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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MW821908.1
|
Physostegia chlorotic mottle virus
|
De Jonghe,K., Foucart,Y.
|
Research Institute for Agriculture, Fisheries and Food, Plant
|
Belgium
|
2022-04-18
|
GBVC_PhCMoV_01
|
Alphanucleorhabdovirus physostegiae
|
Alphanucleorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
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|
GenBank
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Belgium
|
Belgium
|
Stachys affinis
|
plant leaf
|
2019
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Physostegia chlorotic mottle virus isolate GBVC_PhCMoV_01, complete genome
|
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AATCTAACAGAAAGAGGGTTTCCCGATCCTGTTACTGAAGGGGTGATGTTTTTGAACAAGATGCATGAAAGATTGATGAAGATTGATATCAGCCTGGGTATTGCAGTGGGGACCTTAAAAGGGATATCATTCAGTCAGCAGCCCAACTATGAGAAACTAGTAGAAGATCCAGCATCCATATCTCATGACAGCCCCTCTCATAGCACCTCAACACTTAGAGAGAATGCCAGAGAAGCAGTTTTATCGGTTGCAAAGCACAACAACCCAGATTTTGTGAACCTTGTGTCAGTCGCAAGCAAAGACAACGAGAGGGCCTTTTACACAGCTCTATGCTCCGGGAATAAGCTTGATCCAAAGGTCCTTCATGAGATTGCGAAGGCATCATTATATGGTGTGACCAACAGCTTAATATCTCGTATTGATAAGACACGGACGATACGACGGATGAACGAAACTATGTCTGTGGTATCAGAGCTGGCAGAGTCAGAAGTGAGATACATCGGGTATCTACATGTCCGGGACAAACTGCCGCACGATCTACAGTTCTCCTCCTGCTCCAGACTGACAGCAGACTCCATGCGATCTTTATCTTACAAAAAGCAAGTTCTTGGAGTAACAGTCCCGCATCCCGCTGAATACTTGAATGTTGTGCCTAAGAACGGTCACTTATGTATGTCAGGATACATCACAATTCAAGATGGGCGTCAGACTACAGGGGATATCTGGTCGATCAAAGGCCCTTGCAAGCCTTATTTTGGATCTTACACCAAGGAAAGATTTAAGGCTACTGATATAGCTTCAGCTTACGGTGATGAGGACGTGCTGAAGCGAGCAGTAAGCATCCAAAAGTTGATAGGATGGAGATACCCTGCTGAATCCGCATTCGGGAAGATCATAGCTGCAACTCTTCAGGCGGTTTCGAATGTTGATCCTGAGATAGTCTGGGTGAGAGAAGAAACCATAAGAGGAAGCTATGACCATCGCAGGAACACAGATGCAAACACCCATGGGGGTATACCGAACTTCCTGAACACTGCCAGCACTCACTTGAGTCTGTGCACCTCCACATGGGTAGAGCACTCCAGATCGGGGAAGAATGAGTACATACATTTTCAATCCTGTATGATCACATGTGTCCGGTTCATGCTCAGATACATGATGATACCCCGTTTTACAGACTCTATTACGGAGTATCACGCTCATGAATGCTGTTCAACATGCATAACAGAGATAGAACCCATCCCTCCCGACTCTACTGCTCCAACCATTCCTGTGTCGTTCCCCACACTGCCATTAAATCAGCTGGTATATGTAGAGAGTGAGAACATCAAGATGGACTACACACGGAGGCTCGCCATAGAAGACAGCCAGAGTATCGCTCCCATGATTTTGGAAGACATCACAGTACTGGGATCCTCCCATGATAGGATTGTTGATTGTATCAGCTCAATCCTTGTGATAGAAACCCTTGGGAGGAAACACGGAATGTCCAAAAGCTTTATGATACTTGCCAGAGAAAAGGTCTGTGTGGATGCATGTCTGGTTCTTTACAGGAAAAAGATGACACTTCTTCGCTATGTGGACCCCACCATAAACATCCAAAGTTGCAGGTCTCTGGATGTTCTGTGTGACACTCTGCAAGGAATGGCAGACAAGATGTCCGCCCTCGGTTGGGCCACAGAGGGTCAGCTGGAGGGGGTTTCATCATCTGTAGTATCAGATACATGGGAGAATGACAAACCCATCAACATACTATGCTACCCCAACAGTGTTCTAGGGTGGCTGCCACTCCAGATCGTAATGTATAAGCTAGGGAAAAGCCCCATGCTAGTAGGATGCCCTGACTGTCTGGATATTCTAAGAAGAATGATGAACATGAGGACAAAGGATGCCATGAGTATGAGTATGTGCTCCGCTCACCAGTTTGTCAGTGTAAGGGTACCTATTATATGTGCCCACCCAGACAACCTCCTGAAAGAACTGTCATCAACTGGAGATCCCAACATTCCGGACATGTACCATTTTGAGGATGTTCCTGAGCTGGGACACATCCACATGTCCCATGAGTCTGAACTGTTGGATCTTCCAACGCTCTTACCCATCTTTGCAGTAGGAGAGGAAACATCAGTGCAGGAATGGGCAGATTTGATTCAGAGGTTCATCTGTCATGTGGACGTGGACTTCATTGTGATGGATATTGAGATTGAGTCTGCAGAGATTCTTTATCTAGCTATCAAGACAAGATCAGGCTTCATCAAGCCCATCCACATAATGATTGATGAGCTATCCAACGAAGAAACCGGAAACATCCTAGAGAAATTCAGGAACGGCAAGCTGGGTCAGTGTCCGGTCATCATGTCATACTCAGAAGAAGATCTCCCCGACGGAACAGGATTGGTGCTATCCCAGAAACATGACATCTTGGTGGAGGTTCTAAACTCCAGAGGTCGTGCCTTTTCTGTCATGGGAGGATCCCGACTTTCCAGATTGGATATCGACATGAAAAGGAGGATCAGCGGAGTGTACACATTTCCTAGAGTGAAGGTTCCTGCTCTATTATTGATAGTAGAGTTGAGTAATGAAAATTATCTCACTAATCTCTCTCCCCTTCATCATCTGTATGAAGAAGTGGCACACACCGGACCAGAGACAACACACCAGGACAAGCCAGGACAAAACTTCTCTCACACTTCGACCACCAGACAACAAATAAGTGCATTCACCTTCAAGAACAGGTTGGAGATGATAACGGTATTTTCAAAAAGAATGAGAGAGATAGACAGAATTGACTCCTTCTGCAGGATGAGACGAAAAGCTAGGAGAATACAGGATATCTTGCTGAAACTAGTTGTGAGCGTCCTGGCACATGCAGAGCCCTACGACGCCGACACAATCGGCAGGATCAAATCCATTGACATGGACTCCATTAAAGGAACACTAAAGCCAAGGCTGAGATCATGCAGTATAGAGAGTGTTCTTGTGAGGTTCTATAAGTTGATGTATCTGAAGCTCCGGAGAGATCCCCACCTCAGCAGTATGGGAGTAAAGTGGGAAGATGTTATGCTCTGTATCAACTTCAAGACTCAGAAGAGAAGAGGATTCAACATTGTAGGAACCTAAGCAAAGCCCCATGGAATTAGGCAGCTATCTTAATAAAAACCCTAAACGGCAATTGTAATGGGTTTACTTTAAACAGCTCGGATTGGTCTGAATCTCAATGAAGGCATCTCTCCTAGTATGGGAGTATGGTCAGGCTCTTCAAAAAGTGCCTGCACCTAATAGTGGCATATGATAGATATTGCTTCGGTGGGTGTGT
| 31,237
|
MZ322957.1
|
Physostegia chlorotic mottle virus
|
Temple,C., Blouin,A.G., De Jonghe,K., Foucart,Y., Botermans,M., Westenberg,M., Schoen,R., Gentit,P., Visage,M., Verdin,E., Wipf-Scheibel,C., Ziebell,H., Gaafar,Y.Z.A., Kutnjak,D., Vucurovic,A., Rivarez,M.P.S., Richert-Poggeler,K.R., Ulrich,R., Zia,A., Yan,X.H., Massart,S.
|
Research Institute for Agriculture, Fisheries and Food, Plant
|
Belgium
|
2022-04-18
|
GBVC_PhCMoV_01_SA
|
Alphanucleorhabdovirus physostegiae
|
Alphanucleorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,316
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Stachys affinis
|
plant leaf
|
2019
| null | null |
Physostegia chlorotic mottle virus isolate GBVC_PhCMoV_01_SA, complete genome
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| 31,238
|
MZ389081.1
|
Physostegia chlorotic mottle virus
|
De Jonghe,K., Foucart,Y., Temple,C., Blouin,A., Massart,S.
|
Research Institute for Agriculture, Fisheries and Food, Plant
|
Belgium
|
2022-04-18
|
GBVC_PhCMoV_03_IB
|
Alphanucleorhabdovirus physostegiae
|
Alphanucleorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,297
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Ipomoea batatas
|
plant leaf
|
2020
| null | null |
Physostegia chlorotic mottle virus isolate GBVC_PhCMoV_03_IB, complete genome
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AAGGTGTAATGACCCAAATGTGGCAACCATGAGACTGGGAGGCACGTTATTGAGATAGAATGTAACATAGGGTTACGGTCATTGTGATTGCATTCTTCAGATCTGTGATCTTCGCAGAACCATCCTCTCAACAAGTCCATCACCAGGAGACCGGCTCGACAGCCAGATAATATGACTATTAAATAAAACCCAACAACATATATATAGAATTCACTTATATTGTCATCATTGAGAGAAAGGATATTTGTAATATCTTATCATATTTCAGTCATGAATGTTAACGATGCTCTTGCTTTGTTGTCTAATGAGGTTAAGTATTCAGAATGGGATTCTAGAGAGCACATTCCCTCCGCAGGGGGCAAGGCTGTGCAGGTAGAGTACACCTACAATGATTATCTGTCCAAAATCACATCATTATATGATCTCAGCCCTATGGAGAGCACGGACATTGCCACATCATTCATTAGCTTAATGGATAGTATAGAAAAGAGCACATTGACCGAGAAGGAAATAGCTACGATATTCCGCATTGCTTTCCAGATAAAGAATATTGAAAAGTCATCTGACAGATTGCTATCCAAAGCCCGTCAATATCCGGAAGGCAAAGAGGGTATAGTCAAATCGGCACTCGACAATGTCAAATTATCAGGGGGGGAGTTGCAGACCGCAGCTGCTAGCATAACCATCCCTGCAGGAGGGGTAGCTCAGGCCCCTAGACAGCCTCCGAGTGCATCTGATGTAGCGGTGTCAGGGCCGTATATCTGCATGGCATTACTCAGGCTTATTGCCAAAACAGTGGAATCATTTCAAAGATCACTGCCCACATTGAAGGCAAATTTCGGAAGATTCTATGGTGTCCAATCTCAGGCGGTCAATGACTTTGCACCACCCACTCAATCTCTCATGCAGATCATTCAGGGGCTGGACACGTACACTGCTGCTTCTCAAACCCTCTCATGGATGTTAGGTCAAGCTGAGACCACAGTCCCTCGCTCTGACAAGAACCATGGGTTCATGCGGTATTTGATATATCAACATGCTGAGATGAGGGGAATGCAAGTTTACAAGATGCTGTTAACTACACTTGCAGGACTGCCTGCTATCACCCCTGCCAAATTCCTAAGAGCCATAGAAATACCCGATGCTGTCACTACAATAAAAACTATTGTAAACATCGTTCAGAAATTAGACTTGCCTCCTGAGAGAGTCACCGACTACCACTGGAAATATGCAAAGTATGTGGATCAATCATACTTTGTGAATCTGAGTGCAAGTCGCAATGCAAAATTCATATATTTGATAGCATGCATTATGGAGAAAGAAGGTTTGGTCACAGGTCCTGCTTATGCCAATCCTAAAAATATCAAGGTCCTGGAGGCTCTCAAGAACAACCCGTCCACATCAGCATACTTTGAGAAGATGGCAGACAATTTCCACATGGTGTATGAAGGTTTGGAGGGATTATCAGGAGAGGGTGTCGGAGTGGTAATGAGGATGAGCAACCCGCATAGACCTATGAAGAGGCCCGCCCAGGAGACAGCGACACCATCTGCGAAGAGAGCCGCACCCGCCCCGGCAACCCCCCAAACAGAGGAAATGGTTGTAGATGGACGAGTCGAGGAACCCCAGCCGTCAGTCTCTGCAGATCCAGGCTCCGCAGCAGCAGCCCTGGAGAAAGGTGGATATCTCGACAGTCTGTAAGTGTGCTGGTGTAGTGCATGATTATGTAATATTTGGTTTGAATTTGGTGTTCAATGCATGTTATGTTATCTATCCTGGTGTACTGTTCCTCCTTTAATAAAAACCCAACACACCATGAGTGCCACACGCAACACCACGACCGCACCAGACAAGCCAGGCAATCAAGGGGACGATATATTCATCGAGATGTGTAGAATGGTAGACAATCTATTGTCAGAAAAAGAGAAACAAGATCCCATCAACCAGTCCCACCCCAGGCAAAGTCAAGAAGACGAGAACCAGCCATCCGACACAGAAAGCACAGAGTCATGGACATACTATGACTACACTGACCATCGATACTATCCATCTTATGAGGATAATGACTCTGATATATATGACCTGATGTATGAATGCAACCACGGTGAGTGGGGCAACTAATAGGCAGAGCATACACGCCGCCCCTACACCACCTCTGCGATAAGTTAATAAAAACCCAACACCCCCTCGATATGAAAAATGAATAGAAAATCCACWAGGTCAGAGGACAGAGTGAGTAGCAAACCGTACACTCGAGCAGACAAGAAACAAAAGCTATCCTCTCCCATTTCAGATCAAAACACAGAAAAGACCTCTAACATATCTCCACAAGCTATCACAGATAGAATAAATAACTCTGATAAATACGAGGATATTCATCCAGGTTCCCTCCAGGATTTCATAACCACTCCATCTGACTCACCACCTCACTCTCCTGAAACCATGCCTCCTGTTCCTCCGGAACAAAAACTTATACAAGACATCACCAATCAGTTAAAGAATAACGGAGCTTCAGTGACTTATGAGTCTGTCACTCAGGCTCTAGATAAGTCCAATATCCAGAATACTGAAAATATTGGATTATATGAATCAAGGGCCATCTTATGGTACTCTGCAGGTTATAATGATGCTGTCAGGAGTAGTGAGATTCAAGATGCTAACTTTGCCAAGAAACAGCTTCCTACTGTGTCATCTGGGCTCTTATCTACAGCTAATACTCTAATAGATGTCGTGCAAAAATTTGATGAGATATCAAAACGATTAAACAAGAAAACCTCTATAAGCGATCTTAATAGTGATGAAATAGTGACATTCTGTTTAACCGCATACGATGGAAAATCCTCTAAAGAGAGAGCGTCTAGCCTCATGATGTATTTGCACAATTATATAGGTTACTCAAACATATATAATGATATAGCAAACCCGAACACCGTGGAGAGAGCGTTTAACTTTATGAAGACACTAGACCCCATCGCTGTGGCAGTGATGACTACATTAGGGGAGACTGCAGGTACCCCAATAGTCGCAGACAGGGTGGCGAAGGACAAGCATGCATATGCATTGTACTCAGGGAAACGTGTTTAATTCGTCATGGTAAATCTACTGGGACTAAATAAGCTGTGTAGTATCCAAGTTGCCGCAACTACTACAGGATTGCAATCAACGGCCCATGACCTGTGGACACCCCCAAATCGTAACCTGGTGTATCCAGATGAAGTTCCAAAATCTGTGATTGCTACTATGTTATTATGTGTTTCTTATTTACTATTGTGTGTAGCACTTTTGTTTATTTTGACCATGTTATATTTTAATAAAAACCCAACAACCACGATGGCTGATCTCCGAAGTTTCTCCATGAAAGACAAGAAATTGTCCAAAGATGGGATGGACATTGCTCTCCCCGTCAAGACAGCTGCTGTCAAAAGGTTAGGGGTGGTTCGCAGAATAATGGGTAGTATGGGGTCAGATGCCAAATCATTTGTCAGGTTGACTAAATTTTGCATAATCTGGAAGCCTACATGTCCCCCGGAGAGTCCAGGCACTTTTGCCTTTGAGTTCTACTATGAAAGCGGTGATGCTAAACACGTTATCCTCAAGGGGAAAGGCATGATRGGTCATGCTGTGAAGATAATCATTAATACTTCCATCTACATAAATAAGGAACAGTTGAGAAACTGCCCGTACAAAGTCAATATCATACCTGGTACATCCTCTGATGAAATACTTGGATCTATAGTATTTGATATGTATGTCAGTGGATTTGAGAACTACCCAAAAAACGGGGTACGCAACGTTAATATCTCTGTTGAACCTCCAACATGGCATGGAATGCCTAGTATCTTTTATCAGCTAAATCCACAAGGTGATCAATTCTCATCGAATATAACAAGTATCATCCCGATACTGGATGAATTCCGTGAATCTTATCCGAATGTTATCAAGAAAATTACCAGGAAAGATGATATGGACATCATAGATATGATGGTCCTGAAGTACATGCTGAATGATGATGAGATGGACAAGGTGAAATTCTTGGAGGACGGTCTTCGGCCTGGTTACACCATGTCATCTGATGATATGTTATATTATATGACTCTGTTTACAAGATTTAATATGTCATCTTACCGACCATTTGCATCAGAGATCACTGGGGAACTGAATAAAGAGACTCAATCATCCACTACTAGGTTTTGATGATTGGAAGAGATTGCAAGGAAAGTTATATGTGGTTTTATTCTCCTAAAATAAATAACTCAGCGCTTCCCGTTATAAAATATATTTATATGCACAATGTATCCCTGTCATAATAATATACTTATGTAAAGACTGTATTGTATGAGTTTCTTTAATAAAAACCCAACATCATCATGATTAACGTCATCGGGAAAACTAATGCCTCTGTTCAAGGGATATATGAAGTGGATAGAGAAAGAGTTTCCTTATTGAGCCCTGTGACAGGACAGTTTGTTTCCCTAAATTACATCATAAAGATCAATATGTATGAAAAGGAGATGCAGAAATCATTTGAGGAAGGAGAACTACATTACCATGATATATTTGACATGGTCGAATCTGCTCTAGATCTCCCCACTACTCGTCCTGATTCTATAAAGAGGACTCCTACTAATCTACCTACCAGAGTTGCTAAGACAATTATTCAGATCTGTAGGATCCATGCTATCCATACAAATGCGAAGATGGTGTTTATGACTACTTCTACAGACCACTCGGAAGATACTCCCACTCTAGTCATAAAGGAAGGTGAGACTCTAGTCTCCCCTCATTATGATTCTCACGTGGTGGAAGTGGTCAATCAACCAGGAGAGTCACCCCTATCAGGAAGCTATCATCTCACGCTAGAGAAACCTTACATATCACATGATAATAAGATCATAGGCCATTTATCTTTCGCAGCATATGTAAGGGCTCCTCCACGTGGAAATGCAGTATCACAGGCAAGACTGAACATCAGAGTCTTAGCAAGTAAGTACCAAAGGAGT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| 31,239
|
MZ389082.1
|
Physostegia chlorotic mottle virus
|
De Jonghe,K., Foucart,Y., Temple,C., Arnaud,B., Sebastien,M.
|
Research Institute for Agriculture, Fisheries and Food, Plant
|
Belgium
|
2022-04-18
|
GBVC_PhCMoV_04_LT
|
Alphanucleorhabdovirus physostegiae
|
Alphanucleorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,313
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
| null |
plant leaf
|
2020
| null | null |
Physostegia chlorotic mottle virus isolate GBVC_PhCMoV_04_LT, complete genome
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CCACCCCCACAAGGTGTAATGACCCAAATGTGGCAACCATGAGACTGGGAGGCACGTTATTGAGATAGAATGTAACATAGGGTTACGGTCATTGTGATTGCATTCCTCAGATCTGTGATCTTCGCAGAACCATCCTCTCAACAAGCCCATCACCAGGAGACCGGCTCGACAGCCAGATAATATGACTATTAAATAAAACCCAACAACATATATATATAATTTACTTATATTGTCATCATTGAGAGAAAGGATATTTGTAATATCTTATCATATTTCAATCATGAATGTTAACGATGCTCTTGCTTTGTTGTCTAATGAGGTTAAGTATTCAGAATGGGATTCTAGAGAGCACATTCCCTCCGCAGGGGGCAAGGCTGTGCAGGTGGAGTACACCTACAATGATTATCTGTCCAAAATCACATCATTATATGATCTCAGCCCTATGGAAAGCACGGACATTGCCACATCATTCATTAGCTTAATGGATAGTATAGAAAAGAGCACATTGACTGAGAAGGAAATAGCTATGATATTCCGCATTGCTTTCCAGATAAAGAATATTGAAAAGTCATCTGACAGATTGCTATCCAAAGCCCGTCAATATCCGGAAGGCAAAGAGGGTATAGTCAAATCGGCACTCGACAATGTCAAACTATCAGGGGGGGAGTTGCAGACCGCAGCTGCCAGCATAACCATCCCTGCAGGAGGGGTAGCTCAGGCCCCTAGACAGCCCCCGAGTGCATCTGATGTAGCGGTGTCAGGGCCGTATATCTGCATGGCATTACTCAGGCTTATTGCCAAAACAGTGGAATCATTTCAAAGATCACTGACCACATTGAAGGCAAATTTCGGAAGATTCTATGGTGTCCAATCTCAGGCGGTCAATGACTTTGCACCACCCACTCAGTCTCTCATGCAGATCATTCAGGGACTGGACACGTACACTGCTGCTTCTCAAACCCTCTCATGGATGTTAGGTCAAGCTGAGACCACAGTCCCTCGCTCTGACAAGAACCATGGGTTCATGCGGTATTTGATATATCAACATGCTGAGATGAGGGGAATGCAAGTTTACAAGATGCTGTTAACTACACTTGCAGGACTACCTGCTATCACCCCTGCCAAATTCCTAAGAGCTATAGAGATACCCGATGCTGTCACTACGATAAAAACTATTGTAAATATCGTCCAGAAATTAGACTTGCCTCCCGAGAGAGTCACCGACTACCACTGGAAATATGCAAAGTATGTGGATCAATCATACTTTGTGAATCTGAGTGCAAGTCGCAATGCAAAATTCATATATTTGATAGCATGCATTATGGAGAAAGAAGGCTTGGTCACAGGACCTGCTTATGCCAATCCTAAAAATATCAAGGTCCTGGAGGCTCTCAAGAACAACCCGTCCACATCAGCATACTTTGAGAAGATGGCAGATAATTTCCACATGGTATATGAAGGTTTGGAGGGATTATCAGGAGAGGGTGTCGGAGTGGTAATGAGGATGAGCAACCCGCACAGACCTATGAAGAGGCCAGCCCAGGAGACAGCGACACCATCTGCGAAGAGAGCCGCACCCGCCCCGGCAGCCCCCCAAACAGAGGAAATGGTTGTAGATGGACGAGTCGAGGAACCCCAGCCGTCAGTCTCTGCAGATCCAGGCTCCGCAGCAGCAGCCCTGGAGAAAGGTGGATATCTCGACAGTCTGTAAGTGTGCTGGTGTAATGCATGATTATGTAATATTTGGTTTGAATTTGGTGTTTAATGCATGTTATGTTATCTATCCTGGTGTACTGTTCCTCCTTTAATAAAAACCCAACACACCATGAGTGCCACACGCAACACCACGACCGCACCAGACAAGCCAGACAATCAAGGGGATGATATATTCATCGAGATGTGTAGAATGGTAGACAATCTATTATCAGAAAAAGAGAAACAAGATCCCATCAACCAGTCCAACCCAAGGCAAAGTCAAGAAGACGAAAACCAGCCATCCGACACAGAAAGCACAGAGTCATGGACATACTATGATTACACTGACCATCGATACTATCCATCTTATGAGGATAATGACTCTGATATATATGACCTGATGTATGAATGCAACCACGGTGAGTGGGGCAACTAATAGGCAGAGCATACACACCGCCCCTACACCACCTCTACAATAAGTTAATAAAAACCCAACACCCCCTCGATATGAAAAATGAATAGGAAATCCACTAGGTCGGAAGACAGAGTGAGTAGCAAACCGTACACTCGAGCAGACAAGAAACAAAAGCTATCCTCTCCCATTTCAGATCAAAACACAGAAAAGACCTCTAACATATCTCCACAAGCTATCACAGATAGAATAAATAACTCTGATAAATACGAGGATATTCATCCAGGTTCCCTCCAGGATTTCATAACCACTCCATCTGACTCACCACCTCACTCTCCTGAAACCATGCCTCCTGTTCCTCCGGAACAAAAGCTTATACAAGACATCACCAATCAGTTAAAGAATAACGGAGCTTCAGTGACTTATGAGTCTGTCACTCAGGCTCTAGATAAGTCCAATATTCAGAATACTGAAAATATTGGATTATATGAATCAAGGGCCATCTTATGGTACTCTGCAGGTTATAATGATGCTGTCAGGAGTAGTGAGATTCAAGATGCTAACTTTGCCAAGAAACAGCTTCCTACTGTGTCATCTGGGCTCTTATCAACAGCTAATACTCTAATAGATGTCGTGCAGAAATTTGATGAGATATCAAAACGATTGAACAAGAAAACCTCTATAAGCGATCTTAATAATGATGAAATAGTGACATTCTGTTTAACCGCATACGATGGAAAATCCTCTAAAGAGAGAGCGTCTAGCCTCATGATGTATTTGCACAATTATATAGGTTACTCAAACATATATAATGATATATCCAACCCGAACACCGTGGAGAGAGCGTTTAACTTTATGAAGACACTAGACCCCATCGCTGTGGCAGTGATGACTACATTAGGAGAGACTGCAGGTACCCCAATAGTCGCAGACAGGGCGGCGAAGGACAAGCATGCATATGCATTGTACTCAGGGAAACGTGTTTAATTCGTCATGGTAAATCTACTGGGGCTAAATAAGCTGTGTAGTATCCAAGTTGCCGCAACTATTACAGGATTGCAGTCAACGGCCCATGACCGGTGGGCACCCCCAAATCATAACCTGGTGTATCCAGATGATGTACCAAAATCTGTGATTGCTACTGTGTTATTATGTGTTTCTTATTTACTATTGTGTGTAGCACTTTTGTTTATTTTGATCATGTTATATTTTAATAAAAACCCAACAACCACGATGGCTGATCTCCGAAGTTTTTCCATGAAAGACAAGAAATTGTCCAAAGATGGGATGGACATTGCTCTCCCCGTCAAGACAGCTGCTGTCAAAAGGTTAGGGGTGGTTCGCAGAATAATGGGTAGTATGGGGTCAGATGCCAAATCATTTGTCAGGTTGACTAAATTCTGCATAATCTGGAAGCCTACATGTCCCCCGGAGAGTCCAGGCACTTTTGCCTTTGAGTTCTACTATGAAAGCGGTGATGCTAAACACGTTATCCTCAAGGGGAAAGGCATGATAGGTCATGCTGTGAAGATAATCATTAATACTTCCATCTACATAAATAAGGAACAGTTGAGAAACTGCCCGTACAAAGTCAATATCATACCTGGTACATCCTCTGATGAAATACTTGGATCTATAGTATTTGATATGTATGTTAGTGGATTTGAGAACTACCCAAAAAACGGGGTACGCAACGTCAATATCTCTGTTGAACCTCCAACATGGCATGGAATGCCTAGCATCTTTTATCAGCTAAATCCACAAGGTGATCAATTCTCATCGAATATAACAAGTATCATCCCGATACTGGATGAATTCCGTGAATCTTATCCGAATGTTATCAAGAAGATTACCAGGAAGGATGATATGGACATCATAGATATGATGGTCCTGAAGTACATGCTGAATGATGATGAGATGGACAAGGTGAAATTCTTGGAGGACGGTCTTCGGCCTGGTTACACCATGTCATCTGATGATATGTTATATTATATGACTCTGTTTACAAGATTTAATATGTCATCTTACCGACCATTTGCATCAGAGATCACTGGGGAACTGAACAAAGAGACTCAATCATCCACTACCAGGTTTTGATGATTGGAAGAGATTGCAAGAAAAGTTATATGTGGTTTTATTTTCCTAAAATAAATAACTCAACGCTTCCCGTTATAAAAAATATATTTTTATGCACGATGTATTCCTGTCATAATAATATACTTATGTAAAGACTGTATTGTATGAGTATCTTTAATAAAAACCCAACATCATCATGATTAACGTCATCGGAAAAACTAATGCCTCTGTTCAAGGGATATATGAAGTGGATAGAGAAAAGGTTTCCTTATTGAGCCCTGTGACAGGACAATTTGTTTCTCTAAATTACATCATAAAGATCAATATGTATGAAAAGGAGATGCAGAAATCATTTGAGGAAGGAGAACTACATTACCATGATATATTTGACATGGTCGAATCTGCTCTAGATCTCCCCACTACTCGTCCTGATTCTATAAAGAGGACTCCTACTAATCTACCTACCAGAGTTGCTAAGACAATTATTCAGATCTGTAGGATCCATGCTATCCATACAAATGCGAAGATGGTGTTTATGACTACTTCTACAGACCACTCGGAAGATACTCCCACTCTAGTCATAAAGGAAGGTGAGACTCTAGTCTCCCCTCATTATGACTCTCACGTGGTGGAAGTGGTCAATCAACCAGGAGAGTCACCCCTATCAGGAAGCTATCATCTCACGCTAGAGAAACCTTACATATCACAAGATAATAAGATCATAGGCCATTTATCTTTCGCAGCATATGTAAGGGCTCCTCCACGTGGAAATGCAGTATCACAGGCAAGACTGAACATCAGAGTCTTGGCAAGTAAG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| 31,240
|
OL799269.1
|
Phytophthora pluvialis RNA virus 1
|
Xu,Z., Khalifa,M.E., Frampton,R.A., Smith,G.R., McDougal,R.L., MacDiarmid,R.M., Kalamorz,F., Khalifa,M., MacDiarmid,R.
|
The New Zealand Institute for Plant and Food Research Limited, Bioprotection
|
New Zealand
|
2022-11-15
|
PplRV1_3052
|
Phytophthora pluvialis RNA virus 1
| null | null |
RNA
| 6,742
|
GenBank
| 1
|
New Zealand
|
New Zealand
|
Phytophthora pluvialis
| null |
2019-05
| null | null |
Phytophthora pluvialis RNA virus 1 isolate PplRV1_3052, complete genome
|
GAGACGATGGGTGGCCATCGTCTTGGCCTATGGGCGCCTCAGTAGCGCTCTTAAGTTTATTTCTGACAGCGCGATCGGTAGGATTTGAGAGTAGCGCTGAGATTCGCACATAGGTCGTTGTAGGTCGGGTCTCACCGCCGTAGTTACGGGGTGGTGAGCTAGGACCTGGTGAACGGGCTGAGAGCCCGGTGTGCTCCTGGAGATTTCCCCGTCTCCTTGTTTGTGCTAACGTAACACTCCCCAGGGGTTGCCGCGAGTGGCAGGATGGAATCAAGTTCCGAGACTCGCTGTGCGATGTGGATCAACGCCGTTGTTGATCCGGGGGGTGGGAACGTGCCTCACCGCAGCACTAGGTTGGAATGAAGTACCGAAGTTGCAGAGGTGGAGAGACTGACAGCCAGGTTGTCGGCGTGGGCCGAACCCGAAACAGTCCGAGTAGTGTAGTGCTACTGCCATGACATACAACATTTGCCACACCAAATGCCAATCTGCTCAGCAGGGATTGGGTTACACTACTGCTGCCATCCTCGTTTTCTTCGCGAGTGACAAACTAATGAAGGCGCTAACTTCGGTGGGTTCTGCCGAGGCTAGTGTAATGTTAGGAGCCGGCTTATTGATGAGTCTAAGCATCATTTTCAACTGCACCGCCGCCGCAGTTGGGTACCTTGAGGCCTGTGTTCGTGCAGCTATCACGAAACCAACGCGACAGAGTTTTTACGGACCTGCTCTTCGCGTGGGAACCAGCGGCAAGCTGGTTGCGTCCAGGTTCGCGCACGCCATCCCTTACCGTCGGGTGCCACGTGTGTCTGTGTTGACGGTACTGGTTGTGAGTTTCGCACTCTGCTCATCGCCAGAAGTTGAAGTGAGTGCACTCGATGTGGTCCAAGTGGTTGGACACACCCCGTACGGTTACAGCGGGGTGGGTATCATGTACAAGGTTGCCGCCCTACGCGACCTGTACGCAATGATGATGCTTGGTGGGGACATCGAGACGAACCCGGGGCCTCCTCTTCGTTCCCAGGCTGCCAAGTGGGTAGAGCAGGGAACGAGGGCATCGGATCGTGGCCCGCTGGGTGAAGCGACGCTCATCGTCGACAAGGGTGCTAAGAACATCGCTCTTGGTAAGCGAGGCGCTGACGTGCCAGCGATGCGCCATCTTGGCGGCCTGCCGATGCTGCCGACCCAGTACGCTGTGCGCGTAACTTCCGGTAGTCAGGCTTCGTTTGGTGAAGGCGCTCTGCCCTCATCCTGGCGTGATCCCGAGGACTTCGGTCTTACGGCGGGTGGTTTGGGTGCGACGAGTCACCAGATGCGATGGAGACGCGTCCGCCCTTACGCGGTCGACGAGCTCGACACAACCGAGGCACCAACAATGTATCTCGGACGCCCTGACTCCTTGTCCTATCGTGTGGTAAGCACGGCCCCCAAGTTACGCGTGACCCAAGGACCATTGTTTGCCGGCTACGAAGCGCTGCAAGCAGACACGCCGGTACGTGAGTTGCGCACCATCGCTCAGCTGATGGCCGGTTTCCGTGACACAGACGCAAACCGGGTCGTGTCAAAGACTGTCCGACGCCTGGCGCAGGTGGGTGACCGCACGTGCTACCAGCGTTTCTGGTTCAAGGTATGGTTGGATACGTTCGCCGCTGCTGCTGTGGAGGCTGACGGTGGTGACCACTTGTTCGACTTTGGACAGGCGAATCAGCGTGCCGCAATGCATCAGACGACGGCTGCCGGTGCATTGGTGGAAAGTATCGCTAATGGGCTAGACACCAACTGGTCCAATGTGGTGCGTGGTTCTCACTTCTTCTACAGTGCGGATGAAGGTAGTCGTGATGCTGATTTCATCGGCCTGGTGCACCGGTACGCCTCGTCGTGGCCGCCGTGCCCCGTCACGACCTTACCTGGTCACGCTGCCGGCGCAGGCAACATCGTGAACGGGTATCAGGTCGCTGTCCCGGGGGCTGAGGCCTTCTGGTATCACACAGGCGACTACGACGCGGTGCTCAACGTTGCACCCCGAACCGGGTTTGAGACAGCAGACACCATCCGATCATTTGCTGCTCAGTTTCTTAAGCAGACTGGGTCACATGTGGATTGTCAGACTGGTTTTGAGTTGGCTGCTGCGGTTTGCTTCCGGCACCACCCCAACACGATAGCTGACCCACCAGCCGTTGGACTGCGACGCAGGGCTGCACACCGCACTTTCGATGCGATGATGTCTGGCGACAAGTTGCATCTCCCACGTGACTACACGGCCTCAGAGTACTTTTCTGTGATTCGTGACATCGTGGATACCGCTTCGCCGGTGGCTACGTTGCTGACTATGCGTGTCGAGGCGGTGTGGGCTTACGGTCGCACGTACTCCCTCATGCTTTGTTTGAGTCGTTCCGCTGCCTTCAAAGCGTGTAACATTGCCGCGCGTATACTGAGCAACGTGGGCAACATCGCTGCCGATGCGGCCGAGATGCACCATCTCTCAGAGTTGTGTTCGCGTCACCGGCGAGTKGAGATTTCCGAGTTGGATGTGATCACGCAGAACGCTTGTGGCCACCTATTCGGCTTCATCCCGCAGAAGGATGTGTTCCGAGCCTTCGACCTGCTGGATGATTCAGATCGCCCTGATCTGCTGATTGACGCTTGGTTTCCCGATCACGAGATGCCTCATCTCATCGCACCACCCACAATGTATGCGATGATGCGTGCTGCGTTTGATTACATGGTGCTGCCCTCACTGGATGGACATGTCAAGTGGCCTGAGAACAAGGCGTACCCGGTGCGGCACGGACAGTCGGCTTTAGAACACGCGCGACTAGGACAAACGTTTGGACCAACGTCAACGCGTTTGTGGATCGGAGATGGCGGGCACGAGTATTCAGCGAACTACTACGCGGCCAACAATGCCAGTGACACACACGATTATGTGGCTGACGGTGCAGGCAATAATATAAACGTCTGCTACTGGGAGAAGCCTCGTGAGTTCAACTTGCCCGCGCAACCTAATTTCATCGAGCCACGGCGCATGCTGCAGTTCCCTGATTACCTGGTTCCTGGTTGGGGCGTAACGTACAACCCTCGAGTGCGGAACACTATCGCATGGGGTGTCGAGACCGACAATGGTGCCCGTAGTAGAGTGTGGACCGACGTGGCTCGTAAACAACGTTTCACAGGGCCGAGCTTCGAGATTCACTCTGATCGCCCTCACGTGCCGGAGACTGATTCGCTCATTGACTACTGTGTGTATGAGCTAATTGATAGCGAGACACGCCGTCCCATTGGCTTGGGGTTGGTACCCACCCACGCTCCGCCTCAAGCTAGTCCACCCGTAGCCGCCGACCATGGTGGAACTGCTGCTGGTGGAGCTGCGAACATTGGCCCGGCCCACGAGATGAATGATAATTCACCTCAATATGAGTCGGCTCCTGTCACAGGTTTCGATGAAGCCGGAGGCAGCTCCACCCCAATGTTGCCCCCCCCGCGTCAGGCTCCAGTTCTTCCAATGGCTGGGCGATCCTATGCTGACACCCTCAAGCATCCTCGTGCTGCCAACGGCACTCAACGCGGAGCTAGAGGCCGCCGCCGCGCTAACTCAGTGCGAGGAGGCAGCGGTGGCGGTGGTGGGGCTTCCGGCTCTGGAGCACGCCGTTCGGGCCCGGCGCCGGCCGCTTTACCTGCACCGGGTGGCGCTGCCAGCAACCTCGACCGCGTGCACGAAGAGATCAACCGAATGGAGCGAGCTGCAACACGGTCGAGACTATCTGTCGCACCCCCGCAGCCAGCTTCGGCCCCGCCTTCTCAGACGCTATCTCAGGGGGTTGTGATTCGTGGACCACCTGAGGACCAGGTCCGTTCTAACGTACCGACCGACCAGGCCAGCATGGACGCTCTTCTGCGTGTCACTGATCAGGAGGCTCTACCCGAACCAGTCAGCGGGGGCGTGCAAGATTACTCGAGTGAGGTTGTCCATCACGGGCAAACTTTAAACGAGTATGGCGCGCGCTAAGGCCTGCACGTGCCTTTCCTGTGAGTCCGGCTCGCTTGCTTGAGCTTGCACACCGAAAGGGTGAAAGTGAAGAGTATGCTAGAGCATTCTCGGACACATGGAGGGCGTTCATGGGTACACATAGCGACGTAGGGATTCTGAGTGAGTTACGCACTGCTCGGTTGTCGGTTTTTCCCCGATCAATACCCTTTACCGCTGTGAATCTAGAGWTGACACACCAGCCGAGCCCTGGCCGTGCTGGCGCTCAGACCAACATACGCGCGGGCGAATTACTTGCTTACGCTGCGAAATGTGGTCTGGGGCGAAGGCTTGAGCCTTTCCGTTTGGCCTGGTTAACTGGCGCTTGCCCCGGRTGGAGCAATGCTGCTGTAGCCGGGTGGCTCGCCGTTCTTTTGGTGTCTCCCGAGCGCGCACATCTTCTGCGATTAATCCGTCTTGGATTGCTGCATATGCCGATCAATGACTACATTGATGTATGCAAGCGCATCCATGAGGAATTACGCAAAGATGGGACGCTGCTGGGGGACGCCGTGGGAAGTGAGACACGTGTTCAGCTACAATATCTACATTGTATTGCTGGACGCGGTGACTACGCAACCCAACCAACCGCTGACTTAATCAGCCGCTGTACACCACTGCGCAACCAGTGTTGGGTCAGTATGCATGTAGACGGATCGCTGGAGCTCGATAACGACAGATGGCAACGGGAGTTACGTCTGTCTGTTGATCGGGCTCTAGGTGTCTGCGGGGGTGGCGTACGTTGTGAGACGTTTGAGCACTTCTGGGCGCGTCGGTTAGCTTGGGTCGCTAGTGGAAGTGCACCTGGGTATAAGTTTGATTTGCGTGAGCTGGGTTACGGTTTGCTACGACCTAACAAGCGGCTTGCTCTGGAACAGATTGATCTCGGGCCAATTCTACACGCGATGTACTTCGATCGTGGTGAAATGCTGAGTCGGATGGTTGATAAGTATGAGCTGGCGAAGAATCGTGTTTTGTG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| 22,164
|
OL799270.1
|
Phytophthora pluvialis RNA virus 1
|
Xu,Z., Khalifa,M.E., Frampton,R.A., Smith,G.R., McDougal,R.L., MacDiarmid,R.M., Kalamorz,F., Khalifa,M., MacDiarmid,R.
|
The New Zealand Institute for Plant and Food Research Limited, Bioprotection
|
New Zealand
|
2022-11-15
|
PplRV1_4018
|
Phytophthora pluvialis RNA virus 1
| null | null |
RNA
| 6,760
|
GenBank
| 1
|
New Zealand
|
New Zealand
|
Phytophthora pluvialis
| null |
2019-05
| null | null |
Phytophthora pluvialis RNA virus 1 isolate PplRV1_4018, complete genome
|
GAGACGATGGGTGGCCATCGTCTTGGCCTATGGGCGCCTCAGTTGCGCTCTTAAGTTTATTTCTGACAGCGCGATCGGTAGGACTTGAGAGTAGCGCTGAGATTCGCACATAGGTCGTTGTAGGTCGGGTCTCACCGCCGTAGTTACGGGGTGGTGAGCTAGGACCTGGTGAACGGGCTGAGAGCCCGGTGTGCTCCTGGAGATTTCCCCGTCTCCTTGTTTGTGCTAACGTAACACTCCCCAGGGGTTGCCGCGAGTGGCAGGATGGAATCAAGTTCCGAGACTCGCTGTGCGATGTGGATCAACGCCGTTGTTGATTCGGGGGGTGGGAACGTGCCTCACCGCAACACTAGGTTGGAATGAAGTACCGAAGTTGCAGAGGTGGAGAGACTGACAGCCAGGTTGTCGGCGTGGGCCGAACCCGAAACAGTCCGAGTAGTGTAGTGCTACTGCCATGACATACAACATTTGCCACACCAAATGCCAATCTGCTCAGCAGGGATTGGGTTACACTACTGCTGCCATCCTCGTTTTCTTCGCGAGTGACAAACTAATGAAGGCGCTAACTTCGGTGGGTTCTGCCGAGGCTAGTGTAATGTTAGGAGCCGGCTTATTGATGAGTCTAAGCATCATTTTCAACTGCACCGCCGCAGCAGTTGGGTACTTTGAGGCCTGTGTTCGTGCAGCTATCACGAAACCAACGCGACAGAGTTTTTACGGACCTGCTCTCCGCGTAGGAACCAGCGGCAAGCTGGTTGCGTCCAGGTTCGCACACGCCATCCCTTACCGTCGGGTGCCACGTGTGTCTGTGTTGACGGTACTGGTTGTGAGTTTCGCACTCTGCTCATCGCCTGAAGTTGAAGTGAGTGCGCTCGATGTGGTCCAAGTGGTTGGACACACCCCGTACGGATACAGCGGGGTGGGTATCATGTACAAGGTTGCCGCCCTACGCGACCTGTATGCAATGATGATGCTTGGTGGGGACATCGAGACGAATCCGGGGCCTCCTCTTCGTTCCCAGGCTGCCAAGTGGGTGGAGCAGGGAACGCGAGCGTCGGATCGTGGCCCGCTGGGTGAAGCGACGCTCATCGTTGACAAGGGTGCCAAAAACATCGCCCTTGGTAAGCGTGGTGCTGACGTGCCAGCGATGCGCCATCTTGGAGGCCTGCCGATGTTGCCGACTCAGTACGCTGTGCGCGTCACCTCCGGCAGTCAGGCTTCGTTTGGCGAAGGAGCTCTGCCCCCGTCTTGGCGTGATCCAGAGGACTTCGGTCTTACTGCGGGTGGTTTAGGTGCGACGAGCCACCAGATGCGTTGGAGACGCGTCCGACCTTACGCGGTTGACGAGCTCAGCACGACTGAGGCACCGACAATGTATCTCGGGCGCCCTAACTCTCTGGCTTATCGTGTGGTTAGCACGGCCCCCAAGTTGCGCGTGACCCAAGGACCATTGTTTGCCGGCTATGAGGCGCTGCAAGCGGACACGCCGGTACGCGAATTGCGCACCATCGCCCAGCTCATGGCCGGCTTCCGCGATACGGACGCTAACCGTGTCGTATCGAAGACCGTCCGGCGCCTGGCGCAAGTGGGTGACCGCACGTGCTACCAGCGCTTCTGGTTCAAGGTGTGGTTGGACACGTTTGCCGCTGCGGCTGTAGAGGCTGACGGTGGCGATCACTTGTTCGATTTCGGCCAGGCTAATCAGCGTGCCGCAATGCACCAGACGACGGCTGCTGGTGCACTGGTAGAAAGTATCGCCAATGGACTTGACACCAACTGGTCCAACGTGGTTCGTGGGTCGCACTTCTTCTACAGTGCGGATGAAGGTAGCCGTGACGCTGATTTCATCGGACTGGTGCACCGATACGCCTCATCATGGCCGCCGTGCCCCGTCACGACCTTGCCAGGACACGCTGCCGGCGCAGGCAACATTGTGAATGGGTATCAGGTCGCTGTCCCTGGAGCTGAGGCTTTCTGGTATCACACTGGTGATTACGACGCGGTGCTCAATGTTGCACCCCGAACTGGGTTTGAGACTGCGGACACCATCCGATCATTTGCAGCACAGTTCCTTAAACAGACTGGATCCCATGTGGATTGCCAGACTGGTTTTGAACTAGCTGCTGCTGTTTGCTTCCGCCACCATCCGAACACGATTGCTGACCCACCAGCCGTCGGACTGCGCCGCCGTGCCGCACACCGCACTTTCGATGCGATGATGTCAGGCGACAAGTTGCATCTCCCCCGTGACTACACGGCCTCAGAATACTTTTCTGTGATCCGTGATATCGTGGATACCGCATCGCCAGTGGCCACACTACTGACTATGCGTGTCGAGGCGGTGTGGGCTTACGGGCGCACGTACTCCCTCATGCTCTGCTTGAGTCGTTCCGCTGCCTTCAAAGCGTGTAACATTGCCGCACGTATTTTGAGCAACGTGGGTAACATCGCAGCTGATGCGGCTGAGATGCACCATCTATCAGAGTTGTGTTCGCGGCACCGGCGAGTTGAGATCTCCGAGTTGGATGTCATCACGCAAAACGCTTGTGGCCACCTGTTCGGCTTCATCCCGCAGAAGGATGTATTCCGAGCTTTCGACCTACTGGACGATTCGGATCGCCCTGATTTACTGATTGACGCTTGGTTTCCCGATCATGAGATGCCTCATCTCATCGCTCCACCCACAATGTATGCGATGATGCGCGCAGCTTTCGATTACATGGTACTGCCTTCACTAGATGGACACGTTAAGTGGCCTGAGAACAAGGCGTATCCAGTTCGGCATGGACAGTCGGCTCTAGAACACGCGCGGCTAGGCCAAACGTTCGGACCTACGTCGACGCGCTTGTGGATCGGTGATGGCGGGCATGAGTATTCAGCGAACTACTACGCAGCCAACAATGCGAGTGACACGCATGATTATGTGGCTGATGGTGCAGGCAACAATATTAACGTCTGCTACTGGGAGAAACCGCGTGAGTTTAACTTACCTGCGCAACCCAACTTCGTCGAGCCACGTCGCATGCTACAGTTCCCCGATTACTTGGTACCGGGTTGGGGCGTAACGTACAACCCTCGCGTACGGAACACTATCGCATGGGGTGTTCAGACCGACGATGGTGCGCGTAGCAGAGTGTGGACTGATGTGGCTCGCAAGCAACGTTTCACCGGACCAAGCTTCGAGATTCACTCGGATCGCCCGCACGTGCCGGAGACTGATTCACTCATCGATTACTGTGTGTATGAGCTAATCGATAGTGAGACACGCCGACCGATCGGCTTGGGGCTGGTACCTACTCACGCGCCGCCTCAGGCTAGTCCACCCGTAGCCGCCGACCATGGTGGAGCTGCTGCCGGTGGAGCTGCGAACATTGGACCGGCCCATGAGATGAATGACAATTCACCTCAGTATGAGTCAGCTCCTGTCACTGGATTCGACGAGGCAGGAGGCAGCTCCACTCCAGTGCTACCCCCCCCGCGGCAAGCGCCAGTTCTACCCATGGCTGGACGATCCTACGCCGACACCCTACAGCATCCGCGCGCTACCAACGGGACCCAACGCGGAGCCAGAGGCCGCCGTCGCGCTAACTCGGTGCGAGGAAGCAGCGGCGGTGGCGGTGGTGCTTCTGGTTCTGGAGCGCGCCGTTCAGGCCCGGCTCCGGCCGCTTTACCTTCACCAGGTGGCGCAGCCAGCAACCTCGACCGCGTGCACGAAGAGATCAACCGAATGGAGCGAGCTGCTACGCGGTCGAGACTATCTGTCGCGCCCCCGCAGCCTGCTTCGGCCCCGCCTTCACAGACGTTGTCGCAGGGGGTTGTGATTCGTGGGCCACCTGAAGATCAGGTTCGTTCGAACGTGCCTACTGACCAGGCTAGCATGGACGCTCTCCTGCGTGTCACCGATCAGGAGGCGCTACCCGAACCGGTCAGTGGCGGCGTGCAGGATTACTCGAGTGAGGTCGTCCATCATGGGCAAACTTTAAACGAGTATGGCGCGCGCTAAGGCCTGCACGTGCCTTTCCTGTGAGTCCGGCTCGCCTGCTTGAGCTTGCACACCGCAAGGGTGAAAGTGAAGAGTATGCTAGAGCATTCTCGGACACATGGAGGGCGTTCATGGGTACACATAGCGACGTAGGGATTCTGAGTGAGTTACGCACTGCTCGGTTGTCGGTTTTTCCCCGAACAATACCCTTTACCGCTGTGAATCTAGAGATGACACACCAGCCGAGCCCTGGCCGTGCTGGCGCTCAGACCAACATACGCGCGGGCGAATTACTTGCTTACGCTGCGAAATGTGGTCTCGGGCGAAGGCTTGAGCCTTTCCGTTTGGCCTGGTTAACTGGCGCTTGCCCTGGATGGAGCAATGCTGCTGTTGCCGGGTGGCTCGCCGTTCTTTTGGTGTCTCCCGAGCGCGCACATCTACTGCGATTAATCCGACTTGGATTGCTGCATATGCCGATCAATGATTACATTGATGTCTGCAAGCGCATCCATGAAGAGTTACGCAAAGATGGGACGCTGCTGGGGGACGCCGTGGGGAGCGAGACGCGTGTCCAGCTACAATATCTACATTGTATTGCAGGACGTGGTGATTACGCAACCCAACCAACCGCTGACTTGATCAGCCGTTGTACACCTTTGCGTAATCAGTGTTGGGTCAGTATGCATGCGGACGGATCGCTTGAGCTCGATAACGATAGATGGCAACGTGAGTTACGTCTGTCCGTCGATCGTGCTTTAGGTGTCTGCGGGGGTGGCGTACGTTGCGAAACGTTTGAACACTTCTGGGCTCGTAGGTTAGCTTGGGTCGCTAGTGGAAGTGCGCCTGGGTATAAGTTTGACTTGCGTGAGCTGGGTTACGGTTTGTTACGACCTAACAAGCGGCTGGCTCTGGAGCAGATAGATCTCGGGCCGATTCTACACGCGATGTATTTCGATCGTGGTGAAATGCTGAGTCGGATGGTCGACAAGTATGAGCTGGCGAAGAATCGCGTTTTGTG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Phytophthora pluvialis RNA virus 1
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Xu,Z., Khalifa,M.E., Frampton,R.A., Smith,G.R., McDougal,R.L., MacDiarmid,R.M., Kalamorz,F., Khalifa,M., MacDiarmid,R.
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The New Zealand Institute for Plant and Food Research Limited, Bioprotection
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New Zealand
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New Zealand
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Phytophthora pluvialis
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Phytophthora pluvialis RNA virus 1 isolate PplRV1_4015, complete genome
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| 22,166
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OL799272.1
|
Phytophthora pluvialis RNA virus 1
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Xu,Z., Khalifa,M.E., Frampton,R.A., Smith,G.R., McDougal,R.L., MacDiarmid,R.M., Kalamorz,F., Khalifa,M., MacDiarmid,R.
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The New Zealand Institute for Plant and Food Research Limited, Bioprotection
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New Zealand
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2022-11-15
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PplRV1_4016
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Phytophthora pluvialis RNA virus 1
| null | null |
RNA
| 6,758
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GenBank
| 1
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New Zealand
|
New Zealand
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Phytophthora pluvialis
| null |
2019-05
| null | null |
Phytophthora pluvialis RNA virus 1 isolate PplRV1_4016, complete genome
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GAGACGATGGGTGGCCATCGTCTTGGCCTATGGGCGCCTCAGTTGCGCTCTTAAGTTTATTTCTGACAGCGCGATCGGTAGGACTTGAGAGTAGCGCTGAGATTCGCACATAGGTCGTTGTAGGTCGGGTCTCACCGCCGTAGTTACGGGGTGGTGAGCTAGGACCTGGTGAACGGGCTGAGAGCCCGGTGTGCTCCTGGAGATTTCCCCGTCTCCTTGTTTGTGCTAACGTAACACTCCCCAGGGGTTGCCGCGAGTGGCAGGATGGAATCAAGTTCCGAGACTCGCTGTGCGATGTGGATCAACGCCGTTGTTGATTCGGGGGGTGGGAACGTGCCTCACCGCAACACTAGGTTGGAATGAAGTACCGAAGTTGCAGAGGTGGAGAGACTGACAGCCAGGTTGTCGGCGTGGGCCGAACCCGAAACAGTCCGAGTAGTGTAGTGCTACTGCCATGACATACAACATTTGCCACACCAAATGCCAATCTGCTCAGCAGGGATTGGGTTACACTACTGCTGCCATCCTCGTTTTCTTCGCGAGTGACAAACTAATGAAGGCGCTAACTTCGGTGGGTTCTGCCGAGGCTAGTGTAATGTTAGGAGCCGGCTTATTGATGAGTCTAAGCATCATTTTCAACTGCACCGCCGCAGCAGTTGGGTACTTTGAGGCCTGTGTTCGTGCAGCTATCACGAAACCAACGCGACAGAGTTTTTACGGACCTGCTCTCCGCGTAGGAACCAGCAGCAAGCTGGTTGCGTCCAGGTTCGCACACGCCATCCCTTACCGTCGGGTGCCACGTGTGTCTGTGTTGACGGTACTGGTTGTGAGTTTCGCACTCTGCTCATCGCCTGAAGTTGAAGTGAGTGCGCTCGATGTGGTCCAAGTGGTTGGACACACCCCGTACGGATACAGCGGGGTGGGTATCATGTACAAGGTTGCCGCCCTACGCGACCTGTATGCAATGATGATGCTTGGTGGGGACATCGAGACGAATCCGGGGCCTCCTCTTCGTTCCCAGGCTGCCAAGTGGGTGGAGCAGGGAACGCGAGCGTCGGATCGTGGCCCGCTGGGTGAAGCGACGCTCATCGTTGACAAGGGCGCCAAAAACATCGCCCTTGGTAAGCGTGGTGCTGACGTGCCAGCGATGCGCCATCTTGGAGGCCTGCCGATGCTGCCGACTCAGTACGCTGTGCGCGTCACCTCCGGCAGTCAGGCTTCGTTTGGCGAAGGAGCTCTGCCCCCGTCTTGGCGTGATCCAGAGGACTTCGGTCTTACTGCGGGTGGTTTAGGTGCGACCAGCCACCAGATGCGTTGGAGACGCGTCCGACCTTACGCGGTTGACGAGCTCAGCACGACTGAGGCACCGACAATGTATCTCGGGCGCCCTAACTCTCTGGCTTATCGTGTGGTTAGCACGGCCCCCAAGTTGCGCGTGACCCAAGGACCATTGTTTGCCGGTTATGAGGCACTGCAAGCGGACACGCCGGTACGCGAATTGCGCACCATCGCCCAGCTCATGGCCGGCTTCCGCGATACAGACGCTAACCGTGTCGTATCGAAGACCGTCCGGCGCCTGGCGCAAGTGGGTGACCGCACGTGCTACCAGCGCTTCTGGTTCAAGGTGTGGTTGGACACGTTTGCCGCTGCGGCTGTAGAGGCTGACGGTGGCGATCACTTGTTCGATTTCGGCCAGGCTAATCAGCGTGCCGCAATGCACCAGACGACGGCTGCTGGTGCACTGGTAGAAAGTATCGCCAACGGACTTGACACCAACTGGTCCAACGTGGTTCGTGGGTCGCACTTCTTCTACAGTGCGGATGAAGGTAGCCGTGACGCTGATTTCATCGGACTGGTGCACCGATACGCCTCATCATGGCCGCCGTGCCCCGTCACGACCTTGCCAGGACACGCTGCCGGCGCAGGCAACATTGTGAATGGGTACCAGGTCGCTGTCCCTGGAGCTGAGGCTTTCTGGTATCACACTGGTGATTACGACGCGGTGCTCAATGTTGCACCCCGAACTGGGTTTGAGACTGCGGACACCATCCGATCATTTGCAGCACAGTTCCTTAAACAGACTGGATCCCATGTGGATTGCCAGACTGGTTTTGAACTAGCTGCTGCTGTTTGCTTCCGCCACCATCCGAACACGATTGCTGACCCACCAGCCGTCGGACTGCGCCGCCGTGCCGCACACCGCACCTTCGATGCGATGATGTCAGGCGACAAGTTGCATCTCCCCCGTGACTACACGGCCTCAGAATACTTTTCTGTGATCCGTGATATCGTGGATACCGCATCGCCAGTGGCCACACTACTGACTATGCGTGTCGAGGCGGTGTGGGCTTACGGGCGCACGTACTCCCTCATGCTCTGCTTGAGTCGTTCCGCTGCCTTCAAAGCGTGTAACATTGCCGCACGTATTTTGAGCAACGTGGGTAACATCGCAGCTGATGCGGCTGAGATGCACCATCTATCAGAGTTGTGTTCGCGGCACCGGCGAGTTGAGATCTCCGAGTTGGATGTCATCACGCAAAACGCTTGTGGCCACCTGTTCGGCTTCATCCCGCAGAAGGATGTATTCCGAGCTTTCGACCTACTGGACGATTCGGATCGCCCTGATTTACTGATTGACGCTTGGTTTCCCGATCATGAGATGCCTCATCTCATCGCTCCACCCACAATGTATGCGATGATGCGCGCAGCTTTCGATTACATGGTACTGCCTTCACTAGATGGACACGTCAAGTGGCCTGAGAACAAGGCGTATCCAGTTCGGCATGGACAGTCGGCCCTAGAACACGCGCGGCTAGGCCAAACGTTCGGACCAACGTCGACGCGCTTGTGGATCGGTGATGGCGGGCATGAGTATTCAGCGAACTACTACGCAGCCAACAATGCGAGTGACACGCATGATTATGTGGCTGATGGTGCAGGCAACAATATTAACGTCTGCTACTGGGAGAAACCGCGTGAGTTTAACTTACCTGCGCAACCCAACTTCGTCGAGCCACGTCGCATGCTACAGTTCCCCGATTACTTGGTACCGGGTTGGGGCGTAACGTACAACCCTCGCGTACGGAACACTATCGCATGGGGTGTTCAGACCGACGATGGTGCGCGTAGCAGAGTGTGGACTGATGTGGCTCGCAAGCAACGTTTCACTGGACCAAGCTTCGAGATTCACTCGGATCGCCCGCACGTGCCGGAGACTGATTCACTCATCGATTACTGTGTGTATGAGCTAATCGATAGTGAGACACGCCGACCGATCGGCTTGGGGCTGGTACCTACTCACGCGCCGCCTCAGGCTAGTCCACCCGTAGCCGCCGACCATGGTGGAGCTGCTGCCGGTGGAGCTGCGAACATTGGACCGGCTCATGAGATGAATGACAATTCACCTCAGTATGAGTCAGCTCCTGTCACTGGATTCGACGAGGCAGGAGGCAGCTCCACTCCAGTGCTACCCCCCCCGCGGCAAGCGCCAGTTCTACCCATGGCTGGACGATCCTATGCCGACACCTTACAGCATCCGCGCGCTGCCAACGGGACCCAACGCGGAGCCAGAGGCCGCCGTCGCGCTAACTCGGTACGAGGAAGCAGCGGCGGTGGCGGTGGTGCTTCTGGTTCTGGAGCGCGCCGTTCAGGCCCGGCGCCGGCCGCTTTACCTTCACCAGGTGGCGCAGCCAGCAACCTCGACCGCGTGCACGAAGAGATCAACCGTATGGAGCGGGCTGCTACGCGGTCGAGACTATCAGTCGCGCCCCCGCAGCCAGCTTCGGCCCCGCCTTCACGGACGTTGTCGCAGGGGGTTGTGATTCGTGGGCCACCTGAAGATCAGGTTCGTGCGAACGTGCCTACCGACCAGGCTAGCATGGACGCTCTCCTGCGTGTCACCGATCAGGAGGCTCTACCCGAACCGGTCAGTGGCGGCGTGCAGGATTACTCGAGTGAGGTCGTCCATCATGGGCAAACTTTAAACGAGTATGGCGCGCGCTAAGGCCTGCACGTGCCTTTCCTGTGAGTCCGGCTCGCCTGCTTGAGCTTGCACACCGCAAGGGTGAAAGTGAAGAGTACGCTAGAGTATTCTCGGACACATGGAGGGCGTTCATGGGTACACATAGCGACGTAGGGATTCTGAGTGAGTTACGCACTGCTCGGTTGTCGGTTTTTCCCCGAACAATACCCTTTACCGCTGTGAATCTAGAGATGACACACCAGCCGAGCCCTGGCCGTGCTGGCGCTCAGACCAACATACGCGCGGGCGAATTACTTGCTTACGCTGCGAAATGTGGTCTCGGGCGAAGGCTTGAGCCTTTCCGTTTGGCCTGGTTAACTGGCGCTTGCCCTGAATGGAGCAATGCTGCTGTTGCCGGGTGGCTCGCCGTTCTTTTGGTGTCCCCCGAGCGCGCACATCTACTGCGATTAATCCGACTTGGATTGCTGCATATGCCGATCAATGATTATATTGATGTCTGCAAGCGCATCCATGAAGAGTTACGCAAAGATGGGACGCTGCTGGGGGACGCCGTGGGGAGCGAGACGCGTGTCCAGCTACAATATCTACATTGTATTGCAGGACGTGGTGATTACGCAACCCAACCAACCGCTGACTTGATCAGCCGTTGTACACCTTTGCGTAATCAGTGTTGGGTCAGTATGCATGCGGACGGGTCGCTTGAGCTCGATAACGATAGATGGCAACGTGAGTTACGTCTGTCCGTCGATCGTGCTTTAGGTGTCTGCGGGGGTGGCGTACGTTGCGAAACGTTTGAACACTTCTGGGCGCGTAGGTTAGCTTGGGTCGCTAGTGGAAGTGCGCCTGGGTATAAGTTTGACTTGCGTGAGCTGGGTTACGGTTTGTTACGACCTAACAAGCGGCTGGCTCTGGAGCAGATAGATCTCGGGCCGATTCTACACGCGATGTATTTCGATCGTGGTGAAATGCTGAGTCGGATGGTCGACAAGTATGAGCTGGCGAAGAATCGCGTTTTGTG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| 22,167
|
OL799273.1
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Phytophthora pluvialis RNA virus 1
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Xu,Z., Khalifa,M.E., Frampton,R.A., Smith,G.R., McDougal,R.L., MacDiarmid,R.M., Kalamorz,F., Khalifa,M., MacDiarmid,R.
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The New Zealand Institute for Plant and Food Research Limited, Bioprotection
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New Zealand
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2022-11-15
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PplRV1_4019
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Phytophthora pluvialis RNA virus 1
| null | null |
RNA
| 6,756
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GenBank
| 1
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New Zealand
|
New Zealand
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Phytophthora pluvialis
| null |
2019-05
| null | null |
Phytophthora pluvialis RNA virus 1 isolate PplRV1_4019, complete genome
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GAGACGATGGGTGGCCATCGTCTTGGCCTATGGGCGCCTCAGTTGCGCTCTTAAGTTTATTTCTGACAGCGCGATCGGTAGGACTTGAGAGTAGCGCTGAGATTCGCACATAGGTCGTTGTAGGTCGGGTCTCACCGCCGTAGTTACGGGGTGGTGAGCTAGGACCTGGTGAACGGGCTGAGAGCCCGGTGTGCTCCTGGAGATTTCCCCGTCTCCTTGTTTGTGCTAACGTAACACTCCCCAGGGGTTGCCGCGAGTGGCAGGATGGAATCAAGTTCCGAGACTCGCTGTGCGATGTGGATCAGCGCCGTTGTTGATTCGGGGGGTGGGAACGTGCCTCACCGCAACACTAGGTTGGAATGAAGTACCGAAGTTGCAGAGGTGGAGAGACTGACAGCCAGGTTGTCGGCGTGGGCCGAACCCGAAACAGTCCGAGTAGTGTAGTGCTACTGCCATGACATACAACATTTGCCACACCAAATGCCAATCTGCTCAGCAGGGATTGGGTTACACTACTGCTGCCATCCTCGTTTTCTTCGCGAGTGACAAACTAATGAAGGCGCTAACTTCGGTGGGTTCTGCCGAGGCTAGTGTAATGTTAGGAGCCGGCTTATTGATGAGTCTAAGCATCATTTTCAACTGCACCGCCGCAGCAGTTGGGTACTTTGAGGCCTGTGTTCGTGCAGCTATCACGAAACCAACGCGACAGAGTTTTTACGGACCTGCTCTCCGCGTTGGAACCAGCGGCAAGCTGGTTGCGTCCAGGTTCGCACACGCCATCCCTTACCGTCGGGTGCCACGTGTGTCTGTGTTGACGGTACTGGTTGTGAGTTTCGCACTCTGCTCATCGCCTGAAGTTGAAGTGAGTGCGCTCGATGTGGTCCAAGTGGTTGGACACACCCCGTACGGATACAGCGGGGTGGGTATCATGTACAAGGTTGCCGCCCTACGCGACCTGTATGCAATGATGATGCTTGGTGGGGACATCGAGACGAATCCGGGGCCTCCTCTTCGTTCCCAGGCTGCCAAGTGGGTGGAGCAGGGAACGCGAGCGTCGGATCGTGGCCCGCTGGGTGAAGCGACGCTCATCGTTGACAAGGGCGCCAAAAACATCGCCCTTGGTAAGCGTGGTGCTGACGTGCCAGCGATGCGCCATCTTGGAGGCCTGCCGATGTTGCCGACTCAGTACGCTGTGCGCGTCACCTCCGGCAGTCAGGCTTCGTTTGGCGAAGGAGCTCTGCCCCCGTCTTGGCGTGATCCAGAGGACTTCGGTCTTACTGCGGGTGGTTTAGGTGCGACGAGCCACCAGATGCGTTGGAGACGCGTCCGACCTTACGCGGTTGACGAGCTCAGCACGACTGAGGCACCGACAATGTATCTCGGGCGCCCTAACTCTCTGGCTTATCGTGTGGTTAGCACGGCCCCCAAGTTGCGCGTGACCCAAGGACCATTGTTTGCCGGCTATGAGGCACTGCAAGCGGACACGCCGGTACGCGAATTGCGCACCATCGCCCAGCTCATGGCCGGCTTCCGCGATACGGACGCTAACCGTGTCGTATCGAAGACCGTCCGGCGCCTGGCGCAAGTGGGTGACCGCACGTGCTACCAGCGCTTCTGGTTCAAGGTGTGGTTGGACACGTTTGCCGCTGCGGCTGTAGAGGCTGACGGTGGCGATCACTTGTTCGATTTCGGCCAGGCTAATCAGCGTGCCGCAATGCACCAGACGACGGCTGCTGGTGCACTGGTTGAAAGTATCGCCAACGGACTTGACACCAACTGGTCCAACGTGGTTCGTGGGTCGCACTTCTTCTACAGTGCGGATGAAGGTAGCCGTGACGCTGATTTCATCGGACTGGTGCACCGATACGCCTCATCATGGCCGCCGTGCCCCGTCACGACCTTGCCAGGACACGCTGCCGGCGCAGGCAACATTGTGAATGGGTATCAGGTCGCTGTCCCTGGAGCTGAGGCTTTCTGGTATCACACTGGTGATTACGACGCGGTGCTCAATGTTGCACCCCGAACTGGGTTTGAGACTGCGGACACCATCCGATCGTTTGCAGCACAGTTCCTTAAACAGACTGGATCCCATGTGGATTGCCAGACTGGTTTTGAACTAGCTGCTGCTGTTTGCTTCCGCCACCATCCGAACACGATTGCTGACCCACCAGCCGTCGGACTGCGCCGCCGTGCCGCACACCGCACTTTCGATGCGATGATGTCAGGCGACAAGTTGCATCTCCCCCGTGACTACACGGCCTCAGAATACTTTTCTGTGATCCGTGATATCGTGGATACCGCATCGCCAGTGGCCACACTACTGACTATGCGTGTCGAGGCGGTGTGGGCTTACGGGCGCACGTACTCCCTCATGCTCTGCTTGAGTCGTTCCGCTGCCTTCAAAGCGTGTAACATTGCCGCACGTATTTTGAGCAACGTGGGTAACATCGCAGCTGATGCGGCTGAGATGCACCATCTATCAGAGTTGTGTTCGCGGCACCGGCGAGTTGAGATCTCCGAGTTGGATGTCATCACGCAAAACGCTTGTGGCCACCTGTTCGGCTTCATCCCGCAGAAGGATGTATTCCGAGCTTTCGACCTACTGGACGATTCGGATCGCCCTGATTTACTGATTGACGCTTGGTTTCCCGATCATGAGATGCCTCATCTCATCGCTCCACCCACAATGTATGCGATGATGCGCGCAGCTTTCGATTACATGGTACTGCCTTCACTAGATGGACACGTCAAGTGGCCTGAGAACAAGGCGTATCCAGTTCGGCATGGACAGTCGGCCCTAGAACACGCGCGGCTAGGCCAAACGTTCGGACCAACGTCGACGCGCTTGTGGATCGGTGATGGCGGGCATGAGTATTCAGCGAACTACTACGCAGCCAACAATGCGAGTGACACGCATGATTATGTGGCTGATGGTGCAGGCAACAATATTAACGTCTGCTACTGGGAGAAACCGCGTGAGTTTAACTTACCTGCGCAACCCAACTTCGTCGAGCCACGTCGCATGCTACAGTTCCCCGATTACTTGGTACCGGGTTGGGGCGTAACGTACAACCCTCGCGTACGGAACACTATCGCATGGGGTGTTGAGACCGACGATGGTGCGCGTAGCAGAGTGTGGACTGATGTGGCTCGCAAGCAACGTTTCACTGGACCAAGCTTCGAGATTCACTCGGATCGCCCGCACGTGCCGGAGACTGATTCACTCATCGATTACTGTGTGTATGAGCTAATCGATAGTGAGACACGCCGACCGATCGGCCTGGGGCTGGTACCTACTCACGCGCCGCCTCAGGCTAGTCCACCCGTAGCCGCCGACCATGGTGGAGCTGCTGCCGGTGGAGCTGCGAACATTGGACCGGYTCATGAGATGAATGACAATTCACCTCAGTATGAGTCAGCTCCTGTCACTGGATTCGACGAGGCAGGAGGCAGCTCCACTCCAGTGCTACCCCCCCCGCGGCAAGCGCCAGTGCTACCCATGGCTGGACGATCCTACGCCGACACCCTACAGCATCCGCGCGCTGCCAACGGGACCCAACGCGGAGCCAGAGGCCGCCGTCGCGCTAACTCGGTACGAGGAAGCAGCGGCGGTGGCGGTGGTGCTTCTGGTTCCGGAGTGCGCCGTTCAGGCCCGGCTCCGGCCGCTTTACCTTCACCAGGTGGCGCAGCCAGCAACCTCGACCGCGTGCACGAAGAGATCAACCGTATGGAGCGAGCTGCTACGCGGTCGAGACTATCAGTCGCGCCCCCGCAGCCAGCTTCGGCCCCGCCTTCACAGACGTTGTCGCAGGGGGTTGTGATTCGTGGGCCACCTGAAGATCAGGTTCGTTCGAACGTGCCTACTGACCAGGCTAGCATGGACGCTCTCCTGCGTGTCACCGATCAGGAGGCTCTACCCGAACCGGTCAGTGGCGGCGTGCAGGATTACTCGAGTGAGGTCGTCCATCATGGGCAAACTTTAAACGAGTATGGCGCGCGCTAAGGCCTGCACGTGCCTTTCCTGTGAGTCCGGCTCGCCTGCTTGAGCTTGCACACCGCAAGGGTGAAAGTGAAGAGTATGCTAGAGCATTCTCGGACACATGGAGGGCGTTCATGGGTACACATAGCGACGTAGGGATTCTGAGTGAGTTACGCACTGCTCGGTTGTCGGTTTTTCCCCGAACAATACCCTTTACCGCTGTGAATCTAGAGATGACACACCAGCCGAGCCCTGGCCGTGCTGGCGCTCAGACCAACATACGCGCGGGCGAATTACTTGCTTACGCTGCGAAATGTGGTCTCGGGCGAAGGCTTGAGCCTTTCCGTTTGGCCTGGTTAACTGGCGCTTGCCCTGGATGGAGCAATGCTGCTGTTGCCGGGTGGCTCGCCGTTCTTTTGGTGTCTCCCGAGCGCGCACATCTACTGCGATTAATCCGACTTGGATTGCTGCATATGCCGATCAATGATTATATTGATGTCTGCAAGCGCGTCCATGAAGAGTTACGCAAAGATGGGACGCTGCTGGGGGACGCCGTGGGGAGCGAGACGCGTGTCCAGCTACAATATCTACATTGTATTGCAGGACGTGGTGATTACGCAACCCAACCAACCGCTGACTTGATCAGCCGTTGTACACCTTTGCGTAATCAGTGTTGGGTCAGTATGCATGCGGACGGATCGCTTGAGCTCGATAACGATAGATGGCAACGTGAGTTACGTCTGTCCGTCGATCGTGCTTTAGGTGTCTGCGGGGGTGGCGTACGTTGCGAAACGTTTGAACACTTCTGGGCGCGTAGGTTAGCTTGGGTCGCTAGTGGAAGTGCGCCTGGGTACAAGTTTGACTTGCGTGAGCTGGGTTACGGTTTGTTACGACCTAACAAGCGGCTGGCTCTGGAGCAGATAGATCTCGGGCCGATTCTACACGCGATGTATTTCGATCGTGGTGAAATGCTGAGTCGGATGGTCGACAAGTATGAGCTGGCGAAGAATCGCGTTTTGTG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| 22,168
|
NC_075280.1
|
Picornaviridae sp.
|
Yang,S., Wang,Y., Zhang,W.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
yc-1
|
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,443
|
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Grus japonensis
|
feces
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2014-12
| null |
PRJNA485481
|
Picornaviridae sp. isolate yc-1, complete genome
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TTCGTGTTGGGAGAACCGTCCAAAAGACCCTCCGGGGTTAAACCCCGGAAGGGCTTTTGGACGGTTCTCCCAACACGAAAGATTGGGACACTTCTCGTGGTGAGTGCTTCACTGCGACCCGATGGTGTTATGGAGGGCTTCCATCCCGCCGTTTGCCTAGGCTATAGGCTGTTTTATTTCTTCTTTATTTTTCTCTATTTCCAGGTTGTCTCCATACCGAGAGCTGCTACCGCTGCGCCCGGCGGGGTTAACTCCAGGGCTAGCCTGGAGCTGTGGCCGCCAAAAGTGGAGAGAGTGTGACTAACTGGGATGGTCCGTCCTGAGTGGCTGTTTCCTTGCACATACTAAACATTGATCTGGGTGCTCAGGTAGGCTACGGGTGAAACCTGAGGTGTAATAATGTTCTTCTGTTGAAGAAACTGCACGTCAAACGCTAACCTTATCAGATATAGCTGAGATTTAAGTGTCAAAAAGCTATCAATGATTGCGGGGGGGTGTAAGGCCACCTTGCGATGTTTGGTTGTGTGAGGTTAAGAGGCCCTCTTGATGGGGTTTCCCTAGGCACTCCCCTATGAGTTTAGGGCTACTCAGGGGCACGTTAGGCTTTTCACCGCAAAATATAGTTTACTTCATGATGAGTCTTTTTACAAAAGTTGGAAACGCGTTGGACAGAGTGATCACTTTAGCTGAACCAGATATGGAGGTTGTAGGTGAGAGACCTGACAGGTTGTCGGTTGGTGGGACACAATCTAGTGTGACGGTTGATCAGAATTCTGTTACAGCTGCTGTTGCTGGAGCGATAACAGGAGAGCTGTTGTTATCGTCAGTTGACATACCAGGTGATAAGAGGACCCAAGGAGAAAAATTCTTTGTTATTTATCATGGTGAGTGGAATGCTTCTAAAGGAAACTTGGATGAGATAACACATATTGATATTTGGGAGCAATTGATTGATGCTGATCATTCTGTTAAAGGCTTAATTGAGTATCATGCACTGGCAAGATTTGGTGTTGAAATCATGGTGCAAATAAATCCAACTTCATTTCAAGCAGGAGGAATTCTTGCAGCAATGGTGCCTGTGGCTGTAGAAAATTGTAGTTTGGCATCCTTTACATTGTTTCCACATGCTTTATTGAATTGTAACATAAACAATGTGGGTAGGGTCTTGGTTCCATGGGTTTATACAAGGGGAGCTCTTAAGTGTAGTGACCCACTCTATACCCCCTGGGTCCTCTATTTAATTGTTTGGTCAAAGCTGAGATGTGCCACCTCCACTTCACAGTCAGTAAGCATAACTGTGTTAGCTAGATTTGTTGACTTACAATTGCATGGTATGAAACCCATTTCAACCATGTATAAGCCAGCTGTCAGACAAACTGCTTCTAGTAGGGTTTTTGCAGTTAACAACAGATTTGTTGCTTCTGCTGAATTTCACGCTGGTCTTGGTGATGATCACTGCAGAACTGACCCAACAGTAGCTGGTGGCACGAAAATTCAGGATTTCAGAGTTTGGGTAGAAACACCAACCCTGGTCTGGCAAACAAAAGTAAATATCCAGGATTCAGTGGGCACAGTTTTGTGCAATCTACCCGTGAATCCTTACTGGTACGGGCTAACATACAATGGTGCTGTGAATGGAGTAAGTAGTACCCAATCAGCCACAACCTCCTTGAGTGCTATTGCTAGTATGTATGCTTATTGGCGAGGCGATATAACGTACCATGTGCAAATTTTCCCTACACGGTACCACTCTGGCCGAATTCTTGCTTGTTTTGTCCCTGGTGATGAAAACACCTCAGTGTCAACAATGAATATCCGAAAGGCATCTACTTGTATGTGTGCTGTGATGGACATCACAGGCACTAGTTCTACATTGTGTTTTAGGGTGCCCTGGGTGTCAGAGACACCCTATAAGGTAAATACAAATATCACATCACATGCTTTTGTAGGAAGGTCATCTAGCACTGGTAGGTTTTTGCTAATGGTTTACAATACAGTTAAATGTCCAAGCAATGTTTATGCGGATGTACTGATAAACATCTATGTGAGTGGAACAAATATGGAATTCATGGCACCAGTGATGTGTTTCACAACACATAGGTCTCAAGCAGGAGATGATGTTCTTGGTGAGGCAAAAGACACTGCAGTGAACACAGCTGGTTACACAGAACAGCATCCCATTTTGAAGGTAGACTCATTACCAAGGTTTCCAGGAGAGGTTGAACCCCAAAGAGGAGTGCAAACATCAATTGAAGACCCCATCCTGGCAAAGCAAAAACCCCAAACATTTCCTGAAAGGGACGCAGGTGTGAGTCGGCATGTTGTAGACCACTTGAAAATTACAGAATTTATGGGAAGAGGCATGTATTACGCATATTTCACCATGACGAACAATGATTCTATGCGTTACATTCCAATTCAGTTTGCCTCAACAAGTGGACAGCATATTGGTCCTGGAACATGGCAATGGTTCAACAACCTCTACCATTTGATAAGAGGGCCTATTGATTGTAGTGTGTATGTTGCAGGCGAAGGAGGAGGAATTGAGTTGTCAGTCTTCTTTTTGCCCTATGGCGTTTTCAGCTCTGATTCTAGCCCCTCAGATGATATTTTAACATCAAGCAAGGATTTTTTCCAGGATGAGAAAACTACTGTTGGAGTTTTTCGCTTTAACACCAAGTACACACAAGCATGTCAGTTTAGAATTCCATGGTATCACAACTGTGTGGCCTTGTCTCCTGCAGTTCAGCATAAGTGTAAAGACTACATATTGGGTCACTTGGGTTTTCAGATTAGTTGGCTCTCTGGAGGTGAAACTGTGGGAATTTCAATTTACCTTTCTGTGAACGATGAGACAGAGATCTATTTTCCCAGGCCACCAGCATGTGCGACATTTTTGTCTAAAGCAACAGCAAGGTCTTTAGCTGACCCTAGGCAAGCTGCTATTGAGTCTAGTGTTGATGAAATTGAGGATGAGCAAGATAAGGAATTTCGTGAGTTGGTGGAAAAATACCCAGAAAAGCATCCGAAAACCTTGCTGGCTGAGTTTGAAAAAGAAAAGAAGCCATACAAAAAATTACGTATGGTGGTTGGAGCACATAGATTAGCCAATGCTTTTGAGGACTTGAAGAAATCAAAGTCAACTAGCGAGTTATTTTCACAGGGTGGTCACCATTGGAATGATGGCACAGTGGTTCAGAGTAAGAGGCAAGGCGAACAGTTGCAGGGTTTTTATTTTGATGGTGCAATCTATTTCGCTGAGAGAGTGGGTAGTAAAGGACGTTTTGCCAAAACTGAGATAACAGATGGTTGGGTTGAAACTGGAACAGTTATTTCACCAACAAATGCAGAAAATTGGGCACTGGAAGATTTCTGGGCAGGAATGAGATTTTCTTGGAGTAAGTTCCAGAAAAGTGAAAAGATTAAAGCATTTGAGTCACAGGATTGGGACATGCTGCAACAAAGATGTAACACTTCTGGATTAACACAATTGTTGTCAGTTTTTTCCATATCACGCAGTGTGGTGGATAAAATTGTGGATGGTTCAGAGATTGGCACTAAAGTTAAGGATGTTGTCTCTGACGTGAGCCAATTGACGCAAGAATGCTCCAAATTTTTGGAAGATCTGAAGAAGTCAATGGAAAAATTGGCTAGAGCTGTGTCCAGATCAAAGATAGGTTTGGTCATTAAAATTCTCTTAGAGATTGGTAAATTAGCCATGACCGTTTATCTGTGTCATAAATTGGGGTGGGACTCAGAGACAGTTGGAATTGCCCTGGGGATTTTGTCTCTGGAAATAATGTCAATAACAACAGACTTGTGTGTTTCTGTTAGCCATGCATTTTCAGAAGTTATGTCTGTAATAGTAACAAAAACTGATGATTTAGAAACCCAATCATTGGGATGGATGCGAAGCGTTGTTGCTGGAATTGTAATCTTCAAAAATGTGCGTTCAGCATTTGTGTGGTTAGTGGAAAAGTTGGAAGGTTGGTTGCAGGCTAAGGCAGGAGATGAGTTAAAAATTGTGGAGGCTCTGGAAGATTGTCAGGATGATGTGGAATCTTTGCTTGAAGAGGTTGAGGAGTTTATAATCTGTAGGAAATTGGGGCCATCAGACTTAACAAAAGGCCTGTCCTATGCAAGACGGTTGCGTACTTTAATGTCCTTAACATCGAAACTGAAGGTTGGTACTCCAGTAGTCATAAAAGACATGTTGGGTAGGCTTGTGTCCACCATGCAGAACATTGAAAAGGACACAGGGGTTGTGGTGAGACCTGAACCAGTTGTTCTTTATGCACATGGAGAAAAAGGGCAAGGAAAATCTTTGTTGTGTATGGCTCTTGCTGTGAAAATTTGTACATATTATGGAGTTGACTATACAGATAATATCTACACAAAACCGGTTGACAGTGACTATTGGGATGGTTATGATGGACAGCTTGTCTGTATTATGGATGATATAGGACAAAATACAGATGATCATGACTGGAGTTCCTTCTGTCAACTGGTTTCGACCACACCATTCAGATTGAATATGGCACACTTGCATGAAAAGGGCAAGTATTTCACTTCACCATTCATAATCTGTTCATCCAATGTCAGTGAGCCAAATCCAAAAACAGTATATTGTGCAGAAGCAGTGGAGAGACGTCTACACTTTAAAGTGCGTGTGGGTGCTAGGGAACCCTACAAGTTGAAAAATGGTTGTTTGGATATGGAGAAGGCTGAGCGACAAGGTGTGTTGGCAGACTTGTCATGCTTGCACATGATGAGTGGAGAAGATGAGTATTCATTGAATGATCTTGTTGATTTGATGACAGATACTGTGCAAGACAAGACTGAGCGCTTGGAGAGACTTATGGAGTTGTGGTCACAAAGTGAAACATCACTTAGTGTTGCTTTAAAGAGACTGTTTCAGGCGTCATGTAAATACTCACAGATGAGGCTTGGAATGTTGTGGGATTCCATAAAGAAAAACAAATTTTCAATATTAGCGGCAG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| 323
|
OR881973.1
|
Picornaviridae sp.
|
Antonov,A.S., Ustinov,D.V., Shpak,I.M., Boroday,N.V., Molchanova,E.V.
|
Volgograd Plague Control Research Institute, Laboratory of bioinformatics
| null |
2024-01-07
|
Volgograd p594/18
|
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,373
|
GenBank
| null |
Russia: Volgograd
|
Russia
| null | null |
2018
| null | null |
Picornaviridae sp. isolate Volgograd p594/18, complete genome
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| 9,709
|
OP245250.1
|
Picornaviridae sp.
|
Yu,S.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Lab of Prevention and Control of Swine Diseases
|
China
|
2023-03-01
| null |
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,837
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Picornaviridae sp. strain I-HH-HZY/39, complete genome
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ACTTCTTACCCCAAAGGTAGGATTTGCAATCGCAGTGACCCTAGCAGCAAAGTTTTATAATTTCTATCCCAAAGATAGACGAGGTGAGCGTACTCGATAACGTCTCAGCCAATGTTAACTTGGCTACGTAATAAAGTTAATTTGATGATAATTAGCGTGTTACAACGCGTAAACACAATAATAAACCAACAAATCGCGGAGCGGCAGTTAGCTAGCAGCCAAGTATCCACAGTGTGATATATGTCAAATCAACCAAGATATTTTCCTCTAGAGATTTCCACCACAGAAGAGATAGCAGAGCAATCATGGGAATTACAACTCCGACATCTTATGGTGCGTTTAAGGATTTGGTTCGGGAAGTTAAGTTTGCCAAGAAGAATAACGGTACTAACTATCCTTTTACCATTGCTTTTAGTAATTGGGTTAATGGCTTTGAGAACTACTCCCTCAACATCACCGAGGCGAAATTCCTCGAATCGCCGATATTCCGATGTGGACGAGGAATGGAACTCTCCATTCTGTCGCAGGATGGACGACCCATTCTAGAGAAAGTGCAGGTTGTTGGCACGGGTAACACCAAGAGAGATGCCCACGAAACATGTTTCAAGCGTTTGGTTGCCAAGATATTGAGGATAGGGGGTATTGATTTTACCCAGATGGATTCTTTAACCACCGATGGCGAAATCGTTACATCTCCTGTTACTGATCGTGAGTCCAATGTTATTTTGGAGACAGCTGCTGAGGGTGATAACAAGCAGGTTATCAATATTAGTAGTGCTGAGATAAATAAACAGCTTAGTAGTACTGAATCTACGTATGACATGGTAAAGGACGGATATTCTTTGGTTAATAGATGGTACCCACTACAGATGGTTAAAATTGATACAACCACAGTAGACGTCTTTTCATTGAGGATCCCAGAGGCACTTTATGCTGACTCAAGTAGCGTCAACCTGATTCCTTTGCGAGGTTTTATATATGGGGACCTTGATGTAGAATTTAAGCTGGTTGTTAATGCAGCTCAGTTCCATCAGGGTAGGTTAATTATGGGAGCATTTTATTGTGCCCAAGGGTTCAATAGGTTGGTAACCGTACCAAAATGGTATGCACATACTAGTGCTGGGGCATCTGACTACCGTTATGAGAACCTGCAAACCCAGATTGATTCCATTTATGGTATGGTGCAGCGCCCACACGTCCTATGCGACATGGCTAGTTCTACTTCTGCTTCCTTGTTAGTGAAATATAACTACAATAAGCCATTCGTGCGTCTATTAGATTATGCCAACAATAAGACCGTAAATCCTGGTGTTCTTGGAGGATATTTCGTCAATTTGTCAGCTAAGATGTTGGTGCCATTATCCACTGCTGATGATAATCCAAAGGAAGTCAATTGCACTTTATACTACAGGTTTGTGAAAGCTAACCTTACTGGAATGACACGACAGCACGATTTGACCCAAATGGATGTGCTAGATCTGGGGCTTAGTGCAGCTGAGGCTATCACAGGCCTAGCTCATGATGGGATTGGATATATTCGTAGGGTTGAGAGACAATTATTGAGGAAAGGTAAAATTTTCTCTAATAGGGATAAACCATCCGATGTTTTTGGTCAGAAGGTCGTTGTCCCTAGACCTAGAATGCACTTCCCAAACGGAGTCGGGTTGGCCGACCCTGTTATTCTTGGAGTCGATACGCTTAGCGCAACAACCCACTACGAAGATCCTGGCTATGGCCCCACAAGTTATATTGAATATGCTAGAATTCCTGGGATTGACACCATAGTGACCTGGTCTCTATCTGATATTGCTAAGAAGCAGATCTTCCAACAAATTGTAGTGCCATACTCCTCACATCAAAATCAGACTTTCGACACAACTACAGGGCTCTTTCCCCTAGCCACAAAAATGGACAGTGTACCTCTACACATCGCTACGAATGGGTTTATGTATTGGGGAGGCACCATCTGTTATGAGTTTGACATCGTTAAGACAAACTTCCATAAAGGGTCTATTTTGATAAGTGTCAGTTATGGCAAAGAGACTAATGATAAGATTGGTAGTAACTATGAGAAGATTGTGGACATCCAAGAGACTTCTAAGATAAAAGTTACAGTGCCTTATATATACGACACGGTGGCGAGGCGTACACATAACTTCTCGTACGTTACAGCTTGGGGACAGCTAAGTAATTGGCAACCAGATGCCCTACCAACTTATTCTCGCACTAAGATAACTCTTACTGTGCTGAATCCACTGATTGATATTGGGTCCGTTGCCAATTCTGTAAAGATAATTGTGTGGAAGTATGCAGGTGAGGACTTTTTCTTATCCTCTCCTACTCAGGTCAATAACATTATGTCTGTACCAGTCTCATTTGGTGACCGTGACTTCAACCGGTTGTTAACTTTTCCAGTGAATGAGGATCATACAGCTCCTACAACAGCTGAAAAATATACAGATGTGCTGCCACCAGCTTCATTCCCCGCCGGGAAGAGTGCTAGGACTAGTACAACCAGAGAAAAGACACAAATGGATGCTCAAGATTTCGCTCCTGGCCCAGTAGATCACTACCGTATGCACTCGGGCAATGAGACCAGTTTCAAGAACTTGCTACGAGTGCCCATTCGCATCATAGCTAGCCAGCGCATCAATGCTGATCAGACTCTGTGTCTTCCAGTTATGCCTCTTACTACAGAGTTAATATACAATTATCTACCAAAGCAGCAGAGGTTGGCGATGACCCACCAGCACCAAATAACTAAGATGTTTAGAATGTGGCGAGGATCTATGCGGTATACAATCATGTTACATAATGCCACAACCCACCCTGTTTTCATAACTTTCCTCCCCTCGGATGGCACTTTCAAAAAACTTATTCGACCAAAAAATTTTAATGATCGCTACCATGGGGCCACTTGGAGTAACACCAAAAGATTTTTTTCAAGTGTGGATGATGAGGCTGGTTCGGATTTACCAGATTTGTCAGGCACTGGACACCCGACAACAGTATTGTGTTCCACGGTGAATCCGACGGAGATGGTTGAGGTTCAGTGGACTTTACCAGTTAATTGGGCTCTCATGGATCAAGGGGGTAGGTATACACAACACTGCTGGAGGGATATTAGTTTTACCAACAATGGGCATATATGTGTGTATTGTGATGGGCCTGTAGAGGTCTCAATATTCATGAGTGTTGGTGATGACTTTGAGATGGCAGCCTTTTGTGGTTTGACAGACTACACCCCAAGCTTTGTGCTTAATAACCGGATGGATGATGCGCGCCAAGAGAAAACCCAGATGGATTTTTACAGCTGTGAATCTAGCAGTGATGCTGAATTCATACCGAAAATGGTGCGGAAAACTAGACGAGCTGTAAAGAGAAATCAATTTCTTGTAAAACCAGCCATTTATGGTGTGTCGACAGTGCTACCTTCGCCTTTTGGAGAGATGGTGAGGCAAGCTGTGGTTGCGCATACGATCTATGATCTTAAGGAGAAAGTGTCATCAGCATCGGCTGCTATTACGGAGAATATTAGTGCGGTAAATGTTAGCCATGTGGTGCATGCAATTAGTGGAGCATCTGAATCTATACAGAGTGGTATAGAGCAATTCTCCACTAAGACAGCAGGTGTCGACTCCACCCTAGAAGAATTAAGGGAAACTCTAGGTGGTACACAGAGAATGCAGGACAAGGTTACAAACACATTTGGGAAGGCCGATCATGTATTGACAGATCTGGGTGAAGTACTAGCTGGGGTTAAGAAGACAGTGGACACGGCCAATGGGCTATTAGATGAAGTTCAAGCCCAAGTTGACGGTGGCTTATTTGATTGGGTCAAAACCTTGTTTGGTGGTTTATCCACCATGAGTGGAGTCTGGGACTCTCTTAAGAGCGTTTTTCAAAAGCTGTACGATGCTATTTTGGGATGCGATATAGTAGTGGCCGTGCGGTGTCTGGTTGAGTCCTTATATTCTCTAGGGTTGACTACAAAAGAGTATGTTACTAGAAAGTTGGGATACTTGACCGAGCTTTTTGGCAAAATACTTAAGCAGGGGACGGATGAGACACAGAGTGGGAAGAGCACTGAAGAGAAGAGCGGTATTGATAAAGGCGATGTGCAAACCTTGTTAGGGCTATTATTTGGAGGTGTTCTCACTGTCTACGGGGCTAGTTGCGGACAGCAATGGCAAAAAGGGCACTCCGGAACAATGGCTAGGTGGGTGGACTCATTCGCCATTGGTAAGGGTCTGATGACGATGAATGGCTCTTTCTTGTTCGTTAGGAATGTTTACTCGACCCTCTCGAAGATGGTCAGTCATGTTCTTGGCCTATCCGATCCCCAAATCAAAATACGCCAGTTGCTAATCGACAACCCATCAATAGTCTCAGATTTTGTGCATAATGCCCAGTTGTTCCTCAACAACTACAATGATATCGTGGCTGGAGATGTAGCTACCAAATCACGCTTCTGGATTACTATATGCAACGCTTACCAGATCCGAGCTTGTTTTGCCAAGATAGAAGGGAACTCGACAATGAATGTGCTTAAGGAGTTGTGTCGTGAGGTGATTAAGAAGGCTAATGAGAACACCTCACTCTTCCAGAGTACTGCTGTTAGGTATGAGCCTTACGTCATATGTTTAGAAGGGCAAACAGGTATAGGTAAGTCCTTCCTCACAGCAGAGATCAGTTCCATGTGTCTCGGCAATATAGGGTTAAAGATGGACACAATAGACTACCGGTACGTCGTCAATCCAGGGGTAGACTATTGGAATCTGTATAATGGACAGCCCGTCATAGTTTATGACGACTGGTGCAACTTGGTGGATACGCAGAGCATTAGGAAAGATATATCTGAGCTCTACCAGCTGAAGACTAGTAATGTGATGAACGCACCAAAAGCCGAACTGAGCGAGAAAAAGACGGTTGTCAATCCATTTGTTGTGCTCATGGCTACTAATAATCCTTTTCCTTCCACTAACACCTTAGTAAACACG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| 17,781
|
OP245251.1
|
Picornaviridae sp.
|
Yu,S.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Lab of Prevention and Control of Swine Diseases
|
China
|
2023-03-01
| null |
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,653
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Picornaviridae sp. strain I-QQ-QM/20, complete genome
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CCCCAAAGGTAGGATTTGCAATCGCAGTGACCCTAGCAGCAAAGTTTTATAATTTCTATCCCAAAGATAGACGAGGTGAGCGTACTCGATAACGTCTCAGCCAATGTTAACTTGGCTACGTAATAAAGTCAATTTGATGATAATTAGCGTGTTACAACGCGTAAACACAATAATAAACCAACAAATCGCGGAGCGGCAGTTAGCTAGCAGTCAAGTATCCACAGTGTGATATATGTCAAATCAACCAAGATATTTTCCTCTAGAGATTTCCACCACAGAAGAGATAGCAGAGCAATCATGGGAATTACAACTCCGACATCTTATGGTGCGTTTAAGGATTTGGTTCGGGAGGTTAAGTTTGCCAAGAAGAATAACGGTACTAACTATCCTTTTACCATTGCTTTTAGTAATTGGGTTAATGGCTTTGAGAACTACTCCCTCAACATCACCGAGGCGAAATTCCTCGAATCGCCGATATTCCGATGTGGACGAGGAATGGAACTCTCCATTCTGTCGCAGGATGGACGACCCATTCTAGAGAAAGTGCAGGTTGTTGGCACGGGTAACACCAAGAGAGATGCCCACGAAACATGTTTCAAGCGTTTGGTTGCCAAGATATTGAGGATAGGGGGTATTGATTTTACCCAGATGGATTCTTTAACCACCGATGGCGAAATCGTTACATCTCCTGTTACTGATCGTGAGTCCAATGTTATTTTGGAGACAGCTGCTGAGGGTGATAACAAGCAGGTTATCAATATTAGTAGTGCTGAGATAAATAAACAGCTTAGTAGTACTGAATCTACGTATGACATGGTAAAGGACGGATATTCTTTGGTTAATAGATGGTACCCACTACAGATGGTTAAAATTGATACAACCACAGTAGACGTCTTTTCATTGAGGATCCCAGAGGCACTTTATGCTGACTCAAGTAGCGTTAACCTGATTCCTTTGCGAGGTTTTATATATGGGGACCTTGATGTAGAATTTAAGCTGGTTGTTAATGCAGCTCAGTTCCATCAGGGTAGGTTAATTATGGGAGCATTTTATTGTGCCCAAGGGTTCAATAGGTTGGTAACCGTACCAAAATGGTATGCACATACTAGTGCTGGGGCATCTGACTACCGTTACGAGAACCTGCAAACCCAGATTGATTCCATTTATGGTATGGTGCAGCGCCCACACGTCCTATGCGACATGGCTAGTTCTACTTCTGCTTCCTTGTTAGTGAAATATAACTACAATAAGCCATTCGTGCGTCTATTAGATTATGCCAACAATAAGACCGTGAATCCTGGTGTTCTTGGAGGATATTTCGTCAATTTGTCAGCTAAGATGTTGGTGCCATTATCCACTGCTGATGATAATCCAAAGGAAGTCAATTGCACTTTATACTACAGGTTTGTGAAAGCTAACCTTACTGGAATGACACGACAGCACGATTTGACCCAAATGGATGTGTTAGATCTGGGGCTTAGTGCAGCTGAGGCTATCACAGGCCTAGCTCATGATGGGATTGGATATATTCGTAGGGTTGAGAGACAATTATTGAGGAAAGGTAAAATTTTCTCTAATAGGGATAAACCATCCGATGTTTTTGGTCAGAAGGTCGTTGTCCCTAGACCTAGAATGCACTTCCCAAACGGAGTCGGGTTGGCCGACCCTGTTATTCTTGGAGTCGATACGCTTAGCGCAACAACCCACTACGAAGATCCTGGCTATGGCCCCACAAGTTATATTGAATATGCTAGAATTCCTGGGATTGACACCATAGTGACCTGGTCTCTATCTGATATTGCTAAGAAGCAGATCTTCCAACAAATTGTAGTGCCATACTCCTCACATCAAAATCAGACGTTCGACACAACTACAGGGCTCTTTCCCCTAGCCACAAAAATGGACAGTGTACCCCTACACATCGCTACGAATGGGTTTATGTATTGGGGAGGCACCATCTGTTATGAGTTTGACATTGTTAAGACAAACTTCCATAAAGGGTCTATTTTGATAAGTGTCAGTTATGGCAAAGAGACTAATGATAAGATTGGTAGTAACTATGAGAAGATTGTGGACATCCAAGAGACTTCTAAGATAAAAGTTACAGTGCCTTATATATACGACACGGTGGCGAGGCGTACACATAACTTCTCGTACGTTACAGCTTGGGGACAGCTAAGTAATTGGCAACCAGATGCCCTACCAACTTATTCTCGCACTAAGATAACTCTTACTGTGCTGAATCCACTGATTGATATTGGGTCCGTTGCCAATTCTGTAAAGATAATTGTGTGGAAGTATGCAGGTGAGGACTTTTTCTTATCCTCTCCTACTCAGGTCAATAACATTATGTCTGTACCAGTCTCATTTGGTGACCGTGACTTCAACCGGTTGTTAACTTTTCCAGTGAATGAGGATCATACAGCTCCTACAACAGCTGAAAAATATACAGATGTGCTGCCACCAGCTTCATTCCCCGCCGGGAAGAGTGCTAGGACTAGTACAACCAGAGAAAAGACACAAATGGATGCTCAAGATTTCGCTCCTGGCCCAGTAGATCACTACCGTATGCACTCGGGCAATGAGACCAGTTTCAAGAACTTGCTACGAGTGCCCATTCGCATCATAGCTAGCCAGCGCATCAATGCTGATCAGACTCTGTGTCTTCCAGTTATGCCTCTTACTACAGAGTTAATATACAATTATCTACCAAAGCAGCAGAGGTTGGCGATGACCCACCAGCACCAAATAACTAAGATGTTTAGAATGTGGCGAGGATCTATGCGGTATACAATCATGTTACATAATGCCACAACCCACCCTGTTTTCATAACTTTCCTCCCCTCGGATGGCACTTTCAAAAAACTTATTCGACCAAAAAATTTTAATGATCGCTACCACGGGGCCACTTGGAGTAACACCAAAAGATTTTTTTCAAGTGTGGATGATGAGGCTGGTTCGGATTTACCAGATTTGTCAGGCACTGGACACCCGACAACAGTATTGTGTTCCACGGTGAATCCGACGGAGATGGTTGAGGTTCAGTGGACTTTACCAGTTAATTGGGCTCTCATGGATCAAGGGGGTAGGTACACACAACACTGCTGGAGGGATATTAGTTTTACCAACAATGGGCATATATGTGTGTATTGTGATGGGCCTGTAGAGGTCTCAATATTCATGAGTGTTGGTGATGACTTTGAGATGGCAGCCTTTTGTGGTTTGACAGACTACACCCCAAGCTTTGTGCTTAATAACCGGATGGATGATGCGCGCCAAGAGAAAACCCAGATGGATTTTTACAGCTGTGAATCTAGCAGTGATGCTGAATTCATACCGAAAATGGTGCGGAAAACTAGACGAGCTGTAAAGAGAAATCAATTTCTTGTAAAACCAGCCATTTATGGTGTGTCGACAGTGCTACCTTCGCCTTTTGGAGAGATGGTGAGGCAAGCTGTGGTTGCGCATACGATCTATGATCTTAAGGAGAAAGTGTCATCAGCATCGGCTGCTATTACGGAGAATATTAGTGCGGTAAATGTTAGCCATGTGGTGCATGCAATTAGTGGAGCATCTGAATCTATACAGAGTGGTATAGAGCAATTCTCCACTAAGACAGCAGGTGTCGACTCCACCCTAGAAGAATTAAGGGAAACTCTAGGTGGTACACAGAGAATGCAGGACAAGGTTACAAACACATTTGGGAAGGCCGATCATGTATTGACAGATCTGGGTGAAGTACTAGCTGGGGTTAAGAAGACAGTGGACACGGCCAATGGGCTATTAGATGAAGTTCAAGCCCAAGTTGACGGTGGCTTATTTGATTGGGTCAAAACCTTGTTTGGTGGTTTATCCACCATGAGTGGAGTCTGGGACTCTCTTAAGAGCGTTTTTCAAAAGCTGTACGATGCTATTTTGGGATGCGATATAGTAGTGGCCGTGCGGTGTCTGGTTGAGTCCTTATATTCTCTAGGGTTGACTACAAAAGAGTATGTTACTAGAAAGTTGGGATACTTGACCGAGCTTTTTGGCAAAATACTTAAGCAGGGGACGGATGAGACACAGAGTGGGAAGAGCACTGAAGAGAAGAGCGGTATTGATAAAGGCGATGTGCAAACCTTGTTAGGGCTATTATTTGGAGGTGTTCTCACTGTCTACGGGGCTAGTTGCGGACAGCAATGGCAAAAAGGGCACTCCGGAACAATGGCTAGGTGGGTGGACTCATTCGCCATTGGTAAGGGTCTGATGACGATGAATGGCTCTTTCTTGTTCGTTAGGAATGTTTACTCGACCCTCTCGAAGATGGTCAGTCATGTTCTTGGCCTGTCCGATCCCCAAATTAAAATACGCCAGTTGCTAATCGACAACCCATCAATAGTCTCAGATTTTGTGCATAATGCCCAGTTGTTCCTCAACAACTACAATGATATCGTGGCTGGAGATGTAGCTACCAAATCACGCTTCTGGATTACTATATGCAACGCTTACCAGATCCGAGCTTGTTTTGCCAAGATAGAAGGGAACTCGACAATGAATGTGCTTAAGGAGTTGTGTCGTGAGGTGATTAAGAAGGCTAATGAGAACACCTCACTCTTCCAGAGTACTGCTGTTAGGTATGAGCCTTACGTCATATGTTTAGAAGGGCAAACAGGTATAGGTAAGTCCTTCCTCACAGCAGAGATCAGTTCCATGTGTCTCGGCAATATAGGGTTAAAGATGGACACAATAGACTACCGGTACGTCGTCAATCCAGGGGTAGACTATTGGAATCTGTATAATGGACAGCCCGTCATAGTTTATGACGACTGGTGCAACTTGGTGGATACGCAGAGTATTAGGAAAGATATATCTGAGCTCTACCAGCTGAAGACTAGTAATGTGATGAACGCACCAAAAGCCGAACTGAGCGAGAAAAAGACGGTTGTCAATCCATTTGTTGTGCTCATGGCTACTAATAATCCTTTTCCTTCCACTAACACCTTAGTAAACACGGCCCCACT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| 17,782
|
ON812448.1
|
Picornaviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 10,418
|
GenBank
| null |
China:Jinan
|
China
| null | null |
2018
|
SAMN28669557
|
PRJNA841744
|
MAG: Picornaviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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| 20,798
|
ON812449.1
|
Picornaviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_2
|
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,566
|
GenBank
| null |
China:Jinan
|
China
| null | null |
2018
|
SAMN28669502
|
PRJNA841744
|
MAG: Picornaviridae sp. isolate TIGMIC_2, complete genome
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| 20,799
|
MW674792.1
|
Picornaviridae sp.
|
Keremane,M., Singh,K., Ramadugu,C., Preece,J.
|
USDA ARS, National Clonal Germplasm Repository for Citrus and Dates
|
USA
|
2022-08-27
|
p215
|
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,246
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2012-01-13
|
SAMN18041803
|
PRJNA704425
|
Picornaviridae sp. isolate p215, complete genome
|
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| 26,595
|
MT681985.1
|
Picornaviridae sp.
|
Li,C., Shan,T., Chen,Z., Zhou,J., Li,H., Tong,G., Liu,G., Li,Q.
|
Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences (CAAS), Innovation Team of Small animal Infectious Disease
|
China
|
2021-01-12
| null |
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,459
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Anatidae
|
liver, abdominal cavity, spleen
|
2015
| null | null |
Picornaviridae sp. strain Duck/AH15/CHN/2015, complete genome
|
TTTGAAAACTGGCCCCCTGGGGATCTTTGCACCTTCGAAGTGCATATCCTCAGGGGTCAACCAGGTGGTGGACATAATGTCCACCTTTGTTTCAACATGGTTCTTTGGCATTTTCTCCAGAGTAACTAAAAGATAAATGCCATTTGGATGGATTTTCTGGTTATAAAATGACTTTCCCGTTGATCGGACTTTCCACCATCTTCATTGCCGGGTGGTTGCCAAGCCCGGAAGTGCTATCACTCTTGGATCTAAGCCTTCATCCGTCGCGGATTTCTAGGGCCCATATCTGGTGCTGAAATATTGCAAGGAGTGGCCAACCCTAGTTGTCCAACACTGGAAGTCTTGATCTCATAGACCAGGTAGCCTTGGCACGATTCCTAACCACCAACATGTTTCTCGTGAAATTCCCTCGCCGGGGTATAGTAGCGAGTCTCCTCTGTTGGGTTCATGGTTGGGGGATGCTCCTAGGTAGAGTGGAACCTCTTCTTCATCTTAAGGTGGGACCTGATTCAGTATCCCACTGGAAGTTAGAGGTCTGGGTATTGGGGTAACCCAGCTTGGTCCACACTGCTTGATAGAGTCGCGGCTGGCCGACCTAGGACATCTTTAAAAAGTCAGTTGATTTTAACCTCATGGAGAAATTGATTGAACAAACCACTTCTCAAATAACTACTGCATTGGATGTTGCTCAGGAAACAAAGGAAATTTTGACAGACACCTTGGCTGGTGGCTCAATAGCCACTCCATCCAACAACGCAGCCATCACTACGTCAGAACCAACAAAGTCAGAGGCACCACCTGATCCTACAGATGGATCCGCAGATGATTTTTTATCATGTGCCTACAGTGTTGGGCCACAAGAGGCAAATATAGAAAAGATGGTCCACTTGATTAGTGGATCTTGGTCCACATCTGCAACAAGTTTACAATCCATCACATCAGTTTCTGTTCCAGCTGCCTTCTATTCATCAGACACATTCCCCGCTTGGGGTCAAGTGAGGAATTTTCGGCTCATTCGAACAGCCTATCACCTCAAGCTTGTTGTCAATGGTCCCGCTGGTATTTCAGGCGCACTTGCTCTGGTCTACTGTCCACCCTCCATCTTGCCATATGGAATACCAGGGGCTGCACAGATTGTTCAAACTAGGTCAGTTGTTGGGTCAGCCTATGATGGCCGCAGTATTTTCAATCTGCCACATGTCATTCTCGATCCAAGGGTCAGCACAGAAGTGAGCCTCACTGTACCCTACATGAACTATGAAAATTATGTTAACATCAGGTCTGCTGACAATGCAAAGCTGCTTGTGGGAGGCATCTTTTACGTGGTTGTTGTAGCTCCTCTTGCTGATTCAGTCTCTAATGTGGTTGGGTTTTCTGTCTATGGGGAGTTCATTGACCTAGACCTTCAAGCGCCATGCTATCCAACCAACCCACAAGGCCGGCGCAAGACTCTCCGGCGACGTAGGGTTGCCAATCCTGGATCTCACAACAAACCTCACACCCTCGTGGTGGCGCCTGGTCCGGGTGCCGTCAATGCGGCAAACAGCTCACTTCTTGATGACATTCAGACCCTTGCCATTGGCAATGAGCGGACTGCAGTAGACATGAGAACTGCTGGTGCGCGCGCAAACATTGATGACATGATGCGCATAATGCGCCGCTGGAATCTTTTGAATGGCTCCACCACCACTCTTCCGCAGTGGAATCACGCAGCTGCTCCTGGCACCGAAATAACTGGCCTGGAATTGGCACTCACTGACAGTTTCTGGCCCAACATGAGGATCTTTGCAGACAAATTTCAGTATTTTCGAGGGTCCCTCGAGATAAAGGTAGTTGTCTATGCCACTTCTCTCACCAGTGGTAAGTTTCAGGTGTGCTGGTATCCATTTGACACCACCCGCAGAACAACAAATGCCCTCCAGGCGTACCGGAATTCAGTTTTCATCACAGGAGATGTGTCAAGTGTGCCAACCATTTTGATTCTGCCTTACACTAGTTCCAACTGGAGGCTCAGCACTCGTGCTGACCTAGGTAGAGTGTCAGTGATTGTAGTAAACCAACTCAGCACAGCTGCTGGAACTCTCACTGCACCGAGAGTTGCTATCTTTGGGAGGGTTGGATCTGATTTCCGCTTCTATGCCCCTCGCTTTGGGAGCGTGTCACTAAATCAGACTGCCAATGGCCTTGAGGAAGATGAGGATGATGTGACTGTCTGTTTTGTCAACTTTGATACAACTCCTGTTGACATTGACGGAGCTAGCCACACGTCATCTAGTGTGCTGTTTGGGCGATCTTGGTATATTGGGGCCCTCACTGCTCAAGCGCCAAATCTAAACAATCTGGCCATATACACCCCTCGCCAGGGAGTGCCATCTCTGCTTCGCTCTGTTGCTTATTGGAGTGGTGAGGTTGTCTTCACTGTCATCTCCTATTCCGACAACCCAGCTTATGTGGCACACACTTATGATGAGGCTCATGGTGTCTCAACTCTTGCTGATCTCACCACCTTGGGCGCTGTCATTATACCACCACGACAAACTAAAACATTTGTGGCCCCTTTTTACAGTGTGAACCCTCTGCGTTGTACTGCCTCTGCATCTGGTAGGTGGTTTTCTTCCCCCATTTTTGGGCACCTAGTTGCTTACATTGATGGAGGTCGTGTGGAAGTGTTCCAGAGTCTGCGCCGACCCAACTTGTTTGCTCCAGTCATAATGCCATCTTATGTTTCAACTCTCTCTGAACAGGAACCTTTTGACATCTTCCAGGAAGAACAAGGCTATGATTCCGTTGACTGTCACCTCTGTGAGATCTGTGAGAAAATGGCCAAATGGAGGAGGAGAGGAGATCGCCGTTTACGGTTCTGCCTGAGACTCAAACAACTTGGATTTGAGCTCAACCTTGAGTACTCTCACACTAGTCAGAAGGAGCTCTCCAAACAGGGCATTGAACCTAACCCTGGGCCTTTTCTAGTCTATCAGGATAGAGGACTGTACAATCACTATGGAGTAGCCAGTGGGAATAAGGTGTATCATGTCAATTCTGCAAATATCTTGAAATCTGCTCTCACTGGCGAAGCAGAGATTATTGAGTCTCCCTATGATTCTTCTTGGCAAATCAAACAGGTCATCAACAGTGACTTTTTAGAACACTATTTGAAATTGGCACCTTTTGAAAAATTAACATTCAGTATAAATTCTAATTGTGAGACCTGGGCTCGAGCCATGACTGGCACCTATGGACCTGACCAGGGTACAAATCTTAAGTATGCTGTGGCTGCCATGATTATCTTTTACATTTTTACAAATCTCCCCCACCTTATTGACCCACAGTCTGGAAACTCAGGTATATTGTCCAGTCTTTTGACAAAAATGACAGATTTGATTTTTGGTTCTCTTGAATGTCAGGTTTTGATGTTTGTGATTAAAGCCGTTGTTAGGATTTTGTGTTATCTTGTCCTCTATGCTCATGCCCCAAATCTCATGACAACTGCTTGTTTGGCCACACTTTTAATTATGGATGTAAATTCTGGCTCTTCTCAACCAGGTCTTAAAGCCCTCTGTTCTGCTCTTGTTGAGGGGGATTTCCGAACCTTTTGTGAGCTACTTTTGGAAAAAGCCCAGGTTGTGGATTATCGGGAGGCCAAAGACACAATTCCACAGTTCTCCCGTCTGTTGGATGACCAAGGGGCTCCCTCACCAAAACCATTCAATGATTGGACTAACGCTGCCAAAAATGTTAAGTGGTGGATTACTTCCATTATGGAGGCAGTTAATTGGATAAGGGAATTCTTTTGTCCGAAAACAGAGAAAATTGCAGAGTGGGTTGAGGAGCATGAGACTGAGATATCTACAGTCATTGCTGTTGCAGATGAACACATCACTAAACTCTCCACAGACAAAAAGTATGCTACTTCTCCAGATGGGCTCAAAACCCACAAGCAATTGATTAAAACACTGGGGGATATTTATCACAATATATCTCTGCAGAAGAATCACACACAATTCACCTCTCGCATTTCTTCACTTATTAATAAGCTCACATCAATTCAAGTAGAAGTTACACCAAGCTGGGAATGTAGGCAGGAACCTATTGGATTGTGGATAACTGGAGCTCCAGGGTGTGGTAAATCTTTCTTTGCAAACATGATTGCCAAGAGGGTGAGGGATGAATTGGATTTTACCATCTATTCCAATCCAACTGGATCGAACTATATGGATGGCTATACCAACCAAGACATACACATTTTTGATGATTTTGGCCAAAATAGAGAGGAACCAGAATTTGGATTGATTTGTAATCTTATGTCTTCCATTCAGTTCGCTGTTCCCAAAGCTGCCCTTGAACAGAAAGGCACTTTTTACCAGGGCAAATTGGTTATCATTACCACTAATAAACATGATTTTTCATCATGCACTCTCCTCGATCCTGGGGCTTTGGAACGGCGTTTCCCATATAAATACCACATTCGGCCTCGTTCTAAGTACATGCAAGATGGAAAATTCAATGCTGAATTAGCTGCAAAGACTGGTGACCTTAGGACTGGGGAGTGTTGGGAGCGCTTGCTTGAAAACACTAATGGTAGTGATCAGTGGGTGCCACTGAATGTTGACTTCTTAGTTGGTTCCATCATTGATGCAATTAAGATGCGCAAGGAGATTGCTAGCCTCATGAATCAGGGTCCAACCAGCACTCCCATCGCTGGGGGGGATAAGAAGGAAGCCATTCCAAAATTTTGGGACAATGACACTTTTGAAGACATTGACTTGCGCGATGTTGATTTTACTCCATTTGTTGGTCAGGATGTACCCGAATATGGCCTCTTTTGTTATGAAAATCCAAATGCCCAGATTGACTCACCACCACAGGAAAAAGTGACTAAATACAAGTCTTGGGTCTCGAGGTTTTCCCAGAAGTTGAGGAATTTCTTTATTCGTCACCAACCCTGGATAATTGCTGCTGGTTGCTTAGGCACACTGTGCTCTGTTGGAGCTGCTGTTTACCAACTGTACCATCATTTCAGGGGTGGCACTCATAATGAGAGCCCATACACTGGACAACCCACTCGAGATCTACCAAAGAAGAATTTTGCTACTGAGGCCGCTAAAAAGTTAAGTCAATACATAGGGACATCAGATCAAGGGCCTGTGGACCTCCGCCACATTTGTCGCCGCCTTGTCAATCTTAAAACCAAGAAACACACAATTACTGGACTTGCCCTGTGTAACAAGATTGTAATAACTTATGGTCATGATCCAATTGAGGCTATGGTGGTTGAAGAAGGCAACAAGGAAATTGAGGTCAGCTGTGAAAAGATTACCTATAATGATGAGGACACTGATTTGCAATTGGTTAAACCCAAAAATGAAAAAGATCTTGGTTATCAATTCAAAAATGTCTCTTCTCTCATATACAAGGGAGAATTTCATGGCAAAGGATGGCTCATTTGGAAATTTGGTGAGGAGTATATTATTCAAGAGGTCAGTGACATCACCTTTATTGGGTCTGCTCGCACTCGCTCTGGAACACAATCTGCAGCTGTCTATCTTTACAACGCTAAGACAACTGCTGGAACCTGTGGTGGCCTTCTGGTTGGGAATGTTGATGGTTGTCCTAAGATCTTGGGCATACACACTAGTGGGAACGGTGCCACAGCTGCGGCAAATCGCATTTACCCTGTACTTACTGACCAGGGGGTTGTGACTCACACTGAGAAGTATGCTAAACCACTTTACTTCCAACCCAGGAAGAGCAAATACAGGGAATCTCCTTTTAACGACGGGTCTTCTACTTTGGCTCCTGCTGTTCTATCTAAGAATGACCCTCGTTTAGAAGTTGAGATTGAGGACATCACGCTGCATGTGGCCAGAAAGTACAGAGTTGATAGATTTGATCCACCAAAAGTTGTTTTTGAGTCGGTTAAAATTCATCTTACTCGGAAATTCTTTTCAGTAGTTGGGCTCCAACAATCTATCACTTTTGAGCAAGCAATTAGCACTGAAATTCTTCCAATTGATTGGTCAACCTCTCCAGGGCACAAGTACCCAGGGAAATCAAAAAGAGAATTGGCTGCAGACCCAAAATTTAAGGAAGATGTGTTGTATATGTATTACTGTGGCAGTGCCCCACGCACTTACTTCACTGCCTATCTGAAAGATGAGCTGCGCCCACTTGAAAAAGTCAAAGAGGGCAACACTAGATGTATTGAAGCCTCCAATTGGGACTATACTATCTACTACCGCATGGTTATGGGAAACATCTACAAGAGGATATATGAAGACCGGTGGTGTGAAACAGGTTGTGCAGTTGGGATGAATGCTTTCACTGACTTTGATGTGTTGCACCAGAGAGGGTTTGACTATTACTTGTGTCTGGACTTCAAGAAGTTTGATGGTTCTCTTTCCATGCACCTTTTGAGACACGCTGTTGACATCCTTAAGGAGTGCCATGTTGATCACTATTTGGTTGAGTGCGCTCACGAGCCCACTATTATGTCCAGGCATCAGGTGAGTGATGAGATCTGGGATGTTTCAGGTGGAATGTGTTCAGGTTCCCCTTGCACTACCGTGGTCAACTCTGTCTGTAATCTTCTGGTGTGCTACACTGCCATGTTGTCAGCTGGATTGGAATTTGAGGACCTGTTCATAGTAACATATGGTGATGATGTGGTCATCTCTTCCAAGAAAAAGGTTGATCTCTCCCACGTGCCACTGATGATTAAGATCTTTTTCGGGATGGAGGTCACTGCCGCAGATAAGACTGACAACCTTCGTTGGGTTTCCTTTCTTGACATTGAGTTTCTCAAACGAACACCAACTGTTTTCCATGGGAAGATAGTTGGGGCCCTTTCTCTCCAAAACATGCGAGACCGAATTCAATGGACTCGCGGGGGCCCTGATTTTGACGCCCAGGTTGACAGTTTCCTGTGTGAGCTTGTTCTCCACGGCCGGGAAGCTTATGATAAGGAAGTAGCCCGTCTGAAGGCCATCTGTCCAATCATTCCATTGCCTCCTTATTCCATCATGGAGGCGAAGATGCGGTCAATAATTTTCATGTGACCTCTCCCTGCCGCCCATGAGCGGCAACAACTGTAGTCTTGGGTGCTAGACTGTAAACTCACCCACCTTCGGGGTTTAAGTGTTGTGGGATACCCCGTCGTACACGTAAAACACCCTCACTGGGAACCCGCCAGTTGAAAAGTGGGCCGTCTGTTTTCTCTCCACTTCTTTTGTCACGTCATGAGCAAATAGAGGTGGACGCGTTGATTTTCTAACCTTTTCTAATCAGTAGAGTTTAGAGTTAGTTTTAGTAAGTAGATATAGTTAAAGACAAACAGTGATATAAAGACCACCCTAAATCTCCCACTTTCCGGGTGAGCCCCTAAGCTGTTTGACTTCTTTCTCTATCTTTTACCTTTCCCTACACTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 44,741
|
MT457853.1
|
Picornaviridae sp.
|
Chang,W.-S., Eden,J.-S., Hall,J., Shi,M., Rose,K., Holmes,E.C.
|
School of Life and Environmental Science, The University of Sydney
|
Australia
|
2020-06-28
| null |
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,011
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
| null |
liver, abdominal cavity
|
2013
| null | null |
UNVERIFIED: Picornaviridae sp. strain BWBD_picorna7011, complete genome
|
GGCTTGCTGCATTGAAATATCACATATGATTCTGTATGTGGTGTTTTGATGTGGCAAGTCTCCTTGGGCCCAGCCGGAGGGAGTCCGGCACTTTGGTAACCTAGTAAATCTACTGCTTCCGTCAACGACTCTTCTTTTGGATTATGTTTTGGATTTGGTAAGGTTATAGGGTACCTACCTCCGACCATCCTGATGTGCACTTGACATTATAGTGTTAAGTGGTGGTTGATATTGTGTGATCATAAACTTTGACACATTTACGTCAATCAAGCGGGCACTGTGGTGTCATTTGCATTCATGATGTTAGGACACAAACCTAGTGTGGGGGGCCTTTGTGCACAACTCACATGAGAGCGTCTCATCGAGCAGGACTGCAGTCTATATTGGACCTGTTTTTCAGTATCCATGGGCTGTGGTGCAGGTATTGGGGTAACCTGCTTGACCTGTACGGGGTGATAGCCTGTTGCCGGAACATGGGCGCCGCTCTTTAAACCGGTTGTAATCCTCATGGATCTGCTTCAACCTTTTGTCAACACAACTGAAACACTACTTGATGATGTGTCTGGTGCTATGGAAGCCCTAGGCCTTAAGCCTACTGAGCCCGTCAACCCGAATGACAACCAGGGTGATGTGACCACAGATGTGGTGGAAATTGAGCCTGCAAAACCAAGCATTACCACTGCTGCCAACTCAGTTATAATGGCTGAGGCGGGAGCAGTAGGGGGTGTCAGTGTCCTAGGACAAAAGCCTGGAGATGTGAAGATATCCCAAGGGTTCGAATATTCAACCGGAACCCTGAACCAGTGTAAACTCTTTGAACTCAAGGAGTTTGAATATACTACTTCCAACACAGATTTTACCCTGATTGACACAATCACTCTCCCGAAGGATTACTACTCTGTTCTTCAGAACCCCTCTCATGGTAACTCCCGTTACTTCCAGTATGTCAGGACCCGCTTTATCCTGCAGTTTCAGGTAAATGCACCTCTTGGCGCTAGCGGTGGTATCTTGTTCACTTATGAGCCGCGCTGGCGTAATACGCAGTACCAGAGGGGGACTCTCTGGAACTTTCCTCATGTTGTCCTTGATATAGCTAGGACAACGACTGCAACCCTGCATGTCCCTTTTTCATCTTGTAATAATTATGTTTCCATTGATTCGGATGAGCAGGGGTACGTTTGTGCTTACAGCCTTGGAGAACTCGGGGCTGGGAGTGGCACTGACGCTGCGCTCTATGTTGCTGTATTCATCTCTGCACTTGATAACGAGCTGCAAAACCCGCGACCCCCGCAGCAGATGAAGGTCATACAGATAGGTAACACCCCTGGTAGTATCTGTCTTGGCAACTATGCTCACACTCTCAACGTGCCAACACTTGCAGTTGCAAATGAAGTAGCTGTCTATGATTCTCAGACACCTGGGCTGGGAGCTCCACTTGACTCTATCAAGTGGCTGATGAATCGACCCTCTATGGTCGATAATGGGTTCCTCTATTGGCAGGACCTTCATGAGCGGAATCACCTCCTTTTTGAGGAGGATGTTTACCTTGGGAATATTCCCAACCTCCGCATGCTTGCAGATACTTTCATGTACTTCAGGGGATCACTCCGCCTGCATGTTATGGTCCTGTCCTCTGGCGCACATAGAGGCAGACTTAGGCTATGTTTTTTCCCAAATCTCACACATGGCCAGAGGTTCACTGCTGAAGAATCACGCAACTCTATCTTTTCCATTGTAGATATTGCTTCAACTAACTTCGGCACTCTTATTGTGCCCTATGCTGCAAAAACCTGGATGCGCCTCACTACGGACCTGCTTGGGCGGTTTCAGATTTTCGTAAACAACCAGCTTACTAAGAACACAACTGCGTCAAACAGGGTTCGTATGTACGTGCTCTGTTCACTTGGTGAGGATGCTGAGTTCTACAGTCCTCGTGATTCGGGGGTTGTGTATCAAGGCCCTCCCCCGGCTCCTGGTGCTGTGGACACACTCGAGCATGTACCTGATGCCAGCGCACCATCTAATGCTGTCATTGCTGACCCTGGAAATTTTACACGGTCACACATGGATATTTCTGTGTTCTTTGGCCGTGCTTGGTACGTAAACCAGTTTACTCCTGTTCAGGGGATTAATCACGTGGCAATTCCCTTCCCAGCATCTGGCCATGGCGCTGTCGCTCGCTCTATGGCGTATTTCTCTGGTGAGCTGGTTATTACCATAATGAATGCAACAGACCAGGTCCTTGAAGTCACCCATACCTGGGATGAAATCATAGATACTGAAGCGAAAATTACATCTCATGGGTCGATCGTTGTACCAGTTGATGGAGTGACCAGCTTCAGAAGTCCATACTACTCCAAGTATGCTGTTAGATCTGTTATGTGGGAGCATTCCCTTGGAAGGCTCATAGTTGCTGCACATGGTGACACACCCAGAGGCCAGGTTGAGGTTCGCGTAGCTATGCGCAAACCAAATTTTTATCTTCCAGTTGCACTTCCCTCTGCCGCAAAGAATTTCAATGTTGAGAGTGTTCGTCACTGGATGCTTCCCCCTAGGATGGTAGATTTTTCAGATGACATCCCAAGACTCAAGCCCTCAGCCCCTGTTTTTGACCCAGTTAGAGCTCGGATGAATCAGTTTCTGTTCAACAGACCTGCACAGCAGGGTTGGGTCAGGGACCTGACCAATGATGGGGATATTGAAAGTAACCCAGGCCCTGCATATCTGCTGGTTAGCCCAGATGGTAGATCTCACTACCTCCAGGTTTATGACCTTTGCTTTCAGATTGCAACCAAAAAGAGTTATAATTGCTTTAAGCCCAAGCCTGTTAAGGTTTACATCCAGAGGGCAAAGCCCATTAGCGGTAGTGTTGTAATTGGTGCTGCTTGGGACAGTGAATGCATTAATGAGCTGCGGCACATGCGCGTGACCGGGGTTAAGTATCAGCTCACTGCTGAAGCTCAGGAGGACATAGATGCACTCTTTCCACTTCTGGGCCAGGGATGGGTTTCTGGGCCACAGTCCATCTATTTTCTTTATCTTGCTCTTAGTGCAAAATGGGCTGTTGGTAGCGATCGTCCTGTATACGTTCAGCCCCGCTATGCTCAGGAAGTTACTGTACACCCTGCACATATACATCAGCAGGGCCCGCTTGACCTGATTCATGTTTTATTGCAAACCCTAGATAACAAGGTACTAAGCATGTCTCTGTCAGCATATGCCCCCCTGTTCATCAGGTCTGTAGTGTACCTTCTCTGTATGTATAAAACCCATGATCCAGCAATTACATTGTTGCTTGGTGCAATGATGGCATACGATGTTGCTACCATGAAGCCCCCTCCTGCCATTGCTATTTTGACTGAGGCCATAGCAGCGACAAGCTTCGAGTCACTTTCCAGGATATTCTCTAGTCTTTTTGTTCATGGCAGAATCCCTCGCGCGCTTGGTAATATGATGCGCAGACTCACATCCCGCCTGACTTTCCAGCATAATAGTTTTTTGAATTTTACACGTATTGTGCAGTCAGTCATATTTTGGATCAAAGGTATTATGAAATGTGTTGAGTACATCTGTAAGTTGCGCGATCAGGACAGCTGTCATGAAGCGAATGTAGAGGAGCTTGCCCGACTTTACACTCTTGCTGATTCTGTTTATACAAGCTTTTCTTTGCCACTCACTGAGAGACCTAATCGTGACAAGGAGCGCCGAGAAGTGCTCCAGAAGCTGATGTATGTAAGCCCTTATATATCACGCTTTGGCGCAGAATTTTCCCAGCGTCACTCGCGAGCTATAGATAGGCTTACTAGACTCAAGCCTGCAGCAGACCCCCTCCCTGTGATTCGTACTGAGCCTTTGGGCATCTGGATTTGTGGACCCCCGGGGATGGGAAAGTCACTTCTCATGACAAAGCTGGCAATGGACTTGGCCGAGGGAGGCGGTGTTTATTACCACCCTGGTAATGATAAGTATTATTCTGGGTACAACGGCCAGCGAGTACATTGCTTTGATGATTTGGGTCAGAATAAGGCTGAAGAAGATCTTGCATGCCTGTGTCAGTGCATAAGCTCCTGCCCTTTTCTCGTTTCTGGGGCTGCAGTGGAAGACAAAGGAACGCCTTACACGTCTGAGTATGTGATAGCTACTACAAATAGGACAGGCTTTTCCACTTATACCCTTACCACTCCTGGCGCTCTTGAACGCAGATTCCCTGTTCGCATTATGCTTAAAGAAAAACTGAACCATCAGACCCTGCAGAGCGGTGACTTTCAAGTTCAGCTTGATGGTAAGGACATCAGTTATGTGGACCTTCTTAAATACCTGCGTGACACAATGTCTAAGCGGCACGCGAATACGCAGATTATGGAACAAGGTCCCTCTGCTGAGGACAACCATGATGAGGATGAAGTCGAGGTTAGTGCTGTTAAGCTCAATCTGTTTCCTGAAGAGACCCTCAAAGATAGCGTTCTTTTCTCCAGTGATGATGTACTTAGTGCACCTCCAGCAAAATCCAGCTATATTAGATACTTTTCCGCCGCTATTGATAGTGTGCGTAACCTTGTCAATAATCAGACCGTGCAGAACCTGTTTTCCATTCTCGGTGCTACTGCTGCTGCTACAGTTACCATTCGGATGCTGGCAGATATGCTTGTAGGAGTTGCTTCTGCAGTAGGCAAACTTTTTGCTAATAATGCACCCCAGGGACCCTATAACCCTACCCCCCATGCCAAGCGCATTGACCCAGCTGACTTTGCCCGTAGACATGTATCCCAGCAAGGGCCTAGCATTTCAGGGCTGCGCCATTTGTTTAAATATTGTGGATATGTTCAATATGATGATCTCCATATTTTTATTTTGGCTGTAGGTGGAAAGCGCATTGCTATGAATTATCATACCTTTCAGCTCGTCAAGGATCATGCATATGAGTACCATATTGGTGGGCAGATTGTATCTTGCATACCCAAGCTTGTTGAGCAGCTTGATGATATTGCCATTGCAGAAAT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| 48,818
|
MN933899.1
|
Picornaviridae sp.
|
Zhao,M., Shan,L.T., Yang,X.S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-04-22
|
ltt163shi2
|
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,715
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aegithalos caudatus
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Picornaviridae sp. isolate ltt163shi2, complete genome
|
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|
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|
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|
Zhao,M., Shan,L.T., Yang,X.S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-04-22
|
tit162shi1nc
|
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,594
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Poecile palustris
|
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|
2018
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|
PRJNA600556
|
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|
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| 51,811
|
MN933901.1
|
Picornaviridae sp.
|
Zhao,M., Shan,L.T., Yang,X.S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-04-22
|
wpk139shi03
|
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 5,482
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Dendrocopos leucotos
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Picornaviridae sp. isolate wpk139shi03, complete genome
|
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| 51,812
|
KY312542.1
|
Picornaviridae sp.
|
Yang,S., Wang,Y., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2018-02-04
|
yc-3
|
Picornaviridae sp.
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,912
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Grus japonensis
|
feces
|
2014-12
| null | null |
Picornaviridae sp. isolate yc-3, complete genome
|
ACTGAAGATCCTACAGTAACTACTGCCCCAATGAACGCCACAGATGGGTCTGCTGATGACTACCTATCTTAGTGCTAGTTGAGGTTTGAAGTGAGCCGGTTTTTAGAAGAACCAGTTTCTGAACATTATCATCCCCAGCATCTATTCTATACGCACAAGATAGATAGTCATCAGCAGACACATCTGTGCTACTGCTTGATAGAGTTGCGGCTGGTCAACTTAGATTGGTATAACCAGTTGAGTGGCAAATGGAAAATCTCATGAACAAAGTTGAAACTTCTATTACTGATGTTTTATCCACAGCAGTAGAGTCCATTGAGGAAAGTATTCCTGGCATGGGGCAGACATTAAATCATCAGTCAGCTAATGCTGTCATGACAACTGAAGATCCTACAGTAACTACTGCCCCAATGAACGCCACAGATGGGTCTGCTGATGACTATCTATCTTGTGCGTATAGAATAGATGCTGGGGATGATAATGTTCAGAAAATGGTTCTTCTAAAAACCGGCTCACTTCAAACCTCAACTAGCACTAAGATAGGCACCACTGCTGCTAAATTGCATTTCCCACATTGTATGTTTCAGGATTACACCTATCCTGCAGCTGGACAATCCCATTATTTTTGCTATTTACGGGCGGGAGCACATTTTAAGATCTGTATTAATGCAGCCCCTGGGAGTGTTGGACTTTTAGCAATGGTCTATATGCCACCCGGTTATGAGCATTACTTTCATGTGAATGAACAACAAGCTGATGACAGAGTGGACTTGAAGACTGTCTTGTATTTACCTCATGTTTTAATTGATGTTTCTAAGAATAGCCAGATGTCCTTGACAGTCCCCTATATGAATTATAAGAATTATTTTGATTTTCGTAACACTGCTGTCTATGGTCAACTTTTGCTCTTGTATCTGACACCCTATCACCCCCCTCAATCAGGTAACAACAAGGTGGCTTATGCCATCTATGGTGAATTTTTGGATTTGGACTTTCAGTGTCCCAGGTTTTTACCAACAGCACCGACAAATCTAAGTGACCAGGGCAGAAAGGTATATCCAAGAAGAAAGCATCCAAAGAAACCCAAATCCTCTCCAGATGTCCCACATGTTTTGATACAACCAGGATATGGAACTATGAATTGCTCAAATGCTGTGGCTGCAAATCGGGCTGAGTCTATTGCCTTGGATAATGATAATAGTGCAATGGATCTAAGGACTTCTGGCTGTGCTAGTGTGAGTCACAGCTTAATGGATGTGCTCAGAAAGTGGACTGTGGTTAGGAGGATAAGTTGGAATTCCTCAGCTGGTGTGGGAGTCTGTATTAACACCATCCCAGTAGACTTTGATACAGGAATTTGGAACTGTGTGAAAGATTGTTTTGCCTATTTTAGGGGAGGCCTAGAATTTAAAATGGTTATTGCCTCATCTGTTTTCCATCAAGGTATGATTCAACTTTCCTGGTATCCTGGAGGATCAAACTCTGATCCAAATCTCTACCACATGAGGAATGCCATCTACATTACCCAAGATGTTCGCTCTTCAGGACCAATACTTCTTGCTCCATTTACCTGCACTTCTTGGAGACGCCGATTCAATGGTGGTTATGGAAATCTCCATATCAATGTGGTGAATCCCCTTACTTATAATAATGCAACAACCTCACATGTTTATATCTTATTGATGATGAGGGCAGCAAAAGATTTTGAATTGATGTCTCCCACATATGGTGCACTTTCATTTGGAACAAATTCATATAGTCCATCCATGCCAGCTCGATTGGTAGAGCAAGTCTCACAGAATGAAGAGGAGGAAACAATGACTCTATCTGACCAGGGTAATGATAACAATCCCTGGGAAGAAGATGAGCCTACACCCTTTGTAAACTTTGAGACTGACAAAATTGCCACCCTTTCAGTCAATCATACCAATTTGGAAGCTTGTTTTGGGCGCATGATGTATTCCATTTCATTGACTAAACCCCATGGAGGAAATTTTGTAAACACTGAAATTCCTATCCCACTCCATGGGGTTCAGAAATTAGCCCGTTGTTTTGCCTACATGACAGGGGAATTGATTATAGGTATTGTGAACCGTTCAACCACATCAGCCCTGATGGCTCACTCCTATTTTGAAGAGTCAGTGTTTAATCATTGGAATCAAGTCTTCACCACTGGAGCCTTAGTGATCCCACCTGGAGAGAACAAGGTCTTTAAAGTTCCTTATTACGCAGAGACTCCTTTCCGAGTTACAGCAGCTGCTAATGCTTGTGGAATGTTACATGGCTACTTGACAGATGGTCAATTAGACGTTCTTATCTCGCTGAGAAATGTCCAATTTCTGGTGCCAATCTGTATGCCTCTCTGCGCAGGACGTGTTAACACTCTGACTAACTTGCCATTCCCGCCCTGTGCTCTTGAGAATCAAGGAAATGGTTGTGAAGAAATGAAAATTACAATGAGGAGGAAACATTGTATTGGCTCTGTTGAAGTACATAAAAGTTGTAGACTTCACTACTTCCAACCCCGCTGCTGTAAATGTCAAGAATGGGATTATAAGGACTTCATAGGGCCAGAACCCATCTGCTTGGGACCTTATAAGGATGTCAGACCAAAATTTTATTGTCAGTGTAAGAAGGGAATTTATCATTTTCAATGTGATGAGCACTTTGGGAGGCAGATGTGCTGTGGCTGTGCTCATATCTATGGATGGTTGGATCAAACTGAGAGAGATTTTTTTGAAAAACATGGGAAACCTTGGAAATCACAAGAAGATCTATCTAAGGAGGGAATTGAACCAAACCCTGGTCCCTTTCAATATGTGGCTTGTGATCTTACTGCTCCTGTCTTTAAGTGTCAACCTCATAGGTTTTGTGATCATAAATCGCAATCTCATCAGAATTGTCCACAACACCATAGCCCAGACTCATTTATGTGTTGCCTCTGTTCTGCTCGCCTCCGCATTACGGACAATCGTTATAAGGAAACCGACGCTAAATGGTTGAGCCGATATGGAGTGGAAATGAACCCAGGCCCTGTTTTAACATCTCAGGAAGCAGTAGCTCACTTTTGTGCAACTTTGTTGGATCCATGTCAACAAAGACCAGAAGTTATGGTGAGAGTTTCAGCTAAACCCAAATGCTGGACAATGCGGTTCCATTTTGATTGTGAAAACCACCAACACCTAGCGAAGGAGATGTGTTGCCTTTGTGCTGCTGGATCCCGTGTCACTCAGGATCTTTATGCTGCTACTAATCAAGATCAGTTATCAAATCAAGGCATTGAATCAAATCCTGGGCCCACTTTAGTGTACAAAGACAGAGGATTATATAAACATTATGGTGTCCAAATTGGGGACAAGATCTTCCATATAAATACAGAAAACATCTTGGATGCAGTTATTTCAGGTAAGGCCAATGTGATAATGGAAGACAACATCATGGGCTGGGAAACTGTGGGAGATGAGTATGTGACTGTGGCCGAGAGATATTTACAGGCTGGGTCAATGCCTGATTTTAAATTTAATGTAGACCAGAATTGTGAGACATGGGCCAAACATCTCTTAGGTGATTACGGTCCCACCCAAGGAGAGATTTTAAAACATCGTTTGGCCCAGTGTGTGGCTCTTGGAATGCTTGCCCAGTTTGCTATGTCATCTCAAGGACTGGGTTCAACTGTTCAAGGAATGATGACCAAATTGACTGATTTGATTTTTGGAAATTTGGAAAACCAAATAGTGAAACTGGTTATAAGAGCTGTGGTAAGGATTTTGTGTTATTTGATTTTGTATATACACTCACCCAATTTGATGACCACAGGAGTGCTAGCTGCTTTGCTTGTCTTAGATGCCACATCAATAACAGTTGATGACCCTTTGAAGGTTATGACAAAGGCCTTGATTAATGGAGATTTTACAGAATTTTGTGCAGCTGTGTTAGAAAAATGTGATACTGTTGACGCAGATGCACTAGCTGATACCATACCAACATTTACCAGTTTTGTAGATCAAGGCATGGAAGATGAGGGTCCTAACCCTAAACCATTTAATGATTGGACCACATGTGCTAAGAACATCCAGTGGTGGATGGATGGTGTTATTAAAGCATTCAGGTGGATTAAGGAGAAGCTCTTTCCATCAGATTTGAACTCTTTGGCAAAATGGATGGAGGAGAATGAAGACAACATTGCCACTACTATAGCCTTAGCTGATGAACACTTGGTTTTATTAAAAACTGACAAGGAATATGCCACTTCATCTCAGACAAAGAAGAAACATGTTGCCCTTTGTGACACTATTAGTGGAATGATGTTGAAAATGAAGGATGACCCCAGGTTGAATTCAATGATTAGCCGTCTTAATATCTTGATGGGCAAGCTACAATCGATAAATTTTGAACCTGAAGCAGAATGGACTCACCGACCTGAGCCTTTGGGTATGTGGATCAATGGAGCCCCTGGAGTTGGAAAATCATTTTTGACCAATTTTATAACTAAGAGACTCAAAGAGAAATATGGTTGGAATATATATGCTAATGCTACTGGCTCTAATCACATGGATGGATACACTGACCAGGAAGTCCATGTATTTGATGATTTTGGACAACAGCGTGAAGAGACTGACTATACCTTGATGTGTAATCTGATATCATCAGTTCCATTTATTGTTCCAAAAGCTGAAGTGACTGCTAAAGGGACCACTTACAAGGGTCGAGCAGTTTTGGTAACAACTAATAGAAGGGATTTTTCATCTGTTGCATTGTTTGATGCTGAGGCTCTTGAGCGACGATTTCCATTTAAGTATCAGATTAGACCAAAACCAAAATATGAGTTAAATGGAAAATTGAATGTTGCTTTGGCAATGAGAGATGGAGCCCTTTTGAGTGGGAATGCCTGGGAAAGGAACTTGGGGATTGCAGGATTAGATAAATGGGAACCCTTAGATGGAGACACTTTAATGGAAGAAATTTGTACTGAATTGATGATTAGGGAGAATATAGCCAAA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| 72,237
|
PP158748.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
li,q.Q.
|
Anhui Science and Technology University, College of Animal Science
|
China
|
2024-02-02
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| null |
China: Beijing
|
China
|
Columbidae
| null |
2023
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain PPMV-1/Pigeon/BJ/2023, complete genome
|
ACCAAACAGAGAATCTGTGAGTTACGGTAAAGGGCGAATAAGCAATCGAAGTCGCACGGGTAGAAGGTGTGAACCTCGAGTGCGAGGCCGAAACTCAAGCCTGAGGGAACCTTCTGCCGGCATGTCGTCCGTCTTTGACGAATACGAGCAGCTCCTCGCCGCTCAGACTCGCCCTAATGGAGCTCACGGAGGGGGAGAGAAAGGGAGCACTCTAAAGGTTGAGGTCCCAGTATTCACTCTTAACAGTGATGATCCAGAAGATAGATGGAATTTTGCGGTATTCTGTCTCCGGATTGCTGTTAGTGAGGATGCCAACAAACCGCTCAGGCAAGGTGCTCTCATATCTCTCTTATGCTCCCATTCTCAAGTGATGAGAAACCATGTTGCCCTCGCAGGGAAACAGAATGAGGCCACACTGGCTGTTCTTGAGATTGACAGTTTTACCAACAGTGTGCCCCAATTCAACAACAGGAGTGGAGTGTCTGAGGAGAGAGCACAGAGATTCATGGTGATAGCAGAGTCTCTCCCCCGGGCATGCAGTAACAGTACTCCGTTCGTTACAGTTGGAGTTGAAAATGATGTGCCAGAAGATATAACTGACACTCTGGAAAGAATCTTATCTATCCAGGCTCAGGTATGGGTCACAGTAGCAAAAGCCATGACTGCGTATGAGACAGCAGATGAGTCAGAAACAAGAAGGATCAATAAGTATATGCAGCAAGGTAGAGTCCAGAAGAAGTACATCCTCCATCCCGTATGCAGGAGTGCAATTCAACTCACAATCAGACATTCTCTAGCAGTCCGCATTTTTTTAGTTAGTGAGCTTAAGAGAGGTCGCAATACGGCAGGTGGGAGCTCCACATATTACAACTTAGTTGGGGATGTAGACTCATACATAAGGAACACCGGACTTACTGCATTCTTCCTGACTCTCAAGTACGGAATCAATACCAAGACATCAGCCCTTGCACTCAGCAGCCTCACAGGTGATATCCAAAAGATGAAACAGCTCATGCGTTTATATCGGATGAAAGGAGAAAATGCACCGTACATGACATTGCTAGGTGACAGTGACCAGATGAGCTTTGCACCAGCTGAATATGCACAACTCTATTCTTTCGCCATGGGTATGGCATCAGTCTTGGATAAGGGAACTGGTAAATACCAATTTGCCAGAGACTTCATGAGTACATCATTCTGGAGGCTCGGAGTGGAATATGCTCAGGCTCAGGGGAGTAGCATCAACGAAGATATGGCTGCTGAGCTGAAACTAACTCCAGCAGCAAGGAGGGGCCTGGCAGCTGCTGCCCAACGAGTATCTGAGGAAGTTGGCAATGCGGATATTCCTACTCAACAGGCTGGGGTCCTTACTGGGCTCAGCGACAAAGGTCCCCAAGTTCCACACGGTGGACCAAGCAGGCTGCAAGGGCAACCGGACGCTAGGGATGGGGAGACCCAATTCTTGGACCTAATGAGAGCAGTGGCAAACAGCATGCGAGAAGCGCCAGATTCTGCACAGAGCACCATTCATCCGGAGCCTCTCTCAACTCATGGGCCATCTCAGGACAACGACACCGACTGGGGGTACTGATCGACAGAATTCAGCCCACCCTCACAGGATCATCCCAGACCATCTGCCGGAACCCTCACCAAGCTCCACGACCCACCGACCCAAATGGCCAAACTGGCAAGGGCATCCCTCCGATCCCCCCCTCACCCCTAGCCGCACGACCCCACCTGCCCAGAGCAACACGGGCACAACCCAATCCACCAACGACCCGTGCAGACCCCAGAAGATTAGAAAAAAATACGGGTAGAAGAGAGATATTCAGAGATCAGGATAAGTCACCAAAGTCTCTACTCTCCTCTCTACCCAGTGAACCAGGGTGAACATGGCAACTTTTACTGATGCTGAGATAGAGGATATATTTGAGACCAGTGGAACTGTCATTGACAGTATAATTACGGCCCAGAGCAGACCAGCAGAGACTGTCGGGAAGAGCGCAATCCCGCAAGGTAAGACAAAGGCCCTGAGCATAGCATGGGAGAAGCATGGGAGCACCCAACCATCTGCTGGTCAAGACACCTCCAACCCACAGGACAAACCAGACAAACAGCCATCCGCATCTGAGCAGGCGACCCCACATAATGATCCTCCAACTGTACCCAAAGACCCGCTCCCCACCCAGGCTGCAGGTGATGCTGGTGACACACAGCTCAAGACCGGAGCAAGCAACTCTCTGTTGTCAATGCTTGACAAGCTGAGCAACAAATCATCCAATGCTAAAAAGGGGCCAAGGTCGATCCCCCAGGAGGGCCACCATCAGTCTCCGGCCCACCAACACGGGAATCAGCTGAGCCGTGGAAACAACCAGGAGGGACCACAGCACCAAGCCAAAGCTGCCCCTGGAAACCGGGGCACAGACGCGAGCACAGCATATCATGGACAATGGAAGGAGTCACAACCATCAGCTGGTGCAACCCCTCATGCGCTCCAGTCAGAGCGGAGCCAAGACAATACTCCTGTACCTGTGGAGCATGTCCAACTACCTGTCGACTTTGTGCAGGCGATGATGTCTATGATGGAGGCATTATCACAGAAGGTAAGTAAAATTGACTATCAACTAGACCTAGTCTCAAAGCAGACATCCTCCATCCCTATGATGCGATCTGAAATCCAACAGCTTAAAACATCTGTTGCAATCATGGAGGCCAATTTAGGCATGATGAAAATTCTAGACCCTGGTTGTGCCAACGTTTCGTCCTTAAGTGATCTACGAGCAGTTGCTCGATCCCATCCAGTCTTAGTTTCAGGCCCCGGAGACCCATCCCTTTACGTGACACAAAGGGGTGAAATGACACTCAACAAGCTCTCGCAACCGGTACAGCACCCTTCTGAGTTAATTAAATCCGCCATGGTGAGCGGGCCCGATATGGGAGTGGAGAAGGACACTGTCCGTGCATTAATCACATCGCGCCCGATGCATCCAAGCTCCTCGGCTAAGCTCCTGAGTAAGTTGGATGCAGCCAAGTCGATCGAAGAAATCAGGAAAGTCAAGCGCCTTGCACTAAATGGTTGACAGCCGTCACAGCTCACGGCAGGCTCCCGCCCCACCAGCGCCACAAGGAATCCCTCCCGAACCCTCCCCCACAGACCCTCGCCCCAACAGCCCAAGCAACGACCCTCTCTCGCCTCTCTCACTTCCTCGAGTGATCGCACAACTGCAATCAATCCAACAGCACCAGAGATTAAGAAAAAATACGGGTAGAATCGGAGTACCCTAACTGTTAAAAAATGGACTCATCTAGAACAATCAGGCTGCACTTTGATGCTGCCCTACCTTCCAGCAGCCTGTTAGCATTCCCGATCGTCCTACAAGGCACGGGTGATGGGAAGAAGCGAATCACCCCACAATACAGGATCCAGCGTCTTGACTCATGGACAGACAGCAAGGAAGACTCAGTATTTATCACCACCTACGGATTCATCTTCCAAATTGGGAATGAAGAGGTCACTGTTGGCACGATCAACGACAATCCCAGACATGAGTTACTTTCCTCAGCAATGCTCTGCCTAGGAAGTGTGCCGAATGACGGAGATCTTGTTGAACTGGCGAGGGCCTGCCTCACCATGGTGGTAACCTGCAAGAAAAGTGCAACTAATACTGAGAGAATAGTCTTCTCAGTAGTGCAGGCACCTCGAGTGCTGCAAAGCTGTATGGTTGTGGCAAATAAGTACTCATCAGTGAATGCAGTGAAGCACGTGAAAGCACCCGAGAAAATCCCTGGGAGCGGAACCCTAGAGTATAAAGTGAATTTTGTCTCCTTGACCGTAGTGCCGAGGAAGGATGTCTACAAGATCCCAACTGCAGCATTGAAAATCTCTGGTTCAAGCCTGTACAACCTCGCGCTCAATGTCACTATTGACGTGGAGGTAGACCCGAAGAGCCCACTTGTCAAGTCTCTTTCTAAGTCTGATAGTGGATACTATGCTAATTTGTTCTTGCATATCGGACTCATGTCTACTGTAGACAAGAAGGGAAAGAAAGTTACATTTGACAAGATAGAGGAAAAGATAAGGAGACTCAATCTATCCGTCGGGCTCAGCGATGTACTCGGACCCTCTGTGCTTGTGAAGGCGAGGGGTGCACGGACTAAGCTACTGGCACCCTTTTTCTCCAGCAGCGGGACGGCCTGCTATCCTATAGCAAACGCCTCCCCTCAGGTTGCTAAGATACTCTGGAGTCAAACTGCACACTTGCGAAGTGTGAAAGTCATCATTCAAGCTGGCACTCAACGTGCCGTCGCAGTGACCGCCGACCACGAGGTCACCTCCACCAAGATAGAGAAGAGGTACACCATTGCCAAGTACAATCCCTTTAAGAAATAAGTTGTGTCTCTGAGACTGCGAGCCACCCACTTTTCCGAATCATCACGACACCAGATAACGATCTATCTTGATTGCTTATAGTCAGTTTACCTGCCTATTGAATTAGAAAAAACACGGGTAGAAGAGTCTGGATCCTGGCCGGCACATCCAAAGTGCAACATGGACTCCAAACCCCACATCAGGATCCCGGCATCTCCGACGCTGATCACTCGAATCACTCTGGTACTGAGCTACATCTGCTCGACGAGCTCTCTTGATGGCAGGCCACTTGCTGCTGCGGGGATTGTGGTAACAGGAGATAAAGCAATCAATATATACACCTCATCCCAGACAGGGTCAATCATAGTCAAGTTGCTCCCGAATATGCCCAAGGACAAAGAGGCATGTGCGAAAGCCCCACTAGAGGCATACAACAGAACACTGACCACTTTACTCACCCCCCTCGGTGATTCCATCCGCAGGATACAAGGATCTGTGTCCACATCAGGAGGAAGGAGGCAGAAGCGCTTCATAGGTGCCATTATAGGCAGTGTAGCTCTTGGGGTTGCGACATCGGCACAGATAACAGCAGCTGCGGCCCTAATACAAGCTAACCAGAATGCCGCCAACA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| 9,201
|
OR542540.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Zhou,H., Huang,C., Wang,Z., Lin,Z., Qian,J.
|
Huazhong Agricultural University, National Key Laboratory of Agricultural Microbiology, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-10-18
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2022-01
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Hubei/187/2022, complete genome
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| 11,857
|
OR542541.1
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Pigeon paramyxovirus 1
|
Zhou,H., Huang,C., Wang,Z., Lin,Z., Qian,J.
|
Huazhong Agricultural University, National Key Laboratory of Agricultural Microbiology, College of Veterinary Medicine
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China
|
2023-10-18
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2022-01
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Hubei/188/2022, complete genome
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| 11,858
|
OR542542.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Zhou,H., Huang,C., Wang,Z., Lin,Z., Qian,J.
|
Huazhong Agricultural University, National Key Laboratory of Agricultural Microbiology, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-10-18
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2022-01
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Hubei/190/2022, complete genome
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| 11,859
|
OR542543.1
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Pigeon paramyxovirus 1
|
Zhou,H., Huang,C., Wang,Z., Lin,Z., Qian,J.
|
Huazhong Agricultural University, National Key Laboratory of Agricultural Microbiology, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-10-18
| null |
Orthoavulavirus javaense
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Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2022-01
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Zhejiang/1-3/2022, complete genome
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| 11,860
|
OR542544.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Zhou,H., Huang,C., Wang,Z., Lin,Z., Qian,J.
|
Huazhong Agricultural University, National Key Laboratory of Agricultural Microbiology, College of Veterinary Medicine
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China
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2023-10-18
| null |
Orthoavulavirus javaense
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Orthoavulavirus
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Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
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GenBank
| null |
China
|
China
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Columbidae
| null |
2022-01
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Zhejiang/3-2/2022, complete genome
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| 11,861
|
OR542545.1
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Pigeon paramyxovirus 1
|
Zhou,H., Huang,C., Wang,Z., Lin,Z., Qian,J.
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Huazhong Agricultural University, National Key Laboratory of Agricultural Microbiology, College of Veterinary Medicine
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China
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2023-10-18
| null |
Orthoavulavirus javaense
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Orthoavulavirus
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Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
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GenBank
| null |
China
|
China
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Columbidae
| null |
2022-01
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Zhejiang/5-2/2022, complete genome
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| 11,862
|
OM640464.1
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Pigeon paramyxovirus 1
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Zhang,Y., Wang,W.
|
Northwest A and F university, college of veterinary medicine
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China
|
2022-12-21
| null |
Orthoavulavirus javaense
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Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2020-09-20
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain PPMV-1/pigeon/Gansu/China/02/2020, complete genome
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| 20,282
|
ON939087.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,T.
|
Agricultural University of Hebei, College of Chinese Veterinary Medicine, Animal Medical College
|
China
|
2022-08-13
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Sus scrofa
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tissue
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2021
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/HeBei/210818, complete genome
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| 26,851
|
ON637881.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Chen,H.-W.
|
National Taiwan University, Department of Veterinary Medicine
|
Taiwan
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2022-06-11
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
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Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,290
|
GenBank
| null |
Taiwan
|
Taiwan
| null |
kidney, abdominal cavity
|
2021-03
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain NTU/C239/21, complete genome
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| 30,257
|
MN862497.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,Y., Xue,R., Yang,W., Li,Y., Xue,J., Zhang,G., Huang,B., Qin,Z.
|
China Agricultural University, Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-17
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Columbidae
| null |
1996
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Beijing/BJ96/1996, complete genome
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| 49,031
|
MN862498.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,Y., Xue,R., Yang,W., Li,Y., Xue,J., Zhang,G., Huang,B., Qin,Z.
|
China Agricultural University, Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-17
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2008
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Shandong/JN08/2008, complete genome
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AAGGCAATCGTACGCCAATCAGTTATCTTCCTAACTGATGACTCCCTCACTGACTCAATTATACCAGATTAGAAAAAAGTTAAATTCCGACTCTTTGGAACTCGTATTCGGATTCAGTTAGTTAACTTTAAGCAAGAGTGCGCAAAGTCATCCCTAATTATAGTTATGTCATTCACCAAATCTTTGTTTGGT
| 49,032
|
MN862499.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,Y., Xue,R., Yang,W., Li,Y., Xue,J., Zhang,G., Huang,B., Qin,Z.
|
China Agricultural University, Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-17
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2014
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Shandong/TA14/2014, complete genome
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| 49,033
|
MN862500.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,Y., Xue,R., Yang,W., Li,Y., Xue,J., Zhang,G., Huang,B., Qin,Z.
|
China Agricultural University, Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-17
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2009
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Shandong/PP09/2009, complete genome
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| 49,034
|
MN862501.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,Y., Xue,R., Yang,W., Li,Y., Xue,J., Zhang,G., Huang,B., Qin,Z.
|
China Agricultural University, Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-17
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2013
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Shandong/TA13/2013, complete genome
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| 49,035
|
MN862502.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,Y., Xue,R., Yang,W., Li,Y., Xue,J., Zhang,G., Huang,B., Qin,Z.
|
China Agricultural University, Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-17
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2013
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Shandong/C9/2013, complete genome
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| 49,036
|
MN862503.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,Y., Xue,R., Yang,W., Li,Y., Xue,J., Zhang,G., Huang,B., Qin,Z.
|
China Agricultural University, Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-17
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2016
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Shandong/LCE4/2016, complete genome
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| 49,037
|
MN862504.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,Y., Xue,R., Yang,W., Li,Y., Xue,J., Zhang,G., Huang,B., Qin,Z.
|
China Agricultural University, Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-17
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2017
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Shandong/LC/2017, complete genome
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| 49,038
|
MN862505.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,Y., Xue,R., Yang,W., Li,Y., Xue,J., Zhang,G., Huang,B., Qin,Z.
|
China Agricultural University, Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-17
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2018
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Shandong/3P3/2018, complete genome
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| 49,039
|
MN862506.1
|
Pigeon paramyxovirus 1
|
Tian,Y., Xue,R., Yang,W., Li,Y., Xue,J., Zhang,G., Huang,B., Qin,Z.
|
China Agricultural University, Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-17
| null |
Orthoavulavirus javaense
|
Orthoavulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,192
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Columbidae
| null |
2019
| null | null |
Pigeon paramyxovirus 1 strain Pigeon/Shandong/190610-2/2019, complete genome
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| 49,040
|
OQ348136.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
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2023-04-10
|
SC/C3-32.18/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,037
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona curzoniae
| null |
2021-08
|
SAMN32394778
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PRJNA901878
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MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-32.18/2021 segment L, complete sequence
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CAGGTTTTCCACGTCTGCGCAATGGGGCTTCTCAAAAGTAAACCTCAAAAGCAGGAAGTCGTCATGCCAAGTGCACCTCCAGAATACAGACATATTATGGAGGTTGAGGGTACCTCTCTCTACCCCAAGATCTGCAGAAATTGCTACAAGACCAATGGTGTGATTCATTGTGGCAATCATTACCTCTGCAGAAAGTGCCACCTCATGTTTCTGAGATACAGTTCCAACTGCTGTGTCTGTGGAGGTGAACTTCCCAAAAACTTTGAGCTTAGGCGACCAGACTTTCTTGATTAACCCACAAAGTGGGCCCCGTGGCCTCCCCGAAAGGGGAGGCCACGTGGGCCCAGCCACCGTGTCGTGCGCACGGTGGCTTCTTTGGTTTATTCAACCTCTATTGCATCTGGCTTGTCATGTCTGTTTTTGAATGGGGAGCACAGTGTCCCACGATAGGAGTACTTTCCACCCTGACTAGGAGTGATAAAGGTTCCTAGAGATGCAATGAACCTGATTTTGCTTTGCCCTACTGTGTAGAAGTCTTTTGTGCTTTTATTTAAYTCTTGTCCCAGTCTTTCAATGCCTTCTGGTGTGAGTTTGTCTAAGATGTATTCAAATTGCTCCTCTGGAAGTCTTGCAATCATGGTCTTTGACTCATCAGTCTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCATTGACCAAGTCCAAAATTAATTTTGATCTATCATTTGTATCCAAACATAAAATCCATCCAAGCTTTATTTTCCTTCCGCTCCCCAGTTTAAGGTGATTAGCATGTAGAACCGGCGTGAAGTCCTCTACCTGATCCTCTATGAGAGCAACGGACACAGCCATCTCAGAGGGTGTGAATGCTTCTTTCTTTATGGATAGACTAGCATATTGAACAGTATTTGCAGGGATCCCCAACATACAATTCARGAATTCACCATTACACACAAAAATGGGRTTGTCATCAATTACCATTTGTAGTAARCTAATCGCCGTAGTGGAGGTCTGAGATGAATTAGACGTAAATACCTCCATGTAGTTGATTCTAGTTACCTGAAATTTTGTAGTTTTAGTTCTACTTTCATAAACTAAGAAAGTCGCATCAACATTCAAAGCCAAGGTTGTTTTTAGAAATATTTTTAACTGAGTGACAGATTCTACAAATTTTATCTTGATTGTCAGTTGGATCGTTTCTCCTTCCATTAGACAYTCAAAATTATCAGAAAAACTTAGGTTGGAATTATAACATGCTGATAGTCTACTTATCTGAGATTCTGATTCTTTTGAAGGCAAGCACTCAATCAGTTCATAACCAAATGTAGTGTAAGAGGACACTAAATGCTGAATTTTCATCAATCCTGTGTAATTCTTTTTGACAACCATCCAAATGAAGTGCTGCAATTGGCCAAAGGTTGTGAAGACATCAAGCGTGGCCTCTCCCAACAGGTCACCATCATATGAGTCTAGATTYTTAATCCAGCTAGAACTGATTAAACAGGGACTTAAGAAGGATTTCATACTCATTTCTCTCTTCATTAATTCCATACCATGACTTGGAACTGGTTTCTGTATCTCCAATATGATACCTTCACTTCTTCTGCCGTGATTTTGAACCATATCATACTTTGAGATGATGTATTCTGAAGTTCTATTATATCTCATTAATCGACTTAATAATTTAAGAAATGTAAGCTTCAACTCAATAGTGATACATGTGTCAAGGGCTTTCTGCCTAGGTTGCCAAGATAGTTGACTCACCTGCCTTTCTGTTAAGTAAGGCTCTATAAATTTGTTGAAAACTTCAGCATGGTTTCTTTTAAGACTGTATAAGACTTGATGTATTGAGGCTCTGTCTTGAAGTCCTGCTTTCTTTTCATAAACCCAGCAAGAGTGTGAAGATGTTTTCTGGCTAATGAGTCTAGCTGCTTTTGTGATAGGATTGGTTATTTCACCCAAGACCCAAGGGCCATTTTCTATAGCACTCAATAAATACATACAGACTATATCATCGTTCAATGATCTCTTAAACTGCAGTCGCTCACCATTTACATGTTCACAGCAGCTAATTTGGATACACTCACAGTCTTTATAATAAAGCCATTTCAAAGAAAAACATTTCTTTTCCTCACCTCTAACACATTTCGACCCTAGAGACTCACATAGCCCTGTGAATCCAGATGCAACGCAACTTTGAAATGCAGATTTTCTAAGACTATCTGAAAGAGCTTGCTTGGCACCACTTGAAAAATTCTTAGTTAACCTATTCTGCAAGACTTTAACTAATGGCGGAGCTTCAGATTCTTCAACCACCGTTGTCATCTTAAGAAGCTTACTCCTTAGTATCAATCTTAGAGGAGCAATCTTTGTAGGACAAAGCCAATGATTGAAACTCAGCTTTAAGTCAAGCCCATATTTATCAGAGACATATGCTGTGATTCTGCCTTCCTCTTCCAAAGCTGATTGGATGAATTCTTCAAACTGAAAGCCTGAGAGAAGTTCATGATAAAGCTGTTTAGCAGCCAGACGATAATCTTTCTGAAGGTTCATACTCAGCTCAACAGATCTCTGAATCCTATAAGACCTCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAGATGGGACATAACCTGCATAATTTAGCAATTTATGCATACGACGTATTGAAGAGTTTATCAGGTAAATTGGCACTCCATTGGCACAACACTGGTCCATAATTGTGTCAATTGTGTCTATCAACTGTTCAGGATCTTTGCACTTTAGATTATGAAGAGATGCCAATGTAAACTTGCTTATTAAGGGAACTTCCTCTGACCAAATGAAGAACCTCGATTTAAACTCTCCACAAAAGGATCCTAAAACAGACTTTGGACTTACATATTTGTTTAATAGTTCTGACAACAGTTTATGTATCTCAAGTAAACACAAAATTCTTTGTGTATTTTCCAAGTCCATGGCATCAAGGTCAATCATCATGATCTCATCATCACTAGAAGTAAATGATCTACAGTTTAAACCTAGCATCAATTTCAAACAGGCATGTATAAAATTTTCTGTTATCAACCCATAGAAATCAGAAGCATTGTGAAGGATACCTTGTCCCATGTCAAGCACTGAAGTAAAATTACTAGGGATTTTTTCTTTCTTCATCAGCTCTTTAAGGAAGGAGAAGGTTGGTGAACAACTATTCTTCTTCTCCAAAAGTTTTAACTCAGCACTTAAATATGACTCCAAATATGATNNNNCACAGAGATAAGGAACTTCAACCCTCTTATGCAAGTGCCACAACAAAAGTGTGTTGACCTCATCTTTGCTGAGGGAGCTGCCATCAGGTTGTATAAGGTTTAAGCCAGCTAATAGTGCAATGAACGCTGCAGGCGACATGTGTGGCCCCCATTTTGAGTGATCCATAGAATACACACACTTGTCCCTAACAACCCAGTTCTTCATGTCTTCAACAGCACTGACAAACATATAGTCGTCATTTAGACATGATCCTTTRAAATTCTTAGTCAAAGTCTCAAAATAGTCTTCAATTAACCTTGTATAGAGCTTTGTGTTGATGTCTCCCACATACAGTTCTCTGTTTGAACCAACCTGTTCTTTGTAAGATAAACCAAAGTAAAGTGTGTCTGTTCCTGGTCCAGTCACTTCATACTGAGATGGCTTGTCTGATGAGTAGAATATCAAGTTCTTTAATGTAGGTAACTGCAATTCACACATCATCAACTTTTTACTGAGGGCCTCAGAATTGGAGGTTCTCTCTGTAATTCTAGACTGATCTCTAATCTTTTTAACATTTTGTTGATATTTGTTTTGGGGTCCGCTTGTATGACTATATGCTCCATGTATTTTATTAGCTCCAAGATTTACTATGAGAGAAATAAAACAAGTCTTATAATCTTCATTATAGTAACAGTGAGTTGTGAAATTCTTCAARGTATCTTCTATCAATGTTTCAGCTTTAGGCTTTTCGAACATGAGATCGCTATTTTTATAACGATCACAAAATGTCTTTAGTGAAGATTCAGAGATTAAGTTAATGTCTATTTCAGAAGCCTCATGATATTTTAGCTCATGCTGTATATAATTAGCCTCTGAGAGGCTTAATCCATTTTGCACCCAAAATTGCTTAGTATTTGTGAAAGGTGTCTCATTCAATAGATTGTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTCCTTTGACAAGAGTGAGAATAATCTTTGCTCATTTTCTTCTGAGAGTGTCACATYTGAGGTAATTCCTTTCAACAATTCTTCAACCTTCTTAAAGATTGGCAATCTTCTAAGGTCTGAACGAAATGCACTTAAACTCAACTTCTCATACAAATTAAGCATTGAGGCTGAGAGCACAGTATCAAAATTGTACTCTGTCTTTTCATCAAGCCTAACCACTGATGATTTGTTTGATGCTAAATCTAAAATTGTGGGACTGATAGTTGGATAGTTAGGGTTCTTTTTCAACACCTTTGAAAACCCTTCAATCTGGCCRTTGTTAAACATAAAGAATAAACACTTCAAGAGTTTCTTATCAATGCCTGGTCTAACTGATGTTTGTGGTTCCTTGCTGAAGAAGAAGAAAAGCTCATTTAAAAGCTTTGTTTGTCTATCATGGACACTATCAAGATTTGAAATGGGTTCTTGTCCGATGAGAGAAGAAAACTCTATCTTAGGCTCAAGATATTTTTCAAAGCACTTGATCATGTCAGTCTTTCTGTCAGGGGTTTCTTTTGTGATATAATGACATAAATATGAGATGTTCAGTACGAATTTAAAGTAAGCCACCCTGAAACCGTTTTTTTCCAATTTGCTTTGAAGTTTCTCTAGCATTGTTAAAAGAACCAAGAGAATCAGTTTCTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN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| 16,812
|
OQ348137.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C3-32.2/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,039
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona curzoniae
|
lung
|
2021-08
|
SAMN32394779
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-32.2/2021 segment L, complete sequence
|
CAGGTTTTCCACGTCTGCGCAATGGGGCTTCTCAAAAGTAAACCTCAAAAGCAGGAAGTCGTCATGCCAAGTGCACCTCCAGAATACAGACATATTATGGAGGTTGAGGGTACCTCTCTCTACCCCAAGATCTGCAGAAATTGCTACAAGACCAATGGTGTGATTCATTGTGGCAATCATTACCTCTGCAGAAAGTGCCACCTCATGTTTCTGAGATACAGTTCCAACTGCTGTGTCTGTGGAGGTGAACTTCCCAAAAACTTTGAGCTTAGGCGACCAGACTTTCTTGATTAACCCACAAAGTGGGCCCCGTGGCCTCCCCGAAAGGGGAGGCCACGTGGGCCCAGCCACCGTGTCGTGCGCACGGTGGCTTCTTTGGTTTATTCAACCTCTATTGCATCTGGCTTGTCATGTCTGTTTTTGAATGGGGAGCACAGTGTCCCACGATAGGAGTACTTTCCACCCTGACTAGGAGTGATAAAGGTTCCTAGAGATGCAATGAACCTGATTTTGCTTTGCCCTACTGTGTAGAAGTCTTTTGTGCTTTTATTTAATTCTTGTCCCAGTCTTTCAATGCCTTCTGGTGTGAGTTTGTCTAAGATGTATTCAAATTGCTCCTCTGAAAGTCTTGCAATCATGGTCTTTGACTCATCAGTCTCAATTAAAGAGGTCACCAGTTTGTCTGCATCTTCATTGACCAAGTCCAAAATTAATTTTGATCTATCATTTGTATCCAAACATAAAATCCATCCAAGCTTTATTTTCCTTCCGCTCCCCAGTTTAAGGTGATTAGCATGTAGAACCGGCGTGAAGTCCTCTACCTGATCCTCTATGAGAGCAACGGACACAGCCATCTCAGAGGGTGTGAATGCTTCTTTCTTTATGGATAGACTAGCATATTGAACAGTATTTGCAGGGATCCCCAACATACAATTCARGAATTCACCATTACACACAAAAATGGGRTTGTCATCAATTACCATTTGTAGTAARCTAATCGCCGTAGTGGAGGTCTGAGATGAATTAGACGTAAATACCTCCATGTAGTTGATTCTAGTTACCTGAAATTTTGTAGTTTTAGTTCTACTTTCATAAACTAAGAAAGTCGCATCAACATTCAAAGCCAAGGTTGTTTTTAGAAATATTTTTAACTGAGTGACAGATTCTACAAATTTTATCTTGATTGTCAGTTGGATCGTTTCTCCTTCCATTAGACAYTCAAAATTATCAGAAAAACTTAGGTTGGAATTATAACATGCTGATAGTCTACTTATCTGAGATTCTGATTCTTTTGAAGGCAAGCACTCAATCAGTTCATAACCAAATGTAGTGTAAGAGGACACTAAATGCTGAATTTTCATCAATCCTGTGTAATTCTTTTTGACAACCATCCAAATGAAGTGCTGCAATTGGCCAAAGGTTGTGAAGACATCAAGCGTGGCCTCTCCCAACAGGTCACCATCATATGAGTCTAGATTTTTAATCCAGCTAGAACTGATTAAACARGGACTTAAGAAGGATTTCATACTCATTTCTCTCTTCATTAATTCCATACCATGACTTGGAACTGGTTTCTGTATCTCCAAYATGATACCTTCACTTCTTCTGCCGTGATTTTGAACCATATCATACTTTGAGATGATGTATTCTGAAGTTCTATTATATCTCATTAATCGACTTAATAATTTAAGAAATGTAAGCTTCAACTCAATAGTGATRCATGTGTCAAGGGCTTTCTGCCTAGGTTGCCAAGATAGTTGACTCACCTGCCTTTCTGTTAAGTAAGGCTCTATAAATTTGTTGAAAACTTCAGCATGGTTTCTTTTAAGACTGTATAAGACTTGATGTATTGAGGCTCTGTCTTGAAGTCCTGCTTTCTTTTCATAAACCCAGCAAGAGTGTGAAGATGTTTTCTGGCTAATGAGTCTAGCTGCTTTTGTGATAGGATTGGTTATTTCACCCAAGACCCAAGGGCCATTTTCTATAGCACTCAATAAATACATACAGACTATATCATCGTTCAATGATCTCTTAAACTGCAGTCGCTCACCATTTACATGTTCACAGCAGCTAATTTGGATACACTCACAGTCTTTATAATAAAGCCATTTCAAAGAAAAACATTTCTTTTCCTCACCTCTAACACATTTCGACCCTAGAGACTCACATAGCCCTGTGAATCCAGATGCAACGCAACTTTGAAATGCAGATTTTCTAAGACTATCTGAAAGAGCTTGCTTGGCACCACTTGAAAAATTCTTAGTTAACCTATTCTGCAAGACTTTAACTAATGGCGGAGCTTCAGATTCTTCAACCACCGTTGTCATCTTAAGAAGCTTACTCCTTAGTATCAATCTTAGAGGAGCAATCTTTGTAGGACAAAGCCAATGATTGAAACTCAGCTTTAAGTCAAGCCCATATTTATCAGAGACATATGCTGTGATTCTGCCTTCCTCTTCCAAAGCTGATTGGATGAATTCTTCAAACTGAAAGCCTGAGAGAAGTTCATGATAAAGCTGTTTAGCAGCCAGACGATAATCTTTCTGAAGGTTCATACTCAGCTCAACAGATCTCTGAATCCTATAAGACCTCGAACCATTTGTCCAGTCTGTGCTATCAGTGTCATAGTAGCGATGAAATGGAGATGGGACATAACCTGCATAATTTAGCAATTTATGCATACGACGTATTGAAGAGTTTATCAGGTAAATTGGCACTCCATTGGCACAACACTGGTCCATAATTGTGTCAATTGTGTCTATCAACTGTTCAGGATCTTTGCACTTTAGATTATGAAGAGATGCCARTGTAAACTTGCTTATTAAGGGAACTTCCTCTGACCAAATGAAGAACCTCGATTTAAACTCTCCACAAAAGGATCCTAAAACAGACTTTGGACTTACATATTTGTTTAATAGTTCTGACAACAGTTTATGTATCTCAAGTAAACACAAAATTCTTTGTGTATTTTCCAAGTCCATGGCATCAAGGTCAATCATCATGATCTCATCATCACTAGAAGTAAATGATCTACAGTTTAAACCTAGCATCAATTTCAAACAGGCATGTATAAAATTTTCTGTTATCAACCCATAGAAATCAGAAGCATTGTGAAGGATACCTTGTCCCATGTCAAGCACTGAAGTAAAATTACTAGGGATTTTTTCTTTCTTCATCAGCTCTTTAAGGAAGGAGAAGGTTGGTGAACAACTATTCTTCTTCTCCAAAAGTTTTAACTCAGCACTTAAATATGACTCCAAATATGATTCTACACAGAGATAAGGAACTTCAACCCTCTTATGCAAGTGCCACAACAAAAGTGTGTTGACCTCATCTTTGCTGAGGGAGCTGCCATCAGGTTGTATAAGGTTTAAGCCAGCTAATAGTGCAATGAACGCTGCAGGCGACATGTGTGGCCCCCATTTTGAGTGATCCATAGAATACACACACTTGTCCCTAACAACCCAGTTCTTCATGTCTTCAACAGCACTGACAAACATATAGTCRTCATTTAGACATGATCCTTTGAAATTCTTAGTCAAAGTCTCAAAATAGTCTTCAATTAACCTTGTATAGAGCTTTGTGTTGATGTCTCCCACATACAGTTCTCTGTTTGAACCAACCTGTTCTTTGTAAGATAAACCAAAGTAAAGTGTGTCTGTTCCTGGTCCAGTCACTTCATACTGAGATGGCTTGTCTGATGAGTAGAATATCAAGTTCTTTAATGTAGGTAACTGCAATTCACACATCATCAACTTTTTACTGAGGGCCTCAGAATTGGAGGTTCTCTCTGTAATTCTAGACTGATCTCTAATCTTTTTAACATTTTGTTGATATTTGTTTTGGGGTCCGCTTGTATGACTATATGCTCCATGTATTTTATTAGCTCCAAGATTTACTATGAGAGAAATAAAACAAGTCTTATAATCTTCATTGTAGTAACAGTGAGTTGTGAAATTCTTCAAAGTATCTTCTATCAATGTTTCAGCTTTAGGCTTTTCGAACATGAGATCGCTATTTTTATAACGATCACAAAATGTCTTTAGTGAAGATTCAGAGATTAAGTTAATGTCTATTTCAGAAGCCTCATGATATTTTAGCTCATGCTGTATATAATTAGCCTCTGAGAGGCTTAATCCATTTTGCACCCAAAATTGCTTAGTATTTGTGAAAGGTGTCTCATTCAATAGATTGTTATTCTGTTGGGACACCCTASCTGAAGTTTTCTGTGAATCTTTGTTATCCTGCGCCTTTTTGTACTCYTTTGACAAGAGTGAGAATAATCTTTGCTCATTTTCTTCTGAGAGTGTCACATYTGAGGTAATTCCTTTCAACAATTCTTCAACCTTCTTAAAGATTGGCAATCTTCTAAGGTCTGAACGAAATGCACTTAAACTCAACTTCTCATACAAATTAAGCATTGAGGCTGAGAGCACAGTATCAAAATTGTACTCTGTCTTTTCATCAAGCCTAACCACTGATGATTTGTTTGATGCTAAATCTAAAATTGTGGGACTGATAGTTGGATAGTTAGGGTTCTTTTTCAACACCTTTGAAAACCCTTCAATCTGGCCGTTGTTAAACATAAAGAATAAACACTTCAAGAGTTTCTTATCAATGCCTGGTCTAACTGAYGTTTGTGGTTCCTTGCTGAAGAAGAAGAAAAGCTCATTTAAAAGCTTTGTTTGTCTATCATGGACACTATCAAGATTTGAAATGGGTTCTTGTCCGATGAGAGAAGAAAACTCTATCTTAGGCTCAAGATATTTTTCAAAGCACTTGATCATGTCAGTCTTTCTRTCAGGGGTTTCTTTTGTGATATAATGACATAAATATGAGATGTTCAGTACGAATTTAAAGTAAGCCACCCTGAAACCGTTTTTTTCCAATTTGCTTTGAAGTTTCTCTAGCATTGTTAAAAGAACCAAGAGAATCAGTTTCTCTATTCGGGTCTTTAATGGCTCTATGAGTTTACCAATCAACTTAGTCATGTAAAACCCATTAACTTGAGCCATTACTAAGTATCTCACATTCTGCAATAATATCTGAGTTCTTTTACTCATAGAGCACGATATTAAGATTATAAGTAGTCTTAAGAGTGATTGAATTTCTATAAGTTGAACCTCTTCTTCATCACCGTCAACCAAGAACAAGTCTTCTATTAAAGATATCAAACTCACTTCCAATAACTGTAGCACGCTTTGACTAAAAATTGGAGAAAAGAACCTTGTTGGTTTAGCGCCAAAAGAAACACAAGTTTTATCATCAACAATGGAAAATGTCTTTGAGCCTTCACCTGTTGTCATATAAACTAAATGAGCATCAAACCATATAGGTTGAAAAAAGCACTCTTTAGGAACTGCAGTCTTACTGCTTTTAACTAGCTTACCTGTGTTGATTTTAGGGACACTTCTTGTCTTAATACTATTAACCAAAGCAAGACATATCCTAGACATACATGTGTATGCAATATTTCCGTTGTAGAATACAAATCTAGAAAGTTTGTAGATTCCTTCTTTCAGCAATTGGAGATTTTTAACACCTAGGTCAGTCTTGACATTAAGAATCATCTCCTCTTCAGAGCTGAACAATAGTCTTACCGATTCATCTGTCTCTACATTAGAGATCGGCTCTGGGTTCACCATTTGTTCATAATGTACCTGTATTGGAGTCTGATCGGGAAGACAGTCTTGAATCTTTAATACCATAGACTCAATATGAGATTTGAGTTTTTCTTCTGTTTGGTACTCTAGTAAGGAAGACAGAAGTTCTATYACTGAAGAAAAGCTTATGAGCTCATCTTCTAGTAGGTATGATTTGCAACCTCTATGCCACCTTTTGCATTTACTCAACAAATTTCTTTCTTGGACCAATAACTTCAAGTCAATAAGTCTATCTCCGACAGATTTTAGCAATCCACCTGTGAAATTAAACCTCAAAACCTCTTGATCAATAATACCAGACATAAAACTCTGGTAAATGTCAGTTAGTCTTAAAATGTCTAACACAATYAAGTTGTTTTTCTTAGTGTTCACTATGTTTTTTGACTTCAATTTATTTAACAAGGGCAATTTCCCAACATACATTAAATCTTTAATATCCCAGTATCTCTCCACCAGCCTACATAAATACCTCATTAAGGTAATACTAGCTCCCGAAAATGTTGTTACATTAAGATATTCTGTTGCATACTCTTCAAAGATGTCTGCACTTGTGCCAAATTTGAAATTTTCACTTTCAGTCTCGGTTTTTATCTTTGACATAGCAAGTAATTGTATTTCCGTTAGATACTCTTTGACTGATTCCAGGTTCATATCATCAGATCCAATCTCCTCAAAGAAGGATAATATTGAGTTTTTATACTCTGATTCTGACATAGACAGAAGTTGCAAGCCTAAATCTTGCCCATGACCTGATAATGAATCTATCAGTCTGTCATACTCCATGTCTTGCACTGTTGAATCCACAAGATTATAATATTTTGAATATTTCTCRAGCTTGTATCTCAGCTCAGTTATCAAGTAATCCTCAACGATTCCGTTTTTATARTTTCTTCTTCCATCTACAAAAATTTTTAGAGTCCATCCAGTTTCTCTTTCAAATAGTGACTTAACTCCATCATATTTCACCCTGTCTAGATTCCATTTCTTTGAAAATTGGTCGTCTTTGACTCTAACAAAGACTTCTAGCACTGATAAGGTCTTATTTCTATAGTCAAGTTTGTAACCATCTGGAGTTAGCAGATTAACATCTGGAAAGTTTGGCTGTATATGTTTGACAACATCTGAAAAACTTTTATCTTGATAATTGAATTCCATCTCATGTACTTGACAAGCGTCCAACTCAATGAGCCTAGCTATCAATTTTATGCCTTCAACAAAAACAGCAGCTGGATTGTTCTGTGATAAGAATCTGTTCAGCTGTGCTGACATAAAGGGGACACCCTTGAAGGCTTTGGCTGCCAAAAACTTGAGAGCATCGAGCTCGTCTGAGTCTTCCATGAGTGGTTTGTGAACTGACTCCTCAAAACCTGGGAATC
| 16,813
|
OQ348138.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C3-30.2/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,056
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona sp.
|
lung
|
2021-08
|
SAMN32394773
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-30.2/2021 segment L, complete sequence
|
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| 16,814
|
OQ348139.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C3-30.18/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
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|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona sp.
| null |
2021-08
|
SAMN32394772
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-30.18/2021 segment L, complete sequence
|
GCACCGGGGATTCCCAGGTTTTCCAAGTCTGCGCAATGGGGCTTCTCAAAAGCAAGCATGCGAAAGAAGAAGGAATCATCCCATCAGCACCTCCTGAATATAGACACATCATGGAGGTCGAGGGAACTTCTCTTTACCCAAAAGTCTGCAGAAACTGCTACAAAACGAATGGTGTGATTCACTGCACAAATCACTATCTTTGCCGTAAATGTCACCTCATGTTCCTCAGATATAGCCCCAACTGCTGTGTCTGTGGAAATGAGCTTCCAAGGTCCTTTGAGCTTAGAAGACCCGACTTCCTAGACTAACCCACAAAGTGGGCCCCGTGGCCTCCCCGAAAGGGGAGGCCACGTGGGCCAGCGCCGGCGTCTCCCTGCGCACGGGGGAGACTCGGATGTACTTACTCCACTTCGATGGCGTCGGGCTTGTTGTGTCTTTCACTGAACAAGGAGCACAGCGTTCCCCTATAGGAATATTTTCCTCCTTGGTTTGGGGTTACAAAGGAATTCAGCGAATTTATAAACCTTATTTTCCTCTGCCCTACTGAGTAGAAGTCTCTGTTGTCCTTATTTAACTCTGCCCCCAATCTCTGTCTGTTTTCTGCACTTAGAGCTTTATCAATGGTTTCAAATTGATCTTCTGTCAACATTGAGATGAGAGCTCTGCAGTGTGTGCTTTCTATGAGTGCGTCAACATATCTGTCTGGGTTTTCCTGAGCTGAGCGCATTTGCATTTCGCGCCTCTGTCCAGCTTCAATTGACATCACCCAACCTAACTCTATCTTGTTGCCAATACCTAAAAGTAAGTGGTCTGCATAAATCATAGGAGTGAAATCTTCTTTCTTATCCTCAGTGTAGTTCACTGAGACTGCAATCTCTGAGGGCCTAAATGAATCTCTTTTAAGGTGCACATTCACATACTGAACCGTTCCTTTCTGAAGCCCCAAGAAGCAATCCATAAACTCGCCAGAGTAAATGAACTGAGAATTGTTGTCCACAACCATTTGAAGTAGGCTCATCGCGCCACTAGCAGTCTGTGAAAGATTGCCAGTGAAGACTTCCATGTAGAAGATGTCACAAACATTAAGCTTCACTGTTTTGGATTTTGACTCAAATCCAATCAAAATAGCATCAGCATTTAAAATAAGCTGGGTATTCATCCACAATTTGAGAGCACTGACAGATTCTGTAAACTTTATCTTTAGAATCAGATTTAGCTTTTCTCCTTCCATAAAACACTCAAAATTGTCAAGAAATGAAAGGTTAGAATTATACAAAGAGGACAGATACCTCACCTGGTTCTCAGACTCTTTAGATGGCAAACACTCAGTCATTTGATAATTAAAAGTTGTGTATGAGGAAACTAAGTCTTGGATCTTCATCAAGCCAGAATAACCCTTTTTGGCAACCTTCCAAATGAAGTGTTGGAGCTGGCCAAAAACTGAAAAAACATCTAGAGATGCCTCACTTAATGCTAATTCATTGTAAGAATCTAGATTCCGAATCCAGCTTGAGCTTAATAAACAAGGGCAGAAAAAGGATTTTAACGCCATCTCACCTCTCATTAAGTACATGCTCATGGTGGGTGTTGGTTTGCCAAGCTGTAGGGGCTCTCTATCAGTTCTTCTGGTGTGCGCTTGAATGGCATCATACTTTGAAATCACGTATTCAGTTGATTTAGAATACCTCATCATCCTACTCAACAACTTTAAGAAACTCAAATTTAGTTCAATTGTGATGCAAGTATCCAACGCCTTTTGTCTTGGTTGCCAGGAGAGTTGACTAACCTGCCTCTCAGTTAAATATGGCTCTATGAATTTATTAAAAATCTCTGTGTGATTCCTTTTCAAACTGTACAATACTTGATGTATCGATGCTCTATCCTGCAGTCCAGCTTTCTTTTCATAAATACAACATGAGTGTGAGGATGTCTTCTGCGCCACAATTCTACTTGCTGCTGTCACTGGTAAACTCACCTCACCAAGGACCCAGGGACCATTCTCTATCGCACTCAATAAGTACATACATAAGATGTCATCAGACACTGACCTCTTAAATAGTAATCTATCACCAGTCAGGTGTTCACAGCAATTCACAGGTTCGCAACTGCAATCTTTGTGGTATAACCACCTCAGACTAAAACACCTTTTCTCCGTGCCTCTCACACACTTAGATCCTAGAGATTCGCAAAGTCCAGTGAAGCCTGATGCTACACAGCTTTGAAACGCAGATTTTCTTAAACTGTCTGATAAGGCCTGCTTGGCTCCGCTTGAAAAATTCTTTGTGAGCCTGTTTTGTAACACTTTAACCAACGGTGGTGCATCAATCTCCTCCACAACAGTTGTCATCTTCAGCAATTTACTTCTCAAAATGAGCCGCAGGGGAGCAATTTTTGTTGGAGATAGCCATGCGTTAAATTTAGCTTTTAGCTCAAGATTATACTTATTTGAAGCATAATTGGTGATTTTTCCTTCTTCCTGTAGTGCAGATTGGATGAATTCTTCAAATTGGAATCCTGATAATAACTCGTGATATAGTTGTCTAGCTGCATGTCTAAATTCTTGACTCACTTCTTGATTTATTTCAACAGTTCTTTGGATTCTATACGATCTTGAGCCATTCGTCCAATCTGTGCTATCTGTGTCATAATAAGAATGAAATGGTGATGGGACGTATCCTGCGTAACCCAAAAGCTTATGCATTCTTTTAATACATGAGTTTATCAGGTATATGGGCACCCCATTTGCACAACATTGGTCCATGATGGTGTCTAATGTATCAATTAGCTGTTCAGGATCTTTACATTTAAGGTTATGTAATGACGCCAGTGTGAATTTGGTTATAAGAGGAACTTCTTCTGACCAAATAAAGAAACGTGACTTGAACTCTCCACAAAATGATCCCAAAACTGACTTTGGACTAACATACTTGTTGAGGAGCTCTGATAAAAGCTTATGAATTTCTAGAATGCACAGGATTCTATGACTGTTCTCCAGATCAACAGCATCCAGATCAATCATCATTATTTCATCATCACTAGAAGTGTATGATCTGCAATTTAAACCCATCATTAATTTGAGACACGAATGGATGAAGTTTTCTGTCACTAAGCCATAGAAATCGGAAGCATTGTGAAGAATGCCTTGCCCCATATCAAGCACAGATGAAAAGTTGCTAGGCACTTTCCCATCTTTGAGAAGTTCCCTAACATAGGTGAAGGTTGGTGTGTATTTGCCCTTTTCTTCCATGATTTTCAGTTCACTATTTATGTAGGATTCAAAGTAAGACTCCAAGCACAAATATGGAACCTCCACTTTCTTATGCAGATGCCAGAAGAGTAAGGTATTCACCTCCTCCTTACCCAAAATAGTTCCGTCTGGTTGTAAAAGGTTCAAACCACCTAAAAGAGCAATGAAGGCAGCTGGTGACATGTGAGGCCCCCATTTTGAATGATCCATTGAGTAGACGCATTTATCACTTACCACCCAGTTCTTCATATCTTCTAAGGCCATACTAAAGCTCCTATCATCATTCAGACATGATCCTTTAAAATTGCTCGTCAAGGTTTCAAAGTAATCTTCTATCAGTCTGGTATATAGCTTCGTGTTGATATCCCCAACATACAGCTCCCTATTTGAACCCACCTGCTCTTTATAGGATAGCCCAAAGTATAGATGATCCGTCCCTGGTCCTGTAACATCATACTGTGAAGGCCGGTCAGAAGAATAAAATATTAAATTCTTTAATGTTGGAAGTTGCAATTCACACATCATTAGCTTCTTACTTAAGGCCTCAGAATTAGAAGTTCTCTCTGTTATCCGCGAGCGATCTCTTATATTCTTCACATTCTGCTGATATTTGTTTTGAGGACCACTTGTGTAGCTGTAAGCGCCATGAATTTTATTAGCGCCCATGTTAACAATCAAGGATACGAAACATGTTTTATAATCCTCCTCATAGTAGCAGTGTGTAGTAAAATTCTTCAATGTGTCTTCTATTAACGTCTCGCTCTTTGGTTTATCAAACATAAACTCACTATGTTTAAACCTATCACAGAAGGCTTTCAGAGAGCATTCAGAAATGATGCTCAAGTCAATCTCGGATGCCTCATGGTACTTTAATTCATGCTGTATAAAATTGGCTTCTGGCAGTGTCAAACCGTTGTCAACCCAGAACTTTTTTGTGTTGGTGAATGAGGTGCTGTTAAGTAAGTCGTTGTTTTGAGGGGTCAACTTCATCTGACCTGGTTTCGTGCTTTTTTCACTCTCAGCTATCTTGTATTCTTTCTTCAGCATAGATATGAACTTCTCTTCCTCTACATCACCTAAGGATCCTGCTTCCATGGAGCCTTTTAGCAGTTCTTCAACCTTCTTGAATATTGGTAGTCTTTTCTTGTCAGAGTGGAACACACTATTGTTCATCTTTTCATACAAGTTTAATAAGGAAGCAGATAGAACAGTCTCATAATTATATTCCTCTTTATCAGCCACCCGCACAACTGAGGACTTGTTCGAAGCTAGGTCCAAAACTGTAGGGCTTATTGTTGGGTAATTGGGGTTCCTCTTTAATGTTCTAGAGAACCCTTCAATTTGCCCTGAGTTGAACATGAAGAAAAGACATTTTAAGAGTTTTGCGTCAATACCAGGTCTGCTTGATGATTGAATATTCTTACTAAAGAAGAAACTCAATTCTGCCAATAGCTTTTTTTGCCTTTCTGACGGTCCATCGAGATTAGAGATAGGTTTTTGATTTACAAGCTTAGAAAACTCTATCTTTGGCTCTAAGTATTTCTCAAAACATTTTACAATATCTGTCTTCCTATCTGGTGTTTCCTTTGTGATATAGTGACAAAGATAAGATATGTTTAACATAAACTTAAAATATGCTACTTTGAATCCATTCTTATTCAATTTGTTTTGGAGCTTGTCCATAATACATAAAAGGACAAGAAATATCAGCTTTTCTAATCTAGACTTCAGTGGTTCAACAAGTTTTGTAATT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|
OQ348140.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C3-30.4/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,056
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona sp.
|
kidney, abdominal cavity
|
2021-08
|
SAMN32394774
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-30.4/2021 segment L, complete sequence
|
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| 16,816
|
OQ348141.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C3-17.18a/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,056
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona cansus
| null |
2021-08
|
SAMN32394766
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-17.18a/2021 segment L, complete sequence
|
GCACCGGGGATTCCCAGGTTTTCCAAGTCTGCGCAATGGGGCTTCTCAAGAGCAAGCATGCAAAGGAGGAGGAGGTCGTCCCGACAGCACCACCTGAATACAGACACATCATGGAGGTCGAGGGGACTTCTCTCTACCCAAAGGTCTGCAGGAACTGCTACAAGACAAATGGTGTGATTCACTGCGCAAATCATTACCTTTGTCGCAAATGCCACCTCATGTTCCTAAGATACAGCCCTAATTGCTGTGTCTGCGGAAATGAGCTTCCTAAGTCCTTTGAGCTCAGAAGACCTGACTTCCTAGATTAACCCACAAAGTGGGCCCCGTGGCCTCCCCGAAMGGGGAGGCCACGTGGGCCGGCGCCAGCGTCTCCCTGCGCACGAGGGAGACTCTGGCGYGCTCACTCCACCTCGATGGCGTCAGGTTTGTTGTGTCTCTCACTAAACAGGGAGCATAGCGTTCCTCTGTAGGAATACTTCCCTCCTTGATTTGGGGTTACGAAGGAGTTCAGTGAACTGATGAATCTTATCTTCCTTTGTCCTACTGAATAGAAGTCTTTGTTGTCCTTGTTTAGCTCTGTTCCCAACCTTTCTCTGTTTTCTGTGCTTAGAGCTTTGTCAATAGCTTCAAACTGGTCTTCTGTTAACATCGAGATGAGGGTTCTGCAGTGTGTGCTTTCTACAAGTGCGTCAACATATCTGTCAGGGTTTTCTTGAGCTGAACGCACCTGCATCTCACGTCTCTGACTAGCCTCAATTGACATCACCCAACCTAACTCTATCTTATTGCCAGYGCCTAAAACTAGATGGTCTGCATAAATCATAGGGGTGAAATCTTCTTTTTTATCTTCAGTGTAATTCACTGAGATTGCAATCTCTGAGGGTCTAAATGAATCTCTCTTCAGGTGTATGTTCACATACTGAACTGTTCTTTCCTGAAGCCCTAAGAAGCAGTCGATAAATTCACCAGAATAGATGAATTGAGAATTGTTGTCTACAACCATTTGGAGCAGGTTCATCGCACCACTGGCAGTTTGTGAAAGATTGCTAGTGAAGACTTCCATGTAAAAAATATCACAGATGTTTAGCTTTACTGTCCTGGACTTTGATTCAAATCCAACTAAGATGGCATCAGCATTTAGAATGAGCTGAGTATTCATCCACAACTTGAGAGCACTAACAGATTCTGTGAACTTAATTTTCAGGACTAAGTTCAACTTCTCCCCTTCCATAAAACATTCAAAATTATCAAGGAATGAAAGATTGGAATTGTACAGAGAAGACAAAGATCTCACCTGGCTCTCAGACTCTTTAGATGGCAGACACTCAGTCATCTGATAGTTGAAAGTGGTGTATGAGGAGACCAAGTCTTGAATTTTCATAAGACCAGAATAACCCTTTCTCACAACCTTCCAAATGAAATGTTGTAGTTGACCAAAGACAGAGAAAATGTCTAGAGATGCTTCATTCAAAGCTAATTCATTATAGGAGTCTAAGTTCCGAATCCAGCTTGAACTCAATAAGCAAGGGCAAAAGAAAGACTTTAATGCCATCTCACCTCTCATCAAGTACATGCTCATACTAGGCGTTGGTTTACCAAGCTGAAGGGGCTCTCTRTCAGTTCTTCTGGTGTGCGCTTGTATAGCATCATATTTTGAAATCACGTACTCAGTTGATTTAGAATACCTCATCATCCTACTTAACAACTTCAAAAAGCTCAGGTTCAACTCAATTGTGATACAAGTATCTAGCGCCTTTTGTCTTGGTTGCCAGGAAAGCTGACTCACCTGTCTCTCAGTTAAATAAGGCTCTATGAATTTRTTAAAAATTTCTGCATGATTCCTTTTCAAACTGTATAATACTTGATGTATTGATGCTCTATCCTGTAGTCCAGCCTTCTTTTCATAAATACAACATGAATGTGAGGATGTCTTTTGTGCCACAATTCTACTCGCTGCTGTCACTGGTAGACTCACYTCACCAAGGACCCAAGGACCGTTCTCTATCGCACTTAACAAATACATGCATAAAATATCATCAGACACTGATCTCCTGAATAGCAGTCTATCACCAACCAGGTGCTCACAACAATTTACAGGTTCACAATTGCAGTCTTTATAGTATAACCACYTTAGACTGAAACACTTCTTCTCTATACCTCTCACACACTTAGAACCCAGAGACTCGCAAAGCCCTGTGAAGCCTGATGCCACACAGCTTTGAAATGCTGATTTCCTTAAACTGTCTGATAAGGCCTGCTTAGCTCCACTTGAAAAGTTCTTTGTGAGCCTGTTTTGTAATACTTTCACCAATGGTGGTGCGTCAACCTCCTCTACAACAGTTGTCATCTTCAATAATTTACTCCTTAAAATGAGCCGCAGAGGAGCAATCTTTGTTGGAGATAGCCATGCTTTAAACTTAGTTTTCAAYTCAAGGTTATACTTATTTGAGGCATAATCAGAAATTTTTCCTTCTTCTTGTAATGCAGATTGAATGAAYTCTTCGAACTGAAACCCTGATAGCAGCTCATGGTATAGCTGTCTTGCTGCATGTCTGAACTCCTGACCGATCTCTTGACTCATCTCAACAGACCTTTGAATCCTATACGACCTTGAGCCATTTGTCCAGTCCGTACTGTCTGTGTCATAATAAGAATGAAAGGGTGATGGAATGTAGCCYGCATAACCCAAAAGTTTATGCATCCTTTTAATACATGAATTTATCAAGTATACGGGCACCCCATTCGCACAGCATTGGTCCATAATAGTATCTAATGTGTCAATTAGTTGCTCCGGATCTTTGCATTTGAGGTTATGCAATGATGCCAGTGTGAACTTGGTTATTAGAGGAACCTCTTCCGACCAAATAAAGAATCTCGACTTGAACTCCCCACAAAACGACCCTAGGACTGACTTTGGGCTGACGTATTTATTGAGAAGCTCTGATAAGAGCTTGTGAATCTCTAAGATGCACAAGATCCTATGACTATTTTCCAGATCAATCGCGTCTAAATCAATCATCATTATCTCATCGTCACTAGAAGTGTATGATCTGCAATTCAGGCCCATCATCAGTCTGAGACATGAGTGAATGAAGTTTTCCGTTACTAGTCCGTAGAAGTCGGARGCATTATGAAGGATACCTTGCCCCATATCAAGCACAGATGARAAATTACTAGGCACTTTTCCGCCCTTAAGTAACTCTCTCATATAGGTAAAAGTTGGTGTRTATTTGCCTTTTTCTTCTAAGATTTTCAACTCACTATTTATGTAAGATTCAAAGTAAGACTCCAAGCACAAGTATGGGACCTCCACTTTTTTGTGTAGATGCCAGTAGAGTAAAGTGTTGACTTCTTCTTTTCCTAAAACAGTACCATCTGGCTGCAAGAGATTCAGACCACCCAGGAGAGCAATGAATGCAGCTGGTGACATGTGAGGCCCCCATTTTGAGTGGTCCATTGAGTAGACACACTTGTCACTTACCACCCAGTTTCTCATGTCTTCTAAKGCTATACTGAAGCTTCTGTCATCATTTAAACATGATCCTTTGAAATTYTTCGTCAACGTCTCGAAGTAGTCCTCTATYAATCTAGTGTATAACTTTGTGTTGATGTCTCCAACGTACAGCTCTCTATTTGAGCCAACCTGCTCTTTGTAGGACAACCCAAAGTATAGATGATCAGTCCCTGGTCCTGTCACATCATACTGTGAGGGCCGGTCAGAGGAGTAAAATATTAAATTCTTCAATGTTGGAAGYTGCAGTTCGCACATCATGAGTTTTTTACTCAARGCTTCAGAATTAGACGTTCTTTCTGTTATTCGTGAGCGGTCTCTTATATTCTTCACATTCTGTTGATATTTATTTTGAGGGCCACTTGTGTAGCTGTACGCACCATGAATTTTGTTGGCACCCATATTCACAATTAGAGATATAAAGCATGTTTTGTAGTCCTCCTCATAGTAACAGTGTGTGGTAAAGTTCTTTAATGTGTCCTCTATCAGTGTCTCACTCTTTGGTTTATCAAACATAAACTCACTGTGTCTAAATTTATCACAAAAAGTCTTTAAGGAGCATTCGGAAACAATGCTTAAGTCTATTTCAGAAGCCTCATGGTACTTCAACTCGTGCTGTATGAAGTTGGCTTCTGGTAGTGTTAAACCATTGTCAACCCAAAACTTCTTTGTGTTGGTAAATGAGGTGCTGTTGAGCAAGTCATTGTTYTGAGGCGTCAAATTCACTTGGTTTGGTTTTGTGCCTTTTTCATTTTCAGCTATCTTATACTCYTTCTTTAACATGGAAATAAACTTCTCTTCCTCTGCATCACTCAAAGAACCTGACTCCATGGAACCTTTTAAYAGTTCCTCAACCTTTTTGAATATCGGTAGTCTCTTTTTGTCAGAGTGGAACACACTATTATTCATCCTCTCATATARATTCAGCAAAGAGGCAGACAGAACAGTCTCGTAATTATATTCTTCTTTATCAGCCACCCTTACAACTGAAGACTTGTTTGAAGCYAAGTCTAAGACTGTGGGGCTTATTGTGGGATAATTAGGATTTCTTTTCAATGTTTTAGAGAACCCTTCAATTTGCCCTGAATTAAACATGAAGAAAAGACATTTTAAGAGTTTCACATCGATGCCTGGTCTGCTTGATGATTGAATATTTTTACTAAAGAAAAAGCTCAACTCCGCCAACAGCTTCTTCTGCCTTTCTGATGGCTCATCGAGATTTGAGATAGGCTCCTGGTTTATAAGTTTAGAAAACTCTATCTTTGGCTCCAGGTATTTCTCAAAACACTTCACAATATCTGTTTTCCTATCTGGTGTTTCCTTTGTGATGTAATGACAAAGATAAGATATGTTTAACATGAACTTGAAGTAAGCCACCTTAAATCCATTCTTGTGCAATTTGTCCTGAAGCTTATCCATGATGCATAAGAGCACAAGGAATATCAACTTTTCTAACCTGGACTTCAGTGGTTCAACAAGCTTTGTGATT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| 16,817
|
OQ348142.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C3-17.4a/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,056
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona cansus
|
kidney, abdominal cavity
|
2021-08
|
SAMN32394768
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-17.4a/2021 segment L, complete sequence
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| 16,818
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OQ348143.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C6-241.18/2021
|
Pika arenavirus
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Arenaviridae
|
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|
GenBank
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China
|
China
|
Ochotona cansus
| null |
2021-08
|
SAMN32394780
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C6-241.18/2021 segment L, complete sequence
|
GCACCGGGGATTCCCAGGTTTTCCAAGTCTGCGCAATGGGGCTTCTCAAGAGCAAGCATGCAAAGGAGGAGGAGGTCGTCCCGACAGCACCACCTGAATACAGACACATCATGGAGGTCGAGGGGACTTCTCTCTACCCAAAGGTCTGCAGGAACTGCTACAAGACAAATGGTGTGATTCACTGCGCAAATCATTACCTTTGTCGCAAATGCCACCTCATGTTCCTAAGATACAGCCCTAATTGCTGTGTCTGCGGAAATGAGCTTCCTAAGTCCTTTGAGCTCAGAAGACCTGACTTCCTAGATTAACCCACAAAGTGGGCCCCGTGGCCTCCCCSAAMGGGGAGGCCACGTGGGCCGGCGCCAGCGTCTCCCTGCGCACGAGGGAGACTCTGGCGYGCTCACTCCACCTCGATGGCGTCAGGTTTGTTGTGTCTCTCACTAAACAGGGAGCATAGCGTTCCTCTGTAGGAATACTTCCCTCCTTGATTTGGGGTTACGAAGGAGTTCAGTGAACTGATGAATCTTATCTTCCTTTGTCCTACTGAATAGAAGTCTTTGTTGTCCTTGTTTAGCTCTGTTCCCAACCTTTCTCTGTTTTCTGTGCTTAGAGCTTTGTCAATAGCTTCAAACTGGTCTTCTGTTAACATCGAGATGAGGGTTCTGCAGTGTGTGCTTTCTACAAGTGCGTCAACATATCTGTCAGGGTTTTCTTGAGCTGAACGCACCTGCATCTCACGTCTCTGACTAGCCTCAATTGACATCACCCAACCTAACTCTATCTTATTGCCAGYGCCTAAAACTAGATGGTCTGCATAAATCATAGGGGTGAAATCTTCTTTTTTATCTTCAGTGTAATTCACTGAGATTGCAATCTCTGAGGGTCTAAATGAATCTCTCTTCAGGTGTATGTTCACATACTGAACTGTTCTTTCCTGAAGCCCTAAGAAGCAGTCGATAAATTCACCAGAATAGATGAATTGAGAATTGTTGTCTACAACCATTTGGAGCAGGTTCATCGCACCACTGGCAGTTTGTGAAAGATTGCTAGTGAAGACTTCCATGTAAAAAATATCACAGATGTTTAGCTTYACTGTCCTGGACTTTGATTCAAATCCAACTAAGATGGCATCAGCATTTAGAATGAGCTGAGTATTCATCCACAACTTGAGAGCACTAACAGATTCTGTGAACTTAATTTTCAGGACTAAGTTCAAYTTCTCCCCTTCCATAAAACATTCAAAATTATCAAGGAATGAAAGATTGGAATTGTACAGAGAAGACAAAGATCTCACCTGGCTCTCAGACTCTTTAGATGGCAGACACTCAGTCATCTGATAGTTGAAAGTGGTGTATGAGGAGACCAAGTCTTGAATTTTCATAAGACCAGAATAACCCTTTCTCACAACCTTCCAAATGAAATGTTGTAGTTGACCAAAGACAGAGAAAATGTCTAGAGATGCTTCATTCAAAGCTAATTCATTATAGGAGTCTAAGTTCCGAATCCAGCTTGAACTCAATAAGCAAGGGCAAAAGAAAGACTTTAATGCCATCTCACCTCTCATCAAGTACATGCTCATACTAGGCGTTGGTTTACCAAGCTGAAGGGGCTCTCTRTCAGTTCTTCTGGTGTGCGCTTGTATAGCATCATATTTTGAAATCACGTACTCAGTTGATTTAGAATACCTCATCATCCTACTTAACAACTTCAAAAAGCTCAGGTTCAACTCAATTGTGATACAAGTATCYAGCGCCTTTTGTCTTGGTTGCCAGGAAAGCTGACTCACCTGTCTCTCAGTTAAATAAGGCTCTATGAATTTRTTAAAAATTTCTGCATGATTCCTTTTCAAACTGTATAATACTTGATGTATTGATGCTCTATCCTGTAGTCCAGCCTTCTTTTCATAAATACAACATGAATGTGAGGATGTCTTTTGTGCCACAATTCTACTCGCTGCTGTCACTGGTAGACTCACYTCACCAAGGACCCAAGGACCGTTCTCTATCGCACTTAACAAATACATGCATAAAATATCATCAGACACTGATCTCCTGAATAGCAGTCTATCACCAACCAGGTGCTCACAACAATTTACAGGTTCACAATTGCAGTCTTTATAGTATAACCACYTTAGACTGAAACACTTCTTCTCTATACCTCTCACACACTTAGAACCCAGAGACTCGCAAAGCCCTGTGAAGCCTGATGCCACACAGCTTTGAAATGCTGATTTCCTTAAACTGTCTGATAAGGCCTGCTTAGCTCCACTTGAAAAGTTCTTTGTGAGCCTGTTTTGTAATACTTTCACCAATGGTGGTGCGTCARCCTCCTCTACAACAGTTGTCATCTTCAATAATTTACTCCTTAAAATGAGCCGCAGAGGAGCAATCTTTGTTGGAGATAGCCATGCTTTAAACTTAGTTTTCAAYTCAAGGTTATACTTATTTGAGGCATAATCAGAAATTTTTCCTTCTTCTTGTAATGCAGATTGAATGAAYTCTTCGAACTGAAACCCTGATAGCAGCTCATGGTATAGCTGTCTTGCTGCATGTCTGAACTCCTGACCGATCTCTTGACTCATCTCAACAGACCTTTGAATCCTATACGACCTTGAGCCATTTGTCCAGTCCGTACTGTCTGTGTCATAATAAGAATGAAAGGGTGATGGAATGTAGCCTGCATAACCCAAAAGTTTATGCATCCTTTTAATACATGAATTTATCAAGTATACGGGCACCCCATTCGCACAGCATTGGTCCATAATAGTATCTAATGTGTCAATTAGTTGCTCCGGATCTTTGCATTTGAGGTTATGCAATGATGCCAGTGTGAACTTGGTTATTAGAGGAACCTCTTCCGACCAAATAAAGAATCTCGACTTGAACTCCCCACAAAACGACCCTAGGACTGACTTTGGGCTGACGTATTTATTGAGAAGCTCTGATAAGAGCTTGTGAATCTCTAAGATGCACAAGATCCTATGACTATTTTCCAGATCAATCGCGTCTAAATCAATCATCATTATCTCATCGTCACTAGAAGTGTATGATCTGCAATTCAGGCCCATCATCAGTCTGAGACATGAGTGAATGAAGTTTTCCGTTACTAGTCCGTAGAAGTCGGARGCATTATGAAGGATACCTTGCCCCATATCAAGCACAGATGARAAATTACTAGGCACTTTTCCGCCCTTAAGTAACTCTCTCATATAGGTAAAAGTTGGTGTRTATTTGCCTTTTTCTTCTAAGATTTTCAACTCACTATTTATGTAAGATTCAAAGTAAGACTCCAAGCACAAGTATGGGACCTCCACTTTTTTGTGTAGATGCCAGTAGAGTAAAGTGTTGACTTCTTCTTTTCCTAAAACAGTACCATCTGGCTGCAAGAGATTCAGACCACCCAGGAGAGCAATGAATGCAGCTGGTGACATGTGAGGCCCCCATTTTGAGTGGTCCATTGAGTAGACACACTTGTCACTTACCACCCAGTTTCTCATGTCTTCTAAKGCTATACTGAAGCTTCTGTCATCATTTAAACATGATCCTTTGAAATTYTTCGTCAACGTCTCGAAGTAGTCCTCTATYAATCTAGTGTATAACTTTGTGTTGATGTCTCCAACGTACAGCTCTCTATTTGAGCCAACCTGCTCTTTGTAGGACAACCCAAAGTATAGATGATCAGTCCCTGGTCCTGTCACATCATACTGTGAGGGCCGGTCAGAGGAGTAAAATATTAAATTCTTCAATGTTGGAAGYTGCAGTTCGCACATCATGAGTTTTTTACTCAARGCTTCAGAATTAGACGTTCTTTCTGTTATTCGTGAGCGGTCTCTTATATTCTTCACATTCTGTTGATATTTATTTTGAGGGCCACTTGTGTAGCTGTACGCACCATGAATTTTGTTGGCACCCATATTCACAATTAGAGATATAAAGCATGTTTTGTAGTCCTCCTCATAGTAACAGTGTGTGGTAAAGTTCTTTAATGTGTCCTCTATCAGTGTCTCACTCTTTGGTTTATCAAACATAAACTCACTGTGTCTAAATTTATCACAAAAAGTCTTTAAGGAGCATTCGGAAACAATGCTTAAGTCTATTTCAGAAGCCTCATGGTACTTCAACTCGTGCTGTATGAAGTTGGCTTCTGGTAGTGTTAAACCATTGTCAACCCAAAACTTCTTTGTGTTGGTAAATGAGGTGCTGTTGAGCAAGTCATTGTTTTGAGGCGTCAAATTCACTTGGTTTGGTTTTGTGCCTTTTTCATTTTCAGCTATCTTATACTCYTTCTTTAACATGGAAATAAACTTCTCTTCCTCTGCATCACTCAAAGAACCTGACTCCATGGAACCTTTTAACAGTTCCTCAACCTTTTTGAATATCGGTAGTCTCTTTTTGTCAGAGTGGAACACACTATTATTCATCCTCTCATATARATTCAGCAAAGAGGCAGACAGAACAGTCTCGTAATTATATTCTTCTTTATCAGCCACCCTTACAACTGAAGACTTGTTTGAAGCTAAGTCTAAGACTGTGGGGCTTATTGTGGGATAATTAGGATTTCTTTTCAATGTTTTAGAGAACCCTTCAATTTGCCCTGAATTAAACATGAAGAAAAGACATTTTAAGAGTTTCACATCGATGCCTGGTCTGCTTGATGATTGAATATTTTTACTAAAGAAAAAGCTCAACTCCGCCAACAGCTTCTTCTGCCTTTCTGATGGCTCATCGAGATTTGAGATAGGCTCCTGGTTTATAAGTTTAGAAAACTCTATCTTTGGCTCCAGGTATTTCTCAAAACACTTCACAATATCTGTTTTCCTATCTGGTGTTTCCTTTGTGATGTAATGRCAAAGATAAGATATGTTTAACATGAACTTGAAGTAAGCCACCTTAAATCCATTCTTGTGCAATTTGTCCTGAAGCTTATCCATGATGCATAAGAGCACAAGGAATATCAACTTTTCTAACCTGGACTTCAGTGGTTCAACAAGCTTTGTGATT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Pika arenavirus
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South China Agricultural University, Veterinary College
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Pika arenavirus
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Arenaviridae
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PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-17.18c/2021 segment L, complete sequence
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| 16,820
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OQ348145.1
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Pika arenavirus
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Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
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China
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2023-04-10
|
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|
Pika arenavirus
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Arenaviridae
|
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GenBank
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China
|
China
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Ochotona cansus
|
lung
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2021-08
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SAMN32394767
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PRJNA901878
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MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-17.2b/2021 segment L, complete sequence
|
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| 16,821
|
OQ348146.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C3-17.4c/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,056
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona cansus
|
kidney, abdominal cavity
|
2021-08
|
SAMN32394768
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PRJNA901878
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MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-17.4c/2021 segment L, complete sequence
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| 16,822
|
OQ348147.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C6-247.18/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,056
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona cansus
| null |
2021-08
|
SAMN32394783
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C6-247.18/2021 segment L, complete sequence
|
GCACCGGGGATTCCCAGGTTTTCCAAGTCTGCGCAATGGGGCTTCTCAAGAGCAAGCATGCAAAGGAAGAGGAAGTCGTCCCAACAGCACCTCCTGAGTATAGACACATYATGGAGGTCGAGGGGACTTCTCTCTACCCAAAGGTCTGCAGGAACTGCTACAAGACAAATGGTGTGATTCACTGCACAAATCACTACCTTTGTCGCAAATGCCATCTCATGTTTCTAAGATACAGCCCTAATTGCTGTGTCTGCGGAAATGAGCTTCCTAAGTCCTTCGAACTCAGAAGACCCGACTTCCTAGACTAACCCACAAAGTGGGCCCCGTGGCCTCCCCGAAAGGGGAGGCCACGTGGGCCGGCGCCAGCGTCTCCCTGCGCACGAGGGAGACTTTGGCGCGCCTACTCCACCTCGATGGCATCGGGTTTGTTGTGTCTTTCGCTGAATAGGGAGCAAAGCGTTCCTCTATAGGAGTATCTTCCTCCTTGATTCGGGGTCACGAAGGAGTTTAGTGAACTGATGAATCTTATCTTCCTCTGCCCTACTGAATAGAAGTCTTTGTTGTCCTTATTCAACTCTGCCCCCAACTTTTGTCTGTTTTCTGAGCTTAGGGCTTTGTCGATGACCTCAAATTGATCTTCTGTCAACATCGAAATGAGAGTCCTACAGTGTGTGCTTTCCACAAGTGCGTCAACATACCTGTCTGGGTTTTCCTGAGCTGAACGCACTTGCATCTCACGTCTATGACTTGCTTCAATTGACATCACCCACCCTAATTCTATTTTATTGCCAGCACCTAAAAGTAGATGGTCCGCATAAATCATGGGGGTGAAATCCTCCCTTTTATCTTCAGTGTAATTCACTGAGATTGCAATCTCTGAAGGTCTGAATGAATCCCTCTTCAGGTGTATGTTCACATATTGAACTGTTCTTTCCTGAAGCCCCAAGAAGCAGTCAATAAACTCACCAGAATAGATAAACTGAGAATTGTTGTCCACAACCATTTGAAGCAGGTTCATTGCACCACTGGCAGTTTGTGAAAGGTTGCCAGTGAAAACCTCCATGTAAAAGATATCACAGATATTTAGCTTTACTGTCCCAGACTTTGATTCGAATCCAACCAAGATGGCATCAGCATTTAAAATGAGCTGAGTGTTCATCCACAACTTAAGAGCACTAACAGATTCTGTGAACTTTATCTTCAGAACTAAGTTCAACTTCTCTCCTTCCATGAAACATTCAAAATTATCAAGGAATGAAAGATTGGAATTGTACAAAGAGGACAAGCGTCTCACTTGGCTCTCAGACTCTTTAGATGGCAAACATTCAGTCACCTGATAGTTGAAAGTAGTGTATGAAGAAACTAAGTCCTGAATTTTCATAAGACCAGAATAACCCTTCCTTACAACCTTCCAGATGAAATGTTGTAGTTGGCCAAAAACAGAAAAAACGTCTAGTGATGCCTCACTCAAAGTTAATTCATTGTAGGAGTCTAAGTTCCGAATCCAGCTTGAGCTTAATAAACAAGGGCAGAAGAAAGATTTTAATGCCATCTCACCTCTCATTAAGTACATGCTCAAACTAGGCGTTGGTTTACCAAGCTGAAGGGGCTCTCTATCAGTTCTTCTGGTGTGTGCTTGTATAGCATCATATTTTGAAATCACGTACTCTGTTGATTTAGAATACCTCATCATCCTACTTAATAACTTCAAAAAACTCAGGTTCAATTCAATTGTAATGCAAGTGTCCAATGCCTTTTGCCTTGGCTGCCAGGAGAGCTGACTCACCTGCCTCTCAGTTAAATAAGGTTCTATGAATTTGTTAAAAATCTCTGTGTGATTCCTTTTCAAACTATATAACACTTGATGTATTGATGCTCTATCCTGTAGTCCAGCCTTCTTTTCATAAATACAACATGAGTGTGAGGATGTTTTCTGTGCCACAATTCTACTCGTTGCTGTYACTGGTAGGCTCACCTCACCAAGGACCCAAGGACCATTCTCTATTGCACTTAATAAATACATGCATAAAACATCATCAGACAGTGACCTCCTGAATAGCAATCTATCACCAACCAGGTGCTCACAGCAATTTACAGGTTCACAATTACAATCCTTATAGTATAACCACTTTAAACTGAAACACTTCTTCTCTATGCCTCTCACACACTTAGAACCCAAAGACTCGCAAAGCCCAGTGAAGCCTGACGCCACACAGCTTTGAAATGCTGACTTCCTTAAACTGTCTGACAAGGCCTGCTTTGCTCCACTTGAAAAATTCTTTGTGAGCCTGTTTTGCAACACTTTTACCAATGGTGGTGCGTCAACTTCTTCTACAACAGTTGTCATCTTCAATAACTTACTCCTTAAAATTAGCCGCAGAGGAGCAATTTTTGTTGGGGATAGCCATGCTTCAAACTTAGTTTTCAACTTAAGGTTGTACTTATTTGAAGCATAATCAGAAATTTTCCCTTCTTCTTGTAATGCAGATTGAATAAATTCTTCAAACTGAAACCCTGATAGCAATTCATGGTACAGCTGTCTTGCTGCATGTCTAAACTCTTGACTAATCTCTTGATTCACTTCAACAGATCTTTGAATCCTATACGACCTTGAACCATTTGTCCAGTCAGTGCTGTCTGTGTCATAATAAGAATGAAAGGGTGATGGAATGTAGCCTGCATAACCCAAAAGTTTATGCATCCTTTTAACACATGAATTTATCAGGTATATGGGCACCCCATTTGCACAGCATTGGTCCATAATGGTATCTAGTGTATCAATTAGTTGCTCCGGATCTTTGCATTTGAGGTTATGCAATGATGCTAGTGTGAACTTGGTTATGAGGGGGACTTCTTCAGACCAGATAAAGAACCTTGATTTGAACTCCCCACAGAAAGATCCTAGGACTGACTTTGGGCTGACAAATTTGTTGAGGAGCTCTGATAAAAGCTTATGAATCTCCAAAATACACAAGATTCTATGACTATTCTCTAGATCAATAGCATCTAAATCAATCATCATTATCTCATCATCACTAGAAGTGTATGATCTGCAGTTTAAGCCCATCATCAGTCTGAGACATGAGTGAATGAAGTTCTCCGTTATTAGCCCATAGAAGTCAGAGGCATTATGAAGGATGCCTTGCCCCATATCAAGCACAGATGAAAAGTTGCTAGGCACCTTCCCGCCTTTAAGCAACTCTCTCATGTAGGTAAAAGTTGGTGTGTATTTACCTTTTTCCTCCAAAATTTTTAACTCACTATTTATGTAAGATTCAAAGTAGGACTCTAAACATAAATATGGAACCTCCACTCTTTTGTGTAGATGCCAGTAGAGTAGAGTGTTGACTTCTTCTTTTCCCAAGATAGTGCCATCTGGCTGCAGGAGATTCAGACCACCCAGGAGAGCAATGAATGCAGCCGGTGACATGTGAGGCCCCCACTTAGAGTGGTCCATTGAGTAGACACATTTGTCACTTACCACCCAGTTTCTCATGTCTTCTAAGGCTATACCAAAGCTTCTGTCATCATTTAGACATGATCCCTTGAAATTCTTCGTTAATGTCTCAAAGTAGTCTTCTATTAATCTGGTGTATAACTTTGTGTTAATGTCCCCAACATATAGCTCTCTATTTGAGCCAACTTGCTCTTTGTAGGATAGCCCAAAGTATAGATAATCAGTCCCTGGTCCTGTGACATCATACTGTGAAGGTCGGTCAGAGGAGTAAAATATCAAATTTTTTAGTGTTGGAAGTTGTAATTCGCACATCATGAGTTTCTTACTCAAGGCTTCAGAATTAGACGTCCTTTCTGTTATTCGTGAGCGGTCTCTTATATTCTTCACATTCTGTTGATATTTATTTTGAGGGCCACTCGTATAGCTATACGCACCATGAATTTTGTTGGCACCCATATTCACAATCAGAGATATAAAACATGTTTTATAGTCCTCCTCATAGTAACAGTGTGTRGTGAAGTTCTTTAACGTGTCCTCTATCAGTGTCTCACTCTTTGGTTTATCGAACATAAACTCACTGTGTTTGAATTTGTCACAAAAGGCCTTTAAAGAGCAATCGGAAACGATGCTTAAGTCTATCTCAGAAGCCTCATGGTACTTCAATTCATGCTGTATGAAGTTGGCTTCTGCTAATGTTAAACCATTGTCAACCCAAAATTTCTTTGTGTTGCTAAATGAAGTGCTATTGAGCAAGTCATTGTTCTGAGGGGTCAGATTCACTTGGCTTGGTTTTGCTCCTTTTTCATTCTCAGCAATCTTGTATTCCTTCTTCAACATGGAAATGAACTTCTCTTCCTCTACATCACTCAAAGAACCTGACTCCATGGAGCCTTTTAACAGTTCTTCAACCTTTTTGAATATTGGTAGTCTCTTCTTGTCAGAGTGGAACACACTATTATTCATCTTCTCATACAAATTCAACAAAGAAGCAGACAGAACAGTCTCGTAATTATATTCTTCTTTATCAGCTACCCTTACAACCGAGGACTTGTTTGAAGCTAAGTCTAAGACTGTGGGACTTATTGTAGGGTAATTGGGATTTCTTTTCAATGTTTTAGAAAACCCCTCAATTTGGCCTGAATTGAACATGAAAAAGAGACATTTTAAGAGTTTCACATCGATGCCTGGTCTGCTTGATGACTGAATATTCTTACTGAAGAAAAAGCTCAACTCTGCCAATAGCTTCTTTTGCCTCTCTGATGGGTTATCGAGATTTGAAATGGGCTCCTGATTTATAAGTTTAGAAAACTCTATCTTCGGCTCCAAATATTTCTCAAAGCATTTCACAATATCTGTCTTCCTATCTGGTGTTTCCTTTGTGATGTAATGGCAAAGATAAGATACATTTAACATGAACTTAAAGTATGCCACCTTAAATCCRTTCTTGTGCAATTTGTTTTGGAGCTTGTCCATGATACATAAGAGTACAAGGAATATCAACTTTTCTAACCTGGACTTCAATGGTTCAACAAGTTTTGTGATC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| 16,823
|
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|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
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|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
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|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona cansus
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2021-08
|
SAMN32394767
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PRJNA901878
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MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-17.2a/2021 segment L, complete sequence
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| 16,824
|
OQ348149.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C3-17.4b/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,056
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona cansus
|
kidney, abdominal cavity
|
2021-08
|
SAMN32394768
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-17.4b/2021 segment L, complete sequence
|
GCACCGGGGATTCCCAGGTTTTCCAAGTCTGCGCAATGGGGCTTCTCAAGAGCAAGCATGCAAAGGAAGAGGAAGTCATCCCAACAGCACCTCCCGAGTACAGACACATCATGGAGGTCGAGGGGACTTCTCTCTACCCAAAGGTCTGCAGGAACTGCTACAAGACAAATGGTGTGATTCACTGCACAAATCACTACCTTTGTCGCAAGTGCCATCTTATGTTTCTGAGATACAGCCCTAATTGCTGTGTCTGCGGGAATGAGCTTCCCAAGTCCTTCGAACTCAGAAGACCTGACTTCCTAGACTAACCCACAAAGTGGGCCCCGTGGCCTCCCCGAAAGGGGAGGCCACGTGGGCCGGCGCCAGCGTCTCCCTGCGCACGAGGGGGACTCTGGCGTGCCTACTCCACCTCAATGGCGTCGGGCTTGTTATGTCTCTCACTGAATAAGGAACAGAGCGTCCCTCTATAGGAGTATCTCCCTCCTTGATTTGGGGTCACGAAGGAGTTTAGTGAACTGATGAATCTTATCTTCCTCTGCCCTACTGAATAGAAGTCTTTGTTGTCCTTGTTTAGCTCTGCCCCCAACTTTTGTCTGTTCTCTGAGCTCAAAGCTCTGTCGACAACCTCAAACTGTTCTTCTGTCAACATCGARATGAGGGTCCTGCAGTGTGTGCTTTCTACAAGTGCATCAACATATCTGTCTGGGTTTTCTTGAGCTGAACGCACTTGCATTTCACGTCTCTGACTTGCTTCAATTGACATCACCCAACCTAATTCTATTTTATTGCCAGCGCCTAAAACTAAATGGTCCGCATAAATCATAGGGGTGAAATCCTCCCTTTTGTCCTCAGTATAATTCACTGAAATTGCAATCTCTGAAGGTCTGAATGAATCCCTCTTCAGGTGTATGTTCACATACTGAACTGTTCTTTCCTGAAGCCCTAAGAAGCAGTCAATAAACTCACCAGAATAGATGAACTGAGAATTGTTGTCCACAACCATTTGAAGCAGGTTCATTGCACCACTGGCAGTTTGTGAGAGATTGCCAGTGAAGACTTCCATGTAAAAAATGTCACAGATGTTTAACTTTACTGTCCCAGACTTTGATTCAAATCCAACCAAGATGGCATCAACATTTAGAATGAGCTGAGTATTCATCCACAATTTAAGAGCACTAACAGATTCTGTGAACTTAATTTTCAGAACTAAATTCAACTTCTCTCCTTCCATGAAACATTCAAAATTATCAAGAAATGAAAGATTGGAATTGTACAAAGAGGACARACGTCTCACTTGGCTCTCAGACTCTTTAGATGGCAAACATTCAGTCATCTGATAGTTGAAAGTGGTGTATGAAGAAACCAAGTCTTGAATTTTCATAAGACCAGAATAACCCTTTCTTACAACCTTCCAAATAAAATGTTGTAGTTGGCCAAAAACAGAAAAAACGTCCAGTGATGCCTCACTCAAAGTTAACTCATTATAGGAGTCCAAGTTCCGAATCCAGCTTGAACTTAATAAGCAAGGGCAAAAGAAAGATTTTAATGCCATCTCACCTCTCATCAAGTACATGCTCATACTTGGCGTTGGTTTACCAAGTTGAAGGGGCTCTCTATCAGTTCTTCTGGTGTGCGCTTGTATAGCGTCATATTTTGAGATCACGTACTCGGTTGATTTAGAATACCTCATCATCCTACTTAACAACTTCAGAAAACTTAGGTTCAGTTCAATTGTGATACAAGTGTCCAAGGCCTTTTGTCTTGGCTGCCAGGAGAGCTGACTTACCTGTCTCTCAGTTAAATAAGGTTCTATAAATTTATCAAAAATCTCTGTGTGATTCCTCTTTAAACTATATAGTACTTGATGTATTGATGCTCTATCCTGTAGTCCAGCCTTCTTTTCATAAACGCAACATGAGTGTGAGGATGTTTTTTGTGCCACAATTCTAATTGCTGCTGTCACTGGTAGACTTACTTCACCAAGGACCCAAGGACCGTTCTCTATTGCACTTAACAAATACATGCATAAAACATCATCAGACACCGATCTCCTGAACAACAGTCTATCACCAGTCAGGTGTTCACAGCAATTCACAGGTTCACAATTGCAATCTTTATAGTACAACCACTTTAGGCTGAAACACTTCTTCTCTATGCCTCTTACACACTTAGAACCCAAAGACTCGCAAAGCCCAGTGAAACCTGATGCCACACAGCTTTGAAATGCTGATTTCCTTAAACTGTCTGACAAGGCCTGCTTTGCTCCACTTGAAAAATTCTTTGTAAGCCTGTTTTGTAATACTTTCACCARTGGTGGTGCGTCAACTTCCTCCACAACAGTTGTCATTTTCAATAATTTACTCCTTAAAATTAGCCGTAGAGGAGCAATTTTTGTTGGGGATAGCCATGCTTTAAACTTGGTTTTCAACTCAAGGTTATACTTRTTTGAAGCGTAATCAGAAATTTTCCCTTCTTCTTGTAATGCAGATTGAATAAATTCTTCAAACTGAAACCCTGATAGCAATTCATGGTACAGCTGTCTCGCTGCATGTCTGAACTCTTGACTAATCTCCTGATTCACCTCAACAGATCTTTGGATCCTATACGACCTTGAACCATTTGTCCAGTCAGTACTGTCTGTATCATAATAAGAGTGAAAGGGTGACGGAATGTAGCCTGCATAACCCAAAAGTTTATGCATTCTTTTAACACATGAATTTATCAGGTATATGGGCACTCCATTTGCACAGCATTGGTCCATGATGGTATCCAGTGTATCAATTAGTTGCTCCGGATCTTTGCATTTGAGGTTATGCAACGACGCCAGTGTGAACTTGGTTATGAGAGGGACTTCTTCAGACCAGATAAAGAACCTTGACTTGAACTCCCCACAAAACGATCCTAGAACTGACTTTGGGCTGACAAACTTATTGAGAAGCTCTGATAAAAGCTTATGAATCTCYAAAATACACAAGATCCTATGACTATTCTCTAGATCAACAGCATCTAGATCAATCATCATTATCTCATCATCACTAGAAGTGTATGATCTGCAGTTCAAGCCCATCATCAATCTGAGACATGAGTGAATGAAGTTCTCCGTTACTAGCCCATAGAAGTCGGAAGCATTATGAAGGATGCCTTGCCCCATGTCAAGCACAGATGAAAAATTGCTAGGCACCTTCCCGCCTTTAAGCAACTCTCTCATGTAGGTAAAAGTTGGTGTGTATTTGCCTTTTTCCTCCGAAATTTTCAACTCACTATTTATGTAAGATTCAAAGTAGGATTCTAAGCATAAATATGGAACCTCTACTCTTTTGTGTAGATGCCAGTAGAGTAGAGTGTTGACYTGTTCTTTTCCCAAAACAGTACCATCTGGCTGCAAGAGATTTAGACCACCTAGGAGAGCAATGAATGCAGCCGGTGACATGTGAGGCCCCCACTTGGAGTGGTCCATTGAGTAGACACATTTGTCACTCACCACCCAGTTTCTCATGTCTTCTAAAGCTATACCAAAGCTTCTGTCATCATTTAGACATGATCCTTTGAAATTCTTCGTTAGTGTCTCAAAATAGTCTTCAATTAATCTAGTGTATAACTTTGTRTTGATGTCCCCAACATACAGCTCTCTATTTGAACCAACTTGCTCCTTGTAGGACAGGCCAAAGTATAGATAATCAGTCCCTGGTCCTGTCACATCATACTGTGAGGGCCGGTCAGAGGAGTAAAATATTAAATTTTTTAATGTTGGGAGTTGTAATTCGCACATCATGAGTTTCTTACTCAAGGCTTCAGAATTAGACGTCCTTTCTGTTATTCGTGAGCGGTCTCTTATGTTCTTCACATTCTGCTGATATTTATTCTGAGGGCCACTTGTGTAGCTGTACGCACCATGAATTTTGTTCGCACCCATATTCACAATCAGAGATATAAAACATGTTTTATAGTCCTCCTCATAGTAACAGTGTGTGGTAAAGTTCTTTAACGTGTCCTCTATTAGTGTCTCACTCTTTGGTTTATCGAACATAAACTCACTGTGTTTGAACTTATCACAAAAAGCTTTTAAAGAGCATTCGGAAACGATGCTCAAGTCTATCTCAGAAGCCTCATGGTACTTTAATTCATGCTGTATGAAGTTGGCTTCTGGTAGTGTTAAACCATTATCTACCCAAAACTTCTTTGTGTTGCTAAATGAGGTGCCGTTAAGCAAGTCATTGTTCTGAGGGGTCAAATTCACTTGACCTGGTTTTGTACCYTTTTCATTCTCAGCAATTTTGTATTCCTTCTTTAACATGGAAATGAACTTCTCTTCTTCTGCATCACTCAAAGAACCTGACTCCATGGAGCCTTTTAACAGTTCTTCAACCTTTTTGAATATTGGCAGTCTCCTTTTGTCAGAGTGGAACACACTATTATTCATCTTCTCATACAAATTCAGCAAAGAGGCAGATAGAACAGTCTCGTAATTATATTCTTCTTTATCAGCCACCCTTACAACTGAGGACTTATTTGAGGCTAAATCYAAGACTGTGGGGCTTATTGTAGGATAATTAGGATTTCTTTTCAATGTCTTAGAGAACCCCTCAATTTGCCCTGAATTAAACATGAAAAAGAGACATTTCAAGAGTTTCACATCGATGCCTGGTCTGCTTGATGACTGAATATTCTTGCTGAAGAAAAAGCTCAACTCTGCCAATAGCTTCTTTTGCCTTTCTGATGGTTTATCGAGATTTGAGATGGGCTCCTGTTTTATAAGTTTAGAAAACTCTATCTTCGGCTCCAAATATTTCTCAAAGCATTTCACAATATCTGTCTTCCTATCCGGTGTTTCCTTTGTGATGTAATGGCAAAGATAAGATACATTCAACATGAATTTAAAATATGCTACCTTGAATCCATTCTTGTGCAATTTGTTCTGAAGCTTGTCCATGATACATAAGAGCACAAGAAAAATCAACTTTTCTAGCCTAGATTTCAATGGTTCAACAAGCTTTGTGATT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| 16,825
|
OQ348150.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C3-17.18b/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
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ssRNA(+/-)
| 7,056
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona cansus
| null |
2021-08
|
SAMN32394766
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C3-17.18b/2021 segment L, complete sequence
|
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| 16,826
|
OQ348151.1
|
Pika arenavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-10
|
SC/C6-245.18/2021
|
Pika arenavirus
| null |
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,056
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ochotona cansus
| null |
2021-08
|
SAMN32394782
|
PRJNA901878
|
MAG: Pika arenavirus isolate SC/C6-245.18/2021 segment L, complete sequence
|
GCACCGGGGATTCCCAGGTTTTCCAAGTCTGCGCAATGGGGCTTCTCAAGAGCAAGCATGCAAAGGAAGAGGAAGTCATCCCAACAGCACCTCCCGAGTACAGAYACATCATGGAGGTCGAGGGGACTTCTCTCTACCCAAAGGTCTGCAGGAACTGCTACAAGACAAATGGTGTGATTCACTGCACAAATCACTACCTTTGTCGCAAGTGCCATCTTATGTTTCTGAGATACAGCCCTAATTGCTGTGTCTGCGGGAATGAGCTTCCCAAGTCCTTCGAACTCAGAAGACCYGACTTCCTAGACTAACCCACAAAGTGGGCCCCGTGGCCTCCCCGAAAGGGGAGGCCACGTGGGCCGGCGCCAGCGTCTCCCTGCGCACGAGGGGGACTCTGGCGTGCCTACTCCACCTCAATGGCGTCGGGCTTGTTATGTCTCTCACTGAATAAGGAACAGAGCGTCCCTCTATAGGAGTATCTCCCTCCTTGATTTGGGGTCACGAAGGAGTTTAGTGAACTGATGAATCTTATCTTCCTCTGCCCTACTGAATAGAAGTCTTTGTTGTCCTTGTTTAGCTCTGCCCCCAACTTTTGTCTGTTCTCTGAGCTCAAAGCTCTGTCGACAACCTCAAACTGTTCTTCTGTCAACATCGARATRAGGGTCCTGCAGTGTGTGCTTTCTACAAGTGCATCAACATATCTGTCTGGGTTTTCTTGAGCTGAACGCACTTGCATTTCACGTCTCTGACTTGCTTCAATTGACATCACCCAACCTAATTCTATTTTATTGCCAGCGCCTAAAACTAAATGGTCCGCATAAATCATAGGGGTGAAATCCTCCCTTTTGTCCTCAGTATAATTCACTGAAATTGCAATCTCTGAAGGTCTGAATGAATCCCTCTTCAGGTGTATGTTCACATACTGAACTGTTCTTTCCTGAAGCCCTAAGAAGCAGTCAATAAACTCACCAGAATAGATGAACTGAGAATTGTTGTCCACAACCATTTGAAGCAGGTTCATTGCACCACTGGCAGTTTGTGAGAGATTGCCAGTGAAGACTTCCATGTAAAAAATGTCACAGATGTTTAACTTTACTGTCCCAGACTTTGATTCAAATCCAACCAAGATGGCATCAACATTTAGAATGAGCTGAGTATTCATCCACAATTTAAGAGCACTAACAGATTCTGTGAACTTAATTTTCAGAACTAAATTCAACTTCTCTCCTTCCATGAAACATTCAAAATTATCAAGAAATGAAAGATTGGAATTGTACAAAGAGGACARACGTCTCACTTGGCTCTCAGACTCTTTAGATGGCAAACATTCAGTCATCTGATAGTTGAAAGTGGTGTATGAAGAAACCAAGTCTTGAATTTTCATAAGACCAGAATAACCCTTTCTTACAACCTTCCAAATAAAATGTTGTAGTTGGCCAAAAACAGAAAAAACGTCCAGTGATGCCTCACTCAAAGTTAACTCATTATAGGAGTCCAAGTTCCGAATCCAGCTTGAACTTAATAAGCAAGGGCAAAAGAAAGATTTTAATGCCATCTCACCTCTCATCAAGTACATGCTCATACTTGGCGTTGGTTTACCAAGTTGAAGGGGCTCTCTATCRGTTCTTCTGGTGTGCGCTTGTATAGCGTCATATTTTGAGATCACGTACTCGGTTGATTTAGAATACCTCATCATCCTACTTAACAACTTCAGAAAACTTAGGTTCAGTTCAATTGTGATACAAGTGTCCAAGGCCTTTTGTCTTGGCTGCCAGGAGAGCTGACTTACCTGTCTCTCAGTTAAATAAGGTTCTATAAATTTATCAAAAATCTCTGTGTGATTCCTCTTTAAACTATATAGTACTTGATGTATTGATGCTCTATCCTGTAGTCCAGCCTTCTTTTCATAAACGCAACATGAGTGTGAGGATGTTTTTTGTGCCACAATTCTAATTGCTGCTGTCACTGGTAGACTTACTTCACCAAGGACCCAAGGACCGTTCTCTATTGCACTTAACAAATACATGCATAAAACATCATCAGACACCGATCTCCTGAAYAACAGTCTATCACCAGTCAGGTGTTCACAGCAATTCACAGGTTCACAATTGCAATCTTTATAGTAYAACCACTTTAGGCTGAAACACTTCTTCTCYATGCCTCTTACACACTTAGAACCCAAAGACTCGCAAAGCCCAGTGAAACCTGATGCCACACAGCTTTGAAATGCTGATTTCCTTAAACTGTCTGACAAGGCCTGCTTTGCTCCACTTGAAAAATTCTTTGTAAGCCTGTTTTGTAATACTTTCACCAATGGTGGTGCRTCAACTTCCTCCACAACAGTTGTCATTTTCAATAATTTACTCCTTAAAATTAGCCGTARAGGAGCAATTTTTGTTGGGGATAGCCATGCTTTAAACTTGGTTTTCAACTCAAGGTTATACTTRTTTGAAGCGTAATCAGAAATTTTCCCTTCTTCTTGTAATGCAGATTGAATAAATTCTTCAAACTGAAACCCTGATAGCAATTCATGGTACAGCTGTCTCGCTGCATGTCTGAACTCTTGACTAATCTCCTGATTCACCTCAACAGATCTTTGGATCCTATACGACCTTGAACCATTTGTCCAGTCAGTACTGTCTGTATCATAATAAGAGTGAAAGGGTGACGGAATGTAGCCTGCATAACCCAAAAGTTTATGCATTCTTTTAACACATGAATTTATCAGGTATATGGGCACTCCATTTGCACAGCATTGGTCCATGATGGTATCCAGTGTATCAATTAGTTGCTCCGGATCTTTGCATTTGAGGTTATGCAACGACGCCAGTGTGAACTTGGTTATGAGAGGGACTTCTTCAGACCAGATAAAGAACCTTGACTTGAACTCCCCACAAAACGATCCTAGAACTGACTTTGGGCTGACAAACTTATTGAGAAGCTCTGATARAAGCTTATGAATCTCYAAAATACACAAGATCCTATGACTATTCTCTAGATCAACAGCATCTAGATCAATCATCATTATCTCATCATCACTAGAAGTGTATGATCTGCAGTTCAAGCCCATCATCAATCTGAGACATGAGTGAATGAAGTTCTCCGTTACTAGCCCATAGAAGTCGGAAGCATTATGAAGGATGCCTTGCCCCATGTCAAGCACAGATGAAAAATTGCTAGGCACCTTCCCGCCTTTAAGCAACTCTCTCATGTAGGTAAAAGTTGGTGTGTATTTGCCTTTTTCCTCCGAAATTTTCAACTCACTATTTATGTAAGATTCAAAGTAGGATTCTAAGCATAAATATGGAACCTCTACTCTTTTGTGTAGATGCCAGTAGAGTAGAGTRTTGACYTGTTCTTTTCCCAAAACAGTACCATCTGGCTGCAAGAGATTYAGACCACCTAGGAGAGCAATGAATGCAGCCGGTGACATGTGAGGCCCCCACTTGGAGTGGTCCATTGAGTAGACACATTTGTCACTCACCACCCAGTTTCTCATGTCTTCTAAAGCTATACCAAAGCTTCTGTCATCATTTAGACATGATCCTTTGAAATTCTTCGTTAGTGTCTCAAAATAGTCTTCAATTAATCTAGTGTATAACTTTGTATTGATGTCCCCAACATACAGCTCTCTATTTGAACCAACTTGCTCCTTGTAGGACAGGCCAAAGTATAGATAATCAGTCCCTGGTCCTGTCACATCATACTGTGAGGGCCGGTCAGAGGAGTAAAATATTAAATTTTTTAATGTTGGGAGTTGTAATTCGCACATCATGAGTTTCTTACTCAAGGCTTCAGAATTAGACGTCCTTTCTGTTATTCGTGAGCGGTCTCTTATGTTCTTCACATTCTGCTGATATTTATTCTGAGGGCCACTTGTGTAGCTGTACGCACCATGAATTTTGTTCGCACCCATATTCACAATCAGAGATATAAAACATGTTTTATAGTCCTCCTCATAGTAACAGTGTGTGGTAAAGTTCTTTAACGTGTCCTCTATTAGTGTCTCACTCTTTGGTTTATCGAACATAAACTCACTGTGTTTGAACTTATCACAAAAAGCTTTTAAAGAGCATTCGGAAACGATGCTCAAGTCTATCTCAGAAGCCTCATGGTACTTTAATTCATGCTGTATGAAGTTGGCTTCTGGTAGTGTTAAACCATTATCTACCCAAAACTTCTTTGTGTTGCTAAATGAGGTGCCGTTAAGCAAGTCATTRTTCTGAGGGGTCAAATTCACTTGACCTGGTTTTGTACCYTTTTCATTCTCAGCAATTTTGTATTCCTTCTTTAACATGGAAATGAACTTCTCTTCTTCTGCATCACTCAAAGAACCTGACTCCATGGAGCCTTTTAACAGTTCTTCAACCTTTTTGAATATTGGCAGTCTCCTTTTGTCAGAGTGGAACACACTATTATTCATCTTCTCATACAAATTCAGCAAAGAGGCAGATAGAACAGTCTCGTAATTATATTCTTCTTTATCAGCCACCCTTACAACTGAGGACTTATTTGAGGCTAAATCTAAGACTGTGGGGCTTATTGTAGGATAATTAGGATTTCTTTTCAATGTCTTAGAGAACCCCTCAATTTGCCCTGAATTAAACATGAAAAAGAGACATTTCAAGAGTTTCACATCGATGCCTGGTCTGCTTGATGACTGAATATTCTTGCTGAAGAAAAAGCTCAACTCTGCCAATAGCTTCTTTTGCCTTTCTGATGGTTTATCGAGATTTGAGATGGGCTCCTGTTTTATAAGTTTAGAAAACTCTATCTTCGGCTCCAAATATTTCTCAAAGCATTTCACAATATCTGTCTTCCTATCCGGTGTTTCCTTTGTGATGTAATGGCAAAGATAAGATACATTCAACATGAATTTAAAATATGCTACCTTGAATCCATTCTTGTGCAATTTGTTCTGAAGCTTGTCCATGATACATAAGAGCACAAGAAAAATCAACTTTTCTAGCCTAGATTTCAATGGTTCAACAAGCTTTGTGATT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| 16,827
|
NC_014648.1
|
Pineapple bacilliform CO virus
|
Wu,L.T., Li,H.P.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2010-11-10
| null |
Badnavirus alphananas
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,543
|
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Ananas comosus
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Pineapple bacilliform comosus virus, complete genome
|
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| 7,548
|
OP860302.1
|
Pineapple bacilliform CO virus
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PBCOV/S1-1
|
Badnavirus alphananas
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,567
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple bacilliform CO virus isolate PBCOV/S1-1, complete genome
|
TGGTATCAGAGCCATGTTTCTAGCGTAAACACCTTCGGGGGCCCAAAGGGGGCCTGACAATGGTGGAGTTTTAGATAAGGCGAACTTCCTTCTTATCATCATACTTCTGTGTAGCAATCTTCTTAGCCTAAATTGTTTTCCGAGTAAATAAGTTCCTCACTAGCAAGGGAAAACCTGATCTTTGTTAAGGGGCAAAAGAGCAAAAGACCGCAGATAGCCCAAGAGGGGCTCAGTCGGGTGAGCTTGAGTTCCTGAAACAAAAGGAAGGGGGACACTTTCTAGCAGGACTATTTAACGAGTAAACAATCAAAGGCTCTTGAGAGAGCGAAGGGAGTTATATGAGCCAGAAGGAAGGTAAGCCGTAATAAAACAAAACCTAAGGTCACCCCCGGGGCACCCGATCATCTATAAGTGTTTTCTAGGAATTTGGCATTCTGTTTATGTCCCAGAGATATTGGGAACAAAAACTCGAAGAATATCGCAACTCTCATACCCAAGAGGTTGCAGATCTAGCCTACCTCAATCTTGAAGGAGCTGAGAAGGTCACCCACAAAGACCTTGCTCACAACCTACGCATCAACACCTACCGGCAGGATCTTGCCAATAAGATCCTCGTCGGGCTAAGCCATAAGCACGCCGCGGACATCATCCGCGAAATTCACGAAGACAACCGCAAGCTGCAGAATAACCTGAAGGCCTGTGAAAAGGCTTTGAAGGAGCAGCAGGCGGAGCTGACTGCTATAAAAAGCAGCGTCCCAGCTCTCCGTGAAGAACTCCGCAAAATACAACAAAGCTGGTCGGAGCACCGACCTCTGTCCAAAGACGACGTTGAGAAACTCGTCTTACGCATCAGTGAACAACCAAAGTTCATTGAGCAACAGACGGAGTCCCTCATCAGGGAACTAACCAGCAAGGTGAGTCGGGTGGAACACCTGATCCACCAGTTGGAAGGACGCATCCTTGGATGAGCCTCCAGGAGAAAAGGCAAAACAGGGCCTACAAAGAAGCCTTAGAAGAAACCAGAAATCTGTGGGACACCGCAGTCGGTTTCGTCGACAAAGGCGAGATTGTGGCCAACATCGGCACAATCACAAAACAGCTGAATACGGTCCTCTATCTGCTCCTCGATTTGAGCGAGAGGATCTCCAGACTCGAAAAGGTAGCACCTCCCCAAACGAAGGACATTTCCAAAGATCTCGAGAAGCTCCAGAAACAACTATCAGGGCTTCGGATCTCTGAAGAAGGAGGGTCGAACCTTAAGCAAAAGAAGGTTCCCCTTCGCGTCTACAGAAACCCTTTTGAGATCTTAAAGGGGGAGATCTCCACCAGCAAATGATGAACACCACTCCTCGTGAAGTGGGACAGCCCCTGGTCGAAGACCAGATACGGGGCTACCGACGGACGCAACGAGCCCGTTATGAGGCTCAGGAGGCGGGCAGGCGGCTCGCCAATATTGGAAGAACCATTCTGGGAATGCAGCCAAGGGAGCATACCCTGGCAATGGTGATCGACCCTGAAGCGGAACTGCAACGTTCAATGAGTGAACGTGCCAGAACCGTCCCTGCCGAAGTCCTCTACATGACCCGGCGGGATAACATCCATCATAGGGTCTACTACTTTCGATGTGAAGAAAGGATGAGGGTCTTGGACAGTGACCAGCAAGACCGGACCTTCATCACTCCAGAAGCCTTTGAGCATCTGAAGGAGGCGGGATTCGAGTACATCCATCTCGGAATCCTGCAAGTAAGGTTCCAGATCCTACATCGGCGGTACGCCGGCACCATGGCATTCATCGCCTACAGAGACACCAGGTGGGATAACAGGAAATCCATTATCGCCACTATGGAGGTTGACCTATCTGAAGGCAACCAAATAGTCTACATCATTCCGGATATGATGACCACTATCCGGGACTGCTATGAGCACATCCAAATATCAGTCCGAACCATCGGATATGATGACGACTGGAATGGGGAGTCCAACCTCCTCATCACAAGAGGAATGACGGCCCGACTCTCCAACACACCAAATGTTGGGTTCGCCTACAACATCTCCCGAGTTGCGGACTATCTAAAGTCCAAAGGCGTTAAGGCAATCGACGCCTCGAAGGAGAAGACGACCCAGTTTAAGGGTCGCGAATGGGTACTGAAGCCCAGTCAAGCCAGCATCACTCCAATCATGCCTACCATAGCGGACGCTCACGAACGCTATGACGGAAGTCTAGGCATCAAATTTGGCAATTATCAGGAGGCCAGTACAAGCAGGCCCCCACAATACAATGAACATGACGACGAGATCGTAGAAGACGTAGTCTTGGCGATCATCGACGACCTGCCAGAAGACGACGACGAGGAGGACTATTTTCAACAAATATTGGGTGATTACCAACCTGATTCCCAGGTTGCGCTTGATTACCCAGTCCTCATTCCAACAGAGGATCCGTTTGCATCCTCTTATGCACCACTGACACCACCGGCTCTTACGCCGCTACCAGCATCCGACGATGACAACACCCCCGACGGGATCCGTCCCGTCTTGCAGCGAATCGTGGTGGGGGAGAAGGATTTCACCGATTTCAACACCCTTGATTTCGCATTGAGAGGGTTGGATGTGGAGCTACAAACAACTGATAACTTCACTGAAGAGGAGGAAGAGCTGATCAGCTCCTTCCTCAACCAATTAGAAGAAGAGGAGAACCTGTATTGTAAGGAATCTCCTTCATGTTTATTCACTGATGACAACAACGGCAATGACGAAGAAGAACATCATGTCGTTGCCGCTTCTCTTGAATACCCGGAGTTGAGAAAGATATCTGAAATTATCAACTCCACGGTAGTAGATAGCAATCCGGGCAATCAGTATATGATAGGAGATACTGATATGGATGGACCACCCGGGTATGCACCAGCGCAAGCACAAGCTGCAGCAGTACCACCTACATATGGCGGTACATCTTCATCAGCAAGGGGGCCTTTCAGGTGGAAGAACCCCCATGAACATTTTGAGCTACCATCAGCACACCAGCTGTCTGGGGCAATCTTTGTCATGCCCCAAAACTTTGATCCAAAGGTTTTTGAACGGTGGGAATCCATCGTCCTAAACCATCTGGCGGACAGAAACTTCCCAACCGCCTTAGACAAGATCATCTATGTGGAGAACCTCCTAGGGGAAATGGAGAAAATCACATTCCAGACCTGGAGGATGAGATACGAAGAAGAGTTCGTAAGCTTGCAGACCCGAGTGCTTGGCAACAACGGCACTCAGAACCTGCTCGCTCAAATCCGAAAGGTGTTCTTCCTGGAGGATCCCAAAGGAGGAACCACTGTTTCTCAAGACGCGGCCTATAAGGCCATCAAGAGCTTGACGTGCCAAGAAATGTCCGGACAAGCAATCAGGAAGTATATGTCTTCCTATTTCGATCTGGCGGCACGATCAGGAAGAATGTGGGTGAATGAGGAGCTATCTGACGACTTCTTCACCAAGCTCCCCATGGGTTTAGGCGACAGAGTGCGCCAAGCCTTCTTATCAAGGTACCCCGGCAACACAATAGGGGTTCCAGCAAGGATCACATTCACCCAGCAATATCTGGAAGAGGTCTGTCGGGAGGCAGCCTATCAACGCTCCCTAAAGACCCTGGACTTCTGTAAGGAATTTCCAATCCCGAACTTCTACAAAGGACCACAAAAGAAGTACGGAGTAAGGAAGTCCACCACCTATCGCGGCAAACCTCACAAGTCGCACATCAGAATTGACAAAACAAAGCACTTGAAGAACAGAAAATGCAAGTGCTACATCTGCGGAGAAGAAGGACATTTTGCAAGGGATTGCAAAAACCCGAAGAAGATCGTCGATCGGGTTCATGTCCTAGAAGAATTAGACATCCAAGACGGGATGGATGTCGTCTCGGTCGGAGAGAATGAAGATGAGCTCTCCGATATCTACTCCGTCTCTGAAGGAGAGGAATCCACACATGAGGCATACCACGTCTTCTCCCTTGTGGAAGACTGCCTCATTGGAAAGGCCAACACCTGGAGGTACCAGGTACGAGTTTCCCCAAAAGAATACTACTGTAAACATGAATGGGGATTCTGCTCAAAAATTCTGAAGAACTGCAGAGCCTGCGGGGCAACAGCTCAAACTGGTGAGCGTATGGATTGTCCCCTCTGTAATATGACTATCTGCTCTTCCTGTTCCAATTACTGTTTTGACATAACTATCCCAAAGAACGAGGAAAGAGTACAGGCGATAGTATCATCCTCGACAGCATCAAGGGAGGAAAGCTGGAAAACCATCGCCTTGGAGCAGAGGAAGTTGATTATGAAGCTGGAGAACGAAAAGGAGGCTCTCATAGTAGAGCTAAACCAAGCATTGGAACAACTGAAACAGACGAAGGGAAAAGGGATTCCCGAGCATCAGGATGATGCACTAGAAAAGGAGCTCCTAAAAGAGCTTCTGAGGGAGGAGAAAGAGAAGGCAAAGAAGGCTGAAGAAAGCCTTCAGGAACTTCTGAGGGAAGAAAAAGAAAAAGTAAAGAGGGCTGAAGAAAGCCTTCAGGAACTTCTGAGAGAAGAAAAAGAAAAGGTAAGGAAGGCTGAAGAAAGCCAGAAGGAGACAGCGCTGTTAGTAGAAAAACTGCAAGAGCAGTTACAACAAGCGCTAAGCAACAAGACTACCTGCAACGAGGAAGTACGAGAAGAGGTAGCTGTGATAACTGAGGAAGAGAATCTCAGTTATAGCGCAATCAAGTCTCCAACAAGGTACAACGGCCTGTACAATTTGAAGGCCAAAATTGAAGTTGAAGGAGAAACCGTAGTCCTTAACGCCATCCTGGACACTGGAGCTACGGTATGTATCATCCAAGAAGCCAAAGTTCCTGATCGACTGTGTGAACAGGCTGCAGTGAGTTACACCCTTCACGGTGTCAACTCAACTACATCAGGAAGAAAAGTACTGAAAGGAGGCAAGTTATGGCTTGGAGAACAATTCTTCAGGCTTCCAAG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| 18,377
|
OP860303.1
|
Pineapple bacilliform CO virus
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PBCOV/S2-1
|
Badnavirus alphananas
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,797
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple bacilliform CO virus isolate PBCOV/S2-1, complete genome
|
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| 18,378
|
LC507821.1
|
Pineapple bacilliform CO virus
|
Yanagisawa,H., Sekine,K.
|
Central Region Agricultural Research Center; 2-1-18 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8666
|
Japan
|
2020-04-02
|
PBCOV
|
Badnavirus alphananas
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,541
|
GenBank
| null |
Taiwan
|
Taiwan
|
Ananas comosus
| null |
2015
| null | null |
Pineapple bacilliform CO virus PBCOV genomic RNA, complete genome
|
TGGTATCAGAGCCATGTTTCTAGCGTAAACACCTTCGGGGGCCCAAAGGGGGCCTGACAATGGTGGAGTTTTAGATAAGGCGAACTTCCTTCTTATCATCATACTTCTGTGTAGCAATCTTCTTAGCCTAAATTGTTTTCCGAGTAAATAAGTTCCTCACTAGCAAGGGAAAACCTGATCTTTGTTAAGGGGCAAAAGAGCAAAAGACCGCAGATAGCCCAAGAGGGGCTCAGTCGGGTGAGCTTGAGTTCCTGAAACAAAAGGAAGGGGGACACTTTCTAGCAGGACTATTTAACGAGTAAACAATCAGAGGCTCTTGAGAAAGCGAAGGGAGTTATATGAGCCAGAAGGAAGGTAAGCCGTAATAAAACAAAACCTAAGGTCACCCCCGGGGCACCCGTTCGTCTATAAGTGTGTTTTCTAGAAATTTTGGCATTCTGTTTATGTCCCAGAGATATTGGGAACAAAAGCTCGAAGAATATCGCAACTCTCACACACAAGAGGTTGCAGATCTAGCCTACCTTAATCTTGAAGGAGCTGAGAAGGTCACCCACAAAGACCTTGCTCACAACCTACGCATCAACACCTACCGGCAGGATCTTGCCAATAAGATCCTCGTCGGGCTAAGCCATAAACACGCCGCGGACATCATCCGCGAAATCCACGAAGACAACCGCAAGCTGCAGAATAACCTGAAGGCCTGTGAAAAGGCTTTGAAGGAGCAGCAGGCGGAGCTGACTGCTATAAAAAGCAGCGTCCCAGCTCTCCGTGAAGAACTCCGCAAAATACAACAAAGCTGGTCGGAGCACCGACCTCTGTCCAAAGACGACGTTGAGAAACTCGTCTTACGCATCAGTGAACAACCAAAGTTCATTGAGCAACAGACAGAGTCCCTCATCAGGGAACTAACCAGCAAGGTGAGTCGGGTGGAGCACCTGATCCACCAGCTGGAAGGACGCATCCTTGGATGAGCCTCCAGGAGAAAAAGCAAAACAAGGCCTACAAAGAAGCTTTAGAAGAAACCAGAAATCTGTGGGACACCGCAGCCGGTTTCATCGACAAAAGCGAGATTGTGGCCAACATCGGCACAATAACAAAACAGCTGAACACGGTCCTCTACCTGCTCCTCGATTTGAGCGAGAGGATCTCTAAACTTGAAAAAGTAGCACCTCCCCAAACGAAGGACATTTCCAAAGATCTCGAGAAGCTCCAGAAACAACTATCGGGGCTTCGGATTTCTGAAGAAGGAGGGTCGAACCTTAAGCAAAAGAAGGTTCCCCTTCGCGTCTACAGAAACCCTTTCGAGATCTTAAAGGGGGAGATCTCCACCAGTAAATGATGAACACCACTCCTCGTGAGGTGGGACAGCCCCTGGTCGAAGACCAGATACGGGCTACCGCCGGACCAAACACACTGGATGGGGTCAGGAGGGCGGGCAGGCGACTCGCCAATATTGGAAGAACCATTCTGGGAATGCAGCCAAGGGAGCATACCCTGGCAATGGTGATCGACCCTGAAGCGGAACTGCAACGTTCAATGAGTGAACGTGCCAGAACCGTCCCTGCCGAAGTCCTCTACATGACCCGGCGGGATAACATCCATCATAAGGTCTATTACTTTCGGTGCGAAGAAAGGATGAGGGTCTTGGACAGTGACCAACAAGACCGGACCTTCATCACTCCAGAAGCTTTCGAGCATCTGAAGGAGGCGGGATTCGAGTACATCCATCTCGGAATCCTGCAAGTAAGGTTCCAGATCCTACATCGGCGGTACGCCGGCACCATGGCATTCATCGCCTACAGAGACACCAGGTGGGATAACAGGAAATCCATTATCGCCACTATGGAGGTTGACCTATCTGAAGGCAACCAAATAGTCTACATCATTCCGGATATGATGACCACTATCCGGGACTGCTATGAGCACATCCAAATATCAATCCGAACCATCGGATATGATGACGACTGGAATGGGGAGTCCAACCTCCTCATCACAAGAGGAATGACGGCCCGACTCTCCAACACACCAAATGTTGGGTTCGCCTACAACATCTCCCGAGTTGCGGACTATCTAAAGTCCAAAGGCGTGAAGGCAATTGACGCCTCAAAGGAGAAGACGACCCAGTTTAAGGGTCGCGAATGGGTACTGAAGCCCAGCCAAGCCAGCATCACTCCAATTATGCCTACCATAGCGGACGCTCACGAACGCTATGACGGAAGTCTAGGCATCAAATTTGGCAATTATCAGGAGGCCAGTACAAGCGGGCCCCCACAATACAATGAACATGACGACGAGATCGTCGAAGACGTAGTTCTGGCAATCATCGACGACCTGCCAGAAGACGAAGAGGAGGACTATTTTCAACAAATAGTGAATGATTACCAACCTGATTTCCAGGTTGCGCTTGATTACCCAGTCCTCATTCCAACAGAGGATCCATTTGCATCCTCTTATGCACCACTGACACCACCGGCTCTTACGCCGCTACCAGCATCCGATGACAACACCCCCGACGGGATCCGTCCCGTCTTGCAGCGAATCGTGGTGGGGGAGAAGGATTTCACCGATTTCAACACCCTTGATTTTACATTAAGAGGGTTGGATGTGGAGCTACAAACAACGGATGACTTCACTACAGAAGAGGAAGAGCTGATCAGCTCCTTCCTCAACCAATTAGAAGAAGAGGAGAACCTTTACTGTAAGGAATCTCCTTCATGTCTATTCACTGATGATAACAACGGCAATGACGAAGGAGAACATCATGTCGTTGCCGCTTCTCTTGAATACCCGGAGTTGAGAAAAATATCTGAAATTATCAACTCCACGGTAGTAGACAGCAATCCGGGCAATCAGTATATGATAGGAGATACTGACATGGATGGACCACCCGGGTATGCACCAGCACAAGCACAAGCTGCAGCAGTACCACCTACATATGGCGGTACATCTCCATCAGTGAGGGGGCCTTTCAGGTGGAAGAACCCCCATGAGCATTTTGAGCTACCATCAGCACACCAGCTGTCTGGGGCAATCTTTGTCATGCCCCAAAACTTTGATCCAAAGGTTTTTGAACGGTGGGAATCCATCGTTCTAAACCATCTGGCGGACAGAAACTTCCCAACCGCCTTAGACAAGATCATCTACGTGGAAAACCTCCTAGGGGAAATGGAGAAAATTACATTCCAGACCTGGAGGATGAGATACGAAGAAGAATTCGTAAGCCTGCAGACCCGAGTGCTTGGCAACAACGGCACTCAGAACCTGCTCGCTCAGATCCGAAAGGTGTTCTTCCTGGAAGATCCTAAAGGAGGAACCACTGTTTCTCAGGATGCGGCTTATAAGGCCATCAAGAGCTTGACGTGCCAAGAAATGTCCGGACAAGCAATCAGGAAGTATATGTCTTCCTATTTCGATCTGGCGGCACGATCAGGAAGGATGTGGGTGAATGAGGAGCTATCTGACGACTTCTTCACCAAGCTCCCCATGGGTTTAGGCGACAGAGTGCGCCAAGCCTTCTTATCAAGGTACCCCGGCAACACAATAGGGGTGCCAGCAAGGATCACATTCACCCAACAATATCTGGAAGAGGTCTGTCGGGAGGCAGCCTATCAACGCTCCCTAAAGACCCTGGACTTCTGCAAGGAATTCCCAATCCCGAACTTCTACAAAGGACCACAAAAGAAGTACGGAGTAAGGAAGTCCACCACCTATCGCGGCAAACCTCACAAGTCGCATATCAGAATTGACAAGACGAAGCACTTGAAGAACAGAAAATGCAAGTGCTACATCTGCGGAGAAGAAGGACATTTTGCAAGGGATTGCAAAAACCCGAAGAAGATCGTTGATCGGGTTCATGTCCTAGAAGAATTAGACATCCAAGACGGAATGGATGTCGTCTCGGTCGGAGAGAATGAAGATGAGCTCTCCGATATCTACTCCGTCTCTGAAGGAGAGGAATCCACACACGAGGCATACCACGTCTTCTCCCTTGTGGAAGACTGCCTCATTGGAAAGGCCAACACCTGGAGGTACCAGGTACGAGTTTCCCCAAAAGAATACTATTGTAAACACGAATGGGGATTCAGCTCAAAAATTCTGAAGAACTGCAGAGCCTGCGGGGCAACAGCTCAAACTGGTGAGCGTATGGATTGTCCCCTTTGTAATATGACTATCTGCTCTTCTTGTTCCAATTACTGCTTTGACATAACTATCCCAAAGAATGAGGAAAGAGTACAGGCAATCGTTTCATCCTCAACAGCATCAAGGGAAGAAAGCTGGAAAACCATCGCCTTGGAGCAGAGGAAATTGATTAAAAAGCTGGAAAATGAGAAGGAGGCTCTCATAGTAGAGCTAAATCAAGCATTGGAACAACTGAAACAAACAAAGGGAAAAGGGATTCCCGAGCATCAGGATGATGCGCTAGAGAAGGAGCTCCTAAAAGAGCTTCTGAGGGAAGAGAAAGAGAAGGTAAAGAAGGTTGAAGAAAGCCTTCAGGAACTTCTGAAGAGAAGAGAAAGAGAAGACAAAGAAGGCTGAAGAAAGCCTTCAGGAACTTCTGAGGAAAGAAAAGAGAAAAGGTGAGGAAGGCTGAAGAAAGCCAGAAGGAGACGGCGCTGCTAGTAGAAAAACTGCAAGAGCAGTTACAACAAGCGCTAAGCAACAAGACTACCTGCAACGAAGAAGTACGAGAAGAAGTAGCTGTGATAACTGAGGAGGAGAATCTCAGTTATAGCGCAATCAAGTCTCCAACAAGGTACAACGGCCTGTACAATTTGAAGGCCAAAATTGAAGTCGAAGGAGAAACTGTAGTCCTTAACGCCATCCTGGACACTGGAGCTACGGTATGTATCATCCAAGAAGCCAAGGTTCCTGATAGACTGTGTGAACAGGCTGCAGTGAGTTACACCCTTCACGGTGTCAACTCAACCACATCAGGAAGAAAAGTATTAAAGGGAGGCAAGTTATGGCTTGGAGAACAATTCTTCAGGCTTCCAAGGACA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| 52,984
|
GQ398110.4
|
Pineapple bacilliform CO virus
|
Sether,D.M., Melzer,M.J., Borth,W.B., Hu,J.S.
|
University of Hawaii, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2011-07-08
|
HI1
|
Badnavirus alphananas
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,451
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2007-07
| null | null |
Pineapple bacilliform comosus virus isolate HI1, complete genome
|
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| 98,587
|
GU121676.1
|
Pineapple bacilliform CO virus
|
Wu,L.T., Li,H.P.
|
Lab. of Plant Virology, College of Natural Resources
|
China
|
2010-11-01
| null |
Badnavirus alphananas
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,543
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ananas comosus
| null | null | null | null |
Pineapple bacilliform comosus virus, complete genome
|
TGGTATCAGAGCCATGTTTCTAGCGTAAACACCTTCGGGGGCCCAAAGGGGGCCTGACAATGGTGAAGTTTTAGATAAGGCGAACTTCCTTCTTATCATCATACTTCTGTGTAGCAATCTTATTAGCTTAAATTGTTTTCCGAGTAAATAAGTTCCTCACTAGCAAGGGAAAACCTGATCTTTGTTAAGGGGCAAAAGAGCAAAAGACCGCAGATAGCCCAAGAGGGGCTCAGTCGGGTGAGCTTGAGTTCCTGAAACAAAAGGAAGGGGGACACTTTCTAGCAGGACTATTTAACGAGTAAACAATCAAAGGCTCTTGAGAAAGCGAAGGGGGTTATATGAGCCAGAAGGAAGGTAAGCCGTAATAAAACAAAACCTAAGGTCACCCCCGGGGCACCCGTTCGTCTATAAGTGTGTTTTCTAGAAATTTGGTATTCTGTTTATGTCCCAGAGATATTGGGAACAAAAACTCGAAGAATATCGCAACTCTCATACCCAAGAGGTTGCAGATCTAGCCTACCTTAACCTTGAAGGAGCTGAGAAGGTCACCCACAAAGACCTTGCTCACAACCTACGCATCAACACCTACCGGCAGGATCTTGCCAATAAGATCCTCGTCGGACTAAGTCATAAACACGCCGCGGACATCATCCGCGAAATCCACGAAGACAACCGCAAGCTGCAGAATAACCTGAAGGCCTGTGAAAAGGCTTTGAAGGAGCAGCAGGCGGAGCTGACTGCTGTAAAAAGCAGCGTCCCAGCTCTCCGTGAAGAACTCCGCAAAATACAACAAAGCTGGTCGGAGCACCGACCTCTGTCCAAAGACGACGTTGAGAAACTCGTCTTACGCATCAGTGAACAACCAAAGTTCATTGAGCAACAGACGGAGTCCCTCATCAAGGAGCTAACCAGCAAGGTGAGTCGGGTGGAACACCTGATCCACCAGTTGGAAGGACGCATCCTTGGATGAGCCTCCAGGAGAAAAGGCAAAACAAGGCCTACAAAGAAGCTTTAGAAGAAACCAGAAATCTGTGGGACACCGCAGTCGGTTTCGTCGATAAAAGCGAGATTGTGGCCAACATCGGCACAATAACAAAACAGCTAAATACGGTCCTCTACCTGCTCCTCGATTTGAGCGAGAGGATCTCCAGACTCGAAAAGGTAGCACCTCCCCAAACAAAGGACATTTCCAAAGATCTCGAGAAGCTCCAGAAACAACTGTCAGGGCTTCGGATCTCTGAAGAAGGAGGGTCGAACCTTAAGCAAAAGAAGGTTCCCCTTCGCGTCTTCAGAAACCCTTTTGAGATCTTAAAGGGGGAGATCTCCACCAGTAAATGATGAACACCACTCCTCGTGAAGTGGAACAGCCCCTGGTCGAAGACCAGATATGGGGCTACCGATGGACGCAACGAGCCTGTTATGAGGCTCAGGAGGCGGGCAGGCGGCTCGCCAATATTGGAAGAACTATTCTGGGAATGCAGCCAAGGGAGCATACCCTGGCAATGGTGATCGACCCTGAAGCGGAGCTGCAACGTTCAATGAGTGAACGTGCCAGAACCGTCCCTGCCGAAGTCCTCTACATGACCCGGCGGGATAACATCCATCACAGGGTCTATTACTTTCGATGCGAGGAAAGGATGAGGGTCCTGGACAGTGACCAGCAAGATCGGACCTTCATCACTCCGGAAGCTTTCGAGCATCTGAAGGAGGCGGGATTCGAGTACATCCATCTCGGAATCCTGCAAGTAAGATTCCAGATTCTACATCGGCGGTACGCCGGTACCATGGCATTCATCGCCTACAGAGACACCAGGTGGGATAACAGGAAATCCATTATCGCCACTATGGAGGTTGACCTATCTGAAGGCAACCAAATAGTCTACATCATTCCGGATATGATGACTACTATCCGGGACTGCTATGAGCACATTCAAATATCAATCCGAACCATCGGATATGACGACGACTGGAATGGGGAGTCCAACCTCCTCATCACAAGAGGAATGACGGCCCGACTCTCCAACACACCAAATGTTGGGTTCGCCTACAACATCTCCCGAGTTGCGGACTACTTAAAGTCCAAAGGCGTTAAGGCAATTGACGCCTCAAAAGAGAAGACGACCCAGTTTAAGGGTCGCGAATGGGTACTGAAGCCCAGTCAAGCCAGCGTCACTCCAATCATGCCTACAATAGCGGACGCTCACGAACGCTATGACGGAAGTCTAGGCATCAAATTTGGTAATTATCAGGAGGCCAGTACAAGCGGGCCCCCACAATACAATGAACATGACGACGAGATCGTAGAAGATGTAGTCCTGGCAATCATCGACGACCTGCCAGAAGATGACGAGGAGGACTATTTTCAACAAATATTAAATGATTACCAACCTGACTCCCAGGTTGCGCTTGATTACCCAGTCCTCATTCCAACAGAGGATCCATTTGCATCCTCTTATGCACCACTGACACCACCGGCTCTTACGCCGCTACCAGCATCCGGTGACAACACCCCCGACGGGATCCGTCCCGTCTTGCAGCGAATCGTGGTGGGGGAGAAGGATTTCACCGATTTCAACACCCTTGATTTCACATTGAGAGGGTTGGATGTGGAGTTACAAACAACGGATGACTTCACTGCAGAGGAGGAAGAGCTGATCGGCTCCTTCCTCAACCAACTAGAAGAAGAGGAGAACCTTTACTGTAAGGAATCTCCTTCATGTCTATTCACTGATGACAACAACGGCGATGACGAAGGAGAACATCATGTCGTTGCCGCTTCTCTGGAATACCCGGAGTTGAGAAAGATATCTGAAATCATCAACTCCACGGTAGTAGACAGCAATCCGGGAAATCAGTATATGATAGGAGATACTGATATGGATGGACCACCCGGGTATGCACCAGCACAAGCACAAGCTGCAGCAGTACCACCTACATATGGCGGTACATCTCCATCAGTAAGGGGGCCTTTCAGGTGGAAGAACCCCCATGAGCATTTTGAGCTACCATCAGCACACCAGCTGTCCGGGGCAATCTTTGTCATGCCCCAAAACTTTGATCCAAAGGTTTTTGGGCGGTGGGAATCCATCGTTCTAAACCATCTGGCGGACAGAAACTTCCCAACCGCCTTAGACAAGATCATCTACGTGGAGAACCTCCTAGGGGAAATGGAGAAAATTACATTCCAGACCTGGAGGATGAGATACGAAGAAGAATTCGTAAGCCTGCAGACCCGAGTGCTTGGCAACAACGGCACTCAGAACCTGCTCGCTCAGATCCGAAAGGTATTCTTCCTGGAGGATCCTAAAGGAGGAACCACTGTTTCTCAGGATGCGGCCTATAAGGCCATCAAGAGCTTGACGTGCCAAGAAATGTCCGGGCAAGCAATCAGGAAGTATATGTCTTCCTACTTTGATCTGGCGGCACGATCAGGAAGGATGTGGGTGAATGAGGAGCTATCTGACGACTTCTTCACCAAGCTCCCCATGGGTTTAGGCGACAGAGTGCGCCAAGCCTTCTTATCGAGGTACCCCGGCAACACAATAGGGGTTCCAGCAAGGATCACATTCACCCAGCAATACCTGGAAGAGGTCTGTCGGGAGGCAGCCTATCAACGCTCCCTAAAGACCCTGGACTTCTGCAAGGAATTTCCAATCCCGAACTTCTACAAAGGACCCCAAAAGAAGTACGGAGTAAGGAAGTCCACCACCTATCGCGGCAAACCTCACAAGTCGCATATCAGGATTGACAAGACGAAGCACTTGAAGAACAGAAAATGCAAGTGCTACATCTGCGGAGAAGAAGGACATTTTGCAAGGGATTGCAAAAACCCGAAGAAGATCGTTGATCGGGTTCATGTCCTAGAAGAACTAGACATCCAAGACGGAATGGATGTCGTCTCGGTCGGAGAGAATGAAGATGAGCTCTCCGATATCTACTCCGTCTCTGAAGGAGAGGAATCCACACATGAGGCATACCACGTCTTCTCCCTTGTGGAAGACTGCCTCATTGGAAAGGCCAACACCTGGAGGTACCAGGTACGAGTTTCCCCGAAGGAATACTATTGTAAACACGAGTGGGGATTCAACTCAAAAATTCTAAAGAACTGCAGAGCCTGCGGGGCAACAGCTCAAACTGGTGAGCGTATGGATTGTCCCCTTTGTAATATGACTATCTGCTCTTCCTGTTCCAATTACTGCTTTGACATAACTATCCCAAAGAATGAGGAAAGAGTGCAGGCGATAGTATCATCCTCAACAGCATCAAGGGAAGAAAGCTGGAAAACCATCGCCTTGGAGCAGAGGAAGTTGATTAAGAAGCTGGAGAATGAAAAGGAGGCTCTCATAGTAGAGCTAAATCAAGCATTGGAACAACTGAAACAGACAAAGGGAAAAGGGATTCCCGAGCATCAGGATGATGCGCTAGAAAAGGAGCTCCTAAAAGAGCTTCTGAGGGAAGAGAAAGAGAAGGCAAAGAAGGCTGAGGAAAGCCTTCAGGAACTTCTGAAGGAAGAGAAAGAGAAGGCAAAGAAGGCTGAGGAAAGCCTTCAGGAACTTCTGAGGAAAGAAAAGGAAAAAGTAAGGAAGGCTGAAGAAAGCCAGAAGGAGACGGCGCTGTTAGTAGAAAAACTGCAAGAGCAGTTACAACAAGCGCTAAGCAACAAGACTACCTGCAACGAAGAAGTACGAGAAGAGGTAGCTGTGATAACTGAGGAGGAGAATCTCAGTTATAGCGCAATCAAGTCTCCAACAAGGTACAACGGCCTGTACAATTTAAAGGCCAAAATTGAAGTTGAAGGAGAAACTGTAGTTCTTAACGCCATCCTGGACACTGGAGCTACGGCATGTATCATCCAAGAAGCGAAGGTTCCTGATCGGCCGTGTGAACAGGCTGCAGTGAGTTACACCCTTCACGGTGTCAACTCAACCACATCAGGAAGGAAAGTATTGAAAGGAGGCAAGTTATGGCTTGGAGAACAATTCTTCAGGCTTCCAAGGACA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| 100,116
|
NC_010178.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Melzer,M.J., Sether,D.M., Karasev,A.V., Borth,W., Hu,J.S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2007-12-26
| null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,071
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1, complete genome
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| 7,897
|
OP860291.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-1/S1-1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,048
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1 isolate PMWaV-1/S1-1, complete genome
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GCTTATTTAAGGAACAAATCAAAATCAAATCAAACAACGAAACGAACTTTCCAGATAACTCAAATCTTGTTTCCGAATTCCGAGCTCTTAACACCACTCTAAACGCTTAAAGTTATTTTCCTAACTTCTAAGTTTCATTTTTAATACGCTCTTGTATTAATCAAAGTTTCTGAACGCTTTAACTTTTTCCAAAGAAAAACCCAAAAACAAAATAGTACGTATTTAGGGAAAAAGAAAAATTTCAGTGGCTTGTGTTTTCCTTACAGTATAGGCTTTAAAGTTTCTGTTAAGTATATCGAAATAACGCGTTTAATATTTTTATGGGTTTCCTGACATGAAGCATCATAAAAAGAAGGTACATGTACCACAAAAAGAGAAACCACCTGATGCCAAAATTCCCAACAATAATCCAAATCTCAAGACTGGGTCTTTAAGTTCGCAAAGCGCGAACAAAAAGGAAAAAGTTCTCAGCAACAGAGAGCTTAAACTGAAATTCTTTTACAGCCCAGTTGTAAAAGATCTCTCAGAATATTTTTCCAAAAATAAGACTTCGGATAGTGCGGGGCTAAACCGCAAAACGCCTACACCTCCATCTGGAGGCAATTCCCCGCGTTTAGTTAAAAGGGAGACGGTGGTCCGGGTGCGTGATAGACTGTCACACAAAACCTCCGCAGCCCTTTCCAGAAACAGCTCTTACTCACCTCACGACTCGGATGTCGAAGGCTTTAAGAAGGCAATCAACAGCTACATGCCCAAGCCGGTGGGGTGGAAGAGGAGTCACGCTAAGCGTGAATGGAGGAGGGTTGGTGACAATTCCTTGCAGGAACAAGATCTTCTGCCGTCACCACCAAGATCCCACACGAGCGGCACTGGGAGCGTCGGTTCGGGCAAGGGTCTCGGGCTACGATTCGGAAGTTTTCCGGAAGGTGCCGGGAAAACTGGACCAGACTCCTCACCTCGATCTCTTATCAACGCTGAACGTCGTGACCTACACGACGCAAAACAAGCAGCGTGTCCTGCAAAAGGAAAGACCGTTAGTGAGAGTCTTTCTTCTTCTGAAAGCCAGTCTTCTTCGAGCTATATTCCTGAAGATCCCGTGGTTGAAGACTTCTTCTACAACCACAGACGAAGAAGAGTATGTCTCATGCAAGATGAGAACATAGTCCTGAATGGGGAACACGGAGAGTTAATTGTGCAACTATCAGAGCTGAGTCTAGCTAGAGAGGTACAGCTGGCGGACCATCTAGACTATGACGGCAAGTGGGCTTCCAAAGTTATAGCTGAATTTGTGAGGGATAGGCTGAGGAAGGATAGGTTGAAGGCGCTTAGAGGCAATGTGCTCATAGGCAATAAAGCCTTAGCACATTTCTTTTCCCCGAGCGGCGTGTATCTCGGGAAGGTAGCGCTACACGAGAAAGTGTGGTTCTACTTTAGGACAGCCGGCAGGAGTCACGGAGAATATATTTCGTGCGGGAATGGGAAAGTGAGCCGACTCTTCATCAAAGAACGTTTCCCGACTCTTCATGAAGTAGTGGCTCATGATTGGGCTAAAGGGTACAGTTCGATGGAACACGTGACCCTTTATGATCCAGTGTTCAGCCGCAATGTGCAAGCAAAGAAGGGGTACTGTTGGTTACCTCTTTTCTTAAAATCAAAGATACCACTATCGAAATACCCGCAGTGCCCCTATGTGAGGTTGAACTACCTGAGGAGGTTGTTCGGCGAAATCAATTTAGTCAAGGCGGGTGAATATTATCACTACTCTGAGTTGGGAGCTAAAAATCCAAGGCTTCCTAATGTTCTGGTCGGCGCTAACCCCGGAAGTTCAAATACCGAGGTGGTATCTATGTCGGCAGTGAATGGAAACCCTCTCCTAAGCGTTGCTCTAGACAGTGTAGTGAAGAAGCTGACTATGAGGGAGAGTTCACATTTCCAAAATACAGTCGACGATATTTTAGAAGTGGCTTTGAAATCTGACCTGCGGGAGAGGGTGGATAAGAGGTTTAAAGTCGACTGTTCGATGGCGGTGGAGCAATTGGATCTGCTCCGGAAGATGTTGAAGATTAACAATATAGAAGCTGGTTATGGGAGTCCTGGAGCACATCCTATATTCAACGCTATGAGGAAGTTCTTCAACGAGATGTGTGCTCGCGCTTACAGGGGAGTCCTAGTCTCGGATATTGGGGGCAGTATCTTGAACTGTGTGGTCAACAAGCTGACGAATACTCATGTTTGTGCTCCTAATTTGGATTTAAAAGACGCGGGAAGGCTGAGCAAAGCTTGTATAAGTTTGCTCAATAAAGCCGGAGACTTTAAAGAATTTGACGAGAATTATATAAAATTCATGACTACCGTGTCGAATTTGTCTGTGTGCAACTCGAGTGTTCCCAACTGCAAACATAGGAGCTCTGTTATCACAATGATTGATGTTTATGACATACATGTGGAACAGTTGCTGCAAGCTATGGAGGTCAAAGGCGCAGTTTTGGCTAGGTTGTTCTTTATGTTTCCCCCTGAAATTTTAACGGGTGCAGAGTCAGTACAGTACCCTGAAACATCTCTCACCGTGAGTAAAGACGGGAGAAACTTGATATATTTTATAGGAGAAACAGGTGACTCTTACGTCCACTCCCTAGATACCTTGCTCTCCTATATCACTCGAGGCGTAGTAGTGAGTAAAACAGGAAACAGCTACTACATTGAACTCAACGAGCAGTTTGGTCCTTATTTGGATATTACCGTATCTTTAACCCGAAGGAGAGAAGTTCAGACGCTTCCTAGAAGGTTGGTGCCTTGGACGGCGGGAATGACTCGCATCACGATACCGAGAATGAACGAACATGGAGTGGTGGACAAGTTTTCGATATTGGTCAACAGAGACTTCGTTCGTAGAAGCTTGTCTTACGCCGCTAACGTCTGCAACACCACTGATGACCGTACTTACGAGTACGTCATGTCGAACCTCAGATCGCAGACTACTATGATGGTGGTTGGTTCAAAAATAGTGCACACCAAGGTAGATTTATCTAACGACGTGATCGTTGAGCTACCTACCGTCATTTTGAATGAAGCCGTTTCAAGACGGAATCGTGCCGTCAAAATGTTAAAACAGACTAACAGGGGTTTCCTATATAAGATTTTCTCCACCCTTTATAAAGGATTAACCGCCTCTGTGAGTTGGATATTAGAGAAAATATTCAATTGCCTCCCAAAGTGCGTTGTTGACGCTTGTGAGGATTTATTTAAGACTCATTATGGATTGAAAGATACAGACGATGAAATTGTCATCAATTCTTCCGTAGAGTCTGGACCATTAGAATGCGAAAATGAATATATTGAAGAATTATTAATGATTTCGCAAGCGTTGGCCGGACTAAATTGCAAAGCTGGACCGATGAAGTCTGAGGAAGAAATTAATGAAATTGAAGAAGAGCTTGAAGATAACTCGTTTGAAAACCTCAAAAATCCGATAAACGAATCAAAGAATGAACGGTCTGGAGGTTTAAGAGGTGGTGGCGCAGCCAATTGGTATGATTTCCTACTGCCGAACAGGCCGGAAACCAAACCTGCAGACTCTGCTAGAGCTGCGCTGTGGCGGTTATGCAGGCGTCTGACAAGAATGGTGTGCAATCTAGACATAGTAACTCCCATCAGAAGATTGCTAACGACCCTGCTACTAGCATTGTCGAAGTTTATAAATCCGGACGGAAGATTTGAAAATATTAAAAGGAAAGATGAGGAGAGAATGGATAATGTATTGAAAACTATGGTAGGAGAAATTTTGAAGAGAGGTTTAGTGAAAGTGGGTGATTTATTAAAAGGATTATCTCATGTCGCATGTAAACCACTCGTATGTGTTGGACAAGCATCTGCTACTTTGTTCACCAACGCATGCAGTGCCTTGAATGAAGACGCTGCTGATCGTATCAGACAGCTAAAACACAGGATAGCAAAAGCGCTGAAAGCAGCAGATATGGCTTACCCAAAAGACTGGATAATTGAGGGGAAATATCTCAGGTTTTTCAATAAGTATATCAGGAGATTTATCCCACACGCTGCATTCGCTTCTGTAGTCGTATCTGCCATAGTAATAAGTAAAGCTAACAAAGTGTTTTGTAAAACTTTAAACACTTTGTTTGATAAGCTCAAAAGCAAGTTTGGAAATTTAAAACTGGTGTCGACAAGCACTCTCTGTGCTATAATGTTTGGGATGTGTTTTTGTAAATTCGTCAATTTAATATCTGTTGTCAGTGCTGTCGCAAATCCACTTACATTGGCCTTGCCAGTTTATGTGGGGGCTGAATTTTCTAGCGTAGTACATGACGGTTTAGGCGGAAAAAACATATTTAATTTCAATCGGTTTATGAGAATTTTAATTAACTTAAGCGCGCTTAGGACCCTCAAACCACCGATCGAATACGCGTCTACGTCCGATTCTGATAGAGGCGGTAGAGACGCTACAGATGTTGTTCCTGACCTGAATCGCTTTGACAGGAGGATGGTTATGGCAAGGGCGTTGGATACTTTCAGGGCAGCGGCGGTGAACCTGCAGAGAGACGATACACGCCTAGAAAAGACGTCTCAAACACATGAAGCGCACGAAAACCCTCATCAGGTGGATCTTATAGATCTCACTGATGCACAAGATGACAATCACGAGCGTTTGAGGAAAGGCAAAACTGTCGTTTCTCATGTTCCTGACGCAGTCGCAACTGAACCTCTCACGGTGATGCGAGAATCTGGTGAGATTATGCCTGGTGTGGTACAGGAAATCGGATCATCCAACGGAGTCTCGAGAGGTAGGTTCGAAGGGGTTTTTAAACCCGCTATTACCGTTGTCTTCGGTGAGAAAGATAAAAGACCCTTTGAAGAGTCGTCTGGAGAGAGTGAATCCACAACAATACCCGCAGAAAATTTAGTAGTGGAACATGCGCCGCCGTTAATTTCGGGCGACGAAGCGAGGTCTGAAGGGGAAAGCGTAGAGAACATCCGAACTATCA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| 18,366
|
OP860292.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-1/S2-1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,056
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1 isolate PMWaV-1/S2-1, complete genome
|
ATTAAGTTTATTTAAGTAACAAATCAAAATCAAATCATAAACCGAAACGAACTTTCCAGACTCACTCAATTTCATTTCCGAAATCTGAGCTGTAAACATTACTCTAAACGCCCGAAGTTATTTTCCCAACCTATAAGTTTTATCTCTAATACGCTCCCGTATTAATCTACGTCTCTAAACGTTTTAATATTTTCCAGAAGAAAACCAAAACAAAATAGTACGTGTTTAGGGTAAGACGTTTAACTTTCGTCAGTTTGTGTTTTCCTTGCTATATAAAAATAGCGCTTCTGTTAAGTGTTTTCAAAATGCTGTGGTTTATATTTATAAGAGTTCCCTGATATGAAGCGCGAGATAAAGAAGACATACTCGCAACAAAACCAAAAACCCATAAACAAAAAATTTCCCAACAACAATCCAAAGGCTAAGGCTGGGCAGTCGAGTTCGCAAAACGCGAACGGAAAAGAGAAAGTTCCCAGTAATAAGGAGCTTAAATTAAAATTCTTTTACAGCCCAGTTGTAAAAGACCTTTCTAAACATTTTTCCCAAACCAAGTCTGTGGATAGTGCGGGGCCGAGCCGTAAAACATCTACACCTCCTTCTAGAGGTAGTTCCCCGCAATCAGTAAAGCGAGAGGCGGTGGTCCTCGTTCGTGATAGGCTGTCCCATAAAAATTTTCCGAATATTTCTAGGAACAGCTCATACTCCTCGCACGATTCSGATGTTGAAGGCTTCAAGAAAGCAATCAACAGTTACATACCCAAACCTGAAGGGTGGAAGAGGAGTTTTACTAAACGTCAGTGGAGGAGGGTTGGTGACGATTCCCTGCGAGAACAAGACCTTCTGCCGTCACCACCAAGATCCCACACGAGCAACGATAGGAGCGTCAGTTCGAGCAAGGGTCTCGAGCTACAATTCGGGAGTTTTCCCGAAGTCGCCGGGAAGAATGGACCAGACTCCTCACGTCGATCTCTTATCGACGCTGAACGTCGTAACTTACACGACGCAAAACAAACAGCGTCTCCTGATAGAGAGAAGGCCGCCGGTGGGAGTCTTTCTTCTTCTGAAAGCCAGTCTTCTWCAAGTTATATTTCTGAAGATTCCGTGGTTGAAGACTATTTTTACAACCAAAGGCGAAGAAGAGTGTGTCTCATGAAAGATGAGCACATCGTACTGAACAGGGAGCACGGCGAACTAATCGTCGAGTTATCGGAGCTAAGTTTAGCTAGAGAGACACAGCTAGTGAATCACTTAGACTCTGAGGGCAAGTGGGCTTCCAAATACATAGCTGAATTCGTCAGGGATAGGCTGAGGAAGGACAGATTGAAAGCTCTAAGAGGCAATGTGCTTATAGGTAATAGAGCCATAGCACATTTCTTTTCCCCAGCAGGCGTGTATCTTGGGAAAGTAGCGCTACAGGAGAAAGTGTGGTTCTACTTTAGAACTGCCGGTAGGAGTCACGGAGAGTATATTTCTTGTGGAGATGGGAAAGTGAGCCGACTTTTCATTAAGACACGTTTCCCTACTCTTCAAGAAGTGGTGGCTCATGATTGGGCAAAGGGCTACAGTTCGTTAGAACATATGACGCTTTATGATCCGGTATTCAACCGCAATGTTCACGCAAAGAAGGGGTATTGTTGGTTACCTCTTTTCTTAAAATCTAAAATACCTCTATCGAAATACCCGCAGTGTCCTTATGTGAGATTGAACCATCTGAGGAGGCTGTTTGGTGAGGTAAATTTAGTTAAGGCGGGGGAATACTATCATTATTCGGAGTCAGGAATTAAAAATCCAAAGCTTCCTAATGTTCTGGTCGGCGCAAATCCAGAAGGGCTGAATACTGAAATAGTTTCTATGTCAGCAGTGAACGGAAACCCTCTCCTAAGCGTTGCGCTAGACAGCGTGGTGAAGAAGTTGACTATGAGGGAGAGCTCACATTTCCAAAACACAGTCGACGATATTTTAGAGGTAGCTTTGAAGTCTGATCTGCGGGAGAGGGTGGATAAGAGATTCAAAGTTGACTGTTCGATGACGGCGGAACAATTAGATCTGCTCCGGAAGATGTTGAAGATTAACAATATAGAAGCTGGTTATGGGAGTCCTGGAGCACATCCTATATTCAACGCTATGAGGAAGTTCTTCAACGAGATGTGTGCTCGCGCTTACAGGGGAGTCCTAGTCTCAGATATTGGGGGCAGTATCTTGAACTGTGTGGTCAATAAGCTGACGAATACTCATGTTTGTGCTCCTAATTTGGATTTAAAAGACGCGGGAAGGCTGAGCAAAGCTTGTATAAGTTTGCTCAATAAAGTAGGAGACTTCAAAGAATTCGATGAGAATTATCTCAAATTCATGACTACTATATCTAACTTATCGGTGTGCAACGCGAGTGTTCCTAACTGCAAACATAGGAGCTCTGTTATCACCATGGTCGATGTTTATGACATACATGTGGAACAATTGTTGCAAGCTATGGAGGTTAAAGGTGCAGTCTTGGCCAGATTGTTCTTTATGTTTCCCCCTGAAATTCTAGCAGGTGCAGAGTTGGTGCAGTATCCTGAAACATCTCTCACTGTCAGTAAAGAAGGGAGAGACTTGATATATTTTATAGGAGAAACAGGTGACTCTTACGTTCACTCCCTGGATACCTTGCTCTCCTATATCACTCGAAGCGTAGTAGTGAGCAAAACAGGAAACAGCTACTACATTGAACTSAATGAGCAGTTTGGACCTTATTTGGATATTACCGTATCTTTAACCCGAAGGAGAGAAGTTCAGACGCTTCCTAGAAGGTTGGTGCCTTGGACGGCGGGAATGACTCGCATCACGATACCGAGAATGAACGAACATGGAGTGGTGGACAAGTTTTCGATATTGGTCAACAGAGACTTCGTTCGTAGAAGCTTGTCTTACGCCGCTAACGTCTGCAACACTACCGACGATCGTACTTTCGAGTACGTTATGTCGAATCTCAGGTCGCAGACGACTATGATGGTAGTTGGCTCAAAAATAGTACACACAAAGGTAGATTTATCTAATGACGTGATTGTTGAGCTACCTACTGTCATTCTGAATGAAGCCGTTTCAAGACGGAATCGTGCCGTCAAAATGTTAAAACAGACTAACAGGGGTTTCCTATATAAGATATTCTCCACCCTTTATAAAGGATTAACTGCCTCTGTGWGTTGGGTATTAAAGAAAATATTCAATTGCCTCCCAAAGTGCGTTGTGGACGCTTGTGAGGATTTGTTTAAGACGCATTATGGATTGAAAGATACAGACGATGAAATTGTCGTCAATTCTTCCGTGGAGTCTGGACCATTAGACTGCGAAAATGAATATATTGAAGAATTATTGATGATTTCGCAAGCGTTGGCCGGACTCAATTGCAAAGCTGGACCGATGAAGCTTGAGGAGGAAATTAACGAAATTGAAGAAGAGCTTGAAGATGATTCGTTTGAAAACCTCAAAAATCCGATAAACGAATCAAAGAATSAACGGTCCGGAGGTTTAAAAGGTGGCGGCGCAACCAATTGGTATGATTTCCTACTGCCGAACAGGCCGGAAGCCAAACCTGCAGACTCTGCTAGAGCTGCGCTGTGGCGTTTATGCAGGCGTTTGACAAGAATGGTGTGCAATCTAGACATAGTGACTCCCATCAGAAGATTGCTAACGACCCTGCTACTAGCATTGTCGAAGTTTATAAATCCGGATGGAAGATACGAAAATGTTAAAAGGAAAGATGAGGAGAGACTGGACCAGACATTGAAAACTATGGTAGGAGAAATTTTGAAGAGAGGTTTAGTGAAAGTGGGTGATCTATTAAAGGGATTCTCTCATGTTGCATGTAAACCACTCGTATATGTTGGACAGGCATCCACTACTCTGTTCACCAACGCATGCAGTGCTTTGAAGGAAGATGCTGCTGATCGTATCAGACAGCTAAAACACAGGATAGCAAAAGCGCTGAAAGCAGCAGATATGGCTTACCCAAAAGACTGGATAATTGAGGGGAAATATCTCAGGTTTTTCAATAAGTACATCAGGAGATTTATCCCACACGCTGCATTTGCTTCCGTGGTTGTATCTGCCATAGTAATAAGTAAAGCCAACAAAGTGTTTTGTAAAACTTTAAACACCATGTTTGATAAGCTTAAAAGTAAGTTGGAAAATTTAAAACTTGTGTCGACAAGTACTCTCTGTGCGATAATGTTTGGGATGTGCTTTTGCAAATTCGTCAATTTAATATCTGTTGTCAGTGCTGTCGCAAATCCACTTACATTGGCTTTACCAGTTTATGTGGGGGCTGAATTTTCCAGCGTAGTACATGACGGTTTGGGCGGAAGAAACATACTTAATTTCAATCGGTTTATGAGAATTTTAATCAACTTAAGCGCGCTTAAGACCCTCAAACCACCAATCSAATACGTGCCTACGTCCGATTCTGATAGAAGCGGTAGAGACGCTACAGATGTTGTTCCTGACCTGAATCGCTTCGACAGGAGGATGGTTATGGCTAGGGCGTTGGACACTTTCCGGACAGCGGCGGTGAACCTGCAGAGAGACGAGACACGCCTAGAAAAGGCGTCTCAAACACAAGAATCACACGAAAACCCACATCAGGCGAATCTTATAGATCTCACCAAAGCGCAAGACAGCGATAGCGAGCGTTTGAGGAAAGGTAAAGCTGTCGTCTCTGATGTTCATGATGCGGTTGCGAACGAATCTCTCGAGGTGATGCGAGAATCTGGTGAGATTATGCCTGGTGTAGGACAGGAAATTGGATCATCCAGCGGAGTTTCGAGATGTAGGTTCGAAGGGGTTTTTAAACCCGCTATTCCCGTTGTCTTCGGTGAGAAAGATAAAAGACCCTTTGAAGAGTCGTCTAGAGAGAGTGATTCCACAATAATGCCCGAAAGAAATTTAGTTGTGGAACATACGCAAACATTAATTTTAGGCGACGATGTGAGGTCAGAAGGGGAAAGCGTAGAGAATAACCAAAC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GTCGGCACTTATGTTGCTAATACATGGTGGCAGAGATCTGGGGCTAACATGATGGCGTGGTCGGATTCGGAAGGWTGGGCAAGACACTTATTGGGAAATTTTATAGTGTCGAGAAATTTACTGGGTCATCTTTACTATCCGCTAGCAACCGAGATAAGGGCAGCTTTGGCAACTCCGGAAACATTACTCAGAGCAAAATTAGCTCTAGTCGATGTTCCTGTTACACAGTCGAGTAATTTCGTTTACAAGGTGTCGAAGGTCACCGCGCGTGACATGGCACGTTCGTTGCCTGGGGAGGAGGAACATTTGACGGATTTGATTTTTTGCGTAGGCAATTATCTTGGAGAGTTACCTACGAGAAACCAGATTATGGGAGAAGTCGCTTTACCTGTAGCTGCCGTTCGCAGTGTGGGGAGTGTCATAAGCGTGTCAGATACAGATTTGTCGAATGAGAATAAGCTCGCTGTTTTGAATATGCTGGCGAAGTCAAAAATGGCGGATCCTATCGAAGGAGTGAAATTCGTGTTGGAGAAGCAGAAGATCGATGACATATGCAAACACTTATTCAAATCTGAAGATTTACTTTTATGTTCGTCTCTTCCTGCTGTCAGATACACTATTTTAAAAGCTTTAGAGTCAACTGACGGTTCTACCAGCACGTTTGAAGACCGAGTAGAAACTGCTGTGGTTGTTGGAATCAAAGTGCGGAAAGATCTGCAAGGTTTGTTAAGGTACAAGGATGAAGAAAGCTTGAGTACGCTTCTTGCTAAAACGGCAATCAATTCTGGGGAGATGGTTAGAGGTGACGCTGTTGTTATGCACAGCAAATATGAGGATAATTTGATGGGTAAAACGTTGATGAGAGTTGCTTCACCTTTCACTCAACAACAATACTCCGATCTTACCGCGCGGATAGTGAGAGAGTTTCTGTTGAACAACATGCATGTCGATTTTAACTTTGCTGAAGCAATATTGGCAATTTTACAGAGATACATACATTACAGGACGAATCCGGTWAGATTCACCAATCTACCAACTAAATTGGAGATGGTGCATAAACACAAGACTTATGTCGTGAATTATTCCGGAGTCGACAGAGTGTTTGCTGAGTATCAGAATGCTATCCCAGAGGTGGAAAGGGCTTGGTGTGCGCCGTTAGCTACAGTAGCATACTTCATTCTGCGGGATACTGGAGGTTCATACGCTAAATGGCGAGACATGATGGATATTCCACCTAATTTGAACTTTGATTTTGTGGGCTACGTGGATCCTCGCGCACTGTATGAGCATGAAAACGTTCACCTAGTGCGTTTAGCTCATAGATTCAGGACCGCAAACACTCCGGTAAGAGGGTTTAAGTTAAGTAACAGACTTGTAAACCCGATAGATTTTATGTATGATCAGCTACCTTTGCCTGAGACTGTGAAAAACCATCACAAAACTTTATTWAAACACACTCAGTGAGTGATTATGACTTTTGTTTAAGATGGCTGATTCGAGCAAACAAAAACAACCTGAACATGCTGACTCTGGGCCTAAGACAGTGGAWGACCAAGTCAAGGAAATAATGAACCTGCCTGTGCCGGGAGGTAGAACTACTGTGTCGACGTTTGAAGATTTGATAGCAGCTGAAAATGCTATAATTGATTTCACCAAGGTTGATGTACCACGCATGATTAACGTTCCGATCCCAGGAATAGTTACTAATGCWCACAAGGTGATAGGATCCAAAGCTCTGTGGGAGTTGGGTAAATCGAAGGGTATATCAGAATCGGCGAAACACATGATTCAATTTTTGATGCAATCTTTCCAAGATATGTGCACCTTTTCTACATCACCGAAAGTTTCGGCGACTCAGAACTACTCCACCACAGCTAAGTATGATGGTAAAGATGTTAACGTCACGCACGAGGAGATCAGAATTGCTTTGAGCAACTCACTATCCAATTTGGGATACGATAATCCTATGAGGCAGTTTGGGAGAGGTTTTACTTCCACAATTGTTCAAGGACTGAGTTCTGGGAAGTTGGTGGTTAACACTAGGATATGTACTAAGAACGGAGTACCGAGGAATTATTACTCGTTCTATCCAGATTGCTTACACGTGGAAGCCAGAGTACACGGTGATGATGCAGCGTTGGTAAGTGAGTTAGCCAGAATGGTAGCCATAAACAGAGCAAACTCGAGTGGTTCTGGCGAACACAACGTCTTTGAGAAGACGGCTGTGTCCCCGCACATATTTATGGGCGGACGCAAATAAGGTCTGAGACCTTTATTTTCCTTGTTTAAGGATGGAGAGGATTATATTGGTAAGTAAGGACAAAAACCTCCTCAATGCTAACGAGGAAGAAATATTTTACAAAGTTAAGTACAGTTTGTTCATGCGCGCAAAAGAGGGAAACGAGTGTTCTTTCTTTTACGATAAATTGAACGTCTTCTCTGACTCGAGTAGGAGAAGGTATGCTGAGCTATTTAGTTTCCTCGACTCTCTAGGCAACGTGGTGGCTACCAACAATGAGACATTCCTAAATTTCTTGGATGGACTCAGTGTCGATGATTACATGTTGAGGAGATATGGTGGTCGAGGTAAGAGAGAGTTGAGTGAAGGAGAAAAGAGAGCTCCTTATCTGACTATACCGGTTCCGGCTTTAGAAACACTTTGGGGTGTTATTGAGGAATCGGGTAAGAAGCTACACAAGGTTCATTGTGTTGGCTTCGTTCGAAATCGTGGGTCATCGTGTGATGAACTCTACGATTTTGATAAGTCTTTCGCCGTATTCGATTACGGTGAGGGTTTTGAAGTAGTGTACGGWGGATCCGTAGACTCTTCCAATGTGGCTTTAAAGGGAAAACTTAAAATTCTAAAAGAAGCCGAAGAGAAGACAGGATTAGAGAAGGTGGTCGGTATCCTATCTGAAATTTAAAAGAAAAATGGACCACCTTGGGAAGTGATGACCGGGACTTCCCAACCCGCCTTACCACAGGTAAGATAGGATGTTTATCCGAACGGGGAATGCTAGATGGGGATTATCCCCACCTTAGAAATTCTAGGGCCG
| 18,367
|
OP860293.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-1/S2-2
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 10,801
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1 isolate PMWaV-1/S2-2, complete sequence
|
AAGTTTATTTAAGTACCAAATCAAAATCAAATCATAAACTGCAACGAACTTTCCAAACTAACTCAATTTCATTTCCGAAATTTGAGCTTTGAAACATTATTCTAAACGCCCGAAGTTATTTTCCCAACCTATAAGTTTTATCTCTAATACGCTCCCGTATTAATCTACGTCTCTAAACGTTTTAATATTTTCCAGAAGAAAACCAAAACAAAATAATACGTGTTTAGGGTAAGACGTTTAACTTTCGTCAGTTTGTGTTTTCCTTACTATATAAAAATAGCGCTTCTGTTAAGTGTTTTCAAAATGCCGTGGTTTATATTTATAAGAGTTCCCTAATATGAAGCGCGAGATAAAGAAGACATACTCGCAACAAAACCAAAAACCCATAAACAAAAAATTTCCCAACAACAATCCAAAGGCTAAGGCTGGGCAGTCGAGTTCGCAGAACGCGAACGGAAAAGAGAAAGTTCCCAGTAATAAGGAGCTTAAATTAAAATTCTTTTACAGCCCAGTTGTAAAAGACCTTTCTAAACATTTTTCCAAAACCAAGTCTGTGGATAGTGCGGGGCCGAGCCGTAAAACATCTACACCTCCTTCTAGAGGTAGTTCCCCGCAATCAGTAAAGCGAGAGGCGGTGGTCCTCGTTCGTGATAGGCTGTCCCATAAAAATTTTCCAAATATTTCTAGGAACAGCTCATACTCCTCACACGATTCCGATGTTGAAGGCTTCAAGAAAGCAATCAACAGTTACATGCCCAAACCGGAGGGGTGGAAGAAAAGTTTCACTAAACGTCAGTGGGGGAGGGTTAGTGACGATTCCCTGCGAGAACAAAACCTTTTGCCGTCACCACCAAGATCCCACGCGAGCGATGCTGGGAGCATCAGTCCGAGCAAGGGTCTCGGGCTACAATTTGGAAGTTTTCCCGAAGTCGCCGGGAATGTCAGACGGGGCTCCCCATGTCGATCCCCTGTCAACGCTGAGCGTCGCGACTTACACGACGCAAAACAAGCAGCGTGTCTTGATAAAGGAAAGACCGTTGATGAGAGTCTTTCTTCTTCTGAGAGCCAGTCTTCTACAAGCTATGTTTCTGAAGATTCCGTGGTTGAAGACTATTTTTACGACCAGAAACGCAGGAGAGTGTGTCTCTTGAAGGATGAACACATCGTCCTAAATAGGGAGCACGGGCAGCTAATTGTCGAATTATCTGAGCTGAGTCTAGCGAAGGAGATACAGCTGGTGGATTATTTAGACTCTGCGGGCAAATGGGCTTCCAAGTCTATAGCTGAATTTGTAAGAGATAGGTTGAGGAAGGATAGGTTGAAAGCTCTCAGAGGTAATGTGCTCATTGGCAACAAAGCTTTAGCGCATTTCTTTTCCCCAGCTGGAATTTATCTCGGAAAAGTAGCGCTACAAGAGAAAGTATGGTTTTATTTCAGAACTGCAGGCAGGAGCCACGGAGAGTACATTTCATGTGGCAACGGGAAAGTGAGCCGGCTTTTCATTAAGAACCGTTTTCCAACTCTTCAAGAAGCGGTGGCTCACGACTGGGCGAAAGGCTACAGTTCGTTAGAACATATGACTCTTTACGATCCGGTTTTCGATCGTAATGTACACGCAAAGAAGGGGTATTGTTGGTTACCTCTTTTCTTAAAATCTAAAATACCTCTATCGAAATACCCGCAGTGTCCTTATGTGAGATTGAACCATCTGAGGAGGCTGTTTGGTGAGGTAAATTTAGTTAAGGCGGGGGAATACTATCATTATTCGGAGTCAGGAATTAAAAATCCAAAGCTTCCAAATGTTCTGGTCGGCGCAAATCCAGAAGGGCTGAATACTGAAATAGTTTCTATGTCAGCAGTGAACGGAAACCCCGGAAACCCTCTCCTAAGCGTTGTGCTGGACAGTGTGGTGAAAAAGTTCTCCACCCTTTATAAAGGATTAACTGCCTCTGTGATGTGGATATTAAAGAAAATATTCAATTGCCTCCCAAAGTGCGTTGTTGATGCTTGTGAGGATTTATTTAAGACGCATTATGGATTGAAAGATACAGACGACGAAATTGTCAGAAATTCTTCCGTAGAGTCTGGGCCATTAGAATGCGAAAATGAATATATTGAAGAATTATTAATGATTTCGCAAGCGTTGGCCAGACTAAATTGCAAAGCTGGACCGATGAAGGCTGAGGAAGAAATTAATGAAATTGAAGAAGAGCTTGAAGATGACTCGTTTGAAAACCTCAAAAATCCGATAAACGAATCAAAGAATCAACGGTCTGGAGGTTTAAGAGGTGGTGGTGCAGCCAATTGGTATGATTTCCTATTGCCGAACAGGCCGGAAACCAAACCTGCAGACTCTGCTAGAGCTGCGCTGTGGCGTTTATGCAGGCGTTTGACAAGAATGGTGTGCAATCTAGACATAGTGACTCCCATCAGAAGATTGCTAACGACCCTGCTACTAGCATTGTCGAAGTTTATAAATCCGGATGGAAGATACGAAAATGTTAAAAGGAAAGATGAGGAGAGACTGGACCAGACATTGAAAACTATGGTAGGAGAAATTTTGAAGAGAGGTTTAGTGAAAGTGGGTGATCTATTAAAAGGATTATCTCATGTCGCATGTAAACCACTCGTATATGTTGGACAGGCGTCTGCTACTTTGTTCGCCAACGCACGCAGTGCCTTGAAGGAAGACGCTGCTGATCGTATCAGACAGCTAAAACACAGGATAGCAAAAGCGCTGAAAGCAGCAGATATGGCTTACCCAAAAGACTGGATAATTGAGGGGAAATATCTCAGGTTTTTCAATAAGTATATCAGGAGATTTATCCCACACGCTGCATTCGCTTCCGTRGTTGTATCTGCCATAGTAATAAGTAAAGCTAACAAAGTGTTTTGTAAAACTTTAAACACCTTGTTTGATAAGCTTAAAAGCAAGTTTGGAAATTTAAAACTGGTGTCGACAAGCACTCTCTGTGCTATAATGTTTGGGATGTGTTTTTGTAAATTCGTCAATTTAATATCTGTTGTCAGTGCTGTCGCAAATCCACTTACATTGGCCTTGCCAGTTTATGTGGGGGCTGAATTTTCCAGCGTAGTACATGACGGATTAGGCGGAAGAAACATGTTTAATTTCAATCGGTTTATGAGAATTTTAATCAACTTAAGCGCGCTTAGGACCCTCAAACCACCAATCGAATACGCGTCTACGTCCGATTCTGATAGAGGCGGTAGAGACGCTACAGATGTTGTTCCTGACCTGAATCGCTTCGACAGGAGGATGGTTATGGCTAGGGCGTTGGACACTTTCCGGGCAGCGGCGGTGAACCTGCAGAGAGACGAGACACGCCTAGAAAAGGCGTCTCAAACACAAGAATCACACGAAAACCCACATCAGGCGGATCTTATAGATCTCACTAATGCGCAAGATAACGATCGCGAGCGTTTGAGGAAAGGTAAAGCTGTCGTCTCTGATGTTCATGATGCGGTTGCGAACGAATCTCTCGAGGTGATGCGAGAATCTGGCGAGATTATGCCTGGTGTAGTACAGGAAATTGGATCATCCAGCGGAGYTTCGAGATGTAGGTTCGAAGGGGTTTTTAAACCCGCTATTCCCGTTGTCTTCGGTGAGAAAGATAAAAGACCCTTTGAAGAGTCGTCTAGAGAGAGTGATTCCACAATAATGCCTGAAAGAAATTTAGTTGTGGAACATACGCAAACGTTAATTTTAGGCGACGATGTGAGGTCAGAAGGGGAAAGCGTAGAAAATATCCAAACTGTCAACACGGAAGTCAACGTCTCAAGATGCGTTAATAAGGTATCATCTCCGCTGAAGATAGTAGACCGACCGGAGCAAGGGGTTGTCCAGCAAGTGCGTAAGGTGCAGCCGGTAAACCGATTTCAAGCTGTCAAGACTATCCTAGCCAACACTCTTGGATTCTCATTTACTGGAATGAACAGTTTCCTAGACATAGAAAGTTATAGGACGCTGGTTAGGAGAGTAAGTGGATCTGATGGATATTCTGCTGTGTTAGAAGCTTTATGTCATTCTCTGCACGGGTTGAGGGCTGAGGTTGACGTTTTGGACAAAGTTGTTAAACAGGAGATACCGTTAATCGGTCACAAACACGAATTGTTTTGTAAGAACATACAAGAGCTGGATAGAGTAAAGTACAAACCGAACGGGTTCCAATATTACAACGTAGAACTCAGCAACATTTACGGTTTATTGAACACTCGCAAGTTAGTATACAATAACGATCCTGTGGTTAAAGAATCGGAGGGGATAGTTTTGTTAGAACCACATGAAATCTCGTTCAATTTGATCCGATCGTTAGCGTTAATAGACCTTCTGACGAAAGTTAGCGCCGAGGAAGTAAATAAGGCGATTGACAGTGTGAAATTTGTGAACGCTGTTCCAGGGGCAGGTAAAACCTACCAGATCAAACAGAGGATGTTACGCTGGGTCGATTCGGAAAAGGATGGTAGTGCGTTGTTAGTGTTGACTTCGAGTAGAAACTCAGCTGATACGCTTAAAGCTTTCGCGCAGGAGAAGAGGTTGGGCAAGATGATTCAGATTTTAACGGTCGATGCATTTTTGTTCCAAGCGAGAGGAAGGAATGTAAGACTTTATAAAACGTTGTTGATAGACGAATGCTACATGACACACGCGGGCATATTGCGAGGTATAATCGCCGCTGTTCAGCCGGAAGAGTGTGTACTTTACGGTGATAGGCGACAAGTGCCCTTTATCAACAGAATCAAATTGCTAAATGACAATAAATCCTTTTTGAAACCGAGTTTCGGCAATTATTCAGAGATGTTGATAACTAGGCGGTGTCCCGCAGACATCTGTTGGTGGATGTCCAATGTTAACAATGGGAAGAAAGGAGATCGTTTGTACTCAGGGCCGGTAAAATTGTTTACACAGTCTAAACCAGTCCTAAAAAGTGTAACATGTAAAGCGTTCAGTAAAGGTGATCATAATCTATTCTCACAGGTAG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| 18,368
|
OP860294.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-1/S3-1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,257
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1 isolate PMWaV-1/S3-1, complete genome
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TTAGCTTATTTAAGTAACAAATCAAAATCAAATCAAAAACTGAAACGAACTTTCCAAGTAATCTCACTCTTATTTCCAAAATCTGAGCTACGAACACTTCTCTAAACGCCCGAAGTTTCATTCCATACTTTCAAGTCTCATCTCCGACGCGCTCCCGTTTTATTTTAAGTTTCCAAGCGTTTTAGTATTTTCCAAAGAAAACCCAAAACAAAATAGTACGTTTTTAGTGTAATACGTTTAAATTTCGGTTGCTTACGTTTTCCATACTATATCAAGATAGCGTTTCTATTAAGTATATTTAAAATATCGCTTTTAATATTTTATAGAGTTCCTTAACATGAAGCGTGAGAAGAAGCAAATCTCCTCACAACAAAAACAAAACCCATCTACTACGAAAGTTCCCGACAAAAATCCAAAATCAAAACCTGGGCCGTCAAGCTCGCTAAACGCAGGCCCAAAGGAAAGAGTTCCTAGCAATAGAGAGCTGAAGTTAAAATTCTTTTACAGTCCGGTAGTAAAAGATCTTTCAGAACACTTTCCTAAAACAAAGCCTTCTGAAAAGGCAGGACCGAGCAGTCGATCTCCTACACCTCCTAACAGAGGTAATTCCCCACGCTCATTGAAGCAGGAGGCGGTGGTTTCGGTCCGTGATAGACTATCCCACAAACGTGACGCAAATCTTTCCAGGAATAGCTCGTACTCGTCACACAGTTCCGATGTTGAAGGCTTCAAGAAAGCAATCAACAGTTACATGCCCAAACCGGAGGGCTGGAAGAAAAGTTTTTCTAAACGTCAGTGGGGGAGGGTTAGTGACGATTCCCTGCGAGAACAAAACCTTCTGCCGTCACCACCAAGATCCCACACGAGCAATGCTGGGAGCATCAGTCCGAGCAAGGGTCTCGGGCTACAATTTGGAAGTTTTCCCGAAGTCGCCGGGAATGTCAGACGGGGCTCCCCATGTCGATCCCCTGTCAACGCTGAGCGTCGCGACTTACACGACGCAAAACAAGCAACGTGTCTTGTTAAAGGAGAGACCGTTGATGAAAGTCTTTCTTCTACTGAGAGCCAGTCTTCTACAAGCTATGTTTCTGAAGATTCCGTGGTTGAAGACTATTTTTACGACCAGAGACGCAGGAGAGTGTGTCTCTTGAAGGATGAGCACATCGTTTTGAATAGGGAGCACGGGCAGCTGATTGTCGAATTATCTGAGCTGAGTTTGGCGAAAGAGATACAGCTCGTGGATTATCTGGACTCTGCGGGCAAATGGGCTTCCAAATATATAGCCGAATTCGTCAGAGATAGGTTGAGGAAGGATAGGCTGAAAGCTCTTAGAGGCAATGTGCTCATAGGAAACAAAGCTTTAGCGCATTTCTTTTCCCCAGCTGGAATATACCTAGGAAAAGTAGCGCTACAAGAAAAAATATGGTTCTATTTTAGAACAGCAGGCAGGAGCCACGGAGAGTACATTTCATGTGGCAACGGGAAAGTGAGCCGGCTTTTCATTAAGAACCGTTTCCCAACTCTTCAAGAAGCGGTGGCTCACGACTGGGCGAAAGGCTACAGTTCATTGGAACATATGACTCTTTACGATCCGGTATTCGGTCGTAATGTACATGCAAAGAAGGGGTATTGTTGGTTGCCTCTTTTCTTAAAATCTAAGCTACCTCTATCTAAGTACCCACAATGTCCTTATGTGCGTTTGAACTATCTAAGGAGATTGTTCGGGGAAATCAACTTGATTAAAACAGGTGAATACTATCATTACTCGGAGTTAGGAACTAAAAATCCGAAGCTTCCTAACGTTTTAGTCGGCGCAAATCCGGAAGGGTTAAATACTGAGATAGTTTCTATGTCAGCGGTAAACGGAAACCCTCTCCTAAGCGTCGCTCTAGACAGTGTAGTGAAGAAGTTGACTATGAGGGAGAGCTCGCATTTCCAAAATACTGTCGACGATATTTTGGAGGTGGCTTTGAAATCTGATCTGCGAGAGAGGGTTGACAAAAGGTTCAGAGTTGACTGTTCGATGACGGTAGAACAGTTAGACTTACTCCGGAAAATGTTAAAAATCAACAATATAGAGGCTGGTTATGGGAGTCCTGGAGCACATCCTATATTCAACGCTATGAGGAAGTTCTTCAATGAGATGTGTGCTCGCGCTTATAGGGGAGTTTTGGTCTCAGATATTGGAGGCAGTATTCTGAACTGTGTAGTCAACAAGTTGACGAACACTCATGTTTGCGCTCCAAATCTGGACATAAAGGACGCGGGAAGGCTGAGCAAGGCTTGTATAAGCTTGCTCAATAAAGCAGGAGATTTTAAAGAATTCGACGAAAATTATCTCAAATTCATGACTACTGTATCCAATTTGTCGGTGTGCAATTTGAGTGTTCCCAACTGCAAACATAGGAGCTCTGTTATCACAATGGTTGATGTTTATGATATACATGTGGAACAGTTGTTGCAGGCTATGGAGGTCAAAGGGGCAGTTTTGGCCAGGTTGTTCTTCATGTTTCCCCCTGAAATTTTGGCAGGTGTAGAATCGGTGCAGTACCCCGAAACATCTCTTACTGTAAGCAAAGAGGGGAGAAACTTGATATATTTTATAGGAGAAACAGGTGATTCTTACATCCATTCATTGGATAACTTGCTCTCCTATATTACTCGAAGTGTAGTAGTGAGCAAAACGGGGAACAGCTACTACATAGAACTCAATGAGCAGTTTGGTCCTTATTTGGATATCACTGTATCTTTGACCAGGAGGAGGGAGGCCCAAACGCTTCCTAGAAGGTTGGTACCTTGGACTGCCGGGATGACTCGCATAACGGTACCTAAATTGAATGAACGTGGGGTGGTAGACAAGTTTTCAATATTAGTCAATAGAGACTTCGTTCGTAGAAGTTTGTCTTACGCCGCCAACGTTTGTAATACCACTGATGATCGTACTTACGAGTACGTCATGTCGAACCTTAGGTCGCAGACGACAATGATGGTGGTCGGTTCAAAAATAGTACACACAAAGGTGGAGTTGTCCAATGACGTGATCGTTGAGCTACCTACCGTCATTTTGAATGAAGCCGTTTCAAGACGGAATCGGGCGGTCAAAATGCTGAGACAAACTAACAGAGGTTTCCTACATAAGGTATTCTCCAACCTTTATAAAGGATTAACTGCCTCTGTTAGTTGGATATTAAAGAAAATATTCAAATGTCTCCCGAAGCAAGTCTTGGACGTTTGTGAGGATTTGTTCAAAACTCATTACGAACTGAAAGATACAAACGACGAAATAGTGGTTGATTTTCCTGTGGAGTCTGGTCCACTACAGTGCGAAAATGAGTATATCGAGGAATTATTGATGATCTCACAAGCGTTGGCCGGACTGAATCGTAAATCTGGACCGTTGAAGCCCGAAGATGAAATCAACGAAATTGAAGAAGAGCTTGAAGATGATTCATTTGAGAATCTTAAAAATCCGACTAACGTGCCTAAGAGCAAGCAGTCGGGAGGCTTAAAAGGTGGTGGTGCGACTAATTGGTATGATTTTCTAATACCAAACAAGCCGGAAGCCGAACCCATGGAGTCTACTAGAGCTGTATTGTGGCGATTATGTAGGCGTATGACGAGAATGGTATGCAATTTGGATATAGTGACTCCTATCAGAACATTGCTGACAACCCTGCTGCTGGCATTGTCGAGATTCATAAGTCCGGCGGGAAAATTTGAAATCTCAATCAAAAAGAAGGATGGGGAAAAAATAGATAAAACATTGAAAACTTTGGTGGGAGAAACTTTGAAAAGAGGTTTAGTGAAAGTGGGCGATCTATTGAAAGACTTTGGTCATATTGCATGTAAACCGCTCACGTGTGTCGGAAAAGCATCTGTCACATTATTCACTAGCACATGTGACGCTTTAAAGGAAGATGCTACCGAACGTATCAGGCAGCTGAGACACCGAATAGCAAAAGCTCTGAAAGCTGCGGGCGTGGCTTACCCGAAAGATTGGATAATCGAAGGGAAATATCTCAAATGGTTCAATAAGTATATAAGGAGATTTATCCCTCATGCTGCGCTAGCTTCCGTAGTTGTGTCTGCCATTGTGATAAGCAAAGTTAACAGAGTGTTCTGTGAAACTTTGAACACCTTGTTTGATAAGCTTAAAACCAAGTTGGGAAATTTAAAACTGGTGTCAACGAGTACTCTCTGCGGAATTATACTTGGGCTGTGTTTTTATAAATTCGTCAATTTAATATCTGTGGTTAGTGCTATTACGAATCCACTTTCGTTGGCTCTACCAGTTTATGTGGGCACAGAAATTTCCAGCATTGTACACGACGGTTTGCGTGGAACAAACTTAATCAATTTTAATCGGTTTGTGAGGATTATGATAAATTTGAGCGCGCTTAAGAGTTTCAAACCACCAATCGTATATGATTCTGCATCCGATTCTGATAAAAGTGGTAGAGACGCCACAGATATTGTTCCTGACCTAAATCGATTCGACAGGAGAATGATCATGGCTAGGGCGTTAGACACTTTCCGGGAGGCGGCGGTGAACTTGCGGAGAGACGACGTAAACCCAAATAGTGCGTCTCAAACTCACGAATTGCGAAATGAAACACATCAGGAGAGTCCTGTAAATCATTCTAATGTGCAAGATAACGATCGTGAGCGTTTAAAGAAAGGTAAAGTGGTGATTTATGATATTCCCGACGCGATTGCGGAAGAAACTCTCGAGGTGACGCGAGCGTCTGATAAGATCACGCCTGGTGTAGTACGAGAGTTTGGGTCGTCCAGTGGGACTTCAAACTGTAGATTCGAAGGAGGTTTTAAACCCGCTATTCCTGTCGTCTTCGATGAGAGAGACAAAAGACCCTTTGAAGAGTCGTCTAAAGAGGGTGACTCCACAACAATGTCTGAGAGAAATTTAGAAGTGGATCAAGTGCAGACATTAAATTCAGAAAACGCAGTGATAGCAGAAGGGGAAGGTGTAGAAAATATCCAAA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| 18,369
|
OP860295.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-1/S3-2
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,184
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1 isolate PMWaV-1/S3-2, complete genome
|
TTAGCTTATTTAAGTAACAAATCAAAATCAAATCAAAAACTGAAACGAACTTTCCAAGTAATCTCACTCTTATTTCCAAAATCTGAGCTACGAACACTTCTCTAAACGCCCGAAGTTTCATTCCATACTTTCAAGTCTCATCTCCGACGCGCTCCCGTTTTATTTTAAGTTTCCAAGCGTTTTAGTATTTTCCAAAGAAAACCCAAAACAAAATAGTACGTTTTTAGTGTAATACGTTTAAATTTCGGTTGCTTACGTTTTCCATACTATATCAAGATAGCGTTTCTATTAAGTATATTTAAAATATCGCTTTTAATATTTTATAGAGTTCCTTAACATGAAGCGTGAGAAGAAGCAAATCTCCTCACAACAAAAACAAAACCCATCTACTACGAAAGTTCCCGACAAAAATCCAAAATCAAAACCTGGGCCGTCAAGCTCGCTAAACGCAGGCCCAAAGGAAAGAGTTCCTAGCAATAGAGAGCTGAAGTTAAAATTCTTTTACAGTCCGGTAGTAAAAGATCTTTCAGAACACTTTCCTAAAACAAAGCCTTCTGAAAAGGCAGGACCGAGCAGTCGATCTCCTACACCTCCTAACAGAGGTAATTCCCCACGCTCATTGAAGCAGGAGGCGGTGGTTTCGGTCCGTGATAGACTATCCCACAAACGTGACGCAAATCTTTCCAGGAATAGCTCGTACTCGTCACACAGTTCCGATGTTGAAGGCTTCAAGAAAGCAATCAACAGTTACATGCCCAAACCGGAGGGCTGGAAGAAAAGTTTTTCTAAACGTCAGTGGGGGAGGGTTAGTGACGATTCCCTGCGAGAACAAAACCTTCTGCCGTCACCACCAAGATCCCACACGAGCAATGCTGGGAGCATCAGTCCGAGCAAGGGTCTCGGGCTACAATTTGGAAGTTTTCCCGAAGTCGCCGGGAATGTCAGACGGGGCTCCCCATGTCGATCCCCTGTCAACGCTGAGCGTCGCGACTTACACGACGCAAAACAAGCAACGTGTCTTGTTAAAGGAGAGACCGTTGATGAAAGTCTTTCTTCTACTGAGAGCCAGTCTTCTACAAGCTATGTTTCTGAAGATTCCGTGGTTGAAGACTATTTTTACGACCAGAGACGCAGGAGAGTGTGTCTCTTGAAGGATGAGCACATCGTTTTGAATAGGGAGCACGGGCAGCTGATTGTCGAATTATCTGAGCTGAGTTTGGCGAAAGAGATACAGCTCGTGGATTATCTGGACTCTGCGGGCAAATGGGCTTCCAAATATATAGCCGAATTCGTCAGAGATAGGTTGAGGAAGGATAGGCTGAAAGCTCTTAGAGGCAATGTGCTCATAGGAAACAAAGCTTTAGCGCATTTCTTTTCCCCAGCTGGAATATACCTAGGAAAAGTAGCGCTACAAGAAAAAATATGGTTCTATTTTAGAACAGCAGGCAGGAGCCACGGAGAGTACATTTCATGTGGCAACGGGAAAGTGAGCCGGCTTTTCATTAAGAACCGTTTCCCAACTCTTCAAGAAGCGGTGGCTCACGACTGGGCGAAAGGCTACAGTTCATTGGAACATATGACTCTTTACGATCCGGTATTCGGTCGTAATGTACATGCAAAGAAGGGGTATTGTTGGTTGCCTCTTTTCTTAAAATCTAAGCTACCTCTATCTAAGTACCCACAATGTCCTTATGTGCGTTTGAACTATCTAAGGAGATTGTTCGGGGAAATCAACTTGATTAAAACAGGTGAATACTATCATTACTCGGAGTTAGGAACTAAAAATCCGAAGCTTCCTAACGTTTTAGTCGGCGCAAATCCGGAAGGGTTAAATACTGAGATAGTTTCTATGTCAGCGGTAAACGGAAACCCTCTCCTAAGCGTCGCTCTAGACAGTGTAGTGAAGAAGTTGACTATGAGGGAGAGCTCGCATTTCCAAAATACTGTCGACGATATTTTGGAGGTGGCTTTGAAATCTGATCTGCGAGAGAGGGTTGACAAAAGGTTCAGAGTTGACTGTTCGATGACGGTAGAACAGTTAGACTTACTCCGGAAAATGTTAAAAATCAACAATATAGAGGCTGGTTATGGGAGTCCTGGAGCACATCCTATATTCAACGCTATGAGGAAGTTCTTCAATGAGATGTGTGCTCGCGCTTATAGGGGAGTTTTGGTCTCAGATATTGGAGGCAGTATTCTGAACTGTGTAGTCAACAAGTTGACGAACACTCATGTTTGCGCTCCAAATCTGGACATAAAGGACGCGGGAAGGCTGAGCAAGGCTTGTATAAGCTTGCTCAATAAAGCAGGAGATTTTAAAGAATTCGACGAAAATTATCTCAAATTCATGACTACTGTATCCAATTTGTCGGTGTGCAATTTGAGTGTTCCCAACTGCAAACATAGGAGCTCTGTTATCACAATGGTTGATGTTTATGATATACATGTGGAACAGTTGTTGCAGGCTATGGAGGTCAAAGGGGCAGTTTTGGCCAGGTTGTTCTTCATGTTTCCCCCTGAAATTTTGGCAGGTGTAGAATCGGTGCAGTACCCCGAAACATCTCTTACTGTAAGCAAAGAGGGGAGAAACTTGATATATTTTATAGGAGAAACAGGTGATTCTTACATCCATTCATTGGATAACTTGCTCTCCTATATTACTCGAAGTGTAGTAGTGAGCAAAACGGGGAACAGCTACTACATAGAACTCAATGAGCAGTTTGGTCCTTATTTGGATATCACTGTATCTTTGACCAGGAGGAGGGAGGCCCAAACGCTTCCTAGAAGGTTGGTACCTTGGACTGCCGGGATGACTCGCATAACGGTACCTAAATTGAATGAACGTGGGGTGGTAGACAAGTTTTCAATATTAGTCAATAGAGACTTCGTTCGTAGAAGTTTGTCTTACGCCGCCAACGTTTGTAATACCACTGATGATCGTACTTACGAGTACGTCATGTCGAACCTTAGGTCGCAGACGACAATGATGGTGGTCGGTTCAAAAATAGTACACACAAAGGTGGAGTTGTCCAATGACGTGATCGTTGAGCTACCTACCGTCATTTTGAATGAAGCCGTTTCAAGACGGAATCGGGCGGTCAAAATGCTGAGACAAACTAACAGAGGTTTCCTACATAAGGTATTCTCCAACCTTTATAAAGGACTGACTGCCTCTGTCAGTTGGATATTGAAGAAAATATTCAATTGCCTCCCAAAGCAAATCATTAATATCTGTGAGGATTTATTCAAAAGTCATTATGAGCTAAAAGACACGAACGATGAGATCGTAGTCGATTCTTCCGTGGAGTCTGGTCCTTTAGAATGCGAAAACGAATATATTGAAGAATTATTAATGATTTCACAAGCGTTGGCTGGACTCAATTGTAAATCTGGCCAGATGAAGTCTGATGAAAAAATCTGTGAGATTGAGGAAGAGCTTGAAGATAACTCGTTTGAAAACCTCAAAAATCCGACAACAGACTTCAAGAATAAACAGTCCGGAGGTTTGAAAGGTGGAGGTACAACTAACTGGTACGATTTCTTGTTGCCAAACAAGCCGGAAGCCAAACCTATGGAGTCCACCAGAGCCGTGCTGTGGCGGTTGTGCAGACGGTTGACAAGAATGGTGTGTAATTTGGACATAGTGACTCCCATCAGAAGATTGCTGACGATCCTGCTGCTGGCACTATCGAAGTTTATAAATCCGGAGGGAAAATTTGAAATTTTGATGAAAAAGAAGGATGAGGAGAAAGTTGATAACACATTGAGGACTATGGTGGGAGAGATTTTGAAAAGAGGTTTGGTGAAAGTAGGAGATCTAATGACCAGATTCGCTCATGTTGCATGCAAACCGCTTGTGTTTGTCGGAGAAGCATCAACCGCATTAGTCTCTAGCGCGTACAGTGCCTTAAAGGAAGATGCTGCTGATCGCATCGGACAGCTAAAACACAGGATAGCCAAAGCTTTGAAAGCTGCTGATATGGCTTACCCGAAAGACTGGATAATAGAAGGAAGATATCTCAAATTTTTCAATAAATATATAAGGAGATTTATCCCACATGCTGCACTAGCTTCAGTGGTTGTGTCAGCCGTGGTTATAAGCAAGGTGAATAAAGTGTTTTGTAACACTTTAAACTCCTTGTTTGATAAGCTTAAGAGCAAGCTGAAAAATTTGAAACTGGTGTCAACGAGTACTCTCTGCGCGGTCGTGTTAGGGATGTGTTTTTATAAATTCGTCAATCTGATAGCGGTGGTTAGTGCTGTTTCTAATCCACTTTCGTTGGCTTTACCAGTTTATATGGGAGCTGAATTTTCCAGCGTTGTGAGTGACGGTTTGGGTGGAACAAACCCAATTAATTTCAATCGGTTTGTAAGGATTTTGATGAACTTGAGCGCACTTAAGGCCTTCAAACCACCAATTGAATATGTTTCCGAATCAGACTCTGACAAAAGCGGTAGAGATGCTACGGATGTTGTTCCTGATATAAATCGCTTTGACAGGAGGATGGTCATGGCTAGGGCGTTAGACACGTTCCGGACAGCAGCAGTAAATTTGCAGAGTGATAATACATGCCAAGGAAATTCGTCTCAAACGCATCGTTTACAGGATGAGACACACCAAATTGGTCTTGTTGAGCATAGTAAAGATCAAGACGGTGATCTGGAGCGTTTGAGGAAAGGTAAAGCTGCAGTTGTCGGTATTCCCGACGCGAGTGTGTCAGAAACTCCTAAAGTGACACAGACCGTCATGGAGAACACGCCTGGAGTAGTACAAGAGGTGGGTTCATCCAGCGGAGTTTCGAAAACCAGGTTTGAAGGAGGTTTCAAAGATGCAATTCCTGTCGTTTTCGGTGAGAAAGATAAGAGACCTTTCGAAGAGTCGTCTAGAGATAATGACTCGACAACAGCATCCGAGAGCAATTTAGCGGCGGTACAAACACAAATGTTGGATTCGGATGATGCTGTAAGGTCTGGAGGGGAGGACGTAGAAGAGGTCCAAA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| 18,370
|
MN539275.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Green,J.C., Rwahnih,M.A., Olmedo-Velarde,A., Melzer,M.J., Hamim,I., Borth,W.B., Brower,T.M., Hu,J.S., Al Rwahnih,M., Larrea-Sarmiento,A.E., Hu,J.
|
University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2020-05-13
|
HANA160
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 12,932
|
GenBank
| null |
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2017-02
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1 isolate HANA160, complete genome
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CCCGTATACCTTAAATGAATTAAGTTCATTTAAGTGACCAATTAAAAACAAATCATTCACCACAACGACTTTTCCCGGAAAGTCTTCCTCCAATTTCTCAATTCACATAAACTAAGCAGGCCTAAACGCCGGAAACTTTTTTCCTAAAGCTCGCTAAATCTTTCTGCTGTTTATTAGTATATTAATATCTTTCTTAAAGTCGTTTATTATTTCCAGAAGAAAAACCAAAAATATTAGAATCTGTAGCTTAAGTTTTAATATCAACGATAGATATTATAGTTCCCTATAGTTATATCTGCAATTAATTACTTCTGCTCTGAATTTTAACCGCGTTAATTATCTTTAAAATTCCATATTATGAAAAAGAGGAAAAATAAATATCATTATAGGAAAGATCCAGAGCCCGCTAAGCCGAAAGTTCCTAGTAATAAGGAACTTAAAGCGAAATTTTTCTATAGTCCGATAGTTAAAGATCTATCGGAACACTTTTCCAAGTCGCAAGCAACTGGATCAAGCGACTTGGCGCGGGGCCCGAAATCATCTCGGTCGGGCGGTTGTTCCCCACGTTCTGCTGAGTGGGGACAGGTGATATCTGTGCGCGATAGACTGTCTCATAAGATTTTAAAAAGTTCATCGCAAAACAGTTCTTACTCTTCGCACGATTCCGATGTCGCCGGATTCAAGAAGGCGATCGCAGACAACGTGCCGAAGTTTTTCGAATGGAGGGAGGCGCGTGCTAAACGTGTCTGGAGGAGAGTCAGTGATGATTCCCTGCCGAAACAAGGTTCTTTGCCCACATCACGTAAATCCAAATCGAGTGATGGTGGGAGCCTCGATTCGCGCGACAGTGGCCGCGAGTCAGCAACAAGCGTTCCCAGCAGCAAGTCGGGGAACGCAAAATTGCCGCCCGCCAAACGAGAATCTGGACCTTCGGGTCACATCTCATGTGATTCAAGGCGGGAGACGCGTGGAAATAAAACAAAATGTGAAGACAGGAATCCTTCTCCTATTGAAAGCTCATCTGTTTCGAGCTCTGACTCAAAGGATTCCTTTCTGGAGGGGTTTCTTGAAGATCAAAGCAAAAGAAGAATCTGCATCTTCAAAGACCCAAATATAATCGTTAACAGGGAGCTGGGAGAGTTGACTGTTCAACTCTCGGAAATATCACTAAGCAGGGAGCTTCAGCTAACTGAATGGTTAGACCGTGAAGGAAAATGGGCTTCCAAGTTTGTGGCGGACTTTGTGAGGGATAGGCTGAGGAAGGATAGGCTTAAAGCGTTGCGTGGCAACGTGCTTATCGGAAATAAGGCCATGGCTCATTTCTTTTCCCCAACTGGGATCTACTTGGGGAAGATATCATTAAACGAGAAGGTCTGGTTCTATTTTAGGACCGCGGGAAAAACTCATGGAGAATACATCTCTTGTGGCAACGGGAAGGTGAGTCGGCTATTTATTAAAAATCGTTTCCCGACTCTACAAGAGGCTGTTGCCTACGACTGGGCTAAAGGATATAGCTCTCTGGAGCATGTCACTTTATATGACCCGGTCTTTAAGAAGAATGTAGCCGCAAAAAAGGGTTATTGTTGGCTACCCTTATTCTTGAAATCAAAAATACCCTTATCCAAATATCCGCAGTGCCCGTACGTGAGATTGAATAATCTGAGGCGGCTATTTGGTGAGATCAGCTTGGTAAAGACGGGAGAGTTTTACCACTACTCTGAACTCGGAGTCAAGGACCCCAATCTTCCGAACGTTTTGGTCGGTGCGAGTTCAGTGGAGGGGACTGTGGGGCCCGTCACAATGTCAGCGGTTAATGAGAGTCCGCTGTTGAGTGTCGCACTGGATAGTGTAGTGAAAAAATTGACAATGAGAGAGAGCTCTCATTTCCAAAATGCAGTCGATGACATATTGGAAGTGGCGCTAAAGTCCGATCTTCGTGAAAGGGTTGATAAGAGGTTCAAAGTTAACTGTTCGATGACGGTCGAACAAATGGACCAGCTCAGGAAAATGTTGAAGATCAGTAATATAGAAGTGGGTTATGGAAACCCCGGACCGCATCCAATTTTTAATGCTATGCGCAAATATTTCAATGAAATTTGCGCTCGTGCTTACAGAGGCGTTCGCGTCTCAGACATAGGTGGCAGTCTCATGAATTGTGTGGTAAATAGACTGACAAACACCCATGTTTGCGCGCCGAACGTAGACTTGAAAGATGCGGGACGATTGAGCAAAACGTGCATCGATTTATTGAACAAAGTGTGTGATTTCAAGGAAGTAGATGAGAATTATTTGAGATTTTTATCCACAGTCTCCACGTTATCGGTGTGCAACAAAAGCGTTCCAAATTGCAAACATAGAAGTTCAGTTGTCACCATGGTGGACGTGTATGATATACATGTGGAGGCATTGATAGAGGCCATGGAGGTTAAAGGAGCTATTGTAGCTCGTGTTTTCTTCATGTTTCCACCAGAAATCTTGACGGGCGTAAACATGATTCAATACCCGGGAACGTCTTTAACAGTCACTAAAGAGGGTGGAGAGTTGATCTATTTTATTGGAGAGACGGGAGATTCGTATATTCATTCCTTGGATAATTTGCTCTCGTATGTCCTTAGGAGCGTTGTGGTGAGTAAATCGGGAAACTCTTACTATATTGAACTCAATAATCAGTATGGACCGTATATGGACTTTACTGTGTCATTGACAAAAGGAAGAGATATTAACCGAATTCCAAGACGGATGACTCCATGGACTGCTGGACTCACACGCATTACTATACCCAAACAAAACGCTGTTGGGTCGATAGACAGATTCTCTATTTTGGTAGACAGAGATTTTGTGCGTAGAAGTCTGTCTTACGCGGCTAATGTGTGCAACACAGCTGACGACAGAACATATGAGTATGTTATGTCCAATATAAGGTCGCAGACAACCATGATGGTGGTGGGTTCTAAGATAGTTCACTCAAGGGTGGACTTATCTAATGATATAATAGTCGAGTTACCGACTGTTATACTGAATGAGGCAGTTTCTAGGCGTTCCCAAGCGGTAAAGGCACTGAAACACCAACAGGAGGGTGGGTTTTTGAAGGTGTTTTCTGGTGTTTTTGAAGGTTTATCTGGTACTCTAATGTGGGTGCTGAAGAAGGTCCTTAACTTGTTGCCAGATAGATTGAAAGCATTTTGTAGGACAATGTTCGAATCTCTGTACGGGTTGAAGGATACTGAGGACGAAATAGTCGTTGAAACGTCAGTCGCTAAGGGCGATAGCGATTGCACAACTGAAAATTTGGAAGAGTTATTACAGATTTCCCAGGCTTTAGCCAGTCTGAATTGCAAAGCTGGGCCGATAAATACGGTGGAAGAGATTGAAGAAGAGTTGGAAGATGACTCGTACGAACATTTTAAGAGACCTACCGAAACGAAAAAGATAAATCAAGCAGGGGGTCTAAAAGGCGGAGGTGAGAATAATTGGTATGATTTTCTCCTGCCGAAGAAACCGGAACCTACACCAATGGAGTCCGTTAGAGCAGGACTTTGGCGATTGTGTAGGCGAGCGACCAGGCTGATAACTCGCTTAGATGTGGTGACGCCGATCAGGAGGTTGTTGACGGCTTTACTGCTTACACTGACTAAATTCGTGAATCCACGAGGCGAGTTTACAGTGAAATTTGAGAGGGAGGAAAGAGAGAAAATCGACTCGTCGATGAAAGTATTAATTTGTGAGGCTCTCAAACGCAAACTGGTGGATATTACTGAGTTAGTAAGCGTTGTTCCTAAATTCGCGGCTAAAGTGGCTGGCAACGTAGGTAAATGCGTTGCGGCTCAAGTATCCGGGCTTGGTAAATCCATCGAAGCCGACATCAACGAGAGAGTTAAACAGCTGAAGCACAGAATTGCTAAAGCTTTAAAAGCTGCGGATTTGGCGTACCCGAAGGACTGGTTGATGCAGGGTAAGTACACCATGTGGTTTAATAAATACGTAAAACAATTCATACCACATGCCGCAATATGTTCCGCAGTGGTGGCGGCCGTCGTTATAAGCAGAGTAGACAAAGTTATTTGTAAAGCTCTGAATAATATGTTTCTCACTTTCAGGAAGAAAATGGAGAATCTTAGAGTAACTGAAGTGGGAAATTTATGTGGACTCATTGTAGGGTGCGTTTTGTACAAGATGGTAAATTTGTTAGCTGCAGTGAGTGCCATCTCCAATTTTCACTCTTTAGCGCTGCCGGTTTACGTTGGGGGAGAAGCTGCTAGTGCTGTAATTGATCTATTGCACGGAAAGAGCCTTGTAAATCTGGTTCGGTTTGTGAGAATAATCATCTCTCTTGACAAGCTTAAAACTTTTAAATTTCCGACTGTATCAGTGTCGGAGGAGGCTGTGATTCCTGATGGGAGGGACGCTACTGATGTAATCCCTGACATCAATCGATTTGAGAGAAGATTGATCGTAGCTAAAGCGCTTGATACGTTTAGGGAATCTGCAGCCGCGCCGAACAGGTGTGAAGAACGATCGGTAAGTCGGCCAAGTATTGGAGGTCTAGGTCGCGCCGAAAATGATGAAAGGCCAAAGATCGTATTAGGCGAAGTGGAGGAAAGAGAACAAGATTTTCCAAGATCTAGTGAAACTGCGCACGGGGAAAATTTTGAAAAAGGAGAAACTAGTGGTGTTTCTAAAGTGAGATTTAACGGTGAGTTTAAATCTTCTATTCCATACACACCACCAGTTGGTTTGAAAAGGCCGCTAGAAGCTTCGTCGGATGACGGTTCAGTTGAAGAAATTGTGGTCGATGGCCTGACTGATTTGTCCAAAGCGGATGACACATTGGAGAAAGGAAAAAGTGTACCCGCGGAGGAAGAGTCTACCTATGTTGCGGAACAAACTGAGATCTGCGCAGCGAGAAGAGTGCAGATGCCGACGAAACCTTTGACAGTTTGTGTACAGTCTGACCCTGGTTTCGCTGTGTGCACCGCTGTGAAAAACTACATAGATGGGGA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GGACATCTCTACTATCCGTTGGCGACGGAAATCCGAGCGGCTTTGGCCTCTCCAGACACTTTGCTTAGAGAGAAGCTCGCTTTGGTAGATGTTCCAGTCACTCGATCGAGCAATTTTGCGTACAAAGTTACGAGAGGCATGGCACAAAATTTCGCTCGGTCTCTCCCTGGTGAAGAGAGACATTTGACTGATCTCATATTTTGTGTGGGAAATTATTTGGGAAAATTACCTTCCAGAGATCAAATTTTGGGGGAAGTGTCTTTGCCAATAGCTGCTGTGAGAAACGTGGGGAGCGTGATCAATGTTTCGGATGCAGATTTGTTTAACGAAAATAAGTTGGCGTTGTTAAACATGTTGGCTAAGTCGAAGATGGCTGATCCTGTTGACGGAGTAAAGTTTGTGCTGGAGAAGCAGAAAATAGATGATATGTGCCAACTTTTGTTTAAACCTGAAGACGTTCCGCTCTGTTCGTCTCTTCCCGCTATCAGATACACTATTTTGAAAACATTAGATGCAACTGATAGTTCGACAAGTACATTTGAAGATCGGGTGGAGACTAGTGTTGTGGTAGGTGTAAAGGTGCGGCAAGAATTAAAAGGTTTGTTGCGTTTCAAAGAAGAAGAAGATCTAAATACTTTACTGGCGAAAACTGCAATAAAATCTGGTGAGATGGTGAGAGGTGACGCTGTGGTTATTCAAAACAGGTACGAAGAGAATTTGATGGGTAGGACGTTGATGAGGGTAGCATCACCATTTACTCAAGCCCAATACTCGGATCTCACTGCGAGGATAGTCAGGGAGTTTCTGACGGACAATCTTCACGTGGATTTCAATTTCGCTGAGGCTATCTTGATAATTCTGCAAAGATATATACATTATCGTACGAATCCCGTCCGCTTTACGAATCTACCTACCAAGCTGGAAATCGTACATAAACACAAAACTTATGTCGTTAACTATGCTGGGGTAGATAGAGTCTTTGCCGGATATCAGAATGCTATTCCAGACGTTGAGAGAGCTTGGTGCGCACCTTTGGCGACAGTGGCGTATTTTGTTTTAAGGGATACTGGGGGTTCGTATGCGAAATGGCGAGACATGATGGATATTCCACCTGCTTTAAACTTCGACTTTGTTGGGTTTATGGATCCTAGAGTTCTACCCGAACATGAAAATGTTCATTTGGCGCGTTTAACTCACAGGTTTAAGACTGCCGCCACTCCTGTGAGAGGTTTTAAGTTAGGTAATAGGTTAGTGAATCCGATAGACCATATGTACGACCAATTACCTTTACCCGAAACAGTTAAAGAAAATCACAAGGCTTTGCTTATGCGTACTCGGTGAGTATCGTTGGGTTTGTTTAAAAATGGCTGACTTGAATAAGCAGAAGGAGAAGGCGGCTGATGAAGGTGGTTCCAAATCTGTGGACGCGCAAGTGGATGAGATAATGAATCTGCCTGTGCCGGGAGGACGAACTACTGTAGCTACTTTTGAAGAGTTGATAGCGGCAGAGAATGCCATAATAGATTTTACGAAGGTGGACGTACCTCGAATGATCAATGTTCCTATCCCTGGGATAGTGACTAATGCGCACAAGTTGATAGGGTCGAAAGCTTTATGGGATCTGGGCAAATCAAAGGGTATATCCGAGTCTGCTAAGCACATGATTCAGTTCATGATGCAGTCTTTTCAGGATATGTGTACATTTTCCACATCTCCAAAAGTTTCGGATGCATTGAACCGTACCACCTCGGCTAAGTATGACGGTAAAGAGGTGACTGTGTCTCACGAAGAGATAAGAACTGCTCTGGGAAATTCTCTATCCAGTTTGGGATATGACAACCCGATGAGACAGTTTGGAAGGGCATTTACTTCCGTAATAGTGCAGGGATTGAGTGCCGGCAAACTGGTTGTTAATACCAGAATTTGCACAAAAAACGGAATACCAAGAAATTATTATTCGTTTTATCCAGATTGTCTGCACGTGGAAGCTAGGGTCCATGGTGATGATGCTGCTTTAGTGAGTGAGTTAGGCAGAATGGTGGCGATAAATAGGGCTAACACAAGCGGTACCGGTGAGCACAATGTGTTCGAGAAAACCGCCGTGTCTCCGCATATATTTACTGGTGGACGTAAATGAGGTCGGAGACCTCAACTTTCCTTGTTTAAGGATGGAAAGGATAATTTTGGTAAGTAAAGACAAAAACATTCTCGGAGTGCGGGAGGAAGAGGTATTTTATAAAGTAAAATACAGCTTGTTCTTATGCGCTAAAGAAGGACGAGAGTGTTCTTTCTTTTATGACAAGGTTAACTGTTTTTCTGATATCAGTAGGTCGAGGTATACGGAACTTTTCAGTTTCCTCGATTCTCTTGGTAATGTTGTGGCCACAAATAATGAAACCTTCCTGAATTTCTTGGATGGACTCAGTGTTGATGATTACATGTTAAGAAGGTATGGTGGCTACGGGAGGAAAGAATTAAGCGATGGAGAAAAGGAAGCTCCTTATTTAACTATACCGGTTCCTGCTCTAGAGACTCTGTGGGGAGTGATGGAGGAACCGGTGGAGGAACTACACAAGGTACATTGTGTAGGTTTCGTTCGAAGTTGTGACTCGTCGTGTGACGAATTGTACAAGTTCGATAGATCATTCGCAGTTTTTGACTGTGGGAATGGTTTTGAAGTGGTGTATGGTGGAACCATAGACACTTCCAATGTGGCTGTTCTTAGAAAATTTAAAACATTAAAAGAGGCCGAAGGAAAGACAGGACTGGAGAAGGTAGTTAGTGTTTTGTCTGGATTATAAAATGAAGTTTAACTACCTTGGGAAGTTATGACCGGAGCTTCCCAACCCGACCTACCACAGGTAGGATAGGACGTTTGTCTGAATGGGAAATGCTGGATGGGGAGGTTCCCCACTCTAGAAATTCTAGGGCC
| 50,521
|
MN539276.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Green,J.C., Rwahnih,M.A., Olmedo-Velarde,A., Melzer,M.J., Hamim,I., Borth,W.B., Brower,T.M., Hu,J.S., Al Rwahnih,M., Larrea-Sarmiento,A.E., Hu,J.
|
University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2020-05-13
|
HANA187
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,071
|
GenBank
| null |
USA: HI
|
USA
| null | null |
2017-02
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1 isolate HANA187, complete genome
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| 50,522
|
LC507819.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Yanagisawa,H., Sekine,K.
|
Central Region Agricultural Research Center; 2-1-18 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8666
|
Japan
|
2020-04-02
|
PMWaV-1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,072
|
GenBank
| null |
Taiwan
|
Taiwan
|
Ananas comosus
| null |
2015
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1 PMWaV-1 genomic RNA, complete genome
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TTTTACTTAAATAAATTAAGTTTATTTAAGTAACAAATCAAAAATCAAATCAAAAACTGAAACGAACTTTCCAAACTCACTCAATTTCATTTCCGAAATCTGAGCTGTAAACATCACTCTAAACGCCTGAAGTTATTTTCCCAACTTATAAGTTTTCTCTCTAATACGCTCCCGTATTAATCTACGTCTCTAAACGTTTTAATATTTTCCAGAAGAAAACAAAAACAAAATAGTACGTGTTTAGGGTAAGACGTTTAACTTTCGTCAGTTTGTGTTTTCCCTGCTATATAAAAATAGCGATTCTATTAAGTGTTTTCAAAATACCGTGGTTTATATTTATAAGAGTTCCCTAATATGAAGCGCGAGATAAAGAAGACATACTCGCAACAAAACCAAAAAACAATAAACAAAAAATTTCCCAACAACAATCCAAAGGCTAAAGCTGGGCAGTCGAGTTCGCAAAACGCGAACGGAAAAGAGAAAGTTCCCAGTAATAAGGAACTTAAATTAAAATTCTTTTACAGCCCAGTTGTAAAAGATCTTTCGGAACATTTTTCCAAAACTAAGTCTGTGGATAGTGCGGGGTCGAGCCGTAAAACATCTACACCTCCTTCTAGAGGTGGTTCCCCGCAATCAGTAAAGCGAGAGGCGGTAGTCCTCGTTCGTGATAGGCTGTCCCATAAAAATTTTTCAAATATTTCTAGGAACAGCTCATACTCCTCACACGATTCCGATGTTGAAGGCTTCAAGAAAGCAATCAACAGTTACATACCCAAACCTGAAGGGTGGAAGAGGAGTTTTGCTAAACGTCAGTGGGGGAGGGTTGGTGACGATTCCCTGCGAGAACAAGACCTTCTGCCGTCACCACCAAGATCCCACACGAGCAACGATAGGAGCGTCAGTTCGAGCAAGGGTCTCGAGCTACAATTCGGGAGTTTTCCCGAAGTCGCCGGGAAGAATGGACCAAACTCCTCACGTCGATCTCTTATCGACGCTGAACGTCGTAACTTACACGACGCAAAACAAACAGCGTCTCCTGATAGAGAGAAGGCCGCCGGTGGGAGTCTTTCTTCTTCTGAAAGCCAGTCTTCTTCAAGTTATATTTCTGAAGATTCCGTGGTTGAAGACTATTTTTACAACCAAAGGCGAAGAAGAGTGTGTCTCATGAAAGATGAGCACATTGTACTGAACAGGGAGCACGGCGAACTAATCGTCGAGTTATCGGAGCTAAGTCTAGCTAGAGAGATACAGCTAGTAAATCACTTAGACTCTGAGGGCAAGTGGGCTTCCAAATACATAGCTGAATTTGTCAGAGATAGGCTGAGGAAGGACAGATTGAAAGCTCTAAGAGGCAATGTGCTTATAGGTAATAGAGCCTTAGCACATTTCTTTTCCCCAGCAGGTGTGTATCTTGGGAAGGTAGCGCTACAAGAGAAAGTGTGGTTCTACTTTAGAACTGCCGGTAGGAGTCACGGAGAGTACATTTCTTGTGGAGATGGGAAAGTGAGCCGACTTTTCATTAAGACACGTTTCCCTACTCTTCAAGAAGTGGTGGCTCATGATTGGGCAAAAGGCTACAGTTCGTTAGAACACATGACGCTTTATGATCCGGTATTCAACCGCAATGTTCACGCAAAGAAGGGGTATTGTTGGTTACCTCTTTTCTTAAAATCTAAAATACCTCTATCAAAATACCCGCAGTGTCCTTATGTGAGATTGAACCATCTGAGGAGGCTGTTTGGTGAGGTAAATTTAGTTAAGGCGGGGGAGTACTATCATTATTCGGAGTCAGGGGTTAAAAATCCGAAGCTTCCAAATGTTCTGGTCGGCGCAAATCCAGAAGGGCTGAATACTGAAATAGTGTCTATGTCGGCAGTAAATGGAAACCCTCTCCTAAGCGTTGCGCTAGACAGCGTGGTGAAGAAGTTGACTATGAGGGAGAGCTCACATTTCCAAAACACAGTCGACGATATTTTAGAAGTAGCTTTGAAATCTGATCTGCGGGAGAGGGTGGATAAGAGATTCAAAGTTGACTGTTCGATGACGGCGGAACAATTAGATCTACTCCGGAAGATGTTGAAGATTAATAATATAGAAGCCGGTTATGGGAGTCCTGGAGCACATCCTATATTCAACGCTATGAGGAAGTTCTTCAACGAGATGTGTGCTCGTGCTTACAGGGGAGTCCTAGTCTCAGATATTGGGGGCAGTATCTTGAACTGTGTGGTCAATAAGCTGACGAATACTCATGTTTGTGCTCCTAATTTGGATTTAAAAGACGCGGGAAGGCTGAGCAAAGCTTGTATAAGTTTGCTCAATAAAGTAGGAGACTTCAGAGAATTCGATGAGAATTATCTCAAATTCATGACTACTATATCTAACTTATCGGTGTGCAACGCGAGTGTTCCTAACTGCAAACATAGGAGCTCTGTAATCACTATGGTCGATGTTTATGACATACATGTGGAACAATTATTGCAAGCTATGGAGGTTAAAGGTGCAGTTTTGGCCAGATTGTTCTTTATGTTTCCCCCTGAAATTCTAGCAGGTGCAGAGTCGGTGCAGTATCCTGAAACATCTCTCACTGTCAGTAAAGAAGGGAGAGACTTGGTATATTTTATAGGAGAAACAGGTGACTCTTATGTTCACTCCCTGGACACCTTGCTCTCCTATATCACTCGAAGCGTAGTAGTGAGCAAAACAGGAAACAGCTACTACATTGAACTCAATGAGCAGTTTGGACCCTATTTGGATATTACCGTATCTTTAACCCGAAGGAGGGAAGTTCAGACGCTTCCTAGAAGGTTGGTGCCTTGGACGGCGGGAATGACTCGTATCACAATACCGAGAATGAATGAACATGGAGTGGTGGACAAGTTTTCAATATTAGTCAACAGAGACTTCGTTCGTAGAAGCTTGTCTTACGCCGCTAACGTCTGCAACACTACCGACGATCGTACTTTCGAGTACGTTATGTCGAATCTCAGGTCGCAGACGACTATGATGGTAGTTGGTTCAAAAATAGTACACACAAAGGTGGATTTATCTAATGACGTGATCGTTGAGCTACCTACTGTCATTCTGAATGAAGCCGTTTCAAGACGGAATCGTGCCGTCAAAATGTTGAAACAGGCCAACAGGGGTTTCCTATATAAGATATTCTCCACCCTTTATAAAGGATTAACTGCCTCTGTTTGTTGGGTATTAAAGAAAATATTCAATTGCCTCCCAAAGTGCGTTGTGGACGCTTGTGAGGATTTGTTTAAGACTCATTATGGATTGAAAGATACAGACGATGAAATTGTGGTCAATTCTTCCGTGGAGTCTGGACCATTAGACTGCGAAAATGAATATATTGAAGAATTATTGACGATTTCGCAAGCGTTGGCCGGACTCAATTGCAAAGCTGGACCGATGAAGCTTGAGGAGGAAATTAACGAAATTGAAGAAGAGCTTGAAGATGATTCGTTTGAAAACCTCAAAAATCCGATAAACGAATCAAAGAATGAACGGTCCGGAGGTTTAAAGGGTGGCGGCGCAACCAATTGGTATGATTTCCTACTGCCGAACAGGCCGGAAGCCAAACCTGCAGACTCTGCTAGAGCTGCGCTGTGGCGTTTATGCAGGCGTTTGACAAGAATGGTGTGCAATCTAGACATAGTAACTCCTATCAGAAGATTGCTAACGACCCTGCTACTAGCATTGTCGAAATTTATAAATCCGGATGGAAGATACGAAAATGTTAAAAGGAAAGATGAGGAGAGACTGGACCAGACATTGAAAACTATGGTAGGAGAAATTTTGAAGAGAGGTTTAGTGAAAGTGGGTGATCTATTGAAGGGATTATCTCATGTTGCATGTAAACCACTCGTATATGTTGGACAGGCATCCACTACTCTGTTCACCAACGCATGCAGTGCTTTGAAGGAAGATGCTGCTGATCGTATCAGACAGCTGAAACACAGGATAGCAAAAGCGCTGAAAGCAGCAGACATGGCTTACCCGAAAGACTGGATAATTGAGGGGAAATATCTCAGGTTTTTCAATAAGTATATCAGGAGATTTATCCCACACGCTGCATTTGCTTCCGTGGTTGTATCAGCCATAGTAATAAGTAAAGCCAACAAAGTGTTTTGTAAAACTTTAAACACCATTTTTGATAAGCTTAAAAGTAAGTTGGAAAATTTAAAACTTGTGTCGACGAGTACTCTCTGTGCGATAATGTTTGGGATGTGCTTTTGCAAATTCGTCAATTTAATATCTGTTGTTAGTGCTGTCGCAAATCCACTTACATTGGCTTTACCAGTTTATGTGGGGGCTGAATTTTCCAGCGTAGTACATGACGGTTTGGGCGGAAGAAACATATTTAATTTCAATCGGTTTATGAGAATTTTAATCAACTTAAGCGCGCTTAAGACCCTCAAACCACCAATCGAATACGTGCCTACGTCCGATTCTGATAGAAGCGGTAGAGACGCTACAGATGTTGTTCCTGACCTGAATCGCTTCGACAGGAGGATGGTTATGGCTAGGGCGTTGGACACTTTCCGGACAGCGGCGGTGAACCTGCAGAGAGACGAGACACGCCTAGAAAAGGCGTCTCAAACACAAAATTTGCACGAAAACCCACATCAGGCGAATCTTATAGATCTCACTAAAGCGCAAGACAGCGATAGCGAGCGTTTGAGGAAAGGTAAAGCTGTCGTCTCTGATGTTCATGATGCGGTTGCGAACGAGTCTCTCGAGGTGATGAGAGAATCTGGCGAGATTATGCCTGGTGTAGGACAGGAAATTGGATCATCCAGCGGAGCTTCGAGATGTAGGTTCGAAGGGGTTTTTAAACCTGCTATTCCCGTTGTCTTCGGTGAGAAAGATAAAAGACCCTTTGAAGAGTCGTCTAGAGAGAGTGATTCCACAATAATGCCCGAAAGAAATTTAGTTGTGGAACATACGCAAACGTTGATTTTAGGCGACGATGTGAGGTCAGAAGGGGAAAGCGT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| 52,982
|
MH704740.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Green,J.C., Al Rwahnih,M., Olmedo Velarde,A., Melzer,M.J., Hamim,I., Borth,W.B., Matsumoto Brower,T., Wall,M., Hu,J.S.
|
University of Hawaii, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2019-04-22
| null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,071
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2017-02
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1 strain HTS 1, complete genome
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| 63,160
|
KJ872494.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Yu,N., Luo,Z., Li,X., Fan,H., Liu,Z., He,F.
|
Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Molecular Plant Virus
| null |
2014-09-03
|
Hainan
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,069
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ananas comosus
| null |
2010
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1 isolate Hainan, complete genome
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| 89,072
|
AF414119.3
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Melzer,M.J., Sether,D.M., Karasev,A.V., Borth,W., Hu,J.S.
|
University of Hawaii, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2002-01-22
| null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,071
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 1, complete genome
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| 110,867
|
NC_043105.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
|
Melzer,M.J., Karasev,A.V., Sether,D.M., Hu,J.S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-06-28
| null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 14,861
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Pineapple mealybug wilt associated virus-2 polyprotein (ORF1a) and RNA-dependent RNA polymerase genes, partial cds; and hydrophobic protein p5, heat shock protein 70, p46, coat protein, diverged coat protein, p20, p22, and p6 genes, complete cds
|
CAAGTGGCTTGCCGCTACGACTTAGTCGCCCGCACTGACGCGTCTTTGTTAGACGTGTCTCGATTTAGATTATACCACCTTAGGGTATCGCCCAGTGCCCTGGTGGTAGTATATTCGTGCACTGGGGTTGCAACGAATAATACTTCATCAAAAGCCCCACCTGTTAAAATCGAGAGGCGTGAGTCTCCACGGGTAGCGGTGCCAGCAGCAGATCAGCAGGCTATAGCCGATGCCCGATGGAAAAAGTACGAAGTTATGGATGGGGTCGATGCTAGAGCTTGTCCTGCGACTCTGACGACCCGTGGGCCCGTCGACAAGTTGACGGGTTTGGTTATTACTAATGTCAAACTGTACTCGTGGATACGTATGTACAGTCATTACTTGAAACGGTACACGTGGCTGTACTTCAGGCCCGGCGGGTGTGTTCAGATGCAGTTTGATCGCAGATACCCCACCGTCGCGGATTTTGTGTCGAGCGCTGTAAGAGACGATGCGCCGGCGCTGCCTAAACTGCGCTTTTATTGCCCGTTTCTTCACAGGAGCGTCTTGAGCTCTCGAGGGTGGTGCTGGTTAACCATACCCGGCGTGCAGAAAGCTTTAAGACACTGTGAAACTTTTCCGAGCATAGTGTCTATTTCATACCTGAGGAAGCTCGGGTGTGGGCGGTTCAAGGTTATGCCCACAGGGGATCCCAAGGTGTACCATTTTTCGAATAATAATGGTATACTTATAGATAGCCTCTCATATCACTTGCGTGTGGCGGGTGAGAGGGGCCGAGTCGGTACAGAGCTGGTAGCATCTATCGGCAAAGCGCTCAACCAGGAAGAGGTCTACGCTGGAGTTGTCTCATCCATAACTCAAAAGTTAATGCTGAAAGACCAAAGCGCCTGTGTTAATCACATTGATACCCAGCTCTACAAGATTTTTAAAAATCGTGATGAGGTACTGGGAAAGAAGAGAGTGTGCTACATAAGCTCTCACTTGCCACAAGAAGGAAAGGACCTTTTACGTGAGAGTTTCCCAGAGTTAAATTTGGTATTCTTTGATTCGGTGCATAATGAGCACCCAATGTGCAATAGCGTACGCTATTGTTTTAACGTGCTATTTGCATCAGCGTATAAGAATGTCAAATTTGTGGATGTCGGTGGCAGCGAGAGTTATCACGTGAACATGGGGAACGTTAACGCTCATGTTTGTAACCCCATGGTTGATTGGAAGGACGGCGGACGACGGGTACGAGAGTCTATGTACCTCTCAGACGACGGCTACAAGGTGTGTAACGTGGAGTCGTTGTACAAGGAGGTTGCCGCTGCTAAAGTAACATCCTGCGGCGGACGTTTCGAGGATTGTGGTGTGAGCGCTGATGCAGGGTTTTTTGTTGATGTATACGATATGTCCCTGCAGCAGTTGGCCGATGGAATGGAGAAGAAGAATATGCGCACTTTTAGTCTGGCTTTAATGTACCCCGTAGAGCTGTTGGCAGCTGACGGTGAAATTTACCTTGAAACGCTAGACGTGTTAGTGAAGAGAGAGGGCGATTGTGTGCGCTATAGCGTGGGCGTTACAGGCGAGAGCTACACTCATAGTTATCGTTGTATATCCGCTTATTTCACCGCTCCTGCTGTGGTTGCTAGGGGTGGTACTGTGTTCAAAGTGCAATATGAGGGTTACAGATTGGGGTACCATCATATATCTTTGTGCTTAAGCGACAGCTCTAGTGCTAGCGTTAGTGTGCAAAGGCACATCCGTACCTCCTTCCACGGAAAGAGCATAGTTATGATTCCGAGATTGAATAATGGCGTGATATCCTTCGAGCGTATGGTGTACGATACTGATTTCGTCGATAGGATTTATGCGTACAGTCTAAACACGATCGCCAATCTCGAGAATCGTACGTTCGAGTACGCCGTAGGCAACGTTCGGGCACAAAAGACGCATGTCATTACTGGAACGCGTGTGGTGCATAGTAGAGTAGATATAACGAGTAATGACTTGTGGGGTTTGGTTGTTGCGGTTAGCACTCAAGCCGTGAAAGATAGGCGCAAGAGCCTTGATACGTATTCTTTGGTAAAGGCTTGGGATGGAAACTTTTTGTCAGTAATAAATGTTATGGTGAGACACTTGTTGAGGTACAGTACCACGCTCTTTAGAGGTCTTATGTGGAGTTCCCTGGCGTTAAATTTTGATACTTTCAGGTCTCTGGTGGCAGTGCCTGAAAATTACATATATAGGGTACCGAAGAGCGTGTGTTTGAATTTACGAAGCGTATTACCGTTAGTGACGCTGAATTTTGACTGTGCAGCTGCGGAAACACGTCAACGACTACTTCAGGATATCCGTAGCAAAAGGTATAAGTACGTTTCGAAGGTTCTCGTTAAAGATGCAATAAGCCTAATGAAGAAAAGGCGGTGTTCCGATGGTGAGGATCGCGATATAACTGAAGAGGACGTCGTGTCATTTATTATGAGTAACATGCACAATTTGCATCTTGGGTTTGGTGGGTTACGAGGTGGGGCACGCATTCCGATTCCAACCGTAGGGCTGGCCTCAGTGTTATCGAATGCTAGCTCATCTACAACATCAAGGGTCGCTTTAAAAGTTCTGGCTTCAGCGGTTCGTAGTGTACCCAGGGTTGCGACTGTTGGTGTCTCGGCCGCCACCTCTGCGGTCACTATATGTTATAAGTGCTGGGATAACATAAAGCAGTACAGCGACCACGCGTGCAGTTTTCTAGGCGACGTAGGTCGGAGGTGTGCTATGACGATGGGCGATTGTTGGGAGAGTGACGCCCAGTCTTGGACTGTCGATAAGCACACAAGTTGGTCTGAATGGGTTTTTCTCGCCTTAGATAAAGCGCGTCAGTTCGCCATTGGAACTTTTAAGTCATTACCATCTATCGTCGAGGAATCATTTCGGGATGGTGTTAGGTGCTTCGACTCTACTTGGAAGAGCGGTCAGATCACAAACAGTCACTTGTGTGCGACAGTTGGCGCTATAGGACTGACGACCGCTATGTACGTATGCTATAAAAAGCGCTCGGAGATTAGAGCGTACGCGTCTACAGTTGTTACTACTGTTAATCCACATTTGAGTAACGCAGCCGCTCGCCTTCTGTCGTGGTATGACGGCGTTAAGACTGTGTTGTGTAGCGACGCCTTTTTGGGATGGCTGTATACTCGCTATAACTGTTTAGCTCAATTGATCAGAAAGACGCACATTGAAGGGCGCTGCTTTAGGTATGGGGCCGTTGCGCTCTCGTCGTATATTGTGATGCGTTTTGGGTGCTACCAGGCTGTATACATATGCGCGGGACCACAAGCCAAGGTAGCTATGGCTCTGGCGACGTTGTTGGGGTTAATAAAAGGCGTAGTTCCATGGACCGTACGTAATGTCGTCGTTAATGGTGTAGTTTCATTACTGGGACTATACTATGGTACACTGCCCGAAACGAGCCCCGGTGTTATAATAGTTCGCCCTGTGAATACTTGTAATGTTTACGAGGCGTGCGAGGCTTACTTTGACCCGTCCAGGGACTCACTAACGCGAAACGACGAATCGAACTCTGATGATGACGCTAGTTCGTCTAGTGGTGTTGCACTCGATTCGGTTAAAAGCCTGGATGATTCAACGATACAACGTATAATGTATAGGACAAAAGAATCCCAACCGCTACAGTCAGGTATCCCGACTTGCTCATATGCGCCTGTAACTGAACCAGCCGTTCATACTGGCCCGGAGATAGTGGAGTTGGGACCTTCGCCACTTGATAAAGGAAAGGCTATTGAACGCGTAAATACGCACTCAAGCTCGGAGATAGTGGAGTTGGAACCTCTACCACTTGTTAAAGGAAAAGCGGTTGAATGCGTGAATATGCCGCACATACCCATTAGTGGCGCAGTCGATACAAACCAGGCGTCTAGCAGCTGTACTGCGCCACCGGCAGAGTTTATACCTACAAAACCGCGTACAAATCGCGCATTATCTGATTCCGTTGTCCCTTCGAAGTCAATGAGTACTACTTTGAGTATGATGAGGGACAGCTCGCGGTTCTCGCGCAACAAATGGCTATTGGGACGAGACCCTGTCATTGCTCTTGATGAGCAGAGTGAGCCTGTCATTGTAGGAGACGTAGGTGCATTTGGTGAAGAGGCGCCGGTGGTGGAATACATCTTGTACGTCGCTACTGGTTTATTCAGGCTGTACAGATCCTTAGTGAACGCCGCGAGACTGAGAATCGTTAATGATCAAAAGCGCGTCGTTTTCCCCGCAGTGATACATGAGAGTTGCCCAGGTATATCGGAGGTAAGCCCAACGCATATTATTTTTTCTAAGTCGCAGGGAGAGGACGTGGAGATTGACTCACTGCGGTATGTTTTCTCTGTAAATAGAAAGAGATTTGAGACCGTTGCGGCTCTGAAGATGGCCGATGCCGCTACGGAGAGATATCTGGTGTGTGATGAGATGGTTCCATTCCATAACGCACTGAATTTGGTTGCGGCCATTCATTTATGCGCTGCCGGAAAGGTAGGGAAAAATTTTTCAAAAGTAACCAAGGTATGCGTTAATGCCCCGCCTGGAGGAGGAAAGACAACAAAATTGATTCAGGAGTACTTTAAGGATAGATCTGGCAGTTGTATTATGACCGCCAATCGTGGTAGCGCTATAGATATCAATGATACCATTGAGAGTATAGACGCTGCTAATGCGAGCAAAGCCGCTTCGAACAACGTCAGCGGCGTGGAATCGATAGATAATTATGTTTGTGCTCGTACAGTTAACTCACAAATTATGAACTGCAAAGGAGTAATGAATTATACCTGCGCCCTAGTTGACGAAATGTATTTGATGCACAAGGGTCTGTTGATGTTGGGGGTATTCAGTTCTGGAGCAAGAAGAGCTATATTCTACGGAGATATCAACCAGATCCCCTTCATAAATAGAGAGAAGTGTTTTTACTCTAAGGAGGGTGTGTACTGTCCAGGTAAAGATGAAATTATTTA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| 3,311
|
OP860299.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-2/S1-1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,211
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2 isolate PMWaV-2/S1-1, complete genome
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| 18,374
|
OP860300.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-2/S3-1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,242
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2 isolate PMWaV-2/S3-1, complete genome
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| 18,375
|
OP860301.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-2/S2-1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,218
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2 isolate PMWaV-2/S2-1, complete genome
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| 18,376
|
MN539272.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
|
Green,J.C., Rwahnih,M.A., Olmedo-Velarde,A., Melzer,M.J., Hamim,I., Borth,W.B., Brower,T.M., Hu,J.S., Al Rwahnih,M., Larrea-Sarmiento,A.E., Hu,J.
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University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2020-05-13
|
HANA158
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
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Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,259
|
GenBank
| null |
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2017-02
| null | null |
UNVERIFIED: Pineapple mealybug wilt-associated virus 2 isolate HANA158, complete genome
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| 50,518
|
MN539273.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
|
Green,J.C., Rwahnih,M.A., Olmedo-Velarde,A., Melzer,M.J., Hamim,I., Borth,W.B., Brower,T.M., Hu,J.S., Al Rwahnih,M., Larrea-Sarmiento,A.E., Hu,J.
|
University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2020-05-13
|
HANA187
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Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
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Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,271
|
GenBank
| null |
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2017-02
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2 isolate HANA187, complete genome
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| 50,519
|
LC507822.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
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Yanagisawa,H., Sekine,K.
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Central Region Agricultural Research Center; 2-1-18 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8666
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Japan
|
2020-04-02
|
PMWaV-2
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2
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Ampelovirus
|
Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 15,418
|
GenBank
| null |
Taiwan
|
Taiwan
|
Ananas comosus
| null |
2015
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 2 PMWaV-2 genomic RNA, complete genome
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| 52,985
|
NC_043406.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Sether,D.M., Melzer,M.J., Borth,W.B., Hu,J.S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-06-28
| null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 11,872
|
RefSeq
| 1
|
USA: Hawaii
|
USA
| null | null | null | null |
PRJNA485481
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Pineapple mealybug wilt-associated virus 3 ORF1a and RNA dependent RNA polymerase (RdRp) genes, partial cds; p6 gene, complete sequence; and mall hydrophobic 5.65 kDa protein, heat shock 70-like protein (hsp70h), 61.0 kDa protein (p61), 28.8 kDa putative coat protein (CP), and 24.1 kDa protein (p24) genes, complete cds
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GATGCTCAACAGAAATGTGAGGGCATCGCGTGGATACTGCTGGTTACCTTTATTCTTGAATTCCCATATTCCGGTATCCAAGTACCCGACCAGCCCACTCGTACGCCTAAACTATCTTCGACATCTGTTCGGGGAAATACCACTAATTAAAACCGGAACTTTTTACCATTACTCACAAAAGGGTTTAAAAGATAAAACACTTCCAAATGTTCTCGTTGGTGCTACTCATCAACCCGACGAGATCGAGTCTCTACCTTTGAGTCTGCTGGTCGAAGACCCCCTTCTGAACACTGCTATAGACAGCGTGGTCAAGAAGATGACCATGCGCGAAACGTCGCATTTCCAAAACACTGTAGACGATTTAGTAGAATCGGCGATTAAATGCGACTTGAGAGCGAGGGAAAAAACCAGGTTTAAAATTCCATATCACATGGAGCCAGATCAGGTAGATATTCTCAAGAAGATGTTACACATTTCCAGCGTGCAAGTTGGGTTTGAACCCGCCGGCGCCCACCCTATCTTCAACGCCGTGAGAAAATTTTTCAACGAAATGAACGCCAGGGCTTTTAAAGGCGTTACAGTATCAGACATTGGGGGAAGTGTAGTGAATTGTTTATCGCAAAACCTCTCCAATGTCCACGTGTGTGCTCCGATTGTTGATGTGAAAGGTGCTGGAAGAATTTCTAAATTGAGTATTGACGTAATCAATCGTGCTGTAGATCATTCTTCCGGTGGTGGGAAGTTGGCCACGTTTATATCAAACCTTGGATCTTTATCTGTATGTCATAAACGTGTTCCACACTGCACGTATCCGAGTACTGTCATCACCATGGTGGACGTATATGATGTGCGTATTGAGACACTGCTTTACGCTATGGAAAGGAAAGGGAGTGTCTTGGCTAAAGTGTTTTTGATGTTTCCACCTGAATTATTAAGCGGCGAAAAGATCGCCACTTATCCAGGTACAACACTCACAGTAACAAGAGATGGAGATAGTTTGGTGTACTTCATAGGGAGCACAGGAGACGCTTACGTACACTCATATTCCACTGTCTCCTCCTACCTAACTAAGGCCGTAGTTTTGAGCAACTCTGGATGTAGTTACTACATTGAAGTAAACACTCAATACGGTCCTTATTTGGAAATAACGATATCTCTATCTAAACCAGTTTCTTATAGAAAACTGTGGAGACGGTTGGTACCTTGGAATGCGAACCAAACAAAGATCACTTTTCCCATCACCGATCGTTATGGTTCCCCCACTCAAAAATCGGTGTATGTAGAACGAGATTTCGTGCGACGTAGTCTCGCCTACGCTGCCAATGTCTGTAATACCACCGATGACCGAACTTATGAGTACGTAATGTCAAATTTTCGATCTCAAACTACCATGATGGTAGTAGGGTCAAAAATAGTCCATAGCAGAGTGGATTTCTCCAATGATCTGCTGGTGGAAGTCCCTACGGCTATATTACATGAAGCAGTTAATAGGAGGAATTCGGCTGTGAAAACTATGAAAGCGAGTAGACAACACAAACTGGTGAAATTCGCAAAAGCTGTGCTCACTTTCCTCAGTGAACCAATTAGAGTCCTCCTGCGTTCTTTGTATAGAAGCCTGCCCGAGCAGGTCATTCAGTGGTTCACCTCCATTAATAAGAGCGAATACTCCATCGAGGATACAGCTGATGAGATCATCACAGAAGCCGATTGTCAGATCGGTTCGTTAAACACGGAATGTGAAAATATGGAGGAGATTTTTAATATTGCTCAAGCACTAGCTGTTTTGAGTTCAAAATCGGGAGTTACGGAGGATGAGGAGGAGATACAACCGGATACTTCAGAGTCACCCCTTGAAGAAAGAGAGTGCGCCGAAATAAATGACACTTCTTCTAAGGGTTCACTGAATGGTGGTGCGACTGGTAACTGGTATGATTTTTTACTCCCAGCAACAGCAAATGCAGAGTCAGGAGACTGTTGGAGGGCTCTGTTGTGGAGGGTGATGCGTAGGTTAACGCGTGTTGTCCAATCTTGGGCAACTCCTTTAGGCGCAATTAAATCGTGGTTATTGTCTTTGTTCTTAACAATACTACGATTTTTGAAATTCAGAGCTTCTGAACAATCAACAGAACAAAAAATGGAGAAGAATTTGTGCAAAAGTTTACTCAGGTTTCTCCGCAGTTTGTTAAATAACAAAGTGGTGCAACTCTCTCAACTTGTTAGAAGTTGTGGAGATGGTATAAATCATTTGGGAAAAACTTGTACTTCACATTCAATGAATGTATTAAATAAAATCGCTACTTCAACGCAATCTTACATTAACCAAACGGCGATTTCTCTTGGTGAAGCTGCGGCGAACAGCACAACGAAAATAGGAGAAAAAATAAAATCAAACCTAGCAGAACGCTTAACGAATCTCAAAATTAAAACTGCGATGGTGTTGAAGGCGGCTGGTTTACCCTACCCGCAGGAATGGATTCCTGATAAAACATTTAAAACATGGTTGATACAGGAGGTAGGTAAACATGTTCCTCATATTGCGATAGCTGCTTTATTGTCTGGCGCTGTGTACGCTAGTTTCACCGACAACGTCGTCCGGAGGAATGTGAATGTTTTGTTCGGGAAGGTGTTAAATTTCTTAAACAAGACTGTTTACACTCCGATCCGCAAGTACATATCCAGAATTCGCATAGAATCAAAACTATCTCTTGGACTGAGTCTCTTGGGATTGTTAATGAAAGATGTGGTGTTGTTAACGAGTACTCTCTCCTGTTACAACCATTTGACTCACATCGCTTTCCCAGTATATCTAGGAGCTGAGATATCGAATCTTACTCAGAGGTGTTGGGCGAGGAAGAATCCTATTACTATCGGTCCTCTCTTGCGAATAGCACTCTCGAAAGAGGGGTTTTTAGCATATAGGAGTCCGATCAAGATAGATGAAGGAGAGGTTGTGAGTCCTAGAGACCCGACGGACATAGTACCGGATGTGAGTTTTTCTAACGGAAAACAGGTCTTAGCTAGAGCACTGGATGTTTTTCGATTGAACGCAGCAAAGACCGGACCTGACTCTCACACAACTCCTCTCCGAGCCACAGTAGACGAGAAAACCCCGAAGAAGGTAGAGGAAATTTTGGAAGGTAATGGATCATTAGACAAAGTCCAACCTCACACGATAGAGACAGAACAAAACCTAGCCAACACTCCAGCACAAAACGTTGAATGTCAGAAAACTAAGACTGAAGTTCACCCAACTAAGTTCAGTTCTGGTGACTTACTTGGTAAGAACAAAATTGTCGGCAGTGTTGGGGTAGAGGGATTTGAAGTGGACTCTACAAATTCAGATGAAGCGATGTTGTGTTTAGACGAACTTTTAGAGCAGTGTAATTCCAAGAACGGTCCGACCGGTTTAAAAGACCCCTTATCAAAATCGAATTGCGCTATAACTTTGCATGAAGAANGGGAGTGTTCTAACACGGATAAGATTAATGAGTGGATGCTCGACGCACATGCGGCACTTCGGTTTACGGGAGGATTTAAACCTCCGATTGTAGTGAACCTACCAGGCCACTCGGATAAACCTTCAATTAAAACTTCATCTCCATCTCCGGTTGTCGAATTGCGAGAGTGTAAATCGACATCTGAAATTCAATCGGTTCACTCTACGGAAAGATATGTTCCTCCATATCGTAGAGCTAACTCTGATGGTGGTGTCGAAACCGTAAAGGCAGCGGACATCCGTGCTTGTCAGGTCACATCTACAATCCCCTCGGTGGTCACTGTTCCGGCTGGAAAACCGAGTAAAACGATACGGATGCACACTTCGTTGATAGATGAAGCGAGTTCAGTTTTAGGTGTTGCCTTCAAGTCTAAAGTAGATCTACTAAATGTAGGATTTTACAGAAATTTGACCAGAAGAGTCTCCGGAAATTCAAATAAGGCTAAAGTGTTTGAGGCTTTAGCTCATTCTTTACATGGACTCCGCATGGAGGTGGACGCTATAGACAAAGTGTTGAAAGCACCTAAACCATTAATTGGTAATAGAAATGATCTCTTCACAAGAGACATACAAGAACTAAATATGGTACAAAAAGCGAATTCTGCCAATTTTAAGATTGAAGATCCGGCTAGCAATATGGTCGGTTTGTTGGGGGAGAGAAGGTTGATTTTCAACAACGACAAAATGTTGAAGGAACCTCACGACATAGTGTTTGTTCCCCCATTTGATATTTCGTTTAATTTAGTCAGAACATTGTCGATACTGTTGATGCTGAAAGATCTGACAAACGACGATTTAGATAACGCCTTGGAGACATGCTCTTTTGTTAACGCAGTCCCTGGGGCAGGAAAGACTTACAGCATAAAACAACAAATGTTGAACTGGAAATCGACTGCGAAGAAAGGAGAGCTTCTGTTGGTATTGACGGCTTGCAGAAATTCTGCACAATCTCTTAAAACCTTCGTCTCGGAAAACGCTTTAGACAAAGTACTCTCCGTGATGACCATTGATTCTTACCTCTTCCAAACTCGTCGCGGAAGCCCCTGCAAATACGCGAAAATATTGATCGATGAATGCTACATGGTACATGCTGGTATCATAATCGTCGTGTTAGCGTATGCGAAGCCCGAATCAACCACGCTATTTGGCGGTAGAAGACAGGTACCCTTCATCAATAGAATGAAACTTCTTCAGGATGACAAGGGAATGCTTGTTCCAAATGGCAATTACTCAGAAATGTTGACTACCCACAGATGTCCCGCTGACATATGTTGGTGGATGTCGACCGTTCAATTCCAAAAGAGAGGTGGGAAACTGTACAGTGGAGATGTCAAGTTAATCTCCAAACACCCCATCCTTAAAAGTGTCACGCGTAAAGAATTCAGTAAAACGGACAACACGTTATTCAACGATGTTGACCGAATTATGACCTTCACACAGAATGAGAAGAACGAGTTGATCTCAGATTTCCTAAACGGTAGACATGGTGACCGTCAACGAGCTA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| 3,393
|
OP860286.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-3/S3-2
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 12,196
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3 isolate PMWaV-3/S3-2, complete genome
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ATTGGTTATAGACCACTCAGGAGCCAAATTAAATCAAAACATCAAACCATCACGACTTTCCAGACACATTAACAAAACTTTTCCCAAACAACTTGGCTACTCTATTTTCCTTAATCTCTAATCGCCTTCCAGCTATTTAAAATATTTCTACGCAATTTTAAACGAATTTAATGAGAAAAAACCAAAAATATTTTATTTCCACTCATGTATAAACGCGGTAAGAAGACTATTAGTCAGCTCGAGAATAGAACTAATATACTAAGCTTTCCATATATTAGAACCAATAAAGCTACAAAAGAAAAATACGAACGCGAGTTAGTAGTTAAGACTAAGATTCCATCCGCAAAAGAGCGTAAATTAAAATATTTCTACGATCCCCCTACCCTAAAACCTAAACTCGCTGTTCCACAAAAACCAAAAACAAGTCCGCCATCTACTGTCGGACGATCTAGACAATCATCTCCGAACAATTTTCCTCGCAGGAACAGGGCGGTAGATGAGACCTCTTCGCCCCGCTCACAGACGTCCCAACGTAGTAACAGTAGCGGGAGCTACGTCTGGGTTGCCAAGTCTCAAATTCCCGTGCAAACATGCGAGACCATGTCTCCACCATCGCGATCCAAACCAAGTAGCAGTCGGTCCGAGCGTGAGAGCTCGGGAGGCAGCTCTAACGCAAGCGGAATTCCAAAAACCCCCAACGCTACCATTCGTCGCTGGTATGAGTGTGATTATAGGGGGCCGTTTGGTGAAGTTCCTGGAACCACAATCAACACACGAACCCACCAAAACAAACGGAGAAATCAAGGAAAACAGAAAAACACTCATACACAGGCTGCTGTTGTTGATACAAACCCTATTCCAACAAAACAACATCATTTAATCGTTGATGAAGAAGTACCACCACAACTCCGGAATAAGCCATATTTTTCCCGAAATATGGAGACTGGTGTGGTACATGTCAATTTCTCGTCACTCCCACTGAATGCAGAGTTGACGTTGACTGACTGGTTAGATGAGAAGGGACACCAAGCTTCCGATTTTCTCAACAGCTTTGTCGTAAGTAGATTACGCAAGGATTCACTTAAATTGTTGAGAACTTCAGTACTTATCGGTCGTAGAGCCATTGCACACTGTTTTTCCGATGCCGGTAAGTATCTGGGAAAAGTAATTCTGAATGAGAAGATGTGGTTTTTCTACCGAACCGCCGGCCGCTCACATAGTGAATATATTTCATGCGGCGCTGGTACGGTTAGTAGACTCTTCTTAAAGAACAGGTTCCCAACCCTACACGAGGCAGTAAGCCATGATTGGGCAAAGGGTTATAGTGCTTTAGACCACGTCACATTGTACGACCCAATGCTCAACAGAAATGTGAGAGCATCGCGTGGTTACTGTTGGTTGCCGCTTTTCTTAAGTTCCCACATCCCAATATCAAAATACCCAACTAGCCCGCTGGTACGCCTGAATTATCTCCGTCGCCTGTTTGGGGAGATACCACTACTTAAAAATGGAGACTTCTACCATTACTCGCTGTCTGGCTTGAAAGACAAAACACTTCCTAACGTTCTTGTTGGGGCAACCCAACAATCCGATGAGATCACATCTTTACCATTGAGTTTGTTGGTAGAAGACCCTCTTTTAAACACTGCTATAGACAGTGTGGTGAGGAAAATGACCATGCGCGAAACCTCACACTTCCAAAACACCGTAGATGATCTTGTGGAATCAGCAATCAAGTCTGATTTGAGGGCGAGGGAAAAGACGCGGTTTAGAATCCCGTATCATATGGATCCAGATCAGGTGGATATTCTTAAGAAAATGTTGCACATTTCTAGCGTGCAAGTGGGGTTCGAACCTGCCGGAGCTCACCCGATTTTCAATGCTATGAGAAAATTTTTCAATGAAATGAATGCCAGGGCTTTTAAAGGCGTCACTGTATCAGACATTGGAGGAAGTATCGTGAATTGTTTATCACAGAATCTCTCTAATGTCCACGTGTGTGCCCCGATCGTTGATGTGAAAGATGCTGGTAGGGTTTCAAAGTTAAGCATCGATGTGATCAACCGCGCGGTGGGTCACACCTCCGATGGTGGTGAATTGGCTACATTCATATCAAACATCGGATCCCTATCTGTATGTCATAAGCGTATTCCACACTGCACGCATCCGAGCACTGTTATCACTATGGTGGACGTGTATGATGTACATGTTGAGTCCTTGCTTCACGCGATGGAAAAGAAGGGGAGTGTTTTGGCTAAGGTGTTTTTGATGTTTCCACCCGAACTATTAAGCGGTGAAAGAATCGCCACTTATCCAGGTACTACACTGACCGTGACGAAAGACGAGGACTGCTTGGTATACTTTATAGGAAGTACAGGAGACGCTTATGTGCATTCATATTCCACTGTTGCTTCTTACCTGACCAAGGCTGTAGTTCTGAGCGATTCAGGATGCAGTTACTACATTGAGGTTAACGCTCAATACGGTCCATATCTAGAAATAACGATATCTTTATCTAAACCGGTCACCTACAGAAAGTTGTGGAGGCGGTTGATACCTTGGAATGCTAACCAAACGAAGATTACTTTTCCCATCACCGACCGTTACGGTTCCACTACCACAAGATCGGTGTATGTTGAGCGGGATTTTGTGCGACGTAGTCTTGCCTACGCTGCCAACGTCTGCAACACCACTGATGACCGAACGTATGAGTACGTTATGTCAAATTTCCGATCTCAGACTACCATGATGGTAGTAGGATCAAAAATAATTCATAGCAGAGTGGACTTTTCCAACGATTTATTGGTGGAGGTCCCCACAGCGATCTTACACGAAGCAGTCAACAGAAGAAACACTGCTGTGAAGATGATGAGAGTGAGTAGACAACATAAGCTAGTGAAAATTGCGAAAGCCGTACTCACTTTCCTCGGTGAACCGATAAGGGTTCTATTACGTTCCTTGTGCAAAAACTTACCTGAGCGGGTCACGCAGTGGTTTAATTCCATTCTAAAAAGCGAATACTCCATTGAGGACACGGCGGACGAGATCATCACGGAAGCTGATTGTCAGATCGGTTCACTGAATACCGAGTGTGAAAACATGGAAGAAATTTTTAAAATCGCTCAGGCATTGGCAGTTCTGAGTTCAAAATCAGGGATAATAGAAGACGAGGAAGAGATAAAACCAGACACATCAACGCCTCACTCCGAGGGAAGGGAAATCCTAGATGTTGATGATACCCCTTCTAAAGGTTCACTAAATGGTGGTGCCGTGGGTAATTGGTACGATTTCTTACTCCCGGCAACAGCAAATGCAGAGTCCGGAGATTGTTGGAGGGCTCTGTTATGGAGGGTGATGCGTAGATTGACACGCGCTGTTCAGTCTTGGGCTACTCCTTTAGGCGCGATAAAATCATGGTTATTATCTCTGTTTTTGGCGATACTGCGATTTTTAAAACTCAGAACCACTCAACGACCATCAGAGCGGAAAGTGGAAGAAAATGTGTGCAAATCTCTACTCACTTTCCTTCGCAGCCTATTGAACAACAACGTGATACGATTCTCTCAACTTGTCAATAGTTGTGGAGATGGTACGAACCGTTTGGTAAACACTTGCACTTCCTACGCAACAGACGCTTTGAGCAAAATCGCTACATCGGCACAATCTCATATTCACAAAACGGCAGTTTCTATTGGTGAAGCTGCAGTTGCCGGTATGGTGAAAGTAGGAGGAGGAATTAAGGCGGACATGGCTGAACGTTTGACAGACCTTAGAGTCAGAACAGCATTGGTGCTGAAGGCGGCTGGTCTACCTTATCCGCAAGACTGGATTCCCGACACAACTTTTAAAACTTGGTTTCTCAAGGAAGTGAGTAAACACGTACCTCACATTGCGCTAGCCTCTTTATTAACTGGTGTTGCGTACGCTAGCTTCACCGACAATGTTGTTCGGAGAAATGTAAATACTTTGTTCGGAAAGGTAATGAAATTTTTGAACGAGGCTGTCTACAACCCAATTCGCAAGTATATCTCCAGAGTTCACTTAGAGTCAAAGATGTCTCTAGGACTGAGTCTCTTGGGATTGTTGATGAAAGACGCAGTGTTGTTAACTAGCGCAGTCTCATGTTACAATCATTTGACCCACATTGCTTTCCCAATATATTTGGGAGCTGAAATATCGAATCTAACTATGAGGTGTTGGTCAGGGAAAAATCCTATTACCATAGGTCTCCTTTTACGATTGGCACTCTCGAAAGAGGGGTTTTCAACATACAAGAGTCCAATCAGAGTAGATGATGGAAAAATTTTGTGTCCTAGAGACCCGACCGACATAGTACCGGATGTAAGTTTTTCCACCAGAAGACAGGTGTTGGCCAGAGCGTTGGACGTTTTCCGACAGAACGCGGGAAAATCCGGACAGACAACTCACACAACTCCACTTGGAGCTACGGTGGACGAAGCAACACCGGCAACAGTACCTAAGATCTTGGCGAACGGAGTTACGTCGAATAACGCCCAATTTAACACAGTGGAAACTAAACAACAGTCACCCACTACTCCTTTGCAGACAGCTGATTGTCGGCAGAATATGGTTGAAGCGCCCCACATGGAACGTAAGTCTGGGAATACCACCAGTAAGCCTAAACACACCAGTGAGGTTCTGGGGAAAGCCTTAGAAATTGAGTCTACAGATTCTGATCAGGCGATGTTGCGTTTAGACGCTCTTTTAGAACAATGCGATTCCGAAAATGATTCAATCACACCCAATAACCATTTGTTGAGATCGGACCATGTGACCGTTTTGAATGAAAAAGGAGAGTGTTCTAACACCGATAAAGTTAACGAGTGGTTGAACGACGTTGATGCGGCTTGTCGGTTCGCAGGAGGATTTAAGCCTCCAATTGTATTGAATTTACCCAGTCATTCAAACAAACCGTCGGTCAAAACATCATCTCCATCTCTAGCTGTTGAAGCGCGAGAGTGTAAATCGACGTCCGATAT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ATAACATTACTACAGAGATACATACACTACAGAACAAATCCGTTGCGATTTGTAAACTTACCGGTGAAGATACAAGTGATGTTTAAGGGCAAGATGGAACTAATAGATTACTCGGCGGTTGACGGAGTATTCGCTCAACTTCAAAATTCTTTTCCTGAGGTAGAGAGGTCCTGGTGTGCCCCGTTAGCAACAGTGGCATACTTTTTATTGCGCGATTCGGGTGGTTCTTTTGCTAAATGGCGAGATTTGTGTGATGTTCCACCGGTGTTGAATTTCGATTTTGTGGGATATGTTGACCCTAGAGTTTTATCTAGTTTCGAGCGCAAACATTTGGCGCGCATTGTGCACAGATTTAGAACTGCGAACACGCCTGTGCGGGGTTTTAAAATTGATAATAGATTGATCAACCCAATAGATCATATCTATGACGAGATTGATATGTCTGCGTCTTCTCGCAGCTTACACAGATCATTATTGCTTAGGTAGTTCTGAGAACCACTTTAGATTTCGTTTGAAACTACTGTGGACTAACGAATTTTGGTGAAATTGAATATTCACGAGGAGACGACCGGAACCCCAATCAAATGAGTACGATTCCAGTACCACCCCCTCCCACTGTGCCGTTGAGCTCTACGCAGCAGCAGACTCCCAAAACTGTGGAAGAACAGGTCCAAGAGATTGAAAGTCTACCTCTACCTGGAGGTAGGACTACAGTCAATACATTCGCTGATCTGATATCGTCGGGTAACGCGGTATTGGATTTTACTAAAGTAGAGGTACCACGTATGATCAATATCACTATACCTGGGATAGTGGCAAAGGAACATCGAGTGAAAGGAGCAAAAGCTCTGTGGGAATTGGGTAAGTCGAAAGGAATTTCTGAGAGTGACAAACATATGATACAGTTTCTGATGCAAAGCTTCCAGAGTTTTGTCACTCATTCGACATCACCTAAGGTTTCAGGAGCGTCAAACCGTACTGTGACGGCTAAGTATGACAATAAAGACGTGACAGTATCCCACGAGGAGTTGAAGACTGCTTTAGATAACTCACTAGCCAGTTACGGTTATGAGAATACTATGCGGCAGTTTGGAAGGGCCTTCACTACTGTAATAGTTCAAGGTCTGAGTTCGGGTAAGATGGAGGTCAACACTCGAATTTGTTCTTCTCACGGTATACCTCCTAATTACTATCCTTACTCTCCAGATTGTTTACACGTCGACGCTCGTATACAGGGATACGATGCAGCCCTGGTGAATGAGTTGGGTAAGATGGTGGCTCTTAACAAGACTGCTGGAGGTAAACGTACGCAGCACAACTTGTTTGAGGAGACGGATATATCTCCTCAAATATTTACAGGTAACCGCAGGTGAACGCTCTAGACACCTGTGGTATAACACACCAACTCAGTGGAGGTCTGTGACCTCTACCATTTCGTTAGAAAATGGAAAGAGTGGTGTTGGTAAGTAAAGACAAACAATTATTGGGTGTTAGCTCAAACGAGGTTTTTTACAAACCTCTCAACAGTTTGTTTTTCTACGCTTCAGAGGGACGAAATGTTACATTCTTTTATGATAAGTTAGGTAACACTTTGACGGAAGCTAGAAAGCAGAATTGTGAGTTGTTTTCTTTCCTAGACAACTTAGGAAATGTGGTTGCCACAAACAACGAACAATTTCTGAATTTTCTCGACGGTACCTGCGTGAACGATTATATGGAACGAAGGTACGGAATAGTCGGTGGTAGAGGTTTAAGCCCTACCGAAATGAAAGCTACATATCTAACAGTAAAAGTACCAGTTTTGGATTTACTGTGGAACGTATTAGAGGGTAGCTGTAAGAATCTGACCAAAGTTTTTTGTGTTGGATTCAAAAGATCCGCTGGTTGTTCATTTGATGATCAGTACAACTTCGAATCTTCTTTCGCCGTCTTCGACAGCGGGAGTGGGTTTGAAGCTATCTTCGGTGAGAAGATAGATTTTTCCAGCGATTTTCTCAAAGAGCGGTACGACTCTTTGAGGAAAGCAGAGGATACACATGGAGTTGAGAGGGTGGTTAATCTTCTTTCCAGTGATTAAATATTGAAGACCACCTCGGGGAGAGATGATCCGAGACTTCCCGACCTGACCTGCCACTGGCAGGATAGGACGTAAGTCTGAATGGGGAATAATTTGGGGGGCTTTTGCCCCATCCGAAG
| 18,361
|
OP860287.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-3/S1-1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,337
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3 isolate PMWaV-3/S1-1, complete genome
|
CCGGAATCCTTGCGGCTTCTGATAGCAACACCGTCAGGTCTGATTCTACCAAATTTCTTAAACTCGTTTTCAAGGTCGGACTCCGTGACAGATGGGGGAACATTTCCCACGTAAACAGATTGGTTATAGACCACTCAGGAGCCAAAATATAACAAAACTTCAAAACATCACGACTTTCCAGTCACATCAACAAAACATTTCCCAATCACTTTGGTTACTGTATCTTTCCTAAATCCCTAATCGCTTTCCAGCAGGTTTATATATCTCTATATGTTCTAAACAAATTTTAAGGAAAAAACCAAAAATATTTCAATTTCCCATGCATGTATAAGCGCGGTAAGAAAACAATTAGTCAGCTTGAAAATAGGACTAATATATTAAGCTTTCCATACATTAGAACAAATAAAGCTACAAGAGAGAAATACGAGCGGGAGCTGGTGGTTAAAACGAAAATTCCAACTGCGAAGGAGCGCAAATTGAAATATTTCTACGATCCCCCAGTCATCAAATTCACGCCCGTTTTTCCACATAAACCTCAGAGATGTCCCACATCTCCTGCTCGACAGTCCAGAGGACCATCACCAAACAGCCTTCCAAACAAGAAAAACCCAACAGATGGCACCTCGTCGCCTCGTTCACAAACGTCCCAACGTAGTAACAATAGTGGGACCTACGTCTGGGTTGCCAAATCTCAAGTTCCCGTGCCAACACGCGAGGCCGTGTCTCCATCACTTCGATCCGAATCTAGTAGCGGTCGGACCGAGCGTGAGAGCTCGGGAAGCATTACGAACAGAGTTGGAATTCCAACGACCTCCAACTCTACCATTCGTCGCGGGCACGAACACCATTATAGGAGGACGTCTGGTGAAATTCCTCGACGCACCTTTAATCCGCGAACTTGCCCAAAGGGATGGAGAGGTCAGGGAAAAACCCAGAACGCTACTCCACAGGTTGCTGCTAATATTGCAAACACTTTTCCAATTAAACAACAACCCGTAAAATTTGATGAAGAGGTACCACTGCAACTGAGGAACAAACCTTACCTCACCAGAAATGCCGAAACAGGAGTGGTACATGTAGATCTCACTTCACTCCCCTCAAAATTGGAGCTAACATTAACTGACTGGTTAGACGAGAAAGGACATCTAGCTTCCGATTTTGTGAAAAACTTTGTCGTGGACAGGATACACAAAGATCTACTCAAACAACTAAGATCCGTGGTGCTCATCGGTCGTAGAGCCATAGCCCACGTATTTTCCGATGCGGGTAGATATTTGGGGAAGGTAATCCTGAATGAAAAAATTTGGTTCTACTACCGAACCGCCGGCCGTTCTCACAATGAATATATATCATGCGGTGCGGGTGTGGTCAGTAGATTGTTTTTGAAAAATAGATTCCCCACCTTACACGAAGTTGTAAGCCATGACTGGGCTAAGGGCTACAGTGCCTTAGATCACATCACCCTATACGATCCGATGCTCAACAGAAATGTGAGGGCATCGCGTGGATACTGCTGGTTACCTTTATTCTTAAATTCCCATATTCCGGTATCCAAGTACCCGACCAGCCCACTCGTACGCCTAAACTATCTTCGACATCTGTTCGGGGAAATACCACTAATTAAAACCGGAACTTTTTACCATTACTCACAAAAGGGTTTAAAAGATAAAACACTTCCAAATGTTCTCGTTGGTGCTACTCATCAACCCGACGAGATCGCGTCTCTACCTTTGAGTTTGCTGGTCGAAGACCCCCTTCTGAACACTGCTATAGACAGCGTGGTCAAGAAGATGACCATGCGCGAAACGTCACATTTCCAAAACACTGTGGACGATTTAGTAGAATCGGCGATTAAATGCGACTTGAGAGCGAGGGAAAAAACCAGGTTTAAAATTCCATACCACATGGAGCCAGATCAGGTAGATATTCTCAAGAAGATGTTACACATTTCCAGCGTGCAAGTTGGGTTTGAACCTGCCGGAGCCCACCCTATCTTCAACGCCATGAGAAAATTTTTCAACGAAATGAACGCCAGGGCTTTTAAAGGCGTTACAGTATCAGACATTGGGGGAAGTGTAGTGAATTGTTTATCGCAAAACCTCTCCAATGTCCACGTGTGTGCCCCGATTGTTGATGTGAAAGACGCTGGAAGAATTTCTAAATTGAGTATTGACGTAATCAATCGTGCTGTAGATCATTCTTCCGGTGGTGGGAAGTTGGCCACGTTTATATCAAACCTTGGATCTTTATCTGTATGTCATAAACGTGTTCCACACTGCACGTATCCGAGCACTGTCATCACCATGGTGGACGTATATGATGTGCGTATTGAGACACTGCTTTACGCTATGGAAAGGAAAGGGAGTGTCTTGGCTAAAGTGTTTTTGATGTTTCCACCTGAATTATTAAGCGGCGGAAAGGTCGCCACTTATCCAGGTACAACACTCACAGTAACAAGAGATGGAGATAGTTTGGTGTACTTCATAGGGAGCACAGGAGACGCTTACGTACACTCATATTCCACTGTCTCCTCCTACCTAACTAAGGCCGTAGTTTTGAGCAACTCTGGATGTAGTTACTACATTGAAGTAAACACTCAATACGGTCCTTATTTGGAAATAACGATATCTCTATCAAAACCAGTTTCTTATAGAAAACTGTGGAGACGGTTGGTACCTTGGAATGCGAACCAAACAAAGATCACTTTTCCCATCACTGATCGTTATGGTTCCTCCACTCAAAAATCGGTGTATGTAGAACGAGATTTCGTGCGACGTAGTCTCGCCTACGCAACCAATGTCTGTAATACCACCGATGACCGAACTTATGAATACGTAATGTCAAATCTTCGATCTCAAACTACCATGGTGGTAGTAGGGTCAAAAATAGTCCATAGCAGAGTAGATTTCTCCAATGATCTGCTGGTGGAAGTCCCTACGGCTATATCACATGAAGCAGTTAATAGGAGGAATTCGGCAGTGAAAACGATGAAAGTGAGTAGACAACACAAACTGGTGAAATTCGCAAAAGCTGTGCTCACTTTCCTCAGTGAACCAATTAGAGTCCTCCTGCGTTCTTTGTATAGAAGCCTGCCCGAGCAGGTCATTCAGTGGTTCACCTCCATTAATAAGAGCGAATACTCCATCGAGGATACAGCTAATGAGATCATCGCAGAAGCCGATTGTCAGATCGGTTCGTTAAACACGGATTGTGAAAATATGGAGGAGATTTTTAATATTGCTCAAGCACTAGCTGTTTTGAGTTCAAAATCGGGAGTTATGGAGGATGAGGAGGAGATACAACCCGATACTTCAGAGTCACCCCTTGAAGAAAGAGAGTGCGCCGAAGTAAATGACACTTCTTCTAAGGGTTCATTGAATGGTGGCGCGACTGGTAACTGGTATGATTTTTTACTCCCAGCAACAGCAAATGCAGAGTCAGGAGACTGTTGGAGGGCTCTGTTGTGGAGGGTGATGCGTAGGTTGACGCGTGTTGTCCAATCTTGGGCGACTCCTTTAGGCGCAATTAAATCGTGGTTATTGTCTTTGTTCTTAACAATACTACGATTTTTGAAATTCAGAACTTCTGAACAATCAAAAGAACAAAAAGTGGAGAAGAATTTGTGCAAAAGTTTACTCAGGTTTCTCCGCAGTTTGTTAAATAACAATGTGGTGCAACTCTCTCAACTTGTTAGAAGTTGTGGAGATGGTATAAATCATTTGGGAAAAACTTGTACTTCACATTCAATGAGTGTATTAAATAAAATCGCTACTTCAACGCAATCTTTCATTAACCAAACGGCGATTTCTCTTGGTGAAGCTGCGGCGAACAGCACAACAAAAATAGGAGAAAAAATTAAATCAAACCTAGCAGAACGCTTAACGAATCTCAAAATTAAAACTGCGATGGTGTTGAAGGCGGCTGGTTTACCCTACCCGCAGGAATGGATTCCTGATAAAACATTTAAAACATGGTTGATACAGGAGGTAGGTAAACATGTTCCTCATATTGCGATAGCTGCTTTATTGTCTGGCGCTGTGTACGCTAGTTTCACCGACAACGTCGTCCGGAGGAGAGTGAATGTTTTGTTCGGGAAGGTGTTAAATTTCTTAAACAAGACTGTTTACACTCCGATCCGCAAGTACATATCCAGAATTCGCATAGAATCGAAACTATCTCTTGGACTGAGTCTCTTGGGATTGTTAATGAAAGATGCGGTGTTGTTAACGAGTACTCTCTCCTGTTACAACCATTTGACTCACATCGCTTTCCCAGTGTATCTAGGAGCTGAGATATCGAATCTTACTCAGAGGTGTTGGGCGAGGAAGAATCCTATTACTATCGGTCTTCTCTTGCGAATAGCACTCTCGAAAGAGGGGTTTTTAGCATATAGGAGTCCGATCAAGATAGATGAAGGAGAGGTTGTGAGTCCTAGAGACCCGACGGACATAGTACCGGATGTGAGTTTTTCTAACAGAAAACAGGTCTTAGCTAGAGCACTGGATGTTTTCCGATTGAACGCAGCAAAGACCGGACCTGACTCTCACACAACTCCTCTCGAAGCCACAGTAGACGCAAAAACCCCGAAGAAGGTAGAGGAAATTCTGGAAGGTAAAGGATCATTAGACAAAGTCCAACCTCACACGATAGAGACAGAACAAAACCTAACCAACACTCCAGCACAAAACGTTGAATGTCAGAAAACTACGACTGAAGTTCACCCAACTAAGTTCAGTTCTGGTGACTTACTTGGTAAGAACAAAATTGTCGGTAGTGTTGGGGTAGAGGGATTTGAAGTCGACTCTACAAATTCAGATGAAGCGATGTTGTGTTTGGACGAACTTTTAGAGCAGTGTGATTCCAAGAACGGTCCGACCGGTTTAAAAGACCCCTTATCAAAATCGAATTGCGCTATAACTTTGTATGAAGAAGGGGAGTGTTCTAACACGGATAAGATTAACGAGTGGATGCTCGACGCACATGCAGCACTTCGGTTTACG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| 18,362
|
OP860288.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-3/S3-1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,208
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3 isolate PMWaV-3/S3-1, complete genome
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TGGTTATAGACCACTCAGGAGCCAAAATATAACAAAACTTCAAAACATCACGACTTTCCAGTCACATCAACAAAACATTTCCCAATAACTTTGGTTGCTTTAATTTTTTCAATCCCTAATCGCTTTCCAGTAGGTTTATATATTTCTATATGTTCTAAACAAATTTTAAGAAAAAACCAAAAATATTTTAATTTTTCCACTCATGTATAAGCGCGGTAAGAAAACAATTAGTCAGCTTGAAAATAGAACCAACATATTAAGCTTTCCATACATTAGAACAAATAAAGCAACAAGAGAAAAATACGAGCGGGAGCTGGTGGTTAAAACGAAAGTTCCAACTGCGAAGGAGCGCAAACTGAAATTTTTCTACGATCCCCCAGTCATCAACTTCACGCCCGTTGTTCCACAAAAACCTCAGAGCTGTCCCACATCTCCTATTCGACAGTCCAGAGGGCCATCCCCAAACAGCTTTCCATACAAGAAAAACCCAACAGATGGGACCTCGTCGCCCCGTTCACAAACGTCCCAACGTAGTGAAAATAGCGGGACCTACGTCTGGGTTGCCAAGTCTCAAGTTCCCGTGCCAACACGCGAGGCCGTGTCTCCATCACTTCGATCCGAATCTAGTAGCGGTCGGTCCGAGCGTGAGAGCTCGGGAGGCATTGCGAACAGAGTTGGAATTCCAGCGACCTCCAACTCTACCATTCGTCGCGGGTACGAACACCATCATAGGAGGACGTCTGGTGAAATTCCTCGACGCACCTTTAATCCGCGAACTTGCCGAAATGGATGGAGAGATCAGAGAAAAACCCAGAACACTACTCCACAGGTTGCTGCTAGTGTTGCAAACACTATTCCAATTAAACAACAACCTGTAAAAATCGATGAAGAGGTACCACTACTACTGAGGAACAAACCCTACCTCACTAGAAATGCTGAAACAGGAGTGGTACATGTAGACCTTACTTCACTCCCCTCAAAATTGGAGCTAACATTAACTGACTGGTTAGACGAGAAAGGACATCTAGCTTCCGATTTTGTGAAAAGCTTTGTCGTAGACAGGATACACAAAGATCTACTCAAACAACTACGATCCGTGGTGCTTATCGGTCGTAGAGCCATAGCCCATGTGTTTTCCGATGCGGGTAGATATTTGGGGAAAGTAATACTAAACGAAAAAATGTGGTTCTACTACCGAACCGCCGGCCGTTCACACAATGAATATATATCATGCGGCGCGGGTGTGGTTAGTAGATTATTTTTAAAAAATAGATTCCCCACCTTACATGAAGTTGTAAGCCACGACTGGGCTAAGGGCTACAGCGCCTTAGATCACGTCACCCTATATGATCCGATGCTCAACAGAAATGTGAGGGCATCGCGTGGATACTGCTGGTTGCCTCTGTTTTTAAATTCCCATATTCCGGTGTCCAAGTACCCGACCAGCCCACTCGTACGCCTAAACTATCTTCGACATCTGTTCGGGGAAATACCACTGATTAAAACCGGAACTTTTTACCATTACTCACAAACGGGTTTAAAAGATAAAACACTTCCAAATGTGCTCGTTGGTGCTACTCATCAACCCGACGAGATCGAGTCTCTACCTTTGAGTTTGCTGGTCGAAGACCCCCTTCTGAACACTGCTATAGACAGCGTGGTCAAGAAGATGACCATGCGCGAAACGTCGCATTTCCAAAACACTGTGGACGATCTAGTAGAATCGGCGATTAAATGCGACTTGAGAGCGAGGGAAAGAACCAGGTTTAAAATTCCATACCACATGGAGCCAGATCAGGTAGATATTCTCAAGAAGATGTTACACATTTCCAGCGTGCAAGTTGGGTTTGAACCTGCCGGAGCCCACCCCATCTTCAATGCCATGAGAAAATTTTTCAACGAAATGAACGCCAGGGCTTTTAAAGGCGTTACGGTATCAGATATTGGGGGAAGTGTAGTGAATTGTTTGTCACAAAACCTCTCCAATGTCCACGTGTGCGCCCCGATTGTTGATGTGAAAGACGCTGGAAGGATTTCTAAATTGAGTATTGATGTAATCAATCGTGCTGTAGATCATTCTTCCGGTGGTGGGAAGTTGGCCACGTTTGTATCAAACCTTGGATCTCTATCTGTATGTCATAAACGTGTTCCACACTGCTCGTATCCGAGCACTGTCATCACCATGGTGGACGTGTATGATGTGCGTATTGAGACACTGCTTCACGCTATGGAAAAGAAAGGGAGTGTCTTGGCTAAAGTGTTTTTGATGTTTCCACCTGAATTTTTAAGCGGCGAAAAGATCGCCACTTATCCAGGTACAACACTCACAGTAACAAGAGATGGAGACAGTTTGGTGTACTTCATAGGGAGCACAGGAGACGCTTACGTACACTCATATTCCACTGTCTCCTCCTACCTAACTAAGGCCGTAGTTTTGAGTAACTCTGGATGTAGTTACTACATTGAAGTAAACACTCAATACGGTCCGTATTTGGAAATAACGATATCTCTATCAAAACCAGTTTCTTATAGAAAACTGTGGAGACGGTTGGTACCTTGGAATGCGAACCAAACAAAGATCACTTTTCCCATCACTGATCGTTATGGTTCCCCCACTCAAAAATCGGTGTATGTAGAACGAGATTTCGTGCGACGTAGTCTCGCCTACGCTGCCAATGTCTGTAATACCACAGATGACCGAACTTATGAGTACGTGATGTCAAATTTTCGATCTCAAACTACCATGATGGTAGTAGGGTCAAAAATAGTCCATAGCCGAGTAGATTTCTCCAATGATCTGCTGGTAGAAGTCCCTACAGCTATATTACATGAAGCAGTTAATAGGAGGAATTCAGCTGTGAAAACGATGAAAGTGAGTAGACAACACAAACTGGTGAAAATCGCAAAAGCTGTGTTCACTTTCCTCAGTGAACCAATTAGAGTCCTCCTGCGTTCTTTGTATAGAAGCCTGCCCGAGCAGGTCATTCAGTGGTTCACCTCCATTAATAAGAGCGAATACTCCATCGAGGATACAGCTGATGAGATCATCACAGAAGCCGATTGTCAGATCGGTTCGTTAAACACGGAATGTGAAAATATGGAGGAGATTTTCAATATTGCTCAAGCACTAGCTGTTTTGAGTTCAAAATCGGGAGTTATGGAGGATGAAGAGGAGATACAACCCGACACTTCAGAGTCACCCCTTGAAGAAAGAGAGTGCGCCGAAGTAAATGATACTTCTTCTAAGGGTTCATTGAATGGTGGTGCGACCGGTAACTGGTATGATTTTTTACTCCCAGCAACAGCAAATGCAGAGTCAGGAGACTGCTGGAGGGCTCTGTTGTGGAGGGTGATTCGTAGGCTGACGCGTGTTGTCCAATCTTGGGCAACTCCTTTAGGCGCAATTAAATCGTGGTTATTGTCTTTGTTCTTAACAATACTACGATTTTTGAAATTCAGAACATCTCAGCAATCAGCAGAACAGAAAGTGGAGAAGAATTTGTGCAAAAGTTTACTCGGTTTCCTCCGCAGTCTGTTAATTAACAATGTGGTGCAACTCTCTCAACTTGCTAGAAGTTGTGGAGATGGTATAAATCATTTGGGAAAAACTTGTGCTTCACATTCAATGAATGTATTAAATAAAATCGCTACTTCAACGCAATCTTACGTTAACCAAGCGGCGATTTCTCTTGGTGAAGCTGCGGCGAACAGCGCAACGAAGATAGGAGAAAAATTTAAATCAAACCTAGCAGAACGCTTAACGAATCTCAAAATTAAAACTGCGATGGTGTTGAAGGCGGCTGGTTTACCCTACCCGCAGGAATGGATTCCTGATAAAACATTTAAAACATGGTTGATACAGGAGGTAGGTAAACATGTTCCTCACATTGCGATAGCTACTTTATTGTCTGGCGCTGTGTACGCTAGTTTCACCGACAACGTCGTTCGGAGGAATGTAAATGTTTTGTTCGGGAAGGTGTTAAATTTCTTAAACAAAACTGTTTATACTCCGATCCGCAAGTACATATCCAGAATTCGCATAGAATCGAAACTATCTCTTGGACTGAGTCTCTTGGGATTGTTAATGAAAGATACGGTGTTGTTAACGAGCACACTCTCCTGTTACAACCATTTGACTCACATCGCTTTCCCAGTGTATCTAGGAGCTGAGATATCGAATCTTACTCAGAGGTGTTGGGCGAGGAAGAATCCTATTACTATCGGTCTTCTCTTGCGAATAGCACTCTCGAAAGAGGGGTTTTTAGCATACAGGAGTCCGATCAAGATAGATGAAGGAGAGGTTGTGAGTCCTAGAGACCCGACTGACATAGTACCGGATGTGAGTTTTTCTAATAGAAAACAGGTCTTAGCCAGAGCGCTAGATGTTTTTCGATTGAACGCAGCAAAGACCGGACCTGACTCTCACACAACTCCTCTCGAAGCTACAGTGGACGCAAAAACCCCGAAGAAGGTAGAGGAAATTCTGGAAGGTAAAGGATCATTAGACAATGTCCAACCTCACACGATAGGAACAGAACAAAACCTAACCAACGCTCCAGCACAAACCGTCGAATGTCCGAAAGCTACGACTGAAATTCACCCAACTAAGTTCAGTTCTGGTGACTTACTTGGTAAGAATAAAATTGTCGGCAGTGTTGGGGTAGAGGGGTTTGAAGTGGACTCTACAGATTCTGATGAAGCGATGTTGTGTTTGGACGAACTTTTAGAGCAATGTAATTCCAAGGACAATCCGACCGGTTTAAAAGACCCCTTATCAAAGTCAAAATGCGCGATAACTTTGCATGAAGAAGGGGAGTGTTCCAACACGGATAAGATTAACGAGTGGATGCGCGACGCACAGACGGCACTTCGGTTTACGGGAGGGTTTAAACCTCCGATTGTAGTGAACCTACCAGGCCACTCGGATAAACCTTCAATTAAGACTTCATCTCCATCTCCGGTCGTTGAAGTGCGAGAGTGTAAATCGACATCTGAAATTC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| 18,363
|
OP860289.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-3/S2-1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,164
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
UNVERIFIED: Pineapple mealybug wilt-associated virus 3 isolate PMWaV-3/S2-1, complete genome
|
ATAATAGCCACCGGAATCCTTGCGGCTTCTGATAGCAACACCGTCAGGTCTGATTCTACCAAATTTCTTAAACTCGTTTTCAAGGTCGGACTCCGTGACAGATGGGGGAACATTTCCCACGTAAACAGATTTGCTTTCAACCACTCAGGAGCCAAAATATAACAAAACATCAAAACATCACGACTTTCCAGTCACATCAACAAAACATTTCCCAATCACTTTGGTTACTTTATTTTTCCTCAATCCCTAATCGCTTTCCAGTAGATTTATATATTTCTATATGTTCTAAACAAATTTTWARGGAAAAACCAAAAATATTTTATTTTTCCATGCATGTATAAGCGCGGTAAGAAAACAATTAGTCAGCTTGAAAATAGGACCAACTTATTAAGCTTTCCATACATTAGAACAAATAAAGCAACAAGAGAGAAGTACGAGCGGGAGCTGGTGGTTAAAACGAAGATTCCAACTGCGAAGGAGCGCAAACTGAAATTTTTCTACGATCCCCCAGTCATCAAATTCACGCCCGCTGTTCCACAGAAACCTCGGAGCTGTCCCACATCTCCTACTCGACAGTCCAGAGGGCCATCCCCCAACAACTTTCYATAYAAGAAAAACCCTACAGATGGGACCTCGTCGCCCCGTTCACAAACGTCCCAACGTAGTGACAATAGCGGGACCTACGTCTGGGTTGCCAAGTCTCAAGTTCCCGTGCCAACACGCGAGGCCGTGTCTCCATCACTTCGATCCGAATCTAGTAGCGGTCGGTCCGAGCGTGAGAGCTCGGGAAGCATTACGAACAGAGTTGGAATTCCAGCGACCTCCAACTCTACCATTCGTCGCGGGTACGAACACCATCRTAGGAGGACGTCTGGTGAAATTCCTCGRTGCACCTTTAATCCGCGAACTTGCCCAAAGAGATGGAGAGATCAGGGAAAAACCCAGAACACTACTCCACAGGTTGCTGCTAGTGTTACAAACACTATTCCAATTCAACAACAACCTGTAAAAATTGATGAAGAGGTACCACCACTACTGAGGAACAAACCCTACCTCACTAGAAATGCTGAAACAGGAGTGGTACATGTAGACCTCACTTCACTCCCCTCAAAATTGGAGCTAACATTAACTGACTGGTTAGACGAGAAAGGACATTTAGCCTCCGATTTTGTGAAAAACTTTGTCGTAGACCGATTACACAAAGATCTACTCAAACAACTACGATCCGTGGTGCTTATYGGTCGTAGAGCCATAGCCCATGTGTTTTCCGATGCGGGTAGATATTTGGGGAAAGTRATCTTAAACGAAAAAATGTGGTTCTACTACCGAACCGCCGGCCGTTCACACAATGAATATATATCATGCGGCGCGGGTGTGGTTAGTAGATTATTTTTAAAAAATAGATTCCCCACCTTACATGAGGTTGTAAGCCACGACTGGGCTAAGGGCTACAGCGCCTTAGATCACGTCACCCTATATGATCCGATGCTCAACAGAAATGTGAGGGCATCGCGTGGATACTGCTGGTTGCCTCTGTTCTTAAATTCCCATATTCCGGTGTCCAAGTACCCGACCAGCCCACTCGTACGCCTAAACTATCTTCGACATCTGTTCGGGGAAATACCACTGATTAAAACCGGAACTTTTTACCATTACTCACAAACGGGTTTAAAAGATAAAACACTTCCAAATGTTCTCGTGGGTGCTACTCAACAACCCGACGAGATCGAGTCTCTACCCTTGAGTTTGCTGGTCGAAGACCCCCTTCTGAACACTGCTATAGACAGCGTGGTCAAGAAGATGACCATGCGCGAAACGTCGCATTTCCAAAACACTGTGGACGATCTAGTAGAATCGGCGATTAAATGCGACTTGAGAGCGAGGGAAAAAACCCGGTTTAAAATTCCATACCACATGGAGCCAGATCAGGTAGATATTCTCAAGAAGATGTTACACATTTCCAGCGTGCAAGTTGGGTTTGAACCTGCCGGAGCCCACCCCATCTTCAATGCCATGAGAAAATTTTTCAACGAAATGAACGCCAGGGCTTTTAAAGGCGTTACGGTATCAGATATTGGGGGAAGTGTAGTGAATTGTTTATCACAAAACCTCTCCAATGTCCACGTGTGCGCCCCGATTGTTGATGTGAAAGACGCTGGAAGGATTTCTAAATTGAGTATTGATGTAATCAATCGTGCTGTAGATCATTCTTCCGGTGGTGAGAAGTTGGCCACTTTTATATCAAACCTTGGATCTTTATCTGTATGTCATAAACGTGTTCCACACTGCTCGTATCCGAGCACTGTCATCACCATGGTGGACGTGTATGATGTGCGTATTGAGACACTGCTTTACGCTATGGAAAAGAAAGGGAGTGTCTTGGCTAAAGTGTTTTTGATGTTTCCACCTGAATTGTTAAGCGGCGAAAAGATCGCCACTTATCCAGGTACAACACTCACAGTAACAAGAGATGGAGACAGTTTGGTGTACTTCATAGGGAGCACAGGAGACGCTTACGTACACTCATATTCCACTGTCTCCTCCTACCTAACTAAGGCCGTAGTTTTGAGTAACTCTGGATGTAGTTACTACATTGAAGTAAACACTCAATACGGTCCGTATTTGGAAATAACGATATCTCTATCAAGACCAGTTTCTTATAGAAAACTGTGGAGACGGTTGGTACCTTGGAATGCGAACCAAACAAAGATCACTTTTCCCATCACTGATCGTTATGGTTCCTCCACTCAAAAATCTGTGTATGTAGAACGAGATTTCGTGCGACGTAGTCTCGCCTACGCTGCCAATGTCTGTAATACCACCGATGACCGAACTTATGAGTACGTAATGTCAAATTTTCGATCTCAAACTACCATGATGGTAGTAGGGTCAAAAATAGTCCATAGCCGAGTAGATTTCTCCAATGATCTGCTGGTAGAAGTCCCTACGGCTATATTACATGAAGCAGTTAATAGGAGGAATTCAGCTGTGGAAACGATGAAAGTGAGTAGACAACACAAACTAGTGGAATTCGCAAAAGCTGTGTTCACTTTCCTCAGTGAACCAATTAGAGTCCTCCTGCGCTCTTTGTATAGAAGCCTGCCCGAGCAGGTCATTCAGTGGTTCACCTCCATTAATAATAGCGAATACTCCATCGAGGATACAGCTGATGAGATCATCACAGAAGCCGATTGTCAGATCGGTTCGTTAAACACGGAATGTGAAAATATGGAGGAGATTTTCAATATTGCTCAAGCACTAGCTGTTTTGAATTCAAAATCGGGAGTTATGGAGGATGAAGAGGAGATACAACCCGACACTTCAGAGTCACCCCTTGAAGAAAGAGAGTGCGCCGAAGTAAATGACACTTCTTCTAAGGGTTCATTGAATGGTGGTGCGACCGGTAACTGGTATGATTTTTTACTCCCAGCAACAGCAAATGCAGAGTCAGGAGACTGTTGGAGGGCTCTGTTGTGGAGGGTGATGCGTAGGTTGACGCGTGTTGTCCAATCTTGGGCAACTCCTTTAGGCGCAATTAAATCGTGGTTATTGTCTTTGTTCTTAACAATACTACGATTTTTGAAATTCAGAACTTCTCAACAATCAGCAGAACAGAAAGTGGAGAAGAATTTGTGCAAAAGTTTACTCGGTTTCCTCCGCAGTCTGTTAAATAACAATGTGGTACAACTCTCTCAACTTGTTAGAAGTTGTGGAGATGGTATAAATCATTTGGGAAAAACTTGTGCTTCACACTCAATGAACGTATTAAATAAAATCGCTACTTCAACGCAATCTTACGTTAACCAAGCGGCAATTTCTCTTGGTGAAGCTGCGGCGAACAGCGCAACGAAAATGGGAGGAAAAATTAAATCAAACCTAGCRGAACGCTTAACGAATCTCAAAATTAAAACTGCGATGGTGTTGAAGGCGGCTGGTTTACCCTACCCGCAGGAATGGATTCCTGATAAAACATTTAAAACATGGTTGATACAGGAGGTAGGTAAACATGTTCCTCACATTGCGATAGCTGCTTTATTGTCTGGCGCTGTGTACGCTAGTTTCACCGACAACGTCGTCCGGAGGAATGTAAATGTTTTGTTCGGGAAGGTGTTAAATTTCTTAAACAAAACTGTTTATACTCCGATCTGCAAGTACATATCCAGAATTCGCATAGAATCGAAACTATCTCTTGGACTGAGTCTCTTGGGATTGTTAATGAAAGATGCGGTGTTGTTAACGAGCACACTCTCCTGTTACAACCATTTGACTCACATCGCTTTCCCAGTGTATCTAGGAGCCGAGATATCGAATCTTACTCAGAGGTGTTGGGCGAGGAAGAATCCTATTACTATCGGTCTTCTCTTGCGAATAGCACTCTCGAAAGAGGGGTTTTTAACATACAGGAGTCCGATCAAGATAGATGAAGGAGAGGTTGTGAGTCCTAGAGACCCGACAGACATAGTACCGGATGTGAGTTTTTCTAATAGAAAACAGGTCTTAGCTAGAGCGCTAGATGTTTTCCGATTGAACGCAGCAAAGACTGGACCTGACTCTCACACAACTCCTCTCGAAGCTACAGTGGACGCAAAAACCCCGAAGAAGGTAGAGGAAATTCTGGAAGGTAAAGGATCATTAGACAAAGTCCAACCTCACACGATAGGGACAGAACAAAACCTAACCAACGCTCCAGCACAAAACGTCGAATGTCTGAAAACTACGACTGAAATTCACCCAACCAAGTTCAATTCTGGTGACTTACTTGGTAAGAACAAAATTTTCGGCAGTGTTGGGGTAGAGGGGTTTGAAGTAGACTCTACRAATTCTGATGAAGCGATGTTGTGTTTGGACGAACTTTTGGAACAGTGTAATTCCAAGAACGATCCGACCGGTTTAAAAGACCCCTTATCAAAGTCAAAATGCGCAATAACTTTGCATGAAGAAGGGGAGTGTTCTAACACGGATAAGATTAACGAGTGGATRCGCGACGCACATACGGCACT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CGCTAGGATATCCGGTAGACTGTCTATTGGTACCTACGTAGCGAATACATGGTGGCAAATCAGTCCTAGTGGTATGACTGCTTGGAGTGACTCCGAGGGTTGGGCTCGCCACTTATTAGGTAATTACATAGTGTCGAAAAACCTGTTGGCACACATGTATTACAATTTACAGACTGAAATACGAGCGGCGTTGGCCACTCCTATGTCTGTTTTTCACATGAAAAGCGCTTTGGTAGATGTTCCAGTAACTCAATCYACAGTTTTTAACTACAAAGTTACTAGAACAGCAGCCCGGAGTTTGGCTAGAGAATTACCGGGAGAGGAAACACACCTCACAGACTTAATATTTTGCATCGGAAATTACTTAGGACACCTACCAAATAGATCTCAAATTATAGGGGAAGTACCACTACCAGTCGCAGCTGTGCGTCAGACAGTAAACCCCTTGGTAATCTCGAATGAGTATTTGTCTAATGAGGTGAAACTGGGTGTATTAAACATGATGGGGAAGACAAAAATAGGTGATCCTATTGAAGGTGTGAGATACAAGTTAGAGGCGGAGAGAATAAAGACTATTTGTGAGACGTTATTTCTCCCCGAAGATGTTGACTTGTGCTCGAAACTTCCAGCAGTGCAGTATATTATAGTACAAGCATTAGACTCGACTGATACTCCGATGGATACATTCGAAGATAGAGTGGAGAGTGATGTTTTAGTCGGTGCTAAGTACGAAGTAAATTGCAAGGTCTATTGCGATTTCGCGAGGAAGAAGACCTAAATGTGCTGCTGGCTAAAGCAGCYATCAGACCAAATGAAATGACTAGAGGTGATGGAGTGGTTGTTAGGGCTCGGTATGAGAAGAATGTTGCGGGTAGATCTTTACTGCGAGTTGGGTCACCCTTCTCTCAAGAGCAGTATTCCTTATTGACGGCTAGACTCGTTAGAGCTTTATTGTTAAAGAATCCCACCGTAGACATGAACTATGCCGAGGCAGTGATAACATTGCTGCAGAGGTACATACATTATAGAACGAATCCGTTGCGATTCGTAAACTTACCAGTGAAAATTCAAATGATATTTAAAGGAAAGATAGAACTGATAGATTATTCGGCAGTTGACAGAGTATTTGCTCAACTTCAGAATTCTTTTCCTGAAGTAGAGAGGGCCTGGTGTGCTCCATTRGCRACTGTGGCGTATTTCATACTACGCGATTCAGGTGGTTCTTTCGCTAAATGGCGCGATTTGTGTGACGTACCTCCGGTATTAAATTTCGATTTTGTGGGTTACGTTGACCCCAGAGTTTTATCTAATTCCGAGCGCAAACATCTGGCTCGCATTGTCCATAGATTTAGAACYGCGAACACACCAGTACGTGGTTTTAAAATCGATAATAGGTTGGTCAACCCGATAGATCACATTTACGACGAGGTCAATATGTCTGCGTCTTCTCGCAGCATGCACAGATCATTGTTGAATAGGTAGTTCTGAGAACCACTTTAGATTTGGACTAACGATTTTCTGTAAGATTAAAGATTTGTGAGAAGACGACCGAATCTACGAACAAATGAGTACGATTCCAGTACCACCTCCTCCCTCTGCACCATCGACTCCGGTACAACCGCAGCTACCCAAAACTGATGAGGAACAATTACAGGAGATTGAAAATCTGCCTCTACCTGGAGGTAGGACTACAGTGAATACTTTCACTGATCTGATATCGTCGAATAACGCGGTATTGGATTTCACTAAAGTGGAAGTACCGCGGATGATCAACATCACCATACCTGGGATAGTGGCGAAAGAACATCGAGTGAAGGGAGCAAAAGCACTATGGGAACTAGGTAAATCCAAAGGAATCTCTGAAAGTGACAAACACATGATACAGTTTCTGATGCAGAGTTTCCAAAGTTTCGTCACTCATTCGACATCACCTAAGGTTTCGGGTGCTTCGAACCGTACAATAACTGCTAAGTACGACAACAAAGATGTAACGGTGTCTCATGAAGAGTTAAAGACTACTTTAGATAATTCACTAGCCAGTTACGGCTATGAAAATACTATGAGACAATTYGGGAGGGCTTTCACAACTGCAATAGTTCAGGGTTTAAGTTCGGGCAAGATGGAGGTAAAYACTCGAATTTGCTCTTCTCACGGTATACCTCCTAACTACTATCCCTACTCTCCAGACTGCTTACATGTGGACGCACGCATACAAGGATATGACGCCGCTTTAGCGAACGAGTTAGGGAAGATGGTTGCACTCAACAAAAACGCTGGGGGTAAACGTACGCAACATAACTTGTTTGAGGAGACTGACATATCTCCTCAAATATTTACAGGTAATCGCAGATGAATAGTCTCAATATCTGTAGTGTAAAACACCGACTCAGTGGAGGTCTGTGACCTCTACCATTTCGTTAGAAGATGGAGAGAGTGGTGTTAGTAAGTAAAGATAAACAACTTTTGGGTGTTAGTTCAAACGAGGTTTTTTATAAACCTTTTAACAGCTTGTTTTTCTATGCTTTAGAGGGACGAAACTCAGCGTTCTTCTACGACAAGTTGGGTAACACCTTGACTGAAGCTAGAAAACATAACAGTGAGTTGTTTTCTTTCCTGGACAATTTGGGAAACGTTGTTGCTACGAACAATGAACAATTCTTAAATTTTCTTGATGGTACCTGCGTGAACGATTACATGGAACGAAGGTACGGAACTGTTAGCGGTAGAGTTTTGAACCCTACCGAGAAGAAAGCTACCTACTTAACAGTAAAAGTACCAGTTTTGGATTTACTGTGGAATGTGTTGGAGGATAGCTACGATAACCTAACCAAAGTTTTTTGTGTTGGGTTTAAAAGATCTACTGGTTGTTCGTTTGATGACCAGTACAACTTCGAATCTTCTTTCGCTGTTTTCGACAGCGGGAATGGATTTGAGGCTATCTTCGGTGAGAAGATAGATTTTTCCAGCGATTTTCTCAAAGAGCGATACGATTCTTTGAGGAAAGCAGAAGAAACACATGGAGTTGAGAGGGTGGTCAATCTTCTTTCCAGTGATTAAATGTAGAAGACCACCTCGGGGAGAGACGATCCGAGACTTCCCGACCTGACCTGCCACTGGCAGGATAGGACGTACGTCTGAATGGGGAATAATTTGGGGGGCTTTAG
| 18,364
|
OP860290.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PMWaV-3/S2-2d
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,384
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3 isolate PMWaV-3/S2-2d, complete sequence
|
CCACTCAGGAGCCAAAATATAACAAAACATCAAAACATCACGACTTTCCAGTCACATCAACAAAACATTTCCCAATCACTTTGGTTACTTTAATTTTCCTCAATCCCTAATCGCTTTCCAGTAGATTTATATATTTCTATATGTTCTAAACAAATTTTAAGGAAAAACCAAAAATATTTTATTTTTCCATGCATGTATAAGCGCGGTAAGAAAACAATTAGTCAGCTTGAAAATAGGACCAACTTATTAAGCTTTCCATACATTAGAACAAATAAAGCAACAAGAGAGAAGTACGAGCGGGAGCTGGTGGTTAAAACGAAGGTTCCAACTGCGAAGGAGCGCAAACTGAAATTTTTCTACGATCCCCCAGTCATCAAATTCACGCCCGCTGTTCCACAGAAACCTCGGAGATGTCCCACATCTCTTACTCGACAGTCCAGAGGACCATCCCCCAACAACTTTCCATACAAGAAAAGCCCTACAGATGGGACCTCGTCGCCCCGTTCACAAACGTCCCAACGTAGTGACAATAGCGGGACCTACGTCTGGGTTGCCAAGTCTCAAGTTCCCGTGCCAACACGCGAGGCCGTGTCTCCATCACTTCGATCCGAATCTAGTAGCGGTCGGTCCGAGCGTGAGAGCTCGGGAAGCATTACGAACAGAGTTGGAATTCCAGCGACCTCCAACTCTACCATTCGTCGCGGGTACGAACACCATCATAGGAGGACGTCTGGTGAAATTCCTCGGTGCACCTTTAATCCGCGAACTTGCCCAAAGAGATGGAGAGATCAGGGAAAAACCCAGAACACTACTCCACAGGTTGCTGCTAGTGTTACAAACACTATTCCAATTCAACAACAACCTGTAAAAATTGATGAAGAGGTACCACCACTACTGAGGAACAAACCCTACCTCACTAGAAATGCTGAAACAGGAGTGGTACATGTAGACCTCACTTCACTCCCCTCAAAATTGGAGCTAACATTAACTGACTGGTTAGACGAGAAAGGACATTTAGCCTCCGATTTTGTGAAAAACTTTGTCGTAGACCGATTACACAAAGATCTACTCAAACAACTACGATCCGTGGTGCTTATCGGTCGTAGAGCCATAGCCCATGTGTTTTCCGATGCGGGTAGATATTTGGGGAAAGTAATCTTAAACGAAAAAATGTGGTTCTACTACCGAACCGCCGGCCGTTCACACAATGAATATATATCATGCGGCGCGGGTGTGGTTAGTAGATTATTTTTAAAAAATAGATTCCCCACCTTACATGAGGTTGTAAGCCACGACTGGGCTAAGGGCTACAGCGCCTTAGATCACGTCACCCTATATGATCCGATGCTCAACAGAAATGTGAGGGCATCGCGTGGATACTGCTGGTTGCCTCTGTTCTTAAATTCCCATATTCCGGTGTCCAAGTACCCGACCAGCCCACTCGTACGCCTAAACTATCTTCGACATCTGTTCGGGGAAATACCACTGATTAAAACCGGAACTTTTTACCATTACTCACAAACGGGTTTAAAAGATAAAACACTTCCAAATGTTCTCGTGGGTGCTACTCAACAACCCGACGAGATCGAGTCTCTACCCTTGAGTTTGCTGGTCGAAGACCCCCTTCTGAACACTGCTATAGACAGCGTGGTCAAGAAGATGACCATGCGCGAAACGTCGCATTTCCAAAACACTGTGGACGATCTAGTAGAATCGGCGATTAAATGCGACTTGAGAGCGAGGGAAAAAACCCGGTTTAAAATTCCATACCACATGGAGCCAGATCAGGTAGATATTCTCAAGAAGATGTTACACATTTCCAGCGTGCAAGTTGGGTTTGAACCTGCCGGAGCCCACCCCATCTTCAATGCCATGAGAAAATTTTTCAACGAAATGAACGCCAGGGCTTTTAAAGGCGTTACGGTATCAGATATTGGGGGAAGTGTAGTGAATTGTTTATCACAAAACCTCTCCAATGTCCACGTGTGCGCCCCGATTGTTGATGTGAAAGACGCTGGAAGGATTTCTAAATTGAGTATTGATGTAATCAATCGTGCTGTAGATCATTCTTCCGGTGGTGAGAAGTTGGCCACTTTTATATCAAACCTTGGATCTTTATCTGTATGTCATAAACGTGTTCCACACTGCTCGTATCCGAGTACTGTCATCACCATGGTGGACGTGTATGATGTGCGTATTGAGACACTGCTTTACGCTATGGAAAAGAAAGGGAGTGTCTTGGCTAAAGTGTTTTTGATGTTTCCACCTGAATTGTTAAGCGGCGAAAAGATCGCCACTTATCCAGGTACAACACTCACAGTAACAAGAGATGGAGACAGTTTGGTGTACTTCATAGGGAGCACAGGAGACGCTTACGTACACTCATATTCCACTGTCTCCTCCTACCTAACTAAGGCCGTAGTTTTGAGTAACTCTGGATGTAGTTACTACATTGAAGTAAACACTCAATACGGTCCGTATTTGGAAATAACGATATCTCTATCAAGACCAGTTTCTTATAGAAAACTGTGGAGACGGTTGGTACCTTGGAATGCGAACCAAACAAAGATCACTTTTCCCATCACTGATCGTTATGGTTCCTCCACTCAAAAATCTGTGTATGTAGAACGAGATTTCGTGCGACGTAGTCTCGCCTACGCTGCCAATGTCTGTAATACCACCGATGACCGAACTTATGAGTACGTAATGTCAAATTTTCGATCTCAAACTACCATGATGGTAGTAGGGTCAAAAATAGTCCATAGCCGAGTAGATTTCTCCAATGATCTGCTGGTAGAAGTCCCTACGGCTATATTACATGAAGCAGTTAATAGGAGGAATTCAGCTGTGGAAACGATGAAAGTGAGTAGACAACACAAACTAGTGGAATTCGCAAAAGCTGTGTTCACTTTCCTCAGTGAACCAATTAGAGTCCTCCTGCGCTCTTTGTATAGAAGCCTGCCCGAGCAGGTCATTCAGTGGTTCACCTCCATTAATAATAGCGAATACTCCATCGAGGATACAGCTGATGAGATCATCACAGAAGCCGATTGTCAGATCGGTTCGTTAAACACGGAATGTGAAAATATGGAGGAGATTTTCAATATTGCTCAAGCACTAGCTGTTTTGAATTCAAAATCGGGAGTTATGGAGGATGAAGAGGAGATACAACCCGACACTTCAGAGTCACCCCTTGAAGAAAGAGAGTGCGCCGAAGTAAATGACACTTCTTCTAAGGGTTCATTGAATGGTGGTGCGACCGGTAACTGGTATGATTTTTTACTCCCAGCAACAGCAAATGCAGAGTCAGGAGACTGTTGGAGGGCTCTGTTGTGGAGGGTGATGCGTAGGTTGACGCGTGTTGTCCAATCTTGGGCAACTCCTTTAGGCGCAATTAAATCGTGGTTATTGTCTTTGTTCTTAACAATACTACGATTTTTGAAATTCAGAACTTCTCAACAATCAGCAGAACAGAAAGTGGAGAAGAATTTGTGCAAAAGTTTACTCGGTTTCCTCCGCAGTCTGTTAAATAACAATGTGGTACAACTCTCTCAACTTGTTAGAAGTTGTGGAGATGGTATAAATCATTTGGGAAAAACTTGTGCTTCACACTCAATGAACGTATTAAATAAAATCGCTACTTCAACGCAATCTTACGTTAACCAAGCGGCAATTTCTCTTGGTGAAGCTGCGGCGAACAGCGCAACGAAAATGGGAGGAAAAATTAAATCAAACCTAGCAGAACGCTTAACGAATCTCAAAATTAAAACTGCGATGGTGTTGAAGGCGGCTGGTTTACCCTACCCGCAGGAATGGATTCCTGATAAAACATTTAAAACATGGTTGATACAGGAGGTAGGTAAACATGTTCCTCACATTGCGATAGCTGCTTTATTGTCTGGCGCTGTGTACGCTAGTTTCACCGACAACGTCGTCCGGAGGAATGTAAATGTTTTGTTCGGGAAGGTGTTAAATTTCTTAAACAAAACTGTTTATACTCCGATCTGCAAGTACATATCCAGAATTCGCATAGAATCGAAACTATCTCTTGGACTGAGTCTCTTGGGATTGTTAATGAAAGATGCGGTGTTGTTAACAAGCACACTCTCCTGTTACAACCATTTGACTCACATCGCTTTCCCAGTGTATCTAGGAGCCGAGATATCGAATCTTACTCAGAGGTGTTGGGCGAGGAAGAATCCTATTACTATCGGTCTTCTCTTGCGAATAGCACTCTCGAAAGAGGGGTTTTTAACATACAGGAGTCCGATCAAGATAGATGAAGGAGAGGTTGTGAGTCCTAGAGACCCGACAGACATAGTACCGGATGTGAGTTTTTCTAATAGAAAACAGGTCTTAGCTAGAGCGCTAGATGTTTTCCGATTGAACGCAGCAAAGACTGGACCTGACTCTCACACAACTCCTCTCGAAGCTACAGTGGACGCAAAAACCCCGAAGAAGGTAGAGGAAATTCTGGAAGGTAAAGGATCATTAGACAAAGTCCAACCTCACACGATAGGGACAGAACAAAACCTAACCAACGCTCCAGCACAAAACGTCGAATGTCTGAAAACTACGACTGAAATTCACCCAACCAAGTTCAATTCTGGTGACTTACTTGGTAAGAACAAAATTTTCGGCAGTGTTGGGGTAGAGGGGTTTGAAGTAGACTCTACGAATTCTGATGAAGCGATGTTGTGTTTGGACGAACTTTTGGAACAGTGTAATTCCAAGAACGATCCGACCGGTTTAAAAGACCCCTTATCAAAGTCAAAATGCGCAATAACTTTGCATGAAGAAGGGGAGTGTTCTAACACGGATAAGATTAACGAGTGGATGCGCGACGCACATACGGCACTTCGGTTTACGGGAGGGTTTAAACCTCCGATTGTAGTGAACCTACCAGGCCACTCGGATAAACCTTCAATTAAGACTTCATCTCCATCTCCGGTCGTTGAAGTGCGAGAGTGTAAATCGACATCTGAAATTCAATCCGTTCA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| 18,365
|
MN539274.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Green,J.C., Rwahnih,M.A., Olmedo-Velarde,A., Melzer,M.J., Hamim,I., Borth,W.B., Brower,T.M., Hu,J.S., Al Rwahnih,M., Larrea-Sarmiento,A.E., Hu,J.
|
University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2020-05-13
|
HANA158
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 13,298
|
GenBank
| null |
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2017-02
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3 isolate HANA158, complete genome
|
GATTCTACCAAATTTCTTAAACTCGTTTTCAAGGTCGGACTCCGTGACAGATGGGGGAACATTTCCCACGTAAACCTTGATTGGTTATAGACCACTCAGGAGCCAAAATATAACAAAACTTCAAAACATCACGACTTTCCAGTCACATCAACAAAACATTTCCCAATCACTTTGGTTGCTTTATTTTTCTCAATCCCTAATCGCTTTCCAGTAAGTTCATATATTTCTATATGTTCTAAACAAATTTTAAAGAAAAAACCAAAAATATTTTATTTTTCCACTCATGTATAAGCGTGGTAAGAAGACGATTAGTCAGCTTGAAAATAGGACCAACATATTAAGCTTTCCATACATTAGAACAAATAAAACAACAAAAGAGAAATACGAGCGGGAGCTGGTAGTTAAAACAAAAATTCCAACTGCGAAGGAGCGCAAACTGAAATTTTTCTACGATCCCCCAGTCATCAAATTCACGCCCGTTTTTCCACAGAAACCTCGGAGCTGTCCCACATCTCCTACTCGACAGTCCAGAGGGCCATCCCCCAACAGTTTTCCATACAAGAAAAACCCAACAGATGGGACCTCGTCGCCCCGTTCACAAACGTCCCAACGTAGTAACAATAGCGGGACCTACGTCTGGGTTGCCAAATCTCAAGTTCCCGTGCCAACACGCGAGGCCGTGTCTCCATCACTTCGATCCGAATCTAGTAGCGGTCGGTCCGAGCGTGAGAGCTCGGGAATCATTGCGAACAGAGTTGGAATTCCAGCGACCTCCAACTCTACCATTCGTCGCGGGTACGAACACTATAATAGGAGGACGTCTGGTGAAATTCCTAGACGCACCTTTAATCCGCGAACTTGCCCAAAGGGAAGGCGAGATCAGGGAAGAACCAAAAACACTACTCCACAGGTTGCTGCTAGTGTTGCAAACACTATTCCAATTAAACAACAACCTGTGAGAATCGATGAAGAGGTACCACTACTGCTGAGGAACAAACCCTACCTCACTAGAAACGCTGAAACAGGAGTGGTACATGTAGACCTTACTTCACTCCCCTCAAAATTGGAGCTAACACTGACTGACTGGTTAGACGAGAAAGGACATCTAGCCTCCGATTTTGTGAAAAACTTTGTCGTAGACAGGTTGCACAAAGATCTACTCAAACAATTACGATCCGTGGTGCTTATTGGTCGTAGAGCCATCGCCCATGTATTTTCCGATGCGGGTAGATATTTGGGGAAAGTAATCCTAAACGAGAAAATGTGGTTCTACTACCAAACCGCCGGCCGTTCACACAATGAATACATATCATGCGGCGCGGGTGTGGTTAGTAGATTATTTCTAAAAAATAGATTCCCCACCTTACATGAAGTTATAAGCCACGACTGGGCTAAGGGCTACAGCGCCTTAGATCACGTCACCCTATATGATCCGATGCTCAACAGAAATGTGAGGGCATCGCGTGGTTACTGCTGGTTGCCTCTGTTCCTAAATTCCCATATTCCGGTGTCCAAGTACCCGACCAGCCCACTCGTACGCCTAAACTATCTTCGACATCTGTTCGGGGAAATACCACTGATTAAAACCGGAACTTTTTACCACTACTCACAAACGGGTTTAAAAGATAAAACCCTTCCAAATGTTCTCGTTGGTGCTACTCATCAACCCGACGAGATCGAGTCTCTACCTTTGAGTTTGCTGGTCGAAGACCCCCTTCTGAACACTGCTATAGACAGCGTGGTCAAGAAGATGACCATGCGCGAAACGTCGCATTTCCAAAACACTGTGGACGATCTAGTAGAATCGGCGATTAAGAGCGACTTGAGAGCAAGGGAAAAAACCCGGTTTAAAATTCCATACCACATGGAGCCAGATCAGGTAGATATTCTCAAGAAGATGTTACACATTTCCAGCGTGCAAGTTGGGTTTGAACCTGCCGGAGCCCACCCCATCTTCAATGCCATGAGAAAATTTTTCAACGAAATGAACGCCAGGGCTTTTAAAGGCGTTACGGTATCAGATATTGGGGGAAGTGTAGTGAATTGTTTATCACAAAACCTCTCCAATGTCCACGTGTGCGCCCCGATTGTTGATGTGAAAGACGCTGGAAGGATTTCTAAATTGAGTATTGATGTAATCAATCGTGCTGTAGATCATTCTTCCGGTGGTGGGAAGTTGGCCACGTTTATATCAAACCTTGGATCTTTATCTGTATGTCATAAACGTGTTCCACACTGCTCGTATCCGAGCACTGTCATCACCATGGTGGACGTGTATGATGTGCGTATTGAGACACTGCTTTACGCTATGGAAAAGAAAGGGAGTGTTTTGGCTAAAGTGTTTTTGATGTTTCCACCTGAAATATTAAGCGGCGAAAAGATCGCCACTTATCCAGGTACAACACTCACAGTAACAAGAGATGGAGACAGTTTGGTGTACTTCATAGGGAGCACAGGAGACGCTTACGTACACTCATATTCCACTGTCTCCTCCTACCTAACTAAGGCCGTAGTTCTGAGTAACTCTGGATGTAGTTACTACATTGAAGTAAACACTCAATACGGTCCGTATTTGGAAATAACGATATCTCTATCAAAACCAGTTTCTTATAGAAAACTGTGGAGACGGTTGGTACCTTGGAATGCGAACCAAACAAAGATCACTTTTCCCATCACTGATCGTTATGGTTCCTCCACTCAAAAATCGGTGTATGTAGAACGAGATTTCGTGCGACGTAGTCTCGCCTACGCTGCCAATGTCTGTAATACCACCGATGACCGAACTTATGAGTACGTAATGTCAAATTTTCGATCTCAAACTACCATGATGGTAGTAGGGTCAAAAATAGTCCATAGCCGAGTAGATTTCTCCAATGATCTGCTGGTAGAAGTCCCTACGGCTATATTACATGAAGCAGTTAATAGGAGGAATTCAGCTGTGAAATCGATGAAAGTGAGTAGACAACACAAACTGGTGAAATTCGCAAAAGCTGTGTTCACTTTCCTCAGTGAACCAATTAGAGTCCTCCTGCGTTCTTTGTATAAAAGCCTGCCCGAGCAGGTCATTCAGTGGTTCACCTCCATTAATAAGAGCGAATACTCCATCGAGGATACAGCTGATGAGATCATCACAGAAGCCGATTGTCAGATCGGTTCGTTAAACACAGAATGTGAAAACATGGAAGAGATTTTCAATATTGCTCAAGCACTAGCTGTTTTGAGTTCAAAATCGGGAGTTGTGGAGGATGAAGAGGAGATACAACCCGACACTTCAGAGTCACCCCTTGAAGAAAGAGAGTGCGCCGAAGTAAATGACACTTCTTCTAAGGGTTCATTGAATGGTGGTGCGACTGGTAACTGGTATGATTTTTTACTCCCAGCAACAGCAAATGCAGAGTCAGGAGACTGTTGGAGGGCTCTGTTGTGGAGGGTGATGCGTAGGTTGACGCGTGTTGTCCAATCTTGGGCAACTCCTTTAGGCGCAATTAAATCGTGGTTATTGTCTTTGTTCTTAACAATACTACGGTTTTTGAAGTTCAGAACTTCTCAGCAATCAGCGGAACAGAAAGTGGAGAAGAATTTGTGCAAAAGTTTACTCGGTTTCCTCCGCAGTCTGTTATTTAACAATGTGGTGCAACTCTCTCAACTCGTTAGAAGTTGTGGAGATGGTATAAATCATTTGGGAAAAAGTTGCGCTTCACATTCAATGAACGTATTAAATAAAATCGCTACTTCAACACAATCTTACGTTAACCAAGCGGCGACTTCTCTTGGTGAAGCTGCGGCGAACAGCGCAACGAAAATAGGAGAAAAAATTAAATCAAACCTAGCAGAACGCTTAACGAATCTCAAAATTAGAACTGCGATGGTGTTGAAGGCGGCTGGTTTACCCTACCCGCAGGAATGGATTCCTGATAAAACATTTAAAACATGGTTGATACAGGAGGTAGGTAAACATGTTCCTCACATTGCGATAGCTGCTTTATTGTCTGGCGCAGTGTATGCTAGTTTCACCGACAACGCCGTCCGGAGGAATGTAAATGTTTTGTTCGGGAAGGTGTTAAGTTTCTTAAACAAAACTGTTTACACTCCGATCCGCAAGTACATATCCAGAATTCGCATAGAATCGAAACTATCTCTTGGACTGAGTCTCTTGGGATTGTTAATGAAAGATGCGGTGTTGTTAACGAGCACACTCTCCTGTTACAACCATTTGACTCACATCGCATTCCCAGTGTATCTAGGAGCCGAGATATCGAATCTTACTCAGAGGTGTTGGGTGAGGAAGAATCCTATTACTATCGGTCTTCTCTTGCGAATAGCTCTCTCGAAAGAGGGGTTTTTAGCATACAGGAGTCCGATCAAGATAGATGAAGGAGAGGTTGTGAGTCCTAGAGACCCTACAGACATAGTACCAGATGTGAGTTTTTCTAATAGAAAACAGGTCTTAGCTAGAGCGCTAGATGTTTTCCGATTGAACGCAACAAAAACCGGACCTGACTCTCACACAACTCCTCTCGAAGCTACAGTGGACGCAAAAACCCCGAAGAAGGTAGAGGAAATTCTGGAAGGTAAAGGATCTTTAGACAAAGTCCAACCTCACACGATAGGGACAGAACAAAACCTAACTAACGCTCCAGCACAAAACGTCGAATGTCTGAAAGCTACGACTGAAATTCACCCAACTAAGTTCAGTTCTGGAGACTTACTTGGTAAGAACAAAATTGTCGGCAGTGTTGGGGTAGAGGAGTTTGAAGTGGACTCTACAAATTCTGATGAAGCGATGTTGTGTTTGGACGAACTTTTAGAGCAGTGTAATTCGAAGAACGATCCGACCGGTTTAAAAGACCCCTTATCAAAGTCAAAATGCGCGATAACTTTGCATGAAGAAGGGGAATGTTCTAACACGGATAAGATTAACGAGTGGATGCGCGACGCACATACGGCACTTCGGTTTACGGGAGGGTTTAAACCTCCGATTGTAGTGAACCTACCAGGCC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| 50,520
|
LC507820.1
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Yanagisawa,H., Sekine,K.
|
Central Region Agricultural Research Center; 2-1-18 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8666
|
Japan
|
2020-04-02
|
PMWaV-3
|
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 11,877
|
GenBank
| null |
Taiwan
|
Taiwan
|
Ananas comosus
| null |
2015
| null | null |
Pineapple mealybug wilt-associated virus 3 PMWaV-3 genomic RNA, complete genome
|
GATGCTCAACAGAAATGTGAGGGCATCGCGTGGATACTGCTGGTTGCCTCTGTTCTTAAATTCCCATATTCCGGTGTCCAAGTACCCGACCAGCCCACTCGTACGCCTAAACTATCTTCGACATCTGTTCGGGGAAATACCACTGATTAAAACCGGAAATTTTTACCATTACTCACAAACGGGTTTAAAAGATAAAACACTTCCAAATGTTCTCGTTGGTGCTACTCATCAACCCGACGAGATCGAGTCTCTACCTTTGAGTTTGCTGGTCGAAGACCCCCTTCTGAACACTGCTATAGACAGCGTGGTCAAGAAGATGACCATGCGCGAAACGTCGCATTTCCAAAACACGTAGATGATCTCGTGGAGTCAGCTGTGAAAGTCTGACTTGAGAGCGAGGGAAAAAACGAGGTTCAAAATCCCGTATCACATGGATCCAGATCAAGTGGATATACTTAAGAAGATGTTGCACATTTCCAATGTGCAAGGTGGGATTCGAACCTGCCGGAGCCCATCCGATATTTAATGCTATGAGAAAATTTTTTAACGAAATGAACGCCAGGGCTTTTAAAGGCGTCACAGTCTCAGATATTGGGGGAAGTGTGGTAAATTGTCTATCGCAAAACCTCTCCAACGTCCACGTGTGTGCTCCGATTGTTGATGTGAAAGACGCTGGAAGGATTTCTAAATTGAGTATTGATGTAATCAATCGTGCTGTAGATCATTCTTCCGGTGGTGGGAAGTTGGCCACGTTTATATCAAACCTTGGATCTTTATCTGTATGTCATAAACGTGTTCCACACTGCTCGTATCCGAGCACTGTCATCACCATGGTGGACGTGTATGATGTGCGTATTGAGACACTGCTTTACGCTATGGAAAAGAAAGGGAGTGTCTTGGCTAAAGTGTTTTTGATGTTTCCACCTGAATTATTAAGCGGCGAAAAGATCGCCACTTATCCAGGTACAACACTCACAGTGACAAGAGATGAAGACAGTTTGGTGTACTTCATTGGGAGTACAGGTGACGCTTACGTACACTCATATTCCACCGTCTCTTCATACCTAACTAAGGCTGTAGTTTTGAGTGATTCTGGATGTAGTTATTACATCGAGGTAAACACTCAATACGGTCCTTATTTAGACATAACGGTATCTCTATCGAAACCAGTTTCCTACAGAAAGCTGTGGAGGCGGTTAGTGCCTTGGAATGCGAACCAAACAAAGATCACTTTTCCCATCACTGATCGTTATGGTTCCTCCACTCAAAAATCGGTGTATGTAGAACGAGATTTCGTGCGACGTAGTCTCGCCTACGCTGCCAATGTCTGTAATACCACCGATGACCGAACTTATGAGTACGTAATGTCAAATTTTCGATCTCAAACTACCATGATGGTAGTAGGGTCAAAAATAGTCCATAGCCGAGTAGATTTCTCCAATGATCTGCTGGTGGAAGTCCCAACGGCGATATTACACGAAGCAGTTAACAGGAGAAATTCGGCTGTGAAAATGATGAAGGTAAGTAGGGAACACAAACTGGTAAAATTCGCAAAGGCTGTACTCTCTTTCCTCGGCGAACCGATTAGAGTCCTCCTACGTTCCTTGTATGGAAGTCTACCTCAGCGGGTTACGCAGTGGTTCACCTCCATCTTAAAGTGTGAATACTCTATCGAGGACACAGCAGACGAGATTATCACAGAAGCCGATTGTCAGATCGGTTCGTTGAATACGGAGTGTGAAAATATGGAGGAGGTTTTCAACATCGCTCAGGCGTTGGCGGTTTTAAGTTCTAAGTCGGGAGTCATGGAAGACGAAGAGGAGATACAACCCGATACGTCAGAGTCACCCCTTGAAGAAAGAGAGTGCGCCGAAGTAAATGACATTCGTTCTAAGGGGTCTCTGAATGGTGGTGCTGAGAGCAACTGGTACGATTTTTTACTCCCAACAACCGCGAATGCGGAATCAGGAGACTGCTGGAGAGCACTGTTATGGAGGGTGATGCGTAGATTGACACGTGTTGTCCAATCTTGGGCAACTCCTTTAGGCGCAATTAAATCGTGGTTATTGTCTTTGTTCTTAACAATACTACGATTTTTGAAATTCAGAACTTCTCAGCAATCAGCAGAACAGAAAGTGGAGAAGAATTTGTGCAAAAGTTTACTCGGTTTCCTCCGCAGTCTGTTAATTAACAATGTGGTACAACTCTCTCAACTTGTTAGAAGTTGTGGAGATGGTATAAATCATTTGGGAAAAACTTGCGCTTCACATTCAATGAACGTATTAAATAAAATCGCTACTTCAACGCAATCTTACGTTAACCAAGCGGCGATTTCTCTTGGTGAAGCTGCGGCGAACAGAGCAACGAAGATAGGAGGAAAAATTAAATCAAACCTAGCAGAACGCTTAACGAATCTCAAAATAAGAACTGCGATGGTGTTGAAGGCGGCTGGTTTACCCTACCCGCAGGAATGGATTCCTGATAAAACATTTAAAACATGGTTGATACAGGAGGTAGGTAAACATGTTCCTCACATTGCGATAGCTGCTTTATTGTCTGGCGCTGTGTACGCTAGTTTCACCGACAACGTCGTCCGGAGGAATGTAAATGTTTTGTTCGGGAAGGTGTTGAATTTCTTAAACAAAACTGTTTATACTCCGATCCGCAAGTACATATCCAGAATTCGCATAGAATCGAAACTATCTCTTGGACTGAGTCTCCTGGGATTGTTAATGAAAGATGCGGTGTTGTTAACGAGCACACTCTCCTGTTACAACCATTTGACTCACATCGCTTTCCCGGTGTATCTAGGAGCTGAGATATCGAATCTTACTCAGAGGTGTTGGGCGAGGAAGAATCCTATTACTATCGGTCTTCTCTTGCGAATAGCACTCTCGAAAGAGGGGTTTTTTGCATACAGGAGTCCGATCAAGATAGATGAAGGAGAGGTTGTGAGTCCTAGAGACCCGACAGACATAGTACCGGACGTGAGTTTTTCTAATAGAAAACAGGTCTTAGCTAGAGCGCTAGATGTTTTCCGATTGAACGCAGCAAAGACCGGCCCTGACTCTCACACAACTCCTCTCGAAGCTACAGTGGACGCAAAAACCCCGAAGAAGGTAGAGGAAATTCTGGAAGGCAAAGGATCATTAGACAAAGTCCAACCTCACACGATAGGGACAGAACAAAACCTAACCAACGCTCCAGCACAAAACGTCGAATGTCTGAAAGCTACAACTGAAATTCACCCAACTAAGTTCAGTTCTGGTGACTTACTTGGTAAGAACAAAATTGTCGGCAGTGTTGGGGTAGAGGGGTTTGAAGTGGACTCTACAAATTCTGATGAAGCGATGTTGTGTTTGGACGAACTTTTAGAGCAGTGTAATTCCAAGAACGATCCGACCGGTTTAAAAGACCCCTTATCAAAGTCAAAATACGCGATAACTTTGCATGAAGAAGGGGAGTGTTCTAACACGGATAAGGTTAACGAGTGGATGCGCGACGCACATACGGCACTTCGGTTTACGGGAGGGTTTAAACCTCCGATTGTAGTGAACCTACCAGGCCACTCGGATAAACCTTCAATTAAGACTTCATCTCCATCTCCGGTCGTTGAAGTGCGAGAGTGTAAATCGACATCTGAAATTCAATCCGTTCACTCTACGGAGAGATATATTCCTCCATTTCGTAGAGCTAACTCTGATGGTGGTGTCGAAACCGTAAAGGCAGCGGACATCCGTGCTTGTCAAGTCACATCTACAATCCCCTCGGTGGTCACTGTTCCGGCTGGAAAACCGAGTAAAACGATACGGATGCATACTTCGCTGATAGATGAAGCAAGTTCGGTTTTAGGTGTTGCCTTCAAGTCTAAGGTAGATCTACTAAATGTAGGATTTTACAGAAATTTGACCAGGAGAGTCTCCGGAAATTCGAATAAGGCTAAAGTATTTGAGGCTTTAGCTCATTCTTTACACGGACTCCGCATGGAGGTGGACGCTATAGACAAAGTGTTGAAAGCACCTAAACCGTTAATTGGTAATAGAAATGATCTCTTCACAAGAGACATACAAGAACTAAATATGGTACAAAAAACGAATTCTGCCAATTTTAAGATTGAAGATCCGGCTAGCAATATGGTCGGTTTGTTGGGGGAGAGAAGGTTGATTTTCAACAACGACAAAATTTTGAAAGAACCTCACGACATAGTGTTTGTTCCCCCATTTGATATTTCGTTTAATTTAGTCAGAACACTGTCGATACTGTTGATGCTGAAAGATCTGACAAACGAGGATTTAGATAATGCCTTGGAGAACTGCTCTTTTGTTAACGCAGTCCCTGGGGCAGGAAAGACTTACAGCATAAAACAACAAATGTTGAACTGGAAATCTACTGCGAAGAAAGGAGAGCTTCTGCTGGTATTGACGGCTTGCAGAAATTCTGCACAATCTCTTAAAACTTTCGTCTCAGAAAACGCTTTAGACAAAGTGCTCTCCGTGATGACCATTGATTCTTACCTCTTCCAAACTCGTCGCGGAAGCCCCTGCAAATACGCGAAAATATTGATTGATGAATGCTACATGGTACATGCTGGCATCATAATCGTCTTGTTAGCGTATGCGAAGCCCGAATCGGTCACGCTATTTGGCGATAGAAGACAGGTACCCTTCATCAATAGAATGAAACTTCTTCAGGATGACAAGGGAATGCTTGTTCCAAATGGCAATTACTCAGAAATGTTAACTACTTACAGATGTCCCGCTGACATATGTTGGTGGATGTCGACCGTTCAATTCCAAAAGAGAGGTGGGAAACTGTATAGTGGAGATGTCAAGTTAATATCCAAACACCCCATCCTTAAAAGTGTCACGCGTAAAGAATTCAGTAAAACGGACAACACGTTATTCAACGATGTTGACCGAATTATGACCTTTACACAGAATGAGAAGAACGAGTTGATCTCAGATTTCTTAAACGGTAGACATGGTGACCGTCAACGAGCT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| 52,983
|
NC_078626.1
|
Pineapple secovirus A
| null |
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-06
|
HANA187
|
Sadwavirus alphananas
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,128
|
RefSeq
| null |
USA: Hawaii
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2018
| null |
PRJNA485481
|
Pineapple secovirus A isolate HANA187 segment RNA1, complete sequence
|
AAGGCATCAGAATTATGTGAAAAGGCAACCGGAGATCTTGAATCTCCACCCCGCTCCCGTTAGTTAGGAACGCGACCGAGAATTTAATTCTCATGAGAGTAACCAAGTATCTCTTGGTTCTCTGTTTTCCTTTTCTTTGCACTTGTCCCACCTTTGGGTTGTAAGTTGCACAGCCGTGAAAAGTCGGCACGCTTAGGCGGCAAAGACAACCTCTTCTTTCTTGCAAGCTGTTCCAATTATCTCTCTAATCCAACAACAATGACCAACAAGGATTTTATTGAGGAATTCGAACAGTATTCTAAGACTGTTCTGGTTTGCTTCCCGGAAATTTCAGATGATGAGCTAGTAGAGCTATTTCTTGAATATCGGATATTGCAAGCAGAAACCCAATTGCTTCCTGAGACCAAGGTTCTCATGGGACAATTGGCAACTCTGGATAACGCTGAAAACATATCCTATGAGCAATTAGAGGATATGGCTAGATCAACCAATTCGACGTGTGTTCCACATTTATTGTTGAAACATGCGTTAGCACAACAAGATCTAGCGTGGACTTATCAACAGCAGATCGTGTTCACTGGCAACGACTATCTTAAGGCAGGCAGATTACTGGATATCCACATTAGACTCAGGTCAAATGCTGCCACTGTTGCAGAAGGGATGTTCGAATCTGCATTGGGGGGAATTTCGTCAGCACTCGCTTACACTGGAACGACTATTCTTTTGAAGCGATTGGCGAAAATTCCCCAGAGTTTAGAAAAAGTTGATTTGATCCTACAAAAAATTTTGGATGGCTTTTCCTGGGTCGGCAACCTTGTAGATGGGTTTCAGGCCACACTTTCAGCGATAAAAGCCAATATTCTCAAATGGGTCAATCAAGCCATGGATAAGATGAAATGGTTTTCTGAAAATTTTAGCTTCATCTTTCCAATTTTTGTCAGCGTGTTTCTCGTATGTACAGTCTCTGCAATTGTGAACACGCTCCTCTCATCGCTTGGATACGAGATGCGTGTCCCCACGGCGCGTCTATTCGAAATAGCAGCCGTGGCCTCTTCTATCTACGTCCTCCCTGAACTAGGAGCTAAATTGTTGATGCTCACCGTCTTTGAGAAGACCAAATTACTTAACACTGTTTGGTCTTTGCTAGGAATTCACGGAACTGAGGTTGCAATTACTGATGATGCACCTCCTGAACCGACGGCTGAATCAGGTGACGTTGCGCTTTTCACCTCCCTACTCACATTTGTGACATTTTTCACGAACTGGGAAGTGAAATCAGGTGTAATGGAGATGATGAGATGGTCGAGTTCCTTCAAAGGAGCTTGCGATGGTTTTGAAAAATTCAAGACCATTTCTTCATCCATTAGTATGTGGGCATATGAGCACTTGGGAATAGGCAAGTCCCAGGAGCATGCCCAAGCTCAACATTTGTTGGTTTCCACAGGAATCGATTTAGAGAAGTGGTGTGAAGACGTGGAAACTCTGATAATAGATGGCAATACTGCCAACAAAAGAATGGAAGAGCTTTTGACACGATCGCGAGAGCTGATAGATTTCTACAAGAGAATCGTGTCATTCTCAACAGCTCAGACGAGCAGCTTGGGCTTTCTGTTACGTGAGCGAATAAAGACGGTTGGGAAAAATCTAACCGATTTCGAAGCCAGCGTTGCGCAGGCACGAATGATGGGAGAAGACAGGTTGACCCCCTTTTGCTTTTGTGTATACTCAGTGCCTGGGATGGGGAAATCTATAATGATGAAGAGATTTAAACACGATTTCCTGGATGCCATGGAGGAACCTACGGAGGGGAGAGTGTACCCTCGCAGCCCAGGCGACAAATACTGGTCAGGTTATTTGAAACAAACGCTGGTTTATTATGATGATTTTGCTCAATGCCAGCAGAGAGATGGTGGGTCGGACGAACTTGATCTGATACCACTAGTGTCGGGTGCTGCTCACTGTCTCAACATGGCAGCCATTGGGGAGAAAGGGAGAAATTTTGCCTCCAAATATATATTTCTAAGTACGAACAGACGCGTGGAGGCCCCAGAAGTGATGCTTGCTGATAATAATGCTTTTCGCAGGCGTCGACATTTAATGGTCGAGTTGTTACACGCTGCTGATGTTCCTATTGACCCAACCAGACCATTTGATCATCTGAGATTTAGAAGGTTGAATCCGCTGGAACCAACCCAGCCGTATAGAGACGAGTCCGGAGTAGTTCACAATGAATTATTAACATATCCGGAGCTCCTTGTTCTGACAATCGACACGGCTAAGGCTCATAGGGCCAAAGAAGAAGCACTAGATGCATTTACCACTGCAACTGGAGTGAATCCGCGAGCCCAAAGTGATTACGCTACTTGGTTGTTCGACCCCACGCGATTCGCGGAGAATTCAATTGAATGCCCACACTTCAAGGCAGATCCGCCTCCAGACTATGAATGTTATGGGATTGAGAATGGGGAACCCATGGTGTTTAACACTACAGGCACACTTGTGCCTAATGAGATCTGGACGCCGGCGGAACTTAGATGCTGTTTCTTAACTGCCGAGCGGCAAACACAGAGAGATCTGCTGGATGCACTGCATATGTCAGCATTCATAGATGACGGAGTGTCCACTTATGGCTTACAATGCTTATTCGATAATGTGGATAAAATGTGTTTGGCCAATGGAGGCGTTCGTGCCACTCAAGAGTTCATGCAGGAGCCATATGCAGAATTATGGTCTCGTTGTAGTGCACGAACACGATACTTGATGCAAAGGAAAGCTAGGTATTATAACGATACACGCTCATCATTTGCTCTGGCCAAAGACAAGATAATGAGTCACATTCGAAATTTTAAGGCATCGGAACTATGGGCGAGCCTGCCAATTTCACTCAAATGGCTTTGTGCGGGGCTTGCGTTGTGCACAGTGGGACTTCCTTTGCTATGGATCTTGCGGAAATGCCTGACAGCTGCGGCCAACGGACCGGCAACATTGGCACTAGCCCTTTTCACAGGTGCCAAAATGGAAGGGACAAGTTCTGGTGGTGATGAGCGGGTTCTGAGAGTGCGAGGGAGGCGTGTAAGAGCATTCATGCAAGGTTCCAATTCTACCACGGACATAGTATCCCCTGAGGCTATTGTGTCGATTCAGAAAGCTCAATGCTACATACAATGCCATACTCGATCTGGCAAGTACATGACATGTTGCGGATACTTTTCCGGTCCTCGCAAAATTACAACAACGACCCATGATATGGCAGAGGCTGATTTTACACGATTAATGTGCTTGGTGGATTTCGAAGGAAATTTTATTCACTGTGCCTTCAATCCAGCAAAATTCTTTGTGCCGCTAGAAAACGGGCGGAAAATGAATCTGTGCACCCTAGAGCTCCCATATACTGCTAACCCTCATCATAGTGTGGGTCACTTGAATAAGTACGATTTTATTCGTGGAATGCCTTCTCATTGCCAGGGATACGTGTTGCCAAATCTGAGAATGGAGAATGGCGAGATGATTAGGCAGGTAACCTACTCACCTGTCTTGCGATCAGAGGAAATTTTGGACGTTAAAACCGGAAAACACTGGCCTGCCACTCACTTATTTCAGGCAGCTCTGTCTCACACTGCGGGCTTTTGTGGAAGGTTGGCTTTGATAAAATCAGAGAGCGGGTATAATATTGTTGGGATGCATGTAGCTGGAACTACGATAATGGGGAAGGATTACTCGTACTTTAGCGAGTTGTTTGCCGCTCTAGAACCGGCTGTGGTTCACGCACAAGGAGAACAAATTGCTGAAACTATGATTTTTGAACATGAGAATCCCAAGCAACTCACACCAATGGTGTCCAAAATCGGCTATCTGAGCCGACAACTACCCAAACTTGAAAAGAGTCAGATAGTTCCAAGCCCCATTCATGGAGCTCTGACTACATTGTTCAGGCCACCTAATACCGAACCGACATTGCTTAAAGCTGGTGATCCAAGGGCCCCAATCTTCTATGACCCTTATGCTGAAGGAGTTGTGAAATTTGCTGAGGAAACTGGGCCATTTTCTTTGGAACCCCAATCTGATGAATCGATTGTTATGCAAGACATTCTCCACACATGGCGATCGCAGAATGCGCCACTGGCCCTACCCACTGTCACTTCACTAGAAATAGCAATAAATGGGCAAAATGGACTGGAATATGCCGAAGCTTTGCCCATTAGCACCGGAGAGGGTTTCCCGAGTATTTTGGAACGAAAACATGGCGAATCCGGAAAATTTCGATACTTTGAGGAAGCTGCCGACGGAACTCGCATTCTTCTGGATGAACCACTAGCGCGAGTTAATGAGATTGAGGCAGCGGCTGACACAGGTGATCTTGAAATATTCACTATAGCCTGTGCGAAGGATGAAAAGACTGCTATAAAGAAAGTGCGTGAGACTCCCAAGACCCGGATCTTTGAAATTTTACCATTTGAATTCAACATCGTCATTCGCAAATATTTTCTGTTCTGGATGCAGTGGATGATGAGCTTGCACAATAAATTACCGTGCAAAGTGGGTTTAAACCCTTATTCACAGAGTTGGGATTTGATGGCCCACAAACACTGTAAATTTGATCAACACTTTTGTGGCGATTACTCGGGTTTTGACACCGGCACCAATGTTGAGATAATGCTCAAATTTGCTGATTTGATAAGCGAATTTGCTGATGATGGGGATAGAGCTAAGAGAGTGAGGCGCAATTTGATGAAAGCAGCGGTCACCCGGAAGATGATCGTCGGAGCTGATGTCTATCGCATAAGAGGAGGAACTCCTTCAGGCTTTGCGCTAACGGTCATGATCAATTCACTGATGAATGAATTCTATCTTCGTCTAGCCTGGCGCAAATTATCTCCGCATGCTGATCTTCGAGGGAACTTTTTCTTTTCAAATCATGTTGTGATTTCTGTGTATGGGGACGACAATGTTGTTTCATTTAGCGCCGATGTAGCCCCATGGTACAATCTTGAAACGATAAGCAAGGAGTTGGCTAAGTATGGAGTTAAGTTGGGAGATGGTCGGAAAACGGGAGCCGTTATCAAGTGGCAGAGATTTGATGAGATTGATTTCCTTAAGAGAAGCTGGGTTCCTGTCGACACTGGAGTATATATGTGCCCGATCAATCGAACTTCGATTGAAGAGCAATTGTTTTGGATCAAAGCAGGACGAACGGACAACGATGATCACGTTGAGAGTTTGACGGCCAACTGCGTCAATGTTATGAGAGAAAGCTTTTTCCACGGACATGAATATTGGTTCAAAATTTTTGGGATTATTACACAAGCGTTTCAAGCTGCGAATCTTGAACTGCCTATTCTCCCTTCTTTTCAAGAGTGCGAGCAATTCTGGAGGTCGCAGCGTGAAGGACAAGTCCAGGCACTCCCAATAGAATATTCCTTAAATCCAAGTTTGGTGTTGCGATTTGTACAAGGCTCACTAGTGCAGCGCATCACCGATGATATTACCACTGGAGGTACTCGGCAAAATGCTAACCTACCAGTTGTAATGGTGGTTCCCGGCGTGACAAAACGTCACCCCGTCACTGGTCAGTTGTTGAATGTTCGTTACGGACCACCACAATCACTCTTAAGTGATCTAAAATCCATAGTGGGACCTGTGCACTTTGTCGATGTAAATCCAAAAAGCAAACATCCATCCGAACAAGCCCATCTGTGTGGGATTTTAACATTTTTGCTACGAAATCAACACCGACTACTTGAAGCCTTCGAAGAAGTCAAAAGCTATTTGTGTTTGATAAGTGACAAGTGCTACAATGCCGTGTTTGTGCCTTGTTACGAGCTGATAAAGAATGACCCCAAATTCCGTTTGCTCTAAGATGGGGTACAATCGATGGTTTGCTTAACACTTTGCCTAATCTCATTGCTTCTTAGTTGGGTTATTTGTTTGCACATTAGTATACGAAGATTTTTGTCGGTTTGATCTCTGAGAAACCGTCTGGCCTGTTGGTTGGCCACCTAGGGTGTAGGAGCCTGGGTTTAAACCAACAAATATAGCTATAATAAGCTATTTAGTGTGTATTTGGGTTTGCCTTTATTTCTTTGTTAGTGTGTTTGGCGCTTTCATTGTCCTTTTGGCTTGTCTCAAAC
| 163
|
OP860242.1
|
Pineapple secovirus A
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PSVA/S1-1
|
Sadwavirus alphananas
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,171
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple secovirus A isolate PSVA/S1-1 segment RNA1, complete sequence
|
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| 18,342
|
OP860243.1
|
Pineapple secovirus A
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PSVA/S1-2
|
Sadwavirus alphananas
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,435
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple secovirus A isolate PSVA/S1-2 segment RNA1, complete sequence
|
AGCAACCAGGGATCTTGAATCCCTACCCCGCTCCCGTTAGTCTAGGAAAAGCAACCAGGGATCTTGAATCCCTATTCCGCTCCCGTTAGTTTAGGAAAAGCAACCAGGGATCTTGAATCCCTACCCCACTTCCGATAGTTTAGGACCAGCAACCGGGACCTTGAGTCCCAACCTCCTTCCCATTAGTTTGGGAATCACCTTTGGATTGTGATCTGCACGGCCGTGAATAGTCGGCACGCTTCGGCGGTAGAAACAACCTCCTCTCACAAAGCGCACAGAAAAGGCAACCGGAGATCTTGAATCTCCACCCCACTCCCGTTAACTTAGGAAGCGACCGAGAATCTTGAATTCTCATGAGAGTGTCTAATTTTTAGACCGCTCTCTTTCTCTTCTGTGCACTTTCCCCACCTTTGGGTTGTGAGTTGCACGGCCGTGAAAAGTCGGCACGCTTAGGCGGCAAAGACAACCTCTTCTTTTATCCATTTAACTGCTCCAGTTCTCTTGAATCCAGCCACAATGACCAACAAGGATTTCATTGAGGAATTTGAGCAGTATTCTAAATCCGTTCTGCTTTGCTTTCCAGATATCTCAGATGACGAGCTTGTGGAATTATTTCTTGAATATAAGATATTGCAAACAGAAACTCAACTTCTCCCTGAGACCAAAGCTCTTATGGGGCAGCTAGCAGTCCTTGACAACACCGAGGACATCTCATTTGACAAGTTGGAAGATTTGGTCAAGTTGACCAATTCGACTTGTGTCCCACACCTGTTATTGAAGCACGCGCTGGCCCAACAAGATTTAGCATGGACCCACCAGCAACAAATTGTATTTATTGGGGACGACTACCTTAAAGCAGGCAAAATGCTGGACATTCACATTGGGCTCAAATCAAACTCTGCTGCTGTCACTGAAGGACTTCTCGAATCTGCAGTGGGGGGGATTTCGTCAGCACTCGCTTACACGGGAACAACCATCCTCCTGAAGCGATTGGCGAAAATCCCCCAGAGCCTAGAGAAAGTTGACCTCATTTTGCAGAAGATTTTGGATGGTTTCTCCTGGGTCGGTAACCTAGTTGACGGATTTCAAGCCACATTATCCGCGATCAAGGCGAATGTGCTTAGATGGGTAAACCAGGCTTTAGACAAGATGAAGTGGTTTTCTGAAAATTTCAGCTTCATCTTTCCGATTTTTGTTAGTGTGTTTCTCGTGTGCTCAGTTTCTGCAATAATTAACACACTACTCTCATCGCTTGGATATGAGATGCGCGTTCCTACAGCGCGCTTGTTTGAGATAGCAGCTGTGGCATCCTCTATTTATGTTCTTCCTGAGCTAGGGGCCAAACTGCTAATGCTCACCATTTTCGAGAAGACTAAGCTGCTCAACTCGGTTTGGTCCCTTCTCGGAATTAACGGGACCGAGGTTGCTATCACTGATGATGCACCTCAAGAACCTACAGCCGAATCTGGAGACGTTGCTCTCTTCACCTCCTTGCTTACATTCGTGACATTTTTCACAAATTGGGAGGTGAAATCGGGTCTGCTGGAAATGATGAAGTGGTCAACTTCCTTCAAAGGAGCCTGCGACGGCTTTGAAAAATTCAAGACCATTTCTTCATCAATTAGCATGTGGGCTTATGAACATCTTGGAGTCGGCAAATCACAAGAACAAGCCCAAGCCCAACACTTACTAATCTCCACAGGAATCGATTTGGAGAAATGGTGCGAGGATGTGGAGACGCTGATAATCGAGGGAAATACATCCAATAAAAGAATGGAGGAATTGTTGACACGATCAAGAGAATTGATAGACTTTTATAAGAGGATCGTGTCATTTTCAACAAACCAGACCAGCAGTCTGGGTTTCCTCCTTCGAGAGCGAATTAAAACAGTTGGGAAAAACCTAACTGACTTTGAGGCGAGCGTTGCTCAGGCAAAGATGATGGGGGAAGACAGGTTGACCCCGTTCTGCTTCTGTGTGTATTCCCTGCCTGGGATGGGGAAATCCATAATGATGAAACGATTTAAACACGATTTTTTGGATGCCATGGAAGAGCCCTCCGAAGGACGGGTGTACCCGCGCAGCCCAGGCGATAAATACTGGTCTGGCTACTTGAAGCAGACACTGGTGTATTATGACGACTTTGCTCAGTGTCAGCAGAGGGACGGCGGATCTGATGAACTGGATCTGATACCGCTGGTCTCTGGAGCTGCCCACTGTCTCAATATGGCGGCCATAGGAGAGAAAGGGAGAAATTTTGCTTCAAAGTACATATTCCTGAGCACTAACAGGCGTGTTGAGGCTCCTGAGGTGATGCTTGCTGATAACAACGCTTTTCGACGGCGCCGACACTTAATGGTCGAACTGGTGCATGCTGCTGATGTTCCTATTGATCCAATCAGACCGTTTGACCATTTGAGATTTCGAAGATTGAACCCGCTCGAACCAACCCAGCCATATAGGGATGAATCCGGCGTCATTCATAACGAGTTATTGACATATCCGGAACTTCTCGTCCTTACTATCGATACTGCCAAAGCCCACAGAGCCAAAGAGGAAGCGCTCGATGCATTCACTGCTGCAGCAGGGATAAATCCGCGAGCTCAAAGCAACTACGCCACCTGGTTATTTGATCCAACCAGGTTTGCGGAGAACTCTATAGAGTGTCCTCATTTCAAGGCAGACCCAACCCCAGAGTATGAGTGTTATGGTGTGGAGGATGGGGACCCCATGGTATTTAGTACAGCAGGAACCCTTGTTCCAAGTGAGATCTGGACTCCGGCGGAAATCAGATGCTGCTTTCTGACTGCTGAGCGGCAAACACAAAGGGATCTGCTAGATGCACTGCACATGTCAGCTTTCGTGGACGAAGGAGTGTCGACTTACGGGCTGCAGTGCTTGTTCGATAATGTGGACAAGATCCATCTGGCCGGAGGCGATATTCGTGCCATACAAGAATTCATGCAGGAACCATATGCTGAATTGTGGTCTCATTGCAGCGCACGAACACGATACTTGATGCAGAGGAAAGCGCGATACTACAATTCCACGCGCTCATCATTTGCGCTGGCGAAAGACAAAATAATGAGCCACATCAGGAACTTTAAGGCATCAGAACTTTGGGCAAGCTTACCAGTGTCTCTGAAATGGCTTTGTGCGGGATTGGCCTTGTGCACCATCGGGCTTCCTTTACTGTGGACTTTGCGGAAATGTTTGACAGCTGCGGCAAACGGGCCAGCAACATTGGCGCTAGCTCTTTTTACCGGATCCAAAATGGAAGGAACCAGCTCCGGTGGTGACGAACGAGTGATGAGGGTACGCGGAAGGCGCGTGAGGGCTTTCATGCAAGGTTCCAACTCTGCTACAGACATTGTATCTCCTGAGGCTATCATGTCAATTCAGAAAGCCCAATGTTACATACAATGCCACACACGATCTGGCAAGTACATGACGTGTTGCGGCTATTTTTCTGGCCCTCGCAAGATCACAACGACAACCCACGATATGGCRGAGGCAGATTTCACGCGCCTCATGTGCTTGGTGGATTTTGAGGGAAATTTTACTCACTGTGCCTTCAACCCAGCGAAGTTTTATGTGCCACAGGAGAACGGGCGGAAGATGAACTTGTGTACCCTTGAGCTTCCATACACGGCCAATCCTCACCATAGTGTGGGCCATCTGAACAAATACGACTTTATTCGTGGAATGTCGGCTCATTGTCAAGGATATGTCTTGCCAAATCTGAGAATGGAAACTGGTGAGATGATTAGACAGGTAACTTACTCACCTGTCTTGCGATCTGAGGAGATATTGGACGTTAAAACTGGGAAACATTGGCCTGCCACCCATCTCTTTCAAGCGGCGCTATCTCACACTGCGGGATTCTGTGGCAGGCTGGCTTTGATTAAGTCGGAGAGCGGGTATAACGTGGTTGGAATGCACGTTGCCGGTACCACGATCATGGGGAAAGAATACTCTTATTTTAGTGAGCTTTTCTCCGCTTTGGAACCAACTGTGGTCCATGCCCAAGGGGAGGCAATTGAGGAAACGATGATCTTTGAGCACGAGACTCCAAAACAACTTACTCCGATGGTGTCCAAAATCGGATATCTGAGCCGCCAACTGCCTAAACTTGAGAAGAGCCAGATAGTCCCAAGTCCCATACATGGAGCACTGGTCACCACATTTAGACCACCCAGTACTGAACCGACATTGCTCAAAGCTGGCGATCCGAGGGCACCGATTTTTTATGATCCCTATGCTGAAGGTGTCGTGAAATTTGTTGAAGAAACTGGTCCATTCTCTCTGGAACCCCAGTCTGACGAATCGATCGTAATGCAGGACATTCTACACACATGGCGTTCGCAGAATGTCCCACTGGCATTGCCCACTGTTACTTCGCTTGAAGTAGCAATCAATGGGCAAAATGGTCTTGAATATGCTGAAGCTCTACCTATCAGCACTGGAGAAGGGTTCCCAAGCATACTGGAGCGGAAACATGGTGAGTCTGGGAAGTTTCGATATTTTGAGGAGGCTGCTGATGGAACTCGCATTCTTTTAGAAGAACCGCTCGCGCGAGTCAATGAAATAGAGGCAGCAGCCGAAACTGGCGATCTTGAAATATTTACAATAGCTTGCGCAAAGGACGAGAAAACTGCCATAAAGAAGGTGCGTGAAACTCCTAAGACTCGCATCTTTGAGATTCTGCCATTTGAGTTCAACATCATCATTAGGAAATATTTCTTATTTTGGATGCAATGGATGATGAGTCTGCATAATAAATTGCCGTGCAAGGTGGGTTTGAACCCCTACTCTCAGAGTTGGGATTTAATGGCCCACAAACATTGTAAATTTGACCAGCATTTYTGYGGTGATTATTCAGGTTTCGATACAGGCACTAACGTTGAAATCATGCTTAGATTTGCTGATCTAATAAGCGAATTTGCCAACGATGGAGAGAAAGCCAAGAGGATAAGACGTAATTTGATGAGAGCTGCCGT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| 18,343
|
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Pineapple secovirus A
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|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PSVA/S2-1
|
Sadwavirus alphananas
|
Sadwavirus
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Secoviridae
|
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|
GenBank
| 1
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|
USA
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2020-07
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| 18,344
|
OP860245.1
|
Pineapple secovirus A
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PSVA/S2-2
|
Sadwavirus alphananas
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,046
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple secovirus A isolate PSVA/S2-2 segment RNA1, complete sequence
|
AAAAGGCAACCGGAGATCTTGAATCTCCACCCCGCTCCCGTTAATTAGGAACGCGACCGAGAATCTAATTCTCATGAGAGTAACCAAGTATTTCTTGGTTCTCTGTTTTCCTTTTCTTTGCACTCATCTCACCTTTGGGTTGTAAGTTGCACAGCCGTGAAAAGTCGGCACGCTTAGGCGGCAAAGACAACCTCTTCTTTCTCACGAACTGTTCCAATTATCTCTTTAATCCAACAACAATGACCAACAAGGATTTTATTGAGGAATTTGAACAGTATTCTAAGACTGTTCTGGTTTGCTTTCCGGAGATTTCGGATGATGAGCTAGTAGAGCTATTTCTTGAATATAGGATATTGCAAGCAGAAACCCAGTTGCTTCCCGAGACCAAGGTCCTTATGGGACAATTGGCAGTTCTGGATAATGCTGAGAACATATCCTATGAGCAATTGGAAGATTTGGCTAGATCAACTAACTCGACGTGTGTTCCACATTTACTGTTGAAGCACGCATTAGCGCAACAAGATCTAGCGTGGACCTATCAGCAACAGATTGTCTTTACAGGCAATGATTATCTCAAGGCAGGCAGATTACTGGATATCCACATTGGACTCAAATCAAATGCTGCCGTTGTTGCGGAGGGTATATTCGAATCTGCAGTGGGGGGGATTTCGTCAGCACTAGCTTACACTGGAACGACTATTCTCCTGAAGCGATTGGCGAAAATCCCCCAGAGTCTAGAGAAAGTTGATCTGATCCTGCAGAAAATTTTAGATGGCTTTTCTTGGGTTGGCAACCTTGTGGATGGGTTTCAGGCTACACTCTCAGCAATAAAAGCCAATGTTCTCAAATGGGTCAATCAAGCGATGGATAAGATGAAGTGGTTTTCTGAAAATTTCAACTTCATCTTTCCAATCTTTGTCAGCGTGTTCCTTGTCTGTACAGTTTCCGCGATTGTGAATACACTTCTTTCTTCGCTAGGATACGAAATGCGTGTCCCCACGGCGCGTCTATTTGAAATAGCAGCCGTGGCTTCCTCTATTTACGTTCTCCCTGAGTTGGGGGCAAAATTGTTGATGCTCACTGTCTTCGAGAAAACCAAACTACTCAACACTGTTTGGTCTTTGCTTGGAATTCATGGAACCGAGGTTGCGATTACTGACGACGCACCTCCTGAACCGACAGCTGAATCAGGTGATGTTGCGCTTTTCACCTCCCTACTCACATTTGTGACATTTTTCACGAACTGGGAAGTGAAATCGGGCATGCTGGAGATGATGAAATGGTCGAGTTCCTTTAAAGGAGCTTGCGATGGTTTTGAAAAATTTAAGACCATTTCTTCATCCATTAGTATGTGGGCATACGAGCACTTGGGAATAGGCAAGTCCCAGGAACATGCCCAAGCTCAGCACTTGCTGGTTTCTACAGGAATTGATTTGGAAAAATGGTGTGAAGATGTAGAAACTTTGATAATAGACGGCAATACTTCCAATAGGAGAATGGAAGAGTTATTGACACGATCGCGAGAGCTGATAGATTTCTACAAGAGAATCGTGTCATTCTCGACAACCCAGACGAGTAGCTTGGGCTTTCTGCTGCGCGAGCGAATAAAGACGGTTGGAAAAAATCTAACCGATTTTGAGGCGAACATTGCTCAGGCACGAATGATGGGGGAAGACAGATTAACCCCTTTTTGTTTTTGTGTGTACTCAGTGCCTGGGATGGGGAAATCTATAATGATGAAGAGATTCAAACATGATTTCCTGGATGCCATGGAAGAGCCTACGGAGGGGAGAGTGTACCCTCGCAGCCCAGGTGACAAGTACTGGTCGGGTTATTTGAAACAAACGCTGGTTTATTACGATGATTTTGCTCAATGCCAGCAGAGGGATGGTGGATCAGACGAACTCGATCTGATACCACTAGTATCAGGCGCCGCCCACTGTCTTAATATGGCAGCCATCGGGGAGAAAGGGAGAAATTTTGCCTCCAAATACATATTTCTGAGCACAAACAGACGTGTGGAGGCCCCAGAAGTGATGCTCGCTGACAATAATGCTTTTCGCAGGCGCCGACATTTAATGGTAGARTTGTTRCATGCTGCYGAYGTTCCTRTTGACCCAACTAGACCATTTGAYCATTTGAGGTTCCGAAGACTGAATCCGTTGGAACCGACCCAGCCATATAGAGATGAGTCCGGAGTGGTTCACAATGAATTGTTAACATATCCGGAGCTCCTTGTTTTGACAATCGACACGGCTAAAGCTCAYAGAGCCAAGGAAGAAGCGCTAGACGCATTTACTGCTGCGACGGGAGCGAATCCGCGAGCCCAAAGTGACTATGCTACTTGGTTGTTCGATCCCACACGATTTGCGGAGAATTCAATYGAATGCCCACAYTTTAAGGCAGATCCACCTCCAGAYTATGAATGTTATGGAATCGAGRATGGGGAGCCTATGGTGTTTAACACTACAGGCACACTTGTGCCTAATGAGATTTGGACGCCAGCGGAACTTAGATGCTGTTTCTTGACCGCTGAGCGGCAAACACAGAGAGATTTGCTGGACGCGTTACATATGTCGGCATTTACAGATGATGGAGTGTCCACCTATGGCTTGCAATGTTTATTTGACAATGTGGACAAAGTTTGTTTGGCCAAYGGYAMTATYCRGGCCACTCAAGGGTTTATGCAAGAGCCGTATGCAGAATTGTGGTCTCATTGCAGCGCACGAACACGATACTTGGTKCAAAGGAAAGCCAGGTATTACAACGCYACGCGTTCATCATTTGCCTTGGCTAAGGATAAGATAATGAGTCACATTCGAAATTTCAAGGCATCAGAATTATGGGCGAACCTGCCAGTTTCACTTAAATGGCTTTGCGCGGGGCTCGCATTATGCACAGTAGGACTGCCTTTGCTATGGATCTTGCGGAAATGCTTGACAGCTGCGGCGAATGGACCAGCAACATTGGCACTAGCTCTTTTCACAGGTGCCAAAATGGAGGGGACAAGTTCCGGTGGTGATGAGCGGGTTCTGAGAGTGCGAGGGAGGCGTGTGAGAGCTTTCATGCAAGGTTCCAATTCTGCCACAGACATAGTATCCCCTGAGGCTATTGTGTCAATCCAGAAAGCTCAGTGTTATATACAATGTCATACTCGATCTGGCAAGTACATGACATGTTGCGGATACTTTTCTGGTCCTCGCAAAATCACAACAACGACCCATGATATGGCGGAGGCTGATTTTACACGACTGATGTGCTTGGTGGATTTTGAAGGAAATTTTATTCACTGCGCTTTCAATCCDGCGAAATTCTTTGTGCCGCTAGAAAATGGGCGGAAAATGAATCTGTGCACCCTAGAGCTCCCGTATACTGCTAATCCTCATCACAGTGTGGGCCACTTGAACAAATATGATTTTATTCGCGGAATGCCTTCCCACTGTCAGGGATACGTATTGCCAAATCTGAGAATGGAAACTGGCGAGATGATTAGGCAGGTAACCTATTCACCTGTTTTGCGATCAGAAGAGATCTTGGATGTTAAAACTGGGAAACATTGGCCTGCCACTCACTTATTTCAGGCGGCTYTGTCTCATACTGCAGGCTTTTGTGGGAGGTTGGCTTTGATAAAATCAGAGAGTGGGTACAACATTGTTGGGATGCATGTGGCTGGAACCACAATAATGGGGAAAGATTACTCATACTTTAGTGAGTTGTTTGCTGCTCTAGAACCAGCTGTGGTTCACGCACAAGGAGAACCAATWGCTGAAACTATGATTTTTGAACAYGAGAATCCCAAGCAACTCACACCAATGGTCTCCAAAATTGGCTATCTGAGCCGACAACTACCCAAACTTGAAAAGAGCCAGATAGTTCCAAGCCCCATTCACGGAGCTCTTACTACCTTGTTCAGGCCCCCTAACACTGAACCAACACTGCTCAAAGCTGGTGATCCAAGGGCACCGATCTTCTATGACCCTTATGCTGAAGGAGTTGTGAAATTTGTTGAGGAAACTGGGCCATTTTCTTTGGAAGCCCAATCTGATGAATCAATTGTCATGCAAGACATTCTCCACACATGGCGATCACAGAATGTGCCACTGGCCCTACCCACTGTCACTTCATTGGAAGTAGCAATAAATGGGCAAAATGGACTGGAATACGCTGAGGCTTTGCCCATCAGCACTGGAGAGGGTTTTCCAAGTATTTTGGAGCGAAAACATGGCGAGTCYGGGAAATTTCGATACTTTGAGGAAGCCGCCGATGGAACTCGCATTCTTTTGGATGAGCCACTTGCGCGAGTTAATGAGATTGAAGCAGCGGCTGACACRGGCGATCTTGAAATATTCACTATTGCCTGTGCGAAGGACGAAAAGACTGCTATAAAGAAAGTGCGCGARACTCCTAAAACTCGGATCTTTGAAATTCTRCCATTTGARTTCAACATCGTCATTCGCAAATATTTTCTGTTCTGGATGCAGTGGATGATGAGCCTGCACAACAAATTGCCATGCAAAGTGGGCTTAAATCCTTATTCACAGAGCTGGGATTTAATGGCCCACAAACACTGCAARTTTGATCARCATTTTTGTGGCGATTACTCAGGTTTTGACACTGGCACTAACGTTGAAATAATGCTTAAATTTGCTGATTTGATAAGTGAGTTTGCTGATGATGGGGACAGAGCTAAAAGAGTGAGGCGCAATTTGATGAAAGCAGCAGTCACCCGGAAAATGATTGTTGGAGCTGATGTTTATCGCATAAGAGGGGGAACTCCTTCAGGTTTTGCGCTAACAGTCATGATTAATTCACTGATGAATGAATTCTATCTCCGTCTAGCTTGGCGCAAATTGTCACCTCATGATGATCTTCGAGGGAACTTTTTCTTTTCAAATCATGTTGTAATTTCTGTGTATGGGGAYGACAATGTTGTTTCATTTAGCGCTGATGTTGCTCCGTGGTATAATCTTGAAACGATAAGCAAAGAGTTGGCTAAGTAC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| 18,345
|
MN809923.1
|
Pineapple secovirus A
|
Larrea-Sarmiento,A., Olmedo-Velarde,A., Green,J.C., Al Rwahnih,M., Wang,X., Li,Y.H., Wu,W., Zhang,J., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Borth,W., Melzer,M.J., Hu,J.S., Larrea-Sarmiento,A.E., Hu,J.
|
University of Hawaii at Manoa, Department of Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2020-04-19
|
HANA187
|
Sadwavirus alphananas
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,128
|
GenBank
| 1
|
USA: Hawaii
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2018
| null | null |
Pineapple secovirus A isolate HANA187 segment RNA1, complete sequence
|
AAGGCATCAGAATTATGTGAAAAGGCAACCGGAGATCTTGAATCTCCACCCCGCTCCCGTTAGTTAGGAACGCGACCGAGAATTTAATTCTCATGAGAGTAACCAAGTATCTCTTGGTTCTCTGTTTTCCTTTTCTTTGCACTTGTCCCACCTTTGGGTTGTAAGTTGCACAGCCGTGAAAAGTCGGCACGCTTAGGCGGCAAAGACAACCTCTTCTTTCTTGCAAGCTGTTCCAATTATCTCTCTAATCCAACAACAATGACCAACAAGGATTTTATTGAGGAATTCGAACAGTATTCTAAGACTGTTCTGGTTTGCTTCCCGGAAATTTCAGATGATGAGCTAGTAGAGCTATTTCTTGAATATCGGATATTGCAAGCAGAAACCCAATTGCTTCCTGAGACCAAGGTTCTCATGGGACAATTGGCAACTCTGGATAACGCTGAAAACATATCCTATGAGCAATTAGAGGATATGGCTAGATCAACCAATTCGACGTGTGTTCCACATTTATTGTTGAAACATGCGTTAGCACAACAAGATCTAGCGTGGACTTATCAACAGCAGATCGTGTTCACTGGCAACGACTATCTTAAGGCAGGCAGATTACTGGATATCCACATTAGACTCAGGTCAAATGCTGCCACTGTTGCAGAAGGGATGTTCGAATCTGCATTGGGGGGAATTTCGTCAGCACTCGCTTACACTGGAACGACTATTCTTTTGAAGCGATTGGCGAAAATTCCCCAGAGTTTAGAAAAAGTTGATTTGATCCTACAAAAAATTTTGGATGGCTTTTCCTGGGTCGGCAACCTTGTAGATGGGTTTCAGGCCACACTTTCAGCGATAAAAGCCAATATTCTCAAATGGGTCAATCAAGCCATGGATAAGATGAAATGGTTTTCTGAAAATTTTAGCTTCATCTTTCCAATTTTTGTCAGCGTGTTTCTCGTATGTACAGTCTCTGCAATTGTGAACACGCTCCTCTCATCGCTTGGATACGAGATGCGTGTCCCCACGGCGCGTCTATTCGAAATAGCAGCCGTGGCCTCTTCTATCTACGTCCTCCCTGAACTAGGAGCTAAATTGTTGATGCTCACCGTCTTTGAGAAGACCAAATTACTTAACACTGTTTGGTCTTTGCTAGGAATTCACGGAACTGAGGTTGCAATTACTGATGATGCACCTCCTGAACCGACGGCTGAATCAGGTGACGTTGCGCTTTTCACCTCCCTACTCACATTTGTGACATTTTTCACGAACTGGGAAGTGAAATCAGGTGTAATGGAGATGATGAGATGGTCGAGTTCCTTCAAAGGAGCTTGCGATGGTTTTGAAAAATTCAAGACCATTTCTTCATCCATTAGTATGTGGGCATATGAGCACTTGGGAATAGGCAAGTCCCAGGAGCATGCCCAAGCTCAACATTTGTTGGTTTCCACAGGAATCGATTTAGAGAAGTGGTGTGAAGACGTGGAAACTCTGATAATAGATGGCAATACTGCCAACAAAAGAATGGAAGAGCTTTTGACACGATCGCGAGAGCTGATAGATTTCTACAAGAGAATCGTGTCATTCTCAACAGCTCAGACGAGCAGCTTGGGCTTTCTGTTACGTGAGCGAATAAAGACGGTTGGGAAAAATCTAACCGATTTCGAAGCCAGCGTTGCGCAGGCACGAATGATGGGAGAAGACAGGTTGACCCCCTTTTGCTTTTGTGTATACTCAGTGCCTGGGATGGGGAAATCTATAATGATGAAGAGATTTAAACACGATTTCCTGGATGCCATGGAGGAACCTACGGAGGGGAGAGTGTACCCTCGCAGCCCAGGCGACAAATACTGGTCAGGTTATTTGAAACAAACGCTGGTTTATTATGATGATTTTGCTCAATGCCAGCAGAGAGATGGTGGGTCGGACGAACTTGATCTGATACCACTAGTGTCGGGTGCTGCTCACTGTCTCAACATGGCAGCCATTGGGGAGAAAGGGAGAAATTTTGCCTCCAAATATATATTTCTAAGTACGAACAGACGCGTGGAGGCCCCAGAAGTGATGCTTGCTGATAATAATGCTTTTCGCAGGCGTCGACATTTAATGGTCGAGTTGTTACACGCTGCTGATGTTCCTATTGACCCAACCAGACCATTTGATCATCTGAGATTTAGAAGGTTGAATCCGCTGGAACCAACCCAGCCGTATAGAGACGAGTCCGGAGTAGTTCACAATGAATTATTAACATATCCGGAGCTCCTTGTTCTGACAATCGACACGGCTAAGGCTCATAGGGCCAAAGAAGAAGCACTAGATGCATTTACCACTGCAACTGGAGTGAATCCGCGAGCCCAAAGTGATTACGCTACTTGGTTGTTCGACCCCACGCGATTCGCGGAGAATTCAATTGAATGCCCACACTTCAAGGCAGATCCGCCTCCAGACTATGAATGTTATGGGATTGAGAATGGGGAACCCATGGTGTTTAACACTACAGGCACACTTGTGCCTAATGAGATCTGGACGCCGGCGGAACTTAGATGCTGTTTCTTAACTGCCGAGCGGCAAACACAGAGAGATCTGCTGGATGCACTGCATATGTCAGCATTCATAGATGACGGAGTGTCCACTTATGGCTTACAATGCTTATTCGATAATGTGGATAAAATGTGTTTGGCCAATGGAGGCGTTCGTGCCACTCAAGAGTTCATGCAGGAGCCATATGCAGAATTATGGTCTCGTTGTAGTGCACGAACACGATACTTGATGCAAAGGAAAGCTAGGTATTATAACGATACACGCTCATCATTTGCTCTGGCCAAAGACAAGATAATGAGTCACATTCGAAATTTTAAGGCATCGGAACTATGGGCGAGCCTGCCAATTTCACTCAAATGGCTTTGTGCGGGGCTTGCGTTGTGCACAGTGGGACTTCCTTTGCTATGGATCTTGCGGAAATGCCTGACAGCTGCGGCCAACGGACCGGCAACATTGGCACTAGCCCTTTTCACAGGTGCCAAAATGGAAGGGACAAGTTCTGGTGGTGATGAGCGGGTTCTGAGAGTGCGAGGGAGGCGTGTAAGAGCATTCATGCAAGGTTCCAATTCTACCACGGACATAGTATCCCCTGAGGCTATTGTGTCGATTCAGAAAGCTCAATGCTACATACAATGCCATACTCGATCTGGCAAGTACATGACATGTTGCGGATACTTTTCCGGTCCTCGCAAAATTACAACAACGACCCATGATATGGCAGAGGCTGATTTTACACGATTAATGTGCTTGGTGGATTTCGAAGGAAATTTTATTCACTGTGCCTTCAATCCAGCAAAATTCTTTGTGCCGCTAGAAAACGGGCGGAAAATGAATCTGTGCACCCTAGAGCTCCCATATACTGCTAACCCTCATCATAGTGTGGGTCACTTGAATAAGTACGATTTTATTCGTGGAATGCCTTCTCATTGCCAGGGATACGTGTTGCCAAATCTGAGAATGGAGAATGGCGAGATGATTAGGCAGGTAACCTACTCACCTGTCTTGCGATCAGAGGAAATTTTGGACGTTAAAACCGGAAAACACTGGCCTGCCACTCACTTATTTCAGGCAGCTCTGTCTCACACTGCGGGCTTTTGTGGAAGGTTGGCTTTGATAAAATCAGAGAGCGGGTATAATATTGTTGGGATGCATGTAGCTGGAACTACGATAATGGGGAAGGATTACTCGTACTTTAGCGAGTTGTTTGCCGCTCTAGAACCGGCTGTGGTTCACGCACAAGGAGAACAAATTGCTGAAACTATGATTTTTGAACATGAGAATCCCAAGCAACTCACACCAATGGTGTCCAAAATCGGCTATCTGAGCCGACAACTACCCAAACTTGAAAAGAGTCAGATAGTTCCAAGCCCCATTCATGGAGCTCTGACTACATTGTTCAGGCCACCTAATACCGAACCGACATTGCTTAAAGCTGGTGATCCAAGGGCCCCAATCTTCTATGACCCTTATGCTGAAGGAGTTGTGAAATTTGCTGAGGAAACTGGGCCATTTTCTTTGGAACCCCAATCTGATGAATCGATTGTTATGCAAGACATTCTCCACACATGGCGATCGCAGAATGCGCCACTGGCCCTACCCACTGTCACTTCACTAGAAATAGCAATAAATGGGCAAAATGGACTGGAATATGCCGAAGCTTTGCCCATTAGCACCGGAGAGGGTTTCCCGAGTATTTTGGAACGAAAACATGGCGAATCCGGAAAATTTCGATACTTTGAGGAAGCTGCCGACGGAACTCGCATTCTTCTGGATGAACCACTAGCGCGAGTTAATGAGATTGAGGCAGCGGCTGACACAGGTGATCTTGAAATATTCACTATAGCCTGTGCGAAGGATGAAAAGACTGCTATAAAGAAAGTGCGTGAGACTCCCAAGACCCGGATCTTTGAAATTTTACCATTTGAATTCAACATCGTCATTCGCAAATATTTTCTGTTCTGGATGCAGTGGATGATGAGCTTGCACAATAAATTACCGTGCAAAGTGGGTTTAAACCCTTATTCACAGAGTTGGGATTTGATGGCCCACAAACACTGTAAATTTGATCAACACTTTTGTGGCGATTACTCGGGTTTTGACACCGGCACCAATGTTGAGATAATGCTCAAATTTGCTGATTTGATAAGCGAATTTGCTGATGATGGGGATAGAGCTAAGAGAGTGAGGCGCAATTTGATGAAAGCAGCGGTCACCCGGAAGATGATCGTCGGAGCTGATGTCTATCGCATAAGAGGAGGAACTCCTTCAGGCTTTGCGCTAACGGTCATGATCAATTCACTGATGAATGAATTCTATCTTCGTCTAGCCTGGCGCAAATTATCTCCGCATGCTGATCTTCGAGGGAACTTTTTCTTTTCAAATCATGTTGTGATTTCTGTGTATGGGGACGACAATGTTGTTTCATTTAGCGCCGATGTAGCCCCATGGTACAATCTTGAAACGATAAG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| 51,843
|
NC_022365.1
|
Piper yellow mottle virus
|
Hany,U., Adams,I.P., Glover,R., Bhat,A.I., Boonham,N., Bhat,I.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2013-09-19
| null |
Badnavirus maculapiperis
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,562
|
RefSeq
| 1
|
India
|
India
|
Piper nigrum
| null |
2011
| null |
PRJNA485481
|
Piper yellow mottle virus strain ISH-1, complete genome
|
CTACATTGGTATGCGTTTTTAAGCGTTCGATGAACCACGTGTATCAATGAGACTTATCTAGGGTTTGATGATAAGGTTTGAGTGGGAGCGTCTTTTTAAAGAAGAATATTGAGCCTCGGGGAGCCGTATTCTCTTTTCTTTGTCAGAATAAAGAAGGTATCTTTATTCTCCACTTTGTTTTATCGTTTTGCGTCGGCTGTAAGTGGAAGCTGTCCTCTTCCCTCCACTAGTGTTCAGTGGAAGCCAGCTGTCGCGTGGATTCGAAGCTACTCTTCGAATTGAATCATAAGAGCTTGCCATCCGCGCCTATATAAGCAAGCATGATTCATTTGAGAAGGGCATCGAGTCTAGCATCGAGTCTGCATCGAGTCTAGCATCGAGTCTAGCATCGAGTCGCATCGAGTCGAATTGGATAGAATAGAATTGAGTCGAAGTGTAAGAGTGTAGAGTCAGAGGAAATCTTCAAGAGTTGTGAAGAAATCTTCATATCTGTAAGTTCTCTATTCAAAGTAACGGGTTTTAAGAATTTCTTGGTGTTTGATTCTTTATGTTCTGGTTTGTTATTACTACATCTCTCTTTTTGATCGATCTATATCTTACAAAGTACGCCGAATAGTGTTTGTGGTAAGGCTGAACAGGGTTGCTTAGGAGCGTAAGGTTGGCAGAAGCAGGAGGCTGATAAGACCAACTGTATCCTACCTAGGGACTACTGGTAAGGCTAAGTTATAAACACGACTTTTGTGTATGAGTGAGGTATTTGAGAGATCAATCGAGGATTGGTATAGCAAATCCAGGACTGCGAGGCTAGAACATCTGGATCTTGCTGAAGAACCTAAGGTTTGCAATAGGCAACTTGCGCACAATCTTTCTGTAGTTTTTGATAGAATTTCTCTTTTATCAAAAGTCACTTTAAAAAATTTTAAGTTAATTTTAGAACGTTTGAGTGAGTTAGAGTCAAAAATTGAGAAAAATACCATAAAAATTAAAAATATCCAAAAACCCCTCTCTGAGCAACAACTAGAAGCACTTGTCACCAAGCTTACAGCGCAGCCAAAGGAGATTGAAGAAAGAACTATCTGCCTAGCGACTGAGCTAAGGAAGGAAGTCTCCCAGCTGAAGTTGATGATAGCCAAGGTTGAAAAACTCTTATGAGCTATATCAACACTATCTCAACAAGTGCATACAAAGAAGCATTGCAGGCTACAGAACAACTTGAAGAACCTGCTCTAGGGTTTGTCAAGCCAAGAGACCACAACCGGGAAGGAATCCAGAAAAGTGTTACTGCTGTGACAAAGCAGAACAATACCTTAATCCAGCTTGTGGTTGATCTGCACGAAAAGATCAACACCCTAGAAGAGAAAATTGAAAAACTGAGGAAGGAGCCACCGCAGAGCACAGGTATCTCGGCTGATCTTGTTACTAAATTAGAAAATCTAACTCTACAGGATCAAGGTAAGAAGCCAAAGGAATCTCGAGGGAAAAGACTTGTCTTCAAAGACCCTCTCGAGATCATCAAAGCCGAAAAGAGAAAGCTCGATGGCCCAGGCCCAAGCAAAAACTCTGGTGGAGGACCAAATCACTCAATACAGGCAAAACCAGAGAAGGATGCATAACCTCAGGCAGGCGGTCAGAAGACTAACAAATTCTCAAGCATCCACCAGTGGCCAAGAGATTATTGAACAATCTCTAGATCCTCAGAAACAACTGATGAGGTCAATGACCCAGAGAGCAAGCATCGTACCAGCAGAAGTCCTCTACCATTCCAGAAAGGATGATGTAAATCACAAGGTTTACATCCACAGATCAGAAGAGGCACTATCTGTCACCGAGGGCAACCAAGTGGACAGGACATTCATCCAAGAAGAAAGCCACAAGAAGCTTGTTAAGAGTGGCATTAAGTTTATCCACCTGGGAGTTTTACAGGTACGATTGCAAATTCTGCACAGGAAGGAAGAAGGAACACTGGCACTTGTGGTGTTCCGTGACAACAGATGGAAGGGCGATAAGGGAATTATCGCTACTATGGAAGTAGACCTAACAAAAGGATGCCAAATGGTCTACATAATCCCTGACATAATGATGACGGTAAATGATTTTTACCACAATATTCATATATCTGTCTTAACCAGGGGTTATGAAGGATGGCAGCATGGGGAAGCCAATCTACTTGTGACTCGAGGAATGATAGGTAGGCTATCTAACACCCCAAATGTTGGATTCGCCTATGATATTCAGGAAGTGGTTGACTACTTCATCACTCATGGCGTGAATGCACTGCCCGGAGCTAAGTATGATACAACCAGACTACAAGGGCAGCAGTGGATTTTAAAGAAGCCCGAGCTCATTGTCCCGACTCGGCCAGGACACATCAATTCAAAGGACCTGGTCGATGGCACAATTTCCCTCCGCTTCTCAAATTATACCACACAGGCCAGCACGTCCAAGCTAAAATACAATGCAAATGATGAAGAAATCCAGTCAGATGAAGAGATCCTAGCTTACATCCACCAGGAAAGACAGGAGGTCACAACCCCTGAAGTTCTAGGAGTCATCAGACTGACCCCGGAAGCCAGACTACCGGTCAGAACATCTCCATCTGCGGCCGGATATAACCTGTTTGGAACAGAGAGGCTGGTCATTCAGCCAGGAGAAAGACAACTCCAGAGAACTGGAATCGCTATCAGAGTTCCCGAGGGACACTATGGAAGAATTGCAGCACGATCTTCGGCTGCATGGCAATTGGGAATTGTTGTAGGAGCTGGAGTCATTGATGCCGATTTCCAAGGTGAAATTAAAGTTTTGATATTTAATTTATCAAATTCACCCGTGGAAATTGAAGCAGGTGATGCAGTAGCACAGCTGGTGCTAGAAAGAATTTCGACCCCCTCACTCTCGGTATGGAGAGTCTTCACTGAAGAAACTGTCAGAGGCACAGCCTCCCCATTGGATGAAGACCTCCCGTACCCACAACTGCGCCAACAGCAAGATGACACGTCACCATTGCTGGCGGAAACGGGTGGACATCTACCCAATACAAATTACGAAGAAGAGGAGGCTATTTCACCAGCAGTTACTACCCCGGAGGATATTCAGGACGATCTCTACCAACATGACCTTGCAGCTATCAACACTGAAGGCCCAGTTTGGGACAATTCTGAAGAAGAAGAAGAAGGATACGCTGCAGAAGAAGAAGAAGAGATTGATGACATGGAATATCCCCATGTCAGGGCCCTTAGACTAAAGATGCAGGAGGTATTCTCAGCTCAATCTGAGATCTCACAATACCGTCCACCACAGGATACAGCTATGGGACCCTCTTCCTACCCACCGGCGGTCAATATCACCAATGAAGCAGGACCAAGCAGGCCCATGTTTGAAGGATACAACAAGTCTGGAGTCAGATTCAAGCATAAGGACCTCGCTGACAACTGGACTCTACCTTCAGCCCAGCAACAACAAGGAGCGGTATTTGTTATACCTACTCAATTGGGCTTATTTGACTCTGTGTTTGCTAGGTGGGAGTCCATAACCAAGAATTTAGTAGCAGCACAAGGCTTCACAGATCCAGCTGATAAGGTAGATTTTATTGAAAATCTACTCGGAGAAGCAGAAAAGCTAACCTGGATCCAGTGGAGGTCTACTTACCAAGCCGAGTACCAACAGATGATGAACTCAGCGGATGGGAGAGCAGGGACAGAAAACATACTGTCTCAAGTAAGAAGAATATTTGCTCTAGAGGATCCATCAACAGGATCAACAAAGATACAAGATGAGGCATACAGAGATCTGGAACAACTGACCTGCTCCAACATTAAAGACCTGGTACCATTCTTAAACGATTACCTTAGGCTTGCTGCTAAAACTGGAAGGATGTTTCTAGGTACAGAGCTTTCTGAGAAACTGTGGATGAAGCTGCCCGGGAACCTTGGAAGAAGAATTAAGGAAGCATTTGACAACAAGTACAAGGGAAACGAGGCAGGAGTAATCCCCAGAATCTTATTCACCCACAAGTACCTAGAGGATCAATGCAAGGAGGCAGCATTCCAAAGATCACTGAAGGGAATGACTTTCTGCAACAGCATCCCTATTCCTGGCTATTACTCAAAGGAAAAGAAAATGGGAGTAAGGAGGAGCACTACTTACAAGGGAAAGCCACACTCCTCACATGTCAGGATTGAGAAGAGGAAGCACCTCCTGAGAAACAAGAATTGCAAGTGCTACTTATGCGGTGAAGAAGGGCACTTCGCTAAAGACTGCAACCGGAATAAGAGAGACATTCGGAGAGTTGCTATCTTTGAAGGTTTGGAACTTCCGGAGGACCATGATGTTGTATCAGTCTCAGAAGGAGAGGATGACTCCGACGCCATATACTCTGTATCTGAAGGTGAGGATGGCTCTATTGCAACCATGACCCATTATATTAATGTGTTTTTCGAAGAAGATAGAACATACTGGGTCGGAAAGGCAGGATCATGGCAACCCATGATCAAGGTTACACAGAAGGTCCACGACTGCCAGCACTGCTGGATGGAGAACACTGATGTCCCAAATGACGGACCTATTCAATGCCTGTGTTGCAAGAGGAATTCACAAAAGAATTTCAGGATACACTGCCCAATCTGCAAGGTAACCTCTTGTGGTTTATGTTCAACTTTCTGTTTTGACAAGAGTATTCAGGTCAAGAAAGAGTACGTCGCACCATACAATCCTCGGAATTTACTGGAAGAACAGCAAAGATATATCGAATGGTGTGAACTGGAAATGAAAAGGCTAAAGGAGTCCATAATCCAAAACGATGAGTTAAGGATGGAAAATGATAGACTCCAGCTTGAAAACCGAGACCTGAAGAGGCAGATTGAAAAGCTGCAAGATAAGCAGAAGATGAAGGCCTTAATGGAGGACCTTGGCGAAGAATTTGACTATGAGGAAGAAGTTAATGTTCTAGTTGAAGACTGGGACAACAAAAGAGTCACTAAGGAATTAGATGACCTGGAAGCTGA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| 6,796
|
MW116777.1
|
Piper yellow mottle virus
|
Boari,A.J., Blawid,R., Pantoja,K.C., Kauffmann,C.M., Quadros,A.F., Nagata,T.
|
Embrapa Amazonia Oriental
|
Brazil
|
2021-07-04
|
Para
|
Badnavirus maculapiperis
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,591
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
| null | null |
2017-04-06
| null | null |
Piper yellow mottle virus isolate Para, complete genome
|
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| 40,759
|
MF996373.1
|
Piper yellow mottle virus
|
Che,H.
|
Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Environment and Plant Protection Institute
|
China
|
2018-08-01
|
WN11
|
Badnavirus maculapiperis
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,573
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Piper nigrum
| null |
2017
| null | null |
Piper yellow mottle virus isolate WN11, complete genome
|
CTACATTGGTATGCGTTTTTAAGCGCTCGATGAGCCACGTGTATCAATGAGACTTGTCAAAAGGATGAAGATAAGATTTGAGTGGGAGCGTCTTTTTAAAGGAGAATATTGAGCCTCGGGGAGCCGTATTCTCTTTTACTTTGTCTGAATAATATTCGCCACTTTGTTTTATCGTTTTGCGTCGGCTGTAAGTGGAAGCTGTCCTCTTCCCTCCACTAATGTTCGGTGGAAGCCAGCTGTCGCGTGGATTCGACGCTTCTCTTCAAATTGAATCATAAGAGCTTGCCGTCCGTGCCTATATAAGCAAGCATGGTTCATTTGGAGAAGGCATCGAGTCTAGAAGAGGTCGAGTCTAGGAGCAGCGAGTCGTAGAGAAGTGTAGAAAGAGTCAGAAGAAATCTTCGAGAGTTGTGAAGAAATCTTCATATCTGTAAGTGATACTATTCAATCAAGGGATTTCAGAATTTCTTTGGTGTTTTGATCTTTTTGGTTCTTGTTTGTTATTACTATTTCGCTCTTTTGATCTATCGATAACTTGCGAAGTGCACTAGATAGTGTTTGTGATAAGGTTGAACAGGGTTGCTTAGGAGCGTAAGGTTGGCAGAAGCAGGAGGCTGATAAGACCAACTGTATCGTACCTAGGGACTACTGGTAAGGCTGAGTTGCAAACACGATTCTCGTGTATGAGCGAGGTATTCGAGAAGTCAATTGAGGATTGGTATAGCAAATCTAGAACTGCGAGGCTTGAATATCTTGATCTTGCTGAAGAACCCAAGATTAGTAATAGTCAGCTTGCCCACAATTTGTCTGTAGTTTTTGATAGAGTTTCTTTACTTTCTAAAGTTTCTTTGAAGAATTTTAAGTTAATTTTAGAACGTTTGAGTGATTTAGAGTTAAAAATTAAGAAAAATTCTATAAAAATTAAAAACATCCAAAAACCCCTCTCTGAGCAACAAATCGAAGCACTTGTCGCCAAGCTAACATTGCAGCCAAAGGAGATTGAAGAAAGAACCATCAACCTAGCAGCCGAGCTAAGGAAGGAAGTCTCCCAGCTGAAGTTGATGCTTGCAAAAGTTGAAAAACTTTTATGAGCTACATCAACTCTTCTGCATCAAGTGCATACAAAGAGGCGTTAAAGGCAACTGAGCTACTTGAAGAGCCTGCTCTAGGCTTCATAAAGCCAAGAGACCACAACCGGGAAGGAATTCAGAAGAGTGTTACTGCCGTAACAAAGCAGAACAACACTTTGATACAACTGGTGGTCAGCCTGCACGACAAGATCAACAACCTAGAGGAGAAAGTCGACAAACTGAGGAAAGAGCCATCTCGGGAATCAGGTATTTCTGCCGATCTCATCACGAAATTGGAGAACCTGACATTAAGAGAAAAGGAGAAGCCAAAAGAGGTGAAGGGAAAAAGACTTGTCTTCAGAGACCCTCTTGACATTATCAAATCCGAGAGAAAGAAGCTCGATGGCCCAGTCACAAGCAAAGACTTTGGTGGAAGATCAGATCACTCAGTACAGACAGAACCAAAGGCGGATGCACAATCTCCGACAAGCAGTTAGGAGATTAACAAATTCCCAGGCATCTACAAGCGGCCAAGAGATTATTGACCAATCTTTAGACCCCCAGAAACAGTTGCTGAAATCCATGACGAAGAGAGCCAGCATCGTACCAGCAGAAGTCCTCTACCACTCCAGAAAGGACGATGTAAATCACAAGGTTTACATCCACAGATCAGAAGAGGCACTATCTGTTACTGAAGGAAACCAAGTGGACAGAACCTTCATCCAGGAAGAAAGCCACAAGAAGCTTGTCAGAAGTGGCATTAAATTCATTCATCTTGGTGTTTTACAGGTACGACTGCAGATTTTACACAGAAAGGAGGAAGGAACACTAGCGCTGGTAGTGTTCCGAGACAACAGATGGAAGGGCGATAAGGGAATTATCGCAACCATGGAGGTGGATCTAACAAAAGGATGCCAAATGGTCTACATAATCCCTGACATAATGATGACGGTAAATGACTTTTACCACAATATTCATATATCTATCTTAACCAGGGGTTATGAAGGATGGCAACATGGGGAAGCCAACCTACTTGTCACTCGAGGAATGATTGGTAGGCTATCCAACACTCCAAATGTTGGATTTGCCTACGATATACAAGAAGTGGTTGACTACTTCATCACACATGGCGTGAATGCACTGCCCGGAGCAAAGTATGACACAACAAGATTACAAGGGCAGCAGTGGATATTAAAGAAGCCGGAGCTCATTGTCCCGACTCGGCCAGGACACATCAATTCAAAGGACCTGGTCGATGGAACAGTTTCCCTCCGCTTCTCCAACTATACCACACAGGCAAGCACGTCCAGGCTAAAATACAATGCAAAAGATGAAGAAATCCAGTCTGATGAAGAGATCCTAGCATACCTCCACCACGAAAGACAGGAGGTCACAACTCCTGATGTTCTAGGAGTAATCAGACTCACCCCGGAAGCCAGACTACCGATCAGAACAGCTCCATCTGCTGCCGGATATAACCTGTTCGGAACAGAGAGGCTGGTCATTCAGCCAGGAGAAAAACAACTCCAGAGGAGAACTGGAATCGCCATAAGAATTCCCGAAGGACACTATGGAAGAATTGCAGCACGATCTTCTGCTGCATGGCAATTGGGAATCGTTGTCGGAGCTGGAGTCATAGATGCCGATTTCCAAGGTGAGATTAAAGTTTTGATATCTAATTTATCTAATTCACCCGTGGAAATTGAAGCTGGTGATGCAGTAGCACAGCTGGTGCTCGAGAGAATTTCCACCCCCTCACTCTCGGTATGGCGAGTCTTCACGGAAGAAACTGTTAGAGGCACAGCCTCTCCATTGGATGATGACCTCCCATACCCACAATTGCGCCAACAGCAAGATGACACGTCACCATTGCTGGCGGAAACGGGTGGACATCTACCCAATACAAATTCTGAAGAGGAGGAGGCTATATCACCAGCAGCTACTACCCCGGAGGATATCCAGGACGATCTCTACCAACATGACCTCGCAGCAATCAACACAGAAGGCCCAGTCTGGGACAACTCTGAAGAAGAAGAGGAAGGATATGCTGCAGAAGAAGAAGAAGAGATTGATGACATGGAGTATCCACATGTCAGGGCCCTAAGACTAAAGATGCAGGAGGTATTCTCAACTCAATCTGAAATCTCACAATACCGACCACCACAGGATACAGCAATGGGACCCTCTTGCTACCCACCGGCGGTGAATATCACCAACGAAGCAGGACCCAGCAGGCCCATGTTTGAAGGATACAACAAGACAGGAGTCAGATTCAAGCATAAGGACCTCGCTGATAACTGGACTCTACCTTCGGCCCAGCAACAACAAGGAGCGGTATTTGTTATACCAACTCAATTGGGCTTATTTGACTCTGTATTTGCTAGGTGGGAGTCCATTACCAAGAATCTAGTAGCAGCGCAAGGCTTCACGGATCCAGCTGATAAGGTAGATTTCATTGAAAATCTACTCGGAGAAGCGGAAAAGCTAACATGGATCCAGTGGAGGTCAACATACCAAGCCGAGTACCAAGAGATGATGAACTCAGCAGATGGAAGAGCAGGGACAGAGAACATACTGTCTCAAGTCAGAAGAATATTTGCTCTAGAGGATCCTGCAACAGGATCAACAAAGATTCAAGATGAGGCGTACAGAGATCTGGAACAACTGACCTGCTCCAACCTTAAAGACCTGGTACCATTCTTAAATGATTACCTTAGACTTGCTGCTAAAACTGGAAGGATGTTCCTAGGTACAGAGCTATCTGAGAAGCTGTGGATGAAGCTGCCCGGAAACCTTGGAAGAAGAATCAAGGAAGCATTTGACACCAAGTACAAGGGAAACGAGGCAGGAGTAATCCCGAGAATATTATTCACCCACAAGTACCTAGAGGACCAATGCAAGGAGGCTGCTTTCCAAAGATCACTGAAGGGAATGACTTTCTGTAACAGCATTCCTATTCCCGGATATTACTCCAAGGAAAAGAAGATGGGAGTAAGGAGGAGCACTACATACAAAGGAAAACCACACTCCTCACATGTCCGGATTGAGAAGAGGAAGCATCTCCTGAGAAACAAGAATTGCAAGTGCTACCTATGCGGTGAAGAAGGGCACTTTGCTAAAGACTGCAACCGGAATAAGAGGGACATCCGTAGAGTTGCGATCTTTGAAGGATTGGAACTTCCGAAGGACCATGACGTTGTATCGGTCTCAGAAGGAGAGGATGACTCCGACGCCATATATTCTGTATCTGAAGGTGAGGATGGCTCACTTGCAACAATGACCCACTTCATTAATGTGTTCTTCGAAGAAGACAGGACATACTGGGTCGGCAAGGCGGGATCATGGCAACCTATGATCAAAGTCTCACAGAAGGTCCATGACTGCCAACACTGTTGGATGGAGAACACAGATGTTCCAAATGAGGGATCCATCCAATGCCTTTGTTGCAAGAGAAATTCTCAGAAGAATTTCAGAATCCACTGCCCGATCTGCAAGGTAACTTCCTGTGGCTTGTGTTCAAAGTTTTGCTTTGACAAAAGTATTCAGGTTAAGAAGGAATACGTCGCACCATACAATCCTCGGAACTTACTGGAGGAACAACAGAAATACATTGAATGGTGTGAACTGGAGATGAAGAGACTGAAGGAGTCAATCAACCAAGATAAAGAGCTGAGAATGGAAAATGAAAGACTCCAACTGGAGAATCGAGACCTGAAGAAACAAATACTCAAGCTACAAGAAGGACAGAAGATGAAGGCTCTACTGGAAGACCTTGGAGAAGAGTATGACATGGAAGAAGAAATCAACGTCCTAATCGAAGATTGGGATAGTGAGAAGGTCAATGAGGAGCTGGATTCTTTGGAGGCAGGGATTAACAAGGTAGGAGTGATAATCCCGGAAGAGAAGGTATGCATCAGCAAGGAAGGAGAA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