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|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MK460230.1
|
Porcine astrovirus 2
|
Lv,S.L., Zhang,H.H., Li,J.Y., Hu,W.Q., Song,Y.T., Opriessnig,T., Xiao,C.T., Lv,S.-L.
|
Hunan University, College of Biology
|
China
|
2019-08-12
|
PoAstV2/CHN/WG-R2/2017
|
Porcine astrovirus 2
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,422
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2017-11
| null | null |
Porcine astrovirus 2 isolate PoAstV2/CHN/WG-R2/2017, complete genome
|
CCAAATGTTTGTGTTGGTGCCGCTGGCCCATACCTGGACTGTGAGCCATGTCACTCTACCTTAACCGTGCCGATGAGGCACTGGCAACCCAAGACAGCACCCAGCTCAAACCACGGTTTGATGCTCGGGAATGGTTCGACGAGTTGCGTGCAATTGGACCCAACCTTCCGTGGTATATCACCTACCAACCGCGGATGTTGTTCTTCCCGACTCTTCGACCAGACCGAGTTTTGACCGCGAGTACTGTCTGTGAGGGAGAATGGCGAACCTTCCACCTGGACATCTGTGGTGGGAAGCATGTGGCTGTCGAGGTCAACCATATACCTGACCACCAGCCAACCATCCTTGCCGCCGCCCTCATGGCAGATAGAGCTGAGAAGGCCCGAACAATCTCCGAGCTACGACTGGACAACGAAATACTGAGAGGACAGATTGCCGTGTTGAGACAAGAACAAGCCTCCACGCCCAAATTTTCCCTCAGTTGGTCAACCATATTTGCACTCGTTTTCCTTGGGTTCTCTCTGTTCTGGCACTCTGCACATGCGCTGACAACAACTTCAACCACTCAGTCCGTCAATCCAATCCGCATCTTAGAGCTGAACAAGTGGCTTGATGACTTTATTGAGAGGGCGCAGAAGGTGATACACACTCACCATTACACTGTTGTTAACACGGTTAGATCATCACCATCGTGGCTTCTTGCATCTGCCGTCATACCCCATCTATGGCAGATTGTGGCCATTGCGCTGAGTGTGATCACAGTGTATAAGGCTGAGCATCGCGTCATTTCAATTCTTTTCATTGCCGCTGCATCCATGAGCGGAGCTGACTGGTTGTTTCTCGCAACTGCATCTATGCAAACCATGCTCAGTGCCATCGTCCAGATAGTGTGCGTTGTCATTTCGCACATTGACCCAATTGGTGCCATCTGTGTCTCAGCTTTGGCGATGTTCGGGACGTTTCTAGCCAGCATGTGTGCCACCAACACCACTTTTATCCAGCAATCGCGTGCAGCGTCTATCAATACTGCAACCCTAGTGGTAGCGATTGTTCTTAGGACCCTGGGCCTACCATCCATGCCCCTGGCCCTTGGCCTTGCTATCGTTCGTGCCTATACCATCTTAACTACTCCCACGGGCACTACAATAGAGGTCCGTGGTGAGGATGGCAAGGTCTTAAGCAAGGACCCTGTTAAACCTGGCATTCTCTTTAGGTTTAAACAATCACTCCGCAAGAAGTTTGCCCAGCTCCGATCCACGATGCCACCATTAGTCAGAGTTAACCCTACAGCTGTGGTCAGGATTGAGACATCTGATGGGATCGGGACTGGCTTCTTTTGTGGGAACCATATTGTTACCGCAGGGCACGTACTTGGGCCACATAAAGTAGCCTCAATTTGTGTTGGAACCGCAAAACATCAAGCAACACTGGTCCGCCATGTTGAAGGGAAGGATATCGCTCTGCTTAAGATCCCGCCTCAACTTCAAAATTACCCACGACTCAAGATCGCCTCAAAGATTGAGACCGACTGGCTTTGTGTCTATTCACCTGAGAATGACGGTGCTATTATTCAATCAGTGGTGCCGGGTCATCAGGTAGAGGATTGCCTCGACTATGCTGTCCCAACTCGAGACGGTATGTCTGGTGCGCCAGTCGTGAATGTCGATGGCCGGGTGATGGGGGTTCACTTAACCAACACAGGTTTCACTGGGGGAGCTCAAATCATCACCCTCCAGGATGTCACTGACCCCCCTAAATCCACCCCGACCGAGGACAAGTTGAGACAAGAGCTTGAGGACCTCAGGAAACAACTGGCTGGCTTTAAACAATCTACTACCAGCGCAGACATCGTGGGACTTATAAGAGAGGCCATGGCTCGTGAAATGACGATCCTTCGTTCGGAGTTAAATAAGGAACTGGCAGCGGTCCGTGATGAGCAGGAAACCTTCTCACAGACTAAGAAGGGCAAGACCAAAAGAGGCCGCGGGCGCATCAAGTTAAGGCTTGCTGGTGCCACTAGGCGCAAACAGCGAGGGCCTGTCTTCACAGAGCAAGAGTACCAAGAGCTACTCGACCAGGGTCTGACTCCTGATGACATACGTGATATGGTGGATCAGCTCTATGAGGAAGAAGTCGCAGGCTTTCCAGAATGGGAAGAGTTGAGTGATGGTTATGACCCAGACCAGGACTGGGAGTTCGAATCTGACTCCGATTTTGGGCAGAAAAAGATCACTGTTAAGTCCTTTAAACAATATCTTGAGCGGGACTATGACCCAAAAGACGTGGAGAGCATGTTGAACTCCCTTACCATGGCTGATGTTGACGCTATTGGGCCACTCTATCCCATGGTCGCCAAGTGTAAAGCAACACCACTCTGCTCGGCGCTCTTGTGTCTAGTTGATCGCTACGCTGTGTCTAGTGGTCTATCACCACCCTCTCAAGGCATGCGCTATACCCAGCGTCGTGTTCCAAAAAACGAGAAGCGGGCCCAGAACCAGCGGGCCCGGAAATCCACAAACTAGACGCTTGGGAAGCCCTGCGCCTACCACCGCGCAGGAGGCTAGTGCCGGACAACTACCCAGTTGTCTGTAACCTTCCAATTGATAGGCCCATCTTTGACACTAAGCTAGCTGATGACCCTCTACTTGGCCTTTTACCACCATGTGACCCGGACCTTCCTTTCGGACCAGCCGTTTGGGGACCTGAGGCGTACACCAAGTCCTTTGAGAAGTTCTACTACGCAGAACCATCAAAGTTTTGGGAAATCTTCCCCGAGGAGTGTGCTTTCGCCGACAAACAATGGCGCAGACACTACAACTTCCTTGAGGACTCCCGAGTTATCCATATAACCTCAACAGACAAGAACATGGAATCAACACCAGGGTATCCAAAATGTGAGGTGTATGAGAGTGAGCGGGATTATCTCGAAGACAATGGCTGGGGACCCTACATCAAGGAGTTCAAGCGCGTAGATGCTGGTGAAAAGCCCAAGGTCCTCTGGTACTGCTTCCTCAAAAAAGAACAGCTCAAAAAAGAAAAGATTAAGGACGGGGATATACGGCAAATAGTCTGCCCCGATTCAATCTACTCTAGGATTGGAGCTGCTCTTGAACAACACCAGAACAACCTCATGAAAAAACACACCGAGGATAGCAGTGGTCAGTGCGGCTGGACCCCGTTTTTCGGGGGTTTCGAGAGGAGAATGCGAAAACTCGACCATGGGCACATCATCGAGTTCGACTGGACTCGTTTCGATGGGACTATACCTAGGGCATTATTAAAGCACATTAAAGACCTTCGGTGGGAGAAGATGAATAAAGCACATAGGGAAAGATACAAGCATGTCCACGATTGGTACGTGGAGAATCTCCTAACCCGCTACGTGCTCATGCCCTCCGGGGAAGTCACCATTCAACGCCGAGGTAATCCGTCAGGGCAAATCTCAACAACCCCAGACAACTGTATGGTGAACTTCTGGCTTCAGGCCTTCGAGTTTGCCTACCTCAACAAGGGGAAAGACGTTGACAACCTCTGGAAAGACTATGAAACCATCGTCTACGGGGACGATAGGCTTACTTCAACCCCTTGCATCCCTGACAATTACGTCGAGCGTGTGGTCGAGATGTACAGAACAGTCTTTGGTATGTGGGTCAAACCAGAAAAGGTCAAAGTTACAAACACCATCAAAGGGGCATCCTTCTGTGGATTTACAGTCGGGGACAATTATCAACCAATTCCATCAAACCCCGATAAGCTCTGGGCAAGCCTGGTCACACCTTGTCAGAAACTACCTAATGAATTAGCCCTCTATGGGAAACTCCTTAGCTTTAAAATCCTGCTGCACAACATGGAAGAACATCCTTTCAAGGAATATGTTGAAAAGTGCCTTGCTGCCCTTGAGACCGGGCGCACCTTGCCTAAAATCACTGATGAGCAGCTGGATCGTCTTTGGAGGGGAGGACCAAAGACAGCATCTAATGGCTAACCGCCAGCAGAAGCGTGCTCCACGCACTACGACCAACATCGTGGTGCGCAATGGATCAGCTGCCACTCAGGCGAGGGCGTCTGGCCCGGCAGCAAACAATAGAAGAAGGAGAAACAGAGCAAGGAGAGGACCGCAAGTCAACGTGCGGGTGTTATCCAACAAAAATCAGGCTCGCAGGAGAGCTCCCAGGTCTCAGGACCTCGGTAACCGTGTGGTTGTCCAGAGGATTGTCACGACTCTCGGGACGGTCGGGGCGAATGGGTCAGGCCAGATAGAAACCGAGCTGGCTGTGTTACTTAATCCCAGCACCATGAAGGAGGCTACTGGTAGCAACAACTATGGCCCGGTGCAAATATATGCTTCAACCTACTCCCTATTCCAGATACGTGCTCTCAAGTTACACCTTAAGCCACTTGTTGGCAACTCTGCCGTATCTGGCACTGTGGTCCGTATGTCCTGGAACCCAACCAACAACCCAACCCAGACCTCATGGTCCGCTCTGGGTGCATGTAAACATTCCGATGTGACCCCAGGGCGTGATGGCCGCTTCACGCTTACAGCGCGTGATCTAGCGGGTCCAAAGGATGGTTGGTATAGGACCAACACCAAGGGGGAGCCTATGCTCTCTTTCGCAGGATCACTTGAAATACACACTTTTGGAGAAACTAGAAGCACCTACCAAAATGGCCAATACACAGGAAGCCTTTTCCTTGCAGAGCTTGAGGTGGTCTGGGCATTTAAGGACTATAGCCAGCAACCTGGTCTCATGAACCTTGTTAAGGGTGATAGCACTGGGGATGCCACTGTCTCCACAGATGCCAATGGAAAGCTCATACTCACCACCCCCGCCAATACAGCTCTAGCACGTGCTGCTGCAACAACTACAGCAAGTGAGATCATTTGGATGGTCACCGATGCAGTGATACAGGGAGCCGCGGTCGCCTTCCCACCTCCCTTCAGCTGGTTGCTGAGAGGGGGATGGTGGTTCTTAAAACGCATTGCTGGTGCACCAACTCGCAGCGGAGTGGAGACTTTCGAGATCTATTCTTCCATTAACGATGCTAGAGCAAATGTTCCCTGTATTGCTGACACCACCAATCAGCGCCCAATAAGCATCGGGCAGTTGCATTTCCAGCAGATAACCCCGGGCAACACAGGAGTGTCAACTGGAATACCTCAAGCCAGGCAACTGATTGAGCGCTTTTACCCCCATGATAAGATCTTTGTTCCTATCAGCACGAAAAGACTCAAGTTCAATACCACCAACGAGTGGGTGCCAGGCTTTGACGTCTGGTACCATACTCAAAATGGAGTCCAAAATCCGCAAACTGGACTAGCCTTCTTCGCTGATGGGGAGTCGCGAGCGACTTATAATGTCATGGAGGTTAAGCTATCAGAGGACATTGATGCCAATAAATTTGAGTCTAAAATTTCTATCTATTTGAAAACAGGCAACAACCAGACATCAACTACAGCCGCGCTCATCGGTTTTGCAGTGGCAAAATCCTCATCCACACTTGCTGGCAACAATACTTGGAGGGTAGACACCTTTTTGGTTTATTGTGCTAACAGGGTACAGCACAACTTTGATCAGAGGTGGAAGGGGTCAGTTATGCGCTACCCTGTTGATCAGACGTATGAGGCCAGGCTTTCAACACCAGAGAACTCAGCACAAGGCTTTGTTCGCATTCAGATGGAGCCTGGTAAATGGTATGCCATACAGTTTACCTGCCTCACCACTAGCGCCGACCCAAACCCCCAGCAACTTAGTTGCGGAGGTGAAATTGTGGGCGTCTTTCCATCACGCTCCACCCTGATCACTGGGAATCACACCTTCCCGGTCACTGACTTTGATGGCGATTCATCGCTTGTTCCCGTTTATGGGGCGGGAATTGCATTCACACCTTTCCTTAGCAATGAGATCAATGTGGTGCGTTTGCAAACCCCCACAATTGGCGATGACCGCCATCCCAGTTTTGGGTGCGATGATGCCTGTGAGGAACCCTACTACAGCCAGGAAGAAGAAGACAATGAGGATGAACTTCCCGAACCTCCTGCCCACTTTGACTTTGACTCAGACCTGGATGATGATCAAGACCTTGAAATGGGGCCAGAGGATCACTATTCCGATCCACCAATATCCCGGTTGGTGGTTCGTGATGATGCGTTCGCCCTGTATGAGCAACTTCGTGCGACGCATACAGAACGGGCAGCCCGCTTGGCAGTAAATCAGCTGTTTCCAAGCGATGAGTACACCGAGTTCACCGCGGTGTACCATGACGCGTTAGCTGATGGCCTATCACCTAAGGAAGCTAGAGCTCAAGCTTTGGGTTTTTAGGATGGCACTCGCGTCATGTAAAATTTAATCATTTTTCAGTTTCATTTGTGATTTGATTAGCATAGGTGAAGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 60,325
|
MG930777.1
|
Porcine astrovirus 2
|
Tassoni,L., Zamperin,G., Schiavon,E., Vendramin,V., Cavicchio,L., Mion,M., Tonon,F., Monne,I., Beato,M.S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie, Diagnostic Virology Laboratory
| null |
2018-12-02
| null |
Porcine astrovirus 2
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,396
|
GenBank
| null |
Italy
|
Italy
|
Sus scrofa
|
feces
|
2015-11
| null | null |
Porcine astrovirus 2 strain DIAPD5469-10, complete genome
|
GTCCAAATGTTGGTGGTGGTGCCGCTGGCCCACATACTGGTTGGAGAAAGCATGTCTCTTTTCCTGAACCGTGCCGATGAGGCACTGGCATCTAATGACAGCACCCAGCTTAAAGCCCGGTTTGACGCACGGAAATGGTTTGATGAACTGCGTAGGATTGGACCAAATAAACCTTGGTATATAACCTACCAACCTCGCATGTTCTTTTATCCAACTCTCAAGCTTGACCGTGTGTTGACCGCGAGTACCGTCTGTGAGGAGGAATGGCGCACGTTTGTGTTGGACATGTGTTGTGGTGTCTATACTGCTATCGAAGTCAACCACATCGAGGACCATCAACCAACCATTCTTGCTGCCGCCCTCATAGAGGACCGAGCTGCAAAGTCCCGCACCATCTCCGAACTTCGGCTAGACAATGAACTACTTCGAGGGCAGATTGCTGTGATGCGTCAGGAACGAGCGGAAACACCACGCTTGGCGCTCAACTGGACAACGATCTTCGCCCTGGTGTTCTTCGGCTTCTCACTGTTTTGGCACTCAGCAAACGGCCTGACAACCACATCGACAACCCAGTCAGTAAACCCCATTAAGATCTTGGAGTTGAATGAGTGGCTTGATAATTTCATAAACAAAGCCAAAAATATCATTCACACCCATCATTACACGGTTGTCAATACTGTGAGACAATCTCCCTCGTGGTTGCTCGCCTCGACCGTACTGCCCTATCTTTGGCAAGTTGTGGCAGTTCTGCTTAGCATTATCACAGTTTACAAAGCCGAGAACCGCATCATGTCACTCTTGTTCCTAGCCGCAGCCTCCCTTAGTGGAGGGGACTGGATCTTCCTTGCCAGTGCATCATACCAGACGCACATCAGTGCTGCCATCCAGATTGCATGCGTTATGGTCTCCCACCTTGACCCTATAGGCGCGATATGCACTTCAGCACTCGCAATGTTCGGGACTTTTATCGCCAGCATGTGTGCCAGTAGCACCACCTTTATACAGCACTCAAGGGCAGCATCATTAAACACCGTTGTGCTTATACTCTCCATAATCTTAAGGACAATGAAGTTACCATCACTGCCCATTGCCATCGCCCTCGCCATCGTACGTGCGTACGTTATACTAACTACCCCAACAGGTGCAACTGTGGAGGTTCGGAGTGAGGATGGTAAGGTTGTACAAAAAGAAACCTTACGCCCAGGCTTGCTTTTCCGCTTTAAACAACGCCTGCGGAAGTTTGCTCAACTTCGCTCCGACATGCCGCCGCTTGTCCGGGTCAACCCCTCTGCGGTTGTGCGAATTGAGACACCAGACGGTACAGGTACTGGGTTCTTCTGCGCGAACAACATTGTGACCGCAGGGCATGTTGTTGGACCACACAAAGTTGTATCTATATGTGTTGGTAACTCCAAATTTCAAGCAACCCTCGCACGACACATTGAGGGTAAAGACATCGCCCTGCTAAAGATACCACAGCAGCTGCAGAACTACCCACGTCTGAAGATTGCACCCAAGATAGACCCCTCATGGTTGTGTGTCTACTCACCAGATGGTGATGGTGCCATGATACAATCTGTGGTACCTGGGCATCAGGTCGATGACTGTCTCGATTATGCCACACCAACACGCGATGGGATGTCAGGTGCCCCCGTTGTGAACCCTGACGGACGTGTGATGGCAGTCCACCTCACTAACACCGGCTTCACCGGCGGTGCTCAGATCATTACTCAGTCCGATGTCACTGAACCACCTAAGGTCACACCAGCTGAGGAAAAACTTAGACTTGAGGTTGAGGAGCTTAAAAAGAAACTCGAGAGCTACACTCAATCCAGCGCTCAAGGTGACATCGTGGGATTGATCCGTGAGGCAATGGCACGTGAGATGACCATCCTTAGGAAGGAGCTTAATAAAGAACTTAGTCTTATGGTCCAAGAACAACAAGAGGGCTTTTCTCAAACCAAGAAGGGTAAGAACAAGCGTGGCAGAGGTGCACGCCTCATGCGGCTCGCTGGCGCTAAGAAGCGCAAGCAGAAAGGACCCATGTTCACTGAGGAGGAATACAACAGACTTCTCGAACAGGGCTTGACCCCTGAGGAGATCCGTGACATGGTTGACGAGCTGTATGAGGAGGAGGTCGCCGGCTTTCCAGAGTGGGATGAGATGAGTGACGGGTACGATCCTAATGATGACTGGGAGTTTGAGTCTGACTCCGATTTCGGACAAAGGAAAATGAAGATCGCCTCATTCAACCAATACCTTGAGAGGCATTACAATCCAAAGGATGTCCGGAGCATGTTGGATTCATTGACTCCAGCTGATATTGAAGCCATCGGCCCACTCTACCCGATTACCATCAAGTGCTCCAACCCGGAGCTCTGCTCTGCTCTGCTTTGCCTCATTGATCGCTATGCTGCATTAAATGGTCTGTCACCACCTACACAGGGACTCACTTACACCCAGCGTCGTGTTCCAAAAAACGGGAAGCGGGCCCAGAACCAGCGGGCCCAGAAATCCACAAATTAGACGCATGGGAGTCCCTGCGCCTACCACCGCGCAGGAGGTTGGTACCAGAAGAGTACCCTGTCGTTTGCAACCTTCCGATCAATAGACCCATCTTTGACACCAAGTTAGCAGATGATCCACTCCTTGGCTTGCTACCACCATGTGACCCAGACCTTCCTTTCGGACCTGCCACGTGGGGCCCAGAAGCGTACACAAAATCTTTTGAGAAATTCACGTACGCACAACCATCTAAATTCTGGGAGCTCTACCCTGAAGAGTGCGCGTTCGCCGATAAACAATGGCGGATACATTACAACTTCCTGGAGGACTCTCGAGTCATTCACATAACATCAACTGACAAGAACATGGACTCGACTCCGGGTTTCCCTAAGTGTGAGGAATATGAAAGTGAAAGAGACTACCTCGAAGCCAACGGCTGGGGGCCTTACATCAGGGAATTCAAGCGCATTGACTCAGGAGAGAAGCCACGCGTCCTCTGGTACTGCTTCCTCAAGAAAGAAATACTAAAGAAGGATAAAATCAGGGATAATGATATACGCCAAATCATCTGCCCCGACGCAATCTACTCACGTGTTGGGGCTGCCCTTGAACAACACCAGAACACTCTCATGAAGAAACACACCGAGGATAGCAGCGGCCAGTGTGGCTGGACACCCTTCTACGGCGGGTTCGAGAGAACGGTAAGGAGGCTTGACCGCAATAACATCATTGAGTTTGACTGGACACGTTTTGACGGCACTATCCCCCGTGCCCTCTTCAAGCACATAAAAGACCTTCGTTGGGAGAAGATGAACAAAACACACAGAGAAAGATACAGACACGTACATGACTGGTACGTTGAGAACCTCCTGACAAGGTACGTGCTCATGCCATCTGGAGAGGTTACAATCCAACGTCGGGGAAATCCATCAGGCCAAATTTCAACCACCATGGACAACAATATGGTGAACTTCTGGCTTCAGGCCTTTGAGTTCGCTTACCTAAACAAGGGCAAAGACATTGATGCCCTCTGGAAGGAATATGACACCATTGTCTATGGTGATGACAGGCTCACAACAACACCATGCATACCTGATGACTATGTGCCACGTGTCGTGCAGATGTACAAAGAAGTGTTTGGAATGTGGGTTAAGCCCGAGAAAGTTAAGGTCACAAAAACAGTTAAGGGAGCATCATTCTGCGGGTTCACAGTCGGGGATAATTACCAACCAATTCCATCTAACCCTGACAAGCTCTGGGCAAGCCTCGTCACACCCTGCCAGAAATTGCCAGATGTAACAGCCCTCTGTGGGAAACTCCTTAGCTACAAGATCTTGCTGCACAATATGGAAGATCATCCATTTAAAGAATATGTTGAGAAGTGCCTTGCCGCGCTCGAGGATGGGCAAACCATACCGCGACTCACTGATGAGCAGCTGGATCGTCTTTGGAGGGGAGGACCAAAGACAAGCTCTAATGGCTAGCCGCCAGCAGAAGCGTCAACCGCCGCGCAACACGACTAACATCGTGGTGCGTAATGGCTCCAGCTCGAATCAGGCGGGCCCTACCAACGCCCGGCAAGGACGAAGGAGAAGGAACAGAACAAGGAGAGGGCCACAGGTCAACGTGCGGGTGTTATCCAACAAAAATCAGGTTCGCCGGCGCAATCCTAGGGGCCAGGGCTTCGGTAACCGTATGGTTGTCCAGAAGATTGTCACGACTCTCGGAACGGTTGGCTCCAATGGGACCGGGTCGATCGAGACAGAGCTCGCTGTCTTGCTGAACCCCAGCACAATGAAAGAAACAACAGGCAGCAACACTTACGGGCCGGTGCAGATTTATGCATCGACCTACTCCCTCTTCTCGATCCGCTCCTTGGAGCTTCAGCTGAAACCACTGGTCGGTGGGTCAGCCGTTTCTGGGACAGTTGTGAGGGCATCATGGAACCCAACAAGCAATCCAACTCAAATGTCATGGTCTGCCCTGGGCGCTAGGAAACACGCTGATGTGACACCGGGCAGGGAGGGTAAATTTGTCCTCACAGCCAAAGACCTCAAAGGTCCCAAAGATGGGTGGTATAGAACTAACACCAAAGGAGAACCCATGCTGTCATTTGCTGGCTCGCTTGAAATACACACTTACGGAGAGACCAGGAGCACTTACCAGAATCAGAAATTCACGGGTGGTCTCTTTCTTGCTGAGCTTAAAGTGGTGTGGGCGTTTAAGGATTATGCCCAGCAACCTGGCCTCATGAACCTACTTAAAGGGGATAGCACAGGCAACACAACGGTGTCCACCGATAATGAAGGTAGACTCATCCTAGACACACCCACAACGAGCGCTCTTGCTCGTGCATCGCGCTCGACAACAACAGCAAGTGAGATCATATGGTTGGTCACCGATGCCGTTGTCACAGCTGCAACTCATATGTTTCCCCCCCCATTTAGTTGGTTGCTGAGGGGTGGCTGGTGGTTCCTCAAGAAGATTGGGGGGGCCCCCGGCCGGAGTGGCACCGAGAGGTTCATGATTTATGCCTCAATCAACGATGCCAGGGCCAGCGTCCCATGTGTGTCAACAACAGCCAATGCAGACCCTGTTAATGTTGGTCAGCTCCACTTCCAGCAGATCACCCCCGGCAACACGGGTGTTGGGCCCGATATCCCATCCATACGGGCAATTGACTACCCCCCGCAGGAGCAACCAACCCAGTGCTTTGTAACATCCGCCACTAGACTTAAGGGCGGAACAGGTGATGACTACGTGCCTTCCTACACAGGTTGGTATGTATTCGGTAACACCCAGAACCTCATAAATGGCATTGGTTTTCAGTCAGGCAGCACGCGAGTTGCGACTTTCAACTTGTATAAAGTTACAGCAACAACTGACATTGGTACAATTGATCATACCCAGTTTACCAGTACCATACCGATCTACCTCTTCTTCAACAACACCGATCGGAGAGAGATCGGATATGCTGTCGCAGCTCGCTACGACCACATGGATCAAACCACATCGGTTCGTGTGTCATCACTGCTTGTCTACGCCACTAGGTCAGAGGCATACAACTACCAACAAGACTGGAAGGTAATTAAGGTTGAATACCCCGTGAATAACAACAACAATAAATACAGTGCTAGGGTCACCGCACCTACAGCAGCCGGCCACGCCTACACCAGGCTCAAGGTTGATGCTGGGAACTGGTATGTAATTCAATTTGTGACCCATGGTGTCATCAACCTCGAATATAAGGTGGGTGATATCACAATAGCATGTCGTGGGACGGAGGCCCCACCGACTACAGCAACAAATTTTGTCCCTTCAGCCAGGGACTCACACACGGGCCTACTTCCAGTTTATATGTCTGGTCTACATCTTAGCACGTTTACCAGCTCAGCTGTGCAGGAGGATGCTGATGGCCGAATGTTTTACCTTGATCCATCTTTTGGTTGTGATGATGCACTTGAGTTTCCACCACCTCCTATTGAGGTTGACCCTGCTGATGGTGAAGATGAGGATGAAGAACCTGAAGCCAGCAACTACTATGATTTTGACTCGGACCTGGATGAAGATAAAGATCTTGAAATGGGCCCAGATGATCATTATTCCGATCCACCAATATCCCGGTTGGTGGTTCGTGATGATGCGTTCGCGCTGTATGAGCAACTCCGTGCGACGCACTCTGAACGGGCAGCCCGCTTGGCAGTAAATCAGCTGTATCCAAGCGATGAGTACACCGAATTCACCGAGGTGTACCATGACGCGTTAGCTGATGGCCTATCACCTAAGGAGGCTAGGGCGCAAGCTCTGGGCTTCTAGGATGGCACTCGCGTCATGTAAATTTTAATCATTTTTCAGTTTCATTTGTGATTTTGATTAGCATAGGTGAAGGGG
| 66,478
|
KP982872.1
|
Porcine astrovirus 2
|
Theuns,S., Conceicao-Neto,N., Heylen,E., Zeller,M., Roukaerts,I.D.M., Desmarets,L.M.B., Van Ranst,M., Nauwynck,H.J., Matthijnssens,J.
|
Ghent University, Virology, Parasitology and Immunology
|
Belgium
|
2016-03-31
|
Bel-12R021
|
Porcine astrovirus 2
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,368
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Sus scrofa
| null | null | null | null |
Porcine astrovirus 2 isolate Bel-12R021, complete genome
|
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| 83,130
|
KJ495986.1
|
Porcine astrovirus 2
|
Firth,C., Hesse,R.A., Lee,D., Ng,J., Quan,P.-L., Reddy,S.K., Madson,D.M., Arruda,P.H.E., Henry,S., DeMint,J., Neumann,E., Hardham,J.M., Lipkin,W.I.
|
Columbia University, Center for Infection and Immunity
|
USA
|
2016-02-11
| null |
Porcine astrovirus 2
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,301
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
brain
|
2012
| null | null |
Porcine astrovirus 2 clone ExpPig-36, complete genome
|
GGCCCATACCTGGCTAGAGAAGAAAATGTCTCTTTACTTAAACCGTGCCGATGAGGCACTGGCAACATCTGACGGAACACAGCTCAAACCCCGGTTTGATGCTCGGAACTGGTTTGATGAACTGCGTAGGATTGGCCCAAATCTACCCTGGTACATAACCTACCAACCACGCATGTTGTTCTATCCAACTCTCAAGCCTGACCGAGTTCTGACCGCGAGTACTGTCTGCGAGGGTGAATGGCGAACCTTTGTCTTGGATATGTGCTGTGGCATTCATGTTGCCACTGAGGTCAACCACATACCGGACCACCAACCCACCATTCTCGCTGCCGCCCTAATTGCAGATAGAGCTGAAAAGGCCCGCACGATCTCTGATTTAAGGCTAGACAATGAGATTCTTCGTGGACAGATTGCCATGCTGCGACAGGAGCAGGCTACTACACCGCGGCTGGCCTTGACTTGGCCAACCATTTTTGCTCTTGTGTTCCTTGGGTTTTCACTCTTTTGGCACTCCGCGAATGCTCTGACGACTACTTCGACAACTCAATCTGTTAACCCCATTAAGATCCTAGAACTTAACAAGTGGCTGGATGACTTCATCGACAAAGCAAAGAACGTCATTCACACCCACCACTACACAGTTGTCAACACCGTCAGACAGTCACCATCCTGGCTTCTTGCCACCACGATTGTACCCTACCTCTGGCAAGTTGTCACAGTTGTGCTAAGTGTGGTTACCGTATACAGGGCTGAACATAGGATTCTGTCTCTTCTCTTCCTAGCCGCCGCAACCATCAGCGGTGGGGATTGGGTCTTCCTAGCCAGTGCTTCTTTCCAAACCCATGCCAGCGCGATTATCCAGATTGCCTGTGTCATAATATCACACATGGACCCCATCGGTGCAATCTGTGTCTCCGCATTGGCGATGTTTGGCACGTTCATAGCCAGTATGTGTGTTAGCAGCACTACCTTTATACAACACTCAAGGGCAGCTTCTTTGAACACCGCCATCCTTGTCTTATCCATTGTTCTTAGAACCATGAGGTTACCATCTATGCCCATTGCCATAGGTCTCGCCGTTATCCGCGCCTATACCATACTTACAACACCATCTGGCGCTACGGTGGAGATACGCAGTGATGATGGCAAAGTCCTCGCTAAGGAGAGCCTGAAACCAAGCTTGCTCTTCCGTTTTAAACAGAGGCTTCGGAAGTTTGCCCAACTGCGATCCAGCATGCCACCGCTGGTTCGGGTCAACCCCACTGCGGTCTTGCGCATTGAAACCCCTGATGGTATTGGGACTGGCTTCTTTTGTGCTAACTACATTGTGACGGCCGGGCACGTTGTTGGACAACATAAGGTCGTTTCGGCATGTGTAGGCAATGCTAAGTACCAAGCTCCTGTCGTGCGTCATGTGGAGAACAAGGATATTGCACTCCTAAAAATACCACAACCCTTACAAGCCTATCCTCGTCTCAAGATAGCAAGTAAGATTGAGACTGAATGGTTGTGTGTGTATTCACCTGACGGTGAGGGTGCAATAATATCATCTGTTACTCCTGGGCATCAAGTTGATGAGTGCCTAGATTATGCAACACCAACTCGTGATGGCATGTCAGGAGCCCCAGTGGTCAACGTTGACGGGCGAGTAATGGGTGTCCATCTAACCAACACTGGCTTCACTGGTGGAGCCCAAATTATCACCCAAGCCGATGTAACAGATCCGCCTAAGTCTACACCCACTGAGGACAAGCTTCGTGCCGAACTTGAAGACCTCAAGAAACAACTAGTAACATTCACCCAGTCCAGCGCACATGATGACATCGTAGGCCTCATAAGGGAAGCTATGGCACGGGAGATGAAGATCTTGCGGGCTGAGCTAAACAAGGAGCTCGCCAGCATCACTCAGGACCAACAGGGTGATTTCTCACAAACCAAGAAAGGCAAGACCAAGCGCGGGCGTGGTCGCATCAAGTTGCGGCTTGCTGGTGCAAAGAAACGCAGGCAGAAGGGCCCTGTTTTCACTGAGGAGGAATACCAACGGCTCTTGGACGAGGGTCTGACCCCTGATGAGATCCGCGATATGGTCGATGAACTCTATGAGGAGGAGGCCGCTGGCTTTCCTGAGTGGGAGGAAATGAGCGATGGTTACGATCCAGATCAGGACTGGGAATTTGAGTCTGATTCTGACTTTGGGCAGAAGAAAATAAAGGTGCCTTCCTTCAACCAATACCTTGAAAGGCACTACAATCCCAAAGATGTCCAGAATATGCTAGACTCATTAACTCCTGCTGACATTGAGGCTGTTGGCCCGCTCTATCCATTAACTATCAAGTGCTCCAACCCGGGCCTCTGCTCAGCCCTCCTTTGCTGCATCGACCGCTATGCTGCGCTCAATGGCCTGTCACCACCAACTCAGGGACTTAACTACACCCAGCGTCGTGTTCCAAAAAACGGGAAGCGGGCCCAGAACCATCGGGCCCAGAAATCCACAAACTAGACGCCTGGGAACACCTGCGCCTACCACCGCGCAGGAGGTTAGTGCCAGATAACTATCCAGTTGTCTGCACCCTTCCAATAAACAGGCCCATTTTTGATACCAAGCTAGCTGATGACCCTTTACTTGGCCTTCTACCACCATGTGACCCAGACCTCCCCTTCGGACCAGCCGTGTGGGGGCCCGAGGCTTACACCAAATCATTTGAGAAGTTCTACTACGCAGAACCATCAAAATTCTGGGAACTCTACCCTGAGGAGTGTGCTTTCGCCGATAAGCAATGGCGCAAACACTACAACTTCCTCGAGGACTCCCGCGTTATCCATATTACCTCAACAGACAAGAACATGGACTCAACACCAGGCTACCCAAAATGCGAGGAGTATGAGAGTGAGCGGGATTACCTCGAGGAAAATGGTTGGGGACCCTACATCAAAGAATTTAAACGCGTAGATGCTGGTGAAAGGCCTAAGGTCCTTTGGTACTGTTTCCTAAAGAAAGAGCAGCTCAAGAAGGAAAAAATTAAAGACGGGGATATACGACAGATAGTCTGCCCCGATACAATATACTCCCGGATTGGGGCTGCTCTTGAACAACACCAAAACAACCTCATGAAGAAACACACTGAGGATAGCAGTGGCCAATGCGGCTGGACCCCATTTTTTGGAGGATTTGCGCGGAGGATGCGCAAACTCGACCACGGTCACATCATTGAGTTCGACTGGACTCGGTTTGACGGGACTATACCCAGAGCCTTGCTTAAACACATCAAAGACCTTCGGYGGGAGAAGATGAACAAAGCACATAGAGAAAGATACAAACACGTCCATGACTGGTACGTGGAGAACCTTCTAACCCGCCATGTGCTTATGCCCTCTGGGGAAGTCACCATCCAACGCCGAGGTAACCCGTCAGGGCAAATCTCAACTACTCCAGACAACTGCATGGTGAACTACTGGCTTCAAGCCTTTGAGTTTGCCTACCTCAACAAGGGGAAGGACATCAATGAGCTCTGGAAAGATTATGAGACTATCGTCTATGGAGACGATCGACTGACATCAACCCCTTGCATCCCTGACAACTACGTCGAGCGCGTGGTCGAGATGTACAAGACAGTCTTTGGAATGTGGGTCAAGCCAGAAAAGGTTAAAGTAACAAACACAATCAAAGGGACATCTTTCTGTGGATTCACAGTCGGGGATAATTACCAACCGATTCCATCAAACCCCGATAAGCTCTGGTCAAGCCTTGTTACACCTTGCCAAAAGTTGCCTGATGAATTAGCCCTCTATGGGAAACTCCTTAGCTTTAAAATCCTGATGCACAACAGTGAAGATCATCCTTTCAAGGAGTACATCGAAAAGTGCCTTGCTGCCCTTGAAACCGGGCGCACCCTGCCTAAAATCACTGATGAGCAGCTGGATCGTCTTTGGAGGGGAGGACCAAAGACAGCGTCTAATGGCTAACCGCCAGCAGAAGCGTGGTCCACGCACTACGACCAACATCGTGGTGCGCAATGGAGCAGCTGCCCCCCAGGCGAGGGCGTCTGGCTCGGCAGCAAGTAGGAGGAGAAGAAACAGAGCAAGGAGACAACCCCAAGTCAACGTGCGGGTGCTACCCTCTCAAATTAAGGGTCGCCGCAGGTTTTCTCGGCGCCCGGGTGTCGGTGGTCGCGTGGTTTTCCAGAAGATCAACACAACGCTCGGCACAGTCGGCTCAAATGGTAGTGACCAAATAGAATGCGAACTGACGTGCCTGATGAACCCCGCAACCATGAAGGAGGCTACTGGAAGTAACAGTTTTGGCCCGCTTGGGATCTATGCATCAACATATTCCCTGTTCAAGATGACACGATGTGTTGTGACCCTAAAACCGCTGGTCGGGGATAGTGCCGTTTCAGGCACCGTATGCCGGGTCTCTTGGAATCCAACATCATCCCCATCTCAAACATCGTGGAGCTCACTTGGCGCTCGGAAGCATGTTGATGTCACACCCGGGAAGATTGGGAAATTTGTCCTTACAACCAAGGACCTTGTGGGGCCCAAAGGAGGCTGGTATAAGACCAACACAAAGGGGGATCCTATGATGTCATTTGCAGGCACACTTGAAGTACATACTCTTGGTAAGACCATGTCCACATACCAGAACAATGCCTTCACAGGCGGGCTCTTCCTTGCGGAGCTTGAAACCGAATGGCAGTTTAAGGATTATGCACAGCAACCTGGGATGCTTAACCTAGTCAAGGGTGAAGATACAAAGAATGCCCGAGTGGAATCAAATGGTGACGGGAAGTTGCAGCTGATCCTACCCAACAACTCGCGCATGGCAAGAGCAACAAGTAACGCGTCGAGTGAGATAATCTGGCTAGTAACTGACACCGTCATCAATGTTGGCTCCCAGTTTCTCGGCCCTTTCGGTTGGCTACTCCGTGGTGGGTGGTGGCTTGTAAAACGTGCAGCTGGAGCACCAGTTCGCAGTGGTGAGACCACATTTGACATCTATG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| 83,819
|
KP759770.1
|
Porcine astrovirus 2
|
Lee,S., Jang,G., Lee,C.
|
Kyungpook National University, Department of Microbiology, College of Natural Sciences
|
South Korea
|
2015-07-22
|
KNU14-07
|
Porcine astrovirus 2
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,338
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Sus scrofa
|
feces
|
2014-07
| null | null |
Porcine astrovirus 2 isolate KNU14-07, complete genome
|
CCAAATGTTGGTGTTGGTGCCGCTGGCCCATGCCTGAAGCAGCAAGCATGTCTCTCTACATTAACCGTGCCGATGAGGCACTGGCACAAACGGACGGTACCCAGCTCAAGCCCCGGTTTGATGCGCGGCCTTGGTTCGATGAGTTACGTAAGATCGGAGGCAACAAACCTTGGTATATCACCTACCAACCGAGGATGTTGTTCTTCCCAACTCTTAGGCCTGACCGAATTCTTACCGCGAGCACAGTCACCGAAGGGGAGTGGCGCACTTTCATCTTGGATAGGTGTTGTGGCGAACCTGTGGCTACTGAAGTTAACCATATTGATGACCACCAGCCAACCATCCTCACTGCCGCCCTTATGGAGGACCGAGCTGAGAAGGCCCGTGAGATCTCTGCACTTCGTCTTGACAATGAGCTTCTCCGTGGACAACTGGCATACATGCGGCAAGAGCAAACTTCAACACCCAAAATCGCCTTCAGCTGGACGACCTTGTTTGCACTTGTTTTCATCGGCTTCTCCCTTTGCTGGCACTCCGCGAACGGACTGACTACCACATCCACAACTCAGTCCATGGACCCCATTGGGATTCTGAAGCTGAATGCATGGCTGGAGGAGTTTGTTGACAGGGCCAAGAAGATTGTGCACACTCACCACTACACTGTTGTTAACACGGTCAAGGATTCACCCTCGTGGATTGTCGCCCAAGCGATCACACCTTACTTGTGGCATGCCGTAACTTTGTTCCTTAGTGTTATGACCGTCTACAAGGCTGAACACCGTTTAATATCATTACTATTCTTGGCAGCAGCCTCACTCAGTGGCGGTGACTGGATCTTCTTGGCAAGTGCGTCTCTACAGACACCCATAAGCGCTACCATCCAGATCGTGTGTGTTATGATATCACACATTGACCCAATTGGTGCTATCTGCATGTCCGCACTTGCGATGTTCGTGATCTTCATGGCCAGTATGTGTGCAACCAACACCACATTTGTTCAACAGTCCCGGGCAGCTTCCATCAACACGGTCGTATTGACAGTTTCCATCGTGCTCAGGACACTTAAATTACCGGCGATGCCCATTGCCATCGGGCTCGCTATCATTAGGGCATATTCCATCCTGATTACACCCTCCGCAGCGACAATAGAAGTGCGCAGCGAGGATGGCAAAGTCCTGTCAAAGGAACCAGTCAAGCCTGGTTTACTCTTCCGCTTCAAACAACGGCTGCGCAGGTTCGCACAAGTCAGAACATCGATGCCACCTCTTGTGCGTGTTAATCCTACGGCAGTGGTCCGCATAGAAACACCTGATGGGATTGGGACTGGATTCTTTTGTGCTAACCACATTGTCACCGCCGGTCATGTACTAGGGCCACACAAGGTTGCATCAGTCTGCGTTGGGAATTCTAAATATCAGGCACCACTCACGAGGCATATAGATGGCAAGGACATTGCCCTCCTCAAGATACCACAACAACTACAGAATTACCCACGTCTCAAGATAGCACCTAAGATCGAGACTGACTGGTTGTGTGTGTACTCACCAGATGAGAGTGGCGCAATAATCCAATCCGTTGTTCCTGGTAACCAGGTTGATGACTGCCTTGACTATGCAACACCAACTCGTGATGGCATGTCGGGAGCGCCTGTCGTCAACCCCGATGGCCGCGTTATGGCAGTGCATCTCACCAACACAGGCTTTACTGGTGGAGCCCAAATCTTAACCCAGGCTGATGTCACAGACCCACCCAAGTCCACACCTGCTGAGGACAAGCTTCGTGCTGAGCTGGAAGAATTGAAGAAACAACTAGCAACTTTCACCCAGTCAAGCACCCAAGCAGACGTCATCGGACTTATCCGTGAGGCTATGGCAAGAGAGATGAAGATTCTGCGAAGTGAGATCAACGCAGAACTTGCCAACATCACACAGGCCCAGCAAGACGGCTTCTCACAAACTAAGAAGGGTAAGACCAAGCGTGGACGTGGGCGCATTAAGCTTAGGCTCGCCGGTGCAAAGAAGCGCAGGCAAAAGGGCCCTGTTTTCACTGAGGAGGAATACCAGCGGCTCCTGGATGAGGGCCTCACTCCTGATGAGATCCGTGACACGGTTGATGAGCTCTATGAGGAGGAGTCTGCCGGCTTCCCTGAATGGGAGGAGATGAGCGACGGTTATGACCCTAATGATGACTGGGAGTTTGAATCTGACTCCGACTTTGGGCAGAAGAAAATAAAAGTGCTTTCCTTCAACCAATACCTGGAGAGGCACTATAACCCCAAGGATGTTCGGAACATGCTAGACTCGCTAACACCGGCTGACATCGATGCAGTTGGCCCCGTCTACCCACTCATCATTAAGTGCTCCAATCCAGAACTTTGCTCTGCCCTCTTGTGCTACCTCGACCGATACGCCGCTCTGAATGGTCTGTCACCACCTACTCAGGGTCTTCCTTACACCCAGCGTCGCGTTCCAAAAAACGGGAAGCGGGCCCAGAACCAGCGGGCCCAGAAATCCACAAACTAGATGCCTGGGAAGCCCTGCGCCTACCACCGCGCAGGAGGTTGGTACCTGAGGAGTACCCTGTAATCTGCAACCTTCCAATAAACAGACCAATCTTTGACACTAAGTTAGCAGATGATCCACTCCTTGGTTTATTACCACCCTGTGATCCAGACCTTCCCTTTGGACCTGCCACGTGGGGCCCAGAGGCGTACACAAAATCATTTGAGAAATTTACGTACGCACAACCATCAAAATTCTGGGAACTATACCCTGAAGAATGCGCCTTCGCCGACAAACAGTGGCGAATCCATTATAATTTCCTGGAGGACTCACGAGTCATTCATATAACATCAACTGATAAAAACATGGACTCGACCCCGGGTTTCCCTAAGTGCGAGGAATATGAAAGTGAAAGAGACTACCTCGAAACCAACGGTTGGGGACCCTACATTAGGGAATTTAAGCGCATTGACTCAGGAGAGAAACCCCGCGTCCTCTGGTACTGCTTCCTCAAGAAAGAAATACTTAAGAAGGAAAAGATCAAGGACAGTGATATACGTCAAATCATCTGTCCCGATGCGATCTACTCACGCATTGGAGCTGCCCTTGAACAACATCAAAACACCCTCATGAAGAAACATACTGAGGACAGCAGTGGTCAGTGTGGCTGGACACCGTTCCGAGGTGGCTTTGAAAGAACAGTTAGACGGCTTGACCGCAACCATGTCATCGAGTTCGACTGGACACGCTTTGATGGTACGATACCCCGCGCCCTCTTCAAGCACATAAAGGACCTACGTTGGGAGAAGATGAACAAAACACATAGAGAGAGGTACCGACATATACATGAATGGTACGTCGAAAATCTCCTAACAAGGTACGTGCTCATGCCATCCGGAGAGGTGACAATCCAGCGCCGGGGTAACCCATCAGGTCAAATCTCAACCACCATGGACAACAATATGGTGAATTTCTGGCTTCAAGCCTTTGAGTTCGCCTACCTTAACAAGGGGAAAGATATCGAGGCCCTTTGGAAAGAATATGACACCATTGTCTATGGTGATGACAGGCTCTCAACAACACCATGCCTACCTGAAGACTATGTGCCACGTGTCGTCCAGATGTACAAAGAAGTCTTTGGCATGTGGGTCAAGCCTGAGAAAGTCAAGGTCACAGACACAGTCAAAGGAGCGTCATTTTGTGGATTTACAGTGGGGGACAATTACCAGCCGATACCATCGAACCCCTACAAACTCTGGGCAAGCCTTGTGACACCCTGCCAGAAATTGCCAGACCAAACAGCCCTCTGTGGGAAACTCCTTAGTTATAAGATCTTGATGCACAACAGTGAAGACCATCCATTCAAGGAATATGTTGAGAAGTGCCTTGCCGCGCTCGAGGATGGGCAAATCATACCGCGACTCACTGATGAGCAGCTGGATCGTCTTTGGAGGGGAGGACCAAAGACAAGCTCCAATGGCTAGCCGCCAAAGGAAGTCTCAGCCACGCAACACGACCAACATCGTGGTGCGCAATGGCGCCGCCGCGAATCAGGCGGGCCCTTCCCGAGCAAATCAGGCAAGAAGGAGAAGGAACAGGAGAAAACCACAACAGACCGTGGTGCGGGTGTTATCCAACAAGATTCAGGGTCGCCGGCGCAATCCTAGGGTTCAGGGCTTCGGTAACCGTATGGTTGTCCAGAAGATTGTCACAACTCTCGGGACAGTCGGATCCAATGGGAGTGGGTCAATCGAGACAGAACTCGCTGTCCTCCTCAACCCCAGCACAATGAAGGAGACAACAGGCAGCAACACATACGGTCCAGTGCAAATCTATGCATCGACCTACTCACTTTTCTCGATAAGATCCCTGAAATTACATCTGAAACCATTGGTTGGTGGGTCCGCTGTATCCGGGACAGTTGTTAGAGCATCCTGGAATCCAACAAGCAACCCTACCCAGATGTCATGGTCAGCCCTGGGCGCCAGAAAACACTCGGACACCACACCAGGGCGTGAAGGCAGATTCATCCTCACAGCTAAAGATCTAAAAGGTCCCAAAGACGGATGGTATAGAACCAACACCAAGGGTGAACCCATGCTCTCATTTGCTGGCTCACTTGAGATACACACATTTGGTGAGACTAGAAGCACCTACCAAAATGGGCAATTTACTGGAGGCCTCTTCCTGGCCGAGCTTGAGGTGGTGTGGGCGTTCAAAGACTACGCCCAACAACCAGGCTTAGTCAACCTCCTCAAGGGTGATAGCACTGGGAACACGACTGTGTCGACTGACCAGGATGGCAAATTGATTCTCTCAACACCTTCAACTAGCAGGCTGGCACGAGCAGCAAGAACAACTACAGCCAGCGAGATAATATGGATGGTGACAGATGCTATAGTTCAGACCGCAGCCAGCGGTTTTCCACCTCCTTTCAGCTGGCTGATAAAAGGTGGCTGGTGGTTCCACAAAAGGATCGCCGGAGCCCCCGTGAGGTCT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| 86,600
|
JX556690.1
|
Porcine astrovirus 2
|
Xiao,C.T., Gimenez-Lirola,L.G., Gerber,P.F., Jiang,Y.H., Halbur,P.G., Opriessnig,T.
|
Department of Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine, College of Veterinary Medicine
|
USA
|
2013-02-15
|
AstV2-US-IA122
|
Porcine astrovirus 2
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,334
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2011-06-23
| null | null |
Porcine astrovirus 2 isolate AstV2-US-IA122, complete genome
|
CCAAATGTTGGTGTTGGTGCCGCTGGCCCATGCCTGGAACAGCAAGCATGTCTCTCTATGTCAACCGTGCCGATGAGGCACTGGCACAAATGGACGGTACCCAGCTCAAGTCCCGGTTTGATGCACGGCCTTGGTTCGATGAGTTACGTAAGATCGGAGGTAACAAGCCTTGGTATATTACCTACCAGCCAAGAATGCTGTTCTTCCCAACTCTCAAGCCTGACCGGATTCTTACCGCGAGCACTGTCACCGAAGGAGAATGGCGCACGTTTGTGATGGATAGATGCTGTGGCGAACCAATCGTTATCGAGGTTAACCACATTGATGACCACCAACCTACCATCCTGACCGCCGCTCTCATGGAGGACCGAGCTGAGAAATCCCGAACCATCTCTGAACTTCGCTTGGACAATGAACTTCTCCGTGGACAACTGGCATGCCTGCGTCAAGAGCAATCGACAACACCGAAGCTTTCTTTTAGCTGGACCACTTTGTTTGCTCTTGTGTTTATCGGCTTCTCTCTCTGTTGGCACTCCGCTAATGCTCTTACCACCACGTCTACAACGCATTCTGTGGATCCAATGGGGATTCTTAAGCTGAACGCGTGGCTCGATGAGTTCATTGACAATGCCAAGAAAACCATCCACACACACCACTACACAGTTGTAAACACCATTAAGGAATCACCATCTTGGTTGATCGCCACTGCCATAACGCCGTATATGTGGCATGTGGTCACTGTTGTCCTTAGTATCATAACTGTGTATAAGTCAGAGCGCCGAGTCCTATCTCTGCTCTTCCTAGCAGCGGCGTCACTTAGTGGTGCTGATTGGCTGTTCCTGGCGAGTGCGTCATTGCAGACACCACTTAGTGCTATCATCCAAGTGGTCTGTGTCATCATATCACACATTGACCCGATAGGTGCAATCTGCATTTCCGCATTGGCGATGTTCATGACGTTCGTTGCCAGCATGTGTGCATCCAACACCACATTTATTCAACAGTCCCGAGCAGCCTCGGCCAACACGGCCATCCTAGTGCTGGCTGTAGTGCTCAGGACTCTCCGGCTCCCTGCATTGCCCATTGCCATCGGGCTTGCCATTATCAGGGCTTATTCCATCCTGGTCACACCAACCGCAGCGACAATAGAGGTGCGCAGCGAGGATGGTAAAGTCCTGTCGAAGGAGCCAGTCAAACCTGGCCTGCTTTTCCGGTTCAAGCAAAAAATGAGGAAATTTGCTCAACTGCGATCCAGCATGCCACCGCTGGTCCGCGTCAACCCCACCGCAGTTTTGCGCATTGAAACACCTGATGGCATTGGAACTGGTTTCTTCTGTGCTAACTACATTGTGACTGCTGGGCACGTCGTTGGACAACACAAGGTCGTCTCAGCATGTGTGGGCAATGCCAAGTATCAAGCCCCTGTCGTGCGTCATGTGGAGAACAAGGATATAGCACTTCTCAAAATACCACAGCCATTACAAAGTTACCCTCGTCTCAAAATAGCAAGTAAAATTGAGACTGAATGGTTGTGTGTGTATTCGCCTGATGGTGAGGGTGCCATAGTATCATCTGTCACTCCTGGGCATCAAGTCGAAGAGTGCCTAGACTATGCAACACCAACCCGTGACGGCATGTCAGGAGCTCCAGTGGTCAACGTCGACGGTCGCGTAATGGGTGTTCACTTAACCAATACCGGCTTCACTGGTGGAGCCCAAATCATCACCCAAGCCGACGTCACAGATCCACCCAAGTCCACACCCACTGAGGACAAGCTCCGTGCTGAACTTGAGGACCTCAAGAAGCAACTGGCAACATTTACCCAGTCCAGTACACATGATGACATCATAGGCCTTATAAGAGAGGCTATGGCACGGGAGATGAAGATCCTGCGGGCTGAGTTAAACAAGGAGCTCGCTGGCATCGCTCAAGACCAACATGGTGACTTCTCACAGACCAAGAAAGGCAAAACCAAGCGCGGACGTGGCCGCATCAAGCTCCGACTTGCTGGTGCGAAGAAACGCAGGCAGAAGGGCCCCGTTTTCACCGAGGAGGAATACCAACGACTCCTAGATGAGGGTCTGACCCCCGATGAGATTCGCAATATGGTTGATGAGCTGTATGAGGAGGAGGCTGCTGGCTTTCCTGAGTGGGAAGAGATGAGCGATGGCTATGACCCAGATGAGGACTGGGAGTTTGAGTCTGACTCCGACTTCGGGCAAAGAAAGATAAAAGTTCCCTCCTTTAACCAATATCTTGAGAGGAATTATAACCCCAAGGATGTCCGGAGCATGCTTGACTCGCTGACCCCTGCTGACATAGAGGCCGTAGGACCACTCTACCCACTCACCATCAAGTGCTCCAACCCAGGCCTCTGTTCAGCCCTTCTCTGCTGCATTGACCGCTACGCCGCACTTAATGGTCTGTCACCACCCACACAAGGGCTTAACTACACCCAGCGTCGCGTTCCAAAAAACGGGAAGCGGGCCCAGAACCATCGGGCCCAGAAATCCACAAACTAGACGCTTGGGAGTCCCTGCGCCTACCACCGCGCAGGAGGCTGGTACCAGACAACTACCCGGTTGTCTGCAACCTTCCAATAAATAGGCCCATTTTTGACACTAAACTGGCTGATGACCCTTTGCTTGGCCTTCTACCACCATGTGACCCAGACCTCCCTTTCGGACCAGCCGTGTGGGGACCTGAGGCTTACACTAAGTCATTTGAGAAGTTCTATTACGCAGAACCATCAAAATTCTGGGAACTCTACCCCGAGGAATGTGCTTTCGCCGACAAACAGTGGCGCAAGCATTACAACTTCCTTGAGGACTCTCGCGTCATCCATATTACCTCAACAGACAAGAATATGGACTCAACACCAGGATACCCAAAATGTGAGGAATATGAGAGTGAACGTGACTACCTTGAGGAAAATGGCTGGGGGCCTTACATCAAAGAGTTCAAGCGTATAGATGCTGGTGATAAGCCCAAAGTCCTTTGGTACTGCTTCCTCAAGAAAGAGCAGCTCAAGAAAGAGAAAATCAAAGACGGGGACATACGACAAATAGTCTGCCCCGATACAATCTACTCTAGAATTGGAGCTGCCCTTGAACAACATCAGAATAACCTCATGAAAAAACATACTGAGGATAGTAGTGGTCAATGCGGCTGGACCCCATTTTTTGGAGGCTTCGAGAGGAGGATGCGCAAACTCGACCATGGACATATCATCGAGTTCGACTGGACTCGGTTCGATGGGACCATACCCAGAGCTTTACTAAAGCACATCAAAGACCTGCGGTGGGAGAAAATGAACAAAACGCACAGAGAAAGATACAAACATATCCACGACTGGTACGTGGAGAATCTCCTAACCCGCTACGTGCTCATGCCCTCTGGAGAAGTCACCATCCAACGCCGAGGAAATCCGTCAGGGCAGATCTCAACAACTCCAGACAACTGTATGGTAAACTACTGGCTGCAAGCCTTTGAATTTGCCTACCTTAACAAGGGGAAGGACATCAATGAACTGTGGAAAGACTATGAAACCATTGTCTATGGAGATGACCGACTAACATCAACCCCTTGCATCCCTGACGACTACGTCGAACGCGTGGTTGAAATGTACAAAACAGTCTTTGGAATGTGGGTCAAACCAGAAAAGGTCAAAGTAACAGACACAATCAGAGGGGCATCTTTCTGTGGGTTTACAGTTGGGGACCACTATCAGCCAATTCCATCGAACCCCGATAARCTCTGGTCAAGCCTTGTTACACCTTGTCAAAAACTGCCTGATGAATTAGCCCTCTATGGGAAACTCCTTAGCTTTAAAATCCTGATGCACAACAGTGAAGACCATCCTTTTAAGGAATACATCGAGAAGTGCCTTGCTGCCCTTGAGACCGGGCGCACCTTGCCTAAAATCACTGATGAGCAGCTGGATCGTCTTTGGAGGGGAGGACCAAAGACAGCATCTAATGGCTAACCGCCAGCAGAAGCGTGGTCCACGCACTACGACCAACATCGTGGTGCGCAATGGAGCAGCTGCCCCCCAGGCGAGGGCGTCTGGCCAGGCAGCAGGCAATAGGAGAAGGAGAAACAGAGCAAGGAGACAACCACAGGTCAATGTGCGGGTGTTACCCCCTCAAATTAAGGGTCGCCGCAGGTTTCCTCGGCGCCCGGGTGTCGGTGGTCGCGTGGTTTTCCAGAAGATCAATACAACACTCGGCACAGTCGGTTCAAACGGAAGTGAGCAAATAGAATGTGAACTGACGTGCCTGATGAACCCCGCAACCATGAAAGAGGCCACTGGAAGCAATAGCTTCGGCCCACTTGGGATCTATGCATCAACTTATTCCTTGTTCAAGATGACACGATGTGTTGTGACCTTAAAACCATTGGTTGGGGATAGTGCCGTCTCTGGCACTGTGTGCCGGATTTCCTGGAACCCAACATCATCCCCATCCCAAACGTCGTGGAGTTCACTTGGTGCTCGGAAACATGTTGATGTGACACCTGGGAAAGTTGGTAAATTCATCCTCACAAGCAAGGACCTTGTGGGCCCCAAGGGGGGCTGGTATAAGACCAATACTAAAGGAGATCCCATGATGTCATTTGCAGGCACACTTGAAGTACACACTCTTGGAAAGACTATGTCCACATACCAAAACAATGCCTTTACAGGTGGGCTCTTCCTCGCGGAGCTCGAGACCGAATGGCAATTCAAGGACTATGCACAACAACCTGGGATGCTGAATCTAGTCAAGGGCGAAGATACAAAAAACGCCCGGGTGGAGTCAAATGGTGATGGGAAACTACAGCTAATCCTGCCTAACAACTCGCGCATGGCAAGAGCAACAAGCAATGCGTCGAGTGAGATAATTTGGCTGGTGACTGATACCGTCATCAATGTTGGCTCCCAGTTCCTTGGCCCTTTCGGTTGGTTAATCCGTGGTGGATGGTGGCTTGTCAAACGTGCAGCTGGAGCACCAGTGCGCAGT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| 95,238
|
JF713710.1
|
Porcine astrovirus 2
|
Shan,T., Li,L., Simmonds,P., Wang,C., Moeser,A., Delwart,E.
|
University of California-San Francisco, Blood Systems Research Institute, Department of Laboratory Medicine
|
USA
|
2011-11-02
| null |
Porcine astrovirus 2
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,318
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2010
| null | null |
Porcine astrovirus 2 strain 43/USA, complete genome
|
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| 97,930
|
JF713712.1
|
Porcine astrovirus 2
|
Shan,T., Li,L., Simmonds,P., Wang,C., Moeser,A., Delwart,E.
|
University of California-San Francisco, Blood Systems Research Institute, Department of Laboratory Medicine
|
USA
|
2011-11-02
| null |
Porcine astrovirus 2
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,358
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2010
| null | null |
Porcine astrovirus 2 strain 51/USA, complete genome
|
TGGTGCCGCTGGCCCATACCTGGCTGGAGAAGAAAATGTCTCTGTACCTAAACCGTGCCGATGAGGCACTGGCAACATCTGACGGAACACAGCTCAAACCCCGGTTTGATGCTCGGAACTGGTTTGACGAACTGCGTAGGATTGGCCCAAATCTACCCTGGTACATAACCTACCAACCACGCATGATGTTCTTTCCAACTCTCAAACCTGACCGAGTTCTGACCGCGAGTACCGTATGTGAGGGTGAGTGGCGAACTTTTGTCTTGGATATGTGCTGTGGCGTCCATGTCGCCACTGAGGTCAACCACATACCAGACCACCAACCCACCATTCTCGCCGCCGCCCTTATTGCGGATAGAGCTGAAAAGGCCCGCATGATCTCTGACCTAAGGCTGGATAATGAGATTCTTCGAGGACAGATTGCCGTGTTACGACAGGAGCAAGTCACCACTCCGCGGTTGGCTTTGACTTGGCCAACCATCTTTGCTCTTGTGTTCCTGGGGTTTTCACTCTTTTGGCACTCTGCGAATGCTCTGACGACGACTTCGACAACTCAGTCTGTCAATCCCATGAAGATCTTAGAGCTTAATAAGTGGCTGGACGACTTCATCGACAAAGCTAAGAATGTCATCCACACCCACCACTACACAGTTGTCAACACCGTCAGACAGTCACCATCCTGGCTTCTTGCCACTACGATTGTACCTTACCTCTGGCAAGTTGTCACAGTTGTGCTAAGCGTGATCACCGTCTACAGGGCTGAACACAGGATCCTGTCTCTTCTCTTTCTAGCTGCCGCAACCATCAGCGGTGGGGATTGGGTCTTCTTGGCCAGTGCCTCTTTCCAAACCCACGCCAGTGCAATTATCCAGATTGCTTGTGTCATAATATCACACATGGATCCCATCGGCGCAATCTGTGTCTCCGCATTGGCGATGTTTGGCACGTTCATAGCCAGTATGTGTGCTAGCAGCACTACCTTTATACAACACTCAAGGGCAGCCTCTTTGAACACCGCCATCCTTGTCCTGTCCATTGTCCTTAGGACTATGAGGCTACCGTCCATGCCTATTGCCATAGGCCTCGCCGTCATCCGAGCCTACACCATACTTACAACCCCATCTGGCGCTACAGTGGAGATACGCAGTGATGATGGCAAAGTCCTTGCTAAGGAGAGCCTGAAACCGAGCTTGCTCTTCCGGTTTAAGCAAAAGCTCCGGAAGTTCGCCCAATTACGGTCCAGCATGCCACCATTGGTTCGGGTCAACCCCACTGCAGTCCTGCGCATAGAGACTCCTGATGGTATTGGGACCGGGTTCTTCTGCGCCAATTACATCGTGACGGCAGGGCATGTCGTTGGACAACACAAGGTTGTGTCAGCGTGTGTGGGCAATGCCAAATATCAAGCTCCTGTTGTACGTCATGTGGAGAATAAGGACATAGCACTCCTTAAAATACCACAGCCTTTACAAAGTTACCCTCGTCTCAAGATAGCGAGTAAAATCGAGACTGAGTGGTTGTGTGTGTACTCACCTGATGGTGAGGGTGCTATAGTGTCATCTGTTACTCCTGGTCATCAGGTTGATGAATGTCTTGACTACGCAACACCAACCCGTGACGGTATGTCGGGAGCTCCAGTAGTCAATGTCGACGGTCGAGTCATGGGTGTTCACTTAACCAACACTGGCTTCACCGGCGGAGCCCAAATTCTCACCCAAGCCGACGTCACAGATCCACCTAAGTCCACACCCACTGAAGACAAGCTCCGTGCTGAACTTGAAGAACTCAAGAAACAACTAGCTACATTTACCCAATCCAGTACACATGATGACATCATTGGTCTCATAAGGGAAGCTATGGCACGGGAGATGAAGATTTTGCGAGCTGAGCTAAATAAGGAGCTCGCCATCATCACCCAGGACCAACAGGATGACTTCTCTCAGACTAAAAAGGGTAAGACTAAACGTGGGCGCGGCCGCATCAAGTTGCGGCTCGCGGGTGCGAAGAAGCGTAGGCAGAAAGGCCCCGTCTTCACTGAGGAAGAATACCAACGGCTCCTGGATGAAGGCTTGACCCCTGATGAGATCCGCAACATGGTTGATGAGCTCTACGAGGAGGAATCTGCTGGCTTCCCTGAATGGGAGGAAATGAGTGACGGCTACGACCCAGATGAAGATTGGGAGTTTGAGTCTGATTCTGATTTCGGACAAAAGAAAATAAAAGTTCCTTCTTTTAACCAATACCTTGAAAGGCACTACAACCCCAAAGACGTCCGGAATATGTTGGACTCACTGACCCCTGCTGACATAGAGGCTGTTGGACCACTCTATCCACTAACCATCAAATGTTCCAACCCAGGTCTCTGCTCAGCCCTCCTCTGCTGCATCGACCGTTATGCCGCACTCAACGGCTTGTCACCACCAACTCAGGGGCTTAATTATACCCAGCGTCGTGTTCCAAAAAACGGGAAGCGGGCCCAGAACCATCGGGCCCAGAAATCCACAAACTAGACGCATGGGAGTCCCTGCGCCTACCACCGCGCAGGAGGTTAGTGCCAGATAACTATCCAGTTGTCTGCAATCTTCCAATAAATAGGCCCATTTTTGATACCAAGTTAGCTGATGACCCTTTGCTTGGCCTCTTACCACCATGTGACCCAGACCTTCCCTTCGGACCAGCCGTGTGGGGACCTGAGGCTTATACCAAATCATTTGAAAAGTTTTACTACGCGGAGCCATCAAAATTTTGGGAACTATACCCCGAGGAGTGTGCCTTCGCCGACAAGCAGTGGCGCAAACACTACAACTTCCTTGAGGACTCTCGCGTCATCCATATCACCTCAACAGATAAGAATATGGACTCAACACCAGGATACCCAAAATGTGAGGAGTATGAGAGTGAGCGAGAATACCTCGAGGAAAATGGCTGGGGTCCCTATATCAAGGAATTTAAGCGTGTAGATGCTGGTGAAAAGCCCAAGGTCCTCTGGTACTGCTTCCTAAAAAAAGAGCAACTCAAGAAAGAAAAAATCAAAGACGGGGACATACGACAAATAGTCTGCCCTGATACAATCTATTCCAGGATTGGAGCTGCTCTTGAACAACATCAAAATAATCTTATGAAGAAACATACTGAGGATAGCAGTGGCCAATGCGGCTGGACCCCATTCTTTGGAGGATTCGAGAGGAGGATGCGTGGACTCGATCACGGACACATCATTGAATTCGACTGGACTCGCTTTGACGGAACCATACCCAGAGCATTGCTCAAACACATCAAAGATCTGCGGTGGGAGAAAATGAACAAAACACATAGAGAAAGATATAAACATGTCCACGACTGGTACGTGGAGAATCTCCTAACCCGCTATGTGCTCATGCCCTCTGGGGAGGTCACCGTCCAACGCCGAGGCAACCCGTCAGGGCAAATCTCAACAACCCCAGATAACTGCATGGTGAACTACTGGCTTCAAGCTTTCGAGTTTGCCTACCTCAACAAGGGGAAGGACATCAATGAACTCTGGGGAGACTATGAAACCATCGTCTATGGTGATGACCGATTGACATCAACTCCCTGCATCCCTGACAACTACGTCGATCGCGTGGTCGAGATGTACAAAACAGTCTTCGGAATGTGGGTTAAACCAGAGAAGGTTAAGGTAACAAACACAATCAAAGGGGCATCTTTCTGTGGGTTTACAGTCGGGGACAATTATCAACCAATTCCATCAAACCCCGATAAGCTCTGGTCAAGTCTTGTCACACCTTGCCAAAAATTGCCTGATGAACTAGCCCTCTATGGGAAACTCCTTAGCTTTAAAATCCTGATGCACAACAGTGAAGAACATCCTTTCAAAGAATACATTGAAAAATGCCTTGCAGCCCTTGAAACCGGGCGCACTCTGCCTAAAATCACTGATGAGCAGCTGGATCGTCTTTGGAGGGGAGGACCAAAGACAGCATCTAATGGCTAACCGCCAGCAGAAGCGTGGTCCACGCACTACGACTAACATCGTGGTGCGCAATGGAACAGCTGCCCCCCAGGCGAGGGCGTCTGGAACGGCAGCAGGCAACAGAAGGAGGAGGAATAGAGCAAGGAGACAACCACAACTCAACGTGCGGGTGCTTCCCAGTCAAAATCAGGGTCGCCGCAGGTTTCCTCGGCGCTCGGGTGTCGGTAGTCGCATTGTTTTCCAGAAGATTAACTCAACCCTCGGCACGGTTGGATCCAACGGGAGTGAGCAAATAGAGTGCGAATTAACATGCCTTATGAACCCAGCAACTATGAAGGAGGCAACAGGGAGCAATTCCTTCACACCCTTAGGAATTTATGCATCAACATACTCCTTGTTTAAAATGACTAAATGTACACTCGTGCTCAAACCCCTCGTGGGTGACAGTGCCGTCTCTGGCACCGTGATCCGAGCGTCCTGGAACCCAACCTCAACGCCAACCCAGACCTCCTGGAGCGCTTTAGGTGCCCGCAAGCACGTTGATGTGACACCTGGGAAGACAGGCAGATTCACTCTAACATCTAGAGATTTGGTTGGCCCCAAGGGTGGTTGGTTCAAGACCAACACCAAGGGCGATCCAATGATGGCATTTGCAGGGACTCTCGAAATTCACACCCTAGGGAAGACCATGTCCACATACAAGAATGAAGCTTTCACTGGATCGCTATTCCTGGCTGAACTTGAAACGCAGTGGCAATTCAAAGATTATGCCCAGCAGCCTGGCATGCTTAACCTTGTTAAGGGTGAAGATAAGAGCGCCGCCCGCATAGAGAAGAGTGATGATGGCAAGCTGCAGCTGGTTGTTCCAGGTAATTCCCGGATGGCTAGAGCTTCCAGTGGCGCTGCTAGTGAGATCATCTGGCTTGTCACAGATACTATAATACAGGCCGGAACCAGCCTTTTGGGACCTTTTGGTTGGCTTATCCGTGGTGGATGGTGGCTCGTGAAGCGTGCAGCTAACGCGCCCGTTCGCCGCGATGGCAGCACCACGTTTGATATCTATGCATCTATTTCAGACGCTAGGTCCAACACTCCATGCATAACTGACCAGGCCAGCGTCAACATCCCTGTTGGGGGTCTTCACTTCCAGCAGGTTACACCGGGGAACACTGGAATAGCTGCAGAGGCGACGACGTCGCGTGCAATAATGGACTTAACACCGTCATCACCTACCCAGTGCTATGTCATATCAGCAACAATGTGCAAACCAGGAACAACAGACCTGGTCCCCGCAGCATGCACGTGGTACAATAAACGTGGTGGTCAGAACCACGCACAGGGGGTTGGCTTCAAAGTCGGTGACACTAAAGTAGCCTCTTACAACATCTACAGGGTGGTAGCGCAAACCAACACTGGCCCAATTGACCTTTCAATGTTTGAACACAAGATACCATTCTATCTCTTTACGGAGAGAGATTGGGAGCTTGGCTATGCTGTAGCATCAGCATATGAGCGGATCAATGAATCCCCAAGTATATGGGTCTCAAGTGTGCTGGTGTACGCTACGCAGCAGCGATACCACGGCTTTAACGCCTCCTGGAATGTTACAGATGTCACCTACCCAGAAACTGAGGGCTCAAATGGTTACCAGGCTAAGGTGAACACCCCGGGGCAGGAACGGAATATAAATTTACAAATCAACATGGAACCCGGCAAGTGGTATGTGGTTCAGTTCGCCACCCAGGGCATAATAGATGGGCAGTATATGTCAGGTGAGCATGTCCTTGCTTCCCGTGGCACTGCAACTGTCCCCACCGGTGTTAGATACTTCGCCCCCAGAACAAATGACTCAAATATGGGCTTGCTTCCCGTTTACATCTCAGGGTTGCACCTAACACCGTTCACCACAAGTGCCATCATATTCAACCAGAACCGCATGTTGGTCACTGACGACCTGGACCCAAGGTTTGGCCATGACGATGCTTTTGAGTCCCCGCCCCCACTTGAAGGAGAACTCGGCGGTAGTGATGATGATTTTGAGGACCCAGATGAAGATGAGGATGAAGAACTTGAGCTTGGCCCAGATGATCACTACTCGGACCCACCAATTTCCCGGTTGGTGGTTCGTCCTGAGGCGCAGCTGCTGTACGAGAATCTTGCTGCGCAATTTTCAGACCGGGAAGCCCGCTTGGCAGTAAATCAGCTGTATCCAAGCGATGAGTACAGCAATTTCACCGCGCTGTACCACGACGCGTTAGCTGATGGCCTATCACCTAGGGAAGCTAGGGCATATGCCCTGGGTCTCTAGGATGGCACTCGCGCCGTGAAAAATTAATCATTTTTCAGTTTCATTTGTGATTTGATTAGCATAGGTGAAGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 97,932
|
NC_019494.1
|
Porcine astrovirus 3
|
Xiao,C.T., Gimenez-Lirola,L.G., Gerber,P.F., Jiang,Y.H., Halbur,P.G., Opriessnig,T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2012-11-21
|
US-MO123
|
Porcine astrovirus 3
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,460
|
RefSeq
| 2
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2011-06-24
| null |
PRJNA485481
|
Porcine astrovirus 3 isolate US-MO123, complete genome
|
CCAAATAGAGCTGCCCGTTGGTCCGGCCCTATGGCGTTGCCTTTTGACGACACTCTTAGGTTTGGTTCAGCCGCGGCCCGTGTGAAAGGCCGTAGGCTAGATTCGGTTGCACGTACTAAGCTAAAGGATTTGCTTGGTAATGGACCTTATTTCTACGATTTTGGTCCTTTAGAAGTCGTTGACTCTTCATCAAAGCAGTTGACTGTGAAAATGACTTCTGTGCAAACCGTCTATGTGTCGTCGGTTGTTGAGGACAACTCTTATGTTACCTATAAGTTTGTGCCTGGCGTCAATGAATGGGTTGAAACAGAGCCTGTTCTGCATAAACCCACAGCTTTGGTTGGTGTTCTCTGGCGTGAATATAATCGCTATAAGGACAAAACTGAGTCTCTCTCCCAAGAGCTCTCCCAACTTAGGCTTGAACACTCACTGTTGCGCCATGATTATGAACGTGTACGTCCTCAGCAACCGGCAACCCCTAGGTGCCGGTTAGGGTTTATCACAAAGTTACTTATTGGCTTGCTTATTGGCTCTTTAATGGCACACTCCACCCTTGCATACAAAACACCTGGGACTGGTTTGTTGGGTGAGTGCTTGGATACCGATGTTATCGACGGTAAACAAGTTTGTGTGAACTTTCTCCCTTGGAATGAGACTGAGACCAATCCCACTGATGGCGATAAGACTACTACTATTAGCTGGGATCATGAAGGTCTTCTTGACTTGTTAGTCTTGATAGCTCCTTATCTGGTCTCCTGGCCTATGATAGCAACAATGGTTGGCTTCTTCTATGTTGCCACAGCTGAACAACCTGCTTACATGCTGGTTTCCTTACTCTTGGCAACATATTCAAAGGCCCAAGTTCTGGCCCTTGCTGGCCTACCATTCATGGATATGCCATCAGTTGTTACGCTTTGGGTTTCAATGCTTGTCCATTCATATGATGCTGTCCTTTCATTGTGGGTGGCTCTTCTTCTGGCCGCATTTACCTTATCAGCAGGTGTCTTCATGCCCGATGTACGCTACTCTGACCTGGTCCGTGGCCAGTTAGTGGTTTTCCTTGTTCTCGTCTTTAACTATCTTGTTGTTATGATGTCTTTACCTAACTGGCTTGTCTTCTCCCTTGTCGTTGGTTATAGGGTCCTGCGTGTCTTGACTTTTCTCGTCGCTGAGAAGGTTGAGGTCCGCGGCCCTGACGGTAAGGTTGTAGAAACTCGTACCTCCATGCCTGCGTGGATTAATAAGGCATCTAACTTTTTGCAAACTAAATTCCATCAGAAGATAAGAACAGGTATTTCACCCACAGCACGGGTAATCCCAAATGGGGTTATCGTCGTTGAGACCCAGGATGGCTCAGGAACAGGTTTTAGGTGCCGTAACTACTTAGTCACTGCAGGACATGTTGTGACGGGCACGGAAACACCCAAGATCCAGTGGGCTGGTGTCCCTGCCTACTCTAAAGTTGTCCATCGTGTGCCGGATAAGGACATAGCTTTTCTTGCCATCCCTCAAGAGCTACAGGATCTGCCCTCCTACCGTCTGGCAAAGAAGGTTGAGGATGGCCCTGTAGTTATCACATCTTTGGAAGATTCAGGTGTTTTGTCAGTTGCTGTCACTGAAGGTGTTATAGTGACTGATTCCATAACTTATGCCGTTCAAACTCGGAATGGTATGAGTGGTTCACCTGTTACTAACTTGGATGGTAGGATCCTTGCAGTACACCAAACTAATACCGGCTTTACTGGGGGCGCCGTCATATTGACTGATGAGGACTTTCCACAACCTAAGAAGTCAGCCCGTGAACAGCAACTTGAAGCTCGTATCAAAGAGCTTGAGGCAGCAATGAATCAGTCATCTAATCATGAAGACATTGTGGAGCTTGTCAGAGCTGCAGTGGCCCGAGAATTTAAAGTGCTTCGCACTGAGCTTTCTGCCACCACCTTTACCCAGGCGAAAGGTAAAAACAAGAAACATCATCGTCGTCGTGGTGGGAAGAAGCGCCGTGCTGTCTGGTCAGAAGAAGAGTACAAGGAACTCCTAGAGAAGGGTTTCTCCAAATCACAACTACGTGACATGGCCGAGGTTCTTAGGTCTCATGAGGAAGATCCGTTTGGTTCTGACACTGAATCGGAAGGGGGTTTTCCTGAATGGTCCGATGTTAGTGATGCTGAATCAATTGAACGGGAGTGGTTTGGTCAGTCCTGGGAAGACTGTAAGCCTGTTAAGGAAGAGCCTCAAGACACACTTCCTGTGCATCTCAAAGAGAAGTACACCTTGGATGCCTATGTCATTAGCAAAGAAGAATTGAGATCTTTTGCTAAGGAGTTCAAAGACTATGTTGACAAAGTTGAAGCACTAATTGATAAAACTGTTCAACAGGGTAAGTGGTTACCATCAGTTAACCCCACAGCTATAATTGAGGAACTTAACGATCTATGGTTTGGCCTCAACATGCTGATGTGGGAGAAAGGCTTGGTTCCTTTTACTCAAAGGAAGAAAATCAAGCGTAGGGTTCAAAAAAACTCCAAGGGGGCCCCCAAGAGGGGCCCATTACCTACTCCATGATGGACCTCAAAGCTTGGCGACGCTCCCTGTATGAGGTTGAGCGTCGCTTAGTGCCAGAGGACTACCCGCTTATTGGTGGGGTGCCCCTGGACAGGCCTATCTCTGACTGGGATGAACCTATTGATGACTTACTCTTAATGTTGCCAGCATTTAAAGAAGATCTTAATTACACTCCTGCTGTTTGGGGACCTGAGGCCTATACTAAATCTTTTGAAAAATTTACCTATAGAGAGCCTTGCCCTAATATAGCCGCCACGTACCCACGTGAGTGGTCTTTTGCAACAAAAGCTCTGAGGAGGGAGTACTCTTTTCTTGCTGATTCTGTTTTGACTGACATTGCTGCTACATCTAAGAATGCTGACTCGACCCCAGCTTACCCTAAGTCTCTTTATTGGAAAACTGAAGCAGACTATCTTGGTGAGCGAGGATATCAGGATTACATTAGGCAATTGGATGCCATTTACTCCGGAGAACGTCCAGATGTCCTATGGTACCTTTTCTTAAAGAAAGAGATCCTGAAAGTGGAGAAAGTTGTGCAATCTGATATAAGACAAATCGTTTGTTCTGACCCTATATTTGCACGTATAGGATGTCACTTTGAAGAAGATCAAAATGTCAGGATGAAAAACCACACTAAGACACGCTCTGGCCAATGTGGTTGGTCGCCCTTCTTTGGTGGCTTCAATGACAGGATCAAGCGGCTATGTGCTTGTGACCCTGACTGTTACATAGAATTTGATTGGACACGCTTTGATGGTACTATACCCAATGAGGTGTTTATGCACATCAAGAGAGTCCGCTACTCCTTCTTTGCGAAGGAGTTTAGGACGAAGCGTGTCAAAGAAGCTTACCAATGGTACTGCGAACAACTTTTACACAGGCACGTTGTGCTCCCCTCGGGCGAGGTGACATTGCAGACCCGTGGAAATCCTTCTGGACAAATCTCCACTACCATGGACAATAATATGGTGAATGTGTTTCTTCAAGCATTTGAGTACGCCTATCTGCACCCAGACTGTACAGATGATGAGCTTGAGGCAAACTGGTCTCGTATGGACACCCTAGTCTATGGTGACGATAGACTATCAGCATATGTTGGCCTACCCGCCAATTATGTGGAGAGGGTTGTGACAATGTATTCAGATGTCTTTGGTATGTGGGTGAAACCAGAAAAGGTTATTGTCTCCCCCAGTATCATAGGTCTCACTTTTTGTGGTCTTAGAATTATTAGTGATGGTACCGCCTTCTTACCTGTTCCAGCTGAGACCAATAAGCTTATCTCTGCTCTCATTAAGCCAACCAAGAAATTACAAGATGTGATGACCCTCTATGGGAAACTCCTTTGCTATCGCATCCTTGGCCATAACCTCCCTGATGACAACAAGTTTAAGGCCTACATTTTGGTGGCCTTGGAGGTTGTTGCTAGGCACATCAGGACACGTTGTGGTGATGAGCCACTCCGCTTTACTGATGAGATGCTTGACCGGCTTTGGGGGGGCGGACCAAAGGTCGGATATGGCTGGTGATAAGCTCAACGCATCTGCCAAAGCGGCACCTTTCGCTAAGGAGGTTGCCAAGGAAGTTGTTAAGGAGGAGAAAAAAACTCAGGCACGTAGGCGGAAATGGTATAAGCCCCGTCGACAACAAAATCAGCCCCAACAACAATCCAAGCAACGGACTACTGTGAGCAAACAAGTTGCAAAGAAATTAAAGCAGGAAGGCTTGGAAGGACCACGGCCCCGCTTCTCAGTGCGAGTCTCGGCAACTATTGGGAAGATAGGGCCCAATAAAGAACAGGGACCTGAACTTCAAATTTCAACTTTTCTTCATCCCTCCCTTATGAAGGAACCAAATGATGGCACCAACTTTGGGCCTCTACAGGCCGCTTCAGCGCAGTGGGGCTTGTGGCGCCTTGCAGGCTTAAAGATACGCTGTACGCCCCTGGTTGGGCCGTCAGCGGTGACAGGCTCAGTTTATAGGCTTTCCTTGAATCTTACACAATCACCCGGTAACACTTCCTGGGGTGGTTTGGGTGCACGTAAACATATTGACGTGCCAGTTGGGAAGCAGTCAACTTGGAACCTTCATAGGGGTGACTTGGCCGGCCCGCGACAGACGTGGTGGATGACTGACACTAATGAGGAGGGCGGTCAATCTTGTGGACCTATGGTTGAGATCCATGGCTTAGGGAAAACTTCTTCTACTTATAAAGACGCCGACTGGGTTGGTGATCTTTTTATTGTAGAGGTGGTTGGACGCTGGGAGTTCACCAACTACAATGCCAAACCAGCCCTTGGAACACTAGATCGTGTGACCGAGGACGTTCAAGCCGGTATTGAGGTTGGCTCGGACGGGATCATGACTATGACTCTCCCCCAGCGTTCTAATTTAGTTAAGCATATGTCCACAGCTTATGAAAAGCTACCACTGAATGC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| 7,127
|
ON715001.1
|
Porcine astrovirus 3
|
Carvajal,A., Arguello,H., Cortey,M., Diaz,I., Gomez-Garcia,M., Puente,H.
|
Facultad de Veterinaria, Sanidad Animal
|
Spain
|
2022-10-02
|
SP-VC29
|
Porcine astrovirus 3
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,460
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
|
Sus scrofa
|
feces
|
2017-08-04
| null | null |
Porcine astrovirus 3 isolate SP-VC29, complete genome
|
CCAAATAGAGCTGCCCGTTGGTCCGGCCCTATGGCGTTGCCTTTTGACGACACTCTTAAATTTGGTTCAGCCACGGCCCGAACGAAAGGCCGTAGGCTGGATTCGGTTGCACGCACCAAGCTTAAGGATTTGCTTGGTGATGGTCCTTACTACTATGATTTTGGCCCTCTAGAAGTTGTCGACTCCTCTTCAAAGCAGTTGACCGTAAAAATGGCCTCTGTGCAAACCGTCTATGTGTCGTCGGTTGTTGAGGACAATTCTTATGTCACCTATAAGTTTGTGCCTGGCGTTAATGATTGGGTTGAGACAGAACCTGTTCTCCATAAACCCACTGCTTTGGTTGGTGTCCTTTATCGTGAATATAAACGTTATAAGGACAAGACTGAGTCTCTCTCGCAAGAGCTCTCCCAACTAAAGCTTGAACATTCGTTGTTGCGCCATGATTATGAACGTGTACGTCCTCAGCAACCGGTAGCCCCTAGGTGCCGGTTAGGGTTTATTACAAAATTACTTATTGGCTTGCTTATTGGTTCTCTAATGGCACACTCTACCCTTGCACACAAAACACCTGGGACTGGCTTGATGGGTGAGTGTTTGGACACTGATGTTATTGATGGCAAGCAAGTCTGTGTTAACTTCCTTCCTCGGAATGACACTGAGACCAACCCCACTGATGGCGATAAGACCACCACCATTAGCTGGGATCATGAAGGCTTCTTTGACCTGCTAGTCTTGATAGCCCCCTATTTAGTGTCCTGGCCTATGATAGCAACGGTGGTTGGCTTCTTTTATGTCGCCACGGCTGATCAACCTGCATACATGTTGGTTTCCCTACTCTTGGCAACATACTCAAAAGCCCAGGTCCTAGCCCTTGCTGGTTTACCCTTTATGGATATGCCGTCAGTTGTTACGCTTTGGGTTTCAATGCTTGTTCATTCCTATGATGCTATTCTTTCACTGTGGGTGGCTCTCCTTCTGGCTGCATTTATCTTGTCAGCAGGTGTCTTTATGCCTGATGTACGCTACTCTGACTTGGTCCGCGGTCAGATAGTGGTCTTCCTAGTCCTTGTTTTCAACTACCTTGTTATTATGATGTCTTTGCCTAATTGGCTTGTCTTCTCCCTTGTCGTTGGCTACAGGGTCTTGCGTGTCTTGACCTTTCTCGTCGCTGAGAAGGTTGAGGTTCGCGGCCCTGACGGTAAGGTTGTAGAAACTCGCACTTCCATGCCCGCGTGGATTAATAAGGCATCCAACTTTTTACAAACTAGGTTCCACCAGAAAATAAGGACAGGTATTTCACCTACGGCACGGGTGATCCCAAATGGTGTTATCGTTGTTGAGACCCAAGACGGTTCAGGAACAGGCTTTAGGTGCCGCAACTATCTGGTCACTGCAGGACATGTCGTGACGGGCACAGAAACACCCAAGATTCAATGGGCCGGTGTTACTGCCTATTCTAAAGTTGTCCACCGCGTGCCGGATAAGGATATAGCTTTTCTTGCCATCCCCCAAGAGCTACAGGATCTACCCTCTTACCGTCTGGCAAAGAAGGTTGAAGATGGTCCTGTGGTTATTACATCTTTGGAAGATTCAGGTGCTTTGTCAGTTGCTGTCACTGAAGGTGTTATAGTGACTGATTCTATAACTTATGCCGTTCAAACTCGGAATGGCATGAGTGGTTCACCTGTTACCAACTTAGATGGTAGGATCCTTGCGGTACACCAAACTAACACTGGCTTCACTGGAGGTGCTGTCATACTAATTGATGAGGACTTCCCACAGCCTAAGAAGTCGGCTCGTGAACAACAACTTGAAGCCCGTATTAAAGAGCTTGAGGCCGCAATGAACCAGTCATCTAATCATGAAGACATTGTGGAGCTTGTTAGAGCTGCAGTGGCCCGAGAGTTTAAAGTGCTTCGAACTGAGCTTTCTGCCACCACTTTTATTCAGGCGAAAGGTAAGAACAAGAAACACCATCGCCGTCGTGGTGGAAAGAAGCGTCGTGCCGTCTGGTCAGAAGAAGAATACAAGGAACTTCTGGAAAAGGGCTTCTCTAAATCACAACTACGTGACATGGCTGAGGTTCTTAGGTCCCATGAGGAGGACCCGTTCGGCTCTGACACTGAATCGGAGGGGGGCTTTCCTGAGTGGTCCGATGTTAGCGACACTGAGTCAATTGAACGGGAGTGGTTTGGCCAGTCGTGGGAAGACTGTAAACCTATCAAGGAAGAACCCCAAGACACGCTCCCTGCGCACCTCAAAGACAAGTACACCTTGGATGCCTATGTCATTAGTAAGGAAGAGCTGAGATCTTTTGCCAAGGAGTTTAAAGACTATGTTGATAAGGTTGAAGCACTAATAGATAAAACTGTTCAGCAGGGTAAGTGGTTACCATCAGTTAACCCCACAGCTATAATTGAGGAGCTTAATGACTTATGGTTTGGCTTGAACATGCTGATGTGGGAGAAGGGCTTGGTTCCTTTCACACAAAGAAAGAAAATCAAGCGTAAGGTTCAAAAAAACTCCAAGGGGGCCCCCAAGAGGGGCCCATTACCTACTCCATGATGGACCTCAAAGCTTGGCGGCGCTCCCTATGTGAGGTTGAGCGCCGCTTAGTACCAGAGGGCTACCCGCTTATTGGTGGAGTCCCCCTGGATAGGCCCATCTCTGACTGGGATGAACCTGTTGATGACTTACTCCTAATGTTACCAGCATTTAAAGAAGACCTTAATTATACTCCTGCTGTCTGGGGACCTGAGGCCTATGCTAAATCATTTGACAAGTTCACCTATAGAGAACCTTGCCCTAATATAGCCGCCACGTACCCACGTGAGTGGTCCTTTGCAACAAAAGCTTTAAAGAGGGAGTACTCTTTCCTTGATGGATCTGTCCTGACTGACATTACTGCTACATCTAAAAATGCTGATTCCACCCCTGCTTACCCCAAGTCTCTTTACTGGAAAACTGAAGCAGACTACCTCGGTGAGCGGGGTTATCAGGATTACATTAAGCAATTGGATGCCATTTACTCTGGGGAACGCCCAGATGTCTTATGGTACCTTTTCTTAAAGAAGGAGATCCTGAAAGTGGAAAAAGTTGAACAGGCTGATATTAGACAAATTGTCTGTTCTGACCCCATATTTGCACGCATAGGCTGTCACTTTGAGGAAGATCAAAATGTCAGGATGAAAAACCATACTAGGACACGCTCTGGCCAGTGTGGCTGGTCGCCTTTCTTTGGTGGCTTCAATGACAGGATCAAGCGCCTATGCGCCTGTGATCCTGATTGCTATATAGAGTTTGATTGGACACGCTTTGATGGTACTATACCTAATGAGGTGTTTATGCATATCAAGAAAGTCCGTTACTCTTTCTTCGCGAAGGAGTTCAGGACGAAGCGTGTTAAAGAAGCCTACCAGTGGTATTGCGAACAGCTTTTACACAGGCACGTCGTGCTCCCCTCGGGTGAGGTGACATTACAGACCCGTGGAAATCCTTCTGGGCAAGTTTCCACCACCATGGACAACAATATGGTGAATGTGTTTCTTCAAGCATTTGAGTATGCCTACCTGCATCCAGACTGTGCAGATGATGAACTTGAGGCAAATTGGTCTCGCATGGACACCCTAGTCTATGGTGACGATAGACTATCCGCATATATTGGCTTACCCGCCGATTATGTGGAGAGGGTTGTGGCAATGTACTCAGATGTCTTTGGTATGTGGGTAAAACCAGAAAAGGTCATCGTTTCTCCTAGCATTATAGGCCTTACCTTTTGTGGTCTCAGAATCACTAGTGATGGCACCATCTTCCTACCTGTTCCAGCAGAGACTAACAAGCTTATCTCTGCACTCATCAAGCCAACTAAGAAATTACAAGATGTGATGACCCTCTATGGGAAACTCCTTTGCTACCGCATCCTTGGCCATAACCTCCCTGATGATAACAAGTTTAAGGCTTACATCTTGGTGGCCTTGGAGGTTGTTGCTAGGCACATCAGAACACGTTGTGGTGACGAGCCACTTCGCTTTACTGATGAGATGCTTGACCGGCTTTGGAGGGGAGGACCAAAAGTCGGATATGGCTGGTGATAAGCCCAACGCATCTGCCAAAGCGGCGCCTTTCGCTAAGGAGGTTGCCAAGGAGGTTGTTAAGGAGGAGAAGAAAGTTCAGGCACGTAGGCGGAAATGGTACAAGCCTCGTCGACAACAAAATAAGCCCAGCCATCAATCCAAGCAACGGGCTACTGTGAGCAAACAAGTCACAAAGAAGCTGAAGCAAGAAGGCCTAGAGGGACCACGGCCTCGCTTTTCTGTGCGAGTGTCAGCTACTATTGGGAGGATATGGCCCAATAAAGAACAGGGGCCCGAACTTCAAATATCGACCTTCCTACATCCATCTCTTATGAAGGAGCCAAATGATGGTACTAACTTTGGGCCTTTGCAGGCGGCCTCAGCACAGTGGGGCTTATGGCGTCTTGCAGGATTGAAAATACGCTGTACTCCCTTGGTAGGACCTTCAGCGGTTACAGGCTCAGTTTATAGGCTTTCCTTAAATCTTACACAATCACCCGGGAATACTTCTTGGGGTGGTTTAGGTGCACGTAAACACATTGATGTACCTGTTGGGAAGCAGTCAACTTGGAACCTTCATAGAGGTGACCTGGCTGGCCCCCGCCAGACTTGGTGGATGACTGACACAAATGAAGAAGGTGGTCAGTCCTGTGGACCTATGGTTGAGATCCACGGCTTGGGGAAGACCTCCTCCACATATAAAGACGCCGACTGGGTTGGTGATCTTTTTATAGTGGAGGTGGTTGGGCGCTGGGAGTTTACCAACTACAACGCTAAACCTGCCCTCGGTACTCTGGATCGTGTGACCGAGGATGTCCAAGCCGGTATTGAGGTTGGCTCAGATGGGATCATGACTATGACCCTACCCCAGCGCTCCAATCTAGCAAAACACATGTCCACAGCCTATGAAAAACTGCCACTAAATGCTCTTACAGTGGGTGAGACTATCTGGCAGATAGTTGACGAAGGTGCTGGCCTTATCTCATCAGCAGTGCCTCCGCCCTTTGGTTGGCTCATTAAGGGCGGCTGGTGGTTTGTTAAGAAGGCTATTGGTAGGTCTAATACAGATGAGACTTACTATGTTTACGCTTCTCTTGCAGACGCGCAAAACAATAAGCCTGTTGAGGCGACTCCTTTTTCGCGTATACCTGCCCAGACCACCATTGCATCCACCCAGATTAATGCACCCAACACCGGGCCTTCTTCTTCTCTGGTTATTTCTACACCGTCTGGCTTGCTACCAGAGGACCTTCCATCCACTGCCACCACATTTGAGGCTGTTGGTTATGTCTCGGCCATGTTTTCAGTTAGTCAGACTACACCACTTTCTCCAGTTGTCAACAATATCTTCCCAGTTTTGGGGCAGAATGCAAGCGACTTTGCATTTTCTATCATGCAGAATCCTACACAGGGGGCCGGCAAAGGTATGGGTTGCCTAATATTTCAGTCCGAACCGGTGTTTCTTGGGCTAAATCTGGACACATCTTCGTCCACAGTTGATAACATCTTTTTGCTTGATGACACACCCGGTATTGGTTGGACTGTCAACTTCAATCTTCCAGCTAGTCCAATCACCAACTGTGCGGACGTTTTGGCGTACAAGCATGAGAAATGGGGTGACAACCTTCAGTTCTCGTCCTGGCTTGTCCGCTTCACAAAGGCAATCCCTGAGTCAGCTGGAAACTATTATTGTCTTGTCTCTGCTCCAGTTGTTTCTGCTGTAAACCAGGCTCCAGTTACCATAGTTTTTGATAAGGTGGCAACTCCAAAATTGTCTACTTCTTCTTCTTTGTCGCAGATGCGTGTTTCTATCTCATCTGTACGACCTGGCATGTATGGTGTTATCTACACCCTTGGTAACTACAATGTAACTGATGCAACTGGAGTAGCCACTGCACCAACCCTGACAGGCCCCGTTAATGACAGAGTGGTGCCTGGCCCCTTTCGTGCAGCCACTGGGATTACACCTATTTCGCTCACGACCCAGCTCCCAACATTCTTTCCTTTGTGGGCAAACTTCTTCAGACCGGCATCCCGGCCGACTATGCTTGATACTCTTATGGAGCAAATTCAACAGAGGTTTGGTTTGAAGCCAGTTGAACCTGATTGTAATTCAGATGATGAGAGTGATGTAGAGCCTACTGCTGCTTCCAAATTTGCCAAGCACAGCATGTATGATGCTCTCCGTGATTCTGACTGGGATCACGTTGATGCCGACGCTCTTATCCATTTTATTTCAAAGGCATCTAATCGCCCCCGAGGCCACGCCGAGTAGGAACGAGGGTACAGGGGTTTTGATCTTTGATTGAAATTCTTCAGATCTCTTTAAAATTGATTTTCTTTTTTTTCTTTAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 23,866
|
MT394895.1
|
Porcine astrovirus 3
|
Matias Ferreyra,F.S., Bradner,L.K., Arruda,P.E.H., Harmon,K.M., Arruda,B.L.
|
Iowa State University, Department of Veterinary Diagnostic & Production Animal Medicine
|
USA
|
2021-06-19
| null |
Porcine astrovirus 3
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,434
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Sus scrofa domesticus
|
spinal cord
|
2018-07-06
| null | null |
UNVERIFIED: Porcine astrovirus 3 strain USA/IA/48142/2018, complete genome
|
CCAAATAGAGCTGCCCGTTGGTCCGGCCCTATGGCGTTGCCTTTTGACGACACTCTTAGGTTTGGTTCAGCCGCGGCCCGTGTGAAAGGCCGTAGGTTAGATTCGGTTGCACGCACCAAGCTGAAGGACTTGCTTGGTGATGGACCTTATTTCTATGATTTTGGTCCTTTAGAAGTCGTTGACTCCTCATCAAAGCAGTTGACTGTGAAAATGACTTCTGTGCAAACCGTCTATGTGTCGTCGGTTGTTGAGGACAATTCTTATGTTACCTATAAGTTTGTGCCTGGCGTTAATGAATGGGTTGAAACAGAGCCTGTTCTGCATAAACCCACAGCTTTGGTTGGTGTTCTTTGGCGTGAGTATAATCGCTATAAGGACAAAACTGAGTCTCTCTCCCAAGAGCTCTCCCAACTTAGGCTTGAACACTCACTGTTGCGCCATGATTATGAACGTGTACGTCCTCAGCAACCGGCAACCCCTAGGTGCCGGTTAGGGTTTATTACAAAATTACTCATTGGCTTGCTTATTGGCTCTTTAATGGCACATTCCACTCTTGCACACAAAACACCTGGGACTGGTTTGTTGGGTGAATGCTTGGACACGGATGTCATCGACGGCAAACAAGTCTGTGTAAACTTTCTCCCTTGGAATGAGACCGAGACCAATCCCACTGATGGCGATAAGACTACTACTATTAGCTGGGACCATGAGGGTCTTCTTGACTTGTTAGTCTTGATAGCCCCTTATCTGGTCTCCTGGCCTATGATAGCAACAATGGTTGGCTTCTTCTATGTTGCCACAGCTGAACAACCTGCCTACATGCTGGTTTCCTTGCTTTTGGCAACATATTCAAAGGCCCAAGTTCTGGCCCTTGCTGGCCTACCATTCATGGATATGCCATCAGTTGTTACGCTTTGGGTTTCAATGCTTGTCCATTCATATGATGCTGTCCTTTCACTGTGGGTAGCCCTTCTTTTGGCCGCGTTTACCTTATCAGCAGGTGTCTTTATGCCCGATGTGCGCTATTCTGACCTGGTTCGTGGCCAGTTAGTGGTTTTCCTTGTTCTCGTCTTCAACTATCTTGTTGTTATGATGTCTTTACCTAACTGGCTTGTTTTCTCCCTTGTCGTTGGTTACAGGGTCTTGCGTGTCTTGACTTTTCTCGTCGCTGAGAAGGTTGAGGTCCGCGGCCCTGACGGCAAGGTTGTAGAAACTCGCACCTCCATGCCTGCGTGGATTAATAAGGCATCTAACTTTTTGCAAACTAGATTCCATCAGAAGATAAGAACAGGTATTTCACCCACAGCACGGGTAATCCCAAATGGGGTTATCGTTGTTGAGACCCAGGATGGCTCAGGAACAGGTTTTAGGTGCCGTAACTACCTAGTCACTGCAGGGCATGTTGTGACGGGCACGGAAACACCCAAGATCCAGTGGGCTGGTGTTACTGCCTACTCCAAAGTTGTCCATCGTGTGCCGGATAAGGACATAGCTTTTCTTGCCATCCCTCAAGAGCTACAGGATCTGCCCTCCTACCGTCTGGCAAAGAAGGTTGAGGATGGCCCTGTTGTTATCACATCTTTGGAAGACTCAGGTGCTCTGTCAGTTGCTGTCACTGAAGGTGTTATAGTGACTGATTCTATAACTTATGCCGTTCAAACTCGAAATGGTATGAGTGGCTCACCTGTTACTAACTTGGATGGTAGGATCCTTGCAGTACACCAAACTAACACCGGCTTTACTGGGGGCGCCGTCATATTAGCTGATGAGGACTTCCCACAACCTAAGAAGTCAGCCCGTGAACAGCAACTTGAAGCTCGTATCAAAGAGCTTGAGGCTGCAATGAACCAGTCATCTAATCACGAAGACATTGTGGAGCTTGTCAGAGCTGCAGTGGCCCGAGAATTTAAAGTGCTTCGTACTGAGCTTTCTGCCACCACTTTTATTCAGGCGAAAGGGAAGAACAAGAAACACCATCGTCGTCGTGGTGGGAAAAAGCGTCGTGCTGTCTGGTCAGAAGAGGAATACAAGGAACTCCTGGAGAAGGGTTTCTCCAAATCACAACTACGTGACATGGCCGAGGTTCTTAGGTCTCATGAGGAAGACCCGTTTGGTTCTGACACTGACTCGGAAGGGGGCTTTCCTGAATGGTCCGATATAAGTGATGCCGAATCAATTGAACGGGAATGGTTTGGTCAGTCCTGGGAAGACTGCAAGCCTGTTAAGGAAGAGCCTCAAGACACACTTCCTGTGCATCTTAAAGAGAAGTATACCTTGGATGCTTATGTCATTAGCAAAGAAGAATTGAGATCTTTTGCTAAGGAGTTCAAAGACTATGTTGACAAGGTTGAAGCACTGATTGATAAGACTGTTCAACAGGGTAAGTGGTTACCATCAGTTAACCCCACAGCTATAATTGAGGAACTTAATGATCTATGGTTTGGTCTCAACATGTTGATGTGGGAGAAAGGCTTGGTTCCTTTTACCCAAAGGAAGAAAATCAAGCGTAAGGTTCAAAAAAACTCCAAGGGGGCCCCCAAGAGGGGCCCATTACCTACTCCATGATGGACCTCAAAGCTTGGCGACGCTCCCTGCATGAGGTCGAGCGTCGCTTAGTGCCAGAGGACTACCCGCTTATCGGCGGGGTGCCCCTGGACAGGCCTATCTCTGATTGGGATGAACCTATTGATGACTTACTCTTAATGCTGCCAGCATTTAAAGAAGATCTTAATTACACTCCTGCTGTTTGGGGACCTGAGGCCTATGCTAAATCTTTTGAAAAATTCACCTATAGGGAGCCTTGCCCTAATATAGCCGCCACGTACCCACGTGAGTGGTCTTTTGCAACAAAAGCTCTGAGGAGGGAGTACTCTTTTCTTGCTGATTCTGTTTTGACTGACATTGCTGCTACATCTAAGAATGCTGACTCTACCCCAGCTTACCCTAAGTCTCTTTACTGGAAAACTGAAGCAGACTATCTTGGTGAGCGAGGATATCAGGATTACATTAGGCAATTGGATGCCATTTACTCTGGAGAACGTCCGGATGTCCTATGGTACCTTTTCCTAAAGAAAGAGATCCTGAAAGTAGAGAAAGTTGAGCAATCTGATATAAGACAAATCGTTTGCTCTGACCCTATATTTGCACGTATAGGATGTCACTTTGAAGAAGATCAAAATGTCAGGATGAAAAACCACACTAAGACACGCTCTGGTCAATGTGGCTGGTCGCCCTTCTTTGGTGGCTTCAATGACAGGATCAAGCGGCTATGCGCTTGTGACCCTGACTGTTACATAGAATTTGATTGGACACGCTTTGATGGCACTATACCCAATGAGGTGTTTATGCACATCAAGAGAGTCCGTTACTCTTTCTTTGCGAAGGAGTTTAGGACGAAGCGTGTCAAAGAAGCTTACCAATGGTACTGCGAACAGCTCTTACACAGGCACGTTGTGCTCCCCTCGGGCGAGGTGACATTGCAGACCCGTGGAAATCCCTCTGGACAAATCTCCACTACCATGGACAATAATATGGTGAATGTGTTTCTTCAAGCATTTGAGTACGCCTATCTGCATCCAGACTGTACAGATGATGAGCTTGAGGTGAATTGGTCTCGCATGGACACCCTAGTCTATGGCGATGATAGACTATCAGCATATGTTGGCCTACCCGCCAATTATGTGGAGAGGGTTGTGACAATGTATTCAGATGTCTTTGGTATGTGGGTGAAACCAGAGAAGGTTATTGTCTCCCCCAGTATCATAGGTCTCACTTTTTGTGGTCTCAGAATCATTAGTGATGGCACCGCCTTCTTACCTGTTCCAGCAGAGACTAATAAGCTTATCTCTGCTCTCATCAAGCCAACCAAGAAATTACAAGATGTGATGACCCTCTATGGGAAACTCCTTTGCTATCGCATCCTTGGCCATAACCTCCCTGATGATAATAAGTTTAAGGCCTACATTCTGGTGGCCTTGGAGGTTGTTGCTAGGCACATCAGGACACGTTGTGGTGATGAGCCACTTCGCTTTACTGATGAGATGCTTGACCGGCTTTGGAGGGGAGGACCAAAAGTCGGATATGGCTGGTGATAAGCCCAACGCATCTGCCAAAGCGGCACCTTTCGCCAAGGAGGTTGCCAAGGAAGTTGTTAAGGAGGAGAAAAAGGTTCAGGCGCGTAGGCGGAAATGGTACAAGCCCCGTCGACAACAAAACCAGCCCCAACAACAACCCAAGCAACGGACTACTGTGAGCAAACAAGTTGCGAAGAAATTAAAGCAGGAAGGCTTGGAGGGACCACGGCCCCGCTTCTCAGTGCGAGTCTCGGCAACTATTGGGAAGATAGGGCCCAATAAAGAACAGGGACCTGAACTTCAAATTTCAACTTTTCTTCATCCCTCCCTTATGAAAGAGCCAAACGATGGCACCAACTTTGGGCCTTTACAGGCCGCCTCAGCGCAGTGGGGCTTGTGGCGCCTTGCAGACTTAAAAATACGCTGCACGCCCCTGGTTGGACCGTCAGCGGTGACAGGCTCGGTTTATAGGCTTTCCTTGAATCTTACACAATCACCCGGTAACACTTCCTGGGGTGGTTTGGGTGCACGTAAACATATTGACGTGCCAGTTGGAAAGCAATCTACTTGGAGCCTTCATAGGGGTGACCTGGCCGGCCCACGACAGACGTGGTGGATGACTGACACTAATGAGGAAGGTGGTCAATCTTGTGGACCTATGGTTGAGATCCATGGCTTGGGAAAAACCTCTTCCACCTACAAAGACGCCGACTGGGTTGGTGATCTTTTTATTGTAGAGGTGGTTGGGCGCTGGGAATTCACCAACTATAACGCCAAACCAGCCCTTGGGACTCTAGATCGTGTTACCGAGGATGTTCAAGCTGGCATTGAGGTTGGTTCAGATGGGATCATGACTATGACTCTACCCCAGCGTTCCAATTTGGCTAAGCATATGTCCACAGCTTACGAAAAGTTACCCTTAAATGC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| 41,179
|
MT394896.1
|
Porcine astrovirus 3
|
Matias Ferreyra,F.S., Bradner,L.K., Arruda,P.E.H., Harmon,K.M., Arruda,B.L.
|
Iowa State University, Department of Veterinary Diagnostic & Production Animal Medicine
|
USA
|
2021-06-19
| null |
Porcine astrovirus 3
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,434
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Sus scrofa domesticus
|
spinal cord
|
2018-07-26
| null | null |
UNVERIFIED: Porcine astrovirus 3 strain USA/IA/53214/2018, complete genome
|
CCAAATAGAGCTGCCCGTTGGTCCGGCCCTATGGCGTTGCCTTTTGACGACACTCTTAGGTTTGGTTCAGCCGCGGCCCGTGTGAAAGGCCGTAGGTTAGATTCGGTTGCACGCACCAAGCTGAAGGACTTGCTTGGTGATGGACCTTATTTCTATGATTTTGGTCCTTTAGAAGTCGTTGACTCCTCATCAAAGCAGTTGACTGTGAAAATGACTTCTGTGCAAACCGTCTATGTGTCGTCGGTTGTTGAGGACAATTCTTATGTTACCTATAAGTTTGTGCCTGGCGTTAATGAATGGGTTGAAACAGAGCCTGTTCTGCATAAACCCACAGCTTTGGTTGGTGTTCTTTGGCGTGAGTATAATCGCTATAAGGACAAAACTGAGTCTCTCTCCCAAGAGCTCTCCCAACTTAGGCTTGAACACTCACTGTTGCGCCATGATTATGAACGTGTACGTCCTCAGCAACCGGCAACCCCTAGGTGCCGGTTAGGGTTTATTACAAAATTACTCATTGGCTTGCTTATTGGCTCTTTAATGGCACATTCCACTCTTGCACACAAAACACCTGGGACTGGTTTGTTGGGTGAATGCTTGGACACGGATGTCATCGACGGCAAACAAGTCTGTGTAAACTTTCTCCCTTGGAATGAGACCGAGACCAATCCCACTGATGGCGATAAGACTACTACTATTAGCTGGGACCATGAGGGTCTTCTTGACTTGTTAGTCTTGATAGCCCCTTATCTGGTCTCCTGGCCTATGATAGCAACAATGGTTGGCTTCTTCTATGTTGCCACAGCTGAACAACCTGCCTACATGCTGGTTTCCTTGCTTTTGGCAACATATTCAAAGGCCCAAGTTCTGGCCCTTGCTGGCCTACCATTCATGGATATGCCATCAGTTGTTACGCTTTGGGTTTCAATGCTTGTCCATTCATATGATGCTGTCCTTTCACTGTGGGTAGCCCTTCTTTTGGCCGCGTTTACCTTATCAGCAGGTGTCTTTATGCCCGATGTGCGCTATTCTGACCTGGTTCGTGGCCAGTTAGTGGTTTTCCTTGTTCTCGTCTTCAACTATCTTGTTGTTATGATGTCTTTACCTAACTGGCTTGTTTTCTCCCTTGTCGTTGGTTACAGGGTCTTGCGTGTCTTGACTTTTCTCGTCGCTGAGAAGGTTGAGGTCCGCGGCCCTGACGGCAAGGTTGTAGAAACTCGCACCTCCATGCCTGCGTGGATTAATAAGGCATCTAACTTTTTGCAAACTAGATTCCATCAGAAGATAAGAACAGGTATTTCACCCACAGCACGGGTAATCCCAAATGGGGTTATCGTTGTTGAGACCCAGGATGGCTCAGGAACAGGTTTTAGGTGCCGTAACTACCTAGTCACTGCAGGGCATGTTGTGACGGGCACGGAAACACCCAAGATCCAGTGGGCTGGTGTTACTGCCTACTCCAAAGTTGTCCATCGTGTGCCGGATAAGGACATAGCTTTTCTTGCCATCCCTCAAGAGCTACAGGATCTGCCCTCCTACCGTCTGGCAAAGAAGGTTGAGGATGGCCCTGTTGTTATCACATCTTTGGAAGACTCAGGTGCTCTGTCAGTTGCTGTCACTGAAGGTGTTATAGTGACTGATTCTATAACTTATGCCGTTCAAACTCGAAATGGTATGAGTGGCTCACCTGTTACTAACTTGGATGGTAGGATCCTTGCAGTACACCAAACTAACACCGGCTTTACTGGGGGCGCCGTCATATTAGCTGATGAGGACTTCCCACAACCTAAGAAGTCAGCCCGTGAACAGCAACTTGAAGCTCGTATCAAAGAGCTTGAGGCTGCAATGAACCAGTCATCTAATCACGAAGACATTGTGGAGCTTGTCAGAGCTGCAGTGGCCCGAGAATTTAAAGTGCTTCGTACTGAGCTTTCTGCCACCACTTTTATTCAGGCGAAAGGGAAGAACAAGAAACACCATCGTCGTCGTGGTGGGAAAAAGCGTCGTGCTGTCTGGTCAGAAGAGGAATACAAGGAACTCCTGGAGAAGGGTTTCTCCAAATCACAACTACGTGACATGGCCGAGGTTCTTAGGTCTCATGAGGAAGACCCGTTTGGTTCTGACACTGACTCGGAAGGGGGCTTTCCTGAATGGTCCGATATAAGTGATGCCGAATCAATTGAACGGGAATGGTTTGGTCAGTCCTGGGAAGACTGCAAGCCTGTTAAGGAAGAGCCTCAAGACACACTTCCTGTGCATCTTAAAGAGAAGTATACCTTGGATGCTTATGTCATTAGCAAAGAAGAATTGAGATCTTTTGCTAAGGAGTTCAAAGACTATGTTGACAAGGTTGAAGCACTGATTGATAAGACTGTTCAACAGGGTAAGTGGTTACCATCAGTTAACCCCACAGCTATAATTGAGGAACTTAATGATCTATGGTTTGGTCTCAACATGTTGATGTGGGAGAAAGGCTTGGTTCCTTTTACCCAAAGGAAGAAAATCAAGCGTAAGGTTCAAAAAAACTCCAAGGGGGCCCCCAAGAGGGGCCCATTACCTACTCCATGATGGACCTCAAAGCTTGGCGACGCTCCCTGCATGAGGTCGAGCGTCGCTTAGTGCCAGAGGACTACCCGCTTATCGGCGGGGTGCCCCTGGACAGGCCTATCTCTGATTGGGATGAACCTATTGATGACTTACTCTTAATGCTGCCAGCATTTAAAGAAGATCTTAATTACACTCCTGCTGTTTGGGGACCTGAGGCCTATGCTAAATCTTTTGAAAAATTCACCTATAGGGAGCCTTGCCCTAATATAGCCGCCACGTACCCACGTGAGTGGTCTTTTGCAACAAAAGCTCTGAGGAGGGAGTACTCTTTTCTTGCTGATTCTGTTTTGACTGACATTGCTGCTACATCTAAGAATGCTGACTCTACCCCAGCTTACCCTAAGTCTCTTTACTGGAAAACTGAAGCAGACTATCTTGGTGAGCGAGGATATCAGGATTACATTAGGCAATTGGATGCCATTTACTCTGGAGAACGTCCGGATGTCCTATGGTACCTTTTCCTAAAGAAAGAGATCCTGAAAGTAGAGAAAGTTGAGCAATCTGATATAAGACAAATCGTTTGTTCTGACCCTATATTTGCACGTATAGGATGTCACTTTGAAGAAGATCAAAATGTCAGGATGAAAAACCACACTAAGACACGCTCTGGTCAATGTGGCTGGTCGCCCTTCTTTGGTGGCTTCAATGACAGGATCAAGCGGCTATGCGCTTGTGACCCTGACTGTTACATAGAATTTGATTGGACACGCTTTGATGGCACTATACCCAATGAGGTGTTTATGCACATCAAGAGAGTCCGTTACTCTTTCTTTGCGAAGGAGTTTAGGACGAAGCGTGTCAAAGAAGCTTACCAATGGTACTGCGAACAGCTCTTACACAGGCACGTTGTGCTCCCCTCGGGCGAGGTGACWTTGCARACCCGTGGAAATCCMTCTGGACAAATCTCCACTACCATGGACAATAATATGGTGAATGTGTTTCTTCAAGCATTTGAGTACGCCTATCTGCATCCAGACTGTACAGATGATGAGCTTGAGGTGAATTGGTCTCGCATGGACACCCTAGTCTATGGCGATGATAGACTATCAGCATATGTTGGCCTACCCGCCAATTATGTGGAGAGGGTTGTGACAATGTATTCAGATGTCTTTGGTATGTGGGTGAAACCAGAGAAGGTTATTGTCTCCCCCAGTATCATAGGTCTCACTTTTTGTGGTCTCAGAATCATTAGTGATGGCACCGCCTTCTTACCTGTTCCAGCAGAGACTAATAAGCTTATCTNTGCTCTCATCAAGCCAACCAAGAAATTACAAGATGTGATGACCCTCTATGGGAAACTCCTTTGCTATCGCATCCTTGGCCATAACCTCCCTGATGATAATAAGTTTAAGGCCTACATTCTGGTGGCCTTGGAGGTTGTTGCTAGGCACATCAGGACACGTTGTGGTGATGAGCCACTTCGCTTTACTGATGAGATGCTTGACCGGCTTTGGAGGGGAGGACCAAAAGTCGGATATGGCTGGTGATAAGCCCAACGCATCTGCCAAAGCGGCACCTTTCGCCAAGGAGGTTGCCAAGGAAGTTGTTAAGGAGGAGAAAAAGGTTCAGGCGCGTAGGCGGAAATGGTACAAGCCCCGTCGACAACAAAACCAGCCCCAACAACAACCCAAGCAACGGACTACTGTGAGCAAACAAGTTGCGAAGAAATTAAAGCAGGAAGGCTTGGAGGGACCACGGCCCCGCTTCTCAGTGCGAGTCTCGGCAACTATTGGGAAGATAGGGCCCAATAAAGAACAGGGACCTGAACTTCAAATTTCAACTTTTCTTCATCCCTCCCTTATGAAAGAGCCAAACGATGGCACCAACTTTGGGCCTTTACAGGCCGCCTCAGCGCAGTGGGGCTTGTGGCGCCTTGCAGACTTAAAAATACGCTGCACGCCCCTGGTTGGACCGTCAGCGGTGACAGGCTCGGTTTATAGGCTTTCCTTGAATCTTACACAATCACCCGGTAACACTTCCTGGGGTGGTTTGGGTGCACGTAAACATATTGACGTGCCAGTTGGAAAGCAATCTACTTGGAGCCTTCATAGGGGTGACCTGGCCGGCCCACGACAGACGTGGTGGATGACTGACACTAATGAGGAAGGTGGTCAATCTTGTGGACCTATGGTTGAGATCCATGGCTTGGGAAAAACCTCTTCCACCTACAAAGACGCCGACTGGGTTGGTGATCTTTTTATTGTAGAGGTGGTTGGGCGCTGGGAATTCACCAACTATAACGCCAAACCAGCCCTTGGGACTCTAGATCGTGTTACCGAGGATGTTCAAGCTGGCATTGAGGTTGGTTCAGATGGGATCATGACTATGACTCTACCCCAGCGTTCCAATTTGGCTAAGCATATGTCCACAGCTTACGAAAAGTTACCCTTAAATGC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| 41,180
|
KY940545.1
|
Porcine astrovirus 3
|
Arruda,B., Arruda,P., Hensch,M., Chen,Q., Zheng,Y., Yang,C., Gatto,I.R.H., Ferreyra,F.M., Gauger,P., Schwartz,K., Bradner,L., Harmon,K., Hause,B., Li,G.
|
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine, College of Veterinary Medicine
|
USA
|
2017-12-03
| null |
Porcine astrovirus 3
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,461
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Porcine astrovirus 3 strain USA/IA/7023/2017, complete genome
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|
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|
Boros,A., Albert,M., Pankovics,P., Biro,H., Pesavento,P.A., Phan,T.G., Delwart,E., Reuter,G.
|
ANTSZ, Baranya County Institute of State Public Health Service, Regional Laboratory of Virology
|
Hungary
|
2017-11-15
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Porcine astrovirus 3
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,393
|
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Hungary
|
Hungary
|
Sus scrofa domesticus
|
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|
2016
| null | null |
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Boros,A., Albert,M., Pankovics,P., Biro,H., Pesavento,P.A., Phan,T.G., Delwart,E., Reuter,G.
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ANTSZ, Baranya County Institute of State Public Health Service, Regional Laboratory of Virology
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Hungary
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2017-11-15
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Porcine astrovirus 3
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Mamastrovirus
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Astroviridae
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Hungary
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Sus scrofa domesticus
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| 73,745
|
KY073232.1
|
Porcine astrovirus 3
|
Boros,A., Albert,M., Pankovics,P., Biro,H., Pesavento,P.A., Phan,T.G., Delwart,E., Reuter,G.
|
ANTSZ, Baranya County Institute of State Public Health Service, Regional Laboratory of Virology
|
Hungary
|
2017-11-15
| null |
Porcine astrovirus 3
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,394
|
GenBank
| null |
Hungary
|
Hungary
|
Sus scrofa domesticus
|
brain
|
2015
| null | null |
Porcine astrovirus 3 strain NI-Brain/386-2015/HUN, complete genome
|
CCAAATAGAGCTACCCGTTGGTCCGGCCCTATGGCGTTGCCATTCGACGACACTCTTAAATTTGGCTCAGCCACGGCCCGTATGAAGGGTCGTCGGTTGGACATGGTTGCACGCACCAAGTTAAAAGACTTACTTGGTGATGGTCCTTACTACTATGACTTTGGACCCCTGGAAGTTGTCGACTCTTCTTCTAAGCAGTCAACTGTTAAAATGACTTCCGTGCAAACTGTTTATGTGTCGTCGGTTGTTGAGGACAACTCCTACGTAACCTACAAGTTTGTGCCTGGCGTCAATGATTGGGTTGAAACTGAACCTGTTCTTCATAAACCCACGGCTTTGGTTGGTGTCCTATGGCGTGAGTATAAACGCTACAAGGATAGAACTGAAACTCTTACACAAGAGCTTTCCCAACTCAAGCTTGAACATTCATTATTGCGCCATGATTATGAACGTGTACGTCCTCAGCAACCAATAGCTCCTAAGGGCCGGTTAGGGTTCATCACAAAGTTACTCATTGGCTTACTTATTGGCTCTCTGTTGGCTCACTCTACTCTTGCACATAAGTTACCTGGGACTGGCTTAATGGGTGAATGTTTAGACACTGATGTTATTGATGGTAAGCAGGTGTGTGTGAATTTTATCCCTCGAAATGATACCGAGGCTGACTCACAAGATAAACCTGCTACCACTGTCTGGGATCCTGAAGGTCTTCTTGAGTTGCTTATTCTAGTGGCTCCTTATTTAGTGTCTTGGCCCATGATTGCAACAATGGTTGGCTTTTTCTATGTTGCTACAGCTGAACAGCCTGCCTATATGCTAGTATCTTTACTCTTAGCAACATACTCAAAAGCCCAGGTCTTAGCCCTTGCTGGCCTTCCCTTCATGGATATGCCATCAGTTGTCACGCTCTGGGTTTCTATGCTTATCCATTCATATGATGCTGTTCTTTCATTATGGGTGGCTCTGCTCCTGGCCGCGTTCATCTTGTCTGCTGGCGTCTTCATGCCCGATGTACGCTACTCTGAGTTGGTGCGTGGTCAGGTGGTAGTCTTCCTTGTCCTTGTCCTGAACTACCTTGTTGTAATGATGTCTTTGCCCAACTGGCTTGTCTTCTCCCTTGTCGTTGGCTACAGGATACTGCGTGTTTTAACATTTCTTGTGGCTGAGAAAGTTGAAGTCCGTGGTCCTGATGGCAAGGTTGTAGAGACACGTACTTCCATGCCTGCATGGATTAACAAGGCGTCAAATTTCTTTCAGACTAGGTTTCATCAAAAGATAAGGACAGGTATCTCGCCCACAGCACGGGTGATTCCAAATGGGGTCATCGTTATTGAAACTCAGGATGGTTCAGGAACGGGTTTTAGGTGTCGAAACTACCTTGTCACTGCAGGACATGTTGTGACAGGTACGGAAACACCAAAAATCCAGTGGGCTGGTGTCACTGCTTACTCAAAAGTTGTCCATCGTGTATCAGATAAAGATATTGCTTTTCTTGCCATTCCTCAAGAACTTCAAGATTTACCTTCTTACCGCTTGGCTAAGAAGGTTGAGGATGGTCCCGTGGTTATTACATCCCTAGAGGATTCAGGTGCTCTGTCAGTTGCTGTCACCGAAGGTGTCATAGTGACTGATTCTATAACTTATGCCGTCCAGACACGGAATGGCATGAGTGGTTCACCTGTTACTAACCTTGATGGTAGGATTCTTGCAGTGCATCAAACCAACACTGGTTTCACTGGGGGCGCTGTGATACTATCTGATGAAGACTTTCCACAGCCTAAGAAATCAGCCCGTGAACAACAACTTGAGGCACGTATTAAGGAACTTGAGGCCGCAATGAATCAGTCTTCTGGCCATGAGGACATTGTGGAGCTTGTGAGAGCCGCAGTGGCCCGTGAATTCAAAGTGCTGCGCACTGAACTTTCTGCCACCACTTTTACTCAGGCAAAAGGCAAGAATAAGAAAAATCATCGTCGGCGTGGTGGTAAGAAACGCCGCGCTGTCTGGTCAGAAGAAGAATATAAGGAACTCCTAGAGAAAGGCTTTTCCAAATCACAACTACGTGAAATGGCTGAGGTTCTTAGATCTCATGAGGAAGACCCGTTTGGCTCTGACACTGACTCGGAAGGGGGTTTCCCCGAGTGGTCCGATATTAGTGATACTGAGTCAATTGAACGGGAGTGGTTTGGCCAGTCCTGGGAAGACTGTAAGCCTGTTAAGGAAGAGCCCCAGGACACACTTCCTGTGCACCTTAAAGATAAATACACCTTGGATGCCTATGTCATTAGTAAGGAAGAGTTGAAATCTTTTGCCAAGGAGTTCAAAGACTATGTTGACAAGGTTGAAGCATTAATTGATAAAACTGTCCAACAGGGTAAGTGGTTGCCATCAGTTAATCCCACAGCCATAATCGAGGAGCTTAATGACTTATGGTTTGGCCTAAATATGTTGATGTGGGAGAAAGGCTTGGTTCCTTTTACACAAAGGAAGAAAATCAAGCGTAAGGTTCAAAAAAACTCCAAGGGGGCCCCCAAGAGGGGCCCATTACCTACTCCATGATGGACCTCAAAGCATGGCGGCGCTCCCTGTGTGAGGTTGAGCGCCGCTTAGTACCAGAGGGTTACCCGCTTATTGGTGGGGTGCCTCTGGACAGGCCTATCTCTGATTGGGATGAACCTATTGATGACTTACTCCTAATGTTACCAGCATTTAAAGAGAATCTTAACTACACTCCTGCTGTTTGGGGGCCTGAGGCCTATGCTAAATCATTTGATAAGTTCACTTATAGAGAGCCTTGCCCTAACATAGCCGCCACGTATCCACGTGAGTGGTCTTTTGCAACAAAAGCTTTGAAGAGGGAGTACTCTTTCCTTGATGGCTCTGTCCTGACCGATATTACTGCCACATCCAAAAATGCTGACTCCACCCCTGCTTATCCTAAGTCTCTTTACTGGAAAACTGAAGCAGACTATCTTGGTGAGCGGGGCTATCAGGATTACATTAAGCAATTGGACGCCATCTACTCTGGGGAACGCCCAGATGTTTTATGGTACCTCTTCTTGAAGAAGGAAATCCTGAAAGTGGAAAAAGTCGAGCAGGCCGACATTAGACAAATTGTTTGTTCTGACCCTATATTTGCACGTATAGGTTGTCACTTTGAGGAGGATCAAAACATCAGGATGAAGAACCATACTAGGACACGGTCTGGTCAGTGTGGCTGGTCGCCTTTCTTTGGTGGCTTCAATGACAGGATCAAACGCTTATGCGCTTGTGACCCTGATTGTTACATAGAATTTGATTGGACACGCTTTGATGGTACTATACCTAATGAAGTGTTTATGCACATCAAGAAAGTCCGCTACTCTTTCTTCGCGAAGGAGTTTAGGACGAAGCGTGTTAAAGAAGCCTACCAGTGGTACTGCGAACAGCTCCTGTACAGGCACGTCGTGCTCCCTTCGGGTGAGGTAACATTGCAGACCCGTGGAAACCCCTCTGGACAAATCTCCACCACTATGGACAACAACATGGTAAATGTTTTTCTTCAAGCATTTGAGTACGCCTACTTACACCCAGATTGTACAGATGAGGAACTCGAGGCAAATTGGTCTCGTATGGATACCCTGGTTTATGGTGATGATAGATTATCCGCATATATTGGCTTGCCCGCCAATTATGTGGAGAAGGTTGTAATAATGTACTCAAATGTTTTTGGTATGTGGGTGAAACCAGAAAAAGTTATCGTTTCCCCCAGCATTATAGGTCTCACCTTCTGTGGTCTCAGAATTACCAGCGACGGTACCATCTTTTTACCTGTTCCAGCAGAGACTAACAAGCTTATTTCTGCGCTCATTAAGCCAACCAAGAAACTTCAAGATGTGATGACCCTCTATGGGAAACTCCTTTGCTACCGCATCCTTGGCCACAACCTCCCTGATGACAACAAGTTTAAGGCCTATATTCTGGTGGCCTTGGAGGTTGTTGCTAGGCACATCAGAACACGTTGTGGTGACGAGCCACTCCGCTTTACTGATGAGATGCTTGACCGGCTTTGGAGGGGAGGACCAAAAGTCGGATATGGCTGGTGATAAGCCCAATGCGTCTGCCAAAGCGGCACCTCTTGCTAAGGAGGTTGCCAAGGAGGTTGTTAAGGAGGAGAAGAGAAATCAGGCACGTAGTCGGAAGTGGCGTAAGCCTCGCCGACAGCAAAATCAACCTCAACAATCAAAACAACGAGCCGTTGTGACTAGGCAAGTTACAAAGAAATTAAAGCAAGAGGGCTTGGAAGGACCACGACCCCGCTTTTCTGTACGAGTGTCAGCTACCATTGGAAAGATTGGGCCCAATAAAGAACAGGGGCCCGAACTTCAAATTTCAACTTTCTTACACCCATCTCTTATGAAGGAACCAAATGATGGCACCAATTTTGGGCCTTTGCAAGCAGCCTCAGCACAGTGGGGTCTGTGGCGTCTTGCAGACTTAAAGATACGCTGTACACCCTTAGTTGGGCCATCGGCAGTTACAGGCTCAGTCTATAGGCTTTCCCTAAATCTCACTCAATCACCCGGCAATACCTCTTGGGGTGGCCTAGGTGCACGCAAACATATTGATGTACCAGTGGGAAAGCAATCAACTTGGAGCCTTCACAGGGGCGACCTTGCTGGCCCTCGCCAAACCTGGTGGATGACTGACACTAATGAAGAAGGAGGCCAATCTTGTGGACCTATGGTTGAGATTCATGGCTTGGGAAAGACTTCCTCCACTTATAAAGACGCCGACTGGGTTGGCGATTTGTTTATAGTGGAGGTGGTAGGACGTTGGGAGTTTACCAATTACAATGCTAAGCCCGCCCTCGGCACCTTAGATCGTGTGACCGAGGATGTCCAAGCCGGCATTGAGGTTGGTTCAGATGGGATCATGACTATGACCCTTCCTCAACGCTCCAACCTAGCTAAGCACATGTCAACAGCTTATGAAAAATTACCATTAAATGCCCTTACAGTGGGTGAGACCATTTGGCAGATAGTTGATGAAGGTGCTGGCCTTATCTCATCTGCAGTACCTCCGCCTTTTGGCTGGCTCATTAAAGGTGGCTGGTGGTTTGTTAAGAAGGCCATTGGTAGGTCTAATACAGATGAGACCTATTATGTTTATGCCTCTCTTGCAGATGCGCAAAACAATAAACCTGTTGAGGCGACTCCCTTCTCACGTATACCTGTCCAAACCACCATTGCATCCACCCAGATTAATGCGCCTAACACTGGGCCCTCCTCTTCTCTGGTCATTTCCACGCCTTCTGGCTTGTTACCAGAGGATCTTCCATCTACTGCTACCACCTTTGAGGTCGTTGGCTATGTGTCAGCTATGTTTTCAGTTAATCAGACCACACCGCTTTCTCCAGTTATTAATAATGTGTTCCCAGTTCTGGGGCAGAGTGCAAGTGATTTTGCATTTTCCATCATGCAAAATTCTACACAGGGGGCTGGGAAAGGCATGGGTTGCCTAATCTTTCAGTCCGAGCCGGTGTTCCTTAGGCTAAATCTAGATACATCATCATCTACAGTTGATAACATCTTCTTGCTTGATGATACCCCTGGTATTGGCTGGACTGTTAACTTCAATCTTCCAGCTAGTCCAATCACCAACTGTGCAGATGTCTTGGCGTACAAGCATGAAAAATGGGGTGATAACCTCAAGTTTTCATCTTGGCTTGTCCGCTTAACAAAAGTAATCCCTGAGTCAGCTGGCAACTACTATTGCCTTGTTCCTGCTCCAGTTATTTCACCTGTGTACCAGGCTCCAGTTACTATAGTCTTTGATAAAGTGGCAACTCCAAAGTTGTCTACTTCTTCTTCATTGTCACAGATGCGTGTTTCTATCTCATCTGTGCAGCCTGGTACGTATGGTGTTATCTATACCCTTGGCAGTTATAATGTGACTGATGCCACTGGAGTAGCTACTGCACCGACCCTGACAGGCCCCGTTAATGACAGGGTGGTGCCTGGCCCCTTTCGTGCAGTAACTGGGATTACACCTATCTCGCTCACAACCCAGCTGCCGACATCTTTTCCTTTGTGGGCAAACTTTTTCAGGCCGGCTTCCCGGCCGAGCATGATTGACACTCTTATGGAGCAAATCCAACAGAGGTTTGGTCTGAAGCCAATTGAACCTGACTATAATTCAGATGATGAGAGCGATGTAGAGCCTACAGCTGCTTCTAAATTTGCCAAGCATAGCATGTATGATGCTCTCCGTGATTCTGACTGGGATCACGTTGATGCCGACGCTCTTATCCATTTCATTTCAAAGGCATCCAATCGCCCCCGAGGCCACGCCGAGTAGGAACGAGGGTACAGGGGCTCAGATCTCTTTCAAATTGATCTTTCTCTTTTCAGGC
| 73,746
|
JX556691.1
|
Porcine astrovirus 3
|
Xiao,C.T., Halbur,P.G., Opriessnig,T., Gimenez-Lirola,L.G., Gerber,P.F., Jiang,Y.H.
|
Department of Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine, College of Veterinary Medicine
|
USA
|
2012-11-14
|
US-MO123
|
Porcine astrovirus 3
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,460
|
GenBank
| 2
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2011-06-24
| null | null |
Porcine astrovirus 3 isolate US-MO123, complete genome
|
CCAAATAGAGCTGCCCGTTGGTCCGGCCCTATGGCGTTGCCTTTTGACGACACTCTTAGGTTTGGTTCAGCCGCGGCCCGTGTGAAAGGCCGTAGGCTAGATTCGGTTGCACGTACTAAGCTAAAGGATTTGCTTGGTAATGGACCTTATTTCTACGATTTTGGTCCTTTAGAAGTCGTTGACTCTTCATCAAAGCAGTTGACTGTGAAAATGACTTCTGTGCAAACCGTCTATGTGTCGTCGGTTGTTGAGGACAACTCTTATGTTACCTATAAGTTTGTGCCTGGCGTCAATGAATGGGTTGAAACAGAGCCTGTTCTGCATAAACCCACAGCTTTGGTTGGTGTTCTCTGGCGTGAATATAATCGCTATAAGGACAAAACTGAGTCTCTCTCCCAAGAGCTCTCCCAACTTAGGCTTGAACACTCACTGTTGCGCCATGATTATGAACGTGTACGTCCTCAGCAACCGGCAACCCCTAGGTGCCGGTTAGGGTTTATCACAAAGTTACTTATTGGCTTGCTTATTGGCTCTTTAATGGCACACTCCACCCTTGCATACAAAACACCTGGGACTGGTTTGTTGGGTGAGTGCTTGGATACCGATGTTATCGACGGTAAACAAGTTTGTGTGAACTTTCTCCCTTGGAATGAGACTGAGACCAATCCCACTGATGGCGATAAGACTACTACTATTAGCTGGGATCATGAAGGTCTTCTTGACTTGTTAGTCTTGATAGCTCCTTATCTGGTCTCCTGGCCTATGATAGCAACAATGGTTGGCTTCTTCTATGTTGCCACAGCTGAACAACCTGCTTACATGCTGGTTTCCTTACTCTTGGCAACATATTCAAAGGCCCAAGTTCTGGCCCTTGCTGGCCTACCATTCATGGATATGCCATCAGTTGTTACGCTTTGGGTTTCAATGCTTGTCCATTCATATGATGCTGTCCTTTCATTGTGGGTGGCTCTTCTTCTGGCCGCATTTACCTTATCAGCAGGTGTCTTCATGCCCGATGTACGCTACTCTGACCTGGTCCGTGGCCAGTTAGTGGTTTTCCTTGTTCTCGTCTTTAACTATCTTGTTGTTATGATGTCTTTACCTAACTGGCTTGTCTTCTCCCTTGTCGTTGGTTATAGGGTCCTGCGTGTCTTGACTTTTCTCGTCGCTGAGAAGGTTGAGGTCCGCGGCCCTGACGGTAAGGTTGTAGAAACTCGTACCTCCATGCCTGCGTGGATTAATAAGGCATCTAACTTTTTGCAAACTAAATTCCATCAGAAGATAAGAACAGGTATTTCACCCACAGCACGGGTAATCCCAAATGGGGTTATCGTCGTTGAGACCCAGGATGGCTCAGGAACAGGTTTTAGGTGCCGTAACTACTTAGTCACTGCAGGACATGTTGTGACGGGCACGGAAACACCCAAGATCCAGTGGGCTGGTGTCCCTGCCTACTCTAAAGTTGTCCATCGTGTGCCGGATAAGGACATAGCTTTTCTTGCCATCCCTCAAGAGCTACAGGATCTGCCCTCCTACCGTCTGGCAAAGAAGGTTGAGGATGGCCCTGTAGTTATCACATCTTTGGAAGATTCAGGTGTTTTGTCAGTTGCTGTCACTGAAGGTGTTATAGTGACTGATTCCATAACTTATGCCGTTCAAACTCGGAATGGTATGAGTGGTTCACCTGTTACTAACTTGGATGGTAGGATCCTTGCAGTACACCAAACTAATACCGGCTTTACTGGGGGCGCCGTCATATTGACTGATGAGGACTTTCCACAACCTAAGAAGTCAGCCCGTGAACAGCAACTTGAAGCTCGTATCAAAGAGCTTGAGGCAGCAATGAATCAGTCATCTAATCATGAAGACATTGTGGAGCTTGTCAGAGCTGCAGTGGCCCGAGAATTTAAAGTGCTTCGCACTGAGCTTTCTGCCACCACCTTTACCCAGGCGAAAGGTAAAAACAAGAAACATCATCGTCGTCGTGGTGGGAAGAAGCGCCGTGCTGTCTGGTCAGAAGAAGAGTACAAGGAACTCCTAGAGAAGGGTTTCTCCAAATCACAACTACGTGACATGGCCGAGGTTCTTAGGTCTCATGAGGAAGATCCGTTTGGTTCTGACACTGAATCGGAAGGGGGTTTTCCTGAATGGTCCGATGTTAGTGATGCTGAATCAATTGAACGGGAGTGGTTTGGTCAGTCCTGGGAAGACTGTAAGCCTGTTAAGGAAGAGCCTCAAGACACACTTCCTGTGCATCTCAAAGAGAAGTACACCTTGGATGCCTATGTCATTAGCAAAGAAGAATTGAGATCTTTTGCTAAGGAGTTCAAAGACTATGTTGACAAAGTTGAAGCACTAATTGATAAAACTGTTCAACAGGGTAAGTGGTTACCATCAGTTAACCCCACAGCTATAATTGAGGAACTTAACGATCTATGGTTTGGCCTCAACATGCTGATGTGGGAGAAAGGCTTGGTTCCTTTTACTCAAAGGAAGAAAATCAAGCGTAGGGTTCAAAAAAACTCCAAGGGGGCCCCCAAGAGGGGCCCATTACCTACTCCATGATGGACCTCAAAGCTTGGCGACGCTCCCTGTATGAGGTTGAGCGTCGCTTAGTGCCAGAGGACTACCCGCTTATTGGTGGGGTGCCCCTGGACAGGCCTATCTCTGACTGGGATGAACCTATTGATGACTTACTCTTAATGTTGCCAGCATTTAAAGAAGATCTTAATTACACTCCTGCTGTTTGGGGACCTGAGGCCTATACTAAATCTTTTGAAAAATTTACCTATAGAGAGCCTTGCCCTAATATAGCCGCCACGTACCCACGTGAGTGGTCTTTTGCAACAAAAGCTCTGAGGAGGGAGTACTCTTTTCTTGCTGATTCTGTTTTGACTGACATTGCTGCTACATCTAAGAATGCTGACTCGACCCCAGCTTACCCTAAGTCTCTTTATTGGAAAACTGAAGCAGACTATCTTGGTGAGCGAGGATATCAGGATTACATTAGGCAATTGGATGCCATTTACTCCGGAGAACGTCCAGATGTCCTATGGTACCTTTTCTTAAAGAAAGAGATCCTGAAAGTGGAGAAAGTTGTGCAATCTGATATAAGACAAATCGTTTGTTCTGACCCTATATTTGCACGTATAGGATGTCACTTTGAAGAAGATCAAAATGTCAGGATGAAAAACCACACTAAGACACGCTCTGGCCAATGTGGTTGGTCGCCCTTCTTTGGTGGCTTCAATGACAGGATCAAGCGGCTATGTGCTTGTGACCCTGACTGTTACATAGAATTTGATTGGACACGCTTTGATGGTACTATACCCAATGAGGTGTTTATGCACATCAAGAGAGTCCGCTACTCCTTCTTTGCGAAGGAGTTTAGGACGAAGCGTGTCAAAGAAGCTTACCAATGGTACTGCGAACAACTTTTACACAGGCACGTTGTGCTCCCCTCGGGCGAGGTGACATTGCAGACCCGTGGAAATCCTTCTGGACAAATCTCCACTACCATGGACAATAATATGGTGAATGTGTTTCTTCAAGCATTTGAGTACGCCTATCTGCACCCAGACTGTACAGATGATGAGCTTGAGGCAAACTGGTCTCGTATGGACACCCTAGTCTATGGTGACGATAGACTATCAGCATATGTTGGCCTACCCGCCAATTATGTGGAGAGGGTTGTGACAATGTATTCAGATGTCTTTGGTATGTGGGTGAAACCAGAAAAGGTTATTGTCTCCCCCAGTATCATAGGTCTCACTTTTTGTGGTCTTAGAATTATTAGTGATGGTACCGCCTTCTTACCTGTTCCAGCTGAGACCAATAAGCTTATCTCTGCTCTCATTAAGCCAACCAAGAAATTACAAGATGTGATGACCCTCTATGGGAAACTCCTTTGCTATCGCATCCTTGGCCATAACCTCCCTGATGACAACAAGTTTAAGGCCTACATTTTGGTGGCCTTGGAGGTTGTTGCTAGGCACATCAGGACACGTTGTGGTGATGAGCCACTCCGCTTTACTGATGAGATGCTTGACCGGCTTTGGGGGGGCGGACCAAAGGTCGGATATGGCTGGTGATAAGCTCAACGCATCTGCCAAAGCGGCACCTTTCGCTAAGGAGGTTGCCAAGGAAGTTGTTAAGGAGGAGAAAAAAACTCAGGCACGTAGGCGGAAATGGTATAAGCCCCGTCGACAACAAAATCAGCCCCAACAACAATCCAAGCAACGGACTACTGTGAGCAAACAAGTTGCAAAGAAATTAAAGCAGGAAGGCTTGGAAGGACCACGGCCCCGCTTCTCAGTGCGAGTCTCGGCAACTATTGGGAAGATAGGGCCCAATAAAGAACAGGGACCTGAACTTCAAATTTCAACTTTTCTTCATCCCTCCCTTATGAAGGAACCAAATGATGGCACCAACTTTGGGCCTCTACAGGCCGCTTCAGCGCAGTGGGGCTTGTGGCGCCTTGCAGGCTTAAAGATACGCTGTACGCCCCTGGTTGGGCCGTCAGCGGTGACAGGCTCAGTTTATAGGCTTTCCTTGAATCTTACACAATCACCCGGTAACACTTCCTGGGGTGGTTTGGGTGCACGTAAACATATTGACGTGCCAGTTGGGAAGCAGTCAACTTGGAACCTTCATAGGGGTGACTTGGCCGGCCCGCGACAGACGTGGTGGATGACTGACACTAATGAGGAGGGCGGTCAATCTTGTGGACCTATGGTTGAGATCCATGGCTTAGGGAAAACTTCTTCTACTTATAAAGACGCCGACTGGGTTGGTGATCTTTTTATTGTAGAGGTGGTTGGACGCTGGGAGTTCACCAACTACAATGCCAAACCAGCCCTTGGAACACTAGATCGTGTGACCGAGGACGTTCAAGCCGGTATTGAGGTTGGCTCGGACGGGATCATGACTATGACTCTCCCCCAGCGTTCTAATTTAGTTAAGCATATGTCCACAGCTTATGAAAAGCTACCACTGAATGC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| 95,802
|
NC_023675.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Shan,T., Li,L., Simmonds,P., Wang,C., Moeser,A., Delwart,E.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-03-07
| null |
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,639
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2010
| null |
PRJNA485481
|
Porcine astrovirus 4 strain 35/USA, complete genome
|
GTAGGGGATTCACATCCAAGGTTGATTTAGCTGTCAACTCTGGCAACTATAACGCTAGGCTACAAGCCGGCGAAATGGTTGACCGGTTGAGGTGCTTGCCAGGGCACCGACCAAATTCCCCATGGGACATAAGAACAGTCCCAAGGCATATGATTTACCCAACACTCTCTATTGACCCACGAGATCGTGTTATTATAGCTTCATCTGTGACAACTGATAATGAATGGGTAACCTATGTTCTTGATGGGAATAGTTGGCAGCAAACCATTTGTGCCCAGGATGAACAGGTTGTTATTCTAGTATGCGCCCTTCTTAATGATAAGGATGAGAGGGAAAAGGAACTTGCAACCCTCAAGCTGGAAAATGATCTTAAAGCTCAACAGTGTGCATACCTGAGACAACAAATACCACCAAAAAATCCTGGAGCAAAATGGTCCTGGCTTTCAATCTTTGCACTGCTGGTTCTAACCCTGGCTACACTTAAAGGAGCAATGGCCCTGGAGACAAAGAGTACATCTCATGGAGTTGACTATGATCGAATTGTCCAACTGAATGAGGAACTAGATGTTTTTATACAAAATGCATTGCAAAAGAATTGGACAAAACATGTCACTGAAACATTTGTCTATCACCATAAGACTCAGGGACTTGACTGGAAGGCAAAAATTATGAGTAGCCTTAGTGATTGGTATAATAGTAAGAAGCCACAAACCTCTCACTTGGTTGATAGTGTTTTTTGTGCAATTGGTCTGATACTACCCTGGATTTGGGAGGTCTGTGTCCTTGTGCTTGCAATCTTCATCATCTTTAAAAGTAAGCGTAGGGCACTTGATTGTTTCTACCTAGCAGCAGCATCCTTTTCCAACTTGAAATTTAGTTTTGTTGCTGTGGCCCCCATCCAAACTACACACACCATCTATGTGGCGTGTGCACTGTCAGTTATCCATTGGTGCGACCCAATTGCAGCAGCACTTATATCTCTGGTCTACTTGATTGGTTTCTCTGTGATTGGCATGTTTATGTCTGATGTAGAGTACATCAAACAACTTAGAGCAGTACTCTCATTAGCAATGATTTTTTCATTCCATTGGCTGTGTGACTTATTTGGTGTGCCACCAATTATATTTACAGTCTTATGTTTCTGCTGGAGGCTAGTTAGGCTGTTAACTGCCTTACCTGGGCATGTAATTGAGATAAGGGATCCAACTGGAAAAGTCACACAGAAAGTTAGCTCTTTTGATGGCCCACTCTTTAAATTCTTTCAGGGGCTTAAAGCCAAACTTAAGCAGGTTAGATCAACAACTGTACCTTTAGTCAGAATCAATCCAGCAGCAGTGTGCCACATTTCAACGGGTGACGGTTCGAAAGGGACTGGTTTCTTCTGTGCAAACTATACTGTAACAGCAGCACATGTGCTTGGTAACCATAAAGTAGCGACCATCTGCTACCAGGGAAAGAATTACCAGGCAAATGTAAAGAAAACATCTGAGAAAGACATGATCTTCCTTGAAATACCTGCAGCACTCCAAGGAGTACCTCGGTTCAAGTTATCAAAGAAGTACAACTGCGACTGGGTTTGTGTCCTGGCCCCTAGTGGGGAAGGAGCATTTGTGACATCAGTGGTTGAGGGCAAAGCCCATGAAGGCACATTCTCATATGCATGTCCAACCCGTGACGGGATGTCTGGAGCACCACTTCTAGACATGGACGGTCATGTTCTTGGTATTCATCAAACCAACACTGGCTATACCGGTGGAGCCGTACGGCTTGAACATGAGGATGTGATCGACCCACCAAAGGAAAACACCCAAGTTGCACAATTGAAGAAACAAATTGAGGAACTTAAGATGCAACTCGCGCAGAAGGAAGCTACCCCTACTACTACACCACCTCCAAAACCACAGAGGCCCCCACGCTCTAAGGACATGCAGCAATGCACTATGGAGGATTCTGAAATAGTTGAACTCATCAGGATCGCCATGCAGCGCGAGATGGGGATCTTGCGCGAAGAGATTAATGATAGTCTCTTACAGAAAAAGAAGGGTAAGACCAAGCATGGCCGTGGGAGGAAACATGGTGGTGGACGTAAGAGAAAGATTGGTAGAATGTTTACTGAGGAGGAATATCAGGAGATGCTTGATTCAGGCCTTGAGCCGGAACAGATCCGGGCAATTGCAGAAGATCTCTATGACCAGCAACATGATTTTCCTGAGTGGAGTGATCCTGAAGATGATGATGAGGTAAATGAGTGGTGGTTTGGTGGGGATCATTCTGGCAACGTCCACGAAGACGATGATGAAATACCATCTTACTACCAGAAGAAGAGGAAGCCACTTGGTGACTACCTCATCAAGGAGTGGACCCAGGAAAGCATTGATGAAATGATGGCTTCTCTCTCACCACTTGAGATGAAGAAGGCTAAGCCACTCCTGCAACACTTGAAGTGTGATGATCCACTCAAGAAGACAGTCATTGTTGCAATGCTTGACCGTGTCCTAACTGCCAATGGCCTGTCACCAGTATCCGAGGGTCTTGACTTTCAACAGCGTGTCAAGCCAAAAAACGGCAAGCCGGGGCGCCACGATCCCCAGAAGCCGACCTCGGCGCGTGGAAAAAGTCAGCAGTAAAACCACGCCGACATCTGGTACCTAATGGATATCCGGTCTATTGCAATTTGCCTGTTAATCGACCAATCTGTGATTACAACATTCCTGATGAACCTCTTCTCGGTATCCTACCACCAGCACAGAGTGACTTTGAGTATGCACCAACAGTGTGGGGTCCTGAAGCATTTGCCAAGTCTTTTGAAAAATTTGACTATGCACCCTATTGTGATTTTGAGAAAGAATATCCTGAGTGCACACAATTCGCTGACTGGGCATGGAGAGTCCATCATAACTACCTTGAAGACACAAAAGTCATTCACATCTCAGCCACAGAGAAAAATCTTGATTCAACACCAGCTTATCCTAAAATGTTAGACTATGAAACAGAAGAAGAATTCTTGGATGAGCATGGCTGGGACCCCTATGTGTCTGCCTTTTCAGCAATTGACAGGGGCTATGACCCTGATGCCCTCTGGTACTGTTTCCTCAAGAAGGAAATCTTAAAGAAGAAAAAAATCGAGGATTCAGATATCAGACAAATAGTGTGCGCAGATCCCATCTATGCCAGGATAGGGGCATGCTTTGAACAACATCAGAATCATCTCACAAAACTACACACTGAAACACATTCAGGGCAGTGTGGATGGTCCCCATTCAATGGTGGCTTCACCAGACTTTGTCAACGTCTTGAGTCAAAACCAGGTGTGTTTGTGGAGCTTGACTGGACCAGGTTTGATGGAACTATCCCTGCTCCTCTACTTAAAAGGATCAAGAAGCTCCGCTTTTCAATGCTCTGTACAGAACATCAAGAGCGTTACCAACACATCTATAAATGGTATGTCAGGAATCTACTCAATCGGTATGTTATGATGCCGAGTGGTGAAGTCACTAAGCAGACAAGGGGGAATCCTTCTGGGCAAATTTCAACAACAATTGACAACAACATGGTTAACATCTGGCTCCAGGCCTTTGAGTTCTGTTGGTTCTTTGGACCAGACAAAGAACTGTGGAGGGATTATGACACCATCGTCTATGGAGACGACAGATTGACCCGTTATCCAATCTTACCAGAGAACTACAGAGAAAGGGTCATCGCCCTCTACAAAGATGTCTTTGGGATGTGGATAAAGCCAGAAAAAGTGAAAGTCTCAGAGACACTTGAAGGCCTAACATTCTGTGGATTTACAGTTGGCCCAGATAGGTTGCCTTACCCCACTGATGAAGAGAAACTCTATGCTGGACTTGTAACACCTGCAAGAAAGCTTCCTGATGTCACAGCGCTGCATGGGAAACTCCTGAGCCTACAACTCCTGATGCATAACCATCCTGACAGTGCCTTTAAAGATTACATCAATAAATGTTTGGCTGAAACAGCGAGGCACGCCGAGGATCTGCCTGCCAGACTCACAGAAAGGCAGATGGACAGGCTTTGGAGGGGCGGACCAAAGCATAAGCCTAATGGCTAACACTAAGAACAATGTCCAGCCTCAGGTGGTCACGACTACTACGACGGTGTCTAACCGTCGTGGTAGGCGTCGCCGTAGGCGCGCTAATCGCATACCTCCAGCTACTACAACCACTGTTAGGAGAACTAAAATTACTAAGCCACCTGCTAGGCCTCGCCGTAGGCGCAATAATCGGGCTAGCAATTTTAATCAACAGGGTAGTTCCATCTTCAAACAAAAAATAACAGCAACACTGGGTACAGTTGGTTCAAATCAGGGAGATAAGATTGAGCTTGAAATGGCAGCACTTCTAAACCCAGCCCTCACTAAGGACTCAACTGGTGCTAACGGGTACGGGCCTTTACAAATGTATGCAGCAAATTACAATATGTGGAGAGTAGACAACATTCTCATTAAATTAACACCTCTAGTAGGGGCCTCTGCAGTCTCAGGTACTGCGGTGCGAGTGTCCCTCAATAATGCTGCAACACCTGGGTCACCTTCCTGGTCCGCCCTTGGTGCCAGAAAGCACAAGGATACAAGCCCCGGTAAACCCATGACAATGAGAATTCCTGGATCCGCACTTGCGGGACCAAAGGATGGCTGGTTTTTAACAAATACTAAATCAGAAGCACATATGTGTATTGGTGGATCTATTGAAATCCATACTCTTGGTCAAACAATGTCAACATATCAGGCCAAAGTGTTTACTGGTCCTTTATTCTTGTGTGAGATGACAGCAGTGTGGATGTTTAAAAATTACAACCCTACACCTGGAATGTTGAATTTGGTAAAAACTGATGCCCTTGAGCAGCCTGAGCAGATAAAAATACATTCAAAGCCTGGTGAACCAATTCTGATATCAGTACCAGCAGCCTCCTCATTTGCGCGTGTAGCAGGAGGAATCAATGTGGCCGCAGATGCACCTCCATCTGAAATAATCTGGCAAATCTGTGATACAACAGTTGACCTTTTGAAGGGTGCACTCCCAGCACCTTTTGCTTGGCTCTTTCAAGCAGGCTGGTGGTTTGTAAAACGAATTGCAAACAAAAAGAAGACAGGTGAGAGCATTCCTGGTGAGCCAGATCCAAATGAAGTGACATTCCAGGTATTTCAGAGTATTTCAGATGCACAAAACAACATCCCCTGCATTGCCACTAGTGAAGCTGCAAGTACCAATGTTAACATCACAGGCCTTGAGATCACACAGATCACACCTGGCAACCTTGGTCAGCCACAGGAGTCACTTTTTAGCTTGAGAAGAACTCCTGACGTCACACTTGACCAGATTGAAATAACATCACACCCACTTTTAGGCCAACCAGCATATAATGGGCACATCTTCACACAAGTTCCAAATTCATGTTTTGTGGCACAGAGGGCTGTGGGCACCCCAAAGAGCAAAGTCTACAGCTATATAGCATGGCATCTTAACAACCCAGTTTTTACACAAAACGGGAATGAAATAAATCCTGCCCAAATTTCATCAAACCCTTATCCAATTCTCCACAAGGACGGTTCCAATTTTCGAGAGATTGGGACTGTGTTCGCAGCTGGCTATGCATCAATGGGCCAGACTCCAGATTACAACTGGACAACAATACTGTGGAGATCAAATATAACTGAAGAAGTTAAGATAAGGGGGCAGACTGGTACAACAGATAGGTTTGTCTTTGTTCAACCCACGCAGAGTCAGAACACCTCTAGCCCACCAACAACAGTCTATAATGTTACATTAACAAACCAGATATCTATGCCAGAGAGAAGAGTCCCATTGGTTGCAGGAGAATGGTATTTAAGCTCTTTTGTTACATATCGTGGCGCTGTGGAATTCACAAACTATGGGGTGCCCTTTTATCACAGTCTCCAAAATCCTGCCACAGCAACATCCCAGTATGACATAGGAAGACCTGTGTTTGAAGTGGGTGCAGCCATGCAGACATCAATGCCACTTATTCTCCAACCACCTAGTTCCCAAACTGCCCCAGCACTAACATCTAGTGAGTTAACACAATTGAGGCTACTACTCGCCCCACGTGCTGAGTATCCACCTTCAGAGTATGACAACGTGGATATGGCCCCCATGGAGGGTNAAGAGGAAGAACCTCAGGGAGCAGTGGGAGACACTGAGTCACCACTTGACACCAGGAATTGGGTTGAGTTTGGATATAGAAAGAGGCCACCAACACCTTTTTCACCAACTGGAGAGGAGGAAGAAGATGAAGAGGAATCAGATTTGGATGATGATGATTATGCTGAACCACCTGTTGTGATTAAGAATTTACTTACTCCTGAAGCTAAGAATCTTTATGGTCATCTGAGACAGAAGGGTCTCAGTCATGAGCAAGCAACCAACGCTGCCCAAGCCGCGTTCCCCCACATCGCTCTCGAAGCCTGGGATGCGGCATACCATAATGCCATGGCTGATGGGCTCTCGCCACCCACAGCGCGAGATTGCGCGTGGAAGGCCGTTTCAGATTTCCTTTCCTAATCTGTTCAGTTTTTTCTTGTTTTCTCTTTTCTGAAGTAGATTAGAATTAGCATTTAAAAATTTGAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 6,624
|
ON792967.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Carvajal,A., Arguello,H., Cortey,M., Diaz,I., Gomez-Garcia,M., Puente,H.
|
Facultad de Veterinaria, Sanidad Animal
|
Spain
|
2022-10-02
|
SP-VC29
|
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,513
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
|
Sus scrofa
|
feces
|
2017-06-06
| null | null |
Porcine astrovirus 4 isolate SP-VC29, complete genome
|
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Facultad de Veterinaria, Sanidad Animal
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Spain
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Porcine astrovirus 4
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Astroviridae
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Spain
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Facultad de Veterinaria, Sanidad Animal
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| 23,871
|
ON792972.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Carvajal,A., Arguello,H., Cortey,M., Diaz,I., Gomez-Garcia,M., Puente,H.
|
Facultad de Veterinaria, Sanidad Animal
|
Spain
|
2022-10-02
|
SP-VT41
|
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,513
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
|
Sus scrofa
|
feces
|
2018-05-16
| null | null |
Porcine astrovirus 4 isolate SP-VT41, complete genome
|
TGGCGATGGCCCGCAAGGGATTTACGTCCAAGGTTGATTTAGCTGTCAACTCTGGCAACTATCTTGCCGGCCAACAGGCCGGCACTATGGTTGACCAGTTGAGGTGCTTGCCAGGGCACCGACCAAATTCCCCCTGGAGCATTAAAACAATGCCGCGGCATATGATCTACCCAACACTGAATACTGATCCACGAGATCGTGTCATCATAGCTTCATCTGTGACAGTGGAGAACGAATGGGTGACTTATGTTCTTGACGGGGAAAGTTGGCAGCAAACCATTTGTGCTCAGGATGAACAGGCTGTTATTCTTGTGTGCGCCCTCCTCAATGATAAAGATGAGAAGGAAAAGGAAATCGCAACTCTTAAACTGGAAAATGACCTCAAGGCCCAACAATGTGCATACCTGAGACAGCAGATACCATCAAAACAACCTGAAGCACAATGGTCCTGGCTTTCAATCCTTGCGCTGTTGGTTTTGATCCTGGCTACGTTTAAAGGAGCGACAGCAATGGAGACAAAGAGCACTTCACATGCAGTGGACTATGAAAAAATCATTAAACTCAATGAAGAACTCGATGAGTTTATTAATAATGCATTGCAGAAAAATTGGACTAAGCAAGTCACAGAGGTACATACTGGTCATTATGAAACCACTAACTTGGGCTGGAAGCAAAAGATCATCTCTAGCCTGAATGACTGGTATGCAAATAAGAAACCACAAACTACATACCTAGTCGATTTAGTCCTTTTGGTGGTTGGTCTTATAACACCATGGCTGTGGGAGGTGAGTGTCTTTGCTTTGTCAATCCTTATAATTATAAAGAGTGATAGAAAGGTTTATGACTTTTTCTACCTTGCAGCAGCCTCCTTCTCACAACTGAGATTCAGTTTAATAGTGTTAGCACCACTGCAGACAATCTACACCATCTATTTAACATGTGTTTTTGCAGTGATCTACCATTTTGATCCGATTGCAACATCTTTGATCTCTGTTGTGCATTTAGTGATTTTCTTTATAGTGGGGATGTTCCTTCCAGATGTTGATTATATCAAGAACCTGAGGGCAGTTGGGTCAGTAACATTAATTGTCCTGGCCCACTGGATTTGTGAGCTTTTTGGGATCTCCCCTATTGTCTTAACAGCAGTGTGTTTTATTTGGAGGTTGGCACGTCTCCTTATAGCTATGCCTGGACAAGTGATAGAGATAAGGGACTCATCTGGAAAAATAACTCAGAAAATAAGCTCCTTTGATGGTCCACTTTTTAAATTTTTCCAAGGCCTTAAAGCCAAGCTTAAACAGGTGAGATCAGGGACTGTACCCTTGGTTAGGATCAACCCCTCAGCGGTTTGTCACATCTCCACTGATGATGGATCGAAAGGAACTGGTTTTTTCTGTGCAAACTACATAGTAACAGCTGGACATGTAGTGGGTAGCCATAAAGTTGTAACTATCAATTACCAAGGAAAGAATTTTCAATCCAATGTTAAAAAGACATCTGAAAAAGATTTGGTATTCCTGGAAATACCACCAGCATTTCAGGGTGCTCCTCGACTTAAATTATCTAAGAAGTATAACTGTGATTGGGTTTGTGTTTTAGCCCCAAGTGGTGAGGGCGCATTTGTAACATCAGTGGTAGAAGGTAAAGCCCATGAAGGTACCTTCTCATATCCCTGTCCAACTAGGGATGGGATGTCTGGAGCACCACTGCTTGACGTGGATGGCCATGTGCTTGGTATACATCAAACCAACACTGGCTACACCGGTGGTGCCATTCGACTTGAACATGAGGATGTGATTGACCCACCTAAGGAAAATACCCAGGTTGCACAGCTAAAGAAACAGATTGAGGAACTTAAGATGCAGCTTGCACAGAAGGAATCTACTCTAGCAACACCACCTCCAAAGCCACAAAGACCACCACGCACGAAAGATATGCAGCAGTGTACTATGGATGATTCAGATATAGTTGACTTTGTCAGTATTGCCATGCAGCGTGAGATGGAAGTTCTACGTGATGAGATTAATGAAAATCTCCTCAAACAGAAAAAGAAGGGAAAAACTAAACAAGGCCGTGGTAGGAAGCATGGTGGTGGCCGCATAAGAAAGATTGGCAAGATGTTTACTGAGGAAGAATACCAGGAAATGCTTGATTCAGGCCTTGAACCAGAACAGATTCGGGCAATTGCAGAGGAACTCTATGACCAACAACATGACTTTCCTGAGTGGAGTGATCCTGAAGATGATGATGAGGTTAATGAATGGTGGTTTGGTGATGATTATTCTGGTAATGTCAATGATGATGATGACGAGATACCATCATACTATCAGAAGAAAAGGAAGCCACTTAGTGACTATCTCATTAAGGAGTGGACTCAAGAAAGTATTGAAGAAATGTTAAATTCTCTTTCTCCACTTGAAATGAAGAAGACAAAACCACTCCTTCAACACCTTAAGTGTGATGATCCACTCAAGAAGACAGTCATTGTTGCAATGCTTGACCGTGTCTTAACATCTAATGGTCTGTCACCGGTGTCTGAGGGGCTTGACTTTCAACAACGTGTCAAGCCAAAAAACGGCAAGCAGGGGCGCCACGATCCCCAGAAGCCGACCTCGGTGCGTGGAAAAAGTCAGCAGTAAAACCACGCCGACACTTGGTGCCTGACGGATACCCGGTCTACTGCAACTTGCCTGTTAATCGACCAATCTGTGATTATAACATCCCTGATGAACCCCTCTTAGGTATTCTACCACCAGCACAGAGTGAATTTGACTATGCACCAACAGTGTGGGGTCCTGAAGCATTTGCTAAATCTTTTGAAAAATTTGATTATGCACCTTACTGTGATTTTGAAAAAGAATATCCTGAGTGCACACGCTTTGCTGATTGGGCATGGAGAGTTCATCATACCTACCTTGAGGATTCTAAAGTCATCCACATCTCAGCCACAGAGAAGAACCTTGACTCAACACCAGCTTATCCTAAAATGTTAGACTATGATACAGAAGAAGACTTCCTGGATGAGCATGGCTGGGACCCCTATGTGTCTGCCTTTTCAGCAATTGATAGAGGCTATGAGCCTGATGTACTCTGGTACTGTTTCCTCAAGAAGGAGATCTTAAAGAAGAAAAAAATTGAGGATGCAGATATCAGACAAATCGTGTGTGCAGATCCCATCTATGCGAGGATAGGTGCATGTTTTGAGCAACATCAGAACCATCTTACAAAATTACATACTGAAGAAAGATCAGGGCAGTGTGGATGGTCCCCATTTAATGGTGGCTTCACCAGGCTGTGTGAACGGCTTGAGTCAAAACCAGGTGTCTTTGTGGAGCTTGATTGGACCAGGTTTGATGGAACAATCCCTGCTCCTCTCCTTAAAAGGATCAAAAAGCTCCGCTTTTCAATGCTTTGTACAGAACATCAAGAAAGATACCAACACATCTACAACTGGTATGTCAAAAACTTACTCAATCGGTATGTCATGATGCCGAGTGGTGAGGTCACTAAACAGACAAGGGGGAATCCTTCTGGGCAAATCTCAACAACGATTGATAACAACATGGTAAATATCTGGCTTCAGGCCTTTGAATTCTGCTGGTTCTTTGGACCAGACAAAGAATTGTGGAGGGATTATGACACCATCGTCTATGGAGACGATAGATTGACCCGTTATCCTATTTTACCAGAAAACTACAAAGAAAGGGTCATTCACCTCTACAAGGATGTCTTTGGGATGTGGATAAAACCAGAGAAAGTAAAAATCTCAGAGACACTTGAAGGCCTGACATTCTGTGGATTTACAGTTGGCCCAGACAGGTTACCTTACCCCACTGATGAAGAGAAACTCTATGCTGGACTTGTAACACCTGCAAGAAAGCTCCCTGATGTTACAGCGCTGCATGGGAAACTCCTGAGCCTACAGCTTCTGATGCACAACCATCCTGACAGTGCCTTCAAAGATTACATCAACAAATGTTTGGCTGAAACAGCGAGGCACGCCGAGGATCTGCCTGCAAGACTTACAGAAAGGCAGATGGACAGGCTTTGGAGGGGCGGACCAAAGCATAAGCCTAATGGCTAACAACCAGAAAAATGTCCAACCCAAGGTGGTCACGACTACTACGACGACTACTCGTCGTCGTGGTGGGCGTCGCCGCCGGCGGACTCCTCGCACATCTCAGGCTGGTACGACCACTGTTAGGAGGGTTACCACTACTAGACAACCTGGCAGGCCTCGTCGTGGGCGCCGTAATCGCTTTGGCGCTCCTGGTAAACCGGCTCCTGCCATCTTCAGACAAAGAATCACAGCAACATTAGGTACAGTGGGTTCAAATCAGGGAAATACCATTGAACTTGACATGGCAGTACTTTTAAACCCAGCCATTATGAAAGAAACAACAGGTTCAAATAGCTATGGCCCTTTACAGATATATGCATCAACTTATAGCCTCTGGAGAGTTGACACCATTCTCCTAAAATTAACACCTCTAGTAGGGGCTTCTGCAGTCTCAGGGACTGCGGTGCGAGTGTCCCTTAATAATGCTGCAACACCTGGTTCACCTTCCTGGTCCGCCCTTGGTGCCAGGAAGCATAACGTTACAACCCCGGGTAAGCCTATGACAGGGAGAATCTCTGGATCCTCACTTGAGGGGCCAAAGGATGGCTGGTTCTTAACAAACACACAATCAGAAGCACATATGCGTATTGGGGGCGCTATTGAAATACACACTCTCGGGAAGACCATGTCCACATACCAAAATAAGGTATTGACAGGTGCTTTATTCCTATGTCAGATGACAACTGAATGGCTATTCAAGGATTACAACCCAACACCAGGCATGCTCAACCTCGTCAAAACTGAAGCTCTTGAGCAGTCTGAGCAGATAAAAATACACTCAAAACCTGGTGAACCAATCCTTATATCAGTACCAGCAACTTCCACATTTGCGCGTGTCGCAGGAGGAGTTAATGTGGCCGCAGATGCACCCCCCTCTGAAATAATTTGGCAGATCTGTGATACAACAGTTGATCTTTTGAAAGGTGCACTCCCAGCACCTTTTGCTTGGCTATTCCAGGCAGGCTGGTGGTTTGTAAAACGAATTGCAAATAAGAAGAAGACAGGTGAAAGTATTGCTGGTGAACCGGATCCAAATGAGGTCACATTCCAGGTTTTTCAGAGCATTTCAGATGCACAAAACAATGTTCCATGTATTGCCACTAGTGAAGCTGCAAGTACCAATGTCAATATCACAGGCCTTGAAATCACACAGATTACACCTGGTAACCTTGGCCAGCCACAGGAGTCATTGTTGAGCTTGAGAAAAATTCCTGACCATACACTTGATTCAATTGAGATAACTTCCCATCCAGACCTCGGGCAACCTGCATACAATGGCCACATTTTCACACAAGTTCCAAATGCATGTTTTGTGGCACAAAAGGCCGTAGGCACTCCAAAGAGCAAGGTCTATAGCTATATAGCATGGCATCTTAACAAACCTGTCTTTATGCAAAATGGAAATGAAATAAACCCCGCCCAAATTTCATCGAACCCTTACCCAATACTCCACAAGGACGGCAGCAACTTCCGTGAGATAGGAACCGTCTTTGCAGCTGGCTATGCTGCCATTGGTCAAACACCAGACTATAACTGGACAACAATATTGTGGAGGTCAAATATAACTGAGGAAGTCAAGATAAGGGGTCAAACAGGTGCAACTGATAGATTTGTTTTTGTACAACCAACACAAAGTCAAAACACATCCAGTCCACCAACAACTGTGTATAATGTTACATTAACAAATCAGATGTCCATGCCAGAGAGGAGAATTCCATTGGTAACAGGTGATTGGTATCTAAGCTCCTTTGTCACATATCGTGGCAGCATTGAATTTACAAACTATGGAGTGCCCTTTTACCATGGTCTTCAGAATCCCACTACAACAACATCACAATATGACATAGGTAGACCTGTCTTTGCAGTTGGAGCTGCTATGCAAACATCCATCCCCCTAACACTTACACCGCCTTCACATTCTAGTGTACCATCTTTGACAAACTTTGAGGTTGAACAATTAAGGGTTCTTTTGAATCCAAGAGCCATACCACCTCCCCCACCATCAGAATATGATAATCTGGAAATGCCACACTTGGAAGATGTAGAAGAGGGAGAGTTTGGAGCAGTTGGAGACACTGAATTAAAAGAGTTCTGCCATGGGAAGAGACCACCAACACCATTCTCACCAATGGAAGAGGAGGAAGAAAAAGAAGAAGAATCTGATTTGGATGATGATGATTATGCTGAACCTCCTATTGTGATTAAAAATTTACTTACTCCTGAAGCTAAGGAACTTTATGGGTGTCTGAGACGTCAGGGTCTCAGCCATGAGCAGGCAACTAATGCTGCCCAAGCCGCTTTCCCTCACCTTGCCCTCGAGGCCTGGGATGCGGCATACCATAATGCCATGGCTGATGGACTCTCGCCACCCACAGCGCGAGATTGCGCGTGGA
| 23,872
|
MW962975.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Xu,S.
|
Yunnan Agricultural University, College of Animal Medicine
|
China
|
2021-06-22
|
PAstV4 (YN01-2020)
|
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,725
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2020
| null | null |
Porcine astrovirus 4 isolate PAstV4 (YN01-2020), complete genome
|
CCTCTAGAGATTCCAAATTGACCGTTGGTGGCGATGGCCCGTAAGGGATTTACATCCAAGGTTGATTTAGCTGTCAGCTCTGGCAACTATAATGCCAGGCTTCAAGCCGGCAATATGGTTGACCAGTTGAGGTGCTTGCCAGGGCACCGACCAAGTTCTCCATGGGACATCAGGACCTTACCACGTTATATGATCTACCCAACCTTGTCCACTGACCCAAGAGATCGTGTAATTATAGCATCATCAGTTACAGATGACAATGAATGGGTTACTTATGTCCTTGATGGAGATAGCTGGCGGCAAACCATTTGTGCCCGGGATGAACAGGTTGTCATTCTTGTGTGTGCACTTCTCAACGACAAGGATGAGAAGGAAAAAGAAATTGCAACACTCAAGCTGGAGAATGATCTTAAAGCCCAACAATGCGCATACTTGAGGCAACAAATACCACCAAAAGTTCCTGGAGCAAAATGGTCCTGGCTTTCAATCCTTGCACTCCTGGTTTTGATCTTGGCAACAATTAAGGGAGCTATGTCCTTTGAAACACAAAGTACCTCACATTCAGTGGACTATCAAAAATTGGCAAAACTTAACGAGGAACTTGACAGCTTTATTGAGAATGCACTGCGTAAGAACTGGACAAAGCATGTCACTGAAACCTTTATCCACTACCATACAACTCAAGAGTCAAGCTGGAAATCTAAAATTATAGGTAGCTTGAGCAACTGGTATAACAGTAAAAAACCACAAACATCTTACATGGTTGAGGGAGTTCTGTGTGCAATTGGGCTTGTTTTACCCTGGATCTGGGAGTTGTGCGTCCTTGTACTTGCCATCTTCATAATTTTGAAGAGCAAGAGGAAAGCAATGGATTGCCTCTATTTAGCAGCAGCATCCTTCTCCAATCTAAAATTCAGTTTTGTTGCTGTTGCTCCCATCCAGACGCCACATTCAATTCATGTGGCATGTGTGCTTTCAATCATATACTGGTTTGACCCAATTGCAGCAGCACTCATTTCCCTGTTATACTTGGTTGGCTTTTCAGTGATAGGTATGTTTATGTGTGATGTGGAATACATCAAACACCTTAGGGCAGTCTTCTCACTCTTTATGATCTTTGCCTTCCACTGGTTGTGTGAGCTCTTTGGTTTTCCACCAGTTATCTTCACAGTTCTTTGCTTCTGTTGGAGGCTGCTTAGATTGTTAACAGCAATACCAGGACATGTAATTGAGATAAGGGATCCAACTGGGAAAGTTACACAAAAAGTTAGCTCCTTTGACGGTCCACTTTTTAAATTCTTCCAGGGATTAAAGGCCAAGCTTAAGCAAGTGAGATCAGTGAGTGTACCCTTAGTCAGGATTAATCCAACAGCAGTTTGCCATATCTCGACTGGTGATGGCTCAAAGGGTACTGGTTTCTTTTGTGCAAACTATGTGGTAACAGCAGCACATGTTGTCGGAAACCATAAGGTGGCTACTATCTGCTATCAAGGAAAGAACTATCAAGCTAATGTAAAGAAAACATCAGAAAAAGATATGATCTTCCTTGAGATACCACCAGCTTTACAGGGTGTTCCTCGGTTTAAGCTATCAAAGAAATACAACTGTGACTGGGTTTGTGTCCTAGCACCTAGTGGTGAGGGCGCATTTGTAACATCGGTGGTTGAAGGAAAATCTCATGGCGATACATTCTCTTACCCCTGTCCAACTAGGGATGGGATGTCTGGAGCACCGCTGCTCGATGTGGATGGCCACGTGCTTGGTATACACCAGACCAACACTGGCTACACCGGTGGCGCTGTCCGGCTTGAACATGAGGATGTGATCGACCCACCTAAAGAAAATACCCAGGTTGCAGCTCTCAAGAAGCAAATAGAGGAACTTAAGATGCAGCTTGCACAAAAGGATGCTGCTTCCACCACACCACCTCCAAAACCACAGAGGCCCCCACGCACTAAGGATATGAAACAATGTAACATGGAAGACTCTGACATTGTTGAATTGATTAGGATTGCCATGCAACGCGAGATGGGAATCTTGCGTGAGGAGATTAATGATAGTCTCCTCCAGAAAAAGAAGGGTAAGTCCAAGCATGGTCGTGGGAGGAAACATGGTGGTGGACGCAGGAGAAAAATTGGTAGGATGTTTACTGAAGAGGAGTACCAGGAGATGCTTGATTCAGGTCTTGAACCAGAACAGATCCGGGCAATTGCAGAGGAACTCTATGAACAACAGCATGACTTTCCTGAGTGGAGTGACCCTGAAGACGATGACGAGGTGAATGAGTGGTGGTTTGGTGATGACCACTCTGGCAATGTTAATGACAGTGATGATGAAATACCATCTTATTACCAGAAGAAGAAGAAACCACTTAGTGACTACCTCATTAAGGAGTGGACTAAGGAAAGTATTGATGAAATGTTGGCCTCTCTCTCTCCTCTTGAGATGAAGAAGGCGCAACCACTCCTTCAACACCTGAAATGTGAGGATCCACTCGAGAAAACAGTCATTGTCGCAATGTTGGACCGTCATTTGGCATCACACGGTCTTTCACCGGTGTCCGACGGCCTCGAATATCAACAGAGGATGAAGCCAAAAAACGGCAAGCCGGGGCGCCACGATCCCCAGAAGCCGACCTCGGCGCGTGGAAAAAGTCAGCAGTAAAACCACGCCGACATTTGGTGCCTGACGGATATCCGGTCTACTGTAACTTGCCCGTTAATCGACCAATCTGTGATTATAACATCCCTGATGAACCCCTCTTGGGCATTCTACCACCAGCACAGAGTAACTTTGAGTATGCACCAACAGTGTGGGGCCCTGAAGCATTTGCCAAATCTTTTGAAAAATTTGACTATGCACCCTATTGCGATTTCGAAAAACTCTATCCTGAGTGCACACAGTTTGCTGATTGGGCATGGAGAGTCCACCACTCCTATCTTGAAGACACTAAAGTCATCCATATCTCAGCCACAGAGAAAAATCTTGATTCAACACCAGCTTATCCTAAGATGTTAGACTATGATACAGAAGAAGACTTTTTGGATGAGCATGGCTGGGATCCCTATGTGTCTGCCTTTTCAGCAATTGACAGAGGCTATGACCCTGATGTACTCTGGTACTGCTTCCTTAAGAAAGAGATCCTAAAGAAAAAGAAGATTGAGGATGCAGATATCAGGCAAATAGTGTGTGCTGATCCCATCTATGCCAGGATAGGTGCATGTTTTGAACAACACCAAAACCATCTCACAAAACAGAAAACAAGAACACACTCAGGGCAATATGGATGGTCCCCATTTAATGGTGGCTTCACCGAGCTTTGTCAACGGCTCGAATCTAAACCAGGTGTATTTGTGGAGCTTGACTGGACCAGGTTTGATGGAACAATCCCTGCTCCTCTCCTTAAAAGGATTAAGAAGCTCCGCTTTTCAATGCTCTGTACTGAACATCAAGAGCGTTATCAACACATCTATAAGTGGTATGTTAGAAACCTGCTTAATCGGTATGTCATGATGCCGAGTGGTGAAGTCACTAAGCAGACAAGGGGAAACCCTTCTGGGCAAATTTCAACAACAATTGATAACAACATGGTGAACATCTGGATTCAGGCCTTTGAATTTTGTAACTTCTTTGGACCAGATAAGGAATTGTGGAGGGATTATGACACCATCGTCTATGGAGACGACAGATTGACCCGTTATCCAATCTTACCAGAAAACTACAAAGAAAGGGTCATCGACCTCTACAAGAATGTGTTTGGGATGTGGATAAGACCAGAGAAAGTGAAAGTCTCAGACACACTTGAAGGCCTGACATTCTGTGGATTTACAGTTGGCCCAGACAGGTTACCCTACCCCACTGATGAAGAGAAACTCTATGCTGGACTTGTTACACCTGCAAGAAAGCTCCCTGATGTTACAGCGCTGCATGGGAAACTCCTGAGCCTACAACTCCTGATGCATAACCATCCTGACAGTGCCTTCAAAGATTACATCAATAAATGTTTGGCTGAAACAGCGAGGCACGCCGAGGATCTGCCTGCAAGACTTACAGAAAGGCAGATGGACAGGCTTTGGAGGGGCGGACCAAAGCATAAGCCTAATGGCTAACAACCAGAAAAATGTCCAACCCAATGTGGTTACGACTACTACGACGACTACTCGTCGTCGTGGTGGGCGTCGCCGCCGGCGGACTCCTCGCACATCTCAGGCTGGTACGACCACTGTTAGGAAGGTTACCATTAATAGACAATCTCGTAGGCCTCCTCGTCGGCGCCGTACTAGGCCTGGCAATCCTCCTAAGCCGAGTAACTCAATGTACTCACAGAAAATAACAGCAACATTAGGCTCTGTAGGGGCTAATAAGGGGAATGGTATAGAATTGGAAATGTCAGCATTAATTAATCCAGCCTTAATGAAGGAAACAACAGGCTCTAATCAATTTGGCCCTTTACAAATTGCAGCATCAACTTACAACTTTTGGAGGCTACAATATATGGATATAAAATTAACACCTTTAGTTGGTGCATCTGCGGTATCTGGAACTATGGTAAGAACATCATTAAATCTAGCAGCTCAGCCTGGTTCTCCATCGTGGTCAGCACTTGGAGCACGGAAACATAAAGATACTAATCCTGGAAAGCCCGTGACTTTTAGAATCAGAGGAAGTGAAATAATGGGTCCAAAGGAGGGCTGGTTCTGTTGTAACACAAAGAATGATCCGCAAATGTGCCTTGGGGGCTCAATTGAGATCCACACATTTGGAAAAACGATGTCAACTTACAAATCTGAGCCATTTGATGGGCCCCTCTTCTTAGCAGAGGTTACCGCTCTCTGGCAATTTAAAAATTATAATCCTCAGCCAGGGATGCTAAACTTAGTTAAGGCTGAAACAACAGAGCCAGAAGGATCTGTGAAAATCAATGCAACACCAGGAGAACCTATAACAATTTCAGTACCTACCAGCTCCAACTTTGCACGTACTATTGCCCAGGCTGACCT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| 41,147
|
MK613068.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Chen,S., Zuo,Y., Fan,J., Yuan,G., Wang,J., Liu,R., Xing,Y.
|
Agricultural University of Hebei Province, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2019-09-25
|
PAstV/CH/HB-SJZ/2018
|
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,733
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Porcine astrovirus 4 isolate PAstV/CH/HB-SJZ/2018, complete genome
|
TCCAAATTGACCGTTGGTGGCGATGGCCCGCAAGGGATTTACATCCAAGGTTGATTTAGCTGTCAGCTCTGGCAACTATAACGCCAGGCTTCAAGCCGGCAATATGGTTGACCAGTTGAGGTGCTTGCCAGGGCACCGACCAAATTCTCCATGGGACATTAGGACATTACCACGTCATATGGTCTACCCAACTCTGTCTACTGACCCAAGAGACCGTGTAATTATAGCATCATCAGTTACAGAAGAAAATGAGTGGGTTACCTATGTCCTTGATGGGGAAAGCTGGCGGCAAACCATTTGTGCTCCGGATGAACAGGTTGTCATTCTTGTGTGCGCCCTTCTCAATGATAAAGATGAGAAGGAAAAGGAAATTGCAACACTTAAAATGGAAAATGACTTAAAGAACCAACAATGTGCATACTTGAGACAACAGATACCACCAAAAATCTCTGGAGCAAAATGGTCCTGGCTTTCAATTCTTGCCCTGCTGGTTTTGATTCTTGCTACACTTAAGGGAGCAATGGCACTAGAAACACAAAGCACATCTCATGGTGTTGATTATGATAAGATCATTAAACTCAATGAAGAACTGGATGAGTTTATCACTATTGCACTACAGAAAAATTGGACAAGGTCTGTTACTGAGGTGAATGCTGGCCAATATACAACTAGTGGCTTGGGCTGGAGAGAGAAGATCCTTTCCAGTCTTAATGATTGGTATGAGAGTAAAAAGCCACAGACAACACACTTGGTTGATATGGTTATCTTAGCAGTTGGGCTTATGACACCATGGCTGTGGGAGTTGAGTGTCCTTGTCTTATCAATCCTCATAATCATGAGAAGTGATAGAAAGGTCTACGACTTCTTCTATCTTGCGGCAGCTTCTTTCTCACAGCTAAGATTTAGCCTAATAGTGTTAGCACCACTTCAAACAATTTATACCATCTACCTAACATGTGGCTTGGCAGTAATCTATCACCTTGATCCAATTGCAACATCTTTGATCTCTGTTGTGCATTTATTAATCTTTTCTATAGTGGGGATGTTCCTCCCAGATGTAGATTACATCAAGAATCTGAGGGCAGTTGGGTCGGTGACAGTGATTGTTCTGGCCCACTGGATTTGTGAACTCTTTGGAATCCCCCCAATTGTCTTGACGGCAGTGTGCTTCATTTGGAGGTTGGCACGCCTCCTAATAGCAATGCCTGGACAAGTTATAGAAATAAGGGACTCATCTGGTAAGATAACACAAAAAATTAGCTCCCTTGAAGGCCCACTATTCAAATTCTTTCAGGGGCTTAAAGCTAAACTTAAACAAGTTAGAGCAACAAGTGTGCCTTTAGTTAGAATCAACCCGGCAGCGGTGTGCCACATTTCAACTGGTGATGGCTCAAAGGGAACTGGTTTCTTCTGTGCGAACTATGTGGTGACAGCAGCACATGTTACTGGGAACCACAAGGTAGCAACCATCAGCTACCAGGGGAAGAACTATCAATCAAACGTGAAGAAAACATCAGAAAAAGATATGATCTTCCTTGAAATACCACCAGCTCTGCAGGGTGTTCCTCGATTTAAGTTATCAAAGAAATACAACTGTGACTGGGTCTGTGTCCTGGCACCTAGTGGTGAGGGCGCATTTGTAACATCAGTAGTCGAAGGTAAGGCTCATGGTGATACATTCTCTTACCCCTGCCCAACTAGGGATGGAATGTCTGGAGCACCGCTGCTTGATGTGGATGGCCATGTGCTTGGTATACATCAAACCAACACTGGCTACACCGGTGGCGCTGTCCGACTTGAACATGAGGATGTGATTGACCCACCTAAGGAACATACCCAGGTCGCAGCCCTCAAGAAGCAAATAGAGGAACTCAAGATGCAGCTTGCACAGAAGGATGCTGCTCCTGCTACACCACCTCCAAAACCACAGAGACCTCCACGTACTAAGGATATGAAACAGTGTAACATGGAAGACTCTGACATTGTTGAGTTAATTAGAATTGCCATGCAGCGTGAGATGGGAATCTTACGTGAGGAGATTAATGATAGTCTCCTACAGAAAAAGAAGGGTAAGACCAAGCATGGCCGTGGGAGGAGACATGGTGGTGGACGTAGGAGGAAGATCGGCAGGATGTTTACTGAGGAGGAGTATCAGGAAATGCTTGATTCAGGTCTTGAGCCAGAACAGATTCGGGCAATTGCAGAGGAACTCTATGACCAACAACATGATTTTCCTGAGTGGAGTGATCCTGAAGATGATGATGAGGTGAATGAGTGGTGGTTTGGTGGAGACTATTCTGCCAACGTCAATGATGATGATGATGATATACCATCTTATTACCAAAAGAAGAAGAAACCACTTAGTGATTACCTCATCAAGGAGTGGACTAAGGAAAGTATTGATGAAATGCTGGCCTCCCTCTCGCCTCTCGAGATGAAAAAGGCACAACCACTCCTTCAGCACCTCAAATGTGAGGATCCACTCAAGAAAACAGTCATTGTTGCAATGTTGGACCGTGTTTTGACATCTAATGGTCTCTCACCGGTGTCCGATGGCCTCGAATACCAACAGAGAATGAAGCCAAAAAACGGCAAGCCGGGGCGCCACGATCCCCAGAAGCCGACCTCGGCGCGTGGAAAAAGTCAGCAGTAAAACCACGCCGACACTTGGTGCCTGACGGATACCCGGTCTACTGCAATCTGCCTGTTAATCGACCAATCTGCGATTACAACATCCCTGATGAACCCCTCTTAGGCATTCTACCACCAGCACAGAGTGAATTTGAGTATGCACCAACAGTGTGGGGTCCTGAAGCATTTGCTAAGTCCTTTGAGAAGTTTGACTATGCACCCTATTGTGATTTTGAAAAGGACTATCCTGAGTGCACACAATTTGCTGATTGGGCATGGAGAGTACACCACTTCTATCTTGAGGACACTAAAGTCATCCACATCTCAGCCACAGAGAAAAATCTTGACTCAACACCAGCTTATCCTAAAATGTTAGACTATGAAACAGAAGAAGATTTCTTGGATGAGCATGGCTGGGATCCCTATGTGTCTGCCTTTTCAGCAATCGACAGAGGCTACCAACCTGATGTACTCTGGTACTGCTTCCTCAAGAAAGAGATCTTGAAGAAAAAGAAAATAGAGGACTCAGACATCAGACAGATAGTGTGTGCAGATCCTATTTATGCTAGGATAGGTGCATGTTTTGAACAACACCAGAACCATCTTACAAAGTTACACACGGAAACAAAATCAGGACAATGTGGATGGTCCCCATTTAATGGTGGCTTCACCAGGCTGTGTGAACGGCTTGAGTCAAAACCAGGTGTTTTTGTGGAGCTTGACTGGACCAGGTTTGATGGAACTATCCCTGCTCCTCTCCTCAAGAGAATTAAGAAGCTCCGTTTTTCAATGCTTTGTGAAGAACATCAAAAGAGATATCAACATATTTACGCCTGGTATGTGAAACAACTGCTCAATCGGTATGTCATGATGCCGAGTGGTGAAGTTACTAAGCAGACAAGGGGGAACCCTTCTGGGCAAATTTCAACAACAATTGACAACAATATGGTTAACATTTGGCTCCAGGCCTTTGAATTCTGCTGGTTCTTTGGACCAGATAAAGAATTGTGGAGGGACTATGACACCATCGTCTATGGAGACGACAGATTGACCCGTTATCCAATCCTACCAGAAAACTACAGAGAAAGGGTCATTGCCCTCTACAAGGATGTCTTTGGGATGTGGATAAAACCAGAAAAAGTGAAAGTCTCAGAGACACTTGAAGGCCTAACATTCTGTGGATTTACAGTTAGCCCAGATAGGTTACCTTACCCCACTGATGAAGAGAAACTCTATGCTGGACTTGTAACACCTGCAAGAAAGCTTCCTGATGTCACAGCGCTGCATGGGAAACTCCTGAGCCTACAACTTCTGATGCATAACCATCCTGACAGTGCCTTCAAAGATTACATCACTAAATGTTTGGCTGAAACAGCGAGGCACGCCGAGGATCTGCCTGCAAGACTCACAGAAAGGCAGATGGACAGGCTTTGGAGGGGCGGACCAAAGCATAAGCCTAATGGCTAACAACCAGAAAAATGTCCAACCCAATGTGGTTACGACTACTACGACGACTACTCGTCGTCGTGGTGGGCGTCGCCGTCGGCGGACTCCTCGCACATCTCGGGCTGGTACGACCACTGTTAGGAAGGTTACCATTAATAGACAATCTCGTAGGGCTCCTCGTCGGCGCCGTGCTAGGCCTGGCAATCCTCCTAAACCGAGTACTTCAACCTACTCGCAAAGAATAACAGCAACACTGGGTTCTGTGGGAGCCAATAAGGGGAATGGTATAGAACTGGAAATGTCAGCATTAATTAATCCAGCTTTAATGAAAGAGACAACAGGATCAAACCAGTTCGGTCCCCTGCAAATTGCAGCATCAACCTACAATTTTTGGAGGCTACAGTACATGGATATAAAATTAACACCTTTAGTCGGTGCATCTGCAGTGTCCGGAACTATGGTGAGAACATCATTAAACTTGGCAGCTCAACCAGGCTCTCCATCCTGGTCAGCACTTGGAGCACGAAGACATAAAGATACCAATCCTGGGAAACCTATGACTTTTAGGATCAGAGGAAGTGAAATAATGGGTCCGAAGGAGGGCTGGTTCTGCTGTAATACAAAGAATGATCCACAAATGTGCCTTGGGGGCTCGATTGAGATTCACACACTTGGAAAGACAATGTCAACTTTTAAATCTGAACCCTTTGATGGACCCCTCTTTATAGCAGAGGTCACCGCTCTCTGGCAATTCAAAAACTACAATCCTCAGCCAGGGATGCTAAATTTAATAAAGGCTGAAACAACAGAACCAGAAGGATCCGTAAAAATCAATGCAACACCGGGGGAACCTATTACAATTTCAGTACCTAATAGCTCTAGTTTTGCCCGTACTATTGCCCAGGCTGATCTTGGTGTAGCTG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| 59,412
|
MK460231.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Lv,S.L., Zhang,H.H., Li,J.Y., Hu,W.Q., Song,Y.T., Opriessnig,T., Xiao,C.T., Lv,S.-L.
|
Hunan University, College of Biology
|
China
|
2019-08-12
|
PoAstV4/CHN/WG-R2/2017
|
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,649
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2017-11
| null | null |
Porcine astrovirus 4 isolate PoAstV4/CHN/WG-R2/2017, complete genome
|
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| 60,326
|
MH425243.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Zhao,C.
|
Tianjin University the School of Life Sciences, Microbiology and Immunology Lab
|
China
|
2018-12-11
|
TJ060606
|
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,716
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Porcine astrovirus 4 strain Tianjin/2018, complete genome
|
ATGGCCCGCAAGGGATTTACATCCAAGGTTGATTTAGCTGTCAGCTCTGGCAACTACAACGCTAGGCTTCAAGCCGGCGGAATGGTTGACCAGTTGAGGTGCTTGCCAGGGCACCGACCAAATTCTCCATGGGACATTAGGACTTTACCACGTCATATGATCTACCCAACTCTGTCAACTGATCCACGAGACCGTGTAATTATTGCATCTTCAGTTACAGTGGAAAATGAATGGGTTACCTATGTCCTAGACGGGGATAGCTGGCGGCAAACCATTTGTGCTCCGGATGAACAGGCTGTCATTCTTGTGTGTGCCCTTCTCAACGACAAGGAAGAGAAGGAGAAGGAAATAGCAACATTAAAGATGGAGAATGACCTTAAGAATCAACAATGTGCATACTTGAGACAGCAAATACCACCCAAAAGTACTGGAGCAAAATGGTCCTGGCTTTCAATCCTTGCCCTGTTGGTTTTGATCCTTGCAACACTTAAAGGAGCTATGGCACTGGAAACACAAAGTACATCTCATGCCATGGACTACGATAAGATCATTAAGCTCAATGAGGAACTGGATGAGTTTATTACAATTGCATTACAGAAGAATTGGACAAAACATGTTACTGAGGTAAATGCCGGTCACTATACAACCACTGACCTAGGCTGGAAAAGCAAGATCATTTCTAGCCTTAACGACTGGTATGAAAGCAAAAAACCACAAACTACATACTTAGTCGACTTGGTTCTTTTAGTGGTTGGACTTGTAACACCATGGTTGTGGGAATTGAGTGTGCTTGCCCTGTCGATCCTTATAATTATAAGAAGTGATAGAAAGGTTTATGACTTCTTTTATCTTGCAGCTGCCTCATTCTCACAATTAAGATTTAGTTTAATAGTACTGGCACCACTGCAGACAATCTACACCATCTATCTAACATGTGTCTTAGCGGTCATTTACCATTTTGATCCAATTGCAACATCCCTAATTTCTGTTATGCATCTAGTAATCTTCTCTATAGTGGGGATGTTCCTTCCAGATGTTGACTACATCAAGAACTTGAGGGCGGTTGGGTCAGTGACAATAATTGTCTTGTCCCACTGGATCTGTGAACTCTTTGGAATTCCCCCTGTTGTTTTAACAGCAGTCTGCTTTGTATGGAGGTTAGCACGCCTCCTGATAGCAATGCCTGGACAAGTTATAGAGATACGGGACTCATCTGGAAAAATAACTCAGAAGATCAGCTCTCTTGAAGGTCCTCTCTTCAAATTTTTCCAGGGCCTTAAGGCCAAGCTTAAACAAGTTAGATCAACAACTGTTCCTTTGATTAGGATCAATCCAGCAGCAGTTTGTCATATCTCAACTGGTGATGGTTCAAAGGGCACTGGTTTCTTTTGTGCAAATTATGTTGTAACAGCAGCACATGTGATGGGTAACCACAAGGTAGGAACTGTCTGCTACCAGGGGAAGAACTATCAAGCAAATGTCAAGAAAACATCAGAGAAGGACATGATCTTCCTTGAGATCCCGTCAGCACTGCAAGGTGTTCCTCGGCTAAAACTATCAAAGAAGTACAGCTGTGACTGGGTTTGTGTCCTAGCGCCTAGTGGTGAAGGGGCATTTATAACATCAGTAGTCGAAGGCAAGGCTCATGGTGATACATTCTCTTACCCCTGCCCAACTAGGGATGGAATGTCCGGAGCACCGCTGCTTGATGTGGATGGCCATGTGCTTGGTATACATCAAACCAACACTGGCTACACCGGTGGCGCTGTCCGACTTGAACATGAAGATGTGATTGACCCACCTAAGGAAAACACCCAGGTCGCAGCCCTCAAGAAGCAAATAGAGGAACTTAAGATGCAGCTTGCACAGAAGGATGCTGCTCCTGCTACACTACCTCCAAAACCACAGAGACCTCCACGTACTAAGGATATGAAGCAATGCAACATGGAAGATTCTGACATTGTTGAATTGATTAGGATTGCCATGCAACGCGAGATGGGAATCTTGCGTGAGGAGATTAATGACAGTCTCCTCCAGAAAAAGAAGGGTAAGTCCAAGCATGGCCGTGGGAGGAAACATGGTGGTGGACGCAGGAGAAAAATTGGTAGGATGTTCGCTGAGGAGGAATACCAGGAGATGCTTGATTCAGGTCTTGAACCAGAACAGATCCGGGCAATTGCAGAGGAACTCTATGAACAACAGCATGACTTTCCTGAGTGGAGTGACCCTGAAGATGATGATGAGGTGAATGAGTGGTGGTTTGGAGATGACTACTCTGCCAACGTCAATGATGATGATGATGATATACCATCTTACTACCAAAAGAAGAAAAAGCCACTCAGTGATTACCTCATCAAGGAGTGGACTAAGGAAAGTATTGATGAAATGCTAGCCTCTCTCTCGCCTCTCGAGATGAAAAAGGCAAAGCCACTCCTTCAACACCTTAAATGTGAGGATCCACTCAAGAAAACAGTCATTGTTGCAATGTTGGACCGTGTCTTAACATCTAATGGTCTTTCACCGGTGTCCGATGGCCTTGAATACCAACAAAGAATGAAGCCAAAAAACGGCAAGCCGGGGCGCCACGATCCCCAGAAGCCGACCTCGGCGCGTGGAAAAAGTCAGCAGTAAAACCACGCCGACATTTGGTACCTGACGGATACCCGGTCTACTGTAACTTGCCTGTTAATCGACCAATCTGTGATTACAACATTCCTGATGAACCCCTTCTTGGCATCCTACCACCAGCACAGAGTGAATTTGACTACGCACCAACAGTGTGGGGTCCTGAAGCATTTGCTAAATCTTTTGAGAAGTTTGATTATGCACCCTATTGTGATTTTGAAAAAGAATATCCTGAGTGCACACAGTTTGCTGATTGGGCATGGAGAGTTCACCACTCCTATTTAGAAGACACCAAAGTTATCCATATCTCAGCCACAGAGAAAAATCTTGATTCAACACCAGCTTATCCTAAAATGTTGGACTATGACACAGAAGAAGACTTTTTGGATGAGCATGGCTGGGATCCCTATGTGTCTGCCTTCTCAGCAATTGATAGGGGTTATGACCCTGATGTACTCTGGTACTGTTTCCTCAAGAAAGAAATCTTAAAGAAGAAGAAGATTGAGGATTCAGATATCAGACAAATTGTGTGTGCAGATCCAATTTATGCCAGGATAGGTGCATGTTTTGAGCAACATCAGAACCATCTTACAAAATTGCACACAGAAACAAAATCAGGGCAGTGTGGATGGTCCCCATTTAATGGTGGTTTCACCAGGCTGTGTGAACGGCTTGAGTCAAAATCAGGTGTTTTTGTGGAGCTCGACTGGACCAGGTTTGATGGAACAATCCCTGCTCCTCTCCTTAAAAGAATCAAAAAGCTCCGCTTTTCAATGCTCTGTGAAGAACATCAAAAGAGATATCAACACATTTATGCCTGGTATGTGAAACAACTGCTCAATCGGTACGTCATGATGCCGAGTGGTGAAGTCACTAAGCAGACAAGGGGGAACCCTTCTGGGCAAATTTCAACAACAATTGATAACAACATGGTCAACATCTGGCTTCAGGCCTTTGAATTTTGTTGGTTCTTTGGACCGAACAAGGACTTGTGGAGGGACTATGACACCATCGTCTATGGAGACGATAGATTGACCCGCTATCCAATCTTGCCAGAAAACTATAAGGAAAGGGTCATCCACCTCTACAAGGAAGTCTTTGGGATGTGGATAAAACCAGAGAAAGTAAAAGTCTCAGAGACACTTGAAGGTCTGACATTCTGTGGATTTACAGTTGGCCCAGATAGGCTACCATACCCCACTGATGAAGAGAAACTCTATGCTGGACTTGTTACACCTGCAAGAAAGCTCCCTGATGTCACAGCGCTGCATGGGAAACTCCTGAGCCTACAACTCTTGATGCACAACCATCCTGACAGTGCCTTCAAAGACTACATCAACAAATGTTTGGCTGAAACAGCGAGGCACGCCGAGGATCTGCCTGCAAGACTCACAGAAAGGCAGATGGACAGGCTTTGGAGGGGCGGACCAAAGCATAAGCCTAATGGCTAATGATAAACCCAATGTCCAATCCAAGGTGGTCACGACCACTACGACGGCTACTCGTCGTCGTGGTGGGCGTCGCCGCAGGCGCACTCCTCGCCCATCTCCATCTAACACGACTACTGTTAGGAGGGTCACCACTACTAGACAAACTGGCAGGGTTAATCGTAGGCGCCGTAATCGCTTTGGCAATCCTGGTAGGGCGTCACTTGGGGGCATCAGGCAAAGGATAACAGCTACTCTTGGTACTGTTGGCTCAAACCAGGGACCAAATATTGAACTGGAAATGGCCGCTTTATTGAACCCAGCTCTTATGAAAGAGTCTACAGGATCAAATGTCTATGGGCCCTTGCAAATTTATGCATCAACATACAGTTTGTGGAAGCTAGACTATATTAAGCTCACCCTAACACCTTTAGTAGGTCAAAACGCCGTCTCAGGCACTGCAGTGAGGGCATCTTTTAATGCGTCCGGTCAACCAGGCACCCCAAACTGGTCATCTTTGGGTGCCAGGAAACATAAAGACACAAACCCTGGCCGGCCCCTCACCTTCTACCTGAGTGGTAGTGATATCAAGGGTCCTAAGGAAGGTTGGTTCTATTGTAACACCAAAAATGATCCTAAGATGTGCATAGCAGGAACAATTGAGATACATACGATGGGAAAAACAGTTTCATCTTATAAGAATGAACCTTTTAATGCACCTCTCTTTCTGGCTGAACTTACTGGGCAATGGTCATTTAAAAACTACAATCCACAACCTGGCATGCTTAATCTTGTTAAGACAACAATAGAGGAACAACCACAAACTGTAAAAATTCATTCAAAGCCTGGTGATCCAATTTTGATTTCGGTGCCAGAGGGGTCCTCAATGGCCAGAATAGCTGGTGCTACAGATAATTCAGCAGGAGCAACAGCATCAGAGATAATTTGGCAAATTTGCGACTCAGCAATTGACATAGCCTCTGGAGCTTTTCCGCCTCCCTTTGGGTGGCTTTTTAAATCTGGCTGGTGGTTTGTTAAAAGAATAGCCAATAGGAAGCAGAGTGGTACAGCAGTTGGTGAACCAGATCCAGGCGAGGTAACTTTCCAAGTATACCAGAGCATCTCTGATGCACAGAATGATGTACCTTGCATTGCTACAGGCACTGCGGCAACAGTCAATGCCACCATAAATGACTTGGAAATGATGCAAATAACACCAGGTAATGTTGGGCAACAACAGGAATCAATAGCAGGGTTACGAAGGACAGTAGAACCAACACTGGATCCCATCACAATTATTTCATCTTCTCTACTTGGACAGGCACCACTCTACGGGTCACTTCACCCAACTGAACCTTTGAATGCTATAACGATGCAGGGCCTAGGTGGTTGGGCACAGAAGATACATACCTTCTCCATTCATGAATTGAATAAGCCAGTCTTTTTGCAGGGTGATAATGAAGTTGATCCACAGAGTTTGCAGATAAATACCTACCCAATCTACAAAAAGACCTCATCTACATATGATGTAATAGGGAAAGTTCATGCTGCATCATACGCCCGTACTGGGCGTCAACCCCTAAACTGGACCACATGCCTTTGGAGAGCAACACAAACTACAACATTTACTATCCAGGGCACTAGTTCTAACACCCAGTTCCTTTTTGTTAGGCCAAACATCCAACCTAATCCAGTAAATCTACCTAACTTCACCTATGTGGTGCAGGCAACTAATGCAAAGAATATAGCACAGACACAAATTAGCATTCAGGAAGGCAACTGGTACCTTTCTGTGTTTGCATCTTGGGGAGGCGCCAAAAAGTATGATATCTATGGGGTGGAATTTTGGGCTGGAGATCAAACTGTTAACCCAAGTCAAACTTATGAGGTTGACCCAACATTTGATGCGTATAAGGTAGGTATTATTTTGGGAACAGCGCAACCTTTGCAGCTTCAACTTCCTGTCCAACCAACAGCGCTAACCACCAGTGAGATTCTGGCCCTCAGAGACATTGTTAGTGGCCAGTACCACCCCTTTCCAACTCTTCCACCACCACCACCATCAGAATACGACAATCTGGAAGTGCCACCTTTGGAGGATGAGGAAGAAGAAGAACAAGGTGCCACTGGAGGACATGCCCCCTTGGAAAGAGCCAGTCAACAGAGAGTTAGAGGACCAAATGCAGTTGGGGAGATGTCTCTTGAGAAAACCCTTGACACCAAAAACTGGGTTGAATTTGGCCATATAAAAAGACCACCAACACCTTTTTCACCTATAGAAGAGGAGGATGAGGAAGATGAGGATTCTGATTTAGATGATGATGATTATGCTGAACCTCCCTCTGCCATTAAAAACTTACTTACTCCTGAAGCTAAGGATCTTTATGGTCATTTGAGACAGAAGGGTTTCAGTCATGAGCAGGCAACCAATGCTGCCCAAGCCGCGTTCCCTCATTTTGCTCTTGAAGCCTGGGACGCGGCATACCATAATGCCATGGCTGATGGACTCTCGCCACCTACAGCGCGTGATCTCGCTTGGGCGGCCGTTTCAGATTTCCTTTCCTAATCTGTTCAGTTTTTTCTTGTTTTCTCTTTTCTGAATTAGATTAGAATTAGCATTTAAAAATTTGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 66,178
|
KX060808.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Li,A., Huang,T., Song,D., Zhang,T., Peng,Q., Chen,Y., Zhou,X., Zhang,F., Tang,Y.
|
Jiangxi Agricultural University, College of Vet Medicine
|
China
|
2016-12-12
| null |
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,644
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2014-09
| null | null |
Porcine astrovirus 4 strain JXJA, complete genome
|
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| 79,121
|
KX060809.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Li,A., Huang,T., Song,D., Zhang,T., Peng,Q., Chen,Y., Zhou,X., Zhang,F., Tang,Y.
|
Jiangxi Agricultural University, College of Vet Medicine
|
China
|
2016-12-12
| null |
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,669
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2014-03
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Porcine astrovirus 4 strain CH/JXZS/2014, complete genome
|
TGGTGGCTATGGCCCGTAAGGGATTTACATCCAAGGTTGATTCAGCTGTCAACTCTGGCAACTACAACGCCAGGCTACAAGCCGGTGAGATGGTTGACCAGTTGAGGTGCTTGCCAGGGCACCGACCAAATTCCCCTTGGGACATAAGAACAGTTCCAAGACATATGATCTACCCAACACTCTCTACTGACCCACGAGATCGTGTCATCATAGCATCATCTGTAACAACAGAGAATGAATGGGTAACTTATGTTCTTGATGGGAATAGTTGGCAGCAAACCATTTGTGCTCAAGATGAACAACCTGTCATTCTAGTGTGCGCCCTTCTTAATGATAAAGATGAGAAGGAAAAAGAAATTGCAACACTTAAGATGGAACTTGACCTCAAAAACCAACAATGCGCATACTTGAGACAGCAAATATCACCAAAGAACTCTGGAGCAAAATGGTCCTGGCTTTCAATCCTTGCACTCTTGGTTTTGATTCTGGCTACATTGAAAGGAGCAGTAGCACTGGAAACAAAGAGTACATCCCATGGAGTTGATTATGATCGAATCATTCAACTGAATGAGGAGCTAGATGTTTTCATCCAGAATGCATTGCAAAAGAATTGGACAAAACACGTTACTGAAACATTTGTCTACCATCACAAAACCCAGGGACTAGGCTGGAAGGCAAGAATAGTAAACAGTCTTAGTGAGTGGTATAACAACAAAAAACCACAAACATCTCATATGGTTGATAGTGTGTTTTGTGCAATTGGTTTGATTTTACCTTGGATTTGGGAAGTATGTGTCCTTGTGCTTGCGGTCTTCATCATTCTGAGAAGTAAGCGCAAGGCACTTGACTGTTTCTATTTGGCAGCAGCATCTTTTTCCAACTTAAAGTTTAGTTTTGTTGCTGTGGCCCCAATCCAAACCCCACACACTATCTATGTGGCATGCGCACTATCAGTAGTTTACTGGTGCGATCCAATTGCAGCAGCACTTATTTCCCTGGTCTACTTAATTGGATTTTCAGTGATTGGTATGTTCATGTCTGATGTAGAGTACATTAAACAACTTAGAGCAGTACTCTCACTAGCTATGATCTTTTCATTCCACTGGTTGTGTGACCTATTTGGAGTACCACCAATTATTTTTACAGTCCTATGCTTCTGCTGGAGGTTGGTCAGATTGTTGACTGCACTTCCTGGACACGTCATAGAGATAAGAGATCCAACGGGGAAAGTTACACAAAAAGTTAGCTCTTTTGACGGTCCACTTTTCAAATTCTTCCAAGGATTAAAGGCCAAGCTTAAGCAAGTTAGATCAGTAAGTGTACCATTAGTCAGAATTAATCCAACAGCAGTTTGCCATATCTCGACTGGTGATGGCTCAAAGGGTACTGGTTTCTTCTGTGCAAACTATGTGGTAACAGCCGCACATGTTGTTGGAAATCATAAGGTGGCCACCATCTGTCACCAAGGAAAGAACTACCAAGCTAATGTAAAGAAAACATCAGAGAAAGATATGATCTTCCTTGAAATACCACCAGCCTTACAGGGTGTTCCTCGCTTTAAGTTATCAAAGAAATACAACTGTGACTGGGTCTGTGTCCTGGCACCTAGTGGTGAAGGGGCATTTGTAACATCAGTAGTTGAAGGTAAGGCCCATGGTGACACATTCTCTTACCCCTGTCCAACTAGAGACGGGATGTCTGGAGCACCGCTACTTGATGTGGACGGTCATGTGCTTGGCATACATCAAACCAACACTGGCTACACTGGTGGCGCTGTTCGACTTGAGCATGAGGATGTGATTGATCCACCTAAAGAAAACACCCAAGTTGCACAGCTGAAAAAACAAATTGAGGAACTTAAAATGCAGCTAGCACAAAAGGAAGCCACCCCTGCTACACCACCTCCAAAACCACAAAGGCCTCCACGTACTAAAGATATGAAACAATGTAACATGGAAGACTCTGACATTGTTGAGTTGATTAGGATTGCCATGCAACGCGAGATGGGAATCTTGCGTGAGGAGATTAATGACAGTCTCCTCCAGAAAAAGAAGGGTAAGTCCAAGCATGGCCGTGGGAGGAAACATGGTGGTGGACGCAGGAGAAAAATTGGTAGGATGTTTACTGAAGAGGAATACCAGGAGACGCTTGATTCAGGTCTTGAACCAGAACAGATCCGGGCAATTGCAGAAGAACTTTATGAACAACAGCATGATTTTCCTGAGTGGAGTGACCCTGAAGATGATGATGAGGTGAATGAGTGGTGGTTTGGAGATGACTACTCTGCCAACGTCAATAATGACGATGACGATATACCATCTTACTACCAAAAGAAGAAGAAACCACTTAGTGACTACCTCATCAAGGAGTGGACTAAGGAAAGTATTGATGAAATGCTGGCCTCTCTCTCTCCTCTTGAGATGAAGAAGGCACAACCACTCCTCCAACACCTTAAATGCGAGGATCCACTCAAGAAAACAGTCATTGTTGCAATGTTGGACCGTGTCTTGACATCTAACGGTCTTTCACCGGTGTCCGATGGCCTCGAGTATCAGCAGAGGATGAAGCCAAAAAACGGCAAGCCGGGGCGCCACGATCCCCAGAAGCCGACCTCGGCGCGTGGAAAAAGTCAGCAGTAAAACCACGCCGACACTTGGTGCCTGACGGATATCCGGTCTCCTGCAATCTGCCTGTTAATCGACCAATCTGTGATTACAACATCCCTGATAAACCCCTCTTAGGCATTCTGCCACCAGCACAGAGTGAATTTGAATATGCACCAACAGTGTGGGGTCCTGAAGCATTTGCCAAATCTTTCGAGAAATTTGATTATGCACCCTATTGTGATTTTGAAAAAGAATATCCTGAGTGCACACAGTTTGCTGATTGGGCGTGGAGAGTCCATCACTCCTACCTCGAAGACACTAAAGTCATCCATATCTCAGCCACAGAGAAAAATCTTGATTCAACACCAGCTTATCCTAAAATGTTAGACTATGACACAGAAGAAGACTTCTTGGATGAGCATGGCTGGGATCCTTATGTGTCTGCCTTTTCAGCAATTGACAGGGGCTATGAACCTGATGTACTCTGGTACTGCTTCCTCAAGAAGGAAATCTTAAAGAAGAAAAAGATTGAGGATTCAGATATCAGACAAATAGTATGTGCAGATCCAATCTACGCCAGAATAGGTGCATGTTTTGAACAACATCAGAACCATCTTACAAAGCAGAAAACTAAGACACATTCAGGGCAGTGTGGATGGTCCCCATTTAATGGTGGCTTCACCGAGCTTTGCCAACGGCTCGAATCAAAACCAGGTGTGTTTTTGGAGCTTGACTGGACCAGGTTTGATGGAACAATCCCTGCTCCTCTCCTTAAAAGGATCAAGAAGCTCCACTTTTCAATGCTCTGTACAGAACATCAGGAGCGTTACCAACACATCTACAAATGGTATGTCAAAAACCTGCTCAACCGGTATGTCATGATGCCGAGTGGTGAAGTCACTAAACAGACAAGGGGGAACCCTTCTGGGCAAATTTCAACAACAATTGACAATAATATGGTAAACATCTGGCTACAGGCCTTTGAGTTTTGCTGGTTCTTTGGGCCAGACAAAGAGTTGTGGAGGGATTATGATACCATCGTCTATGGAGACGACAGATTGACCCGCTATCCAATCCTACCAGAGAACTACAGAGAAAGGGTCATTGCCCTCTACAGGGATGTCTTTGGGATGTGGATAAAACCAGAGAAAGTGAAAGTCTCAGAAACACTCGAAGGCCTTACATTCTGTGGCTTTACAGTCGGCCCAGATAGGCTGCCTTACCCCACTGATGAAGAGAAACTCTATGCTGGACTCGTAACACCTGCAAGAAAGCTCCCTGATGTTACAGCGCTGCATGGGAAACTCCTGAGCCTACAACTCCTGATGCATAACCATCCTGACAGTGCCTTTAAAGATTACATTAACAAATGTTTGGCTGAAACAGCGAGGCACGCCGAGGATCTGCCTGCAAGACTCACAGAAAGGCAGATGGACAGGCTTTGGAGGGGCGGACCAAAGCACAAGCCTAATGGCTAACACCCAGAATAATGTCCAACCCAAGGTGGTCACGACTACCACGACGACTACTAGTCGTCGTGGTAGGCGTCGCCGCCGGCGCACTACTCGCACATCTGCAGTTAACAAGACCACTGTTAGGAAGGTTACCACTACTGGACAATCTAGTAGGCCTCGCCGTAGGCGCCGTAATCGCTTTGGCGCTTCTGGTAAATCGGCTCCTGGCAGCATCAGGCAACGGATCACAGCAACACTAGGCACAGTTGGTTCTAATCAAGGGAATGATATTGAGTTGGAGATGTCTAGCCTCTTAAACCCTGCTCTCATGAAGGAAACAACTGGATCCAACCAGCATGGGCCACTACAGATTTATGCATCAACATATAGTTTATGGAAAGTAGATTACATCATGCTAAAGTTAACACCTCTGGTTGGGTCTTCAGCAGTATCTGGTACTGCGGTTAGGGCATCTTTTAACCTTTCAGGACAGCCAGGATCACCCTCATGGTCAGCTTTGGGTGCACGCAAACATAAAGACACTAACCCTGGGCGCCCGATGACCTTTTATTTGAGTGGCAACGACATCAAGGGTCCAAAGGATGGGTGGTTCTACTGTAATACCAAGAATGACCCACAGATGTGTATGGCTGGATCTCTGGAAATTCACACATTGGGGAAAACAATGTCAACATACCAAAATGCAGCTTTTGATGGCCCCCTCTTCTTGGTTGAGTTAACTTGCCAATGGGCTTTCAAAAATTACAATCCACAGCCTGGGATGTTAAATTTAGTTAAAGCTGAACTTAAAGAACCTGAACAACAAGTTAAGATTAACTCCAAGCCTGGAGAACCTATTACTATCTCTGTTCCAGCAAATGCCGCTCTAGCGCGCACAGTTGGCCAAGTAGACCTTGGTGTCTCCGCATCCGCAACACCA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| 79,122
|
KU764484.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Padmanabhan,A., Hause,B.M., Hause,B.
|
KSU, Veterinary Diagnostic Lab
|
USA
|
2016-06-29
|
15-13
|
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,562
|
GenBank
| 1
|
USA: Oklahoma
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2015-10-21
| null | null |
Porcine astrovirus 4 isolate 15-13, complete genome
|
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2016-06-29
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15-14
|
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
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|
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|
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| 81,505
|
JX556692.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Xiao,C.T., Gimenez-Lirola,L.G., Gerber,P.F., Jiang,Y.H., Halbur,P.G., Opriessnig,T.
|
Department of Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine, College of Veterinary Medicine
|
USA
|
2013-02-15
|
AstV4-US-IL135
|
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,647
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2011-06-27
| null | null |
Porcine astrovirus 4 isolate AstV4-US-IL135, complete genome
|
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| 95,239
|
JF713713.1
|
Porcine astrovirus 4
|
Shan,T., Li,L., Simmonds,P., Wang,C., Moeser,A., Delwart,E.
|
University of California-San Francisco, Blood Systems Research Institute, Department of Laboratory Medicine
|
USA
|
2011-11-02
| null |
Porcine astrovirus 4
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,639
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2010
| null | null |
Porcine astrovirus 4 strain 35/USA, complete genome
|
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| 97,933
|
NC_023636.1
|
Porcine astrovirus 5
|
Xiao,C.T., Gimenez-Lirola,L.G., Gerber,P.F., Jiang,Y.H., Halbur,P.G., Opriessnig,T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-03-06
|
AstV5-US-IA122
|
Porcine astrovirus 5
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,500
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2011-06-23
| null |
PRJNA485481
|
Porcine astrovirus 5 isolate AstV5-US-IA122, complete genome
|
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| 6,626
|
OQ781001.1
|
Porcine astrovirus 5
|
Li,Z.H., Jin,J.H., Hu,H.
|
Henan Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-07-31
|
PAstV5-HNPDS-01-P10
|
Porcine astrovirus 5
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,419
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2021
| null | null |
Porcine astrovirus 5 isolate PAstV5-HNPDS-01-P10, complete genome
|
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|
Porcine astrovirus 5
|
Carvajal,A., Arguello,H., Cortey,M., Diaz,I., Gomez-Garcia,M., Puente,H.
|
Facultad de Veterinaria, Sanidad Animal
|
Spain
|
2022-09-26
|
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|
Porcine astrovirus 5
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Astroviridae
|
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|
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Spain
|
Spain
|
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|
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|
2017-01-25
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| 24,228
|
MZ819167.1
|
Porcine astrovirus 5
|
Flores,C., Ariyama,N., Bennett,B., Mena,J., Verdugo,C., Mor,S., Brito,B., Ramirez-Toloza,G., Neira,V., Bennet,B., Ramirez,G.
|
Universidad de Chile, The iThree Institute, Faculty of Science
|
Chile
|
2022-01-08
|
PoAstV5/Swine/CHI/CF2671/2017
|
Porcine astrovirus 5
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,422
|
GenBank
| 1
|
Chile
|
Chile
|
Sus scrofa
|
oronasopharynx
|
2017
| null | null |
Porcine astrovirus 5 isolate PoAstV5/Swine/CHI/CF2671/2017, complete genome
|
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| 33,784
|
MZ819168.1
|
Porcine astrovirus 5
|
Flores,C., Ariyama,N., Bennett,B., Mena,J., Verdugo,C., Mor,S., Brito,B., Ramirez-Toloza,G., Neira,V., Bennet,B., Ramirez,G.
|
Universidad de Chile, The iThree Institute, Faculty of Science
|
Chile
|
2022-01-08
|
PoAstV5/Swine/CHI/FB016/2017
|
Porcine astrovirus 5
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,498
|
GenBank
| 1
|
Chile
|
Chile
|
Sus scrofa
|
feces
|
2017
| null | null |
Porcine astrovirus 5 isolate PoAstV5/Swine/CHI/FB016/2017, complete genome
|
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| 33,785
|
MZ819169.1
|
Porcine astrovirus 5
|
Flores,C., Ariyama,N., Bennett,B., Mena,J., Verdugo,C., Mor,S., Brito,B., Ramirez-Toloza,G., Neira,V., Bennet,B., Ramirez,G.
|
Universidad de Chile, The iThree Institute, Faculty of Science
|
Chile
|
2022-01-08
|
PoAstV5/Swine/CHI/CF2672/2017
|
Porcine astrovirus 5
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,423
|
GenBank
| 1
|
Chile
|
Chile
|
Sus scrofa
|
oronasopharynx
|
2017
| null | null |
UNVERIFIED: Porcine astrovirus 5 isolate PoAstV5/Swine/CHI/CF2672/2017, complete genome
|
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| 33,786
|
MZ819170.1
|
Porcine astrovirus 5
|
Flores,C., Ariyama,N., Bennett,B., Mena,J., Verdugo,C., Mor,S., Brito,B., Ramirez-Toloza,G., Neira,V., Bennet,B., Ramirez,G.
|
Universidad de Chile, The iThree Institute, Faculty of Science
|
Chile
|
2022-01-08
|
PoAstV5/Swine/CHI/FB036/2017
|
Porcine astrovirus 5
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,499
|
GenBank
| 1
|
Chile
|
Chile
|
Sus scrofa
|
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|
2017
| null | null |
Porcine astrovirus 5 isolate PoAstV5/Swine/CHI/FB036/2017, complete genome
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|
MZ819171.1
|
Porcine astrovirus 5
|
Flores,C., Ariyama,N., Bennett,B., Mena,J., Verdugo,C., Mor,S., Brito,B., Ramirez-Toloza,G., Neira,V., Bennet,B., Ramirez,G.
|
Universidad de Chile, The iThree Institute, Faculty of Science
|
Chile
|
2022-01-08
|
PoAstV5/Swine/CHI/FB033/2017
|
Porcine astrovirus 5
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,498
|
GenBank
| 1
|
Chile
|
Chile
|
Sus scrofa
|
oronasopharynx
|
2017
| null | null |
Porcine astrovirus 5 isolate PoAstV5/Swine/CHI/FB033/2017, complete genome
|
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PoAstV5/Swine/CHI/FB032/2017
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Porcine astrovirus 5
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Astroviridae
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| 33,789
|
MT642595.1
|
Porcine astrovirus 5
|
Mi,S., Guo,S., Xing,C., Xiao,C., He,B., Wu,B., Xia,X., Tu,C., Gong,W.
|
Jilin University, Key Laboratory of Zoonoses Research, Ministry of Education, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-10-28
| null |
Porcine astrovirus 5
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,448
|
GenBank
| 1
|
China: Bozhou City, Anhui Province
|
China
|
Sus scrofa
|
kidney, abdominal cavity
|
2014-12
| null | null |
Porcine astrovirus 5 strain PAstV5-AH29-2014, complete genome
|
GTTGGCTGGCTCCGCTAGCTGTTGTTCGCTGATAAAGTGATTTTTTATTCTTACATTGTCCTGTCATTAGCTTTCTTGCTTTGACACCATGGACCAGCTCTTTCGTCGGGGTGACCCCTTTGCTAGGCGCTGGGTTGAGTCTAGACCTGATGTCTATAAGAGCATGCTTAAGCTCTTTCCTGACAATGCAGTAGTCTTTATAACACGTGCACGTCATAATAGGGATTTTGCTCCTGTGGCATCGTCCGTTGACCATGACTCTGAGTGGGTTTCCTATAAGTACATTGGTACTACTTGGGAACAAGTCGATGAGGTTCCTGTCGACTCACAATCGGCAGTTGTCTCAGTCGCCCTCTTAGAGAATGCACGCCTCAAAGAACAGATTAAAGACCTGCAATGTAAGAACTCTCAGGCAGCACTTGAATACTCCCTTCTTCGCCATGACTATGAGAGAATTCGACCAGCGGCACCACAACCCTACAAATGGGGGAAGATCTTCTTCTATGCATTTGTGGTTGGACTTCTTGTGTCGTCACTTCCAATGTCTCATGCCTGGCCTGAAGGTGATCCTGAAAAGTCTGCCAACCACCCAGTTGCTGGATCTCTCTATCCACATCCCCAGGACGATGACTATCAGCGTTCATCTTTCACTTTTGATAACTTGCGCGAGCTCTTGACCGACTGGAACAAAAAAGCCTTTAACTATACACTCTATAGGGATAACCTTTTTAAAGAGTATCTTACTATTAAGGAGCGGCTCATAACTTATGAGTCATCGCCCATCATAAAGGTTTTCCTCTTTTTTAGACCATATTGGAGTCTCTGGTTCTTTTCTTCTTTAACCTTCTTGTTCCAGTCCTATGGCACCTCAAACTGGCTTGTTGCCAGTTTAATCGTTATCTTGTCACTTAAAACTGGTGATCGTACTATGGGACTTATACCAGTACCCTGGATGACGACTACCGGTGCCTGGGCCCATCTCGTGCTCATGTTGGTTTCCCTCTTTGATGCCTTAGGTGCCCTTTTTCTTTCCTTACTTTATCTCCTCTGTGCACCTTTGGTCTATTTATGGCAACCAGATGAGACTTTCTTTGCGACAATACGCAGTTCAACTTTGGTGGCAATTTCAAACCTGCTGGCAGTCCTCTCACGAAACATACCTGGTTGCGACATTCTGTGTCTGTCACTTGTTGTTGCCTGGCGCATCTATCAGGCTTGGTGCACCGTTGGTGCTACCCGCCTAGAGATTAAGACCGCCGATGGGAAAACTGCTAAAGTTGTTTCCTTGGCGCCTAGCTTCTTCCAACGCGCCAGGCGTAAGTTCAGACAGGCCACCAAACCCTTTAGGGCCCCATCTTTTCCAATACCATCCAATTGCTTGGTCCACATCACCACTGACCAGGGCTCTGGTACTGGTTTCAGAACTGGTAACTACCTTGTCACCGCCCGACACGTCGTGGCCGGGGCAACCTCAACAGAGGTTAGTGTTGGTTCATTAACTACCACTTTAACCCCGGCTGACTGGATCCCCCTTGGTGAAAGGGACATAGTTAAAGCCAAGCTGCCTTCAATCTTTCAACACCTTTCTTCTGTAAGGGTCGCTGACAAATCTTCCAACGATTGGATAGGTTTGTTGACCTTTGCTCCTAATGGTAGCTATTATCAGTTGGCCGTAGGAGATGGACTTTGGTTTGATGACACACTTACCTATGCCCTGGATTCTGACAATGGTTCATCCGGTTCACCTGTGATTGACCGCACTGGCAAAGTGGTCGCGGTCCACACCATGTCAACAGGTTACACTGCTTCTGGCCAGCGCCTCGTCCGCGAGGACGTGGAAAACATCTCAAAAGTCCAGGAAAAGGACCGTGAGATAGAGAAGCTTAAAGCAGAGCTTGAGGCACTTAGAGCCCAACCTTCCTTGCAGCAAAGCGATTGCCCACAAGAGGTAGTCGATCTTGTCCGTGAAGCTGTTCGTCAGGAAATGCTTCGCTTGCGCTTGGAATTCGCCCAAGCCAAAGGCAAGAACAAGCGTGGTCGTGGGAGGAAGCACAATCTCAACCTACGTGCCAAACGCATTGGTAAGCAATTTACTGAGCAAGAATATCGCAGACTTCAAGAGGAGGGTTGGACTAAGGATGACTTACGTGACATGGCTTACCAACTTTGGGAGGAAACACAGGCTGAAAATGCAGGCTATGGTGATTGGAGTGACCCAGAGTGGAGCGACGACGCTTCGCTTGGTTCTGACTTCTATGAGGAAGCACTTGACTTCGATCAGAGGAAAGTAATTGAGCCTACAGAACCTGACCAAGTCCCTCGTGAGGAAAATAACGAGGAAAAGAAGAAGTCTGGCCCCTTCCAGCAGTGCCAACTCGCCTGTCGCGACCCTATGCTTTATGAGGTTGACACGGCTGAGTACAAAGTATTAGGTGAGCCCATGCATGAAATCTCGAGGTATGTCAATGAGCTACAGTCACTTACACAAGAGGAATATACACGCAAGGCAACCTACTACTCCGATGCCTTGCGGGAGGCCTGGGATCGCCTTAATGGCTATTGTGTTCATTGCGGCTTTAAACCTTTTTCCCAGAGGAAGATGCGTCATCCTAAGCCACGACAACAACCAAAAAACTCCCGACGGACCCCTCAGGCTGGGGTCGGGAAGAAATAAGCCTGCACTACTGGCTATCCATGCTCCAGGAACCTAAACCACGCTTCCTGGTGCATCCTGACTTCCCCCTTGTCGGTTTCCTACCAATTAACAGACCCTTGTATGACGCATCCAGGCCTAGAGATCCTCTTCTTGGGCTCCTGCCACCAATCAATGTTGAAACTGGTTACGCACCAGCCACATGGGGGCCTCAAGCCTTTATCAATTCCTTTGAGAAGTTCCAGTATGCTCAGCCACCTGACTTCGTGGCAAAAAATCCACAAGCACATCAGTTTGCCCTTAGCAAGCTGCGAGCACACTACTCTTTCCTCCAGGGTACTGCTGTTATCCCTATCACTGCTACTGATAAGGAAACTAACTCCACCCCGGCCTATCCTAAAAACATTGTTTTCAGGAAAGAATCCGACTTCTTGGATCATTTTGGTTGGGGAGCTTATGTTGATGAACTTAAGCATTTGCAGTACAAGCCAGTTCTTTGGTATCTCTTTCTTAAGAAAGAGATCCTGAAAGAGTCTAAAATTCAGGCGGCCGACATCCGCCAGATTTTATGTGCTGATCTTATTTATGGTCGCATAGGCCTCATGTTTGATCAACAACAAAATGTGCGTGTGAAAGAGCGTACTCATGATAAATCATCTCAAGTTGGCTGGACTCCCTTCTTTGGTGGCTTTCAACAACGCATACAACGCCTGGCTTCAACAGGAGCGCGTTATTGGGTGGAAGTGGATTGGACCCGCTATGATGGTACCATACCACAACAATTACTTCGTATCATTCGACAGGTTAGGTGGGAGTTTCTTGACGATGTCTATAAGACCTCAGAGAATCGCAAGCTCTACGAATGGTACGTGCACAACTTGTTGAACCGCTATGTGCTCCTGCCCTCAGGTGAAGTTACATTTCAAGATCGTGGCAATCCCTCTGGGCAAGTCTCCACCTCAGTTGACAATGGCATGGTTAATTATTATCTTCAAGCCTATGAGCACTATGTCCTCAACGGTCCAGACGGTTGGGAAGACACTGACACTTTAATCTATGGTGACGACAGATTGTCCGTCACCAACTTCCCTCCCGATCCTGAGGAGCTCATAAAATTCTACCATGACTATTTTGGCATGTGGGTTAAGAAGGAGAATATTAAAGTACAAGAATCTCCGGTTGGTCTCTCCTTCTGTGGTTTTACCATAACCGAAGACCTTAAACCCTGTCTACAGAGGCCTATGAAATTGCTCGCTTCCATCTTGACACCTGTAACTAAATTACGGGACCCCGAAGTCCTCTATGGGAAACTCCTGAGTATGCTGATCCTGTCACACAATGACCCGCCGGATTCACCACTGCGTCGCTATGTGCGCCGTTGTGTTGATATTCTACGGGCTCGTGTTGGCTCTGATCTGCCAGTCTTTTCAGATAGGATCTTGTCGTATCTTTGGGGGGGAGGACCAAAAAGAGACGATGGCCAATCGGCGTAACAGGAGACCTCCCCAGAGGAGGAGAATGAGGGGGCCTCGGCCCGCTGCAGAAACCTCTACAGTTACAACTACAGTTTCTACCAATGGCCAGACTAAGCCCACTACCAAGACAACTACTGTCAAGACCACTAAGACAGCACCTCGCCAGCAAAACACGCGCCAAGTGCGCAATTTTGTGCGTCGTGAACTACAGAAACGCACTGATGGACCTAAAGCTGCTATAACACAAACTGCCACTCTCACCCTTGGAACCCTCGGGACCAATGGGTCTGGCAATCTCGAGATCGAAGGTGTTGCCCATCTCAACCCTCTCTTGATCAAGGAGAAAACTGCCGCTGCTGGTGCCGGACCAATTCAGGCATTGGCCTCTCAGTATGCCATGTGGCGGTGCTTGTCGCTACGTGTTATACTGGTACCAACGGTCGGGGCTAGTGCGGTTTCTGGCACTGTTGCTCGCACATCTTTAAATCAACCCGGTGCTCCGGCCCAGACCACTTGGTCTGGCTTGGGTGCTAGGAAACATGTTGATGCCACGCCTGGCAGGCGCGTTGAGTTCCGGCTTGGCCGTCGTGATCTGCAAGGACCACGAGATGGTTGGTGGTACACCGATACCTCCAATGGTGTCCAGAACTCTGCAGGTCCTACCATTGAGATTCACTCATATGGTAAGACGGTCTCTACTTTCCAAGCAACTGCTTGGTCTGGTGAACTCTGGCTTGTAGAGCTCCGCGCCACCTGGCAGTTTACCAACTGGAATATGAATCCCAGGCTTCTCTCCTTGGTTGATACTACAATCCCAGAGGGTAAGATAAAGCTTTCCTCATCAGCTGCTGGTGCTCCCGTAGTTCTCAGTGTTGAAAAAGCTGCCAATGCACCCTTAGAGACACAACACGCACCTAACCCACATTCTGCTGGCACTACCAGTGTATCTGAAGTTATTTGGAGAGCTGCTGACGTTGGTATTAAAACAGTTGCTGCTGAGTTGCCCCCCCCTCTCTCTTGGCTGATTGGGGGAGGCTGGTGGTTTATGAAGCGTGTCTTCAATGCCCCAGTTGGTGCAGGTATCAACTCAGCTGAAGTGGATGGCTATTACATCTATGCCACTGCTGTTGACGCTGAGCTTGACAACCCTGTCAAGTCGTCAGCTCCCTTAACTGCAGTTGATGTTAAGGGTAATATCGACATCCAGCAGATGACTCTCCCTGACACAGTTCAAGTGACTCAGGCTTCGGGGCGTTCTATCGATACCCCCGCTTTTACTACTGGTAATGTTGCTGTTTCCACAACTTCCCTTGCCTTTTCTTCTGCTGACATTCTTGGACAGGTTTGCCTATCTGGTACTGAGAAAACCTATGCTCCAGCTTTGGTTTTTACACCATCCAATGTAGATCTTGTCTATGCCAACCTTTACAACATCATGGTGGTTTCTCCAGAGAATCTGGCATTCTTTATGGGCAATCAACTTGCCCGTGCCCCAGTTGGGGTTGAGGCACGCCTGTGCTATAAGACCTCTGGTCAGAATCCTGACGTTAGGGATGTTACTGGCGTCAAGCTCCTTGCTGCTACAAATCCCTTGGCTACATCTGGGGCTGCCCTTATGCAGCTTTACCTCTTCCAGGTGGAGACCACCGCCAGTGCTGAGTTTACCGCAAAACTTCAGGCACTCAATCGTTCCAACAACAGTGTCTATGCCAATCTCATTGGCGTCAACAGAGACCTGAGTTATACTTTCACTGTTGGAACTTACTACCTAGGAATTGCCTGTGGTATGCAGTCTACAGCATATGGTCGGTCCGTAGTTGTTAACGAGACTGACACTAATCAAGTGCCTATCTCTTTGTTCAACTACTTGCCAATTTCACCAGGCTACACACTCTATTCCCAGATGACTGCTTTTGGTTCTGCCTCACGCACTTTAGTGCCTGAGACCACTGAGCTTGACTTTCCTTTCATTCCTGACAACTGTGTGCCACATTTTGATCTTAACCCCAATCAATTGTCCACCTATGAGAAACTTCACCCTCATGTTGGTAGACATTTGGCGGCGCTCTTCGCACATGTGTGCCTAGATGGTGAGCTGCGTGATTTTCTTGATTCTTATCATGATTATCTCGTAGATGGGTTTAGCCCCACCTCTGCTGCAGCAGCTGCCTTGGACTCCGAAAATCTCGTTGAGTCCGACTGAGCCGAGGCCACGCCGAGTAGGAACGAGGGTACAGCTCAGCTTACTTTTACTTCCTTGAATTTAATCATTTAACTGTTTGATTGATTAATTGCTAGAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 46,245
|
JX556693.1
|
Porcine astrovirus 5
|
Xiao,C.T., Gimenez-Lirola,L.G., Gerber,P.F., Jiang,Y.H., Halbur,P.G., Opriessnig,T.
|
Department of Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine, College of Veterinary Medicine
|
USA
|
2013-02-15
|
AstV5-US-IA122
|
Porcine astrovirus 5
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,500
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2011-06-23
| null | null |
Porcine astrovirus 5 isolate AstV5-US-IA122, complete genome
|
CCAAAAGTGAGGTTGGCTGGCTCCGCTAGCTGTTGTTCGCTGATATAGTGATTTAATCCTCTTTATATCGTCCTGTCAATAGCTTCTTTGCTGTGACATTATGGACCAGCTCTTTCGTCGGGGTGATCCTTTCGCTAGGCGTTGGGTCGAGTCTAGGCCTGAGGTCTATAAGAGTATGCTCAAACTCTTCCCTGACAATGCAGTTGTCTTTATAACACGTGCGCGTCACAATAGGGATTTTGCCCCTGTGGCATCATCCGTCGACCATGACTCTGAGTGGGTTTCCTATAAGTACACTGGTACCACATGGGAACAAGTCGACGAGGTTCCTGTCGATTCACAATCGGCAGTTGTCTCAGTGGCCCTCTTGGAGAACGCACGTTTGAAGGAACAAGTCAAAGACCTGCAAGGCAAGAACTCTCAAGCAGCACTCGAATATTCCCTTCTTCGCCATGATTATGAGAGAATCCGGCCAGCGGCACCACAGCCCTATAAATGGGGGAAGATCTTCTTCTACGCGTTTGTGGTCGGACTTCTCGTTTCATCGCTTCCGATGTCACATGCTTGGCCTGAAGGTGATCCTGAGAAATCTGCCAACCATCCAGTTGCTGGTTCCCTTTATCCACATCCTCAGGACGATGACTATCAGCGTTCATCATTCACTTTTGACAACCTGCGTGAGCTCCTGACTGACTGGAACAAAAAAGCTTTCAACTACACACTCTACAGGGACAACCTCTTTAAGGAGTACCTTACCATCAAGGAGCGACTCATAACCTATGAGTCATCACCTATCATTAAGGTTTTCCTCTTTTTTAGGCCCTATTGGAGCCTTTGGTTCTTCTCCTCCCTGACCTTTTTGTTCCAGTCCTATGGCACCTCGAACTGGCTCGTCGCCAGTTTAATTGTCATCTTGTCACTCAAAACTGGAGACCGTACGATGGGACTTATACCAGTCCCTTGGATGACGACTACTGGTGCCTGGGTTCATCTTGTGCTCATGCTGGTCTCCCTCTTTGATGCCTTAGGTGCTCTCTTTCTTTCTCTTCTCTATCTTTTCTGTGCACCTTTGGTTTATCTCTGGCAACCAGATGAAACTTTCTTTTCCACAATACGTAGCTCAACCTTAGTGGCAATTCCAAACCTTCTTGCCGTTCTTTCACGCAATATACCTGGTTGTGATATTTTGTGCTTGTCGCTTGTTGTCTTCTGGCGTATCTACCAGGCTTGGTGCACCGTCGGTGCCACCCGCCTGGAGATTAAGACTGCTGATGGAAAGACTGCCAAGGTTGTCTCATTAGCACCCAGTTTCTTCCAGCGCGCCAGACGCAAGTTTAGGCAAGCCACCAAGCCATTTAGAGCTCCATCTTTTCCGATACCATCTAATTGTTTGGTTCACATCACCACCGACCAGGGTTCTGGAACTGGTTTCAGAACAGGTAACTACCTTGTTACCGCCCGTCATGTTGTTGCTGGAGCTACCTCAACGGAAGTTAGTGTTGGTTCCTTGACTACAACCTTGACCTCGGCCGACTGGATTCCTCTTGGTGAAAGGGATATAGTTAAAGCTAAGCTACCTTCACTCTTCCAGCACCTCTCTTCTGTGAGGGTTGCTGACAAATCCTCTAATGATTGGATTGGTCTACTTACATTTGCCCCTAATGGTAGCTATTATCAGTTGGCCGTTGGAGATGGACTCTGGTTTGATGACACACTTACCTATGCTTTGGACTCTGACAATGGCTCATCTGGTTCACCTGTGATTGACCGTACCGGTAAAGTGGTTGCAGTTCATACCATGTCAACAGGTTATACTGCCTCCGGTCAGCGCCTCGTACGTGAGGATGTTGAAAACATCTCAAAAGTCCAGGAAAAGGACCGAGAGATAGAGAAACTTAAAGCAGAACTTGAGGCCCTTAGAGCTCAGCCCTCTTTACAAAGCCATCCTAGCCCTGTGGAATCAGCTCTGCAGCAGAGTGACTGCCCCCAGGAAGTGGTTGACCTTGTTCGTGAAGCTGTTCGCCAGGAGATGCTTCGCTTGCGCTTGGAATTCGCCCAAGCTAAAGGTAAGAACAAGCGTGGCCGTGGTAGGAAACACAACCTTAACCTACGTGCCAAACGCGTTGGTAAACAGTTTACTGAACAGGAATACCGCAGGCTTCAAGAGGAAGGCTGGACTAAGGATGACTTACGCGACATGGCTTACCAACTCTGGGAGGAAACACAGGCAGAGAATGCAGGCTATGGTGACTGGAGTGACCCAGAATGGAGTGATGACGCCTCACTTGGCTCTGACTTCTATGAAGAAGCACTAGACTTTGATCAGAGGAAAGTGGTCGAGCCTACAGAACCTGATCAGACTCCTCGCGAGGAGTTCAATGAGGAGAAGAAGAAACCTGGCCCTTTCCAACAATGTCAGCTCGCTTGTCGTGACCCCATGCTCTATGAGGTTGACACCGCTGAATACAAAGTCTTAGGTGAGCCCATGCATGAAATCTCGAGGTATGTTAATGAGTTACAATCACTCACTCAAGAGGAATACACACGCAAGGCAACCTACTATTCTGACGCCTTGCGGGAGGCCTGGGATCGTCTTAACGGTTACTGTGTTCATTGTGGCTTCAAACCTTTCTCCCAGAGGAAGATGCGCCATCCCAAGCCACGACAGCAACCAAAAAACTCCCGACGGACCCCTCAGGCTGGGGTCGGGAAGAAATAAGCCTGCATTACTGGCTATCTATGCTCCAGGAACCTAAACCACGTTTCCTGGTGCACCCTGATTTCCCTCTTGTTGGCTTTTTACCAATTAATAGACCTTTGTATGATGCATCCAGGCCTAGAGATCCCCTCTTGGGACTTTTACCACCAATCAATGTTGACACCGGCTATGCACCAGCCACCTGGGGGCCTCAAGCTTTTATCAACTCTTTTGAGAAGTTTCAGTATGCTCAGCCACCTGACTTCGTGGCAAAAAATTCACAGGCACATCAGTTCGCTCTCAGCAAACTGCGAGCACACTACTCTTTCCTTCAAGGTACTGCTGTTATCCCTATCACTGCTACTGATAAGGAGACCAACTCTACTCCAGCCTACCCTAAGAACATTGTTTTTAGGAAAGAATCCGACTTCTTGGATCACTTTAGTTGGGGGGCTTATGTCGATGAACTTAAGCACTTGCAGTACAAACCAGTCTTATGGTATCTCTTCCTCAAGAAAGAGATCTTGAAAGAGTCAAAAATTCAGGCGGCCGATATCCGCCAGATTTTGTGTGCCGATCCCATCTATGGTCGCATAGGCCTTATGTTCGACCAACAACAAAATGTGCGTGTGAAAGAGCGTACACATGACAAATCATCTCAAGTCGGCTGGACTCCCTTCTTCGGTGGCTTTCAACAACGCATACAACGCCTGGCTTCAACCGGAGCACGCTACTGGGTAGAAGTGGACTGGACCCGCTATGATGGCACCATACCACAACAATTGCTTCGTATCATTCGACAAGTCAGGTGGGAGTTTCTTGATGACGTCTACAAGACTGCAGAAAATCGGAAGCTCTATGAATGGTACGTGCACAATCTGTTGAACCGCTATGTGCTCTTGCCCTCAGGTGAAGTCACATTTCAAGATCGTGGCAATCCCTCTGGGCAGGTCTCCACCTCAGTTGACAATGGTATGGTTAATTACTACCTTCAAGCTTATGAGCATTATGTTCTCAATGGTCCAGACGGTTGGGAAGACACTGACACCTTGATCTATGGTGACGACAGGTTGTCTGTTACCAACTTCCCTCCCGACCCTGATGAGCTCATAAATTTTTACCATGACTATTTCGGTATGTGGGTTAAGAAGGAGAACGTAAAAGTGCAAGAAACTCCGGTTGGTCTTTCCTTCTGTGGCTTTACTATAACTGAAGACTTAAAACCATGTCTACAGAGGCCTATGAAACTGCTTGCTTCCATTCTTACACCTGTGACTAAGCTACGGGACCCCGAAGTCCTCTATGGGAAACTCCTGAGTATGCTGATCCTGTCACACAATGACCCACCGGATTCACCACTGCGTCGCTATGTGCGCCGTTGTGTTGATATCCTACGGGCTCGTGTTGGCTCTGATCTGCCAGTCTTTTCAGATAGGATCTTGTCGTATCTTTGGGGGGGAGGACCAAAAAGAGACGATGGCCAATCGGCGTAACAGGAGACCTCCCCAGAGGAGGAGAATGAGGGGGCCCCGCCCAGCTGCAGAAACTTCTACAGTCACAACTACAGTTTCTACTAATGGCCAAACTAAGCCCACTACCAAGACAACTACTGTTAAGACCACCAAGACAGCACCTCGTCAGCAGAACACGCGCCAAGTGCGCAATTTCGTGCGTCGTGAACTGCAAAAACGCACTGATGGACCTAAGGCTGCTATAACTCAAACTGCCACTCTCACCCTTGGTACCCTTGGGACCAATGGGTCTGGCAATCTTGAGATTGAAGGTGTTGCTCATCTTAACCCTCTCTTGATCAAGGAGAAAACTGCCGCTGCTGGTGCTGGGCCAATTCAGGCACTGGCCTCCCAGTACGCCATGTGGCGATGCTTGTCGCTACGTGTTATACTGGTACCAACTGTCGGGGCTAGTGCGGTTTCTGGCACTGTTGCCCGCACATCTTTAAATCAGCCTGGTGCCCCGGCCCAGACCACCTGGTCTGGTTTGGGTGCTAGGAAGCACGTCGATGCCACACCTGGCAGGCGCGTTGAGTTCCGGCTCGGCCGTCGTGATCTACAGGGGCCTCGAGATGGTTGGTGGTATACCGATACCTCCAATGGGGTTCAGAATTCTGCAGGTCCTACCATTGGGATTCATTCTTATGGCAAGACGGTTTCCACTTTCCAAGCAACGGCTTGGTCTGGTGAACTTTGGCTCGTGGAACTCCGCGCCACATGGCAGTTTACAAATTGGAACATGAATCCTAGGCTTCTCTCCTTGGTTGACACTACAATCCCAGAGGGTAAGA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| 95,240
|
JF713711.1
|
Porcine astrovirus 5
|
Shan,T., Li,L., Simmonds,P., Wang,C., Moeser,A., Delwart,E.
|
University of California-San Francisco, Blood Systems Research Institute, Department of Laboratory Medicine
|
USA
|
2011-11-02
| null |
Porcine astrovirus 5
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,478
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
|
feces
|
2010
| null | null |
Porcine astrovirus 5 strain 33/USA, complete genome
|
TGGCTCCGCTAGCTGTTGTTCGCTGATATAGTGATTCAATTCCTCTATTGTCCTGTCAATAGCCCTTTGCTGTGACATTATGGACCAGCTCTTTCGTCGGGGTGATCCTTTCGCTCGGCGTTGGGTCGAGTCTAGGCCTGATGTCTATAAGAGTATGCTCAAACTCTTCCCTGACAATGCAGTTATCTTTATAACACGTGCGCGTCACAATAGGGATTTTGCTCCTGTGGCATCATCCGTTGACCATGACTCTGAGTGGGTTTCCTATAAGTACACCGGTACCACATGGGAACAAGTCGACGAGGTTCCTGTCGATTCACAATCGGCAGTTGTCTCAGTAGCCCTCTTGGAGAACGCACGTTTGAAGGAACAAATCAAAGATCTGCAAGGCAAGAACTCTCAGGCAGCACTCGAATATTCCCTTCTTCGCCATGATTATGAGAGAATCCGGCCAGCGGCACCACAGCCCTACAAATGGGGGAAGATCTTCTTCTACGCGTTTGTTGTCGGACTTCTCGTTGCATCGCTTCCGATGTCGCATGCTTGGCCTGAAGGTGATCCTGAGAAATCTGCCAACCATCCAGTTGCTGGTTCCCTTTATCCACATCCTCAGGACGATGACTATCAGCGTTCATCATTCACTTTTGACAACTTGCGTGAGCTCCTGACTGACTGGAACAAAAAAGCTTTCAACTACACACTTTACAGGGATAACCTCTTTAAGGAGTACCTTACCATCAAGGAGCGACTCATAACCTATGAGTCATCACCCATTATTAAGGTTTTCCTCTTTTTTAGGCCCTATTGGAGCCTTTGGTTCTTTTCTTCCCTGACCTTTTTGTTCCAGTCCTATGGTACCTCGAACTGGCTCGTCGCCAGTTTAATTGTCATCTTGTCACTCAAAACTGGAGACCGTACGATGGGACTTATACCAGTCCCTTGGATGACGACTACTGGTGCCTGGGTTCATCTTGTGCTCATGCTGGTCTCCCTCTTTGATGCCTTGGGTGCTCTCTTCCTTTCTCTTCTCTATCTTTTCTGTGCACCTTTGGTTTACCTCTGGCAACCAGATGAAACCTTCTTTTCCACAATACGTAGCTCAACCTTAGTGGCAATTTCAAACCTGCTTGCCGTCCTTTCACGTAATATACCTGGTTGTGATATCCTGTGCTTGTCGCTTGTTGTCTTCTGGCGCATCTACCAGGCTTGGTGCACCGTTGGTGCCACCCGCCTGGAGATTAAGACCGCTGATGGAAAGACTGCCAAGGTTGTTTCCTTAGCACCCAGTTTCTTCCAGCGCGCCAGACGCAAGTTTAGGCAAGCCACCAAGCCATTTAGAGCTCCATCTTTCCCGATACCATCTAATTGTTTGGTTCACATCACCACCGACCAGGGTTCTGGGACTGGCTTCAGAACAGGTAACTACCTTGTTACCGCTCGCCATGTTGTTGCTGGAGCCACCTCAACGGAAGTTAGTGTTGGTTCCTTAACTACAACCTTGACCTCGGCTGACTGGATTCCCCTTGGTGAAAGGGATATAGTTAAAGCTAAGCTACCTTCACTCTTCCAGCACCTCTCTTCTGTGAGGGTTGCTGACAAATCCTCTAATGATTGGATTGGTCTACTTACATTTGCACCTAATGGTAGCTATTATCAGTTGGCCGTTGGAGATGGTCTCTGGTTTGATGACACCCTTACCTATGCTTTGGATTCTGACAATGGCTCATCTGGCTCACCTGTGATTGACCGCACCGGTAGAGTGGTTGCAGTCCATACCATGTCAACAGGTTACACCGCCTCCGGTCAGCGCCTCGTACGCGAGGACGTTGAAAACGTCTCAAAAGTCCAGGAAAAGGACCGAGAGATAGAGAAACTTAAAGCAGAACTTGAGGCCCTTAGAGCTCAGCCTTCTTTACAAAGCCATCCTGGTCCTGTGGAATCAGCTCTGCAGCAGAGCGACTGTCCCCAGGAAGTGGTTGACCTTGTTCGTGAAGCTGTCCGTCAGGAGATGCTTCGCTTGCGCTTGGAATTCGCCCAAGCTAAAGGTAAGAACAAGCGTGGCCGTGGTAGGAAACACAACCTTAACCTACGTGCCAAACGCGTTGGTAAACAGTTCACTGAACAGGAATACCGCAGGCTTCAAGAGGAAGGCTGGACTAAGGATGACTTGCGCGACATGGCTTACCAACTTTGGGAGGAGACACAGGCAGAGAATGCAGGTTATGGTGACTGGAGTGACCCAGAATGGAGTGATGATGCCTCACTTGGCTCTGACTTCTATGAAGAAGCACTAGACTTTGACCAGAGGAAAGTGGCCGAGCCTGTAGAATCTGATCAGGCTCCTCGCGAGGAGTTTAATGAGGAGAAGAAGAAACCTGGCCCTTTCCAACAATGTCAGCTCGCTTGTCGTGACCCCATGCTCTATGAGGTTGACACCGCTGAATACAAAGTCCTAGGTGAGCCCATGCATGAAATCTCGAGGTATGTTAATGAGCTACAGTCACTCACTCAAGAGGAATACACACGCAAGGCAACCTACTATTCTGACGCCTTGCGGGAGGCCTGGGATCGTCTTAACGGTTACTGTGTTCATTGTGGCTTCAAACCTTTCTCCCAGAGGAAGATGCGCCATCCCAAGCCACGACAGCAACCAAAAAACTCCCGACGGACCCCTCAGGCTGGGGTCGGGAAGAAATAAGCCTGCACTACTGGCTATCTATGCTTCAGGAACCTAAACCACGTTTCCTGGTGCACCCTGACTTCCCTCTTGTCGGCTTCTTACCAATTAATAGACCTTTGTATGATGCATCCAGGCCTAGAGATCCCCTCTTGGGGCTTTTACCACCAATCAATGTTGACACCGGTTATGCACCAGCCACGTGGGGACCCCAAGCTTTTATCAACTCTTTTGAGAAGTTTCAGTATGCTCAACCACCTGATTTCGTGGCAAAAAATCCACAGGCACATCAGTTTGCTCTCAGCAAACTGCGAGCACACTACTCTTTCCTTCAGGGTACTGCTGTCATCCCTATCACTGCTACTGATAAGGAGACCAACTCTACTCCAGCCTATCCTAAGAACATTGTCTTTAGGAAAGAATCTGACTTTTTGGATCACTTTGGTTGGGGGGCTTATGTCGATGAACTTAAGCACTTGCAGTACAAGCCAGTTTTATGGTATCTCTTCCTTAAGAAAGAGATCCTGAAAGAGTCAAAAATTCAGGCGGCCGATATCCGCCAGATTTTGTGTGCCGATCCCATCTATGGTCGCATAGGCCTTATGTTCGACCAACAACAAAATGTGCGGGTGAAAGAGCGTACACAAGATAAATCATCTCAAGTCGGCTGGACTCCCTTCTTTGGTGGCTTTCAACAACGCATACAACGCCTGGCTTCAACCGGAGCACGCTATTGGGTAGAAGTGGACTGGACCCGCTACGATGGCACCATACCACAACAATTACTTCGTATCATTCGACAAGTCAGGTGGGAGTTTCTCGATGACGTCTACAAGACTGCAGAAAATCGGAAGCTCTATGAATGGTACGTGCACAATCTGTTGAACCGATATGTGCTCTTGCCCTCAGGTGAAGTCACATTTCAAGATCGTGGCAATCCCTCTGGGCAGGTTTCCACCTCAGTTGATAATGGTATGGTTAATTACTACCTTCAAGCTTATGAGCACTATGTTCTCAATGGTCCAGACGGTTGGGAAGACACTGACACTTTGATCTATGGTGACGACAGGTTGTCTGTTACCAACTTCCCTCCCGACCCTGATGAGCTCATAAATTTCTACCATGACTATTTCGGTATGTGGGTCAAGAAGGAGAATATAAAAGTGCAAGAAACTCCGGTTGGTCTTTCCTTCTGTGGCTTTACTATAACTGAAGACTTAAAACCATGTCTACAGAGGCCTATGAAATTGCTTGCTTCCATTCTTACACCTGTGACTAAGCTACGGGACCCCGAAGTCCTCTATGGGAAACTCCTGAGTATGCTGATCCTGTCACACAATGACCCACCGGATTCACCACTGCGTCGCTACGTGCGCCGTTGTGTTGATATCCTACGGGCTCGTGTTGGCTCTGATCTGCCAGTCTTTTCAGATAGGATCTTGTCGTATCTTTGGGGGGGAGGACCAAAAAGAGACGATGGCCAATCGGCGTAACAGGAGACCTCCCCAGAGGAGGAGAATGAGGGGGCCCCGGCCCGCTGCAGAAACCTCTACAGTCACAACTACAGTTTCTACTAATGGCCAAACTAAGCCCACTACCAAGACAACCACTGTCAAGACCACCAAGACAGCACCTCGCCAGCAAAACACGCGTCAAGTGCGCAATTTCGTGCGTCGTGAACTGCAAAAACGCACTGATGGACCTAAGGCTGCTATAACTCAAACTGCCACTCTCACCCTTGGGACCCTTGGGACCAATGGGTCTGGCAATCTTGAGATTGAAGGTGTTGCTCATCTTAACCCTCTCTTGATCAAGGAGAAAACTGCCGCCGCTGGTGCTGGACCAATTCAGGCACTGGCCTCCCAATACGCCATGTGGCGATGCTTGTCGCTACGTGTTATACTGGTACCAACTGTCGGGGCTAGTGCGGTTTCTGGCACTGTTGCTCGCACATCTTTGAATCAACCTGGTGCCCCGGCCCAGACCACCTGGTCTGGCTTGGGTGCTAGGAAACATGTTGATGCCACACCTGGCAGGCGCGTTGAGTTCCGGCTTGGCCGTCGTGACCTACAGGGGCCCCGAGATGGTTGGTGGTATACCGATACCTCCAATGGGGTTCAGAATTCTGCAGGTCCTACCATTGAGATCCATTCTTATGGCAAGACGGTTTCCACTTTCCAAGCAACGGCTTGGTCTGGTGAACTCTGGCTCGTGGAACTCCGCGCCACCTGGCAGTTTACAAATTGGAACATGAATCCTAGGCTTCTCTCCTTGGTTGACACTACAATCCCAGAGGGTAAGATAAAGCTTTCTTCATCAGCCGCTGGTGCTCCTGTAGTTCTTAGTGTTGAGAAGGCTGCCAACGCACCCTTAGAGACACAACATGCACCCAATCCACATTCTGCTGGCACTACCAGTGTGTCTGAAGTTATCTGGAGAGCTGCTGACGTCGGGATAAAGACGGTTGCTGCCGAACTACCCCCCCCTCTTTCATGGTTGATTGGGGGAGGTTGGTGGTTCATGAAGCGGGTCTTCAATGCCCCGGTCGGCGCCGGTATCAACTCAGCTGAAGTTGATGGCTATTACATCTACGCCACTGCAGTTGACGCTGAGCTTGACAATCCCGTCAAATCTTCGGCCGCTCTGGCCGCAGTCGATGTGAAAGGTAACATTGACATTCAACAGATGACTCTCCCAGACACAGTTCAAGTGGCACAGGCTTCTGGAGGTTCAGTCTACACGAACACCTTCACAAGTGGCACGGTGGCTATGCAACCTGCCTCTTCTGTGTTCGGTCCCTACACAGGAGGGCTCCTTCACCAGATAGCCCTCATTGGTGATCGCGGCTCCTATGTACCAGCACTTGCCTTACCAACAGATAACTCTGAGACTCTCTATGCACATTTGCTACATATCCTAACTATACCTGCAAATCGCTTGACTTTCCTAATGGGTACTCAGGCAGCTCGCCCACCAGCGGGAGTTGATATTAGACTGTGCTATAAGACAAAGAATCCTTCTCCCACGGTGAGTGATGTAACTCCAGCCAAGTTGCTAGCTGCGACTCCACCTCTAAATACTTCAGGTGCTGCCAAGATGCAACTCTATCTCTTCCAGGTGGATACAACATCATCCGCAAGTTTTGAGTTAACTCTGCGGGAGCTCAACAGAACTAATGGTAGTCAGTATGCCGACGTTGGTAGGTTCCAAACAAGAACTAATCAACATGATTATGTCGTTGGGACCTACTACCTTGGTATAGCCTGTGGCAACCAATCATCATCGTTTGGTCGCCCTGTGGTGATTAACGAACCGGATACTAATCAGGTTCCCATTTCACTGCTGAACTACATACCAATGGGAGCTGGCTACACACTTTGTCCGCCGATGGAGGCTTTTGGCTATACTGCATCCTTGGAAGTGCCCAATACTTATGATTTGGATTTTCCGTTTATGCCTTCTGATTATGTGCCTTCTTTTGGTTTTAATGAAGATCAACGCCTCTTCTATGATAGGCTGATGCCAGTGATTGGTAGACATCTTGCTGCACTGGCAACTCATCTCTGCGTTGAGGGTGAGATGCGAGAGTATCTTGATTCTTATCATGATGGTCTCGTTGATGGACTTAGTCCACCCTCCGCGTCTGCTGCCGCACTAGGCTCCTATAGCAGTGATTCTGAATGAGCCGAGGCCACGCCGAGTAGGACCGAGGGTACAGCTCATGTTTTATTTTTTTGAATCTAATCATTTAACTGTTTTGATTATTTGCCTTAAAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 97,931
|
NC_023673.1
|
Porcine bocavirus
|
Wang,E., Liu,W., Yang,B., Liu,J., Ma,X., Lan,X.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-03-07
|
swBoV CH437
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,275
|
RefSeq
| 1
|
China: Gansu province
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2012-06
| null |
PRJNA485481
|
Porcine bocavirus isolate swBoV CH437, complete genome
|
CCCACACAAGGAAATAAGTATCGGAAAAATAGGGGTTGGCTGGAGATAATGATAGACACGCCTTTTCGGGCACAGCCAATCACAGCGATGGGGTGATTTGACGTGGCTGATTCTGATAGGCTGGAGGACTCTATATAAGGAGAGCAACCAGGAAATAGAGTTCATTCTGCGGCTGGACGCGGAGCTGTTCACATCGATGCAGAAAGAGCGCGTGAGACACTACACCTTCTTCTATTGATGTACATTCTGCCTGAGAAGAGACTACTACAGTCTGTGGACATCGCTCCGCGGGAGAAGACGTCCTGTGAAGGTATATTATGGCTGCTGGCATGGCTTCTGCTAGAGTTGGGCTGTCTGATCAGGAATGGCTGGGTTTTTGGCACGGAGCTATTACTGGTTTCAAGGCTCCCAGCTTTAGCTATGTTATTAGAATTGATATCAAGGACTGGAGACTGGCTGAGAGAGCTATTATGGACATATATTCTAAAGATATGCCTGTCATTCTGGATGATCTGGTAGATCAGGAGAAGGAGCTTCTGCTCTGCGACGTCAATTATAACTGGAAGGAGAGTCTGGCCATGAAGCTCCAGAATCAGCACGGGCTCGGTCAGACGCTCTGTGAGGCTGCTGACATGGCCGCGAAGCGGCTCTTTCAGCTGAAGCAGCAGAGTCACAATCCAGTCTACAGCTGCTTCACTCAGGCTGAGATCGGCGAGATCTATATGCACGTTCATGTAGTGTGCGGAGGAGACGGGCTGACCAAGTGCAACGCTAAAAAAAGCGCTTGGGTTCTGGCTAAATACTTCTGGAGCTATATGCTCGATCTCTGGAAGCACTACGAGAGTTGCTTCGATCCGACCAATCTGCAGTACACCGTGTCGGTGCAGCTGCGTCTACTCTGTGAGAGGGTCAGGGCTCATCAGGACGCGACCGTCTCTTGCTTGACCTATCGAGACCGGCACAACGAGGCTCACGCTCAGCGCATCGATGCTTGCAGCTACATTATGAACTATCTCTTGCCGAAGAATAGACAGCTGGTGACTTGGCTGGATCCTGATGTCTGCACTCCGAGCGTAGCTCGCTTTGAAACCACCAAAACCTACATGTGCAGTCACCTTGACAGACAGCCGATCACTCACTATCTCAGAAAGGCTCTCCATGACCGGCTGGTCATGAACAGTTCTGATGAGACGGGGGAACCTGTCCATAAGATGCCGCGCTGGGGCGATCTTCCTGCGGTAGGTGAAAACTCCTTAGCTAGACAGGCAGGGCCGACAAGGCCGACTAAACTGACGAGAAAACAGCATGTCATGTTAGATACTCTGCAGAGATGTCAGGAAGAGTTTATCTGTACCAAGGAAGAGTTAACGATGCTGCATCCAGATCTAGTGATTATGTTTGAGAGTACTCCGAGCGGGTCTCGAACGCTCGAAGAAGTACTCGAGATGCATCGGGTGAGAATCACTAGAACCGAGACGGCTCTGAGTTACATTAAAAGGCAGTTTCCAGACAACAGATTTATCAAGCCGGAGAATAAGGTGGTCAGGCTGTTGAACATCCAGGGCTACAATCCTATACAGGTCGACCACTGGATGGCGACCGTGCTCTCTAAGAAAGCCGGGAAACAGAACACGATCTGTTTCTTTGGTCCGGCCAGTACGGGGAAGACCAATCTGGCTAAGGCGCTCGCGAGCGCGGTGAAGGTCTATGGTTGTGTCAATCACCTCAACAAGCAGTTTGTCTTTAACGATTGCCAGAACAAGCTCGTATGCTGGTGGGAGGAGGCGGTCATGCACAACGATTATGTAGAGCCAGCTAAATGTCTGATGGGGGGAACGACCTTTAGGGTAGATAGAAAACACCGAGATAGCGCGGAACAGCCTCAAACACCTTTGCTCATCAGCACCAATCATGACATCTACACAGTGGTGGGTGGGAACACAGTGACTACCGTTCATGAGAAACCGATCCGAGATAGAGTAGTTCAGTTCAATTTCATGAAAGCGCTGCCTCAGAACTTTGGAGAGATCTCGGTGACTGAAGTGGCTGATTGGCTCGGCTGGTGCGCCGAGGACTTTGACTGCACGCTCGACGGGTTCAAGAAAGAGTGGGAGCTTGACCGTGTTCCCAACAGCTTTCCTTTAGCTGTCTACTGTGATGGTCATTCACAGGATTTTGTGCTCTACGCTCAAGGACCTTGCCGTCGCTGTGGTGGCTACCTGCCTCATACTACTACCAGCGACGGTGATTGGAGCGAGTCTGCTGCTGCAGGTAGGACTTGGCGCATGCGCGATAGGGAGACACCTATCGGGCGGGGAGGGATGTGCTCATGATCTGTTCTTTGTCTTTCAGAGCCTACTCCGGCAGAGTCTCCAAAGAAAGTGACCGCTACTCAAGGCACTCAGACCGAGCCTGAACCTTCTTCTTCAAGTGAGTACATCGACTGGAGCAGCTGTCCAACCAATGAGTCAGAGATTCAGCGATACAACATCTCGCAGCGGGAAGAGCAACCTCCGGTTCTCTCCTTACTCGACGATCCAGGCGAAGGACCGTCGAGTCAACGAGAGGTCTACAACCGAGAGGGAGCATGGAACGTCTTCGCGGGAGCCAGTGGAGACGGAGACCAAGCCGGGATCCTCGTCACAGTGGACCGCTTCCTGCGGGAGGGGGAGGAAGGGCACATCGACCCCGGGTTCTGGCTCAGCTGTGGGGAGCTCTTGGAAGAGCCGCAAGATGGTTAAGAAGGCTAATCCGGCCACAGTCTTCAGTGAGCACAAAAAGAGGGAGGGAATCGAGTTCGACTTCTGTGGGTTTTACTATCACTCCACAAGAATTGCATCCAAGGGAACTAGATACATTTTTGACATGGCGAAAAAAGACTTTCAGTCTGTCGCCAAACAAAATTGTGTCACCTGGGACCAGCACCGAGAATTACTATTTACTTTTAAACGGTGTCTGGACAATATGTACCGATCTATAATGTATCACTTTAAATTCACTGAATGTCAAAAGTGTCCTTACTGGGATGATGTCTATAAACAGCATTTAGCGGGTGTGCAACCTATTGAAACTGTTCCTCCTTCTTCTGTAGAGCTCACAGACGTGGAAATGCTAGAGGCTGTTGAATCAATGAATGAGTCTTAAGCGCGGTCAGTTCCGCGGGCTTCTATTTCCTGGTTATAATTATTTGGGTCCTTTTAATCCTTTGGAAAACGGTGATCCTGTCAATAAAGCCGACGAGGCCGCAAAAAAACACGATCAAGCCTATAATAATTATATCAATAAAGGTTTAAATCCCTACCTGAAATTTAATAAAGGTGATCAAGACTTTATCGACTCTTTGCAGTCTGACTCTTCTGTGGGCGGTAACTTTGCGCATGCCGTCTTTCACTTGAAAAAACAAATTGCGCCTGCGCTCAACGAGCCTAAAGACACGGGGGAACCTCCGGCCAAAAAGGACAAACGCGCGGGCAATAAACGTCACCTATACTTTGCGCGCTTGAATAAAGGCGCGAAAAAAGCCAAAGCTGATCCTAACAACATGGATGGTGATATGGATAATAATGAACAAGGGGCGGGTGAGGCGCCAGCTGCTGAAGGCGGAGCAAGAGCTGCTGGCGGCGCTGGCGGCGGTGGTGGAGGAGGCCCGAGCGGGAATCACGGCGTCGGCATCTCCACCGGAGGATGGATCGGAGGATCCATCTTAGGGCAAAATAGAATCATCACCAAGAACACACGTCAATGGTGGTGTCCTATCCGCAATGAACATAAATACAAGCGATACCAAGGAATCGCCGATTATAAAATGGAAGGCTATACCACACCTTGGAACATGTTCAACTTCAATCAATACAGCAGCCATTTTAATCCCAATGAATGGCAATGGCTCCTGAACCGAGCCGCGCGCTTCAAGCCCGTCAAAATGGAAATCAAAATCTACAACCTGCAAATCAAACAAGAAAGCAACCAAGACACAACTGCGCAATACACCAACGATCTGACGGCGGGTCTCCACGTCCTTTGCGACGGAGAACACGCCTTTCCTTGGACGCAGCTGCCGTGGGACAAGGGCTGCATGCCGGAGCTGCCTCACGACATCTGGACGCTACAGCAATATGCCTACATCACGTGCGCCTCTGAAGCGCAGGACACGACGAGCAACGGAAACGAGCTCAACATACGAGGCGCCGTGCCCATGTATCTCCTGGAGGAGACGGATCACGCCGTCATCCGCACGGGCGAGAGCATCGCCTTCCATCACTCGTTCGACTGCGGGTGGGTCGACAACACACGCTCGAGCGTCATGCCTCAGATGGCCTGCATCAATCCGCTCATCGACTCCAGACTCGTCGGGGTCTGGCTCAACCAGGCCGGAAACGGGACGAACGAGGACCAGATGAGACCGTATCAAAAACACGGTCCGTGGTGGCCGGGACCCGGATACCGAAACAATAGAAACACCAGCGAGAACGGAACCAACGGACATACCGTCCTGGGACCTTACATCACGGCCTGGAAACCAGAGGGAATGACCTACCAGTCGTCCGCTGTCAGATTCGGAGCGGCCACGGGTCCGTACACGGGAGGCCAGTCGACCGATGTCGTGACAGGCAACGCCAACAACAACGCCAACGTTACGAGATTCACACCGGGAGACGGACTGGGCGGAGCGAACAATAACAACTACTTTATCCAGCGAAGTTCCGTCCAGACGGGAACCAGGGATCAGGCTCTCTATAAAGCCACGGGTCAATCCACACAGGAGATAGAAAATGTCTACATGATGCCGAACCAGGTGTGGGACTCGGCGCAGATCTCCAGGTACAATCCCATCTGGACCAAGATACCCAGGGTGGACAGACATACCTTGCTCGATACCGAGGACGGGACCTTACCGATGACGCATCCTCCGGGAACCATCTACGTCAAATTGGCTCACATTCCAACACCACAGTCGGGTAACAATTCTTACCTTAACATTTACGCAACGGGACAAGTCTCCTGCGAAATTGAATGGGAATTTGAAGAAAACTTTACCAAGAATTGGCGTCCAGAGCGCATGATCGACGGCAACAAGATGAGAGCCGACGTCTACAAAATCAACGCCGATGGAGGATGCGTCTTACCCAACAGCTACTACGAAACCATGCCAACCAGATGGGGGAGGGAAAAGGTTCTGTAACCTTTGCTCTGTATGCATATTCAATAAAGCTCATATGCAGATCAGAAACAGACTGCATGTTGACACTTTAATTTTTATGTGGGTGGTGATGGG
| 6,622
|
OM274029.1
|
Porcine bocavirus
|
Chen,J.
|
Anhui Agricultural University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2022-12-21
|
AH-16
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
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Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,307
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2020
| null | null |
UNVERIFIED: Porcine bocavirus isolate AH-16 NS1-like, NP1-like, and VP1/VP2-like genes, complete sequence
|
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| 20,277
|
OM274030.1
|
Porcine bocavirus
|
Chen,J.
|
Anhui Agricultural University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2022-12-21
|
AH-23
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,360
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2020
| null | null |
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|
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| 20,278
|
OM274031.1
|
Porcine bocavirus
|
Chen,J.
|
Anhui Agricultural University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2022-12-21
|
AH-25
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,481
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2020
| null | null |
UNVERIFIED: Porcine bocavirus isolate AH-25 NS1-like, NP1-like, and VP1/VP2-like genes, complete sequence
|
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| 20,279
|
OM274032.1
|
Porcine bocavirus
|
Chen,J.
|
Anhui Agricultural University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2022-12-21
|
AH-36
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,263
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2020
| null | null |
UNVERIFIED: Porcine bocavirus isolate AH-36 NS1-like, NP1-like, and VP1/VP2-like genes, complete sequence
|
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| 20,280
|
OM274033.1
|
Porcine bocavirus
|
Chen,J.
|
Anhui Agricultural University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2022-12-21
|
AH-70
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,405
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
UNVERIFIED: Porcine bocavirus isolate AH-70 NS1-like, NP1-like, and VP1/VP2-like genes, complete sequence
|
ATTGTTATTATCTTAATATCAACTACCAGGACTCCATGTTTGATTGTCTGCGCTTGCGCGCAGCTATACATCGCGCGCGCGCAGCGCGCCCGCCGAAGGCGGGGCGATATAAGCAAGCGCAAGCGCAGACAATCAAACATGGAGTCCTGGTAGTTGATATTAAGATAATAACAATACGTAAGCATATTGTCATATCCGGGCATGCGCACTAGGGGAGATTTTTGCTGAATCACCGGATATAGGAAATCTTTTTTGCTAAATCACAGGAAACAGGAACTCAAAAAAATGCAAAATCACAGGATATAGGAAGACTTTTTTGCTAAGTCACAGGAAATAGGAAGCAAAAAATGCTAAATCACAGGAAGAACCTTGACAAAGGACACTGTGTAATAATTTAATAGATTACTAGTTATGGGCGGAGACTTTTGTATATAAGGACAGCGCATTAAGCGAACGGTCTCTTTGCTTCACTTCACAGCAGAGAACACACATTTCGACGCTCTCAATCGGCGGCGGTGAGTACAGCATGGCTCTACTTCACTTCAAGAATGCCTTTGAAAGCTTTACGGGTGTTGCCTATACTTATATTCTTCGACTACCTAAATTTCCTGAAGAGAACTATCACTCAAACCTGCAACAATGTTTGGGGAATAGCTTTCACGCAAATCTTTATGAAGACATGGCAAGCACAGGCTTGTATCCAGATTTTCCGATCGAACACTGCTCTGATTTGGCTGACTATCAATCAAAAACTTACGAAAAAAGTCTGGCCGACTTTGCCGAAGTTGCCATAAAAAAGGTGTTTGAAATTCAACAATATACTAAAACACCTTCTTACAACAGCTACATACAAGTAGAACATGGCTCCAATTTACATGTTCACTTGGTGATAGCCGGCACCGGCTTAACAAAATATACTGCGAAAGCTTTTAGGCCTAAACTAGCAGCATATTTCTATGCTCAAATTGAACAAAAACAAAAAGAAATGCTGAAATACCTATACGGCTCAGATGCCTGGAAACCATATACTGAACCAGTAAAAACAGCATTAGAAGAATCACTAAATGGAAGCTCTGAATATTGCACCATTCTACAATACAAAAGTAGAAACGGAGAAATGTACTCTTGTAGAGTAGACCCTAAAAGCTTCGTTTCAAACTATTTACTACCTAAAAACTTAGAAATTGGCTGGAAAAACTGGTCAGGAACATACAAAGTTCCAGGACCAATGGCAGACTCCTTTCTACTGACTGGAAAATACTACACTTACACAAGCATAAACGGCCTACAACTACCTCCAGATGAAAGAAAAAATCTAAAAGACTGGTTAGATGAATCATTTGGAATAAACACATCAGAGCCAATCTTTACTGGAGATCCTTTAGCTGACTTACCAAAGGTAAGCAAAGCTCAATGGGACAAAACAACGCAGCCGGGAGGAAAAATGTCTAAGAGAGAAAGCTTGGTTCTTGATTGCATGAATAGAGCAATCGAAAGCGACTGTTTAACTTACGAACAGCTTGTAGATAAGCACCCAGAACTTATAATAATGATGGAAAGCCAAGCAGGCGGCAACCGTTTAATTGAACAAACCTTAAACATGGTTCACATAAAGCTAACGCAAAAATATACAGCCATGACTTATCTTGTAAAACGGTTTCCGACCTTTGAGCTTGCATTAGACAATAAAGTAATTAGACTGTTGAACTTTCAGGGCTATAACTACTGGCAAGTTGGACATTGGCTTTGTTGCGTGCTAGACAAAAAAAGCGGCAAACAAAATACAGTTAGCTTTTACGGGCCAGCAAGCACCGGTAAAACAAACTTAGCAAAAGCAATAGTAAATGCAGTTAATCTTTTTGGAAACGTGAATCATTTAAACAAAAATTTTGTGTTCAATGATTGCTCCAACAAACTTATTGTTTGGTGGGAAGAAGCATTGATGCACACAGACTGGGTGGAACCAGCAAAATGTGTGCTTGGAGGAACAACTGTGAGAGTCGATAGAAAACACAAAGACTCACAGCTCCTTCCACAAACACCGTGCATAATTTCAACAAACAACAACATCTACGAATGCGTTGGAGGAAATCACGTTTCACACGTACACTGCAAACCCTTAAAAGACAGAGTCGTGCAACTTAATTTCATGAAGACGCTGCCGCAACACTTTGGTGAAATTTCAACAGAAGAGGTGGCAGCATGGCTTCTAACTTGCAAGAACAAATTTCAGTGCACATTAGAAGGTTACTGCAATCAATGGAAAGTGAAACACGTAATAAACGACATGCCACTTGCTAAAGTGTGTGCCTCTCATTCACAGGATTTTACCTTACATGAACAAGGAACGTGCACCCATTGTGGTGCTTACCTGCCTCTTACTATTGATATTGAATCTTGCGGCGGTGATAATTCTGGGGACGACGGACGTAAGTAACATTTTTTACAAAAGGGGCAGGGAAATAAATCTTTAAAAGATACTAAATATCTATTTTTTACAGGTGTCCCTGATTCAGCAATCATCGGAACTAATAGCTCGAGTGCTCGAGGTCAAGGCGGAGAACCTGACAGAAAGAAGGTGAAATACCAGGTACTTACTAAAGAACAGGAAGAATTCCTAGATGAGTGGGCATCACAGCCACAGGATGAATCAGAGATCGAGCTATACAACAGAAGAAGAGAGCAGCTCTTCGAATCGCCACTCTCCTCTGGCAGCAAGGACATCTCCGAAACAGAGCCGACATCGGAGTTGGAGTCGGAGTCGGAGTCGGAGTCCAAGAAGAAAGAGGGAGGAGAGCCCATACAGGGGGAGGAAAGAGATGAGCAGATCTCCCCAGAAACAGGGGAAAGAGAGGATTGAGCAGCCTAGAAAACAATTTAAAGAAAAAAAGAATAGCATTGTTGATGCTTTTGTAAAATATAAAGCTAAGCATAATACTGATCAATCTTTTTGCGGGTTTCACTGGCATTCATGGAGATTAGCTAAAAAGGGCACAGACAGGGTATTTGATGAAATGAAAGCTGAATTTCAAATTCGCTGCAGGGATGGGAAAATTGAGTGGCCTGATGCAAGGGAAATGTTGTTTAAATTTAAAAAAGCTATAGATAAAGATTACAGAAGCATGCTGTGGCACTTCAGATTTACTGAATGTACTAAATGTGATTTTTGGGATGATGTGTACAAAAAACATATGGCTAATGTGCATCATGAACCTCCACAGGAATTAACAGACGAAGAGCTACTTGCAGCATTGCAAGAAGCTGAAGCTGGAAAATAAAACTGATGATCATTGTGCTCATGTTTATTATAAGCTTAATAAAATTTGACATATGAATCAATTGTTTCCTGTGGTACGCTCCAAAAAAAACGACGGCAAAAGAGGACACGGGAAAAAAGCTGAAAAACGACCAAGTGAACTAAAAGATCCTGAAAAACCTACAGGTGAACTCGAACTAGTTGGAGAAAGATCCAACTGTTCCAAAACTCAAAGACATTTTTACTTTGCGCGCCAAAACCAAGGTGCAAAAAGAGCAAAAATGTCCGCACAGGGGGGTGAGAGCATTGACGAGGTTGAAGTGGATACAGGTGCGGGAAGTGGGCGGTCAGGCGGCGGCGGAGGAGGTGGAGGAGGAGGGGGCTCTACAAATGGAGGAATTGGAATGGCAACAGGAGGTTGGGTTGGAGGAACATATTTTGGAAAAAACAAAATAGTGACAAACATAACACGTCAATGGTACGTGCCAATATATAACGGCCACAAATACACAAAACAAGCCGAAACAGATAATACCGGCTTTTGGAACGGAATAAGAACACCATGGGGCTACATTAACATGAACTCATACAGCTGTCATTTTTCTCCAAATGACTGGCAAAGACTTTTAAACAACTACAAAAGGTGGAAACCAAGAAAAATGAGGCTGCAGTTATACAACTTACAAATAAAACAAGTGGTCCAACTAGGCACAGATACACTATACAACAATGATCTGACAGCAGGGGTGCACATTATGTATGACGGGTCACACCAATACCCATACTCACAAAGTGGATGGGACAGTGAGCTAATCCCTGAACTGCCAGGGATGATTTATAAACTGCCAAACTACTGCTACTTCCAGGAGCTAGGTGACATAGGTGATGCAGGCTCAGACTTAAGAGAATCATGGCTGGGGACAGCATGTCCCTTATTCTTTCTTGAAAGCTCTTCACATGAAGTACTAAGAACAGGAGAAGAAACAGGATTTGAATTTGATTTTGATTGTGGATGGGTACATAATGACAGAGCATTTTGTCCACCACAATGCGACTTTAATCCCCTAGTCAAAACCAGGCGAAGCAGAATAATAATGGGTTCTTCAGGAAACACAGCAGAACCATACTATGACTACAAAAAACCTAGCAATTGGATGCCAGGACCAGGAACTCGGCTAAACGGACACCAATCAGGAAGCAATCTAAAAACATCTTCTGGGCCCTTTAACACATCATGGGCACCACCAGGGGTAACACAGGGAAGTGACACAACCTACCTAAACTCACCAGCAATGAATCAATCACAATGGGCCTCAAAATCAATGCCAACAGCACCAGCAAACGCTGCATGCAGTCAAGTAGACCCAAACTCACTAGCATTCAACGAACCAACACAATTAGGACAGCAAGGTGACACTAACATAAGATACAACAACATAAGCAATGATCTAACTAGATGGGGAACAGTATGGAGTCAGTCACAACAAGTATACACATCACAACCAACACAAACTCGACTAGACACAGTATGGCAATACCCAATGCAAGCATGGAACGGACAGGAAGTAACACGCTACGCTCCAATTTGGGACAAACAACCAAACACAGATTACCATACAACATTATCATCATCAGACGGAACACTTCCAATGAAACATCCTCCAGGAAACATATTCATTAAAGTAGCAAAAATTCCAATACCAACAGAAACAAACACAGATTCATATCTAAACATATACTGCAC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| 20,281
|
MH016288.1
|
Porcine bocavirus
|
Libisch,B., Kereszteny,T., Vitanyi,B., Kerenyi,Z., Papp,P., Olasz,F.
|
Agricultural Biotechnology Institute, Department of Genetics
|
Hungary
|
2020-02-28
|
FKI
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,337
|
GenBank
| null |
Hungary
|
Hungary
|
Sus scrofa
| null |
2016
| null | null |
Porcine bocavirus isolate FKI, complete genome
|
GGACGATCCAATCATCACTACCCACACAAGGAAATAAGTATCGAAAAAATAGGGATAGGCGGGAGATAATGATAGACACGCCTTTTCGGGCACAGCCAATGAGGGATATGAGGTGATATGACGTCAAAAGACCTGATTGGGTGGGAGGGTCTATATAAGGAGGGAACCAGGAAGAAGAGCTCATTCTGCTCCGGGACATCGAGGTGTTCACATCGATGCAGGTGAGAGCGGCTCGGCTCTTCTATTGATGTACATTCTGCCTGAGAAGAGGCTACAGTCTGAGCTCATCGCTCCACGGGAGAAGACAGCTCCGGCAAGTATCCTCTTATATCTGCTGGCATGGCTTCTCTTGGAGTTGGGCTGTCTGATCAGGAATGGCTTGGTTATTGGCACGGAGCTATTACTGGTTTCAAGAATCCCAGCTTTAGTTATGTCATCAGAATTGATCTTAAGGATTGGAGAAGCTCTGAGCGTGCCATTATGGACATTTTTTCTAAAGATCTACCGGCCATCATTGATGACCTTGTAGATCAGGAGAAGGAGCTTCTGCTGTGCGATGTCAACTATGACTGGAAGGGTAGTCTGAGCATGAAGCTCAAGAATCAGCACGGGCTCGGTCAGGTCCTCTGTGAGGCTGCTGACATGGCCGCGAAGCGGCTCTTTCAGCTGAAGCAGCAGAGTCACAATCCGGTCTACAGCTGCTTCACTCAGTCTGAGATCGGCGAGACCTATATGCACGTGCATGTGGTGTGCGGAGGAGACGGGCTGACCAAGTGCAACGCTAAAAAGAGCGCTTGGGTCATAGCTAAATATTTCTGGAATTATATGCTCGATCTCTGGAAGCACTACGAGAGCTGTCACGATCCGACCAATCTGCAGTACACCGTCTCGGTGCAGCTGCGTCTGCTCTGCGAGAGAGTCAAGGCTCATCAGGACGCGACCGTCAGCTGTCTGACCTATCGAGACCGGCACAACGAGTCTCACGCTCAGCGGGTCGACGCCTGTAGCTATATCACCAACTATCTTCTGCCAAAGAATAGGATGCTGTGTACCTGGCTGGACGCCGATATCTGCACTCCGAGCGTAGCTCGCTTTGAGTCCAACAAGACCTACATGTGCAGTCACATTGATAGGCAGCCGATCACTCACTATCTCAGAAAGGCTCTCCATGACCGGCTGGTCATGAACAGTCCAGAGGAGACGGGGGAACCTGTCCATAAGATGGCGCGCTGGGGCGATCTTCCTGAGGTGGGTGAGAACTCGCTAGCTAGACAAAACACAGCAACTAGACCGACTAAATTGACGAGAAAGCAGCATGTAATGTTAGATACTCTGCAGAGATGTCAGGAGGAGTTTATCTGTACCAAAGAAGAGTTAACTATGCTACATCCTGATCTAGTGATTATGTTTGAGAGTACTCCGAGTGGGTCTCGAACCCTCGAAGAGGTGCTCGAGATGCATCGGGTGAGGATTACTAGGACAGAGACGGCTCTGAGTTATGTCAGGCGGCAATTTCCAGACAACAAGTTTATCAAGCCGGAGAATAAGGTGATCAGGCTTTTGAACATCCAGGGCTACAATCCTATACAGGCCGGCCACTGGGTGGCGACCGTGCTCTCTAAAAAAGCCGGGAAACAGAACACCATCTGTTTCTTTGGTCCGGCCAGTACAGGAAAAACTAATCTAGCTAAGGCGATCGCGAACGCGGTCAAGGTGTATGGTTGTGTCAATCACCTCAACAAGAGCTTCGTCTTCAACGACTGCCAGAACAAGCTCATATGCTGGTGGGAAGAGGCGGTGATGCACAACGATTGGGTAGAGCCGGCCAAATGTCTGATGGGAGGGACGAGCTTCAGAGTAGATAGGAAACACAAGGATAGCGCGGAGCAGCCTCACACACCTTTGATCCTGAGCACCAATCATGACATTTACACAGTAGTGGGTGGGAACACAGTGACGACCGTTCATGAGAAGCCGATCAGAGATAGAGTAGTTCAGTTCAATTTCATGAAAACGCTGCCTCAGAACTTTGGAGAGATTTCTGTGGCTGATGTGGCTGACTGGCTCGGCTGGTGCGCCGAGGACTTTGACTGCAGTCTCGACGGGTTCAAGAAAGAGTGGGAGCTTGACCGTGTTCCCAACAGTTTTCCTCTAGCGAGCTACTGTGATGGTCATTTGCAGGATTTTGTGCTCTACGCTCAAGGACCTTGTTGTCGCTGTGGTGGTTACCTGCCTCACACTACTACCAGCGACGGTGATTGGAGCGAACCTGCTGCTCCAGGTAGGACTTGGCGCATGCGCGAAAGGGAGACACCTATCGGGCGGGGAGGGATGTGCTCATGATCTATTCTTTGTCTTGCAGAGCCTACTCCGGCAGAGTCTCCAAAGAAAGTGACTGCCACTCAAGGCACTCAGACCGACGAACCTTCTTCTTCGAGTGAGTACATCGACTGGAGCAGTCAACCAACCAATGAGTCAGAGATTCAGCGATACAACATCTCGCAGCGGGAAGAGCAACCTCCGGTTCTCTCCTTACTCGACGATCCAGGCGAGGGAACGTCGAGTCAACGAGAGTCGGTCTACAGCCGAGAGGGAGCATGGAACGTCTTCGCGGGACACAGCGGAGATGGAGGCCAGACCGGGATCCTCGTCGCAGTCGACCGAGTCCTGCGGGAGGGGGAGGAAGGGATCATCGACCCCGGGTTCTGGCTCAGCTGTGGCGAGCTCTTGGAAGAGCCGCAAGATGGCTAAGAGGGCTAATCCGGCCGTCGTCTTCAGTGAGCACAAAAAGAGGGAGGGAATCGGTTTCGACTACTGTGGGTTTTACTATCACTCCACAAGAATTGCAGGCAAGGGAACTAGATACATTTTTGACGTGGCGAAAAGGGACTTTCAGGCTGTCGCCCGGGGAAATTGCATTACCTGGGACCAACATAGAGAATTACTATTTACTTATAAACGATGTCTGGACACTATGTACCGATCTATGATGTATCACTTTAGATTCACTGAGTGTCAGAAATGTCTGTACTGGGATGATTTCTATAGACAGCACTTGGCGGGTGTCACTCCTCCTGAAACTGTTCCTCCTTCTTCTGTAGAGCTCACAGACGTGGAAATGCTAGAGGCTGTTGAAGCAATGAATGAGTCTTAAGCGCGGTCAGTTCCGCGGGCTTCTGTTTCCTGGTTATAATTATTTGGGTCCTTTTAATCCTTTGGAAAACGGTGATCCTGTCAATAAAGCCGACGAGGCCGCAAAAAAACACGATCAAGCCTATAATAATTATATCAATAAAGGTTTAAATCCCTACCTGAAATTTAATAAAGGTGATCAAGACTTTATCGACTCTTTGCAGTCTGACTCTTCTGTGGGCGGTAACTTTGCGCGTGCCGTCTTTCATTTAAAAAAACAAATTGCGCCTGCGCTCAACGAGCCTAAAGACACGGGGGAACCTCCAGCGAAAAAAGACAAACGCGCGGGCAATAAACGTCACCTGTACTTTGCGCGCTTAAATAAAGGCGCGAAAAAAGCCAAAGCTGATCCTAACAATATGGATGGTGATCTGGGAGATAATGAACAGGGCGCAGGTGAAGCGCCAACTGCTGCAGGCGGAGAAAGAGCTGCTGGCGGCGCTGGCGGCGGTGGTGGAGGAGGCGGCGGCGGGAATCACGGCGTCGGCATCTCCACCGGAGGATGGATCGGAGGATCCATCTTGGGACAAAACAAAATAATCACACGCAACACCAGACAATGGTGGTGTCCAATCAGAAACAACCACAAGTATTTAGCTCATGACAAATACAACAAAGACAACTCTCAATTCCATATGCTGGGATACTCTACACCTTGGAACATGTTCAATTTCAACCAATACAGCAGCCATTTTAGTCCCAACGAATGGCAATGGCTCTTGAACAGAGCCGCACGCTTCAGACCTGTGAAAATGGAAGTCAAAATCTATAACCTACAAATCAAACAAGAAAGTACCGTTAGTGGAGACGCGCAATATACCAACGATCTGACAGCGGGTCTTCATGTATTCTGCGACGGAGAACACGCCTATCCTTGGACACAGCTACCATGGGACAAAGGATGTATGCCAGAACTTCCACATGAAATTTGGGAACTGCAACAATACGCCTATTTGGTCGTCGCTTCACAAACACAAGACACAGAATCCAATGAGTTTGAAATGCGCATCAGACAGATGAGTCCAATGTATCTGCTAGAAGAAACGGATCACGCGGTCATCCGGACGGGTGAGAGTATCGTCTTTCATCATACCTTCAGCTGTGGGTGGGTAGATAACACACACTCAAGCAACATGCATCAATTGGCCTGTATCAATCCGCTCATTGATTCTCGACTCGTGAAACACTACTACAACTCTAGCAATCAAGCCAGTAGTACACAGTGTAAAGCTTATCAAAAGAACGGACCTTGGTGGCCGGGACCGGGCTACCGAAGCAATACAACAACCAACGCAGCGGGTCAGAATGGTAATCCTGTAGATTCATCTCTCGGACCATTCTTCAGCGCGTATGTACCACAGGGGATGGATATGGGAAACGTAGGTGCACGCAAGTTTGGCGCACCAACTGGACCATATACTGGTGGGCAATCATCGGCTCCGATCCAAGGTAAAAACAACGTGGTCAATGCCAATATCCTACGCTTTACACCTGGAGATGCAGATGTCACTGAAAGATACAATGCTACTATTGATCAGCAAACAGTGGAAACTGAAACCAGAGATCAGAAACTCTATCAAGCTACAACTGCGAACCAAGGAGAAACAGAAATTGCAGATCTCTACATGATGCCAAATCAAATGTGGGACTCATCACCGGTCTCCAGATATAATCCTATCTGGGTCAAAATACCCAGAGTGGATAGGCACACACTCATTGATACAGAAGATGGTACTTTACCAATGGCACATCCTCCGGGAACCATCTATGTCAAGCTAGCTAACATACCAACTCCAGCAGCAAACTCT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| 53,758
|
MN481505.1
|
Porcine bocavirus
|
Aryal,M., Xin,H., Liu,G.
|
Chinese Academy of Agricultural Sciences, Preventive Veterinary Medicine
|
China
|
2020-02-12
|
China_2018
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,163
|
GenBank
| null |
China: Hebei province
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2018-08
| null | null |
Porcine bocavirus isolate China_2018, complete genome
|
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| 53,928
|
MH454686.1
|
Porcine bocavirus
|
Zheng,H., Han,H., Chen,H., Hou,H.
|
Henan Agricultural University, College of Animal Science and Veternary Medicine
|
China
|
2018-07-28
|
PBoV-TY
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,156
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-10-27
| null | null |
Porcine bocavirus isolate PBoV-TY, complete genome
|
GATAGAGCCATAAAGATGTGAAATTATTAACTTTTGGGTAAATGTTAAGAGAATAATTAACCTTGAGCGGGGATATAAGAGCTGAAATCGAAAGCGCTGGAGTCACTGCGAGCCTGGCTGCGAGCGAGAGCGACGTTGGGTGAGTGCGATGGAGTGCTTCGATCTGGGAGAATACGCTACCGCTGATGACTTTCTGGGCTTTCGGGACCCTGCATACACCTATATCATACGTCTGCCTTTTAGAGACTGGAGGGGACTAGAGAATGTGCTTCAGCACGCCTGCACTCCAGCTCAGTATAGAGAGCTGCTGGACGTGGATGATTCTGGGCATACTGTCTTTGATGATGCTCCAGGCAATACAGACACTGCTGCTCTCCTGCATTTTCTGGCCAGGAACGGGCCTCAGTGGTCTTATGGAAGATTTCTCATACACTGTGCGCATCGCGCGGCCGAGCGGGAGTTCAGAAACAAGCAGGGCAGACGAGACCCGGAGTTCAGCTGCTACTGTCAGCTCGAGCTCAGCGACACGATGCACATCCACGTCGTTCTCGCGGGGTCGGGGCTCAACAAGTACAACGCGAAAGCCTGGAGGAACGTGTTAGCCTATGGGTTCTTTAACAATGTACTAGATGGGATCAAGCAGAACCTGGGGCATCTGGATGCTGTAGAGTATCAGAACATCATCCATCCTCTGGTCAATGCGAGGAACAGATGCGTGCTGGACTATACCGAGAACTGCAGCATCCTGCAGTACAAGAGCAGGCGGGGGGAGATGTACGCGTGCCGGGTGGACGGGAAAGAGTTCATCGTCAACTACCTGCTCTGTAAGAACCTGAAGTTCAATCAGCACGTGAATCCTCAAGACATCACTCCGATCGGGGCTCACTTCATCGAGGCGACCAAGACCTACGCCATCAGCAGCATCAACGAGAAGCTGGTTCCTGAGCACATGCGCAGGCAGATCTTTGAGAGACTGAGGAAGGTCAAGGACAGGTCTCTGGAGCCGGTCTTCGGGGGAGATCCCTACGGAGACCTGCCTCAGGTAGAGAGATCGGAGTGGGTGCAGACCGCGAGCGGAGGGGGGAGGATGACCAAGAGAGAGGGTCTGATGCTCGATTGCATGAGACGCTGTTTCACCGAGAACATCACCTCGTACGAGGAGATGGTGAGAGAGTGTCCCGATCTGACCATCATGATCGAGAGTCAGGCGGGAGGCAGCAGGCTGATAGAGCAGGTGATGGGCATGACACACATCAAGATCACGCAGAGCTACACCGCGCTGGGGTACATGCAGAAACTGTTCGGGGAGAGAGCGCAGCTGGAGAACGACAACCGGGTGTTCAGACTCATGAACTTCCAGGGATACAATCCCTGGCAGGCGGGACACTGGGTGTGCTGCGTGCTGGACAAGAAGAGCGGGAAGCAGAACACGCTCTGCTTCTACGGACCGGCCAGCACGGGGAAGACCAATCTGGCCAAGAGCATCGTGCAGGCCTGCAAGCTGTACGGCTGCGTGAACCATCAGAACAAGAACTTCGTCTTCAACGACTGCGCGGCCAAGCTGATCGTGTGGTGGGAAGAGGCGCTGATGCACAACGACTGGGTGGAACAGGCCAAGTGCATCCTGGGAGGAACCGAGTTCAGGATCGACAGAAAGAACCGGGACTCTATGCTGTTGCCGAAGACGCCGGTGGTCATCTCGAGCAACAACGACCTGTACACCGTGGTGGGAGGCAACACGGTGTCTCAAGTCCACAGCAAGCCTCTGCGAGAGAGGATCGTGCAGTGGAACTTCATGAAGATGCTGGAACCGACGTTCGGGGAGATCACTCCGGAAGAGACTGCTGCATGGCTCCTGGCCTGCAGAGAACGCTTCGACTGCACGCTGGAGGGATTCTACAGAGAGTGGGACCTGCAGGTAACACCAAACGTGTTTCCCATCGGTAACCTGTGTCCCTCTCATTCGCAGGACTGGACGCTGCATGAGCGTGGCTTTTGTTCTGCGTGTGGCGGCTATTATCCTCTGGAGACTCGCGAGGACGATCTCTTTAGCCTGCGAGGGGAGCACGACGGTGAGTGGACGAGGGAGGACAGCCTGTTCTGGGAGGGCGTGGTGGAACGTCTCTCTGACAACATCTCTCGCCTGCAGAAACTGGTGAGGGGAGCGAACAGCCTGAGGAGAGCCGCGGACGAAAGAGACGGGCATCGACCGAAGAGGGAGAAGAACCTCAGCCAGCCAAAAGACGAAGCGAGCGTCTAGGTAAGAAGCCGAGAGTCACCTTCTACGAGCCCGAGAGCAGCGAGGAGGACGAGTTCGACAGTCAGCCTCAGGATGAGCTCAGCGAGATCAGATACAGACACAGGCAGGAGAGGAGAGAAGCGGTCGAGGAGCCGATCGAGGAGCCGCAGCCGGGACCGAGCACCGGATCTGCCTCCGAAAAAAAGGGACTATCGCCGTCGGAGTGGGGAGAGAGGCTCGGGGTCCTCACCAGATCGCTCGACGAGGGGGAACCCATCGTGCTCCACTGCTTCGAGAACATCCCGAGTGACTTCAGCGACATGGAGGAGACCGAATGACTCTCGGGACGGGGGGAGAATGTGGGGAAATAAAAATAAAAAGAATAAAACAAACCCTTACGAGGTATTCAGCCAGCACATGGCCAAGTTCAAGCCAGACAAAAGCTATTGTGGCTTCTACTGGCACAGCTGCCGGCTGGCTCGTAAGGGCACTGATTATATCTTTACCGAGGGGATGCGGGATTTTCAAAAACGCTGTAAAGACAATAAATGTGAATGGAAAGATGTCAGGGAAATACTGTTCGGCCTCAAGAAGGTCCTAGATCAGGGGTACCGAAACATGATGTATCACTTTAGACATACTCAGTGTGAAAAATGTAACTACTGGGATGAAGTGTATAAGATGCACCTGGCTAACGTGTCTCCTTCTGAAACAGAACCGCAGGAGCTGACGGACGAGGAGATGCTTGCCGCGGCCATGGAGGTCGATGGCGCCCACGAATAGAAAACCGGGCGGGTGGGTGCTGCCGGGACACAGATACTTGGGTCCGTTCAACCCGATAGATAACGGGGAGCCTGTGAACGCGGCAGACGCGGCAGCCAGGAGACACGATCTGAAATACGATCAGTACCTGAAAGAGGGAAAGAATCCCTATCTGTATTTCAATAAAGCCGATTCTGATTTTCTCGAAGATCTCGAGTCCGACCGTTCTTTCGGCGGGTGGATCGGAAAGGGCGTGTTTGGACTCAAACGAGCGATCGCACCGACGCTCGACGAGTCCTCGGGCAAACAGAACACGGGGGGACCTTCGGCGGCCAAGAAGCCGAGGGTCGATCCTCAGCGGGCGCAGAAGCGCAAGCTCTACTTTGCCAGACAGGCAAAAGAGGCCAAAAAACAAAAAATGAGCTCGGGAGGTGATCCCAGCGAAGACACGGGGGCGGGGGACGGAGAACAGGGGGGAGAATCTTCAACCATGACGGGACGCTCCGGAGGAGGAGCGGGAGGCGGTGGAGGAGGGGGCGGCAGCGTGGGATTCAGCACCGGAGGGTGGGAAGGAGGCACCTACTTCAGCGATCACACCGTGACCACGACCAACACCAGGCAGTGGTACACGGGGATCCTGAACGGGCATCGCTACTCGAAGCTCGCTCAGCCCTCGGTGGGCGATAATGCAACACCTCCGTGGGTGGGGATTCAGACACCATGGGCCTACCTGAACGTCAACTGCTATCACTGCCACTTCAGTCCTCAGGACTGGCAGAGGCTCCTGAACGAATACAAGGCCTGGCGGCCAAAGAGGATGCACATACGCATCTACAACCTGCAGATCAAACAGATCACCACGATGGGAGCGGACACGCTCTACCAGAACGATCTGACCGCGGGGGTGCACATCTTCTGCGACGGGAGCCATCAGTACCCGTACGCGCAGCACCCTTGGGACGAGGGGGCGTCGCCTGAGCTGCCGAACGAGATCTGGAAGCTACCGCAGTACGCCTACTTCCAGTATCAGGGAGATCTGACCGATCACACCACAAATCAGACGGCCCAGAACGTGGAACGCATGCTGCGATCCAACGTACCGCTGTTCCTGCTGGAGAACAGCAACCACGAAGTGCTGAGGACCGGAGAGATGACCCAATTCAGCTTCACCTTCCAGTCCGGGTGGGTCACCAACGACAGAGCGTACTGCTGTCCGCAGGCCGACTTCAATCCGCTCGTGGAAACAAGAAGATACTACCCAACGTGGAACGGCACAAGCAACTCATATTCATACAACAGATACGGGCCCTACAAAAAACCGAGCAACTGGATGCCGGGACCGGGGCTGGCCTACAAGGGCGCTACACACACAAACAACAGTCCAAATGATGCGAGAGGGCCGATCGTGACCACGATCGCTCCATTGGGAACGATCTCTGGCGGGTCTACACCGTCAAACGAAGCTCCGAATGACGGTGAGAACACCATATCTGCGGACGGCGTGAAACAATGCGGTTGGCAGACGGCGCCGGTGAACGGAGCCTGCGCTAGAACAGACTATCCTACACTCGCCTTCGATCCGAGCGATAGATCCACTAACAACAACATACCGACCAGAAACCTAGACATAGACATGACACGATGGTATCGTGTACACGAGCCGGTTAGAAGCACAGCGGGTGGAAGCAACTACTACAACGTGGATGATGTTTGGATGTATCCAAACCAGGCTTGGAACTCCACGCCGATCTGCAGAGACAACCCTATCTGGGACAAGGTGCCGAGGACGGACAGACACACGCTGCTGGATTCATCTGACGGAACACTACCGATGAAACATCCACCGGGAAACATCTTCATTAAGTGTGCAAAGATTCCGGTTCCGACGAGCAACAATACCGACAGCTACCTGAACATCTACGTGACGGGACAAGTCACCTACACCGTCGAATGGGAAGTGCAACGGTACCAGACCAAGAACTGGAGACCAGAACTCAGA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| 69,695
|
MF085373.1
|
Porcine bocavirus
|
Wang,Y., Zhao,J., Zheng,M., Liu,Z., Shen,Q., Fan,Z., Jiang,L., Yang,S.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2017-09-25
|
PBov-JZ08
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,156
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Mustela lutreola
|
feces
|
2016-04-02
| null | null |
Porcine bocavirus isolate PBov-JZ08, complete genome
|
GTATGCGCATGCGCGTTGATATACATCGCGCGCGCGAAGCGCGCCCGCCGCAGGCGGGGCGATATAAGCAACGCGCATGCGCATACAACATGGAGTCCTAGTGGTGAAATAAAGTTATAACAATACAAAATGGATGTGTAATGTGACGTCATATCCGGACATGCGCACTTTCTTATGCGGAAATAAAATTGCTCAGTCATCGGAAGAACCTTGAAAGGGTATCGTGTAATATTTAATAAGTTACTAAATGGGTGGAGTTATGCACTGTATAAAAGACGAGAACACCAGTTCTCTTCCTCTTTCTTCGCACTCGCAGAAAGACTGTCAGCATCGGCACAGCGCAATCAACCTGGTGGTGAGTAACCATGCCTCTGATCAACTTTCAAGCAGCATTTGAGAGCTTCGGGGGAATTGCATATACTTATATTTTAAGATTTCCTAAATTTCCTACGGATGACTATCATAATATGCTACAGCAGTGCTTAGGAGATAGCGAGAACAGTTGCTTGCATGAATCGGAAGAATGTGGAAAACACTATCCAGAATTTCCAAATGAATGTTCCGATTTAGCCGATTATCAACGAAAAACATATGAACACAACATTTCAGTGTTCGCAGAAACAGCTGTAAGAAAGGTGTTTGAAAATCAGCAAATGACAAGAACACCATCTTACACGAGCTTTGTTCAAGTTGAGCACGGACAAAATCTCCATGTTCACTTAGTGCTGTCCGGAGACGGGCTCACAAAATATACAGCGAAAAACTTTAGATCAAAACTAGCTGTATATTTTTATGCACAACTTGAACAAAAACAAAAAGAAGAGCTGCAAGAGCTGTATGGAACGCCGAGATGGGCACCATACACAAAACCAATTTCAGACGCGCTAACTAAATCTCAAGAAGGAAGCACAGACTTCTGCACTGTACTACAGTACAAAAGCAGAAATGGAGAAATGTACTCGTGCCGCGTGGATGCGCGAAGCTTCATTGCTAACTACATGCTGCCAAAGAACCTAGAAATCAACAACAAAATATGGTCAAATACTTACAAAGTTCCAGGGCCAATGGCAGACTCATTTATTTTAAATGGAAACACATACACATACCAGAGCATCAACTCAATGCAAATCTTGCCGCACATTAGAAGAGATCTTAAGGAATGGCTGGAAGATTTGCATGGAATAAATGCTGACGAGCCGGTCTTTTCTGGAGATCCGCTTTCTGACCTACCAAAGGTAAGAAAAGCACAATGGGAAAAAACGGCGCAACCGGGAGGAAAAATGTCTAAACGAGAAGGCTTAGTACTAGATTGCATGAATAGAGCCATTGAATCTGACTGCTTAACATACGAACAATTAGTAGACAAACACCCGGAAATAATAATCATGATGGAAAGCCAAGCAGGTGGAAGCAAGCTGATAGAACAAACTTTGAACATGGTGCATATAAAACTAACACAAAAGTATACAGCCATGTCATATATGATGAAACGGTTTCCAACCTTTAGCCTGCAATTAGACAATAAAGCAATTAGATTATTGAATTATCAAGGCTATAATTGCTGGCAAGTTGGACACTGGCTGTGTACTGTGTTAGATAAGAAGAGCGGAAAGCAGAACACCATAAGTTTTTATGGTCCTGCCAGTACAGGAAAGACCAACCTGGCCAAAGCCATTGTAAATTGTGTAAATCTATTTGGCAATGTGAATCATTTAAACAAAAACTTTGTATTTAACGATTGCTCGAACAAGCTGGTCGTATGGTGGGAAGAAGCACTAATGCACACCGACTGGGTAGAACCTGCTAAATGTGTTTTGGGTGGAACAACAGTAAGAATTGACAGAAAACACAAAGATTCACAACTGCTGCCGCAGACTCCATGCATCATATCTACAAACAACAACATTTACGAGTGTGTAGGTGGAAACCACGTCTCTCATGTGCACTGCAAGCCATTAAAGGACAGAGTGGTTCAGCTAAATTTTATGAAAAGCTTACCACAAAACTTCGGAGAAATACAAGAACAAGAGATTGCAGATTGGTTGTTAACCTGCAAAGAGAAATACACATGCACATTGGACGGATACTGCACTACATGGAAAACGAAGAACGTGACCAATGACATGCCGTTGGCTAAGTTATGCCCTTCTCATTCGCAGGACTTCACGCTCCATGAGAACGGAACGTGTACCCGCTGCGGTGGTTATTTGCCTCTTGATACTGACCCTCAATCTGATATCGAGATCAGATTGAGGGGACGACGGAGGGGAGTACTGCATTTAAAAAATAAATTATACATAATATATACATTATATTAAAACAACTATGAAATTAACCTATATTTCATTTATATTTAGACGTCCCTACTGCTGAAGTCATCGGAAACAATCTCGGAAGTCCTGAGCCTGGTATCACAGAACCAGACAGAAAAAAAATAAAAAAACAGGTACAACAAAGGCTGGAATTTCTTGAAAAGTGGGCATCACAACCTCGAGACAGCTATGAGTGGGCAGAATACATACAGGAAAGAGACCAACTATTCAGAGAGGACAACTCGGAGGAGTCCTTTGAAGGAGAGAAAGGAGAAACACCACGAGAAGGAACGGAGACGGAGCAGAAGCAGGAGCCCCTTGAGAAAGATTCAGAACAAAATGGAGGAATTGAAGAAACAGCCTTTTAGACAAAAGGCCAGGGAGGATGCTAAACAAAGAGTTAGCGTGGTAGATACATTTGTTAAGTTCAAAGCTAAACATAATACAGAAATGTCATTTTGTGGGTTTCATTGGCACTCATGGAGATTAGCTAAAAAGGGAACAGACAAAGTATTTGATGACATGAAAGCCGAATTTCAATCTAGATGCAAAGAAGGAAAGGTGGAATGGGTGGATGTCAGGGAAATGCTGTTTAGATTTAAAAAAGCAATGGATAAAGATTACAGAAGCATGATGTGGCATTTTAAGTTTACAGAATGTGAAAAATGTGATTTTTGGGATGATGTGTACAAAAAACATATGGCTAATGTGTATCATGAACCTCCACAGGAGCTCACTGATGAAGAGCTGCTAGCCGCTGTTCAGGAAACTGAACTAAATGACCAATGAATTATTGAATTGATGTTCACTGTATGCTTAATTAAATAAAACATATGAATCAACATTTTCATGTTGTAAAACAACCTAAGAGGGAAAGAGTTAAGCCAAAAGACCACGGCAACAAGAGACAAAATCCAGAACCTGAGATCCCTCAAGAAGTAGGAGGTTTACAACTTACAGGAGAAAAAAAAGACTGTAAAAAACAGCAAAGGAGCTTCTATTTTGCACGACAAGCACAAGGTGCTAAGAGGGCCAGAATGGGTGACACTCCACAAGGGGAAACAGACGATGTGGTAGACAGCGGGGTGGGACGATCAGGAGGGGCAGGAGGTGGGGGCGGAGGAGGAGGTGGGTCTGGTAATATTGGGATGGCAACCGGTGGTTGGGTGGGGGGGACATATTTCGGTAAAAATAAGGTGGTCACAAACATAACCAGGCAATGGTTCGTTCCCATATATAATGGACACAAATACACAAAAGAAACAGAAACAGACAACAGTGGGTTTTGGACAGGAATCAGGACTCCATGGGGGTACATCAACATGAACTCATACAGCTGTCACTTTTCGCCAAATGACTGGCAGAGGCTATTGAACAACTATAAAAGATGGCGGCCGCAGAAAATGAGAGTGCAGCTATACAACCTGCAAATAAAGCAGGTGGTAAAACTAGGGACTGACACGTTGTACAACAACGATCTAACAGCAGGCGTGCACGTCATGTGTGATGGCTCACATCAGTATCCATATTCACAGAGCGGGTGGGACTCAGAGCTGATACCAGAACTACCGGGCACGGTATATAAACTGCCAAATTACTGCTACTTCCAAGAGCTGGGGGACATCGGGGACGGAAACACTGACATAAGGGAAACATGGCTAGGGACGGCATGTCCGTTATATTTTCTTGAAAACACATCACACGAAGTGCTTCGCACTGGGGAGGACACTACATTTGAATTTGACTTCGATTGCGGTTGGATATTCAACGACAGAGCATTTTGTCCTCCACAATGTGATTTTAATCCACTAGTAAAAACCAGAAGGAACAGATTCATATGGGGATCAAGCGGTAATTCCGCCGAACCATATTACAATTACAAAAAGCCATCAAACTGGATGCCAGGTCCGGGCACCAGACTAAACGGCAACATGGGCGGCACAAACCTAAAAACATCAGCAGGGGCATTCAACACTACATGGGCACCACCGGGGGCACAACAGTCAACAACAAGCACAACATACATGGGCTCACCAGCACTACAACAAGTAAACTGGCCAGGGAAATCAATGCCAACAGCTCCAGCAAATGCAGCATGCAGTCAGGTAGACCCAGAAAGACTAATATATGACGAACCAACACAAACGGGGCAAACAGCGGACGCAAGCTTAAAATACAATAACATAAGCAATGACCTAACAAGATGGGGAACAGTATGGAGTCAAGCCCAAACAGCTGCTTCAGGGGGAACCACAAACACTAGACTAGACACAGTCTGGCAATATCCTATGCAAGCATGGAATGGACAGGAAGTGACTAGATATGCTGCCATATGGGACAAACAACCAAACACAGACTTCCACACAACACTGTCATCCTCAGATGGAACAATTCCAATGAAACACCCACCTGGAAACATTTTCATAAAAGTAGCAAAAATACCAATACCCACTGAAGGGGGGGAGGACTCATACTTAAACATATATTGCACGGGACAAATCTCCATTGAAATAGAGTGGGAAGCTGAAGAATACGAAACAAAGAACTGGAGACCAGAGCTCAGAATTTCATCTGCAACAATTGGAAGAAACATGTACAACATGAATGCAGCAGGACAATACAACACAAATGGAAGCATATATAGCTCAATGCCAACCAGATTCGGAATGAACAGAGTCAACTAAAAAT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| 74,577
|
KX017193.1
|
Porcine bocavirus
|
Qiao,H., Chen,H.Y., Fu,P.F., Yang,M.F., Han,H.Y., Zhang,Y., Yang,X.W., Xu,P.L.
|
Henan Agricultural University, College of Animal Husbandry and Veterinary Science
|
China
|
2016-05-23
| null |
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,173
|
GenBank
| null |
China: Henan
|
China
|
Sus scrofa
| null | null | null | null |
Porcine bocavirus strain CH/HNZM, complete genome
|
GATAGAGCCATAAAGATGTGAAATTATTAACTTTTGGGTAAATGTTAAGAGAATAATTAACCTTGAGCGGGGATATAAGAGCTGAAATCGAAAGCGCTGGAGTCACTGCGAGCCTGGCTGCCAGCGAGGACGACGTTGGGTGAGTGCGATGGAGACCTACGCTCTGGGAGAATACGCTACTGCTGATGACTTTCTGGGCTTTCGGGACCCTGCATACACCTATATCATACGTCTGCCTTTCAGAGACTGGCGGGGGTTAGAGAATGTGCTTCAGCACGCCTGCACTCCAGCTCAGTATAGACAGCTGCTGGACGTGGATGATTCTGGGCATACTGTCTTTGATGATGCTCCAGACAATACAGATACTGCTGCTCTCCTGCATTTTCTGGCCAGGAACGGGCCTCAGTGGCATTATGGAAGGTTCCTCATACACTGCGCGCATCACGCGGTCAGCCAGGAGTTCAGGAACAAGCAGGGCAGACGAGACCCGGAGTTCAGCTGCTTCTGTCAGCTCGAGCTCAGCGATACGATGCACATCCACGTCGTCATCGCGGGGTCGGGGCTCAACAAGTACAACGCGAAAGCTTGGAGAAATGTAATAGCCTATGGGTTCTTCAATAAGATGCTGGATGGGATCAAGAGCAACCTGGGGCATCTGGATGCTGTCGAGTATCAGAACATCATCCATCCTTTAATCAATGCGAGGAACAGATGCGTGCTGGACTATACCGATAACTGCAGCATCCTGCAGTACAAGAGCAGGCGGGGAGATATGTACGCGTGCCGGGTGGACGGGAAAGAGTTCATCGTCAACTACCTACTCTGTAAGAACCTGATGTTCAATCAACACGTGAGACCTCAGGACATCACTCCGATCGGGTCTCATTTCATCGAGTCGACGAAGACATACGCCATCAGCAGCATCAACGGGAAGCTGGTTCCCGAGCACATGCGCAGACCGATCTTTGATAGGCTGAAGAAAGTCACGGACAGGTCTCTGGAGCCGGTCTTCGGAGGAGATCCCTACGGAGACCTGCCTCAGGTAGAAAGAGCGGAGTGGGTGCAAACCACGAGCGGAGGGGGGAGGATGACCAAGAGAGAGGGTCTGATGCTCGATTGCATGAGACGCTGTTTCAGTGAGAACATCACCTCGTACGAGGAGATGGTGGGGAAGTGTCCCGATCTGACGATCATGATCGAGAGTCAGGCGGGAGGCAACAGGCTGATAGAGCAGGTGATGGGCATGACACACATCAAGATCGTGCAGAGCTACACCGCGCTGGGATACGTCCAGAAACTGTTCGGGGAGAGCGCGCAACTGGAAAACGACAACCGGGTGTTCAGACTCTTGAACTTCCAGGGATACAATCCCTGGCAGGTGGGACACTGGGTGTGCTGCGTGCTGGACAAGAAGAGCGGGAAGCAGAACACGCTCTGCTTCTACGGACCGGCCAGCACGGGGAAGACCAATATGGCCAAGAGCATCGTTCAGGCCTGCAAGCTGTACGGCTGCGTGAACCATCAGAACAGGAACTTCGTCTTCAACGACTGCGCGGCCAAGCTGATCGTGTGGTGGGAAGAGGCGCTGATGCACACGGACTATGTGGAACAGGCCAAGTGCATCCTGGGAGGGACCGAGTTCAGGATCGACCGAAAGAACAAAGACTCGCATCTACTACCAAAGACGCCGGTGGTCATCTCGAGCAACAACGACCTGTACACCGTGGTGGGAGGCAACACGGTGTCTCAGGTCCACAGCAGGCCTCTGCGAGAGAGGATCGTGCAGTTTAACTTCATGAAGATGCTGGAACCGACGTTCGGGGAGATCACTCCGGAAGAGACTGCTGCGTGGCTCCTGGCCTGCAGAGAGCGCTTTGACTGCACGCTGGAGGGATTCTACAGAGAGTGGGACTTGCAGGTAACGCCAAACGTGTTTCCCATCGGTAACCTGTGTCCCTCTCATTCACAGGACTACACGCTGCATGAGCGTGGCTTTTGTTCTGCGTGTGGCGGCTATTATCCTCTGGAGACTCGCGAAGACGATCTCTATAGCCTGCGAGGGGAGCACGACGGTGAGTGGACGAGGGAGGACAGCCTGTTCTGGGAGGGCGTGGTGGAACGTCTCTCTGACAGTATCTCTCGCCTGCAGAAACTGGTGAGGGGAGCGAACAGCCTGAGGAGAGCCGCGGACGAAAGAGACGGGCATCGACCGAAGAAGGAGAAGGAGCTCAGCCAGCCAAAAGACGAAGCGAGCGTCTAGGTAAGAAGCCGAGAGTCACCTTCTACGAGCCCGTGAGCAGCGACGAGGACGAGTTCGACAGTCAGCCTCAAGATGAGCTCAGCCAGATCAGACACAGACGCAAGCAGGAGAGGGAAGCGGTCGAGGAGCCGGTCGAGGAGCCGCGACCGGGACCAAGCACCGGGGCTGCCTCCGAAAAAAAGGGACTATCGCCGTCGGAGTGGGGAGAGAGGCTCGGGGTCCTCACCAGATCGCTCGACGAGGGGGAGCCCATCGTGCTCCACTGCTTCGAGAACATCCCGAGTGACTTCAGCGACATGGAGGAGACCGAATGACTCTCGGGACGGGGGGAGAATGTGGGGAGGGAAAAATAAAAATAAAAAGACAAACCCTTACGAGGTATTCAGCCAGCACATGGCCAAGTACAAACCAGAAAAAAGCTATTGTGGATTCTACTGGCACAGCTGCCGACTGGCTCGTAAGGGCACTGATTATATCTTTACTGAGGGGCAACGGGATTTCCAAAAACGCTGTAAAGACAATAAATGTGAGTGGAAAGATGTCAGGGAAATACTGTTCGGCCTCAAGAAGGTCCTAGATCAGGGATATAGAAACATGATGTATCACTTTAGACATACTCAATGTGAAAAATGTGACTACTGGGATAATGTGTATAGGATGCACCTGGCTAACGTGTCTCCTTCTGAAACAGAACCGCAGGAGCTGACGGACGAGGAGATATTAGCCGCGGCCATGGAGGTCGATGGCACCCACGAATAGAAAACCGGGCGGGTGGGTGCTGCCGGGACACAGATACTTGGGTCCGTTCAACCCGATAGAGAACGGAGAGCCTGTGAACGCGGCAGACGCGGCAGCCAGGAGACACGATCTGAAATACGATCAGTACCTGAAAGAGGGAAAGAATCCCTATCTGTATTTCAATAAAGCCGATTCTGATTTTCTCGAAGATCTCGAGTCCGACCGTTCTTTCGGCGGGTGGATCGGAAAGGGCGTGTTTGGACTCAAACGAGCGATCGCACCGACGCTCGACGAGTCCTCGGGCAAACAGAACACGGGGGGTCCTTCGGCGGCCAAGAAGCCGAGGGTCGATCCTCAGAGGGCGCAGAAGCGCAAGCTCTACTTTGCCAGACAGGCAAAAGAAGCCAAAAAACAAAAGATGAGCTCGGGAGGTGATCCCAGCGAAGACACTGGGGCGGGAGACGGAGAACAGGGGGGAGAATCTTCGACCATGACGGGACGCTCCGGGGGAGGAATGGGAGGCGGTGGAGGAGGAGGCGGCAGCGTGGGATTCAGCACCGGAGGGTGGGAAGGGGGCACCTACTTCAGCGATCACACCGTGACCACGACCAACACCAGGCAGTGGTACACGGGGATCCTGAACGGGCATCGCTACTCGAAGCTCGCTCAGCCCTCGGTGGGCGATAATGCAACACCTCCGTGGGTGGGGATTCAGACACCGTGGGCCTACCTAAACGTCAACTGCTATCACTGCCACTTCAGTCCTCAGGACTGGCAGAGGCTCCTGAACGAATACAAGGCCTGGAGGCCAAAGAGGATGCACATACGCATCTACAACCTGCAGATCAAACAGATCACCACGATGGGAGCGGACACGCTCTACCAGAACGATCTGACCGCAGGGGTGCACATCTTCTGCGACGGGAGTCATCAATACCCGTACGCGCAGCATCCTTGGGACGAAGGGGCATCACCTGAGCTTCCAAACGAGATCTGGAAGCTACCGCAGTACGCCTACTTCCAGTATCAGGGAGATCTGACCGATCACACCACGGTAAACACGGCACAGAACGTGGAGCGCATGCTGCGATCCAACGTACCGCTGTTCCTGCTGGAGAACAGCAACCACGAGGTGCTGAGGACCGGAGAGATGACCCAATTCAGCTTCACTTTCCAATCCGGGTGGGTCACCAACGACAGAGCGTACTGCTGTCCGCAGGCCGACTTCAATCCGCTCGTGGAAACGAGAAGATACTACCCGACGTGGAGCGGCTCAACTAACTCGTACTCGTATAACAGATACGGGCCCTACAAAAAACCGAGCAACTGGATGCCGGGACCGGGGCTGGCCTACAAGGGTGCCACACACACAAACCAGAAACCAAATGATGCGAGAGGGCCGATCGTCACCACGATCGCTCCATTGGGAACGATCTCTAACGGGTCTACACCGTCAAACGAGGCTCCGAATGACGGTGAAAACGCCATATCTGCGGACGGCGTCAGACAGAGCGGTTGGCAGACGGGGCCGGTGAACGGAGCCTGCGCCAGAACAGACTATCCCACGCTCGCCTTCGATCCGAGCGATAGATCCACTAACAACAACATACCAACCAGAAACCTAGACATAGACATGACACGATGGTATCGTGTACACGAACCAGTTAGAAGCGCAAGTGGAAGCACCTACTACAACGAAGATGATGTTTGGATGTATCCAAACCAAGTATGGAACTCCACGCCGATCTGCAGAGACAACCCTATCTGGGACAAGGTACCGAGGACGGACCACAACACGATACTGGATTCCTCTGACGGAACGCTGCCGATGAAACATCCACCGGGAAACATCTTCATTAAGTGTGCAAAGATCCCGATTCCGACGAGCAACAATTCCGACAGCTACTTGAACATCTACGTGACGGGACAAGTCACCTACACCGTGGAATGGGAAGTGCAACGGTACCAGACCAAGAACTGGAGACCAGAAAACAGAACGACCGCCGGGGCCTACAATCAACACGAGATCTACAACATCGGGGAGAACGGAGTGTACAACAGGGCCAACACCTTCAACGAATGCATGCCAACTAAGTGCGGAATTAATCGTGTATTGTAAAATTCAATGTACAACAAAATCAAGAAAAACCCAGATATCTGCAGAGCTCCGGCAAT
| 81,911
|
KM402139.1
|
Porcine bocavirus
|
Zhou,Y., Tang,F.L., Zhu,K.S., Zhu,W.Z., Luo,Z.J., Lin,X.Z.
|
Huizhou Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau of P.R.C., Animal Quarantine
|
China
|
2014-11-26
|
GD11
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,019
|
GenBank
| null |
China: Guangdong
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2013-12-09
| null | null |
Porcine bocavirus isolate GD11, complete genome
|
GACGCTGGGTGAGTGCGATGGAGTGCTACGCTCTGGGACAATACGCTACCTATGAGGACTTTCTGGGCTTTCGGGATCCTGCATACACCTATATCATACGTCTGCCTTTTAGAGACTGGCGGGGACTAGAGAATGGGCTTCAACACATCTGCACTCCAGCTGAGTATAGAGAGCTGCTGGACGTGGATGATGCTGGGCATACTGTGTTTGATGATGCTCCAGACAATACAGACACTGCTGCTCTCCTGCATTTTATGGCCAGGAACGGGCCTCAGTGGCATTATGGAAGATTTCTCATACACTGTGCGCATCGCGCGGTCAGACGGGAATTCAGAAACAAGCAGGGCAGACAGGATCCGGAGTTCAGCTGCTACTGTCAGCTCGAGCTCAGCGATACGATGCACATCCATCTCGTCCTCGGGGGGCCGGGGCTCAACAAGTACAACGCGAAAGCCTGGAGGAACGTGATAGCCTACGGGTTCTTTAACGAGATGCTAGATGGGATCAAGCGCAACCTGGGGCATCTGGAGAGTGTAGAGTATCAGAACATCATCCATCCTCTGATCAATGCGAGAAACAGATGCGTGCTAGACTATACCGAACACTGCAGCATCCTGCAGTACAAGAGCAGGCGAGGAGAGATGTACGCGTGCCGGGTGGACGGGAAAGAGTTCATCGTCAACTACCTGCTCTGCAAGAACCTGAAGTTCAATCAACACGTGAATCCTCAAGACATCACTCCGATCGGAGCTCACTTCATCGAGGCGACCAAGACCTACGCCATCAGCAGCATCAACGAGAAGCTGGTTCCAGAGCACATGCGCAGGCAGATCTTTGAGAGGCTGAGGAAGGTCACGGACAGGTCTCTGGAGCCAGTCTTCGGGGGAGATCCCTACGGAGACCTGCCTCAGGTAGAGAGAGCGGAGTGGGTGCAGACCACAAGCGGAGGGGGGAGGATGACCAAGAGAGAGGGTCTGATGCTCGATTGCATGAGACGCTGTTTCAGTGAGAACATCACCTCGTACGAGGAGATGGTGGGGAAGTGTCCCGATCTGACCATCATGATCGAGAGCCAGGCGGGAGGCAGCAGGCTGATAGAGCAGGTGATGGGCATGACACACATCAAGATCGTGCAGAGCTACACCGCGCTGGGATACATCCAGAAACTGTTCGGGGAGAGCGCGCAACTGGAGAACGACAACCGGGTGTTCAGACTCTTGAACTTCCAGGGATACAATCCCTGGCAAGTAGGACACTGGGTGTGCTGCGTGCTGGACAAGAAGAGCGGAAAACAAAACACGATCTGCTTCTACGGACCGGCCAGCACGGGGAAGACCAATCTGGCCAAGAGCGTCGTTCAAGCCTGCAAGCTGTACGGCTGCGTGAACCATCAGAACAAGAACTTCGTCTTCAACGACTGCGCGGCCAAGCTGATCGTGTGGTGGGAAGAGGCGCTGATGCACACGGACTATGTGGAACAAGCCAAGTGCATCCTGGGAGGAACCGAATTCAGGATCGACCGAAAAAACAAGGACTCGCATCTACTACCGAAGACACCGGTGGTCATCTCGAGCAACAACGACCTATACACCGTGGTGGGAGGCAACATCGTGTCTCAGGTCCACAGCAAGCCTCTGCGAGAGAGGATCGTGCAATTGAACTTTATGAAGATGCTGGAACCGACGTTCGGGGAGATCACTCCGGAAGAGACTGCAGCTTGGCTCCTGGCCTGCAGAGAACGCTTTGACTGCACGCTAGAGGGATTCTACAGAGAGTGGAACTTGCAGGTAACACCAAACGTGTTTCCCATCGGTAACCTGTGTCCCTCTCATTCGCAGGACTGGACGCTGCATGAGCGTGGCTTTTGCTCTGCGTGTGGCGGCTATTATCCTCTGGAGACTCGCGAGGACGATCTCTTCAGTGTGCGAGCAGAGCACGACGGTGAGTGGACGAGGGAGGACAGCCTGTTCTGGGAGGGCGTGGTGGCGCGTCTCTCTGACAACATCTCTCGCCTGCAGAAACTGGTGAGGGGAGCGAACAGCCTGAGGAGAGTCGCGGACGAAAGAGACGGGCATCGAGAGAGGAGAGAGAAAAAGAACCTCAGCCAGCCAAAAGACGAAGCGAGCGTCTAGGTAAGAAGCCGAGAGTCACCTTCTACGAGCCTGTGAGCAGCAGCGAGGAGGACGAGTTCGACAGTCAGCCTCAGGATGAGCTCAGCCAGATCAGACACAGACAGTGGCAGGAGAGGAGAGAAGCGGTCGAGGAGCCGGTCGAGGAGCCGCAGCCGGGACCGAGCACCACCGGAGCTACCTCCGAAAAAAAGGGACTATCGCCGTCGGAGTGGGGAGAGAGGCTCGGAGTCATCTCCAGATCGCTCGACGAGGGGGAGCCCATCGTGCTCCACTGCTTCGAGAGCATCCCGAGTGACTTCAGCGACATGGAGGAGACCGAATGACTCTCGGGACGGGGGGAGAATGTGGGGAGGGAAAAATAAAAAGAATAAAACAAACCCTTACGAGGTATTCAGCCAGCACATGGCCAAGTACAAACCAAACAAAAGCTATTGTGGTTTCTACTGGCACAGCTGCCGACTAGCTCGTAAGGGCACAGAGTATATCTTTACCGAGGGGATGAGAGATTTTCAAAAACGCTGTAAAGACAATAAATGTGAATGGAAAGATGTCAGGGAAATACTATTCGGGTTTAAAAAAGTCTTTGATCAAGGATATAGAAACATGATGTATCACTTTAGACATACTCAATGTGAAAAATGTGACTACTGGGATCAAGTGTATTTAAAACATTTGGCTAACGTGTCTCCTTCCGAAACAGAACCGCAGGAGCTGACAGACGAGGAGATGCTAGCCGCGGCCATGGAGGTCGATGGCACCCACGAATAGAAAACCGGGCGGGTGGGTACTGCCGGGACACAGATACTTGGGTCCGTTCAACCCGATAGAGAACGGGGAGCCTGTGAACGCGGCAGACGCGGCAGCCAGGGGACACGATCTGAAATACGATCAGTACCTGAAAGAGGGAAAGAATCCCTATCTGTATTTCAATAAAGCCGATTCTGATTTTCTCGAAGATCTCGAGTCCGACCGTTCTTTCGGCGGGTGGATCGGAAAGGGCGTGTTTGGACTCAAACGAGCGATCGCACCGACGCTCGACGAGTCCTCGGGCAAACAGAACACGGGGGGTCCTTCAGCGGCCAAGAAGCCGAGGGTCGATCCTCAGAGGGCGCAGAAGCGCAAGCTCTACTTTGCCAGACAGGCAAAGGAGGCCAAAAAACAAAAAATGAGCTCAGGAGGTGATCCCAGCGAAGACACGGGGGCGGGAGACGGAGAGCAGGGGGGAGAATCTTCAGCCATGGCGGGACGCTCCGGAGGAGGAGCGGGAGGCGGTGGAGGAGGGGGAGGAGGAGGAGGCAGCGTGGGATTCAGCACCGGTGGGTGGGAAGGAGGCACCTACTTCAGCGATCACACCGTGACCACGACCAACACCAGACAGTGGTACACGGGGATCCTGAACGGGCATCGCTACTCGAAGCTCGCTCAGAACACGGGAGGGAGCGGTCAGACACCGGCAACGCATCCCTGGACGGGAATCCAAACGCCGTGGGCCTATCTGAACCTCAACTGCTATCACTGCCACTTCAGTCCTCAGGACTGGCAGAGACTCCTGAACGAATACAAGGCCTGGCGGCCAAAGAGGATGCACGTGCGCATCTACAACCTGCAGATCAAACAGATCACCACGCTGGGGCAGGACACGCTCTACCAAAACGATCTGACCGCGGGGGTGCACATCTTCTGCGACGGGAGCCATCAGTATCCGTACGCGCAACACCCTTGGGACGAAGGAGCGTCACCGGAGCTTCCGAACGAGATCTGGAAGCTACCGCAGTACGCCTACTTCCAATATCAGGGAGATCTGACCGATGACACCACGGTACAGACGGCCCAGAACGTGGAGCGCATGCTGCGATCCAACATACCGCTGTTCCTGCTGGAGAACAGCAACCACGAGGTGCTGAGGACAGGAGAAATGACCGAATTCAGCTTCACCTTCCAGTCCGGGTGGGTCACCAACGACAGAGCGTACTGCTGTCCGCAATCCGACTTCAATCCGCTCGTACAATCGAGAAGATACTACCCGACGTGGAGCGGCTCAAATAACTCGTATTCATATACCAGATACGGGCCCTACAAAAAACCAAGCAACTGGATGCCGGGACCGGGACTGGCCTACAAGGGTGCCACACACACAAACCAGAAACCAGATGAGGCGAGAGGACCGATCATCACAACGATCGCTCCGAGAGGAACGATCTCTACCGGGTCTACACCGTCAAACGACGCTCCGAACGACGGTGACAACACCATATCTGCGGACGGAGTCAGACAAGCAGGTTGGCAGACGGCGCCGGTGAACGGAGCCTGCGCCAGAACAGACTATCCAACGCTCGCCTTCGATCCGAGCGATAGATCCACTAACCAGAACATACCGACCAGAAACCTGGACATAGACATGACACGGTGGTATCGTGTACACGAAGCGGTTAGAAGTACAGGGAGTGGAAGCACCTACTACAACGTGGATGATATTTGGATGTATCCAAACCAGGCTTGGAACTCCACGCCGATCTGCAGAGACAACCCTATCTGGGACAAGGTGCCGAGGACGGACAAACACACGCTACTGGATTCTTCTGACGGAACGCTGCCGATGAAACATCCACCGGGAAACATCTTCATTAAATGTGCAAAAATTCCAGTTCCGACGAGTAACGGAGCCGACAGCTACCTGAACATATACGTGACGGGACAAGTCACATACACCGTCGAATGGGAAGTGCAACGGTACCAGACCAAGAACTGGAGACCAGAACTCAGAACAAACGCCGGGAGCTTCAATCAACACGAGATCTACAACATCGGGACCGATGGAACATACAACAGGGCAAACACCTTCAACGAATGCATGCCAACTAAGTGCGGAATTAATCGTGTATTGTAA
| 88,636
|
KF360033.1
|
Porcine bocavirus
|
Wang,E., Liu,W., Yang,B., Liu,J., Ma,X., Lan,X.
|
Chinese Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology, Key Laboratory of Grazing Animal Diseases, Lanzhou Veterinary Research Institute
|
China
|
2013-10-29
|
swBoV CH437
|
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,275
|
GenBank
| 1
|
China: Gansu province
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2012-06
| null | null |
Porcine bocavirus isolate swBoV CH437, complete genome
|
CCCACACAAGGAAATAAGTATCGGAAAAATAGGGGTTGGCTGGAGATAATGATAGACACGCCTTTTCGGGCACAGCCAATCACAGCGATGGGGTGATTTGACGTGGCTGATTCTGATAGGCTGGAGGACTCTATATAAGGAGAGCAACCAGGAAATAGAGTTCATTCTGCGGCTGGACGCGGAGCTGTTCACATCGATGCAGAAAGAGCGCGTGAGACACTACACCTTCTTCTATTGATGTACATTCTGCCTGAGAAGAGACTACTACAGTCTGTGGACATCGCTCCGCGGGAGAAGACGTCCTGTGAAGGTATATTATGGCTGCTGGCATGGCTTCTGCTAGAGTTGGGCTGTCTGATCAGGAATGGCTGGGTTTTTGGCACGGAGCTATTACTGGTTTCAAGGCTCCCAGCTTTAGCTATGTTATTAGAATTGATATCAAGGACTGGAGACTGGCTGAGAGAGCTATTATGGACATATATTCTAAAGATATGCCTGTCATTCTGGATGATCTGGTAGATCAGGAGAAGGAGCTTCTGCTCTGCGACGTCAATTATAACTGGAAGGAGAGTCTGGCCATGAAGCTCCAGAATCAGCACGGGCTCGGTCAGACGCTCTGTGAGGCTGCTGACATGGCCGCGAAGCGGCTCTTTCAGCTGAAGCAGCAGAGTCACAATCCAGTCTACAGCTGCTTCACTCAGGCTGAGATCGGCGAGATCTATATGCACGTTCATGTAGTGTGCGGAGGAGACGGGCTGACCAAGTGCAACGCTAAAAAAAGCGCTTGGGTTCTGGCTAAATACTTCTGGAGCTATATGCTCGATCTCTGGAAGCACTACGAGAGTTGCTTCGATCCGACCAATCTGCAGTACACCGTGTCGGTGCAGCTGCGTCTACTCTGTGAGAGGGTCAGGGCTCATCAGGACGCGACCGTCTCTTGCTTGACCTATCGAGACCGGCACAACGAGGCTCACGCTCAGCGCATCGATGCTTGCAGCTACATTATGAACTATCTCTTGCCGAAGAATAGACAGCTGGTGACTTGGCTGGATCCTGATGTCTGCACTCCGAGCGTAGCTCGCTTTGAAACCACCAAAACCTACATGTGCAGTCACCTTGACAGACAGCCGATCACTCACTATCTCAGAAAGGCTCTCCATGACCGGCTGGTCATGAACAGTTCTGATGAGACGGGGGAACCTGTCCATAAGATGCCGCGCTGGGGCGATCTTCCTGCGGTAGGTGAAAACTCCTTAGCTAGACAGGCAGGGCCGACAAGGCCGACTAAACTGACGAGAAAACAGCATGTCATGTTAGATACTCTGCAGAGATGTCAGGAAGAGTTTATCTGTACCAAGGAAGAGTTAACGATGCTGCATCCAGATCTAGTGATTATGTTTGAGAGTACTCCGAGCGGGTCTCGAACGCTCGAAGAAGTACTCGAGATGCATCGGGTGAGAATCACTAGAACCGAGACGGCTCTGAGTTACATTAAAAGGCAGTTTCCAGACAACAGATTTATCAAGCCGGAGAATAAGGTGGTCAGGCTGTTGAACATCCAGGGCTACAATCCTATACAGGTCGACCACTGGATGGCGACCGTGCTCTCTAAGAAAGCCGGGAAACAGAACACGATCTGTTTCTTTGGTCCGGCCAGTACGGGGAAGACCAATCTGGCTAAGGCGCTCGCGAGCGCGGTGAAGGTCTATGGTTGTGTCAATCACCTCAACAAGCAGTTTGTCTTTAACGATTGCCAGAACAAGCTCGTATGCTGGTGGGAGGAGGCGGTCATGCACAACGATTATGTAGAGCCAGCTAAATGTCTGATGGGGGGAACGACCTTTAGGGTAGATAGAAAACACCGAGATAGCGCGGAACAGCCTCAAACACCTTTGCTCATCAGCACCAATCATGACATCTACACAGTGGTGGGTGGGAACACAGTGACTACCGTTCATGAGAAACCGATCCGAGATAGAGTAGTTCAGTTCAATTTCATGAAAGCGCTGCCTCAGAACTTTGGAGAGATCTCGGTGACTGAAGTGGCTGATTGGCTCGGCTGGTGCGCCGAGGACTTTGACTGCACGCTCGACGGGTTCAAGAAAGAGTGGGAGCTTGACCGTGTTCCCAACAGCTTTCCTTTAGCTGTCTACTGTGATGGTCATTCACAGGATTTTGTGCTCTACGCTCAAGGACCTTGCCGTCGCTGTGGTGGCTACCTGCCTCATACTACTACCAGCGACGGTGATTGGAGCGAGTCTGCTGCTGCAGGTAGGACTTGGCGCATGCGCGATAGGGAGACACCTATCGGGCGGGGAGGGATGTGCTCATGATCTGTTCTTTGTCTTTCAGAGCCTACTCCGGCAGAGTCTCCAAAGAAAGTGACCGCTACTCAAGGCACTCAGACCGAGCCTGAACCTTCTTCTTCAAGTGAGTACATCGACTGGAGCAGCTGTCCAACCAATGAGTCAGAGATTCAGCGATACAACATCTCGCAGCGGGAAGAGCAACCTCCGGTTCTCTCCTTACTCGACGATCCAGGCGAAGGACCGTCGAGTCAACGAGAGGTCTACAACCGAGAGGGAGCATGGAACGTCTTCGCGGGAGCCAGTGGAGACGGAGACCAAGCCGGGATCCTCGTCACAGTGGACCGCTTCCTGCGGGAGGGGGAGGAAGGGCACATCGACCCCGGGTTCTGGCTCAGCTGTGGGGAGCTCTTGGAAGAGCCGCAAGATGGTTAAGAAGGCTAATCCGGCCACAGTCTTCAGTGAGCACAAAAAGAGGGAGGGAATCGAGTTCGACTTCTGTGGGTTTTACTATCACTCCACAAGAATTGCATCCAAGGGAACTAGATACATTTTTGACATGGCGAAAAAAGACTTTCAGTCTGTCGCCAAACAAAATTGTGTCACCTGGGACCAGCACCGAGAATTACTATTTACTTTTAAACGGTGTCTGGACAATATGTACCGATCTATAATGTATCACTTTAAATTCACTGAATGTCAAAAGTGTCCTTACTGGGATGATGTCTATAAACAGCATTTAGCGGGTGTGCAACCTATTGAAACTGTTCCTCCTTCTTCTGTAGAGCTCACAGACGTGGAAATGCTAGAGGCTGTTGAATCAATGAATGAGTCTTAAGCGCGGTCAGTTCCGCGGGCTTCTATTTCCTGGTTATAATTATTTGGGTCCTTTTAATCCTTTGGAAAACGGTGATCCTGTCAATAAAGCCGACGAGGCCGCAAAAAAACACGATCAAGCCTATAATAATTATATCAATAAAGGTTTAAATCCCTACCTGAAATTTAATAAAGGTGATCAAGACTTTATCGACTCTTTGCAGTCTGACTCTTCTGTGGGCGGTAACTTTGCGCATGCCGTCTTTCACTTGAAAAAACAAATTGCGCCTGCGCTCAACGAGCCTAAAGACACGGGGGAACCTCCGGCCAAAAAGGACAAACGCGCGGGCAATAAACGTCACCTATACTTTGCGCGCTTGAATAAAGGCGCGAAAAAAGCCAAAGCTGATCCTAACAACATGGATGGTGATATGGATAATAATGAACAAGGGGCGGGTGAGGCGCCAGCTGCTGAAGGCGGAGCAAGAGCTGCTGGCGGCGCTGGCGGCGGTGGTGGAGGAGGCCCGAGCGGGAATCACGGCGTCGGCATCTCCACCGGAGGATGGATCGGAGGATCCATCTTAGGGCAAAATAGAATCATCACCAAGAACACACGTCAATGGTGGTGTCCTATCCGCAATGAACATAAATACAAGCGATACCAAGGAATCGCCGATTATAAAATGGAAGGCTATACCACACCTTGGAACATGTTCAACTTCAATCAATACAGCAGCCATTTTAATCCCAATGAATGGCAATGGCTCCTGAACCGAGCCGCGCGCTTCAAGCCCGTCAAAATGGAAATCAAAATCTACAACCTGCAAATCAAACAAGAAAGCAACCAAGACACAACTGCGCAATACACCAACGATCTGACGGCGGGTCTCCACGTCCTTTGCGACGGAGAACACGCCTTTCCTTGGACGCAGCTGCCGTGGGACAAGGGCTGCATGCCGGAGCTGCCTCACGACATCTGGACGCTACAGCAATATGCCTACATCACGTGCGCCTCTGAAGCGCAGGACACGACGAGCAACGGAAACGAGCTCAACATACGAGGCGCCGTGCCCATGTATCTCCTGGAGGAGACGGATCACGCCGTCATCCGCACGGGCGAGAGCATCGCCTTCCATCACTCGTTCGACTGCGGGTGGGTCGACAACACACGCTCGAGCGTCATGCCTCAGATGGCCTGCATCAATCCGCTCATCGACTCCAGACTCGTCGGGGTCTGGCTCAACCAGGCCGGAAACGGGACGAACGAGGACCAGATGAGACCGTATCAAAAACACGGTCCGTGGTGGCCGGGACCCGGATACCGAAACAATAGAAACACCAGCGAGAACGGAACCAACGGACATACCGTCCTGGGACCTTACATCACGGCCTGGAAACCAGAGGGAATGACCTACCAGTCGTCCGCTGTCAGATTCGGAGCGGCCACGGGTCCGTACACGGGAGGCCAGTCGACCGATGTCGTGACAGGCAACGCCAACAACAACGCCAACGTTACGAGATTCACACCGGGAGACGGACTGGGCGGAGCGAACAATAACAACTACTTTATCCAGCGAAGTTCCGTCCAGACGGGAACCAGGGATCAGGCTCTCTATAAAGCCACGGGTCAATCCACACAGGAGATAGAAAATGTCTACATGATGCCGAACCAGGTGTGGGACTCGGCGCAGATCTCCAGGTACAATCCCATCTGGACCAAGATACCCAGGGTGGACAGACATACCTTGCTCGATACCGAGGACGGGACCTTACCGATGACGCATCCTCCGGGAACCATCTACGTCAAATTGGCTCACATTCCAACACCACAGTCGGGTAACAATTCTTACCTTAACATTTACGCAACGGGACAAGTCTCCTGCGAAATTGAATGGGAATTTGAAGAAAACTTTACCAAGAATTGGCGTCCAGAGCGCATGATCGACGGCAACAAGATGAGAGCCGACGTCTACAAAATCAACGCCGATGGAGGATGCGTCTTACCCAACAGCTACTACGAAACCATGCCAACCAGATGGGGGAGGGAAAAGGTTCTGTAACCTTTGCTCTGTATGCATATTCAATAAAGCTCATATGCAGATCAGAAACAGACTGCATGTTGACACTTTAATTTTTATGTGGGTGGTGATGGG
| 92,800
|
KF206154.1
|
Porcine bocavirus
|
Cadar,D., Csagola,A., Lorincz,M., Novosel,D., Becskei,Z., Tuboly,T.
|
USAMV, Department of Infectious Diseases
|
Romania
|
2013-08-04
| null |
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,053
|
GenBank
| null |
Serbia
|
Serbia
|
Sus scrofa domesticus
| null |
2010
| null | null |
Porcine bocavirus strain 20ZS-RS, complete genome
|
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GCCAACCAGGTGGGGGCAGGAAAAAGTTCTGTAACCTTGCTCTGTTTCACCCC
| 93,541
|
KF206164.1
|
Porcine bocavirus
|
Cadar,D., Csagola,A., Lorincz,M., Novosel,D., Becskei,Z., Tuboly,T.
|
SZIEAOTK, Department of Microbiology and Infectious Diseases
|
Hungary
|
2013-08-04
| null |
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,109
|
GenBank
| null |
Croatia
|
Croatia
|
Sus scrofa domesticus
| null |
2010
| null | null |
Porcine bocavirus strain 703-3DI-HR, complete genome
|
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| 93,542
|
KF206166.1
|
Porcine bocavirus
|
Cadar,D., Csagola,A., Lorincz,M., Novosel,D., Becskei,Z., Tuboly,T.
|
SZIEAOTK, Department of Microbiology and Infectious Diseases
|
Hungary
|
2013-08-04
| null |
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,049
|
GenBank
| null |
Croatia
|
Croatia
|
Sus scrofa domesticus
| null |
2011
| null | null |
Porcine bocavirus strain 710-3DI-HR, complete genome
|
GGGGGGATATGACGTCAACGATCCTGATTGGGTGGGAGGGTCTATATAAGGAGGAAACCAGGAAGAGGAGCTCATTCTTCGGCGGGACATCGAGATGTTCACATCGATAAAATGAGCTTCTGTCATCGTTCTCGTTTGAGATCATCGCTGGCGAAGACAGCTCCGGCAAGTACTCTATTATATCTGCTGTCATGGCTTCTGCTGGAGTTGGGCTGTCTGATCAGGAATGGATTAATTTCTGGCATGGAGCTATTACAGGCTTTAAGAATCCATGCTATACATATGTCATTCGCGTGGATATTAAGGACTGGAGAGTTAATGAGAGAGCTCTTATGGACATGTTTTCAAAAGATCTACCTACCATGTTGGATGACATGGTAGATGCTGAAAAAGAAATGCTCATCACTGATCTCGATTATAACTGGAAGGCCAGTTTAGCTATGAAGCTTCAAAATCATCACAGCCTCGGTCAGATCCTCTGTGAGTCTGCCGACATGGCCGTCAAGCGGCTCTTTCAGCTGAAGCAGCAAAATCACAATCCAGTCTATAGCTGCTTCACACAAGCAGAATTAGGCGAGGAAACCATGCACATACACATTGTATGTGGAGGGGATGGTCTGACCAAATTTAACGCCAAAAAGAGCACCTTTACTATCGCTAAATACTTTTGGAACACTATGCTTGAGCTCTGGAAACACTACGAGAGCTGCTACGATCCTTCCAATGTTCAATATGCCATCTCAGTTCAGCTACGCTTGCTCTGTGAGCGTGTGAAGGCTCATCAGGATACGACCGTCACTTGTCTAACCTATCGAGACCGACACAACGAGTCTCACGCTCAGCGGGTCGGTCGATCCTTGCAGCTCATCACACCTATCTCTTGCCGAAGAAGATCGCTGTGTACCTGGCTGGGTCCCGATATGAGCACTCCGAGCGTAGCTCAGTTTGAGTCCAACAAGACCTACATGTGCAGTCACATTGACAGGCAGCCGATCACTCAATATCTCAGAAAGGCTCTCTATGACCGGCTGGTCATGAACAGCGCCGAGGAGACAGGGGAACCTGTCCATAAGGCGGCGCGCTGGAGCGATCTGCCGGAGGTGGGTGAGAACTCGCTAGCTAGACAGAACATTCAGACTAGGCCGACTAAACTGACTAGAAAGCAGCATGTGATGTTAGATACTCTGCAGAGATGTCAGGAGGAGTTTATCTGTACTAAAGAGGAGCTGACTATGTTACATCCAGATCTAGTCATTATGTTTGAAAGTACTCCAAGCGGGTCTCGAACCCTCGAGGAGGTGCTCGAGATGCATCGGGTGAGAATCACTAGAACAGAGACGGCTCTAAGTTACATTAGGCGGCAGTTTCCAGACAGCAAGTTTATCAAGCCAGAGAATAAGGTAGTCAGACTGTTGAACATTCAGGGCTACAATCCTATCCAGGCCGGCCACTGGGTGGCGACCGTGCTCTCTAAGAAGGCCGGGAAACAGAACACGATCTGTTTCTTTGGTCCGGCTAGTACAGGCAAGACTAACTTGGCTAAAGCTATCGCTAATGCAGTGAAGGTGTACGGTTGTGTCAATCACCTCAACAAAAGCTTTGTCTTTAACGATTGCCAGAACAAGCTTATATGCTGGTGGGAAGAGGCGGTGATGCACAACGATTGGGTAGAACCAGCTAAGTGTCTGATGGGAGGGACGAGCTTCAGGGTAGATAGAAAACACAAGGATAGCGCGGAGCAGCCTCACACACCTTTGATCCTGAGCACCAATCATGACATTTACACCGTGGTGGGTGGGAACACAGTGACTACCGTTCATGAGAAGCCAATCAGAGACAGAGTAGTTCAGTTCAATTTCATCACAACTCTGCCTCAGAACTTCGGAGAGATTTCTGTGGCTGATGTGGCTGACTGGCTCGGACGGTGCGCCGTGGACCTTGACTGCAGTCTCGACGGGTTCAAGAAGGAATGGGAGCTTGACCGTGTTCCCAACAGTTTTCCTCTAGCGAGCTACTGTGATGGTCATTTGCAGGATTTTGTGCTCTACGCTCAAGGACCTTGTTGTCGCTGTGGTGGTTACCTGCCTCACACTACTACCAGCGACGGTGATTGGAGCGAGCCTGCTGCTCAAGGTAGGACTTGGCGCATGCGCGATAGGGAGACACCTATCGGGCGGGGAGGGATGTGCTCATGATCTGTTCTTTGTCTTTCAGAGCCTACTCCGGCAGAGTCTCCAAAGAAAGTAACCGCGACTCAGGGAACACAGACCGACGAGCCTTCGAGTGAGTACATCGACTGGAGCAGTTGTCCAACCAATGAGTCTGAAATTCTCCGATACCAAATCTCGCAGCAGCCAGAGCAACCGGTTCTCTCCTTACTCGACGATCCAGGCGAGGGAACGTCGAGTCAACGAGAGGTCTACAACCGGGACGGAGCATGGAACGTCTTCCTCGGAACGGATGGAGACGGATCCCAGGCCGGGATCCTCGTCACAGTCGACCAAGTTCTTCGGGAGGGAGAGGAAGGGGTCATCGAGCCAGAATTCTGGCTCAGCTGTGGGGAATCCTTGGAAGAGGGGCAAGATGGCTAAGAGACAAAATCCGGCCACGGTCTTCAGTGAGCACAAAAAGAGGGAAGGGATTGACATTAACTTCTGTGGGTTTTACTATCACTCCACAAGAGTTGCGGGAAGAGGAACTCAGTGGATTTTTGATGTGGGCAAAAGAGAATTTCAATCTGTTGCCAGACAAAATTGTATTACATGGGACCAATGCCGAGAGTTACTATTCACTTATAAACGGTGTTTGGACCATATGTACCGATCTATGATGTGGCATTTTAGATTTACTCCTTGTGATAAATGTGATTACTGGGATGATTTTTATAGACAGCACCTAGCGGGTGTACAACCTGTTGAAACTATCTCTCCTTCTCCTTTACCAGAGTTATCAGATGTGGAAATGTTAGAAGCAGTTGAATCAATGAATGAGTCTTAAGCGCGGTCAGTTCCGCGGGCTTCTGTTTCCTGGTTATAATTATTTGGGTCCTTTTAATCCTTTGGAAAACGGTGATCCTGTGTTTAATGCTGACGAGGCCGCACAAAACCACGATCAAGCTTATAATAAATATATCAATAAAGGTTTAAATCCCTACCTGAAATTTAATAAAGGTGACCAAGATTTTATCGACTCTTTGCAGTCTGACTCTTCTGTGGGCGGTAACTTTGCGCGTGCCGTCTTTCATTTAAAAAAACAAATTGCGCCTGCGCTCAACGAGCCTAAAGACACGGGGGAACCTCCGGCCAAAAAGGACAAACGCGCGGGCAATAAACGTCACCTGTACTTTGCGCGCCTGAATAAAGGCGCGAAAAAATCCAAAGCTGATAATAACAACATGGATGGTGATCTGGGAGATAACGAACAAGGAGCGGGTGAGGCGCCTGCTGCTGCAGGCGGAGAGAGAGCTGGTGGCGGTGGTGGCGCGATTGGTGGAGGAGGAGGCGGCAACAACCACGGCGTCGGCATCTCCACCGGAGGATGGATCGGGGGATCCATCTTAGGACACAACACCATCATCACACGCAACACACGTCAATGGTGGTGTCCTATCCGAGATAATCACCTGTACAAACGATACACGACACACAACAAAAATGGTACCGACTTTAAATTGGAAGGATATACCACACCTTGGAACATGTTCAACTTTAACCAATACAGCAGCCATTTTAATCCTAACGAATGGCAATGGCTCATCAACCGAGCCAAACGCTTCAGACCGAAGCGCACGCAAATCAAAATCTATAACCTACAAATCAAACAAGAAAGCACACAAGACGCAACCGCACAATATACCAACGATCTCACCGCGGGTCTTCACGTGCTCTGCGACGGAGAACACGCCTTTCCTTGGACGCAACTACCTTGGGACCAGGGATGCATGCCGGAACTGCCTCACGATATCTGGAAACTGCAGCAATACGCCTACATCACGGTCGTCGCTGGGGCGCAGGACTCGGTAAACAACGGAGACGAGCTCAACATACGATGTGCCGTGCCCATGTATCTCCTGGAGGAGACGGATCACGCCGTCATCCGCACGGGCGAGAGCATCGTCTTCCATCACACCTTTGACTGTGGGTGGGTCGACAACACGCGCTCGAGCATCACGCCTCAGATGGCCTGCATCAATCCGCTCGTCGACTCCAGACTCGTCGGAGTCTGGCTCAACCAACAACAAAACGGAACAAACGAGAACCAGTTGAGACCGTATCAGAAACACGGTCCATGGTGGCCGGGACCCGGCTATCGAGACAATAGAAACACCAGCGAGGGAGGAACCCAAGGAAATACCGTCCTGGGACCTTACATCAGCGTCTGGAAGCCGGACGGAGTAGCCTACGATGGGTCCACTGTCAAATACGGAACAGCCACGGGTCCGTACACGGGAGGCCAATCAAGCGACATCACGTCGGGCAACTCCCACAACAACGCCAACCAGTTCCGATTCACAGCGGGAGACGGACCGGGTGGATCGAACAATCACAACTACTTTATCCGGCGAAGTTCCGCACAAACGGGAACCAGGGACCAGGCTCTCTATCGAGCCACAGGAACCTCAACCACCGAAGAAGCAAGAGTCTACATGATGCCGAACCAGATGTGGGACTCGGCGCCCATCAACAGGTACAATCCCATCTGGGTCAAGGTACCCAGAGTGGACAGACACACCTTGCTCGACACCGAAGACGGAACCTTACCCATGACGCATCCTCCGGGAACCATCTACGTCAAGCTGGCCAATATTCCGACTCCAAATGGCACGGGGCATCTCAACATTTACGCCACGGGACAAGTCTCCTGTGAAATTGAATGGGAATACGAAGAACACTTCAACAAAAACCGGCGTCCAGAGCGCAGGATCGACGGCAACAAGATGCGCGCCGACGTCTACAAAATCAACCCCGAGGGCGGATACGATCTGCCTCAATCTTATTACGAAACCATGCCAACCAGGTGGGGGCAGGAAAAAGTACTGTAACCTCTGTA
| 93,543
|
KF206168.1
|
Porcine bocavirus
|
Cadar,D., Csagola,A., Lorincz,M., Novosel,D., Becskei,Z., Tuboly,T.
|
SZIEAOTK, Department of Microbiology and Infectious Diseases
|
Hungary
|
2013-08-04
| null |
Porcine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,001
|
GenBank
| null |
Hungary
|
Hungary
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Sus scrofa domesticus
| null |
2011
| null | null |
Porcine bocavirus strain G85-3AT-HU, complete genome
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CTGACACATGAGAATGATGATTATTCTGCAGAAGAGAATGCTACAATCTATGGTCATCGCTCCGCGGGAGAAGACAGCTCCGGCAAGTATCCTCTTATATCTGCTGGCATGGCTTCTCTTGGAGTTGGGCTGTCTGATCAGGAATGGCTTAGTTATTGGCACGGAGCTATTACTGGTTTCAAGAATCCCAGCTTTAGTTATGTCATCAGAATTGATATTAAGGATTGGAGAGTCGCTGAGCGTGCCATTATGGACATTTTTTCTAAAGATCTACCGTCCATCTTGGATGATCTGGTAGATTCTGAGAAGGAGTTTCTGCTCTGCGACGTCAACTATGACTGGAAAGGCAGTCTGAGCATGAAGCTCAAGAATCATCACGGGCTCGGTCAGGTCCTCTGTGAGGCTGGGGACATGGCCGCGAAGCGGCTGTTCCAGCTGAAGCAGCAGAGTCACAATCCGGTCTACAGCTGCTTCACTCAGTCAGAGATAGGTGACACCTATATGCACGTCCATCTGGTGCTGGGAGGAGACGGGCTGACCAAGTGCAACGCTAAAAAGAGCGCTTGGGTCCTGGCTAAATATTTCTGGAATTATATGCTCGATCTCTGGAAGCACTACGAGAGCTGCCACGATCCGACCAATATGCAGTACACCGTCTCGGTGCAGCTGCGTCTGCTCTGCGAGAGGGTCAGAGCTCATCAGGACGCGACCGTCACCTGTCTGACCTATCGAGACCGGCACAACGAGTCTCACGCTCAGCGCATCGACGCTAGCAGCTTCATCACCAACTATCTCTTGCCGAAGAATAGATCGCTGTGTACCTGGCTGGGTCCAGATATCTGCACTCCGAGCGTAGCTCAGTTTGAGTCCAACAAGACCTACATGTGCAGTCACATTGACAGGCAGCCGATCACTCACTATCTCAGAAAGGCTCTCTATGACCGGCTGGTCATGAACAGCGCCGAGGAGACAGGGGAACCTGTCCATAAGGCGGCGCGCTGGAGCGATCTGCCTGAGGTGGGTGAGAACTCGCTGGCTAGACAGAACACTCACACTAGGCCGACTAAACTGACTAGAAAGCAGCATGTGATGTTAGATACTCTGCAGAGATGTCAGGAAGAGTTTATCTGTACCAAGGAAGAGCTGACTATGCTCCATCCAGATCTGGTGATTATGTTTGAGAGTACTCCGAGCGGGTCTCGAACCCTCGAGGAGGTGCTGGAAATGCATCGAGTGAGGATCACTAGAACAGAAACGGCTCTGAGTTACATCAGGCGACAGTTTCCAGACAACAAGTTTATCAAACCAGAGAATAAAGTGATCAGGCTATTGAACATTCAGGGCTACAATCCTATTCAGATCGGCCACTGGGTGGCGACCGTGCTCTCTAAGAAGGCCGGGAAACAAAACACGATCTGTTTCTATGGTCCGGCTAGTACAGGCAAAACCAACCTGGCTAAAGCTATCGCTAATGCGGTCAAGGTGTATGGTTGTGTCAATCACCTCAACAAGAGCTTTGTCTTTAACGACTGTCAGAGCAAGCTCATATGCTGGTGGGAAGAGGCAGTGATGCACAATGACTGGGTGGAACCGGCTAAATGTCTGATGGGAGGGACGAGCTTCAGAGTAGATAGAAAACACAAGGATAGCGCGGAACTACCTCACACACCTTTGATCCTGAGCACCAATCATGACATTTACACGGTGGTGGGTGGAAACACCGTGACTACCGTTCATGAGAAGCCGATTAGAGATAGAGTAGTTCAGTTCAATTTCATGAAAACGCTGCCTCAGAACTTTGGAGAAATTTCAGTGGCTGATGTGGCTGACTGGCTCGGCTGGTGCGCCAAAGACTTTGACTGCAGTCTCGACGGGTTCAAGAAGGAATGGGACCTTGACCGTGTTCCCAACAGTTTTCCTCTAGCGAGCTACTGTGATGGTCATTTGCAGGATTTTGTGCTCTACGCTCAAGGACCTTGTTGTCGCTGTGGTGGTTACCTGCCTCACACTACTACCAGCGACGGTGATTGGAGCGAGCCTGCTGCTCCAGGTAGGACTTGGCGCATGCGCGATAGGGAGACACCTATCGGGCGGGGAGGGATGTGCTCACCTTTCGCTCTTTGTCTTGCAGAGCCTACTCCGGCAGAGTCTCCAAAGAAAGTAACTGCCACTCAAGGCACGCAGACCGACTATTCTTCGAGTGAGTACATCGACTGGAGCAGTCAACCAGCCAATGAGTCAGAGATTCTCCGATACCAAATCTCGCAGCAGCCAGAGCAACCTGCGGTTCTCTCCTTACTCGACGATCCAGGGGAAGGAACGTCGAGTCAACGAGAGGTCTACAGCCGCGAGGGAGCATGGAATGTCTTCGCTGGAGCGGATGGAGACGGATCCCAAACCGGGATCCTCGTCACAGTCGACCGGGTCCTTCGGGAGGGAGAGGAAGGAATCATCGAGCCGGAGTTCTGGCTCAGCTGCGGGGAATCTTTGGAAGAGGGGCAAGATGGCTAAGAGGGCTAATCCGGCGACGGTCTTCAGTGAGCACAGAAAGAGGGAGGGGGTTGAGGTTGACCTCTGTGGGTTTTACTATCACTCCACAAGAATTGCAGGAAAAGGAACTAGATGGATTTTTGATGTGGGTAAAAAAGAATTCCAATCAGTTGCCAGACAAAATTGTATTACATGGGACCAATGTAGAGAGCTACTTTTTACGTATAAACGGTGCCTGGACAATATGTACCGATCTATAATGTATCACTTTAGATTCACTGAATGTCAGAGATGTCCTTACTGGGATGATGTCTATAGACAGCACTTGGCTAATGTCACTCCGATTGAAACTGTTCCTCCTTCTCCTTTGCCAGAGCTATCAGATGTGGAAATGTTAGAGGCTGTTGAATCAATGAATGAGTCTTAAGCGCGGTCAATTCCGCGGGCTTCTGTTTCCTGGTTATAATTATTTGGGTCCTTTTAATCCTTTGGAAAACGGTGATCCTGTCAATAAAGCCGACGAGGCCGCAAAAAAACACGATCAAGCCTATAATACATATATCAATAAAGGTTTAAATCCCTACCTAAAATTTAATAAAGGTGATCAAGACTTTATCGACTCTTTGCAGTCTGATTCTTCTGTGGGCGGTAACTTTGCGCGTGCCGTCTTTCATTTGAAAAAACAAATTGCGCCTGCGCTCAACGAGCCTAAAGACACGGGGGAACCTCCGGCCAAAAAGGACAAACGCGCGGGCAATAAACGTCACCTATACTTTGCGCGCTTGAATAAAGGCGCGAAAAAAGCCAAAGCTGATCCTAACAACATGGATGGTGATATGGATAATAATGAACAAGGAGCGGGTGAGGCGCCAGCTGCTGAAGGCGGAGCAAGAGCTGCTGGCGGCGCTGGCGGCGGTGGTGGAGGAGGCCCGAGCGGGAATCACGGCGTCGGCATCTCCACGGGAGGATGGATCGGGGGATCCATCTTAAATAACAATAGAATCATCACCAAGAACACACGTCAATGGTGGTGTCCTATCCGAAACCAACATAAATACAAACGATACACAGGATACAATGAAGGGGGAACATCCTATACAATGGAAGGCTATACTACGCCATGGAACATGTTCAACTTTAACCAATACAGCAGCCATTTTAATCCTCATGAATGGCAATGGCTCGTCAACCGAGCCGCGCGCTTCAGACCCGTCAAAATGGAAGTCAAGATCTACAACCTACAAATAAAACAAGAAAGCACATTAGACAATAACGCACAATATACCAACGATCTGACGGCGGGTCTTCACGTCCTCTGCGACGGACAACACGCTTTTCCTTGGACGCAACTACCCTGGGACAAGGGCTGTATGCCAGAGCTACCACATGAAGTCTGGGCCCTACAACAATACGCTTACATCACCGTCTCTTCACAATCACAAGACACAAGCAGCTCCGGTGATGAAATGGCCATACGCAAAATGGTTCCTATGTATCTCTTGGAAGAAACAGACCACGCCGTCATCCGCACAGGCGAGAGCATCGTCTTTCATCATTCCTTCGACTGTGGCTGGGTCGATAATACACACTCAAGCAATATGCCTCAATTGGCTTGCATCAATCCACTCATCGACTCCAGACTCGTTAAAAGATATATGAATGCTAGCAATTCATCACATGAAAAAGAACAACAATGCAGACCGTACCAAAAGAACGGACCTTGGTGGCCAGGTCCTGGTATACGAAACAATCAAAACACAGACGGATCCTACAACGAATCCATCTTGGGACCCTATGTCAGCACCTTTAATCCTGAAGGAATGAGCTATCAAGTATCCGTTCTCAAATACGGTGTTCCTACGGGTCCATACACGGGTGGTCAATCAGCCAGACGTCCCGGACAAACGGGTGAAACGACCAATAACGCCAACTATCTCCGTTTCACACCAGGAGATGGACCGGGTGGACAGGACCAAAATAACCACTTTATCCAAAGACAGTCCACTCTCACAGCAACCAGAGATCAATGTCTCTACAAATCCACTGGTCAGTCAACAACAGAATTAAACGAATCCTGGATGATGCCAAATCAGATGTGGGATTCGGCACAAATCTCCAGATACAATCCAATCTGGGTCAAAATACCCAGAGTGGATAGACATACTATGCTCGATACCGAAGATGGAACCTTACCGATGACGCATCCTCCGGGAACAATCTACGTCAAACTAGCAAATATTCCAGCACCAAGCACAGCAAACAACTCATATCTCACCATTTACGCTACGGGACAAGTCTCCTGTGAAATTGAATGGGAGTTCGAAGAACACTTTAACAAGAACTGGCGTCCAGAACGCAGAATCGATGTCATGCAGATGGGCGGAGATACCTACAAAATCGACGGCAATGGTGCCTACAGATTACCTGGCTCCTATTATGAAACCATGCCAACCAGATTGGGACACGAAAAAGTTCTGTAACCATTGTACTACTATATTCCCTATCTACCCC
| 93,544
|
NC_039208.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Woo,P.C., Lau,S.K., Lam,C.S., Lau,C.C., Tsang,A.K., Lau,J.H., Bai,R., Teng,J.L., Tsang,C.C., Wang,M., Zheng,B.J., Chan,K.H., Yuen,K.Y., Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Lam,C.S.F., Lau,C.C.Y., Tsang,A.K.L., Lau,J.H.N., Teng,J.L.L., Tsang,C.C.C., Zheng,B.-J., Chan,K.-H., Yuen,K.-Y.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2018-08-24
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,425
|
RefSeq
| 1
|
China: Hong Kong
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2010
| null |
PRJNA485481
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Porcine coronavirus HKU15 strain HKU15-155, complete genome
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GACTAAAGATAAAAATTATAGCATTAGTCTATAATTTTATCTCCCTAGCTTCGCTAGTTCTCTACCGACACCAATCCAGGTGCGTCTGCCACCAAGTTGGCTACCCTTTCTAGGGGCGCTTTTGCGCTTGCTCACCATTAGATTACCTGGAAACCAGCCATTCAGGTTGGAGTTTCCCCAGGCTCTTTTGTGTGGGCATTAGCGGCTTGTGGTTTTTGCACAAAATYTAAGCTACTTACCGTTCCTCTGACCATCCACCACTTCTATAGACAGCACTGACTACCGTAGGGTTTAAGTCACACCGGTCTGCACCGCCCGTCAGCGGACACATTACCCAGCATAGCACTCCTTGCACCGAGCCTAGGTAGGATAAAACCCCCTACCGGGTGACTCTTAAGGCGTTTCCTCCACGGGATAGCCACTAGTCACTAGGTGTAAGTGATCTGATCTGGGCGTATTGTGTTGCGCAAGTGTGATACCCATAGGAGCGTGGAATCCTATTCTGCGGCTCAGTGCCTGATATAGCTGTAAAATGGCCAAGAACAAGTCCAAGCGCGACGCTATTGCGTTGCCTGAAAATGTACCACCACCTCTGCAACTTTTCATTCATGTTGCAGCTGCTGAAGAGGGTCACCCTAAGGTTACTACTTACCTTGGCAACTATAACCTCTATGCCACCAAGGCTCCGCCTGGCGTGCAGGTTCTTAGTGCTAAAACCTCTCTTACTGACTTTGAGAATGTCTTTGGAGCTCAACCCACCTTGCGATCAATTCGTAATCTGGTTTGTGAGGCTCGCTCGGCTGAATGGACAACTTCCAAGAATGCTTTTGCACTCAAAGCCACTCAACTTGACTACTCTGATGCCGTTTTGAGGGCAATGATTCGTTTTTGCCCTCCAAAGGTGTCCACACTCGCTGCCTTTGCTCTTTTTGGCCGATTGGTTAAAATTGAGGACAAGGAACTTGCTGAGTTAGCTCGTAATACTGCCCTTGAGTTGGCGTACACGGCTAAAATTGGTACATCTCTTGCTGACACGAGATCTGTCTCACTTATTCATAAGGACGCTTATCTAACTCTCAGTAATGAGGTTGTTGGCGTAACTTTTACTGCCGCACTTATGGCAAAGGCTACCACTGTTAATGGAGCAATGCAATACTCAAACTTTTACCTCTACCCTCGTGCCACTATTAAGGTAACCGATGGTAAGGCTGAAGCAATTGCAACTAAGCCTCTGTCTGCTGCCACTAAAGGCAAGCAAATCACAGAGGATGTCAACCTTCTCCCTGACTATCAGCAGCTGCTTGTTGATCAAGTGACTGGCACTGAGGTTAAGGTTGGAGCTCTAACCTATGTTAAGACCACTGATTCGCCACCCCTTTACTTTCCCAAAGTCAAGGGTGGTGTTATTGGTATTGCACTTAAGCAGCAGGGCACTGCGGCTAAGAAGCTCAATGTAGTCTTCCATGCTCAACCTGATGATGTTCTGCTAGCCTTCATACAACTTCAGCAATTCTTGAACCGTACTTCGGATTCAAGTGTTGAAATTACTGATTGCCAGAGTTATGAAGTATCTCCAACTGTGACGGTCAAAATTGGCCCGTCTAAACCTGGGGATGTCATCGTGGCTACTGATGAGGAATACCTTAAATGCTTTGAAACCCCTGAGGTAGGTAGGCTCTATAAGGTTTTCCAAACTCAATCTTGGGCTATCATTGAGCGTTCCTTCTCCAGTTTGAAGATCCGCGTGTCCAAAGCTTTATCAGCATTTATAAGTTTTCTGCAAAACCTTGCAGATAACTTTACTGCAATAAGTGGTGTTGTCACTGCACTCATTCGTGAACTCCAGGATCTTACCCTGGATGTGGCGACACGTATCACTAACATACAATTTGTTTACCGTGCCGGTAAGCTTATTGTCGACACTACAAGTGTCATAGCTAAACTTTTCCAGCCATTCTGTGATTTTATATCACCTTTCCTTCGGAAAGTTGCTGGTTTTGCAATTTACACTGTTGGTAATCGCATGCTTATGTTTACCAGCACTGGCACCTTTCTTCTCACAAAGGCAACTACTAAGATACTCAATAAGGCAAAGTACATCTTTGATGTGGAGCCTGAGTACCCAGTAGATGTAACAACATCCAAAGTTGTAGTACATGAAGCACTCCAGCAAACCGACACTAAGCCTACTAGAGCTCTAGAGGCTGTTGATGTCGTTGTTGGTAATACTGTACTGCAAATGGCTACTGATGGCACTGCGTTCTACCCATCGGATGGTACGCACGCCTCTCTTCCAGGATTCAAAGCAGGCTCGGATGAGCTTTTTATAAGCTTCAACTGCGACCTCTTTGATGATGAGACTAATGCTCAAATCAACGAAACACTCGCTGCATATGAGCTTAACCAACTAGTGGCTCCAGGTGATTCTACACCGCGTCAAATTGCGACGTTGGTTGTCGATACACTTGCAGATGCTATAACAGACCACTTTCCGGAGAAAACCATTGATCTACCTGAAGACTATCAAGTCTTTTCTGACCATGATGACCTCCCACTCGCACAATACCACATCCCTGATCACCTGAGCCTGTATATTCAGGCTATGGAAGGTGAAGATGATAGTGGTGATGAAATATGTATTGAGGACGATGATTACGACTGTCCTCAAGCCGACGAAGACACAGAAGGAGTAATTCCCCAACAGTGGGAACTTCCTGATGTTGATAAATTTTTACTCAAGATCCAGGAACGGAAGACCAGCAGCGACGAAGTACTTAGCGTTGACGTCTATCCTAAACCAGAGCCAGTCGGCAATGTTGGGATTGACGACAGCGCGTCGGAAAAGAAGCCAAATGGGGACTCAGTACCGGATCCTGAGGTCCATCCAACACTAGAGAGTGTGGATGTTGAACGACCAACCGAAACAGCAAACCAGGCTGTTGAAGACAAACCTTCTGATACCACCTTTGTGGTTGATGAGGAACAATTACAAGAATCAACACCAGAACATGAACTCCGCTCCTATGAGGGGGAGTTTGATTCTGATGATGAAATTATTATTCCTATAGTACCAGTAACACCTGCGGATTTAAAACCACAGACTATTACTATAAAGGAGTACTTTAAGTCTGAAAAACTTGAGACTATTAACGAAGGATCCACAGAGTCAGTTACACAATCTGACGATTCGTTCGACGAGTCATTTGTTGATGCTGAGTCTGATGATCCACAAGATCCTGCTGTATATGATGATACAACAATTATAACGGACAGTACTGATGTAGGCGATGAGCCTGAGACAACTCTAGCTACCATCGTTAACACACCTCTGACACTCGATAATAACTTGCCACCTGAAGCCATTAAACAACCCAGCCCGACTAAGGTTGAGTTAGTTGTTGGTGAATTGGCGAGTATTAAATTTGACAATTCTGTCCTAGTCAACCCTGCTAATGCGCAATTAACAAATGGCGGTGGAGCTGCCCGTGCAATTGCAAAATTAGCTGGTCCAAAATATCAAGAGTACTGTAATAGTGTGGCTCCTATCTCAGGACCGCTTACCACGGACTCTTTTGATGCCAAGAAACTTGGTGTAGCCTGCATCTTGCATGTAGTGCCACCCAAAGGTTCTGACCCTAATGTACAAGAACTCCTGTATCAAGCTTACAAGAGTATCCTTACTGAACCAGCACACTATGTTATACCTATACTAGGTGCTGGTATCTTTGGATGCAACCCAGTCCACTCTCTGGATGCGTTCAGGAAAGCATGTCCAAGTGACATAGGTCGTGTGACCCTTGTCACTATGAACAAAAACCATTTGCAGGTGTGGGATGCTCTCAATAGGACCATTGTACGCACCACTACTGATTATGATCAAGTTACCACCAAGGCCCTTACACCCCAGGGAGTGTTAGAAGCCAATCTCTTTGATGGTGAGGACTTTGTTCAAGAACCAAAACCCGGTCAAATCTACCTTGAGGTTACTGAAGAAGTTCAGAACCAAGCCAAGGAACTTGACCTTAACCTTCAGCAATACTGCGTCTACCTGAAGACTTGCCACCATAAATGGGTTGTGAGTCGTACGAACGGGTTGATGCATCTAAAACAAAAAGATAACAATTGTTTTGTTAGTGCAGGTGTAAACCTGTTTCAAAACACTGCTTATCAACTTAGACCTGCTATTGATGCTCTCTATAGGGAGTATCTCAATGGTAATCCAAACAGATTTGTTGCTTGGATCTACGCATCCACTAACCGTCGTGTTGGTGAGATGGGTTGTCCACAGCAAGTTATTTCTTTGCTCGTTAGTAACTCTGACGCAGCATTTTCAGCAACTACAGCCTGTTGTAACACCTACTTTAACCACACAGGTGTTATTTCAGTAGCTCGTGAATATGACCCAATACAACCAAAGGTCTACTGCATGAAGTGTGATGTGTGGACTCCCTTTACACCCCAGAGTGGAAAAGGTGCAGTTGCAATTGGTACTTCTGCAGATGAACCTACCGGTCCTGCCATTAAATTTGCCGCAGCTCACTGCTGGTACACTAATGGCAAGAAAACAGTTAATGGCTATGACACTAAAGCTAATGTTGTAGCTACTTATCATAGGTTTGACGTGCCTAAGCCTCAACTTGTCGAGGACGTGGTTGCGCTGCCTACTAAAAATGACTTTGAAGTTCTCAATGTTGAAGAACTGCCGCAGGATAGTGTGCTCCATTTGGACCCACCTCCTGTACAGGCCTTACAACCTAAGGCTAACCAACACGTTGAGACTCTAGAAAACCCAGATTATCTGGACATTTTGGATCTTTGGATTCGTAAACCCAAATTCATCCTCGTAAAGTCGTGGAGTGTTTTGGGTAGAGCACTATGTAAGGCAGGTAAAGTTGTCTTTGTCAGTGCTTCGCTTTTGACCCGTTTCTACAATTACCTTGTAGAGATTGGTGCTCTTGACTCAGCAATAAGGTTGTCAATCGATCTTACCTGTAAATTTG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AGCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTCAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTCCAGAGAGTCGTAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTTTGTAGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCGCCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGCAAAAAAAAAAAAAAAA
| 4,225
|
KT381613.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Wang,L., Hayes,J., Sarver,C., Byrum,B., Zhang,Y.
|
Ohio Department of Agriculture, Animal Diseases Diagnostic Lab
|
USA
|
2015-10-19
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| 1
|
USA: Ohio
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2014-05-07
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain OH11846, complete genome
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| 85,183
|
KM012168.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Killian,M.L., Koster,L.G., Jenkins-Moore,M., Swenson,S.L.
|
National Veterinary Services Laboratories, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2014-09-24
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,411
|
GenBank
| null |
USA: Michigan
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2014-03-17
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain Michigan/8977/2014, complete genome
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GCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTGTTAAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTCCAGAGAGTCGTAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTTTGTGGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCGCCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGC
| 88,933
|
KJ620016.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Wang,L., Byrum,B., Zhang,Y.
|
Ohio Department of Agriculture, Animal Diseases Diagnostic Lab
|
USA
|
2014-06-07
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| 1
|
USA: Michigan
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2014-03-18
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain MI6148, complete genome
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TTTGAGATAAAGCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTGTTAAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTCCAGAGAGTCGTAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTTTGTAGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCGCCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGC
| 90,206
|
KJ584355.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Wang,L., Byrum,B., Zhang,Y.
|
Ohio Department of Agriculture, Animal Diseases Diagnostic Lab
|
USA
|
2014-06-03
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| 1
|
USA: Ohio
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2014-02-12
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain IL2768, complete genome
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TCGGGGTCATTTGTCTGCCAATAGTGCCCACTTTGCCCTTGCAAACCTAACCGATACACTCATAACACTTACCAATACTACTATATCGCAAATCACTTATTGTGATAAGTCAGTAGTTGATTCAATAGCATGCCAGCGCTCTTCTCACGAAGTGGAGGATGGGTTTTACTCCGACCCTAAATCTGCCGTTAGAGCTAGGCAACGTACTATTGTTACACTACCTAAGCTCCCTGAGCTTGAAGTAGTGCAGTTAAATATTTCTGCACACATGGATTTTGGCGAAGCCAGACTTGACAGCGTTACCATCAATGGTAACACATCCTATTGTGTCACTAAGCCTTACTTCAGGCTTGAAACTAACTTTATGTGTACAGGTTGCACTATGAATCTGCGCACTGATACCTGTAGTTTTGACCTGTCAGCAGTAAACAATGGCATGTCATTCTCTCAATTCTGTCTAAGCACTGAATCTGGTGCTTGTGAGATGAAAATTATTGTTACCTACGTATGGAATTACTTGCTAAGGCAGCGTTTGTATGTTACTGCTGTAGAGGGCCAGACTCACACTGGAACCACTTCAGTACATGCAACAGACACTTCTAGTGTAATCACTGATGTCTGCACTGACTACACTATCTATGGAGTCTCTGGTACTGGCATTATTAAGCCATCAGATCTCTTATTGCACAATGGCATAGCATTCACCTCTCCAACAGGTGAGCTTTATGCATTTAAAAATATAACCACTGGCAAAACCCTTCAGGTCTTACCGTGTGAAACCCCTTCTCAACTGATTGTGATAAACAACACCGTTGTCGGTGCTATCACATCCAGTAATTCAACTGAAAATAATAGGTTTACTACTACTATTGTCACACCTACTTTCTTTTATTCCACAAATGCCACCACTTTCAACTGCACTAAGCCTGTTTTGTCCTATGGACCTATCAGCGTGTGTAGTGATGGTGCAATTGTGGGAACATCCACATTACAGAATACTCGACCATCCATAGTTTCACTATACGATGGCGAAGTTGAAATACCATCTGCATTTTCTCTTTCCGTTCAGACGGAGTACTTGCAAGTTCAAGCAGAGCAAGTTATAGTTGATTGTCCTCAGTATGTATGCAATGGCAACAGCCGTTGTCTACAATTACTGGCACAATACACCTCAGCTTGCTCTAACATTGAAGCAGCTCTGCATTCCTCTGCACAGTTGGATAGCAGAGAGATTATAAATATGTTTCAAACATCAACACAGTCCTTGCAGTTAGCTAATATTACCAACTTCAAGGGTGACTACAATTTTAGCAGCATACTAACCACCAGAATTGGTGGCAGATCTGCTATTGAAGACCTTCTTTTTAATAAAGTTGTTACTAGTGGCCTTGGCACTGTTGATCAGGACTACAAATCCTGCTCTAGAGACATGGCCATCGCTGACTTAGTTTGTTCCCAGTATTACAATGGCATCATGGTTCTACCTGGTGTTGTTGATGCTGAGAAAATGGCAATGTATACTGGCTCTCTTACTGGAGCTATGGTATTTGGAGGACTGACTGCCGCAGCGGCAATACCATTTGCCACGGCAGTACAAGCTCGCCTCAATTATGTCGCACTGCAAACAAATGTACTACAAGAAAACCAGAAAATTCTTGCAGAATCATTTAACCAAGCAGTTGGCAATATATCACTTGCACTATCTTCTGTTAATGATGCCATCCAGCAAACTTCTGAGGCTCTTAACACCGTAGCTATTGCTATTAAAAAGATTCAAACAGTTGTTAACCAGCAGGGCGAGGCATTATCACACCTGACTGCACAGCTGTCAAACAATTTTCAAGCAATTTCGACTTCTATTCAAGACATTTACAATCGTCTTGAGGAAGTAGAGGCTAACCAGCAAGTTGACCGTCTCATCACAGGACGGTTGGCTGCACTTAATGCATATGTTACTCAGTTACTCAATCAGATGTCTCAGATTAGACAATCTCGATTGTTAGCTCAGCAAAAGATTAATGAGTGTGTCAAATCACAGTCGTCCAGATACGGTTTCTGTGGAAATGGCACACACATCTTCTCACTTACACAGACTGCACCAAATGGCATATTTTTCATGCATGCAGTGCTAGTACCCAACAAATTCACACGTGTCAACGCTTCTGCCGGCATTTGTGTGGATAATACGAGAGGCTACTCATTGCAGCCTCAACTTATACTCTACCAGTTTAATAACTCCTGGAGAGTTACACCTAGAAATATGTATGAACCCAGACTGCCCCGGCAGGCTGATTTCATACAATTAACTGATTGCAGCGTTACTTTTTACAACACCACCGCTGCTAATCTTCCCAATATTATCCCTGACATTATAGATGTCAATCAAACAGTCAGTGATATTATTGACAATTTACCTACAGCAACACCTCCTCAGTGGGATGTTGGTATCTATAACAACACTATTCTCAACCTCACCGTTGAGATTAATGATCTACAAGAGCGGTCTAAAAACCTCTCACAGATTGCAGATCGTTTACAAAATTATATTGACAATCTTAACAATACTCTAGTTGACCTTGAATGGCTCAACAGAGTGGAAACTTATCTTAAATGGCCGTGGTATATATGGCTTGCCATTGCCCTGGCTCTTATTGCATTTGTGACAATCCTCATAACAATCTTTCTTTGTACTGGTTGTTGTGGTGGTTGCTTTGGTTGTTGTGGCGGTTGTTTTGGCCTTTTCTCTAAGAAGAAAAGGTATACCGACGACCAACCAACACCGTCCTTTAAGTTTAAGGAATGGTAGTCGACGACTGGGCCGTTACCATCCCTGGACAATATATTATTGCTATACTAGTTGTCATCTGCATTGGTGTGGCACTACTTTTTATTAATACTTGCTTAGCTTGTGTTAAATTATTTTACAAGTGCTACCTAGGGGCAGCATATCTTGTTAGGCCTATTATAGTGTACTACTCCAAGCCGAACCCCGTACCTGAGGATGAGTTTGTAAAAGTACACCAATTTCCTAGAAACACTCACTATGTCTGACGCAGAAGAGTGGCAAATTATTGTTTTCATTGCGATCATATGGGCGCTTGGCGTCATCCTCCAGGGAGGCTATGCCACGCGTAATCGTGTGATCTATGTTATTAAACTTATTCTGCTTTGGCTGCTCCAACCCTTCACCCTAGTGGTGACCATTTGGACCGCAGTCGACAGATCATCTAAGAAGGACGCAGTTTTCATTGTGTCCATAATTTTTGCCGTACTGACCTTCATATCCTGGGCCAAGTACTGGTATGACTCAATTCGTTTATTAATGAAAACCAGATCTGCATGGGCACTCTCACCTGAGAGTAGACTCCTTGCAGGGATTATGGATCCAATGGGTACATGGAGGTGCATTCCCATCGACCACATGGCTCCAATTCTCACACCAGTCGTTAAGCATGGCAAGCTCAAGCTACATGGGCAAGAGCTGGCCAATGGCATATCAGTCAGAAATCCGCCACAGGATATGGTGATAGTGTCACCAAGTGACACCTTTCACTACACTTTTAAGAAACCTGTGGAATCAAACAACGATCCAGAATTTGCTGTTCTGATATACCAGGGTGACCGCGCTTCAAACGCTGGACTTCACACCATAACCACTTCAAAGGCCGGTGACGCTCGCCTGTATAAGTATATGTAATGTGCAACTGCCATCTGCAGCTGCGAGATTTATATAGATTGTGCAATAAGCGGCACATCAGAAGAGACGATGTTCCTGAGCTTATTGACCCTCTCGTTAAAACTCGCTGTTTTGCTTACAGTCTCGTGGTTCTTGCTAATGCTAATCCAATTGCATTTAGCATACTACCTCGGAAAATTCTTATCAATGGTGAGCCTTTACTGCTTGAATATGGTAGCATATATGGTAAAGACTTTATCATTCGACCATCGCTCCAAGTCATTCTTGAAGATGAATTAAATTAAAGTTTTGACACCAATCTATCATGGCTGCACCAGTAGTCCCTACTACTGACGCGTCTTGGTTTCAGGTGCTCAAAGCTCAAAACAAAAAGGCTACTCATCCTCAGTTTCGTGGCAATGGAGTTCCGCTTAACTCCGCCATCAAACCCGTTGAAAACCATGGCTACTGGCTGCGTTACACCAGACAAAAGCCAGGTGGTACTCCCATTCCTCCATCCTATGCCTTTTATTATACTGGCACAGGTCCCAGAGGAAATCTTAAGTATGGTGAACTCCCTCCTAATGATACCCCAGCAACCACTCGTGTTACTTGGGTTAAGGGTTCGGGAGCTGACACTTCTATTAAACCTCATGTTGCCAAACGCAACCCCAACAATCCTAAACATCAGCTGCTACCTCTCCGATTCCCAACCGGAGATGGCCCAGCTCAAGGTTTCAGAGTTGACCCCTTCAACGCTAGAGGAAGACCTCAGGAGCGTGGAAGTGGCCCAAGATCTCAATCTGTTAACTCCAGAGGCACAGGCAATCAGCCCAGGAAACGCGACCAATCTGCACCAGCTGCGGTACGTCGTAAGACCCAGCATCAAGCTCCCAAGCGGACTTTACCCAAGGGTAAAACCATTTCTCAGGTATTTGGCAACCGGTCTCGTACTGGTGCCAATGTCGGCTCTGCAGACACTGAGAAGACGGGTATGGCTGATCCTCGCATCATGGCTCTAGCCAGACATGTGCCTGGTGTTCAGGAAATGCTTTTCGCTGGCCACCTTGAGAGCAACTTTCAGGCGGGGGCAATTACCCTTACCTTCTCCTACTCAATCACAGTCAAGGAGGGTTCTCCTGACTATGAGAGACTTAAGGATGCGCTCAATACGGTCGTTAACCAGACCTATGAGCCACCTACCAAACCAACTAAGGACAAGAAGCCTGACAAACAAGACCAGTCTGCTAAACCCAAACAGCAGAAGAAACCTAAAAAGGTAACTCTGCCAGCAGACAAACAGGATTGGGAGTGGGATGATGCTTTTGAGATAAAGCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTGTTAAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTCCAGAGAGTCGTAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTTTGTGGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCGCCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGC
| 90,218
|
KJ584356.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Wang,L., Byrum,B., Zhang,Y.
|
Ohio Department of Agriculture, Animal Diseases Diagnostic Lab
|
USA
|
2014-06-03
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| 1
|
USA: South Dakota
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2014-02-20
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain SD3424, complete genome
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TTTGAGATAAAGCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTGTTCAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTCCAGAGAGTCGTAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTTTGTGGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCGCCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGC
| 90,219
|
KJ584357.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Wang,L., Byrum,B., Zhang,Y.
|
Ohio Department of Agriculture, Animal Diseases Diagnostic Lab
|
USA
|
2014-06-03
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| 1
|
USA: Kentucky
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2014-03-07
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain KY4813, complete genome
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TCGGGGTCATTTGTCTGCCAATAGTGCCCACTTTGCCCTTGCAAACCTAACCGATACACTCATAACACTTACCAATACTACTATATCGCAAATCACTTATTGTGATAAGTCAGTAGTTGATTCAATAGCATGCCAGCGCTCTTCTCACGAAGTGGAGGATGGGTTTTACTCCGACCCTAAATCTGCCGTTAGAGCTAGGCAACGTACTATTGTTACACTACCTAAGCTCCCTGAGCTTGAAGTAGTGCAGTTAAATATTTCTGCACACATGGATTTTGGCGAAGCCAGACTTGACAGCGTTACCATCAATGGTAACACATCCTATTGTGTCACTAAGCCTTACTTCAGGCTTGAAACTAACTTTATGTGTACAGGTTGCACTATGAATCTGCGCACTGATACCTGTAGTTTTGACCTGTCAGCAGTAAACAATGGCATGTCATTCTCTCAATTCTGTCTAAGCACTGAATCTGGTGCTTGTGAGATGAAAATTATTGTTACCTACGTATGGAATTACTTGCTAAGGCAGCGTTTGTATGTTACTGCTGTAGAGGGCCAGACTCACACTGGAACCACTTCAGTACATGCAACAGACACTTCTAGTGTAATCACTGATGTCTGCACTGACTACACTATCTATGGAGTCTCTGGTACTGGCATTATTAAGCCATCAGATCTCTTATTGCACAATGGCATAGCATTCACCTCTCCAACAGGTGAGCTTTATGCATTTAAAAATATAACCACTGGCAAAACCCTTCAGGTCTTACCGTGTGAAACCCCTTCTCAACTGATTGTGATAAACAACACCGTTGTCGGTGCTATCACATCCAGTAATTCAACTGAAAATAATAGGTTTACTACTACTATTGTCACACCTACTTTCTTTTATTCCACAAATGCCACCACTTTCAACTGCACTAAGCCTGTTTTGTCCTATGGACCTATCAGCGTGTGTAGTGATGGTGCAATTGTGGGAACATCCACATTACAGAATACTCGACCATCCATAGTTTCACTATACGATGGCGAAGTTGAAATACCATCTGCATTTTCTCTTTCCGTTCAGACGGAGTACTTGCAAGTTCAAGCAGAGCAAGTTATAGTTGATTGTCCTCAGTATGTATGCAATGGCAACAGCCGTTGTCTACAATTACTGGCACAATACACCTCAGCTTGCTCTAACATTGAAGCAGCTCTGCATTCCTCTGCACAGTTGGATAGCAGAGAGATTATAAATATGTTTCAAACATCAACACAGTCCTTGCAGTTAGCTAATATTACCAACTTCAAGGGTGACTACAATTTTAGCAGCATACTAACCACCAGAATTGGTGGCAGATCTGCTATTGAAGACCTTCTTTTTAATAAAGTTGTTACTAGTGGCCTTGGCACTGTTGATCAGGACTACAAATCCTGCTCTAGAGACATGGCCATCGCTGACTTAGTTTGTTCCCAGTATTACAATGGCATCATGGTTCTACCTGGTGTTGTTGATGCTGAGAAAATGGCAATGTATACTGGCTCTCTTACTGGAGCTATGGTATTTGGAGGACTGACTGCCGCAGCGGCAATACCATTTGCCACGGCAGTACAAGCTCGCCTCAATTATGTCGCACTGCAAACAAATGTACTACAAGAAAACCAGAAAATTCTTGCAGAATCATTTAACCAAGCAGTTGGCAATATATCACTTGCACTATCTTCTGTTAATGATGCCATCCAGCAAACTTCTGAGGCTCTTAACACCGTAGCTATTGCTATTAAAAAGATTCAAACAGTTGTTAACCAGCAGGGCGAGGCATTATCACACCTGACTGCACAGCTGTCAAACAATTTTCAAGCAATTTCGACTTCTATTCAAGACATTTACAACCGTCTTGAGGAAGTAGAGGCTAACCAGCAAGTTGACCGTCTCATCACAGGACGGTTGGCTGCACTTAATGCATATGTTACTCAGTTACTCAATCAGATGTCTCAGATTAGACAATCTCGATTGTTAGCTCAGCAAAAGATTAATGAGTGTGTCAAATCACAGTCGTCCAGATACGGTTTCTGTGGAAATGGCACACACATCTTCTCACTTACACAGACTGCACCAAATGGCATATTTTTCATGCATGCAGTGCTAGTACCCAACAAATTCACACGTGTCAACGCTTCTGCCGGCATTTGTGTGGATAATACGAGAGGCTACTCATTGCAGCCTCAACTTATACTCTACCAGTTTAATAACTCCTGGAGAGTTACACCTAGAAATATGTATGAACCCAGACTGCCCCGGCAGGCTGATTTCATACAATTAACTGATTGCAGCGTTACTTTTTACAACACCACCGCTGCTAATCTTCCCAATATTATCCCTGACATTATAGATGTCAATCAAACAGTCAGTGATATTATTGACAATTTACCTACAGCAACACCTCCTCAGTGGGATGTTGGTATCTATAACAACACTATTCTCAACCTCACCGTTGAGATTAATGATCTACAAGAGCGGTCTAAAAACCTCTCACAGATTGCAGATCGTTTACAAAATTATATTGACAATCTTAACAATACTCTAGTTGAACTTGAATGGCTCAACAGAGTGGAAACTTACCTTAAATGGCCGTGGTATATATGGCTTGCCATTGCCCTGGCTCTTATTGCATTTGTGACAATCCTCATAACAATCTTTCTTTGTACTGGTTGTTGTGGTGGTTGCTTTGGTTGTTGTGGCGGTTGTTTTGGCCTTTTCTCTAAGAAGAAAAGGTATACCGACGACCAACCAACACCGTCCTTTAAGTTTAAGGAATGGTAGTCGACGACTGGGCCGTTACCATCCCTGGACAATATATTATTGCTATACTAGTTGTCATCTGCATTGGTGTGGCACTACTTTTTATTAATACTTGCTTAGCTTGTGTTAAATTATTTTACAAGTGCTACCTAGGGGCAGCATATCTTGTTAGGCCTATTATAGTGTACTACTCCAAGCCGAACCCCGTACCTGAGGATGAGTTTGTAAAAGTACACCAATTTCCTAGAAACACTCACTATGTCTGACGCAGAAGAGTGGCAAATTATTGTTTTCATTGCGATCATATGGGCGCTTGGCGTCATCCTCCAGGGAGGCTATGCCACGCGTAATCGTGTGATCTATGTTATTAAACTTATTCTGCTTTGGCTGCTCCAACCCTTCACCCTAGTGGTGACCATTTGGACCGCAGTCGACAGATCATCTAAGAAGGACGCAGTTTTCATTGTGTCCATAATTTTTGCCGTACTGACCTTCATATCCTGGGCCAAGTACTGGTATGACTCAATTCGTTTATTAATGAAAACCAGATCTGCATGGGCACTCTCACCTGAGAGTAGACTCCTTGCAGGGATTATGGATCCAATGGGTACATGGAGGTGCATTCCCATCGACCACATGGCTCCAATTCTCACACCAGTCGTTAAGCATGGCAAGCTCAAGCTACATGGGCAAGAGCTGGCCAATGGCATATCAGTCAGAAATCCGCCACAGGATATGGTGATAGTGTCACCAAGTGACACCTTTCACTACACTTTTAAGAAACCTGTGGAATCAAACAACGATCCAGAATTTGCTGTTCTGATATACCAGGGTGACCGCGCTTCAAACGCTGGACTTCACACCATAACCACTTCAAAGGCCGGTGACGCTCGCCTGTATAAGTATATGTAATGTGCAACTGCCATCTGCAGCTGCGAGATTTATATAGATTGTGCAATAAGCGGCACATCAGAAGAGAGGATGTTCCTGAGCTTATTGACCCTCTCGTTAAAACTCGCTGTTTTGCTTACAGTCTCGTGGTTCTTGCTAATGCTAATCCAATTGCATTTAGCATACTACCTCGGAAAATTCTTATCAATGGTGAGCCTTTACTGCTTGAATATGGTAGCATATATGGTAAAGACTTTATCATTCGACCATCGCTCCAAGTCATTCTTGAAGATGAATTAAATTAAAGTTTTGACACCAATCTATCATGGCTGCACCAGTAGTCCCTACTACTGACGCGTCTTGGTTTCAGGTGCTCAAAGCTCAAAACAAAAAGGCTACTCATCCTCAGTTTCGTGGCAATGGAGTTCCGCTTAACTCCGCCATCAAACCCGTTGAAAACCATGGCTACTGGCTGCGTTACACCAGACAAAAGCCAGGTGGTACTCCCATTCCTCCATCCTATGCCTTTTATTATACTGGCACAGGTCCCAGAGGAAATCTTAAGTATGGTGAACTCCCTCCTAATGATACCCCAGCAACCACTCGTGTTACTTGGGTTAAGGGTTCGGGAGCTGACACTTCTATTAAACCTCATGTTGCCAAACGCAACCCCAACAATCCTAAACATCAGCTGCTACCTCTCCGATTCCCAACCGGAGATGGCCCAGCTCAAGGTTTCAGAGTTGACCCCTTCAACGCTAGAGGAAGACCTCAGGAGCGTGGAAGTGGCCCAAGATCTCAATCTGTTAACTCCAGAGGCACAGGCAATCAGCCCAGGAAACGCGACCAATCTGCACCAGCTGCGGTACGTCGTAAGACCCAGCATCAAGCTCCCAAGCGGACTTTACCCAAGGGTAAAACCATTTCTCAGGTATTTGGCAACCGGTCTCGTACTGGTGCCAATGTCGGCTCTGCAGACACTGAGAAGACGGGTATGGCTGATCCTCGCATCATGGCTCTAGCCAGACATGTGCCTGGTGTTCAGGAAATGCTTTTCGCTGGCCACCTTGAGAGCAACTTTCAGGCGGGGGCAATTACCCTTACCTTCTCCTACTCAATCACAGTCAAGGAGGGTTCTCCTGACTATGAGAGACTTAAGGATGCGCTCAATACGGTCGTTAACCAGACCTATGAGCCACCTACCAAACCAACTAAGGACAAGAAGCCTGACAAACAAGACCAGTCTGCTAAACCCAAACAGCAGAAGAAACCTAAAAAGGTAACTCTGCCAGCAGACAAACAGGATTGGGAGTGGGATGATGCTTTTGAGATAAAGCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTGTTAAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTCCAGAGAGTCATAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTTTGTGGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCGCCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGC
| 90,220
|
KJ584358.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Wang,L., Byrum,B., Zhang,Y.
|
Ohio Department of Agriculture, Animal Diseases Diagnostic Lab
|
USA
|
2014-06-03
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| 1
|
USA: Pennsylvania
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2014-02-18
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain PA3148, complete genome
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TCGGGGTCATTTGTCTGCCAATAGTGCCCACTTTGCCCTTGCAAACCTAACCGATACACTCATAACACTTACCAATACTACTATATCGCAAATCACTTATTGTGATAAGTCAGTAGTTGATTCAATAGCATGCCAGCGCTCTTCTCACGAAGTGGAGGATGGGTTTTACTCCGACCCTAAATCTGCCGTTAGAGCTAGGCAACGTACTATTGTTACACTACCTAAGCTCCCTGAGCTTGAAGTAGTGCAGTTAAATATTTCTGCACACATGGATTTTGGCGAAGCCAGACTTGACAGCGTTACCATCAATGGTAACACATCCTATTGTGTCACTAAGCCTTACTTCAGGCTTGAAACTAACTTTATGTGTACAGGTTGCACTATGAATCTGCGCACTGATACCTGTAGTTTTGACCTGTCAGCAGTAAACAATGGCATGTCATTCTCTCAATTCTGTCTAAGCACTGAATCTGGTGCTTGTGAGATGAAAATTATTGTTACCTACGTATGGAATTACTTGCTAAGGCAGCGTTTGTATGTTACTGCTGTAGAGGGCCAGACTCACACTGGAACCACTTCAGTACATGCAACAGACACTTCTAGTGTAATCACTGATGTCTGCACTGACTACACTATCTATGGAGTCTCTGGTACTGGCATTATTAAGCCATCAGATCTCTTATTGCACAATGGCATAGCATTCACCTCTCCAACAGGTGAGCTTTATGCATTTAAAAATATAACCACTGGCAAAACCCTTCAGGTCTTACCGTGTGAAACCCCTTCTCAACTGATTGTGATAAACAACACCGTTGTCGGTGCTATCACATCCAGTAATTCAACTGAAAATAATAGGTTTACTACTACTATTGTCACACCTACTTTCTTTTATTCCACAAATGCCACCACTTTCAACTGCACTAAGCCTGTTTTGTCCTATGGACCTATCAGCGTGTGTAGTGATGGTGCAATTGTGGGAACATCCACATTACAGAATACTCGACCATCCATAGTTTCACTATACGATGGCGAAGTTGAAATACCATCTGCATTTTCTCTTTCCGTTCAGACGGAGTACTTGCAAGTTCAAGCAGAGCAAGTTATAGTTGATTGTCCTCAGTATGTATGCAATGGCAACAGCCGTTGTCTACAATTACTGGCACAATACACCTCAGCTTGCTCTAACATTGAAGCAGCTCTGCATTCCTCTGCACAGTTGGATAGCAGAGAGATTATAAATATGTTTCAAACATCAACACAGTCCTTGCAGTTAGCTAATATTACCAACTTCAAGGGTGACTACAATTTTAGCAGCATACTAACCACCAGAATTGGTGGCAGATCTGCTATTGAAGACCTTCTTTTTAATAAAGTTGTTACTAGTGGCCTTGGCACTGTTGATCAGGACTACAAATCCTGCTCTAGAGACATGGCCATCGCTGACTTAGTTTGTTCCCAGTATTACAATGGCATCATGGTTCTACCTGGTGTTGTTGATGCTGAGAAAATGGCAATGTATACTGGCTCTCTTACTGGAGCTATGGTATTTGGAGGACTGACTGCCGCAGCGGCAATACCATTTGCCACGGCAGTACAAGCTCGCCTCAATTATGTCGCACTGCAAACAAATGTACTACAAGAAAACCAGAAAATTCTTGCAGAATCATTTAACCAAGCAGTTGGCAATATATCACTTGCACTATCTTCTGTTAATGATGCCATCCAGCAAACTTCTGAGGCTCTTAACACCGTAGCTATTGCTATTAAAAAGATTCAAACAGTTGTTAACCAGCAGGGCGAGGCATTATCACACCTGACTGCACAGCTGTCAAACAATTTTCAAGCAATTTCGACTTCTATTCAAGACATTTACAACCGTCTTGAGGAAGTAGAGGCTAACCAGCAAGTTGACCGTCTCATCACAGGACGGTTGGCTGCACTTAATGCATATGTTACTCAGTTACTCAATCAGATGTCTCAGATTAGACAATCTCGATTGTTAGCTCAGCAAAAGATTAATGAGTGTGTCAAATCACAGTCGTCCAGATACGGTTTCTGTGGAAATGGCACACACATCTTCTCACTTACACAGACTGCACCAAATGGCATATTTTTCATGCATGCAGTGCTAGTACCCAACAAATTCACACGTGTCAACGCTTCTGCCGGCATTTGTGTGGATAATACGAGAGGCTACTCATTGCAGCCTCAACTTATACTCTACCAGTTTAATAACTCCTGGAGAGTTACACCTAGAAATATGTATGAACCCAGACTGCCCCGGCAGGCTGATTTCATACAATTAACTGATTGCAGCGTTACTTTTTACAACACCACCGCTGCTAATCTTCCCAATATTATCCCTGACATTATAGATGTTAATCAAACAGTCAGTGATATTATTGACAATTTACCTACAGCAACACCTCCTCAGTGGGATGTTGGTATCTATAACAACACTATTCTCAACCTCACCGTTGAGATTAATGATCTACAAGAGCGGTCTAAAAACCTCTCACAGATTGCAGATCGTTTACAAAATTATATTGACAATCTTAACAATACTCTAGTTGACCTTGAATGGCTCAACAGAGTGGAAACTTACCTTAAATGGCCGTGGTATATATGGCTTGCCATTGCCCTGGCTCTTATTGCATTTGTGACAATCCTCATAACAATCTTTCTTTGCACTGGTTGTTGTGGTGGTTGCTTTGGTTGTTGTGGCGGTTGTTTTGGCCTTTTCTCTAAGAAGAAAAGGTATACCGACGACCAACCAACACCGTCCTTTAAGTTTAAGGAATGGTAGTCGACGACTGGGCCGTTACCATCCCTGGACAATATATTATTGCTATACTAGTTGTCATCTGCATTGGTGTGGCACTACTTTTTATTAATACTTGCTTAGCTTGTGTTAAATTATTTTACAAGTGCTACCTAGGGGCAGCATATCTTGTTAGGCCTATTATAGTGTACTACTCCAAGCCGAACCCCGTACCTGAGGATGAGTTTGTAAAAGTACACCAATTTCCTAGAAACACTCACTATGTCTGACGCAGAAGAGTGGCAAATTATTGTTTTCATTGCGATCATATGGGCGCTTGGCGTCATCCTCCAGGGAGGCTATGCCACGCGTAATCGTGTGATCTATGTTATTAAACTTATTCTGCTTTGGCTGCTCCAACCCTTCACCCTAGTGGTGACCATTTGGACCGCAGTCGACAGATCATCTAAGAAGGACGCAGTTTTCATTGTGTCCATAATTTTTGCCGTACTGACCTTCATATCCTGGGCCAAGTACTGGTATGACTCAATTCGTTTATTAATGAAAACCAGATCTGCATGGGCACTCTCACCTGAGAGTAGACTCCTTGCAGGGATTATGGATCCAATGGGTACATGGAGGTGCATTCCCATCGACCACATGGCTCCAATTCTCACACCAGTCGTTAAGCATGGCAAGCTCAAGCTACACGGGCAAGAGCTGGCCAATGGCATATCAGTCAGAAATCCGCCACAGGATATGGTGATAGTGTCACCAAGTGACACCTTTCACTACACTTTTAAGAAACCTGTGGAATCAAACAACGATCCAGAATTTGCTGTTCTGATATATCAGGGTGACCGCGCTTCAAACGCTGGACTTCACACCATAACCACTTCAAAGGCCGGTGACGCTCGCCTGTATAAGTATATGTAATGTGCAACTGCCATCTGCAGCTGCGAGATTTATATAGATTGTGCAATAAGCGGCACATCAGAAGAGAGGATGTTCCTGAGCTTATTGACCCTCTCGTTAAAACTCGCTGTTTTGCTTACAGTCTCGTGGTTCTTGCTAATGCTAATCCAATTGCATTTAGCATACTACCTCGGAAAATTCTTATCAATGGTGAGCCTTTACTGCTTGAATATGGTAGCATATATGGTAAAGACTTTATCATTCGACCATCGCTCCAAGTCATTCTTGAAGATGAATTAAATTAAAGTTTTGACACCAATCTATCATGGCTGCACCAGTAGTCCCTACTACTGACGCGTCTTGGTTTCAGGTGCTCAAAGCTCAAAACAAAAAGGCTACTCATCCTCAGTTTCGTGGCAATGGAGTTCCGCTTAACTCCGCCATCAAACCCGTTGAAAACCATGGCTACTGGCTGCGTTACACCAGACAAAAGCCAGGTGGTACTCCCATTCCTCCATCCTATGCCTTTTATTATACTGGCACAGGTCCCAGAGGAAATCTTAAGTATGGTGAACTCCCTCCTAATGATACCCCAGCAACCACTCGTGTTACTTGGGTTAAGGGTTCGGGAGCTGACACTTCTATTAAACCTCATGTTGCCAAACGCAACCCCAACAATCCTAAACATCAGCTGCTACCTCTCCGATTCCCAACCGGAGATGGCCCAGCTCAAGGTTTCAGAGTTGACCCCTTCAACGCTAGAGGAAGACCTCAGGAGCGTGGAAGTGGCCCAAGATCTCAATCTGTTAACTCCAGAGGCACAGGCAATCAGCCCAGGAAACGCGACCAATCTGCACCAGCTGCGGTACGTCGTAAGACCCAGCATCAAGCTCCCAAGCGGACTTTACCCAAGGGTAAAACCATTTCTCAGGTATTTGGCAACCGGTCTCGTACTGGTGCCAATGTCGGCTCTGCAGACACTGAGAAGACGGGTATGGCTGATCCTCGCATCATGGCTCTAGCCAGACATGTGCCTGGTGTTCAGGAAATGCTTTTCGCTGGCCACCTTGAGAGCAACTTTCAGGCGGGGGCAATTACCCTTACCTTCTCCTACTCAATCACAGTCAAGGAGGGTTCTCCTGACTATGAGAGACTTAAGGATGCGCTCAATACGGTCGTTAACCAGACCTATGAGCCACCTACCAAACCAACTAAGGACAAGAAGCCTGACAAACAAGACCAGTCTGCTAAACCCAAACAGCAGAAGAAACCTAAAAAGGTAACTCTGCCAGCAGACAAACAGGATTGGGAGTGGGATGATGCTTTTGAGATAAAGCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTGTTAAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTCCAGAGAGTCGTAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTTTGTGGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCGCCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGC
| 90,221
|
KJ584359.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Wang,L., Byrum,B., Zhang,Y.
|
Ohio Department of Agriculture, Animal Diseases Diagnostic Lab
|
USA
|
2014-06-03
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| 1
|
USA: Nebraska
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2014-02-21
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain NE3579, complete genome
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TTTGAGATAAAGCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTGTTAAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTCCAGAGAGTCGTAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTTTGTGGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCGCCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGC
| 90,222
|
KJ462462.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Wang,L., Byrum,B., Zhang,Y.
|
Ohio Department of Agriculture, Animal Diseases Diagnostic Lab
|
USA
|
2014-03-30
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| 1
|
USA: Ohio
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2014-01-31
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain OH1987, complete genome
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TTTGAGATAAAGCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTGTTAAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTCCAGAGAGTCGTAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTTTGTAGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCGCCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGC
| 91,275
|
KJ569769.1
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Wang,L., Zhang,Y., Byrum,B.
|
Ohio Department of Agriculture, Animal Diseases Diagnostic Lab
|
USA
|
2014-03-30
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| 1
|
USA: Ohio
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2014-02-13
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain IN2847, complete genome
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TTTGAGATAAAGCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTGTTAAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTCCAGAGAGTCGTAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTTTGTGGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCGCCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGC
| 91,276
|
JQ065042.2
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Woo,P.C., Lau,S.K., Lam,C.S., Lau,C.C., Tsang,A.K., Lau,J.H., Bai,R., Teng,J.L., Tsang,C.C., Wang,M., Zheng,B.J., Chan,K.H., Yuen,K.Y., Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Lam,C.S.F., Lau,C.C.Y., Tsang,A.K.L., Lau,J.H.N., Teng,J.L.L., Tsang,C.C.C., Zheng,B.-J., Chan,K.-H., Yuen,K.-Y.
|
The University of Hong Kong, Department of Microbiology
|
China
|
2012-03-19
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,430
|
GenBank
| 1
|
China: Hong Kong
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2009
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain HKU15-44, complete genome
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| 97,401
|
JQ065043.2
|
Porcine coronavirus HKU15
|
Woo,P.C., Lau,S.K., Lam,C.S., Lau,C.C., Tsang,A.K., Lau,J.H., Bai,R., Teng,J.L., Tsang,C.C., Wang,M., Zheng,B.J., Chan,K.H., Yuen,K.Y., Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Lam,C.S.F., Lau,C.C.Y., Tsang,A.K.L., Lau,J.H.N., Teng,J.L.L., Tsang,C.C.C., Zheng,B.-J., Chan,K.-H., Yuen,K.-Y.
|
The University of Hong Kong, Department of Microbiology
|
China
|
2012-03-19
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,425
|
GenBank
| 1
|
China: Hong Kong
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2010
| null | null |
Porcine coronavirus HKU15 strain HKU15-155, complete genome
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| 97,402
|
PP130097.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Zhou,J., Sun,D.
|
University
|
China
|
2024-01-24
|
HD2023
|
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,402
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null | null | null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate HD2023, complete genome
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| 9,510
|
OR672111.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Su,M., Wang,Y.
|
Shanxi Agricultural University, School of Animal Medicine
|
China
|
2023-11-19
|
CHN-HN-2023
|
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,381
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2023
| null | null |
UNVERIFIED: Porcine deltacoronavirus isolate CHN-HN-2023, complete genome
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| 10,812
|
OR762053.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Mingjun,S., Xiaoxu,D.
|
College of Animal Science and Technology & College of Veterinary Medicine, Zhejiang A&F University
|
China
|
2023-11-13
|
ZD2022
|
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,402
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2022-06
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate ZD2022, complete genome
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| 11,080
|
OR230676.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Zhang,J., Liu,Z.
|
Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Institute of Animal Health
|
China
|
2023-09-20
|
HeN17
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Coronavirus HKU15
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Deltacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,420
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate HeN17, complete genome
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| 12,772
|
OP501870.1
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Porcine deltacoronavirus
|
Guo,Z.
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Henan Academy of Agricultural Sciences, Henan Provincial Key Laboratory of Animal Immunology
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China
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2023-09-15
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CHN-HeN06-2022
|
Coronavirus HKU15
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Deltacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 25,403
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2022-05-10
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate CHN-HeN06-2022, complete genome
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| 12,966
|
OQ790128.1
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Porcine deltacoronavirus
|
Li,K., Luo,R.
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Huazhong Agriculture University, College of Animal Sciences and Technology/College of Veterinary Medicine
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China
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2023-08-08
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PDCoV-KQ-Swine-2023
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Coronavirus HKU15
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Deltacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 25,402
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2023-02-15
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate PDCoV-KQ-Swine-2023, complete genome
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| 14,115
|
OQ790129.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Li,K., Luo,R.
|
Huazhong Agriculture University, College of Animal Sciences and Technology/College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-08
|
PDCoV-SN-Swine-2018
|
Coronavirus HKU15
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Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,389
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-11-03
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate PDCoV-SN-Swine-2018, complete genome
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| 14,116
|
OR269935.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Li,K., Luo,R.
|
Huazhong Agriculture University, College of Animal Sciences and Technology/College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-07-26
|
PDCoV/WH/2023
|
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,402
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2023-05-15
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate PDCoV/WH/2023, complete genome
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| 14,560
|
OQ473581.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Wang,Z., Sun,M., Liang,X., Bai,J., Liu,X., Wang,X., Jiang,P.
|
Nanjing Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-07-18
| null |
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,435
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
abdominal cavity
|
2022
| null | null |
Porcine deltacoronavirus strain JS2021-LX, complete genome
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| 14,649
|
OR122653.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Zhang,Y., Hu,H.
|
Henan Agricultural University, Key Laboratory for Animal-Derived Food Safety of Henan Province
| null |
2023-07-04
|
HNZK-02-P120
|
Coronavirus HKU15
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Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,425
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021-10-04
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate HNZK-02-P120, complete genome
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| 14,797
|
OR122654.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Zhang,Y., Hu,H.
|
Henan Agricultural University, Key Laboratory for Animal-Derived Food Safety of Henan Province
| null |
2023-07-04
|
HNZK-02-P150
|
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,425
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2022-10-20
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate HNZK-02-P150, complete genome
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| 14,798
|
OQ718500.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Kim,H.R., Park,J., Lee,K.K., Jeoung,H.Y., Lyoo,Y.S., Park,S.C., Park,C.K., Kim,H.-R., Lee,K.-K., Park,C.-K.
|
Kyungpook National University, College of Veterinary Medicine
|
South Korea
|
2023-06-12
|
KPDCoV-2201
|
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Sus scrofa
| null |
2022
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate KPDCoV-2201 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), spike protein (S), envelope protein (E), membrane protein (M), nonstructural protein (NS6), nucleocapsid protein (N), and nonstructural protein (NS7) genes, complete cds
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TTTGAGATAAAGCAGGAATCAGCAGCGTAGACATCAATCTATGTCTGTCTAACCCACCCAACTCCACTCAAATATCTCTTTGGTTTCAGAGAGTCATAGTGTATAGCCAGAGAGCCAGTCAGAGGGCGCTATCATGCAAACTAGGGCTGGCTACTCTAGCACAGAATCACATCCCGATAATCAACAGTGCTAGAAGGTTGATTATACCATTTAATATGCCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGGGTACAGCATAATCTCAACTTTTGTTGAGCCACAATTTTAATCCTAATTGGAGAAGGCCAAAGGACTGTACTACTTCTGTAGGTGTAGCAGTCGCCCAGTGGGAAAGCACCAACTAGGTTACAATTGTGGTGGGGACAAATTAGGGGAAATTAAATTGGCTTATAGGGGGGATGGAGC
| 15,202
|
OP792038.1
|
Porcine deltacoronavirus
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Jia,X., Li,J.
|
Huazhong Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-05-30
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PDCoV WH-A
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Coronavirus HKU15
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Deltacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 25,424
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2020-12
| null | null |
UNVERIFIED: Porcine deltacoronavirus isolate PDCoV WH-A, complete genome
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| 15,522
|
OQ736716.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Cheng,Y., Mou,C., Shi,K., Chen,Z.
|
Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
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China
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2023-04-19
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PDCoV-GX2022-2
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Coronavirus HKU15
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Deltacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 25,355
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2022
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate PDCoV-GX2022-2, complete genome
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| 16,654
|
OQ736717.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Chch,Y., Mou,C., Shishi,K., Chen,Z.
|
Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
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China
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2023-04-19
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PDCoV-GX2022-1
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Coronavirus HKU15
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Deltacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 25,360
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate PDCoV-GX2022-1, complete genome
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| 16,655
|
OQ566226.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Lee,D., Jang,G., Lee,C.
|
Gyeongsang National University, College of Veterinary Medicine and Virus Vaccine Research Center
|
South Korea
|
2023-03-20
|
GNU-2105
|
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Sus scrofa
| null |
2021
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate GNU-2105, complete genome
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| 17,341
|
OQ566227.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Lee,D., Jang,G., Lee,C.
|
Gyeongsang National University, College of Veterinary Medicine and Virus Vaccine Research Center
|
South Korea
|
2023-03-20
|
GNU-2105-P1
|
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Sus scrofa
| null |
2021
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate GNU-2105-P1, complete genome
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| 17,342
|
OQ566228.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Lee,D., Jang,G., Lee,C.
|
Gyeongsang National University, College of Veterinary Medicine and Virus Vaccine Research Center
|
South Korea
|
2023-03-20
|
GNU-2105-P5
|
Coronavirus HKU15
|
Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Sus scrofa
| null |
2021
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate GNU-2105-P5, complete genome
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| 17,343
|
OQ547740.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Pan,S., Cheng,Y., Shi,K., Mou,C., Chen,Z.
|
Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
|
China
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2023-03-14
|
PDCoV-GX2021-1
|
Coronavirus HKU15
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Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 25,422
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021
| null | null |
Porcine deltacoronavirus isolate PDCoV-GX2021-1, complete genome
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| 17,584
|
OQ551110.1
|
Porcine deltacoronavirus
|
Li,C., Miao,D., Zhou,Z., Wei,X.
|
Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Institute of Animal Husbandry and Veterinary Science
|
China
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2023-03-14
|
CHN-JS-2018
|
Coronavirus HKU15
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Deltacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 25,458
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-02-27
| null | null |
Porcine deltacoronavirus strain CHN-JS-2018 complete genome
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| 17,585
|
NC_003436.1
|
Porcine epidemic diarrhea virus
|
Kocherhans,R., Bridgen,A., Ackermann,M., Tobler,K., Carvajal,A., Duarte,M., Rasschaert,D., Laude,H.
|
University of Zurich, Virologisches Institut, Vet. Med. Fak.
|
Switzerland
|
2001-04-23
| null |
Porcine epidemic diarrhea virus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,033
|
RefSeq
| 5
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Porcine epidemic diarrhea virus, complete genome
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GTTGGCAGCGCGTTTTGCTGTCGTCTTTCTCTATTGCCCACTTTTATATTACTGTGGTGCACTTTTAGATGCAACTATTATTTGTTGCGCACTTATTGGCAGGCTTTGTTTAGTCTGCTTTTACTCCTGGCGCTATAAAAATGCGCTTTTTATTATCTTTAATACTACGACACTTTCTTTTCTCAATGGTAAAGCAGCTTATTATGACGGCAAATCCATTGTGATTCTAGAAGGTGGCGACCATTACATCACTTTTGGCAACTCTTTTGTTGCTTTCGTTAGTAACATTGACTTGTATCTAGCTATACGTGGGCGGCAAGAAGCTGACCTACATCTGTTGCGAACTGTTGAGCTTCTTGATGGCAAGAAGCTTTATGTCTTTTCGCAACATCAAATTGTTGGCATTACTAATGCTGCATTTGACTCAATTCAACTAGACGAGTATGCTACAATTAGTGAATGATAATGGTCTAGTAGTTAATGTTATACTTTGGCTTTTCGTACTCTTTTTCCTGCTTATTATAAGCATTACCTTCGTCCAATTGGTTAATCTGTGCTTCACTTGTCACCGGTTGTGTAATAGCGCAGTTTATACACCTATAGGGCGCCTGTATAGAGTTTATAAGTCTTACATGCGAATTGACCCCCTCCCCAGTACTGTTATTGACGTATAAACGAAATATGTCTAACGGTTCTATTCCCGTTGATGAGGTGATTGAACACCTTAGAAACTGGAATTTCACATGGAATATCATACTGACGATACTACTTGTAGTGCTTCAGTATGGCCATTACAAGTACTCTGTGTTCTTGTATGGTGTCAAGATGGCTATTCTATGGATACTTTGGCCTCTTGTGTTGGCACTGTCACTTTTTGACGCATGGGCTAGCTTCCAGGTCAACTGGGTCTTTTTCGCTTTCAGCATCCTTATGGCTTGCATCACTCTTATGCTGTGGATAATGTATTTTGTCAATAGCATTCGGTTGTGGCGCAGGACACATTCTTGGTGGTCTTTCAATCCTGAAACTGACGCGCTTCTCACTACTTCTGTGATGGGCCGACAGGTCTGCATTCCAGTGCTTGGAGCACCAACTGGTGTAACGCTAACACTCCTTAGTGGTACATTGCTTGTAGAGGGCTATAAGGTTGCTACTGGCGTACAGGTAAGTCAATTACCTAATTTCGTCACAGTCGCCAAGGCCACTACAACAATTGTCTACGGACGTGTTGGTCGTTCAGTCAATGCTTCATCTGGCACTGGTTGGGCTTTCTATGTCCGGTCAAAACACGGCGACTATTCAGCTGTGAGTAATCCGAGTGCGGTTCTCACAGATAGTGAGAAAGTGCTTCATTTAGTCTAAACAGAAACTTTATGGCTTCTGTCAGCTTTCAGGATCGTGGCCGCAAACGGGTGCCATTATCTCTCTATGCCCCTCTTAGGGTTACTAATGACAAGCCCCTTTCTAAGGTACTTGCAAACAACGCTGTACCCACTAACAAGGGGAATAAGGACCAGCAAATTGGGTACTGGAATGAGCAAATTCGCTGGCGCATGCGCCGTGGTGAGCGAATTGAACAACCTTCCAATTGGCATTTCTACTACCTCGGAACAGGACCTCACGGCGACCTCCGTTATAGGACTCGTACTGAGGGTGTTTTCTGGGTTGCTAAAGAAGGCGCAAAGACTGAACCCACTAATTTGGGTGTCAGAAAGGCGTCTGAAAAGCCAATCATTCCAAAATTCTCTCAACAGCTCCCCAGTGTAGTTGAGATTGTTGAACCTAACACACCTCCTGCTTCACGTGCAAATTCGCGTAGCAGGAGTCGTGGCAATGGCAACAATAGGTCTAGATCTCCAAGTAACAACAGAGGCAATAACCAGTCCCGTGGTAATTCACAGAATCGTGGAAATAACCAGGGTCGTGGAGCTTCTCAGAACAGAGGAGGCAATAATAATAACAATAACAAGTCTCGTAACCAGTCCAATAACAGGAACCAGTCAAATGACCGTGGTGGTGTAACATCACGCGATGATCTGGTGGCTGCTGTCAAGGATGCACTTAAATCTTTGGGTATTGGAGAAAATCCTGACAGGCATAAGCAACAGCAGAAGCCTAAGCAGGAAAAGTCTGACAACAGCGGCAAAAATACACCTAAGAAGAACAAATCCAGGGCCACTTCGAAGGAACGTGACCTCAAAGACATCCCAGAGTGGAGGAGAATTCCCAAGGGCGAAAATAGCGTAGCAGCTTGCTTCGGACCCAGAGGGGGCTTCAAAAACTTTGGAGATGCGGAATTTGTCGAAAAAGGTGTTGATGCGTCAGGCTATGCTCAGATCGCCAGTTTAGCACCAAATGTTGCAGCATTGCTCTTTGGTGGTAATGTGGCTGTTCGTGAGCTAGCGGACTCTTACGAGATTACATACAACTATAAAATGACTGTGCCAAAGTCAGATCCAAATGTTGAGCTTCTTGTTTCACAGGTGGATGCATTTAAAACTGGGAATGCAAAACTCCAGAGAAAGAAGGAAAAGAAGAACAAGCGTGAAACCACGCTGCAGCAGCATGAAGAGGCCATCTACGATGATGTGGGTGCGCCATCTGATGTGACCCATGCCAATCTGGAATGGGACACAGCTGTTGATGGTGGTGATACGGCCGTTGAAATTATCAACGAGATCTTCGATACAGGAAATTAAACAATGTTAGACCGGCTTATCCTGGCTATGTTCCAGGGTAGTGCCATTACACTGTTATTACTGAGTGTTTTTCTAGCGACTTGGCTGCTGGGCTATGGCTTTGCCCTCTAACCAGCGGTCTTGGTCTTGCACACAACGGTAAGCCAGTGGTAATGTCAGTGCAAGAAGGATATTACCATAGCACTGTCACGAGGGGAACGCAGTACCTTTTCATCTAAACCTTTGCACGAGTAATTAAAGATCCGCTTGACGAGCCTATATGGAAGAGCGTGCCAGGTATTTGACTTAAGGACTGTTAGTAACTGAAGACCTGACGGTGTTGATATGGATACAC
| 8,658
|
PP107941.1
|
Porcine epidemic diarrhea virus
|
Kim,D.M., Moon,S.H., Kim,S.C., Cho,H.S., Tark,D., Kim,D.-M., Moon,S.-H., Kim,S.-C., Cho,H.-S.
|
Korea Zoonosis Research Institute, Laboratory for Infectious Disease Prevention
| null |
2024-01-30
|
CKT-7 p0
|
Porcine epidemic diarrhea virus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,012
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Sus scrofa
| null | null | null | null |
Porcine epidemic diarrhea virus isolate CKT-7 p0, complete genome
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