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Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Nelsen,C.J., Murtaugh,M.P., Faaberg,K.S., Kapur,V., Elam,M.R., Pawlovich,T.M., Kakach,L.T., Faaberg,K., Nelsen,C.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2018-08-24
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Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
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Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2, complete genome
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3,999
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Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/IA/104589-1/2021
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,019
GenBank
1
USA: IA
USA
Sus scrofa
null
2021
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/IA/104589-1/2021, complete genome
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GAACCACGCGGCCGAAATT
11,086
OR669516.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/IA/90715-5/2021
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,019
GenBank
1
USA: IA
USA
Sus scrofa
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2021
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/IA/90715-5/2021, complete genome
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GAACCACGCGGCCGAAATT
11,087
OR669517.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/IN/04584GF/2022
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
14,970
GenBank
1
USA: IN
USA
Sus scrofa
null
2022
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/IN/04584GF/2022, complete genome
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11,088
OR669518.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/IL/01810A/2012
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
14,995
GenBank
1
USA: IL
USA
Sus scrofa
null
2012
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/IL/01810A/2012, complete genome
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11,089
OR669519.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/AZ/74959GA/2020
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,386
GenBank
1
USA: AZ
USA
Sus scrofa
null
2020
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/AZ/74959GA/2020, complete genome
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11,090
OR669520.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/IL/17142GA/2022
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,109
GenBank
1
USA: IL
USA
Sus scrofa
null
2022
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/IL/17142GA/2022, complete genome
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GATGTGTGGTGAATGGCACTGATTGATATTGTGCCTCTAAGTCACCTATTCAATTAGGGCGACCGTATGGGGGTAACATTTAATTGGCGTGAACCATGCGGCCGAAATT
11,091
OR669521.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/KY/47082-2/2020
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,394
GenBank
1
USA: KY
USA
Sus scrofa
null
2020
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/KY/47082-2/2020, complete genome
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11,092
OR669522.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/PA/60596-1/2020
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,406
GenBank
1
USA: PA
USA
Sus scrofa
null
2020
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/PA/60596-1/2020, complete genome
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11,093
OR669523.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/TN/45339-3/2021
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,402
GenBank
1
USA: TN
USA
Sus scrofa
null
2021
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/TN/45339-3/2021, complete genome
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11,094
OR669524.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/IN/57008/2013
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,398
GenBank
1
USA: IN
USA
Sus scrofa
null
2013
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/IN/57008/2013, complete genome
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11,095
OR669525.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/IN/26125/2012
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,416
GenBank
1
USA: IN
USA
Sus scrofa
null
2012
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/IN/26125/2012, complete genome
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11,096
OR669526.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/IA/93743-1/2020
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,011
GenBank
1
USA: IA
USA
Sus scrofa
null
2020
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/IA/93743-1/2020, complete genome
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GAACCATGCGG
11,097
OR669527.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Krueger,K.M., Yim-Im,W., Li,G., Gauger,P.C., Almeida,M.N., Aljets,E.K., Zhang,J.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-11-12
USA/UT/34926-1/2021
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,366
GenBank
1
USA: UT
USA
Sus scrofa
null
2021
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/UT/34926-1/2021, complete genome
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11,098
OR634972.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Almeida,M.N., Gauger,P.C., Zimmerman,J.J., Ye,F., Rademacher,C.J., Armenta Leyva,B., Munguia-Ramirez,B., Tarasiuk,G., Schumacher,L.L., Aljets,E.K., Thomas,J.T., Zhu,J.H., Trexel,J.B., Zhang,J.
Iowa State University, VDPAM
USA
2023-11-07
USA/MN/01775GA/2021
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,109
GenBank
1
USA: MN
USA
Sus scrofa
null
2021
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/MN/01775GA/2021, complete genome
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AATGAGTGGTGAATGGCACTGATTGACATTGTGCCTCTAAGTCACCTATTCAATTAGGGCGACCGTATGGGGGTAAGATTTAATTGGCGAGAACCATGCGGCCGAAATT
11,203
OR634973.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Almeida,M.N., Gauger,P.C., Zimmerman,J.J., Ye,F., Rademacher,C.J., Armenta Leyva,B., Munguia-Ramirez,B., Tarasiuk,G., Schumacher,L.L., Aljets,E.K., Thomas,J.T., Zhu,J.H., Trexel,J.B., Zhang,J.
Iowa State University, VDPAM
USA
2023-11-07
USA/NE/05828-3/2020
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,009
GenBank
1
USA: NE
USA
Sus scrofa
null
2020
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/NE/05828-3/2020, complete genome
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GCCGAAATT
11,204
OR634974.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Almeida,M.N., Gauger,P.C., Zimmerman,J.J., Ye,F., Rademacher,C.J., Armenta Leyva,B., Munguia-Ramirez,B., Tarasiuk,G., Schumacher,L.L., Aljets,E.K., Thomas,J.T., Zhu,J.H., Trexel,J.B., Zhang,J.
Iowa State University, VDPAM
USA
2023-11-07
USA/85099/2018
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,014
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
null
2018
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/85099/2018, complete genome
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ATGCGGCCGAAATT
11,205
OR634975.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Almeida,M.N., Gauger,P.C., Zimmerman,J.J., Ye,F., Rademacher,C.J., Armenta Leyva,B., Munguia-Ramirez,B., Tarasiuk,G., Schumacher,L.L., Aljets,E.K., Thomas,J.T., Zhu,J.H., Trexel,J.B., Zhang,J.
Iowa State University, VDPAM
USA
2023-11-07
USA/81793-6/2019
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
14,998
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
null
2019
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/81793-6/2019, complete genome
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11,206
OR634976.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Rawal,G., Almeida,M.N., Gauger,P.C., Zimmerman,J.J., Ye,F., Rademacher,C.J., Armenta Leyva,B., Munguia-Ramirez,B., Tarasiuk,G., Schumacher,L.L., Aljets,E.K., Thomas,J.T., Zhu,J.H., Trexel,J.B., Zhang,J.
Iowa State University, VDPAM
USA
2023-11-07
USA/IN/65239GA/2014
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,110
GenBank
1
USA: IN
USA
Sus scrofa
null
2014
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate USA/IN/65239GA/2014, complete genome
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GAATGAGTGGTGAATGGCACTGATTGACATTGTGCCTCTAAGTCACCTATTCAATTAGGGCGACCGTATGGGGGTAATATTTAATTGGCGAGAACCATGCGGCCGAAATT
11,207
OQ538073.1
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2
Li,W., Li,C., Guo,Z., Xu,H., Gong,B., Sun,Q., Zhao,J., Xiang,L., Leng,C., Peng,J., Zhou,G., Tang,Y., Liu,H., An,T., Cai,X.H., Tian,Z.J., Wang,Q., Zhang,H.
Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology
China
2023-10-25
SDQD95
Betaarterivirus suid 2
Betaarterivirus
Arteriviridae
ssRNA(+)
15,379
GenBank
1
China
China
Sus scrofa
null
2022
null
null
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus 2 isolate SDQD95, complete genome
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11,575
OR209251.1
Porcine respiratory coronavirus
Rawal,G., Yim-im,W., Aljets,E., Halbur,P., Zhang,J., Opriessnig,T.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-07-08
PRCV/USA/AR310/1989_ISU
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,869
GenBank
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USA
USA
Sus scrofa
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1989
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null
Porcine respiratory coronavirus isolate PRCV/USA/AR310/1989_ISU, complete genome
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14,733
OR209252.1
Porcine respiratory coronavirus
Rawal,G., Yim-im,W., Aljets,E., Halbur,P., Zhang,J., Opriessnig,T.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-07-08
PRCV/USA/LEPP1/1991_ISU
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,898
GenBank
null
USA
USA
Sus scrofa
null
1991
null
null
Porcine respiratory coronavirus isolate PRCV/USA/LEPP1/1991_ISU, complete genome
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14,734
OR209253.1
Porcine respiratory coronavirus
Rawal,G., Yim-im,W., Aljets,E., Halbur,P., Zhang,J., Opriessnig,T.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-07-08
PRCV/USA/1894X/1992_ISU
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,782
GenBank
null
USA
USA
Sus scrofa
null
1992
null
null
Porcine respiratory coronavirus isolate PRCV/USA/1894X/1992_ISU, complete genome
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14,735
OR209254.1
Porcine respiratory coronavirus
Rawal,G., Yim-im,W., Aljets,E., Halbur,P., Zhang,J., Opriessnig,T.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine
USA
2023-07-08
PRCV/USA/ISU20-92330/2020
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,792
GenBank
null
USA
USA
Sus scrofa
null
2020
null
null
Porcine respiratory coronavirus isolate PRCV/USA/ISU20-92330/2020, complete genome
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14,736
OK078898.1
Porcine respiratory coronavirus
Martinenghi,L.D., Rasmussen,T.B.
Statens Serum Institut, Department of Virus & Microbiological Special Diagnostics
Denmark
2023-01-01
PRCV-1/90-DK
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,594
GenBank
null
Denmark
Denmark
Sus scrofa
oronasopharynx
1990
null
null
Porcine respiratory coronavirus isolate PRCV-1/90-DK, complete genome
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Porcine respiratory coronavirus
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Huazhong Agricultural University, Veterinary Medicine
China
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Porcine respiratory coronavirus strain PRCV/USA/Minnesota-46140/2016, complete genome
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KR270796.1
Porcine respiratory coronavirus
Wang,L., Zhang,Y.
Ohio Department of Agriculture, Animal Diseases Diagnostic Lab
USA
2015-08-16
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Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,765
GenBank
1
USA: Ohio
USA
Sus scrofa
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2014-07-24
null
null
Porcine respiratory coronavirus strain OH7269, complete genome
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86,346
NC_003987.1
Porcine sapelovirus 1
Krumbholz,A., Dauber,M., Henke,A., Birch-Hirschfeld,E., Knowles,N.J., Stelzner,A., Zell,R.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2002-05-19
null
Sapelovirus A
Sapelovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,491
RefSeq
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA485481
Porcine sapelovirus 1, complete genome
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8,582
MN241819.1
Porcine sapelovirus 1
Malik,Y.S., Bhat,S., Sircar,S., Yadav,P.D., Majumdar,T., Patil,V., Nyayanit,D., Shete,A., Dhama,K., Mourya,D.T., Singh,R.K.
IVRI, Biological Standardization
India
2021-07-31
WB-76-tc
Sapelovirus A
Sapelovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,494
GenBank
null
India
India
Sus scrofa
feces
2018
null
null
Porcine sapelovirus 1 strain PSV/IND/WB-76-tc/2018, complete genome
ACACTCATTTCCCCCCTCCACCCTTATGGTGGTTGTATCCCACATACCCTCACCCTCCCTTCCAAACAGGACGGATGAAAGGCATCAAACCTGCGGTAAGGACAAATGGTATGACTTTGGATACACTTGAATGGCAGTAGCGTGGCGAGCTATGGAAAAATCGCAATTGTCGATAGCCATGTTAGCGACGCGCTTCGGCGTGCTCCTTTGGTGATTCGGCGACTGGTTACAGGAGAGTAGGCAGTGAGCTATGGGCAAACCTCTACAGTATTACTTAGAGGGAATGTGCAATTGAGACTTGACGAGCGTCTCCCTAGAGATGTGGCGCATGCTCTTGGCATTACCATAGTAAGCTTCCAGGTTGGGAGACCTGGACTGGGCCTATACTACCTGATAGGGTCGCGGCTGGCCGCCTGTAACTAGTATAGTCAGTTGAAACCCCCCATGGAATCTACTACTACTCTTTCATTTTGCAACTGGATCCCTAAGAAGCAGAGAGCCCGTGTGTACCTTACCACCAGCGTGACACACGAGAAATCAATTGGACCATACACATACATGGTCTCAGACATGATCATGAAAGAAAATAGTAGGACCTCCCTTGCTATGGCTTACGTAGAAGGGAAGACACTTGTGTTCAACACTGGTACACAATTAGGTCAAGTACATTCTGCCAACACAGGTAACAAACCACAAGGAGCGTATAACCATGGTTCTGGAAGTATCACACAGGTGAATTATTATGGTTCAGATTATTCCCAAGCGTGGAACCCCACACAACAACAGATGGATCCCTCCCAGTTTACCAAACCAGTGACTGAAATAGCTAATGCAATGGCAGGACCATCACTCAAGGCACCTGACAAGGAAGAAGAAGGATACAGTGACAGGCTGATGCAACTAACAGCAGGTAATTCGTGTATAACAACACAGGAAGCAGCTAAGGCAGTAGTGGCATATGGACAATGGCCTAGTTACAACATTGACGGAGGTGAACATCTAGACCTTGCTACCACCCCCGGGACCGCAGTGGATAGGTTTTACACCTTTGATAGCTTGCAGTGGACAAACACTCAAGTGGGTGAATGGTCGTTGCCTTTACCGGGAGGGCTAATGGATACAGGAGTGTTTGGACAAAATTTGAGATTCCACTATTTGTCAAGAATGGGCTTCTGTGTACATGTGCAATGTAATGCTTCCAAGTTCCACCAAGGAGCTCTCATAGTTGCAATGATACCTGAACATCAAACCCCTACTCAGGTGAGCAATGGATTTGAGTACAGAAATGGTGTTAATTACCAAGGAAACAATTATCCTACAGAGCAATTGACTATATTCCCACACCAAATTATAAATTTGAGGACAAATAACTCTGCAACAATTGTTTATCCATACACCAATTGCACTCCTGCTGGTTTTGGGCTGGCACACAATTTTGTAACATTGGTTATTAGAGTGTTGGTGCCCCTTAGGTACAACGATGGTGCATCCACCTTTGTTCCCATAACAGTTAGTGTAGCCCCAATGTGTTCCCAATTTGCAGGGTTGAGATCTGCCGTGTCAAGACAAGGTTTTCCTGTTAGGCAGGTACCAGGAAGTCAACAATTCATGACAACACAAAGAGATAACGGTATACCTATATATCCAGAATTTGAAAAAACACATGGATTTAGACTACCTGGTAGAGTCACTAACTTGCTTCAGGTAGCACAGGTGGGGACATTTTTGAAATTTGACAATAATGTTAATGCAACAAGTGGAGTGTACTTGAATCTGGATGTGACACAGGGCAATCAGACAGCTAGAATAGCAGCCATTGATGTTAGCATGATATCTGGACATTTAGTGACAACCTATCTTTCCCGTTTGGCACAAATGTATGCAAATTATAGAGGATCTGTTGTTTTTGAATTTATGTTTTGTGGCAGTCAAATGGCCACTGGCAAATTGCTTATTGCTTACACTCCACCCGGTGGTTCCTCACCAACTACAAGAACTGATGCAATGTTAGCAACACATGTTATTTGGGATATAGGCTTACAGTCAACATGTAAATTAGTGGTTCCCTATATATCTTCTTCCCAATATAGGCAAAACAATGTGAACCAGACCACATTGTCATACAATGGATGGGTAACTGTGTTCCAACAAACAGCACTTGTGGTACCACCTGGTGCACCATCGACATGTCAGTTAGTGGTTACAGTCAGTGCTGCAGACAATTTTGTGTTGAGAGTTCCCACTGATACTGCTTACTTTGCGGACTACCAGGGGGATGTGAAAGATATAGTACAGGCTAGTATAAATTCCACCCTACAGAATGCTTTAAACACCAGACCACAGCAAGAACAATCATCCAATGGAATAATGATTAATCAGGGGGATGCACCAGCACTCACAGCTGCTGAGACCGGCGAATCTGATACAAACTCAGGTGGGTCCACGATGGAGCTTCAGGCCACCAATTGTGTGTTTAGCTTAAGAGAAACAGATTTGGAGTACCTGATGTCTAGATATTCTTTAATGTATGAAGGAACTTTAGATTACACCAGTGGAACTGGTGAGAGGCATTTAAGATATAATGTAGATTTTAGGACAATAGGTAAATCAGGTAGTGATATTACTAAGTTTAGGGCTTTTACATACTGGAGGTTTGATCTAGATGTGGTTGTGATGATGTTAGAGGACAAAGCATCCAAAGTATCAAATGTTATGTTTCAAGTTTTGTTCACGCCACATGGAGGTGCTGTCCCTACCAGACATAACTCCCAGATATGGAACGCCCCCAATTCCACAAGTATTTACACCAGAGTGGGAAATGCTCCAGCTTCATTTAGAATACCTTTTATGTCTGTTTGCAATTATTATACTTCCTTTTATGATGGTGATGGTAATTTTGATCGGAATGGTGCTTCTTATGGTGTTAATCCTGGTAATTTTATAGGTACAATATCCATTAGAATGGCTAATGATTTTTCTACTGATGCCACTACTGGTTCTTTTAGAGCTAAGATTTTCCTTAGACCTGTAAATATTGAAGCTTATATGCCTAGACCCTTAATTTCATATAAGGCTAATGGTGATGCTAGAGAAGATAGTTCTAGATATTATCCTGCAACACAATTGGGACCATATGAAATTTGCCAAACCAGGAATGCCTCAGAATTATTGGAGACCAAATGGGCCAAATATTCATGTTCAGTTAGGTTTGATAGAGGATCATTTACAGCTTGGTTTGTGGGAGAAGACCTCCTGTTGGTACCCTACCATGCTGCAAACAATTGGAGCCAAACAACACATGTTTACCTCTGGAGAGCATGGGAAAAAGATTGGAGAGACCATCCCGAATTGGAAATGAAGGTACCAATAGAGGAAATGTGGACAGATTCCACAAGAGACCTCACTTTCCTTAAGATATCTTACGCTACCACCTATTGGTTGGAAATGCCATCCAAGGGATCTGCAATTGGAGATTACACTGTTGTGGTCAATTCAGCACACTTTCCATGGAAGCAATATACAGGTCCCAAACCATTTAGACATCCCTATTTACATATTGGGCAACACACACAATACAGACTATGGATGGCACAAGGTGATGCTGATAATGGCTTCTGTGGAGCCGGCTTGATATCCAAAGGCAAACTTTATGGTATTGTTACAGCCAAAACTGAATGTAAATCTGGGGGTACATTTGTGGCATATACTGAGTTAGATGAAGATACCTTTCTCCAGACACAACAGAGATGTTTTGATTTTGGCATGGACACACACTTTAACCTAGGGATGCATGATTGGGTCCAGGGACTTGGCCAGGTCTTTGGGGAAGGTGTATCAGGAGAAGTTAAGAAACAAGTAGAAGACTATTTAGGTCAAATTAAACCCATTATAGATGCAGGTACTAATAAAGTTAAGGATGTTATTAAAGATGAAATGGTTAGTGCTAGCATGTCCTTGCTTGTTAAGGTAGTGGCCTCTTTAGTATTATATATGAACTCAAAGGATGAATGTAAGATGTCTACTTTAGCCTCTCTTGGTGCTTTGTTAGGTGTAGATATATTTTTAACTGATCCTATTATGTATTTGTATAGTAAGATAACAGGAGAACCACATAAACAGGGTCCATCTGATTGGCTTAAGGATTTTAATATAGCTATTAATTCACTTAAAGGGTTTGATTTTCTATGCTCCAAGTTGATGCAATTAATAGAATGGATTAAGCAGTTTTTCCAGAGAGTAGAACCAGAATATAAGTATTTTAAAGAGCTACTTGAGTCATGGCCCAAAGTTTGTGCCAAGGTTTTGGAGTTTAAAAATTGCAAAACAACATTAGGCCAAGAAGATATATGCCAGATTAAGGTATACATAGATAAATTGATTGAATTGGGTAATAAATATGGACATAAATTTAATTTGCAAATGTCTCAGTTACTGCAATGTTCAAACATAATAAACAAAGCTTACAGTAACATGACAAGATCCAGACATGAACCAGTAGCAATGCTTATACACGGTGCTCCTGGGACTGGAAAATCCCTGGCCACTGAGATAATTGGTAGAGCAATAGCAGATAAATTGGATAATCAGAGACCTTATACCCTTCCACCTGACCCCAAGCATTTTGATGGTTATAATCAACAGAAGGTAGTTATAATGGATGATTTGGGCCAGAACCCAGATGGTGAAGATTGTAAAATGTTTTGCCAGATGGTATCTACCACCACTTATATTCCACCAATGGCCTCCCTTGATGAGAAAGGATTACCCTTTATTTCTGATTTTGTTTTGGCTTCTACCAACCAACATGCTTTAACCCCTCGCACCATTGCCGAACCAGATGCTATAAATAGGAGATGGTTTATGAATGTGGATATTCACCTTAAGAAGGAATATAAGGATGATAGAGGAAGATTGGATATGTCTAAATGTGTTCCATGTAAGGATTGCAAACCAAACAACTTTAGAAAATGTAACCCATTAGTTTGTGGTAAAGCAATTAT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39,969
MN241820.1
Porcine sapelovirus 1
Malik,Y.S., Bhat,S., Sircar,S., Yadav,P.D., Majumdar,T., Patil,V., Nyayanit,D., Shete,A., Dhama,K., Mourya,D.T., Singh,R.K.
IVRI, Biological Standardization
India
2021-07-31
TN-400-tc
Sapelovirus A
Sapelovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,467
GenBank
null
India
India
Sus scrofa
feces
2016
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null
Porcine sapelovirus 1 strain PSV/IND/TN-400-tc/2016, complete genome
ACACTCATTTCCCCCCTCCACCCTTATGGTGGTTGTATCCCACATACCCTCACCCTCCCTTCCAAACAGGACGGATGAAAGGCATCAAACCTGCGGTAAGGACAAATGGTATGACTTTGGATACACTTGAATGGCAGTAGCGTGGCGAGCTATGGAAAAATCGCAATTGTCGATAGCCATGTTAGCGACGCGCTTCGGCGTGCTCCTTTGGTGATTCGGCGACTGGTTACAGGAGAGTAGGCAGTGAGCTATGGGCAAACCTCTACAGTATTACTTAGAGGGAATGTGCAATTGAGACTTGACGAGCGTCTCCCTAGAGATGTGGCGCATGCTCTTGGCATTACCATAGTAAGCTTCCAGGTTGGGAGACCTGGACTGGGCCTATACTACCTGATAGGGTCGCGGCTGGCCGCCTGTAACTAGTATAGTCAGTTGAAACCCCCCATGGAATCTACTACTACTCTTTCATTTTGCAACTGGATCCCTAAGAAGCAGAGAGCCCGTGTGTACCTTACCACCAGCGTGACACACGAGAAATCAATTGGACCATACACATACATGGTCTCAGACATGATCATGAAAGAAAATAGTAGGACCTCCCTTGCTATGGCTTACGTAGAAGGGAAGACACTTGTGTTCAACACTGGTACACAATTAGGTCAAGTACATTCTGCCAACACAGGTAACAAACCACAAGGAGCGTATAACCATGGTTCTGGAAGTATCACACAGGTGAATTATTATGGTTCAGATTATTCCCAAGCGTGGAACCCCACACAACAACAGATGGATCCCTCCCAGTTTACCAAACCAGTGACTGAAATAGCTAATGCAATGGCAGGACCATCACTCAAGGCACCTGACAAGGAAGAAGAAGGATACAGTGACAGGCTGATGCAACTAACAGCAGGTAATTCGTGTATAACAACACAGGAAGCAGCTAAGGCAGTAGTGGCATATGGACAATGGCCTAGTTACAACATTGACGGAGGTGAACATCTAGACCTTGCTACCACCCCCGGGACCGCAGTGGATAGGTTTTACACCTTTGATAGCTTGCAGTGGACAAACACTCAAGTGGGTGAATGGTCGTTGCCTTTACCGGGAGGGCTAATGGATACAGGAGTGTTTGGACAAAATTTGAGATTCCACTATTTGTCAAGAATGGGCTTCTGTGTACATGTGCAATGTAATGCTTCCAAGTTCCACCAAGGAGCTCTCATAGTTGCAATGATACCTGAACATCAAACCCCTACTCAGGTGAGCAATGGATTTGAGTACAGAAATGGTGTTAATTACCAAGGAAACAATTATCCTACAGAGCAATTGACTATATTCCCACACCAAATTATAAATTTGAGGACAAATAACTCTGCAACAATTGTTTATCCATACACCAATTGCACTCCTGCTGGTTTTGGGCTGGCACACAATTTTGTAACATTGGTTATTAGAGTGTTGGTGCCCCTTAGGTACAACGATGGTGCATCCACCTTTGTTCCCATAACAGTTAGTGTAGCCCCAATGTGTTCCCAATTTGCAGGGTTGAGATCTGCCGTGTCAAGACAAGGTTTTCCTGTTAGGCAGGTACCAGGAAGTCAACAATTCATGACAACACAAAGAGATAACGGTATACCTATATATCCAGAATTTGAAAAAACACATGGATTTAGACTACCTGGTAGAGTCACTAACTTGCTTCAGGTAGCACAGGTGGGGACATTTTTGAAATTTGACAATAATGTTAATGCAACAAGTGGAGTGTACTTGAATCTGGATGTGACACAGGGCAATCAGACAGCTAGAATAGCAGCCATTGATGTTAGCATGATATCTGGACATTTAGTGACAACCTATCTTTCCCGTTTGGCACAAATGTATGCAAATTATAGAGGATCTGTTGTTTTTGAATTTATGTTTTGTGGCAGTCAAATGGCCACTGGCAAATTGCTTATTGCTTACACTCCACCCGGTGGTTCCTCACCAACTACAAGAACTGATGCAATGTTAGCAACACATGTTATTTGGGATATAGGCTTACAGTCAACATGTAAATTAGTGGTTCCCTATATATCTTCTTCCCAATATAGGCAAAACAATGTGAACCAGACCACATTGTCATACAATGGATGGGTAACTGTGTTCCAACAAACAGCACTTGTGGTACCACCTGGTGCACCATCGACATGTCAGTTAGTGGTTACAGTCAGTGCTGCAGACAATTTTGTGTTGAGAGTTCCCACTGATACTGCTTACTTTGCGGACTACCAGGGGGATGTGAAAGATATAGTACAGGCTAGTATAAATTCCACCCTACAGAATGCTTTAAACACCAGACCACAGCAAGAACAATCATCCAATGGAATAATGATTAATCAGGGGGATGCACCAGCACTCACAGCTGCTGAGACCGGCGAATCTGATACAAACTCAGGTGGGTCCACGATGGAGCTTCAGGCCACCAATTGTGTGTTTAGCTTAAGAGAAACAGATTTGGAGTACCTGATGTCTAGATATTCTTTAATGTATGAAGGAACTTTAGATTACACCAGTGGAACTGGTGAGAGGCATTTAAGATATAATGTAGATTTTAGGACAATAGGTAAATCAGGTAGTGATATTACTAAGTTTAGGGCTTTTACATACTGGAGGTTTGATCTAGATGTGGTTGTGATGATAAATGTTATGTTTCAAGTTTTGTTCACGCCACATGGAGGTGCTGTCCCTACCAGACATAACTCCCAGATATGGAACGCCCCCAATTCCACAAGTATTTACACCAGAGTGGGAAATGCTCCAGCTTCATTTAGAATACCTTTTATGTCTGTTTGCAATTATTATACTTCCTTTTATGATGGTGATGGTAATTTTGATCGGAATGGTGCTTCTTATGGTGTTAATCCTGGTAATTTTATAGGTACAATATCCATTAGAATGGCTAATGATTTTTCTACTGATGCCACTACTGGTTCTTTTAGAGCTAAGATTTTCCTTAGACCTGTAAATATTGAAGCTTATATGCCTAGACCCTTAATTTCATATAAGGCTAATGGTGATGCTAGAGAAGATAGTTCTAGATATTATCCTGCAACACAATTGGGACCATATGAAATTTGCCAAACCAGGAATGCCTCAGAATTATTGGAGACCAAATGGGCCAAATATTCATGTTCAGTTAGGTTTGATAGAGGATCATTTACAGCTTGGTTTGTGGGAGAAGACCTCCTGTTGGTACCCTACCATGCTGCAAACAATTGGAGCCAAACAACACATGTTTACCTCTGGAGAGCATGGGAAAAAGATTGGAGAGACCATCCCGAATTGGAAATGAAGGTACCAATAGAGGAAATGTGGACAGATTCCACAAGAGACCTCACTTTCCTTAAGATATCTTACGCTACCACCTATTGGTTGGAAATGCCATCCAAGGGATCTGCAATTGGAGATTACACTGTTGTGGTCAATTCAGCACACTTTCCATGGAAGCAATATACAGGTCCCAAACCATTTAGACATCCCTATTTACATATTGGGCAACACACACAATACAGACTATGGATGGCACAAGGTGATGCTGATAATGGCTTCTGTGGAGCCGGCTTGATATCCAAAGGCAAACTTTATGGTATTGTTACAGCCAAAACTGAATGTAAATCTGGGGGTACATTTGTGGCATATACTGAGTTAGATGAAGATACCTTTCTCCAGACACAACAGAGATGTTTTGATTTTGGCATGGACACACACTTTAACCTAGGGATGCATGATTGGGTCCAGGGACTTGGCCAGGTCTTTGGGGAAGGTGTATCAGGAGAAGTTAAGAAACAAGTAGAAGACTATTTAGGTCAAATTAAACCCATTATAGATGCAGGTACTAATAAAGTTAAGGATGTTATTAAAGATGAAATGGTTAGTGCTAGCATGTCCTTGCTTGTTAAGGTAGTGGCCTCTTTAGTATTATATATGAACTCAAAGGATGAATGTAAGATGTCTACTTTAGCCTCTCTTGGTGCTTTGTTAGGTGTAGATATATTTTTAACTGATCCTATTATGTATTTGTATAGTAAGATAACAGGAGAACCACATAAACAGGGTCCATCTGATTGGCTTAAGGATTTTAATATAGCTATTAATTCACTTAAAGGGTTTGATTTTCTATGCTCCAAGTTGATGCAATTAATAGAATGGATTAAGCAGTTTTTCCAGAGAGTAGAACCAGAATATAAGTATTTTAAAGAGCTACTTGAGTCATGGCCCAAAGTTTGTGCCAAGGTTTTGGAGTTTAAAAATTGCAAAACAACATTAGGCCAAGAAGATATATGCCAGATTAAGGTATACATAGATAAATTGATTGAATTGGGTAATAAATATGGACATAAATTTAATTTGCAAATGTCTCAGTTACTGCAATGTTCAAACATAATAAACAAAGCTTACAGTAACATGACAAGATCCAGACATGAACCAGTAGCAATGCTTATACACGGTGCTCCTGGGACTGGAAAATCCCTGGCCACTGAGATAATTGGTAGAGCAATAGCAGATAAATTGGATAATCAGAGACCTTATACCCTTCCACCTGACCCCAAGCATTTTGATGGTTATAATCAACAGAAGGTAGTTATAATGGATGATTTGGGCCAGAACCCAGATGGTGAAGATTGTAAAATGTTTTGCCAGATGGTATCTACCACCACTTATATTCCACCAATGGCCTCCCTTGATGAGAAAGGATTACCCTTTATTTCTGATTTTGTTTTGGCTTCTACCAACCAACATGCTTTAACCCCTCGCACCATTGCCGAACCAGATGCTATAAATAGGAGATGGTTTATGAATGTGGATATTCACCTTAAGAAGGAATATAAGGATGATAGAGGAAGATTGGATATGTCTAAATGTGTTCCATGTAAGGATTGCAAACCAAACAACTTTAGAAAATGTAACCCATTAGTTTGTGGTAAAGCAATTATCTTACTGGATAGGAAGACTCAAAAGAA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39,970
KY053835.1
Porcine sapelovirus 1
Ray,P.K., Desingu,P.A., Kumari,S., John,J.K., Sethi,M., Sharma,G.K., Pattnaik,B., Singh,R.K., Saikumar,G.
Indian Veterinary Research Institute, Pathology
India
2017-03-14
IVRI/PSV/SPF/C-6/2015
Sapelovirus A
Sapelovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,491
GenBank
1
India
India
Sus scrofa
feces
2015
null
null
Porcine sapelovirus 1 isolate IVRI/PSV/SPF/C-6/2015, complete genome
ACACCCATTTCCCCCCTCCACCCTTAAGGTGGTTGTATCCCCTATACCCTATCCTCCCTTCCAAACAGGATGGACAAATGGACTTGACATTATGGCAAGTACATAAGGTATGGTCTTTGGATACACCTGAATGGTAGTAGCGTGGCGAGCTATGGAAAAATCGCAATTGTCGATAGCCATGTCAGTGACGCGCTTCGGTGTGCTCCTTTGGTGATTCGGCGACTGGTTACAGGAGAGTAGGCAGTGAGCTATGGGCAAACCCCTGCAGTATTACTCAGGGGAATGTGCAATTGAGGCTTGACGAGCGTCTCTTAGAGATGTGGCGCATGCTCTTGGCATTACCATAGTGAGCTTCCAGGTTGGGAGACCTGGACTGGGCCTATACTACCTGATAGGGTCGCGGCTGGCCGCCTGTAACTAGTATAGTCAGTTGAAAACCCCCCATGGAATCTACTACTACTCTTTCATTTTGCAACTGGATCCCTAAGAAACAGAGAGCCCGTGTGTACCTCACCACCAGTGTCACACACGAGAAATCAATCGGACCATATACATATGTGGTCTCAGATATGATCATGAAAGAAAACAGTAGAACCTCCCTTGCTATGGCATACGTAGAAGGGGAGACACTTGTGTTCAACAACGGTACACAGTTGGGACAAGTACACTCATCTAACACAGGTAACAAACCACAAGGTGCTTACAACCATGGCTCTGGAAGCATAACACAAGTCAACTACTATGGGTCTGATTACTCACAAGCATGGAATCCCACCCAACAACAAATGGACCCATCTCAGTTTACCAAACCAGTGACAGAGATTGCTGGTATGGTGGCAGGACCCACATTAAAAGCACCTGACAAGGAGGAAGAAGGATATAGTGACAGATTGATGCAGTTGACAGCTGGAAACTCTTGTATAACAACACAGGAAGCAGCTAAGGCAGTGGTAGCTTATGGACAATGGCCTAGTTACAATATTGATGGTGGGGAACATCTAGACCTTGCCACCACCCCTGGAACCTCTGTGGACAGGTTCTACACATTTGATAGCTTACAATGGACAAACACCCAGGTAGGTGAGTGGTCACTACCACTACCAGGGGGTCTGATGGATACTGGAGTATTTGGGCAAAATTTGAGATTTCATTACCTGTCAAGGATGGGTTTTTGTGTCCATGTGCAATGTAATGCTTCCAAATTCCATCAGGGTGCATTTATAGTTGCTATGATACCTGAACATCAGACTCCAACGCAGGTTAGTAATGGATTTGAATACAGGAACGGTGTAATTTATCAGGGAAACAATTATCCCACAGAACAGTTAACTATATTCCCACATCAAATTATAAACCTAAGGACAAATAATTCTGCAACAATTGTTTACCCATATACAAATTGTACACCTGCTGGTTTTGGTTTAGCACATAATTTTGTTACACTGGTCATTAGAGTGTTAGTACCCCTTAGATATAATACAGGTGCATCCACATTTGTTCCTATAACAGTTAGTGTAGCCCCAATGTGTTCTCAGTTCGCAGGGTTGAGATCCGCTGTAACGAGGCAAGGGTTTCCTGTTAGACAGGTACCGGGGAGTCAACAGTTCATGACAACACAGAGGGATAATGGTATACCTATATACCCAGAGTTTGAGAAGACACACAATTTTAAATTACCGGGTAGGGTCACTAATTTACTCCAGGTAGCTCAGGTGGGAACCATTTTAAAGTTTAGTAACAATGTCAATGCCTCAAGTGGTGTGTATTTAAATTTAGATGTGACCCAGGGCAACCAAACAGCTAGAATAGCAGCTATTGATGTTAGTATGATATCTGCACCTGTATCCACAACTTATCTCTCTCGCTTGGCACAGATGTATGCAAATTACAGGGGATCTGTTGTATTTGAATTTATGTTTTGTGGTAGTCAGATGGCCACTGGTAAATTACTTATTGCCTACACACCACCTGGTGGCTCTTCCCCTACAACGAGGACTGATGCAATGCTGGCAACACATGTTATTTGGGATATAGGCCTGCAGTCAACATGTAAAATTGTAGTTCCCTACATTTCCTCATCACAGTACAGGCAAAATAATGTGACAAGAACCACACTATCATATAATGGCTGGGTGACTGTGTTCCAACAGACAGCACTTGTTGTACCTCCTGGTGCACCATCGACATGTCAGTTGGTGGTTACAGTTAGTGCTGCAGACAACTTTGTGTTGAGGATCCCTACAGACACTGCTTACTTTGCAGACTACCAGGGTGATGTTAAAGATATAGTACAGGCCAGCATAAATTCTACTTTGCAGAATGCACTGAACACCAGACCACAACAAGAGCAGTCATCCAACGGTATAATGATTAATCAAGGGGATGCACCAGCATTGACAGCTGCTGAGACTGGGGAATCTGATACAAACTCAGGTGGATCTACCATGGAACTTCAGGCAACCAATTGTGTGTTTAGTTTAAGGGAAACAGATTTAGAGTATTTAATGTCTAGATATTCTCTTATGTATGAAGGAACATTAGACTACACCAACGCAAGTGGTAGGAGGCATTTGAGGTATGACCTAAGTTTTAGGACAATTGGTAAGTCAGGTAGTGATATTACTAAGTTTAGAGCTTTCACATACTGGAGGTTTGATTTGGATGTGGTTGTGATGATGTTGGAGGATAAACCTGCTGCTGTGAGAAATTTGATGTTCCAGATTTTGTTTACCCCACATGGGGGTGCTGTACCTTCAACACACAACTCCCAGATATGGAATGCTCCAAATTCCACTAGTATTTATACCAGAGTAGGGAACTGCCCAGCATCATTTAGGATACCTTTTATGTCTGTTTGTAATTATTATACTTCTTTTTATGATGGTGATGGTAATTTTGACCAGAACGGTGCTGCCTATGGCATCAATCCAGGTAATTTTATAGGTACAATATCTATTAGAATGGCAAATGATTTTTTTACTGATGCTACCACTGGTTCCTTTAGGGCCAAGATTTTTCTTAGACCTGTAAATATTGAAGCCTATATGCCTAGACCCCTTGTTTCCTACAAGGCTAATGGTGATGCTAGAGAGGATAGCTCCATGTACTACCCTGCAACCCAAACAGGGCCCTACGAGATCTGTCAAACTAAGAACGCCACAGAATTAACAGATACCAAATGGGCCAACTATTCATGCTCAGTGAGGTTTGACAGGGGGTCCTTTACAGCCTGGTTTGTGGGAGAAGAACTGTTACTGGTGCCCTACCATGCTGCAAACAATTGGAGTCAGACAACACACGTTTATCTGTGGAGAGCTTGGGAAAAAGATTGGAGGGACCACCCCGAATTGGAGATGAAGGTGCCCATAGAAGACATGTGGACTGACTCAACTAGAGATATAACCTTTCTTAAGATATCCTATGCAACAACATATTGGTTAGATATGCCTGCTAGAGGTTCTGCCATTGGAGATTATGTTGTTGTAATTAATTCTGCACATTTTCCTTGGAAACAATATAAAGGGCCTAAGCCATTTAGACACCCCTATTTACATATTGGACAACACACTCAGTACAGGCTGTGGATGGCAAAAGGTGATGCTGACAACGGCTTCTGTGGAGCCGGATTAATATCTAATGGGAAACTATATGGCATAGTTACAGCAAAGACTGAGAGCAAATCTGGGGATATTTATGTGGCATCTACTGAATTAGATGAGGACTCTTTTCTTCAGACACAACAGAGATGCTTTGATTTTGGGATGGATACACATTTCAATCTGGGAATGCACGACTGGGTCCAAGGGCTTGGACAAGTCTTTGGAGAGGGTGTGTCTGGTGAAGTTAAGAGACAGGTAGAAGATTATTTAGGTCAGATTAAGCCCATTATAGATGCAGGCACCAATAAAGTTAAGGATGTTATTAAAGATGAGATGGTTAGTGCTAGCATGTCCCTATTAGTTAAAGTAGTTGCTTCTTTAGTACTGTATATGAACTCTAAGGATGACTGTAAGATGTCCACTCTAGCTTCTTTAGGTGCTTTATTAGGTGTAGATATATTTATGACCGACCCCATTATGTACTTATATTCAAAAATAACTGGAGAACCACATAAACAAGGGCCCTCTGATTGGCTGAAAGATTTTAATATTGCTATTAATTCACTTAAGGGATTTGATTTTCTTTGTTCCAAATTGATGCAGCTAATTGAATGGATTAAGCAGTTTTTCCAGAGAGTGGAACCAGAATATAAATATTTTAAAGAGTTGCTTGAATCCTGGCCTAAAGTTTGTGCAAAGGTATTGGAATTTAAGAATTGCAAAACTACACTAGGTCAGGAAGATATATGCCAGATAAAGGTATATATTGACAAATTAATTGAACTGGGTAACAAATATGGTCATAAATTTAATTTACAAATGTCTCAGTTACTGCAATGTTCAAACATAATAAATAAAGCTTACAGTAACATGACAAGATCCAGACATGAACCAGTGGCTATGCTTATACATGGTGCTCCAGGTACAGGGAAGTCTCTGGCTACTGAGATAATTGGTAGGGCTATAGCAGATAAGTTAGATAATCAGAGACCCTATACCCTTCCACCTGATCCCAAGCACTTTGATGGATATAATCAACAGAAGGTAGTTATAATGGATGATTTAGGACAGAATCCAGATGGTGAAGATTGTAAAATGTTTTGTCAGATGGTGTCAACAACAACCTATATTCCACCTATGGCCTCCTTGGATGAGAAGGGTTTGCCCTTCATATCTGATTTTGTTTTTGCCTCTACCAACCAACATGCCCTAACCCCTCGCACTATTGCTGAACCAGATGCAATAAATAGAAGATGGTTTATGAATGTGGACATTCACCTCAAGAAGGAATTTAAAGATGATAGGGGAAGATTGGACATGGCAAAGTGCTTACCTTGCAAGGATTGCAAACCGACCAACTTTAGGAAGTGTAACCCACTAGTGTGTGGTAAAGCTATCATA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77,700
AF406813.1
Porcine sapelovirus 1
Krumbholz,A., Dauber,M., Henke,A., Birch-Hirschfeld,E., Knowles,N.J., Stelzner,A., Zell,R.
Institute for Virology
Germany
2002-05-19
null
Sapelovirus A
Sapelovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,491
GenBank
1
null
null
null
null
null
null
null
Porcine enterovirus 8 strain V13, complete genome
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110,792
MW316743.1
Porcine sapovirus
Shen,H., Zhang,J., Gauger,P.C., Burrough,E.R., Harmon,K., Wang,L., Zheng,Y., Petznick,T., Li,G.
Veterinary Diagnostic Laboratory, Iowa State University
USA
2021-05-10
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,333
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
null
2019-02-12
null
null
Porcine sapovirus strain SaV/GIII/USA/NE_9550B/2019, partial genome
GTGATCGTGATGGCTAACTGCCGTCCGTTGCCTATTGGGCACTTGCCCAACAGGATTTTTAGCACCCCACGACTCACCCCAGGGTGGGTGTGGGCGTGCACTAAGGAAGCCATGTTTAAGCTAGAGTGGCTTCAAGATCCGGTGGTCATTCGACAGCCGGATGTTTACATCGCGCAGGGGGTGGTGGATGATTTCTTCCGCCCCAAGCGTGTTTTACAGGGTGACCCACAGCTCATAGCACAGGTGTTACTTGGTGATGCCAGTGGCCCGCTGGTCGGGCCTGTCTCAATGCAGCAACTAACATCGTTGCTGCATGAGGTTTCACAGGCACTAAATGACCACAAGCATCCCCTGGCCAACAGATATACCAAAGCATCTTTGCAAAGATATGCAGACACCTTGTCCAACTATATACCTCTAGTGGAGATATTAACTGGACCAAAGGACCTCACCCCGCGTGACGTGCTCGAGCAACTCGCGGCTGGGCGTGAATGGGAGTGTGTCCCAGACAGCGCCCTCAAGAAGGTCTTTCGGGACATGTGGCAATACATTTGTGAGGGCTGTGACAGCGTGTACATTAAACTGCAGGATGTGAAGCGCAAGATACCCCACATTGACACCACTGTGTTGAAACAGTTCTTTATCACACTCACAGACACCATATCAATGGCAACAGCGCTAGACACCAAAACCTGGTTGGCACACATACTGGGCTGGCTCAAGCCCACCTGTTTGGTGATGATTATGCAACAACACATCAACTCCCCCCAGGGGTGGGCGGCCACACTAACTGCCCTTGCAGAGCTCTACTATGGCATCATGCCGCTCACCGAGGTGCTCGGGTCCATCGCCGGTTGGGTCACTGACAAGTTTGCCGATGTGACCACCAACACCTGGGGCAAGTTCAAGGCTTGGTGGGACAATCTTTACACACCGCAAGCCGGCAATGACTTGATCATACTAGGTGGTGTTGTCGGGCTGGTGTACTTCATGGTTTTTGGAGATGCACCCACCCAGATGTTCACCAAGAAGCTAATGAAGGTGTGTGGGTTCATCACATCCACTGTGGCAGCGATCAAGGCTGCTATGTGGATAGTTGATTACTTTAAGCAACGCGAACATGAACATCAGGTTCGCGTCACCTTGGCCAGGTGGGCCGCACTCCAGGAGGTCATCAAGCAGAACAGGTGTGCTGGCCTTAGTGAAGTCGCCAAACTGAAAGAATGCTGTGAAGTCTTGCTGAATGAGGTCACCGAATTGATGTACAAGCTGGGCGCCTCGCCTCTAGCGGGGTTGATACGTAGCACCTCTGATGTCATACAGACCACCATCAATGACTTGGCTCAGCTGATGGCGTACGACACCCAACGCAAACCCCCCGCCATGATCGTGTTTGGTGGGCCACCTGGTATAGGTAAGACCCGGTTGGTTGAAGCTCTGGCCAGACAGCTTGGGGAGGTCAGCCACTTCACCATGACCGTCGACCACTACGACACCTACACGGGCAATGCAGTGGCAATATGGGACGAATTTGATGTGGACTCAAAGCAGGCATTCATCGAGGCCACCATCGGTATTGTCAATTGTGCCCCCTACCCCTTAAACTGCGACCGGCCAGAGGCAAAGGGCAGGGTGTTCACGTCAAAGTATGTGTTGGCTACCACCAACTGTCCCACACCAGTCATGCCTGACCACCCGAGGGCCATGGCGTTCTGGCGTCGCATAACCTTCATTGATGTCACTGCCCCCACAATTGAACAATGGCTGGTTGACAACCCCGGGCGCAAGGCACCGGCCAGCCTTTTCAAAGAGGATTTCTCCCACTTGCAGTGCTCCGTGCGTGGGTACACAGCCTATGACGAAAAAGGCAACACGCTCAGTGGCAAGGTGGCTCGGGCTAAGTATGTGTCAGTCAACAACCTGCTCGACCTGATCAAAGAGAAGTACAACAGTGAAGCTACTGACATTAAACATCTGTGGTTCACCGTTCCACAGGGCATTCACAAGCAGGCACGAGACATCATACTGGGGTGGCTGCGGTTCCACTCCTACCCCAACACCGTGGCTGACAACATACCCCTCTCAGAAGTCAGGGACCCCACCTGCTTCGGGTATGTGGTCATTTCTGATGTGGACCCGCCTCGGCATGTGAGTGACCATGTGGCACACATTGAAGTGGAGTCAATATTGCGCACCGACATCATGGACCTTTTGAGAGAGGGAGGCGGAGGCCTGTTCAGGGCGTTGAAGGTCAAAAGCGCCCCTCGGAATTGTGTGATCAACAAAGTCATGATGCAAGCGCACCACACCACCCTGCAGGTGCTTACCAGCCAGGAACCAAACCCACCAAACCTGCCCCGACCCAGACGTTTGGTTTTTGTTGAGTCACCAATTGACATCATTAGCGCCCTGCGACACCACGTAGGGTTCTGCACCATTCCAGGCATAGTCAAGTTAATCACATCGGGAGTGGGCCTGGGTGTGGAAAACCTGGGCAATTTCTTGCAATCCATCGCCGGCAATGTCAGATTCCCTTTGCAGTCCGAGTGCTCACTACTCAGGACACCCGGCGGTGATGTGCTATTCTACACATCAGGGCAAGCAGCAGTGTGGGCGACACCCGCACGTTTTCCAATCATCACCCCGGGAGAGGCGACTGTTGGCAAAGATGTGTGTTCTGAATCATCCTGGTGGGACATCCTCAAGGCCTTGTTTAGCACGCTGGTGGTGGCCTTCGGCCCCATAGCCACATTGGTGCTGACTGCACACAACTTGGCCTACTTGAACACCCGTGAGAACACCTTGAGTGAGGCAAAAGGTAAAAACAAGCGCGGCCGCGGTGCCCGCAAAGCCATCGCCCTCAGGGACGATGAGTATGATGAATGGCAGGACATCATTCGTGACTGGCGCAAGGAAATGACTGTCCAACAGTTCTTGGATCTGAAAGAGCGCGCCCTTTCCGGTGCCTCTGACCCTGATTCACAGAGGTACAATGCCTGGCTGGAACTGCGCGCAAAGAGATTGAGTGCCGGGGCCTACCAGCATGCAGTTGTAGACATCATTGGGAAATCAGGACATAGGCGCGAGGTGATCCGCACACAGGTGATGCGGGCGCCCCGTGAACCAAAAGCAGACACCTATGATAGTGAGGGGCGTGGTTACGTGGTGCCCATGACTGCCCAGGAAAAACACACAGGCTGGGCAGTGCACATTGGAAATGGCCGACTGGTCACTTGCACACATGTGGCCAACATGTGCGATCGCGTGGCTGAGGTGGAGTTCAAGATCACAGAAACAGATCGCGACACTTGCATCATCACCGCCCCACTCGGCCACCTACCTAGTGTCGCCCTTGGGGATGGACCACCGGCCTTTTACACCACCAACTTCCACCCCATCCGTGTGTTGGATGAGGGTAGTTGGGACACCACCACCACCCGTGTCACCGGTTGGCGTGTTGTCATTAACAACGGCACCACAACTGCCCCTGGTGATTGCGGCCAACCGTACTTGAACGCACGCCGGCAGCTCGTTGGTGTGCATGCAGCAACAAGCACATGTGGGGTCAAGAAACTGGTGTCTAGGGTGCAGACCAAAAGGGCATTAAAGGCCACATTTCCTTGGAAGGGCCTGCCTGTCACCAACATGCCCGATGCCGGGGGCTTGCCCACTGGCACGCGGTACCACCGCTCTATCGCGTGGCCCAAGCAGCTGCCTGAGGAGACACATGCCCCTGCCCCCTATGGTGTTAATGATCCCCGGTATTCCTTCTCCCAACACCAAATGATTGCCAACAACCTACAACCCTACACCAAAACCCCAGTTGCATTAGACCAGACCTTGCTGCAACGTGCTGTCAAACACACAAAGGGCTACCTAGACCAAGTCATTGGAACACACAGATCCCCAAATCTCACCTATGCGGCAGCAGTGGACTCGATGGCCCACGACACAGCATGTGGACCAAATTTGCCTGGCCGCAAGAAGGATTACATGACAGATCAGGGGGAGCCCATTGGACCACTCAAACAAATGTTGGAGGAAGCTTGGGACATGGCTCACCGAGGTGTCCCGCGCAAGCACGAGTACAAGCTTGCGCTCAAGGATGAACTCCGGCCCATAGAAAAGAATGATCAAGGCAAAAGGCGCCTCCTTTGGGGCTGTGACGCTGGGGTGTCGCTGGTGGCCAACGCCGTGTTTAAACCTGTGGCCGAGCGCTTGGTGGACACCGTGCCCATGCACCCTGTGGCTGTTGGCATATGTATGGACAGCCCCCAAATTGAGCAGATGAACCAGGCTCTAACTGGTAGGGTGCTGTACTGCTTGGACTACAGCAAGTGGGACTCCACGCAAAATCCGGCTGTGACAAGCGCCAGTGTTGACATCTTGGCCTCGTACGCTGAGGACACACCACTCACATCAGCTGCCATAGCTACACTATGTTCGCCAGCCATCGGTCGACTTGACGACATTGGTTTGACTGTTACAACGGGTCTCCCCTCTGGCATGCCGTTTACCAGTGTCATAAATTCAGTCAACCACATGGTGTATTTTGCCATGGCTGTGCTTGAGGCTTACGAGGAGTTCAAGGTGCCCTATATGGGGAACATTTTTGATAACGAGACTGTTTACACCTACGGGGATGACTGTGTGTATGGCCTCACACCGGCAACAGCTTCCATCATGCCGGTGGTGGTCAAAAACCTGACCAGCTACGGACTGGTTCCAACCGCTGCAGACAAATCCCAAACCATTGAACCCACTGACACCCCAGTTTTCCTCAAACGCACCTTTTCCCAAACACCCTTTGGACTGCGGGCACTGCTTGATGAAACTAGTCTGGCGCGACAGTGCTACTGGGTAAAAGCCAACCGCACAACAGACCTTTTTGAGCCAGCAGCTGTTGATGTGGAAATCAGGAAAAACCAGTTGGAGGTCATGCTTGCGTACGCCAGTCAGCATCCAAAGGCAGTGTTTGACAAGCTTGCAAGTATGGTTGA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42,190
MW316744.1
Porcine sapovirus
Shen,H., Zhang,J., Gauger,P.C., Burrough,E.R., Harmon,K., Wang,L., Zheng,Y., Petznick,T., Li,G.
Veterinary Diagnostic Laboratory, Iowa State University
USA
2021-05-10
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,325
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
null
2020-02-25
null
null
Porcine sapovirus strain SaV/GIII/USA/MO_1188/2020, partial genome
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42,191
MW316750.1
Porcine sapovirus
Shen,H., Zhang,J., Gauger,P.C., Burrough,E.R., Harmon,K., Wang,L., Zheng,Y., Petznick,T., Li,G.
Veterinary Diagnostic Laboratory, Iowa State University
USA
2021-05-10
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,333
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
null
2020-09-01
null
null
Porcine sapovirus strain SaV/GIII/USA/NE_67454/2020, partial genome
GTGATCGTGATGGCTAACTGCCGTCCGTTGCCTATTGGGCATTTGCCCAACAGGATTTTTAGCACCCCACGACTCACCCCAGGGTGGGTGTGGGCGTGCACCAAAGAAGCCATGTTCAAGCTAGAGTGGCTTCAAGATCCGGTGGTCATTCGACAGCCGGATGTTTATATTGCGCAAGGGGTGGTGGACGATTTCTTCCGCCCCAAGCGTGTTTTGCAGGGAGACCCGCAGCTCATAGCACAAGTGTTGCTTGGTGATGCCAGTGGCCCGCTGGTTGGCCCCGTTTCCATGCAGCAACTGACATCACTGTTACATGAGGTTTCACAGGCACTAAGTGACCACAAGCACCCCTTGGCCAATAGATACACCAAAGCCTCTTTGCAGAGGTATGCAGACACTTTGTCAAACTACATACCCCTAGTAGAGATACTAACTGGGCCAAAAGACCTCACCCCTCGTGATGTACTCGAACAACTCGCGGCTGGGCGTGAGTGGGAGTGCGTCCCAGACAGTGCCCTCAAAAAGGTCTTCCGGGACATGTGGCAATACATTTGTGAGGGGTGTGATAGTGTGTACATCAAACTGCAAGATGTGAAACGCAAGATACCTCACATCGACACTACAGTGTTGAAGCAATTCTTTATCACACTCACAGACACCATATCAATGGCAACAGCCCTAGACACCAAGACCTGGTTGGCGCACATTTTGGGTTGGCTTAAACCCACCTGTTTGGTGATGATCATGCAACAACACATCAATTCACCCCAGGGGTGGGCAGCCACCTTGACTGCCCTTGCAGAGCTGTACTATGGAATCATGCCCCTAACCGAGGTGCTCGGCTCCATTGCCGGCTGGGTCACTGACAAATTCGCTGATGTGACCACTAACACTTGGGGCAAGTTCAAGGCGTGGTGGGACAATCTTTACACGCCGCAAGCCGGTAATGACCTGATCATATTAGGGGGTGTTGTTGGACTGGTGTATTTCATGGTGTTTGGAGACGCCCCCACTCAGATGTTCACCAAGAAGTTAATGAAGGTGTGTGGCTTCATCACATCCACAGTGGCAGCGATTAAGGCCGCCATGTGGATCGTGGATTATTTCAAGCAGCGCGAGCATGAACATCAGGTTCGCGTCACTCTGGCAAGGTGGGCTGCACTTCAGGAGGTTATCAAGCAAAACAGGTGTGCTGGTCTTAGTGAGGTCACCAAGTTGAAAGAGTGCTGTGAGGTCTTGTTAAACGAAGTCACTGAGCTAATGTACAAGCTGGGTGCTTCGCCTCTGGCAGGACTGATACGTAGCACTTCTGATGTCATACAGACCACCATCAATGATTTGGCCCAGCTGATGGCGTACGACACCCAACGCAAGCCTCCTGCTATGATTGTGTTTGGTGGACCTCCAGGCATAGGCAAGACCCGGCTTGTTGAAGCTCTGGCCAGACAACTCGGGGAAGTCAGCCACTTCACCATGACCGTCGACCACTACGACACCTACACAGGCAATGCTGTGGCAATTTGGGATGAATTTGACGTGGATTCAAAGCAAGCTTTTATAGAGGCCACCATTGGTATTGTCAATTGTGCACCCTACCCCCTGAACTGTGATCGGCCGGAGGCAAAGGGTAGAGTGTTCACGTCAAAGTACGTGTTGGCCACCACCAATTGCCCCACACCAGTCATGCCCGACCACCCAAGAGCCATGGCATTCTGGCGCCGCATAACCTTTGTTGATGTCACCGCCCCAACAATTGAACAATGGCTAGTTGACAACCCCGGGCGCAAGGCACCAGCCAGCCTCTTCAAAGAAGACTTTTCCCACCTGCAGTGCTCCGTTCGTGGGTACACCGCCTATGATGAAAAAGGCAACACGCTCAGTGGCAAAGTGGCACGAGCCAAGTACGTGTCAGTCAACAACCTGCTTAACCTAATCAAGGAAAAGTACAATAGTGAAGCCACTGATATCAAACACCTGTGGTTCACTGTTCCACAGGGCATCCACAAGCAGGCACGAGACATCATACTGGGCTGGCTGCGGTTCCACTCTTACCCCAATACAGTGGCTGACAACATACCTCTCTCAGAGGTCAGGGACCCCACTTGCTTCGGGTATGTGGTGATATCGGATGTGGATCCACCACGACACGTGAGCGACCATGTGGCACACATTGAAGTGGAATCAATACTACGTAGTGACATCATGGATCTCCTGAGAGAGGGGGGTGGTGGCTTGTTCAGGGCATTGAAGGTGAAGAGCGCCCCCCGTAACTGTGTGATCAACAAGGTCATGATGCAGGCGCACCATACCACTTTGCAGGTGCTTACAAGCCAGGAACCAAACCCACCAAACCTACCCCGACCCAGGCGTCTGGTTTTTGTTGAATCACCAATTGACATCATTAGTGCCTTGCGACACCATGTGGGGTTCTGCACCATTCCAGGCATAGTCAAGTTGATCACATCTGGAGTGGGCCTGGGTGTGGAGAACCTGGGCAATTTCTTGCAGTCCATCGCTGGCAATGTCAGATTTCCTTTGCAGTCTGAGTGTTCACTGCTCAGGACACCTGGTGGTGACGTATTGTTCTACACCTCTGGACAGGCTGCAGTGTGGGCAACACCCGCACGCTTTCCAATTATCACTCCAGGAGAGGCTTCCGTTGGTAAAGATGTGTGCTCTGAATCCTCCTGGTGGGACATTCTTAAGGCCTTATTTAGCACGCTGGTGGTGGCCTTTGGCCCCATAGCCACATTGGTGCTCACCGCACACAACTTGGCCTACCTGAACACCCGTGACAACACCCTGAGTGAGGCTAAAGGGAAAAACAAACGTGGCCGTGGAGCCCGCAAGGCCATCGCCCTCAGGGACGATGAATATGATGAGTGGCAGGACATCATTCGTGACTGGCGCAAAGAAATGACTGTCCAACAGTTCCTGGACCTCAAGGAGCGTGCTCTATCTGGTGCCTCTGACCCTGACTCACAGAGATACAATGCCTGGCTCGAACTACGTGCCAAGAGATTGAGTGCCGGGGCCTACCAGCATGCAGTTGTGGACATCATTGGAAAATCAGGCCACAGGCGCGAAGTGATTCGCACACAGGTTATGCGAGCCCCTCGTGAGCCAAAAGCAGACACATATGACAGTGAGGGGCGTGGTTATGTGGTGCCCATGACTGCTCAGGAAAAACACACAGGCTGGGCAGTGCACATTGGGAATGGCAGGTTGGTCACCTGCACACATGTGGCCAACATGTGCGATCGTGTGGCCGATGTGGAGTTCAAGGTCACAGAAACGGACCGTGACACATGCATCATCAGCGCCCCGCTGGGCCATTTGCCCAGTGTTGCCCTTGGGGATGGACCACCAGCCTTTTACACCACCAACTTCCACCCCATCCGTGTGCTGGATGAGGGCAGTTGGGATACCACCACCACCCGCGTCACCGGGTGGCGTGTCATCATCAACAACGGGACCACAACCGCCCCTGGTGACTGTGGCCAACCCTACTTAAATGCACGCCGACAACTTGTGGGGGTGCATGCAGCAACAAGCACCTGTGGGGTCAAGAAGCTTGTGTCCAGAGTGCAGACCAGAAAGGCATCGAAAACCACTTTCCCTTGGAAAGGCCTACCCGTTACCAACATGCCTGACGCCGGTGGCCTGCCTACTGGCACGCGGTACCATCGTTCCATCGCGTGGCCCAAACAGTTGCCGGGGGAAACGCACGCCCCAGCCCCTTATGGCGTGAGTGATCCCCGGTACCCTTTCTCCCAACACCAAATGATTGCCAATAATTTACAACCATACACCAAAACTCCAGCCACACTGGACCAGACCCTGTTACAGCGTGCGGTCAAACACACAAAGGGTTACTTGGACCAAGTCATAGGGACACACAGGTCCCCAAACCTCACTTACGCGGCAGCAGTGGATTCAATGGCCCACGACACGGCATGTGGGCCAAATCTGCCTGGCCGCAAGAAGGATTACATGACAGACCAGGGGGAGCCTATTGGGCCACTTAAACAGATGCTAGAGGAGGCTTGGGACATGGCACACCGTGGTGTCCCGCGCAAGCACGAATATAAACTTGCGCTTAAGGATGAACTCCGACCCATAGAGAAAAATGACCAGGGCAAGAGGCGACTCCTTTGGGGCTGTGATGCTGGGGTGTCGCTGGTGGCCAATGCCGTATTCAAGCCTGTGGCCGAGCGCCTGGTGGACACAGTGCCCATGCACCCGGTGGCTGTTGGCATATGCATGGATAGTCCTCAAATCGAACAAATGAACCAGGCCTTAACTGGTAGGGTGCTGTACTGTTTGGACTACAGTAAATGGGACTCCACTCAAAATCCGGCTGTGACGAGCGCCAGTGTAGACATCTTGGCCTCCTATGCTGAGGATACACCACTCACCTCAGCAGCCATAGCCACACTGTGTTCGCCAGCTACCGGCCGGCTTGACGACATTGGCTTGACTGTTACAACAGGGCTCCCCTCTGGCATGCCGTTCACTAGTGTCATAAACTCTGTCAATCACATGATATACTTCGCCATGGCTGTGCTTGAGGCTTATGAGGAGTTTAAGGTGCCCTATATGGGGAACATCTTTGACAATGAGACTGTTTACACATATGGGGACGACTGTGTGTACGGCCTAACACCGGCAACGGCTTCCATCATGCCGGTGGTGGTCAAAAACCTGACCAGCTACGGGCTGGTTCCAACTGCTGCAGACAAGACCAACACCATTGAACCCACTGACACCCCAGTGTTCCTCAAGCGCACCTTCTCCCAAACACCCTTTGGGCTACGGGCACTGCTTGACGAAACAAGTCTAGCGCGGCAATGTTACTGGGTCAAGGCCAACCGCACCACAGATCTCTTTGAACCTGCGGCCGTTGATGTGGAGATCAGGAAAAATCAACTGGAGGTCATGCTCGCATACGCCAGCCAACACCCAAGAGCAGTGTTTGACAAGCTGGCAAATATGGTCGA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42,192
MW316751.1
Porcine sapovirus
Shen,H., Zhang,J., Gauger,P.C., Burrough,E.R., Harmon,K., Wang,L., Zheng,Y., Petznick,T., Li,G.
Veterinary Diagnostic Laboratory, Iowa State University
USA
2021-05-10
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,329
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
null
2020-09-01
null
null
Porcine sapovirus strain SaV/GIII/USA/KS_66065/2020, partial genome
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42,193
MW316752.1
Porcine sapovirus
Shen,H., Zhang,J., Gauger,P.C., Burrough,E.R., Harmon,K., Wang,L., Zheng,Y., Petznick,T., Li,G.
Veterinary Diagnostic Laboratory, Iowa State University
USA
2021-05-10
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Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,322
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
null
2019-05-01
null
null
Porcine sapovirus strain SaV/GIII/USA/NE_7211-1/2019, partial genome
GTGATCGTGATGGCTAATTGCCGTCCGTTGCCTATTGGGCACTTGCCCAACAGGATTTTTAGCACCCCACGACTCACCCCAGGGTGGGTGTGGGCGTGCACTAAGGAAGCCATGTTTAAGCTAGAGTGGCTTCAAGATCCGGTGGTCATTCGACAGCCGGATGTTTACATCGCGCAGGGGGTGGTGGATGATTTCTTCCGCCCCAAGCGTGTTTTACAGGGTGACCCACAGCTCATAGCACAGGTGTTACTTGGTGATGCCAGTGGCCCGCTGGTCGGGCCTGTCTCAATGCAGCAACTAACATCGTTGCTGCATGAGGTTTCACAGGCACTAAATGACCACAAGCATCCCCTGGCCAACAGATATACCAAAGCATCTTTGCAAAGATATGCAGACACCTTGTCCAACTATATACCTCTAGTGGAGATATTAACTGGACCAAAGGACCTCACCCCGCGTGACGTGCTCGAGCAACTCGCGGCTGGGCGTGAATGGGAGTGTGTCCCAGACAGCGCCCTCAAGAAGGTCTTTCGGGACATGTGGCAATACATTTGTGAGGGCTGTGACAGCGTGTACATTAAACTGCAGGATGTGAAGCGCAAGATACCCCACATTGACACCACTGTGTTGAAACAGTTCTTTATCACACTCACAGACACCATATCAATGGCAACAGCGCTAGACACCAAAACCTGGTTGGCACACATACTGGGCTGGCTCAAGCCCACCTGTTTGGTGATGATTATGCAACAACACATCAACTCCCCCCAGGGGTGGGCGGCCACACTAACTGCCCTTGCAGAGCTCTACTATGGCATCATGCCGCTCACCGAGGTGCTCGGGTCCATCGCCGGTTGGGTCACTGACAAGTTTGCCGATGTGACCACCAACACCTGGGGCAAGTTCAAGGCTTGGTGGGACAATCTTTACACACCGCAAGCCGGCAATGACTTGATCATACTAGGTGGTGTTGTCGGGCTGGTGTACTTCATGGTTTTTGGAGATGCACCCACCCAGATGTTCACCAAGAAGCTAATGAAGGTGTGTGGGTTCATCACATCCACTGTGGCAGCAATCAAGGCTGCTATGTGGATAGTTGATTACTTTAAGCAACGCGAACATGAACATCAGGTTCGCGTCACCTTGGCCAGGTGGGCCGCACTCCAGGAGGTCATCAAGCAGAACAGGTGTGCTGGCCTTAGTGAAGTCGCCAAACTGAAAGAATGCTGTGAAGTCTTGCTGAATGAGGTCACCGAATTGATGTACAAGCTGGGCGCCTCGCCTCTAGCGGGGTTGATACGTAGCACCTCTGATGTCATACAGACCACCATCAATGACTTGGCTCAGCTGATGGCGTACGACACCCAACGCAAACCCCCCGCCATGATCGTGTTTGGTGGGCCACCTGGTATAGGTAAGACCCGGTTGGTTGAAGCTCTGGCCAGACAGCTTGGGGAGGTCAGCCACTTCACCATGACCGTCGACCACTACGACACCTACACGGGCAATGCAGTGGCAATATGGGACGAATTTGATGTGGACTCAAAGCAGGCATTCATCGAGGCCACCATCGGTATTGTCAATTGTGCCCCCTACCCCTTAAACTGCGACCGGCCAGAGGCAAAGGGCAGGGTGTTCACGTCAAAGTATGTGTTGGCTACCACCAACTGTCCCACACCAGTCATGCCTGACCACCCGAGGGCCATGGCGTTCTGGCGTCGCATAACCTTCATTGATGTCACTGCCCCCACAATTGAACAATGGCTGGTTGACAACCCCGGGCGCAAGGCACCGGCCAGCCTTTTCAAAGAGGATTTCTCCCACTTGCAGTGCTCCGTGCGTGGGTACACAGCCTATGACGAAAAAGGCAACACGCTCAGTGGCAAGGTGGCTCGGGCTAAGTATGTGTCAGTCAACAACCTGCTCGACCTGATCAAAGAGAAGTACAACAGTGAAGCTACTGACATTAAACATCTGTGGTTCACCGTTCCACAGGGCATTCACAAGCAGGCACGAGACATCATACTGGGGTGGCTGCGGTTCCACTCCTACCCCAACACCGTGGCTGACAACATACCCCTCTCAGAAGTCAGGGACCCCACCTGCTTCGGGTATGTGGTAATTTCTGATGTGGACCCGCCTCGGCATGTGAGTGACCATGTGGCACACATTGAAGTGGAGTCAATATTGCGCACCGACATCATGGACCTTTTGAGAGAGGGAGGCGGAGGCCTGTTCAGGGCGTTGAAGGTCAAAAGCGCCCCTCGGAATTGTGTGATCAACAAAGTCATGATGCAAGCGCACCACACCACCCTGCAGGTGCTTACCAGCCAGGAACCAAACCCACCAAACCTGCCCCGACCCAGACGTTTGGTTTTTGTTGAGTCACCAATTGACATCATTAGCGCCCTGCGACACCACGTAGGGTTCTGCACCATTCCAGGCATAGTCAAGTTAATCACATCGGGAGTGGGCCTGGGTGTGGAAAACCTGGGCAATTTCTTGCAATCCATCGCCGGCAATGTCAGATTCCCTTTGCAGTCCGAGTGCTCACTACTCAGGACACCCGGCGGTGATGTGCTATTCTACACATCAGGGCAAGCAGCAGTGTGGGCGACACCCGCACGTTTTCCAATCATCACCCCGGGAGAGGCGACTGTTGGCAAAGATGTGTGTTCTGAATCATCCTGGTGGGACATCCTCAAGGCCTTGTTTAGCACGCTGGTGGTGGCCTTCGGCCCCATAGCCACATTGGTGCTGACTGCACACAACTTGGCCTACTTGAACACCCGTGAGAACACCTTGAGTGAGGCAAAAGGTAAAAACAAGCGCGGCCGCGGTGCCCGCAAAGCCATCGCCCTCAGGGACGATGAGTATGATGAATGGCAGGACATCATTCGTGACTGGCGCAAGGAAATGACTGTCCAACAGTTCTTGGATCTGAAAGAGCGCGCCCTTTCCGGTGCCTCTGACCCTGATTCACAGAGGTACAATGCCTGGCTGGAACTGCGCGCAAAGAGATTGAGTGCCGGGGCCTACCAGCATGCAGTTGTAGACATCATTGGGAAATCAGGACATAGGCGCGAGGTGATCCGCACACAGGTGATGCGGGCGCCCCGTGAACCAAAAGCAGACACCTATGACAGTGAGGGGCGTGGTTACGTGGTGCCCATGACTGCCCAGGAAAAACACACAGGCTGGGCAGTGCACATTGGAAATGGCCGACTGGTCACTTGCACACATGTGGCCAACATGTGCGATCGCGTGGCTGAGGTGGAGTTCAAGATCACAGAAACAGATCGCGACACTTGCATCATCACCGCCCCACTCGGCCACCTACCTAGTGTCGCCCTTGGGGATGGACCACCGGCCTTTTACACCACCAACTTCCACCCCATCCGTGTGTTGGATGAGGGTAGTTGGGACACCACCACCACCCGTGTCACCGGTTGGCGTGTTGTCATTAACAACGGCACCACAACTGCCCCTGGTGATTGCGGCCAACCGTACTTGAACGCACGCCGGCAGCTCGTTGGTGTGCATGCAGCAACAAGCACATGTGGGGTCAAGAAATTGGTGTCTAGGGTGCAGACCAAAAGGGCATTAAAGGCCACATTTCCTTGGAAGGGCCTGCCTGTCACCAACATGCCCGATGCCGGGGGCTTGCCCACTGGCACGCGGTACCACCGCTCTATCGCGTGGCCCAAGCAGCTGCCTGAGGAGACACATGCCCCTGCCCCCTATGGTGTTAATGATCCCCGGTATTCCTTCTCCCAACACCAAATGATTGCCAACAACCTACAACCCTACACCAAAACCCCAGTTGCATTAGACCAGACCTTGCTGCAACGTGCTGTCAAACACACAAAGGGCTACCTAGACCAAGTCATTGGAACACACAGATCCCCAAATCTCACCTATGCGGCAGCAGTGGACTCGATGGCCCACGACACAGCATGTGGACCAAATTTGCCTGGCCGCAAGAAGGATTACATGACAGATCAGGGGGAGCCCATTGGACCACTCAAACAAATGTTGGAGGAAGCTTGGGACATGGCTCACCGAGGTGTCCCGCGCAAGCACGAGTACAAGCTTGCGCTCAAGGATGAACTCCGGCCCATAGAAAAGAATGATCAAGGCAAAAGGCGCCTCCTTTGGGGCTGTGACGCTGGGGTGTCGCTGGTGGCCAACGCCGTGTTTAAACCCGTGGCCGAGCGCTTGGTGGACACCGTGCCCATGCACCCTGTGGCTGTTGGCATATGTATGGACAGCCCCCAAATTGAGCAGATGAATCAGGCTCTAACTGGTAGGGTGCTGTACTGCTTGGACTACAGCAAGTGGGACTCCACGCAAAATCCAGCTGTGACAAGCGCCAGTGTTGACATCTTGGCCTCGTACGCTGAGGACACACCACTCACATCAGCTGCCATAGCTACACTATGTTCGCCAGCCATCGGTCGACTTGACGACATTGGTTTGACTGTTACAACGGGTCTCCCCTCTGGCATGCCGTTTACCAGTGTCATAAATTCAGTCAACCACATGGTGTATTTTGCCATGGCTGTGCTTGAGGCTTACGAGGAGTTCAAGGTGCCCTATATGGGGAACATTTTTGATAACGAGACTGTTTACACCTACGGGGATGACTGTGTGTATGGCCTCACACCGGCAACAGCTTCCATCATGCCGGTGGTGGTCAAAAACCTGACCAGCTACGGACTGGTTCCAACCGCTGCAGACAAATCCCAAACCATTGAACCCACTGACACCCCAGTTTTCCTCAAACGCACCTTTTCCCAAACACCCTTTGGACTGCGGGCACTGCTTGATGAAACTAGTCTGGCGCGACAGTGCTACTGGGTAAAAGCCAACCGCACAACAGACCTTTTTGAGCCAGCAGCTGTTGATGTGGAAATCAGGAAAAACCAGTTGGAGGTCATGCTTGCGTACGCCAGTCAGCATCCAAGGGCAGTGTTTGACAAGCTTGCAAGTATGGTTGA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42,194
MW316755.1
Porcine sapovirus
Shen,H., Zhang,J., Gauger,P.C., Burrough,E.R., Harmon,K., Wang,L., Zheng,Y., Petznick,T., Li,G.
Veterinary Diagnostic Laboratory, Iowa State University
USA
2021-05-10
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,292
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
null
2019-06-18
null
null
Porcine sapovirus strain SaV/GIII/USA/NE_7211-4/2019, partial genome
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42,195
MW316756.1
Porcine sapovirus
Shen,H., Zhang,J., Gauger,P.C., Burrough,E.R., Harmon,K., Wang,L., Zheng,Y., Petznick,T., Li,G.
Veterinary Diagnostic Laboratory, Iowa State University
USA
2021-05-10
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,323
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
null
2019-08-06
null
null
Porcine sapovirus strain SaV/GIII/USA/IA_4517-1/2019, partial genome
CGTGATGGCTAACTGCCGTCCGTTCCCTGTTGGGCAAACGCCCAAGAGGATTTTTGGCATCCCACGACTCACCCCAGGGTGGGTGTGGGTTTGCCCAAACGTCAACAATGGCGTTTACAAAATTGAACAGCCCGAGAGGGTTGTCATCACGCCCAAGCGTGAAGTTTATCACGCCCAGGGTGTGGTTGAGGACTTCTTTCGTCCAAAGAGAGTCCTACAAGGAGACCCCCAGCTCATTGCACAAGTGCTCCTTGGTGATGCAAACGGGCCGTTGCATGGCCCGGTCTCCATGCAAGAGCTGGTGTCACTCTTGCATGAGGTTTCACAGGCACTCAAGGACCATAAACATCCACTTGCAGTGAGGTACAGCAAGGGGTCTTTGCAAAAGTATGCTGACACACTGTCCAACTACATACCACTCACAGAGATACTCACTGGCCCAAAAGACCTCACCCCACGTGACGTGCTTGAACAACTAGCAGCGGGGCGTGACTGGGAACACGTGCCAGACAACATGCTCAAGAAAGTCTTCAGAGACATGTGGCAACACATCTGTGATGGTTGCGATGGGGTGTACATAAAGTTGCAAGATGTGCGCCGCAAAATGCCACAGATTGACACCACAGTGCTAAAGCAGTTCTGTGTTACCCTAGCTGACACCATCACAGCAGCCACTGCATTAGACACCAAAACGTGGCTTGCACATGTGCTAGGGTGGCTGAAACCAACATGCCTGGTGATGATCATGCAACAACATGTGAACTCACCACCAGGTTGGGCTGCCACGTTGACAGCGTTGGCTGAGCTGTATTATGGCATCATACCCCTGACCGAAACCCTCAGTTCCATGGCTGCCTGGGTCACAGACAAGTTTGCAGACTTGACCACGCATGCATGGGCGAAGTTCAAAGCCTGGTGGGACGGCCTCTACACTCCACAAGCCGGCAATGACCTATTGATACTTGGGGGTGTGGTTGGCCTGGTGTACTTTATGATATTTGGTGATGCGCCAACCTCCATGTTCACCAAAAAACTAATGAAGGTGTGTGGTCTTATGACATCCACTGTGGCAGCCGTAAAGGCGGCCATGTGGATTGTCGACTATTTCAAACAACGTGAGCATGAGCATCAAGTACGTGTCACCTTGGCTCGGTGGGCTGCACTACAGGAAGTGATCAAACAGAACAGGTGTGCCGGTCTGCAGGAGATCACCAAATTAAAGGAGTGTTGTGAAGTGCTATTAAGTGAGGTCACCGAGTTAATGTACAAGCTTGGCGCTTCGCCACTTGCAGGCCTTGTACGGAGCACCTCGGATGTGATCCAAGGTTCTATCAATGAGCTGGCTCAGCTAATGGCATATGACACCCAGAGGAAGCCCCCAGCCATGATCGTCTTTGGGGGTCCGCCTGGCATTGGCAAAACGAGGCTGGTTGAGGCCCTAGCACGCCAGCTGGGTGAGGTCAGCCACTTCACCATGACTGTAGATCATTATGACACCTACACAGGCAATCCGGTGGCCATCTGGGATGAGTTCGACGTGGATTCCAAACAAGCATTCATAGAGGCCACCATCGGCATAGTCAATTGTGCCCCCTACCCGCTGAACTGTGACAGGCCAGAGGCCAAGGGCCGCGTGTTCACCTCCCGCTACATACTGGCAACCACCAATTGTCCAACCCCTGTGTTACCAGACCATCCACGTGCCATGGCCTTCTGGCGCCGCATCACCTTCATAGATGTCACGGCCCCAACCATTGAACAGTGGCTGGTTGACAATCCTGGTCGTAAGGCCCCAAGCACCCTGTTCAAGGAAGACTTTTCCCACTTACACTGTGTGGTGCGAGGGTACACGGCATACGATGAGAAAGGAAACACACTGAATGGTAAGGTTGCAAAGTCCAGGTACATATCGGTCAACAGCCTTGTCAATCTCATCAAAGAAAGGTATGAAAGTGAAGCTCACAGCCCCAAACACCTCTGGTTTACAACACCTCCGGCCATCAGGCAACAAGTCAGGGATGTGGTGCTTGGTTGGATGCGGTTCTACTCATACCCCAACACTGTGGCTGACAACATACCACTCTCAGAAGTCAGCGAGCCCACCTGTTTTGGGTACGTTGTGGTTAGTGAGGTGGACCCCCCCCGACATGTAGCCGAACACGTCGCACACATTCAGGTTGAGTCTGTCTCCCGCTGTGACATACTTGAGCTGCTGAAAGAAGGAGGGGGTGGTCTGTTCAGGGCTCTAAAAGTGGTAAGTGCACCACGCAGCACTGTTATCAACAAAATCGTGATGCAGGCACACCACACAACCCTACATGTTCTAACAGCCCAGGATCCCCAGCCACCCAACTTGCCCAGACCCAGAAGGTTGGTGTTCGTGGAATCACCTATTGACGTCATCAGCGCACTGCGACACCACGTTGGTTTCTGCACAATACCAGGCATTGTGCGCCTTGTCACTTCAGGCGTGGGCATTGGTGTGGAGAGCCTCGGCAATTTCCTGCAATCCATAGCTGGAAACGTGCGGTTCCCTTTGCAATCGGAATGCACTCTCATGAGAACCCCTGGGGGGGATGTGCTCTTCTACACCTCTGGACAAGCTGTGGTATGGGCCACGCCCTCACGATTCCCTATAGTGACACCAGGGGAGGGAGTTGTCGGCAAAGAAGTGTGCGCGGAATCATCTTGGTGGGACATCCTAAAAACCTTGCTTAGTACCATTGTGTCAGCGTTCGGGCCCATAGCCACACTCATGCTGACAGCCCACAACCTGGCCTACCTTAACACTAGGTCCGAGACATGCAGTGAGGCCAAAGGTAAGAACAAACGTGGGCGTGGTGCGCGCAAAGCAATTGCGCTGCGCGATGATGAGTACGATGAGTGGCAGGACATCATCAGAGATTGGCGTAAAGAGATGACAGTGCAGCAATTTCTGGACCTCAAAGAGCGGGCCCTGTCAGGAGCCTCCGACCCTGACTCACAAAGGTACAATGCTTGGCTGGAGTTGCGGGCCAAGCGCCTCAGCGCAGGCGCCTACCAACATGCAGTTGTGGACATTATTGGCAGATCTGGACACCGCCGTGAAGTAATTCGCACACAGATGATGCGGGCCCCCCGTGAACCCCACGCAGACACCTACGACAGTGAGGGGCGCGGGTTTGTGGTTCCCATGACTGCCCAGGACAAGCACACTGGGTGGGCTGTTCATGTGGGCAACGGCCGGCTGGTGACGTGCACACACGTGGCCAACTTGTGTGACAGGGTTGGGGGTGAGGAGTTTCAAATCACCAGCAGGGACCGTGACACCTGCATGATAACTGCTCCACTTGGACACCTGCCTAGTGTGGCCATTGGCGAGGGCAACCCGGCGTTTTACACCACAAATTTCCACCCAGTCAAAATTCTTGACGAAGGAAGCTGGGATACCACCACTACCCGCGTCGATGGTTGGCGGGTGATTATCACAAATGGAACAACAACAGCGCCTGGTGATTGCGGGCAGCCCTACCTAAATTCAAGGCGCCAACTCGTGGGTGTGCACGCAGCCACAAGCACTTGTGGCCTTAAAAAGTTGGTCTCCCGTGTGCAAAGCAAGAGGCAGGCCAAGGAAACCTTTCCCTGGAAGGGTCTACCTGTTTGCAGGATGCCTGACGCCGGGGGGTTGCCCGTTGGCACCAGGTACCATCGCTCAATCGCCTGGCCTGAGCCACAGCCGGGCGAGACGCACGCCCCGGCACCCTACGGTGTAAATGACCCAAGGTACCCTTTTTCCCAACACCAGATGATAGCCAACAATCTCCAACCTTACACTGCAACACCAACAAGCTTGGATAAAACCTTGCTTCAGCGTGCTGTGCGTCACACCAAGGGCTATCTAGATCAAGTCATTGGCACTCACAGGTCACCAAACCTCACCTACGCCGCGGCAGTTCAGTCCATGGCCCATGACACAGCATGTGGACCAAACTTGCCAGGCAGGAAAAAGGACTACATGACAGATGAGGGTGAACCAATAGGGCCCCTGAAAGACATGTTGGAGGAGGCGTGGGATCTTGCCCACCGGGGGGTTCCGAGGCGGCACGAGTATAAGCTGGCCCTAAAAGATGAGCTGCGGCCGATTGCCAAAAACGAGCAGGGCAAGCGCCGTTTGCTGTGGGGTTGCGATGCTGGTGTCTCAATGGTGGCCAACGCAGCCTTCAAGCCTGTGGCAGAAAGGCTGGCTGATACAGTACCCATGCACCCCGTTGCAGTGGGTATCTGCATGGATAGCCCCCAAGTGGAGAAAATGAACCAGGCGCTAACGGGCCGTGTGTTGTATTGCATGGATTACAGCAAGTGGGACTCAACGCAACATCCTGATGTCACCAGTGCCAGCGTGGAGATCCTTGCATCATACGCTGAGGACACCCCGCTAACATCTTCTGCCATAGCCACCCTCTGTGCCCCTGCCGTTGGGAGGTTGGATGACATGGGGCTCACCGTCACAACTGGATTGCCATCAGGGATGCCCTTCACCAGTGTGATCAATTCACTCAACCACATGATCTACTTCGCCATGGCCACGCTTGAGGCCTATGGTGAATTTGGTGTGCCCTATGTTGGTAATGTGTTTGATAATGAGACCATTTACACCTATGGTGATGACTGTGTGTATGGTGTGACACCAGCCACTGCCTCCTTGATGCCCACCTTGATCAAAAACCTGAGGAGTTATGGCCTTGTGCCCACTGCTGCAGATAAGTCTGAAACCATCGAACCCACCAGCACTCCTGTGTTTCTCAAGCGCACTTTCGCTCAAACAGCTTTTGGCTTGCGTGCGCTCCTTGATGAGACCAGTCTTGCCCGACAGTGTTACTGGGTTAAAGCAAATCGCACCACCAACCTGTATGAACCCGCAGCGGTGGACATCGAAATTAGGAGGAATCAGTTAGAGGTGATGCTGGCTTATGCCAGTCAACACCCAAGACCAACCTTTGATCGGCTGGCACAGTTGGCAG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42,196
MW316759.1
Porcine sapovirus
Shen,H., Zhang,J., Gauger,P.C., Burrough,E.R., Harmon,K., Wang,L., Zheng,Y., Petznick,T., Li,G.
Veterinary Diagnostic Laboratory, Iowa State University
USA
2021-05-10
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,346
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
null
2019-10-01
null
null
Porcine sapovirus strain SaV/GIII/USA/IA_0365/2019, partial genome
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42,197
MK965898.1
Porcine sapovirus
Wang,L., Marthaler,D., Fredrickson,R., Gauger,P.C., Zhang,J., Burrough,E.R., Petznick,T., Li,G.
University of Illinois at Urbana-Champaign, Veterinary Diagnostic Laboratory
USA
2020-01-13
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,338
GenBank
null
USA: Illinois
USA
Sus scrofa
null
2019
null
null
Porcine sapovirus strain IL31538, complete genome
GTGATCGTGATGGCTAATTGCCGTCCGTTGCCTATTGGGCATTTGCCCAACAGGATTTTTGGCACCCCACGACTCACCCCAGGGTGGGTGTGGGCGTGCACTAATGGAGCTGCATTCAAACTAGAGTGGCTCCAAGACCCGGTGGTCATACGACCCCCGGAGGTTTTTGTTGCGCAAGGGGTGGTAGATGATTTCTTCCGCCCCAAGCGCGTTTTGCAGGGTGACCCACAACTTATCGCACAGGTCTTACTGGGCGACGCCAATGGGCCACTCGTTGGCCCTGTGTCCATGCAGCAGCTAACATCACTGCTGCATGAGGTGTCGCAGGCCCTGAATGACCACAAACACCCATTGGCTGGCAGATACACCAGAGCCTCATTGCAGAGGTACGCGGATACACTGTCCAATTACATACCCCTTGTTGACATCCTGACAGGACCTAAAGACCTCACCCCACGAGATGTCCTTGAGCAACTCGCAGCAGGACGCGAGTGGGAGTGTGTACCAGACAGTGCCCTTAAGAAGGTTTTCAGGGACATGTGGCAGCACATCTGTGAGGGGTGTGATAGCGTGTACATAAAGCTGCAAGATGTAAAACGCAAGATGCCACACATTGACACCACTGTGCTGAAGCAGTTTTTCATCACACTCACAGACACCATATCCATGGCAACAGCCTTGGACACCAAGACATGGCTTGCACACATATTGGGCTGGCTCAAACCCACCTGTCTGGTAATGATCATGCAACAACATGTCAACTCTCCCCAGGGATGGGCCGCCACGCTAACTGCTCTAGCCGAGTTGTATTATGGTATCATGCCATTGACAGAGACACTTGGCTCTATTGCTGGTTGGGTGACTGACAAGTTTGCTGACATGGCGACCAACACCTGGAGCAAGTTCAAAACCTGGTGGGACAGCCTGTACACACCACAGGCTGGCAACGACCTCATCATCTTGGGGGGTGTGATTGGGCTGGTATACTTCATGGTGTTTGGTGACGCGCCCACCCAAATGTTCACCAAAAAGTTAATGAAGGTGTGTGGCTTTATCACCTCCACAGTGGCTGCTATCAAAGCGGCCATGTGGATAGTAGATTACTTTAAACAGCGTGAACACGAGCATCAAGTTCGTATCACGCTGGCCAGGTGGGCTGCATTGCAAGAGGTGATCAAACAGAATAGGTGTGCTGGCCTGTCTGAGGTGACCAAATTGAAAGAGTGTTGTGAGGTGTTGTTGAACGAGGTCACCGAGCTAATGTACAAACTCGGCGCCTCTCCTCTGGCAGGGCTGATACGCAGCACCTCTGACGTCATACAAACTACCATCAATGACCTGGCCCAACTGATGGCTTATGACACCCAGCGCAAGCCACCCGCCATGATAGTGTTTGGTGGACCTCCAGGCATAGGTAAGACCAGGCTAGTGGAAGCTCTAGCAAGACAGTTGGGAGAAGTCAGCCATTTCACAATGACCGTTGACCACTATGACACCTACACTGGCAATACTGTCGCAATCTGGGATGAGTTTGACGTGGACTCAAAACAAGCCTTCATTGAGGCCACCATCGGCATTGTCAACTGCGCCCCTTACCCCTTGAACTGTGATCGGCCAGAGGCAAAGGGTAGGGTGTTCACCTCTCAGTACATCCTGGCCACCACCAACTGCCCTACCCCAGTCATGCCCGACCACCCAAGGGCCATGGCCTTTTGGCGCCGTGTAACATTCATTGATGTGACAGCGCCAACAATTGAACAGTGGTTGGTGGACAACCCGGGCCGCAAGGCTCCTGCCTCCCTCTTCAAGGATGACTTTTCTCACCTACAGTGTTCAGTGCGTGGCTACACTGCTTATGATGAAAAAGGCAATACACTGAGTGGCAAAGTGGCCAGGGCCAAATATGTGTCAGTGAACAACCTGCTAGATTTGATCAAGGAAAAGTACAACAGTGAGGCCACTGACATTAAACACTTGTGGTTTACAGTCCCACAGGCCATACACAAACAAGCCCGTGATATTATACTGGGCTGGCTACGATTCCACTCTTACCCAAACACAGTGGCAGACAACATACCACTGTCTGAGGTCAGGGACCCCACGTGCTTCGGGTACGTGGTCATTTCTGACGTGGATCCGCCACGACATGTGAGTGACCATGTTGCCCACATTGAGGTGGAATCGGTACTACGCACCGACATCATGGATCTGCTGAGGGAAGGTGGTGGCGGCTTGTTCAGGGCCCTAAAAGTGAAGAGTGCCCCTCGCAACAGTGTTATCAATAAAGTCATGATGCAAGCGCATCACACCACCTTACAAGTGCTCACCAACCAGGAACCAAATCCACCAAACTTGCCACGCCCCAGGCGCTTAGTGTTTGTAGAATCACCCATTGACATCATCAGCGCGTTGCGGCACCATGTCGGTTTTTGCACCATCCCCGGCATCGTCAAGATGGTCACATCTGGGGTAGGTCTGGGTGTCGAAAACCTTGGAAACTTTCTGCAATCCATCGCTGGCAACGTTCGGTTTCCCCTGCAATCTGAGTGTTCACTGCTCAGGACACCCGGTGGTGACGTCCTATTTTATACCTCAGGGCAGGCTGCCGTTTGGGCCACTCCTGCGCGCTTCCCGATTGTCACCCCAGGTGAGGCGTCAGTTGGCAAGGACGTTTGTGCAGAGTCTTCCTGGTGGGATATTCTCAAAGCACTTTTCAGCACGCTTGTGGTGGCATTTGGGCCAATAGCCACACTGGTGTTGACAGCACACAACCTGGCCTATCTAAACGCCCGTGAAGGCACGCTCAGCGAAGCAAAAGGGAAAAACAAACGAGGGCGTGGCGCACGCAAGGCCATTGCCCTCAGGGATGACGAGTATGATGAGTGGCAGGACATCATACGTGACTGGCGCAAAGAAATGACTGTCCAACAATTCCTGGATCTCAAAGAGCGTGCCCTGTCCGGCGCCTCCGACCCCGATTCGCAGAGGTATAATGCCTGGCTTGAATTGCGTGCGAAGAGATTGAGTGCCGGGGCCTACCAGCATGCGGTTGTGGACATCATTGGAAAGTCAGGCCACAGGCGTGAAGTCATTCGCACACAGGTGATGCGAGCCCCTCGTGAACCAAAGGCAGACACCTACGACAGTGAGGGGCGTGGTTACGTGGTGCCCATGACTGCTCAGGAAAAACACACAGGTTGGGCAGTGCATGTTGGGAATGGCAGGTTGGTCACTTGCACACACGTGGCCAACATGTGTGATCGTGTGGCTGAAGTTGAGTTTAAGATCACTGAAACTGACCGTGACACATGCATCATCACTGCTCCGCTTAGCCACTTGCCCAGTGTGGCCCTTGGGGATGGACCACCAGCCTTCTATACCACCAATTTCCACCCCGTCCGTGTGCTGGATGAGGGCAGTTGGGACACTACAACCACCCGCGTCACCGGTTGGCGTGTCATCATCAATAACGGGACCACGACTGCCCCCGGTGATTGTGGCCAACCATACTTGAATGCGCGCCGGCAGCTTGTCGGGGTGCATGCGGCAACAAGCACATGTGGGGTCAAGAAACTTGTGTCCAGGGTTCAGACCAAAAGAGCATCAAAAGCCACATTTCCTTGGAAAGGTTTACCCGTCACCAACATGCCTGACGCTGGTGGCCTGCCCACTGGCACGCGGTACCACCGCTCCACCGCATGGCCCAAGCAGCTGCCAGAGGAGACGCACGCCCCCGCCCCTTATGGTGTGAATGATCCCCGGTACCCCTTTTCCCAGCACCAAATGATTGCTAACAATTTGCAACCTTACACCAAAACTCCAATCGCACTGGACCAGACCCTGCTGCAGCGCGCTGTCAAGCACACAAAGGGCTACCTGGATCAAGTCATTGGAACACACAGGTCCCCAAACCTCACCTACGCAGCAGCAGTGGACTCGATGGCCCACGACACGGCATGTGGACCGAATCTGCCTGGCCGCAAGAAAGATTACATGACAGACCAGGGGGAGCCCATTGGGCCACTCAAGCAGATGTTGGAGGATGCTTGGGACATGGCACACCGAGGTGTCCCACGCAAGCACGAGTATAAGCTTGCGCTTAAGGATGAACTCCGGCCCATGGAAAAGAATGACCAAGGCAAGAGGCGCCTCCTTTGGGGCTGTGACGCCGGGGTGTCGTTGGTGGCCAACGCCGTGTTCAAGCCCGTGGCCGAGCGTTTGGTGGACACTGTGCCCATGCACCCGGTGGCTGTTGGCATATGCATGGACAGTCCTCAAATTGAGCAGATGAACCAGGCCTTGACTGGTAGGGTGTTGTATTGTTTGGACTACAGCAAGTGGGATTCCACGCAAAACCCGGCTGTGACGAGTGCCAGTGTTGACATCTTGGCCTCCTATGCTGAGGACACACCACTCACCTCAGCAGCCATAGCCACTCTGTGCTCACCGGCCATCGGCCGGCTTGACGACATTGGTTTGACTGTTACAACAGGACTCCCCTCTGGCATGCCGTTCACCAGTGTTATAAACTCTGTCAACCACATGATATACTTTGCTATGGCTGTGCTTGAAGCTTATGAGGAGTTCAAGGTGCCCTATATGGGAAACATTTTTGACAACGAGACTGTCTACACATATGGGGATGACTGTGTGTACGGTCTAACACCCGCAACGGCCTCCATCATGCCGGTGGTGGTCAAAAACCTGACCAGTTACGGATTGGTTCCAACTGCTGCAGACAAATCCCAAACTATTGAACCCACTGACACCCCAGTGTTTCTCAAGCGCACCTTTTCTCAAACACCCTTTGGGCTGCGTGCACTGCTTGACGAAACAAGTCTAGCGCGGCAGTGCTACTGGGTCAAAGCCAACCGCACCACAGATCTCTTTGAACCAGCGGCCATTGATGTGGAAATCAGGAAAAACCAACTAGAGGTCATGCTTGCTTACGCCAGTCAACATCCAAGGGCAGTGTTTGACAAACTTGCAAATATGGTTGA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54,705
MK965900.1
Porcine sapovirus
Wang,L., Marthaler,D., Fredrickson,R., Gauger,P.C., Zhang,J., Burrough,E.R., Petznick,T., Li,G., Marthanler,D.
Kansas State University, Veterinary Diagnostic Laboratory
USA
2020-01-13
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Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,307
GenBank
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USA: Nebraska
USA
Sus scrofa
null
2019
null
null
Porcine sapovirus strain SaV/GIII/USA/NE7.5/2019, complete genome
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54,706
MK965901.1
Porcine sapovirus
Wang,L., Marthaler,D., Fredrickson,R., Gauger,P.C., Zhang,J., Burrough,E.R., Petznick,T., Li,G., Shen,H., Zheng,Y.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic Laboratory
USA
2020-01-13
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,311
GenBank
null
USA: Illinois
USA
Sus scrofa
null
2015
null
null
Porcine sapovirus strain IL20671, complete genome
CCTGTTGGGCAAATGCCCAATAGGATTTTCAGCACCCCACGACTCACCCCAGGGTGGGTGTGGGCGTGTGCTAAGGAAGCCATGTTTAAGCTAGAGTGGCTTCAAGATCCGGTGGTCATTCGACAGCCGGATGTTTACATCGCGCAAGGGGTGGTGGATGATTTCTTCCGCCCCAAGCGTGTTCTACAGGGTGATCCACAGCTCATAGCACAGGTGTTGCTTGGTGATGCCAGCGGTCCACTGGTAGGACCTGTCTCAATGCAGCAACTAACATCGTTGCTGCATGAGGTTTCACAGGCACTAAATGATCACAAACATCCCCTGGCCAACAGGTACACCAAAGCCTCTTTGCAAAGATATGCAGACACCTTGTCAAACTACATACCCCTAGTGGAGATATTGACTGGGCCAAAAGACCTCACCCCGCGCGACGTGCTCGAGCAACTCGCGGCTGGGCGTGAGTGGGAGTGTGTCCCAGACAGTGCCCTCAAGAAGGTCTTTCGGGACATGTGGCAGTATATTTGTGAGGGCTGTGACAGCGTGTACATTAAACTGCAGGATGTGAAGCGAAAGATACCCCACATCGACACCACTGTGTTGAAACAGTTCTTTATCACACTCACAGATACCATATCAATGGCAACAGCGTTAGACACCAAAACCTGGTTGGCACATATACTGGGTTGGCTCAAGCCCACCTGTTTGGTGATGATCATGCAGCAACACATCAACTCTCCCCAGGGGTGGGCAGCCACACTAACTGCCCTTGCAGAGCTGTACTATGGCATCATGCCGCTCACCGAGGTGCTCGGGTCCATCGCCGGTTGGGTCACTGACAAGTTTGCTGATGTAACCACCAATACCTGGGGCAAGTTCAAGGCTTGGTGGGACAATCTTTACACACCGCAAGCCGGCAATGACTTGATCATACTAGGGGGTGTTGTCGGGCTGGTGTACTTCATGGTTTTTGGAGACGCACCCACCCAGATGTTCACCAAAAAGCTAATGAAGGTGTGCGGGTTCATCACATCTACAGTGGCAGCGATCAAGGCTGCTATGTGGATAGTGGATTACTTCAAGCAGCGCGAACATGAACACCAGGTTCGCGTCACTTTGGCAAGGTGGGCCGCACTCCAGGAGGTCATCAAGCAGAACAGGTGTGCTGGCCTTAGCGAGGTCACCAAGCTGAAAGAATGCTGTGAAGTCTTGCTGAATGAGGTCACTGAACTGATGTACAAGCTGGGTGCCTCGCCTTTGGCGGGGCTGATACGTAGTACCTCTGACGTCATACAAACTACCATCAATGAATTGGCTCAGCTGATGGCATATGACACCCAACGCAAGCCCCCCGCCATGATCGTGTTTGGTGGGCCACCAGGTATAGGTAAGACCCGGTTGGTTGAAGCTCTGGCCAGACAGCTTGGGGAGGTCAGCCACTTCACCATGACTGTTGACCACTACGACACCTATACAGGCAACGCAGTGGCAATTTGGGACGAATTTGATGTGGACTCAAAGCAGGCATTTATCGAGGCCACCATCGGTATTGTTAACTGTGCCCCCTACCCCTTAAACTGCGACCGGCCAGAGGCAAAGGGCAGGGTGTTTACGTCAAAGTATGTGCTGGCCACCACCAATTGCCCCACACCAGTCATGCCCGACCACCCGAGGGCCATGGCATTCTGGCGTCGCATAACCTTCATTGATGTCACTGCCCCAACAATTGAACAGTGGCTGGTTGACAACCCCGGGCGCAAGGCGCCGGCCAGCCTTTTCAAAGAGGACTTTTCCCATTTGCAGTGTTCCGTGCGTGGGTACACCGCCTATGACGAAAAAGGTAACACGCTCAGTGGCAAGGTGGCTCGGGCTAGGTATGTGTCAGTCAACAATCTGCTCGACCTGATCAAAGAGAAGTACAACAGTGAAGCCACTGACATCAAGCACCTGTGGTTCACTGTTCCACAGGGCATTCACAAGCAGGCACGAGACATCATACTGGGTTGGCTGCGGTTCCACTCCTACCCCAACACCGTGGCCGACAACATACCCCTCTCAGAAGTTAGGGACCCTACCTGCTTCGGGTATGTAGTCATTTCTGATGTGGACCCACCTCGGCATGTGAGTGACCATGTAGCACACATTGAAGTGGAGTCAATACTGCGCAACGACATCATGGACCTCTTGAGAGAGGGAGGTGGAGGCCTGTTTAGGGCGTTGAAGGTCAAAAGCGCCCCTCGGAGTTGTGTGATCAACAAAGTCATGATGCAAGCGCACCACACCACCCTGCAGGTGCTCACAAACCAGGAGCCAAACCCACCAAACCTGCCCCGACCCAGACGTTTGGTTTTTGTTGAGTCACCAATTGACATCGTTAGTGCCTTGCGACACCACGTGGGGTTCTGCACCATCCCAGGCATGGTTAAGTTGATCACATCGGGAGTGGGCCTGGGTGTGGAAAATCTGGGCAATTTTCTGCAGTCTATCGCCGGCAATGTCAGGTTTCCTTTGCAGTCCGAGTGCTCACTACTCAGGACACCTGGTGGTGACGTGCTATTCTACACCTCTGGGCAGGCAGCAGTATGGGCAACACCCGCACGTTTTCCAATCGTCACTCCGGGAGAGGCATCTGTTGGCAAAGATGTGTGTTCTGAGTCCTCCTGGTGGGACATCCTCAAGGCCTTGTTTAGCACGCTGGTGGTGGCCTTCGGCCCCATAGCCACATTGGTGCTGACCGCACACAACTTGGCCTACTTGAACACCCGTGAGAACACCTTGAGCGAGGCAAAAGGCAAAAACAAGCGTGGCCGCGGTGCCCGCAAGGCCATCGCCCTTAGGGACGATGAATATGATGAATGGCAGGACATTATTCGTGACTGGCGCAAGGAAATGACTGTTCAACAGTTCTTGGACCTGAAAGAGCGCGCCCTTTCCGGTGCCTCTGACCCTGACTCGCAGAGGTACAATGCCTGGCTGGAACTGCGTGCAAAGAGGTTGAGTGCCGGGGCCTACCAGCATGCGGTTGTGGACATCATCGGGAAATCAGGACACAGGCGCGAGGTGATTCGCACACAGGTGATGCGGGCCCCCCGTGAACCAAAAGCAGACACCTACGACAGTGAGGGGCGAGGTTACGTGGTGCCCATGACTGCCCAGGAAAAACACACAGGCTGGGCAGTGCACATCGGAAACGGCCGATTGGTGACTTGCACACATGTGGCCAACATGTGCGATCGCGTGGCTGAGGTGGAGTTCAAGGTCACAGAAACAGATCGCGACACTTGCATCATCACCGCCCCACTCGGCCACCTGCCCAGTGTTGCCCTTGGGGATGGACCACCGGCCTTTTACACCACCAATTTCCACCCCATCCGTGTGTTGGACGAGGGTAGTTGGGACACCACAACCACCCGTGTCACCGGTTGGCGTGTTGTCATTAACAACGGCACCACAACTGCCCCTGGTGACTGCGGCCAACCGTACTTGAACGCACGCCGGCAGCTCGTTGGTGTGCATGCAGCAACAAGTACATGTGGGGTCAAGAAATTGGTGTCTAGGGTGCAGACCAAAAGGGCATCAAAGGTCACATTTCCTTGGAAGGGCCTGCCTGTCACCAATATGCCCGACGCTGGTGGCTTGCCCACTGGCACGCGGTACCACCGCTCTATTGCGTGGCCCAAGCAGTTGCCTGAGGAAACGCATGCCCCTGCCCCCTATGGTGTTAATGATCCCCGGTACCCCTTCTCCCAACACCAAATGATTGCCAACAACCTACAACCCTACACCAAAACCCCAGTCGCACTAGACCAGACCTTGCTGCAACGTGCCGTCAAACACACAAAGGGCTACCTAGACCAAGTTATTGGGACACACAGGTCCCCAAACCTCACCTATGCGGCAGCAGTGGACTCGATGGCCCACGACACAGCATGTGGGCCAAATTTGCCTGGCCGCAAGAAGGATTACATGACAGATCAGGGGGAGCCCATTGGACCACTCAAACAAATGTTGGAGGAAGCTTGGGACATGGCTCACCGAGGTGTCCCGCGCAAGCACGAGTACAAGCTCGCGCTCAAGGATGAACTCCGGCCCATAGAAAAGAATGATCAAGGCAAGAGGCGCCTTCTTTGGGGCTGTGACGCTGGGGTGTCGCTGGTGGCCAATGCCGTGTTCAAACCTGTGGCCGAGCGTCTGGTGGACACCGTGCCCATGCACCCTGTAGCTGTTGGCATATGTATGGACAGCCCCCAAATTGAGCAGATGAACCAGGCCTTAACTGGCAGGGTGCTGTACTGTTTGGACTACAGCAAGTGGGACTCTACGCAAAATCCAGCTGTGACGAGCGCCAGCGTTGACATCTTGGCCTCGTACGCTGAGGACACACCACTCACATCAGCTGCCATAGCTACATTGTGTTCACCAGCCATCGGTCGACTTGACGACATTGGTTTGACTGTTACAACGGGTCTCCCCTCTGGCATGCCATTCACCAGTGTCATAAATTCAGTCAACCACATGGTGTATTTTGCCATGGCTGTGCTTGAGGCTTACGAGGAGTTCAAGGTGCCCTACATGGGGAACGTTTTTGACAATGAGACTGTTTACACCTACGGGGATGACTGTGTGTATGGCCTGACACCGGCAACTGCTTCCATCATGCCGGTGGTGGTTAAAAACCTGACCAGTTACGGGCTGGTTCCAACTGCTGCAGACAAGTCCCAAACCATTGAACCCACTGACACCCCAGTGTTCCTCAAACGCACCTTTTCCCAAACACCTTTTGGACTGCGGGCTTTGCTTGATGAAACTAGTTTGGCGCGACAGTGCTACTGGGTCAAAGCCAACCGCACCACAGACCTTTTTGAGCCAGCTGCTGTTGATGTGGAGATTAGGAAAAACCAGTTGGAGGTTATGCTCGCGTACGCCAGTCAGCATCCAAGGGTGGTGTTTGACAAGCTTGCAAGCATGGTTGAGGCAACTGCAAATGCTGAGGGTTACCAAGT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54,707
MK965904.1
Porcine sapovirus
Wang,L., Marthaler,D., Fredrickson,R., Gauger,P.C., Zhang,J., Burrough,E.R., Petznick,T., Li,G., Shen,H., Zheng,Y.
Iowa State University, Veterinary Diagnostic Laboratory
USA
2020-01-13
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,333
GenBank
null
USA: Nebraska
USA
Sus scrofa
null
2019
null
null
Porcine sapovirus strain NE9550, complete genome
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54,708
MK962337.1
Porcine sapovirus
Martin,M., Darwich,L., Puente,H., Gomez de Nova,P.J., Carvajal,A., Franzo,G., Cortey,M., Diaz,I., Vidal,A., Martin Valls,G.E., Mateu,E.
Universitat Autonoma de Barcelona, Sanitat i Anatomia Animals, Facultat de Veterinaria
null
2019-11-17
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Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,320
GenBank
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Spain
Spain
Sus scrofa
feces
2017-05-30
null
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Porcine sapovirus strain SAV/Pig-wt/ESP/P284/2017, complete genome
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Porcine sapovirus
Martin,M., Darwich,L., Puente,H., Gomez de Nova,P.J., Carvajal,A., Franzo,G., Cortey,M., Diaz,I., Vidal,A., Martin Valls,G.E., Mateu,E.
Universitat Autonoma de Barcelona, Sanitat i Anatomia Animals, Facultat de Veterinaria
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2019-11-17
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
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GenBank
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Spain
Spain
Sus scrofa
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2017-09-22
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null
Porcine sapovirus strain SAV/Pig-wt/ESP/P452/2017, complete genome
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58,255
MK962339.1
Porcine sapovirus
Martin,M., Darwich,L., Puente,H., Gomez de Nova,P.J., Carvajal,A., Franzo,G., Cortey,M., Diaz,I., Vidal,A., Martin Valls,G.E., Mateu,E.
Universitat Autonoma de Barcelona, Sanitat i Anatomia Animals, Facultat de Veterinaria
null
2019-11-17
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,320
GenBank
null
Spain
Spain
Sus scrofa
feces
2017-07-04
null
null
Porcine sapovirus strain SAV/Pig-wt/ESP/P361A-2/2017, complete genome
GTGCTCATGATGGCTAATTGCCGTCCGTTGCCTATTGGGCATTTGCCCAACAGGATTTTTAGCACCCCACGACTCACCCCAGGGTGGGTGTGGGCGTGCACTAATAAAGCCATGTTCAAACTGGAATGGCTTCAAGATCCGGTGGTCATCCGACCGCCGGATGTCTTTGTTGCGCAAGGGGTGGTGGATGATTTCTTCCGCCCCAAGCGCGTTTTGCAGGGTGACCCGCAGCTCATCGCACAGGTTCTACTTGGTGATGCTAGCGGGCCATTGGTCGGCCCTGTATCCATGCAGCAGCTAACATCACTGCTGCATGAGGTGTCACAAGCGTTAAATGATCACAAGCATCCATTGGCTAACAGGTACACCAGAGCTTCCTTGCAAAGGTATGCTGATGCCTTGTCCAACTACATACCTCTTGTGGATATTCTGACAGGACCAAAGGACCTCACTCCTCGGGACGTTCTCGAACAACTAGCAGCAGGGCGCGAGTGGGAATGTGTGCCAGATAGTGCCCTGAAGAAGGTTTTTAGGGACATGTGGCAGTACGTCTGTGAGGGGTGTGATAGTGTGTACATAAAGCTCCAGGATGTGAAGCGCAAAATGCCACACATTGACACCACAGTGTTGAAACAGTTTGTCATCACACTGACAGACACCATCTCTATGGCAACAGCCCTGGACACCAAAACGTGGCTCGCACACATTCTGGGTTGGCTTAAGCCCACCTGCCTGGTCATGATCATGCAGCAACACGTCAACTCCCCCCAGGGGTGGGCCGCCACACTGACAGCCCTGGCAGAACTGTACTACGGCATCATGCCGCTGACTGAGACGCTTGGCTCTGTCGCCAGCTGGGTGACTGACAAATTTGCCGACATGGCAACCGGCACCTGGGGCAAATTCAAATCTTGGTGGGACAGCCTCTATACACCTCAGGCAGGTAACGACCTCATCATACTGGGGGGCGTTGTTGGGTTGGTGTATTTCATGGTGTTTGGCGACGCACCCACCCAAATGTTCACTAAGAAGCTAATGAAGGTGTGTGGTTTCATCACTTCCACAGTGGCTGCCATTAAAGCTGCCATGTGGATAGTGGATTACTTCAAACAACGCGAGCACGAACATCAAGTCCGCGTCACCCTGGCAAGGTGGGCTGCACTCCAGGAGGTGATCAAGCAAAACAGATGCGCTGGCCTCAGTGAGGTCACCAAGCTGAAGGAGTGTTGTGAGGTACTGCTGAACGAAGTGACTGAGCTCATGTACAAACTGGGCGCATCACCTTTGGCGGGTTTGATACGCAGCACCTCTGATGTCATACAAACCTCCATCAATGATTTGGCTCAGCTGATGGCCTATGACACCCAGCGCAAACCACCTGCCATGATAGTGTTTGGAGGTCCACCGGGCATAGGCAAAACACGCCTGGTGGAGGCCCTGGCTAGACAGTTGGGAGAGGTCAGCCATTTCACCATGACCGTCGACCACTACGACACCTACACCGGCAATGCAGTTGCAATCTGGGATGAATTTGATGTGGACTCAAAACAGGCTTTCATTGAGGCCACCATTGGCATCGTGAACTGTGCCCCCTACCCCCTGAACTGCGATCGCCCGGAAGCAAAGGGCAGGGTTTTTACGTCAAAGTATGTGTTGGCCACAACCAACTGCCCCACTCCAGTCATGCCCGACCATCCAAGGGCAATGGCCTTTTGGCGCCGTATAACATTCATTGACGTGACTGCCCCCACAATCGAACAGTGGCTGATAGACAATCCAGGCCGTAAAGCCCCGGCAAGTTTGTTCAAGGAGGACTTTTCCCACCTGCAGTGTTCAGTGCGTGGGTACACCGCCTATGATGAGAAGGGCAACACACTTAGTGGCAAAGTGGCCAGGGCTAAATATGTGTCAGTCAACAACCTCCTTGATCTGATCAAAGAAAAGTACAACAGCGAGGCCGCTGACATTAAGCACTTGTGGTTCACTGTTCCACAAGCCATCCACAAACAGGCACGTGACATCATCCTGGGGTGGCTACGGTTCCACTCATACCCAAACACTGTGGCAGATAACATACCCCTGTCTGAAGTCAGAGACCCCACGTGCTTCGGGTATGTGGTGATTTCTGATGTGGACCCGCCACGGCATGTGGCAGAACACGTTGCCCACATAGAGGTTGAGTCAATACTGCGCAATGACATCATGGACTTACTCAGGGAGGGCGGTGGAGGCCTGTTCAGAGCTTTGAAGGTCAAGGGTGCCCCTCGCAGCTGTATCATCAACAAAGTTATGATGCAAGCACACCACACCACCTTGCAGGTGCTGACCAGCCAAGAACCACACCCCCCAAATTTGCCCCGGCCCAGGCGCTTGGTGTTCGTCGAGTCACCAATTGACATCATCAGTGCCTTGCGACACCATGTCGGGTTTTGCACCATCCCGGGCATTGTCAAACTGATCACCTCTGGTGTGGGACTGGGCGTGGAAAACTTGGGCAATTTTCTCCAGTCTATTGCGGGCAATGTTCGGTTCCCTCTGCAGTCTGAGTGCTCACTACTCAGAACGCCCAGTGGGGACGTCCTGTTCTACACCTCAGGACAGGCCGCCGTCTGGGCCACACCCGCGCGCTTCCCGATAATCACGCCAGGAGAGGCTTCAGTGGGTAAGGAGGTCTGCTCTGAATCCTCTTGGTGGGATATCCTAAAAGCACTCTTCAGCACACTAGTGGTGGCCTTTGGACCCATCGCCACACTAGTGTTGACAGCCCACAACTTGGCCTATTTAAACACCCGCGAGAACACGCTCAGTGAGGCAAAAGGGAAAAACAAACGCGGGCGCGGGGCTCGCAAGGCCATAGCCCTCAGGGACGATGAGTATGATGAGTGGCAGGACATCATACGTGATTGGCGCAAAGAGATGACAGTGCAACAGTTTTTAGACCTCAAGGAGCGTGCATTGTCAGGTGCCTCAGACCCGGATTCCCAAAGGTATAACGCCTGGCTTGAGCTACGCGCGAAGCGGCTGAGCGCCGGGGCATACCAACATGCAGTGGTGGACATCATTGGCAAGTCAGGTCACAGGCGTGAGGTGATCCGCACACAGGTGATGCGTGCCCCACGTGAGCCAAAAGGCGATGTCTATGATAGTGAGGGGCGCGGATACGTTGTGCCCATGACTGCCCAAGAGAAACATACGGGTTGGGCAGTCCACATCGGGAATGGCCGACTGGTCACGTGCACGCACGTGGCTAACATGTGTGATCGTGTGGCCGATGTGGAGTTCAAAGTTGCAGAAACTGATCGCGACACCTGCATCATCACTGCCCCTCTAGGCCACTTGCCCAGTGTTGCGCTCGGCGATGGACCACCAGCATTCTACACAACCAACTTTCACCCTGTTCGGGTGTTGGACGAAGGCAATTGGGACACCACAACAACCCGTGTGACGGGGTGGCGTGTGATCATCAACAATGGCACAACAACAGCACCTGGTGACTGTGGCCAGCCGTACCTCAATGCACGGCGTCAGTTGGTTGGAGTGCACGCCGCAACTAGCACCTGTGGGGTGAAAAAGCTTGTGTCAAGGGTGCAGACCAAGAAGGCAGCAAAAACCACTTTCCCCTGGAAGGGTTTGCCGGTGACCACCATGCCTGACGCAGGTGGGCTGCCCACTGGAACCCGGTACCATCGGTCCATTGCGTGGCCAAAATTCCTACCAGAGGAGACGCATGCACCTGCACCCTACGGCGTGAATGATCCAAGGTACCCGTTCTCACAGCACCAAATGATTGCCAACAACCTGCAGCCTTACACCAACACACCTGTTGCCTTGGACCAGACACTGCTGCAACGTGCAGTCAAGCATACCAAGGGCTACCTTGATCAAATCATTGGGACCCACAGATCACCAAACCTCACTTATGCCGCTGCTGTGGAGTCAATGGCCCACGATACGGCGTGTGGACCAAACTTGCCTGGCCGCAAAAAGGACTACATGACGGACCAAGGAGAGCCAATTGGTCCTCTGAAACAAATGCTGGAAGAGGCATGGGACATGGCACATCGTGGTGTTCCACGCAGACATGAATACAAGCTCGCACTAAAGGACGAGCTTCGCCCCATAGAAAAGAATGATCAAGGCAAAAGGCGCCTTTTGTGGGGCTGCGATGCTGGCGTGTCGCTGATAGCCAATGCCGTTTTCAAACCAGTGGCCGAACGCCTTGTGGACACTGTGCCCATGCACCCGGTGGCTGTTGGCATTTGCATGGACAGCCCCCAGATTGAGCAAATGAACCAAGCCCTGACGGGCAGAGTGCTTTATTGTCTGGATTACAGCAAATGGGATTCCACACAAAACCCTGCCGTTACCTGCGCCAGTGTTGACATCTTGGCCTCTTACGCCGAGGACACACCCTTGTCATCTGCAGCCATAGCCACCCTATGCTCTCCAGCCGTGGGCAGGCTAGACGACATTGGCTTGACTGTGGCGTCGGGGCTCCCCTCTGGCATGCCTTTCACCAGCGTCATCAATTCAGTGAATCACATGATTTACTTTGCCATGGCAGTGCTCGAGGCCTACGAGGAGTTTAAGGTGCCCTACATGGGCAACATTTTTGACAACGAGACCGTCTACACCTACGGGGACGATTGTGTGTACGGCTTGACACCAGCCACAGCATCCATTATGTCGGTGGTTGTTAAAAATTTAACCAGTTATGGCTTGGTCCCCACTGCTGCAGATAAATCTCAAAACATCGAACCAACAAGCACCCCTGTGTTCCTCAAGCGCACCTTTTCTCAAACCCCTTTTGGTCTACGCGCACTCCTGGACGAGACCAGTCTGGCGCGACAGTGTTACTGGGTGAAGGCAAACCGCACCACAGATCTCTTCGAGCCAGCAGCTGTTGATGTGGACATCAGGAAAAACCAACTTGAGGTGATGCTCGCGTATGCGAGCCAACACCCCAGACCGGTGTTTGACAAGCTGGCAGGCATGGCTGA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58,256
MK962340.1
Porcine sapovirus
Martin,M., Darwich,L., Puente,H., Gomez de Nova,P.J., Carvajal,A., Franzo,G., Cortey,M., Diaz,I., Vidal,A., Martin Valls,G.E., Mateu,E.
Universitat Autonoma de Barcelona, Sanitat i Anatomia Animals, Facultat de Veterinaria
null
2019-11-17
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,320
GenBank
null
Spain
Spain
Sus scrofa
feces
2017-01-19
null
null
Porcine sapovirus strain SAV/Pig-wt/ESP/VC6/2017, complete genome
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58,257
LC469052.1
Porcine sapovirus
Oka,T., Nagai,M.
School of Veterinary Medicine; 1-17-71, Fuchinobe, Chuo-ku, Sagamihara, Kanagawa 252-5201
Japan
2019-03-26
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,211
GenBank
null
Japan:Tottori
Japan
Sus scrofa
null
2018-06-27
null
null
Porcine sapovirus Pig/HgYa2018/JPN/2018 genomic RNA, complete genome
GTGATGAGTATGGCGGCTACTTGCCGTCATAAACATTGTGCGCACTTCGCGCGTATTAACGCGCAGTGTGCTGAGTTGGGTGTTATCACACCTGACCACATTTGGGGCTATGGCTCATTGGGGTGTCAACCCCGCGGGCCTACGCCCAGTTTATATCGATTGCAGGGGCTGTTCGATTTCTTGGCCCCCGATCCCCAAACGTCCAAGGGGGATCGCAATTGTTACAACTTGCCCACCTTTGATGACCCAGTCTCTTTCCTGACGGCGCTACTTAGTGAACACACCAAACAGGTGGTTGGCCCTGTTACTACAGGGACAATTCATGCTCTGAGGCAATCACTAGTGGACGCCACCATGCGTGACACAGGGCCACTGGCCGGGAAATTGTCAAGGCAACAGATGAACAACATGCTGGCCGCGCTTGCGGTTCTCACGCCCACACCCACACACATACTTGAGAGTCGCACATTGCTCGACCAAGCCTTGCAGACACAGACACACAGCAACTTGCGGGCCGCGATTACTGCCGGCATTGTTAAAGGTGTAGACTGCATTAGAGACAAGACTTCTTGGGTTCGTGATTTCTTCACAGATTGCAAGAGTGGACTGGCGAAAGGAATCAAGGCCATCTGCTTGGGGCTCGCTGCCCATTTCGAGGACGCGCAAAACAGTGCCCAGACAGCATCTGATTTTCTTGGAGTTTTGAAACCAGTCACCCTGAGTATGATAATAAAGTGTCACAACAACACTCCAGCTGGCTGGGTGGTCACTCTAACGGCACTGAGAGAGTTGTATGGCTGTAGCACTTCAGACCTTGGCCAAATCCTCACCCAGCTGGTGGAACTGTTCATGAACGTTGCACAGGAGGCCTGGAGCCTTATCCTCAAGTTGGCAGGCTACACCCTCCAGTCGATAGACCTCGTTGGCTTTGCCGTTGTTGCAATGTGTGGATTGTACTTCATCTGCACTGGGTCACATTGCACCAAGTCCATCATTCAACGGTTCAAGTCGATTTTGGGTGGTGTCATCACTCTAGCCTCAGCGGTGCGGGCTTTTCAGTACTTCATGGAACTTGTGCATAGAGAAGAGGTGAACCGCAAAGTCACCAAGTTTATGGTTCGCGTTGCGGCCTTCATAGATGCCACAAAAATCAAGGATTTGAAGGCCTCCGAAGCACAAGAAGTGTTTGAATTTGCTGATGTGCTCATCTGTGAAGGTCAATCGTTACTGACTGACAACATAGGACCGCTGGTGCCACTTGTTCAATCGGCATTGCGTGATGTTGCGAACCATCGTGTAAACCTCCAAGCTCTTGTTGAGGCAAACAAACGGCAGGAGCCCCCCAAGATGTATGTGTTTTGCGGTCCCCCTGGAATAGGGAAGACGACCCTGGTTAACGCGCTCATAAAGGACTTAGGTGTAAAGTCGAGTGCTTTCTCCCTTATGATTGACCACCATGACCATTATACTGGAGAGGACGTGGCGGTGTGGGACGAGTTCGACACAGACCCAAAACAGGCATTCGTTCAGACTGTGATCTCTATGGTCAACACCGTCCCAATGCCGCTCAACTGTGACCGTGTGGAGAACAAGGGTCGTTGCTTTACTTCAAAGCTGATCTTGGCGACCACTAACAATGAGACCCCTTTGCAACCAAATGACCCCAGGTACGCGGCTTTTATGCGCCGTGTAACTTACATAGATGTGAGTGCTGAGCGCATCAGTGATTGTTACAACAATGGGCGCAAGCCGAACCCTAGCTTGTTTAAGGCTGATTACTCCCACTTGACGTTGATGCGGCGTTGTGCCATGGCTTACAACTCTGCTGGGAACTTGCCCAACGGTAAGTGCTTTGGACCCACCCCAATAACGTACAGCAAGTTGTTGGCCGACCTGAAGGTTGACCTGGCATCATTCAAGCTCCAGGGCCCCGAGTGGGAAGGCTTGTGGATTAAGTGCGTGAAGCCCCACCACGTCCCTGGTGTGACGGAGTATTTCAACTGCGTGTTTAAACACCTTGGCTCACCGAACCGTGTAGTCACCACACGCACGTTATCTGAGGTGGGTTTTTACGATGTCATCGTCACCACCGAGTCACCACCAGCGGGGTCGAAGTTTCATGAAGTGGTCATAGAGGGGTTCAGGACTATGCCAGATTGTGTCAGGGACCCCTATGACAGACCACTAAGCATGTTTGATTTTAGGGGCACCCCCTCGCAAACACTTTTGAACACCGCCATCAATCAGGTGCGTGGACACATGGTTATCACCTCCACGCAGCCCGTTGACGTCAGCAAGCTGCCCAGACCCAGGCGCATAGCCACCATTGACAACTGGTATGGTTTGATTAAGGCAGCTTTTGCCCACTGTACGTTGTTCACACCATTCGCCTTGATGAGGATGGTGCGAAACGGAGCCACTCTGACTCAGGGCAATGTTGAAGAGTTCTTCCGGAATGTGACCAAGGATGTGCGGTTCAGTGGAAACCCTGAATGCACGCTCATCAGGGGGCCCCTCTATGACATCTTATTTTTCACATGCGGTGGGAGCTGTACTTGGATCCTGCCAGGGCGAATGCCCGTCGCTGGGTTGGGCCCTATAGGGGACCTCACCGTGCCCACTAGATCGGTCGTCAGTTGCACCCTCACCCAGGCGATCGGTATGGCGTTAAATTCACTTGTCAACTTTTTGAAGCCGTATGTGGGTGTCTTCGCAACCTCACTTGCCCTATCAACAGTCTGGGGCACCACCTTGCAAAAGAAGAAAGGCAAGAACAAGAAAGGGGGCTTTCGTGCGCTCAGTGATGAGGAGTACCAGGAGTACCTAGATATCCAACGTGACTGGAGACAAAAGATGACTGTTGATGAGTACCTGGATGTAGTCGCAAACCCCGACAGTGACTATGTTGAGAGGTATGCCGCCTGGTCAAGGCTGCGTGGTTTGCGAATGGCGAATAACGCCTACAACCATGCCACAGTCACAGTGGGGCGCGATGGGATGTCCTGGGAAGTGCAAGGGCCCTCGGCCACCGTCAATCTCACAGCTGACGATGGCACAGTCGTAGGGTTTGCCAACCGCATAGGGCAAGGTGTGTTTGCAACTTGCACGCACCTGCTTGATATGGCAACGGCGGTTGATGGAGTCCCATTCACCCAAATGCAGACCGTTGGTGATTGCACCCTAATAAGACAGCAGGTACCAACCCCAGGTCCACACTATAGGGTTTCCCAGACGACGCAACCACGGGCGATTGGGGTGGCAAAGCACCCAGTCACCACAATTGGACAAACGCAGAAGGTTGTGAGCGGTGTCAACATTGTTGGCTGGAAAGTCACCACTGAGCACCAGACTCACAGTGGTGATTGTGGCACTCCTTACTTCGACTCAGAGGGGGCTCTGGTTGGACTTCACAGTGCCTCAGCCAATGTTGGAAACATCAAATTGGTATCTAGGGTGGTACCACAAAAACAGGCACAGGAGGTGCACGAGTTGACGTGGAAGGACTTGCAAGCCAATAGGAGCGAGCCAACCATGGGTCCACTGCCAGGGTCAACGAAGTACCACAAGTCATTCATGCACTTCGACTGTGGGTTTGAACCAGCCAACTTTGGTCCTTGTGACCAGCGTTGTCCAAAGCCACTCACCGATGTCATAGCTTCCCAGCTTAGACCCTACCAGGAGCAACCGCCACACATTAATGAGGAGCTGCTTGGCCGGGGCGTCAGACACGTCAGGGCATTTCTGAGGCACATACTTGGGACACATCGTAGGAAGCAGATCGATCTCGTCAGTGCTTTCAAGAGCCTCAACATGAAGAGCTCAAATGGACCTTGGTTTCCCGGGTGTAAAAGGGACTACACCATGGATGATGGTGCCCCGAATGCATTGCTCCACAACTACATCGAGTCAAAGATCATTGAAATGAAGAGGGGGGATTACACCCACGCCTACAAATTGTCCTTGAAGGACGAACTCAGGCCCAGTGAGAAAGTGAGAGCGGGGAAGCGCAGGCTCCTGTGGGGTTGTGACGTGGCCCTGTCCACCGTCTGTGCAATGGTGTTCAAACAGCTGTTTGACGACTTTGCAGCTGCTGCACCCTGCGTTGGAAGCTGCGTCGGGATCGACATGGACAACGTCGCAACCGTTAAGCTTCTTAACACCATGTTCACGGGCACTCACGTGGTTTGTGCGGACTACAGCCAGTGGGATTCGACTTTGCATCCTCGTGTGATTGAGGAGGCAGTTGACACGCTGCTTGAGTTTGTCGACAACACTGATCTTTGTGTGGCTGTTCGCAACATCTTGGTTTCTCGGCCACGTGGGCTTGTCTTTGACATTAGCGTGCCCACTTTTAAGGGGCTCCCCTCAGGCATGCCCGGCACAAGTATAATAAACTCCGTGTGCCACTTGATCTTGTTCGCATGCAGTGTGTTGGACTGTTACGCGAGAGTGAACGCGCCATACCACGGAAACGTGTTTTCCAATGAGCGGGTGGTGGTTTATGGCGACGACTGCGTGTATGGTTGGACCACAGCCACCGCTTCAATGGCCACACAGTTCTGGAACACCATGAGGTCTTTTGGCATGAAACCCACCAACCCTACCAAGGACGGGGACCCCGCGTTCACTGACACCATTCAGTTTCTTAAGCGGACAATAGTTCTCGCTGAGGGGACGCTGGTTGCCGCCCTTGAAAAATCTTCCTTGGAACGCCAGTTGTGCTGGATAAAGGGGCCCAAAACCACAACAATGGAGCCAATCTACCCACCAGACCCTGAGGTGCGTTTGATGCAGATCCAGAATGCGGTTTGGAGGGCCGCTGCCCACGGGCCAGAATATTTTGAGAAGTTTGAGCAACTTGCAACGGAATTGTGTAAGCGTGAGTTGCTGCCATACGCTGGGACAAAATACTCTGAGGCCATCGAGTTGATAACCAACATTTCATCAATCCCGCCCGATGGCGAGGCTATTGTGTATGTCATGGAGGGCCCAGAGGGCTC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64,334
KT922087.1
Porcine sapovirus
Lu,Z.
OARDC, Food Animal Health Research Program
USA
2016-01-09
null
Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,320
GenBank
null
USA
USA
null
null
1979-11-15
null
null
Porcine sapovirus strain Cowden, complete genome
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84,241
KT922088.1
Porcine sapovirus
Lu,Z., Chen,N.
OARDC, Food Animal Health Research Program
USA
2016-01-09
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Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,320
GenBank
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USA
USA
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2010-05-20
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Porcine sapovirus strain TCA-Cowden, complete genome
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84,242
KT922089.1
Porcine sapovirus
Lu,Z., Wang,Q.
OARDC, Food Animal Health Research Program
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Sapporo virus
Sapovirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,347
GenBank
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USA
USA
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null
Porcine sapovirus strain JJ259, complete genome
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84,243
NC_022787.1
Porcine torovirus
Sun,H., Lan,D., Lu,L., Chen,M., Wang,C., Hua,X., Cui,L., Yang,Z., Yuan,C.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2013-11-12
null
Porcine torovirus
Torovirus
Tobaniviridae
ssRNA(+)
28,301
RefSeq
1
China
China
Sus scrofa
feces
2010
null
PRJNA485481
Porcine torovirus strain SH1, complete genome
TGACGTATCTTTAGTTGATTTTGAAGGCTTGAAATAAAGCTTTTAAAACCCCTTTACGGTTTGTCCACCATACGGACATTGTTCAGACCGCAGTGTCTTGTCAAGGAGGTTCAGCCTTGACTTTACTTCTCTGTGAGGAATCTACTCAGAAATACTGCTTGCGTACTAGTAGTTACAAGAGTCGCCACCTAGTACTTACAAGCGGGTCAAACCGCCCTCCGGAACGGTGGAGACTCCCTCCCGAACGTGTGCTTGACGTGACCAACTTTGGTCTAGCTTTCTGAGAAATACTCCAGGGCTGTATCTAACCACTTTTGTTGTCAATTGTGGTTATTTATCAACCAAACATCGTGTGACTCACCTCCAGCTTTGCTGCAGGCCTTCGGGACTAAACGAGTTCATACGCTTTGTGGTTAGTTTTAGGACTTACCATCTCTCTATATCGCCAACCTGATTCTTTTTATTCTTAAGTTTTGCGTCTATACGCTATTTTCTTACGGTTGGCAGTTTGTTTGGTTGTTTGCACAGTTTCTTTTAATACCAATTTTTACTGTGCTTTTAGTTTTTACAGCTAAGGCTGTTTTTTATTTACTTAAGTTGCTCGAAGCAGCTTTTACAACATTAGTTCTAATTTCAATTGAAAAGCTAAGGGGTGTCAGGAAACAACATAGACGCCCTTCTTGTGGTGTCTAGTTGATATTAATCTGGCAAACAAATACCAGGTTATTGACTCTTTGTGGAGTGAGACTTACGAGTATCAATTTGCCTATTTTGGACACCCATACAAAAATGTCCAAGATCTCAAAAAAGCCCACCAGCGAAACCGAGCCGCTTTTGTGCTCAAGTATCTTGGACCTAACTTCCAGGTCCCAGTTTTTGGACCAGTGTTTAGGTACACCACAAAACCTGGTATCACTTTCAAAGATGGATCCATCTATCTCGGTGTCACCGACTTTGGGACTCAAGTCCACATCAACCCCCTACAGCTCTTTACAAAGTTTGCAATTACTTGTCCTGAACACCTCATCCACCCAGTTCAAATGGACTACCGGGTCTATCTCGAAACTGAAGGCTCAGTTGGAGAGAGAATTGTGCAGGGGGTTAGTGCCTTTGAACGATATTACCCCAGGAAGCAATTATGTGGAACTATCGTTAATGATCCCTTCACTTTTGACTGGGCAGGAAATATCCACAACTACTACTTCACCAGAAATGTACTCAGATACGGTACAAAATTGTATCAAGTTAATGGAAACAAACTTATTGAAAGGTGTTCAGGCATTGAGAGATCAGACATCTTGCCAAGAATACTTTCTGAATGCCAATTACCAATCCTTGATACCACCCCAACTCCTGCTGAACGCGATGAGGATGTCATCTGTTGCGACTTTGAGTCCCTTGACATTAGAGAGTACCCGGCTCTTGCTGAAACTAAGCCATTTCCATGGCGGCACTTCAGTCAGTTACACCTCAATGATTAAGGGGTTTGCAGATTGTTCTAGACGTGATGAAAAGTGTCTTAAGCGTCGCTTAACAAAGGAACAAAAGAGTCAGGAGGAAGGTAGCTTTGATGCTGGTAGGGTTATCACATTAGGGGGAAGGATGTACCGTTATGAGGTTATAGTCTTGAAATGCAGTGATGAGAATGATGATTTCACTGGTTATGATGACCCAATAGAACAGTTAGAATACGACCTTGAGACTGTGCCACATTGCTGGAAAGAACTTGTTGAAGGTAAGTGTCTTACCCGTGCTAAGGCAACTTGGGATCTTACAGAAGATCTTGATGTTGAGTTAGACCGTATACATATTGAGGAAGTCAAAAGTCTTCAGCGTTCAGGTGCTAGTTGGGATTTATCTAGTGTTGGTGTTGATAGTCAAGATTTAGAGGAAAGAGTCTTTTCACGTGTTTGGTTAAAACAATCTTCCAAGTACTTTGGTACAAAATTACAACAAGTGTCAGAGCTTTTTAAGAGTGAGGGTTTGGCAGAACTTGTATCAACAATGAATGGTATAAATTCAGTTAGGGTTGGTGATAAGTGGTTAAATTTTAGAGATCAAGGCAAATCATGTGTGTTTTTTGTTTATACCAATGATAACGTCTATTTGGCCACAACACGTCAAAGAGTTAGTTGTGATTACATTATTACCAAATTTAAGAGTGTTAAGTGGATTGGTAATAAACCTGATAAGTGTAAAATTACCAAAGTGTTAGCATGGTTGATTTCTGTTAATAGAGTTAAGAATAGCACCAGAGTAATTACACCAATGTTGTGTAAACAGGGTAAAATTAGTCATAAGGAGGTTGATTATTTAGATATGAGTGTTTTAGATAAATATGCAAGTTGTGCTTTTGGACCTACATGTGTACAGAAAGTTAAAAAGTTTTTATTAAGTTATTATAAGTGTGATAGTGATTTTGATTTATTAGATAATTTTTTGACACCTGTTAAATGTGGTAAAAAGAAAATGGTTTTTGAGAAGTGTTCTTGTAAAAATCACCAGTTTTATGTGGCACAGTTTGACAACCATGTTGTTTTGGGTTTGGGACGACCTAATGGCATTTTGTATCCTGAAGAAGTACCAGCTTATGCAAGAGTTTATGCCGTTGGGTTTGCCAATGATAAGCATGGTGTGGAGATTCACTACTATTCTGAGATGGATAACAACCAACTACCACAAGAATACTGCTTTGTTGCCCATGACCAACACCATCAACAGGGGGGTGAAGGTGACTATGTAAACTTTCACCCTGATGATTTTGAGGACGGTCCATTTCCTAACCTTGATTTTGATATTGATTATGATGACTTAATTTGGCCTGATGCACCAATTCCTGTACCTTCACCATATGGTTACCATCAGGGGCAACGTTTGAGAGATCTTTGTGTGGCAGATGGTGGTTTTGGTTGTGACTGCCCACGTTGTGATGGTAGTTATATTTACCACCCAGTTAGACCTCGTCATTATGAATCTTTTGAAGAAGTGGGTCCATTTTTTAAAATGTGTGAATTTAGGTTTACTTTTTCAGGCCAAATTTATAACCAGTTTTATGGGTTGGGGCCAAAAGTTCGTTTACAGGATCTGGTAAAAGCAGGTAACAAGTTGTTACAGCTGTTAATAAGGGGTCAGTTAGAAGAATTAGATTTACCATCTGAAATTTTGAATTGTTTAACATATTTGAAATTGGGTTTGAATATTCATCCATTTGTTTGGCCAGCCCCATTTTTTACTAGTAGTGGTGAGTGGGTTGATATTTTTGATGGTAATGATTTTGCGTTTGGTATAGATTTTAATAAGACAATTGGTATGATAGAGAGTGTGCAGTTTTTATGTGAAAACTTTCTTTCATTAAGTTGCCCATTGGAGAAGTTGTACCAGGATTTACATACTGATGAGGAAGTTAAACAAATGTTTTGGTCAACAACCCACATGAAATATATATATTTGGCATTAATACATAGTGAAAGGTCTTTTAAGGCTATTTTGAATAATACACAATTAAATAATTCTCAATTGGCAAAATTAATTACAATTGGAACTTTAGATGCCCCAATAGTTTCACCTTGTGCGTGTGAGGGTAATTGTGACCATGCTAAACCATATAATTGGACTGGTATATTAAATAAGGTATCTAAATATGCCACATTAAAGCAGTTGATTGGTTTGTCCTACCATGATAAAAGGTTATTGGTTTTAAAAATGACACAACGTTATTTTCAAATAGAAGAAGGATTATTTCAACCAGTTCAATTGTTAATGGCTCCATTTTATAGTTTTAATGACAATGTTGAACCAGATGAACAACCACTAACTGGGATGTTCCATCAAAACGTAATGCAAATGTTTGACACTTGTGTGATGCCTGATGTTATTACTAAACTGAAAAGAACTAGGGCTTCAGCTAATGACCTTTTTTGTATTTTGGCTGATTACTTTAGACGATCATTTGCTTACCGTTATTACCGTGTTGCCGAATTTTCAGATCTTGAAAAGACTCAAGTTTTTACAGATTTAACATCAGCATTGTCTGGTGGAACAAGTAAAATTGGTGCCTATGCTGTGTGTAGAATGGTGGAACCTAGAAGTGTAGCTACAACTTGTGAAAAGTCCATGTTCCCACCTGAAGTTGTACGAGCCATACGGGGTTATTTACCAGTTAGTTTTAATACAGGTGTTATGAATTATATAGATGAAAATTGTGATTTTGATTATTGTAATTTAGAGTTTTGTATTAGTGGTAAAGGTTTAACTAAGTTGAGTCAGAGTGGTTTAATAGAGTGTAAGACTAATTTATTTGTTGTTAGATTTAATACTGTACCTTTATTGTATGTAACCAGTAAACCTATATGCTTGAGTGAGTTTAGTTTAGAAGCTTCAGTGTCCTTGTTAGGTGATTTTAATGTGAATGTAGATATTGTTCCAGGTGCTACACTTTTTGGCTTATACTTTACTAATGGAAAGGCATGTCAAGATGTTTGGGAGACATTACCACGATTTGGACTTGGTTGTTTGTCAACTCCAAAGTTACATCCTAAATTTAAGCCATTTGATAATTTAGCTGAAGTTTGTTTTTTCAAACAAAAGGTTAAACTTGTTTCACTTGTTAATAATTTTACACCAGTTGAAATAGTTAAGCCAGAAGTTCCAAAAACTGTTATAGTGGATTTACTACCATATTATGGCTCAGTTGGGTTCCAAGGTTTTGTTGCACCTAAGTGTGTTCTACCTGGAACTTTAGCAACTCATTATTGTAAGTTGAATAATCAATTGGATAAGTGTGTTCAGGTTACAAAGTTGGCTGTTGCTCATGCATTTTATTTTAAACCCTCAAACATGGGTTCATTATTTCATTTAGATCCAATGTATGGTAAAAGCTATGGTAAACCAGCTGTAGTTCAATTTGAGCCTGTGGGACTTATAAAGGAGGTAAATGTACTTGTTTACCAATTTCGTGAACATGTTGCAATACATTACTTTCCTGAATGCCCCACCTATGT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6,766
ON649880.1
Porcine torovirus
Carvajal,A., Arguello,H., Cortey,M., Diaz,I., Gomez-Garcia,M., Puente,H.
Facultad de Veterinaria, Sanidad Animal
Spain
2022-10-05
SP-VC29
Porcine torovirus
Torovirus
Tobaniviridae
ssRNA(+)
28,262
GenBank
null
Spain
Spain
Sus scrofa
feces
2017-06-06
null
null
Porcine torovirus isolate SP-VC29, complete genome
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23,808
MT684462.1
Porcine torovirus
Qin,P., Yang,Y.L., Hu,Z.M., Zhang,Y.Q., Mei,X.Q., Liang,Q.Z., Lu,Z., Wang,B., Chen,R., Huang,Y.W.
Zhejiang University, Department of Veterinary Medicine, College of Animal Sciences
China
2021-05-11
null
Porcine torovirus
Torovirus
Tobaniviridae
ssRNA(+)
28,296
GenBank
1
China: Zhejiang
China
Sus scrofa
feces
2016
null
null
Porcine torovirus strain ZJU39, complete genome
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42,176
LC483442.1
Porcine torovirus
Fujii,Y., Kashima,Y., Sunaga,F., Aoki,H., Imai,R., Sano,K., Katayama,Y., Omatsu,T., Oba,M., Furuya,T., Tsuzuku,S., Ouchi,Y., Shirai,J., Mizutani,T., Oka,T., Nagai,M.
School of Veterinary Medicine; 1-17-71, Fuchinobe, Chuo-ku, Sagamihara, Kanagawa 252-5201
Japan
2019-12-27
null
Porcine torovirus
Torovirus
Tobaniviridae
ssRNA(+)
28,329
GenBank
1
Japan:Ibaraki
Japan
Sus scrofa
null
2018
null
null
Porcine torovirus Ibaraki/2018 genomic RNA, complete genome
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57,149
MH603532.1
Porcine torovirus
Xu,S., Zhou,J., Ye,X., Zhu,X., Chen,J., Sun,Z., Wang,D., Fang,L., Xiao,S.
Huazhong Agricultural University, State Key Laboratory of Agricultural Microbiology
China
2019-03-16
HB1
Porcine torovirus
Torovirus
Tobaniviridae
ssRNA(+)
28,276
GenBank
null
null
null
Sus scrofa
feces
null
null
null
Porcine torovirus isolate HB1, complete genome
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64,645
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Porcine torovirus
Pohlmann,A.
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, 17489 Greifswald - Insel Riems
Germany
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Porcine torovirus
Torovirus
Tobaniviridae
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GenBank
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Germany
Germany
Sus scrofa
null
2014-12-01
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PRJEB19039
Porcine torovirus isolate PToV_GER_L00926-K20_14-01_2014 genome assembly, complete genome: monopartite
GACATTGTTCAGACCGCAGTGTCTCGTCAAGGAGGTCCAGCCTTGACTTTACTACCCTGTGAGGAATCTACTCAGAAATACTGCTTGCGTACTAGTAGTTACAAGAGTTGACACCTAGTACTTACAAGCGGGTCAAACCGCCCTCCGGAACGGTGGAAACTCCCTCCCGAACGTGCGCTTGACGTGACCAACTTTGGTCTAGCTTTCTGAGAAACACTCCAGGGCTGTATCTAACCACTTTTGTTCAATTGTGGTTATTTTCAACCAAACATCGTGTGACTCACCTCCAGCTTTGCTGCAGGCCTTCGGGACTAAACGAGTTCATACGCTTTGTGGTTAGTTTTAGGACTTATCATTTTTTTCATCGCCAACCTGATTCTTTTTATTCTTAAATTTTGCGTCTATACGCTATTTTCTTATGGTTGGCAGTTTGTTTGGTTGTTTGCACAGTTTCTTTTAATACCAATTTTTACTGTGCTTTTAGTTTTTACAGCTAAGGCTGTTTTTTACTTACTTAAGTTGCTCGAAGCAGCTTTTACAACATTAGTTTTAATTTTGATTGAAAAGTTAAAGGGTGTCAGGAAACAACATAGACGCCCTTCTTGTGGTGTCTAGTTTGCTTTAATCTGGCAAACAAATACCAGGTTATTGACTCCTTGTGGAGTGAGACATACGAGTATCAATTTGCTTATTTTGGACACCCATATAAAAATGTCCAAGATCTTAAAAAAGCTCATCAACGAAACCGAGCCGCTTTTGTGCTCAAGTATCTTGGACCTAACTTCCAAGTCCCAGCTTTTGGACCAGTGCTTAGGTACACCACAAAACCTGGTATTACTTTCAAAGATGGATCCGTCTATCTTGGAACAACCGATTTTGGGACCCAAGTCCACATCAACCCATTGCAACTCTTTACAAAGTTTGCAATTACTTGCCCTGAACACCTCATCCACCCAGTTCAAATGGACTACCGGGTCTATCTCGAAACTGAGGGGTCATTTGGAGAGAGAATTGTGCAGGGGGTTAGTGCCTTTGAACGATTTTACCCCAAACGGCAATTATGTGGAACTATCGTTAATGATCCCTTCACTTTTGACTGGGCAGGAAACATCCACAACTATTACTTCACCAGAAATGTACTCAGGTACGGTACAAAATTGTATCAAGTTAATGGAAACAAACTTATTGAAAGGTGTTCAGGCATTGAAAGATCAGACATCTTGCCAAGAATACTTTCTGAATGCCAACTACCAATCCTTGATACCACCCCAACTCCTGCTGAACGCGATGAGGATGTCATCTGTTGCGACTTTGAGTCCCTTGACATTAGAGAATACCCGGCTCTTGCTGAAACTAAGCCTTTTCCGTGGCGGCACTTCAGTCAGTTACACCTCAATGATTAAGGGGTTTGCAGATTGCTCTAGGCGTGATGAAAAATGCCTAAAACGCCGTCTAACAAAGGAACAAAAGAGCCAGGAGAAAGGTAGTTTTGATGCTAACAAGGTTATCACATTAGGGGGAAGGATGTACCGTTACCAGGTTCTGGTTTTGAAGTATAGTGATGAGAATGATGATTTTACTGGTTTTGATGATCCTAGCGAACAGTTGGAATACACCCTTGAAACTGTTCCACATTGCTGGAAAGAACTTGTTGAGGGTAAATGTTTAACCCGTGCCAAAGCAACTTGGGATCTTACAGAAGATTTAGATGTTGAGTTAGACCGTATACATGTTGAAGAAACTAAGAGCCTTCAACGGTCAGATGCAAGCTGGGATCTATCTAGTATTGGTGTTGACAGTCAAGATTTAGAGGAAAAGATTTTTTCACGTGTCTGGTTGAAACAATCCTCCAAGTACTTTGGTACAAAATTACAGCAAGTATCAGAGCTCTTTAAGAGTGAGGGGTTAGCAGAATTAACACCAATAATGAATGGTGTAAACTCAGTTAAGATTGGTGATAAATGGCTAAATTTTAGAGATCAAGGCAAATCTAAAGTGTTTTTTGTTTATACCAATGATAATATTTATTTGGCTATAACCCGTCAAAGAGTTAGTTGTGATTACATTTTTACCAAGTTTAAGAGTGTTAGATGGATTGGTAATAAACCTGATAAGTGTGGAATTATTAAAGTGTTAGCATGGGTGACTTCTGTTAATAGAGCAAAAAATTGTACTAGAGTAGCTACACCAATGTTATGTAAACAGGGTAAAATTAGTCATAAGAAGGTTGGTTATTTAGATATGAGTGTTTTAGATAAATATGCTGGTTGTGCCTTTGGTCCCACATGTGTACAGAAAGTTAAAAAGTTTTTATTAAGTTATTATAATTGTGAGAGTGATTTTGATTTGCTAGATAATTTTTTAACACCTGTCAAGTGTGGTAGGAAGTGGATGGTTTTTGAGAAGTGTTCTTGCAAGAATCATCAGTTTTATGTAGCACAATTTGACAATCATGTTGTATTGGGTCTAGGAAGACCTAATGGCATTTTATATCCTGAGGAGGTACCAAGTTATGCTGAAGTTTATGCAGTAGGGTTTGCAAATGGAATGAGTGGTGTAGAGGTCCACTACTATTCTGAGATGGAACACAACCATCTACCACAAGAGTTTTGTTTTGTTGCCCATGACCAACAGCATCAAGAAGATGTTGATGGTGGTTATGTAAACTACCATCTTGATGATGTTGAGGATAACCCATTTCCTAGTTTTGATTTTAGTTTTGAGGGTGATGATTTAATTTGGCCTGATGCACCAGTTCCTGTACCGTCACCCTACGGTTATCATCATGGGCAACGTTTGAGGGAAATCTGTGTTGCAGATGAAGGTTTTGGTTGTGATTGCCTTCGTTGTGATGGTCTATATATTTATTATCCCGTTAGACCTCGTCATTATGAATCTTTTGATGAAGTTGGCCCATTTATTAAAATGTGTGAATTTAGATTGACTTATTCAGGACAAGTTTATAACCAATTTTATGGGTTGGGACCAAAAGTTTATATACAAGGTTTGGTAGAAGCAGGTAATAAATTGTTACAGTTGTTAACAAGAGGGCAGTTAGAAGAATTTGAATTACCATCTGAAATTTTAACCTGTTTAACCTATTTGAAATTAGGTTTAAATGTACACCCCTTTGTTTGGCCAGCTCCATTTTTTACAGGTACTGGTGAGTGGGTTGATATTTTTGATGGTAGTGATGTTGGCTTTTATGGTGAAGATTTTTCTAAAATAACGACAGGTATGGTTGAAAGTGTAAAGTTTTTGTTTAATAATTTTTACTCTTTAAGCTGCCCTTTAGAGAAGTTATACCAAAGTTTACATAATGATGAGGATGTTAAACGGATGTTTTGGTCAACAACCCATATGAAATATATTTACCTAGCCTTATTACATAGTGAGAAGTCTTTTAGAGCTATATTGGATAGTAGACAACTGAACAACCCAGAATTGGCAAAATTAATAACAATTGGCACACTTGATGCTCCAATAGTTTCACCTTGTCTTTGTGATGGTGACTGTGACCACGCTAAACCATATAATTGGACTGGTATATTGAGTAAGGTTTGCAAATTTGTTACATTAAACCAGTTGGTAGGATTATCCTATCGTGAGAAAAGACAATTAGTTTTGGAAATGACACAGCACTATTTTCAAACAGAAGAAGGGCTCTGCCAACCAGTCCAGTTGTTAATGACACCTTTTTATAGTTTTAATGATAATACAGAGCCAGATGAACAGCCATTAACTGGTGTGTTTCACCAACAAGTAATGCAGATGTTTGATACCTGTGTTATGCCTGACGTTATTATTAAATTGAAAAGGTCTAGAACTTCAGCTAATGATCTTTTTGGTATATTGTCTAATTATTTTAGACGATCATTTGTCTACCGGTGTTATTGCTTAGCTGAATTTTCACATGTTGAAAAAACTCAGGTTTTTACAGATCTGACATCTGCTTTGTCTAGAGGGACAAATATTGGTGGCTATGCTGTGTGTAGAATGGTTGAGCCTAGGAGGGAGGTTACTACTTGTGAAAGGTCAAACCTTCCACCAGAGGTTGTACAGACCATTCGAAAGTTTTTTCCTGTTAGTTTTAATACAGGTGTTATGAATTATGTAGATAATAATTGTGATTTTGAATATTGCAATTTAGAATTTTGTATTAGTGGTAAAGGTTTTTGTAGGTTAGGCCAGAGTAGGTGTATAAAATATAAGACAAATTTGTTTGTTATTAGATTTAGGACTTTGCCTTTGTTGTATGTTACTAGTAGACCTATGCATTTGAGTGAGTTTAGCCTAGATGTTGCAATTTCTCTTTTGGGTGATTTTAATTTAGATATAGATATTGTTCCAGGTGTTACTTTATTTGGCTTATATTTTACTAACGGGAAGGTGTGTGATGGTAATTGGGAGACGTTACCACGATTTGGACTTGGTTGTTTATCAACTCCAAAATTACATCCAAAATTTCAACCGTTTGAGAATTTAGCTGAGGTTTGGTTTTATAAACAAAAAGTTAGATTAGTACCACTTGTTGGCAACTTTGCGCCAGTTGATATAGTTAAACCAAATATTCCAAAAACTGTAACAGTTGAGTTACTACCATATTATAGCTCAATTGGATATCAAGGTTTTGTTGCACCTAAGTGTGTTTTGCCTGGAACTTTAGCAACCCACTACTGTAAGTTGAACCATCAATTGGATAAATGTGTTCAGGTTGTAAAGTTGGCAGTTTCTCATGCATTTTATTTTAAACCATCAAATATGGGTTCACCATATCACTTAGATCCAATGCTCGGTACTAGTTATGGAAAGCCGGCTATAGTTCAATTTGAACCTGTAGGACTTATAAAGGAAGTTAATGTACTTGTCTATCAATTTGGCAACCATGTTGCTATACACTACTTTCCTGAATGTCCTACATATGTGGCAGATGGACATTATCCAAGTAAATTTGTTGGTATATGGTTGGGCTATTTACCATCTGTTGAAGAAGTTAAAAT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Porcine torovirus
Anbalagan,S., Peterson,J., Wassman,B., Elston,J., Schwartz,K.
Newport Laboratories, Diagnostics
USA
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Porcine torovirus
Torovirus
Tobaniviridae
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GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
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2014-01-02
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null
Porcine torovirus strain PToV/NPL/2014, complete genome
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88,761
JQ860350.1
Porcine torovirus
Sun,H., Lan,D., Lu,L., Chen,M., Wang,C., Hua,X., Cui,L., Yang,Z., Yuan,C.
Shanghai Jiaotong University, School of Agriculture and Biology
China
2013-11-06
null
Porcine torovirus
Torovirus
Tobaniviridae
ssRNA(+)
28,301
GenBank
1
China
China
Sus scrofa
feces
2010
null
null
Porcine torovirus strain SH1, complete genome
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92,737
NC_023637.1
Posavirus 1
Shan,T., Li,L., Simmonds,P., Wang,C., Moeser,A., Delwart,E.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2014-03-06
null
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,840
RefSeq
1
USA
USA
Sus scrofa
feces
2010
null
PRJNA485481
Posavirus 1, complete genome
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6,627
MW654196.1
Posavirus 1
Liu,P.
Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangdong Public Laboratory of Wild Animal Conservation and Utilization
China
2022-06-16
null
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,226
GenBank
null
China
China
Sus scrofa
null
2019
null
null
Posavirus 1 strain WBP1, complete genome
AAGGTCCACCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGTTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTACTACTTGTGGCTCTAATTGTATTGGTTCTTGCTCTACTCAATCTAATGATGTTTCTAATTCCTTTAAAAAACAAAAACTACAAAAAACTTCTTACAATCTTGAAGAATTCTTTAACCATGATCTTCCTGATCCTATGGTTTCTTATCGTCAAAAAATTTCATCAAGAATTCTTGAAAATCAAGGTTGCATTCATTCTGATTCTCATCTTACTCCTCGTGTGTTTTCATTCTCTACTGTTGGCATGTTAAGATCCGAACTTTTTGATTCATTACATCTCCACAAATACAATAAGGTATTTGCTGCATCTTACCATGACATCACTGAAGATATGATCAACAATGGCTCATTAAACCTTGAAAAACTTACTGAATACTGTAATGGTAAACATTTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCATGAACCTATTGATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATCATTCTTGTTGATCCAATGAAAACTATTTCCTATTGCTCATCTCTATTTACTACTGTCATTAATCTTGTAAACTATTACGACCATGTACCTGTTGCAAAATGGCGTGCCTCTGATCGTGCTATAGTTGATCTTATTAATCAAAATTTTAGTCTTTACATTTTATCATTTACTCAAGATGAACTCATTCAGTATGCTATTGCTTGTTGTTATTCTTATGATTATTCTCATGTTGTTGAGTTCGTCAATGKCTTACTAAGCTATTATCAAATACTCTCTACTTTTATTTCTGACTCCGACTCTCCTGCTTCTAAACTTGTTGTGTCTTCATTCATTGCTAGATATTCCTTAGATCATTATTGGCGTTATGCTGAAGCTCAAGATGGTATCTTAAGTACTTTCTGGAGCTTAGTCAAAAGTGCTACTGGTTTATTCCAAGGTACTCTTAATCTGGTTTTGAATGCTGCTACTTCTGTCGCTAATGAATTGTTAACTAAATCTATGAATTTCCTTGCATGTACTTTAGATCCTACTTCTTCAATTGTTACCTCTGTTCTGAATTCAATTAGCTCAGTTATTACTCAATTATTCTCTGCTCTTAATCTTACTGTAACTTGGGTAGAAGAAAAAGCTGAAGATGTTGCTACAACATTTGAGGCTTTGACTTCCTTAATTAACGTTAAACTTAAATACAATCCTGATAAAACTACTAAATTAACTCGTGTTGGTCTTACTTTTATGTTCGTCGTCTTAGGTATTTGGGTTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGTTATAGCTTGTTATCTAAGATGTTCGAAATCCTTGCTAATTTCTCATCTCATTGGACACGCGTAGAACCTCAAGGTCCTAATACTTCTCCTGGTGAATTATCTATTCCTGGAACTATTATTTCTCTTATCTGCATTTTCGTTTGTGGTTGGCAATACGACAATCATCCTATTATCAACAATATTGGTAAACTAATCACTCGTTTTGCTCCTATGAAAGCTTCCATGGAAAAAGCCTTGTCCTGCGTTTGTTCTTTACTCCCTGCATGTATCTCTCGTTTTATTTTCGACTTATCTCCTGAATCTACTGACTCTATTCTCGCTGATATCTCTGATTTTATCACTGATGTTAACGTTGCTCGTGTTTTCTCTACTACTCCCGCTGCAATTATCTCTGACGAATATGTTCAGATTTTATCTGAACTTATGACTCGAGGTAAAGAATTACAAGATCGTGTTAGTAAAAATTCTGATATCCCTACTTCTCCTCTTTACAATCCATTCTTCCAATCCTTAACTCAAATCGTTTCCCTTACTACTAATATCGTTCAAATTCGTCGCTCATCTGAAGCTCGCCCTCGTCCTACCTGGGTTCACTTCTTTGGTGATGCTGGTGCTGGTAAAACATTTTTTGCTCAGAATGCTTCTGTTCTATTTGCTGGTATTCGTCGATTTGACGGTAAATCTGAATCTACTCCTAAAACCTATACTATTCCTACTGCTTCTCAATACTGGGATGGCTTCCAACAGGATGTCTATCCTATTACTGTATTTGAAGAAATCTGGGGTGTGATGGATGGTCAAACTGCTATGCAAGTTGATTATCCTAACACTCTTCTCCAATTAATGTCCTCTGCCACTTTCATGCCTCCAATGGCTGCTATTACTAGCGGTGTGGTTGGTATGAAAGGTACTACTTTTAACTCCACTCTCTTCCTCTCTTGTCATAATAATCCCTTCCCTAACAACTGGGGTGGTGATTCTTATGCTCTTGCTAGACGTATGAATTACCTCTTTAAAGTTGTTGCTCCTACTGCTGATAAACCCTATTGTGTCAATGAAAAAGTACTCGATAGTAAAGGTCAAACTCATGAACTCGCTGTTGAATATTTCTGCGCTCGTAAGGGTGTAGATTTTGATCAAGATTGCTTTGTTATGCGTTACCGCAAGGGTGAAAAGGTTGTTGTGAAGCCTTGTGTGTTAACTGTTGAAATGTATCGTAAAGCTTGGAAATTTGTACCTTACAAAGTAATTGTTGAAAATAATACTCCTGATGCTGTCGAAAGTACTCTCCCTAAAAATCCTGAAAATCCTGAATCTCCTGTTACTCAATTCTTAACTGTTGATGAAGTTATTGCTAATGTTATGGATACTGTCAACTTTAATGTTCGTGGTTTCTTGCAATCCGCTGAATCAAGTGGTCTTAAATATAATCTTAAACTCAAGGAATCATATGATGCTCTCTATCGTGCAATTGTCTTCGAGAAAGACCCTCAAAAAGTCTTTAATACAATCGTTGATAATCAAGTTGATGTTGTTCATGATAATTTAGTAATTGAAGATAACGTTGTTAATAATGCTCTTGGTGTTGTTGATGATCTTATTGATAGCGTTGCCGATGAAGTTAAGAATCAATCTTCCGAATTCCACTCTGTTACTACTGATTCTGATCCTGATGAAATCTACGTTCCATCAGGAGAAGAAAATGTCCCTGTTGCTCCTGAAAATACTCCTGATCCTAATCCTGAATCTGCTGTCTCATCTGCTGAAGCTCAAGGTCCAACAAAGCTTGTTGTTAAGTCTGATTCATCTTCTCCTGAAGTTGAGCTTGCTCAATTTGATGGAAAGATTGAACCCCAAACTTTCCTTAACAATGCTAATGGTTTCGTTCGTCGTCTTACCAATGCTCTTAAAGGTGGTCCTCGTGATGTTGAAGATCCTATTCATAAGAAAGTGATTCGTGGTTTGGTCCGTACTTTACCTGCTTATTCCTCATCAGACCCTATTATTGTCGAACCCACTATCTTAGGTCAAAACATCTCTGGTCTTACTCTTAATGCTGCTTTTGTTGAATCCTATGGTGCTTTATTTGAATCTCTATTTTCTACTATTTCTACTGAACTTTCATTTTCTCCTAAACTTGCAAACTGTAAATTATATTACTTCGGTAATACAATTTCTGATCCTAAAGTCCCTTTCAAAACTCATCCATTTTTCTCCTCAAAATTCAATACTGATATCTTCTTCCAATACTTATCCCTCATTTGCCCTTTTACTCAATTAGCTGTCGGTCTTCCTGCTGACGCTCAGTCTCAACCTCTACTCATCATTTCTGAAGATGATCAATATTATCTTATTGATCGTGCTGGTCGTGTAATTCGTAATATGAATGATTTGCGTGTTGGTGAAAATAATTCCTATGGTGTCTCTAATTATGATTTTTGTATTCAATCTCCTACTCATTCAATCGCTGCTGGTCTCCTTTACTGGAATGAAAATGCTTATCAATTACAACAGTTCGATGCCGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCTAATGGACAATCTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATCCTCCTTTCATTTGTCGTCATTGTGATGATCCTTTCGCCGTTTCTTGTTACAAGAAAGGTTGGAAGGTCTGTACTCATTGTCTACGTTTCTATCATGATACTATTTATCCTCTTCTTGAAGGTAGTAAATGTACCTCAATTGTTTCACATGGTTATCATTCACTCATTCCTTTATCTGAAATTAGCTCTGGAAATCTTACTGCTCTTTCACTTACTGTACCTAAACCCGATTATTCCTACTTTTGTTCTATGGCTGTTATTACTCTTGCATTATCTAAAAAGATAGATGGTACACGTTGCATTGAACACCGTTCTCTTTTACTTACTCAAGAATTAGCTGAATTCATTAATCTATCTTTATTACTGGATCAACAAGATGTTGTTGATGCTGCTCGTGATGTTAAAGTTTCTAATTGTTCTACATTTGGTGAAGTTGATGTTATGCCTACTATTCCTATTCAATATGATGATGATATTAAACATGTCGACATCATTGATGATTCTGTAATAAATAAAAGTTTTACTCCTCAAGCTCATTCATTTATTTCTTATGTTGTTGTTGGTGCTTCATTATGTGGTATTGTTTATGCTATTTATAAGTCATTTTTTCCATCTAAAGCTAAACTCTGGGAAAGTCAAAGTGAACCTCCTACTCGTGTAACTGCTGCTGTCCGTCGAAATAATCTTCCTAAATACTCTCATTTATCTGATCTTAAATCTGTTCCAAATGCTGTTTTAAAAGGTGATGCTGAATCTGCTGTTCAAATGACTACTGCTGAAGTCACTATTGATGGTGTTACTGTTAAAGGTTTCATGCCTTTATCTAATATATTTATGTCTTATACTCATACATTAACTCAATTGTTAAAGCATTACTCATCAATTAATCCTATTTATGTTAAAGTACACTTATCCAATGGTGATCGTGATTATTGTTTACGTAATTATGCTCCTGATTTGAATTCTGATGTTGTCGTTGATTTAGAAAATGATTTACTCGCTTGGAAATTACCTCCTCAAGTACAATGTGTTCCTGAACGTCTCTCTTTACTATGTACTAATGATGAATTATCTTCTG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30,169
MN090137.1
Posavirus 1
Chung,H.C., Nguyen,V.G., Huynh,T.M., Do,H.Q., Vo,D.C., Park,Y.H., Park,B.K., Chung,H.
Seoul National University, Department of Veterinary Medicine Virology Laboratory, College of Veterinary Medicine and Research Institute for Veterinary Science
Korea
2020-06-07
DTx_2019
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,840
GenBank
1
South Korea
South Korea
Sus scrofa
feces
2019-05-09
null
null
Posavirus 1 isolate DTx_2019, complete genome
TCTTGACATCATGAAAATGGTGTTATTTTTTCGGGGGAAAGGTTCCCAGAAAAGGGGGTTTTTCTGTTGCTGGAAAAGGGGCTTTCTTTTTTATCTCCTTAAACTCCCTAATTTGCATTCTGGGGGATCAAGCGGCCCAAATCCCAAGCGTTTATCACTTCCTTGCGTGCGTACCCGAAAATTTATTGAACTTGGCTTGAATTATAAGCAATGCTTCTTATAGCGGACACTTTGAGAATATAATGCTTGCATGGATTAATGTATACTGTTTCCAATAACAAACCTAGACACGCAGTTGCGTTGATGGTTGTATCAATCACATACTTGTGTTGAACTCGTGTTAATCCTCGATCGCTATATGTTTGCCTCCTACTTCCAATAAAATAGATTACATACGCGACATGCCTTTGTGGTTTACCTATTGGCCTCTGTCAAAAACAAATCGTTTGATTTGTAGTCTCCTGGCCTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCTCGTCGGATGGAAAGGTCCATCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGCTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAATTCTTGTGGCTCTACTGTATCTAGTTCTTGTTCTACTAACTCTACTAATGTTACTGGTTCTAATTCTAATAATGCTACTGATTCTATGTTCGAAAAACTCTCCTATGTCAATATAGATAATGTCCTTGATCCTGATATCCCTCACGTCACTGAAATTCATCGCAAGCGGATTTCAGATGATATCCTCGAATCTCAAGGCTGTACTTGCTCTGAACCTATTCTCACTCCTCGTGTATTTTCTTTCTCTACTCTTGGCATGCGTAAATCTGAATTATTTGATCCTCTGTATCTTCATAAATATAATAAAGTATTTTGCAATTCTTATCACGATATTACTTTAAGCATGATCAAGAATGGATCAATCAATCTTGATAAACTTGATTCTTATTGTAATGGTAAATTATTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCATGTACCTATTGATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATTATTCTGGTTGATCCTATGAAAACTATTTCCTATTGTTCTTCTTTATTCACTACTGTTATTAATATTGTTAGAATTTATGATCAAGTTCCTGTTGCAAAGTGGCGAACCGCTGATCATGCTATTGTTGATCTTATTAATCAAAATTTTAGTCTTTATATTCTTTCGTTTACTCAAGAAGAACTTATGCAATATGCTATAGCTTGTGGCCGCCGCTATCATTATTCTCATGTTGCTGAGTTTGTTAATGTTTTGTTGACTTATTACCAAATATTATCAACTTTTATTTCTGATTATGATTGTCCTGCTTCTAAACTTGTCGTTTCATCTTATATGGCTCGATACTCTCTTGATCACTATTGGCAATATGCTGAAGCTCAAGATGGTATCTTTAGTGATTTTTGGAACTTAATTAAAAGTGCTACTGGTTTATTCACTGGTACTTTAGATACTATTCTTAAAGCTGCTACTAGCGTTGCTAGTACTACTTTAACTAAGTCAATGAACTTTCTTGCTAATACTCTTGATCCTACTTGTTCCGTCATCAACTCAGTTCTTAATTCTATTTCTTCCGTTATTGATAAATTATTTAATGCTCTTAATATTACTATTTCCTGGGTGGAAGAAACAGCTGATGATGTCGCAACTGGATTTGAATCTTTATTTAATCTTATTAGTCTTAAATTCAAATATAAACATGATAAAGTTGCTAAGTTAACTCGTGTTGGTTTAACCTTCATGTTGGTTGTCTTAGGTGTTTGGGTTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGCTACAGCTTATTATCTAAGATGCTTGATATTCTCTCTAATTTTTCATCCAAATACACTCGTATGGAACCTCAAGGTGCTGACGTTGGTCCTGGTGAACTCTCTATTCCTGGTACTATTATTTCTCTCATCTGCATTTTTGTCTGTGGCTGGGAATATGCTGATCATCCTGTTATTAATAATATTGGTAAACTTATTACTCGTTTTGCTCCAATGAAAGCTTCTATGGAAAAGGCTCTATCCTGTGTATGTTCTTTACTTCCTGCTTGTATTTCTCGTTTTATCTTCTCATTATCTCCTGAAAGTACTGATGCTATTTTGGCTGATATTTCTGATTTTATTACTGATGTCAACATTGCTCGTGTGTTCTCTACTACTCCCTCTGCTATTATTTCCGATGAATATGTTGATATCCTCTCAAAACTTATGACTCGTGGTGATGAATTAGTCAAACGTGTTAATGCTGATCCCAAAATTCCTCAATCTCCTCCTTATTCTCCATTTTTCCAATCTTTATCTCAAATTACTGCTTTGACTACTAACATTGTTCAAATTCGTCGATCTTCTGAGGCTCGTCCTAGACCCACTTGGGTCCACTTCTTTGGTGATGCTGGTGCTGGTAAAACTTTCTTTGTTCAAAATGCTTCTACTTTGTTTGCTGGTATTCGACGTTTTGATGGTAAGTCTGAGTCCTGTCCTAAGTCTTATGTCATTCCTACTGCCTCTCAATATTGGGATGGTTTCCAACAAGACGTTTATCCAATTACAGTATTTGAAGAAATTTGGGGTGTTTTAGATGGTCAATCTGCTTTACAAATCGATTATCCTAATACTCTTCTGCAACTTATGTCTTCAGCTACATTCATGCCTCCTATGGCTGCTATTACAAGTGGTGTAGTCGGTATGAAAGGTACTACCTTTAATTCAACATTGTTCCTTTCTTGTCACAACAATGCTCTTCCTAATAATTGGGGTGGTGATGCCTATGCTCTTGCTAGACGTATGAATTATATATTCAAAGTTATTGCTCCTACTTCTGATAATCCTTATTGTGAAACTCAGAAAATGCTTGATTCCAAAGGCAATGTTCATGAAGTTACTGTTCAATATTATTGTGGTCGTAAAGGTATAGATAGTGATCAAGATTGTTTTATGATGAAGTACGCTCAAGGCGAGAAGGTTGTTGTTAAACCTTGTGTGCTTACTGTCGATCTCTACCGTAAGGCTTGGCGTTTTGTTCCTTATCTCACCCAAGTCAAAAATAATACTCCTGAAATTATTGCTACTGAACTTGCTGAAAATCCTGCTGATCCTAATTCTCTTAAAACTCAATCTTTGACTGTTGATGAAGTTGTATCTAATATTCTTAGTACTGTTGATTTTAATGTTGCTGGTTTCTTAAAGTCCGCTGAATCCAGTGGTCTCAAATATAATCTTAAACTTAAGGAATCATATGATGCTCTTTATCGTGCTATTGTGTTTGATAAGAACCCTCAAAAGGTTTTTGATGCTATTGTTGATAATCAAATCGATGCTGTTCGTGATAATTTAGATCCAACTGAAGGTATTGTCAATAATACTCTTGAAGCTGCAGATGATGTTATCGAAGGTGTTATTGCTGAAGTCAAGAATCAATCTTCTGAATTCCAATCCGTTAATTCTGACTCTGATCCTGAAGAAATTTATAAACCTGATGGTGATGAACCAGCTCCAGCTCCGGATCCTGATCCTGAAACTGCTGGTCCTAAAGCTGAAACTCAACGTCCATTTAGTAAACGTACTGTTAAGTCTAGTAATGATTCAACTGAACTTGAATTGTCTGAATTTGATGGTAAAGTCGATCCTCAAACCTTCCTTGATAATTCTCGCGATCTCGTTCGTCGTGTCACAAATGCTATGAAAGGTGGTCCTCGTGATGTTGAAGATCCTATTTCTCGTAAGATTATTCGTGGTCTTGTCCGTACACTTCCTGCTGTTAAGTCCAATGATCCCATAATTGTTGAACCTAATGCTGCTGGTCAAAACATCTCTGGTGCTGTTCTAAATGCTGCCTTCTATGAATCTTATGCTACTCTATTTGAATCATTATTTGCTGTGGTTTCTACTAGTTTGTCTTATTCTCCTTCACTTGCTAATTGTTCTATTTATTTCTTTGGTCAAACAATTAGTGATTCTAAGGTTCCATTTGCTAACCATCCATTCTTCTCTTCTAAGTTTAATACTGATATCTTTTATCAATACTTATCACTCATTCGTCCTGTTACTACTATTGCTCCTGGATTCCCCCCTGAAATTAAGTCTCATCCATTATTTATTATTGCTGAAGATTCAATTTACTATTTGGTTGATCGTAATGGTACTGTAATCCGATCTATGGATGATCTACGTGTTGGTGAAACTAACTCTTATGGTGTTTCTAATTATGATTTTGCTATTCTATCTCCTACCAATCCAATTGCTTCTGGTCTTTTATATTGGAACGAGAATGCCTATCAACTTGTTAATTTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCTAATGGACAAACTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATTCTCCATTCATTATTCAACATTCTGATGATCCTTTTGCTCCATCTTGTTATCAAGGTGGTTGGAAGATCTGTGTCCATTGTCTTCGTTGCTATCATCCTGTCATCTATCCTCTTCTTGAAGGTAGCAAGTGTACCTCAATTGTTTCACATGGATATCATTCTCTTATTGAATTGTCTGAAGTTAGTTCTGCTAATCTTTCGGCTCTATCATTCACTGTACCTAAACCTGATTACTCTTACTTCCGTTCTATGGCTGTTTTAACTCTTGCCCTTTCTAAACTTACTGACGGTACTAAACATGTTGAAAATCGAATCCTTCATTTTACCTATGATTTACCTAAGGTTTTTAACGAAACTCCATTGTGGAAAGGTTCGGGCAAAAATGTTCTCGAAGCTGCTAGTTCCATGAAAGTTTCTACTAGTGACTCTTATGGCGTAGTTGATACCATGCCTTCCATTCCTGTTTTATATGATGATGATGTTAAACATGTTGATGTCATTGATAATTCTGTAATTAATAAAGCTCTTACTCCTCAATCACATTCATTCATTTCTTACGTAGTTATTGGTG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49,858
MN090138.1
Posavirus 1
Chung,H.C., Nguyen,V.G., Huynh,T.M., Do,H.Q., Vo,D.C., Park,Y.H., Park,B.K., Chung,H.
Seoul National University, Department of Veterinary Medicine Virology Laboratory, College of Veterinary Medicine and Research Institute for Veterinary Science
Korea
2020-06-07
NP1x_2018
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,840
GenBank
1
South Korea
South Korea
Sus scrofa
feces
2018-02-07
null
null
Posavirus 1 isolate NP1x_2018, complete genome
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49,859
MN090139.1
Posavirus 1
Chung,H.C., Nguyen,V.G., Huynh,T.M., Do,H.Q., Vo,D.C., Park,Y.H., Park,B.K., Chung,H.
Seoul National University, Department of Veterinary Medicine Virology Laboratory, College of Veterinary Medicine and Research Institute for Veterinary Science
Korea
2020-06-07
SS_2017
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,840
GenBank
1
South Korea
South Korea
Sus scrofa
feces
2017-05-17
null
null
Posavirus 1 isolate SS_2017, complete genome
TCTTGACATCATGAAAATGGTGTTATAATTCGGGCGTAAGGGTTTCCAGAAATGGTGATTCTTATGTTGCTGCGAAAGTGGCTTTCTCTTTTATCTCCTTAAACTCCTTATTTTGCATTCTGGCTGATCAAGCGGCCCAAATCGCAAGCGTTTATCACTTCCTTGCGTGCGTACCCGAAAATTTATTGAACTTGGCCTGAATTATAAGCAATGCTTCTTATAGCGGACCCTTTGAGAATATAATGCTTGCATGGATTAATGTATACTGTTTCCAATAACAAACCTAGACACGCAGTTGCGTTGATGGTTGTATCAATCACATACTTGTGTTGAACTCGTGTTAATCCTCGATCGCTATATGTTTGCCTCCTACTTCCAATAAAATAGATTACATACGCGACATGCCTTTGTGGTTTACCTATTGGCCTCTGTCAAAAACAAATCGTTTGATTTGTAGTCTCCTGGCCTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCTCGTCGGATGGAAAGGTCCATCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGCTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAATTCTTGTGGCTCTACTGTATCTAGTTCTTGTTCTACTAACTCTACTAATGTTACTGGTTCTAATTCTAATAATGCTACTGATTCTATGTTCGAAAAACTCTCCTATGTCAATATAGATAATGTCCTTGATCCTGATATCCCTCACGTCACTGAAATTCATCGCAAGCGGATTTCAGATGATATCCTCGAATCTCAAGGCTGTACTTGCTCTGAACCTATTCTCACTCCTCGTGTATTTTCTTTCTCTACTCTTGGCATGCGTAAATCTGAATTATTTGATCCTCTGTATCTTCATAAATATAATAAAGTATTTTGCAATTCTTATCACGATATTACTTTAAGCATGATCAAGAATGGATCAATCAATCTTGATAAACTTGATTCTTATTGTAATGGTAAATTATTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCATGTACCTATTGATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATTATTCTGGTTGATCCTATGAAAACTATTTCCTATTGTTCTTCTTTATTCACTACTGTTATTAATATTGTTAGAATTTATGATCAAGTTCCTGTTGCAAAGTGGCGAACCGCTGATCATGCTATTGTTGATCTTATTAATCAAAATTTTAGTCTTTATATTCTTTCGTTTACTCAAGAAGAACTTATGCAATATGCTATAGCTTGTTGTCGTCGCTATCATTATTCTCATGTTGCTGAATTTGTTAATGTTTTATTGACTTATTACCAAATATTGTCTACTTTTATTTCTGATTATGATTGTCCTGCTTCTAAACTTGTCGTTTCATCTTATATGGCTCGATACTCTCTTGATCACTATTGGCAATATGCTGAAGCTCAAGATGGTATCTTTAGTGATTTTTGGAACTTAATTAAAAGTGCTACTGGTTTATTCACTGGTACTTTAGATACTATTCTTAAAGCTGCTACTAGCGTTGCTAGTACTACTTTAACTAAGTCAATGAACTTCCTTGCTAATACTCTTGATCCTACTTGTTCCGTCATCAACTCAGTTCTTAATTCTATTTCTTCCGTTATTGATAAATTATTTAATGCTCTTAATATTACTATTTCCTGGGTGGAAGAAACAGCTGATGATGTCGCAACTGGATTTGAATCTTTATTTAATCTTATTAGTCTTAAATTCAAATATAAACATGATAAAGTTGCTAAGTTGACTCGTGTTGGTTTAACCTTCATGTTGGTTGTCTTAGGTGTTTGGGTTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGCTACAGCTTATTATCTAAGATGCTTGATATTCTCTCTAATTTTTCATCCAAATACACTCGTATGGAACCTCAAGGTGCTGACGTTGGTCCTGGTGAACTCTCTATTCCTGGTACTATTATTTCTCTCATCTGCATTTTTGTTTGTGGCTGGGAATATGCTGATCATCCTGTTATTAATAATATTGGTAAACTTATTACTCGTTTCGCTCCAATGAAAGCTTCTATGGAAAAGGCTCTATCCTGTGTATGTTCTTTACTTCCTGCTTGTATTTCTCGTTTTATCTTCTCATTATCTCCTGAAAGTACTGATGCTATTTTGGCTGATATTTCTGATTTTATTACTGATGTCAACATTGCTCGTGTGTTCTCTACTACTCCTTCTGCTATTATTTCTGATGAATATGTTGATATCCTCTCAAAACTTATGACTCGTGGTGATGAATTAGTCAAACGTGTTAGTGCTGATCCCAAAATTCCTCAATCTCCTCTCTATTCTCCATTTTTCCAATCTTTATCTCAAATTACTACTCTTACTACAAATATCGTTCAAATTCGTCGATCCTCTGAAGCTCGTCCTAGACCTGTTTGGGTTCACTTCTTTGGGGATGCTGGGGCTGGTAAAACTTTTTTTGTTCAAAATGCTTCTACTTTGTTTGCTGGTATTCGACGTTTTGATGGTAAATCTGAGTCTTGTCCTAAATCTTATGTGATTCCTACTGCCTCTCAATATTGGGATGGTTTCCAACAAGATGTTTATCCAATTACGGTATTTGAAGAAATTTGGGGTGTCTTAGATGGTCAATCTGCTTTACAAATCGATTATCCTAATACTCTTCTTCAACTTATGTCTTCAGCTACTTTCATGCCTCCAATGGCTGCTATTACTAGTGGTGTCGTTGGTATGAAAGGTACTACCTTCAATTCTACATTGTTCCTTTCTTGTCACAACAATGCTCTTCCTAATAATTGGGGTGGTGATGCTTATGCTCTTGCTAGACGTATGAATTATATATTCAAAGTTATTGCTCCTACTTCTGATAATCCCTATTGTGAAACTCAGAAAATGCTCGATTCTAAAGGTAGTGTTCATGAAGTTACTGTTCAATATTATTGTGGTCGTAAAGGTATAGATAGTGATCAAGACTGCTTTATGATGAAGTATGCTCAAGGCGAGAAGATTGTTGTTAAACCTTGTGTGTTAACTGTTGATCTATACCGTAAGGCTTGGCGTTTCGTTCCTTATCTCACCCAAGTCCAAAATAACACTCCTGAAATTATTGCTACTGAACTTGCTGAAAATCCTGCTGATCCTAATTCTCTTAAAACTCAGTCCCTAACTGTTGATGAAGTTGTATCTAATATTCTTAGTACTGTTGATTTTAATGTTGCTGGTTTCTTAAAGTCTGCTGAATCAAGTGGCCTCAAATATAATCTTAAACTTAAGGAATCATATGATGCTCTTTATCGTGCTATTGTGTTTGATAAGAACCCTCAAAAGGTTTTTGATGCTATTGTTGATAATCAGGTTGATACTGTTCGTGATAATCTAGATCCAACTGAAGGTGTTGTCAATAATACTCTTGAAGCTGTTGATGATGTTATTGATGGGGTTATTGCTGAAGTTAAGAATCAATCTTCGGAGTTCCAATCTGTTAATTCCGATTCTGATCCTGAAAAAATTTATAAGCCTGAAGGGGAAGAACCCGCTCCGCCTCCGGATCCTGATCCTGAAACTGCTGTTTCCAATGCTGAAGCTCAACGTCCATTTAGTAAACGTACTGTTAAGTCTAGTAATGATTCAACTGAACTTGAATTGTCTGAATTTGATGGTAAAGTCGATCCTCAAACCTTCCTTGATAATTCTCGCGATCTCGTTCGTCGTGTCACAAATGCTATGAAAGGTGGTCCTCGTGATGTTGAAGATCCTATTTCTCGTAAGATTATTCGTGGTCTTGTCCGTACACTTCCTGCTGTTAAGTCCAATGATCCCATAATTGTTGAACCTAATGCTGCTGGTCAAAACATCTCTGGTGCTGTTCTAAATGCTGCCTTCTATGAATCTTATGCTACTCTATTTGAATCATTATTTGCTGTGGTTTCTACTAGTTTGTCTTATTCTCCTTCACTTGCTAATTGTTCTATTTATTTCTTTGGTCAAACAATTAGTGATTCTAAGGTTCCATTTGCTAACCATCCATTCTTCTCTTCTAAGTTTAATACTGATATCTTTTATCAATACTTATCACTCATTCGTCCTGTTACTACTATTGCTCCTGGATTCCCCCCTGAAATTAAGTCTCATCCATTATTTATTATTGCTGAAGATTCAATTTACTATTTGGTTGATCGTAATGGTACTGTAATCCGATCTATGGATGATCTACGTGTTGGTGAAACTAACTCTTATGGTGTTTCTAATTATGATTTTGCTATTCTATCTCCTACCAATCCAATTGCTTCTGGTCTTTTATATTGGAACGAGAATGCCTATCAACTTGTTAATTTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCTAATGGACAAACTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATTCTCCATTCATTATTCAACATTCTGATGATCCTTTTGCTCCATCTTGTTATCAAGGTGGTTGGAAGATCTGTGTCCATTGTCTTCGTTGCTATCATCCTGTCATCTATCCTCTTCTTGAAGGTAGCAAGTGTACCTCAATTGTTTCACATGGATATCATTCTCTTATTGAATTGTCTGAAGTTAGTTCTGCTAATCTTTCGGCTCTATCATTCACTGTACCTAAACCTGATTACTCTTACTTCCGTTCTATGGCTGTTTTAACTCTTGCCCTTTCTAAACTTACTGACGGTACTAAACATGTTGAAAATCGAATCCTTCATTTTACCTATGATTTACCTAAGGTTTTTAACGAAACTCAATTGCTCAAAGGTACTGGCAAAAATGTTGTTGAAGTTGCGGGTTCTATGAAAGTCTCTACTTGTGATTCTTATGGTGTAGTCGATACCATGCCTTCTATTCCTGTCTTATATGATGATGATGTTAAGCATGTTGATGTTATTGATAATTCTGTGATTAACAAAGCTCTTACTCCTCAATCACATTCTTTTATTTCTTATGTAGTTATTGGTG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49,860
MK606528.1
Posavirus 1
Aoki,H., Sunaga,F., Ochiai,H., Masuda,T., Ito,M., Akagami,M., Naoi,Y., Sano,K., Katayama,Y., Omatsu,T., Oba,M., Sakaguchi,S., Furuya,T., Ouchi,Y., Shirai,J., Mizutani,T., Oka,T., Nagai,M.
Azabu university, School of veterinary medicine
Japan
2019-06-09
Ishi-Im1/JPN/2015
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,841
GenBank
1
Japan
Japan
Sus scrofa
feces
2015-11-11
null
null
Posavirus 1 isolate Ishi-Im1/JPN/2015, complete genome
GAATTTCCTAATTCTCATATCATAGGTTTTGCTGGCGCATTACCTTGACTTCGCCTGCGCGATGTTATATTTTGAGTCAAAGATGGTTGCTGGCGCGATTGTCTTTGATAGCTGCTGGCGCGGCTTTCTCAATCTCCTCAAACTCCTTATTTTGCATTCTGGCTGTTCAAGCGGCCCAAATCGCAAGCGTCTCTCATTTCCTTGCGTGCGTACCCGAAAATTTATTGAATTTGGCTTGAATTATAAGCAATGCTTCTTATAGCGGACACTTTGAGAATATAATGCTTGCATGGATTAATGTATACTGTTTCAAATAACAAACCTAGACACGCAGTTGCGTTGATGGTTGTATCAATCACATACGGGTGTTGAACTCGTGTTAATCCTCGATCGCTATATGTTTGCCTCCTACTTCCAATAAAATAGATTACATACGCGACATGCCTTTGTGGGTTACCTATTGGCCTCTGTCAAAAACAAATCGTTTGATTTGTAGTTTCCTAGCCTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCTCGTCGGATGGAAAGGTCCATCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGTTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAATTCTTGTGGCTCTACTGTATCTAGTTCTTGTTCTACTAACTCTAATAATGCTACTGATTCTATGTTCGAAAAACTCTCCTATGTCAATATAGAAAATGTCCTTGATCCTGATATCCCTCACGTCACTGAAATTCATCGCAAGCGGATTTCAGATGATATCCTCGAATCTCAAGGCTGTACTTGCTCTGAACCTATTATTACTCCTCGTGTGTTTTCATTCTCAACTCTTGGCATGCGTAAATCTGAATTATTCGATCCTTTATATCTTCATAAATATAACAAAGTATTCTGCAATTCTTATCACGATATTACGTTAAGCATGATCAAGAATGGATCAATCAATCTTGATAAACTTGATTCTTACTGCAATGGCAAATTATTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCATGTACCTATTGATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATTATTCTGGTTGATCCTATGAAAACTATTTCTTATTGCTCTTCATTATTTACTACTGTTATTAATATTGTTAGAATATATGATCAAGTTCCCGCTGTAAAGTGGCGAACCGCTGATCGTGCTATTGTTGATCTTATTAATCAAAATTTTAGTCTTTATATTCTTTCATTTACTCAAGAAGAACTTATGCAATATGCTATAGCTTGTTGTCGTTGCTATCATTATTCTCATGTTGCTGAGTTTGTCAATGTCTTATTAACTTATTATCAAATATTGTCAACTTTTATTTCTGAATATGATTGTCCTGCCTCTAAACTTGTTGTTTCTTCTTATATGGCTCGCTATTCTCTCGATCATTATTGGCAATATGCTGAAGCTCAAGATGGTATCTTTAGCGACTTTTGGAATTTATTGAAAAGTGCTACTGGTTTATTTAAGGGTACTTTTGAAACTGTTATTAAAGCAGCTACTGGTGTTGCAACCACTACTTTAACTAAGTCGATGAATTTCTTAGCAAATACTCTTGACCCTGCTTGTTCTGTCATTAGCTCAGTTCTTAATTCTATTTCTTCCGTTATTACTAAATTATTCTCTGCTCTTAACATCGCTATTGATTGGGTGGAAGAAAAAGCTGATGATGTTGTTACTGGCTTTGAAGCTTTATTCAATCTTATTAGTCTTAGAGTTAAATATGTACAAAAGAACACTGCTAAATTGACTCGTGTTGGTTTGGCTTTTATGCTCGTCGTCTTAGGTGTTTGGATTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGCTATACTTTATTGACTAAGATGCTCGATATTCTTTCTAAATTTTCCTCTAGCTATACTCGCATGGAACCTCAAGGTGCTAACGTTGGTCCTGGTGAACTCTCTATTCCTGGTACTATTATTTCTCTTATTTGTATTTTCGTTTGTGGCTGGGAATACGCTGATCATCCTATTATCAATAATATTGGTAAATTAATTACTCGATTCGCTCCAATGAAGGCTTCTATGGAAAAAGCTTTGTCCTGTGTGTGCTCTTTACTTCCTGCTTGTATTTCTCGTTTTATTTTTACATTGTCTCCTGAAAGTTCTGATGCTGTTTTGGCTGATATTTCTGATTTTATTACTGATGTGAATGTTGCTCGTGTCTTCTCAACTACACCTTCTGCTATTATTTCCGATGAATATGTCAACATTCTTTCTGAACTTATGACTCGTGGTGATGCTTTGGTTAAACGTGTTAGTGCTGATTCCACTATTGCTCAATCTCCTCTTTATGCTCCATTTTTCCAATCCTTATCTCAAATCACTGCTTTGACTACTAATATTGTTCAAATTCGTCGATCCTCTGAAGCTCGTCCTAGACCTACTTGGGTCCATTTCTTTGGCGATGCTGGTGCTGGTAAAACTTTCTTTGTTCAAAATGCTTCCACTTTGTTTGCTGGTATTCGACGTTTCGATGGTAAGTCTGAATCTAGTCCTAAATCTTATGTGATTCCTACTGCTTCTCAATATTGGGATGGTTTCCAACAAGATGTCTATCCAATTACAGTATTTGAAGAAATTTGGGGTGTTTTAGATGGTCAATCTGCTTTACAAATCGATTATCCTAATACTCTTCTCCAACTTATGTCCTCAGCTACTTTCATGCCTCCAATGGCTGCTATTACAAGTGGTGTAGTTGGTATGAAAGGTACCACCTTCAATTCAACATTATTCCTCTCTTGTCATAATAATGCTCTTCCTAACAATTGGGGTGGTGATGCATATGCTCTTGCTAGACGTATGAATTATATATTCAAAGTTATTGCTCCTACTTCTTCAAAACCTTATCGTGAAACTCAGAAAATGCTCGATTCCAAAGGTAATGTTCATGAAGTTACTGTTGAATACTATTGTGGCCGTAAAGGTATTGATAGTGATCAAGATTGTTTTATGATGAAGTATGCTCAAGGCGAGAAGGTCGTTGTTAAACCTTGTGTGCTTACTGTTGATCTCTATCGTAAGGCTTGGCGTTTCGTTCCTTATATTACCCAAGTCCAAAATAATACTCCTGAAATTATTGCTACTGAACTTGCCGAAAATCCTGCTGATCCTAATTCTCTTAAAACTCAATCTTTAACTGTTGATGAAGTTGTGTCTAATATTCTTAGTACTGTTGATTTTAATGTTGCTGGTTTCTTAAGGTCTGCTGAATCTAGTGGTCTCAAATATAATCTTAAACTTAAGGAATCATACGATGCTCTTTATCGTGCAATTGTGTTTGACAAGAACCCTCAAAAGGTTTTTGATGCTATTGTTGATAATCAAGTTGATGCTGTTCGTGATAACTTAGATCCAACTGAAGGTGTTGTCAATAACACTCTTGAAGCTGCAGATGATGTTATTGAAGGTGTTATTGCTGAAGTTAAGAATCAATCTTCTGAGTTCCAATCTGTTAATTCTGACTCTGATCCTGAAGAAATCTACAAACCTGAAGGTGATGAACCTGCTCCAGTTCCAGATCCTGATCCTGATACTGCTGTTTCTAATGCTGAAGCTCAAGGTCCATTCAGTAAACGTGCTGTTAAGTCTAGTAATGATTCACCTGCTTATGAATTATCTCAATTCGATGGTAAGGTTGATCCTCAAAATTTCCTTGATAATTCTCGTGATCTTGTTCGTCGTATTACTAACGCCATGAAAGGTGGTCCACGTGATGTTGAAGATCCAGTCTCTCGCAAGATTATTCGTGGTCTTGTTCGTACACTTCCTGCTGTGAAATCCAATGATCCTATCATTGTTGAACCTGAAACTATTGGTCAAAACATTACTGGTGCTACTTTGAATGCTGCTTTTTATGAATCTTATGCTACTTTATTTGAATCATTATTCTCCGTTGTTTCTACTGAATTGTCTTACTCTCCTTCTTTAGCTAATTGTTCTATTTATTTCTTTGGTCAAACAATTAGTGATTCTAAGGTTCCATTCGCCAATCATCCTTTCTTCTCATCTAAGTTCAATACTGATGTCTTTTATCAATATTTATCTATTATTCGTCCTGTTACTACTATTGCTCCTGGATTCCCTCCTGAAATTAAATCTCATCCTCTATTCATTATTGCTGAAGATTCGATTTATTACTTGGTCGATCGTAATGGTGCTATAATTCGTTCTATGAATGACTTACGTGTTGGTGAAACTAACTCATATGGTGTTTCTCATCAAGATTTTACCATCTTGTCTCCTACAAATCCTATTGCTTCTGGTCTTTTATATTGGAATGAGAATGCCGATCAACTCGTTAAATTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCAAATGGACAAACTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATCCTCCATTCGTAATTCAACATTCTGATGATCCTTTTGCTCCATCTTGTTATCAAGGTGGTTGGAAGATCTGTGTCCATTGTCTTCGTTGCTATCATTCCGTTATTTATCCTCTTTTAGAAGGTAGCAAATGTACTTCAATTGTCTCACATGGATATCATTCTCTTATTGAATTATCTGAAGTTAGTTCTGCTAATCTCTCCGCTCTTTCATTCACTGTACCTAGACCTGATTATTCCTATTTCTGTTCTATGGCTGTTTTAACTCTAGCTCTCTCTAAAATTTGTGATGGTACCAAGCGTGTAGAACACCGAACACTTAATTTTACCTATGAATTAGCTAAAGTTATTAATGAATCTCAATTGTTGAAGGGTACTGGCAAAGATGTTGTTGAAGCTGCTAGTACTATGAAAGTTTCTACTTGTGATTCTTATGGTGTAGTCGATACCATGCCTTCTATTCCTGTCTTATATGATGATGATGTTAAGCATGTTGATGTTATTGATAATTCTGTGATTAACAAAGCTCTTACTCCTCAATCGCATTCCTTTGTTTCTT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62,278
MK606529.1
Posavirus 1
Aoki,H., Sunaga,F., Ochiai,H., Masuda,T., Ito,M., Akagami,M., Naoi,Y., Sano,K., Katayama,Y., Omatsu,T., Oba,M., Sakaguchi,S., Furuya,T., Ouchi,Y., Shirai,J., Mizutani,T., Oka,T., Nagai,M.
Azabu university, School of veterinary medicine
Japan
2019-06-09
Ishi-Im3/JPN/2015
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,856
GenBank
1
Japan
Japan
Sus scrofa
feces
2015-11-11
null
null
Posavirus 1 isolate Ishi-Im3/JPN/2015, complete genome
TGAGAATTTCCTAATTCTCATATCATAGGTTTTGCTGGCGCATTACCTTGACTTCGCCTGCGCGATGTTATATTTTGAGTCAAAGATGGTTGCTGGCGCGATTGTCTTTGATAGCTGCTGGCGCGGCTTTCTCAATCTCCTCAAACTCCTTATTTTGCATTCTGGCTGTTCAAGCGGCCCAAATCGCAAGCGTCTCTCATTTCCTTGCGTGCGTACCCGAAAATTTATTGAATTTGGCTTGAATTATAAGCAATGCTTCTTATAGCGGACACTTTGAGAATATAATGCTTGCATGGATTAATGTATACTGTTTCAAATAACAAACCTAGACACGCAGTTGCGTTGATGGTTGTATCAATCACATACGGGTGTTGAACTCGTGTTAATCCTCGATCGCTATATGTTTGCCTCCTACTTCCAATAAAATAGATTACATACGCGACATGCCTTTGTGGGTTACCTATTGGCCTCTGTCAAAAACAAATCGTTTGATTTGTAGTTTCCTAGCCTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCTCGTCGGATGGAAAGGTCCATCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGTTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAATTCTTGTGGCTCTACTGTATCTAGTTCTTGTTCTACTAACTCTAATAATGCTACTGATTCTATGTTCGAAAAACTCTCCTATGTCAATATAGAAAATGTCCTTGATCCTGATATCCCTCACGTCACTGAAATTCATCGCAAGCGGATTTCAGATGATATCCTCGAATCTCAAGGCTGTACTTGCTCTGAACCTATTATTACTCCTCGTGTGTTTTCATTCTCAACTCTTGGCATGCGTAAATCTGAATTATTCGATCCTTTATATCTTCATAAATATAACAAAGTATTCTGCAATTCTTATCACGATATTACGTTAAGCATGATCAAGAATGGATCAATCAATCTTGATAAACTTGATTCTTACTGCAATGGCAAATTATTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCATGTACCTATTGATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATTATTCTGGTTGATCCTATGAAAACTATTTCTTATTGCTCTTCATTATTTACTACTGTTATTAATATTGTTAGAATATATGATCAAGTTCCCGCTGTAAAGTGGCGAACCGCTGATCGTGCTATTGTTGATCTTATTAATCAAAATTTTAGTCTTTATATTCTTTCATTTACTCAAGAAGAACTTATGCAATATGCTATAGCTTGTTGTCGTTGCTATCATTATTCTCATGTTGCTGAGTTTGTCAATGTCTTATTAACTTATTATCAAATATTGTCAACTTTTATTTCTGAATATGATTGTCCTGCCTCTAAACTTGTTGTTTCTTCTTATATGGCTCGCTATTCTCTCGATCATTATTGGCAATATGCTGAAGCTCAAGATGGTATCTTTAGCGACTTTTGGAATTTATTGAAAAGTGCTACTGGTTTATTTAAGGGTACTTTTGAAACTGTTATTAAAGCAGCTACTGGTGTTGCAACCACTACTTTAACTAAGTCGATGAATTTCTTAGCAAATACTCTTGACCCTGCTTGTTCTGTCATTAGCTCAGTTCTTAATTCTATTTCTTCCGTTATTACTAAATTATTCTCTGCTCTTAACATCGCTATTGATTGGGTGGAAGAAAAAGCTGATGATGTTGTTACTGGCTTTGAAGCTTTATTCAATCTTATTAGTCTTAGAGTTAAATATGTACAAAAGAACACTGCTAAATTGACTCGTGTTGGTTTGGCTTTTATGCTCGTCGTCTTAGGTGTTTGGATTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGCTATACTTTATTGACTAAGATGCTCGATATTCTTTCTAAATTTTCCTCTAGCTATACTCGCATGGAACCTCAAGGTGCTAACGTTGGTCCTGGTGAACTCTCTATTCCTGGTACTATTATTTCTCTTATTTGTATTTTCGTTTGTGGCTGGGAATACGCTGATCATCCTATTATCAATAATATTGGTAAATTAATTACTCGATTCGCTCCAATGAAGGCTTCTATGGAAAAAGCTTTGTCCTGTGTGTGCTCTTTACTTCCTGCTTGTATTTCTCGTTTTATTTTTACATTGTCTCCTGAAAGTTCTGATGCTGTTTTGGCTGATATTTCTGATTTTATTACTGATGTGAATGTTGCTCGTGTCTTCTCAACTACACCTTCTGCTATTATTTCCGATGAATATGTCAACATTCTTTCTGAACTTATGACTCGTGGTGATGCTTTGGTTAAACGTGTTAGTGCTGATTCCACTATTGCTCAATCTCCTCTTTATGCTCCATTTTTCCAATCCTTATCTCAAATCACTGCTTTGACTACTAATATTGTTCAAATTCGTCGATCCTCTGAAGCTCGTCCTAGACCTACTTGGGTCCATTTCTTTGGCGATGCTGGTGCTGGTAAAACTTTCTTTGTTCAAAATGCTTCCACTTTGTTTGCTGGTATTCGACGTTTCGATGGTAAGTCTGAATCTAGTCCTAAATCTTATGTGATTCCTACTGCTTCTCAATATTGGGATGGTTTCCAACAAGATGTCTATCCAATTACAGTATTTGAAGAAATTTGGGGTGTTTTAGATGGTCAATCTGCTTTACAAATCGATTATCCTAATACTCTTCTCCAACTTATGTCCTCAGCTACTTTCATGCCTCCAATGGCTGCTATTACAAGTGGTGTAGTTGGTATGAAAGGTACCACCTTCAATTCAACATTATTCCTCTCTTGTCATAATAATGCTCTTCCTAACAATTGGGGTGGTGATGCATATGCTCTTGCTAGACGTATGAATTATATATTCAAAGTTATTGCTCCTACTTCTTCAAAACCTTATCGTGAAACTCAGAAAATGCTCGATTCCAAAGGTAATGTTCATGAAGTTACTGTTGAATACTATTGTGGCCGTAAAGGTATTGATAGTGATCAAGATTGTTTTATGATGAAGTATGCTCAAGGCGAGAAGGTCGTTGTTAAACCTTGTGTGCTTACTGTTGATCTCTATCGTAAGGCTTGGCGTTTCGTTCCTTATATTACCCAAGTCCAAAATAATACTCCTGAAATTATTGCTACTGAACTTGCCGAAAATCCTGCTGATCCTAATTCTCTTAAAACTCAATCTTTAACTGTTGATGAAGTTGTGTCTAATATTCTTAGTACTGTTGATTTTAATGTTGCTGGTTTCTTAAGGTCTGCTGAATCTAGTGGTCTCAAATATAATCTTAAACTTAAGGAATCATACGATGCTCTTTATCGTGCAATTGTGTTTGACAAGAACCCTCAAAAGGTTTTTGATGCTATTGTTGATAATCAAGTTGATGCTGTTCGTGATAACTTAGATCCAACTGAAGGTGTTGTCAATAACACTCTTGAAGCTGCAGATGATGTTATTGAAGGTGTTATTGCTGAAGTTAAGAATCAATCTTCTGAGTTCCAATCTGTTAATTCTGACTCTGATCCTGAAGAAATCTACAAACCTGAAGGTGATGAACCTGCTCCAGTTCCAGATCCTGATCCTGATACTGCTGTTTCTAATGCTGAAGCTCAAGGTCCATTCAGTAAACGTGCTGTTAAGTCTAGTAATGATTCACCTGCTTATGAATTATCTCAATTCGATGGTAAGGTTGATCCTCAAAATTTCCTTGATAATTCTCGTGATCTTGTTCGTCGTATTACTAACGCCATGAAAGGTGGTCCACGTGATGTTGAAGATCCAGTCTCTCGCAAGATTATTCGTGGTCTTGTTCGTACACTTCCTGCTGTGAAATCCAATGATCCTATCATTGTTGAACCTGAAACTATTGGTCAAAACATTACTGGTGCTACTTTGAATGCTGCTTTTTATGAATCTTATGCTACTTTATTTGAATCATTATTCTCCGTTGTTTCTACTGAATTGTCTTACTCTCCTTCTTTAGCTAATTGTTCTATTTATTTCTTTGGTCAAACAATTAGTGATTCTAAGGTTCCATTCGCCAATCATCCTTTCTTCTCATCTAAGTTCAATACTGATGTCTTTTATCAATATTTATCTATTATTCGTCCTGTTACTACTATTGCTCCTGGATTCCCTCCTGAAATTAAATCTCATCCTCTATTCATTATTGCTGAAGATTCGATTTATTACTTGGTCGATCGTAATGGTGCTATAATTCGTTCTATGAATGACTTACGTGTTGGTGAAACTAACTCATATGGTGTTTCTCATCAAGATTTTACCATCTTGTCTCCTACAAATCCTATTGCTTCTGGTCTTTTATATTGGAATGAGAATGCCGATCAACTCGTTAAATTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCAAATGGACAAACTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATCCTCCATTCGTAATTCAACATTCTGATGATCCTTTTGCTCCATCTTGTTATCAAGGTGGTTGGAAGATCTGTGTCCATTGTCTTCGTTGCTATCATTCCGTTATTTATCCTCTTTTAGAAGGTAGCAAATGTACTTCAATTGTCTCACATGGATATCATTCTCTTATTGAATTATCTGAAGTTAGTTCTGCTAATCTCTCCGCTCTTTCATTCACTGTACCTAGACCTGATTATTCCTATTTCTGTTCTATGGCTGTTTTAACTCTAGCTCTCTCTAAAATTTGTGATGGTACCAAGCGTGTAGAACACCGAACACTTAATTTTACCTATGAATTAGCTAAAGTTATTAATGAATCTCAATTGTTGAAGGGTACTGGCAAAGATGTTGTTGAAGCTGCTAGTACTATGAAAGTTTCTACTTGTGATTCTTATGGTGTAGTCGATACCATGCCTTCTATTCCTGTCTTATATGATGATGATGTTAAGCATGTTGATGTTATTGATAATTCTGTGATTAACAAAGCTCTTACTCCTCAATCGCATTCCTTTGTTT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62,279
MK606530.1
Posavirus 1
Aoki,H., Sunaga,F., Ochiai,H., Masuda,T., Ito,M., Akagami,M., Naoi,Y., Sano,K., Katayama,Y., Omatsu,T., Oba,M., Sakaguchi,S., Furuya,T., Ouchi,Y., Shirai,J., Mizutani,T., Oka,T., Nagai,M.
Azabu university, School of veterinary medicine
Japan
2019-06-09
Ishi-Ya2/JPN/2015
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,817
GenBank
1
Japan
Japan
Sus scrofa
feces
2015-11-19
null
null
Posavirus 1 isolate Ishi-Ya2/JPN/2015, complete genome
AGAATTTCCAATTCTCATATCATAGGTTTTGCTAACGCATTACCTTGACTTCGCTCACGCGTTGTTATATTTTGAGTCAAAGATGGTTGCTAACGCGATTATCTTTGAAGCTGCTAACGCGGCTTTCTCAATCTCCCCAAACTCCTTACTCTGCATCCTGGCTGTTCAAGCGGCCTAAATCGCAAGCGTCCGACATTTCCTTGCGTGCGTACCCGAAAATTTATTGAATTTGGCTTGAATTATAAGCAATGCTTCTTATAGCGGACACTTTGAGAATATAATGCTTGTATGGATTAATGTGTACTGTTTTAAATAACTAACCTAGACACGCAGTTGCGTTGATGGTTGTACCAATCACTTACAAGTATTGAACTCGTGTTGATCCTCGATCGCTATATGTTTGCCTCCTGCTTCCAATAAAATAGATTACATACGCGACATGCCTTTGTGGGTTACCTATTGGCCTCTGTCAAAAACAAATCGTTTGATTTGTAGCTTCCCGGTGTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCCCGTCGGGTGGAAAGGTCCACCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGCTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAATATTTGTGGCCCTACTGTATCTAGTTCTTCTTCTGCTCAATCTGACTCTAAAAAACAAAAACTACAAAAAACTGCTTACAACCTTGAAGAATTCTTTGATCATGATCTTCCTGATCCTATGGTCTCTTATCGTTCTAAAATTTCAACAAGAATTCTTGAAAATCAAGGTTGCATTCACTCTGATTCTCATCTTACTCCTCGTGTGTTTTCATTCTCTACTGTTGGCATGTTAAGATCTGAACTTTTCGACTCTCTTCATCTTCATAAATACAATAAAGTCTTTGCTGCATCTTATCATGACATTACTGAAGAAATGATCAACAATGGTTCTTTGAACCTCGATAAACTCGTTACTTATTGTAATGGTAAACATTTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCATGAACCTATTAATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATCATTCTTGTTGATCCTATGAAAACTATTTCCTATTGCTCATCTCTATTTACTACTATCATTAACCTTGTAAACTATTACGATCATGTACCTGTTGCAAAATGGCGTACCGCTGACCGTGCTATAGTTGATTTAATTAATCAAAATTTTAGTCTTTATATTCTTTCATTTACTCAAGATGAACTCATTCAATATGCTATTGCTTGTTGTTATTCTTATGATTATTCTCATGTTGCTGAGTTCGTCAACGTCTTACTAAGCTATTATCAAATACTCTCTACTTACATTTCTGATTATGACTCTCCTGCTTCTAAACTTGTTGTATCTTCATTTATCGCTAGATATTCACTTGATCACTATTGGCGTTATGCTGAAGCTCAAGATGGTATTTTATCTACCTTCTGGACTTTAGTTAAAGGTGCTACTAATTTATTCCAAGGTACCTTATCTCTAGTTTTAAATGCTGCTACTTCTGTTGCTAATGAATTACTTACTAAATCAATGAACTTTTTGGCTTATACTCTTGATCCTACTTCTGCTATTGTTTCATCTGTATTAAACTCTATAAGCTCTGTCATTGAACGTTTATTCTCATCTCTTAATCTTACTGTAACTTGGGTAGAAGAAAAAGCTGAAGATGTTGCTACAACATTTGAGGCTCTTTCTTCCTTAATCACTATGAAACTTAAATACAAACCTGATAAATCTACTCGTCTTACTCGTGTTGGTCTTACATTTATGTTCGTCGTCTTAGGTATCTGGGTTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGTTATAACTTATTATCTAAGATGTTCGAAATCCTTGCTAATTTCTCTTCTCATTGGACACGCGTAGAACCTCAAGGTCCTAATACTTCTCCTGGTGAATTATCCATTCCTGGAACTATTATTTCTCTTATCTGCATTTTTGTCTGTGGTTGGCAATACGACACTCATCCTATTATTAATAACATTGGTAAACTCATTACTCGTTTTGCTCCTATGAAAGCTTCCATGGAAAAAGCCTTGTCCTGCGTTTGTTCATTACTCCCTGCTTGTATTTCCCGATTTATTTTTAACCTATCTCCTGAAAGTTCTGATGCTATTCTTGCTGATATCTCTGATTTCATCACTGATGTCAATGTAGCTCGCGTTTTCTCTACTACCCCTGCTGCTATTATCTCTGACGAATATGTCCAGATTTTATCTGAACTTATGACTCGAGGTAAAGAATTACAAGATCGTGTCAGTAAAAATCCTGAACTCCCTAACTCTCCTCTCTATAATCCATTCTTCCAATCCTTAACTCAAATTATTTCCCTTACTACTAATATCGTTCAAATTCGTCGATCCTCTGAAGCTCGCCCTCGACCTACCTGGGTCCACTTCTTTGGTGATGCTGGTGCTGGTAAAACATTTTTCGCTCAGAATGCTTCTGTTCTATTTGCTGGTATTCGTCGATTTGACGGTAAATCCGAATCTACTCCTAAAACCTATACTATTCCTACTGCTTCTCAATACTGGGATGGCTTCCAACAGGATGTCTATCCTATTACTGTATTTGAAGAAATTTGGGGTGTGATGGATGGTCAAACTGCTATGCAAGTTGATTATCCTAACACTCTTCTCCAACTTATGTCCTCTGCTACTTTCATGCCTCCAATGGCTGCTATTACTAGTGGTGTGGTTGGTATGAAAGGTACTACTTTTAACTCCACTCTCTTCCTCTCATGTCACAATAATCCCTTCCCTAACAACTGGGGTGGTGATTCATATGCTCTTGCTAGACGTATGAACTACCTCTTTAAAGTTGTTGCTCCTACTGCTAATGATCCTTATACTGTCACTGAAAAGGTACTTGATAGCAAAGGTGTATCTCATGAAATTACTGCTGAATACTTCTGCGCTCGTAAGGGTGTAGATTTTGATCAAGACTGTTTTGTTGTACGATACAGAAAAGGTGAAAAGTTAGTTGTTAAACCTTGCGTTTTAACTGTTGATATGTATCGTAAAGCTTGGAAATTTATACCTTACAAAACTGTTGTTGAAAATAATACTCCTGAAGCTGTCTGTACTACTCTCCCTAAAGATCCTGAAAACTCTGAATCCCCTCAAACTCAATTCTTAACTGTTGATGAAGTTATCGCTAACGTTCTTGATACTGTTAATTTTAATGTACGTGGTTTCTTGCAATCCGCTGAATCAAGTGGTCTTAAATATAATCTTAAACTCAAGGAATCATATGATGCTCTTTATCGTGCTATTGTTTTTGAAAAAGACCCTCAAAAAGTCTTTGAAACTATAGTCGATAATCAAGTTGATGTCGTTCGTGATAATTTAGAAATTGGTGACAATACTATCAATTCTGCTTTAAGTGTTGTTGATGATATGATTGATGGTGTTGCTGATGAAGTTAAGAATAATACTACTGAATTCCACTCTGTCTCCTGTGAATCTGATCCTGATGAAATTTATGTTCCATCTGGTGATGAAAATCCCCCTGCTGCTCCTGAAAATACTCCCAATCCTATTCCTGAATCTGCTGTTTCCTCTGCTGAAGCTCAAGGTCCTACTAGACTCGTTGTTAAGTCAGATTCCGCTTCTCCCGAAGTTGAGCTTGCTCAATTCGACGGAAAAGTTGAACCTCAAACTTTCCTTAGCAATGCTAATAACCTTGTTCGTCGTATGACGAATGCTCTTAAAGGTGGTCCTCGTGATGTTGAAAATCCTATTCATAAAAAGATTATTCGTGGTTTGGTTCGTACTTTACCTGCTTATTCATCTTCTAATCCTATTATCGTCGAACCTGGTGTTACTGGTCAAAACATTACCGGATTAACTTTAAATGCTGCTTTTGTAGAATCTTATGGTGCTTTATTTGAAACTCTATTCTCTACTCTTTCTACTGAACTCTCCTATTCTCCTCAAATTGCTAACTGTAAATTGTATTACTTCGGTAAAACAATTACTGAATCTTCTGTTCCATTCAAAACTCATCCATTTTTCTCCTCAAAATTCAATACTGATATCTTCTTCCAATACCTCTCTCTCATTTGCCCTTTTACTCAATTAGCTCCTGGTCTTCCTTCTGATGCTAAGTCTCAACCTCTCCTCATTATTGCTGAAGATGATCAATATTATCTTATTGATCGTGCTGGTCGTGTGATTCGCAATATGAATGACTTACGTGTTGGTGAAAATAATTCTTATGGTGTTTGTAATTATGATTTCTGTATTCAATCTCCTACTCACTCTATCGCTGCTGGTCTCTTATACTGGAATGAAAATTTTATTCAATTACAACAATTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCTAATGGACAATCTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATCCTCCTTTCATTTGTCAACATTGTGATGATCCTTTCGCTGTTTCTTGTTACAAGAATGGTTGGAAGGTCTGTGTTCATTGTCTACGTTTCTATCATGATACTATATACCCTCTTCTTGAAGGTAGTAAATGTACCTCAATTGTTTCACATGGATATCATTCATTAATTCCTCTTTGTGAGATTAGCTCCGCAAATCTTACTGCTCTATCATTTACTATTCCTAAACCTGATTACTCTTATTTCTGTTCTATGGCTGTTATTACTCTTGCATTATCTAAAACGATAAATGGCACTAAATCTGTTGAACATAGTTCACTTCTACTTACTCAAGATATTGCTTTAGTTGTTAATCAATCCTTATTACTGGATCAACAAGATGTCGTCGATGCTGCTCGCGATGTTAAAGTTTCTAATTGTTCTGCATTTGGCGAAGTTGATGTTATGCCTACTATTCCTATTCAATATGATGATGATGTTAAACACGTCGATATCATTGATGATTCTGTAATAAATAAAAGTCTTACTCCTCAATCTCATTCATTTATGTCTTA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62,280
MK606531.1
Posavirus 1
Aoki,H., Sunaga,F., Ochiai,H., Masuda,T., Ito,M., Akagami,M., Naoi,Y., Sano,K., Katayama,Y., Omatsu,T., Oba,M., Sakaguchi,S., Furuya,T., Ouchi,Y., Shirai,J., Mizutani,T., Oka,T., Nagai,M.
Azabu university, School of veterinary medicine
Japan
2019-06-09
Ishi-Ya8/JPN/2015
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,365
GenBank
1
Japan
Japan
Sus scrofa
feces
2015-10-29
null
null
Posavirus 1 isolate Ishi-Ya8/JPN/2015, complete genome
TTCCCGGTGTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCCCGTCGGGTGGAAAGGTCCACCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGCTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAATATTTGTGGCCCTACTGTATCTAGTTCTTCTTCTGCTCAATCTGACTCTAAAAAACAAAAACTACAAAAAACTGCTTACAACCTTGAAGAATTCTTTGATCATGATCTTCCTGATCCTATGGTCTCTTATCGTTCTAAAATTTCAACAAGAATTCTTGAAAATCAAGGTTGCATTCACTCTGATTCTCATCTTACTCCTCGTGTGTTTTCATTCTCTACTGTTGGCATGTTAAGATCTGAACTTTTCGACTCTCTTCATCTTCATAAATACAATAAAGTCTTTGCTGCATCTTATCATGACATTACTGAAGAAATGATCAACAATGGTTCTTTGAACCTCGATAAACTTGTTACTTATTGTAATGGTAAACATTTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCATGAACCTATTAATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATCATTCTTGTTGATCCTATGAAAACTATTTCCTATTGCTCATCTCTATTTACTACTATCATTAACCTTGTAAACTATTACGATCATGTACCTGTTGCAAAATGGCGTACCGCTGACCGTGCTATAGTTGATTTAATTAATCAAAATTTTAGTCTTTATATTCTTTCATTTACTCAAGATGAACTCATTCAATATGCTATTGCTTGTTGTTATTCTTATGATTATTCTCATGTTGCTGAGTTCGTCAACGTCTTACTAAGCTATTATCAAATACTCTCTACTTACATTTCTGATTATGACTCTCCTGCTTCTAAACTTGTTGTATCTTCATTTATTGCTAGATATTCACTTGATCACTATTGGCGTTATGCTGAAGCTCAAGATGGTATTTTATCTACCTTCTGGACTTTAGTTAAAGGTGCTACTAATTTATTCCAAGGTACCTTATCTCTGGTTTTAAATGCTGCTACTTCTGTTGCTAATGAATTACTTACTAAATCAATGAACTTTTTGGCTTATACTCTTGATCCTACTTCTGCTATTGTTTCATCTGTATTAAACTCTATAAGCTCTGTCATTGAACGTTTATTCTCATCTCTTAATCTTACTGTAACTTGGGTAGAAGAAAAAGCTGAAGATGTTGCTACAACATTTGAGGCTCTTTCTTCCTTAATCACTATGAAACTCAAATACAAACCTGATAAATCTACTCGTCTTACTCGTGTTGGTCTTACATTTATGTTCGTCGTCTTAGGTATCTGGGTTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGTTATAACTTATTATCTAAGATGTTCGAAATCCTTGCTAATTTCTCTTCTCATTGGACACGCGTAGAACCTCAAGGTCCTAATACTTCTCCTGGTGAATTATCCATTCCTGGAACTATTATTTCTCTTATCTGCATTTTTGTCTGTGGTTGGCAATACGATACTCATCCTATTATTAATAACATTGGTAAACTCATTACTCGTTTTGCTCCTATGAAAGCTTCCATGGAAAAAGCCTTGTCCTGCGTTTGTTCATTACTCCCTGCTTGTATTTCCCGATTTATTTTTAACCTATCTCCTGAAAGTTCTGATGCTATTCTTGCTGATATCTCTGATTTCATCACTGATGTCAATGTAGCTCGCGTTTTCTCTACTACCCCTGCTGCTATTATCTCTGACGAATATGTCCAGATTTTATCTGAACTTATGACTCGAGGTAAAGAATTACAAGATCGTGTCAGTAAAAATCCTGAACTCCCTAACTCTCCTCTCTATAATCCATTCTTCCAATCCTTAACTCAAATTATTTCCCTTACTACTAATATCGTTCAAATTCGTCGATCCTCTGAAGCTCGCCCTCGACCTACCTGGGTCCACTTCTTTGGTGATGCTGGTGCTGGTAAAACATTTTTCGCTCAGAATGCTTCTGTTCTATTTGCTGGTATTCGTCGATTTGACGGTAAATCCGAATCTACTCCTAAAACCTATACTATTCCTACTGCTTCTCAATACTGGGATGGCTTCCAACAGGATGTCTATCCTATTACTGTATTTGAAGAAATTTGGGGTGTGATGGATGGTCAAACTGCTATGCAAGTTGATTATCCTAACACTCTTCTCCAACTTATGTCCTCTGCTACTTTCATGCCTCCAATGGCTGCTATTACTAGTGGTGTGGTTGGTATGAAAGGTACTACTTTTAACTCCACTCTCTTCCTCTCATGTCACAATAATCCCTTCCCTAACAACTGGGGTGGTGATTCATATGCTCTTGCTAGACGTATGAACTACCTCTTTAAAGTTGTTGCTCCTACTGCTAATGATCCTTATACTGTCACTGAAAAGGTACTTGATAGCAAAGGTGTATCTCATGAAATTACTGCTGAATACTTCTGCGCTCGTAAGGGTGTAGATTTTGATCAAGACTGTTTTGTTGTACGATACAGAAAAGGTGAAAAGTTAGTTGTTAAACCTTGCGTTTTAACTGTTGATATGTATCGTAAAGCTTGGAAATTTATACCTTACAAAACTGTTGTTGAAAATAATACTCCTGAAGCTGTCTGTACTACTCTCCCTAAAGATCCTGAAAACTCTGAATCCCCTCAAACTCAATTCTTAACTGTTGATGAAGTTATCGCTAACGTTCTTGATACTGTTAATTTTAATGTACGTGGTTTCTTGCAATCCGCTGAATCAAGTGGTCTTAAATATAATCTTAAACTCAAGGAATCATATGATGCTCTTTATCGCGCTATTGTTTTTGAAAAAGACCCTCAAAAAGTCTTTGAAACTATAGTCGATAATCAAGTTGATGTCGTTCGTGATAATTTAGAAATTGGTGACAATACTATCAATTCTGCTTTAAGTGTTGTTGATGATATGATTGATGGTGTTGCTGATGAAGTTAAGAATAATACTACTGAATTCCACTCTGTCTCCTGTGAATCTGATCCTGATGAAATTTATGTTCCATCTGGTGATGAAAATCCCCCTGCTGCTCCTGAAAATACTCCCAATCCCATTCCTGAATCTGCTGTTTCCTCTGCTGAAGCTCAAGGTCCTACTAGACTCGTTGTTAAGTCAGATTCCGCTTCTCCCGAAGTTGAGCTTGCTCAATTCGACGGAAAAGTTGAACCTCAAACTTTCCTTAGCAATGCTAATAACCTTGTTCGTCGTATGACGAATGCTCTTAAAGGTGGTCCTCGTGATGTTGAAAATCCTATTCATAAAAAGATTATTCGTGGTTTGGTTCGTACTCTACCTGCTTATTCATCTTCTAATCCTATTATTGTCGAACCTGGTGTTACTGGTCAAAACATTACCGGATTAACTTTAAATGCTGCTTTTGTAGAATCTTATGGTGCTTTATTTGAAACTCTATTTTCTACTCTTTCTACTAAACTCTCCTATTCTCCTCAAATTGCTAACTGTAAATTGTATTACTTCGGTAAAACAATTACTGAATCTTCTGTTCCATTCAAAACTCATCCATTTTTCTCCTCAAAATTCAATACTGATATCTTCTTCCAATACCTCTCTCTCATTTGCCCCTTTACTCAATTAGCTCCTGGTCTCCCTTCTGATGCTAAGTCTCAACCTCTTCTCATTATTGCTGAAGATGATCAATATTATCTTATTGATCGTGCTGGTCGTGTGATTCGCAATATGAATGACTTACGTGTTGGTGAAAATAATTCTTATGGTGTTTGTAATTATGATTTCTGCATTCAATCTCCTACTCACTCTATCGCTGCTGGTCTCTTATACTGGAATGAAAATCTTATTCAATTACAACAATTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCTAATGGACAATCTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATCCTCCTTTCATTTGTCAACATTGTGATGATCCTTTCGCCGTTTCTTGTTACAAGAATGGTTGGAAGGTCTGTGTTCATTGTCTACGTTTCTATCATGATACTATATACCCTCTTCTTGAAGGTAGTAAATGTACCTCAATTGTTTCACATGGATATCATTCATTAATTCCTCTTAGTGAGATTAGCTCCGCAAATCTTACTGCTTTATCATTTACTATTCCTAAACCTGATTACTCTTATTTCTGTTCTATGGCTGTTATTACTCTTGCATTATCCAAAACGATAAATGGCACTAAATCTGTTGAACATAGTTCACTCCTACTTACTCAAGATGTCGCTTTAGTTGTTAATCAATCCTTATTACTGGATCAACAAGATGTCGTCGATGCTGCTCGTGATGTTAAAGTTTCTAATTGTTCTGCATTTGGCGAAGTTGATGTTATGCCTACTATTCCTATTCAATATGATGATGATGTTAAACACGTCGATATCATTGATGATTCTGTAATAAATAAAAGTCTTACTCCTCAATCTCATTCATTTATGTCTTATATTGTTGTTGGTGCTTCATTATGTGGTATTGTTTATGCTATTTATAAATCTTTCTTCCCTGCTAAAGCCAAACTTTGGGAAAGCCAAAGTGAACCTCCTAGTCGTGTTACTGCTGCTGTTCGTCGTAATAATACTCCTAAATACTCTCATTTATCTGATCTTAAATCTGTTCCTAATGCTGTTTTAAAAGGTGATGCTGAATCTGCTGTTCAAATGACTACTGCTGAAGTCACTATTGATGGTGTTACTGTTAAAGGTTTTATGCCTTTATCTAATATATTCATGTCTTATACTCATACATTAACTCAATTATTGAAAAATTACTCATCTATTAATCCAATTTATGTTAAAGTACACTTATCTAATGGTGATCGTGATTATTGTTTACGTAATTATGCTCCTGATTTGAATTCTGATGTTGTTGTTGATTTAGAAAATGATTTACTCGCTTGGAAATTACCTCCTCAAGTACAATGTGTTCCTGATCGTCTCTCT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62,281
MK606533.1
Posavirus 1
Aoki,H., Sunaga,F., Ochiai,H., Masuda,T., Ito,M., Akagami,M., Naoi,Y., Sano,K., Katayama,Y., Omatsu,T., Oba,M., Sakaguchi,S., Furuya,T., Ouchi,Y., Shirai,J., Mizutani,T., Oka,T., Nagai,M.
Azabu university, School of veterinary medicine
Japan
2019-06-09
Ishi-Im2/JPN/2016
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,816
GenBank
1
Japan
Japan
Sus scrofa
feces
2016-11-25
null
null
Posavirus 1 isolate Ishi-Im2/JPN/2016, complete genome
AGAATTTCCAATTCTCATATCGTAGACTGGCTGAAAAGTTGGTCTTGACGTCGTGAAAATGGCGTTATATTTTGAGTGTAAGGGTTTCCTGAAAAGGTAATTCTTATATTGCTGTGAAAACGGCTTTCTCTTTTTATCTCCTCAAACTCCTTATTTTGCATTCTGGCTGTTCAAGCGGCCCAAATCGCAAGCGTATTACATTTCCTTGCGTGCGTACCCGAAAATTTATTGAATTTGGCTTGAATTATAAGCAATGCTTCTTATAGCGGACACTTTGAGAATATAATGCTTGCATGGATTAATGTATACTGTTTCAAATAACAAACCTAGACACGCAGTTGCGTTGATGGTTGTATCAATCACATACGGGTGTTGAACTCGTGTTAATCCTCGATCGCTATATGTTTGCCTCCTACTTCCAATAAAATAGATTACATACGCGACATGCCTTTGTGGTTTACCTATTGGCCTCTGTCAAAAACAAATCGTTCGATTTGTAGTTTCCTGGCCTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCTCGTCGGATGGAAAGGTCCATCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGTTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAATTCTTGTGGCTCTACTGTATCTAGTTCTTGTTCTACTAACTCTAACAATGCTACTGGTTCTATGTTTGAAAAACTCTCCTATGTCAATATAGATAATGTCCTTGATCCCGATATCCCTCACATCACTGAAGTTCATCGCAAGCGGATTTCAGATGATATCCTCGAATCTCAAGGCTGTACTTGCTCTGAACCTATTCTCACTCCTCGTGTGTTTACTTTTTCAACTCTTGGCATGCGTAAATCTGAACTTTTTGATCCTTTGTATCTTCATAAATACAATAAAGTATTCTGCAATTCATATCATGATATTACTGAAAGCATGATCAAGAGTGGATCAATCAATCTTGATAAACTTGATTCTTACTGCAATGGCAAATTATTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCACGTACCTATTGATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATTATTCTGGTTGATCCTATGAAAACTATTTCTTATTGTTCTTCTTTATTCACTACTATTATTAATATTGTTAGAATATATGATCAAGTTCCTGCTGCAAAGTGGCGAACTGCAGATCACGCTATTATTGATCTCATTAATCAAAACTTTAGTCTCTATATCCTTTCTTTCACTCAAGAAGAACTTATGCAATATGCTATAGCTTGTTGTCGTAGCTATCATTATCCTCATGTTGCTGAATTTGTAAATGTCTTATTAACTTATTACCAAATATTGTCAACTTTTATTTCTGATTATGATTGTCCCGCTTCTAAACTCGTTGTTTCATCCTATATGGCTCGATATTCTCTCGATCATTATTGGCAATATGCTGAAGCTCAAGATGGTATTTTTAGTGATTTTTGGAATTTATTGAAAAGTGCTACTGGTTTATTTAAAGGTACCTTTGAAACTGTCATCAAGGCTGCTACTAGTGTTGCAACTACTACTTTAACTAAATCAATGAATTTCCTTGCTAATACTCTAGACCCTGCTTGTTCCGTCATTAGCTCAGTTCTTACTTCTATTTCTTCCGTTATTACTAAATTATTCACTGCTCTTAATCTCACTATTGAATGGGTGGAAGAAAAGGCTGATGATATTGTAACTGGCTTTGAAGCTTTGTTTAATCTTATGAGTCTTAGAGTGAAATATGTACAAAAGAATACAGCTAAATTGACTCGTGTTGGTTTGGCTTTTATGCTTGTTGTCTTAGGTGTATGGATTGCTTGTCAAGTCGGTTTCTTTGGTTATAGTTTATTAAGTAAAATGCTTGATATTCTTTCTAAATTTTCCTCTAGCTATACTCGTATGGAACCTCAAGGTGCTAACGTTGGTCCTGGTGAACTCTCTATTCCTGGTACTATTATTTCTCTCATCTGTATTTTTGTTTGTGGCTGGGAATATGCTGACCATCCTATTATTAATAATATTGGTAAATTGATTACTCGATTTGCTCCAATGAAAGCTTCTATGGAAAAGGCTTTATCCTGTGTATGTTCCTTACTTCCTGCTTGTATTTCTCGTTTTATCTTTACATTGTCTCCTGAAAGTTCTGATGCTGTCTTGGCTGATATTTCTGATTTTATTACTGATGTTAATGTTGCTCGTGTTTTCTCAACTACTCCTTCTGCAATTATTTCTGATGAATATGTTAATATTCTTTCTGAACTTATGACTCGTGGTGACGCTTTGGTTAAACGTGTTAGTGCTGATTCTAGTATTGCTCAATCTCCTCTCTATGCTCCATTTTTCCAATCTTTGTCTCAAATCACTGCTCTTACTACTAATATTGTTCAAATTCGTCGATCCTCTGAAGCTCGTCCTAGACCTACTTGGGTCCACTTCTTTGGTGATGCTGGTGCTGGTAAAACTTTCTTTGTTCAAAATGCTTCTACTTTATTTGCTGGTATTCGACGTTTTGATGGTAAATCTGAATCTTGTCCTAAGTCTTATGTTATTCCCACTGCCTCTCAATATTGGGACGGTTTCCAACAAGATGTCTATCCAATTACGGTATTTGAAGAAATTTGGGGTGTTTTAGATGGTCAATCTGCCTTACAAATCGATTATCCTAATACTCTTCTTCAACTTATGTCCTCAGCTACTTTCATGCCTCCAATGGCAGCTATTACAAGTGGTGTAGTTGGTATGAAAGGTACTACCTTCAATTCTACATTATTCCTTTCTTGTCATAATAATGCTCTTCCTAACAATTGGGGTGGTGATGCATATGCTCTTGCTAGACGTATGAATTATATATTTAAAGTTATTGCTCCTACTTATTCAAAACCTTACAGTGAAACTCAGAAAATGCTCGATTCAAAAGGTAATGTTCATGAAGTTACTGTTGATTATTACTGTGGCCGTAAAGGTATTGATAGTGATCAAGATTGTTTTATGATGAAGTATGCTCAAGGCGAGAAGGTTGTTGTTAAACCTTGTGTGCTTACTGTAGATCTCTATCGTAAGGCTTGGCGTTTCGTTCCCTATATTACCCAAGTCCAAAACAATACTCCCGAAATTCTTGCTACTGAACTTGCCAAGAATCCTGAAGATTCTAATTCTCTTAAAACTCAATCCTTAACTGTTGATGAAGTTGTGGCTAATATTCTTAGTACTGTTGATTTCAATGTTGCTGGTTTCTTAAAGTCTGCTGAATCCAGTGGTCTCAAATACAATCTTAAACTTAAGGAATCATATGATGCTCTATATCGTGCAATTGTGTTTGACAAGAACCCTCAAAAGGTTTTTGATGCTATTGTCGATAATCAAGTTGATGCTGTTCGTGATAATTTAGACCCAACTGAAGGTGTTGTTAATAACACTCTTGAAGCTGCGGATGATGTTATCGAAGGTGTTATTGCTGAAGTTAAAAACCAATCTTCTGAGTTCCAATCTGTTAATTGTGACTCTGATCCTGAGGAAATTTATAAACCTGATGGTGATGAACCTGCTCCAATTCCTGATCCTGATCCTGAAACTGCTGTTTCTAATGCTGAAGCTCAAGGTCCATTTAGTAAACGTGTTGTTAAGTCTAGTAATGATTCATCTGAAGTTGAATTGTCCCAATTTGATGGTAAAGTTGATCCTCAAACTTTCCTTGACAATTCTCGTGATTTTGTTCGTCGTGTAACGAATGCTATGAAAGGTGGTCCACGTGATGTTGAAGATCCCATTTCCCGCAAGATCATTCGTGGTCTTGTCCGTACACTTCCTGCTGTAAAGTCCAATGATCCTATTGTTGTTGAACCTGCTAACATGACTAATTATATCTCTGGTGCTACCTTAAATGCTGCTTTCTTTGAATCTTATGCTACTATGTTTGAATCTCTATTCTCAACTGTTTCTACTAGCTTATCCTATTCTCCTTCTCTTGCTAACTGTACTATTTATTACTTTGGTCATACAATTAGTGATTCTAAGGTTCCATTTGCTAGCCATCCATTCTTTTCTTCAAAATTCAATACTGATATTTTCTATCAATACTTATCACTTATTCGTCCTGTTACTAGTATTGCTCCTGGATTTCCTCATGAAATTGAATCCCATCCTCTATTCATTATTGCTGAAGATTCGATTTATTATTTAGTCGATCGTAATGGTACTGTAATTCGTTCTATGGATGATTTGCGTGTTGTTGAGACTAACTCTTATAGTGTTTCTAATTATGATTTTGCTATTCTTTCACCTACCAATCCTATTGCTTCCGGTCTTCTATATTGGAATGAGAATGCTTCCCAACTTATTACTTTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCTAATGGACAAACTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATTCTCCGTTCATTATTCAACATTCCGATGATCCTTTTGCTCCATCTTGTTATCAAGGTGGTTGGAAGATTTGTGTCCATTGTCTTCGTTGCTATCATCCTGTCATTTATCCTCTTCTTGAAGGTAGCAAATGTACTTCTATTGTTTCACATGGATATCATTCTCTTATTGAATTGTCTGAAGTTAGTTCTGCAAATCTCTCTGCTTTGTCATTTACTGTACCTAAACCTGATTATTCTTATTTTTGTTCTATGGCTGTTTTGACTCTTGCTCTTTCCAAACTTTGTGATGGTACTAAACGTGTTGAACATCGTACACTTAATTTTACTTATGAATTAGCTAAGGTGATTGATGCATCTCAATTATTGAAGGGTACTGGCAAAGATGTTGTTGAAGTTGCTAGTTCTATGAAAGTTTCTACTTGTGATTCTTATGGTGTAGTTGATACCATGCCTTCTATTCCTGTCTTATATGATGATGATGTTAAGCATGTTGATGTTATTGATAATTCTGTGATTAACAAAGCTCTTACTCCTCAATCGCATTCTTTTGTT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62,283
MK606536.1
Posavirus 1
Aoki,H., Sunaga,F., Ochiai,H., Masuda,T., Ito,M., Akagami,M., Naoi,Y., Sano,K., Katayama,Y., Omatsu,T., Oba,M., Sakaguchi,S., Furuya,T., Ouchi,Y., Shirai,J., Mizutani,T., Oka,T., Nagai,M.
Azabu university, School of veterinary medicine
Japan
2019-06-09
Ishi-Im8/JPN/2016
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,839
GenBank
1
Japan
Japan
Sus scrofa
feces
2016-11-25
null
null
Posavirus 1 isolate Ishi-Im8/JPN/2016, complete genome
GAATTTCCTAATTCTCATATCATAGGTTTTGCTGGCGCATTACCTTGACTTCGCTTGCGCGTTGTTATATTTTGAGTCAAAGATGGTTGCTGGCGCGATTGTCTTTGATAGCTGCTGACGCGGCTTTCTCAATCTCCTCAAACTCCTTATTTTGCATTCTGGCTGTTCAAGCGGCCCAAATCGCAAGCGTCTTTCACTTCCTTGCGTGCGTACCCGAAAATTTATTGAATTTGGCTTGAATTATAAGCAATGCTTCTTATAGCGGACACTTTGAGAATATAATGCTTGCATGGATTAATGTATACTGTTTCAAATAACAAACCTAGACACGCAGTTGCGTTGATGGTTGTATCAATCACATACGGGTGTTGAACTCGTGTTAATCCTCGATCGCTATATGTTTGCCTCCTACTTCCAATAAAATAGATTACATACGCGACATGCCTTTGTGGGTTACCTATTGGCCTCTGTCAAAAACAAATCGTTTGATTTGTAGTTTCCTAGCCTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCTCGTCGGATGGAAAGGTCCATCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGTTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAATTCTTGTGGCTCTACTGTATCTAGTTCTTGTTCTACTAACTCTAATAATGCAACTGATTCTATGTTCGAAAAACTCTCCTATGTCAATATAGAAAATGTCCTTGATCCTGATATCCCTCACGTCACTGAAATTCATCGCAAGCGGATTTCAGATGATATCCTCGAATCTCAAGGCTGTACTTGCTCTGAACCTATTATTACTCCTCGTGTGTTTTCATTCTCAACTCTTGGCATGCGTAAATCTGAATTATTCGATCCCTTATATCTTCATAAATATAACAAAGTATTCTGCAATTCTTATCACGATATTACATTAAGCATGATCAAGAATGGATCAATCAATCTTGATAAACTTGATTCTTACTGCAATGGCAAATTATTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCACGTACCTATTGATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATTATTCTGGTTGATCCTATGAAAACTATTTCTTATTGCTCTTCATTATTTACTACTGTTATTAATATTGTTAGAATATATGATCAAGTTCCTGCTGTAAAGTGGCGAACCGCTGATCGTGCTATTGTTGATCTTATTAATCAAAATTTCAGTCTCTATATTCTTTCATTTACTCAAGAAGAACTTATGCAATATGCTATAGCTTGTTGTCGTTGCTATCATTATTCTCATGTTGCTGAGTTTGTCAATGTCTTATTAACTTATTATCAAATATTGTCAACTTTTATTTCTGAATATGATTGTCCTGCCTCTAAACTCGTTGTTTCATCTTATATGGCTCGTTATTCTCTTGATCATTATTGGCAATATGCTGAAGCTCAAGATGGTATCTTTAGCGACTTTTGGAATTTATTGAAAAGTGCTACTGGTTTATTTAAGGGTACTTTTGAAACTGTTATTAAAGCAGCTACTGGTGTTGCAACTACTACTTTAACTAAGTCGATGAATTTCTTAGCAAATACTCTTGACCCTGCTTGTTCTGTCATTAGCTCAGTTCTTAATTCTATTTCTTCCGTTATTACTAAACTATTCTCTGCTCTTAACATCGCCATTGATTGGGTGGAAGAAAAAGCTGATGATGTTGTTACTGGCTTTGAAGCTTTATTCAATCTTATTAGTCTTAGAGTTAAATATGTACAAAAGAACACTGCTAAATTGACTCGTGTTGGTTTGGCTTTTATGCTCGTCGTCTTAGGTGTTTGGATTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGCTATACTTTATTGACTAAGATGCTCGATATTCTTTCTAAATTTTCCTCTAGCTATACTCGCATGGAACCTCAAGGTGCTAACGTTGGTCCTGGTGAACTCTCTATTCCTGGTACTATTATCTCTCTTATTTGTATTTTTGTTTGTGGCTGGGAATATGCTGATCATCCTATTATCAATAATATTGGTAAATTAATTACTCGATTCGCTCCAATGAAGGCTTCTATGGAAAAGGCTTTATCATGTGTGTGCTCTTTACTTCCTGCTTGTATCTCTCGTTTTATTTTTACATTGTCTCCTGAAAGTTCTGATGCTGTTTTGGCTGATATTTCTGATTTTATTACTGATGTGAATGTTGCTCGTGTCTTCTCAACTACACCTTCTGCTATTATTTCTGATGAATATGTCAACATTCTTTCTGAACTTATGACTCGTGGTGATGCTTTGGTTAAACGTGTTAGTGCTGATTCCACTATTGCTCAATCTCCTCTTTATGCTCCATTTTTCCAATCTTTATCTCAAATTACTGCTTTGACTACTAATATTGTTCAAATTCGTCGATCCTCTGAAGCTCGTCCTAGACCTACTTGGGTCCATTTCTTTGGCGATGCTGGTGCTGGTAAAACTTTCTTTGTTCAAAATGCTTCCACTTTGTTTGCTGGTATTCGACGTTTCGATGGTAAGTCTGAATCTAGTCCTAAATCTTATGTCATTCCTACTGCTTCTCAATATTGGGATGGTTTCCAGCAAGATGTCTATCCAATTACAGTATTTGAAGAAATTTGGGGTGTTTTAGATGGTCAATCTGCTTTACAAATCGATTATCCTAATACTCTTCTCCAACTTATGTCCTCAGCTACTTTCATGCCTCCAATGGCTGCTATTACAAGTGGTGTAGTTGGTATGAAAGGTACCACCTTCAATTCTACATTATTCCTTTCCTGTCATAATAATGCTCTTCCTAACAATTGGGGTGGTGATGCATATGCTCTTGCTAGACGTATGAATTATATATTCAAAGTTATTGCTCCTACTTCTTCAAAACCTTATCGTGAAACTCAGAAAATGCTCGATTCCAAAGGTAATGTTCATGAAGTTACTGTTGAATACTATTGTGGCCGTAAAGGTATTGATAGTGATCAAGATTGTTTTATGATGAAGTATGCTCAAGGCGAGAAGGTCGTTGTTAAACCTTGTGTGCTTACTGTTGATCTCTATCGTAAGGCTTGGCGCTTTGTTCCTTATATTACCCAAGTCCAAAATAATACTCCTGAAATTATTGCTACTGAACTTGCCGAAAATCCTGCTGATCCTAATTCTCTTAAAACTCAATCTTTAACTGTTGATGAAGTTGTGTCTAATATTCTTAGTACTGTTGATTTTAATGTTGCTGGCTTCTTAAAGTCTGCTGAATCTAGTGGTCTCAAATATAATCTTAAACTTAAGGAATCATATGATGCTCTTTATCGTGCAATTGTGTTTGACAAGAACCCTCAAAAGGTTTTTGAAGCTATTGTTGATAATCAAATTGACGCTGTTCGTGATAACTTAGATCCAACTGAAGGTGTTGTCAATAACACTCTTGAAGCTGCAGATGATGTTATTGAAGGTGTTATTGCTGAAGTTAAGAATCAATCTTCTGAGTTCCAATCTGTTAATTCTGACTCTGATCCTGAAGAAATTTATAAACCTGAAGGTGATGAACCTGCTCCAGTTCCAGATCCTGATCCTGATACTGCTGTTTCTAATGCTGAAGCTCAAGGTCCATTCAGTAAACGTGCTGTTAAGTCTAGTAATGATTCACCTGCTTATGAATTATCTCAATTCGATGGTAAGGTTGATCCTCAAAATTTCCTTGATAATTCTCGTGATCTTGTTCGTCGTATTACTAATGCCATGAAAGGTGGTCCACGTGATGTTGAAGATCCAGTCTCTCGCAAGATTATTCGTGGTCTTGTTCGTACACTTCCTGCTGTTAAATCCAATGATCCTATCATTGTTGAACCTGAAACTATTGGTCAAAACATTACTGGTGCTACTTTGAATGCTGCCTTTTATGAATCTTATGCTACTTTATTTGAATCATTATTCTCCGTTGTTTCTACTGAATTGTCTTATTCTCCTTCTTTAGCTAATTGTTCTATTTATTTCTTTGGTCAAACAATTAGTGATTCTAAGGTTCCATTCGCCAATCATCCTTTCTTCTCATCTAAGTTCAATACTGATGTCTTTTATCAATATTTATCTATTATTCGTCCTGTTACTACTATTGCTCCTGGATTCCCTCCTGAAATTAAATCTCATCCTCTATTCATTATCGCTGAAGATTCGATTTATTATTTGGTCGATCGTAATGGTGCTATAATTCGTTCTATGAATGACTTACGTGTTGGTGAAACTAACTCATATGGTGTTTCTCATCAAGATTTTACAATCTTGTCTCCTACTAATCCTATTGCTTCTGGTCTTTTATATTGGAATGAGAATGCCGATCAACTCGTTAAATTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCAAATGGACAAACTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATCCTCCATTCGTAATTCAACATTCTGACGATCCTTTTGCTCCATCTTGTTATCAAGGTGGTTGGAAGATCTGTGTCCATTGTCTTCGTTGCTATCATTCCGTTATTTATCCTCTTTTAGAAGGTAGCAAATGTACTTCAATTGTCTCACATGGATATCATTCTCTTATTGAATTATCTGAAGTTAGTTCTGCTAATCTCTCCGCTCTTTCATTCACTGTACCTAGACCTGATTATTCCTATTTCTGTTCTATGGCTGTTTTAACTCTAGCTCTCTCTAAAATTTGTGATGGTACTAAGCGTGTAGAACACCGAACACTTAATTTTACCTATGAATTAGCTAAAGTTATTAATGAATCTCAATTGTTGAAGGGTACTGGCAAAGATGTTGTTGAAGCTGCTAGTACTATGAAAGTTTCTACTTGTGATTCTTATGGTGTAGTCGATACCATGCCTTCTATTCCTGTCTTATATGATGATGATGTTAAGCATGTTGATGTTATTGATAATTCTGTGATTAACAAAGCTCTTACTCCTCAATCGCATTCCTTTGTTTCTT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62,286
LT898419.1
Posavirus 1
Pohlmann,A.
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, 17489 Greifswald - Insel Riems
Germany
2017-08-08
PsaV/GER/L01017-K01_15-07/2015
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,815
GenBank
null
Germany
Germany
Sus scrofa
null
2015-01
SAMEA81285418
PRJEB19039
Posavirus 1 isolate PsaV_GER_L01017-K01_15-07_2015 genome assembly, complete genome: monopartite
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75,282
KU981058.1
Posavirus 1
Chen,J., Zhang,X., Shi,D., Shi,H., Liu,J., Feng,L.
Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Division of Swine Infectious Diseases, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology
China
2016-05-01
null
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,819
GenBank
null
China
China
Sus scrofa
feces
2015-12-03
null
null
Posavirus 1 strain HBTS-11, complete genome
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82,178
KT724282.1
Posavirus 1
Chen,J., Wang,X., Ji,Z., Zhang,X., Shi,H., Feng,L.
Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Division of Swine Infectious Diseases, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology
China
2016-02-17
null
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,840
GenBank
null
China
China
Suidae
feces
2014-08-03
null
null
Posavirus 1 strain SDQD-25, complete genome
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83,763
KR019687.1
Posavirus 1
Hause,B.M., Hesse,R.A., Anderson,G.A.
Kansas State University, Veterinary Diagnostic Laboratory
USA
2015-06-10
null
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,607
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
feces
2015-01-09
null
null
Posavirus 1 strain 958-4, complete genome
GATATCATGTCCTGGCTGTTCAAGCGGCCTAAATCGCAAGCGTTTTTCATTTCCTTGCGTGCGTACCCGAAAATTTATTGAACTTGGCTTGAATCATAAGCAATGCTTCTTATAGCGGACACTTTGAGAATATAACACTTGTATGGATTAATGTGTGCTGTTTTAAATAACAAACCTAGACACGCAGTTGCGTTGATGGTTGTACCAATCACATATAAGTGTTGAACTCGTGTTGATCCTCGATCGCTATATGTTTGCCTCCTGCTTCCAATAAAATAGATTACATACGCGACATGCCTTTGTGGGTTACCTATTGGCCTCTGTCAAAAACAAATCGTATGATTTGTAGCTTCCCGGTGTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCTCGTTGGGTGGAAAGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGCTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAATTCTTGTGGCTCTACTGTATCTAGTTCTTCTTCAACTCAATCTATTAATGTTTCTAATCCCGTTAAAAAACAAAAATTACAAAAAACTGCTTACAATCTTGAAGAATTCTTTGATCATGATCTTCCTGATCCTATGGTCTCTTATCGTTCAAAAATTTCATCAAGAATTCTTGAAAATCAAGGTTGCATTCACTCTGATTCTCATCTTACTCCTCGTGTGTTTTCATTTTCTACTGTTGGCATGTTAAGATCTGAACTTTTTGACTCTCTTCATCTTCTTAAATACAACAAAGTCTTTGCTGCATCTTATCATGACATTACTGAAGAAATGATCAACAATGGTTCTTTGAATCTCGATAAACTCGTTACTTATTGTAATGGTAAACATTTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCATGAACCTATTAATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATCATTCTTGTTGATCCTATGAAAACCATTTCCTATTGCTCATCTCTATTTACTACTATCATTAATCTTGTAAACTATTATGATCATGTACCCGTTTCTAAATGGCGTGCCTCTGATCGTGCTATAGTTGATCTCATTAATCAAAATTTTAGTCTTTATATTCTTTCATTTACTCAAGATGAACTCATCCAATATGCTATTGCTTGTTGTTATTCTTATGATTATTCTCATGTTGCTGAGTTCGTCAACGTCTTACTAAGCTATTATCAAATACTCTCTACTTACATTTCTGACTCTGATTCTCCTGCTTCTAAACTTGTTGTATCTTCATTTATTGCTAGATATTCTCTCGATCATTATTGGCGTTATGCTGAAGCTCAAGATGGTATTTTATCTACCTTCTGGAGTTTAGTCAAAGGTGCTACTAATCTTTTTCAAGGTACCTTATCTCTAGTTTTAAATGCTGCTACTTCACTTGCAAATGAATTGCTCACTAAATCTATGAACTTCTTAGCCTATACTTTAGATCCTACTTCTTCTATTGTATCCTCCGTATTGAATTCCATTAGTTCTGTGATTGAACGTTTATTTGCTTCACTTAATCTTACTGTAACTTGGGTAGAAGAAAAGGCTGAGGATGTTGCTACAACATTCGAAGCTCTTTCTTCCTTAATCACTATGAAACTTAAATATAAACCTGATAAATCTACTCGTCTCACTCGCGTTGGTCTTACATTTATGTTCGTCGTCTTAGGTATCTGGGTTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGTTATAACTTATTATCTAAGATGTTCGAAATCCTTGCTAACTTCTCTTCTCCTTGGACACGCGTAGAACCTCAAGGTCCTAACACTTCTCCTGGTGAATTATCCATTCCTGGAACTATCATTTCTCTTATTTGTATTTTTGTCTGTGGTTGGCAATACGATACTCATCCTATTATTAACAATATTGGTAAACTTATTACTCGTTTTGCTCCTATGAAAGCTTCCATGGAAAAAGCCTTGTCCTGCGTTTGTTCATTACTCCCTGCTTGTATTTCCCGTTTTATCTTCAATTTATCTCCTGAAAGTTCTGATGCTATTCTTGCCGACATCTCTGATTTTATCACTGATGTTAATGTAGCTCGTGTTTTCTCAACTACCCCTGCTGCTATTATCTCTGACGAATATGTTCAGATTCTTTCTGAACTTATGACTCGTGGTAAAGAATTGCAAGATCGTATCAGTAAAAATCCTGAAATCCCTACCTCTCCTCTCTATAATCCATTCTTCCAATCCTTAACTCAAATCGTTTCCCTTACTACTAATATCGTTCAAATTCGTCGATCCTCTGAAGCTCGCCCTCGACCTACCTGGGTCCACTTCTTTGGTGATGCTGGTGCTGGTAAAACATTTTTCGCTCAGAATGCTTCTGTTCTATTTGCTGGTATTCGTCGATTTGACGGTAAATCCGAATCTAATCCTAAAACCTATACTATTCCTACTGCTTCTCAATACTGGGATGGCTTCCAACAGGATGTCTATCCTATTACTGTATTTGAAGAAATCTGGGGTGTTATGGATGGTCAAACTGCTATGCAAGTTGATTATCCTAATACTCTTCTCCAACTTATGTCCTCTGCTACTTTCATGCCTCCAATGGCTGCTATTACTAGTGGTGTGGTTGGTATGAAAGGTACTACTTTTAACTCCACTCTCTTCCTCTCATGTCACAATAATCCCTTCCCTAATAACTGGGGTGGTGACTCATATGCTCTTGCTAGACGTATGAATTACCTCTTTAAAGTTATTGCTCCTACTTCTACTAATCCTTATACTGTCACTGAAAAAGTACTTGATAGCAAAGGAGTATCTCACGAAGTTGTTGTTGATTACTACTGTGCTCGTAAGGGCATAGATTATGATCAAGATTGTTTTGTTGCTCGATACAAGAAAGGTGATAAGTTAGTTGTTAAACCTTGTGTTTTAACTGTTGAAATGTATCGAAAAGCTTGGAAATTTGCTCCTTACAAAACTGTTGTTGAAAATAATACTCCTGAAGCTGTTAGTACTACTCTTCCTAAAAATCCTACTGACTCCGAATCTCCTCAAACTCAATACTTAACTGTTGATGAAGTTATTGCAAACGTTCTTGATACTGTTAACTTTAATGTTCATGGTTTCTTGCAATCTGCTGAATCAAGCGGACTCAAATATAATCTTAAACTCAAGGAATCATATGATGCTTTATATCGTGCTATTGTTTTTGAAAAAGACCCTCAAAAAGTCTTTGAAACAATCGTCGATAATCAAGTTGATGTCGTTCGTGATAACTTAGAAGTTGCTGACAATACTATCAATGCTGCTTTAAGTGTTGTTGATGATATGATTGATGGTGTTGCTGATGAAGTTAAGAATAAATCTACTGAATTCCACTCTGTTACTTCTGACTCTGATCCAGATGAGATTTACGTCCCACCTGGTGATGAAAATGTCCCTCCTGCTCCTGAAAATACTCCTGATCCTATTCCTGAATCTGCTGTTTCATCTGCTGAAGCTCAAGGTCCTCAAAAGCTTGTTGTTAAGTCCGATTCATCTTCTCCCGAAGTTGAGCTTGCTCAATTTGACGGAAAAGTTGAACCCCAATCTTTCCTTAACAATGCTAATAATCTTGTTCGTCGAGTTACTAATGCTCTTAAAGGTGGTCCTCGTGATGTTGAAAATCCTATTCATAAGAAAATTATTCGTGGTTTGGTTCGAACTTTACCTGCTTACTCTTCTTCTACTCCTATTATTGTCGAACCTGGTGTTACTGGTCAAAACATTACTGGATTAACTTTAAATGCTGCTTTTGCTGAATCTTATGGTGCTTTATTTGAATCTCTATTCTCTATTCTTTCTACTGAACTCTCCTACTCTCCTAAAATTGCTAACTGTAAATTGTATTACTTCGGTAATTCAATTTCAGAATCTTCTGTTCCATTCAAAACTCATCCATTTTTCTCCTCAAAATTCAATACTGATATCTTCTTCCAATACCTCTCCCTCATTTGCCCTTTTACTCAATTAGCTCCTGGTCTTCCAGCTGATGCTAAGTCTCAACCTCTCCTTATTATTGCTGAAGATGATCAATATTATCTTATTGATCGTGCTGGTCGTGTGATTCGCAATATGAATGACTTACGTGTTGGTGAAAATAATTCCTATGGTGTCTGTAATTATGATTTCTGTATTCAATCTCCTACTCATTCTATCGCTGCTGGTCTTCTCTATTGGAATGAAAATCTTATTCAATTACAACAATTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCTAATGGACAATCTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATCCTCCTTTCCTCTGTCAACATTGTGATGATCCTTTCGCTGTTTCTTGTTTCAAGAATGGCTGGAAGGTGTGTACTCATTGTCTACGTTTCTATCATGATACAATCTATCCTCTCATCGAAGGTAGTAAATGTACTTCAATTGTTTCACATGGATATCATTCTTTAATTCCTCTTGGTGAGATTAGCTCCGCAAATCTTACTGCTCTTTCATTCACTGTTCCTAAACCTGATTACTCTTACTTTTGTTCTATGGCTGTTATTACTCTTGCTCTATCAAAAACGATAAATGGCACAAAATGTGTTGAACATAGTTCTCTTGTACTTACTCAAGATGTTGCTTTAGTTGTTAATCAATCCCTATTACTGGATCAACAAGATGTTGTTGACGTTGCTCGTGATGTTAAAGTTTCTAATTGCTCTACTTATGGCGAAGTTGATGTTATGCCTACTGTTCCTATTCAATATGATGATGATGTTAAACACGTTGATATCATCGATGATTCCGTAATAAACAAAAGTCTTACTCCTCAATCTCATTCATTTATGTCTTATGTTGTTATTGGTGCTTCATTATGTGGTATTGTTTATGCTATTTATAAATCTTTCTTCCCTGCTAAAGCAAAACTTTGGGAAAGTCAAAGTGAACCTCCTAGTCGTGTTACTGCTGCTGTTCGTCGTAATAATACTCCTAAA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86,942
JF713720.1
Posavirus 1
Shan,T., Li,L., Simmonds,P., Wang,C., Moeser,A., Delwart,E.
University of California-San Francisco, Blood Systems Research Institute, Department of Laboratory Medicine
USA
2011-11-02
null
Posavirus 1
Posavirus
null
ssRNA(+)
9,840
GenBank
1
USA
USA
Sus scrofa
feces
2010
null
null
Posavirus 1, complete genome
TCTTGACATCATGAAAATGGTGTTATATTTTGAGCTTAGGGGTCTCCAGAAATGGTGATTCCTATGTTGCTGCGAAAGTGGCTCTCTCTTTTATCTCCCTAAACTCCTTAATCTGCATCCTGGCTGTTCAAGCGGCCCAAATCGCAAGCGTCTAACATTTCCTTGCGTGCGCACCCGAAAATTTATTGAACTTGGCTTGAATCATAAGTAATGCTTCTTATAGCGGACACTTTGAGAATATAATGCTTGTATGGATTAATGTATACTGTTTTAAATAACAAACCTAGACACGCAGTTGCGTTGATGGTTGTATCAATCACATATAAGTGTTGAACTCGTGTTAATCCTCGATCGCTATATGTTTGCCGCCTACTTCCAATAAAATAGATTACATGCGCGTCATGCCTTTGTGGGTTACCTATTGGCCTCTGACAAAAACAAGTCGTAAGATTTGTAGCTTCCCGGTGTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCTCGTAGGGTGGAAAGGTCCACCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGTCCTGGTTGTCGCAATTCCAGGCGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAACTCTTGTGGCTCTACTGTATCTAGTTCTTGTTCTACTAACTCTAATAATACTACTGGCTCTAATACTGAAAAACTTACATATGTTAATATAGATAATATCCTTGATCCTGATATCCCTCACGTCACTGAAGTTCGCCGAAAACGAATTTCAGATCATATCATTGAATCTCAAGGATGTACTTGCTCTGAACCTACTATAACTCCTCATGCGTTTTCATTTTCTACTCTTGGCATGTATAGATCTGAACTTTTTGATTCTTTACATTTACACAAATATAACAAAGTATTTATTAATTCCTATCATGATATTACTCTAGACATGATCAAGAATGGATCAATCAATCTTGATAAACTTGAATCTTATTGTAATGGTAAACTATTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCATGAACCTATTAAATTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATTGTTCTTGTTGATCCTATGAAAACCATTTCCTATTGCTCTTCATTATTTACTACTATTATTAATCTTGTTAATATTTATGATCATGTTCCTACTGCAAAGTGGCGAACCGCTGATCGTGCTATTGTTGATCTTATTAATCTTAATTTTAGTCTCTACATTCTTTCATTTACTCAAGAAGAACTCATGCAATATGCTATAGCTTGTTGTCGTCGCTATCAATATTCTCATGTTGCTGAGTTTGTTAATGTCTTACTAACCTATTATCAAATATTATCAACTTTTATTTCTGATTATGACTCTCCTGCTTCTAAACTTGTCGTTTCATCTTTTATGGCTCGATACTCTCTTGATCACTATTGGCGATATGCTGAAGCTCAAGATGGTATCTTTAGTGATTTTTGGAATTTACTCAAAAGTGCTACTGGTTTATTCAAGGGTACTTTTGAAGCTGTCATTAAGGCTGCTACTGGCGTTGCTAGTACTACCTTAACTAAGTCAATGAACTTCCTTGCAAATACTTTAGATCCTACTTGCTCTGTCATTAGCTCAGTTCTTAATTCTATTTCTTCCGTTATTACTATATTATTTACTGCTCTTATTATTACTATTGAGGGGGTGGAAGAAAAAGCTGATGATGTTGTAACTGGATTTGAAGCTTTATTCAATCTTATTAGTCTTAAACTCAAATATACACAAAAGAATTCTGCTAAATTAACTCGTGTTGGTTTATCTTTCATGTTTGTCGTCTTAGGTGTATGGGTTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGCTACAATTTATTATCTAAGATGCTTGATATTCTATCTATGTTTTCCTCCAAATACACTCGTATGGAACCTCAAGGTGCTAACGTTGGTCCTGGTGAGCTCTCTATTCCTGGTACTATTATTTCTCTTATCTGCATTTTCGTCTGTGGCTGGGAATATGCTGATCATCCTATTATTAATAATATTGGTAAACTCATTACTCGATTCGCTCCAATGAAAGCTTCTATGGAAAAGGCTCTATCCTGTGTATGTTCATTACTCCCTGCTTGTATCTCTCGTTTTATCTTCTCATTATCTCCTGAAAGTACTGATGCTGTTTTGGCTGATATTTCTGATTTTATTACTGATGTTAATGTTGCTCGTGTTTTCTCTACTACTCCTTCTGCTATTATTTCTGATGAATATGTCAACATTCTTTCTGAACTCATGACTCGTGGTGATGCTTTGGTCAAACGTGTTAGTGCTGATCCTAATATCCCTCAATCTCCTCTTTACTCTCCATTTTTCCAATCTTTATCCCAAATTATTACTCTAACTACTAATATCGTTCAAATTCGTCGATCTTGTGAAGCTCGTCCTAGACCTGTTTGGGTCCACTTCTTTGGTGATGCTGGTGCTGGTAAAACTTTCTTTGTTCAAAATGCTTCTACTTTATTTGCTGGTATTCGACGTTTTGATGGTAAATCTGAATCCTGTCCTAAATCTTATGTTATTCCTACTGCTTCTCAATACTGGGATGGCTTCCAACAGGATGTCTATCCAATTACAGTATTTGAAGAAATCTGGGGTGTTTTAGATGGTCAATCTGCTTTACAAATTGATTATCCAAATACTCTTCTCCAACTTATGTCCTCTGCAACTTTCATGCCTCCTATGGCTGCTATTACTAGTGGTGTAGTTGGTATGAAAGGTACTACCTTTAATTCTACTTTATTCCTCTCTTGTCATAATAATCCTCTTCCTAACAACTGGGGTGGTGATGCATACGCTCTTTCTAGACGTATGAATTACATATTCAAAGTTGTTGCTCCTACCTCTACTAATCCTTATTGTGAAACTCAAAAGATGCTCGACTCCAAGGGTAATACTCATGAAGTTGTTGTTGAATACTACTGCGGCCGTAAGGGCGTAGATAGTGATCAAGATTGCTTTATGATGCGATATGCTCAAGGTGAGAAGTTGATTGTTAAACCTTGTGTGCTTACTGTTGAATTATATCGTAAGGCTTGGCGTTTCGTTCCTTATATTTCCCAAGTCAAAAATAATACTCCTGAAGTTGTTGCTACTGAACTTGCTCAAAATCCTACTGACTCTAATTCCCTCAAAACTCAATTCTTAACTGTTGATGAAGTTGTATCTAATATTCTTAATACTGTTAATTTCAATGTTGCTGGTTTCTTAAAGTCTGCTGAATCTAGTGGTCTCAAATATAATCTCAAACTTAAGGAATCATATGATGCTCTTTATCGTGCAATTGTGTTTGAAAAGAACCCTCAAAAGGTTTTTGATACCATTGTCGATAATCAAGTTGATGTTGTTCGTGATAACTTAGATATAACTGATGGTGTGGTCAATAATGCTCTTGATGCTGTTGAAGATGTTATTGATGGTGTTATTGCTGAAGTTAAGAATCGCTCTTCCGAATTCCAATCTGTTAACTCCGATTCTGAACCTGATGAGATTTTTAATCCCGAAGGTGAAGAATCTGCTCCTACTCCTGATCCTAATCCTGATACTGCTGTTTCAAATGCTGAAGCACAAGGTCCATTTAGTAGACGTGTTGTCAAGTCTGGTGATGCTTCTCCTGAACTCGAATTGTCTCAATTTGATGGAAAAGTTGATCCTCAAAATTTCATTGATAACTCTCGTGATTTTGTTCGTCGTATGACTAATGCTATGAAAGGTGGTCCACGTGATGTTGAAGATCCTATTTCTCGCAAGATTATTCGTGGTCTTGTCCGTACATTCCCTGCTGTTAAGTCCAATGATCCTGTCATTGTTGAACCTCAAGTTATGGGTCAAAACATTACTGGCGCTATCTTGAATGCTGCTTTTTATGAATCTTATGCTACTTTATTTGAATCATTATTCTCTGTTCTTGAAACTAATCTCTCCTACTCTCCTTCTCTTGCTAATTGCTCTATTTACTACTTCGGTCAAACAATTAGTGATTCCAAGGTCCCATTTGCTAATCATCCATTTTTCTCCTCTAAATTCAATACTGATGTCTTTTATCAATACTTATCTCTCATTCGTCCTGTTACTACTATTGCTCCTGGATTCCCTCTTGAAATCAAGTCTCATCCTCTATTCATTATTGCTGAAGATTCAACTTATTATTTGGTTGATCGTAATGGTACTGTAATTCGTTCCATGAATGATTTACGTGTTGGTGAAACTAACTCTTATGGTGTTTCTAATTATGATTTTGCTATTTTATCTCCTACTAATCCTATTGCTTCCGGTCTTTTATATTGGAATGAGAATGCCTATCAACTTACTAATTTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCTAATGGACAAACTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATCCTCCATTCATTATTCAACATGCTGATGATCCTTTCTCTCCATCTTGTTATCAAGGTGGTTGGAAGATCTGTGTCCATTGTCTTCGTTGCTATCATCCTACTATCTACCCTCTTTTAGAAGGTAGCAAATGTACCTCAATTGTCTCACATGGATTCCATTCTCTTATTGAATTATCTGAAGTTAGTTCTGCTAATCTATCTGCTCTATCATTTACTGTACCTAAACCTGATTATTCCTATTTCTGTTCTATGGCTGTTTTAACTCTTGCTCTTTCGAAGATTTGTGACGGTACAAAGCGTGTAGAACATCGTGATCTTAACTTTACTTATGAATTAGCTAAGGTTATTAATGAATCTCAATTATTACAATCTGTTGGCAAAGATGTTGTTGATGTTGCTAGCTCTATGAAAGTTTCTACCTGTGATTCATATGGTGTAGTCGATACCATGCCTTCTATTCCTGTTTTATATGATGATGATGTTAAACATGTTGATGTTATTGATACCTCTGTGATAAACAAAGCTTTTACTCCTCAATCACATTCCTTTGTTTCTTATTTAGTTATTGGTGCTTCATTATGTGGTGTTGTCTATG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97,934
NC_032412.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2016-12-29
17489_95_2
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,570
RefSeq
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-04-18
null
PRJNA485481
Posavirus sp. isolate 17489_95_2, complete genome
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5,073
KX673215.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
12087_40
Posavirus sp.
null
null
unknown
11,036
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2012-03-12
null
null
Posavirus sp. isolate 12087_40, complete genome
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78,880
KX673216.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
12087_42
Posavirus sp.
null
null
unknown
11,318
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2012-03-14
null
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Posavirus sp. isolate 12087_42, complete genome
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78,881
KX673217.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
12144_61
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,729
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2012-04-10
null
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Posavirus sp. isolate 12144_61, complete genome
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78,882
KX673218.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
14226_38
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,190
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2012-03-06
null
null
Posavirus sp. isolate 14226_38, complete genome
AATATGGTGTCACCTATGTTTATCTTGTTTCCCATCCCACAATGGGACCATGTAACACTGGTAAAATTGTGGAACCCCCCCGCCGTAAGGCAAACCCTTCCCTCACCAAAATGTCACAAGCTAATGATGTTTTGAACTGTGTTGGCGAACAAGTCCCTGCTCCCACTAATGAGGAGTCTGGTGTCGCCTTTTCTCTTTCTACCTCCCAGCCCACGATGGGACCATGCAACAATGGTAAAATTGTGGAAACCCCTTGCTGTAAAGCAAATTCTACTCAAACCAAAATGTCCGAAGTTACTGATAACTCCCACTGTGTTGGCGTAAAAGTCCCTGCTCCTACAACTATGGAGTCTGGTGTCGCCGTTCGTCCTACTATTGTTTGTGAATCTGCAGAAGAGATTGATAGAAGATTGAAAAAGTATGATGAGATGATGAAGACTGAAGAAGAGAAGAAGAGAGAAGAGATGTTGAAGAACAAGATCTGGCAAGAAGAAGTTGATGCTGGAGTCGTTCTTATCCATGGTGGTCCTAACAATGGTAAATACATTGTTAAGAACCGCAAAACTGGAGAACGAAGGTTAATGGACCATAATCCTTATGCCCCTGTAACCGCTACCCCGCTGCCTGAACATAGCCCCAAAACCCCTGCCCCTGAACACCCTGTACCTAAACCCACCCCTGTTACCACCCCAATCCCTGGACTCAAAGTCCTCCGACCTTTTGACCCCAAACCCTCCACCCTTGAACCCCCTGCCCCTGAACCTTTCATGGTTGTAGCCTCTGCCAAGCCTGTGGAAGTCAACCTTAAGCTAGAGAAGCCCGATGGTGTGAAAACACATACTTGGACTGCTCGTAAGTTTGACCCTAAGGAGAAGAAGCTTGCTAAAAACCCCGCCGTTGCTGATAACAGTGTTCGCGCCGAGATTGCTAAGGAACAAGGTATCAAGAAGCAAGATGTTCCCAAGCCCGATGAGCTGAAGACGCGTGCCCGTCGTGGAAAACGTGGTCGCCAAGGAGAGAAGAGGCGTACCTTAGCCAAGCAACGTAATGAGAACTATGAGGCGTCTCGTAAGGAGAAGACTAAGGATAGGAAGAAGAAGCAATTGAAGTTAGCTACTCATGCTGTTGCTGATAAGTGTCACAGCTTGATGGTTAAAGACCGTGAAGAGCGTAAGCTTTCCCTGCCCCCTACTCTACACTGGCAAGAGATGTTACATGCCCTGCGTTATTGCACTACGATTCAGAAGTACGATTACCGTGGAGTACCCTCTGCTAAGAACCCTGAGAAGTGGTCTTATTGCAACGTTATTAATTATGTCTTACATAATCTTAACGATCCCAAAAGACTACGTGCCGCTGTCGTCTATTTCTTGCAGAGACTCAACATTCCTAAGGCTAATTATTTTGATATTTCAAGGTTATCCAAACGTGCTGCTGCCAAACAGGCCGTTATCATGTCTTTCAGTGCCCTTGAATATCAGAGTGATTCTTTCTGTGATTACCTTTGTGAATTGGAGAGTTACTGTGCTGCTAATGGTGAAGATGGTGTTACCATTAAAGGTATTGATTCCTACATCGAAGCCATGGGTAAGTCTATCGCCACTGATAATGTCCCGACTGGTACTATAGCTGCTGCTGGTCTCATTAATCCCGATGGATCTTATCCCGATGATTTTGACGATGATGAACTCGCCACCCTCCCCGACCGTGAACCTATCAAGAAGATTGAAGAAGAAGTTGTGTGTTCTGAACCTGCTGATGATGATGTGCAGGAGGAGCCTCAGGCCCAACCTGAGATGTGCCCTGCCGGTCAATCTTGTTCCTGTGAAGTCAATACTAACATCGATGTTGATGTCAATCAAACCGTCGATGATGAGAATGATCCAGAAGTGAACGAGATTATCGATAATGCTATGAGAAACTGCTACACTATGATGGAATCGATTAACGACAACAAGCTAATGAGTGTCATCCAAGCTCACGGACCTGTTGATTTTGTCATCCGACAACTCACTCGTCTGATTGTGAACCCATGCAAATCAATCTGCAACTACTTAGCTGAAACTGTGCGTAATTTCGTTGGTGATGCTCTAAAGAGATTCACTGATGCTCTGAAGTCATTGTTTGCGAACCTTGGACTCAACTGGCTCTGGGAAACTTTCCTCGCTATGTTGGCCATGATCCGTGAAGCTGCTGAAGAAGTTGTTCACAAGATTGAGAAGTTACTCACTATCAATGCCGCAAAGGATGTCATGATTACGATTGTCATTTGCTTTACCGTGTTTGTTTTGTATAAGATCTTTAGAACAATGTGGTCTGCTGAGCGCGCCACCAAGCTTGTAATGGGATCTACAGCGTTTGCTAATGCCTCACCCGCATCTTACGTTATGCCCATTCTAGCTCTTGTTGGTGCCATTGTCCCTGCTGGAAACTACGTCACCCGATTCTTGTCTAACTACAAAGCCCTTATGACCTCCTCCGATGCTGTTGCTAGTGTTGATACCATGTTGAGCTGGCTGTTACCCCAGTCTGTCCTGTCAGCAATATCTAATAACCCTGCTGACAGTGAATTTGCTATGCTCACTGGTGGTTACAACACTATCATTGCCTTTGGAAACTGTGCAGAAGTTCTTCTAGACCCTGGTGTGATCTCTTACATTGATTCCTACCTCACCCAGTGTCAGAACTACCTCGTTAAGTATAGAAACGATAAGACTTGTAGTACTGTGAATGGATATTACCGCGATGTTGCCAAGATTGAACGTGATGTGACTCGTCATGTCACGACAGCTGGTGTCCGTATGGAACCAGTTTGTATGAGACTTTTTGGCAACTCTGGTGTTGGTAAGTCCAAGGCTGTTGCTCAAATGATTGCCGATATGCATTATGCCCCCCATCAATGGCAAACTATTACCATTGGTGAGCGTACGTTTGAGCAACTAACAGGATGTGAGAGAGTTCTTGTGTTCGATGAGATTTATGCTAATGAGAAACTCAGAGTCGAGACTGCCGATCGCTTTAAGCAGATTGTCAATTCAGTCCCTACCCACGTCAATGGCTCTGACATTGTTGGTATTGAATCTAATAAGCACTCCTCTCTAGCCCCCGATATCGTGTTTGCTACTTCCGAGAAACTTGTGTACCCCGCTGCCCTGTCTGGAATTAACCTTCAATCACTCTATAACCGTGAACATTTCCGTTATGAAGTCACTGGAGATGAAGAGATGATGACTAAGTTAGGATTAAAGACTGATCACAAGGATGTCGAGTTGGATCCTGAAGATCAGAAACACCTACCCTGGCTTAGATTTACTGAAGTTTTTAAGACTGAAGGTTACGAATACAAAGGAGAGACCTTTACCTATGATCAGGTTAAAGAACGTTTAGTTGAAGAAGTTCGTCGTCGTAAGAAGATTTTTGCCACCAGAAAGGTCATTGATAAGAAGCATGATGTCCCCTGTCAGGTTTTTTATGACCTCCTGTCTAGCAATTACAATTCACTGAACGTTGTCCCCCCCAAAGATTCTGATATTGAACAGAAATACCGTGCCCTACTTGATTTAGCCGCTGTTGAAATCCAGGATGATCTTCCTCGCCTTGCCGCCAAGATGATGAAGTTCTCAATCGGTAAGAAGAAGAACACCCAGGTTTGTGCCATGTGTGCGACTAATGCTAATCTTGAACACCGCGACTTTACTGTTGACAATTGTGTTCACCACCTTACCTTGCAAGGAGATGATCACAATGGTGAGGAAGGTTGGGCTTACCAGCTTTCCCTCGCCAACCACACCTATCGGTACATTGAAGATATTGCTGAAGGTGATGTCAAACAGTTAGACTATGACCCTATGCCCCTCGAAATGGTTAATGCCGCTGTTTCTGAAGCCGATGTGAAGCTTAGATGTGCTCGTCAGAAGTACCTTAAGTATTATAACGAAGCACGTCGCGCCCGCAATGCCTACTTCATGAAGTCCCTTGGTTATGATGATTCTCAAGCCGTCAGTGACGCTGTGAAGACTGTTGGTAGTTTGGCCCTTGGTGCCGCTGCACTTGGTGGTTTTTACACCTTGTTCAAGTGGTTACTTGGACCTCGCCAACCCAAATATGTTGCTGAGACTTATGATGTTCGAATCCGCCGTCAACAGAAGCAAGTGAAACCCATGACCGTTGAGGCTCACCAGAGCTCCATGGTTGTGAGTTACGTAACGCTCAACGTTGATCGTAAGACTGATGATACCGACCGTGTTTTACCTGTCCGATGTGTTTATGTTGGAAATGACCGTTTCTTGACCTATGCTCACTGGCTCCCTAGCGATGACTCAAAGCTTGACGAGTTTTCCTACTCCCTTACGTATGGTGGCCACACCTACGCTTTGAAGGAACGTCCCAAGTTTTACACTCCAAAGGCTGAGAGTGCTAGAGATATTTGTGTTTTCCGTGTTGCTACGAACCTTTCCCCTGCGAACTACTTTGCTAACCTAGCCAAAACCGAAGCTGGTGTCCTTTCATCAGCTGCAGACACTCTTGTGACAATGCCGGGTTCTCGTGCCCAGTATTACCCCGAAGTTATTGAGTGTAGTTACCAAGGTTTTGATATAGTTACGAAGATGCCCAGGATGTACACTGTGGATAATGTGCTTAGTGTCCCAATACCTAGTATTTCTGGCGATTGTGGCAAAGTCCTTTTGGACCAAGCCAATCGTATCGTTGGAATTCTGGTTGCCGGCACTATCACTGGACAATCTGCGTCAATGTTCCAGGTTGTCTCCAAAGAAGAAGTTGATACCCTCTGCCCCGTCTACGAATCTCACTGCCCTGCGTCATGGAAGAGTCCCGCGACTTACCCTGTTTGCCGTGGTTCCCGTCTACACGCTACCTCCCTTCGCAGCGCTTGCGAAGAGAAGGCAGGAACTCGTTTCTACAAGCCTCCTATGAGTGCGTCCACCTCCGCTATAGGCGTTGATCCTAAGGACACATTCATCCAACGACTTAAGGAATGT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78,883
KX673219.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
14226_39
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,071
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2012-03-06
null
null
Posavirus sp. isolate 14226_39, complete genome
GCTAATGATGTTTTGAACTGTGTTGGCGAACAAGTCCCTGCTCCCACTAATGAGGAGTCTGGTGTCGCCTTTTCTCTTTCTACCTCCCAGCCCACGATGGGACCATGCAACAATGGTAAAATTGTGGAAACCCCTTGCTGTAAAGCAAATTCTACTCAAACCAAAATGTCCGAAGTTACTGATAACTCCCACTGTGTTGGCGTAAAAGTCCCTGCTCCTACAACTATGGAGTCTGGTGTCGCCGTTCGTCCTACTATTGTTTGTGAATCTGCAGAAGAGATTGATAGAAGATTGAAAAAGTATGATGAGATGATGAAGACTGAAGAAGAGAAGAAGAGAGAAGAGATGTTGAAGAACAAGATCTGGCAAGAAGAAGTTGATGCTGGAGTCGTTCTTATCCATGGTGGTCCTAACAATGGTAAATACATTGTTAAGAACCGCAAAACTGGAGAACGAAGGTTAATGGACCATAATCCTTATGCCCCTGTAACCGCTACCCCGCTGCCTGAACATAGCCCCAAAACCCCTGCCCCTGAACACCCTGTACCTAAACCCACCCCTGTTACCACCCCAATCCCTGGACTCAAAGTCCTCCGACCTTTTGACCCCAAACCCTCCACCCTTGAACCCCCTGCCCCTGAACCTTTCATGGTTGTAGCCTCTGCCAAGCCTGTGGAAGTCAACCTTAAGCTAGAGAAGCCCGATGGTGTGAAAACACATACTTGGACTGCTCGTAAGTTTGACCCTAAGGAGAAGAAGCTTGCTAAAAACCCCGCCGTTGCTGATAACAGTGTTCGCGCCGAGATTGCTAAGGAACAAGGTATCAAGAAGCAAGATGTTCCCAAGCCCGATGAGCTGAAGACGCGTGCCCGTCGTGGAAAACGTGGTCGCCAAGGAGAGAAGAGGCGTACCTTAGCCAAGCAACGTAATGAGAACTATGAGGCGTCTCGTAAGGAGAAGACTAAGGATAGGAAGAAGAAGCAATTGAAGTTAGCTACTCATGCTGTTGCTGATAAGTGTCACAGCTTGATGGTTAAAGACCGTGAAGAGCGTAAGCTTTCCCTGCCCCCTACTCTACACTGGCAAGAGATGTTACATGCCCTGCGTTATTGCACTACGATTCAGAAGTACGATTACCGTGGAGTACCCTCTGCTAAGAACCCTGAGAAGTGGTCTTATTGCAACGTTATTAATTATGTCTTACATAATCTTAACGATCCCAAAAGACTACGTGCCGCTGTCGTCTATTTCTTGCAGAGACTCAACATTCCTAAGGCTAATTATTTTGATATTTCAAGGTTATCCAAACGTGCTGCTGCCAAACAGGCCGTTATCATGTCTTTCAGTGCCCTTGAATATCAGAGTGATTCTTTCTGTGATTACCTTTGTGAATTGGAGAGTTACTGTGCTGCTAATGGTGAAGATGGTGTTACCATTAAAGGTATTGATTCCTACATCGAAGCCATGGGTAAGTCTATCGCCACTGATAATGTCCCGACTGGTACTATAGCTGCTGCTGGTCTCATTAATCCCGATGGATCTTATCCCGATGATTTTGACGATGATGAACTCGCCACCCTCCCCGACCGTGAACCTATCAAGAAGATTGAAGAAGAAGTTGTGTGTTCTGAACCTGCTGATGATGATGTGCAGGAGGAGCCTCAGGCCCAACCTGAGATGTGCCCTGCCGGTCAATCTTGTTCCTGTGAAGTTAATACTAACATCGATGTTGATGTCAATCAAACCGTCGATGATGAGAATGATCCAGAAGTGAACGAGATTATCGATAATGCTATGAGAAACTGCTACACTATGATGGAATCGATTAACGACAACAAGCTAATGAGTGTCATCCAAGCTCACGGACCTGTTGATTTTGTCATCCGACAACTCACTCGTCTGATTGTGAACCCATGCAAATCAATCTGCAACTACTTAGCTGAAACTGTGCGTAATTTCGTTGGTGATGCTCTAAAGAGATTCACTGATGCTCTGAAGTCATTGTTTGCGAACCTTGGACTCAACTGGCTCTGGGAAACTTTCCTCGCTATGTTGGCCATGATCCGTGAAGCTGCTGAAGAAGTTGTTCACAAGATTGAGAAGTTACTCACTATCAATGCCGCAAAGGATGTCATGATTACGATTGTCATTTGCTTTACCGTGTTTGTTTTGTATAAGATCTTTAGAACAATGTGGTCTGCTGAGCGCGCCACCAAGCTTGTAATGGGATCTACAGCGTTTGCTAATGCCTCACCCGCATCTTACGTTATGCCCATTCTAGCTCTTGTTGGTGCCATTGTCCCTGCTGGAAACTACGTCACCCGATTCTTGTCTAACTACAAAGCCCTTATGACCTCCTCCGATGCTGTTGCTAGTGTTGATACCATGTTGAGCTGGCTGTTACCCCAGTCTGTCCTGTCAGCAATATCTAATAACCCTGCTGACAGTGAATTTGCTATGCTCACTGGTGGTTACAACACTATCATTGCCTTTGGAAACTGTGCAGAAGTTCTTCTAGACCCTGGTGTGATCTCTTACATTGATTCCTACCTCACCCAGTGTCAGAACTACCTCGTTAAGTATAGAAACGATAAGACTTGTAGTACTGTGAATGGATATTACCGCGATGTTGCCAAGATTGAACGTGATGTGACTCGTCATGTCACGACAGCTGGTGTCCGTATGGAACCAGTTTGTATGAGACTTTTTGGCAACTCTGGTGTTGGTAAGTCCAAGGCTGTTGCTCAAATGATTGCCGATATGCATTATGCCCCCCATCAATGGCAAACTATTACCATTGGTGAGCGTACGTTTGAGCAACTAACAGGATGTGAGAGAGTTCTTGTGTTCGATGAGATTTATGCTAATGAGAAACTCAGAGTCGAGACTGCCGATCGCTTTAAGCAGATTGTCAATTCAGTCCCTACCCACGTCAATGGCTCTGACATTGTTGGTATTGAATCTAATAAGCACTCCTCTCTAGCCCCCGATATCGTGTTTGCTACTTCCGAGAAACTTGTGTACCCCGCTGCCCTGTCTGGAATTAACCTTCAATCACTCTATAACCGTGAACATTTCCGTTATGAAGTCACTGGAGATGAAGAGATGATGACTAAGTTAGGATTAAAGACTGATCACAAGGATGTCGAGTTGGATCCTGAAGATCAGAAACACCTACCCTGGCTTAGATTTACTGAAGTTTTTAAGACTGAAGGTTACGAATACAAAGGAGAGACCTTTACCTATGATCAGGTTAAAGAACGTTTAGTTGAAGAAGTTCGTCGTCGTAAGAAGATTTTTGCCACCAGAAAGGTCATTGATAAGAAGCATGATGTCCCCTGTCAGGTTTTTTATGACCTCCTGTCTAGCAATTACAATTCACTGAACGTTGTCCCCCCCAAAGATTCTGATATTGAACAGAAATACCGTGCCCTACTTGATTTAGCCGCTGTTGAAATCCAGGATGATCTTCCTCGCCTTGCCGCCAAGATGATGAAGTTCTCAATCGGTAAGAAGAAGAACACCCAGGTTTGTGCCATGTGTGCGACTAATGCTAATCTTGAACACCGCGACTTTACTGTTGACAATTGTGTTCACCACCTTACCTTGCAAGGAGATGATCACAATGGTGAGGAAGGTTGGGCTTACCAGCTTTCCCTCGCCAACCACACCTATCGGTACATTGAAGATATTGCTGAAGGTGATGTCAAACAGTTAGACTATGACCCTATGCCCCTCGAAATGGTTAATGCCGCTGTTTCTGAAGCCGATGTGAAGCTTAGATGTGCTCGTCAGAAGTACCTTAAGTATTATAACGAAGCACGTCGCGCCCGCAATGCCTACTTCATGAAGTCCCTTGGTTATGATGATTCTCAAGCCGTCAGTGACGCTGTGAAGACTGTTGGTAGTTTGGCCCTTGGTGCCGCTGCACTTGGTGGTTTTTACACCTTGTTCAAGTGGTTACTTGGACCTCGCCAACCCAAATATGTTGCTGAGACTTATGATGTTCGAATCCGCCGTCAACAGAAGCAAGTGAAACCCATGACCGTTGAGGCTCACCAGAGCTCCATGGTTGTGAGTTACGTAACGCTCAACGTTGATCGTAAGACTGATGATACCGACCGTGTTTTACCTGTCCGATGTGTTTATGTTGGAAATGACCGTTTCTTGACCTATGCTCACTGGCTCCCTAGCGATGACTCAAAGCTTGACGAGTTTTCCTACTCCCTTACGTATGGTGGCCACACCTACGCTTTGAAGGAACGTCCCAAGTTTTACACTCCAAAGGCTGAGAGTGCTAGAGATATTTGTGTTTTCCGTGTTGCTACGAACCTTTCCCCTGCGAACTACTTTGCTAACCTAGCCAAAACCGAAGCTGGTGTTCTTTCATCAGCTGCAGACACTCTTGTGACAATGCCGGGTTCTCGTGCCCAGTATTACCCCGAAGTTATTGAGTGTAGTTACCAAGGTTTTGATATAGTTACGAAGATGCCCAGGATGTACACTGTGGATAATGTGCTTAGTGTCCCAATACCTAGTATTTCTGGCGATTGTGGCAAAGTCCTTTTGGACCAAGCCAATCGTATCGTTGGAATTCTGGTTGCCGGCACTATCACTGGACAATCTGCGTCAATGTTCCAGGTTGTCTCCAAAGAAGAAGTTGATACCCTCTGCCCCGTCTACGAATCTCACTGCCCTGCGTCATGGAAGAGTCCCGCGACTTACCCTGTTTGCCGTGGTTCCCGTCTACACGCTACCTCCCTTCGCAGCGCTTGCGAAGAGAAGGCAGGAACTCGTTTCTACAAGCCTCCTATGAGTGCGTCCACCTCCGCTATAGGCGTTGATCCTAAGGACACATTCATCCAACGACTTAAGGAATGTACTAACGAGACACTGTGTGATCAGACCCTTATCAATCGTGCTAAGGCTGATCTAATCCACCTCTGGACCGTTGAAGACCGTCACTACCCCACCCCCTCGATGAAAGATGCTGTTTGTGG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78,884
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Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
14250_11
Posavirus sp.
null
null
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9,680
GenBank
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Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2012-03-21
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Posavirus sp. isolate 14250_11, complete genome
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78,885
KX673246.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
16915_3
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,296
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-03-19
null
null
Posavirus sp. isolate 16915_3, complete genome
TCTACAGGGACTTTTACACCAACACAGTTATTCACACTAGTCATGAGTTACCTGATTAGTGTGAATAACTGTGTTGGTGTAAAAGTCCCTGTTCCAACCACTGAGGAATATGGTGTCACCTATGTTTATCTTGTCTCCCACCCCACAATGGGACCATGTAACATTGGTAAAATTGTGGATTCCCCTCGCCGTAAGGCAAATCCTTCCCCCACCAAAATGTCACAAGCTAATGATGTTTTGAACTGTGTTGGCGAACAAGTCCCTGCTCCCACTAATGAGGAGTCTGGTGTCGCCCTTTCTCTTTCTACCTCCCAGCCCACGATGGGACCATGCAACAATGGTAAAATTGTGGAAACCCCCTGCTGCAAAGCAAATTCTACTCAAACCAAAATGYCCGAAGTTACTGATAACTCCCACTGTGTTGGCGTAAAAGTCCCTGCTCCTACAACCATGGAGTCTGGTGTCGCCATTCGTCCTACTACTGTTTGTGAATCTGAAGAAGAGATTAATAGAAGATTGAAGAAGTATGATGAGATGATGAAGACTGAAGAAGAGAAGAAGAGAGAAGAAATGTTGAAGAACAAGATCTGGCAAGAAGAAGTTGATGCTGGAGTCGTTCTTATCCATGGCGGTCCTAACAATGGTAAATACATTGTTAAGAACCGCGAAACTGGAGAACGAAAGTTAATGGACCATAACCCTTATGCCCCTGTAACCGCTACCTCGCTGCCTGAACATAGCTCTAAAACCCCTGCCCCTGAACACCCTGTACCCAAACCCATTCCTGTTACCACCCCAATCCCTGGACTCAAAGTCCTCCGACCTTTTGACCCCAAACCCTCCACTCTTGAACCCCCTGCCCCCGAACCTTTCATGGTCGTAGCCTCTGCCAAGCCTGTGGAAGTCAACCTTAAGCTAGAGAAGCCTGATGGYGTTAAGACACACACCTGGACCGCTCGTAAGTATGACCCCAAGGAGAAGAAGCTTGCYAAGAACCCCGCCGTTGCTGATAACAGTGTTCGCGCCGAGATTGCTAAGGAACAAGGTATCAAGAAGCAAGATGTTCCTAAGCCCGATGAGCTGAAGACGCGTGCCCGTCGTGGAAAACGTGGTCGCCAAGGAGAGAAGAGGCGTACCTTAGCCAAGCAACGTAATGAGAACTATGAGGCGTCTCGTAAGGAGAAGACTAAGGATAGGAAGAAGAAGCAATTGAAGTTAGCCACTCATGCTGTCGCTGATAAGTGTCACAGCTTGATGGTTAAAGACCGTGAAGAGCGCAAGCTYTCCTTGCCCCCCACTTTGCACTGGCAAGAGATGTTACATGCCCTCCGTTATTGCACTACGATTCAGAAGTATGATTACCGTGGAGTACCCTCTGCTAAGAATCCCGAGAAGTGGTCTTACTGCAACGTTATCAATTATGTTTTACATAATCTTAACGACCCCAAAAGACTACGTGCTGCTGTCATCTATTTCTTGCAGAGACTTAACATTCCTAAGGCTAATTACTTTGATATTTCAAGGTTATCCAAACGTGCTGCTGCCAAACAGGCAGTTATCATGTCTTTCAGTGCCCTTGAATATCAGAGCGATTCTTTTTGTGATTACCTTTGTGAATTAGAGAGTTACTGTGCTGCTAATGGTGAAGATGGYGTTACCATTAAAGGTATTGATTCCTATATTGATGCTATGGGTAAGTCTATCGCCACTGACAATGTCCCARCTGGTACTATAGCTGCTGCTGGTCTCATCAACCCCGATGGATCTTATCCTGATGACTTTGACGATGATGAACTCGCCACCCTTCCCGACCGTGAACCTATCAAGAAGACTGAAGAAGAAGTTGTGTGTTCTGAACCTGTTGRTGATGATGTGCAGGAGGAGCCTCAGGCTCAACCTGAGATGTGCCCTGCCGGTCAATCTTGTTCCTGTGAAGTCAATACGAACGTCGATGTTGATATCAATCAACCTGTCGATGATGAGAATGACCCAGAAGTGAACGAGATTATCGATAATGCTATGAGAAACTGCTATACTATGATGGAATCGATTAACGACAACAAGCTAATGAGTGTCATCCAAGCTCATGGACCTGTTGATTTTGTCATCCGACAACTCACTCGTTTGATTGTGAACCCATGCAAGTCAATCTGCAACTACTTAGCTGAAACTGTGCGTAATTTYGTTGGTGATGCTCTCAAGAGATTCACTGATGCTCTGAAGTCCTTGTTTGCGAATCTTGGACTCAACTGGCTCTGGGAAACCTTCCTCGCTATGCTAGCCATGATTCGTGAAGCTGCTGAAGAAGTTGTTCACAAGATTGAGAGGTTGCTCACTATCAATGCYGCAAAGGAYGTCATGATCACGATTGTCATTTGCTTTACTGTGTTCGTTTTGTATAAGATCTTTAGGACGATGTGGTCTGCTGAACGCGCCACTAAGCTTGTAATGGGATCCACAGCGTTTGCCAACGCTTCTCCCGCATCTTACGTTATGCCCATTCTTGCTCTTGTTGGTGCCATTGTCCCCGCTGGAAACTACGTCACCCGATTTTTATCTAACTACAAAGCCCTTATGACCTCTTCCGATGCTGTTGCTAGTGTTGATACCATGTTGAGCTGGCTGTTACCTCAATCTGTCCTGTCAGCCATATCTAATAACCCTGCYGACAGTGAATTCGCTATGCTCACTGGTGGTTACAACACTATCATTGCCTTTGGAAACTGTGCAGAAGTTCTTCTAGACCCTGGTGTGATCTCTTACATTGATTCTTACCTCACCCAGTGTCAGAACTACCTCGTTAAGTATAGAAACGATAAGACTTGTAGTACTGTGAATGGATATTACCGCGATGTTGCCAAGATTGAACGTGATGTGACTCGTCATGTCACGACGGCTGGTGTCCGTATGGAACCAGTTTGTATGAGACTTTTTGGTAACTCCGGTGTCGGTAAGTCCAAGGCTGTTGCTCAAATGATTGCCGATATGCATTATGCCCCCCATCAATGGCAAACTATTACCATTGGTGAGCGTACGTTCGAGCAACTCACGGGATGTGAGAGAGTTCTTGTGTTCGATGAGATTTATGCTAATGAGAAACTCAGAGTCGAGACTGCTGACCGCTTCAAGCAGATTGTCAATTCAGTCCCTACCCACGTCAATGGCTCTGATATYGTTGGTATTGAATCTAATAAGCACTCCTCTCTAGCTCCCGATATCGTGTTTGCTACTTCCGAGAAACTTGTGTACCCCGCTGCCTTGTCTGGAATTAACCTTCAATCACTTTATAACCGTGAACATTTCCGCTACGAAGTCACTGGAGATGAAGAGATGATGACCAAGTTGGGATTAAAGACTGATCACAAGGATGTCGAGTTGGCTCCTGAAGATCAGAAACACCTACCCTGGCTTAGATTCACTGAAGTCTTTAARAATGAAGGTTACGAATACAAAGGAGAGACCCTCACTTATGATCAGGTTAAGGAACGTTTAGTCGAAGAAGTTCGTCGCCGTAAGAAGATTTTTGCCACTAGGAAGGTTATTGATAAGAAGCATGATGTCCCCTGTCAGGTTTTTTATGACCTCCTATCTAGTAATTACAATTCACTGAACGTTGTCCCTCCCAAAGATTCTGATATTGAACAGAAATACCGTGCCCTACTTGATTTAGCCGCTGTCGAAATCCAGGATGACCTTCCTCGCCTTGCTGCCAAGATGATGAAGTTCTCACTCGGTAAGAAGAARAACACCCAGGCTTGTGCCATGTGTGCGACTAATGCTAATCTTGAACACCGTGATTTTACTGTTGACAATTGTGTTCATCACCTCACCTTGCAAGGAGATGATCACAACGGTGAGGAAGGTTGGGCTTATCAGCTCTCCCTTGCCARTCACACCTATCGGTACATTGAAGATATTGCTGAAGGTGATGTCAAACAGTTAGACTATGACCCCATGCCCCTCGAAATGGTTAATGCCGCTGTCTCTGAAGCTGACGTGAAGCTTAGATGTGCCCGTCAGAAGTACCTTAAGTATTATAACGAAGCACGTCGTGCTCGCAATGCCTACTTTATGAAGTCCCTTGGTTATGATGATTCTCAAGCCGTCAGTGACGCTGTGAAGACTGTTGGTAGTTTAGCTCTTGGTGCCGCTGCACTTGGTGGTTTTTACACCTTGTTCAAGTGGTTACTGGGACCTCGCCAGCCCAAATATGTTGCTGAGACTTACGATGTTCGAATCCGCCGTCAACAGAAGCAAGTGAAACCCATGACCGTTGAGGCTCACCAGAGCTCCATGGTTGTGAGTTACGTGACGCTCAATGTTGACCGTAAGACTGACGATGTTGACCGTGTTTTGCCTGTCCGATGTGTTTACGTTGGAAATGACCGTTTTTTGACATATGCTCACTGGCTCCCTAGCGATAACTCAAAGCTTGACGAGTTTTCCTACTCCCTTACGTATGGTGGTCACACCTACGCTCTGAAGGAACGCCCCAAGTTTTACACCCCGAAGGCTGAGAGTGCTAGAGATATTTGTGTTTTCCGTGTTGCTACGAACCTTTCCCCTGCGAATTACTTTGCTAACCTAGCCAAGACCGAGGCTGGTGTACTCTCATCAGCTGCTGACACTCTTGTGACAATGCCGGGTTCTCGTGCCCAGTATTACCCCGAAGTTATTGAGTGTAGCTACCAAGGTTTTGATATAGTTACAAAGATGCCCAGGATGTACACTGTGGATAATGYGCTTAGYGTCCCAATACCTAGTATTTCGGGCGATTGTGGCAAAGTCCTTTTGGACCAAGCTAATCGTATCGTTGGAATTCTGGTTGCTGGCACTATCACGGGACAATCTGCGTCAATGTTCCAGATTGTCTCCAAAGAAGAAGTTGATACCCTCTGCCCCGTCTACGAATCTCACTGCCCTGCGTCATGGAAGAGTCCCGCGACTTACCCTGTTTGCCGTGGTTCCCGTCTACACGCTACCTCCCTCCGCAGTGCTTG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78,911
KX673247.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
16915_5
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,204
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-03-19
null
null
Posavirus sp. isolate 16915_5, complete genome
CACCTATGTTTATCTTGTCTCCCACCCCACAATGGGACCATGTAACATTGGTAAAATTGTGGATTCCCCTCGCCGTAAGGCAAATCCTTCCCCCACCAAAATGTCACAAGCTAATGATGTTTTGAACTGTGTTGGCGAACAAGTCCCTGCTCCCACTAATGAGGAGTCTGGTGTCGCCCTTTCTCTTTCTACCTCCCAGCCCACGATGGGACCATGCAACAATGGTAAAATTGTGGAAACCCCCTGCTGCAAAGCAAATTCTACTCAAACCAAAATGTCCGAAGTTACTGATAACTCCCACTGTGTTGGCGTAAAAGTCCCTGCTCCTACAACCATGGAGTCTGGTGTCGCCATTCGTCCTACTACTGTTTGTGAATCTGAAGAAGAGATTAATAGAAGATTGAAGAAGTATGATGAGATGATGAAGACTGAAGAAGAGAAGAAGAGAGAAGAAATGTTGAAGAACAAGATCTGGCAAGAAGAAGTTGATGCTGGAGTCGTTCTTATCCATGGCGGTCCTAACAATGGTAAATACATTGTTAAGAACCGCGAAACTGGAGAACGAAAGTTAATGGACCATAACCCTTATGCCCCTGTAACCGCTACCTCGCTGCCTGAACATAGCTCTAAAACCCCTGCCCCTGAACACCCTGTACCCAAACCCATTCCTGTTACCACCCCAATCCCTGGACTCAAAGTCCTCCGACCTTTTGACCCCAAACCCTCCACTCTTGAACCCCCTGCCCCCGAACCTTTCATGGTCGTAGCCTCTGCCAAGCCTGTGGAAGTCAACCTTAAGCTAGAGAAGCCTGATGGCGTTAAGACACACACCTGGACTGCTCGTAAGTATGACCCCAAGGAGAAGAAGCTTGCCAAGAACCCCGCCGTTGCTGATAACAGTGTTCGCGCCGAGATTGCTAAGGAACAAGGTATCAAGAAGCAAGATGTTCCTAAGCCCGATGAGCTGAAGACGCGTGCCCGTCGTGGAAAACGTGGTCGCCAAGGAGAGAAGAGGCGTACCTTAGCCAAGCAACGTAATGAGAACTATGAGGCGTCTCGTAAGGAGAAGACTAAGGATAGGAAGAAGAAGCAATTGAAGTTAGCCACTCATGCTGTCGCTGATAAGTGTCACAGCTTGATGGTTAAAGACCGTGAAGAGCGCAAGCTTTCCTTGCCCCCCACTTTGCACTGGCAAGAGATGTTACATGCCCTCCGTTATTGCACTACGATTCAGAAGTATGATTACCGTGGAGTACCCTCTGCTAAGAATCCCGAGAAGTGGTCTTACTGCAACGTTATCAATTATGTTTTACATAATCTTAACGACCCCAAAAGACTGCGTGCTGCTGTCATCTATTTCTTGCAGAGACTTAACATTCCTAAGGCTAATTACTTTGATATTTCAAGGTTATCCAAACGTGCTGCTGCCAAACAGGCAGTTATCATGTCTTTCAGTGCCCTTGAATATCAGAGCGATTCTTTTTGTGATTACCTTTGTGAATTAGAGAGTTACTGTGCTGCTAATGGTGAAGATGGCGTTACCATTAAAGGTATTGATTCCTATATTGATGCTATGGGTAAGTCTATCGCCACTGACAATGTCCCAGCTGGTACTATAGCTGCTGCTGGTCTCATCAACCCCGATGGATCTTATCCTGATGACTTTGACGATGATGAACTCGCCACCCTTCCCGACCGTGAACCTATCAAGAAGACTGAAGAAGAAGTTGTGTGTTCTGAACCTGTTGGTGATGATGTGCAGGAGGAGCCTCAGGCTCAACCTGAGATGTGCCCTGCCGGTCAATCTTGTTCCTGTGAAGTCAATACGAACGTCGATGTTGATATCAATCAACCTGTCGATGATGAGAATGACCCAGAAGTGAACGAGATTATCGATAATGCTATGAGAAACTGCTATACTATGATGGAATCGATTAACGACAACAAGCTAATGAGTGTCATCCAAGCTCATGGACCTGTTGATTTTGTCATCCGACAACTCACTCGTTTGATTGTGAACCCATGCAAGTCAATCTGCAACTACTTAGCTGAAACTGTGCGTAATTTTGTTGGTGATGCTCTCAAGAGATTCACTGATGCTCTGAAGTCCTTGTTTGCGAATCTTGGGCTCAACTGGCTCTGGGAAACCTTCCTCGCTATGCTAGCCATGATTCGTGAAGCTGCTGAAGAAGTTGTTCACAAGATTGAGAGGTTGCTCACTATCAATGCCGCAAAGGATGTCATGATCACGATTGTCATTTGCTTTACTGTGTTCGTTTTGTATAAGATCTTTAGGACGATGTGGTCTGCTGAACGCGCCACTAAGCTTGTAATGGGATCCACAGCGTTTGCCAACGCTTCTCCCGCATCTTACGTTATGCCCATTCTTGCTCTTGTTGGTGCCATTGTCCCCGCTGGAAACTACGTCACCCGATTTTTATCTAACTACAAAGCCCTTATGACCTCTTCCGATGCTGTTGCTAGTGTTGATACCATGTTGAGCTGGCTGTTACCTCAATCTGTTCTGTCAGCCATATCTAATAACCCTGCTGACAGTGAATTCGCTATGCTCACTGGTGGTTACAACACTATCATTGCCTTTGGAAACTGTGCAGAAGTTCTTCTAGACCCTGGTGTGATCTCTTACATTGATTCTTACCTCACCCAGTGTCAGAACTACCTCGTTAAGTATAGAAACGATAAGACTTGTAGTACTGTGAATGGATATTACCGCGATGTTGCCAAGATTGAACGTGATGTGACTCGTCATGTCACGACGGCTGGTGTCCGTATGGAACCAGTTTGTATGAGACTTTTTGGTAACTCCGGTGTCGGTAAGTCCAAGGCTGTTGCTCAAATGATTGCCGATATGCATTATGCCCCCCATCAATGGCAAACTATTACCATTGGTGAGCGTACGTTCGAGCAACTCACGGGATGTGAGAGAGTTCTTGTGTTCGATGAGATTTATGCTAATGAGAAACTCAGAGTCGAGACTGCTGACCGCTTCAAGCAGATTGTCAATTCAGTCCCTACCCACGTCAATGGCTCTGATATTGTTGGTATTGAATCTAATAAGCACTCCTCTCTAGCTCCCGATATCGTGTTTGCTACTTCCGAGAAACTTGTGTACCCCGCTGCCTTGTCTGGAATTAACCTTCAATCACTTTATAACCGTGAACATTTCCGCTACGAAGTCACTGGAGATGAAGAGATGATGACCAAGTTGGGATTAAAGACTGATCACAAGGATGTCGAGTTGGCTCCTGAAGATCAGAAACACCTACCCTGGCTTAGATTCACTGAAGTCTTTAAGAATGAAGGTTACGAATACAAAGGAGAGACCCTCACTTATGATCAGGTTAAGGAACGTTTAGTCGAAGAAGTTCGTCGCCGTAAGAAGATTTTTGCCACTAGGAAGGTTATTGATAAGAAGCATGATGTCCCCTGTCAGGTTTTTTATGACCTCCTATCTAGTAATTACAATTCACTGAACGTTGTCCCTCCCAAAGATTCTGATATTGAACAGAAATACCGTGCCCTACTTGATTTAGCCGCTGTCGAAATCCAGGATGATCTTCCTCGCCTTGCTGCCAAGATGATGAAGTTCTCACTCGGTAAGAAGAAGAACACCCAGGCTTGTGCCATGTGTGCGACTAATGCTAATCTTGAACACCGTGATTTTACTGTTGACAATTGTGTTCATCACCTCACCTTGCAAGGAGATGATCACAACGGTGAGGAAGGTTGGGCTTATCAGCTCTCCCTTGCCAATCACACCTATCGGTACATTGAAGATATTGCTGAAGGTGATGTCAAACAGTTAGACTATGACCCCATGCCCCTCGAAATGGTTAATGCCGCTGTCTCTGAAGCTGACGTGAAGCTTAGATGTGCCCGTCAGAAGTACCTTAAGTATTATAACGAAGCACGTCGTGCTCGCAATGCCTACTTTATGAAGTCCCTTGGTTATGATGATTCTCAAGCCGTCAGTGACGCTGTGAAGACTGTTGGTAGTTTAGCTCTTGGTGCCGCTGCACTTGGTGGTTTTTACACCTTGTTCAAGTGGTTACTGGGACCTCGCCAGCCCAAATATGTTGCTGAGACTTACGATGTTCGAATCCGCCGTCAACAGAAGCAAGTGAAACCCATGACCGTTGAGGCTCACCAGAGCTCCATGGTTGTGAGTTACGTGACGCTCAATGTTGACCGTAAGACTGACGATGTTGACCGTGTTTTGCCTGTCCGATGTGTTTACGTCGGAAATGACCGTTTTTTGACATATGCTCACTGGCTCCCTAGCGATAACTCAAAGCTTGACGAGTTTTCCTACTCCCTTACGTATGGTGGTCACACCTACGCTCTGAAGGAACGCCCCAAGTTTTACACCCCGAAGGCTGAGAGTGCTAGAGATATTTGTGTTTTCCGTGTTGCTACGAACCTTTCCCCTGCGAATTACTTTGCTAACCTAGCCAAGACCGAGGCTGGTGTACTCTCATCAGCTGCTGACACTCTTGTGACAATGCCGGGTTCTCGTGCCCAGTATTACCCCGAAGTTATTGAGTGTAGCTACCAAGGTTTTGATATAGTTACAAAGATGCCCAGGATGTACACTGTGGATAATGTGCTTAGTGTCCCAATACCTAGTATTTCGGGCGATTGTGGCAAAGTCCTTTTGGACCAAGCTAATCGTATCGTTGGAATTCTGGTTGCTGGCACTATCACGGGACAATCTGCGTCAATGTTCCAGATTGTTTCCAAAGAAGAAGTTGATACCCTCTGCCCCGTCTACGAATCTCACTGCCCTGCGTCATGGAAGAGTCCCGCGACTTATCCTGTTTGCCGTGGTTCCCGTCTACACGCTACCTCCCTCCGCAGTGCTTGCGAAGAGAAGGCAGGAACTCGTTTCTACAAGCCTCCTATGAGTGCGTCCACATCCGCAATAGGCGTTGATCCTAAAGACACATTCATTCAACGACTTAAGGAATGTACTAACGAGA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78,912
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Posavirus sp.
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Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
17489_2
Posavirus sp.
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null
unknown
9,835
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-03-27
null
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Posavirus sp. isolate 17489_2, complete genome
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78,914
KX673250.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
17489_26
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,827
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-04-03
null
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Posavirus sp. isolate 17489_26, complete genome
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78,915
KX673251.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
17489_27
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,773
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-04-03
null
null
Posavirus sp. isolate 17489_27, complete genome
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78,916
KX673252.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
17489_28
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,824
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-04-03
null
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Posavirus sp. isolate 17489_28, complete genome
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78,917
KX673253.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
17489_30
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,672
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-04-03
null
null
Posavirus sp. isolate 17489_30, complete genome
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78,918
KX673254.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
17489_34
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,710
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-04-03
null
null
Posavirus sp. isolate 17489_34, complete genome
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78,919
KX673255.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
17489_35
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,733
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-04-03
null
null
Posavirus sp. isolate 17489_35, complete genome
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78,920
KX673256.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
17489_36
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,729
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-04-03
null
null
Posavirus sp. isolate 17489_36, complete genome
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78,921
KX673257.1
Posavirus sp.
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
United Kingdom
2016-12-27
17489_39
Posavirus sp.
null
null
unknown
9,640
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-04-03
null
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Posavirus sp. isolate 17489_39, complete genome
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Posavirus sp.
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Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
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GenBank
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Viet Nam
Viet Nam
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United Kingdom
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Viet Nam
Viet Nam
Sus scrofa
feces
2013-03-27
null
null
Posavirus sp. isolate 17489_4_2, complete genome
TGCGTACCCGAAAATCTATTGAACTTGGCTTGAATTATAAGCAATGCTTCTTATAGTGGACACTTTGAGAACATAATGCTTGCATGGATTAATGTATACTGTTTCAAATAACAAACCTAGACACGCAGTTGCGTTGATGGTTGTATCAATCACATACTTGTGTTGACCTCGTGTTAATCCTCGATCGCTATATGTTTGCCTCCTACTTCCAATAAAATAGATTACATACGCGACATGCCTTTGTGGTTTACCTATTGGCCTCTGTCAAAAACAAATCGTATGGTTTGTAGTTTCCTGGCCTAAAAAGCTGGGCGCGGTCTGGCTCTCGTCGGATGGAAAGGTCCATCAATGGCTGGTTGAGTGTAAGCTCCGGTGTTCTGGTTGTCGCAATTCCAGACGTCGTAATAACCTATATTGCATCTGACTCTAATTCTTGTGGCTCTACTGTATCTAGTTCTTGTTCTACTAACTCTAATAATACTACTGGTTCTAATTCCAATAATGCTACTGATTCTATGTTCGAAAAACTCTCCTATGTCAATATAGATAATGTCCTTGATCCCGATATCCCTCACGTCACTGAAATTCATCGCAAGCGGATTTCAGATGATATCCTTGAATCTCAAGGCTGTACTTGCTCTGAACCTATTCTCACTCCTCGTGTATTTTCTTTCTCTACTCTTGGCATGCGTAAGTCTGAATTATTTGATCCTTTATATCTTCATAAATATAATAAAGTATTCTGCAATTCTTATCACGATATTACTTTAAGCATGATCAAGAATGGATCAATCAATCTTGATAAACTTGATTATTACTGTAATGGAAAATTATTTGATGGTCAAATTGATCCTACTGCTCATGTACCTATTGATTTTGTCTTTGATCATTCAAATATGGGTATTATTCTGGTTGATCCTATGAAAACTATCTCTTATTGTTCTTCTTTATTCACTACTATTATTAATATTGTTAGAATATATGATCAAGTTCCCGCTGCAAAGTGGCGAACTGCTGATCACGCTATTATTGAACTCATTAATCAAAATTTTAGTCTTTACATTCTTTCATTTACTCAAGAAGAACTTATGCAATATGCTATAGCTTGTTGTCGTTGCTATCATTATTCTCATGTTGCTGAATTTGTAAATGTCTTATTAACTTATTACCAGATATTGTCAACTTTTATTTCTGATTATGATTGTCCTGCTTCTAAACTTGTTGTTTCATCCTATATGGCTCGATATTCTCTCGATCATTATTGGCAATATGCTGAAGCTCAAGATGGTATCTTCAGTGATTTCTGGAATTTATTGAAAAGTGCTACTGGTTTATTCAAGGGTACTTTTGAAGCTGTTATTAAAGCAGCCACTAGTGTTGCGACTACTACTTTAACTAAGTCTATGAATTTCCTTGCAAATACTCTTGATCCTACCTGTGCTGTCATTGGCTCAGTTCTTAATTCTATTTCTTCTGTTATTACTAAATTATTCGCTGCTCTTAACGTTACTATTGATTGGGTGGAAGAAAAAGCTGATGATATTGTAACTGGATTTGAATCTCTATTTAACCTCATTAGTCTTAGAGTTAAATATGTGCAAAAGAATACGGCTAAATTGACTCGTGTTGGTTTGGCTTTCATGCTCGTTGTCTTAGGTGTGTGGATTGCTTGTCAAGTTGGTTTCTTTGGCTATAATTTATTGTCTAAAATGCTCGACATTCTTTCTAAATTCTCTTCCAGTTATACTCGTATGGAACCTCAAGGTGCTAACGTTGGTCCTGGTGAACTATCTATTCCTGGCACTATTATTTCTCTTATTTGTATTTTCGTTTGTGGCTGGGAATATGCTGATCATCCTATTATTAATAATATTGGCAAGTTGATTACTCGATTTGCTCCAATGAAAGCTTCTATGGAAAAGGCTTTATCCTGTGTATGTTCCTTACTTCCTGCTTGTATTTCTCGTTTTATTTTTACATTGTCTCCTGATAGTTCCGATGCCGTCTTGGCTGATATTTCTGATTTTATTACTGATGTTAATGTTGCTCGTGTTTTTTCAACTACACCCTCTGCTATTATTTCTGATGAATATGTTAACATTCTCTCTGAACTTATGACTCGTGGTGATGCTTTGGTTAAACGTGTTAGTGCTGATTCTAATATTACTCAATCTCCTCTTTACGCCCCATTTTTCCAATCCTTATCTCAAATTACTGCTTTGACTACTAACATTGTTCAAATTCGTCGATCTTCTGAAGCTCGTCCTAGACCCACTTGGGTCCACTTCTTTGGTGATGCTGGTGCTGGTAAAACTTTCTTTGTTCAAAATGCTTCTACTTTGTTTGCTGGTATTCGACGTTTCGATGGTAAATCTGAATCTTGTCCTAAATCCTATGTGATTCCTACTGCCTCCCAATACTGGGATGGTTTCCAACAAGATGTCTATCCAATTACAGTATTTGAAGAAATTTGGGGTGTTCTAGATGGTCAATCTGCTTTACAAATCGATTATCCTAATACTCTTCTTCAACTTATGTCCTCAGCTACCTTCATGCCTCCAATGGCGGCTATTACGAGCGGTGTGGTTGGTATGAAAGGCACTACCTTCAATTCTACGTTATTCCTTTCTTGTCATAATAATGCTCTTCCTAACAATTGGGGTGGTGATGCATATGCCCTTGCTAGACGTATGAATTATATTTTTAAAGTTATTGCTCCTACTTCTAATAATCCTTATTGTGAAACTCAGAAAATGCTCGATTCTAAAGGTAATGTTCACGATGTTACTGTTCAATATTACTGTGGTCGTAAAGGTATAGATAGTGATCAAGATTGTTTTATGATGAAGTATGCTCAAGGCGAGAAGGTTGTTGTTAAACCTTGTGTGCTTACCGTTGATCTCTACCGTAAGGCTTGGCGTTTCGTTCCTTATCTCACCCAAGTCCAAAATAACACTCCTGAAATTATTGCTACTGAACTTGCTGAAAATCCTGCTGATCCTAATTCTCTTAAAACTCAATCCTTGACTGTTGATGAAGTTGTATCTAATATTCTTAGTACTGTTGATTTCAATGTCGCTGGTTTCTTAAAATCTGCTGAATCTAGTGGTCTCAAATATAATCTTAAACTTAAGGAATCGTATGATGCTCTTTATCGTGCTATTGTGTTTGACAAGAACCCTCAAAAGGTTTTTGATGCTATTGTTGATAATCAAGTCGATGCTGTTCGTGATAACTTAGATCCAACTGAAGGTATTGTCAATAATACTCTTGAAGCTGCAGATGATGTCATTGATGGTGTTATTGCTGAAGTTAAGAACCAATCTTCTGAGTTCCAATCTGTTAATTCTGACTCTGATCCTGAAGAAATTTATAAACCTGATGGTGATGAACCCGCTCCAGCTCCTGATCCTGATCCTGATACTGCTGTATCCAATGCTGAAGCTCAAGGTCCATTTAGTAAACGTACTGTCAAGTCTAGTAATGATTCAACTGAACTTGAATTATCTGAATTCGACGGTAAAGTCGACCCTCAAACCTTCCTTGATAATTCTCGTGATCTTGTTCGTCGTGTAACAAATGCTATGAAAGGTGGTCCACGTGATGTTGAAGATCCTATTTCTCGTAAGATTATTCGTGGTCTCGTTCGTACACTTCCAGCTGTAAAGTCTAATGATCCCATAATTGTCGAACCCAATGCTGCTGGTCAATATGTCTCCGGTGCTGTTTTAAATGCTGCCTTTTATGAATCTTATGCTACTTTATTTGAATCATTATTCGCTGTTGTTTCTACTGGTTTGTCTTATTCTCCCTCACTTGCTAATTGTTCTATTTATTTCTTTGGTCAAACAATTAGTGATCCTAAGGTTCCATTTGCTAACCATCCATTCTTTTCTTCTAAGTTTAATACTGATATTTTTTATCAATACTTGTCACTCATTCGTCCCGTTACTACTATTGCTGCTGGATTCCCTCCTGAAATTAAGTCTCACCCACTTTTTATTATCGCTGAAGATTCAATTTATTATTTGGTTGATCGCAATGGTACTGTAATTCGCTCCATGGATGATTTACGTGTTGGTGAAACTAACTCTTATGGTGTTTCTAATTATGATTTTGCTATTTTATCTCCTACCAATCCTATTGCTTCTGGTCTTTTATATTGGAATGAAAATGCCTATCAACTTGTTAATTTTGATCCTGTGAAAAACGTTTCTGCTCTTGTATCTAATGGACAAACTGCTCGTAGCCGAGGCGCTTATTCTCCTTTCATTATTCAACATTCTGATGATCCCTTTGCTCCATCTTGTTACCAAGGTGGTTGGAAGATCTGTGTCCATTGTCTTCGTTGCTATCATCCTGTTATTTATCCTCTTCTCGAAGGTAGCAAATGTACCTCAATTGTTTCTCATGGATATCATTCTCTTATTGAATTGTCTGAAGTTAGTTCTGCTAATCTTTCTGCTTTATCATTTACTGTACCTAAACCTGATTATTCTTATTTCTGTTCAATGGCTGTTTTAACTCTTGCTCTTTCAAAACTTACCGATGGTACTAAGCGCGTTGAACATCGATCTCTTCATTTCACCTATGATTTAGCTAAAGTTATTAATGAATCTCAATTATTGAAAGGTTCTGGCAAAGATGTTCTTGAAGCTGCTAGTTCCGTGAAAGTCTCTACAAGTGATTCTTATGGCGTAGTTGATACCATGCCTTCTATTCCTGTTTTATATGATGATGATGTTAAACATGTTGATGTCATTGATAATTCTGTAATTAATAAGGCTCTTACTCCTCAATCACATTCTTTTATATCCTATGTTGTTATTGGTGCTTCATTGTGTGGTGTTGTCTATGCTTTGTACAAATCGTTCTTCCCTTCAAAGGCCAAGTTATGGGAAAGTCAAAGTGAACCTCCTACTCGTGTTACTGCTGCTATTCGTCGTAATAATAATCCTAAGTATTCTCATTTATCTGATCTCAAAACTGTTCCTAATGCT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78,924
NC_003632.1
Potato aucuba mosaic virus
Xu,H., Leclerc,D., Leung,B., AbouHaidar,M.G.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
1995-03-02
null
Potato aucuba mosaic virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,059
RefSeq
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA485481
Potato aucuba mosaic virus, complete genome
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8,910
MT193475.1
Potato aucuba mosaic virus
Chen,B., Lu,Y., Peng,J., Lin,L., Yan,F., Chen,J.
Ningbo University, Institute of Plant Virology
China
2020-06-03
Shaoxing
Potato aucuba mosaic virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,156
GenBank
null
China
China
Solanum tuberosum
null
2019-05
null
null
Potato aucuba mosaic virus isolate Shaoxing, complete genome
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49,914
MT193476.1
Potato aucuba mosaic virus
Chen,B., Lu,Y., Peng,J., Lin,L., Yan,F., Chen,J.
Ningbo University, Institute of Plant Virology
China
2020-06-03
Huzhou
Potato aucuba mosaic virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,138
GenBank
null
China
China
Solanum tuberosum
null
2019-05
null
null
Potato aucuba mosaic virus isolate Huzhou, complete genome
GAAAACAAAACAACAAACAACAAAGACGCTTAACACATATCCAGCTTCAAAGCCGACATTAAATTGTCAATTTGTAGTTAGAATGTCTCGGTTAAAGAACGTCTTAGAACAAATAAGAGACCCCTCAGTCATAACTGCTATCAATGAGTCAGCCTATGAGGCAATCAGACCAGTCCTTAAAGAAGCACTCGTCAATTGTCCGTACGCACTCACCAAAGAAGAAGGGGATGAACTAGAAGGAATGGGAATTAGCATAAATCCGTACGCCTCACAAGTACATACACACGCCGCGGCTAAAGCCATTGAGAATAGAATGCTTGAAGTAGTAGGGCATCATCTACCTAAAGAACCTGTTACCTTTATGAGCCTTAAAAGAAGTAAACTGAGGTTTTTGAGACGTGGCCCACAAATGAATGACCACTTTGTCAACCCAATAGTGGAAGCTAAAGATCTTACTCGCTATGAGAATGCTGATCGTGCAGAGTCGTATTATTACTGCTCTACAAGTGTTGCCTATCTGTCTGACAGTCTACACTTCCTATCATTGGAAGAATTGGCACACATCTTCACATCCTCAAACAAGCTTGAAACACTTTTAGCTACCGTTGTTTTGCCTGTCGAAGCTTGTCAAAAGAGACCGTCTCTGTATCCTACCGTTTACACTATAAACTACTCAGACGACGGGTTTTGCTACCTCCCTGGAAATCATGCAGGCGGAGCTTATTACCATAACTATTCCACCCTGCAATGGCTTAAAGTTGATTCTATTGAGTGCGTTGATAAACTTGCCTACGCTGAATCTTTCACTCTAACATTTCAACTTATTGAATCGCTAGGCGCAAACCACTTGTTTGTCATTTCCAAGAAGAATCTGATCACGCCAAAGATTAGATCTTTTAAGAAAGATAGCCATGTGCTTTTGCCTCAGATTTTCCACCCTAAACAGAGGAACGCTAATAAGCCAATTAAGAAGACTCAAGCTATGCAACTGTACTTGTACTGCAAATCTGTTAAGGAAGCCACTATGCGGGACATCTTTGCTAAGATTCGACAAATAGTGCCTACTCAAGAGGTTGACTTGTATGATCCTGATGAACTAACTCACATCGCAAACTACTTCTATGTAGTATCCCATCTGAGTTGTGTCAATGATCATCAATCACTATTGAAAGCTGGGTTCTTCCAAAAATTATTCATTCCCATCAAAAATTATTTGAGAGAACTTTCTGAAACAGTCAATGGGAAGACTGAGTTTTCTCAAGTCCTTGCTGCTTTGTCATGGACCACCTTCACTTATGACGTGGAACCTGAGAAGGTGTCTGTCAAATATGCTAACTGCAGAAGTGTGGCTGTTGCTAGACATTTGGGCACCACTGCTTTCCACCAGCACAAAAGGAATAGACAGAGGCTGCACGGCGTAGAACTCGTGGGACCAGATGATGAAACTGTTCTTGCTGTAAGCGAGAGTCAAACTGTGGAGCTGAATTCTGACAATCAATCTGTGAGTAGCATGGCCAGCACAGAATTAGCCGAAGTTAGAAGTGTGGCATCAACACTGATTTCCCCCACCTCTACTTCGGCAACCAGCTTAGCTTTAGACGACCAATTATGGGCAGAACTGCTGTTACGGAAAGCTGGCCAGAAAAGGGTCGTTAATGTTAACAATCTTGGTGTCCCATTCGAAAGGGATAGGAAAAACCATGCTGCACAATGGGTCCCTACTGGTATGGAAAACTTGATGAATGAAGTCGCAAATTGCTTACAAAACCCAATTAATTTAGGCTTTTGTCAGGAACTTCCTGCGAATTATTCAAGCAGCTGGCACACCTACCAGAATTTGCTGATCACATCAGATTTAGTCTGTGTCATCTCTGATGCGCCAGCAATGCTCGAACTCAAAACTCGGAAAAAGAAAAAACAAACTGTGATGCCCATCTTTCCGGGTCAATGCAATTTAATTAGTAGTTTGCAAATTAGAGATTGTAGATTTCGTTTTGTTAGTAATGCTGCTTGTAGGATAGTTGAACTAATGTTTGTGGAAAGCGATGTTCCAAGAAAGAATCGCAGTTGGGAAATCACAACGACAGAGAGTGATTCTGATGCTCAAAGTGACCAGCCCAAGCAAGAGCCTATTGATGAGGTAGATTTCCTGAATGGCATTCTAGGGAATAATGTGAGCTCTGGTCCCACCCTCTCTGAACCAAATGCTACAGAGGATACGACCAACCAGTCTGACACACAAAGAAAGATGGTGGCTGCATCGCAAACTGCCATTGAAGCAACACCAAACCCGAGTTTTGGAAGACACACTGTCATAGCCGAAAACGCACAGGATGTGAAGAGTCCAGCCTCCTTAGCCGTTATTGACCCTACTACACTTCCATGGGCAGCATGGCTTGATGTACTCAAACAACACGGTTTTCGTGGCTTGGACTTGCAGAAAGATCCCTATGACAAAATTATCTACCCTGTTGACAAAGTGCAAATCTTACCACATGCAGAGTGGGACACAGTGCCGGACTTGAACCTTAGAGTGGCATTACAACAACTTAAAAGGTTCCCAATCAAGATTAAAGTCAACCACCAGAGGGCAGCTGCTTATGGATCAGACATCAAGAATAAGCGCACCGGCAAATTGCTATTGGACCAACCAAAACAATGGCGTGAGTCTTTTGCTTACAAGATGATCAATCGTGATTTGGAAAGAGTTGTGGTTGTGATCCATGGTGCTGGTGGTTGCGGCAAGTCCAGGTTTCTTCAGGAGTGGCTCAACAACCATGAGGATATGAATAGTGTCTGCACAATTGTATGCCCCACCATTGAGTTAAGGAACGACTGGTCAAAGAAAATTCCCAAGTTGGAACCTACCAACATCAAAACATTCGAGAAGGCAATGCTCCAAAATGCAAAAAAAATTGTCATATTTGATGATTACAGCAAGCTCCCGGCGGGATTCATTGAAGCTTACATGATCCACCACAACTCTGTAGACTTATTCATACTCACTGGTGACACAAAGCAATCTGAACACCATGAAAGGAATCGTGAGGCCTATATCTCTACACTGGAGCCAGCCACAGAAGTCTACTCTCAACATTGTGAATATTACTTGAACTGTACACATAGGAACGTCAAAGCTTTGGCAAATAAACTTGGAGTATATTCAGAAGTGGAGGGGGATTTGATCGTGCATGTAAAGAAAGTTCCACTCAAAGGCAAGAGGCTGCCCATGTTGGTCCCATCTAACGACAAGAGTGACGCTTTGGTAGATCTTGGGAATGTGTCCATGACATATGCTGGGTGTCAAGGGCTCACTTGTCAAATGATCCAAGTTCTGATAGACAATCACACACAGTTTTGCTCTGAACAGGTCCTCTACACCTGCCTTTCCCGCGCTGTCAATGAAATCGCTTTTATCAACACTGGCCCAAATTCTGAAGACTTTTGGAGCAAATTGGACTCCACTCCATACTTAAAGGCTTTTATAGACAATTACCGGGATGAGAAAACAGAACGTTTCCTGTCCACTCCTGCCCCTGCTGAGCCTCAAGAGCCTGAGCTACCAAAGACACACTTGCCGGTGGCACCCAATCACCTGTTAGAGAACCACATCTCTAACTTAAGGGAGAAGCATGACCGGGAAATCTTCAGCAAGAACTTTGGGTATAGTAACGCCATCCAGGGAGCAGGTGTTACAGAACTGTTTCAGCACCAACAGGCCAAGGATGAGTCTTTGCTATGGGCAACCATTGAAGCTAGATTGGCCATCTCAAGTCCCGAGAACAACTGGAAAGAGTTCGTGCTCAAGAAAGACATCGGTGATATTCTATTCTTCAATTACCATGCTTTAATGGAATTGCCAGATGAATCACCACCATTCGAACCAAGGCTGTGGGCTGTGTGCAAAGCTGAAGTTACTAATACTTACATGGCTAAACCTATGGCTAATCTCATCAATGCAGCTCAAAGACAGAGCCCAGATTTCCACCCTGAGAAAATTGCACTCTTCCTGAAATCGCAGTGGGTGAAAAAAGTGGAGAAGTTGGGTTGCATCAAAGTCAAGCCAGGACAAACCATTGCCGCTTTCATGCAGGAAACCGTAATGGTTTACGGCACTATGGCCAGGTACCTAAGGAAGAAGAGACAGGAGTTTCAACCAAGGAGAGTTTTTATCAACTGTGAGAAAACTTCTGAAGACTTTGGGGCGTTCATTAGAGACAATTGGAACTTTGATAGGAAAGCCCACACAAACGACTTCACAGCTTTTGATCAATCACAAGATGGCGCTATGCTACAATTTGAAGTTGCTAAATGTCGGTTTTTCAACATTCCAGAAGATGTCATTGAAGGTTACATTCATATTAAGCTGAACGCCCACATTTTCCTTGGCACCTTGAGCATAATGCGACTATCTGGCGAAGGTCCCACCTTTGACGCTAACACTGAGTGTTCTATTGCTTACACTGCCACCCGGTTCCACATACCGAAAGACAGTACTCATGTTTATGCTGGGGATGATATGGCGGTGGACTGTGATTTAGTAGAAAAGAAATCTTTTGCCAAGTTAGCTAAAGAGTTAAAGCTCACTTCCAAGACCATCAAGCCAAATCAGAGGAAAGGGGACTGGGCCGAATTTTGCAGTTGGATGATTACGCCCAAAGGTATCGTCAAAAATCCTGTTAAGCTCAATGCTTCATTAGAATTGGCAGCAGCACTGAAGAAAAGCAATGAGGTGGCTCGATCCTACGCTCTTGAATGTAAATTCGCTTTTGATTTGCGGGATGATGTATATTCAATATTTACTGAACAAGAAATGGAGCATCATTGGAGTTGTGTTCGGCAATTGCTCTTCCTTAAACAATCTGAAGTGCTCAACACCCACAAAGATATGCTTGCTTTAAAACCCTCATTTGATGATCCGCCCAGGCGAAGCAAGGCTGTTAAAAGAAGGGAGGCCAAGGAAAGGAAGGCGAGAGTCGTTGCGATTCTCCCACCCAACT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49,915
MG356505.1
Potato aucuba mosaic virus
Xu,H., Li,X., Hammill,D., Cody,S., Nie,J.
Canadian Food Inspection Agency
Canada
2018-09-26
PAMV165
Potato aucuba mosaic virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,101
GenBank
null
Bangladesh
Bangladesh
Solanum tuberosum
null
2015-11
null
null
Potato aucuba mosaic virus isolate PAMV165, complete genome
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