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|
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EU862839.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Henn,M.R., Kuntzen,T., Young,S., Kodira,C., Koehrsen,M., Jaffe,D., Berlin,A., Heiman,D., Hepburn,T., Sykes,S., Borenstein,D., Crawford,M., Engels,R., Freedman,E., Howarth,C., Larson,L., Ledlie,T., Lewis,B., Montgomery,P., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Sisk,P., Stolte,C., White,J., Zeng,Q., Yandava,C., Oleary,S., Alvarado,L., Shenoy,N., Godfrey,P., Champion,M., Gnerre,S., Grabherr,M., Mauceli,E., Daar,E.S., Donfield,S.M., Gomperts,E.D., Walker,B.D., Lander,E., Galagan,J., Nusbaum,C., Allen,T.M., Birren,B.
|
Broad Institute of MIT and Harvard
|
USA
|
2009-12-21
|
HCV-1a/US/BID-V175/1990
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,306
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
|
1990
| null |
PRJNA31239
|
Hepatitis C virus subtype 1a isolate HCV-1a/US/BID-V175/1990, complete genome
|
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|
Broad Institute of MIT and Harvard
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USA
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2009-12-21
|
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|
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|
Hepacivirus
|
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|
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|
USA
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|
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|
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| 101,478
|
EU862841.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Henn,M.R., Kuntzen,T., Young,S., Kodira,C., Koehrsen,M., Jaffe,D., Berlin,A., Heiman,D., Hepburn,T., Sykes,S., Borenstein,D., Crawford,M., Engels,R., Freedman,E., Howarth,C., Larson,L., Ledlie,T., Lewis,B., Montgomery,P., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Sisk,P., Stolte,C., White,J., Zeng,Q., Yandava,C., Oleary,S., Alvarado,L., Shenoy,N., Godfrey,P., Champion,M., Gnerre,S., Grabherr,M., Mauceli,E., Liu,Z., Xing,Y., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Riely,C.A., Marion,T.N., Walker,B.D., Lander,E., Galagan,J., Nusbaum,C., Allen,T.M., Birren,B.
|
Broad Institute of MIT and Harvard
|
USA
|
2009-12-21
|
HCV-1a/US/BID-V48/2003
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,292
|
GenBank
| null |
USA: Tennessee
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
|
2003
| null |
PRJNA31239
|
Hepatitis C virus subtype 1a isolate HCV-1a/US/BID-V48/2003, complete genome
|
TGGCGTTAGTATGAGTGTCGTACAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATAAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTTAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCTAGATTGGGTGTGCGCGCGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCGCGTCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTATGGCAATGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCCTGTCCCCCCGTGGCTCTCGGCCTAGCTGGGGCCCTACAGACCCCCGGCGCAGGTCGCGCAATCTGGGTAAGGTCATCGATACCCTCACGTGCGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATTCCGCTCGTCGGCGCCCCTCTTGGAGGCGCTGCCAGGGCCTTGGCGCATGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAACTATGCAACAGGGAACCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTCCTGGCCCTGTTCTCTTGCCTGACTGTGCCCGCGTCAGCCTACCAAGTACGCAACTCCTCGGGCCTTTACCATGTCACCAATGATTGCCCCAATTCGAGTATTGTGTACGAGACGGCCGATACCATTCTGCACTCTCCGGGGTGTGTCCCTTGCGTTCGCGAGGGTAACACCTCGAAATGTTGGGTGGCGGTGGCCCCCACAGTGGCCACCAGGGATGGCAAACTCCCCACAACGCAGCTTCGACGTCACATCGACCTGCTTGTCGGGAGCGCCACCCTCTGCTCGGCCCTCTATGTGGGGGACCTGTGCGGGTCTGTCTTCCTTGTCGGTCAACTGTTCACTTTCTCCCCCAGGCGCTACTGGACAACACAGGACTGTAATTGTTCCATCTACCCCGGCCATATAACGGGTCACCGCATGGCATGGGATATGATGATGAACTGGTCCCCCACAGCGGCGCTGGTAGTAGCTCAGCTGCTCAGGATCCCGCAAGCCATCTTGGACATGATCGCTGGTGCCCACTGGGGAGTCCTAGCGGGCATAGCGTATTTCTCCATGGTGGGGAACTGGGCGAAGGTCCTGGTGGTTCTGTTGCTGTTTGCCAGCGTCGATGCGGAGACCCAGACCACTGGGGGGAGTGTTGCTAAGGACACGTAAGGACTCACTAGTCTTTTCTCTCGGGGCCCCAAGCAGAATATCCAGCTGATCAACACCAATGGCAGTTGGCACATCAACCGCACAGCCTTGAACTGTAATGCGAGCCTCGACACTGGCTGGGTAGCGGGGCTCATCTATTATCACCAATTCAACTCTTCAGGCTGCCCCGAGAGGTTGGCCAGCTGTAGACCCCTTGCCGATTTCGACCAGGGCTGGGGCCCTATCAGCTACGCCAACGGAAGCGGCCCCGAACACCGCCCCTACTGCTGGCACTACCCCCCAAAACCTTGTGGTATCGTGCCAGCACGGAATGTGTGCGGCCCAGTGTATTGCTTCACTCCCAGTCCCGTGGTGGTGGGAACGACTGACAAGTTTGGCGTTCCTACCTACAGCTGGGGTGAAAATGACACGGACGTCTTCCTCCTTAATAACACCAGGCCACCGCTGGGCAATTGGTTCGGTTGCACCTGGATGAACTCAACTGGATTCACCAAAGTGTGCGGAGCGCCCCCTTGCGCCATCGGAGGGGAGGGCAACAACACCTTGCGCTGCCCCACTGACTGTTTCCGCAAGCATCCGGAAGCCACGTACTCTCGGTGCGGCTCCGGTCCCTGGCTTACACCCAGGTGCCTGGTCGACTATCCGTATAGGCTTTGGCATTATCCCTGTACCGTGAACTACACCGTGTTTAAGGTCAGGATGTACGTGGGGGGGGTCGAGCACAGGCTGGAAGCTGCTTGCAACTGGACGCGGGGCGAACGTTGCGATCTGGACGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGCTGCTGTTGTCCACCACACAGTGGCAGGTCCTTCCGTGTTCCTTCACAACCTTGCCAGCCTTGTCCACCGGCCTCATCCACCTCCACCAGAACATCGTGGACGTGCAATATCTGTACGGGGTGGGGTCAAGCATCGCGTCCTGGGCCATCAAGTGGGAGTACGTCATTCTCCTGTTTCTTCTGCTTGCAGACGCGCGCATCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGCTACTCATATCCCAAGCTGAGGCAGCTTTGGAGAACCTCGTAATACTTAATGCAGCATCCCTGGCCGGGACGCATGGGCTTGTATCCTTCCTTGTGTTCTTCTGCTTTGCGTGGTACCTGAAGGGTAGGTGGGTGCCCGGAGCGGTCTACGCCCTCTACGGGATGTGGCCTCTCCTCCTACTCCTGCTGGCGTTGCCTCAGCGGGCGTACGCGCTGGACACGGAGGTGGCCGCGTCGTGTGGCGGCGTTGTTCTTGTCGGGTTAATGGCTTTGACTCTGTCACCATATTACAAGCGCTATATCAGCTGGTGCATGTGGTGGCTTCAGTATTTTCTGACCAGAGGAGAAGCACAACTGCACATGTGGGTTCCCCCCCTTGACGTTCGCGGGGGGCGCGACGCTGTCATCTTACTTATGTGTGCTGTACACCCGACCCTGATGTTTGACATCACCAAGCTGCTGCTGGCCGTCTTCGGACCCCTTTGGATTCTTCAAGCCAGTTTGCTTAAAGTACCCTACTTCGTGCGCGTTCAAGGCCTTCTCCGGATCTGCGCGCTAGCGCGCAAGATGGCCGGGGGCCATTACGTGCAAATGGCCATCATCAAGGTGGGGGCGCTTACTGGCACCTATGTCTATAACCATCTCACTCCCCTTCGGGACTGGGCGCACAACGGCCTACGAGATCTGGCCGTGGCTGTAGAACCAGTCATCTTTTCCCAGATGGAGACCAAGCTCATCACATGGGGAGCAGACACCGCCGCATGCGGTGACATCATCCACGGCTTGCCCGTCTCTGCCCGCAGGGGCCGAGAGATATTGCTCGGACCAGCCGACGGAATGGCCTCCAAGGGGTGGAGGTTGCTGGCGCCCATCACGGCGTATGCCCAGCAGACAAGGGGCCTCTTGGGGTGCATAATCACCAGCCTGACCGGCCGGGACAAAAACCAGGTAGAGGGTGAGGTCCAGATTGTGTCAACTGCTGCCCAGACCTTCCTGGCAACCTGCATCAACGGGGTATGCTGGACTGTCTACCACGGGGCCGGAACAAGGACCATTGCGTCACCCAAGGGTCCTGTCATCCAGATGTATACCAACGTAGACCAAGACCTCGTAGGCTGGCCCGCTCCCCAAGGTGCCCGCTCATTGACACCCTGCACATGCGGCTCCTCGGACCTCTACCTGGTTACGAGGCACGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGCGGGGTGATAGTAGGGGCAGCCTGCTTTCGCCCCGGCCCATCTCTTACTTAAAAGGCTCCTCGGGGGGTCCGCTGTTGTGCCCCGCGGGACACGCCGTAGGCATATTCAGGGCCGCGGTGTGCACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATCCCCGTAGAGAGCCTAGAGACAACCATGAGGTCCCCGGTGTTCACAGACAACTCTTCTCCACCAGCAGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCACACCTGCATGCTCCCACCGGCAGCGGTAAAAGCACCAAGGTCCCGGCCGCATACGCGGCTCAGGGCTACAAGGTGCTGGTGCTCAACCCCTCCGTCGCTGCAACGCTGGGCTTTGGCGCTTACATGTCCAAGGCCCATGGGATTGATCCTAACATCAGGACTGGGGTGAGAACAATTACCACAGGCAGCCCCATTACGTACTCCACCTACGGCAAGTTCCTTGCCGACGGCGGGTGTTCGGGGGGTGCTTATGACATAATAATTTGTGACGAGTGCCACTCTACGGATGCCACATCCATCTTGGGCATCGGCACTGTCCTTGACCAAGCAGAGACTGCGGGGGCACGACTGGTTGTGCTCGCCACTGCTACCCCTCCGGGCTCCGTCACGGTGCCCCATCCCAACATCGAGGAGGTTGCTCTGTCCACCACCGGGGAGATCCCCTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTCGAAGTAATTAAGGGGGGGAGACATCTCATCTTCTGCCACTCAAAGAAGAAGTGTGACGAGCTCGCCGCAAAACTGGGTGCGTTGGGCATCAATGCCGTGGCCTACTACCGCGGCCTTGACGTGTCCGTCATCCCGACCAGCGGTGATGTTGTTGTCGTGGCAACTGATGCTCTCATGACTGGCTACACCGGCGACTTCGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACCCAGACAGTCGACTTCAGCCTTGACCCTACCTTCACCATTGAGACAACCACGCTTCCCCAGGATGCCGTCTCCCGTACTCAACGTCGGGGAAGGACTGGCAGAGGGAAGCCAGGCATCTATAGATTTGTGGCACCGGGAGAGAGGCCCTCTGGCATGTTCGACTCATCCGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCGGGCTGTGCTTGGTATGAGCTCACACCCGCCGAGACCACAGTTAGGCTACGAGCATACATGAACACCCCGGGGCTTCCCGTGTGCCAAGACCATCTTGAATTTTGGGAAGGCGTCTTCACGGGTCTCACCCACATAGACGCCCACTTCTTATCCCAGACAAAGCAGAGCGGGGAAA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| 101,479
|
AB520610.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Weng,L., Hirata,Y., Arai,M., Kohara,M., Wakita,T., Watashi,K., Shimotohno,K., He,Y., Zhong,J., Toyoda,T., Takagi,A., Amiya,T., Tobita,Y., Umehara,T., Ishida,Y., Tateno,C.
|
Advanced Medical Research Laboratories; 3-16-89, Kashima, Yodogawa-ku, Osaka-shi, Osaka 532-8505
|
Japan
|
2009-09-05
| null |
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,598
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Hepatitis C virus genotype 1a genomic RNA, complete genome, strain: HCV-RMT
|
GCCAGCCCCCTGATGGGGGCGACACTCCACCATGAATCACTCCCCTGTGAGGAACTACTGTCTTCACGCAGAAAGCGTCTAGCCATGGCGTTAGTATGAGTGTCGTGCAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATCAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCTAGATTGGGTGTGCGCGCGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCGCGTCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTATGGCAATGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCCTGTCCCCCCGTGGCTCTCGGCCTAGCTGGGGCCCCACAGACCCCCGGCGCAGGTCACGCAATTTGGGTAAGGTCATCGATACCCTCACGTGTGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATTCCGCTCGTCGGCGCCCCTCTTGGGGGCGCTGCCAGGGCCCTGGCGCATGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAACTATGCAACAGGGAACCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTTCTAGCCCTGCTCTCTTGCCTGACTGTGCCCGCATCAGCCTACCAAGTACGCAACTCCTCGGGCCTTTACCATGTCACCAATGATTGCCCTAACTCGAGTATTGTGTACGAGACGGCCGACACCATTCTACACTCTCCGGGGTGTGTTCCTTGCGTTCGCGAGGATAACGCCTCGAGATGTTGGGTGCCGGTGGCCCCCACAGTGGCCACCAGGGACGGCAAACTCCCCACAACGCAGCTTCGACGTCACATCGATCTGCTTGTCGGGAGCGCCACCCTCTGCTCGGCCCTCTATGTAGGGGACTTGTGCGGGTCCGTCTTTCTTGTCAGCCAACTGTTCACTTTTTCCCCCAGGCGCCACTGGACAACGCAAGACTGCAACTGTTCTATCTACCCCGGCCATATAACGGGTCACCGCATGGCGTGGGATATGATGATGAACTGGTCCCCTACGGTCGCGCTGGTAATGGCTCAGCTGCTCAGGGTCCCACAAGCCATCTTGGACATGATCGCTGGTGCTCACTGGGGAGTCCTAGCGGGCATAGCGTATTTCTCCATGGTGGGGAACTGGGCGAAGGTTCTGGTGGTGCTGTTGCTGTTTGCCGGCGTTGACGCGCAAACCTACGTCACCGGGGGGAGTGCCGCTCGGGGCGCGTCCGGACTCGCCAACCTTTTTACACCGGGCGCCAAGCAGGATATCCAGCTGATCAACACCAATGGCAGTTGGCACATCAACCGTACGGCCTTGAACTGTAATGCGAGCCTTGACACTGGTTGGGTCGCAGGGCTCTTTTATTACCATAAATTCAACTCTTCAGGTTGCCCTGAGAGGATGGCCAGCTGCAAACCCCTTGCCGATTTCGACCAGGGCTGGGGCCCTATTCGCCACGCCAACGGAAGCGGCCCCGAACATCGACCCTACTGCTGGCACTACCCCCCAAAACCTTGTGGTATCGTGTCAGCACAGACTGTATGTGGCCCAGTGTATTGCTTCACCCCCAGCCCCGTAGTGGTGGGAACGACCAACCGGTTGGGCGTGCCCACCTACAGTTGGGGCACCAATGATACGGACGTTTTCGTCCTTAATAACACCAGGCCACCGTTGGGCAATTGGTTCGGTTGCACTTGGATGAACTCATCTGGATTTACCAAAGTGTGCGGAGCGCCTCCTTGTGTCATCGGAGGAGTGGGCAACAACACCCTGCACTGCCCCACTGACTGTTTCCGCAAGCATCCGGAAGCCACGTACTCTCGGTGTGGCTCCGGTCCCTGGATCACGCCCAGGTGCCTGGTCCACTATCCTTATAGGCTTTGGCATTATCCTTGCACCGTCAACTACACCCTGTTCAAAGTCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCACAGGCTGGAAGTTGCTTGCAACTGGACGCGGGGCGAGCGTTGTGATCTGGACGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGCTGCTGCTGTCCACCACACAGTGGCAGGTCCTCCCGTGTTCTTTCACGACCTTGCCAGCCTTGACTACCGGCCTCATCCACCTCCACCAGAACATCGTGGACGTGCAATACCTGTACGGGGTGGGGTCAAGCATTGTGTCCTGGGCCATCAAGTGGGAATACGTCATCCTTCTGTTCCTCCTGCTTGCAGACGCGCGCATCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGCTACTCATATCCCAAGCGGAGGCGGCTTTGGAGAACCTTGTGTTACTCAATGCAGCGTCTCTGGCCGGGACGCACGGTCTTGCGTCCTTCCTCGTGTTCTTCTGCTTTGCATGGTATCTGAAGGGTAGGTGGGTGCCCGGAGTGGCCTACGCCTTCTACGGGATGTGGCCTCTCCTCCTGCTCCTGTTGGCGTTGCCCCAGCGGGCATACGCGCTGGACACGGAGATGGCCGCGTCGTGTGGCGGCGTTGTTCTTGTCGGGTTGATGGCGCTAACTCTGTCACCGTACTACAAGAGCTATATCAGCTGGTGCTTATGGTGGCTTCAGTACTTCCTAACTAGGATAGAAGCGCTACTGCACGTGTGGGTCCCCCCCCTCAATGTCCGAGGAGGGCGCGACGCTGTCATCCTGCTCACGTGTGTTGTACACCCGACCTTGGTATTCGACATCACCAAGCTACTACTGGCCGTCTTCGGACCCCTTTGGATTCTCCAAACCAGTCTGCTCAAGGTGCCCTACTTCGTGCGCGTCCAAGGCCTTCTCCGGGCCTGCGCGCTAGCGCGTAAGGTGGCCGGAGGCCATTACGTGCAGATGGTCATCATCAAGTTGGGGGCGCTTACTGGCACCTACATCTACAACCATCTCACTCCTCTCCGGGACTGGGCGCACAACGGCCTACGAGATCTGGCCGTGGCTGTAGAGCCAGTCGTCTTTTCCCAGATGGAGACCAAGCTCATCACGTGGGGGGCGGACACCGCCGCGTGCGGTGACATCATCAACGGCCTGCCTGTCTCTGCCCGTAGGGGCCAAGAGATATTGCTCGGACCGGCCGATGGAATGGTCTCTAAGGGGTGGAGGTTGCTGGCGCCCATCACGGCGTATGCCCAGCAGACAAGGGGCCTCCTGGGATGCATAATTACTAGCCTGACCGGCCGGGACAAAAACCAGGTGGAGGGTGAGGTCCAGATTGTGTCAACTGCTGCCCAGACCTTCCTGGCAACCTGCATCAACGGAGTGTGCTGGACTGTCTACCACGGGGCCGGAACAAGGACCATCGCGTCACCCAAAGGTCCCGTCATCCAGATGTATACTAATGTAGACCAAGACCTTGTAGGCTGGCCCGCTCCCCAAGGTGCCCGCTCATTGACACCCTGCACTTGCGGCTCCTCGGACCTTTACTTGGTCACGAGGCACGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGCGGGGTGATAGCAGGGGCAGCCTGCTCTCGCCCCGGCCTATCTCTTACTTGAAAGGCTCTTCGGGGGGCCCATTGCTGTGCCCCGCGGGACACGCCGTAGGCATATTCAGGGCCGCGGTGTGCACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATCCCCGTAGAGAGTCTAGAGACAACCATGAGGTCCCCGGTGTTCACAGACAACTCCTCCCCACCAGCAGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCCCACCTGCATGCTCCCACCGGCAGCGGTAAGAGTACCAAGGTCCCGGCCGCATACGCGGCTCAGGGCTACAAGGTGCTGGTGCTCAACCCCTCCGTTGCTGCAACACTGGGCTTTGGTGCTTATATGTCCAAGGCCCATGGGATTGATCCTAACATCAGGACTGGGGTGAGGACAATCACTACTGGCAGCCCCATCACGTACTCCACCTACGGCAAGTTCCTTGCTGATGGCGGGTGCTCGGGGGGTGCTTATGACATAATAATTTGTGACGAGTGCCACTCTACGGATGCAACATCCGTCTTGGGCATCGGCACTGTCCTTGACCAAGCAGAGACTGCGGGGGCGAGACTGGTCGTGCTCGCCACCGCTACCCCTCCGGGCTCTGTCACTGTGCCCCATCCTAACATCGAGGAGGTTGCTCTGTCCACCACCGGAGAGATCCCCTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTTGAGGCAATCAAGGGGGGGAGACATCTCATCTTCTGCCATTCAAAAAAGAAGTGCGACGAGCTCGCTGCAAAGCTGGTCGCGATGGGCGTCAATGCCGTGGCTTACTACCGCGGCCTCGACGTGTCCGTCATCCCAACCAGTGGCGATGTTGTCGTCGTGGCAACTGATGCCCTCATGACCGGCTATACCGGCGACTTTGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACCCAGACAGTCGACTTCAGCCTTGACCCTACCTTCACCATTGAGACAACCACGCTCCCCCAGGACGCTGTCTCCCGCACTCAACGTCGGGGCAGGACTGGCAGGGGGAAGCCAGGCATCTACAGATTTGTGGCACCGGGGGAGCGCCCCTCCGGCATGTTTGACTCGTCCGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCGGGCTGTGCTTGGTATGAGCTCACACCCGCCGAGACCACAGTTAGGCTACGAGCATATATGAACACCCCGGGGCTCCCCGTGTGCCAAGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTCTTCACGGGTCTCACCCATATAGACGCCCATTTCCTATCCCAGACAAAGCAGAGTGGGGAAAACCTTCCTTACCTGGTAGCGTACCAAGCCACCGTGTGCGCTAGGGCTCAGGCCCCCCCCCCATCGTGGGACCAGATGTGGAAGTGCTTGATCCGCCTCAAGCCCACCCTTCATGGGCCAACACCTCTGCTATACAGACTGGGCGCTGTTCAGAATGAAGTCACCCTGACGCACCCAATCACCAAGTACATCATGACATGCATGTCGGCTGACCTGGAGGTCGTCACGAGTACCTGGGTGCTCGTCGGCGGCGTCCTGGCTGCTTTGGCCGCGTATTGCCTATCCACAGGCTGCGTGGTCATAGTAGGCAGGATTGTCTTGTCCGGGAAGCCGGCTATCATACCTGACAGGGAAGTCCTCTACCGGGAGTTCGATGAGATGGAAGAGTGCTCTCAGCACTTGCCGTACATCGAGCAGGGGATGATGCTCGCCGAGCAGTTCAAGCAGAAGGCCCTCGGCCTCCTGCAGACCGCGTCCCGCCAGGCAGAGGTCATCGCCCCTACCGTCCAAACCAACTGGCAGAGACTCGAGGCCTTCTGGGCGAAGCATATGTGGAACTTCATCAGTGGGATACAATATCTGGCGGGCCTGTCAACGTTGCCTGGTAATCCCGCCATTGCATCATTGATGGCTTTTACAGCTGCCGTCACCAGCCCACTAACCACCGGCCAAACTCTCCTCTTCAACATTTTGGGGGGGTGGGTGGCTGCCCAGCTCGCAGCCCCCGGTGCCGCTACCGCCTTTGTGGGCGCTGGCTTAGCCGGCGCCGCCATCGGCAGTGTTGGACTGGGGAAGGTCCTCGTGGACATCCTTGCAGGGTATGGCGCGGGCGTGGCGGGAGCTCTTGTAGCATTTAAGATCATGAGCGGTGAGGTTCCCTCCACAGAGGACCTGGTCAATCTACTGCCTGCCATCCTTTCGCCCGGAGCCCTTGTAGTCGGTGTGGTCTGCGCAGCAATACTACGCCGGCACGTTGGCCCGGGCGAGGGAGCAGTGCAGTGGATGAACCGGTTGATAGCCTTCGCCTCCCGGGGGAACCACGTTTCCCCCACGCACTACGTGCCGGAGAGCGATGCAGCTGCCCGCGTCACTGCCATACTCAGCAGCCTCACTGTGACCCAGCTCCTGAGGCGACTACACCAGTGGCTAAGCTCGGAGTGTACCACTCCATGCTCCGGTTCCTGGCTAAGGGACATCTGGGACTGGATATGCGAGGTGCTGAGCGATTTTAAGACCTGGCTGAAGGCCAAGCTCATGCCACAACTGCCTGGGATTCCCTTTGTGTCCTGCCAACGCGGGTACAGGGGGGTCTGGCGAGGAGATGGCATTATGCACACTCGCTGCCCCTGTGGAGCTGAGATCGCCGGACATGTCAAGAACGGGACGATGAGGATCGTCGGTCCTAAGACCTGCAGAAACACGTGGAGTGGGACCTTCCCCATCAACGCCTACACCACGGGCCCCTGTACCCCCCTTCCTGCGCCGAACTATACGTTCGCGCTGTGGAGGGTGTCTGCGGAGGAATACGTGGAAATAAGGCAGGTGGGGGACTTCCACTACGTGACGGGCATGACTGCTGACAACCTTAAGTGCCCATGCCAGGTCCCATCGCCCGAATTTTTCACAGAACTGGATGGGGTGCGCCTGCATAGGTTTGCGCCCCCTTGCAAGCCCTTGCTACGAGATGAGGTGTCGTTCAGAGTAGGACTACACGACTACCCGGTGGGGTCGCAGTTACCTTGCGAGCCTGAACCGGATGTGGCCGTACTGACGTCCATGCTCACCGATCCCTCCCATATAACGGCAGAGGCGGCTGGGAGGAGGTTAGCAAGGGGATCGCCCCCTTCTCTGGCCAGCTCCTCGGCCAGCCAGCTGTCCGCTCCATCTCTCAAAGCAACTTGCACCACCAACCACGACTCCCCTGACGCCGAGCTCATAGAGGCTAACCTCCTGTGGAGGCAGGAGATGGGCGGCAACATCACCAGGGTTGAGTCAGAGAACAAAGTGGTAGTCCTGGACTCCTTCGATCCGCTTGTGGCAGAAGAGGACGAACGGGAGATCTCCGTGGCCGCAGAGATCCTGCGGAAGTCTCGGAGATTCGCTCCGGCCCTGCCCATTTGGGCACGGCCGGACTACAACCCCCCGTTACTGGAGACGTGGAAAAAGCCGGACTACGAGCCACCTGTGGTCCATGGCTGCCCGCTTCCACCTCCAAAGTCCCCTCCTGTGCCTCCGCCCCGGAAGAAGCGGACGGTGGTCCTCACTGAATCAACTGTATCCACTGCCTTGGCTGAGCTTGCTACCAAGAGCTTTGGCAGCTCTTCAACTTCCGGTATAACGGGCGACAACACGACAGCGTCCTCTGAGCCCGCCCCCTCTGTCTGCCCTCCAGACTCCGACGCTGAGTCCTATTCTTCCATGCCCCCCCTGGAGGGGGAGCCTGGGGATCCGGATCTCAGCGACGGGTCATGGTCGACGGTCAGTAGTGGGGCTGGCACGGAGGATGTCGTGTGTTGCTCAATGTCCTATTCCTGGACAGGCGCACTCATCACCCCGTGTGCCGCGGAAGAACAAAAATTGCCTATCAACGCACTGAGCAACTCATTACTGCGTCACCACAACCTCGTGTATTCCACCACCTCACGCAGTGCTTGCCAAAGGCAGAAGAAAGTCACATTTGACAGACTGCAAGTTCTGGACAACCACTACCAGGACGTGCTCAAGGAGGTTAAGGCGGCGGCGTCAAAAGTGAAGGCTAACTTGCTATCCGTAGAGGAAGCTTGCAGCCTGACGCCCCCACATTCAGCCAGATCAAAATTTGGCTATGGGGCAAAAGACGTCCGTTGCCATGCCAGAAAGGCCGTAAACCACATCAACTCCGTGTGGAAAGACCTTCTGGAAGACAGTGTTACACCAATAGACACAACCATCATGGCTAAGAACGAAGTTTTCTGCGTTCAGCCTGAGAAGGGGGGTCGTAAGCCAGCTCGTCTCATCGTGTACCCTGACCTGGGTGTGCGCGTGTGCGAGAAAATGGCCCTGTACGACGTGGTAAAAAAACTCCCCCTGGCCGTGATGGGAAGCTCCTACGGATTCCAGTACTCACCAGGACAGCGGGTTGAATTCCTCGTGCAAGCGTGGAAGTCCAAGGGGACCCCAATGGGGTTCTCGTATGATACCCGCTGCTTTGACTCTACAGTCACTGAGAGCGATATCCGTACGGAGGAGGCAATCTACCAGTGTTGTGACCTGGACCCCCAAGCCCGCGTGGCCATCAAGTCCCTCACCGAGAGGCTTTATGTCGGGGGTCCTCTTACCAATTCAAGGGGGGAAAACTGCGGCTATCGCAGGTGCCGCGCAAGCGGCGTACTGACAACTAGCTGTGGTAACACCCTCACTTGCTACATCAAGGCCCGAGCAGCCTGTCGAGCCGCAGGGCTCCGGGACTGCACCATGCTCGTGTGTGGCGACGACTTAGTCGTTATCTGTGAAAGCCAGGGGGTCCAAGAGGATACAGCGAGCCTGAGAGCCTTCACGGAGGCTATGACCAGGTACTCCGCTCCCCCCGGGGACCCCCCCCAACCAGAATACGACTTGGAGCTCATAACATCGTGCTCCTCTAACGTGTCAGTCGCCCACGACGACACTGGAAAGAGGGTCTATTACCTTACCCGTGACCCTACAACTCCCCTCGCGAGAGCCGCGTGGGAGACAGCAAGACACACTCCAGTCAATTCCTGGCTAGGCAACATAATCATGTTTGCCCCCACATTGTGGGTGAGAATGATACTGCTGCCCCACTTCTTCAGTGTCCTCATGGCCAGGGACCAACTTGAACAGGCCCTTGATTGCGAAATCTACGGAGCCTGCTACTCCATAGAACCACTGGACCTACCTCCAATCATTCAAAGACTCCATGGCCTTAGCGCATTTTCACTCCACAGTTACTCTCCAGGTGAAATCAATAGGGTGGCCGCATGCCTCAGAAAACTTGGGGTCCCGCCCTTGCGAGCTTGGAGACACCGGGCCCGGAGCATCCGCGCTAAGCTTCTGTCCAGAGGAGGCAGGGCTGCCACGTGTGGCAAGTACCTCTTCAATTGGGCAGTAAGAACAAAGCTCAAACTCACTCCAATAGCGGCCGCTAGCCAGCTGGACTTGTCCGGTTGGTTCACGGCTGGCTACAGCGGGGGAGACATTTATCACAGCGTGTCTCGTGCCCGGCCCCGCTGGTTCTGGTTTTGCCTACTCCTGCTTGCTGCAGGGGTAGGCATCTACCTCCTCCCCAACCGATGAAGGTTGGGGTAAACACTCCGGCCTCTTAGGCCATTCCTGTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTCTTCTTTAATGGTGGCTCCATCTTAGCCCTAGTCACGGCTAGCTGTGAAAGGTCCGTGAGCCGCATGACTGCAGAGAGTGCTGATACTGGCCTCTCTGCAGATCATGT
| 102,312
|
GQ149768.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Henn,M.R., Kuntzen,T., Young,S., Koehrsen,M., Lennon,N., Erlich,R., Anderson,S., Rizzolo,K., Green,L., Ryan,E., Yu,Q., Berlin,A., Heiman,D., Hepburn,T., Sykes,S., Borenstein,D., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Heilman,E., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Montgomery,P., Park,D., Pearson,M., Richards,J., Roberts,A., Sisk,P., Stolte,C., White,J., Alvarado,L., Champion,M., Godfrey,P., Shenoy,N., Yandava,C., Zeng,Q., Schulze zur Wiesch,J., Kim,A., Lauer,G., Lui,Z., Xing,Y., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Riley,C.A., Marion,T.N., Walker,B.D., Nusbaum,C., Allen,T.M., Birren,B.
|
Broad Institute of MIT and Harvard
|
USA
|
2009-06-17
|
HCV-1a/US/BID-V2147/2002
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,303
|
GenBank
| null |
USA: Massachusetts
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
|
2002
| null |
PRJNA31239
|
Hepatitis C virus subtype 1a isolate HCV-1a/US/BID-V2147/2002, complete genome
|
GTTAGTATGAGTGTCGTACAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATAAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTTAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCTAGATTGGGTGTGCGCGCGACAAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCACGTCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTATCCTTGGCCCCTCTATGGCAACGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCCTGTCTCCCCGCGGCTCCCGGCCTAGCTGGGGCCCCACAGACCCCCGGCGTAGGTCGCGCAATTTGGGTAAGGTCATCGACACCCTCACGTGCGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATACCGCTCGTCGGCGCCCCTCTTGGGGGCGCTGCCAGGGCCCTGGCGCATGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAACTATGCAACAGGGAACCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTTCTGGCCCTGCTCTCTTGCCTGACTGTGCCCGCTTCGGCCTACCAAGTGCGCAACTCCACGGGGCTTTACCATGTCACCAATGATTGTCCTAACTCGAGCATTGTGTTCGAGGCGGCCGATGCCATCCTGCACGCTCCGGGGTGTGTCCCTTGCGTTCGCGAGGGTAACGTCTCGAGGTGCTGGGTGGCGATCACCCCCACGGTGGCCACCAAGGACGGCAAACTCCCCACGACCCAGCTTCGACGTCACATCGATCTGCTCGTCGGGAGCGCTACCCTCTGTTCGGCCCTCTACGTGGGGGACCTGTGCGGGTCTATCTTTCTTGTCAGCCAACTGTTCACCTTCTCTCCCAGGCGTTACTGGACGACGCAAGGCTGCAACTGCTCTATCTATCCCGGCCATATAACGGGTCACCGTATGGCATGGGATATGATGATGAACTGGTCCCCTACGACGGCATTGGTAGTAGCTCAGCTGCTCCGGATCCCACAAGCCATCTTGGATATGATCGCTGGCGCCCACTGGGGAGTCCTGGCGGGCATAGCGTATTTTTCCATGGTGGGGAACTGGGCGAAGGCCCTGGTAGTGCTGCTGCTATTTGCCGGCGTCGACGCGGAGACCCACGTCTCCGGGGGAAGCGCCGCCCACGCCGTGCACGGACTTACCAGCATCTTCTCAAGAGGTCCTTCACAGAAGATCCAGCTAATCAACACCAATGGCAGTTGGCATATCAATAGGACGGCCTTGAACTGTGATGAAAGTCTTCACACCGGATGGTTAGCAGGGCTTCTCTATTACAATCAGTTCAACTCTTCAGGCTGTACCCAGAGGATGGCTAGCTGCCGACCCCTTGCTGCTTTTGCCCAGGGCTGGGGCCCTATCAGCTATGCCAACGTAAGTGGCTCCGACCAACGCCCCTACTGCTGGCACTACCCTCCAAGACCCTGCGGTATTGTGCCCGCAAAGAGCGTGTGTGGCCCGGTATATTGTTTCACTCCCAGCCCCGTGGTGGTGGGGACGACCGACAAGTCGGGCGTGCCTACTTACAACTGGGGCGCAAATGATACGGACGTCTTCGTCCTTAACAACACCAGGCCACCGATGGGCAATTGGTTTGGTTGCACCTGGATGAACTCAACTGGATTTACCAAAGTGTGCGGAGCACCCCCTTGTGCCATCGGAGGGGTGGGCAACAACACTCTGCTCTGCCCCACTGATTGTTTCCGCAAGCATCCGGAAGCCACATACTCTCGGTGCGGCTCCGGTCCCTGGATCACACCCCGGTGCATGGTCCACTACCCGTATAGGCTGTGGCATTACCCTTGTACTCTCAACTACACCATATTCAAGGTCAGGATGTATGTGGGAGGAGTCGAGCACAGGTTGGAAGTTGCCTGCAACTGGACGCGGGGCGAACGTTGCGATCTGGAAGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGCTGCTGTTGTCCACCACACAGTGGCAAGTCCTTCCGTGCTCCTTCACGACCCTGCCGGCCTTGTCCACCGGTCTCATCCACCTCCACCAGAACATCGTGGACGTGCAGTATCTGTACGGGGTGGGGTCGAGCATCGTGTCGTGGGCCATTAAGTGGGAGTACGTCGTTCTCCTGTTCCTACTGCTTGCAGACGCACGCGTCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGTTACTCATATCCCAAGTGGAAGCGGCTTTGGAGAACCTCGTGATGCTCAATGCGGCATCCCTGGCCGGAACGCGCGGTCTTGTACCCTTCCTCGTGTTCTTCTGCTTTGCATGGTATCTGAAGGGTAAGTGGGTGCCCGGGGCGGTCTACGCCCTTTACGGGGTGTGGCCTCTCCTCCTGCTCTTGCTGGCGTTGCCCCAACGGGCATACGCGCTGGACACGGAGGCGGCCGCGTCGTGTGGTGGTGTTGTTCTTGTCGGGTTAATGGCGCTGACTCTGTCACCATATTACAAGCGCTATATCAGCTGGTGCTTATGGTGGCTTCAGTATTTTCTGACCAGGGTAGAAGCGCAACTGCATGTGTGGGTTCCCCCCCTTAGCGTTCGAGGGGGGCGTGACGCCATCATTTTACTCGCGTGTGTTATGCACCCGACTTTGGTATTCGACATCACCAAACTGCTGCTGGCCGTCTTCGGACCCCTGTGGATTCTTCAAGCCAGCCTACTTAAAGTGCCCTACTTTGTGCGCGTTCAAGGCCTCCTCCGGATCTGCGCGCTAGCGCGGAAGGTGGTCGGAGGCCATTACGTGCAGATGGTCATCATTAAGTTAGGGGCGCTTACTGGCACCTATGTTTATAACCACCTCACTCCTCTCCGGGACTGGGCGCACAACGGCCTGCAAGATCTGGCCGTGGCTGTAGAGCCAGTCGTCTTCTCCCCAATGGAGACCAGGCTTATCACGTGGGGGGCGGACACCGCTGCGTGCGGTGACATCATCAGTGGCCTACCTGTCTCCGCCCGTAGGGGCCGGGAGATATTGCTTGGACCAGCCGATGGAATGGTCTCCAAGGGGTGGAGGTTGCTAGCACCCATCACGGCGTACGCCCAGCAGACAAGGGGCCTCCTAGGGTGTATAATCACCAGCCTAACCGGCCGGGACAAAAACCAGGTGGAGGGTGAGGTCCAAATTGTGTCAACTGCTGCCCAAACTTTCCTGGCGACGTGCATCAATGGGGTATGCTGGACTGTCTACCACGGAGCTGGAACGAGGACCATCGCATCATCCAAGGGTCCTGTTATTCAGATGTATACCAATGTGGATAAGGACCTTGTAGGTTGGCCCGCTCCTCAAGGTGCCCGCTCATTGACACCTTGCACCTGCGGCTCCTCGGACCTCTACCTGGTCACGAGGCACGCCGATGTCATTCCTGTGCGCCGGCGAGGTGATAGCAGGGGCAGCCTGCTTTCGCCCCGGCCCATTTCCTACTTGAAAGGCTCCTCGGGGGGTCCGCTGTTGTGCCCCGCGGGACACGCCGTGGGCATATTCAGAGCCGCGGTGTGTACTCGTGGGGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATCCCTGTGGAGGGCCTAGAGACAACTATGAGGTCCCCCGTGTTTACGGACAATTCCGCTCCACCAGCAGTACCCCAGAGCTTCCAGGTGGCCCACTTGCACGCTCCCACAGGCAGCGGTAAGAGCACCAAGGTCCCGGCCGCGTACGCGGCTCAGGGCTACAAGGTGCTGGTGCTCAACCCTTCCGTTGCTGCGACACTGGGCTTTGGTTCTTATATGTCCAAGGCCCATGGGATCGATCCTAACATCAGGACCGGGGTGAGAACAATTACCACAGGCAGCCCCATCACGTACTCCACCTACGGCAAGTTCCTTGCCGACGGCGGGTGCTCAGGGGGTGCTTATGACATAATAATTTGTGATGAGTGCCACTCCACGGATTCCACATCCATCTTGGGCATCGGCACTGTCCTTGACCAGGCAGAGACTGCGGGGGCGAGACTGGTCGTGCTCGCCACCGCCACCCCTCCGGGCTCTGTCACCGTGCCCCATCCCAACATCGAGGAGGTTGCTCTGCCCACCACTGGGGAGATCCCCTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTCGAGGTGATCAAGGGGGGGAGACATCTCATCTTCTGCCACTCAAAGAAGAAGTGCGACGAGCTCGCCGCAAAGTTGGTCGCACTGGGCGTCAATGCCGTGGCCTATTACCGCGGTCTTGACGTGTCTGTCATCCCGACCAGCGGCGACGTTGTCGTTGTGGCAACCGACGCCCTCATGACCGGCTTTACCGGCGACTTCGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACCCAGACAGTCGATTTCAGCCTTGACCCTACTTTCACTATTGAGACAACCACGCTTCCCCAAGATGCTGTCTGCCGCACTCAACGTCGGGGTAGGACTGGCAGGGGGAAGCCAGGCATCTACAGATTTGTGGCACCGGGGGAGCGCCCATCCGGCATGTTCGACTCGTCCGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCGGGCTGTGCTTGGTATGAGCTCACGCCCGCCGAGACTACAGTCAGGCTGCGAGCGTACCTGAACACCCCGGGGCTCCCCGTGTGCCAGGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTCTTTACGGGTCTCACTCATATAGATGCCCACTTCCTATCCCAGACAAAGCAGAGTGGGGAAAACCTTCCTTACCTGGTAGCGTACCAAGCCACTGTGTGCGCTAGGGCTCAAGCCCCTCCTCCATCGTGGGACCAGATGTGGAAGTGTTTGATCCGCCTCAAGCCCACCCTCCATGGGCCAACACCTCTGCTATACAGACTGGGCGCTGTTCAGAATGAGGTCACCTTGACGCACCCGGTCACCAAATACATCATGACATGTATGTCGGCCGACCTGGAGGTCGTCACGAGCACCTGGGTGCTCGTTGGCGGCGTCCTGGCTGCTTTGGCCGCGTATTGCTTATCAACGGGCTGCGTGGTCATAGTGGGCAGGGTTGTCTTGTCCGGGAAGCCGGCAATCATACCTGATAGGGAAACCCTCTACCGGGAGTTCGATGAGATGGAAGAGTGCTCTCAGCACTTACCGTACATCGAGCAAGGGATGATGCTCGCTGAGCAGTTCAAGCAGAAGGCTCTCGGCCTCCTGCAGACCGCGTCCCGTCAGGCAGAGGTTATCACCCCTGCTGTCCAGACCAACTGGCAAAAGATCGAGGTCTTCTGGGCGAAACATATGTGGAACTTCATCAGCGGGATACAATACTTGGCGGGCCTGTCAACGTTGCCTGGTAACCCCGCTATTGCTTCATTGATGGCTTTTACAGCTGCTGTCACCAGCCCACTAACCACTAGCCAAACCCTCCTCTTCAACATATTGGGAGGGTGGGTGGCTGCCCAGCTCGCCGCCCCCGGTGCCGCTACCGCCTTTGTGGGCGCTGGCCTGGCTGGCGCCGCCATCGGCAGTGTTGGACTGGGGAAGGTCCTCGTGGACATCCTTGCAGGGTATGGCGCGGGCGTGGCGGGAGCTCTTGTAGCATTTAAGATCATGAGCGGCGAGGTCCCCTCCACGGAAGACCTAGTCAATCTACTGCCCGCCATCCTCTCGCCTGGAGCCCTTGTAGTCGGTGTGGTCTGCGCAGCGATACTGCGTCGGCACGTTGGCCCGGGCGAGGGGGCAGTGCAATGGATGAACCGGCTGATAGCCTTCGCCTCCCGGGGGAACCATGTTTCCCCCACGCACTACGTGCCGGAGAGCGACGCAGCTGCCCGCGTCACTGCCATACTCAGCAGCCTCACTGTGACCCAGCTCCTGAGGCGACTGCACCAGTGGATAAGCTCAGAGTGTACCACTCCATGCTCCGGTTCCTGGCTAAGGGACATTTGGGACTGGATATGCGAGGTGCTAAGCGACTTTAAAACCTGGTTAAAAGCCAAGCTCATGCCGCAACTGCCTGGGATCCCCTTTGTATCCTGCCAGCGCGGGTATAGGGGGGTCTGGCGAGGGGACGGCATCATGCACACTCGCTGCCACTGTGGAGCTGAGATCACCGGACATGTCAAAAATGGGACGATGAGGATCGTCGGTCCTAGGACCTGCAGGAACATGTGGAGTGGGACCTTCCCCATTAACGCCTACACCACGGGCCCCTCCACCCCTCTTCCTGCGCCGAACTATACGTTCGCGCTGTGGAGGGTGTCTGCGGAGGAGTACGTGGAGATAAGGCAGGTGGGGGACTTCCACTACGTGACGGGTATGACTACTGACAATCTTAAATGCCCGTGCCAGGTTCCATCGCCCGAATTTTTTACAGAATTGGACGGGGTGCGCCTACATAGGTTTGCGCCTCCCTGCAAGCCCTTGCTACGGGAGGAGGTATCATTCAGGGTAGGACTCCACGAGTACCCGGTCGGGTCGCAATTACCTTGCGAACCCGAACCGGACGTAACCGTGGTGACGTCCATGCTCACCGATCCCTCCCACATAACGGCAGAGGCGGCCGGGAGAAGGTTGGCGAGGGGATCACCCCCCTCTGAGGCCAGCTCCTCGGCTAGCCAGCTGTCCGCTCCATCTCTCAAGGCAACTTGCACCACCAACCATGACTCCCCTGATGCCGAGCTCATAGAGGCCAACCTCCTATGGAGGCAGGAGATGGGCGGCAACATCACCAGGGTCGAGTCAGAAAACAAAGTGGTGATTCTGGACTCTTTCGATCCGCTTGTGGCGGAGGAGGATGAGCGGGAGATCTCCGTACCCGCAGAAATCCTGCGGAAGTCTCGGAGATTCGCCCAGGCCCTGCCCATTTGGGCGCGGCCGGACTATAATCCCCCGCTAGTGGAGACGTGGAAAAAGCCTGACTACGAACCACCTGTGGTCCATGGCTGTCCGCTTCCACCTCCACAGTCCCCTCCTGTGCCTCCGCCCCGCAAGAAGCGGACGGTGGTCCTCACCGACTCAACCGTGTCTACTGCCTTGGCAGAGCTTGCCACCAAAAGTTTTGGCAGCTCCTCAACTTCCGGTGCCACGGGTGATAGTACAACAACGTCCTCTAAGCCCACCTCTTCTGGCCACTCCCCAGACTCCGACGCCGAGTCCTACTCTTCCATGCCCCCCCTGGAGGGGGAGCCTGGGGATCCGGATCTCAGCGACGGGTCATGGTCGACGGTCAGTAGTGAGGCCAGCACAGAGGATGTCGTGTGCTGCTCGATGTCTTACACCTGGACGGGCGCACTCGTCACCCCGTGCTCCGCGGAAGAACAGAAACTGCCCATCAATGCACTGAGCAACTCGTTGCTACGTCACCACAACCTGGTGTATTCTACCACCTCACGCAGTGCTTGCCAAAGGCAGAAGAAAGTCACATTTGACAGACTGCAAGTTCTGGACAGCCACTACCAGGACGTGCTCAAGGAGGTTAAAGCAGCGGCGTCAAAAGTGAAGGCCAACTTGCTATCCGTGGAGGAAGCTTGTAGCCTGACGCCCCCACACTCAGCCAGATCCAAGTTTGGCTATGGGGCAAAAGACGTCCGTTGCCATGCCAGAAAGGCCGTAGCCCACATCAACTCCGTGTGGAAAGACCTTCTGGAAGACAGTGTAACACCAATAGACACTACCATCATGGCCAAGAACGAAGTTTTCTGCGTTCAGCCCGAGAAAGGGGGTCGCAAGCCAGCTCGTCTCATCGTGTTCCCCGACCTGGGTGTGCGCGTGTGCGAGAAGATGGCCCTGTACGACGTGGTTAAAAAGCTCCCCGTGGCCGTGATGGGAGACTCTTACGGATTCCAATACTCACCAGGACAGCGGGTTGAATTCCTCGTGCAAGCGTGGAAGTCCAAGAAGACCCCGATGGGGTTCTCGTATGATACCCGCTGCTTTGACTCCACAGTCACTGAGAGCGATATCCGTACAGAGGAAGCAATCTACCAATGTTGTGACCTGGACCCCCAAGCCCGCGTGGCCATCAAGTCCCTCACCGAGAGGCTTTATGTTGGGGGCCCTCTTACCAATTCAAGGGGGGAGAACTGCGGCTACCGCAGGTGCCGCGCGAGCGGCGTACTAACAACTAGCTGTGGTAACACCCTCACTTGCTACATCAAGGCCCAAGCAGCCTGTCGAGCCGCAGGGCTCCAGGACTGCACCATGCTTGTGTGTGGCGACGACTTAGTCGTTATCTGTGAAAGTGCGGGAGTCCAGGAGGACGCGGCGAGCCTGAGAGCCTTCACGGAGGCTATGACCAGGTATTCCGCCCCCCCCGGGGACCCCCCACAACCAGAATACGACTTGGAGCTCATAACATCTTGCTCCTCCAACGTGTCAGTCGCCCACGACGGCATGGGAAAGAGGGTCTACTACCTCACCCGTGACCCTACAACCCCCCTCGCGAGAGCCGCGTGGGAGACAGCAAGACACACTCCAGTTAATTCCTGGCTAGGCAACATAATCATGTTTGCCCCCACATTGTGGGCGAGGATGATACTGATGACCCATTTCTTTAGCGTCCTCATAGCCAGGGATCAGCTTGACCAGGCCCTTGATTGCGAGATCTACGGGGCCTGCTACTCCATAGAACCACTGGACCTACCTCCAATCATCCAAAGACTCCACGGCCTTAGCGCATTTTCACTCCACAGTTACTCTCCAGGTGAGATTAATAGGGTGGCCGCATGCCTCAGAAAACTTGGGGTCCCGCCCTTGCGAGCTTGGAGACACCGGGCCCGGAGCGTCCGCGCTAGGCTTCTGTCCAGAGGAGGCAGGGCTGCCATTTGTGGCAAGTACCTCTTCAACTGGGCAGTAAGAACAAAGCTCAAACTCACTCCAATAGCGGCCGCTGGCCAGCTGGACTTGTCCAGCTGGTTCACGGCTGGCTACAGCGGGGGAGACATTTATCACAGCGTGTCTCGTGCCCGGCCCCGCTGGTTCTGGTTTTGCCTACTCCTGCTTGCTGCAGGGGTAGGCATCTACCTCCTCCCCAACCGGTGAAGGTTGGGGTAAACA
| 102,689
|
EU781746.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Timm,J., Li,B., Daniels,M.G., Bhattacharya,T., Reyor,L.L., Allgaier,R., Kuntzen,T., Fischer,W., Nolan,B.E., Duncan,J., Schulze zur Wiesch,J., Kim,A.Y., Frahm,N., Brander,C., Chung,R.T., Lauer,G.M., Korber,B.T., Allen,T.M., Berical,A., Lennon,N., Berlin,A.M., Young,S.K., Lee,B., Heckerman,D., Carlson,J., Kleyman,M., McMahon,C.M., Birch,C., Schulze Zur Wiesch,J., Ledlie,T., Koehrsen,M., Kodira,C., Roberts,A.D., Rosen,H.R., Bihl,F., Cerny,A., Spengler,U., Liu,Z., Xing,Y., Schneidewind,A., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Galagan,J.E., Nusbaum,C., Walker,B.D., Lake-Bakaar,G.V., Daar,E.S., Jacobson,I.M., Gomperts,E.D., Edlin,B.R., Donfield,S.M., Talal,A.H., Marion,T., Birren,B.W., Henn,M.R., Fischer,W.F., Riely,C.A.
|
Massachusetts General Hospital, Partners AIDS Research Center
|
USA
|
2009-05-31
|
00U
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,402
|
GenBank
| 2
|
USA: Massachusetts, Boston area
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Hepatitis C virus subtype 1a isolate 00U, complete genome
|
TATCACTCCCCTGTGAGGCACTACCCTCCAAAACCTATCACTCCCCTGTGAGGAACTACTGTCTTCACGCAGAAAGCGTCTRGCCAKGGCGTTAGTATGAGTGTCGTGCAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATAAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACCTGTTGCCGCGCAGGGGCCCTAGATTGGGTGTGCGCGCGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCGCGTCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTATGGCAATGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCCTGTCTCCCCGCGGCTCTCGGCCTAGCTGGGGCCCCACAGACCCCCGGCGTAGGTCGCGCAATTTGGGTAAGGTCATCGATACCCTTACGTGCGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATACCGCTCGTCGGCGCCCCTCTCGGAGGCGCTGCCAGGGCCCTGGCGCATGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAATTATGCAACAGGGAACCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTCCTGGCCCTGCTCTCTTGCCTGACCGTGCCCGCTTCAGCCTACCAAGTGCGCAACTCCACGGGGCTTTACCATGTCACCAATGATTGCCCTAACTCGAGTATTGTGTACGAGGCGGCCGATGCCATCCTGCACACTCCGGGGTGTGTCCCTTGCGTTCGCGAGGGTAACGCCTCGAGGTGTTGGGTGGCGATGTCCCCCACGGTGGCCACCAGGGACGGCAGACTCCCCACAACGCAGCTTCGACGTCACATCGATCTGCTTGTCGGGAGCGCCACCCTCTGCTCGGCCCTCTACGTGGGGGACCTGTGCGGGTCCGTCTTTCTTGTCGGTCAACTGTTCACCTTCTCTCCCAGGCGCCACTGGACGACACAGGGCTGCAATTGTTCTATCTATCCCGGCCATATAACGGGCCACCGCATGGCATGGGATATGATGATGAACTGGTCCCCTACAGCGGCGTTGGTAGTAGCTCAACTGCTCCGGATCCCACAAGCCATCTTGGACATGATCGCTGGCGCTCACTGGGGAGTCCTAGCGGGCGTAGCGTATTTCTCCATGGTGGGGAACTGGGCGAAGGTCCTGGTAGTGTTGCTGCTATTTGCCGGCGTCGATGCGCAAACCCATATCACCGGGGGAAGTACCGCCCATGCCGCGGCCGGACTTGCTAATCTCTTCAGCATGGGCCCCAAGCAGGACATCCGGCTGATCAACACCAACGGCAGTTGGCACATCAATCGCACGGCCTTGAACTGCAATGAGAGCCTTAACACCGGCTGGGTAGCAGGGCTTTTGTATTACAACAAGTTCAACTCTTCAGGCTGTTCCGAGAGGTTGGCCAGTTGCCGCCCTCTTACCGATTTTGCCCAGGGCTGGGGCCCTATCAGTTATGCCAATGGAAGCGGTCCCGACCAACGCCCCTACTGCTGGCACTACCCCCCAAGACCGTGTGGTATCGTGCCCGCGAAGAGCGTGTGTGGCCCAGTATATTGCTTCACTCCCAGCCCCGTGGTGGTGGGAACGACCGACAGGTCGGGCGCGCCAACCTACAGCTGGGGTGAAAATGAAACGGACGTCTTCATCCTTAACAACACCAGGCCACCGCTGGGCAATTGGTTCGGTTGTACCTGGATGAACTCATCTGGGTTCACCAAAGTATGTGGAGCACCCCCTTGTGTCATCGGGGGGGTGGGCAATAACACCCTGCGCTGCCCCACTGATTGTTTCCGCAAGCATCCGGAAGCCACATACTCTCGGTGTGGCTCCGGCCCTTGGATTACACCCAGGTGCTTGGTCAACTATCCGTATAGACTCTGGCATTATCCTTGTACCATCAACTACACCATATTTAAAGTCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCACAGGCTGGAAGCTGCTTGCAACTGGACGCGGGGCGAACGTTGTGATCTAGAAGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGTTGCTGCTGTCCACCACACAGTGGCAGGTCCTCCCGTGTTCCTTCACGACCCTGCCAGCCTTGTCCACCGGCCTCATCCACCTCCACCAGAACATCGTGGACGTGCAGTACTTGTACGGGGTGGGGTCAAGCATCGCGTCCTGGGCCATTAAGTGGGATTACGTCGTTCTCCTGTTCCTTCTGCTTGCAGACGCGCGCGTCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGTTACTCATATCCCAAGCGGAGGCGGCACTGGAGAACCTCGTAGTACTCAATGCAGCATCCTTGGCCGGGACACATGGTCTAGTACCCTTCCTCGTGTTCTTCTGCTTTGCATGGTATCTGAAGGGTAAGTGGGCACCCGGAGCTGTCTACGCCTTCTACGGGATGTGGCCTTTCCTCCTGCTCCTGCTGGCGCTGCCCCACCGGGCATACGCACTGGACACGGAGGTGGCCGCGTCGTGTGGCGGCGTTATTCTTGCCGGGTTAATGGCGCTGACTCTGTCACCATATTACAAGCGCTATATCAGCTGGTGCTTGTGGTGGCTTCAGTATTTTCTGACCAGAGTAGAAGCGCAACTGCACGAGTGGGTTCCCCCCCTCGACGTCCGAGGGGGGCGCGACGCTGTCATCTTACTCATGTGTGTTGTACACTCGACCCTGGTATTTGACATCACCAAACTACTGCTGGCCGTCCTCGGACCCCTTTGGGTTCTTCAAGCCAGTTTGCTTAAAGTACCCTACTTTGTGCGCGTTCAGGGCCTTCTCCGGATCTGCGCGCTAGCGCGGAAGATGGCCGGAGGCCATTACGTGCAAATGGCCATCATCAAGTTAGGGGCGCTTACTGGCACCTATGTTTATAACCATCTCACTCCTCTTCGGGACTGGGCGCACAACGGCCTGCGAGATCTGGCCGTGGCTGTGGAGCCAGTTGTTTTCTCCACAATGGAGACCAAGCTCATCACGTGGGGGGCAGACACCGCCGCCTGCGGGGACATCATCAACGGCTTGCCCGTCTCCGCCCGTAGAGGCCGGGAGATACTGCTCGGACCGGCCGATGGAATGGTCTCCAAGGGGTGGAGGTTGCTGGCGCCCATCACGGCGTACGCCCAGCAGACAAGGGGCCTCCTAGGGTGCATAATCACCAGCTTGACTGGCCGGGACAAGAACCAAGTGGAGGGTGAGATCCAGATTGTGTCAACCGCTGCCCAAACATTCCTGGCGACGTGCATCAATGGGGTATGCTGGACTGTCTACCACGGGGCCGGAACGAGGACCATTGCATCACCCAAGGGTCCCGTTATCCAGATGTATACCAATGTGGACAAAGACCTTGTGGGCTGGCCTGCTCCCCAAGGTGCCCGCTCATTGACACCCTGCACCTGCGGCTCCTCGGACCTCTACCTGGTCACGAGGCACGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGCGGGGTGATAGCAGGGGCAGCCTGCTTTCGCCCCGGCCCATTTCCTACTTGAAAGGCTCCTCAGGGGGTCCGCTGTTGTGCCCCGCGGGACACGCCGTGGGCATATTTAGGGCCGCGGTGTGCACCCGTGGGGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATCCCTGTGGAGAACCTAGAGACAACTATGAGGTCCCCGGTGTTCACGGACAACTCTTCTCCACCAGCAGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCCCACCTGCATGCTCCCACCGGCAGCGGCAAGAGCACCAAGGTCCCGGCTGCTTATGCAGCTCAGGGCTACAAGGTGCTGGTGCTCAACCCCTCTGTTGCTGCAACACTGGGCTTTGGTGCCTACATGTCCAAGGCCCATGGGGTCGATCCTAATGTCAGGACCGGGGTGAGAACAATTACCACTGGCAGCCCCATCACGTACTCCACCTACGGCAAGTTCCTTGCCGACGGCGGGTGCTCAGGGGGTGCTTATGACATAATAATCTGTGACGAGTGCCACTCCACGGATGCCACATCCATCTTGGGCATCGGCACCGTCCTTGACCAAGCAGAGACTGCGGGGGCGAGACTGGTTGTGCTCGCCACCGCTACTCCTCCGGGCTCCGTCACCGTGCCCCATCCTAACATCGAGGAGGTTGCTTTGTCCACCACTGGAGAGATCCCTTTCTACGGCAAGGCCATCCCCCTCGAAGTAATCAAGGGGGGGAGACATCTCATCTTCTGTCACTCGAAGAAGAAGTGTGACGAGCTCGCCGCGAAGCTGGTCGCATTGGGCATCAATGCCGTGGCCTACTACCGCGGTCTTGACGTGTCCGTCATCCCGACCAGCGGCGACGTTGTCGTCGTAGCGACTGATGCTCTCATGACCGGCTTTACCGGAGACTTCGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACCCAGACAGTCGACTTCAGCCTTGACCCTACCTTCACCATTGAGACAACCACGCTCCCCCAGGATGCCGTCTCCCGCACTCAGCGTCGGGGTAGGACCGGCAGGGGGAAGCCAGGCATCTACAGATTTGTGGCACTAGGGGAGCGCCCTTCCGGCATGTTCGACTCGTCTGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCGGGCTGTGCTTGGTATGAGCTCACGCCCGCCGAGACTACAGTTAGGCTACGAGCGTACATGAACACCCCGGGGCTCCCCGTGTGCCAGGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTCTTTACGGGCCTCACTCATATAGATGCCCACTTCCTATCCCAGACAAAGCAGAGTGGGGAGAACCTTCCTTACCTGGTAGCGTACCAAGCCACCGTGTGCGCTAGGGCTCAAGCCCCTCCCCCATCGTGGGACCAGATGTGGAAGTGCTTGAACCGCCTCAAGCCCACCCTCCATGGGCCAACACCCCTGCTGTACAGACTGGGCGCTGTTCAGAATGAAGTCACCCTGACGCACCCAATCACCAAATACATCATGACATGCATGTCGGCCGACCTGGAGATCGTCACGAGCACCTGGGTGCTCGTTGGCGGCGTCCTGGCTGCTTTGGCTGCGTATTGCCTGTCAACAGGCTGCGTGGTCATAGTGGGCAGGATTGTCTTGTCCGGGAAGCCAGCAATTATACCTGACAGGGAAGTCCTCTACCGGGAGTTCGATGAGATGGAAGAGTGCTCTCAGCACTTACCGTACATCGAGCAAGGGATGGCGCTCGCTGAGCAGTTCAAGCAGAAGGCCCTCGGCCTCCTGCAGACCGCGTCCCGCCAGGCGGAGGTTATTACCCCTACTGTCCAGACCAACTGGCAAAAACTCGAGGCCTTCTGGGCGAAGCATATGTGGAACTTCATCAGTGGGATACAATACTTGGCTGGCCTATCAACGCTGCCTGGCAACCCCGCCATTGCCTCATTGATGGCTTTTACAGCTGCTGTCACTAGCCCACTAACCACTAGCCAAACCCTCCTCTTCAATATATTGGGGGGGTGGGTGGCCGCTCAGCTCGCTGCCCCTGGTGCCGCTACCGCCTTTGTGGGTGCCGGCTTAGCTGGCGCCGCCATCGGCGGTGTTGGACTGGGGAAGGTCCTCGTGGACATTCTTGCAGGATATGGCGCGGGCGTGGCGGGAGCTCTTGTAGCATTCAAGATCATGAGCGGTGAGGTCCCCTCCACGGAGGACCTGGTCAATCTACTGCCCGCCATCCTCTCTCCTGGAGCCCTTGTGGTCGGTGTGGTCTGCGCAGCGATACTGCGCAGGCACGTTGGCCCGGGCGAGGGGGCAGTGCAGTGGATGAACCGGCTGATAGCCTTCGCCTCCCGGGGGAACCATGTGTCCCCCACGCACTACGTGCCGGAGAGCGATGCAGCTACCCGCGTCACTGCCATACTCAGCAGCCTCACTGTAACCCAGCTCCTAAGGCGACTGCACCAGTGGATATCCTCGGAGTGCACCACTCCATGCTCCGGTTCCTGGCTAAGGGACGTCTGGGACTGGATATGCGAGGTGCTGAGCGACTTTAAGACCTGGCTAAAAGCCAAGCTCGTGCCACAACTCCCCGGGATTCCCTTCGTGTCCTGCCAACGCGGGTACAAGGGGGTCTGGCGAGGGGACGGCATCATGCACACTCGCTGCCACTGTGGAGCTGAGATCACTGGACATGTCAAAAACGGGACGATGAGGATCGTCGGTCCTAGGACCTGCAGGAACATGTGGAGTGGGACCTTTCCCATTAACGCCTACACCACGGGCCCCTGTACCCCCCTTCCTGCGCCGAACTATACGTTCGCGCTGTGGAGGGTGTCTGCAGAGGAGTACGTGGAGATAAGGCGGGTGGGAGACTTCCACTACATAACGGGTATGACTACTGACAATCTCAAATGCCCGTGCCAGGTCCCATCGCCTGAATTCTTCACAGAATTRGACGGGGTGCGCCTACATAGGTTTGCGCCCCCTTGCAAGCCCTTGCTGCGGGAGGAGGTATCATTCAGAGTGGGACTCCATGAGTACCCRGTGGGGTCGCAATTRCCTTGCGAGCCCGAACTGGACGTGGCCGTATTGACGTCCATGCTCACTGATCCCTCCCATATAACAGCAGAAGCGGCCGGGAGAAGGTTGGCGAGAGGATCACCCCCCTCTGAGGCCAGCTCCTCGGCTAGCCAGCTGTCCGCTCCATCTCTCAAGGCAACTTGCACCACCAACCATGACTCCCCTGACGCCGAGCTCATAGAAGCCAAYCTCCTATGGAGGCAGGAGATGGGCGGCAACATCACCAGGGTTGAGTCAGAGAACAAAGTGGTGATCCTGGACTCTTTCGATCCGCTTGTGGCGGAGGAGGACGAGCGGGAGATCTCCGTACCCGCAGAAATTCTGCGGAAGTCTCGGAGATTCGCCCCGGCCCTGCCCATATGGGCGCGGCCGGACTACAACCCCCCGCTAATAGAGACGTGGAAAAAGCCTGACTACGAACCACCTGTGGTCCATGGTTGCCCGCTTCCACCTCCACAGTCCCCTCCTGTGCCTCCGCCTCGGAAGAAGCGGACGGTGGTCCTCACCGAATCAACCTTACCTACTGCCTTGGCCGAACTTGCCACCAAAAGTTTTGGCAGCTCCTCAACTTCCGGCATTACGGGCGACAATACGACAACATCCTCTGAGTCCGCTCCTTCTGGCTGCTCCCCAGATTCCGACGCTGAGTCCTTTTCTTCCATGCCCCCCCTGGAGGGGGAGCCTGGGGATCCGGACCTCAGCGATGGGTCATGGTCGACGGTCAGCAGCGGGGCTGACGCGGAGGATGTCGTGTGCTGCTCAATGTCTTATTCCTGGACAGGTGCACTCGTCACCCCGTGCGCCGCAGAGGAACAAAAACTGCCCATCAACGCACTGAGCAACTCGTTGCTACGTCACCACAATCTGGTGTATTCCACCACCTCACGCAGTGCTTGCCAAAGGCAGAAGAAAGTCACATTTGACAGACAGCAAGTTCTGGACAGCCATTACCAGGACGTGCTCAAGGAGGTTAAGGCAGCGGCGTCAAAAGTGAAGGCTAACTTGCTATCCGTAGAGGAAGCTTGCAGCCTGACGCCCCCACACTCAGCCAGATCTAAGTTTGGCTATGGGGCAAAAGACGTCCGTTGCCATGCCAGAAAGGCCGTAAACCACATCAACTCCGTGTGGAAAGACCTTCTGGAAGACAGTGTAACACCAATAGATACTACCATCATGGCTAAGAACGAGGTTTTCTGCGTTCAGCCTGAGAAGGGGGGTCGTAAGCCAGCTCGTCTCATCGTGTTCCCCGACCTGGGYGTGCGCGTGTGTGAGAAGATGGCCCTGTACGACGTGGTTAGCAAGCTCCCTGTAGCCGTGATGGGAAGCTCCTACGGATTCCAATACTCACCAGGACAGCGGGTTGAATTCCTCGTGCAAGCGTGGAAGTCCAAGAAAACCCCAATGGGGTTCTCGTATGATACCCGCTGCTTTGACTCCACAGTCACTGAGAATGACATCCGTACGGAGGAGGCAATTTACCAATGTTGTGACCTGGACCCCCAAGCCCGTGTGGCCATCAAGTCTCTCACTGAGAGACTTTATGTTGGGGGCCCTCTTACCAATTCAAGGGGGGAGAACTGCGGCTACCGCAGATGCCGCGCGAGCGGCGTACTGACGACTAGCTGTGGTAACACCCTCACATGCTACATCAAGGCCCGGGCAGCCTGTCGAGCCGCAGGGCTCCAGGACTGCACCATGCTCGTGTGCGGCGACGACTTAGTCGTTATCTGTGAAAGTGCGGGGGTTCAGGAGGACGCGGCGAGCCTGAGAGCCTTCACGGAGGCTATGACCAGGTACTCTGCCCCCCCCGGGGATCCCCCACAACCAGAATACGACTTGGAGCTCATAACGTCATGCTCCTCCAACGTGTCGGTCGCCCACGACGGCGCTGGAAGAAGGGTCTACTACCTTACCCGTGACCCTACAACCCCCCTCGCGAGAGCCGCGTGGGAGACAGCAAGACACACTCCAGTCAATTCCTGGCTAGGCAACATAATTATGTTTGCCCCCACATTGTGGGCGAGGATGATACTGATGACCCATTTCTTTAGCGTCCTCATAGCCAGGGATCAGCTTGAACAGGCCCTTGATTGCGAGATCTACGGAGCCTGCTACTCCATAGAACCACTGGACCTACCTCCAATCATTCAAAGACTCCATGGCCTTAGCGCATTTTCACTCCATAGTTACTCTCCAGGTGAAATCAATAGGGTGGCCGCATGCCTCAGAAAACTTGGGGTCCCGCCCTTGCGAGCTTGGAGACACCGGGCCCGAAGTGTCCGCGCTAGGCTTCTGTCCAGAGGAGGCAGGGCTGCCATCTGTGGCAAGTACCTCTTCAACTGGGCAGTAAGGACAAAGCTCAAACTCACTCCAATAGCGGCCGCTGGCCAGCTGGACTTGTCCGGCTGGTTCACGGCTGGTTACAGCGGGGGAGACATTTATCACAGCGTGTCTCATGCCCGGCCCCGCTGGTTCTGGTTTTGCCTACTCCTGCTCGCTGCAGGGGTAGGCATCTACCTCTTCCCCAACCGCTGAAGGTTGGGGTAAACACTCCGGCCT
| 102,956
|
EU781747.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Timm,J., Li,B., Daniels,M.G., Bhattacharya,T., Reyor,L.L., Allgaier,R., Kuntzen,T., Fischer,W., Nolan,B.E., Duncan,J., Schulze zur Wiesch,J., Kim,A.Y., Frahm,N., Brander,C., Chung,R.T., Lauer,G.M., Korber,B.T., Allen,T.M., Berical,A., Lennon,N., Berlin,A.M., Young,S.K., Lee,B., Heckerman,D., Carlson,J., Kleyman,M., McMahon,C.M., Birch,C., Schulze Zur Wiesch,J., Ledlie,T., Koehrsen,M., Kodira,C., Roberts,A.D., Rosen,H.R., Bihl,F., Cerny,A., Spengler,U., Liu,Z., Xing,Y., Schneidewind,A., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Galagan,J.E., Nusbaum,C., Walker,B.D., Lake-Bakaar,G.V., Daar,E.S., Jacobson,I.M., Gomperts,E.D., Edlin,B.R., Donfield,S.M., Talal,A.H., Marion,T., Birren,B.W., Henn,M.R., Fischer,W.F., Riely,C.A.
|
Massachusetts General Hospital, Partners AIDS Research Center
|
USA
|
2009-05-31
|
00Z
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,374
|
GenBank
| 2
|
USA: Massachusetts, Boston area
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Hepatitis C virus subtype 1a isolate 00Z, complete genome
|
AAGTATCACTCCCCTGTGAGGAACTACTGTCTTCACGCAGAAAGCGTCTAGCCATGGCGTTAGTATGAGTGTCGTGCAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATCAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCTAGATTGGGTGTGCGCGCGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCACGTCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTATGGCAATGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCCTGTCTCCCCGTGGCTCTCGGCCTAGCTGGGGCCCCACAGACCCCCGGCGTAGGTCGCGCAATTTGGGTAAGGTCATCGATACCCTTACGTGCGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATACCGCTCGTCGGCGCCCCTCTTGGAGGCGCTGCCAGGGCCCTGGCGCATGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAACTATGCAACAGGGAATCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTTCTAGCCCTGCTCTCTTGTCTGACTGTGCCCGCTTCAGCCTACCAAGTGCGCAACTCCACGGGGCTTTACCATGTCACCAATGATTGCCCTAACTCGAGTATTGTGTACGAGGCGGCTGATGCCATCCTGCACACTCCGGGGTGCGTCCCTTGCGTTCGCGAGGGTAACATCTCGAGGTGCTGGGTGGCGGTGACCCCCACGGTAGCCACCAAGGACGGCAACCTCCCCGCAGCGCAGCTTCGACGTCACATCGATCTGCTTGTCGGGAGCGCCACCCTTTGTTCGGCCCTCTACGTGGGGGACCTGTGCGGGTCTGTCTTCCTTGTCGGTCAGCTGTTTACCTTCTCTCCCAGGCGCCACTGGACGACGCAGGGCTGCAATTGCTCCATCTACCCCGGCCATATAACGGGTCACCGCATGGCATGGGATATGATGATGAACTGGTCCCCTACGACGGCGTTGGTAGTGGCTCAGCTGCTCCGGATCCCACAAGCCATCTTGGACATGATCGCTGGCGCTCACTGGGGAGTCCTGGCGGGCATAGCGTATTTCTCCATGGTGGGGAACTGGGCGAAGGTCCTGGTAGTGCTGCTGCTATTTGCCGGCGTCGACGCGGAAACCCACGTCACCGGGGGAAGTGCCGCCCGCGCTGCGTACGGAATTTCATCTTTCCTCTCACCAGGCGCCAAGCAGAACATCCAGCTGATCAACACCAACGGCAGCTGGCACATCAACCGCACGGCCTTGAACTGCAATGAAAGCCTTACCACCGGCTGGTTAGCAGGGCTTTTCTATCACCACAAATTCAACTCTTCAGGCTGTCCTGAGAGGTTGGCCAGCTGCAAACCCCTTACCTATTTTGCCCAGGGCTGGGGCCCCATTAGTTATGCCAACGGAAGCGGCCCCGACCAACGGCCTTACTGCTGGCACTACCCCCCACGACCTTGCGGTATTGTGCCCGCAAAGAATGTGTGTGGCCCGGTATATTGCTTCACTCCCAGCCCCGTGGTGGTGGGAACGACCGACAGGTCGGGCGCGCCTACCTACAGCTGGGGTGAAAATGAGACGGACGTCTTCGTCCTTAACAACACCAGGCCGCCGCTGGGCAATTGGTTCGGTTGTACCTGGATGAACTCAACTGGATTCACCAAAGTGTGCGGAGCGCCTCCTTGTGTCATCGGAGGGGTGGGCAACCAAACCCTGCACTGCCCCACTGATTGCTTCCGCAAACACCCGGAAGCCACATACTCTCGGTGCGGCTCCGGTCCCTGGATCACACCCAGGTGCCTGGTCGACTACCCGTATAGGCTTTGGCACTACCCTTGTACCGTCAACTACACCATATTCAAAGTCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCACAGGCTGGACGCTGCCTGCAACTGGACACGGGGTGAACGTTGTGATCTGGAAGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGTTACTGCTGTCCACCACGCAATGGCAGGTTCTTCCGTGTTCCTTCACGACTCTGCCAGCCTTGTCCACCGGCCTCATCCACCTCCACCAGAACATTGTGGACGTACAGTACCTGTACGGGGTGGGGTCCAGCATCGCGTCCTGGGCCATTAAGTGGGAGTATGTTGTTCTCCTGTTCCTCCTGCTCGCAGACGCGCGCGTCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGCTACTCATATCCCAAGCGGAGGCGGCTTTGGAGAACCTTGTAACACTCAATGCAGCATCCCTGGCCGGGACGCACGGTCTTGTATCCTTCCTCGTGTTCTTCTGCTTTGCATGGTATCTGAAGGGTAGGTGGGCGCCCGGAGCGGTCTACGCCCTCTACGGGATGTGGCCTCTTCTCCTGCTCCTGTTGGCGTTGCCCCAGCGGGCATACGCGATGGACACGGAGGTGGCCGCGTCGTGTGGTGGCGTTGTTCTTGTCGGGTTAATGGCGCTGACTCTGTCACCATACTACAAGCGCTATATCAGCTGGTGCTTATGGTGGCTTCAGTATTTTCTGACCAGAGTAGAAGCGCAACTGCACGTGTGGGTTCCCCCCCTCAACGTTCGAGGGGGGCGTGACGCCGTCATCTTACTCATGTGTGTTGTACACCCGGCTCTGATATTCGACATCACCAAACTGCTGCTGGCCGTCTTCGGACCCCTTTGGATTCTTCAAGCCAGTCTGCTTAAAGTACCCTACTTTGTGCGCGTCCAAGGCCTTCTCCGGTTCTGCGCGCTAGCGCGGAAGATGGTCGGAGGCCATTACGTGCAAATGGCCATCATCAAGTTAGGGGCGCTTACTGGCACCTATGTTTATAACCATCTCACTCCTCTTCGGGACTGGGCGCACAACGGCCTGCGAGATCTGGCCGTGGCTGTAGAGCCAGTCACCTTTTCCCGAATGGAGACCAAGCTCATCACATGGGGGGCAGATACCGCCGCCTGCGGTGACATCATCAACGGCTTGCCTGTCTCCGCCCGCAGGGGCCGGGAGATACTGCTTGGACCAGCCGATGGAATGGTCTCCAAGGGGTGGAGGTTGCTGGCGCCCATCACGGCGTACGCTCAGCAGACAAGGGGCCTCCTAGGGTGTATAATCACCAGCCTAACTGGCCGGGACAAAAACCAAGTGGAGGGTGAGGTCCAGATTGTGTCAACTGCTGCCCAAACATTCCTGGCAACGTGCATCAATGGGGTGTGCTGGACTGTCTACCACGGGGCCGGAACGAGGACCATCGCATCACCCAAGGGTCCTGTTATCCAGATGTACACCAATGTGGACAAAGACCTCGTGGGCTGGCCCGCTCCTCAAGGTGCTCGCTCACTGACACCCTGCACCTGCGGCTCCTCGGACCTTTACCTGGTCACGAGGCACGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGCAAGGTGATAGCAGGGGCAGCCTGCTGTCGCCCAGGCCCATTTCCTACTTGAAAGGCTCCTCGGGGGGCCCGCTGCTGTGCCCCGCGGGACACGCCGTAGGCATATTCAGAGCCGCGGTGTGCACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATCCCTGTGGAGAACCTAGAGACTACCATGAGGTCCCCGGTGTTCACGGACAACTCCTCTCCGCCAGCCGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCTCACCTGCATGCTCCCACAGGCAGCGGTAAGAGCACCAAGGTCCCGGCTGCGTATGCAGCTCAGGGCTATAAAGTGCTGGTACTCAACCCCTCCGTTGCTGCAACACTGGGCTTTGGTGCTTACATGTCCAAGGCTCATGGGATCGATCCTAACATCAGGACCGGGGTGAGAACAATTACCACTGGCAGCCCCATCACGTACTCCACCTACGGCAAGTTCCTTGCCGACGGCGGGTGCTCAGGGGGCGCTTATGACATAATAATTTGTGACGAGTGCCACTCCACGGATGCCACATCCATCTTGGGCATCGGCACTGTCCTTGACCAAGCAGAGACTGCGGGGGCGAGACTGGTTGTACTCGCCACCGCCACCCCTCCGGGCTCCATCACTGTGCCCCACTCTAACATCGAGGAGGTTGCTCTGTCCACCACCGGAGAGATCCCTTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTCGAAGTAATCAAGGGGGGGAGACATCTCATTTTCTGTCATTCAAAGAAAAAGTGCGACGACCTCGCCGCAAGACTGGTCGCACTGGGCATCAACGCCGTGGCTTACTACCGCGGTCTTGACGTGTCCGTCATCCCGACCAGCGGCGATGTTGTCGTCGTGGCAACTGATGCTCTCATGACTGGCTTTACCGGCGATTTCGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACCCAGACAGTCGATTTCAGCCTTGACCCTACCTTCACCATTGAGACAACCACGCTCCCCCAGGATGCTGTCTCCCGCACTCAACGTCGGGGCAGGACTGGCAGGGGGAAGCCAGGCATCTACAGATTTGTGGCACCGGGGGAGCGCCCCTCTGGTATGTTCGACTCGTCCGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCGGGCTGTGCTTGGTATGAGCTCACGCCCGCCGAGACCACAGTTAGGCTACGAGCGTACATGAACACCCCGGGGCTCCCTGTGTGCCAGGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTCTTTACAGGCCTCACTCATATAGATGCCCACTTCCTATCCCAGACAAAGCAGAGTGGGGAAAACCTTCCTTACCTGGTAGCGTACCAAGCCACCGTGTGCGCTAGGGCTCAAGCCCCTCCCCCATCGTGGGACCAGATGTGGAAGTGTTTGATCCGCCTCAAGCCCACCCTCCATGGGCCAACACCCCTGCTATACAGACTGGGAGCTGTTCAGAATGAAGTCACCCTGACGCACCCAGTCACCAAATACATCATGACATGCATGGCGGCCGACCTGGAGGTCGTCACGAGCACCTGGGTGCTCGTTGGCGGCGTCCTGGCTGCTTTGGCCGCATACTGCCTGTCAACAGGCTGCGTGGTCATAGTGGGCAGGGTTGTCTTGTCCGGGAAGCCGGCAATCATACCTGACAGGGAAGTCCTTTACCGAGAGTTCGATGAGATGGAAGAGTGCTCTCAGCACTTACCGTACATCGAGCAAGGGATGATGCTCGCCGAGCAGTTCAAGCAGAAGGCCCTCGGCCTCCTGCAGACCGCATCCCGTCAGGCAGAGGTTATCGCCCCTGCTGTCCAGACCAACTGGCAAAAACTCGAGGCCTTCTGGGCGAAGCATATGTGGAATTTCATCAGTGGGATACAATACTTGGCGGGCTTGTCAACGCTACCTGGTAACCCCGCCATTGCTTCATTGATGGCTTTTACAGCTGCTGTCACCAGCCCACTAACCACTAGCCAAACCCTCCTCTTCAACATATTGGGGGGGTGGGTGGCTGCCCAGCTCGCCGCCCCCGGTGCCGCTACTGCCTTTGTGGGCGCTGGCTTAGCTGGCGCCGCCATCGGCAGTGTTGGACTGGGGAAGGTCCTCATAGACATTCTTGCAGGGTATGGCGCGGGCGTGGCGGGGGCTCTCGTGGCATTCAAGATCATGAGCGGTGAGGTCCCCTCCACGGAAGACCTGGTCAATCTACTGCCCGCCATCCTCTCGCCTGGGGCCCTTGTGGTCGGTGTGGTCTGTGCAGCGATACTGCGCAGGCACGTTGGCCCGGGCGAGGGGGCAGTGCAATGGATGAACCGGCTAATAGCCTTCGCCTCCCGGGGGAACCATGTTTCCCCCACGCACTACGTGCCGGAGAGCGACGCAGCTGCCCGCGTCACTACCATACTCAGCAGCCTCACTGTAACCCAGCTCCTGAGGCGACTGCACCAGTGGATAAGCTCGGAGTGCACCACCCCATGCTCCGGTTCCTGGTTAAGGGACATCTGGGATTGGATATGCGAGGTGCTGAGCGACTTTAAGACCTGGCTAAAAGCCAAGCTCATGCCACAGCTGCCAGGGATCCCCTTTGTGTCCTGCCAGCGCGGGTATAAGGGGGTCTGGCGAGGGGACGGCATCATGCACACTCGCTGCCACTGTGGAGCTGAGATCACTGGACATGTCAAAAACGGGACGATGAGGATCGTCGGTCCTAGGACCTGCAGGAACATGTGGAATGGGACCTTCCCCATCAACGCCTACACCACGGGCCCCTGTACCCCCCTTCCTGCACCGAACTACACGTTCGCGCTGTGGAGGGTGTCTGCAGAGGAATACGTGGAGATAAGGCAGGTGGGGGACTTCCACTACGTGACGGGTATGACTACTGACAATCTTAAGTGCCCGTGCCAGGTCCCATCGCCCGAATTTTTCACAGAATTGGACGGGGTGCGCCTACATAGGTTTGCGCCCCCCTGCAAGCCCTTGCTGCGGGAGGAGGTATCATTCAGAGTAGGACTCCACGAGTACCCGGTGGGGTCGCAACTACCTTGCGAGCCCGAACCGGACGTGGCCGTGTTGACGTCCATGCTCACTGATCCCTCCCATATAACAGCAGAGGCAGCCGGGAGAAGGTTGGCGAGGGGATCACCCCCTTCTGAGGCCAGCTCCTCGGCTAGCCAGCTGTCTGCTCCATCTCTCAAGGCAACTTGCACCGCCAACCATGACTCCCCTGACGCCGAGCTCATAGAGGCCAACCTCCTGTGGAGGCAGGAGATGGGCGGCAACATCACCAGGGTTGAGTCAGAAAACAAAGTGGTGGTTCTGGACTCCTTTGATCCGCTTGTGGCGGAGGAGGACGAGCGGGAGATCTCCGTACCCGCGGAAATCCTGCGGAAGTCTCGGAGATTCACCCCGGCCCTGCCCATTTGGGCGCGGCCGGACTATAACCCCCCGCTAATAGAGGTGTGGAAAAAGCCTGACTACGAACCACCTGTGGTCCATGGCTGTCCGCTTCCACCTCCAAAGTCCCCTCCTGTGCCTCCGCCCCGGAAGAAGCGGACGGTGGTCCTCACCGAATCAACCCTATCTACTGCCTTGGCCGAGCTTGCCACCAAAAGTTTTGGCGGCTCCTCAACTTCCGGCGTAACGGGCGACAATACAACAACATCCTCTGAGCCCGCCCCCTCTGGCTGCCCCCCCGACTCCGACGCTGAGTCCTATTCCTCCATGCCCCCCCTGGAGGGGGAGCCTGGGGATCCGGATCTTAGCGACGGGTCATGGTCGACGGTCAGTAGTGAGGCCGGCACGGAGGATGTCGTGTGCTGCTCAATGTCTTACTCTTGGACAGGCGCACTCATCACCCCGTGCGCCGCGGAGGAACAGAAACTGCCCATCAACGCACTGAGCAACTCGTTGCTGCGTCACCACAATTTGGTGTATTCCACCACCTCACGCAGTGCTTGCCTTAGGCAGAAGAAAGTCACATTTGACAGACTGCAAGTTCTGGACAGCCATTACCAGGACGTGCTCAAGGAGGTTAAGGCAGCGGCGTCAAAAGTGAAGGCTAACTTGCTATCCGTAGAGGAAGCTTGCAGCCTGACGCCCCCACACTCAGCCAGATCCAAGTTTGGCTATGGGGCAAAAGACGTCCGTTGCCACGCCAGAAAGGCCGTAACCCACATCAACTCCGTGTGGAAAGACCTTCTGGAAGACAGTGTAACACCAATAGACACTACCATCATGGCTAAGAACGAGGTTTTCTGCGTTCAGCCTGAGAAGGGGGGTCGTAAGCCAGCTCGTCTCATCGTGTTCCCCGACCTGGGTGTGCGCGTGTGCGAGAAGATGGCCCTATACGACGTGGTTTCCAAGCTCCCCTTGGCCGTGATGGGAAGCTCTTACGGATTTCAGTACTCACCAGGACAGCGGGTTGAGTTCCTCGTGCAAGCGTGGAAATCAAAAAAGAACCCAATGGGGTTCTCGTATGACACCCGCTGCTTTGACTCCACAGTCACTGAGAACGATATCCGTACTGAGGAGGCAATCTACCAATGTTGTGACCTGGACCCCCAAGCCCGCGTGGCCATCAAGTCCCTCACCGAGAGGCTTTATGTTGGGGGCCCTCTTACCAATTCAAGGGGGGAGAACTGCGGCTACCGCAGGTGCCGCGCGAGCGGCGTACTGACAACTAGCTGTGGTAACACCCTCACTTGCTACATCAAGGCCCAAGCAGCCTGTCGAGCCGCAGGGCTCCAGGACTGCACCATGCTCGTGTGCGGCGATGACTTAGTCGTTATCTGTGAAAGTGCGGGGGTCCAGGAGGACGCGGCGAGCCTGAGAGCCTTCACGGAGGCTATGACCAGGTACTCCGCCCCCCCCGGGGACCCCCCACAACCAGAATACGACTTGGAGCTCATAACATCATGCTCCTCCAACGTGTCAGTCGCCCACGATGGCACTGGAAAGAGGGTCTACTACCTCACCCGTGACCCTACAACTCCCCTCGCGCGAGCCGCGTGGGAGACAGCAAGACACACTCCAGTCAATTCCTGGCTAGGCAACATAATCATGTTTGCCCCCACGCTGTGGGCGAGGATGATACTGATGACCCATTTCTTTAGCGTCCTCATAGCCAGGGATCAGCTTGAACAGGCCCTTGATTGCGAGATCTACGGAGCCTGCTACTCCATAGAACCACTGGATCTACCTCCAATCATTCAAAGACTCCATGGCCTTAGCGCATTCTCACTCCACAGTTACTCTCCAGGTGAAATCAATAGGGTGGCCGCATGCCTCAGAAAACTTGGGGTACCGCCCTTGCGAGCTTGGAGACACCGGGCCCGGAGCGTCCGCGCTAAGCTTCTGTCCAGAGGAGGCAGGGCTGCCATATGTGGCAAGTACCTCTTCAACTGGGCAGTAAGAACAAAGCTCAAACTCACTCCAATAGCGGCCGCTGGCCAGCTGGACTTGTCCGGCTGGTTCACGGCTGGCTACAGCGGGGGAGACATTTATCACAGCGTGTCTCATGCCCGGCCCCGCTGGTTCTGGTTTTGCCTACTCCTGCTTGCTGCAGGAGTAGGCATCTACCTCCTCCCCAACCGATGAAGGTTGGGGTAAACACTCCGGCCTCTTA
| 102,957
|
EU781748.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Timm,J., Li,B., Daniels,M.G., Bhattacharya,T., Reyor,L.L., Allgaier,R., Kuntzen,T., Fischer,W., Nolan,B.E., Duncan,J., Schulze zur Wiesch,J., Kim,A.Y., Frahm,N., Brander,C., Chung,R.T., Lauer,G.M., Korber,B.T., Allen,T.M., Berical,A., Lennon,N., Berlin,A.M., Young,S.K., Lee,B., Heckerman,D., Carlson,J., Kleyman,M., McMahon,C.M., Birch,C., Schulze Zur Wiesch,J., Ledlie,T., Koehrsen,M., Kodira,C., Roberts,A.D., Rosen,H.R., Bihl,F., Cerny,A., Spengler,U., Liu,Z., Xing,Y., Schneidewind,A., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Galagan,J.E., Nusbaum,C., Walker,B.D., Lake-Bakaar,G.V., Daar,E.S., Jacobson,I.M., Gomperts,E.D., Edlin,B.R., Donfield,S.M., Talal,A.H., Marion,T., Birren,B.W., Henn,M.R., Fischer,W.F., Riely,C.A.
|
Massachusetts General Hospital, Partners AIDS Research Center
|
USA
|
2009-05-31
|
00R
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,369
|
GenBank
| 2
|
USA: Massachusetts, Boston area
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Hepatitis C virus subtype 1a isolate 00R, complete genome
|
TGTGAGGAACTACTGTCTTCACGCAGAAAGCGTCTAGCCATGGCGTTAGTATGAGTGTCGTGCAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATAAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCTAGATTGGGTGTGCGCGCGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGAGGCAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCACGTCGGTCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTATGGTAACGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCCTGTCTCCCCGTGGCTCTCGGCCTAACTGGGGCCCCACAGACCCCCGGCGTAGGTCGCGCAATCTGGGTAAGGTCATCGATACCCTTACGTGTGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATACCGCTCGTCGGCGCTCCTCTCGGAGGCGTTGCCAGGGCCCTGGCGCACGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAACTACGCAACAGGGAATCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTCCTGGCTCTGCTTTCTTGCCTGACTGTGCCTGCTTCAGCTTACCAAGTGCGCAACTCCACAGGGCTTTACCACGTCACCAATGATTGCCCTAACTCGAGTATTGTGTACGAGACGACCGATGCCATCCTACACGCTCCAGGGTGCGTCCCTTGCGTCCGCGAGGGTAACGCCTCGAGGTGTTGGGTGGCGATGACCCCCACGGTGGCCACCAGGGATGGTAAACTCCCCACAACGCAGCTTCGACGTCACATCGATCTGCTTGTCGGGAGCGCCACCCTATGCTCGGCCCTCTACGTGGGGGACTTGTGCGGGTCTGTCTTTCTTGTCGGTCAGCTGTTTACCTTCTCTCCTAGGCACCATTGGACGACGCAAGACTGCAATTGTTCTATGTATCCCGGCCATATAACGGGCCACCGCATGGCATGGGACATGATGATGAACTGGTCCCCTACGACGGCATTGGTAGTGGCTCAGCTGCTCCGGATCCCACAAGCCATCGTGGATATGATCGCTGGTGCCCACTGGGGAGTCCTAGCGGGCATAGCGTATTTCTCCATGGTGGGGAACTGGGCGAAGGTCCTGGTAGTGCTGCTGCTATTCGCCGGCGTTGACGCGGAAACCCACGTCACCGGGGGAGTAACCGGTTCCGTCACGTCGAAGCTTGTTGGTTTCCTCGCACATGGCCCCAGGCAGAACATCCAGCTTATCAACTCCAATGGTAGTTGGCACATCAATAGCACGGCCCTGAACTGCAACGACAGCCTTCAGACCGGCTGGATAGCGGGGCTCCTTTACCGCTACAGATTCAACTCTTCAGGCTGCCCCGAGAGAATGGCCAGCTGTCGACCCCTTACCTATTTTGCCCAGGGCTGGGGTCCTATCGGGCATGCCAATGGAAGCGGCCCCGACCACCGCCCCTACTGCTGGCACTATCCTCCAAAACCCTGTGGCATTGTGTCTGCACGAACTGTTTGTGGCCCGGTATATTGTTTCACTCCCAGCCCCGTAGTAGTGGGAACGACCGACAGGTCGGGCGTCCCTACCTACAACTGGGGGGAGAACGATACGGACGTCTTCCTCCTTAACAACACCAGGCCACCGCTGGGCAATTGGTTCGGTTGCACCTGGATGAACTCAACTGGATACACCAAAGTGTGCGGAGCGCCCCCTTGTACCATCGGAGGGGTGGGCAACAACACCTTGCACTGCCCCACTGATTGCTTCCGCAAGCATCCGGAAGCCACATACTCTCGGTGCGGCTCCGGTCCCTGGATTACACCCAGGTGCCTGGTCGACTATCCTTACAGACTTTGGCACTATCCTTGTACCATCAACTACACCATATTCAAAGTCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCATAGGCTGGATGCTGCTTGCAACTGGACGCGGGGCGAACGCTGCGACCTGTCCGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGCTGCTGCTGTCCACCACGCAGTGGCAGGTCCTTCCGTGTTCGTTTACAACCCTGCCAGCCCTGTCCACCGGCCTCATCCATCTCCACCAGAATATCGTGGACGTGCAGTACTTGTACGGGGTGGGGTCAAGCATCGCGTCCTGGGCCATCAAGTGGGATTACGTCGTCCTCCTGTTCCTTCTGCTTGCGGACGCGCGCGTCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGTTACTCATATCCCAAGCAGAGGCGGCTTTGGAGAACCTCGTGGTACTCAATGCAGCATCTTTGGCCGGGACGCACGGTCTTGTATCCTTCCTTGTGTTCTTCTGCTTTGCATGGTATCTAAAGGGCAGGTGGGTGCCCGGAGCGGCCTACGCCATCTACGGAATGTGGCCTCTCCTCCTGCTCCTCTTGGCGTTGCCCCAGCGGGCGTACGCGCTGGACACAGAGGTGGCCGCGTCATGTGGTGGCGTTGTTCTTGTCGGGTTAATGGCGCTGACTCTGTCACCATATTACAAGCACTATATCAGCTGGTGCGTGTGGTGGCTTCAGTATTTTCTGACTAGAGCAGAAGCGCAACTGCACGTGTGGGTCCCCCCCCTTAACATCCGGGGGGGGCGTGACGCCGTCATCCTACTCATGTGTGTTGTACACCCAGCCTTGGTGTTCGACGCCACCAAACTGCTGCTGGCCATCTTCGGACCCCTTTGGATTCTCCAAGCCAGTTTGCTTAGAGCACCCTACTTTGTGCGCGTTCAAGGCCTTCTCCGGATCTGTGCGTTAGCGCGGAAGATGGTCGGAGGTCATTACGTGCAAATGGTCATTATCAAGTTAGGGGCGCTTACTGGCACCTATGTATATAACCATCTTACTCCTCTCAAGGACTGGGCGCACAACGGCCTGCGAGATCTGGCCGTGGCTGTGGAACCAGTCGTCTTCTCCCCGATGGAGACCAAGCTCATCACATGGGGGGCAGACACCGCCGCGTGCGGTGACATCATCAACGGCTTGCCCGTCTCCGCCCGCAAGGGCCGAGAGATACTGCTCGGGCCAGCCGACGGAATGGTCTCCAAGGGGTGGAGGTTGCTGGCGCCCATCACGGCGTACGCCCAGCAGACAAGAGGCCTTCTAGGGTGTATAATCACCAGCCTGACCGGCCGGGATAAAAACCAAGTGGAGGGCGAGATCCAGATTGTGTCAACTGCCACTCAGACCTTCCTGGCAACATGCATCAATGGGGTATGCTGGACTGTCTACCACGGGGCCGGGACGCGGACCATCGCATCACCCAAGGGTCCTGTTATCCAAATGTATACTAATGTAGACCAGGACCTCGTAGGCTGGCCCTCTCCTCAGGGTGCCCGTTCATTGACGCCTTGCACCTGCGGCTCCTCGGACCTTTACCTGGTCACGAGGCACGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGCGGGGTGATAGCAGGGGCAGCCTACTTTCGCCCCGACCCATTTCTTACTTGAAAGGCTCCTCGGGGGGTCCGTTGTTGTGCCCCGCGGGACACGCTGTAGGCATATTCAGGGCCGCGGTGTGTACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATTCCCGTGGAGAGCCTAGAAACAACTATGAGGTCCCCGGTGTTCACGGACAACTCCTCTCCACCAGCAGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCCCACCTGCATGCTCCCACCGGTAGCGGTAAGAGCACCAAGGTCCCGGCCGCATACGCGGCTCAGGGCTACAAAGTGCTGGTGCTCAACCCCTCTGTTGCTGCAACATTGGGTTTTGGCGCTTACATGTCCAAGGCTCATGGAATTGATCCTAACATCAGGACCGGGGTGAGAACAATTACCACTGGCAGCCCTATCACGTACTCCACCTATGGCAAATTCCTTGCCGACGGCGGGTGCTCAGGGGGTGCTTATGACATAATAATCTGTGACGAGTGCCATTCTACGGATGCCACATCCATCTTGGGCATCGGCACCGTCCTTGACCAAGCAGAGACTGCGGGGGCGAGGCTGGTTGTGCTCGCCACCGCCACCCCTCCGGGCTCCGTCACTGTGCCCCATTCCAACATTGAGGAGGTCGCTCTATCCACCACCGGAGAGATCCCTTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTTGAGGTAATCAAGGGGGGGAGACATCTCATCTTCTGTCACTCAAAGAAGAAGTGCGACGAGCTCGCCGCAAAGCTGGTCGCACTGGGCATTAATGCCGTGGCTTACTACCGCGGTCTTGACGTGTCCGTCATCCCGACCAGCGGTGATGTTGTCGTCGTGGCAACTGATGCTCTCATGACCGGCTATACCGGCGACTTCGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGCGTCACCCAAACAGTCGATTTCAGCCTTGACCCTACCTTTACCATTGAGACAACCACGCTTCCCCAGGATGCCGTCTCCCGCACTCAACGTCGGGGCAGGACCGGCAGGGGAAAGCCAGGTATCTACAGATTTGTGGCACCGGGGGAGCGCCCCTCCGGCATGTTCGACTCGTCCGTCCTCTGTGAGTGTTATGACGCAGGTTGTGCTTGGTATGAGCTCACGCCCGCCGAGACCACAGTTAGGTTACGAGCGTACATGAATACCCCGGGGCTTCCCGTGTGCCAGGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTCTTTACGGGTCTCACCCATATA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| 102,958
|
EU781749.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Timm,J., Li,B., Daniels,M.G., Bhattacharya,T., Reyor,L.L., Allgaier,R., Kuntzen,T., Fischer,W., Nolan,B.E., Duncan,J., Schulze zur Wiesch,J., Kim,A.Y., Frahm,N., Brander,C., Chung,R.T., Lauer,G.M., Korber,B.T., Allen,T.M., Berical,A., Lennon,N., Berlin,A.M., Young,S.K., Lee,B., Heckerman,D., Carlson,J., Kleyman,M., McMahon,C.M., Birch,C., Schulze Zur Wiesch,J., Ledlie,T., Koehrsen,M., Kodira,C., Roberts,A.D., Rosen,H.R., Bihl,F., Cerny,A., Spengler,U., Liu,Z., Xing,Y., Schneidewind,A., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Galagan,J.E., Nusbaum,C., Walker,B.D., Lake-Bakaar,G.V., Daar,E.S., Jacobson,I.M., Gomperts,E.D., Edlin,B.R., Donfield,S.M., Talal,A.H., Marion,T., Birren,B.W., Henn,M.R., Fischer,W.F., Riely,C.A.
|
Massachusetts General Hospital, Partners AIDS Research Center
|
USA
|
2009-05-31
|
00-21
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,332
|
GenBank
| 2
|
USA: Massachusetts, Boston area
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Hepatitis C virus subtype 1a isolate 00-21, complete genome
|
GTGAGGAACTACTGTCTTCACGCAGAAAGCGTCTAGCCATGGCGTTAGTATGAGTGTCGTGCAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATAAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCTAGATTGGGTGTGCGCGCGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCACGTCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTACGGCAATGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCCTGTCTCCCCGTGGCTCTCGGCCTAGCTGGGGCCCCACAGACCCCCGGCGTAGGTCGCGCAATTTGGGTAAGGTCATCGATACCCTTACGTGCGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATACCGCTCGTCGGCGCCCCTCTTGGAGGCGCTGCCAGGGCCCTGGCGCACGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAACTACGCAACAGGGAATCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTCCTGGCCCTGCTTTCTTGCCTGACTGTGCCTGCTTCAGCTTACCAAGTGCGCAACTCCACGGGGCTTTACCATGTCACCAATGATTGCCCTAACTCGAGTATTGTGTACGAGACGACCGATGCCATCCTACACGCTCCGGGGTGTGTCCCTTGCGTCCGCGAGGGTAACGTCTCGAGGTGTTGGGTGGCGATGACCCCCACGGTGGCCACCAGGGATGGCAAACTCCCCACAACGCAGCTTCGACGTCACATCGATCTGCTTGTCGGGAGCGCCACCCTATGCTCGGCCCTCTACGTGGGGGACCTGTGCGGGTCTGTCTTTCTTATTGGTCAGCTGTTCACCTTTTCTCCCAGGCACCATTGGACGACGCAAGACTGCAATTGTTCTATCTATCCCGGCCATATAACGGGTCACCGCATGGCATGGGACATGATGATGAACTGGTCCCCTACGACGGCACTGGTAGTGGCTCAACTGCTCCGGATCCCACAAGCCATCGTGGATATGATCGCTGGTGCTCACTGGGGAGTCCTAGCGGGCATAGCGTATTTCTCCATGGTGGGGAACTGGGCGAAGGTCCTGGTAGTGCTGCTGCTATTCGCCGGCGTCGACGCGACCACCTACCTCACCGGGGAAAATGTCGGTCGCACCTTGACGGGGCTTCAAAGCATCTTTGCTCCGGGCGCCCAGCAGCGCGTCCAGCTCATCAACTCCAATGGCAGTTGGCACATTAACAGGACGGCCTTGAACTGTAACACCAGCCTCGAGACCGGCTGGCTAGCAGGGCTCATCTACCAGTGGAAATTCAACTCTTCAGGCTGCCCTGAGAGACTGGCCAGCTGTCGACCCCTTACCGACTTTGCCCAGGGCTGGGGCCCCATCGGGCACGCCAATGGAAGCGGCCCCGACCATCGCCCCTACTGCTGGCACTACCCTCCAAAACCTTGTGGTATTGTGCCTGCACAAACCGTTTGTGGCCCGGTATATTGTTTCACTCCCAGCCCCGTGGCGGTGGGAACCACCGACAGGTCGGGCGTGCCTACCTACAGCTGGGGGGAGAATGATACGGACGTCTTCGTCCTTAACAACACCAGGCCACCGCTGGGCAATTGGTTCGGTTGCACCTGGATGAACTCAACTGGGTACACCAAAGTGTGCGGAGCACCCCCTTGTACCATCGGAGGGGTGGGCAACAACACCTTGCACTGCCCCACTGATTGCTTCCGCAAACATCCGGAAGCCACATACTCTCGGTGTGGCTCCGGTCCCTGGCTTACACCCAGGTGTCTGGTCGACTATCCTTATAGACTTTGGCACTACCCTTGTACCGTCAACTACACCGTGTTCAAAGTCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCATAGGCTGGATGCTGCCTGCAACTGGACACGGGGCGACCCTTGTGATCTGGCAGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGCTGCTGCTGTCCACCACACAGTGGCAGGTCCTTCCGTGTTCGTTCACGACCCTGCCAGCCTTGTCCACCGGCCTCATCCACCTCCACCAGAATATCGTGGATGTGCAGTACTTGTACGGGGTGGGGTCAAGCATTACGTCCTGGGCCATCAAGTGGGATTACGTTGTTCTCCTGTTTCTTCTGCTTGCGGACGCGCGCGTCTGCTCTTGCTTGTGGATGATGTTGCTCATATCCCAAGCAGAGGCGGCTTTGGAGAACCTCGTAGTACTCAATGCAGCATCTTTGGCCGGGACGCACGGTCTTGTCTCCTTCCTCGTGTTCTTCTGCTTTGCGTGGTATCTAAAGGGTAGGTGGGTGCCCGGAGCGGCCTACGCCTTCTACGGGATGTGGCCTCTCCTCCTGCTCCTTGTGGCGTTGCCCCAGCGGGCATACGCGCTGGACACGGAGGTGGCCGCGTCATGTGGCGGCGTTATTCTTGTCGGGTTAATGGCGCTGACTCTGTCACCATATTACAAGTGCTATATCAGCTGGTGCGTGTGGTGGCTTCAGTACTTCCTGACTAGAGCAGAAGCGCAACTGCACGTGTGGGTTCCCCCCCTCAACGTCCGAGGGGGGCGCGACGCCGTCATCCTACTCACGTGTGCTGTGCACCCGACCTTGGTATTCGACATCACCAAACTGCTGCTGGCCATCTTCGGACCCCTTTGGATTCTCCAAGCCAGTTTGCTCAAAGTACCCTACTTTGTGCGCGTTCAAGGCCTTCTCCGGATCTGTGCGTTAGCGCGGAAGATGGCCGGAGGCCATTACGTGCAAATGGTCATCATCAAGTTAGGGGCGCTTACTGGCACCTACATATATAACCATCTCACTCCTCTTACGGACTGGGCGCACAACGGCCTGCGAGATCTGGCCGTGGCTGTAGAGCCAGTTGTCTTCTCCCAAATGGAGACCAAGCTCATCACATGGGGGGCGGACACCGCCGCGTGCGGTGACATCATCAACGGCTTGCCCGTCTCCGCCCGCAGGGGCCGAGAGATACTGCTCGGACCAGCCGATGGGATGGTCTCCAAGGGGTGGAGGTTGCTGGCGCCCATCACGGCGTACGCCCAGCAAACAAGAGGCCTCCTAGGATGTATAATCACCAGCCTGACCGGCCGGGATAAAAACCAAGTGGAGGGCGAGGTCCAGATTGTGTCAACTGCTGCCCAGACCTTCTTGGCAACATGCATCAACGGGGTGTGCTGGACTGTTTACCACGGGGCCGGGACGAGGACCATCGCGTCACCCAAGGGTCCTGTTATTCAAATGTACACCAATGTAGACCAAGACCTCGTAGGTTGGCCCGCTCCTCAGGGTGCCCGTTCATTGACACCTTGCACCTGCGGCTCCTCGGACCTTTACCTGGTCACGAGGCATGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGCGGGGTGATAGCAGGGGCAGCTTACTTTCGCCCCGGCCCATTTCTTACTTGAAAGGCTCCTCGGGGGGTCCGCTGTTGTGCCCCGCGGGGCACGCCGTAGGCATATTCAGGGCCGCGGTGTGTACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGACTTCATCCCCGTAGAGAGCCTAGAGACAACCATGAGGTCCCCGGTGTTCACGGACAACTCCTCTCCACCAGCAGTACCCCAGAGCTTTCAGGTGGCCCACCTACATGCTCCCACCGGTAGCGGCAAGAGCACCAAGGTCCCGGCTGCATACGCGGCTCAGGGTTACAAGGTGCTGGTGCTCAACCCCTCTGTTGCTGCAACATTGGGTTTTGGTGCTTACATGTCCAAGGCTCATGGAATTGATCCTAACATCAGGACCGGGGTGAGAACAATTACCACTGGTAGCCCCATTACGTACTCCACCTACGGCAAGTTCCTTGCCGATGGCGGGTGCTCAGGGGGTGCCTATGACATAATAATTTGTGACGAGTGCCATTCCACGGATGCCACGTCCATCTTGGGCATCGGCACTGTCCTTGACCAAGCGGAGACTGCAGGGGCGAGGCTCGTTGTGCTCGCCACCGCCACCCCTCCGGGCTCCGTCACTGTGCCCCATCCTAACATTGAGGAGGTCGCTCTATCCACCACCGGAGAGATCCCTTTTTATGGCAAGGCTATCCCCCTTGAGGTAATCAAGGGGGGGAGACATCTCATCTTCTGTCATTCAAAGAAGAAGTGTGACGAGCTCGCCGCAAAGCTGGTCGCAATGGGCGTCAATGCCGTGGCCTACTATCGCGGTCTTGACGTGTCCGTCATCCCGACCAGTGGCGATGTTGTCGTCGTGGCAACTGATGCTCTCATGACCGGCTTTACTGGCGACTTCGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACCCAAACAGTCGATTTCAGCCTTGACCCTACCTTCACCATCGAGACAACCACGCTTCCCCAGGATGCCGTCTCCCGCACTCAACGTCGGGGTAGGACCGGCAGGGGAAAGCCAGGTATCTACAGATTTGTGGCACCAGGGGAGCGCCCCTCCGGCATGTTCGACTCGTCTGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCAGGTTGCGCTTGGTATGAGCTCACGCCCGCCGAGACCACAGTTAGGCTAAGAGCGTACATGAACACCCCGGGGCTTCCCGTGTGCCAGGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTCTTTACGGGTCTCACCCATATAG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| 102,959
|
EU781750.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Timm,J., Li,B., Daniels,M.G., Bhattacharya,T., Reyor,L.L., Allgaier,R., Kuntzen,T., Fischer,W., Nolan,B.E., Duncan,J., Schulze zur Wiesch,J., Kim,A.Y., Frahm,N., Brander,C., Chung,R.T., Lauer,G.M., Korber,B.T., Allen,T.M., Berical,A., Lennon,N., Berlin,A.M., Young,S.K., Lee,B., Heckerman,D., Carlson,J., Kleyman,M., McMahon,C.M., Birch,C., Schulze Zur Wiesch,J., Ledlie,T., Koehrsen,M., Kodira,C., Roberts,A.D., Rosen,H.R., Bihl,F., Cerny,A., Spengler,U., Liu,Z., Xing,Y., Schneidewind,A., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Galagan,J.E., Nusbaum,C., Walker,B.D., Lake-Bakaar,G.V., Daar,E.S., Jacobson,I.M., Gomperts,E.D., Edlin,B.R., Donfield,S.M., Talal,A.H., Marion,T., Birren,B.W., Henn,M.R., Fischer,W.F., Riely,C.A.
|
Massachusetts General Hospital, Partners AIDS Research Center
|
USA
|
2009-05-31
|
03-31
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,337
|
GenBank
| 2
|
USA: Massachusetts, Boston area
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Hepatitis C virus subtype 1a isolate 03-31, complete genome
|
GCAGAAAAGCGTCTAGCCATGGCGTTAGTATGAGTGTCGTACAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATAAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCTAGATTGGGTGTGCGCGCGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGTGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCACGTCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTATGGCAATGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCCTGTCTCCCCGTGGCTCTCGGCCTAGCTGGGGCCCCACAGACCCCCGGCGTAGGTCGCGCAATTTGGGTAAGGTCATCGATACCCTTACGTGCGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATACCGCTCGTCGGCGCCCCTCTTGGGGGTGCTGCCAGGGCTCTGGCGCATGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAACTATGCAACAGGGAACCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTCCTGGCCTTGCTTTCTTGCTTGACTGTGCCCGCTTCAGCCTATCAAGTGCGCAACTCCACAGGGCTTTACCATGTCACCAATGATTGCCCTAACTCGAGCATTGTGTACGAGACGGCTGATGCCATCCTGCACGCTCCGGGGTGTGTCCCTTGCGTCCGCGAGGGTAACGCCTCGAGGTGTTGGGTGGCGATGACCCCCACAGTGGCCACCAGGGACGGCAAGCTCCCCACGACGCAGCTTCGACGTCACATCGATCTGCTTGTTGGGAGCGCCACCCTCTGCTCGGCCCTCTACGTGGGGGACTTGTGCGGGTCTGTCTTTCTTGTCGGTCAGCTGTTCACCTTCTCTCCCAGGCACCACTGGACGACGCAAGACTGCAATTGCTCCATCTACCCTGGCCATATAACAGGTCACCGCATGGCATGGGATATGATGATGAACTGGTCCCCTACGACGGCGTTGGTAATGGCTCAGCTACTCCGGATCCCACAAGCCATCTTGGATATGATCGCCGGTGCTCACTGGGGCGTCCTAGCGGGCATAGCGTACTTCTCCATGGTGGGGAACTGGGCGAAGGTCCTGGTAGTGCTGCTGCTATTCGCCGGTGTCGACGCGGAAACCCACGTCACCGGGGGAACTGAAGGTAAAGCTGTAATGGGACTCAGTCGTCTCCTCACACTGGGCGCCAAGCAGAACGTCCAGCTCATCAACTCTAATGGCAGTTGGCACATCAACAGCACGGCCTTGAACTGCAATACCAGCCTCGAGACCGGCTGGTTAGCTGGGCTCTTCTATTACAACAAATTCAACTCTTCAGGTTGCCCCGAGAGAATGGCTAGCTGTCGACCCCTTACCGACTTTGCCCAGGGCTGGGGCCCTATTGGATACACCAATGGAAGCGGCCCCGACCAGCGCCCCTACTGCTGGCACTACCCTCCAAGACCTTGTGGTATTGTGCCCGCAAAAACTGTTTGTGGCCCGGTATATTGTTTCACTCCCAGCCCTGTGGCGGTGGGAACGACTGACAGGTCAGGCGCGCCTACCTACAACTGGGGTGAAAATGATACGGACGTCTTCGTCCTTAACAACACCAGGCCACCTCTGGGCAATTGGTTCGGTTGCACCTGGATGAACTCAACTGGGTACACCAAAGTGTGCGGAGCGCCCCCTTGTACCATCGGAGGGGTGGGCAACGACACCTTGCACTGCCCCACTGATTGCTTCCGCAAGCATCCGGATGCCACATACTCTCGGTGCGGCTCCGGACCCTGGATCACACCCAGGTGCCTGGTCGACTACCCCTATAGACTTTGGCATTACCCTTGTACCATCAACTACACCATATTCAAAGTCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCACAGGCTGGACGCTGCCTGCAACTGGACACGGGGCGAACGTTGTGATCTGGAAGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGCTACTGCTGTCCACCACACAGTGGCAGGTTCTTCCGTGTTCGTTCACGACCCTGCCAGCCTTGTCCACCGGCCTCATCCACCTCCACCAGAACATCGTGGACGTGCAGTACTTGTACGGGGTAGGGTCAAGCATTGCGTCCTGGGCCGTCAAGTGGGATTACGTTGTTCTCCTGTTCCTTCTGCTTGCGGACGCGCGCGTCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGTTACTCATATCCCAAGCGGAGGCGGCTTTGGAGAACCTCGTGATACTCAATGCAGCATCTCTGGCCGGGACGCATGGTCTCGTGTCCTTCCTCGTGTTCTTCTGCTTTGCGTGGTATCTGAAGGGTAAGTGGGTGCCCGGAGCGGCCTACGCCATCTACGGGATGTGGCCCCTCCTCCTGCTCCTCTTGGCATTGCCCCAGCGGGCATATGCGCTGGACACGGAGGTGGCCGCGTCGTGTGGCGGCGTTGTTCTTGTCGGGTTAATGGTGCTGACTCTGTCACCATATTACAAGCACTATATCAGCTGGTGCATGTGGTGGCTTCAGTATTTTCTGACTAGAGCAGAAGCACAACTGCACGTGTGGGTTCCCCCCCTCAACGTTCGAGGGGGGCGCGATGCCGTCATCTTACTCACGTGTGCTATACACCCGTCCTTGGTATTCGACATCACCAAATTGCTGCTGGCCGTCTTCGGACCCCTTTGGATTCTTCAAGCCAGTTTGCTTCAAGTGCCCTACTTTGTGCGCGTTCAAGGCCTTCTCCGGATCTGCGCGCTAGCGCGGAAGATGGTCGGAGGCCATTACGTGCAAATGGCCATCATCAAGTTAGGGGCGCTTACTGGCACCTATGTCTATAACCATCTCACTCCCCTTAAGGACTGGGCACACAACGGCCTGCGAGATCTGGCCGTGGCTGTAGAGCCAGTCGTCTTCTCCCAAATGGAGACCAAGCTCATCACATGGGGGGCAGACACCGCTGCGTGCGGTGACATCATCAACGGCCTGCCCGTCTCAGCCCGCAGGGGCCAGGAGATACTGCTCGGACCGGCCGACGGAATGGTCTCCAAGGGATGGAGGTTGCTGGCGCCCATTACAGCGTACGCCCAGCAGACAAGAGGCCTCCTAGGGTGTATAATCACCAGCCTGACCGGCCGGGACAAAAACCAAGTGGAGGGCGAGGTCCAGATTGTGTCAACTGCTGCCCAGACCTTTCTGGCAACATGCATCAATGGGGTGTGCTGGACTGTCTACCACGGGGCCGGGACGAGGACCATCGCATCACCCAAAGGTCCCGTCATCCAAATGTATACCAACGTGGACCAAGACCTCGTAGGCTGGCCCGCTCCTCAAGGTGCCCGCTCATTGACACCCTGCACCTGCGGCTCCTCGGACCTTTATTTGGTCACGAGGCATGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGAGGGGTGATAGCAGGGGCAGCCTGCTTTCGCCCCGGCCCATTTCTTACTTGAAAGGCTCCTCGGGAGGTCCGCTGTTGTGCCCCGCGGGACACGCCGTAGGCATATTCAGGGCTGCGGTGTGCACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATCCCCGTGGAGAGCCTAGAGACAACCATGAGGTCCCCGGTGTTCACGGACAACTCCTCTCCACCAGCAGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCCCACCTGCATGCTCCCACCGGCAGCGGCAAGAGCACCAAGGTCCCGGCTGCATACGCAGCTCAGGGCTACAAGGTGCTGGTGCTCAACCCCTCTGTTGCTGCAACACTGGGCTTTGGAGCTTACATGTCTAAAGCCCATGGGATTGATCCTAACATCAGGACCGGGGTGAGAACAATTACCACTGGCAGCTCCATCACGTACTCCACCTACGGTAAGTTCCTTGCCGACGGCGGGTGTTCAGGGGGTGCTTATGACATAATAATCTGTGACGAGTGCCATTCCACGGATGCCACATCCATCTTGGGCATCGGCACCGTCCTTGACCAAGCAGAGACTGCGGGGGCGAGACTGGTTGTGCTCGCCACCGCCACCCCTCCGGGCTCCGTCACCGTGCCCCACCCTAACATTGAGGAGGTTGCTCTGTCCACCACCGGAGAGATCCCTTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTAGAGGTGATCAAGGGGGGGAGACATCTCATCTTCTGTCACTCAAAGAAGAAGTGCGACGAGCTCGCCGCAAAGCTGGTCGCATTGGGCATCAACGCCGTGGCCTATTACCGCGGCCTTGACGTGTCCGTCATCCCGACCAGCGGCGACGTTGTCGTCGTGGCAACTGATGCTCTCATGACCGGCTATACTGGCGACTTCGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACCCAGACAGTCGATTTCAGCCTTGACCCTACCTTCACCATTGAGACAACCACGCTTCCCCAGGACGCTGTCTCCCGCACTCAACGTCGGGGTAGGACCGGCAGGGGGAAGCCAGGCATCTACAGATTTGTGGCACCGGGGGAGCGCCCCTCCGGCATGTTCGACTCATCCGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCAGGCTGTGCTTGGTATGAGCTCACGCCCGCCGAGACCACAGTTAGGCTACGAGCGTACATGAACACCCCGGGGCTTCCCGTGTGCCAGGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTCTTTACGGGCCTCACCCATATAGATGCCCACTTCCTATCCCAG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| 102,960
|
EU781751.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Timm,J., Li,B., Daniels,M.G., Bhattacharya,T., Reyor,L.L., Allgaier,R., Kuntzen,T., Fischer,W., Nolan,B.E., Duncan,J., Schulze zur Wiesch,J., Kim,A.Y., Frahm,N., Brander,C., Chung,R.T., Lauer,G.M., Korber,B.T., Allen,T.M., Berical,A., Lennon,N., Berlin,A.M., Young,S.K., Lee,B., Heckerman,D., Carlson,J., Kleyman,M., McMahon,C.M., Birch,C., Schulze Zur Wiesch,J., Ledlie,T., Koehrsen,M., Kodira,C., Roberts,A.D., Rosen,H.R., Bihl,F., Cerny,A., Spengler,U., Liu,Z., Xing,Y., Schneidewind,A., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Galagan,J.E., Nusbaum,C., Walker,B.D., Lake-Bakaar,G.V., Daar,E.S., Jacobson,I.M., Gomperts,E.D., Edlin,B.R., Donfield,S.M., Talal,A.H., Marion,T., Birren,B.W., Henn,M.R., Fischer,W.F., Riely,C.A.
|
Massachusetts General Hospital, Partners AIDS Research Center
|
USA
|
2009-05-31
|
02-08
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,336
|
GenBank
| 2
|
USA: Massachusetts, Boston area
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Hepatitis C virus subtype 1a isolate 02-08, complete genome
|
CGACGGCCAGGGCGTTAGTATGAGTGTCGTACAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATAAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCTAGATTGGGTGTGCGCGCGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCACGTCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTATGGCAATGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCTTGTCCCCCCGTGGCTCTCGGCCTAGCTGGGGCCCCACAGACCCCCGGCGTAGGTCGCGCAATTTGGGTAAGGTCATCGATACCCTCACGTGCGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATACCGCTCGTCGGCGCCCCTCTTGGGGGCGCTGCCAGGGCCCTGGCGCATGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAATTATGCAACAGGGAATCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTCCTGGCCCTGCTCTCTTGCTTGACAGTGCCCGCTTCAGCCTACCAAGTGCGCAACTCCACGGGGCTTTACCATGTCACCAATGAYTGCCCTAACTCGAGTATTGTGTACGAGGCGGCCGATGCCATCCTGCACACTCCGGGGTGTGTCCCTTGCGTTCGCGAGGGTAACACCTCGAGGTGTTGGGTGGCGATGACCCCCACGGTGGCCACCAGGGACGGCAAACTCCCCACAACGCAGCTTCGACGTCACATCGATCTGCTTGTCGGGAGCGCCACCCTCTGCTCGGCCCTCTACGTGGGAGACCTGTGCGGGTCTGTCTTTCTTGTCGGTCAACTGTTCACCTTCTCCCCAAGGCGACACTGGACGACGCAGGACTGCAATTGTTCTATCTACCCTGGTCATATAACGGGTCACCGTATGGCATGGGATATGATGATGAACTGGTCCCCTACGGCGGCGCTGGTAGTAGCCCAGCTGCTCCGGATCCCACAAGCCATCTTGGACATGATCGCTGGTGCCCACTGGGGAGTCCTGGCGGGCATAGCGTATTTCTCCATGGTGGGGAACTGGGCGAAGGTCCTGGTAGTGTTGCTGCTATTTGCCGGCGTTGACGCGGAAACCCACACCACCGGGGGAGCTGCAGCCCACACCACGGCTAGCCTTGTTCGGTTCCTCCAACCAGGTCCCAAGCAGAACATCCAGCTGATCAACACCAACGGCAGTTGGCACATCAACAGGACGGCCTTGAACTGCAATGACAGCCTTGAGACCGGCTGGCTAGCAGGGCTTTTCTACTATCACAAATTTAACTCTTCAGGTTGTCCCGAAAGGATGGCCAGCTGCCGGCCCCTTACTGATTTTCCCCAGGGCTGGGGCCCTATCAGTCATGCCAACGGAAGTGGCCCCGACCAACGCCCCTATTGCTGGCACTACCCCCCAAGACCTTGTGGTATTGTGCCCGCAAAGAGCGTGTGTGGCCCGGTGTACTGCTTCACTCCCAGCCCCGTGGCGGTGGGAACGACCGACAGGGCGGGTGTGCCTACCTACAACTGGGGCACAAATGATACGGACGTCTTCGTCCTTAACAACACCAGACCGCCGCTGGGCAATTGGTTCGGTTGTACTTGGATGAACTCAACTGGATTCACCAAAGTGTGCGGAGCGCCCCCCTGTGTCATCGGAGGGGTGGGCAACAACACTTTGCAATGCCCCACTGATTGTTTCCGCAAGCATCCGGAAGCCACGTACTCTCGGTGCGGCTCCGGCCCCTGGATTACACCCAGGTGCCTGGTCAACTACCCGTATAGGCTTTGGCATTATCCTTGCACCGTCAACTACACCATATTTAAAGTCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCACAGGCTGGAAGCTGCCTGCAACTGGACGCGGGGCGAACGTTGTGATCTGGAAGACAGGGATAGGTCCGAGCTCAGCCCGTTGCTACTGTCCACCACACAGTGGCAGGTCCTCCCGTGTTCCTTCACGACTCTGCCAGCCTTGTCCACCGGCCTCATCCACCTCCACCAGAACATCGTGGACGTGCAGTACTTGTACGGGGTGGGGTCAAGCATTGCGTCCTGGGCCATTAAGTGGGATTACGTCGTTCTCCTGTTCCTTCTGCTCGCAGACGCGCGCGTCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGTTGCTCATATCCCAGGCGGAGGCGGCTTTGGAGAACCTCGTAGTACTCAATGCAGCATCCTTGGCCGGAACGCACGGTCTTGTATCCTTCCTCGTGTTCTTCTGCTTTGCATGGTACCTGAAGGGTAGGTGGGTGCCCGGGGCGGTCTACGCCTTCTACGGGATGTGGCCTCTCCTCCTGCTCCTGCTGGCGTTGCCCCAGCGGGCGTACGCACTGGACACGGAGGTGGCCGCGTCGTGTGGCGGCGTTGTTCTTGTCGGGTTAATGGCGCTGACTCTCTCACCATATTACAAGCGCTATATCAGCTGGTGCTTATGGTGGCTTCAGTATTTTCTGACCAGAGTAGAAGCGCATCTGCACGTGTGGGTCCCCCCCCTCAACGTCCGAGGGGGGCGCGACGCTGTCATCCTACTCATGTGTGTTGTACACCCGACCCTGGTATTTGACATCACCAAACTACTACTGGCCGTCTTCGGGCCCCTTTGGATTCTTCAAGCCAGTTTGCTTAAAGTACCCTACTTTGTGCGCGTTCAAGGCCTTCTCCGGATCTGCGCGCTAGCGCGGAAGATGGCAGGAGGCCATTACGTGCAAATGGTCATCATCAAGTTAGGGGCGCTTACTGGCACCTATGTTTATAACCATCTCACTCCCCTTCGGGACTGGGCGCACAACGGCCTGCGAGATCTGGCCGTGGCGGTGGAGCCGGTCGTCTTCTCCCAAATGGAGACCAAGCTCATCACGTGGGGGGCAGACACCGCCGCGTGCGGTGACATCATCAATGGCTTGCCCGTCTCCGCCCGCAGGGGCCGGGAGATACTGCTTGGACCAGCCGATGGAGCGACCTCCAAGGGGTGGAGGTTGCTGGCGCCCATCACGGCGTACGCCCAGCAGACAAGGGGCCTCCTAGGGTGCATAATCACCAGCCTGACTGGCCGGGACAAAAACCAAGTGGAGGGTGAGGTCCAGATTGTGTCAACCGCTGCCCAAACTTTCCTGGCAACGTGCATCAATGGGGTATGCTGGACTGTCTACCACGGGGCCGGAACGAGGACCATCGCATCACCCAAGGGTCCCGTTATCCAGATGTATACCAATGTGGACAAAGACCTTGTGGGCTGGCCCGCTCCCCAAGGTGCCCGCTCACTGACACCCTGCACCTGCGGCTCCTCGGACCTTTACCTGGTCACGAGGCACGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGCGGGGTGATAGCAGGGGCAGCCTGCTCTCGCCCCGGCCCATTTCCTACTTGAAAGGCTCCTCGGGGGGTCCGCTGTTATGCCCCGCGGGACACGCCGTGGGCATATTCAGGGCCGCGGTGTGCACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATCCCTGTGGAGAACCTAGAGACAACCATGAGGTCCCCGGTGTTCACGGACAACTCCTCTCCACCAGCAGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCCCACCTGCACGCTCCCACTGGCAGCGGCAAGAGCACCAAGGTCCCGGCTGCATACGCAGCTCAGGGCTATAAGGTGTTAGTGCTCAACCCCTCTGTTGCTGCAACACTGGGCTTTGGTGCTTACATGTCCAAGGCACATGGAATCGATCCTAACATCAGGACCGGGGTGAGGACGATTACTACTGGCAGCCCCATCACGTACTCCACCTACGGCAAGTTCCTTGCCGACGGTGGGTGTTCAGGGGGTGCTTATGACATAATAATTTGTGACGAGTGCCATTCCACGGATGCCACATCCATCTTGGGCATCGGCACCGTCCTTGACCAAGCAGAGACTGCGGGAGCGAGACTGGTTGTGCTCGCCACCGCCACCCCTCCGGGCTCCATCACCGTGCCTCATCCTAACATCGAGGAGGTTGCTCTGTCCACCACCGGAGAGATCCCTTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTCGAGGCAATCAAGGGGGGGAGACATCTAATCTTCTGTCACTCAAAGAAGAAGTGCGACGAGCTCGCCGCAAAGCTGGTCGCATTGGGCATCAATGCCGTGGCCTACTACCGCGGTCTTGACGTGTCTGTCATCCCGACCAGCGGCGATGTTGTCGTCGTTGCGACCGATGCCCTCATGACCGGCTTTACCGGCGACTTCGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACCCAGACAGTCGATTTCAGCCTTGACCCTACCTTCACCATTGAGACAACCACGCTCCCCCAGGATGCTGTCTCCCGCACTCAACGTCGGGGCAGGACTGGCAGGGGGAAGCCAGGCATCTACAGATTTGTGGCACCAGGGGAGCGCCCCTCTGGCATGTTCGACTCGTCTGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCGGGCTGCGCTTGGTATGAGCTCACGCCCGCCGAGACTACAGTTAGGCTACGAGCGTACATGAACACCCCGGGGCTTCCCGTGTGCCAAGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTCTTTACGGGCCTCACCCACATAGATGCCCACTTCCTATCCCAGACAAAGCAGAGTGGGGAGAACCTTCCTTACCTGGTAGCGTACCAAGCCACCGTGTGCGCTAGGGCGCAAGCCCCTCCCCCATCGTGGGACCAGATGTGGAAGTGTTTGACCCGTCTCAAACCCACCCTTCATGGGCCAACACCTCTGCTATACAGACTGGGCGCTGTTCAGAATGAAGTCACCCTGACGCACCCAATCACCAAATACATCATGACATGCATGTCGGCCGACCTGGAGGTCGTCACGAGCACCTGGGTGCTCGTTGGCGGCGTCCTGGCTGCTTTGGCCGCGTATTGCCTGTCAACAGGCTGCGTGGTCATAGTGGGCAGGATTGTCTTGTCCGGGAAGCCGGCAATTGTACCTGACAGGGAAGTTCTCTACCGGGAGTTCGATGAGATGGAAGAGTGCTCTCAGCACTTACCGTACATCGAGCAAGGGATGATGCTCGCTGAGCAGTTCAAGCAGAAGGCCCTCGGCCTCCTGCAGACCGCGTCCCGCCAGGCAGAGGTTATCGCCCCTGCTGTCCAGACCAACTGGCAAAAACTCGAGGCCTTCTGGGCGAAGCATATGTGGAACTTCATCAGTGGGATACAATAYTTGGCGGGCCTGTCAACGTTGCCTGGCAACCCCGCCATCGCTTCATTGATGGCTTTTACAGCTGCTGTCACTAGCCCACTAACCACTAGCCAAACCCTCCTCTTCAACATATTGGGGGGGTGGGTGGCTGCCCAGCTCGCCGCTCCCGGTGCCGCTACTGCCTTTGTGGGCGCTGGCCTAGCTGGCGCCGCCATCGGCAGTGTTGGACTGGGAAAGGTCCTCATGGACATCCTTGCAGGGTATGGCGCGGGCGTGGCGGGAGCTCTTGTAGCATTCAAGATCATGAGCGGCGAGGTCCCCTCCACGGAGGACCTGGTCAATCTACTGCCCGCCATCCTCTCGCCTGGAGCCCTTGTGGTCGGTGTAGTCTGCGCGGCAATACTGCGCCGACACGTTGGCCCGGGCGAGGGGGCAGTGCAATGGATGAACCGGCTAATAGCCTTCGCCTCCCGGGGGAACCATGTCTCCCCCACGCACTACGTGCCGGAGAGCGATGCCGCCGCCCGCGTCACTGCCATACTTAGCAGTCTCACTGTTACCCAGCTCCTGAGGCGACTGCACCAGTGGATAAGCTCGGAGTGTACCACTCCGTGCTCCGGTTCCTGGCTAAGGGACATCTGGGACTGGATATGCGAGGTGCTGAGCGACTTTAAGACCTGGCTAAAAGCCAAGCTCATGCCACAACTGCCTGGGATCCCCTTTGTGTCCTGCCAGCGCGGGTATAGGGGGGTCTGGCGAGGGGATGGCATTATGCACACTCGCTGCCACTGTGGAGCTGAGATCACTGGACATGTCAAAAACGGGACGATGAGGATCGTCGGTCCTAGGACCTGCAGGAACATGTGGAATGGGACTTTCCCCATTAACGCCTACACCACGGGCCCCTGTACTCCCCTTCCTGCGCCGAACTATAAGTTCGCGCTGTGGAGGGTGTCTGCAGAGGAATACGTGGAGATAAGGCAGGTGGGGGATTTCCACTACGTGACGGGTATGACTACTGACAATCTCAAATGCCCATGCCAGGTCCCATCGCCCGAATTTTTCACAGAATTGGACGGGGTGCGCTTACATAGGTTTGCGCCCCCTTGCAAGCCCTTGCTGCGGGAGGAGGTATCATTCAGAGTAGGACTCCACGAGTACCCGGTGGGGTCGCAATTACCTTGCGAGCCCGAACCGGACGTGGCCGTGTTGACGTCCATGCTCACTGATCCCTCCCATATAACAGCAGAGGCGGCCGGGAGAAGGTTGGCAAGAGGGTCACCCCCTTCTGTGGCCAGCTCCTCGGCTAGCCAGCTGTCTGCTCCATCTCTCAAGGCAACTTGCACTGCCAACCATGACTCCCCTGACGCCGAGCTCATAGAGGCTAACCTCCTATGGAGGCAGGAGATGGGCGGCAACATCACCAGGGTTGAGTCAGAGAACAAAGTGGTGATTCTGGACTCCTTCGATCCGCTTGTGGCGGAGGAGGACGAGCGGGAGATCTCCGTACCCGCAGAAATCCTGCGGAAATCTCGGAGGTTCGCTCCGGCCCTGCCCATTTGGGCGCGGCCGGACTACAACCCCCCGCTGATAGAGACGTGGAAGAAGCCTGACTACGAACCACCTGTGGTCCATGGCTGCCCGCTTCCACCTCCACAGTCCCCTCCTGTGCCTCCGCCTCGGAAGAAGCGGACGGTGGTCCTCACCGAATCAACCGTGTCTACTGCCTTGGCCGAACTTGCCACCAAAAGTTTTGGCAGCTCTTCAACCTCCGGTATTACGGGCGACAATACGACAACATCCTCTGAGCCCTCCCCTTCTGGCTGCCCCCCAGACTCCGACGCTGAGTCCTATTCTTCCATGCCCCCCCTGGAGGGGGAGCCTGGGGATCCGGATCTCAGCGACGGGTCATGGTCGACGGTCAGTAGTGAGGCCGACACGGAGGATGTCGTGTGCTGCTCGATGTCTTATACCTGGACAGGCGCACTTGTCACCCCGTGCGCCGCGGAAGAACAAAAGCTTCCCATCAACGCACTGAGCAACTCGTTGCTACGTCATCACAATCTGGTGTATTCCACCACCTCACGCAGTGCTTGCCAAAGGCAGAAGAAAGTCACATTTGACAGACTGCAAGTTCTGGACAGCCATTACCAGGACGTGCTCAAGGAGGTTAAAGCAGCGGCGTCAAAAGTGAAGGCTAACTTGCTATCCGTAGAGGAAGCTTGCAGCCTGACGCCCCCACACTCAGCCAAATCCAAGTTTGGCTATGGGGCAAAAGACGTCCGTTGCCATGCCAGAAAGGCCGTAAACCACATCAACTCCGTGTGGAAAGACCTTCTGGAAGACAGTGTAACACCAATAGACACTACCATCATGGCTAAGAACGAGGTTTTCTGCGTTCAGCCTGAGAAGGGGGGTCGTAAGCCAGCTCGTCTCATCGTGTTCCCCGACCTGGGTGTGCGCGTGTGCGAGAAGATGGCTCTGTACGACGTGGTTAGCAAGCTCCCCCTGGCCGTGATGGGAAGCTCCTACGGATTCCAATACTCACCAGGACAGCGGGTTGAATTCCTCGTGCAAGCGTGGAAATCCAAGAAGACCCCAATGGGGTTCTCGTATGATACCCGCTGCTTTGACTCCACAGTCACTGAGAGCGATATCCGTACGGAGGAGGCAATCTACCAATGTTGTGACCTGGACCCCCAAGCCCGTGTGGCCATCAAGTCCCTCACTGAGAGGCTTTATGTCGGGGGCCCTCTTACCAATTCAAGGGGGGAGAACTGCGGCTACCGCAGGTGCCGCGCGAGCGGCGTGCTGACAACTAGCTGTGGTAACACCCTCACTTGCTACATCAAGGCCCGGGCAGCCTGTCGAGCCGCAGGGCTCCAGGACTGCACCATGCTCGTGTGTGGCGACGACTTAGTCGTTATCTGTGAAAGTGCGGGGGTCCAGGAGGACGCGGCGCGCCTGAGAGCCTTCACGGAGGCTATGACCAGGTACTCCGCCCCCCCCGGGGACCCCCCACAACCAGAATACGACTTGGAGCTGATAACATCATGCTCCTCCAACGTGTCAGTCGCCCACGACGGCGCTGGAAAGAGGGTCTACTACCTCACCCGTGACCCCACAACTCCCCTCGCGAGAGCCGCGTGGGAGACAGCAAGACACACTCCAGTCAATTCCTGGCTAGGCAACATAATTATGTTTGCCCCCACACTGTGGGCGAGGATGATACTGATGACCCATTTCTTTAGCGTCCTCATAGCCAGGGATCAGCTTGAACAGGCCCTTGATTGCGAGATCTACGGAGCCTGTTACTCCATAGAACCACTGGATCTACCTCCAATCATTCAAAGACTCCATGGCCTCAGCGCATTTTCACTCCATAGTTACTCTCCAGGTGAAATCAATAGGGTGGCCGCATGCCTCAGAAAACTTGGGGTCCCGCCCTTGCGAGCCTGGAGACACCGGGCCCGGAATGTCCGCGCTAGGCTTCTGTCCAGAGGAGGCAGGGCTGCCATATGTGGCAAGTACCTCTTCAACTGGGCAGTAAGGACAAAGCTCAAACTCACTCCAATACCGGCCGCTGGCCAGCTGGACTTGTCCGGTTGGTTCACGGCTGGGTACAGCGGGGGAGACATTTATCACAGCGTGTCTCATGCCCGGCCCCGCTGGTTCTGGTTTTGCCTACTCCTGCTCGCTGCAGGGGTAGGCATCTACCTCCTCCCCAACCGATGAAGGTTGGGGTAAACACTCCGGCCTCTTAAGCCATT
| 102,961
|
EU781752.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Timm,J., Li,B., Daniels,M.G., Bhattacharya,T., Reyor,L.L., Allgaier,R., Kuntzen,T., Fischer,W., Nolan,B.E., Duncan,J., Schulze zur Wiesch,J., Kim,A.Y., Frahm,N., Brander,C., Chung,R.T., Lauer,G.M., Korber,B.T., Allen,T.M., Berical,A., Lennon,N., Berlin,A.M., Young,S.K., Lee,B., Heckerman,D., Carlson,J., Kleyman,M., McMahon,C.M., Birch,C., Schulze Zur Wiesch,J., Ledlie,T., Koehrsen,M., Kodira,C., Roberts,A.D., Rosen,H.R., Bihl,F., Cerny,A., Spengler,U., Liu,Z., Xing,Y., Schneidewind,A., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Galagan,J.E., Nusbaum,C., Walker,B.D., Lake-Bakaar,G.V., Daar,E.S., Jacobson,I.M., Gomperts,E.D., Edlin,B.R., Donfield,S.M., Talal,A.H., Marion,T., Birren,B.W., Henn,M.R., Fischer,W.F., Riely,C.A.
|
Massachusetts General Hospital, Partners AIDS Research Center
|
USA
|
2009-05-31
|
03-11
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,326
|
GenBank
| 2
|
USA: Massachusetts, Boston area
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Hepatitis C virus subtype 1a isolate 03-11, complete genome
|
ACGGCCAGGGCGTTAGTATGAGTGTCGTGCAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATCAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTATACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCTAGATTGGGTGTGCGCACGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGGAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCGCGTCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTACGGCAATGAGGGCTGCGGGTGGGCAGGATGGCTCTTGTCCCCCCGCGGTTCTCGGCCTAGTTGGGGCCCCACAGACCCCCGGCGCAGGTCGCGCAATTTGGGTAAGGTCATCGATACCCTCACGTGCGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATCCCGCTCGTCGGCGCCCCTCTTGGAGGCGCTGCCAGGGCCCTGGCGCATGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAACTATGCAACAGGGAACCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTTCTGGCCCTGCTCTCTTGCCTGACTGTGCCCGCGTCAGCCTACCAAGTACGCAACTCCTCGGGCCTTTACCATGTTACCAATGACTGCCCCAATTCGAGCATTGTGTACGAGACGAAAGACACCATTCTACACTCTCCGGGGTGTGTCCCTTGCGTGCGCGAGGGTAACGTCTCGAAGTGTTGGGTGCCGGTGGCCCTTACGGTGGCCACCAGGGACGGCAACCTCCCCACAACGCAGCTTCGACGTCACATCGATCTGCTCGTCGGGAGCGCCACCCTCTGCTCGGCCCTCTATGTGGGGGACTTGTGCGGGTCTGTCTTTCTCGTTGGTCAACTGTTCACCTTCTCCCCCAGACGCCACTGGACAACGCAGGACTGCAACTGTTCTATGTACCCCGGCCATATAACGGGCCACCGTATGGCATGGGATATGATGATGAACTGGTCTCCTACATCGGCGCTGGTAGTAGCCCAGCTGCTCAGGGTTCCGCAAGCCATCTTGGACATGATCGCTGGTGCCCACTGGGGAGTCCTAGCGGGCTTAGCGTATTTCTCCATGGTGGGCAACTGGGCGAAGGTCCTGGTAGTGCTGTTGCTGTTTGCCAGCGTCGATGCGGGTACCCACGTCACCGGGGGGAGTGCCGCTCACGACGTGTCTGCACTTGCCGGTTTTTTCCGCAGGGGCGCCAAGCAGAATATCCAGCTGATCAACACCAACGGCAGTTGGCACGTCAATCGCACTGCCTTGAACTGTAATGCGAGCCTCGACACCGGCTGGGTAGCGGGGCTCCTCTATTACCACAGATTCAACTCTTCAGGCTGCCCCGAGAGGATGGCCAGCTGTAGACCCCTCGCCGATTTTGACCAGGGCTGGGGTCCTATCACCAACGTCGACGGAGGCGGCTCCGAGTATCGCCCCTACTGCTGGCACTACCCTCCAAAGCCTTGTGGTATTGAGCCAGCACAAAACGTGTGTGGCCCAGTGTATTGCTTCACTCCCAGCCCCGTGGTGGTGGGAACGACCGACAAGGTGGGCGTGCCTACCTACAACTGGGGTGAGAATGACACGGACGTCTTCGTCCTCAATAACACCAGGCCACCGTTGGGCAATTGGTTCGGTTGCACCTGGATGAACTCATCTGGATTTGTCAAAGTGTGCGGAGCACCTCCTTGTATCATCGGAGGAGCGGGCAACAAGACCTTGCACTGCCCCACTGACTGTTTCCGCAAGCATCCGGACGCCACGTATTCTCGGTGTGGCTCCGGCCCCTGGCTCACGCCTAGGTGCCTGGTTGATTATCCTTATAGGCTTTGGCATTATCCCTGTACCGTCAATTACACCCTATTCAAAATCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCACAGGCTGGTAGCCGCTTGCAACTGGACATATGGCGAGCGTTGTAATCTGGACGACAGGGACAGGTCTGAGCTCAGCCCGCTGCTGCTGTCCACCACACAGTGGCAGGTCCTTCCGTGTTCCTTTACGACCTTGCCAGCCTTGACTACCGGCCTCATCCACCTCCACCAGAACATCGTGGACGTACAATACTTGTACGGGGTGGGGTCAAGCATTGTGTCCTGGGCCATTAAGTGGGAGTACGTCATCCTCCTGTTTCTCCTGCTTGCAGACGCGCGTATCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGCTACTCATATCCCAAGCGGAGGCGGCTTTGGAGAACCTTGTGCTGCTCAATGTGGCGTCTCTGGCCGGGACGCACGGTCTTGCGTCCTTCCTCGTGTTCTTTTGCTTTGCATGGTATCTGAAGGGTAAGTGGGTGCCCGGAGCGGCCTACGCCGTTTACGGGATGTGGCCTCTCCTCCTGCTCCTGTTGGCGTTGCCCCAACGAGCATACGCGCTGGACACAGAGATAGCCGCGTCGTGTGGTGGCGTTGTTTTTATCGGGTTAATGGCGCTGACTCTGTCGCCGCATTACAAGCACTATATCAGCTGGTGCTTATGGTGGCTTCAGTATTTCCTGACCAGAGTGGAAGCGCTATTGCACGTGTGGGTTCCCCCCCTCAACGCCCGAGGGGGGCGCGACGCTGTCATCCTACTCATGTGTGTAGTACACCCGGTTTTGGTATTTGACATCACCAAGCTGCTGCTGGCCGTCCTCGGACCCCTTTGGATTCTTCAAGCCAGTCTGCTCAAGGTGCCTTACTTCGTGCGCGTCCAAGGCCTTCTCCGGCTCTGCGCGCTAGCGCGCAAGGTGGCCGGAGGCCATTACGTGCAGATGGCCATCATCAAGGTGGGGGCGCTTACTGGCACGTATATTTATAACCATCTTACTCCTCTTCGCGACTGGGCGCATAACGGCCTACGAGATCTGGCCGTGGCCGTAGAGCCAGTCGTCTTTTCCCAGATGGAGACCAAGCTCATTACGTGGGGGGCGGACACCGCTGCATGCGGTGACATCATCAACGGCTTGCCCGTCTCTGCCCGTAGAGGCCGGGAGATACTGCTCGGACCGGCCGATGGAATGGTCTCCAAGGGGTGGAGGTTGCTGGCGCCCATCACGGCGTATGCTCAGCAGACGAGGGGCCTCTTGGGATGCATAATTACCAGCCTGACTGGCCGGGATAAAAACCAGGTGGAGGGTGAGGTTCAGATTGTGTCGACTGCTACTCAGACCTTCCTGGCAACCTGCATCAACGGAGTGTGCTGGACTGTCTACCACGGGGCTGGAACAAGGACCGTTGCGTCACCCAAGGGTCCTGTTATCCAGATGTATACCAATGTAGACCAAGACCTCGTGGGTTGGCCCGCTCCCCAAGGTGCTCGCTCATTGACACCCTGCACCTGCGGCTCCTCGGACCTTTACCTGGTCACGAGGCACGCCGATGTCATTCCCGTACGTCGGCGGGGTGATAGTAGGGGCAGCCTGCTTTCGCCTCGGCCCATCTCTTACTTGAAAGGCTCCTCGGGGGGCCCACTGCTGTGCCCCGCGGGACACGCCGTTGGCATATTCAGGGCCGCGGTGTGCACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATCCCCGTAGAGAGCCTAGAGACAACCATGAGGTCCCCGGTGTTCACAGACAATTCCTCCCCGCCAGCAGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCCCACCTGCATGCTCCCACCGGTAGTGGTAAGAGCACCAAGGTCCCGGCCGCATACGCGGCTCAGGGCTACAAGGTGCTGGTGCTCAACCCCTCCGTTGCTGCAACATTGGGCTTTGGTGCTTACATGTCCAAAGCCCATGGGATTGATCCTAACATCAGGACTGGGGTGAGGACAATCACTACTGGCAGCCCCATCACGTACTCCACCTACGGCAAGTTTCTTGCCGACGGCGGGTGCTCAGGGGGTGCTTATGACATAATAATTTGTGACGAGTGCCACTCCACGGATGCAACATCCATTTTGGGCATCGGTACCGTCCTTGACCAGGCAGAGACTGCAGGGGCGAGGCTGGTTGTGCTCGCCACCGCTACCCCTCCGGGCTCCGTCACTGTGCCCCACCCTAACATCGAGGAGGTTGCTCTGTCCACCACCGGAGAGATCCCTTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTTGCGGCGATCAAGGGGGGGAGACATCTCATCTTTTGCCACTCAAAAAAAAAGTGCGACGAGCTCGCCGCAAAACTGGTCGCGTTAGGCATCAACGCCGTGGCCTACTACCGCGGCCTTGATGTGTCTGTCATCCCAACCAGTGGCGATGTTGTCGTTGTGGCAACTGATGCTCTCATGACCGGCTTTACCGGCGACTTCGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACCCAGACAGTCGACTTCAGCCTTGACCCTACCTTCACCATTGAGACAACCACGCTCCCCCAGGATGCCGTCTCCCGCACTCAACGTCGGGGCAGGACTGGCAGGGGGAAGCCAGGTATTTACAGATTTGTGGCACCGGGGGAACGCCCGTCCGGTATGTTCGACTCGTCCGTCCTCTGCGAGTGCTATGACGCGGGTTGCGCTTGGTATGAGCTCACGCCCGCCGAGACCACTGTTAGGCTACGAGCGTACATGAACACCCCGGGGCTTCCCGTGTGTCAAGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTCTTCACGGGCCTCACCCATATAGACGCCCACTTCTTATCCCAGACAAAGCAGAGT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| 102,962
|
EU781753.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Timm,J., Li,B., Daniels,M.G., Bhattacharya,T., Reyor,L.L., Allgaier,R., Kuntzen,T., Fischer,W., Nolan,B.E., Duncan,J., Schulze zur Wiesch,J., Kim,A.Y., Frahm,N., Brander,C., Chung,R.T., Lauer,G.M., Korber,B.T., Allen,T.M., Berical,A., Lennon,N., Berlin,A.M., Young,S.K., Lee,B., Heckerman,D., Carlson,J., Kleyman,M., McMahon,C.M., Birch,C., Schulze Zur Wiesch,J., Ledlie,T., Koehrsen,M., Kodira,C., Roberts,A.D., Rosen,H.R., Bihl,F., Cerny,A., Spengler,U., Liu,Z., Xing,Y., Schneidewind,A., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Galagan,J.E., Nusbaum,C., Walker,B.D., Lake-Bakaar,G.V., Daar,E.S., Jacobson,I.M., Gomperts,E.D., Edlin,B.R., Donfield,S.M., Talal,A.H., Marion,T., Birren,B.W., Henn,M.R., Fischer,W.F., Riely,C.A.
|
Massachusetts General Hospital, Partners AIDS Research Center
|
USA
|
2009-05-31
|
99I
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,325
|
GenBank
| 2
|
USA: Massachusetts, Boston area
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Hepatitis C virus subtype 1a isolate 99I, complete genome
|
CGGCCAGGGCGTTAGTATGAGTGTCGTGCAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATCAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCGAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCCAGGTTGGGTGTGCGCGCGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCGCGTCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTATGGCAATGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCCTGTCCCCCCGTGGCTCTCGGCCTAGTTGGGGCCCTACAGACCCCCGGCGTAGGTCGCGCAACTTGGGTAAGGTCATCGATACCCTCACGTGCGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATTCCGCTCGTCGGCGCCCCTCTTGGGGGCGCTGCCAGGGCCCTGGCGCACGGCGTCCGGGTTCTGGAAGACGGCGTGAACTATGCAACAGGGAACCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTTCTTTTGGCCCTGCTCTCTTGTCTGACTGTGCCCGCTTCAGCCTACCAAGTACGCAATTCCTCGGGCCTTTACCATGTCACCAACGACTGCCCTAATTCGAGTATTGTGTACGAGACGACCGATGCCATTCTACACTCTCCGGGGTGTGTCCCTTGCGTTCGCGAGGGTAACGCCTCGAAATGTTGGGTGGCGGTGGCCCCCACGGTGGCCACCAAGGACGGCAAACTCCCCTCGACGCAGCTTCGACGTCATATCGATCTGCTTGTCGGGGGTGCCACCCTCTGCTCGGCCCTCTATGTGGGGGATCTGTGCGGGTCTGTCTTTCTTGTCGGTCAACTGTTCACTCTCTCCCCCAGGCGTCACTGGACAACGCAAGACTGCAATTGTTCCATCTACCCCGGCCATATAACGGGTCACCGCATGGCATGGGATATGATGATGAACTGGTCGCCTACAGCAGCGCTGGTAGTAGCTCAGCTGCTCAGGATCCCGCAAGCCATCTTGGACATGATCGCTGGTGCCCACTGGGGAGTCCTAGCGGGCATAGCGTATTTCTCCATGGTGGGGAACTGGGCAAAGGTCCTGGTAGTGCTGTTGCTGTTTGCCGGCGTTGATGCAGGAACCCACATCAGTGGGGGGAAAGCTGCTCAGACCACGTCTTCATTCACCAGATTTTTCACTCCGGGCGCCAAGCAGAATGTCCAGCTGGTCAACACCAACGGCAGTTGGCACATTAATCGCACAGCCTTGAACTGTAATACGAGCCTTAACACTGGCTGGATAGCGGGGCTCTTCTCCCACTACAATTTCAACTCTTCAGGCTGCCCCGAGAGGATGGCCAGCTGTAGACTCCTTGCCGATTTCGACCAAGGCTGGGGCCCTATCAGTTACACCAACGGAAGCGGCCCCGAACACCGCCCTTACTGCTGGCACTACCCCCCAAAGCCTTGTGGCATCGTGCCAGCACAGACTGTATGTGGCCCAGTGTATTGCTTCACTCCCAGTCCCGTGGTAGTGGGAACGACCAACAAGTTGGGCGTGCCCACCTACACCTGGGGTGAGAATGACACGGACGTTTTCATCCTTAACAACACCAGGCCACCGTTGGGCAATTGGTTTGGCTGCACCTGGATGAACGGAACTGGATATACCAAAGTGTGCGGAGCGCCTCCTTGTAACATCGGAGGGACGGGCAACAACACCTTGCACTGCCCCACTGACTGTTTCCGCAAGCATCCGGAAGCCACATACTCTCGGTGTGGCTCCGGTCCCTGGCTCACGCCCAGGTGCCTAGTCCACTATGCTTACAGGCTCTGGCACTATCCTTGTACCATCAACTACACCCTGTTCAAAGTCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCACAGGCTGGAAGTTGCTTGCAACTGGACGCGGGGTGAGCGCTGTGATCTGGACGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGCTGCTGCTGTCCACCACGCAGTGGCAGGTCCTCCCGTGCTCCTTCACGACCCTGCCAGCCTTGACTACCGGCCTCATCCACCTCCACCAGAACATCGTGGACGTGCAATACCTGTACGGGGTGGGGTCAAGCCTTGTGTCCTGGGCCATCAAGTGGGAGTACGTCGTTCTCTTGTTTCTCCTGCTCGCAGACGCGCGCGTCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGCTACTCATATCCCAAGCGGAGGCAGCTTTGGAGAACCTCGTATTACTCAATGCRGCATCTCTGGCCGGGACGCATGGCCTTGTGTCCTTCCTCGTGTTCTTCTGCTTTGCATGGTATCTGAAGGGTAGGTGGGTGCCTGGAGCGGCCTACGCCTTCTACGGGATGTGGCCTCTCCTCCTGCTCCTGTTGGCGTTGCCCCAACGGGCATACGCGATGGACACGGAGATGGCTGCGTCGTGTGGTGGCGTTGTTCTTGTCGGGTTAATGGTGCTGACTCTGTCGCCGCATTACAAGCGCTATATCTGTTGGTGCCTATGGTGGCTTCAGTATTTCCTGACCAGAGTGGAAGCGCATCTGCACATGTGGGTTCCCCCCCTCAACGTCCGAGGGGGGCGTGACGCTGTCATCCTGCTCATGTGTGTTGTACACCCGGCCTTGGTATTTGACATCACCAAGCTGCTGCTGGCCGTCTTCGGACCCCTTTGGATTCTTCAAGCCAGTCTGCTCAAAGTGCCCTACTTCGTGCGCGTCCAAGGCCTTCTCCGGATCTGCGCGCTAGCGCGCAAGATCGCCGGAGGCCATTACGTGCAGATGGCCATCATCAAGGTGGGGGCGCTTACTGGCACTTATATCTATAACCATCTCACTCCCCTTCGGGACTGGGCGCACAACGGCCTACGAGAYCTGGCAGTGGCTGTAGAGCCAGTCACCTTTTCCCAGATGGAGACCAAGCTCATCACGTGGGGGGCGGACACCGCGGCATGCGGTGAYATCATCAACGGCTTGCCCGTCTCTGCCCGCAGGGGCCGAGAGATATTGCTCGGACCAGCCGATGGAATGGTYTCCAAGGGGTGGAGGCTSCTGGCGCCCATTACGGCGTACGCCCAGCAGACAAGGGGCCTCTTGGGATGCATAATTACCAGCCTGACCGGCCGGGACAAAAACCAGGTGGAGGGTGAGGTTCAGATTGTGTCAACGGCTGCCCAGACCTTCCTGGCAACCTGCATCAACGGGGTGTGCTGGACTGTCTACCACGGGGCCGGAACRAGGACCATAGCGTCACCCAAGGGTCCTGTTATCCAGATGTATACCAACGTAGACCAAGACCTCGTGGGCTGGCCCGCYCCCCAAGGCGCCCGCTCACTGGTGCCCTGCACTTGCGGCTCCTCGGACCTTTACCTGGTTACGAGGCACGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGCGGGGTGATAGCAGGGGCAGCCTGCTTTCGCCCCGGCCCATCTCTTACCTGAAAGGCTCYTCAGGGGGCCCACTGCTGTGCCCCGCGGGACACGCCGTAGGCATATTCAGGGCCGCGGTGTGCACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGACTTTATCCCCGTAGAGAGCTTGGAGACAACCATGAGGTCCCCGGTGTTCACAGACAACTCCTCTCCGCCAGCAGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCCCACCTGCATGCTCCCACCGGCAGCGGTAAGAGCACCAAGGTCCCGGCCGCGTACGCGGCTCAAGGCTACAAGGTGCTAGTGCTCAACCCCTCCGTTGCTGCAACACTGGGCTTTGGTGCTTACATGTCCAAGGCCCATGGGATTGATCCTAACATCAGGACTGGGGTAAGGACAATTACTACTGGCAGCCCCATCACGTACTCCACCTACGGCAAGTTCCTTGCCGACGGCGGGTGCTCAGGGGGTGCTTATGACATAATAATTTGTGACGAATGCCACTCYACGGATGCAACATCCATCTTGGGCATCGGAACTGTCCTTGACCAAGCAGAGACTGCGGGGGCGAGACTGGTTGTGCTCGCCACCGCTACCCCTCCGGGCTCCGTCACTGTGCCCCATCCTAACATCGAGGAGGTTGCTCTGTCCACCACCGGTGAGATCCCCTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTCGAGGCAATCAAGGGGGGGAGGCATCTCATCTTCTGCCACTCAAAGAAGAAGTGCGACGAACTCGCCGCGAAACTGGTCGCGTTGGGCATCAATGCCGTGGCTTACTACCGCGGCCTTGACGTGTCCGTCATCCCGACCAGTGGCGATGTYGTCGTCGTAGCAACTGATGCCCTCATGACCGGCTTTACCGGCGATTTCGATTCGGTGATAGACTGTAACACGTGTGTCACCCAGACAGTCGACTTCAGCCTTGACCCTACCTTCACCATTGAGACAACCACGCTTCCCCAGGATGCTGTCTCCCGCACTCAACGTCGGGGCAGGACTGGCAGGGGGAAGCCAGGCATCTACAGATTTGTGGCRCCGGGGGAGCGCCCTTCCGGCATGTTCGACTCGTCTGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCGGGCTGTGCTTGGTATGAACTCACACCCGCCGAGACCACAGTTAGGCTACGAGCATATATGAACACCCCAGGGCTCCCCGTRTGCCAAGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTTTTTACRGGTCTCACCCATATAGACGCCCACTTCCTATCTCAGACAAAACAGAGCG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| 102,963
|
EU781754.1
|
hepatitis C virus genotype 1a
|
Timm,J., Li,B., Daniels,M.G., Bhattacharya,T., Reyor,L.L., Allgaier,R., Kuntzen,T., Fischer,W., Nolan,B.E., Duncan,J., Schulze zur Wiesch,J., Kim,A.Y., Frahm,N., Brander,C., Chung,R.T., Lauer,G.M., Korber,B.T., Allen,T.M., Berical,A., Lennon,N., Berlin,A.M., Young,S.K., Lee,B., Heckerman,D., Carlson,J., Kleyman,M., McMahon,C.M., Birch,C., Schulze Zur Wiesch,J., Ledlie,T., Koehrsen,M., Kodira,C., Roberts,A.D., Rosen,H.R., Bihl,F., Cerny,A., Spengler,U., Liu,Z., Xing,Y., Schneidewind,A., Madey,M.A., Fleckenstein,J.F., Park,V.M., Galagan,J.E., Nusbaum,C., Walker,B.D., Lake-Bakaar,G.V., Daar,E.S., Jacobson,I.M., Gomperts,E.D., Edlin,B.R., Donfield,S.M., Talal,A.H., Marion,T., Birren,B.W., Henn,M.R., Fischer,W.F., Riely,C.A.
|
Massachusetts General Hospital, Partners AIDS Research Center
|
USA
|
2009-05-31
|
F730P
|
Hepacivirus hominis
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,316
|
GenBank
| 2
|
USA: Massachusetts, Boston area
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Hepatitis C virus subtype 1a isolate F730P, complete genome
|
GCCAGGGCGTTAGTATGAGTGTCGTGCAGCCTCCAGGACCCCCCCTCCCGGGAGAGCCATAGTGGTCTGCGGAACCGGTGAGTACACCGGAATTGCCAGGACGACCGGGTCCTTTCTTGGATTAACCCGCTCAATGCCTGGAGATTTGGGCGTGCCCCCGCAAGACTGCTAGCCGAGTAGTGTTGGGTCGCGAAAGGCCTTGTGGTACTGCCTGATAGGGTGCTTGCGAGTGCCCCGGGAGGTCTCGTAGACCGTGCACCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGTCGCCCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGTGGCGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACTTGTTGCCGCGCAGGGGCCCCAGGTTGGGTGTGCGCGCGACGAGGAAGACTTCCGAGCGGTCGCAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCCCAAGGCGCGTCGGCCCGAGGGCAGAACCTGGGCTCAGCCCGGGTACCCTTGGCCCCTCTATGGCAATGAGGGCTGCGGGTGGGCGGGATGGCTCCTGTCCCCCCGTGGTTCTCGGCCTAGTTGGGGCCCCACAGACCCCCGGCGTAGGTCGCGCAATCTGGGTAAGGTCATCGATACCCTTACGTGCGGCTTCGCCGACCTCATGGGGTACATACCGCTCGTCGGCGCCCCCCTTGGAGGCGCTGCCAGGGCCCTGGCGCACGGCGTCCGGGTGCTGGAAGACGGCGTGAACTATGCAACAGGGAACCTTCCTGGTTGCTCTTTCTCTATCTTCCTTCTGGCCCTGCTCTCTTGCCTGACTGTGCCCGCTTCAGCCTACCAAGTGCGCAACTCTTCGGGGCTTTACCATGTCACCAATGATTGCCCCAACTCGAGCATTGTGTACGAGGCGGCCGATGCCATCCTGCACACTCCGGGGTGTGTCCCTTGCGTTCGCGAGGGTAACGCCTCGAGGTGCTGGGTGGCGTTGACCCCCACGGTGGCCACCAGGGACGGCAAACTCCCCACAGCGCAGCTTCGACGTCACATCGATCTGCTTGTCGGGAGTGCCACCCTTTGCTCGGCCCTCTACGTGGGGGACCTGTGCGGGTCTGTCTTCCTTGTCGGTCAACTGTTCACCTTCTCCCCCAGGCGCCACTGGACGACGCAAGGCTGCAATTGTTCTATCTATCCCGGCCATATAACGGGTCACCGCATGGCATGGGATATGATGATGAACTGGTCTCCTACGGCGGCGTTGGTAGTAGCTCAGCTGCTCCGGATCCCACAAGCCATCTTGGACATGATCGCCGGTGCTCACTGGGGAGTCCTGGCGGGCATGGCGTATTTCTCCATGGTGGGGAACTGGGCGAAGGTCCTGGTTGTGCTGCTGCTATTTGCCGGCGTCGACGCGGAAACCCACGTCACCGGGGGAGCTGCCGGCCACGCCTTGTCTGGTCTTACTGCACTGTTCCAACCTGGCGCCAGGCAGAACATCCAGCTGATCAACACCAACGGCAGTTGGCACATCAACCGCACAGCCTTAAACTGCAATGATAGCCTTAACACCGGCTTTTTAGCAGGGCTCTTCTATTATGGCAAATTCAACTCTTCAGGCTGTTCCGAGAGGTTGGCCAGTTGCCGACCCCTTGCCGATTTTCCCCAGGGCTGGGGCCCTATCAGTTATGCCAACGGAAGCGGCCCCGACCAGCGCCCCTACTGCTGGCACTACCCCCCCAGACCTTGTGGTATTGTGCCCGCAAAGAGCGTGTGTGGCCCTGTATACTGCTTCACTCCCAGCCCCGTGGTGGTGGGAACGACCGACAGGTCGGGCGCGCCTACCTACAACTGGGGTGAAAATGATACGGACGTCTTCGTCCTCAACAACACCAGGCCGCCGCTGGGCAATTGGTTCGGTTGTGCATGGATGAACTCATCTGGATTCACCAAGGTATGCGGAGCACCCCCTTGTAACATCGGAGGGGTGGGCAACACCACCTTGCTCTGCCCCACTGATTGTTTCCGCAAGCATCCGGAAGCCACGTACTCTCGGTGCGGCTCCGGTCCCTGGATTACACCCAGGTGCCTGGTCGACTACCCGTATAGGCTTTGGCATTATCCTTGTACCATCAACTACACCATATTTAAAGTCAGGATGTACGTGGGAGGGGTCGAGCACCGGCTACAAGCTGCCTGCAACTGGACGCGGGGCGAACGTTGTGACCTGGAAGACAGGGACAGGTCCGAGCTCAGCCCGTTGCTGTTGTCCACCACACAGTGGCAGGTCCTTCCGTGTTCCTTCACGACCTTGCCAGCCTTGTCCACCGGCCTCATCCATCTCCACCAGAACATCGTGGACGTGCAGTACTTGTACGGGGTGGGGTCAAGCATTGCGTCCTGGGCCATTAAATGGGATTACGTCGTTCTCCTGTTCCTTCTGCTTGCAGACGCGCGCATCTGCTCCTGCTTGTGGATGATGCTACTCATATCCCAAGCGGAGGCGGCTTTGGAGAACCTCATAATACTCAATGCAGCATCCCTGGCCGGGACGCACGGTCTTGTATCCTTCCTCGTGTTCTTCTGCTTTGCATGGTATCTGAAGGGTAGGTGGACGCCCGGAGCGGTCTACGTCTTCTACGGGATGTGGCCTCTCCTCCTGCTCCTGTTGGCGTTGCCCCAGCGGGCGTACGCTCTGGACACGGAGGTGGCCGCGTCGTGTGGCGGCGTTGTTCTTGTCGGGTTGATGGCGCTGACTCTGTCACCATATTACAAGCACTATGTCAGCTGGTGCTTATGGTGGCTTCAGTATTTTCTGACCAGAGTAGAAGCGCAGTTACACGTGTGGGTTCCCCCTCTCAACGTCCGAGGGGGGCGCGACGCCGTCATCTTACTCATGTGTGTCGTGCACCCGACCCTGGTATTTGACATCACCAAACTGCTGCTGGCCGTCTTCGGACCCCTTTGGATTCTTCAAGCCAGTTTGCTTAAAGTGCCCTACTTTGTGCGCGTTCAAGGCCTTCTCCGGATCTGCGCGCTAGCGCGGAAGATGGCCGGAGGCCATTACGTGCAAATGGTCATCATCAAGTTAGGGGCGCTCACTGGCACCTATGTCTATAACCATCTCACTCCTCTTCGGGACTGGGCGCATAACGGCCTGCGAGATCTGGCCGTGGCTGTAGAGCCAGTCGTCTTCTCTCGAATGGAAACCAAGCTCATCACGTGGGGGGCAGACACTGCCGCATGCGGCGACATCATCAACGGTTTGCCCGTCTCCGCCCGTAGGGGCCGGGAGATATTGCTTGGACCAGCCGATGGAATGGTCTCCAAGGGGTGGAGGTTGCTGGCGCCTATCACGGCGTACGCCCAGCAGACAAGGGGCCTCCTAGGATGTATAATCACCAGCCTGACTGGCCGAGACAAAAACCAAGTGGAGGGTGAGGTCCAGATTATGTCAACTGCTGCCCAAACTTTCCTGGCAACGTGCATCAATGGGGTATGCTGGACTGTCTACCACGGGGCCGGAACGAGGACCATGGCATCACCCACGGGTCCCGTTATCCAGATGTATACCAATGTAGACCAAGACCTGGTGGGCTGGCCCGCTCCTCAAGGTGCCCGTTCATTGACACCCTGCACCTGCGGCTCCTCGGACCTCTACCTGGTCACGAGGCACGCCGATGTCATTCCCGTGCGCCGGCGGGGTGATAGCAGGGGCAGCCTGCTTTCGCCCCGGCCCATCTCCTATTTAAAAGGCTCCTCGGGGGGTCCGCTGTTGTGCCCCGCGGGACACGCCGTCGGCATATTCAGGGCCGCGGTGTGCACCCGTGGAGTGGCTAAGGCGGTGGATTTTATCCCTGTGGAGAGCCTAGAGACAACCATGAGGTCCCCGGTGTTCACGGACAACTCTTCTCCACCAGCAGTGCCCCAGAGCTTCCAGGTGGCTCACCTGCACGCTCCCACCGGCAGCGGCAAAAGCACCAAGGTCCCGGCCGCATACGCGGCTCAGGGCTACAAGGTGCTAGTGCTCAACCCCTCTGTTGCCGCAACATTGGGCTTTGGTGCTTACATGTCCAAGGCCCATGGGATCGACCCTAACATCAGGACCGGGGTGAGGACAATTACCACTGGCAGCCCCATTACGTACTCCACCTACGGCAAGTTTCTTGCCGACGGCGGGTGCTCAGGGGGTGCTTATGACATAATAATTTGTGATGAGTGCCACTCCACGGATGCCACATCCATCTTGGGCATCGGCACTGTTCTTGACCAAGCAGAGACTGCGGGGGCGAGACTGGTCGTGCTCGCCACCGCTACCCCTCCGGGCTCTATCACTGTGCCCCATCCTAACATCGAGGAGGTTGCTCTGTCCACCACCGGAGAGATCCCTTTTTACGGCAAGGCTATCCCCCTCGAGGTAATCAAGGGGGGGAGACATCTCATCTTCTGCCACTCGAAGAAGAAGTGCGACGAGCTCGCCGCAAAGCTGGTTGCACTGGGCATCAATGCCGTGGCCTACTACCGCGGTCTTGACGTGTCCGCCATCCCGACCAGCGGAGACGTTGTCGTTGTGGCGACCGATGCTCTCATGACCGGCTATACCGGCGACTTTGACTCGGTGATAGACTGCAACACGTGTGTCACCCAGACAGTCGATTTCAGCCTTGACCCTACTTTCACCATTGAGACAACCACGCTCCCCCAGGACGCTGTCTCCCGCACTCAACGTCGGGGCAGGACTGGCAGGGGGAAGCCAGGCATCTACAGATTTGTGGCACCGGGGGAACGCCCCTCCGGCATGTTCGACTCGTCCGTCCTCTGTGAGTGCTATGACGCGGGCTGTGCTTGGTATGAGCTCACGCCCGCCGAGACTACAGTTAGGCTACGAGCGTACATGAACACCCCGGGGCTTCCCGTGTGCCAAGACCATCTTGAATTTTGGGAGGGCGTCTTTACGGGCCTTACCCATATAGATGCCCACTTCCTATCTCAGACAAAGCAGAGTGGG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| 102,964
|
NC_012213.1
|
human papillomavirus 108
|
Nobre,R.J., Herraez-Hernandez,E., Fei,J.W., Langbein,L., Kaden,S., Grone,H.J., de Villiers,E.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2009-03-13
| null |
Gammapapillomavirus 6
|
Gammapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
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| 7,149
|
RefSeq
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|
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| 7,709
|
OP971018.1
|
human papillomavirus 108
|
Happel,A.-U., Balle,C., Havyarimana,E., Brown,B., Maust,B., Konstantinus,I.N., Feng,C., Yi,B.H., Gill,K., Bekker,L.-G., Passmore,J.-A.S., Jaspan,H.B., Varsani,A.
|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
|
2023-01-14
|
UC091_LW_V1
|
Gammapapillomavirus 6
|
Gammapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,157
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
2016-09-15
|
SAMN22416357
|
PRJNA767784
|
Human papillomavirus 108 isolate UC091_LW_V1, complete genome
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| 19,484
|
OP971066.1
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human papillomavirus 108
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Happel,A.-U., Balle,C., Havyarimana,E., Brown,B., Maust,B., Konstantinus,I.N., Feng,C., Yi,B.H., Gill,K., Bekker,L.-G., Passmore,J.-A.S., Jaspan,H.B., Varsani,A.
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Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
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2023-01-14
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UC137_LW_V2
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Gammapapillomavirus 6
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Gammapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,158
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GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
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Homo sapiens
| null |
2017-05-29
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SAMN30889836
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PRJNA881266
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Human papillomavirus 108 isolate UC137_LW_V2, complete genome
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ATGTATATAAAGGATACACAGGACGGTGCCTCTTCCTTTTTATTTGGACATGGGCGCTTGCGGGTCTTTGTAAGAGGGAATGAATATTGTACCATTTTTATTACTAGGGTGGCAAATATATTTGTGCTGTGTATTTGTTATTACTGTATTGTGTATGTTAAAAATATTTTTATATTTAGGCATTACGGTATAATTTGGGACTGTGTCAGTATTGTACATAGGTACTGTGTGTGTACTAGTAATATATAATAATGAGAGGCAAAGCACCTACTATTAAGGATGTTGATTTAGAACTGCATAGTTTAATTTTACCTGAAAACTTGCTGTGTGGTGAGGAGGTTACATTTGAAGAGGAGGAGCAGGAAGAGCAGGATAAGTGTCCTTACCGGGTGGTGACAGAATGTGGGGTTTGTCATAAGGGATTGTGTATGTATGTGTTGGCCACGGACGAAGGAATCAGAGGGTTTGAGCAACAGCTGTGTGGAGACCTTGACATTGTGTGTCCTGCCTGTGCCAAGCAACGAGAACGAAATGGAGGACAAAGACACTAAAGGTACATCTTTTTGTATTGACAATACTACAGAGGCCATACAATTTATAGAGACTGAAGCCGAATGCGATGAGTGTCTAGACTCGTTGGAAGCATTATTTGAAGAAAGCGATGGGACAGATGTTTCTGATTTAATTAATAATATTGATGAACCCGATGAGGGGAATCCCCATGCACTGTTAAATAGGCAGCAGCTAGAAGAGGACAGTCAGCTGCTAAGTGTGCTAAAACGAAAGTATACTAGTCCTAGCCCGAAGCAGCAGGTTTTAGATTTGAGTCCCAGACTTGAATCGTTGTGTGTGTCGCCACGAGGAACAAGCAGTAAAAGACGGCTGTTTGAGGACAGTGGCTTAGGACATGAAGCTGAAGATTCTAATGAAAGGGTGGAAAAGGTAGCATCGCAAGCGGCACAACCTAGTAATGAGACTAATGGGGAACAGGAGCAGCAGTCTGTGAGTGCAACGCAAAATGGGGATACACAGTGCCTGGACATTTTGCATAGTAACAACAGGCTTGCAACAGCATTAACAAAATTTAAAAACACGTTTGGGGTGGGATATAAAGAACTAACAAGACCGTTTAAAAGTAATAAAACATGCTGCCACAGCTGGGTGGCGGTAATATATGGTGTAAGAGCAGAAATGTTAGAAGCGTCAAAAACATTGTTAAAACCACATTGTGACTTTTTTCAAATTCTTAATCCAAGTATGGGTACAGGGGTTACGGTGTTAATATTATTTGAATTTGCTAGCTCAAAATGCAGGGATACAGTAACAAGGTTATTATGTAATATATTTAATGTAGAAGAGTACCAAATACTTGCAGATCCACCGCGTCATAAAAGTGTTGCAGTAGCATTATTTTTTTATAGACATAGCTTATCAAATATTAGCTTTACAGAGGGTGTAATGCCTGATTGGTTAAAAAAGCAAACTATGTTAAACCACCAGCAGGAGGCAGACACCTTTGAATTAGCTCCTATGGTGCAGTGGGCATATGATAATAATATATGGGAAGAAGCAGAATTAGCATATCAATATGCATGTTTAGCAGATGTAGAACCTAATGCTGCAGCATGGCTAAAAAGTAACAATCAATATAAATATGTATCTGACTGTGCAAAAATGGTAAAAATGTATAAAAGATACGAGATGCGCCAAATGTCTATAGGACAATGGATAAAAAAGTGTGGTGAAACTGTTGATGGGGAAGGAGACTGGAAAAAGCTAATTAATTTACTGAAATATCAGGATGTGTCTATTATTCCATTTTTAACAAGTTTAAGAATGTTTTTAAAAGGTGAACCAAAAAAAAACTGTATTGTTATATGGGGACCACCAGACACAGGGAAGTCTATGTTTTGTTATAGCCTAATACGATATTTACAAGGTAAAGTAGTATCATATGCTAATAGCAAAAGTCAATTTTGGCTACAACCACTTACAGAGGCAAAAATAGGACTTATAGATGATGCCACATTTCCATGCTTTCAGTTTATGGATGTATATATGCGAAGTGGATTAGATGGAAATGAGGTATCAGTTGATTGTAAACATAAAACGCCTATGCAAGTAAAATTGCCACCTATGCTTGTAACCTCCAACATTAATGTGCATGCAGAGACATCTTTAAAATATTTACATAGTAGACTAACAGGATATAATTTTCCACATAAATTACCAGTAGATAGTAATGGCAATGTAGTGTACAAGATCACTCATGCAGATTGGAAATGTTTTTTTAGCAAGCTGGAGCAGCAGTTAGACCTGTGTGAACCAGAGGACAGTACAGATGGAGACACTGGTGCAACGTTTCGATGTTGTGCAAGACAAACTACTGGGGCTTTATGAGGCCGGTCACACAGACCTGGATTCTCAAATACAATATTGGGACCTTGTAAGGCAAGAAAATGTACTGTTGAACTTTGCCAGAAGGCATGGAATACAGATGCTGGGCCTACAAAGAGTGCCCCCATTGGCTATCTCAGAAAGCAAGGCAAAAACAGCCATTATGATGAGACTGGTGCTAGATAGCCTTAAAAAGTCACCATTTGGGCAGGAGCCATGGGGACTAACAGATACCAGTCATGAACTGTATACAACACCACCGGAAAACACATTTAAAAAAGGTGGTACACAAGTGGAAGTGCTATATGACAACGAGGAAAATAAAGCCATGCCATATACAAAGTGGAAATACATTTATTACCAAGATTCAGAAGACCTGTGGCATAAGACACATGCACAGGTAGATGCGGAAGGCCTGTATTTTGTAGATACACAAATGCACAAACATTATTATGTACAGTTTAACAAAGAGGCAATGCAATATGGACATAAAGGTGTATGGCAAGTAAGAACTGGAACTGACACTATATTTGGTGCTTCTTCTGTTGCCAGCACGTCGCGGGGGCCTGAAGCCACCAGTACCGATTCCCAAGCCGGGAGACTACCTGAACGAAAAAGAAAGCGACGCAGACGGTATCCCTCGACGACCACCACCGCGACGTCCGAAAGCGACACAGAGGAAAGCACTTCAGACAATCGAGGAAGGAAGCGACGAAGACTCAGAGAAAGAAAACATAGATCGCGACACAGGTGGGGAACAGGCACAGAATCTGCTTCTGACACTTCTGCATCAGTGGGATCAAGACATCGAAGCCCTAATAGACACTATCCGTCGAGACTTGCAAGGTTACAAGCTGAGGCTAGGGATCCCCCCATATTAATAGTAAAAGGAACATCTAACACACTAAAATGTTGGAGGTACAGGTGTAAAACAAAATATAGTGGCTTATTTGCAAATATTAGTACAGGCTTTACATGGGTGGCGGGAGCTGGTACACCAGAGGGGCATGCACGAATACTAGTAGCCTTTAAAGATAAAATGCAAAGAGACTTGTTTATGCAAACTGTGAAATTACCTAAAGGCACATCATGTGCATTAGGTAATCTGGAATCATTGTAACCACATGCCAATAATGCTGCCTAACTGTCCCCTGTAAATGTATCCCTTCCCCAAAGGTGTATATTGTTGTATATAGATAAAATAGTAAAATGGATGCACAGCCTCCTGCAAAGCGGCGCAAAAGGGACACTGTAGAAAATATATATAAACATTGTGTGGCGTCAGGTACATGTCCAGATGATGTACGTAATAAAGTAGAACAAACCACATTAGCTGATAAAATTTTAAAATGGATTGCCAGTGTGGTGTACTTTGGGGGCTTGGGTATAGGAACGGGTAAGGGCACAGGGGGTTCCTCTGGGTATGTTCCTATAGGAACAGGGGGAGGGGGACGTGTAACATCACAGGGCACACTACTTAGGCCAGGTGTGGTGGTTGATCCCATTGGCCCCCCTGACATTGTTCCTGTAGATGTGGTAACCCCCGACGCGGCTTCCATTGTTCCCCTGGAGGTGTCCCCAACGCCCACCGATGCTATAGTACCTGTAGACCCTCTGCAGCCCGATATTGTTGTCCCTTTAGACCCTGTCTCTGACATTACTATTGATACTACATCTCCAGCTGTTGCTACTATTGACTCTACCAGTGCTATACTAGAGGTGCAGCCCACCACGTCCACGCCTAGACGTGTATCATTAAATAGTACTAGACATGCCACCCCATCATATATTTCTGTGTATGGTCATCCTACAGACCCTGTGTCACAGGCAGCCGCAGAGGTTATTATTGGTGCAGCTGCCACCGATGGTACAGTTGTTGATATTGGTGAATCTATACCTTTGGATACATTTATACAATCCAGGGGGTCTTCTACCTTTGATATTGAACCTGCAGCACAACCTCGCACAAGCACCCCCAGGGCTTTCCAAAGGGCGTTCCAAAGGGCAAGAGACCTGTATAACAGGCGGGTGCAGCAAGTTAGAACTAGAAATGTAAACTTTTTAAACCGCCCACGTCAGGCGGTAACATTTCAATTTGAAAATCCCGCCTTTGAGGAGGAGGTAACCTTACAGTTTGAGCAGGATTTAAATACACTTGCTGCTGCTGCTCCTGACCCGGATTTTGCAGATGTAATCCGCCTTGGGCGGCCACGCGTTTCAGAAACACCAGAAGGTCATGTAAGAATAAGCCGGTTGGGGCAGCGTGGCACCATTCGTACACGTAGTGGCCTGCAAATTGGGCCACACGTACATTACTATTATGATATTAGTAGTATTCATCCTGACTCTATTGAATTGCGTCCTATAGGTCAGCATTCTGGAGAGTCAGGGATTATTTCTAATGCTTCTGCAGTTGCTGAGTCGTCTTTTATTGAGGGTCATACAATACAGGAGCCTTTACTAAATGCTGACTTAGAAGATACTTATACTGAGGACTTTACTTCGTCCCGCCTACGCTTTGCAGGCCTTCAGGGTGTTTCTATATCTCCTGCCTTGGAAACTGTAACATTACCTCCTGGTGCTGCTTTACAATTTATAATAAC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| 19,532
|
LR861885.1
|
human papillomavirus 108
|
Wienecke-Baldacchino K,A.
|
Laboratoire National de Sante, Epidemiology and Microbial Genomics, 1, Rue Louis Rech, 3555 Dudelange
|
Luxembourg
|
2020-09-01
|
LNS3912637_HPV108
|
Gammapapillomavirus 6
|
Gammapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,158
|
GenBank
| null |
Luxembourg
|
Luxembourg
|
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJEB39467
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Human papillomavirus type 108 isolate LNS3912637_HPV108, complete genome
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| 47,396
|
LR861925.1
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human papillomavirus 108
|
Wienecke-Baldacchino K,A.
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Laboratoire National de Sante, Epidemiology and Microbial Genomics, 1, Rue Louis Rech, 3555 Dudelange
|
Luxembourg
|
2020-09-01
|
LNS5517012_HPV108
|
Gammapapillomavirus 6
|
Gammapapillomavirus
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Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,158
|
GenBank
| null |
Luxembourg
|
Luxembourg
|
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJEB39467
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Human papillomavirus type 108 isolate LNS5517012_HPV108, complete genome
|
ATTAATTTATTGTACATTTTACCAGTTATTAAACTGTTTGGCATGTTTACAGTCTCATGTCCTGTTTCTGTGTGATTTATTGTGACTCATTGCATGTCCATTTGCCACACCTGGCTTTTAGTATTTGGCTTCCGTCCTTTTTGGACGTGCATAGACCACGTCCTAGGTTTTTGGCTACTTTTATGCATTTTTGTGTGTTCTGCAGTACCGATAACGGTCGCGCAACGTTTGCCAAGTTTCAGGTATGTACTCTGCAAGTTTTAACAATGCTATTAGTCACTCTGTAATAACTGTTCCGGTTGTTGGCGCCCGTCCTATGACCGGTAGCGGTGCTTTGCCATTTCTTGTTCGGGTGATTGTTGTTGGCAACTATTATCCCTTTCATATTTTATTACAACCGGGAGGGGTACCATGTATATAAAGGATACACAGGACGGTGCCTCTTCCTTTTTATTTGGACATGGGCGCTTGCGGGTGTTTGTAACAGGGAATGAATATTGTACCATTTTTATTACTAGGGTGGCAAATATATTTGTGCTGTGTATTTGTTATTACTGTATTGTGTATGTTAAAAATATTTTTATACCTAGGCATTACGGTATAATTTGGGACTGTGTCAGTATTGTACATAGGTACTGTGTGTGTACTAGTAATATATAATAATGAGAGGCAAAGCACCTACTATTAAGGATGTTGATTTAGAACTGCATAGTTTAATTTTACCTGAAAACTTGCTGTGTGGTGAGGAGGTTACATTTGAAGAGGAGGAGCAGGAAGAGCAGGATAAGTGTCCTTACCGGGTGGTGACAGAATGTGGGGTTTGTCATAAGGGATTGTGTATGTATGTGTTGGCCACGGACGAAGGAATCAGAGGGTTTGAGCAACAGCTGTGTGGAGACCTTGACATTGTGTGTCCTGCCTGTGCCAAGCAACGAGAACGAAATGGAGGACAAAGACACTAAAGGTACATCTTTTTGTATTGACAATACTACAGAGGCCATACAATTTATAGAGACTGAAGCCGAATGCGATGAGTGTCTAGACTCGTTGGAAGCATTATTTGAAGAAAGCGATGGGACAGATGTTTCTGATTTAATTAATAATATTGATGAACCCGATGAGGGGAATCCCCATGCACTGTTAAATAGGCAGCAGCTAGAAGAGGACAGTCAGCTGCTAAGTGTGCTAAAACGAAAGTATACTAGTCCTAGCCCGAAGCAGCAGGTTTTAGATTTGAGTCCCAGACTTGAATCGTTGTGTGTGTCGCCACGAGGAACAAGCAGTAAAAGACGGCTGTTTGAGGACAGTGGCTTAGGACATGAAGCTGAAGATTCTAATGAAAGGGCGGAAAAGGTAGCATCGCAAGCGGCACAACCTAGTAATGAGACTAATGGGGAACAGGAGCAGCAGTCTGTGAGTGCAACGCAAAATGGGGATACACAGTGCCTGGACATTTTGCATAGTAACAACAGGCTTGCAACAGCATTAACAAAATTTAAAAACACGTTTGGGGTGGGATATAAAGAACTAACAAGACCGTTTAAAAGTAATAGAACATGCTGCCACAGCTGGGTGGCGGTAATATATGGTGTAAGAGCAGAAATGTTAGAAGCATCAAAAACATTGTTAAAACCACATTGTGACTTTTTTCAAATTCTTAATCCAAGTATGGGTACAGGGGTTACGGTGTTAATATTATTTGAATTTGCTAGCTCAAAATGCAGGGATACAGTAACAAGGTTATTATGTAATATATTTAATGTAGAAGAGTACCAAATACTTGCAGATCCACCGCGTCATAAAAGTGTTGCAGTAGCATTATTTTTTTATAGACATAGCTTATCAAATATTAGCTTTACAGAGGGTGTAATGCCTGATTGGTTAAAAAAGCAAACTATGTTAAACCACCAGCAGGAGGCAGACACCTTTGAATTAGCTCCTATGGTGCAGTGGGCATATGATAATAATATATGGGAAGAAGCAGAATTAGCATATCAATATGCATGTTTAGCAGATGTAGAACCTAATGCTGCAGCATGGCTAAAAAGTAACAATCAATATAAATATGTATCTGACTGTGCAAAAATGGTAAAAATGTATAAAAGATACGAGATGCGCCAAATGTCTATAGGACAATGGATAAAAAAGTGTGGTGAAACTGTTGATGGGGAAGGAGACTGGAAAAAGCTAATTAATTTACTGAAATATCAGGATGTGTCTATTATTCCATTTTTAACAAGTTTAAGAATGTTTTTAAAAGGTAAACCAAAAAAAAACTGTATTGTTATATGGGGACCACCAGACACAGGGAAGTCTATGTTTTGTTATAGCTTAATACGATATTTACAAGGTAAAGTAGTATCATATGCTAATAGCAAAAGTCAATTTTGGCTACAACCACTTACAGAGGCAAAAATAGGACTTATAGATGATGCCACATTTCCATGCTTTCAGTTTATGGATGTATATATGCGAAGTGGATTAGATGGAAATGAGGTATCAGTTGATTGTAAACATAAAACGCCTATGCAAGTAAAATTGCCACCTATGCTTGTAACCTCCAACATTAATGTGCATGCAGAGACATCTTTAAAATATTTACATAGTAGACTAACAGGATATAATTTTCCACATAAATTACCAGTAGATAGTAATGGCAATGTAGTGTACAAGATCACTCATGCAGATTGGAAATGTTTTTTTAGCAAGCTGGAGCAGCAGTTAGACCTGTGTGAACCAGAGGACAGTACAGATGGAGACACTGGTGCAACGTTTCGATGTTGTGCAAGACAAACTACTGGGGCTTTATGAGGCCGGTCACACAGACCTGGATTCTCAAATACAATATTGGGACCTTGTAAGGCAAGAAAATGTACTGTTGAACTTTGCCAGAAGGCATGGAATACAGATGCTGGGCCTACAAAGAGTGCCCCCATTGGCTATCTCAGAAAGCAAGGCAAAAACAGCCATTATGATGAGACTGGTGCTAGATAGCCTTAAAAAGTCACCATTTGGGCAGGAGCCATGGGGACTAACAGATACCAGTCATGAACTGTATACAACACCACCGGAAAACACATTTAAAAAAGGTGGTGCACAAGTGGAAGTGCTATATGACAACGAGGAAAATAAAGCCATGCCATATACAAAGTGGAAATACATTTATTACCAAGATTCAGAAGACCTGTGGCATAAGACACATGCACAGGTAGATGCGGAAGGCCTGTATTTTGTAGATACACAAATGCACAAACATTATTATGTACAGTTTAACAAAGAGGCAATGCAATATGGACATAAAGGTGTATGGCAAGTAAGAACTGGAACTGACACTATATTTGGTGCTTCTTCTGTTGCCAGCACGTCGCGGGGGCCTGAAGCCACCAGTACCGATTCCCAAGCCGGGAGACTACCTGAACGAAAAAGAAAGCGACGTAGACGCTATCCCTCGACGACCACCACCGCGACGTCCGAAAGCGACACAGAGGAAAGCACTTCAGACAATCGAGGAAGGAAGCGACGAAGACTCAGAGAAAGAAAACATAGATCGCGACACAGGTGGGGAACAGGCACAGAATCTGCTTCTGACACTTCTGCATCAGTGGGATCAAGACATCGAAGCCCTAATAGACACTATCCGTCGAGACTTGCAAGGTTACAAGCTGAGGCTAGGGATCCCCCCATATTAATAGTAAAAGGAACATCTAACACACTAAAATGTTGGAGGTACAGGTGTAAAACAAAATATAGTGGCTTATTTGCAAATATTAGTACAGGCTTTACATGGGTGGCGGGAGCTGGTACACCAGAGGGGCATGCACGAATACTAGTAGCCTTTAAAGATAAAATGCAAAGAGACTTGTTTATGCAAACTGTGAAATTACCTAAAGGCACATCATGTGCATTAGGTAATCTGGAATCATTGTAACCACATGCCAATAATGCTGCCTAACTGTCCCCTGTAAATGTATCCCTTCCCCAAAGGTGTATATTGTTGTATATAGATAAAATAGTAAAATGGATGCACAGCCTCCTGCAAAGCGGCGCAAAAGGGACACTGTAGAAAATATATATAGACATTGTGTGGCGTCAGGTACATGTCCAGATGATGTACGTAATAAAGTAGAACAAACCACATTAGCTGATAAAATTTTAAAATGGATTGCCAGTGTGGTGTACTTTGGGGGCTTGGGTATAGGAACGGGTAAGGGCACAGGGGGTTCCTCTGGGTATGTTCCTATAGGAACAGGGGGAGGGGGACGTGTAACATCACAGGGCACACTACTTAGGCCAGGTGTGGTGGTTGATCCCATTGGCCCCCCTGACATTGTTCCTGTAGATGTGGTAACCCCCGACGCGGCTTCCATTGTTCCCCTGGAGGTGTCCCCAACGCCCACCGATGCTATAGTACCTGTAGACCCTCTGCAGCCCGATATTGTTGTCCCTTTAGACCCTGTCTCTGACATTACTATTGATACTACATCTCCAGCTGTTGCTACTATTGACTCTACCAGTGCTATACTAGAGGTGCAGCCCACCACGTCCACGCCTAGACGTGTATCATTAAATAGTACTAGACATGCCACCCCATCATATATTTCTGTGTATGGTCATCCTACAGACCCTGTGTCACAGGCAGCCGCAGAGGTTATTATTGGTGCAGCTGCCACCGATGGTACAGTTGTTGATATTGGTGAATCTATACCTTTGGATACATTTATACAATCCAGGGGGTCTTCTACCTTTGATATTGAACCTGCAGCACAACCTCGCACAAGCACCCCCAGGGCTTTCCAAAGGGCGTTCCAAAGGGCAAGAGACCTGTATAACAGGCGGGTGCAGCAAGTTAGAACTAGAAATGTAAACTTTTTAAACCGCCCACGTCAGGCGGTAACATTTCAATTTGAAAATCCCGCCTTTGAGGAGGAGGTAACCTTACAGTTTGAGCAGGATTTAAATACACTTGCTGCTGCTGCTCCTGACCCGGATTTTGCAGATGT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|
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human papillomavirus 108
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Wienecke-Baldacchino K,A.
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Laboratoire National de Sante, Epidemiology and Microbial Genomics, 1, Rue Louis Rech, 3555 Dudelange
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Gammapapillomavirus
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Papillomaviridae
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GenBank
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Luxembourg
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Luxembourg
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Homo sapiens
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PRJEB39467
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Human papillomavirus type 108 isolate LNS2084294_HPV108, complete genome
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| 47,480
|
LR862058.1
|
human papillomavirus 108
|
Wienecke-Baldacchino K,A.
|
Laboratoire National de Sante, Epidemiology and Microbial Genomics, 1, Rue Louis Rech, 3555 Dudelange
|
Luxembourg
|
2020-09-01
|
LNS8643673_HPV108
|
Gammapapillomavirus 6
|
Gammapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,158
|
GenBank
| null |
Luxembourg
|
Luxembourg
|
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJEB39467
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Human papillomavirus type 108 isolate LNS8643673_HPV108, complete genome
|
ATTAATTTATTGTACATTTTACCAGTTATTAAACTGTTTGGCATGTTTACAGTCTCATGTCCTGTTTCTGTGTGATTTATTGTGACTCATTGCATGTCCATTTGCCACACCTGGCTTTTAGTATTTGGCTTCCGTCCTTTTTGGACGTGCATAGACCACGTCCTAGGTTTTTGGCTACTTTTATGCATTTTTGTGTGTTCTGCAGTACCGATAACGGTCGCGCAACGTTTGCCAAGTTTCAGGTATGTACTCTGCAAGTTTTAACAATGCTATTAGTCACTCTGTAATAACTGTTCCGGTTGTTGGCGCCCGTCCTATGACCGGTAGCGGTGCTTTGCCATTTCTTGTTCGGGTGATTGTTGTTGGCAACTATTATCCCTTTCATATTTTATTACAACCGGGAGGGGTACCATGTATATAAAGGATACACAGGACGGTGCCTCTTCCTTTTTATTTGGACATGGGCGCTTGCGGGTGTTTGTAACAGGGAATGAATATTGTACCATTTTTATTACTAGGGTGGCAAATATATTTGTGCTGTGTATTTGTTATTACTGTATTGTGTATGTTAAAAATATTTTTATACCTAGGCATTACGGTATAATTTGGGACTGTGTCAGTATTGTACATAGGTACTGTGTGTGTACTAGTAATATATAATAATGAGAGGCAAAGCACCTACTATTAAGGATGTTGATTTAGAACTGCATAGTTTAATTTTACCTGAAAACTTGCTGTGTGGTGAGGAGGTTACATTTGAAGAGGAGGAGCAGGAAGAGCAGGATAAGTGTCCTTACCGGGTGGTGACAGAATGTGGGGTTTGTCATAAGGGATTGTGTATGTATGTGTTGGCCACGGACGAAGGAATCAGAGGGTTTGAGCAACAGCTGTGTGGAGACCTTGACATTGTGTGTCCTGCCTGTGCCAAGCAACGAGAACGAAATGGAGGACAAAGACACTAAAGGTACATCTTTTTGTATTGACAATACTACAGAGGCCATACAATTTATAGAGACTGAAGCCGAATGCGATGAGTGTCTAGACTCGTTGGAAGCATTATTTGAAGAAAGCGATGGGACAGATGTTTCTGATTTAATTAATAATATTGATGAACCCGATGAGGGGAATCCCCATGCACTGTTAAATAGGCAGCAGCTAGAAGAGGACAGTCAGCTGCTAAGTGTGCTAAAACGAAAGTATACTAGTCCTAGCCCGAAGCAGCAGGTTTTAGATTTGAGTCCCAGACTTGAATCGTTGTGTGTGTCGCCACGAGGAACAAGCAGTAAAAGACGGCTGTTTGAGGACAGTGGCTTAGGACATGAAGCTGAAGATTCTAATGAAAGGGCGGAAAAGGTAGCATCGCAAGCGGCACAACCTAGTAATGAGACTAATGGGGAACAGGAGCAGCAGTCTGTGAGTGCAACGCAAAATGGGGATACACAGTGCCTGGACATTTTGCATAGTAACAACAGGCTTGCAACAGCATTAACAAAATTTAAAAACACGTTTGGGGTGGGATATAAAGAACTAACAAGACCGTTTAAAAGTAATAGAACATGCTGCCACAGCTGGGTGGCGGTAATATATGGTGTAAGAGCAGAAATGTTAGAAGCATCAAAAACATTGTTAAAACCACATTGTGACTTTTTTCAAATTCTTAATCCAAGTATGGGTACAGGGGTTACGGTGTTAATATTATTTGAATTTGCTAGCTCAAAATGCAGGGATACAGTAACAAGGTTATTATGTAATATATTTAATGTAGAAGAGTACCAAATACTTGCAGATCCACCGCGTCATAAAAGTGTTGCAGTAGCATTATTTTTTTATAGACATAGCTTATCAAATATTAGCTTTACAGAGGGTGTAATGCCTGATTGGTTAAAAAAGCAAACTATGTTAAACCACCAGCAGGAGGCAGACACCTTTGAATTAGCTCCTATGGTGCAGTGGGCATATGATAATAATATATGGGAAGAAGCAGAATTAGCATATCAATATGCATGTTTAGCAGATGTAGAACCTAATGCTGCAGCATGGCTAAAAAGTAACAATCAATATAAATATGTATCTGACTGTGCAAAAATGGTAAAAATGTATAAAAGATACGAGATGCGCCAAATGTCTATAGGACAATGGATAAAAAAGTGTGGTGAAACTGTTGATGGGGAAGGAGACTGGAAAAAGCTAATTAATTTACTGAAATATCAGGATGTGTCTATTATTCCATTTTTAACAAGTTTAAGAATGTTTTTAAAAGGTAAACCAAAAAAAAACTGTATTGTTATATGGGGACCACCAGACACAGGGAAGTCTATGTTTTGTTATAGCTTAATACGATATTTACAAGGTAAAGTAGTATCATATGCTAATAGCAAAAGTCAATTTTGGCTACAACCACTTACAGAGGCAAAAATAGGACTTATAGATGATGCCACATTTCCATGCTTTCAGTTTATGGATGTATATATGCGAAGTGGATTAGATGGAAATGAGGTATCAGTTGATTGTAAACATAAAACGCCTATGCAAGTAAAATTGCCACCTATGCTTGTAACCTCCAACATTAATGTGCATGCAGAGACATCTTTAAAATATTTACATAGTAGACTAACAGGATATAATTTTCCACATAAATTACCAGTAGATAGTAATGGCAATGTAGTGTACAAGATCACTCATGCAGATTGGAAATGTTTTTTTAGCAAGCTGGAGCAGCAGTTAGACCTGTGTGAACCAGAGGACAGTACAGATGGAGACACTGGTGCAACGTTTCGATGTTGTGCAAGACAAACTACTGGGGCTTTATGAGGCCGGTCACACAGACCTGGATTCTCAAATACAATATTGGGACCTTGTAAGGCAAGAAAATGTACTGTTGAACTTTGCCAGAAGGCATGGAATACAGATGCTGGGCCTACAAAGAGTGCCCCCATTGGCTATCTCAGAAAGCAAGGCAAAAACAGCCATTATGATGAGACTGGTGCTAGATAGCCTTAAAAAGTCACCATTTGGGCAGGAGCCATGGGGACTAACAGATACCAGTCATGAACTGTATACAACACCACCGGAAAACACATTTAAAAAAGGTGGTGCACAAGTGGAAGTGCTATATGACAACGAGGAAAATAAAGCCATGCCATATACAAAGTGGAAATACATTTATTACCAAGATTCAGAAGACCTGTGGCATAAGACACATGCACAGGTAGATGCGGAAGGCCTGTATTTTGTAGATACACAAATGCACAAACATTATTATGTACAGTTTAACAAAGAGGCAATGCAATATGGACATAAAGGTGTATGGCAAGTAAGAACTGGAACTGACACTATATTTGGTGCTTCTTCTGTTGCCAGCACGTCGCGGGGGCCTGAAGCCACCAGTACCGATTCCCAAGCCGGGAGACTACCTGAACGAAAAAGAAAGCGACGTAGACGCTATCCCTCGACGACCACCACCGCGACGTCCGAAAGCGACACAGAGGAAAGCACTTCAGACAATCGAGGAAGGAAGCGACGAAGACTCAGAGAAAGAAAACATAGATCGCGACACAGGTGGGGAACAGGCACAGAATCTGCTTCTGACACTTCTGCATCAGTGGGATCAAGACATCGAAGCCCTAATAGACACTATCCGTCGAGACTTGCAAGGTTACAAGCTGAGGCTAGGGATCCCCCCATATTAATAGTAAAAGGAACATCTAACACACTAAAATGTTGGAGGTACAGGTGTAAAACAAAATATAGTGGCTTATTTGCAAATATTAGTACAGGCTTTACATGGGTGGCGGGAGCTGGTACACCAGAGGGGCATGCACGAATACTAGTAGCCTTTAAAGATAAAATGCAAAGAGACTTGTTTATGCAAACTGTGAAATTACCTAAAGGCACATCATGTGCATTAGGTAATCTGGAATCATTGTAACCACATGCCAATAATGCTGCCTAACTGTCCCCTGTAAATGTATCCCTTCCCCAAAGGTGTATATTGTTGTATATAGATAAAATAGTAAAATGGATGCACAGCCTCCTGCAAAGCGGCGCAAAAGGGACACTGTAGAAAATATATATAGACATTGTGTGGCGTCAGGTACATGTCCAGATGATGTACGTAATAAAGTAGAACAAACCACATTAGCTGATAAAATTTTAAAATGGATTGCCAGTGTGGTGTACTTTGGGGGCTTGGGTATAGGAACGGGTAAGGGCACAGGGGGTTCCTCTGGGTATGTTCCTATAGGAACAGGGGGAGGGGGACGTGTAACATCACAGGGCACACTACTTAGGCCAGGTGTGGTGGTTGATCCCATTGGCCCCCCTGACATTGTTCCTGTAGATGTGGTAACCCCCGACGCGGCTTCCATTGTTCCCCTGGAGGTGTCCCCAACGCCCACCGATGCTATAGTACCTGTAGACCCTCTGCAGCCCGATATTGTTGTCCCTTTAGACCCTGTCTCTGACATTACTATTGATACTACATCTCCAGCTGTTGCTACTATTGACTCTACCAGTGCTATACTAGAGGTGCAGCCCACCACGTCCACGCCTAGACGTGTATCATTAAATAGTACTAGACATGCCACCCCATCATATATTTCTGTGTATGGTCATCCTACAGACCCTGTGTCACAGGCAGCCGCAGAGGTTATTATTGGTGCAGCTGCCACCGATGGTACAGTTGTTGATATTGGTGAATCTATACCTTTGGATACATTTATACAATCCAGGGGGTCTTCTACCTTTGATATTGAACCTGCAGCACAACCTCGCACAAGCACCCCCAGGGCTTTCCAAAGGGCGTTCCAAAGGGCAAGAGACCTGTATAACAGGCGGGTGCAGCAAGTTAGAACTAGAAATGTAAACTTTTTAAACCGCCCACGTCAGGCGGTAACATTTCAATTTGAAAATCCCGCCTTTGAGGAGGAGGTAACCTTACAGTTTGAGCAGGATTTAAATACACTTGCTGCTGCTGCTCCTGACCCGGATTTTGCAGATGT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| 47,559
|
FM212639.1
|
human papillomavirus 108
|
Nobre,R.J., Herraez-Hernandez,E., Fei,J.W., Langbein,L., Kaden,S., Grone,H.J., de Villiers,E.M.
|
de Villiers E.M., Characterization of Tumorviruses, Deutsches Krebsforschungszentrum, Im Neuenheimer Feld 242, Heidelberg, 69120
|
Germany
|
2009-03-09
| null |
Gammapapillomavirus 6
|
Gammapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,149
|
GenBank
| 1
| null | null | null |
lesion_tumor
| null | null | null |
Human papillomavirus type 108, complete genome
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| 103,548
|
OP711982.1
|
human papillomavirus 11
|
Coppee,R., Ferre,V.M., Gbeasor-Komlanvi,F.A., Vacher,S., Bucau,M., Salou,M., Lameiras,S., Couvelard,A., Claver Dagnra,A., Bieche,I., Descamps,D., Ekouevi,D.K., Ghosn,J., Charpentier,C.
|
Universite Paris Cite, Inserm UMR1137
|
France
|
2023-11-24
|
L324R564_HPV11
|
Alphapapillomavirus 10
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Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,951
|
GenBank
| null |
Togo
|
Togo
|
Homo sapiens
| null |
2017-08
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate L324R564_HPV11, complete genome
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CTTAATAACAATCTTAGTTTAAAAAATAGGAGGGACCGAAAACGGTTTAACCGAAAACGGTTATATATAAACCAGCCCAAAAAATTAGCAGACGAGGCATTATGGAAAGTAAAGATGCCTCCACGTCTGCAACATCCATAGACCAGTTGTGCAAGACGTTTAATCTTTCTTTGCACACTTTGCAAATTCAGTGCGTGTTTTGCAGGAATGCACTGACCACCGCAGAGATATATGCATATGCCTATAAGAACCTAAAGGTTGTGTGGCGAGACAACTTTCCCTTTGCAGCGTGTGTCTGTTGCTTAGAACTGCAAGGGAAAATTAACCAATATAGACACTTTAATTATGCTGCATATGCACCTACAGTAGAAGAAGAAACCAAGGAAGATATTTTAAAAGTGTTAATTCGTTGTTACCTGTGTCACAAGCCGTTGTGTGAAATAGAAAAACTAAAGCACATATTGGAAAAGGCACGCTTCATAAAACTAAATAACCAGTGGAAGGGTCGTTGCTTACACTGCTGGACAACATGCATGGAAGACTTGTTACCCTAAAGGATATATTATTAGACCTGCAGCCTCCTGACCCTGTAGGGTTACATTGCTATGAGCAATTAGAAGACAGCTCAGAAGATGAGGTGGACAAGGTGGACAAACAAGACGCACAACCTTTAACACAACATTACCAAATACTGACCTGTTGCTGTGGATGTGACAGCAACGTCCGACTGGTTGTGGAGTGCACAGACGGAGACATCAGACAACTACAAGACCTTTTGCTGGGCACACTAAATATTGTGTGTCCCATCTGCGCACCAAAACCATAACAAGGATGGCGGACGATTCAGGTACAGAAAATGAGGGGTCGGGGTGTACAGGATGGTTTATGGTAGAAGCCATAGTAGAGCACACTACAGGTACACAAATATCAGAAGATGAGGAAGAGGAGGTGGAGGACAGTGGGTATGACATGGTGGACTTTATTGATGACAGGCATATTACACAAAATTCTGTGGAAGCACAGGCATTGTTTAATAGGCAGGAGGCGGATGCTCATTATGCGACTGTGCAGGACCTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCATATGTAAGTCCTATAAGCAATGTAGCTAATGCAGTAGAAAGTGAGATAAGTCCACGGTTAGACGCCATTAAACTTACAACACAGCCAAAAAAGGTAAAGCGACGGCTGTTTGAAACACGGGAATTAACGGACAGTGGATATGGCTATTCTGAAGTGGAAGCTGCAACGCAGGTAGAGAAACATGGCGACCCGGAAAATGGGGGAGATGGTCAGGAAAGGGACACAGGGAGGGACATAGAGGGTGAGGGGGTGGAACATAGAGAGGCGGAAGCAGTAGACAACAGCACCCGAGAGCATGCAGACACATCAGGAATATTAGAATTACTAAAATGTAAGGATATACGATCTACATTACATGGTAAGTTTAAAGACTGCTTTGGGCTGTCCTTTGTTGATTTAATTAGGCCATTTAAAAGTGATAGAACCACATGTGCCGATTGGGTGGTTGCAGGATTTGGTATACATCATAGCATAGCAGATGCATTTCAAAAGTTAATTGAGCCATTAAGTTTATATGCACATATACAATGGCTTACAAATGCATGGGGAATGGTACTATTAGTATTAATAAGGTTTAAAGTAAATAAGAGCAGATGTACCGTGGCACGTACATTAGGTACGTTATTAAATATACCTGAAAATCACATGTTAATTGAGCCTCCTAAAATACAAAGTGGCGTAGCAGCCCTGTATTGGTTTAGGACAGGCATTTCAAATGCAAGTACAGTTATAGGGGAGGCGCCGGAATGGATAACGCGCCAGACCGTTATTGAACATAGTTTGGCTGACAGTCAATTTAAATTAACTGAAATGGTGCAGTGGGCATATGATAATGATATTTGTGAAGAAAGTGAGATAGCATTTGAATATGCACAGCGTGGAGACTTTGACTCCAATGCAAGGGCCTTTTTAAATAGTAATATGCAGGCTAAATATGTAAAAGATTGTGCAATTATGTGCAGACATTATAAACATGCAGAAATGAAAAAGATGTCTATGAAACAATGGATTAAGTATAGGGGTACTAAAGTTGACAGTGTAGGTAACTGGAAGCCAATTGTGCAGTTCCTTAGACATCAAAACATAGAATTTATTCCATTTTTAAGCAAACTAAAATTATGGCTGCACGGAACGCCCAAAAAAAATTGTATAGCCATTGTGGGGCCACCTGACACTGGGAAGTCGTGCTTTTGCATGAGTTTAATTAAGTTTTTGGGGGGAACAGTGATTAGTTATGTTAATTCCTGCAGCCATTTCTGGCTACAGCCACTAACGGATGCAAAGGTGGCATTATTGGATGATGCCACACACCCATGTTGGACATATATGGATACATATATGAGAAACCTATTAGATGGTAATCCTATGAGCATAGATAGAAAACATAGAGCATTAACATTAATTAAGTGTCCACCGCTACTAGTTACATCAAATATAGACATTAGCAAAGATGAGAAATACAAATATTTACATAGTAGGGTTACCACATTTATATTTCCAAATCCATTCCCCTTTGACAGAAATGGGAATGCAGTATATGAACTATCAGATGCAAACTGGAAATGTTTCTTTGAAAGACTGTCGTCCAGCCTAGACATTGAGGATTCAGAGGACGAGGAAGATGGAAGCAATAGCCAAGCGTTTAGATGCGTGCCAGGATCAGTTGTTAGAACTTTATGAAGAAAACAGTATTGATATACACAAACACATTATGCATTGGAAATGCATACGATTGGAAAGTGTATTACTACATAAAGCAAAACAAATGGGCCTGAGCCACATTGGGTTACAAGTAGTACCACCATTAACTGTGTCAGAGACTAAAGGACATAATGCTATTGAAATGCAAATGCATTTAGAATCCTTAGCAAAAACTCAGTATGGTGTGGAACCTTGGACATTACAGGACACCAGTTATGAAATGTGGCTAACACCACCCAAACGGTGCTTTAAAAAACAGGGAAATACTGTGGAGGTAAAATTTGATGGCTGTGAAGACAATGTAATGGAGTATGTGGTATGGACACATATATACCTGCAGGACAACGACTCATGGGTAAAAGTCACTAGTTCCGTAGATGCCAAGGGCATATATTATACATGTGGACAATTTAAAACATATTATGTAAATTTTAATAAAGAGGCACAAAAGTATGGTAGTACCAATCATTGGGAAGTATGTTATGGCAGCACAGTTATATGTTCTCCTGCATCTGTATCTAGCACTGTACGAGAAGTATCCATTGCTGAACCTACTACATACACCCCCGCACAGACCACCGCCCCTACAGTGTCCGCCTGCACCACGGAAGACGTGTCGGCGCCGCCTAGAAAGCGAGCACGTGGACCGTCCACTAACAACACCCTGTGTGTGGCCAACATCAGATCCGTGGACAGTACAATCAAAAACATCGTCACTGACAATTACAACACGCACCAAAGAAGGAACAACTGTCATAGTACAGCTACGCCTATAGTGCAACTGCAAGGTGATTCCAATTGTTTAAAATGTTTTAGATATAGACTTAATGACAAATATAGACATTTGTTTGAATTAGCATCTTCAACGTGGCATTGGGCCTCACCTGAGGCACCACATAAAAATGCAATTGTAACATTAACATATAGCAGTGAGGAACAACGTCAGCAATTTTTAAACAGTGTAAAAATACCACCTACCATTAGGCATAAGGTGGGGTTTATGTCATTGCATTTATTGTAACCATTGCACCTGTATATATGTATATGTGTACATAACATACGTGTATGGAGGTAGTGCCTGTACAAATTGCTGCAGGAACAACTACAACATTGATATTGCCTGTTGTTATTGCATTTGCAGTATGTTTTCTTAGTATTGTACTTATAATATTGATATCTGATTTTCTTGTATATACATCTGTGCTGGTACTAACACTTCTTTTATATTTGCTTTTGTGGCTTCTATTAACAACCCCTTTGCAATTCTTTTTACTAACACTGTGTGTGTGCTATTTTCCTGCCTTTTATATACACATATACATTGTGCAAACGCAACAATAATGGTGATGTTAACCTGTCAGTTAAATGATGGTGATACATGGTTGTTTCTGTGGTTGTTTACTGCATTTGTTGTAGCTGTACTTGGATTGTTGTTACTACATTACAGGGCTGTACATGGTACTGAAAACACTAAATGTGCTAAGTGTAAATCAAACCGCAATACTAATGTGGATTATGTGTATATGTTACATGGTGATAATGGAGATTATGTGTACATGAACTAGAGTAAACCTTTTTTATACAGTGTGTGGTGTACGTTAGTTATATATAATGAAACCTAGGGCACGCAGACGTAAACGTGCGTCGGCCACACAACTATATCAAACATGCAAGGCCACTGGTACATGTCCCCCAGATGTAATTCCTAAAGTTGAACATACTACTATTGCAGATCAAATATTAAAATGGGGAAGCTTAGGGGTTTTTTTTGGTGGGTTGGGTATTGGTACAGGGGCTGGTAGTGGCGGTCGTGCAGGGTATATACCCTTGGGAAGCTCTCCTAAGCCTGCTATTACTGGGGGGCCAGCAGCACGTCCGCCAGTGCTTGTGGAGCCTGTTGCCCCTTCCGATCCCTCCATTGTGTCCTTAATTGAAGAGTCTGCTATCATTAATGCTGGTGCACCTGAGGTGGTACCCCCTACACAGGGTGGCTTTACTATAACATCATCGGAATCAACTACACCTGCTATTTTAGATGTGTCTGTTACCAATCACACTACCACTAGTGTGTTTCAAAATCCACTGTTTACAGAACCGTCTGTAATACAGCCCCAACCACCTGTGGAGGCCAGTGGTCACATACTTATATCTGCCCCAACAATAACATCCCAACATGTAGAAGAAATTCCACTAGACAC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| 10,663
|
MZ334485.1
|
human papillomavirus 11
|
Hosnjak,L., Kocjan,B., Poljak,M.
|
University of Ljubljana, Faculty of Medicine, Institute of Microbiology and Immunology
|
Slovenia
|
2022-09-26
| null |
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,933
|
GenBank
| null |
Slovenia
|
Slovenia
|
Homo sapiens
| null | null | null | null |
Human papillomavirus 11 strain OB42/04-HPV11, complete genome
|
ATGGAAAGTAAAGATGCCTCCACGTCTGCAACATCCATAGACCAGTTGTGCAAGACGTTTAATCTTTCTTTGCACACTCTGCAAATTCAGTGCGTGTTTTGCAGGAATGCACTGACCACCGCAGAGATATATGCATATGCCTATAAGAACCTAAAGGTTGTGTGGCGAGACAACTTTCCCTTTGCAGCGTGTGCCTGTTGCTTAGAACTGCAAGGGAAAATTAACCAATATAGACACTTTAATTATGCTGCATATGCACCTACAGTAGAAGAAGAAACTAATGAAGATATTTTAAAAGTGTTAATTCGTTGTTACCTGTGTCACAAGCCGTTGTGTGAAATAGAAAAACTAAAGCACATATTGGGAAAGGCACGCTTCATAAAACTAAATAACCAGTGGAAGGGTCGTTGCTTACACTGCTGGACAACATGCATGGAAGACTTGTTACCCTAAAGGATATAGTACTAGACCTGCAGCCTCCTGACCCTGTAGGGTTACATTGCTATGAGCAATTAGAAGACAGCTCAGAAGATGAGGTGGACAAGGTGGACAAACAAGACTCACAACCTTTAACACAACATTACCAAATACTGACCTGTTGCTGTGGATGTGACAGCAACGTCCGACTGGTTGTGGAGTGCACAGACGGAGACATCAGACAACTACAAGACCTTTTGCTGGGCACACTAAATATTGTGTGTCCCATCTGCGCACCAAAACCATAACAAGGATGGCGGACGATTCAGGTACAGAAAATGAGGGGTCGGGGTGTACAGGATGGTTTATGGTAGAAGCCATAGTAGAGCACACTACAGGTACACAAATATCAGAAGATGAGGAAGAGGAGGTGGAGGACAGTGGGTATGACATGGTGGACTTTATTGATGACAGGCATATTACACAAAATTCTGTGGAAGCACAGGCATTGTTTAATAGGCAGGAGGCGGATGCTCATTATGCGACTGTGCAGGACCTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCATATGTCAGTCCTATAAGCAATGTAGCTAATGCAGTAGAAAGTGAGATAAGTCCACGGTTAGACGCCATTAAACTTACAACACAGCCAAAAAAGGTAAAGCGACGGCTGTTTGAAACACGGGAATTAACGGACAGTGGATATGGCTATTCTGAAGTGGAAGCTGCAACGCAGGTAGAGAAACATGGCGACCCGGAAAATGGGGGAGATGGTCAGGAAAGGGACACAGGGAGGGACATAGAGGGTGAGGGGGTGGAACATAGAGAGGCGGAAGCAGTAGACGACAGCACCCGAGAGCATGCAGACACATCAGGAATATTAGAATTACTAAAATGTAAGGATATACGATCTACATTACATGGTAAGTTTAAAGACTGCTTTGGGCTGTCATTTGTTGATTTAATTAGGCCATTTAAAAGTGATAGAACCACATGTGCCGATTGGGTGGTTGCAGGATTTGGTATACATCATAGCATAGCAGATGCATTTCAAAAGTTAATTGAGCCATTAAGTTTATATGCACATATACAATGGCTTACAAATGCATGGGGAATGGTACTATTAGTATTAATAAGGTTTAAAGTAAATAAGAGCAGATGTACCGTGGCACGTACATTAGGTACGTTATTAAATATACCTGAAAATCACATGTTAATTGAGCCTCCTAAAATACAAAGTGGCGTAGCAGCCCTGTATTGGTTTAGGACAGGCATTTCAAATGCAAGTACAGTTATAGGGGAGGCGCCGGAATGGATAACGCGCCAGACCGTTATTGAACATAGTTTGGCTGACAGTCAATTTAAATTAACTGAAATGGTGCAGTGGGCATATGATAATGATATTTGTGAAGAAAGTGAGATAGCATTTGAATATGCACAGCGTGGAGACTTTGACTCCAATGCAAGGGCCTTTTTAAATAGTAATATGCAGGCTAAATATGTAAAAGATTGTGCAATTATGTGCAGACATTATAAACATGCAGAAATGAAAAAGATGTCTATTAAACAATGGATTAAGTATAGGGGTACTAAAGTTGACAGTGTAGGTAACTGGAAGCCAATTGTGCAGTTTCTAAGACATCAAAACATAGAATTTATTCCATTTTTAAGCAAACTAAAATTATGGCTGCACGGAACGCCCAAAAAAAATTGTATAGCCATTGTAGGGCCACCTGACACTGGGAAGTCGTGCTTTTGCATGAGTTTAATTAAGTTTTTGGGGGGAACAGTTATTAGTTATGTTAATTCCTGCAGCCATTTTTGGCTACAGCCACTAACGGATGCAAAAGTGGCATTATTGGATGATGCCACACAACCATGTTGGACATATATGGATACATGTATGAGAAACCTATTAGATGGTAATCCTATGAGCATAGATAGAAAACATAGAGCATTAACATTAATTAAGTGTCCACCGCTACTGGTTACATCAAATATAGACATTAGCAAAGAGGAGAAATACAAATATTTACATAGTAGGGTTACCACATTTACATTTCCAAATCCATTCCCCTTTGACAGAAATGGGAATGCAGTATATGAACTATCAGATGCAAACTGGAAATGTTTCTTTGAAAGACTGTCGTCCAGCCTAGACATTGAGGATTCAGAGGACGAGGAAGATGGAAGCAATAGCCAAGCGTTTAGATGCGTGCCAGGATCAGTTGTTAGAACTTTATGAAGAAAACAGTATTGATATACACAAACACATTATGCATTGGAAATGCATACGATTGGAAAGTGTATTACTACACAAAGCAAAACAAATGGGCCTGAGCCACATTGGGCTACAAGTAGTACCACCATTAACTGTGTCAGAGACTAAAGGACATAATGCTATTGAAATGCAAATGCATTTAGAATCCTTAGCAAAAACTCAGTATGGTGTGGAACCTTGGACATTACAGGACACCAGTTATGAAATGTGGCTAACACCACCCAAACGGTGCTTTAAAAAACAGGGAAATACTGTGGAGGTAAAATTTGATGGCTGTGAAGACAATGTAATGGAGTATGTGGTATGGACACATATATACCTGCAGGACAACGACTCATGGGTAAAAGTAACTAGTTCCGTAGATGCCAAGGGCATATATTATACATGTGGACAATTTAAAACATATTATGTAAATTTTAATAAAGAGGCACAAAAGTATGGTAGTACCAATCATTGGGAAGTATGTTATGGCAGCACAGTTATATGTTCTCCTGCATCTGTATCTAGCACTGTACGAGAAGTATCCATTGCTGAACCTACTACATACACCCCCGCACAGACCACCGCCCCTACGGTGTCCGCCTGCACCACGGAAGACGGCGTGTCGGCGCCGCCTAGAAAGCGAGCACGTGGACCGTCCACTAACAACACCCTGTGTGTGGCCAACATTAGATCCGTGGACAGTACAATCAACAACATCGTCACTGACAATTACAACAAGCACCAAAGAAGGAACAACTGTCACAGTGCAGCTACGCCTATAGTGCAACTGCAAGGTGATTCCAATTGTTTAAAATGTTTTAGATATCGACTGAATGACAAATATAGACATTTGTTTGAATTAGCATCTTCAACGTGGCATTGGGCCTCACCTGAGGCACCACATAAAAATGCAATTGTAACATTAACATATAGCAGTGAGGAACAACGTCAGCAATTTTTAAACAGTGTAAAAATACCACCCACCATTAGGCATAAGGTGGGGTTTATGTCATTACATTTATTGTAACCATTGCACCTGTATATATGTATATGTGTACATAACATACGTGTATGGAGGTAGTGCCTGTACAAATTGCTGCAGCAACAACTACAACATTGATATTGCCTGTTGTTATTGCATTTGCAGTATGTTTTCTTAGTATTGTACTTATAATATTAATATCTGATTTTCTAGTATATACATCTGTGCTGGTACTAACACTTCTTTTATATTTGCTTTTGTGGCTTTTATTAACAACCCCTTTGCAATTCTTTTTACTAACACTGTGTGTGTGCTATTTTCCTGCCTTTTATATACACATATACATTGTGCAAACGCAACAATAATGGTGATGTTAACCTGTCACTTAAATGATGGTGATACATGGTTGTTTCTGTGGTTGTTTACTGCATTTGTTGTAGCTGTACTTGGATTGTTGTTACTACATTACAGGGCTGTACATGGTACTGAAAAAACTAAATGTGCTAAGTGTAAATCAAACCGCAATACTACTGTGGATTATGTGTATATGTCACATGGTGATAATGGAGATTATGTGTACATGAACTAGAGTAAACCTTTTTTATACAGTGTGTGGTGTACGTTAGTTATATATAATGAAACCTAGGGCACGCAGACGTAAACGTGCGTCAGCCACACAACTATATCAAACATGCAAGGCCACTGGTACATGTCCCCCAGATGTAATTCCTAAAGTTGAACATACTACTATTGCAGATCAAATATTAAAATGGGGAAGCTTAGGGGTTTTTTTTGGTGGGTTAGGTATTGGTACAGGGGCTGGTAGTGGCGGTCGTGCAGGGTATATACCCTTGGGAAGCTCTCCTAAGCCTGCTATTACTGGGGGGCCAGCAGCACGTCCGCCAGTGCTTGTGGAGCCTGTTGCCCCTTCCGATCCCTCCATTGTGTCCTTAATTGAGGAGTCTGCTATTATTAATGCTGGTGCACCTGAGGTGGTACCCCCTACACAGGGTGGCTTTACTATAACATCATCTGAATCGACTACACCTGCTATTTTAGATGTGTCTGTTACCAATCACACTACCACTAGTGTGTTTCAAAATCCACTGTTTACAGAACCGTCTGTAATACAGCCCCAACCACCTGTGGAGGCCAGTGGTCACATACTTATATCTGCCCCAACAATAACATCCCAACATGTAGAAGACATTCCACTAGACACTTTTGTTGTATCCTCTAGTGATAGTGGACCTACATCCAGTACTCCTCTTCCTCGTGCTTTTCCTCGGCCTCGGGTGGGTTTGTATAGTCGTGCCTTAC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| 24,220
|
MW404328.1
|
human papillomavirus 11
|
Nagy,Z., Petho,Z., Kardos,G., Major,T., Szucs,A., Szarka,K.
|
University of Debrecen, Department of Medical Microbiology
|
Hungary
|
2021-07-18
|
AO-RRP3
|
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,933
|
GenBank
| 1
|
Hungary
|
Hungary
|
Homo sapiens
| null |
2020-04
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate AO-RRP3, complete genome
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CTTAATAACAATCTTAGTTTAAAAAAGAGGAGGGACCGAAAACGGTTCAACCGAAAACGGTTATATATAAACCAGCCCAAAAAATTAGCAGACGAGGCATTATGGAAAGTAAAGATGCCTCCACGTCTGCAACATCCATAGACCAGTTGTGCAAGACGTTTAATCTTTCTTTGCACACTCTGCAAATTCAGTGCGTGTTTTGCAGGAATGCACTGACCACCGCAGAGATATATGCATATGCCTATAAGAACCTAAAGGTTGTGTGGCGAGACAACTTTCCCTTTGCAGCGTGTGCCTGTTGCTTAGAACTGCAAGGGAAAATTAACCAATATAGACACTTTAATTATGCTGCATATGCACCTACAGTAGAAGAAGAAACTAATGAAGATATTTTAAAAGTGTTAATTCGTTGTTACCTGTGTCACAAGCCGTTGTGTGAAATAGAAAAACTAAAGCACATATTGGGAAAGGCACGCTTCATAAAACTAAATAACCAGTGGAAGGGTCGTTGCTTACACTGCTGGACAACATGCATGGAAGACTTGTTACCCTAAAGGATATAGTACTAGACCTGCAGCCTCCTGACCCTGTAGGGTTACATTGCTATGAGCAATTAGAAGACAGCTCAGAAGATGAGGTGGACAAGGTGGACAAACAAGACTCACAACCTTTAACACAACATTACCAAATACTGACCTGTTGCTGTGGATGTGACAGCAACGTCCGACTGGTTGTGGAGTGCACAGACGGAGACATCAGACAACTACAAGACCTTTTGCTGGGCACACTAAATATTGTGTGTCCCATCTGCGCACCAAAACCATAACAAGGATGGCGGACGATTCAGGTACAGAAAATGAGGGGTCGGGGTGTACAGGATGGTTTATGGTAGAAGCCATAGTAGAGCACACTACAGGTACACAAATATCAGAAGATGAGGAAGAGGAGGTGGAGGACAGTGGGTATGACATGGTGGACTTTATTGATGACAGGCATATTACACAAAATTCTGTGGAAGCACAGGCATTGTTTAATAGGCAGGAGGCGGATGCTCATTATGCGACTGTGCAGGACCTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCATATGTCAGTCCTATAAGCAATGTAGCTAATGCAGTAGAAAGTGAGATAAGTCCACGGTTAGACGCCATTAAACTTACAACACAGCCAAAAAAGGTAAAGCGACGGCTGTTTGAAACACGGGAATTAACGGACAGTGGATATGGCTATTCTGAAGTGGAAGCTGCAACGCAGGTAGAGAAACATGGCGACCCGGAAAATGGGGGAGATGGTCAGGAAAGGGACACAGGGAGGGACATAGAGGGTGAGGGGGTGGAACATAGAGAGGCGGAAGCAGTAGACGACAGCACCCGAGAGCATGCAGACACATCAGGAATATTAGAATTACTAAAATGTAAGGATATACGATCTACATTACATGGTAAGTTTAAAGACTGCTTTGGGCTGTCATTTGTTGATTTAATTAGGCCATTTAAAAGTGATAGAACCACATGTGCCGATTGGGTGGTTGCAGGATTTGGTATACATCATAGCATAGCAGATGCATTTCAAAAGTTAATTGAGCCATTAAGTTTATATGCACATATACAATGGCTTACAAATGCATGGGGAATGGTACTATTAGTATTAATAAGGTTTAAAGTAAATAAGAGCAGATGTACCGTGGCACGTACATTAGGTACGTTATTAAATATACCTGAAAATCACATGTTAATTGAGCCTCCTAAAATACAAAGTGGCGTAGCAGCCCTGTATTGGTTTAGGACAGGCATTTCAAATGCAAGTACAGTTATAGGGGAGGCGCCGGAATGGATAACGCGCCAGACCGTTATTGAACATAGTTTGGCTGACAGTCAATTTAAATTAACTGAAATGGTGCAGTGGGCATATGATAATGATATTTGTGAAGAAAGTGAGATAGCATTTGAATATGCACAGCGTGGAGACTTTGACTCCAATGCAAGGGCCTTTTTAAATAGTAATATGCAGGCTAAATATGTAAAAGATTGTGCAATTATGTGCAGACATTATAAACATGCAGAAATGAAAAAGATGTCTATTAAACAATGGATTAAGTATAGGGGTACTAAAGTTGACAGTGTAGGTAACTGGAAGCCAATTGTGCAGTTTCTAAGACATCAAAACATAGAATTTATTCCATTTTTAAGCAAACTAAAATTATGGCTGCACGGAACGCCCAAAAAAAATTGTATAGCCATTGTAGGGCCACCTGACACTGGGAAGTCGTGCTTTTGCATGAGTTTAATTAAGTTTTTGGGGGGAACAGTTATTAGTTATGTTAATTCCTGCAGCCATTTTTGGCTACAGCCACTAACGGATGCAAAAGTGGCATTATTGGATGATGCCACACAACCATGTTGGACATATATGGATACATATATGAGAAACCTATTAGATGGTAATCCTATGAGCATAGATAGAAAACATAGAGCATTAACATTAATTAAGTGTCCACCGCTACTGGTTACATCAAATATAGACATTAGCAAAGAGGAGAAATACAAATATTTACATAGTAGGGTTACCACATTTACATTTCCAAATCCATTCCCCTTTGACAGAAATGGGAATGCAGTATATGAACTATCAGATGCAAACTGGAAATGTTTCTTTGAAAGACTGTCGTCCAGCCTAGACATTGAGGATTCAGAGGACGAGGAAGATGGAAGCAATAGCCAAGCGTTTAGATGCGTGCCAGGATCAGTTGTTAGAACTTTATGAAGAAAACAGTATTGATATACACAAACACATTATGCATTGGAAATGCATACGATTGGAAAGTGTATTACTACACAAAGCAAAACAAATGGGCCTGAGCCACATTGGGCTACAAGTAGTACCACCATTAACTGTGTCAGAGACTAAAGGACATAATGCTATTGAAATGCAAATGCATTTAGAATCCTTAGCAAAAACTCAGTATGGTGTGGAACCTTGGACATTACAGGACACCAGTTATGAAATGTGGCTAACACCACCCAAACGGTGCTTTAAAAAACAGGGAAATACTGTGGAGGTAAAATTTGATGGCTGTGAAGACAATGTAATGGAGTATGTGGTATGGACACATATATACCTGCAGGACAACGACTCATGGGTAAAAGTAACTAGTTCCGTAGATGCCAAGGGCATATATTATACATGTGGACAATTTAAAACATATTATGTAAATTTTAATAAAGAGGCACAAAAGTATGGTAGTACCAATCATTGGGAAGTATGTTATGGCAGCACAGTTATATGTTCTCCTGCATCTGTATCTAGCACTGTACGAGAAGTATCCATTGCTGAACCTACTACATACACCCCCGCACAGACCACCGCCCCTACGGTGTCCGCCTGCACCACGGAAGACGGCGTGTCGGCGCCGCCTAGAAAGCGAGCACGTGGACCGTCCACTAACAACACCCTGTGTGTGGCCAACATTAGATCCGTGGACAGTACAATCAACAACATCGTCACTGACAATTACAACAAGCACCAAAGAAGGAACAACTGTCACAGTGCAGCTACGCCTATAGTGCAACTGCAAGGTGATTCCAATTGTTTAAAATGTTTTAGATATCGACTGAATGACAAATATAGACATTTGTTTGAATTAGCATCTTCAACGTGGCATTGGGCCTCACCTGAGGCACCACATAAAAATGCAATTGTAACATTAACATATAGCAGTGAGGAACAACGTCAGCAATTTTTAAACAGTGTAAAAATACCACCCACCATTAGGCATAAGGTGGGGTTTATGTCATTACATTTATTGTAACCATTGCACCTGTATATATGTATATGTGTACATAACATACGTGTATGGAGGTAGTGCCTGTACAAATTGCTGCAGCAACAACTACAACATTGATATTGCCTGTTGTTATTGCATTTGCAGTATGTTTTCTTAGTATTGTACTTATAATATTAATATCTGATTTTCTAGTATATACATCTGTGCTGGTACTAACACTTCTTTTATATTTGCTTTTGTGGCTTTTATTAACAACCCCTTTGCAATTCTTTTTACTAACACTGTGTGTGTGCTATTTTCCTGCCTTTTATATACACATATACATTGTGCAAACGCAACAATAATGGTGATGTTAACCTGTCACTTAAATGATGGTGATACATGGTTGTTTCTGTGGTTGTTTACTGCATTTGTTGTAGCTGTACTTGGATTGTTGTTACTACATTACAGGGCTGTACATGGTACTGAAAAAACTAAATGTGCTAAGTGTAAATCAAACCGCAATACTACTGTGGATTATGTGTATATGTCACATGGTGATAATGGAGATTATGTGTACATGAACTAGAGTAAACCTTTTTTATACAGTGTGTGGTGTACGTTAGTTATATATAATGAAACCTAGGGCACGCAGACGTAAACGTGCGTCAGCCACACAACTATATCAAACATGCAAGGCCACTGGTACATGTCCCCCAGATGTAATTCCTAAAGTTGAACATACTACTATTGCAGATCAAATATTAAAATGGGGAAGCTTAGGGGTGTTTTTTGGTGGGTTAGGTATTGGTACAGGGGCTGGTAGTGGCGGTCGTGCAGGGTATATACCCTTGGGAAGCTCTCCTAAGCCTGCTATTACTGGGGGGCCAGCAGCACGTCCGCCAGTGCTTGTGGAGCCTGTTGCCCCTTCCGATCCCTCCATTGTGTCCTTAATTGAGGAGTCTGCTATTATTAATGCTGGTGCACCTGAGGTGGTACCCCCTACACAGGGTGGCTTTACTATAACATCATCTGAATCGACTACACCTGCTATTTTAGATGTGTCTGTTACCAATCACACTACCACTAGTGTGTTTCAAAATCCACTGTTTACAGAACCGTCTGTAATACAGCCCCAACCACCTGTGGAGGCCAGTGGTCACATACTTATATCTGCCCCAACAATAACATCCCAACATGTAGAAGACATTCCACTAGA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| 40,375
|
MN788368.1
|
human papillomavirus 11
|
Szarka,K., Nagy,Z.
|
University of Debrecen, Department of Medical Microbiology
|
Hungary
|
2020-09-09
|
JO-RRP10
|
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,933
|
GenBank
| null |
Hungary
|
Hungary
|
Homo sapiens
| null |
2018-06-26
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate JO-RRP10, complete genome
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| 47,148
|
MK463914.1
|
human papillomavirus 11
|
Xu,H., Zhang,W.
|
the Affiliated Hospital of Jiangsu University, Department of Dermatology
|
China
|
2019-08-24
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HPV11-gw-1103
|
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,933
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null |
2016
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate HPV11-gw-1103, complete genome
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ATGGAAAGTAAAGATGCCTCCACGTCTGCAACATCCATAGACCAGTTGTGCAAGACGTTTAATCTTTCTTTGCACACTCTGCAAATTCAGTGCGTGTTTTGCAGGAATGCACTGACCACCGCAGAGATATATGCATATGCCTATAAGAACCTAAAGGTTGTGTGGCGAGACAACTTTCCCTTTGCAGCGTGTGCCTGTTGCTTAGAACTGCAAGGGAAAATTAACCAATATAGACACTTTAATTATGCTGCATATGCACCTACAGTAGAAGAAGAAACTAATGAAGATATTTTAAAAGTGTTAATTCGTTGTTACCTGTGTCACAAGCCGTTGTGTGAAATAGAAAAACTAAAGCACATATTGGGAAAGGCACGCTTCATAAAACTAAATAACCAGTGGAAGGGTCGTTGCTTACACTGCTGGACAACATGCATGGAAGACTTGTTACCCTAAAGGATATAGTACTAGACCTGCAGCCTCCTGACCCTGTAGGGTTACATTGCTATGAGCAATTAGAAGACAGCTCAGAAGATGAGGTGGACAAGGTGGACAAACAAGACTCACAACCTTTAACACAACATTACCAAATACTGACCTGTTGCTGTGGATGTGACAGCAACGTCCGACTGGTTGTGGAGTGCACAGACGGAGACATCAGACAACTACAAGACCTTTTGCTGGGCACACTAAATATTGTGTGTCCCATCTGCGCACCAAAACCATAACAAGGATGGCGGACGATTCAGGTACAGAAAATGAGGGGTCGGGGTGTACAGGATGGTTTATGGTAGAAGCCATAGTAGAGCACACTACAGGTACACAAATATCAGAAGATGAGGAAGAGGAGGTGGAGGACAGTGGGTATGACATGGTGGACTTTATTGATGACAGGCATATTACACAAAATTCTGTGGAAGCACAGGCATTGTTTAATAGGCAGGAGGCGGATGCTCATTATGCGACTGTGCAGGACCTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCATATGTAAGTCCTATAAGCAATGTAGCTAATGCAGTAGAAAGTGAGATAAGTCCACGGTTAGACGCCATTAAACTTACAACACAGCCAAAAAAGGTAAAGCGACGGCTGTTTGAAACACGGGAATTAACGGACAGTGGATATGGCTATTCTGAAGTGGAAGCTGCAACGCAGGTAGAGAAACATGGCGACCCGGAAAATGGGGGAGATGGTCAGGAAAGGGACACAGGGAGGGACATAGAGGGTGAGGGGGTGGAACATAGAGAGGCGGAAGCAGTAGACGACAGCACCCGAGAGCATGCAGACACATCAGGAATATTAGAATTACTAAAATGTAAGGATATACGATCTACATTACATGGTAAGTTTAAAGACTGCTTTGGGCTGTCATTTGTTGATTTAATTAGGCCATTTAAAAGTGATAGAACCACATGTGCCGATTGGGTGGTTGCAGGATTTGGTATACATCATAGCATAGCAGATGCATTTCAAAAGTTAATTGAGCCATTAAGTTTATATGCACATATACAATGGCTTACAAATGCATGGGGAATGGTACTATTAGTATTAATAAGGTTTAAAGTAAATAAGAGCAGATGTACCGTGGCACGTACATTAGGTACGTTATTAAATATACCTGAAAATCACATGTTAATTGAGCCTCCTAAAATACAAAGTGGCGTAGCAGCCCTGTATTGGTTTAGGACAGGCATTTCAAATGCAAGTACAGTTATAGGGGAGGCGCCGGAATGGATAACGCGCCAGACCGTTATTGAACATAGTTTGGCTGACAGTCAATTTAAATTAACTGAAATGGTGCAGTGGGCATATGATAATGATATTTGTGAAGAAAGTGAGATAGCATTTGAATATGCACAGCGTGGAGACTTTGACTCCAATGCAAGGGCCTTTTTAAATAGTAATATGCAGGCTAAATATGTAAAAGATTGTGCAATTATGTGCAGACATTATAAACATGCAGAAATGAAAAAGATGTCTATTAAACAATGGATTAAGTATAGGGGTACTAAAGTTGACAGTGTAGGTAACTGGAAGCCAATTGTGCAGTTTCTAAGACATCAAAACATAGAATTTATTCCATTTTTAAGCAAACTAAAATTATGGCTGCACGGAACGCCCAAAAAAAATTGTATAGCCATTGTAGGGCCACCTGACACTGGGAAGTCGTGCTTTTGCATGAGTTTAATTAAGTTTTTGGGGGGAACAGTTATTAGTTATGTTAATTCCTGCAGCCATTTCTGGCTACAGCCACTAACGGATGCAAAAGTGGCATTATTGGATGATGCCACACAACCATGTTGGACATATATGGATACATATATGAGAAACCTATTAGATGGTAATCCTATGAGCATAGATAGAAAACATAGAGCATTAACATTAATTAAGTGTCCACCGCTACTGGTTACATCAAATATAGACATTAGCAAAGAGGAGAAATACAAATATTTACATAGTAGGGTTACCACATTTACATTTCCAAATCCATTCCCCTTTGACAGAAATGGGAATGCAGTATATGAACTATCAGATGCAAACTGGAAATGTTTCTTTGAAAGACTGTCGTCCAGCCTAGACATTGAGGATTCAGAGGACGAGGAAGATGGAAGCAATAGCCAAGCGTTTAGATGCGTGCCAGGATCAGTTGTTAGAACTTTATGAAGAAAACAGTATTGATATACACAAACACATTATGCATTGGAAATGCATACGATTGGAAAGTGTATTACTACACAAAGCAAAACAAATGGGCCTGAGCCACATTGGGCTACAAGTAGTACCACCATTAACTGTGTCAGAGACTAAAGGACATAATGCTATTGAAATGCAAATGCATTTAGAATCCTTAGCAAAAACTCAGTATGGTGTGGAACCTTGGACATTACAGGACACCAGTTATGAAATGTGGCTAACACCACCCAAACGGTGCTTTAAAAAACAGGGAAATACTGTGGAGGTAAAATTTGATGGCTGTGAAGACAATGTAATGGAGTATGTGGTATGGACACATATATACCTGCAGGACAACGACTCATGGGTAAAAGTAACTAGTTCCGTAGATGCCAAGGGCATATATTATACATGTGGACAATTTAAAACATATTATGTAAATTTTAATAAAGAGGCACAAAAGTATGGTAGTACCAATCATTGGGAAGTATGTTATGGCAGCACAGTTATATGTTCTCCTGCATCTGTATCTAGCACTGTACGAGAAGTATCCATTGCTGAACCTACTACATACACCCCCGCACAGACCACCGCCCCTACAGTGTCCGCCTGCACCACGGAAGACGGCGTGTCGGCGCCGCCTAGAAAGCGAGCACGTGGACCGTCCACTAACAACACCCTGTGTGTGGCCAACATTAGATCCGTGGACAGTACAATCAACAACATCGTCACTGACAATTACAACAAGCACCAAAGAAGGAACAACTGTCACAGTGCAGCTACGCCTATAGTGCAACTGCAAGGTGATTCCAATTGTTTAAAATGTTTTAGATATCGACTGAATGACAAATATAAACATTTGTTTGAATTAGCATCTTCAACGTGGCATTGGGCCTCACCTGAGGCACCACATAAAAATGCAATTGTAACATTAACCTATAGCAGTGAGGAACAACGTCAGCAATTTTTAAACAGTGTAAAAATACCACCCACCATTAGGCATAAGGTGGGGTTTATGTCATTACATTTATTGTAACCATTGCACCTGTATATATGTATATGTGTACATAACATACGTGTATGGAGGTAGTGCCTGTACAAATTGCTGCAGCAACAACTACAACATTGATATTGCCTGTTGTTATTGCATTTGCAGTATGTTTTCTTAGTATTGTACTTATAATATTAATATCTGATTTTCTAGTATATACATCTGTGCTGGTACTAACACTTCTTTTATATTTGCTTTTGTGGCTTTTATTAACAACCCCTTTGCAATTCTTTTTACTAACACTGTGTGTGTGCTATTTTCCTGCCTTTTATATACACATATACATTGTGCAAACGCAACAATAATGGTGATGTTAACCTGTCACTTAAATGATGGTGATACATGGTTGTTTCTGTGGTTGTTTACTGCATTTGTTGTAGCTGTACTTGGATTGTTGTTACTACATTACAGGGCTGTACATGGTACTGAAAAAACTAAATGTGCTAAGTGTAAATCAAACCGCAATACTACTGTGGATTATGTGTATATGTCACATGGTGATAATGGAGATTATGTGTACATGAACTAGAGTAAACCTTTTTTATACAGTGTGTGGTGTACGTTAGTTATATATAATGAAACCTAGGGCACGCAGACGTAAACGTGCGTCAGCCACACAACTATATCAAACATGCAAGGCCACTGGTACATGTCCCCCAGATGTAATTCCTAAAGTTGAACATACTACTATTGCAGATCAAATATTAAAATGGGGAAGCTTAGGGGTTTTTTTTGGTGGGTTAGGTATTGGTACAGGGGCTGGTAGTGGCGGTCGTGCAGGGTATATACCCTTGGGAAGCTCTCCTAAGCCTGCTATTACTGGGGGGCCAGCAGCACGTCCGCCAGTGCTTGTGGAGCCTGTTGCCCCTTCCGATCCCTCCATTGTGTCCTTAATTGAGGAGTCTGCTATTATTAATGCTGGTGCACCTGAGGTGGTACCCCCTACACAGGGTGGCTTTACTATAACATCATCTGAATCGACTACACCTGCTATTTTAGATGTGTCTGTTACCAATCACACTACCACTAGTGTGTTTCAAAATCCACTGTTTACAGAACCGTCTGTAATACAGCCCCAACCACCTGTGGAGGCCAGTGGTCACATACTTATATCTGCCCCAACAATAACATCCCAACATGTAGAAGACATTCCACTAGACACTTTTGTTGTATCCTCTAGTGATAGTGGACCTACATCCAGTACTCCTCTTCCTCGTGCTTTTCCTCGGCCTCGGGTGGGTTTGTATAGTCGTGCCTTAC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human papillomavirus 11
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Xu,H., Zhang,W.
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the Affiliated Hospital of Jiangsu University, Department of Dermatology
|
China
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2019-08-24
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Alphapapillomavirus 10
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Alphapapillomavirus
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GenBank
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China
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China
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Human papillomavirus 11 isolate HPV11-gw-1104, complete genome
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| 60,216
|
MK463916.1
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human papillomavirus 11
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Xu,H., Zhang,W.
|
the Affiliated Hospital of Jiangsu University, Department of Dermatology
|
China
|
2019-08-24
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HPV11-gw-1105
|
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,932
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GenBank
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China
|
China
| null | null |
2016
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate HPV11-gw-1105, complete genome
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ATGGAAAGTAAAGATGCCTCCACGTCTGCAACATCCATAGACCAGTTGTGCAAGACGTTTAATCTTTCTTTGCACACTCTGCAAATTCAGTGCGTGTTTTGCAGGAATGCACTGACCACCGCAGAGATATATGCATATGCCTATAAGAACCTAAAGGTTGTGTGGCGAGACAACTTTCCCTTTGCAGCGTGTGCCTGTTGCTTAGAACTGCAAGGGAAAATTAACCAATATAGACACTTTAATTATGCTGCATATGCACCTACAGTAGAAGAAGAAACTAATGAAGATATTTTAAAAGTGTTAATTCGTTGTTACCTGTGTCACAAGCCGTTGTGTGAAATAGAAAAACTAAAGCACATATTGGGAAAGGCACGCTTCATAAAACTAAATAACCAGTGGAAGGGTCGTTGCTTACACTGCTGGACAACATGCATGGAAGACTTGTTACCCTAAAGGATATAGTACTAGACCTGCAGCCTCCTGACCCTGTAGGGTTACATTGCTATGAGCAATTAGAAGACAGCTCAGAAGATGAGGTGGACAAGGTGGACAAACAAGACTCACAACCTTTAACACAACATTACCAAATACTGACCTGTTGCTGTGGATGTGACAGCAACGTCCGACTGGTTGTGGAGTGCACAGACGGAGACATCAGACAACTACAAGACCTTTTGCTGGGCACACTAAATATTGTGTGTCCCATCTGCGCACCAAAACCATAACAAGGATGGCGGACGATTCAGGTACAGAAAATGAGGGGTCGGGGTGTACAGGATGGTTTATGGTAGAAGCCATAGTAGAGCACACTACAGGTACACAAATATCAGAAGATGAGGAAGAGGAGGTGGAGGACAGTGGGTATGACATGGTGGACTTTATTGATGACAGGCATATTACACAAAATTCTGTGGAAGCACAGGCATTGTTTAATAGGCAGGAGGCGGATGCTCATTATGCGACTGTGCAGGACCTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCATATGTAAGTCCTATAAGCAATGTAGCTAATGCAGTAGAAAGTGAGATAAGTCCACGGTTAGACGCCATTAAACTTACAACACAGCCAAAAAAGGTAAAGCGACGGCTGTTTGAAACACGGGAATTAACGGACAGTGGATATGGCTATTCTGAAGTGGAAGCTGCAACGCAGGTAGAGAAACATGGCGACCCGGAAAATGGGGGAGATGGTCAGGAAAGGGACACAGGGAGGGACATAGAGGGTGAGGGGGTGGAACATAGAGAGGCGGAAGCAGTAGACGACAGCACCCGAGAGCATGCAGACACATCAGGAATATTAGAATTACTAAAATGTAAGGATATACGATCTACATTACATGGTAAGTTTAAAGACTGCTTTGGGCTGTCATTTGTTGATTTAATTAGGCCATTTAAAAGTGATAGAACCACATGTGCCGATTGGGTGGTTGCAGGATTTGGTATACATCATAGCATAGCAGATGCATTTCAAAAGTTAATTGAGCCATTAAGTTTATATGCACATATACAATGGCTTACAAATGCATGGGGAATGGTACTATTAGTATTAATAAGGTTTAAAGTAAATAAGAGCAGATGTACCGTGGCACGTACATTAGGTACGTTATTAAATATACCTGAAAATCACATGTTAATTGAGCCTCCTAAAATACAAAGTGGCGTAGCAGCCCTGTATTGGTTTAGGACAGGCATTTCAAATGCAAGTACAGTTATAGGGGAGGCGCCGGAATGGATAACGCGCCAGACCGTTATTGAACATAGTTTGGCTGACAGTCAATTTAAATTAACTGAAATGGTGCAGTGGGCATATGATAATGATATTTGTGAAGAAAGTGAGATAGCATTTGAATATGCACAGCGTGGAGACTTTGACTCCAATGCAAGGGCCTTTTTAAATAGTAATATGCAGGCTAAATATGTAAAAGATTGTGCAATTATGTGCAGACATTATAAACATGCAGAAATGAAAAAGATGTCTATTAAACAATGGATTAAGTATAGGGGTACTAAAGTTGACAGTGTAGGTAACTGGAAGCCAATTGTGCAGTTTCTAAGACATCAAAACATAGAATTTATTCCATTTTTAAGCAAACTAAAATTATGGCTGCACGGAACGCCCAAAAAAAATTGTATAGCCATTGTAGGGCCACCTGACACTGGGAAGTCGTGCTTTTGCATGAGTTTAATTAAGTTTTTGGGGGGAACAGTTATTAGTTATGTTAATTCCTGCAGCCATTTCTGGCTACAGCCACTAACGGATGCAAAAGTGGCATTATTGGATGATGCCACACAACCATGTTGGACATATATGGATACATATATGAGAAACCTATTAGATGGTAATCCTATGAGCATAGATAGAAAACATAGAGCATTAACATTAATTAAGTGTCCACCGCTACTGGTTACATCAAATATAGACATTAGCAAAGAGGAGAAATACAAATATTTACATAGTAGGGTTACCACATTTACATTTCCAAATCCATTCCCCTTTGACAGAAATGGGAATGCAGTATATGAACTATCAGATGCAAACTGGAAATGTTTCTTTGAAAGACTGTCGTCCAGCCTAGACATTGAGGATTCAGAGGACGAGGAAGATGGAAGCAATAGCCAAGCGTTTAGATGCGTGCCAGGATCAGTTGTTAGAACTTTATGAAGAAAACAGTATTGATATACACAAACACATTATGCATTGGAAATGCATACGATTGGAAAGTGTATTACTACACAAAGCAAAACAAATGGGCCTGAGCCACATTGGGCTACAAGTAGTACCACCATTAACTGTGTCAGAGACTAAAGGACATAATGCTATTGAAATGCAAATGCATTTAGAATCCTTAGCAAAAACTCAGTATGGTGTGGAACCTTGGACATTACAGGACACCAGTTATGAAATGTGGCTAACACCACCCAAACGGTGCTTTAAAAAACAGGGAAATACTGTGGAGGTAAAATTTGATGGCTGTGAAGACAATGTAATGGAGTATGTGGTATGGACACATATATACCTGCAGGACAACGACTCATGGGTAAAAGTAACTAGTTCCGTAGATGCCAAGGGCATATATTATACATGTGGACAATTTAAAACATATTATGTAAATTTTAATAAAGAGGCACAAAAGTATGGTAGTACCAATCATTGGGAAGTATGTTATGGCAGCACAGTTATATGTTCTCCTGCATCTGTATCTAGCACTGTACGAGAAGTATCCATTGCTGAACCTACTACATACACCCCCGCACAGACCACCGCCCCTACAGTGTCCGCCTGCACCACGGAAGACGGCGTGTCGGCGCCGCCTAGAAAGCGAGCACGTGGACCGTCCACTAACAACACCCTGTGTGTGGCCAACATTAGATCCGTGGACAGTACAATCAACAACATCGTCACTGACAATTACAACAAGCACCAAAGAAGGAACAACTGTCACAGTGCAGCTACGCCTATAGTGCAACTGCAAGGTGATTCCAATTGTTTAAAATGTTTTAGATATCGACTGAATGACAAATATAGACATTTGTTTGAATTAGCATCTTCAACGTGGCATTGGGCCTCACCTGAGGCACCACATAAAAATGCAATTGTAACATTAACCTATAGCAGTGAGGAACAACGTCAGCAATTTTTAAACAGTGTAAAAATACCACCCACCATTAGGCATAAGGTGGGGTTTATGTCATTACATTTATTGTAACCATTGCACCTGTATATATGTATATGTGTACATAACATACGTGTATGGAGGTAGTGCCTGTACAAATTGCTGCAGCAACAACTACAACATTGATATTGCCTGTTGTTATTGCATTTGCAGTATGTTTTCTTAGTATTGTACTTATAATATTAATATCTGATTTTCTAGTATATACATCTGTGCTGGTACTAACACTTCTTTTATATTTGCTTTTGTGGCTTTTATTAACAACCCCTTTGCAATTCTTTTTACTAACACTGTGTGTGTGCTATTTTCCTGCCTTTTATATACACATATACATTGTGCAAACGCAACAATAATGGTGATGTTAACCTGTCACTTAAATGATGGTGATACATGGTTGTTTCTGTGGTTGTTTACTGCATTTGTTGTAGCTGTACTTGGATTGTTGTTACTACATTACAGGGCTGTACATGGTACTGAAAAAACTAAATGTGCTAAGTGTAAATCAAACCGCAATACTACTGTGGATTATGTGTATATGTCACATGGTGATAATGGAGATTATGTGTACATGAACTAGAGTAAACCTTTTTTATACAGTGTGTGGTGTACGTTAGTTATATATAATGAAACCTAGGGCACGCAGACGTAAACGTGCGTCAGCCACACAACTATATCAAACATGCAAGGCCACTGGTACATGTCCCCCAGATGTAATTCCTAAAGTAGAACATACTACTATTGCAGATCAAATATTAAAATGGGGAAGCTTAGGGGTTTTTTTTGGTGGGTTAGGTATTGGTACAGGGGCTGGTAGTGGCGGTCGTGCAGGGTATATACCCTTGGGAAGCTCTCCTAAGCCTGCTATTACTGGGGGGCCAGCAGCACGTCCGCCAGTGCTTGTGGAGCCTGTTGCCCCTTCCGATCCCTCCATTGTGTCCTTAATTGAGGAGTCTGCTATTATTAATGCTGGTGCACCTGAGGTGGTACCCCCTACACAGGGTGGCTTTACTATAACATCATCTGAATCGACTACACCTGCTATTTTAGATGTGTCTGTTACCAATCACACTACCACTAGTGTGTTTCAAAATCCACTGTTTACAGAACCGTCTGTAATACAGCCCCAACCACCTGTGGAGGCCAGTGGTCACATACTTATATCTGCCCCTACAATAACATCCCAACATGTAGAAGACATTCCACTAGACACTTTTGTTGTATCCTCTAGTGATAGTGGACCTACATCCAGTACTCCTCTTCCTCGTGCTTTTCCTCGGCCTCGGGTGGGTTTGTATAGTCGTGCCTTAC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human papillomavirus 11
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Xu,H., Zhang,W.
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the Affiliated Hospital of Jiangsu University, Department of Dermatology
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China
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2019-08-24
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HPV11-gw-1106
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Alphapapillomavirus 10
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
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GenBank
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China
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China
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2016
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate HPV11-gw-1106, complete genome
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| 60,218
|
MK463918.1
|
human papillomavirus 11
|
Xu,H., Zhang,W.
|
the Affiliated Hospital of Jiangsu University, Department of Dermatology
|
China
|
2019-08-24
|
HPV11-gw-1107
|
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,933
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null |
2016
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate HPV11-gw-1107, complete genome
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ATGGAAAGTAAAGATGCCTCCACGTCTGCAACATCCATAGACCAGTTGTGCAAGACGTTTAATCTTTCTTTGCACACTCTGCAAATTCAGTGCGTGTTTTGCAGGAATGCACTGACCACCGCAGAGATATATGCATATGCCTATAAGAACCTAAAGGTTGTGTGGCGAGACAACTTTCCCTTTGCAGCGTGTGCCTGTTGCTTAGAACTGCAAGGGAAAATTAACCAATATAGACACTTTAATTATGCTGCATATGCACCTACAGTAGAAGAAGAAACTAATGAAGATATTTTAAAAGTGTTAATTCGTTGTTACCTGTGTCACAAGCCGTTGTGTGAAATAGAAAAACTAAAGCACATATTGGGAAAGGCACGCTTCATAAAACTAAATAACCAGTGGAAGGGTCGTTGCTTACACTGCTGGACAACATGCATGGAAGACTTGTTACCCTAAAGGATATAGTACTAGACCTGCAGCCTCCTGACCCTGTAGGGTTACATTGCTATGAGCAATTAGAAGACAGCTCAGAAGATGAGGTGGACAAGGTGGACAAACAAGACTCACAACCTTTAACACAACATTACCAAATACTGACCTGTTGCTGTGGATGTGACAGCAACGTCCGACTGGTTGTGGAGTGCACAGACGGAGACATCAGACAACTACAAGACCTTTTGCTGGGCACACTAAATATTGTGTGTCCCATCTGCGCACCAAAACCATAACAAGGATGGCGGACGATTCAGGTACAGAAAATGAGGGGTCGGGGTGTACAGGATGGTTTATGGTAGAAGCCATAGTAGAGCACACTACAGGTACACAAATATCAGAAGATGAGGAAGAGGAGGTGGAGGACAGTGGGTATGACATGGTGGACTTTATTGATGACAGGCATATTACACAAAATTCTGTGGAAGCACAGGCATTGTTTAATAGGCAGGAGGCGGATGCTCATTATGCGACTGTGCAGGACCTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCATATGTAAGTCCTATAAGCAATGTAGCTAATGCAGTAGAAAGTGAGATAAGTCCACGGTTAGACGCCATTAAACTTACAACACAGCCAAAAAAGGTAAAGCGACGGCTGTTTGAAACACGGGAATTAACGGACAGTGGATATGGCTATTCTGAAGTGGAAGCTGCAACGCAGGTAGAGAAACATGGCGACCCGGAAAATGGGGGAGATGGTCAGGAAAGGGACACAGGGAGGGACATAGAGGGTGAGGGGGTGGAACATAGAGAGGCGGAAGCAGTAGACGACAGCACCCGAGAGCATGCAGACACATCAGGAATATTAGAATTACTAAAATGTAAGGATATACGATCTACATTACATGGTAAGTTTAAAGACTGCTTTGGGCTGTCATTTGTTGATTTAATTAGGCCATTTAAAAGTGATAGAACCACATGTGCCGATTGGGTGGTTGCAGGATTTGGTATACATCATAGCATAGCAGATGCATTTCAAAAGTTAATTGAGCCATTAAGTTTATATGCACATATACAATGGCTTACAAATGCATGGGGAATGGTACTATTAGTATTAATAAGGTTTAAAGTAAATAAGAGCAGATGTACCGTGGCACGTACATTAGGTACGTTATTAAATATACCTGAAAATCACATGTTAATTGAGCCTCCTAAAATACAAAGTGGCGTAGCAGCCCTGTATTGGTTTAGGACAGGCATTTCAAATGCAAGTACAGTTATAGGGGAGGCGCCGGAATGGATAACGCGCCAGACCGTTATTGAACATAGTTTGGCTGACAGTCAATTTAAATTAACTGAAATGGTGCAGTGGGCATATGATAATGATATTTGTGAAGAAAGTGAGATAGCATTTGAATATGCACAGCGTGGAGACTTTGACTCCAATGCAAGGGCCTTTTTAAATAGTAATATGCAGGCTAAATATGTAAAAGATTGTGCAATTATGTGCAGACATTATAAACATGCAGAAATGAAAAAGATGTCTATTAAACAATGGATTAAGTATAGGGGTACTAAAGTTGACAGTGTAGGTAACTGGAAGCCAATTGTGCAGTTTCTAAGACATCAAAACATAGAATTTATTCCATTTTTAAGCAAACTAAAATTATGGCTGCACGGAACGCCCAAAAAAAATTGTATAGCCATTGTAGGGCCACCTGACACTGGGAAGTCGTGCTTTTGCATGAGTTTAATTAAGTTTTTGGGGGGAACAGTTATTAGTTATGTTAATTCCTGCAGCCATTTCTGGCTACAGCCACTAACGGATGCAAAAGTGGCATTATTGGATGATGCCACACAACCATGTTGGACATATATGGATACATATATGAGAAACCTATTAGATGGTAATCCTATGAGCATAGATAGAAAACATAGAGCATTAACATTAATTAAGTGTCCACCGCTACTGGTTACATCAAATATAGACATTAGCAAAGAGGAGAAATACAAATATTTACATAGTAGGGTTACCACATTTACATTTCCAAATCCATTCCCCTTTGACAGAAATGGGAATGCAGTATATGAACTATCAGATGCAAACTGGAAATGTTTCTTTGAAAGACTGTCGTCCAGCCTAGACATTGAGGATTCAGAGGACGAGGAAGATGGAAGCAATAGCCAAGCGTTTAGATGCGTGCCAGGATCAGTTGTTAGAACTTTATGAAGAAAACAGTATTGATATACACAAACACATTATGCATTGGAAATGCATACGATTGGAAAGTGTATTACTACACAAAGCAAAACAAATGGGCCTGAGCCACATTGGGCTACAAGTAGTACCACCATTAACTGTGTCAGAGACTAAAGGACATAATGCTATTGAAATGCAAATGCATTTAGAATCCTTAGCAAAAACTCAGTATGGTGTGGAACCTTGGACATTACAGGACACCAGTTATGAAATGTGGCTAACACCACCCAAACGGTGCTTTAAAAAACAGGGAAATACTGTGGAGGTAAAATTTGATGGCTGTGAAGACAATGTAATGGAGTATGTGGTATGGACACATATATACCTGCAGGACAACGACTCATGGGTAAAAGTAACTAGTTCCGTAGATGCCAAGGGCATATATTATACATGTGGACAGTTTAAAACATATTATGTAAATTTTAATAAAGAGGCACAAAAGTATGGTAGTACCAATCATTGGGAAGTATGTTATGGCAGCACAGTTATATGTTCTCCTGCATCTGTATCTAGCACTGTACGAGAAGTATCCATTGCTGAACCTACTACATACACCCCCGCACAGACCACCGCCCCTACAGTGTCCGCCTGCACCACGGAAGACGGCGTGTCGGCGCCGCCTAGAAAGCGAGCACGTGGACCGTCCACTAACAACACCCTGTGTGTGGCCAACATTAGATCCGTGGACAGTACAATCAACAACATCGTCACTGACAATTACAACAAGCACCAAAGAAGGAACAACTGTCACAGTGCAGCTACGCCTATAGTGCAACTGCAAGGTGATTCCAATTGTTTAAAATGTTTTAGATATCGACTGAATGACAAATATAGACATTTGTTTGAATTAGCATCTTCAACGTGGCATTGGGCCTCACCTGAGGCACCACATAAAAATGCAATTGTAACATTAACCTATAGCAGTGAGGAACAACGTCAGCAATTTTTAAACAGTGTAAAAATACCACCCACCATTAGGCATAAGGTGGGGTTTATGTCATTACATTTATTGTAACCATTGCACCTGTATATATGTATATGTGTACATAACATACGTGTATGGAGGTAGTGCCTGTACAAATTGCTGCAGCAACAACTACAACATTGATATTGCCTGTTGTTATTGCATTTGCAGTATGTTTTCTTAGTATTGTACTTATAATATTAATATCTGATTTTCTAGTATATACATCTGTGCTGGTACTAACACTTCTTTTATATTTGCTTTTGTGGCTTTTATTAACAACCCCTTTGCAATTCTTTTTACTAACACTGTGTGTGTGCTATTTTCCTGCCTTTTATATACACATATACATTGTGCAAACGCAACAATAATGGTGATGTTAACCTGTCACTTAAATGATGGTGATACATGGTTGTTTCTGTGGTTGTTTACTGCATTTGTTGTAGCTGTACTTGGATTGTTGTTACTACATTACAGGGCTGTACATGGTACTGAAAAAACTAAATGTGCTAAGTGTAAATCAAACCGCAATACTACTGTGGATTATGTGTATATGTCACATGGTGATAATGGAGATTATGTGTACATGAACTAGAGTAAACCTTTTTTATACAGTGTGTGGTGTACGTTAGTTATATATAATGAAACCTAGGGCACGCAGACGTAAACGTGCGTCAGCCACACAACTATATCAAACATGCAAGGCCACTGGTACATGTCCCCCAGATGTAATTCCTAAAGTTGAACATACTACTATTGCAGATCAAATATTAAAATGGGGAAGCTTAGGGGTTTTTTTTGGTGGGTTAGGTATTGGTACAGGGGCTGGTAGTGGCGGTCGTGCAGGGTATATACCCTTGGGAAGCTCTCCTAAGCCTGCTATTACTGGGGGGCCAGCAGCACGTCCGCCAGTGCTTGTGGAGCCTGTTGCCCCTTCCGATCCCTCCATTGTGTCCTTAATTGAGGAGTCTGCTATTATTAATGCTGGTGCACCTGAGGTGGTACCCCCTACACAGGGTGGCTTTACTATAACATCATCTGAATCGACTACACCTGCTATTTTAGATGTGTCTGTTACCAATCACACTACCACTAGTGTGTTTCAAAATCCACTGTTTACAGAACCGTCTGTAATACAGCCCCAACCACCTGTGGAGGCCAGTGGTCACATACTTATATCTGCCCCAACAATAACATCCCAACATGTAGAAGACATTCCACTAGACACTTTTGTTGTATCCTCTAGTGATAGTGGACCTACATCCAGTACTCCTCTTCCTCGTGCTTTTCCTCGGCCTCGGGTGGGTTTGTATAGTCGTGCCTTAC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| 60,219
|
MK463919.1
|
human papillomavirus 11
|
Xu,H., Zhang,W.
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the Affiliated Hospital of Jiangsu University, Department of Dermatology
|
China
|
2019-08-24
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HPV11-gw-1108
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Alphapapillomavirus 10
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,930
|
GenBank
| null |
China
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China
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2016
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate HPV11-gw-1108, complete genome
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| 60,220
|
MK463920.1
|
human papillomavirus 11
|
Xu,H., Zhang,W.
|
the Affiliated Hospital of Jiangsu University, Department of Dermatology
|
China
|
2019-08-24
|
HPV11-gw-1109
|
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,933
|
GenBank
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China
|
China
| null | null |
2016
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate HPV11-gw-1109, complete genome
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ATGGAAAGTAAAGATGCCTCCACGTCTGCAACATCCATAGACCAGTTGTGCAAGACGTTTAATCTTTCTTTGCACACTCTGCAAATTCAGTGCGTGTTTTGCAGGAATGCACTGACCACCGCAGAGATATATGCATATGCCTATAAGAACCTAAAGGTTGTGTGGCGAGACAACTTTCCCTTTGCAGCGTGTGCCTGTTGCTTAGAACTGCAAGGGAAAATTAACCAATATAGACACTTTAATTATGCTGCATATGCACCTACAGTAGAAGAAGAAACTAATGAAGATATTTTAAAAGTGTTAATTCGTTGTTACCTGTGTCACAAGCCGTTGTGTGAAATAGAAAAACTAAAGCACATATTGGAAAAGGCACGCTTCATAAAACTAAATAACCAGTGGAAGGGTCGTTGCTTACACTGCTGGACAACATGCATGGAAGACTTGTTACCCTAAAGGATATAGTACTAGACCTGCAGCCTCCTGACCCTGTAGGGTTACATTGCTATGAGCAATTAGAAGACAGCTCAGAAGATGAGGTGGACAAGGTGGACAAACAAGACTCACAACCTTTAACACAACATTACCAAATACTGACCTGTTGCTGTGGATGTGACAGCAACGTCCGACTGGTTGTGGAGTGCACAGACGGAGACATCAGACAACTACAAGACCTTTTGCTGGGCACACTAAATATTGTGTGTCCCATCTGCGCACCAAAACCATAACAAGGATGGCGGACGATTCAGGTACAGAAAATGAGGGGTCGGGGTGTACAGGATGGTTTATGGTAGAAGCCATAGTAGAGCACACTACAGGTACACAAATATCAGAAGATGAGGAAGAGGAGGTGGAGGACAGTGGGTATGACATGGTGGACTTTATTGATGACAGGCATATTACACAAAATTCTGTGGAAGCACAGGCATTGTTTAATAGGCAGGAGGCGGATGCTCATTATGCGACTGTGCAGGACCTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCATATGTAAGTCCTATAAGCAATGTAGCTAATGCAGTAGAAAGTGAGATAAGTCCACGGTTAGACGCCATTAAACTTACAACACAGCCAAAAAAGGTAAAGCGACGGCTGTTTGAAACACGGGAATTAACGGACAGTGGATATGGCTATTCTGAAGTGGAAGCTGCAACGCAGGTAGAGAAACATGGCGACCCGGAAAATGGGGGAGATGGTGAGGAAAGGGACACAGGGAGGGACATAGAGGGTGAGGGGGTGGAACATAGAGAGGCGGAAGCAGTAGACGACAGCACCCGAGAGCATGCAGACACATCAGGAATATTAGAATTACTAAAATGTAAGGATATACGATCTACATTACATGGTAAGTTTAAAGACTGCTTTGGGCTGTCATTTGTTGATTTAATTAGGCCATTTAAAAGTGATAGAACCACATGTGCCGATTGGGTGGTTGCAGGATTTGGTATACATCATAGCATAGCAGATGCATTTCAAAAGTTAATTGAGCCATTAAGTTTATATGCACATATACAATGGCTTACAAATGCATGGGGAATGGTACTATTAGTATTAATAAGGTTTAAAGTAAATAAGAGCAGATGTACCGTGGCACGTACATTAGGTACGTTATTAAATATACCTGAAAATCACATGTTAATTGAGCCTCCTAAAATACAAAGTGGCGTAGCAGCCCTGTATTGGTTTAGGACAGGCATTTCAAATGCAAGTACAGTTATAGGGGAGGCGCCGGAATGGATAACGCGCCAGACCGTTATTGAACATAGTTTGGCTGACAGTCAATTTAAATTAACTGAAATGGTGCAGTGGGCATATGATAATGATATTTGTGAAGAAAGTGAGATAGCATTTGAATATGCACAGCGTGGAGACTTTGACTCCAATGCAAGGGCCTTTTTAAATAGTAATATGCAGGCTAAATATGTAAAAGATTGTGCAATTATGTGCAGACATTATAAACATGCAGAAATGAAAAAGATGTCTATTAAACAATGGATTAAGTATAGGGGTACTAAAGTTGACAGTGTAGGTAACTGGAAGCCAATTGTGCAGTTTTTAAGACATCAAAACATAGAATTTATTCCATTTTTAAGCAAACTAAAATTATGGCTGCACGGAACGCCCAAAAAAAATTGTATAGCCATTGTAGGGCCACCTGACACTGGGAAGTCGTGCTTTTGCATGAGTTTAATTAAGTTTTTGGGGGGAACAGTTATTAGTTATGTTAATTCCTGCAGCCATTTCTGGCTACAGCCACTAACGGATGCAAAAGTGGCATTATTGGATGATGCCACACAACCATGTTGGACATATATGGATACATATATGAGAAACCTATTAGATGGTAATCCTATGAGCATAGATAGAAAACATAGAGCATTAACATTAATTAAGTGTCCACCGCTACTGGTTACATCAAATATAGACATTAGCAAAGAGGAGAAATACAAATATTTACATAGTAGGGTTACCACATTTACATTTCCAAATCCATTCCCCTTTGACAGAAATGGGAATGCAGTATATGAACTATCAGATGCAAACTGGAAATGTTTCTTTGAAAGACTGTCGTCCAGCCTAGACATTGAGGATTCAGAGGACGAGGAAGATGGAAGCAATAGCCAAGCGTTTAGATGCGTGCCAGGATCAGTTGTTAGAACTTTATGAAGAAAACAGTATTGATATACACAAACACATTATGCATTGGAAATGCATACGATTGGAAAGTGTATTACTACACAAAGCAAAACAAATGGGCCTGAGCCACATTGGGCTACAAGTAGTACCACCATTAACTGTGTCAGAGACTAAAGGACATAATGCTATTGAAATGCAAATGCATTTAGAATCCTTAGCAAAAACTCAGTATGGTGTGGAACCTTGGACATTACAGGACACCAGTTATGAAATGTGGCTAACACCACCCAAACGGTGCTTTAAAAAACAGGGAAATACTGTGGAGGTAAAATTTGATGGCTGTGAAGACAATGTAATGGAGTATGTGGTATGGACACATATATACCTGCAGGACAACGACTCATGGGTAAAAGTAACTAGTTCCGTAGATGCCAAGGGCATATATTATACATGTGGACAATTTAAAACATATTATGTAAATTTTAATAAAGAGGCACAAAAGTATGGTAGTACCAATCATTGGGAAGTATGTTATGGCAGCACAGTTATATGTTCTCCTGCATCTGTATCTAGCACTGTACGAGAAGTATCCATTGCTGAACCTACTACATACACCCCCGCACAGACCACCGCCCCTACAGTGTCCGCCTGCACCACGGAAGACGGCGTGTCGGCGCCGCCTAGAAAGCGAGCACGTGGACCGTCCACTAACAACACCCTGTGTGTGGCCAACATTAGATCCGTGGACAGTACAATCAACAACATCGTCACTGACAATTACAACAAGCACCAAAGAAGGAACAACTGTCACAGTGCAGCTACGCCTATAGTGCAACTGCAAGGTGATTCCAATTGTTTAAAATGTTTTAGATATCGACTGAATGACAAATATAGACATTTGTTTGAATTAGCATCTTCAACGTGGCATTGGGCCTCACCTGAGGCACCACATAAAAATGCAATTGTAACATTAACCTATAGCAGTGAGGAACAACGTCAGCAATTTTTAAACAGTGTAAAAATACCACCCACCATTAGGCATAAGGTGGGGTTTATGTCATTACATTTATTGTAACCATTGCACCTGTATATATGTATATGTGTACATAACATACGTGTATGGAGGTAGTGCCTGTACAAATTGCTGCAGCAACAACTACAACATTGATATTGCCTGTTGTTATTGCATTTGCAGTATGTTTTCTTAGTATTGTACTTATAATATTAATATCTGATTTTCTAGTATATACATCTGTGCTGGTACTAACACTTCTTTTATATTTGCTTTTGTGGCTTTTATTAACAACCCCTTTGCAATTCTTTTTACTAACACTGTGTGTGTGCTATTTTCCTGCCTTTTATATACACATATACATTGTGCAAACGCAACAATAATGGTGATGTTAACCTGTCACTTAAATGATGGTGATACATGGTTGTTTCTGTGGTTGTTTACTGCATTTGTTGTAGCTGTACTTGGATTGTTGTTACTACATTACAGAGCTGTACATGGTACTGAAAAAACTAAATGTGCTAAGTGTAAATCAAACCGCAATACTACTGTGGATTATGTGTATATGTCACATGGTGATAATGGAGATTATGTGTACATGAACTAGAGTAAACCTTTTTTATACAGTGTGTGGTGTACGTTAGTTATATATAATGAAACCTAGGGCACGCAGACGTAAACGTGCGTCAGCCACACAACTATATCAAACATGCAAGGCCACTGGTACATGTCCCCCAGATGTAATTCCTAAAGTTGAACATACTACTATTGCAGATCAAATATTAAAATGGGGAAGCTTAGGGGTTTTTTTTGGTGGGTTAGGTATTGGTACAGGGGCTGGTAGTGGCGGTCGTGCAGGGTATATACCCTTGGGAAGCTCTCCTAAGCCTGCTATTACTGGGGGGCCAGCAGCACGTCCGCCAGTGCTTGTGGAGCCTGTTGCCCCTTCCGATCCCTCCATTGTGTCCTTAATTGAGGAGTCTGCTATTATTAATGCTGGTGCACCTGAGGTGGTACCCCCTACACAGGGTGGCTTTACTATAACATCATCTGAATCGACTACACCTGCTATTTTAGATGTGTCTGTTACCAATCACACTACCACTAGTGTGTTTCAAAATCCACTGTTTACAGAACCGTCTGTAATACAGCCCCAACCACCTGTGGAGGCCAGTGGTCACATACTTATATCTGCCCCAACAATAACATCCCAACATGTAGAAGACATTCCACTAGACACTTTTGTTGTATCCTCTAGTGATAGTGGACCTACATCCAGTACTCCTCTTCCTCGTGCTTTTCCTCGGCCTCGGGTGGGTTTGTATAGTCGTGCCTTAC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human papillomavirus 11
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Xu,H., Zhang,W.
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the Affiliated Hospital of Jiangsu University, Department of Dermatology
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China
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2019-08-24
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HPV11-gw-1110
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Alphapapillomavirus 10
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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GenBank
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China
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China
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2016
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate HPV11-gw-1110, complete genome
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| 60,222
|
MK463922.1
|
human papillomavirus 11
|
Xu,H., Zhang,W.
|
the Affiliated Hospital of Jiangsu University, Department of Dermatology
|
China
|
2019-08-24
|
HPV11-gw-1111
|
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,962
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null |
2016
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate HPV11-gw-1111, complete genome
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ATGGAAAGTAAAGATGCCTCCACGTCTGCAACATCCATAGACCAGTTGTGCAAGACGTTTAATCTTTCTTTGCACACTCTGCAAATTCAGTGCGTGTTTTGCAGGAATGCACTGACCACCGCAGAGATATATGCATATGCCTATAAGAACCTAAAGGTTGTGTGGCGAGACAACTTTCCCTTTGCAGCGTGTGCCTGTTGCTTAGAACTGCAAGGGAAAATTAACCAATATAGACACTTTAATTATGCTGCATATGCACCTACAGTAGAAGAAGAAACTAATGAAGATATTTTAAAAGTGTTAATTCGTTGTTACCTGTGTCACAAGCCGTTGTGTGAAATAGAAAAACTAAAGCACATATTGGGAAAGGCACGCTTCATAAAACTAAATAACCAGTGGAAGGGTCGTTGCTTACACTGCTGGACAACATGCATGGAAGACTTGTTACCCTAAAGGATATAGTACTAGACCTGCAGCCTCCTGACCCTGTAGGGTTACATTGCTATGAGCAATTAGAAGACAGCTCAGAAGATGAGGTGGACAAGGTGGACAAACAAGACTCACAACCTTTAACACAACATTACCAAATACTGACCTGTTGCTGTGGATGTGACAGCAACGTCCGACTGGTTGTGGAGTGCACAGACGGAGACATCAGACAACTACAAGACCTTTTGCTGGGCACACTAAATATTGTGTGTCCCATCTGCGCACCAAAACCATAACAAGGATGGCGGACGATTCAGGTACAGAAAATGAGGGGTCTGGGTGTACAGGATGGTTTATGGTAGAAGCTATAGTGCAACACCCAACAGGTACACAAATATCAGACGATGAGGATGAGGAGGTGGAGGACAGTGGGTATGACATGGTGGACTTTATTGATGACAGCAATATTACACACAATTCACTGGAAGCACAGGCATTGTTTAACAGGCAGGAGGCGGACGCCCATTATGCGACTGTGCAGGACCTAAAACGAAAGTATTTAGGTAGTCCATATGTAAGTCCTATAAGCAATGTAGCTAATGCAGTAGAAAGTGAGATAAGTCCACGGTTAGACGCCATTAAACTTACAACACAGCCAAAAAAGGTAAAGCGACGGCTGTTTGAAACACGGGAATTAACGGACAGTGGATATGGCTATTCTGAAGTGGAAGCTGCAACGCAGGTAGAGAAACATGGCGACCCGGAAAATGGGGGAGATGGTCAGGAAAGGGACACAGGGAGGGACATAGAGGGTGAGGGGGTGGAACATAGAGAGGCGGAAGCAGTAGACGACAGCACCCGAGAGCATGCAGACACATCAGGAATATTAGAATTACTAAAATGTAAGGATATACGATCTACATTACATGGTAAGTTTAAAGACTGCTTTGGGCTGTCATTTGTTGATTTAATTAGGCCATTTAAAAGTGATAGAACCACATGTGCCGATTGGGTGGTTGCAGGATTTGGTATACATCATAGCATAGCAGATGCATTTCAAAAGTTAATTGAGCCATTAAGTTTATATGCACATATACAATGGCTTACAAATGCATGGGGAATGGTACTATTAGTATTAATAAGGTTTAAAGTAAATAAGAGCAGATGTACCGTGGCACGTACATTAGGTACGTTATTAAATATACCTGAAAATCACATGTTAATTGAGCCTCCTAAAATACAAAGTGGCGTAGCAGCCCTGTATTGGTTTAGGACAGGCATTTCAAATGCAAGTACAGTTATAGGGGAGGCGCCGGAATGGATAACGCGCCAGACCGTTATTGAACATAGTTTGGCTGACAGTCAATTTAAATTAACTGAAATGGTGCAGTGGGCATATGATAATGATATTTGTGAAGAAAGTGAGATAGCATTTGAATATGCACAGCGTGGAGACTTTGACTCCAATGCAAGGGCCTTTTTAAATAGTAATATGCAGGCTAAATATGTAAAAGATTGTGCAATTATGTGCAGACATTATAAACATGCAGAAATGAAAAAGATGTCTATTAAACAATGGATTAAGTATAGGGGTACTAAAGTTGACAGTGTAGGTAACTGGAAGCCAATTGTGCAGTTTCTAAGACATCAAAACATAGAATTTATTCCATTTTTAAGCAAACTAAAATTATGGCTGCACGGAACGCCCAAAAAAAATTGTATAGCCATTGTAGGGCCACCTGACACTGGGAAGTCGTGCTTTTGCATGAGTTTAATTAAGTTTTTGGGGGGAACAGTTATTAGTTATGTTAATTCCTGCAGCCATTTCTGGCTACAGCCACTAACGGATGCAAAAGTGGCATTATTGGATGATGCCACACAACCATGTTGGACATATATGGATACATATATGAGAAACCTATTAGATGGTAATCCTATGAGCATAGATAGAAAACATAGAGCATTAACATTAATTAAGTGTCCACCGCTACTGGTTACATCAAATATAGACATTAGCAAAGAGGAGAAATACAAATATTTACATAGTAGGGTTACCACATTTACATTTCCAAATCCATTCCCCTTTGACAGAAATGGGAATGCAGTATATGAACTATCAGATGCAAACTGGAAATGTTTCTTTGAAAGACTGTCGTCCAGCCTAGACATTGAGGATTCAGAGGACGAGGAAGATGGAAGCAATAGCCAAGCGTTTAGATGCGTGCCAGGATCAGTTGTTAGAACTTTATGAAGAAAACAGTATTGATATACACAAACACATTATGCATTGGAAATGCATACGATTGGAAAGTGTATTACTACACAAAGCAAAACAAATGGGCCTGAGCCACATTGGGCTACAAGTAGTACCACCATTAACTGTGTCAGAGACTAAAGGACATAATGCTATTGAAATGCAAATGCATTTAGAATCCTTAGCAAAAACTCAGTATGGTGTGGAACCTTGGACATTACAGGACACCAGTTATGAAATGTGGCTAACACCACCCAAACGGTGCTTTAAAAAACAGGGAAATACTGTGGAGGTAAAATTTGATGGCTGTGAAGACAATGTAATGGAGTATGTGGTATGGACACATATATACCTGCAGGACAACGACTCATGGGTAAAAGTAACTAGTTCCGTAGATGCCAAGGGCATATATTATACATGTGGACAATTTAAAACATATTATGTAAATTTTAATAAAGAGGCACAAAAGTATGGTAGTACCAATCATTGGGAAGTATGTTATGGCAGCACAGTTATATGTTCTCCTGCATCTGTATCTAGCACTGTACGAGAAGTATCCATTGCTGAACCTACTACATACACCCCCGCACAGACCACCGCCCCTACAGTGTCCGCCTGCACCACGGAAGACGGCGTGTCGGCGCCGCCTAGAAAGCGAGCACGTGGACCGTCCACTAACAACACCCTGTGTGTGGCCAACATTAGATCCGTGGACAGTACAATCAACAACATCGTCACTGACAATTACAACAAGCACCAAAGAAGGAACAACTGTCACAGTGCAGCTACGCCTATAGTGCAACTGCAAGGTGATTCCAATTGTTTAAAATGTTTTAGATATCGACTGAATGACAAATATAGACATTTGTTTGAATTAGCATCTTCAACGTGGCATTGGGCCTCACCTGAGGCACCACATAAAAATGCAATTGTAACATTAACCTATAGCAGTGAGGAACAACGTCAGCAATTTTTAAACAGTGTAAAAATACCACCCACCATTAGGCATAAGGTGGGGTTTATGTCATTACATTTATTGTAACCATTGCACCTGTATATATGTATATGTGTACATAACATACGTGTATGGAGGTAGTGCCTGTACAAATTGCTGCAGCAACAACTACAACATTGATATTGCCTGTTGTTATTGCATTTGCAGTATGTTTTCTTAGTATTGTACTTATAATATTAATATCTGATTTTCTAGTATATACATCTGTGCTGGTACTAACACTTCTTTTATATTTGCTTTTGTGGCTTTTATTAACAACCCCTTTGCAATTCTTTTTACTAACACTGTGTGTGTGCTATTTTCCTGCCTTTTATATACACATATACATTGTGCAAACGCAACAATAATGGTGATGTTAACCTGTCACTTAAATGATGGTGATACATGGTTGTTTCTGTGGTTGTTTACTGCATTTGTTGTAGCTGTACTTGGATTGTTGTTACTACATTACAGGGCTGTACATGGTACTGAAAAAACTAAATGTGCTAAGTGTAAATCAAACCGCAATACTACTGTGGATTATGTGTATATGTCACATGGTGATAATGGAGATTATGTGTACATGAACTAGAGTAAACCTTTTTTATACAGTGTGTGGTGTACGTTAGTTATATATAATGAAACCTAGGGCACGCAGACGTAAACGTGCGTCAGCCACACAACTATATCAAACATGCAAGGCCACTGGTACATGTCCCCCAGATGTAATTCCTAAAGTTGAACATACTACTATTGCAGATCAAATATTAAAATGGGGAAGCTTAGGGGTTTTTTTTGGTGGGTTAGGTATTGGTACAGGGGCTGGTAGTGGCGGTCGTGCAGGGTATATACCCTTGGGAAGCTCTCCTAAGCCTGCTATTACTGGGGGGCCAGCAGCACGTCCGCCAGTGCTTGTGGAGCCTGTTGCCCCTTCCGATCCCTCCATTGTGTCCTTAATTGAGGAGTCTGCTATTATTAATGCTGGTGCACCTGAGGTGGTACCCCCTACACAGGGTGGCTTTACTATAACATCATCTGAATCGACTACACCTGCTATTTTAGATGTGTCTGTTACCAATCACACTACCACTAGTGTGTTTCAAAATCCACTGTTTACAGAACCGTCTGTAATACAGCCCCAACCACCTGTGGAGGCCAGTGGTCACATACTTATATCTGCCCCAACAATAACATCCCAACATGTAGAAGACATTCCACTAGACACTTTTGTTGTATCCTCTAGTGATAGTGGACCTACATCCAGTACTCCTCTTCCTCGTGCTTTTCCTCGGCCTCGGGTGGGTTTGTATAGTCGTGCCTTAC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| 60,223
|
MK313761.1
|
human papillomavirus 11
|
Szarka,K.
|
University of Debrecen, Department of Medical Microbiology
|
Hungary
|
2019-07-03
|
AO-RRP1/HPV11
|
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,875
|
GenBank
| null |
Hungary
|
Hungary
|
Homo sapiens
| null |
2014-09-05
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate AO-RRP1/HPV11, complete genome
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|
MK313762.1
|
human papillomavirus 11
|
Szarka,K.
|
University of Debrecen, Department of Medical Microbiology
|
Hungary
|
2019-07-03
|
AO-RRP2/HPV11
|
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,933
|
GenBank
| null |
Hungary
|
Hungary
|
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2016-11-26
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate AO-RRP2/HPV11, complete genome
|
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|
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GenBank
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Hungary
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Human papillomavirus 11 isolate JO-RRP2/HPV11, complete genome
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| 61,941
|
MK313764.1
|
human papillomavirus 11
|
Szarka,K.
|
University of Debrecen, Department of Medical Microbiology
|
Hungary
|
2019-07-03
|
JO-RRP7/HPV11
|
Alphapapillomavirus 10
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,933
|
GenBank
| null |
Hungary
|
Hungary
|
Homo sapiens
| null |
2013-06-17
| null | null |
Human papillomavirus 11 isolate JO-RRP7/HPV11, complete genome
|
CTTAATAACAATCTTAGTTTAAAAAAGAGGAGGGACCGAAAACGGTTCAACCGAAAACGGTTATATATAAACCAGCCCAAAAAATTAGCAGACGAGGCATTATGGAAAGTAAAGATGCCTCCACGTCTGCAACATCCATAGACCAGTTGTGCAAGACGTTTAATCTTTCTTTGCACACTCTGCAAATTCAGTGCGTGTTTTGCAGGAATGCACTGACCACCGCAGAGATATATGCATATGCCTATAAGAACCTAAAGGTTGTGTGGCGAGACAACTTTCCCTTTGCAGCGTGTGCCTGTTGCTTAGAACTGCAAGGGAAAATTAACCAATATAGACACTTTAATTATGCTGCATATGCACCTACAGTAGAAGAAGAAACTAATGAAGATATTTTAAAAGTGTTAATTCGTTGTTACCTGTGTCACAAGCCGTTGTGTGAAATAGAAAAACTAAAGCACATATTGGGAAAGGCACGCTTCATAAAACTAAATAACCAGTGGAAGGGTCGTTGCTTACACTGCTGGACAACATGCATGGAAGACTTGTTACCCTAAAGGATATAGTACTAGACCTGCAGCCTCCTGACCCTGTAGGGTTACATTGCTATGAGCAATTAGAAGACAGCTCAGAAGATGAGGTGGACAAGGTGGACAAACAAGACTCACAACCTTTAACACAACATTACCAAATACTGACCTGTTGCTGTGGATGTGACAGCAACGTCCGACTGGTTGTGGAGTGCACAGACGGAGACATCAGACAACTACAAGACCTTTTGCTGGGCACACTAAATATTGTGTGTCCCATCTGCGCACCAAAACCATAACAAGGATGGCGGACGATTCAGGTACAGAAAATGAGGGGTCGGGGTGTACAGGATGGTTTATGGTAGAAGCCATAGTAGAGCACACTACAGGTACACAAATATCAGAAGATGAGGAAGAGGAGGTGGAGGACAGTGGGTATGACATGGTGGACTTTATTGATGACAGGCATATTACACAAAATTCTGTGGAAGCACAGGCATTGTTTAATAGGCAGGAGGCGGATGCTCATTATGCGACTGTGCAGGACCTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCATATGTAAGTCCTATAAGCAATGTAGCTAATGCAGTAGAAAGTGAGATAAGTCCACGGTTAGACGCCATTAAACTTACAACACAGCCAAAAAAGGTAAAGCGACGGCTGTTTGAAACACGGGAATTAACGGACAGTGGATATGGCTATTCTGAAGTGGAAGCTGCAACGCAGGTAGAGAAACATGGCGACCCGGAAAATGGGGGAGATGGTCAGGAAAGGGACACAGGGAGGGACATAGAGGGTGAGGGGGTGGAACATAGAGAGGCGGAAGCAGTAGACGACAGCACCCGAGAGCATGCAGACACATCAGGAATATTAGAATTACTAAAATGTAAGGATATACGATCTACATTACATGGTAAGTTTAAAGACTGCTTTGGGCTGTCATTTGTTGATTTAATTAGGCCATTTAAAAGTGATAGAACCACATGTGCCGATTGGGTGGTTGCAGGATTTGGTATACATCATAGCATAGCAGATGCATTTCAAAAGTTAATTGAGCCATTAAGTTTATATGCACATATACAATGGCTTACAAATGCATGGGGAATGGTACTATTAGTATTAATAAGGTTTAAAGTAAATAAGAGCAGATGTACCGTGGCACGTACATTAGGTACGTTATTAAATATACCTGAAAATCACATGTTAATTGAGCCTCCTAAAATACAAAGTGGCGTAGCAGCCCTGTATTGGTTTAGGACAGGCATTTCAAATGCAAGTACAGTTATAGGGGAGGCGCCGGAATGGATAACGCGCCAGACCGTTATTGAACATAGTTTGGCTGACAGTCAATTTAAATTAACTGAAATGGTGCAGTGGGCATATGATAATGATATTTGTGAAGAAAGTGAGATAGCATTTGAATATGCACAGCGTGGAGACTTTGACTCCAATGCAAGGGCCTTTTTAAATAGTAATATGCAGGCTAAATATGTAAAAGATTGTGCAATTATGTGCAGACATTATAAACATGCAGAAATGAAAAAGATGTCTATTAAACAATGGATTAAGTATAGGGGTACTAAAGTTGACAGTGTAGGTAACTGGAAGCCAATTGTGCAGTTTCTAAGACATCAAAACATAGAATTTATTCCATTTTTAAGCAAACTAAAATTATGGCTGCACGGAACGCCCAAAAAAAATTGTATAGCCATTGTAGGGCCACCTGACACTGGGAAGTCGTGCTTTTGCATGAGTTTAATTAAGTTTTTGGGGGGAACAGTTATTAGTTATGTTAATTCCTGCAGCCATTTCTGGCTACAGCCACTAACGGATGCAAAAGTGGCATTATTGGATGATGCCACACAACCATGTTGGACATATATGGATACATATATGAGAAACCTATTAGATGGTAATCCTATGAGCATAGATAGAAAACATAGAGCATTAACATTAATTAAGTGTCCACCGCTACTGGTTACATCAAATATAGACATTAGCAAAGAGGAGAAATACAAATATTTACATAGTAGGGTTACCACATTTACATTTCCAAATCCATTCCCCTTTGACAGAAATGGGAATGCAGTATATGAACTATCAGATGCAAACTGGAAATGTTTCTTTGAAAGACTGTCGTCCAGCCTAGACATTGAGGATTCAGAGGACGAGGAAGATGGAAGCAATAGCCAAGCGTTTAGATGCGTGCCAGGATCAGTTGTTAGAACTTTATGAAGAAAACAGTATTGATATACACAAACACATTATGCATTGGAAATGCATACGATTGGAAAGTGTATTACTACACAAAGCAAAACAAATGGGCCTGAGCCACATTGGGCTACAAGTAGTACCACCATTAACTGTGTCAGAGACTAAAGGACATAATGCTATTGAAATGCAAATGCATTTAGAATCCTTAGCAAAAACTCAGTATGGTGTGGAACCTTGGACATTACAGGACACCAGTTATGAAATGTGGCTAACACCACCCAAACGGTGCTTTAAAAAACAGGGAAATACTGTGGAGGTAAAATTTGATGGCTGTGAAGACAATGTAATGGAGTATGTGGTATGGACACATATATACCTGCAGGACAACGACTCATGGGTAAAAGTAACTAGTTCCGTAGATGCCAAGGGCATATATTATACATGTGGACAGTTTAAAACATATTATGTAAATTTTAATAAAGAGGCACAAAAGTATGGTAGTACCAATCATTGGGAAGTATGTTATGGCAGCACAGTTATATGTTCTCCTGCATCTGTATCTAGCACTGTACGAGAAGTATCCATTGCTGAACCTACTACATACACCCCCGCACAGACCACCGCCCCTACAGTGTCCGCCTGCACCACGGAAGACGGCGTGTCGGCGCCGCCTAGAAAGCGAGCACGTGGACCGTCCACTAACAACACCCTGTGTGTGGCCAACATTAGATCCGTGGACAGTACAATCAACAACATCGTCACTGACAATTACAACAAGCACCAAAGAAGGAACAACTGTCACAGTGCAGCTACGCCTATAGTGCAACTGCAAGGTGATTCCAATTGTTTAAAATGTTTTAGATATCGACTGAATGACAAATATAGACATTTGTTTGAATTAGCATCTTCAACGTGGCATTGGGCCTCACCTGAGGCACCACATAAAAATGCAATTGTAACATTAACCTATAGCAGTGAGGAACAACGTCAGCAATTTTTAAACAGTGTAAAAATACCACCCACCATTAGGCATAAGGTGGGGTTTATGTCATTACATTTATTGTAACCATTGCACCTGTATATATGTATATGTGTACATAACATACGTGTATGGAGGTAGTGCCTGTACAAATTGCTGCAGCAACAACTACAACATTGATATTGCCTGTTGTTATTGCATTTGCAGTATGTTTTCTTAGTATTGTACTTATAATATTAATATCTGATTTTCTAGTATATACATCTGTGCTGGTACTAACACTTCTTTTATATTTGCTTTTGTGGCTTTTATTAACAACCCCTTTGCAATTCTTTTTACTAACACTGTGTGTGTGCTATTTTCCTGCCTTTTATATACACATATACATTGTGCAAACGCAACAATAATGGTGATGTTAACCTGTCACTTAAATGATGGTGATACATGGTTGTTTCTGTGGTTGTTTACTGCATTTGTTGTAGCTGTACTTGGATTGTTGTTACTACATTACAGGGCTGTACATGGTACTGAAAAAACTAAATGTGCTAAGTGTAAATCAAACCGCAATACTACTGTGGATTATGTGTATATGTCACATGGTGATAATGGAGATTATGTGTACATGAACTAGAGTAAACCTTTTTTATACAGTGTGTGGTGTACGTTAGTTATATATAATGAAACCTAGGGCACGCAGACGTAAACGTGCGTCAGCCACACAACTATATCAAACATGCAAGGCCACTGGTACATGTCCCCCAGATGTAATTCCTAAAGTTGAACATACTACTATTGCAGATCAAATATTAAAATGGGGAAGCTTAGGGGTTTTTTTTGGTGGGTTAGGTATTGGTACAGGGGCAGGTAGTGGCGGTCGTGCAGGGTATATACCCTTGGGAAGCTCTCCTAAGCCTGCTATTACTGGGGGGCCAGCAGCACGTCCGCCAGTGCTTGTGGAGCCTGTTGCCCCTTCCGATCCCTCCATTGTGTCCTTAATTGAGGAGTCTGCTATTATTAATGCTGGTGCACCTGAGGTGGTACCCCCTACACAGGGTGGCTTTACTATAACATCATCTGAATCGACTACACCTGCTATTTTAGATGTGTCTGTTACCAATCACACTACCACTAGTGTGTTTCAAAATCCACTGTTTACAGAACCGTCTGTAATACAGCCCCAACCACCTGTGGAGGCCAGTGGTCACATACTTATATCTGCCCCAACAATAACATCCCAACATGTAGAAGACATTCCACTAGA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|
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|
human papillomavirus 11
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Szarka,K.
|
University of Debrecen, Department of Medical Microbiology
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Alphapapillomavirus
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|
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GenBank
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Hungary
|
Hungary
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Homo sapiens
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Human papillomavirus 11 isolate JO-RRP8/HPV11, complete genome
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MK313766.1
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human papillomavirus 11
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Szarka,K.
|
University of Debrecen, Department of Medical Microbiology
|
Hungary
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2019-07-03
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JO-RRP9/HPV11
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Alphapapillomavirus 10
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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GenBank
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Hungary
|
Hungary
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Human papillomavirus 11 isolate JO-RRP9/HPV11, complete genome
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University of Debrecen, Department of Medical Microbiology
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Human papillomavirus 11 isolate CAC1/HPV11, complete genome
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| 61,945
|
NC_001357.1
|
human papillomavirus 18
|
Cole,S.T., Danos,O.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1987-09-19
| null |
Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,857
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Human papillomavirus - 18, complete genome
|
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| 9,087
|
OP711995.1
|
human papillomavirus 18
|
Coppee,R., Ferre,V.M., Gbeasor-Komlanvi,F.A., Vacher,S., Bucau,M., Salou,M., Lameiras,S., Couvelard,A., Claver Dagnra,A., Bieche,I., Descamps,D., Ekouevi,D.K., Ghosn,J., Charpentier,C.
|
Universite Paris Cite, Inserm UMR1137
|
France
|
2023-11-24
|
V521R485_HPV18
|
Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,857
|
GenBank
| null |
Togo
|
Togo
|
Homo sapiens
| null |
2017-08
| null | null |
Human papillomavirus 18 isolate V521R485_HPV18, complete genome
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human papillomavirus 18
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Universite Paris Cite, Inserm UMR1137
|
France
|
2023-11-24
|
V521R490_HPV18
|
Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
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GenBank
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Togo
|
Togo
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Alphapapillomavirus
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GenBank
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Togo
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Human papillomavirus 18 isolate V521R502_HPV18, complete genome
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human papillomavirus 18
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|
Universite Paris Cite, Inserm UMR1137
|
France
|
2023-11-24
|
V523E10_HPV18
|
Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
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|
GenBank
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Togo
|
Togo
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Human papillomavirus 18 isolate V523E10_HPV18, complete genome
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human papillomavirus 18
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Human papillomavirus 18 isolate V523E22_HPV18, complete genome
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human papillomavirus 18
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Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
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2023-01-14
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UC008_LW_V3
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Alphapapillomavirus 7
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GenBank
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South Africa
|
South Africa
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| null |
2016-07-12
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|
Human papillomavirus 18 isolate UC008_LW_V3, complete genome
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|
human papillomavirus 18
|
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|
Alphapapillomavirus
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|
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South Africa
|
South Africa
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Human papillomavirus 18 isolate UC094_LW_V2, complete genome
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| 19,514
|
OP971083.1
|
human papillomavirus 18
|
Happel,A.-U., Balle,C., Havyarimana,E., Brown,B., Maust,B., Konstantinus,I.N., Feng,C., Yi,B.H., Gill,K., Bekker,L.-G., Passmore,J.-A.S., Jaspan,H.B., Varsani,A.
|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
|
2023-01-14
|
UC094_LW_V3
|
Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,824
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
2017-05-23
|
SAMN30889828
|
PRJNA881266
|
Human papillomavirus 18 isolate UC094_LW_V3, complete genome
|
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| 19,549
|
ON322746.1
|
human papillomavirus 18
|
Fragoso-Fonseca,D.E., Jimenez-Morales,M., Ruiz-Hernandez,U.E., Centeno-Cayetano,G.B., Andrade-Montiel,E., Corona-Valdespino,E., Gonzalez-Martinez,B.E., Esteban-Valencia,Md.C., Araiza-Rodriguez,A., Hernandez-Rivas,L., Ramirez-Gonzalez,J.E., Escobar-Escamilla,N., Salvador-Patino,A., Garces-Ayala,F.
|
Instituto de Diagnostico y Referencia Epidemiologicos (InDRE) "Dr. Manuel Martinez Baez", Secretaria de Salud, Unidad de Desarrollo Tecnologico e Investigacion Molecular
|
Mexico
|
2022-12-17
|
InDRE 341
|
Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,857
|
GenBank
| null |
Mexico: Laboratorio Estatal de Salud Publica (LESP) Jalisco
|
Mexico
|
Homo sapiens
| null | null | null | null |
Human papillomavirus 18 isolate InDRE 341, complete genome
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| 20,354
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ON322747.1
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human papillomavirus 18
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Fragoso-Fonseca,D.E., Jimenez-Morales,M., Ruiz-Hernandez,U.E., Centeno-Cayetano,G.B., Andrade-Montiel,E., Corona-Valdespino,E., Gonzalez-Martinez,B.E., Esteban-Valencia,Md.C., Araiza-Rodriguez,A., Hernandez-Rivas,L., Ramirez-Gonzalez,J.E., Escobar-Escamilla,N., Salvador-Patino,A., Garces-Ayala,F.
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Instituto de Diagnostico y Referencia Epidemiologicos (InDRE) "Dr. Manuel Martinez Baez", Secretaria de Salud, Unidad de Desarrollo Tecnologico e Investigacion Molecular
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Mexico
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2022-12-17
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InDRE 395
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Alphapapillomavirus 7
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,857
|
GenBank
| null |
Mexico: Laboratorio Estatal de Salud Publica (LESP) Jalisco
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Mexico
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Homo sapiens
| null | null | null | null |
Human papillomavirus 18 isolate InDRE 395, complete genome
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ATTAATACTTTTAACAATTGTAGTATATAAAAAAGGGAGTAACCGAAAACGGTCGGGACCGAAAACGGTGTATATAAAAGATGTGAGAAACACACCACAATACTATGGCGCGCTTTGAGGATCCAACACGGCGACCCTACAAGCTACCTGATCTGTGCACGGAACTGAACACTTCACTGCAAGACATAGAAATAACCTGTGTATATTGCAAGACAGTATTGGAACTTACAGAGGTATTTGAATTTGCATTTAAAGATTTATTTGTGGTGTATAGAGACAGTATACCGCATGCTGCATGCCATAAATGTATAGATTTTTATTCTAGAATTAGAGAATTAAGACATTATTCAGACTCTGTGTATGGAGACACATTGGAAAAACTAACTAACACTGGGTTATACAATTTATTAATAAGGTGCCTGCGGTGCCAGAAACCGTTGAATCCAGCAGAAAAACTTAGACACCTTAATGAAAAACGACGATTTCACAACATAGCTGGGCACTATAGAGGCCAGTGCCATTCGTGCTGCAACCGAGCACGACAGGAACGACTCCAACGACGCAGAGAAACACAAGTATAATATTAAGTATGCATGGACCTAAGGCAACATTGCAAGACATTGTATTGCATTTAGAGCCCCAAAATGAAATTCCGGTTGACCTTCTATGTCACGAGCAATTAAGCGACTCAGAGGAAGAAAACGATGAAATAGATGGAGTTAATCATCAACATTTACCAGCCCGACGAGCCGAACCACAACGTCACACAATGTTGTGTATGTGTTGTAAGTGTGAAGCCAGAATTAAGCTAGTAGTAGAAAGCTCAGCAGACGACCTTCGAGCATTCCAGCAGCTGTTTCTGAACACCCTGTCCTTTGTGTGTCCGTGGTGTGCATCCCAGCAGTAAGCAACAATGGCTGATCCAGAAGGTACAGACGGGGAGGGCACGGGTTGTAACGGCTGGTTTTATGTACAAGCTATTGTAGACAAAAAAACAGGAGATGTAATATCAGATGACGAGGACGAAAATGCAACAGACACAGGGTCGGATATGGTAGATTTTATTGATACACAAGGAACATTTTGTGAACAGGCAGAGCTAGAGACAGCACAGGCATTGTTCCATGCGCAGGAGGTCCACAATGATGCACAAGTGTTGCATGTTTTAAAACGAAAGTTTGCAGGAGGCAGCACAGAAAACAGTCCATTAGGGGAGCGGCTGGAGGTGGATACAGAGTTAAGTCCACGGTTACAAGAAATATCTTTAAATAGTGGGCAGAAAAAGGCAAAAAGGCGGCTGTTTACAATATCAGATAGTGGCTATGGCTGTTCTGAAGTGGAAGCAACACAGATTCAGGTAACTACAAATGGCGAACATGGCGGCAATGTATGTAGTGGCGGCAGTACGGAGGCTATAGACAACGGGGGCACAGAGGGCAACAACAGCAGTGTAGACGGTACAAGTGACAATAGCAATATAGAAAATGTAAATCCACAATGTACCATAGCACAATTAAAAGACTTGTTAAAAGTAAACAATAAACAAGGAGCTATGTTAGCAGTATTTAAAGACACATATGGGCTATCATTTACAGATTTAGTTAGAAATTTTAAAAGTGATAAAACCACGTGTACAGATTGGGTTACAGCTATATTTGGAGTAAACCCAACAATAGCAGAAGGATTTAAAACACTAATACAGCCATTTATATTATATGCCCATATTCAATGTCTAGACTGTAAATGGGGAGTATTAATATTAGCCCTGTTGCGTTACAAATGTGGTAAGAGTAGACTAACAGTTGCTAAAGGTTTAAGTACGTTGTTACACGTACCTGAAACTTGTATGTTAATTCAACCACCAAAATTGCGAAGTAGTGTTGCAGCACTATATTGGTATAGAACAGGAATATCAAATATTAGTGAAGTAATGGGAGACACACCTGAGTGGATACAAAGACTTACTATTATACAACATGGAATAGATGATAGCAATTTTGATTTGTCAGAAATGGTACAATGGGCATTTGATAATGAGCTGACAGATGAAAGCGATATGGCATTTGAATATGCCTTATTAGCAGACAGCAACAGCAATGCAGCTGCCTTTTTAAAAAGCAATTGCCAAGCTAAATATTTAAAAGATTGTGCCACAATGTGCAAACATTATAGGCGAGCCCAAAAACGACAAATGAATATGTCACAGTGGATACGATTTAGATGTTCAAAAATAGATGAAGGGGGAGATTGGAGACCAATAGTGCAATTCCTGCGATACCAACAAATAGAGTTTATAACATTTTTAGGAGCCTTAAAATCATTTTTAAAAGGAACCCCCAAAAAAAATTGTTTAGTATTTTGTGGACCAGCAAATACAGGAAAATCATATTTTGGAATGAGTTTTATACACTTTATACAAGGAGCAGTAATATCATTTGTGAATTCCACTAGTCATTTTTGGTTGGAACCGTTAACAGATACTAAGGTGGCCATGTTAGATGATGCAACGACCACGTGTTGGACATACTTTGATACCTATATGAGAAATGCGTTAGATGGCAATCCAATAAGTATTGATAGAAAGCACAAACCATTAATACAACTAAAATGTCCTCCAATACTACTAACCACAAATATACATCCAGCAAAGGATAATAGATGGCCATATTTAGAAAGTAGAATAACAGTATTTGAATTTCCAAATGCATTTCCATTTGATAAAAATGGCAATCCAGTATATGAAATAAATGACAAAAATTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGCACGAGGAAGAGGAAGATGCAGACACCGAAGGAAACCCTTTCGGAACGTTTAAGTGCGTTGCAGGACAAAATCATAGACCACTATGAAAATGACAGTAAAGACATAGACAGCCAAATACAGTATTGGCAACTAATACGTTGGGAAAATGCAATATTCTTTGCAGCAAGGGAACATGGCATACAGACATTAAACCACCAGGTGGTGCCAGCCTATAACATTTCAAAAAGTAAAGCACATAAAGCTATTGAACTGCAAATGGCCCTACAAGGCCTTGCACAAAGTGCATACAAAACCGAGGATTGGACACTGCAAGACACATGCGAGGAACTATGGAATACAGAACCTACTCACTGCTTTAAAAAAGGTGGCCAAACAGTACAAGTATATTTTGATGGCAACAAAGACAATTGTATGACCTATGTAGCATGGGACAGTGTGTATTATATGACTGATGCAGGAACATGGGACAAAACGGCTACCTGTGTAAGTCACAGGGGATTGTATTATGTAAAGGAAGGGTACAACACGTTTTATATAGAATTTAAAAGTGAATGTGAAAAATATGGGAACACAGGTACGTGGGAAGTACATTTTGGGAATAATGTAATTGATTGTAATGACTCTATGTGCAGTACCAGTGACGACACGGTATCCGCTACTCAGCTTGTTAAACAGCTACAGCACACCCCCTCACCGTATTCCAGCACCGTGTCCGTGGGCACCGCAAAGACCTACGGCCAGACGTCGGCTGCTACACGACCTGGACACTGTGGACTCGCGGAGAAGCAGCATTGTGGACCTGTCAACCCACTTCTCGGTGCAGCTACACCTACAGGCAACAACAAAAGACGGAAACTCTGTAGTGGTAACACTACGCCTATAATACATTTAAAAGGTGACAGAAACAGTTTAAAATGTTTACGGTACAGATTGCGAAAACATAGCGACCACTATAGAGATATATCATCCACCTGGCATTGGACAGGTGCAGGCAATGAAAAAACAGGAATACTGACTGTAACATACCATAGTGAAACACAAAGAACAAAATTTTTAAATACTGTTGCAATTCCAGATAGTGTACAAATATTGGTGGGATACATGACAATGTAATACATATGCTGTAGTACCAATATGTTATCACTTATTTTTTTATTTTGCTTTTGTGTATGCATGTATGTGTGCTGCCATGTCCCGCTTTTGCCATCTGTCTGTATGTGTGCGTATGCATGGGTATTGGTATTTGTGTATATTGTGGTAATAACGTCCCCTGCCACAGCATTCACAGTATATGTATTTTGTTTTTTATTGCCCATGTTACTATTGCATATACATGCTATATTGTCTTTACAGTAATTGTATAGGTTGTTTTATACAGTGTATTGTACATTGTATATTTTGTTTTATACCTTTTATGCTTTTTGTATTTTTGTAATAAAAGTATGGTATCCCACCGTGCCGCACGACGCAAACGGGCTTCGGTAACTGACTTATATAAAACATGTAAACAATCTGGTACATGTCCACCTGATGTTGTTCCTAAGGTGGAGGGCACCACGTTAGCAGATAAAATATTGCAATGGTCAAGCCTTGGTATATTTTTGGGTGGACTTGGCATAGGTACTGGCAGTGGTACAGGGGGTCGTACAGGGTACATTCCATTGGGTGGGCGTTCCAATACAGTGGTGGATGTTGGTCCTACACGTCCCCCAGTGGTTATTGAACCTGTGGGCCCCACAGACCCATCTATTGTTACATTAATAGAGGACTCCAGTGTGGTTACATCAGGTGCACCTAGGCCTACGTTTACTGGCACGTCTGGGTTTGATATAACATCTGCGGGTACAACTACACCTGCGGTTTTGGATATCACACCTTCGTCTACCTCTGTGTCTATTTCCACAACCAATTTTACCAATCCTGCATTTTCTGATCCGTCCATTATTGAAGTTCCACAAACTGGGGAGGTGTCAGGTAATGTATTTGTTGGTACCCCTACATCTGGAACACATGGGTATGAGGAAATACCTTTACAAACATTTGCTTCTTCTGGTACGGGGGAGGAACCCATTAGTAGTACCCCATTGCCTACTGTGCGGCGTGTAGCAGGTCCCCGCCTTTACAGTAGGGCCTACCAACAAGTGTCAGTGGCTAACCCTGAGTTTCTTACACGTCCATCCTCTTTAATTACATATGACA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| 20,355
|
ON322748.1
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human papillomavirus 18
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Fragoso-Fonseca,D.E., Jimenez-Morales,M., Ruiz-Hernandez,U.E., Centeno-Cayetano,G.B., Andrade-Montiel,E., Corona-Valdespino,E., Gonzalez-Martinez,B.E., Esteban-Valencia,Md.C., Araiza-Rodriguez,A., Hernandez-Rivas,L., Ramirez-Gonzalez,J.E., Escobar-Escamilla,N., Salvador-Patino,A., Garces-Ayala,F.
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Instituto de Diagnostico y Referencia Epidemiologicos (InDRE) "Dr. Manuel Martinez Baez", Secretaria de Salud, Unidad de Desarrollo Tecnologico e Investigacion Molecular
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Mexico
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2022-12-17
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InDRE 406
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Alphapapillomavirus 7
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,856
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GenBank
| null |
Mexico: Laboratorio Estatal de Salud Publica (LESP) Jalisco
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Mexico
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Homo sapiens
| null | null | null | null |
Human papillomavirus 18 isolate InDRE 406, complete genome
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| 20,356
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ON322749.1
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human papillomavirus 18
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Fragoso-Fonseca,D.E., Jimenez-Morales,M., Ruiz-Hernandez,U.E., Centeno-Cayetano,G.B., Andrade-Montiel,E., Corona-Valdespino,E., Gonzalez-Martinez,B.E., Esteban-Valencia,Md.C., Araiza-Rodriguez,A., Hernandez-Rivas,L., Ramirez-Gonzalez,J.E., Escobar-Escamilla,N., Salvador-Patino,A., Garces-Ayala,F.
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Instituto de Diagnostico y Referencia Epidemiologicos (InDRE) "Dr. Manuel Martinez Baez", Secretaria de Salud, Unidad de Desarrollo Tecnologico e Investigacion Molecular
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Mexico
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2022-12-17
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InDRE 366
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Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,824
|
GenBank
| null |
Mexico: Laboratorio Estatal de Salud Publica (LESP) Jalisco
|
Mexico
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Homo sapiens
| null | null | null | null |
Human papillomavirus 18 isolate InDRE 366, complete genome
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ATTAATACTTTTAACAATTGTAGTATATAAAAAAGGGAGTAACCGAAAACGGTCGGGACCGAAAACGGTGTATATAAAAGATGTGAGAAACGCACCACAATACTATGGCGCGCTTTGAGGATCCAACACGGCGACCCTACAAGCTACCTGATCTGTGCACGGAACTGAACACTTCACTGCAAGACATAGAAATAACCTGTGTATATTGCAAGACAGTATTGGAACTTACAGAGGTATTTGAATTTGCATTCAAAGATTTATTTGTAGTGTATAGAGACAGTATACCGCATGCTGCATGCCATAAATGTATAGATTTCTATTCTAGAATTAGAGAATTAAGATATTATTCAGACTCTGTGTATGGAGACACATTAGAAAAACTAACTAACACTGGGTTATACAATTTATTAATAAGGTGCCTGCGGTGCCAGAAACCGTTGAATCCAGCAGAAAAACTTAGACACCTTAATGAAAAACGACGATTCCACAAAATAGCTGGGCACTATAGAGGCCAGTGCCATTCGTGCTGCAACCGAGCACGACAGGAGAGACTCCAACGACGCAGAGAAACACAAGTATAATATTAAGTATGTATGGACCTAAGGCAACATTGCAAGACATTGTATTGCATTTAGAGCCTCAAAATGAAATTCCGGTTGACCTTCTATGTCACGAGCAATTAAGCGACTCAGAGGAAGAAAACGATGAAATAGATGGAGTTAATCATCAACATTTACCAGCCCGACGAGCCGAACCACAACGTCACACAATGTTGTGTATGTGTTGTAAGTGTGAAGCCAGAATTGAGCTAGTAGTAGAAAGCTCAGCAGACGACCTTCGAGCATTCCAGCAGCTGTTTCTGAGCACCCTGTCCTTTGTGTGTCCGTGGTGTGCATCCCAGCAGTAAGCAACAATGGCTGATCCAGAAGGTACAGACGGGGAGGGCACGGGGTGTAACGGCTGGTTTTATGTACAAGCTATTGTAGACAAAAAAACAGGAGATGTAATATCTGATGACGAGGACGAAAATGCAACAGACACAGGGTCGGATATGGTAGATTTTATTGATACACAAGGAACATTTTGCGAACAGGCAGAGCTAGAGACAGCACAGGCATTGTTTCATGCGCAGGAGGTCCACAATGATGCACAAGTGTTGCATGTTTTAAAACGAAAGTTTGCAGGAGGCAGCAAAGAAAACAGTCCATTAGGGGAGCGGCTGGAGGTGGATACAGAGTTAAGTCCACGGTTACAACAAATATCATTAAATAGTGGGCAAAAAAAGGCAAAAAGGCGGCTGTTCACAATATCAGATAGTGGCTATGGCTGTTCTGAAGTGGAAGCAACACAGATTCAGGTAACTACAAATGGCGAACAGGGCGGCAATGTATGTAGTGGCGGCAGTACAGAGGCTATAGACAATGGGGGCACAGAGGGCAACAACAGCAGTGTAGACGGTACAAGTGACACTAGCAATATAGAAAATGTAAATCCACAATGTACCATAGCACAATTAAAAGACTTGTTAAAAGTAAACAATAAACAAGGAGCTATGTTAGCAGTATTTAAAGACACATATGGGCTATCATTTACAGATTTAGTTAGAAATTTTAAAAGTGATAAAACCACGTGTACAGATTGGGTTACAGCTATATTTGGAGTAAACCCAACAATAGCAGAAGGATTTAAAACACTAATACAGCCATTTATATTATATGCCCATATTCAATGTCTTGACTGTAAATGGGGAGTATTAATATTAGCCCTGTTGCGGTACAAATGTGGTAAAAGTAGACTAACAGTTGCTAAAGGTTTAAGTACGTTGTTACACGTACCTGAAACTTGTATGTTAATTCAACCACCAAAATTGCGAAGTAGTGTTGCAGCACTGTATTGGTATAGAACAGGAATATCAAATATTAGTGAAGTAATGGGAGACACACCTGAGTGGATACAAAGACTTACTATTATACAACATGGAATAGATGATAGCAATTTTGATTTGTCAGAAATGGTACAATGGGCATTTGATAATGAGCTGACAGATGAAAGCGATATGGCATTTGAATATGCCTTATTAGCAGACAGCAACAGCAATGCGGCTGCCTTTTTAAAAAGCAATTGCCAAGCTAAATATTTAAAAGATTGTGCCACAATGTGCAAACATTATAGGCGAGCCCAAAAACGACAAATGAATATGTCACAGTGGATACGATTTAGATGTTTAAAAATAGATGAAGGGGGAGATTGGAGACCAATAGTGCAATTTTTGCGATACCAACAAATAGAGTTTATAACATTTTTAGGAGCCTTAAAATCATTTTTAAAAGGAACTCCCAAAAAAAATTGTTTAGTATTTTGTGGACCAGCAAATACAGGAAAATCATATTTTGGAATGAGCTTTATACACTTTATACAAGGAGCAGTAATATCATTTGTAAATTCTACTAGTCATTTTTGGTTGGAACCGTTAACAGATACCAAGGTGGCCATGTTAGATGATGCAACAACCACGTGTTGGACATACTTTGATACCTATATGAGAAATGCTTTAGATGGCAATCCCATAAGTATTGATAGAAAGCACAAACCATTAATACAACTAAAATGTCCTCCAATACTACTAACCACAAATATACATCCAGCAAAGGATAACAGATGGCCATATTTAGAAAGTAGAATAACAGTATTTGAATTTCCAAATGCATTTCCATTTGATAAAAATGGCAATCCAGTATATGAAATAAATGACAAAAATTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGCACGAGGAAGAGGAAGATGCAGACACCGAAGGAAACCCTTTCGGAACGTTTAAGTGCGTTGCAGGACAAAATCATAGACCACTATGAAAATGACAGTAAAGACATAGACAGCCAAATACAGTATTGGCAACTAATACGTTGGGAAAATGCAATATTCTTTGCAGCAAGGGAACATGGCATACAGACATTAAACCACCAGGTGGTGCCAGCCTATAACATTTCAAAAAGTAAAGCACATAAAGCTATTGAACTTCAAATGGCCCTACAAGGCCTTGCACAAAGTGCATACAAAACCGAGGATTGGACACTGCAAGACACATGCGAGGAACTATGGAATACAGAACCTACGCACTGCTTTAAAAAAGGTGGCCAAACAGTACAAGTATATTTTGATGGCAACAAAGACAATTCTATGAACTATGTAGCATGGGACAGTGTGTATTATATGACTGATGCAGGAACATGGGACAAAACAGCTACCTGTGTAAGTCACAGGGGATTGTATTATGTAAAAGAAGGGTACAACACGTTTTATATAGAATTTAAAAGTGAATGTGAAAAATATGGGAACACAGGTACGTGGGAAGTACATTTTGGGAATAATGTAATTGATTGTAATGACTCTATGTGCAGTACCAGTGACGACACGGTATCCGCTACTCAGCTTGTTAAACAGCTACAGCACACCCCCTCACCGTATTCCAGCACCGTGTCCGTGGGCACCGCAAAGACCCACGGCCAGACGTCGGCTGCTACAAGACCTGGACACTGTGGACTTGCGGAGACGCAGCAGTGTGGACCTGTCAACCCACTTCTCGGTGCAGCTACAGGCAACAACAAAAGACGGAAACTCTGTAGTGGTAACACTACGCCTATAATACATTTAAAAGGTGACAGAAACAGTTTAAAATGTTTAAGGTACAGATTACGAAAACATAGCGAGCACTATAAAAATATATCATCCACCTGGCATTGGACAGGTGCATGCAATGAAAAAACAGGAATACTAACTGTAACATATAATAGTGAAACACAAAGAACAAAATTTTTAAATACTGTTGCAATTCCAGATAGTGTACAAATATTGGTGGGATACATGACAATGTAATATGTTATCACTTATTTTTTTATTTTGCTTTTGTGTATGCTTGTATGTGTGCTGCCATGTCCCGCTTTTGCCATCTGTCTGTATGTGTGCGTATGCATGGGTATTGGTATTTGTGTATATTGTGATAATAACGTCCCCTGCCACAGCATTCACAGTATATGTATTTTGTTTTTTATTGCCCATGCTACTATTGCATATACATGCTATATTGTCTTCACAATAATTGTATAGGTTGGTTTATACAGTGTATTGTACATTGTATATTTTGTTTTATACCTTTTATGCTTTTTGTATTTTTATAATAAAATCATGGTTTCCCACCGTGCCGCACGACGCAAACGGGCTTCGGTGACTGACTTATATAAAACATGTAAACAATCTGGTACATGTCCATCTGATGTTGTTAATAAGGTAGAGGGCACCACGTTAGCAGATAAAATATTGCAATGGTCAAGCCTTGGTATATTTTTGGGTGGACTTGGCATAGGTACTGGAAGTGGTACAGGGGGTCGTACAGGGTACATTCCATTGGGTGGGCGTTCCAATACAGTTGTGGATGTTGGTCCTACACGTCCTCCAGTGGTTATTGAACCTGTGGGCCCCACAGACCCATCTATTGTTACATTAATAGAGGACTCCAGTGTTGTTACATCAGGTGCACCTAGGCCTACTTTTACTGGCACGTCTGGGTTTGATATAACATCTGCTGGTACAACTACACCTGCAGTTTTGGATATCACACCTTCGTCTACCTCTGTTTCTATTTCCACAACCAATTTTACCAATCCTGCATTTTCTGATCCGTCCATTATTGAAGTTCCACAAACTGGGGAGGTGTCAGGTAATGTATTTGTTGGTACCCCTACATCTGGAACACATGGGTATGAAGAAATACCTTTACAAACATTTGCTTCTTCTGGTACGGGGGAGGAACCCATTAGTAGTACCCCATTGCCTACTGTGCGGCGTGTAGCAGGTCCCCGCCTTTACAGTAGGGCCTACCAACAAGTGTCTGTGGCTAACCCTGAGTTTCTTACACGTCCATCCTCTTTAATTACCTATGACAACCCGGCCTTTGAGCCTATGGACACT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| 20,357
|
ON322750.1
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human papillomavirus 18
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Fragoso-Fonseca,D.E., Jimenez-Morales,M., Ruiz-Hernandez,U.E., Centeno-Cayetano,G.B., Andrade-Montiel,E., Corona-Valdespino,E., Gonzalez-Martinez,B.E., Esteban-Valencia,Md.C., Araiza-Rodriguez,A., Hernandez-Rivas,L., Ramirez-Gonzalez,J.E., Escobar-Escamilla,N., Salvador-Patino,A., Garces-Ayala,F.
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Instituto de Diagnostico y Referencia Epidemiologicos (InDRE) "Dr. Manuel Martinez Baez", Secretaria de Salud, Unidad de Desarrollo Tecnologico e Investigacion Molecular
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Mexico
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2022-12-17
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InDRE 392
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Alphapapillomavirus 7
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,824
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GenBank
| null |
Mexico: Laboratorio Estatal de Salud Publica (LESP) Jalisco
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Mexico
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Homo sapiens
| null | null | null | null |
Human papillomavirus 18 isolate InDRE 392, complete genome
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| 20,358
|
MW836821.1
|
human papillomavirus 18
|
Munsamy,Y., Seedat,R.Y., Sekee,T.R., Bester,P.A., van Jaarsveldt,D., Burt,F.J.
|
University of the Free State, Division of Virology, School of Pathology
|
South Africa
|
2021-06-30
|
VBD17/15
|
Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,857
|
GenBank
| null |
South Africa: Free State
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
2015-05-12
| null | null |
Human papillomavirus 18 isolate VBD17/15, complete genome
|
ATTAATACTTTTAACAATTGTAGTATATAAAAAAGGGAGTAACCGAAAACGGTCGGGACCGAAAACGGTGTATATAAAAGATGTGAGAAACACACCACAATACTATGGCGCGCTTTGAGGATCCAACACGGCGACCCTACAAGCTACCTGATCTGTGCACGGAACTGAACACTTCACTGCAAGACATAGAAATAACCTGTGTATATTGCAAGACAGTATTGGAACTTACAGAGGTATTTGAATTTGCATTTAAAGATTTATTTGTGGTGTATAGAGACAGTATACCGCATGCTGCATGCCATAAATGTATAGATTTTTATTCTAGAATTAGAGAATTAAGACATTATTCAGACTCTGTGTATGGAGACACATTGGAAAAACTAACTAACACTGGGTTATACAATTTATTAATAAGGTGCCTGCGGTGCCAGAAACCGTTGAATCCAGCAGAAAAACTTAGACACCTTAATGAAAAACGACGATTTCACAACATAGCTGGGCACTATAGAGGCCAGTGCCATTCGTGCTGCAACCGAGCACGACAGGAACGACTCCAACGACGCAGAGAAACACAAGTATAATATTAAGTATGCATGGACCTAAGGCAACATTGCAAGACATTGTATTGCATTTAGAGCCCCAAAATGAAATTCCGGTTGACCTTCTATGTCACGAGCAATTAAGCGACTCAGAGGAAGAAAACGATGAAATAGATGGAGTTAATCATCAACATTTACCAGCCCGACGAGCCGAACCACAACGTCACACAATGTTGTGTATGTGTTGTAAGTGTGAAGCCAGAATTGAGCTAGTAGTAGAAAGCTCAGCAGACGACCTTCGAGCATTCCAGCAGCTGTTTCTGAACACCCTGTCCTTTGTGTGTCCGTGGTGTGCATCCCAGCAGTAAGCAACAATGGCTGATCCAGAAGGTACAGACGGGGAGGGCACGGGTTGTAACGGCTGGTTTTATGTACAAGCTATTGTAGACAAAAAAACAGGAGATGTAATATCAGATGACGAGGACGAAAATGCAACAGACACAGGGTCGGATATGGTAGATTTTATTGATACACAAGGAACATTTTGTGAACAGGCAGAGCTAGAGACAGCACAGGCATTGTTCCATGCGCAGGAGGTCCACAATGATGCACAAGTGTTGCATGTTTTAAAACGAAAGTTTGCAGGAGGCAGCACAGAAAACAGTCCATTAGGGGAGCGGCTGGAGGTGGATACAGAGTTAAGTCCACGGTTACAAGAAATATCTTTAAATAGTGGGCAGAAAAAGGCAAAAAGGCGGCTGTTTACAATATCAGATAGTGGCTATGGCTGTTCTGAAGTGGAAGCAACACAGATTCAGGTAACTACAAATGGCGAACATGGCGGCAATGTATGTAGTGGCGGCAGTACGGAGGCTATAGACAACGGGGGCACAGAGGGCAACAACAGCAGTGTAGACGGTACAAGTGACAATAGCAATATAGAAAATGTAAATCCACAATGTACCATAGCACAATTAAAAGACTTGTTAAAAGTAAACAATAAACAAGGAGCTATGTTAGCAGTATTTAAAGACACATATGGGCTATCATTTACAGATTTAGTTAGAAATTTTAAAAGTGATAAAACCACGTGTACAGATTGGGTTACAGCTATATTTGGAGTAAACCCAACAATAGCAGAAGGATTTAAAACACTAATACAGCCATTTATATTATATGCCCATATTCAATGTCTAGACTGTAAATGGGGAGTATTAATATTAGCCCTGTTGCGTTACAAATGTGGTAAGAGTAGACTAACAGTTGCTAAAGGTTTAAGTACGTTGTTACACGTACCTGAAACTTGTATGTTAATTCAACCACCAAAATTGCGAAGTAGTGTTGCAGCACTATATTGGTATAGAACAGGAATATCAAATATTAGTGAAGTAATGGGAGACACACCTGAGTGGATACAAAGACTTACTATTATACAACATGGAATAGATGATAGCAATTTTGATTTGTCAGAAATGGTACAATGGGCATTTGATAATGAGCTGACAGATGAAAGCGATATGGCATTTGAATATGCCTTATTAGCAGACAGCAACAGCAATGCAGCTGCCTTTTTAAAAAGCAATTGCCAAGCTAAATATTTAAAAGATTGTGCCACAATGTGCAAACATTATAGGCGAGCCCAAAAACGACAAATGAATATGTCACAGTGGATACGATTTAGATGTTCAAAAATAGATGAAGGGGGAGATTGGAGACCAATAGTGCAATTCCTGCGATACCAACAAATAGAGTTTATAACATTTTTAGGAGCCTTAAAATCATTTTTAAAAGGAACCCCCAAAAAAAATTGTTTAGTATTTTGTGGACCAGCAAATACAGGAAAATCATATTTTGGAATGAGTTTTATACACTTTATACAAGGAGCAGTAATATCATTTGTGAATTCCACTAGTCATTTTTGGTTGGAACCGTTAACAGATACTAAGGTGGCCATGTTAGATGATGCAACGACCACGTGTTGGACATACTTTGATACCTATATGAGAAATGCGTTAGATGGCAATCCAATAAGTATTGATAGAAAGCACAAACCATTAATACAACTAAAATGTCCTCCAATACTACTAACCACAAATATACATCCAGCAAAGGATAATAGATGGCCATATTTAGAAAGTAGAATAACAGTATTTGAATTTCCAAATGCATTTCCATTTGATAAAAATGGCAATCCAGTATATGAAATAAATGACAAAAATTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGCACGAGGAAGAGGAAGATGCAGACACCGAAGGAAACCCTTTCGGAACGTTTAAGTGCGTTGCAGGACAAAATCATAGACCACTATGAAAATGACAGTAAAGACATAGACAGCCAAATACAGTATTGGCAACTAATACGTTGGGAAAATGCAATATTCTTTGCAGCAAGGGAACATGGCATACAGACATTAAACCACCAGGTGGTGCCAGCCTATAACATTTCAAAAAGTAAAGCACATAAAGCTATTGAACTGCAAATGGCCCTACAAGGCCTTGCACAAAGTGCATACAAAACCGAGGATTGGACACTGCAAGACACATGCGAGGAACTATGGAATACAGAACCTACTCACTGCTTTAAAAAAGGTGGCCAAACAGTACAAGTATATTTTGATGGCAACAAAGACAATTGTATGACCTATGTAGCATGGGACAGTGTGTATTATATGACTGATGCAGGAACATGGGACAAAACGGCTACCTGTGTAAGTCACAGGGGATTGTATTATGTAAAGGAAGGGTACAACACGTTTTATATAGAATTTAAAAGTGAATGTGAAAAATATGGGAACACAGGTACGTGGGAAGTACATTTTGGGAATAATGTAATTGATTGTAATGACTCTATGTGCAGTACCAGTGACGACACGGTATCCGCTACTCAGCTTGTTAAACAGCTACAGCACACCCCCTCACCGTATTCCAGCACCGTGTCCGTGGGCACCGCAAAGACCTACGGCCAGACGTCGGCTGCTACACGACCTGGACACTGTGGACTCGCGGAGAAGCAGCATTGTGGACCTGTCAACCCACTTCTCGGTGCAGCTACACCTACAGGCAACAACAAAAGACGGAAACTCTGTAGTGGTAACACTACGCCTATAATACATTTAAAAGGTGACAGAAACAGTTTAAAATGTTTACGGTACAGATTGCGAAAACATAGCGACCACTATAGAGATATATCATCCACCTGGCATTGGACAGGTGCAGGCAATGAAAAAACAGGAATACTGACTGTAACATACCATAGTGAAACACAAAGAACAAAATTTTTAAATACTGTTGCAATTCCAGATAGTGTACAAATATTGGTGGGATACATGACAATGTAATACATATGCTGTAGTACCAATATGTTATCACTTATTTTTTTATTTTGCTTTTGTGTATGCATGTATGTGTGCTGCCATGTCCCGCTTTTGCCATCTGTCTGTATGTGTGCGTATGCATGGGTATTGGTATTTGTGTATATTGTGGTAATAACGTCCCCTGCCACAGCATTCACAGTATATGTATTTTGTTTTTTATTGCCCATGTTACTATTGCATATACATGCTATATTGTCTTTACAGTAATTGTATAGGTTGTTTTATACAGTGTATTGTACATTGTATATTTTGTTTTATACCTTTTATGCTTTTTGTATTTTTGTAATAAAAGTATGGTATCCCACCGTGCCGCACGACGCAAACGGGCTTCGGTAACTGACTTATATAAAACATGTAAACAATCAGGTACATGTCCACCTGATGTTGTTCCTAAGGTGGAGGGCACCACGTTAGCAGATAAAATATTGCAATGGTCAAGCCTTGGTATATTTTTGGGTGGACTTGGCATAGGTACTGGCAGTGGTACAGGGGGTCGTACAGGGTACATTCCATTGGGTGGGCGTTCCAATACAGTGGTGGATGTTGGTCCTACACGTCCCCCAGTGGTTATTGAACCTGTGGGCCCCACAGACCCATCTATTGTTACATTAATAGAGGACTCCAGTGTGGTTACATCAGGTGCACCTAGGCCTACGTTTACTGGCACGTCTGGGTTTGATATAACATCTGCGGGTACAACTACACCTGCGGTTTTGGATATCACACCTTCGTCTACCTCTGTGTCTATTTCCACAACCAATTTTACCAATCCTGCATTTTCTGATCCGTCCATTATTGAAGTTCCACAAACTGGGGAGGTGTCAGGTAATGTATTTGTTGGTACCCCTACATCTGGAACACATGGGTATGAGGAAATACCTTTACAAACATTTGCTTCTTCTGGTACGGGGGAGGAACCCATTAGTAGTACCCCATTGCCTACTGTGCGGCGTGTAGCAGGTCCCCGCCTTTACAGTAGGGCCTACCAACAAGTGTCAGTGGCTAACCCTGAGTTTCTTACACGTCCATCCTCTTTAATTACATATGACA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| 40,814
|
LC636307.1
|
human papillomavirus 18
|
Yamaguchi,M., Iwata,T., Matsumoto,K., Kukimoto,I.
|
Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2021-06-12
|
K1604
|
Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,857
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
| null | null | null | null |
Human papillomavirus type 18 K1604 DNA, complete genome
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| 41,576
|
LC636308.1
|
human papillomavirus 18
|
Yamaguchi,M., Iwata,T., Matsumoto,K., Kukimoto,I.
|
Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2021-06-12
|
K2085
|
Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,857
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
| null | null | null | null |
Human papillomavirus type 18 K2085 DNA, complete genome
|
ATTAATACTTTTAACAATTGTAGTATATAAAAAAGGGAGTAACCGAAAACGGTCGGGACCGAAAACGGTGTATATAAAAGATGTGAGAAACACACCACAATACTATGGCGCGCTTTGAGGATCCAACACGGCGACCCTACAAGCTACCTGATCTGTGCACGGAACTGAACACTTCACTGCAAGACATAGAAATAACCTGTGTATATTGCAAGACAGTATTGGAACTTACAGAGGTATTTGAATTTGCATTTAAAGATTTATTTGTGGTGTATAGAGACAGTATACCGCATGCTGCATGCCATAAATGTATAGATTTTTATTCTAGAATTAGAGAATTAAGACATTATTCAGACTCTGTGTATGGAGACACATTGGAAAAACTAACTAACACTGGGTTATACAATTTATTAATAAGGTGCCTGCGGTGCCAGAAACCGTTGAATCCAGCAGAAAAACTTAGACACCTTAATGAAAAACGACGATTTCACAACATAGCTGGGCACTATAGAGGCCAGTGCCATTCGTGCTGCAACCGAGCACGACAGGAACGACTCCAACGACGCAGAGAAACACAAGTATAATATTAAGTATGCATGGACCTAAGGCAACATTGCAAGACATTGTATTGCATTTAGAGCCCCAAAATGAAATTCCGGTTGACCTTCTATGTCACGAGCAATTAAGCGACTCAGAGGAAGAAAACGATGAAATAGATGGAGTTAATCATCAACATTTACCAGCCCGACGAGCCGAACCACAACGTCACACAATGTTGTGTATGTGTTGTAAGTGTGAAGCCAGAATTGAGCTAGTAGTAGAAAGCTCAGCAGACGACCTTCGAGCATTCCAGCAGCTGTTTCTGAACACCCTGTCCTTTGTGTGTCCGTGGTGTGCATCCCAGCAGTAAGCAACAATGGCTGATCCAGAAGGTACAGACGGGGAGGGCACGGGTTGTAACGGCTGGTTTTATGTACAAGCTATTGTAGACAAAAAAACAGGAGATGTAATATCAGATGACGAGGACGAAAATGCAACAGACACAGGGTCGGATATGGTAGATTTTATTGATACACAAGGAACATTTTGTGAACAGGCAGAGCTAGAGACAGCACAGGCATTGTTCCATGCGCAGGAGGTCCACAATGATGCACAAGTGTTGCATGTTTTAAAACGAAAGTTTGCAGGAGGCAGCACAGAAAACAGTCCATTAGGGGAGCGGCTGGAGGTGGATACAGAGTTAAGTCCACGGTTACAAGAAATATCTTTAAATAGTGGGCAGAAAAAGGCAAAAAGGCGGCTGTTTACAATATCAGATAGTGGCTATGGCTGTTCTGAAGTGGAAGCAACACAGATTCAGGTAACTACAAATGGCGAACATGGCGGCAATGTATGTAGTGGCGGCAGTACGGAGGCTATAGACAACGGGGGCACAGAGGGCAACAACAGCAGTGTAGACGGTACAAGTGACAATAGCAATATAGAAAATGTAAATCCACAATGTACCATAGCACAATTAAAAGACTTGTTAAAAGTAAACAATAAACAAGGAGCTATGTTAGCAGTATTTAAAGACACATATGGGCTATCATTTACAGATTTAGTTAGAAATTTTAAAAGTGATAAAACCACGTGTACAGATTGGGTTACAGCTATATTTGGAGTAAACCCAACAATAGCAGAAGGATTTAAAACACTAATACAGCCATTTATATTATATGCCCATATTCAATGTCTAGACTGTAAATGGGGAGTATTAATATTAGCCCTGTTGCGTTACAAATGTGGTAAGAGTAGACTAACAGTTGCTAAAGGTTTAAGTACGTTGTTACACGTACCTGAAACTTGTATGTTAATTCAACCACCAAAATTGCGAAGTAGTGTTGCAGCACTATATTGGTATAGAACAGGAATATCAAATATTAGTGAAGTAATGGGAGACACACCTGAGTGGATACAAAGACTTACTATTATACAACATGGAATAGATGATAGCAATTTTGATTTGTCAGAAATGGTACAATGGGCATTTGATAATGAGCTGACAGATGAAAGCGATATGGCATTTGAATATGCCTTATTAGCAGACAGCAACAGCAATGCAGCTGCCTTTTTAAAAAGCAATTGCCAAGCTAAATATTTAAAAGATTGTGCCACAATGTGCAAACATTATAGGCGAGCCCAAAAACGACAAATGAATATGTCACAGTGGATACGATTTAGATGTTCAAAAATAGATGAAGGGGGAGATTGGAGACCAATAGTGCAATTCCTGCGATACCAACAAATAGAGTTTATAACATTTTTAGGAGCCTTAAAATCATTTTTAAAAGGAACCCCCAAAAAAAATTGTTTAGTATTTTGTGGACCAGCAAATACAGGAAAATCATATTTTGGAATGAGTTTTATACACTTTATACAAGGAGCAGTAATATCATTTGTGAATTCCACTAGTCATTTTTGGTTGGAACCGTTAACAGATACTAAGGTGGCCATGTTAGATGATGCAACGACCACGTGTTGGACATACTTTGATACCTATATGAGAAATGCGTTAGATGGCAATCCAATAAGTATTGATAGAAAGCACAAACCATTAATACAACTAAAATGTCCTCCAATACTACTAACCACAAATATACATCCAGCAAAGGATAATAGATGGCCATATTTAGAAAGTAGAATAACAGTATTTGAATTTCCAAATGCATTTCCATTTGATAAAAATGGCAATCCAGTATATGAAATAAATGACAAAAATTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGCACGAGGAAGAGGAAGATGCAGACACCGAAGGAAACCCTTTCGGAACGTTTAAGTGCGTTGCAGGACAAAATCATAGACCACTATGAAAATGACAGTAAAGACATAGACAGCCAAATACAGTATTGGCAACTAATACGTTGGGAAAATGCAATATTCTTTGCAGCAAGGGAACATGGCATACAGACATTAAACCACCAGGTGGTGCCAGCCTATAACATTTCAAAAAGTAAAGCACATAAAGCTATTGAACTGCAAATGGCCCTACAAGGCCTTGCACAAAGTGCATACAAAACCGAGGATTGGACACTGCAAGACACATGCGAGGAACTATGGAATACAGAACCTACTCACTGCTTTAAAAAAGGTGGCCAAACAGTACAAGTATATTTTGATGGCAACAAAGACAATTGTATGACCTATGTAGCATGGGACAGTGTGTATTATATGACTGATGCAGGAACATGGGACAAAACGGCTACCTGTGTAAGTCACAGGGGATTGTATTATGTAAAGGAAGGGTACAACACGTTTTATATAGAATTTAAAAGTGAATGTGAAAAATATGGGAACACAGGTACGTGGGAAGTACATTTTGGGAATAATGTAATTGATTGTAATGACTCTATGTGCAGTACCAGTGACGACACGGTATCCGCTACTCAGCTTGTTAAACAGCTACAGCACACCCCCTCACCGTATTCCAGCACCGTGTCCGTGGGCACCGCAAAGACCTACGGCCAGACGTCGGCTGCTACACGACCTGGACACTGTGGACTCGCGGAGAAGCAGCATTGTGGACCTGTCAACCCACTTCTCGGTGCAGCTACACCTACAGGCAACAACAAAAGACGGAAACTCTGTAGTGGTAACACTACGCCTATAATACATTTAAAAGGTGACAGAAACAGTTTAAAATGTTTACGGTACAGATTGCGAAAACATAGCGACCACTATAGAGATATATCATCCACCTGGCATTGGACAGGTGCAGGCAATGAAAAAACAGGAATACTGACTGTAACATACCATAGTGAAACACAAAGAACAAAATTTTTAAATACTGTTGCAATTCCAGATAGTGTACAAATATTGGTGGGATACATGACAATGTAATACATATGCTGTAGTACCAATATGTTATCACTTATTTTTTTATTTTGCTTTTGTGTATGCATGTATGTGTGCTGCCATGTCCCGCTTTTGCCATCTGTCTGTATGTGTGCGTATGCATGGGTATTGGTATTTGTGTATATTGTGGTAATAACGTCCCCTGCCACAGCATTCACAGTATATGTATTTTGTTTTTTATTGCCCATGTTACTATTGCATATACATGCTATATTGTCTTTACAGTAATTGTATAGGTTGTTTTATACAGTGTATTGTACATTGTATATTTTGTTTTATACCTTTTATGCTTTTTGTATTTTTGTAATAAAAGTATGGTATCCCACCGTGCCGCACGACGCAAACGGGCTTCGGTAACTGACTTATATAAAACATGTAAACAATCTGGTACATGTCCACCTGATGTTGTTCCTAAGGTGGAGGGCACCACGTTAGCAGATAAAATATTGCAATGGTCAAGCCTTGGTATATTTTTGGGTGGACTTGGCATAGGTACTGGCAGTGGTACAGGGGGTCGTACAGGGTACATTCCATTGGGTGGGCGTTCCAATACAGTGGTGGATGTTGGTCCTACACGTCCCCCAGTGGTTATTGAACCTGTGGGCCCCACAGACCCATCTATTGTTACATTAATAGAGGACTCCAGTGTGGTTACATCAGGTGCACCTAGGCCTACGTTTACTGGCACGTCTGGGTTTGATATAACATCTGCGGGTACAACTACACCTGCGGTTTTGGATATCACACCTTCGTCTACCTCTGTGTCTATTTCCACAACCAATTTTACCAATCCTGCATTTTCTGATCCGTCCATTATTGAAGTTCCACAAACTGGGGAGGTGTCAGGTAATGTATTTGTTGGTACCCCTACATCTGGAACACATGGGTATGAGGAAATACCTTTACAAACATTTGCTTCTTCTGGTACGGGGGAGGAACCCATTAGTAGTACCCCATTGCCTACTGTGCGGCGTGTAGCAGGTCCCCGCCTTTACAGTAGGGCCTACCAACAAGTGTCAGTGGCTAACCCTGAGTTTCTTACACGTCCATCCTCTTTAATTACATATGACA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human papillomavirus 18
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2021-06-12
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Alphapapillomavirus 7
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Alphapapillomavirus
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GenBank
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Japan
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Japan
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Homo sapiens
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Human papillomavirus type 18 K2226 DNA, complete genome
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|
LC508989.1
|
human papillomavirus 18
|
Kukimoto,I., Yamaguchi,M., Tenjimbayashi,Y., Hirose,Y., Onuki,M., Iwata,T., Matsumoto,K.
|
Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2020-05-02
|
SW024
|
Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,857
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
| null | null | null | null |
Human papillomavirus type 18 SW024 DNA, complete genome
|
ATTAATACTTTTAACAATTGTAGTATATAAAAAAGGGAGTAACCGAAAACGGTCGGGACCGAAAACGGTGTATATAAAAGATGTGAGAAACACACCACAATACTATGGCGCGCTTTGAGGATCCAACACGGCGACCCTACAAGCTACCTGATCTGTGCACGGAACTGAACACTTCACTGCAAGACATAGAAATAACCTGTGTATATTGCAAGACAGTATTGGAACTTACAGAGGTATTTGAATTTGCATTTAAAGATTTATTTGTGGTGTATAGAGACAGTATACCGCATGCTGCATGCCATAAATGTATAGATTTTTATTCTAGAATTAGAGAATTAAGACATTATTCAGACTCTGTGTATGGAGACACATTGGAAAAACTAACTAACACTGGGTTATACAATTTATTAATAAGGTGCCTGCGGTGCCAGAAACCGTTGAATCCAGCAGAAAAACTTAGACACCTTAATGAAAAACGACGATTTCACAACATAGCTGGGCACTATAGAGGCCAGTGCCATTCGTGCTGCAACCGAGCACGACAGGAACGACTCCAACGACGCAGAGAAACACAAGTATAATATTAAGTATGCATGGACCTAAGGCAACATTGCAAGACATTGTATTGCATTTAGAGCCCCAAAATGAAATTCCGGTTGACCTTCTATGTCACGAGCAATTAAGCGACTCAGAGGAAGAAAACGATGAAATAGATGGAGTTAATCATCAACATTTACCAGCCCGACGAGCCGAACCACAACGTCACACAATGTTGTGTATGTGTTGTAAGTGTGAAGCCAGAATTGAGCTAGTAGTAGAAAGCTCAGCAGACGACCTTCGAGCATTCCAGCAGCTGTTTCTGAACACCCTGTCCTTTGTGTGTCCGTGGTGTGCATCCCAGCAGTAAGCAACAATGGCTGATCCAGAAGGTACAGACGGGGAGGGCACGGGTTGTAACGGCTGGTTTTATGTACAAGCTATTGTAGACAAAAAAACAGGAGATGTAATATCAGATGACGAGGACGAAAATGCAACAGACACAGGGTCGGATATGGTAGATTTTATTGATACACAAGGAACATTTTGTGAACAGGCAGAGCTAGAGACAGCACAGGCATTGTTCCATGCGCAGGAGGTCCACAATGATGCACAAGTGTTGCATGTTTTAAAACGAAAGTTTGCAGGAGGCAGCACAGAAAACAGTCCATTAGGGGAGCGGCTGGAGGTGGATACAGAGTTAAGTCCACGGTTACAAGAAATATCTTTAAATAGTGGGCAGAAAAAGGCAAAAAGGCGGCTGTTTACAATATCAGATAGTGGCTATGGCTGTTCTGAAGTGGAAGCAACACAGATTCAGGTAACTACAAATGGCGAACATGGCGGCAATGTATGTAGTGGCGGCAGTACGGAGGCTATAGACAACGGGGGCACAGAGGGCAACAACAGCAGTGTAGACGGTACAAGTGACAATAGCAATATAGAAAATGTAAATCCACAATGTACCATAGCACAATTAAAAGACTTGTTAAAAGTAAACAATAAACAAGGAGCTATGTTAGCAGTATTTAAAGACACATATGGGCTATCATTTACAGATTTAGTTAGAAATTTTAAAAGTGATAAAACCACGTGTACAGATTGGGTTACAGCTATATTTGGAGTAAACCCAACAATAGCAGAAGGATTTAAAACACTAATACAGCCATTTATATTATATGCCCATATTCAATGTCTAGACTGTAAATGGGGAGTATTAATATTAGCCCTGTTGCGTTACAAATGTGGTAAGAGTAGACTAACAGTTGCTAAAGGTTTAAGTACGTTGTTACACGTACCTGAAACTTGTATGTTAATTCAACCACCAAAATTGCGAAGTAGTGTTGCAGCACTATATTGGTATAGAACAGGAATATCAAATATTAGTGAAGTAATGGGAGACACACCTGAGTGGATACAAAGACTTACTATTATACAACATGGAATAGATGATAGCAATTTTGATTTGTCAGAAATGGTACAATGGGCATTTGATAATGAGCTGACAGATGAAAGCGATATGGCATTTGAATATGCCTTATTAGCAGACAGCAACAGCAATGCAGCTGCCTTTTTAAAAAGCAATTGCCAAGCTAAATATTTAAAAGATTGTGCCACAATGTGCAAACATTATAGGCGAGCCCAAAAACGACAAATGAATATGTCACAGTGGATACGATTTAGATGTTCAAAAATAGATGAAGGGGGAGATTGGAGACCAATAGTGCAATTCCTGCGATACCAACAAATAGAGTTTATAACATTTTTAGGAGCCTTAAAATCATTTTTAAAAGGAACCCCCAAAAAAAATTGTTTAGTATTTTGTGGACCAGCAAATACAGGAAAATCATATTTTGGAATGAGTTTTATACACTTTATACAAGGAGCAGTAATATCATTTGTGAATTCCACTAGTCATTTTTGGTTGGAACCGTTAACAGATACTAAGGTGGCCATGTTAGATGATGCAACGACCACGTGTTGGACATACTTTGATACCTATATGAGAAATGCGTTAGATGGCAATCCAATAAGTATTGATAGAAAGCACAAACCATTAATACAACTAAAATGTCCTCCAATACTACTAACCACAAATATACATCCAGCAAAGGATAATAGATGGCCATATTTAGAAAGTAGAATAACAGTATTTGAATTTCCAAATGCATTTCCATTTGATAAAAATGGCAATCCAGTATATGAAATAAATGACAAAAATTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGCACGAGGAAGAGGAAGATGCAGACACCGAAGGAAACCCTTTCGGAACGTTTAAGTGCGTTGCAGGACAAAATCATAGACCACTATGAAAATGACAGTAAAGACATAGACAGCCAAATACAGTATTGGCAACTAATACGTTGGGAAAATGCAATATTCTTTGCAGCAAGGGAACATGGCATACAGACATTAAACCACCAGGTGGTGCCAGCCTATAACATTTCAAAAAGTAAAGCACATAAAGCTATTGAACTGCAAATGGCCCTACAAGGCCTTGCACAAAGTGCATACAAAACCGAGGATTGGACACTGCAAGACACATGCGAGGAACTATGGAATACAGAACCTACTCACTGCTTTAAAAAAGGTGGCCAAACAGTACAAGTATATTTTGATGGCAACAAAGACAATTGTATGACCTATGTAGCATGGGACAGTGTGTATTATATGACTGATGCAGGAACATGGGACAAAACGGCTACCTGTGTAAGTCACAGGGGATTGTATTATGTAAAGGAAGGGTACAACACGTTTTATATAGAATTTAAAAGTGAATGTGAAAAATATGGGAACACAGGTACGTGGGAAGTACATTTTGGGAATAATGTAATTGATTGTAATGACTCTATGTGCAGTACCAGTGACGACACGGTATCCGCTACTCAGCTTGTTAAACAGCTACAGCACACCCCCTCACCGTATTCCAGCACCGTGTCCGTGGGCACCGCAAAGACCTACGGCCAGACGTCGGCTGCTACACGACCTGGACACTGTGGACTCGCGGAGAAGCAGCATTGTGGACCTGTCAACCCACTTCTCGGTGCAGCTACACCTACAGGCAACAACAAAAGACGGAAACTCTGTAGTGGTAACACTACGCCTATAATACATTTAAAAGGTGACAGAAACAGTTTAAAATGTTTACGGTACAGATTGCGAAAACATAGCGACCACTATAGAGATATATCATCCACCTGGCATTGGACAGGTGCAGGCAATGAAAAAACAGGAATACTGACTGTAACATACCATAGTGAAACACAAAGAACAAAATTTTTAAATACTGTTGCAATTCCAGATAGTGTACAAATATTGGTGGGATACATGACAATGTAATACATATGCTGTAGTACCAATATGTTATCACTTATTTTTTTATTTTGCTTTTGTGTATGCATGTATGTGTGCTGCCATGTCCCGCTTTTGCCATCTGTCTGTATGTGTGCGTATGCATGGGTATTGGTATTTGTGTATATTGTGGTAATAACGTCCCCTGCCACAGCATTCACAGTATATGTATTTTGTTTTTTATTGCCCATGTTACTATTGCATATACATGCTATATTGTCTTTACAGTAATTGTATAGGTTGTTTTATACAGTGTATTGTACATTGTATATTTTGTTTTATACCTTTTATGCTTTTTGTATTTTTGTAATAAAAGTATGGTATCCCACCGTGCCGCACGACGCAAACGGGCTTCGGTAACTGACTTATATAAAACATGTAAACAATCTGGTACATGTCCACCTGATGTTGTTCCTAAGGTGGAGGGCACCACGTTAGCAGATAAAATATTGCAATGGTCAAGCCTTGGTATATTTTTGGGTGGACTTGGCATAGGTACTGGCAGTGGTACAGGGGGTCGTACAGGGTACATTCCATTGGGTGGGCGTTCCAATACAGTGGTGGATGTTGGTCCTACACGTCCCCCAGTGGTTATTGAACCTGTGGGCCCCACAGACCCATCTATTGTTACATTAATAGAGGACTCCAGTGTGGTTACATCCGGTGCACCTAGGCCTACGTTTACTGGTACGTCTGGGTTTGATATAACATCTGCGGGTACAACTACACCTGCGGTTTTGGATATCACACCTTCGTCTACCTCTGTGTCTATTTCCACAACCAATTTTACCAATCCTGCATTTTCTGATCCGTCCATTATTGAAGTTCCACAAACTGGGGAGGTGTCAGGTAATGTATTTGTTGGTACCCCTACATCTGGAACACATGGGTATGAGGAAATACCTTTACAAACATTTGCTTCTTCTGGTACGGGGGAGGAACCCATTAGTAGTACCCCATTGCCTACTGTGCGGCGTGTAGCAGGTCCCCGCCTTTACAGTAGGGCCTACCAACAAGTGTCAGTGGCTAACCCTGAGTTTCTTACACGTCCATCCTCTTTAATTACATATGACA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| 50,683
|
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|
human papillomavirus 18
|
Kukimoto,I., Yamaguchi,M., Tenjimbayashi,Y., Hirose,Y., Onuki,M., Iwata,T., Matsumoto,K.
|
Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
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2020-05-02
|
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Alphapapillomavirus 7
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
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|
GenBank
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Japan
|
Japan
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Homo sapiens
| null | null | null | null |
Human papillomavirus type 18 SW044 DNA, complete genome
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| 50,684
|
NC_038889.1
|
human papillomavirus 30
|
Delius,H., Hofmann,B.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2018-08-24
| null |
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,852
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
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|
Human papillomavirus type 30 genomic DNA
|
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| 4,143
|
OP971007.1
|
human papillomavirus 30
|
Happel,A.-U., Balle,C., Havyarimana,E., Brown,B., Maust,B., Konstantinus,I.N., Feng,C., Yi,B.H., Gill,K., Bekker,L.-G., Passmore,J.-A.S., Jaspan,H.B., Varsani,A.
|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
|
2023-01-14
|
UC084_LW_V1
|
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,881
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
2016-09-08
|
SAMN22416354
|
PRJNA767784
|
Human papillomavirus 30 isolate UC084_LW_V1, complete genome
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|
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human papillomavirus 30
|
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|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
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2023-01-14
|
UC084_LW_V2
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Alphapapillomavirus 6
|
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Papillomaviridae
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GenBank
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South Africa
|
South Africa
|
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| null |
2016-12-21
|
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|
Human papillomavirus 30 isolate UC084_LW_V2, complete genome
|
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| 19,479
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|
human papillomavirus 30
|
Happel,A.-U., Balle,C., Havyarimana,E., Brown,B., Maust,B., Konstantinus,I.N., Feng,C., Yi,B.H., Gill,K., Bekker,L.-G., Passmore,J.-A.S., Jaspan,H.B., Varsani,A.
|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
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|
UC159_LW_V2
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Alphapapillomavirus
|
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|
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South Africa
|
South Africa
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Human papillomavirus 30 isolate UC159_LW_V2, complete genome
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| 19,568
|
LR861842.1
|
human papillomavirus 30
|
Wienecke-Baldacchino K,A.
|
Laboratoire National de Sante, Epidemiology and Microbial Genomics, 1, Rue Louis Rech, 3555 Dudelange
|
Luxembourg
|
2020-09-01
|
LNS0328678_HPV30
|
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,881
|
GenBank
| null |
Luxembourg
|
Luxembourg
|
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJEB39467
|
Human papillomavirus type 30 isolate LNS0328678_HPV30, complete genome
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| 47,353
|
LR862000.1
|
human papillomavirus 30
|
Wienecke-Baldacchino K,A.
|
Laboratoire National de Sante, Epidemiology and Microbial Genomics, 1, Rue Louis Rech, 3555 Dudelange
|
Luxembourg
|
2020-09-01
|
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|
Alphapapillomavirus 6
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Alphapapillomavirus
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|
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|
GenBank
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Luxembourg
|
Luxembourg
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Homo sapiens
| null | null | null |
PRJEB39467
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Human papillomavirus type 30 isolate LNS6893423_HPV30, complete genome
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| 47,507
|
KU298887.1
|
human papillomavirus 30
|
Siqueira,J.D., Alves,B.M., Prellwitz,I.M., Furtado,C., Meyrelles,A.R., Machado,E.S., Seuanez,H.N., Soares,M.A., Soares,E.A., Delwart,E.L.
|
Instituto Nacional de Cancer Jose Alencar Gomes da Silva, Programa de Genetica
|
Brazil
|
2016-04-14
|
110A.30
|
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,817
|
GenBank
| 1
|
Brazil
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
cervix
| null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate 110A.30, complete genome
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GTTTATAGAAAGGGAGTGACCGAAATAGGTTTTCAACCGAAAACGGTACATATAAAAGCACTGTACCAGACGGACAGTGTACCCATGGCTTTCAAATTTGAAAATACAGGCGAGCGCCCACGTACTGTGCACCATCTTTGTGAGGTACAAGAAACATCGTTGCTGGAGCTACAGCTACAGTGTGTATATTRCAAGAAGGAATTATCCAGCTCAGAGGTATATAATTTTGCATGTAAAGATTTAAGACTGGTATATAGGGAGGACAGCCCATATGCAGTGTGCAATTTCTGTTTATTATTTTATAGTAAAGTAAGAAAGATTAGACATTACAACTATTCATTGTATGGGGCAAGCCTAGTGGCATTAACTAAAAAARAGTTATTTRATTTATTAATAAGGTGCTACAGATGTCAACAGCCGTTGACACCAGAGGAAAAACAGTTACACTGTGAATATAAGAAACGGTTTCACAGAATATCACGTACGTGGACCGGGTTATGTCTGCAATGCTGGAGACACACAACGTCCACTGAGACAGCAGTATAATCATGCACGGTAAAGTAACAACTATTCCAGAATATATTTTGGACCTTGTACCGCAAACTGAGATTGACCTGCATTGCTATGAGCAATTGAACAGCTCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAAGTAGACAATTTACAGAAGCAGCCACAGCAAGCTAGACAAGAAGAACAACATCCTTGTTACCTAATTAACACACAGTGTTGTAGGTGTGCGTCTGCGGTGCAGTTGGCTGTTCAGAGTTCCACAAAAGAGCTGCGTGCCCTACAACAGATGCTTATGGGCGCACTGGAGCTAGTGTGTCCCCTGTGTGCAACAAGGCGGTAAACTGCAATGGCGTCACCTGAAGGTACAGATGATGAGGGAGGGGGGTGCACGGGATGGTTTCATGTTGAGGCTGTAGTCAAGAAACGTACGGGAGATATAATATCAGAGGACGAAACAGAAGAAGATGAGGGCACAGCATCAGATTTAGATGGGTTTCTAGACAATAGTAATGTAATAACAACACAGGCAGACAGAGAGACAGCTCAGCAGTTATTGCATGCCCAAAACACATATGCAGATACACAGACGCTGCACAATTTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCGTTGGGAGACATTAGTAATCAGCAATTTGTGTGCCGGGAAGGAGTAAAACGAAGGATAATTGATACAGACGTGGCCGACAGCGGGTATGGCAATACTTTGGAAGTGGAAGCAAYGCAACAGGTACAGGATAATACGTATGGTAGTGGTAAACAGCAAGATGGAGGCTCACAGACTAGTGTGTGTAGCAGGGAAAACAGCATAGAAGCAGACAGTGATATGGATATAGGCGCCACGCCACCACAGCAAATACAAGAATTATTAAAATCTAGTAATGTACAGGCAAAGCTGTGTTATAAATTTAAAGAGTTATTTGGAATTCCATTTTCAGAATTGGTACGTACATTTAAAAGTGACAGCACATGTTGTCATGACTGGATATGTGCCATGTTTGGTGTTAATGAAACGTTAGCAGAGGCATTAAAAACAATTATTAAATCACAGTGCATGTATTACCATATACAGTGTTTAACGTGTACATGGGGCGTTGTAATATTAATGTTAATTAGATATACATGTGGAAAAAATAGAAAAACAATTATAAAATCACTAAGTTCAATTGTAAATGTGCCTAGCGAACAAATGCTTGTGCAGCCACCTAAAATACGTAGCCCTGCCGTTGCATTATACTTTTACAAAACTGCAATGTCTAATATTAGTGACATATATGGTGAGACACCAGAATGGATACAGCGACAAACACAAATACAGCACAGTTTCCAGGACTGCCAATTTGAACTGTCGAAAATGGTGCAATGGGCATTTGATAATGAAGTAACAGATGACAGTGACATTGCATTTTACTATGCACAGTTAGCAGATGTGGATAGTAATGCACAGGCTTTTTTAAAAAGCAATATGCAGGCCAAATATGTAAAGGATTGTGGAATAATGTGCAGACACTATAAAAGAGCACAACAACAACAAATGAACATGAAACAATGGATTACACACATATGTAGTAAAGTAGATGAGGGCGGGGACTGGAGGCCAATTGTACAGTTTCTAAGATATCAAGGGGTTGACTTTATTTCATTTTTAAGTTATTTTAAATTATTTCTACGAGGCACACCAAAACACAACTGCCTAGTACTATATGGACCACCAAACACAGGAAAGTCATGTTTTGCTATGAGCCTTATACAATTTTTTCAGGGGTCTGTTATTTCATATGTAAATTCACACAGTCACTTTTGGTTACAACCGTTAGACAATGCTAAATTGGGAATGCTAGATGATGCCACAGATGCATGCTGGAGATATATAGATGAATATATGCGAAATTTATTAGATGGGAATCCTGTAAGTTTAGATAGAAAACATAAACAACTAGTACAAATAAAATGTCCACCAGTAATAATAACAACAAATATTAATCCACTGCACGATGCAAAATTGCAGTACTTGCACAGTAGAATACATGTGGTGCCATTTTTAAATCCATTTCCAATTGATACAAATGGTAATCCTGTATATCAATTAAATAATGTAAACTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGAACAACGACGAAGACAAGGAAAACCATGGAGACTCTATGCCAACGTTTAGATGCGTGCCAGGAGAAAATTCTAGACTGTTTTGAAAACGATAGTAAAAAAATCGAAGACCATATAGTGTACTGGAAAGCTGTACGACATGAAAATGTTGTATTATATAAAGCAAGACAAAATAATATTACTAACCTACGCCACCAGGTGGTGCCATGTTTACAAGTGTGTAAAGCAAAGGCATGTGTTGCTATAGAAATACAAATGGCATTGGAATCATTATATAAAACAGAGTATAACGTGGAGGAGTGGACATTAAAAGATGTATGTGAAAATATGTGGCATACAGCACCAAAACAGTGTTTTAAAAAAGGTGGAAAACATATAGAAGTGTGGTTTGATGGGAAAAAAGACAATCGAACTGAATATGTTGTGTGGCAATGGGTGTATTACTGTGGGGACAATGGGTGGACTAAAGTGCCTTCTGTAGTAGATTACAAAGGTATATATTATGTACATGACGGTAACAGAGTATATTATACAGACTTTAAGGACGAGGCAGTAAAGTATGGGTATAAAGGCACATGGGAAGTGCATATGGGAAATGAAAGTATTTATTGTCCCGACTCTGTGTCTAGTACCCTCAGATCCAACGTATCCCCTGTTGAAACTGTTTTCGAATACAACACCTATCAAACCCCCACCACCTCCACGCCCGTGGGCGCCAACGAAGCCGCGTCCTCCGCACGGCCGGGAAAACGTCCCAGAACCACAGAGCCCGACAGTACAGACACCACCAGACAGTCCGCTGCCAGAGAGTCCCACGCACACCGTGTCAACACAAACAACACAAACAACAGACAGTGCCTTGGTGGAGCTACATGTTACAACACAGAAGTCGATGGTGGTTATAAGACTACACCTGTAGTGCATTTAAAAGGTGAACCAAACAGATTAAAGTGTTTAAGATATAGGTGTCAAAAACATAAGCACCTATTTGTAAATATATCGTCTACATATCATTGGACCAATACACATACAGAGTACAGCTACATTACTGTTGTATATAAAGATGAGACCCAGCGTGCCAACTTTTTAAATGTTGTAAAAATACCACCCAGTATACAAATTGTAATGGGACATATGACAGGTGTTGATATGTAACAACACATATGTTGTAATTRGTACAACAAACATGTAATATTGTATTACACATGTAAATATTATTGTGTACTATATTCATACAACAACAAACGCCATATTTTGCTGCTACGCCTGTTATATATTGCAACCATTGTTTTATTTGTTAGTTTTGTGTTTTTGCTTTGCTRTTTTGTGTGCCTGTGTGTCTGCCTATATGTGCCGCTTTTGCTGTCTGCCTCGTTGTTTGCTACCTGTTTATTACTTATAATATTGTTTTGGTTTGTTGTTGCATCATCCTACATTACTGCATTTACTATATTTTTGCTGTTTTTTTATATACCTTTATTACTTGTATATGCCCATGCTGTGTGGTTAATAAACACACAATAAATTGTTTTGTAACATATTACACTTTTGCTTTGTGTAGGGCGTGTACTATGGTCGCCCACCGGGCACGCAGACGGAAACGGGCCTCTGCTACTCAGCTGTATCAAACGTGCAAGCAGGCTGGCACATGTCCATCTGATGTTATTAACAAAATTGAACACACAACTTTGGCAGATAAGATATTACAATGGGGTAGTTTGTTTACATTTTTTGGTAATTTAGGTATAGGCACTGGTGCAGGCTCTGGGGGGCGTGCTGGTTATGTTCCGTTAGGTACACGGCCTACAACAGTTGTGGACGCATCCCCTGCTAGACCACCTATTGTTGTTGAATCTGTGGGTCCTACGGACCCTTCCATTGTTACACTGGTTGAGGAGTCTAGTGTGGTTAATGCTGGAGCATCATTCCCTAATTTTACAGGCACTGCAGGCTTTGAGGTTACGTCTTCTTCTACCACAACACCTGCTGTATTAGACATTACACCTACCACTGGCTCTGTCCATGTTAGTAGTACCCATTTTACCAATCCCTCCTTTGTTGAACCCCCAGTTATTGAGGTTCCACAAACTGGGGAGGTATCCGGCCATATATTAGTTAGCACTCCCACATCTGGTGTACATAGTTATGAAGAAATACCTATGCAAACATTTGCTGTGCATGGTACAGGCACTGAACCTATTAGTAGTACCCCTATTCCTGGGTTACGACGTATAGCTGCCCCTAGATTGTATCAAAGGGCCTTTCAGCAGGTAAAGGTCACTGACCCCACATTCCTTACCAAACCTGAAACATTAATT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| 82,539
|
KF436837.1
|
human papillomavirus 30
|
Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
|
Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
|
USA
|
2015-10-19
|
Qv26381
|
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,852
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Qv26381, complete genome
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| 85,121
|
KF436838.1
|
human papillomavirus 30
|
Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
|
Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
|
USA
|
2015-10-19
|
Rw933
|
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,852
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Rw933, complete genome
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TGAAAGTTACAAGCATAGTTTATAGAAAGGGAGTGACCGAAATAGGTTTTCAACCGAAAACGGTACATATAAAAGCACTGTACCAAACGGACAGTGTACCCATGGCTTTCAAATTTGAAAATACAGGCGAGCGCCCACGTACTGTGCACCATCTTTGTGAGGTACAAGAAACATCGTTGCTGGAGCTACAGCTACAGTGTGTATATTGCAAGAAGGAATTATCCAGCTCAGAGGTATATAATTTTGCATGTAAAGATTTAAGACTGGTATATAGGGAGGACAGCCCATATGCAGTGTGCAATTTCTGTTTATTATTTTATAGTAAAGTAAGAAAGATTAGACATTACAACTATTCATTGTATGGGGCAAGCCTAGTGGCATTAACTAAAAAAGAGTTATTTGATTTATTAATAAGGTGCTACAGATGTCAACAGCCGTTGACACCAGAGGAAAAACAGTTACACTGTGAATATAAGAAACGGTTTCACAGAATATCACGTACGTGGACCGGGTTATGTCTGCAATGCTGGAGACACACAACGTCCACTGAGACAGCAGTATAATCATGCACGGTAAAGTAACAACTATTCCAGAATATATTTTGGACCTTGTACCGCAAACTGAAATTGACCTGCATTGCTATGAGCAATTGAACAGCTCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAAGTAGACAATTTACAGAAGCAGCCACAGCAAGCTAGACAAGAAGAACAACATCCTTGTTACCTAATTAACACACAGTGTTGTAGGTGTGCGTCTGCGGTGCAGTTGGCTGTTCAGAGTTCCACAAAGGAGCTGCGTGCCCTACAACAGATGCTTATGGGCGCACTGGAGCTAGTGTGTCCCCTGTGTGCAACAAGGCGGTAAACTGCAATGGCGTCACCTGAAGGTACAGATGATGAGGGAGGGGGGTGCACGGGATGGTTTCATGTTGAGGCTGTAGTCAAGAAACGTACGGGAGATATAATATCAGAGGACGAAACAGAAGAAGATGAGGGCACAGCATCAGATTTAGATGGGTTTCTAGACAATAGTAATGTAATAACAACACAGGCAGACAGAGAGACAGCTCAGCAGTTATTGCATGCCCAAAACACATATGCAGATACACAGACGCTGCACAATTTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCGTTGGGAGACATTAGTAATCAGCAATTTGTGTGCCGGGAAGGAGTAAAACGAAGGATAATTGATACAGACGTGGCCGACAGCGGGTATGGCAATACTTTGGAAGTGGAAGCAACGCAACAGGTACAGGATAATACGTATGGTAGTGGTAAACAGCAAGATGGAGGCTCACAGACTAGTGTGTGTAGCAGGGAAAACAGCATAGAAGCAGACAGTGATATGGATATAGGCGCCACGCCACCACAGCAAATACAAGAATTATTCAAATCTAGTAATGTACAGGCAAAGCTGTGTTATAAATTTAAAGAGTTATTTGGAATTCCATTTTCAGAATTGGTACGTACATTTAAAAGTGACAGCACATGTTGTCATGACTGGATATGTGCCATGTTTGGTGTTAATGAAACCTTAGCAGAGGCATTAAAAACAATTATTAAATCACAGTGCATGTATTACCATATACAGTGTTTAACGTGTACATGGGGCGTTGTAATATTAATGTTAATTAGATATACATGTGGAAAAAATAGAAAAACAATTATAAAATCACTCAGTTCAATTGTAAATGTGCCCAGCGAACAAATGCTTGTGCAGCCACCTAAAATACGTAGCCCTGCCGTTGCATTATACTTTTACAAAACTGCAATGTCTAATATTAGTGACATATATGGTGAGACACCAGAATGGATACAGCGACAAACACAAATACAGCACAGTTTTCAGGACTGCCAATTTGAACTGTCGAAAATGGTGCAATGGGCATTTGATAATGAAGTAACAGATGACAGTGACATTGCATTTTACTATGCACAGTTAGCAGATGTAGATAGTAATGCACAGGCTTTTTTAAAAAGCAATATGCAGGCCAAATATGTAAAGGATTGTGGAATAATGTGCAGACACTATAAAAGAGCACAACAACAACAAATGAACATGAAACAATGGATTACACACATATGTAGTAAAGTAGATGAGGGCGGGGACTGGAGGCCAATTGTACAGTTTTTAAGATATCAAGGGGTCGACTTCATTTCATTTTTAAGTTATTTTAAATTATTTTTACGAGGCACACCAAAACACAACTGCCTAGTATTATATGGACCACCAAACACAGGAAAGTCATGTTTTGCTATGAGCCTTATACAATTTTTTCAGGGGTCTGTTATTTCATATGTAAATTCACACAGTCACTTTTGGTTACAACCGTTAGACAATGCTAAATTGGGAATGCTAGATGATGCCACAGATGCATGCTGGAGATATATAGATGAATACATGCGAAATTTATTAGATGGGAATCCTGTAAGTTTAGATAGAAAACATAAACAACTAGTACAAATAAAATGTCCACCAGTAATAATAACAACAAATATTAATCCACTGCACGATGCAAAATTGCAGTACTTGCACAGTAGAATACATGTGGTGCCATTTCTAAATCCATTTCCAATTGATACAAATGGTAATCCTGTATATCAATTAAATAATGTAAACTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGAACAACGACGAAGACAAGGAAAACCATGGAGACTCTATGCCAACGTTTAGATGCGTGCCAGGAGAAAATTCTAGACTGTTTTGAAAACGATAGTAAAAAAATTGAAGACCATATAGTGTACTGGAAAGCTGTACGACATGAAAATGTTGTATTATATAAAGCAAGACAAAATAATATTACTAAACTACGCCACCAGGTGGTGCCATGTTTACAAGTGTGTAAAGCAAAGGCATGTGTTGCTATAGAAATACAAATGGCATTGGAATCATTATATAAAACAGAGTATAAAGTGGAGGAGTGGACATTAAAAGATGTATGTGAAAATATGTGGCATACAGCACCAAAACAGTGTTTTAAAAAAAGTGGAAAACGTATAGAAGTGTGGTTTGATGGGAAAAAAGACAATCGAACTGAATATGTTGTGTGGCAATGGGTGTATTACTGTGGGGACAATGGGTGGACTAAAGTGCCTTCTGTAGTAGATTACAAAGGTATATATTATGTACATGACGGTAACAAAGTATATTATACAGACTTTAATGACGAGGCAGTAAAGTATGGGTATAAAGGCACATGGGAAGTGCATATGGGAAATGAAAGTATTTATTGTCCCGACTCTGTGTCTAGTACCCTCAGATCCAACGTATCCCCTGTTGAAACTGTTTTCGAATACAACACCTACAACACCTATCAAACCCCCACCACCTCCACGCCCGTGGGCGCCAACGAAGCCGCGTCCTCCGCACGGCCGGGAAAACGTCCTAGAACCACAGAGCCCGACAGTACAGACACCACCAGACAGTCCGCTGCCAGAGAGTCCCACGCAAACCGTGGCAACACAAACAACACAAACAACAGACAGTGCCTTGGTGGAGCTACATGTTACAACACAGAAGTCGACGGTGGTTATAAGACTACACCTGTAGTGCATTTAAAAGGTGAACCAAACAGATTAAAGTGTTTAAGATATAGGTGTCAAAAACATAAGCACCTATTTGTAAATATATCGTCTACATATCATTGGACCAATACACATACAGAGTACAGCTACATTACTGTTGTATATAAAGATGAGACCCAGCGTGCCAACTTTTTAAATGTTGTAAAAATACCACCCAGTATAAAAATTGTAATGGGACATATGACAGGTGTTGATATGTAACAACACATATGTTGTAATTGGTACAACAAACATGTAATATTGTATTACACATGTAAATATTATTGTGTACTATATTCATACAACAACAAACGCCATATTTTGCTGCTACGCCTGTTATATATTGCAACCATTGTTTTATTTGTTAGTTTTGTGTTTTTGCTTTGCTGTTTTGTGTGCCTGTGTGTCTGCCTATATGTGCCGCTTTTGCTGTCTGCCTCGTTGTTTGCTACCTGTTTATTACTTATAATATTGTTTTGGTTTGTTGTTGCATCGTCCTACATTACTGCATTTACTATATTTTTGCTGTTTTTTTATATACCTTTATTACTTGTATATGCCCATGCTGTGTGGTTAATAAACACACAATAAATTGTTTTGTAACATATTACACTTTTGCTTTGTGTAGGGCGTGTACTATGGTCGCCCACCGGGCACGCAGACGAAAACGGGCCTCTGCTACTCAGCTGTATCAAACGTGCAAGCAGGCTGGCACATGTCCATCTGATGTTATTAACAAAATTGAACACACAACTTTGGCAGATAAGATATTACAATGGGGTAGTTTGTTTACATTTTTTGGTAATTTAGGTATAGGCACTGGTGCAGGCTCTGGGGGGCGTGCTGGTTATGTTCCGTTAGGTACACGGCCTACAACAGTTGTGGACGCATCCCCTGCTAGGCCACCTATTGTTGTTGAATCTGTGGGTCCTACGGACCCTTCCATTGTTACACTGGTTGAGGAGTCTAGTGTGGTTAATGCTGGAGCATCATTCCCTAATTTTACAGGCACTGCAGGCTTTGAGGTTACGTCTTCTTCTACCACAACACCTGCTGTATTAGACATTACACCTACCACTGGCTCTGTCCATGTTAGTAGTACCCATTTTACCAATCCCTCCTTTGTTGAACCCCCAGTTATTGAGGTTCCACAAACTGGGGAGGTATCCGGCCATATATTAGTTAGCACTCCCACATCTGGTGTACATAGTTATGAAGAAATACCTATGCAAACATTTGCTGTGCATGGTACAGGCACTGAACCTATTAGTAGTACCCCTATTCCTGGGTTACGACGTATAGCTGCCCCTAGATTGTATCAAAGGGCCTTTCAGCAGGTAAAGGTCACTGACCCCACAT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| 85,122
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KF436839.1
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human papillomavirus 30
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Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
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Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
|
USA
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2015-10-19
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Rw20
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Alphapapillomavirus 6
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,852
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Rw20, complete genome
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| 85,123
|
KF436840.1
|
human papillomavirus 30
|
Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
|
Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
|
USA
|
2015-10-19
|
Rw046
|
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,852
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Rw046, complete genome
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TGAAAGTTACAAGCATAGTTTATAGAAAGGGAGTGACCGAAATAGGTTTTCAACCGAAAACGGTACATATAAAAGCACTGTACCAAACGGACAGTGTACCCATGGCTTTCAAATTTGAAAATACAGGCGAGCGCCCACGTACTGTGCACCATCTTTGTGAGGTACAAGAAACATCGTTGCTGGAGCTACAGCTACAGTGTGTATATTGCAAGAAGGAATTATCCAGCTCAGAGGTATATAATTTTGCATGTAAAGATTTAAGACTGGTATATAGGGAGGACTGCCCATATGCAGTGTGCAATTTCTGTTTATTATTTTATAGTAAAGTAAGAAAGATTAGACATTACAACTATTCATTGTATGGGGCAAGCCTAGTGGCATTAACTAAAAAAGAGTTATTTGATTTATTAATAAGGTGCTACAGATGTCAACAGCCGTTGACACCAGAGGAAAAACAGTTACACTGTGAATATAAGAAACGGTTTCACAGAATATCACGTACGTGGACCGGGTTATGTCTGCAATGCTGGAGACACACAACGTCCACTGAGACAGCAGTATAATCATGCACGGTAAAGTAACAACTATTCCAGAATATATTTTGGACCTTGTACCGCAAACTGAAATTGACCTGCATTGCTATGAGCAATTGAACAGCTCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAAGTAGACAATTTACAGAAGCAGCCACAGCAAGCTAGACAAGAAGAACAACATCCTTGTTACCTAATTAACACACAGTGTTGTAGGTGTGCGTCTGCGGTGCAGTTGGCTGTTCAGAGTTCCACAAAAGAGCTGCGTGCCCTACAACAGATGCTTATGGGCGCACTGGAGCTAGTGTGTCCCCTGTGTGCAACAAGGCGGTAAACTGCAATGGCGTCACCTGAAGGTACAGATGATGAGGGAGGGGGGTGCACGGGATGGTTTCATGTTGAGGCTGTAGTCAAGAAACGTACGGGAGATATAATATCAGAGGACGAAACAGAAGAAGATGAGGGCACAGCATCAGATTTAGATGGGTTTCTAGACAATAGTAATGTAATAACAACACAGGCAGACAGAGAGACAGCTCAGCAGTTATTGCATGCCCAAAACACATATGCAGATACACAGACGCTGCACAATTTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCGTTGGGAGACATTAGTAATCAGCAATTTGTGTGCCGGGAAGGAGTAAAACGAAGGATAATTGATACAGACGTGGCCGACAGCGGGTATGGCAATACTTTGGAAGTGGAAGCAACGCAACAGGTACAGGATAATACGTATGGTAGTGGTAAACAGCAAGATGGAGGCTCACAGACTAGTGTGTGTAGCAGGGAAAACAGCATAGAAGCAGACAGTGATATGGATATAGGCGCCACGCCACCACAGCAAATACAAGAATTATTAAAATCTAGTAATGTACAGGGAAAGCTGTGTTATAAATTTAAAGAGTTATTTGGAATTCCATTTTCAGAATTGGTACGTACATTTAAAAGTGACAGCACATGTTGTCATGACTGGATATGTGCCATGTTTGGTGTTAATGAAACCTTAGCAGAGGCATTAAAAACAATTATTAAATCACAGTGCATGTATTACCATATACAGTGTTTAACGTGTACATGGGGCGTTGTAATATTAATGTTAATTAGATATACATGTGGAAAAAATAGAAAAACAATTATAAAATCACTAAGTTCAATTGTAAATGTGCCCAGCGAACAAATGCTTGTGCAGCCACCTAAAATACGTAGCCCTGCCGTTGCATTATACTTTTACAAAACTGCAATGTCTAATATTAGTGACATATATGGTGAGACACCAGAATGGATACAGCGACAAACACAAATACAGCACAGTTTTCAGGACTGCCAATTTGAACTGTCGAAAATGGTGCAATGGGCATTTGATAATGAAGTAACAGATGACAGTGACATTGCATTTTACTATGCACAGTTAGCAGATGTGGATAGTAATGCACAGGCGTTTTTAAAAAGCAATATGCAGGCCAAATATGTAAAGGATTGTGGAATAATGTGCAGACACTATAAAAGAGCACAACAACAACAAATGAACATGAAACAATGGATTACACACATATGTAGTAAAGTAGATGAGGGCGGGGACTGGAGGCCAATTGTACAGTTTTTAAGATATCAAGGGGTCGACTTCATTTCATTTTTAAGTTATTTTAAATTATTTTTACGAGGCACACCAAAACACAACTGCCTAGTATTATATGGACCACCAAACACAGGAAAGTCATGTTTTGCTATGAGCCTTATACAATTTTTTCAGGGGTCTGTTATTTCATATGTAAATTCACACAGTCACTTTTGGTTACAACCGTTAGACAATGCTAAATTGGGAATGCTAGATGATGCCACAGATGCATGCTGGAGATATATAGATGAATATATGCGAAATCTATTAGATGGGAATCCTGTAAGTTTAGATAGAAAACATAAACAACTAGTACAAATAAAATGTCCACCAGTAATAATAACAACAAATATTAATCCACTGCACGATGCAAAATTGCAGTACCTGCACAGTAGAATACATGTGGTGCCATTTCTAAATCCATTTCCAATTGATACAAATGGTAATCCTGTATATCAATTAAATAATGTAAACTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGAACAACGACGAAGACAAGGAAAACCATGGAGACTCTATGCCAACGTTTAGATGCGTGCCAGGAGAAAATTCTAGACTGTTTTGAAAACGATAGTAAAAAAATTGAAGACCATATAGTGTACTGGAAAGCTGTACGACATGAAAATGTTGTATTATATAAAGCAAGACAAAATAATATTACTAAACTACGCCACCAGGTGGTGCCATGTTTACAAGTGTGTAAAGCAAAGGCATGTGTTGCTATAGAAATACAAATGGCATTGGAATCATTATATAAAACAGAGTATAAAGTGGAGGAGTGGACATTAAAAGATGTATGTGAAAATATGTGGCATACAGCACCAAAACAGTGTTTTAAAAAAAGTGGAAAACGTATAGAAGTGTGGTTTGATGGGAAAAAAGACAATCGAACTGAATATGTTGTGTGGCAATGGGTGTATTACTGTGGGGACAATGGGTGGACTAAAGTGCCTTCTGTAGTAGATTACAAAGGTATATATTATGTACATGATGGTAACAAAGTATATTATACAGACTTTAATGACGAGGCAGTAAAGTATGGGTATAAAGGCACATGGGAAGTGCATATGGGAAATGAAAGTATTTATTGTCCCGACTCTGTGTCTAGTACCCTCAGATCCAACGTATCCCCTGTTGAAACTGTTTTCGAATACAACACCTACAACACCTATCAAACCCCCACCACCTCCACGCCCGTGGGCGCCAACGAAGCCGCGTCCTCCGCACGGCCGGGAAAACGTCCCAGAACCACAGAGCCCGACAGTACAGACACCACCAGACAGTCCGCTGCCAGAGAGTCCCACGCAAACCGTGTCAACACAAACAACACAAACAACAGACAGTGCCTTGGTGGAGCTACATGTTACAACACAGAAGTCGACGGTGGTTATAAGACTACACCTGTAGTGCATTTAAAAGGTGAACCAAACAGATTAAAGTGTTTAAGATATAGGTGTCAAAAACATAAGCACCTATTTGTAAATATATCGTCTACATATCATTGGACCAATACACATACAGAGTACAGCTACATTACTGTTGTATATAAAGATGAGACCCAGCGTGCCAACTTTTTAAATGTTGTAAAAATACCACCCAGTATACAAATTGTAATGGGACATATGACAGGTGTTGATATGTAACAACACATATGTTGTAATTGGTACAACAAACATGTAATATTGTATTACACATGTAAATATTATTGTGTACTATATTCATACAACAACAAACGCCATATTTTGCTGCTACGCCTGTTATATATTGCAACCATTGTTTTATTTGTTAGTTTTGTGTTTTTGCTTTGCTGTTTTGTGTGCCTGTGTGTCTGCCTATATGTGCCGCTTTTGCTGTCTGCCTCGTTGTTTGCTACCTGTTTATTACTTATAATATTGTTTTGGTTTGTTGTTGCATCGTCCTACATTACTGCATTTACTATATTTTTGCTGTTTTTTTATATACCTTTACTACTTGTATATGCCCATGCTGTGTGGTTAATAAACACACAATAAATTGTTTTGTAACATATTACACTTTTGCTTTGTGTAGGGCGTGTACTATGGTCGCCCACCGGGCACGCAGACGAAAACGGGCCTCTGCTACTCAGCTGTATCAAACGTGCAAGCAGGCTGGCACATGTCCATCTGATGTTATTAACAAAATTGAACACACAACTTTGGCAGATAAGATATTACAATGGGGTAGTTTGTTTACATTTTTTGGTAATTTAGGTATAGGCACTGGTGCAGGCTCTGGGGGGCGTGCTGGTTATGTTCCGTTAGGTACACGGCCTACAACAGTTGTGGACGCATCCCCTGCTAGGCCACCTATTGTTGTTGAATCTGTGGGTCCTACGGACCCTTCCATTGTTACACTGGTTGAGGAGTCTAGTGTGGTTAATGCTGGAGCATCATTCCCTAATTTTACAGGCACTGCAGGCTTTGAGGTTACGTCTTCTTCTACCACAACACCTGCTGTATTAGACATTACACCTACCACTGGCTCTGTCCATGTTAGTAGTACCCATTTTACCAATCCCTCCTTTGTTGAACCCCCAGTTATTGAGGTTCCACAAACTGGGGAGGTATCCGGCCATATATTAGTTAGCACTCCCACATCTGGTGTACATAGTTATGAAGAAATACCTATGCAAACATTTGCTGTGCATGGTACAGGCACTGAACCTATTAGTAGTACCCCTATTCCTGGGTTACGACGTATAGCTGCCCCTAGATTGTATCAAAGGGCCTTTCAGCAGGTAAAGGTCACTGACCCCACAT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| 85,124
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KF436841.1
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human papillomavirus 30
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Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
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Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
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USA
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2015-10-19
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Qv27356
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Alphapapillomavirus 6
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,843
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Qv27356, complete genome
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| 85,125
|
KF436842.1
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human papillomavirus 30
|
Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
|
Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
|
USA
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2015-10-19
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Qv00510
|
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,843
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Qv00510, complete genome
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| 85,126
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KF436843.1
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human papillomavirus 30
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Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
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Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
|
USA
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2015-10-19
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Rw85
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Alphapapillomavirus 6
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,843
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Rw85, complete genome
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| 85,127
|
KF436844.1
|
human papillomavirus 30
|
Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
|
Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
|
USA
|
2015-10-19
|
Rw060
|
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,881
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Rw060, complete genome
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TGAAAGTTACAAGCATAGTTTATAGAAAGGGAGTGACCGAAATGGGTTTTCAACCGAAAACGGTACATATAAAAGCACTGTACCAAACGGACAGTGTACCCATGGCTTTCAAATTTGAAAATACAGGCGAGCGCCCACGTACTGTGCACCATCTTTGTGAGGTACAAGAAACATCGTTGCTGGAGCTACAGCTACAGTGTGTATATTGCAAGAAGGAATTATCCAGCTCAGAGGTATATAATTTTGCATGTAAAGATTTAAGACTGGTATATAGGGAGGACAGCCCATATGCAGTGTGCAATTTCTGTTTATTATTTTATAGTAAAGTAAGAAAGATTAGACATTACAACTATTCATTGTATGGGGCAAGCCTAGTGGCATTAACTAAAAAAGAGTTATTTGATTTATTAATAAGGTGCTACAGATGTCAACAGCCGTTGACACCAGAGGAAAAACAGTTACACTGTGAATATAAGAAACGGTTTCACAGAATATCACGTACGTGGACCGGGTTATGTCTGCAATGCTGGAGACACACAACGTCCACTGAGACAGCAGTATAATCATGCACGGTAAAGTAACAACTATTCCAGAATATATTTTGGACCTTGTACCGCAAACTGAAATTGACCTGCATTGCTATGAGCAATTGAACAGCTCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAAGTAGACCATTTACAGAAGCAGCCACAGCAAGCTAGACAAGAAGAACAACATCCTTGTTACCTAATTAACACACAGTGTTGTAGGTGTGCGTCTGCGGTGCAGTTGGCTGTTCAGAGTTCCACAAAAGAGCTGCGTGCCCTACAACAGATGCTTATGGGCGCACTGGAGCTAGTGTGTCCCCTGTGTGCAACAAGGCGGTAAACTGCAATGGCGTCACCTGAAGGTACAGATGATGAGGGAGGGGGGTGCACGGGATGGTTTCATGTTGAGGCTGTAGTCAAGAAACGTACGGGAGATATAATATCAGAGGACGAAACAGAAGAAGATGAGGGCACAGCATCAGATTTAGATGGGTTTCTAGACAATAGTAATGTAATAACAACACAGGCAGACAGAGAGACAGCTCAGCAGTTATTGCATGCCCAAAACACATATGCAGATACACAGACGCTGCACAATTTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCGTTGGGAGACATTAGTAATCAGCAATTTGTGTGCCGGGAAGGAGTAAAACGAAGGATAATTGATACAGACGTGGCTGACAGCGGGTATGGCAATACTTTGGAAGTGGAAGCAACGCAACAGGTACAGGATAATACGTATGGTAGTGGTAAACAGCAAGATGGAGGCTCACAGACTAGTGTGTGTAGCAGGGAAAACAGCATAGAAGCAGACAGTGATATGGATATAGGCGCCACGCCACCACAGCAAATACAAGAATTATTTAAATGTAGTAATGTACAGGCAAAGCTGTGTTTTAAATTTAAAGAGTTATTTGGAATTCCATTTTCAGAATTGGTACGTACATTTAAAAGTGACAGCACATGTTGTCATGACTGGATATGTGCCATGTTTGGTGTTAATGAAACCTTAGCAGAGGCATTAAAAACAATTATTAAATCACAGTGCATGTATTACCATATACAGTGTTTAACGTGTACATGGGGCGTTGTAATATTAATGTTAATTAGATATACATGTGGAAAAAATAGAAAAACAATTATAAAATCACTAAGTTCAATTGTAAATGTGCCCAGCGAACAAATGCTTGTGCAGCCACCTAAAATACGTAGCCCTGCCGTTGCATTATACTTTTATAAAACTGCAATGTCTAATATTAGTGACATATATGGTGAGACACCAGAATGGATACAGCGACAAACACAACTACAGCACAGTTTCCAGGACTGCCAATTTGAACTGTCGAAAATGGTGCAATGGGCATTTGATAATGAAGTAACAGATGACAGTGACATTGCATTTTACTATGCACAGTTAGCAGATGTGGATAGTAATGCACAGGCCTTTTTAAAAAGTAATATGCAGGCCAAATATGTAAAGGATTGTGGAATAATGTGCAGACACTATAAAAGGGCACAACAACAACAAATGAACATGAAACAATGGATTACACACATATGTAGTAAAGTAGATGAGGGCGGGGACTGGAGGCCAATTGTACAGTTTTTAAGATATCAAGGGGTCGACTTTATTTCATTTTTAAGTTATTTTAAATTATTTTTACGAGGCACACCAAAACACAACTGCCTAGTATTATATGGACCACCAAACACAGGAAAGTCATGTTTTGCTATGAGCCTTATACAATTCTTTCAGGGGTCTGTTATTTCATATGTAAATTCACACAGTCACTTTTGGTTACAACCGTTAGACAATGCTAAATTGGGAATGCTAGATGATGCCACAGATGCATGCTGGAGATATATAGATGAATATATGCGAAATTTATTAGATGGGAATCCTGTAAGTTTAGATAGAAAACATAAACAACTAGTACAAATAAAATGTCCACCAGTAATAATAACAACAAATATTAATCCACTGCACGATGCAAAATTGCAGTACTTGCACAGTAGAATACATGTGGTGCCATTTCTAAATCCATTTCCAATTGATACAAATGGTAATCCTGTATATCAATTAAATAATGTAAACTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGAACAACGACGAAGACAAGGAAAACCATGGAGACTCTATGCCAACGTTTAGATGCGTGCCAGGAGAAAATTCTAGACTGTTTTGAAAACGATAGTAAAAAAATTGAAGACCATATAGTGTACTGGAAAGCTGTACGACATGAAAATGTTGTATTATATAAAGCAAGACAAAATAATATTACTAAACTACGCCACCAGGTGGTGCCATGTTTACAAGTGTGTAAAGCAAAGGCATGTGTTGCTATAGAAATACAAATGGCATTGGAATCATTATATAAAACAGAGTATAAAGTGGAGGAGTGGACATTAAAAGATGTATGTGAAAATATGTGGCATACAGCACCAAAACAGTGTTTTAAAAAAAGTGGAAAACGTATAGAAGTGTGGTTTGATGGGAAAAAAGACAATCGAACTGAATATGTTGTGTGGCAATGGGTGTATTACTGTGGGGACAATGGGTGGACTAAAGTGCCTTCTGTAGTAGATTACAAAGGTATATATTATGTACATGACGGTAACAAAGTCTATTATACAGACTTTAAGGACGAGGCAGTAAAGTATGGGTATAAAGGCACATGGGAAGTGCATATGGGAAATGAAAGTATTTATTGTCCCGACTCTGTGTCTAGTACCCTTAGATCCAACGTATCCCCTGTTGAAACTGTTTTCGAATACAACACCTATCAAACCCCCACCACCTCCACGCCCGTGGGCGCCAACGAAGCCGCGTCCTCCGCACGGCCGGGAAAACGTCCCAGAACCACTGAGCCCGACAGTACAGACACCACCAGACAGTCCGCTGCCAGAGAGTCCCACGCAAACCGTGTCGCAAGCAACACAAACAACACAAACAACAGACAGTGCCTTGGTGGAGCTACATGTTACAACACAGAAGTCGATGGTGGTTATAAGACTACACCTGTAGTGCATTTAAAAGGTGAACCAAACAGATTAAAGTGTTTAAGATATAGGTGTCAAAAACATAAGCACCTATTTGTAAATATATCGTCTACATATCATTGGACCAATACACATACAGAGTACAGCTACATTACTGTTGTATATAAAGATGAGACCCAGCGTGCCAACTTTTTAAATGTTGTAAAAATACCACCCAGTATACAAATTGTAATGGGACATATGACAGGTGTTGATATGTAACAACACATATGTTGTAATTGGTACAACAAACATGTAATATTGTATTACACATGTAAATATTATTGTGTACTATATTCATACAACAACAAACGCCATATTTTGCTGCTACGCCTGTTATATATTGCAACCATTGTTTTATTTGTTAGTTTTGTGTTTTTGCTTTGCTGTTTTGTGTGCCTGTGTGTCTGCCTATATGTGCCGCTTTTGCTGTCTGCCTCGTTGTTTTCTACCTGTTTATTACTCATAATATTGTTTTGGTTTGTTGTTGCATCGTCCTACATTACTACATTTACTATATTTTTGCTGTTTTTTTATATACCTTTATTACTTGTATATGCCCATGCTGTGTGGTTAATAAACACACAATAAATTGTTTTGTAACATATTACACTTTTGCTTTGTGTAGGGCGTGTACTATGGTCGCCCACCGGGCACGCAGACGAAAACGGGCCTCTGCTACTCAGCTGTATCAAACGTGCAAGCAGGCTGGCACATGTCCATCTGATGTTATTAACAAAATTGAACACACAACTTTGGCAGATAAGATATTGCAATGGGGTAGTTTGTTCACATTTTTTGGTAATTTAGGTATAGGCACTGGTGCAGGCTCTGGGGGGCGTGCTGGTTATGTTCCGTTAGGTACACGGCCTACAACAGTTGTGGACGCATCCCCTGCTAGGCCACCTATTGTTGTTGAATCTGTGGGTCCTACGGACCCTTCCATTGTTACACTGGTTGAGGAGTCTAGTGTGGTTAATGCTGGAGCATCATTCCCTAATTTTACAGGCACTGCAGGCTTTGAGGTTACGTCGTCTTCTACCACAACACCTGCTGTATTAGACATTACACCTACCACTGGCTCTGTCCATGTTAGTAGTACCCATTTTACCAATCCCTCCTTTGTTGAACCCCCAGTTATTGAGGTTCCACAAACTGGGGAGGTATCCGGCCATATATTGGTTAGCACTCCCACATCTGGTGTACATAGTTATGAAGAAATACCTATGCAAACATTTGCTGTGCATGGTACAGGCACTGAACCTATTAGTAGTACCCCTATTCCTGGGTTACGACGTATAGCTGCCCCTAGATTGTATCAAAGGGCCTTTCAGCAGGTAAAGGTCACTGACCCCACATTCC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| 85,128
|
KF436845.1
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human papillomavirus 30
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Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
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Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
|
USA
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2015-10-19
|
Rw063
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Alphapapillomavirus 6
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,881
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Rw063, complete genome
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| 85,129
|
KF436846.1
|
human papillomavirus 30
|
Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
|
Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
|
USA
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2015-10-19
|
Qv19092
|
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,881
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Qv19092, complete genome
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TGAAAGTTACAAGCATAGTTTATAGAAAGGGAGTGACCGAAATGGGTTTTCAACCGAAAACGGTACATATAAAAGCACTGTACCAAACGGACAGTGTACCCATGGCTTTCAAATTTGAAAATACAGGCGAGCGCCCACGTACTGTGCACCATCTTTGTGAGGTACAAGAAACATCGTTGCTGGAGCTACAGCTACAGTGTGTATATTGCAAGAAGGAATTATCCAGCTCAGAGGTATATAATTTTGCATGTAAAGATTTAAGACTGGTATATAGGGAGGACAGCCCATATGCAGTGTGCAATTTCTGTTTATTATTTTATAGTAAAGTAAGAAAGATTAGACATTACAACTATTCATTGTATGGGGCAAGCCTAGTGGCATTAACTAAAAAAGAGTTATTTGATTTATTAATAAGGTGCTACAGATGTCAACAGCCGTTGACACCAGAGGAAAAACAGTTACACTGTGAATATAAGAAACGGTTTCACAGAATATCACGTACGTGGACCGGGTTATGTCTGCAATGCTGGAGACACACAACGTCCACTGAGACAGCAGTATAATCATGCACGGTAAAGTAACAACTATTCCAGAATATATTTTGGACCTTGTACCGCAAACTGAAATTGACCTGCATTGCTATGAGCAATTGAACAGCTCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAAGTAGACCATTTACAGAAGCAGCCACAGCAAGCTAGACAAGAAGAACAACATCCTTGTTACCTAATTAACACACAGTGTTGTAGGTGTGCGTCTGCGGTGCAGTTGGCTGTTCAGAGTTCCACAAAAGAGCTGCGTGCCCTACAACAGATGCTTATGGGCGCACTGGAGCTAGTGTGTCCCCTGTGTGCAACAAGGCGGTAAACTGCAATGGCGTCACCTGAAGGTACAGATGATGAGGGAGGGGGGTGCACGGGATGGTTTCATGTTGAGGCTGTAGTCAAGAAACGTACGGGAGATATAATATCAGAGGACGAAACAGAAGAAGATGAGGGCACAGCATCAGATTTAGATGGGTTTCTAGACAATAGTAATGTAATAACAACACAGGCAGACAGAGAGACAGCTCAGCAGTTATTGCATGCCCAAAACACATATGCAGATACACAGACGCTGCACAATTTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCGTTGGGAGACATTAGTAATCAGCAATTTGTGTGCCGGGAAGGAGTAAAACGAAGGATAATTGATACAGACGTGGCTGACAGCGGGTATGGCAATACTTTGGAAGTGGAAGCAACGCAACAGGTACAGGATAATACGTATGGTAGTGGTAAACAGCAAGATGGAGGCTCACAGACTAGTGTGTGTAGCAGGGAAAACAGCATAGAGGCAGACAGTGATATGGATATAGGCGCCACGCCACCACAGCAAATACAAGAATTATTCAAATGTAGTAATGTACAGGCAAAGCTGTGTTTTAAATTTAAAGAGTTATTTGGAATTCCATTTTCAGAATTGGTACGTACATTTAAAAGTGACAGCACATGTTGTCATGACTGGATATGTGCCATGTTTGGTGTTAATGAAACCTTAGCAGAGGCATTAAAAACAATTATTAAATCACAGTGCATGTATTACCATATACAGTGTTTAACGTGTACATGGGGCGTTGTAATATTAATGTTAATTAGATATACATGTGGAAAAAATAGAAAAACAATTATAAAATCACTAAGTTCAATTGTAAATGTGCCCAGCGAACAAATGCTTGTGCAGCCACCTAAAATACGTAGCCCTGCCGTTGCATTATACTTTTATAAAACTGCAATGTCTAATATTAGTGACATATATGGTGAGACACCAGAATGGATACAGCGACAAACACAACTACAGCACAGTTTCCAGGACTGCCAATTTGAACTGTCGAAAATGGTGCAATGGGCATTTGATAATGAAGTAACAGATGACAGTGACATTGCATTTTACTATGCACAGTTAGCAGATGTGGATAGTAATGCACAGGCCTTTTTAAAAAGTAATATGCAGGCCAAATATGTAAAGGATTGTGGAATAATGTGCAGACACTATAAAAGGGCACAACAACAACAAATGAACATGAAACAATGGATTACACACATATGTAGTAAAGTAGATGAGGGCGGGGACTGGAGGCCAATTGTACAGTTTTTAAGATATCAAGGGGTCGACTTTATTTCATTTTTAAGTTATTTTAAATTATTTTTACGAGGCACACCAAAACACAACTGCCTAGTATTATATGGACCACCAAACACAGGAAAGTCATGTTTTGCTATGAGCCTTATACAATTCTTTCAGGGGTCTGTTATTTCATATGTAAATTCACACAGTCACTTTTGGTTACAACCGTTAGACAATGCTAAATTGGGAATGCTAGATGATGCCACAGATGCATGCTGGAGATATATAGATGAATATATGCGAAATTTATTAGATGGGAATCCTGTAAGTTTAGATAGAAAACATAAACAACTAGTACAAATAAAATGTCCACCAGTAATAATAACAACAAATATTAATCCACTGCACGATGCAAAATTGCAGTACTTGCACAGTAGAATACATGTGGTGCCATTTCTAAATCCATTTCCAATTGATACAAATGGTAATCCTGTATATCAATTAAATAATGTAAACTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGAACAACGACGAAGACAAGGAAAACCATGGAGACTCTATGCCAACGTTTAGATGCGTGCCAGGAGAAAATTCTAGACTGTTTTGAAAACGATAGTAAAAAAATTGAAGACCATATAGTGTACTGGAAAGCTGTACGACATGAAAATGTTGTATTATATAAAGCAAGACAAAATAATATTACTAAACTACGCCACCAGGTGGTGCCATGTTTACAAGTGTGTAAAGCAAAGGCATGTGTTGCTATAGAAATACAAATGGCATTGGAATCATTATATAAAACAGAGTATAAAGTGGAGGAGTGGACATTAAAAGATGTATGTGAAAATATGTGGCATACAGCACCAAAACAGTGTTTTAAAAAAAGTGGAAAACGTATAGAAGTGTGGTTTGATGGGAAAAAAGACAATCGAACTGAATATGTTGTGTGGCAATGGGTGTATTACTGTGGGGACAATGGGTGGACTAAAGTGCCTTCTGTAGTAGATTACAAAGGTATATATTATGTACATGACGGTAACAAAGTCTATTATACAGACTTTAAGGACGAGGCAGTAAAGTATGGGTATAAAGGCACATGGGAAGTGCATATGGGAAATGAAAGTATTTATTGTCCCGACTCTGTGTCTAGTACCCTTAGATCCAACGTATCCCCTGTTGAAACTGTTTTCGAATACAACACCTATCAAACCCCCACCACCTCCACGCCCGTGGGCGCCAACGAAGCCGCGTCCTCCGCACGGCCGGGAAAACGTCCCAGAACCACTGAGCCCGACAGTACAGACACCACCAGACAGTCCGCTGCCAGAGAGTCCCACGCAAACCGTGTCGCAAGCAACACAAACAACACAAACAACAGACAGTGCCTTGGTGGAGCTACATGTTACAACACAGAAGTCGACGGTGGTTATAAGACTACACCTGTAGTGCATTTAAAAGGTGAACCAAACAGATTAAAGTGTTTAAGATATAGGTGTCAAAAACATAAGCACCTATTTGTAAATATATCGTCTACATATCATTGGACCAATACACATACAGAGTACAGCTACATTACTGTTGTATATAAAGATGAGACCCAGCGTGCCAACTTTTTAAATGTTGTAAAAATACCACCCAGTATACAAATTGTAATGGGACATATGACAGGTGTTGATATGTAACAACACATATGTTGTAATTGGTACAACAAACATGTAATATTGTATTACACATGTAAATAGTATTGTGTACTATATTCATACAACAACAAACGCCATATTTTGCTGCTACGCCTGTTATATATTGCAACCATTGTTTTATTTGTTAGTTTTGTGTTTTTGCTTTGCTGTTTTGTGTGCCTGTGTGTCTGCCTATATGTGCCGCTTTTGCTGTCTGCCTCGTTGTTTTCTACCTGTTTATTACTCATAATATTGTTTTGGTTTGTTGTTGCATCGTCCTACATTACTGCATTTACTATATTTTTGCTGTTTTTTTATATACCTTTATTACTTGTATATGCCCATGCTGTGTGGTTAATAAACACACAATAAATTGTTTTGTAACATATTACACTTTTGCTTTGTGTAGGGCGTGTACTATGGTCGCCCACCGGGCACGCAGACGAAAACGGGCCTCTGCTACTCAGCTGTATCAAACGTGCAAGCAGGCTGGCACATGTCCATCTGATGTTATTAACAAAATTGAACACACAACTTTGGCAGATAAGATATTACAATGGGGTAGTTTGTTCACATTTTTTGGTAATTTAGGTATAGGCACTGGTGCAGGCTCTGGGGGGCGTGCTGGTTATGTTCCGTTAGGTACACGGCCTACAACAGTTGTGGACGCATCCCCTGCTAGGCCACCTATTGTTGTTGAATCTGTGGGTCCTACGGACCCTTCCATTGTTACACTGGTTGAGGAGTCTAGTGTGGTTAATGCTGGAGCATCATTCCCTAATTTTACAGGCACTGCAGGCTTTGAGGTTACGTCGTCTTCTACCACAACACCTGCTGTATTAGACATTACACCTACCACTGGCTCTGTCCATGTTAGTAGTAGCCATTTTACCAATCCCTCCTTTGTTGAACCCCCAGTTATTGAGGTTCCACAAACTGGGGAGGTATCCGGCCATATATTAGTTAGCACTCCCACATCTGGTGTACATAGTTATGAAGAAATACCTATGCAAACATTTGCTGTGCATGGTACAGGCACTGAACCTATTAGTAGTACCCCTATTCCTGGGTTACGACGTATAGCTGCCCCTAGATTGTATCAAAGGGCCTTTCAGCAGGTAAAGGTCACTGACCCCACATTCC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|
KF436847.1
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human papillomavirus 30
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Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
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Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
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USA
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2015-10-19
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Qv03085
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Alphapapillomavirus 6
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,881
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Qv03085, complete genome
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| 85,131
|
KF436848.1
|
human papillomavirus 30
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Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
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Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
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USA
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2015-10-19
|
Rw120
|
Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,881
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Rw120, complete genome
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TGAAAGTTACAAGCATAGTTTATAGAAAGGGAGTGACCGAAATAGGTTTCCAACCGAAAACGGTACATATAAAAGCACTGTACCAAACGGACAGTGTACCCATGGCTTTCAAATTTGAAAATACAGGCGAGCGCCCACGTACTGTGCACCATCTTTGTGAGGTACAAGAAACATCGTTGCTGGAGCTACAGCTACAGTGTGTATATTGCAAGAAGGAATTATCCAGCTCAGAGGTATATAATTTTGCATGTAAAGATTTAAGACTGGTATATAGGGAGGACAGCCCATATGCAGTGTGCAATTTCTGTTTATTATTTTATAGTAAAGTAAGAAAGATTAGACATTACAACTATTCATTGTATGGGGCAAGCCTAGTGGCATTAACTAAAAAAGAGTTATCTGATTTATTAATAAGGTGCTACAGATGTCAACAGCCGTTGACACCAGAGGAAAAACAGTTACACTGTGAATATAAGAAACGGTTTCACAGAATATCACGTACGTGGACCGGGTTATGTCTGCAATGCTGGAGACACACAACGTCCACTGAGACAGCAGTATAATCATGCACGGTAAAGTAACAACTATTCCAGAATATATTTTGGACCTTGTACCGCAAACTGAAATTGACCTGCATTGCTATGAGCAATTGAACAGCTCAGAGGAAGAGGATGAGGATGAAGTAGACCATTTACAGAAGCAGCCACAGCAAGCTAGACAAGAAGAACAACATCCTTGTTACCTAATTAACACACAGTGTTGTAGGTGTGCGTCTGCGGTGCAGTTGGCTGTTCAGAGTTCCACAAAAGAGCTGCGTGCCCTACAACAGATGCTTATGGGCGCACTGGAGCTAGTGTGTCCCCTGTGTGCAACAAGGCGGTAAACTGCAATGGCGTCACCTGAAGGTACAGATGATGAGGGAGGGGGGTGCACGGGATGGTTCCATGTTGAGGCGGTAGTCAAGAAACGTACGGGAGATATAATATCAGAGGACGAAACAGAAGAAGATGAGGGCACAGCATCAGATCTAGATGGGTTTTTAGACAATAGTAATGTAATACCAACACAGGCAGACAGAGAGACAGCTCAGCAGTTATTGCATGCCCAAAACACATATGCAGATACACAGACGCTGCACAATTTAAAACGAAAGTATTTAGGCAGTCCGTTGGGAGACATTAGTAATCAGCAATCTGTGTGCCGGGAAGGAGTAAAACGAAGGATAATTGATACAGACGTGGCCGACAGCGGGTATGGCAATACTTTGGAAGTGGAAGCAACGCAACAGGTACAGGAGAATACGTATGGTAGTGGTAAACAGCAAGATGGAGGCTCACAGACTAGTGTGTGTAGCAGGGAAAACAGCATAGGATCAGACAGTGATATGGATATAGGCGCCACGCCACCACAGCAAATACAAGAATTATTAAAATGTAGTAATGTACAGGCAAAGCTGTGTTTTAAATTTAAAGAGTTATTTGGAATTCCATTTTCAGAATTGGTACGTACATTTAAAAGCGACAGCACATGTTGTCATGACTGGATATGTGCCATGTTTGGTGTTAATGAAACCTTAGCAGAGGCATTAAAAACAATTATTAAATCACAGTGCATGTATTATCATATACAGTGTTTAACATGTGCATGGGGCGTTGTAATATTAATGTTAATTAGATATACATGTGGAAAAAATAGAAAAACAATTATAAAATCACTAAGTTCCATTGTAAATGTGCCTAGCGAGCAAATGCTTGTGCAGCCACCTAAAATACGTAGCCCTGCCGTTGCATTATACTTTTACAAAACCGCAATGTCCAATATTAGTGACATATATGGTGAGACACCAGAATGGATACAGCGACAAACACAGATACAGCACAGTTTCCAGGACTGCCAATTTGAACTATCTAAAATGGTGCAATGGGCATTTGATAATGAAGTAACAGATGACAGTGAAATTGCATTTTACTATGCACAGTTAGCAGATGTGGATAGTAATGCACAGGCCTTTCTAAAAAGCAATATGCAGGCCAAATATGTAAAGGATTGTGGAATAATGTGCAGACATTATAAAAGAGCACAACAACAACAAATGAATATGAAACAATGGATTACACACATATGTAGCAAAGTAGATGAGGGCGGGGACTGGAGGCCAATTGTACAGTTTTTAAGATATCAAGGGGTCGACTTCATTTCATTTTTAAGTTATTTTAAATTATTTTTACGAGGCACACCAAAACACAACTGCCTAGTAATATATGGACCACCAAACACAGGAAAGTCATGTTTTGCTATGAGCCTTATAAAATTTTTTCAGGGGTCTGTTATTTCATATGTAAATTCACACAGTCACTTTTGGTTACAACCGTTAGACAATGCTAAATTGGGAATGCTAGATGATGCCACAGATGCATGCTGGAGATATATAGATGAATATATGCGAAATTTATTAGATGGCAATCCTGTAAGTTTAGATAGAAAACATAAACAACTAGTACAAATAAAATGTCCACCAGTAATAATAACAACAAATATTAATCCACTGCACGATGCAAAATTGCAGTACTTGCACAGTAGAATACATGTGGTGCCATTTCTAAATCCATTTCCAATTGATACAAATGGTAATCCTGTATATCAATTAAATAATGTAAACTGGAAATGTTTTTTTGAAAGGACATGGTCCAGATTAGATTTGAACAACGACGAAGACAAGGAAAACCATGGAGACGCTATGCCAACGTTTAGATGCGTGCCAGGAGAAAATTCTAGACTGTTTTGAAAATGATAGTAAAAAAATTGAAGACCATATAGTGTACTGGAAAGCTGTACGACATGAAAATGTTGTATTATATAAAGCAAGACAAAATAATATTACTAAACTACGCCACCAGGTGGTGCCATGTTTACAAGTGTGTAAAGCAAAGGCATGTGTTGCTATAGAAATACAAATGGCATTGGAATCATTATATAAAACAGAGTATAAAGTGGAGGAGTGGACATTAAAAGATGTATGTGAAAATATGTGGCATACAGCACCAAAACAGTGTTTTAAAAAAAGTGGAAAACGTATAGAAGTGTGGTTTGATGGGAAAAAGGACAATCGAACTGAATATGTTGTGTGGCAATGGGTGTATTACTGTGGGGACAATGGGTGGACTAAAGTGCCTTCTGTAGTAGATTACAAAGGTATATATTATGTACATGACGGTAACAAAGTATATTATACAGACTTTAAGGACGAGGCATTAAAGTATGGGTATAAAGGCACATGGGAAGTGCATATGGGAAATGAAAGTATTTATTGTCCCGACTCTGTGTCTAGTACCCTCAGATCCAACGTATCCCCTGTTGAAACTGTTCTCGAATACAACACCTATCAAACCCCCACCACCTCCACGCCCGTGGGCGCCAACGAAGCCGCGTCCTCCGCACGGCCGGGAAAACGTCCCAGAACCACAGAGCCCGACAGTACAGACACCACCAGACAGTCCGCTGCCAGAGAGTCCCACGCAAACCGTGTCGCAAGCAACACAAACAACACAAACAACAGACAGTGCCTTGGTGGAGCTACATGTTACAACACAGAAGTCGATGGTGGTTATAAGGCTACACCTGTAGTGCATTTAAAAGGTGAACCAAACAGATTAAAGTGTTTAAGATATAGGTGTCAGAAACATAAGCACCTATTTGTAAATATATCGTCTACATATCATTGGACCAATACACATACAGAGTACAGCTACATTACTGTTGTATATAAAGATGAGACCCAGCGTGCCAACTTTTTAAATGTTGTAAAAATACCCCCCAGTATACAAATTGTAATGGGACATATGACAGGTGTTGATATGTAACAACACATATGTTGTAATTGGTACAACAAACATGTAATATTGTATTACACATGTAAATATTATAGTGTACTATATTAATACAACAACAAACGCCATATTGTGCTGCTACGCCTGTTATATATTGCAACCATTGTTTTATTTGTTAGTTTTGTGTTTTTGCTTTGCTGTTTTGTGTGCCTGTGTGTCTGCCTATATGTGCCGCTTTTGCTGTCTGCCTCGTTGTTTTCCACCTGTTTATTACTGATAATATTGTTTTGGTTTGTTGTTGCATCGTCCTACATTACTGCATTTACTATATTTTTGCTGTTTTTTTATATACCTTTATTACTTGTATATGCCCATGCTGTGTGGTTAATAAACACACAATAAATTGTTTTATAACATATTACACTTTTGCTTTGTGTAGGGCGTGTACTATGGTCGCCCACCGGGCACGCAGACGAAAACGGGCCTCTGCTACTCAGCTGTATCAAACGTGCAAGCAGGCTGGCACATGTCCCTCTGATGTTATTAACAAAATTGAACACACAACTTTGGCAGATAAGATATTGCAATGGGGTAGTTTGTTTACATTTTTTGGTAATTTAGGTATAGGCACTGGTGCAGGCTCTGGGGGGCGTGCTGGTTATGTTCCTTTGGGTACACGGCCTACTACAGTTGTGGACGCATCCCCTGCTAGGCCACCTATTGTTGTTGAATCTGTGGGTCCTACGGACCCTTCCATTGTTACACTGGTTGAGGAGTCTAGTGTGGTGAATGCTGGAGCATCCTTCCCTAATTTTACAGGCACTGCAGGCTTTGAGGTTACGTCTTCTTCTACTACAACACCTGCTGTATTAGACATTACACCTACCACTGGCTCTGTCCATGTTAGTAGTACCCATTTTACCAATCCCTCCTTTATTGAACCCCCTGTTATTGAGGTTCCACAAACCGGGGAGGTATCTGGCCATATATTAGTTAGTACTCCCACATCTGGTGTACATAGTTATGAAGAAATACCTATGCAAACATTTGCTGTGCATGGTACAGGCACTGAACCTATTAGTAGTACCCCTATTCCTGGGTTACGACGTATAGCTGCCCCTAGATTGTATCAAAGGGCCTTTCAGCAGGTGAAGGTCACTGACCCCACATTCC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| 85,132
|
KF436849.1
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human papillomavirus 30
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Burk,R.D., Harari,A., Chen,Z., Burk,R.
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Albert Einstein College of Medicine, Department of Pediatrics
|
USA
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2015-10-19
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Qv32716
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Alphapapillomavirus 6
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,881
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus 30 isolate Qv32716, complete genome
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Universite Paris Cite, Inserm UMR1137
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France
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2023-11-24
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Alphapapillomavirus 9
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Togo
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Togo
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human papillomavirus 31
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Coppee,R., Ferre,V.M., Gbeasor-Komlanvi,F.A., Vacher,S., Bucau,M., Salou,M., Lameiras,S., Couvelard,A., Claver Dagnra,A., Bieche,I., Descamps,D., Ekouevi,D.K., Ghosn,J., Charpentier,C.
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Human papillomavirus 31 isolate V521R484_HPV31, complete genome
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| 10,670
|
OP712005.1
|
human papillomavirus 31
|
Coppee,R., Ferre,V.M., Gbeasor-Komlanvi,F.A., Vacher,S., Bucau,M., Salou,M., Lameiras,S., Couvelard,A., Claver Dagnra,A., Bieche,I., Descamps,D., Ekouevi,D.K., Ghosn,J., Charpentier,C.
|
Universite Paris Cite, Inserm UMR1137
|
France
|
2023-11-24
|
V521R488_HPV31
|
Alphapapillomavirus 9
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,878
|
GenBank
| null |
Togo
|
Togo
|
Homo sapiens
| null |
2017-08
| null | null |
Human papillomavirus 31 isolate V521R488_HPV31, complete genome
|
TAATAATAATAATCTTGTTATAAAAAAGTAGGGAGTAACCGAAATTGGTGAACCGAAAACGGTTGGTATATAAAGCACATAGTATTTTGTGCAAACCTACAGACGCCATGTTCAAAAATCCTGCAGAAAGACCTCGGAAATTGCATGAACTAAGCTCGGCATTGGAAATACCCTACGATGAACTAAGATTGAATTGTGTCTACTGCAAAGGTCAGTTAACAGAAACAGAGGTATTAGATTTTGCATTTACAGATTTAACAATAGTATATAGGGACGACACACCATACGGAGTGTGTACAAAATGTTTAAGATTTTATTCTAAAGTAAGTGAATTTAGATGGTATAGATATAGTGTGTATGGAACAACATTAGAAAAATTGACAAACAAAGGTATATGTGATTTATTGATTAGGTGTATAACGTGTCAAAGACCGTTGTGTCCAGAAGAAAAACAAAGACATTTGGATAAAAAGAAACGATTCCACAACATAGGAGGAAGGTGGACAGGACGTTGCATAGTATGTTGGAGAAGACCTCGTACTGAAACCCAAGTGTAAACATGCGTGGAGAAACACCTACATTGCAAGACTATGTGTTAGATTTGCAACCTGAGGCAACTGACCTCCACTGTTATGAGCAATTACCCGACAGCTCAGATGAGGAGGATGTTATAGACAGTCCAGCTGGACAAGCAAAACCGGACACATCCAATTACAATATCGTTACCTTTTGTTGTCAGTGTGAGTCTACACTTCGTTTGTGTGTACAGAGCACACAAGTAGATATTCGCATATTGCAAGAGCTGTTAATGGGCTCATTTGGAATCGTGTGCCCCAACTGTTCTACTAGACTGTAACTACAATGGCTGATCCAGCAGGTACAGATGGGGAGGGGACGGGATGCAATGGTTGGTTTTATGTAGAAGCAGTAATCGACAGACAGACAGGGGACAACATTTCAGACGACGAAAATGAAGACAGTAGTGATACTGGGGAGGATATGGTTGACTTTATTGACAATTGTAATGTATACAACAATCAGGCAGAAGCAGAGACAGCACAGGCATTGTTTCATGCACAGGAAGCGGAGGAACATGCAGAGGCTGTGCAGGTTCTAAAACGAAAGTATGTAGGTAGTCCTTTAAGTGATATTAGTAGTTGTGTGGATTATAATATTAGTCCACGGTTAAAAGCTATATGCATAGAAAATAACAGTAAAACAGCAAAACGAAGACTTTTCGAACTTCCAGACAGCGGGTATGGCAATACTGAAGTGGAAACGCAGCAGATGGTACAGGTAGAGGAGCAACAAACAACATTAAGTTGTAATGGTAGTGACGGGACACATAGTGAACGAGACAATGAAACTCCAACACGTAATATATTGCAAGTGTTAAAAACTAGCAATGGTAAAGCTGCTATGTTAGGTAAATTTAAAGAATTATATGGTGTAAGTTTTATGGAACTAATTAGGCCATTTCAAAGCAATAAAAGCACATGTACTGATTGGTGTGTAGCTGCGTTTGGAGTTACAGGTACAGTTGCAGAAGGATTTAAAACCCTATTGCAACCATATTGTTTGTATTGCCATTTACAAAGTTTAGCATGTTCCTGGGGCATGGTTATGTTAATGCTTGTGAGATTTAAATGTGCAAAAAATAGAATAACAATTGAAAAATTATTAGAAAAGTTATTGTGTATATCTACAAATTGTATGTTAATTCAGCCACCCAAATTACGTAGTACAGCTGCAGCATTATATTGGTATAGAACAGGAATGTCAAACATTAGTGATGTATATGGTGAAACACCAGAATGGATAGAAAGACAAACAGTATTACAGCATAGTTTTAATGACACAACATTTGATTTGTCCCAAATGGTACAATGGGCATATGACAATGATGTTATGGATGATAGTGAAATTGCCTATAGATATGCACAATTAGCTGACAGTGATAGTAATGCATGTGCATTTTTAAAAAGTAATTCGCAGGCAAAAATAGTTAAAGATTGTGGAACAATGTGTAGACATTATAAACGAGCAGAAAAACGACAAATGTCCATGGGACAGTGGATTAAAAGTAGATGTGACAAAGTTAGTGACGAAGGTGACTGGAGGGACATAGTAAAGTTTTTAAGATATCAACAAATAGAATTTGTGTCATTTTTATCTGCATTAAAGCTATTTTTAAAAGGAGTGCCAAAGAAAAACTGTATTTTAATACATGGTGCACCTAATACAGGTAAATCATATTTTGGAATGAGCCTTATGAGCTTTTTACAAGGATGTATAATATCATATGCAAATTCAAAAAGTCATTTTTGGTTACAACCACTGGCTGATGCTAAAATAGGCATGTTAGATGATGCTACAACGCCATGTTGGCATTATATAGACAATTACCTACGAAATGCACTAGATGGCAACCCTGTATCTATAGATGTAAAGCATAAAGCTTTAATGCAGTTAAAATGTCCTCCTTTATTGATTACATCTAATATAAATGCAGGTAAGGATGACAGATGGCCATACCTACATAGCAGACTGGTGGTTTTTACATTTCCAAATCCATTTCCCTTTGACAAAAACGGAAATCCAGTATATGAATTAAGTGATAAAAACTGGAAATCCTTTTTCTCAAGGACGTGGTGCAGATTAAATTTGCACGAGGAAGAGGACAAAGAAAACGATGGAGACTCTTTCTCAACGTTTAAATGTGTGTCAGGACAAAATATTAGAACATTATGAAAATGATAGTAAACGACTTTGTGATCATATAGACTATTGGAAACATATTCGACTTGAATGTGTATTAATGTATAAAGCAAGAGAAATGGGAATACACAGTATTAACCACCAGGTGGTGCCAGCGTTGTCAGTATCAAAGGCCAAAGCCTTACAAGCTATTGAACTACAAATGATGTTGGAAACATTAAATAACACTGAATACAAAGATGAGGACTGGACAATGCAGCAAACAAGTCTTGAACTGTATTTAACTGCACCTACAGGGTGTTTAAAAAAACATGGATATACTGTACAGGTGCAATTTGATGGTGATGTACACAACACCATGCATTATACTAACTGGAAATTTATATACCTATGTATAGATGGCCAATGTACTGTTGTGGAAGGGCAAGTTAATTGTAAGGGCATTTATTATGTACATGAAGGACATATAACATATTTTGTAAATTTTACAGAAGAGGCAAAAAAATATGGGACTGGTAAAAAATGGGAAGTGCATGCGGGTGGTCAGGTAATTGTTTTTCCTGAATCTGTATTTAGCAGTGACGAAATATCCTTTGCTGGGATTGTTACAAAGCTACCAACAGCCAACAACACCACCACATCGAATTCCAAAACCTGCGCCTTGGGCACCAGTGAAGGTGTGCGGCGGGCGACGACGTCTACTAAGCGACCAAGAACAGAGCCAGAGCACAGAAACACCCACCACCCCAACAAGTTGTTGCGAGGCGACTCCGTGGACAGTGTCAACTGTGGGGTCATCAGTGCAGCTGTATGCACAAACCAAACAAGGGCTGTCAGTTGTCCTGAAACTACACCTATAATACACTTAAAAGGTGATGCAAATATATTAAAATGTTTAAGATATAGGCTGTCAAAATATAAACAATTGTATGAACAAGTGTCATCTACATGGCATTGGACATGTACAGATGGAAAACATAAAAATGCTATTGTAACCTTAACATATACAAGTACATCACAAAGAGACGATTTTTTAAATACTGTAAAAATACCTAACACAGTATCAGTGTCAACAGGATATATGACTATTTAGCCTAATGATTGAACTGCATATTTCTACAGTAAGCATTGTGCTATGCTTTTTGCTTTGCTTTTGTGTGCTACTATTTGTGTGTCTTGTCATACGTCCACTTGTGCTGTCTGTGTCGGTATATGCAACACTACTATTATTAATTGTGGTTTTATGGGTTATTGCAACCTCACCATTACGTTGTTTTTGTATATATGTTGTGTTTATATATATTCCATTATTTGTAATTCATACACATGCATCCATTTTAAGTCAACAGTAACTTTTTTACTTGTGTATACTGTTGTTTGTATTGGTATTGGTATAATAAACTTTTTTACTTTTTTTTTATTATTACCATGCGGTCCAAACGCTCTACAAAACGCACTAAACGTGCGTCTGCTACACAATTATATCAAACATGTAAAGCAGCAGGTACTTGTCCATCAGACGTTATACCTAAAATAGAACATACTACCATTGCAGACCAAATATTAAGGTATGGTAGTATGGGTGTGTTTTTTGGTGGGTTGGGTATTGGGTCCGGATCTGGTACTGGGGGTCGCACTGGATATGTCCCTCTTAGTACACGTCCTTCTACAGTATCTGAGGCAAGTATACCTATTAGACCACCAGTTAGCATTGACCCTGTAGGTCCCTTGGACCCCTCTATAGTAAGTCTTGTTGAAGAATCTGGAATTATTGATGTTGGTGCCCCTGCTCCTATACCACACCCTCCTACAACATCTGGGTTTGACATTGCTACAACTGCAGACACAACACCTGCAATTTTAGATGTAACAAGTGTTAGCACACATGACAATCCTACTTTCACTGATCCATCTGTATTGCAACCTCCTACACCTGCAGAAACATCAGGTCATTTACTACTTTCATCATCATCTATTAGCACACATAATTATGAGGAAATACCTATGGATACATTTATTGTTTCTACTAATAATGAAAACATAACAAGTAGCACACCCATTCCAGGGGTGCGCCGTCCTGCACGTTTAGGGTTATATAGTAAGGCTACACAACAAGTAAAAGTTATTGATCCAACGTTTCTTAGTGCTCCAAAACAACTAATTACATATGAAAACCCTGCCTATGAAACTGTAAATGCTGAAGAATCTTTATACTTTTCCAATACATCGCATGATATGGCCCCTGATCCCGACTTTCTAGATATTATAGCATTACATAGGCC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| 10,680
|
LC779559.1
|
human papillomavirus 31
|
Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
|
Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-10-04
|
K2851
|
Alphapapillomavirus 9
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,957
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null | null |
Human papillomavirus 31 K2851 DNA, complete genome
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LC779560.1
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human papillomavirus 31
|
Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-10-04
|
K2611
|
Alphapapillomavirus 9
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
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GenBank
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Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
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2019
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Human papillomavirus 31 K2611 DNA, complete genome
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Human papillomavirus 31 K2404 DNA, complete genome
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LC779562.1
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human papillomavirus 31
|
Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
|
Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-10-04
|
K5134
|
Alphapapillomavirus 9
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,880
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2022
| null | null |
Human papillomavirus 31 K5134 DNA, complete genome
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TAATAATAATAATCTTAGTATAAAAAAGTAGGGAGTGACCGAAAGTGGTGAACCGAAAACGGTTGGTATATAAAGCACATAGTATTTTGTGCAAACCTACAGACGCCATGTTCAAAAATCCTGCAGAAAGACCTCGGAAATTGCATGAACTAAGCTCGGCATTGGAAATACCCTACGATGAACTAAGATTGAATTGTGTCTACTGCAAAGGTCAGTTAACAGAAACAGAGGTATTAGATTTTGCATTTACAGATTTAACACTAGTATATAGGGACGACACACCACACGGAGTGTGTGCAAAATGTTTAAGATTTTATTCTAAAGTAAGTGAATTTAGATGGTATAGATATAGTGTGTATGGAACAACATTAGAAAAATTGACAAACAAAGGTATATGTGATTTGTTAATTAGGTGTATAACGTGTCAAAGACCGTTGTGTCCAGAAGAAAAACAAAGACATTTGGATAAAAAGAGACGATTCCACAACATAGGAGGAAGGTGGACAGGACGTTGCATAGTATGTTGGAGAAGACCTCGTACTGAAACCCAAGTGTAAACATGCGTGGAGAAACACCTACGTTGCAAGACTATGTGTTAGATTTGCAACCTGAGGCAACTGACCTCCACTGTTATGAGCAATTACCCGACAGCTCAGATGAGGAGGATGTTATAGACAGTCCAGCTGGACAAGCAAAACCGGACACATCCAATTACAATATCGTTACCTTTTGTTGTCAGTGTGAGTCTACACTTCGTTTGTGTGTACAGAGCACACAAGTAGATATTCGCATATTGCAAGAGCTGTTAATGGGCTCATTTGGAATCGTGTGCCCCAACTGTTCTACTAGACTGTAACTACAATGGCTGATCCAGCAGGTACAGATGGGGAGGGGACGGGATGCAATGGTTGGTTTTATGTAGAAGCAGTAATTGACAGACAGACAGGGGACAACATTTCAGAGGACGAAAATGAAGACAGTAGTGATACTGGGGAGGATATGGTTGACTTTATTGACAATTGTAATGTATACAACAATCAGGCAGAAGCAGAGACAGCACAGGCATTGTTTCATGCACAGGAAGCGGAGGAACATGCAGAGGCTGTGCAGGTTCTAAAACGAAAGTATGTAGGTAGTCCTTTAAGTGATATTAGTAGTTGTGTGGATTATAATATTAGTCCACGGTTAAAAGCTATATGCATAGAAAATAACAGTAAAACAGCAAAACGAAGACTCTTTGAACTTCCAGACAGCGGGTATGGCAATACTGAAGTGGAAACGCAGCAGATGGTACAGGTAGAGGAGCAACAAACAACATTAAGTTGTAATGGTAGTGACGGGACACATAGTGAACGAGACAATGAAACTCCAACACGTAATATATTGCAAGTGTTAAAAACTAGCAATGGTAAAGCTGCTATGTTAGGTAAATTTAAAGAATTATATGGTGTAAGTTTTATGGAACTAATTAGGCCATTTCAAAGCAATAAAAGCACATGTACTGATTGGTGTGTAGCTGCGTTTGGAGTTACAGGTACAGTTGCAGAAGGATTTAAAACCTTATTGCAACCATATTGTTTGTATTGCCATTTACAAAGTTTAGCATGTTCCTGGGGCATGGTTATGCTAATGCTTGTGAGATTTAAATGTGCAAAAAATAGAATAACAATTGAAAAATTATTAGAAAAATTATTGTGTATATCTACAAATTGTATGTTAATTCAGCCACCCAAATTACGTAGCACAGCTGCAGCATTATATTGGTACAGAACAGGAATGTCAAACATTAGCGATGTATATGGTGAAACACCAGAATGGATAGAAAGACAAACAGTATTACAGCATAGTTTTAATGACACAACATTTGATTTGTCCCAAATGGTACAATGGGCATATGACAATGATGTTATGGATGATAGTGAAATTGCCTATAAATATGCACAATTAGCTGACAGTGATAGTAATGCATGTGCATTTTTAAAAAGTAATTCGCAGGCAAAAATAGTTAAAGATTGTGGAACAATGTGTAGACATTATAAACGAGCAGAAAAACGACAAATGTCCATGGGACAGTGGATTAAAAGTAGATGTGACAAAGTTAGTGACGAAGGTGACTGGAGGGACATAGTAAAGTTTTTAAGATATCAACAAATAGAATTTGTGTCATTTTTATCTGCATTAAAGCTGTTTTTAAAAGGAGTGCCAAAGAAAAACTGTATTTTAATACATGGTGCACCTAATACAGGTAAATCATATTTTGGAATGAGCCTTATTAGCTTTTTACAAGGATGTATAATATCATATGCAAATTCAAAAAGTCATTTTTGGTTACAACCACTGGCTGATGCTAAAATAGGCATGTTAGATGATGCTACAACGCCATGTTGGCATTATATAGACAATTACCTACGAAATGCACTAGATGGCAACCCTGTATCTATAGATGTAAAGCATAAAGCTTTAATGCAGTTAAAATGTCCTCCTTTATTGATTACATCTAATATAAATGCAGGTAAGGATGACAGATGGCCATACCTACATAGCAGACTGGTGGTTTTTACATTTCCAAATCCATTTCCATTTGACAAAAACGGAAATCCAGTATATGAATTAAGTGATAAAAACTGGAAATCCTTTTTCTCAAGGACGTGGTGCAGATTAAATTTGCACGAGGAAGAGGACAAAGAAAACGATGGAGACTCTTTCTCAACGTTTAAATGTGTGTCAGGACAAAATATTAGAACATTATGAAAATGATAGTAAACGACTTTGTGATCATATAGACTATTGGAAACATATTCGACTTGAATGTGTATTAATGTATAAAGCAAGAGAAATGGGAATACACAGTATTAACCACCAGGTGGTGCCAGCGTTGTCAGTATCAAAGGCCAAAGCCTTACAAGCTATTGAACTACAAATGATGTTGGAAACATTAAATAACACTGAATACAAAAATGAGGACTGGACAATGCAGCAAACAAGTCTTGAACTGTATTTAACTGCACCTACAGGGTGTTTAAAAAAACATGGATATACTGTAGAGGTGCAATTTGATGGTGATGTACACAACACCATGCATTATACTAACTGGAAATTTATATACCTATGTATAGATGGCCAATGTACTGTTGTGGAAGGACAAGTTAATTGTAAGGGCATTTATTATGTACATGAAGGACATATAACATATTTTGTAAATTTTACAGAAGAGGCAAAAAAATATGGGACTGGTAAAAAATGGGAAGTGCATGCGGGTGGTCAGGTAATTGTTTTTCCTGAATCTGTATTTAGCAGTGACGAAATATCCTTTGCTGGGATTGTTACAAAGCTACCAACAGCCAACAACACCACCACATCGAATTCCAAAACCTGCGCCTTGGGCACCAGTGAAGGTGTGCGGCGGGCGACGACGTCTACTAAGCGACCAAGAACAGAGCCAGAGCACAGAAACACCCACCACCCCAACAAGTTGTTGCGAGGCGACTCCGTGGACAGTGTCAACTGTGGGGTTATCAGTGCAGCTGCATGCACAAACCAAACAAGGGCTGTCAGTTGTCCTGCAACTACACCTATAATACACTTAAAAGGTGATGCAAATATATTAAAATGTTTAAGATATAGGCTGTCAAAATATAAACAATTGTATGAACAAGTGTCATCTACATGGCATTGGACATGTACAGATGGAAAACATAAAAATGCTATTGTAACCTTAACATATATAAGTACATCACAAAGAGACGATTTTTTAAATACTGTAAAAATACCTAACACAGTATCAGTGTCAACAGGATATATGACTATTTAGCCTAATGATTGAACTAGATATTTCTACAGTAAGCATTGTGCTATGCTTTTTGCTTTGCTTTTGTGTGCTACTATTTGTGTGTCTTGTCATACGTCCACTTGTGCTGTCTGTGTCGGTATATGCAACACTACTATTATTAATTGTGATTTTATGGGTTATTGCAACCTCTGCACTACGTTGTTTTTGTATATATATTGTGTTTATATATATTCCATTATTTGTAATTCATACACATGCATCCATTTTAAGTCAGCAGTAACTTTTTTACTTGTGTATACTGGTGTGTGTATTGGTATTGGTATTGGTATTGGTATAATAAACTTTTTTACTTTTTTTTTATTATTACCATGCGGTCCAAACGCTCTACAAAACGCACTAAACGTGCATCTGCTACACAATTATATCAAACATGTAAAGCAGCAGGTACTTGTCCATCAGACGTTATACCTAAAATAGAACATACTACCATTGCAGACCAAATATTAAGGTATGGTAGTATGGGTGTTTTTTTTGGTGGGTTGGGTATTGGGTCCGGCTCTGGTACTGGGGGTCGCACTGGATATGTCCCTCTGAGTACACGTCCTTCTACAGTATCTGAGGCAAGTATACCTATTAGACCACCAGTTAGCATTGACCCTGTAGGTCCCTTGGACCCCTCTATAGTAAGTCTTGTTGAAGAATCTGGTATTGTTGATGTTGGTGCCCCTGCTCCTATACCACACCCTCCTACAACATCTGGGTTTGACATTGCTACAACTGCAGACACAACACCTGCAATTTTAGATGTAACAAGTGTTAGCACACATGAAAATCCTACTTTTACTGATCCATCTGTATTGCAACCTCCTACACCTGCAGAGACATCAGGTCATTTACTACTTTCATCATCATCTATTAGCACACATAATTATGAGGAAATACCTATGGATACATTTATTGTTTCTACTAATAATGAAAACATAACAAGTAGCACACCCATTCCAGGGGTGCGCCGTCCTGCACGTTTAGGGTTATATAGTAAGGCTACACAACAAGTAAAAGTTATTGATCCAACGTTTCTTAGTGCTCCAAAACAACTAATTACATATGAAAACCCTGCCTATGAAACTGTAAATGCTGAAGAATCTTTATACTTTTCCAATACATCGCATAATATAGCCCCTGATCCCGACTTTTTAGATATTATAGC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human papillomavirus 31
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Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
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2023-10-04
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Alphapapillomavirus 9
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Alphapapillomavirus
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Japan
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Japan
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Human papillomavirus 31 K2275 DNA, complete genome
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LC779564.1
|
human papillomavirus 31
|
Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-10-04
|
K2517
|
Alphapapillomavirus 9
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,892
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
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2019
| null | null |
Human papillomavirus 31 K2517 DNA, complete genome
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human papillomavirus 31
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Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
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2023-10-04
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Alphapapillomavirus 9
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Alphapapillomavirus
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GenBank
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Japan
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Japan
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Homo sapiens
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Human papillomavirus 31 K2679 DNA, complete genome
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LC779566.1
|
human papillomavirus 31
|
Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-10-04
|
K3002
|
Alphapapillomavirus 9
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,910
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
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2020
| null | null |
Human papillomavirus 31 K3002 DNA, complete genome
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TAATAATAATAATCTTAGTATAAAAAAGTAGGGAGTGACCGAAAGTGGTGAACCGAAAACGGTTGGTATATAAAGCACATAGTATTTTGTGCAAACCTACAGACGCCATGTTCAAAAATCCTGCAGAAAGACCTCGGAAATTGCATGAACTAAGCTCGGCATTGGAAATACCCTACGATGAACTAAGATTGAATTGTGTCTACTGCAAAGGTCAGTTAACAGAAACAGAGGTATTAGATTTTGCATTTACAGATTTAACAATAGTATATAGGGACGACACACCACACGGAGTGTGTACAAAATGTTTAAGATTTTATTCAAAAGTAAGTGAATTTAGATGGTATAGATATAGTGTGTATGGAACAACATTAGAAAAATTGACAAACAAAGGTATATGTGATTTGTTAATTAGGTGTATAACGTGTCAAAGACCGTTGTGTCCAGAAGAAAAACAAAGACATTTGGATAAAAAGAAACGATTCCACAACATAGGAGGAAGGTGGACAGGACGTTGCATAGCATGTTGGAGAAGACCTGGTACTGAAACCCAAGTGTAAACATGCGTGGAGAAACACCTACGTTGCAAGACTATGTGTTAGATTTGCAACCTGAGGCAACTGACCTCTACTGTTATGAGCAATTACCCGACAGCTCAGATGAGGAGGATGTCATAGACAGTCCAGCTGGACAAGCAGAACCGGACACATCCAATTACAATATCGTTACCTTTTGTTGTCAGTGTGAGTCTACACTTCGTTTGTGTGTACAGAGCACACAAGTAGATATTCGCATATTGCAAGAGCTGTTAATGGGCTCATTTGGAATCGTGTGCCCCAACTGTTCTACTAGACTGTAACTACAATGGCTGATCCAGCAGGTACAGATGGGGAGGGGACGGGATGCAATGGTTGGTTTTATGTAGAAGCAGTAATTGACAGACAGACAGGGGACAACATTTCAGAGGACGAAAATGAAGACAGTAGTGATACTGGGGAGGATATGGTTGACTTTATTGACAATTGTAATGTATACAACAATCAGGCAGAAGCAGAGACAGCACAGGCATTGTTTCATGCACAGGAAGCGGAGGAACATGCAGAGGCTGTGCAGGTTCTAAAACGAAAGTATGTAGGTAGTCCTTTAAGTGATATTAGTAGTTGTGTGGATTATAATATTAGTCCACGGTTAAAAGCTATATGCATAGAAAATAACAGTAAAACAGCAAAACGAAGACTCTTTGAACTTCCAGACAGCGGGTATGGCAATACTGAAGTGGAAACGCAGCAGATGGTACAGGTAGAGGAGCAACAAACAACATTAAGTTGTAATGGTAGTGACGGGACACATAGTGAACGAGAGAATGAAACTCCAACACGTAATATATTGCAAGTGTTAAAAACTAGCAATGGTAAAGCTGCTATGTTAGGTAAATTTAAAGAATTATATGGTGTAAGTTTTATGGAACTAATTAGGCCATTTCAAAGCAATAAAAGCACATGTACTGATTGGTGTGTAGCTGCGTTTGGAGTTACAGGTACAGTTGCAGAAGGATTTAAAACCCTATTGCAACCATATTGTTTGTATTGCCATTTACAAAGTTTAGCATGTTCCTGGGGCATGGTTATGTTAATGCTTGTGAGATTTAAATGTGCAAAAAATAGAATAACAATTGAAAAATTATTAGAAAAATTATTGTGTATATCTACAAATTGTATGTTAATTCAGCCACCCAAATTACGTAGCACAGCTGCAGCATTATATTGGTACAGAACAGGAATGTCAAACATTAGCGATGTATATGGTGAAACACCAGAATGGATAGAAAGACAAACAGTATTACAGCATAGTTTTAATGACACAACATTTGATTTGTCCCAAATGGTACAATGGGCATATGACAATGATGTTATGGATGATAGTGAAATTGCCTATAAATATGCACAATTAGCTGACAGTGATAGTAATGCATGTGCATTTTTAAAAAGTAATTCGCAGGCAAAAATAGTTAAAGATTGTGGAACAATGTGTAGACATTATAAACGAGCAGAAAAACGACAAATGTCCATGGGACAGTGGATTAAAAGTAGATGTGACAAAGTTAGTGACGAAGGTGACTGGAGGGACATAGTAAAGTTTTTAAGATATCAACAAATAGAATTTGTGTCATTTTTATCTGCATTAAAGCTGTTTTTAAAAGGAGTGCCAAAGAAAAACTGTATTTTAATACATGGTGCACCTAATACAGGTAAATCATATTTTGGAATGAGCCTTATTAGCTTTTTACAAGGATGTATAATATCATATGCAAATTCAAAAAGTCATTTTTGGTTACAACCACTGGCTGATGCTAAAATAGGCATGTTAGATGATGCTACAACGCCATGTTGGCATTATATAGACAATTACCTACGAAATGCACTAGATGGCAACCCTGTATCTATAGATGTAAAGCATAAAGCTTTAATGCAGTTAAAATGTCCTCCTTTATTGATTACATCTAATATAAATGCAGGTAAGGATGACAGATGGCCATACCTACATAGCAGACTGGTGGTTTTTACATTTCCAAATCCATTTCCATTTGACAAAAACGGAAATCCAGTATATGAATTAAGTGATAAAAACTGGAAATCCTTTTTCTCAAGGACGTGGTGCAGATTAAATTTGCACGAGGAAGAGGACAAAGAAAACGATGGAGACTCTTTCTCAACGTTTAAATGTGTGTCAGGACAAAATATTAGAACATTATGAAAATGATAGTAAACGACTTTGTGATCATATAGACTATTGGAAACATATTCGACTTGAATGTGTATTAATGTATAAAGCAAGAGAAATGGGAATACACAGTATTAACCACCAGGTGGTGCCAGCGTTGTCAGTATCAAAGGCCAAAGCCTTACAAGCTATTGAACTACAAATGATGTTGGAAACATTAAATAACACTGAATACAAAAATGAGGACTGGACAATGCAGCAAACAAGTCTTGAACTGTATTTAACTGCACCTACAGGGTGTTTAAAAAAACATGGATATACTGTAGAGGTGCAATTTGATGGTGATGTACACAACACCATGCATTATACTAACTGGAAATTTATATACCTATGTATAGATGGCCAATGTACTGTTGTGGAAGGGCAAGTTAATTGTAAGGGCATTTATTATGTACATGAAGGACATATAACATATTTTGTAAATTTTACAGAAGAGGCAAAAAAATATGGGACTGGTAAAAAATGGGAAGTGCATGCGGGTGGTCAGGTAATTGTTTTTCCTGAATCTGTATTTAGCAGTGACGAAATATCCTTTGCTGGGATTGTTACAAAGCTACCAACAGCCAACAACACCACCACATCGAATTCCAAAACCTGCGCCTTGGGCACCAGTGAAGGTGTGCGGCGGGCGACGACGTCTACTAAGCGACCAAGAACAGAGCCAGAGCACAGAAACACCCACCACCCCAACAAGTTGTTGCGAGGCGACTCCGTGGACAGTGTCAACTGTGGGGTTATCAGTGCAGCTGCATGCACAAACCAAACAAGGGCTGTCAGTTGTCCTGCAACTACACCTATAATACACTTAAAAGGTGATGCAAATATATTAAAATGTTTAAGATATAGGCTGTCAAAATATAAACAATTGTATGAACAAGTGTCATCTACATGGCATTGGACATGTACAGATGGAAAACATAAAAATGCTATTGTAACCTTAACATATATAAGTACATCACAAAGAGACGATTTTTTAAATACTGTAAAAATACCTAACACAGTATCAGTGTCAACAGGATATATGACTATTTAGCCTAATGATTGAACTAAATATTTCTACAGTAAGCATTGTGCTATGCTTTTTGCTTTGCTTTTGTGTGCTACTATTTGTGTGTCTTGTCATACGTCCACTTGTGCTGTCTGTGTCGGTATATGCAACACTACTATTATTAATTGTAATTTTATGGGTTATTGCAACCTCTCCATTACGTTGTTTTTGTATATATGTTGTGTTTATATATATTCCATTATTTGTAATTCATACACATGCATCTATTTTAAGTCAACAGTAACTTTTTTACTTGTGTATACTGTTGTTTGTATTGGTATTGGTATTGGTATTGGTATTGGTATTGGTATTAGTATAATAAACTTTTTTACTTTTTTTTTATTATTACCATGCGGTCCAAACGCTCTACAAAACGCACTAAACGTGCGTCTGCTACACAATTATATCAAACATGTAAAGCAGCAGGTACTTGTCCATCAGACGTTATACCTAAAATAGAACATACTACCATTGCAGACCAAATATTAAGGTATGGTAGTATGGGTGTTTTTTTTGGTGGGTTGGGTATTGGGTCCGGCTCTGGTACTGGGGGTCGCACTGGATATGTCCCTCTTAGTACACGTCCTTCTACAGTATCTGAGGCAAGTATACCTATTAGACCACCAGTTAGCATTGACCCTGTAGGTCCCTTGGACCCCTCTATAGTAAGTCTTGTTGAAGAATCTGGAATTGTTGATGTTGGTGCCCCTGCTCCTATACCACACCCTCCTACAACATCTGGGTTTGACATTGCTACAACTGCAGACACAACACCTGCAATTTTAGATGTAACAAGTGTTAGCACACATGAAAATCCTACTTTTACTGATCCATCTGTATTGCAGCCTCCTACACCTGCAGAAACATCAGGTCATTTACTACTTTCATCATCATCTATTAGCACACATAATTATGAGGAAATACCTATGGATACATTTATTGTTTCTACTAATAATGAAAACATAACAAGTAGCACACCCATTCCAGGGGTGCGCCGTCCTGCACGTTTAGGGTTATATAGTAAGGCTACACAACAAGTAAAAGTTATTGATCCAACGTTTCTTAGTGCTCCAAAACAGCTAATTACATATGAAAACCCTGCCTATGAAACTGTAAATGCTGAAGAAACTTTATACTTTTCCAATACATCGCATAATATAGCCCCTGATCCCGA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human papillomavirus 31
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Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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2023-10-04
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GenBank
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Japan
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Japan
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Human papillomavirus 31 K3007 DNA, complete genome
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| 12,227
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LC779568.1
|
human papillomavirus 31
|
Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-10-04
|
K3018
|
Alphapapillomavirus 9
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,945
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2020
| null | null |
Human papillomavirus 31 K3018 DNA, complete genome
|
TAATAATAATAATCTTAGTATAAAAAAGTAGGGAGTGACCGAAAGTGGTGAACCGAAAACGGTTGGTATATAAAGCACATAGTATTTTGTGCAAACCTACAGACGCCATGTTCAAAAATCCTGCAGAAAGACCTCGGAAATTGCATGAACTAAGCTCGGCATTGGAAATACCCTACGATGAACTAAGATTGAATTGTGTCTACTGCAAAGGTCAGTTAACAGAAACAGAGGTATTAGATTTTGCATTTACAGATTTAACAATAGTATATAGGGACGACACACCACACGGAGTGTGTACAAAATGTTTAAGATTTTATTCAAAAGTAAGTGAATTTAGATGGTATAGATATAGTGTGTATGGAACAACATTAGAAAAATTGACAAACAAAGGTATATGTGATTTGTTAATTAGGTGTATAACGTGTCAAAGACCGTTGTGTCCAGAAGAAAAACAAAGACATTTGGATAAAAAGAAACGATTCCACAACATAGGAGGAAGGTGGACAGGACGTTGCATAGCATGTTGGAGAAGACCTCGTACTGAAACCCAAGTGTAAACATGCGTGGAGAAACACCTACGTTGCAAGACTATGTGTTAGATTTGCAACCTGAGGCAACTGACCTCTACTGTTATGAGCAATTACCCGACAGCTCAGATGAGGAGGATGTCATAGACAGTCCAGCTGGACAAGCAGAACCGGACACATCCAATTACAATATCGTTACCTTTTGTTGTCAGTGTGAGTCTACACTTCGTTTGTGTGTACAGAGCACACAAGTAGATATTCGCATATTGCAAGAGCTGTTAATGGGCTCATTTGGAATCGTGTGCCCCAACTGTTCTACTAGACTGTAACTACAATGGCTGATCCAGCAGGTACAGATGGGGAGGGGACGGGATGCAATGGTTGGTTTTATGTAGAAGCAGTAATTGACAGACAGACAGGGGACAACATTTCAGAGGACGAAAATGAAGACAGTAGTGATACTGGGGAGGATATGGTTGACTTTATTGACAATTGTAATGTATACAACAATCAGGCAGAAGCAGAGACAGCACAGGCATTGTTTCATGCACAGGAAGCGGAGGAACATGCAGAGGCTGTGCAGGTTCTAAAACGAAAGTATGTAGGTAGTCCTTTAAGTGATATTAGTAGTTGTGTGGATTATAATATTAGTCCACGGTTAAAAGCTATATGCATAGAAAATAACAGTAAAACAGCAAAACGAAGACTCTTTGAACTTCCAGACAGCGGGTATGGCAATACTGAAGTGGAAACGCAGCAGATGGTACAGGTAGAGGAGCAACAAACAACATTAAGTTGTAATGGTAGTGACGGGACACATAGTGAACGAGAGAATGAAACTCCAACACGTAATATATTGCAAGTGTTAAAAACTAGCAATGGTAAAGCTGCTATGTTAGGTAAATTTAAAGAATTATATGGTGTAAGTTTTATGGAACTAATTAGGCCATTTCAAAGCAATAAAAGCACATGTACTGATTGGTGTGTAGCTGCGTTTGGAGTTACAGGTACAGTTGCAGAAGGATTTAAAACCCTATTGCAACCATATTGTTTGTATTGCCATTTACAAAGTTTAGCATGTTCCTGGGGCATGGTTATGTTAATGCTTGTGAGATTTAAATGTGCAAAAAATAGAATAACAATTGAAAAATTATTAGAAAAATTATTGTGTATATCTACAAATTGTATGTTAATTCAGCCACCCAAATTACGTAGCACAGCTGCAGCATTATATTGGTACAGAACAGGAATGTCAAACATTAGCGATGTATATGGTGAAACACCAGAATGGATAGAAAGACAAACAGTATTACAGCATAGTTTTAATGACACAACATTTGATTTGTCCCAAATGGTACAATGGGCATATGACAATGATGTTATGGATGATAGTGAAATTGCCTATAAATATGCACAATTAGCTGACAGTGATAGTAATGCATGTGCATTTTTAAAAAGTAATTCGCAGGCAAAAATAGTTAAAGATTGTGGAACAATGTGTAGACATTATAAACGAGCAGAAAAACGACAAATGTCCATGGGACAGTGGATTAAAAGTAGATGTGACAAAGTTAGTGACGAAGGTGACTGGAGGGACATAGTAAAGTTTTTAAGATATCAACAAATAGAATTTGTGTCATTTTTATCTGCATTAAAGCTGTTTTTAAAAGGAGTGCCAAAGAAAAACTGTATTTTAATACATGGTGCACCTAATACAGGTAAATCATATTTTGGAATGAGCCTTATTAGCTTTTTACAAGGATGTATAATATCATATGCAAATTCAAAAAGTCATTTTTGGTTACAACCACTGGCTGATGCTAAAATAGGCATGTTAGATGATGCTACAACGCCATGTTGGCATTATATAGACAATTACCTACGAAATGCACTAGATGGCAACCCTGTATCTATAGATGTAAAGCATAAAGCTTTAATGCAGTTAAAATGTCCTCCTTTATTGATTACATCTAATATAAATGCAGGTAAGGATGACAGATGGCCATACCTACATAGCAGACTGGTGGTTTTTACATTTCCAAATCCATTTCCATTTGACAAAAACGGAAATCCAGTATATGAATTAAGTGATAAAAACTGGAAATCCTTTTTCTCAAGGACGTGGTGCAGATTAAATTTGCACGAGGAAGAGGACAAAGAAAACGATGGAGACTCTTTCTCAACGTTTAAATGTGTGTCAGGACAAAATATTAGAACATTATGAAAATGATAGTAAACGACTTTGTGATCATATAGACTATTGGAAACATATTCGACTTGAATGTGTATTAATGTATAAAGCAAGAGAAATGGGAATACACAGTATTAACCACCAGGTGGTGCCAGCGTTGTCAGTATCAAAGGCCAAAGCCTTACAAGCTATTGAACTACAAATGATGTTGGAAACATTAAATAACACTGAATACAAAAATGAGGACTGGACAATGCAGCAAACAAGTCTTGAACTGTATTTAACTGCACCTACAGGGTGTTTAAAAAAACATGGATATACTGTAGAGGTGCAATTTGATGGTGATGTACACAACACCATGCATTATACTAACTGGAAATTTATATACCTATGTATAGATGGCCAATGTACTGTTGTGGAAGGGCAAGTTAATTGTAAGGGCATTTATTATGTACATGAAGGACATATAACATATTTTGTAAATTTTACAGAAGAGGCAAAAAAATATGGGACTGGTAAAAAATGGGAAGTGCATGCGGGTGGTCAGGTAATTGTTTTTCCTGAATCTGTATTTAGCAGTGACGAAATATCCTTTGCTGGGATTGTTACAAAGCTACCAACAGCCAACAACACCACCACATCGAATTCCAAAACCTGCGCCTTGGGCACCAGTGAAGGTGTGCGGCGGGCGACGACGTCTACTAAGCGACCAAGAACAGAGCCAGAGCACAGAAACACCCACCACCCCAACAAGTTGTTGCGAGGCGACTCCGTGGACAGTGTCAACTGTGGGGTTATCAGTGCAGCTGCATGCACAAACCAAACAAGGGCTGTCAGTTGTCCTGCAACTACACCTATAATACACTTAAAAGGTGATGCAAATATATTAAAATGTTTAAGATATAGGCTGTCAAAATATAAACAATTGTATGAACAAGTGTCATCTACATGGCATTGGACATGTACAGATGGAAAACATAAAAATGCTATTGTAACCTTAACATATATAAGTACATCACAAAGGGACGATTTTTTAAATACTGTAAAAATACCTAACACAGTATCAGTGTCAACAGGATATATGACTATTTAGCCTAATGATTGAACTAAATATTTCTACAGTAAGCATTGTGCTATGCTTTTTGCTTTGCTTTTGTGTGCTACTATTTGTGTGTCTTGTCATACGTCCACTTGTGCTGTCTGTGTCGGTATATGCAACACTACTATTATTAATTGTAATTTTATGGGTTATTGCAACCTCTCCATTACGTTGTTTTTGTATATATGTTGTGTTTATATATATTCCATTATTTGTAATTCATACACATGCATCTATTTTAAGTCAACAGTAACTTTTTTACTTGTGTATACTGTTGTTTGTATTGGTATTGGTATTGGTATTGGTATTGGTATTGGTATTAGTATAATAAACTTTTTTACTTTTTTTTTATTATTACCATGCGGTCCAAACGCTCTACAAAACGCACTAAACGTGCGTCTGCTACACAATTATATCAAACATGTAAAGCAGCAGGTACTTGTCCATCAGACGTTATACCTAAAATAGAACATACTACCATTGCAGACCAAATATTAAGGTATGGTAGTATGGGTGTTTTTTTTGGTGGGTTGGGTATTGGGTCCGGCTCTGGTACTGGGGGTCGCACTGGATATGTCCCTCTTAGTACACGTCCTTCTACAGTATCTGAGGCAAGTATACCTATTAGACCACCAGTTAGCATTGACCCTGTAGGTCCCTTGGACCCCTCTATAGTAAGTCTTGTTGAAGAATCTGGAATTGTTGATGTTGGTGCCCCTGCTCCTATACCACACCCTCCTACAACATCTGGGTTTGACATTGCTACAACTGCAGACACAACACCTGCAATTTTAGATGTAACAAGTGTTAGCACACATGAAAATCCTACTTTTACTGATCCATCTGTATTGCAGCCTCCTACACCTGCAGAAACATCAGGTCATTTACTACTTTCATCATCATCTATTAGCACACATAATTATGAGGAAATACCTATGGATACATTTATTGTTTCTACTAATAATGAAAACATAACAAGTAGCACACCCATTCCAGGGGTGCGCCGTCCTGCACGTTTAGGGTTATATAGTAAGGCTACACAACAAGTAAAAGTTATTGATCCAACGTTTCTTAGTGCTCCAAAACAGCTAATTACATATGAAAACCCTGCCTATGAAACTGTAAATGCTGAAGAAACTTTATACTTTTCCAATACATCGCATAATATAGCCCCTGATCCCGA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| 12,228
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LC779569.1
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human papillomavirus 31
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Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
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Japan
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2023-10-04
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K2558
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Alphapapillomavirus 9
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,939
|
GenBank
| null |
Japan
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Japan
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Homo sapiens
| null |
2019
| null | null |
Human papillomavirus 31 K2558 DNA, complete genome
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| 12,229
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LC779570.1
|
human papillomavirus 31
|
Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-10-04
|
K2299
|
Alphapapillomavirus 9
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,921
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null | null |
Human papillomavirus 31 K2299 DNA, complete genome
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TAATAATAATAATCTTAGTATAAAAAAGTAGGGAGTGACCGAAAGTGGTGAACCGAAAACGGTTGGTATATAAAGCACATAGTATTTTGTGCAAACCTACAGACGCCATGTTCAAAAATCCTGCAGAAAGACCTCGGAAATTGCATGAACTAAGCTCGGCATTGGAAATACCCTACGATGAACTAAGATTGAATTGTGTCTACTGCAAAGGTCAGTTAACAGAAACAGAGGTATTAGATTTTGCATTTACAGATTTAACAATAGTATATAGGGACGACACACCACACGGAGTGTGTACAAAATGTTTAAGATTTTATTCAAAAGTAAGTGAATTTAGATGGTATAGATATAGTGTGTATGGAACAACATTAGAAAAATTGACAAACAAAGGTATATGTGATTTGTTAATTAGGTGTATAACGTGTCAAAGACCGTTGTGTCCAGAAGAAAAACAAAGACATTTGGATAAAAAGAAACGATTCCACAACATAGGAGGAAGGTGGACAGGACGTTGCATAGCATGTTGGAGAAGACCTCGTACTGAAACCCAAGTGTAAACATGCGTGGAGAAACACCTACGTTGCAAGACTATGTGTTAGATTTGCAACCTGAGGCAACTGACCTCTACTGTTATGAGCAATTACCCGACAGCTCAGATGAGGAGGATGTCATAGACAGTCCAGCTGGACAAGCAGAACCGGACACATCCAATTACAATATCGTTACCTTTTGTTGTCAGTGTGAGTCTACACTTCGTTTGTGTGTACAGAGCACACAAGTAGATATTCGCATATTGCAAGAGCTGTTAATGGGCTCATTTGGAATCGTGTGCCCCAACTGTTCTACTAGACTGTAACTACAATGGCTGATCCAGCAGGTACAGATGGGGAGGGGACGGGATGCAATGGTTGGTTTTATGTAGAAGCAGTAATTGACAGACAGACAGGGGACAACATTTCAGAGGACGAAAATGAAGACAGTAGTGATACTGGGGAGGATATGGTTGACTTTATTGACAATTGTAATGTATACAACAATCAGGCAGAAGCAGAGACAGCACAGGCATTGTTTCATGCACAGGAAGCGGAGGAACATGCAGAGGCTGTGCAGGTTCTAAAACGAAAGTATGTAGGTAGTCCTTTAAGTGATATTAGTAGTTGTGTGGATTATAATATTAGTCCACGGTTAAAAGCTATATGCATAGAAAATAACAGTAAAACAGCAAAACGAAGACTCTTTGAACTTCCAGACAGCGGGTATGGCAATACTGAAGTGGAAACGCAGCAGATGGTACAGGTAGAGGAGCAACAAACAACATTAAGTTGTAATGGTAGTGACGGGACACATAGTGAACGAGAGAATGAAACTCCAACACGTAATATATTGCAAGTGTTAAAAACTAGCAATGGTAAAGCTGCTATGTTAGGTAAATTTAAAGAATTATATGGTGTAAGTTTTATGGAACTAATTAGGCCATTTCAAAGCAATAAAAGCACATGTACTGATTGGTGTGTAGCTGCGTTTGGAGTTACAGGTACAGTTGCAGAAGGATTTAAAACCCTATTGCAACCATATTGTTTGTATTGCCATTTACAAAGTTTAGCATGTTCCTGGGGCATGGTTATGTTAATGCTTGTGAGATTTAAATGTGCAAAAAATAGAATAACAATTGAAAAATTATTAGAAAAATTATTGTGTATATCTACAAATTGTATGTTAATTCAGCCACCCAAATTACGTAGCACAGCTGCAGCATTATATTGGTACAGAACAGGAATGTCAAACATTAGCGATGTATATGGTGAAACACCAGAATGGATAGAAAGACAAACAGTATTACAGCATAGTTTTAATGACACAACATTTGATTTGTCCCAAATGGTACAATGGGCATATGACAATGATGTTATGGATGATAGTGAAATTGCCTATAAATATGCACAATTAGCTGACAGTGATAGTAATGCATGTGCATTTTTAAAAAGTAATTCGCAGGCAAAAATAGTTAAAGATTGTGGAACAATGTGTAGACATTATAAACGAGCAGAAAAACGACAAATGTCCATGGGACAGTGGATTAAAAGTAGATGTGACAAAGTTAGTGACGAAGGTGACTGGAGGGACATAGTAAAGTTTTTAAGATATCAACAAATAGAATTTGTGTCATTTTTATCTGCATTAAAGCTGTTTTTAAAAGGAGTGCCAAAGAAAAACTGTATTTTAATACATGGTGCACCTAATACAGGTAAATCATATTTTGGAATGAGCCTTATTAGCTTTTTACAAGGATGTATAATATCATATGCAAATTCAAAAAGTCATTTTTGGTTACAACCACTGGCTGATGCTAAAATAGGCATGTTAGATGATGCTACAACGCCATGTTGGCATTATATAGACAATTACCTACGAAATGCACTAGATGGCAACCCTGTATCTATAGATGTAAAGCATAAAGCTTTAATGCAGTTAAAATGTCCTCCTTTATTGATTACATCTAATATAAATGCAGGTAAGGATGACAGATGGCCATACCTACATAGCAGACTGGTGGTTTTTACATTTCCAAATCCATTTCCATTTGACAAAAACGGAAATCCAGTATATGAATTAAGTGATAAAAACTGGAAATCCTTTTTCTCAAGGACGTGGTGCAGATTAAATTTGCACGAGGAAGAGGACAAAGAAAACGATGGAGACTCTTTCTCAACGTTTAAATGTGTGTCAGGACAAAATATTAGAACATTATGAAAATGATAGTAAACGACTTTGTGATCATATAGACTATTGGAAACATATTCGACTTGAATGTGTATTAATGTATAAAGCAAGAGAAATGGGAATACACAGTATTAACCACCAGGTGGTGCCAGCGTTGTCAGTATCAAAGGCCAAAGCCTTACAAGCTATTGAACTACAAATGATGTTGGAAACATTAAATAACACTGAATACAAAAATGAGGACTGGACAATGCAGCAAACAAGTCTTGAACTGTATTTAACTGCACCTACAGGGTGTTTAAAAAAACATGGATATACTGTAGAGGTGCAATTTGATGGTGATGTACACAACACCATGCATTATACTAACTGGAAATTTATATACCTATGTATAGATGGCCAATGTACTGTTGTGGAAGGGCAAGTTAATTGTAAGGGCATTTATTATGTACATGAAGGACATATAACATATTTTGTAAATTTTACAGAAGAGGCAAAAAAATATGGGACTGGTAAAAAATGGGAAGTGCATGCGGGTGGTCAGGTAATTGTTTTTCCTGAATCTGTATTTAGCAGTGACGAAATATCCTTTGCTGGGATTGTTACAAAGCTACCAACAGCCAACAACACCACCACATCGAATTCCAAAACCTGCGCCTTGGGCACCAGTGAAGGTGTGCGGCGGGCGACGACGTCTACTAAGCGACCAAGAACAGAGCCAGAGCACAGAAACACCCACCACCCCAACAAGTTGTTGCGAGGCGACTCCGTGGACAGTGTCAACTGTGGGGTTATCAGTGCAGCTGCATGCACAAACCAAACAAGGGCTGTCAGTTGTCCTGCAACTACACCTATAATACACTTAAAAGGTGATGCAAATATATTAAAATGTTTAAGATATAGGCTGTCAAAATATAAACAATTGTATGAACAAGTGTCATCTACATGGCATTGGACATGTACAGATGGAAAACATAAAAATGCTATTGTAACCTTAACATATATAAGTACATCACAAAGAGACGATTTTTTAAATACTGTAAAAATACCTAACACAGTATCAGTGTCAACAGGATATATGACTATTTAGCCTAATGATTGAACTAAATATTTCTACAGTAAGCATTGTGCTATGCTTTTTGCTTTGCTTTTGTGTGCTACTATTTGTGTGTCTTGTCATACGTCCACTTGTGCTGTCTGTGTCGGTATATGCAACACTACTATTATTAATTGTAATTTTATGGGTTATTGCAACCTCTCCATTACGTTGTTTTTGTATATATGTTGTGTTTATATATATTCCATTATTTGTAATTCATACACATGCATCTATTTTAAGTCAACAGTAACTTTTTTACTTGTGTATACTGTTGTTGGTATTGGTATTGGTATTAGTATAATAAACTTTTTTACTTTTTTTCTATTATTACCATGCGGTCCAAACGCTCTACAAAACGCACTAAACGTGCGTCTGCTACACAATTATATCAAACATGTAAAGCAGCAGGTACTTGTCCATCAGACGTTATACCTAAAATAGAACATACTACCATTGCAGACCAAATATTAAGGTATGGTAGTATGGGTGTTTTTTTTGGTGGGTTGGGTATTGGGTCCGGCTCTGGTACTGGGGGTCGCACTGGATATGTCCCTCTTAGTACACGTCCTTCTACAGTATCTGAGGCAAGTATACCTATTAGACCACCAGTTAGCATTGACCCTGTAGGTCCCTTGGACCCCTCTATAGTAAGTCTTGTTGAAGAATCTGGAATTGTTGATGTTGGTGCCCCTGCTCCTATACCACACCCTCCTACAACATCTGGGTTTGACATTGCTACAACTGCAGACACAACACCTGCAATTTTAGATGTAACAAGTGTTAGCACACATGAAAATCCTACTTTTACTGATCCATCTGTATTGCAGCCTCCTACACCTGCAGAAACATCAGGTCATTTACTACTTTCATCATCATCTATTAGCACACATAATTATGAGGAAATACCTATGGATACATTTATTGTTTCTACTAATAATGAAAACATAACAAGTAGCACACCCATTCCAGGGGTGCGCCGTCCTGCACGTTTAGGGTTATATAGTAAGGCTACACAACAAGTAAAAGTTATTGATCCAACGTTTCTTAGTGCTCCAAAACAGCTAATTACATATGAAAACCCTGCCTATGAAACTGTAAATGCTGAAGAAACTTTATACTTTTCCAATACATCGCATAATATAGCCCCTGATCCCGACTTTCTAGATATTATAGCATTACA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| 12,230
|
LC779571.1
|
human papillomavirus 31
|
Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
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Japan
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2023-10-04
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K2564
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Alphapapillomavirus 9
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,892
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
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Homo sapiens
| null |
2019
| null | null |
Human papillomavirus 31 K2564 DNA, complete genome
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LC779572.1
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human papillomavirus 31
|
Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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Pathogen Genomics Center; 4-7-1 Gakuen, Musashi-murayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-10-04
|
K2704
|
Alphapapillomavirus 9
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
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|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
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2019
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Human papillomavirus 31 K2704 DNA, complete genome
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human papillomavirus 31
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Kogure,G., Tanaka,K., Matsui,T., Onuki,M., Matsumoto,K., Iwata,T., Kukimoto,I.
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2023-10-04
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Japan
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Japan
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Human papillomavirus 31 K2738 DNA, complete genome
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