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|
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Human papillomavirus 89 isolate 65C.89, complete genome
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human papillomavirus 89
|
Terai,M., Burk,R.D.
|
Albert Einstein College of Medicine, Microbiology & Immunology
|
USA
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2002-08-05
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Alphapapillomavirus 3
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Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
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GenBank
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Human papillomavirus - cand89, complete genome
|
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| 110,698
|
OP971095.1
|
human papillomavirus 91
|
Happel,A.-U., Balle,C., Havyarimana,E., Brown,B., Maust,B., Konstantinus,I.N., Feng,C., Yi,B.H., Gill,K., Bekker,L.-G., Passmore,J.-A.S., Jaspan,H.B., Varsani,A.
|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
|
2023-01-14
|
UC113_LW_V1
|
Alphapapillomavirus 8
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
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| 7,950
|
GenBank
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South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
2016-10-31
|
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|
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|
Human papillomavirus 91 isolate UC113_LW_V1, complete genome
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| 19,561
|
OP971097.1
|
human papillomavirus 91
|
Happel,A.-U., Balle,C., Havyarimana,E., Brown,B., Maust,B., Konstantinus,I.N., Feng,C., Yi,B.H., Gill,K., Bekker,L.-G., Passmore,J.-A.S., Jaspan,H.B., Varsani,A.
|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
|
2023-01-14
|
UC113_LW_V2
|
Alphapapillomavirus 8
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,950
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
2016-10-31
|
SAMN30889833
|
PRJNA881266
|
Human papillomavirus 91 isolate UC113_LW_V2, complete genome
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| 19,563
|
LR861844.1
|
human papillomavirus 91
|
Wienecke-Baldacchino K,A.
|
Laboratoire National de Sante, Epidemiology and Microbial Genomics, 1, Rue Louis Rech, 3555 Dudelange
|
Luxembourg
|
2020-09-01
|
LNS2123864_HPV91
|
Alphapapillomavirus 8
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,959
|
GenBank
| null |
Luxembourg
|
Luxembourg
|
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJEB39467
|
Human papillomavirus type 91 isolate LNS2123864_HPV91, complete genome
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| 47,355
|
LR861935.1
|
human papillomavirus 91
|
Wienecke-Baldacchino K,A.
|
Laboratoire National de Sante, Epidemiology and Microbial Genomics, 1, Rue Louis Rech, 3555 Dudelange
|
Luxembourg
|
2020-09-01
|
LNS5859951_HPV91
|
Alphapapillomavirus 8
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,959
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GenBank
| null |
Luxembourg
|
Luxembourg
|
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJEB39467
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Human papillomavirus type 91 isolate LNS5859951_HPV91, complete genome
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ATGAGTAAGTACTGTGTTAGGCACACCTGCAGACCGAAACCGGTCGCTGCACACCTTACATTCTTTGTGGTTATTAGTAACAATTATTATCCTTGTACTAAAGGGAGTAACCGAAAACGGTCCGACCGAAAGCGGTACATATATAAACCACCCAAAAAACATAGCTTGTGGGGCATAATGTCTGCACGTAGCTGCTCCCAAAACGCTAAGACCATATTTGAGTTGTGTGACCAGTGTAACATAACTCTGCCTACTCTGCAAATTAGTTGTATATTTTGCAAGAAGTGTTTGACAACCACGGAAGTGTTGTCGTTTGCATTTAGGGATTTAAAGGTTGTGTGGCGCGACAGTTATCCGTTTGCAGCGTGTTTGGCCTGCTTAAAATTTTATGGTAAAATAAGCCAATATAGACATTTTAAGTACGCGGCATTAGCAGTAACAGTAGAGGAAGAAACACAACAAACTGTATTCGAGTTGTGCATTCGCTGTTGTAAGTGCCACAAGCCATTGTCGCCTATAGAAAAGGTGCAGCACATTGTGCAAAAAGCCCACTTTTTTTACATAAGTAACGCGTGGAAGGGATATTGCCTACACTGCTGGAAGTCATGTATGGAAAAGCGCCGACGCTCAGAGACTATGTGCTAACCTTGCAACCAGAACCTAGAAGTTTAACCTGTGACGAGCAATTAGACAGCTCAGACTCAGAGGATGAGCGTGAGCAACCCACGCAACAGGACCAGCAAGTGGACCTACAAGTTTACAGAGTTGTAACCGAGTGCACCTCTTGTTATTGTTCAATTCGTCTTGTTGTGAAGAGCTCAAGCAGTGACATCAAGAAGCTCGAGGAGCTGCTGTTGGGGACATTACAAATTGTGTGTCCCTTGTGCACTACAGCTGTGTGACTGCAATGGCTGATAAACAAGGTACAGAGGATGAGGGGTTGGGATGTTCAGGCTGGTTTATAGTAGAGGCCACAGTAGACAAAACCACGGAAAATGATATATCAGAAGATGAAATTGAGGAGGAAGAGGATAGTGGGTTTGACATGGTAGATTTTATTAATAATACATTAGAGGACAGCTGTGCAGAACAAAGCTGTGCGCAGGCCCTGTTAAATAAACAGCAAGCGGATGCTGATGCTGCTATAGTACAGGAGCTAAAACGAAAGTATATTAGTCCATATGTAAGTCCTATACAGTGTTTACAGGAGTCTGTGGACAGGGACCTAAGTCCTAGGTTGCATGCCATAAAGATAGGAGGCGGACAAAAGGCAAAAAGGAGACTGTTTGAACCGACAGAGCAGCGGCATAGTAACTATGGCAATTGTGAAGTGGAAGCAACTGAGACACAGGTAGATGTGGAAAATGGCGGACCGGAACGCCATATGGGGGCCATACAACATTGTGGGAGGGGGGGGAGTAGTGTGGCGGAAGCAGTGCAAGTAGTAGAGGAAGAGGGTGTAACAAACAATAGCCAGACTACAGGAGAGCAAAGCCCACGCACGCGTATTGTAGAATTATTTAAAGACAAAGATGTTACTGTAAAACTCTTAGGTAAGTTTAAAGACTTATTTGGCGTGGGATTTAATGATTTGGTAAGACAGTTTAAAAGTGATAAATCAACATGTACTGATTGGGTATATAGTGTATTTGGTGTTAATCCATCAATAGCAGAAGGATTTCATATGTTATTAAAAGAACAAACATTATACCTACATACCCAATGGGTTACATGCCGATGGGGGATGGTGTTGCTTGCATTGTGTAGATATAAGGTTGCCAAAAATCGCAGTACAGTCGGTAGACAGCTTGCACAAATGTTAAATGTACCTGTGCAACAAATATTGATACAGCCTCCAAAATTACAAAGCGCTCCAGCAGCACTGTTTTGGTTTAGAGCCGGTATGGGAAATGGTAGTGAAGTATCGGGCACAACACCGGAATGGATAAGTAGACAGACAGTGTTAGAACACAGTTTTGCAGACACACAGTTTAGTTTAACAAATATGGTGCAATGGGCATATGATAATGGATATACAGAAGAATGTGACATAGCTTATTATTATGCACAACTAGGAGACACGGATGCAAATGCCGCTGCATTTTTAAAAAGTAATATGCAAGCTAGGTATGTTAGAGATTGTGCATGTATGTGTAAACATTATAAGCTAGCAGAAATGAAAAAAATGACTATGGCAGAGTGGATTAAGCATAGAGGAGAGAAGTGTAATGATGGGGACTGGAAACCTATAATACGATTTTTAAGATATCAGCATATAGATATTATTACATTTTTAGCATCCTTAAAAAAATGGCTGCATGGCATACCAAAAAAAAATTGTATTTGCATAATAGGGCCGCCCGACACAGGTAAATCAAGTTTTGGAATGAGTTTAATGAAGTTCCTAGGCGGCACTATGTTATCATATGTAAATTCAAGTAGCCATTTTTGGTTACAGTCCTTAGTAGATGCAAAGGCAGCCATGTTAGATGATGTTACAGCAGCATGTTGGAATTACATGGATATGCATATGCGAAATTTATTAGACGGCAATCTTACAAGTATTGATAGAAAGCATAAAGCATTAGCAGTTATAAAGTGTCCTCCGTTATTACTAACATCCAACATGGATATTACTACAGATGATAAGTATAAGTATTTAAAAAGTAGAATTACAACATTTACATTTCCTAATGCATTTCCATTTGATACTAATGGCAATGCAATTTATGAGTTCAATGATGAAAATTGGAACTCCTTTTTTAAAAGGTTGGCATCAAGCCTAGAACTGGAAACTGCAGAGGACGAAAATGGAGACACTAGCCAGGCGTCTAGATATGTGCCAGGAACAGTTGTTAGAACTGTATGAAAAAGACAGCAGAGATCTGCAGGACCATGTGTTGCATTGGAAATGTATACGTTATGAGTGTGCATTATATTATAAAGCAAGAGAAATGGGCATCAAACATCTAGGCCACCAGGTGGTGCCAAAGCTAGAAGTATCACGAGCAAAAGCACATGTGGCAATTGAAATGCAATTATCATTAGAATCATTATTACAAACTGAATATAGCATAGAGCCGTGGACACTACAGGACACATGTCAAGAACTATGGCACACGGAACCAAAAAAATGTTTTAAAAAACGGGGACAGACAGTAGAAGTGAGATTTGACTGCAACCCTGAAAATACAATGCAATACACCTCATGGTCAGAAATATATGTACCCGTGAATGACACGTGGGTAAAAGTACATGGCCATGTGGACTATAAAGGCCTTTCATATACTGTGTGTGGGCAAAAAACTTATTATGTAGATTTTAGTAAGGAGGCACAAACGTATGGGGATACTGGACAATGGAACGTTGTTGTGGGCTCAAACGTCATATCTTCTCCTGCATCTGTATCTAGTACTGTCACCGAAGTATCCTCTGTTGCGTCTACTGAACTCGACTCCAGAACAGCGACCACCGTCCCAGATTCCACGTGCACCCAAAAAGACTACGAGGAGCAAGCGCCGCCTAGGAAGCGAGTGCGATTCGAGCCCCACACAACCCAGATCCCCTGTACCTTGGCCAGAACTGTTGGAGGAGAGCCATTGGACAGTAGAGACCCACGAATCATCCCTAAGCATTCGAACCACAACCAAGGAGGGCACAGTGGTGGAAGTAACGCTACGCCTATAGTTCAATTACAAGGTGATGCTAACTCACTAAAATGTTTTAGATACAGATTGGGCAAATATAAATATTTGTATGTGGATGTGTCATCTACATGGCGATGGACAACAGAATCTAATAAACAAAACAGTGCATTAATTACATTAACATATGCTAGTGTACAACAAAGGGAGGCGTTTTTAGCTACTGTAAAAATTCCCACAACAATTAAACATTGTTTAGGATTTTTAACAATTATGTAAATAGTACCCTATTAATTTGTAAAACTACCTTGTATATTGATTGTATAGTGGAACTGTTACTGTGACGTTAAGGGTGTTGTAACACTCTAACCACACAACCAGCCAACCTGCTGCTATTTTTGTTAATAGATGTAAAGCTTGGCATTTTATTAGTTAATGTGCTTGTTTGCATAATTGCTGTATTGGTGTGCGCATGGTTTGCGGACAACCTGGTGTGGGCTTCTGTGCTTGCTTCAGCTTCTATACTTTACTTCTTATCTTGGTCTGCACTTATATCACTTACTAACGTGTTTATATTAATACTTGTAGTGTGGTTTGTACCGGCCCTTTTATTACATTTACATATTACATTGCAAATTGAAACACAGCAATTGTAAATACATTGGTGTGCATATATTTGTACCTAGCATTATGTTAACTTGTCAATTTGATGATGGTGATTCATGGATGTTGTTATGGCTACTTGTAACATTTATAACTGTATTGTTGATGTTATTAGTGTTTCATTATAGGACAGTTAAGCTGCTGCCCTCCAGCAAATAAACAACTTAATTACTGTGTTTATATAAACATGGTTTCTTATACACTTAAAAGGCGCAAGCGCGCGTCTGCTACACAATTATATCAAACATGCAAGGCTGCAGGCACTTGTCCCTCTGATGTAATTAACAAGGTTGAGCATACTACAATAGCAGATCAAATATTAAAATGGGCTAGCATGGGTGTGTATTTTGGAGGGTTAGGCATTGGAACCGGCTCTGGAAGTGGAGGAAGAACAGGCTATGTACCTATTCCAACAGGTCGCACAGGTACTGTTCCTAAAGTTAGTGCAGAGCCTGGGGTAGTGTCACGTCCTCCAGTTGTAATAGAACCTGTTGCTCCAACCGATCCTTCCATTGTTTCATTAATTGAAGAATCAAGTATAATTGAGTCCGGGGCTCCAATCACAACTATACCGTCCCATGGTGGTTTTGAGGTAACATCATCTGGGTCAGATGTCCCAGCCATTTTAGATGTGTCACCAACAACATCTGTGCATGTTACCACCACTACACATTTAAATCCTGCATTTACTGA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| 47,446
|
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human papillomavirus 91
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Wienecke-Baldacchino K,A.
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Laboratoire National de Sante, Epidemiology and Microbial Genomics, 1, Rue Louis Rech, 3555 Dudelange
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Luxembourg
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2020-09-01
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Alphapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
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GenBank
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Luxembourg
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Luxembourg
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Homo sapiens
| null | null | null |
PRJEB39467
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Human papillomavirus type 91 isolate LNS7013133_HPV91, complete genome
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| 47,511
|
LR862082.1
|
human papillomavirus 91
|
Wienecke-Baldacchino K,A.
|
Laboratoire National de Sante, Epidemiology and Microbial Genomics, 1, Rue Louis Rech, 3555 Dudelange
|
Luxembourg
|
2020-09-01
|
LNS9786324_HPV91
|
Alphapapillomavirus 8
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,959
|
GenBank
| null |
Luxembourg
|
Luxembourg
|
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJEB39467
|
Human papillomavirus type 91 isolate LNS9786324_HPV91, complete genome
|
ATGAGTAAGTACTGTGTTAGGCACACCTGCAGACCGAAACCGGTCGCTGCACACCTTACATTCTTTGTGGTTATTAGTAACAATTATTATCCTTGTACTAAAGGGAGTGACCGAAAACGGTCCGACCGAAAGCGGTACATATATAAACCACCCAAAAAACATAGCTTGTGGGGCATAATGTCTGCACGTAGCTGCTCCCAAAACGCTAAGACCATATTTGAGTTGTGTGACCAGTGTAACATAACTCTGCCTACTCTGCAAATTAGTTGTATATTTTGCAAGAAGTGTTTGACAACCACGGAAGTGTTGTCGTTTGCATTTAGGGATTTAAAGGTTGTGTGGCGCGACAGTTATCCGTTTGCAGCGTGTTTGGCCTGCTTAAAATTTTATGGTAAAATAAGCCAATATAGACATTTTAAGTACGCGGCATTAGCAGTAACAGTAGAGGAAGAAACACAACAAACTGTATTCGAGTTGTGCATTCGCTGTTGTAAGTGCCACAAGCCATTGTCGCCTATAGAAAAGGTGCAGCACATTGTGCAAAAAGCCCACTTTTTTTACATAAGTAACGCGTGGAAGGGATATTGCCTACACTGCTGGAAGTCATGTATGGAAAAGCGCCGACGCTCAGAGACTATGTGCTAACCTTGCAACCAGAACCTAGAAGTTTAACCTGTGACGAGCAATTAGACAGCTCAGACTCAGAGGATGAGCGTGAGCAACCCACGCAACAGGACCAGCAAGTGGACCTACAAGTTTACAGAGTTGTAACCGAGTGCACCTCTTGTTATTGTTCAATTCGTCTTGTTGTGAAGTGCTCAAGCAGTGACATCAAGAAGCTCGAGGAGCTGCTGTTGGGGACATTACAAATTGTGTGTCCCTTGTGCACTACAGCTGTGTGACTGCAATGGCTGATAAACAAGGTACAGAGGATGAGGGGTTGGGATGTTCAGGCTGGTTTATAGTAGAGGCCACAGTAGACAAAACCACGGAAAATGATATATCAGAAGATGAAATTGAGGAGGAAGAGGATAGTGGGTTTGACATGGTAGATTTTATTAATAATACATTAGAGGACAGCTGTGCAGAACAAAGCTGTGCGCAGGCCCTGTTAAATAAACAGCAAGCGGATGCTGATGCTGCTATAGTACAGGAGCTAAAACGAAAGTATATTAGTCCATATGTAAGTCCTATACAGTGTTTACAGGAGTCTGTGGACAGGGACCTAAGTCCTAGGTTGCATGCCATAAAGATAGGAGGCGGACAAAAGGCAAAAAGGAGACTGTTTGAACCGACAGAGCAGCGGCATAGTAACTATGGCAATTGTGAAGTGGAAGCAACTGAGACACAGGTAGATGTGGAAAATGGCGGACCGGAACGCCATATGGGGGCCATACAACATTGTGGGAGGGGGGGGAGTAGTGTGGCGGAAGCAGTGCAAGTAGTAGAGGAAGAGGGTGTAACAAACAATAGCCAGACTACAGGAGAGCAAAGCCCACGCACGCGTATTGTAGAATTATTGAAAGACAAAGATGTTACTGTAAAACTCTTAGGTAAGTTTAAAGACCTATTTGGCGTGGGATTTAATGATTTGGTAAGACAGTTTAAAAGTGATAAATCAACATGTACTGATTGGGTATATAGTGTATTTGGTGTTAATCCATCAATAGCAGAAGGCTTTCATATGTTATTAAAAGAACAAACATTATACCTACATACCCAATGGGTTACATGCCGATGGGGGATGGTGTTGCTTGCATTGTGTAGATATAAGGTTGCCAAAAATCGCAGTACAGTCGGTAGACAGCTTGCACAAATGTTAAATGTACCTGTGCAACAAATATTGATACAGCCTCCAAAATTACAAAGCGCTCCAGCAGCACTGTTTTGGTTTAGAGCCGGTATGGGAAATGGTAGTGAAGTATCGGGCACAACACCGGAATGGATAAGTAGACAGACAGTGTTAGAACACAGTTTTGCAGACACACAGTTTAGTTTAACAAATATGGTGCAATGGGCATATGATAATGGATATACAGAAGAATGTGACATAGCTTATTATTATGCACAACTAGGAGACACGGATGCAAATGCCGCTGCATTTTTAAAAAGTAATATGCAAGCTAGGTATGTTAGAGATTGTGCATGTATGTGTAAACATTATAAGCTAGCAGAAATGAAAAAAATGTCTATGGCAGAGTGGATTAAGCATAGAGGAGAGAAGTGTAATGATGGGGACTGGAAACCTATAATACGATTTTTAAGATATCAGCATATAGATATTATTACATTTTTAGCATCCTTAAAAAAATGGCTGCATGGCATACCAAAAAAAAATTGTATTTGCATAATAGGGCCGCCCGACACAGGTAAATCAAGTTTTGGAATGAGTTTAATGAAGTTCCTAGGCGGCACTATGTTATCATATGTAAATTCAAGTAGCCATTTTTGGTTACAGTCCTTAGTAGATGCAAAGGCAGCCATGTTAGATGATGTTACAGCAGCATGTTGGAATTACATGGATATGCATATGCGAAATTTATTAGACGGCAATCTTACAAGTATTGATAGAAAGCATAAAGCATTAGCAGTTATAAAGTGTCCTCCGTTATTACTAACATCCAACATGGATATTACTACAGATGATAAGTATAAGTATTTAAAAAGTAGAATTACAACATTTACATTTCCTAATGCATTTCCATTTGATACTAATGGCAATGCAATTTATGAGTTCAATGATGAAAATTGGAACTCCTTTTTTAAAAGGTTGGCATCAAGCCTAGAACTGGAAACTGCAGAGGACGAAAATGGAGACACTAGCCAGGCGTCTAGATATGTGCCAGGAACAGTTGTTAGAACTGTATGAAAAAGACAGCAGAGATCTGCAGGACCATGTGTTGCATTGGAAATGTATACGTTATGAGTGTGCATTATATTATAAAGCAAGAGAAATGGGCATCAAACATCTAGGCCACCAGGTGGTGCCAAAGCTAGAAGTATCACGAGCAAAAGCACATGTGGCAATTGAAATGCAATTATCATTAGAATCATTATTACAAACTGAATATAGCATAGAGCCGTGGACACTACAGGACACATGTCAAGAACTATGGCACACGGAACCAAAAAAATGTTTTAAAAAACGGGGACAGACAGTAGAAGTGAGATTTGACTGCAACCCTGAAAATACAATGCAATACACCTCATGGTCAGAAATATATGTACCCGTGAATGACACGTGGGTAAAAGTACATGGCCATGTGGACTATAAAGGCCTTTCATATACTGTGTGTGGGCAAAAAACTTATTATGTAGATTTTATTAAGGAGGCACAAACGTATGGGGATACTGGACAATGGAACGTTGTTGTGGGCTCAAACGTCATATCTTCTCCTGCATCTGTATCTAGTACTGTCACCGAAGTATCCTCTGTTGCGTCTACTGAACTCGACTCCAGAACAGCGACCACCGTCCCAGATTCCACGTGCACCCAAAAAGACTACGAGGAGCAAGCGCCGCCTAGGAAGCGAGTGCGATTCGAGCCCCACACAACCCAGATCCCCTGTACCTTGGCCAGAACTGTTGGAGGAGAGCCATTGGACAGTGGAGACCCACGAATCATCCCTAAGCATTCGAACCACAACCAAGGAGGGCACAGTGGTGGAAGTAACGCTACGCCTATAGTTCAATTACAAGGTGATGCTAACTCACTAAAATGTTTTAGATACAGATTGGGCAAATATAAATATTTGTATGTGGATGTGTCATCTACATGGCGATGGACAACAGAATCTAATAAACAAAACAGTGCATTAATTACATTAACATATGCTAGTGTACAACAAAGGGAGGCGTTTTTAGCTAATGTAAAAATTCCCACAACAATTAAACATTGTTTAGGATTTTTAACAATTATGTAAATAGTACCCTATTAATTTGTAAAACTACCTTGTATATTGATTGTATAGTGGAACTGTTACTGTGACGTTAAGGGTGTTGTAACACTCTAACCACACAACCAGCCAACCTGCTGCTATTTTTGTTAATAGATGTAAAGCTTGGCATTTTATTAGTTAATGTGCTTGTTTGCATAATTGCTGTATTGGTGTGCGCATGGTTTGCGGACAACCTGGTGTGGGCTTCTGTGCTTGCTTCAGCTTCTATACTTTACTTCTTATCTTGGTCTGCACTTATATCACTTACTAACGTGTTTATATTAATACTTGTAGTGTGGTTTGTACCGGCCCTTTTATTACATTTACATATTACATTGCAAATTGAAACACAGCAATTGTAAATACATTGGTGTGCATATATTTGTACCTAGCATTATGTTAACTTGTCAATTTGATGATGGTGATTCATGGATGTTGTTATGGCTACTTGTAACATTTATAACTGTATTGTTGATGTTATTAGTGTTTCATTATAGAACAGTTAAGCTGCTGCCCTCCAGCAAATAAACAAATTAATTACTGTGTTTATATAAACATGGTTTCTTATACACTTAAAAGGCGCAAGCGCGCGTCTGCTACACAATTATATCAAACATGCAAGGCTGCAGGCACTTGTCCCTCTGATGTAATTAACAAGGTTGAGCATACTACAATAGCAGATCAAATATTAAAATGGGCTAGCATGGGTGTGTATTTTGGAGGGTTAGGCATTGGAACTGGCTCTGGAAGTGGAGGAAGAACAGGCTATGTACCTATTCCAACAGGTCGCACAGGTACTGTTCCTAAAGTTAGTGCAGAGCCTGGGGTAGTGTCACGTCCTCCAGTTGTAATAGAACCTGTTGCTCCAACCGATCCTTCCATTGTTTCATTAATTGAAGAATCAAGTATAATTGAGTCCGGGGCTCCAATCACAACTATACCGTCCCATGGTGGTTTTGAGGTAACATCATCTGGGTCAGATGTCCCAGCCATTTTAGATGTGTCACCAACAACATCTGTGCATGTTACCACCACTACACATTTAAATCCTGCATTTACTGA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| 47,583
|
AF419318.1
|
human papillomavirus 91
|
Terai,M., Burk,R.D.
|
Albert Einstein College of Medicine, Microbiology & Immunology
|
USA
|
2002-07-31
| null |
Alphapapillomavirus 8
|
Alphapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,966
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human papillomavirus type 91, complete genome
|
ATGAGTAAGTACTGTGTTAGGCACACCTGCAGACCGAAACCGGTCGCTGCACACCTTACATTCTTTGTGGTTATTAGTAACAATTATTATGCTTGTACTAAAGGGAGTAACCGAAAACGGTCCGACCGAAAGCGGTACATATATAAACCACCCAAAAAACATAGCTTGTGGGGCATAATGTCTGCACGTAGCTGCTCCCAAAACGCTAAGACCATATTTGAGTTGTGTGACCAGTGTAACATAACTCTGCCTACTCTGCAAATTAGTTGTATATTTTGCAAGAAGTGGTTGACAACCACGGAAGTGTTGTCGTTTGCATTTAGGGATTTAAAGGTTGTGTGGCGCGACAGTTATCCGTTTGCAGCGTGTTTGGCCTGCTTAAAATTTTATGGTAAAATAAGCCAATATAGGCATTTTAAGTACGCGGCATTAGCAGTAACAGTAGAGGAAGAAACACAACAAACTGTATTCGAGTTGTGCATTCGCTGTTGTAAGTGCCACAAGCCATTGTCGCCTATAGAAAAGGTGCAGCACATTGTGCAAAAAGCCCACTTTTTTTACATAAGTAACGCGTGGAAGGGATATTGCCTACACTGCTGGAAGTCATGTATGGAAAAGAGCCGACGCTCAGAGACTATGTGCTAACCTTGCAACCAGAACCTAGAAGTTTAACCTGTGACGAGCAATTAGACAGCTCAGACTCAGAGGATGAGCGTGAGCAATCCACGCAACAGGACCAGCAAGTGGACCTACAAGTTTACAAAGTTGTAACCGAGTGCACCTCTTGTTATTGTTCAATTCGTCTTGTTGTGAAGTGCTCAAGCAGTGACATCAAGACGCTGGAGGAGCTGCTGTTGGGGACATTACAAATTGTGTGTCCCTTGTGCACTACAGCTGTGTGACTGCAATGGCTGATAAACAAGGTACAGAGGATGAGGGGTTGGGATGTTCAGGCTGGTTTATAGTAGAGGCCACAGTAGACAAAACCACGGAAAATGATATATCAGAAGATGAAATTGAGGAGGAAGAGGATAGTGGGTTTGACATGGTAGATTTTATTAATAATACATTAGAGGACAGCTGTGCAGAACAAAGCTGTGCGCAGGCCCTGTTGAATAAACAGCAAGCGGATGCTGATGCTGCTATAGTACAGGAGCTAAAACGAAAGTATATTAGTCCATATGTAAGTCCTATACAGTGTTTACAGGAGTCTGTGGACAGGGACCTAAGTCCTAGGTTGCATGCCATAAAGATAGGAGGCGGACAAAAGGCAAAAAGGAGACTGTTTGAACCGACAGAGCAGCGGCATAGTAACTATGGCAATTGTGAAGTGGAAGCAACTGAGACACAGGTAGATGTGGAAAATGGCGGACCGGAACGCCATATGGGGGCCATACAACATTGTGGGAGGGGGGGGAGTAGTGTGGCGGAAGCAGTGCAAGTAGTAGAGGAAGAGGGTGTAACAAACAATAGCCAGACTACAGGAGAGCAAAGCCCACGCACGCGTATTGTAGAATTATTTAAAGACAAAGATGTTACTGTGAAACTCTTAGGTAAGTTTAAAGACTTATTTGGCGTGGGATTTAATGATTTGGTAAGACAGTTTAAAAGTGATAAATCAACATGTACTGATTGGGTATATAGTGTATTTGGTGTTAATCCATCAATAGCAGAAGGATTCCATATGTTATTAAAAGAACAAACATTATACCTACATACCCAATGGGTTACATGCCGATGGGGGATGGTGTTGCTTGCATTGTGTAGATATAAGGTTGCCAAAAATCGCAGTACAGTCGGTAGACAGCTTGCACAAATGTTAAATGTACCTGTGCAACAAATATTGATACAGCCTCCAAAATTACAAAGCGCTCCAGCAGCACTGTTTTGGTTTAGAGCCGGTATGGGAAATGGTAGTGAAGTATCGGGCACAACACCGGAATGGATAAGTAGACAGACAGTGTTAGAACACAGTTTTGCAGACACACAGTTTAGTTTAACAAATATGGTGCAATGGGCATATGATAATGGATATACAGAAGAATGTGACATAGCTTATTATTATGCACAACTAGGAGACACGGATGCAAATGCCGCTGCATTTTTAAAAAGTAATATGCAAGCTAGGTATGTTAGAGATTGTGCATGTATGTGCAAACATTATAAGCTAGCAGAAATGAAAAAAATGTCTATGGCAGAGTGGATTAAGCATAGAGGAGAGAAGTGTAATGATGGGGACTGGAAACCTATAATACGATTTTTAAGATATCAGCATATAGATATTATTACATTTTTAGCAGCCTTAAAAAAATGGCTGCATGGCATACCAAAAAAAAATTGTATTTGCATAATAGGGCCGCCCGACACAGGTAAATCAAGTTTTGGAATGAGTTTAATGAAGTTCCTAGGCGGCACTATGTTATCATATGTAAATTCAAGTAGCCATTTTTGGTTACAGTCCTTAGTAGATGCAAAGGCAGCCATGTTAGATGATGTTACAGCAGCATGTTGGAATTACATGGATATGCATATGCGAAATTTATTAGACGGCAATCTTACAAGTATTGATAGAAAGCATAAAGCATTAGCAGTTATAAAGTGTCCTCCGTTATTACTAACATCCAACATGGATATTAATACAGATGATAAGTATAAGTATTTAAAAAGTAGAATTACAACATTTACATTTCCTAATGCATTTCCATTTGATACTAATGGCAATGCAATTTATGAGTTCAATGATGAAAATTGGAACCCCTTTTTTAAAAGGTTGGCATCAAGTCTAGAACTGGAAACTGCAGAGGACGAAAATGGAGACACTAGCCAGGCGTCTAGATATGTGCCAGGAACAGTTGTTAGAACTGTATGAAAAAGACAGCAGAGATCTGCAGGACCATGTGTTGCATTGGAAATGTATACGTTATGAGTGTGCATTATATTATAAAGCAAGAGAAATGGGCATCAAACATCTAGGCCACCAGGTGGTGCCAAAGCTAGAAGTATCACGAGCAAAAGCACATGTGGCAATTGAAATGCAATTATCATTAGAATCATTATTACAAACTGAATATAGCATAGAGCCGTGGACACTACAGGACACATGTCAAGAACTATGGCACACGGAACCAAAAAAATGTTTTAAAAAACGGGGACAGACAGTAGAAGTGAGATTTGACTGCAACCCTGAAAATACAATGCAATACACCTTATGGTCAGAAATATATGTACCCGTGAATGACACGTGGGTAAAAGTACATGGCCATGTGGACTATAAAGGCCTTTCATATACTGTGTGTGGGCAAAAAACATATTATGTAGATTTTATTAAGGAGGCACAAACGTATGGGGATACTGGACAATGGAACGTTGTTGTGGGCTCAAACGTCATATCTTCTCCTGCATCTGTATCTAGTACTGTCACCGAAGTATCCTCTGTTGCGTCTACTGAACCCGACTCCAGAACAGCGACCACCGTCCCAGATTCCACGTGCACCCAAAAAGACTACGAGGAGCAAGCGCCGCCTAGAAAGCGAGTGCGATTCGAGCCCCACACAACCCAGATCCCCTGTACCTTGGCCAGAACTGTTGGAGGAGAGCCATTGGACAGTAGAGACCCACGAATCATCCCTAAGCATTCGAACCACAACCAAGGAGGGCACAGTGGTGGAAGTAACGCTACGCCTATAGTTCAATTACAAGGTGATGCTAACTCACTAAAATGTTTTAGATACAGATTGGGCAAATATAAATATTTGTATGTTGATGTGTCATCTACATGGCGATGGACAACAGAATCTAATAAACAAAACAGTGCATTAATTACATTAACATATGCTAGTGTACAACAAAGGGAGGCGTTTTTAGCTAATGTAAAAATTCCCACAACAATTAAACATTGTTTAGGATTTTTAACAATTATGTAAATAGTACCCTATGAATTTGTAAAACTACCTTGTATATTGCTTGTATAGTGGAACTGTTACTGTGACGTTAAGGGTGTTGTAACACTCTAACCACACAACCAGCCAACCTGCTGCTATTTTTGTTAATAGATGTAAAGCTTGGCATTTTATTAGTTAATGTGCTTGTTTGCATAATTGCTGTATTGGTGTGCGCATGGTTTGCGGACAACCTGGTGTGGGCTTCTGTGCTTGCTTCAGCTTCTATACTTTACTTTTTATCTTGGTCTGCACTTATATCACTTACTAACGTGTTTATATTAATACTTGTAGTGTGGTTTGTACCGGCCCTTTTATTACATTTACATATTACATATTACATTGCAAATTGAAACACAGCAATTGTAAATACATTGGTGTGCATATATTTGTACCTAGCATTATGTTAACTTGTCAATTTGATGATGGTGATTCATGGATGTTGTTATGGCTACTTGTAACATTTATAACTGTATTGTTGATGTTATTAGTGTTTCATTATAGGACAGTTAAGCTGCTGCCCTCCAGCAAATAAACAAATTAATTACTGTGTTTATATAAACATGGTTTCTTATACACTTAAAAGGCGCAAGCGCGCGTCTGCTACACAATTATATCAAACATGCAAGGCTGCAGGCACTTGTCCCTCTGATGTAATTAACAAGGTTGAGCATACTACAATAGCAGATCAAATATTAAAATGGGCTAGCATGGGTGTGTATTTTGGAGGGTTAGGCATTGGAACTGGCTCTGGAAGTGGAGGAAGAACAGGCTATGTACCTATTCCAACAGGTCGCACAGGTACTGTTCCTAAAGTTAGTGCAGAGCCTGGGGTAGTGTCACGTCCTCCAGTTGTAATAGAACCTGTGGCTCCAACCGATCCTTCCATTGTTTCATTAATTGAAGAATCAAGTATAATTGAGTCCGGGGCTCCAATCACAACTATACCATCCCATGGTGGTTTTGAGGTAACATCATCTGGGTCAGATGTCCCAGCCATTTTAGATGTGTCACCAACAACATCTGTGCATGTTACCACCACTACACATTTAAATCCTGCAT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| 110,703
|
NC_018668.1
|
hunnivirus A1
|
Reuter,G., Pankovics,P., Knowles,N.J., Boros,A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2012-10-02
| null |
Hunnivirus A
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,583
|
RefSeq
| 1
|
Hungary
|
Hungary
|
Bos taurus
|
feces
|
2008-02-29
| null |
PRJNA485481
|
Bovine hungarovirus 1 strain BHUV1/2008/HUN, complete genome
|
TCGCCCCTCCTTTCCCCCCTTATTTTCCCTTTTCCCTCTCTCCCTCCCTTTGTAACTTAACGTTTGGCAAGAACCCTCACCTGTCAATTGGGACCACCACTTTCAGTGACCCCATGCGAAGTAGTGAGAGAGAATAAGCTTTCTTACCCTTCATTTGTGAACCCTTCAGTCGAAGCCGCTTGGAATAAGATAGGAGGAAAAGTTCATTCTAAATGGAGTGAAACATGTACTTCAGAATTTCTAGCACGCGCTGGGCTTTCTTGCGTGTGACGGCACTGTCTTGCCGGAGCTCTCCACACTGACACCCCACGCTTGTGGACCTTGGTGGCAGATGACAACACTGCAGCTGGAATTGAGTGTCTGGTACACTCTGTGTAACAGTGAAAACAATGTGATCACTTCGGTGAGCTAGTAGCCTGTGGACCAACAACTGGTAACAGTTGCCTCAGGGGCCAAAAGCCACGGTGTTTACAGCACCCTACTGGTTTGATTGGAGCAATCCAAGATGTCACAGAGTTAGTAATTGCCAAGCAGTCCGTACTGGTATCTTGACATACCGTGCAGTTTTGGATAGTGAAGGATGCCCTGACGGTACCCATAGGTAACAAGTGACACTATGGATCTAAGCAGGGGCTCACTCTACGCTGCTTTACAGCTGGCTGTGAGTTAAAAAACGTCTAGCTATCCACAACCTAGGGGACTAGGTTTTCCTTTTATTTAGATTACAATTATATGGTGACAATTGTTGTTGTTTGGTATAGCTTCATTGTTGCTAAGAAGGTTTTTCACTGCTTTCAGAGAGCTTTTCACAACGGATCTTTTGTTTACCAAACAAATACAACAGCAGGCAATATGGAGATTCCAGCAATGGATTTTGATTTGCCTAGTGACATCTGGAATGAGGAGGCCGACTTTGAATTTGATGTTGAGTCGACTATGCTTTTGGATGGTCAGACGCCAGAAGACTTTTTCTTTGAGTTTCAGGGACCTGGACAAAGTAAGCAGGAATCTGGCAACACAAACAATTCAGGAAACCATGGAGTAATAAATTACAATTTTTACAACCAGCAATGGCAAAATTCAGTTGATTTGGAGCATGCCATGGAAAACAATGCCACAGCCTACGGAGGTGCTGGTGGTGGTGATTCTACCCACACTACTAACCGCACTGAAAACCTGTTGTTGTCTGGACTCCAGGCAGTTTCTAACATCCTGCCGTTGCTGGCAGACGGCCTTACAGAAGACTTTGAGAATTCAGATAGAGTGGGTAAGACCCAGGCGGGTGCTACAACACTGGTTACACAACATCAGGTTGGATGCATGACTTACCCAGGTCGCAAGTCTGGACCATCACCTTCAAGTGCCGCTGACGAGCCCACCACTGCTGGGCCGTCTGTTGATAGATTTATAACATTACCAGTTGGTAATTGGACACAGACACAGGCAGTCTACTCTGGATGGGCTTTGCCACTGCCTTGGGTACCCTTGACTAGAAACACTCCTTTTGGTGCCTTGGGCCGTAGGCATTTTCTGCTTAATTGTGGGTGGCACATCCAAGTGCAAGTGAATTCAACACGCTTTCATGGTGGTGCTTTGGGTGTTTTTATGGTGCCACAGTTTGTTTACACTAGCCAAACTGATTTGACTGGACCAAAACCCTTGATGGCAACAGATTATCCACTTTTCAACCAGCAACAGTTGTTTCTGTTTCCACACCAAATCTTGAATCCTCGGACTAATTCTTCAGTAGACATACAAGTTCCATATGCTAATTGCACCCCTGGCTGTGATCCAACTCAGCAGGCCCCTTGGACCCTGTTGATTGTGGTACTGTCTCCCTTATCATATGCCAGTGGAGCAACGACCTCATTGGAGGTGGTTGCTTCCATAAGGCCACTTCAGGCACAGTTCCATGGAATAAGGCAGACAAATTCTGAGTTTGAAGGACTGCCAAAGAACCGCAATGAAAGTTCTGCATTTGCCTTTTGTTCTACACAACCCCACTCTGCTGAGCCAGACTATGGTGCCATGCACCGTTCGTCACCATCTTTTCTGCCAGCAGAGATAACGGATTTTCTGCAAATATCCCAGATTCCAACTTTGACCTCAATTCGTGCAGTTTCTTTTCAGCAAGCAGTACCAAAGCAAGCGCTGCTGACTATGAATGTGTCTCTAACAGCAAATGACTTGTTGAACACTAGCTTGGAAACAGTGTCTCGGGGTTTTGCACAGTACCGTGGCAGTATTCTGATTAGGATGTTGTACACTGGAAATCAGATGCAAAATGTGAGGTATGTGGCGGCATACACGCCACCCGGCGCACTGCCACCAGCTGACCGGCGGCAAACTATGGTTGGAATCTATACAATTTATGATACTGGTTTGAATTCTGGCAGTGATTTTGTGATCCCCTTCATATCAACAACAGATTACAGGTACTGCAATGCTGTGGATGGTCTCGAAGTTGGTAGTGGTGGCTATTTTACAATTTGGCAATTGACCACACTGGCTGTACCACCTGGTTCCCCAACAACTGCTGAACTTTTGATTTTTGCTGCTTCTGGAAAAGACTTTGAATGGCGGTGCGTGGCCAGTCCATATCTTGCACTTCAGGGTGAGGACACCCAGATAACACCTGCCGAAACTGGGCAGACTCCTGAGGTTACAGCTGAAAATTCCAACCAGAATGTGGTGCCAATTCCATACGCACCTCAGAGGATTTCACATAGCGCTGTGCGCTTTTGGTATGACAGATTTTTCTTAGCTGACAGCCTTCAGGTCAACTATAAGAGTAGCGGGTCATACCTGCATGTGCTCAGGTGGCCTGACATTTTTGAGAAAATCCCAGAAGTGCGCTGGTTTATGCATGCCACCTACTGTAGATTTGAACTGGAAATTGCAATTCGACCTTGGAATCAGGATGTGGTTGATTATGAGATGGTGTATTGGCCACCTGGTTCATTGTTACCAACAGACACTGTAACATGGGTTTCAACAGCAGATAGACGCATGCGCCAGTCGGGCCCACAGCCTCGCTGGACCTGGAATACTGGAACCACCCCTTGTTTTACAGCTAGGATACCATTTACTGCACCTTCTTCAGTTCTGACTCAGACCTACACTGGTTGGAGCAATACAAGCCATGCTGAAGGGACTTTCGGCAACACTCCGGGCCTGAATGTCCTAGGCGCTCTGACCCTCACTCAGGGCTCTAAGAATGGTAGTGGTACAGTGATTACTTACATTTCTTACCGGTTGGTGGATATTCAGATGTGGTGCCCACGCCCTGGGCTCTATGTTGCCCCACCAATCCAACAGTCTTCTGGTGCTACAAATTTTTCTCTCTTGAGGCTTGCAGGTGATGTTGAATTGAATCCAGGACCTCCGATTCTTAGTGTTGCTAGGAAATTGGACCCAGATTTGGATCAGATGTTTAAGAAATTTGAAATTATGCAGGAAAGTTTTAAGAAATTGACTGATTGTGCCCAGTGGATAAATGTATTTTCTGATATTGATAAAAGGAAATGGTTTAAAAGGATAATGAAATTTCTTTCTTATGCTGTGATTCTTTCCCGTGCCCGGCATGATCCCCTGCTTGCTGCAGCTACTGCTTTTCTTCTTTCAGGTGATTGGCTTTCACGGCTGTGTGCCAAAATAGTTAAATGGCTGCCGAGCCACTGCAGGACACAACCACCACCTTTCCCCTCTTCAGATGAAAACCCAGATGATGGAAGTAAAGATATTAAGAAAGAAAGTGCCTCTAGTGGCTTCAGCCTGCTAGTTGTCTTTAAAAATTCTTCTAAACCTCTTTCAGTGAATTCAGGTGACATCAAACCTAAAACAGATGATGTGCCATTGATTGATTTGACCAACATGGGGCCAAAGATTGACTACCCCGGCTCCCATAATCCATTTGGAGAATCACTGGCCGACAAGCTGGTTCAGGAAAATGAGAGATTAGTTGCTGAAGCGCAGGCTGAGTATGCACGCCGTAGTGCTAATCCATTTGAAGACACGGACGTTGAACCAGAGAAATTGTTTGATAAATTTAAAAGATTCTTTTCCAAAACACCTAAGATGGAAGGCCCAATTATGTCAGAAATAAATCAGGTGCTGGTCCTCTGCCGCAATGCACAGTGGCTAGCCCAGCAACTTCAAAAGATCCTGGGCTGGCTTGGAGTTTGGAAGCAACAAGAAGAAGATGCCTCCGAGGAACGCTTTAGGGAAAGAATGCAAGTGTACCCTCAGATGATGGAACAGTATGAACAGTACAAGAATTCTCCTAGACACCAGAAATGGAATGACTGCAAGACATGGTTTGATGAGATGCGGAAACTTGCAGTATTGCATGATCCTAAATTAGTGAATTTGTTTCCAAACATGGCAAGCATACCACACGAGAACTCTAGACAAGAGCCAATTTTGATTGTGCTAAGAGGCAAACCAGGCCAGGGCAAATCTGTTGCTGCAAGTATGCTGGCACAGATGTTTGCCCATTCTCTTTCAGGTAAACCAGATTATTACAGTTATAATTCCTCAACAAATTATTTCGATGGGTACCAACAGCAGCCTGTCGTTTTGATTGACGATCTTGGGCAAGACCCAGCAGGGACTGACTTTTCAGTCTTCTGCCAGATGATTTCAACCACACCCTTTCTACCAAACATGGCTAGTTTGAATGATAAAGGGATCAAATTTAAGAGTGATGTGATCATTGCCACCACTAATCTTCCAGAGTTTAAACCAGTAACAATTGCAGATCCTGGAGCACTTCAGAGAAGGATAAATTTTGATTTTGAAGTTGAAGCAGGACAATCGTATAAAACAAAAGCTGGAACACTTGATTTGGCAAAAGCATTGGAACCCACAGGATGTTCAGCACCCCTCCATATGGTGAAAGCTGACATACATTTGTTCTCTAGTGCGTGCTTGAAGTTTAAAGACCGCATGGCTAGATGCGAGTGTAGTTTGGTTGGAGTCTATGATAGGGTGATGAACTC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| 7,228
|
OP245252.1
|
hunnivirus A1
|
Yu,S.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Lab of Prevention and Control of Swine Diseases
|
China
|
2023-03-01
| null |
Hunnivirus A
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,547
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Hunnivirus A1 strain I-HG-JC/61, complete genome
|
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| 17,783
|
OP245253.1
|
hunnivirus A1
|
Yu,S.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Lab of Prevention and Control of Swine Diseases
|
China
|
2023-03-01
| null |
Hunnivirus A
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,533
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Hunnivirus A1 strain I-HH-XA/9, complete genome
|
CTCCCTTTTCTCCCTCCCTTTGCAACTTGATGCTTGACAAGAACCCTCACCTGTCAATTGGGACCACCACTTTCAGTGACCCCATGCGAAGTAGTGAGAGAGAACAAGCTTTCTTACCCTTCATTTGTGGACCCTTCAGTCGAAGCCGCTTGGAATAAGATAGGAGGAAAAGTTCATTCTAAATGGAGTGAAACATGTACACTAAAACTTCTAGCACGTGCTGGACTTTCCAACATGTGACGGCACTGTCTTGCCGGAACTCTTTACACTGACGCCCCACGCTTGTGGACCTTGGCGGCAGATGACAACACTGCAGCTGGAATTGAGTGTCTGGTACACTCTGTGTAACAGTGAAAACAATGTGATCACTTCGGTGGGCTAGTAGCCTGTGGACTAACAACTGGTGACAGTTGCCTCAGGGGCCAAAAGCCACGGTGTTAGCAGCACCCTACTAGTTTGATTGGAGCAATCCAAGATGTTACAGAGTTAGTAACTGCCAAACAGCTTGTATTGGTATCTTGACATACCGTGCAGTTCTGGGTAGTAAAGGATGCCCTGACGGTACCCGTAGGTAACAAGTGACACTATGGATCTAAGCAGGGGCTCACTCTATGTTGCTTTACAACTAGCTGTGAGTTAAAAAACGTCTAGCTATCCACAACCTAGGGGACTAGGTTTTCCTTTTATTTGAACTACTACTTTATGGTGACAGTTGTTGTTGTTTGGTTTAGCTTCATCATTGTTAAAAGAACTTTCTGCTGCATTCAGAGGACTTTTTACAACGGATTTTCTATTCGCCAAGCAGGTTCAACAACAGTCAATATGGAGATTCCAACAATGGATTTTGATTTGCCTGGTGATATCTGGAATGAGGAGGCCGACTTTGAACTTGATGTTGAGTCGACTATGCTTTTGGATGGTCAGACGCCAGAGGAATTTTTCTTTGAGTTCCAGGGACCTGGACAGAGCAAGCAAGAGTCTGGCAACACAAATAATTCAGGAAACCATGGAGTTATAAATTACAACTTTTACAACCAACAATGGCAGAACTCAGTTGACTTGGAACATGCCATGGAGAACAACGCTACAGCTTACGGTGGTGCAGGTGGTGGTGATTCAACCCACACTACTAACCGTACTGAAAACTTGTTGCTCTCTGGCTTGCAGGCTGCAGCGAACATTTTGCCTCTCTTGGCTGATGGCCTGACAGAGGATTTTGAAAATTCAGATCGGGTTGGTAAGACCCAAGCTGGAGCCACCACACTTGTGACACAACACCAGGTGGGTTGTATGACTTACCCTGGCCGCAAAGCTGGGCCATCTCCCTCCAGTGCAGCTGATGAGCCAACAAAAGCCGGCCCTTCAGTGGACCGGTTTATAACTATTCCTGTTGGACACTGGACCAATACAACAGCCGTTTATTCTGGCTGGGCTCTGCCCCTCCCCTGGACACCACTGTCGAGGAACACCCCATTTGGTGCTTTGGCCCGCCGCCACTTTTTGTTAACTTGTGGCTGGCATGTTCAGGTGCAGGTCAACAGTACCAGGTTTCATGGTGGTGCCCTTGGAGTGTTTATGGTGCCGCAATTTGTGTTTCAAAATCAGACCAACTTGGAAGTCCCACAGTTGCTTAGGGCTGAGGACTATCCCCTTTTTAATCAGCAGCAGTTGTTTTTGTTCCCACATCAGATACTGAACCCCCGGACAAATTCTTCAGTTGACATTCAGGTGCCTTATGCAAATTGCACCCCCGGGTGCGACCCTACACAACAGGCACCCTGGACGCTATTAATTGTGGTAATTTCACCTCTCTCTTATGCCAGTGGTGCCACTACTTCTCTTGAGATTGTGGCTTCAATCAGACCTCTTGAAACAGAATTTCATGGCATAAGACAGACCAATGCACAATTTGAAGGCCTCCCCAAGAACCGGAACGAGAGTGCTTCGTATGCCTTTTGTTCTACCCAACCACACACTGCAGAACCAGACTACGGTGCCATGCACCGTTCATCCCCCGCTTTTCTTCCAGCAGAAGTAAAGGATTTTTTACAGATATCACAGGTGCCAACATTGACTTCAATTAGAGCAATCTCATTTCAGCAGTCCGTTCCGGACAATGCACTGCTACAAATGAATGTGTCACTGACAGCTAATGATTTGTTGAACACCAGTCTTGAAACAGTGTCCCGAGGATTTGCACAGTATCGCGGGAGCATTTTGATCCGAATGCTGTATACTGGAAATCAAATGCAGAATGTGAGATTTGTGGCTGCGTATACACCCCCTGGGGCAGAACCACCAGCCACGTTGCAAGAAGCTATGGATGGCATCTACACAATTTATGATACTGGACTGAATGCAGGCAATGATTTTGTGATACCATTCATTTCAACAACAGACTACCGCTATTGTAATGCCACAGAAGGCCTAGAAGTAGGCAGCGGTGGCTATTTTACAATTTGGCAGCTAACTACTCTTGCTGTGCCACCAGGCTCACCAACAACCGCTGAACTTTTAATTTTTGCTGCTAGCGGTAAAGATTTTGAGTGGCGGTGTGTGGCCAGCCCCTACCTTGCATTTGAAGGTGAAGGCACCCAAATCACACCTGCAGAAACAGGACAGACTCCAGAAGTGACTGCTAGAAACTCAAACCAAGCTGTTGTGGACATACCTTATGCTTCACGCCGCATTTCGCACAGTGCAGTACGGTTTTGGTTTGACAGGTTTTTTCTGGCAGATACTTTGCAGGTAAATTACAAAGGAGACAGAGCTTGTATTCATGAACTTAAATGGCCAGACATAATGCATAGAATACCAGAAATTCAATGGTTTACACATGCTACTTATATTCGGTTTGAACTTGAAATTGCACTAAGACCCTGGAACCAAGATGAGGTTGATTTTGAAATGGTTTATTGGCCACCAGGTTCATATGTACCAACTGGAAATGTGGCTTGGAACTCCAGTGCGGCAGCATGCATGCGCCTGGCTGGTCCACAACCCCGTTGGACTTGGAACACCCGTACCACACCTTGCTTTACTACTAGAATTCCTTTCACTTCACCCGCTTCGGTGCTAACCCAGACCTATACTGGTTGGAGCAGCACAGTTCACAATGCTGATACTTTTGGCAAAACCCCAGGCTTGAACACCTTGGGCACATTGACACTGACACAGGGCTCAAAGAATGGGAGTGGTTCTGTTACCACTTACATTTCATACAGATTTGTTGATATGCAATTGTGGTGCCCTAGACCGGGGCAGTATTTGACACCACCAAATCCACCCAACCAAGGGGCTACAAATTTTTCACTGCTAAAACTTGCAGGAGATGTTGAAATGAACCCAGGGCCCCCAATTCTCAGTGTCGCCAGAAAACTGGACCCAGATTTGGATCAGATGTTTAAAAAATTTGAGACAATGCAGGAAAGCTTTAAGAAGCTAATGGATTTTGCACAGTGGATTGATGTTTTTTCCAATATTGATAAAAGAAAGTGGTTTAAAAGGATAATGAAATTTCTTTCTTATGCAGTGATTCTTTCCCGCGCTCGGCATGATCCTTTGCTTGCTGCTGCTACAGCTTTTCTTCTTTCAGGCGATTGGCTTTCTCGGCTGTGTGTTAAGATTTGCAACTGGCTGCAAGGCCACTGCAGGACCCAGCCACCACCTTTTCCCTCCTCGGATGATAATCCAGATGACAAGGATAAGAACCCTAAAAAAGAAAGTACCTCCAGTAGCTTTAGTCTGCTGGATGTTTTTAAAAGCTCCTCTAAGCCTCTTTCAGTAAATTCAGGTGACATCAAGCCTACAACGGATGATGTGCCATTGATTGATTTGACTAACATGGGACCAAAAATTGACTATCCTGGTTCCCATAACCCATTTGGAGAGTCACTAGCTGACAAGCTAGTTCAAGAGAATGAAAAATTGGTTGCAGAAGCGCAAGCAGAGTATGCACGCCGCAGCGCCAACCCATTTGAAGATTCTGATGTGGAACCTGAAAAGCTATTTGACAAATTTAAAAGATTTTTTTCAAAGACACCTAAAATGGAAGGACCAGTACTTTCAGAGATAAACCAAGTCCTGGTTCTCTGTAGGAACGCACAGTGGCTTGCACAGCAAATTCAAAAGGTGCTTACTTGGCTTGGGATTTGGAAACAACAGGAAGAAGATGCCTCTGAGGAACGCTTTAGAGAAAGAATGCAAGTGTACCCCCAGATGATGGAACAGTACGAACAGTACAAGAACTCCCCCAGACATCAGAAATGGAATGACTGTAAGGCATGGTTTGATGAGATGCGTAAACTTGCAGTGCTACATGATCCCAAATTGGTTAATTTGTTCCCAAATATGGCAAGCATACCACATGAAAATTCTAGACAGGAACCAATTTTGATTGTGCTGAGAGGAAAACCAGGACAGGGTAAGTCTGTTGCGGCTAGTATGCTGGCACAGATGTTTGCCCACTCCCTTTCAGGGAAACCAGATTATTATAGTTATAATTCATCTACAAATTATTTTGATGGGTACCAACAACAACCAGTTGTTTTAATTGATGATCTTGGACAAGACCCAGCAGGCACAGATTTTTCAGTTTTTTGTCAGATGATTTCAACAACACCCTTTTTACCGAACATGGCTAGTTTGAATGACAAAGGGATTAAGTTTAAAAGTGATGTGATTATTGCTACAACTAACCTTCCAGAATTTAAACCAGTTACAATTGCAGATCCTGGAGCACTCCAAAGAAGGATAAATTTTGATTTTGAAGTTGAAGCAGGACAGTCATATAGGACTAAAACCGGAACACTTGATTTGGCAAAAGCATTGGAACCTACTGGATGCTCAGCACCTCTTCACATGGTCAAGGCCGACATTCACTTGTTTTCTAGCGCGTGCTTGAAATTTAAAGATCGCATGGCTAGATGCGAGTGCAGTTTGGTCGAGGTCTATGATAGAGTGATGAACTCACATAAAAGAAGGAATGATTTGGCAAATAA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| 17,784
|
OP245254.1
|
hunnivirus A1
|
Yu,S.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Lab of Prevention and Control of Swine Diseases
|
China
|
2023-03-01
| null |
Hunnivirus A
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Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,532
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Bos taurus
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feces
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2021
| null | null |
Hunnivirus A1 strain I-HRB-FY/57, complete genome
|
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| 17,785
|
OP245255.1
|
hunnivirus A1
|
Yu,S.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Lab of Prevention and Control of Swine Diseases
|
China
|
2023-03-01
| null |
Hunnivirus A
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,557
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Hunnivirus A1 strain I-QQ-XH/21, complete genome
|
CTTATTTTTACCTTCTCCCTCCCTTTGTGACTTGATGTTTGACAAGGACCCTCACCTGTCAATTGGGACCACCACTTTCAGTGACCCCATGCGAAGTAGTGAGAGAGAACAAGCTTTCTTACCCTTCATTTGTGAACCCTTCGGTCGAAGCCGCTTGGAATAAGATAGGAGGAAAAGTTCATTCTAAATGGAGTGAAACATGTACTTCAGAATTTCTAGCACGTGTTGGGCTTTCCAGCATGTGACGGCACTGTCTTGCCGGAACTTTTCACACTGCCACCCCACACTTGTGGACCTCGGTGACAGATGACAACACTGCAGCTGGAATTGGGTGTCTAATACACTCTGTGTAACAGCGAAAACAATGTAATCACTTCGGTGGGCTAGTAGCCTGTGGACTAACAACTGGTAACAGTTGCCTCAGGGGCCAAAAGCCACGGTGTTTGCAGCACCCTACTAGTTTGATTGGAGCAATCCAAGATGTTACAGAGTCAGTAACTGCTAAGCAGCTTGTATTGGTATCTCGACATACCGTGCAGTTTTGGGTAGTGAAGGATGCCCTGACGGTACCCGTAGGTAACAAGTGACACTATGGATCTAAGCAGGGGCTCGCTCTATGTTGCTTTACAACTAGCTGCGAGTTAAAAAACGTCTAGCTATCCACAACCTAGGGGACTAGGTTTTCCTTTTATTTTGACTATAATTATATGGTGACAATTGTTGTTGTTTGGTGCAGCTTCATTGTTGCTAAAAGAGCTTTTTACTGTGTCCAGAGAATTTTTCACAACGGACTTCTTATTCGCCAAGCAGACTCAACAACAGTCAATATGGAGATTTCAACAATGGATTTTGATTTGCCTAGTGATGTCTGGAATGAGGAAGCCGACTTTGAATTTGATGTTGAGTCGACTATGCTTTTGGATGGTCAGACGTCAGAGGAATTTTTCTTTGAGTTTCAGGGACCTGGACAAAGCAAGCAAGAGTCTGGCAACACAAATAATTCAGGAAACCATGGAGTAATAAATTATAATTTTTACAACCAACAATGGCAGAATTCTGTTGATCTGGAACATGCTATGGAAAATAATGCCACAGCCTATGGAGGCGCTGGTGGTGGTGATTCGACCCACACCACCAACCGCACAGAGAATTTGCTACTTTCTGGCCTACAAGCTGCCGCAAACATTTTGCCTCTTTTAGCTGATGGCCTAACAGAAGATTTTGAGAATTCAGACCGCGTTGGCAAAACTCAGGCTGGGGCCACCACGCTGGTCACACAACACCAGGTGGGTTGCATGACCTATCCTGGGCGCAAAGCTGGGCCATCTCCCTCTAGCGCCGCTGATGAGCCAACGACAGCTGGTCCCTCAGTGGACCGGTTCATAACCATTCCTGTTGGGCACTGGACTAACACAACAGCAGTTTATTCCGGCTGGGCCCTGCCACTCCCTTGGACACCATTGTCAAGGAACACACCGTTTGGTGCTTTGGCCCGCCGCCACTTCTTGCTAACTTGTGGTTGGCATGTGCAGGTACAGGTTAACAGCACCAGGTTCCATGGTGGAGCCTTAGGTGTGTTTATGGTACCACAATTTGTGTTTCAAAATCAGACCAACTTAGAAGTCCCACAATTGCTTAGAGCAGAGGATTATCCTCTTTTTAATCAGCAACAGCTGTTTTTGTTTCCACACCAGATTCTGAATCCTCGAACAAATTCCTCAGTTGATATCCAGGTGCCCTATGCAAATTGCACACCTGGTTGTGATCCCACACAGCAGGCACCATGGACACTGCTGATTGTAGTGATTTCACCTCTTTCTTATGCTAGTGGTGCCACTACTTCTCTTGAAATTGTGGCTTCAATTAGACCCCTTGAAACTGAATTCCACGGCATAAGGCAGACCAATGCACAATTTGAGGGTCTTCCAAAGAATCGAAATGAAAGTGCCTCATATGCTTTTTGTTCCACTCAGCCACACACTGCCGAGCCAGATTATGGTGCTATGCACCGTTCATCCCCCGCTTTTCTTCCTGCTGAGATAAAGGATTTCTTACAGGTCTCACAAGTGCCAACATTGACTTCAACCAGGGCAGTTTCATTCCAGCAGTCTGTTCCTGACAATGCGCTGCTGACGATGAACGTGTCACTAACTGCCAATGATCTGCTGAACACCAGCCTCGAAACGGTATCCCGAGGGTTTGCACAATACCGCGGGAGCATCCTGGTTCGGATGCTATACACCGGGAACCAAATGCAGAATGTGAGATTCGTGGCAGCATACACACCCCCTGGGGCCGAGCCACCGGCCACATTGCAAGAAGCCATGGATGGCATTTACACAATTTATGACACTGGATTGAATGCAGGCAATGATTTTGTGATACCATTTATTTCAACAACAGACTATCGCTACTGCAATGCCACTGAAGGTCTTGAAGTGGGTAGTGGTGGTTATTTCACAATTTGGCAGTTGACCACACTTGCTGTGCCACCTGGCTCACCAACAACCGCTGAGCTTTTGATTTTTGCCGCTAGTGGCAAAGATTTCGAGTGGCGTTGTGTTGCCAGCCCATATCTTGCACTTGAAGGCGAAGGCACTCAGATCACACCTGCTGAAACCGGACAGACACCAGAGGTGACAGCAAGAAATTCAAATCAGGCAGTTGTGGACATTCCTTATGCCTCGCGCCGCATTTCTCATAGTGCAGTGCGGTTTTGGTTTGACAGGTTTTTCCTAGCAGACACCTTGCAGGTTAACTACAAAGGAAGTGGAGCCTGCATTCATGAGCTTAAATGGCCGGACATGATGCACAGAATACCTGAAATTCAATGGTTTACACATGCAACCTACATCCGGTTTGAGCTTGAGATTGCTTTGAGACCTTGGAACCAGGATGAAGTTGATTTTGAGATGGTTTATTGGCCACCAGGCTCTTACATTCCAACTGGAGATGTGGCTTGGAACTCCACTGCTGCACGGTGCATGCGTTTAGCAGGGCCACAGCCTCGCTGGACGTGGAACACCCGCACCACTCCTTGCTTTACTACCAGAATCCCATTTACTTCACCTGCTTCTGTGTTAACACAGACCTATACTGGTTGGAGTAGCACAACACATAATGCAGACACTTTTGGGAAAGCCCCAGGGCTGAACACTCTAGGAACATTGACACTAACACAGGGATCAAAGAATGGAAGTGGTTCTGTTACCACCTACATTTCATACAGGTTTGTTGACATGCAGCTGTGGTGCCCAAGACCGGGACAATATTTGACACCACCAAGTCCTCCCAATCAGGGAGCCACAAACTTTTCACTGTTGAAATTGGCAGGTGATGTTGAAATGAACCCAGGGCCCCCAATTCTTAGTGTTGCTAGAAAGTTGGACCCAGATTTGGACCAAATGTTTAAAAAATTTGAGTCAATGCAGGAAAGCTTTAAAAAATTAATGGATTTTGCCCAGTGGATTGATGTGTTTTCTAACATTGATAAAAGGAAATGGTTTAGAAGAATAATGAAATTTCTCTCTTATGCTGTAATTCTTTCTCGTGCTCGCCACGATCCCTTGCTTGCTGCAGCTACTGCCTTTCTCCTCTCAGGTGATTGGCTCTCCCGGTTGTGTGCTAAGATCTGCAATTGGCTGCAGAGCCACTGTAGGACTCAGCCACCACCTTTTCCTTCTTCAGACGACAACCCAGATGACAAAAACAGTGATGCCAAGAAGGTTAATAACTCCAGCACCTTTAGCTTGTTGGATGTTTTTAAGAATCCTGCTAAGCCCCTTTCAGTTAATTCAGGTGACATCAAACCCAAAACAGACGATGTGCCATTGATAGATTTGACTAACATGGGGCCAAAGATTGATTACCCTGGCTCCTACAATCCATTTGGAGAGTCATTGGCCGACAAATTGGTTCATGAAAATGAAAAATTGGTTGCAGAGGCACAGGCAGAGTACGCACGCCGCAGCGCTAACCCATTTGAAGATTCTGATGTGGAGCCTGAAAAGTTGTTTGATAAATTTAAGAGATTTTTTTCTAAGACACCAAAAATGGAAGGACCTGTCCTTTCAGAGATAAATCAGGTGCTTGTGTTGTGCCGCAATGCCCAGTGGCTCGCACAGCAGATCCAAAAAGTGCTTAATTGGCTTGGAATTTGGAAGCAACAAGAAGAGGATGCCTCTGAGGAACGCTTTAGAGAAAGAATGCAAGTGTATCCTCAAATGATGGAGCAATATGAACAGTACAAGAATTCTCCTAGACACCAGAAATGGACAGATTGCAAAACTTGGTTTGATGAGATGCGGAAACTTGCAGTGTTGCATGATCCCAAACTTGTGAATTTGTTTCCAAATATGGCAAGCATACCACATGAAAATTCTAGACAAGAACCAATCCTGATTGTGCTGCGGGGCAAACCAGGTCAGGGTAAGTCTGTTGCTGCCAGTATGCTGGCGCAGATGTTTGCCCATTCACTTTCAGGCAAACCAGATTACTACAGTTATAATTCATCCACAAATTATTTTGATGGATACCAGCAACAACCTGTTGTTCTGATAGATGATCTTGGACAAGATCCTGCAGGCACAGATTTTTCAGTTTTTTGTCAGATGATTTCAACAACACCTTTCCTTCCAAATATGGCTAGTTTGAATGACAAGGGAATTAAATTTAAGAGTGATGTGATAATTGCCACAACCAACCTTCCAGAGTTTAAACCAGTTACAATTGCCGATCCTGGAGCACTCCAGAGAAGAATCAATTTTGATTTTGAGGTTGAAGCTGGGCAGTCATATAAAACTAAAACTGGAACACTTGACTTGGCAAAAGCATTGGAACCCACTGGTTGTTCAGCGCCCCTTCATATGGTCAAAGCCGACATACACTTATTTTCTAGTGCATGCTTGAAATTTAAAGACCGCATGGCTAGATGTGAGTGCAGTTTGGTTGAGGTCTATGATAGGGTGATGAATTCCCACAAAAGGAGGAATGATTTGGCA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| 17,786
|
OP245256.1
|
hunnivirus A1
|
Yu,S.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Lab of Prevention and Control of Swine Diseases
|
China
|
2023-03-01
| null |
Hunnivirus A
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,566
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Bos taurus
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feces
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2021
| null | null |
Hunnivirus A1 strain R-MDJ-HS-1/30, complete genome
|
CCCTTTTCCCTTTATTTTCTCCCTCCCTTTGTAATTTGACATTTGACAAGGACCCTCACCTGTCAATTGGGACCACCACTTTCAGTGACCCCATGCGAAGTAGTGAGAGAGAACAAGCTTTCTTACCCTTCATTTGTGAACCCTTCAGTCGAAGCCGCTTGGAATAAGATAGGAGGAAATGTTCATTCTAAATGGAGTGAAACATGTACTTTAGAATTTCTAGCACATGTTGGGCTTTCCAGCGTGTGACGGCACTGTCTTGCCGGAATTCTCTACACTGACACCCCACACTTGTGGACCTTGGTGGCAGATGACACCACTGTAGCTGGAATTGAGTGTCTAATGTATTCTGTGCAACAGTGAAAGCAATGTGATCACTTCGGTGGGCTAGTAGCCTGTGGATCAACAACTGGTAACAGTTGCCTCAGGGGCCAAAAGCCACGGTGTTTGCAGCACCCTACTAGTTTGATTGGAGCAATCCAAGATGTTACAGAGCTAGTAACTGCCAAACGGTCTATATTGGTATCTTGACATACCGTGCAGTTTTGGATAGTGAAGGATGCCCTGACGGTACCCGTAGGTAACAAGTGACACTATGGATCTAAGCAGGGGCTCACTCTGTGCTGCTTTACAGCTAGCTGTGAGTTAAAAAACGTCTAGCTATCCACAGCCTAGGGGACTAGGTTTTCCCTTTATTTTAACTGTAGTTTTATGGTGACAATTGTTGTTGTTTGGTACAGCTTTATTGTTGTTAGAAAAGCTTTTTGCAGTTTGCGAAGAATTTTTCACAACGGATTCTTTGCTTACCAAGCAAATACAGCAGCAGTCAATATGGAGATTCCAACAATGGATTTTGATCTGCCTAGTGGCATCTGGAACGAGGAAGCCGACTTTGAATTGGATGTTGAGTCGACTATGCTTTTGGATGGTCAGACGGCAGAAGACTTTTTCTTTGAGTTTCAAGGACCTGGACAGAGCAAGCAAGAGTCTGGGAACACAAACAACTCAGGAAACCATGGAGTGATAAATTATAATTTTTACAATCAGCAGTGGCAGAATTCAGTTGATTTGGAACATGCCATGGAAAATAATGCTACCGCCTACGGTGGCGCTGGTGGTGGTGACTCAACACACACCACCAATAGGACAGAAAATTTGCTTTTGTCAGGGCTTCAAACAGTTTCAAACATCTTACCACTTTTGGCTGATGGTTTGACTGAAGATTTTGAAAATTCGGATCGCGTTTCCAAAGTTCAAGCAGGAGCATCCACCCTTGTTACTCAACATTATGCTGGATGCTTAACATACCCAAAGCCAAAAACCAAACTGGCCCTGACTAGTGCTGCAGATCAACCCACACATGCTGGACCTTCTGTTGACCGCTTTATAACACTTAAAGTTGGTGAGTGGAACGTGTCCACTGCGGTTTACAGCGGGTGGTACATACCACTGCCGTGGACCGCATTGACGCGTAACACACCCTTTGCCTCGCTGGGCAGGAGGCATTTCTTGCTTAACTGTGGTTGGCATGTCCAGATACAGGTGAATTCTACCAGGTTTCATGGTGGCGCGCTCTTGGTAGCAATGGTGCCCCAATTTGTGATTGCAAGTCAAAGCACCCTTGCCCAAGGTGTTTTTAAAGATTTTACTGATACCCCACAGTTTAATTTGCAAAGCATGTTTGTGTACCCTCACCAGATCTTGAACCCACGTACAAATTCATCCTGTGAAATTTCAGTGCCATATGCAAATGTAACACCAGGGTGTGATCCAAAAGAACAGGCACCTTGGAGCCTTGTTGTTATGGTCATTTCACAGTTGTCTTATGGTAGTGGGGCTACACCAACCTTGGACATTGTTGCAGCAATAAGGCCAGTTGAAGCTGAATTTCATGGAATCAGACAGACAAACGCCCTATTTGAAGGGCTGCCTAAAATGAAGAATGAATCAGGATCATTTGCCTTTTGCTCAACGCAGCCACATCCAGTGGAACCTGATTATGGTGCTATGGTTCGCTCCTCACCTAAATTCTTGCCTGCCAAGATTGAAGACCTGCTCCAGATCTCGTGCATTCCAACATTGACTTTCAAAAGGGCTGTCACATTTTTGCAGACCGCACCACGAGCACCACTGATCACTTTGAATGTGTCGCTCTCATCTGCAGATTTGGTGAATACTGCTTTGGAAACAGTCAGCCGCGGTTTTGCCCAGTACCGCGGGAGTATTTTGATCCGCATGATTTTTACAGGCAATCAAATGCAGAATGTGCGGTATGCTGCAGTTTACACACCACCTGGGGCAGACCCACCAGACAATCTGGAAGAAGCGCTGGATGGTGTGTACACAATATTTGACACAGGTCTAAATTCCTCAGCAGATTTTGTAATTCCATTTATTTCAACTACAGATTTTAGGTATTGCAATTCTGACCAGGTGTATGATGTGGCAGTGGCTGGGTATTTTACAGTGTGGCAGCTAACAAATTTGGCAGTACCACCTGGGTCGCCTACAACTGCAGAGCTTTTAGTGCTTGCTGCTTCAGGTGCAGATTTTGAGTGGCGCTGCCCAACGGCGCCATATCTCGCTCTGCAAGGCGAAGATACCCAGATAACTCCAGCTGAAACCGGTTCTACTCCGGTGGTTACAGCAGATAACACCAATGCAGAGACTTCAGACATACCATACGCACCAGTTAGATTGTCGCATAGCTCAGTCAGGTTTTGGTTTGATCGCTTTTTCTTGGCTGATGTGCTGGATGTTGTGCCCAAGCAGAACAGTAGTGCCACACGCTACGTTCTTTCATGGGAGAACATGACAAGGAATATCCCCGAGGTGCGTTGGTTCACCCATGCTACATATTTGAGGTTTGAACTTGAGATTGCTTTGAAAACATGGAATTCTGACAATGTGGATGTGGAAATGGTGTTTTACCCAGTTGGTTCAGTTGTGCCTACTGGAACAGTGAACTGGAGTGGTGCCACCGCCCCATTGTCATTGCGTGTCAGTGGTGCGTGCCCTCGCTGGTGTTGGAATGCAAAGGTGACACCAGTTTTTACAACCAGAATTCCTTTCACTTCACCTGCTTCTGTTTTCACCAACACTTATTCTGGCTGGTCAACGTGGGACCACACCCAATCCACTTTTGGCAAAACTCCAGGGCTTAATACATTTGGAACCTTGGAACTAACAACAACAGCAGGGAATAATACTGCATTTTACCTTTCAGTTAGATTTGTGGACATTGAAATGTTTTGCCCCAGGCCTGGGATGTATATAGATCCACCCCCACCACAGTCCAGGGGTGCAACAAATTTTTCACTTTTAAAATTGGCAGGAGATGTTGAGATGAACCCAGGGCCCCCAATTCTTAGCGTTGCCAGGAAACTGGACCCAGATTTGGACCAGATGTTTAAAAAATTTGAGTCAATGCAGGAAAGTTTCAAAAAATTAATGGATTTTGCACAGTGGATTGATGTGTTTTCCAACATCGATAAAAGGAAATGGTTTAAAAGAATAATGAAATTCCTTTCCTATGCTGTGATTCTTTCTCGTGCGCGCCATGATCCCTTGCTTGCTGCAGCTACTACTTTTCTTCTTTCAGGTGATTGGCTTTCTCGGTTGTGTGCCAAGATCTGCAAGTGGCTGCAAAGCCACTGCAGAACTCAGCCGCCCCCTTTCCCTTCTTCAGATGACAATCCAGATGACAAGGATGGAAATGCTAAGAAAGAGAGTGCCTCCAGCAGCTTTAGTTTGCTGGATGTTTTTAAAAGCTCTACCAAGCCTCTTTCAGTGAATTCAGGTGATATTAAGCCTAAAATAGATGATGTGCCACTGATAGATTTGACTAACATGGGACCAAAGATTGACTACCCTGGCTCCCACAACCCATTTGGAGAATCATTGGCTGATAAATTGGTTCGTGAAAATGAGAAATTGGTCGCAGAAGCACAGACAGAGTATGCACGCCGTAGTGCTAACCCATTTGAAGACTCTGATGTGGAACCTGAAAAGCTGTTTGATAAATTTAAGAGGTTTTTCTCCAAGACACCAAAGATGGAAGGACCTGTCCTTTCAGAGATAAATCAGGTGCTTGTGTTGTGCCGCAATGCCCAGTGGCTTGCACAGCAGATCCAAAAAGTGCTTAACTGGCTTGGAATTTGGAAGCAACAAGAAGAAGATGCCTCTGAGGAACGCTTTAGGGAAAGAATGCAGGTGTACCCTCAGATGATGGAACAATATGAACAGTACAAGAATTCTCCCAGGCACCAGAAATGGACAGATTGTAAAACTTGGTTTGATGAGATGCGGAAACTTGCAGTGTTGCATGACCCCAAACTTGTGAATTTGTTTCCAAATATGGCAAGTATACCACATGAAAATTCTAGACAAGAACCAATCTTGATTGTGCTGCGAGGTAAACCAGGCCAGGGCAAGTCTGTTGCTGCCAGTATGTTGGCACAGATGTTTGCCCATTCACTTTCAGGTAAACCAGATTACTATAGCTATAATTCATCTACAAATTATTTTGATGGATACCAACAGCAACCTGTTGTTTTGATTGATGATCTTGGACAAGACCCAGCAGGCACAGATTTTTCAGTTTTTTGTCAGATGATTTCTACAACACCTTTTCTTCCAAATATGGCTAGTTTGAATGATAAAGGAATTAAATTTAAGAGTGATGTGATAATTGCCACAACCAACCTTCCAGAATTTAAACCAGTTACAATTGCAGATCCTGGAGCACTCCAGAGAAGGATTAATTTTGATTTTGAGGTTGAAGCTGGACAGTCGTACAGAACCAAAACTGGAACACTTGACTTGGCAAAAGCATTGGAACCCACCGGCTGTTCTGCGCCCCTTCATATGGTCAAAGCCGACATACACTTGTTTTCTAGCGCATGCTTGAAATTTAAAGATCGCATGGCTAGATGTGAGTGTAGCTTAGTTGAGGTCTATGATAGGGTGATGAATTCCCATAAAAGAAGGAATGATTTGGC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| 17,787
|
OP245257.1
|
hunnivirus A1
|
Yu,S.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Lab of Prevention and Control of Swine Diseases
|
China
|
2023-03-01
| null |
Hunnivirus A
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,558
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Hunnivirus A1 strain R-QQ-FQ/28, complete genome
|
CCTTTTCCCTTTATTTTCTCCCTCCCTTTGTAACTTGACATTTGATAAGGACCCTCACCTGTCAATTGGGACCACCACTTTCAGTGACCCCATGCGAAGTAGTGAGAGAGAGCAAGCTTTCTTACCCTTCATTTGTGAACCCTTCAGTCGAAGCCGCTTGGAATAAGATAGGAGGAAATGTTCATTCTAAATGGAGTGAAACATGTACTTTAGAATTTCTAGCACATGTTGGGCTTTCCAGCGTGTGACGGCACTGTCTTGCCGGAATTCTCTACACTGACACCCCACGCTTGTGGACCTTGGTGGCAGATGACACCACTGTAGCTGGAATTGAGTGTCTAATGCATTCTGTGCAACAGTGAAAGCAATGTGATCACTTCGGTGGGCTAGTAGCCTGTGGATCAACAACTGGTAACAGTTGCCTCAGGGGCCAAAAGCCATGGTGTTTGCAGCACCCTACTAGTTTGATTGGAGCAATCCAAGATGTTACAGAGCTAGTAACTGCCAAACAGTCTGTATTGGTATCTTGACATACCGTGCAGTTCTGGATAGTGAAGGATGCCCTGACGGTACCCGTAGGCAACAAGTGACACTATGGATCTAAGCAGGGGCTCACTCTATGCTGCTTTACAGCTAGCTGTGAGTTAAAAAACGTCTAGCTATCCACAACCTAGGGGACTAGGTTTTCTTTTTATTTTAACTACAAATTTTATGGTGATAATTGTTGCTATTTGGTACAGCTTTATTGTTGCTAGAAAAGCTTTTTGCAGTCTACAAAGAATTTCCCACAACGGATTCTCTATTTACCAAGCAAATACAACAGCAGTCAATATGGAGATTCCAACAATGGGTCTTGATTTGCCTAGTGGCATCTGGAATGAGGAAGCCGACTTTGAACTGGATGTTGAGTCGACTATGCTTTTGGATGGTCAGACGGCAGAAGACTTTTTCTTTGAGTTTCAGGGACCTGGACAGAGTAAGCAGGAGTCTGGGAACACTAACAACTCAGGGAACCATGGAGTGATAAATTACAACTTTTACAATCAACAGTGGCAAAATTCAGTTGATTTGGAACATGCCATGGAAAACAACGCCACCGCTTATGGTGGTGCTGGTGGTGGTGATTCAACACACACCACCAATAGGACAGAGAATTTGCTTTTGTCTGGGCTCCAGACAGTTTCAAACATCCTGCCATTGCTGGCTGATGGCCTGACTGAGGATTTTGAAAATTCAGACCGCGTCTCTAAGACACAGGCTGGAGCTTCAACTCTTGTCACTCAACATTATGTTGGATGTTTGACTTACCCAAAGAAAAACAAAAAGTTGGCACTCACTAGTGCAGCGGATCACCCAACACAGGCTGGCCCTTCAGTAGACCGGTTCATCACTCTCCCAGTAGGTGAATGGACCACTTCAACACAGGTGTACAGTGGCTGGTACCTACCGTTGCCTTGGTCAGTTTTGAAGCGGAACACACCGTTTGCTTCACTTGGGCGGCGGCATTTTCTGCTTAATTGTGGCTGGCATGTTCAAGTGCAAGTTAATTCCACTCGTTTTCATGGTGGTGCACTGTTGGTTGCGATGGTGCCCCAGTTTACAATGAAAACACAGACAAATTTGGAGCCGGATAAATTTATTAATTATACAGATGTACCAAATTTTAATTTGCAGAGCCTCTTTGTGTGTCCACACCAAATTTTGAACCCGAGAACGAATTCCTCGTGTGAAATTGAAGTGCCTTATGCAAATGCAACACCTGGGTGTGATCCAAAAGAACAGGCACCGTGGACGCTGGTTGTGATGGTTATTTCAGATTTGACTTATAATGCTGGTGCCACAACTACATTGGACATAGTGGCATCAGTGAGGCCAATTGAAGCACAGTTTCATGGAATTAGGCAGACAAATTCTGAGTTTGAAGGACTTCCTAAAGTTAAGAATGAATCAAGTTCATATTCCTTTTGCTCAACCCAGCCACACACTGTGGAGCCAGACTATGGCGCAATGGTGAGATCATCTCCTGCCTTTTTGCCAGCACAAATTACAGATCTTTTGCAAATTTCTTCAATACCCACGCTGACAAACAAACGGGTGGTTACCTTTCAACAGGTTGCGCCAGATACACCCCTATTGACGCTAAATGTGTCCCTTTCAGCAACAGATTTGGTCAATACAGCAATTGAAACAGTGAGCCGTGGTTTTGCTCAATACCGCGGCAGCATTCTGATTCGCATGTTGTTTACAGGTAACCAGATGCAAAATGTTAGATATGTGGCGGCTTACACACCACCTGGGGCTGATCCACCAGACAACTTGAGTGAAGCTATGGATGGGATTTATACAATTTATGATACAGGTTTGAATTCTTCTTCAGATTTTGTGATACCTTACATTTCTACTACTGATTTTAGGTATTGCAATTCTGACCAACAGTATGATGTGGCAGTTGCTGGGTACTTTACAGTTTGGCAGCTTACAAATTTGGCAGTTCCACCTGGCTCACCACCCAATGCTGACCTATTAATTTTTGCAGCCACTGGAGCAGATTTTGAATGGAGGTGTGTTACAACGCCGTTCCTGGCCCTAGAAGGTGAAGATACGCAAATAACACCAGCAGAAACTGGAGCTACACCAGTAGTGACAGCCTCAAATTCAAATCAAAATGCAGTAGCAATTCCATACAACCCCCCCCGTTTGTCACACAGTTCTGTGAGATTTTGGTTTGACCGGTTTTTTCTGATTGATATCTTGGATGTGGCTTCAAAGCAGAATGCAACTTCAACCAGGTATGTCCTTTCATGGGAAAACCTGACAAAGAACATACCGGAAGTGAGGTGGTACACTCATGCCACTTACATTCGGTTTGAACTGGAACTGGCCTTGAAAGCATGGAATGCTGATGATAATGATGTTGAGATGGTCTTTTATCCAGTTGGTTCTGTTGTCCCTAGTGGCACTACAGACTGGAACAGTGTTGCAGCGCCAACAGCCATGCGCCACACTGGTGCCTGTCCTAGATGGGCCTGGAACACTAAGACAACACCAGTTTTTACAACTAGGATACCCTTTACTGCTCCTTCTTCAGTTTTTTCTAACACCTTTACTGGTTGGGGCAACTGGCAACATACTGCTGGCAGTTTTGGCCAAACCCCGGGGCTGAACACCCTAGGGACTCTGCAGTTGACCCAGTCTTCTGGCTCGGGTGTGAAATATTACCTTTCGGCACGTTTTGCTGATATGCAGTTGTTCTGTCCACGGCCAGGCCAGTATGTGGATCCACCTCTTCCCAAAGCTCGGGGTGCTACAAATTTTTCTTTGCTGAAACTTGCAGGTGATGTTGAAATGAATCCAGGACCTCCAATTCTTAGTGTTGCCAGAAAGCTGGATCCGGATTTGGACCAGATGTTTAGAAAATTTGAATCAATGCAGGAAAGTTTTAAGAAATTGATGGATTTTGCACAGTGGATTGATGTGTTTTCTAATATTGATAAAAGGAAATGGTTTAAAAGGATAATGAAATTTCTTTCTTATGCTGTTATTCTTTCTCGCGCTAAACACGATCCTTTGCTTGCAGCTGCTACTGCTTTTCTTCTTTCAGGTGATTGGCTTTCTAGATTGTGTGCCAAAGTTTGCAAATGGCTGCAGAGTCATTGCCGCACGCAGCCTCCCCCCTTCCCCACCTCTGATGATAATCCAGACGATGAAGAGAAAGGGATAAAGAAGCATGGTGCCTCCGGCGGTTTCAGCCTGCTGGATGTTTTTAGAGACACTGCAAAACCACTTTCAGTAAATTCAGGAGACATTAAACCCAAAACTGAAGATGTACCACTAATTGATTTGACCAACATGGGGCCTAAGATTGATTATCCAGGCTCTCACAACCCATTTGGTGAATCATTGGCTGACAAGCTGGTTCAAGAAAATGAGAAATTGGTTGCAGAGGCACAGGCTGAGTACGCTCGCCGTAGTGCCAACCCATTTGAGGACACAGATGTTGAACCAGAGAAATTGTTTGACAAATTTAAGAAGTTTTTTTCCAAAACCCCCAAAATGGAAGGTCCAATTTTGTCAGAAATTAATCAAGTGCTGGTGCTCTGCCGCAATGCACAGTGGTTGGCTCAACAACTCCAGAAGGTGCTTGATTGGCTTGGAATTTGGAAACAGCAAGAAGAAGATGCCTCTGAGGAACGCTTCAGAGAAAGGATGCAAGCGTACCCTCAGATGATGGAGCAGTATGAACAGTACAAGAATTCTCCCAGACATCAAAAATGGAATGATTGTAAGAAATGGTTTGATGAAATGCGCAAATTGGCAGTTTTGCATGATCCAAAGTTGGTGAACTTGTTTCCAAATATGGCTAGTATTCCACATGAAAACTCCAGACAAGAACCAATTTTGATTGTGTTACGAGGCAAGCCAGGCCAGGGTAAATCTGTTGCTGCTAGCATGTTGGCACAGATGTTTGCCCATTCACTTTCAGGTAGACCAGATTATTACAGTTATAATTCATCTACAAATTATTTTGACGGGTACCAACAGCAACCCGTTGTTTTGATTGATGATCTTGGACAAGACCCAGCAGGTACTGATTTTTCAGTTTTTTGTCAGATGATTTCAACAACGCCCTTTATTCCAAATATGGCTAGCTTGAATGATAAAGGAATTAAATTTAAGAGTGATGTGATAATTGCCACAACCAATCTCCCAGAGTTTAAACCAGTTACAATTGCAGACCCAGGAGCCCTTCAGAGAAGAATAAATTTTGATTTTGAAGTTGAAGCAGGACAGTCATATAAAACCAAAACTGGAACACTTGATTTGGCAAAAGCAATGGAACCCACTGGGTGCTCAGCGCCCCTTCACATGGTCAAAGCTGACATACATTTGTTTTCTAGTGCATGCCTGAAATTTAAAGACCGCATGGCTAGATGTGAATGCAGTTTGGTTGAGGTCTATGATAGGGTGATGAATTCCCATAAAAGGAGGAATGATTTGGC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| 17,788
|
JQ941880.1
|
hunnivirus A1
|
Reuter,G., Pankovics,P., Knowles,N.J., Boros,A.
|
ANTSZ Baranya County Institute of State Public Health Sevice, Regional Laboratory of Virology
|
Hungary
|
2012-09-25
| null |
Hunnivirus A
|
Hunnivirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,583
|
GenBank
| 1
|
Hungary
|
Hungary
|
Bos taurus
|
feces
|
2008-02-29
| null | null |
Bovine hungarovirus 1 strain BHUV1/2008/HUN, complete genome
|
TCGCCCCTCCTTTCCCCCCTTATTTTCCCTTTTCCCTCTCTCCCTCCCTTTGTAACTTAACGTTTGGCAAGAACCCTCACCTGTCAATTGGGACCACCACTTTCAGTGACCCCATGCGAAGTAGTGAGAGAGAATAAGCTTTCTTACCCTTCATTTGTGAACCCTTCAGTCGAAGCCGCTTGGAATAAGATAGGAGGAAAAGTTCATTCTAAATGGAGTGAAACATGTACTTCAGAATTTCTAGCACGCGCTGGGCTTTCTTGCGTGTGACGGCACTGTCTTGCCGGAGCTCTCCACACTGACACCCCACGCTTGTGGACCTTGGTGGCAGATGACAACACTGCAGCTGGAATTGAGTGTCTGGTACACTCTGTGTAACAGTGAAAACAATGTGATCACTTCGGTGAGCTAGTAGCCTGTGGACCAACAACTGGTAACAGTTGCCTCAGGGGCCAAAAGCCACGGTGTTTACAGCACCCTACTGGTTTGATTGGAGCAATCCAAGATGTCACAGAGTTAGTAATTGCCAAGCAGTCCGTACTGGTATCTTGACATACCGTGCAGTTTTGGATAGTGAAGGATGCCCTGACGGTACCCATAGGTAACAAGTGACACTATGGATCTAAGCAGGGGCTCACTCTACGCTGCTTTACAGCTGGCTGTGAGTTAAAAAACGTCTAGCTATCCACAACCTAGGGGACTAGGTTTTCCTTTTATTTAGATTACAATTATATGGTGACAATTGTTGTTGTTTGGTATAGCTTCATTGTTGCTAAGAAGGTTTTTCACTGCTTTCAGAGAGCTTTTCACAACGGATCTTTTGTTTACCAAACAAATACAACAGCAGGCAATATGGAGATTCCAGCAATGGATTTTGATTTGCCTAGTGACATCTGGAATGAGGAGGCCGACTTTGAATTTGATGTTGAGTCGACTATGCTTTTGGATGGTCAGACGCCAGAAGACTTTTTCTTTGAGTTTCAGGGACCTGGACAAAGTAAGCAGGAATCTGGCAACACAAACAATTCAGGAAACCATGGAGTAATAAATTACAATTTTTACAACCAGCAATGGCAAAATTCAGTTGATTTGGAGCATGCCATGGAAAACAATGCCACAGCCTACGGAGGTGCTGGTGGTGGTGATTCTACCCACACTACTAACCGCACTGAAAACCTGTTGTTGTCTGGACTCCAGGCAGTTTCTAACATCCTGCCGTTGCTGGCAGACGGCCTTACAGAAGACTTTGAGAATTCAGATAGAGTGGGTAAGACCCAGGCGGGTGCTACAACACTGGTTACACAACATCAGGTTGGATGCATGACTTACCCAGGTCGCAAGTCTGGACCATCACCTTCAAGTGCCGCTGACGAGCCCACCACTGCTGGGCCGTCTGTTGATAGATTTATAACATTACCAGTTGGTAATTGGACACAGACACAGGCAGTCTACTCTGGATGGGCTTTGCCACTGCCTTGGGTACCCTTGACTAGAAACACTCCTTTTGGTGCCTTGGGCCGTAGGCATTTTCTGCTTAATTGTGGGTGGCACATCCAAGTGCAAGTGAATTCAACACGCTTTCATGGTGGTGCTTTGGGTGTTTTTATGGTGCCACAGTTTGTTTACACTAGCCAAACTGATTTGACTGGACCAAAACCCTTGATGGCAACAGATTATCCACTTTTCAACCAGCAACAGTTGTTTCTGTTTCCACACCAAATCTTGAATCCTCGGACTAATTCTTCAGTAGACATACAAGTTCCATATGCTAATTGCACCCCTGGCTGTGATCCAACTCAGCAGGCCCCTTGGACCCTGTTGATTGTGGTACTGTCTCCCTTATCATATGCCAGTGGAGCAACGACCTCATTGGAGGTGGTTGCTTCCATAAGGCCACTTCAGGCACAGTTCCATGGAATAAGGCAGACAAATTCTGAGTTTGAAGGACTGCCAAAGAACCGCAATGAAAGTTCTGCATTTGCCTTTTGTTCTACACAACCCCACTCTGCTGAGCCAGACTATGGTGCCATGCACCGTTCGTCACCATCTTTTCTGCCAGCAGAGATAACGGATTTTCTGCAAATATCCCAGATTCCAACTTTGACCTCAATTCGTGCAGTTTCTTTTCAGCAAGCAGTACCAAAGCAAGCGCTGCTGACTATGAATGTGTCTCTAACAGCAAATGACTTGTTGAACACTAGCTTGGAAACAGTGTCTCGGGGTTTTGCACAGTACCGTGGCAGTATTCTGATTAGGATGTTGTACACTGGAAATCAGATGCAAAATGTGAGGTATGTGGCGGCATACACGCCACCCGGCGCACTGCCACCAGCTGACCGGCGGCAAACTATGGTTGGAATCTATACAATTTATGATACTGGTTTGAATTCTGGCAGTGATTTTGTGATCCCCTTCATATCAACAACAGATTACAGGTACTGCAATGCTGTGGATGGTCTCGAAGTTGGTAGTGGTGGCTATTTTACAATTTGGCAATTGACCACACTGGCTGTACCACCTGGTTCCCCAACAACTGCTGAACTTTTGATTTTTGCTGCTTCTGGAAAAGACTTTGAATGGCGGTGCGTGGCCAGTCCATATCTTGCACTTCAGGGTGAGGACACCCAGATAACACCTGCCGAAACTGGGCAGACTCCTGAGGTTACAGCTGAAAATTCCAACCAGAATGTGGTGCCAATTCCATACGCACCTCAGAGGATTTCACATAGCGCTGTGCGCTTTTGGTATGACAGATTTTTCTTAGCTGACAGCCTTCAGGTCAACTATAAGAGTAGCGGGTCATACCTGCATGTGCTCAGGTGGCCTGACATTTTTGAGAAAATCCCAGAAGTGCGCTGGTTTATGCATGCCACCTACTGTAGATTTGAACTGGAAATTGCAATTCGACCTTGGAATCAGGATGTGGTTGATTATGAGATGGTGTATTGGCCACCTGGTTCATTGTTACCAACAGACACTGTAACATGGGTTTCAACAGCAGATAGACGCATGCGCCAGTCGGGCCCACAGCCTCGCTGGACCTGGAATACTGGAACCACCCCTTGTTTTACAGCTAGGATACCATTTACTGCACCTTCTTCAGTTCTGACTCAGACCTACACTGGTTGGAGCAATACAAGCCATGCTGAAGGGACTTTCGGCAACACTCCGGGCCTGAATGTCCTAGGCGCTCTGACCCTCACTCAGGGCTCTAAGAATGGTAGTGGTACAGTGATTACTTACATTTCTTACCGGTTGGTGGATATTCAGATGTGGTGCCCACGCCCTGGGCTCTATGTTGCCCCACCAATCCAACAGTCTTCTGGTGCTACAAATTTTTCTCTCTTGAGGCTTGCAGGTGATGTTGAATTGAATCCAGGACCTCCGATTCTTAGTGTTGCTAGGAAATTGGACCCAGATTTGGATCAGATGTTTAAGAAATTTGAAATTATGCAGGAAAGTTTTAAGAAATTGACTGATTGTGCCCAGTGGATAAATGTATTTTCTGATATTGATAAAAGGAAATGGTTTAAAAGGATAATGAAATTTCTTTCTTATGCTGTGATTCTTTCCCGTGCCCGGCATGATCCCCTGCTTGCTGCAGCTACTGCTTTTCTTCTTTCAGGTGATTGGCTTTCACGGCTGTGTGCCAAAATAGTTAAATGGCTGCCGAGCCACTGCAGGACACAACCACCACCTTTCCCCTCTTCAGATGAAAACCCAGATGATGGAAGTAAAGATATTAAGAAAGAAAGTGCCTCTAGTGGCTTCAGCCTGCTAGTTGTCTTTAAAAATTCTTCTAAACCTCTTTCAGTGAATTCAGGTGACATCAAACCTAAAACAGATGATGTGCCATTGATTGATTTGACCAACATGGGGCCAAAGATTGACTACCCCGGCTCCCATAATCCATTTGGAGAATCACTGGCCGACAAGCTGGTTCAGGAAAATGAGAGATTAGTTGCTGAAGCGCAGGCTGAGTATGCACGCCGTAGTGCTAATCCATTTGAAGACACGGACGTTGAACCAGAGAAATTGTTTGATAAATTTAAAAGATTCTTTTCCAAAACACCTAAGATGGAAGGCCCAATTATGTCAGAAATAAATCAGGTGCTGGTCCTCTGCCGCAATGCACAGTGGCTAGCCCAGCAACTTCAAAAGATCCTGGGCTGGCTTGGAGTTTGGAAGCAACAAGAAGAAGATGCCTCCGAGGAACGCTTTAGGGAAAGAATGCAAGTGTACCCTCAGATGATGGAACAGTATGAACAGTACAAGAATTCTCCTAGACACCAGAAATGGAATGACTGCAAGACATGGTTTGATGAGATGCGGAAACTTGCAGTATTGCATGATCCTAAATTAGTGAATTTGTTTCCAAACATGGCAAGCATACCACACGAGAACTCTAGACAAGAGCCAATTTTGATTGTGCTAAGAGGCAAACCAGGCCAGGGCAAATCTGTTGCTGCAAGTATGCTGGCACAGATGTTTGCCCATTCTCTTTCAGGTAAACCAGATTATTACAGTTATAATTCCTCAACAAATTATTTCGATGGGTACCAACAGCAGCCTGTCGTTTTGATTGACGATCTTGGGCAAGACCCAGCAGGGACTGACTTTTCAGTCTTCTGCCAGATGATTTCAACCACACCCTTTCTACCAAACATGGCTAGTTTGAATGATAAAGGGATCAAATTTAAGAGTGATGTGATCATTGCCACCACTAATCTTCCAGAGTTTAAACCAGTAACAATTGCAGATCCTGGAGCACTTCAGAGAAGGATAAATTTTGATTTTGAAGTTGAAGCAGGACAATCGTATAAAACAAAAGCTGGAACACTTGATTTGGCAAAAGCATTGGAACCCACAGGATGTTCAGCACCCCTCCATATGGTGAAAGCTGACATACATTTGTTCTCTAGTGCGTGCTTGAAGTTTAAAGACCGCATGGCTAGATGCGAGTGTAGTTTGGTTGGAGTCTATGATAGGGTGATGAACTC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| 96,208
|
NC_076712.1
|
papaya mottle-associated virus
| null |
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
KE-Mer-04
|
Carlavirus PapMaV
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,080
|
RefSeq
| null |
Kenya: Meru County
|
Kenya
|
Carica papaya
| null |
2017
| null |
PRJNA485481
|
Papaya mottle associated virus isolate KE-Mer-04, complete genome
|
TCCGAGCTCAACAATATCCAAACAAATCCAAGATTCTAAAGTAATACCTACTCATTAATCTTGTTTTCGTTACCATGGCTTTGACATACAGAACGCCAATGGAGGATATTGTTGCGTCATTCGAGCCAGCAATGCAAAATGCGATTGCATCCACAGCGGCTAATGGGTACAAACTCATGGAGGAGAGAAATTTCAGTATTGCCAACTACAAAATGGACAGCAAGTCCAAGGAGAAGTTGAGTCAGGCTGGAATTTACCTCAGTCCTTTTTCTGCTGTAGTGCATTCACACCCAGTATGTAAAACTTTAGAAAATTATCTCCTGTACAGCGTACTACCAAATTACATTAATAATAAATTTCTTTTTGTAGGAATCAAGGATAGTAAACTTAGTACTCTTAAAGCTAGAGATCCAAGGCTCAACCTCGTGGAGAGTATTAATAGGTACGTAACTAGCGCTGATATGGCAAGATACTCGCAAGAGTTCACAACTTTCAATTCTAAGCCACACGAGAGTTTAAAGCGCCATAAATTAAGCCTTGAGGGGGCCACACTCCGAGATCTAGTCCCTGCTGCAATGGCAAAGAAGGGCAAGAATTTCTTTTTGCATGATGAGTTGCATTATTGGGGAAAGCAAGACTTGATGACTTTTCTTGAGGTCTTTGGTCCTGAAATGCTTCTCGCAACGGTAGTTATCCCGCCAGAATTGTTAATAGGAGCTACACAAAGTCTAAATCCATGGTGTTATAAATTCCAAATTATTGGAAATAACCTCCTCTTCTTTCCAGACGGTGAAAGAACTGAGGGTTATGAGCAACCACTATCTGGAAGATACATACTCAAAACGAATGAAATAAATTTACTAAATGGGGAGACTTATTGTGTGGATATCATATGTAGCAAATTCGCACACCACCTAGTTTGCATTTCTAAAGGAAGGAGGAAAACGAACAAATACAGATGCTTTGGTAACTTCGAGGCTGTAAGTTTCGAAAAGTTAAAAAACTTAAGCACAATGAATCAGAGCTATTTCCCTATTAGCTTTGAAGTAACTTCCAAGATTTTTCGGTATTTGGTGTCACTAAAGAAGCCAGATCTTCAATCAGCTATAGCAAAATTAAGTCAAATTGTAGCTGAGCCGAACTGTAATGAAATCAAATTTGTTACAGAATTTGCTCAATTGGTTATCAGCAGTGGAGGTGTTAATTCTTTACTTAATCCAGATCGATTGAAGATCTTTTTCTCAAAATTCTACAAAAAAAGTCTCCCAGATTGGCTTAGCACTAAAATTAAAGCAGTGAGGGACGTAAGTTTGGAAGAATTCATGAGAGATTTGGAACCCCTAAGTTTGACAATAGAACTTGAAACTCTAGAAAGGGGGTTCTTTGAAGATTTTTTTGAAAATGATGGCTTCGAAGCAGAAAGTTACATTGATGTTCCTGAATTAATTGAGGAGAGGTTCCAATTTGGAGGTGGAAAGAATGAAAAGCACATTGGGAAGCCATATGTTGGCATTGAGGTGGATGAAAGGAAGCCAGAACCTATTTTGATCATTAATGCTGACAAGTTCATACATAGGGCAGCAGTGCTATTTCGAAATAGTTTTCTTAATGCTGAAAGTAGTTTCATAAGCAAAAAAGCTTTAGAGGAGTTCATTCTAATGCTCTGCTCATCCAACAAAATGTTATTAAGTGCTTTGTCTCTGGAGGTGCAAGGACTCAAGATGGAGGATTTCATAGACAAAATCATTAAGAGAATTAAAGCATTAATGGTTAATTGTATGAGACCCACATTCAATGAACTCAGAATGCAATGGTTTTTGATGAAGAGACGATTAAACACCAGGTGTATCTGCAATTATGCAGAATTCTCTGGAGTCTCCAAAGACTTAGAGAGGGCTTGGTCTAAAATCGTCCTCAATATTCCAAAGGTTGGGAATTCTCTCAGAAAAGTCCAGATGGATTGGGAAGAGGTACCAAGTGACAAACAAAGAAAGCCAACGGTCATTAGCACTGATAAGTTAGCAGTTCCAGAAGTCAAGTGCTGTTCGCAAATTGAAAGCATTGAGACTCTAAAGCTTAAAAATGGATTTGAGTTCATTGCGGATAAGTATCCTCTGGGAGAAATCGTGAAGATTTGCGATAATGAGGGTGAAAAAGTTAATTCGAATCCTCAAGATCAAGCAATTGAAGAGTGGCCTGAATGGCTAACTGTTTGGTGCCAAATAATGAAGATACCTGATGGATTCAATAGGATAATGCTGCAGAAGACCCATAAAACGCACCTGGGGTGCAGAGTAGAAGAGGTGAAGGAAGAGGGCTCCCGATTCAAAATTTTGGTGAATATTAGGGGAGAGTCGCAAGTGGTTGCGAGTTGTTCTAGGCAAATCCACATGGTACCTATCACAGAAGAGCTTGGAGCGATAATCTCACAAACAGAAGAGGAGGAAAAGAACCACCCAATATTAGCCAGCCAAAGTAGTGATGCCAAAGTTACCGTAGTCTTATATAAAGGTCCCTCAGGATCAAAACCGGCCAAAAAGTCTGATGAGGCGCTTATTAGAGTGAGGGAGGATGATTCTGAAGGAGCTTTCAGTCAGGACGAGATTGAGAGAGCGTTTGTGGCCAAATCTGTATCAACCTTCAGTCTTCTTGATGAAGTGAAAGTACCTGAAAGCGAGAAGGACCAATTACCAGGCAGGACTGCCTCTTTCTATTCAAGAAATGGAGAAGGATATCAGTACAAAGGAGGGAATCACAAGTCTCTCGGATGGGGACTTTGGTTGGAGGATGCCATCCGAATGTGCAAACTAAATCCTGAAGCATTTGATCATTGCTTGGTGCAGAGGTACAGTAAGGGTGGAAAGATAGGATTTCATTCAGATGATGAACCGTGCTACCCTAAAGGAAACGCTATTCTTACCATCAATGCAACTGGGGCATGCAAATTTGGAACCCGAAGGAAGGAGGGAAAAGACTCTTGTGATTTTTTCCTCCTCAATGGAAGTCAAATATTAGTTATGCCTTTCGGATTTCAAGAAAGCCACAAGCATAGCGTTGGAGAATGTAGTGAAGGCCGGATATCCATGACCTTTAGGTCAACAAATGCTGACCAGAGGAATCTACTTCTATCTCGGAAAAATGAGGAGGAAATCAAGGTGAATGATGGGGGTTTGATTGAAATAGGGATCGAAGAAGTTGAAGAAATGGGAGATATGAGCGAGAAAGGTCGATTCAGATCCTTATTCGATTATTTCTCTGACACTTTTGAGTACAATTCTGAAGAACTTCTTTCTCTCCTGGGGGGCATTGAAGATATTTCTTTCTCATCCGAAAATGAACGTTTTACAGCAATCGAAAGAACCTTTGGGAGAGAGATATTTTCAATTTTCTTCAAATTCATGAGCATAAGAGCGGTGAATTTCTCCATCCTCGTACCTGAATTGTCATGCTGCTTCCGTCTCACAAGAAACAATGGAGCAAAGGAGAATGCGCTCTTAATGTTGGATCTTCAGGAATTGAGCTTCGTGAGAGTATTGCCAAAAAATATTTGTGTTCTCACTGCTATCTCAGAGTGCTGGGGTCGAAAGATTGAGGAGGTGCTTAGAGTGATGGAGCGTGAGGATAATGAAGGTTTGTATGGGGAGCTCATTAAGGGTAGAGGCATTTCAATTAGAAATCTTGGGGAGGTCTTCAAAATTTTCTCAATTAGAGCCAATATCATAATGGGAGATCGAACATTCACACTCAATGAAAATGGAACTATTTGCGGATCTTTTAAGATTGATGGTGACCATCTCAATTTTATTAAGATGAAAAAAGATCCAGGTGCTCGCTTATTGAAAAGGATAGACGTTAGCAAACAATTTTCTAAGGAGTTGCGTCAACAAATCAAGGCTCTCTCTAGTGAATTGCCATTTTATTGCAACTTTAAGCGCGCCTCCTTATTGGCAGACAGCTTCCATGGAGCGAGTACAGGTGTCCTATTGTCTGAACTTTTCAATGGAGAAAAGAACTATAAAGAAGTTATGAGTAATAAGAATGGGGAATTAGTGAAGATTTTTTGCATTCTAGGGACTTTTGGGTGTGGCAAGAGCTACTTATTCAAATCACTAATTAAAGGTGCTCTTGGAAAAAAATTTGATCTCGTAACTCCAAGAAGGGCCCTCCTTGAAGAAATCAAAAAAGATATCGGTTTTCAGGATCGAATGGAGAATAGAAGGAAGAGAGGGCAAGAGGGTTGGTTTTTGTCTACTTTTGAAAAGTTCATTAAGAGGACTCAATTCTTGGTCGAAGGTCAAGTAGTGTTCATTGATGAAATACAACTCTATCCACCCGGCTACCTCGATCTGATTCTATCTTTAGCTCCCAGTGGGATAATGTGGGTAGTTTTTGGGGACCCATGTCAGAGCGATTATCACAGCGAAAAAGACGAGTTCATTCTCTCGCAAATGCCAAGTAATGTCGAAGTGCTTCTCAGAGACCAAACTTTTCGGTTCAATATCCAAAGTTGCAGATTCCAGAATAGGAATTTCATTGGAAGATTACCATGTGACTTCTCCAATGCAATGCTGAACTTTGATGAACCCTATCTTTTGAGGGAGGGCCTTGAAGCCTTATCAGAATTGGAACCCAAATACAAAGAAGTGGTCCTCGTCAGCTCTTTTGAGGAGAAGAAAATTGTTGAAGCCTATTGCACTAATGCTAAGAAAATACTCACCTTCGGTGAAAGTACGGGTTTGACATTTAATTGAGGAACTGTTCTTATCACCCTCATCTCAGAGAGAACAAATGACAAGAGATGGCTGACAGCGTTGAGCAGATTCAGAAGGAACATTTGCTTGGTCAATAGCACTGGGTACTCTACTGACAATCTTTTGATTAGTTATAGAGATCGATGCTTGGGACGGTTCTTTTCAGGGACAGCTTCAAAGGACAACATTTTGGGCATGCTTGAGGGTAAGGCCTTGTTTTACAATGGTTTTGACTGCGAACGAGAGAGA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| 611
|
MK984599.1
|
papaya mottle-associated virus
|
Mumo,N.N., Mamati,G.E., Ateka,E.M., Rimberia,F.K., Asudi,G.O., Boykin,L.M., Machuka,E.M., Njuguna,J.N., Pelle,R., Stomeo,F.
|
Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Horticulture
|
Kenya
|
2020-03-17
|
KE-Thar-03
|
Carlavirus PapMaV
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,079
|
GenBank
| null |
Kenya: Tharaka Nithi County
|
Kenya
|
Carica papaya
| null |
2017
| null | null |
Papaya mottle-associated virus isolate KE-Thar-03, complete genome
|
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|
MK984600.1
|
papaya mottle-associated virus
|
Mumo,N.N., Mamati,G.E., Ateka,E.M., Rimberia,F.K., Asudi,G.O., Boykin,L.M., Machuka,E.M., Njuguna,J.N., Pelle,R., Stomeo,F.
|
Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Horticulture
|
Kenya
|
2020-03-17
|
KE-Mer-04
|
Carlavirus PapMaV
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
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|
GenBank
| null |
Kenya: Meru County
|
Kenya
|
Carica papaya
| null |
2017
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Papaya mottle-associated virus isolate KE-Mer-04, complete genome
|
TCCGAGCTCAACAATATCCAAACAAATCCAAGATTCTAAAGTAATACCTACTCATTAATCTTGTTTTCGTTACCATGGCTTTGACATACAGAACGCCAATGGAGGATATTGTTGCGTCATTCGAGCCAGCAATGCAAAATGCGATTGCATCCACAGCGGCTAATGGGTACAAACTCATGGAGGAGAGAAATTTCAGTATTGCCAACTACAAAATGGACAGCAAGTCCAAGGAGAAGTTGAGTCAGGCTGGAATTTACCTCAGTCCTTTTTCTGCTGTAGTGCATTCACACCCAGTATGTAAAACTTTAGAAAATTATCTCCTGTACAGCGTACTACCAAATTACATTAATAATAAATTTCTTTTTGTAGGAATCAAGGATAGTAAACTTAGTACTCTTAAAGCTAGAGATCCAAGGCTCAACCTCGTGGAGAGTATTAATAGGTACGTAACTAGCGCTGATATGGCAAGATACTCGCAAGAGTTCACAACTTTCAATTCTAAGCCACACGAGAGTTTAAAGCGCCATAAATTAAGCCTTGAGGGGGCCACACTCCGAGATCTAGTCCCTGCTGCAATGGCAAAGAAGGGCAAGAATTTCTTTTTGCATGATGAGTTGCATTATTGGGGAAAGCAAGACTTGATGACTTTTCTTGAGGTCTTTGGTCCTGAAATGCTTCTCGCAACGGTAGTTATCCCGCCAGAATTGTTAATAGGAGCTACACAAAGTCTAAATCCATGGTGTTATAAATTCCAAATTATTGGAAATAACCTCCTCTTCTTTCCAGACGGTGAAAGAACTGAGGGTTATGAGCAACCACTATCTGGAAGATACATACTCAAAACGAATGAAATAAATTTACTAAATGGGGAGACTTATTGTGTGGATATCATATGTAGCAAATTCGCACACCACCTAGTTTGCATTTCTAAAGGAAGGAGGAAAACGAACAAATACAGATGCTTTGGTAACTTCGAGGCTGTAAGTTTCGAAAAGTTAAAAAACTTAAGCACAATGAATCAGAGCTATTTCCCTATTAGCTTTGAAGTAACTTCCAAGATTTTTCGGTATTTGGTGTCACTAAAGAAGCCAGATCTTCAATCAGCTATAGCAAAATTAAGTCAAATTGTAGCTGAGCCGAACTGTAATGAAATCAAATTTGTTACAGAATTTGCTCAATTGGTTATCAGCAGTGGAGGTGTTAATTCTTTACTTAATCCAGATCGATTGAAGATCTTTTTCTCAAAATTCTACAAAAAAAGTCTCCCAGATTGGCTTAGCACTAAAATTAAAGCAGTGAGGGACGTAAGTTTGGAAGAATTCATGAGAGATTTGGAACCCCTAAGTTTGACAATAGAACTTGAAACTCTAGAAAGGGGGTTCTTTGAAGATTTTTTTGAAAATGATGGCTTCGAAGCAGAAAGTTACATTGATGTTCCTGAATTAATTGAGGAGAGGTTCCAATTTGGAGGTGGAAAGAATGAAAAGCACATTGGGAAGCCATATGTTGGCATTGAGGTGGATGAAAGGAAGCCAGAACCTATTTTGATCATTAATGCTGACAAGTTCATACATAGGGCAGCAGTGCTATTTCGAAATAGTTTTCTTAATGCTGAAAGTAGTTTCATAAGCAAAAAAGCTTTAGAGGAGTTCATTCTAATGCTCTGCTCATCCAACAAAATGTTATTAAGTGCTTTGTCTCTGGAGGTGCAAGGACTCAAGATGGAGGATTTCATAGACAAAATCATTAAGAGAATTAAAGCATTAATGGTTAATTGTATGAGACCCACATTCAATGAACTCAGAATGCAATGGTTTTTGATGAAGAGACGATTAAACACCAGGTGTATCTGCAATTATGCAGAATTCTCTGGAGTCTCCAAAGACTTAGAGAGGGCTTGGTCTAAAATCGTCCTCAATATTCCAAAGGTTGGGAATTCTCTCAGAAAAGTCCAGATGGATTGGGAAGAGGTACCAAGTGACAAACAAAGAAAGCCAACGGTCATTAGCACTGATAAGTTAGCAGTTCCAGAAGTCAAGTGCTGTTCGCAAATTGAAAGCATTGAGACTCTAAAGCTTAAAAATGGATTTGAGTTCATTGCGGATAAGTATCCTCTGGGAGAAATCGTGAAGATTTGCGATAATGAGGGTGAAAAAGTTAATTCGAATCCTCAAGATCAAGCAATTGAAGAGTGGCCTGAATGGCTAACTGTTTGGTGCCAAATAATGAAGATACCTGATGGATTCAATAGGATAATGCTGCAGAAGACCCATAAAACGCACCTGGGGTGCAGAGTAGAAGAGGTGAAGGAAGAGGGCTCCCGATTCAAAATTTTGGTGAATATTAGGGGAGAGTCGCAAGTGGTTGCGAGTTGTTCTAGGCAAATCCACATGGTACCTATCACAGAAGAGCTTGGAGCGATAATCTCACAAACAGAAGAGGAGGAAAAGAACCACCCAATATTAGCCAGCCAAAGTAGTGATGCCAAAGTTACCGTAGTCTTATATAAAGGTCCCTCAGGATCAAAACCGGCCAAAAAGTCTGATGAGGCGCTTATTAGAGTGAGGGAGGATGATTCTGAAGGAGCTTTCAGTCAGGACGAGATTGAGAGAGCGTTTGTGGCCAAATCTGTATCAACCTTCAGTCTTCTTGATGAAGTGAAAGTACCTGAAAGCGAGAAGGACCAATTACCAGGCAGGACTGCCTCTTTCTATTCAAGAAATGGAGAAGGATATCAGTACAAAGGAGGGAATCACAAGTCTCTCGGATGGGGACTTTGGTTGGAGGATGCCATCCGAATGTGCAAACTAAATCCTGAAGCATTTGATCATTGCTTGGTGCAGAGGTACAGTAAGGGTGGAAAGATAGGATTTCATTCAGATGATGAACCGTGCTACCCTAAAGGAAACGCTATTCTTACCATCAATGCAACTGGGGCATGCAAATTTGGAACCCGAAGGAAGGAGGGAAAAGACTCTTGTGATTTTTTCCTCCTCAATGGAAGTCAAATATTAGTTATGCCTTTCGGATTTCAAGAAAGCCACAAGCATAGCGTTGGAGAATGTAGTGAAGGCCGGATATCCATGACCTTTAGGTCAACAAATGCTGACCAGAGGAATCTACTTCTATCTCGGAAAAATGAGGAGGAAATCAAGGTGAATGATGGGGGTTTGATTGAAATAGGGATCGAAGAAGTTGAAGAAATGGGAGATATGAGCGAGAAAGGTCGATTCAGATCCTTATTCGATTATTTCTCTGACACTTTTGAGTACAATTCTGAAGAACTTCTTTCTCTCCTGGGGGGCATTGAAGATATTTCTTTCTCATCCGAAAATGAACGTTTTACAGCAATCGAAAGAACCTTTGGGAGAGAGATATTTTCAATTTTCTTCAAATTCATGAGCATAAGAGCGGTGAATTTCTCCATCCTCGTACCTGAATTGTCATGCTGCTTCCGTCTCACAAGAAACAATGGAGCAAAGGAGAATGCGCTCTTAATGTTGGATCTTCAGGAATTGAGCTTCGTGAGAGTATTGCCAAAAAATATTTGTGTTCTCACTGCTATCTCAGAGTGCTGGGGTCGAAAGATTGAGGAGGTGCTTAGAGTGATGGAGCGTGAGGATAATGAAGGTTTGTATGGGGAGCTCATTAAGGGTAGAGGCATTTCAATTAGAAATCTTGGGGAGGTCTTCAAAATTTTCTCAATTAGAGCCAATATCATAATGGGAGATCGAACATTCACACTCAATGAAAATGGAACTATTTGCGGATCTTTTAAGATTGATGGTGACCATCTCAATTTTATTAAGATGAAAAAAGATCCAGGTGCTCGCTTATTGAAAAGGATAGACGTTAGCAAACAATTTTCTAAGGAGTTGCGTCAACAAATCAAGGCTCTCTCTAGTGAATTGCCATTTTATTGCAACTTTAAGCGCGCCTCCTTATTGGCAGACAGCTTCCATGGAGCGAGTACAGGTGTCCTATTGTCTGAACTTTTCAATGGAGAAAAGAACTATAAAGAAGTTATGAGTAATAAGAATGGGGAATTAGTGAAGATTTTTTGCATTCTAGGGACTTTTGGGTGTGGCAAGAGCTACTTATTCAAATCACTAATTAAAGGTGCTCTTGGAAAAAAATTTGATCTCGTAACTCCAAGAAGGGCCCTCCTTGAAGAAATCAAAAAAGATATCGGTTTTCAGGATCGAATGGAGAATAGAAGGAAGAGAGGGCAAGAGGGTTGGTTTTTGTCTACTTTTGAAAAGTTCATTAAGAGGACTCAATTCTTGGTCGAAGGTCAAGTAGTGTTCATTGATGAAATACAACTCTATCCACCCGGCTACCTCGATCTGATTCTATCTTTAGCTCCCAGTGGGATAATGTGGGTAGTTTTTGGGGACCCATGTCAGAGCGATTATCACAGCGAAAAAGACGAGTTCATTCTCTCGCAAATGCCAAGTAATGTCGAAGTGCTTCTCAGAGACCAAACTTTTCGGTTCAATATCCAAAGTTGCAGATTCCAGAATAGGAATTTCATTGGAAGATTACCATGTGACTTCTCCAATGCAATGCTGAACTTTGATGAACCCTATCTTTTGAGGGAGGGCCTTGAAGCCTTATCAGAATTGGAACCCAAATACAAAGAAGTGGTCCTCGTCAGCTCTTTTGAGGAGAAGAAAATTGTTGAAGCCTATTGCACTAATGCTAAGAAAATACTCACCTTCGGTGAAAGTACGGGTTTGACATTTAATTGAGGAACTGTTCTTATCACCCTCATCTCAGAGAGAACAAATGACAAGAGATGGCTGACAGCGTTGAGCAGATTCAGAAGGAACATTTGCTTGGTCAATAGCACTGGGTACTCTACTGACAATCTTTTGATTAGTTATAGAGATCGATGCTTGGGACGGTTCTTTTCAGGGACAGCTTCAAAGGACAACATTTTGGGCATGCTTGAGGGTAAGGCCTTGTTTTACAATGGTTTTGACTGCGAACGAGAGAGA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Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Horticulture
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Kenya
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Papaya mottle-associated virus isolate KE-Mer-05, complete genome
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| 53,486
|
MK984603.1
|
papaya mottle-associated virus
|
Mumo,N.N., Mamati,G.E., Ateka,E.M., Rimberia,F.K., Asudi,G.O., Boykin,L.M., Machuka,E.M., Njuguna,J.N., Pelle,R., Stomeo,F.
|
Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Horticulture
|
Kenya
|
2020-03-17
|
KE-Mac-07
|
Carlavirus PapMaV
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,072
|
GenBank
| null |
Kenya: Machakos County
|
Kenya
|
Carica papaya
| null |
2017
| null | null |
Papaya mottle-associated virus isolate KE-Mac-07, complete genome
|
TCAACAATATCCAAACAAATCCAAGATTCTAAAGTAATACCTACTCATTAATCTTGTTTTCGTTACCATGGCTTTAACATACAGAACGCCAATGGAGGATATTGTTGCGTCATTCGAGCCGGCTATGCAAAATGCGATTGCATCCACAGCGGCTAATGGGTACAAACTCATGGAGGAGAGAAATTTCAGTATTGCCAACTACAAAATGGACAGCAAGTCCAAGGAGAAGTTGAGTCAGGCTGGAATTTACCTCAGCCCTTTTTCTGCTGTGGTGCATTCACACCCAGTGTGTAAAACTTTAGAAAATTATCTCCTGTACAGCGTACTACCAAATTATATTAATAATAAATTTCTTTTTGTAGGAATCAAGGATAGTAAACTTAGCACTCTTAAAGCTAGAGATCCAAGGCTCAACCTCGTGGAGAGCATTAATAGGTACGTAACTAGCGCTGATATGGCAAGATACTCGCAAGAGTTCACAACTTTCAATTCTAAGCCACACGAGAGTTTAAAGCGCCATAAATTAAGCCTTGAGGGAGCCACACTTCGAGATCTAGTCCCTGCTGCAATGGCAAAAAAGGGAAAGAATTTCTTTTTGCATGATGAACTTCATTATTGGGGAAAGCAAGACTTAATGACTTTTCTTGAGGTCTTTGGTCCTGAAATGCTTCTCGCAACGGTGGTTATCCCACCAGAATTGTTAATAGGAGCTACACAAAGTCTAAATCCATGGTGTTATAAATTCCAAATTATTGGAAATAACCTCCTCTTTTTTCCAGATGGTGAAAGAACTGAGGGTTATGAGCAACCACTTTCTGGAAGATACATACTCAAAACGAATGAAATAAATTTACTGAATGGGGAGACTTATTGTGTGGATATCATATGTAGTAAATTCGCACACCACCTAGTTTGTATTTCTAAAGGAAGGAGGAAAACGAACAAATACAGATGCTTTGGTAACTTCGAGGCCGTAAGTTTCGAAAAATTAAAAAACTTAAGCACAATGAATCAGAATTATTTCCCTATTAGCTTTGAAGTAACCTCCAAGATTTTTCGGTATTTGGTGTCACTAAAGAAGCCAGATCTTCAGTCAGCTATAGCAAAATTGAGTCAAATTGTAGCTGAGCCAAACTGTAATGAAATCAAATTTGTTACAGAATTTGCTCAATTGGTGATCAGCAGTGGAGGGGTTAATTCTTTGCTTAATCCAGATCGACTGAAGATCTTTTTCTCAAAATTCTACAAAAAAAGTCTCCCAGATTGGCTTAGTACCAAAATCAAAGCAGTAAGAGATGTAAGTTTGGAAGAATTCATGAGAGATTTGGAACCCCTAAGTTTGACGATAGAACTTGAAACTCTAGAAAGGGGGTTCTTTGAAGATCTTTTTGAAAATGATGGCTTCGAAGCAGAAAGTTACATTGATGTTCCTGAATTAATTGAGGAGAGGTTCCAATTTGGAAGTGGAAAGAATGAAAAGCACATTGGAAAGCCATATGCTGGCATTGAAGTGGATGAAAGGAAGCCAGAACCTATTTTGATTATTAATGCTGACAAGTTCATACACAGGGCAGCAGTGCTATTTCGGAATAGTTTTCTTAATGCTGAAAGTAGATTCATAAGCAAAAAAGCTTTAGAGGAGTTTATTCTAATGCTCTGCTCATCCAACAAAATGCTATTAAGTGCTTTGTCTCTAGAGGTGCAAGGGCTCAAGATGGAGGATTTCATCGACAAAATCATTAAGAGAATTAAAGCATTAATGGTTAATTGTATGAGACCCACATTTAACGAGCTCAGAATGCAATGGTTTTTGATGAAGAGGCGATTAAACACCAGGTGTATCTGCAATTATGCAGAATTCTCTGGAGTCTCCAAAGACTTAGAGAAGGCTTGGTCTAAAATCGTGCTCAATATTCCAAAGGTTGGGAATTCTCTCAGAAAAGTCCAGATGGGTTGGGAAGAGGTATCAGGTGATAAACAGGGGAAGCCAACAGTTATTAGCACTGATAAGTTTGCAGTTCCAGAAGTCAAGTGCTGTTCGCAAATTGAAAGCATTGAGACTCCAATGCTTAAAAATGGATTTGAGTTTATTGCGGATAAGTACCCTCTGGGAAAAATCGTGAAGATTTGCGATAATGAGGGTGAAGAAGTTAATTTGAATCCTCAAGATCAAGCAATTGAAGAGTGGCCAGAATGGTTAACTGTTTGGTGCCAAATAATGAAGATACCTGATGGATTCAATAGGGTAATGCTGCAGAAGACCCATAAAACGCACCTAGGGTGCAGAGTGGAAGAGGTGAAGGAAGAGGGCTCTCGATTCAAAATTTTGGTGAATATTAAGGGAGAGTCGCAAGTGGTTGCGAGTTGTTCCAAGCAAATCCATATGGTACCTATCTCAGAAGAGCTTGGAGCGATAATCTCACAGACAGAAGAGGAGGAAAAAAACCACCCAATATTGGCCAGCCAAAGTAGTGATGTCAAAGTTACCATAGTCTTATATAAAGGTCCCTCAGGATCAAAATCGGCCAAAAAACCTGATGAGGCACTTACTAGAGTGAGGGAGGATGATTCTGAAGGAGCTTTCAGTCAGGACGAGATTGAGAGAGCGTTTGAGGCCAAATCTGTGTCAACCTTCAGTCTTCTTAATGAAGTGAAAGTACCTGAAAACGAAAGAGACCAATTACCAGGCAGAACTGCCTCTTTCTATTCAAGAAATGGAGAAGGGTATCAGTACAAAGGAGGGAATCACAAGTCTCTCGGATGGGGACTTTGGTTGGAGGATGCCATCCGAACGTGCAAACTAAATCCTGAAGCATTTGATCATTGCTTGGTGCAGAGGTACAGCAAGGGTGGAAAGATAGGATTTCATTCAGATGATGAATCGTGCTACCCAAAAGGAAATGCTATTCTTACCATCAATGTAACTGGGGCATGCAAATTTGGAACCCGAAGGAAGGAGGGAAAGGACTCTTGTGATTTTTTTCTCCTCAATGGAAGTCAAATATTAATTATGCCTTTCGGATTTCAAGAAAGTCACAAGCATAGTGTTGGAGAATGTAGTGAAGGCCGGATATCCATGACCTTCAGGTCAACAAATGCTGACCAAAGAAACCTACTTCTATCCCGGAAAAATGAGGAGGAAATCAAGGTGAATGATGGGGGCCTGATTGAAATAGGGATCGAAGAAGTTGAGGAAATGGGAGATATGAGCGAGAAAGGTCGATTCAGGTCCTTATTCGATTATTTCTCTGACACTTTTGAGTACAATTCTGAAGAGCTTCTTTCTCTCCTGGGGGGCATTGAAGATATTTCTTTCTCATCCGAAAATGAACGTTTTACAGCAATTGAAAGAACCTTTGGGAGAGAGATATTTTCAATTATCTTCAAATTCATGAGCATAAGGGCGGTAAATTTCTCCATCCTCGTACCTGAATTATCATGCTGCTTCCATCTCACAAGAAACAATGGAGCGAAGGAGAATGCACTCTTAATGTTGGATCTTCAGGAATTGAGCTTCGTGAGAGTATTGCCAAAAAATATTTGTGTTCTCACTGCTATCTCAGAGTGCTGGGGTCGAAAGATTGAGGAGGTGCTTAGAGTGATGGAGCGTGAGGATAATGAAGGTTTGTATGGGGAGCTCATCAAAGGTAGAGGCATTTCTATTAGAAATCTTGGGGAGGTCTTCAAAATTTTCTCAATTAGGGCCAATATCATAATGGGGGATCGAACATTCACACTCAATGAAAATGGTACTATTTGCGGATCTTTTAAGATTGATGGTGACCATCTCAATTTTATTAAGGTGAAAAAAGATCCAGGTGCTCGCTTATTGAAAAGGATAGATGTTAACAAACAATTTTCTAAGGAGTTACGTCAACAAATCAAGGCTCTCTCCAGTGAATTACCATTTTATTGCAACTTTAAGCGCGCCTCCTTATTGGCAGACAGCTTCCATGGAGCGAGCACAGGTGTTCTATTGTCAGAACTTTTCAATGGAGAAAAGAACTACAAGGAAGTTATGAGTAATAAAAATGGAGAATTAGTGAAGATTTTTTGCATTCTAGGAACTTTTGGGTGCGGCAAGAGCTACTTATTCAAATCACTAATTAAAGGTGCTCTTGGAAAAAAATTCGATCTCGTAACTCCAAGAAGGGCTCTCCTTGAGGAGATCAAAAAAGATATCGGTTTTCAGGATCGAGTGGAGAATAGAAGGAAGAGAGGGCAAGAGGGTTGGTTTTTGTCTACTTTTGAGAAGTTCATTAAGAGAACTCAATTCTTGGTTGAAGGTCAAGTAGTGTTCATTGATGAAATACAACTCTATCCACCCGGCTATCTCGATCTGATTCTATCTTTAGCTCCCAGTGGAATAATGTGGGTAGTTTTTGGGGACCCATGTCAGAGCGATTATCACAGCGAGAAAGACGAGTTCATTCTCTCACAAATGCCAAGTAATGTCGAGGTGCTTCTCAGAGACCAAACTTTTCGGTTCAATATCCAAAGTTGCAGATTCCAGAATAGGAATTTCATTGGAAGATTACCATGTGACTTCTCCAATGCGATGCTGAACTTTGATGAACCCTATCTTTTGAGGGAGGGCCTTGAAGCTTTATCAGAATTGGAACCCAAATACAAAGAAGTGGTCCTCGTCAGCTCTTTTGAGGAGAAGAAAATTGTTGAAGCCTATTGCACTAATGCTAAGAAAATACTTACCTTCGGTGAAAGCACGGGTTTGACATTTAATTGGGGAACTGTCCTTATCACCCTCATCTCAGAGAGAACAAATGACAAGAGATGGCTGACAGCGTTGAGCAGGTTCAGAAGGAACATTTGCTTGGTTAATAGCACTGGATACTCTACTGACAATCTCTTGACTAGTTATAGAGATCGATGCTTGGGACGATTCTTTTCTGGGACAGCTTCAAAGGACAACATTTTGGGCATGCTTGAAGGTAAGGCCTTGTTTTACAATGGTTTTGACAAAGAACAAGAGAGAACGCCCA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| 53,488
|
MK984604.1
|
papaya mottle-associated virus
|
Mumo,N.N., Mamati,G.E., Ateka,E.M., Rimberia,F.K., Asudi,G.O., Boykin,L.M., Machuka,E.M., Njuguna,J.N., Pelle,R., Stomeo,F.
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Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Horticulture
|
Kenya
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2020-03-17
|
KE-Mak-08
|
Carlavirus PapMaV
|
Carlavirus
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Betaflexiviridae
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| 9,080
|
GenBank
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Kenya: Makueni County
|
Kenya
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2017
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Papaya mottle-associated virus isolate KE-Mak-08, complete genome
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| 53,489
|
NC_079071.1
|
pineapple secovirus B
| null |
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-06
| null |
pineapple secovirus B
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,956
|
RefSeq
| null |
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2019-08
| null |
PRJNA485481
|
Pineapple secovirus B segment RNA1, complete sequence
|
ACATGGGAAACAAAGCGAACGTTTCTCTTCAGCGACCGTCACTTTCCTTGCGAACTTAATTGCGATCTTTCTTTTGATTGTCTCTTCGACTTGTTCTACTTCGTTTCTTGCTTAGCAAATCTGACCTGACCCTATTTAGGGCGCTAAACAGGCTCCAGTCGTATCGTAACGATCGTTTCATACCACTTCAATGGCCTCTCAGGTTGAAAGCGATTGCTTACGCTATGTTGTTACAGAAGAGGAAGCCCTCCTCGTTTTAGAGGCAGACTTCCTCATTTGCTATTTTGAGGAACTTGAACGCACTGGTAACGTGTGCGTGCCAGCTCCTGCTGGTGGCTCAGCTGATAATGATATCCGTCAATCAGTGATGGAAATTGTTAATAAATTACCAGCTGAACACCCTGCCTCCACCGACGTCCAACTGGCAGAATGTCTATTCTTCGATGTTGGTGAGGATCTGAGGAAAGGATTGGACAAGCATTTCTATCCTCATTTCGATAGAAATGATGCTGACTATAATCCACAAGGCATCCTCGGCAGTTTTGCTCAAGGTGCCTTCATAGAAATTGGTAGTCGCACTATTGGTCGTCTGATGGCCAAAGTGGGCTCAGCTGTGAGTCCTTTTTCTCAACTACTCGCTAAAATGGATATCATTTTAGACAAAGTAGTTAGTGCTTTTGATTGGCTTGCAAATATCGTTGATGGATGCATGAATTTTCTGACCTCACTTAGGGACAAATTCAAATCACTGATTCAGACTTGTCTTGAGAAACTTAAATGCTTTGCTGAACACTTTAGCTACTTAATGCCGTTAGTTTGCGGAGTGTTCTTTTCATCATGTTTCTTTTTTCTATTGAATAAATTTTTGAGCTATGTCGCGCCTTCATATGTTATGTCTTATGGAAGGTTGGTTGAAATAATATCAATTGTTGCAGCAGTCATTGGAATAAAGGAATTTGGTCAATACTTTATGACCATGGAATCTGATGCTCGGAAGTCCTTCATAAACGCTATCAAGAACTTTCTGGGCTTTGGTGATGTTGAAAGTGGCTTGGCTGTGAATGAAAGTGAGCCACAAGTACAATCAGGCCTCATGGACGTTGGACTGTTTGGTTGCCTTGTCTCCATGATTACATTCTTTGCAGATGAAAAGTTTCGGGTCGATTTCTGGGGATTTGCAAAAACTGCAGCGGCTCTGAAGAATATCTCAGATGGATACGACAAAGTTAGTAAGATGATGGGAGACATCACTCTATGGTTCTTCCAAAAACTTGGTACGAGTGGTATCGATGGAAGTGGTGCTGCACAAGCTCTCATGTTGCAAACTGGGATTGGGCTTAGTCAGTGGATGGAAGATTGTGAAAAACTCATAATAGAGGGCAACACGGTCACCCATTCAATGCAGTGGGTCTTTTCTGAGAGTCGGCGCCTAATTGATCAAGGAGCCGTCATTTCTAGTTATTTTGCTAGAACTAATGACGGCACGACTTTCCACTTGCGAGCGCGATTCGTGGCTGTGGAGAAGAGCCTAAAAGAATTTTATGGGAAAATCAAACAGGCTAATCTGAGTAATCAACATAGACTGACTCCTTTCACAATTTGCTTCATGAGTGAACCTGGAGTTGGAAAATCAACAGCTGTACGACCCTTTTGCGACACCTTCCTAGATGCTATGGGTGAACCCAAAGCTGATAGGATTTATACAAGAAATGGCGGGGACGCGTACTGGTCGAACTACATACGTCAGCCGTGTGTTTTGTTTGACGATTTTGGACAGACGCGCCAAGAAAATAATAGGTTTGATGAGGAAACCTTAATCCAGCTTGTTACTTGCAATCCGCACATGTTACCTATGGCTGCCGTCGAGGAAAAAGGCAGGCCCTTTGATTCGAAATACATAGTCATGTGCACCAACAGGGAGTACGCTCACTCTGAGGCTGATCTGGCTGATCAAAATGCTTTTCTGAGACGACGAAAGCTGCTGTGGAAGGTTGCGAGAGATGATCGCGTGGCTTTCGACCCCACATGTTGTTGGAAAAATCTTCTATTTACTAGAATGGATTCTCTCCATCCACGCCGCCGGCACGTTGATCAGGTGACCCTGACTTTCCCAGACATGATTGCATATTCAGCAAACCAGGCTAGAGCACATTTTGCTCTAGAACAGACAATGTTGGACAGCATTTCGACCTGCACGGACTCCTTTCATCTTGAGGAGGACCAAAATGGCCACTTTCGAGTGGTTTTTGACAACGTGGATGCTGAGGTCCACAATGCGGAAATGAGGAGGGCCAATAATCCCAACATTGAGAGGTATAGAGTCCAGAGTGGAGAATCTTTCACTTATTTTAGTTGCCAAAGACCACTTAGTCAGGGACAACATTGCCCAAATTTTGCAAATCACGTGGACGAATTTAATTCATGTACTCTTGACACGATTGGGGGCAAAGTTTTCTGTTCTAACGGGGGGGTTTTCCCAAGTGAAAGTGTTCAGTGGTCCAGTCATGAAAGTTATTTCATTGACAATATGGCTAAGTCAACGGGCTTGTTCGAGGTACAAGTGAATTTGCTGGCCAGTTTATTGATGGACGACACAAATATGGAAGAATTCATGGACTGGAGAAGGAATGTGCTTTTTGACGATATAGTTGGAGATGGTATTGACCCCCCTGCTTCTATCCGCAGTAAGAATCCGGATGTTCCGGATACGGTGTTCCAAGAATATTGGTCCAAACTCAGCGATCGTTCTCGATACTTGGCCATTATGTGGCGAGATCTCACGCCGAAATCATCACTGAAACAAGCCATAGAAGGATTCAAGGAAGCAATCTCTGGGATTAAATGTGTACGGCTTTGGGAGTCATTGCCCTTTTGGCTTAAGTGGGCAATCGGATTTTTCGGCATCTTTGCGGGAGGATGTGTTGTCTATTCTTCTCTCAGGTGGCTCGCTGTACTTGGCCAACAGACTGGAGTTAAGCTGTTGTCCTATGTTTTAGGAGCAGATCCTTTCCAAGTACAGGGTACTTCATCAGGCGGTGATGAAAGGATCAACCGCACGCGACGTGTTGCTGTGCGAGGTTTCAGAGCACAGAGTGCTGCTTATGAGTCGATCCCGCATCCTGACGCATGGGACAAGTGCAAGAAAGCAATGATTCGAGTTGAGGGGACGGGCATCAAATCACACAGACCGTTTGCCTTCTGTGGTCTGATGATAGGTCCACGAAGATTCGTGGCCCCTGCTCATAGCGTTGTTCTGATGAACTTTGGTGTTTCTATGATGGTGACGAATGGTGAGGGCATGGGATGTACTTTCTATTGTAGATATGCACCCACCATGCTTGATGAATACCCAGAGTTTCCGGGAAAAATGAAAAGTTTGGTTGTGATGGAGTATTCAAGATTGACGCCACCTCTGGCTTATTACAGCAACATAGTAACTGATTTTTCCCTGGAGGTGAGTAGGTGTGTGCCGGGCTTTATCATGCCAAATATCAACCCTGACAGCGCTGATTTCCCACATGTCACCGAATTCTTTAAGGTGAATAGAGTTGACGACATTGCTGATGGAGCCTCAGGCATGACTTGGAAAGCTATTAAAACCTTCCATGCCAAGGAGGTCGGGAAAGATGGAATGTGTGGACGTCTCGCCCTAATAGACAGGAATAACACTCTGCAAGTGGTTGGAATGCATTGCTATGGGCGACCATCCGACTCGATTTTCTGTGACTTTGAAAAACATTTTGTTGTTGAAACTTATAAAGCACAATCTGAATATAATCAGTGTTTTGAGAGAACTCAGATAACTGAGATGGTGGATCTTGTTGGCACACTTGATGTTAGGGTTCCACGCTTAGAGAAAAGCCAGATTGAAAAATCCTTAATTCATGACACTTTAAAGGAAATGTGGCGTGACCCTCTAACTGAGCCTACAATTTTGTCTCGTGTGGATCCTCGCCCGCCCTATTCATATGATCCATACGAAATGGGAGTGAGGAAGTTTGATAAGGAGGCAGGACCATTTGATTTGAGAGAAGGGACAGAGTTCAACAAAGCCCTGGCTGATATCAAACAGAGTTGGTTGGATATTAAGCCGGAATCGTTTAAGATAGAACCGGTGTGTTCTTTGGATGTCGCCATTAATGGAGTCGATGGAATGCCCTATGCTGAAAATTTTCCGATTAGCACTTCAGAGGGATATCCTTATCTGCTCGAGCGCCAGCATGGAGAGAGTGGAAAATATAGATACTTTGAAGAGGATCTATCCGGAAAGAGGAAACCCAAGGGAGATTGGGTTAAGGACGTTGATGAGATTGAGAATCTGTGTGCTTCTGAAGAACTTGAAATTTTCTCCATCGCATGTGCAAAGGACGAGAAAACCAAATTGGCCAAGGTTTACGAGACTCCAAAAACACGAATTTTCGAAATCTTGCCCTTCACGTATAATCTATTGGTCAGAAAATATTTCCTGTTCTGGATGCAGTGGATGATGGAAAACCATATGAATCTTCCATGCAAGGTTGGTTTAGATTGTTTCTCCTATAACTGGGACATTATGGCATCTCAACATATGGCCTTTGCGAACCATTTTAATGGTGACTATTCGGGTTTTGACACGAATACGTCACGAGACATGATGATGAAAATTTGCGATATCATTTGCGATTTTGCTGATGATGGTGTTCGGAATCGCACTATTAGGAGGAATCTTATATGGGCTGCTGTGAACAGGAAATTGATAATTGGAGACAAGATTTTCGAAGTTAGAGGTGGCACCCCATCCGGCTTTGCTCTCACTGTGCTGATTAATTCTGTTATGAATGAATGGTTTTTGCGAGCGAGCTGGTATGCCATAATGCGTGTTCAGGAACCAATTCTGGCCAACAGTCGAGATTTTAGATCTCATGTGCGCCTTTCTGTTTATGGTGATGACAATGTTGTTTCCATGTCGAACCAGGTTGTCGAGCTGTACAATCTTGTAACCATTTCTGAATATCTCAAGC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| 265
|
OP860246.1
|
pineapple secovirus B
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PSVB/S2-2
|
pineapple secovirus B
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,973
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple secovirus B isolate PSVB/S2-2 segment RNA1, complete sequence
|
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| 18,346
|
OP860247.1
|
pineapple secovirus B
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PSVB/S3-2
|
pineapple secovirus B
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,985
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
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Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
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2023-02-14
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pineapple secovirus B
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Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
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Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
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USA
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2023-02-14
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PSVB/S1-4
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pineapple secovirus B
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Sadwavirus
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Secoviridae
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ssRNA(+)
| 5,903
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GenBank
| 1
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USA: HI
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USA
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Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple secovirus B isolate PSVB/S1-4 segment RNA1, complete sequence
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|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
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|
pineapple secovirus B
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
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|
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pineapple secovirus B
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PSVB/S1-7
|
pineapple secovirus B
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,004
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
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2020-07
| null | null |
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|
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pineapple secovirus B
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Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
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Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
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USA
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2023-02-14
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PSVB/S1-6
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pineapple secovirus B
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Sadwavirus
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Secoviridae
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ssRNA(+)
| 5,903
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GenBank
| 1
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USA: HI
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USA
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Ananas comosus
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2020-07
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Pineapple secovirus B isolate PSVB/S1-6 segment RNA1, complete sequence
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|
OP860257.1
|
pineapple secovirus B
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PSVB/S3-1
|
pineapple secovirus B
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,963
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple secovirus B isolate PSVB/S3-1 segment RNA1, complete sequence
|
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|
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|
pineapple secovirus B
|
Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
|
Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
|
USA
|
2023-02-14
|
PSVB/S2-1
|
pineapple secovirus B
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,898
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple secovirus B isolate PSVB/S2-1 segment RNA1, complete sequence
|
GAACGAAACAAAGCGAACGTTTCACTTCAGCGACCGTCACTTTCCTTGCGAACTCAATTGCGATCTTTCTTTTGATTGTCTCTTCGACTTGTTCTGCTCCGTTTCTTGCTTAGCAAATCTGACCTGACCCTATTTAGGGCGCTAAACAGGCTCCAGTCATAACGTAACGATCGTTTCACACCACTTCAATGGCCTCTCAGGTTGAAAGCGATTGCTTACGCTATGTTGTTACAGAAGAGGAAGCTCTCCTCGTTTTAGAGGCAGACTTCCTCATTTGTTATTTTGAGGAACTTGAACGCACTGGCAATGTGTGCGTGTCAGCTCCTGCTGGTGGCTCTGCTGATAACGATATCCGTCAATCAGTGATGGAAATTGTCAACAAACTACCAGCTGAACACCCTGCCTCCACTGACGTCCAACTGGCAGAATGTCTATTCTTTGATGTTGGCGAGGATTTGAGGAAAGGATTGGACAAACATTTCTATCCTCACTTTGATAGAAATGATACCGACTATAATCCGCAAGGCATCCTCGGCAGTTTTGCTCAAGGTGCCTTCATAGAAATCGGTAGTCGCACTATTGGTCGTCTGATGGCCAAAGTGGGCTCAGCTGTGAGCCCTTTTTCTCAACTACTTGCCAAAATGGATATCATTTTGGACAAGGTTGTCAGTGCTTTTGATTGGCTTGCAAACATCGTTGATGGATGCATGAATTTTCTGACCTCACTTAGGGATAAATTCAAGTCATTGATCCAGACTTGTCTCGAAAAACTCAAATGCTTTGCTGAGCACTTTAGTTATTTGATGCCGTTAGTTTGTGGAGTGTTCTTTTCATCCTGTTTCTTTTTCTTACTGAATAAGTTTCTGAGCTATGTTGCGCCTTCTTACGTTATGTCTTATGGAAGGTTAGTTGAAATAATATCGATTGTGGCAGCAGTTATAGGAATAAAGGAATTTGGTCAATACTTTATGACCATGGAATCTGATGCTCGGAAGTCCTTCATAAACGCCATCAAGAACTTCCTGGGCTTTGGTGATGTTGAAAGTGGCCTGGCTGTGAATGAAAGTGAGCCACAAGTACAATCAGGCCTCATGGACGTTGGACTATTTGGTTGCCTTGTCTCCATGATAACTTTCTTTGCAGATGAAAAATTCCGGGTTGACTTCTGGGGATTCGCAAAAACTGCAGCGGCCCTAAAGAATATTTCGGATGGATATGACAAGGTCAGTAAGATGATGGGAGACATCACTCTATGGTTCTTCCAAAGACTTGGCACGAGTGGCATTGATGGCAGCGGTGCTGCACAAGCTCTCATGCTGCAAACTGGGATCGGACTGAGTCAGTGGATGGAAGATTGTGAGAAACTCATAATAGAGGGCAACACGGTCACCCATTCAATGCAATGGGTCTTTTCTGAGAGTAGACGTCTAATTGATCAAGGAGCCGTCATTTCTAGTTATTTTGCTAGAACTAATGACGGCACGACTTTTCACTTAAGAGCGCGGTTTGTGGCTGTGGAGAAAAGCCTCAAAGAATTCTACGGGAAAATCAAACAGGCAAACTTGAGCAATCAGCATAGACTGACTCCTTTCACAATTTGCTTCATGAGTGAACCTGGAGTCGGAAAATCAACGGCTGTGCGACCCTTCTGCGACACCTTCTTAGATGCTATGGGTGAACCCAAAGCTGACAGGATATACACGAGAAATGGCGGGGATGCATACTGGTCAAACTACATACGACAGCCATGTGTCCTGTTTGATGATTTTGGACAGACGCGTCAAGAGAATAACAGGTTTGATGAGGAAACCTTAATTCAGCTTGTTACTTGTAATCCTCACATGCTACCTATGGCTGCTGTTGAGGAAAAAGGCAGGCCATTTGACTCGAAATACATAGTCATGTGTACCAACAGAGAGTACGCTCACTCTGAGGCTGATCTGGCTGATCAAAATGCTTTCTTGAGACGGCGGAAATTATTATGGAAGGTTGCGAGAGACGATCGTGTGGCTTTTGACCCCACATGCTGTTGGAAAAATCTGCTATTTACTAGAATGGATTCTCTCCATCCGCGCCGTCGACATGTCGACCAGGTAACCCTGACTTTCCCGGACATGATCGCGTACTCAGCAAACCAAGCTAGGGCGCATTTTGCTCTAGAACAGACAATGTTGGACAGCATTTCAACATGTACGGACTCCTTTCATCTTGAGGAGGACCAAAATGGCCACTTTCGAGTGGTCTTCGACAATGTGGATGCTGAGGTCCACAATGCAGAAATGAGGAGAGCCAATAATCCCAACATTGAGAGGTATAGAGTCCAGAGTGGAGAATCTTTCACTTATTTTAGCTGTCAAAGACCACTTAGCCAGGGACTACATTGCCCAAATTTTGCGAATCATGTGGATGAATTCAATTCGTGTACTCTTGACACGATTGGGGGCAAAGTTTTCTGTTCTAATGGGGGAGTTTTCCCAAGTGAAAGTGTCCAGTGGTCTGATCATGAACGTTATTTCATCGATAACATGGCCAAATCAACCGGTTTGTTCGAAGTACAAGTGAATTTGCTGGCCAGCTTATTAATGGACGATACAAACATGGAAGAATTCATGGATTGGAGGAGGAATGTTCTATTCAATGAGATAGTAGGAGATGGTATTGACCCCCCTGCTTCTATTTGCAGTAGGAATCCAGACGTCCCGGACACAGTTTTTCAAGAATACTGGTCCAAACTCAGTGATCGTTCTCGATACTTGGCCATTATGTGGCGAGACCTTTCGCCGAAATCATCGCTGAAACAGGCCATAGAAGGATTCAAAGAAGCAATCTCTGGGATTAAATGTGTACGACTTTGGGAGTCATTGCCCTTTTGGCTCAAGTGGGCAATCGGATTTTTCGGTATTTTTGCGGGAGGATGTGTTGTCTATTCTTCTCTCAGGTGGCTTGCTGTGCTTGGTCAACAGACTGGAGTTAAGCTGTTGTCCTATGTTTTAGGAGCAGATCCCTTCCAAGTACAAGGTACATCATCAGGTGGTGATGAAAGGATCAATCGCACGCGACGTGTTGCTGTGCGAGGTTTCAGAGCGCAGAGCGCTGCTTATGAGTCAATCCCACATCCTGATGCATGGGACAAATGCAAGAAAGCAATGATTCGAGTTGAGGGAACGGGCATCAAATCACACAGACCATTTGCCTTCTGTGGTCTGATGATAGGTCCAAGAAGATTTGTGGCTCCTGCTCATAGTGTCGTTTTGATGAATTTTGGAGTTTCTATGATGGTGACGAACGGCGAGGGCATGGGGTGTACTTTCTACTGTAGATATGCACCCACCATGCTTGATGAATATCCAGAGTTTCCTGGAAAGATGAAGAGTTTGGTTGTGATGGAATATTCAAGGTTGACGCCACCTCTGGCTTATTACAGCAACATAGTAACTGATTTTTCCCTGGAGGTGAGTAGGTGTGTGCCAGGATTTATTATGCCAAATATCAATCCTGACAGCGCCGATTTTCCGCACGTCACTGAATTCTTTAAGGTGAATAGAGTTGATGACATTGCTGATGGAGCCTCAGGCATGACTTGGAAAGCCATTAAAACCTTTCACGCCAAGGAGGTTGGGAAAGATGGGATGTGTGGGCGCCTTGCTCTGATAGACAGGAATAACACCCTGCAAGTGGTTGGAATGCATTGTTATGGGCGACCATCCGACTCGATCTTCTGTGATTTTGAAAAACATTTCGTCGTGGAAACTTATAAAGCACAATCTGAGTACAATCAGTGTTTTGAGAGAACTCAGATAACCGAGATGGTAGATCTTGTTGGCACACTTGATGTTAGAGTTCCACGCTTAGAGAAAAGTCAGATCGAGAAATCATTAATTCATGACACTTTAAAGGACATGTGGCGTGACCCTCTAACTGAGCCTACAATTTTGTCCCGAGTGGATCCTCGCCCGCCCTACTCATATGATCCATACGAAATGGGAGTGAGAAAGTTTGACAAAGAGGCAGGGCCATTTGATTTGAGAGAGGGGACGGAATTTAACAAAGCCCTGTCCGATATCAAACAAAGTTGGTTGGATATCAAACCGGAATCGTTTAAGATAGAACCGGTATGTTCTTTGGATGTTGCCATCAATGGAGTCGATGGAATGCCCTATGCTGAAAATTTTCCAATAAGCACTTCAGAGGGATATCCCTATCTACTTGAGCGTCAGCACGGAGAGAGTGGGAAATACAGATACTTTGAAGAGGACCTGTCCGGCAAGAGAAAACCCAAAGGAGATTGGGTCAAGGATGTTGATGAAATTGAGAACTTGTGTGCCTCAGAAGAACTTGAAATTTTCTCCATCGCGTGCGCAAAGGACGAGAAGACCAAATTGGCCAAGGTTTATGAGACTCCAAAGACACGAATATTTGAGATCTTGCCCTTCACGTACAATCTACTGGTCAGAAAATATTTCCTGTTCTGGATGCAATGGATGATGGAAAATCACATGAATCTTCCATGCAAAGTTGGTTTGGATTGTTTCTCCTACAATTGGGACATTATGGCATCTCAACACATGGCCTTCGCAAACCATTTTAATGGTGATTATTCGGGTTTTGACACGAATACATCACGAGACATGATGATGAAAATTTGTGATATCATTTGTGATTTTGCTGATGATGGTGTTCGAAATCGCACCATTAGGAGGAATCTTATATGGGCTGCTGTGAACAGGAAATTGATAATTGGAGATAAAATTTTCGAAGTTAGAGGTGGCACTCCATCCGGCTTCGCTCTCACCGTGCTGATTAATTCTGTTATGAATGAATGGTTTTTGCGAGCAAGCTGGTATGCCATAATGCGCGTTCAGGAACCGATTTTGGCCAACAGCCGAGATTTTAGATCTCATGTACGCCTTTCTGTTTATGGTGATGATAATGTCGTTTCCATGTCGAACCAGGTTGTTGAATTGTACAATCTTGTGACCATTTCTGATTATCTCAAACAA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| 18,358
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OP860259.1
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pineapple secovirus B
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Larrea-Sarmiento,A.E., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Domingo,R., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M.J., Hu,J., Larrea-Sarmiento,A.
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Cornell University, Plant Pathology and Plant Microbe Biology Section
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USA
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2023-02-14
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PSVB/S1-1
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pineapple secovirus B
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Sadwavirus
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Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,958
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2020-07
| null | null |
Pineapple secovirus B isolate PSVB/S1-1 segment RNA1, complete sequence
|
AACGAAACAAAGCGAACGTTTCTCTTCAGTGACCGTCACTTTTCTTGCGAACTTAATTGTGATCTTTCTTTTTGATTGTCTCTTCGACTTGTTCTACTTCGTTTCTTGCTTAGCAAATCTGACCTGACCCTATTTAGGGCGCTAAACAGGCTCCAGTCGTATCGCAACGATCGTTTCACACCACTTCAATGGCCTCTCAGGTTGAAAGCGATTGCTTGCGCTATGTTGTTACAGAAGAGGAAGCCCTCCTTGTTTTAGAGGCAGACTTCCTCATTTGCTATTTTGAGGAACTTGAACGCACTGGTAACGCGTGCGTGCCAGCTCCTGCTGGTGGCTCGGCTGATAATGATATCCGTCAATCAGTGATGGAAATTGTTAATAAGCTACCAGCTGAACACCCTGCCTCCACCGACGTCCAATTGGCAGAATGTCTATTCTTCGATGTTGGTGAGGATCTGAGGAAGGGATTGGACAAGCATTTCTATCCTCATTTTGATAGAAATGATGCTGATTATAATCCACAAGGCATCCTCGGCAGTTTTGCTCAAGGTGCCTTCATTGAAATTGGCAGTCGCACTATTGGTCGTCTGATGGCCAAAGTGGGCTCAGCTGTGAGCCCTTTTTCTCAACTACTTGCTAAAATGGATATTATTTTGGACAAAGTAGTTAGTGCTTTTGATTGGCTTGCAAATATTGTTGATGGATGTATGAATTTTCTGACTTCACTTAGGGATAAATTCAAGTCACTGATTCAGACTTGTCTTGAAAAACTTAAATGTTTTGCTGAACACTTTAGTTATTTAATGCCGTTAGTTTGTGGGGTGTTCTTTTCATCCTGTTTCTTTTTCCTATTGAATAAATTTTTAAGCTATGTCGCGCCTTCATATGTTATGTCTTATGGAAGGTTGGTTGAAATAATATCGATTGTGGCAGCAGTCATCGGGATAAAGGAATTTGGTCAATACTTTATGACCATGGAATCCGACGCTCGGAAGTCCTTCATAAATGCTATCAAGAATTTTCTGGGCTTTGGTGATGTTGAAAGTGGCTTGGCTGTGAATGAAAGTGAGCCACAAGTGCAATCAGGCCTCATGGATGTTGGACTGTTTGGTTGCCTTGTCTCCATGATTACATTCTTTGCAGATGAAAAGTTTCGGGTCGACTTCTGGGGATTTGCAAAAACTGCAGCGGCCCTAAAGAACATCTCAGATGGCTACGATAAGGTTAGTAAGATGATGGGAGACATTACTTTATGGTTCTTCCAAAAGCTTGGCACGAGTGGTATTGATGGAAGTGGTGCTGCGCAGGCTCTCATGCTACAAACCGGGATTGGGCTTAGTCAGTGGATGGAAGATTGTGAAAAACTCATAATAGAGGGCAACACGGTCACCCATTCAATGCAATGGGTCTTTTCTGAGAGTCGGCGCCTAATTGATCAAGGAGCCGTCATTTCTAGTTACTTTGCTAGAACCAATGACGGCACGACCTTTCATTTACGAGCGCGATTCGTGGCCGTGGAGAAGAGCCTAAAAGAATTCTATGGGAAGATCAAACAGGCTAATCTGAGTAATCAACACAGACTGACTCCTTTCACAATTTGCTTCATGAGTGAGCCTGGAGTTGGAAAGTCAACGGCTGTACGGCCCTTCTGCGACACCTTCCTAGATGCTATGGGTGAGCCCAAAGCTGACAGGATTTACACGAGAAATGGTGGGGACGCGTACTGGTCAAACTACATACGTCAGCCGTGTGTTTTGTTTGATGATTTTGGACAAACGCGACAAGAAAATAATAGGTTTGATGAGGAAACCTTAATTCAGCTTGTCACTTGCAATCCGCACATGCTACCCATGGCTGCCGTCGAGGAAAAAGGCAGGCCCTTTGATTCGAAATATATAGTAATGTGCACCAACAGGGAGTACGCTCATTCCGAGGCTGATCTAGCTGATCAAAATGCTTTTCTGAGACGGCGAAAGCTGCTGTGGAAGGTTGCGAGAGATGATCGCGTGGCTTTCGACCCCACATGTTGTTGGAAAAATCTTCTATTTACTAGAATGGATTCTCTTCACCCGCGCCGTCGACATGTTGATCAGGTGACCCTGACTTTCCCAGATATGATTGCGTATTCAGCAAACCAAGCTAGAGCACATTTTGCTCTAGAACAGACAATGTTGGATAGCATTTCAACCTGTACGGACTCCTTTCATCTTGAGGAGGACCAAAATGGCCACTTTCGAGTGGTTTTTGACAATGTGGATGCTGAGGTCCACAATGCAGAAATGAGGAGGGCCAATAATCCCAACATTGAGAGATATAGAGTTCAGAGTGGAGAATCTTTCACTTATTTTAGTTGTCAAAGACCACTTAGTCAGGGACTACACTGCCCGAATTTTGCGAATCATGTGGACGAATTTAATTCATGTACTCTTGACACGATTGGGGGCAAAGTTTTCTGTTCTAACGGGGGGGTTTTCCCAAGCGAAAGCGTCCAGTGGTCCAGTCACGAAAGTTATTTCATTGATAATATGGCTAAGTCAACGGGTTTATTCGAAGTACAAGTGAACTTGCTGGCCAGTTTATTGATGGACGACACAAATATGGAAGAATTCATGGACTGGAGAAGGAATGTCCTTTTCAATGATATAGTTGGAGATGGTATTGATCCCCCTGCTTCTATCCGCAGTAAGAATCCGGATGTTCCGGACACGGTGTTCCAAGAATATTGGTCCAAACTCAGCGATCGTTCTCGATATCTGGCCATTATGTGGCGAGACCTTACGCCGCAATCATCGCTGAAACAAGCCATAGAAGGATTTAAGGAAGCAATCTCTGGAATTAAATGCGTACGGCTTTGGGAGTCATTACCCTTTTGGCTTAAGTGGGCAATTGGATTTTTCGGCATCTTTGCGGGAGGATGTGTTGTCTATTCTTCTCTCAGGTGGCTTGCTGTACTTGGCCAACAGACCGGAGTCAAGCTGTTGTCCTACGTTTTAGGAGCAGATCCTTTCCAAGTACAGGGCACTTCATCAGGCGGTGATGAAAGGATCAATCGCACGCGACGTGTTGCTGTGCGAGGTTTCAGAGCGCAGAGTGCTGCTTATGAGTCGATCCCGCATCCTGACGCATGGGACAAGTGCAAGAAAGCAATGATTCGAGTTGAGGGGACGGGCATCAAATCACACAGACCATTTGCCTTCTGTGGTCTGATGATAGGTCCACGAAGATTTGTGGCCCCTGCCCATAGCGTTGTTCTAATGAACTTTGGTGTTTCTATGATGGTGACGAATGGTGAGGGCATGGGATGTACTTTCTATTGTAGATATGCACCCACCATGCTTGATGAATACCCAGAGTTTCCTGGAAAAATGAAGAGTTTGGTTGTGATGGAATATTCAAGGTTAACGCCACCTCTGGCTTATTACAGCAACATAGTAACTGATTTTTCTCTGGAGGTGAGTAGGTGTGTGCCGGGCTTTATCATGCCAAATATCAATCCTGACAGCGCTGATTTCCCACATGTCACCGAATTCTTTAAGGTGAATAGAGTTGACGACATTGCTGATGGAGCCTCAGGCATGACTTGGAAGGCTATCAAAACCTTCCATGCCAAGGAGGTTGGGAAAGACGGAATGTGTGGACGCCTCGCCCTAATAGACAGAAACAACACTCTGCAAGTGATCGGAATGCATTGCTATGGGCGACCATCTGACTCAATTTTCTGTGATTTTGAAAAACATTTTGTTGTTGAAACTTATAAAGCACAATCTGAGTATAATCAGTGTTTTGAGAGAACTCAGATAACTGAGATGGTGGATCTTGTCGGCACACTTGATGTTAGGGTTCCACGCTTAGAGAAAAGCCAGATTGAAAAATCCTTAATTCATGATACTTTAAAGGATATGTGGCGTGGCCCTCTAACTGAGCCCACAATTTTGTCTCGTGTGGACCCTCGCCCGCCCTACTCATATGATCCATACGAAATGGGAGTGAGGAAATTCGACAAGGAGGCAGGGCCATTTGATTTGAGAGAAGGGACAGAATTCAATAAAGCCTTGACAGATATCAAACAAAGCTGGTTGGATATTAAGCCGGAATCATTCAAGATAGAACCGGTGTGTTCTTTAGATGTCGCCATCAATGGAGTCGACGGAATGCCCTATGCTGAAAATTTTCCGATAAGCACTTCAGAGGGATACCCTTATCTGCTCGAGCGTCAGCATGGAGAGAGCGGAAAATATAGATACTTTGAAGAAGACCTATCCGGGAAAAGGAAACCCAAGGGAGACTGGATCAAGGACGTTGACGAGATTGAGAATCTGTGTGCTTCTGAAGAACTTGAAATTTTCTCCATCGCATGCGCAAAGGATGAGAAGACTAAATTGGCCAAGGTCTACGAGACTCCAAAAACACGAATTTTCGAAATCTTGCCCTTCACGTACAATTTGTTGGTCAGGAAATATTTCCTGTTCTGGATGCAGTGGATGATGGAGAACCATATGAATCTTCCGTGCAAGGTTGGTTTGGATTGTTTCTCCTATAACTGGGACATCATGGCATCTCAACATATGGCCTTCGCGAATCATTTTAATGGTGACTATTCGGGTTTTGACACGAATACATCACGAGACATGATGATGAAAATCTGCGACATCATTTGTGATTTTGCTGACGATGGTGTTCGGAATCGAACTATTAGGAGGAATCTTATATGGGCTGCTGTGAACAGGAAATTGATAATCGGAGACAAGATTTTCGAAGTCAGAGGTGGCACTCCATCCGGCTTTGCTCTTACTGTGCTGATTAATTCTGTTATGAATGAATGGTTTTTGCGAGCGAGTTGGTATGCCATAATGCGTGTTCAAGAACCAATTTTGGCCAACAGTCGAGATTTTAGATCTCATGTGCGCCTTTCTGTTTATGGTGATGACAACGTTGTTTCCATGTCGAACCAGGTTGTCGAGTTGTACAATCTTGTGACCATTTCTGATTATCTCAAACAATTTGGCATCAAATTGTCTGATGGTGCTAAAACTGGCGTACTTAAGAAGAGAATGAATTTTGAGGAGATTGATTTTCTCAAAAGAAAATGGACTGTTGGAAACTTTGGTTGGTTCCATTGTCCTCTTGATCGGACTTCTATCGAGGAGCAATTGTTTTGGATAAAGAAATCGGATGACCCTCTGGCCAGTGTTCAGATGAATGTAGACAATGTTCTCCGTGAATCATTTCATCATGGTAGAGACTATTTTGATATGATAAGAAGGGTCATCTCAAAAGCTGCCAATCTTAAAGGACTGGAGATTCTCTTGTTAAGTTTTGAAGATTGTGCAGATATGTGGACCACGCAGAGAACTAAAGGCAATGCCAATGTTCCAGTGTGTTATGATTTGCCTTACCTGAAGAAGCGCTATTTGGAGACTCAAGTGCGTGGTCTGGGCGAAAAGAGGTTTGATCCGATTTATGGTATGACCATTGCGCGACTCAATAATTTTGATCCTAAATGGCGCCAAGCTGATAAAGTCGTGATTCTGACTGATGGGGGAGGTTCCTATATCAAACACAATGGAACTTTATGTTTAGATATCACTACTGATGGTGGTATGCAAATGAGAAAGCTTCGAGAGTACATTTCCAACGGGGACTTCAGACGCTGCTATGTTACTCATCCCTCCAATGTTGCTGCTTGTGGGGTGTATGCACTTCTGACTTATCTTTTTGTGTTTCCTGAAGAAAAATCAATGCTGCATGCTTGGGTAGATCTGCTTGATGAAAATGCTTACAAGCAATTTATCAAACTTAATTCCTTTGTGTGAATGTTGTGTGACTCCTGTGTTAGCTAGCGGCCGGGCTATTGTGTGTGATTTCCTAGCCACCCATAATTAAATAAATTGATGTGTGCTTATGTTTTTGAGTGTTTAGTGTGTGATGCTCTAAATTTATGCATGCTTTCTGCCAAAA
| 18,359
|
OM777135.1
|
pineapple secovirus B
|
Larrea-Sarmiento,A., Geering,A.D.W., Olmedo-Velarde,A., Wang,X., Borth,W., Matsumoto,T.K., Suzuki,J.Y., Wall,M.M., Melzer,M., Moyle,R., Sharman,M., Hu,J., Thomas,J.E., Larrea-Sarmiento,A.E., Thomas,J.
|
University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2022-10-29
| null |
pineapple secovirus B
|
Sadwavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,956
|
GenBank
| 1
|
USA: HI
|
USA
|
Ananas comosus
| null |
2019-08
| null | null |
Pineapple secovirus B segment RNA1, complete sequence
|
ACATGGGAAACAAAGCGAACGTTTCTCTTCAGCGACCGTCACTTTCCTTGCGAACTTAATTGCGATCTTTCTTTTGATTGTCTCTTCGACTTGTTCTACTTCGTTTCTTGCTTAGCAAATCTGACCTGACCCTATTTAGGGCGCTAAACAGGCTCCAGTCGTATCGTAACGATCGTTTCATACCACTTCAATGGCCTCTCAGGTTGAAAGCGATTGCTTACGCTATGTTGTTACAGAAGAGGAAGCCCTCCTCGTTTTAGAGGCAGACTTCCTCATTTGCTATTTTGAGGAACTTGAACGCACTGGTAACGTGTGCGTGCCAGCTCCTGCTGGTGGCTCAGCTGATAATGATATCCGTCAATCAGTGATGGAAATTGTTAATAAATTACCAGCTGAACACCCTGCCTCCACCGACGTCCAACTGGCAGAATGTCTATTCTTCGATGTTGGTGAGGATCTGAGGAAAGGATTGGACAAGCATTTCTATCCTCATTTCGATAGAAATGATGCTGACTATAATCCACAAGGCATCCTCGGCAGTTTTGCTCAAGGTGCCTTCATAGAAATTGGTAGTCGCACTATTGGTCGTCTGATGGCCAAAGTGGGCTCAGCTGTGAGTCCTTTTTCTCAACTACTCGCTAAAATGGATATCATTTTAGACAAAGTAGTTAGTGCTTTTGATTGGCTTGCAAATATCGTTGATGGATGCATGAATTTTCTGACCTCACTTAGGGACAAATTCAAATCACTGATTCAGACTTGTCTTGAGAAACTTAAATGCTTTGCTGAACACTTTAGCTACTTAATGCCGTTAGTTTGCGGAGTGTTCTTTTCATCATGTTTCTTTTTTCTATTGAATAAATTTTTGAGCTATGTCGCGCCTTCATATGTTATGTCTTATGGAAGGTTGGTTGAAATAATATCAATTGTTGCAGCAGTCATTGGAATAAAGGAATTTGGTCAATACTTTATGACCATGGAATCTGATGCTCGGAAGTCCTTCATAAACGCTATCAAGAACTTTCTGGGCTTTGGTGATGTTGAAAGTGGCTTGGCTGTGAATGAAAGTGAGCCACAAGTACAATCAGGCCTCATGGACGTTGGACTGTTTGGTTGCCTTGTCTCCATGATTACATTCTTTGCAGATGAAAAGTTTCGGGTCGATTTCTGGGGATTTGCAAAAACTGCAGCGGCTCTGAAGAATATCTCAGATGGATACGACAAAGTTAGTAAGATGATGGGAGACATCACTCTATGGTTCTTCCAAAAACTTGGTACGAGTGGTATCGATGGAAGTGGTGCTGCACAAGCTCTCATGTTGCAAACTGGGATTGGGCTTAGTCAGTGGATGGAAGATTGTGAAAAACTCATAATAGAGGGCAACACGGTCACCCATTCAATGCAGTGGGTCTTTTCTGAGAGTCGGCGCCTAATTGATCAAGGAGCCGTCATTTCTAGTTATTTTGCTAGAACTAATGACGGCACGACTTTCCACTTGCGAGCGCGATTCGTGGCTGTGGAGAAGAGCCTAAAAGAATTTTATGGGAAAATCAAACAGGCTAATCTGAGTAATCAACATAGACTGACTCCTTTCACAATTTGCTTCATGAGTGAACCTGGAGTTGGAAAATCAACAGCTGTACGACCCTTTTGCGACACCTTCCTAGATGCTATGGGTGAACCCAAAGCTGATAGGATTTATACAAGAAATGGCGGGGACGCGTACTGGTCGAACTACATACGTCAGCCGTGTGTTTTGTTTGACGATTTTGGACAGACGCGCCAAGAAAATAATAGGTTTGATGAGGAAACCTTAATCCAGCTTGTTACTTGCAATCCGCACATGTTACCTATGGCTGCCGTCGAGGAAAAAGGCAGGCCCTTTGATTCGAAATACATAGTCATGTGCACCAACAGGGAGTACGCTCACTCTGAGGCTGATCTGGCTGATCAAAATGCTTTTCTGAGACGACGAAAGCTGCTGTGGAAGGTTGCGAGAGATGATCGCGTGGCTTTCGACCCCACATGTTGTTGGAAAAATCTTCTATTTACTAGAATGGATTCTCTCCATCCACGCCGCCGGCACGTTGATCAGGTGACCCTGACTTTCCCAGACATGATTGCATATTCAGCAAACCAGGCTAGAGCACATTTTGCTCTAGAACAGACAATGTTGGACAGCATTTCGACCTGCACGGACTCCTTTCATCTTGAGGAGGACCAAAATGGCCACTTTCGAGTGGTTTTTGACAACGTGGATGCTGAGGTCCACAATGCGGAAATGAGGAGGGCCAATAATCCCAACATTGAGAGGTATAGAGTCCAGAGTGGAGAATCTTTCACTTATTTTAGTTGCCAAAGACCACTTAGTCAGGGACAACATTGCCCAAATTTTGCAAATCACGTGGACGAATTTAATTCATGTACTCTTGACACGATTGGGGGCAAAGTTTTCTGTTCTAACGGGGGGGTTTTCCCAAGTGAAAGTGTTCAGTGGTCCAGTCATGAAAGTTATTTCATTGACAATATGGCTAAGTCAACGGGCTTGTTCGAGGTACAAGTGAATTTGCTGGCCAGTTTATTGATGGACGACACAAATATGGAAGAATTCATGGACTGGAGAAGGAATGTGCTTTTTGACGATATAGTTGGAGATGGTATTGACCCCCCTGCTTCTATCCGCAGTAAGAATCCGGATGTTCCGGATACGGTGTTCCAAGAATATTGGTCCAAACTCAGCGATCGTTCTCGATACTTGGCCATTATGTGGCGAGATCTCACGCCGAAATCATCACTGAAACAAGCCATAGAAGGATTCAAGGAAGCAATCTCTGGGATTAAATGTGTACGGCTTTGGGAGTCATTGCCCTTTTGGCTTAAGTGGGCAATCGGATTTTTCGGCATCTTTGCGGGAGGATGTGTTGTCTATTCTTCTCTCAGGTGGCTCGCTGTACTTGGCCAACAGACTGGAGTTAAGCTGTTGTCCTATGTTTTAGGAGCAGATCCTTTCCAAGTACAGGGTACTTCATCAGGCGGTGATGAAAGGATCAACCGCACGCGACGTGTTGCTGTGCGAGGTTTCAGAGCACAGAGTGCTGCTTATGAGTCGATCCCGCATCCTGACGCATGGGACAAGTGCAAGAAAGCAATGATTCGAGTTGAGGGGACGGGCATCAAATCACACAGACCGTTTGCCTTCTGTGGTCTGATGATAGGTCCACGAAGATTCGTGGCCCCTGCTCATAGCGTTGTTCTGATGAACTTTGGTGTTTCTATGATGGTGACGAATGGTGAGGGCATGGGATGTACTTTCTATTGTAGATATGCACCCACCATGCTTGATGAATACCCAGAGTTTCCGGGAAAAATGAAAAGTTTGGTTGTGATGGAGTATTCAAGATTGACGCCACCTCTGGCTTATTACAGCAACATAGTAACTGATTTTTCCCTGGAGGTGAGTAGGTGTGTGCCGGGCTTTATCATGCCAAATATCAACCCTGACAGCGCTGATTTCCCACATGTCACCGAATTCTTTAAGGTGAATAGAGTTGACGACATTGCTGATGGAGCCTCAGGCATGACTTGGAAAGCTATTAAAACCTTCCATGCCAAGGAGGTCGGGAAAGATGGAATGTGTGGACGTCTCGCCCTAATAGACAGGAATAACACTCTGCAAGTGGTTGGAATGCATTGCTATGGGCGACCATCCGACTCGATTTTCTGTGACTTTGAAAAACATTTTGTTGTTGAAACTTATAAAGCACAATCTGAATATAATCAGTGTTTTGAGAGAACTCAGATAACTGAGATGGTGGATCTTGTTGGCACACTTGATGTTAGGGTTCCACGCTTAGAGAAAAGCCAGATTGAAAAATCCTTAATTCATGACACTTTAAAGGAAATGTGGCGTGACCCTCTAACTGAGCCTACAATTTTGTCTCGTGTGGATCCTCGCCCGCCCTATTCATATGATCCATACGAAATGGGAGTGAGGAAGTTTGATAAGGAGGCAGGACCATTTGATTTGAGAGAAGGGACAGAGTTCAACAAAGCCCTGGCTGATATCAAACAGAGTTGGTTGGATATTAAGCCGGAATCGTTTAAGATAGAACCGGTGTGTTCTTTGGATGTCGCCATTAATGGAGTCGATGGAATGCCCTATGCTGAAAATTTTCCGATTAGCACTTCAGAGGGATATCCTTATCTGCTCGAGCGCCAGCATGGAGAGAGTGGAAAATATAGATACTTTGAAGAGGATCTATCCGGAAAGAGGAAACCCAAGGGAGATTGGGTTAAGGACGTTGATGAGATTGAGAATCTGTGTGCTTCTGAAGAACTTGAAATTTTCTCCATCGCATGTGCAAAGGACGAGAAAACCAAATTGGCCAAGGTTTACGAGACTCCAAAAACACGAATTTTCGAAATCTTGCCCTTCACGTATAATCTATTGGTCAGAAAATATTTCCTGTTCTGGATGCAGTGGATGATGGAAAACCATATGAATCTTCCATGCAAGGTTGGTTTAGATTGTTTCTCCTATAACTGGGACATTATGGCATCTCAACATATGGCCTTTGCGAACCATTTTAATGGTGACTATTCGGGTTTTGACACGAATACGTCACGAGACATGATGATGAAAATTTGCGATATCATTTGCGATTTTGCTGATGATGGTGTTCGGAATCGCACTATTAGGAGGAATCTTATATGGGCTGCTGTGAACAGGAAATTGATAATTGGAGACAAGATTTTCGAAGTTAGAGGTGGCACCCCATCCGGCTTTGCTCTCACTGTGCTGATTAATTCTGTTATGAATGAATGGTTTTTGCGAGCGAGCTGGTATGCCATAATGCGTGTTCAGGAACCAATTCTGGCCAACAGTCGAGATTTTAGATCTCATGTGCGCCTTTCTGTTTATGGTGATGACAATGTTGTTTCCATGTCGAACCAGGTTGTCGAGCTGTACAATCTTGTAACCATTTCTGAATATCTCAAGCAATTTGGCATCAAATTGTCTGATGGTGCCAAAACTGGCGTACTTAAGAAGAGAATGAATTTTGAAGAGATCGATTTTCTCAAAAGAAAATGGACCGTTGGAAACTTTGGTTGGTTTCATTGTCCTCTTGATCGGACTTCTATCGAGGAACAATTGTTTTGGATAAAGAAATCAGATGACCCTCTGGCCAGCGTTCAGATGAATGTAGACAATGTTCTCCGTGAGTCATTTCATCATGGTAGAGACTATTTTGATACGATAAGAAGGGTCATCTCGAAAGCTGCTAATCTCAAAGGACTGGAAATTCTCCTGTTAAGTTTTGAAGATTGCGCAGACATGTGGACCACACAGAGAACTAAAGGCAATGCCAATGTTCCAGTGTGTTTCGATTTGCCTTACCTGAAGAAGCGCTATTTGGAGACCCAAGTGCGTGGCCTGGGCGAAAAGAGATTTGATCCGATTTATGGTATGACCATTGCGCGACTCAACAATTTTGATCCTAAATGGCGCCAAGCTGATAAGGTCGTGATTCTGACTGATGGGGGAGGTTCCTATGTTAAACACAATGGAACTTTGTGTTTAGATATCACTACTGATGGTGGTATGCAAATGAGAAAACTTCGAGAGTACATTTCCAATGGGGACTTTAGACGCTGCTATGTTACTCACCCCTCCAATGTTGCTGCTTGTGGGGTGTATGCACTTCTGACTTATCTCTTTGTGTTTCCTGAAGAAAAATCGATGTTGCATGCTTGGGTGGATTTGCTTGATGAAAATGCTTATAAGCAATTTATCAAACTTAATTCCTTCGTGTGAATATTGTGTGACTCTTGTGTCAGCTAGTGGTTAGGCTACTGTGTGTGATTTCCTAGCCACCATATTTAAATAAAATTGATGTGTGCTTATGTTTTTGAGTGTTTAGTGTGTGATGCTCTAAATTTATGCATGCTTTCTACC
| 22,532
|
OR683414.1
|
raspberry enamovirus 1
|
Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2023-11-06
|
45/2022
|
raspberry enamovirus 1
|
Enamovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,539
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Rubus idaeus
|
plant leaf
|
2022
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate 45/2022, complete genome
|
ATGTGGTTGGATTTTGATTTTATTCAACACGGTTTGTTTCGAGGATTAGTACCACACGCACGTTTATTTAGCGCGGATCACTCTCAGCCTATGATTGTGGCCCGGTCTATGTTCACGTCTTGCACACTACCTATCATTCATCACAACCAACACATTTTCTACACTCAGAATGCTGAAGGCTATTTACGTTACGTTTTGGCTTTTCTTGTGGGTGTCTTGGAACGGCACATCGAGCACGGTGAGTGCGCTCGAGATTGTGCCACCCCCTACTATGTCACGGCCCAGATCCTCCTGTTGGTGCTTACCCACCCCGCATCTCCCATCAGAATTGCTGGGGTCAGGTGGGCTTCTGATCAATGGATTGAAGTCGAATCCTCCCTTGTCCTTCGCCAGCTTGCAAGAGCTCTTGGGAGGCTTGGGATGTGTTTGCGCCAACCCGATATGGCAGAACCATACCCTAACAGACCCCGTTTTAAACTATACGAGCTGTGTGGATTGGCAAACCGAGGGGAACGGGCTATGGCTGGTTCGGGTGAATGGATCCCGTTGTTTGACTTCGTTGATGATGCCCAAACTCTGGTTGATATCAGCTGGACGAGAGGTGATGAGCATGGTTTCGATGCTCCCAGGTCCCATTGTACGGATCCTGCACGATTCTGGGAATTTATTCTCCGGATTGCTGGAGACGTGGATCGTCGCTCTATTAACTCTCTCACGGGATCTGTTAGCTACACTAATTGGCCTACTAGAAACCTTGTACATACACTACAGTGTGGCAAGTCTCTGGGGCGCATTTTATGTGCTGACATCACACCCGCGGCGCTTTATAATGACTGGAATGCTCACTGCTTTTATCTGTTGGGCGAAAGAGGTGACATTTTCTCGACTACTCCTGAACTGGTACATGGTGCCTATGAAAATTATGACTCTGAGTCTGACCTTGATGATGAGGATTTTATCGAACTTGATGGGTCGGACCTGGAAGATGATTAGGGCTCCTGTGGATGTCTGTGAACGGTTGCTTGACGCATGGCCTAGGACTCGGATTTCTGCGATTCCCCCGAAAGGAGTTATTGTCAGATTTGAAGATGATAATGGTCATGTTGGTTTTGGCTCCTGTGTTAAGGTTTCGTGTTTGAAAGGCATCTACTGTTGGGTGCCTAAGCATGTTCTCGATTATAGTACCAAAATCAGAGGACCGAAAGGTTCGATGAGTGTGACTGTAATGAGGCCCTTTTACACTGACGAGGAGGGGGACAGTATCCTTTTGCGAGGACCAGATAACTGGAACTCAAATTTGGGACTGAAACCAGCTGAGGTCTTGCCTATAACCAAGGCTCGCCGTGGCTCCACCAAGTTCTATATCGAGCGCGAAGTGAAGGAGGGACAAGGATACACCTGGTTTTGCCAAACTGCTGACCTGTATGAAATGTACAGAGGTTTTATTAGGGTTGGTGTTGAAAGTGAACCGGGAGATTCTGGACTCCCTTATTTTTCGGGAAACAAGATTGTTGCCATGCATGTTGGAGCGTATGGTGATATCAATGAAAACAAAGCCACTTTTCTGGTGGAAATCCCAGGCGTAACAGGTCCGGCTTACTTAGTTGAAAGTGCACACACTGAAACTAGGTTGCTGACTTTAGCTGAGGACATCGCAGAAGGTGAAGAACTCTTAGCCAGAGTTGTTAAAGTGGCTGGCTCCAGATACCAGGTCAGTCTAAACAATACTGTGCAGAAGCGACTTGGGTTGGCCTATAAGCCTAAAGGCCGACATTGGGGAGACGTCTCGGATGATGAAGATGATGACTCATATAAAGACGATATCCTCAGAACTTTCGGGGCTTTGGAAAGTACTTACGACAGAAAATCCCGTTCTGAACCACCTAACTTGGAGGAGAAGAATGGTGTTCCTGAAGTTCGTCCTGAACCAACTAAGCCCGAGGATTTAAACTTAAGGCCCCGGTACACCTCCGGGAAAACAAAGGTGGAGTTGATGCAGGAGAATGCGGAAATTCTCGAACAGCTGGTGAATCTAGCGGCAATCAAGAGCGAAGACCTCGAGAGCGCCAAGATGCTAAAGCAGTTCCTGAGCCCAGTTTTCGAAGCAGTAGGCAACGACAAAAGTGGAAGGGCCAAAGAAGGAAGCGGGGACCAGCCTGGGATGACCTCCCAAGTGAAGGACCCATCGACATCTGCGGACCAATCACCAAAGTTGTCCCGAAGTGCCAAGAGAAACCTGCGAAAGAAGGCAAAGAGACAGGAAGCCAAGCTGGAAAAGCAAAGAAGCAAAACTGTCATCAATGCCCCAATTCCTTCAGCTCCAAAAGAAGCCCCCAAGTCCAAGGACAAGGGGAAGAAGAAAATGGAGGAGGAAAAGGAAAAGAAGCAAAGGCCGGTCAAGAAGGTCCAGATTCGCAAGAAGGGTGGTTCACTCGACTTTGCGGAGGTGGAACGGATGGTGGCCGATGCGATTATCAGAGGAATCTCCAAGGCCGCAAAACCTCCATTGAAGGACTCTTTCCAGAGTTCTACAAGTGGTCCGAAAGAATGAGCCAAGGGAGACATGGAGAGGCTCCGCCTGGGTTCGCCTGGGTGGGGTATTGCCAGGCATTTTACTATCCGCCTCATGATAAGGGGTTATCTAGTTTTGGGAAACAGCTGATGGAGCAACATTCTTGGCTGTCTGAGATCTGCAAAGATTTTGGATGGCCTCAGTTTGGGGCTTCTGCTGAGTTCCGATCCTTGACCCTACAAGCCGAACGCCGCATTAAGGCTATAAATAGTGCGGAAATCCCTCCCCTGAAGAAGCGATTGGCTGTAATGGCTGATTGTGCCAAGAGATACTGGGGCGTGAGGATGCTCTGTCCGAATTGGGCTCGTAATGGGCTCGATAAGGTGGCCGGTTGGTCGGAATTTCTAGACAGTGTACACAGTCTGGAGCCTACTGCCGGAAGTGGAGTTCCTTATGCTATGTGGAGTGGCAGGAAAACCCATGAAGATTGGGTGGGTGAACGCGGTAGTCTCGTAGAAATATGGGATTTAGTGTGGACTCGCCTGAATAGAATGGAGGAGTACTGTTTCTCCACTGCAGAACAGGCCGTGAAGGATGGGATTTGTGACCCTATAAGGCTCTTCGTCAAAGGAGAACCGCACAAGATAGCAAAGTTGAAGGAGGGTAGATACCGCTTAATTGCGAGTGTTTCTCTAGTAGACCAGCTGATTGCGCGGATGCTCTTTGGTTTTCAAAATAAAAGAGAGCTTAGGTGTTACCGAGAGATACCGAGTTGTCCGGGTATGGGTTTGAGCACTGATGATCAAGTACTTGAGTTCGTAACCCGCCTGGCCAGCAAGGTTGGTGTTGACCCACAAGACCTGGTTAAGAATTACCAGGATTATATAGTACCCACGGATTGCTCTGGTTTCGACTGGAGTGTTCCGGATTGGCTTCTGGAGGATGACTTAGAGGTCAGGAATGTTTTGACGCAGCAACTGTCTCCCACGATGTTTAAGTTGAGGAAGACTTGGTTAAAGTGTCTTAATAATTCTGTCTTTTGTCTATCTGACGGTTCGCTCCTAGCGCAGACCATACCTGGCGTACAGAAATCGGGTTCGTACAACACCTCTTCCTCTAATTCGAGGATGCGGGTTATGTTGTCCCAATATGCTGGTGCTGAGTGGTGTTTTGCAATGGGGGATGATGCGATTGAGAGCACCTCTACTGATCTTAGTGTCTATCAGACTCTTGGGATTAAGTGTGAGAAGGCTGAAAAGTTTGATTTCTGCTCTCATATCTTCGTTGAACCTTCGGTGGCAATTCCAGTAAATGTGGGGAAGATGCTCTATGGAGTTTTGTGTGGTCACCATCCAGATAGTGTCTCAGATGCTGACAAGTTGAAATATTACGAGTCGGCCATGGCTGTAGCTAATGAATTGAGGCACCTTCCCGAGGGCTTATATCTTAAAATCTTGCGTGCTCTGGATCTCGTGAGCTAAGGCGAGCACAAAATTTTAAAAGAGGGAAGTAAAATATATAAGTATATATAATAATATAAGTATAATGGCGAAGAAGAAGACTGGAATGACCAAATCTCAGAAGCGTAATCAGAAGAGGAAAGCTAAGGCTCTCGCTGCGAAGAAAGCAGGCACGAAGGTTCAACCTCGAAAGGGGAAGACCAACCGGGCTAGCTCGAGCGGTGGGGGCTTTAAAGCTACTACTCAGACGACGATGCATTATGAATGGACAACCAACACGGTGAAAGGAAATGATAACGGCAAGGTGGTGATCGGAAAAGACTCTACTTATGAGAAATTGAAGAATGCCATCGCTGGATATCAACGGTACCGAGTGTTTCACTTTGAGGTTCTATACATTACTGAGGCAGCCTCTACTGATAGGGGTTGTTTGGCGTATCGGCTTGATAATTCCAATTCTTTGAGCTCCAAGGGGTTGTCGAAAGATAATACCTGGGGCTTGAGGTCTAATGGGAGAGTTGCTTACAACAAAACTCAGCTGTGTGACAAGGACTTTTATGAGTTTAATGAAAACCAGTTTGCCTTTCTTTATGAGGGTACTGGGGAATCGGTTACTGTTGGTCACATGAAATACCGCTGTTCTGTTCTTCTTAGTATGCCTAAATAGGATGTTGGCAGTCCGTCGCCTTCTCCTGCCCCTGAACCTCCTTCCCCTTCCCCTAGTCCTGAACCCCCTGCGGAGCCAAAAGCTTTGTGGGGTTACTGTGGGGTGCCTTCTTGCTTTGTCTATACTCGAAAGAATGACGAAGACTTCAGTGTGGGAAATACCGATTCAATCTCTCTATATAGATGGGAAGATGAGAAGTGGGAAAACGCTTCTTTGACTGTCCGTACTGAGAAATCTGATAAAACGGTTAAACACACCTTTGATATCCCTTTTCGTAAGTTGGGGGTGTTTGAGGTCCATATTGAGTGTGAGGGTGCCATGGCGGTTAAGGATTCTGTATCTGGTGGCTCTGAGCTCCAGTGGAAAGGGTTAGTGGCCTATGATGATAATATTGTGGGCTGGGATGTCAGGGGTTGGGTTGGTGCTAAAATGACAAATCTGTCTGCTGTGCGTGATAAGTTGCATGGACATCCCGATGCCGAGGTGAATGGTTGTAATTTTCGGAGAAAGCAGTGTCTAGAAATGGACTATACTGCCAGTTTCCGGATTGAAATAGCCGATGTTAGCCAAGGCTTGGGATTAATTGCTCCTGTGATCAACTGTGATTCATTGTTTAACTTTGTGGTTTCCTATGGGAATTACACTTGGAAGACGATGGAGTATGGTAGTATCGCCATCGTGGTGGATGAGATTGGTTCAAACGGATTAAGCCAAAACCAAAGAGGTGTTGCCGACCTTAAAGGGCTTCTTAGGAGTAAGATTAAACACTCGAAAAGGGCTGCACCAGCCTTGGTTTTACCAAAAGAAGTGCCTTCTTTGGAGAAAGAGGTTAACAAATCTCCCCTTTCCAGGATTGACAGCTGGAGAGGAGTGCCGGGATCTAATTCCGGTAAGCCGTGA
| 11,213
|
OR683415.1
|
raspberry enamovirus 1
|
Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2023-11-06
|
64/2021
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raspberry enamovirus 1
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Enamovirus
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Solemoviridae
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ssRNA(+)
| 5,610
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GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
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Rubus idaeus
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plant leaf
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2021
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate 64/2021, complete genome
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ATCAACTGATTTGTAACCGTACGAACAAGATTTGTTGGTTCTTTCTTTTATGTGGTTGGATTTTGATTTTATTCAACACGGTTTGTTTCGAGGAATAGTGCCGCACGCGCGATTGTTCAGTGCTGATCACTCACAGCCTATGATTGTGAGACGGTCTATGTTCACATCTTGCACGTTGCCTATAATCCATCACAACCAACACATTTTCTACACCCAAAATGCTGAAGGCTATCTACGTTACGTTCTGGCTTTTCTTGTGGGTGTCTTGGACAGGCACATCGAGCATGGTGAATGCGCTCGAGATTGTGCCACCCCCTACTATGTCACGGCCCAAATCCTCCTGTTGGTGCTTACCCACCCCGCATCTCCCATCAGAATTGCTGGGGTCAGGTGGGCTTCTGATCAATGGATTGAAGTCGAATCCTCCCTTGTCCTTCGCCAGCTTGCAAGAGCTCTTGGGAGGCTTGGGATGTGTTTGCGCCAACCCGATATGGCAGAACCATACCCTAACAGACCTCGCTTTAAACTATACGAGCTGTGTGGATTGGCAAACCGAGGGGAACGGGCTATGGCTGGTTCGGGTGAATGGGTCCCGTTGTTTGACTTCGTTGATGATGCCCAAACTCTGGTTGATATCAGCTGGACGAGAGGTGATGAACATGGTTTCGATACTCCCAGGTCCCATTGTACGGATCCTGCACGATTCTGGGAATTTATTCTCAGGATTGCTGGAGACATGGATCGTCGCTCTATTAACTCTCTCACGGGATCTGTTAGCTACACTAATTGGCCTACTAGAAACCTTGTACATACATTACAGTGTGGCAAGTCTCTGGGGGGCATTTTACGTGCTGACATCACACCCGCGGCGCTTTATCATGACTGGAATGCTCACTGCATTCATTTGCTGGGCGAAAGAGGTGACATTTTCTCGACTACTCCTGAATTGGTACATGGTGCCTATGAAAATTATGACTCTGAGTCTGACCTTGATGATGAAGATTTTATCGAATTTGATGGGTCGGATCTGGAAGATGATTAGGGTGCCAGTGGATGTCTGTGAACGGTTGCTTGATGCGTGGCCTAGGACTCGGATATCTGCGATTCCTCCGAAAGGGGTGATTGTTAGATTTGAAGATGACTTTGGTCATGTTGGTTTTGGCTCCTGTATTAGGGTTGCGTGCTTGAAAGGTATCTATTGTTGGGTGCCCAAGCATGTTCTTGACTACAGTACCACAATAAGGGGGCCGAAAGGCTCCATGAGTGTGACTTTGATGAGGCCCTTTTATGAGGACTTTACAGGGGACAGTATTCTTTTGCGGGGACCAGATAATTGGAACTCGAATTTGGGACTGAAACCTGCGGATGTCTTGCCTATAACCAGGGCGCGCCGTGGCTCCACCAAATTCTATATCGAGCGCGAGGTGAAAGAGGGGCAAGGTTTTACTTGGTTTTGCCAAACCGCCGACCTATATGAGATGTACAAAGGTTTCATTAGGGTTGGGGTTGAAAGCGAGCCTGGTGATTCTGGACTTCCTTACTTTTCGGGAAACAAGATTGTTGCTATGCATGTTGGAGCGTATGGTGACATCAATGAAAACAAGGCCACTTTTCTGGTTGAAATTCCTGGCATTACAGGGCCGGCTTACTTGGTTGAAAGTGCACACACTGAAACTAGGTTGCTAACCTTGGCTGAGGACATCGCAGAAGGTGAAGAACTCCTGGCTAGAGTTGTTAAAATAGCCGGCGCCAACTACCAGGTCAGTCTAAACAACACTGTGCAGAAGAGACTTGGTTTGGCCTACAAGCCTAAAGGCCGACACTGGGGAGACGTCTCAGATGATGAAGATGATGATTCTTATAAGGACGATATCCTCAGAACTTTTGGAGCTTTGGAAAAGACTTATGACAGGAAATCCCGTTCTGAACCACCTAAGTTTGAGAGTGAAAACTTTCGGACATTGGAGGAGAAGAATGGAATCAATGATGTTCGTCCTGATCCAACTAAGCCCGAGGATTTAAACTTAAGGCCCCGGTACACCTCCGGGAAAACAAAGGTGGAGTTGATGCAGGAGAATGCGGATATTCTCGAACAGCTGGTGAATCTAGCGGCAATCAAGAGCGAAGATCTCGAGAGCGCCAAGATGCTAAAGCAGTTCCTGAGCCCAGTTTTCGAAGCAGTAGGCAGCGACAAAAGTGGAAAGGCCAAAGAAGGAAGCGGGGCCCCGCTTGGGATGACCTCCCGAGTGAAGGACCCATCGACATCTGCGGACCAATCACCAAAGCTGTCCCGAAGTGCCAAGAGAAACCTGCGAAAGAAGGCAAAGAGACAGGAGGCCAAGCTAGAAAAGCAAAGAAGCAAAACTGTCATCAATGCCCCAATTCCCCAGGATCCGAAGGAAGCCCCCAAGTTGAAAGACAAGGGGAAGAAGAAAATGGAAGAAGGGGAGAAGAAGCAAAGGCCGGTCAAGAAAGTCCAGATTCGCAAGAAGGGTGGTTCACTCGACTTTGCGGAGGTGGAACGGATGGTGGCCGATGCGATTATCAGAGGAATCTCCAAGGCCGCAAGACCTCCATTGAAGGACTCTTCCCCGAGTTCTACAAGTGGTCCGAAAGAATGAGCCAAGGAAGACATGGAGAGGCTCCGCCTGGGTTCGCCTGGGTGGGGTATTGCCAGGCATTTTACTATCCACCTCATGATAAGGGGTTGTCTAGTTTTGGAAAGCAGCTGATGGAGCAACATGCTTGGCTGTCTGAGATCTGTAAAGATTTTGGATGGCCTCAGTTTGGGGCTTCTGCTGAGTTTCGATCTTTGACCCTACAAGCCGAACGCCGCATTAAGGCTATAAATAGTGCGGAAATCCCCCCCTTAAAGAAACGGTTGGCTGTAATGGCTGACTGCGCCAAGAGGTATTGGGGTGTGAGGATGCTCTGTCCGAATTGGGCTCGTAATGGGCTTGATAAGGTGGCCGGTTGGTCGGAATTTCTAGACAGTGTACACAGTCTGGAGCCCACTGCCGGGAGTGGAGTTCCTTATGCCATGTGGAGTGGCAGGAAAACCCATGAAGATTGGGTGGGCGAACGCGGTAGTCTCGTAGAAATATGGGATTTAGTGTGGACCCGCTTGAACAGAATGGAGGATTATTGCTTCTCTACTGCTGAACAGGCTGTGAAGGATGGGATTTGTGACCCTATAAGGCTCTTCGTCAAAGGAGAACCGCATAAGATTGCTAAGTTGAAAGAGGGTAGATACCGCTTAATTGCGAGTGTTTCTCTAGTAGACCAGCTGATTGCGCGGATGCTCTTTGGTTTTCAAAATAAAAGAGAGCTTAGGTGTTACCGAGAAATACCGAGTTGTCCAGGTATGGGTTTGAGCACTGATGATCAAGTACTTGAGTTCGTAACCCGCCTGGCCGACAAGGTTGGTGTTGATCCACAAGACCTGGTTGAGAACTACCAGGATTACATAGTACCTACGGATTGCTCCGGTTTCGATTGGAGTGTTCCGGAGTGGCTTCTGGAGGATGATTTAGAGGTCAGGAATGTTTTGACGCAGCAACTGTCTCCCACGATGTTTAAGTTGAGGAAGACTTGGTTAAAGTGTCTCAATAATTCTGTCTTTTGTTTGTCTGACGGCTCGCTCCTAGCGCAGACCATACCTGGCGTACAGAAATCGGGTTCGTACAATACCTCCTCCTCTAATTCGAGGATGCGGGTTATGTTGTCCCAATATGCTGGTGCTGAGTGGTGTTTTGCAATGGGGGATGATGCAATTGAGAGCATCTCCACTGATCTTAGTGTCTATCAGACTCTTGGGATTAAGTGTGAGAAGGCTGAAAAGTTTGATTTCTGCTCTCATATTTTCGTCGAACCTTCAGTGGCCGTTCCTGTAAATGTGGGGAAAATGCTCTACGGAGTTTTGTGTGGTCACCACCCAGATAGTGTCTCAGATGCTGACAAGTTGAAATATTATGAGTCGGCTATGGCCGTGGCTAATGAGCTGAGGCACCTTCCCGAGGGCTTATATCTTAAAATCTTGCGTGCTCTGGATCTCGTGAGCTAGGACGAGCACAAAATTTTAAAAGAGGGAAGTAAAATATATAAGTATATATAATAATATAATTACAATGGCGAAGAAGAAGACTGGAATGACCAAATCTCAGAAGCGTAATCAGAAGAGGAAAGCCAAGGCTCTCGCTGCGAAGAAAGCAGGCACGAAGGTTCAACCCCGAAAGGGGAAGACCAACCGGGCTAGCTCGAGCGGTGGGGGTTTTAAAGCTACTACTCAGACAACTATGCATTATGAGTGGACAACCAACACGGTGAAAGGAAATGATAACGGCAAGGTGGTGATCGGAAAAGACTCTACTTATGAGAAATTGAAGAATGCCATCGCTGGATACCAACGGTACCGAGTGTTTCACTTTGAGGTTCTATACATTACTGAGGCAGCCTCTACTGATAGGGGCTGTTTGGCGTATCGGCTTGATAATTCCAATTCTTTGAGCTCTAAGGGGTTGTCGAAAGATAATACCTGGGGCTTGAGGTCTAATGGGAGAGTCGCTTACAACAAAACTCAGCTGTGTGACAAGGACTTCTATGAGTTTAATGAGAACCAGTTTGCCTTTCTTTATGAGGGTACTGGGGAATCGGTTACTGTTGGTCATATGAAATACCGCTGTTCTGTTCTTCTTAGTATGCCTAAATAGGATGTTGGCAGTCCGTCGCCATCTCCTGCCCCTGAACCTCCTTCCCCTTCCCCTAGTCCTGAACCCCCTGCGGAGCCAAAAGCTTTGTGGGGTTACTGTGGGGTGCCTTCTTGCTTTGTCTACACTCGAAAGAATGACGAAGACATCAGTGTGGGTAAGACCGATTCAATCTCTCTATATAGATGGGAAGATGAGAAGTGGGATAACGCTTCTTTGACTGTCCGTACTGAGAAATCTGATAAAACGGTTAAGCATACCTTTGATATTCCCTTTCGTAAGTTGGGGGTGTTC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| 11,214
|
OR683416.1
|
raspberry enamovirus 1
|
Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2023-11-06
|
ALOJ-12
|
raspberry enamovirus 1
|
Enamovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,247
|
GenBank
| null |
Norway
|
Norway
|
Rubus idaeus
|
plant leaf
|
2021
| null | null |
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|
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| 11,215
|
OR683417.1
|
raspberry enamovirus 1
|
Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2023-11-06
|
ALOJ-13
|
raspberry enamovirus 1
|
Enamovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,792
|
GenBank
| null |
Norway
|
Norway
|
Rubus idaeus
|
plant leaf
|
2021
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate ALOJ-13, complete genome
|
CTGAGATTTTCCAAGTGCAAGATTTCTCTATCAACTGTTTTGTAACTGTACGAACAAGATTTGTTAGTTCTTTTATGTGGTTGGATTTTGATTTTATTCAACACGGTTTGTTTCGAGGGTTAGTACCGCACGCACGTTTATTTAGCGCGGATCATTCTCAGCCTATGATTGTGGCCCGGTCTATGTTCACGTCTTGCTCATTACCAATCATTCATCACAACCAACACATTTTCTACACTCAAAATGCTGAAGGCTACTTACGTTACGTTTTGGCTTTTCTTGTGGGTGTCTTGGATCGGCACATCGAGCATGGTGAATGCGCTCGAGATTGTGCCACCCCCTACTATGTCACGGCCCAAATCCTCCTGTTGGTGCTTACCCACCCCGCATCTCCCATCAGAATTGCTGGGGTCAGGTGGGCTTCTGATCAATGGATTGAAGTCGAATCCTCCCTTGTCCTTCGCCAGCTTGCAAGAGCTCTTGGGAGGCTTGGGATGTGTTTGCGCCAACCCGATATGGCAGAACCATACCCTAACAGACCTCGCTTTAAACTATACGAGCTGTGTGGATTGGCAAACCGAGGGGAACGGGCTATGGCTGGTTCGGGTGAATGGATCCCGCTGTTTGACTTCGTTGATGATGCCCAAACTCTGGTTGATATCAGCTGGACGAGAGGTGATGAGCATGGTTTCGATGCTCCCCGGTCCCATTGTACGGATCCTGCGCGATTCTGGGAATTTATTCTCCGAATTGCTGGGGACATGGATCGCCGCTCTATTAACTCTCTCACGGGATCTGTTAGCTATACTAATTGGCCTACTAGAAACCTTGTACATACACTACAGTGTGGCAAGTCTCTGGGGGGCATTTTACGTGCTGACATCACACCCGCGGCGCTTTATAATGACTGGAATGCTCACTGCTTTTATCTGTTGGGCGAAAGAGGTGACATTTTCTCGACTACTCCTGAACTGGTACATGGTGCCTATGAAAATTACGATTCTGAGTCTGAAGACGATGATGATGATTTTATCGTTTATGACGGTTCGGATTTGGAAGATGATTAAGACACCAGTGGATGTCTGTGAACGGTTGCTTGATGCGTGGCCTAGGACTCGGATCTCTGCGATTCCTCCAAAAGGGGTTATTGTTAGATTTGAGGATGATTTTGGTCATGTGGGTTTTGGCTCCTGTATTAGGGTTGCGTGTTTAAAAGGCATCTATTGTTGGGTGCCCAAGCATGTCCTTGACTATAGTACCACAATAAGGGGGCCGAAAGGTTCCATGAGTGTAACTTTGATGAGGCCCTTTTATGAGGATTTCACGGGAGACAGTATCCTTTTGCGAGGACCAGACAACTGGAACTCAAATTTGGGACTGAAGCCTGCGGATGTCTTGCCCATAACCAGGGCGCGTCGCGGTTCTACTAAGTTCTATATCGAGCGCGAAGTGAAAGAGGGACAAGGTTTTACTTGGTTTTGCCAAACAGCTGACCTGTATGAGATGTACAAAGGTTTTATTAGGGTTGGGGTTGAAAGCGAGCCTGGTGATTCTGGACTTCCTTATTTTTCGGGAAACAAGATTGTTGCTATGCATGTTGGAGCGTATGGCGACATCAATGAAAACAAAGCCACCTTTCTGGTTGAAATCCCTGGCATTACTGGGCCGGCCTATTTGGTTGAAAGTGCACACACTGAAACTAGGTTGCTGACCCTGGCTGAGGACATCGCAGAGGGTGAAGAACTCTTGGCTAGAGTTGTTAAAGTAGCCGGTTCCAACTACCAGGTCAGTCTAAACAACACTGTGCAGAAGAGACTTGGTCTGGCCTATAAGCCTAAAGGCCGGCATTGGGGAGACGTCTCGGACGATGAAGATGATGATTCATACAAGGACGATATCCTCAAAACATTCGGGGCTTTGGAGAGTACTTACGACAGAAAACCCCGTTTTGATCCACCTTTGGAGGAGAAGAATGGAGTTAATGAAGTTCGTCCAGATCCTACTAAGCCCGAGGATTTAAACTTAAGGCCCCGGTACACCCCCGGGAAAACAAAGGTGGAACTGATGCAGGAGAATGCGGAAATTCTCGAACAGCTGGTGAATCTAGCGGCAATCAAGAGCGAAGATCTCGAGAGCGCCAAGATGCTAAAGCAGTTCCTGAGCCCAGTTTTCGAAGCAGTAGGCAACGACAAAAGTGGAAGGGCCAAAGAAGGAAGCGGGGATCAGCCTGGGATGACCTCCCAAGTGAAGGACCCATCGACATCTGCGGACCAATCACCAAAGTTGTCCCGAAGTGCCAAGAGAAACCTGCGAAAGAAGGCAAAGAGACAGGAAGCCAAGCTAGAAAAGCAAAGAAGCAAGACTGTTATCAATGCCCCAATTCCTCCAGCTCCAAAAGAAGCCCCCAAGTCCAAGGACAAAGGGAAGAAGAAAATGGAAGAGGAAAAGGAAAAGAAGCAAAGGCCGGTCAAGAAGGTCCAGATTCGCAAGAAGGGTGGTTCACTCGACTTTGCGGAGGTGGAACGGATGGTGGCCGATGCGATTATCAGAGGAATCTCCAAGGCCGCAAAACCTCCATTGAAGGACTCTTCCCAGAGTTCTACAAGTGGTCCGAAAGAATGAGCCAAGGAAGACATGGAGAGGCTCCGCCTGGGTTCGCCTGGGTGGGGTATTGCCAGGCATTTTACTATCCGCCTCATGATAAAGGGTTGTCTAGTTTTGGGAAACAGCTGATGGAGCAACATTCTTGGCTGTCTGAGATCTGTAAAGATTTTGGATGGCCTCAGTTTGGGGCTTCTGCTGAATTCCGATCTTTGACCCTACAAGCCGAACGCCGCATTAAGGCTATAAATAGTGCGGAAATCCCTCCCCTTAAGAAGCGATTGGCTGTAATGGCTGATTGTGCCAAGAGATATTGGGGCGTGAGGATGCTCTGTCCGAATTGGGCTCGTAATGGGCTTGATAAGGTGGCCGGCTGGTCGGAATTTCTAGACAGTGTACACAGTCTGGAGCCTACTGCCGGGAGTGGAGTTCCCTATGCTATGTGGAGTGGCAGGAAAACCCATGAAGATTGGGTGGGTGAACACGGTAGTCTCGTAGAAATATGGGACTTAGTGTGGACTCGCTTGAACAGAATGGAGGACTACTGTTTCTCTACAGCTGAACAGGCTGTGAAGGATGGGATTTGTGACCCCATAAGGCTCTTCGTTAAAGGAGAACCGCATAAGATAGCAAAGTTGAAAGAGGGTAGATACCGCTTAATAGCGAGTGTTTCTCTAGTAGACCAGCTGATTGCGCGGATGCTCTTTGGTTTTCAAAATAAAAGAGAGCTTAGGTGTTACCGAGAAATACCAAGTTGTCCGGGTATGGGTTTGAGCACTGATGATCAAGTACTTGAGTTCGTAACCCGCCTGGCCAGCAAGGTTGGTGTTGATCCACAAGACCTGGTTAAGAATTATCAGGATTACATAGTACCCACGGATTGCTCTGGTTTCGACTGGAGTGTTCCGGATTGGCTTCTGGAGGATGATTTAGAGGTCAGGAATGTTTTGACGCAGCAACTGTCTCCCACGATGTTTAAGTTGAGGAAGACTTGGTTAAAGTGTCTTAATAATTCTGTCTTTTGTCTATCTGACGGCTCGCTCCTAGCGCAGACCATACCTGGTGTACAGAAATCGGGTTCATACAATACCTCCTCCTCTAATTCAAGGATGCGGGTTATGTTGTCCCAATATGCTGGTGCTGAGTGGTGTTTTGCAATGGGAGATGACGCGATTGAGAGCACCTCTACTGATCTCAGTGTCTATCAGACTCTTGGGATTAAGTGTGAGAAGGCTGAAAAGTTTGATTTTTGTTCTCATATCTTCGTTGAACCTTCGGTGGCAATTCCAGTAAATGTGGGGAAGATGCTCTACGGAGTTTTGTGTGGTCACCACCCAGATAGTGTCTCAGATGCTGACAAGTTGAAATATTATGAGTCGGCCATGGCTGTAGCCAATGAATTGAGGCACCTTCCCGAGGGCTTATATCTTAAAATCTTGCGTGCTCTGGATCTCGTGAGCTAAGGCGAGCACAAAATTTTAAAAGAGGGAAGTAAAATATATAAGCATATATAATAATATAATCATAATGGCGAAGAAGAAGACTGGAATGACCAAATCTCAGAAGCGTAATCAGAAGAGGAAAGCTAAGGCTCTCGCTGCGAAGAAGGCAGGCACGAAGGTTCAACCTCGAAAGGGGAAGACCAACCGGGCTAGCTCGAGCGGTGGAGGCTTTAAAGCTACTACTCAGACGACGATGCATTATGAGTGGACAACCAACACGGTGAAAGGAAATGATAACGGCAAGGTGGTGATCGGAAAAGACTCAACTTATGAGAAATTGAAGAATGCCATCGCTGGATACCAACGGTACCGAGTGTTTCACTTTGAGGTTCTATACATTACTGAGGCAGCTTCTACTGATAGGGGTTGTTTGGCGTATCGACTTGATAATTCCAATTCTTTGAGTTCTAAGGGATTGTCGAAAGATAATACCTGGGGCTTGAGGTCTAATGGGAGAGTCGCTTACAACAAAACTCAGCTGTGTGACAAGGATTTCTATGAGTTTAATGAGAACCAGTTTGCCTTTCTTTATGAGGGTACTGGGGAATCGGTTACTGTTGGTCATATGAAATACCGTTGTTCTGTTCTTCTTAGTATGCCTAAATAGGATGTTGGCAGTCCGTCGCCTTCTCCTGCCCCTGAACCTCCTTCCCCTTCCCCTAGTCCTGAACCCCCCGTAGAGTCAAAAGCTTTGTGGGGTTACTGTGGGGTGCCTTCTTGCTTTGTCTATACTCGAAAGAATGACGAAGACATCAGTGTGGGTAAGACCGATTCAATCTCTCTATATAGATGGGAAGATGAGAAGTGGGATAACGCTTCTTTGACCGTCCGTACTGAGAAATCTGATAAAACGGTTAAACATACCTTTGATATTCCCTTTCGCAAGTTGGGAGTGTT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| 11,216
|
OR683418.1
|
raspberry enamovirus 1
|
Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2023-11-06
|
CF322
|
raspberry enamovirus 1
|
Enamovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,765
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Rubus idaeus
|
plant leaf
|
2022
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate CF322, complete genome
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| 11,217
|
OR683419.1
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raspberry enamovirus 1
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Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
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Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2023-11-06
|
CF863
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raspberry enamovirus 1
|
Enamovirus
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Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,742
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Rubus idaeus
|
plant leaf
|
2022
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate CF863, complete genome
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|
OR683420.1
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raspberry enamovirus 1
|
Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2023-11-06
|
CF866
|
raspberry enamovirus 1
|
Enamovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,735
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Rubus idaeus
|
plant leaf
|
2022
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate CF866, complete genome
|
TAAGATCTTTCTATCAACTGATTTGTAACCGTACGAACAAGATTTGTTGGTTCTTTCTTTTATGTGGTTGGAGTTTGACTTTCTTCAACACGGTTTGTTTCGAGGAATAGTGCCGCACGCGCGATTGTTCAGTGCTGATCACTCCCAGTCTATGATTGTGAGACGGTCTATGTTCACATCTTGCACGTTGCCTATAATCCATCACAACCAACACATTTTCTACACCCAAAATGCTGAAGGCTATCTACGTTACGTTTTGGCTTTTCTTGTGGGTGTCCTGGAACGACACATCGAGCACGGTGAATGCGCTCGAGATTGTGCCACCCCATACTATGTCACGGCCCAAATCCTCCTGTTGGTGCTTACCCACCCCGCATCTCCCATCAGAATTGCTGGGGTCAGGTGGGCTTCTGATCAATGGATTGAAGTCGAATCCTCCCTTGTCCTTCGCCAGCTTGCAAGAGCTCTTGGGAGGCTTGGGATGTGTTTGCGCCAACCCGATATGGCAGAACCATACCCTAACAGACCTCGCTTTAAACTATACGAGCTGTGTGGATTGGCAAACCGAGGGGAACGGGCTATGGCTGGTTCGGGTGAATGGGTCCCGTTGTTTGACTTCGTTGATGATGCCCAAACTCTGGTTAATATCAGCTGGACGAGAGGTGATGAACATGGTTTCGATACTCCCAGGTCCCATTGTACGGATCCTGCGCGATTCTGGGAATTTATTCTCAGGATTGCTGGAGATGTGGATCGTCGCTCTATTAACTCTCTCACGGGATCTGTTAGCTACACTAATTGGCCTACTAGAAACCTTGTACATACATTACAGTGTGGCAAGTCTCTGGGGCGCATTTTATGTGCTGACATCACACCCGCGGCGCTTTATAATGACTGGAACAATCACTGCTTTTATCTGTTGGGCGAAAGGAGTGACATTTTCCCGACTACTCCTGAATTGGTACATGGTGCCTTTGAAAATTATGACTCTGAGTCTGACCTTGATGATGAAGATTTTATCGAGTTTGATGGGTCGGACCTGGAAGATGATTAAGACCCCAGTGGATGTTTGTGAGCGGTTGCTTGATGCTTGGCCTAGGACTCGGATTTCTGCGGTTCCTCCGAAAGGAGTTATTGTTAGATTTGAAGATGACAATGGTCATGTTGGTTTTGGCTCCTGTGTTAGGGTTGCGTGTTTGAAAGGTATCTATTGTTGGGTGCCCAAGCATGTTCTTGACTATAGTACCACAATAAGAGGACCGAAAGGTTCAATGAGTGTGACTTTGATGAGACCCTTTTACACTGACGAGGAGGGAGACAGTATCCTTTTGCGAGGACCAGATAACTGGAACTCAAATTTGGGACTGAAACCAGCCGATGTTTTGCCTGTAACCAGAGCCCGCCGTGGTTCCACCAAGTTTTACATTGAGCGTGAAGTGGAGAAGGGAAAAGGGTATACCTGGTTTTGCCAGACTGCCGACCTGTATGAAATGTATAGAGGTTTTATTAGGGTTGGTGTTGAAAGCGAGCCTGGGGATTCTGGACTCCCTTACTTTTCAGGAAACAAAATTGTTGCTATGCATGTTGGAGCGTATGGTGACATAAATGAAAACAAAGCCACTTATCTGGTGGAGATCCCCGGCGTCACAGGTCCGGCCTACTTGGTTGAAAGTGCACACACTGAAACTAGGTTGCTGACTTTAGCTGAGGACATCGCAGAAGGTGAAGAGCTCTTGGCCAGAGTTGTTAAAGTGGCCGGCTCCAGATACCAGGTCAGTTTAAACAATACAGTACAGAAGCGACTTGGGTTGGCCTATAAGCCTAAAGGCCGACACTGGGGAGACGTCTCGGATGATGAAGATGATGACTCATATAAAGACGATATCCTCAGAACATTCGGGGCTTTGGAGAGTACCTACGACAGAAAACCTCGTTCTGATCTAAAAGAGAAGAATGGAGTTGATGAAGTTCGTCCTGATCCTACCAAGCCCGAGGATTTAAACTTAAGGCCCCGGTACACCTCCGGGAAAACAAAGGTGGAATTGATGCAGGAGAATGCGGAAATTCTCGAACAGCTGGTGAATCTAGCGGCAATCAAGAGCGAAGATCTCGAGAGCGCCAAGATGCTAAAGCAGTTCCTGAGCCCAGTTTTCGAAGCAGTAGGCAACGACAAAAGTGGAAGGGCCAAAGAAGGAAGCGGGGACCAGCCTGGGATGACCTCCCAAGCGAAGGACCCATCGACATCTGCGGACCAATCACCAAAGTTGTCCCGAAGTGCCAAGAGAAACCTGCGAAAGAAGGCAAAGAGACAGGAAGCCAAGCTGGAAAAGCAGAGAAGCAGAACTGTTATCAATGCCCCAATTCCTCCAGCTCCAAAAGAAGCCCCCAAGTCCAAGGACAAAGGGAAGAAGAAAATGGAAGAGGAAAAGGAAAAGAAGCAAAGGCCGGTCAAGAAGGTCCAGATTCGCAAGAAGGGTGGTTCGCTCGACTTTGCGGAGGTGGAACGGATGGTGGCCGATGCGATTATCAGAGGAATCTCCAAGGCCGCAAAACCTCCATCGAAGGACTCTTTCCAGAGTTCTACAAGTGGTCCGAAAGAATGAGCCAAGGGAGACATGGAGAGGCTCCGCCTGGGTTCGCCTGGGTGGGGTATTGCCAGGCATTTTACTATCCGCCTCATGATAAGGGGTTATCTAGTTTTGGGAAACAGCTGATGGAGCAACATTCTTGGCTGTCTGAGATCTGCAAAGATTTTGGATGGCCTCAGTTTGGGGCTTCTGCTGAGTTCCGATCCTTGACCCTACAAGCCGAACGCCGCATTAAGGCTATAAATAGTGCGGAAATCCCTCCCCTGAAGAAGCGATTGGCTGTAATGGCCGATTGTGCCAAGAGATATTGGGGTGTGAGGATGCTCTGTCCGAATTGGGCTCGTAATGGGCTTGATAAGGTGGCCGGTTGGTCGGAGTTTCTAGACAGTGTACACAGTCTGGAGCCTACTGCCGGGAGTGGAGTTCCTTATGCTATGTGGAGTGGCAGGAAAACCCATGAAGATTGGGTGGGCGAACGCGGTAGTCTCGTAGAAATATGGGATTTAGTGTGGACCCGCTTGAACAGAATGGAGGATTACTGTTTCTCTACTGCTGAACAGGCAGTGAAGGATGGGATTTGTGACCCCATAAGGCTCTTCGTTAAAGGAGAACCGCACAAGATAGCAAAGTTGAAAGAGGGTAGATACCGCTTAATTGCGAGTGTTTCTCTAGTAGACCAGCTGATTGCGCGGATGCTCTTTGGTTTTCAAAATAAAAGAGAGCTTAGGTGTTACCGAGAAATACCGAGTTGTCCGGGTATGGGTTTGAGCACTGATGATCAAGTACTTGAGTTCGTAACCCGCCTGGCCAGCAAGGTTGGTGTTGATCCACAGGACCTGGTTGAAAATTACCGGGATTATATAGTACCCACGGATTGCTCTGGTTTTGACTGGAGTGTTCCGGATTGGCTTCTGGAGGATGATTTAGAGGTCAGGAATGTTTTGACGCAGCAACTGTCTCCCACGATGTTTAAGTTGAGGAAGACCTGGTTAAAGTGTCTTAATAATTCTGTCTTTTGTCTATCTGACGGCTCGCTCCTAGCGCAGACCATACCTGGCGTACAGAAATCGGGCTCATACAATACCTCTTCCTCCAATTCGAGGATGCGGGTTATGTTGTCCCAATATGCTGGTGCTGAGTGGTGTTTTGCAATGGGGGATGATGCGATTGAGAGCACCTCTACTGATCTCAGTGTCTATCAGACTCTTGGGATTAAGTGTGAGAAGGCTGAAAAGTTTGATTTCTGCTCTCATATCTTCGTCGAACCTTCGGTGGCAATTCCAGTGAATGTGGGGAAAATGCTCTACGGAGTTTTGTGTGGTCACCACCCAGATAGTGTCTCGGATGCTGACAAGTTGAAATATTATGAGTCGGCTATGGCTGTGGCTAATGAGCTGAGACACCTTCCCGAGGGCTTATATCTTAAAATCTTGCGTGCTCTGGATCTCGTGAGCTAAGGCGAGCACAAAATTTTAAAAGAGGGAAGTAAAATATATAAGTATATATAATAATATAATTATAATGGCGAAGAAGAAGACTGGAATGACCAAATCTCAGAAGCGTAACCAGAAGAGGAAAGCTAAGGCTCTCGCTGCAAAGAAAGCAGGCACGAAGGTTCAACCCCGAAAGGGGAAGACCAACCGGGCTAGCTCGAGTGGCGGGGGCTTTAAAGCTACTACTCAGACAACTATGCATTATGAGTGGACAACCAACACGGTGAAAGGAAATGATAACGGCAAGGTGGTGATCGGAAAAGACTCAACTCATGAGAAATTGAAGAATGCCATCGCTGGATATCAACGGTACCGAGTGTTTCACTTTGAGGTTCTATACATCACTGAGGCAGCCTCTACTGATAGGGGTTGTTTGGCGTATCGGCTTGATAATTCCAATTCTTTGAGCTCTAAGGGGTTGTCGAAAGATAACACCTGGGGCTTGAGGTCTAATGGGAGGGTCGTTTACAACAAAACTCAGCTGTGTGATAAGGACTTTTATGAGTTTAATGAGAACCAGTTTGCCTTTCTTTATGAGGGTACTGGGGAATCGGTTACTGTTGGTCACATGAAATACCGCTGTTCTGTTCTTCTTAGTATGCCTAAATAGGATGTTGGCAGTCCGTCGCCTTCTCCTGCCCCTGAACCTCCTTCCCCTTCCCCTAGTCCTGAACCCCCTGCGGAGCCAAAAGCTTTGTGGGGTTACTGTGGGGTGCCTTCTTGCTTTGTCTATACTCGAAAGAATGACGAAGACTTCAGTGTGGGAAATACCGATTCAATCTCTCTATATAGATGGGAAGATGAGAAGTGGGAAAACGCTTCTTTGACTGTCCGTACTGAGAAATCTGATAAAACGGTTAAACACACCTTTGATATCCCTTTTCGTAAGTTGGGGGTGTTTGAGGTCCATATTGAATGT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| 11,219
|
OR683421.1
|
raspberry enamovirus 1
|
Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2023-11-06
|
CF867
|
raspberry enamovirus 1
|
Enamovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,765
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Rubus idaeus
|
plant leaf
|
2022
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate CF867, complete genome
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| 11,220
|
OR683422.1
|
raspberry enamovirus 1
|
Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2023-11-06
|
CF872
|
raspberry enamovirus 1
|
Enamovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,765
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Rubus idaeus
|
plant leaf
|
2022
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate CF872, complete genome
|
TAAGATCTTTCTATCAACTGATTTGTAACCGTACGAACAAGATTTGTTGGTTCTTTCTTTTATGTGGTTGGATTTTGATTTTATTCAACACGGTTTGTTTCGAGGAATAGTGCCGCACGCGCGATTGTTCAGTGCTGATCACTCACAGCCTATGATTGTGAGACGGTCTATGTTCACATCTTGCACGTTGCCTATAATCCATCACAACCAACACATTTTCTACACCCAAAATGCTGAAGGCTATCTACGCTACGTTCTGGCTTTTCTTGTGGGTGTCTTGGACAGGCACATCGAGCATGGTGAATGCGCTCGAGATTGTGCCACCCCCTACTATGTCACGGCCCAAATCCTCCTGTTGGTGCTTACCCACCCCGCATCTCCCATCAGAATTGCTGGGGTCAGGTGGGCTTCTGATCAATGGATTGAAGTCGAATCCTCCCTTGTCCTTCGCCAGCTTGCAAGAGCTCTTGGGAGGCTTGGGATGTGTTTGCGCCAACCCGATATGGCAGAACCATACCCTAACAGACCTCGCTTTAAACTATACGAGCTGTGTGGATTGGCAAACCGAGGGGAACGGGCTATGGCTGGTTCGGGTGAATGGGTCCCGTTGTTTGACTTCGTTGATGATGCCCAAACTCTGGTTGATATCAGCTGGACGAGAGGTGATGAACATGGTTTCGATACTCCCAGGTCCCATTGTACGGATCCTGCGCGATTCTGGGAATTTATTCTCAGGATTGCTGGAGACGTGGATCGTCGCTCTATTAACTCTCTCACGGGATCTGTTAGCTACACTAATTGGCCTACTAGAAACCTTGTACATACATTACAGTGTGGCAAGTCTCTGGGGGGCATTTTATGTGCTGACATCACACCCGCGGCGCTTTATCATGACTGGAATGCTCACTGCGTTCATTTGCTGGGCGAAAGAGGTGACATTTTCTCGACTACTCCTGAATTGGTACATGGTGCCTATGAAAATTATGACTCTGAGTCTGACCTTGATGATGAAGATTTTATCGAATTTGATGGGTCGGATCTGGAAGATGATTAGGGTGCCAGTGGATGTCTGTGAACGGTTGCTTGATGCGTGGCCTAGGACTCGGATATCTGCGATTCCTCCGAAAGGGGTGATTGTTAGATTTGAAGATGACTTTGGTCATGTTGGTTTTGGCTCCTGTATTAGGGTTGCGTGCTTGAAAGGTATCTATTGTTGGGTGCCCAAGCATGTTCTTGACTACAGTACCACAATAAGGGGGCCGAAAGGCTCCATGAGTGTGACTTTGATGAGGCCCTTTTATGAGGACTTTACAGGGGACAGTATTCTTTTGCGGGGACCAGACAACTGGAACTCGAATTTGGGACTGAAACCTGCGGATGTCTTGCCTATAACCAGGGCGCGCCGTGGCTCCACCAAATTCTATATCGAGCGCGAGGTGAAAGAGGGGCAAGGTTTTACTTGGTTTTGCCAAACAGCCGACCTATATGAGATGTACAAAGGTTTCATTAGGGTTGGGGTTGAAAGCGAGCCTGGTGATTCTGGACTTCCTTACTTTTCGGGAAACAAGATTGTTGCTATGCATGTTGGAGCGTATGGTGACATCAATGAAAACAAAGCCACTTTTCTGGTTGAAATTCCTGGCATTACAGGGCCGGCTTACTTGGTTGAAAGTGCACACACTGAAACTAGGTTGCTAACCTTGGCTGAGGACATCGCAGAAGGTGAAGAACTCCTGGCTAGAGTTGTTAAAATAGCCGGCACCAACTACCAGGTCAGTCTAAACAACACTGTGCAGAAGAGACTTGGTTTGGCCTACAAGCCTAAAGGCCGACACTGGGGAGACGTCTCAGATGATGAAGATGATGATTCTTATAAGGACGATATCCTCAGAACTTTTGGAGCTTTGGAAAAGACTTATGACAGGAAATCCCGTTCTGAACCACCTAAGTTTGAGAGTGAAAACTTTCGGACATTGGAGGAGAAGAATGGAATCAATGATGTTCGTCCTGATCCAACTAAGCCCGAGGATTTAAACTTAAGGCCCCGGTACACCTCCGGGAAAACAAAGGTGGAGTTGATGCAGGAGAATGCGGATATTCTCGAACAGCTGGTGAATCTAGCGGCAATCAAGAGCGAAGATCTCGAGAGCGCCAAGATGCTAAAGCAGTTCCTGAGCCCAGTTTTCGAAGCAGTAGGCAGCGACAAAAGTGGAAAGGCCAAAGAAGGAAGCGGAGCCCCGCTTGGGATGACCTCCCGAGTGAAGGACCCATCGACATCTGCGGACCAATCACCAAAGCTGTCCCGAAGTGCCAAGAGAAACCTGCGAAAGAAGGCAAAGAGACAGGAGGCCAAGCTAGAAAAGCAAAGAAGCAAAACTGTCATCAATGCCCCAATTCCCCAGGATCCGAAAGAAGCCCCCAAGTTGAAAGACAAGGGGAAGAAGAAAATGGAAGAAGGGGAGAAGAAGCAAAGGCCGGTCAAGAAAGTCCAGATTCGCAAGAAGGGTGGTTCACTCGACTTTGCGGAGGTGGAACGAATGGTGGCCGATGCGATTATCAGAGGAATCTCCAAGGCCGCAAGACCTCCATTGAAGGACTCTTCCCCGAGTTCTACAAGTGGTCCGAAAGAATGAGCCAAGGAAGACATGGAGAGGCTCCGCCTGGGTTCGCCTGGGTGGGGTATTGCCAGGCATTTTACTATCCACCTCATGATAAGGGGTTGTCTAGTTTTGGAAAGCAGCTGATGGAGCAACATGCTTGGCTGTCTGAGATCTGTAAAGRTTTTGGATGGCCTCAGTTTGGGGCTTCTGCTGAGTTTCGATCTTTGACCCTACAAGCCGAACGCCGCATTAAGGCTATAAATAGTGCGGAAATCCCCCCCTTAAAGAAACGGTTGGCTGTAATGGCTGACTGCGCCAAGAGGTATTGGGGTGTGAGGATGCTCTGTCCGAATTGGGCTCGTAATGGGCTTGATAAGGTGGCCGGTTGGTCGGAATTTCTAGACAGTGTACACAGTCTGGAGCCCACTGCCGGGAGTGGAGTTCCTTATGCCATGTGGAGTGGCAGGAAAACCCATGAAGATTGGGTGGGCGAACGCGGTAGTCTCGTAGAAATATGGGATTTAGTGTGGACCCGCTTGAACAGAATGGAGGATTATTGCTTCTCTACTGCTGAACAGGCTGTGAAGGATGGGATTTGTGACCCTATAAGGCTCTTCGTCAAAGGAGAACCGCATAAGATTGCTAAGTTGAAAGAGGGTAGATACCGCTTAATTGCGAGTGTTTCTCTAGTAGACCAGCTGATTGCGCGGATGCTCTTTGGTTTTCAAAATAAAAGAGAGCTTAGGTGTTACCGAGAAATACCGAGTTGTCCAGGTATGGGTTTGAGCACTGATGATCAAGTACTTGAGTTCGTAACCCGCCTGGCCGACAAGGTTGGTGTTGATCCACAAGACCTGGTTGAGAACTACCAGAATTATATAGTACCTACGGATTGCTCCGGTTTCGATTGGAGTGTTCCGGAGTGGCTTCTGGAGGATGATTTAGAGGTCAGGAATGTTTTGACGCAGCAACTGTCTCCCACGATGTTTAAGTTGAGGAAGACTTGGTTAAAGTGTCTCAATAATTCTGTCTTTTGTTTGTCTGACGGCTCGCTCCTAGCGCAGACCATACCTGGCGTACAGAAATCGGGTTCGTACAATACCTCCTCCTCTAATTCGAGGATGCGGGTTATGTTGTCCCAATATGCTGGTGCTGAGTGGTGTTTTGCAATGGGGGATGATGCAATTGAGAGCATCTCCACTGATCTTAGTGTCTATCAGACTCTTGGGATTAAGTGTGAGAAGGCTGAAAAGTTTGATTTCTGCTCTCATATTTTCGTCGAACCTTCAGTGGCCGTTCCTGTAAATGTGGGGAAAATGCTCTACGGAGTTTTGTGTGGTCACCACCCAGATAGTGTCTCAGATGCTGACAAGTTGAAATATTATGAGTCGGCTATGGCCGTGGCTAATGAGCTGAGGCACCTTCCCGAGGGCTTATATCTTAAAATCTTGCGTGCTCTGGATCTCGTGAGCTAGGACGAGCACAAAATTTTAAAAGAGGGAAGTAAAATATATAAGTATATATAATAATATAATTACAATGGCGAAGAAGAAGACTGGAATGACCAAATCTCAGAAGCGTAATCAGAAGAGGAAAGCTAAGGCTCTCGCTGCAAAGAAAGCAGGCACGAAGGCTCAACCCCGGAAGGGGAAGACCAACCGGGCTAGCTCGAGCGGTGGGGGCTTTAAAGCTACTACTCAGACAACTATGCATTATGAGTGGACTACCAACACGGTGAAAGGAAATGATAACGGCAAGGTGGTGATTGGAAAAGACTCAACTCATGAGAAATTGAAGAATGCCATCGCTGGATACCAACGGTACCGAGTGTTTCACTTCGAGGTTCTATACATTACTGAGGCAGCTTCTACTGACAGAGGTTGTTTGGCGTATCGGCTTGATAATTCCAATTCTTTGAGCTCTAAGGGGTTGTCGAAAGATAATACCTGGGGTTTGAGGTCTAATGGGAGAGTTGTTTACAACAAAACTCAGCTGTGTGACAAGGACTTTTATGAGTTTAATGAGAACCAGTTCGCCTTTCTTTATGAGGGTACTGGGGAATCGGTTACTGTTGGTCACATGAAATACCGCTGTTCTGTTCTTCTTAGTATGCCTAAATAGGATGTTGGCAATCCGTCGCCAGCACCTGCCCCTGAACCTCCTTCCCCTTCCCCTAGTCCTGAACCCCCCGCGGAGCCAAAAGCTTTGTGGGGTTACTGTGGGGTGCCTTCTTGCTTTGTCTATACTCGAAAGAATGACGAAGACATCAGTGTGGGTAAGACCGATTCAATTTCTCTATATAGATGGGAAGATGAGAAGTGGGACAACGCTTCTTTGACTGTCCGTACTGAGAAATCTGATAAAACGGTTAAACATACCTTTGATATTCCCTTTCGCAAG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|
OR683423.1
|
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|
Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2023-11-06
|
CF879b
|
raspberry enamovirus 1
|
Enamovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,742
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Rubus idaeus
|
plant leaf
|
2022
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate CF879b, complete genome
|
CAAGATCTTTCTATCGACTGTTTTGTAACTGTACGAACAAGATTTGTTAGTTCTTTTATGTGGTTGGATTTTGACTTTATTCAACACGGCTTGTTTCGAGGATTAGTACCACACGCACGTTTATTTAGCGCGGATCACTCTCAGCCTATGATTGTGGCCCGGTCTATGTTCACGTCTTGTACACTACCTATCATTCATCACAACCAACACATTTTCTACACTCAAAATGCTGAAGGCTATTTACGTTACGTTTTGGCTTTTCTTGTGGGTGTTTTGGAACGGCACATCGAGCACGGTGAGTGCGCTCGAGATTGTGCCACCCCCTACTATGTCACGGCCCAGATCCTCCTGTTGGTGCTTACCCACCCCGCATCTCCCATCAGAATTGCTGGGGTCAGGTGGGCTTCTGATCAATGGATTGAAGTCGAATCCTCCCTTGTCCTTCGCCAGCTTGCAAGAGCTCTTGGGAGGCTTGGGATGTGTTTGCGCCAACCCGATATGGCAGAACCATACCCTAACAGACCCCGTTTTAAACTATACGAGCTGTGTGGATTGGCAAACCGAGGGGAACGGGCTATGGCTGGTTCGGGTGAATGGATCCCGCTGTTTGACTTCGTTGATGATGCCCAAACTCTGGTTGATATCAGCTGGACGAGAGGTGATGAGCATGGTTTCGATGCTCCCAGGTCCCATTGTACGGATCCTGCACGATTCTGGGAATTTATTCTCCGGATTGCTGGAGACATGGATCGTCGCTCTATTAACTCTCTCACGGGATCTGTTAGCTACACTAATTGGCCTACTAGAAACCTTGTACATACACTACAGTGTGGCAAGTCTCTGGGGCGCATTTTATGTGCTGACGTCACACCCGCGACGCTTTATAATGACTGGAATGCTCACTGCTTTTATCTGTTGGGCGAAAGAGGTGACATTTTCTCGACTACTCCTGAACTGGTACATGGTGCCTATGAAAATTACGACTCTGAGTCTGACCTTGATGATGAGGATTTTATCGAATTTGATGGGTCGGACCTGGAAGATGATTAGGGCTCCTGTGGATGTCTGTGAACGGTTGCTTGACGCATGGCCTAGGACTCGGATTTCTGCGATTCCTCCGAAAGGAGTTATTGTCAGATTTGAAGATGATAATGGTCATGTTGGTTTTGGCTCCTGTGTTAAGGTTTCGTGTTTGAAAGGTATCTATTGTTGGGTGCCTAAGCATGTTCTCGATTATAGTACCAAAATCAGAGGACCGAAAGGTTCGATGAGTGTGACTGTAATGAGGCCCTTTTACACTGACGAGGAGGGGGACAGTATCCTTTTGCGAGGACCAGATAACTGGAACTCAAATTTGGGACTGAAACCAGCTGAGGTCTTGCCTATAACCAGGGCTCGCCGTGGCTCCACCAAGTTCTATATCGAGCGCGAAGTGAAGGAGGGACAAGGATACACCTGGTTTTGCCAAACTGCTGACCTGTATGAAATGTACAGAGGTTTTATTAGGGTCGGTGTTGAAAGTGAACCGGGAGATTCTGGACTCCCTTATTTTTCGGGAAACAAGATTGTTGCCATGCATGTTGGAGCGTATGGTGACATCAATGAAAACAAAGCCACTTTTCTGGTGGAAATCCCAGGCGTAACAGGTCCGGCTTACTTAGTTGAAAGTGCACACACTGAAACTAGGTTGCTGACTTTAGCTGAGGACATCGCAGAAGGTGAAGAACTCTTAGCCAGAGTTGTTAAAGTGGCTGGCTCCAGATACCAGGTCAGTCTAAATAATACTGTGCAGAAGCGACTTGGGTTGGCCTATAAGCCTAAAGGCCGACATTGGGGAGACGTCTCGGATGATGAAGATGATGACTCATATAAAGACGATATCCTCAGAACTTTCGGGGCTTTGGAAAGTACTTACGACAGAAAATCCCGTTCTGAACCACCTAACTTGGAGGAGAAGAATGGTATTCCTGAAGTTCGTCCTGAACCAGCTAAGCCCGAGGATTTAAACTTAAGGCCCCGGTACACCTCCGGGAAAACAAAGGTGGAATTGATGCAGGAGAATGCGGAAATTCTCGAACAGCTGGTGAATCTGGCGGCAATCAAGAGCGAAGACCTCGAGAGCGCCAAGATGCTAAAGCAGTTCCTGAGCCCAGTTTTCGAAGCAATAGGCAACGACAAAAGTGGAAGGGCCAAAGAAGGAAGCGGGGACCAGCCTGGGATGACCTCCCAAGTGAAGGACCCATCGACATCTGCGGACCAATCACCAAAGTTGTCCCGAAGTGCCAAGAGAAACCTGCGAAAGAAGGCAAAGAGACAGGAAGCCAAGCTGGAAAAGCAAAGAAGCAAAACTGTTATCAATGCCCCAATTCCTCCGGTTCCAAAAGAAGCCCCCAAGTCCAAGGACAAGGGGAAGAAGAAAATGGAGGAGGAAAAGGAAAAGAAGCAAAGGCCGGTCAAGAAGGTCCAGATTCGCAAGAAGGGTGGTTCACTCGACTTTGCGGAGGTGGAACGGATGGTGGCCGATGCGATTATCAGAGGAATCTCCAAGGCCGCAAAACCTCCATTGAAGGACTCTTTCCAGAGTTCTACAAGTGGTCCGAAAGAATGAGCCAAGGAAGACATGGAGAGGCTCCGCCTGGGTTTGCCTGGGTGGGGTATTGCCAGGCATTTTACTATCCGCCTCATGATAAGGGGTTATCTAGTTTTGGGAAACAGCTGATGGAGCAACATTCTTGGCTGTCTGAGATCTGCAAAGATTTTGGATGGCCTCAGTTTGGGGCTTCTGCTGAGTTCCGATCCTTGACCCTACAAGCCGAACGCCGCATTAAGGCTATAAATAGTGCGGAAATCCCTCCCCTGAAGAAGCGATTGGCTGTAATGGCTGATTGTGCCAAGAGATACTGGGGCGTGAGGATGCTCTGTCCGAATTGGGCTCGTAATGGGCTCGACAAGGTGGCCGGTTGGTCGGAATTTCTAGACAGTGTACACAGTCTGGAGCCTACTGCCGGGAGTGGAGTTCCTTATGCTATGTGGAGTGGCAGGAAAACCCATGAAGATTGGGTGGGTGAACACGGTAGTCTCGTAGAAATATGGGACTTAGTGTGGACTCGCCTGAATAGAATGGAGGATTACTGTTTCTCTACTGCAGAACAGGCCGTGAAGGATGGGATTTGTGACCCTATAAGGCTCTTCGTTAAAGGAGAACCGCACAAGATAGCGAAGTTGAAGGAGGGTAGATACCGCTTAATTGCGAGTGTTTCTCTAGTAGACCAGCTGATTGCGCGGATGCTCTTTGGTTTTCAAAATAAGAGAGAGCTTAGGTGTTACCGAGAGATACCGAGTTGTCCGGGTATGGGTTTGAGCACTGATGATCAAGTACTTGAGTTCGTAACCCGCCTGGCCAGCAAGGTTGGTGTTGACCCACAAGACCTGGTTAAGAATTACCAGGATTATATAGTACCCACGGATTGCTCTGGTTTCGACTGGAGTGTTCCGGATTGGCTTCTGGAGGATGACTTAGAGGTCAGGAATGTTTTGACGCAGCAACTGTCTCCCACGATGTTTAAGTTGAGGAAGACTTGGTTAAAGTGTCTTAATAATTCTGTCTTTTGTCTATCTGACGGCTCGCTTCTAGCGCAGACCATACCTGGCGTACAGAAATCGGGTTCGTACAATACCTCTTCCTCCAATTCGAGGATGCGGGTTATGTTGTCCCAATATGCTGGTGCTGAGTGGTGTTTTGCAATGGGGGATGATGCGATTGAGAGCACCTCTACTGATCTTAGTGTCTATCAGACTCTTGGGATTAAGTGTGAGAAGGCTGAAAAGTTTGATTTCTGCTCTCATATCTTCGTTGAACCTTCGGTGGCAATTCCAGTAAATGTGGGGAAGATGCTCTATGGAGTTTTGTGTGGTCACCATCCAAATAGTGTCTCAGATGCTGACAAGTTGAAATATTACGAGTCGGCCATGGCTGTAGCTAATGAATTGAGGCACCTTCCCGAGGGCTTATATCTTAAAATCTTGCGTGCTCTGGATCTCGTGAGCTAAGGCGAGCACAAAATTTTAGAAGAGGGAAGTAAAATATATAAGTATATATAATAATATATAAGTATAATGGCGAAGAAGAAGACTGGAATGACCAAATCTCAGAAGCGTAATCAGAAGAGGAAAGCTAAGGCTCTCGCTGCGAAGAAAGCAGGCACGAAGGTTCAACCTCGAAAGGGGAAGACCAACCGGGCTAGCTCGAGCGGTGGGGGCTTTAAAGCTACTACTCAGACGACGATGCATTATGAATGGACAACCAACACGGTTAAAGGAAATGATAACGGCAAGGTGGTGATCGGAAAAGACTCTACTTATGAGAAATTGAAGAATGCCATCGCTGGATACCAACGGTACCGAGTGTTTCACTTTGAGGTTCTATACATCACTGAGGCAGCTTCTACAGATAGGGGTTGTTTGGCGTATCGGCTTGATAATTCCAATTCTTTGAGCTCTAAGGGGTTGTCGAAAGATAATACCTGGGGCTTGAGGTCTAATGGGAGAGTTGTTTACAACAAAACTCAGCTGTGTGATAAGGACTTTTATGAGTTTAATGAAAACCAGTTTGCCTTTCTTTATGAGGGTACTGGGGATTCGGTTACTGTTGGTCACATGAAATACCGCTGTTCTGTTCTTCTTAGTATGCCTAAATAGGATGTTGGCAGTCCGTCGCCTTCTCCTGCCCCTGAACCTCCTTCCCCTTCCCCTAGTCCTGAACCCCCTGCGGAGCCAAAAGCTTTGTGGGGTTACTGTGGGGTACCTTCTTGCTTTGTCTATACTCGAAAGAATGACGAAGACTTCAGTGTGGGAAATACCGATTCAATCTCTCTATATAGATGGGAAGATGAGAAGTGGGAAAACGCTTCTTTGACTGTCCGTACTGAGAAATCTGATAAAACGGTTAAACACACCTTTGATATCCCTTTTCGCAAGTTGGGGGTGTTTGAGGTCCATAT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| 11,222
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OR683424.1
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raspberry enamovirus 1
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Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
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Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
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Czech Republic
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2023-11-06
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CF882
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Enamovirus
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Solemoviridae
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ssRNA(+)
| 5,740
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GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
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Rubus idaeus
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plant leaf
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2022
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate CF882, complete genome
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Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
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Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
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2023-11-06
|
CG683
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raspberry enamovirus 1
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Enamovirus
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Solemoviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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Czech Republic
|
Czech Republic
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Rubus idaeus
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Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
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Czech Republic
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2023-11-06
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CH103
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raspberry enamovirus 1
|
Enamovirus
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Solemoviridae
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ssRNA(+)
| 5,765
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GenBank
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Czech Republic
|
Czech Republic
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|
OR683427.1
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raspberry enamovirus 1
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Koloniuk,I., Cmejla,R., Hamborg,Z., Blystad,D.-R., Pribylova,J., Rejlova,M., Valentova,L., Sarkisova,T., Sapkota,B., Trandem,N., Spak,J., Tan,J.L., Zemek,R.
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Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
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2023-11-06
|
GR
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raspberry enamovirus 1
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Enamovirus
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Solemoviridae
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GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
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Rubus idaeus
|
plant leaf
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2021
| null | null |
Raspberry enamovirus 1 isolate GR, complete genome
|
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| 11,226
|
NC_038311.1
|
rhinovirus A1
|
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2018-08-24
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,137
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Human rhinovirus 1 strain ATCC VR-1559, complete genome
|
TTAAAACTGGGTGTGGGTTGTTCCCACCCACACCACCCAATGGGTGTTGTACTCTGTTATTCCGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTTCCCTCCCCTCCCCATCCTTTTACGTAACTTAGAAGTTTTAAATACAAGACCAATAGTAGGCAACTCTCCAGGTTGTCTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGATGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACAGATACCGTTATCCGCAAAGTGCCTACACAGAGCTTAGTAGGATTCTGAAAGATCTTTGGTTGGTCGTTCAGCTGCATACCCAGCAGTAGACCTTGCAGATGAGGCTGGACATTCCCCACTGGTAACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCACCTCTCATGAGGTGTGAAGCCAAAGATCGGACAGGGTGTGAAGAGCCGCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAAACCTGCAGCCATGGCTCATAAGCCAATGAGTTTATGGTCGTAACGAGTAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTATTAATTGCTTATGGTGACAATATATATATTGATATATATTGGCATCATGGGCGCCCAGGTATCTAGACAAAATGTTGGTACACACTCAACCCAAAATTCAGTGTCAAATGGATCAAGTTTAAATTACTTTAATATAAATTACTTCAAGGATGCTGCCTCAAGTGGTGCATCTAGATTAGATTTCTCTCAAGATCCAAGCAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTCTTAGAAAAGGGGATCCCAACACTACAATCACCATCTGTTGAGGCTTGTGGCTATTCAGACAGGATTATGCAAATAACCAGAGGAGATTCAACAATCACATCTCAAGATGTAGCAAATGCTGTGGTTGGGTATGGGGTCTGGCCGCATTACTTAACACCACAAGATGCCACTGCTATAGACAAACCAACACAACCTGATACATCATCAAATAGATTTTATACACTAGAGAGTAAACATTGGAATGGTAGTTCAAAAGGATGGTGGTGGAAATTACCAGATGCTCTTAAAGACATGGGTATTTTTGGAGAAAATATGTATTATCATTTCCTGGGTAGAAGTGGATATACAGTTCATGTGCAGTGTAATGCTAGTAAATTCCATCAGGGTACCTTGTTAGTTGCAATGATACCAGAACACCAGCTAGCAAGTGCAAAACACGGAAGTGTGACTGCTGGTTACAAACTCACACACCCAGGTGAGGCTGGCAGAGATGTAAGTCAAGAACGTGATGCAAGTTTAAGACAACCTAGTGATGATAGTTGGCTTAATTTTGATGGCACCCTTCTTGGAAATTTATTAATTTTCCCACATCAATTTATAAACCTTAGGAGTAATAATTCTGCAACTCTAATAGTACCATATGTAAATGCTGTGCCAATGGATTCAATGCTTCGACATAATAACTGGAGCCTGGTCATCATACCAATTAGTCCATTACGTAGTGAAACTACATCTTCTAATATAGTGCCAATCACTGTATCAATAAGTCCCATGTGTGCTGAATTTTCTGGTGCAAGAGCAAAAAACATTAAACAAGGATTACCTGTATATATAACTCCAGGATCTGGGCAATTCATGACTACTGATGATATGCAATCACCTTGTGCACTACCCTGGTACCATCCTACTAAAGAAATATCTATTCCGGGTGAAGTTAAAAACCTTATAGAAATGTGTCAAGTTGATACCTTGATTCCAGTCAATAATGTGGGTAACAATGTTGGAAATGTCAGTATGTACACTGTACAACTAGGGAACCAAACAGGCATGGCACAAAAAGTCTTTTCAATAAAAGTAGACATTACATCACAGCCTTTGGCTACAACTTTAATTGGGGAGATTGCAAGCTATTACACCCATTGGACTGGCAGTCTGCGATTTAGTTTTATGTTTTGTGGGACTGCAAACACAACACTTAAATTATTACTTGCATACACACCACCTGGTATTGATGAACCAACAACTAGAAAGGATGCAATGCTAGGGACACATGTTGTGTGGGATGTTGGATTGCAGTCTACTATATCTCTTGTTGTACCATGGGTGAGTGCCAGCCACTTCAGGTTAACTGCAGATAATAAATACTCCATGGCTGGTTATATCACATGTTGGTACCAAACTAATTTAGTAGTGCCCCCAAGTACGCCACAGACTGCTGATATGCTGTGTTTTGTTTCTGCATGTAAAGATTTTTGTCTACGAATGGCAAGGGATACAGATTTACACATACAAAGTGGTCCAATAGAGCAAAATCCAGTAGAAAACTACATTGATGAAGTTTTAAATGAAGTTTTAGTAGTGCCGAATATAAAAGAAAGTCATCACACTACATCAAACTCTGCCCCACTTTTAGATGCTGCAGAGACGGGACACACCAGTAATGTTCAACCAGAAGATGCTATAGAGACAAGGTATGTTATAACATCACAAACAAGAGATGAGATGAGTATAGAAAGTTTCCTTGGTAGATCTGGTTGTGTCCACATCTCAAGAATAAAGGTTGATTACACTGACTATAATGGACAGGACATAAATTTCACAAAATGGAAAATCACACTACAGGAAATGGCACAGATTAGGAGAAAATTTGAATTGTTTACATATGTCAGGTTTGACTCAGAAATAACCTTGGTGCCTTGTATTGCTGGTAGAGGAGACGACATTGGACATATTGTAATGCAATATATGTATGTTCCTCCAGGAGCTCCAATTCCTTCAAAAAGAAACGATTTCTCATGGCAATCAGGCACCAATATGTCAATATTCTGGCAACATGGACAGCCATTTCCTAGATTTTCTTTACCATTTCTTAGCATTGCATCAGCTTATTATATGTTTTATGATGGATATGATGGAGACAACACTTCTTCCAAGTATGGTAGCGTAGTTACTAATGATATGGGTACTATATGCTCAAGAATAGTTACAGAAAAACAGAAACATTCTGTTGTCATCACAACACACATATATCATAAAGCTAAACACACAAAAGCTTGGTGTCCTAGGCCCCCTAGAGCTGTCCCTTACACACATAGTCATGTGACTAATTATATGCCAGAAACAGGTGACGTGACAACAGCCATAGTCCGCAGAAACACTATAACAACTGCTGGGCCCAGTGATCTATATGTGCATGTAGGTAACTTAATATATAGAAACTTACATCTGTTCAATTCTGAAATGCATGATTCAATTTTGATTTCATACTCTTCTGATTTAATCATATACCGCACAAACACTATAGGTGATGATTATATTCCCAATTGTAACTGCACTGAGGCTACTTATTATTGTAGACACAAAAATAGGTATTACCCAATAAAAGTTACTCCACATGATTGGTATGAAATACAAGAGAGTGAATATTACCCCAAACACATCCAATACAACCTATTAATTGGTGAAGGACCATGTGAACCTGGTGATTGTGGTGGAAAACTTCTTTGTAGACATGGTGTCATTGGCATAATCACAGCAGGTGGTGAAGGTCATGTAGCATTTATAGATCTTAGACAATTTCACTGTGCTGAGGAACAAGGCATAACTGATTACATACACATGTTGGGAGAGGCTTTTGGCAATGGTTTTGTAGATAGTGTTAAAGAACAAATAAATGCAATAAATCCAATCAATAACATTAGTAAGAAGGTTATTAAGTGGCTACTTAGAATAATCTCGGCTATGGTTATTATAATCAGAAACTCCTCTGACCCTCAAACGATCATAGCAACCTTGACACTAATTGGTTGCAATGGTTCACCATGGAGATTTCTCAAAGAAAAGTTTTGCAAATGGACCCAATTAACTTATATCCACAAAGAGTCTGATTCATGGCTTAAGAAATTCACTGAAATGTGTAATGCTGCACGTGGTCTTGAATGGATTGGTAATAAAATTTCAAAATTTATAGATTGGATGAAATCTATGCTACCCCAGGCCCAATTGAAAGTTAAATACTTGAATGAAATAAAGAAACTCAGTTTGCTTGAAAAACAGATTGAAAATCTACGTGCGGCAGATAGTGCAACACAAGAGAAAATCAAATGTGAAATTGACACCCTACATGATCTATCGTGCAAATTTCTTCCTTTGTATGCACATGAGGCAAAAAGAATCAAAGTGCTTTATAATAAATGTTCCAATATAATTAAACAAAGAAAGAGAAGTGAACCGGTGGCGGTGATGATACATGGACCACCCGGTACTGGTAAATCTATAACAACTAACTTCTTGGCTAGAATGATAACAAATGAAAGTGATGTGTACTCATTACCTCCAGATCCCAAATATTTTGATGGTTATGACAATCAGAGTGTTGTAATCATGGATGATATTATGCAAAATCCAGATGGAGAAGACATGACACTATTTTGCCAAATGGTTTCAAGTGTTACATTTATACCACCCATGGCTGATTTGCCTGACAAGGGTAAACCATTTGATTCAAGATTTATCTTATGTAGTACTAACCACTCGCTTTTAGCCCCACCTACTATATCTTCATTACCCGCAATGAATAGAAGATTTTTCTTTGACTTAGATATTGTAGTTCATGACAATTATAAAGATACACAAGGGAAATTAGATGTATCCAAAGCTTTTCGACCTTGTAATGTTAACACCAAAATTGGCAATGCAAAATGTTGTCCATTTGTATGTGGTAAGGCAGTGWCATTCAAAGATCGCAGCACTTGCTCAACATACACCTTAGCTCAAGTTTACAATCACATTTTGGAAGAAGACAAAAGAAGGAGACAGGTGGTGGATGTCATGTCTGCAATTTTCCAAGGACCAATTTCTTTAGACGYTCCACCACCACCAGCTATAGYAGATCTGTTACAATCAGTTAGAACACCTGAGGTAATCAAGTACTGTCAAGATAATAAATGGGTCATTCCAGCAGAGTGCCAAGTG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| 4,017
|
OQ842402.1
|
rhinovirus A1
|
Sereewit,J., Hajian,P., Xie,H., Greninger,A.L.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
|
USA
|
2023-05-16
|
RV-A1/USA/6P3/2010
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,163
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2010-08
|
SAMN33761365
|
PRJNA939713
|
Rhinovirus A1 isolate RV-A1/USA/6P3/2010, complete genome
|
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UW Virology, Laboratory Medicine
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USA
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GenBank
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USA
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USA
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2009-10
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Rhinovirus A1 isolate RV-A1/USA/12J7/2015, complete genome
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| 16,026
|
LC699424.1
|
rhinovirus A1
|
Egawa,K., Kakizaki,M., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Sato,M., Sakuma,H., Suzuki,S., Hosoya,M., Takeda,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2022-03-23
|
HRV_A1_Fukushima_OR274_2021
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,067
|
GenBank
| 1
|
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2021
|
SAMD00490734
|
PRJDB13572
|
Rhinovirus A1 HRV_A1_Fukushima_OR274_2021 genomic RNA, complete genome
|
CCCCATCCTTTATGTAACTTAGAAGTTTTAAATATAAGACCAATAGCAGGCAACTCTCCAGGTTGTCTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGACGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACTGATATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACACAGAGCTTAGTAGGATTCTGGAAGATCTTTGGTTGGTCGCTCGGCTGCATACCCAGCAGTAGACCTTGCAGATGAGGCTGGACATTCCCCACTGGTAACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCTCTTATGAGGTGTGAAGCCAAGGATTGGACAGGGTGTGAAGAGCCGCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAAACCCGCAGCCATGGCTCATAAACCAATGAGTTTGTGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTATTAATTGCTTATGGTGACAATATATACATAGATATATATTGGCATCATGGGCGCTCAAGTATCTAGACAAAATGTTGGTACACACTCAACCCAAAATTCAGTGTCAAATGGATCAAGTTTAAATTACTTTAATATAAATTACTTTAAGGATGCTGCCTCAAGCGGTGCATCTAGGTTAGATTTTTCCCAAGATCCAAGCAAATTTACTGACCCAGTCAAAGATGTTTTAGAAAAGGGAATTCCAACACTACAATCACCATCTGTTGAGGCCTGTGGTTATTCAGATAGGATTATACAAATAACTAGGGGGGACTCAACAATTACATCACAAGATGTGGCAAATGCTGTGGTTGGATATGGAGTTTGGCCACACTATTTAACTCCACAAGATGCGACTGCTATAGATAAACCAACACAACCTGACACATCATCGAATAGGTTTTACACACTAGAAAGTAAACATTGGGATGGCAATTCTAAGGGATGGTGGTGGAAATTACCAGATGCTCTTAAGGATATGGGCATTTTTGGAGAGAATATGTATTATCATTTTTTGGGTAGAAGTGGATATACAGTTCATGTACAATGCAATGCTAGCAAATTTCATCAAGGTACCCTCTTAGTTGCAATGATACCAGAACACCAATTAGCAAGTGCAAAAAATGGAAAAGTAACTGCTGGTTATAATCTTACTCACCCAGGAGATGCTGGTAGAGTTGTAGGTCAACAACGTGATACCAACTTAAGACAGCCTAGTGATGATAGTTGGCTTAATTTTGATGGTACTCTCCTTGGAAATCTGTTAATTTTTCCACATCAGTTCATAAATCTTAGAAGTAATAACTCTGCAACTTTAATAGTACCCTATGTGAATGCTGTGCCAATGGACTCAATGCTCCGACACAACAACTGGAGTTTAGTTATTATACCAATCAGTCCATTACGTAGTGAAGCTACATCTTCTAACATAGTACCAATTACTGTGTCAATAAGTCCCATGTGTGCTGAATTTTCTGGTGCAAGAGCAAAGAATGTTAAACAAGGCTTACCTGTTTACATAACCCCAGGATCTGGACAGTTTATGACAACTGATGACATGCAATCACCTTGTGCACTACCATGGTATCACCCCACTAAGGAAATATCTATCCCAGGTGAAGTAAAGAATCTCATAGAAATGTGTCAAGTAGATACCTTGATTCCAGTCAATAATGTGGGTACTAATGTTGGAAATATTAGTATGTACACAGTACAGTTAGGTCAGATGGAAGTGGCACAGGAGGTCTTTGCAATTAAAGTGGACATTACATCACAACCTTTGGCTACAACTTTACTTGGAGAAATTGCAAGTTATTACACACATTGGACTGGAAGCTTACGGTTTAGTTTTATGTTTTGTGGAACTGCAAACACCACACTCAAACTATTGCTTGCATATACACCACCTGGAATTGATAAACCAACAACTAGGAAAGATGCAATGCTGGGAACACATGTTGTATGGGATGTTGGTTTGCAATCTACCATATCTCTTGTTGTACCATGGGTGAGTGCCAGTCATTTTAGGCTAACTGCAAATGATAAGTATTCAATGGCTGGTTACATCACATGTTGGTATCAAACTAACTTAGTGGTGCCCCCAAACACCCCACAAACTGCTGATATGTTATGTTTTGTTTCTGCATGCAAAGACTTCTGTCTACGAATGGCTAGGGATACAGATCTACATACACAGAGTGGCCCAATAGAGCAAAATCCAGTAGAAAATTATATTGATGAGGTTTTGAATGAAGTTTTGGTAGTGCCAAATATAAAAGAAAGTCACCACACCACATCAAATTCTGCTCCACTCTTGGATGCTGCAGAGACAGGACACACTAGTAATGTACAACCAGAAGATGCCATAGAAACAAGGTATGTTATAACATCACAAACAAGAGATGAAATGAGCATAGAAAGTTTTCTCGGTAGATCTGGTTGTATACACATCTCAAGAATAAAAGTTGATTACAATGATTACAATGGGCAAAATAAAAACTTTACACAGTGGAAAATCACACTGCAGGAGATGGCACAAATTAGAAGGAAATTTGAATTATTTACATATGTTAGATTTGATTCAGAAGTGACTTTAGTGCCTTGCATTGCTGGTAGAGGTGATGACATTGGTCATGTTGTGATGCAATACATGTATGTCCCTCCAGGAGCTCCAATTCCAAAAACAAGAGATGACTTTTCATGGCAGTCAGGCACTAATATGTCAATATTCTGGCAACATGGACAACCTTTCCCCAGATTTTCTCTACCATTTCTTAGTATTGCATCAGCTTATTACATGTTTTATGATGGGTATGATGGGGATAATTCTTCTGCTAAGTATGGTAGTGTAGTTACTAATGAAATGGGCACCATATGTTCAAGAATAGTCACAGAGAGGCAAGAACATCCTGTTGTTATCACAACACACATATACCACAAAGCCAAACACACAAAAGCTTGGTGTCCCAGGCCTCCTAGAGCTGTTCCTTATACACATAGTCATGTAACTAATTATGTGCCAAAGACAGGTGATGTGACAACAGCTATAGTCCCTAGAACCAACATGAAGACTGTTGGACCTAGTGATCTATACGTACATGTGGGTAATTTAATATATAGAAATTTACATTTATTCAATTCTGAAATGCATGATTCAGTTCTAGTCTCATATTCTTCTGATCTAATCATATACCGCACAAACACTATAGGTGATGATTATATACCTAGTTGTAACTGTACAGAGGCTACTTATTACTGTAAACACAAAAATAGATACTATCCAATAAAAGTCACTCCACATGATTGGTACGAAATTCAAGAAAGTGAATACTATCCTAAGCACATTCAATATAATCTACTAATTGGTGAAGGACCATGTGAGCCTGGTGATTGTGGTGGAAAACTTCTCTGTAGACATGGTGTCATTGGCATAATCACAGCAGGTGGTGAGGGCCATGTAGCATTTACAGATCTTAGGCAGTTCCAATGTGCTGAGGAACAGGGTATAACTGATTACATACACATGTTAGGGGAAGCCTTTGGTAATGGTTTTGTAGACAGTGTCAAGGAACAAATTAATGCAATAAATCCAATTAATAGTATCAGCAAGAAAGTTATCAAGTGGCTACTTAGAATAATTTCAGCCATGGTCATCATAATTAGAAACTCTTCTGATCCTCAAACAATCATAGCAACCCTGACTCTAATTGGCTGTAATGGCTCACCATGGAGATTTCTTAAAGAAAAATTTTGTAAGTGGACTCAATTAACATATATTCACAAGGAATCTGACTCGTGGCTTAAGAAATTTACTGAAATGTGTAATGCTGCACGTGGTCTTGAGTGGATTGGCAACAAAATTTCAAAGTTCATAGATTGGATGAAATCAATGCTACCTCAAGCTCAGCTAAAAGTCAAATACCTAAATGAGATAAAGAAACTTAGTTTATTAGAAAAACAAATTGAAAATCTGCGCGCAGCGGATAATGCCACACAAGAAAAGATAAAGTGCGAAATTGACACCTTGCACGATTTGTCATGTAAATTTCTTCCCTTATATGCACATGAGGCAAAGAGAATTAAAGTGCTTTACAACAAATGTTCTAATATAATTAAACAAAGGAAAAGAAGTGAACCAGTGGCAGTGATGATACATGGGCCACCTGGTACTGGCAAGTCCATAACAACTAATTTCTTGGCTAGAATGATAACAAATGAGAGTGATGTGTATTCATTACCCCCAGATCCCAAATATTTTGATGGGTATGATAATCAGAGTGTTGTGATTATGGATGACATTATGCAAAACCCTGATGGGGAGGACATGACACTATTTTGTCAAATGGTCTCAAGTGTTACATTCATACCACCTATGGCTGACTTACCAGACAAGGGCAAACCATTTGATTCAAGGTTCATTTTGTGTAGCACTAACCATTCACTCTTAGCCCCACCTACCATATCTTCATTACCTGCAATGAATAGAAGGTTTTTCTTTGATTTAGATATTGTAGTTCATGATAACTATAAAGATGCACAAGGAAAACTAGATGTATCTAAGGCTTTTCAACCCTGTGATGTCAATACTAAAATTGGAAATGCAAAATGTTGTCCATTTGTGTGTGGTAAGGCAGTATCATTTAAGGATCGTAGCACTTGCTCAACATACACCTTAGCTCAAGTTTACAATCACATCTTGGAAGAAGACAAGAGAAGGAGACAAGTGGTAGATGTCATGTCTGCAATTTTCCAGGGACCAATTTCTCTAGATGCTCCACCACCACCAGCTATAACAGATCTATTGCAATCAGTTAGGACACCTGAAGTGATAAAATACTGCCAGGATAACAAATGGATAGTCCCAGCGGAGTGCCAAATAGAGAGAGACTTAAATATTGCTAATAGCATAATAACTATTATAGCAAACATCATAAGTATAGCTGGTATTATATTTGTGATTTATAAACTTTTTTGCACA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| 32,243
|
MN749147.1
|
rhinovirus A1
|
Addetia,A., Phung,Q., Greninger,A.L.
|
University of Washington, UW Virology
|
USA
|
2020-01-20
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,144
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2015
| null | null |
Rhinovirus A1 strain 12J7, complete genome
|
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| 54,609
|
MN749150.1
|
rhinovirus A1
|
Addetia,A., Phung,Q., Greninger,A.L.
|
University of Washington, UW Virology
|
USA
|
2020-01-20
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,084
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2015
| null | null |
Rhinovirus A1 strain 12L1, complete genome
|
TTCCCACTCACACCACCCAATGGGTGTTGTACTCTGTTATTCCGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTCCCCNNNNNNCCCTACCCCTTTACGTAACTTAGAAGCTTTAAACATGAGACCAATAGCAGGCAACTTTCCAGGTTGTCTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGATGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACTGATATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACACAGAGCCTAGTAGGATTCTGAAAGATCTTTGGTTGGTCGCTCAGCTGCATACCCAGCAGTAGACCTTGCAGATGAGGCTGGACATTCCCCACTGGTAACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCTCTTACGAGGTGTGAAGCCAAGGATTGGACAGGGTGCGAAGAGCCGCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAAACCTGCAGCCATAGCTCATAAGCCAATGAGTTTATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCATTTTTCCTTTTATCAATTGCTTATGGTGACAATATATATATAAATATATATATTGGCATCATGGGCGCTCAGGTATCCAGACAAAATGTTGGCACACATTCAACCCAAAATTCAGTATCAAATGGGTCAAGTCTAAATTACTTCAATATAAATTATTTCAAGGATGCTGCCTCAAGTGGTGCATCTAGATTAGATTTTTCTCAAGATCCAAGCAAATTCACTGATCCAGTTAAAGATGTCTTAGAAAAAGGGATTCCAACATTACAATCGCCATCTGTTGAGGCTTGTGGTTACTCAGATAGGATTATACAAATTACCAGAGGTGACTCAACAATCACATCACAAGATGTGGCAAATGCTGTGGTTGGATACGGAGTCTGGCCACATTATCTAACACCACAAGATGCCACTGCCATAGATAAACCAACGCAACCTGACACATCATCAAATAGATTTTATACATTAGATAGTAAACATTGGTCCAATACTTCAAAAGGATGGTGGTGGAAATTGCCAGATGCTCTTAAAGAAATGGGCATCTTTGGAGAAAACATGTTTTACCATTTCCTGGGTAGAAGTGGGTATACAGTTCATGTGCAGTGTAATGCTAGTAAATTCCATCAAGGTACCTTGTTAGTCGCAATGATACCAGAACATCAATTAGCAAGTGCAAAGCATGGAAGTGTGACCGTTGGTTACAAACTAACACACCCAGGTGAAGCTGGTAGAGATGTGAGTCAGGATCGTAACACAAGTTTAAATCAACCTAGTGATGATAGTTGGCTCAATTTTGATGGTACCCTGCTTGGAAATTTATTGATTTTCCCACATCAGTTTATAAACCTTAGAAGTAATAATTCTGCAACTATAATAGTGCCATATGTAAATGCTGTGCCAATGGATTCAATGCTTCGACACAATAATTGGAGCCTAGTCATTATACCAATTTGTTCATTACGTAGTGAAACTTCATCTACTAATATAGTACCAATCACTGTGTCAATAAGCCCTATGTGTGCTGAATTTTCTGGTGCAAGAGCAAAAAATGTTATACAAGGACTACCTGTATACATGACCCCAGGATCTGGACAATTCATGACCACTGATGATATGCAGTCACCTTGTGCGTTACCTTGGTACCATCCCACTAAAGAAATATCTATTCCAGGTGAAGTTAAAAACCTTATAGAAATGTGTCAAGTTGACACTTTGATTCCAGTCAATAATGTGGGCAATAATGTTGGAAACATTAGTATGTATACTGTGCAACTGGAAAACAAAACAGAAATGGCACAAAAAGTCTTTTCAATAAAAGTAGATATAACATCACAACCTTTAGCTACAACTTTACTTGGAGAGATTGCAAGTTATTACACTCACTGGACTGGCAGTCTACGGTTTAGTTTTATGTTCTGTGGAACTGCAAACACAACACTTAAATTACTACTTGCATATACACCACCTGGCATTGGTGAACCAACAAATAGAAAAGAAGCAATGCTAGGAACACATGTCGTGTGGGATGTTGGACTGCAATCTACTATATCTCTTGTTGTGCCATGGGTGAGTGCTAGTCACTTTAGATTAACTGCAGATAACAAATACTCCATGGCTGGTTATATCACATGTTGGTACCAAACTAACTTAGTAGTACCCCCAAGCACACCACAAACTGCTGATATGCTATGCTTTGTCTCTGCATGTAAAGATTTCTGTTTGCGAATGGCAAGGGATACAGATTTACACATACAAAGTGGCCCAATAGAGCAAAATCCAGTAGAAAATTACATTGATGAAGTTTTGAATGAAGTTTTAGTGGTGCCGAATATAAAAGAGAGTCATCACACTACATCAAATTCTGCTCCACTTTTGGATGCTGCAGAAACGGGACACACCAGTAATGTGCAACCAGAGGATGCTATAGAAACAAGGTATGTTATAACATCACAAACAAGAGATGAAATGAGTATAGAAAGTTTCCTTGGTAGGTCTGGTTGTGTTCACACTTCAAAAATAAAAGTTGATTATACTAACTATAATGGAGAAAACTTAAACTTTACAAAATGGAAGATCACACTACAGGAGATGGCACAAATTAGAAGGAAATTTGAATTGTTTACATATGTCAGGTTTGATTCAGAAGTAACTTTGGTGCCTTGTATTGCTGGTAGGGGAGATGACATCGGACACGTTGTAATGCAATACATGTATGTCCCTCCAGGAGCTCCAATACCCTCAAAAAGAGATGATTTTGCATGGCAATCAGGTACTAATATGTCTATATTCTGGCAACATGGGCAGCCATTCCCTAGATTTTCTTTACCATTTCTTAGTATTGCATCAGCTTATTACATGTTTTATGATGGATATGATGGAGACAACCCTTCTTCAAAGTATGGTAGTGTAGTTACTAATGACATGGGTACTATATGTTCAAGGATAGTTACAGAAAAACAGAAACACCAAATTGTTATCACAACACACATATATCATAAAGCTAAGCACATAAAAGCTTGGTGTCCCAGGCCTCCTAGAGCTGTACCTTATACACACAGTCATGTAACTAATTATAAACCAGAAACAGGTGATGTGAGAACAGCCATAGTCCGCAGAGATGCCATAACAACTGCTGGGCCTAGTGATCTATATGTGCATGTGGGTAATCTAATATATAGAAATTTACATCTGTTCAATTCTGAAATGCATGATTCAATTTTGGTCTCATACTCTTCTGATTTAATCATATACCGCACAAACACTACAGGTGATGATTATATCCCTAATTGCAATTGTACTGAGGCTACATATTATTGTAAGCACAAGAACAGGTATTATCCAATAAAAGTTACTTCACATGATTGGTATGAAATACAAGAGAGTGAATATTACCCCAAACATATCCAATACAACCTGTTAATTGGTGAAGGACCATGTGAACCCGGTGATTGTGGCGGTAAACTCCTTTGTAGACATGGTGTTATCGGCATAATCACAGCAGGTGGTGAAGGGCATGTAGCATTCATAGATCTTAGACAATTTCAATGTGCTGAGGAGCAAGGCATAACTGATTACATACATATGCTAGGAGAGGCCTTTGGTAATGGTTTTGTAGATAGTGTCAAGGAACAGATAAATGCAATTAATCCAATCAATAACATTAGTAAAAAGATCATTAAGTGGTTGCTTAGGATAATCTCAGCTATGGTCATCATAATCAGAAACTCCTCTGATCCTCAAACAATCATAGCAACCTTAACGCTTATTGGTTGTAGTGGTTCACCATGGAGGTTTCTCAAAGAAAAGTTTTGCAAATGGACCCAATTGACTTACATCCACAAAGAATCTGATTCATGGTTGAAGAAATTCACTGAGATGTGTAATGCCGCACGTGGTCTTGAATGGATTGGTAACAAAATTTCAAAATTTATAGATTGGATGAAGTCAATGTTACCTCAAGCTCAATTAAAAGTCAAATATTTGAATGAAATGAAGAAGCTCAATTTGCTTGAAAAACAAATTGAGAATCTACGTGCAGCGGATAGTGCAACACAGGAAAAAATTAAATGTGAAATTGACACTTTACATGACTTATCATGTAAATTTCTCCCTTTGTATGCACATGAGGCAAAAAGAATCAAAGTACTATATAATAAATGCTCTAACATAATCAAACAAAGAAAGAGAAGTGAGCCAGTGGCTGTGATGATACATGGACCACCTGGTACTGGTAAATCCATAACAACTAGTTTCTTAGCCAGAATGATAACAAATGAAAGTGATGTGTACTCATTACCCCCAGATCCTAAATACTTTGATGGTTATGACAATCAGAGCGTTGTAATCATGGATGACATTATGCAGAACCCAGATGGGGAGGACATGACACTATTCTGTCAGATGGTTTCAAGTGTTACGTTTATACCACCTATGGCTGACTTGCCTGATAAGGGCAAACCATTTGATTCAAGGTTTATCTTATGTAGTACTAACCACTCACTTTTGGCCCCACCCACTATATCTTCATTACCTGCAATGAACAGAAGATTTTTCTTTGACTTGGATATTGTGGTACATGACAATTACAAGGATATGCAAGGGAAATTAGATGTATCCAAGGCTTTTCAACCCTGTGATGTCAACACCAAAATTGGTAATGCAAAATGTTGTCCATTTGTATGTGGCAAGGCAGTTACATTTAAAGATCGTAGTACTTGCTCAACATACACCTTAGCCCAAGTTTATAATCATATTTTAGAAGAAGATAAGAGAAGGAGACAGGTAGTAGATGTCATGTCTGCAATATTCCAAGGGCCAATTTCTTTAGATGCTCCACCACCACCAGCTATAGCAGACTTACTACAATCAGTTAGAACACCTGAAGTAATTAAATACTGTCAAGATAATAAATGGATTGTTCCAGCAGAGTGTCAAATTGAGAGAGATTTAAATATA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| 54,612
|
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|
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|
Addetia,A., Phung,Q., Greninger,A.L.
|
University of Washington, UW Virology
|
USA
|
2020-01-20
| null |
Rhinovirus A
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Enterovirus
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Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,037
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
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Homo sapiens
| null |
2015
| null | null |
Rhinovirus A1 strain 12M3, complete genome
|
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| 54,615
|
MN749156.1
|
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|
Addetia,A., Phung,Q., Greninger,A.L.
|
University of Washington, UW Virology
|
USA
|
2020-01-20
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,137
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2015
| null | null |
Rhinovirus A1 strain 12O2, complete genome
|
TTAAAACTGGGTGTGGGTTGTTCCCACTCACACCACCCAATGGGTGTTGTACTCTGTTATTCCGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTCCCTCCCCCTCCTACCCCTTTACGTAACTTAGAAGTTTTAAACACGAGGCCAATAGCAGGCAACTTTCCAGGTTGTCTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGATGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACTGATATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACACAGAGCCTAGTAGGATTCTGAAAGATCTTTGGTTGGTCGCTCAGCTGCATACCCAGCAGTAGACCTTGCAGATGAGGCTGGACATTCCCCACTGGTAACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCTCTTACGAGGTGTGAAGCCAAGGATTGGACAGGGTGCGAAGAGCCGCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAAACCTGCAGCCATAGCTCATAAGCCAATGAGTTTATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCATTTTTTCCTTTTATCAATTGCTTATGGTGACAATATATATATAAATATATATTGGCATCATGGGCGCTCAGGTATCCAGACAAAATGTTGGCACACATTCAACCCAAAATTCAGTATCAAATGGGTCAAGTTTAAATTACTTCAATATAAATTATTTCAAGGATGCTGCCTCAAGTGGTGCATCTAGATTAGATTTTTCCCAAGATCCAAGCAAATTCACTGATCCAGTTAAAGATGTCTTAGAAAAAGGGATTCCAACATTACAATCGCCATCTGTTGAGGCTTGTGGTTACTCAGATAGGATTATACAAATTACCAGAGGTGACTCAACAATCACATCACAAGATGTGGCAAATGCTGTGGTTGGATACGGAGTCTGGCCACATTATTTAACACCACAAGATGCCACTGCCATAGATAAACCAACACAACCTGACACATCATCAAATAGATTTTATACATTAGATAGTAAACATTGGTCCAATACTTCAAAAGGATGGTGGTGGAAATTGCCAGATGCTCTTAAAGAAATGGGCATCTTTGGAGAAAACATGTTTTACCATTTCCTGGGTAGAAGTGGGTATACAGTTCATGTGCAGTGTAATGCTAGTAAATTCCATCAAGGTACCTTGTTAGTCGCAATGATACCAGAACATCAATTAGCAAGTGCAAAGCATGGAAGTGTGACCGTTGGTTACAAACTAACACACCCAGGTGAAGCTGGTAGAGATGTGAGTCAGGATCGTAATACAAGTTTAAATCAACCTAGTGATGATAGTTGGCTCAATTTTGATGGTACCCTGCTTGGAAATTTATTGATTTTCCCACATCAGTTTATAAACCTTAGAAGTAATAATTCTGCAACTATAATAGTGCCATATGTAAATGCTGTGCCAATGGATTCAATGCTTCGACACAATAATTGGAGTCTAGTCATTATACCAATTTGTTCGTTACGTAGTGAAACTTCATCTACTAATATAGTACCAATCACTGTGTCAATAAGCCCTATGTGTGCTGAATTTTCTGGTGCAAGAGCAAAAAATGTTATACAAGGACTACCTGTATACATGACCCCAGGATCTGGACAATTCATGACCACTGATGATATGCAGTCACCTTGTGCGTTACCTTGGTACCATCCCACTAAAGAAATATCTATTCCAGGTGAAGTTAAAAACCTTATAGAAATGTGTCAAGTTGACACTTTGATTCCAGTCAATAACGTGGGCAATAATGTTGGAAACATTAGTATGTATACTGTGCAACTGGAAAACAAAACAGAAATGGCACAAAAAGTCTTTTCAATAAAAGTAGACATAACATCACAGCCTTTAGCTACAACTTTACTTGGAGAGATTGCAAGTTATTACACTCACTGGACTGGCAGTCTACGGTTTAGTTTTATGTTCTGTGGAACTGCAAACACAACACTTAAATTACTACTTGCATATACACCACCTGGCATTGGTGAACCAACAAATAGAAAAGATGCAATGCTAGGAACACATGTCGTGTGGGATGTTGGACTACAATCTACTATATCTCTTGTTGTGCCATGGGTGAGTGCTAGTCACTTTAGATTAACTGCAGATAACAAATACTCCATGGCTGGCTATATCACATGTTGGTACCAAACTAACTTAGTAGTACCCCCAAGCACACCACAAACTGCTGATATGCTATGCTTTGTCTCTGCATGTAAAGATTTCTGTTTGCGAATGGCAAGGGATACAGATTTACACATACAAAGTGGCCCAATAGAGCAAAATCCAGTAGAAAATTACATTGATGAAGTTTTGAATGAAGTTTTAGTGGTGCCAAATATAAAAGAGAGTCATCACACTACATCAAATTCTGCTCCACTTTTGGATGCTGCAGAAACGGGACACACCAGTAATGTGCAACCAGAGGATGCTATAGAAACAAGGTATGTTATAACATCACAAACAAGAGATGAAATGAGTATAGAAAGTTTCCTTGGTAGGTCTGGTTGTGTTCACACTTCAAAAATAAAAGTTGATTATACTAACTATAATGGAGAAAACTCAAACTTTACAAAATGGAAGATCACACTACAGGAGATGGCACAAATTAGAAGGAAATTTGAATTGTTTACATATGTCAGGTTTGATTCAGAAGTAACTCTGGTGCCTTGTATTGCTGGTAGGGGAGATGACATCGGACACGTTGTAATGCAATACATGTATGTCCCTCCAGGAGCTCCAATACCCTCAAAAAGAGATGATTTTGCATGGCAATCAGGTACTAATATGTCTATATTCTGGCAACATGGGCAGCCATTCCCTAGATTTTCTTTACCATTTCTTAGTATTGCATCAGCTTATTACATGTTTTATGATGGATATGATGGAGACAACCCTTCTTCAAAGTATGGTAGTGTAGTTACTAATGACATGGGTACTATATGTTCAAGGATAGTTACAGAAAAACAGAAACACCAAATTGTTATCACAACACACATATATCATAAAGCTAAGCACATAAAAGCTTGGTGTCCCAGGCCTCCTAGAGCTGTACCTTATACACACAGTCATGTAACCAATTATAAACCAGAAACAGGTGATGTGAGAACAGCCATAGTCCGCAGAGATGCCATAACAACTGCTGGGCCTAGTGATCTATATGTGCATGTGGGTAATCTAATATATAGAAATTTACATCTGTTCAATTCTGAAATGCATGATTCAATTTTGGTCTCATACTCTTCTGATTTAATCATATACCGCACAAACACTACAGGTGATGATTATATCCCTAATTGCAATTGTACTGAGGCTACATATTATTGTAAGCACAAGAACAGGTATTATCCAATAAAAGTTACTTCACATGATTGGTATGAAATACAAGAGAGTGAATATTACCCCAAACATATCCAATACAACCTGTTAATTGGTGAAGGACCATGTGAACCCGGTGATTGTGGCGGTAAACTCCTTTGTAGACATGGTGTTATCGGCATAATCACAGCAGGTGGTGAAGGGCATGTAGCATTCATAGATCTTAGACAATTTCAATGTGCTGAGGAGCAAGGCATAACTGATTACATACATATGCTAGGAGAGGCCTTTGGTAATGGTTTTGTAGATAGTGTTAAGGAACAGATAAATGCAATTAATCCAATCAATAACATTAGTAAAAAGATCATTAAGTGGTTGCTTAGGATAATCTCAGCTATGGTCATCATAATCAGAAACTCCTCTGATCCTCAAACAATCATAGCAACCTTAACGCTTATTGGTTGTAGTGGTTCACCATGGAGGTTTCTCAAAGAAAAGTTTTGCAAATGGACCCAATTGACTTACATCCACAAAGAATCTGATTCATGGTTGAAGAAATTCACTGAGATGTGTAATGCCGCACGTGGTCTTGAATGGATTGGTAACAAAATTTCAAAATTTATAGATTGGATGAAGTCAATGCTACCTCAAGCTCAATTAAAAGTCAAATATTTAAATGAAATGAAGAAGCTCAATTTGCTTGAAAAACAAATTGAGAATCTACGTGCAGCGGATAGTGCAACACAGGAAAAAATTAAATGTGAAATTGACACTTTACATGACTTATCATGTAAATTTCTCCCTTTGTATGCACATGAGGCAAAAAGAATCAAAGTACTGTATAATAAATGCTCTAACATAATCAAACAAAGAAAGAGAAGTGAGCCAGTGGCTGTGATGATACATGGACCACCTGGTACTGGTAAATCCATAACAACTAGTTTCTTAGCCAGAATGATAACAAATGAAAGTGATGTGTACTCATTACCCCCAGATCCTAAATACTTTGACGGTTATGACAATCAGAGTGTTGTAATCATGGATGACATTATGCAGAACCCAGATGGGGAGGACATGACACTATTCTGTCAGATGGTTTCAAGTGTTACGTTTATACCACCTATGGCTGACTTGCCTGATAAGGGCAAACCATTTGATTCAAGGTTTATCTTATGTAGTACTAACCACTCACTTTTGGCCCCACCCACTATATCTTCATTACCTGCAATGAACAGAAGATTTTTCTTTGACTTGGACATTGTGGTACATGACAATTACAAGGATATGCAAGGGAAATTAGATGTATCCAAGGCTTTTCAACCCTGTGATGTCAACACTAAAATTGGTAATGCAAAATGTTGTCCATTTGTATGTGGCAAGGCAGTTACATTTAAAGATCGTAGTACTTGCTCAACATATACCTTAGCCCAAGTTTATAATCATATTTTAGAAGAAGATAAGAGAAGGAGACAGGTAGTAGATGTCATGTCTGCAATATTCCAAGGGCCAATTTCTTTAGATGCTCCACCACCACCAGCTATAGCAGACTTACTACAATCAGTTAGAACACCTGAAGTAATTAAATACTGTCAAGATAATAAATGGATTGTTCCAGCAGAGTGTCAAATT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| 54,618
|
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|
rhinovirus A1
|
Addetia,A., Phung,Q., Greninger,A.L.
|
University of Washington, UW Virology
|
USA
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2020-01-20
| null |
Rhinovirus A
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Enterovirus
|
Picornaviridae
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ssRNA(+)
| 7,134
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GenBank
| null |
USA
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USA
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Homo sapiens
| null |
2015
| null | null |
Rhinovirus A1 strain 12O3, complete genome
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| 54,619
|
MF973193.1
|
rhinovirus A1
|
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J., Shean,R.C., Jerome,K.R., Kuypers,J.M.
|
UW, Lab Medicine
|
USA
|
2017-12-09
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,097
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJNA338014
|
Rhinovirus A1 strain 5Q1, complete genome
|
ACCACCCAATGGGTGTTGTACTCTGTTATTCCGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTTCCCTCCCCTCCCCATCCTTTTACGTAACTTAGAAGTTTTAAATACAAGACCAATAGTAGGCAACTCTCCAGGTTGTCTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGATGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACAGATACCGTTATCCGCAAAGTGCCTACACAGAGCTTAGTAGGATTCTGAAAGATCTTTGGTTGGTCGTTCAGCTGCATACCCAGCAGTAGACCTTGCAGATGAGGCTGGACATTCCCCACTGGTAACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCACCTCTCATGAGGTGTGAAGCCAAAGATCGGACAGGGTGTGAAGAGCCGCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAAACCTGCAGCCATGGCTCATAAGCCAATGAGTTTATGGTCGTAACGAGTAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTATTAATTGCTTATGGTGACAATATATATATTGATATATATTGGCATCATGGGCGCCCAGGTATCTAGACAAAATGTTGGTACACACTCAACCCAAAATTCAGTGTCAAATGGATCAAGTTTAAATTACTTTAATATAAATTACTTCAAGGATGCTGCCTCAAGTGGTGCATCTAGATTAGATTTCTCTCAAGATCCAAGCAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTCTTAGAAAAGGGGATCCCAACACTACAATCACCATCTGTTGAGGCTTGTGGCTATTCAGACAGGATTATGCAAATAACCAGAGGAGATTCAACAATCACATCTCAAGATGTAGCAAATGCTGTGGTTGGGTATGGGGTCTGGCCGCATTACTTAACACCACAAGATGCCACTGCTATAGACAAACCAACACAACCTGATACATCATCAAATAGATTTTATACACTAGAGAGTAAACATTGGAATGGTAGTTCAAAAGGATGGTGGTGGAAATTACCAGATGCTCTTAAAGACATGGGTATTTTTGGAGAAAATATGTATTATCATTTCCTGGGTAGAAGTGGATATACAGTTCATGTGCAGTGTAATGCTAGTAAATTCCATCAGGGTACCTTGTTAGTTGCAATGATACCAGAACACCAGCTAGCAAGTGCAAAACACGGAAGTGTGACTGCTGGTTACAAACTCACACACCCAGGTGAGGCTGGCAGAGATGTAAGTCAAGAACGTGATGCAAGTTTAAGACAACCTAGTGATGATAGTTGGCTTAATTTTGATGGCACCCTTCTTGGAAATTTATTAATTTTCCCACATCAATTTATAAACCTTAGGAGTAATAATTCTGCAACTCTAATAGTACCATATGTAAATGCTGTGCCAATGGATTCAATGCTTCGACATAATAACTGGAGCCTGGTCATCATACCAATTAGTCCATTACGTAGTGAAACTACATCTTCTAATATAGTGCCAATCACTGTATCAATAAGTCCCATGTGTGCTGAATTTTCTGGTGCAAGAGCAAAAAACATTAAACAAGGATTACCTGTATATATAACTCCAGGATCTGGGCAATTCATGACTACTGATGATATGCAATCACCTTGTGCACTACCCTGGTACCATCCTACTAAAGAAATATCTATTCCGGGTGAAGTTAAAAACCTTATAGAAATGTGTCAAGTTGATACCTTGATTCCAGTCAATAATGTGGGTAACAATGTTGGAAATGTCAGTATGTACACTGTACAACTAGGGAACCAAACAGGCATGGCACAAAAAGTCTTTTCAATAAAAGTAGACATTACATCACAGCCTTTGGCTACAACTTTAATTGGGGAGATTGCAAGCTATTACACCCATTGGACTGGCAGTCTGCGATTTAGTTTTATGTTTTGTGGGACTGCAAACACAACACTTAAATTATTACTTGCATACACACCACCTGGTATTGATGAACCAACAACTAGAAAGGATGCAATGCTAGGGACACATGTTGTGTGGGATGTTGGATTGCAGTCTACTATATCTCTTGTTGTACCATGGGTGAGTGCCAGCCACTTCAGGTTAACTGCAGATAATAAATACTCCATGGCTGGTTATATCACATGTTGGTACCAAACTAATTTAGTAGTGCCCCCAAGTACGCCACAGACTGCTGATATGCTGTGTTTTGTTTCTGCATGTAAAGATTTTTGTCTACGAATGGCAAGGGATACAGATTTACACATACAAAGTGGTCCAATAGAGCAAAATCCAGTAGAAAACTACATTGATGAAGTTTTAAATGAAGTTTTAGTAGTGCCGAATATAAAAGAAAGTCATCACACTACATCAAACTCTGCCCCACTTTTAGATGCTGCAGAGACGGGACACACCAGTAATGTTCAACCAGAAGATGCTATAGAGACAAGGTATGTTATAACATCACAAACAAGAGATGAGATGAGTATAGAAAGTTTCCTTGGTAGATCTGGTTGTGTCCACATCTCAAGAATAAAGGTTGATTACACTGACTATAATGGACAGGACATAAATTTCACAAAATGGAAAATCACACTACAGGAAATGGCACAGATTAGGAGAAAATTTGAATTGTTTACATATGTCAGGTTTGACTCAGAAATAACCTTGGTGCCTTGTATTGCTGGTAGAGGAGACGACATTGGACATATTGTAATGCAATATATGTATGTTCCTCCAGGAGCTCCAATTCCTTCAAAAAGAAACGATTTCTCATGGCAATCAGGCACCAATATGTCAATATTCTGGCAACATGGACAGCCATTTCCTAGATTTTCTTTACCATTTCTTAGCATTGCATCAGCTTATTATATGTTTTATGATGGATATGATGGAGACAACACTTCTTCCAAGTATGGTAGCGTAGTTACTAATGATATGGGTACTATATGCTCAAGAATAGTTACAGAAAAACAGAAACATTCTGTTGTCATCACAACACACATATATCATAAAGCTAAACACACAAAAGCTTGGTGTCCTAGGCCCCCTAGAGCTGTCCCTTACACACATAGTCATGTGACTAATTATATGCCAGAAACAGGTGACGTGACAACAGCCATAGTCCGCAGAAACACTATAACAACTGCTGGGCCCAGTGATCTATATGTGCATGTAGGTAACTTAATATATAGAAACTTACATCTGTTCAATTCTGAAATGCATGATTCAATTTTGATTTCATACTCTTCTGATTTAATCATATACCGCACAAACACTATAGGTGATGATTATATTCCCAATTGTAACTGCACTGAGGCTACTTATTATTGTAGACACAAAAATAGGTATTACCCAATAAAAGTTACTCCACATGATTGGTATGAAATACAAGAGAGTGAATATTACCCCAAACACATCCAATACAACCTATTAATTGGTGAAGGACCATGTGAACCTGGTGATTGTGGTGGAAAACTTCTTTGTAGACATGGTGTCATTGGCATAATCACAGCAGGTGGTGAAGGTCATGTAGCATTTATAGATCTTAGACAATTTCACTGTGCTGAGGAACAAGGCATAACTGATTACATACACATGTTGGGAGAGGCTTTTGGCAATGGTTTTGTAGATAGTGTTAAAGAACAAATAAATGCAATAAATCCAATCAATAACATTAGTAAGAAGGTTATTAAGTGGCTACTTAGAATAATCTCGGCTATGGTTATTATAATCAGAAACTCCTCTGACCCTCAAACGATCATAGCAACCTTGACACTAATTGGTTGCAATGGTTCACCATGGAGATTTCTCAAAGAAAAGTTTTGCAAATGGACCCAATTAACTTATATCCACAAAGAGTCTGATTCATGGCTTAAGAAATTCACTGAAATGTGTAATGCTGCACGTGGTCTTGAATGGATTGGTAATAAAATTTCAAAATTTATAGATTGGATGAAATCTATGCTACCCCAGGCCCAATTGAAAGTTAAATACTTGAATGAAATAAAGAAACTCAGTTTGCTTGAAAAACAGATTGAAAATCTACGTGCGGCAGATAGTGCAACACAAGAGAAAATCAAATGTGAAATTGACACCCTACATGATCTATCGTGCAAATTTCTTCCTTTGTATGCACATGAGGCAAAAAGAATCAAAGTGCTTTATAATAAATGTTCCAATATAATTAAACAAAGAAAGAGAAGTGAACCGGTGGCGGTGATGATACATGGACCACCCGGTACTGGTAAATCTATAACAACTAACTTCTTGGCTAGAATGATAACAAATGAAAGTGATGTGTACTCATTACCTCCAGATCCCAAATATTTTGATGGTTATGACAATCAGAGTGTTGTAATCATGGATGATATTATGCAAAATCCAGATGGAGAAGACATGACACTATTTTGCCAAATGGTTTCAAGTGTTACATTTATACCACCCATGGCTGATTTGCCTGACAAGGGTAAACCATTTGATTCAAGATTTATCTTATGTAGTACTAACCACTCGCTTTTAGCCCCACCTACTATATCTTCATTACCCGCAATGAATAGAAGATTTTTCTTTGACTTAGATATTGTAGTTCATGACAATTATAAAGATACACAAGGGAAATTAGATGTATCCAAAGCTTTTCGACCTTGTAATGTTAACACCAAAATTGGCAATGCAAAATGTTGTCCATTTGTATGTGGTAAGGCAGTGACATTCAAAGATCGCAGCACTTGCTCAACATACACCTTAGCTCAAGTTTACAATCACATTTTGGAAGAAGACAAAAGAAGGAGACAGGTGGTGGATGTCATGTCTGCAATTTTCCAAGGACCAATTTCTTTAGACGTTCCACCACCACCAGCTATAGCAGATCTGTTACAATCAGTTAGAACACCTGAGGTAATCAAGTACTGTCAAGATAATAAATGGGTCATTCCAGCAGAGTGCCAAGTGGAAAGAGACTTAAATATAGCCAATAGCATAA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| 73,328
|
MF973194.1
|
rhinovirus A1
|
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J., Shean,R.C., Jerome,K.R., Kuypers,J.M.
|
UW, Lab Medicine
|
USA
|
2017-12-09
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,941
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJNA338014
|
Rhinovirus A1 strain 7A2, complete genome
|
TTCCCCGGTTGACGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACTGATATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACACAGAGCCTAGTAGGATTCTGAAAGATCTTTGGTTGGTCGCTCAGCTGCATACCCAGCAGTAGACCTTGCAGATGAGGCTGGACATTCCCCACTGGTAACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCTCTTATGAGGTGTGAAGCCAAGGATTGGACAGGGTGCGAAGAGCCGCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAAACCTGCAGCCATAGCTCATAAGCCAATGAGTTTATGGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTATCAATTGCTTATGGTGACAATATATATAAATATATATATTGGCATCATGGGCGCTCAGGTATCCAGACAAAATGTTGGCACACACTCAACCCAAAATTCAGTGTCAAATGGATCAAGTTTAAATTACTTTAATATAAATTATTTCAAGGATGCTGCCTCAAGTGGCGCATCTAGATTAGATTTTTCTCAAGATCCAAGCAAATTCACTGATCCAGTTAAAGATGTCTTAGAAAAAGGGATTCCAACATTACAATCACCATCTGTTGAGGCTTGTGGTTATTCAGATAGGATTATACAAATCACCAGAGGTGACTCAACAATTACATCCCAAGATGTGGCGAATGCTGTGGTTGGGTATGGAGTCTGGCCACATTATTTAACACCACAAGACGCCACTGCCATAGATAAACCAACACAACCCGACACATCATCAAATAGATTTTATACATTAGAAAGCAAACATTGGACTAGTTCTTCAAAAGGATGGTGGTGGAAATTGCCAGATGCTCTTAAAGACATGGGCATCTTTGGAGAAAACATGTATTATCATTTCCTGGGTAGAAGTGGATATACAGTTCATGTGCAGTGTAATGCTAGTAAATTCCATCAAGGTACCTTGTTAGTCGCAATGATACCAGAACATCAACTGGCAAGTGCAAAACATGGAAGTGTGACTGTTGGTTACAAGCTAACACACCCAGGTGAGGCTGGTAGAGATGTGAGTCAGGAACGTGACACAAGTTTAAGACAACCTAGTGATGATAGTTGGCTTAATTTTGATGGTACCCTGCTTGGAAATTTATTGATTTTCCCACATCAGTTTATAAACCTTAGAAGTAATAATTCTGCAACTATAATAGTACCATATGTAAATGCTGTGCCAATGGATTCAATGCTTCGGCACAATAACTGGAGCCTAGTTATCATACCAATTTGTTCATTGCGTAGTGAAACTTCATCTACTAATATAGTACCAATCACTGTGTCAATAAGTCCCATGTGTGCTGAATTTTCTGGTGCAAGAGCAAAAAATGTTAAACAAGGATTGCCTGTATACATGACCCCAGGGTCTGGACAGTTCATGACCACTGACGATATGCAATCACCTTGTGCACTACCTTGGTACCATCCTACTAAAGAAATATCTATTCCAGGTGAAGTTAAAAACCTTATAGAAATGTGTCAAGTTGATACCTTGATTCCAGTCAATAATGTGGGCAATAATGTTGGGAATATTAGTATGTACACTGTGCAATTAGAAAACCAAACAGGTATGGCACAAAAAGTCTTTTCAATAAAAGTAGATATAACATCACAACCTTTGGCTACAACTTTAATTGGAGAAATTGCAAGTTACTACACCCATTGGACTGGCAGTCTACGATTTAGTTTCATGTTTTGTGGAACTGCAAATACAACACTTAAATTACTACTTGCATACACACCACCTGGTATTGATGAACCAACAAATAGAAAAGATGCAATGCTAGGAACACATGTCGTGTGGGATGTTGGATTACAATCTACTATATCTCTTGTTGTGCCATGGGTGAGTGCTAGTCACTTTAGATTAACTGCAGATAATAAATACTCTATGGCTGGTTATATTACATGTTGGTACCAAACTAACCTAGTAGTACCCCCAAACACACCACAAACTGCTGATATGCTATGCTTTGTCTCTGCATGTAAGGATTTCTGTCTGCGAATGGCAAGGGATACAGACTTACACATACAAAGTGGCCCAATAGAGCAAAATCCAGTAGAAAATTACATCGATGAAGTTTTGAATGAAGTTTTAGTAGTGCCAAATATAAAAGAGAGTCATCACACTACATCAAATTCTGCTCCACTTTTAGATGCTGCAGAAACGGGACACACCAGTAATGTGCAACCAGAAGATGCTATAGAAACAAGGTATGTCATAACATCACAAACAAGAGATGAAATGAGCATAGAAAGCTTCCTTGGTAGATCTGGCTGTGTTCACACTTCAAGAATAAAAGTTGATTATACTGATTATAATGGAGAGAACTTAAATTTTACAAAATGGAACATCACACTGCAGGAGATGGCACAGATTAGAAGGAAATTTGAATTGTTTACATATGTCAGGTTTGATTCAGAAGTAACCTTGGTGCCTTGTATTGCTGGTAGAGGAGATGACATTGGACACATTGTAATGCAATATATGTATGTCCCTCCAGGAGCCCCAATTCCCTCAAAAAGAAATGATTTTACATGGCAATCAGGCACCAATATGTCTATATTCTGGCAACATGGGCAGCCATTCCCTAGATTTTCTTTACCATTTCTTAGTATTGCATCAGCTTATTACATGTTTTATGATGGATATGATGGGGACAACACTTCTTCAAAGTATGGTAGTGTAGTTACTAATGACATGGGTACTATATGTTCTAGAATAGTTACAGAAAAACAGAAACATCCTATTGTTATTACAACACACATATATCATAAAGCTAAACACATAAAAGCTTGGTGTCCCAGGCCCCCTAGAGCTGTACCTTACACACACAGTCATGTAACCAATTATAAACCAGAAACAGGTGATGTAGAAACAGCCATAGTTCGCAGAAATGCCATAACAACTGCTGGGCCTAGTGATCTATATGTGCATGTAGGTAACCTAATATATAGAAATTTACATCTGTTTAATTCTGAAATGCATGATTCAATTTTGGTCTCATACTCTTCTGATTTAATCATATACCGCACAAACACTACAGGTGATGATTATATCCCTAATTGCAATTGTACTGAGGCTACATATTATTGTAAACACAAGAACAGGTATTACCCAATAAAAGTTACTTCACATGATTGGTATGAGATACAAGAGAGTGAATATTACCCCAAACATATCCAATACAACCTCTTGATTGGTGAAGGACCATGTGAGCCCGGTGATTGTGGTGGTAAACTCCTTTGTAGACATGGTGTTATCGGCATAATCACAGCAGGTGGTGAAGGGCATGTAGCATTCATAGATCTTAGACAATTTCAATGTGCTGAGGAGCAAGGCATAACTGATTATATACATATGTTAGGAGAGGCTTTTGGTAATGGTTTTGTAGATAGTGTTAAGGAACAGATAAATGCAATTAATCCAATTAATAATATTAGTAAAAAGATTATTAAGTGGTTGCTTAGAATAATCTCAGCTATGGTCATTATAATCAGAAACTCCTCTGATCCTCAAACAATCATAGCAACCTTAACGCTTATTGGTTGCAATGGTTCACCATGGAGGTTTCTTAAGGAAAAGTTTTGCAAATGGACCCAATTAACTTACATCCACAAAGAATCTGATTCATGGTTAAAGAAATTCACTGAGATGTGTAATGCTGCACGTGGCCTTGAATGGATTGGTAACAAAATTTCAAAATTTATAGATTGGATGAAGTCAATGTTACCTCAAGCTCAATTGAAAGTCAAATATTTAAATGAAATGAAGAAGCTCAATCTACTTGAAAAACAAATTGAAAATCTGCGTGCAGCAGATAGTGCAACACAGGAAAAAATTAAATGTGAAATTGACACTTTACATGATCTATCATGCAAATTTCTCCCTTTGTATGCACATGAGGCAAAAAGAATCAAAGTGCTATATAACAAATGTTCCAATATAATCAAACAAAGAAAGAGAAGTGAACCGGTGGCTGTGATGATACATGGACCACCTGGTACTGGTAAATCCATAACAACTAGTTTCTTAGCCAGAATGATAACAAATGAAAGTGATGTGTACTCATTACCTCCAGATCCTAAATACTTTGATGGTTATGACAATCAGAGTGTTGTAATTATGGATGACATCATGCAGAACCCAGATGGGGAGGACATGACACTATTCTGTCAGATGGTTTCAAGTGTTACATTTATACCACCTATGGCTGACTTGCCTGATAAGGGCAAACCATTTGATTCAAGGTTTATCTTATGTAGTACCAACCACTCACTTTTGGCCCCACCTACCATATCTTCATTGCCTGCAATGAACAGAAGATTCTTCTTTGACTTGGATATTGTGGTACATGACAATTACAAGGATATGCAAGGCAAATTAGACGTATCCAAGGCTTTCCAACCCTGTGATGTCAACACTAAAATTGGCAATGCAAAATGTTGTCCATTCGTATGTGGTAAGGCAGTTACATTTAAAGATCGTAGCACTTGTTCAACATACACCTTAGCCCAAGTTTATAATCACATTTTAGAGGAAGACAAGAGAAGAAGACAGGTAGTAGATGTCATGTCTGCAATATTCCAAGGGCCAATTTCTTTAGATGCTCCACCACCACCAGCTATAGCAGACTTGCTACAATCAGTTAGAACACCTGAGGTAATTAAATATTGTCAAGACAATAAATGGATTGTTCCAGCAGAGTGTCAAATTGAGAGAGACTTAAATATAGCCAATAGCATAATAACTATCATAGCAAATATAATAAGTATAGCTGGTATCATATTTATAATTTATAAATTATTTTGCTCATTACAAGGACCATATTCAGGTGAACCTAAACCTAAGACTAAGATGCCTGAAAGAAGAGTAGTTGCTCAAGGTCCAGAAGAAGA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| 73,329
|
FJ445111.1
|
rhinovirus A1
|
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
|
University of Maryland School of Medicine
|
USA
|
2009-02-13
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,137
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA32533
|
Human rhinovirus 1 strain ATCC VR-1559, complete genome
|
TTAAAACTGGGTGTGGGTTGTTCCCACCCACACCACCCAATGGGTGTTGTACTCTGTTATTCCGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTTCCCTCCCCTCCCCATCCTTTTACGTAACTTAGAAGTTTTAAATACAAGACCAATAGTAGGCAACTCTCCAGGTTGTCTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGATGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACAGATACCGTTATCCGCAAAGTGCCTACACAGAGCTTAGTAGGATTCTGAAAGATCTTTGGTTGGTCGTTCAGCTGCATACCCAGCAGTAGACCTTGCAGATGAGGCTGGACATTCCCCACTGGTAACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCACCTCTCATGAGGTGTGAAGCCAAAGATCGGACAGGGTGTGAAGAGCCGCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAAACCTGCAGCCATGGCTCATAAGCCAATGAGTTTATGGTCGTAACGAGTAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTATTAATTGCTTATGGTGACAATATATATATTGATATATATTGGCATCATGGGCGCCCAGGTATCTAGACAAAATGTTGGTACACACTCAACCCAAAATTCAGTGTCAAATGGATCAAGTTTAAATTACTTTAATATAAATTACTTCAAGGATGCTGCCTCAAGTGGTGCATCTAGATTAGATTTCTCTCAAGATCCAAGCAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTCTTAGAAAAGGGGATCCCAACACTACAATCACCATCTGTTGAGGCTTGTGGCTATTCAGACAGGATTATGCAAATAACCAGAGGAGATTCAACAATCACATCTCAAGATGTAGCAAATGCTGTGGTTGGGTATGGGGTCTGGCCGCATTACTTAACACCACAAGATGCCACTGCTATAGACAAACCAACACAACCTGATACATCATCAAATAGATTTTATACACTAGAGAGTAAACATTGGAATGGTAGTTCAAAAGGATGGTGGTGGAAATTACCAGATGCTCTTAAAGACATGGGTATTTTTGGAGAAAATATGTATTATCATTTCCTGGGTAGAAGTGGATATACAGTTCATGTGCAGTGTAATGCTAGTAAATTCCATCAGGGTACCTTGTTAGTTGCAATGATACCAGAACACCAGCTAGCAAGTGCAAAACACGGAAGTGTGACTGCTGGTTACAAACTCACACACCCAGGTGAGGCTGGCAGAGATGTAAGTCAAGAACGTGATGCAAGTTTAAGACAACCTAGTGATGATAGTTGGCTTAATTTTGATGGCACCCTTCTTGGAAATTTATTAATTTTCCCACATCAATTTATAAACCTTAGGAGTAATAATTCTGCAACTCTAATAGTACCATATGTAAATGCTGTGCCAATGGATTCAATGCTTCGACATAATAACTGGAGCCTGGTCATCATACCAATTAGTCCATTACGTAGTGAAACTACATCTTCTAATATAGTGCCAATCACTGTATCAATAAGTCCCATGTGTGCTGAATTTTCTGGTGCAAGAGCAAAAAACATTAAACAAGGATTACCTGTATATATAACTCCAGGATCTGGGCAATTCATGACTACTGATGATATGCAATCACCTTGTGCACTACCCTGGTACCATCCTACTAAAGAAATATCTATTCCGGGTGAAGTTAAAAACCTTATAGAAATGTGTCAAGTTGATACCTTGATTCCAGTCAATAATGTGGGTAACAATGTTGGAAATGTCAGTATGTACACTGTACAACTAGGGAACCAAACAGGCATGGCACAAAAAGTCTTTTCAATAAAAGTAGACATTACATCACAGCCTTTGGCTACAACTTTAATTGGGGAGATTGCAAGCTATTACACCCATTGGACTGGCAGTCTGCGATTTAGTTTTATGTTTTGTGGGACTGCAAACACAACACTTAAATTATTACTTGCATACACACCACCTGGTATTGATGAACCAACAACTAGAAAGGATGCAATGCTAGGGACACATGTTGTGTGGGATGTTGGATTGCAGTCTACTATATCTCTTGTTGTACCATGGGTGAGTGCCAGCCACTTCAGGTTAACTGCAGATAATAAATACTCCATGGCTGGTTATATCACATGTTGGTACCAAACTAATTTAGTAGTGCCCCCAAGTACGCCACAGACTGCTGATATGCTGTGTTTTGTTTCTGCATGTAAAGATTTTTGTCTACGAATGGCAAGGGATACAGATTTACACATACAAAGTGGTCCAATAGAGCAAAATCCAGTAGAAAACTACATTGATGAAGTTTTAAATGAAGTTTTAGTAGTGCCGAATATAAAAGAAAGTCATCACACTACATCAAACTCTGCCCCACTTTTAGATGCTGCAGAGACGGGACACACCAGTAATGTTCAACCAGAAGATGCTATAGAGACAAGGTATGTTATAACATCACAAACAAGAGATGAGATGAGTATAGAAAGTTTCCTTGGTAGATCTGGTTGTGTCCACATCTCAAGAATAAAGGTTGATTACACTGACTATAATGGACAGGACATAAATTTCACAAAATGGAAAATCACACTACAGGAAATGGCACAGATTAGGAGAAAATTTGAATTGTTTACATATGTCAGGTTTGACTCAGAAATAACCTTGGTGCCTTGTATTGCTGGTAGAGGAGACGACATTGGACATATTGTAATGCAATATATGTATGTTCCTCCAGGAGCTCCAATTCCTTCAAAAAGAAACGATTTCTCATGGCAATCAGGCACCAATATGTCAATATTCTGGCAACATGGACAGCCATTTCCTAGATTTTCTTTACCATTTCTTAGCATTGCATCAGCTTATTATATGTTTTATGATGGATATGATGGAGACAACACTTCTTCCAAGTATGGTAGCGTAGTTACTAATGATATGGGTACTATATGCTCAAGAATAGTTACAGAAAAACAGAAACATTCTGTTGTCATCACAACACACATATATCATAAAGCTAAACACACAAAAGCTTGGTGTCCTAGGCCCCCTAGAGCTGTCCCTTACACACATAGTCATGTGACTAATTATATGCCAGAAACAGGTGACGTGACAACAGCCATAGTCCGCAGAAACACTATAACAACTGCTGGGCCCAGTGATCTATATGTGCATGTAGGTAACTTAATATATAGAAACTTACATCTGTTCAATTCTGAAATGCATGATTCAATTTTGATTTCATACTCTTCTGATTTAATCATATACCGCACAAACACTATAGGTGATGATTATATTCCCAATTGTAACTGCACTGAGGCTACTTATTATTGTAGACACAAAAATAGGTATTACCCAATAAAAGTTACTCCACATGATTGGTATGAAATACAAGAGAGTGAATATTACCCCAAACACATCCAATACAACCTATTAATTGGTGAAGGACCATGTGAACCTGGTGATTGTGGTGGAAAACTTCTTTGTAGACATGGTGTCATTGGCATAATCACAGCAGGTGGTGAAGGTCATGTAGCATTTATAGATCTTAGACAATTTCACTGTGCTGAGGAACAAGGCATAACTGATTACATACACATGTTGGGAGAGGCTTTTGGCAATGGTTTTGTAGATAGTGTTAAAGAACAAATAAATGCAATAAATCCAATCAATAACATTAGTAAGAAGGTTATTAAGTGGCTACTTAGAATAATCTCGGCTATGGTTATTATAATCAGAAACTCCTCTGACCCTCAAACGATCATAGCAACCTTGACACTAATTGGTTGCAATGGTTCACCATGGAGATTTCTCAAAGAAAAGTTTTGCAAATGGACCCAATTAACTTATATCCACAAAGAGTCTGATTCATGGCTTAAGAAATTCACTGAAATGTGTAATGCTGCACGTGGTCTTGAATGGATTGGTAATAAAATTTCAAAATTTATAGATTGGATGAAATCTATGCTACCCCAGGCCCAATTGAAAGTTAAATACTTGAATGAAATAAAGAAACTCAGTTTGCTTGAAAAACAGATTGAAAATCTACGTGCGGCAGATAGTGCAACACAAGAGAAAATCAAATGTGAAATTGACACCCTACATGATCTATCGTGCAAATTTCTTCCTTTGTATGCACATGAGGCAAAAAGAATCAAAGTGCTTTATAATAAATGTTCCAATATAATTAAACAAAGAAAGAGAAGTGAACCGGTGGCGGTGATGATACATGGACCACCCGGTACTGGTAAATCTATAACAACTAACTTCTTGGCTAGAATGATAACAAATGAAAGTGATGTGTACTCATTACCTCCAGATCCCAAATATTTTGATGGTTATGACAATCAGAGTGTTGTAATCATGGATGATATTATGCAAAATCCAGATGGAGAAGACATGACACTATTTTGCCAAATGGTTTCAAGTGTTACATTTATACCACCCATGGCTGATTTGCCTGACAAGGGTAAACCATTTGATTCAAGATTTATCTTATGTAGTACTAACCACTCGCTTTTAGCCCCACCTACTATATCTTCATTACCCGCAATGAATAGAAGATTTTTCTTTGACTTAGATATTGTAGTTCATGACAATTATAAAGATACACAAGGGAAATTAGATGTATCCAAAGCTTTTCGACCTTGTAATGTTAACACCAAAATTGGCAATGCAAAATGTTGTCCATTTGTATGTGGTAAGGCAGTGWCATTCAAAGATCGCAGCACTTGCTCAACATACACCTTAGCTCAAGTTTACAATCACATTTTGGAAGAAGACAAAAGAAGGAGACAGGTGGTGGATGTCATGTCTGCAATTTTCCAAGGACCAATTTCTTTAGACGYTCCACCACCACCAGCTATAGYAGATCTGTTACAATCAGTTAGAACACCTGAGGTAATCAAGTACTGTCAAGATAATAAATGGGTCATTCCAGCAGAGTGCCAAGTG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| 103,679
|
ON729339.1
|
rhinovirus A101
|
Sereewit,J., Xie,H., Greninger,A.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
| null |
2022-07-20
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,124
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2017
|
SAMN28886789
|
PRJNA338014
|
Rhinovirus A101 strain SC1270, complete genome
|
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|
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|
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|
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|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
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| 7,039
|
GenBank
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USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021
|
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|
PRJNA723895
|
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|
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Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/K4V8RA, complete genome
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|
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UW Virology, DLMP
|
USA
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2022-01-04
|
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|
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Enterovirus
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Picornaviridae
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|
GenBank
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USA
|
USA
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Homo sapiens
| null |
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|
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|
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2022-01-04
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Enterovirus
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Picornaviridae
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USA
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Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/YB9UM7, complete genome
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| 34,097
|
OL961539.1
|
rhinovirus A101
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,039
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-07-03
|
SAMN23789527
|
PRJNA1066815
|
Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/QNHAVA, complete genome
|
ACAGTTTTATGATCCCCTACCCCAAATGTAACTTAGAAACATGTACACAATGATCAATAGGGTGGTGGCTATCCAAGTCACCTAAGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTGAGTGTGGATATGCTTTACCCAAGGCAGAAACTAATCTCATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGGGAAGCCTAGTAATATTCTGAAGGTATTCTGGTTGGTCGCTCAGTTGCATTCACCCGTGCAATAGACCTGGCAGATGGGGCTAGGCATACCCCACTGGTAACAGTGGCCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCACACCTTCGGGTGTGAAGCCATAATATTGACAGGGTGTGAAGAGCCTACTGTGCTCACCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTATCCATTGCACACAAGCCAGTGTGTTTATGGTCGTAATGGGTAACTACGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTAATATTGCTTATGGTGACATTATATATTGATATAGTGTCATCATGGGTGCACAGGTTTCCAGACAAAACGTTGGGACTCACTCAACACAAAATGCAGTGTCTAATGGCTCAAGTTTAAATTATTTTAACATCAATTATTTTAAAGATGCAGCATCGAGTGGAGCATCAAGGTTAGATTTTTCACAAGACCCCAGTAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTTTTAACAAAAGGAATTCCAACACTACAGTCCCCATCTGTTGAGGCTTGTGGATACTCAGACAGGATAATACAAATAACAAGAGGGAACTCAACAATAACATCACAAGATGTAGCAAATGCAGTTGTTGGGTATGGAGTGTGGCCTCAATACTTGCCTGATGATGATGCTAGTGCTATTGACAAACCAACCCATCCAGATACGTCATCAAACAGGTTCTATACATTAGACAGTAAAGAGTGGAAAAATGATTCTAAGGGATGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTCTCAAAAATATGGGAATTTTTGGAGAAAATCTGTTTTATCATTTCCTAGGCAGAGCTGGATACACAGTGCATGTGCAATGTAATGCAAGCAAATTTCATCAAGGTGCATTAGTTGTTGCTGCAATTCCAGAACACCAGTTGGCATATATCGGATCAGAAAATGTCAGTGTGGGATATAAACATACACACCCTGGAGAAACAGGGCGAACACTCAACGACAGAGCAAATAATAACTCACAACAACCCACTGATGAAAGCTGGTTAAATTGTGATGGAACATTGTTAGGAAACATCACCATCTACCCACACCAATTTATCAACCTGAGGAGTAACAATTCAGCCACTTTAATTCTACCTTATGTAAATGCTGTTCCCATGGATTCAATGGTTAGACACAACAACTGGAGTATCGTGATAATACCCGTGTCTCCGCTCCAGACCATAGAAGGAACACCTTATGTGCCAATCACACTATCAATAAGCCCCATGGCCTCAGAATTCTCAGGTGCTCGTAACACAGCCAGACCACAAGGCCTGCCAGTTATGCTCACCCCAGGCTCAGGACAATTCCTCACTACAGATGATGCACAATCACCTTCAGCTTTACCCTATTTTCATCCAACAAAAGAAATATTCATACCAGGTAGAGTCACTAACTTATCAGAGATTTGCCAAGTTGATTCAATGATTCCAATTAACAATACAGTAGCAGGCCACAAAAAAGTGGGTATGTATGCAGTTCGTGTGGGTGTCCAAACAGCATCAGCCAGAGAAGTTTTCGCTATACCAGTGGATGTTGCCTCTCAACCCTTAGCAACCACTCTTATTGGAGAAATAGCTAGTTATTATACACACTGGACAGGATCCATAAGATTCTCTTTCATGTTTTGTGGCACAGCCAACACTAGTCTCAAACTACTCATAGCATACACGCCACCTGGAGTAGCCAAACCAGATTCAAGGACAAAGGCCATGCTAGGAACTCATGTAGTGTGGGATGTTGGATTACAGTCCACTGTATCAATGGTAGTCCCTTGGGTCTCTGCAAGTCACTATAGACTTACCACACCTGATACATACTCAAAAGCTGGATACATTACTTGCTGGTATCAAACCAATTTTGTAGTGCCTCCAAGTACCCCAAGTACTGCAGATATCATATGCTTTGTGTCTGGTTGCAAGGATTTCTGTCTAAGGATGGCCAGAGACACAAATTTACACTCTCAAACTGTCAACATCACACAAAATCCAGTTGAGAAGTATACTGAAGCAATTCTAAATGAAGTCTTAACAGTCCCAAATATACAGCCTAGTTCAGGCAACACTTCTAATGCAGCTCCAGTTTTAGATGCTGCTGAGACTGGTCACACCAATCAGACACAACCAGAAGACACAGTAGAAACTAGGTATGTTATCACAGATCAAACGCGTGATGAAATGAGTGTTGAGAGTTTCTTAGGGAGATCAGGTTGCATTTCTGAAATGCATACCATTGTAGAACATGGTAGAGATGTGTATAATGCAGTGAATAAAAATTTTACTACATGGAAGATCACCCTAAAGGAGATGGCACAAATCAGAAGAAAGTGTGAATTGTTTACATACTTGAGATTTGATTCAGAAATAACTATAGTGCCCACAGTGGCTGGACAAGGGAATGACACCGGGCATGTGGTACTTCAGTACATGTTTGTCCCACCAGGGGCTCCAGTCCCTAAGAAAAGAGATGATTACACATGGCAATCTGGCACGAATGCTTCAGTTTTCTGGCAGCAAGGTCAAACCTACCCCAGATTCACAATACCCTTCATGAGCATTGCCTCAGCATACTATATGTTTTATGATGGATATGAAGATGATACACCGAATTCAAAATATGGTGCAGTTATAACAAATGACATGGGAACACTGTGTGTACGTATTGTAACTGAACAACAAGCAAATACTGTACACATTACAAGCAGGGTCTATCATAAAGCAAAACATATTAGTGCATGGTGTCCACGACCACCCAGAGCTGTAGCATATCAGCGTGTACATAATACCAACTTTGTTCCAGAAACAGGGCAAGTAGAAATACAAATACCCACAAGAACAGATCTTACTACTGTGGGCCCCTCAGATATGTATGTACATATGAATAACCTCATATACAGAAATCTACATTTGTGTGATCCAGAAGACTTGGATGATTCAGTATTAATTTGTTATTCCAGTGATTTAGTCATATACCGAACAAATACCAAAGGTGATGATTATATCCCAGTGTGTAACTGCACTGAAGCAACATACTACTGTAAACACAAGGATAGGTATTTCCCAATAAATGTTAAGAAACATCAGTGGTATGAAATACAAGAATCTGAATACTACCCAAAACACATACAATACAATATATTAATTGGAGAAGGACCGTGTGCACCTGGAGATTGTGGAGGGAAACTACTATGTAAGCATGGAGTCATTGGAATAGTCACTGCAGGTGGAGAAAATCATGTAGCATTTATTGATTTGAGAGACTTCCATGTTGCTGATGAACAGGGCATAACAGATTACATACACACACTTGGAGAGGCGTTTGGTGCAGGTTTTGTAGATAATATTAAGGATCAGATACAGGCTATAAACCCAATAAATAGAGTAACTAGCAAGATAGTTAAATGGATAATCAGAATCATATCAGCAGTTACAATAATCATTAGAAACAGTGCAGACCCACACACAATAGTTGCAACTCTAGCTTTAATTGGTTGCTCCGGTTCACCATGGAGATTCATTAAAGAGAAAGTGTGTAATTGGTTACAATTATCATACATACATAAAGAATCAGATGGATGGATCAAAAAATTCACTGAGATGTGCAATGCTGCTAGGGGTTTGGAGTGGCTTGGAAACAAGATATCAAAATTTATCGACTGGCTCAAGTCAATGCTACCACAAGCTAAACTTAAGGTCGATTTCATTGGGAAACTCAAACAGCTACCCTTATTAGAAAAAGAGATTGATGGATTAAGACTAGCAACCCAGAAACAACAACAAGAGTACATTGACACCCTTAGAGTTATGTTAGATGCATCTAATAAATTTCTGCCTCTATATGCACTTGAAAATAAAAGAATCAAAGAACTTCTTAAGAGGAGTGAAATGATCCTCCGCACAGCTAAAAGGACTGAACCAGTTGGGGTGCTTTTCCATGGTGAACCAGGTACAGGTAAATCAATTGCTACATCAATATTGGCAAGAATGATAACCACAGAATCTGACATATATTCACTACCACCATCGCCAAAATACTTTGATGGCTATGACCAGCAGAGTGTTGTTATCATGGATGATATTATGCAGAACCCCAGTGGTGAGGATATGTCACTTTTTTGTCAAATGGTGTCATCAGTTCCCTTTATCCCACCTATGGCAGATTTACCAGACAAAGGAAAGCCTTTTTCTTCAGATTATGTACTAGCTAGTACAAATCATACTCTATTACATCCCCCAACTATAACATGCACTACAGCAATGAACAGAAGATTTTTCCTAGATCTAGACATAATAGTTAAGGAGAATTACAAACTTAACCAGGGTAAACTTAATTTGCAATGTGCACTGAAACCATGCCAGGATGGTAAAATTGGGAATGCAAAGTGTTGCCCTCTGATATGTGGGAAGGCTGTAGTGTTTAAAGATAGAGATACAGGAGACCACCTATCTCTAGCCACAGTGTATAATAAAATAATTGAGGAAAGTAAAAACAGAAAAGAACTAACCAGTTCACTACAGGCAATTTTCCAAGGTCCAATTGATGTAGTTAATAAACCACCTCCACCTGCCATATTGGATCTTCTTAAATCAGTCAGGAATCCAGATGTCATCAAATATTGTGAGGAAAATAAATGGATTGTACCAGCAGATTGTAAATTAGAGAGAGACTTAAACTATGCTAATTTAGTAATTTCTATGATTGCTAATGTTATCAGTATAATGGGGGTTATATATATTAT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|
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|
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|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
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UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
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Enterovirus
|
Picornaviridae
|
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| 7,040
|
GenBank
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|
USA
|
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| null |
2021-06-22
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Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/RTCGPQ, complete genome
|
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| 34,141
|
OM001363.1
|
rhinovirus A101
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,020
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-07-02
|
SAMN24289203
|
PRJNA1066815
|
Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/6QH7WE, complete genome
|
CCCCAAATGTAACTTAGAAGCATGTACACAATGATCAACAGGGTGGTGGCTATCCAAGTCACCTAAGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTGAGTGTGGATATGCTTTACCCAAGGCAGAAACTAATCTCATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGGGAAGCCTAGTAACATTTTGAAGGTATTCTGGTTGGTCGCTCAGTTGCATTCACCCATGCAATAGACCTGGCAGATGGGGCTAGGCATACCCCACTGGTAACAGTGGCCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCACACCTTCGGGTGTGAAGCCATAATATTGACAGGGTGTGAAGAGCCTACTGTGCTCACCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTATCCATTGCACACAAGCCAGTGTGTTTATGGTCGTAATGGGCAACTACGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTAATATTGCTTATGGTGACATTATATATTGATATAGTGTCATCATGGGTGCACAAGTTTCCAGACAAAACGTTGGAACTCACTCAACACAAAATGCAGTGTCTAATGGCTCAAGTTTAAATTATTTTAACATTAATTATTTTAAAGATGCAGCATCGAGTGGAGCATCAAGGTTAGATTTTTCACAAGATCCCAGTAAGTTCACTGACCCAGTTAAAGATGTTTTAACAAAGGGAATTCCAACACTGCAATCCCCATCTGTTGAGGCTTGCGGTTATTCAGACAGAATAATACAAATAACAAGAGGGAATTCGACAATAACATCACAAGATGTGGCAAATGCAGTTGTTGGGTATGGAGTGTGGCCTCAATACTTGCCTGATGATGATGCTAGTGCTATTGACAAACCAACCCATCCAGATACATCTTCAAACAGATTCTATACATTAGACAGTAAAGAGTGGAAAAATGATTCTAAGGGATGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTCTCAAAAATATGGGAATTTTTGGAGAAAATCTATTTTATCACTTCCTAGGCAGAGCTGGATACACAGTACATGTGCAATGCAATGCAAGCAAATTTCATCAAGGTGCGTTAGTTGTTGCTGCAATTCCAGAACACCAGTTGGCATATATCGGATCAGAAAATGTCAGTGTGGGATATAAACACACACACCCTGGGGAAACAGGACGAACACTCAATGACAGAGCAAATAACAACTCACAACAACCTACTGATGAAAGCTGGTTAAATTGTGATGGGACATTGTTAGGAAATATCACCATCTACCCACACCAATTTATCAACCTAAGGAGTAACAACTCAGCTACTTTAATTCTACCTTATGTAAATGCTGTTCCTATGGATTCAATGGTTAGACATAACAACTGGAGTATTGTGATAATACCCGTGTCTCCGCTTCAGACCATAGAAGGAACACCTTATGTGCCAATCACACTATCAATAAGCCCTATGGCCTCTGAATTCTCAGGTGCTCGGAACACAGCCAGACCACAAGGCCTACCAGTTATGCTCACCCCAGGCTCAGGACAATTCCTTACTACAGATGATGCACAATCACCTTCAGCTTTACCTTATTTTCATCCAACAAAAGAAATATTTATACCAGGTAGAGTCACTAACTTATCAGAGATCTGCCAAGTTGACTCGATGATTCCAATTAACAATACAGTAACAGGTCACAAAAAGGTGGGTATGTATGCAGTTCGTGTGGGTGTCCAAACAGCATCAGCCAGAGAAGTCTTTGCTATGCCAGTAGATGTTGCCTCTCAACCCTTAGCAACCACTCTTATTGGAGAAATAGCTAGTTATTATACACACTGGACAGGATCTATAAGATTCTCTTTCATGTTTTGTGGTACAGCCAATACTAGTCTCAAACTACTCATAGCATACACACCACCTGGAGTAGCCAAACCAGATTCAAGGACAAAAGCTATGCTAGGGACTCATGTAGTGTGGGATGTTGGATTGCAGTCCACTGTATCAATGGTAGTCCCTTGGGTCTCTGCAAGTCACTACAGACTTACCACACCTGATACATATTCAAAAGCTGGATACATTACTTGCTGGTATCAAACAAACTTTGTAGTGCCTCCAAGTACTCCAAGTACTGCAGATATCATATGCTTTGTGTCTGGCTGCAAGGATTTCTGTTTAAGAATGGCCAGAGACACAAACTTGCACTCTCAAACTGTCAACATTACACAAAATCCAGTTGAGAAGTATGCTGAAGCAATTCTAAATGAAGTCTTAACAGTCCCAAATATACAGCCTAGTTCAGGCAACACTTCTAATGCAGCCCCAGTTTTAGACGCTGCTGAGACTGGTCACACCAACCAGACACAACCAGAAGACACAGTAGAAACTAGGTATGTCATCACAGATCAAACGCGTGATGAAATGAGTGTTGAGAGTTTCTTAGGGAGATCAGGTTGTATTTCTGAAATGCATACCATTGTAGAACATGGTAAAGATGTGTATAATGCAGTGAATAAAAATTTTACTACATGGAAGATTACCCTAAAAGAGATGGCACAAATCAGAAGAAAGTGTGAATTGTTTACATACTTGAGATTTGATTCAGAAATAACTATAGTGCCCACAGTAGCTGGGCAAGGGAATGACACCGGACATGTGGTGCTTCAGTATATGTTTGTACCACCAGGGGCTCCGGTCCCTAAGAAAAGAGATGACTACACATGGCAATCTGGCACGAATGCTTCAGTTTTCTGGCAGCAGGGTCAAACCTACCCCAGATTCACAATACCCTTCATGAGCATTGCTTCAGCATACTATATGTTTTATGATGGATATGAAGATGATACACCAAATTCAAAGTATGGTGCAGTTGTAACAAATGACATGGGAACACTGTGTGTACGTATTGTAACTGAACAACAAGCAAATACTGTACACATTACAAGCAGGGTCTATCATAAAGCAAAACATATTAGTGCATGGTGTCCACGACCACCCAGAGCTGTAGCATATCAGCGTGTACACAATACCAACTTTGTTCCAGAAACAGGACAAGTAGAAATACAAATACCCACAAGAACAGATCTTACTACTGTAGGCCCCTCAGACATGTATGTACATATGGATAGCCTCATATACAGAAATCTACATTTGTGTGATCCAGAAGATTTAGATGATTCAGTATTAATTTGTTACTCCAGTGATTTAGTCATATACCGAACAAATACCAAAGGTGATGACTATATTCCAGTGTGTAACTGCACTGAAGCAACATACTACTGTAAACACAAGGATAGGTACTTCCCAATAAATGTTAAGAAACATCAGTGGTATGAAATACAAGAATCTGAATACTACCCAAAACACATACAATACAACATATTAATTGGAGAAGGACCGTGTGCACCTGGAGATTGTGGAGGAAAACTACTATGTAAACATGGAGTTATTGGAATAGTCACTGCAGGTGGAGAAAACCATGTGGCATTTATTGATTTGAGAGACTTCCATGTTGCTGATGAACAGGGCATAACAGATTACATACACACACTTGGAGAGGCCTTTGGTGCAGGTTTTGTAGATAATATTAAGGATCAGATACAGGCTATAAACCCAATAAATAGAGTAACTAGCAAGATAGTTAAGTGGATAATCAGAATCATATCAGCAGTTACAATAATCATTAGAAACAGTGCAGACCCACACACAATAATTGCAACACTAGCTTTAATTGGTTGTTCTGGTTCACCGTGGAGATTCATTAAAGAGAAAGTGTGCAATTGGTTACAACTATCATACATACATAAAGAATCAGATGGATGGATCAAAAAATTTACCGAAATGTGTAATGCTGCTAGGGGTTTAGAATGGCTTGGAAACAAGATATCAAAATTCATTGACTGGCTTAAGTCAATGCTACCACAAGCTAAACTCAAGGTTGATTTTATTGGGAAACTCAAACAGCTACCCTTATTGGAAAAAGAGATTGATGGATTAAGACTAGCAACCCAAAAACAGCAACAAGAATACATTGATACCCTTAGAGTTATGTTAGATGCATCTAATAAGTTCCTGCCTCTATACGCACTTGAGAACAAAAGAATCAAAGAACTTCTTAAGAGAAGTGAGATGATCCTCCGCACAGCTAAAAGAACTGAACCAGTTGGGGTGCTTTTTCATGGTGAACCAGGCACAGGTAAATCGATTGCTACATCAATATTGGCAAGAATGATTACCACAGAATCTGATATATATTCATTACCACCATCACCAAAATACTTTGATGGTTATGACCAACAGAGTGTTGTTATCATGGATGATATTATGCAGAACCCCAGTGGTGAGGATATGTCACTTTTTTGTCAAATGGTGTCATCAGTCCCTTTTATCCCACCTATGGCAGATTTACCAGACAAAGGAAAACCTTTTTCTTCAGATTATGTACTAGCCAGTACAAATCACACTTTATTACATCCCCCAACTATAACATGCACCACAGCAATGAACAGAAGATTTTTCCTAGATTTAGACATAATAGTTAAGGAGAACTACAAAATTAATCAGGGTAAACTTAATTTACAATGTGCATTGAAACCATGTCAGGATGGTAAAATTGGGAATGCAAAATGTTGCCCTCTGATATGTGGGAAGGCTGTAGTGTTTAAAGATAGAGATACAGGAGACCACCTGTCTTTAGCCACAGTGTATAATAAAATAATTGAAGAAAGCAAAAACAGAAAAGAACTAACCAGTTCACTACAGGCAATTTTCCAAGGTCCAATTGATGTAGTTAATAAACCACCTCCACCTGCCATATTAGATCTTCTTAAATCAGTCAGGAATCCAGATGTTATCAAATATTGTGAGGAAAATAAGTGGATTGTACCAGCAGATTGTAAATTAGAGAGAGACTTAAACTATGCTAATTTAGTAATTTCTATGATTGCTAATGTTATCAGTATAATGGGAGTTATATATATTATATACAAATTATTTTGCTCA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| 34,151
|
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|
rhinovirus A101
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,039
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-07-06
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SAMN24289212
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PRJNA1066815
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Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/CBMCLT, complete genome
|
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|
OM001398.1
|
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|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,039
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-06-21
|
SAMN24255302
|
PRJNA1066815
|
Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/2Z473W, complete genome
|
ACAGTTTTATGATCCCCTACCCCAAATGTAACTTAGAAACATGTACACAATGATCAATAGGGTGGTGGCTATCCAAGTCACCTAAGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTGAGTGTGGATATGCTTTACCCAAGGCAGAAACTAATCTCATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGGGAAGCCTAGTAATATTCTGAAGGTATTCTGGTTGGTCGCTCAGTTGCATTCACCCGTGCAATAGACCTGGCAGATGGGGCTAGGCATACCCCACTGGTAACAGTGGCCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCACACCTTCGGGTGTGAAGCCATAATATTGACAGGGTGTGAAGAGCCTACTGTGCTCACCTTGAATCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTATCCATTGCACACAAGCCAGTGTGTTTATGGTCGTAATGGGTAACTACGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTAATATTGCTTATGGTGACATTATATATTGATATAGTGTCATCATGGGTGCACAGGTTTCCAGACAAAACGTTGGGACTCACTCAACACAAAATGCAGTGTCTAATGGCTCAAGTTTAAATTATTTTAACATCAATTATTTTAAAGATGCAGCATCGAGTGGAGCATCAAGGTTAGATTTTTCACAAGACCCCAGTAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTTTTAACAAAAGGAATTCCAACACTACAGTCCCCATCTGTTGAGGCTTGTGGATACTCAGACAGGATAATACAAATAACAAGAGGGAACTCAACAATAACATCACAAGATGTAGCAAATGCAGTTGTTGGGTATGGAGTGTGGCCTCAATACTTGCCTGATGATGATGCTAGTGCTATTGACAAACCAACCCATCCAGATACGTCATCAAACAGGTTCTATACATTAGACAGTAAAGAGTGGAAAAATGATTCTAAGGGATGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTCTCAAAAATATGGGAATTTTTGGAGAAAATCTGTTTTATCATTTCCTAGGCAGAGCTGGATACACAGTGCATGTGCAATGTAATGCAAGCAAATTTCATCAAGGTGCATTAGTTGTTGCTGCAATTCCAGAACACCAGTTGGCATATATCGGATCAGAAAATGTCAGTGTGGGATATAAACATACACACCCTGGAGAAACAGGGCGAACACTCAACGACAGAGCAAATAATAACTCACAACAACCCACTGATGAAAGCTGGTTAAATTGTGATGGAACATTGTTAGGAAACATCACCATCTACCCACACCAATTTATCAACCTGAGGAGTAACAATTCAGCCACTTTAATTCTACCTTATGTAAATGCTGTTCCCATGGATTCAATGGTTAGACACAACAACTGGAGTATCGTGATAATACCCGTGTCTCCGCTCCAGACCATAGAAGGAACACCTTATGTGCCAATCACACTATCAATAAGCCCCATGGCCTCAGAATTCTCAGGTGCTCGTAACACAGCCAGACCACAAGGCCTGCCAGTTATGCTCACCCCAGGCTCAGGACAATTCCTCACTACAGATGATGCACAATCACCTTCAGCTTTACCCTATTTTCATCCAACAAAAGAAATATTCATACCAGGTAGAGTCACTAACTTATCAGAGATTTGCCAAGTTGATTCAATGATTCCAATTAACAATACAGTAGCAGGCCACAAAAAAGTGGGTATGTATGCAGTTCGTGTGGGTGTCCAAACAGCATCAGCCAGAGAAGTTTTCGCTATACCAGTGGATGTTGCCTCTCAACCCTTAGCAACCACTCTTATTGGAGAAATAGCTAGTTATTATACACACTGGACAGGATCCATAAGATTCTCTTTCATGTTTTGTGGCACAGCCAACACTAGTCTCAAACTACTCATAGCATACACGCCACCTGGAGTAGCCAAACCAGATTCAAGGACAAAGGCCATGCTAGGAACTCATGTAGTGTGGGATGTTGGATTACAGTCCACTGTATCAATGGTAGTCCCTTGGGTCTCTGCAAGTCACTATAGACTTACCACACCTGATACATACTCAAAAGCTGGATACATTACTTGCTGGTATCAAACAAATTTTGTAGTGCCTCCAAGTACCCCAAGTACTGCAGATATCATATGCTTTGTGTCTGGTTGCAAGGATTTCTGTCTAAGGATGGCCAGAGACACAAATTTACACTCTCAAACTGTCAACATCACACAAAATCCAGTTGAGAAGTATACTGAAGCAATTCTAAATGAAGTCTTAACAGTCCCAAATATACAGCCTAGTTCAGGCAACACTTCTAATGCAGCCCCAGTTTTAGATGCTGCTGAGACTGGTCACACCAATCAGACACAACCAGAAGACACAGTAGAAACTAGGTATGTCATCACAGATCAAACGCGTGATGAAATGAGTGTTGAGAGTTTCTTAGGGAGATCAGGTTGCATTTCTGAAATGCATACCATTGTAGAACATGGTAGAGATGTGTATAATGCAGTGAATAAAAATTTTACTACATGGAAGATCACCCTAAAGGAGATGGCACAAATCAGAAGAAAGTGTGAATTGTTTACATACTTGAGATTTGATTCAGAAATAACTATAGTGCCCACAGTGGCTGGACAAGGGAATGACACCGGGCATGTGGTACTTCAGTACATGTTTGTCCCACCAGGGGCTCCAGTCCCTAAGAAAAGAGATGATTACACATGGCAATCTGGCACGAATGCTTCAGTTTTCTGGCAGCAAGGTCAAACCTACCCCAGATTCACAATACCCTTCATGAGCATTGCCTCAGCATACTATATGTTTTATGATGGATATGAAGATGATACACCGAATTCAAAATATGGTGCAGTTGTAACAAATGACATGGGAACACTGTGTGTACGTATTGTAACTGAACAACAAGCAAATACTGTACACATTACAAGCAGGGTCTATCATAAAGCAAAACATATTAGTGCATGGTGTCCACGACCACCCAGAGCTGTAGCATATCAGCGTGTACATAATACCAACTTTGTTCCAGAAACAGGGCAAGTAGAAATACAAATACCCACAAGAACAGATCTTACTACTGTGGGCCCCTCAGATATGTATGTACATATGGATAACCTCATATACAGAAATCTACATTTGTGTGATCCAGAAGACTTGGATGATTCAGTATTAATTTGTTATTCCAGTGATTTAGTCATATACCGAACAAATACCAAAGGTGATGATTATATCCCAGTGTGTAACTGCACTGAAGCAACATACTACTGTAAACACAAGGATAGGTATTTCCCAATAAATGTTAAGAAACATCAGTGGTATGAAATACAAGAATCTGAATACTACCCAAAACACATACAATACAATATATTAATTGGAGAAGGACCGTGTGCACCTGGAGATTGTGGAGGGAAACTACTATGTAAGCATGGAGTCATTGGAATAGTCACTGCAGGTGGAGAAAATCATGTAGCATTTATTGATTTGAGAGACTTCCATGTTGCTGATGAACAGGGCATAACAGATTACATACACACACTTGGAGAGGCGTTTGGTGCAGGTTTTGTAGATAATATTAAGGATCAGATACAGGCTATAAACCCAATAAATAGAGTAACTAGCAAGATAGTTAAATGGATAATCAGAATCATATCAGCAGTTACAATAATCATTAGAAACAGTGCAGACCCACACACAATAGTTGCAACTCTAGCTTTAATTGGTTGCTCCGGTTCACCATGGAGATTCATTAAAGAGAAAGTGTGTAATTGGTTACAATTATCATACATACATAAAGAATCAGATGGATGGATCAAAAAATTCACTGAGATGTGCAATGCTGCTAGAGGTTTGGAGTGGCTTGGAAACAAGATATCAAAATTTATCGACTGGCTCAAGTCAATGCTACCACAAGCTAAACTTAAGGTCGATTTCATTGGGAAACTCAAACAGCTACCCTTATTAGAAAAAGAGATTGATGGATTAAGACTAGCAACCCAGAAACAACAACAAGAGTACATTGACACCCTTAGAGTTATGTTAGATGCATCTAATAAATTTCTGCCTCTATATGCACTTGAAAATAAAAGAATCAAAGAACTTCTTAAGAGGAGTGAAATGATCCTCCGCACAGCTAAAAGGACTGAACCAGTTGGGGTGCTTTTCCATGGTGAACCAGGTACAGGTAAATCAATTGCTACATCAATATTGGCAAGAATGATAACCACAGAATCTGACATATATTCACTACCACCATCACCAAAATACTTTGATGGCTATGACCAGCAGAGTGTTGTTATCATGGATGATATTATGCAGAACCCCAGTGGTGAGGATATGTCACTTTTTTGTCAAATGGTGTCATCAGTTCCCTTTATCCCACCTATGGCAGATTTACCAGACAAAGGAAAGCCTTTTTCTTCAGATTATGTACTAGCTAGTACAAATCATACTCTATTACATCCCCCAACTATAACATGCACTACAGCAATGAACAGAAGATTTTTCCTAGATCTAGACATAATAGTTAAGGAGAATTACAAACTTAACCAGGGTAAACTTAATTTGCAATGTGCACTGAAACCATGCCAGGATGGTAAAATTGGGAATGCAAAGTGTTGCCCTCTGATATGTGGGAAGGCTGTAGTGTTTAAAGATAGAGATACAGGAGACCACCTATCTCTAGCCACAGTGTATAATAAAATAATTGAGGAAAGTAAAAACAGAAAAGAACTAACCAGTTCACTACAGGCAATTTTCCAAGGTCCAATTGATGTAGTTAATAAACCACCTCCACCTGCCATATTGGATCTTCTTAAATCAGTCAGGAATCCAGATGTCATCAAATATTGTGAGGAAAATAAATGGATTGTACCAGCAGATTGTAAATTAGAGAGAGACTTAAACTATGCTAATTTAGTAATTTCTATGATTGCTAATGTTATCAGTATAATGGGGGTTATATATATTAT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| 34,186
|
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|
rhinovirus A101
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
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UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
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Enterovirus
|
Picornaviridae
|
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| 7,090
|
GenBank
| null |
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|
USA
|
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| null |
2021
|
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|
PRJNA723895
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Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/8WF6RG, complete genome
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| 34,193
|
OM001413.1
|
rhinovirus A101
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,020
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021
|
SAMN24255303
|
PRJNA723895
|
Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/32263Q, complete genome
|
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Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/B67TLB, complete genome
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| 34,202
|
OM001420.1
|
rhinovirus A101
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,039
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-06-21
|
SAMN24255325
|
PRJNA1066815
|
Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/CJ9SQ3, complete genome
|
ACAGTTTTATGATCCCCTACCCCAAATGTAACTTAGAAACATGTACACAATGATCAATAGGGTGGTGGCTATCCAAGTCACCTAAGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTGAGTGTGGATATGCTTTACCCAAGGCAGAAACTAATCTCATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGGGAAGCCTAGTAATATTCTGAAGGTATTCTGGTTGGTCGCTCAGTTGCATTCACCCGTGCAATAGACCTGGCAGATGGGGCTAGGCATACCCCACTGGTAACAGTGGCCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCACACCTTCGGGTGTGAAGCCATAATATTGACAGGGTGTGAAGAGCCTACTGTGCTCACCTTGAATCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTATCCATTGCACACAAGCCAGTGTGTTTATGGTCGTAATGGGTAACTACGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTAATATTGCTTATGGTGACATTATATATTGATATAGTGTCATCATGGGTGCACAGGTTTCCAGACAAAACGTTGGGACTCACTCAACACAAAATGCAGTGTCTAATGGCTCAAGTTTAAATTATTTTAACATCAATTATTTTAAAGATGCAGCATCGAGTGGAGCATCAAGGTTAGATTTTTCACAAGACCCCAGTAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTTTTAACAAAAGGAATTCCAACACTACAGTCCCCATCTGTTGAGGCTTGTGGATACTCAGACAGGATAATACAAATAACAAGAGGGAACTCAACAATAACATCACAAGATGTAGCAAATGCAGTTGTTGGGTATGGAGTGTGGCCTCAATACTTGCCTGATGATGATGCTAGTGCTATTGACAAACCAACCCATCCAGATACGTCATCAAACAGGTTCTATACATTAGACAGTAAAGAGTGGAAAAATGATTCTAAGGGATGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTCTCAAAAATATGGGAATTTTTGGAGAAAATCTGTTTTATCATTTCCTAGGCAGAGCTGGATACACAGTGCATGTGCAATGTAATGCAAGCAAATTTCATCAAGGTGCATTAGTTGTTGCTGCAATTCCAGAACACCAGTTGGCATATATCGGATCAGAAAATGTCAGTGTGGGATATAAACATACACACCCTGGAGAAACAGGGCGAACACTCAACGACAGAGCAAATAATAACTCACAACAACCCACTGATGAAAGCTGGTTAAATTGTGATGGAACATTGTTAGGAAACATCACCATCTACCCACACCAATTTATCAACCTGAGGAGTAACAATTCAGCCACTTTAATTCTACCTTATGTAAATGCTGTTCCCATGGATTCAATGGTTAGACACAACAACTGGAGTATCGTGATAATACCCGTGTCTCCGCTCCAGACCATAGAAGGAACACCTTATGTGCCAATCACACTATCAATAAGCCCCATGGCCTCAGAATTCTCAGGTGCTCGTAACACAGCCAGACCACAAGGCCTGCCAGTTATGCTCACCCCAGGCTCAGGACAATTCCTCACTACAGATGATGCACAATCACCTTCAGCTTTACCCTATTTTCATCCAACAAAAGAAATATTCATACCAGGTAGAGTCACTAACTTATCAGAGATTTGCCAAGTTGATTCAATGATTCCAATTAACAATACAGTAGCAGGCCACAAAAAAGTGGGTATGTATGCAGTTCGTGTGGGTGTCCAAACAGCATCAGCCAGAGAAGTTTTCGCTATACCAGTGGATGTTGCCTCTCAACCCTTAGCAACCACTCTTATTGGAGAAATAGCTAGTTATTATACACACTGGACAGGATCCATAAGATTCTCTTTCATGTTTTGTGGCACAGCCAACACTAGTCTCAAACTACTCATAGCATACACGCCACCTGGAGTAGCCAAACCAGATTCAAGGACAAAGGCCATGCTAGGAACTCATGTAGTGTGGGATGTTGGATTACAGTCCACTGTATCAATGGTAGTCCCTTGGGTCTCTGCAAGTCACTATAGACTTACCACACCTGATACATACTCAAAAGCTGGATACATTACTTGCTGGTATCAAACAAATTTTGTAGTGCCTCCAAGTACCCCAAGTACTGCAGATATCATATGCTTTGTGTCTGGTTGCAAGGATTTCTGTCTAAGGATGGCCAGAGACACAAATTTACACTCTCAAACTGTCAACATCACACAAAATCCAGTTGAGAAGTATACTGAAGCAATTCTAAATGAAGTCTTAACAGTCCCAAATATACAGCCTAGTTCAGGCAACACTTCTAATGCAGCCCCAGTTTTAGATGCTGCTGAGACTGGTCACACCAATCAGACACAACCAGAAGACACAGTAGAAACTAGGTATGTCATCACAGATCAAACGCGTGATGAAATGAGTGTTGAGAGTTTCTTAGGGAGATCAGGTTGCATTTCTGAAATGCATACCATTGTAGAACATGGTAGAGATGTGTATAATGCAGTGAATAAAAATTTTACTACATGGAAGATCACCCTAAAGGAGATGGCACAAATCAGAAGAAAGTGTGAATTGTTTACATACTTGAGATTTGATTCAGAAATAACTATAGTGCCCACAGTGGCTGGACAAGGGAATGACACCGGGCATGTGGTACTTCAGTACATGTTTGTCCCACCAGGGGCTCCAGTCCCTAAGAAAAGAGATGATTACACATGGCAATCTGGCACGAATGCTTCAGTTTTCTGGCAGCAAGGTCAAACCTACCCCAGATTCACAATACCCTTCATGAGCATTGCCTCAGCATACTATATGTTTTATGATGGATATGAAGATGATACACCGAATTCAAAATATGGTGCAGTTGTAACAAATGACATGGGAACACTGTGTGTACGTATTGTAACTGAACAACAAGCAAATACTGTACACATTACAAGCAGGGTCTATCATAAAGCAAAACATATTAGTGCATGGTGTCCACGACCACCCAGAGCTGTAGCATATCAGCGTGTACATAATACCAACTTTGTTCCAGAAACAGGGCAAGTAGAAATACAAATACCCACAAGAACAGATCTTACTACTGTGGGCCCCTCAGATATGTATGTACATATGGATAACCTCATATACAGAAATCTACATTTGTGTGATCCAGAAGACTTGGATGATTCAGTATTAATTTGTTATTCCAGTGATTTAGTCATATACCGAACAAATACCAAAGGTGATGATTATATCCCAGTGTGTAACTGCACTGAAGCAACATACTACTGTAAACACAAGGATAGGTATTTCCCAATAAATGTTAAGAAACATCAGTGGTATGAAATACAAGAATCTGAATACTACCCAAAACACATACAATACAATATATTAATTGGAGAAGGACCGTGTGCACCTGGAGATTGTGGAGGGAAACTACTATGTAAGCATGGAGTCATTGGAATAGTCACTGCAGGTGGAGAAAATCATGTAGCATTTATTGATTTGAGAGACTTCCATGTTGCTGATGAACAGGGCATAACAGATTACATACACACACTTGGAGAGGCGTTTGGTGCAGGTTTTGTAGATAATATTAAGGATCAGATACAGGCTATAAACCCAATAAATAGAGTAACTAGCAAGATAGTTAAATGGATAATCAGAATCATATCAGCAGTTACAATAATCATTAGAAACAGTGCAGACCCACACACAATAGTTGCAACTCTAGCTTTAATTGGTTGCTCCGGTTCACCATGGAGATTCATTAAAGAGAAAGTGTGTAATTGGTTACAATTATCATACATACATAAAGAATCAGATGGATGGATCAAAAAATTCACTGAGATGTGCAATGCTGCTAGAGGTTTGGAGTGGCTTGGAAACAAGATATCAAAATTTATCGACTGGCTCAAGTCAATGCTACCACAAGCTAAACTTAAGGTCGATTTCATTGGGAAACTCAAACAGCTACCCTTATTAGAAAAAGAGATTGATGGATTAAGACTAGCAACCCAGAAACAACAACAAGAGTACATTGACACCCTTAGAGTTATGTTAGATGCATCTAATAAATTTCTGCCTCTATATGCACTTGAAAATAAAAGAATCAAAGAACTTCTTAAGAGGAGTGAAATGATCCTCCGCACAGCTAAAAGGACTGAACCAGTTGGGGTGCTTTTCCATGGTGAACCAGGTACAGGTAAATCAATTGCTACATCAATATTGGCAAGAATGATAACCACAGAATCTGACATATATTCACTACCACCATCACCAAAATACTTTGATGGCTATGACCAGCAGAGTGTTGTTATCATGGATGATATTATGCAGAACCCCAGTGGTGAGGATATGTCACTTTTTTGTCAAATGGTGTCATCAGTTCCCTTTATCCCACCTATGGCAGATTTACCAGACAAAGGAAAGCCTTTTTCTTCAGATTATGTACTAGCTAGTACAAATCATACTCTATTACATCCCCCAACTATAACATGCACTACAGCAATGAACAGAAGATTTTTCCTAGATCTAGACATAATAGTTAAGGAGAATTACAAACTTAACCAGGGTAAACTTAATTTGCAATGTGCACTGAAACCATGTCAGGATGGTAAAATTGGGAATGCAAAGTGTTGCCCTCTGATATGTGGGAAGGCTGTAGTGTTTAAAGATAGAGATACAGGAGACCACCTATCTCTAGCCACAGTGTATAATAAAATAATTGAGGAAAGTAAAAACAGAAAAGAACTAACCAGTTCACTACAGGCAATTTTCCAAGGTCCAATTGATGTAGTTAATAAACCACCTCCACCTGCCATATTGGATCTTCTTAAATCAGTCAGGAATCCAGATGTCATCAAATATTGTGAGGAAAATAAATGGATTGTACCAGCAGATTGTAAATTAGAGAGAGACTTAAACTATGCTAATTTAGTAATTTCTATGATTGCTAATGTTATCAGTATAATGGGGGTTATATATATTAT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|
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|
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|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
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UW Virology, DLMP
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USA
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2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
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Enterovirus
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Picornaviridae
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ssRNA(+)
| 7,039
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|
USA
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| null |
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Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/H6FXGU, complete genome
|
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| 34,218
|
OM001440.1
|
rhinovirus A101
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,090
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021
|
SAMN24255346
|
PRJNA723895
|
Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/MUXYR5, complete genome
|
GGTGTAGTATACTTGTATCCCGGTACATTTATACGCCAGTTTTATAATCCCTACCCCAAATGTAACTTAGAAGCATGTACACAACGATCAATAGGGTGATGGCTATCCAAGTCATCTAAGATCAAGCACTTCTGTCTCCCCGGTGAGTGTGAATATGCCTTACCCAAGGCAAAAGCTAATCTCATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGGGAAGCCTAGTAACATTCTGAAGATATTTTGGTTGGTCGATCAGTTGCACTCACCCATGCAATAGACCTGGCAGATGGGGCTAGGCATACCCCACTGGTAACAGTGGCCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCACACCTTCGGGTGTGAAGCCATAATATTGACAGGGTGTGAAGAGCCTACTGTGCTCACCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTATCCATTGCACACAAACCAGTGTGTCTATGGTCGTAATGGGCAACTACGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTTCTTTAATACTGCTTATGGTGACATTATATATTGATATAGTGTCATCATGGGTGCACAGGTTTCCAGACAGAATGTTGGAACTCACTCAACACAAAATGCAGTATCCAATGGTTCAAGTTTGAATTATTTTAATATTAATTACTTTAAAGATGCAGCATCAAGTGGAGCATCAAGATTAGATTTTTCACAGGATCCTAGTAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTTTTGACAAAAGGAATTCCAACATTGCAGTCCCCATCTGTTGAGGCTTGTGGATATTCAGACAGGATAATACAGATAACAAGGGGAAACTCAACAATAACATCACAAGATGTGGCAAATGCAGTTGTTGGGTATGGAGTATGGCCCCAATATTTACCTGATGATGATGCTAGTGCTATTGACAAACCAACTCATCCAGACACCTCCTCAAACAGATTCTACACATTAGAAAGCAAGGAGTGGAAAAGTGACTCCAAGGGATGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTCTCAAGAATATGGGAATTTTCGGGGAAAACCTCTTCTACCACTTCTTAGGTAGAGCCGGATACACAGTACATGTGCAGTGCAATGCAAGCAAATTCCATCAAGGTGCATTAGTTGTTGCTGCAATCCCAGAACACCAGTTGGCATACATAGGATCAGAGAATGTTAGTGTAGGATATAAACACACACACCCTGGGGAATCGGGACGAACACTTAATGATAGAGAGAATAATAACTCACAACAACCTACTGATGAAAGCTGGTTGAACTGTGATGGGACACTATTAGGAAACATTACTATCTTTCCACACCAGTTCATTAATTTGAGAAGCAACAACTCAGCCACTCTGATTCTACCTTATGTCAATGCTGTTCCCATGGATTCAATGGTTAGGCACAATAACTGGAGTATCGTGATAATACCCGTATCACCACTCCAGACCATAGAGGGGACACCTTATGTCCCAATCACATTATCAATAAGTCCTATGGCTTCAGAATTTTCAGGTGCTCGAAACACATCCAGACAAGGCCTGCCAGTTATGCTCACTCCAGGTTCAGGACAATTTCTCACCACAGATGATGCACAATCACCATCGGCTTTACCCTATTTCCATCCAACGAAGGAAATATTCATACCAGGTAGGGTTACCAATCTATCAGAAATTTGCCAAGTAGATTCAATGATTCCAATTAACAACACAGTGGCAAGTCATAAAAGGGTGAGTATGTATGCAGTTCGTGTGGGTGTCCAAACAGCACCAGCCAGGGAAGTCTTTGCTATACCAGTAGATGTTGCCTCTCAACCTTTAGCAACCACTCTTATTGGAGAAATAGCTAGCTACTACACACATTGGACAGGCTCTATAAGATTCTCCTTCATGTTCTGTGGTACAGCTAACACTAGCCTCAAACTGCTTGTTGCATACACACCGCCTGGAGTGCCTAAGCCAGACTCAAGGACAAAAGCCATGTTAGGAACTCATGTGGTATGGGATGTTGGTTTGCAGTCCACTGTATCGATGGTGGTGCCCTGGGTTTCTGCAAGCCATTATAGGCTCACTACACCTGATACATACTCCAAAGCTGGATACATTACTTGTTGGTATCAGACAAACTTTGTAGTGCCTCCAAGCACCCCAAAAACTGCAGATATCATATGTTTTGTGTCTGGTTGTAAGGATTTCTGTTTAAGGATGGCCAGAGACACAAACCTACATTCTCAAACTGTCAATATCACACAAAACCCAGTTGAGAAGTACACTGAAGCAATCTTAAATGAAGTCCTAACAGTCCCAAACATACAACCTAGTTCAGGCAACACCTCTAATGCAGCTCCAGTCCTAGATGCCGCTGAGACTGGTCACACCAGCCAAACACAACCAGAAGATACAGTGGAAACCAGGTATGTCATCACGGATCAAACCCGTGATGAGATGAGTGTTGAAAGTTTCTTAGGGAGATCAGGTTGTATTTCTGAAATGCACACCATTGTGGAACATGGTGAAGATGTGTATAATGCAGTGGATAAAAATTTCACTAAATGGAAGATTACCTTAAAGGAGATGGCACAAATCAGAAGAAAATGTGAATTGTTTACATATTTGAGATTTGATTCAGAAATAACTATAGTACCCACAATAGCTGGACAGGGAAATGATATTGGACATGTGGTGCTCCAATATATGTTTGTTCCACCAGGAGCTCCAATCCCCACAAAGAGAGATGATTATACATGGCAGTCTGGCACAAATGCTTCAGTTTTCTGGCAGCAAGGTCAAACCTACCCTAGATTCACAATACCTTTCATGAGCATTGCATCAGCATATTACATGTTTTATGATGGATATGAAGATGATACACCAAACTCAAAGTATGGTGCAGTTGTAACAAATGACATGGGAACATTGTGTGTGCGTATTGTAACCGAACAACAGGCAAATACTGTACACATTACAAGCAGGGTCTATCATAAGGCAAAACATATCAGTGCATGGTGTCCACGACCACCTAGAGCTGTAGCATACCAGCGTGTACATAACACCAATTTTGTCCCAGCAACAGGACAAGTAGAGATACAGATACCCACAAGAGCAGATCTTACTACTGTGGGCCCCTCAGACATGTATGTACATATGGACAACCTCATATATAGAAACCTACATCTGTGTAACCCAGAAGACTTAGATGATTCAGTATTAATATGTTACTCCAGTGATTTAGTCATATACCGAACAAATACTAAAGGTGATGATTACATTCCAATGTGCAACTGTACTGAAGCAACATACTACTGTAAGCACAAAGATAGATATTTTCCAGTAAATGTCAAGAAACATCAGTGGTATGAAATACAAGAATCTGAATATTACCCAAAACACATACAATATAATATATTAATTGGGGAAGGACCATGTGCACCAGGAGACTGTGGGGGAAAATTACTATGCAAACATGGAGTTATTGGCATAGTCACTGCAGGTGGAGAGAATCATGTAGCATTCATTGATTTGAGGGACTTTCACATTGCTGATGAACAGGGTATAACAGATTATATACACACACTTGGAGAAGCATTTGGTGCAGGCTTTGTAGATAACATTAAAGATCAGATACAGGCTATAAACCCAATAAATAGAGTAACTAGTAAGATAGTTAAGTGGATAATCAGAATCATATCAGCAGTTACAATCATCATTAGAAATAGTGCAGATCCACATACAATTGTTGCAACTTTAGCCTTGATTGGTTGCTCTGGTTCACCATGGAGATTTATTAAAGAAAAAGTGTGTAATTGGTTGCAATTATCATACATACATAAAGAATCAGATGGTTGGATTAAAAAATTTACTGAAATGTGCAATGCTGCCAGGGGTTTAGAATGGCTTGGAAATAAAATATCAAAGTTTATTGACTGGCTCAAATCAATGCTACCACAAGCTAAACTCAAAGTTGACTTCATTGGGAAACTTAAGCAACTACCCTTATTAGAGAAGGAGATTGATGGACTAAGACTAGCAACCCAGAAACAGCAGCAAGAATACATTGATACCCTCAGAATCATGTTAGATGCATCTAATAAATTTCTGCCTTTGTATGCACTTGAGAATAAAAGAATCAAAGAGTTACTTAAAAGAAGTGAGATGATCCTCCGTACAGCCAAAAGAACTGAACCCGTAGGGGTACTCTTTCATGGTGAACCAGGTACAGGCAAATCAATTGCTACATCTATATTAGCAAGAATGATAACCACAGAATCTGACATATACTCACTACCACCATCACCAAAATACTTTGATGGTTATGACCAGCAAAGTGTCGTTATCATGGATGACATCATGCAAAACCCCAGTGGTGAGGACATGTCACTCTTCTGTCAGATGGTGTCATCAGTTCCTTTTATCCCACCCATGGCAGATTTACCAGACAAAGGGAAACCTTTCTCTTCAGATTATGTATTAGCTAGTACTAATCATACCTTACTACATCCTCCAACTATAACATGCACTACAGCAATGAACAGGAGATTTTTCCTAGATTTAGATATAATAGTCAAAGAGAGCTACAAACTCAGTCAGGGCAAACTTAACTTACAGTGTGCACTTAAACCATGCCAAGATGGTAAAATTGGAAATGCAAAGTGTTGCCCCTTGATATGTGGAAAAGCTGTAGTGTTTAAAGACAGAGATACAGGAGATCATTTATCTCTGGCCACAGTCTACAACAAGATAGTTGAGGAGAGTAAGAATAGAAAAGAGTTAACCAGCTCATTACAGGCAATTTTCCAAGGTCCAATTGATGTAGTTAATAAGCCACCCCCACCTGCCATATTGGATCTCCTTAAATCAGTTAGAAATCCAGATGTTATCAAATACTGTGAGGAAAATAGATGGATTATACCAGCAGACTGTAAATTAGAGAGAGATTTAAATTATGCCAATTTAGTAATATCCATGATTGCTAAT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| 34,227
|
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|
rhinovirus A101
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
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UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
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Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,039
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-05-27
|
SAMN24255357
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PRJNA1066815
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Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/T8HRXF, complete genome
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|
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|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
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Enterovirus
|
Picornaviridae
|
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| 7,039
|
GenBank
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USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-06-21
|
SAMN24255361
|
PRJNA1066815
|
Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/U2NC4T, complete genome
|
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Enterovirus
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Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/WH3U28, complete genome
|
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| 34,247
|
OK254825.1
|
rhinovirus A101
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2021-12-11
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,077
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-06-22
|
SAMN21173555
|
PRJNA1066815
|
Rhinovirus A101 strain RvA101/USA/2021/2XQHXY, complete genome
|
GTAGTATACTTGTATTCCGGTACATTTATACGCCAGTTTTATGATCCCCCACCCCAAATGTAACTTAGAAGCATGTACACAATGATCAATAGCGTGGTGGCTATCCAAGTCACCTAAGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTGAGTGTGGATATGCTTTACCCAAGGCAGAAACTAATCTCATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGGGAAGCCTAGTAACATTTTGAAGGTATTCTGGTTGGTCGCTCAGTTGCATTCACCCGTGCAATAGACCTGGCAGATGGGGCTAGGCATACCCCACTGGTAACAGTGGCCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCACACCTTCGGGTGTGAAGCCATAATATTGACAGGGTGTGAAGAGCCTACTGTGCTCACCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTATCCATTGCACACAAGCCAGTGTGTTTATGGTCGTAATGGGCAACTACGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTAATATTGCTTATGGTGACATTATATATTGATATAGTGTCATCATGGGTGCACAAGTTTCCAGACAAAACGTTGGAACTCACTCAACACAAAATGCAGTGTCTAATGGCTCAAGTTTAAATTATTTTAACATTAATTATTTTAAAGATGCAGCATCGAGTGGAGCATCAAGGTTAGATTTTTCACAAGATCCCAGTAAGTTCACTGACCCAGTTAAAGATGTTTTAACAAAGGGAATTCCAACACTGCAATCCCCATCTGTTGAGGCTTGTGGTTATTCAGACAGAATAATACAAATAACAAGAGGGAACTCGACAATAACATCACAAGATGTGGCAAATGCAGTTGTTGGGTATGGAGTGTGGCCTCAATACTTACCTGATGATGATGCTAGTGCTATTGACAAACCAACCCATCCAGATACATCTTCAAACAGATTCTATACATTAGACAGTAAAGAGTGGAAAAATGATTCTAAGGGATGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTCTCAAAAATATGGGAATTTTTGGAGAAAATCTATTTTATCACTTCCTAGGCAGAGCTGGATACACAGTACATGTGCAATGCAATGCAAGCAAATTTCATCAAGGTGCGTTAGTTGTTGCTGCAATTCCAGAACACCAGTTGGCATATATCGGATCAGAAAATGTCAGTGTGGGATATAAACACACACACCCTGGGGAAACAGGACGAACACTCAATGACAGAGCAAATAATAACTCACAACAACCTACTGATGAAAGCTGGTTAAATTGTGATGGGACATTGTTAGGAAATATCACCATCTACCCACACCAATTTATCAACCTAAGGAGTAACAACTCAGCTACTTTAATTCTACCTTATGTAAATGCTGTTCCTATGGACTCAATGGTTAGACATAACAATTGGAGTATTGTGATAATACCCGTGTCTCCGCTTCAGACCATAGAAGGAACACCTTATGTGCCAATCACACTATCAATAAGCCCTATGGCCTCTGAATTCTCAGGTGCTCGGAACACAGCCAGACCACAAGGCCTACCAGTTATGCTCACCCCAGGCTCAGGACAATTCCTTACTACAGATGATGCACAATCACCTTCAGCTTTACCCTATTTTCATCCAACAAAAGAAATATTTATACCAGGTAGAGTCACTAACTTATCAGAGATCTGCCAAGTTGACTCAATGATTCCAATTAACAATACAGTAACAGGCCACAAAAAGGTGGGTATGTATGCAGTTCGTGTGGGTGTCCAAACAGCATCAGCCAGAGAAGTCTTTGCCATACCAGTAGATGTTGCCTCTCAACCCTTAGCAACCACTCTTATTGGAGAAATAGCTAGTTATTATACACACTGGACAGGATCTATAAGATTCTCTTTCATGTTTTGTGGTACAGCCAATACTAGTCTCAAACTACTCATAGCATACACACCACCTGGAGTAGCCAAACCAGATTCAAGGACAAAAGCTATGCTAGGGACTCATGTAGTGTGGGATGTTGGATTGCAGTCCACTGTATCAATGGTAGTCCCTTGGGTCTCTGCAAGTCACTACAGACTTACCACACCTGATACATATTCAAAAGCTGGATACATTACTTGCTGGTATCAAACAAACTTTGTAGTGCCTCCAAGTACTCCAAGTACTGCAGATATCATATGCTTTGTGTCTGGCTGCAAGGATTTCTGTTTAAGAATGGCCAGAGACACAAACTTGCACTCTCAAACTGTCAACATCACACAAAATCCAGTTGAGAAGTATACTGAAGCAATTCTAAATGAAGTCTTAACAGTCCCAAATATACAGCCTAGTTCAGGCAACACTTCTAATGCAGCCCCAGTTTTAGACGCTGCTGAGACTGGTCACACCAACCAGACACAACCAGAAGACACAGTAGAAACTAGGTATGTCATCACAGATCAAACGCGTGATGAAATGAGTGTTGAGAGTTTCTTAGGGAGATCAGGTTGTATTTCTGAAATGCATACCATTGTAGAACATGGTAAAGATGTGTATAATGCAGTGAATAAAAATTTTACTACATGGAAGATTACCCTAAAAGAGATGGCACAAATCAGAAGAAAGTGTGAATTGTTTACATACTTGAGATTTGATTCAGAAATAACTATAGTGCCCACAGTAGCTGGGCAAGGGAATGACACCGGACATGTGGTGCTTCAGTATATGTTTGTACCACCAGGGGCTCCGGTCCCTAAGAAAAGAGATGACTACACATGGCAATCTGGCACGAATGCTTCAGTTTTCTGGCAGCAGGGTCAAACCTACCCCAGATTCACAATACCCTTCATGAGCATTGCTTCAGCATACTATATGTTTTATGATGGATATGAAGATGATACACCAAATTCAAAGTATGGTGCAGTTGTAACAAATGACATGGGAACACTGTGTGTACGTATTGTAACTGAACAACAAGCAAATACTGTACACATTACAAGCAGGGTCTATCATAAAGCAAAACATATTAGTGCATGGTGTCCACGACCACCCAGAGCTGTAGCATATCAGCGTGTACACAATACCAACTTTGTTCCAGAAACAGGACAAGTAGAAATACAAATACCCACAAGAACAGATCTTACTACTGTAGGCCCCTCAGACATGTATGTACATATGGATAACCTCATATACAGAAATCTACATTTGTGTGATCCAGAAGACTTAGATGATTCAGTATTAATTTGTTATTCCAGTGATTTAGTCATATACCGAACAAATACCAAAGGTGATGACTATATTCCAGTGTGTAACTGCACTGAAGCAACATACTACTGTAAACACAAGGATAGGTATTTCCCAATAAATGTTAAGAAACATCAGTGGTATGAAATACAAGAATCTGAATACTACCCAAAACACATACAATACAACATATTAATTGGAGAAGGACCGTGTGCACCTGGAGATTGTGGAGGAAAACTACTATGTAAACATGGAGTTATTGGAATAGTCACTGCAGGTGGAGAAAACCATGTGGCATTTATTGATTTGAGAGACTTCCATGTTGCTGATGAACAGGGCATAACAGATTACATACACACACTTGGAGAGGCCTTTGGTGCAGGTTTTGTAGATAATATTAAGGATCAGATACAGGCTATAAACCCAATAAATAGAGTAACTAGCAAGATAGTTAAGTGGATAATCAGAATCATATCAGCAGTTACAATAATCATTAGAAACAGTGCAGACCCACACACAATAGTTGCAACACTAGCTTTAATTGGTTGTTCTGGTTCACCGTGGAGATTCATTAAAGAGAAAGTGTGCAATTGGTTACAACTATCATACATACATAAAGAATCAGATGGATGGATCAAAAAATTTACCGAAATGTGTAATGCTGCTAGGGGTTTAGAATGGCTTGGAAACAAGATATCAAAATTCATTGACTGGCTCAAGTCAATGCTACCACAAGCTAAACTCAAGGTTGATTTTATTGGGAAACTCAAACAGCTACCCTTATTGGAAAAAGAGATTGATGGATTAAGACTAGCAACCCAAAAACAGCAACAAGAATACATTGATACCCTTAGAGTTATGTTAGATGCATCTAATAAGTTCCTGCCTCTATACGCACTTGAGAACAAAAGAATCAAAGAACTTCTTAAGAGAAGTGAGATGATCCTCCGCACAGCTAAGAGAACTGAACCAGTTGGGGTGCTTTTTCATGGTGAACCAGGCACAGGTAAATCGATTGCTACATCAATATTGGCAAGAATGATTACCACAGAATCTGATATATATTCACTACCACCATCACCAAAATACTTTGATGGTTATGACCAACAGAGTGTTGTTATCATGGATGATATTATGCAGAACCCCAGTGGTGAGGATATGTCACTTTTTTGTCAAATGGTGTCATCAGTCCCTTTTATCCCACCTATGGCAGATTTACCAGACAAAGGAAAACCTTTTTCTTCAGATTATGTACTAGCCAGTACAAATCATACTTTATTACATCCCCCAACCATAACATGCACCACAGCAATGAACAGAAGATTTTTCCTAGATTTAGATATAATAGTTAAGGAGAACTACAAAATTAATCAGGGTAAACTTAATTTACAATGTGCATTGAAACCATGTCAGGATGGTAAAATTGGGAATGCAAAATGTTGCCCTCTGATATGTGGGAAGGCTGTAGTGTTTAAAGATAGAGATACAGGAGACCACCTGTCTTTAGCCACAGTGTATAATAAAATAATTGAAGAAAGCAAAAACAGAAAAGAACTAACCAGTTCACTACAGGCAATTTTCCAAGGTCCAATTGATGTAGTTAATAAACCACCTCCACCTGCCATATTAGATCTTCTTAAATCAGTCAGGAATCCAGATGTTATCAAATATTGTGAGGAGAATAAGTGGATTGTACCAGCAGATTGTAAATTAGAGAGAGACTTAAACTATGCTAATTTAGTAATTTCTATGATTGCTAAT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| 35,266
|
OK128339.1
|
rhinovirus A11
|
Zhang,Z., Tan,L., Tan,M., Zhang,X., He,W., Li,M., He,J., Pan,Y., Xu,B., Bin,S., Gan,Z., Yan,L., Sun,Y., Jiang,H., Sun,Q.
|
The Kunming Children's Hospital, Kunming Medical University, Institute of Pediatrics
|
China
|
2022-10-29
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,094
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
lung, oronasopharynx
|
2020-07-15
| null | null |
Rhinovirus A11 strain HRVA11/KM50/Kunming/CHN/2020, complete genome
|
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| 22,493
|
OK128340.1
|
rhinovirus A11
|
Zhang,Z., Tan,L., Tan,M., Zhang,X., He,W., Li,M., He,J., Pan,Y., Xu,B., Bin,S., Gan,Z., Yan,L., Sun,Y., Jiang,H., Sun,Q.
|
The Kunming Children's Hospital, Kunming Medical University, Institute of Pediatrics
|
China
|
2022-10-29
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,173
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
lung, oronasopharynx
|
2020-07-16
| null | null |
Rhinovirus A11 strain HRVA11/KM55/Kunming/CHN/2020, complete genome
|
CCACCTGGATCTCCCACGTGGAGTTGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATCTCCCCTTCCCCTTTTTGTAACTTAGAAGATGAACTCACCGACCAATAGGCGACATTTATCCAAAATGTCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAGGATGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACATCTGCGATCGTTATCCGCAAAACAACTACGCAAAGCCTAGTACCACTTTTGAGAGTATGTGGTTGGTCGCTCCACTATAAACCCAATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAGCTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGTGCCTCTAGTAGGCACGAAGCCATATATTTGACAAGGTGCGAAGAGCCCCGTGTGCTTGTTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGTGCACAATCCAGTGCATGGCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTTCCTTTTATTTGCTTATGGTGACAATATATATAATACATATATATTGGCATCATGGGCGCTCAGGTATCCAGACAGAATGTTGGTACACATTCCACACAGAATTCAGTCTCAAATGGTTCAAGTCTAAATTATTTTAATATAAATTACTTTAAAGATGCTGCTTCAAGTGGTGCCTCAAAACTTGAATTTTCACAAGACCCTAGCAAATTTACTGACCCAGTTAAAGATGTATTGGAAAAAGGCATCCCTACTTTACAGTCTCCAACAGTGGAAGCATGTGGATATTCGGACAGGATTATACAAATTACAAGAGGTGATTCCACAATAACATCACAAGATGTGGCAAATGCTGTGGTTGGATACGGAGTATGGCCTCATTACCTAACATCACAAGATGCTACAGCTATAGACAAGCCTTCTCGCCCAGACACCTCCTCAAATAGATTCTACACCCTAGAGAGTAAGCAATGGATGTCAACTTCTAAAGGATGGTGGTGGAAATTACCTGATGCCCTTAGGGACATGGGAATCTTTGGTGAAAATATGTTCTATCACTTTCTTGGAAGGAGTGGTTATACAGTACATGTTCAATGCAATGCCAGCAAGTTCCATCAAGGCACCTTAATAGTTGCAATGATACCAGAACATCAATTAGCTAGTGCAACAACTGGTAATGTGACAGCTGGCTATAAGCTCACACATCCTGGTGAGCGTGGTAGAGATGTCAGTCTCACAGACCGCCAAGATATCACAAAGCAACCTAGTGATGACAGCTGGCTTAATTTTGATGGTACACTGTTAGGTAACATAACCATATATCCACACCAGTTTATTAATCTTAGAAGTAATAACTCAGCCACAATTATTGTACCCTATGTAAATGCAGTCCCCATGGATTCAATGTTAAGACATAATAATTGGAGTTTAGTTATTATACCAATATGCCCATTGGAATCAGAATTGAACACACCTGTGCCTATCACTATATCCATAAGCCCCATGTGTGCTGAATTCTCTGGTGCTCGTGCACGCAACCAAGGCCTGCCAGTACTAATAACACCAGGATCTGGTCAGTTTATGACAACAGATGATTTCCAATCCCCTAGTGCACTACCTTGGTTTCACCCTACTAAAGAAATTTCAATACCAGGTCAAGTGAGAAACCTCATTGAACTTTGCCAAGTTGACACATTAATCCCCATAAACAGTGTGGAAGGGAACACTGACAACACAAGTATATACACTGTTACATTAACCAGGGAAACCAGTTTGGCACAAGAGATATTTGCAATAAAGGTTGACGTAGCATCACAACCCCTTGCTACCACCTTGATTGGTGAAATAGCCAGCTATTACACTCACTGGACAGGCAGTATTCGCTTCAGCTTCCTCTTCTGTGGTACTGCAAATACCACTCTCAAATTGTTAATAGCATACACACCACCTGGCATAAGCAAACCCACTAATAGGAAAGAAGCAATGTTGGGTACTCATGTAGTTTGGGATGTTGGTTTGCAATCTACAATTTCAATGGTAGTCCCATGGGTGAGTGCTAGTCATTATAGAAATACCACACCAGATACATACTCTCTTGCTGGCTTTGTCACTTGCTGGTATCAAACTAATCTAGTGGTGCCACCCAGCACGCCAACTACTGCTAAGATGCTGTGCTTTGTCTCAGGCTGCAAAGACTTCTGCTTGAGAATGGCACGAGACACCAATTTACATCTACAAAGTGGACCCATAGAGCAAAACCCAGTGGAAGATTATGTTGATGGAATTCTAAATGAGGTTCTAGTTGTACCCAACATAAAGGAGAGTCAAGCCACCACATCAAACTCAGCACCTGCTCTAGATGCAGCAGAAACTGGACATACCAGTAAAGTACAGCCAGAGGACATGATTGAAACTAGATATGTGCAAACCTCACAAACCCTTGATGAAATGAGCATTGAGAGCTTCTTAGGTAGATCTGGTTGTATTCACATGTCCAAACTAATTGTGCAGTATGAAGACTATAATGGAAAGAAAAATTTCAACACATGGAAGATAAATTTACAGGAAATGGCACAAATTAGAAGGAAATTTGAAATGTTCACATATACTAGATTTGATTCAGAGATCACACTAGTACCCTGTATAGCTGCAAAAGGAGATGACATTGGTCATGTCGTAATGCAATATATGTATGTTCCACCAGGTGCTCCAGTCCCAGAGAAGAGAGATGATTACACATGGCAGTCAGGAACAAATGCCTCCATCTTCTGGCAATATGGTCAAACATACCCAAGATTCTCTCTGCCTTTTATGAGTATAGCCTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGATATGATGGAGATCAACCAAATTCCAGATATGGTAATATAGTTACTAATGATATGGGTACCCTGTGTTATAGAATAGTAACTGATGACCATAGACACAAAATTGAGGTCACAACTAGAGTATACCATAAAGCAAAGCATGTAAAAGTGTGGTGTCCAAGACCACCTAGAGCTGTGGAATATACTCACACTCATGTAACCAATTATAAACCACAAGAAGGACAGGTGAAAACAGCTGTCAAGGCTAGGAAAACAATTAAGACAGCAGGACCAAGTGACATGTATGTACATGTCGGAAATCTCATATACAGGAATTTACACCTTTTCAATTCAGATATTCATGATTCTATATTAGTATCATACTCATCAGACTTAGTCATATACCGAACAAACACTACAGGTGATGACTATATACCAACTTGTGATTGTACAGATGCAACCTACTTTTGCAAGCATAAGAATAGATACTATCCAATAAAAGTCACCAGTCATGATTGGTATGAGATCCAAGAAAGTGAATATTACCCAAAACATATACAATACAATTTATTGATAGGTGAGGGACCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGTAAATTACTGTGTAAACATGGGGTTATTGGCATAATAACTGCAGGTGGTGAAGGTCATGTGGCATTTATTGATTTGAGACATTTCCATTGTGCTGAAGAACAAGGGATTACTGATTACATACACATGCTTGGGGAAGCTTTTGGTAGCGGGTTTGTTGATAGTGTGAAAGATCAAATCAATGCCATAAATCCAATCAACAATATAAGTAGGAAAATTGTTAAATGGATCCTTAGAATAATATCAGCAATGGTAGTGATCATTAGAAACTCATCTGACCCCCAGACCATAATAGCTACACTGACCCTACTTGGTTGTTCTGGCTCGCCATGGAGATTTTTAAAAGAAAAATTTTGTAAATGGACACAATTAAATTACATCCACAAAGAATCAGATACATGGCTTAAAAAATTCACTGAAATGTGCAATGCTGCTAGGGGTTTAGAATGGATTGGTAACAAAATATCAAAATTCATTGAATGGATGAAGTCAATGCTACCACAAGCACAACTTAAAATTAAGTACCTTAATGAATTGAAGAAATTGAATCTCCTAGAAAAACAAATTGAGCATTTGAGGATTGCTGACTCTAGCACTCAGGAGAAGATTAAATGTGAAATAGACACCCTACACGATCTATCATGTAAATTTCTTCCATTGTATGCCAGTGAAGCCAAGAGAATCAAAGTTCTACATAATAAATGCAATGTGATTATAAAGCAAAAGAAAAGGTGTGAACCAGTGGCAGTTGTTATACACGGTGAACCTGGAACTGGGAAATCCATGACAACAAATTTTTTGGCAAGAATGATAACTAATGATAGTGATATTTATTCACTCCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATATGACCAACAGAGTGTGGTCATAATGGATGACATCATGCAAAATCCAAGTGGTGATGACATGACTCTATTCTGTCAAATGGTGTCTAGTGTCACATTTATCCCTCCCATGGCTGATCTTCCAGATAAGGGAAAGCCTTTTGATTCTAGATTTGTTTTGTGTAGTACAAATCATAGCATGTTAGCACCACCCACTATTACATCTTTACCAGCAATGAATAGAAGATTTTTCCTGGACTTAGACATAGTAGTTAGTGAGAAGTATAAAGATTTGCAGGGAAAACTTAATGTGACTGCTGCTTTCCAGCCTTGTGATATTAATGCTAGAATTGGTAACGCACGCTGCTGCCCATTTATATGTGGGAAGGCAGTGATGTTCAAAGACAGAAATACTTGCCAATCTTATACACTAGCACAAGTCTATAATCACATGCTTGATGAAGACAAAAGACGCAGACAAGTTGTAGATGTTATGACTGCAATCTTTCAGGGACCAATTACACTAGAAGGACCTCCACCAGCTGCAATCAGTGATTTATTACAATCAGTTAGGACTCCAGAAGTTATTAAGTATTGTGAGGAAAACAAGTGGATAATCCCAGCTGAATGTAAGATAGAAAGAGATCTTAACATAGCTAACACCATAATTACAATCAT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| 22,494
|
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|
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|
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|
The Kunming Children's Hospital, Kunming Medical University, Institute of Pediatrics
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China
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2022-10-29
| null |
Rhinovirus A
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Enterovirus
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Picornaviridae
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| 7,101
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| null |
China
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China
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Homo sapiens
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lung, oronasopharynx
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2020-07-26
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Rhinovirus A11 strain HRVA11/KM61/Kunming/CHN/2020, complete genome
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| 22,495
|
OM001464.1
|
rhinovirus A11
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,082
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021
|
SAMN24255371
|
PRJNA723895
|
Rhinovirus A11 strain RvA11/USA/2021/X97RTD, complete genome
|
CCACMTGGRWSWYCCAKGTGGAGTTGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATCTCCCCTTCCCCTTTTGTAACTTAGAAGATGAACTCACCGACCAATAGGTGACATTTATCCAAAATGTCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAGGATGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACATCTGCGATCGTTATCCGCAAAACAACTACGCAAAGCCTAGTACCACTTTTGAAAGTATGTGGTTGGTCGCTCCACTATAAACCCAATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAGCTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGTGCCTCCAGTAGGCACGAAGCCATATATTTGACAAGGTGCGAAGAGCCCCGTGTGCTTGTTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGTGCACAATCCAGTGCATGGCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCCTTTTATTTGCTTATGGTGACAATATATATAATACATATATATTGGCATCATGGGCGCTCAGGTATCCAGACAGAATGTTGGTACACACTCCACACAGAATTCAGTCTCAAATGGTTCAAGTCTAAATTATTTTAATATAAATTACTTTAAAGATGCTGCTTCAAGTGGTGCCTCAAAACTTGAATTTTCACAAGACCCTAGCAAATTTACTGACCCAGTTAAAGATGTACTAGAAAAAGGCATCCCTACTTTACAGTCTCCAACAGTGGAAGCATGTGGATATTCGGACAGGATTATACAAATTACAAGAGGTGATTCTACAATAACATCACAGGATGTGGCAAATGCTGTGGTTGGATACGGAGTATGGCCTCATTACCTAACATCACAAGATGCTACAGCTATAGACAAGCCTTCTCGCCCAGACACCTCCTCAAATAGATTTTACACCCTAGAGAGTAAGCAATGGATGTCAACTTCTAAAGGATGGTGGTGGAAATTACCTGATGCCCTTAGGGACATGGGAATCTTTGGTGAAAATATGTTCTATCACTTTCTTGGAAGGAGTGGCTATACAGTACATGTTCAATGCAATGCCAGCAAGTTCCATCAAGGCACCTTAATAGTTGCAATGATACCAGAACATCAATTAGCAAGTGCAACAACTGGTAATGTGACAGCTGGCTATAAGCTCACACATCCTGGTGAGCGTGGTAGAGATGTCAGTCTCACAGACCGCCAAGATATCACAAAGCAACCTAGTGATGACAGCTGGCTTAATTTTGATGGTACACTGTTAGGTAACATAACCATATATCCACACCAGTTTATTAATCTTAGAAGCAATAACTCAGCCACAATTATTGTACCCTATGTAAATGCAGTTCCCATGGATTCAATGTTAAGACATAATAATTGGAGTTTAGTTATTATACCAATATGCCCATTGGAATCAGAATTGAACACACCTGTGCCTATCACTATATCTATAAGCCCCATGTGTGCTGAATTCTCTGGTGCTCGTGCACGCAACCAAGGCCTGCCAGTACTAATAACACCAGGTTCTGGTCAGTTTATGACAACAGATGATTTCCAATCCCCTAGTGCACTACCTTGGTTTCACCCTACTAAAGAAATTTCAATACCAGGCCAAGTGAGAAACCTCATTGAACTTTGCCAAGTTGACACATTAATCCCCATAAACAGTGTGGAAGGGAACACTGACAACACAAGTATATACACTGTTACATTAACCAGGGAAACCAGTTTAGCACAAGAGATATTTGCAATAAAGGTTGACATAGCATCACAACCCCTTGCTACCACCTTGATTGGTGAGATAGCCAGCTATTACACTCACTGGACAGGCAGTATTCGCTTCAGCTTCCTCTTCTGTGGTACCGCAAATACCACTCTCAAATTGTTAATAGCATACACACCACCTGGCATAAGCAAACCCACTAATAGGAAAGAGGCAATGTTGGGTACTCATGTAGTTTGGGATGTTGGTTTGCAATCTACAATTTCAATGGTGGTCCCATGGGTGAGTGCTAGTCATTATAGAAATACCACACCAGATACATACTCTCTTGCTGGCTTTGTCACTTGCTGGTATCAAACTAACCTAGTGGTACCACCCAGCACGCCAACTACTGCTAAGATGCTGTGCTTTGTCTCAGGCTGCAAAGACTTCTGCTTGAGAATGGCACGAGACACCAATTTACATCTACAAAGTGGACCCATAGAGCAAAACCCAGTGGAAGATTATGTTGATGGAATTCTAAATGAGGTTCTAGTTGTACCCAACATAAAGGAGAGTCAAGCCACCACATCAAACTCAGCACCTGCTCTAGATGCAGCAGAAACTGGACATACCAGTAAAGTACAGCCAGAGGACATGATTGAAACTAGATATGTGCAAACCTCACAAACCCTTGATGAAATGAGCATTGAGAGCTTCTTAGGTAGATCTGGTTGTATTCACATGTCCAAACTAATTGTGCAGTATGAAGACTATAATGGAAAGAAAAATTTCAACACATGGAAGATAAATTTACAGGAAATGGCACAAATTAGAAGGAAATTTGAAATGTTCACATATACTAGATTTGATTCAGAGATCACACTAGTACCCTGTATAGCTGCAAAAGGAGATGACATTGGTCATGTCGTAATGCAATATATGTATGTTCCACCAGGTGCTCCAGTCCCAGAGAAGAGAGATGATTACACATGGCAGTCAGGAACAAATGCCTCCATCTTCTGGCAGTATGGTCAAACATACCCAAGATTCTCTCTGCCTTTTATGAGTATAGCCTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGATATGATGGAGATCAACCAAATTCCAGATATGGTAATATAGTTACTAATGATATGGGTACCCTGTGTTATAGAATAGTAACTGATGACCATAGACACAAAATTGAGGTCACAACTAGAGTATACCATAAAGCAAAGCATGTAAAAGTGTGGTGTCCAAGACCACCTAGAGCTGTGGAATATACTCACACTCATGTAACCAATTATAAACCACAAGAAGGACAGGTGAAAACAGCTGTCAAGGCTAGGAAAACAATTAAGACAGCAGGACCAAGTGACATGTATGTACATGTCGGAAATCTCATATACAGGAATTTACACCTTTTCAATTCAGATATTCATGATTCTATATTAGTATCATACTCATCAGACTTAGTCATATACCGAACAAACACTACAGGTGATGACTATATACCAACTTGTGATTGTACAGATGCAACCTACTTTTGCAAGCATAAGAATAGATACTATCCAATAAAAGTCACCAGTCATGATTGGTATGAGATCCAAGAAAGTAAATATTACCCAAAACATATACAATACAATTTATTGATAGGTGAGGGACCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGTAAATTACTGTGTAAACATGGGGTTATTGGCATAATAACTGCAGGTGGTGAAGGTCATGTGGCATTTATTGATTTGAGACATTTCCTTTGTGCTGAAGAACAAGGGATTACTGATTACATACACATGCTTGGGGAAGCTTTTGGTAGCGGGTTTGTTGATAGTGTGAAAGATCAAATCAATGCCATAAATCCAATCAACAATATAAGTAGGAAAATTGTTAAATGGATCCTTAGAATAATATCAGCAATGGTAGTGATCATTAGAAATTCATCTGACCCCCAGACCATAATAGCTACACTGACCCTACTTGGTTGTTCTGGCTCGCCATGGAGATTTTTAAAAGAAAAATTCTGTAAATGGACACAATTAAATTACATCCACAAAGAATCAGATACATGGCTTAAGAAATTCACTGAAATGTGCAATGCTGCTAGGGGTTTAGAATGGATTGGTAACAAAATATCAAAATTCATTGAATGGATGAAGTCAATGCTACCACAAGCACAACTTAAAATTAAGTACCTTAATGAATTGAAGAAATTGAATCTCCTAGAAAAACAAATTGAGCATTTGAGGATTGCTGACTCTAGCACTCAGGAGAAGATTAAATGTGAAATAGACACCCTACACGATCTATCATGTAAATTTCTTCCATTGTATGCCAGTGAAGCCAAGAGAATCAAAGTTCTACATAATAAATGCAATGTGATTATAAAGCAAAAGAAAAGGTGTGAACCAGTGGCAGTTGTTATACACGGTGAACCTGGAACTGGGAAATCCATGACAACAAATTTTTTGGCAAGAATGATAACTAATGATAGTGATATTTATTCACTCCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATATGACCAGCAGAGTGTGGTCATAATGGATGACATCATGCAAAATCCAAGTGGTGATGACATGACCCTATTCTGTCAAATGGTGTCTAGTGTCACATTTATCCCTCCTATGGCTGATCTTCCAGATAAGGGAAAGCCTTTTGATTCTAGATTTGTTTTGTGTAGTACAAACCATAGCATGTTAGCACCACCCACTATTACATCTTTACCAGCAATGAATAGAAGATTTTTCCTGGACTTAGACATAGTAGTTAGTGAGAAGTATAAAGATTTGCAGGGAAAACTTAATGTGACTGCTGCTTTCCAACCTTGTGATGTTAATGCTAGAATTGGTAACGCACGCTGCTGCCCATTTATATGTGGGAAGGCAGTGATGTTCAAAGACAGAAATACTTGCCAATCTTATACACTAGCACAAGTCTATAATCACATGCTTGATGAAGACAAAAGACGCAGACAAGTTGTAGATGTTATGACTGCAATCTTTCAGGGACCAATTACACTAGAAGGACCTCCACCAGCTGCAATCAGTGATTTATTACAATCAGTTAGGACTCCAGAAGTTATTAAGTATTGTGAGGAAAACAAGTGGATAATCCCAGCTGAATGTAAGATAGAAAGAGATCTTAACATAGCTAACACCATAATTACAATTATAG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|
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|
rhinovirus A11
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2021-12-11
| null |
Rhinovirus A
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Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,073
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-06-22
|
SAMN21173625
|
PRJNA1066815
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Rhinovirus A11 strain RvA11/USA/2021/PLXFU8, complete genome
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| 35,311
|
OL133740.1
|
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|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2021-12-11
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,082
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-07-15
|
SAMN22374304
|
PRJNA1066815
|
Rhinovirus A11 strain RvA11/USA/2021/GX93YX, complete genome
|
CCACCTGGATCTCCCATGTGGAGTTGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATCTCCCCTTCCCCTTTTGCAACTTAGAAGATGAACTCACCGACCAATAGGTGACATTTATCCAAAATGTCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAGGATGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACATCTGCGATCGTTATCCGCAAAACAACTACGCAAAGCCTAGTACCACTTTTGAAAGTATGTGGTTGGTCGCTCCACTATAAACCCAATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAGCTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGTGCCTCCAGTAGGCACGAAGCCATATATTTGACAAGGTGCGAAGAGCCCCGTGTGCTTGTTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGTGCACAATCCAGTGTATGGCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCCTTTTATTTGCTTATGGTGACAATATATATAATACATATATATTGGCATCATGGGCGCTCAGGTATCCAGACAGAATGTTGGTACACACTCCACACAGAATTCAGTCTCAAATGGTTCAAGTCTAAATTATTTTAATATAAATTACTTTAAAGATGCTGCTTCAAGTGGTGCCTCAAAACTTGAATTTTCACAAGACCCTAGCAAATTTACTGACCCAGTTAAAGATGTATTAGAAAAAGGCATCCCTACTTTACAGTCTCCAACAGTGGAAGCATGTGGATATTCGGACAGGATTATACAAATTACAAGAGGTGATTCTACAATAACATCACAGGATGTGGCAAATGCTGTGGTTGGATACGGAGTATGGCCTCATTACCTAACATCACAAGATGCTACAGCTATAGACAAGCCTTCTCGCCCAGACACCTCCTCAAATAGATTTTACACCCTAGAGAGTAAGCAATGGATGTCAACTTCTAAAGGATGGTGGTGGAAATTACCTGATGCCCTTAGGGACATGGGAATCTTTGGTGAAAATATGTTCTATCACTTTCTTGGAAGGAGTGGCTATACAGTACATGTTCAATGCAATGCCAGCAAGTTCCATCAAGGCACCTTAATAGTTGCAATGATACCAGAACATCAATTAGCAAGTGCAACAACTGGTAATGTGACAGCTGGCTATAAGCTCACACATCCTGGTGAGCGTGGTAGAGATGTCAGTCTCACAGACCGCCAAGATATCACAAAGCAACCTAGTGATGACAGCTGGCTTAATTTTGATGGTACACTGTTAGGTAACATAACCATATATCCACACCAGTTTATTAATCTTAGAAGCAATAACTCAGCCACAATTATTGTACCCTATGTAAATGCAGTTCCCATGGATTCAATGTTAAGACATAACAATTGGAGTTTAGTTATTATACCAATATGCCCATTGGAATCAGAATTGAACACACCTGTGCCTATCACTATATCTATAAGCCCCATGTGTGCTGAATTCTCTGGTGCTCGTGCACGCAACCAAGGCCTGCCAGTACTAATAACACCAGGTTCTGGTCAGTTTATGACAACAGATGATTTCCAATCCCCTAGTGCACTACCTTGGTTTCACCCTACTAAAGAAATTTCAATACCAGGTCAAGTGAGAAACCTCATTGAACTTTGCCAAGTTGACACATTAATCCCCATAAACAGTGTGGAAGGGAACACTGACAACACAAGTATATACACTGTTACATTAACCAGGGAAACCAGTTTAGCACAAGAGATATTTGCAATAAAGGTTGACATAGCATCACAACCCCTTGCTACCACCTTGATTGGTGAGATAGCCAGCTATTACACTCACTGGACAGGCAGTATTCGCTTCAGCTTCCTCTTCTGTGGTACCGCAAATACCACTCTCAAATTGTTAATAGCATACACACCACCTGGCATAAGCAAACCCGCTAATAGGAAAGAAGCAATGTTGGGTACTCATGTAGTTTGGGATGTTGGTTTGCAATCTACAATTTCAATGGTAGTCCCATGGGTGAGTGCTAGTCATTATAGAAATACCACACCAGATACATACTCTCTTGCTGGCTTTGTCACTTGCTGGTATCAAACTAACCTAGTGGTACCACCCAGCACGCCAACTACTGCTAAGATGCTGTGCTTTGTCTCAGGCTGCAAAGACTTCTGCTTGAGAATGGCACGAGACACCAATTTACATCTACAAAGTGGACCCATAGAGCAAAACCCAGTGGAAGATTATGTTGATGGAATTCTAAATGAGGTTCTAGTTGTACCCAACATAAAGGAGAGTCAAGCCACCACATCAAACTCAGCACCTGCTCTAGATGCAGCAGAAACTGGACATACCAGTAAAGTACAGCCAGAGGACATGATTGAAACTAGATATGTGCAAACCTCACAAACCCTTGATGAAATGAGCATTGAGAGCTTCTTAGGTAGATCTGGTTGTATTCACATGTCCAAACTAATTGTGCAGTATGAAGACTATAATGGAAAGAAAAATTTCAACACATGGAAGATAAATTTACAGGAAATGGCACAAATTAGAAGGAAATTTGAAATGTTCACATATACTAGATTTGATTCAGAGATCACACTAGTACCCTGTATAGCTGCAAAAGGAGATGACATTGGTCATGTCGTAATGCAATATATGTATGTTCCACCAGGTGCTCCAGTCCCAGAGAAGAGAGATGATTACACATGGCAGTCAGGAACAAATGCCTCCATCTTCTGGCAGTATGGTCAAACATACCCAAGATTCTCTCTGCCTTTTATGAGTATAGCCTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGATATGATGGAGATCAACCAAATTCCAGATATGGTAATATAGTTACTAATGATATGGGTACCCTGTGTTATAGAATAGTAACTGATGACCATAGACACAAAATTGAGGTCACAACTAGAGTATACCATAAAGCAAAGCATGTAAAAGTGTGGTGTCCAAGACCACCTAGAGCTGTGGAATATACTCACACTCATGTAACCAATTATAAACCACAAGAAGGACAGGTGAAAACAGCTGTCAAGGCTAGGAAAACAATTAAGACAGCAGGACCAAGTGACATGTATGTACATGTTGGAAATCTCATATACAGGAATTTACACCTTTTCAATTCAGATATTCATGATTCTATATTAGTATCATACTCATCAGACTTAGTCATATACCGAACAAACACTACAGGTGATGACTATATACCAACTTGTGATTGTACAGATGCAACCTACTTTTGCAAGCATAAGAATAGATACTATCCAATAAAAGTCACCAGTCATGATTGGTATGAGATCCAAGAAAGTGAATATTACCCAAAACATATACAATACAATTTATTGATAGGTGAGGGACCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGTAAATTACTGTGTAAACATGGGGTTATTGGCATAATAACTGCAGGTGGTGAAGGTCATGTGGCATTTATTGATTTGAGACATTTCCATTGTGCTGAAGAACAAGGGATTACTGATTACATACACATGCTTGGGGAAGCTTTTGGTAGCGGGTTTGTTGATAGTGTGAAAGATCAAATCAATGCCATAAATCCAATCAACAATATAAGTAGGAAAATTGTTAAATGGATCCTTAGAATAATATCAGCAATGGTAGTGATCATTAGAAACTCATCTGACCCCCAGACCATAATAGCTACACTGACCCTACTTGGTTGTTCTGGCTCGCCATGGAGATTTTTAAAAGAAAAATTCTGTAAATGGACACAATTAAATTACATCCACAAAGAATCAGATACATGGCTTAAGAAATTCACTGAAATGTGCAATGCTGCTAGGGGTTTAGAATGGATTGGTAACAAAATATCAAAATTCATTGAATGGATGAAGTCAATGCTACCACAAGCACAACTTAAAATTAAGTACCTTAATGAATTGAAGAAATTGAATCTCCTAGAAAAACAAATTGAGCATTTGAGGATTGCTGACTCTAGCACTCAGGAGAAGATTAAATGTGAAATAGACACCCTACACGATCTATCATGTAAATTTCTTCCATTATATGCCAGTGAAGCCAAGAGAATCAAAGTTCTACATAATAAATGCAATGTGATTATAAAGCAAAAGAAAAGGTGTGAACCAGTGGCAGTTGTTATACACGGTGAACCTGGAACTGGGAAATCCATGACAACAAATTTTTTGGCAAGAATGATAACTAATGATAGTGATATTTATTCACTCCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATATGACCAACAGAGTGTGGTCATAATGGATGACATCATGCAAAATCCAAGTGGTGATGACATGACCCTATTCTGTCAAATGGTGTCTAGTGTCACATTTATCCCTCCTATGGCTGATCTTCCAGATAAGGGAAAGCCCTTTGATTCTAGATTTGTTTTGTGTAGTACAAACCATAGCATGTTAGCACCACCCACTATTACATCTTTACCAGCAATGAATAGAAGATTTTTCCTGGACTTAGACATAGTAGTTAGTGAGAAGTATAAAGATTTGCAGGGAAAACTTAATGTGACTGCTGCTTTCCAACCTTGTGATGTTAATGCTAGAATTGGTAACGCACGCTGCTGCCCATTTATATGTGGGAAGGCAGTGATGTTCAAAGACAGAAATACTTGCCAATCTTATACACTAGCACAAGTCTATAATCACATGCTTGATGAAGACAAAAGACGCAGACAAGTTGTAGATGTTATGACTGCAATCTTTCAGGGACCAATTACACTAGAAGGACCTCCACCAGCTGCAATCAGTGATTTATTACAATCAGTTAGGACTCCAGAAGTTATTAAGTATTGTGAGGAAAACAAGTGGATAATCCCAGCTGAATGTAAGATAGAAAGAGATCTTAACATAGCTAACACTATAATTACAATTATAG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|
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| null |
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Enterovirus
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2021-07-15
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Rhinovirus A11 strain RvA11/USA/2021/UMQEVQ, complete genome
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| 35,478
|
MZ670589.1
|
rhinovirus A11
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2021-09-07
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,082
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-06-09
|
SAMN20216685
|
PRJNA1066815
|
Rhinovirus A11 strain RvA11/USA/2021/R3TYRP, complete genome
|
CCACGTGGGAGATCCAGGTGGAGTTGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATCTCCCTTTCCCCTTTTGTAACTTAGAAGATGAACTCACCGACCAATAGGTGACATTTATCCAAAATGTCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAGGATGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACATCTACGATCGTTATCCGCAAAACAACTACGCAAAGCCTAGTACCACTTTTGAGAGTATGTGGTTGGTCGCTCCACTATAAACCCAATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAGCTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGTGCCTCCAGTAGGCACGAAGCCATATATTTGACAAGGTGCGAAGAGCCCCGTGTGCTTGTTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGTGCACAATCCAGTGCATGGCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCCTTTTATTTGCTTATGGTGACAATATATATAATACATATATATTGGCATCATGGGCGCCCAGGTATCCAGACAGAATGTTGGTACACACTCCACACAGAATTCAGTCTCAAATGGCTCAAGTTTAAATTATTTTAATATAAATTACTTTAAAGATGCTGCTTCAAGTGGTGCCTCAAAACTCGAATTTTCACAAGACCCTAGCAAATTTACTGACCCAGTTAAAGATGTATTGGAAAAAGGCATCCCTACTTTACAGTCTCCAACAGTGGAAGCATGTGGATATTCGGACAGGATTATACAAATTACAAGAGGTGATTCCACAATAACATCACAAGATGTGGCAAATGCTGTGGTTGGATACGGAGTGTGGCCTCATTATCTAACATCACAAGATGCTACAGCTATAGACAAGCCTTCTCGCCCAGACACCTCCTCAAATAGATTCTACACCCTAGAGAGTAAGCAATGGATGTCAACTTCTAAAGGATGGTGGTGGAAATTACCTGATGCCCTTAGGGACATGGGAATCTTTGGTGAAAATATGTTCTATCACTTTCTTGGAAGGAGTAGTTATACAGTACATGTTCAATGTAATGCCAGCAAGTTCCATCAAGGCACCTTAATAGTTGCAATGATACCAGAACATCAATTAGCAAGTGCAACAACTGGTAATGTGACAGCTGGCTATAAGCTCACACATCCTGGTGAGCGTGGTAGAGATGTCAGTCTCACAGACCGCCAAGATATCACAAAGCAACCTAGTGATGACAGCTGGCTTAATTTTGATGGTACACTGTTAGGTAACATAACCATATATCCACACCAGTTTATTAATCTTAGAAGCAATAACTCAGCCACAATTATTGTACCCTATGTAAATGCAGTCCCCATGGATTCAATGTTAAGACATAATAATTGGAGTCTAGTTATTATACCAATATGCCCATTGGAATCAGAATTGAACACACCTGTGCCTATCACTATATCCATAAGCCCTATGTGCGCTGAGTTCTCTGGTGCTCGTGCACGCAATCAAGGCCTGCCAGTACTAATAACACCAGGATCTGGTCAGTTTATGACAACAGATGATTTCCAATCTCCTAGTGCACTACCTTGGTTTCACCCTACTAAAGAAATTTCAATACCAGGTCAAGTGAGAAACCTCATTGAACTTTGCCAAGTTGACACATTAATCCCCATAAACAGTGTGGAAGGGAACACTGACAACACAAGTATATACACTGTTACATTAACCAGGGAAACCAGTTTGGCACAAGAGATATTTGCAATAAAGGTTGACATAGCATCACAACCCCTTGCTACCACCTTGATTGGTGAAATAGCCAGCTATTACACTCACTGGACAGGCAGCATTCGCTTCAGCTTCCTCTTCTGTGGTACTGCAAATACCACTCTCAAATTGTTAATAGCATACACACCACCTGGCATAAGTAAACCCACTAATAGGAAAGAAGCAATGTTGGGTACTCATGTAGTTTGGGATGTTGGTTTGCAATCTACAATTTCAATGGTAGTCCCATGGGTGAGTGCTAGTCATTATAGAAATACCACACCAGATACATACTCTCTTGCTGGCTTTGTCACTTGCTGGTATCAAACTAATCTAGTGGTACCACCCAGCACGCCAACTACTGCTAAGATGCTGTGCTTTGTCTCAGGCTGCAAAGACTTCTGCTTGAGAATGGCACGAGACACCAATCTACATCTACAAAGTGGACCTATAGAGCAAAACCCAGTGGAAGATTATGTTGATGGAATTCTAAATGAGGTTCTAGTTGTACCTAACATAAAGGAGAGTCAAGCCACCACATCAAACTCAGCACCTGCTCTAGATGCAGCAGAAACTGGACATACCAGTAAAGTACAGCCAGAGGACATGATTGAAACTAGATATGTGCAAACCTCACAGACTCTTGATGAAATGAGCATTGAGAGCTTCTTAGGTAGATCTGGTTGTATTCACATGTCCAAACTAATTGTGCAGTATGAAGACTATAATGGAAAGAAAAATTTCAACACATGGAAAATAAATTTACAGGAAATGGCACAAATTAGAAGGAAATTTGAAATGTTCACATATACTAGATTTGATTCAGAAATCACACTAGTACCCTGTATAGCTGCAAAAGGAGATGACATTGGTCATGTTGTAATGCAATATATGTATGTTCCACCAGGTGCTCCAGTCCCAGAGAAGAGAGACGATTACACATGGCAGTCAGGAACAAATGCCTCCATCTTCTGGCAATATGGTCAAACATACCCAAGATTCTCTCTGCCTTTTATGAGTATAGCCTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGATATGATGGAGATCAACCAAATTCCAGATATGGTAATATAGTTACCAATGATATGGGTACCCTGTGTTATAGAATAGTAACTGATGACCATAGACACAAAATTGAAGTCACAACTAGAGTATACCATAAAGCAAAGCATGTAAAAGTGTGGTGTCCAAGACCACCTAGAGCTGTGGAATATACTCACACTCATGTAACCAATTATAAACCACAAGAAGGACAGGTGAAAACAGCTGTCAAGGCTAGGAAAACAATTAAGACAGCAGGTCCAAGTGACATGTATGTACATGTCGGAAATCTCATATACAGGAATTTACACCTTTTCAATTCAGATATTCATGATTCTATATTAGTATCATACTCATCAGACTTAGTCATATACCGAACAAACACTACAGGTGATGACTATATACCAACTTGTGATTGTACAGATGCAACCTACTTTTGCAAGCATAAGAATAGATACTATCCAATAAAAGTCACCAGTCATGATTGGTATGAGATCCAAGAAAGTGAATATTACCCAAAACATATACAATACAATTTATTGATAGGTGAGGGACCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGTAAATTACTGTGTAAACATGGGGTTATTGGCATAATAACTGCAGGTGGTGAAGGTCATGTGGCATTTATTGATTTGAGACATTTCCATTGTGCTGAAGAACAAGGGATTACTGATTACATACACATGCTTGGGGAAGCTTTTGGTAGCGGGTTTGTTGATAGTGTGAAAGATCAAATCAATGCCATAAATCCAATCAACAATATAAGTAGGAAAATTGTTAAATGGATCCTTAGAATAATATCAGCAATGGTAGTGATTATTAGAAACTCATCTGACCCCCAGACCATAATAGCTACACTGACCCTACTTGGCTGTTCTGGCTCGCCATGGAGATTTTTAAAAGAAAAATTCTGTAAATGGACACAATTAAATTACATCCACAAAGAATCAGATACATGGCTTAAGAAATTCACTGAAATGTGCAATGCTGCTAGGGGTTTAGAATGGATTGGTAACAAAATATCAAAATTCATTGAATGGATGAAGTCAATGCTACCACAAGCACAACTTAAAATTAAGTACCTTAATGAATTGAAGAAATTAAATCTCCTAGAAAAACAAATTGAGCATTTGAGAATTGCTGACTCTAGCACTCAGGAGAAGATTAAATGTGAAATAGACACCCTACACGATCTATCATGTAAATTTCTCCCATTGTATGCCAGTGAAGCCAAGAGAATCAAAGTTCTGCATAATAAATGCAATGTGATTATAAAACAAAAGAAAAGGTGTGAACCAGTGGCAGTTGTTATACACGGTGAACCTGGAACTGGGAAATCCATGACAACAAATTTTCTAGCAAGAATGATAACTAATGATAGTGATATTTATTCACTCCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATATGACCAACAGAGTGTGGTCATAATGGATGACATCATGCAAAATCCAAGTGGTGATGACATGACTCTATTCTGTCAAATGGTGTCTAGTGTCACATTTATCCCTCCCATGGCTGATCTTCCAGATAAGGGAAAGCCTTTTGATTCTAGATTTGTTTTGTGTAGTACAAATCATAGTATGCTAGCACCACCCACTATTACATCTTTACCAGCAATGAATAGAAGATTTTTCCTGGACTTAGACATAGTAGTTAGTGAGAAGTATAAAGATTTGCAGGGAAAACTTAATGTGACTGCTGCTTTCCAACCTTGTGATGTTAACGCTAGAATTGGTAACGCACGCTGCTGCCCATTTATATGTGGGAAGGCAGTGATGTTCAAAGACAGAAACACTTGCCAATCTTATACACTAGCACAAGTCTATAATCACATGCTTGATGAAGACAAAAGACGTAGACAAGTTGTAGATGTTATGACTGCAATCTTTCAGGGACCAATTACACTAGAAGGACCTCCACCAGCTGCAATTAGTGATTTATTACAATCAGTTAGGACTCCAGAGGTTATTAAGTATTGTGAGGAAAACAAGTGGATAATCCCAGCTGAATGTAAGATAGAAAGAGATCTTAACATAGCTAACACTATAATTACAATTATAG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| 38,126
|
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|
rhinovirus A11
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2021-09-07
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
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| 7,082
|
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|
USA
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| null |
2021-06-10
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Rhinovirus A11 strain RvA11/USA/2021/WNJ7NJ, complete genome
|
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| 38,186
|
MZ540952.1
|
rhinovirus A11
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2021-08-08
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,082
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-05-13
|
SAMN19819240
|
PRJNA1066815
|
Rhinovirus A11 strain RvA11/USA/2021/XHZLKL, complete genome
|
CCACCTGGATCTCCCATGTGGAGTTGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATCTCCCCTTCCCCTTTTGTAACTTAGAAGATGAACTCACCGACCAATAGGTGACATTTATCCAAAATGTCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAGGATGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACATCTGCGATCGTTATCCGCAAAACAACTACGCAAAGCCTAGTACCACTTTTGAAAGTATGTGGTTGGTCGCTCCACTATAAACCCAATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAGCTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGTGCCTCCAGTAGGCACGAAGCCATATATTTGACAAGGTGCGAAGAGCCCCGTGTGCTTGTTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGTGCACAATCCAGTGCATGGCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCCTTTTATTTGCTTATGGTGACAATATATATAATACATATATATTGGCATCATGGGCGCTCAGGTATCCAGACAGAATGTTGGTACACACTCCACACAGAATTCAGTCTCAAATGGTTCAAGTCTAAATTATTTTAATATAAATTACTTTAAAGATGCTGCTTCAAGTGGTGCCTCAAAACTTGAATTTTCACAAGACCCTAGCAAATTTACTGACCCAGTTAAAGATGTACTAGAAAAAGGCATCCCTACTTTACAGTCTCCAACAGTGGAAGCATGTGGATATTCGGACAGGATTATACAAATTACAAGAGGTGATTCTACAATAACATCACAGGATGTGGCAAATGCTGTGGTTGGATACGGAGTATGGCCTCATTACCTAACATCACAAGATGCTACAGCTATAGACAAACCTTCTCGCCCAGACACCTCCTCAAATAGATTTTACACCCTAGAGAGTAAGCAATGGATGTCAACTTCTAAAGGATGGTGGTGGAAATTACCTGATGCCCTTAGGGACATGGGAATCTTTGGTGAAAATATGTTCTATCACTTTCTTGGAAGGAGTGGCTATACAGTACATGTTCAATGCAATGCCAGCAAGTTCCATCAAGGCACCTTAATAGTTGCAATGATACCAGAACATCAATTAGCAAGTGCAACAACTGGTAATGTGACAGCTGGCTATAAGCTCACACATCCTGGTGAGCGTGGTAGAGATGTCAGTCTCACAGACCGCCAAGATATCACAAAGCAACCTAGTGATGACAGCTGGCTTAATTTTGATGGTACACTGTTAGGTAACATAACCATATATCCACACCAGTTTATTAATCTTAGAAGCAATAACTCAGCCACAATTATTGTACCCTATGTAAATGCAGTTCCCATGGATTCAATGTTAAGACATAATAATTGGAGTTTAGTTATTATACCAATATGCCCATTGGAATCAGAATTGAACACACCTGTGCCTATCACTATATCTATAAGCCCCATGTGTGCTGAATTCTCTGGTGCTCGTGCACGCAACCAAGGCCTGCCAGTACTAATAACACCAGGTTCTGGTCAGTTTATGACAACAGATGATTTCCAATCCCCTAGTGCACTACCTTGGTTTCACCCTACTAAAGAAATTTCAATACCAGGCCAAGTGAGAAACCTCATTGAACTTTGCCAAGTTGACACATTAATCCCCATAAACAGTGTGGAAGGGAACACTGACAACACAAGTATATACACTGTTACATTAACCAGGGAAACCAGTTTAGCACAAGAGATATTTGCAATAAAGGTTGACATAGCATCACAACCCCTTGCTACCACCTTGATTGGTGAGATAGCTAGCTATTACACTCACTGGACAGGCAGTATTCGCTTCAGCTTCCTCTTCTGTGGTACCGCAAATACCACTCTCAAATTGTTAATAGCATACACACCACCTGGCATAAGCAAACCCACTAATAGGAAAGAAGCAATGTTGGGTACTCATGTAGTTTGGGATGTTGGTTTGCAATCTACAATTTCAATGGTAGTCCCATGGGTGAGTGCTAGTCATTATAGAAATACCACACCAGATACATACTCTCTTGCTGGCTTTGTCACTTGCTGGTATCAAACTAACCTAGTGGTACCACCCAGCACGCCAACTACTGCTAAGATGCTGTGCTTTGTCTCAGGCTGCAAAGACTTCTGCTTGAGAATGGCACGAGACACCAATTTACATCTACAAAGTGGACCCATAGAGCAAAACCCAGTGGAAGATTATGTTGATGGAATTCTAAATGAGGTTCTAGTTGTACCCAACATAAAGGAGAGTCAAGCCACCACATCAAACTCAGCACCTGCTCTAGATGCAGCAGAAACTGGACATACCAGTAAAGTACAGCCAGAGGACATGATTGAAACTAGATATGTGCAAACCTCACAAACCCTTGATGAAATGAGCATTGAGAGCTTCTTAGGTAGATCTGGTTGTATTCACATGTCCAAACTAATTGTGCAGTATGAAGACTATAATGGAAAGAAAAATTTCAACACATGGAAGATAAATTTACAGGAAATGGCACAAATTAGAAGGAAATTTGAAATGTTCACATATACTAGATTTGATTCAGAGATCACACTAGTACCCTGTATAGCTGCAAAAGGAGATGACATTGGTCATGTCGTAATGCAATATATGTATGTTCCACCAGGTGCTCCAGTCCCAGAGAAGAGAGATGATTACACATGGCAGTCAGGAACAAATGCCTCCATCTTCTGGCAGTATGGTCAAACATACCCAAGATTCTCTCTGCCTTTTATGAGTATAGCCTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGATATGATGGAGATCAACCAAATTCCAGATATGGTAATATAGTTACTAATGATATGGGTACCCTGTGTTATAGAATAGTAACTGATGACCATAGACACAAAATTGAGGTCACAACTAGAGTATACCATAAAGCAAAGCATGTAAAAGTGTGGTGTCCAAGACCACCTAGAGCTGTGGAATATACTCACACTCATGTAACCAATTATAAACCACAAGAAGGACAGGTGAAAACAGCTGTCAAGGCTAGGAAAACAATTAAGACAGCAGGACCAAGTGACATGTATGTACATGTCGGAAATCTCATATACAGGAATTTACACCTTTTCAATTCAGATATTCATGATTCTATATTAGTATCATACTCATCAGACTTAGTCATATACCGAACAAACACTACAGGTGATGACTATATACCAACTTGTGATTGTACAGATGCAACCTACTTTTGCAAGCATAAGAATAGATACTATCCAATAAAAGTCACCAGTCATGATTGGTATGAGATCCAAGAAAGTGAATATTACCCAAAACATATACAATACAATTTATTGATAGGTGAGGGACCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGTAAATTACTGTGTAAACATGGGGTTATTGGCATAATAACTGCAGGTGGTGAAGGTCATGTGGCATTTATTGATTTGAGACATTTCCATTGTGCTGAAGAACAAGGGATTACTGATTACATACACATGCTTGGGGAAGCTTTTGGTAGCGGGTTTGTTGATAGTGTGAAAGATCAAATCAATGCCATAAATCCAATCAACAATATAAGTAGGAAAATTGTTAAATGGATCCTTAGAATAATATCAGCAATGGTAGTGATCATTAGAAATTCATCTGACCCCCAGACCATAATAGCTACACTGACCCTACTTGGTTGTTCTGGCTCGCCATGGAGATTTTTAAAAGAAAAATTCTGTAAATGGACACAATTAAATTACATCCACAAAGAATCAGATACATGGCTTAAGAAATTCACTGAAATGTGCAATGCTGCTAGGGGTTTAGAATGGATTGGTAACAAAATATCAAAATTCATTGAATGGATGAAGTCAATGCTACCACAAGCACAACTTAAAATTAAGTACCTTAATGAATTGAAGAAATTGAATCTCCTAGAAAAACAAATTGAGCATTTGAGGATTGCTGACTCTAGCACTCAGGAGAAGATTAAATGTGAAATAGACACCCTACACGATCTATCATGTAAATTTCTTCCATTGTATGCCAGTGAAGCCAAGAGAATCAAGGTTCTACATAATAAATGCAATGTGATTATAAAGCAAAAGAAAAGGTGTGAACCAGTGGCAGTTGTTATACACGGTGAACCTGGAACTGGGAAATCCATGACAACAAATTTTTTGGCAAGAATGATAACTAATGATAGTGATATTTATTCACTCCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATATGACCAGCAGAGTGTGGTCATAATGGATGACATCATGCAAAATCCAAGTGGTGATGACATGACCCTATTCTGTCAAATGGTGTCTAGTGTCACATTTATCCCTCCTATGGCTGATCTTCCAGATAAGGGAAAGCCTTTTGATTCTAGATTTGTTTTGTGTAGTACAAACCATAGCATGTTAGCACCACCCACTATTACATCTTTACCAGCAATGAATAGAAGATTTTTCCTGGACTTAGACATAGTAGTTAGTGAGAAGTATAAAGATTTGCAGGGAAAACTTAATGTGACTGCTGCTTTCCAACCTTGTGATGTTAATGCTAGAATTGGTAACGCACGCTGCTGCCCATTTATATGTGGGAAGGCAGTGATGTTCAAAGACAGAAATACTTGCCAATCTTATACACTAGCACAAGTCTATAATCACATGCTTGATGAAGACAAAAGACGCAGACAAGTTGTAGATGTTATGACTGCAATCTTTCAGGGACCAATTACACTAGAAGGACCTCCACCAGCTGCAATCAGTGATTTATTACAATCAGTTAGGACTCCAGAAGTTATTAAGTATTGTGAGGAAAACAAGTGGATAATCCCAGCTGAATGTAAGATAGAAAGAGATCTTAACATAGCTAACACCATAATTACAATTATAG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| 39,577
|
EF173414.1
|
rhinovirus A11
|
Tapparel,C., Junier,T., Gerlach,D., Cordey,S., Van Belle,S., Perrin,L., Zdobnov,E.M., Kaiser,L., Frayard,S.
|
University Hospital of Geneva, Infectious Medicine
|
Switzerland
|
2007-07-15
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,125
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Human rhinovirus 11, complete genome
|
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| 107,031
|
OM001397.1
|
rhinovirus A12
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2022-01-04
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,106
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-06-22
|
SAMN24255301
|
PRJNA1066815
|
Rhinovirus A12 strain RvA12/USA/2021/2PYKSY, complete genome
|
CCCACCAVACTGCCCACTGGGCGTAGTGCTCTCATATTCCGGTATGCTTGCACGCCAGTTTTATTCCCCCTTTCCCCATTGTAACTTAGAAGCAAAGCACACATGATCAATAGGAGATAACTCGCCAGGTTATTCAAGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCAAGTGTGAATATGCTTTATCCAAGGCAAAAGCTAATCTTGTCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGAGAAGCCTAGTAATGCTCAAGATGTAGTTTGGCTGGTCGCTCCGCTGTTTCCCACAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACACTCCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTATGGGTGTGAAGCCAAACTTACTGACAGGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACCTTGATTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGCTGCTATTACACGCGAACCAGTGTGTGGATAGTCGTAATGAGCAATAGTGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTAATTTGTCTTATGGTCACAATATATATATAACGTATATTGTGATCATGGGCGCTCAGGTATCAAGACAGAATGTTGGTACGCATTCAACTCAGAACTCAGTTTCAGGTGGATCTAGCTTAAATTATTTCAACATCAATTATTTCAAAGATGCAGCATCTAGCGGAGCATCTAGATTGGATTTCTCTCAAGACCCAAGTAAATTCACTGATCCAGTAAAAGATGTGTTAACTAAAGGAATACCCACACTGCAATCACCAACTGTTGAAGCTTGTGGTTACTCTGACCGCATCATACAGATCACCAGAGGAGATTCAACCATAACATCACAGGATATAGCAAATGCTGTTGTTGCTTATGGCGTTTGGCCACATTACCTCTCTGCTGAAGATGCAAATGCAATAGACAAGCCAACTCGCCCAGACACATCATCCAACCGATTTTACACTTTAGAGAGCAAACAGTGGATGGAGAACTCAAAAGGTTGGTGGTGGAAATTACCAGATGCCCTCAAAGACATGGGAATATTTGGAGAAAACATGTTTTATCATTTCTTGGGAAGAGCTGGATATACAATACATGTACAATGTAATGCTAGTAAATTTCATCAAGGTACATTGATGGTTGTTGCTATTCCTGAACATCAGCTTGCATACATTGGCACTGGCAATGTCACGGTGGGATACAAGCATACACATCCAGGGGAATCAGGTAGAATAATAGCAAACAATGCAGACAATAACACCAGACAACCTAGTGATGATAATTGGCTTAATTGTGATGGCACATTAATGGGCAACTTACCAATATTCCCACACCAGTTCATTAATCTCCGGACTAACAATTCTGCAACTCTGATACTGCCATACATGAATTGTGTGCCTATGGACTCAATGCTGAGACATAACAACTGGTCACTGTTAATAATACCTGTTTGTCCACTACAGGTTGATCAGCAGGCAACTAGGTTTGTACCAATAACCATTTCAATCAGTCCAATGTTTGCAGAGTTCAGTGGAGCCAGAAATGCAACAATACCTCAGGGTTTACCAGTTATGATAACACCAGGATCTGGTCAATTCCTGACAACGGATGATGCTCAATCACCTTCAGCTTTACCTTATTTTCATCCTACAAAAGAAATCTTTATACCAGGGCAGGTTAAAAACTTGATTGAAATGTGTCAAGTTGATACCTTGATACCTGTAAACAATGTGCAGGCTTCCAAAAATAACATAAGTATGTACACAGTTCAATTGAACACACAAACTGATGTTGCAAAAGAAGTTTTTGCCATTCCAGTGGATGTAGCTTCTCAACCCTTAGCTACTACCATGCTTGGAGAGCTTTCCAGTTACTTCACCCACTGGACAGGCAGTCTACGCTTCAGTTTTATGTTTTGTGGAACGGCAAATACTACTTTGAAACTCTTGATTGCATACACGCCCCCTGGTGTTCCTAAACCAGATACTAGGAAGAAAGCTATGCTTGGCACCCACCTAGTGTGGGATGTGGGGTTACAATCAACAGTATCCATGATTGTGCCATGGGTATCAGCAAGCCATTTCCGCTTTACAACTCCAGATACCTATTCAAAAGCTGGCTACATAACTTGCTGGTACCAAACAAACTTTGTTGTACCCCCAGGAACCCCAAACTCAGCTAATATGTTATGTTTTGTGTCTGCGTGTAAAGATTTCTGCTTGAGAATGGCCCGTGATACAGACTTGCATTCACAAGATACACCCATTACACAGAATCCAGTAGAGAGGTATGTTGATGAAGTGCTAAATGAGGTCTTAGTTGTCCCAAACATAAACAAAAGTAATGGGCAGTCGTCAAATGCAGCACCAGCACTGGATGCCGCAGAGACTGGTCATACTAGCCAAACACAACCAGAAGATGTGATTGAAACCAGATATGTGATTACAGACCAGACTAGGGACGAGATGTCAATTGAATCTTTTCTTGGCCGCTCCGGTTGTATCTCAATTATTGAATTGGACCTAGACCATGAAAATTATTCAGCAGAAGGGAGCAACTTTAAGACATGGAAGATAAATCTTAAGGAAATGGCCCAAATTAGAAGGAAAAATGAACTTTTCACCTACTTAAGGTTTGATTCAGAAATTACCATTGTTCCAAGCAATGCAGCAATAGAAGGAAGCAATGGTCATGTGGTAATCCAGTACATGTATGTGCCTCCCGGTGCTCCACTGCCCAAGAAGCGTGATGATTACACGTGGCAATCTGGTACCAATGCCTCAGTCTTTTGGCAGGAGGGCCAACCTTACCCCAGATTCACAATTCCTTTCATTAGCATTGCTTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGATATGCTGACGACAACCCAAGTGCACCTTATGGAACTGTAGTCACTAATGACATGGGTTCACTATGTGTCAGAATAGTTACAGACCAGCAAAAACACAAAGTCAAGATTACTAGTAGAATATACCACAAAGCAAAACACATCAGTGCTTGGGGTCCTAGACCACCAAGAGCTGTACCATACCAGCATATACACAACCCAAATTACAAAACAAGTAGTGGAGTTCCAGACAATAGAGTTAAACTTAGGGAAACACTCACTACAGTTGGACCATCTGATTTATACGTCCACTGTGGAGACCTTATTTACAGGAATCTACATTTGTGTGAGCCAGAACATCTAAATGATAGTGTGCTTATTTGTTACAGTTCGGATTTAGTCATTTACCGCACAAACTCTAAAGGAGATGACTATGTTCCAAGCTGTGATTGCACTGAATGCACTTTCTATTCTAAACACAAGGATAGATACTTCCCTATCACAGTAAAGAAGTACAACTGGTTTGAAATACAAGAAAGTGATTATTACCCAAAACATATACAGTACAACATTTTGATTGGTGATGGTCCTGTCCAGGCTGGAGATTGTGGAGGAAAGCTGCTTTGCAAGCATGGTGTGATTGGTATTGTTACAGCAGGTGGCAGTGGCAAAGTGGCTTTCATTGACCTGCGAGATTTTCATGTGGCTGACGAACAAGGAATTTCTGATTACATCACAAATTTAGGTGAAGCCTTTGGTCAAGGTTTCATGTCACAAGTCAAGGACCAGATTTCTGAATTAAACCCTATGAACAAAATAACAGGGAAAGTGCTCAAATGGACAATCCGTATAATTTCAGCCTTGACAATAGTTGTTAGAAACAGTTCAGATCCTTTGACCATTGTGGCAACACTTGCAATGTTAGGATGCAATGGTTCACCCTGGCGTTTTCTAAAAGAAAAAATCTGTAAATGGTTTCAGCTAAATTATGTACATAAAGAATCAGATGGATGGTTGAAAAAATTTACTGAAATGTGCAATGCAGCCAGAGGACTCGAATGGATTGGAAACAAAATCTCAAAGTTCATTGATTGGTTAAAAGCTATGCTGCCACAAACACAGTTAAAGTTGGAATACTTAAAATTGTTGAAGCAACTACCCTTGCTTGAGAAGCAAATTGATGGTCTGAGAGCAGCTACAGAAAAACAAAGAGAAGACTACACGGAGACAATTTCCAGGTTAGATGATTTATCAAAAAAGTTTCTGCCACTGTACCCTGCAGAAGCTAAGAGAATATCAGTCCTGTACAAAAGAAGCCAGACAATTCTTAAGACTTCAAAAAGAACTGAGCCTGTGGGCATTTTGTTTCATGGAGAGCCGGGCACTGGAAAATCAATCACTACTTCTGTCCTAGCAAGGATGTTAACCAGTGACTCTGATATATATTCTCTGCCACCAGCTCCTAAATACTTTGATGGTTATGACCAACAAACAGTTGTCATCATGGACGACATTATGCAAAATCCCAGTGGAGAGGATATGACACTCTTTTGTCAAATGGTATCTTCAGTTCCTTTTATACCACCAATGGCAGATTTGCCAGACAAGGGTAAACACTTTACATCAGAGTATGTTCTAGCAAGCACTAATCACTCTATTCTGAATCCTCCAACTATTACTTCTACTACAGCTATGAATAGAAGGTTCTACCTTGACTTGGATATTGTAGTACACCCAAGTTTTCAGATTAACCAAGGCAAATTAAATCTTGTTGCTGCACTTAAACCTTGTGACACTGGTAAAGTTGGAAATGCCACCTGCTGTCCTTTGATTTGCGGCAAAGCCCTAACCTTCAGAGACAGAAACACAAATGAGTCATATGCACTTTCAACCATATACAACAAGATTGTAGAAGAGAACAAAAACAGAAAAATGCTTTCAAAAAGTCTAGAGGCTATTTTCCAAGGTCCTATTTCTCTTAAAAACCCACCACCTCCAGCAATAGCAGATTTGTTGAATGCTGTCAGAACACCAGAAGTTATAAAATATTGTGAGGAAAACAACTGGATAGTTCCAGCCCAGTGTACAATTGAAAGGGAATTAAATTATTGCAACTTAGTATTAT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