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NC_033738.1 | Cacao mild mosaic virus | Chingandu,N., Zia-Ur-Rehman,M., Sreenivasan,T.N., Surujdeo-Maharaj,S., Umaharan,P., Gutierrez,O.A., Brown,J.K., Guttierez,O. | National Center for Biotechnology Information, NIH | USA | 2017-02-16 | SCA6 | Badnavirus tessellotheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,533 | RefSeq | 1 | Trinidad and Tobago | Trinidad and Tobago | Theobroma cacao | plant leaf | 2015-07-13 | null | PRJNA485481 | Cacao mild mosaic virus isolate SCA6, complete genome | 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MW052520.1 | Cacao mild mosaic virus | Ramos-Sobrinho,R., Ferro,M.M.M., Nagata,T., Puig,A.S., Keith,C.V., Britto,D.S., Gutierrez,O.A., Marelli,J.P., Brown,J.K., Marelli,J.-P. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2021-05-09 | PR3 | Badnavirus tessellotheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,514 | GenBank | 1 | Puerto Rico | USA | Theobroma cacao | plant leaf | 2019-12 | null | null | Cacao mild mosaic virus isolate PR3, complete genome | 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| 42,216 |
MW052521.1 | Cacao mild mosaic virus | Ramos-Sobrinho,R., Ferro,M.M.M., Nagata,T., Puig,A.S., Keith,C.V., Britto,D.S., Gutierrez,O.A., Marelli,J.P., Brown,J.K., Marelli,J.-P. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2021-05-09 | BR321 | Badnavirus tessellotheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,520 | GenBank | 1 | Brazil | Brazil | Theobroma cacao | plant leaf | 2019-09 | null | null | Cacao mild mosaic virus isolate BR321, complete genome | 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| 42,217 |
MW052522.1 | Cacao mild mosaic virus | Ramos-Sobrinho,R., Ferro,M.M.M., Nagata,T., Puig,A.S., Keith,C.V., Britto,D.S., Gutierrez,O.A., Marelli,J.P., Brown,J.K., Marelli,J.-P. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2021-05-09 | BR322 | Badnavirus tessellotheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,524 | GenBank | 1 | Brazil | Brazil | Theobroma cacao | plant leaf | 2019-09 | null | null | Cacao mild mosaic virus isolate BR322, complete genome | TGGTATCAGAGCTATGTTTGTTAAAAGCATGGCTGGCTAAACACTTGGTGAGATTGAAAGGAAAGAGTGACGAGGTTTTTCTTAACGATTATTTTGTTAAAGCAGATTCTTATCAGAAAGACATTAGCAGGAAGAGCGGTAAGACCGAAGAAGTGTCCTCTGAAAAGGAGCAAAAGGACAAGGCCATAGCACTAAGAAGCCAAGGAAGGTGAAAGAAGGTGCGAACCCTTGTATGAGCTTTGAATAGGAGTGAAAGATCGTGGCAAGCTTTGGAGGAAGTTGATGTCTGAAAGGTGGGAACGAGCAATAGCAGAATGGTATGATAAGTCAAGAACCTCTGATCTTGAGTACTTAGATCTCGCATCTTCTCATAAGGTTTCGAATTCAGATCTTGCAAACAATATAGCTGTAGTGTACGATCGTTTAAATTTACTTTCTCGTGTCCATATTAAGGACTGTAAAAAGATCCTTGAAGAAATCGACGGTGTAAAAAGGGAAAGCAGGAAGTTGAGACAGGAGGTGTCTAACTTGACTATTACTGTTCTTGAGAACAAGCCCATCACAAAAGCCCAAGTTCTTGAGATCACGGAGCAGATTTCCAAACAGCCCAAGGAAATCGAAGAGCAGGCTTTGGCCCTTTTAACTAAGGTAAACCAAAAGCTAGCACAGGTAGAAGTATTGGTGGCTAAGCTTGAGGCTTGGACCAATACATGAGTAATCTTGCTAACAGAAGAGCAAGCAGTGCATATACTGATTCTCTTGAAGCCACTGAAGAGTTGAATAGCCCAGCACTTGGATTCATCGACCCAACACAGTATCGAGGACCAACTGCTAGTGCTATTGCACAGATAAAACAGGTTAACACTTTAATCTGTTTAGTTGTTGACTTGACAGAAAAGGTTGAAGCTCTTACAGCTAAGGTAAGGAGCTTAGAAGCGGTCTTTAAGGCAACTGAAAAGGATAAGGGCACCGAGGAGCTGTTGAAGCAACTTCAGGGACTGAAGCTTGGAGAAACTTCGAGACCTCCACAGAAGGAAGGAACTTTACGAGTGTTTGTTGATCCAAAGACACTTGTAGAGAAGGCTAGAAACGAGAAACGATGACTTCTCGTACAGAAACTGTGACTCAACCACAAACTGGTATCAACTTTGAGGACCAGATCCGTGGATACAGGACAGGACAGAGGCGGCGCTACAACTGGGCACGACAAGCAAGAAGGTTAAGGAGTAGGATCAGACGATCGCCTAGACAACCTGAGACGTTGGAAACACAGATAGACCCCCAGGCTGAGCTGAGCATGTCACTGCAGAGGCGTGCTAGTATAGTACCAGCTGAGGTATTGTACCACTCAAGACAGGATGATATCAATCACCGTGTCTACCAGCACTGGAGTGAAGAGGCTGTCAACTGCATTGACGGACAGCAGATCGATAGAACACTGGTTACGATGGAGAGTTATAGTACCTTAAACCGTGCAGGTTTTCGGTATATCCATGTTGGCGTGATCCAGGTAAGATTGCAGATCTTACATAGGCGGGAGATGGGAACGTTAGCCTATGTTGTCTTCAGAGATAACCGACTACTCGGTGATCAAGCAATCTTGGCACAGATGGAAGTTAGTCTGGCTGACGGTGGTCACCAGATGATTTATGTCGTACCAGACATAATGATGACGGTTGGAGACTTTTACAGAAACATCCAGATCTCCATACAGACTAGAGGGTACGGCAACTGGAGGAATGCAGAAGCAAATCTATTAGTAACAAGGGGACTAGTAGGAAGGTTATCCAACACCTCAAATGTGGGATTTGAATACTCCATCAGTAACGTTACAGATTATCTCACTAGTCATGGAGTAAGAGCTATTCCAGGGAAAAGGGTATCAGAATCGGAGCACCTTGGAAGAAGCTGGATACTTAGGGAGCCAGAAGTATCAATCATACAACAACCCACAATTGCAGACACAAGGAACCTACCAAACGGTTCAGTAAGTGTGAGGTTCGGAGGATATGAGGCAGCACCTGAAACCTCAAGGGCAAGGTTTGATGAAAACGACAACGAAATCATGGATGACGATGAGAGTCAGATAGCTGAGGAAGTCCATGTTATGATCATTGATAAAGACGATGAGGAATGGGAAGAGCTGAACAGGCAAATGATGGCTGACTTTGCAGAAGAAGAGCAAAAACACACAGAGCCAATCATTGCGGAGGAGGATATCTATCTCTTACCAGAGATGGAGGACTTGCTGAACATCTCAACATACGCAGATTTGAGCAATGGTAACAACCTAACAAGTGTAATTAATGGTTTTATCATTGTCAGTATCTATCACAATGGTAAAGACATGAAGATCCTGAAAGTCAGAAATGACACGAAGGAGATCAAGTTGATCAGCAAAGGAGATATCATTGGACAAGGTAAAGTCCAACAGGAGGAAATTCACTTTACTGAGGAAGAAGCTCGGGCGGAGCTTAAGAAGCTAATTGCAGGAGAAGAAGTACATATGGAGGCAGAATCTTCGGTACAGTCCGGATCTTATAGATTACCAACGGACGCTACCATGGGACCACCAATTTATCCACCTGCAAGGCAAAGGTTTGATGGACCATCTACATCTTCTATTCCGATGGATCCACCGGTATATAGAGCACCACCAAAGGCAAAGGTTCCAGATTATCAGAACTGGTGGAACCTCCCAACTGCACAAATAAACGGAGGCGCAATGTTCATAATCCCAGCAGATTTCAGCAAATTTGATGATGTTTTTATGCGATGGGAGAGCATTACAAAGAACGTGGTGGCACTACAAAACTTCTCAGACAACAAAGACAAGGCGGAGTTCATTGAGAACTTGCTAGGAGAAACAGAGAAGTTAGCATGGATACAATGGCGAAGTATCTATGAGGAGGAATACCAGACCCTTATTGGTACGATGGATGGAAGGTCTGGAACACAGAACATGTTATCACAGATTAGAAGGATCTTTACATTGGAGGACCCATATCAGGGCTCTACAATGAGTCAAGATCAGGCGTACAAAGACTTAGAGCGCTTAACCTGTACAGATGTCAAGCACATTCTGGAGTACCTAAGGCAGTTCATGTACCTTGCATCAAAGACGGGACGATTGTTTACATCATCAGAGCTGTCTTCAAAACTGTTCGTAAAGATGCCAGGAGACTTGGGGAAACGAATAGAAGACTCATTCAAGGCTAAGTACCCAGGTAACACGGTTGGGGTATTTCCTCGTATTGTCTTTTCATTTAAATACTTGGAAAACCAGTGCAAGGAGGCATCATTCCAGAGAAGCCTGAAGAGCCTAGAATTCTGCAAGCAAATGCCCATCCCAGGGTATTACGGAACTGATAAGAAGCGCCTAGGTATCAGGAAGGCTACACATTACAAAGGAAAGCCGCATAGCACGCACGTAAAGATAGAGAAGCACAAACATTTGAGGACGAAGAAGTGTAAGTGCTACCTTTGTGGAGAAGAAGGTCATTTTGCAAGGGAGTGCAAGAATGACAACAGGAACATTCATAGACAGACTATGTACCAATCATTGGAGCTACCAAAGGATTTTGAGTTGGTATCTGCTGAGGAGAATGATTCAGGAGATGAGATATACAGTATGTCTGAAGGTGAAGATCCAACCACAATGTTCATGAATCTAACACCTTTAGCGCAGGTTGAAGACTGTCTCACTCTTGACTGGGAATATAAAGATGTCTATGAGTACCGACATTTTGGTACTTGTACATCTGACATCCAGCAACCACAAAAGCAACGAACAAAGGTCTATGAAGAGGGAGGAAATGGTCATGATAGAGCCTTTTATCGCTATTACGGACCACCAGATGGACGTGAAAACTGGCCGGAAACACCTATCCCTACGGGTTGGGGTAGTGACTTTGACTCTGACAGCGACACTAATGATACCGAGGATGAAGAGATCTACATGATGCAAGAAGAACAGTTGTTTAACGAACATTGGATTGGAAAACGTGGTGGATGGCAGCCCCTAATTAAACTCTCTGATATTGAGTTTAACTGTGTACATCAATGGCAGCACAACACCCAAGTTCGTGACTGTCCTGAACATTGCAGATGCTGTAACAAGGAGACTTCAGACAGATGCAGGATACAATGTGGATACTGCAAGATCACAGCCTGCAGTTTGTGTGCATTTAGTTACTTTGACATCAAGGTAACTCAAAGAAAGGAATTTGTTTCACCTTATTATGCTACACCATCTTTGTTAAAGGAAAACCAGGAGTACATTTCATGGTGTCAAGCGGAGCTAAACAAGACCGGTGAGGCAATGATGCACATTAGGAAGGAAAATGCAGCACAAAGCGAAGTCATCACAGCGCAGGAAGACATCATCAACAAACTCAAGGAGGAGAAGTTGGATAAAGAAAAGATTCTGAAGGAGCTCAAACAGGAGCTACAGCAGGAAAAGGAAAAGTTCTTACGGGAAATTGAAGAACAGAAAGAGCTTTTCAAAAGGCAGATTGAAGAGGAAAAGGCTAAGTTCCTTAGCCTAAAGCAAAAACAGACGGAGGAAGAAGAATGTCTTCTTGTAAAAGAGGAACCAGAAGAGCAAAAGGTTGAAGAAACATTGGCAATATCCGGAAAGCTGATCATCATAGAAGGACGCATTGAGATAGAAGGAGTTAAGCCCTTCACAGTTAAAGCTTTGTTGGATACAGGAGCATCATGTTGTAACATCAAGAAGGAATTTGTACCAATAAACGCGGTCGAACAATGCAACTATCCAGTCTTGATTCACGGCGTAAATTCAACCTTGGAAGTCAACCAAAAGCTGAAGCAGGGAAAGCTTATCATTGGAAGTCAGGAGTTCAGGTTACCTCATACCTACGTACTTCCTATGAACAAAAATTTGGTCACTGACATGCAGATGATCATTGGTTGCAACTTCATACGCTCACTACATGGTGGAGTAAGGATAGAAGGGAACGAAGTCACCTTCTACAAGT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| 42,218 |
KX276640.1 | Cacao mild mosaic virus | Chingandu,N., Zia-Ur-Rehman,M., Sreenivasan,T.N., Surujdeo-Maharaj,S., Umaharan,P., Gutierrez,O.A., Brown,J.K., Guttierez,O. | University of Arizona, The School of Plant Sciences | USA | 2017-02-04 | SCA6 | Badnavirus tessellotheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,533 | GenBank | 1 | Trinidad and Tobago | Trinidad and Tobago | Theobroma cacao | plant leaf | 2015-07-13 | null | null | Cacao mild mosaic virus isolate SCA6, complete genome | 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| 78,313 |
MH785297.1 | Cacao red vein-banding virus | Chingandu,N., Dongo,L., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, The School of Plant Sciences | USA | 2019-04-20 | NIG1 | Cacao red vein-banding virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 6,839 | GenBank | 1 | Nigeria | Nigeria | Theobroma cacao | plant leaf | 2017-03-18 | null | null | Cacao red vein-banding virus isolate NIG1, complete genome | 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| 63,184 |
MH785298.1 | Cacao red vein-banding virus | Chingandu,N., Dongo,L., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, The School of Plant Sciences | USA | 2019-04-20 | NIG7 | Cacao red vein-banding virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 6,868 | GenBank | 1 | Nigeria | Nigeria | Theobroma cacao | plant leaf | 2017-03-18 | null | null | Cacao red vein-banding virus isolate NIG7, complete genome | 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| 63,186 |
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| 63,188 |
MH785302.1 | Cacao red vein-banding virus | Chingandu,N., Dongo,L., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, The School of Plant Sciences | USA | 2019-04-20 | NIG13 | Cacao red vein-banding virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 6,880 | GenBank | 1 | Nigeria | Nigeria | Theobroma cacao | plant leaf | 2017-03-18 | null | null | Cacao red vein-banding virus isolate NIG13, complete genome | 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| 63,190 |
MH029281.1 | Cacao red vein-banding virus | Dongo,L., Chingandu,N., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, The School of Plant Sciences | USA | 2019-01-16 | NIG5 | Cacao red vein-banding virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 6,869 | GenBank | null | Nigeria | Nigeria | Theobroma cacao | null | 2017-02-01 | null | null | Cacao red vein-banding virus isolate NIG5, complete genome | 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| 65,715 |
NC_038378.1 | Cacao swollen shoot CD virus | Kouakou,K., Kebe,B.I., Kouassi,N., Ake,S., Cilas,C., Muller,E. | National Center for Biotechnology Information, NIH | USA | 2018-08-24 | CI152-09 | Badnavirus alphainflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,203 | RefSeq | null | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | null | 2009-01 | null | PRJNA485481 | Cacao swollen shoot CD virus isolate CI152-09, complete genome | 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| 51,740 |
MN433936.1 | Cacao swollen shoot CD virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Kipi7a | Badnavirus alphainflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,212 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot CD virus isolate Kipi7a, complete genome | 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| 51,741 |
MN433937.1 | Cacao swollen shoot CD virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Kipi10a | Badnavirus alphainflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,173 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot CD virus isolate Kipi10a, complete genome | TGGTATCAGAGCTTGGTTAGAATCATGGTCATGTCCGGCTAAAACCTAAGGTTAGGGAAGGGGAAAGAGTGAGGCTACTGTTAGAGTTTAAACACCAGTCCCAAAATACTGTTCCGACATCCACTAGAAGTAAACCAAACCGTTGAAAGTTTGTTGTCTTAAAAGAAAAAGGCGTAACCCTAAAGAGTACCTAGAGAGAGGGAAGAGAGGGGAGAAGATGATCTTTTGAAGGCAAAAATCAAGACTATTCCTATTATGCTCTACAGTTGCAGCGAAAGCTGATCTTCTGTATCAGAACGGGAGAAAACTTGGTTGATGTCTAGTCGATGGGAGAATAGTATCCAAGAGTGGTATGAGAAGTCTCACACAGCCAATCTCGAGTACCTAGACCTAGCCTCTGTTAGTAAAGTGACCAACAACCAGATAGCTCATAACCTTGCAGTAACTTTTGATAGATTGAACTTAGGAAACCGTGTTTTCATCAAAAACCTAAAACAAATTCAAGAGTCTTTAGCTGAAACAAACACTAGGATTGACACCCTAGAAGTAGGCCTAAGAAGGCTAACCAAACAACTCAAAGAAAACAAACCTTTAACCGAGCAAGAAGTCCGTCGGTTAGTAGGAGAAATTGCACAGCAACCCAAGATCGTTGAGGAACAGGCCCTCAAGATCTCTCAAGAGCTTGAACAGAAGCTTGCAGAAGTTGAAAAACTTCTCCACAATCTTGGCCTTGTAATTGGTCAATGACTGATAGCCCCAGCTATCAACAAGCTCTCAAAGAAGCTGAGAAAGTTGATCCTCCAGCAGTCGGGTTAACAACTACTGAAGGAGTAACCGCACTCAACGGGTTGAGGACGGTGATAAAGCAGAACAACTTGCAGATCTGGCTACTGGCCGATATAGCAGACAAGTTAGCTGATCTTCTGACTGAGCAGAAGAAATCAAGGAAGGAAAAGGCGAAGGAAGTAGCCATCCCAGAAGACCTAATATCCAAACTCCAAGGATTATCCATCCAGGAGAGAGGAGACGAAAAGGTCACAAGAAAGAAGGAGACTAAAGGAAACCTCTACGGTTTCAAAGATCCTTACAAGATCCTAGCCGCAGAAGTAGCAAAGATCACTCCAAAGCCTCCTGCAAAAGAGAAAAAGGATGAGTCAAACCAGAGCTCATCAGATGCCTAGCGTCACCACCACGGTGAATGAACAGGGAGAAGGTCCTCTCTTTGAGGATCAAGTCAGAGATTACAGGAGAAGCCAAAGGCGTCTATTCAACTTGAGGAGAAAAGCCAGAAGAGCACAAAGTGCTTTAACAGGGTCCAGATCTAGACACCAAGAGACCCTTGAACAAGAAATAGACCCTCAGACTACTCTGAGACTGTCCATGCAAGAAAGGGCAAGACTAGTACCAGCTGAGGTACTGTACAGATCAAGGAGAGACACAGTGCACCACCGTGTCTATACGCATAGATCGGAAGAATCTATCCTATGCGTCGGAGGAAATCAAGTCGACAGAACGTTTATACAACCATCCAGTCTAGAAAGACTACAAAGGACGGGGATGTCCTTTATACATATTGGTATTCTGCAAGTCAGAATCCAGATCCTGCATCGACAAGAAGAAGGAACGATGGCCTTAGTGGTATTCCGTGACAATAGATGGGCCGGAGATCAAGCCATCTTTGCACAAATGGAAGTTGACCTAACCAAAGGTAGCCAATTGGTGTTCGTGGTACCTGATACCATGATGACTATTGGAGATTTTGCTAGAAACGTACAACTATCTATCCTAACAAGGGGATACGATAACTGGCAAAATGGAGAGGCCAATCTACTAGTAACCAGGAGCATGACAGGTAGACTGTCAAACACACCAAACGTAGCCTTTGCGTACCAAATAGCAAGCGCTACAGACTACTTGGCCAGTCATGGTGTTAAAGCAATAGCAGGAAAGAAGGTAAATCTGCAGCAACTAAGAAACCAACAATGGGTTCTACGACCCCCACAGGCAGATGTACTACCGATGCAGCCAAGATCAGTAGAAACAAGAAACCTGATAGATGGAAGTATATCCATCAGATTCCATGATTATGAGGTAGCTCCTTCAACATCAGGACCTCATTACAACGAAAATGATGAAGAAGTGGAATCAGAATCAGAGGCAGAAATCAGGGAGCATACAGTCGCAGTCTGGATAATTGGGGAAGAAGAATATCCAGATGAGTATGGAAGAACTAAAATCTGGGAAGAATCAAGCAATGGCAATGGACGATTCTTCAGATATTACACACCTCCACCAGTATCCAACGAACCCATTATCGCCACAGGATGGGATGATGATGAGGAAGATGATTGTGACTCAAGGTGGGATACTAGTCCAGAAAGTGAGGGTGAAGAACCAGACGAGCCTTTATGGGATGAAGAGGATGATGAAGAAGAAGAAGTACAGGATGAACCTGTATGGCACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTATGACCCTAATGCATACATGGCATACTTGCAGAAAGAAGCAGATGACTGGACAGAAATTATTGCCAGTCTTAACCCAGAAATGGAGTACCCACAAAGAAGGGCAGCAGTAGCGGAGACTGTTTTCTCAGAAACAGTAGATTACACCCCACCAGGAGATACGTTGATGACACCAGTAGGATACCCTCCTGCTTCATCATCAAGATCAACGGTCACAACTCCTAGTAGGCCCCCGCTATACGAAGGAAGGATACCAAGTGCATCAAGGGTCCTTAGAAGAGATGACTACACAGAATGGTGGCAATTACCATCATCACAAGGGACCACAGGAGCACTGTTTGTGATGCCAAAACAGATTGGGCTATTTCATGATGTTTTCTCAAGATGGGAGTCCATTACAAAGAACTATGTTTCGGCCCAAGGCATTACTGACCCAACAGAAAAGATGGAGTTTATTGAAAATCTGTTGGGAGAAACAGAAAAACTTACCTGGATCCAATGGAGAATGAAGTATGAAGCTGAATATCAACAGCTGCTGACTCTAGCAGAAGGGAGGCAAGGAACTCAAAATATCCTGTCTCAAATAAAAAGAGTCTTCTCACTTGAAGACCCAGCTTCAGGATCCACTAGAATCCAAGACTCTGCTTACAGAGATTTGGAGAGATTGACATGCCACAATATAAAAGACATAGTCCAGTTTCTGAATGACTATGGAAGATTGGCAGCTAAGAGTGGAAGACTGTTCATTGGAACAGAGCTTAGTGAAAAACTCTGGATGAAGATGCCACCGGAGTTAGGCCACAGAATGAGAGAAGCTTTCCAGAGGGAGTATGAAGGCAATGAAGTAGGAGTATTCCCACGAATACTATTCGCCTATCGTTACCTTGAGCAAGAATGCAAGGATGCTGCTTTCAAAAGAAGTTTGAAGTCCCTGAGTTTTTGCAAAGATATGCCTATAACAGGCTATTATGACAAAAGCTCCAGATATGGAATGCGAAGATCCAAGACGTACAAAGGGAAGCCTCATGCATCTCATGCGAGGATTGAGAAGAGGAAACACCTGGTAAGAAACAAGAGGTGCAAATGTTATCTCTGTGGAGATGAAGGCCACTTCGCAAGGGAATGTCCCAATAACAAAAGGGATGTTAAAAGAGTGGCAATATTTGAAGGCATTAACCTCCCAGATAACTATGAGATAGTTTCAGTGGAAGAGGGAGAGGAAGACTCAGACGCTATCTATAGCTTGTCTGAAAATGAAGAAGAACTTCAGGATGAAGTACTTCATGAGAAAGTCTTCATGATGCGAGAAGGAGACCGATCCTATTGGTTGGGAAAAGCAAATCACTGGACAGCTATGGTCAAAGTTAGTTATCAACAGTATCACTGTCCACATCAGTGGGAGCACAACAAAGAAATTCCAATAATGGCCCTTATCAACTGCCATTTTTGTAAGCAGCCCACAAATCTTAGAGGAAGAGTGCACTGCCCAACATGTCAGCTCACCAGCTGCTATATGTGTGCACCAATCTACTGTGATGTCCAAGTCCAACAACAACCAAAGGCCCCTGTACCATTTAGCCCAAATGCATTGCTACAACAGCAGGCCGCATATATCCGCTGGCTCGAATCTGAAAATAAAAGGCTTAATGAGCTCGTGGAGTTCTACAAAAGGCTCTTGGACGGAGGATCCAAACTCCAACAGGAGTTGGAAGCTGACAGAAAGGAATTGGAAGCTTTGGAAGCTGACAGAAAGGAATTGGAAGCCCATGACAAAGGAAAAAGGGTCCAATTCACGGAAGAAGAAAAGGTCCAGCTCACTGAAGAGTTAGAAGAGACCTATATGGCCTATCTTGAAGAGGACACAACCACACGTGTCGTGGGTCATACAACAGAAGGACCTTCAGAAGTTAAGAAAGTGGTAAAGAAAAGCAACATGCTATATAACCTCGAGGTTATCCTGATCATACCTGAGGTAGGAAAACCACTAAAAGTCAAAGCGATATTGGATACAGGAGCAACTACATGCTGTATCAATATCAATTCTGTTCCGAAGGAGGCTATCGAACAGAATACATTCCTGGTGCAGTTCAGGGGAATCAACTCCACACAATCCGTTGATAAGAAGCTCCGTTACGGACGTATGACTATTAGCGGACATCAATTCAGAATTCCCTATTGCTATGCATTCCCATTATCTCTCGGCGACGGTATCGAAATGATACTTGGTTGCAATTTCATCAGAGGAATGTACGGTGGACTTAGGATCGAAGGCTCTACAATTACATTCTACAAGAATGTCACTACAATCCACACTAAGTTAGCCGCTGGAATGGTTGGTGGAACAACCTCTTTTTGTCCGGAGGAAGGAGGAAGCAGTAGTTGTCACAAATTTGAATTCGAAGAATCAGAAGTATTGGATGATGATGCAGAAATAGACTTCGAATCCCACCAACAGATCATAAGCCATGCAGTAACACAAGTTACAGCACCAAG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| 51,742 |
MF642718.1 | Cacao swollen shoot CD virus | Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A. | CIRAD, UMR BGPI | France | 2017-12-09 | CIDivo-15 | Badnavirus alphainflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,205 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2015 | null | null | Cacao swollen shoot CD virus isolate CIDivo-15, complete genome | 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JN606110.1 | Cacao swollen shoot CD virus | Kouakou,K., Kebe,B.I., Kouassi,N., Ake,S., Cilas,C., Muller,E. | CIRAD, UMR BGPI | France | 2012-06-30 | CI152-09 | Badnavirus alphainflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,203 | GenBank | null | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | null | 2009-01 | null | null | Cacao swollen shoot CD virus isolate CI152-09, complete genome | 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| 96,862 |
NC_043535.1 | Cacao swollen shoot Ghana Q virus | Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A. | National Center for Biotechnology Information, NIH | USA | 2019-06-28 | Gha40-15 | Badnavirus epsiloninflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,102 | RefSeq | 1 | Ghana | Ghana | Theobroma cacao | plant leaf | 2015 | null | PRJNA485481 | Cacao swollen shoot Ghana Q virus isolate Gha40-15, complete genome | 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| 73,317 |
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| 73,318 |
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| 73,319 |
MF642729.1 | Cacao swollen shoot Ghana Q virus | Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A. | CIRAD, UMR BGPI | France | 2017-12-09 | Gha64-99 | Badnavirus epsiloninflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,186 | GenBank | 1 | Ghana | Ghana | Theobroma cacao | plant leaf | 1999 | null | null | Cacao swollen shoot Ghana Q virus isolate Gha64-99, complete genome | 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| 73,320 |
MF642734.1 | Cacao swollen shoot Ghana Q virus | Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A. | CIRAD, UMR BGPI | France | 2017-12-09 | Gha53-15 | Badnavirus epsiloninflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 6,985 | GenBank | 1 | Ghana | Ghana | Theobroma cacao | plant leaf | 2015 | null | null | Cacao swollen shoot Ghana Q virus isolate Gha53-15, complete genome | 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| 73,325 |
NC_040693.1 | Cacao swollen shoot Ghana R virus | Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A. | National Center for Biotechnology Information, NIH | USA | 2019-02-12 | Gha53-15 | Cacao swollen shoot Ghana R virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 6,985 | RefSeq | 1 | Ghana | Ghana | Theobroma cacao | plant leaf | 2015 | null | PRJNA485481 | Cacao swollen shoot Ghana R virus isolate Gha53-15, complete genome | 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| 73,321 |
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| 73,322 |
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| 73,323 |
MF642733.1 | Cacao swollen shoot Ghana R virus | Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A. | CIRAD, UMR BGPI | France | 2017-12-09 | Gha39-15 | Cacao swollen shoot Ghana R virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,097 | GenBank | 1 | Ghana | Ghana | Theobroma cacao | plant leaf | 2015 | null | null | Cacao swollen shoot Ghana R virus isolate Gha39-15, complete genome | 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| 73,326 |
NC_076048.1 | Cacao swollen shoot Togo A virus | Muller,E., Sackey,S. | National Center for Biotechnology Information, NIH | USA | 2023-05-04 | Wobe12 | Badnavirus zetainflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,297 | RefSeq | 1 | Togo:Litime | Togo | Theobroma cacao | plant leaf | null | null | PRJNA485481 | Cacao swollen shoot Togo A virus complete genome | 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NC_038379.1 | Cacao swollen shoot Togo A virus | Duan,X., Di,D., Yu,Q., Zhang,A., Miao,H., Yang,Z. | National Center for Biotechnology Information, NIH | USA | 2018-08-24 | Hebei | Badnavirus zetainflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 13,221 | RefSeq | null | China | China | Triticum aestivum | null | 2009-04 | null | PRJNA485481 | Cacao swollen shoot Togo A virus isolate Hebei, complete genome | 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MF642716.1 | Cacao swollen shoot Togo A virus | Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A. | CIRAD, UMR BGPI | France | 2017-12-09 | Gha25-15 | Badnavirus zetainflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,229 | GenBank | 1 | Ghana | Ghana | Theobroma cacao | plant leaf | 2015 | null | null | Cacao swollen shoot Togo A virus isolate Gha25-15, complete genome | 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GU985153.1 | Cacao swollen shoot Togo A virus | Duan,X., Di,D., Yu,Q., Zhang,A., Miao,H., Yang,Z. | Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciences, Plant Protection Institute | China | 2010-04-12 | Hebei | Badnavirus zetainflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 13,221 | GenBank | null | China | China | Triticum aestivum | null | 2009-04 | null | null | Cacao swollen shoot Togo A virus isolate Hebei, complete genome | 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| 101,115 |
AJ781003.1 | Cacao swollen shoot Togo A virus | Muller,E., Sackey,S. | Muller E., UMR BGPI, Cirad, TA 41/K, Campus International de Baillarguet, 34398 Montpellier cedex 5 | France | 2004-11-25 | Wobe12 | Badnavirus zetainflatheobromae | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,297 | GenBank | 1 | Togo:Litime | Togo | Theobroma cacao | plant leaf | null | null | null | Cacao swollen shoot Togo A virus complete genome | 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| 8,954 |
MN433933.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Ghana6 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,314 | GenBank | 1 | Ghana | Ghana | Theobroma cacao | plant leaf | 2013-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Ghana6, complete genome | 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MN433934.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Ghana1b | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 6,978 | GenBank | 1 | Ghana | Ghana | Theobroma cacao | plant leaf | 2013-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Ghana1b, complete genome | 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| 51,739 |
MN433938.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Buyo15 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,090 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Buyo15, complete genome | 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| 51,743 |
MN433939.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Buyo17 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,066 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Buyo17, complete genome | 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| 51,744 |
MN433940.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Buyo7 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,055 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Buyo7, complete genome | 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| 51,745 |
MN433941.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Buyo4 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,045 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Buyo4, complete genome | 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| 51,746 |
MN433942.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Buyo5 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,045 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Buyo5, complete genome | 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| 51,747 |
MN433943.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Kipi7b | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,080 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Kipi7b, complete genome | 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| 51,748 |
MN433944.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Kipi10b | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,055 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Kipi10b, complete genome | 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| 51,749 |
MN433945.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Kipi26 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,064 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Kipi26, complete genome | 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| 51,750 |
MN433946.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Krag15 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,063 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Krag15, complete genome | 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| 51,752 |
MN433948.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Krag1 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,027 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Krag1, complete genome | 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| 51,753 |
MN433949.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Krag5 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,027 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Krag5, complete genome | 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| 51,754 |
MN433950.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Pbou21 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,031 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Pbou21, complete genome | 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MN433951.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Pbou3 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,024 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Pbou3, complete genome | 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| 51,756 |
MN433952.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Pbou12 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,018 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Pbou12, complete genome | 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| 51,757 |
MN433953.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Krag8 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,023 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Krag8, complete genome | 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| 51,758 |
MN433954.1 | Cacao swollen shoot virus | Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K. | University of Arizona, School of Plant Sciences | USA | 2020-04-26 | Krag9 | Cacao swollen shoot virus | Badnavirus | Caulimoviridae | dsDNA-RT | 7,041 | GenBank | 1 | Cote d'Ivoire | Cote d'Ivoire | Theobroma cacao | plant leaf | 2016-02 | null | null | Cacao swollen shoot virus isolate Krag9, complete genome | 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| 3,470 |
OK523474.1 | Cache Valley virus | Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O., Pickering,B., Rahim,N.M., Tomczyk,M., Bryan,B., Duizer,G., Copeland,S. | Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit | Canada | 2022-11-02 | SK/Canada/WIN-AH-2021-OTH-0002 | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,835 | GenBank | null | Canada: Saskatoon, SK | Canada | Ovis aries | placenta | 2020-12-31 | null | null | Cache Valley virus isolate SK/Canada/WIN-AH-2021-OTH-0002 segment L, complete sequence | 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| 22,406 |
OL555724.1 | Cache Valley virus | Al-Heeti,O., Wu,E.L., Ison,M.G., Saluja,R.K., Ramsey,G., Matkovic,E., Ha,K., Hall,S., Banach,B., Wilson,M.R., Miller,S., Chiu,C.Y., McCabe,M., Bari,C., Zimler,R.A., Babiker,H., Freeman,D., Popovitch,J., Annambhotla,P., Lehman,J.A., Fitzpatrick,K., Velez,J.O., Davis,E.H., Hughes,H.R., Panella,A., Brault,A., Erin Staples,J., Gould,C.V., Tanna,S., Brault,A.C., Gould,Cv., Staples,E. | Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-borne Diseases | USA | 2022-08-08 | R132738d | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,871 | GenBank | 1 | USA: Illinois | USA | Homo sapiens | cerebrospinal fluid | 2021 | null | null | Cache Valley virus isolate R132738d segment L, complete sequence | 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| 27,291 |
MZ612422.1 | Cache Valley virus | Lopez,K., Wilson,S.N., Coutermash-Ott,S., Tanelus,M., Stone,W.B., Porier,D.L., Auguste,D.I., Muller,J.A., Allicock,O.M., Paulson,S.L., Erasmus,J.H., Auguste,A.J. | Virginia Polytechnic Institute and State University, Entomology | USA | 2021-08-16 | W08491 | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,866 | GenBank | 1 | USA | USA | Culex tarsalis | null | null | null | null | Cache Valley virus isolate W08491 segment L, complete sequence | AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACTAAACCAAAAACAATATGGAGGACCAAATGTATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAATCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATTTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTTTGTGCTTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTTCTCTTAGATGAGATCATCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTTAATATACCAAATGTTACACCTGATAATTACATCTGGGACGATGATTTCCTAATTATAATGGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGATAGTACAGAAATAACATACAAAAAATATACAACCCTGATACTACCAGTTATGGAGCAGATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAATCCTGTGACATATCAAATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCCATACAGCTAGATTTTTCAAAGTTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAGTTTGCAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGACTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGATGATACTCCAGAATTGTATGACCACCCAATTTATAAAGAATTCATAGGATCCATGCCCCCTAGATTTGTGAACTTATTCGATGAAGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTATACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAATGGTGAATATATGAAACCTACGCAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTAATGAGCCGAAGAATTTCTGAAGAAAGGGATATCATAACAGATATAAATAAACAGAAGCCGTCCATACATTTTATATGGGCAAAAAATGCTAATAGGAAACTAAGTGGTGCAACTGCAAAGCTCATATTTTTGTCAAACTCTTTACAGTCTATCATTGAGCCTTCAACTTGGACAGATTCATTAAAAGCAATTGGCAAGAGTATGGATATAGATGGCAACGTTGGAGCATATGAGAATCTCTGCATGGAAAGGAAGTTGATAGCCAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTCTTCAAAGGACAGGAAAGACAAAAATTCTTTAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAAGACAAAACTACAACCGATCTAGAACTAGATAAGCCAAAGATATTAGACTTCAACAATACCATTGTCCTGATGGCAGCAAGGTCAATGATAAACAAAAACAAAACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGGGTATTCTCAGACCAAATAAAGGAGGCTTCAGAAGATACATTTAACACATTAAAAAAGATTAATAAAACATGTTTTTGGCAATGCATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGAAATATTCTTTCAGTATCACAATATAACAGGCATAATACTTTCAGAGTAGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTCGTGTTCCCTTCTTCAGACATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAGTCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACTTTAGAATTAAAAACAAAAAACTTTATATCTATTAGCAAGGCTATTAGGCTAGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTGTCATCCCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTATTGTATAATAATAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTAAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAAAGTATGTTATCTTTAACTGAACCATCTAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATTTCCAGTCATGTAAAAGATTATATATCTGAAAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGCGTCTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTGAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACACAGAAAGGTGTAAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTCCCCGGTAGAGTAAACCTCAAAGAATATATCAATCAGATTTACTTACCTTTTTATTTTAACGCAAAAGGCCTTCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGATCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACTCAGAGGATGGATGACTTGGGCATATGGTCTAAGCATGGAAAGAAACAACATGTTAATCTACCAATATTGATTCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCTAGACATAATCATTTGAGAAACAGAGTGGAAAGCCGCAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTCAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCCACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTACCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTAGATGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCGAATTATAGAGATTACATTTCTGTTAAAGTATTTGATAGATTATATGAGTTATTCAAATTAAAAGAATTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCATAAGGACTTTTCATTTACATTTTTTAATAAAGGACAAAAGACAGCAAAGGACAGAGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGTATGTATGTTATAGAGAGAATCTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTGGAGAAAAAAGCAGAGGAAGAGATAAGATACATCGTGGAGAAGACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCTACAAAAGCATTGAAACTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGATGTTTTCTATAAGTATTTTTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCGAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTACCAGATGATTTGCTATCCAACATATTAGATCAAAAAACTCCATACAACAATGATTTAATTCTAAACTCAACTAATGGTTTAAATGCCAACTTTGTAAACATAAAAAGGAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTACATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAGACTATGAAGTTGCTAGACGGAGATTGTCTGGTAAATTCTATGGTTCATTCGGACGACAATCAGACATCCCTTGCCATCATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTTTGTCTCACTTTTGGATGCCAGGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGCAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGATGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGCTGCAGCCATTGGATAACTCATTTAACATATAACATGCTAGATGAGCAAGTGAATTGCCCAACAAATCATTTACCATTTACAAATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTATATCAATGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAGTGGCTAGCTCAATTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTAAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGAAGTAGGTCCTTGTTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAATTCTATGTCTAATGATGATTATAAAGAAACATTGAGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGTGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAAAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCCCATAAACCAATCATTGACTATAGCAGTATCTTTGATAAGTTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCGGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGGGACATCAATCATCTACCCTTAGATCTGGAAGACATAAGTATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCGGAATTCAGAAATATGAAATTAATACATCATTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGATCTACCCGGTGCTGAGCCAACAGAGCTTGAGAAAGACTTACACCACTTGAATGAGTTTTTAGAAAGCACTGGTATCAAAGAAAAAATAGGGCAAAATATGGATAACCCACCCAAGCATTTAAC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| 39,478 |
MZ612423.1 | Cache Valley virus | Lopez,K., Wilson,S.N., Coutermash-Ott,S., Tanelus,M., Stone,W.B., Porier,D.L., Auguste,D.I., Muller,J.A., Allicock,O.M., Paulson,S.L., Erasmus,J.H., Auguste,A.J. | Virginia Polytechnic Institute and State University, Entomology | USA | 2021-08-16 | 4B | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,866 | GenBank | 1 | USA | USA | Aedes japonicus | null | null | null | null | Cache Valley virus isolate 4B segment L, complete sequence | AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACTAAACCAAAAACAATATGGAGGACCAAATGTATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAATCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATTTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTTTGTGCTTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTCCTCTTGGATGAGATCGTCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTCAATATACCAAATGTCACACCTGATAATTACATTTGGGATGATGATTTCCTAATTATAATAGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGACAGCACCGAAATAACATACAAAAAGTATACAACTCTGATTTTACCAGTCATGGAACAAATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAACCCTGTGACATATCAGATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCCATACAACTAGATTTTTCAAAGTTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAATTTGCAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGACTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGGTGATACTCCAGAGTTGTATGATCATCCAATTTATAAAGAATTTATAGGATCCATGCCCCCTAGATTTGTAAACTTATTCAATGAGGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTATACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAACGGCGAATATATGAAACCTACACAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTGATGAGTCAAAGAATCTCTGAAGAAAGGGATATCACAACAGATATAAATAAGCAGAAGCCATCCATACATTTTATATGGGCAAAAAATGCTAACAGGAAACTAAGTAGTGCAACTGCAAAGCTTATATTTTTGTCAAACTCTTTACAATCTATCATTGAGCCTTCAACTTGGACAGATTCATTAAGAGCAATTGGCAAAAGTATGGATATAGATGGCAATGTTGGAGCTTATGAGAACCTCTGTATGGAAAGGAAGTTGATAGCCAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTCTTCAAAGGACAGGAAAGACAAAAATTCTTTAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAAGATAAAACTACAACTGACCTAGAACTAGATAAGCCAAAGATATTAGACTTCAACAATACTATTGTTCTGATGGCAGCGAGATCAATGATAAACAAAAATAAGACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGGGTATTCTCAGACCAAATAAAGGAGGCTTCAGAAGATACATTTAACACATTAAAAAAGATAAACAAAACATGTTTTTGGCAATGTATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGGAATATTCTCTCAGTATCACAATACAACAGGCATAACACTTTCAGAGTGGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTCGTGTTCCCTTCTTCAGACATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAGTCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACCTTAGAATTAAAGACAAAAAACTTTATATCTATTAGCAAGGCTATTAGACTGGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTGTCATCTCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTACTGTATAATAACAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTGAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAGAGTATGTTATCTCTAACTGAACCATCTAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATCTCTAGTCATGTAAAGGATTATATATCTGAAAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGCGTCTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTGAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACACAGAAAGGTGTAAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTTCCTGGTAGAGTAAACCTTAAAGAATATATCAATCAAATCTACTTGCCTTTTTACTTTAATGCAAAGGGCCTTCATGAAAAGCATCACGTTATGATAGATCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACCCAAAGGATGGATGATTTGGGCATATGGTCTAAGCATGAAAAGAAGCAACATGTTAATTTGCCAATATTGATCCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCTAGACATAATCATTTGAGAAACAGAGTGGAGAGCCGCAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTCAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCCACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTACCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTAGATGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCAAATTATAGAGATTATATCTCTGTTAAAGTATTTGATAGATTATACGAGTTATTTAAATTAAAAGAACTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCACAAGGACTTTTCATTTACATTCTTTAATAAAGGACAAAAGACAGCAAAGGACAGGGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGTATGTATGTTATAGAGAGAATCTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTGGAGAAAAAAGCAGAAGAAGAGATAAGATACATTGTAGAGAAGACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCCACAAAAGCATTGAAATTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGATGTTTTCTATAAGTATTTTTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCGAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTGCCAGATGATTTGCTATCTAACATATTAGATCAAAAAACTCCATATAACAATGATTTAATCCTAAATTCAACTAATGGTTTAAATGCCAACTTTGTAAACATAAAAAGGAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTACATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAAACTATGAAGCTGCTAGATGGAGATTGTCTGGTGAATTCAATGGTTCATTCAGATGACAATCAAACATCTCTTGCCATTATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTCTGTCTCACTTTTGGATGCCAAGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGCAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGATGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGCTGCAGCCATTGGATAACTCATTTAACATACAACATGCTAGATGAACAAGTAAATTGCCCGACAAATCATTTACCATTTACAGATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTACATCAATGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAGTGGCTAGCTCAATTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTAAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGGAGTAGATCCTTGTTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAATTCTATGTCTAATGATGACTATAAAGAAACATTGGGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGTGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAAAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCGCATAAACCAATCATTGACTATAGCAGTATCTTTGATAAATTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCGGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGAGACATCAATCATTTACCCTTAGATCTGGAGGACATAAGCATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCGGAATTCAGGAATATGAAATTGATACATCACTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGACTTACCTGGTGCTGAGCCCACAGAGCTTGAAAAAGACTTGCATCACTTAAATGAGTTTTTAGAAAACACTGGTATCAAGGAAAAAATAGAGCAAAACATGGACAACCCACCCAAGCACTTAAC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| 39,479 |
MK861967.1 | Cache Valley virus | Hughes,H.R., Yates,K., Naqvi,S.H., Lambert,A.J., Velez,J., Kosoy,O., Turabelidze,G., Staples,J.E. | Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-Borne Diseases | USA | 2020-01-27 | R103016b | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | null | USA: Missouri | USA | Homo sapiens | blood | 2015-09 | null | null | Cache Valley virus isolate R103016b segment L, complete sequence | 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| 54,421 |
MH166879.1 | Cache Valley virus | Dunlop,J.I., Szemiel,A.M., Navarro,A., Wilkie,G.S., Tong,L., Modha,S., Mair,D., Vattipally,S.B., Da Silva Filipe,A., Li,P., Vanlandingham,D.L., Higgs,S., Elliott,R.M., Kohl,A. | University of Glasgow, MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research | United Kingdom | 2018-09-11 | null | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | null | United Kingdom | United Kingdom | null | null | 2018-03-09 | null | null | Cache Valley virus strain 6V633 segment L, complete sequence | 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| 68,688 |
KX100135.1 | Cache Valley virus | Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H. | Friedrich-Loeffler-Institut | Germany | 2017-07-27 | null | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | 1 | USA | USA | Culiseta inornata | null | 1956 | null | null | Cache Valley virus strain 6V633 segment L, complete sequence | 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| 75,556 |
KX100138.1 | Cache Valley virus | Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H. | Friedrich-Loeffler-Institut | Germany | 2017-07-27 | null | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | 1 | USA | USA | Ochlerotatus communis | null | 1967 | null | null | Cache Valley virus strain W728-67 segment L, complete sequence | AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACTAAACCAAGAACAATATGGAGGACCAAATGTATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAATCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATCTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTCTGTACTTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTTCTCTTAGATGAGATCATCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTCAATATACCAAATGTTACACCTGATAATTACATCTGGGATGATGATTTCCTAATTATAATGGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGATAGTACAGAAATAACATACAAAAAATATACAACCCTGATTCTACCAGTTATGGAGCAAATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAACCCTGTGACATATCAGATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCCATACAGCTAGATTTTTCAAAATTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAGTTTGCAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGATTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGATGATACTCCAGAATTGTATGACCACCCAATTTATAAAGAATTCATAGGATCCATGCCTCCTAGATTTGTGAACTTATTCGATGAAGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTATACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAATGGTGAATATATGAAACCCACGCAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTAATGAGCCGAAGAATTTCTGAAGAAAGGGATATCATAACAGATATAAATAAACAGAAGCCGTCCATACACTTTATATGGGCAAAAAATGCTAATAGGAAACTAAGTAGTGCAACTGCAAAGCTCATATTTTTGTCAAACTCTTTACAGTCTATCATTGAGGCTTCAACTTGGACAGATTCATTAAAAGCAATTGGCAAAAGTATGGATATAGATGGCAACGTTGGAGCATATGAGAATCTCTGCATGGAAAGGAAGTTGATAGCCAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTCTTCAAAGGACAGGAAAGACAAAAATTCCTTAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAAGACAAAACTACAACTGATCTAGAACTAGATAAGCCAAAAATATTAGACTTCAACAATACCATTGTCCTGATGGCAGCAAGGTCAATGATCAACAAAAACAAAACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGGGTATTCTCAGACCAAATAAAGGAGGCTTCAGAAGATACATTCAACACATTAAAAAAGATTAATAAAACATGTTTTTGGCAATGCATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGAAATATTCTTTCAGTATCACAATATAACAGGCATAATACTTTCAGAGTAGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTTGTGTTCCCTTCTTCAGACATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAATCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACTTTAGAATTAAAAACAAAAAACTTTATATCTATTAGCAAGGCTATTAGGCTAGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTGTCATCCCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTATTGTATAATAATAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTAAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAAAGTATGTTATCTTTAACTGAACCATCCAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATCTCCAGTCATGTAAAAGATTATATATCTGAAAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGTGTCTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTGAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACACAGAAAGGTGTAAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTCCCCGGTAGAGTAAACCTCAAAGAATATATCAATCAGATTTACTTACCTTTTTATTTTAACGCAAAAGGCCTTCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGACCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACTCAGAGGATGGATGACTTGGGCATATGGTCTAAGCATGGAAAGAAACAACATGTTAATCTACCAATATTGATTCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCTAGACATAATCATTTGAGAAACAGAGTGGAGAGCCGCAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTCAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCCACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTACCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTGGATGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCGAATTATAGAGATTACATTTCTGTTAAAGTATTTGATAGATTATATGAGTTATTCAAATTAAAAGAATTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCACAAGGACTTTTCATTTACATTCTTTAATAAAGGACAAAAGACAGCAAAGGACAGAGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGTATGTATGTTATAGAGAGAATCTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTAGAGAAAAAAGCAGAGGAAGAGATAAGATACATCGTGGAGAAGACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCTACAAAAGCATTGAAACTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGATGTTTTCTATAAGTATTTTTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCGAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTACCAGATGATTTGCTATCCAACATATTAGATCAAAAAACTCCATACAACAATGATTTAATTCTAAACTCAACTAATGGTTTAAATACCAACTTTGTAAACATAAAAAGGAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTACATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAGACTATGAAGTTGCTGGATGGAGATTGTCTGGTAAATTCTATGGTTCATTCGGACGACAATCAGACATCCCTTGCCATCATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTCTGTCTCACCTTTGGATGCCAGGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGTAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGATGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGCTGCAGCCATTGGATAACTCATTTAACATATAACATGCTAGATGAGCAAGTGAATTGCCCAACAAATCATTTACCTTTTACAAATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTATATCAATGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAGTGGCTAGCTCAATTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTGAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGAAGTAGGTCCTTATTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAACTCTATGTCTAATGACGATTATAAAGAAACATTGAGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGTGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAAAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCCCATAAACCAATCATTGACTATAGCAGTATCTTTGATAAGTTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCGGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGGGACATCAATCATCTACCCTTAGATCTGGAGGACATAAGTATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCGGAATTCAGAAATATGAAATTAATACATCATTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGATCTACCCGGTGCTGAGCCAACAGAGCTTGAGAAAGACTTACACCACTTGAATGAGTTTTTAGAAAGCACTGGTATCAAAGAAAAAATAGGGCAAAATATGGATAACCCACCCAAGCATTTAAC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| 75,557 |
KX100141.1 | Cache Valley virus | Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H. | Friedrich-Loeffler-Institut | Germany | 2017-07-27 | null | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | 1 | USA | USA | Ochlerotatus trivittatus | null | 1967 | null | null | Cache Valley virus strain W308-67 segment L, complete sequence | 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| 75,558 |
KX100144.1 | Cache Valley virus | Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H. | Friedrich-Loeffler-Institut | Germany | 2017-07-27 | null | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | 1 | Mexico | Mexico | Psorophora confinnis | null | 1971 | null | null | Cache Valley virus strain MPB1-1551 segment L, complete sequence | AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACTAAACCAAGAACAATATGGAGGACCAAATGTATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAATCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATCTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTCTGTGCTTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTTCTCTTAGATGAGATCATCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTTAATATACCAAATGTTACACCTGATAATTACATCTGGGATGATGATTTCCTAATTATAATGGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGATAGTACAGAAATAACATACAAAAAATATACAACCCTGATTCTACCAGTTATGGAGCAGATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAATCCTGTGACATATCAGATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCCATACAGCTAGATTTTTCAAAGTTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAGTTTGCAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGATTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGATGATACTCCAGAATTGTATGACCACCCAATTTATAAAGAATTCATAGGATCCATGCCCCCTAGATTTGTGAACTTATTCGATGAAGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTATACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAATGGTGAATATATGAAACCCACGCAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTAATGAGCCGAAGAATTTCTGAAGAAAGGGATATCATAACAGATATAAATAAACAGAAGCCGTCCATACATTTTATATGGGCAAAAAATGCTAATAGGAAACTAAGTAGTGCAACTGCAAAGCTCATATTTTTGTCAAACTCTTTACAGTCTATCATTGAGCCTTCAACTTGGACAGATTCATTAAAAGCAATTGGCAAAAGTATGGATATAGATGGCAACGTTGGAGCATATGAGAATCTCTGCATGGAAAGGAAGTTGATAGCTAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTCTTCAAAGGACAGGAAAGACAAAAATTCCTTAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAAGACAAAACTACAACTGATCTAGAACTAGATAAGCCAAAGATATTAGACTTCAACAATACCATTGTCCTGATGGCAGCAAGGTCAATGATAAACAAAAACAAAACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGGGTATTCTCAGACCAAATAAAGGAGGCTTCAGAAGATACATTCAACACACTGAAAAAGATTAATAAAACATGTTTTTGGCAATGCATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGAAATATTCTTTCAGTATCACAATATAACAGGCATAATACTTTCAGAGTAGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTCGTGTTCCCTTCTTCAGACATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAGTCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACTTTAGAATTAAAAACAAAAAACTTTATATCTATTAGCAAGGCTATTAGGCTAGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTGTCATCCCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTATTGTATAATAATAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTAAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAAAGTATGTTATCTTTAACTGAACCATCTAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATCTCCAGTCATGTAAAAGATTATATATCTGAGAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGTGTTTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTGAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACGCAGAAAGGTGTAAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTCCCCGGTAGAGTAAACCTCAAAGAATATATCAATCAGATTTACTTACCTTTTTATTTTAACGCAAAAGGCCTTCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGACCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACTCAGAGGATGGATGACTTGGGCATATGGTCTAAGCATGGAAAGAAACAACATGTTAATCTACCAATATTGATTCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCTAGACATAATCATTTGAGAAACAGAGTGGAGAGCCGCAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTCAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCCACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTACCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTGGATGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCGAATTATAGAGATTACATTTCTGTTAAAGTATTTGATAGATTATATGAGTTATTCAAATTAAAAGAATTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCACAAGGACTTTTCATTTACATTTTTTAATAAAGGGCAAAAGACAGCAAAGGACAGAGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGCATGTATGTTATAGAGAGAATCTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTAGAGAAAAAAGCAGAGGAAGAGATAAGATACATCGTGGAGAAGACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCTACAAAAGCATTGAAACTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGATGTTTTCTATAAGTATTTTTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCGAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTACCAGATGATTTGCTATCCAACATATTGGATCAAAAAACTCCATACAACAATGATTTAATTCTAAACTCAACTAATGGTTTAAATGCCAACTTTGTAAACATAAAAAGGAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTACATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAGACTATGAAGTTGCTGGACGGAGATTGTCTGGTAAATTCTATGGTTCATTCGGACGACAACCAGACATCCCTTGCCATTATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTCTGTCTCACTTTTGGATGCCAGGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGTAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGATGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGCTGCAGCCATTGGATAACTCATTTAACATATAACATGCTAGATGAGCAAGTGAATTGCCCAACAAATCATTTACCATTTACAAATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTATATCAACGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAGTGGCTAGCTCAATTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTAAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGAAGTAGGTCCTTGTTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAATTCTATGTCTAATGATGATTATAAAGAAACATTGAGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGTGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAAAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCCCATAAACCAATCATTGACTATAGCAGTATCTTTGACAAGTTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCGGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGGGACATCAATCATCTACCCTTAGATCTGGAGGACATAAGTATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCGGAATTCAGAAATATGAAATTGATACATCATTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGATCTACCCGGTGCTGAGCCAACAGAGCTTGAGAAAGACTTACACCACTTGAATGAGTTTTTAGAAAGCACTGGTATCAAAGAAAAAATAGGGCAAAATATGGATAACCCACCCAAGCATTTAAC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| 75,559 |
KX100147.1 | Cache Valley virus | Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H. | Friedrich-Loeffler-Institut | Germany | 2017-07-27 | null | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | 1 | USA | USA | Ovis aries | null | 1980 | null | null | Cache Valley virus strain CK-102 segment L, complete sequence | 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| 75,560 |
KX100150.1 | Cache Valley virus | Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H. | Friedrich-Loeffler-Institut | Germany | 2017-07-27 | null | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | 1 | USA | USA | Equus caballus | null | 1980 | null | null | Cache Valley virus strain MI80-1-450 segment L, complete sequence | AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACTAAACCAAGAACAATATGGAGGACCAAATGTATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAATCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATCTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTCTGTGCTTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTTCTCTTAGATGAGATCATCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTTAATATACCAAATGTTACACCTGATAATTACATCTGGGATGATGATTTCCTAATTATAATGGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGATAGTACAGAAATAACATACAAAAAATATACAACCCTAATACTACCAGTTATGGAGCAGATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAATCCTGTGACATATCAGATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCTATACAGCTAGATTTTTCGAAGTTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAGTTTGAAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGATTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGATGATACTCCAGAATTGTATGACCACCCAATTTATAAAGAATTCATAGGATCCATGCCCCCTAGATTTGTGAACTTATTCGATGAAGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTATACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAATGGTGAATATATGAAACCTACGCAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTAATGAGCCGAAGAATTTCTGAAGAAAGGGATATCATAACAGATATAAATAAACAGAAGCCGTCCATACATTTTATATGGGCAAAAAATGCTAATAGGAAACTAAGTAGTGCAACTGCAAAGCTCATATTTTTGTCAAACTCTTTACAGTCTATCATTGAGCCTTCAACTTGGACAGATTCATTAAAAGCAATTGGCAAAAGTATGGATATAGATGGCAACGTTGGAGCATATGAGAATCTCTGCATGGAAAGGAAGTTGATAGCCAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTCTTCAAAGGACAGGAAAGACAAAAATTCCTTAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAAGACAAAACTACAACCGATCTAGAACTAGATAAGCCAAAGATATTAGACTTCAACAATACCATTGTCCTGATGGCAGCAAGGTCAATGATAAACAAAAACAAAACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGGGTATTCTCAGACCAAATAAAGGAGGCTTCAGAAGATACATTCAACACACTAAAAAAGATTAATAAAACATGTTTTTGGCAATGCATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGAAATATTCTTTCAGTATCACAATATAACAGGCATAATACTTTCAGAGTAGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTCGTGTTCCCTTCTTCAGACATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAGTCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACTTTAGAATTAAAAACAAAAAACTTTATATCTATTAGCAAGGCTATTAGGCTAGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTGTCATCCCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTATTGTATAATAATAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTAAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAAAGTATGTTATCTTTAACTGAACCATCTAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATCTCCAGTCATGTAAAAGATTATATATCTGAAAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGTGTCTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTAAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACACAGAAAGGTGTAAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTCCCCGGTAGAGTAAACCTCAAAGAATATATCAATCAGATTTACTTACCTTTTTATTTTAACGCAAAAGGCCTTCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGACCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACTCAGAGGATGGATGACTTGGGCATATGGTCTAAGCATGGAAAGAAACAACATGTTAATCTACCAATATTGATTCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCTAGACATAATCATTTGAGAAACAGAGTGGAGAGCCGCAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTTAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCCACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTACCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTGGACGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCGAATTATAGAGATTACATTTCTGTTAAAGTATTTGATAGATTATATGAGTTATTCAAATTAAAAGAATTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCACAAGGACTTTTCATTTACATTTTTTAATAAAGGGCAAAAGACAGCAAAGGACAGAGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGTATGTATGTTATAGAGAGAATTTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTAGAGAAAAAAGCAGAGGAAGAGATAAGATACATCGTGGAGAAGACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCTACAAAAGCATTGAAACTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGATGTTTTCTATAAGTATTTCTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCGAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTACCAGATGATTTGCTATCCAACATATTGGATCAAAAAACTCCATACAACAATGATTTAATTCTAAACTCAACTAATGGTTTAAATGCCAACTTTGTAAACATAAAAAGGAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTACATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAAACTATGAAGTTGCTGGACGGAGATTGTCTGGTAAATTCTATGGTTCATTCGGACGACAACCAGACATCCCTTGCCATCATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTCTGTCTCACTTTTGGATGCCAGGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGTAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGATGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGTTGCAGCCATTGGATAACTCATTTAACATATAACATGCTAGATGAGCAAGTGAATTGCCCAACAAATCATTTACCATTTACAAATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTATATCAATGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAATGGCTAGCTCAATTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTAAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGAAGTAGGTCCTTGTTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAATTCTATGTCTAATGATGATTATAAAGAAACATTGAGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGTGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAAAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCCCATAAACCAATCATTGACTATAGCAGTATCTTTGATAAGTTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCAGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGGGACATCAATCATCTACCCTTAGACCTGGAGGACATAAGTATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCGGAATTCAGAAATATGAAATTAATACATCATTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGATCTACCCGGTGCTGAGCCAACAGAGCTTGAGAAAGACTTACACCATTTGAATGAGTTTTTAGAAAGCACTGGTATCAAAGAAAAAATAGGGCAAAATATGGATAACCCACCCAAGCATTTAAC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| 75,561 |
KX100153.1 | Cache Valley virus | Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H. | Friedrich-Loeffler-Institut | Germany | 2017-07-27 | null | Orthobunyavirus cacheense | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | 1 | USA | USA | Homo sapiens | null | 2003 | null | null | Cache Valley virus strain WI-03BS7669 segment L, complete sequence | 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| 75,562 |
NC_002815.2 | Cactus virus X | Liou,M.R., Chen,Y.R., Liou,R.F., Liou,M.-R., Hung,C.-L., Liou,R.-F. | National Center for Biotechnology Information, NIH | USA | 2001-07-02 | null | Cactus virus X | Potexvirus | Alphaflexiviridae | ssRNA(+) | 6,614 | RefSeq | 1 | null | null | Selenicereus undatus | null | null | null | PRJNA485481 | Cactus virus X, complete genome | 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| 8,649 |
BK011045.1 | Cactus virus X | Jiang,P., Shao,J., Nemchinov,L.G. | USDA-ARS Beltsville Agricultural Research Center, Molecular Plant Pathology Laboratory | USA | 2021-02-20 | alfalfa A | Cactus virus X | Potexvirus | Alphaflexiviridae | ssRNA(+) | 6,603 | GenBank | 1 | China | China | Medicago sativa | null | 2018-01-08 | null | null | TPA_asm: Cactus virus X isolate alfalfa A, complete genome | 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| 44,082 |
LC128411.1 | Cactus virus X | Park,C.Y., Kim,J.S., Lee,J.H., Lee,S.H. | College of Agriculture and Life Sciences, Kyungpook National University, Plant virus laboratory; 80 Daehakro, Bukgu, Daegu 702-701 | Korea | 2016-03-30 | null | Cactus virus X | Potexvirus | Alphaflexiviridae | ssRNA(+) | 6,618 | GenBank | null | South Korea:Jeju | South Korea | Selenicereus undatus | null | null | null | null | Cactus virus X genomic RNA, complete genome | 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| 83,157 |
JF937699.1 | Cactus virus X | Lu,Y.-C., Mao,C.-H., Li,Y.-S., Chang,Y.-C. | National Taiwan University, Plant Pathology and Microbiology | Taiwan | 2014-07-01 | NTU | Cactus virus X | Potexvirus | Alphaflexiviridae | ssRNA(+) | 6,627 | GenBank | null | Taiwan | Taiwan | Hylocereus | null | 2005 | null | null | Cactus virus X isolate NTU, complete genome | 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OY979772.1 | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Hackl,T. | Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen | Netherlands | 2023-12-15 | null | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Mavirus | Lavidaviridae | dsDNA | 19,452 | GenBank | null | null | null | null | null | null | SAMEA112966047 | PRJEB61642 | Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite | 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OY515905.1 | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Hackl,T. | Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen | Netherlands | 2023-07-27 | null | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Mavirus | Lavidaviridae | dsDNA | 19,832 | GenBank | null | null | null | null | null | null | SAMEA112966039 | PRJEB61642 | Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite | 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OX559051.1 | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Hackl,T. | Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen | Netherlands | 2023-05-04 | null | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Mavirus | Lavidaviridae | dsDNA | 19,928 | GenBank | null | null | null | null | null | null | SAMEA112966043 | PRJEB61642 | Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite | 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OX559228.1 | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Hackl,T. | Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen | Netherlands | 2023-05-04 | null | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Mavirus | Lavidaviridae | dsDNA | 19,758 | GenBank | null | null | null | null | null | null | SAMEA112966041 | PRJEB61642 | Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite | 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OX559517.1 | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Hackl,T. | Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen | Netherlands | 2023-05-04 | null | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Mavirus | Lavidaviridae | dsDNA | 19,354 | GenBank | null | null | null | null | null | null | SAMEA112966046 | PRJEB61642 | Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite | 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OX559518.1 | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Hackl,T. | Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen | Netherlands | 2023-05-04 | null | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Mavirus | Lavidaviridae | dsDNA | 19,961 | GenBank | null | null | null | null | null | null | SAMEA112966044 | PRJEB61642 | Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite | 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OX560369.1 | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Hackl,T. | Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen | Netherlands | 2023-05-04 | null | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Mavirus | Lavidaviridae | dsDNA | 19,377 | GenBank | null | null | null | null | null | null | SAMEA112966040 | PRJEB61642 | Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite | 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OX560865.1 | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Hackl,T. | Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen | Netherlands | 2023-05-04 | null | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Mavirus | Lavidaviridae | dsDNA | 19,755 | GenBank | null | null | null | null | null | null | SAMEA112966048 | PRJEB61642 | Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite | 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OX560867.1 | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Hackl,T. | Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen | Netherlands | 2023-05-04 | null | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Mavirus | Lavidaviridae | dsDNA | 20,417 | GenBank | null | null | null | null | null | null | SAMEA112966042 | PRJEB61642 | Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite | 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KU052222.1 | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Fischer,M.G., Hackl,T. | Max Planck Institute for Medical Research, Biomolecular Mechanisms | Germany | 2016-12-09 | endo_mavirus | Cafeteriavirus-dependent mavirus | Mavirus | Lavidaviridae | dsDNA | 40,196 | GenBank | 1 | null | null | Cafeteria roenbergensis | null | 2014-01-20 | null | null | Cafeteriavirus-dependent mavirus, complete genome | 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| 79,144 |
KJ542626.1 | Calovo virus | Dufkova,L., Pachler,K., Kilian,P., Chrudimsky,T., Danielova,V., Ruzek,D., Nowotny,N. | Veterinary Research Institute, Virology | Czech Republic | 2014-05-20 | null | Calovo virus | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | 1 | Czech Republic | Czech Republic | null | null | 1963 | null | null | Calovo virus strain 134 segment L, complete sequence | 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| 90,391 |
KJ542629.1 | Calovo virus | Dufkova,L., Pachler,K., Kilian,P., Chrudimsky,T., Danielova,V., Ruzek,D., Nowotny,N. | Veterinary Research Institute, Virology | Czech Republic | 2014-05-20 | null | Calovo virus | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | 1 | Croatia | Croatia | null | null | 1969 | null | null | Calovo virus strain JAn (MS3) segment L, complete sequence | 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| 90,392 |
KJ542632.1 | Calovo virus | Dufkova,L., Pachler,K., Kilian,P., Chrudimsky,T., Danielova,V., Ruzek,D., Nowotny,N. | Veterinary Research Institute, Virology | Czech Republic | 2014-05-20 | null | Calovo virus | Orthobunyavirus | Peribunyaviridae | ssRNA(-) | 6,870 | GenBank | 1 | Slovakia | Slovakia | null | null | 1975 | null | null | Calovo virus strain 8020 segment L, complete sequence | 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