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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
OR865216.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Kwak,H.-R., Byun,H.-S., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-12-20
|
CABYV-M-NJ7
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,683
|
GenBank
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South Korea: Naju
|
South Korea
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Cucurbitaceae
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2022-12
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Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate CABYV-M-NJ7, complete genome
|
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| 10,146
|
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|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Lee,B.-C., Kwak,H.-R., Byun,H.-S., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-12-20
|
CABYV-M-GJ1-1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,683
|
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| null |
South Korea: Gwangju
|
South Korea
|
Cucurbitaceae
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2020-09
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|
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| 10,147
|
OQ865059.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Al-Ogaidi,L.L., Alisawi,O.N., Qasim,N.A., Ibrahim,B.Y.
|
Faculty of Agriculture, Kufa University, Plant Protection
|
Iraq
|
2023-06-12
|
Iraq
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,662
|
GenBank
| null |
Iraq
|
Iraq
|
Cucurbita
|
plant leaf
|
2022-10-11
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate Iraq, complete genome
|
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| 15,204
|
OP909804.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Vidal,A.H., Lacorte,C., Sanches,M.M., Alves-Freitas,D.M.T., Abreu,E.F.M., Pinheiro-Lima,B., Rosa,R.C.C., Jesus,O.N., Campos,M.A., Felix,G.P., Abreu,A.C.R., Santos,Y.S., Lacerda,A.L.M., Varsani,A., Melo,F.L., Ribeiro,S.G.
|
Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, Laboratorio de Interacao Planta Praga III
|
Brazil
|
2023-04-01
|
PF-558
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,676
|
GenBank
| null |
Brazil: Bahia,Lencois
|
Brazil
|
Passiflora edulis
| null |
2015-06
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate PF-558, complete genome
|
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| 16,972
|
OP909805.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Vidal,A.H., Lacorte,C., Sanches,M.M., Alves-Freitas,D.M.T., Abreu,E.F.M., Pinheiro-Lima,B., Rosa,R.C.C., Jesus,O.N., Campos,M.A., Felix,G.P., Abreu,A.C.R., Santos,Y.S., Lacerda,A.L.M., Varsani,A., Melo,F.L., Ribeiro,S.G.
|
Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, Laboratorio de Interacao Planta Praga III
|
Brazil
|
2023-04-01
|
PF-564
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,677
|
GenBank
| null |
Brazil: Bahia,Lencois
|
Brazil
|
Passiflora edulis
| null |
2015-06
| null | null |
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|
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| 16,973
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OP909806.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Vidal,A.H., Lacorte,C., Sanches,M.M., Alves-Freitas,D.M.T., Abreu,E.F.M., Pinheiro-Lima,B., Rosa,R.C.C., Jesus,O.N., Campos,M.A., Felix,G.P., Abreu,A.C.R., Santos,Y.S., Lacerda,A.L.M., Varsani,A., Melo,F.L., Ribeiro,S.G.
|
Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, Laboratorio de Interacao Planta Praga III
|
Brazil
|
2023-04-01
|
PF-799
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,672
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GenBank
| null |
Brazil: Bahia,Lencois
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Brazil
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Passiflora edulis
| null |
2015-07
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate PF-799, complete genome
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ACAAAAGATACGAGCGGGTGATGCAAATTGAGTCTGTCGAGCAACAATTAATCTTCAGACCAACCCGACGCACGAGCAGCGACGATCGAAAGTTGAACGTAGCATACTTTCTGATCAATCATATTTCTTTTTTGGCGACCAATGGCACACATTTACTTCGCCTTTTTCTTGCTCGCTTGCCTCTGCTCATCAGTGAGCAGTTATCAGGGGACTATGTTTACACCCCTGGAGCTAGTAAGCGCATCACGCTGGCTCAATTCCACCGCCACTGCGGAGCCCCTCTCCCATCTTCAAGTGCAGTTGATTTACGACTGCCCGCCACACAAGACGTTGCGCGATTTTTCCTCGCGCGACATTACTCTAGAGCTCTGGGAGAGAGGATACAACGAAACCAGACAAACCTTTTCAGAGGTTATGCAGAATTTGCAAAATTTATTAACGTCTGGTGTTCGTCGTTGTCGCACAGGCTTAGAGAGTTTGCTCCACGCGACTTTACGAGCAGCAACATATTTGTGGACCTCTCTAATTTGGGCCACAGCTTGTGCGACTTGGTACTTGCTCAGCAAGTACACAATCGAGATGCTTATACTCGCCTCGCTTTACATATCCACCGTATATATGGTGAAGATGGCGGCTTGGATTTTTGGCGACTTGCCAATTTCCCTATTAAAAGCTGGCCTTTCAATAGCGAGAGGTATCTCGAGGGCTCTGTGGTACAGAAGGAGCTACAATGCTGAGAAATCCGTAGAAGGATATCTCTCATTCAAGATCCCACAGAACCCCCCCAAAAACTCGGTCTTGCAGGTCCAACACAAAGATGGATCGCACGCCGGGTATGCTACCTGTGTGACGCTGTACAATGGAACGAATGGGCTTCTCACAGCCCATCATGTTGCTGTCCCAGGTAGCAAAGTCGTCTCCACCAGGAACGGAAATAAGATTCCTCTTTCTGAGTTTAGATCCATTATGGAGTCTGAGAAGAGGGATCTTGTGCTACTGGCGGGTCCTCCAAACTGGGAGGGTGCCCTCGCCTGTAAGGCCGTCCAGTTCCAATCTGCCCAGCACCTTTGCAAATCAAAGGCCTCCTTCTACGCTTATGACGGAGAGGGATGGATTTCATCCAATGCTGAAATTGTCGGCATTGCAGAGGGCAAAACCCATGCATCTGTGTTAAGCAACACGGATGCTGGTCACAGTGGCACCCCATATTTTAACGGAAAAACAGTTTTGGGTGTCCACGTGGGTGGAGCTAAAAATGAAAATTTCAATTATATGGCCCCTATACCGCCCGTTCACGGTCTCACCAGTCCCAGTTATGAATTTGAGACCACGGCCCCCCAAGGACGCCTGTTCACACAGGAAGAGATAGACGAACTCATTGAAGAATTTTCCTTCAGTGAGATCACGTCCATAATGGGACATCGCCGATTCCACAACATGCACGACTCGCAGCGACGTCAAGCTGATTATGAGCACGAGTCGGGAAATGGGCAGGCGGCAGCGTCCGCCGAAACAACCGCACCCGATGCCACCCCCGCGGTTGGGCGCAAAAGTGGAGACGCACAGTCTCCTGTTGCTCCCTCTTCCCCGAAGGTCAACACATACACGCCTCCGAACAAACGGGAAAACCGCACTGCTTCTGCAGCATCCCCCACCACCAATGCTTCTACCGACACTTTGTCGGAAATCAAAAAGGCAATAACGGACAAAATCGATGTCCGTTCGATAGAGAAGCAAGTGGTCCAAGCCTTGGCGGATCGAGCCATGAAGAAACCGCGAACACGCAGACGCGGCAGGAGAAGTTCGAAGAACTCGCAACCAACTTCTCAAATTTCTTCGATGCCCAGTACACCTGGGAACAAGGCGGGGAAGAAGCCCCAGGATTCGAAAAAGTCGGATTCCTCCCCCAGTTTTACCACGCTAAACAAAAGAAAAGCTCGAATTGGGGAGACAAAATCTGCAAACAGCACCCAGAAATGGGTGATCTCACAAAAGGCTTCGGGTGGCCCCAGTTCGGCGCGAAAGCCGAACTGAAATCGCTGCGGCTGCAAGCCGCGCGTTGGCTGGAACGTGCCCAGTCAGTTAAAATCCCCTCGTCTGAGGAGCGGGAGCACGTTATAGAGAGATGCTGCCGGGCATATCAAGCTGCAAGAACTAATGGCCCGATGGCAACGAGAGGAGATCGACTTTCCTGGGATAACTTCCTACAGGATTTCAAACAGGCGGTCCTCTCGTTGGAAATGGACGCAGGAATAGGAGTCCCGTACATAGCCTACGGCAAGCCAACCCACCGCGGGTGGGTTGAAGACAAGAAACTCCTTCCGATATTGGCTCGTCTCACCTTCAACCGACTACAGAAGATGTTGGAGGTAAGGCATGTTGACTTATCGCCTGCGGAACTTGTGCGAGAGGGTCTCTGTGACCCTATTCGAGTGTTCGTCAAAGGAGAACCGCACAAGCAAGCAAAGTTGGATGAAGGCCGCTATCGCCTCATCATGAGCGTCTCTCTAGTAGACCAATTGGTTGCCCGGGTTTTGTTCCAAAATCAAAATAAACGCGAAATAGCGTTGTGGAGAGTGGTTCCCTCCAAACCCGGTTTTGGCTTGTCTACAGATGAGCAAGTAGCGGAGTTCATGCAGATTCTCTCCGCTCAAGTTGGGCTAACGCCTTCGGAGTTGATCACCGAGTGGCGAGCCCACATGATAGCAACTGACTGCTCCGGTTTTGACTGGAGCGTTTCGGACTGGCTTCTTGAAGACGACATGGAAGTCCGAAACCGCCTGACGCTTGATTTAAACGAAACCACGCGCCGCTTACGTGCAGCGTGGCTATATTGCATATCGAACAGCGTCCTCTGCCTTTCAGATGGTACATTATTAGCGCAGAGAGTCCCAGGCGTGCAGAAGAGTGGCAGCTACAACACGTCATCGAGCAATTCCCGCATTCGGGTGATGGCAGCCTACCACTGCGGCGCAGAATGGGCTATGGCGATGGGCGATGATGCCCTTGAGTCAGCTTGCTCGAACCTCGAGCGTTACAAATCGCTCGGTTTTAAAGTCGAGGAGTCCTCAAAACTGGAATTTTGCTCTCATATCTTTGAGAAAGAGGACCTCGCCATTCCGGTTAACAAGGCGAAAATGCTTTACAAGCTTATACATGGTTATGAACCGGAATGCGGCAATGTGGAAGTCCTGATCAATTACCTGGCCGCCTGCTTTTCTGTTCTCAATGAACTGCGGTCCGATCCTTCCCTTGTCGAGACTCTCCATCAGTGGCTGGTTGCCCCAGTACAGCCACAAAAGATATAAGGGGAGTATAAAGAACACTAGCCAAGCACACACGAGTTGCAAGCATTGGAAGTATAAGTCTCGTTACCAAGAGCCCACACAATAGATTACAAATTTCTCGCAGGATTTTCCAGCGGTCTATTGTCTGCTATACCTGTCACGGTTATTGGGCTCTATTTTGTCTACCTAAAGATTTCAGCACACGTGCGAGCAATTGTTAATGAATACGGTCGTGGCTAGAAATCAAAATGCAGGGAGGCGAAGGCGAAGAGATCAACGCCCTGCGCGGCGTGACCGCGTGGTTGTGGTCAACCCCATTGGGGGACCACCGCGCGGAAGACGACAACGAAGAAACCGCCGACGCCCTAATCGAGGAGGCAGAGCTAGAAGAAGAAGCCCAGGCGAAACATTTGTATTTTCAAAGGACAATCTCACGGGCAGTTCCTCAGGAAGTATCACCTTCGGGCCGTCTCTATCAGAGAGCCCAGCATTCAGCTCTGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCATCATGGTCCAGTTGGAGTTCATCTCCGAGGCCTCTTCCACCTCCTCGGGTTCCATCTCTTATGAGTTGGACTCCCACTGCAAGCTTAGCTCCCTCCAATCCACGATTAATAAATTTGGAATCACCAAGAATGGATTGCGACGTTGGACCGCTAAGCAAATCAACGGGATGGAATGGCATGATGCAACCGAAGACCAATTCAAGATCCTCTATAAAGGGAATGGATCTTCCTCGGTTGCGGGCAGCTTCAGAATCACCATCAAGTGCCAGGTCCAGAACCCGAAATAGGTAGACGGGCAGTTCCCCCCCCCCCCAGGTCCTAGCCCAACCCCACCACCCCCACCTCCTCAGCCTCAACCTCAACCCTGCGCTCAGCGCTTCTGGGGTTATGAAGGCAACCCACAAAACAAGATACTCACGGCTGAAAATTCAAGGAATATTGATTCCCGGCCGTTGAATTTTGTGCAAATGTACAAGTGGGAAGATGAGAAGTGGGATAAGGTCAACCTTCAGGCCGGATATTCTCGCAACGACCGACGTTGTATGGAGACGTACCTCACAATTCCAGCAGATAAAGGAAAATTCCACGTTTATCTTGAAGCTGATGGTGAGTTCGTCGTCAAGCACATCGGTGGCGAGTTCGACGGCAGTTGGCTTGGAAACATCGCCTACGATGTTTCCCAAAGAGGCTGGAACATAGGGAATTACAAAGGCTGTAAAATTACAAACTACCAATCCAACACGGCTTTTGTGGCGGGGCATCCCGACGCGACGATGAATGGCAAAAACTTTGATAGCGCGCGGGTGGTTGAAGTCGATTGGTTCGCTTCCTTTGAGCTAGAATGTGATGATGAGGAAGGAAGCTGGGCTATATACCCCCCCCCCATACAGAAAGATTCTTCATATAATTACACCGTATCATACGGGAATTACACGGAGAAGTATTGTGAGTGGGGGGCTATTTCAGTGTCAATCGACGAGGATAACAACAATGGGAACGTGCCAAGAAGAATACCACGCAAGGGGGCAATGGCGTGGTCTACCCCTGAACCATCTTTTTCAGGGGATGATAGTCAAAGACAAGACTTTAACACTCCTTCGCTTGAAGAGCGAGGTTCCGATGCCCTGGAATCGGAAACAGAGAAGGAAGAGGACAACCTTCTTGAACTTGAGGAAGAAAA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| 16,974
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OP909807.1
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Cucurbit aphid-borne yellows virus
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Vidal,A.H., Lacorte,C., Sanches,M.M., Alves-Freitas,D.M.T., Abreu,E.F.M., Pinheiro-Lima,B., Rosa,R.C.C., Jesus,O.N., Campos,M.A., Felix,G.P., Abreu,A.C.R., Santos,Y.S., Lacerda,A.L.M., Varsani,A., Melo,F.L., Ribeiro,S.G.
|
Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, Laboratorio de Interacao Planta Praga III
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Brazil
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2023-04-01
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PF-724-1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
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Solemoviridae
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ssRNA(+)
| 5,676
|
GenBank
| null |
Brazil: Bahia,Lencois
|
Brazil
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Passiflora edulis
| null |
2015-07
| null | null |
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|
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| 16,975
|
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|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Vidal,A.H., Lacorte,C., Sanches,M.M., Alves-Freitas,D.M.T., Abreu,E.F.M., Pinheiro-Lima,B., Rosa,R.C.C., Jesus,O.N., Campos,M.A., Felix,G.P., Abreu,A.C.R., Santos,Y.S., Lacerda,A.L.M., Varsani,A., Melo,F.L., Ribeiro,S.G.
|
Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, Laboratorio de Interacao Planta Praga III
|
Brazil
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2023-04-01
|
PF-724-2
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
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Polerovirus
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Solemoviridae
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ssRNA(+)
| 5,676
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GenBank
| null |
Brazil: Bahia,Lencois
|
Brazil
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Passiflora edulis
| null |
2015-07
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|
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| 16,976
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OP909809.1
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Cucurbit aphid-borne yellows virus
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Vidal,A.H., Lacorte,C., Sanches,M.M., Alves-Freitas,D.M.T., Abreu,E.F.M., Pinheiro-Lima,B., Rosa,R.C.C., Jesus,O.N., Campos,M.A., Felix,G.P., Abreu,A.C.R., Santos,Y.S., Lacerda,A.L.M., Varsani,A., Melo,F.L., Ribeiro,S.G.
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Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, Laboratorio de Interacao Planta Praga III
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Brazil
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2023-04-01
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PF-724-3
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Cucurbit aphid-borne yellows virus
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Polerovirus
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Solemoviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
| null |
Brazil: Bahia,Lencois
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Brazil
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Passiflora edulis
| null |
2015-07
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2023-04-01
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Cucurbit aphid-borne yellows virus
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Polerovirus
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Solemoviridae
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Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, Laboratorio de Interacao Planta Praga III
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Brazil
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| 16,979
|
OP909812.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Vidal,A.H., Lacorte,C., Sanches,M.M., Alves-Freitas,D.M.T., Abreu,E.F.M., Pinheiro-Lima,B., Rosa,R.C.C., Jesus,O.N., Campos,M.A., Felix,G.P., Abreu,A.C.R., Santos,Y.S., Lacerda,A.L.M., Varsani,A., Melo,F.L., Ribeiro,S.G.
|
Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, Laboratorio de Interacao Planta Praga III
|
Brazil
|
2023-04-01
|
PF-729
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,675
|
GenBank
| null |
Brazil: Bahia,Lencois
|
Brazil
|
Passiflora edulis
| null |
2015-07
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate PF-729, complete genome
|
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| 16,980
|
OM948834.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Rabadan Manzanera,P., Juarez Gomez,M., Gomez Lopez,P.
|
CEBAS-CSIC, Pathology
| null |
2023-01-16
|
1.1M/M
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,672
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
|
Cucurbitaceae
| null |
2014
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate 1.1M/M, complete genome
|
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| 19,382
|
OM948835.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Rabadan Manzanera,P., Juarez Gomez,M., Gomez Lopez,P.
|
CEBAS-CSIC, Pathology
| null |
2023-01-16
|
10.1Z/M
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,672
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
|
Cucurbita pepo var. melopepo
| null |
2020
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate 10.1Z/M, complete genome
|
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| 19,383
|
OM948836.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Rabadan Manzanera,P., Juarez Gomez,M., Gomez Lopez,P.
|
CEBAS-CSIC, Pathology
| null |
2023-01-16
|
11.1Z/M
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,672
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
|
Cucurbita pepo var. melopepo
| null |
2012
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate 11.1Z/M, complete genome
|
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|
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|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Rabadan Manzanera,P., Juarez Gomez,M., Gomez Lopez,P.
|
CEBAS-CSIC, Pathology
| null |
2023-01-16
|
18.1M/A
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,672
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
|
Cucurbitaceae
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2016
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate 18.1M/A, complete genome
|
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| 19,385
|
OM948838.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Rabadan Manzanera,P., Juarez Gomez,M., Gomez Lopez,P.
|
CEBAS-CSIC, Pathology
| null |
2023-01-16
|
18.1Z/A
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,672
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
|
Cucurbita pepo var. melopepo
| null |
2015
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate 18.1Z/A, complete genome
|
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| 19,386
|
OM948839.1
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Rabadan Manzanera,P., Juarez Gomez,M., Gomez Lopez,P.
|
CEBAS-CSIC, Pathology
| null |
2023-01-16
|
19.1M/M
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,672
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
|
Cucurbitaceae
| null |
2015
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate 19.1M/M, complete genome
|
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|
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|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Rabadan Manzanera,P., Juarez Gomez,M., Gomez Lopez,P.
|
CEBAS-CSIC, Pathology
| null |
2023-01-16
|
19.1M/M
|
Cucurbit aphid-borne yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,672
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
|
Cucurbitaceae
| null |
2019
| null | null |
Cucurbit aphid-borne yellows virus isolate 19.1M/M, complete genome
|
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| 19,388
|
NC_018173.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Okuda,M., Okazaki,S., Yamasaki,S., Okuda,S., Sugiyama,M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2012-07-18
| null |
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
RefSeq
| 1
|
Japan:Kumamoto
|
Japan
|
Cucumis melo
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Cucurbit chlorotic yellows virus RNA 1 segment, complete sequence
|
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| 7,280
|
NC_018174.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Okuda,M., Okazaki,S., Yamasaki,S., Okuda,S., Sugiyama,M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2012-07-18
| null |
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,041
|
RefSeq
| 1
|
Japan:Kumamoto
|
Japan
|
Cucumis melo
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Cucurbit chlorotic yellows virus RNA 2 segment, complete sequence
|
GGAAATTATCCACGGTTTCCCCGAGGTAATGGGAAGTCCCAACCCCCTCGAAACAGCCCCCTCGCTTTCTCAGCGTGGAAACTGAGAGAGGAGAATGGAGTATTGTGTGGGCGCACTAGTTGTATACACACATGCCATTCTTCGATCTTAGTAACTGAGATCGCCTATCTTGACAACACTCAGTTGTCAACATGTCCAAACAAAACAAAAACAAAAAACAAAATAACACAATAAACGCCTGCCACTAAACAAGGCTTTAGTCAACGATCGTACAAAGTAACTGGTGTACGGTTGCCGCGTTTGTTAGTCACCACCGCCTCTGGCTAAGGGTCGGTCACGGTGCAAGTCGTCTGACGACTGGTGAAGAATCCCAGTCGTCTACTACGTACCTGCATTGTTGTCCCATATCCCCCCCCCCAGAGATCCGGTTTGTTTATCCGTTTGTCATTTTCCTTATGTTGATGAAATAAAAATCATTAAAGTGTTATACACTTTTTATATGTAATTTAATTTTGTCGTTTCTAAGAACATGATCAAGTCGTGAGTCATATTTTACTTTAAACCTATCGCCTGTCTTCAAGACAGTCGTTATTAATCCGACAAGTTGGTATCGGAATGTTGATTCACATTTGTCATTCGTTCTTGGAACGGTTGTATTTGTCGTTTTAGTGTTTTATCATCTTATTGTTGTGTTTTTGTTTTTGAGTTTTTGTTTCCAGTGCAGTTTGAGTTAGTGTTCTAAAAGCAAGTTTTGTGAGAGTTGACGAAAACTATAAACCTACCGCCTTTCTTTCGGAAAGTCGTTATCAATCCGACAAGTTGGTATCGGATGGTTAACTTACACAATACTTTGATTTTTATTACTGTCGAATTTGTTTAAACGCATTTAATTTCTTGATTGTGTGTGTCTCTTGTGGAACTCAACAAAATAGATTAGCTATTGAGTCTCATTATTTTAGTTTATAGATACGTTATTATTTTTCTGTTGCTTTCTTGAGCATTAGTTTGTTGTTTGTAATTAAAGATCGTTCATCATGCCAAAAGCTTTCAAATTTGATCGATATTTAATTTCACTGCAACCGATGTCAGGTTCAGCGTCATCGAAAAATCAACACGTGTCTAATAATATATATTTTTCATTTTGTTCAATCTATCTGTTGTCGTAATATTCTTGTAAATTAATTTGTGTTTCTTATTCCGAATAACATGTCTGCTAAGGCTGGTTTGGATTTTGGTACCACTTTTTCGACCATTAGTGCGTATGTCAATGGTGTTATGAGAGTTTTAAAACTGAACGACACTGAGTTCATTCCTACCTGTTTAGCCATAACCATTACGGGAGATGTGGTTGTTGGTGGTCCAGCCCAAGTTCTTGAGGAAGACGAGGTGGCTAACTGTTATTTTTATGATTTGAAGAGATGGGTTGGTGTAGATAAAATCAATTTTGATGAAATAAAAGAAAAAATAAAACCATTATATGTGGCGGAGTTAGATGGTAATGATGTCAAATTGACTGGAATTGATCGTGGTTTCTCATGTACGTACACAGTTAAACAGCTGATTTTATTGTACGTTGAGACTCTGGTCAGACTATTTTCAAAAGTTGAAAATTTGAACATAATTAGTCTAAATGTTTCAGTACCAGCAGATTATAAGTGCAAACAAAGGATGTTTATGAAATCGGTGTGTGATAGTTTGGGTTTTTCACTGCGAAGGATTATCAACGAACCGTCAGCAGCAGCTATTTATTTTGTATCAAAATATGCTCATTTCGATTCTTTCCTCATGTACGATCTTGGCGGTGGTACTTACGATTCATCTTTAATTGTTAAGGATGGGAAATATGTCACTGTCGCAGACACTGAGGGAGATTCGTTCTTAGGTGGTAGAGATATAGACAGAGCAATTTCAAATTATATAAAAAATAAATACAATCTTAAATTTCCGTTGTCAGCCGATTTCCTAGCTTCAATCAAGGAAGAGGCCAATTCTAAAGGAAGGGATTCCTTTAATGTGGTGGATGAAAAGGGGCGTTTGATAACTGTGAAAATGTCTAGAGAAGAGTTGGACTCGTGCATTGAGCCGTTTTCGAAGAAGAGCATCAACATCATAAAAAATATGGTTGTGAGAAACCAAATTAGGTCTGGTGCTTTATTTCTTGTGGGTGGTTCTTCACTGTTAAAGAAAATTCAAAGCGATGTAGCACAATTTGCGAAGAGTCACAATTTAGAGTGCATCATTGATCCAGACCTTCGATCAGCAGTGTCTTTTGGTTGTTCTATGTCACACGCTCAAGAGGACACAGGTAATATGGTTTACATCGATTGTAATTCTCATCCGTTGATGGACATAGCATTTTTTGGTAATCCTAAAGTCTTGGTCCGTAAACCAATGGCGATACCATACACATATAGGAAAGAGGAGTTTTTCAAATCTCACTATAGCACCATTTTGAATGTATATGAAGGGTCTGATCCATTTGTATTGTATAATGATTGGTTGATAAGTGCACGTATGCAGTCCAGTCTGTATTGCAATATAGGTGAAACTTTAGAGTACTTGTACAAATATAGTGTGGATGGTATATTAGAGTTATCAGTAAAAAATAAGACCACTGGCAAGGAGACGGTTTTACCTAATACTTTTACTTTGACTGAAAGTATTAAGAAATTGAATCTCAATTTGACTCAGTTATCTAATGTTGATGAAACAGCTACGTTGATAGCGATTTTGAGTCACTTTAAACCCGATCTTAAGCATTTACTAACTTACGTGAAAACACCCACGATTTTTGAGACGAAATTGAATAATATTTCATCTGCAAAAGAACTATATAAAAATCTTGTAGATATAAATGAAAAATTTAGCAACACATGAATGGGATTAAAGATAGTACTTTATTATTTTAATTGTGGTTTCTCAATATACTATTGTTCAGATAACAGGTTGTTTGAAGGTGACTTTGAAACCATATACACAGAGGATTTCAAAGATTTACTGGAGGTCGTGACCAATTATCCATTTGTTAAATTACAATGGTGAGTTTGAAGGAAAGTGAAAAATTAAAACATTGTTTTCAACTTCTTTTCAAACGTACAGATGTGTCTCCACAACTAGACGCTTTAGTTGAATACATGAGAAATAATTATAGGACAGAGAATTCCAACGTATATAAATCAATCAGTAGAAAGTCACCAATGTCATTTGACTCCCAATTTAGGCAAGTGGCTGGTGACATTCACTTTGTTGAACATGACAATAAGAGTATAGTAAAACTCATATATATCTACTTTAATAAGGTGGAACCGAACCTGTTAAAGAAATTGGCTTATCAACCGGGTTCATTATTCGTGACAGATGAATGGCTAGATTATTTATCTGAATGGGAAAAATATCTAGACAAGTCCATGAACGACTACCTCAATGACAACAAATCCTTAGGGTGTCTGTACACAGAAGATGACATTGCACGACATTACCCTGGATCCAGTAGATCTAGACTGATAACACTTTACAGGGTGTGTAATTCCCAGGGTCGTTTAATACCCATAGATGAGTTTCTATCAGGAGAAATTAAAGGTTTCGACATTCCCACAGCATCAGATGCAGTATTGATAGGTGAGGGTATATCAAACAATCCATTATTTTCTGAATGTGTTCAAGCTTTCAGAGAGTATGTCAGGTTAATGAATTCTAAAGCTGGTCAAGCAAAAATCAATGTGAATAAGAGATTTTTTGACGTTTACTTCGAATCAATGTCACAGAATCCTGAGATGATCAGAGTAAAAGAGAACCCCCTTGTTTTGGCTAAGTTTATGAAAGAATTCGATTCCCTCACAGTGAATAGTCGAGGTTTTGCCGACAACATTAACGCCATTAAAACTTTGGACAAGGATTTCCAAAGATTCATAAAGGATGTGTTTATGTTGAACAATAGTCTGGATGAAGATTCTTTATTTGTGAAGATGCCAAAAGATTCAGTAATCGATATCCTAGGTCAACCAATTTCTTTATCGAACTATCTTAGGACCAGTGATATACCACCACCACTGAGTAACTCATCGTCACTTTCAGATGTTGTCGATACCGTAGTCTCAGAAGGATTTTACTCGTTTTTTAAGAAATTTGGTGTTACAGACAAACAACTACTATTGGACGCGTTATTGTTTGTATTCGGTAAGCTCACTACCAATAAAAATTTTTGGGAAAAACCAAATAATGTGAAATTTAAAGTTGATAGTAAGGTCATTAGTTTCGTCTCATCAGATTTGACTAGTCATATTAAAAACTGTGTTAAGAGGTTTGATCCTACTTATGATTGTAACAACATAATAAGACAGTGGGCTAATTTGAGAGGTAACAGGGCAGTCAGACTGTTTAGATTGACAGGATTCAGACCTGGATTGTTCAGCACTATTCCTGGTATTGTTCCTTGGATGAGATTCGATTTCTTCAAGTTGTTAACTGTTCAAAACCTTAGTCATGATGAAGAGACATCTTTCCGCACACTCCGCCTAATGACGGAGCACAAGTCGAATAAGTCTAGTAGCGACGATTGTGAATTTTATAAATGGATCTCTCGAAGTTAATTGAAAAATATGGTGAGGACAAAGTGGAAAAGTACTACTCGTTGTACAGAAATGCAAAATTTTCAGCAGGCGGTACTACTTTATGCGTCTTAAGGTTGATCAACGAAAAATTAATGAAATTCACCGAGGACAATAAACCTTCAGGATTTAATGACGTTGACGTATCGGAATTTCTAGAATGTGTATATTGGTTTAGCTTATTACCAAAATTTTTTAACTGATCAGTGATTATCTTCAAATTCAATTTGTTTTACTGTAGTCTGGAGGTATATTTCGTAAGTGATCGCAATCAATAAGGCGGCGACCTAATCGAAAAAATAATTTTGAAAAGTTACTCGATCTACATTAAATATGGAGAAGACTGACAATAAACAAAACGATGATTTGAACAAGATAACTGAGGATGGAGCC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| 7,281
|
OR865218.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-12-20
|
CCYV-W-HA1-1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
GenBank
| null |
South Korea: Haman
|
South Korea
|
Citrullus lanatus
| null |
2023-01
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-W-HA1-1 segment RNA1, complete sequence
|
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| 10,148
|
OR865219.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-12-20
|
CCYV-W-HA1-1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,041
|
GenBank
| null |
South Korea: Haman
|
South Korea
|
Citrullus lanatus
| null |
2023-01
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-W-HA1-1 segment RNA2, complete sequence
|
GGAAATTATCCACGGTTTCCCCGAGGTAATGGGAAGTCCCAACCCCCTCGAAACAGCCCCCTCGCTTTCTCAGCGTGGAAACTGAGAGAGGAGAATGGATTATTGTGTGGGCGCACTAGTTGTATACACACATGCCATTCTTCGATCTTAGTAACTGAGATCGCCTATCTTGACAACACTCAGTTGTCAACATGTCCAAACAAAACAAAAACAAAAAACAAAATAACACAATAAACGCCTGCCACTAAACAAGGCTTTAGTCAACGATCGTACAAAGTAACTGGTGTACGGTTGCCGCGTTTGTTAGTCACCACCGCCTCTGGCTAAGGGTCGGTCACGGTGCAAGTCGTCTGACGACTGGTGAAGAATCCCAGTCGTCTACTACGTACCTGCATTGTTGTCCCATATCCCCCCCCCCAGAGATCCGGTTTGTTTATCCGTTTGTCATTTTCCTTATGTTGATGAAATAAAAATCATTAAAGTGTTATACACTTTTTATATGTATTTTAATTTTGTCGTTTCTAAGAACATGATCAAGTCGTGAGTCATATTTTACTTTAAACCTATCGCCTGTCTTCAAGACAGTCGTTATTAATCCGACAAGTTGGTATCGGAATGTTGATTCACATTTGCTATTCGTTCTTGGAACGGTTGTATTTGTCGTTTTAGTGTTTTATCATCTTATTGTTGTGTTTTTGTTTTTGAGTTTTCGTTTCCAGTGCAGTTTGAGTTAGTGTTCTAAAAGCAAGTTCTGTGAGAGTTGACGAAAACTATAAACCTACCGCCTTTCTCTCGGAAAGTCGTTATCAATCCGACAAGTTGGTATCGGATGGTTAACTTACACAATACTTTGATTTTTATTACTGTAGAATTTGTTTAAACGCATTTAATTTCTTGATTGTGTGTATCTCTTGTGGAACTCAACAAAATAGATTAGCTATTGAGTCTCATTATTTTAGTTTATAGATACGTTATTATTTTTCTGTTGCTTTCTTGAGCATTAGTTTGTTGTTTGTAATTAAAGATCGTTCATCATGCCAAAAGCTTTCAAATTTGATCGATATTTAATTTCACTGCAACCGATGTCAGGTTCAGCGTCATCGAAAAATCAACACGTGTCTAATAATATATATTTTTCATTTTGTTCAATCTATCTGTTGTCGTAATATTCTTGTAAATTAATTTGTGTTTCTTATTCCGAATAACATGTCTGCTAAGGCTGGTTTGGATTTTGGTACCACTTTTTCGACCATTAGTGCGTATGTCAATGGTGTTATGAGAGTTTTAAAACTGAACGACACTGAGTTCATTCCTACCTGTTTAGCCATAACCATTACGGGAGATGTGGTTGTTGGTGGTCCAGCCCAAGTTCTTGAGGAAGACGAGGTGGCTAACTGTTATTTTTATGATTTGAAGAGATGGGTTGGTGTAGATAAAATCAATTTTGATGAAATAAAAGAAAAAATAAAACCATTATATGTGGCGGAGTTAGATGGTAATGATGTCAAATTGACTGGAATTGATCGTGGTTTCTCATGTACGTACACAGTTAAACAGCTTATTTTATTGTACGTTGAGACTCTGGTCAGACTATTTTCAAAAGTTGAAAATTTGAACATAATTAGTCTAAATGTTTCAGTACCAGCAGATTATAAGTGCAAACAAAGGATGTTTATGAAATCGGTGTGTGATAGTTTGGGTTTTTCACTGCGAAGGATTATCAACGAACCGTCAGCAGCAGCTATTTATTTTGTATCAAAATATGCTCATTTCGATTCTTTCCTCATGTACGATCTTGGCGGTGGTACTTACGATTCATCTTTAATTGTTAAGGATGGGAAATATGTCACTGTCGCAGACACTGAGGGAGATTCGTTCTTAGGTGGTAGAGATATAGACAGAGCAATTTCAAATTATATAAAAAATAAATACAATCTCAAATTTCCGTTGTCAGCCGATTTCCTAGCTTCAATCAAGGAAGAGGCCAATTCTAAAGGAAGGGATTCCTTTAATGTGGTGGATGAAAAGGGGCGTTTGATAACTGTGAAAATGTCTAGAGAAGAGTTGGACTCGTGCATTGAGCCGTTTTCGAAGAAGAGCATCAACATCATAAAAAATATGGTTGTGAGAAACCAAATTAGGTCTGGTGCTTTATTTCTTGTGGGTGGTTCTTCACTGTTAAAGAAAATTCAAAGCGACGTAGCACAATTTGCGAAGAGTCACAATTTAGAGTGCATCATTGATCCAGACCTTCGATCAGCAGTGTCTTTTGGTTGTTCTATGTCACACGCTCAAGAGGACACAGGTAATATGGTTTACATCGATTGTAATTCTCATCCGTTGATGGACATAGCATTTTTTGGTAATCCTAAAGTCTTGGTCCGTAAACCAATGGCGATACCATACACATATAGGAAAGAGGAGTTTTTCAAATCTCACTATAGCACCATTTTGAATGTATATGAAGGGTCTGATCCATTTGTATTGTATAATGATTGGTTGATAAGTGCACGTATGCAGTCCAGTCTGTATTGCAATATAGGTGAAACTTTAGAGTACTTGTACAAATATAGTGTGGATGGTATATTAGAGTTATCAGTAAAAAATAAGACCACTGGCAAGGAGACGGTTTTACCTAATACTTTTACTTTGACTGAAAGTATTAAGAAATTGAATCTCAATTTGACTCAGTTATCTAATGTTGATGAAACAGCTACGTTGATAGCGATTTTGAGTCACTTTAAACCCGATCTTAAGCATTTACTAACTTACGTGAAAACACCCACGATTTTTGAGACGAAATTGAATAATATTTCATCTGCAAAAGAACTATATAAAAATCTTGTAGATATAAATGAAAAATTTAGCAACACATGAATGGGATTAAAGATAGTACTTTATTATTTTAATTGTGGTTTCTCAATATACTATTGTTCAGATAACAGGTTGTTTGAAGGTGACTTTGAAACCATATACACAGAGGATTTCAAAGATTTACTGGAGGTCGTGACCAATTATCCATTTGTTAAATTACAATGGTGAGTTTGAAGGAAAGTGAAAAATTAAAACATTGTTTTCAACTTCTTTTCAAACGTACAGATGTGTCTCCACAACTAGACGCTTTAGTTGAATACATGAGAAATAATTATAGGACAGAGAATTCCAACGTATATAAATCAATCAGTAGAAAGTCACCAATGTCATTTGACTCCCAATTTAGGCAAGTGGCTGGTGACATTCACTTTGTTGAACATGACAATAAGAGTATAGTAAAACTCATATATATCTACTTTAATAAGGTGGAACCGAACCTGTTAAAGAAATTGGCTTATCAACCGGGTTCATTATTCGTGACAGATGAATGGCTAGATTATTTATCTGAATGGGAAAAATATCTAGACAAGTCCATGAACGACTACCTCAATGACAACAAATCCCTAGGGTGTCTGTACACAGAAGATGACATTGCACGACATTACCCTGGATCCAGTAGATCTAGACTGATAACACTTTACAGGGTGTGTAATTCCCAGGGTCGTTTAATACCCATAGATGAGTTTCTATCAGGAGAAATTAAAGGTTTCGACATTCCCACAGCATCAGATGCAGTATTGATAGGTGAGGGTATATCAAACAATCCATTATTTTCTGAATGTGTTCAAGCTTTCAGAGAGTATGTCAAGTTAATGAATTCTAAAGCTGGTCAAGCAAAAATCAATGTGAATAAGAGATTTTTTGACGTTTACTTCGAATCAATGTCACAGAATCCTGAGATGATCAGAGTAAAAGAGAACCCCCTTGTTTTGGCTAAGTTTATGGGAGAATTCGATTCCCTCACAGTGAATAGTCGAGGTTTTGCCGACAACATTAACGCCATTAAAACTTTGGACAAGGATTTCCAAAGATTCATAAAGGATGTGTTTATGTTGAACAATAGTCTGGATGAAGATTCTTTATTTGTGAAGATGCCAAAAGATTCAGTAATCGATATCCTAGGTCGACCAATTTCTTTATCGAACTATCTTAGGACCAGTGATATACCACCACCACTGAGTAACTCATCGTCACTTTCAGATGTTGTCGATACCGTAGTCTCAGAAGGATTTTACTCGTCTTTTAAGAAATTTGGTGTTACAGACAAGCAACTACTATTGGACGCGTTACTGTTTGTATTCGGTAAGCTCACTACCAATAAAAATTTTTGGGAAAAACCAAATAATGTGAAATTTAAAGTTGATAGTAAGGTCATTAGTTTCGTCTCATCAGATTTGACTAGTCATATTAAAAACTGTGTTAAGAGGTTTGATCCTACTTATGATTGTAACAACATAATAAGACAGTGGGCTAATTTGAGAGGTAACAGGGCAGTCAGACTGTTTAGATTGACAGGATTCAGACCTGGATTGTTCAGCACTATTCCTGGTATTGTTCCTTGGATGAGATTCGATTTCTTCAAGTTGTTAACTATTCAAAACCTTAGTCATGATGAAGAGACATCTTTCCGCACACTCCGCCTAATGACGGAGCACAAGTCGAATAAGTCTAGTAGCGACGATTGTGAATTTTATAAATGGATCTCTCGAAGTTAATTGAAAAATATGGTGAGGACAAAGTGGAAAAGTACTACTCGTTGTACAGAAATGCAAAATTTTCAGCAGGCGGTACTACTTTATGCGTCTTAAGGTTGATCAACGAAAAATTAATGAAATTTACCGAGGACAATAAACCTTCAGGATTTAATGACGTTGACGTATCGGAATTTCTAGAATGTGTACATTGGTTTAGCTTATTACCAAAATTTTTTAACTGATCAGTGATTATCTTCAAATTCAATTTGTTTTACTGTAGTCTGGAGGTATATTTCGTAAGTGATCGCAATCAATAAGGCGGCGACCTAATCGAAAAAATAATTTTGAAAAGTTACTCGATCTACATTAAATATGGAGAAGACTGACAATAAACAAAATGATGATTTGAACAAGATAACTGAGGATGGAGCC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| 10,149
|
OR865220.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Lee,B.-C., Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-12-20
|
CCYV-M-JJU1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
GenBank
| null |
South Korea: Jeonju
|
South Korea
|
Cucurbitaceae
| null |
2023-08
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-M-JJU1 segment RNA1, complete sequence
|
GGAAATCAACACTCCTTCGTACGAAGAGAAAAACTCTAAGTACGAATTTCCAGCCCTTGAAGCCGCTTCCTTAATGGCCGTGACTTCGCCCCAAACCCACCCCTTGCTACCAAGAGGATGTGCCGTGCCACCATGTGGTCTGGCATACTTCTTGAGATGTGTTCCACGCTTGTGGTACGCATCACTAACCTATCCCAACAAAACTAAAAATAACATAAAACAAAACAAAAAGCAACTAAAACAAACTCGATTAGGTCCCGTACAGACCGGTGGTAAAGTTGCACCACCAACTTCAGTCTACAAAGTGTCCTTCAAAAGACGCTTAGTATCCCCGGGACCTAACCCTGTAAAAATCCAAATACTAAGTAACGGTAATGCTCTCCTTATTCCTCAACCGAGATCATATTACAAAACTAGGTTGAATGTGTTGAGGTCTATGTGTAATATTCCATATTGCAAATTTAATAGAATGCCCAAAGCTGTCATTTCGAAATTTGGGTATGATGTTAATAAGATTAATGAAATAATTGACCAGACCCTTAATAGTAAAGTAGGTGGCACTGAAACCCCAGTTCGTCAACTTGATGAGACCATCCAAGGTGCCACAAAATCTGGGGATGGTTACAAAATTTATAATTTTAATAATAAGCGTGTAGTAGAGATTTTTGTTTGTTTTAATAGTTATGTTAAAGATATTTATATGTGTAAGTTTGTTTTAGAGTTAAAATATAATAAAAATGGGAGACCTGTTGATGTGTTAGTGTCATTAATCAAATCTTATGGGAAGACACCCGGTCAACATTTCTGTTCTCCTTTCCTCTTGTCTTCACGTCTCGACACAAGACAATTTTCTGCCAAAGTCCTGTTAGCGTCAATCCTTGACAAAGTACCTGATTACTCATACTTTTATGGGTTATATTTGGGTAAATTATTCAGTCAACGCTTAACAGTGGCTAGGTCAACTGTCTTTGCTGCGTGCCAACAGTACCTCAACTACATGAGAAGCAAGGTTGGGTCAACTGTGTCGAGCCCTGTGAAATCCAAAGTCAACAAAATATCAAGACCCATTCACAAGTATTCTGTGATGCATTTTGTCACTAGAACTGGGTTTGAATATTTTGTCATTCGTTTTAATGATGGTAGGGAAGTGAGGATTAACAATTCTAGATTTGCCATCAAAGAGATGTATAATGCAACCCTTGATAGGGGGTCGTTTTACATCCATCCCAAGTGTTACACTCCAAATTGGGAAAGATTTGAGTCCTGTGGCAACAGATACTGCTGGATTCCTGCTTTCGGCAAAGCTAATATGAGAATGCCCAGAGATTTAGTCCCTTACCCTGAGATGAATTATGGGTATTTATTGCAGTGTGGTTTGGAAAAAGTTTTAGCTGGTAGGTTGATGAGGGTTAGGGATGATTATTTTCACTTTGACGTCAACTACAACATCAAAGGATCTATGGTGAGATATGGTAGTAAGATTGGTGTTAAGCTTGATAATGATTTTGATGGTATAATAAAAAATATAGAGATTTTGTATGATGATATCAGTGCAGGTATAATATCAGGGTCAAATCTGCGAAGCGACAACCCATTACTCAACACAATAACCACCAGGCTGTCGAATCAGATTAATGATCAATGCAACAAGGCAAAGGATTTGGTGATACCCACTTGTATGACTAGTAGACAAAAGCGGGAATTAAGTGAACTTTTTCCCGAGATTAACTTTGATTTCACCGAGTCCACTTTCTCTACTCATGCTCTAGCCACAGCCATGAGACATGCTGAGAATTATTTGTTGGCTAGGAAGTGTGGTTTTAGGGATTTTGTTGATGCAGGTGGTGATATTACTCATTATCTAGGTAAAATTGTATCAGGCGTGCATGTTTGTACTCCGATAGTCGACGTTAAAGATGCTCACAGACACATGACCAGGAGTAACAAACTAGACAAAATGATTGGTGTTTGTGAAAAAGCTGATATGTGCGACAAACTAACTCAGAATTGCAGAGTTGAGAAACCCAACATTATAGCCGTTCAGGTATATGATATGACATTGGAGGACTTCGCTCGAGCTTTGGTGTCACACAAAGCGAAAAGAGTGGATTTCACCATGATTATTCCTCCTGAGATTTATGATGAAGATTGTGATGTTAGTTTGTTTGATGACTCTATTAAAGTCAAATGTGAGGGGAATAAAGTACAGTATTCTTATGGTGACAGTGGTGAAATCTATCAACATGACAGGGAGAACTTGAAAAGAATTTTGACGACACAGATTTTTGAAGTGGACGGGATGATCTTCAAGAAAACCCTTGAAACGTCACGTAAACAACTTCATTTTTATTCAGTTGTCGAATGCTCCGATATGATGAACGGTAAATATATCACCGAGACTCATTATACAAGGTCAGAGTTGGACAAATTATGTATAAGAGTACCTGTTGAAAATGAGGCACGGGTTGTCGAGCACATGAAGATAAAGATGGATAAATCCTGTTTTCACAACCTGGTAGAATATGCTATGAACACAGTATTGAGGTTAGATGAGAAAGCATTTGAATACATTTTGTCTCAATACAGGGCTCGAAAATCTATTTCGATCAGAGGTGGTAAGGTTACGCAGGTTGGAGCCGACATGCATCCGAAAGCTGTGGCAGGTTTGATTGGTGCTGTAGCTGGTTATGGTCTGCGATTGCGAGAACAATCACATAAATCCGCAAAAGTTGCTTATTCTGAGTATTACACACCATCGCTTTTCCGTATGTTATGTAAGATTGTTTCTTATGTAATGAAGAGGTTGTGTAGCTGGACTCACGAGTTCTTAAATGAGGTGTTGAAGTATGTGACACCAAAATACATTTATAGTGAAGTGACTGCTAATCAATGTGGTGTGTATGAATATATAGGTGAATATAGGTTTAAACAGACCGTGAATATAGTTGGCAAGAGAAACGAGAGGAGGATTCTGTCCGACAGTTATGAAAAATTTAAGAAATACAGTGAGAAGGTGTATGAAAATCTCGACACCCATACTTCTGATAAGGAAGAATTATTCACCCAGGATATTCAGAAAACGTTGAATGATATTTTCGATCTGGGTGGTGCTGGGAAGTCTATGCCTACTCCTAGTGTCAACATCCAAATGTTACCATTCAACGTTTATAATAAGATCTATTCATTGTTGTTGGGTTGGTTGAAGGATGATAAGAGAACGGCAAGGTATACCAACTATATTTGTGGAATTTATGATTATTATAAAAATTTTTCACATTCAACTTATGATTTCGTTGTAAATATTTTGAAGGAGATATTTTTAGCCATAAAGAACGGTGTGGTAAATTTTTCTCAAAAAGTTGCAGGAAATCTGAAGAGAGCTGCATCGACAATGAAAAATTTGATAAAAATGAAGAACACCAATTGGGAAAAAGACTTGGATGATATGCTTAAGAAAACAGATGAAATGTTCGGAGTTGATACGCATGAACAGAGGAATGACTGTTCATCTGTTTCAAATGGTGGTATCTATGAAGGATTGGACAAGTTGTTTGATATCGGTAATGAAGGGGGTTCTGGCAGGGTTAGTTCAAAAATAGGTGTGGTTTGTGACAAGTTAATTTTGAAGGCAAATCAGTGTTTGCTTAATGTCAAAACATTTTGCACAGCCTTTGTTGAATCACTAATAAGTCTGTCCGGTCGTTGTGCTGTGAAGACTAAGGAATTCAAAGTTTTTGTGGGGAAAATCGTTGAACAGTTGATGGAAACATCATCACTGATAAGAATAGTCGACGGTGTAGCTTTCACTTTTGTCAATCTTTTTATGGCATTAGTGTTAGGAGAGATAAATTTTATTCGCTTATTCTTAGCCACGTGCACTTTCCTCTACCTCAGACATTCGAAAGCAAATGTTAAATGGGTCGGTAATTACGTGTTAGGAGACGCCGCATCAGCCCTCATCGCGAACCCAGGCTATACAGGTCTCATTATGGCCCCAGTCACTTTAATAGCGAGTAGGGTTGTGGGATTGGAGTTGAAAAGTAAGTGTACGAGATTCATTAAAGATGAAGAAAAAGCATTAAATATGGTCGCTAGTGAAGTTAATAATAAATATCACTTTGATTGGTTGAGACCTGAAATTGTTAAATCTTTAATAGGTTTTTCTGTGATTCTGATGCTGTTAGCTCCGAGATATGGCATAAGTATGATCATATTTTTTATGTTGTTGAATGATTATGTTAAGTATCTTAGGAGTTACTGTGTCAGAGCCAATATCATGTTAAGCTATGGTAGTGTGTTGAAGAGAACGATACCATCAGGGAGATATAAAGCACTAAAGAATATCTTCGTCAAAAAATTTGACACGTCAATATTCTCGGCCAAGAAAGAAGAAGGTGTTAATGGGGGCGACGAAGATGATAACAATGATGTCATTTGTAGGGTGGGTATGAAACCTGACGATGATGATGTTGAAGTTGAATTGGGATATGATGGGAAAGAAATAGTGAACGAGAGCAAACATGCAAATTGGGGTTCTGAGTCGAATTCTACAGAATCACCAGAATGTGTGGACGGTTTAAATTTTTCTTTACTAAAACCGTCAACAGACAGAACCCAAGTCAATTGTTCTGTCCATTTCTCCCTAAGTCATGCTTTGTTAGATTTTCCGCTGACAAATTACCATGACTTTGTACCGACTGGTGATGATTTTATTGATTGTGTTAGTGAATTTTACCATTTAGAAGCTAAGAAGTTACATGATGAGTTAGGAAGAGTCAATAATGCCGTTAGAGTTTACTTTGAACACAGTCTTGAAAAGAAATCGGTTGGTGAAGCAGTGTGGGCCATGAGAAATTATTTCAATGATTCCTCTGTGTTTATTAACTTGAACGGTCTACATTGGCATAGGTTGGGTAAGGGCGATAAGAAAGTCACCAATGTCGAGGCTATGTGTAAATACACTATTGACAATGACTTAATGGACTTTACACAAAAATACT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| 10,150
|
OR865221.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Lee,B.-C., Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-12-20
|
CCYV-M-JJU1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,041
|
GenBank
| null |
South Korea: Jeonju
|
South Korea
|
Cucurbitaceae
| null |
2023-08
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-M-JJU1 segment RNA2, complete sequence
|
GGAAATTATCCACGGTTTCCCCGAGGTAATGGGAAGTCCCAACCCCCTCGAAACAGCCCCCTCGCTTTCTCAGCGTGGAAACTGAGAGAGGAGAATGGATTATTGTGTGGGCGCACTAGTTGTATACACACATGCCATTCTTCGATCTTAGTAACTGAGATCGCCTATCTTGACAACACTCAGTTGTCAACATGTCCAAACAAAACAAAAACAAAAAACAAAATAACACAATAAACGCCTGCCACTAAACAAGGCTTTAGTCAACGATCGTACAAAGTAACTGGTGTACGGTTGCCGCGTTTGTTAGTCACCACCGCCTCTGGCTAAGGGTCGGTCACGGTGCAAGTCGTCTGACGACTGGTGAAGAATCCCAGTCGTCTACTACGTACCTGCATTGTTGTCCCATATCCCCCCCCCCAGAGATCCGGTTTGTTTATCCGTTTGTCATTTTCCTTATGTTGATGAAATAAAAATCATTAAAGTGTTATACACTTTTTATATGTAATTTAATTTTGTCGTTTCTAAGAACATGATCAAGTCGTGAGTCATATTTTACTTTAAACCTATCGCCTGTCTTCAAGACAGTCGTTATTAATCCGACAAGTTGGTATCGGAATGTTGATTCACATTTGCTATTCGTTCTTGGAACGGTTGTATTTGTCGTTTTAGTGTTTTATCATCTTATTGTTGTGTTTTTGTTTTTGAGTTTTTGTTTCCAGTGCAGTTTGAGTTAGTGTTCTAAAAGCAAGTTCTGTGAGAGTTGACGAAAACTATAAACCTACCGCCTTTCTCTCGGAAAGTCGTTATCAATCCGACAAGTTGGTCTCGGATGGTTAACTTACACAATACTTTGATTTTTATTACTGTCGAATTTGTTTAAACGCATTTAATTTCTTGATTGGGTGTATCTCTTGTGGAACTCAACAAAATAGATTAGCTATTGAGTCTCATTATTTTAGTTTATAGATACGTTATTATTTTTCTGTTGCTTTCTTGAGCATTAGTTTGTTGTTTGTAATTAAAGATCGTTCATCATGCCAAAAGCTTTCAAATTTGATCGATATTTAATTTCACTGCAACCGATGTCAGGTTCAGCGTCATCGAAAAATCAACACGTGTCTAATAATATATATTTTTCATTTTGTTCAATCTATCTGTTGTCGTAATATTCTTGTAAATTAATTTGTGTTTCTTATTCCGAATAACATGTCTGCTAAGGCTGGTTTGGGTTTTGGTACCACTTTTTCGACCATTAGTGCGTATGTCAATGGTGTTATGAGAGTTTTAAAACTGAACGACACTGAGTTCATTCCTACCTGTTTAGCCATAACCATTACGGGAGATGTGGTTGTTGGTGGTCCAGCCCAAGTTCTTGAGGAAGACGAGGTGGCTAACTGTTATTTTTATGATTTGAAGAGATGGGTTGGTGTAGATAAAATCAATTTTGATGAAATAAAAGAAAAAATAAAACCATTATATGTGGCGGAGTTAGATGGTAATGATGTCAAATTGACTGGAATTGATCGTGGTTTCTCATGTACGTACACAGTTAAACAGCTGATTTTATTGTACGTTGAGACTCTGGTCAGACTATTTTCAAAAGTTGAAAATTTGAACATAATTAGTCTAAATGTTTCAGTACCAGCAGATTATAAGTGCAAACAAAGGATGTTTATGAAATCGGTGTGTGATAGTTTGGGTTTTTCACTGCGAAGGATTATCAACGAACCGTCAGCAGCAGCTATTTATTTTGTATCAAAATATGCTCATTTCGATTCTTTCCTCATGTACGATCTTGGCGGTGGTACTTACGATTCATCTTTAATTGTTAAGGATGGGAAATATGTCACTGTCGCAGACACTGAGGGAGATTCGTTCTTAGGTGGTAGAGATATAGACAGAGCAATTTCAAATTATATAAAAAATAAATACAATCTCAAATTTCCGTTGTCAGCCGATTTCCTAGCTTCAATCAAGGAAGAGGCCAATTCTAAAGGAAGGGATTCCTTTAATGTGGTGGATGAAAAGGGGCGTTTGATAACTGTGAAAATGTCTAGAGAAGAGTTGGACTCGTGCATTGAGCCGTTTTCGAAGAAGAGCATCAACATCATAAAAAATATGGTTGTGAGAAACCAAATTAGGTCTGGTGCTTTATTTCTTGTGGGTGGTTCTTCACTGTTAAAGAAAATTCAAAGCGATGTAGCACAATTTGCGAAGAGTCACAATTTAGAGTGCATCATTGATCCAGACCTTCGATCAGCAGTGTCTTTTGGTTGTTCTATGTCACACGCTCAAGAGGACACAGGTAATATGGTTTACATCGATTGTAATTCTCATCCGTTGATGGACATAGCATTTTTTGGTAATCCTAAAGTCTTGGTCCGTAAACCAATGGCGATACCATACACATATAGGAAAGAGGAGTTTTTCAAATCTCACTATAGCACCATTTTGAATGTATATGAAGGGTCTGATCCATTTGTATTGTATAATGATTGGTTGATAAGTGCACGTATGCAGTCCAGTCTGTATTGCAATATAGGTGAAACTTTAGAGTACTTGTACAAATATAGTGTGGATGGTATATTAGAGTTATCAGTAAAAAATAAGACCACTGGCAAGGAGACGGTTTTACCTAATACTTTTACTTTGACTGAAAGTATTAAGAAATTGAATCTCAATTTGACTCAGTTATCTAATGTTGATGAAACAGCTACGTTGATAGCGATTTTGAGTCACTTTAAACCCGATCTTAAGCATTTACTAACTTACGTGAAAACACCCACGATTTTTGAGACGAAATTGAATAATATTTCATCTGCAAAAGAACTATATAAAAATCTTGTAGATATAAATGAAAAATTTAGCAACACATGAATGGGATTAAAGATAGTACTTTATTATTTTAATTGTGGTTTCTCAATATACTATTGTTCAGATAACAGGTTGTTTGAAGGTGACTTTGAAACCATATACACAGAGGATTTCAAAGATTTACTGGAGGTCGTGACCAATTATCCATTTGTTAAATTACAATGGTGAGTTTGAAGGAAAGTGAAAAATTAAAACATTGTTTTCAACTTCTTTTCAAACGTACAGATGTGTCTCCACAACTAGACGCTTTAGTTGAATACATGAGAAATAATTATAGGACAGAGAATTCCAACGTATATAAATCAATCAGTAGAAAGTCACCAATGTCATTTGACTCCCAATTTAGGCAAGTGGCTGGTGACATTCACTTTGTTGAACATGACAATAAGAGTATAGTAAAACTCATATATATCTACTTTAATAAGGTGGAACCGAACCTGTTAAAGAAATTGGCTTATCAACCGGGTTCATTATTCGTGACAGATGAATGGCTAGATTATTTATCTGAATGGGAAAAATATCTAGACAAGTCCATGAACGACTACCTCAATGACAACAAATCCCTAGGGTGTCTGTACACAGAAGATGACATTGCACGACATTACCCTGGATCCAGTAGATCTAGACTGATAACACTTTACAGGGTGTGTAATTCCCAGGGTCGTTTAATACCCATAGATGAGTTTCTATCAGGAGAAATTAAAGGTTTCGACATTCCCACAGCATCAGATGCAGTATTGATAGGTGAGGGTATATCAAACAATCCATTATTTTCTGAATGTGTTCAAGCTTTCAGAGAGTATGTCAGGTTAATGAATTCTAAAGCTGGTCAAGCAAAAATCAATGTGAATAAGAGATTTTTTGACGTTTACTTCGAATCAATGTCACAGAATCCTGAGATGATCAGAGTAAAAGAGAACCCCCTTGTTTTGGCTAAGTTTATGAAAGAATTCGATTCCCTCACAGTGAATAGTCGAGGTTTTGCCGACAACATTAACGCCATTAAAACTTTGGACAAGGATTTCCAAAGATTCATAAAGGATGTGTTTATGTTGAACAATAGTCTGGATGAAGATTCTTTATTTGTGAAGATGCCAAAAGATTCAGTAATCGATATCCTAGGTCAACCAATTTCTTTATCGAACTATCTTAGGACCAGTGATATACCACCACCACTGAGTAACTCATCGTCACTTTCAGATGTTGTCGATACCGTAGTCTCAGAAGGATTTTACTCGTTTTTTAAGAAATTTGGTGTTACAGACAAACAACTACTATTGGACGCGTTATTGTTTGTATTCGGTAAGCTCACTACCAATAAAAATTTTTGGGAAAAACCAAATAATGTGAAATTTAAAGTTGATAGTAAGGTCATTAGTTTCGTCTCATCAGATTTGACTAGTCATATTAAAAACTGTGTTAAGAGGTTTGATCCTACTTATGATTGTAACAACATAATAAGACAGTGGGCTAATTTGAGAGGTAACAGGGCAGTCAGACTGTTTAGATTGACAGGATTCAGACCTGGATTGTTCAGCACTATTCCTGGTATTGTTCCTTGGATGAGATTCGATTTCTTCAAGTTGTTAACTGTTCAAAACCTTAGTCATGATGAAGAGACATCTTTCCGCACACTCCGCCTAATGACGGAGCACAAGTCGAATAAGTCTAGTAGCGACGATTGTGAATTTTATAAATGGATCTCTCGAAGTTAATTGAAAAATATGGTGAGGACAAAGTGGAAAAGTACTACTCGTTGTACAGAAATGCAAAATTTTCAGCAGGCGGTACTACTTTATGCGTCTTAAGGTTGATCAACGAAAAATTAATGAAATTCACCGAGGACAATAAACCTTCAGGATTTAATGACGTTGACGTATCGGAATTTCTAGAATGTGTATATTGGTTTAGCTTATTACCAAAATTTTTTAACTGATCAGTGATTATCTTCAAATTCAATTTGTTTTACTGTAGTCTGGAGGTATATTTCGTAAGTGATCGCAATCAATAAGGCGGCGACCTAATCGAAAAAATAATTTTGAAAAGTTACTCGATCTACATTAAATATGGAGAAGACTGACAATAAACAAAATGATGATTTGAACAAGATAACTGAGGATGGAGCC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| 10,151
|
OR492252.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Gezovitch,O., Luria,N., Lachman,O., Sela,N., Smith,E., Dombrovsky,A.
|
ARO, volcani center, Plant Pathology and Weed research
|
Israel
|
2023-10-21
|
cannabis1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
GenBank
| null |
Israel
|
Israel
|
Cannabis sativa
| null |
2020-09
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate cannabis1 segment RNA1, complete sequence
|
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| 11,807
|
OP912391.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Lee,B.-C., Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-02-01
|
CCYV-C-JJ2
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
GenBank
| null |
South Korea: Jeju
|
South Korea
|
Cucumis sativus
| null |
2021-10
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-C-JJ2 segment RNA1, complete sequence
|
GGAAATCAACACTCCTTCGTACGAAGAGAAAAACTCTAAGTACGAATTTCCAGCCCTTGAAGCCGCTTCCTTAATGGCCGTGACTTCGCCCCAAACCCACCCCTTGCTACCAAGAGGATGTGCCGTGCCACCATGTGGTCTGGCATACTTCTTGAGATGTGTTCCACGCTTGTGGTACGCATCACTAACCTATCCCAACAAAACTAAAAATAACATAAAACAAAACAAAAAGCAACTAAAACAAACTCGATTAGGTCCCGTACAGACCGGTGGTAAAGTTGCACCACCAACTTCAGTCTACAAAGTGTCCTTCAAAAGACGCTTAGTATCCCCGGGACCTAACCCTGTAAAAATCCAAATACTAAGTAACGGTAATGCTCTCCTTATTCCTCAACCGAGATCATATTACAAAACTAGGTTGAATGTGTTGAGGTCTATGTGTAATATTCCATATTGCAAATTTAATAGAATGCCCAAAGCTGTCATTTCGAAATTTGGGTATGATGTTAATAAGATTAATGAAATAATTGACCAGACCCTTAATAGTAAAGTAGGTGGCACTGAAACCCCAGTTCGTCAACTTGATGAGACCATCCAAGGTGCCACAAAATCTGGGGATGGTTACAAAATTTTTAATTTTAATAATAAGCGTGTAGTAGAGATTTTTGTTTGTTTTAATAGTTATGTTAAAGATATTTATATGTGTAAGTTTGTTTTAGAGTTAAAATATAATAAAAATGGGAGACCTGTTGATGTGTTAGTGTCATTAATCAAATCTTATGGGAAGACACCCGGTCAACATTTCTGTTCTCCTTTCCTCTTGTCTTCACGTCTCGACACAAGACAATTTTCTGCCAAAGTCCTGTTAGCGTCAATCCTTGACAAAGTACCTGATTACTCATACTTTTATGGGTTATATTTGGGTAAATTATTCAGTCAACGCTTAACAGTGGCTAGGTCAACTGTCTTTGCTGCGTGCCAACAGTACCTCAACTACATGAGAAGCAAGGTTGGGTCAACTGTGTCGAGCCCTGTGAAATCCAAAGTCAACAAAATATCAAGACCCATTCACAAGTATTCTGTGATGCATTTTGTCACTAGAACTGGGTTTGAATATTTTGTCATTCGTTTTAATGATGGTAGGGAAGTGAGGATTAACAATTCTAGATTTGCCATCAAAGAGATGTACAATGCAACCCTTGATAGGGGGTCGTTTTACATCCATCCCAAGTGTTACACTCCAAATTGGGAAAGATTTGAGTCCTGTGGCAACAGATACTGCTGGATTCCTGCTTTCGGCAAAGCTAATATGAGAATGCCCAGAGATTTAGTCCCTTACCCTGAGATGAATTATGGGTATTTATTGCAGTGTGGTTTGGAAAAAGTTTTAGCTGGTAGGTTGATGAGGGTTAGGGATGATTATTTTCACTTTGACGTCAACTACAACATCAAAGGATCTATGGTGAGATATGGTAGTAAGATTGGTGTTAAGCTTGATAATGATTTTGATGGTATAATAAAAAATATAGAGATTTTGTATGATGATATCAGTGCAGGTATAATATCAGGGTCAAATCTGCGAAGCGACAACCCATTACTCAACACAATAACCACCAGGCTGTCGAATCAGATTAATGATCAATGCAACAAGGCAAAGGATTTGGTGATACCCACTTGTATGACTAGTAGACAAAAGCGGGAATTAAGTGAACTTTTTCCCGAGATTAACTTTGATTTCACCGAGTCCACTTTCTCTACTCATGCTCTAGCCACAGCCATGAGACATGCTGAGAATTATTTGTTGGCTAGGAAGTGTGGTTTTAGGGATTTTGTTGATGCAGGTGGTGATATTACTCATTATCTAGGTAAAATTGTATCAGGCGTGCATGTTTGTACTCCGATAGTCGACGTTAAAGATGCTCACAGACACATGACCAGGAGTAACAAACTAGACAAAATGATTGGTGTTTGTGAAAAAGCTGATATGTGCGACAAACTAACTCAGAATTGCAGAGTTGAGAAACCCAACATTATAGCCGTTCAGGTATATGATATGACATTGGAGGACTTCGCTCGAGCTTTGGTGTCACACAAAGCGAAAAGAGTGGATTTCACCATGATTATTCCTCCTGAGATTTATGATGAAGATTGTGATGTTAGTTTGTTTGATGACTCTATTAAAATCAAATGTGAGGGGAATAAAGTACAGTATTCTTATGGTGACAGTGGTGAAATCTATCAACATGACAGGGAGAACTTGAAAAGAATTTTGACGACACAGATTTTTGAAGTGGACGGGATGATCTTCAAGAAAACCCTTGAAACGTCACGTAAACAACTTCATTTTTATTCAGTTGTCGAATGCTCCGATATGATGAACGGTAAATATATCACCGAGACTCATTATACAAGGTCAGAGTTGGACAAATTATGTATAAGAGTACCTGTTGAAAATGAGGCACGGGTTGTCGAGCACATGAAGATAAAGATGGATAAATCCTGTTTTCACAACCTGGTAGAATATGCTATGAACACAGTATTGAGGTTAGATGAGAAAGCATTTGAATACATTTTGTCTCAATACAGGGCTCGAAAATCTATTTCGATCAGAGGTGGTAAGGTTACGCAGGTTGGAGCCGACATGCATCCGAAAGCTGTGGCAGGTTTGATTGGTGCTGTAGCTGGTTATGGTCTGCGATTGCGAGAACAATCACATAAATCCGCAAAAGTTGCTTATTCTGAGTATTACACACCATCGCTTTTCCGTATGTTATGTAAGATTGTTTCTTATGTAATGAAGAGGTTGTGTAGCTGGACTCACGAGTTCTTAAATGAGGTGTTGAAGTATGTAACACCAAAATACATTTATAGTGAAGTGACTGCTAATCAATGTGGTGTGTATGAATATATAGGTGAATATAGGTTTAAACAGACCGTGAATATAGTTGGCAAGAGAAACGAAAGGAGGATTCTGTCCGACAGTTATGAAAAATTTAAGAAATACAGTGAGAAGGTGTATGAAAATCTCGACACCCATACTTCTGATAAGGAAGAATTATTCACCCAGGATATTCAGAAAACGTTGAATGATATTTTCGATCTGGGTGGTGCTGGGAAGTCTATGCCTACTCCTAGTGTCAACATCCAAATGTTACCATTCAACGTTTATAATAAGATCTATTCATTGTTGTTAGGTTGGTTGAAGGATGATAAGAGAACGGCAAGGTATACCAACTATATTTGTGGAATTTATGATTATTATAAAAATTTTTCACATTCAACTTATGATTTCGTTGTAAATATTTTGAAGGAGATATTTTTAGCCATAAAGAACGGTGTGGTAAATTTTTCTCAAAAAGTTGCAGGAAATCTGAAGAGAGCTGCATCGACAATGAAAAATTTGATAAAAATGAAGAACACCAATTGGGAAAAAGACTTGGATGATATGCTTAAGAAAACAGATGAAATGTTCGGAGTTGATACGCATGAACAGAGGAATGACTGTTCATCTGTTTCAAATGGTGGTATCTATGAAGGATTGGACAAGTTGTTTGATATCGGTAATGAAGGGGGTTCTGGCAGGGTTAGTTCAAAAATAGGTGTGGTTTGTGACAAGTTAATTTTGAAGACAAATCAGTGTTTGCTTAATGTCAAAACATTTTGCACAGCCTTTGTTGAATCACTAATAAGTCTGTCCGGTCGTTGTGCTGTGAAAACTAAGGAATTTAAAGTTTTTGTGGGGAAAATCGTTGAACAGTTGATGGAAACATCATCACTGATAAGAATAGTCGACGGTGTAGCTTTCACTTTTGTCAATCTTTTTATGGCATTAGTGTTAGGAGAGATAAATTTTATTCGCTTATTCTTAGCCACGTGCACTTTCCTCTACCTCAGACATTCGAAAGCAAGTGTTAAATGGGTCGGTAATTACGTGTTAGGAGACGCCGCATCAGCCCTCATCGCGAACCCAGGCTATGCAGGTCTCATTATGGCCCCAGTCACTTTAATAGCGAGTAGGGTTGTGGGATTGGAGTTGAAAAGTAAGTGTACGAGATTCATTAAAGATGAAGAAAAAGCATTAAATATGGTCGCTAGTGAAGTTAATAATAAATATCACTTTGATTGGTTGAGACCTGAAATTGTTAAATCTTTAATAGGTTTTTCTGTGATTCTGATGCTGTTAGCTCCGAGATATGGCATAAGTATGATCATATTTTTTATGTTGTTGAATGATTATGTTAAGTATCTTAGGAGTTACTGTGTCAGAGCCAATATCATGTTAAGCTATGGTAGTGTGTTGAAGAGAACGATACCATCAGGGAGATATAAAGCACTAAAGAATATCTTCGTCAAAAAATTTGACACGTCAATATTCTCGGCCAAGAAAGAAGAAGGTGTTAATGGGGGCGACGAAGATGATAACAATGATGTCATTTGTAGGGTGGGTATGAAACCTGACGATGATGATGTTGAAGTTGAATTGGGATATGATGGGAAAGAAATAGTGAACGAGAGCAAACATGCAAATTGGGGTTCTGAGTCGAATTCTACAGAATCACCAGAATGTGTGGACGGTTTAAATTTTTCTTTACTAAAACCGTCAACAGACAGAACCCAAGTCAATTGTTCTGTCCATTTCTCCCTAAGTCATGCTTTGTTAGATTTTCCGCTGACAAATTACCATGACTTTGTACCGACTGGTGATGATTTTATTGATTGTGTTAGTGAATTTTACCATCTAGAAGCTAAGAAGTTACATGATGAGTTAGGAAGAGTCAATAATGCCGTTAGAGTTTACTTTGAACACAGTCTTGAAAAGAAATCGGTTGGTGAAGCAGTGTGGGCCATGAGAAATTATTTCAATGATTCCTCTGTGTTTATTAACTTGAACGGTCTACATTGGCATAGGTTGGGTAAGGGCGATAAGAAAGTCACCAATGTCGAGGCTATGTGTAAATACACTATTGACAATGACTTAATGGACTTTACACAAAAATACT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| 18,784
|
OP912392.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Kwak,H.-R., Byun,H.-S., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-02-01
|
CCYV-C-NS6
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
GenBank
| null |
South Korea: Nonsan
|
South Korea
|
Cucumis sativus
| null |
2021-05
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-C-NS6 segment RNA1, complete sequence
|
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| 18,785
|
OP912393.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-02-01
|
CCYV-M-UR27
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
GenBank
| null |
South Korea: Uiryeong
|
South Korea
|
Cucurbitaceae
| null |
2020-07
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-M-UR27 segment RNA1, complete sequence
|
GGAAATCAACACTCCTTCGTACGAAGAGAAAAACTCTAAGTACGAATTTCCAGCCCTTGAAGCCGCTTCCTTAATGGCCGTGACTTCGCCCCAAACCCACCCCTTGCTACCAAGAGGATGTGCCGTGCCACCATGTGGTCTGGCATACTTCTTGAGATGTGTTCCACGCTTGTGGTACGCATCACTAACCTATCCCAACAAAACTAAAAATAACATAAAACAAAACAAAAAGCAACTAAAACAAACTCGATTAGGTCCCGTACAGACCGGTGGTAAAGTTGCACCACCAACTTCAGTCTACAAAGTGTCCTTCAAAAGACGCTTAGTATCCCCGGGACCTAACCCTGTAAAAATCCAAATACTAAGTAACGGTAATGCTCTCCTTATTCCTCAACCGAGATCATATTACAAAACTAGGTTGAATGTGTTGAGGTCTATGTGTAATATTCCATATTGCAAATTTAATAGAATGCCCAAAGCTGTCATTTCGAAATTTGGGTATGATGTTAATAAGATTAATGAAATAATTGACCAGACCCTTAATAGTAAAGTAGGTGGCACTGAAACCCCAGTTCGTCAACTTGATGAGACCATCCAAGGTGCCACAAAATCTGGGGATGGTTACAAAATTTATAATTTTAATAATAAGCGTGTAGTAGAGATTTTTGTTTGTTTTAATAGTTATGTTAAAGATATTTATATGTGTAAGTTTGTTTTAGAGTTAAAATATAATAAAAATGGGAGACCTGTTGATGTGTTAGTGTCATTAATCAAATCTTATGGGAAGACACCCGGTCAACATTTCTGTTCTCCTTTCCTCTTGTCTTCACGTCTCGACACAAGACAATTTTCTGCCAAAGTCCTGTTAGCGTCAATCCTTGACAAAGTACCTGATTACTCATACTTTTATGGGTTATATTTGGGTAAATTATTCAGTCAACGCTTAACAGTGGCTAGGTCAACTGTCTTTGCTGCGTGCCAACAGTACCTCAACTACATGAGAAGCAAGGTTGGGTCAACTGTGTCGAGCCCTGTGAAATCCAAAGTCAACAAAATATCAAGACCCATTCACAAGTATTCTGTGATGCATTTTGTCACTAGAACTGGGTTTGAATATTTTGTCATTCGTTTTAATGATGGTAGGGAAGTGAGGATTAACAATTCTAGATTTGCCATCAAAGAGATGTATAATGCAACCCTTGATAGGGGGTCGTTTTACATCCATCCCAAGTGTTACACTCCAAATTGGGAAAGATTTGAGTCCTGTGGCAACAGATACTGCTGGATTCCTGCTTTCGGCAAAGCTAATATGAGAATGCCCAGAGATTTAGTCCCTTACCCTGAGATGAATTATGGGTATTTATTGCAGTGTGGTTTGGAAAAAGTTTTAGCTGGTAGGTTGATGAGGGTTAGGGATGATTATTTTCACTTTGACGTCAACTACAACATCAAAGGATCTATGGTGAGATATGGTAGTAAGATTGGTGTTAAGCTTGATAATGATTTTGATGGTATAATAAAAAATATAGAGATTTTGTATGATGATATCAGTGCAGGTATAATATCAGGGTCAAATCTGCGAAGCGACAACCCATTACTCAACACAATAACCACCAGGCTGTCGAATCAGATTAATGATCAATGCAACAAGGCAAAGGATTTGGTGATACCCACTTGTATGACTAGTAGACAAAAGCGGGAATTAAGTGAACTTTTTCCCGAGATTAACTTTGATTTCACCGAGTCCACTTTCTCTACTCATGCTCTAGCCACAGCCATGAGACATGCTGAGAATTATTTGTTGGCTAGGAAGTGTGGTTTTAGGGATTTTGTTGATGCAGGTGGTGATATTACTCATTATCTAGGTAAAATTGTATCAGGCGTGCATGTTTGTACTCCGATAGTCGACGTTAAAGATGCTCACAGACACATGACCAGGAGTAACAAACTAGACAAAATGATTGGTGTTTGTGAAAAAGCTGATATGTGCGACAAACTAACTCAGAATTGCAGAGTTGAGAAACCCAACATTATAGCCGTTCAGGTATATGATATGACATTGGAGGACTTCGCTCGAGCTTTGGTGTCACACAAAGCGAAAAGAGTGGATTTCACCATGATTATTCCTCCTGAGATTTATGATGAAGATTGTGATGTTAGTTTGTTTGATGACTCTATTAAAGTCAAATGTGAGGGGAATAAAGTACAGTATTCTTATGGTGACAGTGGTGAAATCTATCAACATGACAGGGAGAACTTGAAAAGAATTTTGACGACACAGATTTTTGAAGTGGACGGGATGATCTTCAAGAAAACCCTTGAAACGTCACGTAAACAACTTCATTTTTATTCAGTTGTCGAATGCTCCGATATGATGAACGGTAAATATATCACCGAGACTCATTATACAAGGTCAGAGTTGGACAAATTATGTATAAGAGTACCTGTTGAAAATGAGGCACGGGTTGTCGAGCACATGAAGATAAAGATGGATAAATCCTGTTTTCACAACCTGGTAGAATATGCTATGAACACAGTATTGAGGTTAGATGAGAAAGCATTTGAATACATTTTGTCTCAATACAGGGCTCGAAAATCTATTTCGATCAGAGGTGGTAAGGTTACGCAGGTTGGAGCCGACATGCATCCGAAAGCTGTGGCAGGTTTGATTGGTGCTGTAGCTGGTTATGGTCTGCGATTGCGAGAACAATCACATAAATCCGCAAAAGTTGCTTATTCTGAGTATTACACACCATCGCTTTTCCGTATGTTATGTAAGATTGTTTCTTATGTAATGAAGAGGTTGTGTAGCTGGACTCACGAGTTCTTAAATGAGGTGCTGAAGTATGTGACCCCAAAATACATTTATAGTGAAGTGGGTGATAATCAATGTGGTGTGTATGAATATATAGGTGAATATAGGTTTAACCAGACCGTGAATATAGTTGGCAAGAGAAACGAAAGGAGGATTCTGTCCGACAGTTATGAAAAATTTAAGAAATACAGTGAGAAGGTGTATGAAAATCTCGACACCCATACTTCTGATAAGGAAGAATTATTCACCCAGGATATTCAGAAAACGTTGAATGATATTTTCGATCTGGGTGGTGCTGGGAAGTCTATGCCTACTCCTAGTGTCAACATCCAAATGTTACCATTCAACGTTTATAATAAGATCTATTCATTGTTGTTGGGTTGGTTGAAGGATGATAAGAGAACGGCAAGGTATACCAACTATATTTGTGGAATTTATGATTATTATAAAAATTTTTCACATTCAACTTATGATTTCGTTGTAAATATTTTGAAGGAGATATTTTTAGCCATAAAGAACGGTGTGGTAAATTTTTCTCAAAAAGTTGCAGGAAATCTGAAGAGAGCTGCATCGACAATGAAAAATTTGATAAAAATGAAGAACACCAATTGGGAAAAAGACTTGGATGATATGCTTAAGAAAACAGATGAAATGTTCGGAGTTGATACGCATGAACAGAGGAATGACTGTTCATCTGTTTCAAATGGTGGTATCTATGAAGGATTGGACAAGTTGTTTGATATCGGTAATGAAGGGGGTTCTGGCAGGGTTAGTTCAAAAATAGGTGTGGTTTGTGACAAGTTAATTTTGAAGGCAAATCAGTGTTTGCTTAATGTCAAAACATTTTGCACAGCCTTTGTTGAATCACTAATAAGTCTGTCCGGTCGTTGTGCTGTGAAGACTAAGGAATTCAAAGTTTTTGTGGGGAAAATCGTTGAACAGTTGATGGAAACATCATCACTGATAAGAATAGTCGACGGTGTAGCTTTCACTTTTGTCAATCTTTTTATGGCATTAGTGTTAGGAGAGATAAATTTTATTCGCTTATTCTTAGCCACGTGCACTTTCCTCTACCTCAGACATTCGAAAGCAAATGTTAAATGGGTCGGTAATTACGTGTTAGGAGACGCCGCATCAGCCCTCATCGCGAACCCAGGCTATGCAGGTCTCATTATGGCCCCAGTCACTTTAATAGCGAGTAGGGTTGTGGGATTGGAGTTGAAAAGTAAGTGTACGAGATTCATTAAAGATGAAGAAAAAGCATTAAATATGGTCGCTAGTGAAGTTAATAATAAATATCACTTTGATTGGTTGAGACCTGAAATTGTTAAATCTTTAATAGGTTTTTCTGTGATTCTGATGCTGTTAGCTCCGAGATATGGCATAAGTATGATCATATTTTTTATGTTGTTGAATGATTATGTTAAGTATCTTAGGAGTTACTGTGTCAGAGCCAATATCATGTTAAGCTATGGTAGTGTGTTGAAGAGAACGATACCATCAGGGAGATATAAAGCACTAAAGAATATCTTCGTCAAAAAATTTGACACGTCAATATTCTCGGCCAAGAAAGAAGAAGGTGTTAATGGGGGCGACGAAGATGATAACAATGATGTCATTTGTAGGGTGGGTATGAAACCTGACGATGATGATGTTGAAGTTGAATTGGGATATGATGGGAAAGAAATAGTGAACGAGAGCAAACATGCAAATTGGGGTTCTGAGTCGAATTCTACAGAATCACCAGAATGTGTGGACGGTTTAAATTTTTCTTTACTAAAACCGTCAACAGACAGAACCCAAGTCAATTGTTCTGTCCATTTCTCCCTAAGTCATGCTTTGTTAGATTTTCCGCTGACAAATTACCATGACTTTGTACCGACTGGTGATGATTTTATTGATTGTGTTAGTGAATTTTACCATTTAGAAGCTAAGAAGTTACATGATGAGTTAGGAAGAGTCAATAATGCCGTTAGAGTTTACTTTGAACACAGTCTTGAAAAGAAATCGGTTGGTGAAGCAGTGTGGGCCATGAGAAATTATTTCAATGATTCCTCTGTGTTTATTAACTTGAACGGTCTACATTGGCATAGGTTGGGTAAGGGCGATAAGAAAGTCACCAATGTCGAGGCTATGTGTAAATACACTATTGACAATGACTTAATGGACTTTACACAAAAATACT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| 18,786
|
OP912394.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Kwak,H.-R., Byun,H.-S., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-02-01
|
CCYV-W-JE7
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
GenBank
| null |
South Korea: Jeongeup
|
South Korea
|
Citrullus lanatus subsp. vulgaris
| null |
2022-09
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-W-JE7 segment RNA1, complete sequence
|
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| 18,787
|
OP912395.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Lee,B.-C., Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-02-01
|
CCYV-C-JJ2
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,040
|
GenBank
| null |
South Korea: Jeju
|
South Korea
|
Cucumis sativus
| null |
2021-10
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-C-JJ2 segment RNA2, complete sequence
|
GGAAATTATCCACGGTTTCCCCGAGGTAATGGGAAGTCCCAACCCCCTCGAAACAGCCCCCTCGCTTTCTCAGCGTGGAAACTGAGAGAGGAGAATGGATTATTGTGTGGGCGCACTAGTTGTATACACACATGCCATTCTTCGATCTTAGTAACTGAGATCGCCTATCTTGACAACACTCAGTTGTCAACATGTCCAAACAAAACAAAAACAAAAAACAAAATAACACAATAAACGCCTGCCACTAAACAAGGCTTTAGTCAACGATCGTACAAAGTAACTGGTGTACGGTTGCCGCGTTTGTTAGTCACCACCGCCTCTGGCTAAGGGTCGGTCACGGTGCAAGTCGTCTGACGACTGGTGAAGAATCCCAGTCGTCTACTACGTACCTGCATTGTTGTCCCATATCCCCCCCCCCAGAGATCCGGTTTGTTTATCCGTTTGTCATTTTCCTTATGTTGATGAAATAAAAATCATTAAAGTGTTATACACTTTTTATATGTAATTTAATTTTGTCGTTTCTAAGAACATGATCAAGTCGTGAGTCATATTTTACTTTAAACCTATCGCCTGTCTTCAAGACAGTCGTTATTAATCCGACAAGTTGGTATCGGAATGTTGATTCACATTTGCCATTCGTTCTTGGAACGGTTGTATTTGTCGTTTTAGTGTTTTATCATCTTATTGTTGGGTTTTTGTTTTTGAGTTTTTGTTTCCAGTGCAGTTTGAGTTAGTGTTCTAAAAGCAAGTTCTGTGAGAGTTGACGAAAACTATAAACCTACCGCCTTTCTCTCGGAAAGTCGTTATCAATCCGACAAGTTGGTATCGGATGGTTAACTTACACAATACTTTGATTTTTATTACTGTCGAATTTGTTTAAACGCATTTAATTTCTTGATTGTGTGTATCTCTTGTGGAACTCAACAAAATAGATTAGCTGTTGAGTCTCATTATTTTAGTTTATAGATACGTTATTATTTTTCTGTTGCTTTCTTGAGCATTAGTTTGTTGTTTGTAATTAAAGATCGTTCATCATGCCAAAAGCTTTCAAATTTGATCGATATTTAATTTCACTGCAACCGATGTCAGGTTCAGCGTCATCGAAAAATCAACACGTGTCTAATAATATATATTTTTCATTTTGTTCAATCTATCTGTTGTCGTAATATTCTTGTAAATTAATTTGTGTTTCTTATTCCGAATAACATGTCTGCTAAGGCTGGTTTGGATTTTGGTACCACTTTTTCGACCATTAGTGCGTATGTCAATGGTGTTATGAGAGTTTTAAAACTGAACGACACTGAGTTCATTCCTACCTGTTTAGCCATAACCATTACGGGAGATGTGGTTGTTGGTGGTCCAGCCCAAGTTCTTGAGGAAGACGAGGTGGCTAACTGTTATTTTTATGATTTGAAGAGATGGGTTGGTGTAGATAAAATCAATTTTGATGAAATAAAAGAAAAAATAAAACCATTATATGTGGCGGAGTTAGATGGTAATGATGTCAAATTGACTGGAATTGATCGTGGTTTCTCATGTACGTACACAGTTAAACAGCTGATTTTATTGTACGTTGAGACTCTGGTCAGACTATTTTCAAAAGTTGAAAATTTGAACATAATTAGTCTAAATGTTTCAGTACCAGCAGATTATAAGTGCAAACAAAGGATGTTTATGAAATCGGTGTGTGATAGTCTGGGTTTTTCACTGCGAAGGATTATCAACGAACCGTCAGCAGCAGCTATTTATTTTGTATCAAAATATGCTCATTTCGATTCTTTCCTCATGTACGATCTTGGCGGTGGTACTTACGATTCATCTTTAATTGTTAAGGATGGGAAATATGTCACTGTCGCAGACACTGAGGGAGATTCGTTCTTAGGTGGTAGAGATATAGACAGAGCAATTTCAAATTATATAAAAAATAAATACAATCTCAAATTTCCGTTGTCAGCCGATTTCCTAGCTTCAATCAAGGAAGAGGCCAATTCTAAAGGAAGGGATTCCTTTAATGTGGTGGATGAAAAGGGGCGTTTGATAACTGTGAAAATGTCTAGAGAAGAGTTGGACTCGTGCATTGAGCCGTTTTCGAAGAAGAGCATCAACATCATAAAAAATATGGTTGTGAGAAACCAAATTAGGTCTGGTGCTTTATTTCTTGTGGGTGGTTCTTCACTGTTAAAGAAAATTCAAAGCGATGTAGCACAATTTGCGAAGAGTCACAATTTAGAGTGCATCATTGATCCAGACCTTCGATCAGCAGTGTCTTTTGGTTGTTCTATGTCACACGCTCAAGAGGACACAGGTAATATGGTTTACATCGATTGTAATTCTCATCCGTTGATGGACATAGCATTTTTTGGTAATCCTAAAGTCTTGGTCCGTAAACCAATGGCGATACCATACACATATAGGAAAGAGGAGTTTTTCAAATCTCACTATAGCACCATTTTGAATGTATATGAAGGGTCTGATCCATTTGTATTGTATAATGATTGGTTGATAAGTGCACGTATGCAGTCCAGTCTGTATTGCAATATAGGTGAAACTTTAGAGTACTTGTACAAATATAGTGTGGATGGTATATTAGAGTTATCAGTAAAAAATAAGACCACTGGCAAGGAGACGGTTTTACCTAATACTTTTACTTTGACTGAAAGTATTAAGAAATTGAATCTCAATTTGACTCAGTTATCTAATGTTGATGAAACAGCTACGTTGATAGCGATTTTGAGTCACTTTAAACCCGATCTTAAGCATTTACTAACTTACGTGAAAACACCCACGATTTTTGAGACGAAATTGAATAATATTTCATCTGCAAAAGAACTATATAAAAATCTTGTAGATATAAATGAAAAATTTAGCAACACATGAATGGGATTAAAGATAGTACTTTATTATTTTAATTGTGGTTTCTCAATATACTATTGTTCAGATAACAGGTTGTTTGAAGGTGACTTTGAAACCATATACACAGAGGATTTCAAAGATTTACTGGAGGTCGTGACCAATTATCCATTTGTTAAATTACAATGGTGAGTTTGAAGGAAAGTGAAAAATTAAAACATTGTTTTCAACTTCTTTTCAAACGTACAGATGTGTCTCCACAACTAGACGCTTTAGTTGAATACATGAGAAATAATTATAGGACAGAGAATTCCAACGTATATAAATCAATCAGTAGAAAGTCACCAATGTCATTTGACTCCCAATTTAGGCAAGTGGCTGGTGACATTCACTTTGTTGAACATGACAATAAGAGTATAGTAAAACTCATATATATCTACTTTAATAAGGTGGAACCGAACCTGTTAAAGAAATTGGCTTATCAACCGGGTTCATTATTCGTGACAGATGAATGGCTAGATTATTTATCTGAATGGGAAAAATATCTAGACAAGTCCATGAACGACTACCTCAATGACAACAAATCCCTAGGGTGTCTGTACACAGAAGATGACATTGCACGACATTACCCTGGATCCAGTAGATCTAGACTGATAACACTTTACAGGGTGTGTAATTCCCAGGGTCGTTTAATACCCATAGATGAGTTTCTATCAGGAGAAATTAAAGGTTTCGACATTCCCACAGCATCAGATGCAGTATTGATAGGTGAGGGTATATCAAACAATCCATTATTTTCTGAATGTGTTCAAGCTTTCAGAGAGTATGTCAGGTTAATGAATTCTAAAGCTGGTCAAGCAAAAATCAATGTGAATAAGAGATTTTTTGACGTTTACTTCGAATCAATGTCACAGAATCCTGAGATGATCAGAGTAAAAGAGAACCCCCTTGTTTTGGCTAAGTTTATGAAAGAATTCGATTCCCTCACAGTGAATAGTCGAGGTTTTGCCGACAACATTAACGCCATTAAAACTTTGGACAAGGATTTCCAAAGATTCATAAAGGATGTGTTTATGTTGAACAATAGTCTGGATGAAGATTCTTTATTTGTGAAGATGCCAAAAGATTCAGTAATCGATATCCTAGGTCAACCAATTTCTTTATCGAACTATCTTAGGACCAGTGATATACCACCACCACTGAGTAACTCATCGTCACTTTCAGATGTTGTCGATACCGTAGTCTCAGAAGGATTTTACTCGTTTTTTAAGAAATTTGGTGTTACAGACAAACAACTACTATTGGACGCGTTATTGTTTGTATTCGGTAAGCTCACTACCAATAAAAATTTTTGGGAAAAACCAAATAATGTGAAATTTAAAGTTGATAGTAAGGTCATTAGTTTCGTCTCATCAGATTTGACTAGTCATATTAAAAACTGTGTTAAGAGGTTTGATCCTACTTATGATTGTAACAACATAATAAGACAGTGGGCTAATTTGAGAGGTAACAGGGCAGTCAGACTGTTTAGATTGACAGGATTTAGACCTGGATTGTTCAGCACTATTCCTGGTATTGTTCCTTGGATGAGATTCGATTTCTTCAAGTTGTTAACTGTTCAAAACCTTAGTCATGATGAAGAGACATCTTTCCGCACACTCCGCCTAATGACGGAGCACAAGTCGAATAAGTCTAGTAGCGACGATTGTGAATTTTATAAATGGATCTCTCGAAGTTAATTGAAAAATATGGTGAGGACAAAGTGGAAAAGTACTACTCGTTGTACAGAAATGCAAAATTTTCAGCAGGCGGTACTACTTTATGCGTCTTAAGGTTGATCAACGAAAAATTAATGAAATTCACCGAGGACAATAAACCTTCAGGATTTAATGACGTTGACGTATCGGAATTTCTAGAATGTGTATATTGGTTTAGCTTATTACCAAAATTTTTTAATTGATCAGTGATTATCTTCAAATTCAATTTGTTTTACTGTAGTCTGGAGGTATTTTTCGTAAGTGATCGCAATCAATAAGGCGGCGACCTAATCGAAAAAATAATTTTGAAAAGTTACTCGATCTACATTAAATATGGAGAAGACTGACAATAAACAAAATGATGATTTGAACAAGATAACTGAGGATGGAGCC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| 18,788
|
OP912396.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Kwak,H.-R., Byun,H.-S., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-02-01
|
CCYV-C-NS6
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,041
|
GenBank
| null |
South Korea: Nonsan
|
South Korea
|
Cucumis sativus
| null |
2021-05
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-C-NS6 segment RNA2, complete sequence
|
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| 18,789
|
OP912397.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-02-01
|
CCYV-M-UR27
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,041
|
GenBank
| null |
South Korea: Uiryeong
|
South Korea
|
Cucurbitaceae
| null |
2020-07
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-M-UR27 segment RNA2, complete sequence
|
GGAAATTATCCACGGTTTCCCCGAGGTAATGGGAAGTCCCAACCCCCTCGAAACAGCCCCCTCGCTTTCTCAGCGTGGAAACTGAGAGAGGAGAATGGAGTATTGTGTGGGCGCACTAGTTGTATACACACATGCCATTCTTCGATCTTAGTAACTGAGATCGCCTATCTTGACAACACTCAGTTGTCAACATGTCCAAACAAAACAAAAACAAAAAACAAAATAACACAATAAACGCCTGCCACTAAACAAGGCTTTAGTCAACGATCGTACAAAGTAACTGGTGTACGGTTGCCGCGTTTGTTAGTCACCACCGCCTCTGGCTAAGGGTCGGTCACGGTGCAAGTCGTCTGACGACTGGTGAAGAATCCCAGTCGTCTACTACGTACCTGCATTGTTGTCCCATATCCCCCCCCCCAGAGATCCGGTTTGTTTATCCGTTTGTCATTTTCCTTATGTTGATGAAATAAAAATCATTAAAGTGTTATACACTTTTTATATGTATTTTAATTTTGTCGTTTCTAAGAACATGATCAAGTCGTGAGTCATATTTTACTTTAAACCTATCGCCTGTCTTCAAGACAGTCGTTATTAATCCGACAAGTTGGTATCGGAATGTTGATTCACATTTGCTATTCGTTCTTGGAACGGTTGTATTTGTCGTTTTAGTGTTTTATCATCTTATTGTTGGGTTTTTGTTTTTGAGTTTTTGTTTCCAGTGCAGTTTGAGTTAGTGTTCTAAAAGCAAGTTCTGTGAGAGTTGACGAAAACTATAAACCTACCGCCTTTCTCTCGGAAAGTCGTTATCAATCCGACAAGTTGGTATCGGATGGTTAACTTACACAATACTTTGATTTTTATTACTGTCGAATTTGTTTAAACGCATTTAATTTCTTGATTGTGTGTATCTCTTGTGGAACTCAACAAAATAGATTAGCTATTGAGTCTCATTATTTTAGTTTATAGATACGTTATTATTTTTCTGTTGCTTTCTTGAGCATTAGTTTGTTGTTTGTAATTAAAGATCGTTCATCATGCCAAAAGCTTTCAAATTTGATCGATATTTAATTTCACTGCAACCGATGTCAGGTTCAGCGTCATCGAAAAATCAACACGTGTCTAATAATATATATTTTTCATTTTGTTCAATCTATCTGTTGTCGTAATATTCTTGTAAATTAATTTGTGTTTCTTATTCCGAATAACATGTCTGCTAAGGCTGGTTTGGATTTTGGTACCACTTTTTCGACCATTAGTGCGTATGTCAATGGTGTTATGAGAGTTTTAAAACTGAACGACACTGAGTTCATTCCTACCTGTTTAGCCATAACCATTACGGGAGATGTGGTTGTTGGTGGTCCAGCCCAAGTTCTTGAGGAAGACGAGGTGGCTAACTGTTATTTTTATGATTTGAAGAGATGGGTTGGTGTAGATAAAATCAATTTTGATGAAATAAAAGAAAAAATAAAACCATTATATGTGGCGGAGTTAGATGGTAATGATGTCAAATTGACTGGAATTGATCGTGGTTTCTCATGTACGTACACAGTTAAACAGCTTATTTTATTGTACGTTGAGACTCTGGTCAGACTATTTTCAAAAGTTGAAAATTTGAACATAATTAGTCTAAATGTTTCAGTACCAGCAGATTATAAGTGCAAACAAAGGATGTTTATGAAATCGGTGTGTGATAGTTTGGGTTTTTCACTGCGAAGGATTATCAACGAACCGTCAGCAGCAGCTATTTATTTTGTATCAAAATATGCTCATTTCGATTCTTTCCTCATGTACGATCTTGGCGGTGGTACTTACGATTCATCTTTAATTGTTAAGGATGGGAAATATGTCACTGTCGCAGACACTGAGGGAGATTCGTTCTTAGGTGGTAGAGATATAGACAGAGCAATTTCAAATTATATAAAAAATAAATACAATCTCAAATTTCCGTTGTCAGCCGATTTCCTAGCTTCAATCAAGGAAGAGGCCAATTCTAAAGGAAGGGATTCCTTTAATGTGGTGGATGAAAAGGGGCGTTTGATAACTGTGAAAATGTCTAGAGAAGAGTTGGACTCGTGCATTGAGCCGTTTTCGAAGAAGAGCATCAACATCATAAAAAATATGGTTGTGAGAAACCAAATTAGGTCTGGTGCTTTATTTCTTGTGGGTGGTTCTTCACTGTTAAAGAAAATTCAAAGCGATGTAGCACAATTTGCGAAGAGTCACAATTTAGAGTGCATCATTGATCCAGACCTTCGATCAGCAGTGTCTTTTGGTTGTTCTATGTCACACGCTCAAGAGGACACAGGTAATATGGTTTACATCGATTGTAATTCTCATCCGTTGATGGACATAGCATTTTTTGGTAATCCTAAAGTCTTGGTCCGTAAACCAATGGCGATACCATACACATATAGGAAAGAGGAGTTTTTCAAATCTCACTATAGCACCATTTTGAATGTATATGAAGGGTCTGATCCATTTGTATTGTATAATGATTGGTTGATAAGTGCACGTATGCAGTCCAGTCTGTATTGCAATATAGGTGAAACTTTAGAGTACTTGTACAAATATAGTGTGGATGGTATATTAGAGTTATCAGTAAAAAATAAGACCACTGGCAAGGAGACGGTTTTACCTAATACTTTTACTTTGACTGAAAGTATTAAGAAATTGAATCTCAATTTGACTCAGTTATCTAATGTTGATGAAACAGCTACGTTGATAGCGATTTTGAGTCACTTTAAACCCGATCTTAAGCATTTACTAACTTACGTGAAAACACCCACGATTTTTGAGACGAAATTGAATAATATTTCATCTGCAAAAGAACTATATAAAAATCTTGTAGATATAAATGAAAAATTTAGCAACACATGAATGGGATTAAAGATAGTACTTTATTATTTTAATTGTGGTTTCTCAATATACTATTGTTCAGATAACAGGTTGTTTGAAGGTGACTTTGAAACCATATACACAGAGGATTTCAAAGATTTACTGGAGGTCGTGACCAATTATCCATTTGTTAAATTACAATGGTGAGTTTGAAGGAAAGTGAAAAATTAAAACATTGTTTTCAACTTCTTTTCAAACGTACAGATGTGTCTCCACAACTAGACGCTTTAGTTGAATACATGAGAAATAATTATAGGACAGAGAATTCCAACGTATATAAATCAATCAGTAGAAAGTCACCAATGTCATTTGACTCCCAATTTAGGCAAGTGGCTGGTGACATTCACTTTGTTGAACATGACAATAAGAGTATAGTAAAACTCATATATATCTACTTTAATAAGGTGGAACCGAACCTGTTAAAGAAATTGGCTTATCAACCGGGTTCATTATTCGTGACAGATGAATGGCTAGATTATTTATCTGAATGGGAAAAATATCTAGACAAGTCCATGAACGACTACCTCAATGACAACAAATCCCTAGGGTGTCTGTACACAGAAGATGACATTGCACGACATTACCCTGGATCCAGTAGATCTAGACTGATAACACTTTACAGGGTGTGTAATTCCCAGGGTCGTTTAATACCCATAGATGAGTTTCTATCAGGAGAAATTAAAGGTTTCGACATTCCCACAGCATCAGATGCAGTATTGATAGGTGAGGGTATATCAAACAATCCATTATTTTCTGAATGTGTTCAAGCTTTCAGAGAGTATGTCAGGTTAATGAATTCTAAAGCTGGTCAAGCAAAAATCAATGTGAATAAGAGATTTTTTGACGTTTACTTCGAATCAATGTCACAGAATCCTGAGATGATCAGAGTAAAAGAGAACCCCCTTGTTTTGGCTAAGTTTATGAAAGAATTCGATTCCCTCACAGTGAATAGTCGAGGTTTTGCCGACAACATTAACGCCATTAAAACTTTGGACAAGGATTTCCAAAGATTCATAAAGGATGTGTTTATGTTGAACAATAGTCTGGATGAAGATTCTTTATTTGTGAAGATGCCAAAAGATTCAGTAATCGATATCCTAGGTCAACCAATTTCTTTATCGAACTATCTTAGGACCAGTGATATACCACCACCACTGAGTAACTCATCGTCACTTTCAGATGTTGTCGATACCGTAGTCTCAGAAGGATTTTACTCGTTTTTTAAGAAATTTGGTGTTACAGACAAACAACTACTATTGGACGCGTTATTGTTTGTATTCGGTAAGCTCACTACCAATAAAAATTTTTGGGAAAAACCAAATAATGTGAAATTTAAAGTTGATAGTAAGGTCATTAGTTTCGTCTCATCAGATTTGACTAGTCATATTAAAAACTGTGTTAAGAGGTTTGATCCTACTTATGATTGTAACAACATAATAAGACAGTGGGCTAATTTGAGAGGTAACAGGGCAGTCAGACTGTTTAGATTGACAGGATTTAGACCTGGATTGTTCAGCACTATTCCTGGTATTGTTCCTTGGATGAGATTCGATTTCTTCAAGTTGTTAACTGTTCAAAACCTTAGTCATGATGAAGAGACATCTTTCCGCACACTCCGCCTAATGACGGAGCACAAGTCGAATAAGTCTAGTAGCGACGATTGTGAATTTTATAAATGGATCTCTCGAAGTTAATTGAAAAATATGGTGAGGACAAAGTGGAAAAGTACTACTCGTTGTACAGAAATGCAAAATTTTCAGCAGGCGGTACTACTTTATGCGTCTTAAGGTTGATCAACGAAAAATTAATGAAATTTACCGAGGACAATAAACCTTCAGGATTTAATGACGTTGACGTATCGGAATTTCTAGAATGTGTATATTGGTTTAGCTTATTACCAAAATTTTTTAACTGATCAGTGATTATCTTCAAATTCAATTTGTTTTACTGTAGTCTGGAGGTATATTTCGTAAGTGATCGCAATCAATAAGGCGGCGACCTAATCGAAAAAATAATTTTGAAAAGTTACTCGATCTACATTAAATATGGAGAAGACTGACAATAAACAAAATGATGATTTGAACAAGATAACTGAGGATGGAGCC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| 18,790
|
OP912398.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Kwak,H.-R., Byun,H.-S., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-02-01
|
CCYV-W-JE7
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,041
|
GenBank
| null |
South Korea: Jeongeup
|
South Korea
|
Citrullus lanatus subsp. vulgaris
| null |
2022-09
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-W-JE7 segment RNA2, complete sequence
|
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| 18,791
|
OP912400.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
|
National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-02-01
|
CCYV-W-UR16
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
GenBank
| null |
South Korea: Uiryeong
|
South Korea
|
Citrullus lanatus subsp. vulgaris
| null |
2020-07
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-W-UR16 segment RNA1, complete sequence
|
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| 18,792
|
OP912401.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Lee,B.-C., Kim,H.-S.
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National Institute of Agricultural Sciences, Agro-food Safety and Crop Protection
|
South Korea
|
2023-02-01
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CCYV-W-UR16
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Cucurbit chlorotic yellows virus
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Crinivirus
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Closteroviridae
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South Korea: Uiryeong
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South Korea
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Citrullus lanatus subsp. vulgaris
| null |
2020-07
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate CCYV-W-UR16 segment RNA2, complete sequence
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| 18,793
|
MZ392418.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Lin,Q., He,Z., Tang,Y.
|
Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Plant Protection Research Institute
|
China
|
2022-10-09
|
GDNS
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Cucumis sativus
| null |
2020-10
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate GDNS segment RNA1, complete sequence
|
GGAAATCAACACTCCTTCGTACGAAGAGAAAAACTCTAAGTACGAATTTCCAGCCCTTGAAGCCGCTTCCTTAATGGCCGTGACTTCGCCCCAAACCCACCCCTTGCTACCAAGAGGATGTGCCGTGCCACCATGTGGTCTGGCATACTTCTTGAGATGTGTTCCACGCTTGTGGTACGCATCACTAACCTATCCCAACAAAACTAAAAATAACATAAAACAAAACAAAAAGCAACTAAAACAAACTCGATTAGGTCCCGTACAGACCGGTGGTAAAGTTGCACCACCAACTTCAGTCTACAAAGTGTCCTTCAAAAGACGCTTAGTATCCCCGGGACCTAACCCTGTAAAAATCCAAATACTAAGTAACGGTAATGCTCTCCTTATTCCTCAACCGAGATCATATTACAAAACTAGGTTGAATGTGTTGAGGTCTATGTGTAATATTCCATATTGCAAATTTAATAGAATGCCCAAAGCTGTCATTTCGAAATTTGGGTATGATGTTAATAAGATTAATGAAATAATTGACCAGACCCTTAATAGTAAAGTAGGTGGCACTGAAACCCCAGTTCGTCAACTTGATGAGACCATCCAAGGTGCCACAAAATCTGGGGATGGTTACAAAATTTATAATTTTAATAATAAGCGTGTAGTAGAGATTTTTGTTTGTTTTAATAGTTATGTTAAAGATATTTATATGTGTAAGTTTGTTTTAGAGTTAAAATATAATAAAAATGGGAGACCTGTTGATGTGTTAGTGTCATTAATCAAATCTTATGGGAAGACACCCGGTCAACATTTCTGTTCTCCTTTCCTCTTGTCTTCACGTCTCGACACAAGACAATTTTCTGCCAAAGTCCTGTTAGCGTCAATCCTTGACAAAGTACCTGATTACTCATACTTTTATGGGTTATATTTGGGTAAATTATTCAGTCAACGCTTAACAGTGGCTAGGTCAACTGTCTTTGCTGCGTGCCAACAGTACCTCAACTACATGAGAAGCAAGGTTGGGTCAACTGTGTCGAGCCCTGTGAAATCCAAAGTCAACAAAATATCAAGACCCATTCACAAGTATTCTGTGATGCATTTTGTCACTAGAACTGGGTTTGAATATTTTGTCATTCGTTTTAATGATGGTAGGGAAGTGAGGATTAACAATTCTAGATTTGCCATCAAAGAGATGTATAATGCAACCCTTGATAGGGGGTCGTTTTACATCCATCCCAAGTGTTACACTCCAAATTGGGAAAGATTTGAGTCCTGTGGCAACAGATACTGCTGGATTCCTGCTTTCGGCAAAGCTAATATGAGAATGCCCAGAGATTTAGTCCCTTACCCTGAGATGAATTATGGGTATTTATTGCAGTGTGGTTTGGAAAAAGTTTTAGCTGGTAGGTTGATGAGGGTTAGGGATGATTATTTTCACTTTGACGTCAACCACAACATCAAAGGATCTATGGTGAGATATGGTAGTAAGATTGGTGTTAAACTTGATAATGATTTTGATGGTATAATAAAAAATATAGAGATTTTGTATGATGATATCAGTGCAGGTATAATATCAGGGTCAAATCTGCGAAGCGACAACCCATTACTCAACACAATAACCACCAGGCTGTCGAATCAGATTAATGATCAATGCAACAAGGCAAAGGATTTGGTGATACCCACTTGTATGACTAGTAGACAAAAGCGGGAATTAAGTGAACTTTTTCCCGAGATTAACTTTGATTTCACCGAGTCCACTTTCTCTACTCATGCTCTAGCCACAGCCATGAGACATGCTGAGAATTATTTGTTGGCTAGGAAGTGTGGTTTTAGGAATTTTGTTGATGCAGGTGGTGATATTACTCATTATCTAGGTAAAATTGTATCAGGCGTGCATGTTTGTACTCCGATAGTCGACGTTAAAGATGCTCACAGACACATGACCAGGAGTAACAAACTAGACAAAATGATTGGTGTTTGTGAAAAAGCTGATATGTGCGACAAACTAACTCAGAATTGCAGAGTTGAGAAACCCAACATTATAGCCGTTCAGGTATATGATATGACATTGGAGGACTTCGCTCGAGCTTTGGTGTCACACAAAGCGAAAAGAGTGGATTTCACCATGATTATTCCTCCTGAGATTTATGATGAAGATTGTGATGTTAGTTTGTTTGATGACTCTATTAAAGTCAAATGTGAGGGGAATAAAGTACAGTATTCTTATGGTGACAGTGGTGAAATCTATCAACATGACAGGGAGAACTTGAAAAGAATTTTGACGACACAGATTTTTGAAGTGGACGGGATGATCTTCAAGAAAACCCTTGAAACGTCACGTAAACAACTTCATTTTTATTCAGTTGTCGAATGCTCCGATATGATGAACGGTAAATATATCACCGAGACTCATTATACAAGGTCAGAGTTGGACAAATTATGTATAAGAGTACCTGTTGAAAATGAGGCACGGGTTGTCGAGCACATGAAGATAAAGATGGATAAATCCTGTTTTCACAACCTGGTAGAATATGCTATGAACACAGTATTGAGGTTAGATGAGAAAGCATTTGAATACATTTTGTCTCAATACAGGGCTCGAAAATCTATTTCGATCAGAGGTGGTAAGGTTACGCAGGTTGGAGCCGACATGCATCCGAAAGCTGTGGCAGGTTTGATTGGTGCTGTAGCTGGTTATGGTCTGCGATTGCGAGAACAATCACATAAATCCGCAAAAGTTGCTTATTCTGAGTATTACACACCATCGCTTTTCCGTATGTTATGTAAGATTGTTTCTTATGTAATGAAGAGGTTGTGTAGCTGGACTCACGAGTTCTTAAATGAGGTGTTGAAGTATGTGACACCAAAATACATTTATAGTGAAGTGACTGCTAATCAATGTGGTGTGTATGAATATATAGGTGAATATAGGTTTAAACAGACCGTGAATATAGTTGGCAAGAGAAACGAAAGGAGGATTCTGTCCGACAGTTATGAAAAATTTAAGAAATACAGTGAGAAGGTGTATGAAAATCTCGACACCCATACTTCTGATAAGGAAGAATTATTCACCCAGGATATTCAGAAAACGTTGAATGATATTTTCGATCTGGGTGGTGCTGGGAAGTCTATGCCTATTCCTAGTGTCAACATCCAAATGTTACCATTCAACGTTTATAATAAGATCTATTCATTGTTGTTGGGTTGGTTGAAGGATGATAAGAGAACGGCAAGGTATACCAACTATATTTGTGGAATTTATGATTATTATAAAAATTTTTCACATTCAACTTATGATTTCGTTGTAAATATTTTGAAGGAGATATTTTTAGCCATAAAGAACGGTGTGGTAAATTTTTCTCAAAAAGTTGCAGGAAATCTGAAGAGAGCTGCATCGACAATGAAAAATTTGATAAAAATGAAGAACACCAATTGGGAAAAAGACTTGGATGATATGCTTAAGAAAACAGATGAAATGTTCGGAGTTGATACGCATGAACAGAGGAATGACTGTTCATCTGTTTCAAATGGTGGTATCTATGAAGGATTGGACAAGTTGTTTGATATCGGTAATGAAGGGGGTTCTGGCAGGGTTAGTTCAAAAATAGGTGTGGTTTGTGACAAGTTAATTTTGAAGGCAAATCAGTGTTTGCTTAATGTCAAAACATTTTGCACAGCCTTTGTTGAATCACTAATAAGTCTGTCCGGTCGTTGTGCTGTGAAGACTAAGGAATTCAAAGTTTTTGTGGGGAAAATCGTTGAACAGTTGATGGAAACATCATCACTGATAAGAATAGTCGACGGTGTAGCTTTCACTTTTGTCAATCTTTTTATGGCATTAGTGTTAGGAGAGATAAATTTTATTCGCTTATTCTTAGCCACGTGCACTTTCCTCTACCTCAGACATTCGAAAGCAAGTGTTAAATGGGTCGGTAATTACGTGTTAGGAGACGCCACATCAGCCCTCATCGCGAACCCAGGCTATGCAGGTCTCATTATGGCCCCAGTCACTTTAATAGCGAGTAGGGTTGTGGGATTGGAGTTGAAAAGTAAGTGTACGAGATTCATTAAAGATGAAGAAAAAGCATTAAATATGGTCGCTAGTGAAGTTAATAATAAATATTACTTTGATTGGTTGAGACCTGAAATTGTTAAATCTTTAATAGGTTTTTCTGTGATTCTGATGCTGTTAGCTCCGAGATATGGCATAAGTATGATCATATTTTTTATGTTGTTGAATGATTATGTTAAGTATCTTAGGAGTTACTGTGTCAGAGCCAATATCATGTTAAGCTATGGTAGTGTGTTGAAGAGAACGATACCATCAGGGAGATATAAAGCACTAAAGAATATCTTCGTCAAAAAATTTGACACGTCAATATTCTCGGCCAAGAAAGAAGAAGGTGTTAATGGGGGCGACGAAGATGATAACAATGATGTCATTTGTAGGGTGGGTATGAAACCTGACGATGATGATGTTGAAGTTGAATTGGGATATGATGGGAAAGAAATAGTGAACGAGAGCAAACATGCAAATTGGGGTTCTGAGTCGAATTCTACAGAATCACCAGAATGTGTGGACGGTTTAAATTTTTCTTTACTAAAACCGTCAACAGACAGAACCCAAGTCAATTGTTCTGTCCATTTCTCCCTAAGTCATGCTTTGTTAGATTTTCCGCTGACAAATTACCATGACTTTGTACCGACTGGTGATGATTTTATTGATTGTGTTAGTGAATTTTACCATTTAGAAGCTAAGAAGTTACATGATGAGTTAGGAAGAGTCAATAATGCCGTTAGAGTTTACTTTGAACACAGTCTTGAAAAGAAATCGGTTGGTGAAGCAGTGTGGGCCATGAGAAATTATTTCAATGATTCCTCTGTGTTTATTAACTTGAACGGTCTACATTGGCATAGGTTGGGTAAGGGCGATAAGAAAGTCACCAATGTCGAGGCTATGTGTAAATACACTATTGACAATGACTTAATGGACTTTACACAAAAATACT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| 23,741
|
MZ392419.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Lin,Q., He,Z., Tang,Y.
|
Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Plant Protection Research Institute
|
China
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2022-10-09
|
GDNS
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Cucurbit chlorotic yellows virus
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Crinivirus
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Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,041
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GenBank
| null |
China
|
China
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Cucumis sativus
| null |
2020-10
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate GDNS segment RNA2, complete sequence
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| 23,742
|
MZ392420.1
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Lin,Q., He,Z., Tang,Y.
|
Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Plant Protection Research Institute
|
China
|
2022-10-09
|
GDLJ
|
Cucurbit chlorotic yellows virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 8,607
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Cucumis sativus
| null |
2020-06
| null | null |
Cucurbit chlorotic yellows virus isolate GDLJ segment RNA1, complete sequence
|
GGAAATCAACACTCCTTCGTACGAAGAGAAAAACTCTAAGTACGAATTTCCAGCCCTTGAAGCCGCTTCCTTAATGGCCGTGACTTCGCCCCAAACCCACCCCTTGCTACCAAGAGGATGTGCCGTGCCACCATGTGGTCTGGCATACTTCTTGAGATGTGTTCCACGCTTGTGGTACGCATCACTAACCTATCCCAACAAAACTAAAAATAACATAAAACAAAACAAAAAGCAACTAAAACAAACTCGATTAGGTCCCGTACAGACCGGTGGTAAAGTTGCACCACCAACTTCAGTCTACAAAGTGTCCTTCAAAAGACGCTTAGTATCCCCGGGACCTAACCCTGTAAAAATCCAAATACTAAGTAACGGTAATGCTCTCCTTATTCCTCAACCGAGATCATATTACAAAACTAGGTTGAATGTGTTGAGGTCTATGTGTAACATTCCATATTGCAAATTTAATAGAATGCCCAAAGCTGTCATTTCGAAATTTGGGTATGATGTTAATAAGATTAATGAAATAATTGACCAGACCCTTAATAGTAAAGTAGGTGGCACTGAAACCCCAGTTCGTCAACTTGATGAGACCATCCAAGGTGCCACAAAATCTGGGGATGGTTACAAAATTTATAATTTTAATAATAAGCGTGTAGTAGAGATTTTTGTTTGTTTTAATAGTTATGTTAAAGATATTTATATGTGTAAGTTTGTTTTAGAGTTAAAATATAATAAAAATGGGAGACCTGTTGATGTGTTAGTGTCATTAATCAAATCTTATGGGAAGACACCCGGTCAACATTTCTGTTCTCCTTTCCTCTTGTCTTCACGTCTCGACACAAGACAATTTTCTGCCAAAGTCCTGTTAGCGTCAATCCTTGACAAAGTACCTGATTACTCATACTTTTATGGGTTATATTTGGGTAAATTATTCAGTCAACGCTTAACAGTGGCTAGGTCAACTGTCTTTGCTGCGTGCCAACAGTACCTCAACTACATGAGAAGCAAGGTTGGGTCAACTGTGTCGAGCCCTGTGAAATCCAAAGTCAACAAAATATCAAGACCCATTCACAAGTATTCTGTGATGCATTTTGTCACTAGAACTGGGTTTGAATATTTTGTCATTCGTTTTAATGATGGTAGGGAAGTGAGGATTAACAATTCTAGATTTGCCATCAAAGAGATGTATAATGCAACCCTTGATAGGGGGTCGTTTTACATCCATCCCAAGTGTTACACTCCAAATTGGGAAAGATTTGAGTCCTGTGGCAACAGATACTGCTGGATTCCTGCTTTCGGCAAAGCTAATATGAGAATGCCCAGAGATTTAGTCCCTTACCCTGAGATGAATTATGGGTATTTATTGCAGTGTGGTTTGGAAAAAGTTTTAGCTGGTAGGTTGATGAGGGTTAGGGATGATTATTTTCACTTTGACGTCAACTACAACATCAAAGGATCTATGGTGAGATATGGTAGTAAGATTGGTGTTAAACTTGATAATGATTTTGATGGTATAATAAAAAATATAGAGATTTTGTATGATGATATCAGTGCAGGTATAATATCAGGGTCAAATCTGCGAAGCGACAACCCATTACTCAACACAATAACCACTAGGCTGTCGAATCAGATTAATGATCAATGCAACAAGGCAAAGGATTTGGTGATACCCACTTGTATGACTAGTAGACAAAAGCGGGAATTAAGTGAACTTTTTCCCGAGATTAACTTTGATTTCACCGAGTCCACTTTCTCTACTCATGCTCTAGCCACAGCCATGAGACATGCTGAGAATTATTTGTTGGCTAGGAAGTGTGGTTTTAGGAATTTTGTTGATGCAGGTGGTGATATTACTCATTATCTAGGTAAAATTGTATCAGGCGTGCATGTTTGTACTCCGATAGTCGACGTTAAAGATGCTCACAGACACATGACCAGGAGTAACAAACTAGACAAAATGATTGGTGTTTGTGAAAAAGCTGATATGTGCGACAAACTAACTCAGAATTGCAGAGTTGAGAAACCCAACATTATAGCCGTTCAGGTATATGATATGACATTGGAGGACTTCGCTCGAGCTTTGGTGTCACACAAAGCGAAAAGAGTGGATTTCACCATGATTATTCCTCCTGAGATTTATGATGAAGATTGTGATGTTAGTTTGTTTGATGACTCTATTAAAGTCAAATGTGAGGGGAATAAAGTACAGTATTCTTATGGTGACAGTGGTGAAATCTATCAACATGACAGGGAGAACTTGAAAAGAATTTTGACGACACAGATTTTTGAAGTGGACGGGATGATCTTCAAGAAAACCCTTGAAACGTCACGTAAACAACTTCATTTTTATTCAGTTGTCGAATGCTCCGATATGATGAACGGTAAATATATCACCGAGACTCATTATACAAGGTCAGAGTTGGACAAATTATGTATAAGAGTACCTGTTGAAAATGAGGCACGGGTTGTCGAGCACATGAAGATAAAGATGGATAAATCCTGTTTTCACAACCTGGTAGAATATGCTATGAACACAGTATTGAGGTTAGATGAGAAAGCATTTGAATACATTTTGTCTCAATACAGGGCTCGAAAATCTATTTCGATCAGAGGTGGTAAGGTTACGCAGGTTGGRGCCGACATGCATCCGAAAGCTGTGGCAGGTTTGATTGGTGCTGTAGCTGGTTATGGTCTGCGATTGCGAGAACAATCACATAAATCCGCAAAAGTTGCTTATTCTGAGTATTACACACCATCGCTTTTCCGTATGTTATGTAAGATTGTTTCTTATGTAATGAAGAGGTTGTGTAGCTGGACTCACGAGTTCTTAAATGAGGTGTTGAAGTATGTGACACCAAAATACATTTATAGTGAAGTGACTGCTAATCAATGTGGTGTGTATGAATATATAGGTGAATATAGGTTTAAACAGACCGTGAATATAGTTGGCAAGAGAAACGAAAGGAGGATTCTGTCCGACAGTTATGAAAAATTTAAGAAATACAGTGAGAAGGTGTATGAAAATCTCGACACCCATACTTCTGATAAGGAAGAATTATTCACCCAGGATATTCAGAAAACGTTGAATGATATTTTCGATCTGGGTGGTGCTGGGAAGTCTATGCCTACTCCTAGTGTCAACATCCAAATGTTACCATTCAACGTTTATAATAAGATCTATTCATTGTTATTGGGTTGGTTGAAGGATGATAAGAGAACGGCAAGGTATACCAACTATATTTGTGGAATTTATGATTATTATAAAAATTTTTCACATTCAACTTATGATTTCGTTGTAAATATTTTGAAGGAGATATTTTTAGCCATAAAGAACGGTGTGGTAAATTTTTCTCAAAAAGTTGCAGGAAATCTGAAGAGAGCTGCATCGACAATGAAAAATTTGATAAAAATGAAGAACACCAATTGGGAAAAAGACTTGGATGATATGCTTAAGAAAACAGATGAAATGTTCGGAGTTGATACGCATGAACAGAGGAATGACTGTTCATCTGTTTCAAATGGTGGTATCTATGAAGGATTGGACAAGTTGTTTGATATCGGTAATGAAGGGGGTTCTGGCAGGGTTAGTTCAAAAATAGGTGTGGTTTGTGACAAGTTAATTTTGAAGGCAAATCAGTGTTTGCTTAATGTCAAAACATTTTGCACAGCCTTTGTTGAATCACTAATAAGTCTGTCCGGTCGTTGTGCTGTGAAGACTAAGGAATTCAAAGTTTTTGTGGGGAAAATCGTTGAACAGTTGATGGAAACATCATCACTGATAAGAATAGTCGACGGTGTAGCTTTCACTTTTGTCAATCTTTTTATGGCATTAGTGTTAGGAGAGATAAATTTTATTCGCTTATTCTTAGCCACGTGCACTTTCCTCTACCTCAGACATTCGAAAGCAAGTGTTAAATGGGTCGGTAATTACGTGTTAGGAGACGCCGCATCAGCCCTCATCGCGAACCCAGGCTATGCAGGTCTCATTATGGCCCCAGTCACTTTAATAGCGAGTAGGGTTGTGGGATTGGAGTTGAAAAGTAAGTGTACGAGATTCATTAAAGATGAAGAAAAAGCATTAAATATGGTCGCTAGTGAAGTTAATAATAAATATTACTTTGATTGGTTGAGACCTGAAATTGTTAAATCTTTAATAGGTTTTTCTGTGATTCTGATGCTGTTAGCTCCGAGATATGGCATAAGTATGATCATATTTTTTATGTTGTTGAATGATTATGTTAAGTATCTTAGGAGTTACTGTGTCAGAGCCAATATCATGTTAAGCTATGGTAGTGTGTTGAAGAGAACGATACCATCAGGGAGATATAAAGCACTAAAGAATATCTTCGTCAAAAAATTTGACACGTCAATATTCTCGGCCAAGAAAGAAGAAGGTGTTAATGGGGGCGACGAAGATGATAACAATGATGTCATTTGTAGGGTGGGTATGAAACCTGACGATGATGATGTTGAAGTTGAATTGGGATATGATGGGAAAGAAATAGTGAACGAGAGCAAACATGCAAATTGGGGTTCTGAGTCGAATTCTACAGAATCACCAGAATGTGTGGACGGTTTAAATTTTTCTTTACTAAAACCGTCAACAGACAGAACCCAAGTCAATTGTTCTGTCCATTTCTCCCTAAGTCATGCTTTGTTAGATTTTCCGCTGACAAATTACCATGACTTTGTACCGACTGGTGATGATTTTATTGATTGTGTTAGTGAATTTTACCATTTAGAAGCTAAGAAGTTACATGATGAGTTAGGAAGAGTCAATAATGCCGTTAGAGTTTACTTTGAACACAGTCTTGAAAAGAAATCGGTTGGTGAAGCAGTGTGGGCCATGAGAAATTATTTCAATGATTCCTCTGTGTTTATTAACTTGAACGGTCTACATTGGCATAGGTTGGGTAAGGGCGATAAGAAAGTCACCAATGTCGAGGCTATGTGTAAATACACTATTGACAATGACTTAATGGACTTTACACAAAAATACT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| 23,743
|
NC_004809.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Aguilar,J.M., Franco,M., Marco,C.F., Berdiales,B., Rodriguez-Cerezo,E., Truniger,V., Aranda,M.A., Abad,J., Gomez-Guillamon,M.L.
|
CEBAS-CSIC, Mejora y Patologia Vegetal
|
Spain
|
2003-05-17
|
AlLM
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,123
|
RefSeq
| 1
|
Spain
|
Spain
|
Cucurbitaceae
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus RNA1, complete sequence
|
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| 8,493
|
NC_004810.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Aguilar,J.M., Franco,M., Marco,C.F., Berdiales,B., Rodriguez-Cerezo,E., Truniger,V., Aranda,M.A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-05-17
|
AlLM
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,976
|
RefSeq
| 1
|
Spain
|
Spain
|
Cucurbitaceae
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus RNA2, complete genome
|
GAAATACTACGGTAAATCCATTGGGATACGGCCAGACAGCCTTCCTCCCACTCCACCCCCCCCTCTCTTCTAATGAAGAGTATTAGATATGGTAAACTTTAAACCAATATCGTGACACTATGTGTCCCGGTTGTTCCAGCAAGTTGGTACTGGAGCCATGTCTAATATTTAGATTTAGACCCATCTATATATATATGTATATGTATATATTAGATTAGTTTATTCATACATAAACATAACACAACACAAACAAAATCAGCATATGTGAGTACCTTAAACTAGGCTAGGCTAGACAAGCTTCGGTTGATTGCATTATCACATAGGTGCATCAACAAACTGGTGGTTGCCACAGTGGAGACGAACTCCGAAGGCAGCCGACCACCTTGTTGTGAAGAGCCCCGTTTAAGCCCCCCCATATATGTTGATTAGTACTTTCCAAATCAAACGGTTTTATGGTTAAAATTTTTACTATAAACCTAGTCTGAGATGATAAGATTCAAGGGCTGTGATTGGGCAAGTTGGTACTCAAGAACTTTTAGTCATGATTCAATATGATTTGAATACGCTTGTTGTGTTGTAGTAAAAGAACTCTTTTCAAACACTACGCTGTCACGTTAATCACCGAGTTTCAAAAGGAAAAATCTTAGTAGTGATGTTTTGCCTTCCCAACGAGTGTTGGTAGTCACGGATCGAAGAGATCGACATCACACACTGAGATGTTCGTTAGATACAAAGTGATTAATCGTGAGTGTTCGAATTGATGTTTTGTGTTTATATATGTAGCTCATGTACAAAATTCTGGCTCTGCAGTTTTCAAGCTCCTTAAGACTTAAAGCCACTGGGCTTAATGTGGGAGAAGTTCTCCTAGTGTAAGAGATGAACTCCGTGCGCTCGTTAGGTACCGGATAACTCAGAGTGTTGGTTCTGAGAAGGAGTGTCTGAAGGTTATATCCAGAAGTTTGTATTGAGTAAAAAATAAACTAATCGTTGTTTTTAATAAGAATAGGCGTAGTTTAGTTAGTCATAGGTTCATTTATGGTAGATTATACTATAAGCTTCCTCGTCTCTTAGGTTTAGGGCCGTGGATAAGTCAGCAAGTTGGCACTGATAGATCTATTGTGATTGATCCATTGTTCTAACTAGTCCACGTCCTGTTCTTTAGCTTTTGTTTAAATATATGTATAAAAATTTTTCTACTATTATTTTTCAATTTGTGTGCTCTAGAGTCAAATTATGGCGAAGGCTGGTTTGGATTTTGGTACTACTTTCTCTACTATCAGCAGTTATGTTAATGGTGTTATGAAAGTTTTGAAATTGAACGAAACTGAATTTATCCCTACCTGTTTAGCCATAACGTCTAATAATGATGTGGTTGTTGGAGGTCCCGCTCAAGTATTGTCTAATAGTGACATGCCTAACTGTTACTTTTATGACTTGAAAAGGTGGGTAGGTGTTGACAGTATCAATTATAATGTGATAAAAACCAAAATCAATCCAGTGTATGTCACCGAGTTACGTGGTAACGACGTGTACATCACTGGTATCGATAGAGGTTATACCTGCACTTACACAGTCAAACAATTGATATTGTTATACATTGAAACTTTAGTAAGATTGTTTTCTAAAGTTGAGTCCATAACCATAACTAGTCTTAACGTCTCTGTTCCAGCTGATTATAAATGTAAGCAGCGTATGTTTATGAAATCAGTTTGTGACAGTCTAGGTTTTTCATTACGTAGAATTATAAACGAACCATCTGCAGCAGCTATATACTTTGTTTCAAAGTATCCGCAGTATAACAACTTCCTGATGTATGACTTCGGAGGAGGAACTTTTGATTCTTCTCTAATAGTCAGAGACGGTAAGTATGTCACAGTGGCTGATACTGAAGGTGATTCGTTTTTGGGAGGTAGAGACATTGATAATGCTATCGCTGACTATATAACAACGACGTATGGTATGAAAGGTGGTTTGTCCGCTGACGTACTGGCGTCTATAAAGGAGGATTGTAATTCTAAGGGTAGAGAGAATTTCAATGTTATAGATTCATCAGGCAAACTTCATAATGTGAAATTCACAAGACAAGATCTGAGTCGTTGCATTGAACCTTTCTCTAAGAAGAGCATAGCACTGCTTGATAATATGGTAGTGCGTAACATAACAAAAGATTCCGCTGTGTTTATGGTTGGAGGTTCATCATTGTTGAAGAAAGTTCAACATGATGTGATGAATTACTGTGCTAGAACGAAACTAGAATGCATCATTGATAAAGACCTTAGATCAGCAGTGTCATTTGGTTGCTCTATGTCACATGCCCAAGAAGACACAAAAAATATGATATACATCGATTGTAATTCACATCCCTTAATGGACATATCATATTTTTGTTCTCCAAAGATTATAGTTAGGAAACCTATGGCCATACCTTATACTGGAGTGCGAGAAGAAACCTTAACAAGACACTATACAACAATTTTGAACGTTTACGAGGGATCAGATCCCTTCGTTTTGAACAACGATTGGTTGATTAGTGCCAATATGCAGTCCAACAAGTACGGTGAGATAGGTGATACATTACAATATCTTTACAAATATAATGTAGATGGCATCTTAGAGTTGGTTGTGAGGAATAAAAGAACAGGTAAGGAGACGGTACTTCCCAATTCCTTTGCTTTGACTGAGAGTATAAAGAAGCTGGATGTAAATCTAACTCAATTGTCAAATATTGATGAATTGGCAACTTTGGTAGCTATTATGAGTTACTATAAGCCTGAATTAAAGTACCTCCTGACTTATGTAAAGACACCAACTATTTTTGAAAATGAAATTAAGAAATTTGGATCTGGTGAAGATTTATATAAATCCTTAGCTGCTCTGAATAAAAATTTCAAGTAAATTTGGATGTCATTAATTATAGTTATATATTCATTTTGTGACGGTATTAATATATATTATTGTAGTGATAGACGTGATTTTGAAGGTGATCACCAAGTTAGGCAATTAGACAACCTTCAAGACTTGTGCGAGATATTGCTGACTCACCCCTTTTATAAAACTTCATGGTGAATCTGATAGATAGTCCCAATTTACATGATGCTTTCTCTTTATTATTCAAAGCAAGAGATGTTAAAGGAAAAATTGAAAGTTTGGTGAAATACATAAAATCCAATCTCTCCACTGTCAATGCGTCTGCTTTTAGACCCATCGGTGGTGTGCGAGGTTTGGTGTATGATTCAAAATTTTCTATTTTTCAAGGTAATGTTCGGTTTAACATAGATGACGATAAATCCATCCTGAAGTGTATTTTAGTATACTTCTATCACGTGGATCCGTCTCTTCTGAAGAAAACCGCTTATAAGCCAGAATCCTTTTTCATCACAGACAACTGGAGAGAACATCTTGAGAAATGGCGAAAATATATCGACATGACAATGAACGAGTATTTGGTCGATAACAAGGATGTGGGTTGTACATACACCGAAAAGGAGATCAAGAATCATTACCCAGGGCAAAGTGATATCAGATTAATAACTCTATATCGGGTGTGTAATTCACAAGGCAGGTTAGTTCCTCTGCAGGAGTTTCTTTCTAGTGAGATCAAAGGATTTGACATCAAAACCGACGACGCTGGTCCTACCATCGTAGAAGGTTTAGGTGGAAATGATTTGTTTAAGGAGTGCTTAGTGGCTTTTAAGGATTATGTTAAACTGAACAGTTCTAAAGCTGGTCTTGAAAAGATCAAGGTCAACCAAAGATATTTTTCAGTTTACCTTGACTCCTTAAATAGCAATAACGATCTAAAAAATATCTCTGACAATCCTTTGGTTCTAGCGAAGTTCATGTTGGATTTTGACAATTTAACATCATCTACAGTTGGTTTCGCAGCTAATATTGATGCTATTAAAAAATTGGACGTGAACTTTAAGGCATTTTGTGAAAAGGTTTTTAACTTAAAAACCCGTTTAAATGAAGACAAATTATTCATAAATATGCCTAAGAACTCTGTTGTAGAAGTCCTTGGACAGCCCATATCAATTGGGAATTATATTAGATCATCAAAGATTCCACCCCCAGTGTCCAATTCTAGCTCTCTTCCTGAACACATAGATGAATTGGTGTCTAAAGCCATGTGTGATTTTATGTCGCAATTTGGTGAATTCGAAAGTAAATTTGTTTTGGACGGTCTACTTTTCGTTTTTGGTAAATTAACCACGAATGAAAAGTTTTGGCGTTCTGACAAACTCGTGTCGTTTTCAATAGACAAAAAACCGATATCATTTCGAGCATGTGATTTTAGAAGTTATCTCATCGGTTCGGTAAAGTCAAGAGATGTGTTATTCAATTGTGACAACATCATCAGACAATGGGCGAATCATAGAGGTAATAGAGCTATGAGATTATTCAAAGTGAGTGGCTTCAAACCTGGATTGTTTAGCACAGTTCCAAACATACTACCCTGGATGAGATTCGATTTCTTCAAACTGTTGTCAAGTGATTATCTTGACGATGATGAGATCAAGTCGCTTCGAACTCTACGTCTTATGACCGAGCATAAGTCGAATAAGACTAAGGCTGACGAACACAGATTCACGACATGGATCTCACAACGGTTATAGACAAATTTGGAGTAGAAAAGGTTGAAGTGTATCTTAAGTTATATAATCAAATTAGAATGGAGAGAGGGGGGGTGAGCAATTTTTTGTTGAGATTGATCGACTCAAAGTTCAAAAAATTTTTGGATCATGATACTAAGATGGATTACAATGATGAAGAGACAATTGAACTACTGCAATGTTTGTCATCATTTGTCAATATGATTCCATCTTATTACTAAAATCTCTGGATCGTTCTCATTATCGGATGAAGTAGTTTTGCAAGAAGATACTACATTTGAAATAAGAATTTTAGTGCAGCTATCAAACAATCATGGCGAGTTCGAGTGAGAATAAAACTTCCAAAGATGATACAAAAATTATAAGTGAACACGTGGAAGATGAGTC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| 8,494
|
OR589766.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Ayyed,B., Alisawi,O.N., Al Fahad,M.A.
|
Faculty of Agriculture, Kufa University, Plant Protection
|
Iraq
|
2023-10-23
|
Saladin
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,042
|
GenBank
| null |
Iraq
|
Iraq
|
Cucumis sativus
|
plant leaf
|
2022-02-03
|
SAMN37503414
|
PRJNA1019918
|
MAG: Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate Saladin segment RNA1, complete sequence
|
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| 11,785
|
OR589767.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Ayyed,B., Alisawi,O.N., Al Fahad,M.A.
|
Faculty of Agriculture, Kufa University, Plant Protection
|
Iraq
|
2023-10-23
|
Saladin
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,923
|
GenBank
| null |
Iraq
|
Iraq
|
Cucumis sativus
|
plant leaf
|
2022-02-01
|
SAMN37503414
|
PRJNA1019918
|
MAG: Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate Saladin segment RNA2, complete sequence
|
AGACAGCCTTCCTCCCACTCCACCCCCCCCTCTCTTCTAATGAAGAGTATTAGATATGGTAAACTTTAAACCAATATCGTGACACTATGTGTCCCGGTTGTTCCAGCAAGTTGGTACTGGAGCCATGTCTAATATTCAGATTTAGACCCATCTATATATATATGTATATGTATATATTAGATTAGTTTATTCATACATAAACATAACACAACACAAACAAAATCAGCATATGTGAGTACCTTAAACTAGGCTAGGCTAGACAAGCTTCGGTTGATTGCATTATCACATAGGTGCATCAACAAACTGGTGGTTGCCACAGTGGAGACGAACTCCGAAGGCAGCCGACCACCTTGTTGTGAAGAGCCCCGTTTAAGCCCCCCCATATATGTTGATTAGTACTTTCCAAATCAAACGGTTTTATGGTTAAAATCTTTACTATAAACCTAGTCTGAGATGATAAGATTCAAGGGCTGTGATTGGGCAAGTTGGTACTCAAGAACTTTTAGTCATGATTCAATATGATTTGAATACGCTTGTTGTGTTGTAGTAAAAGAACTCTTTTCAAACACTACGCTGTCACGTTAATCACCGAGTTTCAAAAGGAAAAATCTTAGTAGTGATGTTTTGCCTTCCCAACGAGTGTTGGTAGTCACGGATCGAAGAGATCGACATCACACACTGAGATGTTCGTTAGATACAAAGTGATTAATCGTGAGTGTTCGAATTGATGTTTTGTGTTTATATATGTAGCTCATGTACAAAATTCTGGCTCTGCAGTTTTCAAGCTCCTTAAGACTTAAAGCCACTGGGCTTAATGTGGGAGAAGTTCTCCTAGTGTAAGAGATGAACTCCGTGCGCTCGTTAGGTACCGGATAACTCAGAGTGTTGGTTCTGAGAAGGAGTGTCTGAAGGTTATATCCAGAAGTTTGTATTGAGTAAAAAATAAACTAATCGTTGTTTTTAATAAGAATAGGCGTAGTTTAGTTAGTCATAGGTTCATTTATGGTAGATTATACTATAAGCTTCCTCGTCTCTTAGGTTTAGGGCCGTGGATAAGTCAGCAAGTTGGCACTGATAGATCTATTGTGATTGATCCATTGTTCTAACTAGTCCACGTCCTGTTCTTTAGCTTTTGTTTAAATATATGTATAAAAATTTTTCTACTATTATTTTTCAATTTGTGTGCTCTAGAGTCAAATTATGGCGAAGGCTGGTTTGGATTTTGGTACTACTTTCTCTACTATCAGCAGTTATGTTAATGGTGTTATGAAAGTTTTGAAATTGAACGAAACTGAATTTATCCCTACCTGTTTAGCCATAACGTCTAATAATGATGTGGTTGTTGGAGGTCCCGCTCAAGTATTGTCTAATAGTGACATGCCTAACTGTTACTTTTATGACTTGAAAAGGTGGGTAGGTGTTGACAGTATCAATTATAATGTGATAAAAACCAAAATCAATCCAGCGTATGTCACCGAGTTACGTGGTAACGACGTGTACATCACTGGTATCGATAGAGGTTATACTTGCACTTACACAGTCAAACAATTGATATTGTTATACATTGAAACTTTAGTAAGATTGTTTTCTAAAGTTGAGTCCATAACCATAACTAGTCTTAACGTCTCTGTTCCAGCTGATTATAAATGTAAGCAGCGTATGTTTATGAAATCAGTTTGTGACAGTCTAGGTTTTTCATTACGTAGAATTATAAACGAACCATCTGCAGCAGCTATATACTTTGTTTCAAAGTATCCGCAGTATAACAACTTCCTGATGTATGACTTCGGAGGAGGAACTTTTGATTCTTCTCTAATAGTCAGAGACGGTAAGTATGTCACAGTGGCTGATACTGAAGGTGATTCGTTTTTGGGAGGTAGAGACATTGATAATGCTATCGCTGACTATATAACAACGACGTATGGTATGAAAGGTGGTTTGTCCGCTGACGTACTGGCGTCTATAAAGGAGGATTGTAATTCTAAGGGTAGAGAGAATTTCAATGTTATAGATTCATCAGGCAAACTTCATAATGTGAAATTCACAAGACAAGATCTGAGTCGTTGCATTGAACCTTTCTCTAAGAAGAGCATAGCACTGCTTGATAATATGGTAGTGCGTAACATAACAAAAGATTCTGCTGTGTTTATGGTTGGAGGTTCATCATTGTTGAAGAAAGTTCAACATGATGTGATGAATTACTGTGCTAGAACGAAACTAGAATGCATCATTGATAAAGACCTTAGATCAGCAGTGTCATTTGGTTGCTCTATGTCACATGCCCAAGAAGACACAAAAAATATGATATACATCGATTGTAATTCACATCCCTTAATGGATATATCATATTTTTGTTCTCCAAAGATTATAGTTAGGAAACCTATGGCCATACCTTATACTGGAGTGCGAGAAGAAACCTTAACAAGACACTATACAACAATTTTGAACGTTTACGAGGGATCAGATCCCTTCGTTTTGAACAACGATTGGTTGATTAGTGCCAATATGCAGTCCAACAAGTACGGTGAGATAGGTGATACATTACAATATCTTTACAAATATAATGTAGATGGCATCTTAGAGTTGGTTGTGAGGAATAAAAGAACAGGTAAGGAGACGGTACTTCCCAATTCCTTTGCTTTGACTGAGAGTATAAAGAAGCTGGATGTAAATCTAACTCAATTGTCAAATATTGATGAATTGGCAACTTTGGTAGCTATTATGAGTTACTATAAGCCTGAATTAAAGTACCTCCTGACTTATGTAAAGACACCAACTATTTTTGAAAATGAAATTAAGAAATTTGGATCTGGTGAAGATTTATATAAATCCTTAGCTGCTCTGAATAAAAATTTCAAGTAAATTTGGATGTCATTAATTATAGTTATATATTCATTTTGTGACGGTATTAATATATATTATTGTAGTGATAGACGTGATTTTGAAGGTGATCACCAAGTTAGGCAATTAGACAACCTTCAAGACTTGTGCGAGATATTGCTGACTCACCCCTTTTATAAAACTTCATGGTGAATCTGATAGATAGTCCCAATTTACATGATGCTTTCTCTTTATTATTCAAAGCAAGAGATGTTAAAGGAAAAATTGAAAGTTTGGTGAAATACATAAAATCCAATCTCTCCACTGTCAATGCGTCTGCTTTTAGACCCATCGGTGGTGTGCGAGGTTTGGTGTATGATTCAAAATTTTCTATTTTTCAAGATAATGTTCGGTTTAACATAGATGACGATAAATCCATCCTGAAGTGTATTTTAGTATACTTCTATCACGTGGATCCGTCTCTTCTGAAGAAAACCGCTTATAAGCCAGAATCCTTTTTCATCACAGACAACTGGAGAGAACATCTTGAGAAATGGCGAAAATATATCGACATGACAATGAACGAGTATTTGGTCGATAACAAGGATGTGGGTTGTACATACACCGAAAAGGAGATCAAGAATCATTACCCAGGGCAAAGTGATATCAGATTAATAACTCTATATCGGGTGTGTAATTCACAAGGCAGGTTAGTTCCTCTGCAGGAGTTTCTTTCTAGTGAGATCAAAGGATTTGACATCAAAACCGACGACGCTGGTCCTACCATCGTAGAAGGTTTAGGTGGAAATGATTTGTTTAAGGAGTGCTTAGTGGCTTTTAAGGATTATGTTAAACTGAACAGTTCTAAAGCTGGTCTTGAAAAGATCAAGGTCAACCAAAGATATTTTTCAGTTTACCTTGACTCCTTAAATAGCAATAACGATCTAAAAAATATCTCTGACAATCCTTTGGTTCTAGCGAAGTTCATGTTGGATTTTGACAATTTAACATCATCTACAGTTGGTTTCGCAGCTAATATTGATGCTATTAAAAAATTGGACGTGAACTTTAAGGCATTTTGTGAAAAGGTTTTTAACTTAAAAACCCGTTTAAATGAAGACAAATTATTCATAAATATGCCTAAGAACTCTGTTGTAGAAGTCCTTGGACAGCCCATATCAATTGGGAATTATATTAGATCATCAAAGATTCCACCCCCAGTGTCCAATTCTAGCTCTCTTCCTGAACACATAGATGAATTGGTGTCTAAAGCCATGTGTGATTTTATGTCGCAATTTGGTGAATTCGAAAGTAAATTTGTTTTGGACGGTCTACTTTTCGTTTTTGGTAAATTAACCACGAATGAAAAGTTTTGGCGTTCTGACAAACTCGTGTCGTTTTCAATAGACAAAAAACCGATATCATTTCGAGCATGTGATTTTAGAAGTTATCTCATCGGTTCGGTAAAGTCAAGAGATGTGTTATTCAATTGTGACAACATCATCAGACAATGGGCGAATCATAGAGGTAATAGAGCTATGAGATTATTCAAAGTGAGTGACTTCAAACCTGGATTGTTTAGCACAGTTCCAAACATACTACCCTGGATGAGATTCGATTTCTTCAAACTGTTGTCAAGTGATTATCTTGACGATGATGAGATCAAGTCGCTTCGAACTCTACGTCTTATGACCGAGCATAAGTCGAATAAGACTAAGGCTGACGAACACAGATTCACGACATGGATCTCACAACGGTTATAGACAAATTTGGAGTAGAAAAGGTTGAAGTGTATCTTAAGTTGTATAATCAAATTAGAATGGAGAGAGGGGGGGTGAGCAATTTTTTGTTGAGATTGATCGACTCAAAGTTCAAAAAATTTTTGGATCATGATACTAAGATGGATTACAATGATGAGGAGACAATTGAACTACTGCAATGTTTGTCATCATTTGTCAATATGATTCCATCTTATTACTAAAATCTCTGGATCGTTCTCATTATCGGATGAAGTAGTTTTGCAAGAAGATACTACATTTGAAATAAGAATTTTAGTGCAGCTATCAAACAATCATGGCGAGTTCGAGTGAGAATAAAACTTCCAAAGATGATACAAAAATTATAAGTGAACACGTGGAAGATGAGTCTGACAATGAAACAAAGGGTGTGGCAAAGAGAGA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| 11,786
|
OQ685958.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Lahuf,A.A., Mohammed,M.S.
|
University of Kerbala, Plant Protection
|
Iraq
|
2023-04-15
|
isolate Iraq-1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,120
|
GenBank
| null |
Iraq
|
Iraq
|
Cucurbita pepo
| null |
2022
|
SAMN33788369
|
PRJNA945568
|
MAG: Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate isolate Iraq-1 segment RNA1, complete sequence
|
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| 16,697
|
OQ685959.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Lahuf,A.A., Mohammed,M.S.
|
University of Kerbala, Plant Protection
|
Iraq
|
2023-04-15
|
Iraq-1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,976
|
GenBank
| null |
Iraq
|
Iraq
|
Cucurbita pepo
| null |
2022
|
SAMN33788369
|
PRJNA945568
|
MAG: Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate Iraq-1 segment RNA2, complete sequence
|
GAAATACTACGGTATATCCATTGGGATACGGCCAGACAGCCTTCCTCCCACTCCACCCCCCCCTCTCTTCTAATGAAGAGTATTAGATATGGTAAACTTTAAACCACTGCCGCGGCATCATGTGTTTCGGTAGTTCCAGCAAGTTGGTACTGGAGCCATGTCTAATATTCTGATTTAGACCCATTATATATATATATTTATATATATATTAGAGTAGTTTATTCATAAATAAACATAACACAACACAAACAAAAACAGCATATGTGAGTACCTTAAACTGAGCTAAGCTAAATTAGCTTAAGTTGATTGCATTATCACATAGGTGCATCAACGAACTGGTGGTTGCCACAGTGGAGACGAACTCCGAAGGCAGCCGATTACCTTGTTGTTCAGTGCCTCGCTTATGCCCCCCCATATATGTTGTTTAGTACTTTCCAAATCAAACGGTTTCATGGTTGAGATTTTCACTATAAACCTAGTCTGAGATGATAAGATTCAAGGACTGTGATTGGGCAAGTTGGTACCCAAGAACTTTCAGTCATGATTCAATCAGATTTGAGTACATTTGTTGTGTTGTTGTAAAGGAGCTTCTTTCAAATGCCGCGCTGTCACGTTTTCCACCTAGTTTCAAACGGGATTATTTTAGTAGTGATGTTTTGCCTTCCCAACGAGTGTTGGTAGTCACGGATCGAAGAGATCAACATCATGCGCTAAAACGTTTCGCAGATACGAAGTGATTAATTGTGGGTGTTTGAATGTTTGTTTTATGTTTATTTATGTAGCTTATGTACAAATTTCTGGCTCTACAATCTTCACACTTCTTAAGACTTAAAGCCACTGGGCTTAATGTGGGAAATGTTTTCCTAGTGTAAGAGATGAACTCCGTGCATTCGTTAGGTACCGGATAACTCAGAGTGTTGGTTCTGAGAAGAAGTGTTTGAAGGTTATATCCAGTAGTTTGTGTTGAGTGATAAGTGAACTATTCGTTTTATTTAATAAGAATGGGCGTAGTTTAGTTAGTCATAGGTTTGGTGATAGTGGCTTATACTATAAACTTCCTCGTCTCTTTTGCTTAGGGCCGTGGATAAATCAGCAAGTTGGTACTGATGGACCCACTGTGATTAATCCATTGTTCTAACTAGTCCACGTTCTGTTCTTTAGTTTTTGTTTAAATTTAATGTATAAAAATTTTTCTACTATTATTTTTCAATTTGTGTGCTCTAGAGTCAAATTATGGCGAAGGCTGGTTTGGATTTTGGTACTACTTTCTCTACTATCAGCAGTTATGTTAATGGTGTTATGAAAGTTTTGAAATTGAACGAAACTGAATTTATCCCTACCTGTTTAGCCATAACGTCTAATAATGATGTGGTTGTTGGAGGTCCCGCTCAAGTATTGTCTAATAGTGACATGCCTAACTGTTACTTTTATGACTTGAAAAGGTGGGTAGGTGTTGACAGTATCAATTATAATGTGATAAAAACCAAAATCAATCCAGTGTATGTCACCGAGTTACGTGGTAACGACGTGTACATCACTGGTATCGATAGAGGTTATACCTGCACTTACACAGTCAAACAATTGATATTGTTATACATTGAAACTTTAGTAAGATTGTTTTCTAAAGTTGAGTCCATAACCATAACTAGTCTTAACGTCTCTGTTCCAGCTGATTATAAATGTAAGCAGCGTATGTTTATGAAATCAGTTTGTGACAGTCTAGGTTTTTCATTACGTAGAATTATAAACGAACCATCTGCAGCAGCTATATACTTTGTTTCAAAGTATCCGCAGTATAACAACTTCCTGATGTATGACTTCGGAGGAGGAACTTTTGATTCTTCTCTAATAGTCAGAGACGGTAAGTATGTCACAGTGGCTGATACTGAAGGTGATTCGTTTTTGGGAGGTAGAGACATTGATAATGCTATCGCTGACTATATAACAACGACGTATGGTATGAAAGGTGGTTTGTCCGCTGACGTACTGGCGTCTATAAAGGAGGATTGTAATTCTAAGGGTAGAGAGAATTTCAATGTTATAGATTCATCAGGCAAACTTCATAATGTGAAATTCACAAGACAAGATCTGAGTCGTTGCATTGAACCTTTCTCTAAGAAGAGCATAGCACTGCTTGATAATATGGTAGTGCGTAACATAACAAAAGATTCCGCTGTGTTTATGGTTGGAGGTTCATCATTGTTGAAGAAAGTTCAACATGATGTGATGAATTACTGTGCTAGAACGAAACTAGAATGCATCATTGATAAAGACCTTAGATCAGCAGTGTCATTTGGTTGCTCTATGTCACATGCCCAAGAAGACACAAAAAATATGATATACATCGATTGTAATTCACATCCCTTAATGGACATATCATATTTTTGTTCTCCAAAGATTATAGTTAGGAAACCTATGGCCATACCTTATACTGGAGTGCGAGAAGAAACCTTAACAAGACACTATACAACAATTTTGAACGTTTACGAGGGATCAGATCCCTTCGTTTTGAACAACGATTGGTTGATTAGTGCCAATATGCAGTCCAACAAGTACGGTGAGATAGGTGATACATTACAATATCTTTACAAATATAATGTAGATGGCATCTTAGAGTTGGTTGTGAGGAATAAAAGAACAGGTAAGGAGACGGTACTTCCCAATTCCTTTGCTTTGACTGAGAGTATAAAGAAGCTGGATGTAAATCTAACTCAATTGTCAAATATTGATGAATTGGCAACTTTGGTAGCTATTATGAGTTACTATAAGCCTGAATTAAAGTACCTCCTGACTTATGTAAAGACACCAACTATTTTTGAAAATGAAATTAAGAAATTTGGATCTGGTGAAGATTTATATAAATCCTTAGCTGCTCTGAATAAAAATTTCAAGTAAATTTGGATGTCATTAATTATAGTTATATATTCATTTTGTGACGGTATTAATATATATTATTGTAGTGATAGACGTGATTTTGAAGGTGATCACCAAGTTAGGCAATTAGACAACCTTCAAGACTTGTGCGAGATATTGCTGACTCACCCCTTTTATAAAACTTCATGGTGAATCTGATAGATAGTCCCAATTTACATGATGCTTTCTCTTTATTATTCAAAGCAAGAGATGTTAAAGGAAAAATTGAAAGTTTGGTGAAATACATAAAATCCAATCTCTCCACTGTCAATGCGTCTGCTTTTAGACCCATCGGTGGTGTGCGAGGTTTGGTGTATGATTCAAAATTTTCTATTTTTCAAGGTAATGTTCGGTTTAACATAGATGACGATAAATCCATCCTGAAGTGTATTTTAGTATACTTCTATCACGTGGATCCGTCTCTTCTGAAGAAAACCGCTTATAAGCCAGAATCCTTTTTCATCACAGACAACTGGAGAGAACATCTTGAGAAATGGCGAAAATATATCGACATGACAATGAACGAGTATTTGGTCGATAACAAGGATGTGGGTTGTACATACACCGAAAAGGAGATCAAGAATCATTACCCAGGGCAAAGTGATATCAGATTAATAACTCTATATCGGGTGTGTAATTCACAAGGCAGGTTAGTTCCTCTGCAGGAGTTTCTTTCTAGTGAGATCAAAGGATTTGACATCAAAACCGACGACGCTGGTCCTACCATCGTAGAAGGTTTAGGTGGAAATGATTTGTTTAAGGAGTGCTTAGTGGCTTTTAAGGATTATGTTAAACTGAACAGTTCTAAAGCTGGTCTTGAAAAGATCAAGGTCAACCAAAGATATTTTTCAGTTTACCTTGACTCCTTAAATAGCAATAACGATCTAAAAAATATCTCTGACAATCCTTTGGTTCTAGCGAAGTTCATGTTGGATTTTGACAATTTAACATCATCTACAGTTGGTTTCGCAGCTAATATTGATGCTATTAAAAAATTGGACGTGAACTTTAAGGCATTTTGTGAAAAGGTTTTTAACTTAAAAACCCGTTTAAATGAAGACAAATTATTCATAAATATGCCTAAGAACTCTGTTGTAGAAGTCCTTGGACAGCCCATATCAATTGGGAATTATATTAGATCATCAAAGATTCCACCCCCAGTGTCCAATTCTAGCTCTCTTCCTGAACACATAGATGAATTGGTGTCTAAAGCCATGTGTGATTTTATGTCGCAATTTGGTGAATTCGAAAGTAAATTTGTTTTGGACGGTCTACTTTTCGTTTTTGGTAAATTAACCACGAATGAAAAGTTTTGGCGTTCTGACAAACTCGTGTCGTTTTCAATAGACAAAAAACCGATATCATTTCGAGCATGTGATTTTAGAAGTTATCTCATCGGTTCGGTAAAGTCAAGAGATGTGTTATTCAATTGTGACAACATCATCAGACAATGGGCGAATCATAGAGGTAATAGAGCTATGAGATTATTCAAAGTGAGTGGCTTCAAACCTGGATTGTTTAGCACAGTTCCAAACATACTACCCTGGATGAGATTCGATTTCTTCAAACTGTTGTCAAGTGATTATCTTGACGATGATGAGATCAAGTCGCTTCGAACTCTACGTCTTATGACCGAGCATAAGTCGAATAAGACTAAGGCTGACGAACACAGATTCACGACATGGATCTCACAACGGTTATAGACAAATTTGGAGTAGAAAAGGTTGAAGTGTATCTTAAGTTATATAATCAAATTAGAATGGAGAGAGGGGGGGTGAGCAATTTTTTGTTGAGATTGATCGACTCAAAGTTCAAAAAATTTTTGGATCATGATACTAAGATGGATTACAATGATGAAGAGACAATTGAACTACTGCAATGTTTGTCATCATTTGTCAATATGATTCCATCTTATTACTAAGATCTCTGGATCATTCTCATTATCGGATGAAGTAGTTTTGCAAGAAGATACTACATTTGAATTACAAATTTGAGTGCAGTTATCAAACAAATATGGCGAGTTCGAGTGAGAATAAAACTTCCAAAGATGATACAAAAATTATAAGTGAACACGTGGAAGATGAGTC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| 16,698
|
MW685457.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Kavalappara,s.R., Milner,H., Konakalla,N., Bag,S.
|
University of Georgia, Department of Plant Pathology, UGA Tifton
|
USA
|
2022-04-01
|
CF2A-524_1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,123
|
GenBank
| null |
USA: Georgia
|
USA
|
Cucumis sativus
| null |
2020
| null | null |
Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate CF2A-524_1 segment RNA 1, complete sequence
|
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| 31,889
|
MW147553.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Tabassum,A., Bag,S.
|
University of Georgia, Plant Pathology
|
USA
|
2022-01-23
|
14C
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,127
|
GenBank
| null |
USA: Georgia
|
USA
| null | null |
2018-10-02
| null | null |
Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate 14C segment RNA1, complete sequence
|
GAAATATTTTCCTTGGTATAAGAGAGGAACTCCCACTACCAACTACATTTCCAACACCCTTCAATCAGACTCTTCCCAACACTCTTTTGGAAGTATGTCGTCGTCAATAGTGGCCGCTGACAACCAAACTAACGTTGCTCTCACCAGCACCGTTAATGTGAAAGGAAGTTTCTACCAACACCACAACCTCCACAAACACGGAAACAAAACAAATAAAGCCATCAAGCGAGTAAACAAGACAGAACAAGACTCAAACAAGCGCGATGAGCTATTCGCTGGCCGGGTCGCGGTCTCTCCTAAGACTTTTAGGAATAGATTGGTTGCACCAGGTCTTAATCCCCACGATGTCATTATCCTCAGTAACGGCAACGCCCAGCTAATTCCAATTAAAAAATCTTTTGTAAAAAATCGTTTAAATATATTAAGGTCTATCTGTTCTATCCCCACCTGCAATTTTAATAAAATGCCGAAACCTGTCATCTACAAGTTCGGTTATGATGTAGATAGAATTAATAGAGCCATAGACAGTTATATTAGTAGTAAAGTAGGTACAACAAATGAAAAACCCCGTGCTCCAACTGAGATAATTCGTGGTGTGACTAAATATGGTGATGGTTACAGACTGTCCCATTATGAGGAGACGGGGACCACAAAAATATCTGTTTGTTTTGATAGATTAGTTAAAGGCAAATATATGTTTGAAATAACTTTGACAGAAAAATTTAATAAATCAAAAGTTTTTGAGGATTTTAGAGTCGAAGCGAAGAAACTGTATGCTAATACGACCGGGCAAAGTTACTGTCAACCTTTTGATCTCCACGGTCGTGCAAATCCTCTTCAGTACCATGTTAAGGTAGTACTGGCTTCTGTTTTACAAAAAATTCCTGATTACCAGTATTATTTTGGTACTTATTTTGGTAACAAATACGCCAAGACCATAAAATCCTGTAAACATCTGGTATATGTATCTTGTTACAACTTTTTTCAATTTTGTATTAGCAAAGTGGGCGTTAATGCGTCTGCTCGACCTGTCAGATTGGTTGACAAAGGGAATCTAAAGACCCACTTTGCAAAAATTGATTTGAGAGTTGATCTGAATGGAAGGGAGTACTTCGTCGTCACCAACGTCAGAGGTGAAGTGTATAACATACCAAACGATAGGCAAGCTATCAGAAATATGTATAACGCCACCTTGGATAATGGTAAATACGTAATCCATGGGGAGTGTATCACTCCGTATGGTACCCGTTATAAGTCTCATCCGAATCAATATTGCTGGATAAAAATCTCTTCCAGAGCCAAGATTGCTATGCCCAGGGAGTTAATACCGTTCCCTGAATTAAACTATGGATTTCTGGTGTCTTGTGGTTTAGGCCAAACTATGCAAGGTAGATTAAAAACCACAGGACCGGGACTACTCCATTACGATGGCAATCTTCATGGTGGAAAACAAGTTATAAGGTACGGCAGTAAAGTGGGAGTTAGGATAGAAACTGAATCAGATCACCTCATCAAGAACATCGAAATATTGTTCGATGAGCTTTGTACTGGAGTGGTCTCGACTTCAACTTTAAGAGGGGACAATCCATTAATGAACAACCTAACAAACAGAATGTCTGATATGATAAATAAGCAATGTGCTAAGAATAAAGATATCGTCATATCTACATGCTTGAACAACAGGCAGAAGAGAGAATTAACGGAGCTTTTTCCCGAGATAAATTATGAATTTCAAGATTCGTCTTATTCGTCACATCCCCTGGCGACGGCAATGAGACATACAGAGAATTTTTTGTTGGCCAGGTCTTGCAATAACAGGCAATTTATTGATGCAGGAGGTAACGTAGTGTACCATTTGAAGAAGATGGTAGCTGATGTGCATGTTTGCTCTCCTGTAGTGGATGTTAAAGATGCTCACAGGCATATGACCAGAAGTCTTCAATTGGATAAAATGAAAGGTATAGATGAAAGAGTTACCATGTGTTGCAATCTTGTTCAAGATTGTGATGTGGTGTACCCAAACATTATATCTGTTCAAGTCTATGATATGACTCTTCAGGATATGGCCAGGGCACTAGTGTCACATAAAGCTAAGAGGTACGATTTCTCTATGATCATACCGCCTGAAATCTATGACGACAATTGTGATGTGCTGTTATTTGACGATTCTGTGAGAGTGCGCGTGATCGACAATAAGGTCAAGTACGAATATGGTGATTCAGGTGAGGCGTACTATCATGATAGGGAGAATTTAAAAAATATACTTGCAACTCAAATTTTTGAGGTGGACGGAATTATTTACAAGAAGACTCTAGAGAATTCAAGAAAGCAGCTGCACTTCTATTCTCTTGTAACCTGCGTGGATATGCCCACTGGAATTTACAGATTGGAGACGCATTATAATAGGTCTGAGACTGATAAATTACAAATAAGAGTACCTGTCGAGGGATACGACAAACAAGTGACTATGGAAATCATCAAGGTCGAAAAGTCAAACTATCATCACATGATTGAATATGCGATGAATACAGTGTTGAAGCTCGACGAGAAGGCTTACGAATACCTTCTGTCTCAATACAGAGCTAGGAAAAGTGTGTCAATCCGCGGAGGGAAGGTCACTCAAATCACCTGTGACATGAATCCTAAGGCTGTCGCCGGATTCATAGGTGCCTTGGCAGGATGTGCTTTGAGGCTAAGGGAACAGGCTCACAGATCCGCAAAACTTGCTTACCTGGACTTCTATGCCCCGTCATTGTTGCGGTATATTGCTAAGGTAATATGTGTGATTTTAAAGAGGGTAAACAATTGGACCAAAAAATATTTTGAAAGTGTTCTAAAATTTTTGACTCCAGAATCTGTCCTTGAACAGGTCAATAGTGAAAGTTGCGGTGTTTATGCGCAGGAAGGTGAATACAATTTCGTGCAAACCGTAAACGTTATCAATGAGGGAGAGAGGAAGAATGTGTTGTCCGAATCCATACAGAAATTCAAAAAATTTGAAGAGAAGATGGTTGACAATCTGGAGAACAAAACGGCGGAACATCAACAGTTTTTCAATCCGGATATGCAAGATGTTATGAATGACATCTTCAATCTAGGGGCGGGAAGTGCAAGTCCAACACCTTCATTAGAATTGATGTATATCACATCATACAGGTTTTATCAGCGTATATATGAAGTTCTTTCTTGGTTTTGTAAGGATAATAAAAAATGTGGAAAATTTTGCAACTTCATATGTGCGATATGGGGGTACTTGAGAGAGAAAGGACTGTTGACCTTTTCCATATTTTTAAATTTAGTGATGGATGTGATAAACTTCCTCAAATCCGGTGTCAATAAATTACCAGGACAGATTGGGCTGAGGTTCAAGAGGATATTTGAATTGGTTTCGAACAAATTCTCTAGTACCAACCGATCTTTTGAAGAAAAACTGGATAAGTTATTAAAGGAAGAAGAGCACATGTACGTTTTAAGAGATACATCAAAGATCTCCGAAACGTATCACCTGGAGACTGATGAAGAAGATGTAGATTTGAACGCTTTATTTGATCTGGCTAGTATCGGTGGAGGAAGCAAGTATTTTCGTTTCTACACACTAAATTTAAAGTCTGTGTTTCCTAGGTTCAAAAAATTTTTGTACCATTTGAACCGTTTGAAATATAAATGTTGCTCAATAATTGAGAAGTTCCTTAATATGTGCAAAGTAGGTGGCACAAGAGTGAAGGAATTTTGCAAGTTCTATTTTGATCTGATTTTTGAGGAAGATGGTTTGAACTATATTATCAAAAATGTGTCTTTCAACGCGGTTAATATCTTTGTTGCGCTGATGGTAGGAGACGTGAGCATATTCAGAACATTAATTTCTTCAATTTACTACGCTTACATGTCATGTTATGGTAGAGAAAGCAAATTGATTGGGGGGGAGAGCATGTCTAGATCGATCGGTTTCATGCTTATGACACCTAGTTTACCTGGTATAATAACTTTACCAATTAAACTGGCGGCCGAATTAAATTTGGGAAGCAGTATAAAATTGTACTTTTCAGATAAAGAAAGATTCAAACCCGCTGCTACTAATTTAATAGCCAAAGATGTATTGCTTAAAGATCAAGTTGTTAAATTGACAAGTATGACTACTCAGAGACTTTGCTCTATCAGTTTGATCTTAATGTTGATCGATATCAAGTGGGGTTTATCGTTCATTATAACATTTTATCTTTTGACGTCTTTTGCGAGATACGTTAAATCGATATGTGTTGGAGCCAATATTCTAATTAGCTATGGTAAGGAATTGGACAGACTAAATCCTACCATGAAATATAGAAAGTTGAAGAAGCTTTTTGTTGAGAGATTTGACAAATCGCGATTTTTAAAACCAAATAACAAGCCCGAAGACGAAAGCGAGGATTTTTCAGATAGAGCTGAAATCTGTCGTGTCGGTAATGAGCAGTGTAATTCTGATGTGGAAGTGGAATTGGATCATAAAGGAAAAGTTGTGTACGATAAATCACGCGACCTATCCACCTTATCCAATTTTCAATCAGATTGCGCAGAGGATAGGGTCGATGGTTTAAATTTTTCGTTGCTAAACCCAACTTTAGACAGAACTCAAATTGAATGTAATGTTTCTTTTAGCCTTAGCCATGCGCTGTTGATATTCCCAAAGAGTGATGGTTTGGATTTCGTACAAACGGGGAATGATTTACTAGACAGTGTAAAAGAATTCTACCATCTGGAGGCTAAGAAATTACATGACGAGATGGGGAGGTTAAACGGTGCTATTAGGAAGTACTACGAACTGAATTTAGAGACCAAATCTGTTCGTGACGCTATTTGGCATTTAAGGAATTATTTAGATGACTCTTCTTTGTATGCGATGTTGGACAGTAGAAGCTGGTATAGACTTGGCAAGAAAGACCACGGTTTCACCACTTTAGAGGCGGAGTGCAAATATACACACGAGAATGAGTTGGTGGATTTTGACACTGTAAAATCTGGTG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| 33,562
|
FJ492808.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Turina,M., Falk,B.W.
|
UC-Davis, Plant Pathology
|
USA
|
2009-01-04
|
Arizona-1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,976
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Cucurbitaceae
| null |
2006-10
| null | null |
Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate Arizona-1 segment RNA2, complete sequence
|
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| 104,147
|
EF547827.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Turina,M., Falk,B.W.
|
UC-Davis, Plant Pathology
|
USA
|
2007-05-19
|
Arizona-1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,127
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Cucurbitaceae
| null | null | null | null |
Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate Arizona-1 segment RNA1, complete sequence
|
GAAATATTTTCCTTGGTATAAGAGAGGAACTCCCACTACCAACTACATTTCCAACACCCTTCCATCAGACTCTTCCCAACACTCTTTTGGAATTATGTCGTCGTCACTAGTTGCCGCTGACAACCAAACTAACGTTGCTCTCACCAGCACCGTTAATGTGAAAGGAAGTTTCTACCAACACCACAACCTCCACAAACACGGAAACAAAACAAATAAAGCCATCAAGCGAGTAAACAAGACAGAACAAGACTCAAACAAGCGCGATGAGCTATTCGCTGGGCGGGTCGCGGTCTCTCCTAAGACTTTTAGGAATAGATTGGTTGCACCAGGTCTTAATCCCCACGATGTCATTATCCTCAGTAACGGCAACGCCCAGCTAATTCCAATTAAAAAATCTTTTGTAAAAAATCGTTTAAATATATTAAGGTCTATCTGTTCTATCCCCACCTGCAATTTTAATAAAATGCCGAAACCTGTCATCTACAAGTTCGGTTATGATGTAGATAGAATTAATAGAGCCATAGACAGTTATATTAGTAGTAAAGTAGGTACAACAAATGAAAAACCCCGTGCTCCAACTGAGATAATTCGTGGTGTGACTAAATATGGTGATGGTTACAGACTGTCCCATTATGAGGAGACGGGGACCACAAAAATATCTGTTTGTTTTGATAGATTAGTTAAAGGCAAATATATGTTTGAAATAACTTTGACAGAAAAATTTAATAAATCAAAAGTTTTTGAGGATTTTAGAGTCGAAGCGAAGAAACTGTATGCTAATACGACCGGGCAAAGTTACTGTCAACCTTTTGATCTCCACGGTCGTGCAAATCCTCTTCAGTACCATGTTAAGGTAGTACTGGCTTCTGTTTTACAAAAAATTCCTGATTACCAGTATTATTTTGGTACTTATTTTGGTAACAAATACGCCAAGACCATAAAATCCTGTAAACATCTGGTATATGTATCTTGTTACAACTTTTTTCAATTTTGTATTAGCAAAGTGGGCGTTAATGTGTCTGCTCGACCTGTCAGATTGGTTGACAAAGGGAATCTAAAGACCCACTTTGCAAAAATTGATTTGAAAGTTGATCTGAATGGAAGGGAGTACTTCGTCGTCACCAACGTCAGAGGTGAAGTGTATAACATACCAAACGATAGGCAAGCTATCAGAAATATGTATAACGCCACCTTGGATAATGGTAAATACGTAATCCATGGGGAGTGTATCACTCCGTATGGTACCCGTTATAAGTCTCATCCGAATCAATATTGCTGGATAAAAATCTTTTCCAGAGCCAAGATTGCTATGCCCAGGGAGTTAATACCGTTCCCTGAATTAAACTATGGATTTCTGGTGTCTTGTGGTTTAGGCCAAACTATGCAAGGTAGATTAAAAACCACAGGACCGGGACTACTCCATTACGATGGCAATCTTCATGGTGGAAAACAAGTTATAAGGTACGGCAGTAAAGTGGGAGTTAGGATAGAAACTGAATCAGATCACCTCATCAAGAACATCGAAATATTGTTCGATGAGCTTTGTACTGGAGTGGTCTCGACTTCAACTTTAAGAGGGGACAATCCATTAATGAACAACCTAACAAACAGAATGTCTGATATGATAAATAAGCAATGTGCTAAGAATAAAGATATCGTCATATCTACATGCTTGAACAACAGGCAGAAGAGAGAATTAACGGAGCTTTTTCCCGAGATAAATTATGAATTTCAAGATTCGTCTTATTCGTCACATCCCCTGGCGACGGCAATGAGACATACAGAGAATTTTTTGTTGGCCAGGTCTTGCAATAACAGGCAATTTATTGATGCAGGAGGTAACGTAGTGTACCATTTGAAGAAGATGGTAGCTGATGTGCATGTTTGCTCTCCTGTAGTGGATGTTAAAGATGCTCACAGGCATATGACCAGAAGTCTTCAATTGGATAAAATGAAAGGTATAGATGAAAGAGTTACCATGTGTTGCAATCTTGTTCAAGATTGTGATGTGGTGTACCCAAACATTATATCTGTTCAAGTCTATGATATGACTCTTCAGGATATGGCCAGGGCACTAGTGTCACATAAAGCTAAGAGGTACGATTTCTCTATGATCATACCGCCTGAAATCTATGACGACAATTGTGATGTGCTGTTATTTGACGATTCTGTGAGAGTGCGCGTGATCGACAATAAGGTCAAGTACGAATATGGTGATTCAGGTGAGGCGTACTATCATGATAGGGAGAATTTAAAAAATATACTTGCAACTCAAATTTTTGAGGTGGACGGAATTATTTACAAGAAGACTCTAGAGAATTCAAGAAAGCAGCTGCACTTCTATTCTCTTGTAGCCTGCGTGGATATGCCCACTGGAATTTACAGATTGGAGACGCATTATAATAGGTCTGAGACTGATAAATTACAAATAAGAGTACCTGTCGAGGGATACGACAAACAAGTGACTATGGAAATCATCAAGGTCGAAAAGTCAAACTATCATCACATGATTGAATATGCGATGAATACAGTGTTGAAGCTCGACGAGAAGGCTTACGAATACCTTCTGTCTCAATACAGAGCTAGGAAAAGTGTGTCAATCCGCGGAGGGAAGGTCACTCAAATCACCTGTGACATGAATCCTAAGGCTGTCGCCGGATTCATAGGTGCCTTGGCAGGATGTGCTTTGAGGCTAAGGGAACAGGCTCACAGATCCGCAAAACTTGCTTACCTGGACTTCTATGCCCCGTCATTGTTGCGGTATATTGCTAAGGTAATATGTGTGATTTTAAAGAGGGTAAACAATTGGACCAAAAAATATTTTGAAAGTGTTCTAAAATTTTTGACTCCAGAATCTGTCCTTGAACAGGTCAATAGTGAAAGTTGCGGTGTTTATGCGCAGGAAGGTGAATACAATTTCGTGCAAACCGTAAACGTTATCAATGAGGGAGAGAGGAAGAATGTGTTGTCCGAATCCATACAGAAATTCAAAAAATTTGAAGAGAAGATGGTTGACAATCTGGAGAACAAAACGGCGGAACATCAACAGTTTTTCAATCCGGATATGCAAGATGTTATGAATGACATCTTCAATCTAGGGGGGGGAAGTGCAAGTCCAACACCTTCATTAGAATTGATGTATATCACATCATACAGGTTTTATCAGCGTATATATGAAGTTCTTTCTTGGTTTTGTAAGGATAATAAAAAATGTGGAAAATTTTGCAACTTCATATGTGCGATATGGGGGTACTTGAGAGAGAAAGGACTGTTGACCTTTTCCATATTTTTAAATTTAGTGATGGATGTGATAAACTTCCTCAAATCCGGTGTCAATAAATTACCAGGACAGATTGGGCTGAGGTTCAAGAGGATATTTGAATTGGTTTCGAACAAATTCTCTAGTACCAACCGATCTTTTGAAGAAAAACTGGATAAGTTATTAAAGGAAGAAGAGCACATGTACGTTTTAAGAGATACATCAAAGATCTCCGAAACGTATCACCTGGAGACTGATGAAGAAGATGTAGATTTGAACGCTTTATTTGATCTGGCTAGTATCGGTGGAGGAAGCAAGTATTTTCGTTTCTACACACTAAATTTAAAGTCTGTGTTTCCTAGGTTCAAAAAATTTTTGTACCATTTGAACCGTTTGAAATATAAATGTTGCTCAATAATTGAGAAGTTCCTTAATATGTGCAAAGTAGGTGGCACAAGAGTGAAGGAATTTTGCAAGTTCTATTTTGATCTGATTTTTGAGGAAGATGGTTTGAACTATATTATCAAAAATGTGTCTTTCAACGCGGTTAATATCTTTGTTGCGCTGATGGTAGGAGACGTGAGCATATTCAGAACATTAATTTCTTCAATTTACTACGCTTACATGTCATGTTATGGTAGAGAAAGCAAATTGATTGGGGGGGAGAGCATGTCTAGATCGATCGGTTTCATGCTTATGACACCTAGTTTACCTGGTATAATAACTTTACCAATTAAACTGGCGGCCGAATTAAATTTGGGAAGCAGTATCAAATTGTACTTTTCAGATAAAGAAAGATTCAAACCCGCTGCTACTAATTTAATAGCCAAAGATGTATTGCTTAAAGATCAAGTTGTTAAATTGACAAGTATGACTACTCAGAGACTTTGCTCTATCAGTTTGATCTTAATGTTGATCGATATCAAGTGGGGTTTATCGTTCATTATAACATTTTATCTTTTGACGTCTTTTGCGAGATACGTTAAATCGATATGTGTTGGAGCCAATATTCTAATTAGCTATGGTAAGGAATTGGACAGACTAAATCCTACCATGAAATATAGAAAGTTGAAGAAGCTTTTTGTTGAGAGATTTGACAAATCGCGATTTTTAAAACCAAATAACAAGCCCGAAGACGAAAGCGAGGATTTTTCAGATAGAGCTGAAATCTGTCGTGTCGGTAATGAGCAGTGTAATTCTGATGTGGAAGTGGAATTGGATCATAAAGGAAAAGTTGTGTACGATAAATCACGCGACCTATCCACCTTATCCAATTTTCAATCAGATTGCGCAGAGGATAGGGTCGATGGTTTAAATTTTTCGTTGCTAAACCCAACTTTAGACAGAACTCAAATTGAATGTAATGTTTCTTTTAGCCTTAGCCATGCGCTGTTGATATTCCCAAAGAGTGATGGTTTGGATTTCGTACAAACGGGGAATCATTTACTAGACAGTGTAAAAGAATTCTACCATCTGGAGGCTAAGAAATTACATGACGAGATGGGGAGGTTAAACGGTGCTATTAGGAAGTACTACGAACTGAATTTAGAGACCAAATCTGTTCGTGACGCTATTTGGCATTTAAGGAATTATTTAGATGACTCTTCTTTGTATGCGATGTTGGACAGTAGAAGCTGGTATAGACTTGGCAAGAAAGACCACGGTTTCACCACTTTAGAGGCGGAGTGCAAATATACACACGAGAATGAGTTGGTGGATTTTGACACTGTAAAATCTGGTG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| 107,165
|
AY242077.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Aguilar,J.M., Franco,M., Marco,C.F., Berdiales,B., Rodriguez-Cerezo,E., Truniger,V., Aranda,M.A., Abad,J., Gomez-Guillamon,M.L.
|
EELM-CSIC, Estacion Experimental 'La Mayora', Virology
|
Spain
|
2003-05-13
|
AlLM
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,123
|
GenBank
| 1
|
Spain
|
Spain
|
Cucurbitaceae
| null | null | null | null |
Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate AlLM segment RNA1, complete sequence
|
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| 110,406
|
AY242078.1
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Aguilar,J.M., Franco,M., Marco,C.F., Berdiales,B., Rodriguez-Cerezo,E., Truniger,V., Aranda,M.A.
|
CEBAS-CSIC, Mejora y Patologia Vegetal
|
Spain
|
2003-05-13
|
AlLM
|
Cucurbit yellow stunting disorder virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,976
|
GenBank
| 1
|
Spain
|
Spain
|
Cucurbitaceae
| null | null | null | null |
Cucurbit yellow stunting disorder virus isolate AlLM segment RNA2, complete sequence
|
GAAATACTACGGTAAATCCATTGGGATACGGCCAGACAGCCTTCCTCCCACTCCACCCCCCCCTCTCTTCTAATGAAGAGTATTAGATATGGTAAACTTTAAACCAATATCGTGACACTATGTGTCCCGGTTGTTCCAGCAAGTTGGTACTGGAGCCATGTCTAATATTTAGATTTAGACCCATCTATATATATATGTATATGTATATATTAGATTAGTTTATTCATACATAAACATAACACAACACAAACAAAATCAGCATATGTGAGTACCTTAAACTAGGCTAGGCTAGACAAGCTTCGGTTGATTGCATTATCACATAGGTGCATCAACAAACTGGTGGTTGCCACAGTGGAGACGAACTCCGAAGGCAGCCGACCACCTTGTTGTGAAGAGCCCCGTTTAAGCCCCCCCATATATGTTGATTAGTACTTTCCAAATCAAACGGTTTTATGGTTAAAATTTTTACTATAAACCTAGTCTGAGATGATAAGATTCAAGGGCTGTGATTGGGCAAGTTGGTACTCAAGAACTTTTAGTCATGATTCAATATGATTTGAATACGCTTGTTGTGTTGTAGTAAAAGAACTCTTTTCAAACACTACGCTGTCACGTTAATCACCGAGTTTCAAAAGGAAAAATCTTAGTAGTGATGTTTTGCCTTCCCAACGAGTGTTGGTAGTCACGGATCGAAGAGATCGACATCACACACTGAGATGTTCGTTAGATACAAAGTGATTAATCGTGAGTGTTCGAATTGATGTTTTGTGTTTATATATGTAGCTCATGTACAAAATTCTGGCTCTGCAGTTTTCAAGCTCCTTAAGACTTAAAGCCACTGGGCTTAATGTGGGAGAAGTTCTCCTAGTGTAAGAGATGAACTCCGTGCGCTCGTTAGGTACCGGATAACTCAGAGTGTTGGTTCTGAGAAGGAGTGTCTGAAGGTTATATCCAGAAGTTTGTATTGAGTAAAAAATAAACTAATCGTTGTTTTTAATAAGAATAGGCGTAGTTTAGTTAGTCATAGGTTCATTTATGGTAGATTATACTATAAGCTTCCTCGTCTCTTAGGTTTAGGGCCGTGGATAAGTCAGCAAGTTGGCACTGATAGATCTATTGTGATTGATCCATTGTTCTAACTAGTCCACGTCCTGTTCTTTAGCTTTTGTTTAAATATATGTATAAAAATTTTTCTACTATTATTTTTCAATTTGTGTGCTCTAGAGTCAAATTATGGCGAAGGCTGGTTTGGATTTTGGTACTACTTTCTCTACTATCAGCAGTTATGTTAATGGTGTTATGAAAGTTTTGAAATTGAACGAAACTGAATTTATCCCTACCTGTTTAGCCATAACGTCTAATAATGATGTGGTTGTTGGAGGTCCCGCTCAAGTATTGTCTAATAGTGACATGCCTAACTGTTACTTTTATGACTTGAAAAGGTGGGTAGGTGTTGACAGTATCAATTATAATGTGATAAAAACCAAAATCAATCCAGTGTATGTCACCGAGTTACGTGGTAACGACGTGTACATCACTGGTATCGATAGAGGTTATACCTGCACTTACACAGTCAAACAATTGATATTGTTATACATTGAAACTTTAGTAAGATTGTTTTCTAAAGTTGAGTCCATAACCATAACTAGTCTTAACGTCTCTGTTCCAGCTGATTATAAATGTAAGCAGCGTATGTTTATGAAATCAGTTTGTGACAGTCTAGGTTTTTCATTACGTAGAATTATAAACGAACCATCTGCAGCAGCTATATACTTTGTTTCAAAGTATCCGCAGTATAACAACTTCCTGATGTATGACTTCGGAGGAGGAACTTTTGATTCTTCTCTAATAGTCAGAGACGGTAAGTATGTCACAGTGGCTGATACTGAAGGTGATTCGTTTTTGGGAGGTAGAGACATTGATAATGCTATCGCTGACTATATAACAACGACGTATGGTATGAAAGGTGGTTTGTCCGCTGACGTACTGGCGTCTATAAAGGAGGATTGTAATTCTAAGGGTAGAGAGAATTTCAATGTTATAGATTCATCAGGCAAACTTCATAATGTGAAATTCACAAGACAAGATCTGAGTCGTTGCATTGAACCTTTCTCTAAGAAGAGCATAGCACTGCTTGATAATATGGTAGTGCGTAACATAACAAAAGATTCCGCTGTGTTTATGGTTGGAGGTTCATCATTGTTGAAGAAAGTTCAACATGATGTGATGAATTACTGTGCTAGAACGAAACTAGAATGCATCATTGATAAAGACCTTAGATCAGCAGTGTCATTTGGTTGCTCTATGTCACATGCCCAAGAAGACACAAAAAATATGATATACATCGATTGTAATTCACATCCCTTAATGGACATATCATATTTTTGTTCTCCAAAGATTATAGTTAGGAAACCTATGGCCATACCTTATACTGGAGTGCGAGAAGAAACCTTAACAAGACACTATACAACAATTTTGAACGTTTACGAGGGATCAGATCCCTTCGTTTTGAACAACGATTGGTTGATTAGTGCCAATATGCAGTCCAACAAGTACGGTGAGATAGGTGATACATTACAATATCTTTACAAATATAATGTAGATGGCATCTTAGAGTTGGTTGTGAGGAATAAAAGAACAGGTAAGGAGACGGTACTTCCCAATTCCTTTGCTTTGACTGAGAGTATAAAGAAGCTGGATGTAAATCTAACTCAATTGTCAAATATTGATGAATTGGCAACTTTGGTAGCTATTATGAGTTACTATAAGCCTGAATTAAAGTACCTCCTGACTTATGTAAAGACACCAACTATTTTTGAAAATGAAATTAAGAAATTTGGATCTGGTGAAGATTTATATAAATCCTTAGCTGCTCTGAATAAAAATTTCAAGTAAATTTGGATGTCATTAATTATAGTTATATATTCATTTTGTGACGGTATTAATATATATTATTGTAGTGATAGACGTGATTTTGAAGGTGATCACCAAGTTAGGCAATTAGACAACCTTCAAGACTTGTGCGAGATATTGCTGACTCACCCCTTTTATAAAACTTCATGGTGAATCTGATAGATAGTCCCAATTTACATGATGCTTTCTCTTTATTATTCAAAGCAAGAGATGTTAAAGGAAAAATTGAAAGTTTGGTGAAATACATAAAATCCAATCTCTCCACTGTCAATGCGTCTGCTTTTAGACCCATCGGTGGTGTGCGAGGTTTGGTGTATGATTCAAAATTTTCTATTTTTCAAGGTAATGTTCGGTTTAACATAGATGACGATAAATCCATCCTGAAGTGTATTTTAGTATACTTCTATCACGTGGATCCGTCTCTTCTGAAGAAAACCGCTTATAAGCCAGAATCCTTTTTCATCACAGACAACTGGAGAGAACATCTTGAGAAATGGCGAAAATATATCGACATGACAATGAACGAGTATTTGGTCGATAACAAGGATGTGGGTTGTACATACACCGAAAAGGAGATCAAGAATCATTACCCAGGGCAAAGTGATATCAGATTAATAACTCTATATCGGGTGTGTAATTCACAAGGCAGGTTAGTTCCTCTGCAGGAGTTTCTTTCTAGTGAGATCAAAGGATTTGACATCAAAACCGACGACGCTGGTCCTACCATCGTAGAAGGTTTAGGTGGAAATGATTTGTTTAAGGAGTGCTTAGTGGCTTTTAAGGATTATGTTAAACTGAACAGTTCTAAAGCTGGTCTTGAAAAGATCAAGGTCAACCAAAGATATTTTTCAGTTTACCTTGACTCCTTAAATAGCAATAACGATCTAAAAAATATCTCTGACAATCCTTTGGTTCTAGCGAAGTTCATGTTGGATTTTGACAATTTAACATCATCTACAGTTGGTTTCGCAGCTAATATTGATGCTATTAAAAAATTGGACGTGAACTTTAAGGCATTTTGTGAAAAGGTTTTTAACTTAAAAACCCGTTTAAATGAAGACAAATTATTCATAAATATGCCTAAGAACTCTGTTGTAGAAGTCCTTGGACAGCCCATATCAATTGGGAATTATATTAGATCATCAAAGATTCCACCCCCAGTGTCCAATTCTAGCTCTCTTCCTGAACACATAGATGAATTGGTGTCTAAAGCCATGTGTGATTTTATGTCGCAATTTGGTGAATTCGAAAGTAAATTTGTTTTGGACGGTCTACTTTTCGTTTTTGGTAAATTAACCACGAATGAAAAGTTTTGGCGTTCTGACAAACTCGTGTCGTTTTCAATAGACAAAAAACCGATATCATTTCGAGCATGTGATTTTAGAAGTTATCTCATCGGTTCGGTAAAGTCAAGAGATGTGTTATTCAATTGTGACAACATCATCAGACAATGGGCGAATCATAGAGGTAATAGAGCTATGAGATTATTCAAAGTGAGTGGCTTCAAACCTGGATTGTTTAGCACAGTTCCAAACATACTACCCTGGATGAGATTCGATTTCTTCAAACTGTTGTCAAGTGATTATCTTGACGATGATGAGATCAAGTCGCTTCGAACTCTACGTCTTATGACCGAGCATAAGTCGAATAAGACTAAGGCTGACGAACACAGATTCACGACATGGATCTCACAACGGTTATAGACAAATTTGGAGTAGAAAAGGTTGAAGTGTATCTTAAGTTATATAATCAAATTAGAATGGAGAGAGGGGGGGTGAGCAATTTTTTGTTGAGATTGATCGACTCAAAGTTCAAAAAATTTTTGGATCATGATACTAAGATGGATTACAATGATGAAGAGACAATTGAACTACTGCAATGTTTGTCATCATTTGTCAATATGATTCCATCTTATTACTAAAATCTCTGGATCGTTCTCATTATCGGATGAAGTAGTTTTGCAAGAAGATACTACATTTGAAATAAGAATTTTAGTGCAGCTATCAAACAATCATGGCGAGTTCGAGTGAGAATAAAACTTCCAAAGATGATACAAAAATTATAAGTGAACACGTGGAAGATGAGTC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| 110,407
|
NC_016144.1
|
Cuevavirus lloviuense
|
Negredo,A., Palacios,G., Vazquez-Moron,S., Gonzalez,F., Dopazo,H., Molero,F., Juste,J., Quetglas,J., Savji,N., de la Cruz Martinez,M., Herrera,J.E., Pizarro,M., Hutchison,S.K., Echevarria,J.E., Lipkin,W.I., Tenorio,A., Gonzalez,F.L., Dopazo,H.N., Hutchison,S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2011-11-03
|
Lloviu virus/M.schreibersii-wt/ESP/2003/Asturias-Bat86
|
Cuevavirus lloviuense
|
Cuevavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,927
|
RefSeq
| 1
|
Spain
|
Spain
|
Miniopterus schreibersii
| null |
2003
| null |
PRJNA485481
|
Lloviu cuevavirus isolate Lloviu virus/M.schreibersii-wt/ESP/2003/Asturias-Bat86, complete genome
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| 7,422
|
OQ630505.1
|
Cuevavirus lloviuense
|
Fletcher,P., Feldmann,F., Takada,A., Crossland,N.A., Hume,A.J., Albarino,C., Kemenesi,G., Muhlberger,E., Feldmann,H., Marzi,A.
|
Rocky Mountain Laboratories, NIAID, NIH, Laboratory of Virology
|
USA
|
2023-07-02
|
Hungary/2019/378
|
Cuevavirus lloviuense
|
Cuevavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,019
|
GenBank
| null |
Hungary
|
Hungary
|
Miniopterus schreibersii
| null |
2019-09-24
| null | null |
Cuevavirus lloviuense isolate Hungary/2019/378, complete genome
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| 14,812
|
ON186772.1
|
Cuevavirus lloviuense
|
Toth,G.E., Leopardi,S., De Benedictis,P., Hume,A.J., Muhlberger,E., Kemenesi,G.
|
University of Pecs, National Laboratory of Virology
|
Hungary
|
2023-01-29
|
Italy/2021
|
Cuevavirus lloviuense
|
Cuevavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,861
|
GenBank
| null |
Italy
|
Italy
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Miniopterus schreibersii
| null |
2021-09
| null | null |
Lloviu cuevavirus isolate Italy/2021, complete genome
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| 18,988
|
MZ541881.1
|
Cuevavirus lloviuense
|
Toth,G., Vanmechelen,B., Maes,P., Kemenesi,G.
|
University of Pecs, National Laboratory of Virology
|
Hungary
|
2022-02-15
|
Hungary/2019/378
|
Cuevavirus lloviuense
|
Cuevavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,019
|
GenBank
| null |
Hungary
|
Hungary
|
Miniopterus schreibersii
|
blood
|
2019-09-24
| null | null |
Lloviu cuevavirus isolate Hungary/2019/378, complete genome
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| 32,884
|
JF828358.1
|
Cuevavirus lloviuense
|
Negredo,A., Palacios,G., Vazquez-Moron,S., Gonzalez,F., Dopazo,H., Molero,F., Juste,J., Quetglas,J., Savji,N., de la Cruz Martinez,M., Herrera,J.E., Pizarro,M., Hutchison,S.K., Echevarria,J.E., Lipkin,W.I., Tenorio,A., Gonzalez,F.L., Dopazo,H.N., Hutchison,S.
|
Columbia University, Center for Infection and Immunity
|
USA
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2011-10-30
| null |
Cuevavirus lloviuense
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Cuevavirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 18,927
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GenBank
| 1
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Spain
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Spain
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Miniopterus schreibersii
| null |
2003
| null | null |
Lloviu virus strain MS-Liver-86/2003, complete genome
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CACACAAAAAGAAAAAAAGTTTTTTTAACCTTTTTGTGTCCTTAATACCTTGAAGAATATTAATCTCTTCCCGGAAATCGAGATCGAGATCTGGCTTCAAGTAACACTAATTTTCGCAGTGTCCTTGACTAAGGTTGAGAATATCTGTGTTCTTTTGGGTGATCTCCATACGATAATCACTCATATTGTGTCGCCACTCAAGATCAAGATCTGGCAAACCCAGCTGGTTGACCAAGGTACTTGGGAGACCTCTTGGCCCAAGCTGGAGTGTCCTCTGGTATTCACCTGACAGTAATAGTCCTAAAACAGTGTGCAATCGGTTCACCGTAAATTATCATTGATATCTGTTATATCCTAATAAGCATTCAAAATCCAATCCTCCCCTGAATAACAGCCCAATCCGCAAAGTACTTTGGGTATAGGTATAATCCAAGTTGAATTCTCAAGTAGACAACTAGGCCTTTGAGTATCCTGTGATCATGAATCGTTATCTTGGTCATGGTACTAGAACATCTAGGGAAAATACCAACCTGAGTGAATTACATGGTATTCTAAGCCTCGGGTTAAATGTAGATCATACCATTGTAAGGAAGAAGAGCATCCCGTTGTTTGAGATCGGTAACTCTGATCAAGTATGTAATTGGATAATTCAAATAATTGAGGCTGGGGTGGACCTGCAGGATGTTGCTGATAGCTTTTTAACAATGCTCTGCGTAAATCATGCTTATCAAGGAGATCCTAATTTGTTCCTTGAGAGTCCTGCAGCTCATTATTTAAAAGGACATGGTATCCACTTCGAAATCCAGCATCGTGATAATGTTGATCACATCACAGATCTCCTTGGAGTAGGGAGTCGAGACAAATCACTCAGAAAAACTCTTTCTGCACTTGAATTCGAGCCTGATGGCTCAACTACGGCTGGGATGTTTTTGTCTTTCGCAAGTTTATTTCTCCCGAAGTTAGTTGTCGGTGAACGTGCCTGCTTGGAAAAAGTGCAGCGGCAAATTCAAATTCATGCAGAACAAGGCTTAATCCAATATCCCACCCAATGGCAGTCCGTAGGACATATGATGGTTGTATTCAGGCTGATTCGTGTCAACTTTGTCCTCAAATTCCTCCTAGTTCACCAGGGCATGCACATGATGGCTGGGCATGATGCTAATGATGCAATCATTGCCAATTCAATATCCCAAACACGATTTTCAGGATTGTTAATCGTGAAGACTGTCCTAGAGCATATTCTCCAAAAAACTGAGGCAGGGGTCCAACTTCATCCATTAGCTCGAACCTCGAAAGTCAAAGGAGAACTCCTTGCATTCAAATCAGCACTGGAAGCGTTGGCCTCACACAGAGAGTATGCACCATTTGCACGGCTCTTGAACCTCTCTGGTGTTAATAATCTAGAACATGGCCTGTATCCTCAGCTCTCTGCCATCGCGCTTGGAGTTGCTACAGCTCATGGTAGCACACTAGCAGGAGTTAATGTGAGTGAACAATACCAGCAACTCCGAGAGGCTGCAACAGAGGCTGAGAAACAATTACAACAGCACTCAGAGATGCGGGAATTGGAGACCCTTGGACTGGATGAACAAGAAAGGAAGATCCTTGCAACATTCCACTCCCGGAAAAATGAGATCAACATTCAACAGACCAGCTCGATATTAGCAATTCGTAAGGAACGACTCCGCAAGCTGACAGAGGCCCTCAATGAAGAAAAGAATAAGAATGCACTTGATGATGAGGACGAAAGTGAAGAAGACGACTGGTCACCAGAAAATAGGGGGATACGGAGCAACAAGGGATCAACCAAAGAGTCATCCTCCTACACTGCTAGCAGAACCGAAGAAGACAGAAACAATTATAATAGTAAGGATGACCATCTCTCAGGAAAGGAACAAATGTCCACTCAACAGGAGTCAGGTGCTGACGATCTTGATCTTTTCGATCTGGACGACGACGGTGATACAAACAGCCAGGATCCAAACAACAGACAAAAACAATCCGATACTCAACAAACACAAGAATCCAGTGACCGTTCCGACTATTCAAGGCGACCAGCCTACGACTGGCCCCCAGGCGACAGGCCCCACACAACACAGGCTACAGATGAGCACACTGACCTCTTGAACAAGGACCATCGACGCAACCAGGTGAAGCCCGGAAGAAGGGGAAATGATCCAAGGACCCTCCCATTAATCAGCTTTGATGACAATGAGGGAGAGATCTTAGACGACAAGTCAGACCTCCCTGCTCCAGACACCCACTCAGACCCCGACACTGAGGAGTCAGAGGAAGAACATCCAGATGAAGAACTACTACCACCTGCTCCTAAGTACAACACTAAAACTTCAGAGCAAGAACCCGGGGATTGGAAGCAGCCCACTAGCCCCCTAAGTACAATACCGGAAGAAGAGGGAGGTCATGAGGCAAACAACGATAATTCCGAGTCTGATCTGATCGATCAAATGTACCAGCATATATTTGAGACAGAAGGCGCTTATGCAGCTATCAACTATTATTACAAAACCACAGGTCGACCAGTGACCTTCACCTCAAACAACAACCATGACTACACATTTCCTCAAGACATTGAAGGTCTGTTCCCACCGTGGGAAGGCAAAGAAAATCAAAAGGTGGCAGAGATCCTCACCAACTCTCTACATGAGACAGGGCAAGAATGGGCTGATATGAGTGCAAAGGAACGGTACCTTTTCTTGATAAATAACTAATCACCCCATTAAAATTGCTCATGGGGCCTGGAGAGAAACCTGCGCTGCATGTAATTAACCATCAAGCAGTAATCTCTACACTAAGATCAATTCATCAATGCATGTGAGCAAAGAGACCGCGGGCTGAACATAATGGAACAAAAGTCGAAGAATATTAAGAAAAACCCGGCAACGTGTTGTAGAGGTGGCAACAGAGAAACCTCCACGGCATATCAGCCAATCAACACAGCCCAACACAAAGGAGACACCCGACGGGACACAAATCCAAGGGTCAGGTGATCCCGCCCCAAACACAGGACTCAAAGCCCACCAGAAGGGCACACCCCAGAGACTCCACAGGCCATCCCTCTCCAAAAGACCCGAGACGAACTACACGGCATGGACAAAGTGACGGATGCCATCATGACTGGGCGATTATCACTCGACACAATCCCTGGCTTTCAATGCTCTGCGCCGACCTCCAGGAGCAGGCCCACCGGGCGAAAGTGTCCACCGTGGGAAGGACCACTCATTGAGCCCAAGACTTCCGCCAACAAATCAACACAAACTGAGAACATCTACCAAAGCGACCAGGTCCTACGCGAAATCAAACAACTGAGCTCAATTCTAGCCCACCAAATCACAACCATGGAGAGGCTAGAGGGTTCACTTCAAAGCATACACCAACAGCTTCAGGTGGTCGGGGGCATGGCACATAACCTAACATCCTTGACAACCCTGTGCACAGAAATGGTTGCCAAATATGACTTCCTTGTCATGACCACCGGACGAGCAACTGCAACAGCGGCGGCAACAGAGGCTTACTGGAAAGAACATGGGAAAGCCCCACCTGGCCCAGCCTTGTTCGAAGCAGATGCACTTAAGGCACGAATCCAAGAAAATCCCAAAAGTGTCCCGACTGATGTTAGAGAGGCCTTTGACCGTCTAGAGAAGACTGAGGAGGTAACAGAGAGGACGTTCGGAAAGCCAACCATCTCAGCTAAGCTCCTCAAGGAACTTCTCTATGATCATCTTCCTGGATATGGGACTGCCTTCCATCAGCTTGCCCAAGTCGTATGCAAGGTCGGGAAAGACAATGATCTCCTGGATATCATACATGCTGAGTTCCAGGCCAGCCTAGCAGAGGGTGACTCTCCGCAATGTGCCCTGATTCAGATCACGAAGCGAATCCCCATCTTCGGGGAGACACCACCTCCCGTCATCTACATAAAAACAAAACAAGAAATACCCAAAGCATGCCAAAAAAGCCTCCGCCCTCTTCCCCCCAATCCTAAAATTGAACGGGGCTGGGTATGCCATTATGTAACAGCAGATGGAAAGGAAATGGGCCTCAAGATATAAAACTGAACAAGCACTCCAAAGGCCTACATCCAACATCATTATGGTGGACAACCTGTCCCAATCCAGTACACAGGCAAAAAACCTGCAACAACAGGAGGTGCCCAATAACCCGAGTTCCCCTACAATCTCGAGCGGAAAAAGCTGACTACGAGGCTGTCAGAAGGGGGCCACAGGAAATATGGCTTACCACCTCCCGACCAGGGCACAATCTGCACAAAACACACCATCTCCATCTCCACCCCAAAACCAGGACCAGAGGCAGGAACAAGCACAAAGGGCCTACATCGGGCTCAAGCATGAGCAGCCAGACACATATCCAAGACCCTTCACCCCATCAACCCCAAGACCAACAACAAGGCTGCAGCGCTGCAACACCAAAATAAGATTGACTACCCTGCAAAGATCCCTCCACATACAACACGACAATCCATAAATCCCTAGAGCCTAACGGCCAACCACACCAAACACTCACGAGGAAGACGCCACCCGCAAAGCAACCCAAATGAACAACACCAGCAGCTCCCCGACCACCCGGACGGGCAACCGAGAGCACAACACCTCAAACCCGTCAACAGACCGCCACAGAGGACCCGGCTAAAACCCCTCCTGAGACAAGACCAGACACCATATCCCATCTACATTGATCCCAAAACAAAATACTGAAGAATATTAAGAAAAAACACCTTGGCTTGACAGTTCATAAGCGACCTTATAAGAGGATACTCTATACGTGGATAGAGAATGTTCTCCAAACATGTAACACTTCCACCACCTCCATACAATCCAAGCTCACCGGAAGGACTCTATTACAACCCAGATGCAGGGAAGAAACATGGGAACCCACACTCCCATCCCGTCCCGCACACGGAGCACTCCCGAGCCTCCAACACCATTCGTCCAACTGCCGATTTCAGCCTTGACTATGACAGT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| 97,953
|
NC_040574.1
|
Culex Iflavi-like virus 4
|
Sadeghi,M., Altan,E., Deng,X., Barker,C.M., Fang,Y., Coffey,L.L., Delwart,E., Coffey,L.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-02-12
| null |
Culex Iflavi-like virus 4
| null |
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,673
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
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Culex
| null |
2016-07-02
| null |
PRJNA485481
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Culex Iflavi-like virus 4 strain CIVL/Kern, complete genome
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| 3,822
|
NC_040716.1
|
Culex Iflavi-like virus 4
|
Sadeghi,M., Altan,E., Deng,X., Barker,C.M., Fang,Y., Coffey,L.L., Delwart,E., Coffey,L.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-02-12
| null |
Culex Iflavi-like virus 4
| null |
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,698
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
|
Culex
| null |
2016-07-02
| null |
PRJNA485481
|
Culex Iflavi-like virus 4 strain CIVL4/Fresno, complete genome
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GTAATATCGTTCTTTGAAAATCAAGTGAAATTTTTGTTACTCTTCGGACAAAAAGCCTACGGGTAAGCTAGAAGAATAGAAATATTTGTTAATCTTCGAACAAATAGCCTACGGGTAAGCTAGAAGAATTTAAAACGTTTGTTTTCAATTCAAGTTTATAATATTATTCATCCATTTGTAGTACAGCATAAAGTGTATGAATACTATTAGTTTACTTGAGCACCAAAGAGTTGAAGAAGTTCAGTCAAGACCAAGATTTCAAATTGACCTTGAACAAGTATGGAGGGACTTACAAACTCATTTACGGCGGCGACCATTTCTAATTCCAATACTGTTTATATGCGGAATTATCTTAATTCCCATCCTCGCATTGCGACCAAGCAGATTGAATACACCTGTCGAGGAAGATACACCACCTCCGTCACCCTGTACCAACGAGGACAAACCCGAGTGTTATTTAGTGTGAGGCAATCCGGACCAAATAAGAAATTGTGCATGGAATACTGTTATGCAAAAGTGGCTGAGTACTTGAAATCGATCAAGGATGATTGGAAAGTTCAAGGTTTAGAGGAAGATTTGAAATTGAGTAATAATACCTTGGTATTTGGAGAGGAAGGAAATAAGAAGGTGGAAGAGGATACCTCAGAAATACAAGATGTTAATGCTAAATTTCAACTTCTAACAGATGACCAACGGGAATCCCTACTCCGAGATTATAAATTGGAATATCAAGATGAGTATGAAGATTGGACTGTTGAGCGCATCATAATTCACGGCCGTCTGTTGAGACAATTGCGGAAATACGACTCACCAATGTTGGAGGCTTTGTGTCGTCAAGTGTATTGTGGTGGTTTGAACAATGCAGTGTCATACGTAATTAGGGATTTGCATCCAGATATAAAGAGAGATAAAGTGTGGCATAGTAGATTTGGTCCTTACGAAGAGGGATACAAAATTAGAGACGATGTGGGAGTGTTTTTAGTGGACAGGATTATGAATCAACCTTTAGGTACTGTTCTGACGATAATAAGACAAACAAAGGAGAAGATTGATGCCAGAGAAGCTCGTGAGAAAGCAATGAAGGAAAAGAGCCATAGAAGATATTATGTTGGATTTTCTGAAGAAGGAACTTGGTCTTGCCAAGGATTAGATTCTGACCAGCCAAACGAAATTGCAGCGTCCTTGGATGAGAGTAAAGGCGTTACTACAACATCTGAAAATGTTACTATAGTAGGAGCTGCGGAGTCAGTGGAAGAATCAATTATAACCCCCTTGCCTAAAGATTTATTAAGTTTGAGTTCCACGGAAAAAGTGTATGATTTTACAGAAGATAGTGCTGGAATAATGTCTAGATTTATGCCTTTGGAAACAGTTAACATCTCAGCTACGGAAGCTGGTTTAATTAAAAGTTGGCGTATTATAGAGGATTTGGTTAAAATTAATAGTATCACCACCCTTCCAATTCAAGGTTTCATGTTAGGGCATTATGATTTAGAATTTAAATTGATTGCTCAGGGTGTTCCTCAACAAGCGTGTTTGTTAATGTTAGGTCACTGTCCAAACCCATATGGGTTATATGACAAGTTTGCTACTCAGCAGGGATGGACAGTTGATGGTGCTGGGGCAGCCACTAGTGCTAATTATCCTGTTAAACCTGTATACGAAACACACAAAACGTACTTGAGTGTGGAAGCATCAGTCATGAGACCTAATGTAATGTTGAGCTTGGAATCCCAAGGAGAAGTGACCTTGAAGGTCAAGCAAAAATATCATAAAACCATGATTCGAAATTTTGACTATTTAAAAGCATCAGGAACTAATCCAGGTATAAGAGGGGGAATGCAAGGCTTGTTGACTTTACATGCTTTAACACCTGTTCTAGTAGGTACGGGAACAAGTTCTAATTTTGATATCAGAATATTATTTAGATTTGTGCAGGCGAAACTAGGGGCAATGACTGAACCAGTTAAAGAGAAGACAGCTGAAGCACGTTATAGTCATTTGTATGTAGTACCACATGATTTTAAAGATTGGGATTCCCTAAAGGTCTCACAAGATCCAGAGACAGAAAAGAAGCGTCAAGCAATTAGGTCTAAATACAGAGTGCAAGGTCCAGCTATGTCGGTTCTTGGAGGAGTGAAATCAGGCATGATGACTGCCGTTGGAGTTATAGATTCTATTGAGGGATTAACTGGGTACAATAATAAGAAAATCAAAAATAAGGACAAACCGGTTGATTCAGTATCGCAAGTAACTACAATTCCCAGACCGCGAATGAATTTCACAAATGGAGAGGGTCCGGATTCAGCTGTAATTGTTGGTATTAGTTGGGTGGAGTTAACACATATATTGCAATCTTTTGAAGATGAACCAAAATCATACAAAGATTTAGTTAATATCCCCAGTCTTATGCACACTGTTAAGATAGGGGATACCACTTTGCCAGGTTCTCAGTTGTGGAGCTGGAATCTCCAACCCACTGATGGGAATTGGCCTTTAACACCAGGGCAATTTGCTTCCTACGGATACGCTAACAATTGGATGCACACTACAGTGGCTATTGTTAGTTCAGGATTTACGAATTACTCGGGGGGCATGATTCTATGTGGACAATTTGTGAAGACAATGTTTCATAAAGCCTCTATTGAGGTGGCTATTCGTTTTGGTCGGGATTTAACTAATAATGCCATAGAGAATTCATATGTAACCATAATAAACGTGCAGGATACTTCCGCTTTTGAAGTGCAAATTCCTTATATTTATGATACACCAACTCGTCCTGTTTCAGGTTCCTCAACAGCAGTAGCTCTACCAAATACTACTAATCCGGCAAATTATGCTTTTGCTCATAGTGCTGCTATTACTATAAGGGTTTTGAATAGGTTGATTGTTGGTGCTGGGGCTTCTACTGAAATTCATTGTTTACTTTGGCTAAAAGGGGCCGAAGATTTTTCACTAAACTTTCCTAGGAGCTTTAATTGTAATTTGCTACCAGAGATTAAGAAACTAGTGTATCCACCACAAGTTATGTCTGTAACCCAGGGTATCACAACTCCACTACAATTTGCAGTGGTAGCTAGACCTGATACGAATGTTCCCAAATTCTTCCAGCAGTATACACCAAATACTTATATGGCGCCAAATTATGTGCAGGGTCCAGGAGAAGAACGTCACACCATTTTAACTAATACAGAACATTTAAATTTTAAATCAATTCTGAAGATGCCAGTTAAAATTCTTAATTATTATTCGTATGAACCCTGGATAAAGTACAAAGTGAACACGGTGTCAGATACAATGGTGGAAGTGTCGGATCGCGCTTATCTTACCATCCCAGTGGCTCCTTTGAATTCTACTTTTGTGCAATATTTAACTAATGAGATATATGGGGAAAATAAATTAGGAGAGACGCTGGGATCATTAACCCAATCACATGCATATGTCGTTAACACAATGTTTGGAATGTTTTCAGGATCCTTGGCTATGACTATTATTGTTGATGAAGGAGATTCTCCAGTTTATTGGGCTTATCTACCCCATGATTATAGATTGCGTAAATTGTACGGAGGTTTAAATCAGACAACTCAAAAGGCTGTAATGACACACTCAGCTCAACCAGTTCTTACCTCCAAGAATTGGAAGAGTGTATTTTTGGGTTCTACAACAGAAACTCATATGGATTTGATGTCTGCAGGAGGCTTGAACGGGATTATAGTCCCGAAAGTTAATCCAACAGAAAAGATCATTATTCCTATGTCGGCCCCATTGAATTGGCTACTGATGAACCGGTCGATTATGAACGAATCAAAGAAATTTATGACGCAGACAATGAGAGAAAATTCTGAATGGTTTAATGGCCATCTTGCTATCTGGTGCAATGTGAAATGCAAGATTTCAATTTTGTTAAACATGGGCGATGATTTTGAACTTGGAGGATTTTTGGGTCATCCGGGTTTCCCAAATATTCATGGTTGGATAAATGTAGATGATGATCGAAGAGTTGATTTGACAAAGTTTGTAACACAAGGTGAGGATGTTGAAGTGGCTGATCAGCAGATAGGTGATGAGGAGAATTTTAGAAGTATAGAAGAAGAGGTGAAAGCCATTTTGGAAAATGAAGAGGAAGTTTCTGCAGAAAAACAGACTGAGTATGACAAATTGATGCTAGAATATGAAAATGAACAACCAATAGAAAGAACTAATGACCCTCAAGTTTTTAGAACACAAGGTGAATCGGGTTTTCAGCTTAAGGACCTAACCCTAAATGGGTGGAAGTCCTTGAAATCCATGATTGTTTCGACTGCTGTTACTACAGCAGCAACATTGGCTTTTAATGAAATCGATAGGGGTACATCTGCTGCATTTGGAGCTGTTGCATTGTATACTTGTATGGGTGGAGTTCAACAACTTATACGTATTAATAGATCAGCAGAAATGAGTTCTGAAATTGTTCAGGAGTCTGTGCAAGTAGTTAGAGAAACTACAGAGGAGTTAGCGGCTAATGCGATGTCCGAGATCAAAAATATGATTGACCAATTGTTTCCCTTTTTAAGATCTACGTCCGAGTTCATGAGCTCTTTGTGGAACATAGCTCAACATTTAGTGCACGCAGCCTTAGCTCAGAATTGGAGTAACGCAGCCTTTGCAGGATTTTGCGTTATGATGGAGATGAAACTACTTGAATGGAAGGATTGGAAGAAATTAAGCCAACCCATGGAATTATTTTTTACTAGAGCTCAAACGTTTACTACACAGGGACCCGAGACCTGGACTTCTCTAGCTCAAGTGTTAACGTCATTGATTTGCGCTAAGGTACAGGTCAAGGCGGATGGTGGTTTGCAATCTTACTTGGCGAAAATTTTTTCTATGCATGATTATAGAGCTGTTGGTGGGTTGAATAGCATTCTTTCTTTGGTACGAACGGTAATGAATGCGGTCTCTGTTATCACGAATTGGGCGTTTCAGGAAGCTGATCCCAACATAGCCTTATTGACTGCGTT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| 3,909
|
NC_040832.1
|
Culex Iflavi-like virus 4
|
Sadeghi,M., Altan,E., Deng,X., Barker,C.M., Fang,Y., Coffey,L.L., Delwart,E., Coffey,L.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-02-12
| null |
Culex Iflavi-like virus 4
| null |
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 10,319
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
|
Culex
| null |
2016-07-02
| null |
PRJNA485481
|
Culex Iflavi-like virus 4 strain CIVL4-Sonoma, complete genome
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GGGCTATTGATGATTTTCTTGGCAACGCAGGCACTCGGGTCGCATAATCTAGTTCCACACACAGTGCTAATAGAACGCCGTCTATTAGGTGCTCGTCCTCCGAGCATACTCCAACAGCCTTCCTTATGTGTGGTCTCGCAACCCAGAGCCCTACTCTATCCGTTCCTTGATTCTGGAGACGGCCTTGGGGGATACAGAGGGAGCGGCAAAGGTAACATGAACTGTCCTACTCTTCTTCGGGGTCCCGGACCCTCCATGCCTTGATTACAGCGATGGTCTTGGGGCTCAATTCATGTTAGAAACGTTAGTAAGCGCACCTAGGAACGACACGTACACCAGACCGGTTACCCGGATGTTGGCGCCGCTCAATTCAATGGTGGCCAGGTTGAGGGGTTTCCCTGGTTGGATCGTACCGTGAGATACATGTCGCGAGTTCCTGAACAGCACTTGCTGAATTCCACCACCCACTGGGATGGCTCTTGACTCGCAGCTCACCGCCTGAGTACCACCACCTTCTAGTTGGGTGGTGAAAAGTCGGATTAAAACTGATCCGACTGCTGTACCTACGAGGGTACACTGGACTGTGCAAACGCGCCACGGCAAGTTTGCTAGGGCAGGCGGGAGCGTGACGGTACCACTGCTAGTGAAGCTGAACTCAATTGGTACTGAGAAGTTAGGCCTCACTGCCACCGGGACTGTCATCACCCCAACAGGTGTCCTGGAGCCGACACCCTTTCTACTACTCCGTTTCCTAACCATTCTGGCGTTGTCTTTCACTCCTGGCTATTAGACTTTATGAATGGTTCCTACACTTCTGACTTATGGCTTTATTGTCCTCATAAAGTGTATGAATACTATTACATTACTTGAAGAACAAAGAGTTGAAGAAGTTCGATCACAATCAAGATTTCAAATAGATCTTGAACAATTATGGAGGGACTTACAAACTCAATTACGGCGGCGACCAATTCTAATACCAATACTATTTATATGCGGAATTATCTTAATTCCCATCCTCGCATTGCGACCAAACAGATCGAGTACACCTGTCGAGGAAAATACACCACCTCCGTCACCTTGTATCAACGTGGACAAACCCGAGTGTTATTTAGTGTAAAACAATCTGGTTCAAACAAGAAAATGTGTATGGAACACTGTTATACAAAAGTGGCTGAATATTTGAAGTTGGTTAAAGATGATTGGAAAGTTCAAGGTAATGAGGAAGATCTTAAATTGAGTGAAAATATTGACGACGGAATAATTGGTGGTATCTCTGAACTATTTCAATTGGATTCTGAGAGAAAATTTTATTTGCTGGCGGATGAACAGAAAGCACAATTATTGGAAGATTACAAATTAGAATATCAAGGTGAGTATGAAGAATGGACTGTGGAACAAGTTATAGTTCATGGTCGTTTACTAAGACAAATGCGTAAATTTGATTCACCAATACTTAAAGCTTTGAGTCAACAAGTGTATCATGGTGGTTTGGACAATGCTTTGAATTTTGTAATTAGAAATTTGTATGATGATATTAAAAGAGGGAAAAAGTGGAGTAGTCGATTTGGTCCTTATGGAGATAAATATAAAATAGGAGATGATGTTGGCATGTTTTTGGTGGATAATATTATGAACCAACCTATGGGAACTGTTCTAACAATTATGAGACAAGTTAAGGAGAAGATTGATAATTGGGAAGCCTATGGAAAATACGGGAAAGGTAAGAGATTCTCCGAAAAAGAAAATTGGGTTTGTCAGGGATTAGATTCAGACCAATCCAATGAAATAACTGCGTCTTTGGATGAAAGTAAGGGTATTACAACAACTTCCGAAAATGTAACTATAGTGGGAGCTGCTGAATCTGTAGAAGAATCAATCCTTACTTCTTTGCCAAGAGATTTATTGAACTTAAGTTCCACTGAAAAAATTTATGATTTTACTGAAGATAATGCTGGAATAATGTCGCGCTTTATGCCACTGGAAACTGTAAACGTAGCTGCTACAGAGGCTGGTTTGATTAAAAGTTGGCGAATTATAGAAGATTTGGTTAAGATAAACAGTATCACCACATTGCCGATACAAGGTTTTATGTTGGGTCACTATGATTTGGAATTTAAGTTGATTGCACAGGGTGTTCCACAACAAGCATGTTTATTAATGTTGGGTCATTGCCCTAATCCATATGGTTTATATGATAAATTTATTTCGCAGCAAGGTTGGACCGTCGATGGTGCTGGTGGAGCTACAGGAACAAATTATCCAGTTAAACCTGTTTATGATACTTATGAAACTTATTTGAGTATAAATGCCTCCGTTATGAGACCGAACGTTCAATTAAGTTTGGAATCGCAGGGAGAAGTTACCTTAAAGGTAAAGCAGAAATATCATAAGACCATGATTCGGAATTTTGATTACTTGAAAGCTTCAGGTACGAACCCAGGAATTAGAGGAGGAATGCAAGGATTGTTAACTTTGCATGCTTTGACCCCTGTTTTGGTTGGAACTGGTACCAGTGCAAATTTCGATATACGAATTTTATTTAGATTTGTGCAAGCTAAATTAGGGGCTATGACAGAACCAGTTAAAGAGAAGACAACTAGTTCACGATATAATCATTTGTATGTAGTGCCTCATGATTTTAAAGATTGGGATTCTTTAAAAATTTCCCAGGACCCCGAGATAGAGAAGAAACGTCAAGTTATCAGGGCTAAATATAGAGTGCAAGGCCCCGCAATGTCGGTATTGGGAGGCGTGAAATCGGGCATGATGACAGCAGTTGGAGTTATTGATTCCATAGAAGGTCTCACAGGACACAGTAATAAGAAAATCAAGAACAAAGATAAACCTGTTGATGCGGTTTCTCAAGTTACGACAATTCCACGACCACGAATGAATTTTACAAATGGAGAGGGTCCTGATTCAGCAGTGATAGTTGGAATTAGTTGGGTTGAATTAACCCATATTTTACAGTCTTTTGAGGATGAACCTAAGTCATATAAGGATTTAGTTAATATTCCAAGTCTTATGAGAACCATAAGGTTAGGGGATACCACTTTACCTGGATCCCAACTGTGGAGTTGGAATTTACAACCTACGGATGGTAATTGGCCATTAACACCAGGACAGTTTGCAACTTATGGATATGCTAACAATTGGATGAATACTACTGTGGCAATAGTTAGCTCAGGGTTCACAAATTATTCAGGGGGTATGATTTTGTGTGGGCAATTTGTCAAAACAATGTTCCATAAAGCTTCAATTGAAATTGCTATTCGATTTGGACGTGATCTGACAAATAATGCTATTGAAAACTCATATGTAACTATTATAAATGTTCAAGACACATCGGCTTTTGAGGTGCATATTCCTTATATTTACGATACACCAACACGGCCAGTTTCAGGATCTTCAACAGCAGTTGCTCTTCCAAACACTACGAATCCAGCTAATTATGCCTTCGCACATAGTGCAGCTGTAACAATTAGAGTTTTGAATAGGTTGATAGTTGGATCGGGAGCTTCTACTGAGATTCATTGTGTACTTTGGTTGAAAGGAGCAGAAGATTTTTCTTTAAACTTTCCAAGAAGTTTCAATAGTAATTTAATGCCAGAAATCAAGAAACTTGTGTATCCTCCACAAGTTATATCGGTGACTCAGGGACTTACTACACCTTTGCAATTCGCTGTTGTTGCACGACCTGATACCAATTCACCAAGATTCTTTCAACAATATACTCCCAACACCTATTTGGCGCCTAATTATGTCCAAGGTCCGGGTGAAGAACGGCATACGATTTTGACTAATACAGAACACTTGAATTTCAAATCAATTTTAAAAATGCCAGTTAAGATTATAAACTATTATTCATATGAACCTTGGGTAAAGTATAATGTAAATACAGTTTCAGATACTATGGTGGAAGTCTCAGATAGGGCTTATATTACTCTTCCAGTAGCACCCTTAAACTCCACATTTGTGCAATATCTAACCAATGAAATATATGGAGCAAACAAATTAGGAGAAACATTAGGTTGTTTAACTCAGTCACATGCTTACGTTGTGAATACAATGTTTGGAATGTTTTCTGGATCTTTGGCTTTGACTATTATAGTAGATGAAGGCGACTCTCCAGTCTATTGGGCTTATTTACCCCATGATTATAGATTGCGAAAATTATATGGGGGTTTGAACCAGACCACGCAAAAGGCCGTTACGACTCACTCAGCTCAACCTGTTCTTACTTCTAAGAATTGGAAGAGTGTGTTTTTGGGTACAACTACTGAAACCCATATGGATTTGATGTCTGCAGGTGGTTTAAACGGTATAATAGTTCCAAAGGTTAATCCCACTGAGAAAATAATTATTCCAATGTCCGCTCCACTAAATTGGTTACTTATGAACCGGTCAATTATGAATGAATCTAAGAAATTCACAACTCAAACAATGCGTGAAAATTCTGAATGGTTCAATGGGCATTTGGCAATATGGTGCAACACAAAGTGTAAAATTTCTGTGTTGTTAAATATGGGTGATGATTTTGAGCTTGGAGGTTTTCTTGGGCATCCCGGTTTTCCAAACATCCATGGATGGATTAACGTCGATGATGATAGGCGAGTTGATTTAACTAAGTTTGTGACACAAGGTCAAGAAGTTATAGACCAGAACAATGAATTGGATGACGAACCAGATATCTCTGAGGATGTGAAAGGAGAAGTGGAAGCAATAATAGCAAATGATGAAGATGCTTCTGCAGAAACACAAGCAGAATATGATAAATTAATGAGAGAATGGGAAAATGAACAACCGATTCAGGTGCCTGCGGACCCACAAGTTTTTAGGACACAAGGAGAGTCGGGTTTTCAGCTTAAGGACCTAACCCTTAATGGGTGGAAGTCCTTGAAATCGATGATTGTCTCTACAGCTGTTACTACGGCAGCAACATTAGCCCTAAATGAAGTGGATAAAGGAGCTTCAGCAGCTTTTGGTGCAGTAGCTCTGTA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| 3,959
|
MW699045.1
|
Culex Iflavi-like virus 4
|
Wang,L., Rosales Rosas,A.L., De Coninck,L., Shi,C., Bouckaert,J., Matthijnssens,J., Delang,L.
|
KU Leuven, Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2021-04-18
|
Cifla4_Leuven_Pool2
|
Culex Iflavi-like virus 4
| null |
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,634
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Culex pipiens
| null |
2019
| null | null |
Culex Iflavi-like virus 4 isolate Cifla4_Leuven_Pool2, complete genome
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AAGATTAACAAATATTTCACTTGATTTTCTAAGAACGATTGAAGCTTGTAATATCGTTCTTAGAAAATCAAGTGAAATATTTGTTAATCTTCGGACAAATAGCCTACGGGTGAGTGAGAAGAAAAATTAAAATATTTGTTATTCTTCGGACAAATAGCCTATGGGTAAGCGAGAAGGAAATTCAAATTGTGTTTAAATATTCTTTCATTTGAAGTACAGCATAAAGTGTATGAATACTATTACATTATTTGAAGAACAAAGAGTTGAAGAAGTTCAATCACGCCCACGCTTTCAAATAGATTTGGAACAAATATGGAGGGACTTACAAACTCAATTATGGCGGCGACCAATTCTAATCCCAATACTGTTTATATGCGGAATTATCTTAATTCCCATCCTCGCATTGCGACCAAACAGATCGAATACACCTGTAGAGGAAAATACACCACCTCCGTCACCTTGTATCAACGAGGACAAACCCGAGTGTTATTTAGTGTGAAACAATCTGGTTCAAATAAGAAAATGTGTATGGAATACTGTTATACAAAGGTTGCCGAGTATCTAAAGTTGGTGAATGACGATTGGAAGGTGCAAGGATTGGAAGAAAATCCTAAATTAGCGGATGATAATTTGATACAAACTTTGGATGTAGAGAAGAAATTTCAAGAATTATCGGAAAAACAAAAAGAAACTATTCTAGAAGATTATAGATTGGAATATCAAAATCAATATGAAGATTGGCCTGTTGAACGTGTTATTATATATGGACGCTTATTAAGACAAATGCGTAAATTTGATTCTCCAATGTTATTTGCTTTGAGCCAACAAATTTATTTTGGTGGTTTAGAAGATGCTATTAAAATTATGATTGGAAATTTATATGAAGATGTTAAGAGAGCTAAAGTATGGCATGGTCAGTTTGGTCCTTATGAGAGTGGATATAAAATACGAGATGACGTTGGTATGTTCTTAGTAGATAAAATCATGAATCAACCAATAGGGTCAATTTTAGATATAATAAAACACGTGAAGGATGAAAGAGATAATTGGGACTACGAGAAGAAAGGAAATTGGGCTTGTCAAGGACTTGATTCTGATCAACCTAGTGAAATAACAGCTTCATTAGATGAGAGTAAAGGAGTTACCACAATAACAGAGAATGTAACTGTGGTAGGAGCGGCCGAGTCAATAGAAAAGTCTATTCTAACATCATTACCCAGAGATTTACTAGGTTTAAGTTCAACTGAAAAGGTGTATGATTTTACAGATGATAGTGCTGGAATCATGTCTCGTTTTATGCCATTGGAAACTGTGAATGTAGCAGCTACTGAAGCTGGTTTGATTAAAAGTTGGCGTATTATAGAAGATTTGGTTAAAATTAATAGTATAACGACATTACCCATTCAAGGCTTTATGTTAGGTCATTATGATTTAGAATTTAAATTAATTGCCCAAGGAGTGCCACAACAAGCTTGTTTGTTAATGCTGGGACATTGTCCTAATCCATATGGTCTGTATGATAAATTTGTCTCACAGCAAGGTTGGACTGTAGATGGGGCTGGTGGAGCAACAAGTACTAATTATCCAGTGAAGCCAGTTTATGAGACTTATGAGACATACTTGAGTGTTGATGCTTCAGTGATGAGACCTAATGTGCAGTTGAGCTTGGAATCACAAGGAGAAGTTACTCTTAAAGTTAAGCAAAAATACCACAAAACTATGATTCGAAATTTTGATTATTTGAAAGCCTCTGGAACAAATCCTGGTATACGTGGTGGAATGCAAGGTTTGCTCACCCTACATGCTCTAACACCAGTCTTGGTAGGAACTGGCACTAGTAATAATTTTGATGTGAGAATTTTGTTTAGATTCGTGCAAGCTAAGTTGGGAGCTATGACGGAACCAGTTAAGGAGAAAACCACTAGTGCTCGTTATAATCATTTGTATGTAGTGCCTCATGATTTTAAGGATTGGGAAGTGCTTAAAGTTTCTCAGGACCCAGAAGTTGAAAAGAAACGCCAAGTAATTAGGGCAAAGTATCGAGTGCAAGGTCCTGCAATGTCAGTACTTGGTGGTGTGAAATCAGGGATGATGACAGCAGTAGGAGTGATCGATTCTATAGAAGGCATTACTGGATATAATAATAAGAAGATTAAGAACAAGGATAAACCAGTGGATGCTGTGTCTCAAGTTACTACCATACCTAGACCTCGAATGAATTTTACAAATGGTGAAGGACCTGACTCAGCTGTTATAGTGGGAATAAGTTGGGTTGAACTAACCCATATTTTACAATCTTTTGAGGATGAACCTAAATCGTATAAGGATTTGCTCAATATACCCAGTTTAATGAAAACTATTGAATTGGGAGACACCTCATTACCAGGTTCGCAACTCTGGAGTTGGAATCTGCAACCAACTGATGGAAATTGGCCCCTATCTCCTGGACAGTTCGCTTCTTATGGGTATGCTAATAATTGGATGCATACAACAGTAGCTATAGTGAGTTCTGGGTTCACGAATTATTCTGGAGGTATGATTTTGTGTGGGCAATTTGTTAAAACAATGTTCCATAAAGCCTCAATTGAAATTGCTATTAGATTTGGACGTGATTTGACTAGTAATGCTATTGAGAATTCTTATGTTACCATTATCAATGTACAAGACACATCAGCTTTTGAAGTTCATATTCCTTATATCTATGATACTCCCACCCGCCCAGTATCAGGTTCTTCAACAGCAGTAGCCCTTCCTAACACAACTAATCCTGCTAATTATGCTTTTGCTCATAGTGCTGCAATAACTATAAGAGTTTTAAATAGATTAATTGTTGGATCAGGAGCTTCATCAACAATACGTTGTTTACTCTGGCTGAAAGGAGCTGAAGATTTTTCATTGAATTTCCCACGAAGTTTTAATTGTAATTTAATGCCAGAGATTAAGAAATTAGTGTATCCACCGCAAGTTATTTCTGTCACCCAAGGAGTTACAACTCCATTACAATTTGCCGTTGTAGCGAGACCCGATACAAATTTGCCGAAATTCTTTCAACAATATACCCCTAATGTTTATCTTGCGCCAAATTATGTTCAAGGACCTGATAGTGAACGACATACTATCTTAACCAACACTGAACATTTAAATTTTAAATCAATTCTTAAAATGCCAGTTAAAGTCATTAATTATTATTCATATGAACCCTGGGTTAAATATAAAATAAATACGGTTGCGGAAACAGAGGTAGAGGTATCAGACAGGGCCTATTTAACCATCCCTGTTGCACCTTTGAATTCAACTTTTGTACAATATTTGACTCATGAGTTGTATGGGGAGAATAAATTAGGAGAGACTCTGGGATCTTTGACACAATCACATGCCTATGTAGTGAATACCATGTTTGGAATGTTTTCTGGATCTTTAGCTATGACCATTATTGTAGATGAGGGAGATGCTCCTGTATATTGGGCTTATTTGCCTCATGATTACAGATTGAGAAAATTGTATGGAGGATTAAATCAAACCACTCAGAAAGCTGTTATGACCCATTCATCTCAACCTGTTCTTACTTCTAAGAATTGGAAGAGTGTATTTTTGGGTTCTACTACTGAAACACATATGGATCTTATGTCTGCGGGAGGTTTGAATGGAATTATAGTACCTAAAGTCAATCCCACGGAGAAAATAATCATCCCAATGTCTGCCCCATTAAATTGGTTATTGATGAATCGATCAATTATGAATGAATCAAAGAAATTCACGACACAGACAATGCGTGAGAACTCTGAGTGGTTCAACGGACATCTTGCTATATGGTGTAATGTAAAATGTAAGATTTCAGTTTTGTTGAATATGGGGGATGATTTTGAGTTGGGAGGATTTTTAGGACATCCAGGTTTTCCAAATATTCATGGATGGATTAATGTTGATGATGATCGAAGAGTTGATTTAACAAAATTTGTCACTCAAGGTGAAGAAATAGCATACTCAGATCAACAGGAGGAAACTGAAGAAGAAGGCGTATCAGATGCAATTAAAAAGGAAGTGGAGGCTATACTTGCAGAAGATGATTTAGTGTCAGAAGATATTCAAACTGAATATGATAAATTAATGCTAGAATGGGAGAATGAACAACCAGTGGAGATACCATTAAACCCACAAGTCTTTGTGACTCAAGGGGAATCGGGTTTTCTGCTTAAGGACCTAACCCTTTCTGGGTGGAAGTCCTTGAAATCTATGATAATGTCTACAGCAGTGACTACAGCTGCAACTTTGGCATTCAATGAAATGGATAGAGGTGCCTCAGCAGCTTTTGGAGCTGTAGCGCTCTACACCTGTATGGGAGGAGTACAACAATTAATCCGAATTAATAGAACTGCTGAAATGAGTTCAGAAATTGTGCAGGATTCAGTTCAAGTTGTACGTGAGACTACTGAAGAATTAGCAGCGAATGCAATGTCGGAAATCAAAAACATGATAGATCAATTATTTCCATTTTTGCGTTCTACCTCAGAGTTTATGGGCTCTTTATGGAATATAGCCCAACATTTAGTTCATGCAGCTCTAGCACAAAATTGGAGTAACGCAGCTTTTGCAGGTTTTTGTGTTATGATGGAAATGAAATTGTTAGAATGGAAAGATTGGAAAAAGTTGTGTCAACCTATGGAATTGTTTTTTACTAGGGCACAATCCTTCATCACTCAGGGGCCAGAAACTTGGACTTCATTAGCACAAGTTTTAACATCTTTGATTTGTGCAAAGGTGCAAGTGAAGGCAGATGGGGGGCTTCAGTCTTATCTAGCTAAAATCTTTTCGATGCATGATTATAGAGCTGTAGGAGGGTTGAATAGTATTTTATCATTGGTTCGGACAGTCATGAATGCAGTTTCTGTTATCACCAATTGGGCTTTTCAGGAAGCTGATCCAAATATTGCATTATTAACTGCTTTACAAAATCAAGGAGAAGATTTGGAAGATTTTGCGGCGCAAGCAAGTGAGTTTCTTACATTCTTTGCTGATTTAGAAGTGACCAAGCGTGAGAATAGAATCAAGTATTTAGCATTAATTTTGCGAGCTATTAAAATTAGAGAAATCCTCGTAAGAGTGAATGATCCAAAAATAGCAGGACCTCTATTACAAACATGTGTTAAAGTTATTGAAAAAGCTAATTCAGTACAGTACTTGTTGCAGTGTGATATTGTTAAGCAGGAACCATTTATTTTGTGGCTAGAGGGTGAGTCAAAAATTGGAAAATCTTTTTGTGTCTATAAGATTATTGGGCATATTTTTAAAGAAGCTGGTTATGCTTTGAATACCACGGACTATATATTTACAGTAAATTTGGCTTTACAATTTATGAATGGTTTAAGATCTTGTCATAAAGCTTGGTTTATAGACGATGCATTGAGTATTAGGGACATTGAATCGATTAAGAGGTTTGTCGATTGTATGATATCTTTGAAGACATCAACTCCATTTAATGTACCTAGAGCAGAAATTGAAAATAAAGATCAGGTAGCTCAGCCGCAATTAGTGGTTGTTACTTCAAACAAAGAGAATGCTTTTCCCCAATTGTCTGAGGTACCTTGTATTAAAGCGTTGTTACGGAGGAGGGACTACATGGCTCATTTAGAGTTAGCCCAACCAAACCACTCCCTTTCAGATTATAGTGAGGAAGAACTTGATGAATTCCTCCATTTGGTTTGTATGAGGTATCTGGATGTAACCGACCCTACATCTTTAGCTTCTAGGAGAATGACTTTTTACGAATTTTTGGGTGAAGTAGCAAAAGAATTCATTGATTATATGAAAGCAGAACAACGCAATCAATTTAAGAAATATCAATATCTAATTCAGTGCTTGAGTAAGAATGCAATTGATAGCTTAAATATTGGAAATCCATTTGAATTGATTAATAGGTGTAATTATGATCAACCATCTCAAGCTTCCATTAGAATGATGGTAGAAGATGAAGTTTGTGTGTTAATGGAGACTATAAAACAAGCTGAATTTATGAAAACAAAACTCCCAAGAGATGACCAAGTATTTGCCACTCAAGGTTTGTTGGAAAAGTTTCAAAGTTGGATAGATTGGTTCGCTTATTACATTAAAACTGTGTATAAGTTAATTTCTAATACAGCAATTAGATGCATGAGGTGTTCAGATAGGGCTTTTAGTCAAGGAACATCCATTTGGTGTGAAGATGGAGGGCATCATTTGTGTTTGGCCTGCGCTGCTAATGATATGCAACAGAGTCCAGCACTTAGTACACTGCGGTGCCCAATGCATCCCTCTAGTCGTATCACTTTAGAAATGTCTGGCATTTTGCAAAGTATGTTTGCTAATCTAGTTGATCAAAAATTGGATGGATCCAATATGACTCTACATATGATAGCTACAGCATTAGAGGGTAATATGGAGGCATCTACCTATCTATCTGTTTTGAGAGCTATTAATATGACATGTTCTTTATTCAAATTTGCGACTCAAGACGAACTAGAAGAGATAGATAACCCAATTTTGATTGATGGGTGTGTGAAAGATTATCTGAAAACTCTAGTAGTATCAAATTATTATTATCCTGTGGATCAGTTATCTGTAAAGGTCAATATGCAAGAAAAGTTCTTATACTTAGTTAATATGGGAATCATACCACGCTCAAATAATTATGTTTGTCCTCATTCCCTTTTGGCTGCTAAATTTTTGTTCTATGGTGGAAAGTTTGTTTTGGTTGATGATCCTGAAGTCGTTTTGGAAGATTTCATTTGTGATCAAGGGGTGTGTGCTTTCTCTCATGTGGTATTTTTACAAACAATAGTTGAAAATTTCGATGTTACTTGGAAGTTGTGTCAGGAACATAAAAATAGAACCCGGCGAGCAATTGAAAGAAACTGGCCAAAGTTCCTGTGGCCTCCTGGTATGAAAGAAGCGAAGGATTTAAATTTTAGAATAAAGAAGTTTCTTAAAACAAGTTGGTGGGAACAGTATATGCCGGAAAATCCTGTTTTACAAAAACTAATTAAAGTTGTGTGTCCTTTACTTGCAGTCCTTGGAGTGTGTTGGGCTTCAGCTAAAGCAGCTAGTGCTTTATGGAATTGGATTTCGCAGTATATTGGGTTTGGGCCACAAGCTAAAACGAATGCTGATTACGGACATTCAACTAGGTCTCGGGTTCTTAAAACGAGGAAGACTCGAGTGTATGCCACTCAAAGCACACAAAATTTTGAGAATAAACTAGATAAGATAGCAAATAATTATATTGTGTTAGAGATAGGATCTGCTCAACTGACTGCATGGGGAATAAAAGGGAGCACTTTCCTTATACCAAAACACTTAACGCATAGCTTAAAGTCCCTAGAAGAAGTAATTATACATTTTCCAACTAGGGAAGAACCCCCTATTAGTGTTAGATCAGACAATATTGAAATTATCCTAGTGCCAGATCGGGATTTAGCTAAGTGTACTATAAAACATGGAAAAATTTTATTTAAGGATTGTTCAAAATTTCTTCAACGGAGGGCTATTACGGACTGGATCGATAGAACAGGTTTAATTATGCAAGTTGAAAATAAGACAGTGTTTGATGTTGAAACTAGAATTTTGAATACAATGGATCATTCGACAGCCACTAATTCTAGAGGTATTGTTTTTGCTAATTGTGGAAGTGTAGTATATGATTATCAGAAAGCTGGATTGTGTGGATCTCTTCTGTGTGTTGATAGTATCTTCCCAATTATTTCCATGCACATAAGTGGCAGTGAGAGTTTGAATAAGGGTATTGGTGTGATTTTGTATCAGGAAGATTTTGAAGTCCAAGGAGCCAGTCTTGTAGACATGCCTATGGAAGAAGTGGTTACTTTTGGACCTGATTGCCAAGTTCAATATGTTGGTAATGTGGAGCCCTCAATGGTTGCTTTTATACCAAATAAATCCACTATTGTGCCTAGTGCTATCGCTTCAGCAATTTCAAGGAGAGAAGCCTGTGATTTGTTAAGTCCTCGACCTAGGACTTATCCAGCATTTCTAAGTAAAGTTGAGTTTGTTCAGTATGCTGATGTGTTTTTACACTACAAGCATCCAGAGACGCCTTTAATTTATGGAGTTAGAAAGAATGGAAAACCGAGTAAAGATTTTAGTGTGTTGCACATAGAACGGGCTTTTAAGGAGGTAGCAGATTTGATTTTGGCTGGGGAACCTCTACCCAAAGAATATGTACGGGTTATGTCAGTGGAGGAAGCTGTAATGGGAATTAATACAGACTTAGATGAGGAAGATCCTTTGTATTTTGGCAAATTACCCTTAGACACAAGTTCAGGTTGGCCGTATTCTACATCCCAATATATGAGAGACTATGCTGTCCAAAAGAAAACAAAAGATGGGTGGATTTCGATCACTTATAATTCAGAAACAGGTTTTCCAGAAAAATGTAAAATTCATGAGAAAATTTTAGAGGATCACAATTTTAACATGCTGCAAAGAGAACGTGGGGAACCAGCTTTTAATGTTTTTCAAGATTGCTTAAAGGATGAAAAAAGAAAAGAGGAGAAAGTACTTTCAGAAGGAGGTACTAGATTGTTTTCAATGTCTAATATAGAAGGGTCTATAGCTCTTCGTAGGTTCACTTTAAGTTTAACTAACCATATTAAGAATAATAGGATATATAATGGTGTGTGTGTTGGAATCAATCCTGAGTCACCAGAATGGACATTTTTAGCAGATGTGATTAGAAAGCATGATAATTATTTTACCACTGACTTTACAAATTTTGGAGCTGGTTTAAACTATTATTGTGGGATGAAATTTGCTGATTTGATTAAAATTTATTACTTAAGAGCTGGGGTTGAATTAGATGAGAACCAAATAAGGTGTATAGATGCTTTGATACAAGAGTTGATGGGTTCATACCATATTGCTCATAACACTATTTATAGAACTTTTGCAGGCAGTCCTTCCGGTGCTTGTATAACTGTAGAAATTAATAGTTTTGTGCATTTAATGTATGTGGTAATTTGTTGGAATATAGTGTGTGATCTTATGTATGAAAAACGTAATGGAGTGAATAAGTTAAAATATAAGTATCCAGAGTTATTTGGGTATCTGCAGGATATAGATCTAGAGATGAATGTAGAAGATTTCGCCGGAAATGTGACTGCTTGTGTTTACGGAGATGATGGTATCTTCTCAGTTTCAGATGAATTTGCTAAGGTTTTTAATGGAGTTGTGGTTAATTTGATTCTTAAAGAGCATGGTATCGGGGTTACTGATGCAAGTAAATCCCAAAAGATTCAACCAACAGTACCATTTGAGGAATGTACCTTTCTTAAGCGGAAGTTTATAACTCACCCTTTATGTGAACATATGTATGCTGCAGAGATGGAGTGGCTGTCCATTGAAGAATGTATTAAGTGGATTCATAAGTCTAGTATTGAATCTGATGAAAGTCGAACAAGAGAAAACTGTTTGCAAAGTTTGCGTTTGTCTTGGGGGCACGGAGAACACGTGTTTACTAAATGGCAGAATATATTGAATGCTTTGTTGATGGGTATTCGAGTACGGGGAATACACACAACTTGGATGGAGTTAGCTAGAGAGATGTATCCAGATTTGTGTGTGAAATTCTGCTAAACTTAAAATAAAC
| 42,614
|
MT096522.1
|
Culex Iflavi-like virus 4
|
Birnberg,L., Temmam,S., Aranda,C., Correa-Fiz,F., Talavera,S., Bigot,T., Eloit,M., Busquets,N.
|
IRTA, Animal Health CReSA
|
Spain
|
2020-03-25
|
FTA1-8
|
Culex Iflavi-like virus 4
| null |
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,669
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
| null | null |
2015
|
SAMN13978317
|
PRJNA604676
|
MAG: Culex Iflavi-like virus 4 isolate FTA1-8, complete genome
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| 53,187
|
MT096530.1
|
Culex Iflavi-like virus 4
|
Birnberg,L., Temmam,S., Aranda,C., Correa-Fiz,F., Talavera,S., Bigot,T., Eloit,M., Busquets,N.
|
IRTA, Animal Health CReSA
|
Spain
|
2020-03-25
|
FTA2-8
|
Culex Iflavi-like virus 4
| null |
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,669
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
| null | null |
2015
|
SAMN13978318
|
PRJNA604676
|
MAG: Culex Iflavi-like virus 4 isolate FTA2-8, complete genome
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| 53,194
|
MH188011.1
|
Culex Iflavi-like virus 4
|
Sadeghi,M., Altan,E., Deng,X., Barker,C.M., Fang,Y., Coffey,L.L., Delwart,E., Coffey,L.
|
Institute of Biomedicine, Virology
|
Finland
|
2018-08-29
| null |
Culex Iflavi-like virus 4
| null |
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,698
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Culex
| null |
2016-07-02
| null | null |
Culex Iflavi-like virus 4 strain CIVL4/Fresno, complete genome
|
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| 68,945
|
MH188012.1
|
Culex Iflavi-like virus 4
|
Sadeghi,M., Altan,E., Deng,X., Barker,C.M., Fang,Y., Coffey,L.L., Delwart,E., Coffey,L.
|
Institute of Biomedicine, Virology
|
Finland
|
2018-08-29
| null |
Culex Iflavi-like virus 4
| null |
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 10,319
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Culex
| null |
2016-07-02
| null | null |
Culex Iflavi-like virus 4 strain CIVL4-Sonoma, complete genome
|
GGGCTATTGATGATTTTCTTGGCAACGCAGGCACTCGGGTCGCATAATCTAGTTCCACACACAGTGCTAATAGAACGCCGTCTATTAGGTGCTCGTCCTCCGAGCATACTCCAACAGCCTTCCTTATGTGTGGTCTCGCAACCCAGAGCCCTACTCTATCCGTTCCTTGATTCTGGAGACGGCCTTGGGGGATACAGAGGGAGCGGCAAAGGTAACATGAACTGTCCTACTCTTCTTCGGGGTCCCGGACCCTCCATGCCTTGATTACAGCGATGGTCTTGGGGCTCAATTCATGTTAGAAACGTTAGTAAGCGCACCTAGGAACGACACGTACACCAGACCGGTTACCCGGATGTTGGCGCCGCTCAATTCAATGGTGGCCAGGTTGAGGGGTTTCCCTGGTTGGATCGTACCGTGAGATACATGTCGCGAGTTCCTGAACAGCACTTGCTGAATTCCACCACCCACTGGGATGGCTCTTGACTCGCAGCTCACCGCCTGAGTACCACCACCTTCTAGTTGGGTGGTGAAAAGTCGGATTAAAACTGATCCGACTGCTGTACCTACGAGGGTACACTGGACTGTGCAAACGCGCCACGGCAAGTTTGCTAGGGCAGGCGGGAGCGTGACGGTACCACTGCTAGTGAAGCTGAACTCAATTGGTACTGAGAAGTTAGGCCTCACTGCCACCGGGACTGTCATCACCCCAACAGGTGTCCTGGAGCCGACACCCTTTCTACTACTCCGTTTCCTAACCATTCTGGCGTTGTCTTTCACTCCTGGCTATTAGACTTTATGAATGGTTCCTACACTTCTGACTTATGGCTTTATTGTCCTCATAAAGTGTATGAATACTATTACATTACTTGAAGAACAAAGAGTTGAAGAAGTTCGATCACAATCAAGATTTCAAATAGATCTTGAACAATTATGGAGGGACTTACAAACTCAATTACGGCGGCGACCAATTCTAATACCAATACTATTTATATGCGGAATTATCTTAATTCCCATCCTCGCATTGCGACCAAACAGATCGAGTACACCTGTCGAGGAAAATACACCACCTCCGTCACCTTGTATCAACGTGGACAAACCCGAGTGTTATTTAGTGTAAAACAATCTGGTTCAAACAAGAAAATGTGTATGGAACACTGTTATACAAAAGTGGCTGAATATTTGAAGTTGGTTAAAGATGATTGGAAAGTTCAAGGTAATGAGGAAGATCTTAAATTGAGTGAAAATATTGACGACGGAATAATTGGTGGTATCTCTGAACTATTTCAATTGGATTCTGAGAGAAAATTTTATTTGCTGGCGGATGAACAGAAAGCACAATTATTGGAAGATTACAAATTAGAATATCAAGGTGAGTATGAAGAATGGACTGTGGAACAAGTTATAGTTCATGGTCGTTTACTAAGACAAATGCGTAAATTTGATTCACCAATACTTAAAGCTTTGAGTCAACAAGTGTATCATGGTGGTTTGGACAATGCTTTGAATTTTGTAATTAGAAATTTGTATGATGATATTAAAAGAGGGAAAAAGTGGAGTAGTCGATTTGGTCCTTATGGAGATAAATATAAAATAGGAGATGATGTTGGCATGTTTTTGGTGGATAATATTATGAACCAACCTATGGGAACTGTTCTAACAATTATGAGACAAGTTAAGGAGAAGATTGATAATTGGGAAGCCTATGGAAAATACGGGAAAGGTAAGAGATTCTCCGAAAAAGAAAATTGGGTTTGTCAGGGATTAGATTCAGACCAATCCAATGAAATAACTGCGTCTTTGGATGAAAGTAAGGGTATTACAACAACTTCCGAAAATGTAACTATAGTGGGAGCTGCTGAATCTGTAGAAGAATCAATCCTTACTTCTTTGCCAAGAGATTTATTGAACTTAAGTTCCACTGAAAAAATTTATGATTTTACTGAAGATAATGCTGGAATAATGTCGCGCTTTATGCCACTGGAAACTGTAAACGTAGCTGCTACAGAGGCTGGTTTGATTAAAAGTTGGCGAATTATAGAAGATTTGGTTAAGATAAACAGTATCACCACATTGCCGATACAAGGTTTTATGTTGGGTCACTATGATTTGGAATTTAAGTTGATTGCACAGGGTGTTCCACAACAAGCATGTTTATTAATGTTGGGTCATTGCCCTAATCCATATGGTTTATATGATAAATTTATTTCGCAGCAAGGTTGGACCGTCGATGGTGCTGGTGGAGCTACAGGAACAAATTATCCAGTTAAACCTGTTTATGATACTTATGAAACTTATTTGAGTATAAATGCCTCCGTTATGAGACCGAACGTTCAATTAAGTTTGGAATCGCAGGGAGAAGTTACCTTAAAGGTAAAGCAGAAATATCATAAGACCATGATTCGGAATTTTGATTACTTGAAAGCTTCAGGTACGAACCCAGGAATTAGAGGAGGAATGCAAGGATTGTTAACTTTGCATGCTTTGACCCCTGTTTTGGTTGGAACTGGTACCAGTGCAAATTTCGATATACGAATTTTATTTAGATTTGTGCAAGCTAAATTAGGGGCTATGACAGAACCAGTTAAAGAGAAGACAACTAGTTCACGATATAATCATTTGTATGTAGTGCCTCATGATTTTAAAGATTGGGATTCTTTAAAAATTTCCCAGGACCCCGAGATAGAGAAGAAACGTCAAGTTATCAGGGCTAAATATAGAGTGCAAGGCCCCGCAATGTCGGTATTGGGAGGCGTGAAATCGGGCATGATGACAGCAGTTGGAGTTATTGATTCCATAGAAGGTCTCACAGGACACAGTAATAAGAAAATCAAGAACAAAGATAAACCTGTTGATGCGGTTTCTCAAGTTACGACAATTCCACGACCACGAATGAATTTTACAAATGGAGAGGGTCCTGATTCAGCAGTGATAGTTGGAATTAGTTGGGTTGAATTAACCCATATTTTACAGTCTTTTGAGGATGAACCTAAGTCATATAAGGATTTAGTTAATATTCCAAGTCTTATGAGAACCATAAGGTTAGGGGATACCACTTTACCTGGATCCCAACTGTGGAGTTGGAATTTACAACCTACGGATGGTAATTGGCCATTAACACCAGGACAGTTTGCAACTTATGGATATGCTAACAATTGGATGAATACTACTGTGGCAATAGTTAGCTCAGGGTTCACAAATTATTCAGGGGGTATGATTTTGTGTGGGCAATTTGTCAAAACAATGTTCCATAAAGCTTCAATTGAAATTGCTATTCGATTTGGACGTGATCTGACAAATAATGCTATTGAAAACTCATATGTAACTATTATAAATGTTCAAGACACATCGGCTTTTGAGGTGCATATTCCTTATATTTACGATACACCAACACGGCCAGTTTCAGGATCTTCAACAGCAGTTGCTCTTCCAAACACTACGAATCCAGCTAATTATGCCTTCGCACATAGTGCAGCTGTAACAATTAGAGTTTTGAATAGGTTGATAGTTGGATCGGGAGCTTCTACTGAGATTCATTGTGTACTTTGGTTGAAAGGAGCAGAAGATTTTTCTTTAAACTTTCCAAGAAGTTTCAATAGTAATTTAATGCCAGAAATCAAGAAACTTGTGTATCCTCCACAAGTTATATCGGTGACTCAGGGACTTACTACACCTTTGCAATTCGCTGTTGTTGCACGACCTGATACCAATTCACCAAGATTCTTTCAACAATATACTCCCAACACCTATTTGGCGCCTAATTATGTCCAAGGTCCGGGTGAAGAACGGCATACGATTTTGACTAATACAGAACACTTGAATTTCAAATCAATTTTAAAAATGCCAGTTAAGATTATAAACTATTATTCATATGAACCTTGGGTAAAGTATAATGTAAATACAGTTTCAGATACTATGGTGGAAGTCTCAGATAGGGCTTATATTACTCTTCCAGTAGCACCCTTAAACTCCACATTTGTGCAATATCTAACCAATGAAATATATGGAGCAAACAAATTAGGAGAAACATTAGGTTGTTTAACTCAGTCACATGCTTACGTTGTGAATACAATGTTTGGAATGTTTTCTGGATCTTTGGCTTTGACTATTATAGTAGATGAAGGCGACTCTCCAGTCTATTGGGCTTATTTACCCCATGATTATAGATTGCGAAAATTATATGGGGGTTTGAACCAGACCACGCAAAAGGCCGTTACGACTCACTCAGCTCAACCTGTTCTTACTTCTAAGAATTGGAAGAGTGTGTTTTTGGGTACAACTACTGAAACCCATATGGATTTGATGTCTGCAGGTGGTTTAAACGGTATAATAGTTCCAAAGGTTAATCCCACTGAGAAAATAATTATTCCAATGTCCGCTCCACTAAATTGGTTACTTATGAACCGGTCAATTATGAATGAATCTAAGAAATTCACAACTCAAACAATGCGTGAAAATTCTGAATGGTTCAATGGGCATTTGGCAATATGGTGCAACACAAAGTGTAAAATTTCTGTGTTGTTAAATATGGGTGATGATTTTGAGCTTGGAGGTTTTCTTGGGCATCCCGGTTTTCCAAACATCCATGGATGGATTAACGTCGATGATGATAGGCGAGTTGATTTAACTAAGTTTGTGACACAAGGTCAAGAAGTTATAGACCAGAACAATGAATTGGATGACGAACCAGATATCTCTGAGGATGTGAAAGGAGAAGTGGAAGCAATAATAGCAAATGATGAAGATGCTTCTGCAGAAACACAAGCAGAATATGATAAATTAATGAGAGAATGGGAAAATGAACAACCGATTCAGGTGCCTGCGGACCCACAAGTTTTTAGGACACAAGGAGAGTCGGGTTTTCAGCTTAAGGACCTAACCCTTAATGGGTGGAAGTCCTTGAAATCGATGATTGTCTCTACAGCTGTTACTACGGCAGCAACATTAGCCCTAAATGAAGTGGATAAAGGAGCTTCAGCAGCTTTTGGTGCAGTAGCTCTGTA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| 68,946
|
MH188015.1
|
Culex Iflavi-like virus 4
|
Sadeghi,M., Altan,E., Deng,X., Barker,C.M., Fang,Y., Coffey,L.L., Delwart,E., Coffey,L.
|
Institute of Biomedicine, Virology
|
Finland
|
2018-08-29
| null |
Culex Iflavi-like virus 4
| null |
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,673
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Culex
| null |
2016-07-02
| null | null |
Culex Iflavi-like virus 4 strain CIVL/Kern, complete genome
|
TAATCTGTATTATTTGCAAACGATTGAAACTTGTAATATCGTTTTTGGAAAATCAAGTGAAATATTTGTTAATCTTCGGACAAATAGCCTACGGGTAAGTGAGAAGAAAAAGTTAAAATATTTGTTATTCTTCGGACAAATAGCCTATGGGTAAGTGAGAAGGAAATTCAAATTGTGTTTAAACATTCTTTCATTTGAAGTACAGCATAAAGTGTATGAATACTATTACATTATTTGAAGAACAAAGAGTTGAAGAAGTTCAATCACGCCCACGCTTTCAAATAGATTTGGAACAAATATGGAGGGACTTACAAACTCAAATACGGCGGCGACCAATTCTAATCCCAATACTGTTTATATGCGGAATTATCTTAATTCCCATCCTCGCATTGCGACCAAACAGATTGAATACACCTGTAGAGGAAAATACTCCACCTCCGTCACCTTGTATCAACGAGGACAAACCCGAGTGTTATTTAGTGTGAAACAATCTGGTTCAAACAAGAAAATGTGTATGGAATACTGTTACACCAAGGTTGCTGAGTATCTGAAGTTGGTGAATGACGATTGGAAGGTGCAAGGATTGGAAGAAAATCTTAAATTAACGGATGACAATTTGATACAAACTTTGGATGTAGAGAAGAAATTTCAAGAACTATCGGAAAAACAAAAAGAAACTATTCTAGAAGATTATAAACTGGAATATCAAAATCAATATGAAGTTTGGCCTGTTGAACGCATTATTATATATGGACGCTTATTAAGACAAATGCGTAGATTTGATTCTCCAATGTTATTTGCTCTGAGCCAACAAATTTATTTTGGTGGTTTAGAAGATGCTATTAAAATCACGATTGGAAATTTGTATGAAGATGTTAAGGGAGCTAAAGTATGGCATGGTCAATTTGGTCCTTATGAGAGTGGATATAAAATACGAGATGATGTTGGTATGTTCTTAGTAGACAAAATCATGAATCAACCAATAGGGTCAATTTTGAATATAATAAAACACGTGAAAGATGAAAGAGATAATTTGGAAAACTACGAGAAGGTTATGTTAGCCCACAGAGAAAATAGACAGGTGGTCAATTTCATTGAGAAAGGAAATTGGGCTTGTCAAGGACTTGATTCTGATCAACCTAGTGAGATAACAGCTTCATTAGATGAGAGTAAAGGAGTTACCACAACAACAGAGAATGTAACTGTGGTTGGAGCAGCCGAGTCAATAGAAGCGTCTATTCTAACATCATTACCCAGAGATTTGCTAGGTTTAAGTTCAACTGAAAAGGTGTATGATTTTACAGATGATAGTGCTGGAATCATGTCTCGCTTTATGCCATTGGAAACTGTTAATGTAGCAGCTACTGAAGCTGGTTTGATTAAAAGTTGGCGTATTATAGAAGATTTAGTTAAAATTAATAGTATTACGACATTACCCATTCAAGGCTTCATGTTAGGTCATTATGATTTAGAATTTAAATTAATCGCCCAAGGAGTGCCACAACAAGCTTGTTTGTTGATGTTGGGACATTGTCCTAATCCATATGGTCTATATGATAAATTTGTATCGCAGCAAGGTTGGACTGTAGATGGAGCTGGTGGAGCAACAAGTACTAATTATCCAGTGAAGCCAGTTTATGAGACTTACGAGACATACTTGAGTGTTGATGCTTCAGTCATGAGACCTAATGTGCAACTGAGCTTGGAATCACAAGGAGAAGTGACCCTTAAAGTTAAGCAAAAATACCACAAAACTATGATTCGAAATTTTGATTATTTGAAAGCCTCTGGAACAAATCCTGGTATACGTGGTGGAATGCAAGGTTTGCTTACCCTACATGCTCTAACACCAGTCTTGGTAGGAACTGGCACTAGTAATAATTTTGATGTAAGAATTTTGTTTAGATTCGTACAAGCTAAGTTGGGAGCTATGACAGAACCAGTTAAGGAGAAAACCACTAGTGCTCGTTATAATCATTTGTATGTAGTGCCACATGATTTTAAGGATTGGGAGGCGCTTAAAGTTTCTCAGGATCCTGAAGTTGAGAAGAAACGCCAAGTAACTAGGGCAAAGTATCGAGTGCAAGGTCCCGCAATGTCAGTACTTGGTGGTGTGAAATCGGGGATGATGACAGCAGTTGGAGTGATTGATTCTATAGAAGGCATTACTGGATATAATAATAAGAAGATTAAGAATAAGGATAAACCAGTAGACGCCGTGTCTCAAGTTACTACCATACCTAGACCTCGAATGAATTTTACAAATGGTGAGGGACCTGACTCAGCTGTTATAGTGGGAATAAGTTGGGTTGAATTAACCCATATTTTGCAATCTTTTGAGGATGAACCTAAATCGTATAAGGATTTGCTCAATATACCCAGTTTAATGAAAACTATTGAATTGGGAGACACCTCATTACCAGGTTCGCAACTCTGGAGTTGGAATCTGCAACCAACTGATGGAAATTGGCCCCTATCTCCTGGACAGTTCGCTTCTTATGGGTATGCTAATAATTGGATGCATACAACAGTAGCCATAGTGAGTTCTGGATTTACGAATTATTCTGGGGGTATGATTTTGTGTGGGCAATTTGTTAAAACAATGTTCCATAAAGCTTCTATTGAAATTGCTATTAGATTTGGACGTGATTTGACTAGTAATGCTATCGAGAATTCTTATGTTACCATTATTAATGTACAAGATACATCAGCTTTTGAAGTTCATATTCCTTATATCTATGATACTCCCACTCGCCCAGTATCAGGTTCTTCAACAGCAGTAGCCCTTCCTAACACAACCAATCCTGCTAATTATGCTTTTGCTCATAGTGCTGCAATAACTATAAGAGTTCTAAATAGATTAATTGTTGGATCAGGAGCTTCATCAACAATACGTTGTTTACTCTGGCTGAAAGGAGCTGAAGATTTTTCATTGAATTTCCCACGAAGTTTTAATTGTAATTTAATGCCAGAGATTAAGAAACTAGTGTATCCACCGCAGGTTATTTCCGTCACTCAAGGAGTTACAACTCCATTACAATTTGCCGTTGTAGCGAGACCTGATACAAATGTGCCGAAATTCTTTCAGCAATATACCCCAACTGCTTATCTTGCACCAAATTATGTTCAAGGACCTGATAGTGAACGACATACTATTTTAACTAACACAGAACATTTAAACTTTAAATCAATTCTTAAAATGCCAGTTAAAATTATTAATTATTATTCATATGCGCCCTGGGTTAAATATAAAATAAATACAGTTGCAGAAACGGAGGTGGAGGTATCAGACAGAGCCTATCTAACCATCCCTGTTGCACCTTTGAACTCAACTTTTGTACAATACTTGACTAATGAGTTGTATGGGGAGAATAAATTAGGAGAGACTTTGGGATCTTTGACACAATCACATGCTTATGTGGTGAATACTATGTTTGGAATGTTTTCTGGATCTTTAGCTATGACCATTATTGTAGATGAGGGAGATGCTCCTGTATATTGGGCTTATTTGCCTCATGACTACAGATTGAGAAAATTGTATGGAGGATTAAATCAAACAACTCAGAAAGCTGTTATGACCCATTCATCTCAACCTGTTCTTACTTCTAAGAATTGGAAGAGTGTATTTTTGGGTTCTACAACTGAAACACACATGGATCTTATGTCTGCAGGAGGTTTGAATGGAATTATAGTACCTAAAGTCAATCCTACGGAGAAAATAATCATTCCAATGTCTGCCCCGATAAATTGGTTATTGATGAATCGATCAATTATGAATGAATCAAAGAAATTCACGACACAGACAATGCGTGAGAACTCCGAGTGGTTCAACGGACATCTTGCTATATGGTGTAATGTAAAATGTAAGATTTCAGTTTTGTTGAATATGGGGGATGATTTTGAATTGGGAGGATTTTTAGGACATCCAGGTTTTCCAAATATTCATGGATGGATTAATGTTGACGACGATCGAAGAGTTGATTTAGCAAAATTTGTCACTCAAGGTGAAGAAATAGCATACTCAGATCAACAGGAAGAANNTGTATCAGATGCTATTAAAAAGGAAGTGGAGGCTATACTTGCAGAAGATGATTTGGTGTCAGAAGATGTCCAAACTGAATATGATAAATTAATGCTAGAATGGGAGAATGAACAACCGGTGGAGATACCATCAAACCCACAAGTCTTTGTGACTCAAGGGGAATCGGGTTTTCTGCTTAAGGACCTAACCCTTTCTGGGTGGAAGTCCTTGAAATCTATGATAATGACTACAGCAGTGACTACAGCTGCAACTTTGGCATTCAACGAAATGGATAGAGGTGCCTCAGCAGCTTTTGGAGCTGTAGCGCTCTACACATGTATGGGAGGAGTACAACAATTAATCCGGATTAATAGATCTGCTGAGATGAGTTCGGAAATTGTGCAGGATTCAGTACAAGTTGTACGTGAAACTACTGAAGAATTAGCAGCAAATGCAATGTCGGAAATTAAAAACATGATAGATCAATTATTTCCATTTTTGCGTTCTACCTCAGAGTTTATGGGCTCTTTATGGAATATAGCCCAACATTTAGTTCATGCAGCTTTAGCACAAAACTGGAGTAACGCAGCTTTTGCAGGTTTTTGTGTTATGATGGAAATGAAATTATTGGAATGGAAAGATTGGAAAAAGTTGTGTCAGCCTATGGAATTGTTTTTTACTAGGGCACAATCCTTCATCACTCAAGGGCCAGAAACCTGGACTTCATTAGCACAAGTTTTAACATCTTTGATTTGTGCAAAGGTGCAAGTGAAGGCAGATGGGGGACTTCAGTCTTATTTAGCTAAAATCTTTTCAATGCATGATTATAGAGCTGTAGGAGGGTTGAATAGTATTTTATCATTGGTTCGGACAGTTATGAATGCGGTTTCTGTTATCACCAATTGGGCCTTTCAGGAAGCTGATCCAAATATTGCATTATTAACTGCTTTACAAAATCAAGGGGAAGATTTGGAAGATT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| 68,947
|
NC_008604.2
|
Culex flavivirus
|
Hoshino,K., Isawa,H., Tsuda,Y., Yano,K., Sasaki,T., Yuda,M., Takasaki,T., Kobayashi,M., Sawabe,K.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2006-11-30
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
RefSeq
| 1
|
Japan:Tokyo, Shinjuku
|
Japan
|
Culex pipiens
| null |
2003
| null |
PRJNA485481
|
Culex flavivirus, complete genome
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AGTTTTTAAAAACTTCGGCTTGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTACACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCGGGCTCCTCCGGATGGTTGTTACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGGGTGTGCGGAGCACATCTCAGCCGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCACCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCCTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGTTTGGGAGCTGGCTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCACGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTACACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCTCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTCATGCTCACCGGCGTGATGATGGTGCTGGGCGCCGTCGTCATTGATATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACACAGATCTTCGAGGGGAAGACCAACCGCACTGATCATGTGCACTTGTTTAAGCTCCCCACGGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTTATGAAAAAGTGCCCCAAGGTCGCTGATCTTGCGAAGGATCTGGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGAGTTGCCAGCACCAACCAGAAGCTAGATTTTCTGGCGGAAGTGGAACTGGTGACGTTCAAAGCTATAAGGGAGAACAAAACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATTGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGGAACGCGGACTACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACACTAAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCGGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGATTGTCACGTGAACGCGTCATTCTCGACTGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGATCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAGCTGCATTGCGGAGAGGGGTATAACGTGTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTTCCTGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAATGCCGCTGTTACTTGTCGGCTAGAATCAGAGCGATTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGCAAACACCACGAAGGACTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCCGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCCGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTTTTGGTGAAAAACATTTTGGAACCCCAGCTCGTCTGGGATAATGCCATTGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTATTCTTGTCAGATCATGCTTGACAAACTGGTTAGCGGTAGTTTTAAGGACTGCCCGGGGATCAAGTCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTCGGATACGACGGAGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAAGCAACTAATGAGAGCTGCTCTGTGGGGCTGACGTGCCACGGATGCTACCTCCTTGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAATCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAGCATGTGGTTGACAAGTACCGGAGGTTTGGAACTGCTGGAGTGGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCTAGCTCGACGATTCTCGTCGGACTCGCCGCTCTGGTGTTTCTTGACAAACGAATTGTGTTCTTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTCTGGAAAAGCTTGTCACAATGGCCGACCCGGGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTACGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATTTGTGAGGACGTCTTGCAATGCGCCGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATTGTTTACGTTAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTGAAAATTGGTGACTTAACCATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGACGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGCGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATCGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAAATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGTTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCAACAGATTACTGCCCCACGTACCTGGCCGGATCGTTTGTGAAAAATGACATAGGCGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAAAGCAGGAAGGTGAACGGAACGTGGACATTGGTCGACCTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAAGCTTATACGTTTGATTTGACGGCCTTTAATGACTCATCGCTGTTCATGCCGGCACAATACGGCGCTCCGATGTCTAAAGCAAACCACATTCCTGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTGCGCGAGGGGGTGGTCCCCGGAACTCAGGTTGAAGAAAGCCCATCTTGTGACAACCGCGGGTCCGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCCATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAGCCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTACCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCACCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGCACGTGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTCGGGTGGTCTTGGATTGGATTATCGTACTCGCTTGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGCTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTACCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATCTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTACTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCGGTGGCTGGAATGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGCTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGAATCATGGCCATCAATACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTACCTCTCTACGTGGCTGGAGTATCGGTCTTTCGATCCAATGAGGTGAATGATGTCCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCCAACGGAACATACCGGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGCTACGCCAAAGACGGTGTGTTCAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGTGATGTTTACCGGGACATGGCTTCGTATGGTGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCTCGAGGACTCAGTGGTTGTTCGTGTCGTGCAGAACGATGGTAGCGTACTGTGTGCTAGAAGCTCCACGGCAAGTATTAGCATCGATGGAAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCTGTGCACGCGTTGGATGGTCGTGTCGTTGGACTGTACGGTTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCTTGATCACAAGCGGAGAAGTCACCGCAGAGGAAAACTTTGAGGAAGACACAG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| 8,047
|
LC770161.1
|
Culex flavivirus
|
Faizah,A.N., Kobayashi,D., Azerigyik,F.A., Itokawa,K., Matsumura,R., Kai,I., Miura,K., Hirayama,K., Isawa,H.
|
Medical Entomology; Toyama 1-23-1, Shinjuku, Tokyo 162-8640
|
Japan
|
2024-01-18
|
CxFV/Cpmol/Japan
|
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,830
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Culex pipiens
| null |
2018
| null | null |
Culex flavivirus CxFV/Cpmol/Japan RNA, nearly complete genome
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CGGGAGTTTTTAAAAACTTCGGCTTGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTATACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCTGGGCTCCTCCGGATGGTTGCTACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAAAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGGGCACATCTCAGCTGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCATCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCTTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGTTTGGGAATTGGCTGGGGATCGATTCTTCAGGAGGACATTGTGCAGGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCTCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTCATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTGGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACTCAGATCTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACTGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTCCCCACAGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTGATGAAAACGTGCCCTAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATCTAGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGAGTTGCCAGCACCACCCAGAAGCTAGATTTTCTAGCGGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAAGCCATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATAGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTAGCAATCGGAACGTGGACTACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACACTAAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGATTGCCACGTGAACGCGTCATTCTCGACTGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGATCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAACTGCATTGCGGAGAGGGGTATAACGTGTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTTCCCGTGACTTTTCGGTTTGCAAAGCTGGGCAATGCCGCTGTCACTTGCCGGCTAGAATCAGAGCGATTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGCAAACACCACGAAGGACTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCAGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCCGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCCAATGAAGTTTTAGTAAAAAACATTTTGGAACCTCAGCTCGTTTGGGATAATGCCATTGCCACGCAGGACGGCTTTCGTGATGTTGGCTTTTCTTGTCAGATCATGCTTGACAAACTGGTTAGCGGTAGTTTTAAGGATTGCCCGGGGATTAAGTCTTCAGTCTTTGTCCAAAGCGGTTTCGGATACGACGGGGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAAGCAACTAATGAGAGCTGCTCAGTGGGGCTGACGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGAGCATTTGTTGGGTGTGGGAATCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAGCATGTGGTTGACAAGTACCGGAGGTTTGGAACTGCCGGAGTTGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGCTGGCTGCTCTGGTGTTCCTTGACAAACGGATTGTGTTCTTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTGTGGAAGAGCTTGTCACAATGGCCGACCCGGGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTTCAGAACAGTTGAAAAAGACGAACAAGGTGTGTATTATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGTGCCGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATTGTTTACGTCAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTCCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTGAAAATTGGTGATTTAACGATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAATTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATCGCGGAAGCCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAGATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGTTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCAGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAGCCAACAGATTACTGCCCCACGTACCTGGCCGGATCGTTTGTGAAAAATGACATAGGCGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAAAGTGAACGGAACGTGGACATTGGTCGACCTGGAACTAACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAAGCTTATACGTTTGATTTGACGGCTTTTAATGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCACAATACGGCGCTCCGATGTCTAAAGCAAACCACATTCCTGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTTCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTGCGCGAGGGGGTGGTCCCCGGAACTCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGCGGGTCCGCAGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTCAAGGTCGACAACGACTACTTCTACCCCATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAACCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCGATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTCTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTCTTGCACCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGCACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCCATGTCGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTATTCGCTTGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTGCTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCGGTGGCTGGAGTGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACAGGGTTGCTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGCATTATGGCCATGAATACCTACGTCGGGGTCATTCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTACCTCTTTACGTGGCTGGAGTATCGGTCTTTCGATCTAATGAGGTGAATGATGTTCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGTAGCGACTTCGGGCATCTGCCCGACGGAACATACCAGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGTTACGCCAAAGACGGAGTGTTCAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGCGATGTTTACCGGGACATGGCTTCGTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCCCGAGAGCTCAGTGGTTGTTCGTGTCGTGCAGAACGATGGGAGCGTAGTGTGTGCCAGAAGCTCCACGGCAAGCATTAGCATTGATGGAAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCGGTGCATGCGTTGGATGGTCGTGTCGTTGGACTGTATGGGTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCTTGATCACAAGCGGAGAAGTCACCGCAGAGGAAAACTCTGAGGAAGAC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| 9,603
|
OM914715.1
|
Culex flavivirus
|
Ying,S., Fu,S., Xu,X., Li,B., Nie,K., Li,X., Wang,H., Liang,G.
|
Jiamusi University, School of Public Health
|
China
|
2022-12-19
|
NX1908
|
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,759
|
GenBank
| null |
China: Ningxia
|
China
|
Culex pipiens pallens
| null |
2019-06-26
| null | null |
Culex flavivirus isolate NX1908, complete genome
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GAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCAGGCTCCTCCGGATGGTTGCTACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGAGCACTTCTCAGCTGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCACCGTCGCGGAGGCGGAACAGGTCCTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGCTTGGGAATTGGCTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAAGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCCCTTGAGGCAAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATTGCATTCATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTGGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACACAGATCTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACTGATCATGTGCATTTGTTCAAACTCCCCACGGACGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTTATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTCGCGAAGGATCTGGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAGTTCACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCGAAGAAGCGTGAACGACGAGCTGCCAGCACCAACCAGAAGCTAGACTTTTTGGCGGAGGTGGAACTGGTGGCGTTCAAGGCTATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATTGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGGAACGTGGACTACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCGTTGTACACGCTAAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCCGATTGTCACGTGAACGCGTCATTCTCAACTGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGATCAATGGTAAAGAACGTGTCTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTCGCCACGTGTGTTGAACTGCATTGTGGAGAAGGGTACAACGTGTCGTCAGTCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACGGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTTCCCGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAATGCCGCTGTCACATGCCGGCTAGAATCAGAGCGATTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGCAAACACCACGAAGGATTGTTTGTGCGATCTCAAATCGATGAGTGGCCCGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCCGGTTTGGAACGGATTGTGGTTTGGGGAGACGCCAGGGCCAATGAAGTGCTGGTGAAAAACATCTTGGAACCTCAGCTCGTATGGGATAATGCTATTGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTTTCCTGTCAGATCATGCTTGACAAGCTGGTTAGCGGTAGTTTTAAGGATTGCCCAGGGATCAAATCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTCGGATATGACGGAGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAAGCCACCAATGAGAGCTGCTCGGTGGGGCTGACGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAACCACACCGGAACCCTTGTGATTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGCGTGTTGAACCCGATTTCGCAGGGTTGGAGAATGGCCAAGCATGTGGTTGATAAGTACCGAAGGTTCGGAACTGCTGGAGTGGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGTTGGCTGCTCTGGTGTTGCTTGACAAACGGATTGTTTTCTTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCCGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTGTGGAAAAGCTTGTCACAATGGCCGACCCGGGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTCGTTTCGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAAGTGTGCATCATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGCGCCGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATTGTTTACGTTAACACCTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTAAAAATTGGTGACCTAACAATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGTGGGTTCTTAAGCCGCACCAAGATCGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAGATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGTTTTGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTAGCAAAACCAACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCCGGATCGTTTGTGAAGAATGACATAGGCGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAAGGTGAACGGAACGTGGACATTGGTTGACCTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAAGCCTATACGTTTGATTTGACGGCCTTTAATGATTCGTCGCTGTTCATGCCGGCACAATACGGCGCTCCGATGTCTAAAGCAAACCACATTCCTGGGTACAAGACGCAAACGGAGTTTCCTTGGTACAAAGCTGACATCGTGTTGCGCGAGGGAGTGGTCCCTGGAACGCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGCGGGTCCGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGATAAGCGGGTGTTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCCATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAACCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTGCTGGTGGGCGCGCTTTTGCACCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGCACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTCGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTTGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCAATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTACCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGCTGTATCAGATGCCGACGACGGCGTCGGTGGTGTTCCTAGGGGGACTGCTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCGGTGGCTGGAATGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGCTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGAATCATGGCCATGAATACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGTTTGCTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTACCCCTTTACGTGGCTGGAGTGTCGGTATTTCGATCTAATGAGGTGAACGATGTTCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCCGACGGAACATACCGGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGCTACGCCAAAGACGGTGTGTTCAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGTCTACACTCCGGCGATGTCTACCGGGACATGGCTTCGTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGACTCCCCCGAGAGCTCAGTGGTTGTTCGTGTCGTGCAGAACGATGGGAGCGTGTTGTGTGCTAGAAGCTCCACGGCAAGTATCAGCATCGATGGAAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGATTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCGGTGCATGCGCTGGATGGTCGTGTCGTTGGACTGTACGGTTATGGATTTTTCATCGGATGGAAGTACCACTCCTTGATCACGAGCGGAGAAGTCACCGCAGAGGAAAACTCTGAGGAAAACACAGTTTCTCGCCGGTTCGTTGATTGGCATCCAGGAAAGGGGAAGACCAGACGCGTGTTGGT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TGGCCACAGTTAGCACAACACGACGAATCATAGAGCAAGAAGCTGGAAGTCAGAAGTTCACGGAGGGGTTGCGGATACTTGGGCGATACCGGGCCCCAACCGACGACGTGTTCTGGTGAGAATCACGCGACTGGTAGAGAACAACATCTCTAGAAAAGGTTAACGTTGCGAGGCAACGGGAACCCCGTAAGGAAGGACAAGGCTGTCCTTGAGTGCTAACGACACTCCGGCCCCAGTTCCCAGAGCCASGGTYTCGGCTCCACGGTGTTGGAAGACACCCTCGCAGCCATGGCTGCATGACGCGCGCAAGGAAGGACATGGCTGTCCTTGGGTACTAACGACACCCCGCCCCCAGTTCTCAAGGTTAGAGTTATAACCTCAGGGTGTTGGAAGACATCCAGGCCAGAGCAGGGCCATCGCAAGGGAGGATTTTCCTTGGGTACTGACCATACCCCGACCCCAGTCCGATAGGTCATGGAATGACCCCATGGTGCTGAGAGGGCATCCAAACAAGCTGAGCATCTTGGATTCTGCTCCCGTAAGGAAAGCGCAAGCTTTGAGCATTGACAACGCTCCGGCCCCAGTCCCCCAGGTTATGGGAGAATAACCCCGACGTGCTGAAAGGGCACGAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATAGAATCCAGGTGACTGACGCCACCTCCCGAAATGTGTATAGTAACAGAGCATGCCTGCAGCAGCAGGTCTCCACCGTTAGGAGATTTTGTTTGGCGGGGA
| 20,338
|
OK413947.1
|
Culex flavivirus
|
Lwande,O.W., Naslund,J., Sjodin,A., Lantto,R., Luande,V.N., Bucht,G., Ahlm,C., Agwanda,B., Obanda,V., Evander,M.
|
Umea University, Clinical Microbiology, Virology Section
|
Sweden
|
2022-10-19
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,640
|
GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
| null | null |
2019
| null | null |
Culex flavivirus strain CxFV_Mygg_341, complete genome
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TTTTTAAAAACTTTGGCTTGGTTACACCGCTGATTGGTTACACCTACATAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAAAGATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCAGGCTCCTCCAGGTGGTTGCTACCATCGGAGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGAAGTGTGCGGAGCACACCTCAGCTAGTCTCCGGCGGTGCGCAGCATCGTCGCGGAGGCGGAACGGGTCCTAGGGCCAGAGGTCTGCTAGGACGCTTGGGAATTGGTTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCCCTCATGCACTTGGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGACCGCCGCTTACGCTCACTGACACGACGCGTGACTGCCCTTGAGGCTAAACGCTCCGCGAAGAACGCTGTACGAATCACGCTCATACTCACTGGCTTGATGATGGTGCTCGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTTTCCACGGCGAAAGGGACGCAGATTTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACCGATCATGTGCATTTGTTCAAGCTTCCCACGGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTGATGAAAAAGTGCCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAAGATCTTGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTCTGCGTTACCACCGATGTGCGCCGAAGAAGCGTGAGCGACGAGCTGCCAACACCAACCAGAAGCTAGACTTTCTAGCAGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAGGCCATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCCATTGCGAAGAGGTGGCCGATGTGGGTGGTAATACTACTTGCAATTGGAACGTGGACAACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAGCCGTTATACACGCTGAAGGCGGAAAAGATGACCATGCTGCAGACAATCATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTCCGCACTGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAGTTGCTCGCTGATTGTCACGCAAATGCGTCTTATTCGACCGATGTGTGTCCCGGAGGATCGCAGTTGAACATGGGTGAGATCAATGGCAAAGAACGCGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGTTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACTTGTGTTGAACTGCATTGCGAAGAAGGTTACAATGTCTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAGTTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATCAGTGATGTTCCTGTGACTTTTCGGTTTGCAAAACTGGGCAATGCCGCTGTCACTTGCCGGCTGGAATCTGAGCGATTGCTTCTGGACTATTACCATGTGACGGGCAAATACCATGAAGGACTGTTTGTGCGGTCGCAAATCGATGAGTGGCCTGGAGCGCACGCCACTGCGAGTGGAAGAGCTGGTTTGGAACGAATCGTGGTTTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTTCTTGTGAAGAACATCCTGGAACCTCAGCTCATATGGGACAACGCTATTGCCACTCAAGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTCTCTTGCCAGATCATGCTTGACAAGCTGGTTAGCGGCAGTTTCAAGGATTGTCCGGGGATCAAATCTTCGGTGTTTGTCCAAAGTGGTTTCGGCTATGATGGAGTGGTGATGACGAGTTTGTCCAAGGCAACTAACGAAAGCTGCTCGGTTGGGTTGACGTGCCATGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCCGGAACTTCGACTGCAAAGGCTTTCGTTGGGTGTGGGAATCACACCGGAACCCTTGTGATTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGCGTGTTGAATCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAACATGTGGTTGACAAATACCGGAGGTTTGGCACTGCTGGAGTAGGAGGTGTATGGCACGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTTGGGCTAGCTGCTTTGGTGTTGCTCGACAAACGGATTGTTTTCTTGCTGCTGTTGTGCGGATACTTCATCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCCGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCCGGAGGGTTTGTGTGGAAAAGCTTGTCTCAGTGGCCGACTCGAGAACACTCTGTTGAACTCGATGACCAGCACTTGATCACGGCTCTTGTTTCGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGCATCATCTGTGAGGATGTCCTACAATGCGCCGCCGCTCGTGGTGCTGTTGGAGACATTACCCACGTTGACAATGAAATTGTTTACGTTAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAAAAAGTCCATGGCGTTAAGATCGGTGATCTAACAATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTCGATCCGAGCCAATATGGTGAGCTGAGTAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATCGCGGAAACCGGTGAGCACAAAGTCATCCGCGTGATAACTAGTGCCTCTCCATATGAAAAGATCTGCGAGCAAGCGTTCGCTCTGCAGTACGGTTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTTGGCTCAAATGTCGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCAGGGTCGTTTGTGAAGAATGACATAGGCGCGTACACTGACGGGATGATGTGGATGAAGAGCAAGAAAGTGAACGGGACGTGGACTTTGGTTGACTTGGAGCTGACACAGAGCCACCAATGCATTTGGCCTCAAGCGTACACGTTTGATTTGACAGCCTTTAACGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCGCAATACGGAGCTCCGATGTCCAAAGCCAACCACATACCGGGCTACAAGACGCAAACAGAGTTTCCTTGGTACAAGGCAGATATCGTGTTGCGCGAGGGAGTGGTCCCTGGAACGCAAGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAATCGCGGGTCCGCAGTGAAAGTTGATCCCGCTATCGCCAAGAAGTGGTGTTGTAAGACATGCCTCTCAGCTGACAAACGGGTGTTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATTCGACCAGCGGCGACCCAACCAGAAGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGGCATCAATGTTCGGGACAATGAAAGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAGGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTAAGCCCATCCGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCATCTGCTGACCATCCGAACCAAACATCGGTGGGCCCAACGCACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCAAACACCTATGCCGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTCGCTGCTGTTCCGAATGGTTCAGCACTGTTGGTGCACTTTTGGCTGGCAGTTCAGCTCTCGTCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCACTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGGTACGCATTGAGCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTTTTCCCAATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAGTCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCACGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTGTTCCATTCGCGTGTACAAGAACTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGAGCTTCGAAGCCCTCATTAATAGCTGGAATGTGCTTAGCGGGATTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTCTACCAGATGCCGACGACGGCGTCAGTGGTGTTCCTGGGGGGACTGCTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCCCCTCCAACACACCTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAACAGGGGTGCCGTTGGACTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGTCCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTATCAACGGGGTTGTTGGTTTACGTTGGCTGCATGGGAGTCATGGCCATGAACACCTACGTTGGAGTCATCCTGATGTGTGCTTGCTGGTGGACGAACGCTCCTGAGTGGCTACCTCTTTACGTAGCTGGATCATCGATCTTTCGATCTAACGAAGTGAACGACGTTCTTATTACCCCTCCAGAGTACGAGCAAGAAGCGCAGTTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCAGACGGAACATATCGGGTAGTCGCTCGCTCACTACTTATGACCAGCCACGTGGGGGCAGGTTATGCCAAGGACGGTGTGTTCAACACGCTATGGCATGTGACATCTGGTGGAAGTCTCACTTGGCAAGGGAGACACGTACGCCTACACTCCGGTGATGTTTACCGAGACATGGCTTCGTATGGTGGACCGTGGAACATCGCTGATTCACCTGAGAGTTCGGTGGTTGTCCGCGTTGTGCAGAACGATGGTAGTGTGTTGTGTGCCAGAAGTTCTACGGCGAGCATTAGCGTTGATGGGAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCGGTGCATGCGTTGGATGGCCGCGTTGTTGGTCTGTATGGATATGGATTTTTCATCGGATGGAAGTATCACTCCTTAATCACAAGTGGAGAAGTCGTTGCAGAGGACACTGTTGAGGAGGACACAGTT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| 22,848
|
MN294938.1
|
Culex flavivirus
|
Fang,Y.
|
National Institute of Parasitic Diseases (NIPD), Chinese Center for Disease Control and Prevention (China CDC), Dept. of Vector-borne Tropical Disease
|
China
|
2020-09-01
|
SA-JD-AJ-AJ-16-1-C7
|
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,799
|
GenBank
| null |
Saudi Arabia: Al-Janoub, Jeddah
|
Saudi Arabia
|
Culex quinquefasciatus
| null |
2016-01-31
| null | null |
Culex flavivirus isolate SA-JD-AJ-AJ-16-1-C7, complete genome
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TGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTACACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCGAAAATGGGAAGGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCAGGCTCCTCCAGGTGGTTGCTACCATCGGAGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGAAGTGTGCGGAGCACACCTCAGCTAGTCTCCGGCGGTGCGCAGCATCGTCGCGGAGGCGGAACGGGTCCTAGGGCCAGAGGCCTGCTAGGACGCTTGGGAATTGGTTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCCCTCATGCACTTGGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGACCGCCGCTTACGCTCACTGACACGTCGCGTCACTGCCCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGAATCTCTCTCATACTCACTGGCTTGATGATGGTGCTCGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGCGAAAGGGACGCAGATTTTCGAGGGGAAAACCAATCGCACCGATCATGTGCACTTGTTCAAACTTCCCACGGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTGATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATCTTGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTCTGCGGTACCACCGATGTGTGCCGAAGAAGCGTGAGCGACGAGTTGCCAACACCAACCAGAAGCTAGACTTTCTAGCGGAGGTGGAGCTGGTGACGTTCAAGGCCATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCCATCGCAAAGAGGTGGCCGATGTGGGTGGTAATTCTACTTGCAATTGGAACGTGGACAACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAGCCGTTATACACGCTGAAGGCAGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATCATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTCCGCACTGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAGTTGCTCGCTGATTGTCACGCAAATGCATCTTATTCGACTGATGTGTGTCCCGGAGGATCGCAGTTGAACATGGGTGAGATCAACGGTAAAGAACGCGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGTTTCAAGTGGGGAATTGGGTTTGTTGCCACTTGTGTTGAACTGCATTGCGAAGAAGGTTACAATGTCTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAGTTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATCAGTGACGTGCCTGTGACTTTTCGGTTTGCAAAACTGGGCAATGCCGCTGTCACTTGCCGGCTGGAATCTGAGCGATTGCTTCTGGACTACTACCATGTGACGGGCAAATACCATGAAGGACTGTTTGTGCGGTCGCAAATCGATGAGTGGCCAGGAGCGCACGCCACTGCGAGTGGAAGAGCTGGTTTGGAACGAATCGTGGTTTGGGGAGACGCTAGGGCTAATGAAGTTCTTGTGAAGAACATCCTGGAACCTCAGCTCATATGGGACAGCGCTATTGCCACTCAAGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTCTCTTGCCAGATCATGCTCGACAAGCTGGTTAGCGGCAGTTTCAAGGATTGTCCGGGGATCAAATCTTCGGTGTTTGTCCAAAGTGGTTTCGGCTATGATGGAGTGGTGATGACAAGTCTGTCCAAGGCAACTAACGAAAGCTGCTCGGTTGGGTTGACGTGCCATGGATGCTACCTCCTTGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGGACTTCGACTGCAAAGGCTTTCGTTGGGTGTGGGAATCACACCGGGACCCTTGTGATTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGCGTGTTGAATCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAACATGTGGTTGACAAGTACCGGAGGTTTGGCACTGCTGGAGTAGGAGGTGTATGGCACGATTTTGTTGGAGGGTTTTCATTGTTCAGCCTGCTGTCCAGCTCGACGATTCTAGTTGGGCTGGCTGCTTTGGTTTTGCTCGACAAACGGATTGTTTTCTTGCTGCTGTTGTGCGGATACTTCATCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCCGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCTGGAGGGTTTGTGTGGAAGAGCTTGTCTCAGTGGCCGACCCGAGAACACTCTGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTTCGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATCTGTGAGGATGTCCTACAATGTGCCGCTGCTCGTGGTGCCGTTGGAGACATTACCCACGTTGACAATGAAATTGTTTACGTTAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAAAAAGTCCATGGCGTTAAGATCGGTGACCTAACAATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTCGATCCGAGCCAATATGGTGAGCTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATCGCGGAAACCGGTGAACACAAGGTCATCCGCGTGATAACTAGTGCCGCTCCATATGAGAAGATCTGCGAGCAAGCGTTTGCTCTGCAGTACGGTTTCGTCCGATTCACCCGCAGGGTGTTTGGCTCAAATGTCGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCTACGTACCTAGCAGGGTCGTTTGTGAAGAATGACATAGGCGCGTACACTGACGGGATGATGTGGATGAAGAGCAAGAAAGTGAACGGGACGTGGACTTTGGTTGACCTGGAGCTGACACAGAGCCACCAATGCATTTGGCCCCAAGCGTACACGTTTGATTTGACAGCTTTTAACGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCGCAATACGGAGCTCCGATGTCCAAGGCCAACCACATACCGGGCTACAAGACGCAAACAGAGTTTCCTTGGTACAAGGCAGATATCGTGTTGCGTGAGGGAGTGGTCCCTGGAACGCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAATCGCGGGTCCGCAGTGAAAGTTGATCCCGCTATAGCCAAAAAGTGGTGTTGTAAGACATGTCTCTCAGCTGACAAACGGGTGTTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATTCGACCAGCGGCGACCCAACCAGAAGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGGCATCAATGTTTGGGACAATGAAAGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAGGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTAAGCCCATCCGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCATCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGGTGGGCCCAACGCACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCAAACACCTATGCCGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTCGCTGCTGTTCCGAATGGTTCAGCACTGTTGGTGCACTTCTGGCTGGCAGTTCAGCTCTCGTCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCACTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGGTACGCATTGAGCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTTTTCCCAATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAGTCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCACGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTGTTTCATTCGCGTGTACAAGAACTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGAGCTTCGAAGCCCTCATTAATAGCTGGAATGTGCTTAGCGGGATTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCAGTGGTATTCCTGGGGGGACTGCTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAACACACCTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAACAGGGGTGCCGTTGGACTGCGAGGAAGAGCCCACAATACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGTCCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGTTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGAGTCATGGCCATGAACACCTACGTTGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGCTGGTGGACAAACGCTCCTGAGTGGCTACCTCTTTACGTGGCTGGATCATCGATCTTCCGGTCTAACGAGGTGAACGACGTTCTTATTACCCCTCCAGAATACGAGCAGGAAGTGCAGTTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCAGACGGAACGTATCGGGTAGTTGCTCGCTCTCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGTTATGCCAAGGACGGCGTGTTCAACACGCTATGGCACGTGACATCTGGTGGAAGTCTCACTTGGCAAGGGAGACACGTACGCCTACACTCCGGTGATGTTTATCGAGACATGGCTTCGTATGGTGGACCGTGGAACATCGCTGATTCACCTGAGAGCTCGGTGGTTGTCCGCGTTGTGCAGAACGATGGTAGTGTGTTGTGTGCCAGAAGTTCTACGGCGAGCATTAGCGTTGATGGAAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCGGTGCATGCGTTGGATGGCCGCGTTGTTGGTCTGTATGGATATGGATTTTTCATCGGATGGAAGTATCACTCCTTGATCACAAGTGGGGAAGTCGTTGCAGAGGACACTGTTGAGGAAGACACAGTTTCTCGGCGGTTCGTTGAT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TTTAATCGGTGAGCGGGACAGGGCAGCGTGGTCAAAGAATATCGTGGCCACCGTCAGCACAACCCGGCGAATCATCGAGCAAGAAGCAGGAAGCCAAAAGTTCACGGAAGGGCTGCGGATACTTGGGCGATACCGAGCTCCAGCCGACGACGTGTTCTGGTGAGGATCACGCAGGTCGTAGAGAACCACCTCTCTAGAAACGGTTAACGTTGCAAAGCAACGAGAACCCCGCAAGGAAGGACTAGGCTGTCCTTGGGTGCTAACGACACTCCGGCCCCAGTTCCCAGAGCCAGGGTTTTGGCTTCACAGTGTTGGAAGACACTCTCGCGGCCATGGCTGCACAATGCGCGCAAGGAAGGACATGGCTGTCCTTGGGTACTAACGACACCCCGCCCCCAGTTCTCAAGGTTGGAGCTACAACCTCAGGATGTTGGAAGACATCCAGGCCAAAGCAGGGCCATCGCAAGGGAGGATTTTCCTCGGGTACTGACCACACCCCGACCCCAGTCCAATAGGCCATGGAATGGCCCCGTGGTGCTGAAAGGGCATCCAAACAAGCTGAGCATCTTGGAGTCTGCTCCCGTAAGGAAAGCGCTAGCTTTGAGCATTGACGACGCTCCGGCCCCAGTCCCCCAGGTTATGGAGGAATAACCCCGACGTGTTGGAAGGACACGAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATAGAATCCAGGTGACTGACGCCACCTCCCGAAATGTGTATAGTAACAGAGCATGCCTGCAGCAGCAGGTCTCCACCGTTAGGAGACTTGTTGTGGGC
| 47,607
|
MT197496.1
|
Culex flavivirus
|
Ferreira,R.S., Cruz,L.C.T.A., Souza,V.J., Neves,N.A.S., Souza,V.C., Filho,L.C.F., Lemos,P.S., Lima,C.P.S., Naveca,F.G., Atanaka,M., Nunes,M.R.T., Slhessarenko,R.D.
|
Universidade Federal de Mato Grosso, Ciencias Basicas em Saude
| null |
2020-05-13
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,159
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Culex quinquefasciatus
| null |
2017
| null | null |
UNVERIFIED: Culex flavivirus strain 111, complete genome
|
GATTGGTTACACCTACATAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAAAGATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAGGAAGGGGCCAGGCTCCTCCAGGTGGTTGCTACCATCGGAGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGAAGTGTGCGGAGCACACCTCAGCTRGTCTCCGGCGGTGCGCAGCATCGTCGCGGAGGCGGAACGGGTCCTAGGGCCAGAGGTCTGCTAGGACGCTTGGGAATTGGTTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCCCTCATGCACTTGGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGACCGCCGCTTACGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCCCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGAATCACGCTCATACTCACTGGCTTGATGATGGTGCTCGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTTTCCACGGCGAAAGGGACGCAGATTTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACCGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTTCCCACGGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTGATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAAGATCTTGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTCTGCGTTACCACCGATGTGTGCCGAAGAAGCGTGAGCGACGAGCTGCCAACACCAACCAGAAGCTAGACTTTCTAGCAGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAGGCCATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCCATTGCGAAGAGGTGGCCGATGTGGGTGGTAATACTACTTGCAATTGGAACGTGGACCACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAGCCGTTATACACGCTGAAGGCGGAAAAGATGACCATGCTGCAGACAATCATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTCCGCACTGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAGTTGCTCGCTGATTGTCACGCAAATGCGTCTTATTCGACTGATGTGTGTCCCGGAGGATCGCAGTTGAACATGGGTGAGATCAACGGCAAAGAACGCGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGTTTCAAGTGGGGGATCGGGTTTGTTGCCACTTGTGTTGAACTGCATTGCGAAGAAGGTTACAATGTCTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAGTTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATCAGTGATGTTCCTGTGACTTTTCGGTTTGCAAAACTGGGCAATGCCGCTGTCACTTGCCGGCTGGAATCTGAGCGATTACTTCTAGACTACTACCATGTGACGGGCAAATACCATGAAGGATTGTTTGTGCGGTCGCAAATCGATGAGTGGCCAGGAGCGCACGCCACTGCGAGTGGAAGAGCTGGTTTGGAACGAATCGTGGTTTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTCCTTGTGAAGAACATCCTGGAACCTCAGCTCATATGGGACAACGCTATTGCCACTCAAGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTCTCTTGCCAGATCATGCTTGACAAGTTGGTTAGCGGCAGTTTCAAGGATTGTCCGGGGATCAAATCCTCGGTGTTTGTCCAAAGTGGTTTCGGCTATGATGGAGTGGTGATGACAAGTTTGTCCAAGGCAACTAACGAAAGCTGCTCGGTTGGGTTGACGTGCCATGGATGTTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACTGCAAAGGCGTTCGTTGGGTGTGGAAATCACACCGGGACCCTTGTGATTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGCGTGTTGAATCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAACATGTGGTTGACAAATACCGGAGGTTTGGCACTGCTGGAGTRGGAGGTGTATGGTACGATTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGCTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTTGGGCTAGCTGCTTTGGTGTTGCTCGACAAACGGATTGTTTTCTTGCTGCTGTTGTGCGGATACTTCATCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCCGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCCGGAGGGTTTGTGTGGAAAAGCTTGTCTCAGTGGCCGACCCGAGAACACTCTGTTGAACTCGATGACCAGCACTTGATCACGGCTCTTGTTTCGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGCATCATCTGTGAGGATGTCCTACAATGCGCCGCCGCTCGTGGTGCTGTTGGAGACATTACCCACGTTGACAATGAAATTGTTTACGTTAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAAAAAGTCCATGGYGTTAAGATCGGTGACCTAACAATGCAGCTAGCTCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTCGATCCGAGCCAATATGGTGAGCTGAGTAGTGGGTTCTTGAGTCGCACCAAGATCGCGGAAACTGGTGAGCACAAGGTCATCCGCGTGATAACTAGTGCCTCTCCATATGAAAAGATCTGCGAGCAAGCGTTCGCTCTGCAGTACGGTTTCGTCCGGTTTACCCGCAGGGTGTTTGGCTCAAATGTCGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCAGGGTCGTTTGTGAAGAATGACATAGGCGCGTACACTGACGGGATGATGTGGATGAAGAGCAAGAAAGTGAACGGGACGTGGACTTTGGTTGACCTGGAGCTGACACAGAGCCACCAATGCATTTGGCCCCAAGCGTACACGTTTGATTTGACAGCCTTTAACGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCGCAGTACGGAGCTCCGATGTCCAAAGCCAACCACATACCGGGCTACAAGACGCAAACAGARTTCCCTTGGTACAAGGCAGATATCGTGTTACGCGAGGGAGTGGTCCCTGGGACGCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGATAATCGCGGGTCCGCAGTGAAAGTTGATCCCGCTATCGCCAAAAAGTGGTGTTGTAAGACATGCCTCTCAGCTGACAAACGGGTGTTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATTCGACCAGCGGCGACCCAACCAGAAGTGACCATTGACGCTGACGGTGAAGACATGGACGAGATGGCATCAATGTTCGGGACAATGAAAGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAGGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTAAGCCCATCCGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCAYCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGATGGGCCCAACGCACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCAAACACCTATGTCGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTCGCTGCTGTTCCGAATGGTTCAGCACTGTTGGTGCACTTCTGGCTGGCAGTTCAGCTCTCGTCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCACTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGGTACGCATTGAGCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTTTTCCCAATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAGTCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCACGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTGTTCCATTCGCGTGTACAAGAACTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGAGCTTCGAAGCCCTCATTAATAGCTGGAATGTGCTTAGCGGGATTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTTTACCAGATGCCGACGACGGCATCAGTGGTGTTCCTGGGGGGACTGCTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAACACACCTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAACAGGGGTGCCGTTGGACTGCGAGGAAGAGCCCACAATACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGTCCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTATCAACGGGGTTGTTGGTTTACGTTGGCTGTATGGGAGTCATGGCCATGAACACCTACGTTGGAGTCATCCTGATGTGTGCTTGCTGGTGGACGAACGCTCCTGAGTGGCTACCTCTTTACGTAGCTGGATCATCGATCTTTCGATCTAACGAGGTGAACGACGTTCTTATTACCCCTCCAGAGTACGAGCAGGAAGCGCAGTTAAGCAACGACTTCGGGCATCTGCCAGACGGAACATATCGGGTAGTCGCTCGCTCACTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGTTATGCCAAGGACGGTGTGTTCAACACGCTATGGCATGTGACATCTGGTGGAAGTCTCACTTGGCAAGGGAGACACGTACGCTTACACTCCGGTGATGTTTATCGAGACATGGCCTCGTATGGTGGACCGTGGAACATCGCTGATTCACCTGAGAGCTCGGTGGTTGTCCGCGTTGTGCAGAACGATGGTAGTGTGTTGTGTGCTAGAAGTTCTACGGCTARCATTAGYGTTGATGGGAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGGTCGTCAGGATCTCCGGTGCATGCGTTGGATGGCCGCGTTGTTGGTCTGTATGGGTATGGATTTTTCATCGGATGGAAGTATCACTCCTTGATCACAAGCGGAGAAGTCGTTGCAGAGGACACTGTTGAGGAAGACACAGTTTCTCGGCGGTTCGTTGATTGGCACCCAGGAA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CGGGATAGGGCAGCGTGGTCAAAGAATATCGTGGCCACCGTCAGCACAACCCGGCGAATCATCGAGCARGAGGCAGGAAGCCAAAAGTTCACGGAAGGGCTGCGGATACTTGGGCGATACCGAGCTCCAGCCGACGACGTGTTCTGGTGAGGTCGCTAG
| 50,528
|
LC504568.1
|
Culex flavivirus
|
Amoa-Bosompem,M., Kobayashi,D., Murota,K., Faizah,A.N., Itokawa,K., Fujita,R., Osei,J.H.N., Agbosu,E., Pratt,D., Kimura,S., Kwofie,K.D., Ohashi,M., Bonney,J.H.K., Dadzie,S., Sasaki,T., Ohta,N., Isawa,H., Sawabe,K., Iwanaga,S.
|
Medical Entomology; 1-23-1 Toyama, Shinjuku, Tokyo 162-8640
|
Japan
|
2020-01-30
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,270
|
GenBank
| 1
|
Ghana:Damongo
|
Ghana
|
Culex
| null |
2016-08
| null | null |
Culex flavivirus 16GH36 genomic RNA, complete genome
|
AAACTTTGGCTTGGTTACACCGCTGATTGGTTACACCTACATACGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGTAAAAATGGGAAGGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCAGGCTCCTCCAGGTGGTTGCTACCATCGGAGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGAAGTGTGCGGAGCACACCTCAGCTAGTCTCCGGCGGTGCGCAGCATCGTCGCGGAGGCGGAATGGGTCCTAGGGCCAGAGGTCTGCTAGGACGCTTGGGAATTGGTTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGATATTGTGCAGGCCCTCATGCACTTGGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGACCGCCGCTTACGCTCACTGACACGACGCGTGACTGCCCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGAATCACGCTCATACTCACTGGCTTGATGATGGTGCTCGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTTTCCACGGCGAAAGGGACGCAGATTTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACCGATCATGTGCATTTGTTCAAGCTTCCCACGGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTGATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAAGATCTTGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTCTGCGTTACCACCGATGTGTGCCGAAGAAGCGTGAGCGACGAGCTGCCAACACCAACCAGAAGCTAGACTTTCTAGCAGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAGGCCATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGTGTGGCCATTGCGAAGAGGTGGCCGATGTGGGTGGTAATACTACTTGCAATCGGAACGTGGACCACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAGCCGTTATACACGCTGAAGGCGGAAAAGATGACCATGCTGCAGACAATCATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTCCGCACTGGAGCGGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAGTTGCTCGCTGATTGTCACGCAAATGCGTCTTATTCGACTGATGTGTGTCCCGGAGGATCGCAGTTGAACATGGGTGAGATCAACGGCAAGGAACGCGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGTTTCAAGTGGGGGATCGGGTTTGTTGCCACTTGTGTTGAACTGCATTGCGAAGAAGGTTACAATGTCTCGTCAATCGCTAGGTCGTCCATCGTGATGAACATTACAGCGAAGTTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATCAGTGATGTTCCTGTGACTTTTCGGTTTGCAAAACTGGGCAATGCCGCTGTCACGTGCCGGCTGGAATCTGAGCGATTACTTCTGGACTACTACCATGTGACGGGCAAATACCATGAAGGATTGTTTGTGCGGTCGCAAATCGATGAGTGGCCAGGAGCGCACGCCACTGCGAGTGGAAGAGCTGGCTTGGAACGAATCGTGGTTTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTTCTTGTGAAGAACATCCTGGAACCTCAGCTCATATGGGACAACGCTATTGCCACTCAAGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTCTCTTGCCAGATCATGCTTGACAAGTTGGTGAGCGGCAGTTTCAAGGATTGTCCGGGGATCAAATCTTCGGTGTTTGTCCAAAGTGGTTTCGGCTATGATGGAGTGGTGATGACAAGTTTGTCTAAAGCAACTAACGAAAGCTGCTCGGTTGGGTTGACGTGCCATGGATGTTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACTGCAAAGGCTTTCGTTGGGTGTGGAAATCACACCGGGACCCTTGTGATTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGCGTGTTGAATCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAACATGTGGTTGACAAATACCGGAGGTTTGGCACTGCTGGAGTAGGAGGTGTATGGTACGATTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGCTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTTGGGCTAGCTGCTTTGGTGTTGCTCGACAAACGGATTGTTTTCTTGCTGCTGTTGTGCGGATACTTCATCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCCGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCCGGAGGGTTTGTGTGGAAAAGCTTGTCTCAGTGGCCGACCCGAGAACACTCTGTTGAGCTCGATGACCAGCACTTGATCACGGCTCTTGTTTCGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGCATCATCTGTGAGGACGTCCTACAATGCGCCGCCGCTCGTGGTGCTGTTGGAGACATTACCCACGTTGACAATGAAATTGTTTACGTCAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAAAAAGTCCATGGCGTTAAGATCGGTGACCTAACAATGCAGCTAGCTCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTCGATCCGAGCCAATATGGTGAGCTGAGTAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAAATCGCGGAAACTGGTGAGCACAAGGTCATCCGCGTGATAACTAGTGCCTCTCCATATGAAAAGATCTGCGAGCAAGCGTTCGCTCTGCAGTACGGTTTCGTCCGGTTTACCCGCAGGGTGTTTGGCTCAAATGTCGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCAGGGTCGTTCGTGAAGAATGACATAGGCGCGTACACTGACGGGATGATGTGGATGAAAAGCAAGAAAGTGAACGGGACGTGGACTTTGGTTGACCTGGAGCTGACACAGAGCCACCAATGCATTTGGCCCCAAGCGTACACGTTTGATTTGACAGCCTTTAACGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCGCAATACGGAGCTCCGATGTCCAAAGCCAACCACATACCGGGCTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGTACAAGGCAGATATCGTGTTGCGCGAGGGAGTGGTCCCTGGAACGCAGGTTGAAGAGAGCCCGTCTTGTGATAATCGCGGGTCCGCAGTGAAAGTTGATCCCGCTATCGCCAAAAAGTGGTGTTGTAAGACATGCCTCTCAGCTGACAAACGGGTGTTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATTCGACCAGCGGCGACCCAACCAGAAGTGACCATTGACGCTGACGGTGAGGACATGGACGAGATGGCATCAATGTTCGGGACAATGAAAGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAGGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTAAGCCCATCCGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCTCTTTTGCATCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGATGGGCCCAACGCACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTACCATCAAACACCTATGCCGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTCGCTGCTGTTCCGAATGGTTCAGCACTGTTGGTGCACTTCTGGCTGGCAGTTCAGCTCTCGTCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCACTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGGTACGCATTGAGCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTTTTCCCAATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAGTCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCACGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTGTTCCATTCGCGTGTACAAGAACTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGAGCTTCGAAGCCCTCATTAATAGCTGGAATGTGCTTAGCGGGATTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTTTACCAGATGCCGACGACGGCATCAGTGGTGTTCCTGGGGGGACTGCTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAACACACCTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAACAGGGGTGCCGTTGGACTGCGAGGAAGAGCCCACAATACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGTCCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTATCAACGGGGTTGTTGGTTTACGTTGGCTGCATGGGAGTCATGGCCATGAACACCTACGTTGGAGTCATCCTGATGTGTGCTTGCTGGTGGACGAACGCTCCTGAGTGGCTACCTCTTTACGTAGCTGGATCATCGATCTTTCGATCTAACGAGGTGAACGACGTTCTTATTACCCCTCCAGAGTACGAGCAGGAAGCGCAGTTAAGCAACGACTTCGGGCATCTGCCAGACGGAACATATCGGGTAGTCGCCCGCTCACTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGTTATGCCAAGGATGGTGTGTTCAACACGCTATGGCATGTGACATCTGGTGGAAGTCTCACTTGGCAAGGGAGACACGTACGCCTACACTCTGGTGATGTTTATCGAGACATGGCCTCGTATGGTGGACCGTGGAACATCGCTGATTCACCTGAGAGCTCGGTGGTTGTCCGCGTTGTGCAGAACGATGGTAGTGTGTTGTGTGCTAGAAGTTCTACGGCTAGCATTAGCGTTGATGGGAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCGGTGCATGCGTTGGATGGCCGCGTTGTTGGTCTGTATGGGTATGGATTTTTCATCGGATGGAAGTATCACTCCTTGATCACAAGTGGAGAAGTCGTTGCAGAGGACACTGTTGAGGAAGACACAGTTTCTCGGC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| 54,403
|
MH719098.1
|
Culex flavivirus
|
Charles,J., Tangudu,C.S., Hurt,S.L., Tumescheit,C., Firth,A.E., Garcia-Rejon,J.E., Machain-Williams,C., Blitvich,B.J.
|
Iowa State University, Veterinary Microbiology and Preventive Medicine
|
USA
|
2018-11-21
|
CxFV-T1123
|
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| 1
|
Mexico
|
Mexico
|
Culex quinquefasciatus
| null |
2008
| null | null |
Culex flavivirus isolate CxFV-T1123, complete genome
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AGCTGCTAAAAACTTTGGCTTGGTTACACCGCTGATTGGTTACACCTACATAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAAAAATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGAGCTAGGCTCCTCCAGGTGGTTGCTACCATCGGAGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGAAGTGTGCGGAGCACACCTCAGCTAGTCTCCGGCGGTGCGCAGCATCGTCGCGGAGGCGGAACGGGTCCTAGGGCCAGAGGTCTGCTAGGACGCTTGGGAATTGGTTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCCCTCATGCACTTGGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGACCGCCGCTTACGCTCACTGACACGACGCGTGACTGCCCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGAATCACGCTCATACTCACTGGCTTGATGATGGTGCTCGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTTTCCACGGCGAAAGGGACGCAGATTTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACCGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTTCCCACGGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTGATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTCGCGAAAGATCTTGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTCTGCGTTACCACCGGTGTGTGCCGAAGAAGCGTGAGCGACGAGCTGCCAACACCAACCAGAAGCTAGACTTTCTAGCAGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAGGCCATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCCATTGCGAAGAGGTGGCCGATGTGGGTGGTAATACTACTTGCAATTGGAACGTGGACCACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAGCCGTTGTACACGCTGAAGGCGGAAAAGATGACCATGCTGCAGACAATCATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTCCGCACTGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAGTTGCTCGCTGATTGTCATGCAAATGCGTCTTATTCGACTGATGTGTGTCCCGGAGGATCGCAGTTGAACATGGGTGAGATCAACGGCAAAGAACGCGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGTTTCAAGTGGGGGATCGGGTTTGTTGCCACTTGTGTTGAACTGCACTGCGAAGAAGGTTACAATGTCTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAGTTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATCAGTGATGTTCCTGTGACTTTTCGGTTTGCAAAATTGGGCAATGCCGCTGTCACTTGCCGGCTGGAATCTGAGCGATTGCTTTTGGACTACTACCATGTGACGGGCAAATACCACGAAGGATTGTTTGTGCGGTCGCAAATTGATGAGTGGCCAGGAGCGCACGCCACTGCGAGTGGAAGAGCTGGTTTGGAACGAATCGTGGTTTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTTCTTGTGAAGAACATCCTGGAACCTCAGCTCATATGGGACAACGCTATTGCCACTCAAGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTCTCTTGCCAGATCATGCTTGACAAGTTGGTTAGCGGCAGTTTCAAGGATTGTCCGGGGATCAAATCTTCGGTGTTTGTCCAAAGTGGTTTCGGCTATGATGGAGTGGTGATGACAAGTTTGTCCAAGGCGACTAACGAAAGCTGCTCGGTTGGGTTGACGTGCCATGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACTGCAAAGGCTTTCGTTGGGTGTGGAAATCACACCGGGACCCTTGTGATTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGCGTGTTGAATCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAACATGTGGTTGACAAATACCGGAGGTTTGGCACCGCTGGAGTAGGAGGTGTATGGTACGATTTTGTTGGAGAGTTTTCATTGTTCAGCCTGCTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTTGGGCTAGCTGCTCTGGTGTTGCTCGACAAACGGATTGTTTTCTTGCTGCTGTTGTGCGGATACTTCATCTACACCAAGGCCGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCCGAGAGAAAGGTCGTGTCCTGCGGATCCGGAGGGTTCGTGTGGAAAAGCTTGTCTCAGTGGCCGACCCGAGAACACTCTGTTGAACTCGATGACCAGCACCTGATCACGGCTCTTGTCTCGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGCATCATCTGTGAGGATGTCCTACAATGCGCCGCCGCTCGTGGTGCTGTTGGAGACATTACCCACGTTGACAATGAAATTGTTTACGTTAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAAAAAGTCCATGGCGTTAAGATCGGTGACCTAACAATGCAGCTAGCCCTGGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTCGATCCGAGCCAATATGGTGAGCTGAGTAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATCGCGGAAACTGGTGAGCACAAGGTCATCCGCGTGATAACTAGTGCCTCTCCATATGAAAAGATCTGCGAGCAAGCGTTTGCTCTGCAGTACGGTTTCGTCCGATTTACCCGCAGGGTGTTTGGCTCAAATGTCGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCAGGGTCGTTTGTGAAGAATGACATAGGCGCGTACACTGACGGGATGATGTGGATGAAGAGCAAGAAAGTGAACGGAACGTGGACTTTGGTTGACCTGGAGCTGACACAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAAGCGTACACGTTTGATTTGACAGCCTTTAACGACTCGTCTCTGTTCATGCCGGCGCAATACGGAGCTCCGATGTCCAAAGCCAACCACATACCGGGCTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGCACAAGGCAGATATCGTGTTGCGCGAAGGAGTGGTCCCTGGAACGCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGATAATCGCGGGTCCGCAGTGAAAGTTGATCCCGCTATCGCAAAAAAGTGGTGTTGTAAGACGTGCCTCTCAGCTGACAAACGGGTGTTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATCCGACCAGCGGCGACCCAACCAGAAGTGACCATTGACGCTGACGGTGAAGACATGGACGAGATGGCATCAATGTTCGGGACAATGAAAGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTAAGCCCATCCGTGGAGGGAGTTTCTCCCTTACTGGTGGGCGCTCTTTTGCATCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGATGGGCCCAACGTACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCAAACACCTATGCCGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTCGCTGCTGTTCCGAATGGTTCAGCACTGTTGGTGCACTTCTGGCTGGCAGTTCAGCTCTCGTCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCACTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGGTACGCATTGAGCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTTTTCCCAATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAGTCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCACGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTGTTCCATTCGCGTGTACAAGAACTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGAGCTTCGAAGCCCTCATTACTAGCTGGAATGTGCTTAGCGGGATTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTTTATCAGATGCCGACGACGGCATCAGTGGTGTTCCTGGGGGGACTGCTAATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAACACACCTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAACAGGGGTGCCGTTGGACTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGTCCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTATCAATGGGGTTGTTGGTTTACGTTGGCTGCATGGGAGTCATGGCCATGAACACCTACGTTGGAGTCATCCTGATGTGCGCTTGCTGGTGGACGAACGCTCCTGAGTGGCTGCCTCTTTACGTAGCTGGATCATCGATCTTTCGATCCAACGAGGTGAACGACGTTCTTATTACCCCTCCAGAGTACGAGCAGGAAGCGCAGTTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCAGACGGAACATATCGGGTAGTCGCTCGCTCACTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGTTATGCCAAGGACGGTGTGTTCAACACGCTATGGCATGTGACATCTGGTGGAAGTCTCACTTGGCAAGGGAGACACGTACGCCTACACTCCGGTGATGTTTATCGAGACATGGCCTCGTATGGTGGACCGTGGAACATCGCTGATTCACCTGAGAGCTCGGTGGTTGTCCGCGTTGTGCAGAACGATGGTAGTGTGTTGTGTGCTAGAAGTTCTACGGCTAGCATTAGCGTCGATGGGAAGCGTGTTCAGGTCATCGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCGGTGCATGCGTTGGATGGCCGCGTTGTTGGTCTGTATGGGTATGGATTTTTCATCGGATGGAAGTATCACTCCTTGATCACAAGTGGAGAAGTCGTTGCAGAGGACACTGTTGAGGAAGACACGG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AAGGACATCAACTGTGGAAGTTTGATCGGTGAGCGGGATAGGGCAGCGTGGTCAAAGAATATCGTGGCCACCGTCAGCACAACCCGGCGAATCATCGAGCAAGAGGCAGGAAGCCAAAAGTTCACGGAAGGGCTGCGGATACTTGGGCGATACCGAGCTCCAGCCGACGACGTGTTCTGGTGAGGATCACGCAGGTCGTAGAAAACTACCTCTCTAGAAACGGTTAACGTTGCGAAGCAACGGGAACCCCGCAAGGAAGGACTAGGCTGTCCTTGGGTGCTAACGACACTCCGGCCCCAGTTCCCAGAGTCAGGGTTTTTGCTCCACGGTGTTGGAAGACACCCTCGCGGCCATGGCTGCACAATGCGCGCAAGGAAGGACATGGCTGTCCTTGGGTACTAACGACACCCCGCCCCCAGTTCTCAAGGTTGGAGTTACAACCTCAGGATGTTGGAAGACATCCAGGCCAGAGCAGGGCCATCGCAAGGGAGGATTTTCCTCGGGTACTGACCACACCCCGACCCCAGTCCAATAGGTCATGGAATGGCCCCGTGGTGCTGAAAGGGCATCCAAACAAGCTGAGCATCTTGGAGTCTGCTCCCGTAAGGAAAGCGCAAGCTTTGAGCATTGACGACGCTCCGGCCCCAGTCCCCCAGGTTATGGAGGAATAACCCCGACGTGTTGGAAGGACACGAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATAGAATCCAGGTGACTGACGCCACCTCCCGAAATGTGTATAGTAACAGAGCATGCCTGCAGCAGCAGGTCTCCACCGTTAGGAGACTTGTTGTGGGCAAGCTTTTGTTCACGTCT
| 67,042
|
MH188006.1
|
Culex flavivirus
|
Sadeghi,M., Altan,E., Deng,X., Barker,C.M., Fang,Y., Coffey,L.L., Delwart,E., Coffey,L.
|
Institute of Biomedicine, Virology
|
Finland
|
2018-08-29
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,776
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Culex
| null |
2016-07-02
| null | null |
Culex flavivirus strain CFV/San Francisco, complete genome
|
CAGGATCGCACCACCATCTCGAAGCGAACGAATGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAGAACAGGAGANNNNNNANNNNANNANNNNAANGNNNNAGACAGTAGAAGACAGTAGANGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCGGGCTCCTCCGGATGGTTGCTACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGAGCACATCTCAGCTGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCATCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCTTAGGGCCGGAGGTCTTCTAGGACGTTTGGGAATTGGCTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCTCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTCATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTGGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGTTAAAGGGACGCAGATCTTCGAGGGGAAGACTAATCGCACTGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTCCCCACAGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTGATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATCTAGAAGGAGTGGATTGTGGGTCATCATGGACAGAATTCACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGTGTAGCCAGCACCACCCAGAAGCTAGATTTTCTAGCGGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAAGCCATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATAGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGTCTCGTGGGCTCGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACACTAAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGACTGTCATGTTAACGCGTCATTCTCGACTGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGATCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAACTGCATTGCGGAGAGGGGTACAACGTGTCGTCAATCGCTAGATCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTTCCCGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAATGCCGCTGTTACTTGCCGGCTAGAATCAGAGCGATTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGCAAACACCACGAAGGACTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCAGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCCGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTTTTAGTGAAAAACATCTTGGAACCTCAGCTCGTCTGGGATAATGCCATTGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTTTCTTGTCACATCATGCTTGACAAACTGGTTAGCGGTAGTTTTAAGGATTGCCCGGGGATCAAGTCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTTGGGTACGACGGAGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAAGCAACCAATGAGAGCTGCTCAGTGGGGCTGACGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAATCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAGCATGTGGTTGACAAGTACCGGAGGTTCGGAACTGCTGGAGTTGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGCTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGCTGGCTGCTCTGGTGTTTCTTGACAAACGGATTGTGTTCTTGCTGCTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTCTGGAAAAGCTTGTCACAATGGCCCACCCGGGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTACAGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGCGCCGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGAGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATTGTTTACGTTAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTGAAAATTGGTGATTTGACGATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATCGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAGATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGTTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCGAAGCCAACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCCGGATCGTTTGTGAAGAATGACATAGGCGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGTAGGTATGTGAACGGAACGTGGACATTGATCGACCTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGTATTTGGCCCCAAGCTTATACGTTTGATTTGACGGCTTTCAATGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCACAATACGGCGCTCCGATGTCTAAAGCAAATCACATTCCTGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTTCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTGCGCGAGGGGGTGGTCCCCGGAACTCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGCGGGTCCGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCCATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTGCAACCAGAGGTGACCATTGACGCTGCCGACGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTGTTGCACCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGCACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTCGGGTGGTCTTGGATTGGACTGTCGTACTCGCTAGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTACCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGCTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTGCTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCGGTGGCTGGAGTGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCGACAGGGTTGCTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGCATCATGGCCATGAATACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTGCCTCTTTACGTGGCTGGAGTATCGGTTTTTCGATCCAACGAGGTGAATGATGTCCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCATCTGCCCGACGGAACATACCAGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGTTACGCCAAAGACGGAGTGTTCAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGCGATGTTTACCGGGACATGGCTTCTTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCCCGAGAGCTCAGTGGTTGTTCGCGTCGTGCAGAACGATGGGAGCGTGTTGTGTGCCAGAAGCTCCACGGCAAGTATTAGCATCGATGGAAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCGGTGCATGCGTTGGATGGTCGTGTCGTTGGACTGTATGGTTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCTTGATCACAAGCGGAGAAGTCACCGCAGAGGAAAGCTCTGAGGAA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GAAGACGAAGGACATAAACTGTGGAAGTTTGATCGGTGAGCGGGACAGGGCAGCGTGGTCGAAGAATATCGTGGCCACAGTTAGTACAACTCGACGAATCATCGAGCAAGAAGCTGGAAGTCAGAAGTTCACGGAAGGGTTGCGGATACTTGGGCGATACCGAGCTCCAACCGACGACGTGTTCTGGTGAGAATCACGCGACTCGTAGAGAACAACGTCTCTAGAAAAGGTTAACGTTGCGAAGCAACGGGAGCCCCGTAAGGAAGGACAAGGCTGTCCTTGAGTGCTAACGACACTCCGGCCCCAGTTCCCAGAGCAAGGGTTTTTGCTCCACGGTGCTGGAAGACACCCTCGCGGCCATGGCTGCACGACGCGCGCAAGGAAGGACATGGCTGTCCTTGGGTACTAACGACACCCCGCCCCCAGTTCTCAAGGTTAGAGTTATAACCTCAGGGTGTTGGAAGACATCTAGGCCAGAGCAGAGCCATCGCAAGGGAGGATTTTCCTCGGGTACTGACCATACCCCGACCCCAGTCCGATAGGTCATGGAATGACCCCATGGTGCTGAGAGGGCATCCAAACAAGCTGAGCATCTTGGATTCTGCTCCCGTAAGGAAAGCGCAAGCTTTGAGCATTGACAACGCTCCGGCCCCAGTCCCCCAGGTTATGGGAGAATAACCCCGACGTGCTGGAAGGGCACGAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGAGAGAATCCAGGTGACTGACGACACCCCGCCCCCAGTTCTCAAGGTTA
| 68,942
|
KY349933.1
|
Culex flavivirus
|
Serra,O.P., Cardoso,B.F., Anjos,T.P., Slhessarenko,R.D.
|
Universidade Federal de Mato Grosso
| null |
2018-07-28
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,640
|
GenBank
| null |
Brazil: Cuiaba, MT
|
Brazil
|
Culex quinquefasciatus
| null |
2013-04-10
| null | null |
Culex flavivirus strain CxFV_BR/MT_CbaAr1256p2/2013, complete genome
|
TTTTTAAAAACTTTGGCTTGGTTACACCGCTGATTGGTTACACCTACATAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAAAGATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAGGAAGGGGCTAGGCTCCTCCAGGTGGTTGCTACCATCGGAGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGAAGTGTGCGGAGCACACCTCAGCTAGTCTCCGGCGGTGCGCAGCATCGTCGCGGAGGCGGAACGGGTCCTAGGGCCAGAGGTCTGCTAGGACGCTTGGGAATTGGTTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCCCTCATGCACTTGGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGACCGCCGCTTACGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCCCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGAATCACGCTCATACTCACTGGCTTGATGATGGTGCTCGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTTTCCACGGCGAAAGGGACGCAGATTTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACCGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTTCCCACGGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTGATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTCGCGAAAGATCTTGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTCTGCGTTACCACCGATGTGTGCCGAAGAAGCGTGAGCGACGAGCTGCCAACACCAACCAGAAGCTAGACTTTCTAGCAGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAGGCCATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCCATTGCGAAGAGGTGGCCGATGTGGGTGGTAATACTACTTGCAATTGGAACGTGGACCACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAGCCGTTATACACGCTGAAGGCGGAAAAGATGACCATGCTGCAGACAATCATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTCCGCACTGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAGTTGCTCGCTGATTGTCACGCAAATGCGTCTTATTCGACCGATGTGTGTCCCGGAGGATCGCAGTTGAACATGGGTGAGATCAACGGCAAAGAACGCGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGTTTCAAGTGGGGGATCGGGTTTGTTGCCACTTGTGTTGAACTGCATTGCGAAGAAGGTTACAATGTCTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAGTTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATCAGTGATGTTCCTGTGACTTTTCGGTTTGCAAAACTGGGCAATGCCGCTGTCACTTGCCGGCTGGAATCTGAGCGATTACTTCTAGACTACTACCATGTGACGGGCAAATACCATGAAGGATTGTTTGTGCGGTCGCAAATCGATGAGTGGCCAGGAGCGCACGCCACTGCGAGTGGAAGAGCTGGTTTGGAACGAATCGTGGTTTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTCCTTGTGAAGAACATCCTGGAACCTCAGCTCATATGGGACAACGCTATTGCCACTCAAGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTCTCTTGCCAGATCATGCTTGACAAGTTGGTTAGCGGCAGTTTCAAGGATTGTCCGGGGATCAAATCCTCGGTGTTTGTCCAAAGTGGTTTCGGCTATGATGGAGTGGTGATGACAAGTTTGTCCAAGGCAACTAACGAAAGCTGCTCGGTTGGGTTGACGTGCCATGGATGTTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACTGCAAAGGCGTTCGTTGGGTGTGGAAATCACACCGGGACCCTTGTGATTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGCGTGTTGAATCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAACATGTGGTTGACAAATACCGGAGGTTTGGCACTGCTGGAGTAGGAGGTGTATGGTACGATTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGCTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTTGGGCTAGCTGCTTTGGTGTTGCTCGACAAACGGATTGTTTTCTTGCTGCTGTTGTGCGGATACTTCATCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCCGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCCGGAGGGTTTGTGTGGAAAAGCTTGTCTCAGTGGCCGACCCGAGAACACTCTGTTGAACTCGATGACCAGCACTTGATCACGGCTCTTGTTTCGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGCATCATCTGTGAGGATGTCCTACAATGCGCCGCCGCTCGTGGTGCTGTTGGAGACATTACCCACGTTGACAATGAAATTGTTTACGTTAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAAAAAGTCCATGGCGTTAAGATCGGTGACCTAACAATGCAGCTAGCTCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTCGATCCGAGCCAATATGGTGAGCTGAGTAGTGGGTTCTTGAGTCGCACCAAGATCGCGGAAACTGGTGAGCACAAGGTCATCCGCGTGATAACTAGTGCCTCTCCATATGAAAAGATCTGCGAGCAAGCGTTCGCTTTACAGTACGGTTTCGTCCGGTTTACCCGCAGGGTGTTTGGCTCAAATGTCGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCAGGGTCGTTTGTGAAGAATGACATAGGCGCGTACACTGACGGGATGATGTGGATGAAGAGCAAGAAAGTGAACGGGACGTGGACTTTGGTTGACCTGGAGCTGACACAGAGCCACCAATGCATTTGGCCCCAAGCGTACACGTTTGATTTGACAGCCTTTAACGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCGCAGTACGGAGCTCCGATGTCCAAAGCCAACCACATACCGGGCTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGTACAAGGCAGATATCGTGTTACGCGAGGGAGTGGTCCCTGGGACGCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGATAATCGCGGGTCCGCAGTGAAAGTTGATCCTGCTATCGCCAAAAAGTGGTGTTGTAAGACATGCCTCTCAGCTGACAAACGGGTGTTTCATTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATTCGACCAGCGGCGACCCAACCAGAAGTGACCATTGACGCTGACGGTGAAGACATGGACGAGATGGCATCAATGTTCGGGACAATGAAAGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAGGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTAAGCCCATCCGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCATCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGATGGGCCCAACGCACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCAAACACCTATGTCGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTCGCTGCTGTTCCGAATGGTTCAGCACTGTTGGTGCACTTCTGGCTGGCAGTTCAGCTCTCGTCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCACTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGGTACGCATTGAGCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTTTTCCCAATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAGTCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCACGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTGTTCCATTCGCGTGTACAAGAACTGGGGATGCTCACCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGAGCTTCGAAGCCCTCATTAATAGCTGGAATGTGCTTAGCGGGATTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTTTACCAGATGCCGACGACGGCATCAGTGGTGTTCCTGGGGGGACTGCTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAACACACCTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAACAGGGGTGCCGTTGGACTGCGAGGAAGAGCCCACAATACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGTCCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTATCAACGGGGTTGTTGGTTTACGTTGGCTGTATGGGAGTCATGGCCATGAACACCTACGTTGGAGTCATCCTGATGTGTGCTTGCTGGTGGACGAACGCTCCTGAGTGGCTACCTCTTTACGTAGCTGGATCATCGATCTTTCGATCTAACGAGGTGAACGACGTTCTTATTACCCCTCCAGAGTACGAGCAGGAAGCGCAGTTAAGCAACGACTTTGGGCATCTGCCAGACGGAACATATCGGGTAGTCGCTCGCTCACTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGTTATGCCAAGGACGGTGTGTTCAACACGCTATGGCATGTGACATCTGGTGGAAGTCTCACTTGGCAAGGGAGACACGTACGCTTACACTCCGGTGATGTTTATCGAGACATGGCCTCGTATGGTGGACCGTGGAACATCGCTGATTCACCTGAGAGCTCGGTGGTTGTCCGCGTTGTGCAGAACGATGGTAGTGTGTTGTGTGCTAGAAGTTCTACGGCTAGCATTAGCGTTGATGGGAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGGTCGTCAGGATCTCCGGTGCATGCGTTGGATGGCCGCGTTGTTGGTCTGTATGGGTATGGATTTTTCATCGGATGGAAGTATCACTCCTTGATCACAAGCGGAGAAGTCGTTGCAGAGGACACTGTTGAGGAAGACACAGTT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GGACATCAACTGTGGAAGTTTGATCGGTGAGCGGGATAGGGCAGCGTGGTCAAAGAATATCGTGGCCACCGTCAGCACAACTCGGCGAATCATCGAACAAGAGGCAGGAAGCCAAAAGTTCACGGAAGGGCTGCGGATACTTGGGCGATACCGAGCTCCAGCCGACGACGTGTTCTGGTGAGGATCACGCAGGTCGTAGAGAACTACCTCTCTAGAAACGGTTAACGTTGCGAAGCAACGGGAACCCCGCAAGGAAGGACTAGGCTGTCCTTGGGTGCTAACGACACTCCGGCCCCAGTTCCCAGAGCCAGGGTTTTGGCTTCACGGTGTTGGAAGACACCCTCGCGGCCATGGCTGCACAAAGCGCGCAAGGAAGGACATGGCTGTCCTTGGGTACTAACGACACCCCGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCACAACCTCCGGATGTTGGAAGACATCCAGGCCAGAGCAGGGCCATCGCAAGGGAGGATTTTCCTCGGGTGCTGACCACACCCCGACCCCAGTCCAATAGGTCATGGAATGGCCCCGTGGTGCTGAAAGGGCATCCAAACAAGCTGAGCATCTTGGAGTCTGCTCCCGTAAGGAAAGCGTAAGCTTTGAGCATTGACGACGCTCCGG
| 69,681
|
MF582365.1
|
Culex flavivirus
|
Kyaw Kyaw,A., Tun,M.M., Buerano,C.C., Nabeshima,T., Sakaguchi,M., Ando,T., Inoue,S., Mya,Y.Y., Hayasaka,D., Thu,H.M., Thant,K.Z., Morita,K., Kyaw,A.K., Ngwe Tun,M.M., Myint,Y.Y.
|
Institute of Tropical Medicine, Nagasaki University, Virology Department
|
Japan
|
2018-07-03
|
M-15
|
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,472
|
GenBank
| 1
|
Myanmar
|
Myanmar
|
Culicidae
| null |
2014
| null | null |
Culex flavivirus isolate M-15, complete genome
|
GTTTATTATTTTATCGCCGCTTGTGACTATAAAGTTACCTAGCGGAGAGAGATGAAGAAGAAGGAGTTCAAGGCTCAGGGCAGGGCGCAAGTTCCCTGGTCCCTAGGCCGCTCGAAGGAAGGAGAAGTGAAGAAGAAGAAGGAGAAGGAGAGGGCCACCGCCGAAAGAAGGCTGGTGCCTCACAAGAGGGCCAACCAGCGTGCTGGACTAGTGGCCAACGCCGGACGGCGTGGTGGCCTGTTGGGACGCCTGGGGATTGGATGGAGTGCCTTCCTACAGGAAGACATCGTTCAAGCCATCATGCATCTCGTTTTGGTCTTACACGCTCTGTTCGCCTCATTTGATCGCCGGATTCGAACGTTGGCGCGACGGGTTTCTGCATTGGAAGTTCGCCGCTCAGCCAACAACCCACTTTACATGGTCATCGTGCTCTCGTTCCTCATGGTGTTGTGCGGATGTGTCATCATCGACATGCAAGTGTCGACTGCCAAAGGAATTCAAATTTTTGAGGGAAAGGTCAATCGGACGGAGCATCTACACCTGTTCAAACTTCCTGCCGATGGATGCTGGAATGGGATCCTTGTCTCAAAGAAGTGCCCAAGGGTTGACAATCTGTCAAAAGATCTTGAATCTGTTGACTGTGGCTCAACTTGGATCGAGTTCACGTTGCGCTACCATCGCTGTCTTCCGAAGAAGCGTGTGAAACGTGCGCCGGAAAAACCAAAAACCGACTTGCTCGCTGAGGTGGAAATGGTCACGTTCAAAACTATCAGAGAAAATAAAACGATCTTTGTCATTGGTCTGTTGTGCGTGGCCATTGCCAAACGCTGGCCAATGTGGATTGTGATTCTCCTAGCTGTGGGGACATGGACCACTGTCAAGGGCGAGTTCGTGGAACCTCTGTACACATTGAAAGCTGAGAAGATGACGATGCTGCAGACGATTATCCGACCGGAAGAAGGCTACGTCATTGCCACCCCAAACGGCTTGCTGGAATTCAAAACGGGCGCGGCTGAGATTTATGGTGGTCAGTGGCTCCGTGAGTTGCTAGCAGATTGCTATGTGAATGCTACCTATTCGACTGACGTTTGTCCCGGTGGCTCGCAGCTGAACATGGCCGAGATCATGGCTAAGGAACGTGTTTGCACCACGCAACCATACAACCGTGGATGGGGCACTGGATGCTTCAAGTGGGGCATAGGCTTTGTTGGCACTTGTGTGGAATTGCATTGTGAAAAAGGATACAACGTTTCTTCAATAGCGAGATCTGCCATTGTCATGAATGTGACCGCCAGCTTTCACTCCGTTAGCAACACGCAACAGATGACCGGTGACATTCCGGTCACATTTCGGTTCGCAAAGCTTGGCAACGCTGCCATGACATGTAGGCTGGAATCAGAACAACTGCTTCTAGATTACTACCACGTGTCTGGGGATGTGCATGAAGGATTGTTCTTGCGCTCCCAGATTGACAGTTGGCCAGGCGTACACTCCACGGCCGGCGGACGCTTTGGCCTGGAGAAGGTCGTAGTATGGGGTGACACCAAATCAAACGAGGTTCTGGTGAAGAACATCGTGGAACCGCATCTCACTTGGGATGACGCAATCGCTACACATGATGGTTTTCGTGACGTATCATTTGCTTGCCAGATCATGCTGGATAAGCTTGTTAGCGGAGCGTTTAAGGACTGCCAAGGACTGAAATCATCCATGTTTGTTCAGGATGGTTTTGGGTACAGCGGCGTCGTCATCACAACCCTGACCCAAGCAGCGAACGAGAGCTGCTCAGTGAGCCTTGTCTGTCACGGTTGCTATTTGCAGTCGACAAAACTGGTTTTTTCCCCGGGCTCAACCTCAGCAAGGGCGTTCGTCGGATGTGGCAATCATTCCGGAACGCTTGTTGTTGGAAACGGAATCCTTCCCATCAATTGCGTCATGAATCCGATATCACAAGGTTGGCGCCTAGCAAAGCATGTGATGGATAAGTACAAACGCTTTGGTGCTCCTGGGATCGCTGGCGTCTGGCATGACTTCTTTGGAAAGTTTTCGCTTGGCGCCCTGTTCTCCAACACCACGATCCTCATCATTATCGCCGTGGCCTTCATCGTTGACAAGCGGGTGGCTTTCCTGCTTGTGCTATTGGGATACCTGTACTTCGCGCGTGCTGACGTTGGGTGTGGGTTTGATACTGAGCGAAAGATCGTGTCGTGCGGCTCTGGTGGATTCGTTTGGAAAAACATTGCCCAATGGCCGACTGGGGACCATTCAGTGGAACTGGAAGATTTAGAGGTAGTGTCAGCGTTGATCACAGAGCAGCTCCGGCGAACGAGCAAAGTCTGTCTGATTTGCGAAGACGTTCTGCAATGCGCCGCAGCCCGGAGCATTGCCCATAGCATCACCAAAGTCGACAATGACCTTGTTTACACCAACGACACGATGTCACACGGCAGAACGTTCCCACGCTTGCGAAAAGCCGTGCACGGAGTCAAAATCGGAGATGTCACCATGCAATTGGCTCTGGCTGCTGTGAACGGTTCACTTGATGCCGAGCAGTTCGGCACGTTGGATAGCGGAATCTTCACGTACACTAAGGTAAATGAGACAGACTCCCACAAGGTTGTCAGAGTCGTGACCAGCGGAAGTCCGTACAAGCACGTCTGTGCCCAGGCCTTTGCCTTGCAGTATGGATTCGTGCGTTTCACAAGGAAAGTTTACGGATCGAACATCGTCGTCAAACCGGTTGAACAGCCCAGTGAGATATGCCCAACATACCTAGCTGGATCTTACGTGAAAAACGACATTGCAGCTTACACTGATGGTATGATGTGGATGCGCAGTCGAAAAGTCAACGGAACGTGGGAATTGTTCGAGCTGGAGCTGACCCAAAGTCACCAGTGCATCTGGCCGCGTGAATACACGTTTGATGCCACAGCGTTCAACGACTCATCACTGTTCATGCCAGCTGTTTACGGAGCGCCAATGTCACGAGCCAACCACATTCCTGGATACAAGACGCAGACAGAATTTCCGTGGTACAAAGCCGACATTCAACTCCACTCAGGACCAGTCCCTGGAACGGAGGTAGAGTCTAGCGCCTCATGTGACAACCGGGGTTCAGCTGTGAAAGTAGAACCAACCGTGGCGAAAAAATGGTGTTGCAAGACCTGCTTGCTCAACGGTCGCGAACCGATCCATCTAAAGGTGGATGGAGCGTATTTCTATCCGATGGAGATTCGACCTGTTACATCGCATTCCACGCTGACCATCGAGAAGGGTGGCCAAACCATTGACGACATGGACCTGATGTTTAACAACACGGTTTCAGCGATCCCCGGAACTGGAGCGTTTCCGGATTTCCAGAACAGCCTGCCAGTGGAAGGGATGTCTCCCCTACTGGTGGGCGTGTTCCTGCACTTCCTCACGTTGCGCACAAGAAACCGGTGGATGCAGAGAACATGTGGTACATGGCTGCTGTTCCTAGTCTGTGGAATTCCCTCCGACGGATGGCGTGGGTGGTCATGGATTGGATTGTCGTATTCACTCGCTGCTGTTCCGCATGGTACCACACTGCTAGTGCACTTCTGGTTGGCGTTGCAGTACTCTGCATCGCACTTGTTCTTTCTTGGATGGGTTATTCGCCGACGCGTCGAATCATCGCACGAGTACGCTCTCACGGTGTTCGCAGCCGAGTGGCTGCTCTCACGGGTACAAGAGCTATTGCCATCGACATCCCTCCTGGATCACATGGTGTTTCCGATTTACGTGACGCTAGCACTCAACATGAAGTCTCAATTCGTGCCTGTGGACACGATAGTACTTTTGAACTATGTTGTGGCCCATCCGTTAACAGCCCTGGTAACGGTAGTCGTTGGTGCCCTGGCGACCTTTACTATTCACGTTTACAGGAACTGGAAGCGCTCACCGAATTTGTGGAGGAGTGGGCTTCGAGCTTCGAAGTCCTCAATTCTTCTTGGATTGTACTACGTGATGTTGTACGTGTTATGCGCGTTTCTCGAGGGGATCGGGATGCCGAGGACGGGCCAGGTAGTGTTTCTGGGGGGTCTGCTCCTAGGGATAATGACCAGGCTGGCCCCTCCGATGCGCCTGGACTTAGTTCCCGTCCACGGAAACGACGTGCCGAGAGATTGCGAAGAACAGCCAACGCGACTTCCTCCAGGATTGGAAGGATCATACGGAGCGGACGGAGTTGAATTCACCAACCTAACCGACGTCGGCTCCATCACGATGGGAATCTTGATTTATGTGGGATGTCTTGGCGTGATGGTCCTCAACACTCCTCTTGGAGTTGTGCTGATGAGTGTCTGCTGGTGGACGAAGGCGCCCTTGTGGTTGCCGAGATATCTCCTTGGAGCTACCGCCTATCGCGCTGGGGTGAACGACTTGCTCCTAGCCCCTCCAGTGTATGCAGATGAGGTGGATGTTGAAACCGACTTTGGTCACATCCCTGACGGAACCTACCAGGTTGTCGGCACCACGCTATGCATGAAATTTCATGTTGGAGCTGGTCAAGTGAAAGACGGTGTGTTCAACACGCTGTGGCACGTAACCTCGGGAGGCACTGTGCACTGGCAAGGAAGAGCTGTTCGGGCTCACTCCGCTGACGTTTACAAAGACATGGTTTCATACGGCGGACCCTGGAATATTGCTGACTCACAAGAAGAAGTGGTAGTTGTCCGAGTAGTCCAGCGTGATGGTAGTGTGTCATGCGAAAAGCTGTCGACCGCTCTGGTCACTGTGAACAGGAACCCTGTACGTGTTGTTGGCAAGGATTTTGGGCGCGGATCATCAGGGTCTCCGATACATGCTCTAGATGGGCGTGTGGTTGGCTTGTATGGCTACGGATTTTATGTCGGCTGGAACTATTTTTCCCTTGTCACAAGTGGTAACGCGACCGAGAACGCGGTGGAGGAAGAAGATCGGTCAACACGAAAGTTCGTTGACTGGCATCCGGGACGAGGCAAGACACGAAAAGTACTGGT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| 70,158
|
MF582366.1
|
Culex flavivirus
|
Kyaw Kyaw,A., Tun,M.M., Buerano,C.C., Nabeshima,T., Sakaguchi,M., Ando,T., Inoue,S., Mya,Y.Y., Hayasaka,D., Thu,H.M., Thant,K.Z., Morita,K., Kyaw,A.K., Ngwe Tun,M.M., Myint,Y.Y.
|
Institute of Tropical Medicine, Nagasaki University, Virology Department
|
Japan
|
2018-07-03
|
M-20
|
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,472
|
GenBank
| 1
|
Myanmar
|
Myanmar
|
Culicidae
| null |
2014
| null | null |
Culex flavivirus isolate M-20, complete genome
|
GTTTATTATTTTATCGCCGCTCGTGACTATAAGGTTACCTAGCGGAGAGAGATGAAGAAGAAGGAGTTCAAGGCTCAGGGCAGGGCGCAAGTTCCCTGGTCCCTAGGCCGCTCGAAGGAAGGAGAAGTGAAGAAGAAGAAGGAGAAGGAGAGGGCCACCGCCGAAAGAAGGCTGGTGCCTCACAAGAGGGCCAACCAGCGTGTTGGACTGGTGGCCAGCGCCGGACGGCGTGGTGGCCTGCTGGGACGCCTGGGGATTGGATGGAGTGCCTTCCTACAGGAAGACATCGTTCAAGCCATCATGCATCTCGTTTTGGTCTTACACGCTTTGTTCGCCTCATTTGATCGCCGGATTCGAACGTTGGCGCGACGGGTTTCTGCATTGGAAGTTCGCCGCTCAGCCAACAACCCACTTTACATGGTCATCGTGCTCTCGTTCCTCATGGTGTTGTGCGGATGTGTCATCATCGACATGCAAGTGTCGACTGCCAAAGGAATTCAAATTTTTGAGGGAAAGGTCAATCGGACGGAGCATCTACACCTGTTCAAACTTCCTGCCGATGGATGCTGGAATGGGATCCTTGTCTCAAAGAAGTGCCCAAGGGTTGACAATCTGTCAAAAGATCTTGAATCTGTTGACTGCGGCTCAACTTGGATCGAGTTTACGTTGCGTTACCATCGCTGTCTTCCGAAGAAGCGTGTGAAACGTGCGCCGGAAAAACCAAAAACCGACTTGCTCGCTGAGGTGGAAATGGTCACGTTCAAAACTATCAGAGAAAATAAAACGATCTTTGTCATTGGTCTGTTGTGCGTGGCCATTGCCAAACGCTGGCCAATGTGGATTGTGATTCTCCTAGCTGTGGGGACATGGACCACTGTCAAGGGCGAGTTCGTGGAACCTCTGTACACATTGAAAGCTGAGAAGATGACGATGCTGCAGACGATTATCCGACCGGAAGAAGGCTACGTCATTGCCACCCCAAACGGCTTGCTGGAATTCAAAACGGGCGCGGCTGAGATTTATGGTGGTCAGTGGCTCCGTGAGTTGCTAGCAGATTGCTATGTGAATGCCACCTATTCGACTGACGTTTGTCCCGGTGGTTCGCAGCTGAACATGGCCGAGATCATGGCTAAGGAACGTGTTTGCACCACGCAACCATACAACCGTGGATGGGGCACTGGATGCTTCAAGTGGGGCATAGGCTTTGTTGGCACTTGTGTGGAATTGCATTGTGAAAAAGGATACAACGTTTCTTCAATAGCGAGATCTGCCATTGTCATGAATGTGACCGCCAGCTTTCACTCCGTTAGCAACACGCAACAGATGACCGGTGACATTCCGGTCACATTTCGGTTCGCAAAGCTTGGCAACGCTGCCATGACATGTAGGCTGGAATCAGAACAACTGCTTCTAGATTACTACCACGTGTCTGGGGATGTGCATGAAGGATTGTTCTTGCGCTCCCAGATTGACAGTTGGCCAGGCGTACACTCCACGGCCGGCGGACGCTTTGGCCTGGAGAAAGTCGTAGTATGGGGTGACACCAAATCAAACGAAGTTCTGGTGAAGAACATCGGGGAACCGCATCTCACTTGGGATGACGCAATCGCTACACATGATGGTTTTCGTGACATATCATTCGCTTGCCAGATCATGTTGGATAAGCTTGTTAGCGGAGCGTTTAAGGACTGCCAAGGACTGAAATCATCCATGTTTGTTCAGGATGGTTTTGGGTACAGTGGCGTCGTCATCACAACCCTGACCCACGCAGCGAACGAGAGCTGCTCAGTGAGTCTTGTCTGTCACGGTTGCTATTTGCAATCGACAAAACTCGTTTTTTCCCCGGGTTCAACCTCAGCAAGGGCGTTTGTCGGATGTGGCAATCATTCCGGAACGCTTGTTGTTGGAAACGGAATTCTCCCCATCAATTGCGTTATGAATCCGATATCACAAGGTTGGCGCCTAGCAAAGCATGTGATGGACAAGTACAAACGCTTTGGAGCTCCTGGGGTCGCCGGCGTCTGGCATGACTTCTTTGGAAAGTTTTCGCTTGGCGCCCTGTTCTCCAACACCACGATTCTCATCATCATCGCCGTGGCCTTCATCGTTGACAAGCGGGTGGCTTTCCTGCTTGTGCTATTGGGATACTTGTACTTTGCGCGTGCTGATGTTGGGTGTGGGTTTGACACTGAGCGAAAGATCGTGTCGTGCGGCTCTGGTGGATTCGTTTGGAAAAACATTGCCCAATGGCCGACTGGGGACCATTCAGTGGAGCTAGAAGATTTAGAGGTAGTGTCAGCGTTGCTCACAGAGCAGCTCCGGCGAACGAGCAAAGTCTGTCTGATTTGCGAAGACGTTCTGCAATGCGCCGCAGCCCGGAGCATTGCCCATAGTATCACCAAAGTCGACAATGACCTTGTTTACACCAACGACACGATGTCACACGGCAGAACGTTCCCACGCTTGCGAAAAGCCGTGCACGGAGTCAAAATCGGAGATGTCACCATGCAATTGGCTCTGGCTGCTGTGAACGGTTCACTTGATGCCGAGCAGTTCGGCACGTTGGATAGCGGAATCTTCACGTACACTAAGGTAAATGAGACAGACTCCCACAAGGTTGTCAGAGTCGTGACCAGCGGAAGTCCGTACAAGCACGTCTGTGCCCAGGCCTTTGCCTTGCAGTATGGATTCGTGCGTTTCACAAGGAAAGTTTACGGATCGAACATCGTCGTCAAACCGGTTGAACAGCCCAGTGAGATATGCCCAACATACCTGGCTGGATCTTACGTGAAAAACGACATTGCAGCTTACACTGATGGTATGATGTGGATGCGCAGTCGAAAAGTCAACGGAACGTGGGAATTGTTCGAGCTGGAGCTGACCCAAAGTCACCAGTGCATCTGGCCGCGTGAATACACGTTTGATGCCACAGCGTTCAACGACTCATCACTGTTCATGCCAGCTGTTTACGGAGCGCCAATGTCACGAGCCAACCACATTCCTGGATACAAGACGCAGACAGAATTTCCGTGGTACAAAGCCGACATTCAACTCCACTCAGGACCAGTCCCTGGAACGGAGGTAGAGTCTAGCGCCTCATGTGACAACCGGGGTTCAGCTGTGAAAGTAGAACCAACCGTGGCGAAAAAATGGTGTTGCAAGACCTGCTTGCTCAACGGTCGCGAACCGATCCATCTAAAGGTGGATGGAGCGTATTTCTATCCGATGGAGATTCGACCTGTTACATCGCATTCCACGCTGACCATCGAGAAGGGTGGCCAAACCATTGACGACATGGACCTGATGTTTAACAACACGGTTTCAGCGATCCCCGGAACTGGAGCGTTTCCGGATTTCCAGAACAGCCTGCCAGTGGAAGGGATGTCTCCCCTACTGGTGGGCGTGTTCCTGCACTTCCTCACGTTGCGCACAAGAAACCGGTGGATGCAGAGAACATGTGGTACATGGCTGCTGTTCCTAGTCTGTGGAATTCCCTCCGACGGATGGCGTGGGTGGTCATGGATTGGATTGTCGTATTCACTCGCTGCTGTTCCGCATGGTACCACACTGCTAGTGCACTTCTGGTTGGCGTTGCAGTACTCTGCATCGCACTTGTTCTTTCTTGGATGGGTTATTCGCCGACGCGTCGAATCATCGCACGAGTACGCTCTCACGGTGTTCGCAGCCGAGTGGCTGCTCTCACGGGTACAAGAGCTATTGCCATCGACATCCCTCCTGGATCACATGGTGTTTCCGATTTACGTGACGCTAGCACTCAACATGAAGTCTCAATTCGTGCCTGTGGACACGATAGTACTTTTGAACTATGTTGTGGCCCATCCGTTAACAGCCCTGGTAACGGTAGTCGTTGGTGCCCTGGCGACCTTTACTATTCACGTTTACAGGAACTGGAAGCGCTCACCGAATTTGTGGAGGAGTGGGCTTCGAGCTTCGAAGTCCTCAATTCTTCTTGGATTGTACTACGTGATGTTGTACGTGTTATGCGCGTTTCTCGAGGGGATCGGGATGCCGAGGACGGGCCAGGTAGTGTTTCTGGGGGGTCTGCTCCTAGGGATAATGACCAGGCTGGCCCCTCCGATGCGCCTGGACTTAGTTCCCGTCCACGGAAACGACGTGCCGAGAGATTGCGAAGAACAGCCAACGCGACTTCCTCCAGGATTGGAAGGATCATACGGAGCGGACGGAGTTGAATTCACCAACCTAACCGACGTCGGCTCCATCACGATGGGAATCTTGATTTATGTGGGATGTCTTGGCGTGATGGTCCTCAACACTCCTCTTGGAGTTGTGCTGATGAGTGTCTGCTGGTGGACGAAGGCGCCCTTGTGGTTGCCGAGATATCTCCTTGGAGCTACCGCCTATCGCGCTGGGGTGAACGACTTGCTCCTAGCCCCTCCAGTGTATGCAGATGAGGTGGATGTTGAAACCGACTTTGGTCACATCCCTGACGGAACCTACCAGGTTGTCGGCACCACGCTATGCATGAAATTTCATGTTGGAGCTGGTCAAGTGAAAGACGGTGTGTTCAACACGCTGTGGCACGTAACCTCGGGAGGCACTGTGCACTGGCAAGGAAGAGCTGTTCGGGCTCACTCCGCTGACGTTTACAAAGACATGGTTTCATACGGCGGACCCTGGAATATTGCTGACTCACAAGAAGAAGTGGTAGTTGTCCGAGTAGTCCAGCGTGATGGTAGTGTGTCATGCGAAAAGCTGTCGACCGCTCTGGTCACTGTGAACAGGAACCCTGTACGTGTTGTTGGCAAGGATTTTGGGCGCGGATCATCAGGGTCTCCGATACATGCTCTAGATGGGCGTGTGGTTGGCTTGTATGGCTACGGATTTTATGTCGGCTGGAACTATTTTTCCCTTGTCACAAGTGGTAACGCGACCGAGAACGCGGTGGAGGAAGAAGATCGGTCAACACGAAAGTTCGTTGACTGGCATCCGGGACGAGGCAAGACACGAAAAGTACTGGT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| 70,159
|
AB701766.1
|
Culex flavivirus
|
Obara-Nagoya,M., Yamauchi,T., Watanabe,M., Hasegawa,S., Iwai-Itamochi,M., Horimoto,E., Takizawa,T., Takashima,I., Kariwa,H., Nagoya,M.
|
Department of Virology; Nakataikoyama 17-1, Imizu, Toyama 939-0363
|
Japan
|
2013-01-09
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| 1
|
Japan: Toyama
|
Japan
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2004
| null | null |
Culex flavivirus RNA, complete genome, strain: Toyama71
|
AGTTTTTAAAAACTTCGGCTTGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTACACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCGGGCTCCTCCGGATGGTTGCAACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGAGCACATCTCAGCTGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCACCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCTTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGTTTGGGAATTGGCTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCCCTTGAGGCTAGACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTCATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTTGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACACAGATCTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACTGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTCCCCACAGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTTATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATCTGGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGAGTTGCCAGCACCAACCAGAAGCTAGATTTTCTAGCGGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAAGCTATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATTGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGGAACGTGGACTACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACACTGAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGATTGTCACGTAAACGCGTCATTCTCGACTGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGGTCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACCGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAACTGCATTGCGGAGAGGGATATAACGTGTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTCCCCGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAACGCCGCTGTTACTTGCCGGCTAGAATCAGAGCGACTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGTAAACACCACGAAGGATTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCCGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCTGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTCTTAGTGAAAAACATCTTGGAACCTCAGCTCGTATGGGATAATGCCATTGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTTTCTTGTCAGATCATGCTTGACAAGCTGGTTAGCGGTAGTTTCAAGGATTGCCCGGGGATCAAGTCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTCGGATACGACGGTGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAGGCAACTAATGAGAGCTGCTCGGTGGGGCTGGCGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAACCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACAACAATCCACGTTGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGCGAATGGCCAAGCATGTGGTTGACAAGTACCGGAGGTTTGGAACTGCTGGAGTTGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGCTGGCCGCTCTGGTGTTTCTTGACAAACGGATTGTGTTCCTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTGTGGAAAAGCCTGTCGCAATGGCCGACCCGTGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTACGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGCGCAGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATTGTTTACGTTAACACCTCGTTGTCTTTTGACAGGACCTTTCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTGAAAATTGGTGACCTGACGATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATTGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAGATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGCTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCCGGATCGTTTGTTAAAAATGACATAGGTGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAAGGTGAACGGAACGTGGACATTGGTCGACTTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAGGCTTATACGTTTGATTTGACGGCCTTTAATGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCACAGTACGGCGCTCCGATGTCTAAAGCAAACCACATTCCCGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTACGCGAGGGGGTGGTCCCCGGGACTCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGTGGGTCTGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAACCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCACCTGCTGACAATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGTACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTTGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTTGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGCTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTGCTGATCGGGATAGTCACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAATGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGCTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGAATCATGGCCATGAACACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTACCTCTTTACGTGGCTGGAGTATCGGTCTTTCGATCTAATGAGGTGAATGATGTCCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCCGATGGAACATACCAGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGGGCAGGTTACGCCAAAGACGGTGTGTTTAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGCGATGTTTACCGGGACATGGCTTCGTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCCCGAGAGCTCAGTGGTTGTTCGTGTCGTGCAGAACGATGGGAGCGTGTTGTGTGCTAGAAGCTCCACGGCAAGTATTAGCATCGATGGAAAGCGTGTTCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCGCCGGTGCATGCGTTGGATGGTCGTGTAGTTGGACTGTACGGTTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCCTGATCACAAGCGGAGAAGTTACCGCAGAGGAAAACTTTGAGGAAGACACAG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AAGGACATAAACTGTGGAAGTTTGATCGGTGAGCGGGACAGGGCAGCGTGGTCGAAGAATATCGTGGCCACAGTTAGTACGACTCGACGAATCATCGAGCAAGAAGCTGGAAGTCAGAAGTTCACGGAAGGGTTGCGAATACTTGGGCGATACCGAGCTCCAACCGACGACGTGTTCTGGTGAGAATCACGCGACTCGTAGAGAACAACATCTCTAGAAAAGGTTAACGTTGCGAAGCAACGGGAACCCCGTAAGGAAGGACAAGGCTGTCCTTGAGTGCCAACGACGCTCCGGCCCCAGTTCCCAGAGCCAGGGTTTTAGCTCCACGGTGCTGGAAGACACCCTCGCGGCCATGGCTGCACGACGCGCGCAAGGAAGGACATGGCTGTCCTTGGGTACTAACGACACCCCGCCCCCAGTTCTCAAGGTTAGAGTTATAACCTCAGGGTGTTGGAAGACATCCAGGCCAGAGCAGGGCCATCGCAAGGGAGGATTTTCCTCGGGTACTGACCATACCCCGACCCCAGTCCGATAGGTCATGGAATGACCCCATGGTGCTGAGAGGGCATCAAAACAAGCTGAGCATCTTGGATTCTGCTCCCGTAAGGAAAGCGCAAGCTTTGAGCATTGACAACGCTCCGGCCCCAGTCCCCCAGGTTATGGGAGAATAACCCCGACGTGCTGGAAGGGCACGAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATAGAATCCAGGTGACTGACGCCACCTCCCGAAATGTGTATAGTAACAGAGCATGCCTGCAGCAGCAGGTCTCCACCGTTAGGAGACTTGTTGTGGGCAAGCTTTTGTTCACGTCT
| 95,390
|
AB701767.1
|
Culex flavivirus
|
Obara-Nagoya,M., Yamauchi,T., Watanabe,M., Hasegawa,S., Iwai-Itamochi,M., Horimoto,E., Takizawa,T., Takashima,I., Kariwa,H., Nagoya,M.
|
Department of Virology; Nakataikoyama 17-1, Imizu, Toyama 939-0363
|
Japan
|
2013-01-09
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| 1
|
Japan: Toyama
|
Japan
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2005
| null | null |
Culex flavivirus RNA, complete genome, strain: Toyama734
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AGTTTTTAAAAACTTCGGCTTGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTACACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCGGGCTCCTCCGGATGGTTGCAACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGAGCACATCTCAGCTGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCACCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCTTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGTTTGGGAATTGGCTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCCCTTGAGGCTAGACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTCATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTTGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACACAGATCTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACTGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTCCCCACAGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTTATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATCTGGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGAGTTGCCAGCACCAACCAGAAGCTAGATTTTCTAGCAGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAAGCTATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATTGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGGAACGTGGACTACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACACTGAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGATTGTCACGTAAACGCGTCATTCTCGACTGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGGTCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACCGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAACTGCATTGCGGAGAGGGATATAACGTGTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTCCCCGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAACGCCGCTGTTACTTGCCGGCTAGAATCAGAGCGACTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGTAAACACCACGAAGGATTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCCGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCTGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTCTTAGTGAAAAACATCTTGGAACCTCAGCTCGTATGGGATAATGCCATTGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTTTCTTGTCAGATCATGCTTGACAAGCTGGTTAGCGGTAGTTTCAAGGATTGCCCGGGGATCAAGTCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTCGGATACGACGGTGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAGGCAACTAATGAGAGCTGCTCGGTGGGGCTGGCGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAACCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACAACAATCCACGTTGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGCGAATGGCCAAGCATGTGGTTGACAAGTACCGGAGGTTTGGAACTGCTGGAGTTGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGCTGGCCGCTCTGGTGTTTCTTGACAAACGGATTGTGTTCCTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTGTGGAAAAGCCTGTCGCAATGGCCGACCCGTGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTACGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGCGCAGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATTGTTTACGTTAACACCTCGTTGTCTTTTGACAGGACCTTTCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTGAAAATTGGTGACCTGACGATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATTGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAGATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGCTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCCGGATCGTTTGTTAAAAATGACATAGGTGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAAGGTGAACGGAACGTGGACATTGGTCGACTTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAGGCTTATACGTTTGATTTGACGGCCTTTAATGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCACAGTACGGCGCTCCGATGTCTAAAGCAAACCACATTCCCGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTACGCGAGGGGGTGGTCCCCGGGACTCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGTGGGTCTGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAACCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCACCTGCTGACAATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGTACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTTGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTTGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGCTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTGCTGATCGGGATAGTCACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAATGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGCTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGAATCATGGCCATGAACACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTACCTCTTTACGTGGCTGGAGTATCGGTCTTTCGATCTAATGAGGTGAATGATGTCCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCCGATGGAACATACCAGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGGGCAGGTTACGCCAAAGACGGTGTGTTTAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGCGATGTTTACCGGGACATGGCTTCGTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCCCGAGAGCTCAGTGGTTGTTCGTGTCGTGCAGAACGATGGGAGCGTGTTGTGTGCTAGAAGCTCCACGGCAAGTATTAGCATCGATGGAAAGCGTGTTCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCGCCGGTGCATGCGTTGGATGGTCGTGTAGTTGGACTGTACGGTTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCCTGATCACAAGCGGAGAAGTTACCGCAGAGGAAAACTTTGAGGAAGACACAG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AAGGACATAAACTGTGGAAGTTTGATCGGTGAGCGGGACAGGGCAGCGTGGTCGAAGAATATCGTGGCCACAGTTAGTACGACTCGACGAATCATCGAGCAAGAAGCTGGAAGTCAGAAGTTCACGGAAGGGTTGCGAATACTTGGGCGATACCGAGCTCCAACCGACGACGTGTTCTGGTGAGAATCACGCGACTCGTAGAGAACAACATCTCTAGAAAAGGTTAACGTTGCGAAGCAACGGGAACCCCGTAAGGAAGGACAAGGCTGTCCTTGAGTGCCAACGACGCTCCGGCCCCAGTTCCCAGAGCCAGGGTTTTAGCTCCACGGTGCTGGAAGACACCCTCGCGGCCATGGCTGCACGACGCGCGCAAGGAAGGACATGGCTGTCCTTGGGTACTAACGACACCCCGCCCCCAGTTCTCAAGGTTAGAGTTATAACCTCAGGGTGTTGGAAGACATCCAGGCCAGAGCAGGGCCATCGCAAGGGAGGATTTTCCTCGGGTACTGACCATACCCCGACCCCAGTCCGATAGGTCATGGAATGACCCCATGGTGCTGAGAGGGCATCAAAACAAGCTGAGCATCTTGGATTCTGCTCCCGTAAGGAAAGCGCAAGCTTTGAGCATTGACAACGCTCCGGCCCCAGTCCCCCAGGTTATGGGAGAATAACCCCGACGTGCTGGAAGGGCACGAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATAGAATCCAGGTGACTGACGCCACCTCCCGAAATGTGTATAGTAACAGAGCATGCCTGCAGCAGCAGGTCTCCACCGTTAGGAGACTTGTTGTGGGCAAGCTTTTGTTCACGTCT
| 95,391
|
AB701768.1
|
Culex flavivirus
|
Obara-Nagoya,M., Yamauchi,T., Watanabe,M., Hasegawa,S., Iwai-Itamochi,M., Horimoto,E., Takizawa,T., Takashima,I., Kariwa,H., Nagoya,M.
|
Department of Virology; Nakataikoyama 17-1, Imizu, Toyama 939-0363
|
Japan
|
2013-01-09
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| 1
|
Japan: Toyama
|
Japan
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2006
| null | null |
Culex flavivirus RNA, complete genome, strain: Toyama1701
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AGTTTTTAAAAACTTCGGCTTGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTACACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCGGGCTCCTCCGGATGGTTGCAACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGAGCACATCTCAGCTGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCACCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCTTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGTTTGGGAATTGGCTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCCCTTGAGGCTAGACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTCATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTTGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACACAGATCTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACTGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTCCCCACAGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTTATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATCTGGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGAGTTGCCAGCACCAACCAGAAGCTAGATTTTCTAGCAGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAAGCTATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATTGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGGAACGTGGACTACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACACTGAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGATTGTCACGTAAACGCGTCATTCTCGACTGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGGTCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACCGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAACTGCATTGCGGAGAGGGATATAACGTGTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTCCCCGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAACGCCGCTGTTACTTGCCGGCTAGAATCAGAGCGACTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGTAAACACCACGAAGGATTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCCGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCTGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTCTTAGTGAAAAACATCTTGGAACCTCAGCTCGTATGGGATAATGCCATTGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTTTCTTGTCAGATCATGCTTGACAAGCTGGTTAGCGGTAGTTTCAAGGATTGCCCGGGGATCAAGTCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTCGGATACGACGGTGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAGGCAACTAATGAGAGCTGCTCGGTGGGGCTGGCGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAACCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACAACAATCCACGTTGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGCGAATGGCCAAGCATGTGGTTGACAAGTACCGGAGGTTTGGAACTGCTGGAGTTGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGCTGGCCGCTCTGGTGTTTCTTGACAAACGGATTGTGTTCCTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTGTGGAAAAGCCTGTCGCAATGGCCGACCCGTGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTACGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGCGCAGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATTGTTTACGTTAACACCTCGTTGTCTTTTGACAGGACCTTTCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTGAAAATTGGTGACCTGACGATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATTGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAGATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGCTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCCGGATCGTTTGTTAAAAATGACATAGGTGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAAGGTGAACGGAACGTGGACATTGGTCGACTTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAGGCTTATACGTTTGATTTGACGGCCTTTAATGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCACAGTACGGCGCTCCGATGTCTAAAGCAAACCACATTCCCGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTACGCGAGGGGGTGGTCCCCGGGACTCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGTGGGTCTGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAACCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCACCTGCTGACAATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGTACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTTGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTTGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGCTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTGCTGATCGGGATAGTCACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAATGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGCTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGAATCATGGCCATGAACACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTACCTCTTTACGTGGCTGGAGTATCGGTCTTTCGATCTAATGAGGTGAATGATGTCCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCCGATGGAACATACCAGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGGGCAGGTTACGCCAAAGACGGTGTGTTTAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGCGATGTTTACCGGGACATGGCTTCGTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCCCGAGAGCTCAGTGGTTGTTCGTGTCGTGCAGAACGATGGGAGCGTGTTGTGTGCTAGAAGCTCCACGGCAAGTATTAGCATCGATGGAAAGCGTGTTCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCGCCGGTGCATGCGTTGGATGGTCGTGTAGTTGGACTGTACGGTTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCCTGATCACAAGCGGAGAAGTTACCGCAGAGGAAAACTTTGAGGAAGACACAG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AAGGACATAAACTGTGGAAGTTTGATCGGTGAGCGGGACAGGGCAGCGTGGTCGAAGAATATCGTGGCCACAGTTAGTACGACTCGACGAATCATCGAGCAAGAAGCTGGAAGTCAGAAGTTCACGGAAGGGTTGCGAATACTTGGGCGATACCGAGCTCCAACCGACGACGTGTTCTGGTGAGAATCACGCGACTCGTAGAGAACAACATCTCTAGAAAAGGTTAACGTTGCGAAGCAACGGGAACCCCGTAAGGAAGGACAAGGCTGTCCTTGAGTGCCAACGACGCTCCGGCCCCAGTTCCCAGAGCCAGGGTTTTAGCTCCACGGTGCTGGAAGACACCCTCGCGGCCATGGCTGCACGACGCGCGCAAGGAAGGACATGGCTGTCCTTGGGTACTAACGACACCCCGCCCCCAGTTCTCAAGGTTAGAGTTATAACCTCAGGGTGTTGGAAGACATCCAGGCCAGAGCAGGGCCATCGCAAGGGAGGATTTTCCTCGGGTACTGACCATACCCCGACCCCAGTCCGATAGGTCATGGAATGACCCCATGGTGCTGAGAGGGCATCAAAACAAGCTGAGCATCTTGGATTCTGCTCCCGTAAGGAAAGCGCAAGCTTTGAGCATTGACAACGCTCCGGCCCCAGTCCCCCAGGTTATGGGAGAATAACCCCGACGTGCTGGAAGGGCACGAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATAGAATCCAGGTGACTGACGCCACCTCCCGAAATGTGTATAGTAACAGAGCATGCCTGCAGCAGCAGGTCTCCACCGTTAGGAGACTTGTTGTGGGCAAGCTTTTGTTCACGTCT
| 95,392
|
AB701769.1
|
Culex flavivirus
|
Obara-Nagoya,M., Yamauchi,T., Watanabe,M., Hasegawa,S., Iwai-Itamochi,M., Horimoto,E., Takizawa,T., Takashima,I., Kariwa,H., Nagoya,M.
|
Department of Virology; Nakataikoyama 17-1, Imizu, Toyama 939-0363
|
Japan
|
2013-01-09
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,836
|
GenBank
| 1
|
Japan: Toyama
|
Japan
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2007
| null | null |
Culex flavivirus RNA, complete genome, strain: Toyama1849
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AGTTTTTAAAAACTTCGGCTTGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTACACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACAGTAAGAAGAAGAAGGGGCCGGGCTCCTCCGGATGGTTGTTACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGAGCACATCTCAGCTGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCACCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCCTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGTTTGGGAGTTGGCTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCATGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTACACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCTCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTCATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTGGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACACAGATCTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACTGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTCCCCACGGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTCATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATTTGGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGAGTTGCCAGCACCAACCAGAAGCTAGATTTTCTGGCGGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAGGCTATAAGGGAGAACAAAACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATTGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGGAACGTGGACGACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACGCTAAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCTGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGATTGTCACGTAAACGCGTCATTCTCGACTGATGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGCTGAGATCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGTTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAGCTGCATTGCGGAGAGGGGTATAACGTGTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTTCCCGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAATGCCGCTGTTACTTGTCGGCTGGAATCAGAGCGATTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGCAAACACCACGAAGGACTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCCGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCTGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTTTTGGTGAAAAACATCTTGGAACCTCAGCTCGTCTGGGATAATGCCATTGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTATTCTTGTCAGATCATGCTTGACAAACTGGTTAGCGGTAGTTTTAAGGATTGCCCGGGAATCAAGTCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTCGGATACGATGGAGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAAGCAACTAATGAGAGCTGCTCGGTGGGGCTGACGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAATCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACGACAATCCACGTCGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAGCATGTGGTCGACAAGTACCGGAGGTTTGGAACTGCTGGAGTGGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGCTCGCCGCTCTGGTGTTTCTTGACAAACGGATCGTGTTCTTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTCTGGAAAAGCTTGTCACAATGGCCGACCCGGGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTACGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGCGCCGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATCGTTTACGTTAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATCCCGAAGAAGGTTCATGGCGTGAAAATTGGTGACTTAACGATGCAGCTAGCCCTAGCCTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATCGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAAATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGTTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCAACAGATTACTGCCCCACGTACCTGGCCGGATCGTTTGTGAAAAATGACATAGGCGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAAGGTGAACGGAACGTGGACATTGGTCGACCTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAAGCTTATACGTTTGATTTGACGGCCTTTAATGACTCATCGCTGTTCATGCCGGCACAATACGGCGCTCCGATGTCTAAGGCAAACCACATTCCTGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTGCGCGAGGGGGTGGTACCCGGAACTCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGCGGGTCTGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCCATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAGCCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCACCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGCACATGTGGAACCTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTCGGGTGGTCTTGGATTGGATTATCGTACTCGCTTGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTACCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTACTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCGGTGGCTGGAGTGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGTTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGAATCATGGCCATTAATACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTACCTCTCTACGTGGCTGGAGTATCGGTCTTTCGATCCAATGAGGTGAATGATGTCCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCCGACGGAACATACCGGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACTAGCCACGTGGGAGCAGGCTACGCCAAAGACGGTGTGTTCAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGTGATGTTTACCGGGACATGGCTTCGTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCTCGAGGACTCAGTGGTTGTTCGTGTCGTGCAGAACGATGGGAGCGTATTGTGTGCTAGAAGCTCCACGGCAAGTATTAGCATCGATGGAAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCGGTGCACGCGTTGGATGGTCGTGTCGTTGGACTGTACGGTTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCTTGATCACAAGCGGAGAAGTCACCGCAGAGGAAAACTTTGAGGAAGACACAG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| 95,393
|
AB701770.1
|
Culex flavivirus
|
Obara-Nagoya,M., Yamauchi,T., Watanabe,M., Hasegawa,S., Iwai-Itamochi,M., Horimoto,E., Takizawa,T., Takashima,I., Kariwa,H., Nagoya,M.
|
Department of Virology; Nakataikoyama 17-1, Imizu, Toyama 939-0363
|
Japan
|
2013-01-09
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,836
|
GenBank
| 1
|
Japan: Toyama
|
Japan
|
Culex pipiens
| null |
2004
| null | null |
Culex flavivirus RNA, complete genome, strain: Toyama41
|
AGTTTTTAAAAACTTCGGCTTGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTACACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACAGTAAGAAGAAGAAGGGGCCGGGCTCCTCCGGATGGTTGTTACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGAGCACATCTCAGCCGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCACCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCCTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGTTTGGGAGTTGGCTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCATGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTACACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCTCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTCATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTGGGCGCCGTCGTCATTGATATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACACAGATCTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACTGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTCCCCACGGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTCATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATCTGGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTTACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGAGTTGCTAGCACCAACCAGAAGCTAGATTTTCTGGCGGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAGGCTATAAGGGAGAACAAAACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATTGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGGAACGTGGACTACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACGCTAAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCTGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGATTGTCACGTAAACGCGTCATTCTCGACTGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGATCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAGCTGCATTGCGGAGAGGGGTATAACGTGTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTTCCCGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAATGCCGCTGTTACTTGTCGGCTAGAATCAGAGCGATTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGCAAACACCACGAAGGACTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCCGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCCGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTTTTGGTGAAAAACATCTTGGAACCTCAGCTCGTCTGGGATAATGCCATTGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTATTCTTGTCAGATCATGCTTGACAAACTGGTTAGCGGTAGTTTTAAGGATTGCCCGGGAATCAAGTCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTCGGATACGACGGAGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAAGCAACTAATGAGAGCTGCTCGGTGGGGCTGACGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAATCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACGACAATCCACGTCGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAGCATGTGGTTGACAAGTACCGGAGGTTTGGAACTGCTGGAGTGGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGCTCGCCGCTCTGGTGTTTCTTGACAAACGGATTGTGTTCTTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTCTGGAAAAGCTTGTCACAATGGCCGACCCGGGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTACGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGCGCCGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATCGTTTACGTTAACACTTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTGAAAATTGGTGACTTAACGATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATCGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAAATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGTTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCAACAGATTACTGCCCCACGTACCTGGCCGGATCGTTTGTGAAAAATGACATAGGCGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAAGGTGAACGGAACGTGGACATTGGTCGACCTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAAGCTTATACGTTTGATTTGACGGCCTTTAATGACTCATCGCTGTTCATGCCGGCACAATACGGCGCTCCGATGTCTAAGGCAAACCACATTCCTGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTGCGCGAGGGGGTGGTACCCGGAACTCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGCGGGTCTGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCCATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAGCCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCACCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGCACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTCGGGTGGTCTTGGATTGGATTATCGTACTCGCTTGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTACCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTACTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCGGTGGCTGGAGTGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGCTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGAATCATGGCCATTAATACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTACCTCTCTACGTGGCTGGAGTATCGGTCTTTCGATCCAATGAGGTGAATGATGTCCTCATCACCCCTCCGGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCCGACGGAACATACCGGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGCTACGCCAAAGACGGTGTGTTCAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGTGATGTTTACCGGGATATGGCTTCGTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCTCGAGGACTCAGTGGTTGTTCGTGTCGTGCAGAACGATGGGAGCGTGTTGTGTGCTAGAAGCTCCACGGCAAGTATTAGCATCGATGGAAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCGGTGCACGCGTTGGATGGTCGTGTCGTTGGACTGTACGGTTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCTTGATCACAAGCGGAGAAGTCACCGCAGAGGAAAACTTTGAGGAAGACACAG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AAGGACATAAACTGTGGAAGTTTGATTGGTGAGCGGGACAGGGCAGCGTGGTCGAAGAATATCGTGGCCACAGTTAGTACAACTCGACGAATCATCGAGCAAGAAGCTGGAAGTCAGAAGTTCACGGAAGGGTTGCGGATACTTGGGCGATACCGAGCTCCAACCGACGACGTGTTCTGGTGAGAATCACGCAACTCGTAGAGAACAACATCTCTAGAAAAGGTTAACGTTGCGAAGCAACGGGAACCCCGTAAGGAAGGACAAGGCTGTCCTTGAGTACTAACGACACTCCGGCCCCAGTTCCCAGAGCCAGGGTTTAGCTCCACGGTGCTGGAAGACACCCTCGCAGCCATGGCTGCACGACGCGCGCAAGGAAGGACATGGCTGTCCTTGGGTACTAACGACACCCCGCCCCCAGTTCTCAAGGTTAGAGTTATAACCTCAGGGTGTTGGAAGACATCCAGGCCATAGTAGGGCCATCGCAAGGGAGGATTTTCCTCGGGTACTGACCATACCCCGACCCCAGTCCGATAGGTCATGGAATGACCCCATGGTGCTGAGAGGGCATCCAAACAAGCTGAGCATCTTGGATTCTGCTCCCGTAAGGAAAGCGTAAGCTTTGAGCATTGACAACGCTCCGGCCCCAGTCCCCCAGGTTATGGGAGAATAACCCCGACGTGCTGGAAGGGCACGAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATAGAATCCAGGTGACTGACGCCACCTCCCGAAATGTGTATAGTAACAGAGCATGCCTGCAGCAGCAGGTCTCCACCGTTAGGAGACTTGTTGTGGGCAAGCTTTTGTTCACGTCT
| 95,394
|
AB701771.1
|
Culex flavivirus
|
Obara-Nagoya,M., Yamauchi,T., Watanabe,M., Hasegawa,S., Iwai-Itamochi,M., Horimoto,E., Takizawa,T., Takashima,I., Kariwa,H., Nagoya,M.
|
Department of Virology; Nakataikoyama 17-1, Imizu, Toyama 939-0363
|
Japan
|
2013-01-09
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| 1
|
Japan: Toyama
|
Japan
|
Culex pipiens
| null |
2004
| null | null |
Culex flavivirus RNA, complete genome, strain: Toyama75
|
AGTTTTTAAAAACTTCGGCTTGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTACACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCGGGCTCCTCCGGATGGTTGCAACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGAGCACATCTCAGCTGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCACCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCTTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGTTTGGGAATTGGCTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCCCTTGAGGCTAGACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTCATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTTGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACACAGATCTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACTGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTCCCCACAGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTTATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATCTGGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGAGTTGCCAGCACCAACCAGAAGCTAGATTTTCTAGCGGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAAGCTATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATTGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGGAACGTGGACTACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACACTGAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGATTGTCACGTAAACGCGTCATTCTCGACTGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGGTCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACCGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAACTGCATTGCGGAGAGGGATATAACGTGTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTCCCCGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAACGCCGCTGTTACTTGCCGGCTAGAATCAGAGCGACTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGTAAACACCACGAAGGATTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCCGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCTGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTCTTAGTGAAAAACATCTTGGAACCTCAGCTCGTATGGGATAATGCCATTGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTTTCTTGTCAGATCATGCTTGACAAGCTGGTTAGCGGTAGTTTCAAGGATTGCCCGGGGATCAAGTCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTCGGATACGACGGTGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAGGCAACTAATGAGAGCTGCTCGGTGGGGCTGGCGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAACCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACAACAATCCACGTTGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGCGAATGGCCAAGCATGTGGTTGACAAGTACCGGAGGTTTGGAACTGCTGGAGTTGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGCTGGCCGCTCTGGTGTTTCTTGACAAACGGATTGTGTTCCTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTGTGGAAAAGCCTGTCGCAATGGCCGACCCGTGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTACGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGCGCAGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATTGTTTACGTTAACACCTCGTTGTCTTTTGACAGGACCTTTCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTGAAAATTGGTGACCTGACGATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATTGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAGATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGCTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCCGGATCGTTTGTTAAAAATGACATAGGTGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAAGGTGAACGGAACGTGGACATTGGTCGACTTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAGGCTTATACGTTTGATTTGACGGCCTTTAATGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCACAGTACGGCGCTCCGATGTCTAAAGCAAACCACATTCCCGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTACGCGAGGGGGTGGTCCCCGGGACTCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGTGGGTCTGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAACCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCACCTGCTGACAATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGTACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTTGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTTGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGCTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTGCTGATCGGGATAGTCACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAATGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGCTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGAATCATGGCCATGAACACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTACCTCTTTACGTGGCTGGAGTATCGGTCTTTCGATCTAATGAGGTGAATGATGTCCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCCGATGGAACATACCAGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGGGCAGGTTACGCCAAAGACGGTGTGTTTAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGCGATGTTTACCGGGACATGGCTTCGTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCCCGAGAGCTCAGTGGTTGTTCGTGTCGTGCAGAACGATGGGAGCGTGTTGTGTGCTAGAAGCTCCACGGCAAGTATTAGCATCGATGGAAAGCGTGTTCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCGCCGGTGCATGCGTTGGATGGTCGTGTAGTTGGACTGTACGGTTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCCTGATCACAAGCGGAGAAGTTACCGCAGAGGAAAACTTTGAGGAAGACACAG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AAGGACATAAACTGTGGAAGTTTGATCGGTGAGCGGGACAGGGCAGCGTGGTCGAAGAATATCGTGGCCACAGTTAGTACGACTCGACGAATCATCGAGCAAGAAGCTGGAAGTCAGAAGTTCACGGAAGGGTTGCGAATACTTGGGCGATACCGAGCTCCAACCGACGACGTGTTCTGGTGAGAATCACGCGACTCGTAGAGAACAACATCTCTAGAAAAGGTTAACGTTGCGAAGCAACGGGAACCCCGTAAGGAAGGACAAGGCTGTCCTTGAGTGCCAACGACGCTCCGGCCCCAGTTCCCAGAGCCAGGGTTTTAGCTCCACGGTGCTGGAAGACACCCTCGCGGCCATGGCTGCACGACGCGCGCAAGGAAGGACATGGCTGTCCTTGGGTACTAACGACACCCCGCCCCCAGTTCTCAAGGTTAGAGTTATAACCTCAGGGTGTTGGAAGACATCCAGGCCAGAGCAGGGCCATCGCAAGGGAGGATTTTCCTCGGGTACTGACCATACCCCGACCCCAGTCCGATAGGTCATGGAATGACCCCATGGTGCTGAGAGGGCATCAAAACAAGCTGAGCATCTTGGATTCTGCTCCCGTAAGGAAAGCGCAAGCTTTGAGCATTGACAACGCTCCGGCCCCAGTCCCCCAGGTTATGGGAGAATAACCCCGACGTGCTGGAAGGGCACGAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATAGAATCCAGGTGACTGACGCCACCTCCCGAAATGTGTATAGTAACAGAGCATGCCTGCAGCAGCAGGTCTCCACCGTTAGGAGACTTGTTGTGGGCAAGCTTTTGTTCACGTCT
| 95,395
|
AB701772.1
|
Culex flavivirus
|
Obara-Nagoya,M., Yamauchi,T., Watanabe,M., Hasegawa,S., Iwai-Itamochi,M., Horimoto,E., Takizawa,T., Takashima,I., Kariwa,H., Nagoya,M.
|
Department of Virology; Nakataikoyama 17-1, Imizu, Toyama 939-0363
|
Japan
|
2013-01-09
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| 1
|
Japan: Toyama
|
Japan
|
Culex pipiens
| null |
2005
| null | null |
Culex flavivirus RNA, complete genome, strain: Toyama740
|
AGTTTTTAAAAACTTCGGCTTGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTACACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCGGGCTCCTCCGGATGGTTGCTACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGAGCACATCTCAGCTGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCACCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCCTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGTTTGGGAATTGGCTGGGGAGCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTACACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCTCTTGAGGCTAAACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTTATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTTGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACACAGATCTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACTGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTCCCCACAGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTTATGAAGAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATCTGGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACAGAATTTACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGAGTTGCCAGCACCAACCAGAAGCTAGATTTTCTAGCGGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAAGCTATAAGGGAGAATAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTATGCGTGGCTATTGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGGAACGTGGACTACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACACTAAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAATGGACTTCTCGAGTTTCGCACCGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGATTGTCACGTAAACGCGTCATTCTCGACGGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGATCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACTGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAACTGCATTGCGGAGAGGGGTATAACGTGTCGTCAATCGCTAGGTCATCTATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTTCCCGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAATGCCGCTGTAACTTGCCGGCTAGAATCAGAGCGATTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGCAAACACCACGAAGGATTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCCGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCTGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTTTTAGTGAAAAACATCTTGGAACCTCAGCTCGTATGGGATAATGCCATCGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTTTCTTGTCAGATCATGCTTGACAAACTGGTTAGCGGTAGTTTTAAGGATTGCCCGGGGATCAAGTCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTCGGATACGACGGAGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAAGCAACTAATGAGAGCTGCTCGGTGGGGCTGACGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAATCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACGACAATCCACGTTGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGAGAATGGCCAAGCATGTGGTTGACAAATACCGGAGGTTTGGAACTGCTGGAGTTGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGTAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGCTGGCTGCTCTGGTGTTTCTTGACAAACGGATTGTGTTCTTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTGTGGAAAAGCTTGTCACAATGGCCGACCCGGGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTCTCGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGCGCCGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATTGTTTACGTTAACACCTCGTTGTCTTTTGACAGGACTTTTCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTTAAAATTGGTGACCTAACGATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATAGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAGATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGCTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCAACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCCGGATCGTTTGTAAAAAATGACATAGGCGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAAGGTGAACGGAACGTGGACATTGGTCGACCTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAAGCTTATACGTTTGATTTGACGGCCTTTAATGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCACAATACGGCGCTCCGATGTCTAAAGCAAACCACATTCCTGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTTCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTGCGCGAGGGGGTGGTCCCCGGAACTCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGCGGGTCCGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTCAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCCATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAACCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCACCTGCTGACCATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGCACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTCGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTAGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTACCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGTTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTGCTGATCGGGATAGTGACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGCTTCCGGTAGCTGGAATGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGCTGGTTTACATCGGCTGCATGGGAATCATGGCCATGAATACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGTTACCTCTTTACGTGGCTGGAGTATCGGTCTTTCGATCTAATGAGGTGAATGATGTCCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCCGACGGAACATACCGGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGAGCAGGCTACGCCAAAGACGGTGTGTTCAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGCGATGTTTACCGGGACATGGCTTCGTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCCCGAGAGCTCAGTGGTTGTGCGTGTCGTGCAGAACGATGGCAGCGTTTTGTGTGCTAGAAGCTCCACGGCAAGTATTAGCATCGATGGAAAGCGTGTCCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCTCCGGTGCATGCGTTGGATGGTCGTGTCGTTGGACTGTACGGTTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCTTGATCACAAGCGGAGAAGTCACCGCAGAGGAAAACTTTGAGGAAGACACAG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| 95,396
|
AB701773.1
|
Culex flavivirus
|
Obara-Nagoya,M., Yamauchi,T., Watanabe,M., Hasegawa,S., Iwai-Itamochi,M., Horimoto,E., Takizawa,T., Takashima,I., Kariwa,H., Nagoya,M.
|
Department of Virology; Nakataikoyama 17-1, Imizu, Toyama 939-0363
|
Japan
|
2013-01-09
| null |
Culex flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| 1
|
Japan: Toyama
|
Japan
|
Culex pipiens
| null |
2005
| null | null |
Culex flavivirus RNA, complete genome, strain: Toyama791
|
AGTTTTTAAAAACTTCGGCTTGGTTACACCGCAGATTGGTTACACCTACACAAGGCTTGAGTTGTTTATAATAGTCGTTTTTCTCGCAGAAATGGGAAAGGACGACGGTAAGAAGAAGAAGGGGCCGGGCTCCTCCGGATGGTTGCAACCACCGGGGCGCGCTGGCTTAGGAAGGAAGGAGGAGAAAAAGAAGAAGGAGAAGAGGAGTGTGCGGAGCACATCTCAGCTGGTCTCCGGCGGTGCGCAGCACCGCCGCGGAGGCGGAACAGGTCTTAGGGCCGGAGGTCTACTAGGACGTTTGGGAATTGGCTGGGGATCGATTCTCCAGGAGGACATTGTGCAGGCACTCATGCACTTAGTGCTGGTGCTGCACTCTGTTTTCATCGCAATTGATCGACGCTTGCGCTCACTGACACGGCGCGTGACTGCCCTTGAGGCTAGACGCTCTGCGAAGAACGCTGTACGGATCGCATTCATGCTCACTGGCGTGATGATGGTGCTTGGCGCCGTCGTCATTGACATGCAGGTCTCCACGGTGAAAGGGACACAGATCTTCGAGGGGAAGACCAATCGCACTGATCATGTGCACTTGTTCAAGCTCCCCACAGATGGCTGCTGGAGTGGCACATTGGTTATGAAAAAGTGTCCCAAGGTTGCTGATCTTGCGAAGGATCTGGAAGGAGTGGATTGTGGTTCATCATGGACGGAATTCACTTTGCGCTACCATCGATGCGTGCCAAAGAAGCGTGAACGACGAGTTGCCAGCACCAACCAGAAGCTAGATTTTCTAGCAGAGGTGGAACTGGTGACGTTCAAAGCTATAAGGGAGAACAAGACCATCGCTATCATCGTCTTGTTGTGCGTGGCTATTGCGAAGAGATGGCCGATGTGGGTGGTGATACTACTCGCAATTGGAACGTGGACTACGGTGAAGGGAGAATTTGTTGAACCATTGTACACACTGAAAGCGGAAAAGATGACCATGTTGCAGACAATAATGCGACCAGACGAAAGCTACGTGATTTCCACGCCGAACGGACTTCTTGAGTTTCGCACCGGAGCAGCCGAGATATATGGCGGCCAATGGATGCGTGAATTGCTCGCTGATTGTCACGTAAACGCGTCATTCTCGACTGACGTGTGTCCTGGAGGATCTCAGCTGAACATGGGTGAGGTCAATGGTAAAGAACGTGTTTGCTCAACCCAGCCCTACAATCGTGGATGGGGAACCGGATGCTTCAAGTGGGGAATCGGGTTTGTTGCCACGTGTGTTGAACTGCATTGCGGAGAGGGATATAACGTGTCGTCAATCGCTAGGTCATCCATCGTGATGAACATCACAGCGAAATTCCACTCAGTGGATGACGTCCAGCAACTCATTAGTGATGTCCCCGTGACTTTTCGATTTGCAAAGCTGGGCAACGCCGCTGTTACTTGCCGGCTAGAATCAGAGCGACTGCTTCTTGACTACTATCACGTGACAGGTAAACACCACGAAGGATTGTTTGTGCGGTCTCAAATCGATGAGTGGCCCGGAGCGCACGCCACTGCTAGTGGAAGGGCTGGTTTGGAACGGATTGTGGTCTGGGGAGACGCCAGGGCTAATGAAGTCTTAGTGAAAAACATCTTGGAACCTCAGCTCGTATGGGATAATGCCATTGCCACGCAGGACGGTTTTCGTGATGTTGGCTTTTCTTGTCAGATCATGCTTGACAAGCTGGTTAGCGGTAGTTTCAAGGATTGCCCGGGGATCAAGTCTTCAGTCTTCGTCCAAAGCGGTTTCGGATACGACGGTGTGGTGATGACAAGCTTGTCCAAGGCAACTAATGAGAGCTGCTCGGTGGGGCTGGCGTGCCACGGATGCTACCTCCTCGCGACGAAGATGGTGTTCGGACCTGGAACTTCGACCGCAAGGGCATTTGTTGGGTGTGGGAACCACACCGGAACCCTTGTGGTTGGAGGAACAACAATCCACGTTGAGTGTGTGTTGAACCCGATTTCGCAAGGTTGGCGAATGGCCAAGCATGTGGTTGACAAGTACCGGAGGTTTGGAACTGCTGGAGTTGGAGGCGTGTGGCATGACTTTGTTGGAAAGTTTTCATTGTTCAGCCTGTTGTCCAGCTCGACGATTCTCGTCGGGCTGGCCGCTCTGGTGTTTCTTGACAAACGGATTGTGTTCCTGCTACTTTTGTGCGGATACTTTGTCTACACCAAGGCAGATGTGGGTTGCGGATTTGACCCTGAGAGAAAGGTTGTGTCCTGCGGATCAGGAGGGTTCGTGTGGAAAAGCCTGTCGCAATGGCCGACCCGTGAACATTCAGTTGAACTCGATGACCAACACTTGATCACGGCTCTTGTTACGGAACAGTTGAAGAAGACGAACAAGGTGTGTATCATTTGTGAGGATGTCTTGCAATGCGCAGCCGCTCGTAGTGCTGTTGGGGAGATTACCCACGTTGACAATGAGATTGTTTACGTTAACACCTCGTTGTCTTTTGACAGGACCTTTCCTCGAATTCCGAAGAAGGTTCATGGCGTGAAAATTGGTGACCTGACGATGCAGCTAGCCCTAGCTTCAGTTGGGGGAGCGGTTGATGCCAGCCAATATGGTGAGTTGAGCAGTGGGTTCTTGAGCCGCACCAAGATTGCGGAAACCAGTGAACACAAGGTCATCCGTGTGATAACAAGTGCCTCTCCATACGAGAAGATATGTGAGCAGGCGTTCGCGCTGCAGTACGGCTTCGTCCGGTTCACCCGCAGGGTGTTCGGTTCAAATGTTGTGGTCAAGCCCGTGGCAAAACCGACAGATTACTGCCCCACGTACCTAGCCGGATCGTTTGTTAAAAATGACATAGGTGCGTACACCGATGGGATGATGTGGATGAAGAGCAGGAAGGTGAACGGAACGTGGACATTGGTCGACTTGGAACTGACGCAGAGCCATCAATGCATTTGGCCCCAGGCTTATACGTTTGATTTGACGGCCTTTAATGACTCGTCGCTGTTCATGCCGGCACAGTACGGCGCTCCGATGTCTAAAGCAAACCACATTCCCGGGTACAAGACGCAAACAGAGTTCCCTTGGTACAAAGCTGATATCGTGTTACGCGAGGGGGTGGTCCCCGGGACTCAGGTTGAAGAGAGCCCATCTTGTGACAACCGTGGGTCTGCTGTGAAAGTTGACCCTGCCATTGCCAAGAAGTGGTGTTGCAAGACGTGCTTCTCAGCTGACAAGCGGGTATTTCACTTTAAGGTCGACAACGATTACTTCTACCCAATGGAGATTCGACCAGCGGCTGTTCAACCAGAGGTGACCATTGACGCTGACGGCGAAGACATGGACGAGATGACATCAATGTTCGGGACAATGAAGGCAGTCGTGCCGCCAGTGGAAGGGTCCTATCCGGATTTCCGGCTCAGCCCATCTGTGGAGGGAGTTTCTCCCCTACTGGTGGGCGCGCTTTTGCACCTGCTGACAATTCGAACCAAACATCGGTGGGCTCAACGTACATGTGGAACTTGGATTTTGTTCCTCCTGTTTGGAGTGCCATCCAACACCTATGTTGGGTGGTCTTGGATTGGATTGTCGTACTCGCTTGCTGCTGTTCCGAATGGTACGGCTCTGTTGGTGCATTTCTGGCTGGCAGTTCAGTTCTCATCATCGCACTTGTTCTTTTTGGGATGGGCGCTACGGCAACGTGTACGATCATCAGTTGGATACGCATTGACCGTGTTCTTCGCCGAGTGGCTTCTCTTGAAGTTACGGCAGCTGTGGGAATCGACATACCTCCTCGACCACGTGCTGTTCCCGATGTACGTGATGTTGGCGTTCAATCTGAAATCACAGTTCGTGCCTGTGGACTCGATGGTACTGCTGAACTATGTTGTGACGCATCCTGCAGTTGCGACGGCCATGGTAACAGGAGGTGCCCTGGTGATTTATTCCATTCGCGTGTACAAGAGCTGGGGATGCTCTCCGAACTTGTGGAGGAGTGGACTTCGCGCTTCGAGGCGCTCATTAGTGGCTGGAATGTGCTTGGCGGGGTTGTACGTGCTCTCAACGTGTCTCGAGCTGTATCAGATGCCGACGACGGCATCGGTGGTGTTCCTAGGAGGACTGCTGATCGGGATAGTCACCAGGATGGCTCCTCCAGCGCACTTGGAGTTGGTTCCAGTGGCTGGAATGGGAGTGCCGTTGGATTGCGAGGAAGAGCCCACAACACTTCCGTCTGGATTAGAAGGAACTTACGGACCGGATGGAGTGGAATTCACGAACTTGACGGACAACAGTAGAGTGTCAACGGGGTTGCTGGTTTACGTCGGCTGCATGGGAATCATGGCCATGAACACCTACGTCGGGGTCATCCTGATGTGTGCTTGTTGGTGGACAAACGCGCCCGAGTGGCTACCTCTTTACGTGGCTGGAGTATCGGTCTTTCGATCTAATGAGGTGAATGATGTCCTCATCACCCCTCCAGAGTATGAGCAGGAAGCACAGCTAAGCAACGACTTCGGGCACCTGCCCGATGGAACATACCAGGTGGTTGCTCGCTCGCTGTTCATGACCAGCCACGTGGGGGCAGGTTACGCCAAAGACGGTGTGTTTAACACGCTTTGGCATGTGACATCTGGTGGAAGCCTCACATGGCAAGGGAGAAACGTGCGCCTACACTCTGGCGATGTTTACCGGGACATGGCTTCGTATGGCGGATCGTGGAACATTGCTGATTCCCCCGAGAGCTCAGTGGTTGTTCGTGTCGTGCAGAACGATGGGAGCGTGTTGTGTGCTAGAAGCTCCACGGCAAGTATTAGCATCGATGGAAAGCGTGTTCAGGTCATTGGCCATGACTATGGAAAAGGATCGTCAGGATCGCCGGTGCATGCGTTGGATGGTCGTGTAGTTGGACTGTACGGTTATGGATTTTTCATTGGATGGAAGTACCACTCCCTGATCACAAGCGGAGAAGTTACCGCAGAGGAAAACTTTGAGGAAGACACAG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| 95,397
|
MF176245.1
|
Culex mononega-like virus 1
|
Shi,M., Neville,P., Nicholson,J., Eden,J.S., Imrie,A., Holmes,E.C., Eden,J.-S.
|
The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
|
Australia
|
2017-06-20
| null |
Culex mononega-like virus 1
| null | null |
ssRNA(-)
| 7,130
|
GenBank
| 1
|
Australia: Point Douro
|
Australia
|
Culex globocoxitus
| null |
2015-09-07
| null | null |
Culex mononega-like virus 1 strain mos172gb79286 segment 1, complete sequence
|
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|
Culex mononega-like virus 1
|
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The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
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2017-06-20
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Culex mononega-like virus 1
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Culex globocoxitus
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Culex mononega-like virus 1 strain mos172gb79286 segment 2, complete sequence
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|
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|
Culex mononega-like virus 1
|
Shi,M., Neville,P., Nicholson,J., Eden,J.S., Imrie,A., Holmes,E.C., Eden,J.-S.
|
The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
|
Australia
|
2017-06-20
| null |
Culex mononega-like virus 1
| null | null |
ssRNA(-)
| 7,137
|
GenBank
| 1
|
Australia: Siesta Park
|
Australia
|
Culex globocoxitus
| null |
2015-09-15
| null | null |
Culex mononega-like virus 1 strain mos191gb14102 segment 1, complete sequence
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Culex mononega-like virus 1
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The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
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Australia
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2017-06-20
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Culex mononega-like virus 1
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|
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|
Culex mononega-like virus 1
|
Shi,M., Neville,P., Nicholson,J., Eden,J.S., Imrie,A., Holmes,E.C., Eden,J.-S.
|
The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
|
Australia
|
2017-06-20
| null |
Culex mononega-like virus 1
| null | null |
ssRNA(-)
| 7,123
|
GenBank
| 1
|
Australia: Siesta Park
|
Australia
|
Culex australicus
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The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
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2017-06-20
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|
The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
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Culex mononega-like virus 1
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Culex mononega-like virus 1
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Shi,M., Neville,P., Nicholson,J., Eden,J.S., Imrie,A., Holmes,E.C., Eden,J.-S.
|
The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
|
Australia
|
2017-06-20
| null |
Culex mononega-like virus 1
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|
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| 1
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Australia
|
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The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
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| 76,108
|
NC_075303.1
|
Culex mononega-like virus 2
|
Shi,M., Neville,P., Nicholson,J., Eden,J.S., Imrie,A., Holmes,E.C., Eden,J.-S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
| null |
Doupovirus australiaense
|
Doupovirus
|
Xinmoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,259
|
RefSeq
| 1
|
Australia: Point Douro
|
Australia
|
Culex australicus
| null |
2015-09-07
| null |
PRJNA485481
|
Culex mononega-like virus 2 strain mos172X59831, complete genome
|
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| 332
|
NC_035133.1
|
Culex mononega-like virus 2
|
Shi,M., Neville,P., Nicholson,J., Eden,J.S., Imrie,A., Holmes,E.C., Eden,J.-S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2017-06-27
| null |
Doupovirus australiaense
|
Doupovirus
|
Xinmoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,297
|
RefSeq
| 1
|
Australia: Siesta Park
|
Australia
|
Culex globocoxitus
| null |
2015-09-15
| null |
PRJNA485481
|
Culex mononega-like virus 2 strain mos191gb23464, complete genome
|
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| 4,349
|
MF176247.1
|
Culex mononega-like virus 2
|
Shi,M., Neville,P., Nicholson,J., Eden,J.S., Imrie,A., Holmes,E.C., Eden,J.-S.
|
The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
|
Australia
|
2017-06-20
| null |
Doupovirus australiaense
|
Doupovirus
|
Xinmoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,283
|
GenBank
| 1
|
Australia: Point Douro
|
Australia
|
Culex globocoxitus
| null |
2015-09-07
| null | null |
Culex mononega-like virus 2 strain mos172gb89800, complete genome
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AAAAAACAAAAGTTTTTTTAGTTTTGAACTCGGAACCAGGTACGCGGTGGCGAAACCTAGTCCTTGTAATGCGGGACTTCGGTGATGAGTGATCCTCTAGCGAACCACTTGTAATAAAAACCGACTAGTTAGAGGTCACAAAAACCGTTGAAGATGGACAACACTGTATCGGCGCTTCGCACTCTCTCGCTTGTCCAGGTTGAGAATGCCCGGATTGTAACCCCCGGCATCAGGCATAATGAACGAGCCACGACCGGGCTTGTCATGGACCCGAACGGAGTCGAACCCCTACCGATCTTGTACTGGAGGACATTCGAGGAAGCTGAAGAAGTCTTCTACATGACAGACTACGGTAAGCAATCGGCCAAGAACTTTGCCAACCCGTCTGTGCATCGGATGGAGGTTGCTCAACCTATTCACACCGAGTACCGCATGGTGACCCCATACAGAATGGGACTTGCCACATCTCTGCGATTGAAGTGGGAAACCTGCGGTTACGAATCTCGAGGGGCATACCGTACATACACAACTGTTGATGGAATCGAACGCTTCCAAATCAATCTGTTCTGCATCCCACTCATGCGAATTCCGGGTTTTTTCGAAAACCTCCGAGAATACCAGGAGCACCCAGATGAGGGTATCCAGATTTCTGATGGATCTTACATTCTCGGGGACCTCAAGAATCGCGCAGTCACGGAGGATGACATCCAGAATGTGCTGGATTACAATGAAGAACATCCCGAGAAGCCGCAAAGGATCCCTACGCTCGGAGCCCTCATGGACTTCAGGGAAAGGAGATTCCTGAATGACATCGACAACCAGTGGGACAAGGCAATTCACGATGTAGAGGTGCCTGCCGACGCCTTGATGAAGACTGAGAACGAGTGGGAGTACACTGCTTTCTTGAACGTCTACTCCTTCACGAAGATGGCAAGCGGTGACACTGAAGTGACTCGGAACAGTCGCTACAAAGCGAACCTGGCGCGCCGCTTGAACGCCTTGAAAGCTCTCAAGTCAGATCGGGACTTGAATGTTGATGACTTCATCAACACTAAAATCACATTGACACACTTGATGCGACACTTCGATGATATGTCGTATTATCCACGGTTGAAGTGTACCATCCTAAAGACCTTGATGAACTCCCAGGATCCTTTGTGCGCCAACCTCAAGATGCTTCTGAGCGAGCACCAAATGACTGTCTTTTGTGCGATTGCAGCCTTCATCGCCACAAAAGAGCTGAGTGTCCTTCACATTCTTCACGAAGTCTCCTGCCACTACGGGCAGTTCGTACGCACAATCGAAGGTCTCAAGAAGAAGTTCGGTACAGAAGGTTGGAGATATGTCAAGCTGCTAGACCCGCTGAATCAGGTCACCTCCGGGCAGATCTACGCTGAGCTCGGAACGGCTGCACGAGCCTGGATTGCAGTCCAGCCTGGGCATGAGAGCTTCGGGAACCTGGTGAACAAGGGTAAGATCCCTGCCAGGTACAAGATTTACGCTTCGCGTCCAGTTCCCCCAGACTGCCTAGAGGAGGGAGTTAACATGATGAATGTGGTACGAGACAATTTGGAGCGGATTGGTTTCACCATCAAGCTGGAGCAATTCACCCAAGCAAAATGGGCAGAATTGGTTGTGACAACTGCAGAGCAGCGCGCAGCAGTCGGGAACCGAGTGTAAGGATCGATGAGGAAGATCCTGGGAATTAGTCTTAGAAAAACCCGATAGTTACTAGTCAAGCAATCATGAACTATATAACGCCGACGATTTTGGTTGCCGTCATTGTGATCGCCCATACAGTGGCCATTCGGTCACTGTCTTACGACATGACGGACAGGGTGCCTGTGATCGCCCTCATCAATGACCACGCTTCGTGGTTCATGAAATTGACCGTCAGCCCGGTGACGATCAATTTTTACGCGACGCTGACCTCCTTCTTCGCCACCTTAGCCCTGATGGGTGTGGTGGCTAAAAATTGGCGGGCGTATGTCCGGGACATACAACGAGGGGTGGTGAGGGCGGAGGTGTTGATGAGATCAGCGTGACTGCGCTGGTCTGCTTCTAGTTTCTCCCTGAGAGAGTTAATCTGTGGAACCCGGGATTTCCTGAGGCGTGCACACGACAGTGTTGTGCAGCTTACGTCTTGCATAAGATGCTGTCGTGCTTATTTTGAGCGAATGAAACTCCTCAATTCTGCCGAAGAAGGGGGATCCTAGGTTTCAACTAGTTACTCTCTCAGAGGAATAGTTTGGTTTATTTGTTAGTTTCATTGTTTTTATATACATGTTTATATGTGTGTTTGTTTGTTACATATATTTTATTTTATATATATGCACATGTTTTTTTGATGTTGGTCAGGTTTGGCAATTCGGAGCTCTATACACTCATCTTCCATGATTCTAAATTCTCTGTAGAAATTCACATATACGTGTGTATATATGTATATTTTGATACTGAACTGCTCTACAAGGAGTTTATCACAAATTGAGAAGTGGTATCCTTTTTTTAGAAAAACCCGCTAGTTACTATTCAAATCAAAATGCCTGAGTTAATCCGATTCAAAGCAATGCTGTTGTCGAAGAAGGGCAACCGTTGCAGGTTCCCCCGTGCTGTTATGAAGAAAACCGAATTTACTGAGTCTGAGGCTTTGTCCATTTGGTGTATCAGTCAACTCCTGAACTACTGTGCGTGTTGGTCTCTGACGGAAGGGATATACGCCTTGACTGGCATCAAGATCGATAGTGGAGCCTGCAGTCCGGCAGCTTGGCATTCTCTGAGTTGTTATCCAGAGTCTGTTTCAACAGAGTTCCTCTCTCTTGTTAGATGCGTCGGTTCATGCGGAGACCCACAGAAATACATGTCCCTCTTCCATGGGGATTGGCGTCACACTTCCACAAGCACATTGACTACATTCACTGTCGCCCAGCTGGCAGATGTCTTGGATTATGTCTTTGCAACTGATGGTACAAGGCGTGAACATCACCTCTTGGAGATAGCGAAGATGGAAGAGCTCCAGCACTTCAAAATCCCCGAGCTCTTACAGTGTTTACACCGGAAGGGTCAGTCCCATGTTGTCACCGAGCTATGCCGTCATGGGAATCATCGGAACGCTACACCTCCACGCAGTTCCATTTCTCCCGCTGGTAGTATAAAATCCGGGTATTCCCCGTTGGTTGAGGATGAGTTCCCCGCAATGAAAGATATACCAGGTATGAGTGACAGGACGAGGACCCGGTTCACACTGACTGAAGAGGAGGCGATACAGATTGAGAAGGAAGAACGATCAAAGGCTCAACCTCCCTCTCTACTCGACAGTTATATGCGAGCGACAACGCTAACATTCCTGAGCGAAAGTGGTGTCCTCTCCCTATTGAACCGGTACAACAGTGAGTGGGAAAGGGAAGTCGCAGAGATGAGTGAGAATGAGCGACACGGGACAATGACCTACATGTGCACAACAATGATCCTGGAGCAACTCCAAGGAGAGAGCTACGACAAGGAACGGGTCCAAATAGTCTGGCCAGCAAGAAAGTGTGCTGTTCAGACAATAACTGACAGTATCGCTCGCCGACTTTGCATGGAACAGACCGCCACTACCACAATAGTGGAGACTTACCGGATGGTCAAGACTCTCTACAACAAGGCTATTTCAGAAGGGAAGGTTCTGTCTGAAATTCATGGAGGTGAAATGATCACTGATCCGGACGAGAATGAACCACCTGGTAAGTCCGCTGGCCAAGACCCGCCGGTGCCTGGCACGACCAAGACCGGTCAATCATCTCAAGTGCCCGAGCAGTTGTACCGGACTCGTCCACCCTACAAAAAGGGATTTTCAATCGCCCAAGTTGGTGATCACTTTGTGTACCATAAAGAGTGAACAAGAACTTTCGACTGTATATATATTTAGAAAAACCCGTTAGTTACCCATCAAAGTCATTGCTATCTTCTTAACCCGGTTGCTGTGTTAGCTTTGTACAAATTGTAACGAGCTCTCGAATACTGTACAGAACACAGGTACATAAATATATATATACACCCATACATAAATATTTTTCCAGCACACTTCGAACCTAATTACTTCTTTCACTTTCAACTTTTAATTTTGATTTTAATTTTTGATTTTTAATTTTAAGCTTAATTTTAACTTTAACTTTAATTTTAGCTTTAATTCCAATTTTAATTTCAATCTTCCACCTTAACTCTAGCTCTGATCACTATATCTCTGTCGTGCTTTTGTTGTCTGCTTCCAGCCTCACTGTCCTTCTAGGAAAGATTTCTCCCGGGCTATAAACAAATCAATCACCCCATTTCCAATCTCCTAGATGAAGATGGAGGTGCATCTGTTAGTATTCCTGTCATTCGTAGCCTTAAGTGCTGGTTTCATCGCGTACGACTGTAATGGCTCCAGAATCCAGAAAACAACTGTCTCTCTGGTGGAGACTCCCTCCTGTACATTTGAATTGGAGAATGTTACAGAGAGTGAGGTAGCTGTGGCGGTCACCCAATCTGCCTTGACTCAGGAGATACCGTTTTACCGTTGTCTCATTGTGGCATACCACCACATCTGGAGATGTGGTTCGGTCATTGATACCAATGTCCAAGGAGGAGATTATGCCGAGGTAATCAGAACAACCAAGTCAGAATGCGAAGAAATGATCAATCATAAAAAGTATAAAACTATCGGAGGTAACAGCGTCAGTATTGACCTACCACCGGGAGGAAGAACATCTTTCTCATATACCAGCTGGGGTCAAGTGAAAGATTCAGGGAGCTGTGTGGCCGGTCCGATCTTATACTCCGGAGGCACAAGTTATGATCAACACACAAGAAATACCCGGCTTGAGATCCTTTACACCCGTGGAGTCGGAAGAGTCGCTGTGGAAAAGAAGAGCCTTATCATGCCAAATGGGATGCAATGTAATGTTGCCTTGGAAGAGTGTGAGTTAGCGGACTACGGGCAGGTGTTCTGGAAACAACCTGTCCCAAGTTGTCAGAACGAG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| 76,077
|
MF176268.1
|
Culex mononega-like virus 2
|
Shi,M., Neville,P., Nicholson,J., Eden,J.S., Imrie,A., Holmes,E.C., Eden,J.-S.
|
The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
|
Australia
|
2017-06-20
| null |
Doupovirus australiaense
|
Doupovirus
|
Xinmoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,259
|
GenBank
| 1
|
Australia: Point Douro
|
Australia
|
Culex australicus
| null |
2015-09-07
| null | null |
Culex mononega-like virus 2 strain mos172X59831, complete genome
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| 76,081
|
MF176298.1
|
Culex mononega-like virus 2
|
Shi,M., Neville,P., Nicholson,J., Eden,J.S., Imrie,A., Holmes,E.C., Eden,J.-S.
|
The University of Sydney, Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Biological Sciences and Sydney Medical School
|
Australia
|
2017-06-20
| null |
Doupovirus australiaense
|
Doupovirus
|
Xinmoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,297
|
GenBank
| 1
|
Australia: Siesta Park
|
Australia
|
Culex globocoxitus
| null |
2015-09-15
| null | null |
Culex mononega-like virus 2 strain mos191gb23464, complete genome
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