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State Key Laboratory of Rice Biology and Ministry of Agriculture Key Laboratory of Molecular Biology of Crop Pathogens and Insects, Institute of Insect Sciences, Zhejiang University
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2014-06-30
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China
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Diadegma semiclausum ichnovirus
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China
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China
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Diadegma semiclausum ichnovirus
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Ye,X.-Q.
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State Key Laboratory of Rice Biology and Ministry of Agriculture Key Laboratory of Molecular Biology of Crop Pathogens and Insects, Institute of Insect Sciences, Zhejiang University
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2014-06-30
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Diadegma semiclausum ichnovirus
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Ichnoviriform
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China
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China
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Diadegma semiclausum ichnovirus segment 46, complete sequence
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National Center for Biotechnology Information, NIH
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So
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Dichorhavirus orchidaceae
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|
Dey,K., Velez-Climent,M., Padmanabhan,C., Nunziata,S., Rivera,Y., McVay,J., Roy,A.
|
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
|
USA
|
2021-12-06
|
Smilax
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Dichorhavirus
|
Rhabdoviridae
|
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|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Smilax auriculata
| null |
2020-10
| null | null |
Orchid fleck dichorhavirus isolate Smilax segment RNA 1, complete sequence
|
CCTGTGTGTAAGGGTTATCCTTACACAGGATAACCCGCTATTGGTCTTCTAGTGCAAGTGGCAGAAATGACCGCTTAAACAGATCCCCTAAGTTTGGATGCTGAGCTAGCGCGGTAGTGTATTGGTGAGTCCTTCTCCCTTAGCTACGGTCCCAGCCCTAAATACATGATGTAAACAAAACAACAAGTGGATAAAAATTGCATTGATTGAACAAAATTGTACTAATATCTCTCTCTCTACGTAGGAAACATGGCTAACCCAAGTGAGATTGATTACATGACTCCCCTCTCTGCATACGAGGGAGTTCCCGCTGAATACCAAGAAGCAACAAGCTCCCCAACACCGAAGGAATACACCAGAGATGCAGCCAAAGCGATCCCAATATGCATCCTCCCTGCCCCGCCAGGCAATGAGGTTGAGGTGGCTGAAGCCTTCAGAGAGGCAACACTGGGCACTGAAACAGTCCTGTCAAAGTTGCAACTGGCACAAATAATGTCCCTGGGATTTATGATCCAGATGTCGGGAGATCCTGAGGCATTGATGCAGGGAGTGGCGGAGGGGTCATTCCTGGAGACCATGACCATGCCGGACATTAAGACGAGGCAGGACAGCAGGATCACAGCAGCCATAGCAGCCATGGCATTGGACCCAACAGAGGAGGGGCCAGATGACCTGGAGGACAGATCTCAGCAGGCAGATGCGGAGAGTGCGCTGTCCAAGGCCAGAGCAATGGTGTACATATGCTTAAGCCTCATGAGGCTGGCTGTAAAGCCGGCTGAGTCATTTATGAAGGGTGTTCATCAGATCAAACAGGCATATTCAGTCCTGGTAGGAGAGCATTCTGAATTCCTGTTCAATTACTCCTATTCAGAAGGAATGTGCAGGAATATAGCCGACATGTTCAACCAATGTGATGATCTCAAAGCAACTCTTTGCCATCATTGTGCCATAGCTGATGAGACGCACCACACCAATAGGAAGAGGCACGGACTTCTCAGATTCCTAATCCTTCAACATGTGGATCTCACGGGGATGATCCCATATGGAATGTACATTGACATGCGAAGGCACTTCACCCTCTTAACACCCGGCCAGTTGCTAACATGGCTTCATGACAACCAGGTATCTAGACCTCTCAGTGTGATTGCGGACATAAACACCAGGTATGATGTTTCTAACGGGTCAGATCGGTTCTGGAGGTACTCAAGGGGTCTGGACCCAGGATTCTTCATAGCTTTACAACAGTCAAAATGTGTCACTCTGATAGCCAGGATGGCACATATACTGGTGAAGGGAGGAGCCGTCGCTGTCAATGAATACTCCGATCCTCGAAAGGCAAAGTCATTGGAGAACAAGCCTGGGCTGGCAGCGGAGGCAGACAAGTTCGCCACTGAGTTTGTGGAGGCATACAACGGCCTATCAGGATCAAGTGCAAACGCCGGCCCTGTGTCCCGCAAACTCTACAACCAGGGCAGAGGCATCCCGACCCGCAGGGGCCTGTTCACACCCCCTTCCGCCAGACCCGCGCCCGTTGTGAATGTACACGTCCCTGCCGCCTCGTCCTCTCTGACAGGGGCCCTGGATGCCATGAACAGTGACTGACAGCCATCTCTCCATGGAAGACCCCATCTCTATCATAACAATATGCTATATATGCGTGCATTTAAATAAAACAACAACAGCGGAACTTGTGTTTGTTTATCACTTCATACATATTAACAGCTTCACATATATTCTCATTACAGGGAAATGTTCACCACCAAGGTAAATATGTACCCAGAGGTCCCCAGCTCATCCCAAGTGTCCGACGACATAGACAACGACACACACGTAGATGAGGTCGCAGCATTTGTGAGGAAATGGTCAGCTGCCGGACTATCTCCCCCTGTCACCCTTGCAAAGAACCTCAGAGCATGGGTAGCGAACAACACCAACCCAGGGAACCCCTTGGTGCTGGACGACAGGATGCTTAGTCTCACGACCATGATATGGAACACAGCAGCGGAGCATTATACTATGATCGGTAAATCTCAGGTCAATCGCATGTCAGCGCTTATTGACCAGCTGGGGGAGATCTCCGGCCGCAAACCGCAGCAGGGTCCTTCATTCGACATGCCACCTCCCCCTCCTAAGAGGAAACACCCGGATTCACTAGACACTAACCCTATCTTAGGCTTAATAGGTCAGGACTGGGACGAGAAGAAGGACAAACAGTGGAGGGAGAAGCCTGCAGATAAGAAACATCTAGTGCTCAACTGGGTGTTACATGAATATTTGGGAGTCCTAACAAAACCGGTAACGATCAAGTGGATAACAGACAATCCGTCGTCTCTGGAGTTGGGAGCAGTTTCAGCATACGCCCTGAAACATCAGGCCAGCTTGTCCGACTGTGACAAAGAGGCCCTCAGAGCACTTGTGGTTCAGACAGTGAAGAACACCCCCAAAAGGCCATGCCTGGACTAGGTGATATTCTATCAGCTTTATCATATATATGTTTCTCATTGTCTGTCATGCATATGATAATAGAAATGCTCAATAGTGACTCACCGGACTCCATAATATATGTACTAGGCATTATGCAGTACGTCGTTGTAATTCATGCATTTAAATAAAACATCAACCTATGTCATTAACTGTTATCACACCCTCTACAATCACAATACACATACCCGCTCTTGCGTCAACCATCCTGCAGGAGCTAAGATGTCCACATTGCCAGTATCCACTCTTCACAGGTCCAACGCTAGGGACGAGGTCAGAGAGACGGCAAGTCGTAGGATGGCCCACGGGTCCGACAGCAATGTGACGGACTTCAACAAAAATCTGCAAACTGCTGAGGCTTGGCAGAAACGCCTAATACACAAAACGTCCATCAAGGTGACTGGATCGGAAGGTGAGGGGAGGATCACCATGGTGAGAAAGCCCATACTGTTTGACATCATGAACAGTCTAAACAGCATACTTCCCACATCGACAAAGCCAACATGGATCATGGGGATGGCCATCAAGTGGGTTCCGACATGTGACCTGTCCACAACAGGGACCATCAAGGTATCAATCCAGAATAAGGCTGTCAACAATCCTGTTTTAAGGGATCACACTGTTGTCTCCATGACCCAAAGAGTCACAACCCCATTTGAGGTCCAATACACATCATCCTCCAAGCTAGCTAACCGGACAGGCACGAGGGGGAATCCCTGGATGTATACATATTTCATAGAGGGAATGGATGACGCTCCGATAGACATGGAGGTGGGGGATATTGTTGTTATGCCTATGATTAGGTCTGATGACACCACGACACAGTGGTATGAGGGTGTGAAGTGCAATGTGTATGGAGGCCACCTCCCTCCGAACACACCGGTGGTCACCCACCGTGCACCCGGACCCAGGTTCAAGACCAACATGAATGAGACAAAACCAAACACAGAGACGCTCAGGAGGCACCTCAACGTCCAGGGATCCACCGATACAGATGAAGATCTGGTCTTCAAAATGATACAGTGTTGCGACGGGGAGACTGCAGGATCTATAATGAAGGGGATAAGATCCTCAGTGTGGGCTCCTTTGGCCAAGACTGACAGGGATTATGTTGTAATTAAGGAGATGCTTCATGACTGTCGGGTGGGCAGAGTACTGAGCTACATCACCCTCAGCGAGGTAGAGGGTCTCAGCACCATGGGAGGTGACAAAAGCCACAGCTATCGTTAATTGTTACTCAGGCTAAGTACCCTGACGGAGAATGCTGCCTTCCCAATAAGCATATCTACTTATCTACCGTAATTTAAATAAAACAACAATCTTCGAATCATTGATCATTTATATATCAGATCTAACAATTGTCTTTTATCATGTCTAAGCAGATCAATATGTGCACTGTGATGTCCTTCAGATCACTCATCACTGTGATAGGACCCAGGTCAGTGGATCTTGGAGCCGGATTCAAGGAGGCGGTGCTGCGAGCAATCACTTCACTCAAGGTCAAGGCCAAGGACCCGAAAGGGGCCGAGATAGATGGCCCCTGGCAAGAGCTACTGGTGGAGATTGCCACCATGACCAAATCAGCATTCACCGGCCCGACCATCAAGAAAGACCTAGAGCAGGGAAATGTCTACCGATATGCGATGACAGTAGGCGGCATGTTGAGCACATCACACAATACTAATGGAAGACTGATGACTGTCAGGACTGGACCTCTATATGATACAGACCACTATCATGTGTCTGGGGAGGTTGATATTGATAAAATGGATGGTTTCAAAGCAACGATAACACTGTCTGTGGCCACTGTCAAAAGAGAACGTCAACAGTGCGAGGCAGGCATCGGGGAATACCATGTTTTACCGATCAAGGGCAAAAATCCCCCACGACCCGCCAGCAACACCGCGGGACCCAGTGGTTAGAGCCATCAACAGCTCAGGGCCTGCTCTCCCTCCTATCAGGCGTGGATAATTACTTACGGAGGAAGAAGTCTCGACTATCTTATGTTTTAAAGGACGGTGAATGAAGCATATAACCATATGCATATCTTAATGATATGCCCTATATAATCTGATTTAAATAAAACAATAATGATAGTACAAACGAAACAGCCCGGCACGATGTCAACCTTCTGCTTTTTAACCGTATTAATGTTTCTTCTTATCTCAGGTTTTGAGGCTTTATCCCTGGTTCCAAAGACAGTTTGTGAAAAAGAGGTGGGGCTACATGTGGATGAATGGCTCCATTCATGTTTGGGGGCCTGCAAGAGCAGCGATAACGACCTTGATATGACACCCCACATGTTGATGGAGCCCACATTGGAGTACTTTAAGGCCTTCGGGTACTTCATACATGTATCAACCCTCACCAAGTCGTCACATACCTTCCTACTCGGTGGGTGTCACATCACCTCACAGGAGACCCCCAGCGATTCTCAAGAGCTTCCCACTAATATGGCTGAGAATATATTGAGGCATGGCGGCCCTGAGGGAGAGGTATTTATGACAAAAGAGCCCAAA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| 35,505
|
OL606757.1
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Dey,K., Velez-Climent,M., Padmanabhan,C., Nunziata,S., Rivera,Y., McVay,J., Roy,A.
|
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
|
USA
|
2021-12-06
|
Smilax
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Dichorhavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 6,013
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Smilax auriculata
| null |
2020-10
| null | null |
Orchid fleck dichorhavirus isolate Smilax segment RNA 2, complete sequence
|
ATACACAGGACAACCAACTGTCTCATTGCGAAGTCAAATTCCGTGATGGGTCCGTCTTTCCTAGAATAAGGGAAGGATACTATAGGATTGATCCTAGTTCTTCTCTACGCTGGGTGCTTCACGGATCATAAAAAACAACCAACCATCATATATTATTACGCATACACTTTTGAACTAATCAGATATGAATTCACTATTTCAGGAATGTTACACCGAGTCCCTGATGGACGATAATACGGACACCATCATCACCGGTAAGGGGAGGTCTGCCCACAATGAGGGAGAATACCACCTAAAGTCTGCCCTGAGAAGCCACAGTGATTATGTGAAAAACAAGCATCAAGCCAAGGATCTGCTAAAGCTCAGTGAACATACATCTGTATATGCACCGAAAAACCCATGCAAGTTACTGCCCACTCTATGGAGAGGGGTGATTGAAGGGGAGGAGTGGGTTGAAGATGAGATCATAATATACTTGAGAGAGCTCTATCATGACGACGAAACAGACGACTGTGCTCTTGAACTCCTTGATGCAGAGCTGGAACATGTGTGTCATGACGATGACAAAACAGGGATAATGCAGGGAGTCGTACAGTGTCAGGAGGATGCATGGAACAAACATACCATCTACGGTAGGGCCAATATCCTTCGATGGGCCTTGACAAGGATAGTGATCGATCACAATAAAGAGGAGCCTACAGAACTCAGCCCCATGGGGAGGAAATTGGACGACAAGGTGTTTGCTTATTCACTGAGCAGCTCATTATCTATGATGATAAGCAGAAGTTGGTGTCATCTGATGGTTAATGACAGCCCAGGCACCATCAACATCCAGCACTTGATCAACACCCTGGATAAACTGACGGAACGAGTGAACATAATGACCTACCTAACTCTCTGCAATAAGACTGGACTTTCAAGCATTTATCCATCAGTAGACATCACTTTGAAAATAATTCAGCTGGGTGACAATTTAGTATTGAATGAAGGCAATAATGCTTTCCGCGGGTTGGCCAGTTACGAAGCCATCTGTGTCGGTGAGATAATCAACAGGGGCGATTCGTCCGTGTGGGATGTTGGTAGATTCCTCAACACTATGTTACAGGAGGTTGGATCATTGGGAGAGAACTACAAGACATGGTCATCTGATGTCCTGGTGATACTGCAAGGTTTGAAGATCCAGCAAGTGTCATGCCTGCATGGCATGTATCGTATCTGGGGACATCCAGTTGTTGATCTTGAGAAGGGCCTCATGAAGCTTCGTTCAGTAGCTCTAATGGAGAAGGAGATCCCACCAGAGTGTGCCAGGAATACCTCCAATATGTTCAAGGAGATATTCTTCACGCAATACTTCAGACGCCACAAGTTTTACCCTCCACACACCTGGACCGGTCCGGAAGGAAGCAATTACATCAAGCAGGTCCTATCACTTGAGAAAGAGTTGGATATTCACAACATAAGATACCACTTGGAGGATTGGGAGAACATCAGATGTGAGAAGACATTCGAGATTCCGGCCACATACAGTCTTGCATCATGTATCAAAGACAGAGCTATATCCCCGAAACGGTCAGAGTTAGTATCCATGATAATCAGGGGGGGATCTGTAATGAGTCAAAGCTCAAGGAGGGGGGTTCTGAAATGGCTGGATAGTACCATGATCCCTGTGAGAGAATTCTTGGATGGCATAGATGAATCAGGATTGTCGAAAGACAACTCAATTATCGGCCTGTACCCAAAGGAAAGAGAGTTAAAGATGGAGGCCAGGTTCTTTGCTCTAATGTCCTTTCAAATGAGGTTATACTTTACAATCACAGAGCATATGGCAAATGACAATCTCTTGGACTACTTCCCCATGGTCACAATGTCTGACAGCATGCTGGAGCTAAACAAGAAGCTGGACACTCTGAGCCGAAAGCAGGTTACTAAAAAGGAGGGTGTGGTGCATTATGTGGTCAACATCGATTTCAGAAAATGGAACCAACAGATGAGAGAGGAGATGACTGTCCCCATGTTCCTTGATGCTGATAGACTGTTTGGCTACACCAATCTGGTGGGGCGGACACATGAGATTTTCAAGTCCTCATATATATACTTATCCTCAGGGGAATATGTACCACAAGTCTCACTCAGAGGAAGGTTGGTGCATGAGGAGCCCTACAGTTGGACCAATGACCCTTCTGGGAAAGAGGGCCTGCGGCAGAAATATTGGACCATCATGACTGCGTGTGACTTAATGTATGTAGCTAGACAACATGGGTTGAAGATTGATCTGGTGGGCGGGGGAGACAATCAGGTGCTGATTGTGGAGGTGACCACCGACAAGGTTGGAGATGGAGGTGAATTAACAACGGAGGGGAAATCCGAGTGTAAATTCAAGATGGGAACATTCATGCATCATCTGTCCAATTACATGGAGAAGAAAGGCCTGCCGCTAAAGACAGAGGAAACCTGGATCTCCCCCAACCTGCTCATGTTCTTCAAGATGATGTATTATGACCATACCACTCTGGTGTCACCTCTCAAACAGGCCTCGAGGGTGTTTCCGTTATCTAATGATCAAGTTATGACTATTGGCAACATGGCCGCCACTGTGTCCTCAGGAGTCACAGTACTATCCTCCAAGGACATGCAGATTGGCCCAGCAGCTGCATTCGGAAGGCTAATATGTGCCGACTTAGCATCATTGGTCACCAAGGATCATCCCCTGTCTGATGGAGGAGAGATGTGGTCGGACAGCATAAGCATTTGCAGGGGTGGCTCAAGAAGGAAGGTCAACATTAAGCCGGACCTCAAAACCCCAATGAGAATCTTCCTGTCATTAACACTCCTACATAAAGTCATGGGAGGTCCAGCCATAGTATCACCCCTGGGTATGATGATGAGGGGATTTCCTGATCCACTATGTGAGCATTTGACCTGGATCAGTATGATTAAGTCAAAATTCTCACAGGCCGCTAACTTCGCTTGTATGTCTATCAACACCAAGGTCCCTTGGGCCCATCTGCTTGAAGACCCGGTCAGTGTCAACCATGACGCTCCCATGCATGGATTGGCTGTACTTAGAAGAGAAGCAGAGCAAGCTCTCGCTAAAGCCTCTGGCTATAAGAATCGAGATTTTATGGACCTGGCTCGCTGTTGCAACAAGAGTCAAATGGAGGGATTGGCTGAGGCACTATGCTCCGGCAAGAATGTAGATATAAGGGTGTTACATGATGTTATGGGTGCAAGCTTAGGAGGGTATTTCAACTCCATAGCCTCTAAGGTAAACAAGACTGCCACCGTCCTAAGGATGAACAAGAGCTCCTCCGTCATTGCCACCATTGCAGTACAGGAAAAACATTGCATGAGTTATTTTGCTGCCTCATCATCAGTGCCTCACGATCTCACTCCCCTGAAATGTCCAACAGCCACAGCTAGACGATACAGAAGACTGAGCTGGGGCAAGGAAATCCTGTCCATCACTACCCCGCATCCTGCAGCCTTCTTGAAACCAGTGATTGGAGACCATCAGTGTGACCACAACTATGTGCAGACCAAGACATCAGGAGGGAACCTGATCAATCCCCACTCTAGAGGGCCATATCCGGTTTATATGGGCTCATACACAAGGGAGAAGTTCAAGCCTACTGAGATGGCGGCGGCTTACGGAGAAGAGGACCTACTGTCCAGACCCATTCATCTGATGAAGCTGGTTAATTGGAGATATTCATCATCATCCAACATGGCCAGGATCCTGAAATGCCTGCTGAGCTCTCTTACTGATGCTGATGCCACTCTTTTCTACGGAATGATGGAGTGGATTGCAGGAGATGCAGAGCATAGATATCAAGACATGGCGACCAAGCACGGGGGGGTTCCCAATGTCGCTCACTCCATACTGTCTTATGTCCGAGCTCACACCACCACATTTAGGAAACACTCCCGCGGAGGGAAAAATGAGACTCTCCACTTCCAGGCCGTCATGATATACACATCAATGATAGCCCTGTTCAAGAAATATGGGGGAATCATCCATTGGCATGAGAGCTGTGGCGAATGCATCCAGCAAACTGTGGGCAACGTTGATGTGGTACTGACAAAGAGGGTGGAGTTCCCGATCCTGAAAGGAAATCTCTTTGCATATGTCCCGGCGGAAAGTATAAAGTTTCACTACCATGACATGAAGAGGATTCGGTCTGTGGAGGATCTGGGATTCCGTACTGTGTCATACGAATCCATGAGCCCCTTGGATAGAAGAACTGCCAGCATCAGCATGCTGTCTGCAGTAATATCGTCCAGTGAGTCTAGGGATAAATCATCTGTTACCATGAGTAGCATAGAGATGTGGGCCGGGACTGTCAATCTCACAGAGATCATCCCTGCAGTATGCCTGAGGGTGTCGGTGGCCGAACTCATGAGAACGGGCGAGTGGTCATGGCCCAAGCCCCACCTCAAGAAAAGAATAATCATGCTGCTAGAGCCATTCATAAGGTCAAAACTTGGGAGGTACCAGCTGCTGGAAATGGGTGTGACCCTGGATGAACTACGATCCAACAACCCGGGGGTGCTCCTAGACATTGTTCAGGTGGTTATGGATAACAGCAGAATAACACCGAAGATTATCCCGAATAGAGTCTCTCCCAGTTGGGTCAATGACGTAATATGTGCTAAGATTTATGAGAATGAGCATATAATCTTCTGTTCCGGATGTCTGACAAAAGGCCCATGTGTGGATAAAGTGGAGATATGCAATGACATCCTCATGGAATACACCTTCAAGGTGTGTTCGGCTACATTGCCGGTCCTCAAAGGAGACATGTCTCAAATTATATGTGATAGGGACTTCTCGAATGACCCAGATTGGACTTCATCACCAGTCCAGTTGTTTGAAATGATGGACAATCCGGCTGCTCAGTTCACTCCATTCCCAAGGGACGGGCCCATAGCAGTGTCAAGACCATTGGGCAGTGCCGGATTGTCAAGCATCCTGGATATACTGGCAGAGACCGATGGAATCA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| 35,506
|
MK578000.1
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Roy,A., Stone,A.L., Otero-Colina,G., Hartung,J.S., Schneider,W.L., Brlansky,R.H., Srivastava,S.K., Wei,G., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K.
|
United States Department of Agriculture, USDA-APHIS-PPQ-Center for Plant Health Science & Technology
|
USA
|
2019-10-22
|
S9
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Dichorhavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 6,296
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Citrus aurantium
| null |
2012-12-15
| null | null |
Dichorhavirus orchidaceae isolate S9 segment RNA1, complete sequence
|
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| 58,580
|
MK578001.1
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Roy,A., Stone,A.L., Otero-Colina,G., Hartung,J.S., Schneider,W.L., Brlansky,R.H., Srivastava,S.K., Wei,G., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K.
|
United States Department of Agriculture, USDA-APHIS-PPQ-Center for Plant Health Science & Technology
|
USA
|
2019-10-22
|
S9
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Dichorhavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 5,860
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Citrus aurantium
| null |
2012-12-15
| null | null |
Dichorhavirus orchidaceae isolate S9 segment RNA2, complete sequence
|
ACACAGGACAACCAACTGTCTCATTGCGAAGTCAAATTCCGTGATGGGTCCGTCTTTCCTAGAATAAGGGAAGGATACTATAGGATTGATCCTAGTTCTTCTCTACGCTGGGTGCTACACGGATCATGCAAAACAACCAAATATCATATATTATTGCGCATACACTTTTGAACTAATCAGATATGAATTCACTGTTTCAGGAATGTTACACAGAGTCCTTAATGGACGATAACACGGACACCATCATCACCGGTAAGGGGAGATCTGCCCATAATGAGGGAGAATACCATCTAAAGTCTGCCCTGAGAAGCCACAGTGATTATGTGAAGAACAAGCATCAAGCCAAGGATCTGCTGTGGCTCAGTGAGCATACATCCGTACATGCATCGAAGAATCCATGCAAACTGCTACCCACTCTATGGAAGGGAGTGGTCGAAGGGGAGGAGTGGGTTGAGGATGAGGTTGTAATATATCTAAAGGAGCTCTATCATGATGACGAGACTGATGATTGTGCTCTTGAGCTCCTAGATGCAGAGCTGGAGCATGTGTGCCACGACGATGACAAAACAGGGATAATGCAGGGGGTCGTACAGTGTCAGGAGGATGCATGGAACCGACACACCATCTACGGTAGAGCTAACATCCTTCGGTGGGCCCTGACAAGGATAGTGATAGATCATAATAAAGAGGAGCCAACAGAGCTTAGTCCCATGGGGAGGAAGTTGGATGGCGGGGTGTTTGCTTATTCATTGAGCAGCTCATTATCTATGATGATAAGCAGAAGTTGGTGTCATCTGATGATCAATGACAGCCCCGGAACCATCAACATTCAGCACCTGATCAACACCCTGGATAAACTGACAGAACGAGTGAACATAATGACTTATCTAACCCTCTGCAACAAGACTGGGCTCTCAAGCATTTATCCGTCAGTTGACATCACTCTGAGAATCATTCAGCTAGGTGACCAATTGATACTGAATGAGGGCAATAATGCCTTTCGCGGGCTGGCCAGTTATGAAGCTATCTGTGTCGGTGAGATAATCAACAGGGGGGACTCATCAGTGTGGGATGTCGGGAGATTTCTCAACACCATGCTACAGGAGGTTGGTGCATTGGGGGAGAACTACAAGACATGGTCATCAGATGTTCTAGTAATACTTCAAGGTCTAAGGATACAACAAGTGTCATGCCTGCATGGCATGTATCGCATCTGGGGACATCCGGTTGTTGATCTTGAGAAAGGCCTCATGAAGCTCCGCTCGGTGGCTCTGATGGAGAAAGAGATTCCGCCTGAATGTGCCAGGAATACCTCCAACATGTTCAAGGAGATATTCTTCACACAGTATTTCAGGCGACACAAGTTTTACCCTCCACATACCTGGACCGGTCCTGAAGGAAGCAATTACATCAAGCAGGTCCTATCACTTGAGAAGGAGTTGGATATACACAACATAAGATATCACTTGGAGGACTGGGAGAATATCAGATGTGAGAAGACGTTCGAGATCCCGGCCACATACAGCCTTGCATCATGTATCAAAGATAGAGCAATATCCCCAAAACGATCAGAGTTGGTATCCATGATCATCAGAGGAGGATCTGTAATGAGTCAAAGCTCCAGAAGGGGGGTGTTAAAATGGCTGGACAGCACCATGATCCCTGTGAGAGAATTCCTGGATGGTATAAATGAGTCGGGATTGTCAAAGGACAACTCAATTATTGGCCTATATCCTAAAGAACGAGAGTTGAAGATGGAGGCCAGGTTCTTTGCTCTGATGTCCTTCCAAATGAGGTTGTGCTTCACAATTACTGAGCATATGGCGAATGACAACCTCCTGGACTACTTTCCCATGGTCACAATGTCTGACAGCATGCTGGAGCTGAACAAAAAGCTGGACACTCTAAGTAGAAAGCAAGTCACAAAGAAGGAGGGTGTGGTACATTATGTGGTCAATATAGATTTCAGAAAATGGAACCAACAGATGAGGGAAGAGATGACTGTCCCTATGTTTCTTGATGCTGATAGACTGTTCGGTTACACCAATCTGGTGGGGCGGACGCATGAGATCTTTAAGTCCTCATATATATACTTATCCTCAGGGGAATACGTACCACAAGTCTCACTCAGAGGAAGGTTGGTGCATGAGGAGCCCTACAGCTGGACCAATGACCCCTCTGGGAAAGAAGGTCTGAGGCAAAAATATTGGACCATCATGACTGCATGTGATTTGATGTATGTAGCTAGACAACATGGGCTGAAGATTGATCTGGTAGGCGGGGGTGACAATCAGGTCCTGATTGTGGAAGTGACCACGGACAAAGTCGGGGATGGAGGTGAATTGACCATGGAGGGGAAGTCTGAGTGCAAATACAAGATGGGGACATTCATGAGCCATCTGTCCAATTACATGGAGAAGAAAGGCCTGCCGTTGAAAACAGAGGAGACCTGGATTTCACCCAACCTACTCATGTTCTTCAAGATGATGTATTATGATCATACTACTCTGGTGTCACCTCTCAAGCAAGCCTCGAGAGTGTTTCCGCTGTCAAATGATCAAGTCATGACTATTGGCAACATGGCAGCCACTGTCTCTTCGGGGGTTACAGTACTATCCTCCAAAGACATGCAGATTGGCCCAGCAGCTGCTTTTGGAAGACTCATATGTGCTGATTTAGCATCGTTGGTCACCAAGGATCATCCCTTGTCTGATGGAGGAGAGATGTGGTCAGACAGCATAAATATTTGCAGAGGTGGCTCTAGGAGGAAGATCAACGTTAGGCCGGACCTCAAAACTCCGATGAGAATTTTCCTGTCATTAACACTCCTGCACAAGGTCATGGGAGGTCCAGCCATAGTCTCACCCCTGGGTATGATGATGAGGGGATTTCCTGATCCGCTTTGTGAACACTTGACTTGGATCAGTATGATAAAGATAAAATTCCCCCAAGCCACTAACTTTGCTTGTATGTCCATCAACACCAAGGTTCCTTGGGCTCACCTACTTGAAGACCCGGTCAGTGTCAACCATGATGCCCCCATGCATGGGCTGGCTGTGCTTAGAAGGGAGGCAGAGCAAGCCCTCGCTAAAGCCTCTGGTTATAAGAATCGAGACTTCATGGACCTGGCCCGCTGTTGTAACAAGAGTCAGATGGAGGGACTGGCTGAGGCACTATGCTCTGGCAAGAATGTGGATATAAGGGTGTTGCATGATGTCATGGGTGCAAGCTTAGGAGGATATTTCAACTCCATAGCCTCCAAGGTTAACAAGACTGCCACTGTCCTGAGAATGAACAAAAGCTCCTCAGTCATCGCGACCATTGCGGGACAGGAACGACACTGCATGAGTTATTTTGCCGCATCATCATCAGTGCCTCACGACCTTACTCCCCTGAAATGTCCGACAGCCACAGCTAGGAGGTACAGAAGATTGAGCTGGGGCAAGGAAATCCTGTCCATAACTACCCCGCATCCTGCAGCCTTCCTGAAACCAGTGATTGGAGACCATCAATGTGACCACAACTATGTGCAGACCAAAACATCGGGAGGGAACCTGATCAACCCACACTCTAGAGGGCCATACCCGGTTTACATGGGCTCGTATACCAAGGAGAAGTTCAAGCCCACTGAGATGGCGGCGGCTTACGGAGAGGAGGACCTACTGTCCAGACCCATCCACCTGATGAAGCTGATCAATTGGAGATACTCATCATCATCCAACATGGCCCGGATCCTCAAATGCCTGTTGAGCTCTCTGACTGATGCTGATGCTACACTTTTCTATGGGATGATGGAGTGGATTGCAGGAGACGCAGAGCATAGGTACCAGGACATGGCTACCAAACACGGGGGGGTTCCCAATGTCGCCCACTCTATACTGTCTTATGTCCGAGCTCACACCACCACATTCAGGAAGCATTCCCGAGGAGGGAAGAATGAGACACTTCACTTCCAGGCCGTCATGATATACACATCAATGATAGCCCTGTTCAAGAAATACGGGGGAATTATCCATTGGCATGAGAGCTGTGGAGAGTGCATCCAACAGACTGTCGGCAATGTGGATGTGGTCCTGACGAAGAGGGTGGAATTCCCAATATTGAAAGGGAATCTCTTTGCATATGTCCCGGCAGAAAGTATCAAATTCCATTATCATGACATGAAGAGGATCCGGTCTGTGGAGGATCTAGGATTCCGTACTGTGTCATATGAATCCATGAGCTCCTTAGACAGAAGAACCGCCAGCATCAGCATGCTGTCCGCAGTGATATCGTCCAGTGAGTCCAGGGACAAATCATCGGTTACCATGAGTAGCATAGAAATGTGGGCCGGGACTGTCAATCTCACAGAGATCATCCCCGCCGTGTGCCTGAGGGTGTCAGTGGCAGAGCTCATGAGAACAGGCGAATGGTCATGGCCTAAGCCTCACCTTAAGAAGCGAATAATCATGTTATTAGAACCATTCATAAGGTCAAAGCTGGGGAGGTATCAGTTGTTGGAAATGGGTGTGACTCTGGATGAGTTACGATCCAACAATCCTGGGGTGCTTCTGGACATCATTCAGGTGATCATGGACAACAGCAGGATGACACCGAAGATCATCCCCAATCGAGTTTCCCCCAGTTGGGCCAACGATGTTATATGTGCTAAGATATATGAGAATGAGCATATCATCTTCTGTTCCGGATGTTTGGCGAAAGGTCCATGTGTGGATAAAGTGGAGATATGCAATGATATCCTTATGGAATACACCTTCAAGGTATGCTCAGCCACATTGCCGGTTCTCAAAGGAGACATGTCTCAGATCATATGTGATAGAGACTTCTCAAATGACCCGGATTGGACTTCATCGCCTGTCCAGTTGTTCGAAATGATGGACAATCCAGCTGCTCAGTTCACTCCATTCCCAAGGGACGGGCCCATAGCTGTGTCAAGGCCACTGGGCAGTGCCGGATTATCAAGCATTCTGGATATACTGGCAGAGACCAATGGAATTATCATGGTCGGGGATGACAGTGTCAGTATCACTATATGGAGACAGTTCAGAGCAACCAGGAGGGTTATGATCTTCAAGACAGGGGATAATCACCTTGAAGCTGCCTGTGACTTCATATGTATGGCCCCTGATGAAGCAGACCTACTTATGGACAGTGAAAGTCCGGACGGGAAGGCTGATGTATATTATGGGGATAACATCCCTGTAGCTCCCGGTTGGTGGATAGTGACCAGTCGAAAAGATGTCAACAGATTGTACAAGTATGGCAAAGACATGAGCCCCACCAGGGTATTAATCTCCAAGGACAGAGGTCAAACCAGGGCAATCTGTGCTGTCAAGATGGAGCAATCCCCAGGACAAAAGTGGGGAGACTTCCAAGCCACCTACAAAAAGATTGAGATGAGATGCGGAAACTACAGTGGGATGGTAAGAAATCCCACCAGCAAGAACAAGTTAGTATCATGCGCGGTGTCATTATTTCACAGGGTCAATGGAGATATAGAAGAGGCAGTCAAATGCTGTGTGACGGAGATGAGGACGATTTTCTGGAGGAACGAATTATATACTAAGAAGGCAAAGGAGCTGATGTATCTGATGTCAACACTGCACATGGCCGGCATGGAGGGCGGAATAGAGTTTGCAAGACGATCTATCAAGCCTAGGGCAGTGAGGCGACCTTACAGGATTCTCATCAAGACAACCGCTAGAAACAACTACAAGGCAGCTAATGATGTCACAGACGTGAGAGAGCTATTCAGAGTAACTCCCAAGCCTACCGGAGCACCCGGAGGAGATATCATCATAAATATCGGGAAATAAGTAATTTTGTTTAAATTATATTCATTTAAGGAAAAAAAAAAAAA
| 58,581
|
MK522804.1
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Cook,G., Clase,R., Steyn,C., Basson,E., Grout,T.G., Fourie,P.H., Moore,S., Kirkman,W.
|
Citrus Research International, Disease Management
|
South Africa
|
2019-07-23
|
CL
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Dichorhavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 6,431
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Citrus
| null |
2018-04
| null | null |
Dichorhavirus orchidaceae isolate CL segment RNA1, complete sequence
|
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|
Citrus Research International, Disease Management
|
South Africa
|
2019-07-23
|
CL
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
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|
Rhabdoviridae
|
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|
GenBank
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South Africa
|
South Africa
|
Citrus
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2018-04
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|
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|
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|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Cook,G., Clase,R., Steyn,C., Basson,E., Grout,T.G., Fourie,P.H., Moore,S., Kirkman,W.
|
Citrus Research International, Disease Management
|
South Africa
|
2019-07-23
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Br
|
Dichorhavirus orchidaceae
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Dichorhavirus
|
Rhabdoviridae
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ssRNA(-)
| 6,431
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|
South Africa
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2018-06
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|
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| 61,648
|
MK522807.1
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Cook,G., Clase,R., Steyn,C., Basson,E., Grout,T.G., Fourie,P.H., Moore,S., Kirkman,W.
|
Citrus Research International, Disease Management
|
South Africa
|
2019-07-23
|
Br
|
Dichorhavirus orchidaceae
|
Dichorhavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 6,001
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Orchidaceae
| null |
2018-06
| null | null |
Dichorhavirus orchidaceae isolate Br segment RNA2, complete sequence
|
ACACAGGACAACCAACTGTCTCATTGCGAAGTCAAATTCCGTGATGGGTCCGTCTTTCCTAGAATAAGGGAAGGATACTATAGGATTGATCCTAGTTCTTCTCTACGCTGGGTGCTTCACGGATCATAAAAAACAACCAACCATCATATATTATTACGCATACACTTTTGAACTAATCAGATATGAATTCACTATTTCAGGAATGTTACACCGAGTCCCTGATGGACGATAATACGGACACCATCATCACCGGTAAGGGGAGGTCTGCCCACAATGAGGGAGAGTACCACCTAAAGTCTGCCCTGAGAAGCCACAGTGATTATGTGAAAAACAAGCATCAAGCCAAGGATCTGCTAAAGCTCAGTGAACATACATCTGTATATGCTCCGAAAAACCCATGCAAGTTACTGCCCACTCTATGGAGAGGGGTGATTGAAGGGGAGGAGTGGGTTGAAGATGAGGTTATAATATACTTGAGAGAGCTCTATCATGACGACGAAACAGACGACTGTGCTCTTGAGCTCCTTGATGCAGAGCTGGAACATGTGTGTCATGACGATGACAAAACAGGGATAATGCAGGGAGTCGTACAGTGTCAGGAGGATGCATGGAACAAACATACCATCTACGGTAGGGCCAATATCCTTCGATGGGCCTTGACGAGGATAGTGATCGATCACAATAAAGAGGAGCCTACAGAACTCAGCCCCATGGGGAGGAAATTGGACGATAAGGTGTTTGCTTATTCACTGAGCGGCTCATTATCTATGATGATAAGCAGAAGTTGGTGTCATCTGATGATTAATGACAGCCCAGGCACCATCAACATCCAGCACTTGATCAACACCCTGGATAAACTGACGGAACGAGTGAACATAATGACCTACCTAACTCTCTGCGATAAGACTGGACTTTCAAGCATTTATCCATCAGTAGACATCACTTTGAAAATAATTCAGCTGGGTGACAACTTAATATTAAATGAAGGCAATAATGCTTTTCGCGGGTTGGCCAGTTACGAAGCCATCTGTGTCGGTGAGATAATCAACAGGGGCGATTCGTCAGTGTGGGATGTTGGTAGATTCCTCAACACTATGTTACAAGAGGTTGGATCATTGGGAGAGAACTACAAGACATGGTCATCTGATGTCCTGGTGATACTGCAAGGTTTGAAAATCCAGCAAGTGTCATGCCTGCATGGCATGTATCGTATCTGGGGACATCCAGTTGTTGATCTTGAGAAGGGCCTCATGAAGCTTCGTTCAGTAGCTCTAATGGAGAAGGAGATCCCACCAGAATGTGCCAGGAATACCTCCAATATGTTCAAGGAGATATTCTTCACGCAATACTTCAGACGCCACAAGTTTTACCCTCCACACACCTGGACCGGTCCGGAAGGAAGCAATTACATCAAGCAGGTCCTATCACTTGAGAAAGAGTTGGATATACACAACATAAGATACCACTTGGAGGATTGGGAGAACATCAGATGTGAGAAGACATTCGAAATTCCGGCCACATACAGTCTTGCATCATGTATCAAAGACAGAGCCATATCCCCGAAACGGTCAGAGTTAGTATCCATGATAATCAGAGGGGGATCTGTAATGAGTCAAAGCTCAAGGAGGGGGGTTCTGAAATGGCTTGATAGTACCATGATTCCTGTGAGAGAATTCTTGGATGGCATAGATGAATCAGGATTGTCAAAAGACAACTCAATTATCGGCCTGTACCCAAAGGAAAGAGAGTTAAAGATGGAGGCCAGGTTCTTTGCTCTAATGTCCTTTCAAATGAGGTTATACTTTACAATCACAGAGCATATGGCAAATGACAATCTCTTGGACTACTTCCCCATGGTCACAATGTCTGACAGCATGCTGGAGCTAAACAAGAAGCTGGACACTCTGAGCCGAAAGCAGGTTACTAAAAAGGAGGGTGTGGTGCATTATGTGGTCAACATCGATTTCAGAAAATGGAACCAACAGATGAGAGAGGAGATGACTGTCCCCATGTTCCTTGATGCTGATAGACTGTTTGGCTACACCAATCTGGTGGGGCGGACACATGAGATTTTCAAGTCCTCATATATATACTTATCCTCAGGGGAATATGTACCACAAGTCTCACTCAGAGGAAGGTTGGTGCATGAGGAGCCCTACAGTTGGACCAATGACCCTTCTGGGAAAGAGGGCCTGCGGCAGAAATATTGGACCATCATGACTGCGTGTGACCTAATGTATGTAGCTAGACAACATGGGTTGAAGATTGATCTGGTGGGCGGGGGAGACAATCAGGTGCTGATTGTGGAGGTGACCACCGACAAGGTTGGAGATGGAGGTGAATTAACAACGGAGGGGAAATCAGAGTGCAAATTCAAGATGGGAACATTCATGCGTCATCTGTCCAATTACATGGAGAAGAAAGGCTTACCGCTAAAGACAGAGGAAACCTGGATCTCCCCCAACCTGCTCATGTTCTTCAAGATGATGTATTATGACCATACCACTCTGGTGTCACCTCTCAAACAGGCCTCGAGGGTGTTTCCGTTATCTAATGATCAAGTCATGACTATTGGCAACATGGCAGCCACTGTGTCCTCAGGAGTCACAGTACTATCCTCCAAGGACATGCAGATTGGCCCAGCAGCTGCATTCGGAAGGCTAATATGTGCCGACTTAGCATCATTGGTCACCAAGGATCATCCCCTGTCTGATGGAGGAGAGATGTGGTCGGACAGCATAAGCATTTGCAGGGGTGGCTCAAGAAGGAAGGTCAACGTTAAGCCGGACCTCAAAACCCCAATGAGAATCTTCCTGTCATTAACACTCCTACATAAAGTCATGGGAGGTCCAGCCATAGTATCACCCCTGGGTATGATGATGAGGGGATTTCCTGACCCACTCTGTGAGCATTTGACCTGGATCAGTATGATTAAGTCAAAATTCTCACAGGCCGCTAACTTCGCTTGTATGTCCATCAACACCAAGGTCCCTTGGGCCCATCTGCTTGAAGACCCGGTCAGTGTCAACCATGACGCTCCCATGCATGGATTGGCCGTACTCAGAAGAGAAGCAGAGCAAGCTCTCGCTAAAGCCTCTGGCTATAAGAATCGAGATTTTATGGACCTGGCTCGCTGTTGCAACAAGAGTCAAATGGAGGGATTGGCTGAGGCACTATGCTCCGGCAAGAATGTAGATATAAGGGTGTTACATGATGTTATGGGTGCAAGCTTAGGAGGGTATTTCAACTCCATAGCCTCTAAGGTAAACAAGACTGCCACCGTCCTAAGGATGAACAAGAGCTCCTCCGTCATTGCCACCATTGCAGGACAGGAAAGACATTGCATGAGTTATTTTGCTGCCTCATCATCAGTGCCTCACGATCTCACCCCCCTGAAATGTCCAACAGCCACAGCTAGACGATACAGAAGGCTGAGCTGGGGCAAGGAAATCCTGTCCATCACTACCCCGCATCCTGCAGCCTTCTTGAAACCAGTGATAGGAGACCATCAGTGTGACCACAACTATGTGCAGACCAAGACATCAGGAGGGAACCTGATCAATCCCCACTCTAGAGGGCCGTATCCGGTTTATATGGGCTCATACACAAGGGAGAAGTTCAAGCCTACTGAGATGGCGGCGGCTTACGGAGAAGAGGACCTACTGTCCAGACCCATTCATCTGATGAAGCTAATCAATTGGAGATATTCATCATCATCCAACATGGCCAGGATCCTGAAATGCCTGCTGAGCTCTCTTACTGATGCTGATGCCACTCTTTTCTACGGAATGATGGAGTGGATTGCAGGAGATGCAGAGCATAGATATCAAGACATGGCGACCAAACACGGGGGAGTTCCCAATGTCGCTCACTCCATACTGTCTTATGTCCGAGCTCACACCACCACATTTAGGAAACACTCCCGCGGAGGGAAAAATGAGACTCTCCACTTCCAGGCCGTCATGATATATACATCAATGATAGCCCTGTTCAAGAAATATGGGGGAATCATCCATTGGCATGAGAGCTGTGGCGAATGCATCCAGCAAACTGTGGGCAACGTTGATGTGATACTGACAAAGAGGGTGGAGTTCCCAATCCTGAAAGGAAATCTCTTTGCATATGTCCCGGCGGAAAGTATAAAGTTTCACTACCATGACATGAAGAGGATTCGGTCTGTGGAGGATCTGGGATTCCGTACTATGTCATACGAATCCATGAGCCCCTTGGATAAAAGAACTGCCAGCATCAGCATGCTGTCCGCAGTGATATCGTCCAGTGAGTCTAGGGATAAATCATCTGTTACCATGAGTAGCATAGAGATGTGGGCCGGGACTGTTAATCTCACAGAGATCATCCCTGCAGTATGCCTGAGGGTGTCGGTGGCCGAACTCATGAGAACGGGCGAATGGTCATGGCCCAAGCCCCACCTCAAGAAAAGAATAATCATGCTGCTAGAGCCATTCATAAGGTCAAAACTTGGGAGGTACCAGCTGTTGGAAATGGGTGTGACCCTGGATGAACTACGATCCAACAACCCGGGGGTGCTCCTAGACATTGTTCAGGTGGTTATGGATAACAGCAGAATGACACCGAAGATTATCCCGAATAGAGTCTCTCCCAGTTGGGTCAATGACGTCATATGTGCTAAGATTTATGAGAATGAGCACATAATCTTCTGTTCCGGATGTCTGACAAAAGGCCCATGTGTGGATAAAGTGGAAATATGCAATGACATCCTCATGGAATACACCTTCAAGGTGTGTTCGGCTACATTGCCGGTCCTCAAAGGAGACATGTCTCAGATTATATGTGATAGGGACTTCTCGAATGACCCAGATTGGACTTCATCGCCTGTCCAGTTGTTTGAAATGATGGACAATCCGGCTGCTCAATTCACTCCATTCCCAAGGGACGGGCCCATAGCAGTGTCAAGACCATTGGGCAGTGCCGGATTGTCAAGCATCCTGGATATACTGGCAGAGACCAATGGAACCATCATGGTCGGGGATGACAGTGTCAGCATCACTATATGGAGACAGTTTAGAGCAACCAGGAAGGTGATGATTTTCAAGACAGGTGATAACCACCTTGAAGCTGCCTGTGACTTTATCTGTATGGCCCCGGATGAAGCGGACCTGCTCATGGATAGTGAAAGCCCGGATGGGAAGGCTGACGTATATTATGGGGATAACATTCCTATAGCGCCCGGTTGGTGGATTATAACTAGCAGGAGAGATGTCAACAGATTGTACAAATATGGAAAGGACATGAGCCCCACCAGGGTACTAATCTCCAAGGATAGAGGTCAAACCAGAGCAATCTGTGCTGTCAAGATGGAGCAGACCCCGGGCCAGAAGTGGGGAGATTTTCAGGCCACATACAAGAAGATTGAAATGAGATGCGGAAACTACAGTGGGATGGTAAGAAATCCCACAAGCAAGAACAAGTTAATATCATGTGCGGTGTCATTATTCCACAGGGTCAATGGAGATATAGAAGAGGCAGTCAAATGCTGTGTGACGGAGATGAGGACGATTTTCTGGAGGAACGAATTATATACTAAGAAAGCAAAGGATCTCATGTACCTGATGTCAACATTGCACATGGCAGGCATGGAGGGAGGGATAGAGTTTGCAAGACGATCTATCAAGCCTAGAGCAGTGAGACGACCTTACAGAATCCTCATCAAGACTACCGCCAGAAACAATTATAAGGCTGCCAATGATGTCACAGACGTGAGAGAGCTATTCAGAGTAACTCCCAAGCCTATCGGAGCACCCGGGGGAGATATCATCATAAATATCGGGAAATAAGTAATTTTGTTTAAATTATATACATTTAAAGAAAACCGGGTATCTCGGGCTCCCCCCCACTATCGTATATTTTTGTTCACAACTGCGTTAAGAAGGACTAGGACTAGGTCCCGGAGGTGCAACTGGGTCACACCGGAGTCGCAAGGAGATTTCATCAATCCATGTACTGTTGATCTGTCCTGTGT
| 61,649
|
OP186470.1
|
Dicistroviridae sp.
|
Wang,x.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
|
China
|
2023-04-01
| null |
Dicistroviridae sp.
| null |
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,507
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null |
feces
|
2021
| null | null |
Dicistroviridae sp. strain H-A/14, complete genome
|
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| 16,967
|
OP186471.1
|
Dicistroviridae sp.
|
Wang,x.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
|
China
|
2023-04-01
| null |
Dicistroviridae sp.
| null |
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,685
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null |
feces
|
2021
| null | null |
Dicistroviridae sp. strain I-JX-MX/2, complete genome
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| 16,968
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OP186472.1
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Dicistroviridae sp.
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Wang,x.
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Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
|
China
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2023-04-01
| null |
Dicistroviridae sp.
| null |
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,635
|
GenBank
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China
|
China
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feces
|
2021
| null | null |
Dicistroviridae sp. strain I-QQ-GM/12, complete genome
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| 16,969
|
OP186473.1
|
Dicistroviridae sp.
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Wang,x.
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Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
|
China
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2023-04-01
| null |
Dicistroviridae sp.
| null |
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,692
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null |
feces
|
2021
| null | null |
Dicistroviridae sp. strain I-SH-YZY/6, complete genome
|
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| 16,970
|
ON811697.1
|
Dicistroviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Dicistroviridae sp.
| null |
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,097
|
GenBank
| null |
China:Suizhou
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
SAMN28669396
|
PRJNA841744
|
MAG: Dicistroviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
|
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| 20,380
|
ON811698.1
|
Dicistroviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_2
|
Dicistroviridae sp.
| null |
Dicistroviridae
|
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|
GenBank
| null |
China:Suizhou
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
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|
PRJNA841744
|
MAG: Dicistroviridae sp. isolate TIGMIC_2, complete genome
|
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|
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|
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|
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|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
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|
2022-12-16
|
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|
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| null |
Dicistroviridae
|
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|
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MAG: Dicistroviridae sp. isolate TIGMIC_3, complete genome
|
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| 20,382
|
NC_038381.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Bomer,M., Turaki,A.A., Silva,G., Kumar,P.L., Seal,S.E.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2018-08-24
|
DBALV-[3RT]
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,609
|
RefSeq
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Dioscorea cayenensis subsp. rotundata
|
plant leaf
| null | null |
PRJNA485481
|
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-[3RT], complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTTGTTGTTTCTTGTGTTTGTGAAATGGGAATGAGAGGCTAAAACCCTTCTCAGGGTGCGAAGGTAAGGGAAATTGTCTTGATAGAATTTTTCATTATTTTCTCTGAATCTTTAAGTACTGCAATCTGGTTGCTTTATCAATACAGTTTTTGTGACATCGGAAAGTATTGAAATTTTTAATTTACGGAAATAAGGTCTTAAGTTTGAAGTATTTATGTTTAATGGGTGCTGGCTTGATACTGAATTGAGCTTCTGAAAACGCAAAAGACAAGGGCACTATATCCCGCCAAGGCAGGAGGCCGTCAAGGGTGAACCCCCGAGGTGAGTGTTCAAGGAGCTCAGTAAGGTTGAAAAGCTAGTGGTACCTTAGACATAAATATCAAAACTGAGGGCTTTTTCTTCTGTAAAAAGGAAATTGAACGGTTTATTGCTTAAAAGAGGGTTACTGGTTCGACTTGCCTTAGTTCTGAGGCCTGGCCTGGTCCAGCAACTTCAGGGCTTTGTGTACAGAGAACACTGCACTTTAACCCGGAAAGCACGAACCTTCAATACTTACTTATGTTATGATGAACTGTAGAGTATAAGTGATCATGAGTCGGTCTCTAGATTTGGAGAAAACATTGAAAGACTATCTTGATAAAAGTACCGAACCTGAGTACCTTGACCTTCATACCATTGACAGACCCACAACCAAACAGCTAGCTAACAATCTCTGTTATTTGAACCACCAGGCGAAACTATTGTCCCGTGTTTCTTTAAAATATTTCTTCCAGTTACAGGAGGAAATCCAGCAACTGAAAGCGGAGAACGTCAAACTCCGGAAAGAACTGGTCAATCTGACCAAAGAGGTGGTTGAAAACCGCCCCCTGACTGAGAGGAAGGTTCAGGACCTCGTGTTGAGGATCACTGAACAACCGAAGGAAATCGAACAACAGGCAGTGCGCCTAGTGAAGGATCTATCTTCAAAGCTTGATCGGGTGGAAGCAATCTTGCGAAAGGTTGAGGGGAACACCTCTTTATGAGTGAAGAACTCATAAGAGCCCTGAAAACCGTCGAGCACATTGAGCCACCGGCCGTAGGGTTTGTAAGATCCTACGATTATCAAAACAAACTCGCCGGAGCAGTAGCATCAACTCAAAAGCAGAACAACACTATTCTGCAGCTGTTTGTCCAGTTGTTCGAGAAGGTCGCGGAAGTCAAGGCTGACCTTGAAGTTATCAAGAAGCAGTTGGCAGCCCCAACTGAACGTGAAGCATCTGACAGTCTACTTGACCAGGTAATCTCAAAACTTGGCAAGTTATCTCTTGCTGACAAGGTTCCTGAAAAGCCAGGAAAGTTACTTGTCTGGAAGGACCCTGCTCTGATCTACAAAGAAGAGCTTGAAAAGCTATCTTAATGGAGCGGCCCCAGACATCCACTACCCTAGCTACTACACCGTCAGTCTTTGAGGACCAAGTCAGAGACTACCGCCTCGGTGCTCGGAGGCGCTATAACATGAGTCAAGCGGCGCAAAAGCTTGCGAAGACTCTCACTTTTGGGAAATACAGTCAACCTACGTTGGAGCAACAGGTTGACCCTGAGAAGACACTACAGCTCTCATCCATGCAGAGGGCATCCCTAGTACCAGCCGAAGTACTCTATCATTCAAGACCTGATACTGTAAATCATAAGGTCTATATGCATTGGTCTGAGGAGTCAGACCTGGTGGTCAACCGTCAATATGACTCGACGTTCATCCGTCCAGAGTCATATACAACACTGATGAAGTCTGGCATGCAGTTCATTCATATTGGACTGATGCAAGTAAGAATCCAGATCCTGCACAGAGCTGAAGCAGGAACACTCGCAATGATCGTATTCAGAGACTGTTCTTGGAGAGGAAGACGGTCTATGATTGCGAAGATGGAAGTTGATTTGACCAAGGGGAGTCAAATGGTGTATATAGCGCCCAACCTTATAAAGAGGCTTACAGATTTCTATAACAACATCCAAATCTCTATCCTTACCAAAGGATATGACGATTACCAGAATTCTGAAGCCAATCTTTTGATTACTAAAGGTTTAGTGGGCAGGCTATCGAACACCTCAAATGTTGGCTTTGCATACTCCATTTCGGGCATCACCGATTACTTTGTGACACACGGAGTTCAGGCAATCAAAGGCCAACCGGTTTCAACTGAAGAATTCCAGGAAACTCTCTGGAATATTAAACCTTCTAATTTGGTTGTGCCAACACAACCAACTTTTGCCGAGGAGAGGGAGTTAGCAGATGGGAGCATCTCAATTCGATTCTCCAGGTACAAACCTGTACCACAGTTACCCGAGGTCTCCTACAATGCTAATGATGAAGAACTGGGCGATGACGAGAGGCATATAATTGCTTATCTGTCTACCCCGAACCTCGTGGTCAGACTAGTGAATGAAAATGCTATTCTGCCTCAAAGGATGTCTCATGGCGCAGTGGGCTATGACATTGCAATCACAGAAGCTGCTGAAATTTTGCCTGGACAACAGAAGCTACTACCAACAGGTATTTCTCTGCAAGTACCTAATGGTTTCTATGCACACTTATTCATTAAATCTGGAGTAGCTTTGAGGAAGGGGCTGATCCTTAACGCTGGTGTAATTGATCCTGATTACACTGGAGAGTTGAAGCTCTTATTGCTAAACCCTACTGGAGCCCCAGTACATGTCCAAGCAGGAGAGTTTATTGCTCAGGCAGTCCTGCAGGCTATTATTACACCACCAGTCCAGGAAGCACAAGCTCTACAAATGACTCTCCGAGGAGACAGAGGCTTTGGAGAAATGTCCCGCACCAGACTTCCCCCAGTAGAATCTGATGATGGATCACCATCATCACCCTTGTCTGAAGAAGTTCGCATCCTGTTCGAGGATGATCCTTTTCTTGAAGATCCTACTATCTATACTATTGATTCTTTTAACCATTCTTTTAATGATGAAGAAGAGATGGACTATATTTCCTATCTCTATCATCTAGATGATATACCAGCAAATGACGCCCCGATCTATGATGATTATCCTGAAGAAGGCGAGGTAGATGTGTTCAACTTGGCTACACTCGACAGCGGATTTGATCTTGACTATCCAACATTACAGAAGCTCGAAGCAACCATTGCTTCTACCGCTGTTTCTGAATACAGGCCCCCAGAGGACACCACCATGAATCCTCCCATATACCCACCAGCGAGGATTTCTGGACAGGCCTCTACAAGTACCGGCCCAACTTCTACAAGCTATACATCTGGGCCTGGGCCATCCTCTTCAGGCTATTCACAAAGGACACCCTCAGGTGTTCACTTCAGGGCAAGAGACTATTCCAACAACTGGTCTCTTCCATCGGCACAGCAAAACACTGGTGCCATGTTTTACTTACCCCTAGAGCTGGTGAAATTTGACGAGGTATTTTCCCGCTGGGAAAGTATCACGAAGAATCTTGTCTCACAACAGTCATTTATCACTGGCAAAGAGAAGGCGGAGTTCATAGAAAACCTTCTCGGGGAAACAGAAAAGTTGACTTGGATTCAGTGGAGAACGGCTTTTCCCACTGAATATGAAACACTGCTTGCCTCAGCAGATGGGAGAGAAGGAACTCAAAATATTCTGTCCCATATCCGCACCATTTTCACACTCGAAGACCCATACAGGGGCTCTACTAAGGTGCAGGAGCAAGCATATCTTGATCTTGAGCGCATTAGCTGCCGCGATGTAAAGGACCTCATCCCCTTCTTGAACGAATACATGAGGCTGGCGGCCAAGACAGGTAGACTCTTCATCTCCACCGAATTATCTGACAAAATTTGGATGAAGCTACCAGGTGATTTGGGAAAGCGCATCAAGACAAAGTTTGAAGAGCAATATGCCGGAAACACTATCGGAGTGCATCCTCGAATAATGTTCATCTACAAGTTCTTGGAAGAGGAATGTAAAAATGCGGCATTCATGAGATCCATGAAGAACCTCCAATTCTGCAGCAAGATCCCAATCCCGGGATACTATGGAGGAGCTGAGAAGAAATACGGCGTACGAAAATCAAAGACGTACAAAGGGAAGCCACACCAGTCGCACGTCCGTATTGAGAAGAGAAAGCACCTAACCAGAGAAAAACGCTGTAAATGTTTTCTCTGCGGGAAAGAAGGGCACTATGCTCGAGAGTGTCCTAATGACAGGCGCGACATCAAACGTGTCGCAATTTTTGAAGGGTTATCCATCCCAGATGACTTCGACATCGTCTCCGTACACGAAGGAGAGGAACAGAGTGATGCTATCTACTCTGTTTCAGAAGGCGAGAATGAAAGTATTGACCAGGAGGTCAACACTTTTATTTCGTACGGGGAAGGAGGTACCGGTTCTACCACACATTTTTCCAATCAAACTCTTTATTATTTAAAAGAGGAAGGAACAGTGACCCACTACTACCTTGGAGGAGGAGGAACCAAGGTTTCTGTCAAGGTCACGCAAAAAGAGCACGACTGTACACACGATTGGGTGCTCTACGGTGAAAACAATGCACATTGCAGGTTCTGCAGGAGAGAGGTAATGCAGAGATGGAATGCCAAATGTAATAAATGTGACATTACTACTTGTGGCATGTGCTCTGACCACTATGTAGGTTTAAGAGTCCCCTGCAAAAGACCTGAAGTACAGCAAGTGTACCAGCCTACGAATTTGCTAGTGGAACAGCGAAATTACATTATGAGCTGCGAGGAAGAAATCGCGAGGCTGAAAAATGAAATAGAGGCAATGAAGATCTCCTCAGAGAATCAACTGGTTGCTGAGAAGATAGCAAGGGCTGTGGAAGAAGAGCATCTGAAGAAGGAAGTTCAAGCACTGAAGCTTGAAAATGACCGGCTAACTCTGGAGAACGAAGACCAAAGGAAGGAGTTAGAGAAGAAGAACAAGGAGGTTCTGGACCTCCAGTCCTATATTGAAGAACATGATGTGAATGTTCTCATTTGTGAAGGCAACGA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| 4,041
|
ON402788.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Santos,G.B.L., Ferro,M.M.M., Assuncao,I.P., Ramos-Sobrinho,R., Lima,G.S.A.
|
Universidade Federal de Alagoas, Campus de Engenharias e Ciencias Agrarias
|
Brazil
|
2023-04-03
|
DBMU
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,420
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Dioscorea bulbifera
|
plant leaf
|
2021-09
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBMU, complete genome
|
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| 16,953
|
MH404165.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
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Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2019-06-29
|
DBALV-VUT12_DA
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Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
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Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,531
|
GenBank
| null |
Vanuatu
|
Vanuatu
|
Dioscorea alata
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-VUT12_DA, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTCCTTTGTGATTGTTAAGTGCAGTATGGAAGGCTAAGGCCTTACCAGGGTATCAGGGTAAAGGAAATTATCTAGTTTCTTCTTTGTTTTCTTAATCAAAAGGCTGAAATTGATATTGCTTTCTCTATTTATAGTTTCTTGAGAAGATTTTGAAATTTTTAGCATACATGTTCTTAGAGTTTGAAGTGTTTATGCTTAATGGGTGTTTGTTGATACTGAGCCGAGCCTTGAAAGCACAAAAGACGCTGAAATTAAATTTGCTTTCTCTATTTATAGTTTCTTGAGAAGATTTTGAAATTTTTAGCATACATGCTCTTAGAGTTTGAAGTGTTTATGCTTAATGGGTGTTTGTTGATACTGAGCCGAGCCTTGAAAGCACAAAAGACGAAGGCACTATATCCCGTCAGGCAAGAGGCCGTTTAGGGTGAAACCCGGAGGTGAGTGTATAAGGGGCTTTGGTAAGGTTGAAACTTGCGGTACCTTGAGTATAAACATCAAAACTCGAAAGATTATGCTATGTTCTTTAATTTCTTAATCATCTTACCGGAACTATGTTCGATGAAAGGATATCATGAGTAGGTCTATTGATCTTGAGAAAACACTGAAAGATTATCTAGATAAGAGTACTGAACCTGAATACCTTGATTTATATACTGTTGACAAACCCACAACCAAGCAGCTTGCTAATAATCTCTGTTACTTGAATCACCAGGCAAAACTTTTGTCTCGTGTTTCTTTAAAACATTTCTTTCAGTTACAGGAAGAAATACAGGAGTTGAAGGCGGAAAACCGCAGACTTCGTAAAGATCTGGTCAATCTGACCAAAGAGGTGGTTGAGAATCGCCCCCTGACAGAAAGGAAGGTTCAGGACCTCGTGCTGAGGATTACTGAACAGCCAAAAGAAATTGAACAACAGGCAGTGCGCCTAGTCAAGGATCTAACGGTAAAGCTTGATCGGGTGGAAGCAATCTTACGACAGGTTGAAGGGAGCACCTCCTTATGAGCGAAGAACTCATAAGAGCCCTTAAAGCCGTCGAACACATTGAACCACCAGCCGTAGGATTTGTAAAATCTTACGATTATCAGAACAAGCTTGCTGGAGCCGTAGCAGCATCCCAAAAGCAGAACAACACTATTCTGCAATTGCTGATACACTTGTTTGAAAAGGTCGCTGAAGTCAAAACCGACCTTGAAGCTATCAAAAGGCAGTTGGCAGCCCCAACTGACCGTGAAGTGTCTGACAACCTACTTGACCAGGTAATCTCAAAACTTGGCAAGTTATCTCTTGCTACCAAGGTTCCTGAGAAGCCAGGAAAGTTACTTGTCTGGAAGGACCCTGCTCTCATCTACGAAGAAGAACTTGAAAAGCTATCTTAATGGAGCGGCCTCAGACAACATCAACTACCTTAGCTTCAACACCTTCAGTCTTTGAAGATCAAGTCAGAGACTACCGCCTTGGTGCTCGAAGGCGATACAACATGAGTCAAGCAGCGCAAAAGCTAGCGAAGACCCTCACTCTTGGGAAATACTATCAACCTACGCTGGAGCAGCAGGTTGATCCTGAGAAGACTCTGCAGCTCTCATCCATGCAGAGGGCATCCCTTGTACCAGCTGAGGTACTTTATCACTCAAGACCTGACACTGTCAATCACAAGGTCTATATGCATTGGTCTGAGGAATCGGACCTGGTGGTCAACCATCAATATGACTCAACATTCATCCGGCCAGAGTCATATGCCACACTGATGAAATCTGGCATGCAGTTCATACACATTGGACTGATGCAGGTAAGAATCCAGATCCTGCACAGAGCTGAAGCAGGAACTCTTGCAATGATTGTTTTTAGGGACTGTTCATGGAGAGGAAAACGGTCCATGATTGCAAAGATGGAGGTTGATTTGACTCGAGGTAGTCAAATGGTATACATAGCGCCCAACCTTATAAAGAGGCTTTCAGATTTCTACAACAACATTCAAATCTCTATCCTTACCAAAGGATATGATGACTATCAGAATTCTGAAGCTAATCTTTTGATTACAAAAGGTTTAGTGGGCAGGCTATCAAACACATCCAATGTTGGCTTCGCATACTCTATTTCAGGCATCACCGACTACTTTGTCACACATGGTGTGCAAGCAATCAAAGGCCAACCTATTTCAACTGAAGAATTCCAGGAAACTCTCTGGAATATCAAGCCTTCTAATTTGGTTGTGCCAACACAACCAACTTTTGCCGAGGAGAGGGAGTTGGCGGACGGGAGCATCTCAATTCGATTTTCCCGATACAAACCAGTACCGCAGCTACCAGAAGTCTCCCATAATGATGAAGAACTGGGGGATGATGAAAGACATATAATTGCTTATCTGTCTACCCCGAATCTTGTGGTAAGGTTAGTAAATGAAAACGCAGTTCTACCACAAAGAATGTCCCATGGTGCAGTAGGCTATGACATTGCAATTACTGAAGCCGCTGAAATACTGCCAGGACAACAGAAGTTACTCCCAACAGGTATTTCTTTGCAAGTACCAAATGGATTTTATGCTCATCTATTTATTAAATCCGGAGTAGCTTTGAGAAAAGGGTTAGTTCTTAATGCTGGTGTAATTGATCCTGATTACACTGGAGAGCTGAAGTTGCTACTACTTAACCCTACTGGAACCCCAGTACATGTACAAGCAGGCGAATTTATTGCTCAGGCCGTCCTGCAAGCCGTTATCACACCACCAGTACAAGAGGCTCAAGCTCTACAAATAACGCTTCGAGGAGATAGAGCTTTTGGGGAAATGTCCCGCACTCATATCCCTCCAATTGCAACAGAAGAAGATGAGGGATCACCATCATCACCATTGTCTGAAGAAGTTCGCATCCTATTTGAGGATGATCCTTTTATTGACGACCCTACTATTTATACTTTAATTTCTTTTAATGATTCTTTTAAAGAAGAGATGGAGTATATTTCCTATCTCTACAATCCGGATGCACCTGTATATGACGATTATCCGGAAGACGAAGCTGAAGGAGATATCTTCAATCTGGCAACACTTGATAGCAGCCTTGATCTTGACTATCCTATACTACAGAGGCTTGAAGCAACCATTGCTTCTTCTGCTATCTCAGAATACAGACCGCCAGAAGACACCACTATGAATCCTCCAATATATCCACCAGCAAGGATCTCTGGACAAGCTTCCACAAGCTCAGGGCAACCTTCTACATCAGGGCAACCTGCGCCTAACTATTCACAGAGGGTGCCTGCAGGAGTACACTTCAGGGCAAGAGACTACTCTAACAATTGGTCTCTTCCATCGGCACAACAAAACACTGGTGCCATGTTCTACTTGCCACTGGAGTTGGTAAAGTTCGATGAGGTATTTTCCCGATGGGAAAGTATCACAAAGAATCTGGTCTCACAACAGTCATTCATCACAGGCAAAGAGAAGGCTGAATTCATAGAAAACCTTCTCGGAGAAACTGAAAAACTGACCTGGATTCAGTGGAGGACAGCTTTTCCCACTGAATATGAAACACTGCTTGCCTCAGCAGATGGGAGAGAAGGCACACAGAATATCCTGTCCCATATCCGCACCATTTTCACACTTGAAGACCCATACAGGGGTTCTACTAAGGTGCAAGAGCAAGCATATCTAGATCTTGAGCGCATCAGCTGCCAAGATGTGAAGGACCTCATTCCCTTCTTAAATGAATACATGAGGTTGGCAGCAAAGACAGGTAGACTCTTCATCTCAACTGAATTATCTGACAAAATCTGGATGAAGCTACCAGGTGACTTGGGAAAGCGCATCAAGTCAAAATTTGAAGAGCAATATGCCGGGAACACTATCGGGGTACATCCTCGAATAATGTTCATCTATAAGTTCCTGGAAGAAGAGTGCAAGAATGCAGCATTCATGCGGTCTATGAAGAACCTCCAGTTCTGTAGTAAAATTCCAATCCCAGGCTACTATGGAGGAGCTGAAAAGAAATATGGTGTGCGGAAATCTAAAACATACAAAGGGAAGCCACACCAGTCTCATGTCCGCATTGAGAAACGAAAGCACTTGACAAGAGAGAAGCGCTGTAAATGCTTCCTCTGTGGAAAGGAAGGGCACTATGCTCGAGAGTGTCCAAATGACCGCCGCGACATCAAACGTGTCGCAATCTTTGAAGGATTATCTATCCCAGAAGACTTTGATATTGTCTCAGTGCATGAAGGAGAAGAGCAGAGTGATGCAATTTACTCTGTTTCTGAAGGAGAGAATGAAAGTATTGACCCAGAGGTCAACACTTTTATTTCGTACGGGGAAGGGGGAAGAGGTACCACTCCAACTCAAACTCTTTATTACTTGCGAGAGGAAGGTACAATTACCCACTATTACCTTGGAGGCGGAGGAACCAAGGTTTCTGTTAAGGTCACACAGAAAGAGCACGACTGTACACATGATTGGGTGCTCTACAGTGAAAACAATTCACACTGCCGGTTCTGCAAAAGGGAGGTAATGCAGAGATGGAATGCCAAATGCAATAAATGTAACATTACAACTTGTGGCATGTGCTCTGACCATTATGTAGGTCTAAGAGTTCCCTGCAAAAGACCGGAGGTGCAACAAGTCTATCAGCCAACGAACCTGCTAGCAGAACAGCGCAATTACATAATGAGCTGTGAAGAAGAAATTCTAAGGCTGAAGAAGGAAATTGAAGCAATGAAGATCTCCTCAGAAAATCAACTAGTTGCTGAGAAGATGGCAAGAGCTGCCGAAGAGGAGAATTTGAAGAAGGAAGTTCTAGCACTGAAGCTGGAGAATGATCGTCTAACTCTAGAGAATGAAGATCAAAAGAAAGAGTTAGAAAAGAAAAACAAGGAGGTACTGGATCTCCAGTCCTATATTGAGGAACATGATCTTAAGGAACATGATCTTAATGTCCTCATCTGTGAAGGAAACGACAAACAGGTAGCAGCTTCTATACCTGTTCAAGACCGAAGAA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| 62,003
|
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|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2019-06-29
|
DBALV-VUT01_DTV
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Badnavirus alphadioscoreae
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Badnavirus
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Caulimoviridae
|
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| null |
Vanuatu
|
Vanuatu
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Dioscorea transversa
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Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-VUT01_DTV, complete genome
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| 62,004
|
MH404167.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2019-06-29
|
DBALV-VUT01_DTF
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,579
|
GenBank
| null |
Vanuatu
|
Vanuatu
|
Dioscorea trifida
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-VUT01_DTF, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTCCTTTTGTGATTGTTAAGTTCAGTATGGAAGGCTAAGACCTTACCAGGGTATCAGGGTAAAGGAAATTATCTAGTTTTTTTCCTTTGTTTTTCTTAATCAAAAGGCTGAAATTGATATTGCTTTCTCTATTTTATAGTTTCATTGATTGGTTTCCTTTGTGATTGTTAAGTTCAGTATGGAAGGCTAAGACCTTACCAGGGTATCAGGGTAAAGGAAATTATCTAGTTTCTTCTTTGTTTTCTTAATCAAAAGGCTGAAATTGATATTGCTTTCTCTATTTATAGTTTCTTGAGAAGATTTTGAAATTTTTAGCATACATGCTCTTAGAGTTTGAAGTGTTTATGCTTAATGGGTGTTTGTTGATACTGAGCCGAGCCTTGAAAGCACAAAAGACGAAGGCACTATATCCCGTCAGGCAAGAGGCCGTTTAGGGTGAAACCCGGAGGTGAGTGTATAAGGGGCTTTGGTAAGGTTGAAACTTGCGGTACCTTGAGTATAAACATCAAAACTCGAAAGATTATGCTATGTTCTTTAATTTCTTAATCATCTTACCGGAACTATGTTTGATGAAAGGATATCATGAGTAGGTCTATTGATCTTGAGAAAACACTGAAAGATTATCTAGATAAGAGTACTGAACCTGAATACCTTGATTTATATACTGTTGACAAACCCACAACCAAGCAGCTTGCTAATAATCTCTGTTACTTAAATCACCAGGCAAAACTTTTGTCTCGTGTTTCTTTAAAACATTTCTTTCAGTTACAGGAAGAAATACAGGAGTTGAAGGCGGAAAACCGCAGACTTCGTAAAGATCTGGTCAATCTGACCAAAGAGGTGGTTGAGAATCGCCCCCTGACAGAAAGGAAGGTTCAGGACCTCGTGCTGAGGATTACTGAACAGCCAAAAGAAATTGAACAACAGGCAGTGCGCCTAGTCAAAGATCTAACGGTAAAGCTTGATCGGGTGGAAGCAATCTTACGACAGGTTGAAGGGAGCACTTCCTTATGAGTGAAGAACTCATAAGAGCCCTTAAAGCCGTCGAGCACATTGAACCACCAGCCGTAGGATTTGTAAAATCTTACGACTATCAGAACAAGCTTGCTGGAGCCGTAGCAGCATCCCAAAAGCAGAACAACACTATTCTGCAATTGCTGATACACTTGTTTGAAAAGGTCGCTGAAGTCAAAACCGACCTTGAAGCTATCAAAAGGCAGTTGGCAGCCCCAACTGACCGTGAAGTGTCTGACAACCTACTTGACCAGGTAATCTCAAAACTTGGCAAGTTATCTCTTGCTACCAAGGTTCCTGAGAAGCCAGGAAAGTTACTTGTCTGGAAGGATCCTGCTCTCATCTACGAAGAAGAACTTGAAAAGCTATCTTAATGGAGCGACCTCAGACAACATCAACTACCTTAGCTTCAACACCTTCAGTCTTTGAAGATCAAGTCAGAGACTACCGCCTTGGTGCTCGAAGGCGATACAACATGAGTCAAGCAGCGCAAAAGCTAGCGAAGACCCTCACTCTTGGGAAATACTATCAACCTACGCTGGAGCAGCAGGTTGATCCTGAGAAGACTCTGCAGCTCTCATCCATGCAGAGGGCATCCCTTGTACCAGCTGAGGTACTTTATCACTCAAGACCTGACACTGTCAATCACAAGGTCTATATGCATTGGTCTGAGGAATCGGACCTGGTGGTCAACCATCAATATGACTCAACATTCATCCGGCCAGAGTCATATGCCACACTGATGAAATCTGGCATGCAGTTCATACACATTGGACTGATGCAGGTAAGAATCCAGATCCTGCATAGAGCTGAAGCAGGAACTCTTGCAATGATTGTTTTTAGGGACTGTTCATGGAGAGGAAAACGGTCCATGATTGCAAAGATGGAGGTTGATTTGACTCGAGGTAGTCAAATGGTATACATAGCGCCCAACCTTATAAAGAGGCTTTCAGATTTTTACAACAACATTCAAATCTCTATCCTTACCAAAGGATATGATGACTATCAGAATTCTGAAGCTAATCTTTTGATTACAAAAGGTTTAGTGGGCAGGCTATCAAACACATCCAATGTTGGCTTCGCATACTCTATTTCAGGCATCACCGACTACTTTGTCACACATGGTGTGCAAGCAATCAAAGGCCAACCTATTTCAACTGAAGAATTCCAGGAAACTCTCTGGAATATCAAGCCTTCTAATTTGGTTGTGCCAACACAACCAACTTTTGCCGAGGAGAGGGAGTTGGCGGACGGGAGCATCTCAATTCGATTTTCCCGATACAAACCAGTACCACAGCTACCAGAAGTCTCCCATAATGATGAAGAACTGGGGGATGATGAAAGACATATAATTGCTTATCTGTCTACCCCGAATCTTGTGGTAAGGTTAGTAAATGAAAACGCAGTTCTACCACAAAGAATGTCCCATGGTGCAGTAGGCTATGACATTGCAATTACTGAAGCCGCTGAAATACTGCCAGGACAACAGAAGTTACTCCCAACAGGTATTTCTTTGCAAGTACCTAATGGATTTTATGCTCATCTATTTATTAAATCCGGAGTAGCTTTGAGAAAAGGGTTAGTTCTTAATGCTGGTGTAATTGATCCTGATTACACTGGAGAGCTGAAGTTGCTACTACTTAACCCTACTGGAACCCCAGTACATGTACAAGCAGGCGAATTTATTGCTCAGGCCGTCCTGCAAGCCGTTATCACACCACCAGTACAAGAGGCTCAAGCTCTACAAACAACGCTTCGAGGAGATAGAGCTTTTGGGGAAATGTCCCGCACTCATATCCCTCCAACTGCAACAGAAGAAGATGAGGGATCACCATCATCACCACTGTCTGAAGAAGTTCGCATCCTATTTGAGGATGATCCTTTTATTGACGACCCTACTATTTATACTTTAATTTCTTCTGAAGAAGAGATGGAGTATATTTCCTATCTCTACAATCCGGATGCACCTGTATATGACGATTATCCGGAAGACGAAGCTGAAGGAGATGTCTTCAATCTGGCTGACGATTATCCGGAAGACGAAGCTGAAGGAGATGTCTTCAATCTGGCAACACTTGATAGCAGCCTTGATCTTGACTATCCTATACTACAGAGGCTTGAAGCAACCATTGCTTCTTCTGCTATCTCAGAATACAGACCGCCAGAAGACACCACTATGAATCCTCCAATATATCCACCAGCAAGGATCTCTGAACGAGCTTCCACAAGCTCAGGGCAACCTTCTACATCAGGGCAACCTGCGCCTAACTATTCACAGAGGGTGCCTGCAGGAGTACACTTCAGGGCAAGAGACTACTCTAACAATTGGTCTCTTCCATCGGCACAACAAAACACTGGTGCCATGTTCTACTTGCCACTGGAGTTGGTAAAGTTCGATGAAGTATTTTCCCGATGGGAAAGTATCACAAAGAATCTGGTCTCACAACAGTCATTCATCACAGGCAAAGAGAAGGCTGAATTCATAGAAAACCTTCTCGGAGAAACTGAAAAACTGACCTGGATTCAGTGGAGGACAGCTTTTCCCACTGAATATGAAACACTGCTTGCCTCAGCAGATGGGAGAGAAGGCACACAGAATATCCTGTCCCATATCCGCACCATTTTCACACTTGAAGACCCATACAGGGGTTCTACTAAGGTGCAAGAGCAAGCATATCTAGATCTTGAGCGCATCAGCTGCCGAGATGTGAAGGACCTCATTCCCTTCTTAAATGAATACATGAGGTTGGCAGCAAAGACAGGTAGACTCTTCATCTCAACTGAATTATCTGACAAAATCTGGATGAAGCTACCAGGTGACTTGGGAAAGCGCATCAAGTCAAAATTTGAAGAGCAATATGCCGGGAACACTATCGGGGTACATCCTCGAATAATGTTCATCTATAAGTTCCTGGAAGAAGAGTGCAAGAATGCAGCATTCATGCGGTCTATGAAGAACCTCCAGTTCTGTAGTAAAATTCCAATTCCAGGCTACTATGGAGGAGCTGAAAAGAAATATGGTGTGCGGAAATCTAAAACATACAAAGGGAAGCCACACCAGTCTCATGTCCGCATTGAGAAACGAAAGCACTTGACAAGAGAGAAGCGCTGTAAATGCTTCCTCTGTGGAAAGGAAGGGCACTATGCTCGAGAGTGTCCAAATGACCGCCGCGACATCAAACGTGTCGCAATCTTTGAAGGATTATCTATCCCAGAAGACTTTGATATTGTCTCCGTGCATGAAGGAGAAGAGCAAAGTGATGCAATTTACTCTGTTTCTGAAGGAGAGAATGAAAGTATTGACCCAGAGGTCAACACTTTTATTTCGTACGGGGAAGGGGGAAGAGGTACCACTCCAACTCAAACTCTTTATTACTTGCGAGAGGAAGGTACAGTTACCCACTATTACCTTGGAGGCGGAGGAACCAAGGTTTCTGTTAAGGTCACACAGAAAGAGCACGACTGTACACATGATTGGGTGCTCTACAGTGAAAACAATTCACACTGCCGGTTCTGCAAAAGGGAGGTAATGCAGAGATGGAATGCCAAATGCAATAAATGTAACATTACAACTTGTGGCATGTGCTCTGACCATTATGTAGGTCTAAGAGTTCCCTGCAAAAGACCGGAGGTGCAACAAGTCTATCAGCCAACGAACCTGCTAGCAGAACAGCGCAATTACATAATGAGCTGTGAAGAAGAAATCCTAAGGCTGAAGAATGAAATTGAAGCAATGAAGATCTCCTCAGAAAATCAACTAGTTGCTGAGAAGATAGCAAGAGCTGTCGAAGAGGAGAATTTGAAGAAGGAAGTTCTAGCACTGAAGCTGGAGAATGATCGTCTAACTCTAGAGAATGAAGATCAAAAGAAAGAGTTAGAGAAGAAAAACAAGGAGGTACTGGACCTCCAGTCCTATATTGAGGAACATGATCTTAAGGAACATGATCTTAATGTCCTCATCTGTGAAGG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| 62,005
|
MH404168.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
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Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2019-06-29
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DBALV-TON02_DE
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
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Caulimoviridae
|
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| 7,390
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GenBank
| null |
Tonga
|
Tonga
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Dioscorea esculenta
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-TON02_DE, complete genome
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| 62,006
|
MH404169.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2019-06-29
|
DBALV-VUT04_DB
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,502
|
GenBank
| null |
Vanuatu
|
Vanuatu
|
Dioscorea bulbifera
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-VUT04_DB, complete genome
|
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| 62,007
|
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|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
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|
2019-06-29
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Badnavirus alphadioscoreae
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Badnavirus
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Vanuatu
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Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-VUT02_DB, complete genome
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| 62,008
|
MH404171.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
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Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
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Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
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Australia
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2019-06-29
|
DBALV-VUT04_DE
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
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Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,401
|
GenBank
| null |
Vanuatu
|
Vanuatu
|
Dioscorea esculenta
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-VUT04_DE, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTCCTTTGTGATTGTTAAGTTCAGTATGGAAGGCTAAGACCTTACCAGGGTATCAGGGTAAAGGAAATTATCTAGTTTCTTCTTTGTTTTCTTAATCAAAAGGCTGAAATTGATATTGCTTTCTCTATTTATAGTTTCTTGAGAAGATTTTGAAATTTTTAGCGCAATGGAGGCCACATTTAAAAAGCACGTGGATGCATTACTGGAGCTCAAGGTGATTCGGCCCAGCACGAGTCAACATCGAACTACCATGACAATCGGTTCTGATCAGTAACTCCTTTTTATCCAAGTAATGAATTTTGAATTTATCCATGCAATTCATTACTCTTCATTCTCTAGAGTTAGACGATCATTCTCCAGCTTCAGTGCTAGAACTTCCTTCTTCAAATTCTCCTCTTCGATCAGCTCTTAAATTTTCTTAATCATCTTACCGGAACTATGTTTGATGAAAGGATATCATGAGTAGGTCTATTGATCTTGAGAAAACACTGAAAGATTATCTAGATAAGAGTACTGAACCTGAATACCTTGATTTATATACTGTTGACAAACCCACAACCAAGCAGCTTGCTAATAATCTCTGTTACTTGAATCACCAGGCAAAACTTTTGTCTCGTGTTTCTTTAAAACATTTCTTTCAGTTACAGGAAGAAATACAGGAGTTGAAGGCGGAAAACCGCAGACTTCGTAAAGATCTGGTCAATCTGACCAAAGAGGTGGTTGAGAATCGCCCCCTGACAGAAAGGAAGGTTCAGGACCTCGTGCTGAGGATTACTGAACAGCCAAAAGAAATTGAACAACAGGCAGTGCGCCTAGTCAAGGATCTAACGGTAAAGCTTGATCGGGTGGAAGCAATCTTACGACAGGTTGAAGGGAGCACTTCCTTATGAGCGAAGAGCTCATAAGAGCCCTTAAAGCCGTCGAACACATTGAACCACCAGCCGTAGGATTTGTAAAATCTTACGACTATCAGAACAAGCTTGCTGGAGCCGTAGCAGCATCCCAAAAGCAGAACAACACTATTCTGCAATTGCTGATACACTTGTTTGAAAAGGTCGCTGAAGTCAAAACCGACCTTGAAGCTATCAAAAGGCAGTTGGCAGCCCCAACTGACCGTGAAGTGTCTGACAACCTACTTGACCAGGTAATCTCAAAACTTGGCAAGTTATCTCTTGCTACCAAGGTTCCTGAGAAGCCAGGAAAGTTACTTGTCTGGAAGGATCCTGCTCTCATCTACGAAGAAGAACTTGAAAAGCTATCTTAATGGAGCGGCCTCAGACAACATCAACTACCTTAGCTTCAACACCTTCAGTCTTTGAAGATCAAGTCAGAGACTACCGCCTTGGTGCTCGAAGGCGATACAACATGAGTCAAGCAGCGCAAAAGCTAGCGAAGACCCTCACTCTTGGGAAATACTATCAACCTACGCTGGAGCAGCAGGTTGATCCTGAGAAGACTCTGCAGCTCTCATCCATGCAGAGGGCATCCCTTGTACCAGCTGAGGTACTCTATCACTCAAGACCTGACAATGTCAATCACAAGGTCTATATGCATTGGTCTGAGGAATCGGACCTGGTGGTCAACCATCAATATGACTCAACATTCATCCGGCCAGAGTCATATGCCACACTGATGAAATCTGGCATGCAGTTCATACACATTGGACTGATGCAGGTAAGAATCCAGATCCTGCATAGAGCTGAAGCAGGAACTCTTGCAATGATTGTTTTTAGGGACTGTTCATGGAGAGGAAAACGGTCCATGATTGCAAAGATGGAGGTTGATTTGACTCGAGGTAGTCAAATGGTATACATAGCGCCCAACCTTATAAAGAGGCTTTCAGATTTTTACAACAACATTCAAATCTCTATCCTTACCAAAGGATATGATGACTATCAGAATTCTGAAGCTAATCTTTTGATTACAAAAGGTTTAGTGGGCAGGCTATCAAACACATCCAATGTTGGCTTCGCATACTCTATTTCAGGCATCACCGACTACTTTGTCACACATGGTGTGCAAGCAATCAAAGGCCAACCTATTTCAACTGAAGAATTCCAGGAAACTCTCTGGAATATCAAGCCTTCTAATTTGGTTGTGCCAACACAACCAACTTTTGCCGAGGAGAGGGAGTTGGCGGACGGGAGCATCTCAATTCGATTTTCCCGATACAAACCAGTACCACAGCTACCAGAAGTCTCCCATAATGATGAAGAACTGGGGGATGATGAAAGACATATAATTGCTTATCTGTCTACCCCGAATCTTGTGGTAAGGTTAGTAAATGAAAACGCAGTTCTACCACAAAGAATGTCCCATGGTGCAGTAGGCTATGACATTGCAATTACTGAAGCCGCTGAAATACTGCCAGGACAACAGAAGTTACTCCCAACAGGTATTTCTTTGCAAGTACCTAATGGATTTTATGCTCATCTATTTATTAAATCCGGAGTAGCTTTGAGAAAAGGGTTAGTTCTTAATGCTGGTGTAATTGATCCTGATTACACTGGAGAGCTGAAGTTGCTACTACTTAACCCTACTGGAACCCCAGTACATGTACAAGCAGGCGAATTTATTGCTCAGGCCGTCCTGCAAGCCGTTATCACACCACCAGTACAAGAGGCTCAAGCTCTACAAACAACGCTTCGAGGAGATAGAGCTTTTGGGGAAATGTCCCGCACTCATATCCCTCCAACTGCAACAGAAGAAGATGAGGGATCACCATCATCACCACTGTCTGAAGAAGTTCGCATCCTATTTGAGGATGATCCTTTTATTGATGACCCTACTATTTATACTTTAATTTCTTTCAATGATTCTTTTGAAGGAGAGATGGAGTATATTTCCTATCTCTACAATCCGGATGCACCTGTATATGACGATTATCCGGAAGACGAAGCTGAAGGAGATGTCTTCAATCTGGCAACACTTGATAGCAGCCTTGATCTTGACTATCCTATACTACAGAGGCTTGAAGCAACCATTGCTTCTTCTGCTATCTCAGAATACAGACCGCCAGAAGACACCACTATGAATCCTCCAATATATCCACCAGCAAGGATCTCTGAACAAGCTTCCACAAGCTCCGGGCAACCTGCGCCTAACTATTCACAGAGGGTGCCTGCAGGAGTACACTTCAGGGCAAGAGACTACTCTAACAATTGGTCTCTTCCATCGGCACAACAAAACACTGGTGCCATGTTCTACTTGCCACTGGAGTTGGTAAAGTTCGATGAAGTATTTTCCCGATGGGAAAGTATCACAAAGAATCTGGTCTCACAACAGTCATTCATCACAGGCAAAGAGAAGGCTGAATTCATAGAAAACCTTCTCGGAGAAACTGAAAAACTGACCTGGATTCAGTGGAGGACAGCTTTTCCCACTGAATATGAAACACTGCTTGCCTCAGCAGATGGGAGAGAAGGCACACAGAATATCCTGTCCCATATCCGCACCATTTTCACACTTGAAGACCCATACAGGGGTTCTACTAAGGTGCAAGAGCAAGCATATCTAGATCTTGAGCGCATCAGCTGCCGAGATGTGAAGGACCTCATTCCCTTCTTAAATGAATACATGAGGTTGGCAGCAAAGACAGGTAGACTCTTCATCTCAACTGAATTATCTGACAAAATCTGGATGAAGCTACCAGGTGACTTGGGAAAGCGCATCAAGTCAAAATTTGAAGAGCAATATGCCGGGAACACTATCGGGGTACATCCTCGAATAATGTTCATCTATAAGTTCCTGGAAGAAGAGTGCAAGAATGCAGCATTCATGCGGTCTATGAAGAACCTCCAGTTCTGTAGTAAAATTCCAATTCCAGGCTACTATGGAGGAGCTGAAAAGAAATATGGTGTGCGGAAATCTAAAACATACAAAGGGAAGCCACACCAGTCTCATGTCCGCATTGAGAAACGAAAGCACTTGACAAGAGAGAAGCGCTGTAAATGCTTCCTCTGTGGAAAGGAAGGGCACTATGCTCGAGAGTGTCCAAATGACCGCCGCGACATCAAACGTGTCGCAATCTTTGAAGGATTATCTATCCCAGAAGACTTTGATATTGTCTCCGTGCATGAAGGAGAAGAGCAGAGTGATGCAATTTACTCTGTTTCTGAAGGAGAGAATGAAAGTATTGACCCAGAGGTCAACACTTTTATTTCGTACGGGGAAGGGGGAAGAGGTACCACTCCAACTCAAACTCTTTATTACTTGCGAGAGGAAGGTACAGTTACCCACTATTACCTTGGAGGCGGAGGAACCAAGGTTTCTGTTAAGGTCACACAGAAAGAGCACGACTGTACACATGATTGGGTGCTCTACAGTGAAAACAATTCACACTGCCGGTTCTGCAAAAGGGAGGTAATGCAGAGATGGAATGCCAAATGCAATAAATGTAACATTACAACTTGTGGCATGTGCTCTGACCATTATGTAGGTCTAAGAGTTCCCTGCAAAAGACCGGAGGTGCAACAAGTCTATCAGCCAACGAACCTGCTAGCAGAACAGCGCAATTACATAATGAGCTGTGAAGAAGAAATTCTAAGGCTGAAGAATGAAATTGAAGCAATGAAGATCTCCTCAGAAAATCAACTAGTTGCTGAGAAGATAGCAAGAGCTGTCGAAGAGGAGAATTTGAAGAAGGAAGTTCTAGCACTGAAGCTGGAGAATGATCGTCTAACTCTAGAGAATGAAGATCAAAAGAAAGAGTTAGAGAAGAAAAACAAGGAGGTACTGGACCTCCAGTCCTATATTGAGGAACATGATCTTAAGGAACATGATCTTAATGTCCTCATCTGTGAAGGAAACGACAAACAGGTAGCAGCTTCTATACCTGTTCAAGACCGAAGAAATGGGCTCTACAATCTAGTAGTGGAGCTAGAAATCCCAGGATGCGCACCACTGAAGGTGAACGCCATCCTTGACACTGGTGCAACCACATGTTGCATCAACAGTGAAGGACTCCCTAAAGAGATGATGGAA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| 62,009
|
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Dioscorea bacilliform AL virus
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Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
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Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
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Australia
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2019-06-29
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Badnavirus alphadioscoreae
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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Vanuatu
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Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-VUT01_DE, complete genome
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| 62,010
|
MH404173.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2019-06-29
|
DBALV-VUT38_DA
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,523
|
GenBank
| null |
Vanuatu
|
Vanuatu
|
Dioscorea alata
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-VUT38_DA, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTCCTTTGTGATTGTTTGGAATGCTAAGGCCTTACCAGGGTATATCAGGGTAAAGGAAATTATCTAGTTTCTTCTTTGTTTTCTTAATCAAAAGGCTGAAATTGATATTGCTTTCTCTATTTATAGTTTCTAGAGAAGATTTTGAAATTTTTAGCATACATGTTTCTTAGAGTTTGAAGTGTTTATGCTTAATGGGTGTTTGTTGATACTGAGCCAAGCCTTGAAAGCACAAAAGACGAAGGCACTATATCCCGTCAGGCAAGAGGCCGTTTAGGGTGAAACCCGGAGGTGAGTGTATAAGGGGCTTTGGTAAGGTTGAAACTTGCGGTACCTTGAGTATAAACATCAAAACTCGAAAGATTATGTTATGTTCTTTAATTTCTTAATCATCTTACCGGAACTATGTTCGATGAAAGGATATCATGTGAGTGTATAAGGGGCTTTGGTAAGGTTGAAACTTGCGGTACCTTGAGTATAAACATCAAAACTCGAAAGATTATGTTATGTTCTTTAATTTCTTAATCATCTTACCGGAACTATGTTCGATGAAAGGATATCATGAGTAGGTCTATTGATCTTGAGAAAACATTGAAAGATTATCTAGATAAGAGTACTGAACCTGAATACCTTGATTTATATACTGTTGACAAACCCACAACTAAGCAGCTCGCTAGTAATCTCTGTTACTTGAATCACCAGGCAAAACTCTTGTCCCGTGTTTCTTTAAAACATTTCTTTCAGTTACAGGAAGAAATACAGGAGTTGAAGGCGGAAAACCGCAGACTTCGTAAAGATCTGGTCAATCTGACCAAAGAGGTGATTGAGAATCGCCCCCTGACAGAAAAGAAGGTTCAGGACCTCGTGCTGAGGATTACTGAACAGCCAAAAGAAATTGAACAACAGGCAGTGCGCCTAGTCAAGGATCTAACTATAAAGCTTGATCGGGTGGAAGCAATCTTACGACAGGTTGAAGGGAGCACTTCCTTATGAGCGAAGAACTCATAAGAGCCCTTAAAGCCGTCGAACACATTGAACCACCAGCCGTAGGATTTGTAAAATCTTACGATTATCAGAACAAGCTTGCTGGAGCCGTAGCAGCATCCCAAAAGCAGAACAACACTATTCTGCAATTGCTGATCCACTTGTTTGAAAAGGTCGCTGAAGTCAAAGCCGACCTTGAAGCCATCAAAAGGCAGTTGGCAGCCCCAACTGACCGTGAAGTGTCTGACAACCTACTTGACCAGGTAATCTCAAAACTTGGCAAGTTATCTCTCGCTACCAAGGTTCCTGAGAAGCCAGGAAAGTTACTTGTCTGGAAGGACCCTGCTCTCATCTACGAAGAAGAATTTGAAAAGCTTTCTTAATGGAGCGGCCTCAGACATCAACTACCTTAGCTTCAACACCTTCAGTCTTTGAAGATCAAGTCAGAGACTACCGCCTTGGTGCTAGAAGGCGTTACAACATAAGTCAAGCAGCGCAAAAGCTAGCGAAGACTCTCACTTTTGGGAAGTACTATCAACCCACGCTGGAGCAGCAGGTTGATCCGGAGAAGACTCTGCAGCTCTCATCCATGCAGAGGGCATCCCTTGTACCAGCAGAGGTACTGTACCACTCAAGACCTGACTCTATCAATCACAAGGTCTATATGCATTGGTCTGAGGAATCGGACCTGGTGGTCAATCGTCAATATGACTCAACATTCATCCGACCAGAGTCATATGCTACACTGATGAAGTCCGGCATGCAGTTCATACACATTGGACTGATGCAGGTAAGAATCCAGATCCTGCACAGAGCTGAAGCAGGAACTCTTGCAATGATTGTTTTTAGGGACTGTTCTTGGAGAGGAAAACGGTCCATGATAGCAAAGATGGAGGTTGATTTGACTCGAGGGAGTCAAATGGTATACATAGCGCCCAACCTTATAAAGAGGCTTTCAGATTTCTACAACAACATTCAAATCTCTATCCTTACCAAAGGATATGATGATTATCAAAATTCTGAAGCTAATCTTTTAATTACAAAAGGTTTAGTGGGTAGGCTATCAAACACCTCCAATGTTGGCTTCGCATACTCTATTTCAGGCATCACCGACTACTTTGTCACACATGGTGTGCAAGCAATTAAAGGCCAACCTATTTCAACTGAAGAATTCCAGGAAACTCTCTGGAATATCAAGCCTTCTAATTTGGTTGTGCCAACACAACCAACTTTTGCCGAGGAGAGGGAGTTGGCGGACGGGAGCATCTCAATTCGATTTTCCCGATACAAACCAGTACCACAGCTACCAGAAGTCTCCTACAACAATGAAGAACTGGGGGATGATGAAAGACACATAATTGCTTATCTGTCTACCCCGAATCTTGTGGTCAGATTAGTAAATGAAAATGCAGTTCTGCCACAAAGGATGTCACATGGCGCAGTAGGCTATGATATTGCAATCACTGAAGCCGCTGAAATACTGCCCGGACAACAAAAGCTACTTCCAACAGGTATTGCTTTGCAAGTACCTAATGGATTTTATGCTCATCTATTTATTAAATCAGGAGTAGCTTTGAGAAAAGGGTTAATTCTTAATGCTGGTGTAATCGATCCTGATTACACGGGAGAGCTGAAGTTACTACTACTTAACCCTACTGGAACCCCAGTACATGTACAAGCAGGCGAATTTATTGCTCAGGCCGTCCTGCAAGCAATTATTACACCACCAGTACAAGAAGCTCAAGCTCTACAAATGACTCTGCGAGGAGATAGAGCTTTTGGGGAAATGTCCCGCACTCATATCCCTCCAACTGTAACTGAAGAAGATGAGGGATCACCATCATCACCACTGTCTGAAGAAGTTCGCATCCTATTTGAGGATGACCCCTTTATTGATGACCCTACTATTTATACTTTAAATTCTTTTGAAGAAGAGATGGAGTATATTTCCTATCTCTACAATCCGGATGCACCTGCATATGACGATTATCCGGAAGAAAGAGTTGAAGAAGATGTCTTCAATCTGGCAACACTTGATAGCAGCCTTGATCTTGACTATCCTATACTACAGAGGCTTGAAGCAACCATTGCTTCCTCTGCTATCTCAGAATACAGACCGCCAGAAGACACCACTATGAATCCTCCAATATATCCACCAGCGAGGATCTCTGGACAAGCTTCCACGAGCTCAGGGCAACCTTCTACATCAGGGCAACCTGTGCCTAACTATTCACAGAGGGTGCCTGCAGGAGTACACTTCAGGGCAAGAGACTACTCCAACAATTGGTCTCTTCCATCGGCACAACAAAACACTGGTGCCATGTTCTACTTGCCACTGGAGTTGGTGAAGTTTGATGAGGTATTTTCCCGATGGGAAAGTATCACGAAGAATCTGGTCTCACAACAGTCATTCATCACGGGGAAAGAGAAGGCTGAATTCATAGAAAACCTTCTCGGAGAAACAGAAAAACTGACTTGGATTCAGTGGAGAACAGCTTTTCCCACTGAATATGAAACATTGCTTGCCTCAGCAGATGGGAGAGAAGGCACACAGAATATCCTGTCCCATATCCGCACCATTTTCACACTTGAAGACCCATACAGGGGTTCTACTAAGGTGCAAGAGCAAGCATATCTGGATCTTGAGCGCATCAGCTGCCGAGATGTGAAGGACCTCATTCCCTTCTTAAATGAATACATGAGGTTGGCAGCAAAGACAGGTAGACTCTTCATCTCAACTGAATTATCTGACAAAATCTGGATGAAGCTACCAGGTGACTTGGGGAAACGCATCAAGTCAAAATTTGAAGAGCAATATGCCGGGAACACTATCGGGGTACATCCTCGAATAATGTTCATCTATAAGTTCCTAGAGGAGGAATGTAAGAATGCGGCATTCATGAGATCTATGAAGAACCTCCAGTTCTGTAGCAAAATTCCAATCCCAGGCTACTATGGAGGAGCTGAAAAGAAATATGGTGTACGGAAGTCCAAGACATACAAAGGGAAGCCACACCAGTCTCATGTCCGCATTGAGAAACGAAAGCACCTGACAAGAGAGAAGCGCTGCAAATGCTTCCTCTGTGGAAAGGAAGGGCATTATGCTCGAGAATGCCCAAATGACCGCCGCGACATCAAGCGTGTCGCAATCTTTGAAGGATTATCTATCCCGGAAGACTTTGATATCGTCTCCGTACATGAAGGAGAAGAACAGAGTGATGCAATCTACTCTGTTTCTGAAGGAGAGAATGAAAGTATTGACCCAGAGGTCAACACTTTTATTTCGTACGGGGAAGGGGGAAGAGGTACCACTCCAACTCAAACTCTTTATTATTTGCGAGAAGAAGGTACAATTACCCACTATTACCTTGGAGGCGGAGGAACCAAGGTTTCTGTTAAAGTTACACAGAAGGAGCACGACTGTACACATGATTGGGTGCTCTACAGTGAAAACAACTCACAATGCCGGTTCTGCAAAAGGGAGGTAATACAGAGATGGAATGCCAAATGTAATAAATGTAACATTACAACTTGTGGCATGTGCTCTGACCATTATGTAGGTCTAAGAGTCCCCTGCAAAAGACCGGAGGTGCAGCAAGTCTATCAGCCTACAAACCTACTGGCGGAACAGCGCAATTACATAATGAGCTGTGAGGAAGAAATTTTAAGGCTGAAGAATGAAATTGAAGCGATGAAGATCTCCTCAGAAAATCAACTTGTTGCTGAGAAGATGGCAAGAGCTGCTGAAGAGGAGAACTTGAAGAAGGAAGCTCTAGCACTGAAGCTGGAGAATGATCGTCTAACTCTGGAGAATGAAGATCAAAAGAAGGAGTTAGAGAAGAAAAACAAGGAGGTACTGGATCTCCAGTCCTATATTGAGGGACATGATCTTAATGTCCTCATCTGTGAAGGAAACGACAAACAGGTTGCAGCTTCTATACCTGTTCAAGATCGAAGAAATGGGCTCTACAATCTAGTAGTGGAGCTAGAAATCCCAGGATG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| 62,011
|
MH404174.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2019-06-29
|
DBALV-VUT01_DB
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
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| 7,512
|
GenBank
| null |
Vanuatu
|
Vanuatu
|
Dioscorea bulbifera
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2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-VUT01_DB, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTCCTTTGTGATTATGGAAGGCTAAGGCCTTACCAGGGTATCAGGGTAAAGGAAATTATCTAGTTTCTTCTTTGTTTTCTTAATCAAGAGGCTGAAATTGATATTGCTTTCTCTATTTATAGTTTCTTGAGAAGATTTTGAAATTTTAGCATACATGCTCTTAGAGTTTGAAGTGTTTATGCTTAATGGGTGTTTGTTGATACTGAGCCGAGCCTTGAAAGCACAAAAGACGAAGGCACTATATCCCGTCAGGCAAGAGGCCGTTTAGGGTGAAACCCGGAGGTGAGTGTATAAGGGGCTTTGGTAAGGTTGAAACTTGCGGTACCTTGAGTATAAACATCAAAACTCGAAAGATTATGTTATGTTCTTTAATTTCTTAATCATCTTACCGGAACTGTGTTCGATGAAAGGATATCATGAGTAGGTCTATTGATCTTGAGAAAACACTGAAAGTTGCGGTACCTTGAGTATAAACATCAAAACTCGAAAGATTATGTTATGTTCTTTAATTTCTTAATCATCTTACCGGAACTGTGTTCGATGAAAGGATATCATGAGTAGGTCTATTGATCTTGAGAAAACACTGAAAGATTATCTAGATAAGAGTACTGAACCTGAATACCTTGATTTATATACTGTTGACAAACCCACAACCAAGCAGCTTGCTAATAATCTCTGTTACTTGAATCACCAGACAAAACTTCTGTCTCGTGTTTCTTTAAAACATTTCTTTCAGTTACAGGAAGAAATACAGGAGTTGAAGGCGGAAAACCGCAGACTTCGTAAAGATCTGGTCAATCTGACCAAAGAAGTGGTTGAGAACCGCCCCCTGACAGAAAGAAAGGTTCAGGACCTCGTGCTGAGGATTACTGAACAACCAAAAGAAATTGAACAACAGGCAGTGCGCCTAGTCAAAGATCTAACTGTAAAGCTTGATCGAGTGGAAGCAATCTTACGACAGGTTGAAGGGAGCACTTCCTTATGAGCGAAGAACTCATAAGAGCCCTTAAAGCCGTCGAACATATTGAACCACCAGCCGTAGGATTTGTAAAATCTTACGATTATCAGAACAAGCTTGCTGGAGCCGTAGCAGCATCCCAAAAGCAGAACAACACTATTCTGCAATTGCTAATCCACTTGTTTGAGAAGGTCGCTGAAGTCAAAGCCGACCTTGAAGTTATCAAAAGGCAGTTGGCAGCCCCAACTGACCGTGAAGTGTCTGACAACCTACTTGACCAGGTAATCTCAAAACTTGGCAAGTTATCTCTCGCTACTAAGGTTCCTGAGAAGCCAGGAAAGTTACTTGTCTGGAAGGACCCTGCTCTCATCTACGAAGAAGAACTTGAAAAGCTATCTTAATGGAGCGGCCACAGACATCAACTATCTTAGCTTCAACACCTTCAGTCTTTGAAGATCAAGTCAGAGACTACCGCCTTGGTGCTCGAAGGCGATACAACATGAGTCAAGCAGCGCAAAAGCTAGCGAAGACTCTCACTTTTGGGAAATACTATCAACCTACGCTGGAGCAGCAGGTTGATCCTGAGAAGACTCTGCAGCTCTCATCCATGCAGAGGGCATCCCTTGTACCAGCAGAGGTATTGTACCACTCAAGACCTGACTCTATCAATCATAAGGTCTATATGCATTGGTCTGAGGAATCGGACCTGGTGATCAACCATCAATATGACTCGACATTCATCCGACCAGAGTCATATGCCACACTGATGAAATCCGGCATGCAGTTCATACACATTGGACTGATGCAGGTAAGAATCCAGATCCTGCACAGAGCTGAAGCAGGAACTCTTGCAATGATTGTTTTTAGGGACTGTTCTTGGAGAGGAAAACGGTCCATGATTGCAAAAATGGAGGTTGATTTGACTCGAGGGAGTCAAATGGTGTACATAGCGCCCAACCTTATAAAGAGGCTTTCAGATTTCTACAACAACATTCAAATCTCTATCCTTACAAAAGGATATGATGATTATCAAAATTCTGAAGCTAATCTTTTGATTACAAAAGGTTTAGTGGGCAGGCTATCAAACACCTCCAATGTTGGCTTCGCATACTCTATTTCAGGCATCACCGACTACTTTGTCACACATGGTGTGCAAGCAATCAAAGGCCAACCTGTTTCAACTGAAGAATTCCAGGAAACTCTCTGGAATATCAAGCCTTCTAATTTGGTTGTGCCAACACAACCAACTTTTGCCGAGGAGAGGGAGTTGGCGGACGGGAGTATCTCAATTCGATTTTCCCGATATAAACCAGTACCGCAGCTACCAGAAGTCTCCTACAACAATGATGAAGAACTGGGGGATGATGAAAGACACATAATTGCTTATCTGTCTACCCCGAATCTTGAAGAAAGATTAGTGATCACCATCGCAATTCTACCACAAAGAATGTCCCATGGTGCAGTAGGCTATGACATTGCAATTACTGAAGCCGCTGAAATACTGCCAGGACAACAAAAGTTACTCCCAACAGGTATTTCTTTGCAAGTACCTAATGGATTTTATGCTCATCTATTTATTAAATCAGGAGTAGCTTTGAGAAAAGGGTTAGTTCTTAATGCTGGTGTAATTGATCCTGATTACACTGGAGAGGTGAAATTGTTACTGCTAAACCCTACTGGAACCCCAGTACATGTTCAAGCAGGAGAATTTATTGCTCAAATAGTCCTGCAAGCAATTATCACACCACCAGTACAAGAAGCTCAAGCTCTACAAATGACTCTGCGAGGAGATAGAGCTTTTGGGGAAATGTCCCGCACTCATATCCCTCCAACTGCAACAGAAGAAGATGAGGGATCACCATCATCACCACTGTCTGAGGAAGTTCGCATCCTATTTGAGGATGACCCATTTATTGATGACCCTACTATTTATACTTTAAATCCTTTTGAAGAAGAGATGGAGTATATTTCCTATCTCTACAATCCGGATGCACCTGTATATGACGATTATCCGGAAGACGAAGCTGAAGGAGATGTCTTCAATCTGGCAACACTTGATAGCAGTCTTGATCTTGACTATCCCATACTACAGAGGCTTGAAGCAACCATTGCCTCTTCTGCTATTTCAGAATACAGACCGCCAGAAGACACCACTATGAATCCTCCAATATATCCACCAGCGAGGATCTCTGGACAAGCTTCCACGAGCTCAGGGCAACCTTCTACATCAGGGCAACCTGCGCCTAACTATTCACAGAGGGTGCCTGCAGGAGTACACTTCAGGGCAAGAGACTACTCTAACAATTGGTCTCTTCCATCGGCACAACAAAACACTGGTGCCATGTTCTACTTGCCACTGGAGTTGGTGAAATTTGATGAGGTATTTTCCCGATGGGAGAGTATCACAAAGAATCTGGTCTCACAACAGTCATTCATCACGGGCAAAGAAAAGGCTGAATTCATAGAAAACCTTCTCGGAGAAACTGAAAAACTGACTTGGATTCAGTGGAGGACAGCTTTTCCCACTGAATATGAAACACTGCTTGCCTCAGCAGATGGGAGAGAAGGCACACAGAATATCCTGTCCCATATCCGCACCATTTTCACACTTGAAGACCCATACAGGGGTTCTACTAAGGTGCAAGAGCAAGCATACCTGGATCTTGAGCGCATCAGCTGCCGAGATGTGAAGGACCTCATTCCATTCTTAAATGAATATATGAGGCTGGCAGCAAAGACAGGTAGACTTTTCATCTCAACTGAATTATCTGACAAAATCTGGATGAAGCTACCAGGTGACTTGGGGAAGCGCATCAAGTCAAAATTTGAAGAGCAATATGCCGGGAACACTATCGGGGTACATCCTCGAATAATGTTCATCTATAAGTTCCTAGAGGAGGAATGTAAGAATGCGGCATTCATGCGGTCCATGAAGAACCTCCAGTTCTGTAGCAAAATTCCAATCCCAGGCTACTATGGAGGAGCTGAAAAGAAATATGGTGTGCGGAAATCAAAGACATACAAAGGGAAGCCGCACCAGTCTCATGTCCGCATTGAGAAAAGAAAACACCTGACCAAGGAAAAGCGCTGCAAATGCTTTCTCTGTGGAAAGGAAGGGCACTATGCTCGAGAGTGTCCAAATGACCGCCGCGACATCAAACGAGTCGCAATCTTTGAAGGATTGTCTATCCCAGAAGACTTTGATATTGTCTCCGTGCATGAAGGAGAAGAACAGAGTGATGCAATCTACTCTGTTTCTGAAGGAGAGAATGAAAGTATTGACCCAGAGGTCAACACTTTTATTTCGTACGGGGAAGGGGGAAGAGGTACCACTCCAACTCAAACTCTTTATTATTTGCGAGAGGAAGGTACAATTACCCACTATTACCTTGGAGGCGGAGGAACCAAGGTTTCTGTTAAAGTTACACAGAAAGAGCACGACTGTACACATGATTGGGTGCTCTACAGTGAAAATAACTCACATTGCCGGTTCTGCAAAAGGGAGGTAATACAGAGATGGAATGCCAAATGCAATAAATGTAATATTACAACTTGTGGCATGTGCTCTGACCATTATGTAGGTCTAAGAGTTCCCTGCAAAAGACCGGAGGTGCAGCAAGTCTATCAGCCTACGAACTTGCTAGCGGAACAGCGCAATTACATAATGAGCTGTGAAGAAGAAATTTTAAGGCTAAAGAATGAAATTGAAGCAATGAAGATCTCCTCAGAAAATCAACTTGTTGCTGAGAAGATGGCAAGAGCTGCCGAAGAGGAGAACTTGAAGAAGGAAGTTCTAGCATTGAAGCTGGAGAATGATCGTCTAACTCTAGAGAATGAAGATCAAAAGAAAGAGTTAGAGAAGAAAAACAAGGAGGTGTTGGACCTCCAGTCCTATATTGAAGAACATGATCTTAAGGAACATGATCTTAATGTCCTCATCTGTGAAGGTAACGATAAACAGGTTGCAGCTTCTATACCTGTTCAAGACCGAAGAAATGGGCTCTACAATCTAGTAGTGGAGCTAG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| 62,012
|
MG948562.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2019-01-01
|
DBALV-VAN02_De
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,509
|
GenBank
| null |
Vanuatu
|
Vanuatu
|
Dioscorea esculenta
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-VAN02_De, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTCCTTTGTGATTGTTAAGTTCAGTATGGAAGGCTAAGACCTTACCAGGGTATCAGGGTAAAGGAAATTATCTAGTTTCTTCTTTGTTTTCTTAATCAAAAGGCTGAAATTGATATTGCTTTCTCTATTTATAGTTTCTTGAGAAGATTTTGAAATTTTTTAGCATACATGCTCTTAGAGTTTGAAGTGTTTATGCTTAATGGGTGTTTGTTGATACTGAGCCGAGCCTTGAAAGCACAAAAGACGAAGGCACTATATCCCGTCAGGCAAGAGGCCGTTTAGGGTGAAACCCGGAGGTGAGTGTATAAGGGGCTTTGGTAAGGTTGAAACTTGCGGTACCTTGAGTATAAACATCAAAACTCGAAAGATTATGCTATGTTCTTTAATTTCTTAATCATCTTACCGGAACTATGTTTGATGAAAGGATATCATGAGTAGGTCTATTGATCTTGAGAAAGGTTTAAACTTGCGGTACCTTGAGTATAAACATCAAAACTCGAAAGATTATGCTATGTTCTTTAATTTCTTAATCATCTTACCGGAACTATGTTTGATGAAAGGATATCATGAGTAGGTCTATTGATCTTGAGAAAACACTGAAAGATTATCTAGATAAGAGTACTGAACCTGAATACCTTGATTTATATACTGTTGACAAACCCACAACCAAGCAGCTTGCTAATAATCTCTGTTACTTGAATCACCAGGCAAAACTTTTGTCTCGTGTTTCTTTAAAACATTTCTTTCAGTTACAGGAAGAAATACAGGAGTTGAAGGCGGAAAACCGCAGACTTCGTAAAGATCTGGTCAATCTGACCAAAGAGGTGGTTGAGAATCGCCCCCTGACAGAAAGGAAGGTTCAGGACCTCGTGCTGAGGATTACTGAACAGCCAAAAGAAATTGAACAACAGGCAGTGCGCCTAGTCAAGAATCTAACGGTAAAGCTTGATCGGGTGGAAGCAATCTTACGACAGGTTGAAGGGAGCACTTCCTTATGAGCGAAGAGCTCATAAGAGCCCTTAAAGCCGTCGAACACATTGAACCACCAGCCGTAGGATTTGTAAAATCTTACGACTATCAGAACAAGCTTGCTGGAGCCGTAGCAGCATCCCAAAAGCAGAACAACACTATTCTGCAATTGCTGATACACTTGTTTGAAAAGGTCGCTGAAGTCAAAACCGACCTTGAAGCTATCAAAAGGCAGTTGGCAGCCCCAACTGACCGTGAAGTGTCTGACAACCTACTTGACCAGGTAATCTCAAAACTTGGCAAGTTATCTCTTGCTACCAAGGTTCCTGAGAAGCCAGGAAAGTTACTTGTCTGGAAGGATCCTGCTCTCATCTACGAAGAAGAACTTGAAAAGCTATCTTAATGGAGCGGCCTCAGACAACATCAACTACCTTAGCTTCAACACCTTCAGTCTTTGAAGATCAAGTCAGAGACTACCGCCTTGGTGCTCGAAGGCGATACAACATGAGTCAAGCAGCGCAAAAGCTAGCGAAGACCCTCACTCTTGGGAAATACTATCAACCTACGCTGGAGCAGCAGGTTGATCCTGAGAAGACTCTGCAGCTCTCATCCATGCAGAGGGCATCCCTTGTACCAGCTGAGGTACTCTATCACTCAAGACCTGACACTGTCAATCACAAGGTCTATATGCATTGGTCTGAGGAATCGGACCTGGTGGTCAACCATCAATATGACTCAACATTCATCCGGCCAGAGTCATATGCCACACTGATGAAATCTGGCATGCAGTTCATACACATTGGACTGATGCAGGTAAGAATCCAGATCCTGCATAGAGCTGAAGCAGGAACTCTTGCAATGATTGTTTTTAGGGACTGTTCATGGAGAGGAAAACGGTCCATGATTGCAAAGATGGAGGTTGATTTGACTCGAGGTAGTCAAATGGTATACATAGCGCCCAACCTTATAAAGAGGCTTTCAGATTTTTACAACAACATTCAAATCTCTATCCTTACCAAAGGATATGATGACTATCAGAATTCTGAAGCTAATCTTTTGATTACAAAAGGTTTAGTGGGCAGGCTATCAAACACATCCAATGTTGGCTTCGCATACTCTATTTCAGGCATCACCGACTACTTTGTCACACATGGTGTGCAAGCAATCAAAGGCCAACCTATTTCAACTGAAGAATTCCAGGAAACTCTCTGGAATATCAAGCCTTCTAATTTGGTTGTGCCAACACAACCAACTTTTGCCGAGGAGAGGGAGTTGGCGGACGGGAGCATCTCAATTCGATTTTCCCGATACAAACCAGTACCACAGCTACCAGAAGTCTCCCATAATGATGAAGAACTGGGGGATGATGAAAGACATATAATTGCTTATCTGTCTACCCCGAATCTTGTGGTAAGGTTAGTAAATGAAAACGCAGTTCTACCACAAAGAATGTCCCATGGTGCAGTAGGCTATGACATTGCAATTACTGAAGCCGCTGAAATACTGCCAGGACAACAGAAGTTACTCCCAACAGGTATTTCTTTGCAAGTACCTAATGGATTTTATGCTCATCTATTTATTAAATCCGGAGTAGCTTTGAGAAAAGGGTTAGTTCTTAATGCTGGTGTAATTGATCCTGATTACACTGGAGAGCTGAAGTTGCTACTACTTAACCCTACTGGAACCCCAGTACATGTACAAGCAGGCGAATTTATTGCTCAGGCCGTCCTGCAAGCCGTTATCACACCACCAGTACAAGAGGCTCAAGCTCTACAAATGACGCTTCGAGGAGATAGAGCTTTTGGGGAAATGTCCCGCACTCATATCCCTCCAACTGCAACAGAAGAAGATGAGGGATCACCATCATCACCACTGTCTGAAGAAGTTCGCATCCTATTTGAGGATGATCCTTTTATTGATGACCCTACTATTTATACTTTAATTTCTTTCAATGATTCTTTTGAAGGAGAGATGGAGTATATTTCCTATCTCTACAATCCGGATGCACCTGTATATGACGATTATCCGGAAGACGAAGCTGAAGGAGATGTCTTCAATCTGGCAACACTTGATAGCAGCCTTGATCTTGACTATCCTATACTACAGAGGCTTGAAGCAACCATTGCTTCTTCTGCTATCTCAGAATACAGACCGCCAGAAGACACCACTATGAATCCTCCAATATATCCACCAGCAAGGATCTCTGAACAAGCTTCCACAAGCTCCGGGCAACCTGCGCCTAACTATTCACAGAGGGTGCCTGCAGGAGTACACTTCAGGGCAAGAGACTACTCTAACAATTGGTCTCTTCCATCGGCACAACAAAACACTGGTGCCATGTTCTACTTGCCACTGGAGTTGGTAAAGTTCGATGAAGTATTTTCCCGATGGGAAAGTATCACAAAGAATCTGGTCTCACAACAGTCATTCATCACAGGCAAAGAGAAGGCTGAATTCATAGAAAACCTTCTCGGAGAAACTGAAAAACTGACCTGGATTCAGTGGAGGACAGCTTTTCCCACTGAATATGAAACACTGCTTGCCTCAGCAGATGGGAGAGAAGGCACACAGAATATCCTGTCCCATATCCGCACCATTTTCACACTTGAAGACCCATACAGGGGTTCTACTAAGGTGCAAGAGCAAGCATATCTAGATCTTGAGCGCATCAGCTGCCGAGATGTGAAGGACCTCATTCCCTTCTTAAATGAATACATGAGGTTGGCAGCAAAGACAGGTAGACTCTTCATCTCAACTGAATTATCTGACAAAATCTGGATGAAGCTACCAGGTGACTTGGGAAAGCGCATCAAGTCAAAATTTGAAGAGCAATATGCCGGGAACACTATCGGGGTACATCCTCGAATAATGTTCATCTATAAGTTCCTGGAAGAAGAGTGCAAGAATGCAGCATTCATGCGGTCTATGAAGAACCTCCAGTTCTGTAGTAAAATTCCAATTCCAGGCTACTATGGAGGAGCTGAAAAGAAATATGGTGTGCGGAAATCTAAAACATACAAAGGGAAGCCACACCAGTCTCATGTCCGCATTGAGAAACGAAAGCACTTGACAAGAGAGAAGCGCTGTAAATGCTTCCTCTGTGGAAAGGAAGGGCACTATGCTCGAGAGTGTCCAAATGACCGCCGCGACATCAAACGTGTCGCAATCTTTGAAGGATTATCTATCCCAGAAGACTTTGATATTGTCTCCGTGCATGAAGGAGAAGAGCAGAGTGATGCAATTTACTCTGTTTCTGAAGGAGAGAATGAAAGTATTGACCCAGAGGTCAACACTTTTATTTCGTACGGGGAAGGGGGAAGAGGTACCACTCCAACTCAAACTCTTTATTACTTGCGAGAGGAAGGTACAGTTACCCACTATTACCTTGGAGGCGGAGGAACCAAGGTTTCTGTTAAGGTCACACAGAAAGAGCACGACTGTACACATGATTGGGTGCTCTACAGTGAAAACAATTCACACTGCCGGTTCTGCAAAAGGGAGGTAATGCAGAGATGGAATGCCAAATGCAATAAATGTAACATTACAACTTGTGGCATGTGCTCTGACCATTATGTAGGTCTAAGAGTTCCCTGCAAAAGACCGGAGGTGCAACAAGTCTATCAGCCAACGAACCTGCTAGCAGAACAGCGCAATTACATAATGAGCTGTGAAGAAGAAATCCTAAGGCTGAAGAATGAAATTGAAGCAATGAAGATCTCCTCGGAAAATCAACTAGTTGCTGAGAAGATAGCAAGAGCTGTCGAAGAGGAGAATTTGAAGAAGGAAGTTCTAGCACTGAAGCTGGAGAATGATCGTCTAACTCTAGAGAATGAAGATCAAAAGAAAGAGTTAGAGAAGAAAAACAAGGAGGTACTGGACCTCCAGTCCTATATTGAGGAACATGATCTTAAGGAACATGATCTTAATGTCCTCATCTGTGAAGGAAACGACAAACAGGTAGCAGCTTCTATACCTGTTCAAGACCGAAGAAATGGGCTCTACAATCTAGTAGTGGAGCTAGAAATCCCAGGATGCGCACCACTGAAGGTGAACGCCATCCTTGACACTGGTGCAACCACATGTTGCATCAACAGTGAAGGACTCCCTAAAGAGATGATGGAAGATAACACCTTCAAGGTGAAGTTCACTGGAGCCAATTCCGTAATGATAGCAGAGAAGAAGCTTAAATACGGAATGATGAAGATTGAAGGTCATGTTTTCAGAATTCCTTACACATTTGCCTTCCCACTGAGGCTCGGAGGTGGAGAACAACTAGTCATTGGTTGTAACTTCATACGATCAATGAACGGAGGAGTCCGAATTGAGGGAAATGACGTGACGTTCTACAAGAACATCACAACTGTGAAGACCATGACGGAAGTTCCGAAGATTCTAGCTCTGGAGGAGTTAGAAATGGAAGAAGAAGAGTACATTGCCTTGCAAAGTACATACAGCAGTATATGTCCTGTGGTCCAGGATAACTTCAAGGCAAGGTATGAGGAACTAATTATTCAGCTTAAAAATGCAGGTTATATCGGGGAAAATCCAATGAAATTTTGGGCTAAAAACAAGGTCCAGTGCAAGCTGGAAATTATCAACCCAAACCTAACTATTCAGGACAAGCCCCTTAAGCATGTAACACCTGCAATGGAGGCCACATTTAAAAAGCACGTGGATGCATTACTGGAGCTCAAGGTGATTCGGCCCAGCACGAGTCAACATCGAACTACAGCGTTCATCGTATACTCGGGAACGACTGTTGACCCAGCTACTGGCCAGGAGAAGAAAGGCAAGGAAAGAATGGTATTCAACTACAAACGATTGAATGATAATACTGAGAAGGACCAGTACAGCCTTCCAGGTATTAATACCATTCTGAAGAAAGTTGGAAACAGCAAGATCTACTCAAAGTTTGATCTAAAAAGCGGTTTCCACCAAGTGGCGATGCATCCCGACTCAGTACAGTGGACAGCCTTCTGTGTCCCTGGAGGTCTCTACGAATGGCTTGTGATGCCGTTCGGATTGAAGAATGCTCCGTCCGTATTCCAAAGAAAGATGGACAACTGTTTTCGAGGTACGGAGGATTTTATTGCTGTATACATTGATGACATTCTTGTGTTTTCCAGAACACCAGAGGAACATGCTGAGCATCTGCTGAAGATGTTGTCAATCTGTAAGGAGCATGGGCTGGTTCTGAGCCCAACAAAAATGAAAATTGGCACCCCTACAGTGGAATTCTTGGGAGCCACTATCGGGAACAGCAAAATCAAGCTTCAAGAGCATATTATTAAAAAGATAGCTGACTTCAAGGAGGAAGAGCTAAAAACTACCAAGGGACTTAGGTCATGGCTTGGTATACTCAACTATGCTCGAAGTTACATCCCGAACTTGGGGAAAACATTGGGGCCACTATACTCAAAAATAAGTCCAACTGGTGAAAGAAGAATGAATGACCAAGATTGGGACTTAATCAGGAAGATCAAGAGGCAAATCCACAATCTGCCTGATCTCGAGATACCCCCAGAAGATGCCTTCATAATTCTGGAAGTGGATGGCTGTATGGAGGGCTGGGGAGGAGTTTGCAAGTGGAGGCCCAAGAAAAATGATCCAAGATCCACAGAGAAAGTCTGTGCCTATGCCAGTGGGAAATTTGACATCCCAAAGTCTACTATCGACGCTGAGATCCACGCAGTAATGAATTGCATGGATAAATTCAAAATTCATTACTTGGATAAAAAGGAGTTACTGATCAGAACCGATTGTCATGCAATAATGGCGTTCTACAACAAAAGCTCCTGCAACAAACCTTCAAGGGTTCGATGGATCGCGTTTAATGACTTCTTAACAGGATTAGGCATTCCTGTGATAATTGAGCACATTGATGGCAAGAATAATGTTCTTGCAGATGCACTATCAAGGTTAGTATGTTCAATTATTAAAAATCCTGCATACTGGCAAACCAAGGAAGAACTATTAAAGCAAACAGAGGAGGCTCTGCAGCAAATAATAAAGAAGCCTCATCATGGAGCTATTGCCAAGATAGCTTCTCTTGTCAAGAGAATCTTGGAGGACGTGCCCACGTAACCTCCATCAACAATGGTGTGTTTCTTTTCAAGTTGTGTTTGTTCAAGTCCTTCGGATTGATGAGCTGTCTCTCATCAACGAAGTTTACCTTTGTATCGGATTGCTGAGGTGTCAGCATCCTAATAAGTGTGTTTGTTTAGAAAGGATTGAGCCCCGGGGAGCCGTCCTTTAGAGAGTTAGTGGATGCCAAGTGTTCGGCATCTGTGTGTTTGCTTATGCTTTAAGCAAAGTAGAAGGAATAATTGAGTGTCGATGGGGCCCATTGAGCACCCGACTCAATCATTCTCTTCCTTTCTTATGGCTATATAAGCACTTGTAATTGTAAGTTGCAGATCATCGAGAAAAACTCAGAGATCTACTTCTTAAATAAAAGAAAAATTTTGTGTCTCAAAGAGTGCAATACTCGAGACAAGATCCTTTACACCCGCATTCCGCACTT
| 65,950
|
KX008571.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Bomer,M., Turaki,A.A., Silva,G., Kumar,P.L., Seal,S.E.
|
University of Greenwich, Natural Resources Institute
| null |
2016-07-26
|
DBALV-[2ALa]
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,544
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Dioscorea alata
|
plant leaf
| null | null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-[2ALa], complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTATTTTCTTATGTCAATGAGTGGCTAAGGCCCTTCTTCAGGGTACGAAGGTAAAGGAAATTATCTTGGTTTTCTTTCATTAATTTCTTCGAATCATAAGAACTGCAATCTGGTTGTTTTATCAATATAGTTTTTGTGCTATAAGAAAGTATTGAGATTTTTGTTTTACGGGAATACAGTCTGAAGTTTGAAATATTTATGCTTAATGGGTGTTCGTTTGATACTGATCTGAGTTTCTGAAAACGCAAAAGACAAGGGCACTATATCCCGTCAAGGCAGGAGGCCGTTAAGGGTGAACCCCCGAGGTGAGTGTTTAAGGAACTCAGTGAGGTTGAAAAACTTGCGGTACCTTAGGTATAAATACTAAAACTAAAAGGCTTTATCTTCTGTAAAAAGGAAATTGAACGGTTTTTAGCTTGAAAGAGGGCTACTGGTTCGACTTGCCTTTGTTCTGAGGCCTGGCCTGGTCCAGTAACTTCAGGACTCTGTGTACAGAGAACACTGCACTTTAGCCCGGAAAGCACGAACCTTCAATATTTGCTTATATTATGAGAACTATAAAGTGTAAACAATCATGAGTCGGTCTATAGATTTGGAGAAAACTTTGAAAGATTACCTTGATAAGAGTACTGAGCCAGAGTACCTTGACCTTTACACTGTTGACAGACCTACAACCAAGCAGCTTGCTAACAATCTCTGCTACTTGAATCACCAGGCAAAACTTTTGTCCCGTGTTTCTTTAAAACATTTCTTTCAGTTACAGGAAGAAATTCAGGAATTGAAGGCGGAAAACCGCAGACTCCGTAAAGATTTGGTCAATTTGACCAAAGAGGTGGTTGAGAACCGCCCCCTCACAGAGAAGAAGGTTCAGGACCTCGTGCTGAGGATTACTGAACAGCCAAAGGAGATCGAGCAACAGGCAGTGCGCCTAGTCAAAGATCTATCTGTGAAGATTGATCGGGTTGAAGCAATTTTGCGAAAGGTTGAAGGGAGCACCTCTTTATGAGTGAAGAACTCATAAAGGCCCTAAAAGCCGTTGAGCACATTGAACCACCGGCCGTAGGATTTGTCAAGACCTACGATTATCAAAACAAGCTCGCCGGAGCAGTAGCATCAACACAGAAGCAGAACAACACAATTCTGCAGTTGTTGATCCAGTTGTTTGAAAAGGTCACTGAAGTCAAAGCTGACCTTGAAGTCATTAAGAAGCAGTTGGCAGCCCCAACTAACCGTGAAGCGTCTGACAATCTACTTGACCAGGTAATCTCAAAACTTGGCAAGTTATCTATTGCTGACAAGGTTCCTGAGAAGCCAGGAAAGCTTCTTGTCTGGAAGGACCCTGCTCTCATCTACAAAGAAGAACTTGAAAAGCTATCTTAATGGAGCGGCCCCAGACATCAACAACCTTGGCTACCACGCCATCAGTCTTTGAAGATCAAGTCAGAGACTACCGCCTTGGTGCTCGAAGGCGATACAACATGAGTCAAGCGGCGCAAAAGCTTGCGAAGACTCTCACTTTTGGGAAATACTATCAACCTACGCTGGAGCAGCAGGTTGATCCAGAGAAGACTCTGCAGCTCTCATCCATGCAGAGGGCATCCTTGGTACCAGCTGAGGTACTATATCACTCAAGACCTGACACTGTGAATCATAAGGTCTATATGCACTGGTCTGAGGAATCTGACCTGGTGGTCAACCGGCAATATGACTCTACATTCATCCGACCGGAGTCATACGCCACACTGATGAAATCTGGCATGCAGTTCATACACATTGGACTGATGCAGGTACGCATACAAATCCTGCACAGAGCTGAAGCAGGTACTCTTGCACTAATCGTTTTTAGAGACTGTTCTTGGAAAGGAAGACGGTCCATGATTGCAAGGATGGAAGTTGATTTGACTCGGGGAAGTCAAATGGTGTACATAGCGCCCAACCTTATAAAGAGGCTTACGGATTTCTACAACAACATTCAAATCTCTATCCTTACCAAAGGATATGATGATTACCAGAACTCCGAAGCTAATCTTTTGATCACAAAAGGTTTAGTGGGCAGGCTATCAAACACCTCCAATGTTGGCTTTGCATACTCTATTTCGGGCATCACCGACTACTTTGTCACACATGGAGTGCAAGCAATTAAAGGCCAACCGATCTCAATTGAAGAATTCCAGGAAACTCTCTGGAACATCAAGCCTTCTAATTTGGTTGTGCCAACACAACCAACTTTTGCGGAGGAGAGGGAGTTAGCAGATGGGAGCATCTCAATTCGATTTTCCCGGTACAAACCAGTACCGCAAATGCCAGAAGTCTCCTATAACAACAATGATGAGGAACTGGGCGATGATGAAAGACACATAATTGCTTATCTGTCTACCCCAAATCTTGTGGTCAGGCTCTTAAATCCTGATGCAATCCTGCCACAAAGAATGTCACATGGCGCAGTAGGCTATGACATTGCAATAACTGAAGCCGCTGAAATATTGCCAGGACAGCAGAAGCTACTACCAACAGGTATTTCTTTGCAAGTACCTAACGGTTTCTATGCTCACTTATTCATTAAATCTGGAGTAGCTCTGAGAAAAGGGTTAGTTCTTAATGCTGGTGTGATCGATCCTGATTACACTGGAGAATTGAAACTGTTGCTGCTTAACCCTACTGGAGCCCCAGTACATGTCCAGGCAGGAGAATTCATTGCTCAGGCTGTCCTACAAGCCATTATTACACCGCCAGTTCAAGAGGCTCAAGCTCTACAAATGACTCTTCGAGGAAGTCGAGGCTTTGGAGAGATGTCCCAAGCTCAAGCCCCTCCAGTTGAATCAGATGGTGGATCACCATCATCACCCTTGTCTGATGAAGTTCGCGTCCTATTTGAGGACGACCCCTTTATTGATGACCCTACTATTTATACTTTACATTCTTTCAATGATTCTTTTGAAGAAGAGATGGAGTATATTTCCTATCTCTACAATCCGGATGCACCTGTATATGACGATTATCCGGAGGAAGATGAAGAAGATGTGTTCAACCTGGCAACACTCGATAGCAGTTTTGATCTTGACTATCCAACATTGCAAAAGCTGGAAGCAACTATTGCTTCTACTGCTATTTCGGAGTACAGACCGCCAGAAGACACCACTATGAACCCGCCCACATATCCACCTGCAAGGGTTTCTGGGCAGGCTTCTACAAGTACCGGCCCAACTTCTACAAGTCAAACATCTGGGCCTGGGCCATCTTCTTCGAGCTATTCACAAAGGACACCTCCAGGTGTTCACTTCAGGGCAAGAGACTACTCCAACAACTGGTCTCTTCCATCGGCACAACAAAACACTGGTGCCATGTTTTACTTGCCCCTAGAATTGGTGAAATTTGATGAGGTATTTTCCCGTTGGGAAAGTATCACAAAGAATGTGGTTTCTCAACAATCATTCATCACAGGCAAAGAGAAGGCTGAATATATAGAAAACCTTCTCGGGGAGACTGAGAAACTCACCTGGATTCAGTGGAGAACAGCTTTTCCCGCTGAATATGAAACACTGCTTGCCTCAGCTGATGGGAGGGAAGGAACGCAGAATATCCTGTCCCATATTCGCACCATCTTCACACTGGAAGACCCATACAGGGGTTCTACTAAGGTGCAAGAGCAAGCATATCTTGATCTTGAGCGCATCAGCTGCCGTGATGTGAAGGACCTCATTCCATTCTTAAACGAGTACATGAGGTTGGCAGCCAAGACAGGTAGACTCTTCATCTCAACTGAATTATCTGACAAAATTTGGATGAAGCTACCAGGTGACTTGGGAAAGCGCATCAAGACGAAGTTTGAAGAACAGTATGCTGGGAACACAATTGGTGTTCACCCTCGAATCATGTTCATTTATAAATTCTTGGAAGAAGAATGCAAGAATGCGGCATTCATGAGATCAATGAAGAACCTCCAGTTCTGTAGCAAAATTCCAATCCCAGGCTACTATGGAGGAGCTGAGAAGAAATATGGTGTGCGGAAATCAAAGACCTATAAAGGAAAGCCACACCAGTCTCATGTCCGTATTGAGAAGAGAAAGCATCTGACCAGGGAGAAGCGCTGCAAATGCTTCCTCTGTGGAAAGGAAGGGCACTATGCTCGAGAGTGTCCTAATGACCGACGCGACATCAAGCGTGTCGCAATCTTTGAAGGATTGTCTATTCCTGAAGACTTTGACATTGTCTCCGTACATGAAGGAGAAGAGCAGAGTGATGCAATTTACTCTGTTTCTGAAGGAGAAAATGAAAGTATTGACCCGGAGGTCAACACTTTTATTTCGTACGGGGAAGGGGAGAGAGGTACCATTCCAACTCAAACTCTTTATTATTTGCGAGAGGAAGGTACAGTTACACACTACTACCTTGGGGGCGGAGGAACCAAGGTTTCTATCAAAGTGACACAGAAAGAGCACGACTGTACACATGATTGGGTGCTCTATGGTGAAAATAATTCACAGTGCCGGTTCTGCAAAAGGGAGGTAATGCAACGATGGAATGCCAAATGCAATAAATGTAATATTACAACTTGTGGCATGTGCTCTGACCATTATGTAGGTCTGAGAGTCCCTTGCAAGAGACCGGAAGTACAGCAAGTTTATCAGCCTACGAACTTGCTAGCGGAGCAGCGAAACTACATCATGAGCTGTGAAGAAGAAATTTCAAGGCTGAAGAATGAAATCGAAGCGATGAAGATCTCCTCAGAAAATCAACTTGTTGCTGAGAAGATAGCGAGAGCTGTTGAGGAAGATCACTTGAAGAAGGAAGTTCTAGCGCTGAAGCTAGAGAATGATCGTCTAACTCTGGAGAATGAAGACCAGAAGAAGGAGTTAGAGAAGAAAAACAAGGAGGTGCTTGACCTCCAGTCCTACATTGAGGAACATGATGTGAATGTCCTCATCTGTGAAGGTAATGACAAACAGGTTGCAGCTTCTATACCTGTTCAAGATAGAAGAAATGG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| 80,805
|
KX008572.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Bomer,M., Turaki,A.A., Silva,G., Kumar,P.L., Seal,S.E.
|
University of Greenwich, Natural Resources Institute
| null |
2016-07-26
|
DBALV-[2ALb]
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,544
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Dioscorea alata
|
plant leaf
| null | null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-[2ALb], complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTATTTTCTTATGTCAATGAGTGGCTAAGGCCCTTCTTCAGGGTACGAAGGTAAAGGAAATTATCTTGGTTTTCTTTCATTAATTTCTTCGAATCATAAGAACTGCAATCTGGTTGTTTTATCAATATAGTTTTTGTGCTATAAGAAAGTATTGAGATTTTTGTTTTACGGGAATACAGTCTGAAGTTTGAAATATTTATGCTTAATGGGTGTTCGTTTGATACTGATCTGAGTTTCTGAAAACGCAAAAGACAAGGGCACTATATCCCGTCAAGGCAGGAGGCCGTTAAGGGTGAACCCCCGAGGTGAGTGTTTAAGGAACTCAGTGAGGTTGAAAAACTTGCGGTACCTTAGGTATAAATACTAAAACTGAAAGGCTTTATCTTCTGTAAAAAGGAAATTGAACGGTTTTTAGCTTGAAAGAGGGCTACTGGTTCGACTTGCCTTTGTTCTGAGGCCTGGCCTGGTCCAGTAACTTCAGGACTCTGTGTACAGAGAACACTGCACTTTAGCCCGGAAAGCACGAACCTTCAATACTTGCTTATATTATGAGAACTATAAAGTGTAAACAATCATGAGTCGGTCTATAGATTTGGAGAAAACTTTGAAAGATTACCTTGATAAGAGTACTGAGCCAGAGTACCTTGACCTTTACACTGTTGACAGACCTACAACCAAGCAGCTTGCTAACAATCTCTGCTACTTGAATCACCAGGCAAAACTTTTGTCCCGTGTTTCTTTAAAACATTTCTTTCAGTTACAGGAAGAAATTCAGGAATTGAAGGCGGAAAACCGCAGACTCCGTAAAGATTTGGTCAATTTGACCAAAGAGGTGGTTGAGAACCGCCCCCTCACAGAGAAGAAGGTTCAGGACCTCGTGCTGAGGATTACTGAACAGCCAAAGGAGATCGAGCAACAGGCAGTGCGCCTAGTCAAAGATCTATCTGTGAAGATTGACCGGGTTGAAGCAATTTTGCGAAAGGTTGAAGGGAGCACCTCTTTATGAGTGAAGAACTCATAAAGGCCCTAAAAGCCGTTGAGCACATTGAACCACCGGCCGTAGGATTTGTCAAGACCTACGATTATCAAAACAAGCTCGCCGGAGCAGTAGCATCAACACAGAAGCAGAACAACACAATTCTGCAGTTGTTGATCCAGTTGTTTGAAAAGGTCACTGAAGTCAAAGCTGACCTTGAAGTCATTAAGAAGCAGTTGGCAGCCCCAACTAACCGTGAAGCGTCTGACAATCTACTTGACCAGGTAATCTCAAAACTTGGCAAGTTATCTATTGCTGACAAGGTTCCTGAGAAGCCAGGAAAGCTTCTTGTCTGGAAGGACCCTGCTCTCATCTACAAAGAAGAACTTGAAAAGCTATCTTAATGGAGCGGCCCCAGACATCAACAACCTTGGCTACCACGCCATCAGTCTTTGAAGATCAAGTCAGAGACTACCGCCTTGGTGCTCGAAGGCGATACAACATGAGTCAAGCGGCGCAAAAGCTTGCGAAGACTCTCACTTTTGGGAAATACTATCAACCTACGCTGGAGCAGCAGGTTGATCCAGAGAAGACTCTGCAGCTCTCATCCATGCAGAGGGCATCCTTAGTACCAGCTGAGGTACTATACCACTCAAGACCTGACACTGTGAATCATAAGGTCTATATGCACTGGTCTGAGGAATCTGACCTGGTGGTCAACCGGCAATATGACTCTACATTCATCCGACCGGAGTCATACGCCACACTGATGAAATCTGGCATGCAGTTCATACACATTGGACTGATGCAGGTACGCATACAAATCCTGCACAGAGCTGAAGCAGGTACTCTTGCACTAATCGTTTTTAGAGACTGTTCTTGGAAAGGAAGACGGTCCATGATTGCAAGGATGGAAGTTGATTTGACTCGGGGAAGTCAAATGGTGTACATAGCGCCCAACCTTATAAAGAGGCTTACGGATTTCTACAACAACATTCAAATCTCTATCCTTACCAAAGGATATGATGATTACCAGAACTCCGAAGCTAATCTTTTGATCACAAAAGGTTTAGTGGGCAGGCTATCAAACACCTCCAATGTTGGCTTTGCATACTCTATTTCGGGCATCACCGACTACTTTGTCACACATGGAGTGCAAGCAATTAAAGGCCAACCGATCTCAACTGAAGAATTCCAGGAAACTCTCTGGAACATCAAGCCTTCTAATTTGGTTGTGCCAACACAACCAACTTTTGCGGAGGAGAGGGAGTTAGCAGATGGGAGCATCTCAATTCGATTTTCCCGGTACAAACCAGTACCGCAAACGCCAGAAGTCTCCTATAACAACAATGATGAGGAACTGGGTGATGATGAAAGACACATAATTGCTTATCTGTCTACCCCAAATCTTGTGGTCAGGCTCTTAAATCCTGATGCAATCCTGCCACAAAGAATGTCACATGGCGCAGTAGGCTATGACATTGCAATAACTGAAGCCGCTGAAATATTGCCAGGACAGCAGAAGCTACTACCAACAGGTATTTCTTTGCAAGTACCTAACGGTTTCTATGCTCACTTATTCATTAAATCTGGAGTAGCTCTGAGAAAAGGGTTAGTTCTTAATGCTGGTGTGATCGATCCTGATTACACTGGAGAATTGAAACTGTTGCTGCTTAACCCTACTGGAGCCCCAGTACATGTCCAGGCAAGAGAATTCATTGCTCAGGCTGTCCTACAAGCCATTATTACACCGCCAGTTCAAGAGGCTCAAGCTCTACAAATGACTCTTCGAGGAAGTCGAGGCTTTGGAGAGATGTCCCAAGCTCAAGCCCCTCCAGTTGAATCAGATGGTGGATCACCATCATCACCCTTGTCTGATGAAGTTCGCGTCCTATTTGAGGACGACCCCTTTATTGATGACCCTACTATTTATACTTTACATTCTTTCAATGATTCTTTTGAAGAAGAAATGGAGTATATTTCCTATCTCTACAATCCGGATGCACCTGTATATGACGATTATCCGGAGGAAGATGAAGAAGATGTGTTCAACCTGGCAACACTCGATAGCAGTTTTGATCTTGACTATCCAACATTGCAAAAGCTGGAAGCAACTATTGCTTCTACTGCTATTTCGGAGTACAGACCGCCAGAAGACACCACTATGAACCCGCCCACATATCCACCTGCAAGGGTTTCTGGGCAGGCTTCTACAAGTACCGGCCCAACTTCTACAAGTCAAACATCTGGGCCTGGGCCATCTTCTTCGAGCTATTCACAAAGGACACCTCCAGGTGTTCACTTCAGGGCAAGAGACTACTCCAACAACTGGTCTCTTCCATCGGCACAACAAAACACTGGTGCCATGTTTTACTTGCCCCTAGAATTGGTGAAATTTGATGAGGTATTTTCCCGTTGGGAAAGTATCACAAAGAATGTGGTTTCTCAACAATCATTCATCACAGGCAAAGAGAAGGCTGAATATATAGAAAACCTTCTCGGGGAGACTGAGAAACTCACCTGGATTCAGTGGAGAACAGCTTTTCCCGCTGAATATGAAACACTGCTTGCCTCAGCTGATGGGAGGGAAGGAACGCAGAATATCCTGTCCCATATTCGCACCATCTTCACACTGGAAGACCCATACAGGGGTTCTACTAAGGTGCAAGAGCAAGCATATCTTGATCTTGAGCGCATCAGCTGCCGTGATGTGAAGGACCTCATTCCATTCTTAAACGAGTACATGAGGTTGGCAGCCAAGACAGGTAGACTCTTCATCTCAACTGAATTATCTGACAAAATTTGGATGAAGCTACCAGGTGACTTGGGAAAGCGCATCAAGACGAAGTTTGAAGAACAGTATGCTGGGAACACAATTGGTGTTCACCCTCGAATCATGTTCATTTATAAATTTTTGGAAGAAGAATGCAAGAATGCGGCATTCATGAGATCAATGAAGAACCTCCAGTTCTGTAGCAAAATTCCAATCCCAGGCTACTATGGAGGAGCTGAGAAGAAATATGGTGTGCGGAAATCAAAGACCTATAAAGGAAAGCCACACCAGTCTCATGTCCGTATTGAGAAGAGAAAGCATCTGACCAGGGAGAAGCGCTGCAAATGCTTCCTCTGTGGAAAGGAAGGGCACTATGCTCGAGAGTGTCCTAATGACCGACGCGACATCAAGCGTGTCGCAATCTTTGAAGGATTGTCTATTCCTGAAGACTTTGACATTGTCTCCGTACATGAAGGAGAAGAGCAGAGTGATGCAATTTACTCTGTTTCTGAAGGAGAAAATGAAAGTATTGACCCGGAGGTCAACACTTTTATTTCGTACGGGGAAGGGGAGAGAGGTACCATTCCAACTCAAACTCTTTATTATTTGCGAGAGGAAGGTACAGTTACACACTACTACCTTGGAGGCGGAGGAACCAAGGTTTCTATCAAAGTAACACAGAAAGAGCACGACTGTACACATGATTGGGTGCTCTATGGTGAAAATAATTCACAGTGCCGGTTCTGCAAAAGGGAGGTAATGCAACGATGGAATGCCAAATGCAATAAATGTAATATTACAACTTGTGGCATGTGCTCTGACCATTATGTAGGTCTGAGAGTCCCTTGCAAGAGACCGGAAGTACAGCAAGTTTATCAGCCTACGAACTTGCTAGCGGAGCAGCGAAACTACATCATGAGCTGTGAAGAAGAAATTTCAAGGCTGAAGAATGAAATCGAAGCGATGAAGATCTCCTCAGAAAATCAACTTGTTGCTGAGAAGATAGCGAGAGCTGTTGAGGAAGATCACTTGAAGAAGGAAGTTCTAGCGCTGAAGCTAGAGAATGATCGTCTAACTCTGGAGAACGAAGACCAGAAGAAGGAGTTAGAGAAGAAAAACAAGGAGGTGCTTGACCTCCAGTCCTACATTGAGGAACATGATGTGAATGTCCTCATCTGTGAAGGTAATGACAAACAGGTTGCAGCTTCTATACCTGTTCAAGATAGAAGAAATGG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| 80,806
|
KX008573.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus
|
Bomer,M., Turaki,A.A., Silva,G., Kumar,P.L., Seal,S.E.
|
University of Greenwich, Natural Resources Institute
| null |
2016-07-26
|
DBALV-[3RT]
|
Badnavirus alphadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,609
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Dioscorea cayenensis subsp. rotundata
|
plant leaf
| null | null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus isolate DBALV-[3RT], complete genome
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| 80,807
|
MH404155.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus 2
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
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2019-06-29
|
DBALV2-PNG59_DA
|
Badnavirus betadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,860
|
GenBank
| null |
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
|
Dioscorea alata
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate DBALV2-PNG59_DA, complete genome
|
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Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
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Australia
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Badnavirus
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GenBank
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Papua New Guinea
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Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate DBALV2-PNG58_DA, complete genome
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| 61,994
|
MH404157.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus 2
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2019-06-29
|
DBALV2-PNG51_DA
|
Badnavirus betadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,876
|
GenBank
| null |
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
|
Dioscorea alata
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate DBALV2-PNG51_DA, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTCTTGAAGATGATTATCGGCTAAAGAACCCTATCAGGGTACTAAGGTAAGAAGTCTAGTTGTGTGTTACCACAAATGACTGTGTAAATCTCAGGTGTAGGAGCCGTAAGACCTCCCGGTCTCATATTTTTGCATGAAAGCTTTACTATCAGTTTTATAAGTTTTTAGGAGAATTATGCTTTTATGAGTTATTATGATAATTTTAACTGATTTATAAAGCATTTCTTAAGTTTTTGAGGGATTTGTTTTTCTGCACAATTTAGTCCTGCCAAAAGGAAAGTTTAAACAACATAAAAAGATGTTAAATTGAACTCATTGTTGAATTCGAAGGAAGACAGTCCTTCCCTACTGTGACTACTACGGGTGTGCACGGGTAAGTACACAGAGGTTGTGAAGATTTTACCATCCAAGGCTATTTGAATCTAAGCCCGAGAAGGAGAAACCTGTAAGTCCTAAGGAGAGGCCTGGCGAGTACGTAAGGGTGAAAATTCAGAGAAGGCTTGAGAAATGGTAAAATAAAGAAAAACCTAAAAAAAGGAAATTAATAAACGCCTCTGGCAGGGCAAAAATTGGAAAGATTAACTGTCTTAGCTCAAAGGCTTAATTTCTGCTTTGATCTCAGTTATTTTTATCAGAATCAATCTCATATTTGCTTAATTGGTTCCTAAAAATTTTATTTTATTGATAGTATTACTTTTATACATAATATGATTCAAGGAGATAATCTTATAGGTTACCCTACATCTTTGACTAAGCATGTCTGACATATGGGAGAAAAACATCCTAACGTGGTATACCACTTCTAGAACTTCAAGCCTGAAGTACCTTGATCTTGCTGAAACTGATAATCCCAAAAAGAAAGAGCTTGCAAACAACATCGCAGTTTGCTACGATAGGATCTGCCTATCATCAAAAGTGCATCTGAAGCATTTTAAGATTCTTGAAGAACAAATTCAAGAATTACGAGCTGAGAACGAGCGTCTAACTCTCGCGCTCAACAATCTCACAAAAGAGGTCATCGAAAACAGGCCTCTTACAGAAAAAGAAGTAAAGAAGCTGGTGAGGCAAATTGTAGCTCAACCCAAGTTGGTGGAGCAGCAGACAATTGCACTAGCTGAAGATTTGAAGAAAAAGATTGATCAGGTTGAAGGTCTGATCCACAAAATCAAAGACACAGTCTCATGAGCATTGCCAGCTCAAAAGGCAAGGTCTCATACGTTGAAGCACTCACTCTCACAGAAGATATCGAACCACCGGCTTTAGGCTTTGGAAAGCCGATCGAGTTCAAGGGCTCAGTGAGCTCTTACTGTGGGGCTATAATCAAGCAAAACAACACCATAATTCAATTGCTTGTAAGCCTCCACGAGAAGGTTGAAAGTATTGACGAAAGACTCAAAAAGATTGAAAAGAAAGAGTTGTCAATTACCACCGACCTTACAAACGATCTTGTTAGCAAGATCAGTCAGATTAAACTTGGGGATAAACCAATTCCCAAGAAAGGAGTTCTTTTGGTGGATAAAGATCCACTAATCATCATTCGTGAAGAGCAGGAAAAACTCAAATTGCGCAAGCAACAATGAGTAGACAACAGACCCTTGTTCCAACAGTCGAAGACCAAATTCAAGAGTACAGAAACAGCAGAAGGCGACTGTACAACTTACAACAAGGAGTCAAAAGGCTGAGAAATAGGTTGCAGAAAAGAACCTATGAAAGAACACTTGAGCAATACATTGATCCAAATGAACAGCTCAAGTTGTCTATGAAAAAGAGGGCTAAATTGGTGCCAGCTGAGGTGCTATATCACAGCCGAAATGACAATGTAAACCACAAGGTTTACATTCACAGATCTGAAGAAGTAGTGAGAATCACTACAAATCAAGAAGACCGCTCCTTCATTCATGAAGAAAGCTACAATCAACTACAAAGATCCGGTATGGAGTTCATCCATATTGGAATTCTACAGGTCAGGCTCCAAATATTACACAGATCTGACGAAGGCACAATGGCACTTGTTATCTTTCGGGATAACAGCTGGAAAGGAAACAAATCCATCATTGCTTTGATGGAAGTTGATCTCACTCAAGGGCACCAGATGGTGTACCTCGTTCCTGACATCATGATGACTATCAAAGATTTCTACAGGAACATCCAGATATCTGTTCTCACCAAAGGTTATGAAGAGTGGCAAGGAGGCCACAATTTGTTGATAACAAAAGGGATGGTTGGAAGATTGTCCAATACTTCCAATGTTGGCTTTGAATATTCAATCAACAATGTTGCTGATTATCTTGTGAGCCATGGTGTTAAAGCTATCCCTGGAAAGAAATTCTCTGCATCCGAGCTACAGTTCCAAAACTGGAACATAAAACCGTCAAGGGTCTCGGTGCCAATGCAACCGCAAGGTTACAATGGAAGAGAATTAATTGATGGAAGCATTTCCATCAGATTCACTGATTATGAACCAGCTGAACCATCCACCAGAATTCAATACAATGAAAATGATTCTGAGGTGGACCCAGATGAAATTATCGCACCACTGATAGGCGATGATAGCTGGGAAGATTTGCAGGATTCACAAATCTTGCAGTCAATCGCATCTCTATCAGGTAGAGATGATGAGGAAAGAGAAAAATTGCAAGTTCAAATCTTGCACCCTGACGCATTCTTACCATGCAGAATGACAGCCGGAGCTGCCGGCTATGATTTGATATCAATCTCTGAAGATACAGAGATTCCAGCGTTTGGAAGAAGTCTGTTCCAGACCGGATTAGCATTGACAGTGCCCCCAGGTACTTATGGCAGAATAGCACCTAAATCAGGTGTTTCTCTGAACAAGGGCATAATAGTTAATGCTGGGGTCATTGATAGGGATTATATTGGGGAAATCAAAATATTGCTACAAAATGTAAGCCCCAACCCTATTATGATCGCAAAATTTACTTCCATTGCACAACTCATACTGGAGCAATGCAAAATACCTGAAGTCAAGGAAGTACAAGTTCTGGTTCCTACTCTCAGAGGAGAGCAAGGATGGGGATCTACATCAACAATAGCATGCTGTGTTCCCCAACAAACTGAAGAAGAATCATCTTCCAGTGAAGATGATGATAATTTGCCATATCCTCGACTATTGCTGCCAAATCCATTTGCAGCAGTTAATGCCCGCCAACCTTTTGCGGAAGGTGGTGGAGAAGAGGATACCCCTGAAACAACTTCTGATGATGAATCCAGTGCTGAATCTGAATCTTATGATTCAGATGATGAAGAAAATGAAGGTTGGCGTGAAGTTGCCATTACACTACCTGATTATGATGGCTATGAGTCAAGATCTCCTTCTTACTTTCAAAGAGCATTACCAGGAGAAGACTCAGATGATTCTATTGATCTACGTCAACTTGGAGATGCCCTAGATCACCTAGACGACGATGAAGATCACTTTGTATCAACCATTCATCAAGAAGGTGATGAAGATTTTGATCCAAAGGACTACCCATCCTTACTACAGCTGGAGAAAATACTGTCTACTGCGGCCTCAGGATACAATCCTCCGCAAGATACATCAATGGGTCCTGTTTCATACCCACCAGCTACATCTACAACAGTAGAAGCAGGAAGTTCCAGTACAACTCCTTTTAGACCTTCATACGTAACATCTGGAACAAGGTTTAAATCAAAGGACTTTTCTGGGAATTTCTCACTTCCCCCTGCTCAACACCTGCAAGGAGCAATGTTCACAGTTCCCATGCAGATGGGGCAATTTGATGAAGTCTTTATGCGATGGGAAAGCATAACAAAGAATTTGGTATCTCAGCAGAACTTCACCAATGGCAAAGACAAAGCTGAGTTCATCGAAAACTTGCTAGGAGAATATGAAAAGCTAGCATGGATCCAGTGGAGAAGTACATTCACTGCAGAATATGAAGAATTAATCAAAACTGCAGATGGCGCTGAGGGAACACAAAACATTATCTCTCAGATCAGGTACATCTTCACACTTGAAGACCCTTTCAGAGGATCGACACGTATGCAGGATGATGCATACAGAGATTTGAAAAGACTCTCATGTCCAAAGATGGATAACATTATCCAATTCTTAAATGAATACATGAGACTCGCTGCGAAGTCTGGAAGATTGTTCATAGGGACTGAACTCTCTGAAGAACTCTGGAGTAAGCTCCCTGGTGACTTAGGTACGGAACTAAAAACTTTGTTTGATGCAGCATATCCAGGAAATAAAATCGGAGTCCATCCAAGGATTCGATTTGTGTACCAGTACCTGGAGAAAGAATGCAAGAAGGCTGCTTTCAGCAGATCCCTCAAGTCACTACAGTTCTGTAACCAGATCCCTATTCCAGGCTATTACAAAAACAATGAGAAGAAATATGGTGCAAGAAAATCAACTACCTACAAGGGTAAGCCGCACCAGACGCATGTCAGAATTGAAAAGAAGAAACACCTTCAAAGGGAGAGAAAATGCAAGTGCTTCCTTTGTGGAGAAGAAGGACATTTTGCTAGAGAGTGCCCTAATGAAAGAAGAAATGTCAAGAGAGTGGCAATGTTCGAAGGAGTCAACATCCCTGAAGATTATGAAATCATGTCAGTACAGGAGGGAGACCCTATGAGCGATGCCATTTATTCATTATCTGAAGGAGAAGATGGGCAACTCGGGGCAATAATGGACGAAGTAATTTGTTACTTGAGGCAGGAAGATAACACCTATTGGATAGGAAAAGATGACAACTGGCGTGCCCAAGTAAGAGTTACCAAAGAAGTCCATGACTGCAACCACACATGGGAAATGCATCCCGAAATGATTGGGCAGACACCAAGATGCCTTACATGCAAAAGGGATACACAGCAAAGTTGGAGGGCACATTGCTCTAAATGTCAAACTACAAGCTGTGGCATGTGTGGACCCAACTACTTCAACATCAAGATTCCTGTAAGAAAGGTGGAACCTGTCAGGTATGACCCTAAACCCTT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Dioscorea bacilliform AL virus 2
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Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
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Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
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Australia
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2019-06-29
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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GenBank
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Papua New Guinea
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Papua New Guinea
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Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate DBALV2-PNG45_DA, complete genome
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| 61,996
|
MH404159.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus 2
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
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2019-06-29
|
DBALV2-PNG23_DA
|
Badnavirus betadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,863
|
GenBank
| null |
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
|
Dioscorea alata
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate DBALV2-PNG23_DA, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTCGGTTTCTTGAAGATGATTATCGGCTAAAAACCCTATCAGGGTACTAAGGTAAGAAGTCTGGTTGTATGCTATGCCACGGATGACTGTGTAAATTTTAGGTGTAGGAGCCGTAAGACCTTCTGGTCTCATATTTATGCATGAAAGTGTTACTATCAGTGTTATAAGTTTTCAGGAAAATTATGCTTTTATGAGTTGTTATGATAATTTTAACTGGTTTTTAAAGCATTTATTAAGTTTTTGAGGGATTTGTTTCTCTGCACAATTTAGTCCTGCCAAAAGGAAAGTTTAAACAACATAAAAAGATGTTAAATTGAACTCATTGTTGAATCCGAAGGAAGACAGTCCTTCCCTACTGTGACCGCTACGGGTGTGCACGGGTGAGTACACAGAGGTTGTGAAAATTTTACCATCCAAGGCTATCTGAATCTAAGCCCGAGAAGGAGAAACCTGTAAGTCCTAAGGAGAGGCCTGGCGAGTACGTAAGGGTGATGATTCTGAGAAGGCTTGAGAAGAGGTAAAATAAGAGAACCTTACAAAAGGAAATTAATAAACGCCTCTGGCAGGGCAAAAATTGGAAAGATTAACTGTCCTAGCTCAAACGCTTAATTCTTGCTTTGATCTTAGTTATTTTTATCAGAATTAATCTCATATCTGCTTAATTGAGCTCTGAAAATTTATTTAATTGATAGTACTGCTTTTATGTATGATATGGTTCAAGAAGACAATCTTATAGGTTACCCTGCATCTGAAACGAAGCATGTCTGACATCTGGGAGAAAAACATCCTAACGTGGTATGCTACTTCCAGTACTTCGAACCTGAAGTACCTTGATCTTGCAGAGACTGATAATCCTAAAAAGAAAGAGCTCGCAAACAACATAGCTGTTTGCTACGATAGGATCTGCCTATCATCAAAAGTCCATCTAAAGCACTTCAAAATTCTTGAAGAACAAATTCAAGAATTACGAGCAGAGAACGAGCGCTTGACGCTTGCTCTCAAGGAACTCACAAAAGAGGTCATCGAAAACCGGCCTCTTACAGAAAAGGAAGTGAAGAAGCTAGTGAAGCAAATTGTAGCTCAACCCAAGCTGGTAGAGCAACAAACAATTGCACTAGCTGAAGATTTGAAGAAAAAGATCAATCAGGTTGAAAGCCTGATTCACAGAATCAAAGACACCGTCTCATGAGTATTGCCAGCTCAAAGGGCAAGGTGTCTTACGTGGAAGCACTCACACTCACTGAAGATATCGAACCACCAGCTGTTGGCTTTGGTAAGCCATTAGAATTTAAGGGCTCAGTAAGCTCTTACTGTGGGGCAATTATCAAGCAAAACAACACAATAATTCAGTTGCTTGTTAGCCTCCACGAGAAGGTAGAAAGCATTGAGGAAAGACTCCGGAAGGTCGAGAAGAAGGAGCTTTCTCTCACCACTGACCTCACCAACGATCTTGTTAGCAAGATCAGCCAGATCAGGCTTGGGGATAAACCAATTCCCAAGAAAGGTGTTCTTTTAGTGGACAAGGATCCACTAGTGATCATTCGTGAAGAACAAGAGAAGCTCAAATTGCGCAAGCAATAATGAGTGGACAACAGACCCTTGCTACTATAGCTCCAACGGTCGAGGACCAAATCCAAGAATACAGAAACAACAGAAGGCGACTGTACAATCTACAGCAAGGGGCCAGAAGACTGAAAAATAGGTTTCAGAAAAGAACCTATGAAAGAACACTTGAGCAGTACATTGACCCCAATGAGCAGCTCAAGTTGTCCATGAAGAAGAGGGCTAAGTTAGTACCAGCTGAGGTGCTATACCATAGCCGGAGTGACAATGTAAACCACAAGGTTTACATCCACAGATCTGAAGAAGTAGTGAGGATCACTACTAATCAGGAGGACCGCTCTTTCATTCATGAAGAGAGCTACAATCAACTGCAAAAATCCGGTATGGAGTTTGTCCATATTGGGATTTTACAGGTCAGGCTTCAAATTCTACACAGATCTGACGAAGGAACCATGGCGCTTGTTATCTTTCGGGATAACAGCTGGAAAGGAAACAAGTCCATCATTGCTTTGATGGAAGTTGATCTTACTCAGGGACACCAGATGGTGTACCTCGTTCCTGATATCATGATGACAATCAGAGATTTCTACAGGAACATCCAGATTTCTGTCCTTACAAAAGGCTACGAAGAGTGGCAAGGTGGCCACAATCTGCTGATCACAAAGGGAATGGTTGGGAGGCTGTCTAACACCTCCAACGTCGGCTTTGAATACTCAATTAATAATGTTGCTGATTATCTTGTAAGCCATGGCGTTAAAGCTATTCCTGGAAAGAAATTCTCCACAGCCGAGCTGCAGTTCCAAAATTGGAACATAAAACCGTCAAAGGTCTCGGTACCAATGCAACCGCAAGGTTACAATGGTAGAGAATTAATTGATGGAAGCATTTCCATCAGATTCACAGACTATGAACCTGCTGAACCATCCACCAGAATTCAATATAATGAAAATGATTCCGAGGTGGACCCAGACGAGATTATTGCACCGTTAATTGGCGACGATGATTGGGAAGACTTGCAGGCTGCACAAATCCTGCAATCAATCGCATCCCTGTCAGATAGGGATGATGAGGAAGAGAAATTGCAAGTTCAAATCTTGCACCCTGACGCATTCTTACCCTGCAGAATGACGGCCGGAGCTGCCGGCTATGATCTTGTATCTATTTCTGAAGATACAGAGATTCCTGCTTTCGGAAGAAGTCTGTTCCGAACAGGATTGGCGTTGACAGTACCCCCAGGCACTTATGGCAGAATAGCACCCAAATCGGGTGTTTCTCTCAATAAGGGTATAATAGTCAATGCAGGAGTCATTGATAGGGATTACATTGGGGAGATCAAAATATTACTTCAAAATGTGAGCCCCAACCCTGTCATGATAACAAAATTTACTTCCATTGCACAGCTCATATTGGAGCAATGCAAAGTACCTGCAATCAAGGAAGTTCAAGTTCTAGTTCCTACTCTCAGAGGAGAGCAAGGATGGGGATCTACATCAACAGCGGCATGCTGCATTCCCCAAGAAGAAATTGAAGAAGAATCATCTTCCAGTGAAGATGATGACGATGACTTACCATATCCTCGACTATTGCTGCCAAATCCATTTGCAGCAGCTAATGCCCGCCAACCTTTTGCGGAAGGTGGTGGAGAAGAGGATATCCCTGAAACTGAAGATTCAGATGAAGAAAATGATGAAAATGATGAAAATGAAGGTTGGCGTTCATCACCGCCATCAGAAGCTGATGATGACTATGAGTCAAGATCTCCTTCATATTTTCGGAGATCACTGCCAGGAGAAGACTCGGAAGAAGACTCCATTGACTTGCGTCAACTTGGAGATGCACTAGATCACCTTGATGATGATGAAGATCATTTTATATCAACTATTCATCAAGATGGAGAAGAAGACTTTGATCCTAAGGACTACCCGTCCTTATTGCAGCTGGAAAAGATATTGTCTACTGCGGCTTCAGGGTACAATCCCCCGCAGGATACATCTATGGGACCAATCTCATACCCTCCAGCTACATCAACAACTGTTGAAGCAGGAAGCTCCAGTACTACTCCATTCAGACCTTCGTATGTCACAACATCTGGTACAAGGTTTAAATCGAAGGACTTTTCTGGGAACTTTTCACTTCCCCCTGCTCAACATATGCAAGGAGCAATGTTCACTGTTCCCATGCAAATGGGACAATTTGATGAAGTCTTTATGCGATGGGAAAGCATAACCAAAAATCTGGTATCTCAGCAAAATTTTACCAATGGCAAAGACAAAGCTGAGTTCATTGAGAACCTGCTAGGAGAATATGAAAAGCTAGCATGGATCCAGTGGAGAAGTACATTCACTGCAGAATATGATGAGCTGATCAAAACTGCAGATGGCGCTGAGGGAACACAAAACATTATCTCTCAGATCAGGTACATCTTCACACTTGAAGATCCCTTCAGAGGATCAACACGTATGCAGGATGAAGCATACAGAGATTTGAAGAGGCTCTCATGTCCAAAAATGGATAACATTATCCAGTTCTTAAATGAATACATGAGACTCGCAGCAAAATCTGGAAGACTGTTTTTAGGAACAGAACTTTCTGAAGAGTTATGGAGCAAGCTCCCCGGTGACTTAGGTACAGAACTAAAAACTTTGTTTGATGCAGCATATCCAGGTAACAAGATCGGAGTCCACCCAAGGATTCGATTTGTGTACCAGTACCTTGAGAAGGAATGCAAAAAGGCTGCTTTCAGCAGATCTCTTAAGTCACTACAATTCTGTAACCAGATTCCCATCCCTGGTTATTACAAAAATAATGAAAAGAAGTATGGTGCAAGAAAGTCAACTACATACAAGGGCAAGCCGCACCAAACTCATGTCAGAATTGAAAAGAAGAAGCACCTCCAGAGGGAGAGAAAATGTAAATGCTTCCTTTGTGGAGAGGAAGGACATTTTGCCAGAGAATGCCCAAATGAAAGAAGAAACGTCAAAAGAGTGGCGATGTTTGAAGGAGTCAACATTCCTGAAGATTATGAGATTATGTCTGTACAGGAAGGAGACCCTATGAGCGATGCCATTTATTCACTATCTGAAGGAGAAGACGGGCAACTCGGAGCGGTGATTGATGAAGTTATTTGTTACTTGAGGCAAGAAGACAACACCTATTGGATAGGAAAAGATGATAACTGGCGTGCCCAAGTAAGAGTAACAAAGGAAGTTCATGACTGCAATCATACATGGGAGTTTCATCCCGAGATGATTGGACAGACACCAAGGTGTCTGACTTGCAAGAGGGACACACAGCAAAACTGGAGGGCACATTGCTCTAAATGTCAAACTACAAGCTGTGGCATGTGTGGACCCAACTACTTCAACGTCAAAATTCCTGTCAGAAAGGTGGAACCTGTCAGGTATGATCCTAAACCTTTACTTGAAC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|
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Dioscorea bacilliform AL virus 2
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Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
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Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
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Australia
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2019-06-29
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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GenBank
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Papua New Guinea
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Papua New Guinea
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2016-02
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Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate DBALV2-PNG22_DA, complete genome
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| 61,998
|
MH404161.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus 2
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
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2019-06-29
|
DBALV2-PNG20_DA
|
Badnavirus betadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,879
|
GenBank
| null |
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
|
Dioscorea alata
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate DBALV2-PNG20_DA, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTCTTGAAGATGATTATCGGCTAAAGAACCCTATCAGGGTACTAAGGTAAGAAGTCTAGTTGTGTGTTACCACAAATGACTGTGTAAATCTCAGGTGTAGGAGCCGTAAGACCTCCCGGTCTCATATTTTTGCATGAAAGCTTTACTATCAGTTTTATAAGTTTTTAGGAGAATTATGCTTTTATGAGTTATTATGATAATTTTAACTGATTTATAAAGCATTTCTTAAGTTTTTGAGGGATTTGTTTTTCTGCACAATTTAGTCCTGCCAAAAGGAAAGTTTAAACAACATAAAAAGATGTTAAATTGAACTCATTGTTGAATTCGAAGGAAGACAGTCCTTCCCTACTGTGACTACTACGGGTGTGCACGGGTAAGTACACAGAGGTTGTGAAGATTTTACCATCCAAGGCTATTTGAATCTAAGCCCGAGAAGGAGAAACCTGTAAGTCCTAAGGAGAGGCCTGGCGAGTACGTAAGGGTGAAAATTCAGAGAAGGCTTGAGAAATGGTAAAATAAAGAAAAACCTAAAAAAAGGAAATTAATAAACGCCTCTGGCAGGGCAAAAATTGGAAAGATTAACTGTCTTAGCTCAAAGGCTTAATTTCTGCTTTGATCTCAGTTATTTTTATCAGAATCAATCTCATATTTGCTTAATTGGTTCCTAAAAATTTTATTTTATTGATAGTATTACTTTTATACATAATATGATTCAAGGAGATAATCTTATAGGTTACCCTACATCTTTGACTAAGCATGTCTGACATATGGGAGAAAAACATCCTAACGTGGTATACCACTTCTAGAACTTCAAGCCTGAAGTACCTTGATCTTGCTGAAACTGATAATCCCAAAAAGAAAGAGCTTGCAAACAACATCGCAGTTTGCTACGATAGGATCTGCCTATCATCAAAAGTGCATCTGAAGCATTTTAAGATTCTTGAAGAACAAATTCAAGAATTACGAGCTGAGAACGAGCGTCTAACTCTCGCGCTCAACAATCTCACAAAAGAGGTCATCGAAAACAGGCCTCTTACAGAAAAAGAAGTAAAGAAGCTGGTGAGGCAAATTGTAGCTCAACCCAAGTTGGTGGAGCAGCAGACAATTGCACTAGCTGAAGATTTGAAGAAAAAGATTGATCAGGTTGAAGGTCTGATCCACAAAATCAAAGACACAGTCTCATGAGCATTGCCAGCTCAAAAGGCAAGGTCTCATACGTTGAAGCACTCACTCTCACAGAAGATATCGAACCACCGGCTTTAGGCTTTGGAAAGCCGATCGAGTTCAAGGGCTCAGTGAGCTCTTACTGTGGGGCTATAATCAAGCAAAACAACACCATAATTCAATTGCTTGTAAGCCTCCACGAGAAGGTTGAAAGTATTGACGAAAGACTCAAAAAGATTGAAAAGAAAGAGTTGTCAATTACCACCGACCTTACAAACGATCTTGTTAGCAAGATCAGTCAGATTAAACTTGGGGATAAACCAATTCCCAAGAAAGGAGTTCTTTTGGTGGATAAAGATCCACTAATCATCATTCGTGAAGAACAGGAAAAACTCAAATTGCGCAAGCAACAATGAGTAGACAACAGACCCTTGTTCCAACAGTCGAAGACCAAATTCAAGAGTACAGAAACAGCAGAAGGCGACTGTACAACTTACAACAAGGAGTCAAAAGGCTGAGAAATAGGTTGCAGAAAAGAACCTATGAAAGAACACTTGAGCAATACATTGATCCAAATGAACAGCTCAAGTTGTCTATGAAAAAGAGGGCTAAATTGGTGCCAGCTGAGGTGCTATATCACAGCCGAAATGACAATGTAAACCACAAGGTTTACATTCACAGATCTGAAGAAGTAGTGAGAATCACTACAAATCAAGAAGACCGCTCCTTCATTCATGAAGAAAGCTACAATCAACTACAAAGATCCGGTATGGAGTTCATCCATATTGGAATTCTACAGGTCAGGCTCCAAATATTACACAGATCTGACGAAGGCACAATGGCACTTGTTATCTTTCGGGATAACAGCTGGAAAGGAAACAAATCCATCATTGCTTTGATGGAAGTTGATCTCACTCAAGGGCACCAGATGGTGTACCTCGTTCCTGACATCATGATGACTATCAAAGATTTCTACAGGAACATCCAGATATCTGTTCTCACCAAAGGTTATGAAGAGTGGCAAGGAGGCCACAATTTGTTGATAACAAAAGGGATGGTTGGAAGATTGTCCAATACTTCCAATGTTGGCTTTGAATATTCAATCAACAATGTTGCTGATTATCTTGTGAGCCATGGTGTTAAAGCTATCCCTGGAAAGAAATTCTCTGCATCCGAGCTACAGTTCCAAAACTGGAACATAAAACCGTCAAGGGTCTCGGTGCCAATGCAACCGCAAGGTTACAATGGAAGAGAATTAATTGATGGAAGCATTTCCATCAGATTCACTGATTATGAACCAGCTGAACCATCCACCAGAATTCAATACAATGAAAATGATTCTGAGGTGGACCCAGATGAAATTATCGCACCACTGATAGGCGATGATAGCTGGGAAGATTTGCAGGATTCACAAATCTTGCAGTCAATCGCATCTCTATCAGGTAGAGATGATGAGGAAAGAGAAAAATTGCAAGTTCAAATCTTGCACCCTGACGCATTCTTACCATGCAGAATGACAGCCGGAGCTGCCGGCTATGATTTGATATCAATCTCTGAAGATACAGAGATTCCAGCGTTTGGAAGAAGTCTGTTCCAGACCGGATTAGCATTGACAGTGCCCCCAGGTACTTATGGCAGAATAGCACCTAAATCAGGTGTTTCTCTGAACAAGGGCATAATAGTTAATGCTGGGGTCATTGATAGGGATTATATTGGGGAAATCAAAATATTGCTACAAAATGTAAGCCCCAACCCTATTATGATCGCAAAATTTACTTCCATTGCACAACTCATACTGGAGCAATGCAAAATACCTGAAGTCAAGGAAGTACAAGTTCTGGTTCCTACTCTCAGAGGAGAGCAAGGATGGGGATCTACATCAACAATAGCATGCTGTGTTCCCCAACAAACTGAAGAAGAATCATCTTCCAGTGAAGATGATGATAATTTGCCATATCCTCGACTATTGCTGCCAAATCCATTTGCAGCAGTTAATGCCCGCCAACCTTTTGCGGAAGGTGGTGGAGAAGAGGATACCCCTGAAACAACAACTTCTGATGATGAATCCAGTGCTGAATCTGAATCTTATGATTCAGATGATGAAGAAAATGAAGGTTGGCGTGAAGTTGCCATTACACTACCTGATTATGATGGCTATGAGTCAAGATCTCCTTCTTACTTTCAAAGAGCATTACCAGGAGAAGACTCAGATGATTCTATTGATCTACGTCAACTTGGAGATGCCCTAGATCACCTAGACGACGATGAAGATCACTTTGTATCAACCATTCATCAAGAAGGTGATGAAGATTTTGATCCAAAGGACTACCCATCCTTACTACAGCTGGAGAAAATACTGTCTACTGCGGCCTCAGGATACAATCCTCCGCAAGATACATCAATGGGTCCTGTTTCATACCCACCAGCTACATCTACAACAGTAGAAGCAGGAAGTTCCAGTACAACTCCTTTTAGACCTTCATACGTAACATCTGGAACAAGGTTTAAATCAAAGGACTTTTCTGGGAATTTCTCACTTCCCCCTGCTCAACACCTGCAAGGAGCAATGTTCACAGTTCCCATGCAGATGGGGCAATTTGATGAAGTCTTTATGCGATGGGAAAGCATAACAAAGAATTTGGTATCTCAGCAGAACTTCACCAATGGCAAAGACAAAGCTGAGTTCATCGAAAACTTGCTAGGAGAATATGAAAAGCTAGCATGGATCCAGTGGAGAAGTACATTCACTGCAGAATATGAAGAATTAATCAAAACTGCAGATGGCGCTGAGGGAACACAAAACATTATCTCTCAGATCAGGTACATCTTCACACTTGAAGACCCTTTCAGAGGATCGACACGTATGCAGGATGATGCATACAGAGATTTGAAAAGACTCTCATGTCCAAAGATGGATAACATTATCCAATTCTTAAATGAATACATGAGACTCGCTGCGAAGTCTGGAAGATTGTTCATAGGGACTGAACTCTCTGAAGAACTCTGGAGTAAGCTCCCTGGTGACTTAGGTACGGAACTAAAAACTTTGTTTGATGCAGCATATCCAGGAAATAAAATCGGAGTCCATCCAAGGATTCGATTTGTGTACCAGTACCTGGAGAAAGAATGCAAGAAGGCTGCTTTCAGCAGATCCCTCAAGTCACTACAGTTCTGTAACCAGATCCCTATTCCAGGCTATTACAAAAACAATGAGAAGAAATATGGTGCAAGAAAATCAACTACCTACAAGGGTAAGCCGCACCAGACGCATGTCAGAATTGAAAAGAAGAAACACCTTCAAAGGGAGAGAAAATGCAAGTGCTTCCTTTGTGGAGAAGAAGGACATTTTGCTAGAGAGTGCCCTAATGAAAGAAGGAATGTCAAGAGAGTGGCAATGTTCGAAGGAGTCAACATCCCTGAAGATTATGAAATCATGTCAGTACAGGAGGGAGACCCTATGAGCGATGCCATTTATTCATTATCTGAAGGAGAAGATGGGCAACTCGGGGCAATAATGGACGAAGTAATTTGTTACTTGAGGCAGGAAGATAACACCTATTGGATAGGAAAAGATGACAACTGGCGTGCCCAAGTAAGAGTTACCAAAGAAGTCCATGACTGCAACCACACATGGGAAATGCATCCCGAAATGATTGGGCAGACACCAAGATGCCTTACATGCAAAAGGGATACACAGCAAAGTTGGAGGGCACATTGCTCTAAATGTCAAACTACAAGCTGTGGCATGTGTGGACCCAACTACTTCAACATCAAGATTCCTGTAAGAAAGGTGGAACCTGTCAGGTATGACCCTAAACC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Dioscorea bacilliform AL virus 2
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Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
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Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
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Australia
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2019-06-29
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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GenBank
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Papua New Guinea
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Papua New Guinea
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Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate DBALV2-PNG14_DA, complete genome
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| 62,000
|
MH404163.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus 2
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
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Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
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2019-06-29
|
DBALV2-PNG12_DA
|
Badnavirus betadioscoreae
|
Badnavirus
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Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,860
|
GenBank
| null |
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
|
Dioscorea alata
| null |
2016-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate DBALV2-PNG12_DA, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTCGGTTTCTTGAAGATGATTATCGGCTAAAAACCCTATCAGGGTACTAAGGTAAGAAGTCTGGTTGTATGCTATGCCACGGATGACTGTGTAAATTTTAGGTGTAGGAGCCGTAAGACCTTCTGGTCTCATATTTATGCATGAAAGTGTTACTATCAGTGTTATAAGTTTTCAGGAAAATTATGCTTTTATGAGTTGTTATGATAATTTTAACTGGTTTTTAAAGCATTTATTAAGTTTTTGAGGGATTTGTTTCTCTGCACAATTTAGTCCTGCCAAAAGGAAAGTTTAAACAACATAAAAAGATGTTAAATTGAACTCATTGTTGAATTCGAAGGAAGACAGTCCTTCCCTACTGTGACCGCTACGGGTGTGCACGGGTGAGTACACAGAGGTTGTGAAAATTTTACCATCCAAGGCTATCTGAATCTAAGCCCGAGAAGGAGAAACCTGTAAGTCCTAAGGAGAGGCCTGGCGAGTACGTAAGGGTGATGATTCTGAGAAGGCTTGAGAAGAGGTAAAATAAGAGAACCTAACAAAAGGAAATTAATAAACGCCTCTGGCAGGGCAAAAATTGGAAAGATTAACTGTCCTAGCTCAAACGCTTAATTCTTGCTTTGATCTTAGTTATTTTTATCAGAATTAATCTCATATCTGCTTAATTGAGCTCTGAAAATTTATTTAATTGATAGTACTGCTTTTATGTATGATATGGTTCAAGAAGACAATCTTATAGGTTACCCTGCATCTGAAACGAAGCATGTCTGACATCTGGGAGAAAAACATCCTAACGTGGTATGCTACTTCCAGTACTTCGAACCTGAAGTACCTTGATCTTGCAGAGACTGATAATCCTAAAAAGAAAGAGCTCGCAAACAACATAGCTGTTTGCTACGATAGGATCTGCCTATCATCAAAAGTCCATCTAAAGCACTTCAAAATTCTTGAAGAACAAATTCAAGAATTACGAGCAGAGAACGAGCGCTTGACGCTTGCTCTCAAGGAACTCACAAAAGAGGTCATCGAAAACCGGCCTCTTACAGAAAAGGAAGTGAAGAAGCTAGTGAAGCAAATTGTAGCTCAACCCAAGCTGGTAGAGCAACAAACAATTGCACTAGCTGAAGATTTGAAGAAAAAGATCAATCAGGTTGAAAGCCTGATTCACAGAATCAAAGACACCGTCTCATGAGTATTGCCAGCTCAAAGGGCAAGGTGTCTTACGTGGAAGCACTCACACTCACTGAAGATATCGAACCACCAGCTGTTGGCTTTGGTAAGCCATTAGAATTTAAGGGCTCAGTAAGCTCTTACTGTGGGGCAATTATCAAGCAAAACAACACAATAATTCAGTTGCTTGTTAGCCTCCACGAGAAGGTTGAAAACATCGAGGAAAGACTCCGGAAGGTCGAGAAGAAGGAGCTTTCTCTCACCACTGACCTCACCAACGATCTTGTTAGCAAGATCAGCCAGATCAAGCTTGGGGATAAACCAATTCCCAAGAAAGGTGTTCTTTTAGTGGACAAGGATCCACTAGTGATCATTCGTGAAGAACAAGAGAAGCTCAAATTGCGCAAGCAATAATGAGTGGACAACAGACCCTTGCTACTATAGCTCCAACGGTCGAGGACCAAATCCAAGAATACAGAAACAACAGAAGGCGACTATACAATCTACAGCAAGGAGCCAGAAGACTGAAAAATAGGTTTCAGAAAAGAACCTATGAAAGAACACTTGAGCAGTACATTGACCCCAATGAGCAGCTCAAGTTGTCCATGAAGAAGAGGGCTAAGTTAGTACCAGCTGAGGTGCTATACCATAGCCGGAGTGACAATGTAAACCACAAGGTTTACATCCACAGATCTGAAGAAGTAGTGAGGATCACTACTAATCAGGAGGACCGCTCTTTCATTCATGAAGAGAGCTACAATCAACTGCAAAAGTCCGGTATGGAGTTTGTCCATATTGGGATTTTACAGGTCAGGCTTCAAATTCTACACAGATCTGACGAAGGAACCATGGCGCTTGTTATCTTTCGGGATAACAGCTGGAAAGGAAACAAGTCCATCATTGCTTTGATGGAAGTTGATCTTACTCAGGGACACCAGATGGTGTACCTCGTTCCTGATATCATGATGACAATCAGAGATTTCTACAGGAACATCCAGATTTCTGTCCTTACAAAAGGCTACGAAGAGTGGCAAGGTGGCCACAATCTGCTGATCACAAAGGGAATGGTTGGGAGGCTGTCTAACACCTCCAACGTCGGCTTTGAATACTCAATTAATAATGTTGCTGATTATCTTGTAAGCCATGGCGTTAAAGCTATTCCTGGAAAGAAATTCTCCACAGCCGAGCTGCAGTTCCAAAATTGGAACATAAAACCGTCAAAGGTCTCGGTACCAATGCAACCGCAAGGTTACAATGGTAGAGAATTAATTGATGGAAGCATTTCCATCAGATTCACAGACTATGAACCTGCTGAACCATCCACCAGAATTCAATATAATGAAAATGATTCCGAGGTGGACCCAGACGAGATTATTGCACCGTTAATTGGCGACGATGATTGGGAAGACTTGCAGGCTGCACAAATCCTGCAATCAATCGCATCCCTGTCAGATAGGGATGATGAGGAAGAGAAATTGCAAGTTCAAATCTTGCACCCTGACGCATTCTTACCCTGCAGAATGACGGCCGGAGCTGCCGGCTATGATCTTGTATCTATTTCTGAAGATACAGAGATTCCTGCTTTCGGAAGAAGTCTGTTCCGGACAGGATTGGCAATGACTGTACCCTCAGGCACTTATGGCAGAATAGCACCCAAATCGGGTGTTTCTCTCAATAAGGGTATAATAGTCAATGCAGGAGTCATTGATAGGGATTACATTGGGGAGATCAAAATATTACTTCAAAATGTGAGCCCCAACCCTGTCATGATAACAAAATTTACTTCCATTGCACAGCTCATATTGGAGCAATGCAAAGTACCTGCAATCAAGGAAGTCCAAGTTCTAGTTCCTACTCTCAGAGGAGAGCAAGGATGGGGATCTACATCAACAGCGGCATGCTGCATTCCCCAACAAGAAGAAATTGAAGAAGAATCATCTTCCAGTGAAGATGATGACGATGACTTACCATATCCTCGACTATTGCTGCCAAATCCATTTGCAGCAGCTAATGCCCGCCAACCTTTTGCGGAAGGTGGTGGAGAAGAGGATATCCCTGAAACTGAAGATTCAGATGAAGAAAATGATGAAAATGAAGGTTGGCGTTCATCACCGCCATCAGAAACTGATGATGACTATGAGTCAAGATCTCCTACATATTTTCGGAGATCACTGCCAGGAGAAGACTCGGAAGAAGACTCCATTGACTTGCGTCAACTTGGAGATGCACTAGACCACCTCGATGATGATGAGGACCACTTTGTATCCACAATTCATCAAGAGGGTGAAGAAGAAGACTTTGATCCTAAGGACTACCCGTCCTTATTGCAGCTGGAAAAGATATTGTCTACTGCGGCTTCAGGGTACAATCCCCCGCAGGATACATCTATGGGACCAATCTCATACCCTCCAGCTACATCAACAACTGTTGAAGCAGGAAGCTCCAGTACTACTCCATTCAGACCTTCGTATGTCACAACATCTGGTACAAGGTTTAAATCGAAGGACTTTTCTGGGAACTTTTCACTTCCCCCTGCTCAACATATGCAAGGAGCAATGTTCACTGTTCCCATGCAAATGGGACAATTTGATGAAGTCTTTATGCGATGGGAAAGCATAACTAAAAATCTGGTATCTCAGCAAAATTTTACCAATGGCAAAGACAAAGCTGAGTTCATTGAGAACCTGCTAGGAGAATATGAAAAGCTAGCATGGATCCAGTGGAGAAGTACATTCACTGCAGAATATGATGAGCTGATCAAAACTGCAGATGGCGCTGAGGGAACACAAAACATTATCTCTCAGATCAGGTACATCTTCACACTTGAAGATCCCTTCAGAGGATCAACACGTATGCAGGATGAAGCATACAGAGATTTGAAGAGGCTCTCATGTCCAAAAATGGATAACATTATCCAGTTCTTAAATGAATACATGAGGCTCGCAGCAAAATCTGGAAGACTGTTCTTAGGAACAGAACTTTCTGAAGAATTATGGAGCAAGCTCCCCGGTGACTTAGGTACAGAACTAAAAACTTTGTTTGATGCAGCATATCCAGGTAACAAGATCGGAGTCCACCCAAGGATTCGATTTGTGTACCAGTACCTTGAGAAGGAATGCAAAAAGGCTGCTTTCAGCAGATCTCTTAAGTCACTACAATTCTGTAACCAGATTCCCATCCCTGGTTATTACAAAAATAATGAAAAGAAGTATGGTGCAAGAAAGTCAACTACATACAAGGGCAAGCCGCACCAAACTCATGTCAGAATTGAAAAGAAGAAGCACCTCCAGAGGGAGAGAAAATGTAAATGCTTCCTTTGTGGAGAGGAAGGACATTTTGCCAGAGAATGCCCAAATGAAAGAAGAAACGTCAAAAGAGTGGCGATGTTTGAAGGAGTCAACATTCCTGAAGATTATGAGATTATGTCTGTACAGGAAGGAGACCCTATGAGCGATGCCATTTATTCATTATCTGAAGGAGAGGACGGGCAACTCGGAGCGGTGATTGATGAAGTTATTTGTTACTTGAGGCAAGAAGACAACACCTATTGGATAGGAAAAGACGATAACTGGCGTGCCCAAGTAAGAGTAACAAAGGAAGTTCATGACTGCAATCATACATGGGAGTTTCATCCCGAGATGATTGGACAGACACCAAGGTGTCTGACTTGCAAGAGGGACACACAGCAAAACTGGAGGGCACATTGCTCTAAATGTCAAACTACAAGCTGTGGCATGTGTGGACCCAACTACTTCAACGTCAAAATTCCTGTCAGAAAGGTGGAACCTGTCAGGTATGATCCTAAACCTTTACTTGAACAAC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|
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|
Dioscorea bacilliform AL virus 2
|
Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., Harding,R.M., James,A.P.
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Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
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2019-06-29
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DBALV2-PNG07_DA
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Badnavirus betadioscoreae
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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GenBank
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Papua New Guinea
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Papua New Guinea
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Dioscorea alata
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2016-02
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Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate DBALV2-PNG07_DA, complete genome
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| 62,002
|
KY827395.1
|
Dioscorea bacilliform AL virus 2
|
Sukal,A., Kidanemariam,D., Dale,J., James,A., Harding,R., Sukal,A.C., Kidanemariam,D.B., Dale,J.L., James,A.P., Harding,R.M.
|
Queensland University of Technology, Centre for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2017-06-19
|
PNG10
|
Badnavirus betadioscoreae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,871
|
GenBank
| 1
|
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
|
Dioscorea alata
| null |
2017-02
| null | null |
Dioscorea bacilliform AL virus 2 isolate PNG10, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTCTTGAAGATGATTATCGGCTAAAGAACCCTATCAGGGTACTAAGGTAAGAGGTCTGGTTGTATGTTATACCACGGATGACTGTGTAAATTTTAGGTGTAGGAGCCGTAAGACCTTTTTGTTTCATATTTATGCATGAAAGTTTTACTATCAGTATTATAAGTTTTCAGAAAAATTATGCTTTTATGAGTTGTTATGATAATTGTAACTGGTTTTTAAGCATTTATTAAGTTTTTGAGGGATTTGTTTCTCTGCACAATTTAGTCCTGCCAAAAGGAAAAGTTTAAACAACATAAAAAGATGTTTAATTGAACTCATTGTTGAACTCGAAGGAAGACAGTCCTTCCCTACTGTGACCACTACGGGTGTGCACGGGTGAGTACACAGAGGTTGTGAAAATTTTACCGTCCAAAGCTATCAGAGTCTAAGCCTGAGAAGGAGAAACCTGTAAGCCCTAAGGAAGGCCTGGCGAGTACGTAAGGGTGAAGGCTCTGGGAAGATTTGAGAAGTGGTAAAATAAAAAGACCTAAAAAGAAATTAATAAACGCCTCTGGCAGGGCAAAAATTGGAAAGATTAACTGTCCTAGCTCAAACGCTTAATTCTTGCTTTAATCTCAGTTATTCTTATCAGAATTAATCTCATATCTGCTTAATTAGTTTCTGAGAATTTATTTAACTGACAGTATTGCTTTTATGCATGATATGGTTCGAAAAGATAATCTTATAGGTTACCCTACATCTGAAACGAAGCATGTCTGATATCTGGGAGAAAAACATCCTAACGTGGTATGCTACTTCCAGTACTTCGAACCTGAAGTACCTTGATCTTGCAGAAACTGATAATCCTAAAAAGAAAGAGCTCGCAAACAACATAGCAGTTTGCTACGATAGGATCTGCCTATCATCAAAAGTTCATCTGAAACATTTCAAAATTCTTGAAGAACAAATTCAGGAATTGAAGGCTGAAAACGAGCGCTTGACGCTTGCACTCAAAAATCTAACAAAAGAGGTCGTTGAAAATAGGCCTCTCACAGAAAGAGAAGTGAAAAAGCTGGTGAAGCAAATTGTAGCTCAACCCAAGCTGGTAGAGCAACAGACAATTGCACTAGCTGAAGATTTGAAGAAAAAGATTGATCAAGTGGAAGATCTGATCCACAAAATTAAAGAAACAGTTTCATGAGTGTCGCCAGCTCCAAGGGTAAAGTATCTTACGTGGAAGCACTCACACTCACAGAAGATCTTGAACCACCTGCTGCAGGCTTTGTGAAGCCTTCAGAATCTAAGGGCTCAGTGAGCTCTTACTGCGGGGCTATAATCAAGCAGAACAATACCATAATCCAGTTACTTGTTAGCCTCCACGAGAAGGTTGAGAACATTGACGAAAGACTCCGAAAAGTTGAGAAGAAGGAGCTTTCTCTCACCACAAATCTCACAAACGATCTTGTTAGCAAGATCAGCCAGCTCAAACTTGGGGATAAACCAATTCCCAAGAAAGGTGTTCTTTTAGTGGACAAGGATCCACTAGTCATTATTCGTGAAGAACAAGAGAAGCTCAAATTGCGCAAGCAATAATGAGCAGACAGCAGACCCTTGCTACTATAGCTCCAACAGTCGAGGACCAGATTCAAGAATACAGAAACAACAGAAGGCGACTGTACAACTTACAGCAAGGAGCCAGGAGACTGAAAAATAGGTTGCAGAAAAGAACCTATGAAAGGACACTGGAGCAGTACATTGATCCGAATGAACAGCTCAAGTTGTCCATGAAGAAAAGAGCCAAGTTAGTACCTGCTGAGGTACTATACCACAGCCGAAATGACAATGTAAACCACAAGGTTTACATCCACAGATCTGAAGAAGTAGTGAGAATCACTACAAATCAAGAAGACCGCTCTTTCATTCATGAAGAGAGCTACAACCAACTAAGAAAATCTGGTATGGAATTCATCCATATCGGGATTTTACAGGTCAGACTTCAAATATTGCACAGATCTGATGAAGGAACTATGGCTCTGGTTATCTTTCGGGATAACAGTTGGAAGGGAAACAAGTCCATCATTGCCTTGATGGAAGTTGATCTTACTCAAGGACACCAGATGGTGTACCTCGTTCCTGATATTATGATGACAATCAGAGATTTCTACAGGAACATCCAGATCTCTGTTCTTACAAAAGGCTATGAAGAGTGGCAAGGCGGCCACAATCTGTTGATTACAAAAGGAATGGTTGGGAGATTGTCTAACACCTCCAACGTCGGCTTCGAATACTCTATTAATAATGTTGCTGATTATTTGGTAAGCCACGGCGTTAAAGCTATTCCTGGGAAGAAATTCTCTATATCCGAGCTCCAGTTCCAAAATTGGAACATAAAACCGTCAAAAGTCTCGGTGCCAATGCAACCGCAAGGTTACAATGGAAGAGAATTGATTGATGGAAGCATTTCCGTCAGGTTCACAGATTATGAACCAGCTGAACCATCCACCAAGATCCAGTACAATGAAGATGACTCGGAGGTGGACCCAGACGAGATTATTGCACCACTGATAGGTGATGATGATGACTGGGAAGGTTTACAAACAACAATCGCATCTCTATCTGATAGAGGTGATGAGGAAGAGAAATTGCAAGTTCAAATCTTGCACCCTGATGCATTCTTACCATGCAGAATGACAGCCGGAGCTGCCGGCTATGATTTAGTGTCTATCTCTGAAGACACAGAGATTCCTGCGTTTGGAAGAAGTCTGTTCCAAACAGGAATAGCATTGACTGTACCTTCGGGCACCTATGGCAGAATAGCACCTAAATCAGGTGTTTCTCTCAACAAAGGTATAATAGTCAATGCAGGAGTCATTGACAGGGATTATATTGGGGAAATCAAGATATTATTGCAAAATGTGAGCCCCAACCCTATCCTGATCACGAAGTTTACTTCCATTGCACAACTCATACTTGAGCGATGCGAAGTACCTGCTGTCAAGGAAGTACAAGTTCTAGTTCCTACTCTTAGAGGAGCTCAAGGCTGGGGATCTACATCAACAGTGGCATGCTGCCTTCCCCAAACTGAAGAAGAAGAATCATCTTCCAGCGAAGATGACGACGATGATTTACCTTATCCTCGACTATTGCTGCCAAATCCATTTGCAGCAGCTAATGCCCGCCAACCTTTTGCGGAAGGTGGTGGAGAAGAGGATACCCCTGAACCTGAATCCAGCACTGAATCTTATGATTCAGACAATGAAGAAGAAAGAGGTTGGCGTGCACCACCGCCATCCGAAACTGATTATGATGATTATGAGTCTAGATCTCCTTCATACTTTCGAAGGACACTGCCAGGAGAAGACTCAGATGAAGATCTTTCTATTGATCTACGGCAACTGGGAGATGCCCTAGAACATCTTGATGATGATGAAGACCACTTCGTGTCAACTATTCATCAAGAAGGTGAAGAAGAAGATTTTAATCCAAAGGACTACCCGTCCTTACTACAGTTGGAGAAAATACTTTCCACTGCGGCTTCAGGATACAATCCCCCGCAGGATACATCCATGGGTCCGGTCTCGTACCCACCGGCTACTTCCACAACAGTTGAAGCAGGAAGTTCCAGCACAACTCCTTTCAGACCTTCATATGTTACATCTGGCACAAGGTTTAAATCGAAGGACTTTTCCGGGAACTTTTCACTTCCCCCTGCTCAACACATGCAAGGAGCAATGTTCACTGTTCCTATGCAGATGGGACAATTTGATGAAGTTTTCATGCGATGGGAAAGTATAACCAAGAACTTGGTTTCTCAGCAAAATTTCACAAATGGCAAAGACAAAGCCGAGTTCATTGAAAACCTGCTAGGCGAATATGAAAAGCTAGCGTGGATCCAGTGGAGAAGCACATTCACTGCAGAATACGATGAATTGATCAAAACTGCAGATGGTGCTGAGGGAACTCAAAACATTATCTCTCAAATTAGATACATCTTCACATTGGAGGATCCCTTCAGAGGATCAACACGCGCTCAAGATGAAGCCTACAGAGATTTAAAAAGACTCTCATGTCCAAAGATGGATAACATTATCCAGTTCTTAAATGAGTACATGAGACTTGCAGCAAAATCGGGAAGATTGTTCATAGGCACTGAGTTGTCTGAAGAACTATGGAGCAAGCTTCCTGGTGACTTAGGTACGGAACTAAAAACTCTGTTTGATGCAGCATATCCAGGTAACAAGATCGGAGTCCACCCAAGGATCCGGTTCGTGTACCAGTACCTTGAGAAAGAATGCAAGAAGGCTGCTTTCAGCAGATCACTCAAGTCACTGCAATTCTGTAACCAGATTCCTATACCTGGTTATTACAAGAACAATGAGAAGAAATATGGTGCAAGAAAGTCAACTACCTACAAAGGTAAGCCGCACCAAACACATGTCAGAATTGAAAAGAAGAAGCATCTCCAGAGGGAGAGAAAATGTAAATGTTTCCTCTGTGGAGAAGAGGGACATTTTGCTAGAGAGTGCCCAAATGAACGAAGAAATGTCAAAAGAGTGGCAATGTTCGAAGGAGTCAACATCCCTGAAGACTATGAAATCATGTCGGTACAAGAGGGAGATCCTATGAGCGATGCCATTTACTCATTATCCGAAGGAGAGGATGGGCAACTCGGAGCAGTGATAGAAGAAGTAATCTGTTACTTGAGGCAAGAAGACAACACCTATTGGATAGGGAAAGATGACAACTGGCGTGCCCAAGTAAGAGTGACAAAAGAAGTCCATGACTGCAACCACACATGGGAGATGCATCCCGAGATGATTGGGCAGACACCTAGGTGTCTGACGTGTAAAAGGGAAACACAGCAAAGTTGGAGAGCACATTGCTCTAAATGCCAGACTACAAGCTGTGGCATGTGTGGACCCAACTACTTCAACATCAAAATTCCTGTAAGAAGGGTGGAGCCAGTCAGGTATGATCCTAAACCCTTACTTGAACAACAACAGG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| 76,121
|
NC_076205.1
|
Dioscorea bacilliform RT virus
|
Bomer,M., Rathnayake,A.I., Visendi,P., Silva,G., Seal,S.E.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
DBRTV3
|
Dioscorea bacilliform virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,506
|
RefSeq
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Dioscorea cayenensis subsp. rotundata
|
plant leaf
|
2016-10
| null |
PRJNA485481
|
Dioscorea bacilliform RT virus isolate DBRTV3, complete genome
|
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| 431
|
MG711311.1
|
Dioscorea bacilliform RT virus
|
Boemer,M., Rathnayake,A.I., Visendi,P., Sewe,S.O., Sicat,J.P.A., Silva,G., Kumar,P.L., Seal,S.E., Bomer,M.
|
University of Greenwich, Natural Resources Institute
| null |
2018-10-02
|
DBRTV3-[2RT]
|
Dioscorea bacilliform virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,453
|
GenBank
| null |
Nigeria
|
Nigeria
|
Dioscorea cayenensis subsp. rotundata
|
plant leaf
|
2017-05
| null | null |
Dioscorea bacilliform RT virus isolate DBRTV3-[2RT], complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTGTTTCTTATGTCTGTAATGAGTGGCTAAGGCCCTATCTCAGGGTACTAAGGTAAAGGAAACTATCTTGATTTTCCTTCATTATTTTCTCTGAATCTTGAGTACTGAAATTTGGTTGTTTTATCAATATAGTTCTTGTGCTATGAGCAAGTATTGAGATTTTTGTTTTACGGGAATTTAGTCTGAAGTTTGAAATATTTATACCTAATGGGTGTTCGTTTGATACTGAACTAAGTTTCTGAAAACGCAAAAGACAAGGGCACTATATCCCGCCAGGCAGGAGGCCGTTAAGGGTGAACCCCCGAGGTGAGTGTTCAAAGAGCTTAGTAAGGTCGAAAAACTCGCGGTACCTTAGGTATAAATACTAAAACTAAGAGTTTTATCTTCTGTGAGAAAGAAATTGAACGGTTTATTGCTTAAAAGAGGGTTACTGGCTCGACTTGCCTTTGTTCTGAGGCCTGGCCTGGTCCAGCAACTTCAGGACTCTGTGTACAGAGAGCACTGCACTTTAGCCCGGAAAGCACGAACCTTCAATACTGGCTTATAGCATGAGAACTATAAAGACTGAACAATCATGAGTAGGTCAATAGATTTAGAGAAAACTCTGAAGGATTATCTTGACAAAAGTACCGAACCAGAGTACCTTGACCTTTACACCGTTGATAGACCTACAAACAAACAGCTAGCAAACAATCTCTGCTACTTGAATCACCAGGCGAAGTTATTTTCCCGTGTTTCTTTAAAACATTTCTTTCAGCTACAGGAAGAAATACAGGAGTTGAAGTCGGAGAACCGAAGGCTCCGAAAAGAACTGGTCAACCTGACCAAAGAGGTGGTTGAAAACCGCCCGCTGACTGAGAAGAAGGTTCAGGACCTCGTGTTGAGGATCACTGAACAACCAAAAGAGATCGAACAACAGGCAGTGCGCCTAACTGTTGATCTACAAAAGAAGCTTGACAGAGTCGAGGAGATTCTAAAGAAGCTCGAAGGAGCTGTCCTCCTATGAGCGCTCCTCCTACAAGCTCGTCGAAGGAGTACTTGGAGGCACTCAAAGCTACCGAGTCGATTGAACCACCTGCTGTCGGCTACACTCGTCCAGCAGAATACAAGGGACTTGCTTCTGCAATAGCAAGTGTCCAAAAGCAGAACAACACCATCATCCAGTTGTTCACACAGCTTTTCACTCAGCTGAACACAATCCAGGGAGAAATTCTGTCCCTAAAGACTGAACAGAAATCCTCTGTTCAACAAGAGGCCTTACTTGACCAGGTAATTACCAAACTTGGTAAATTATCTATTACTGAGAAGCTACCTGAGAAGACAGGTAAGCTACTGGTGCACAAAGATCCCGTTGTTATCTTCCAAGAAGAAAAGTTAAAGCTCCAAAAATGAGTCAAACCAGAATTCAGGAAGTCTCTACCTCTCAGCAACAATTTGATGATCAAATTAGAGACTACAGACTAGGAGCCCGACGAAGATACAACCTGCAACAAGGGATCAAGAAGATGAAGAATGTCCTACATCTTGGGACATACAATACACCAACTCTGGAACAGCAAGTAGATCCAGAGAAGACCCTGCAGCTTTCAGCAATCAAAAGAGCATCTATGGTGCCCGCAGAGATACTCTATCATGCCCGACCGGACACAGTAAACCATAAAGTCTACATGCACTGGTCTGAAGAGGCTGCTCTGGTTGTGAACAATCAACATGACTCAACCTTCATCCGACCTGAGTCATATGCCACTTTGAAGAAGGCCAACATGCAATTCATACACATAGGCCTAATGCAAGTACGAATACAAGTGCTACACCGACTTGAAGCCGGCACGATGGCACTAGTGGTATTCCGTGATTGTTCTTGGAAAGGCAAGCGATCCACTATCGCTCGCATGGAGGTAGATCTTACAAAGGGGAGTCAACTGGTCTATGTTGCTCCTAACATCATCAAGAAATTCACTGATTTCTACAACAACATCCAAGTATCCATTCTCACGAAAGGATACGACGACTATCAAAACAGTGAAGCAAACCTCCTCATTACTAAGGGTCTGATTGGACGATTGTCCAATACTTCAAATGTTGGTTTTGCCTACACAATTGACGGAGTTGCTGATTATTTCATCACCCATGGAGTCCAGGCATTGAAGGGAATGCCATTGACAACTGACGACTTCCAGGGTACTCTATGGAATATCAAGCCGTCACGAATTGTTATTCCAGCACAACCAACAGTCGCAGATGATCGAGAGCTAGCTGATGGCTCTATTTCTATGCGTTTCGGCGCATACAAACCTGCTCCAGTTCCCGCTTTGGAAGCATCTGAGGAATTCGACTCAGATGAAATTCAAATGGTGAATGTTCTCACTACTTCTGTTTCTGATTTATTAATTAAACTGATGCACAGAGATGCTATTATCCCACAAAGGATAACCGACGGATCTGTTGGTTATGACCTTGCTGCCTGTGAAGACGTTATTGTATCCACAACACAGCCAACACTGGTAAGGACAGGCATAGCAATTGAAGTCCCTAAAGGTACATATGCTCAACTGTACCTAAAGTCTGGATTTGCACTCAAAACGGGCTTGCAAATCTCTGGTGGAGTCATTGATCCAGACTACACAGGGGAGATTCAAATACTTCTCAACAACAATACCCGTAGCAGTATTCCAATTTTGAAGGGTACTTTTGTAGCACAAATCATCTTACATCATGTGGCTATCCCAGATGTTCGAGAAGTAGCACAACTCACTCCAACCCTCAGGAACTCACGAGGTTTTGGGGTACTAACTGCTGAGTCATCCAATTTGGTGACTCGTGTAAAATTTGAAGAAGCAGCACCTCAACCTCAACTAAATGAAGATGCTGATGATGAAGAAGATGCAGATTCTCTCAGTGACTATCTATCATATCTATCATCACGCTCTTTTTGCAGGGAGGGAGGAGAGAAGACTATTGCTGCCGCCGCTGAAGAAGAAGAAGAAGGACTTTATTTTTGTCCTTCACCTGCAAGAGTAACTTTTGCTGATGATCCTTTCAACGAGGATCCAACCATTGCCACTATTCGTGAAGATGGTGACTCACTACCAATATATGACGAAAGTGGTGATGAAGACCGTGATGATGATCTGATCCATGAGCTGGTAGCCTTGGAAGCTGGATTTGATGGAGATCTTGACTATCCCCAGCTAAGGCAATTAGAAGAATGTGTGGTGGCCGCCTCAACTGCGGTTTCTCAATATACACCGCCTGCTGACACAACGATGAACCCACCCACATATCCACCAGCGAGGACGGACGGAGCATCTACATCATTTAATTCAAATCAAGCCTCTTATGGAGGATCCACTTCATTCAACCCAACTCAATCATCCTATTCTTCTGGGAGAACCAGATTCAGGTCGATGGACTATTCCCCGAACTGGCAACTACCATCGGCACAGCAGACAACAGGGGCAATGTTTTATATGCCCTTAGAATTGGAAAAGTTTGATGACATGTTCTCCAGATGGGAGAGCATCACTAAAAATGTTGTTTCTCAACATTCTTTTATTTCAGGACGTGAGAAGGCCGAGTTTATTGAAAACTTACTCGGTGAAACAGAAAAATTAACATGGATCCAATGGAGGACTGCCTACAATGAAGAATACGAGACTCTAATTGCCTCAGCTGATGGTCGAGAAGGAACTCAGAACATCATTTCTCAACTTCGAACCATCTTCACTCTTGAAGATCCGTTCAGAGGATCAACCAAGGTGCAAGAGGAGGCCTATAGAGATCTGGAGAGGATCTCATGTAAAGATGTGCAGAGCATAATCCCATTCATGAACGAATATATGCGGATTGCGGCGAAGACAGGCAGACTCTTTATTTCTTCAGAGTTGTCGGAGAAATTCTGGATGAAGCTCCCGGGTGATCTAGGCAAAGTGATCAAGGAGCAATTTGAAAAGACGCACGTGGGCAACACAATAGGAGTGCACCCCCGAATCCTGTTCACTTACAAATATCTACAGGAGGAGTGCAAGAAAGCAGCCCTTGCGAGATCTCTGAAGAATTTACAATTCTGTAGCAAGATACCCATTCCAGGGTACTATCAGGGCAAGGAGAAGAAGTACGGCGTGAGAAAATCAACTACCTACAAAGGTAAACCTCATGACTCACACGTACGTATTGAGCGCAGGAAGCATCTGGTCCGCTCCAAGAAGTGCAAATGTTTTCTCTGTGGAGCTGAAGGACACTTTGCGCGCGAATGCCCGAGTGACAAGAGAAACGTCAAAAGAATCGCAATTTTTGAAGGAATGGAAATCCCTGAAGACTGCGACATCGTCTCTGTACAAGAAGGGGATGAAATGAGCGATTCAATATTCTCAGTCTCAGAAGGAGAAGGAGGTGAAGGTTTGCAATCTCTAAATCCTGTTATTCAACATCACCTGTTATATCTGAGACAAGAAGATGGCAAATACTTCCTTGGCGGAGGAGGATGGCGAGCGGCTGTACAAGTAACACAGCAGGAACATGATTGTCGCCATCAATGGGAGTATTATGTCCTGAACACTGGTTCCTGCAGATTCTGTAGGAAGGAGATCACCAGAAGATGGCATGCCAAGTGCATGCATTGCAGCATAATTACTTGCGGTTTCTGTTCACAGCACTATGTACAGTTAGAAATACCATGCCAGAAGGAGGAGGTACAGATATACAATCCTCACAGGCTATTATACGAGCAGCAGGAGTATATAAAATTCTGTGAAGTAGAGATTGAGAAATGGAAGAATTCTGCCAAAGCTGCGGAGAAGGTGGCGGAAGACAAAATCCTGGCAGCTTCCATCAGAAATGCAGTTGAAGTCGAAGAACTCAGAAAGGAGTTGGCAACAGTCAAGCTAGAAAGAGATAGGCTTGAACTGGAGAATCGAGACCTGAAGCGGATTCTTGAAGAATCTGAGCAGGTAAATGTTTTAATTTGTGATGGTAAGGAGAAAC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| 68,127
|
MG711312.1
|
Dioscorea bacilliform RT virus
|
Boemer,M., Rathnayake,A.I., Visendi,P., Sewe,S.O., Sicat,J.P.A., Silva,G., Kumar,P.L., Seal,S.E., Bomer,M.
|
University of Greenwich, Natural Resources Institute
| null |
2018-10-02
|
DBRTV3-[3RT]
|
Dioscorea bacilliform virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,448
|
GenBank
| null |
Nigeria
|
Nigeria
|
Dioscorea cayenensis subsp. rotundata
|
plant leaf
|
2017-05
| null | null |
Dioscorea bacilliform RT virus isolate DBRTV3-[3RT], complete genome
|
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| 68,128
|
KX008575.1
|
Dioscorea bacilliform RT virus
|
Bomer,M., Turaki,A.A., Silva,G., Kumar,P.L., Seal,S.E.
|
University of Greenwich, Natural Resources Institute
| null |
2016-07-26
|
DBRTV1-[2RT]
|
Dioscorea bacilliform virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,707
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Dioscorea cayenensis subsp. rotundata
|
plant leaf
| null | null | null |
Dioscorea bacilliform RT virus isolate DBRTV1-[2RT], complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTGTATGATTTGCAGTATGACAGGCTAAGAAGCCCAAAAGGGATTCAGGTAAGGGAAAACTGACTTCAATGAGTTTTTAATATATTTATTTCCCAGAGAAAAGGGCAGAAAGATTATTAACAAGGGTTTATAGTTCATATAAAGTCACTGGTTCGCCTTGCCATTGGTTTTGAGGCCTGGCCTGGTCCAGCAACTTCATACCTTTGGTACAGAGAACACTGCACTTTGACTTGGAGAACACGAACCTGAGTTTTAGTCTCTGTGTTTTAGGGAAATATATTTATAATTGCTAATGGGTGTTTGTTTGAAAAGAGACTTTATGAGCATTAATGGGTGTTTGTTCGAAACAAGCTAATTAGAGTTAAGTGCAAAAGACAAGGGCTCTATATCCCGTCAAGGCAGGTGGCCGTTCAGGGTGATCCCCCGAGGTGAGCACTTAAACTCGAAGTTAGTAAGTTAGAACTTGCGGTACCTTAGTGCTTATAAGAACTTTCTAAAACTTGCGGTACCTTGGCTCTTATAAATGTGTTTCTCTATTATACAAAGAGATAATCAAGTATGTCTGCTATCTGGGAAAATTCATTAAAAGCTTATTTTGAAGGAAGAAGTACCGAACCTGAATACCTTGATTTATATACTGTCGACAAACCTACCAACAAACATCTTGCTACTAATCTTACCTATCTCAATCACCAAGAAAAGCTATTTTCCAAAGTATCTTTGAAACACTTTTATCAGCTACACGAAGAAATACAGCAGCTTAAGGCTGAAAATCTGAAGCTTCGTAAAGATCTGGTTGCTCTAACCAGAGAAGTTGTGGAGAATCGACCCCTAACAGAAAAGAAGGTTCAAGATCTCATCCTGAAGATTACTGAACAACCTAAAGAGATCGAACAACAGGCTGTTCGTCTATCTGAAGATCTGAAGATAAAACTTGAGCGAGTAGAGACTCTCCTGAAGAAGATAGAAGGATCAGTCCTTCTATGAACCATACTGAAGAGTACAAAAGGGCACTGCAAGCAACAGAAGCAATAGACCCTCCCGCTGTTGGATACATTAAACCAACAGAAAAACTAGCTCTAGCGGTGATCAATCTGCAGAAGCAGAACAATACTCTGACCAACCTTATTACACAAATATTTGAGAAATTAACTCAAATACAAACAGAGGTCAGAAGTTTGAAGTCTCAGGCTTCACCGGTAGCTGCATCCGACGAGCTACTGGATAAGGTAATTACCAAACTTGGTAAATTATCTATTGCTGACAAATTACCCGAAAAACAGGGAAAGCTTCTAGTTTTCAAAGATCCGGTGCTGATCTATCAAGAAGAAGCAGAGAAGCTAAAGAGAAGATGAGCCTAGTAACGAGGACCCGAGAAGTTGGTAGCACATCAGCTCCAACACATGAAGACCAGATTCGTGACTACCGGCTAGGAGCACGACGTCGGTACAACATGGGTCTAAAAGCACAGAAGCTGGTGAAGACACTTTCTCGAGGGAAATTCTACAATCCTACCCTCGAACAACAGGTGGAACCTGAAAAGACGTTGCAGCTATCATCAGTGCAACGGGCTTCGTTGGTACCAGCAGAAGTTCTCTACCATTCACGGCCAGACACCGTGAATCATAAAGTATATATGCATTGGTCGGAGGAATCCGATCTCATTATCAACGGCCAGCATGATTCAACTTTCATCAGGCCAGAATCCTATCAACTATTGCAAAGGTCAGGTATGCAATTCATTCATATAGGCCTTATGCAAGTCAGAGTGCAAGTCCTGCATCGTCTGGAGGCAGGAACCATGGCAATGATCGTATTCCGCGATTGCTCGTGGAAAGGGAAGAGGTCTACTATTGCCCGTATGGAAGTAGACCTATCAAAAGGAAGCCAATTGGTGTATGTTGCACCAAACATTATCAAAAGGTTGGCAGATTTCTACAATAATATCCAAATCTCTATCCTTACTAAAGGATACGAGGACTACCAGAATTCAGAGGCCAACTTGCTGATTACCAAAGGCTTAATTGGAAGGCTATCCAATACATCAAATGTTGGGTTTGCCTATTCAATTGATGGTATTGCTGACTACTTCATCACTAATGGTGTTCAAGCTATCAAAGGAGCGCCGATGAGCACAGAAGACATCCAGGGAACTCTCTGGAACATCAAGCCTACAACTCTGGTTGTACCAGTACAACCGACTGCAGCAGATGACCGAGAACTAGCTGATGGAAGTATCTCAGTCAGGTTCTCAAAATACAAGGCTATTCAAGAACCAACAACTCCAGTCTTCAATGATCAAGATGAGGAACTGGATCCAAATGAGCAACATATACTTGCTTATTTATCTGAAGCATCTGACATGCCATTAAAAATCAGACTTCTAAATGCTGATGCGGTTCTACCACAACGAATGTCATACGGGGCTGTAGGCTATGACATAGCCATCACAACCTCCGAAGACATACCACCATACCGACAAGTAAAGTTATCCACTGGATTGGCAATTGAGGTTCCCTACGGAACCTATGCTCAACTATACATCAAGTCAGGTGTGGCTCACAGAACGGGGTTAATGCTGAATGCAGGAGTAATTGATCCAGATTATCGTGGGGAAATCTCGTTACTTCTACATAACCCTACGGACACTACAATCAGTGTTCGCAAAGGTGATTTTCTGGCTCAACTTGTACTACATCAAATCCTAACACCACCAGTACAGGAAGAAAATGCTCTCACCCCAACACTACGAGGCGACCGTGGATTCGGCGCACTCACAGCTGCAGCCTTCATCCCTACATCTGTACCTACAGAACATGTACATAATGAAGCTGATGATGAAGCCGATGAAGCTGATGATGAAATGGAGTATCTCTCCTATTTATCAACAGCTCCTTTTTCGGGGGTAGAAGAGGGAGAAGACGAAGGATATTTCAATCTTGCTGCCGCTGAAGATTACCCAACAACTATTATTGATGCTGCTGAAACATCAACAATAGGCTTTCTCTCGGCACCAATCTATGACACAGATGGAGAAGAAGGAGATGAGGACAATGATGACATACTTCCAAAAAGAATTGCTGTCCTCAGCTTTGAACATGACTATCCACAGCTAAGAGGACTGGAGGAGCATGTGGTCGCTGCCACTTCAACAGCAGTATCAGCATACAGACCACCGGATGACACCACAATGAATCCACCTACTTATCCTCCGGCAAGCAATTTACCAAGTGCAGGAAGTGTGCCAAGCACAAGCTATCCAAGCACAAGCTACCCCACTACTCAAGGAGCCACCTCCGGAGTCGGAAGCGGCACGAGGTTCCGAGCAAAAGACTATTCTGGAAACTGGAACCTACCTTCGGCACAACAGACAACTGGTGCCTTGTTCTACATTCCATTAGAGCTGGGGAAATTTGATGAAACATTTATGCGCTGGGAGAGCATTACAAAGAATCTTGTCTCTCAGCATACTTTCACTTCTGGAAGAGACAAAGCAGAGTTCATTGAAAATCTGCTAGGGGAATACGAAAAGCTAGCATGGATCCAATGGAGGACATCCTACCCTGATGAATATGAGAAGATATTGGAATCCTCAGATGGGCGAGAAGGAACTCAAAATATTCTATCACAAATCAGAACGGTGTTCACTCTCGAAGACCCTTTCAGAGGATCAACCAAAGTACAAGAGGATGCCTACCGAGATTTAGAAAGAATCTCATGCAAAGACATGAAGGATATAATCCCCTTCATGAACGAGTATATGAGGTTAGCTTCAAAAACTGGAAGACTATTTATTTCATCTGAACTTTCAGAAAAATTCTGGATGAAGCTACCAGGAGATCTGGGAAAACGGGTGAAGGAACTCTATGAAGCAAGCTACTCCGGCAACACTATTGGAGTTCACCCAAGGATTCTCTTTACCTACAAATTCCTGGAAGAGGAATGTAAGAAGGCGGCTTTCAGCAGATCACTAAAAGGCCTTCAATTCTGCAATCAAATACCCATCCCTGGGTATTACAAAGGAAAGGAGAAGAGATACGGCGTAAGGAGATCCACAACCTATAAGGGGAAGCCTCATGACTCTCATGTAAGAATAGAGAAGAAGAAGCACCTGATGCGAGAAAAGAGGTGTAAATGTTTCCTCTGCGGCAACGAAGGACATTTTGCTAGAGAATGTCCAAACGATAAGAGGAATATCAAAAGAGTCGCAGTCTTTGAAGGGCTCGAGGTTCCTGATGACTGTGAAATTGTCTCGGTACAAGAAGGAGACAATCAAAGTGACGCAATATATTCTGTCTCTGAGGGAGAAGTGGCTGATGATGTACAGCAAGGAGTAAACGTATTCATACAAAAGGAGACCCTCTACTACTTACGACAAGAAGACAATGCATATTTTCTAGGAGGAGGAGGATGGCGATGTGCTGTAAGAGTCACTCAGCAAGAACATGACTGCAGACACCAATGGGAATACTACTCCCCAACAGTGGCAAATTGCAGATTCTGCAAAAGAGAAGTCATGCAGAGATGGAATGCCAAGTGTTCCAAATGTTCTATACTTACATGCGGTATGTGCTCTGAACATTACCTAGGCCTCAATATACCTTGTCAAAGAGAAGAAATTAGGCAGGTATACAACCCAAGGCAACTAATGATGGAGCAACAAAGCTACATACAAAGCTGCGAACTGGAAATTCAACGACTGAAGGAAGAAATCCAAAATGTCAAAAAGGTCGCTGAGGAGCAAGTTGTTGCAGCAAAAATCAATGAAGCTGTTGCTGTGAAAGAAATGCAGGAACAAATACAGGAGTTGAAGCTTGAAAATGATAGATTGACACTTGAAAATCATGATCTTAAAGAACTCCTCAAGAACAAAGAGCCAGAGCAACTGGAGGTGCTAATCTGTGAAGGGAAGGAAAGGCAGTACATTGCTGCAGCATCGCTCAAAGAAAGAAGAAACGGGCTCTATAATCTAATTGTGGAGAT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| 80,809
|
KX008576.1
|
Dioscorea bacilliform RT virus
|
Bomer,M., Turaki,A.A., Silva,G., Kumar,P.L., Seal,S.E.
|
University of Greenwich, Natural Resources Institute
| null |
2016-07-26
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DBRTV1-[3RT]
|
Dioscorea bacilliform virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
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dsDNA-RT
| 7,708
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GenBank
| 1
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Nigeria
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Nigeria
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Dioscorea cayenensis subsp. rotundata
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plant leaf
| null | null | null |
Dioscorea bacilliform RT virus isolate DBRTV1-[3RT], complete genome
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| 80,810
|
KX008578.1
|
Dioscorea bacilliform RT virus
|
Bomer,M., Turaki,A.A., Silva,G., Kumar,P.L., Seal,S.E.
|
University of Greenwich, Natural Resources Institute
| null |
2016-07-26
|
DBRTV2-[2RT]
|
Dioscorea bacilliform virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,462
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Dioscorea cayenensis subsp. rotundata
|
plant leaf
| null | null | null |
Dioscorea bacilliform RT virus isolate DBRTV2-[2RT], complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTTTAAAAATGATGATGGAGTAGAACTCCCTTTCAGGGTATTCTAGCCGAAGGTGAGTGAGTTTTCAATTAAGGTAAGGTACACTCCCTACTTCTTTAAACGATAGATTTCATTAATAACTTTGAGTAATATTTCCCGAGTAATTGACAGATTTCCAGTCACAAGGAAACCTTGAAGAAGATGCTTAGCTTTGTGTAAGTTCTAAGAGTAAAAGAACTGGGCCCTATATCCCGCCAGGCAGGAGGCCGTTCAGGGTGAAACCCCAGTGTGAATTCTGAAAAACTTATGCATAGTTGAGGTACTTCCAGAGGGGACTAAGAGGCTGAGTAATTCATTAAACGAAAGGGAAGTATTGCAATATAAGTTAGGAATGAAATATGTCGGTTAAATGGGAAAAATCAGTACAAGCCTATTTTGGATCTCACAAACCAGAGCTAGAGTACCTTGATCTTTCATCATTAGAAAAACCACCACTTAAGAGTATTGCTCATAATTTAGCTTATTTAAATTATCAAGAAAAATTGCAATCAAAAGTTCTTTTGAAACATCTGTACACAATTCAAGAGAAAATTTCAGAGCTTGAGGCAGAGAACAAGCGTCTGAGGAAGGACTTGGTGTCTCTCACCAAGGAAGTGGTTGAGAACCGACCACTTACAGAAAGGAAGGTTCAGGAGCTGATCGTCAACATCACTTCTCAACCGAAGGAGATTGAACAACAAGCAGTCAAGCTGTCAAAAGATCTACAGCTCAAGCTTGACCGTGTAGAAGACATCCTAAGGCGCCTCGAGGGTGCCGTGACTGTATGAACTCTGAGTCGCTTGAATATAAGCGAGCTCTACAAGCAGTTGAGTCTTTGGAGCCCCCTGCTCTAGGATTCATAAAACCGGCAGAATTCCGTGCAGGTCTAGCAACAGCATCCGCAGCCATACAAAAGCAGAACAATACTATCATTCAACTGTTGCTGCAATTATCTGAAAAGGTAAACTCGCTGCAAGCAGAGATCAAGACTTTGCGCAAGGAGCCGGAGCTGCCAGACGAGATCTTGGACCAGATTACCTCTAAATTCAACAAACTATCAATTGCTGAGGCTCCAACTGAGCCAAGAGGTAGAATTCTTGTCCATACAGACCCTGTGAAGATCTTCGAGGAAGAAAAATTGAAGCTATGAGCCTCGCAAGAACCACAGAGGGAGTGGCATCCACATCAAGGCCCACTCATGAAGATCAGATCCGAGATTACCGACTCGGACAGAGACGGAGGCACAACCTCCAGCAGGGAATGAAGAAGCTTTCTGCAAAGCTTTTTGGGGGTCCATACTCACGGACCTTGGAACAACAAGTGGACCCTGAGAAGACTCTTCAGGTGTCCATGTATCAAAGAGCATCTTTAGTACCCGCCGAGGTACTTTACCATGCCAGACCAGACACTATTCATCACAAGGTGTATCTCCATTGGTCTGAAGAAGCTGTCCTGGTGATCCAAGGACAATATGACTCTACTTTCATCAGAACAGAGTCATACGAGGCACTGCAGAGGGCAGGTATGCAATTTATACATATAGGCCTCATGCAAGTGCGTATACAGGTTCTGCATCGACTGGAGGCAGGAACCATGGCACTGGTCGCATTTCGAGACTGTTCGTGGAAAGGCCGACGGTCTATCATTGCCAAGATGGAGATTGATCTCTCCAAGGGAAGCCAACTAGTCTATGTGGCTCCCAACATCACTAAACGTGTTGCTGACTTCTACAGAAATATTCAAATTTCTGTAATGACAAAGGGCTACGAGGATTATACAAGCAGTGAAGCCAATCTACTCATTACCAAAAGTATGGTAGGAAGGCTCTCTAACACCTCGAATGTTGGTTTTCAGTACTCTGTTTCAGGAATCGCAGACTACTTTGCTACAAAAGGAGTTCAAGCCCTCAAAGGGACTCCATTTACGGCAGAAGAGTACCAAGGAGAACTATGGAATCTTAAGCCATCTCGGCTTACGATTGCCATGCAGCCCCAAGACTCTGAAGAACGTGAACTGCCTGATCATAGCATTTCAATGAGGTTCACAAGATATGTAGCTGCACGAGAGCCCGCGAGGATTGCATTCAATTCTCAAGACGAAGAAGTATCTGAAGATGAACAGCATGTGCTGGCTGTTCTTCACACTACTGAACAATTCCTGAGGGTGCAAGTCCTTCATCCTGATGCCAGAATACCACAGCGGATGACCGCAGAAGCAGCTGGCTATGACTTAACGGTCATAGAAAGCGCACAACTACAACCAGGGGAGCAGAAACTGTTCAGAACTGGCGTGGCTATTGAAGTTCCAACAGGAACCTATGCACACTTGTTTCCACGGTCAGGAATAGCCCTCATGAAAGGCATCAACATTGGCGCAGGAGTTATTGATCCTGACTATACAGGGGAGGTCAAAGTTCTTATTCAAAATATTTCTACTCAGCCCTGTGACATTTATGCAGGAGAAGCATGTGCTCAAATCATCCTGGAGCAGCACCTCACTCCTGAGGTTAAAGAAGTCGGGGCTATGCGCCCAACTCTTCGTGGAGACCAAGGCTTTGGTTCCACATCTGCAGTAGTATTTTCAATTTTTGAAGACGATGATGATGATAATGATAATGATGATTTCCCATCATTCGCGGAAGGTGGTGGAGAGATGGACTACTTTCCTTTTCAAATTGAAGAATCTGATGAAGATCCTATTGATCTTGCACAACTGGTGCTAGAAGCAGAGGAGGAAATGCTGAAAGAAGTCAAGCTAACAACTGCCACACTTGATCTTGACTACCCAGAGCTTGAAGAACTTCAACGCATTGTTGGTGCTTCAACGGCGATGTCTGAATACTCGCCACCACAAGACACATCAATGAACCCACCAACATATCCCCCAGCCCGAAGAGAATCAGCAGCCTCTGCACCATCCACATCCACGGGCATTTCATCAGGTGCTCCAACTGCCTCAGCAGGCACAAGGTTTCGGGGAAAAGACTACTCTGGTACCTGGACACTGCCATCAGCCCAGCAGACAACAGGGGCAATATTCAACATGCCACTGGAACTGGGAAAGTTCGATGAGGTATTTATGCGTTGGGAAAGTGTAACTAAAAACCTAACTGCCCAACACGTTTTTACTTCAGGAAGGGATAAAGCTGAGTTCATCGAGAATCTACTCGGTGAATATGAAAAATTGACGTGGCTGCAATGGAGGACGGCCTATCCAGCAGAGTATGACACTCTACTAGCTTCAGCAGATGGAAGAGAGGGAACTCAAAATATCCTCTCTCAAATCAGAACAATATTCACCTTGGAAGACCCTTTTAGAGGTTCGACTAAGGTCCAAGAAGATGCATACCGAGACCTTGAGAGGATCTCATGCAATGACATGAAGGACATCATTGCCTTCATGAATGAATACATGCGACTGGCTTCGAAGTCTGGGAGGCTGTTCGTCTCCCCTGAATTATCAGAAAAGTTTTGGCTGAAGTTACCGGGTGACCTCGGTAAGAGAATCAAGGAAAAGTTTGATCAAGCTTACGCTGGAAACAATGTGGGAGTCCACCCACGAATTCTATTCACTTATAAATTCCTTGAGGAAGAGTGTAGAGCAGCAGCATTCAGCAGGTCACTGAAAGGATTGCAATTCTGCAGTCAGATCCCTATCCCAGGATACTACAAAAATTCTGGAAAGAAATACGGAGTTAGGAGGTCAACTACGTACAAGGGGAAACCCCATGAAACACACGTACGTATTGAGAAGAAGAAATACTTGGAGCGAGGAAGTGCGCTCAAGAACAAGAAATGCAAATGCTTTCTGTGCGGAGAAGAAGGCCATTTTGCAAGGGAATGCTCAAGCGATCGAAGAAATATAAAGAGGGTCGCTATATTCGAGGGATTGGAGATCCCTGAAGATTGTGAAATTGTATCTGTGAAGGAAGGTGAAGCACAGAGCGATGCCATCTACCCTATCTCAGAGGGAGAAGACAACAATGAGGTACATAACTTAAACTCAATTACTCACAGCTCATTGTTCTACCTCAGAGCCGAAGACAACACATACTGGCTAGGAGGAGGTGGATGGAGGTTTGCTGTAAAGGTGACTCCACAGGAGCATAATTGTGCACATTCCTGGAGTTACTATGAAGAGCAGTCAAGAACCTGCCGATTCTGTAAACGGGAGGTCATGAAACGGTTCAACGCACACTGTTCCAAATGTTCTATCACTACATGCGGAATGTGTTCGAACCACTACCTCTGGTTCCAGATACCATGCCAACAGGAAGAAGTCAGACCGGTATATGAACCAAGGCAATTGATGAACGAACAAATGACGTGCATCAAACACTGTGAAGAAGAAATTGCCAGACTAAAGCAAGAGGTAGCAGCTGCCAAAATATTGTCAGAAAATGAGATTGTCAGTATGAAGATAAGGGAAGCAGTGGAAACTGATACCCTAAGAAAAGAAAATGAGACGCTACGACTAGAAAATGAGCGTCTGCAATTAGAAGTGGCGGACCTAAATAAAATCATCAAAGGGAAGCAACCAATAATTCCTGAAGATGAAGAGCTTGAAGAGTTGAAACAACAGGTCCAGCAGCTGAAGAAGAGCCTTGAGGAGAAAAGGCTTGGAGTGATAATTTGCGAAGGAAAGGGCGAACAAGTACTGGCAACAACGAGCTCAAGGAATGGGCTTTACAACTTGGTTGTAGAGTTATCTATCCCAGGTATACTCCCTTTCTCTGTTAACGCAATTTTGGATACAGGGGCAACAAACTGTTGCATCAATGAAGAAGGTCTTCCCAAAGGGGCACTGGAAGATAATACCTTCGAGGTGACCTTCACTGGTGCAAACTCAGTAATGAAGGCAAACAAGAAGCTGAAAGGAGGAATGATGAAGATTGGAGATCATCAATTTCGGATTCCTTACACCTTCGCCTTCCCCCTACGACTCGGAGGAGGAGAGCAACTTATT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| 80,812
|
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|
Dioscorea bacilliform RT virus
|
Bomer,M., Turaki,A.A., Silva,G., Kumar,P.L., Seal,S.E.
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University of Greenwich, Natural Resources Institute
| null |
2016-07-26
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DBRTV2-[3RT]
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Dioscorea bacilliform virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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dsDNA-RT
| 7,438
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GenBank
| 1
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Nigeria
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Nigeria
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Dioscorea cayenensis subsp. rotundata
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plant leaf
| null | null | null |
Dioscorea bacilliform RT virus isolate DBRTV2-[3RT], complete genome
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| 80,813
|
NC_005283.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Rima,B.K., Collin,A.M., Earle,J.A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-12-05
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,702
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Dolphin morbillivirus, complete genome
|
ACCAGACAAAGCTGGCTAGGGGTAGAATAACAGATAATGATAAATTATCATACTTAGGATTAATGATCCTATCAATTGGCACAGGATTTGGATAAAGGTTCACAGTCATGGCGACACTTCTTCGGAGTCTAGCTCTGTTCAAGAGGAACAAAGATAGAACACCCCTAATTGCAGGTTCAGGAGGAGCCATAAGAGGGATTAAGCATGTTATCGTAGTCCCAGTACCCGGTGATTCATCGATTGTCACTAGGTCAAGATTATTGGACAGGTTAGTAAGACTTGCTGGTGACCCTTATATAAGTGGACCTAAGCTGACAGGCGTCATGATCAGTATACTATCATTGTTTGTTGAATCACCCAGTCAACTAATACAGCGAATCACTGACGACCCAGATGTCAGCATCAGATTAGTTGAAGTAATCCAAAGTGAGAAGTCCCTATCAGGGCTCACTTTTGCATCCAGAGGCGCTAATATGGAGGATGAGGCGGATGACTATTTCTCTATTCAAGCAGGGGAGGAAGGGGACACCAGAGGAACCCATTGGTTTGAGAACAAAGAGATAGTTGAAATTGAGGTTCAAGACCCAGAAGAATTCAACATACTATTGGCATCTATTCTTGCACAAATTTGGATCCTATTAGCCAAGGCAGTCACTGCTCCAGATACTGCAGCTGACTCCGAGACGAGGCGGTGGATTAAATATACTCAGCAACGCCGTGTAGTGGGTGAGTTTCGGCTTGACAAGGGATGGTTGGATGCTGTGAGAAATCGGATTGCGGAGGACCTATCGTTGAGGAGATTCATGGTGGCATTAATTTTAGATATCAAGAGAACACCAGGGAACAAACCCAGGATTGCCGAGATGATATGCGACATAGACACCTATATCGTCGAGGCAGGTCTTGCTAGCTTCATCCTAACTATCAAATTCGGGATCGAAACAATGTACCCGGCCTTAGGGTTGCATGAATTCTCGGGTGAATTAACTACAGTTGAGTCTCTAATGAACCTCTACCAACAGATGGGCGAGACTGCACCGTACATGGTAATTCTTGAAAACTCAATTCAGAACAAGTTCAGTGCAGGTTCATACCCGCTATTATGGAGCTATGCAATGGGAGTTGGAGTTGAACTTGAAAATTCAATGGGTGGACTTAATTTTGGTCGTTCTTACTTCGACCCTGCATATTTCAGACTGGGTCAAGAGATGGTCAGGAGATCAGCAGGCAAGGTGAGCTCATCGCTAGCCGCAGAACTAGGGATCACAGCCGAGGACGCCAAACTTGTCTCCGAGATTGCTGCGCAGGCTAATGACGACAGAGCTAATAGAGCAATAGGTCCCAAACAAAACCAGATATCGTTTCTTCATCCTGACAGAGGCGATGCCAGTACTCCAGGGAACATCCTTCGCGCAAACGAGGGTGACGGGTCCACCCGGATGAAAAGAGGGGGGAACATTGCTACACCAAAAGGGACAAGCATAGATCAGACATCAACGACTCTCAGCAAAGACACTCTAGACATTGATGAACAGTCCGACAACACTGACGACCCAATTAGTATCCAAAAATCAGCTGAGGCATTAGCCAAGATGAGAGCCATGGCCAAGCTATTGGAAAACCAAGGCCCGCGTGATGTCACTGCGCACGTTTATAATGATAAAGATCTACTTGGCTGAACAAAAGGATCCACTCTGAGCAGCGTCAGACTTTGTATTTTCATCAATATTACAAAAAACTTAGGACCAAAGTCCAAGGAATTGACCTCCACATCATTTCATCCACCGACACCATCCCCAAATGGCAGAGGAGCAGGCCTATCATGTCAATAAGGGACTTGAGTGTCTCAAATCTCTCAGAGAAAATCCGCCCGATGCTGTCGAAATTAAGGAAGCCCAAATTATCCGAAGCAAGGCCGCCTGCGAAGAATCAAGCGAGAGTCATCACCAGGACAACTCCGAAAAAGACACTCTTGATTTCGACGAATCATGCTCTTCAGCAATTAGACCAGAAACGTACCGCATGTTACTTGGTGATGATACAGGATTTAGAGCACCAGGTTACATCCCTAATGAAGGAGAGCCCGAGCCAGGAGACATCGGAAAGGAGGAACCTGCAGTACGATGTTACCATGTTTATGATCACGGCGGTCAAGCGGTTGAAGGAGTCAAGGATGCTGACCTGCTCGTGGTTCCAACAGGCAGTGATGATGATGCAGAATTCAGAGACGGAGATGAGAGCTCTCTCGAGAGCGATGGTGAATCTGGCACTGTTGATACCAGAGGAAATTCTTCCTCTAACAGGGGATCTGCTCCCAGGATTAAGGTCGAGAGATCGTCTGACGTTGAGACTATAAGCAGTGAAGAGCTACAAGGACTGATTAGATCTCAGAGTCAAAAACATAATGGATTTGGAGTAGACAGATTCCTAAAGGTCCCACCAATTCCAACCTCAGTGCCGCTGGACCCCGCTCCCAAATCCATTAAAAAGGGCACAGGAGAGAGATCAGCCTTATCTGGGACGGAGACCGAGTTTTCATTGACAGGTGGTGCAACCCGACTTGCTCAAGAATCAAGATGGGCATCGTCAGAGTCAAGTGCACCTGCGGAGAATGTCCGCCAGTCTGTGACGAATGCAGAGAGGACCCAGAAACCCCCACAAGGATCTGGTACCACAGCCTCCCAGAAATCCCAGAACAATGGCCATTCTGATGATGAGTATGAAGATGAACTCTTTATGGAGGTACAGGAGATTAAAACAGCAATTACAAAGATTAATGAAGATAATCAGCAGATAATATCAAAATTGGACTCTATAATGCTACTAAAGGGTGAAATTGAATCTATCAAGAAACAGATCAATAAGCAAAATATCACTATATCAACTATCGAAGGCCACCTGTCCAGCATAATGATAGCAATTCCAGGATTCGGTAAAGATCCCAATGATCCTACTGCAGACGTAGAACTCAATCCCGATCTGAGACCCATAATTAGCCGTGATGCAGGAAGAGCTCTAGCTGAGGTCCTCAAGAGGCCAGCAGTCGAGAGAAATCCAAAGGTCACCCCAAAGGTCCATCCAGGATCCAAGGGGCAGATTCTGAGGGATCTGCAACTTAAGCCGGTAGACAGGAAAATGAGCTCTGCTGTGGGATTTGTCCCAACTGATGATCTGCCGTCTCGGAGTGTGCTTCGCTCCATGATTAAGTCCAGCAATCTTGAATCAGAACACAAACGAAGCATGATAGGGCTCTTGAATGATGTCAAAAGTGGCAAGGATCTTGGAGAATTTTATCAGATGGTGAAAAAAATCATCAAGTAACATACCAACCTACATCTTATTGCTTGCTTGCCTAGCTTAGTAGTAATGTTAGTCAAAATGATCAATTATAAAAAACTTAGGATTCAAGACTAAGTTGACTACCGTCGAAAATGACCGAGGTTTACGACTTTGATAGATCAGCCTGGGATGTCAAGGGGTCTATTGCTCCCATAGAGCCCACTACTTATCCCGATGGAAGACTGATCCCTCAAGTTAGAGTTATAGATCCAGGCTTAGGTGACAGAAAGGATGAGTGTTTCATGTATATCTTCCTTCTGGGCATATTAGAGGATAATGATATAATGAGCCCCCCAATCGGGAGGACTTTCGGCTCACTCCCGCTCGGAGTAGGACGATCGACTGCTAAACCTGAAGAACTGCTTAAAGAGGCCACCGAATTGGATATTGTGGTAAGGAGGACAGCGGGGTTAAATGAGAAACTAGTCTTCTACAACAATACACCGCTTATGTTATTGACTCCGTGGAAGAAAGTACTTACTGCTGGAAGTGTCTTTAGTGCAAACCAAGTCTGCAATGCTGTCAATCTTATCCCACTTGACACTCCGCAAAGGTTCAGAGTTGTCTATATGAGTATAACCAGACTCTCAGACAATGGATGCTATAGGGTTCCCAGAAAGATGCTGGAGTTCAGATCTGCTAATGCTCTGGCATTCAATATATTAGTGACCATCAGAATTGAAAACGCCGGAATTGTAAGCCGCCCATACATGAGCATGATGAGAGACCCACAGGCGACTTTCATGATCCATATTGGGAACTTCCGCAGAAAGAAGAATGAGGCTTACTCTGCAGATTACTGCAAGATGAAGATAGAAAAAATGGGCCTCGTCTTTGCTCTTGGCGGAATCGGAGGGACCAGCCTACATATCAGATGTACTGGGAAGATGAGTAAGACTCTACATGCTCAGTTAGGGTTTAAGAAAATACTCTGTTACCCCTTAATGGATGTCAACGAAGACCTTAATAGGTACTTGTGGCGTGCAGAATGCAAGATTGTGAGAATCCAAGCTGTTCTTCAGCCATCAGTCCCGCAGGAATTCAGAGTTTATGATGATGTTATTATCAATGATGATCAAGGGTTATTCAAGATTCTTTAAAAAGCTAAAGAATAAGACTTCTCATTTCAGGCTCATAGCTAGTTCATCCAGCAGAATCAACAGAGCTTATATATATTGGATAAATCAGTTCAAAGCTCAATGTAGTTGGAGTTTGTTGTAGGGTTAGTATTGAGAGATAATGGAAGTCCTGATAAAATTCACCATTCAGCTAATCAATGGTAGATAATTATCTGCATGCGCACATAGAAGCTTAGAGTCTTGCTTCTCATCCTGATTCTTGATAATTCCAGCAGAACAAAGCTTCAAACAACACTGTACTCAGTTTCGAATTACCTGATCAACCACAGATCCTCTCCTCGACAATCAGGGGTTAAACAGTCCTACATCCAGTGACCCCAAAAGCCAAGACGTGACATCACTCGCAACCAACTGATGCAAATTATTAAATAAAACTTAGGAGTAAAGTAATTAAGACTCCAAGCAACACCCGACAACCCACTACACCCAAAAACAGACAACGACAACCGGCAGAACAAACAGATCTCGCATAGGCAAAGAGACCACACCACAATTCCTCCTTTGCAATCGACCACACCAGCC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GATTTGTAGCACATTTGTTATCTATGAAGCAAGCAAACTACCTACAATCCCTTATTGGACTCCCTGTTCAGAAAGGATTCTTTAATAGAGTGTTGAGTGGGTTGACCCCGATTGAAAAAGTTCTTATTAATTGCGGGTTAACTGTGAACGGGCCCAAGGTATGTAAGAACTTAGTACATCATGATATCGCGTCTGGATCAGAGGGTCTTGTCAACTCAACTGTTATTTTATACAAAGAATTGGCAAGGTTTAAGGAAAACACAAGGAGTCAACAAGGCATGTTTCACGCTTATCCGGTTCTTGCAGATAGTAGGCAAAGAGAATTAGTATCCAGAATCGCTAGGAAGTATTGGGGGTATATTATACTGTATTCAACAGAACAGGGGGCGCTCAATCAATTGGTAAGAAATCTTAAAGCGGGCTACTTATTATTTGATGTTCATCACAATTTTCTCGTCAAGAATCTTTCCAAATCCGAAAGGGTCTTAATACGGACTCTTATCCCACGGAGAGAGTGGTTATTTAAGCTTGAGACAAGTGAGATAAAGGAGTGGTTTAAGTTGATAGGGTACGGTGCCCTCATCAGAGAGTAATAACTAATGAAGTGGACCCCTGCTCCTGTCCTTGTCAGAGTGATATCAGATTATAATTATTAAGAAAAACAAGATTCGATTTAAGTACCTATACCCAGCTTTGTCTGGT
| 8,434
|
MN606000.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,645
|
GenBank
| null |
Italy: TE
|
Italy
|
Stenella coeruleoalba
|
brain
|
2017
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_22497, complete genome
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TTGGACTCCCTGTTCAGAAAGGATTCTTTAATAGAGTGTTGAGTGGGTTGACCCCGATTGAAAAAGTTCTTATTAATTGCGGGTTAACTGTGAACGGGCCCAAGGTATGTAAGAACTTAGTACATCATGATATTGCGTCTGGATCAGAGGGTCTTGTCAACTCAACTGTTATTTTATACAAAGAATTGGCAAGGTTTAAGGAAAACACAAGGAGTCAACAAGGCATGTTTCACGCTTATCCGGTTCTTGCAGATAGTAGGCAAAGAGAATTGGTATCCAGAATCGCTAGGAAGTATTGGGGGTATATTATACTGTATTCAACAGAACAGGGGGCGCTCAATCAATTGGTAAGAAATCTTAAAGTAGGCTACTTATTATTTGATGTTCATCACAATTTTCTCGTCAAGAATCTTTCCAAATCCGAAAAAGTCTTAATACGGACTCTTATCCAACGGAGAGAATGGTTATTTAAGCTTGAGACAAGTGAGATAAAGGAGTGGTTTAAGTTGATAGGGTACGGTGCCCTCATCAGAGAATAATAACTAATGAAACGGACCCCTGCTCCTGTCCTTGTCAGAGTGATATCAGATTATAATTATTAAGAAAAACAAGATTCGATTTAAGTACCTATACCCAGCTTTGTCT
| 46,175
|
MN606001.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,641
|
GenBank
| null |
Italy: LE
|
Italy
|
Stenella coeruleoalba
|
heart
|
2016
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_20673, complete genome
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CCCTGTTCAGAAAGGATTCTTTAATAGAGTGTTGAGTGGGTTGACCCCGATTGAAAAAGTTCTTATTAATTGCGGGTTAACTGTGAACGGGCCCAAGGTATGTAAGAACTTAGTACATCATGATATTGCGTCTGGATCAGAGGGTCTTGTCAACTCAACTGTTATTTTATACAAAGAATTGGCAAGGTTTAAGGAAAACACAAGGAGTCAACAAGGCATGTTTCACGCTTATCCGGTTCTTGCAGATAGTAGGCAAAGAGAATTGGTATCCAGAATCGCTAGGAAGTATTGGGGGTATATTATACTGTATTCAACAGAACAGGGGGCGCTCAATCAATTGGTAAGAAATCTTAAAGCAGGCTACTTATTATTTGATGTTCATCACAATTTTCTCGTCAAGAATCTTTCCAAATCCGAAAAAGTCTTAATACGGACTCTTATCCAACGGAGAGAATGGTTATTTAAGCTTGAGACAAGTGAGATAAAGGAGTGGTTTAAGTTGATAGGGTACGGTGCCCTCATCAGAGAATAATAACTAATGAGACGGACCCCTGCTCCTGTCCTTGTCAGAGTGATATCAGATTATAATTATTAAGAAAAACAAGATTCGATTTAAGTACCTATACCCAGCTTTGTCTACT
| 46,176
|
MN606003.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,680
|
GenBank
| null |
Italy: IM
|
Italy
|
Stenella coeruleoalba
|
brain
|
2015
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_3908, complete genome
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| 46,177
|
MN606004.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,681
|
GenBank
| null |
Italy: GE
|
Italy
|
Stenella coeruleoalba
|
brain
|
2016
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_95842, complete genome
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| 46,178
|
MN606005.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
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Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,681
|
GenBank
| null |
Italy: TA
|
Italy
|
Stenella coeruleoalba
| null |
2017
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_6020, complete genome
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| 46,179
|
MN606006.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,692
|
GenBank
| null |
Italy: LE
|
Italy
|
Stenella coeruleoalba
|
lung
|
2017
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_6023, complete genome
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| 46,180
|
MN606007.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,689
|
GenBank
| null |
Italy: ME
|
Italy
|
Tursiops truncatus
|
heart
|
2013
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_19929, complete genome
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| 46,181
|
MN606008.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,679
|
GenBank
| null |
Italy: IM
|
Italy
|
Stenella coeruleoalba
|
brain
|
2017
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_26823, complete genome
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| 46,182
|
MN606009.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,680
|
GenBank
| null |
Italy: SS
|
Italy
|
Balaenoptera physalus
|
lymph
|
2011
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_59728, complete genome
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| 46,183
|
MN606010.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,680
|
GenBank
| null |
Italy: CH
|
Italy
|
Physeter catodon
|
spleen, abdominal cavity
|
2014
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_59780, complete genome
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| 46,184
|
MN606011.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,689
|
GenBank
| null |
Italy: SV
|
Italy
|
Stenella coeruleoalba
|
brain
|
2017
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_78983, complete genome
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| 46,185
|
MN606012.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,692
|
GenBank
| null |
Italy: SA
|
Italy
|
Stenella coeruleoalba
|
brain
|
2011
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_80729, complete genome
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| 46,186
|
MN606013.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,690
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Stenella coeruleoalba
|
spleen, abdominal cavity
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2010
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_85537, complete genome
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| 46,187
|
MN606014.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
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ssRNA(-)
| 15,687
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Stenella coeruleoalba
|
lung
|
2008
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_85548, complete genome
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| 46,188
|
MN606015.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Cerutti,F., Giorda,F., Grattarola,C., Mignone,W., Beltramo,C., Keck,N., Lorusso,A., Di Francesco,G., Di Guardo,G., Goria,M., Masoero,L., Acutis,P.L., Casalone,C., Peletto,S.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta, S.S. Genetica e Immunobiochimica
|
Italy
|
2020-10-31
| null |
Morbillivirus ceti
|
Morbillivirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,698
|
GenBank
| null |
Italy: LE
|
Italy
|
Stenella coeruleoalba
|
lung
|
2016
| null | null |
Dolphin morbillivirus strain DMV_IZSPLVA_92300, complete genome
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| 46,189
|
KU720623.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Fauquier,D.A., Litz,J., Sanchez,S., Colegrove,K., Schwacke,L.H., Hart,L., Saliki,J., Smith,C., Goldstein,T., Bowen-Stevens,S., McFee,W., Fougeres,E., Mase-Guthrie,B., Stratton,E., Ewing,R., Venn-Watson,S., Carmichael,R.H., Clemons-Chevis,C., Hatchett,W., Shannon,D., Shippee,S., Smith,S., Staggs,L., Tumlin,M.C., Wingers,N.L., Rowles,T.K., Smith,B.R., Saliki,J.T.
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University of California, School of Veterinary Medicine, One Health Institute
|
USA
|
2017-11-14
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GW2010007A
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Morbillivirus ceti
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Morbillivirus
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Paramyxoviridae
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ssRNA(-)
| 15,702
|
GenBank
| null |
USA: Florida
|
USA
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Stenella longirostris
|
lung
|
2010-06-02
| null | null |
Dolphin morbillivirus isolate GW2010007A, complete genome
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| 73,876
|
KU720624.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Fauquier,D.A., Litz,J., Sanchez,S., Colegrove,K., Schwacke,L.H., Hart,L., Saliki,J., Smith,C., Goldstein,T., Bowen-Stevens,S., McFee,W., Fougeres,E., Mase-Guthrie,B., Stratton,E., Ewing,R., Venn-Watson,S., Carmichael,R.H., Clemons-Chevis,C., Hatchett,W., Shannon,D., Shippee,S., Smith,S., Staggs,L., Tumlin,M.C., Wingers,N.L., Rowles,T.K., Smith,B.R., Saliki,J.T.
|
University of California, School of Veterinary Medicine, One Health Institute
|
USA
|
2017-11-14
|
BCF20110815-LA001
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Morbillivirus ceti
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Morbillivirus
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Paramyxoviridae
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ssRNA(-)
| 15,702
|
GenBank
| null |
USA: Louisiana
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USA
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Tursiops truncatus
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lung
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2011-08-15
| null | null |
Dolphin morbillivirus isolate BCF20110815-LA001, complete genome
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| 73,877
|
KU720625.1
|
Dolphin morbillivirus
|
Fauquier,D.A., Litz,J., Sanchez,S., Colegrove,K., Schwacke,L.H., Hart,L., Saliki,J., Smith,C., Goldstein,T., Bowen-Stevens,S., McFee,W., Fougeres,E., Mase-Guthrie,B., Stratton,E., Ewing,R., Venn-Watson,S., Carmichael,R.H., Clemons-Chevis,C., Hatchett,W., Shannon,D., Shippee,S., Smith,S., Staggs,L., Tumlin,M.C., Wingers,N.L., Rowles,T.K., Smith,B.R., Saliki,J.T.
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University of California, School of Veterinary Medicine, One Health Institute
|
USA
|
2017-11-14
|
631IMMS031711
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Morbillivirus ceti
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Morbillivirus
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Paramyxoviridae
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ssRNA(-)
| 15,702
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GenBank
| null |
USA: Mississippi
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USA
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Tursiops truncatus
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spinal cord
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2011-03-17
| null | null |
Dolphin morbillivirus isolate 631IMMS031711, complete genome
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| 73,878
|
NC_016997.1
|
Donggang virus
|
Blitvich,B.J., Firth,A.E., Wang,Z., Guo,J., Han,Y., An,S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2012-03-23
|
DG0909
|
Donggang virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,791
|
RefSeq
| 1
|
China
|
China
|
Aedes
| null |
2009
| null |
PRJNA485481
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Donggang virus, complete genome
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| 7,352
|
MZ357894.1
|
Donggang virus
|
Zhang,Y.
|
Institute of ZoologyChineses Academy of Sciences, The State Key Laboratory of Integrated Pest Management
|
China
|
2022-03-19
|
5
|
Donggang virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,785
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null | null | null | null |
Donggang virus isolate 5, complete genome
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AGTTGTTGATCTGTGTGAATCAGACTGCGACAGTTCGAGTTTGAAGCGAAAGCTAGCAACAGTATCAACAGGTTTTATTTTGGATTTGGAAACGAGAGTTTCTGGTCATGAGATCAATGGTCTTTCGAGCTAGGAGGCCCGTTAAACGGGCCGTCGATATAATAAAACGTAAGCTGCCTTACGTTCCGCCACCAATGAGGGTGGCCAAAATGGCAGCGAAGAAAGTGATGATGGGAATTGGAAGCTTGAAAGCATTTTTGGCTCTGTTTTTGTTCATGACTTTCACTGGCCGGAAAATTTCTAACGAACAACATAAGAGATTCCGGTCGATAGACAAGACTAAAGCAATGAAGGTGTTGGCGACATTTAAGAAAATTCTTGGAAATCTGATGAAAACCCTTCAAACCCGGAAAAAGAGACCGAATAGACGATCTGCTGGGAGTAATGGAATGATGATGCTAGCCTTGATTGGGACTGCTATGGCAGCCACGAGTATGACTAAAGACGATACCATCTACATGACCGTGGAACCAAAAGATGTAGGGACTTGGCTCTCTATCCGCACACGCCTAGGCAATGGATCGTGTATAGTCAACGCAATGGATGTTGGCACAATGTGTGAAGATAAGGTGACATATGAATGTCCGAAGATTGATGGATCATCTGACCCTGAAGATGTTGACTGTTGGTGTAAGGGGATTTCTGTTGTACTGACCTATGGAAGGTGCAAGACTAATTCCACTACCCCGGCACCTCAGCGTCGCAGATCAAGAAGATCTATCATGATACCTACACACAGTACGGGTGGATTGCACCAAGGAACCGAAGGATGGCACAGGACCAATAATGTGAAGAACTTCCTCATGCGAGTTGAGAAATGGTCACTGAGAAATCCAGGGTACACTGCCTTGATAGCCATTCTAGGATGGACTCTTGGCACAACAACCGCCCAAAAGGTCATTTTTATAGCTTTGCTCTTGATGATCGCACCTGTCTACGGAAGCCAGTGTTCAGGGATCGACAAACGTGACTTCATACAAGGGGTGTCAGGAGGTACCTGGGTAGATGTGGTCTTGGACCGTAAAGGATGCGTGACAATATCAGCAACCGGAAAACCGACCATAGACGTACGGATGGTTAAGATGGAAGCCTCCAATTTGGCATCCGTGCGAACATACTGTCTGGAAGCTTCCACCTCGGAAATTTCATCCGTTAATGGTTGCCCCTCAACTACAGAAGCACATAATGATAAGCGGAAAGACTCAACTTATCTGTGCGAGAGAAGCTACCCTGATAGGGGATGGGGCAATGGATGTGGACTTTTTGGGAGAGGCTCTTTGGATACGTGCGTCAAGTTTGCATGCAGTAAGAAAATGGCAGGACATGCAATCTCAAGAGAGAACATCGTCATAACTGCTGCAGTGTCTGTTCACGGACACTCTGGCGCTGAGAGTGACGACGACTCGCAAAGGAAATCGCGTAAGGAACTGGCAGAGCTCACCATAACTCCTAAAAGCTCCATTGTTGAAGCAGATTTGGGAGATTACGGCAAAGTGCAATTTGAATGCCTGATGGACTTTGGGATTGATTTGGATGACGTTTACACGGCCGATATGTCAGGAAAGTGGTGGTTGGTTAAGCGTGATTGGTATCATGACATTGCTCTCCCATGGACAGCACCCTCCGCTGACTTTTGGCATGACATGGACAGATTGGTGGAATTTAGCACACCACATGCCACTAAGCAGAGTGTGTATACCCTAGGTGACCAAGAAGGAGCCATGTCCACTGCCCTAGGTGATGCGGCCGTTATTGAATACATGTCATCAGGAAGCAAGGTGGTCTTTCGTACAGGGTTCCTAAAATGTAGAGTCAAGATGGAAAATCTGAGATTGAAAGGCTCCACATATATGCAATGTTCCAAGGAGTTCTCTATTCTGAAGAGGCCCACCGCCACCCCGTATGGAACTGTCATCATGCAGGTGAAGTACGCGCAGACTGATGTCCCGTGTCGTGTGCCAGTGGGCGTTCATGAGAGGCCAGGTGGTGAGCAAGTTGGACGTATTATAACAGCCCATCCTATCATTCTTAAACAGAACGATGCACTTGTTATCGAAGTTGAACCCCCGTTTGGAGATAGTGTCATAGAAATTGGTCTAGGCACCACGAAAATAGTGGAACAATGGCATAGAGATGGCAGCTCGATTGGAGCGGCATTCACATCCACCATGAAAGGTGTGGAACGAATGGCTCTATTGGGAGAACACGCTTGGGATTTCGGGTCCGTCGGGGGTTTTTTCAACAGTATGGGCAAGGCTATCCACTCCGTGTTTGGAGGTTTGTTCCGGGCGGTATTTGGAGGTATGAGCTGGATTTCCAAAGTGCTTATCGGTGCAATCTTGATGTGGTTGGGAGTTAGCGCACGGGAAAAAACCCTCGCTATGTCTCTAATCACGGTGGGGGCTATCCTTTTGTATCTGTCTACCATGACCAATGCTGTGTCCGAGGTAGGGTGTAGTTTGGATTTGTCCCGCCATGAAATAAAATGCGGCGATGGAGTGTTTTTATTTCGAGACGTCAGCAACTGGCGTGACAAATACGTGTTCCATCCTGGTTCACCACGTACTCTTGCAGCATCCGTTTGGTCGGCTTGGAACAATGGAATTTGTGGCGTACGCTCAACCACACGTATGGAACACGAAATGTGGAAACAAGTTGAGAATGAGATCAACGGAATATTTGAAGAGAATGCCATTGCCCTTAGTGTCGTTGTTAAGAATGCGAACGGAACATTTCCGCGTGGGCACAAACGCCTCCCAGTCAACACAACAGGACTACAGCACGGATGGAAGACATGGGGAAAGACCAAGTTGATGCAGGTTCCATTGGCAAAGGACGTTTTTATCATTGATGGAAACGATGAGGGTGAATGCGTGTCTACAAATAGATCATGGAACACTTTTAGGGTTGAGGAGTTTGGCACGGGAATCATGAAAACAAAAGTGTTTTTGGATATAAACCCGACTTTAACGAGATACTGCGATACCGAATTGCTTGGAGCAGCTGTGAAAGGAAACCATTCTGCTCATGGTGATCCTGGTTTGTGGATGGTCTCTGAGAAAGAAGGAAGTGAGTGGAAACTCACGAGCCTGTCACTATCCGAGAGTAGGAGGTGTTTGTGGCCTGATTCTCATACTGTCTGGGGACGTGGAGTTGAAGAGACCAAACTCATCCTTCCTGCCAATCTTGGAGGGCCAGTGTCACACATGAACACTAGATATGGCTACTCAACCCAGATCTCTGGACCATGGAACAATGTTCCACTAGACGTGGTCTTTGAGACCTGTCCTGGAACGACGGTTAATGTCACTAGAACATGTGTGGGGAGATCGGCATCGGCAAGGTCAACAACTGACAGTGGGAAGATCATACCGGAGTGGTGTTGCAGAGCCTGCACCATGCCTCCCTTGACATACCGGACACCCGATGGATGCTGGTACGCCATGGAAATCCAGCCAATGAACACCAAGGAGGAGAGTATCCTGAGAGCGAGAGTTTCAGCAGGAGCAGTTCACGGACTAGACAACTTTTCACTGGGATTGTTGGTCATGATGTTGGTCACGCAAGAAGGACTGAAGAGAAGATTCACTAGCAAACATATCATGTTGGCAGGAATAGGGCTTCTCATCTGTGTTATTATGGGTGACCTCACATACACAGATCTGGCTCGGTATGCAGTACTACTCGGGACAACGTTCGCAGAGATGAACTCGGGTGGAGATGTCATGCACCTCGCGCTGGTTGCCACATTTAAAGTCAAACCAGCATACCTGTTGGGTTTCCTCTTTAGGATGCGTTGGTCTCCAAGAGAAAGTTTCATGTTGGTATGTGGTGCCATTCTCATGCAGACCGGAATGGGAGTTCTGGCCTGCCATCACATGATGGATTATGTCCACGCATGTGCCCTTGGTTGGTTGCTTGTCAGATCTTTAGTTGTCCCTGGAATGGTTTCGAAAGCCTTACCCCTTTTATGTTGTCTGGCTCCGTTGCCTTTAGCTGTTATGACTAACGCCACGAGAGCTAGTGTGGCAACTTTGGCAGTTGGAACCATGTTGGCCGGTGCCAAGGGCAAGTCAGTGAAAAAATCCCTACCATGGTTTTCAGCTTTGATTGCATCTTGGATGGGGTGCAATCCACTTGGCATGATGGTGTTCGCCAGTTTTATGAGGAAACATGGCAAGAGATCCTGGCCAGCTGGAGAGGTGATGGCAGCTGTAGGCATCGTATGCGCTCTAGCAGGTGCCATCACAGAAAACCAGGGAGAAGTGGCTGGGCCAGCCGCTGCTGCGGCCCTTATATTCACCGCATATGCCATAAGCGGCAAGGCCAACGACATATTCCTTGAGAAAGCTGGTGAGATGACATGGAGCCATGATGCTCAGCTATCTGGATCAAGTCCAAGAGTGGACGTCAAAGTTGGTGAGAGTGGGGATTTTCGGCTTCGCCACGAGTCTGAAGACTCGTGGCTGAAAACAGGCGTAACAGCTGGCTGTCTCATCATGGCCGGCTTCCATCCCCTTGCCATACCGGTTGCGGGATTGATTTGGTATGGATATGTGAAACATGACCGTAGAGGTGGAGTCTTGTGGGACATTCCACACCCATCAACATCCAAAGCCGGAGACACTGAGACAGGAGTATACCGCATCATGTCCAAACGTCTGTTTGGGGCCACCCAGATAGGTGTGGGGGTGATGTATGAGAGTGTCTTCCACACCATGTGGCATGTCACCAGAGGAGCTTCTCTGATGAGTGGAGAAGGTAGAATTGATCCATATTGGGCTGACGTCCGTGAGGATCTCATCAGCTATGGTGGACCATGGAGATTGAATGGAACGTGGGACGGGACTACTGAAGTGCAACTTATAGCAGTGTCACCTGGCAAAGTTCCTATCAACGTCCAAACGAAACCTGGAAAATTCGTGCTCACTGATGGACGT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| 32,357
|
MZ357895.1
|
Donggang virus
|
Zhang,Y.
|
Institute of ZoologyChineses Academy of Sciences, The State Key Laboratory of Integrated Pest Management
|
China
|
2022-03-19
|
3
|
Donggang virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,877
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null | null | null | null |
Donggang virus isolate 3, complete genome
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GAAAAGTATATTCTGTGTGTGCGTCTTGGTACACAGTTAGTAGTGAGAGTGGAAGGAAAAGAATACACTTTGAAAACATAACGCATTAGAATAGGTTTGAAAGAGTTGAATCAATGAGATCAATGGTCTTTCGAGCTAGGAGGCCCGTTAAACGGGCCGTCGATATAATAAAACGTAAGCTGCCTTACGTTCCGCCACCAATGAGGGTGGCCAAAATGGCAGCGAAGAAAGTGATGATGGGAATTGGAAGCTTGAAAGCATTTTTGGCTCTGTTTTTGTTCATGACTTTCACTGGCCGGAAAATTTCTAACGAACAACATAAGAGATTCCGGTCGATAGACAAGACTAAAGCAATGAAGGTGTTGGCGACATTTAAGAAAATTCTTGGAAATCTGATGAAAACCCTTCAAACCCGGAAAAAGAGACCGAATAGACGATCTGCTGGGAGTAATGGAATGATGATGCTAGCCTTGATTGGGACTGCTATGGCAGCCACGAGTATGACTAAAGACGATACCATCTACATGACCGTGGAACCAAAAGATGTAGGGACTTGGCTCTCTATCCGCACACGCCTAGGCAATGGATCGTGTATAGTCAACGCAATGGATGTTGGCACAATGTGTGAAGATAAGGTGACATATGAATGTCCGAAGATTGATGGATCATCTGACCCTGAAGATGTTGACTGTTGGTGTAAGGGGATTTCTGTTGTACTGACCTATGGAAGGTGCAAGACTAATTCCACTACCCCGGCACCTCAGCGTCGCAGATCAAGAAGATCTATCATGATACCTACACACAGTACGGGTGGATTGCACCAAGGAACCGAAGGATGGCACAGGACCAATAATGTGAAGAACTTCCTCATGCGAGTTGAGAAATGGTCACTGAGAAATCCAGGGTACACTGCCTTGATAGCCATTCTAGGATGGACTCTTGGCACAACAACCGCCCAAAAGGTCATTTTTATAGCTTTGCTCTTGATGATCGCACCTGTCTACGGAAGCCAGTGTTCAGGGATCGACAAACGTGACTTCATACAAGGGGTGTCAGGAGGTACCTGGGTAGATGTGGTCTTGGACCGTAAAGGATGCGTGACAATATCAGCAACCGGAAAACCGACCATAGACGTACGGATGGTTAAGATGGAAGCCTCCAATTTGGCATCCGTGCGAACATACTGTCTGGAAGCTTCCACCTCGGAAATTTCATCCGTTAATGGTTGCCCCTCAACTACAGAAGCACATAATGATAAGCGGAAAGACTCAACTTATCTGTGCGAGAGAAGCTACCCTGATAGGGGATGGGGCAATGGATGTGGACTTTTTGGGAGAGGCTCTTTGGATACGTGCGTCAAGTTTGCATGCAGTAAGAAAATGGCAGGACATGCAATCTCAAGAGAGAACATCGTCATAACTGCTGCAGTGTCTGTTCACGGACACTCTGGCGCTGAGAGTGACGACGACTCGCAAAGGAAATCGCGTAAGGAACTGGCAGAGCTCACCATAACTCCTAAAAGCTCCATTGTTGAAGCAGATTTGGGAGATTACGGCAAAGTGCAATTTGAATGCCTGATGGACTTTGGGATTGATTTGGATGACGTTTACACGGCCGATATGTCAGGAAAGTGGTGGTTGGTTAAGCGTGATTGGTATCATGACATTGCTCTCCCATGGACAGCACCCTCCGCTGACTTTTGGCATGACATGGACAGATTGGTGGAATTTAGCACACCACATGCCACTAAGCAGAGTGTGTATACCCTAGGTGACCAAGAAGGAGCCATGTCCACTGCCCTAGGTGATGCGGCCGTTATTGAATACATGTCATCAGGAAGCAAGGTGGTCTTTCGTACAGGGTTCCTAAAATGTAGAGTCAAGATGGAAAATCTGAGATTGAAAGGCTCCACATATATGCAATGTTCCAAGGAGTTCTCTATTCTGAAGAGGCCCACCGCCACCCCGTATGGAACTGTCATCATGCAGGTGAAGTACGCGCAGACTGATGTCCCGTGTCGTGTGCCAGTGGGCGTTCATGAGAGGCCAGGTGGTGAGCAAGTTGGACGTATTATAACAGCCCATCCTATCATTCTTAAACAGAACGATGCACTTGTTATCGAAGTTGAACCCCCGTTTGGAGATAGTGTCATAGAAATTGGTCTAGGCACCACGAAAATAGTGGAACAATGGCATAGAGATGGCAGCTCGATTGGAGCGGCATTCACATCCACCATGAAAGGTGTGGAACGAATGGCTCTATTGGGAGAACACGCTTGGGATTTCGGGTCCGTCGGGGGTTTTTTCAACAGTATGGGCAAGGCTATCCACTCCGTGTTTGGAGGTTTGTTCCGGGCGGTATTTGGAGGTATGAGCTGGATTTCCAAAGTGCTTATCGGTGCAATCTTGATGTGGTTGGGAGTTAGCGCACGGGAAAAAACCCTCGCTATGTCTCTAATCACGGTGGGGGCTATCCTTTTGTATCTGTCTACCATGACCAATGCTGTGTCCGAGGTAGGGTGTAGTTTGGATTTGTCCCGCCATGAAATAAAATGCGGCGATGGAGTGTTTTTATTTCGAGACGTCAGCAACTGGCGTGACAAATACGTGTTCCATCCTGGTTCACCACGTACTCTTGCAGCATCCGTTTGGTCGGCTTGGAACAATGGAATTTGTGGCGTACGCTCAACCACACGTATGGAACACGAAATGTGGAAACAAGTTGAGAATGAGATCAACGGAATATTTGAAGAGAATGCCATTGCCCTTAGTGTCGTTGTTAAGAATGCGAACGGAACATTTCCGCGTGGGCACAAACGCCTCCCAGTCAACACAACAGGACTACAGCACGGATGGAAGACATGGGGAAAGACCAAGTTGATGCAGGTTCCATTGGCAAAGGACGTTTTTATCATTGATGGAAACGATGAGGGTGAATGCGTGTCTACAAATAGATCATGGAACACTTTTAGGGTTGAGGAGTTTGGCACGGGAATCATGAAAACAAAAGTGTTTTTGGATATAAACCCGACTTTAACGAGATACTGCGATACCGAATTGCTTGGAGCAGCTGTGAAAGGAAACCATTCTGCTCATGGTGATCCTGGTTTGTGGATGGTCTCTGAGAAAGAAGGAAGTGAGTGGAAACTCACGAGCCTGTCACTATCCGAGAGTAGGAGGTGTTTGTGGCCTGATTCTCATACTGTCTGGGGACGTGGAGTTGAAGAGACCAAACTCATCCTTCCTGCCAATCTTGGAGGGCCAGTGTCACACATGAACACTAGATATGGCTACTCAACCCAGATCTCTGGACCATGGAACAATGTTCCACTAGACGTGGTCTTTGAGACCTGTCCTGGAACGACGGTTAATGTCACTAGAACATGTGTGGGGAGATCGGCATCGGCAAGGTCAACAACTGACAGTGGGAAGATCATACCGGAGTGGTGTTGCAGAGCCTGCACCATGCCTCCCTTGACATACCGGACACCCGATGGATGCTGGTACGCCATGGAAATCCAGCCAATGAACACCAAGGAGGAGAGTATCCTGAGAGCGAGAGTTTCAGCAGGAGCAGTTCACGGACTAGACAACTTTTCACTGGGATTGTTGGTCATGATGTTGGTCACGCAAGAAGGACTGAAGAGAAGATTCACTAGCAAACATATCATGTTGGCAGGAATAGGGCTTCTCATCTGTGTTATTATGGGTGACCTCACATACACAGATCTGGCTCGGTATGCAGTACTACTCGGGACAACGTTCGCAGAGATGAACTCGGGTGGAGATGTCATGCACCTCGCGCTGGTTGCCACATTTAAAGTCAAACCAGCATACCTGTTGGGTTTCCTCTTTAGGATGCGTTGGTCTCCAAGAGAAAGTTTCATGTTGGTATGTGGTGCCATTCTCATGCAGACCGGAATGGGAGTTCTGGCCTGCCATCACATGATGGATTATGTCCACGCATGTGCCCTTGGTTGGTTGCTTGTCAGATCTTTAGTTGTCCCTGGAATGGTTTCGAAAGCCTTACCCCTTTTATGTTGTCTGGCTCCGTTGCCTTTAGCTGTTATGACTAACGCCACGAGAGCTAGTGTGGCAACTTTGGCAGTTGGAACCATGTTGGCCGGTGCCAAGGGCAAGTCAGTGAAAAAATCCCTACCATGGTTTTCAGCTTTGATTGCATCTTGGATGGGGTGCAATCCACTTGGCATGATGGTGTTCGCCAGTTTTATGAGGAAACATGGCAAGAGATCCTGGCCAGCTGGAGAGGTGATGGCAGCTGTAGGCATCGTATGCGCTCTAGCAGGTGCCATCACAGAAAACCAGGGAGAAGTGGCTGGGCCAGCCGCTGCTGCGGCCCTTATATTCACCGCATATGCCATAAGCGGCAAGGCCAACGACATATTCCTTGAGAAAGCTGGTGAGATGACATGGAGCCATGATGCTCAGCTATCTGGATCAAGTCCAAGAGTGGACGTCAAAGTTGGTGAGAGTGGGGATTTTCGGCTTCGCCACGAGTCTGAAGACTCGTGGCTGAAAACAGGCGTAACAGCTGGCTGTCTCATCATGGCCGGCTTCCATCCCCTTGCCATACCGGTTGCGGGATTGATTTGGTATGGATATGTGAAACATGACCGTAGAGGTGGAGTCTTGTGGGACATTCCACACCCATCAACATCCAAAGCCGGAGACACTGAGACAGGAGTATACCGCATCATGTCCAAACGTCTGTTTGGGGCCACCCAGATAGGTGTGGGGGTGATGTATGAGAGTGTCTTCCACACCATGTGGCATGTCACCAGAGGAGCTTCTCTGATGAGTGGAGAAGGTAGAATTGATCCATATTGGGCTGACGTCCGTGAGGATCTCATCAGCTATGGTGGACCATGGAGATTGAATGGAACGTGGGACGGGACTACTGAAGTGCAACTTATAGCAGTGTCACCTGGCAAAGTTCCTATCAACGTCCAAACGAAACCTGGAAAATTCGTGCTCACTGAT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| 32,358
|
MZ357896.1
|
Donggang virus
|
Zhang,Y.
|
Institute of ZoologyChineses Academy of Sciences, The State Key Laboratory of Integrated Pest Management
|
China
|
2022-03-19
|
5-3
|
Donggang virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,871
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null | null | null | null |
Donggang virus isolate 5-3, complete genome
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AGTTGTTGATCTGTGTGAATCAGACTGCGACAGTTCGAGTTTGAAGCGAAAGCTAGCAACAGTATCAACAGGTTTTATTTTGGATTTGGAAACGAGAGTTTCTGGTCATGAGATCAATGGTCTTTCGAGCTAGGAGGCCCGTTAAACGGGCCGTCGATATAATAAAACGTAAGCTGCCTTACGTTCCGCCACCAATGAGGGTGGCCAAAATGGCAGCGAAGAAAGTGATGATGGGAATTGGAAGCTTGAAAGCATTTTTGGCTCTGTTTTTGTTCATGACTTTCACTGGCCGGAAAATTTCTAACGAACAACATAAGAGATTCCGGTCGATAGACAAGACTAAAGCAATGAAGGTGTTGGCGACATTTAAGAAAATTCTTGGAAATCTGATGAAAACCCTTCAAACCCGGAAAAAGAGACCGAATAGACGATCTGCTGGGAGTAATGGAATGATGATGCTAGCCTTGATTGGGACTGCTATGGCAGCCACGAGTATGACTAAAGACGATACCATCTACATGACCGTGGAACCAAAAGATGTAGGGACTTGGCTCTCTATCCGCACACGCCTAGGCAATGGATCGTGTATAGTCAACGCAATGGATGTTGGCACAATGTGTGAAGATAAGGTGACATATGAATGTCCGAAGATTGATGGATCATCTGACCCTGAAGATGTTGACTGTTGGTGTAAGGGGATTTCTGTTGTACTGACCTATGGAAGGTGCAAGACTAATTCCACTACCCCGGCACCTCAGCGTCGCAGATCAAGAAGATCTATCATGATACCTACACACAGTACGGGTGGATTGCACCAAGGAACCGAAGGATGGCACAGGACCAATAATGTGAAGAACTTCCTCATGCGAGTTGAGAAATGGTCACTGAGAAATCCAGGGTACACTGCCTTGATAGCCATTCTAGGATGGACTCTTGGCACAACAACCGCCCAAAAGGTCATTTTTATAGCTTTGCTCTTGATGATCGCACCTGTCTACGGAAGCCAGTGTTCAGGGATCGACAAACGTGACTTCATACAAGGGGTGTCAGGAGGTACCTGGGTAGATGTGGTCTTGGACCGTAAAGGATGCGTGACAATATCAGCAACCGGAAAACCGACCATAGACGTACGGATGGTTAAGATGGAAGCCTCCAATTTGGCATCCGTGCGAACATACTGTCTGGAAGCTTCCACCTCGGAAATTTCATCCGTTAATGGTTGCCCCTCAACTACAGAAGCACATAATGATAAGCGGAAAGACTCAACTTATCTGTGCGAGAGAAGCTACCCTGATAGGGGATGGGGCAATGGATGTGGACTTTTTGGGAGAGGCTCTTTGGATACGTGCGTCAAGTTTGCATGCAGTAAGAAAATGGCAGGACATGCAATCTCAAGAGAGAACATCGTCATAACTGCTGCAGTGTCTGTTCACGGACACTCTGGCGCTGAGAGTGACGACGACTCGCAAAGGAAATCGCGTAAGGAACTGGCAGAGCTCACCATAACTCCTAAAAGCTCCATTGTTGAAGCAGATTTGGGAGATTACGGCAAAGTGCAATTTGAATGCCTGATGGACTTTGGGATTGATTTGGATGACGTTTACACGGCCGATATGTCAGGAAAGTGGTGGTTGGTTAAGCGTGATTGGTATCATGACATTGCTCTCCCATGGACAGCACCCTCCGCTGACTTTTGGCATGACATGGACAGATTGGTGGAATTTAGCACACCACATGCCACTAAGCAGAGTGTGTATACCCTAGGTGACCAAGAAGGAGCCATGTCCACTGCCCTAGGTGATGCGGCCGTTATTGAATACATGTCATCAGGAAGCAAGGTGGTCTTTCGTACAGGGTTCCTAAAATGTAGAGTCAAGATGGAAAATCTGAGATTGAAAGGCTCCACATATATGCAATGTTCCAAGGAGTTCTCTATTCTGAAGAGGCCCACCGCCACCCCGTATGGAACTGTCATCATGCAGGTGAAGTACGCGCAGACTGATGTCCCGTGTCGTGTGCCAGTGGGCGTTCATGAGAGGCCAGGTGGTGAGCAAGTTGGACGTATTATAACAGCCCATCCTATCATTCTTAAACAGAACGATGCACTTGTTATCGAAGTTGAACCCCCGTTTGGAGATAGTGTCATAGAAATTGGTCTAGGCACCACGAAAATAGTGGAACAATGGCATAGAGATGGCAGCTCGATTGGAGCGGCATTCACATCCACCATGAAAGGTGTGGAACGAATGGCTCTATTGGGAGAACACGCTTGGGATTTCGGGTCCGTCGGGGGTTTTTTCAACAGTATGGGCAAGGCTATCCACTCCGTGTTTGGAGGTTTGTTCCGGGCGGTATTTGGAGGTATGAGCTGGATTTCCAAAGTGCTTATCGGTGCAATCTTGATGTGGTTGGGAGTTAGCGCACGGGAAAAAACCCTCGCTATGTCTCTAATCACGGTGGGGGCTATCCTTTTGTATCTGTCTACCATGACCAATGCTGTGTCCGAGGTAGGGTGTAGTTTGGATTTGTCCCGCCATGAAATAAAATGCGGCGATGGAGTGTTTTTATTTCGAGACGTCAGCAACTGGCGTGACAAATACGTGTTCCATCCTGGTTCACCACGTACTCTTGCAGCATCCGTTTGGTCGGCTTGGAACAATGGAATTTGTGGCGTACGCTCAACCACACGTATGGAACACGAAATGTGGAAACAAGTTGAGAATGAGATCAACGGAATATTTGAAGAGAATGCCATTGCCCTTAGTGTCGTTGTTAAGAATGCGAACGGAACATTTCCGCGTGGGCACAAACGCCTCCCAGTCAACACAACAGGACTACAGCACGGATGGAAGACATGGGGAAAGACCAAGTTGATGCAGGTTCCATTGGCAAAGGACGTTTTTATCATTGATGGAAACGATGAGGGTGAATGCGTGTCTACAAATAGATCATGGAACACTTTTAGGGTTGAGGAGTTTGGCACGGGAATCATGAAAACAAAAGTGTTTTTGGATATAAACCCGACTTTAACGAGATACTGCGATACCGAATTGCTTGGAGCAGCTGTGAAAGGAAACCATTCTGCTCATGGTGATCCTGGTTTGTGGATGGTCTCTGAGAAAGAAGGAAGTGAGTGGAAACTCACGAGCCTGTCACTATCCGAGAGTAGGAGGTGTTTGTGGCCTGATTCTCATACTGTCTGGGGACGTGGAGTTGAAGAGACCAAACTCATCCTTCCTGCCAATCTTGGAGGGCCAGTGTCACACATGAACACTAGATATGGCTACTCAACCCAGATCTCTGGACCATGGAACAATGTTCCACTAGACGTGGTCTTTGAGACCTGTCCTGGAACGACGGTTAATGTCACTAGAACATGTGTGGGGAGATCGGCATCGGCAAGGTCAACAACTGACAGTGGGAAGATCATACCGGAGTGGTGTTGCAGAGCCTGCACCATGCCTCCCTTGACATACCGGACACCCGATGGATGCTGGTACGCCATGGAAATCCAGCCAATGAACACCAAGGAGGAGAGTATCCTGAGAGCGAGAGTTTCAGCAGGAGCAGTTCACGGACTAGACAACTTTTCACTGGGATTGTTGGTCATGATGTTGGTCACGCAAGAAGGACTGAAGAGAAGATTCACTAGCAAACATATCATGTTGGCAGGAATAGGGCTTCTCATCTGTGTTATTATGGGTGACCTCACATACACAGATCTGGCTCGGTATGCAGTACTACTCGGGACAACGTTCGCAGAGATGAACTCGGGTGGAGATGTCATGCACCTCGCGCTGGTTGCCACATTTAAAGTCAAACCAGCATACCTGTTGGGTTTCCTCTTTAGGATGCGTTGGTCTCCAAGAGAAAGTTTCATGTTGGTATGTGGTGCCATTCTCATGCAGACCGGAATGGGAGTTCTGGCCTGCCATCACATGATGGATTATGTCCACGCATGTGCCCTTGGTTGGTTGCTTGTCAGATCTTTAGTTGTCCCTGGAATGGTTTCGAAAGCCTTACCCCTTTTATGTTGTCTGGCTCCGTTGCCTTTAGCTGTTATGACTAACGCCACGAGAGCTAGTGTGGCAACTTTGGCAGTTGGAACCATGTTGGCCGGTGCCAAGGGCAAGTCAGTGAAAAAATCCCTACCATGGTTTTCAGCTTTGATTGCATCTTGGATGGGGTGCAATCCACTTGGCATGATGGTGTTCGCCAGTTTTATGAGGAAACATGGCAAGAGATCCTGGCCAGCTGGAGAGGTGATGGCAGCTGTAGGCATCGTATGCGCTCTAGCAGGTGCCATCACAGAAAACCAGGGAGAAGTGGCTGGGCCAGCCGCTGCTGCGGCCCTTATATTCACCGCATATGCCATAAGCGGCAAGGCCAACGACATATTCCTTGAGAAAGCTGGTGAGATGACATGGAGCCATGATGCTCAGCTATCTGGATCAAGTCCAAGAGTGGACGTCAAAGTTGGTGAGAGTGGGGATTTTCGGCTTCGCCACGAGTCTGAAGACTCGTGGCTGAAAACAGGCGTAACAGCTGGCTGTCTCATCATGGCCGGCTTCCATCCCCTTGCCATACCGGTTGCGGGATTGATTTGGTATGGATATGTGAAACATGACCGTAGAGGTGGAGTCTTGTGGGACATTCCACACCCATCAACATCCAAAGCCGGAGACACTGAGACAGGAGTATACCGCATCATGTCCAAACGTCTGTTTGGGGCCACCCAGATAGGTGTGGGGGTGATGTATGAGAGTGTCTTCCACACCATGTGGCATGTCACCAGAGGAGCTTCTCTGATGAGTGGAGAAGGTAGAATTGATCCATATTGGGCTGACGTCCGTGAGGATCTCATCAGCTATGGTGGACCATGGAGATTGAATGGAACGTGGGACGGGACTACTGAAGTGCAACTTATAGCAGTGTCACCTGGCAAAGTTCCTATCAACGTCCAAACGAAACCTGGAAAATTCGTGCTCACTGATGGACGT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| 32,359
|
MZ357897.1
|
Donggang virus
|
Zhang,Y.
|
Institute of ZoologyChineses Academy of Sciences, The State Key Laboratory of Integrated Pest Management
|
China
|
2022-03-19
|
5.1-81
|
Donggang virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,780
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null | null | null | null |
Donggang virus isolate 5.1-81, complete genome
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AGTTGTTGATCTGTGTGAATCAGACTGCGACAGTTCGAGTTTGAAGCGAAAGCTAGCAACAGTATCAACAGGTTTTATTTTAGGTTTGAAAGAGTTGAATCAATGAGATCAATGGTCTTTCGAGCTAGGAGGCCCGTTAAACGGGCCGTCGATATAATAAAACGTAAGCTGCCTTACGTTCCGCCACCAATGAGGGTGGCCAAAATGGCAGCGAAGAAAGTGATGATGGGAATTGGAAGCTTGAAAGCATTTTTGGCTCTGTTTTTGTTCATGACTTTCACTGGCCGGAAAATTTCTAACGAACAACATAAGAGATTCCGGTCGATAGACAAGACTAAAGCAATGAAGGTGTTGGCGACATTTAAGAAAATTCTTGGAAATCTGATGAAAACCCTTCAAACCCGGAAAAAGAGACCGAATAGACGATCTGCTGGGAGTAATGGAATGATGATGCTAGCCTTGATTGGGACTGCTATGGCAGCCACGAGTATGACTAAAGACGATACCATCTACATGACCGTGGAACCAAAAGATGTAGGGACTTGGCTCTCTATCCGCACACGCCTAGGCAATGGATCGTGTATAGTCAACGCAATGGATGTTGGCACAATGTGTGAAGATAAGGTGACATATGAATGTCCGAAGATTGATGGATCATCTGACCCTGAAGATGTTGACTGTTGGTGTAAGGGGATTTCTGTTGTACTGACCTATGGAAGGTGCAAGACTAATTCCACTACCCCGGCACCTCAGCGTCGCAGATCAAGAAGATCTATCATGATACCTACACACAGTACGGGTGGATTGCACCAAGGAACCGAAGGATGGCACAGGACCAATAATGTGAAGAACTTCCTCATGCGAGTTGAGAAATGGTCACTGAGAAATCCAGGGTACACTGCCTTGATAGCCATTCTAGGATGGACTCTTGGCACAACAACCGCCCAAAAGGTCATTTTTATAGCTTTGCTCTTGATGATCGCACCTGTCTACGGAAGCCAGTGTTCAGGGATCGACAAACGTGACTTCATACAAGGGGTGTCAGGAGGTACCTGGGTAGATGTGGTCTTGGACCGTAAAGGATGCGTGACAATATCAGCAACCGGAAAACCGACCATAGACGTACGGATGGTTAAGATGGAAGCCTCCAATTTGGCATCCGTGCGAACATACTGTCTGGAAGCTTCCACCTCGGAAATTTCATCCGTTAATGGTTGCCCCTCAACTACAGAAGCACATAATGATAAGCGGAAAGACTCAACTTATCTGTGCGAGAGAAGCTACCCTGATAGGGGATGGGGCAATGGATGTGGACTTTTTGGGAGAGGCTCTTTGGATACGTGCGTCAAGTTTGCATGCAGTAAGAAAATGGCAGGACATGCAATCTCAAGAGAGAACATCGTCATAACTGCTGCAGTGTCTGTTCACGGACACTCTGGCGCTGAGAGTGACGACGACTCGCAAAGGAAATCGCGTAAGGAACTGGCAGAGCTCACCATAACTCCTAAAAGCTCCATTGTTGAAGCAGATTTGGGAGATTACGGCAAAGTGCAATTTGAATGCCTGATGGACTTTGGGATTGATTTGGATGACGTTTACACGGCCGATATGTCAGGAAAGTGGTGGTTGGTTAAGCGTGATTGGTATCATGACATTGCTCTCCCATGGACAGCACCCTCCGCTGACTTTTGGCATGACATGGACAGATTGGTGGAATTTAGCACACCACATGCCACTAAGCAGAGTGTGTATACCCTAGGTGACCAAGAAGGAGCCATGTCCACTGCCCTAGGTGATGCGGCCGTTATTGAATACATGTCATCAGGAAGCAAGGTGGTCTTTCGTACAGGGTTCCTAAAATGTAGAGTCAAGATGGAAAATCTGAGATTGAAAGGCTCCACATATATGCAATGTTCCAAGGAGTTCTCTATTCTGAAGAGGCCCACCGCCACCCCGTATGGAACTGTCATCATGCAGGTGAAGTACGCGCAGACTGATGTCCCGTGTCGTGTGCCAGTGGGCGTTCATGAGAGGCCAGGTGGTGAGCAAGTTGGACGTATTATAACAGCCCATCCTATCATTCTTAAACAGAACGATGCACTTGTTATCGAAGTTGAACCCCCGTTTGGAGATAGTGTCATAGAAATTGGTCTAGGCACCACGAAAATAGTGGAACAATGGCATAGAGATGGCAGCTCGATTGGAGCGGCATTCACATCCACCATGAAAGGTGTGGAACGAATGGCTCTATTGGGAGAACACGCTTGGGATTTCGGGTCCGTCGGGGGTTTTTTCAACAGTATGGGCAAGGCTATCCACTCCGTGTTTGGAGGTTTGTTCCGGGCGGTATTTGGAGGTATGAGCTGGATTTCCAAAGTGCTTATCGGTGCAATCTTGATGTGGTTGGGAGTTAGCGCACGGGAAAAAACCCTCGCTATGTCTCTAATCACGGTGGGGGCTATCCTTTTGTATCTGTCTACCATGACCAATGCTGTGTCCGAGGTAGGGTGTAGTTTGGATTTGTCCCGCCATGAAATAAAATGCGGCGATGGAGTGTTTTTATTTCGAGACGTCAGCAACTGGCGTGACAAATACGTGTTCCATCCTGGTTCACCACGTACTCTTGCAGCATCCGTTTGGTCGGCTTGGAACAATGGAATTTGTGGCGTACGCTCAACCACACGTATGGAACACGAAATGTGGAAACAAGTTGAGAATGAGATCAACGGAATATTTGAAGAGAATGCCATTGCCCTTAGTGTCGTTGTTAAGAATGCGAACGGAACATTTCCGCGTGGGCACAAACGCCTCCCAGTCAACACAACAGGACTACAGCACGGATGGAAGACATGGGGAAAGACCAAGTTGATGCAGGTTCCATTGGCAAAGGACGTTTTTATCATTGATGGAAACGATGAGGGTGAATGCGTGTCTACAAATAGATCATGGAACACTTTTAGGGTTGAGGAGTTTGGCACGGGAATCATGAAAACAAAAGTGTTTTTGGATATAAACCCGACTTTAACGAGATACTGCGATACCGAATTGCTTGGAGCAGCTGTGAAAGGAAACCATTCTGCTCATGGTGATCCTGGTTTGTGGATGGTCTCTGAGAAAGAAGGAAGTGAGTGGAAACTCACGAGCCTGTCACTATCCGAGAGTAGGAGGTGTTTGTGGCCTGATTCTCATACTGTCTGGGGACGTGGAGTTGAAGAGACCAAACTCATCCTTCCTGCCAATCTTGGAGGGCCAGTGTCACACATGAACACTAGATATGGCTACTCAACCCAGATCTCTGGACCATGGAACAATGTTCCACTAGACGTGGTCTTTGAGACCTGTCCTGGAACGACGGTTAATGTCACTAGAACATGTGTGGGGAGATCGGCATCGGCAAGGTCAACAACTGACAGTGGGAAGATCATACCGGAGTGGTGTTGCAGAGCCTGCACCATGCCTCCCTTGACATACCGGACACCCGATGGATGCTGGTACGCCATGGAAATCCAGCCAATGAACACCAAGGAGGAGAGTATCCTGAGAGCGAGAGTTTCAGCAGGAGCAGTTCACGGACTAGACAACTTTTCACTGGGATTGTTGGTCATGATGTTGGTCACGCAAGAAGGACTGAAGAGAAGATTCACTAGCAAACATATCATGTTGGCAGGAATAGGGCTTCTCATCTGTGTTATTATGGGTGACCTCACATACACAGATCTGGCTCGGTATGCAGTACTACTCGGGACAACGTTCGCAGAGATGAACTCGGGTGGAGATGTCATGCACCTCGCGCTGGTTGCCACATTTAAAGTCAAACCAGCATACCTGTTGGGTTTCCTCTTTAGGATGCGTTGGTCTCCAAGAGAAAGTTTCATGTTGGTATGTGGTGCCATTCTCATGCAGACCGGAATGGGAGTTCTGGCCTGCCATCACATGATGGATTATGTCCACGCATGTGCCCTTGGTTGGTTGCTTGTCAGATCTTTAGTTGTCCCTGGAATGGTTTCGAAAGCCTTACCCCTTTTATGTTGTCTGGCTCCGTTGCCTTTAGCTGTTATGACTAACGCCACGAGAGCTAGTGTGGCAACTTTGGCAGTTGGAACCATGTTGGCCGGTGCCAAGGGCAAGTCAGTGAAAAAATCCCTACCATGGTTTTCAGCTTTGATTGCATCTTGGATGGGGTGCAATCCACTTGGCATGATGGTGTTCGCCAGTTTTATGAGGAAACATGGCAAGAGATCCTGGCCAGCTGGAGAGGTGATGGCAGCTGTAGGCATCGTATGCGCTCTAGCAGGTGCCATCACAGAAAACCAGGGAGAAGTGGCTGGGCCAGCCGCTGCTGCGGCCCTTATATTCACCGCATATGCCATAAGCGGCAAGGCCAACGACATATTCCTTGAGAAAGCTGGTGAGATGACATGGAGCCATGATGCTCAGCTATCTGGATCAAGTCCAAGAGTGGACGTCAAAGTTGGTGAGAGTGGGGATTTTCGGCTTCGCCACGAGTCTGAAGACTCGTGGCTGAAAACAGGCGTAACAGCTGGCTGTCTCATCATGGCCGGCTTCCATCCCCTTGCCATACCGGTTGCGGGATTGATTTGGTATGGATATGTGAAACATGACCGTAGAGGTGGAGTCTTGTGGGACATTCCACACCCATCAACATCCAAAGCCGGAGACACTGAGACAGGAGTATACCGCATCATGTCCAAACGTCTGTTTGGGGCCACCCAGATAGGTGTGGGGGTGATGTATGAGAGTGTCTTCCACACCATGTGGCATGTCACCAGAGGAGCTTCTCTGATGAGTGGAGAAGGTAGAATTGATCCATATTGGGCTGACGTCCGTGAGGATCTCATCAGCTATGGTGGACCATGGAGATTGAATGGAACGTGGGACGGGACTACTGAAGTGCAACTTATAGCAGTGTCACCTGGCAAAGTTCCTATCAACGTCCAAACGAAACCTGGAAAATTCGTGCTCACTGATGGACGTGAGAT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| 32,360
|
MZ357898.1
|
Donggang virus
|
Zhang,Y.
|
Institute of ZoologyChineses Academy of Sciences, The State Key Laboratory of Integrated Pest Management
|
China
|
2022-03-19
|
5.82-107
|
Donggang virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,796
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null | null | null | null |
Donggang virus isolate 5.82-107, complete genome
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GAAAAGTATATTCTGTGTGTGCGTCTTGGTACACAGTTAGTAGTGAGAGTGGAAGGAAAAGAATACACTTTGAAAACATAACGCATTAGAATGGATTTGGAAACGAGAGTTTCTGGTCATGAGATCAATGGTCTTTCGAGCTAGGAGGCCCGTTAAACGGGCCGTCGATATAATAAAACGTAAGCTGCCTTACGTTCCGCCACCAATGAGGGTGGCCAAAATGGCAGCGAAGAAAGTGATGATGGGAATTGGAAGCTTGAAAGCATTTTTGGCTCTGTTTTTGTTCATGACTTTCACTGGCCGGAAAATTTCTAACGAACAACATAAGAGATTCCGGTCGATAGACAAGACTAAAGCAATGAAGGTGTTGGCGACATTTAAGAAAATTCTTGGAAATCTGATGAAAACCCTTCAAACCCGGAAAAAGAGACCGAATAGACGATCTGCTGGGAGTAATGGAATGATGATGCTAGCCTTGATTGGGACTGCTATGGCAGCCACGAGTATGACTAAAGACGATACCATCTACATGACCGTGGAACCAAAAGATGTAGGGACTTGGCTCTCTATCCGCACACGCCTAGGCAATGGATCGTGTATAGTCAACGCAATGGATGTTGGCACAATGTGTGAAGATAAGGTGACATATGAATGTCCGAAGATTGATGGATCATCTGACCCTGAAGATGTTGACTGTTGGTGTAAGGGGATTTCTGTTGTACTGACCTATGGAAGGTGCAAGACTAATTCCACTACCCCGGCACCTCAGCGTCGCAGATCAAGAAGATCTATCATGATACCTACACACAGTACGGGTGGATTGCACCAAGGAACCGAAGGATGGCACAGGACCAATAATGTGAAGAACTTCCTCATGCGAGTTGAGAAATGGTCACTGAGAAATCCAGGGTACACTGCCTTGATAGCCATTCTAGGATGGACTCTTGGCACAACAACCGCCCAAAAGGTCATTTTTATAGCTTTGCTCTTGATGATCGCACCTGTCTACGGAAGCCAGTGTTCAGGGATCGACAAACGTGACTTCATACAAGGGGTGTCAGGAGGTACCTGGGTAGATGTGGTCTTGGACCGTAAAGGATGCGTGACAATATCAGCAACCGGAAAACCGACCATAGACGTACGGATGGTTAAGATGGAAGCCTCCAATTTGGCATCCGTGCGAACATACTGTCTGGAAGCTTCCACCTCGGAAATTTCATCCGTTAATGGTTGCCCCTCAACTACAGAAGCACATAATGATAAGCGGAAAGACTCAACTTATCTGTGCGAGAGAAGCTACCCTGATAGGGGATGGGGCAATGGATGTGGACTTTTTGGGAGAGGCTCTTTGGATACGTGCGTCAAGTTTGCATGCAGTAAGAAAATGGCAGGACATGCAATCTCAAGAGAGAACATCGTCATAACTGCTGCAGTGTCTGTTCACGGACACTCTGGCGCTGAGAGTGACGACGACTCGCAAAGGAAATCGCGTAAGGAACTGGCAGAGCTCACCATAACTCCTAAAAGCTCCATTGTTGAAGCAGATTTGGGAGATTACGGCAAAGTGCAATTTGAATGCCTGATGGACTTTGGGATTGATTTGGATGACGTTTACACGGCCGATATGTCAGGAAAGTGGTGGTTGGTTAAGCGTGATTGGTATCATGACATTGCTCTCCCATGGACAGCACCCTCCGCTGACTTTTGGCATGACATGGACAGATTGGTGGAATTTAGCACACCACATGCCACTAAGCAGAGTGTGTATACCCTAGGTGACCAAGAAGGAGCCATGTCCACTGCCCTAGGTGATGCGGCCGTTATTGAATACATGTCATCAGGAAGCAAGGTGGTCTTTCGTACAGGGTTCCTAAAATGTAGAGTCAAGATGGAAAATCTGAGATTGAAAGGCTCCACATATATGCAATGTTCCAAGGAGTTCTCTATTCTGAAGAGGCCCACCGCCACCCCGTATGGAACTGTCATCATGCAGGTGAAGTACGCGCAGACTGATGTCCCGTGTCGTGTGCCAGTGGGCGTTCATGAGAGGCCAGGTGGTGAGCAAGTTGGACGTATTATAACAGCCCATCCTATCATTCTTAAACAGAACGATGCACTTGTTATCGAAGTTGAACCCCCGTTTGGAGATAGTGTCATAGAAATTGGTCTAGGCACCACGAAAATAGTGGAACAATGGCATAGAGATGGCAGCTCGATTGGAGCGGCATTCACATCCACCATGAAAGGTGTGGAACGAATGGCTCTATTGGGAGAACACGCTTGGGATTTCGGGTCCGTCGGGGGTTTTTTCAACAGTATGGGCAAGGCTATCCACTCCGTGTTTGGAGGTTTGTTCCGGGCGGTATTTGGAGGTATGAGCTGGATTTCCAAAGTGCTTATCGGTGCAATCTTGATGTGGTTGGGAGTTAGCGCACGGGAAAAAACCCTCGCTATGTCTCTAATCACGGTGGGGGCTATCCTTTTGTATCTGTCTACCATGACCAATGCTGTGTCCGAGGTAGGGTGTAGTTTGGATTTGTCCCGCCATGAAATAAAATGCGGCGATGGAGTGTTTTTATTTCGAGACGTCAGCAACTGGCGTGACAAATACGTGTTCCATCCTGGTTCACCACGTACTCTTGCAGCATCCGTTTGGTCGGCTTGGAACAATGGAATTTGTGGCGTACGCTCAACCACACGTATGGAACACGAAATGTGGAAACAAGTTGAGAATGAGATCAACGGAATATTTGAAGAGAATGCCATTGCCCTTAGTGTCGTTGTTAAGAATGCGAACGGAACATTTCCGCGTGGGCACAAACGCCTCCCAGTCAACACAACAGGACTACAGCACGGATGGAAGACATGGGGAAAGACCAAGTTGATGCAGGTTCCATTGGCAAAGGACGTTTTTATCATTGATGGAAACGATGAGGGTGAATGCGTGTCTACAAATAGATCATGGAACACTTTTAGGGTTGAGGAGTTTGGCACGGGAATCATGAAAACAAAAGTGTTTTTGGATATAAACCCGACTTTAACGAGATACTGCGATACCGAATTGCTTGGAGCAGCTGTGAAAGGAAACCATTCTGCTCATGGTGATCCTGGTTTGTGGATGGTCTCTGAGAAAGAAGGAAGTGAGTGGAAACTCACGAGCCTGTCACTATCCGAGAGTAGGAGGTGTTTGTGGCCTGATTCTCATACTGTCTGGGGACGTGGAGTTGAAGAGACCAAACTCATCCTTCCTGCCAATCTTGGAGGGCCAGTGTCACACATGAACACTAGATATGGCTACTCAACCCAGATCTCTGGACCATGGAACAATGTTCCACTAGACGTGGTCTTTGAGACCTGTCCTGGAACGACGGTTAATGTCACTAGAACATGTGTGGGGAGATCGGCATCGGCAAGGTCAACAACTGACAGTGGGAAGATCATACCGGAGTGGTGTTGCAGAGCCTGCACCATGCCTCCCTTGACATACCGGACACCCGATGGATGCTGGTACGCCATGGAAATCCAGCCAATGAACACCAAGGAGGAGAGTATCCTGAGAGCGAGAGTTTCAGCAGGAGCAGTTCACGGACTAGACAACTTTTCACTGGGATTGTTGGTCATGATGTTGGTCACGCAAGAAGGACTGAAGAGAAGATTCACTAGCAAACATATCATGTTGGCAGGAATAGGGCTTCTCATCTGTGTTATTATGGGTGACCTCACATACACAGATCTGGCTCGGTATGCAGTACTACTCGGGACAACGTTCGCAGAGATGAACTCGGGTGGAGATGTCATGCACCTCGCGCTGGTTGCCACATTTAAAGTCAAACCAGCATACCTGTTGGGTTTCCTCTTTAGGATGCGTTGGTCTCCAAGAGAAAGTTTCATGTTGGTATGTGGTGCCATTCTCATGCAGACCGGAATGGGAGTTCTGGCCTGCCATCACATGATGGATTATGTCCACGCATGTGCCCTTGGTTGGTTGCTTGTCAGATCTTTAGTTGTCCCTGGAATGGTTTCGAAAGCCTTACCCCTTTTATGTTGTCTGGCTCCGTTGCCTTTAGCTGTTATGACTAACGCCACGAGAGCTAGTGTGGCAACTTTGGCAGTTGGAACCATGTTGGCCGGTGCCAAGGGCAAGTCAGTGAAAAAATCCCTACCATGGTTTTCAGCTTTGATTGCATCTTGGATGGGGTGCAATCCACTTGGCATGATGGTGTTCGCCAGTTTTATGAGGAAACATGGCAAGAGATCCTGGCCAGCTGGAGAGGTGATGGCAGCTGTAGGCATCGTATGCGCTCTAGCAGGTGCCATCACAGAAAACCAGGGAGAAGTGGCTGGGCCAGCCGCTGCTGCGGCCCTTATATTCACCGCATATGCCATAAGCGGCAAGGCCAACGACATATTCCTTGAGAAAGCTGGTGAGATGACATGGAGCCATGATGCTCAGCTATCTGGATCAAGTCCAAGAGTGGACGTCAAAGTTGGTGAGAGTGGGGATTTTCGGCTTCGCCACGAGTCTGAAGACTCGTGGCTGAAAACAGGCGTAACAGCTGGCTGTCTCATCATGGCCGGCTTCCATCCCCTTGCCATACCGGTTGCGGGATTGATTTGGTATGGATATGTGAAACATGACCGTAGAGGTGGAGTCTTGTGGGACATTCCACACCCATCAACATCCAAAGCCGGAGACACTGAGACAGGAGTATACCGCATCATGTCCAAACGTCTGTTTGGGGCCACCCAGATAGGTGTGGGGGTGATGTATGAGAGTGTCTTCCACACCATGTGGCATGTCACCAGAGGAGCTTCTCTGATGAGTGGAGAAGGTAGAATTGATCCATATTGGGCTGACGTCCGTGAGGATCTCATCAGCTATGGTGGACCATGGAGATTGAATGGAACGTGGGACGGGACTACTGAAGTGCAACTTATAGCAGTGTCACCTGGCAAAGTTCCTATCAACGTCCAAACGAAACCTGGAAAATTCGTGCTCA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| 32,361
|
MZ357899.1
|
Donggang virus
|
Zhang,Y.
|
Institute of ZoologyChineses Academy of Sciences, The State Key Laboratory of Integrated Pest Management
|
China
|
2022-03-19
|
3.1-102
|
Donggang virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,866
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null | null | null | null |
Donggang virus isolate 3.1-102, complete genome
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GAAAAGTATATTCTGTGTGTGCGTCTTGGTACACAGTTAGTAGTGAGAGTGGAAGGAAAAGAATACACTTTGAAAACATAACGCATTAGAATAGGTTTGAAAGAGTTGAATCAATGAGATCAATGGTCTTTCGAGCTAGGAGGCCCGTTAAACGGGCCGTCGATATAATAAAACGTAAGCTGCCTTACGTTCCGCCACCAATGAGGGTGGCCAAAATGGCAGCGAAGAAAGTGATGATGGGAATTGGAAGCTTGAAAGCATTTTTGGCTCTGTTTTTGTTCATGACTTTCACTGGCCGGAAAATTTCTAACGAACAACATAAGAGATTCCGGTCGATAGACAAGACTAAAGCAATGAAGGTGTTGGCGACATTTAAGAAAATTCTTGGAAATCTGATGAAAACCCTTCAAACCCGGAAAAAGAGACCGAATAGACGATCTGCTGGGAGTAATGGAATGATGATGCTAGCCTTGATTGGGACTGCTATGGCAGCCACGAGTATGACTAAAGACGATACCATCTACATGACCGTGGAACCAAAAGATGTAGGGACTTGGCTCTCTATCCGCACACGCCTAGGCAATGGATCGTGTATAGTCAACGCAATGGATGTTGGCACAATGTGTGAAGATAAGGTGACATATGAATGTCCGAAGATTGATGGATCATCTGACCCTGAAGATGTTGACTGTTGGTGTAAGGGGATTTCTGTTGTACTGACCTATGGAAGGTGCAAGACTAATTCCACTACCCCGGCACCTCAGCGTCGCAGATCAAGAAGATCTATCATGATACCTACACACAGTACGGGTGGATTGCACCAAGGAACCGAAGGATGGCACAGGACCAATAATGTGAAGAACTTCCTCATGCGAGTTGAGAAATGGTCACTGAGAAATCCAGGGTACACTGCCTTGATAGCCATTCTAGGATGGACTCTTGGCACAACAACCGCCCAAAAGGTCATTTTTATAGCTTTGCTCTTGATGATCGCACCTGTCTACGGAAGCCAGTGTTCAGGGATCGACAAACGTGACTTCATACAAGGGGTGTCAGGAGGTACCTGGGTAGATGTGGTCTTGGACCGTAAAGGATGCGTGACAATATCAGCAACCGGAAAACCGACCATAGACGTACGGATGGTTAAGATGGAAGCCTCCAATTTGGCATCCGTGCGAACATACTGTCTGGAAGCTTCCACCTCGGAAATTTCATCCGTTAATGGTTGCCCCTCAACTACAGAAGCACATAATGATAAGCGGAAAGACTCAACTTATCTGTGCGAGAGAAGCTACCCTGATAGGGGATGGGGCAATGGATGTGGACTTTTTGGGAGAGGCTCTTTGGATACGTGCGTCAAGTTTGCATGCAGTAAGAAAATGGCAGGACATGCAATCTCAAGAGAGAACATCGTCATAACTGCTGCAGTGTCTGTTCACGGACACTCTGGCGCTGAGAGTGACGACGACTCGCAAAGGAAATCGCGTAAGGAACTGGCAGAGCTCACCATAACTCCTAAAAGCTCCATTGTTGAAGCAGATTTGGGAGATTACGGCAAAGTGCAATTTGAATGCCTGATGGACTTTGGGATTGATTTGGATGACGTTTACACGGCCGATATGTCAGGAAAGTGGTGGTTGGTTAAGCGTGATTGGTATCATGACATTGCTCTCCCATGGACAGCACCCTCCGCTGACTTTTGGCATGACATGGACAGATTGGTGGAATTTAGCACACCACATGCCACTAAGCAGAGTGTGTATACCCTAGGTGACCAAGAAGGAGCCATGTCCACTGCCCTAGGTGATGCGGCCGTTATTGAATACATGTCATCAGGAAGCAAGGTGGTCTTTCGTACAGGGTTCCTAAAATGTAGAGTCAAGATGGAAAATCTGAGATTGAAAGGCTCCACATATATGCAATGTTCCAAGGAGTTCTCTATTCTGAAGAGGCCCACCGCCACCCCGTATGGAACTGTCATCATGCAGGTGAAGTACGCGCAGACTGATGTCCCGTGTCGTGTGCCAGTGGGCGTTCATGAGAGGCCAGGTGGTGAGCAAGTTGGACGTATTATAACAGCCCATCCTATCATTCTTAAACAGAACGATGCACTTGTTATCGAAGTTGAACCCCCGTTTGGAGATAGTGTCATAGAAATTGGTCTAGGCACCACGAAAATAGTGGAACAATGGCATAGAGATGGCAGCTCGATTGGAGCGGCATTCACATCCACCATGAAAGGTGTGGAACGAATGGCTCTATTGGGAGAACACGCTTGGGATTTCGGGTCCGTCGGGGGTTTTTTCAACAGTATGGGCAAGGCTATCCACTCCGTGTTTGGAGGTTTGTTCCGGGCGGTATTTGGAGGTATGAGCTGGATTTCCAAAGTGCTTATCGGTGCAATCTTGATGTGGTTGGGAGTTAGCGCACGGGAAAAAACCCTCGCTATGTCTCTAATCACGGTGGGGGCTATCCTTTTGTATCTGTCTACCATGACCAATGCTGTGTCCGAGGTAGGGTGTAGTTTGGATTTGTCCCGCCATGAAATAAAATGCGGCGATGGAGTGTTTTTATTTCGAGACGTCAGCAACTGGCGTGACAAATACGTGTTCCATCCTGGTTCACCACGTACTCTTGCAGCATCCGTTTGGTCGGCTTGGAACAATGGAATTTGTGGCGTACGCTCAACCACACGTATGGAACACGAAATGTGGAAACAAGTTGAGAATGAGATCAACGGAATATTTGAAGAGAATGCCATTGCCCTTAGTGTCGTTGTTAAGAATGCGAACGGAACATTTCCGCGTGGGCACAAACGCCTCCCAGTCAACACAACAGGACTACAGCACGGATGGAAGACATGGGGAAAGACCAAGTTGATGCAGGTTCCATTGGCAAAGGACGTTTTTATCATTGATGGAAACGATGAGGGTGAATGCGTGTCTACAAATAGATCATGGAACACTTTTAGGGTTGAGGAGTTTGGCACGGGAATCATGAAAACAAAAGTGTTTTTGGATATAAACCCGACTTTAACGAGATACTGCGATACCGAATTGCTTGGAGCAGCTGTGAAAGGAAACCATTCTGCTCATGGTGATCCTGGTTTGTGGATGGTCTCTGAGAAAGAAGGAAGTGAGTGGAAACTCACGAGCCTGTCACTATCCGAGAGTAGGAGGTGTTTGTGGCCTGATTCTCATACTGTCTGGGGACGTGGAGTTGAAGAGACCAAACTCATCCTTCCTGCCAATCTTGGAGGGCCAGTGTCACACATGAACACTAGATATGGCTACTCAACCCAGATCTCTGGACCATGGAACAATGTTCCACTAGACGTGGTCTTTGAGACCTGTCCTGGAACGACGGTTAATGTCACTAGAACATGTGTGGGGAGATCGGCATCGGCAAGGTCAACAACTGACAGTGGGAAGATCATACCGGAGTGGTGTTGCAGAGCCTGCACCATGCCTCCCTTGACATACCGGACACCCGATGGATGCTGGTACGCCATGGAAATCCAGCCAATGAACACCAAGGAGGAGAGTATCCTGAGAGCGAGAGTTTCAGCAGGAGCAGTTCACGGACTAGACAACTTTTCACTGGGATTGTTGGTCATGATGTTGGTCACGCAAGAAGGACTGAAGAGAAGATTCACTAGCAAACATATCATGTTGGCAGGAATAGGGCTTCTCATCTGTGTTATTATGGGTGACCTCACATACACAGATCTGGCTCGGTATGCAGTACTACTCGGGACAACGTTCGCAGAGATGAACTCGGGTGGAGATGTCATGCACCTCGCGCTGGTTGCCACATTTAAAGTCAAACCAGCATACCTGTTGGGTTTCCTCTTTAGGATGCGTTGGTCTCCAAGAGAAAGTTTCATGTTGGTATGTGGTGCCATTCTCATGCAGACCGGAATGGGAGTTCTGGCCTGCCATCACATGATGGATTATGTCCACGCATGTGCCCTTGGTTGGTTGCTTGTCAGATCTTTAGTTGTCCCTGGAATGGTTTCGAAAGCCTTACCCCTTTTATGTTGTCTGGCTCCGTTGCCTTTAGCTGTTATGACTAACGCCACGAGAGCTAGTGTGGCAACTTTGGCAGTTGGAACCATGTTGGCCGGTGCCAAGGGCAAGTCAGTGAAAAAATCCCTACCATGGTTTTCAGCTTTGATTGCATCTTGGATGGGGTGCAATCCACTTGGCATGATGGTGTTCGCCAGTTTTATGAGGAAACATGGCAAGAGATCCTGGCCAGCTGGAGAGGTGATGGCAGCTGTAGGCATCGTATGCGCTCTAGCAGGTGCCATCACAGAAAACCAGGGAGAAGTGGCTGGGCCAGCCGCTGCTGCGGCCCTTATATTCACCGCATATGCCATAAGCGGCAAGGCCAACGACATATTCCTTGAGAAAGCTGGTGAGATGACATGGAGCCATGATGCTCAGCTATCTGGATCAAGTCCAAGAGTGGACGTCAAAGTTGGTGAGAGTGGGGATTTTCGGCTTCGCCACGAGTCTGAAGACTCGTGGCTGAAAACAGGCGTAACAGCTGGCTGTCTCATCATGGCCGGCTTCCATCCCCTTGCCATACCGGTTGCGGGATTGATTTGGTATGGATATGTGAAACATGACCGTAGAGGTGGAGTCTTGTGGGACATTCCACACCCATCAACATCCAAAGCCGGAGACACTGAGACAGGAGTATACCGCATCATGTCCAAACGTCTGTTTGGGGCCACCCAGATAGGTGTGGGGGTGATGTATGAGAGTGTCTTCCACACCATGTGGCATGTCACCAGAGGAGCTTCTCTGATGAGTGGAGAAGGTAGAATTGATCCATATTGGGCTGACGTCCGTGAGGATCTCATCAGCTATGGTGGACCATGGAGATTGAATGGAACGTGGGACGGGACTACTGAAGTGCAACTTATAGCAGTGTCACCTGGCAAAGTTCCTATCAACGTCCAAACGAAACCTGGAAAATTCGTGCTCACTGAT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| 32,362
|
JQ086551.1
|
Donggang virus
|
Wang,Z., Guo,J., Han,Y., An,S.
|
Liaoning Center For Disease Control and Prevention, Arbovirus Laboratory
| null |
2012-03-20
|
DG0909
|
Donggang virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,791
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aedes
| null |
2009
| null | null |
Donggang virus isolate DG0909, complete genome
|
GAAAAGTATATTCTGTGTGTGCGTCTTGGTACACAGTTAGTAGTGAGAGTGGAAGGAAAAGAATACACTTTGAAAACATAACGCATTAGAATAGGTTTGAAAGAGTTGAATCAATGAGATCAATGGTCTTTCGAGCTAGGAGGCCCGTTAAACGGGCCGTCGATATAATAAAACGTAAGCTGCCTTACGTTCCGCCACCAATGAGGGTGGCCAAAATGGCAGCGAAGAAAGTGATGATGGGAATTGGAAGCTTGAAAGCATTTTTGGCTCTGTTTTTGTTCATGACTTTCACTGGCCGGAAAATTTCTAACGAACAACATAAGAGATTCCGGTCGATAGACAAGACTAAAGCAATGAAGGTGTTGGCGACATTTAAGAAAATTCTTGGAAATCTGATGAAAACCCTTCAAACCCGGAAAAAGAGACCGAATAGACGATCTGCTGGGAGTAATGGAATGATGATGCTAGCCTTGATTGGGACTGCTATGGCAGCCACGAGTATGACTAAAGACGATACCATCTACATGACCGTGGAACCAAAAGATGTAGGGACTTGGCTCTCTATCCGCACACGCCTAGGCAATGGATCGTGTATAGTCAACGCAATGGATGTTGGCACAATGTGTGAAGATAAGGTGACATATGAATGTCCGAAGATTGATGGATCATCTGACCCTGAAGATGTTGACTGTTGGTGTAAGGGGATTTCTGTTGTACTGACCTATGGAAGGTGCAAGACTAATTCCACTACCCCGGCACCTCAGCGTCGCAGATCAAGAAGATCTATCATGATACCTACACACAGTACGGGTGGATTGCACCAAGGAACCGAAGGATGGCACAGGACCAATAATGTGAAGAACTTCCTCATGCGAGTTGAGAAATGGTCACTGAGAAATCCAGGGTACACTGCCTTGATAGCCATTCTAGGATGGACTCTTGGCACAACAACCGCCCAAAAGGTCATTTTTATAGCTTTGCTCTTGATGATCGCACCTGTCTACGGAAGCCAGTGTTCAGGGATCGACAAACGTGACTTCATACAAGGGGTGTCAGGAGGTACCTGGGTAGATGTGGTCTTGGACCGTAAAGGATGCGTGACAATATCAGCAACCGGAAAACCGACCATAGACGTACGGATGGTTAAGATGGAAGCCTCCAATTTGGCATCCGTGCGAACATACTGTCTGGAAGCTTCCACCTCGGAAATTTCATCCGTTAATGGTTGCCCCTCAACTACAGAAGCACATAATGATAAGCGGAAAGACTCAACTTATCTGTGCGAGAGAAGCTACCCTGATAGGGGATGGGGCAATGGATGTGGACTTTTTGGGAGAGGCTCTTTGGATACGTGCGTCAAGTTTGCATGCAGTAAGAAAATGGCAGGACATGCAATCTCAAGAGAGAACATCGTCATAACTGCTGCAGTGTCTGTTCACGGACACTCTGGCGCTGAGAGTGACGACGACTCGCAAAGGAAATCGCGTAAGGAACTGGCAGAGCTCACCATAACTCCTAAAAGCTCCATTGTTGAAGCAGATTTGGGAGATTACGGCAAAGTGCAATTTGAATGCCTGATGGACTTTGGGATTGATTTGGATGACGTTTACACGGCCGATATGTCAGGAAAGTGGTGGTTGGTTAAGCGTGATTGGTATCATGACATTGCTCTCCCATGGACAGCACCCTCCGCTGACTTTTGGCATGACATGGACAGATTGGTGGAATTTAGCACACCACATGCCACTAAGCAGAGTGTGTATACCCTAGGTGACCAAGAAGGAGCCATGTCCACTGCCCTAGGTGATGCGGCCGTTATTGAATACATGTCATCAGGAAGCAAGGTGGTCTTTCGTACAGGGTTCCTAAAATGTAGAGTCAAGATGGAAAATCTGAGATTGAAAGGCTCCACATATATGCAATGTTCCAAGGAGTTCTCTATTCTGAAGAGGCCCACCGCCACCCCGTATGGAACTGTCATCATGCAGGTGAAGTACGCGCAGACTGATGTCCCGTGTCGTGTGCCAGTGGGCGTTCATGAGAGGCCAGGTGGTGAGCAAGTTGGACGTATTATAACAGCCCATCCTATCATTCTTAAACAGAACGATGCACTTGTTATCGAAGTTGAACCCCCGTTTGGAGATAGTGTCATAGAAATTGGTCTAGGCACCACGAAAATAGTGGAACAATGGCATAGAGATGGCAGCTCGATTGGAGCGGCATTCACATCCACCATGAAAGGTGTGGAACGAATGGCTCTATTGGGAGAACACGCTTGGGATTTCGGGTCCGTCGGGGGTTTTTTCAACAGTATGGGCAAGGCTATCCACTCCGTGTTTGGAGGTTTGTTCCGGGCGGTATTTGGAGGTATGAGCTGGATTTCCAAAGTGCTTATCGGTGCAATCTTGATGTGGTTGGGAGTTAGCGCACGGGAAAAAACCCTCGCTATGTCTCTAATCACGGTGGGGGCTATCCTTTTGTATCTGTCTACCATGACCAATGCTGTGTCCGAGGTAGGGTGTAGTTTGGATTTGTCCCGCCATGAAATAAAATGCGGCGATGGAGTGTTTTTATTTCGAGACGTCAGCAACTGGCGTGACAAATACGTGTTCCATCCTGGTTCACCACGTACTCTTGCAGCATCCGTTTGGTCGGCTTGGAACAATGGAATTTGTGGCGTACGCTCAACCACACGTATGGAACACGAAATGTGGAAACAAGTTGAGAATGAGATCAACGGAATATTTGAAGAGAATGCCATTGCCCTTAGTGTCGTTGTTAAGAATGCGAACGGAACATTTCCGCGTGGGCACAAACGCCTCCCAGTCAACACAACAGGACTACAGCACGGATGGAAGACATGGGGAAAGACCAAGTTGATGCAGGTTCCATTGGCAAAGGACGTTTTTATCATTGATGGAAACGATGAGGGTGAATGCGTGTCTACAAATAGATCATGGAACACTTTTAGGGTTGAGGAGTTTGGCACGGGAATCATGAAAACAAAAGTGTTTTTGGATATAAACCCGACTTTAACGAGATACTGCGATACCGAATTGCTTGGAGCAGCTGTGAAAGGAAACCATTCTGCTCATGGTGATCCTGGTTTGTGGATGGTCTCTGAGAAAGAAGGAAGTGAGTGGAAACTCACGAGCCTGTCACTATCCGAGAGTAGGAGGTGTTTGTGGCCTGATTCTCATACTGTCTGGGGACGTGGAGTTGAAGAGACCAAACTCATCCTTCCTGCCAATCTTGGAGGGCCAGTGTCACACATGAACACTAGATATGGCTACTCAACCCAGATCTCTGGACCATGGAACAATGTTCCACTAGACGTGGTCTTTGAGACCTGTCCTGGAACGACGGTTAATGTCACTAGAACATGTGTGGGGAGATCGGCATCGGCAAGGTCAACAACTGACAGTGGGAAGATCATACCGGAGTGGTGTTGCAGAGCCTGCACCATGCCTCCCTTGACATACCGGACACCCGATGGATGCTGGTACGCCATGGAAATCCAGCCAATGAACACCAAGGAGGAGAGTATCCTGAGAGCGAGAGTTTCAGCAGGAGCAGTTCACGGACTAGACAACTTTTCACTGGGATTGTTGGTCATGATGTTGGTCACGCAAGAAGGACTGAAGAGAAGATTCACTAGCAAACATATCATGTTGGCAGGAATAGGGCTTCTCATCTGTGTTATTATGGGTGACCTCACATACACAGATCTGGCTCGGTATGCAGTACTACTCGGGACAACGTTCGCAGAGATGAACTCGGGTGGAGATGTCATGCACCTCGCGCTGGTTGCCACATTTAAAGTCAAACCAGCATACCTGTTGGGTTTCCTCTTTAGGATGCGTTGGTCTCCAAGAGAAAGTTTCATGTTGGTATGTGGTGCCATTCTCATGCAGACCGGAATGGGAGTTCTGGCCTGCCATCACATGATGGATTATGTCCACGCATGTGCCCTTGGTTGGTTGCTTGTCAGATCTTTAGTTGTCCCTGGAATGGTTTCGAAAGCCTTACCCCTTTTATGTTGTCTGGCTCCGTTGCCTTTAGCTGTTATGACTAACGCCACGAGAGCTAGTGTGGCAACTTTGGCAGTTGGAACCATGTTGGCCGGTGCCAAGGGCAAGTCAGTGAAAAAATCCCTACCATGGTTTTCAGCTTTGATTGCATCTTGGATGGGGTGCAATCCACTTGGCATGATGGTGTTCGCCAGTTTTATGAGGAAACATGGCAAGAGATCCTGGCCAGCTGGAGAGGTGATGGCAGCTGTAGGCATCGTATGCGCTCTAGCAGGTGCCATCACAGAAAACCAGGGAGAAGTGGCTGGGCCAGCCGCTGCTGCGGCCCTTATATTCACCGCATATGCCATAAGCGGCAAGGCCAACGACATATTCCTTGAGAAAGCTGGTGAGATGACATGGAGCCATGATGCTCAGCTATCTGGATCAAGTCCAAGAGTGGACGTCAAAGTTGGTGAGAGTGGGGATTTTCGGCTTCGCCACGAGTCTGAAGACTCGTGGCTGAAAACAGGCGTAACAGCTGGCTGTCTCATCATGGCCGGCTTCCATCCCCTTGCCATACCGGTTGCGGGATTGATTTGGTATGGATATGTGAAACATGACCGTAGAGGTGGAGTCTTGTGGGACATTCCACACCCATCAACATCCAAAGCCGGAGACACTGAGACAGGAGTATACCGCATCATGTCCAAACGTCTGTTTGGGGCCACCCAGATAGGTGTGGGGGTGATGTATGAGAGTGTCTTCCACACCATGTGGCATGTCACCAGAGGAGCTTCTCTGATGAGTGGAGAAGGTAGAATTGATCCATATTGGGCTGACGTCCGTGAGGATCTCATCAGCTATGGTGGACCATGGAGATTGAATGGAACGTGGGACGGGACTACTGAAGTGCAACTTATAGCAGTGTCACCTGGCAAAGTTCCTATCAACGTCCAAACGAAACCTGGAAAATTCGTGCTCACTGAT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|
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|
Dromedary astrovirus
|
Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Teng,J.L.L., Tsang,A.K.L., Joseph,S., Xie,J., Jose,S., Fan,R.Y.Y., Wernery,U., Yuen,K.-Y.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2015-08-18
|
DcAstV-274
|
Dromedary astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,327
|
RefSeq
| null |
United Arab Emirates
|
United Arab Emirates
|
Camelus dromedarius
| null |
2013-04-04
| null |
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|
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|
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| 6,059
|
OP076748.1
|
Dromedary astrovirus
|
Qureshi,M.I., Worthington,B.M., Liu,Y., Cheung,W.Y., Su,S., Zheng,Z., Li,L., Lam,T.T., Guan,Y., Zhu,H., Cheung,Y.M., Lam,T.T.Y.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
China
|
2023-02-01
|
DcAstV/Jd57/KSA/2014
|
Dromedary astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,326
|
GenBank
| 1
|
Saudi Arabia: Jeddah
|
Saudi Arabia
|
Camelus dromedarius
|
feces
|
2014-06-02
| null | null |
Dromedary astrovirus isolate DcAstV/Jd57/KSA/2014, complete genome
|
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| 18,775
|
OP076749.1
|
Dromedary astrovirus
|
Qureshi,M.I., Worthington,B.M., Liu,Y., Cheung,W.Y., Su,S., Zheng,Z., Li,L., Lam,T.T., Guan,Y., Zhu,H., Cheung,Y.M., Lam,T.T.Y.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
China
|
2023-02-01
|
DcAstV/Jd67/KSA/2014
|
Dromedary astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
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ssRNA(+)
| 6,350
|
GenBank
| 1
|
Saudi Arabia: Jeddah
|
Saudi Arabia
|
Camelus dromedarius
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feces
|
2014-06-02
| null | null |
Dromedary astrovirus isolate DcAstV/Jd67/KSA/2014, complete genome
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TACTGGTTGGAGGAAGCATGTCTCTCTACCTGAACCGTGCCGATGAGGCACTGGCATCTAGTGACGGCAATCAGATCAAAGCCCGGTTTGACGCACGAAATTGGTTTGATGAACTGCGCAGGATTGGTCCTAATAAGCCTTGGTATATATCTTACCAACCTCGCATGTTCTTTTTTCCCACAACCAAACCTGACCGTGTATTGACCGCGAGCACTGTCTGTGAGGAGGAATGGCGCACATTTGTGTTGGACATGTGCTGTGGCACACCCACTGCCATTGAAGTCAATCATATCAATGACCATCAACCAACTATACTTACTGCTGCCCTCATAGACGATCGTGCTGCTAAGGCCCGACTGATCTCCGAGCTTCGGCTGGACAATGAGATTCTCCGAGGACAAGTTGCAATGATGCGTCGGGATTATTCTGAGACACCACGTTTGGCGCTAAGCTGGACTACGTTATTTGCCCTTGTGTTCCTCGGTTTTTCACTCTTCTGGCACTCTGCCAATGGCCTGACAACCACCTCGACAACCCAATCAGTAAACCCTATTGGTATGTTGGAGCTTAATAAGTGGCTTGATGATTTCATCAGAAAAGCAAAACATATTATTCATACGCACCACTACACGGTTGTTGAGACGGTTACAAAGTCACCATCTTGGTTGTTGGCCACCACCATCACGCCACACCTGTGGCAGATTGTCACACTTATGCTGGGAATTGTCACAGTGTACAAGGCAGAGAACCGTGCATTGTCTCTCCTCTTCTTAGCCGCTGCATCACTTAGTGGTGGAGATTGGGTCTTTCTCGCCAGTGCTTCATACCAGACGCAAGTTAGTGCTGTCGTTCAGATCATTTGCGTCCTGATATCCCACCTTGATCCAATAGGCGCAATATGTTTCTCAGCACTTGCCATGTTTGGGACCTTCATGGCCAGTATGTGTGCCAGTAGCACTACCTTTATTCAAAATTCCAGGGCTGTATCACTAAACACAGCAGTCCTTGTAACATCAATTGTACTTAGAACGTTGAAACTACCAGCATTACCTATTGCCCTTGCCTTTGCAGTTGTCCGTGCTTATTCTATTTTAACAACTCCAACTGGCGCGACCGTGGAGATACGCAGTGAGGATGGTAAAGTTATAAACAAGGAGACACTTAAACCAGGGCTAATCTTTCGTTTTAAACAACGCTTAAGGAAATTCGCCCAGCTCCGTTCTGATATGCCACCTCTTGTGCGTGTCAATCCTACCGCAGTTGTGCGTATTGAAACACCAGATGGTATAGGCACCGGATTCTTCTGTGCTAACAATATAGTGACAGCAGGGCACGTTCTTGGTCCACACAAAGTTGTGTCTGTCTGTGTCGGTAGCTCTAAATTTCAGGCCACTCTCGCCCGACATATCGAAGGCAAGGACATTGCTTTATTAAAAATACCATCACAACTCCAAAATTATCCACGCCTTAAAATTGCACCTAAAATAGACACTGCATGGCTCTGCGTCTATTCACCAGACACTGATGGGGCCATCATACAATCTGTTGTCCCTGGGCATCAGGTTGATGACTGCCTTGATTATGCAACACCAACGCGTGATGGGATGTCTGGTGCCCCTGTTGTAAATCCCGATGGACGTGTGATGGCAGTCCATCTCACAAATACTGGCTTTACAGGAGGCGCTCAGGTTCTCACCCAGGCTGATGTTACTGACCCGCCGAGAGTAACACCTACTGAAGAGAAACTCCGGCAGGAAGTAGAAGAGCTTAAGAAAAAATTAGAAAGCTATTCTCAATCTAGTGTCCAAGGTGAAATAGTGGGTCTAGTTCGTGAGGCAATGGCGCGGGAAATGACTATTTTGAGGAAAGAGCTGAACAAGGAACTTAGTAATATGGTCCATGAACATCAGGAGAGCTTCTCCCAAACTAAGAAAGGCAAGAACAAATGTGGTAGGGGTGCTCGCCTCATGCGGCTCGCTGGTGCTAAGAAACGTAAGCAAAAAGGACCCATGTTTACTGAAGAGGAATATAACAGGCTAATTGAACAAGGCTTAACCCCAGAGGAGATTCGTGATATGGTTGATGAACTGTATGAGGAGGAGGTTTCCGGGTTTCCAGAGTGGGATGAAATGAGTGATGGCTACGATCCCAATGATGATTGGGAGTTTGAGTCCGATTCCGACTTCGGGCAAAAAACAGTGAAGATCGCATCATTCAACCAATATCTTGAGAGGCATTATAACCCTAAGGATGTCCGGAACATGTTAGATTCTTTGACTCCAGCTGACATTGATGCTATTGGTCCACTCTACCCGATCACCATCAAATGCTCCAGCCCGGAACTTTGCTCTGCCTTGCTCTGCCTTATTGATCGCTACGCAGCATTGAATGGCCTGTCACCACCCACACATGGGCTTACCTATACCCAGCGTCGTGTTCCAAAAAACCCGAAACGGGCCCAAAACCAGCGGGCCCAGAAATCCACAAATTAGACGCATGGGAATCCCTGCGCCTACCACCGCGCAGGAAGTTGGTACCTGAAGAGTACCCTGTTGTTTGCAACCTCTCAATTAACAGACCCATTTTTGATACCAAGCTAGCAGATGATCCACTCCTTGGCTTGCTACCACCTTGTGATCCTGATTTACCTTTCGCACCTGCTGTGTGGGGTCCAGAAGCGTACACTAAATCCTTCGAAAAGTTCTCGTACGCACAACCGTCAAAATTTTGGGAACTCTATCCTGAGGAATGTGCATTCGCTGATAAACAATGGCGAAAACATTACAACTTCTTGGAAGATTCTCGAGTTATCCACATAACATCAACTGATAAGAATATGGATTCAACTCCAGGGTTTCCTAAATGTGAGGAGTACGAGAGCGAAAGGGACTATCTTGAAGCTAATGGGTGGGGACCTTACATTAGGGAGTTTAAACGCATTGACTCAGGAGAGAAACCCCACGTCCTCTGGTACTGCTTCCTCAAGAAAGAGATACTAAAGAAAGAGAAAATCAAGGAAAATGATATACGTCAAATTATTTGCCCCGACGCAATCTACTCACGTATCGGGGCTGCCCTTGAGCAACATCAAAACAACCTTATGAAAAAACACACCGAGGATAGCAGTGGCCAATGTGGTTGGACACCCTTTTATGGTGGGTTTGAGAGAAAGATGAAAAGGCTCGACCGCAATAAAGTTATTGAATTTGATTGGACGCGCTTTGATGGTACAATCCCTCGTGCCCTCTTCAAGCACATTAAAGATCTTCGTTGGGAGAAGATGAATAAAGTGCACAGAGATAGATACAAGCACGTACATGATTGGTATGTTGAAAATCTCCTAAAACGCTATGTGCTTATGCCATCTGGAGAGGTTACGGTCCAACGCCGTGGTAATCCATCAGGTCAGATCTCAACCACCATGGACAACAATATGGTGAACTATTGGCTTCAAGCCTTTGAGTTCGCTTACCTCAATAAGGGAAAAGATATTGATATTTTGTGGAATGAATATGACACCATTGTCTATGGTGATGACAGATTATCAACAACACCTGTTTTGCCCGAAGATTACGTACCGCGTGTCGTTCAGATGTATAAAGAGGTGTTTGGTATGTGGGTCAAGCCTGAAAAAGTCAAGGTCACAGATACAGTTAAGGGAGCATCATTCTGCGGGTTCACAGTAGGGGGCAATTATCAACCCATTCCGTCCAACCCCTACAAACTCTGGGCAAGCCTTGTGACACCCTGTCAAAAATTACCAGACCAAACAGCCCTCTGTGGGAAACTCCTTAGTTATAAGATCTTGATGCACAACAGTGAAGACCATCCATTTAAAGAATATGTTGAGAAGTGCCTTGCCGCGCTTGAGAATGGGCAAACCATACCGCGACTCACTGATGAGCAGCTGGATCGTCTTTGGAGGGGAGGACCAAAGACAAGCTCTAATGGCTAATCGCCAACAGAAGCGTCAGCCACGGACCACGACTAACATCGTGGTACGCAATGGCACCGCCGCGAATCAGGCGGGCCCTTCCCAGGCAAGACAAGCAAGGAGAAGGAGAAACAGGAGAAAACCGCAGGTCAATATCAGGCTGTTGTCCGGTCAAAGTAAGGCTATCCGCAGGGTTCCTCGCCGCCAAGGTGTCGGTAGTCGTGTGGTTTTCCAGAAGATCAATTCGACCCTCGGGACAGTTGGATCCAATGGCAGTGAACAAATCGAATGTGAGATGACATGCCTAATGAATCCAGCCACTATGAAAGAGGCAACTGGTAGTAATAGCTTTACTCCCCTTGGGATATATGCTTCCACATACTCCCTGTTTAGAATGACTAGGTGTACTGTCACACTTAAACCACTTGTTGGTGACAGTGCAGTGTCAGGGACAGTCATTCGCGTTTCGTGGAACCCAACGTCAACACCCACCCAGACATCGTGGAGCGCATTGGGTGCACGGAAACACATTGACGTCACACCTGGTAAAACAGGCAGGTTCACATTAACCGCTAGGGATCTAGTTGGTCCCAAAGGCGGGTGGTTTAAGACCAACACAAAAGGTGATCCCATGATGTCATTTGCAGGTACCATAGAAATACACACACTTGGGAAGACTATGTCCACATACACAAACACTGAATTCAATGGGGGGCTGTTCCTTGCAGAGCTGGAAACACAATGGCAGTTCAAAGACTATGCACAACAACCTGGCATGTTGAATCTCATCAAAGGTGAGGACAAAAGTCAAGCCAGAGTCGAGGTCGCTGATGGCGGCAAACTCCAGTTGGTCGTTCCAGGAAACTCACGCATGGCCAGGGCATCTGGTAATGCTGCCAGTGAGATCATCTGGTTGGTTACTGACACCATCATACAAGCTGGGACTAGCCTGCTGGGACCTTTTGGTTGGCTAATTCGTGGTGGCTGGTGGTTGGTGAAACGTGCTGCCAATGCACCTGTTCGTCGCGATGGAAGTACAACTTTTGACATCTATGCTTCTATCTCT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The University of Hong Kong, School of Public Health
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China
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DcAstV/Jd74/KSA/2014
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Dromedary astrovirus
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Mamastrovirus
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Astroviridae
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Saudi Arabia
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|
KR868721.1
|
Dromedary astrovirus
|
Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Teng,J.L.L., Tsang,A.K.L., Joseph,S., Xie,J., Jose,S., Fan,R.Y.Y., Wernery,U., Yuen,K.-Y.
|
State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases, The University of Hong Kong, Department of Microbiology
|
Hong Kong
|
2015-07-28
|
DcAstV-169
|
Dromedary astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,363
|
GenBank
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United Arab Emirates
|
United Arab Emirates
|
Camelus dromedarius
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2013-02-11
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|
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State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases, The University of Hong Kong, Department of Microbiology
|
Hong Kong
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2015-07-28
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DcAstV-64
|
Dromedary astrovirus
|
Mamastrovirus
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Astroviridae
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|
United Arab Emirates
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|
KR868723.1
|
Dromedary astrovirus
|
Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Teng,J.L.L., Tsang,A.K.L., Joseph,S., Xie,J., Jose,S., Fan,R.Y.Y., Wernery,U., Yuen,K.-Y.
|
State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases, The University of Hong Kong, Department of Microbiology
|
Hong Kong
|
2015-07-28
|
DcAstV-135
|
Dromedary astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,361
|
GenBank
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United Arab Emirates
|
United Arab Emirates
|
Camelus dromedarius
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2013-02-07
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|
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| 86,586
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KR868724.1
|
Dromedary astrovirus
|
Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Teng,J.L.L., Tsang,A.K.L., Joseph,S., Xie,J., Jose,S., Fan,R.Y.Y., Wernery,U., Yuen,K.-Y.
|
State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases, The University of Hong Kong, Department of Microbiology
|
Hong Kong
|
2015-07-28
|
DcAstV-274
|
Dromedary astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,327
|
GenBank
| null |
United Arab Emirates
|
United Arab Emirates
|
Camelus dromedarius
| null |
2013-04-04
| null | null |
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| 86,587
|
MN514962.1
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Dromedary camel coronavirus HKU23
|
So,R.T.Y., Chu,D.K.W., Miguel,E., Perera,R.A.P.M., Oladipo,J.O., Fassi-Fihri,O., Aylet,G., Ko,R.L.W., Zhou,Z., Cheng,M.S., Kuranga,S.A., Roger,F.L., Chevalier,V., Webby,R.J., Woo,P.C.Y., Poon,L.L.M., Peiris,M., Cheng,M.-S.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
Hong Kong
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2019-10-07
|
DcCoV-HKU23/camel/Ethiopia/CAC1019/2015
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Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 31,021
|
GenBank
| 1
|
Ethiopia
|
Ethiopia
|
Camelus dromedarius
| null |
2015-02-21
| null | null |
Dromedary camel coronavirus HKU23 isolate DcCoV-HKU23/camel/Ethiopia/CAC1019/2015, complete genome
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CAATCCGTTTTTAAGCCTCAACCTGCAGGTGTTTTTACTGATCATGATGTTGTTTATGCACAACATTGTTTTAAAGCCCCCACTACTTTTTGCCCATGTAAATTGAATGGCTCTCTTTGTGTTGGTAGTGGTCCTGGTATAGATTTTGGTTATAAATATAGTGGTATAGGTACTTGCCCTGCAGGTACTTATTATTTAACATGCTACAATTATAATCAATGTACTTGTTTATGTGCGCCTGATCCTATTACATCCACAGCCACAGGTTCTTATAATGGTGTTAAATGCCCCCAAACTAGATATTTGTTAGGTGTAGGAGAGCATTGTTCTGGTCTTGCTATTAATAGTGATCATTGTGGAGGCAATCTCTGCACTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGTTGGTCTGTGGATTCTTGTTTACAAGGAGACAGGTGTAATATTTTTTCTAACTTAATTTTGCATGGTGTCAATAGTGGTACTACTTGTTCTAATGATTTGCAAAAATCTAACACAGATATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGCATTTCTGGCCAAGGTGTTTTTGTTGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTTTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTTAGGGATTATTTAACAAATAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGTTATAGTGGTCGTGTGTCTGCGGCTTTTTATGCCAATTCTTCCGAACCAGCATTGCTATTTCGGAATGTTAAATGCAACTACGTTTTTAATAATACTCTTGCACGACATGTTCAACCCGTTAACTACTTTGATAGTTATCTTGGTTGTGTCGTTAATGCGGATAATAGTACCGCTATTGCTGTTCAAACATGTGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTACTGTGTGGATTACTCTAAAGAAAGACGAAGTCGGAGAGCGATTACCACTGGTTATCGCTTTACTAACTTTGAGCCATTTACCGTTAATGCAGTAAATGACAGTTTAGAACCTGTAGGTGGTTTGTATGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACAAGCTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTGCTGCTTTTGTTTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATTACAGTTGGTTGAATATGGTAGTTTTTGTGATAACATAAATGCCATACTCACAGAAGTAAATGAGTTACTTGACACCACACAGTTGCAAGTTGCTAATAGTTTAATGAATGGCGTCACTCTTAGCACTAAGCTAAAAGATGGCGTTAATTTCAATGTAGATGACATCAACTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTTTAGGAAGTGATTGTAATAAAGCTTCCACCAGATCTGCTATAGAGGATTTGCTTTTTGATAAAGTGAAGTTGTCTGATGTCGGTTATGTTGAGGCTTATAATAATTGCACTGGAGGTGCCGAAATTAGGGACCTCATTTGCGTTCAAAGTTATAATGGCATCAAAGTGCTACCTCCACTATTATCTGAAAATCAGATTAGTGGTTACACTTTGGCTGCCACCTCCGCTAGCTTGTTTCCACCATGGACAGCAGCGGCAGGTGTTCCATTTTATTTAAATGTTCAGTATCGTATTAATGGGCTCGGCGTCACTATGGATGTACTAAGCCAAAACCAAAAGCTTATTGCCAATGCATTTAACAACGCTTTGACAGCTATTCAGAATGGGTTTGATGCAACCAATTCTGCTTTAGTTAAAATTCAGGCTGTTGTTAATGCAAATGCTGACGCTCTTAATAATTTATTGCAACAACTATCTAATAGATTTGGTGCCATAAGTGCTTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGGCTCGATGCTCTTGAAGCAGAAGCCCAGATAGATAGACTTATTAATGGTCGTCTTACTGCTCTTAATGCTTATGTCTCTCAACAGCTTAGTGATTCTACACTTGTAAAATTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAAGTTAATGAGTGTGTTAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTCTGCGGTAGTGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCTTATGGTTTGTATTTTATTCATTTTAACTATGTCCCCACTAAGTATGTCACAGCAAAGGTTAGTCCCGGTCTGTGCATTGCTGGTGATAGAGGTTTAGCTCCTAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAATATTTGGATGTTCACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCTATAACTGAAAATAATGTCGTTGTTATGAGTACCTGCGCTGTTAATTATACAAAAGCGCCGGATGTAATGCTGAACACCTCAATACCCAACCTTCCTGATTTTAAGGAGGAATTGGATCAATGGTTTAAAAATCAAACATCGGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATTAATGTCACATTCTTGGACCTACAAGTAGAAATGAATAGGTTGCAGGAGGCAATAAAAGTTTTAAATCAGAGCTACATCAATCTCAAGGACATTGGTACATATGAGTATTATGTAAAGTGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATTGGCTTTGCTGGTGTAGCCATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGTTTTAAGAAATGTGCTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACACCAGGAGTTAGTAATTAAAACATCACATGATGATTAAGTCCGACTTTGATTTTGGCTCCTGACGATATATTACATCCCTTCAATCATGTGAAGTTAATTATAAAACCATTGAGGTTGAGCATATTATAATAGCTACCACAATGCCTGCTGTTTAGTTGGTACTGTGTCTTATATAACTAGTAAACCTGTAATGCCAATGGCTAACCATTGTTGTTACATATTATACTAACATTATGTCTAGTACTGTTTTATAATATTTTATTTAGGCGGTTTTATAGGTATTGATACTAGCACCACTTGTTTTACCTGCTTTTACGGTACTAGTTCCAAACCATATTATAATTTAGGTAGACCTTATAACTTTAAGCATTAATTGCCAAAGTTCCTAAGGCCACGCCTTAGTAATGGACATCTGGAGACCTGAGATTAAATATCTCCGTTATACTAATGGTTTTAATGTCTCAGAATTAGAAGATGTTTGTTTTAAATTTAACTATAAATTTCCTAAAGTAGGATATTGTAGAGTTCCTAGTTATGCTTGGTGCCGTAATCAAGGTAGCTTTTGTGCTACACTTACTCTTTATGGCAAATCCAAACATTATGATAAATATTTCGGAGTAATAACTGGTTTTACAGCATTCGCTAATACTGTAGAGGAGGCTGTTAACAAACTGGTTTTCTTAGCTATTGACTTTATTACCTGGCGTAGACAGGAGTTAAATGTTTATGGCTGATGCTTATTTTGCAGACACTGTGTGGTATGTGGGGCAAATAATTTTTATAGTTGCCATTTGTTTATTTGTTATAATAGTTGTAGTGGCATTTTTGGCAACTTTTAAATTGTGTATTCAACTTTGCGGTATGTGTAATACCTTAGTACTGTCCCCTTCTATTTATGTGTTTAATAGAGGTAGGCAGTTTTATGAGTTTTACAACGATGTAAAACCATTAGTTCTTGATGTGGATGACGTTTAGTTAATCCAAACATTATGAGTAGTATAACTACACCAGCACCAGTTTATACCTGGACTGCTGATGAGGCTATTAAATTCCTAAAGGAATGGAATTTTTCTTTGGGTATTATACTACTTTTTATTACAATCATATTGCAATTTGGATATACAAGTCGCAGTATGTTTGTTTATGTTATTAAGATGATCATTTTGTGGCTTATGTGGCCTCTTACTATAATCTTAACTATTTTCAATTGCGTGTATGCGTTGAATAATGTGTATCTTGGCTTCTCTATAGTTTTTACTATAGTGGCCATTATTATGTGGATTGTGTATTTTGTGAATAGTATCAGGTTGTTTATTAGAACTGGAAGTTGGTGGAGTTTCAACCCAGAAACAAACAACTTGATGTGTATAGATATGAAGGGAAGGATGTATGTTAGGCCGATAATTGAGGACTACCATACCCTTACGGTTACAATAATACGTGGTCATCTTTATATGCAAGGTATAAAACTAGGTACTGGCTATTCTTTGTCAGATTTGCCAGCTTATGTGACTGTTGCTAAGGTTTCACACCTGCTCACGTATAAGCGTGGTTTTCTTGACAAGATAGGCGATACTAGTGGTTTTGCTGTTTATGTTAAGTCCAAAGTCGGTAATTACCGACTGCCATCAACCCAAAAGGGTTCTGGCATGGACACCGCATTGTTGAGAAATAATATCTAAACTTTAAGGATGTCTTTTACTCCTGGTAAGCAATCCAGTAGTAGAGCGTCCTCTGGAAATCGTTCTGGTAATGGCATCCTTAAGTGGGCCGATCAGTCCGATCAATCTAGAAACGTTCAAACCAGGGGTAGAAGAGCTCAACCCAAGCAAACTGTTACTTCTCAGCAACCATCAGGAGGGAATGTTGTACCCTACTATTCTTGGTTCTCTGGAATTACTCAGTTTCAAAAGGGAAAGGAGTTTGAATTTGCAGAAGGACAAGGTGTGCCTATTGCACCAGGAGTCCCAGCTACTGAAGCTAAGGGGTACTGGTACAGACACAACAGACGTTCTTTTAAAACAGCCGATGGCAATCAGCGTCAATTGCTGCCACGATGGTATTTTTACTATCTTGGAACAGGACCGCATGCCAAAGACCAGTATGGCACCGACATTGACGGAGTCTTCTGGGTCGCTAGTAACCAGGCTGATGTCAATACCCCGGCTGACATTCTCGATCGGGACCCAAGTAGCGATGAGGCTATTCCGACTAGGTTTCCGCCTGGCACGGTACTCCCTCAGGGTTACTATATTGAAGGCTCAGGAAGGTCTGCTCCTAATTCCAGATCTACTTCACGCGCATCCAGTAGAGCCTCTAGTGCAGGATCGCGTAGCAGAGCCAATTCTGGCAATAGAACCCCTACCTCTGGTGTAACACCTGATATGGCTGATCAAATTGCTAGTCTTGTTCTGGCAAAACTTGGCAAGGATGCCACTAAGCCACAGCAAGTAACTAAGCAGACTGCCAAAGAAATCAGACAGAAAATTTTGAACAAGCCCCGCCAGAAGAGGAGCCCCAATAAACAATGCACTGTTCAGCAGTGTTTTGGGAAGAGAGGCCCCAATCAGAATTTTGGTGGTGGAGAAATGTTAAAACTTGGAACTAGTGACCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAGATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTGTCTGGGAACCTTGATGAGCCCCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTACAATGGTGCAATTAGATTTGACAGTACACTTTCAGGTTTTGAGACCATAATGAAGGTGTTGAATGAGAATTTGAATGCATACCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAACGTGGTCAGAAGAACGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGCGCCCAAAAGCCGTGTGCAGCAAAATAAGATTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTTTACTGAAGATACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCACCTGGTGGTAACCCCTCGCAGGAAAGTCGGGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGGTAGAGAAGGTTATAGCAGACTATAGATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTGGTAATGTATAGTGTTGGAGTAAGCGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGCGCCCAAGGGGAAGAGCCAGCATGTTAAGTTACCACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAATTGGAAGAATC
| 59,209
|
MN514963.1
|
Dromedary camel coronavirus HKU23
|
So,R.T.Y., Chu,D.K.W., Miguel,E., Perera,R.A.P.M., Oladipo,J.O., Fassi-Fihri,O., Aylet,G., Ko,R.L.W., Zhou,Z., Cheng,M.S., Kuranga,S.A., Roger,F.L., Chevalier,V., Webby,R.J., Woo,P.C.Y., Poon,L.L.M., Peiris,M., Cheng,M.-S.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
Hong Kong
|
2019-10-07
|
DcCoV-HKU23/camel/Morocco/CAC2586/2016
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Betacoronavirus 1
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 31,062
|
GenBank
| 1
|
Morocco
|
Morocco
|
Camelus dromedarius
| null |
2016-03-05
| null | null |
Dromedary camel coronavirus HKU23 isolate DcCoV-HKU23/camel/Morocco/CAC2586/2016, complete genome
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TATTGAAGGCTCAGGAAGGTCTGCTTCTAATTCCAGATCTACTTCACGTGCATCCAGTAGAGCCTCTAGTGCAGGATCGCGTAGTAGAGCCAATTCTGGTAACAGAAACCCTACCTCTGGTGTAACACCTGATATGGCTGATCAAATTGCTAGTCTTGTTTTGGCCAAACTTGGCAAGGATGCCACTAAGCCACAGCAAGTAACTAAGCAGACTGCCAAAGAAATCAGACAGAAAATTTTGAATAAGCCCCGCCAGAAGAGGAGCCCCAATAAACAATGCACTGTTCAGCAGTGTTTTGGGAAGAGAGGCCCCAATCAGAATTTTGGTGGTGGAGAAATGTTAAAACTTGGAACTAGTGATCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAGATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTGTCTGGGAATCTTGACGAGCCCCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAATGGTGCAATTAGATTTGACAGTACACTTTCAGGTTTTGAGACCATAATGAAGGTGTTGAATGAGAATTTGAATGCATATCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGCCAGCGTGGTCACAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGCGCCCAAAAGCCGTGTGCAGCAAAATAAGAGTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCTTATACTGAAGATACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCACCTGGTGGTAATTCCTCGCAGGAAAGTCGGGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATAGATTAATTAGTTGAAAGTTCTGTGTGGTAATGTATATTGTTGGAGAAAGTGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGTGCCCAAGGGGAAGAGCCAGCATGTTAAGTTGCCACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCA
| 59,210
|
MN514964.1
|
Dromedary camel coronavirus HKU23
|
So,R.T.Y., Chu,D.K.W., Miguel,E., Perera,R.A.P.M., Oladipo,J.O., Fassi-Fihri,O., Aylet,G., Ko,R.L.W., Zhou,Z., Cheng,M.S., Kuranga,S.A., Roger,F.L., Chevalier,V., Webby,R.J., Woo,P.C.Y., Poon,L.L.M., Peiris,M., Cheng,M.-S.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
Hong Kong
|
2019-10-07
|
DcCoV-HKU23/camel/Nigeria/NV1010/2015
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Betacoronavirus 1
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,780
|
GenBank
| 1
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Nigeria
|
Nigeria
|
Camelus dromedarius
| null |
2015-11-20
| null | null |
Dromedary camel coronavirus HKU23 isolate DcCoV-HKU23/camel/Nigeria/NV1010/2015, complete genome
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TGTTCAGCAGTGTTTTGGGAAGAGAGGCCCCAATCAGAATTTTGGTGGTGGAGAAATGTTAAAACTTGGAACTAGTGATCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGCTCAAGATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTGTCTGGGAATCTTGACGAGCCCCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAATGGTGCAATTAGATTTGACAGTACACTTTCAGGTTTTGAGACCATAATGAAGGTGTTGAATGAGAATTTGAATGCATACCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGCCAGAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGCGCCCAAAAGTCGTGTGCAGCAAAATAAGAGTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTATACTGAAGACACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCACCTGGTGGTTTCCCTCTCAGGAAAGTCGGGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATAGATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTGGTAATGTATAGTGTTGGAGAAAGTGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGTGCCCCAGGGAGGAGCCAGCATGTTAAGTTATCACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAAT
| 59,211
|
MN514965.1
|
Dromedary camel coronavirus HKU23
|
So,R.T.Y., Chu,D.K.W., Miguel,E., Perera,R.A.P.M., Oladipo,J.O., Fassi-Fihri,O., Aylet,G., Ko,R.L.W., Zhou,Z., Cheng,M.S., Kuranga,S.A., Roger,F.L., Chevalier,V., Webby,R.J., Woo,P.C.Y., Poon,L.L.M., Peiris,M., Cheng,M.-S.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
Hong Kong
|
2019-10-07
|
DcCoV-HKU23/camel/Nigeria/NV1092/2015
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Betacoronavirus 1
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,799
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Camelus dromedarius
| null |
2015-11-23
| null | null |
Dromedary camel coronavirus HKU23 isolate DcCoV-HKU23/camel/Nigeria/NV1092/2015, complete genome
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| 59,212
|
MN514966.1
|
Dromedary camel coronavirus HKU23
|
So,R.T.Y., Chu,D.K.W., Miguel,E., Perera,R.A.P.M., Oladipo,J.O., Fassi-Fihri,O., Aylet,G., Ko,R.L.W., Zhou,Z., Cheng,M.S., Kuranga,S.A., Roger,F.L., Chevalier,V., Webby,R.J., Woo,P.C.Y., Poon,L.L.M., Peiris,M., Cheng,M.-S.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
Hong Kong
|
2019-10-07
|
DcCoV-HKU23/camel/Nigeria/NV1097/2015
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Betacoronavirus 1
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 31,075
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Camelus dromedarius
| null |
2015-11-12
| null | null |
Dromedary camel coronavirus HKU23 isolate DcCoV-HKU23/camel/Nigeria/NV1097/2015, complete genome
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TATTGAAGGCTCAGGAAGGTCTGCTCCTAATTCCAGATCTACTTCACGTGCATCCAGTAGAGCCTCTAGTGCAGGATCGCGTAGTAGAGCCAATTCTGGTAACAGAAACCCTACCTCTGGTGTAACACCTGATATGGCTGATCAAATTGCTAGTCTTGTTTTGGCCAAACTTGGCAAGGATGCCACTAAGCCACAGCAAGTAACTAAGCAGACTGCCAAAGAAATCAGACAGAAAATTTTGAATAAGCCCCGCCAGAAGAGGAGCCCCAATAAACAATGCACTGTTCAGCAGTGTTTTGGGAAGAGAGGCCCCAATCAGAATTTTGGTGGTGGAGAAATGTTAAAACTTGGAACTAGTGATCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAGATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTGTCTGGGAATCTTGACGAGCCCCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAATGGTGCAATTAGATTTGACAGTACACTTTCAGGTTTTGAGACCATAATGAAGGTGTTGAATGAGAATTTGAATGCATATCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGTCAGAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGCGCCCAAAAGCCGTGTGCAGCAAAATAAGAGTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCTTATACTGAAGATACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCACCTGGTGGTAATTCCTCGCAGGAAAGTCGGGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATAGATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTGGTAATGTATATTGTTGGAGAAAGTGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGTGCCCAAGGGGAAGAGCCAGCATGTTAAGTTGCCACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAATTGGAAGAATCA
| 59,213
|
MN514967.1
|
Dromedary camel coronavirus HKU23
|
So,R.T.Y., Chu,D.K.W., Miguel,E., Perera,R.A.P.M., Oladipo,J.O., Fassi-Fihri,O., Aylet,G., Ko,R.L.W., Zhou,Z., Cheng,M.S., Kuranga,S.A., Roger,F.L., Chevalier,V., Webby,R.J., Woo,P.C.Y., Poon,L.L.M., Peiris,M., Cheng,M.-S.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
Hong Kong
|
2019-10-07
|
DcCoV-HKU23/camel/Nigeria/NV1385/2016
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Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,799
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Camelus dromedarius
| null |
2016-01-24
| null | null |
Dromedary camel coronavirus HKU23 isolate DcCoV-HKU23/camel/Nigeria/NV1385/2016, complete genome
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ATAAACAATGCACTGTTCAGCAGTGTTTTGGGAAGAGAGGCCCCAATCAGAATTTTGGTGGTGGAGAAATGTTAAAACTTGGAACTAGTGATCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGCTCAAGATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTGTCTGGGAATCTTGACGAGCCCCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAATGGTGCAATTAGATTTGACAGTACACTTTCAGGTTTTGAGACCATAATGAAGGTGTTGAATGAGAATTTGAATGCATACCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGCCAGAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGCGCCCAAAAGTCGTGTGCAGCAAAATAAGAGTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTATACTGAAGACACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCACCTGGTGGTTTCCCTCTCAGGAAAGTCGGGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATAGATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTGGTAATGTATAGTGTTGGAGAAAGTGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGTGCCCCAGGGAGGAGCCAGCATGTTAAGTTATCACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAATTGGAAG
| 59,214
|
KF906249.1
|
Dromedary camel coronavirus HKU23
|
Woo,P.C., Lau,S.K., Wernery,U., Wong,E.Y., Tsang,A.K., Johnson,B., Yip,C.C., Lau,C.C., Sivakumar,S., Cai,J.P., Fan,R.Y., Chan,K.H., Mareena,R., Yuen,K.Y., Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Wong,E.Y.M., Tsang,A.K.L., Yip,C.C.Y., Lau,C.C.Y., Cai,J.-P., Fan,R.Y.Y., Chan,K.-H., Yuen,K.-Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
Hong Kong
|
2014-04-02
| null |
Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 31,052
|
GenBank
| 1
|
United Arab Emirates: Dubai
|
United Arab Emirates
|
Camelus bactrianus
| null |
2013-04-03
| null | null |
Dromedary camel coronavirus HKU23 strain HKU23-265F, complete genome
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ACTTCACGCGCATCCAGTAGAGCCTCTAGTGCAGGATCGCGTAGTAGAGCCAATTCTGGTAACAGAACCCCTACCTCTGGTGTAACACCTGATATGGCTGATCAAATTGCTAGTCTTGTTCTGGCTAAACTCGGCAAGGATGCTACTAAGCCACAGCAAGTAACTAAGCAGACCGCCAAAGAAATTAGACAGAAAATTTTGAATAAACCCCGCCAGAAGAGGAGCCCCAATAAACAATGCACTGTCCAACAGTGCTTTGGGAAGAGAGGCCCCAATCAGAATTTTGGTGGTGGAGAAATGTTAAAACTTGGAACTAGTGATCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAGATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTGTCTGGGAACCTTGATGAGCCCCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAATGGTGCAATTAGATTTGACAGTACACTTTCAGGTTTTGAGACCATAATGAAGGTGTTGAATGACAATTTGAATGCATACCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGTCAGAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGCGCCCAAAAGTCGTGTGCAGCAAAATAAGAGTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTTTACTGAAAACACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCACCTGGTGGTAACCCCTCGCAGTAAAGTCGGGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATAGATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTAGTAATGTATAGTGTTGGAGAAACTGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGTGCCCAAGGGGAAGAGCCAACATGTTAAGTTACCACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAATTGGAAGAATCACAAAAAAAAAAAAAAAA
| 91,218
|
KF906250.1
|
Dromedary camel coronavirus HKU23
|
Woo,P.C., Lau,S.K., Wernery,U., Wong,E.Y., Tsang,A.K., Johnson,B., Yip,C.C., Lau,C.C., Sivakumar,S., Cai,J.P., Fan,R.Y., Chan,K.H., Mareena,R., Yuen,K.Y., Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Wong,E.Y.M., Tsang,A.K.L., Yip,C.C.Y., Lau,C.C.Y., Cai,J.-P., Fan,R.Y.Y., Chan,K.-H., Yuen,K.-Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
Hong Kong
|
2014-04-02
| null |
Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 31,052
|
GenBank
| 1
|
United Arab Emirates: Dubai
|
United Arab Emirates
|
Camelus bactrianus
| null |
2013-05-15
| null | null |
Dromedary camel coronavirus HKU23 strain HKU23-362F, complete genome
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GGTTTTACAGAGCAAGCTGTTTTTAAGCCTCAACCTGCAGGTGTTTTTACTAATCATGATGTTGTCTATGCACAACATTGTTTTAAAGCCCCTACCACTTTTTGTCCATGTAAATTGAATGGCTCTCTTTGTGTTGGTAGTGGTCCTGGTATAGATGCTGGTTATAAATATAGTGGTATAGGTACTTGCCCTGCAGGTACTTATTATTTAACATGCTACAATTATAATCAATGTACTTGTTTATGTGCACCTGATCCCATCACATCCACAGTCGCAGGTTCTTATAATGGTGTTAAATGCCCCCAAACTAGATATTTGGTTGGTGTAGGAGAGCATTGTTCTGGTCTTGCTATTAATAGTGATCATTGTGGAGGCAATCTTTGTACTTGCCAACCACAAGCATTTTTGGGTTGGTCTGTGGATTCTTGTTTACAAGGGGACAGGTGTAATATTTTTTCTAATTTAATTTTGCATGGTGTTAATAGTGGTACTACTTGTTCTACCGATTTACAAAAAGCTAACACAGACATAATTCTTGGTGTTTGTGTTAATTATGATCTTTATGGTATTTCTGGCCAAGGCATTTTTGTCGAGGTTAATGCGACTTATTATAATAGTTGGCAGAACCTCTTATATGATTCTAATGGTAATCTCTATGGTTTCAGGGATTATTTAACAAATAGAACTTTTATGATTCGTAGTTGTTATAGTGGTCGTGTATCTGCGGCCTTTCATGCTAATTCCTCTGAACCAGCATTGTTATTCAGGAATGTTAAATGCAACTACGTTTTTAATAATACCCTTGCACGACAGGTGCAATCTATTAATTATTTTGATAGTTACCTTGGTTGTGTTGTTAATGCTGACAATAGTACTTCTATTGCTGTCCAAACATGTGATCTCACAGTAGGTAGTGGTTATTGTTTGGATTATTCTATAGATAGACGAAGCCGTAGAGCGATTACCACTGGTTATCGGTTTACTAATTTTGAGCCATTTACTGTTAAGGCAGTAAATGACAGTTTAGAACCTGTAGGTGGTTTGTATGAAATTCAAATACCTTCAGAGTTTACTATAGGTAATATGGAGGAGTTTATTCAAACTAGTTCTCCTAAAGTTACTATTGATTGTGCTGCTTTTGTTTGTGGTGATTATGCAGCATGTAAATCTCAGTTGGTTGAATATGGTAGTTTTTGTGATAACATAAATGCCATACTCACAGAAGTAAATGAGTTATTTGACACTACACAGCTGCAAGTTGCTAATAGTTTAATGAATGGCGCCACTCTTAGCACTAAGCTAAAAGATGGCGTTAATTTCAATGTAGATGACATCAACTTTTCCCCTGTATTAGGTTGTTTAGGAAGTGATTGTAATAAAGCTTCCACTAGATCTGCTATAGAGGATTTGCTTTTTGATAAAGTGAAATTGTCTGATGTCGGTTTTGTTGAGGCTTATAATAATTGCACTGGAGGTGCTGAAATTAGGGACCTCCTTTGTGTTCAAAGTTATAATGGCATCAAAGTGTTACCTCCACTATTATCTGAAAATCAGATTAGTGGTTACACTTTGGCTGCCACCTCCGCTAGCTTGTTTCCACCGTGGACAGCAGCGGCAGGTGTCCCATTTTATTTAAATGTTCAGTATCGTATTAATGGGCTTGGTGTCACTATGGATGTTCTAAGCCAAAACCAAAAGCTTATTGCTAATGCATTTAACAACGCTTTGACAGCCATTCAGAATGGGTTTGATGCAACCAATTCTGCTTTAGTTAAAATCCAGTCTGTTGTTAATGCAAATGCTGAAGCTCTTAATAAGTTATTGCAACAACTATCTAATAGATTTGGTGCCATAAGTGCCTCTTTACAAGAAATTCTATCTAGGCTCGATGCTCTTGAAGCAGAAGCCCAGATAGATAGACTTATTAATGGTCGTCTTACTGCTCTTAATGCTTATGTTTCTCAACAGCTTAGTGATTCTACACTAGTAAAATTTAGTGCAGCACAAGCTATGGAGAAGGTTAATGAGTGTGTTAAAAGCCAATCATCTAGGATAAATTTCTGCGGTAACGGTAATCATATTATATCATTAGTGCAGAATGCTCCTTATGGTTTGTATTTTATCCACTTTAACTATGTCCCCACCAAGTATGTCACAGCAAAGGTTAGTCCCGGTCTGTGCATTGCTGGTGATAGAGGTATAGCTCCTAAGAGTGGTTATTTTGTTAATGTAAATAATACTTGGATGTTCACTGGTAGTGGTTATTACTACCCTGAACCTATAACTGAAAATAATGTTGTTGTTATGAGTACCTGCGCTGTTAATTATACAAAAGCGCCGGATGTAATGCTGAACACTTCAATACCCAACCTTCCTGATTTTAAGGAGGAATTGGATCAATGGTTTAAAAACCAAACATCAGTGGCACCAGATTTGTCACTTGATTATATAAATGTTACATTCTTGGACCTACAAGATGAAATGAATAGGTTACAGGAGGCAATAAAAGTTTTAAATCACAGCTACATCAATCTCAAGGATATTGGTACATATGAGTATTATGTAAAATGGCCTTGGTATGTATGGCTTTTAATTGGCTTTGCTGGTGTAGCTATGCTTGTTTTACTATTCTTCATATGCTGTTGTACAGGATGTGGGACTAGTTGCTTTAAGAAATGTGGTGGTTGTTGTGATGATTATACTGGACACCCAGAGTTAGTAATTAAAACATCACATGACGACTAAGGTCGTCTTTGATTTTGGCTCCTGACGATATATTACATCCCTTCAATCATCTGAAGTTAATTATAAGACCATTAAGGTCGAGCACATTATAATAGCTACCACAATGCCTGCTGTCTTAGTGGGTATTGTGTCTTATATAACTAGTAAATCTGTAATGCCAATGGCTAACCATTGATGGTACAGATTATACTAATATTATGCCTAGTAATGTTTTACATTATTTTATTTAGGACTTTCTATAGGTATTGATACTAGCACCACTGGTTTTACCTGCTTTTACGGTACTAGTTTCAAACCATATTATAATTTAGGTGAACCTTATAACTTTAAGCATTAATTGCCAAAGTTCCTAAGGCCACGCCCTAGTAATGGACATCTGGACACCTGAGATTAAATATCTCCGTTATACTAACGGTTTTAATGTCTCAGAATTAGAAGATGTTTGTTTTAAATTTAACTATAAATTTCCTAAAGTAGGATATTGTAGAGTTCCTAGTCATGCTTGGTGCCGTAATCAAGGTAGCTTTTGTGCTACACTTACTCTTTATGGCAAATCCAAACATTATGATAAATATTTTGGAGTAATAACTGGTTTTACAGCATTCGCTAATACTGTAGAGGAGGCTGTCAACAAACTGGTTTTCTTAGCTGTTGACTTTATTACCTGGCGGAGACAGGAGTTAAATGTTTATGGCTGATGCTTATTTTGCAGACACTGTGTGGTATGTGGGGCAAATAATTTTTATAGTTGCCATTTGTTTATTGGTTATAATAGTTGTAGTGGCATTTTTGGCAACTTTTAAATTGTGTATTCAACTTTGCGGTATTTGTAATACCTTAGTACTGTCCCCTTCTATTTATGTGTTTAATAGAGGTAGGCAGTTTTATGAGTTTTACAACGATGTAAAACCACCAGTTCTTGATGTGGATGACGTTTAGTTAATCCAAACATTATGAGTAGTGTAACTACACCAGCACCAGTTTACACCTGGACTGCTGATGAAGCTATTAAATTCCTAAAGGAATGGAATTTTTCTTTGGGTATTATACTACTTTTTATTACAATCATATTGCAATTTGGATATACAAGTCGCAGTATGTTTGTTTATGTTATTAAGATGATTATTTTGTGGCTTATGTGGCCCCTTACTATCATCTTAACTATTTTCAATTGCGTGTATGCGTTGAATAATGTGTATCTTGGCTTTTCTATAGTTTTTACTATAGTGGCCATTATCATGTGGATTGTGTATTTTGTGAATAGTATCAGGTTGTTTATTAGAACTGGAAGTTGGTGGAGTTTCAACCCAGAAACAAACAACTTGATGTGTATAGATATGAAGGGAAGGATGTATGTTAGGCCTATAATTGAGGACTACCACACCCTTACGGTCACAATAATACGTGGTCATCTTTACATGCAAGGTATAAAACTAGGTACTGGCTATTCTTTGTCTGATTTGCCAGCTTATGTGACTGTTGCTAAGGTTTCACACCTGCTCACGTATAAGCGTGGTTTTCTTGACAAGATAGGCGATACTAGTGGTTTTGCTGTTTATGTTAAGTCCAAAGTCGGTAATTACCGACTGCCATCAACCCAAAAGGGTTCTGGCATGGACACCGCATTGTTGAGAAATAATATCTAAACTTTAAGGATGTCTTTTACTCCTGGTAAGCAATCCAGTAGTAGAGCGTCCTCTGGAAATCGTTCTGGTAATGGCATCCTTAAGTGGGCCGATCAGTCCGACCAATCTAGAAATGTTCAAACCAGGGGTAGAAGAGCTCAACCCAAGCAAACTGTTACTTCTCAGCAACCATCAGGAGGGAATGTTGTACCCTACTATTCTTGGTTCTCTGGAATTACTCAGTTTCAAAAGGGAAAAGAGTTTGAATTTGCAGAGGGACAAGGTGTGCCTATTGCACCAGGAGTCCCAGCTACTGAAGCTAAGGGGTACTGGTACAGACACAACAGACGTTCTTTTAAAACAGCCGATGGCAACCAGCGTCAATTGCTGCCACGATGGTATTTTTACTATCTTGGAACAGGACCTCATGCCAAAGATCAGTATGGCACCGATATCGACGGAGTCTTCTGGGTCGCTAGTAACCAGGCTGATGTCAATACCCCGGCTGACATTCTCGATCGGGACCCAAGTAGCGATGAGGCTATTCCGACTAGGTTTCCGCCTGGCACGGTACTCCCTCAGGGTTACTATATTGAAGGCTCAGGAAGGTCTGCTCCTAATTCCAGATCTACTTCACGCGCATCCAGTAGAGCCTCTAGTGCAGGATCGCGTAGTAGAGCCAATTCTGGTAACAGAACCCCTACCTCTGGTGTAACACCTGATATGGCTGATCAAATTGCTAGTCTTGTTCTGGCTAAACTCGGCAAGGATGCTACTAAGCCACAGCAAGTAACTAAGCAGACCGCCAAAGAAATTAGACAGAAAATTTTGAATAAACCCCGCCAGAAGAGGAGCCCCAATAAACAATGCACTGTCCAACAGTGCTTTGGGAAGAGAGGCCCCAATCAGAATTTTGGTGGTGGAGAAATGTTAAAACTTGGAACTAGTGATCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAGATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTGTCTGGGAACCTTGATGAGCCCCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAATGGTGCAATTAGATTTGACAGTACACTTTCAGGTTTTGAGACCATAATGAAGGTGTTGAATGACAATTTGAATGCATACCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGTCAGAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGCGCCCAAAAGTCGTGTGCAGCAAAATAAGAGTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTTTACTGAAAACACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCACCTGGTGGTAACCCCTCGCAGTAAAGTCGGGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATAGATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTAGTAATGTATAGTGTTGGAGAAATTGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGTGCCCAAGGGGAAGAGCCAACATGTTAAGTTACCACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAATTGGAAGAATCACAAAAAAAAAAAAAAAA
| 91,219
|
KF906251.1
|
Dromedary camel coronavirus HKU23
|
Woo,P.C., Lau,S.K., Wernery,U., Wong,E.Y., Tsang,A.K., Johnson,B., Yip,C.C., Lau,C.C., Sivakumar,S., Cai,J.P., Fan,R.Y., Chan,K.H., Mareena,R., Yuen,K.Y., Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Wong,E.Y.M., Tsang,A.K.L., Yip,C.C.Y., Lau,C.C.Y., Cai,J.-P., Fan,R.Y.Y., Chan,K.-H., Yuen,K.-Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
Hong Kong
|
2014-04-02
| null |
Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 31,052
|
GenBank
| 1
|
United Arab Emirates: Dubai
|
United Arab Emirates
|
Camelus bactrianus
| null |
2013-05-21
| null | null |
Dromedary camel coronavirus HKU23 strain HKU23-368F, complete genome
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