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MN160340.1
European wheat striate mosaic virus
Somera,M., Kvarnheden,A., Desbiez,C., Blystad,D.R., Soovali,P., Kundu,J.K., Gantsovski,M., Nygren,J., Lecoq,H., Verdin,E., Spetz,C., Tamisier,L., Truve,E., Massart,S.
Tallinn University of Technology, Chemistry and Biotechnology
Estonia
2019-11-02
Avinurme4a
Tenuivirus eurotritici
Tenuivirus
Phenuiviridae
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Estonia
Estonia
Triticum aestivum
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2013-07-02
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European wheat striate mosaic virus isolate Avinurme4a segment RNA1, complete sequence
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58,441
MN160341.1
European wheat striate mosaic virus
Somera,M., Kvarnheden,A., Desbiez,C., Blystad,D.R., Soovali,P., Kundu,J.K., Gantsovski,M., Nygren,J., Lecoq,H., Verdin,E., Spetz,C., Tamisier,L., Truve,E., Massart,S.
Tallinn University of Technology, Chemistry and Biotechnology
Estonia
2019-11-02
Hedesunda-PH
Tenuivirus eurotritici
Tenuivirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
9,495
GenBank
1
Sweden
Sweden
Javesella pellucida
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2016-09-06
null
null
European wheat striate mosaic virus isolate Hedesunda-PH segment RNA1, complete sequence
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58,442
MN160342.1
European wheat striate mosaic virus
Somera,M., Kvarnheden,A., Desbiez,C., Blystad,D.R., Soovali,P., Kundu,J.K., Gantsovski,M., Nygren,J., Lecoq,H., Verdin,E., Spetz,C., Tamisier,L., Truve,E., Massart,S.
Tallinn University of Technology, Chemistry and Biotechnology
Estonia
2019-11-02
Hedesunda
Tenuivirus eurotritici
Tenuivirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
9,495
GenBank
1
Sweden
Sweden
Avena sp.
null
2016-09-06
null
null
European wheat striate mosaic virus isolate Hedesunda segment RNA1, complete sequence
ACACAAAGTCCAGGGAAATAAAAACAAAAAATAAGAGATAGACTCATATATTGATCGAATTCAGGAATGGAAGGAGACAATGACTTAGGCATTAACTGTGAAATGTATCAATATCCATTTCCAACTCTGGCAGATGGTTCCATTCCTATTTCCTATTTGCCTGAGAGCCCTGGCTTTAAGTTTGCCCCTGATACAGAGGAAATATTCTGCAACATCATCCCATTGAAGAGTGTGAATCCATCCTCTCAGCTACACTTGCCCATAATTGATATCTTTAGCCAGGATCCAGAGACTCTGCAGACTCACAATATATCTGTAGATAAGTGGGTTTTCTCTCGAATAGTAAGAAAGCATAAGAATGGGATGGTGACCAATAGGTCAGGAGAACATGGGTACTGGAAAACTACTGGTAAGCTAATTGAGTATATGATGAACAACAAAAGATGCACTGTCAAATCGTATGTTCACAATTTAGGGAAGGTAAGCAGTAGTGTGAGAACTGACTGGGCGCTAAAAGAGTTTAGAATAGGAGATGTGGAGCTTGGTCTATACAGACTGATAAGGAGAATCCCAGACAGAGTCTATACAGCAACCAGCTACATAGACCATGGAATAAGGATGACTCCCTCAAGGCGCTCAGCAGACTTTCCAGAAGGGTCAGCTGGGGTACAGATAGATTTCTCTATACACGAGGAATATACAGATGGCCAGGAATCACTTTTCTCTGGAAGCTTGTATCCTTAAGCCTTGGAAACATGAACTTAAGCACCTCCTTGTATCTCAAAATAGCATTTGTGGATATAACATATTGCTCTCTATCTAGGCACTGTTGGTGGAGAGTCATCATGTCTTCAATTCCAATATCTCTAACCATTGCCCTGACATAAGACACCAACAGAGGATGGCAAGATGTTAAATCGTCTCTGAACACCTCTTCTTTTTCCACAAGCAGATCACCAAGCTCAGGGATCTTGTATAAAGCTGAGAGGCAGGAGTCTCTAACTATGGAGTCCAATGAGCCATTGTTCATTAATGTATTCATCCTTTCCATCACTGACTTGTACTCCTCTGGTGCAGTGTTGCTAGGAGTTACTTCTTCTGAGTAATCAGATTCTGTACTGCCATCATGGTTCATGATAAGTCTGGGATTGTTGATAACTGTATTGACGGCTGTCATGTAAAGTTTTTTTAGCCATTCAGCATAACTATCACATTGGAAGAATGCTCTGGCTTGGGGATCTTCTGAGATCAGGCTTAAGATATTTGAGCCATCATTAGGAGAACTCCTCCATAGCAGCCAATCAACAACCCATCCTGGCAACACTATAGTGCTAGTCATCATTTTCTCTCTTCGGATTTGTGGTCCAGACTCCAGTTGGGATGGTAGACTTCTAAATACTTGTATGTCAGACATCTGGAGTTTTGCAGTCATGATAGTAGCTAGGTTGATCCTACCATTCCTTCCATAATTATTGCAAAGCCTCAGACTATGTGTTGTTAGATCCAAAACAAATTTCTGAATATCTGTCCATTCCTTGGTCTTCAAGTATGAATTGTATATGAGGGGACACCCAGGATTCTTGAATTGTTGTTTTTTGAAAGAAAGTAAGTTGCACAAATGTATCTCATTCTGTTTCAGAGCCCATGACTTTGGAGGAGTAGAACAATCATTATCAATGTGATTATCCCTGCACCAGTTCTTCAATTGATGTATGAACCCAACTAGATCAGAGGGATTAGATATAGTCACCTTAACTATATGAGTTTTGATGGTCCCATCATTGCTTTCTCTAGAATCAACGTTTATGACCACATCCTTATCATCAAATGTACCTCTCCATTCACCTTTTCCATAATAGTTGCCTTCTTTATTCCTTTCTTGAATGTTGGTATAGCTTCCTATTATTCCTAACTTCTCATTCCTAATGGATTCAACAATATTGATCCTCTCTGATTCAAATTTCTTTTTTTGCTCGATATATCCTTGCCATGAGGTTATAGACCCCTCATCTATCATGTAGTACCAGTTTCTCACTCCTTCTTCAGCAAATAGAGTTTTGAACCTCATGATGTCATCACCGTTTGCTGTCCTCTTATACTCTGCTACATACTCAGAATATGCTTCAGCAACACTATTTGCTTCCAGTAGTAGCATGTAGCACCTAATATCCTGTCTGTTGACAAATTCATATATGTCAGAGCTTCTCTCAGGATCCCAGACATATATACCCCTATTTTTTAGTGACTCAATTGCATCTTCAACTCTAACAACACTCTCTTGGAATTCATCTTCTGTGATTTGAGCAAGCTTCATGGGCAATTTATCATACAGCATATCATGCAAATCATCCCTAGTTCTACTCGCACCATTCAGAATGAGATCTGGATCACTGCGCAGAATTGTTTGATACATAGAGAACTTATTCCTTCTTGATCCCCAATGTAGGGCACTCCTGGCGATATCATTTCCTTTGACCAATAGTGATCTTACTATACCAATTCTCTCCGATTGAGGTAGAGGAGACTGAGACAATGTCGTCATTATTGAGATTAAACTATCAAAATTCTCTCTAGTTTCTTTAGCCTTTATATCAAATATGTCACCTTTGAATGCAATTCCATTGCTAAAATTGTCCTTTATAGCTGTTATTAAATTAATGTTTCCTCTAGTATTTTTTCCAAATGATCCCACCAAGTGCACCACTCTATGCTTATCTTTGTCTCTAGATGTGAAGTTAACTATTCCTTGTGCTTTCTTATAAGGTCCTGATAGCATCGTCGCTTGTATGCTTGGTCCAAGCCAGGGATACCTCTCTCTATATGTATTCCACAGTATGTCATACACTTTATCATGGGCAGGTAATGTTTTCACTCCGAACCATTTACTAACCGCTACAGCGTACAAAGGAAACCTTGATAAGCCTTCTATTCCAGTTAGATGCACATCTGCTCTAACTCTCCTCCTCATATTCTTTTCTTGATGAGCATACTGAAATTCAATCTGCCCCAAAGTTTCCTTCAGCGAAAGATAGTCTGCATGACATGGGAACAAGAGAGCTATTGTATTCTGATACCTCTCAAAACTTTCATTATCATATCTTATGGTTGTGCGATAAGGATTTAAGTCATCAATCTCGGCTTTAGCTCTGCCATCCTCATCTCTGTATACCACCAGGGTACTCTTTACTCTTCCTACCTTGTCCAGTTTTAGTTCCAATTCATACTTGCTTCTAGACACCCTTTTGTACACTAGTAGACAGACACCAAGCAACTGAGCAGTACATGTCATCAATGTCATATCATCAATCTCTTTTAGGCTACTCTTTCCACATTGAGTGGCAGCATATTTTTCTAAGAACAGCTTTCTAGAAATATCTATACGGTGAGTGCTGATGGGAAGATGATCTTCTAGCATCTTGAGCATTTCACTCTCCAGTGGCTCTGTGGGATCAGATGTTTCAATGTATCTAGGGTGTAGGTCAGTGTTGAATTCATCTGTCCACAGCCTTTTACAGGGGATCATTGAGGATCTTATGAGTTCCTTGATCAGGGATGTTTTGCACTCTTCAGGGTCAGTATCATAATAGGCGGACATAGTGAAGACAATGTGGCGAGACAGGAAGAATGCACTAGTTGCAATCCTCTTTGACAACATGTTCCCTTTTGAGAGGCTCTGAATCACCCCTGGGCTCTTTACCTTGATTGCAATTTTCTGCTTTAGCTCCGTAGCATTGGTTGAGTGGAAGAAATAGATCCTAGGGTTCTCTTCAATCTCATCATATATGTCTTCTCCTAGATCAAGCTCCTTCATCATCTTCAACCACCTCTTCTTGTTGCCATGTCCCACCATTGTTGTTCTAGTAACAAGACCTGTATTCATAGTGTCTTCTGTCACTGCTCGGAGTGTCTGTTTGTCACTGTTCATCTCAGATTCAATCATTTCTTCATACTTTTCTCCTAGCGGACTACTTGCACAAGCATTCCAGAGATTATAATTGAAACCCATGAGTCCTGCACACTTTGGATTGTCCATTAAGAAAAAACCAAGTGCTGGATCATAAGAATTCTTTAGGAGAGTCTCGAAAGCAGGCCATATTGGTGCTACAGATGAACCCAGGAGCCTGTAATGTAGTACTGCTTGAGCTACCTGCACCATGAAAGCCAAGAAGAAGGAGCCACCACCTTCTATGACATCTTTGAGAGTGTTTGACATTTCTTCTTGTACTCCTGCCAGTGTTTCCTGCTCTCCTACAAGTATAGCAGCATTAACCCATCTAAAAGTGGGCCTATGAACATCTCCTCCAAAGAAAAACTCTGAGTTAAATTCCATGACGAATAGAGTGTTTGTGGTGCTCTTTGGTGACTTATATATGCCCAGGTAGTACCCTAGCAGCTCTTTTTTGTCAAACCAGGAATTAGCAATTATCATGACAGATAAGTTGAAAGCAGGGTTGCTATCTATATATGGTACACTTATCATAAAGCTACTATCATCTGAACTCTCCATATTATCAACCACACACTTGTGATCTTGACCATTATCCATTGCTCTGAGTGCAATTGTTAGTTCCTTTTCACATGATTCCCTTAAGTGATCTAAGTATATGGCATGAAACAGGGAGCTAGTATAATGTAGAATCCCCTGCATCATACCAGATTCTGTTTCTATGAAGGCTTGGCCTGGATTCATCCATCTGACTTTCTCCCTTCCTTTATAAACATCAAAAACTTGTTTGACTGCCGAGTCCATCGTGTGGATTTCTACATTCTCATTGAATAGAGTCAGTAACTGATCTCCTAAGAATATCTTCTTGTGGTGCCACAATTGTAGACTTTGGACAATAAACCCATGCAGATAATCAGGAGTCAACCTGAGCATCATGCACATGAACTTAGAAACATAGTGTCCTTGACTCCATTTTGATGCATCATCACTAGTTGACAAGGTTATGTAGTTTTGACCCATCTTGAGCCTAGCTTCCTGATTATGCTTCTCTGGG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58,443
MN160343.1
European wheat striate mosaic virus
Somera,M., Kvarnheden,A., Desbiez,C., Blystad,D.R., Soovali,P., Kundu,J.K., Gantsovski,M., Nygren,J., Lecoq,H., Verdin,E., Spetz,C., Tamisier,L., Truve,E., Massart,S.
Tallinn University of Technology, Chemistry and Biotechnology
Estonia
2019-11-02
Avinurme4b
Tenuivirus eurotritici
Tenuivirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
9,495
GenBank
1
Estonia
Estonia
Triticum aestivum
null
2013-07-02
null
null
European wheat striate mosaic virus isolate Avinurme4b segment RNA1, complete sequence
ACACAAAGTCCAGGGAAATAAAAACAAAAAATAAGAGATAGACTCATAAATTGACCGAATTCAGGAATGGAAGGAGACAATGACTTAGGCATTAACTGTGAAATGTATCAATATCCATTTCCAACTCTGGCAGATGGTTCCATTCCTATTCCCTATTTGCCTGAGAGCCCTGGCTTTAAGTTTGCTCCTGATACAGAGGAAATATTCTGCAACATCATCCCATTGAAGAATATGAATCCATCCTCTCAGCTACACTTGCCCATAATTGATATCTTTAGCCAGGATCCAGAGACTCTGCAGACTCACAATATATCTGTAGATAAGTGGGTTTTCTCTCGAATAGTGAGAAAGCATAAGAATGGGATGGTGACCAACAGGTCAGGAGAACATGGGTACTGGAAAACTACTGGCAAGCCAATTGAGTATATGTTGAACAACAAAAGATGCACTGTCAAATCGTATGTCCACAATTTAGGGAAGGTCAACAGTAGTGTGAGAACTGATTGGGCGCTAAAAGAGTTTAGAATAGGAGATGTGGAGCTTGGTCTATACAGACTGATAAGGAGAATCCCAGATAGAGTCTATACAGCAACCAGCCACATAGACCATGGAATAAGGATGACTCCCTCAAGGCGCTCAGCAGACTTTCCAGAAGGGTCAGCTGGGGTACAGATAGATTTCTCTATACACGAGGAATATACAGATGGCCAGGAATCACTTTTCTCTGGAAGCTTGTATCCTTAAGCCTTGGAAACATGAACTTAAGCACCTCTTTGTATCTCAAAATAGCATTTGTGGATATAACATATTGCTCTCTATCTAGGCACTGTTGGTGGAGAGTCATCATGTCTTCAATTCCAATATCTCTAACCATTGCCCTGACATAAGACACCAACAGAGGATGGCAAGATGTTAAATCATCTCTGAACACCTCTTCTTTTTCCACAAGGAGATCACCAAGCTCAGGGATCTTGTATAAAGCTGAGAGGCAGGAGTCTCTAACTATGGAGTCCAATGAGCCATTGTTCATTAATGTATTCATCCTTTCCATCACTGACTTATACTCCTCTGGTGCAGTGTTGCTAGGAGTTACTTCTTCTGAGTAATCAGATTCTGTACTGCCATCATGGTTCATGATAAGTCTGGGATTGTTGATGACTGTATTGACGGCTGTCATGTAAAGCTTTTTTAGCCATTCAGCATAACTATCACATTGGAAGAATGCTCTGGCTTGGGGATCTTCTGAGATCAGGCTTAAGATATTTGAGCCATCATTAGGAGAACTCCTCCATAGCAGCCAATCAACAACCCATCCTGGCAACACTATAGTGCTAGTCATCATTCTCTCCCTTCGGATTTGTGGTCCAGACTCCAGTTGAGATGGTAGACTTCTAAATACTTGTATGTCAGACATCTGGAGTTTTGCAGTCATTATAGTAGCTAGGTTGATCCTACCATTCCTTCCATAATTGTTGCAAAGCCTCAGACTATGTGTTGTTAGATCCAAAACAAATTTCTGAATATCGGTCCATTCCTTGGTCTTCAAGTATGAATTGTATATGAGGGGACACCCAGGATTCTTGAATTGTTGTTTTTTGAAAGAAAGTAAGTTGCACAAATGTATCTCATTCTGTTTCAGAGCCCATGACTTTGGAGGAGTAGAACAATCATTATCAATGTGATTATCCCTGCACCAGTTCTTCAATTGATGTATGAACCCAACTAGATCAGAGGGATTAGATATAGTCACCTTAACTATATGAGTTTTGATGGTCCCATCATTGCTTTCTCTAGAATCAACGTTTATGACCACATCCTTATCATCAAATGTGCCTCTCCATTCACCTTTTCCATAATAGTTGCCTTCTTTATTCCTTTCTTGAATGTTGGTATAGCTTCCTATTATTCCTAACTTCTCATTCCTAATGGATTCAACAATATTGATCCTCTCTGATTCAAATTTCTTCTTCTGCTCGATATATCCTTGCCATGAGGTTATCGACCCCTCATCTATCATGTAGTACCAGTTTCTCACTCCTTCTTCAGCAAATAGAGTTTTGAACCTCATGATGTCATCACCGTTTGCTGTCCTTTTATACTCTGCTACATACTCAGAATATGCTTCAGCAACACTATTTGCTTCCAGTAGCAGCATGTAGCACCTAATATCCTGTCTGTTGACAAATTCATATATGTCAGAGCTTCTCTCAGGATCCCAGACATATATACCCCTATTCTTTAGTGACTCAATTGCATCCTCAACTCTAACAACACTCTCTTGGAATTCATCTTCTGTGATTTGAGCAAGCTTCATGGGCAATTTATCATACAGCATATCATGCAAATCATCCCTAGTCCTACTCGCACCATTCAGAATGAGATCTGGATCACTGCGCAGAATTGTTTGATACATAGAGAACTTATTCCTTCTTGATCCCCAATGTAGGGCACTCCTGGCGATATCATTTCCTTTGACCAATAGTGATCTTACTATACCAATTCTCTCCGACTGAGGTAGAGGAGACTGAGACAATGTCGTCATTATTGAGATTAAACTATCAAAATTCTCTCTAGTTTCTTTAGCCTTTATATCAAATATGTCACCTTTGAATGCAATTCCATTGCTAAAATTGTCCTTTATAGCTGTTATTAAATTAATGTTTCCTCTAGTATTTTTTCCAAATGATCCCACCAAGTGCACCACTCTATGCTTATCTTTGTCTCTAGATGTGAAGTTAACTATTCCTTGTGCTTTCTTATAAGGTCCTGATAGCATCGTCGCTTGTATGCTGGGTCCAAGCCAGGGATACCTCTCTCTATATGTATTCCACAGTATGTCATACACTTTATCATGGGCAGGTAATGTTTTCACTCCGAACCATTTACTAACCGCTACAGCATACAAAGGAAACCTTGATAAGCCTTCTATTCCAGTCAGATGCACATCTGCTCTAACTCTCCTCCTCATATTCTTTTCTTGATGAGCATACTGGAATTCAATCTGCCCCAAAGTTTCCTTCAGCGAAAGATAGTCTGCATGACATGGGAACAAGAGAGCTATTGTATTTTGATACCTCTCAAAACTTTCATTATCATATCTTATGGTTGTGCGATAAGGATTCAAGTCATCAATCTCGGCTTTAGCTCTGCCATCCTCATCTCTGTATACCACCAGGGTACTCTTTACTCTTCCTACCTTGTCCAGTTTTAGTTCCAATTCATACTTGCTTCTAGACACCCTTTTGTACACTAGCAGACAGACACCAAGTAACTGAGCAGTACATGTCATCAATGTCATATCATCAATCTCTTTTAGGCTACTCTTTCCACACTGAGTGGCAGCATACTTTTCTAAGAACAGCTTTCTAGAAACATCTATACGGTGAGTGCTGATGGGAAGATGATCTTCTAGCATCTTGAGCATTTCACTCTCCAGTGGCTCTGTGGGATCAGATGTCTCAATGTACCTAGGGTGTAGGTCAGTGTTGAACTCATCTGTCCACAGCCTTTTACAAGGGATCATTGAGGATCTTATGAGTTCCTTGATTAGGGATGTCTTGCACTCTTCAGGGTCAGTATCATAATAGGCGGACATAGTGAAGACAATGTGGCGAGACAGGAAGAATGCACTAGTTGCAATCCTCTTTGACAACATGTTCCCTTTTGAGAGGCTCTGAATCACCCCTGGGCTCTTTACCTTGATTGCAATTTTCTGCTTTAGCTCCGTAGCATTGGTTGAGTGGAAGAAATAGATCCTAGGGTTCTCTTCAATTTCATCATATATGTCTTCTCCTAGATCAAGCTCCTTCATCATCTTCAACCACCTCTTCTTGTTGCCATGTCCCACCATTGTTGTTCTAGTAACAAGACCTGTATTCATAGTGTCTTCTGTCACTGCTCGGAGTGTCTGTTTGTCACTGTTCATCTCAGATTCAATCATTTCTTCATACTTTTCTCCTAGTGGACTACTTGCACAAGCATTCCAGAGATTATAATTGAAACCCATGAGTCCTGCACACTTTGGATTATCCATTAAGAAAAAACCAAGTGCTGGATCATAAGAATTCTTTAGGAGAGTCTCGAAAGCAGGCCATATTGGTGCTACAGATGAACCCAGGAGCCTGTAATGTAGTACTGCTTGAGCTACCTGCACCATGAAAGCCAAGAAGAAGGAGCCACCACCTTCTATGACATCTTTGAGAGTGTTTGACATTTCTTCTTGTACTCCTGCCAGTGTTTCCTGCTCTCCCACAAGTATAGCAGCATTAACCCATCTAAAAGTGGGCCTATGAACATCTCCCCCAAAGAAAAACTCTGAGTTAAATTCCATGACGAATAGAGTGTTTGTGGTGCTCTTAGGTGACTTATATATGCCCAGGTAGTACCCTAGCAGCTCTTTTTTGTCAAACCAGGAATTAGCAATTATCATGACAGATAAGTTGAAAGCAGGGTTGCTATCTATATATGGTACACTTATCATAAAGCTACTATCATCTGAACTCTCCATATTATCAACCACACACTTGTGATCTTGACCATTATCCATTGCTCTGAGTGCAATTGTTAGTTCCTTTTCACATGATTCTCTTAAGTGGTCTAAGTATATGGCATGAAACAGGGAGCTAGTATAATGTAGAATCCCCTGCATCATACCCGATTCTGTTTCTATGAAGGCTTGGCCTGGATTCATCCATCTGACTTTCTCCCTTCCTTTATAAACATCGAAAACTTGTTTAACTGCCGAGTCCATCGTGTGGATTTCTACATTCTCATTGAATAGAGTCAGTAACTGATCTCCTAAGAATATCTTTTTGTGGTGCCACAATTGTAGACTTTGGACAATAAACCCATGCAGATAATCAGGAGTCAACCTGAGCATCATACACATGAACTTAGAAACATAGTGTCCTTGACTCCATTTTGATGCATCATCGCTGGTTGACAAGGTTATGTAGTTTTGACCCATCTTGAGCCTAGCTTCCTGATTATGCTTCTCTGGG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58,444
MN160344.1
European wheat striate mosaic virus
Somera,M., Kvarnheden,A., Desbiez,C., Blystad,D.R., Soovali,P., Kundu,J.K., Gantsovski,M., Nygren,J., Lecoq,H., Verdin,E., Spetz,C., Tamisier,L., Truve,E., Massart,S.
Tallinn University of Technology, Chemistry and Biotechnology
Estonia
2019-11-02
Leirsund
Tenuivirus eurotritici
Tenuivirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
9,495
GenBank
1
Norway
Norway
Triticum aestivum
null
2017-07-06
null
null
European wheat striate mosaic virus isolate Leirsund segment RNA1, complete sequence
ACACAAAGTCCAGGGAAATAAAAACAAAAAATAAGAGATAGACTCATACATCTACCGAATTCAAGAATGGAAGGAGACAATGACTTAGGCATTAACTGTGAAATGTATCAATATCCATTTCCAACTCTGGCAGATGGTTCTATTCCTGTTCCCTATTTGCCTGAAAGCCCTGGCTTTAAGTTTGCTCCTGATACAGAGGAAATTTTCTGCAACATTATCCCATTGAAGAATATGAACCCATCCTCTCAGCCACATCTGCCCATAATTGATGTCTTTAGCCAGGACCCAGAGATTCTGCAAACTCACAATATATCTATAGATAAGTGGGTATTTTCTCGAATAGTGAGGAAGTATAAAAATGGGATGATGACCAACAGGTCAGGAGAATATGGGTTCTGGAAGACCACTGGTAAGCCTATTGAGTACATTATGAACAACAAAAGATGCACTGTCAAATCATATGTCCATAATTTGGGGAAGGTCAACTATCATGTGAGAACTAATTGGGTGCTGAAAGAGTTTAGAATAGGAGATGTTGAGCTTGGTCTATACAGACTGATAAAGAGAATTCCAGACAGAGTCTACACAGCAACCAGTCACATTGATCATGGAATGAGGATGACTCCCTCAAGGCGCTCAGTGGATCTTCCAGAAGGGTCAGCTGGAGCACAGATAGATGTCTTTATACACGAGGAATATACAGATGGCCAGGAATCACTTTTCTCTGAAAGCTAGTGTCCTTCAGCCTTGGGAACATGAACTTGAGCACCTCCTTGTATCTCAAAATAGCATTAGTGGAGATAACATATTGCTCTTTATCTAAGCACTGTTGGTGGAGAGTCATCATGTCTTCAATTCCAATATCTCTAACCATTGCCCTGACATAAGACACCAACAGAGGATGGCAAGATGTTAAGTCATCTCTAAACACTTCTTCTTTTTCCACAAGCAGATCACCAAGCTCAGGGATCTTGTATAAAGCAGATAGGCAGGAGTCTCTAACTATGGAGTCCAATGAGCCATTGTTCATCAATGTATTCATCCTATCCATCACTGACTTATACTCTTCTGGTGCAGTGTTGCTGGGAGTTACTTCCTCTGAGTAATCAGATTCTGTACTGCCATCATGGTTCATGATAAGTCTGGGATTGTTGATGACTGTGTTGACTGCTGTCATGTAGAGTTTTCTAAGCCATTCTGCATAACTATCACATTGGAAAAACGCTCTGGCTTGGGGATCTTCTGAGATCAGGCTTAAGATATTTGAGCCATCATTGGGAGAACTCCTCCATAGCAGCCAATCAACAACCCATCCTGGCAACACTATAGTGCTAGTCATCATTCTCTCTCTTCGTATTTGTGGTCCTGATTCCAGTTGAGATGGTAGACTTCTGAATACTTGTATGTCGGACATCTGGAGTTTTGCAGTCATGATAGTAGCTAGGCTGATCCTGCCATTTCTTCCAAAATTGTTGCAGAGTCTCAGACTATGTGTTGTCAGATCCAATACAAATTTCTGAATGTCAGTCCATTCTTTGGTCTTCAAGTATGAGTTGTATATGAGGGGACACCCAGGATTTTTGAATTGTTGCTTCTTGAAAGAAAGTAAGTTGCATAGATGTATCTCATTCTGTTTCAGAGCCCATGACTTTGGAGGGGTTGAACACTCATTATCAATGTGATTATCTCTGCACCAGTTCTTCAGTTGATGAATGAACCCAACTAGATCAGAGGGGTTAGATATAGTCACCTTAACTATGTGAGTTTTGGTTGTTCCATCATTGCTTTCTCTAGAATCAACGTTTATGACCACATCCTTATCATCAAATGTACCTCTCCATTCACCTTTTCCATAATAGTTGCCTTCTTTGTTCCTACCTTGAATGTCTGTATAGCTGCCTATTATCCCTAACTTCTCATTCCTAATAGACTCAACAATGTTGATCCTTTCTGATTCAAATTTCTTCTTCTGCTCGATGTACCCTTGCCATGAGGTTATAGATCCCTCATCTATCATGTAGTACCAGTTCCTCACTCCTTCTTCTGCAAACAGTGTTTTGAACCTCATGATGTCATCACCGTTTGCTGTTCTCTTATACTCTGCCACATATTCAGAATATGCTTCAGTGACACTATTTGCTTCAAGTAGTAGCATATAGCATCTGATGTCTTGCCTATTGACAAATTCATATATGTCAGAGCTTCTCTCAGGATCCCACACATATATACCCCTATTCTTTAGTGACTCAATTGCATCCTCAACTCTAACAACACTCTCTTGGAACTCATCTTCTGTGATTTGAGCAAGTTTCATGGGCAATCTATCATACAGCATATCATGTAAATCATCTCTAGTTCTGCTCGCACCATTCAAAATGAGATCCGGATCACTGCGCAGAATTGTCTGATACATAGAGAACTTGTTCCTTCTTGATCCCCAATGTAGGGCACTCCTGGCGATGTCACTTCCTTTCACCAGTAGTGATCTTACTATACCAATTCTCTCTGACTGAGGTAGAGGAGACTGAGACAATGTTGTCATTATTGAGACTAAACTATCAAAATTCTCTCTAGTTTCTTTTGCCTTTATATCAAATATGTCACCCTTGAATGCAATTCCATTGCTAAAATTGTCCTTTATAGCTGTTATCAGATTAATGTTTCCTCTAGTATTTTTCCCAAATGATCCCACCAGGTGCACTACCCTATGCTTATCTTTGTCTCTAGATGTGAAGTTAACTATTCCTTGTGCTTTCTTATATGGTCCTGATTGCATCGTCGCTTGTATACTGGGTCCAAGCCAGGGATACCTCTCTCTATATGTTCCCCACAATATATCATACACTTTATCATGGGCAGGCAATGTCTTCACTCCGAACCATTTTCTAACCGCTACAGCATACAAAGGGAACCTTGATAAGCCTTCTGTTCCAGTTAGGTGCACATCTGCTCTAACTCTTCTCCTCATATTCTTTTCTTGATGAGCATACTGAAATTCAATCTGCCCCAAAGTTTCCTTTAGCGAAAGGTAGTCTGCATGACAAGGGAATAAGAGGGCTATTGTATTTTGATACCTCTCAAAACTTTCATTATCATATCTTATAGTTGTGCGATAAGGATTCAAGTCTTCAATCTCAGCCCTAGCCCTGCCATCTTCATCTCTATACACCACCAGGGTACTCTTAACTCTTCCAATCTTGTCCAGCCTAAGTTCCAGCTCATACTTGCTTCTAGACACCCTTTTGTACACTAGTAGACAGACACCGAGCAACTGGGCAGTACATGTCATCAATGTCATATCATCAATCTCTTTTAGGCTACTCTTTCCACACTGAGTGGCAGCATATTTTTCTAAGAACAGCCTCCTGGAAACATCTATGCGGTGAGTGCTAATGGGAAGATGATCTTCCAGCATCCTGAGCATTTCACACTCCAGTGGCTCTGTGGGATCAGATGTCTCAATGTATCTAGGGTGTAGATCAGTATTGAACTCATCTGTCCACAGCCTTTTACAAGGGATCATTGATGATCTTATGAGCTCCTTGATCAAAGAAGTCTTGCACTCTTCAGGGTCAGTATCATAATAGGCGGACATGGTGAAGACAATGTGGCGAGATAGGAAGAAAGCACTAGTTGCAATCCTCTTTGACAACATGTTCCCTTTTGAGAGGCTCTGAATCACCCCTGGGCTCTTCACCTTAATTGCAATTTTCTGCTTTAGTTCCGTAGCATTGGTAGAGTGGAAGAAATAGATCCTGGGGTTCTCTTCAATTTCATCATATATTTCTTCTCCTAGATCAAGCTCCTTCATCATTTTTAACCACCTCTTCTTGTTGCCATGCCCCACCATTGTTGTTCTAGTAACAAGACCTGTATTCAGTGTATCTTCTGTCACTGCTCGGAGCGTTTGTTTGTCACTGTTCATCTCAGATTCTATCATCTCTTCATACTTTTCTCCTAGTGGACTACTAGCACAGGCATTCCAGAGATTGTAATTGAAGCCCATGAGACCTGCACATTTTGGATTGTCCATTAAGAAAAATCCAAGTGCTGGATCATAAGAGTTCTTAAGGAGAGTCTCAAAGGCAGGCCATATTGGTGCTACAGATGAACCCAAAAGCCTGTAATGAAGCACCGCTTGAGCTACCTGCACCATGAAAGCCAAGAAGAAGGAGCCACCACCTTCTATGACATCTTTGAGGGTGTTTGACATTTCTTCTTGTACTCCTGCCAGCGTTTCTTGCTCTCCTACAAGTATAGCAGCATTAACCCACCGAAAAGTGGGCCTGTGAACATCTCCCCCGAAAAAGAACTCTGAATTAAATTCCATTACGAATAGAGTGTTTGTAGTACTCTTTGGTGACTTATATATACCTAGGTAGTACCCTAGCAGCTCCTTCTTATCAAACCAAGAATTGGCAATTATCATGACAGATAAGTTGAAGGCAGGGTTACTATCTATATATGGTACACTTATTATAAAGCTACTATCGTCTGAACTCTCCATATTATCAACAACACACTTGTGATCTTGACCATTGTCCATTGCTCTGAGTGCAATAGTTAGCTCCTTTTCACATGATTCTCTCAAGTGATCTAAGTATATAGCATGAAACAGAGAGCTAGTATAATGTAGAATCCCCTGCATCATACCAGATTCTGTCTCAATGAAAGCTTGGCCTGGATTCATCCATCTGACTTTCTCTCTCCCTTTATAAACATCAAAAACTTGTTTAACTGCTGAGTCCATTGTATGGATTTCTACATTCTCATTGAATAGAGTCAGCAGCTGATCTCCCAAAAATATCTTCTTGTGGTGCCACAATTGTAAGCTTTGGACAATAAATCCATGCAGATAATCAGGAGTCAACCTGAGCATCATGCACATAAACTTAGAAACATAGTGTCCTTGACTCCATTTTGATGCATCATCACTAGTTGACAAAGTTATATAGTTTTGACCCATCTTGAGTCTAGCTTCCTGATTATGCTTCTCTGGA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58,445
NC_039212.1
Fathead minnow picornavirus
Phelps,N.B., Mor,S.K., Armien,A.G., Batts,W., Goodwin,A.E., Hopper,L., McCann,R., Ng,T.F., Puzach,C., Waltzek,T.B., Delwart,E., Winton,J., Goyal,S.M., Phelps,N.B.D.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2018-08-24
FHMPV-1
Limnipivirus C
Limnipivirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,746
RefSeq
1
USA
USA
Pimephales promelas
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2011
null
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Fathead minnow picornavirus isolate FHMPV-1, complete genome
GTTTCTGAGCACTGGTAAGAGCTTAGACAAACGTTTTTAAAATTTATTTTCTCTGCAACTTTTGTTTGTGTTTATTTTTATTTGTTAATTTTGCGCCTAAGCATTTGTTGCGAAGTATTTGATTCATTAGTAATATTACTTATTGTTTATTTAGATGGTATTCAAAGTGGTGGGAGTATCGAACCCAAGCGTCGTATGCTATCTCCTTGAACAATTTTTAATCATTGCGAAGTGATCATTGAAAAGGATAGGTGTTTAAGAACTCAAAGAGTGTTAATAATGTTGGGTGACAGGTGTCCCCATAGAATTTATTAACATGATTTGGACTGGTTATCTAGTAAGAAGAACCATCGAACGCACGAGCGAGCATTGCTTGCGGGGCAGTTACCCTGCGTCGATGTAAGTGTGTACCGGGGGGTGCACATGTTGATTCTTTATGGCCTGATAGGGTGCGTCATTCGCGCCTAGATAATTAGTATAATGCGAATGGAATAAATTTACATGGCTTCTATAATTGAAAATTTGACCACAACTTTTGCATCATCAATGCTGGGAACAGCTGAGGATGCTGTCGGGAGTTTGATGGACGCAGCAGTGCGCCCTGTGGAGGCACCCAACGTGATTATTTCAGATCAATCAGCTGTTGCTGAGAGTGAGATTTATGAGACCGGGACAGTGCCACCAGCTCTTACTGCATCCACCGTTGAACAGGAGGTTGGACAGATGAACATTCAGCGATTCGTCAGGCTTGACGCCGCTGAGTGGTCAACTAGTTCGGCCGCTGAAGTGAAGTTGAAAGAGTGGAAACTACCAGATGTCTTCTATGATTCAAAATATCCAACATACAATCTGATGAAGAATTACCACTGGATGAGATCTGATTTCGAGTTCAATTTAATTGTGAACGCGAACATGGGTTTTGCCGGTGCTTTGGTTCTTGTCTATGTGCCCGATGGTGCACACTTTCAATTCGACACTTTCAGGAATTTCCCACACGCCATGATAAATTGCTCACTAAACACATCAGCGAGCCTTAAAATCCCGTATATAAATATGACACAATACTGCGGGATCAAAGATGATGAGGACAACAACGGAACGCTCCGTTTGTATGTTCTGGCACAGCTAAAAGTACCTTCGAGCGGGGGACAAGTTTCAAACTGGACTTTATATGGAAAACTTGTCACTCCTGAGTTTCAGGCTTTCTCTGTTTTACAGGGTCCCGGCTCGAACAACGCTGCAGTCAGGGTGGAGCAGGGTGAGGGTGCCATGTTTATGGCATCACGGCACCATACGGCTTTACGACCGCGTATGGGCTTAACGTCAGAGCGCTCTTCGTCTGACGCACAGGTCGTGGGTGATTCAGCTTTTCGGTCATTGAAACAAGTGACAAACATCGAATCACTCTGGATGGCGCTAGACTGGGCTTACACAGATGAGATTGGGAAACAATTGCTTGTCACCAATGTGATCGTGAAGTCAGACTCCAATGTTGGTAGTATTAAAAACACAACCAACCTTGGATTCTTGTCCAATTTTTACCACGGTTACAAAGGTGATCTCTGTGTTTCAATTCAGTCTGTTGCTTCACGCTTGAATCAGGGCAAACTGCTGATTGTTTTCTATCCTGGAGAGGATAATGATGGAGCTGATTTGTCAATTGACAACATCAATAACGCTTTCACACAGATCCTCGACCTGGGTGGTAAAACAACCGTCCGCTTCACACTACCATATGTGTGTCAACAAACCTACAGACCCATGCATGGTGTCTTTGGCAGGTTTGCCGTTTTCGTGCTTAACCCGCTGACGTACACCCCTGCTTGCCCTTCTGCTGTGCGTGTAATATTTTACATTGGCACTTCATCTTCATTCTCCTTTGTCTATCCGAAGGAGGGTACTGCTAAATTTCAGGGCGACGATGATGATGTGATCATTGAGGAGGAATACATTGAGGAACCAGTCACAAACATTGAGGATGAGGCTTCTACTTCCACACGGATTAAGAGGCCTGTTTTCAGGAATGTGAGGGTTTCTCTACCTGATCAGATCAAGTCAGATCATATGCTGCTGGCCAACCTGTTTGGACGGGCGCATGCTTTGAAACCAACTACATCTACCACCGCTGACAAAACTGCACAACTGGTTCCTACAGCCAAATCTTTCCTGAATGTCTTCAAATTGTTCAGGTACAGGAGTGGCGATATGACCGTCCACATCATGCACACTGCCACCGGACCGCTGGTGGTTGCGCATTCTTACATCAGTGATGATCTGGGCACGGTTGCCGAGGATAATTATTCTCGTATCTTGTCTCAGGGCTCTGTGGCAATGAAACCTGCTTCCAATGCTTCATTATGCGTTCCATTCTACGTGCTCACACCTTTCGTTGAGAGTATGCAGCTTGGTAAGCTATTGATGAGTTCACTTGATGACACAACATACAGCGTCAGGCTTGCTTTAACCTTTGATCGTAATACACGCTTTTACTTTCTGCAATCTCCGCCAGATGTTGTTGCTGCTGATTTCTCCGATGATGATGTTGATGACTTTGAGGGCCCGTCAGACTGGTCCCGCCTGGACCTGCTGGAGCGCACTCTTGACCGTTTGGCGATTGAAACAACCTACCCTGTCAAACCTGTGAGCTATGCTGGACGATTCTTACATTTCCACAGCAAAGCCGAGGTTGATGGCGTTCCATTCTATGCTCAAGGGAAGACCAAACGTGAATGTCGCTTGAAATTGCTTGAACAAATTCTGGCATACAAGCGAGATTTGACTGCTTGTGGTGATGTGGAGTCCAACCCTGGACCCGTATTGGCCATATCTAGCACGTTCGGTTGGAGCTTGATTGATGAGGGCGTGCCGATTACTATCCCGGCACTTAATCTTGCCAATGCTGCTGTTGTTTCCTCACCGCTAGACTCATGGTGGCAAATCTGTGAGATTGAGGGTGATTTTCTCCGCAACTTCAACACTGCGCTTAGTGCGAACTTCGCACCTGACATTGCCATTGCTGATGATGTGCCTCAGACATACACAAACACTGCTATTTTCTTGCAAATAATGTCACGTGGCCTTGTCAGGCGCATCGTCGTCACGCCGTTCATCAGCATGTTTATGCTTGCTGGGTTCAGTAGATGGATCCGTGCACGTTTTGCAAGGTTGCGCTTACTTTTGTCCGGGGATGTTGAACAAAACCCCGGACCAGTTTTCTTTTATAAAGAAACTGACCTTGGCACACATTTCTTGTGCCCGCTTAATTCGGCTAATAACAGGTTCCTTGGTATCTATAATATTGACAACTTCATCTTTTCCAAGGAAATCAGGATTACCTCACGCTGGAGCTCTGTGCCACCTGCAAACACCATCGTGATCACCGAGCGCCAATTCACCAGATTAACAGTATTGGGTGAACATGCGCTTGATGGACACGATGTACGCTTCGTCTTTGATGATCAAACTCTCGAAGACACGCCCTTGCCTTGTCTTTATGCCCTGGTTGCTTTCTGCATGGCGCGAGTTGTTGACGCCGAGTCACCAATATCTGGCGTTGTTCAGTGGATGCTTGGGGTTGATGCTAGTGCTATAGCCAACGCGCAGTTGGCTTCTACGCTTTTCACAGATGACAACCTTCGACGTGTTCTTGGCGATGCATGGTCTGAGGCTTCCTCCTTGCTGCTTAAAGGATTTTTCAAAGTCCTTATGTTTGCTTTTATTTTGTCACAAAGTTCTTCTTCGCTTACACTGCTTAGTGTTTCTTGCTTAGTGGCAGCTGATGTATCTAGTGCTGTTTTCCAGATCTTTCAATCTTGCAACGTTTCTTCTCTGATTAACTACTTGCTTCCCGGCGAGGATGTTATTGGATGTTGTGAACGTGCCCGTATGGTTGGGCTTGCCCATGATATCTTCAAAGATTTCACGGACACTGCGGAGGATTTCACGAGTATGACGCAATTGGCTCGAAATCTAGATTGGTGGGTGCAACGTTTGCTCAAATTGGCCTCATTGATCAGTGAGATGTATAATCCCGACGAAATTCAAAGAAGTTCAAAAATACTCAAGAAAGACGAGACCGTGGTGGTCCAAACCATAGCGGGTGCTGCGGATCTCTATCAGGACATCCGCACGTCTGGTTCTGTTACAAACGAACACAGGAACAGATATGATGAATTGCATGAACAACTTGTGATGTACCAAAAATTGGCAAATATGGTACCGCGACACCCTTTTCAGATACCAATCAATCAGGCACTAATGACCATGAAAAGTGTCCGATATGGGCACCGCGCGCCTGAAAAACCAATCAGACCTGACCCTGTCGGAATTCACTTCTGCGGGATACCTGGCATGGGAAAAACAGTTCTCATGACCAGGATTTGCAACTACCTTGCCAAAGCGCTCAAGACTGAAGTTTACGTCCATGCGCCGGGAGCTGAGTTTTTGGATGGATATTCTGGCCAGAAGGTCCATTACATTGACGAGTTTCTTGCGCATGTTGATGAGAAAGAAGCAAATTTGATCCTGCAATTGATGGGGTGCTCTAACACCATTGTCCCCATGGCTGACCTTGACGATAAAGGAAAGTACTATCAGGCTGAGGTGGTCATTACAACATCTAACACACTACCTTCTTCACACTCCAAGCTGAAATTTCCACAAGCAGTTGCTCGCAGATTTAAAGTTCTGGAATTCAAGGTGAACTCATTATACACCACCGTCGTCAATGGACAGACTGTTTTGGATGGTGAGAAAGCGATGCGTGATGGATCATTTCAGAGTGGTGAGTGTTGGAGTTTCTGCGTCGATGGATTAAATTGGAAAACCTTTTCCTTCAAGAAATTCGTGGCAGAGGTGATGGATATGATTGACAAAAACCGCAAATTTTATGAAAATTTCTCAAAAATTTTGGATGATGATGTTGATGAATTACAGGCCCCTCCCGAAACTCCAGTGGATTCGCAAACCATTCTGGACACACTCGAGATTGAAGGGTTGTT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4,228
KF874490.1
Fathead minnow picornavirus
Phelps,N.B., Mor,S.K., Armien,A.G., Batts,W., Goodwin,A.E., Hopper,L., McCann,R., Ng,T.F., Puzach,C., Waltzek,T.B., Delwart,E., Winton,J., Goyal,S.M., Phelps,N.B.D., Ng,T.F.F.
Blood System Research Institute, Molecular Virology
USA
2014-03-10
20
Limnipivirus C
Limnipivirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,772
GenBank
1
USA
USA
Pimephales promelas
null
2010-05-01
null
null
Fathead minnow picornavirus isolate 20, complete genome
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91,444
KF183915.1
Fathead minnow picornavirus
Phelps,N.B., Mor,S.K., Armien,A.G., Batts,W., Goodwin,A.E., Hopper,L., McCann,R., Ng,T.F., Puzach,C., Waltzek,T.B., Delwart,E., Winton,J., Goyal,S.M., Phelps,N.B.D.
University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
2014-02-27
FHMPV-1
Limnipivirus C
Limnipivirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,746
GenBank
1
USA
USA
Pimephales promelas
null
2011
null
null
Fathead minnow picornavirus isolate FHMPV-1, complete genome
GTTTCTGAGCACTGGTAAGAGCTTAGACAAACGTTTTTAAAATTTATTTTCTCTGCAACTTTTGTTTGTGTTTATTTTTATTTGTTAATTTTGCGCCTAAGCATTTGTTGCGAAGTATTTGATTCATTAGTAATATTACTTATTGTTTATTTAGATGGTATTCAAAGTGGTGGGAGTATCGAACCCAAGCGTCGTATGCTATCTCCTTGAACAATTTTTAATCATTGCGAAGTGATCATTGAAAAGGATAGGTGTTTAAGAACTCAAAGAGTGTTAATAATGTTGGGTGACAGGTGTCCCCATAGAATTTATTAACATGATTTGGACTGGTTATCTAGTAAGAAGAACCATCGAACGCACGAGCGAGCATTGCTTGCGGGGCAGTTACCCTGCGTCGATGTAAGTGTGTACCGGGGGGTGCACATGTTGATTCTTTATGGCCTGATAGGGTGCGTCATTCGCGCCTAGATAATTAGTATAATGCGAATGGAATAAATTTACATGGCTTCTATAATTGAAAATTTGACCACAACTTTTGCATCATCAATGCTGGGAACAGCTGAGGATGCTGTCGGGAGTTTGATGGACGCAGCAGTGCGCCCTGTGGAGGCACCCAACGTGATTATTTCAGATCAATCAGCTGTTGCTGAGAGTGAGATTTATGAGACCGGGACAGTGCCACCAGCTCTTACTGCATCCACCGTTGAACAGGAGGTTGGACAGATGAACATTCAGCGATTCGTCAGGCTTGACGCCGCTGAGTGGTCAACTAGTTCGGCCGCTGAAGTGAAGTTGAAAGAGTGGAAACTACCAGATGTCTTCTATGATTCAAAATATCCAACATACAATCTGATGAAGAATTACCACTGGATGAGATCTGATTTCGAGTTCAATTTAATTGTGAACGCGAACATGGGTTTTGCCGGTGCTTTGGTTCTTGTCTATGTGCCCGATGGTGCACACTTTCAATTCGACACTTTCAGGAATTTCCCACACGCCATGATAAATTGCTCACTAAACACATCAGCGAGCCTTAAAATCCCGTATATAAATATGACACAATACTGCGGGATCAAAGATGATGAGGACAACAACGGAACGCTCCGTTTGTATGTTCTGGCACAGCTAAAAGTACCTTCGAGCGGGGGACAAGTTTCAAACTGGACTTTATATGGAAAACTTGTCACTCCTGAGTTTCAGGCTTTCTCTGTTTTACAGGGTCCCGGCTCGAACAACGCTGCAGTCAGGGTGGAGCAGGGTGAGGGTGCCATGTTTATGGCATCACGGCACCATACGGCTTTACGACCGCGTATGGGCTTAACGTCAGAGCGCTCTTCGTCTGACGCACAGGTCGTGGGTGATTCAGCTTTTCGGTCATTGAAACAAGTGACAAACATCGAATCACTCTGGATGGCGCTAGACTGGGCTTACACAGATGAGATTGGGAAACAATTGCTTGTCACCAATGTGATCGTGAAGTCAGACTCCAATGTTGGTAGTATTAAAAACACAACCAACCTTGGATTCTTGTCCAATTTTTACCACGGTTACAAAGGTGATCTCTGTGTTTCAATTCAGTCTGTTGCTTCACGCTTGAATCAGGGCAAACTGCTGATTGTTTTCTATCCTGGAGAGGATAATGATGGAGCTGATTTGTCAATTGACAACATCAATAACGCTTTCACACAGATCCTCGACCTGGGTGGTAAAACAACCGTCCGCTTCACACTACCATATGTGTGTCAACAAACCTACAGACCCATGCATGGTGTCTTTGGCAGGTTTGCCGTTTTCGTGCTTAACCCGCTGACGTACACCCCTGCTTGCCCTTCTGCTGTGCGTGTAATATTTTACATTGGCACTTCATCTTCATTCTCCTTTGTCTATCCGAAGGAGGGTACTGCTAAATTTCAGGGCGACGATGATGATGTGATCATTGAGGAGGAATACATTGAGGAACCAGTCACAAACATTGAGGATGAGGCTTCTACTTCCACACGGATTAAGAGGCCTGTTTTCAGGAATGTGAGGGTTTCTCTACCTGATCAGATCAAGTCAGATCATATGCTGCTGGCCAACCTGTTTGGACGGGCGCATGCTTTGAAACCAACTACATCTACCACCGCTGACAAAACTGCACAACTGGTTCCTACAGCCAAATCTTTCCTGAATGTCTTCAAATTGTTCAGGTACAGGAGTGGCGATATGACCGTCCACATCATGCACACTGCCACCGGACCGCTGGTGGTTGCGCATTCTTACATCAGTGATGATCTGGGCACGGTTGCCGAGGATAATTATTCTCGTATCTTGTCTCAGGGCTCTGTGGCAATGAAACCTGCTTCCAATGCTTCATTATGCGTTCCATTCTACGTGCTCACACCTTTCGTTGAGAGTATGCAGCTTGGTAAGCTATTGATGAGTTCACTTGATGACACAACATACAGCGTCAGGCTTGCTTTAACCTTTGATCGTAATACACGCTTTTACTTTCTGCAATCTCCGCCAGATGTTGTTGCTGCTGATTTCTCCGATGATGATGTTGATGACTTTGAGGGCCCGTCAGACTGGTCCCGCCTGGACCTGCTGGAGCGCACTCTTGACCGTTTGGCGATTGAAACAACCTACCCTGTCAAACCTGTGAGCTATGCTGGACGATTCTTACATTTCCACAGCAAAGCCGAGGTTGATGGCGTTCCATTCTATGCTCAAGGGAAGACCAAACGTGAATGTCGCTTGAAATTGCTTGAACAAATTCTGGCATACAAGCGAGATTTGACTGCTTGTGGTGATGTGGAGTCCAACCCTGGACCCGTATTGGCCATATCTAGCACGTTCGGTTGGAGCTTGATTGATGAGGGCGTGCCGATTACTATCCCGGCACTTAATCTTGCCAATGCTGCTGTTGTTTCCTCACCGCTAGACTCATGGTGGCAAATCTGTGAGATTGAGGGTGATTTTCTCCGCAACTTCAACACTGCGCTTAGTGCGAACTTCGCACCTGACATTGCCATTGCTGATGATGTGCCTCAGACATACACAAACACTGCTATTTTCTTGCAAATAATGTCACGTGGCCTTGTCAGGCGCATCGTCGTCACGCCGTTCATCAGCATGTTTATGCTTGCTGGGTTCAGTAGATGGATCCGTGCACGTTTTGCAAGGTTGCGCTTACTTTTGTCCGGGGATGTTGAACAAAACCCCGGACCAGTTTTCTTTTATAAAGAAACTGACCTTGGCACACATTTCTTGTGCCCGCTTAATTCGGCTAATAACAGGTTCCTTGGTATCTATAATATTGACAACTTCATCTTTTCCAAGGAAATCAGGATTACCTCACGCTGGAGCTCTGTGCCACCTGCAAACACCATCGTGATCACCGAGCGCCAATTCACCAGATTAACAGTATTGGGTGAACATGCGCTTGATGGACACGATGTACGCTTCGTCTTTGATGATCAAACTCTCGAAGACACGCCCTTGCCTTGTCTTTATGCCCTGGTTGCTTTCTGCATGGCGCGAGTTGTTGACGCCGAGTCACCAATATCTGGCGTTGTTCAGTGGATGCTTGGGGTTGATGCTAGTGCTATAGCCAACGCGCAGTTGGCTTCTACGCTTTTCACAGATGACAACCTTCGACGTGTTCTTGGCGATGCATGGTCTGAGGCTTCCTCCTTGCTGCTTAAAGGATTTTTCAAAGTCCTTATGTTTGCTTTTATTTTGTCACAAAGTTCTTCTTCGCTTACACTGCTTAGTGTTTCTTGCTTAGTGGCAGCTGATGTATCTAGTGCTGTTTTCCAGATCTTTCAATCTTGCAACGTTTCTTCTCTGATTAACTACTTGCTTCCCGGCGAGGATGTTATTGGATGTTGTGAACGTGCCCGTATGGTTGGGCTTGCCCATGATATCTTCAAAGATTTCACGGACACTGCGGAGGATTTCACGAGTATGACGCAATTGGCTCGAAATCTAGATTGGTGGGTGCAACGTTTGCTCAAATTGGCCTCATTGATCAGTGAGATGTATAATCCCGACGAAATTCAAAGAAGTTCAAAAATACTCAAGAAAGACGAGACCGTGGTGGTCCAAACCATAGCGGGTGCTGCGGATCTCTATCAGGACATCCGCACGTCTGGTTCTGTTACAAACGAACACAGGAACAGATATGATGAATTGCATGAACAACTTGTGATGTACCAAAAATTGGCAAATATGGTACCGCGACACCCTTTTCAGATACCAATCAATCAGGCACTAATGACCATGAAAAGTGTCCGATATGGGCACCGCGCGCCTGAAAAACCAATCAGACCTGACCCTGTCGGAATTCACTTCTGCGGGATACCTGGCATGGGAAAAACAGTTCTCATGACCAGGATTTGCAACTACCTTGCCAAAGCGCTCAAGACTGAAGTTTACGTCCATGCGCCGGGAGCTGAGTTTTTGGATGGATATTCTGGCCAGAAGGTCCATTACATTGACGAGTTTCTTGCGCATGTTGATGAGAAAGAAGCAAATTTGATCCTGCAATTGATGGGGTGCTCTAACACCATTGTCCCCATGGCTGACCTTGACGATAAAGGAAAGTACTATCAGGCTGAGGTGGTCATTACAACATCTAACACACTACCTTCTTCACACTCCAAGCTGAAATTTCCACAAGCAGTTGCTCGCAGATTTAAAGTTCTGGAATTCAAGGTGAACTCATTATACACCACCGTCGTCAATGGACAGACTGTTTTGGATGGTGAGAAAGCGATGCGTGATGGATCATTTCAGAGTGGTGAGTGTTGGAGTTTCTGCGTCGATGGATTAAATTGGAAAACCTTTTCCTTCAAGAAATTCGTGGCAGAGGTGATGGATATGATTGACAAAAACCGCAAATTTTATGAAAATTTCTCAAAAATTTTGGATGATGATGTTGATGAATTACAGGCCCCTCCCGAAACTCCAGTGGATTCGCAAACCATTCTGGACACACTCGAGATTGAAGGGTTGTT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Fathead minnow picornavirus
Phelps,N.B., Mor,S.K., Armien,A.G., Batts,W., Goodwin,A.E., Hopper,L., McCann,R., Ng,T.F., Puzach,C., Waltzek,T.B., Delwart,E., Winton,J., Goyal,S.M., Phelps,N.B.D.
University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
2014-02-27
FHMPV-2
Limnipivirus C
Limnipivirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,746
GenBank
1
USA
USA
Pimephales promelas
kidney, spleen
2011
null
null
Fathead minnow picornavirus isolate FHMPV-2, complete genome
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91,586
KC465953.1
Fathead minnow picornavirus
Phelps,N.B., Mor,S.K., Armien,A.G., Batts,W., Goodwin,A.E., Hopper,L., McCann,R., Ng,T.F., Puzach,C., Waltzek,T.B., Delwart,E., Winton,J., Goyal,S.M., Batts,W.N., Winton,J.R.
Western Fisheries Research Center, Virology
USA
2014-02-01
null
Limnipivirus C
Limnipivirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,934
GenBank
1
USA
USA
Pimephales promelas
null
2009-09-01
null
null
Fathead minnow picornavirus strain 09-283, complete genome
TTGAAAGAGAGTCCATACGGGGAACTGCGGTTCTCCTATTGGATTCTGCTTTCACAGTTTCTGAGCACTGGTAAGAGCTTAGACAAACGTTTTTAAAATTTATTTTCTCTGCAACTTTTGTTTGTGTTTATTTTTATTTGTTAATTTTGTGCCTAAACATTTGTTGCGAAGTATTTGATTCATTAGCAATATTCATTATTGTTTATTTAGATGGCATTCAAAGTGGTGGGAGTATCGAACCCAAGCGTCGTATGTTATCTCCTTGAATAATTTTGGATTTTTTCGACATGATCATTGAAAAGGATAAGTGTTTAAGAACTCAAGGAGTGTTAACAATGGTGGGTGACAGGTGTCCCCATATAATTTGTTAACATGATTTGGACTGGTTATCTAGTAAGAAGAACCATCGAACGCACGAGCGAGCATTGCTTGCGGGGCAGTTACCCTGCGTCGATGTAAGTGTGTACCGGGGGGTGCACATGTTGATTCTTTATGGCCTGATAGGGTGCGTCATTCGCGCCTAGATAATTAGTATAATGCGAATGGAATAAATTTACATGGCTTCTATAATTGAAAATTTGACCACAACTTTTGCATCATCAATGCTGGGAACAGCTGAGGATGCTGTCGGGAGTTTGATGGACGCAGCAGTGCGTCCTGTGGAGGCACCGAACGTAATCATTTCTGATCAATCAGCTGTTGCTGAGAGTGAGATTTATGAGACCGGGACAGTGCCGCCAGCTCTCACAGCGTCCACCGTTGAACAGGAGGTTGGACAGATGAACATTCAGCGATTCGTCAGGCTTGACGCCGCTGAGTGGTCAACTAGTTCAGCTGCTGAAGTAAAGTTGAAAGAGTGGAAATTACCAGATGTCTTCTATGATTCAAAATATCCAACATACAATCTGATGAAGAATTACCACTGGATGAGATCTGATTTTGAGTTCAACTTAATTGTGAACGCGAACATGGGTTTTGCTGGTGCTCTGGTGCTTGTTTATGTGCCCGATGGCGCACACTTTCAATTCGACACTTTCAGAAATTTCCCACACGCCATGATAAATTGCTCACTAAACACATCAGCGAGCCTCAAAATCCCGTATATAAATATGACACAATACTGCGGGATCAAAGATGATGAGGACAACAACGGAACGCTCCGTTTGTATGTTCTGGCACAGCTAAAAGTACCTTCGAGCGGGGGACAAGTTTCAAACTGGACTTTATATGGAAAACTTGTCACTCCTGAGTTTCAGGCTTTCTCTGTTTTACAGGGTCCCGGCTCGAACAACGCTGCAGTCAGGGTGGAGCAGGGTGAGGGTGCCATGTTTATGGCATCGCGGCACCATACGGCTTTGCGACCGCGTATGGGCTTAACGTCAGAACGATCTTCGTCCGACGCGCAGGTCGTGGGTGATTCTGCTTTCCGGTCACTGAAACAGGTGACGAACATTGAATCACTCTGGATGGCGCTGGATTGGGCTTACACAGATGAGATTGGGAAACAACTGCTTGTCACTAATGTGATCGTGAAATCAGACTCCAATGTTGGTAGTATTAAAAACACAACCAACCTTGGATTCTTATCTAATTTTTATCACGGCTACAAAGGTGACCTGTGTGTCTCAATTCAGTCTGTTGCTTCACGCTTAAATCAGGGCAAATTGCTGATTGTTTTCTATCCTGGAGAGGATAATGATGGAGCTGATTTGTCAATTGACAATATAAACAATGCTTTCACACAGATTCTTGACCTGGGTGGTAAAACAACCGTTCGCTTCACACTACCGTATGTGTGCCAACAAACCTACAGACCCATGCACGGTGTCTTTGGCAGGTTTGCTGTTTTCGTGCTTAACCCGCTGACATACACACCCGCTTGTCCATCTGCTGTCCGTGTGCTTTTCTACATCGGCACTTCGTCTTCATTCTCCTTTGTCTATCCTAAGGAGGGTACCGCTAAATTTCAGGGGGATGATGACGACGTGATCGTTGAGGAGGAGTACATTGAGGAGCCAGTCACAAACATTGAGGATGAGGCCTCCACGTCCACCCGGATCAAGAGACCTGTTTTCAGGAATGTGAGGGTTTCTCTACCCGACCAGATCAAATCAGACCACATGTTGCTGGCCAACTTGTTTGGACGGGCACATGCTCTGAAACCAACCACATCTACCACCGCTGATAAAACTGCACAACTGGTTCCTACAGCCAAATCTTTTCTGAATGTTTTCAAGCTGTTCAGGTACAGGAGTGGTGATATGACCGTACACATCATGCACACTGGCACCGGGCCACTGGTGGTTGCGCATTCGTACATCAGTGATGATCTGGGCACGGTCGCTGAGGATAATTATTCTCGCGTCTTGTCACAGGGCTCTGTGGCAATGAGACCTGCTTCCAATGCTTCGTTATGTGTGCCATTTTATGTGCTTACACCCTTCGTTGAGAGTATGCAGCTCGGCAAACTGTTGATGAGCTCACTCGATGATACAACCTATAGCGTTAGGCTTGCCCTCACCTTTGACCGCAATACACGCTTCTACTTTCTGCAATCTCCGCCGGATGTTGTTGCTGCTGACTTCTTTGGTGACGATGTTGATGAGCTTGAGGGCCCATCAGATTGGTCCCGCCTGAATTTGCTGGAGCGAACTCTTGATCGTTTGGCGGTTGAAACAACTTACCCCGTTAAACCTGTGAGTTATGCTGGACGTTTCTTACATTTCCACAGCAAGGCTGAGGTTGATGGCGTTCCATTCTACGCGCAAGGGAAGACCAAACGCGAATGTCGCTTAAAACTGCTTGAGCAAATCCTGGCATACAAGCGAGATTTGACTGCTTGTGGCGATGTGGAGTCCAACCCTGGACCCGTATTGGCCATATCCAGCACGTTCGGTTGGAGTTTGATTGATGAGGGTGTGCCAATAACTATACCGGCACTCAACCTTGCTAATGCTGCTGTTGTTTCTTCACCGCTTGACTCATGGTGGCAAATTTGTGAGATTGAAGGCGATTTTCTCCGCAACTTCAACACTGCGCTTAGCGCGAACTTTGCGCCTGATATTGCCATCGCTGACGATGTGCCCCAGACATATACCAATACCGCTATTTTCTTGCAAATAATGTCACGGGGTCTTGTCAGGCGCATTGTTGTCACACCGTTCATCAGCATGTTCATGCTTGCTGGATTCAGTAGATGGATCCGCGCACGTTTTGCGAGGCTGCGCTTGCTTCTGTCCGGGGATGTCGAACAAAACCCTGGGCCAGTTTTCTTCTATAAAGAAACTGATCTTGGCACACATTTCTTGTGTCCACTCAATTCGGCCAACACCAGGTTCCTTGGTATTTATAACATTGACAATTTCATTTTCTCCAAGGAAATCAAGATCACTTCACGCTGGAGTGCTGTCCCAACCTCAAACACCATTGTGATCACCGAGCGCCAGTTCACCAGATTAACAATATTGGGTGAGCATGCGCTTGATGGACATGATGTGCGTTTTGTCTTCGATGATCAAACTCTCGAGGATACACCCTTGCCTTGTCTTTATGCTTTAGTTGCTTTCTGCTTGGCGCGGGTTGTTGACGCTGAGTCACCAATATCTGGCGTTGTTCAGTGGATGCTGGGCGTTGACGCTAGTGCAATAGCTAATGCTCAGCTGGCTTCCACGCTGTTCACAGATGACAATCTTCGGCGTGTTCTTGGCGATGCATGGTCCGAGGCTTCTTCTTTGCTGCTCAAAGGGTTTTTTAAAGTCCTTATGTTTGCTTTCATCCTGTCACAAAGCTCTTCTTCGCTCACACTGCTTAGTGTGTCTTGCCTAGTTGCAGCTGATGTATCTAGTGCTGTCTTCCAGATTTTCCAATCTTGCAATGTATCTTCACTGATTAACTACTTGCTTCCTGGCGAGGACGTTATTGGATGTTGTGAACGTGCACGCATGATTGAGCTCGCCCATGACATTTTCAAAGATTTCTCAGACACCGCAGAGGATTTCACGAGTATGACACAATTGGCCAGGAATCTGGATTGGTGGGTGCAACGTTTGCTTAAATTGGCCTCATTGATTAGTGAGATGTATAACCCTGACGAAATTCAGAGAAGTTCAAAAATACTCAAGAAAGATGAAGCTGTGGTGGTTCAAACCATAGCGGGCGCTGCAGATCTCTATCAAGACATCCGCACGTCTGGTTCTGTTACAAACGAACACAGAAACAGATATGATGAGCTGCATGAACAACTCGTGATGTACCAGAAATTGGCAAACTTGGTGCCGCGACATCCATTCCAAATACCAATCAATCAGGCATTAATGACTATGAAAAGTGTTCGGTACGGGCATCGCGCGCCCGAGAAACCAATCAGACCTGATCCCGTCGGAATCCACTTCTGCGGGATACCTGGTATGGGTAAAACCGTACTCATGACCAGGATTTGCAATTTCCTTGCTAAAGCGCTCAAGACTGAAGTTTACGTCCATGCGCCGGGTGCTGAATTTTTGGATGGATATTCTGGCCAGAAGGTCCATTACATTGATGAGTTCCTCGCGCATGTTGATGAGAAAGAAGCAAATCTGATCTTACAATTGATGGGGTGCTCTAATACAATTGTCCCCATGGCTGATCTTGACGATAAAGGAAAGTATTATCAGGCAGAAGTGGTCATCACGACGTCCAACACGCTACCTTCTTCACACTCCAAATTGAAGTTCCCGCAGGCAGTTGCTCGTAGATTCAAAGTTTTGGAATTCAGAGTAAACTCATTATACACGACGGTTGTCAATGGGCAAACCGTTTTGGATGGTGAAAAAGCAATGCGTGATGGTTCGTTCCAGAGTGGTGAGTGTTGGAGTTTTTGTGTTGACGGATTAAATTGGAAAACTTTTTCTTTCAAGAAATTCGTGGCAGAGGTGATGGATATGATTGACAAAAATCGCAAATTCTATGAAAATTTCTCAAAAATTCTGGATGACGACGTTGATGAATTGCAGGCTCCTCCTGACACCCCGGTAGATTCACATGCCATTCTGGACACACTCGAGATTGAAGGATTGTTCGCTTTTCCGCGCAAGCTGGTTGCTGCTACTAGAGCAAGCGTCCAGTATGCAAAGAATTGGATAACAGAACAATGTAAGGGTTGGACCTTGGACAAGACCATCGCCTGGGTGTCACGTGTTGGTGTCGCAGTTAATGTGCTACGTATTGTGCATTCCACATACACTTTTATCAGGGATCTGACCAAGTGTGATGTGGAGGCACCGTACGACAAAGCCATACGCGTGGACCCTCGGAAGGTTCTCGTTAAGAGGGCTGCCCGTCGGAACGTGCGTGTTGACACTGCACAAGCTCCGGTCGAGTGTGAACAGTACGAGCATTTCGCCAAACCAATGGTGTTTCTAAAATTTGAAGACAGGAAACACAACTCACGCGGCTTCGCAATAGCCAAACGCCAAATTATAACATATGCACATGGATTGGGTAACGGAAATTTGATTGTGCATTATGGAGGTATTGAGATGAATTTGACACCAGATGACTACACAATTAGTGTTTTTGTGGTCGAGGATGGCGAGACTGATATGGCCTGCATTGAATTTGTGAGCGCACTTGGTGTTGAGTTCCCTGATTTCACGCATTTGATTTCTGCGCCTGAGTATGGGCGTGATGCCAGATTGCTGACAGCGTGGGGTGGAAGTTTCCATATTCGGACCGGTGAAAATCTCACCAAAGGAGATTACTCCATGCTACGAGATCCAAATTCAGGTAAGATGTGGGGTATGCGATTCGGACATTTCCGCTACCTCTGCAAAACCCAACCAGGAGACTGTGGTTCCATTATAATTCAGAAACAAAATGGCACCTGGAAATTGATTGGAATGCATAATGCAGCTGGGCAGGGCTCTGCCGTTGCTTTTCGTTTCGATCTGTATCCTCTTGACATCGCACAGGGTGTCATAGTCTCAAAAGAGAAATCAACAATGAGGAGTTTCATGCCCAGCAAGTCTAAATTACGTGAGTCCCCCTTTCATGGTGCTTTCCCTGTTGAGAAGGAGCCCGCTGTTTTGAGTTCTCGCGACACTCGTTTGATCGTGAACATTGACAGCTTGGTGAAGACCAATGGTGAGAAGTACCGTGTTGATAGATTTGACCCAAACACCACAGTCTTTGCAGTTGCAGCACACAAAGTCAAAGAGAGATTCCAAAATCATATCCCTCTTGGCTACATGATCTCAATGGAAGATGCCATTCGTGGGGGTGACATCAACCCCATAGACAAGGACACATCTCCTGGCTACAAATATGTGTCCCGCGGGTTTCGTAAGTGTGACCTCTACCAAATTTTGCCTGATGGCACTGTTCAAATATCCGATATGCTGCGGAAAGATGTTGAAGCCTGGTTAACAGCAATCAAGACTGGGAAAGAGATTGATACGCTTTTCACTGCACATCTGAAAGATGAACTGCGGTCCTGTGAGAAAGTTGAACTTGGCAAGACTCGAGTGATCGAGGCTGCGGAGCTTGACTTTGTTGTGGCATACCGGATGTATATGTCTAGCATTTACTCTGGGTTTTACAACACTGCCGCACATTTGACTGGCATCGCTGCGGGGATTAACCCACCTCGTGATGGACATGAGCTCTATGCAGAGCTATGTTCATACTCAAAATTTCTTGCTCTTGATTACTCCCGTTTCGATGGTTCCCTCCCTGAGATGCTGATGCGCAAAGCAGTTGAGATATTGGCTGAGTTGCATGAGTCCCCGGAAGAAGTTGCCAGACTTCATGAGACCGTGATTGTTTCGAAGCATCTCGTTCTCGATGAACTCTGGACTGTTAAAGGAGGCATGCCTTCCGGGAGCCCTTGCACAACGATTCTCAATTGCATCTGCAACTTGCTTGTCCTTGAGTACTCTTTTCTTGACACCTTCGGAATTGATTACCAGTTCCACTTTGATGGAGACTATACAAGTCGAGACTTTCTGACCGTTGTGTATGGTGATGATTGTATTGTCGCCTACAATGGACCCGAAGTTGGAGCTGCACTCGCCGAAGTGGTCAAGAATGCTTTTGGGATGGAAATCACGCCTGCCAGTAAGGTTGGAGAGGAGTACAACGTGGAGATTCAAGACATTGAGTTTCTGAAAAGGACTTTTTTCCGTCTTCGTGGTCAGCGTGATGACCGCATTGCTCTGCGCTTGAGCTTGACAACCATATTCAACAGCTTGATGTGGATGCGCAATCGCAAGACCTTTGCCGACCAGGTCTTTTCTTTGATGGTCGAACTGTCTGCTTGGGGTCGAGAGCAGTATGACCTCGTTGTTCGCAAGTGCCGTGAGAGACTTAAAGAAAATAGAGAGGTTGTCACCATACCAAACTACGATTTGGCCTTCGAGACCTACTTAGGAATCGTGGATTGGGACGTGGTTGGTGAGGTGACAGCAGAAGAGCTTTTCCCAGTGAAGCTCGAAATTAGTGATGATGATGACTGATTAAATACTGGGACTGACTGATGTCGTTTACGATTTCGCCTGACTGAGTTGATTCTGGACGTGATTTTGACCTTTGCTTGAAGTGACTATTCTTTGGATTACCTATGATGATGATTTGTTGTTTGATGTTATGACCTTTGTTATGAATGACCATTCTTTGGATTTGCCTTTGATGTTGATTTTAGTTATGACCGGATATGTTGACGATGATTGCAGTTGCTTGTTTTATGAGGAGAATTATATACGTTTAATTGGATGTGGCTGAGGCCTAAATTGATAAATTTAGTGGTTAGAACCCCTGCTTTTGCATCCCTTATAGTTTAGATTGTTTAGTGTAATGTTTTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
91,809
NC_043249.1
Feldmannia irregularis virus a
Delaroque,N., Boland,W., Muller,D.G., Knippers,R., Mueller,D.G.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2019-06-28
null
Feldmannia irregularis virus a
Phaeovirus
Phycodnaviridae
dsDNA
6,094
RefSeq
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA485481
Feldmannia irregularis virus a strain FirrV-1 contig E, partial sequence
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Feldmannia irregularis virus a strain FirrV-1 contig B, partial sequence
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Feldmannia irregularis virus a
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National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
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PRJNA485481
Feldmannia irregularis virus a strain FirrV-1 contig A, partial sequence
ACTTTTCTGTCTTATTCCCGGCATGAGGCTCCTTGGGGTCGCGTTGTGTCGTCCTCACGATGTCTTCCGGCGGCGTCGATCGACTTGCATGTTCTTGATCTTACACGTTCGCCCACCTGAGCACCTGGGTAATTGCTCTGTAGTCGAACACATTCTTCTACCTTGGCGGGATCTCACGCTCATGGCCACACTCGACGGGTTTCCAATTCTCAGATCACATCCGCCAATACATCGTCATCGACTCGAGAATTAAAAGCACAGAAGGGCCTTCTCTGCTACCATCCGTATACTCCACCGGGACCTTGGAAGTCATCGTCGCATCGCGTCATGAACAGCATCCTCCCATCGCGGACGCTTCCATATAACATTTCGCGATCTCGTTCGAACCACATTCATGGTGGCTTACTCTTCGCGTTCCCCCTCCTTCCAGAAGCCATATACTTACCCTGAGCCTCCACGAAAAATGGCGCGCTTCAGAGCCAGCAATATTCTGGGCGACCCCTTTGCGATAGCAAGCACGTACATAAACATTGTATGTCTTTGATTAGCCAAAGGGTGGTGGTTAGGATCCGTATCTGATCACCAGTATTGTAGGAGGGGCTAGGATGATGGCGTTATTTTCAACGCAATGACACTGAGTGCTAAGCAAGAAAGTCTCCATAGGCCATGGGGCGTTTCTGCCGTAACCATCCAAGCACGGTGGATCAAAACAATGGTTACCTCTGAGACAAAGGCAATTTGGAGCGAAAGAAATTTTATTTCATAGGCTTGGCGCAATCAGATGCCGCCAGAAGACTGCTGTACCCCTCCCCCCCCACAAAAAATCCTGTCTGGATGGGGGGGGTGGGGGTCGCTATAAGAGTTCTCTAAATAAAAATACGAAACACACTGACAAGCCAAAAGCTCGTCATTACTATCACTATCTGAACCCGAGTAACTGTAGGTCGACCGATGACTACGTTGTTATTTTTAATGCATTATACTTATTGCTATACAAAAAAGACTACATAGGCGCCGAAACGTTTCACCGTGAAGCAACCAAGGCCGGTGGATCCCGAAGATGGTTACCTCTGAGCCAAATACAATTTGGAGCGAAAGAAATTTTATTTCATAGGCTTGGCCAATCAGATGCCGCCAGAAGACTGCTGTACCCCTCCCCCCCCCACAAAAAATCCTGTCTGGATGGGGGGGGGGTGGGGGTCGCTATAAAAGTTCTCTACATAAAAATAACAACACACTGACAAGCCAAAAGCTCGTCATTACTATCACTATCTGAACCCCAGTAACTGTAGGTCGACCGATGACTACGTTGTTATTTTTAATGCATTATACTTATTGCTATACAAAAAAGACTACATAGGCGCCGAAACGTTTCACCGTGAAGCAACCAAGGCCGGTGGATCAAAACAATGGTTACCTCTGAGCCAAATACAATTTGGAGCGAAAGAAATTTTATTTCATAGGCTTGGCCAATCAGATGCCGCCAGAAGACTGCTGTATCCCTCCCCCCCCCACAAAAAATCCTGTCTGGGTGGGGGGGGGTGGGGGTCGCTATAAGAGTTCTCTACATAAAAATACGAAACACAGTGACAAGCCAAAAGCTCGTCATTACTATCACTATCTGAACCCCAGTAACTGTAGGTCGACCGATGACTACGTTGTTATTTTTTAATGGTCTGTACTTATTACTATACAAAAAAGACTACATAGGCGCCGAAACGTTTCACCGTGAAGCAACCAAGGCCGGTGGATCAAAACAATGGTTACCTCTGAGCCAAATACAATTTGGAGCGAAAGAAATTTTATTTCATAGGCTTGGCCAATCAGATGCCGCCAGAAGACTGCTGTACCCCTCCCCCCCCACAAAAAATCCTGTCTGGGTGGGGGGGGGGTGGGGGTCGCTATAAGAGTTCTCTACATAAAAATACGAAACACACTGACAAGCCAAAAGCTCGTCATTACTATCACTATCTGAACCCGAGTAACTGTAGGTCGACCGATGACTACGTTGTTATTTTTAATGCATTATACTTATTGCTATACAAAAAAGACTACATAGGCGCCGAAACGTTTCACCGTGAAGCAACCAAGGCCGGTGGATCAAAACAATGGTTACCTCTGAGCCAAATACAATTTGGAGCGAAAGAAATTTTATTTCATAGGCTTGGCCAATCAGATGCCGCCAGAAGACTGCTGTACCCCTCCCCCCCCCACAAAAAATCCTGTCTGGGTGGGGGGGGGTGGGGGTCGCCATAAGAGTTCTCTACATAAAAATACGAAACACACTGACAAGCCAAAAGCTCGTCATTACTATCACTATCTGAACCCCAGTAACTGTAGGTCGACCGATGACTACGTTGTTATTTTTAATGCATTATACTTATTGCTATACAAAAAAGACTACATAGGCGCCGAAACGTTTCACCGTGAAGCAACCAAGGCCGGTGGATCCAGAAGATGGTAACCTCTGAGCCAAATACAATTTGGAGCGAAAGAAATTTTATTTCATAGGCTTGGCCAATCAGATGCCGCCGAGGTGTTGTCAGACAGTACCATCCCGAAAAAACTGCTGTATGGTGGTGCTGTTCCTCTCTTTTGGTGGAAAGCTAGCTGAAGAGACTGCTGTTTGCTGTTTCCATGGAAGTCACGAGGATTGGTGTCTCTGTGTGTGGGGCAACAGCAGGTAGGTGTTCTTCTCATGTATACCAGACTTATCTCCATGTAGTATGGTGGTTGAAAAGAGTAGAGCAGCAGTGAGAGCATTGCTTTGGTTCAGGACGAAGTCTCACCTGTTCAGTGTAGCCACACGAAGCCCTTGTACTGCCCCATCCGGTCCGACTTCGGCATCTTCAATTCATGTGCCTGCCCTTCCCCTTCCCCGGTTCTCCTTCTCGCTCTCGTTACGCAAATCCTGACGACTGTGTGTGTACCTGCACGCTCATGGTACCGTGCATGCATCATCGGAGGGATGCCATCAGCAGGACGACGAAGCCACGAAGGCCGAGTGAGCTCACAGATGGTTGTTGTCCAGCAGTACCAGGGACAGAAGACTGCTGTACCCCGTATAAGTATTCTTCTTGGATAGTGTACCCCCCTCCCCATAAATACTGCCTGGATGGGTGGGGGGGGGTGTGTGAGGTTTTCGGAGTGCTCTCACCCGTATTTACACACAGATACTCTCTCTCTCCCTCCTCTCCACGTGTGTATCTCCTTCATCTCTTTAACAGAAACCATGTCGTCTGTCAAAGCTGTACAAGGGAGGACGTTCGTCGCGGAGACGGGCAATAAGAAAGCCATGTTGGCAAATTTCAAAGATCTCCAAGGAAGACTACGCGAGCAATACGAGCGTATCTTATTTATCGGTGTCTATGTGGAATCGCCCATAAAGACAAAGATTTTTATCCAATGCGAAACGAGTATGCGGTCGTCTGTGCTGGCGCACTTGTTCGAAGGAGCTGGGATTTCCTTGCTGAAGATTCCGGTCCGTTTTCGCTGGCCGGAATTCCCGTCGTTCGGAGCTTTCTCTCGGCGCTATGGACGTCCGCACCACCCCGGCAAGCATGGCAACGGGGTCAAGGAAATCGGTAGGGAGGACATATCTCATATCGATATCAGTGACATTAGATTCTGTCTCGGATCGCGAGACGAAAACCTAGCACTGGCAAGAGAGGTGTATAGACCCAATCAGCTGCCCGGCAATGATGAGGGTGTTTTACAATTGTTCAGAGAGCGTCTGTTCTTCTCGTTGTTGGCACGATTCGAGACGAGTCTCCTCAAGTGCAGGGGGCGATCGGTGAAGATGGGGACAAGGGCAAACATGAACATTCGCTTTGGGATGGGCGACAGCACTAAAAGGTTTGCCTTTTATGATTTGGGCAGGTGGAATATCCGCCCCAAGTCGGATTTTTTTCAGTTTGTCGTACAACACAGGGTTCCATTGCTCAAACGGGTCGTTTACAACGAGAAGCTTTTTAGCAAGTTGACAGCTGAAGAGCGTGATGAGATCAGAGATCGATTCGCCAGGATCGAAGAGGCAGGGGACACCATGGATGTCACCATGAAGAGCCGAGAATACAAAATCTATCTCGATTCTTTCCAAGAAACCACCAAGCGTTTAGATTTGATGAAGTGTAGGGGCTAAGTGTCAGTAGCACTCGAAGAATCGTAGCATGTAGTGGGTTGCCACTATCAAATAATCCAATTCAAATCTATACTGAAGGTCTCCATATCTCGTTCGGGCGGGGGTTGTCGTCCCGCACCCGCACACACACACACACCCCTTTCCGCCTCTTTCAAGAAAGGCCGATGTCGTCTGGTCAAGTTGTAGGAGGGAGGACGTTCGTCGCGGAGACAACAACGTCGGACAAAAAACTGGCAACGTTCCTAGACCTGAAACAACAACTCCTTGGGCACTACGAGAAGATCACGTTCATAGGTGCGCTGAAGGAGTCGACGAAAGGAACTAAGATATATATTCAATGTCAGACCAAGATGCTGTCTAACGTCCTCGCTCGCATTTTTGAAAATGCTCATGTGTCTTTGGTACGGGAGCCAGACCGTTTTGAGTGGCCGGATTTCCCGAAGTCCATGTACCTCTTCAAACCCGTGTACGGTAGCCCGCAAAAGCCTGGCGTACATGGCAATGGTGTTAAGGAAATGGGCAAGGAAGACGTGTCTCATCTGACGGTTGATGACATTCGATCTTGTCTCGGATCTAGGGAAGAAAACATCAGTCTTACGAGGCAGGTATGTAAGCCTAGTAGTCTGCCTGACAGTGATGACGGTATTCTTGACGTATTCAAGGAGCGCCTGTTTTTCACGTTTCTAGAACGGTTTGAGGTGCGTCTCCAGAAGTGTCGGGGGCGTTCCGTGAAGGAGGGGACTCGATCCAACATGAACATTCGTTTCGGGCTGGGTACAAACGTCAAACGTTTCGCCTTTTATGATGTCCGGCGGAGGAACATCCGTAAGACGTACGACTTCTTTAGTTTGCTGTGACG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3,327
NC_043255.1
Feldmannia irregularis virus a
Delaroque,N., Boland,W., Muller,D.G., Knippers,R., Mueller,D.G., Bothe,G., Thomas,P.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2019-06-28
null
Feldmannia irregularis virus a
Phaeovirus
Phycodnaviridae
dsDNA
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RefSeq
1
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PRJNA485481
Feldmannia irregularis virus a strain FirrV-1 contig C, partial sequence
GGACCTCCGCGTGTAGACCACCAACCGGGCCAACCTCATTCATCTGGGCCTGAACCGGGCATCCGGGCTGCCTGGTTTACACTTCCCCGGGGTCTACAAAAATCAAGACAAACAAACCGGGCACTCTTCTTTGTGAACCGGGCAGGGCCTGAAATGCCCGGTTTGGCCTGGTACAAACACTGTTGGATGCGGTTTGATCAAAAATAAAACAGGTTCCCGCTCGAGTCCAATAATATTAGACTCGTTGTCCTAGATGCTATTACCGATACTGCGGCGCGATTTTGGTCGGGCCGATCTGGTTCGAAACGCAACATAACCGGGCGACTCGTGTTCCTTGTTGTTTAAACCGCAACCTGTACATCCGCCAAGATACATCTGACTCGTTGTAAAAAAAATAAAACAGTATCGACCGCCCGGGGTATCCCCAGCCTGACGGAGTATTTGTCGGGATATCCAGTGTACCACAAATAAGGAGCAACGCCCCCGTGAAAGTTCTTTTTTTTGCATTTTTTCACAAATTATAAATTAAGAAAATTCACGTGTTAAAAGCAAGTATACGCGCAACCACCCGTGGCTCTTTCTTGCTGTTGGATAGCTGTAAGTCCTGGCTCTTGATAGTCTACTGCTGCTGTGTAACACATACAATAACTGCACAATAAATATGGTCCAACGCCCCGTAAAAGTTCTTTTTTTAATTTTTTTCACAAATTATTGAGTAAGAAAATTCACGTGTTAAAAGCAAGTATACGCGCAACCACCCGTGGCTCTTTCTTGCTGTTGGATAGCTGCAAGTCCTGGCTCTTGATAGTATACTGCTGCTGTGTAACACATACAATAACTGTACAATAAATATGGTCCAACGCCCCGTAAAAGTTCTTTTTTTAATTTTTTTCACAAATTATTGAGTAAGAAAATTCATGTACTTAAAGCAAGTATACGCGCAACCACCCGTGGCTCTTTCTTGCTGTTGGATAGCTGTAAGTCCTGGCTCTTGATAGTCTACTGCTGCTGTGTAACACATACAATAACTGCACAATAAATATGGTCCAACGCCCCGTAAAAGTTCTTTTTTTAATTTTTTTCACAAATTATTGAGTAAGAAAATTCACGTGTAAAAGCAAGTATACGCGCAACCACCCGTGGCTCTTTCTTGCTGTTGGATAGCTGTAAGTCCTGCCTCTTGATAGTCTACTGCTGCTGTGTAACACATACAATAACTGCACAATAAATATGGTCCAACGCCCCGTAAAAGTTCTTTTTTTAATTTTTTTCACAAATTATTGAGTAAGAAAATTCACGTGTTAAAAGCAAGTATACGCGCAACCACCCGTGGCTCTTTCTTGCTGTTGGATAGCTGCAAGTCCTGGCTCTTGATAGTCTACTGCTGCTGTGTAACACATACAATAACTGCACAATAAATATGGTCCAACGCCCCGTAAAAGTTCTTTTTTTAATTTTTTACACAAATTATTGAGTGAGTAAATTCACGTGTTAAAAGCAAGTATACGCGCAACCACCCGTGGCTCTTTCTTGCTGTTGGATAGCTACAAGTCCTGGCTCTTCATAGCTCATAGCTGTGTAACACATACAACCACTGTACAATAAATATGGTCCAACGCCCCGTAAAAGTTCTTTTTTTAATTTTTTACACAAATTATTGAGTGAGTAAATTCACGTGTTAAAAGCAAGTATACGCGCAACCACCCGTGGCTCTTTCTTGCTGTTGGATAGCTGTAAGTCCTGGCTCTTCATAGCTCATAGCTGTGTAACACATACAACCACTGTACAACAAATGAAGTGCAACCCCCGTTAGTGTTCCTCTTTGTCTGTACAAGTGTCGACTCTTCTCAGGGTCTACAACTTCTAGTACAGTATCTTACATCTCAGTGCCCGTCATGGAAGAGCCGACAAAGAGGTCAGGAGCGAGCTCGCCCCTCCTGCTCACTCATCCTTTGTTGATTGGAGCGAGACTGGAAAAGACAGGTATGAGTATAGCAGTACCTATTCAATTTTATTATTTCGTAGGGTATATCGATATATAAGGGCGACGTTGGGCTCATGACCAGTCTTATTCTGAAGTACACTCTCGTCTCCGAGGATACCTATCTCAAGGATACTTCTACTTCGGGCTCTGACCTAAGTCTTGCGGTTGGCTCGATTCAAGTAACCGAGGTCGAGCCTTACGGGACGGCCGCGTATTTTGACGGAACTACGCGTTTAGAAATTCAGAATGTTCCAACGTCACTGAGCAACAATTCGGCAAGGTCAATAAGCGTGTGGATATACCCCGTGAGTGCTTCTGACCACAATACTATTCTAACCAGCCGTGAAGACGTATCAAATGTGCACGTGTTACAGTACAGAACAGATTTTAATGTCGCTCTCCAAAATATAAACGTTGGGGTGTTTTCTCCATCAAACAGTTGTCCTCTAAATACATGGACGCACGTAGGGGTCACGTATAATGGTAGTAACACTGTCACCTTATATGTTAACGGGTCTGTTGTCGCTCAACGTACAGATATGGCTTGGAATTTAACTAACGCAGAAATGAAACTCTTTGGCGCCCGAGACGAAGGGTCCAAATTCTTCAATGGAAACATGCTTGATTTTAGACTGTACGGGGGTGACATCGGGGCAACTGAAATGGCTTCTATCGCCTCATCCGGCCCGGATATTTACTCTCTTAGTGCAAATGTGTACACTTATCTCGTAGATCTCACATGGAGAGGCGGCGAAACGACCAGTATTACTCGAACACTAAGTACAGACACGACAAGTGTATTCGACGTGCCATTTGAAACCGGAGAAACCAATACACGTATATTTGTCTTAAACCCTGGTGAGGATCATACATTTCATTTAATTGTAGATGGAAGTGTCGTGAACACGTTGGTGGTATCCGTCCCAACTGTAAGTGAATCAACCGTGGCCGACTTGCTTGAAGCATTGGATAATGATATTACCGTTCTATCTTCGGATGCCGTTGAGGAAATCGGATCATATCTTCCTTTGTCTCTTGAGGGTGAGAATAAATTAAAGAGTCGGATCACCAACAGTCTTGTGACAACAGTCCGGAATGATATTGTTTCATCTGCAGGAGTATCAAGTATTGATTCAGGTGCATACTTACTACTTAATCAAACCATAAACGTAGTCACCCCAGACGGTACGACGACTGCTGTATCGTATAACGAGACATCCGCACCCGACACGGTCACTGTTGGGGATACTTCGTATAGTGTCGGAGATGTGTTCATGGTTGGAAGTAGAAAAGTATGTGTGTATCGAGTTACATGATCTGATTCGAAATTGTCTTGTGTAGTTATTTTTTTTAAAAACTACTGTGCAAGAGCCAGGGGAATAAGAGACAAAAACGAAAAACTATCATAAAGAAACAAGAAGGCTAATTTTTGGGCCATAAACATATTATGGTAATTTATTGTTTGTGGGGACAACGTCCCGTTAGCCCACCCCTCGCTCCACCCCTCCTGCTCACTCATCCTTCCAATCTTATCTTCCACACCCAAACACTCATTTACAGTTAATTATCGAAACGAGACTAAGAATGCGTGTGTAACAGATTGTATGAAGACCATCGCTGCTGTCACAAGCTGTAAGACTCGCTCTATTTGTGTAGCAGTAGCAGCCACATAAGATCTTTCATTACATACGCTCTATTTATGGAGACCATCTTGGTATCGCAAGCCGAAAGACATGCTTTATTTGCAATAGTAGCGACGGTATAGAAGATATCAGTCACGGACACATGAAAGTACCGACGGCAAAAAGGCCAGACGGCGCAAAAGAAGCTGCATGGGCATCATCGAGCTCCTCCCCTACACCTCTCACTCTGCTCTGCTACCTCTTCTACTTCTTTTCTTATCGTCCACCATGTCGACGCAGGAGATTCAGGATTCGGAATGTGACGGCACTATTGTACTACGGCCGAGCAAGGGAAAAGGTGCGATGTACACACACACATTTTTATATTTTTGCAGACGCTCTACAGTCGGGTAGAGCTATCAGCAAGATCGTGGTGCGCTGGTAGAGTACCCCAGTATTTTAACTGCTGTTAAATTTGTTCGCCTCTTGACAGGGCGAGAAAAAAATCCAACGAGACTAATAATAAGAGAGGAGTGTGAAAGCGAAGAAGACACCGATGTCGAGTATACACAAGCATCATGGCCGGAGCTGGAGGACGAAAATCCTCAAAAGAAAAGGTGTGTGTGTTGTGTATGTGTCGAATTCAGAGAGTATCAACAGATACATACCCGAACGTACCAGAAAATCAACGGCGTAGTACCACCTGTGTGTGTTCTGTTGTTCTTGAACCCCGCCTCTCAACTACCTCTTCGCGAGGTGCCTCTGTTTATGAGGATGTGAACGGAGGAACGCACACAAACACACACCCGGCTCTGCAAACGTAAATTGTCTTGCTTTGTACTCTCGCCTCTCACGTACCAACATCGCTTCTCACGTTCCTTGTGACGATTAATCTTTCTTTCCAATGATAATTACGGAAAAAATGTATACAAGCTTATGGACTCATCTCTTGTTGTTTCCCTGATACATTCGCGTTAAATTCAATCATGTATCTTCACGCAGGACTTGCCGGAGGCCCGATACCACTATTTGTGGAAACAACGAAGAAGGACTTAACAAGTGGGAAATCTTGAGGGACAGTCAAAATAATGTGATGGAACTTCAAAAGGTCGCTGAAAAAGGTCGGATCTTTTTACAAGAAGCTGTAGTAACAGGCTTTCGAGGAATGGACAAAAGAATCCGCTGTCAAGAGGAGAGATCGGACGTTTTAGACAAGAGAACGAATGGTATTGAGCGAAAAGTTGATGGTGCAGTGGTCGGCATGAACACGTATCAAAGATACTCGAAAAATGAAAACAAGCAAAGGAAAGAGGAAAACATAGAGGTAAACAAAAACCTTAGCAGGCTTGAGAGGAAGGTGGAAGACAACTTAGCCCTTGGCAATGAGTTAAAGG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Feldmannia irregularis virus a
Delaroque,N., Boland,W., Muller,D.G., Knippers,R., Mueller,D.G.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
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Feldmannia irregularis virus a strain FirrV-1 contig D, partial sequence
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3,329
NC_043257.1
Feldmannia irregularis virus a
Delaroque,N., Boland,W., Muller,D.G., Knippers,R., Mueller,D.G.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2019-06-28
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National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2013-11-14
POR1
Bocaparvovirus carnivoran4
Bocaparvovirus
Parvoviridae
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5,479
RefSeq
null
Portugal
Portugal
Felis catus
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2012-12-01
null
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University of Sydney, Science
Australia
2022-12-06
FPV-2
Bocaparvovirus carnivoran4
Bocaparvovirus
Parvoviridae
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GenBank
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Australia
Australia
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2017
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21,523
ON595890.1
Feline bocaparvovirus 2
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-1
Bocaparvovirus carnivoran4
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,458
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2017
SAMN28578126
PRJNA841246
MAG: Feline bocaparvovirus 2 isolate FPV-1, complete genome
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21,829
MT633126.1
Feline bocaparvovirus 2
Guo,X., Li,W., Wang,Y.
Anhui Agricultural University, Animal Science and Technologial College
China
2020-06-23
HFXA-6
Bocaparvovirus carnivoran4
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,320
GenBank
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China
China
Felis catus
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2019-08
null
null
Feline bocaparvovirus 2 isolate HFXA-6, complete genome
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48,943
KF792837.1
Feline bocaparvovirus 2
Ng,T.F.F., Mesquita,J.R., Nascimento,M.S., Kondov,N.O., Wong,W., Reuter,G., Knowles,N., Vega,E.M., Esona,M.D., Den,X., Vinje,J., Delwart,E.
Blood Systems Research Institute, Molecular Virology
USA
2013-11-12
POR1
Bocaparvovirus carnivoran4
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,479
GenBank
null
Portugal
Portugal
Felis catus
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2012-12-01
null
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Feline bocavirus 2 isolate POR1, complete genome
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92,522
NC_039044.1
Feline bocaparvovirus 3
Zhang,W., Li,L., Deng,X., Kapusinszky,B., Pesavento,P.A., Delwart,E.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2018-08-24
FBD1
Bocaparvovirus carnivoran5
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,407
RefSeq
1
USA
USA
Felis catus
feces
2013-10
null
PRJNA485481
Feline bocaparvovirus 3 isolate FBD1, complete genome
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University of Sydney, Science
Australia
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FPV-2
Bocaparvovirus carnivoran5
Bocaparvovirus
Parvoviridae
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5,353
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null
Australia
Australia
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Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
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2022-11-30
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Australia
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University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-3
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Parvoviridae
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Felis catus
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2017
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PRJNA841246
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21,827
ON595889.1
Feline bocaparvovirus 3
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-1
Bocaparvovirus carnivoran5
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,423
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578142
PRJNA841246
MAG: Feline bocaparvovirus 3 isolate HC-1, complete genome
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21,828
MT633127.1
Feline bocaparvovirus 3
Guo,X., Li,W., Wang,Y.
Anhui Agricultural University, Animal Science and Technologial College
China
2020-06-23
HFXA-18
Bocaparvovirus carnivoran5
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,420
GenBank
null
China
China
Felis catus
feces
2019-08
null
null
Feline bocaparvovirus 3 isolate HFXA-18, complete genome
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48,944
MT633128.1
Feline bocaparvovirus 3
Guo,X., Li,W., Wang,Y.
Anhui Agricultural University, Animal Science and Technologial College
China
2020-06-23
HFTH-22
Bocaparvovirus carnivoran5
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,417
GenBank
null
China
China
Felis catus
feces
2019-08
null
null
Feline bocaparvovirus 3 isolate HFTH-22, complete genome
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48,945
KM017744.1
Feline bocaparvovirus 3
Zhang,W., Li,L., Deng,X., Kapusinszky,B., Pesavento,P.A., Delwart,E.
Blood Systems Research Institute, Molecular virology
USA
2014-08-11
FBD1
Bocaparvovirus carnivoran5
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,407
GenBank
1
USA
USA
Felis catus
feces
2013-10
null
null
Feline bocaparvovirus 3 isolate FBD1, complete genome
ACGCGCGCGCGAAGCGCGCGGCGGCGAAGCCGCCGGCGTTATTTAACCGGCGCGATGACGTGTAAGTGTAGGTGGTATGTTAAGACTATAAGGATCAATGATAGGTTCAGCCATGTAATGATTAACTGACCTTTAACATGATTGGTTGAGAGTTAATGATTAACACATGACCTTTACAATGATTGGTTCTCTGAACCTATAAAAGGAGATGCATTTCCGTATCTGTGTCATTCTGCTTCCGGCGCTCGACGAGAGAGGAACTCCTGGAGCCATCTCGATACCTGCGATCGGTGAGTCGCCAGCAATGGCTGAATTCGATCTGGCTAGCCTCGACGATTTCATCCAATTTGCAGACCCAGCATACACCTATGTGCTGCGTCTACCACTACCTAAAGATCAGAATTATGATGCTCATCTACAGAAAGCATTATGCTACGCTCACGCGGACATCTTGGATGATCCGCTACTCTTTGCTGCCATGCCAGGACCAGAAAGTCCTGGGGCTCAAGCTGATTTTCTGGAGCGCTTTGGTCCTCTGCGATGCTTTGGGACTGAGGTGTGTTATGCTGCGCACATGGCGGCATTTCACTTCTTTTGCACAAAACAAGGGAAAAGACCACCAATAGCGAGTATCTATAGCCAGTGTGAAATAGGCGCAGAAAACATCCACGTGCATATGGTGCTGGCGGGAGACGGCCTGTCCAGATTCTCAGCTAAATCAACCGCGTACATTCTGGGGCAAAAATTTGCAGACAACCTAATAGCAATCCTATCCTCAAATCTGACAAGCGGTAACATTAGCAATCCTAGCTTTGCTTCTTCGCTAATCGCCGCTCTAAAGGAAGCTCAAAAAAAATGTGAGCCAGGCAACGCTGGCGACCTTTGTACCGTGCTGCAGTACAAAAGCCGCAATGGCGCCAGGTATGCTTGTCGAATCGATCCGCGTGAGTTTATCTGTAACTACCTATTATGTAAGAATCTAAAGTTCACATCCTTTGTGGAACCGGAAAAGGCAACTCCGCTATCAGCTTTCTTTCCAATCTCTTCTAAAACATATGCCTGTACACTAATTAATGGAAAATATGTTCCACCTATTAAACGCCGAGAATGGTGGAACCTTCTACGAGACAAGGTCTTAGTTAAAGAAGAACCTATATTCAAAGGAGACGTCTTTGGTGATCTACCAAAGGTAAATACCGCGTCATGGAAACTCACTGGCACGATGGGTCTCGGTGGTGCTCAACCGCATGTAAACGCTAGAATGAGCAAAAAAGAATCACTAATTTTAGACTGTTTAAAACGCTGTGAGGACAATCTATGGTTAACCTATGAGGATCTGGTCGGTGGATGTGCAGATTTGGTTTTAATGCTAGAATCTATGCCGGGTGGAGGCAAATTGATTGAATCTGTATTAAATATGCTGCATGTTCGAATCACGCAAGCGCATAACGCTTTAAGCTACTTGCATGTCAGATATGATTTTAAAGAACTAGCCACACACAGAGACACACTCTACACAAATAAATGTTGGCAATTACTGTTAAAACAAGGATATAATCCTTGGCAAGCAGGACACTGGCTATGTTGTGTCTTGAGCAGAAAAGCCGGAAAACAAAACACAGTAAACTTTTTTGGTCCGGCTAGTACCGGTAAAACTAATATGGCAAAAGCAATCGTCAACGCCGTCAAGCTGTATGGCTGTGTCAATCACCAAAATAGAAACTTTATTTTCAACGACTGCGCGGCCAAACTAATTGTATGGTGGGAAGAATGTTTAATGCATACAGACTGGGTAGAGCAAGCCAAATGTATCTTGGGAGGCACTGAATTTAGAATTGACCGAAAACACAAGGAATCTCATTTACTGCCTCAAACTCCTGTCATCATCTCTACCAACAATAACATATATCAAGCGACAGGAGGCAACTGCATCACTCACGTACACGAGGCTCCACTAAGAGAGCGTGTAGTCCAATTTAATTTTATGAAAAGACTCGAAACTACATTCGGGGAAATAAATCCAAAAGAAATAGCTGAATGGTTGGCCGTATGCACCGCTCGCTTTGAAATCTCGCTAGCCGCTTTTCACGCGACGTGGAAACTAGACAAAACTCCAAACGACTTTCCGCTGAATCAATTCTGTCCTGGTCATTCGCAGGATCTGACTCTCTACGAGACCGGAACGTGCAACAGCTGTGGAGGATTCTATCCGCTAGAATTTCACGACCGCGGGGACATCGAAGACCCTGTCGCAGGTACGAGTCACGATTTACTCTTGACTCCAAACTCTAAAGCTATTGTACAAGATTTTGACCTAAATCTCTTAAAAACTCCAACAGCGACACCAAGTACCTCGAGGCGAGACGAGTCTGACGATCCGGACGAGCCGAGAAAGAAGGTACGGAAAACAAAACACTGCAAAAAAACACTCTTTAGTGACGACTGGTGTTCTCAACCGCGAGACGATGTCGAGTGGAGAATCATCGAAACGTCTTCTCGAAAAACGCCGTCGCCCGAGGTCGCTGGACCGGTCTCCGAGTCCGATTCCGGACAAGCGAGTTCGCTGGAGCTCGACCTCTCACCGAGCGAGTGGGGAGAAATGCTCGGACTCATCGCCGGAAACATCGAAGAAGGAGAACCACCAATCACGCTCCACTGCTTCGAGTCACTGTCTGACGATGACACATTTTGTTAAAAAAATTGAAAAACATCCGCGCGCGTTAAAACCTGTAAAATCAAATAAAACAACTCCTATAGATGTATTTATGCGCCATAGGGCCAAAGAACAGGACGTCTGTCCGCCGTTCTGTGGCTTTTATTGGCATAGTACTAGATTAGCTCGAATGGGTACTGATTATATATTTAACATAGCTAAAGGACAATTTCAAGAAATAAGTAAAAACAATGTAATCTCATGGGATCAATGTAGAGACATGTTATTTGATTTTAAAAAAATGTTAGATTTTAGATACGGATCCATGTTATGGCACTTTGCCATGGGGGAAAATTGTGATAAATGTACTTATTGGGACAAAGTGTACTCTGCTCACCTGGCTCATATCGCTCTACCTACACAGGAAGAGGACTCTGACCCTGTAACTGACGCTGAAATGCTGGCGGTTGCCAAGGGGGTTGATGGCACCAACCAATAGACGTCCTGGCGGTTGGACCGTTCCTGGCTTTAAATATCTTGGTCCATTTAATCCTCTCAATAACGGTGAACCTATAAACGAAGTAGATAAAGTAGCTCAAACACACGATAGAGCATATCAAGCCTATATTGACTCTGGCGTCAATCCATATCTTAACTTTAATAAAGCTGACTCTGATTTCATTGACTCGTTGTCTTCTGACTCGTCTGTGGCGGGCTGGCTTGGCAAGTCAGCGTTTAAACTCAAGAGGTTATTGGCGCCACATCTTACAAAAGAAAAAGAGACTGCGAACAAAGGATCGGGAGCGGGCGGAAAACGACCTAGACTCGATCCGGTACGCGCGCAAAAAAGAAAATACTACTTTGCCAGACAAAACCAGGGTAAAAACTCAAAACAACAAAAAATGGAAAATGAAGTGGAAACGGCTGGAGATGGACAAGAGGGGGCGCCTGCGAGCGATTCTCGCGCTGGTGGCAGTGGGAATGGTGGGACTGGTATGGGTGGCGGTGGTCATGGGGTGGGTATAAGTACAGGAGGATGGAAAGCAGGAACCATGTTCTCTGACACAAAAATCATCACCACCTCAACACGACAATTTTACGCACCAATATACAATGAACACTTATACAAAAAAGTTGTAGGGGACAAAAATTGGATAGGAATCACAACACCATGGGCATATTTTAACTTTAATGAATATGACTCACACTTTACACCAAACGACTGGCAGCGTCTCACGAACGAATATGCCAAATGGAGACCCGTAAGAATGCATGTAAAAATATATAATCTTCAAATCAAACAAAAAGTCACATTAGGTTCAGATACATTATATAATAACGATCTCACTGCCGGTGTTCACATTTTTTGTGACGGGTCTCATCAATTCCCATACTCACAAGCGCCTTGGGATCACGGAACCATGCCAGAATTACCATATGACACATGGAAACTGCCACAATATGCCTACTTTCAATTCCAAGCCGACATCACATACGTCGACACTAGTTCATTAGAAGCAGATAGTGTCAAAAAAAACATGGCGAGAGCTGGTCCATTTTTTATCTTAGAATCTGCAACTCACGAAGTTCTGAGAACAGGAGAAGAAACAGAATTTAATTTTTCATTCGAAAGCGGATGGGTGGATAATACTCGAGCCTATGTCTTACCACAAGCCGACATTAATCCAATGGTACAGACAAGACGATACTTTCCAACATTTGACAGACAAAGCAGCACTAGATTCTCTTACTCTAGATACTCACCATACAACAAACCAAGCAATTGGATGCCAGGTCCCAGTATAGGATACATTGGAAATACACAACCAATAGGGACCGGCAGTGCTTGGAAAGCAAGAGGACCAATCACTGTCTGTGCTCATCCATATTTTACAGCTCCAGAAGGTAGTTCAGGGACAACCAATGACAATCAATCAAACACGGCATTACCATCAGTCGATGGAATGCAAAAATCAGGTCACGATGTAACACCCGCAAACGGGGCTTGCAGTAGACTAGACTCCATAGATCTTGCCTACGATTCATCAGAATACAGCGCAGATCAACAAAGGTTAATTACTAGAAACATAGACAGTGATCTAGCAAGATGGGGCTCCGTCTGGGCACAAGATGGCCATAATGTTGAAATTAATGCAAATGGTACCACTGGGGCCGCAAGAACAAATGTCTCACAATTAAAAAATGTATGGATGTATCCAAATCAAGCATGGGACACAACACCAATTGGTAGAAACAATCCAATATGGGATAAAATTCCAAACACAGACAGACACACCATGCTAGACTCAGGAGACGGAACACTACCCATGGCACATCCTCCTGGTACCATTTTCATAAAAGTAGCCAAAGTTCCAGTCCCAACAGAAAATAATACAAATTCATATTTAGACTTATACGTTACCGGTCAGGTCACATGCACCATTGAATGGGAATGTAAACGATTCTCCACAAAAAATTGGCGTCCGGAAATGCGAACAACGCCTGCGGCGTTCGCAGATCCACTATTGTACACAGTCGACACAAACGGGGTCTACAATACACCAGAAGTATTTACAGAAGCCATGCCCACAAAAATTGGAATCAACAAAGTGCTGTAATGTTTATGATTCAAATAAAGGTAGTCATAAAATGATCACGTGGTGTAATGATTCTTTTTTGGCGCGAAGCAAAACTACAGTTGATCTCTATTCTCTTAATGGACCTACACCTACTCTGACACGTCAGTGTATTGGA
89,224
NC_017823.1
Feline bocavirus
Lau,S.K., Woo,P.C., Yeung,H.C., Teng,J.L., Wu,Y., Bai,R., Fan,R.Y., Chan,K.H., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Teng,J.L.L., Fan,R.Y.Y.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2012-05-04
null
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,331
RefSeq
1
Hong Kong
Hong Kong
Felis catus
null
2009-12-22
null
PRJNA485481
Feline bocavirus, complete genome
CCTGGCGCGATGACGTGTCAGTGAGGGTGTTGTCTAAAGACTATAGGGATCAATGATAGGTTCAGCCATGTAATGATTAACTGACCTTTAACGTGATTGGTTGGGAGTTAATGATTAACATGTGACCTTTACAGTGATTGGTTCTCTGAACCTATAAAAAGAGCTGCATTTCCGTGTCTGTGTCATTCTGCTTCCGGCGCTCGACGAGATCGGACCTGGAGAAGAACAAGTTCCGTCAATTGGTGAGTCGCCATCAATGGCTGAATTCGATACAGCAAGTCTCGACGACTTCATCCAATTTGCAGACCCAGCATATACATACGTGCTGCGTCTTCCATTACCTACAGGGGAAAATTATGAGAGCCAGCTACAGAATGTATTATGCGCTCGATACCCCGATTTATTATCCGATCCGGCATTGTTCGCAACAATGCCTGGACCTGAATCTCCAGGCGCTCAGACTGATTTTTTGGAGCGTTTTGGTCCTAGCCGCTGCTTTGGGGCTGAAGTCTGCTATGCGGCGCATATGGCAGCCTTTAACTWCTTTAGTAGGAAACAGGGAAARGCGCCRCCTATYGCCAGCATCTACACACAATGCGAATTAGGCCAGAGAAACATTCAWTGTCATCTAGTCATGGCCGGCGACGGTCTGTCTCGTTTCTCGGCTAARAGCGCTGCCTACATACTAGGCCAAAAATTTGCAGACAATCTGATTTCTATCATCGAAAATAATCTAAGAAARGGCGACGTMAGYAATCCAGCTTTTGCTACCGCTTTTATCARAGAAATACAAGARGCTCAAAGAAAATGCGAACCAGGCAACGCTGGCGACCTTTGTACTGTGWTGCAATATAAAAGTAGAGGAGGCGGCATGTACGCGTGCCGAATCGATGGCCGCGAGTACATCTGTAACTACCTATTATGCAAGAACCTGAAATGGGTATCTTGCGTGGAACCAGACAAGGCGACTCCTCTTAAAGCCTTCTTTCCAATCGCTTCAAAAACATATGCATTTACTCTAATTAATGGAAAGATTGTTCCGTATCACGTACGTCGTGAATGGTGGAATCAACTACGAGACAAGGTCCTAGTCAGGGACGAACCAATCTTTAAGGGAGACGTGTTTGGAGATCTTCCAAAGGTAAATGCTGCGTCATGGAAATTAACTGGTAATATGGGTCAAGGTACATCTCAGCCGCATGTGAATGCCAGAATGAGTAAAAAAGAATCATTAATACTAGACTGTCTTAAACGTTGCGAGGATAATCTATGGCTAACCTATGAAGATCTGGTCGGTGGTTGTGCCGATTTAATTTTAATGTTGGAATCGATGCCAGGTGGAAGTAAATTAATTGAGTCTGTACTTAACATGTTGCATGTTAGAATCACTCAAACTCATAGTGCGTTGTCCTATTTGCATGTGAGATATGACATGAAAGAACTGGCGACTCACGCAGACTCGCTCCACGCTAATAAAGCATGGAGATTACTACTAAAACAAGGATATAATCCTCTACAAGTGGGACATTGGATCTGCTGTGTCCTACATAAAAAAGCAGGAAAACAAAATACATTAAATTTCTTTGGACCGGCTAGCACCGGTAAAACAAATCTGGCAAAAGCAATCGTGAATGCAATCAAGCTCTATGGTTGCGTCAATCACCAAAACAAAAATTTTATCTTTAACGATTGTGCCGCAAAACTAGTTGTCTGGTGGGAAGAATGTCTCATGCATTCAGACTGGGTCGAGCAAGCTAAATGTATCTTGGGCGGCACGGAGTTTAGAATTGACAGAAAACACAGAGAATCGCATCTATTGCCACAAACTCCTGTAATCATCTCAACGAATAACAATATATATCAAACACTGGGTGGCAACTCGGTCTCACATGTACATGAAGCTCCTCTAAGAGAAAGAGTCGTCCAGTTTAATTTCATGACACGTCTAGAAAGCACCTTTGGAGAGATTGAACCAAGAGAAGTAGCCGAATGGCTATCCATCTGTCTCTCTCGGTTTGACATCTCTCTGGTTGGCTTTCATACTCAATGGAAGCTAAATAAAACTCCAAATGACTTTCCATTGGCTAAATTCTGCGGTGGTCACTCACAGGATCTCGTGTTACATGAGACCGGAACGTGTATGAGCTGTGGCGGATACTATCCTCTAGAACTACACGATCGAGGCGACATCGAGGACGCTACACCAGGTACGAGCTACTCAACTCTATTACAATTAACACCTAAATCTGAAAAATACATACAAGAATTTAACTTGGATCTCTTGAAATCTCCAATAGCGGCCACGAGCACTCCTGTGACTCGACAGGATCCACCTGAGCTTCCTCCAAAAAAGAAGGTACGCAAAGAAAAACACTGCGCACGCGCTCTCTTTACTGACGACTGGTGCTCTCAACCTCGAGACGATGTCGAGTGGCGCGTCGTCCAAGAACGAGCAGAAGCGGCGGCGGCCGAGGTCTCTGGATCGAGATCCGAGTCCGATTCCGGACAAGCGAGCTCGATGGAGCTCGACCTCTCACCAGAACAATGGGGAGAGATGCTCGGACTCATCTCCGGGGACATCGAAGCGGGAGAACCGCCGATCACACTCCACTGCTTTGAATCCATCACCGAAGCTGACTTACTTTGTCAAACGGACTCAGAAACCGAATAAACAAACACCTCTTGATGTCTTTATGAAACATAGAGCCAAAGAGGGGGGAGATGTACCTCCATTTTGTGGGTTTTACTGGCATAGTACTAGATTAGCAAGATTTGGAACAGATGCAATCTTTAATTTGTATAAACCTAAATTTCAAGAAATGTCAAAAAACAATGTAATTACGTGGGATCAATGTCGTGATTTGTTGTTTGATTTTAAAAAGAACCTAGACTATAAATACAGATCTATGATGTGGCATTTTAGCATGGGTGAACAATGTCATAAATGTAATTACTGGGATAAAATGTACGCTGGGCATCTGGCTAATGTATCTCTATCTACACAGGAAGAGGACTCTGACCCTGTAACTGACGCTGAAATGCTGGCGGTTGCCATGGAGGTTGATGGCACCGACCAATAGGCGTCCTGGCGGTTGGACTCTGCCCGGTTTCAGATATCTTGGTCCATTTAATCCATTGAATAACGGTAAACCAGTAAACGAAGTAGATAAAGTTGCTCAAAAGCACGATAAAGCTTACGATTCTTATATCAAGGCTGGCGTCAATCCATATTTGCACTTTAATAAAGCTGACTCTGATTTCATTGATTCGCTGTCTACTGATTCGTCTGTTGCCGGGTGGCTGGGAAAATCGGCGTTTAAACTCAAGAGACTTTTGGCGCCACATCTTTCAAAAGAAAAAGAAGCAGCGGGTAATAAAGGAGGAACTGGTGGAAAACGCGCCAAGCTTGATCCGGTACGGGCTCAAAAAAGAAAATATTATTTTGCCCGTCAAAACCAGGGAAAAAATCCTAAACAACAAAAAATGGAAAATGAAGTTGAGACGGCTGGGGATGGACAAGAGGGGGCGCCAGCTGGCACTGCTCGTGCTGGTGGTGGTGGTAACGGTGCTGGTATGGGTGGTGGTGGCCATGGTGTCGGTGTAAGCACGGGAGGGTGGAGAGCTGGAACTATCTTTTCTGATAATGTTATAATTACAACATCAACTAGACAATGGTATGTTCCAATATATAATGGTCATCTGTACAAAGAAATATTCGCAAATGGGAGCGTAAGAGAATGGGTAGGAATAAGTACCCCTTGGGGATACTTTAATTTCAATGAATACGATGCTCACTTTACACCAAACGATTGGCAACGACTCACAAACGAGTATGCCAAATGGAGACCAAAAAGAATGCATGTCAAGATATACAATCTCCAAATTAAACAAAAGGTGACACTGGGGGTGGACACCCTATATAACAACGACCTTACGGCGGGTGTACACATTTTTTGTGACGGTTCTCATCAATTCCCATACTCACAAAAACCTTGGGATTTTGGAACAATGCCAGAATTGCCATATGATGTATGGAAGCTTCCACAATACGGGTATTTTCAATTTCAAAATGATCTCTCAGATCAATCATCAAACTCGCTTGCAGCAGATAATGTAGAAAAAAATATTGTGAGAAATGCTCCATTTTTTGTATTAGAATCTGCATCTCACGAGGTCCTCAGAACAGGAGAAGAAACAGAATTCAACTTTGAATTTGAATGTGGGTGGGTCACAAATACACGTGCATATGCTCCGCCTCAGGCAGACTTCAATCCATTAGTTGAAACTAGACGTTATTATCCAACATACGACAACTCATCTAGCACTAAATTTGTATACGCTAGATATTCACCATATAACAAACCTAGTAACTGGATGCCCGGTCCGAGTATTGGATATATAGGAAACACAACAACCGGCTCAAACTACCAAACAAGAGGGCCAATCACAGTATGCCCACATCCATATTTTACTACACCTGGAAATTTAGAAACAGACAGGGCATATGACCCACAAAGTGGAACAAATACATTAACCGAAGCTGGCATGAGAAAATCGGGATACGATGTAACACCTGTAAATGGTGCCTGCTCCCGACTGGACTCTGTTGACTTGGCATATGATTCGTCTGAATATAGCTTAAATCAAACAAAATTAATTTCAAGAAACATAGATAGTGACATGGCTAGATGGGGTTCAGTGTGGGCACAGGATGGATTGAATAAAGAAATAGGAGACAATGGACAACCAAACAACACAGACAGAAAAAATATCAGCCAGCTAAAAAACATATGGATGTATCCAAACCAGGCATGGGACACAACACCAATAGCAAGAAACACACCCATATGGGACAAAGTTCCAGACACAGACAGAAACACTATGCTAGATTCGGCTGATGGCACACTACCGATGCCACATCCACCTGGTACTATCTTTGTAAAAGTTGCAAAAATACCAATACCAACCGAAAACAATGCAGATGCATATTTAGATCTATATGTAACAGGACAAGTAACATGTACAATAGAATGGGAAGTAGCAAGATTCAAGACCAAAAACTGGAGACCGGAAATCAGAACATCTGCAACAATGTTTTCAGACCCAAAAATATACTCTGTCAATGCCAGTGGTGTATACAATACACCAGAAACCTTCACAGAATCTATGCCAACAAAATGGGGAATCAACAAAGTTCTGTAAAAATAAAATTACATCATTCATCAAACTGTACGTGTCACGTGAGTTTTCTTTTGCGCGCCAAAAAATCTTTCGTTGATCTCTATACTCTTATACAACACCCTCCACACTGCTACGTCAGTGTGTATGAGA
7,335
OR544345.1
Feline bocavirus
Yao,X.
Henan Agriculture University, College of Veterinary Medicine
China
2023-10-17
null
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,053
GenBank
null
China
China
Felis catus
null
2021
null
null
Feline bocavirus strain NG/104, complete genome
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11,998
OR544346.1
Feline bocavirus
Yao,X.
Henan Agriculture University, College of Veterinary Medicine
China
2023-10-17
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Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
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China
China
Felis catus
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2022
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TGAGTTTTCTTTTGCGCGCCAAAAAAATCTTTCGTTGATCTCTATACTCTTAT
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Feline bocavirus
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Henan Agriculture University, College of Veterinary Medicine
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Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
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China
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2020
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Feline bocavirus strain XF/153, complete genome
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12,000
OR544348.1
Feline bocavirus
Yao,X.
Henan Agriculture University, College of Veterinary Medicine
China
2023-10-17
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Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
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China
China
Felis catus
null
2022
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Feline bocavirus strain XF/148, complete genome
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12,001
OR544349.1
Feline bocavirus
Yao,X.
Henan Agriculture University, College of Veterinary Medicine
China
2023-10-17
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Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,053
GenBank
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China
China
Felis catus
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2021
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Feline bocavirus strain DL/143, complete genome
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OR544350.1
Feline bocavirus
Yao,X.
Henan Agriculture University, College of Veterinary Medicine
China
2023-10-17
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Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,052
GenBank
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China
China
Felis catus
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2021
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Feline bocavirus strain NG/74, complete genome
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12,003
OR544351.1
Feline bocavirus
Yao,X.
Henan Agriculture University, College of Veterinary Medicine
China
2023-10-17
null
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,052
GenBank
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China
China
Felis catus
null
2020
null
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Feline bocavirus strain SB/266, complete genome
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12,004
OR544352.1
Feline bocavirus
Yao,X.
Henan Agriculture University, College of Veterinary Medicine
China
2023-10-17
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Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,052
GenBank
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China
China
Felis catus
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2022
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Feline bocavirus strain SB/127, complete genome
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12,005
OR544353.1
Feline bocavirus
Yao,X.
Henan Agriculture University, College of Veterinary Medicine
China
2023-10-17
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Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,158
GenBank
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China
China
Felis catus
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2022
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Feline bocavirus strain SB/270, complete genome
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12,006
OP158215.1
Feline bocavirus
Liu,Y., Sun,L., Tu,Z., Sun,S., Sun,Y., Yi,L., Tu,C., He,B.
Graduate School, Changchun Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences
China
2023-03-15
XKBM
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,123
GenBank
1
China: Heilongjiang
China
Prionailurus bengalensis
null
2021
null
null
UNVERIFIED: Feline bocavirus isolate XKBM, complete sequence
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17,381
ON595895.1
Feline bocavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-1
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,330
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2017
SAMN28578132
PRJNA841246
MAG: Feline bocavirus isolate FPV-1, complete genome
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21,831
ON595896.1
Feline bocavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-2
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,300
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
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2017
SAMN28578125
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MAG: Feline bocavirus isolate FPV-2, complete genome
GTTTAAAGACTATAGGGATCAATGATAGGTTTAGCCATGTAATGATTAACTGACCTTTAACGTGATTGGTTGAGAGTTAATGATTAACATGTGACCTTTACAGTGATTGGTTCTCTGAACCTATAAGAGGAGCTGCATTTCCGTGTCTGTGTCATTCTGCTTCCGGCGCTCGACGAGATCGGACCTGGAGAAGAACAAGTTCCATCAATTGGTGAGTCGCCATCAATGGCTGAATTCGATACAGCAAGTCTCGACGACTTCATCCAATTTGCAGACCCAGCATATACATACGTGCTGCGTCTTCCATTACCTGCAGAGGGGAATTATGAGAGCCAGCTACAAAATGTATTATGCGCTCGATACCCCGATTTATTATCCGATCCGGCATTGTTCGCAACAATGCCTGGACCTGAATCTCCAGGCGCTCAGACTGATTTTCTGGAGCGTTTTGGTCCTAGCCGCTGCTTTGGGGCTGAAGTCTGCTATGCGGCGCATATGGCAGCCTTTAACTTCTTTAGTAGGAAACAGGGAAAGGCGCCACCTATCGCCAGCATCTACACACAATGCGAATTAGGCCAGAAAAACATTCATTGTCATCTAGTCATGGCCGGCGACGGTCTGTCTCGTTACTCGGCTAAGAGCGCTGCCTACATACTAGGCCAAAAATTTGCAGACAATCTGATTTCTATCGTCGAAAATAATCTAAGAAAGGGCGACGTAAGCAATCCAGCTTTTGCTACCGCTTTTATCAAAGAAATACAAGAAGCTCAAAGAAAATGCGAACCAGGCAACGCTGGCGACCTTTGTACTGTGTTGCAATATAAAAGTAGAGGAGGCGGCATGTACGCGTGCCGAATCGATGGCCGCGAGTTTATCTGTAACTACCTATTATGCAAGAACCTGAGATGGGTATCTTGCGTGGAACCAAACAAGGCGACTCCTCTTAAAGCTTTCTTTCCAATCGCTTCAAAAACATATGCATTTACTCTAATTAATGGAAAAATTGTTCCGTATCACGTGCGTCGTGACTGGTGGAATCAGCTACGAGACAAGGTCCTAGTCAGGGACGAACCAATCTTTAAGGGAGACGTGTTTGGAGATCTTCCAAAGGTAAATGCTGCGTCATGGAAATTAACTGGTACTATGGGTCAAGGTACAGCTCAGCCGCATGTGAATGCCAGAATGAGTAAAAAAGAATCATTAATACTAGACTGTCTTAAACGTTGTGAGGATAATCTATGGCTAACCTATGAAGATCTGGTCGGTGGTTGTGCCGATTTAATTTTAATGTTGGAATCGATGCCAGGTGGAAGTAAATTAATTGAGTCTGTGCTTAACATGTTGCATGTTAGAATCACTCAAACTCATAGTGCGTTATCCTATTTGCATGTGAGATATGACATGAAAGAACTGGCGACTCACGCAGACTCACTCCACGCTAATAAAGCATGGAGATTACTGCTAAAACAAGGATATAATCCTCTACAAGTGGGACATTGGATCTGCTGTGTCCTACATAAAAAAGCAGGAAAACAAAATACATTAAATTTCTTTGGACCGGCTAGCACCGGTAAAACAAATCTGGCAAAAGCAATCGTGAATGCAATCAAGCTCTATGGTTGCGTCAATCACCAAAACAAAAATTTTATCTTTAACGATTGTGCCGCAAAACTCGTTGTCTGGTGGGAAGAATGTCTCATGCATTCAGACTGGGTCGAACAAGCTAAGTGTATCTTGGGCGGCACGGAATTCAGAATTGACAGAAAACACAGAGAATCGCATCTATTGCCACAAACTCCTGTAATCATCTCAACAAATAACAATATATATCAAACACTGGGTGGCAATTCGGTCTCACATGTACATGAAGCTCCTCTAAGGGAAAGAGTCGTCCAGTTTAATTTCATGACACGTCTAGAGAGCACCTTTGGAGAGATTGAACCAAGAGAAGTAGCCGAATGGCTATCCATCTGTCTCTCTCGGTTTGACATCTCTCTGGTTGGCTTTCATACTCAATGGAAGCTAAATAAAACTCCAAATGACTTTCCATTGGCTAAATTCTGCGGTGGTCACTCACAGGATCTCGTGTTGCATGAGACCGGAACGTGTATGAGCTGTGGCGGATACTATCCTCTAGAACTACACGATCGAGGCGACATCGAGGACGCTACACCAGGTACGAGCTACTCAGCTCTATTACAATTAACACCTAGATCTGAAAAATACATACAAGAATTTAACTTGGATCTCTTAAAATCTCCAATAGCGGCCACGAACACTCCTGTGACTCAACCGGATCCACCTGAACTTCCTCCAAAAAAGAAGGTACGCAAAGAAAAGCACTGCGCACGCGCTCTCTTTACTGACGACTGGTGCTCTCAACCTCGAGACGATGTCGAGTGGCGAGTCGTCAAAGAGAGAACAGAAGCGGCGGCGGCCGAGGTCTCTGGATCGAGATCCGAGTCCGATTCCGGACAAGCGAGCTCGATGGAGCTCGACCTCTCACCAGAACAATGGGGAGAGATGCTCGGACTCATCTCCGGGAACATCGAAGAGGGAGAGCCGCCGATCACACTCCACTGTTTTGAATCCATCACCGAAGCTGACTTACTTTGTCAAACGGACTCAGAAACCGAATAAACAAACACCTCTTGATGTCTTTATGAAACATAGAGCCAAAGAGGGGGGAGATGTACCTCCATTTTGTGGGTTTTACTGGCATAGTACTAGATTAGCAAGATTTGGAACAGATGCAATCTTTAATTTGTATAAACCTAAATTTCAAGAAATGTCAAAAAACAATGTAATTACATGGGATCAATGTCGTGATTTGTTGTTTGATTTTAAAAAGAACCTAGACTACAAATACAGATCTATGATGTGGCATTTTAGCATGGGCGAGCAATGTCATAAATGTAATTACTGGGATAAAATGTACGCTGGGCATCTGGCTAATGTATCTCTATCTACACAGGAAGAGGACTCTGACACTGTAACTGACGCTGAAATGCTGGCGGTTGCCATGGAGGTTGATGGCACCGACCAATAGGCGTCCTGGCGGTTGGACTCTGCCCGGTTTCAGATATCTTGGTCCATTTAATCCATTAAATAACGGTAAACCAATAAACGAAGTAGATAAAGTTGCTCAGAAGCACGATAAAGCTTACGATTCTTATATCAAGGCTGGCGTCAATCCATATTTGCACTTTAATAAAGCTGACTCTGATTTCATTGATTCGCTGTCTACTGACTCGTCTGTTGCCGGGTGGCTGGGAAAATCGGCGTTTAAACTCAAGAGACTTTTGGCGCCACATCTTTCAAAAGAAAAAGAAGCAGCGGGTAATAAAGGAGGAACTGGTGGAAAACGCGCCAAGCTTGATCCGGTACGGGCTCAGAAAAGAAAATATTATTTTGCCCGTCAAAACCAGGGAAAAAATCCTAAACAACAAAAAATGGAAAATGAAGTTGAGACGGCTGGAGATGGACAAGAGGGGGCGCCAGCTGGCACTGCTCGTGCTGGTGGTGGTGGTAACGGTGCTGGTATGGGTGGTGGTGGCCATGGTGTCGGTGTAAGCACGGGAGGGTGGAGAGCTGGAACTATCTTTTCTGATAATGTTATAATTACAACATCAACTAGACAATGGTATGTTCCAATCTATAATGGTCATCTGTACAAAGAAATGTACGCAGCTGGAAGCGTAAGAGAATGGGTAGGAATAAGTACCCCTTGGGGATACTTTAATTTCAATGAATACGATGCTCACTTTACACCAAACGATTGGCAACGACTCACAAACGAGTATGCCAAATGGAGACCAAAAAGAATGCATGTCAAGATATACAATCTCCAAATTAAACAAAAGGTAACACTGGGCGTGGACACCCTCTATAACAACGACCTTACAGCGGGGGTACACATTTTTTGTGACGGTTCTCATCAATTCCCATACTCACAAAAACCTTGGGACTTTGGAACAATGCCAGAATTACCATATGATGTATGGAAACTTCCGCAATACGGGTATTTTCAATTTCAAAATGATATCTCAGATCAATCAGCAACCTCGCTTGGAGCAGATAATGTAGAAAAAAATATTGTAAGAAACGCTCCATTTTTTGTATTAGAGTCTGCATCTCACGAGGTCCTCAGAACAGGAGAGGAAACAGAATTCAACTTTGAATTTGAATGTGGGTGGGTCACAAATACACGTGCATATGCTCCGCCTCAAGCAGACTTCAATCCGTTAGTTGAAACTAGACGTTATTATCCAACATACGACAACACATCTAGCACCAAATTTGTATACTCTAGATATTCACCATATAACAAACCTAGTAACTGGATGCCCGGTCCAAGTGTTGGATATATAGGAAACACAACAACCGGCTCACAATACCAAACCAGAGGGCCAATCACAGTATGCACACATCCATATTTTACTACACCTGGAAATTTAAGCACAGACCAGGCATATGACCCACAAAGTGGAACAAATACATTAACCGAAGCTGGCATGAGAAAAGCAGGATACGATGTGACGCCTACAAATGGTGCCTGCTCCCGACTGGACTCTGTTAATTTGGCATATGATTCATCTGAATATAGCATAAATCAAACTAAATTGATTTCAAGAAACATAGATAGTGACATGGCTAGATGGGGTTCAGTGTGGGCACAGGATGGATTGAATAAAGAAATAGGAGACAATGGACAACCAAACAACACAAATAGACAAAATATTAGCCAACTAAAAAACATATGGATGTATCCAAACCAAGCATGGGACACAACACCAATAGCAAGAAACACACCCATATGGGACAAAGTTCCAGACACAGACAGAAACACTATGCTGGATTCGGCTGATGGCACACTGCCGATGCCACATCCACCTGGTACTATCTTTGTAAAAGTTGCAAAAATACCAATACCAACCGAAAACAATGCAGATGCATATTTAGATCTATATGTAACAGGACAAGTAACATGTACAATAGAA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21,832
ON595905.1
Feline bocavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-10
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,320
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2017
SAMN28578111
PRJNA841246
MAG: Feline bocavirus isolate FPV-10, complete genome
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21,833
ON595906.1
Feline bocavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-11
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,315
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2017
SAMN28578126
PRJNA841246
MAG: Feline bocavirus isolate FPV-11, complete genome
GTTTTGGGGGTGTTGTCTAAAGACTATAGGGATCAATGATAGGTTCAGCCATGTAATGATTAACTGACCTTTAACGTGATTGGTTGAAAGTTAATGATTAACATGTGACCTTTACAGTGATTGGTTCTCTGAACCTATAAGAGAAGCTGCATTTCCGTGTCTGTGTCATTCTGCTTCCGGCGCTCGACGAGATCGGACCTGGAGAAGAACAAGTTCCATCAACTGGTGAGTCGCCATCAATGGCTGAATTCGATACAGCAAGTCTCGACGACTTCATCCAATTTGCAGACCCAGCATATACATACGTGCTGCGTCTTCCATTACCTACAGGGGAAAATTATGAGAGCCAGCTACAGAATGTATTATGCGCTCGATACCCCGATTTATTATCCGATCCGGCATTGTTCGCAACAATGCCTGGACCTGAATCTCCAGGCGCTCAGACTGATTTTTTGGAGCGTTTTGGTCCTAGCCGATGCTTTGGGGCTGAGGTCTGCTATGCGGCGCATATGGCAGCCTTTAGCTTCTTTAGCAGAAAACAGGGAAAGGCGCCACCTATCGCCAGCATCTACACACAATGCGAATTAGGCCAGAAAAACATTCATTGTCATCTAGTCATGGCCGGCGACGGTCTGTCTCGTTACTCGGCTAAAAGCGCTGCCTACATACTAGGCCAAAAATTTGCAGACAATCTAATTTCAATCGTCGAAAATAATCTAAGAAAGGGCGACGTAAGCAATCCAGCTTTTGCTAACGCTTTTATCAAAGAAACACAAGAAGCTCAAAGAAAATGCGAACCAGGCAACGCTGGCGACCTTTGTACTGTGATGCAATATAAAAGTAGAGGAGGCGGCATGCACGCGTGCCGAATCGATGGCCGCGAGTATATCTGTAACTACCTGTTATGCAAGAACCTGAAATGGGTATCTTGCGTAGAACCAGACAAGGCAACTCCTCTTAAAGCCTTCTTTCCAATCGCTTCAAAAACATATGCATTTACTCTAATTAATGGAAAGATTGTTCCGTATCACGTGCGTCGTGAATGGTGGAATCAGCTACGAGACAAGGTCCTAGTCAGGGACGAACCAATCTTTAAGGGAGACGTGTTTGGAGATCTTCCAAAGGTAAATGCTGCATCATGGAAATTAACTGGTACTGTGGGTCAAGGTACAGCTCAGCCGCATGTGAATGCCAGAATGAGTAAAAAGGAATCATTAATACTAGACTGTCTTAAACGTTGTGAGGATAATCTATGGCTAACTTATGAAGATCTGGTCGGTGGCTGTGCCGATTTAATTTTAATGTTGGAATCGATGCCAGGTGGAAGTAAATTAATTGAGTCTGTACTTAACATGTTGCATGTTAGAATCACTCAAACTCATAGTGCGTTGTCCTATTTGCATGTGAGATATGACATGAAAGAACTGGCGACTCACGCAGACTCGCTCCACGCTAATAAAGCATGGAGATTACTGCTAAAACAAGGATATAATCCTCTACAAGTGGGACATTGGATCTGCTGTGTCCTACATAAAAAGGCGGGAAAACAAAATACATTAAATTTCTTTGGACCGGCTAGCACCGGTAAAACAAATCTGGCAAAAGCAATCGTGAATGCAATCAAGCTCTATGGTTGCGTCAATCACCAAAACAAAAATTTTATCTTTAACGATTGTGCCGCAAAACTCGTTGTCTGGTGGGAAGAATGTCTCATGCATTCAGACTGGGTCGAGCAAGCTAAATGTATCTTGGGCGGCACGGAATTCAGAATTGACAGAAAACATAGAGAATCGCATCTATTGCCACAAACTCCTGTAATCATCTCAACGAATAACAATATATATCAAACACTGGGTGGCAATTCGGTCTCACATGTACATGAAGCTCCTCTAAGAGAAAGAGTCGTCCAGTTTAATTTCATGACACGTCTAGAGAGCACCTTTGGAGAGATTGAACCAAGAGAAGTAGCCGAATGGCTATCCATCTGTCTCTCTCGGTTTGACATCTCTCTGATTGGCTTTCATACTCAGTGGAAGCTAAATAAAACTCCAAATGACTTTCCATTGGCTAAATTCTGCGGTGGTCACTCACAGGATCTCGTGTTACATGAGACCGGAACGTGTATGAGCTGTGGCGGATACTATCCTCTAGAACTGCACGATCGAGGCGACATCGAGGACGCTACACCAGGTACGAGCTACTCAGCTCTATTACAATTAACACCTAGATCTGAAAAATACATACAAGAATTTAACTTGGATCTCTTAAAATCTCCAATAGCGGCCACGAGCACTCCTGTGACTCAACCGGATCCACCTGAACTTCCTCCAAAAAAGAAGGTACGCAAAGAAAAGCACTGCGCACGCGCTCTCTTTACTGACGACTGGTGCTCTCAACCTCGAGACGATGTCGAGTGGCGAGTCGTCAAAGAGAGAGCAGAAGCGGCGGCGGCCGAGGTCTCTGGATCGAGATCCGAGTCCGATTCCGGACAAGCGAGCTCGATTGAGCTCGACCTCTCGCCAGAACAATGGGGAGAAATGCTCGGACTCATCTCCGGGAACATCGAAGAGGGAGAGCCGCCGATCACACTCCACTGTTTTGAATCCATCACCGAAGCTGACTTACTTTGTCAAACGGACTCAGAAACCGAATAAACAAACACCTCTTGATGTCTTTATGAAACATAGAGCCAAAGAGGGGGGAGATGTACCTCCATTTTGTGGGTTTTACTGGCATAGTACTAGATTAGCAAGATTTGGAACAGATGCAATCTTTAATCTGTATAAACCTAAATTTCAAGAAATGTCTAAAAACAATGTAATTACGTGGGATCAATGTCGTGATTTATTGTTTGATTTTAAAAAGAACCTAGACTATAAATACAGATCTATGATGTGGCATTTTAGCATGGGCGAGCAATGTCATAAATGTAATTACTGGGATAAAATGTACGCTGGGCATCTGGCTAATGTATCTCTATCTACACAGGAAGAGGACTCTGACACTGTAACTGACGCTGAAATGCTGGCGGTTGCCATGGAGGTTGATGGCACCGACCAATAGGCGTCCTGGCGGTTGGACTCTGCCCGGTTTCAGATATCTTGGTCCATTTAATCCATTAAATAACGGTAAACCAATAAACGAAGTAGATAAAGTTGCTCAGAAGCACGATAAAGCTTACGATTCTTATATCAAGGCTGGCGTCAATCCATATTTGCAATTTAATAAAGCTGACTCTGATTTCATTGATTCGCTGTCTACTGACTCGTCTGTTGCCGGGTGGCTGGGAAAATCGGCGTTTAAACTCAAGAGACTTTTGGCGCCACATCTTTCAAAAGAAAAAGAAGCAGCGGGTAATAAAGGAGGAACTGGTGGAAAACGCGCCAAGCTTGATCCGGTACGGGCTCAAAAAAGAAAATATTATTTTGCCCGTCAAAACCAGGGAAAAAATCCTAAACAACAAAAAATGGAAAATGAAGTTGAGACGGCTGGGGATGGACAAGAGGGGGCGCCAGCTGGCACTACTCGTGCTGGTGGTGGTGGTAACGGTGCTGGTATGGGTGGTGGTGGCCATGGTGTCGGTGTAAGCACCGGAGGATGGAGAGCTGGAACTATCTTTTCTGATAATGTTATAATTACAACATCAACTAGACAATGGTATGTTCCAATATATAATGGTCACCTATACAAAGAAATATTCGCAAATGGGAGCGTAAGAGAATGGGTAGGAATAAGTACCCCTTGGGGATACTTTAATTTCAATGAATACGATGCTCACTTTACACCAAACGATTGGCAACGACTCACAAACGAGTATGCCAAATGGAGACCAAAAAAAATGCATGTCAAGATATACAATCTCCAAATTAAACAAAAGGTGACACTAGGGGTGGACACCCTATATAACAACGACCTTACGGCGGGTGTACACATTTTTTGTGATGGTTCTCATCAATTCCCATACTCACAAAAACCTTGGGATTTTGGAACAATGCCAGAATTGCCATATGATGTATGGAAGCTTCCGCAATACGGGTATTTTCAATTTCAAAATGATCTCTCAGATCAATCATCAAACTCGCTTGCAGCAGATAATGTAGAAAAAAATATTGTAAGAAATGCTCCATTTTTTGTATTAGAATCTGCATCTCACGAGGTCCTCAGAACAGGAGAAGAAACAGAATTCAACTTTGAATTTGAATGTGGGTGGGTCACAAATACACGTGCATATGCTCCACCTCAGGCAGACTTCAATCCGTTAGTTGAAACTAGACGTTATTATCCAACATACGACAACACATCTAGCACAAAATTTGTATACGCTAGATATTCACCATATAACAAACCTAGTAACTGGATGCCTGGTCCAAGTATCGGATATATAGGAAACACAACAACCGGCTCAAACTACCAAACCAGAGGGCCAATCACCGTATGCCCACATCCATATTTTACTACACCTGGAAATTTAAACGAAGACAGGGCATATGATCCACAAAGTGGAACAAATACATTAACCGAAACTGGCATGAGAAAATCGGGATACGATGTGACACCTGTAAATGGTGCCTGCTCCCGACTGGACTCTGTTAATTTGGCATATGATTCGTCTGAATATAGCTTAAATCAGACAAAATTGATTTCAAGAAACATAGATAGTGACATGGCTAGATGGGGTTCAGTGTGGGCACAAGATGGATTAAATAAAGAAATTGCAGACAATGGACAACCAAACAACACAGATAGAAAAAATATTAGTCAACTAAAAAACATATGGATGTATCCAAACCAAGCATGGGACACAACACCAATAGCAAGAAACACGCCTATATGGGACAAAGTTCCAGACACAGACAGAAACACTATGCTAGATTCGGCTGATGGCACGCTGCCGATGCCACATCCACCGGGTACTATCTTTGTAAAAGTTGCAAAAATACCAATACCAACTGAAAACAATGCAGATGCATATTTAGATCTATATGTAACAGGACAAGTAA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21,834
ON595907.1
Feline bocavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-1
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,333
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578158
PRJNA841246
MAG: Feline bocavirus isolate HC-1, complete genome
CCAGGCGCGATGACGTGTCAGTGAGGGTGTTGTCTAAAGACTATAGGGATCAATGATAGGTTCAGCCATGTAATGATTAACTGACCTTTAACATGATTGGTTAAGGGTTAATGATTAACATATGACCTTTACAGTGATTGGTTCTCTAAACCTATAAAAGGAGCTGCATTTCCGTGTCTGTGTCATTCTGCTTCCGGCGCTCGACGAGATCGGACCTGGAGAAGAACAAGTTCCATCAACTGGTGAGTCGCCATCAATGGCTGAATTCGATACAGCAAGTCTCGACGACTTCATCCAATTTGCAGACCCAGCATATACATACGTGCTGCGTCTTCCATTACCTGCAGAGGGAAATTATGAGAGCCAGCTACAGAATGTATTATGCGCTCGATACCCCGATTTATTATCCGATCCGGCATTGTTCGCAACAATGCCTGGACCTGAATCTCCAGGCGCTCAGACTGATTTTCTGGAGCGTTTTGGTCCTAGCCGCTGCTTTGGGGCTGAAGTCTGCTATGCGGCGCATATGGCAGCCTTTAGCTTCTTTAGTAGGAAACAGGGAAAGGCGCCACCTATCGCCAGCATCTACACACAATGTGAATTAGGCCAGAGAAACATTCACTGTCATCTAGTCATGGCCGGCGACGGTCTGTCTCGTTACTCGGCTAAGAGCGCTGCCTACATACTAGGCCAAAAATTTGCAGACAATCTGATTTCTATCGTCGAAAATAATCTAAGAAAGGGCGATGTAAGCAATCCAGCTTTTGCTACCGCTTTTATCAAAGAAATACAAGAAGCTCAAAGAAAATGCGAACCAGGCAACGCTGGCGACCTTTGTACTGTGATGCAATATAAGAGTAGAGGAGGCGGTATGTACGCGTGTCGAATCGATGGCCGCGAGTATATCTGTAACTACCTACTATGCAAGAACCTGAAATGGGTATCTTGCGTGGAACCAGACAAGGCGACTCCTCTTAAAGCCTTCTTTCCAATCGCTTCAAAAACATATGCATTTACTTTAATTAATGGAAAGATTGTTCCGTATCACGTGCGTCGTGAATGGTGGAATCAGCTACGAGACAAGGTCCTAGTCAGGGACGAACCAATCTTTAAGGGAGACGTGTTTGGAGATCTTCCAAAGGTAAATGCTGCGTCATGGAAATTAACTGGTACTATGGGTCAAGGTACAGCTCAGCCGCATGTGAATGCCAGAATGAGTAAAAAAGAATCATTAATACTAGACTGTCTTAAACGTTGTGAGGATAATCTATGGCTAACCTATGAAGATCTGGTCGGTGGTTGTGCCGATTTAATTTTAATGTTGGAATCGATGCCAGGTGGAAGTAAATTAATTGAATCTGTGCTTAACATGTTGCATGTTAGAATCACTCAAACTCATAGTGCGTTGTCCTATTTGCATGTGAGATATGACATGAAAGGACTGGCGACTCACGCAGACTCACTCCACGCTAATAAAGCATGGAGATTACTGCTGAAACAAGGATATAATCCTCTACAAGTAGGACATTGGATCTGCTGTGTCCTACATAAAAAGGCGGGAAAACAAAATACATTAAATTTCTTTGGACCGGCTAGCACCGGTAAAACAAATCTGGCAAAAGCAATCGTGAATGCAATCAAGCTCTATGGTTGCGTCAATCACCAAAACAAAAATTTTATCTTTAACGATTGTGCCGCAAAACTCGTTGTCTGGTGGGAAGAATGTCTCATGCATTCAGACTGGGTCGAGCAAGCTAAATGTATCTTGGGCGGCACAGAATTCAGAATTGACAGAAAACACAGAGAATCGCATCTATTGCCACAAACTCCTGTAATCATCTCAACGAATAACAATATATATCAAACACTGGGTGGCAATTCGGTCTCACATGTACATGAAGCTCCTCTAAGAGAAAGAGTCGTCCAGTTTAATTTCATGACACGTCTAGAGAGCACCTTTGGAGAGATTGAACCAAGAGAAGTAGCCGAATGGCTATCCATTTGTCTCTCTCGGTTTGACATCTCTCTGGTTGGCTTTCATACTCAGTGGAAGCTAGATAAAACTCCAAATGACTTTCCATTGGCTAAATTCTGCGGTGGTCACTCACAGGATCTCGTGTTACATGAGACCGGAACGTGTATGAGCTGTGGCGGATACTATCCTCTAGAACTACACGATCGAGGCGACATCGAGGACGCTACACCAGGTACGAGCTACTCAGCTCTATTACAATTAACACCTAGATCTGAAAAATACATACAAGAATTTAACTTGGATCTTTTAAAATCTCCAATAGCGGCCACGAGCACTCCTGTGAATCGACAGGATCCACCTGAGATTCCTCCAAAAAAGAAGGTACGCAAAGAAAAACACTGCGCACGCGCTCTCTTTACTGACGACTGGTGCTCTCAACCTCGAGACGATGTCGAGTGGCGAGTCGTCAAAGAAAGAGCAGAAGCGACGGCGGCCGAGGTCTCTGGATCGAGATCCGAGTCCGATTCCGGACAAGCGAGCTCGATGGAGCTCGACCTCTCACCAGAACAATGGGGAGAGATGCTCGGACTCATCTCCGGGAACATCGAAGCGGGAGAGCCGCCGATCACACTCCACTGTTTCGAATCCATCACCGAAGCTGACTTACTTTGTCAAACGGACTCAGAAACCGAATAAACAAACACCTCTCGATGTCTTTATGAAACATAGAGCCAAAGAGGGGGGAGATGTACCTCCATTTTGTGGGTTTTACTGGCATAGTACTAGATTAGCAAGATTTGGAACAGATGCAATCTTTAATCTGTATAAACCTAAATTTCAAGAAATGTCAAAAAACAATGTAATTACATGGGATCAATGTCGTGATTTGTTGTTTGATTTTAAAAAGAACCTAGACTACAAATACAGATCTATGATGTGGCATTTTAGCATGGGCGAGCAATGTCATAAATGTAATTACTGGGATAAAATGTACGCTGGGCATCTGGCTAATGTATCTCTATCTACACAGGAAGAGGACTCTGACACTGTAACTGACGCTGAAATGCTGGCGGTTGCCATGGAGGTTGATGGCACCGACCAATAGGCGTCCTGGCGGTTGGACTCTGCCCGGTTTCAGATATCTTGGTCCATTTAATCCATTAAATAACGGTAAACCAATAAACGAAGTAGATAAAGTTGCTCAAAAGCACGATAAAGCTTACGATTCTTATATCAAGGCTGGCGTCAATCCATATTTGCACTTTAATAAAGCTGACTCTGATTTCATTGATTCGCTGTCTACTGACTCGTCTGTTGCCGGGTGGCTGGGAAAATCGGCGTTTAAACTCAAGAGACTTTTGGCGCCACATCTTTCAAAAGAAAAAGAAGCAGCGGGTAATAAAGGAGGAACTGGTGGAAAACGCGCCAAGCTTGATCCGGTACGGGCTCAAAAAAGAAAATATTATTTTGCCCGTCAAAACCAGGGAAAAAATCCTAAACAACAAAAAATGGAAAATGAAGTTGAGACGGCTGGGGATGGACAAGAGGGGGCGCCAGCTGGCAATGCTCGTGCTGGTGGTGGTGGTAACGGTGCTGGTATGGGTGGTGGTGGCCATGGTGTCGGTGTAAGCACGGGAGGGTGGAGAGCTGGAACTATCTTTTCTGATAATATTATAATTACAACATCAACTAGACAATGGTATGTTCCAATATATAATGGTCATCTGTACAAAGAAATGTACGCAGCTGGAAGCGTGAGAGAATGGGTGGGAATAAGTACCCCTTGGGGATACTTTAATTTCAATGAATACGATGCTCACTTTACACCAAACGATTGGCAACGACTCACAAACGAGTACGCCAAATGGAGACCAAAAAGAATGCATGTCAAGATATACAATCTCCAAATTAAACAAAAAGTAACACTAGGGGTGGACACCCTCTATAACAACGACCTTACAGCGGGTGTACACATTTTTTGTGACGGTTCTCATCAATTCCCATACTCACAAAAGCCTTGGGACTTTGGAACAATGCCAGAATTACCATATGATGTATGGAAACTTCCGCAATATGGATATTTTCAGTTTCAAAATGATATCTCAGATCAATCAGCAACCTCGCTTGGAGCAGATAATGTAGAAAAAAATATTGTGAGAAACGCTCCATTTTTTGTATTAGAGTCTGCATCTCACGAGGTCCTCAGAACAGGAGAGGAAACAGAATTCAACTTTGAATTTGAATGTGGGTGGGTCACAAATACACGTGCATATGCTCCGCCTCAAGCAGACTTCAATCCGTTAGTTGAAACTAGACGTTATTATCCAACATACGACAACACGTCTAGCACGAAATTTGTATACTCTAGATATTCACCATATAACAAACCTAGTAACTGGATGCCCGGTCCAAGTGTTGGATATATAGGAAACACAACAACCGGCTCACAATACCAAACCAGAGGGCCAATCACAGTATGCACACATCCATATTTTACTACACCTGGAAATTTAAACACAGACCAGGCATATGACCCACAAAGTGGAACAAATACATTAACCGAAGCTGGCATGAGAAAAGCAGGATACGATGTGACACCTACAAATGGTGCCTGCTCCCGACTGGACTCTGTTAATTTGGCATATGATTCATCTGAATATAGCGTAAATCAAACTAAATTGATTTCAAGAAACATAGATAGTGACATGGCTAGATGGGGTTCGGTGTGGGCACAGGATGGATTAAATAAAGAAATAGGAACCGATGGAAGACCAAATAACATAGACAGACAAAATATTAGCCAGCTAAAAAACATATGGATGTATCCAAACCAAGCATGGGACACAACACCAATAGCAAGAAACACACCCATATGGGACAAAGTTCCAGACACAGACAGAAACACTATGCTAGATTCGGCTGATGGCACACTGCCGATGCCACATCCACCGGGTACTATCTTTGTAAAAGTTGCAAAAATACCAATACCAACCGAAAACAATGCAGATGCATATTTAGATCTATA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21,835
ON595910.1
Feline bocavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-3
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,319
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578167
PRJNA841246
MAG: Feline bocavirus isolate HC-3, complete genome
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21,836
ON595912.1
Feline bocavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-5
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
ssDNA(+/-)
5,335
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578134
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University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-7
Bocaparvovirus carnivoran3
Bocaparvovirus
Parvoviridae
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Australia
Australia
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SAMN28578142
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21,838
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Feline bocavirus
Guo,X., Li,W., Wang,Y.
Anhui Agricultural University, Animal Science and Technology College
China
2021-08-18
MASCY1
Bocaparvovirus carnivoran3
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China
China
Felis catus
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2019-08
null
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Feline bocavirus isolate MASCY1, complete genome
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38,919
NC_075569.1
Feline calicivirus
Carter,M.J., Milton,I.D., Meanger,J., Bennett,M., Gaskell,R.M., Turner,P.C.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2023-05-04
null
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,690
RefSeq
2
null
null
null
null
null
null
PRJNA485481
Feline calicivirus, complete genome
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358
NC_001481.2
Feline calicivirus
Sosnovtsev,S., Green,K.Y.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
1993-08-02
null
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,683
RefSeq
1
null
null
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null
null
PRJNA485481
Feline calicivirus, complete genome
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8,984
PP061537.1
Feline calicivirus
Liu,G.Q., Meng,C.C., Tan,X.M.
Shanghai Institute of Veterinary Medicine, CAAS, Team for Companion Animal Biosafety and Prevention Technology
China
2024-01-24
SJ14
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,712
GenBank
null
China
China
Felis catus
oronasopharynx
2022-12-10
null
null
Feline calicivirus isolate SJ14, complete genome
GTAAAAGAAATTTGAGACAATGTCTCAAACTCTGAGCTTCGTGCTTAAAACCCACAGTGTCCGTAAGGACTTTGTGCACTCCGTCAAGTTAACACTTGCCCGGAGGCGCGATCTTCAGTATCTTTATAACAGGCTATCTCGTACTTTCCGTGCGGAAACCTGTCCTTCATGTGCTAGTTATGACGTTTGTCCTAACTGCGCATCTGGTGATATCCCTGATGATGGATCGTCAATTAACTCGATTCCATCTTGGGAAGATGTCACCAAAACATCTACCTATTCTCTCCTATTGTCTGAGGATACGACCGACGAGCTCTGCCCTGATGATTTGGCCAACATTGCATCTCACATTCGTAAGGCATTATCTACTCAGTCTCACCCGGCAAACAATGATATGTGCAAAGAACAGCTCACTTCATTACTTGTCGTAGCTGAAGCGATGTTGCCCCAACGATCACGGTCCACTGTCCCTCGTCACCAACAGCACCAGGCAGCTCGTTTGGAATGGAGAGAGAAATTTTTCTCCAAACCACTTGATTTTCTCCTGGAAAGACTCGGACTGTCAAAGGATATTCTTCAGACTACTGCGATTTGGAAAGTCCTTTTGGAAAAGGCCTGCTACTGCAAATCTTATGGAGAACAATGGTATACTACTGCCAAAGAAAAATTACGCGAAATCAAGAGTTTTGAGGGTAACACTCTCAAGCCTTTGATTGGAGCGTTCATTGATGGCCTCCGATTTTTAACTGTTGACAACCCAAACCCCATTGGATTTCTTCCTAAACTGATTGGATTGATTAAACCTCTTAATTTGGCTATGATAATTGACAACCATGAAAACACTATGTCAGGATGGGTAGTCACAATAACAGCTATTATGGAATTGTATAACATCACAGAGTGCACAATTGACATCATAACATCATTAATAACTGGATTTTATGATAAATTGGCCAAGGCTACTCGGTTTTACAGTCAGGTGAAAAATTTATTTACCGGCTTTAGAACCGAGGATGTTTCAAACTCCTTTTGGTACATGGCAGCTGCAGTTCTATGTTACCTAATTACTGGGCTTATCCCTAACAATGGTAGATTCTCTAAAATCAAAGCTTGTTTGTCAGGTGCTTCTACACTGGTTTCCGGCATCATTGCTACTCAGAAATTAGCAGCCATGTTTGCCACATGGAACTCTGAAACTATTGTTAACGAGCTGTCTGCCAGAACAGTTGCCCTATCCGAACTGAACAACCCAACCACAACATCTGACACTGACTCTGTTGAGAAGTTATTGGAATTGGCTAAGATCTTACATGAGGAAATAAAAGTGCACACACTAAACCCAATAATGCAATCATACAACCCAATCCTTAGAAATCTCATGTCTACGTTGGATGGCGTCATCACATCATGCAACAAAAGGAAGGCAATTGCAAGGAAAAGACCTGTCCCGGTGTGCTACATTCTCACTGGTCCTCCTGGCTGTGGCAAGACTACAGCTGCCCTTGCGTTAGCAAAGAAGTTGTCTGAACAAGAACCATCTGTTATTAACCTTGATGTGGACCACCATGATACCTACACTGGTAATGAAGTTTGTATCATTGATGAATTCGACTCGTCAGATAAAGTTGATTATGCAAATTTTGTTATTGGAATGGTGAATTCGGCCCCTATGGTCTTGAACTGTGACATGCTTGAGAACAAGGGCAAACTCTTTACTTCCAAGTATATCATTATGACCTCCAATTCTGAAACCCCTGTCAAGCCAGCTTCTAAGCGCGCTGGCGCTTTCTATCGAAGGGTAACAATTATTGATGTTACTAATCCTTTGGTAGAGTCGCACAAGCGTGCTAGACCTGGTACTGCTGTTCCTCGTAGCTGCTACAAGAAAAACTTCTCTCACCTATCGCTAGCCAAACGGGGCGCTGAATGCTGGAGTAAGGAGTACGTCCTTGATCCAAAAGGGCTCCAACACCAAAGCATTAAAGCCCCCCCTCCCACTTTCTTAAACATTGATTCACTCGCACAAACTATGAAGCAAGACTTTACTCTTAAGAACATGGCTTTTGAAGCTGAGGATGGATGCAATGAAAACCGTTATGGTTTCATCTGTCAAAAAGAAGAGGTTGAAACAGTGCGTAGACTGCTCAATGCCATCAGAGTTAGGCTCAACGCTACTTTCACAGTATGCGTTGGCCCTGAAGCTTCTAATTCCGTGGGGTGTACTGCTCATGTGTTAACTCCTGAGGAGCCATTCAACGGGAAGAGATTTGTGGTTTCACGCTGCAATGAAGCGTCATTAGCTGCACTGGAAGGCAACTGTGTCCAAACTGCATTGGGCGTGTGTATGTCCAATAAGGATCTCACCCACTTGTGCCACTTCATAAAAGGGAAGATTGTCAATGATAGTGTCAGGTTAGATGAACTACCCGCTAATCAACATGTGGTAACCGTTAACTCGGTGTTTGATTTAGCCTGGGCTCTTCGTCGTCACTTGACACTAGCAGGGCAGTTTCAAGCCATCAGAGCCGCATATGATGTGCTTACTGTCCCCGACAAAATCCCTGCAATGTTGCGTCACTGGATGGATGAGACCTCCTTTTCTGATGACCACGTTGTAACACAATTTGTAACACCTGGTGGCATAGTCATCCTGGAGTCTTGCGGTGGTGCACGCATCTGGGCTTTAGGTCACAACGTGATCCGAGCAGGAGGTGTCACCGCAACACCCACCGGAGGATGTGTTAGGTTAATGGGATTGTCTGCCCCAACCATGCCATGGTCCGAGATCTTTCGTGAGCTCTTCTCTCTCTTAGGTAGAATTTGGTCATCTGTCAAAGTATCAGCCCTAGTACTAACTGCTCTTGGAATGTACGCATCTAGATTTAGACCAAAATCGGAAGCAAAAGGAAAAACCAAATTGAAGATTGGAACATACAGGGGTCGCGGTGTAGCGCTGACTGATGACGAGTACGATGAGTGGCGCGAACACAACGCCTCCAGAAAATTGGATTTGTCAGTGGAGGATTTCTTAATGTTGCGCCATCGTGCCGCTCTAGGAGCCGACGACAATGATGCAGTAAAATTCCGGTCGTGGTGGAACTCCAGAACCAAAATGGCCAATGATTATGAGGATGTCACCGTAATTGGCAAAGGTGGCGTCAAACATGAAAAGATCAGAACCAATACCCTAAAAGCTGTGGATCGTGGTTATGACGTCAGCTTTGCTGAGGAATCAGGACCAGGCACCAAGTTCCACAAGAATGCGATTGGATCTGTCACAGATGTTTGTGGGGAGCACAAAGGCTATTGCATCCACATGGGCCACGGTGTTTACGCATCCGTAGCTCACGTGGTGAAAGGGGATTCATTTTTCTTGGGTGAAAGGATTTTTGATCTTAAGACTAATGGTGAATTTTGCTGCTTTCGCAGCACGAAGATTCTACCTAGTGCTGCACCTTTCTTTTCTGGGAAGCCCACTCGTGATCCGTGGGGATCCCCCGTGGCAACTGAGTGGAAGCCTAAAATGTACACAACAACCTCTGGAAAGATTCTGGGGTGCTTTGCAACAACTTCAACTGAAACTCACCCGGGAGACTGTGGCCTCCCATATATTGATGACAACGGGAGGGTGACCGGCCTCCACACTGGCTCTGGGGGACCCAAAACCCCAAGTGCCAAGTTGGTGGTGCCATATGTGCATATTGACATGAAGACTAAATCCGTCACTGCTCAAAAGTATGACGTAACAAAGCCTGATATAAGTTACAAAGGCTTAATTTGTAAGCAATTGGATGAAATTAGGATTATACCAAAAGGCACACGTCTCCATGTCTCCCCAGCCCACACTGAGGATTATCAAGAATGCTCACACCAACCCGCATCACTTGGAAGCGGGGATCCCCGCTGTCCAAAATCTCTCACTGCTATAGTTGTTGATTCTCTAAAACCATACTGTGAGAAGGTTGAGGGTCCTCCACATGATGTTTTGCACAGAGTTCAAAAGATGCTTATCGACCACCTTTCAGGCTTTGTCCCTATGAACATTTCCTCGGAAACCTCTATGCTCTCAGCTTTCCACAAACTCAATCATGATACTTCCTGTGGACCATACTTGGGTGGCAGAAAGAAAGATCACATGGCTAACGGTGAGCCGGACAAGCAGTTATTGGATCTCCTGTCTGCAAAATGGAAATTGGCCACCCAAGGCATAGCACTACCACATGAGTACACAATTGGGCTAAAGGACGAGTTAAGGCCCGTGGAGAAGGTTAGTGAAGGGAAGAGAAGGATGATTTGGGGTTGTGATGTTGGCGTCGCTACTGTCTGTGCAGCTGCGTTCAAGGGTGTTAGTGACGCAATCACAGCAAATCACCAGTATGGACCAGTCCAGGTTGGCATCAACATGGATAGCCCCAGTGTTGAGGCACTGTACCAGAGAATAAAGAGCGCTGCAAAGGTTTTTGCCGTTGATTACTCCAAGTGGGACTCAACACAATCACCTCGTGTTAGTGCGGCTTCGATTGACATACTTCGGTACTTCTCTGACAGATCGCCCATTGTTGATTCGGCTGCAAACACCTTGAAATCACCTCCTATAGCAATCTTTAATGGTGTAGCTGTGAAAGTGTCTTCTGGTCTTCCTTCGGGTATGCCTTTAACGTCTGTGATCAACTCGCTAAACCACTGTCTGTATGTTGGGTGTGCAATTCTCCAAACTTTAGAGGCCCGGAATATACCTGTAACTTGGAACCTTTTCTCCTCATTTGATATGATGACTTATGGTGATGATGGTGTCTATATGTTTCCAACTATGTTTTCCAGTGTTAGTGATCAGATCTTTGGAAATCTCTCAGCATACGGTCTAAAACCAACCAGGGTTGACAAAACTATCGGAGCAATTGAACCAATTGACCCTGATTCGGTGGTGTTCCTCAAAAGAACAATTACCAGAACCCCTCAAGGTATCAGAGGCTTGTTGGATCGTAGCTCAATCATAAGAC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9,496
PP061538.1
Feline calicivirus
Liu,G.Q., Meng,C.C., Tan,X.M.
Shanghai Institute of Veterinary Medicine, CAAS, Team for Companion Animal Biosafety and Prevention Technology
China
2024-01-24
SJ17
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,703
GenBank
null
China
China
Felis catus
oronasopharynx
2022-12-10
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Feline calicivirus isolate SJ17, complete genome
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9,497
PP061539.1
Feline calicivirus
Liu,G.Q., Meng,C.C., Tan,X.M.
Shanghai Institute of Veterinary Medicine, CAAS, Team for Companion Animal Biosafety and Prevention Technology
China
2024-01-24
XA13
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,703
GenBank
null
China
China
Felis catus
oronasopharynx
2022-12-10
null
null
Feline calicivirus isolate XA13, complete genome
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9,498
PP061540.1
Feline calicivirus
Liu,G.Q., Meng,C.C., Tan,X.M.
Shanghai Institute of Veterinary Medicine, CAAS, Team for Companion Animal Biosafety and Prevention Technology
China
2024-01-24
XA15
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
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GenBank
null
China
China
Felis catus
oronasopharynx
2022-12-10
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Feline calicivirus isolate XA15, complete genome
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9,499
OR791865.1
Feline calicivirus
Liu,G., Meng,C., Tan,X.
Shanghai Institute of Veterinary Medicine, CAAS, Team for Companion Animal Biosafety and Prevention Technology
China
2023-11-25
XA20
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,687
GenBank
null
China
China
Feliformia
oronasopharynx
2022-12-10
null
null
Feline calicivirus isolate XA20, complete genome
GTAAAAGAAATTTGAGACAATGTCTCAAACTCTGAGCTTCGTGCTAAAACCTCACAATGTTAAACAAGACTTTGTGCAATCCGTCAAGGAAACCCTTAGACGGAGGCGCGAGTTACAGTATTCTTTAAACAGGCTTGAGCGCGCTATGCGCCTCGAAGCTTGCCCCTCTTGTGCTAGTTACGACGTTTGTCCTAACTGCACTTCCCGTGATATCCCGGATGATGGTTCCAATGTTGGATCCATCCCTTCCTGGGAAGAAGTCACAAAGACCTCTACCTATTCTCTCTTGATCTCGGAAGACACGGCTGATGAACTTGATGGCGATGATCTGGTACACATAGCTGCTCACATCCGTAAGGCCCTTTCAACCCAGTCACACCCGGCTAACACTGAGCTGTGCAAAGAACAGCTTAATAGTTTGCTAGTTATGGCTGAGGCCATGGTCCCACAACGGTCGAGAGCTTCTATTCCGCTTCACCAGCAACATCAGGCAGCTCGTATAGAATGGAGAGAAAAATTCTTCCACAAACCCCTGGACTTTCTGCTCGAAAGAATTGGCTTATCCAAAGATATCTTGCAAACAACTGCAATTTGGAAGATCATTTTTGAAAAGGCATGTTACTGCAAGTCTTATGGTGAAGAATGGTTCACGGCTGCAAAGGAAAAGATACGTCAACTTAAGGCTTTTGAAGGAAACACGTTGAAACCCCTTATTGGTGGTTTCATCGATGGGTTAAGGCTTATGACTGTTGACAATCCCAACCCACTAGGATTCCTCCCAAAGCTGATTGGCTTGATTAAACCACTTAATCTGGCAATGATCATTGACAACCACGAAAACACACTCTCTGGCTGGATTGTCACTCTCACTGCAATAATGGAACTATATGGTATCACTGAGTGCACAATTGATGTTATAACTTCTATTGTTACAGGTTTTTATGACAAATTGGCAAAAGCTACTAAATTTTACAGCCACGTCAAGAATTTATTCATGGGCTTTCGAACTGAAAATGTGTCAAATACATTCTGGTACATGGCAGCTGCAGTTCTTTGCTATCTAATTACCGGGTTGATCCCAAACAATGGCAGGCTTTCAAAGATTAAGGCTTGCCTTGGAGGGGCAACGACTCTGGTATCTGGAATAATTGCAACTCAAAAACTTGCTGCTATGTTTGCAGCATGGAATTCTGAATCCATCATAAACGAGTTATCGGCAAGAACTGTTGCCCTGTCAGAACTGAACAACCCCACAACAACATCTGACACTGATTCTGTTGAGAGACTATTGGAATTGGCCAAAATCTTGCATGAAGAAATTAAAGTTCACACCTTAAATCCAATCATGCAATCATATAATCCAATCCTGAGAAATTTGATGTCAACCCTGGATGGAGTTGTAAGCTCATGCAACAAACGGAGAGCCGTGGCAAAGAAAAGGCAAGTCCCTGTGTGCTATATTCTCACTGGACCGCCCGGTTGTGGGAAAACCACCGCAGCTCATGCACTTGCAAAGAAACTGTCTGATCAGGAACCTTCCATTATCAACCTTGATGTAGACCATCATGACACATATACTGGTAATGAGGTTTGCATTGTTGATGAATTTGATTCATCCGACAAGGTTGACTATGCAAATTTTGTAATTGGAATGGTCAATTCGGCACCAATGATTCTAAATTGTGATATGCTTGAAAATAAAGGAAAATTGTTCACATCCAAGTACATAATTATGACTTCCAATTCTGAAACCCCTGTGAAGCCAAATTCCAAAAGAGCTGGTGCTTTTTACCGCCGTGTTACAATTGTTGATGTGACAAACCCTCTTGTTGACTCTCACAAGAGGGCTAGACCTGGTACTGCTGTCCCTAGGAGCTGTTACAAAAAGAACTTCTCTCATCTCTGCCTTTCAAAGCGTGGTGCTGAGTGCTGGTCCAAGGAATATGTTCTTGACCCGAAGGGCCTTCAACACCAATCCATCAAGGCACCACCTCCTACTTTTCTAAACATTGATTCCCTGGCCCAAACAATGAAACAGGAATTTATGGTTAAGAACATGGCTTTTGAATCTGAAGATGGCTGTAGTGACCACAGATATGGCTTTATTTGCCAACAGGATGAAGTAGAAACTGTACGTCGCCTGTTAAATGCAATTAGAGCCAGGCTCAACGCAACATTTACAGTTTGTGTGGGGCCCGAAGCATCGCCTTCCGTTGGATGCACAGCTCATGTGTTGACACCTGGTGAGCTATTCAACGGAAAGAAGTTCGTTGTATCACGCTGCAACGAGGCTTCATTGGCCGCATTGGAAGGGAACTGCATACAGACTGCCCTCGGCATCTGTATGTCTAGTTCGGATCTCACTCACTTCTGCCACTACATAAAAGGAAAGATTGTCAATGACAATGTCAGGTTGGATGAACTACCCGCCAATCAACATGTGGTAACTGTTAATTCAGTATTTGATTTGGCCTGGGCTCTTCGCCGACACCTGACCTTGGCAGGGCAGTTCCAAGCAATCAGAGCCGCATATGATGTGCTTACTGCCCCTGACAAGCTCCCTGCTATGTTAAGGCACTGGATGGATGAGACATCATTTTCCAATGAACATGTGGTAACCCAGTTCATTGCACCTGGTGGTGTGGTGATTCTTGAGTCATGCGGAGGTGCACGCATCTGGGCTATGGGTCACAATGTGATTCGTGCCGGAGGCGTGACCTCAACACCAGTTGGTGGATGTGTTAGATTAATGGGTCTCTCTGCTCAAACTTTACCTTGGTCTGAAATTTTCAGGGAACTCTTCTCTCTGCTTGCTAAAATCTGGTCTAATATCAAAGTCTCCACTCTTGTCCTCACTGCACTAGGAATGTATGCATCACGGTTTAGGCCAAAATCTGAAGCAAAAGGAAAAACCAAAACCAAACACAACACCTACAGAGGTCGTGGTGTTGCACTTACTGATGATGAATATGACGAATGGAGAGAACATAACGCCTCCAGAAAACTTGACCTCTCGGTAGAAGATTTCCTAATGTTGAGACACCGAGCAGCATTGGGAGCTGATGACAATGATGCTGTGAAATTTAGGTCATGGTGGAATTCTAGATCGAAAATGGCATATGACGATGTGGATGACGTCACTGTAATTGGCAAAGGTGGCGTAAAACATGAGAAGATTAGAACCAACACCCTAAAAGCCATAGATCGTGGTTATGATGTCAGTTTTGCTGAAGAATCAGGTCCAGGCACTAAATTCCACAAGAATGCAATTGGCTCTGTCACTGATGTCTGCGGTGAACACAAAGGCTACTGTGTGCACATGGGTCATGGGGTTTACGCCTCTGTGGCACATGTTGTGAAGGGTGATTCATTCTTCATGGGTGAGCGAGTGTTCGACGTTAAGACCAACGGTGAATTTTGTTGCTTCCGAAGCACCAAAATTTTGCCAAGTGCTGCGCCCTTCCATACCGGCAAGCCAACAAGGGATCCTTGGGGATCTCCTGTGGCCACCGAGTGGAAGCCCAAGGCCTACACAACAACATCTGGCAAAATTGTTGGTTGCTTTGCTACAACTTCCACCGAAACTCACCCTGGAGATTGCGGTCTCCCTTACATAGATGACAATGGTAGGGTCACCGGTCTCCACACAGGATCAGGTGGACCAAAGACTCCCAGTGCAAAATTGGTTGTTCCATTTATTCCAATTGACATGAGAACAAAATCTGTTACCCCACAAAAATATGACCCCACCAAACCAGATATTAGTTATAAAGGGTTGATTTGCAAACAATTGGATGAAATCAGAATCATTCCAAAAGGTACAAGGTTGCATGTTTCTCCGGCCCACACTGAAGACTTTGAGGAGTGCTCCCATCAGCCCGCATCACTGGGAAGTGGCGACCCACGGTGTCCGAAATCATTGACCGCTATCGTCGTGGATTCGTTAAAGCCCTACTGTGATGCTGTTGAGGGACCACCCCATGACATTCTCCATCGTGTTCAAAAGATGCTGATCGACCACTTGGCTGGCTTTGTCCCCATGAATATCTCTTCTGATCAATCCATGCTATCTGCTTTCCATAAACTAAATCATGACACTTCATGTGGACCCTATCTTGGAGGTAGAAAGAAAGATCATATGGTGAATGGTGAACCTGATAAGCAATTGTTGGATTTGTTGTCTGCAAAATGGAAATTGGCTACACAAGGAATTGGATTGCCTCACGAGTACACCATTGGTTTAAAAGATGAATTGAGGCCAATTGAGAAAGTTCAAGAGGGTAAAAGGAGAATGATTTGGGGATGTGATGTTGGAGTTGCTACAGTATGTGCTGCTGCATTTAAAGGAGTTAGTGATGCAATTACTGCCAACCATCAATATGGGCCTGTTCAGGTCGGTATTAACATGGATGGCCCAAGTGTTGAGGCGCTCTATCAGCGTATCAAGAGTGCAGCTAAGGTTTATGCAGTGGACTACTCCAAATGGGATTCCACCCAATCGCCCCGTGTCAGTGCTGCTTCTATTGACATCCTTAGGTACTTTTCTGATCGATCCCCTATTGTTGACTCTGCAGCAAATACTCTGAAATCACCGCCTATTGCTATCTTTAATGGTGTTGCTGTCAAGGTCTCATCTGGATTGCCATCCGGAATGCCCCTAACATCTGTCATTAACTCGCTGAATCACTGTCTGTATGTTGGATGTGCTATTCTCCAATCTCTTGAAGCACGCAACATCCCTGTTACTTGGAACCTGTTTTCTTCCTTTGATATGATGACTTATGGTGATGATGGTGTTTATATGTTCCCAATGATGTTTGCTAGCGTTAGTGATCAGATTTTCAACAATTTGGCTGCTTATGGGCTAAAACCAACAAGAGTAGATAAGACTGTCGGAGCAATTGAAGCCATTGACCCAGACAGTGTGGTATTCCTCAAAAGAACAATTGTTAGAACACCGCACGGTATTAGAGGTCTTTTAGATCGCAGCTCAATTCTAA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10,638
OR227749.1
Feline calicivirus
Zhong,Z.T., Gong,Y.H., Zhu,W.S., OuYang,M.H., Fu,S.J., Xu,S.P., Gao,M.R., Zou,Y.L., Li,K.
Yichun University, College of Life Sciences and Resources and Environment
China
2023-09-16
null
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,683
GenBank
null
China
China
Feliformia
oronasopharynx
2021
null
null
Feline calicivirus strain CN/YCZT/2021, complete genome
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12,950
OQ814183.1
Feline calicivirus
Liu,G., Meng,C., Lin,L.
Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Companion Animal Team
China
2023-07-31
AH17
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,705
GenBank
null
China
China
Feliformia
null
2022
null
null
Feline calicivirus isolate AH17, complete genome
GTAAAAGAAATTTGAGACAATGTCTCAAACTCTGAGCTTCGTGCTAAAAACTCACAATGTTAGAAATGACTTTGTGCAATCCGTCAAGGAAACTCTTAGACGGAGGCGCGAGTTACAGTACTCTTTAAACAAGCTCGAGCGCTCTATGCGCCTTGAAGCTTGTCCTTCCTGTGCTAGTTATGACATTTGTCCTAACTGCACTTCTCGTGACATCCCTGATGATGGATCTAGTCTTGGATCCATTCCATCTTGGGAAGACGTCACAAAAACCTCTACCTATTCTCTCTTGCTCTCTGAAGATACGGCTGACGAACTCGATGGTGATGAATTGGTACACATTGCTGCCCATATCCGCAAGGCCCTCTCAACTCAATCTCACCCGGCTAATGTAGAGCTGTGCAAAGAACAGCTCAATAATTTGCTGGTAATGGCTGAGGCTATGGTCCCACAGCGGTCACGGTCTTCAATCCCACTTCACCAACAACACCAAGCAGCCCGCATCGAATGGAGAGAGAAATTTTTCCACAAACCTTTGGATTTTCTCCTGGAAAGACTTGGCTTGTCAAAGGATATTCTACAAACAACTGCAATTTGGAAGATTGTTCTTGAGAAAGCTTGCTATTGTAAATCTTATGGGGAAGAGTGGTTTGTAGCTGCAAAAGAAAAACTACGCCAAATCCAAAATTTTGAAGGAAACACACTAAAGCCTCTTATTGGTGGATTTATTGATGGCTTGAGGTTAATGACCGTCGATAACCCCAACCCATTAGGATTCTTACCCAAACTAATTGGATTGATAAAACCACTAAATTTGGCAATGATTATCGACAACCATGAAAACACACTTTCTGGCTGGGTTGTCACGCTCACTGCAATCATGGAACTGTATGGTATCACTGAGTGCACAATTGATGTTATAACATCCATCATCACAGGGTTCTATGATAAACTGGCCAGAGCTACAAAGTTTTTCAGTCATGTTAAAAATCTATTCTTGGGTTTCAGATCTGAGGATGTGTCAAACACATTTTGGTACATGGCAGCTGCAGTTCTTTGCTATCTGATTACTGGGTTGGTCCCCAGCAATGGCAAGCTTGCAAAGATCAAGGCTTGCATTGGTGGTGCCACAACCCTGGTCTCAGGAATAATAGCAACTCAAAAGCTTGCTGCAATGTTTGCAGCATGGAACTCTGAATCCATCATAAATGAGTTATCTGCAAGAACCGTTGCCCTGTCTGAACTCAACAATCCCACAACCACATCAGATACCGACTCTGTGGAGAGACTACTAGAATTGGCCAAAATCTTGCATGAAGAAATCAAAGTTTATACACTAAACCCAATTATGCAATCATATAATCCAATTTTAAGAAATTTGATGTCAACCCTTGATGGAGTTATAACTTCCTGCAACAAGAGAAAGGCGGTGGCAAGGAAAAGGCAAGTTCCAGTGTGCTACATCCTCACCGGGCCACCCGGTTGCGGAAAAACAACAGCCGCGCATGCTCTTGCAAAGAAGCTGTCTGACCAAGAACCATCTATCATCAATTTGGATGTGGATCATCACGACACGTACACTGGTAACGAAGTGTGTATTGTTGATGAGTTTGATTCATCGGATAAGGTCGACTATGCAAATTTTGTAATTGGAATGGTTAATTCGGCACCCATGATCCTAAATTGTGATATGCTTGAAAACAAAGGGAAGCTTTTCACTTCTAAGTATATAATTATGACTTCTAATTCTGAAACCCCTGTCAAGCCTAGCTCCAAGCGGGCTGGTGCCTTCTATCGCCGGGTCACCATCGTTGATGTGACAAACCCCCTTGTTGATTCCCACAAGCGGGCTAGACCTGGTACTGCTGTTCCTAGAACCTGCTACAAAAAGAATTTCTCTCATCTCTGTCTCGCTAAACGTGGCGCTGAGTGCTGGTCGAAAGAGTATGTCCTTGATCCCAAGGGACTCCAACACCAGTCCATCAAGGCGCCCCCTCCCACTTTCTTGAATATTGATTCTTTGGCCCAAACAATGAAACAAGAATTCATGGTTAAGAACATGGCTTTTGAGTCCGAGAATGGCTGTAATGAGCATAGGTATGGCTTTATTTGCCAGCAGAGTGAAGTAGAAACTGTACGTTGCCTGCTAAACGCAATTAGAGCTAGACTTAATGCAACATTCACAGTTTGTGTAGGACCTGAGTCGTCACCTTCTGTTGGATGCACTGCTCATGTATTAACACCTGATGAGCCATTCAACGGGAAGAAGTTCGTTGTGTCACGATGCAATGAGGCTTCTTTGGCTGCATTGGAAGGGAATTGCATACAGACCGCACTTGGCATCTGTATGTCAAATGCCGATCTTACCCATTTTTGTCATTACATTAAAGGTAAGATTGTCAATGACAATGTCAGGTTGGATGAACTACCCGCCAATCAACATGTGGTAACTGTTAACTCGGTGTTTGATTTGGCCTGGGCTCTTCGCCGACACCTGACATTGACTGGGCAGTTTCAAGCGATCAGAGCCGCATATGATGTGCTTACTGCCCCCGACAAGCTACCCGCTATGTTAAGACATTGGATGGATGAGACCTCATTTTCCAATGACCATGTGGTGACTCAGTTCATTGCACCCGGCGGAGTTGTGATTCTTGAATCATGTGGAGGTGCTCGCATATGGGCTATGGGTCACAATGTGATTCGTGCTGGTGGCGTCACCTCAACCCCTGTAGGGGGCTGTGTTAGGTTAATGGGTCTTTCTGCTCAAACAATGCCCTGGTCTGAAATCTTTAGGGAACTTTTCTCTCTACTTGCTAGAATCTGGTCTAACATTAAGGTCTCTACTCTTGTTCTTACCGCTTTGGGAATGTACGCTTCTAGGTTCAGGCCAAAATCTGAAGCCAAGGGGAAGACAAAATCAAAACACAATGCCTACAGAGGTCGTGGGGTTGCACTGACTGATGACGAATATGACGAGTGGAAAGAACACAACGCTTCCAGAAAGCTTGACCTCTCAGTGGAAGATTTTCTAATGTTGAGACACCGAGCGGCCCTGGGAGCTGATGATAACGATGCCGTCAAGTTCAGATCGTGGTGGAACTCTAGATCAAAAATGGCATATGATGATGTGGATGATGTCACGGTAATTGGCAAAGGTGGCGTAAAGCATGAGAGAATTAGAACCAACAACCTAAAAGCTATTGATCGTGGTTACGATGTCAGTTTTGCTGAGGAATCAGGCCCTGGTACCAAATTTCATAAAAATGCAATTGGATCCGTCACTGATGTTTGTGGTGAGCACAAGGGATACTGTGTGCATATGGGTCATGGTGTTTATGCTTCAGTGGCACACGTTGTCAAAGGTGACTCATATTTCATGGGTGAAAGGGTATTTGATGTGAAAACCAACGGTGAATTTTGTTGCTTTCGCAGTACTAAAATCTTACCAAGTGCTGCACCCTTCCACACTGGGAAGCCAACAAGAGACCCTTGGGGTTCCCCTGTGGCCACAGAATGGAAGCCGAAAGCCTACACAACAACATCTGGAAAGATTGTTGGCTGTTTTGCAACAACATCCACTGAAACTCACCCTGGTGATTGTGGCCTCCCTTACATCGATGACAACGGTAGGGTCACTGGTCTCCACACCGGATCAGGTGGACCTAAAACCCCAAGTGCAAAATTGGTTGTTCCATTCGTGTCGATTGATATGAGATCAAAGTCTGTCAGTCCACAAAAATACGATCCCACAAAACCAGATATCAGCTACAAAGGATTAATTTGCAAACAATTGGATGAAATTAGAATTATCCCCAAAGGCACTCGTCTTCATGTTTCCCCTGCTCACACCGAGGACTTTGAAGAATGCTCTCACCAACCTGCCTCACTAGGTAGTGGTGACCCAAGGTGTCCCAAATCTTTGACTGCTATAGTTGTTGATTCCCTAAAACCTTACTGTGAACCTGTTGCAGGACCACCGCATGATGTGCTCCATCGTGGCCAAAAGATGCTCATTGATCACTTGGCTGGATTTGTCCCTATGAACATCTCTTCTGATCAATCTATGCTGTCTGCTTTTCACAAATTAAATCATGACACCTCTTGTGGACCCTATCTTGGAGGTAGAAAGAAAGATCATATGGTTAATGGAGAACCTGACAAGCAACTGTTGGACTTGTTATCTTCAAAATGGAAATTGGCTACGCAAGGAATTGGCCTGCCGCATGAGTACACCATCGGTTTGAAAGATGAATTGAGGCCAGTTGAGAAGGTACAAGAAGGTAAAAGAAGAATGATTTGGGGATGTGATGTTGGCGTTGCTACAGTGTGTGCTGCTGCTTTTAAAGGGGTTAGTGATGCAATAACCGCTAACCATCAGTACGGACCTGTTCAAGTTGGGATAAACATGGACAGCCCAAGCGTTGAAGCACTTTATCAACGCATCAAAAGTGCAGCCAAAGTGTATGCAGTTGATTACTCCAAATGGGATTCCACTCAATCTCCTCGTGTTAGTGCTGCTTCTATTGACATCCTTAGGTACTTCTCTGATCGCTCTCCTATTGTTGATTCTGCAACAAATACTCTAAAATCTCCACCTATTGCTATCTTCAATGGAGTTGCTGTTAAGGTCACCTCTGGGTTGCCTTCAGGGATGCCATTGACATCTGTTATCAACTCACTTAATCACTGCTTATACGTGGGCTGTGCAATTCTTCAATCACTTGAAGCTCGCAACATTCCTGTTACTTGGAACCTGTTTTCTTCTTTCGATATGATGACCTATGGTGATGATGGTGTCTACATGTTCCCAATGATGTTTGCAAGTGTTAGTGATCAAATTTTCAACAATTTGGCAGCTTATGGGTTGAAACCCACAAGGGTAGATAAGACTGTTGGAGCAATTGAGCCTATTGATCCAGAATGTGTGGTCTTCCTTAAGAGGACAATCACTAGAACTCCAAGTGGAATCAGAGGACTTTTGGACCGTAGCTCAATTGTAA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14,500
OQ814184.1
Feline calicivirus
Liu,G., Meng,C., Lin,L.
Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Companion Animal Team
China
2023-07-31
FX5
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,684
GenBank
null
China
China
Feliformia
null
2022
null
null
Feline calicivirus isolate FX5, complete genome
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14,501
OQ814185.1
Feline calicivirus
Liu,G., Meng,C., Lin,L.
Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Companion Animal Team
China
2023-07-31
GZ-VSD
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,705
GenBank
null
China
China
Feliformia
null
2022
null
null
Feline calicivirus isolate GZ-VSD, complete genome
GTAAAAGAAATTTGAGACAATGTCTCAAACTCTGAGCTTCGTGCTTAAAACTCACAGCGTCCGTAAGGACTTTGTGCACTCCGTCAAGTTAACGCTTGCTCGGAGGCGCGATCTTCAGTATTTCTATAACAGGCTCTCTCGCACTTTCCGTGCTGAGGCCTGCCCCTCCTGTGCTAGTTACGACATTTGTCCTAACTGCACTTCTGGTAGCATCCCTGATGATGGGTCGTCAATGAACTCGATCCCATCTTGGGAAGACGTCACCAAAACATCCACTTACTCTCTCCTGTTGTCTGAGGATACGACCGATGAGCTCTGCCCTGATGATTTGGCCAATATCGCATCTCACATTCGTAAGGCATTATCAACCCAATCCCACCCCGCTAACAATGATATGTGCAAAGAACAGCTCACTTCACTGTTAGTCGTAGCGGAAGCAATGTTGCCCCAGCGATCACGGTCCACCATCCCTCTTCATCAACAACACCAGGCGGCACGCTTAGAATGGAGAGAGAAGTTCTTCTCTAAACCGATTGACTTCCTCCTAAAAAGACTCGGACTGTCAAAGGATATTCTTCAGACTACTGCGATTTGGAAAATTCTCCTGGAGAAGGCCTGCTATTGCAAATCCTATGGAGAGCAGTGGTATGCCACCGCAAAAGCAAAATTGCGTGAAGTCAAAAGTTTTGAAGGCAACACCCTTAAACCTTTGATTGGAGCTTTTATTGATGGTCTTCGGTTTATGACTGTTGACAACCCAAATCCCATTGGATTTCTCCCTAAACTAATTGGCTTGATCAAACCCCTCAATTTAGCCATGATAATTGACAACCATGAGAACACAATGTCAGGATGGATAGTTACAATAACAGCTATCATGGAGTTGTACAACATCACTGAATGCACAATTGACATCATAACTTCACTAATAACTGGATTTTATGACAAATTGACAAAGGCTACCCGGTTCTATAGCCAAGTGAAGAACCTATTCACTGGCTTCCGAACCGAGGATGTTTCCAACTCCTTTTGGTACATGGCAGCAGCTGTTTTATGTTACCTGATCACCGGACTTATCCCTAACAACGGAAAATTTTCTAAAATTAAAGCTTGTTTATCAGGCGCTTCCACGCTAGTCTCTGGTATCATTGCCACACAGAAACTTGCTGCAATGTTTGCAACGTGGAGCTCTGAAACTATTGTTAACGAGCTTTCCGCTAGAACAGTTGCTCTCTCTGAATTGAACAACCCAACCACAACATCCGACACTGATTCTGTTGAAAAATTGCTGGAATTGGCTAAGATCTTACATGAGGAAATAAAGGTACACACACTGAATCCAATAATGCAATCATACAACCCAATTCTTAGGAACCTGATGTCCACATTGGATGGCGTCATCACATCATGTAACAAAAGGAAAGCAATTGCCAAAAAGAGACCCGTTCCAGTGTGCTACATTCTCACTGGCCCTCCTGGCTGTGGCAAGACTACAGCTGCCCTAGCATTGGCAAAGAAGTTGTCTGAACAAGAACCATCAGTTATCAATCTTGATGTGGATCATCATGACACATACACTGGGAATGAGGTTTGTATTATTGATGAGTTTGATTCATCCGACAAGGTTGACTACGCAAATTTTGTGATTGGAATGGTAAATTCGGCCCCAATGGTCCTAAATTGTGATATGCTTGAAAACAAGGGCAAACTTTTCACTTCCAAGTATATTATCATGACCTCTAACTCTGAAACTCCTGTCAAACCAGCTTCTAAACGTGCTGGCGCATTCTACCGGAGGGTAACAATCATAGACGTTACCAACCCTTTAGTAGAGTCGCATAAGCGCGCTAAGCCTGGTACCTCTGTTCCCCGCAGTTGCTACAAGAAGAATTTCTCACATCTGTCGCTGGCTAAACGAGGGGCTGAGTGTTGGTGTAAGGAGTACGTCCTTGACCCAAAGGGACTCCAACACCAAAGTATTAAGGCTCCTCCACCCACCTTCTTAAACATTGACTCCCTTGCACAGACCATGAAGCAAGATTTCACTCTAAAGAATATGGCTTTTGAGGCTGAAGATGGATGCAGTGAGAACCGTTATGGGTTCATCTGCCAGAAGGAAGAAGTTGAAACCGTTCGCAGACTACTCAATGCCATTAGGGTAAGACTCAATGCCACCTTCACAGTCTGTGTTGGACCTGAAGCCTCTAGCTCCGTGGGATGCACTGCTCATGTATTGACTCCCGATGAGCCATTCAATGGAAAGAGGTTTGTGGTCTCGCGCTGCAATGAGGCATCCCTAGCTGCATTGGAAGGGAATTGTGTTCAAACTGCACTGGGCGTGTGTATGTCCAACAAGGATCTCACCCACTTGTGTCACTTCATAAAAGGAAAAATTGTCAATGATAGTGTCAGGTTGGATGAACTACCCGCCAATCAACATGTGGTAACCGTTAATTCGGTATTTGATCTGGCCTGGGCTCTTCGCCGTCATCTGACGCTAGCAGGACAGTTTCAAGCCATCAGAGCCGCATATGATGTGCTTACTGTCCCTGACAAGATTCCAGCTATGCTGCGGCACTGGATGGATGAAACCTCCTTTTCAGACGAACACGTCGTAACGCAGTTTGTTACCCCAGGGGGGATAGTTATCCTTGAATCGTGTGGTGGTGCTCGCATCTGGGCTATTGGTCACAATGTGATCAGGGCCGGAGGCATCACTGCCACACCAACCGGGGGTTGTGTACGGTTGATGGGTCTATCTGCTCAAACAATGCCATGGTCTGAAATCTTTAGGGAGCTCTTTGCCCTATTAGGAAGAATTTGGTCTAGTGTCAAAGTTTCTACTCTCGTTCTTACTGCCCTTGGGATGTATGCATCAAGGTTTAGGCCAAAATCTGAAGCAAAAGGAAAAACTAAGTCCAAAATTGGTCCGTACAGAGGACGCGGGGTAGCTCTAACAGATGATGAATACGATGAGTGGAAAGAACACAATGCAACTAGAAAGCTGGATTTATCAGTTGAGGACTTTCTTATGTTGAGACACCGCGCTGCCCTCGGCGCTGATGATGCAGATGCAGTAAAGTTTAGATCCTGGTGGAATTCAAGGTCAAAATTGGCAGACGACTTTGAGGACGTTACCGTGATTGGAAAAGGTGGCGTTAAACATGAGAAAATTAGGACCAATGTTATGAGAGCTGTTGACCGTGGTTACGATATCAGCTTTGCTGAAGAGTCTGGCCCTGGTACAAAATTTCATAAGAACGCAATTGGCTCTGTCACTGATGTGTGTGGTGAACACAAGGGTTACTGTGTCCATATGGGCCACGGTGTGTATGCATCTGTCGCCCATGTGGTCAAGGGGGACTCTTTCTTTTTGGGAGAGCGGATATTTGACCTAAAAACAAATGGTGAGTTCTGCTGTTTCAGAAGTACAAAGATTCTCCCAAGTGCAGCTCCATTCTTCTCTGGCAAACCCACTCGTGACCCATGGGGATCCCCTGTGGCAACAGATTGGAAACCAAAAGCCTACACAACAACATCAGGGAAGATTGTGGGTTGTTTCGCAACCACGTCAACAGAAACCCACCCAGGCGATTGTGGCCTGCCATACATTGATGATAATGGTAGAGTTACAGGGTTGCACACTGGATCTGGTGGTCCCAAAACCCCCAGTGCAAAGTTGGTTGTCCCTTATGTTCACATTGACATGAAAACAAAATCAGTCACAGCTCAAAAATATGATGTTACCAAACCTGATATTAGTTACAAAGGACTAGTCTGCAAGCAATTGGATGAAATTAGGATAATACCAAAAGGCACACGACTCCATGTCTCTCCAGCCCATGTTGATGATTATGAAGAATGTTCACACCAGCCCGCATCCTTGGGCAGTGGTGACCCCCGGTGTCCTAAGTCCCTCACAGCAATTGTTGTTGATTCGCTCAAGCCCTATTGTGACAAGGTTGATGGCCCCCCTCATGATGTTTTGCACCGTGTCCAGAAGATGTTAATAGATCACTTGTCTAGTTTTGTCCCTATGAATATTTCTTCTGAAACCTCCATGTTATCCGCATTTCACAAGCTAAACCATGACACTTCCTGTGGACCCTATTTAGGTGGTAGAAAGAAAGATCACATGACCAATGGAGAGCCCGATAAACCCCTTTTAGATCTCTTGTCTTCAAAGTGGAAATTGGCTACACAGGGTATTGCTCTCCCCCACGAGTATACAATTGGCTTAAAGGATGAGCTTCGGCCTATAGAAAAGGTACAAGAGGGAAAAAGAAGAATGATTTGGGGTTGTGATGTTGGTGTAGCTACCGTCTGTGCTGCTGCATTCAAGGGTGTTAGTGATGCAATTACAGCCAATCATCAGTACGGACCTGTTCAAGTCGGCATAAACATGGACAGTCCTAGTGTTGATGCGCTGTACCAAAGGATCAAGAGCGCTGCTAAGGTGTTTGCTGTTGATTACTCCAAGTGGGACTCAACACAATCACCCCGTGTCAGTGCTGCATCAATTGACATTCTACGATACTTCTCTGATCGATCACCCATTGTTGATTCTGCGGCCAACACTCTCAAGTCTCCCCCAATTGCAATCTTTAATGGAGTTGCTGTAAAGGTATCATCTGGTCTGCCATCGGGAATGCCCCTAACCTCTGTAATCAACTCTTTGAACCACTGCTTGTATGTTGGGTGTGCTATCTTACAGTCATTGGAAGCCAAAAACATCCCTGTTACTTGGAACCTGTTTTCTTCTTTCGATATGATGACTTATGGTGATGATGGTGTGTATATGTTCCCAACTATGTTTGCTAGTGTAAGTGATCTGATATTTGGAAATTTATCTGCTTATGGTCTTAAACCCACTAGAGTAGACAAGTCTGTTGGAGCAATTGAGCCCATTGACCCGGAGGCTGTGGTTTTTCTCAAGCGAACCATCACAAGAACCCCTAATGGTGTAAGGGGACTGCTTGATCGCAGTTCCATACTGCGGC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14,502
ON360072.1
Feline calicivirus
Lu,C., Liu,X., Song,R., Tao,W., Yu,Y., Yang,H., Shan,H., Zhang,C.
Qingdao Agricultural University
China
2023-07-22
FCV-164
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,706
GenBank
null
China
China
Felis catus
oronasopharynx
2020-06-23
null
null
Feline calicivirus isolate FCV-164, complete genome
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14,612
ON360073.1
Feline calicivirus
Lu,C., Liu,X., Song,R., Tao,W., Yu,Y., Yang,H., Shan,H., Zhang,C.
Qingdao Agricultural University
China
2023-07-22
FCV-7
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,705
GenBank
null
China
China
Felis catus
oronasopharynx
2019-12-30
null
null
Feline calicivirus isolate FCV-7, complete genome
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14,613
OQ472996.1
Feline calicivirus
Chen,Y.C., Chen,T.Y., Huang,Z.X., Luo,J., Guo,F.X.
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
China
2023-07-03
FCV-GDJM202201
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,722
GenBank
null
China
China
Felis catus
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2022
null
null
Feline calicivirus isolate FCV-GDJM202201, complete genome
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14,803
OP626899.1
Feline calicivirus
Lanave,G., Buonavoglia,A., Pellegrini,F., Martino,B.D., Profio,F.D., Diakoudi,G., Catella,C., Omar,A.H., Vasinioti,V.I., Cardone,R., Santo,G., Martella,V., Camero,M.
Universita degli studi di Bari, Medicina Veterinaria
null
2023-06-07
460/20-1 OS
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,687
GenBank
null
Italy
Italy
Felis catus
oronasopharynx
2020
null
null
Feline calicivirus isolate 460/20-1 OS, complete genome
AAGAAATTTGAGACAATGTCTCAAACTCTGAGCTTCGTGCTTAAAACTCACAATGTCCGCAAAGACTTTGTGCACTCCGTCAAGCTTACGCTTGCTCGGAGGCGCGATCTTCAGTATTTCTATAACAAGCTCTCTCGCACCATGCGTGCTGAGGCTTGTCCCTCTTGTGCTAGTTATGACGTCTGTCCTAACTGCACTTCTAGTGATATTCCTGACGACGGTTCGTCAATGAACTCGATACCGTCTTGGGAGGATGTCACAAAAACCTCAACCTATTCTCTCTTGCTTTCCGAGGACACTTCTGACGAGCTCTGCCCTGATGACCTGGTTAACATTGCTTCCCACATTCGTAAGGCACTATCCACTCAGTCCCACCCGGCCAATACTGACATGTGCAAAGAACAGCTCACGTCGCTATTGGTTGTGGCTGAAGCGATGCTGCCCCAACGATCACGAGGAACAATCCCCTTGCACCAACAACACCAAACTGCTCGTCTGGAGTGGAGGGAAAAGTTCTTCTCCAAACCACTTGACTTTCTCCTTGCAAAACTCGGCATGTCAAAGGATATTCTTCAAACCACCGCAATCTGGAAAATTGTTTTGGAAAAGGCCTGTTACTGCAAATCCTACGGCGAAGAATGGTTTGATGCTGCCAAAGAGAAGTTGCGTCAAGTCCAAAATTTTGAAGGGAACACATTGAAACCACTGATTGGAGCTTTCATTGATGGCCTGCGATTTATGACCGTAGACAATCCAAACCCGATTGGTTTTCTCCCAAAATTAATAGGCTTGATAAAACCCTTGAACCTGGCTATGATAATTGATAATCATGAGAACACAATGTCTGGTTGGGTGGTTACAATAACAGCAATCATGGAGCTGTACAACATCACTGAGTGTACCATTGATATTGTGACTGCACTGGTGACTGGGTTCTATGACAAATTAGCAAAAGCCACAAAGTTTTACAGTCATGTAAAAAGTTTATTCACTGGCTTTAGGGCAGAAGATGTATCCAACTCGTTCTGGTACATGGCTGCTGCTGTTTTGTGTTACCTAATTACTGGCCTGCTCCCAAATAACGGTAGGTTTTCCAAAATTAAATCTTGCCTAGCTGGTGCATCAACCTTAGTATCTGGTATAATTGCTACACAAAAGCTTGCTGCCATGTTTGCCACATGGAACTCTGAAACAATTGTCAATGAGCTCTCTGCTAGAACAGTTGCCCTCTCTGAACTAAATAACCCCACCACAACTTCAGACACTGATTCTGTTGAAAAACTGCTGGAATTGGCTAAGATCTTGCATGAGGAGATCAAAGTGCACACACTAAACCCAATAATGCAATCATACAACCCAATTCTTAGGAATTTGATGTCAACATTGGATGGTGTGATCACATCTTGTAACAAAAGAAGGGCCATTGCTAGGAAGAGGCCTGTCCCTGTGTGCTATATCCTCACTGGACCACCTGGCTGCGGCAAGACAACGGCCGCCTTGGCGTTGGCAAAGAAGCTTTCAGAGCAAGAACCATCTGTCATCAACCTTGATGTCGACCACCATGACACATACACCGGTAACGAGGTTTGCATTATTGATGAGTTTGATTCCTCTGACAAAGTGGATTATGCAAATTTTGTAATTGGCATGGTTAACTCTGCCCCTATGGTTTTAAATTGTGATATGCTCGAAAACAAGGGGAAACTTTTCACCTCTAAGTATATTATCATGACTTCTAACTCAGAAACCCCTGTAAAGCCCTCTTCAAAGCGGGCTGGCGCGTTCTACCGTAGGGTGACAATCATTGATGTCGCTAACCCTCTGGTGGAATCGCACAAGCGCGCTAGACCTGGCACTGCTGTCCCTCGGAGCTGTTACAAGAAAAACTTTTCTCATCTCTCTCTTGCTAAGCGAGGGGCTGAGTGCTGGTGTAAAGAGTATGTCCTTGACCCTAAAGGACTACAACACCAAACCACGAAGGCACCCCCACCCACCTTCTTAAATATTGATTCCTTGGCACAAACCATGAAGCAGGACTTTACCTTGAAGAATATGGCTTTTGAGGCTGAAGAAGGACATAGCGACCACCGCTACGGATTTGTTTGCCAGAGAGGAGAGGTGGAAACAGTTCGCCGATTACTCAATGCCATTAGAACTAGGCTCAACGCTACGTTCACGGTTTGTGTGGGTGCTGAAGCCTCTCCATCCATTGGTTGCACTGCCCACGTACTCACACCAGACGAACCATTCAATGGTAAAAGGTACGTGGTATCACGCTGTAATGAGGCATCACTATCAGCACTAGAAGGCAACTGTGTACAATCTGCCTTGGGTGTGTGCATGTCCAACAAGGATCTTACCCATTTGTGTCACTTCATAAGAGGGAAGATTGTCAACGATAGTGTTAGGTTAGATGAACTACCCGCCAATCAACATGTGGTAACTGTTAATTCAGTGTTTGATTTGGCCTGGGCTCTTCGTCGCCACCTGACACTAACAGGACAGTTTCAAGCCATCAGAGCCGCATATGATGTGCTTACTGTCCCCGACAAAATTCCAGCTATGTTGCGACACTGGATGGATGAAACATCCTTCTCGGATGAGCACGTTGTCACCCAGTTCGTGACCCCTGGTGGCATTGTCATCCTTGAGTCATGTGGTGGTGCGCGAATTTGGGCTCTAGGTCACAACGTGATTAGAGCCGGAGGCGTCACTGCCACACCAACTGGGGGTTGTGTTAGATTGATGGGTCTGTCAGCTCAAACAATGCCATGGTCGGAAATCTTCAGAGAACTGTTTTCGCTCCTTGGTAAGATCTGGTCAAGTGTTAAGGTTTCAACCCTTGTTCTCACTGCTCTTGGAATGTATGCATCTAGGTTTAGACCAAAATCTGAAGCAAAAGGAAAGACAAAATCCAAAATTGGACCCTATAGAGGTCGAGGAGTGGCCCTCACCGATGATGAATATGACGAATGGAAGGAGCACAACGCTACTAGAAAATTAGACTTATCAGTGGAGGATTTTCTCATGCTAAGGCATCGTGCTGCGCTTGGCGCAGATGACGCTGACGCTGTAAAATTTAGATCCTGGTGGAACTCAAGGTCAAAATTGGCTGACGACTTTGAGGATGTCACTGTAATTGGCAAGAGTGGCGTCAAACATGAAAGAATTAGAACCAACACACTTAGAGCCGTGGACCGTGGCTATGACATAAGCTTCGCAGAAGAGTCAGGCCCGGGTACAAAATTCCACAAGAATGCAATTGGATCTGTGACTGATGTGTGTGGCGAACACAAGGGTTACTGTATCCACATGGGACATGGTGTGTACGCGTCTGTTGCTCATGTGGTAAAAGGTGACTCATTCTTTCTGGGTGAGCGAATCTTTGACCTTAAAACAAATGGAGAATTCTGCTGTTTTAGGAGTACGAAGATTCTCCCAAGTGCAGCCCCCTTCTTCTCGGGAAAACCTACTCGAGATCCTTGGGGTTCCCCAGTGGCAACTGATTGGAAACCCAAGGCATACACAACAACATCAGGAAAGATTGTAGGATGTTTTGCTACCACATCCACAGAAACACACCCAGGTGATTGTGGTCTACCATACATTGACGATAATGGTAGGGTCACAGGATTGCACACCGGATCTGGGGGTCCAAAAACCCCTAGTGCCAAATTAATTGTGCCTTATGTACACATTGACATGAAAGAGAAATCTGTTACTGCCCAAAAGTACGATGTCACAAAACCCGACATTAGCTATAAGGGTCTGATTTGCAAGCAATTGGATGAAATTAGGATCATACCAAAAGGCACAAGACTCCATGTTTCCCCTGCTCACACTGAGGATTACGAGGAGTGCTCACACCAACCAGCATCCTTAGGCAGTGGTGACCCTCGCTGCCCAAAGTCCCTCACTGCAATTGTTGTTGACTCCTTGAAGCCCTACTGTGAAAAAGTGGACGGTCCTCCTCACGATATTCTCCACCGGGTGCAGAAAATGTTGATTGATCATCTTGCTGGCTTTGTTCCTATGAATATATCTTCTGAACAATCTATGATGTCTGCCTTTCACAAGCTTAATCATGACACCTCTTGCGGACCATACCTAGGTGGCAGGAAGAAGGACCACATAGTTAATGGAGAACCAGATAAAGCTTTGTTGGATCTTTTGTCTTCAAAATGGAAATTGGCTACACAAGGAATAGCTCTCCCACATGAATACACAATTGGCCTCAAGGATGAATTGCGACCTGTAGAGAAAGTTCAAGAAGGAAAAAGACGAATGATCTGGGGTTGTGATGTCGGGGTTGCCACCGTCTGTGCCGCTGCATTTAAGGGTGTCAGTGATGCGATAACAGCGAATCATCAGTATGGACCTGTCCAAGTTGGAATAAACATGGATAGCCCTAGTGTTGAGGCGCTGTACCAAAGAATCAAGGCTGCTGCGAAGGTTTTTGCAGTTGATTACTCCAAGTGGGACTCAACTCAATCACCCCGCGTCAGTGCAGCGTCAATTGACATCCTACGGTACTTCTCTGACAGATCACCCATAGTTGATTCGGCTGCAAACACTTTAAAATCACCCCCAGTCGCAATCTTTAACGGCGTTGCTGTAAAAGTCTCTTCTGGTCTACCATCAGGAATGCCCCTAACATCAGTTATTAATTCTCTGAATCACTGTCTGTACCTAGGGTGTGCTATCCTTCAATCACTTGAATCAAGGAATGTACCTGTTACCTGGAATCTGTTCTCTTCCTTTGATATGATGACCTATGGTGATGATGGCGTCTATATGCTTCCAATTATGTTTGCTAGTGTCAGTGACCAGATTTTTGGAAACCTCTCTGCTTATGGCCTAAAACCCACTAGAGTTGATAAATCTGTTGGCGCAATAGAGCCAATTGACCCTGAATCTGTCGTCTTCTTGAAAAGAACAATTACTAGAACGCAGAACGGAGTCAGGGGCTTGTTGGATCGTAGTTCAATAACAAGGCAGTT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15,292
OP626900.1
Feline calicivirus
Lanave,G., Buonavoglia,A., Pellegrini,F., Martino,B.D., Profio,F.D., Diakoudi,G., Catella,C., Omar,A.H., Vasinioti,V.I., Cardone,R., Santo,G., Martella,V., Camero,M.
Universita degli studi di Bari, Medicina Veterinaria
null
2023-06-07
460/20-1 RS
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,687
GenBank
null
Italy
Italy
Felis catus
feces
2020
null
null
Feline calicivirus isolate 460/20-1 RS, complete genome
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15,293
OP626901.1
Feline calicivirus
Lanave,G., Buonavoglia,A., Pellegrini,F., Martino,B.D., Profio,F.D., Diakoudi,G., Catella,C., Omar,A.H., Vasinioti,V.I., Cardone,R., Santo,G., Martella,V., Camero,M.
Universita degli studi di Bari, Medicina Veterinaria
null
2023-06-07
460/20-2 RS
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,687
GenBank
null
Italy
Italy
Felis catus
feces
2020
null
null
Feline calicivirus isolate 460/20-2 RS, complete genome
AAGAAATTTGAGACAATGTCTCAAACTCTGAGCTTCGTGCTTAAAACTCACAATGTCCGCAAAGACTTTGTGCACTCCGTCAAGCTTACGCTTGCTCGGAGGCGCGATCTTCAGTATTTCTATAACAAGCTCTCTCGCACCATGCGTGCTGAGGCTTGTCCCTCTTGTGCTAGTTATGACGTCTGTCCTAACTGCACTTCTAGTGATATTCCTGACGACGGTTCGTCAATGAACTCGATACCGTCTTGGGAGGATGTCACAAAAACCTCAACCTATTCTCTCTTGCTTTCCGAGGACACTTCTGACGAGCTCTGCCCTGATGACCTGGTTAACATTGCTTCCCACATTCGTAAGGCACTATCCACTCAGTCCCACCCGGCCAATACTGACATGTGCAAAGAACAGCTCACGTCGCTATTGGTTGTGGCTGAAGCGATGCTGCCCCAACGATCACGAGGAACAATCCCCTTGCACCAACAACACCAAACTGCTCGTCTGGAGTGGAGGGAAAAGTTCTTCTCCAAACCACTTGACTTTCTCCTTGCAAAACTCGGCATGTCAAAGGATATTCTTCAAACCACCGCAATCTGGAAAATTGTTTTGGAAAAGGCCTGTTACTGCAAATCCTACGGCGAAGAATGGTTTGATGCTGCCAAAGAGAAGTTGCGTCAAGTCCAAAATTTTGAAGGGAACACATTGAAACCACTGATTGGAGCTTTCATTGATGGCCTGCGATTTATGACCGTAGACAATCCAAACCCGATTGGTTTTCTCCCAAAATTAATAGGCTTGATAAAACCCTTGAACCTGGCTATGATAATTGATAATCATGAGAACACAATGTCTGGTTGGGTGGTTACAATAACAGCAATCATGGAGCTGTACAACATCACTGAGTGTACCATTGATATTGTGACTGCGCTGGTGACTGGGTTCTATGACAAATTAGCAAAAGCCACAAAGTTTTACAGTCATGTAAAAAGTTTATTCACTGGCTTTAGGGCAGAAGATGTATCCAACTCGTTCTGGTACATGGCTGCTGCTGTTTTGTGTTACCTAATTACTGGCCTGCTCCCAAATAACGGTAGGTTTTCCAAAATTAAATCTTGCCTAGCTGGTGCATCAACCTTAGTATCTGGTATAATTGCTACACAAAAGCTTGCTGCCATGTTTGCCACATGGAACTCTGAAACAATTGTCAATGAGCTCTCTGCTAGAACAGTTGCCCTCTCTGAACTAAATAACCCCACCACAACTTCAGACACTGATTCTGTTGAAAAACTGCTGGAATTGGCTAAGATCTTGCATGAGGAGATCAAAGTGCACACACTAAACCCAATAATGCAATCATACAACCCAATTCTTAGGAATTTGATGTCAACATTGGATGGTGTGATCACATCTTGTAACAAAAGAAGGGCCATTGCTAGGAAGAGGCCTGTCCCTGTGTGCTATATCCTCACTGGACCACCTGGCTGCGGCAAGACAACGGCCGCCTTGGCGTTGGCAAAGAAGCTTTCAGAGCAAGAACCATCTGTCATCAACCTTGATGTCGACCACCATGACACATACACCGGTAACGAGGTTTGCATTATTGATGAGTTTGATTCCTCTGACAAAGTGGATTATGCAAATTTTGTAATTGGCATGGTTAACTCTGCCCCTATGGTTTTAAATTGTGATATGCTCGAAAACAAGGGGAAACTTTTCACCTCTAAGTATATTATCATGACTTCTAACTCAGAAACCCCTGTAAAGCCCTCTTCAAAGCGGGCTGGCGCGTTCTACCGTAGGGTGACAATCATTGATGTCGCTAACCCTCTGGTGGAATCGCACAAGCGCGCTAGACCTGGCACTGCTGTCCCTCGGAGCTGTTACAAGAAAAACTTTTCTCATCTCTCTCTTGCTAAGCGAGGGGCTGAGTGCTGGTGTAAAGAGTATGTCCTTGACCCTAAAGGACTACAACACCAAACCACGAAGGCACCCCCACCCACCTTCTTAAATATTGATTCCTTGGCACAAACCATGAAGCAGGACTTTACCTTGAAGAATATGGCTTTTGAGGCTGAAGAAGGACATAGCGACCACCGCTACGGATTTGTTTGCCAGAGAGGAGAGGTGGAAACAGTTCGCCGATTACTCAATGCCATTAGAACTAGGCTCAACGCTACGTTCACGGTTTGTGTGGGTGCTGAAGCCTCTCCATCCATTGGTTGCACTGCCCACGTACTCACACCAGACGAGCCATTCAATGGTAAAAGGTACGTGGTATCACGCTGTAATGAGGCATCACTATCAGCACTAGAAGGCAACTGTGTACAATCTGCCTTGGGTGTGTGCATGTCCAACAAGGATCTTACCCATTTGTGTCACTTCATAAGAGGGAAGATTGTCAACGATAGTGTTAGGTTAGATGAACTACCCGCCAATCAACATGTGGTAACTGTTAATTCAGTGTTTGATTTGGCCTGGGCTCTTCGTCGCCACCTGACACTAACAGGACAGTTTCAAGCCATCAGAGCCGCATATGATGTGCTTACTGTCCCCGACAAAATTCCAGCTATGTTGCGACACTGGATGGATGAAACATCCTTCTCGGATGAGCACGTTGTCACCCAGTTCGTGACCCCTGGTGGCATTGTCATCCTTGAGTCATGTGGTGGTGCGCGAATTTGGGCTCTAGGTCACAACGTGATTAGAGCCGGAGGCGTCACTGCCACACCAACTGGGGGTTGTGTTAGATTGATGGGTCTGTCAGCTCAAACAATGCCATGGTCGGAAATCTTCAGAGAACTGTTTTCGCTCCTTGGTAAGATCTGGTCAAGTGTTAAGGTTTCAACCCTTGTTCTCACTGCTCTTGGAATGTATGCATCTAGGTTTAGACCAAAATCTGAAGCAAAAGGAAAGACAAAATCCAAAATTGGACCCTATAGAGGTCGAGGAGTGGCCCTCACCGATGATGAATATGACGAATGGAAGGAGCACAACGCTACTAGAAAATTAGACTTATCAGTGGAGGATTTTCTCATGCTAAGGCATCGTGCTGCGCTTGGCGCAGATGACGCTGACGCTGTAAAATTTAGATCCTGGTGGAACTCAAGGTCAAAATTGGCTGACGACTTTGAGGATGTCACTGTAATTGGCAAGAGTGGCGTCAAACATGAAAGAATTAGAACCAACACACTTAGAGCCGTGGACCGTGGCTATGACATAAGCTTCGCAGAAGAGTCAGGCCCGGGGACAAAATTCCACAAGAATGCAATTGGATCTGTGACTGATGTGTGTGGCGAACACAAGGGTTACTGTATCCACATGGGACATGGTGTGTACGCGTCTGTTGCTCATGTGGTAAAAGGTGACTCATTCTTTCTGGGTGAGCGAATCTTTGACCTTAAAACAAATGGAGAATTCTGCTGTTTTAGGAGTACGAAGATTCTCCCAAGTGCAGCCCCCTTCTTCTCGGGAAAACCTACTCGAGATCCTTGGGGTTCCCCAGTGGCAACTGATTGGAAACCCAAGGCATACACAACAACATCAGGAAAGATTGTAGGATGTTTTGCTACCACATCCACAGAAACACACCCAGGTGATTGTGGTCTACCATACATTGACGATAATGGTAGGGTCACAGGATTGCACACCGGATCTGGGGGTCCAAAAACCCCTAGTGCCAAATTAATTGTGCCTTATGTACACATTGATATGAAAGAGAAATCTGTTACTGCCCAAAAGTACGATGTCACAAAACCCGACATTAGCTATAAGGGTCTGATTTGCAAGCAATTGGATGAAATTAGGATCATACCAAAAGGCACAAGACTCCATGTTTCCCCTGCTCACACTGAGGATTACGAGGAGTGCTCACACCAACCAGCATCCTTAGGCAGTGGTGACCCTCGCTGCCCAAAGTCCCTCACTGCAATTGTTGTTGACTCCTTGAAGCCCTACTGTGAAAAAGTGGACGGTCCTCCTCACGATATTCTCCACCGGGTGCAGAAAATGTTGATTGATCATCTTGCTGGCTTTGTTCCTATGAATATATCTTCTGAACAATCTATGATGTCTGCCTTTCACAAGCTTAATCATGACACCTCTTGCGGACCATACCTAGGTGGCAGGAAGAAGGACCACATAGTTAATGGAGAACCAGATAAAGCTTTGTTGGATCTTTTGTCTTCAAAATGGAAATTGGCTACACAAGGAATAGCTCTCCCACATGAATACACAATTGGCCTCAAGGATGAATTGCGACCTGTAGAGAAAGTTCAAGAAGGAAAAAGACGAATGATCTGGGGTTGTGATGTCGGGGTTGCCACCGTCTGTGCCGCTGCATTTAAGGGTGTCAGTGATGCGATAACAGCGAATCATCAGTATGGACCTGTCCAAGTTGGAATAAACATGGATAGCCCTAGTGTTGAGGCGCTGTACCAAAGAATCAAGGCTGCTGCGAAGGTTTTTGCAGTTGATTACTCCAAGTGGGACTCAACTCAATCACCCCGCGTCAGTGCAGCGTCAATTGACATCCTACGGTACTTCTCTGACAGATCACCCATAGTTGATTCGGCTGCAAACACTTTAAAATCACCCCCAGTCGCAATCTTTAACGGCGTTGCTGTAAAAGTCTCTTCTGGTCTACCATCAGGAATGCCCCTAACATCAGTTATTAATTCTCTGAATCACTGTCTGTACCTAGGGTGTGCTATCCTTCAATCACTTGAATCAAGGAATGTACCTGTTACCTGGAATCTGTTCTCTTCCTTTGATATGATGACCTATGGTGATGATGGCGTCTATATGCTTCCAATTATGTTTGCTAGTGTCAGTGACCAGATTTTTGGAAACCTCTCTGCTTATGGCCTAAAACCCACTAGAGTTGATAAATCTGTTGGCGCAATAGAGCCAATTGACCCTGAATCTGTCGTCTTCTTGAAAAGAACAATTACTAGAACGCAGAACGGAGTCAGGGGCTTGTTGGATCGTAGTTCAATAACAAGGCAGTT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15,294
OP485690.1
Feline calicivirus
Sun,F., Chen,Y.
College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Laboratory of Animal Infectious Diseases and Molecular Immunology
China
2023-04-19
Canine/GXHC01-21
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,721
GenBank
null
China
China
Canis lupus familiaris
null
2022-01-06
null
null
Feline calicivirus isolate Canine/GXHC01-21, complete genome
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16,636
OP485691.1
Feline calicivirus
Sun,F., Chen,Y.
College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Laboratory of Animal Infectious Diseases and Molecular Immunology
China
2023-04-19
Canine/GXNN10-21
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,722
GenBank
null
China
China
Canis lupus familiaris
null
2022-01-06
null
null
Feline calicivirus isolate Canine/GXNN10-21, complete genome
GTAAAAGAAATTTGAGGCAATGTCTCAAACTCTGAGCTTCGTGCTTAAAACTCACAACGTCCGTAAGGACTTTGTGCACTCCGTCAAGTTAACACTTGCTCGGAGGCGCGATCTTCAGTATTTCTATAACAGGCTCTCTCGCACTATCCGTGCTGAGGCCTGCCCCTCTTGTGCTAGTTATGACATCTGTCCTAACTGCACTTCTGGTAGCATTCCTGATGATGGGTCGTCAATTAACTCGATTCCATCCTGGGAAGACGTTACCAAAACTTCCACTTACTCTCTATTGCTGTCTGAGGATACGACCGATGAACTCTGCCCCGATGACTTGGCCAACATTGCATCTCACATTCGCAAGGCACTGTCAACTCAGTCTCATCCAGCCAACAGTGACATGTGCAAAGAACAGCTCACGTCTTTGTTGGTTGTGGCTGAAGCGATGTTGCCTCAGCGATCACGGTCTACAATCCCACTTCAACAGCAACACCAGGCTGCTCGTCTGGAATGGAGAGAAAAGTTCTTTTCTAAGCCTATTGATTTTCTCTTGGAAAGACTCGGATTGTCAAAGGATATTCTGCAAACTACTGCGATTTGGAAAATCCTCTTGGAAAAAGCTTGCTATTGTAAATCTTATGGAGAACAGTGGTACGCAGCCGCAAAAGAAAAATTGCGTGAAGTTAGGACCTTTGAAGGAAACACATTAAAACCTCTAGTTGGAGCTTTCATTGATGGCCTTCGATTTTTGACTGTTGACAACCCAAACCCTATTGGCTTCCTTCCAAAACTGATCGGCTTAATCAAGCCCCTCAATTTGGCTATGATAATTGATAATCATGAGAACACAATGTCAGGGTGGATAGTTACAATAACAGCCATCATGGAGTTATACAACATTACTGAATGCACAATTGACATCATAACGTCATTGATAACCGGGTTTTATGACAAGATAGCCAAGGCTACTCGATTCTATAGCCAAGTGAAAAATTTATTCACCGGGTTTAGAACCGAAGATGCTTCAAATTCTTTCTGGTACATGGCGGCTGCAGTTTTGTGCTATCTGATCACCGGATTAATCCCTAATAATGGGAGATTCTCCAAGATCAAGGCTTGTCTGTCAGGTGCTTCCACATTGGTCTCGGGTATCATTGCCACACAGAAACTGGCCGCAATGTTTGCAACATGGAGCTCTGAGACTATTGTCAATGAGCTCTCTGCCAGAACAGTTGCCCTCTCTGAGTTGAACAACCCAACCACGACTGCTGATACAGATTCTGTTGAAAAACTATTAGAATTGGCCAAAATCTTGCATGATGAAATAAAAGTACACACATTAAATCCAATAATGCAATCATACAATCCAATCCTTAGGAATCTGATGTCCACGTTGGATGGTGTTATAACATCATGCAATAAAAGAAAGGCAATTGCCAGAAAGAGACCTGTCCCAGTGTGCTACATTCTGACTGGCCCTCCTGGTTGTGGAAAAACCACGGCTGCTCTAGCATTGGCAAAGAAACTATCTGATCAAGAACCATCAGTTATCAATCTTGATGTGGATCACCATGACACCTACACTGGCAATGAAGTGTGCATCATTGACGAATTTGACTCATCTGACAAGGTTGATTACGCAAATTTTGTTATTGGAATGGTGAATTCGGCCCCAATGGTGCTAAACTGTGACATGCTTGAGAACAAAGGCAAACTTTTCACTTCTAAATATATTATTATGACCTCAAACTCTGAAACTCCTGTCAAGCCAGCCTCTAAGCGTGCTGGTGCATTCTATCGAAGAGTGACTATTGTAGATGTCACAAATCCTTTGGTTGAATCGCACAAGCGTGCTAGACCTGGCACCTCTGTCCCTCGTAGTTGCTATAAGAAAAATTTCTCACACCTATCATTGGCAAAAAGAGGAGCTGAATGCTGGTGCAAGGAACACGTCCTTGATCCAAAGGGCCTCCAGCACCAAAGCATTAAAGCTCCTCCCCCCACATTCTTAAATATTGACTCTCTTGCGCAAACTATGAAACAAGATTTCACTCTCAAGAACATGGCTTTTGATGCTGAAGAAGGGTGCAGTGAACACCGTTATGGTTTTATCTGCCAAAAGGAGGAGATCGAAACAGTGCGCAGACTGCTTAATGCCATCAGAGTTAGACTCAACGCTACCTTCACGGTTTGTGTGGGGCCTGAAGCTTCCAGTTCCGTTGGATGTACTGCTCATGTGTTAACTCCTGAGGAGACATTCAATGGGAAGAAGTTTGTGGTCTCACGTTGCAATGAGGCATCTCTGGCTGCATTGGAAGGCAACTGCGTCCAAACTGCGTTGGGTATATGCATGTCCAACAAGGACCTCACCCATCTATGCCATTACATAAAAGGGAAGATTATCAATGATAGTGTCAGGTTGGATGAACTACCCGCCAATCAACATGTGGTAACTGTTAATTCGGTGTTTGATTTGGCCTGGGCTCTTCGCCGTCACTTGACACTAGCAGGACAGTTTCAAGCCATCAGAGCCGCATATGATGTGCTTACTGTCCCCGATAAAATCCCAGCCATGTTACGGCACTGGATGGATGAAGCGTCCTTCTCTGATGAGCATGTTGTAACGCAGTTTGTAACCCCAGGGGGGATAGTTATCCTTGAGTCGTGTGGAGGTGCCCGCATCTGGGCTATTGGTCACAATGTGATCAGAGCCGGGGGCGTCACCGCTACACCAACCGGGGGTTGTGTCAGGTTAATGGGACTGTCTGCACAAACAATGCCATGGTCTGAGATCTTTAGAGAGCTCTTTGCTTTGTTGGGAAAAAGCTGGTCAAGTGTTAAAGTTTCTACTCTTGTTCTCACTGCCCTTGGGATGTATGCATCAAGATTTAGACCAAAGTCCGAAGCAAAAGGTAAAACAAAATCAAAGATTGGCCCATACAGAGGCCGTGGTGTGGCTTTAACTGATGATGAATATGATGAATGGAAGGAACACAATGCATCTAGAAAATTGGACCTGTCAGTTGAGGATTTTCTTATGTTAAGACATCGTGCTGCTCTAGGAGCTGATGATGCAGATGCCGTAAAATTTAGATCCTGGTGGAACTCAAGATCAAAATTGGCTGATGATTATGAAGAAGTCACCATAATTGGCAAAGGTGGCGTCAAACATGACAAAATTAGAACTAATGTTATGAAAGCTGTTGATCGTGGCTACGACGTAAGCTTTGCAGAGGAATCTGGCCCTGGCACCAAATTTCACAAAAACGCAATTGGATCTGTTACAGATGTATGTGGCGAACATAAAGGGTATTGTGTTCATATGGGCCACGGTGTATACGCATCAGTTGCCCACGTGGTTAAGGGAGACTCTTTCTTTTTGGGTGAGCGAATCTTTGACCTAAAAACAAATGGTGAATTCTGCTGTTTCAGAAGCACTAAAATTCTCCCAAGTGCAGCCCCGTTCTTTTCCGGCAAACCCACTCGTGACCCATGGGGATCTCCTGTGGCAACAGATTGGAAGCCAAAAGCCTACACTACAACATCAGGAAAGATCGTGGGTTGTTTTGCAACCACATCAACAGAAACTCACCCTGGTGACTGTGGACTGCCATACATTGATGACAATGGTAGGGTCACTGGGTTACATACTGGATCAGGTGGCCCCAAAACTCCAAGTGCAAAATTGGTTGTTCCTTATGTGCACATAGATATGAAAACAAAGTCAGTCACTGCTCAAAAATACGATATCACTAAACCGGATATCAGTTACAAAGGACTAATTTGCAAACAATTGGATGAAATTAGGATTATACCAAAAGGAACGCGGCTTCACGTTTCTCCAGCCCATGTTGATGATTATGAAGAGTGTTCACACCAACCCGCTTCTTTAGGTAGTGGTGACCCTCGGTGCCCCAAATCTCTTACTGCAATTGTAGTTGACTCTCTTAAGCCCTATTGTGATAAGGTTGATGGCCCCCCTCATGATGTCTTGCACCGTGTCCAAAAGATGCTAATTGATCACTTGTCCGGCTTTGTTCCTATGAATATTTCTTCTGAAACCTCCATGTTGTCTGCATTTCACAAGTTGAATCATGACACTTCCTGTGGGCCTTATTTGGGTGGTAGAAAGAAAGATCATATGACCGATGGCGAACCCGACAAACCCCTTCTGGATCTACTGTCTTCGAAGTGGAAACTGGCTACGCAAGGTATCGCTCTCCCTCATGAATACACAATTGGCTTGAAAGATGAGCTCCGGCCTATAGAAAAGGTGCAGGAAGGGAAGAGACGAATGATTTGGGGCTGTGATGTTGGGGTAGCCACTGTTTGTGCTGCTGCATTTAAGGGTGTTAGTGATGCAATTACAGCAAACCACCAGTACGGGCCTGTTCAAGTTGGTATAAACATGGATAGCCCTAGTGTCGATGCGCTGTACCAAAGAATCAAAAGTGCCGCCAAGGTTTTTGCTGTTGATTATTCCAAGTGGGACTCAACACAATCACCCCGTGTCAGTGCTGCATCAATTGACATTTTGCGGTATTTTTCTGACCGGTCTCCCATCGTTGACTCTGCAGCTAACACTTTGAAATCCCCCCCGGTCGCAATCTTTAACGGAGTTGCTGTTAAGGTATCATCTGGCCTACCATCTGGAATGCCCTTAACTTCCGTAATTAACTCACTAAATCACTGTTTGTATGTTGGGTGTGCTATCTTACAATCATTAGAAGCCAAAAACATCCCTGTCACTTGGAACCTATTCTCCTCCTTCGATATGATGACCTATGGTGATGATGGTGTCTACATGTTCCCTACTATGTTTGCTAGTGTGAGTGATCAGATATTTGGAAATCTATCTGCTTATGGCCTTAAACCCACCAGAGTGGACAAGTCTATTGGAGCAATTGAACCAATCGACCCAGAATCTGTGGTTTTCCTTAAAAGAACCATTACAAGAACTCCCAACGGTATAAGAGGATTGCTCGACCGTAGCTCCATACTGCGGC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16,637
OP137265.1
Feline calicivirus
Li,J.
Guangzhou Yuanbo Medical Technology Co., Ltd, Research and development department
China
2023-04-01
DGCV03
Feline calicivirus
Vesivirus
Caliciviridae
ssRNA(+)
7,708
GenBank
null
China
China
Feliformia
null
2020-07-13
null
null
Feline calicivirus isolate DGCV03, complete genome
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16,966
OR711916.1
Feline coronavirus
Zhao,F.
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
China
2023-11-19
DQ2023
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,032
GenBank
null
China
China
Felis catus
null
2023
null
null
UNVERIFIED: Feline coronavirus isolate DQ2023, complete genome
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10,814
OP542206.1
Feline coronavirus
Aplasca,A.C., Martinez,M.P., Evans,S.J.M., Martinez,M.E., Cianciolo,R.E., Bundschuh,M., Puchulu-Campanella,E., Chen,X., Yan,P., Bundschuh,R., Seeley,K.E., Bapodra-Villaverde,P., Garner,M.M., Junge,R.E., Evans,S., Cianciolo,R.
The Ohio State University, Department of Physics
USA
2023-10-27
2020-FM3
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,243
GenBank
1
USA: Ohio
USA
Felis margarita
null
2020-04-29
null
null
Feline coronavirus isolate 2020-FM3, complete genome
CGTGGCTATAACTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCATTCAGTTTGGCAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGGCGCGCCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCTGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACACTTTAAGATCCTCATTAATGAGGACTATCAAGTCAACGTGCCTAGTCTTCCTTTCCGTGACGCGTTGCAGGAAATTAAGTACTGCTACCGTAACGGTTTTGAGGGCTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGCCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTGGGCAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTGCAAGGCTTTATCGTTAGAGCTGAATGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCCCGTACTGGAAATGGCGCCATATATGTAGATCAATACATGTGTGGTTCTGATGGAAAGCCAGTTATTGAGGGCGAGTTTAAGGACTACTTCGGTGATGAGGACGTTATCATCTATGAAGGAGAGGAATACCATTGCGCTTGGTTAACTGTGCGCGATGAAAAACCTTTGTGTCAACAAACTCTCCTTACAATTAGGGAAATCCAATACAACCTGGACATCCCACATAAGTTGCCTAATTGTGCTATCAGAGAAGTAGCACCACCAGTCAAGAAGAACTCTAAGGTTGTTCTATCTGAAGAGTATAGAAAACTCTATGACATCTTCGGTTCACCATTTATGGGTAATGGAGACAGTCTTAACAAGTGCTTTGGCAGCCTCCACTTCATTGCTGCTACCCTTAAGTGCCCTTGTGGCTCTGAAAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGTTTCAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTCATGGCAAGGTTAAAGGTGTCACATTAGGTGCTGTTAAGCCCGGTGATGCTGTTATTACTAGCATGAGCGCTGGCAAGGGTGTGAAATTCTTTGCAAACAGTGTGCTCCAATATGCTGGTGATGTGGAAAATGTCTCTGTCTGGAAAGTGATTAAAACTTTCACTGTTAATGGGACTGTTTGCACCACTGGTTTTGAAGGCGAATTGGACGACTTCATCAAACCAGAGAGTACTTCACTTGTTTCATGCTCTATTAAGAGAGCTTTCATCACTGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGATTGCATTATCACAGGAAAGTTGGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAATGCTAACCTGCTTTTTAAGAAAACACCCTGGTTTGTGCAAAAGTGTGGTGCAATTTTTGTTGATGCTTGGAAAGTTGTTGAGGAACTGCTTTGTTCTCTTAAACTTACATACAAGCAAATTTATGATGTAGTGGCATCTCTCTGCACTTCTGCCTTTACTATTATGGACTACAAACCTGTGTTTGTAGTTTCATCTAATAGTGTTAAGGATCTCGTTGATAAGTGCGTTAAAATTCTTGTTAAGGCCTTCGATGTCTTCACACAGACAATTACAATTGCAGGTGTGGAGGCTAAATGTTTTATTTTGGGTTCTAAATATCTGCTTTTTAACAATGCACTTGTTAAGCTTGTCAGTGTTAAGATACTTGGCAAGCGACAGAAAGGCCTTGATAGTGCTTTCTTTGCTACCAACTTGGTTGGTGCCACTGTCAATGTGACACCACAGCGGACTGAGGCTGTTAACATTAGCCTGAATAAGGTGTATGATGCTGTTACACCAGGTGAAGGTCATATTGTTATCATTGGCGATATGGCTTTTTACAAGAGTGAAGAGTACTATTTTATGATGGCAAGCCCTGATTCAGTCCTTGTTAATAATGTTTTCAAAGCAGCCCGAGTTCCATCCTATAACATTGTTTACAATGTGGATGATTCTACCAAGAGTAAGATGTCATCAGACATCGGAACATCATTCGAATTTGACGGTGATGTGAATGCTGCTATTGCTAAAGTTAATGACTTACTTGTTGCGTTCAGACAAGACAAGCTTTGTTTCAGAGCACTTAAGGATGGTGAAAGTATCTTGGTTGAAGCATACCTTAAGAAATACAAAATGCCAAGTTGTCTCAAAAATCATGTTGGTTTATGGGATATCATAAGACGAGATTCTGACAAGAAGGGGTTTCTTGACACTTTCAGTCATCTTAATGAACTGGAGGATGTCAAGGATGTAAAAATTCAGGCTATCAAAAATATTCTTTGTCCTGATCTTCTGTTAGAATTGGATTTTGGTGCTATTTGGTACAGATGTATGCCAGCCTGCTCTGACACCTCTGTCTTAGGTAATGTTAAAATTATGCTAGGTAACGGTGTTAAAGTGATTTGCGACGGTGGTCACAACCTTGCTAACCGTTTAACAATTAATTATAATAAACTTTGTGACACAGCTCGTAAAGATGTTGAAATTGGTGGTCTACCATTTTCCACATTTAAAACACCATCTAACAGTTTTATTGACATGAAAGATGCTATTTACTCTGTAGTTGAATACGGTGAAGCATTCTCTTTTAAAACTGCAAGTGTGCCTGTAAGCAATAGTGGTACCGTCACAACTGACGATTGGTCAGATCCCATTTTGTTGGAACCTGCAGACTATGTTGAACCTAAAGATAACGGCGATGTAATTGTCATTGCTGGGTACACCTTCTATAAGGATGAAGATGATCATTTTTATCCCTATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTACAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAATCAGTTTCCTTCTCAGACGATGTTAATGTTAAAGAGATTGAACCTGTTACGCGTGTCAGGCTAGAATTTGAGTTTGACAATGAGGTGGTAATGCAGGTTCTTGAAAAAGTCCTTGGTACCAAATATAAGTTTATAGGTACCACCTGGGAAGAGTTTGAAGATTCTATCTCTGAGAAACTTGACAACATCTTTGACAAGCTTGCTGAACAAGGTGTAGAACTTGAAGGTTACTTCATTTACGACACGTGTGGTGGATTTGACATTAACAATCCAGATGGTGTTATGATTTCACAGTACGATCTTAACACAGGTGTTGATGTCAAAAGCGACTCTGATGCAAGCATGGAAGACACCGCCTCGCTTGAAGAAGTGAGTGTCTCAACCGTTGATGTTGAAGATGTTTCATTTGTAGAAGAGGCAACTGTAGCAGTTGCAAATGATGATTCTGTCGAACAAGTTACCCTTGTAGAGGATAACCCTGACGAGCAACTTACCTCAGTGGAGGAAAAGTTTGAAATCTCTGCTAAGAATGATCCATGGGCTGCTGCTGTTGATGAGCAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGTCACCTTTTAAGACGACAGATCTTAATGGTAAAATCATCCTTAAACAACAGGACAATAATTGTTGGATAAATGCTTGCTGTTACCAGCTGCAAGCTTTTGACTTCTTTAATCATGATTTGTGGGATGGTTTTAAGAAAGGTGATGTTATGCCTTTTGTAAATTTCTGTTATGCAGCTCTTACTTTGAAGCAGGGTGACTCAGGAGATGCAGAATATCTTTTGGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCCAAAGTCACACTTAGTGCTAAGTGCGGCTGCGGTGTTAAAGAGATAGTTTTAGAACGAACTGTATTTAAGCTCAAACCTCTTAAGAATGAGTTTAAATATGGTGTCTGTGGTGACTGTAAGCAAATCAATATGTGCAAGTTTGCTAGCGTAGAGGGTTCTGGTGTTTTTGTCCATGATAGAATGGAAAAACAAACGCCTGATTCACAATTTATTGTGACACCTACTATGCATGCAGTTTACACAGGTACAACACAGAATGGTCATTATATGATTGAAGATCGCATTCATGATTACTGTGTGGATGGTATGGGACTTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACTTTGTTCCTTAATGCAAATGTAATGACAACTGAATCTAAAACTATGGTTGAACTACCTGCGCCCGTAAAGGATAAGTGTGTAGAAGAATGTCAAAGTCCTAAAGATCTTGCACTACCCTTTTATAAAGCGGGAAAAGTTTCATTTTACCAAGGAGATTTGGATGTTTTGATTAATTTTCTTGAGCCTGATGTTGTTGTTAACGCTGCTAATGGTGATCTTAAACACGTGGGTGGCGTTGCTAAAGCCATTGATGTGTTCACAGGTGGTAAGTTGACGAGACGTTCTAAAGAATATCTTCGAACTAATAAACCAATAGCTCCTGGTAATGCTGTCCTTTTTGAAAATGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTGAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGACAGTAGAGTTGAAGGTAAACTCTGTAATGTCTACAAGGCAATTGATAAGTGTGATGGTAAGATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATCTTCAAAGTCAAACTTGAAATCTCATTGCAGTGTTTACTTAAAACTGTCACAGATAGAGAATTGAGTGTCTTTGTTTACACTGACCAAGAGAGAATTGCCATAGAAAATTTCTTCAATGGCACTATTCCTGTCAAGGTAACAGAAGACACTGTGAATCAAATGCGTGTGTCTGTAGCGCTTGATAAAACTTACGGTGAACAACTTAAAGGAACAGTTGTTATTAAAGACAAAGATGTTACTAACCAGCTGCCAAGTGTGTCAGATGCTGGTGAAAAAGTCGTTAAGGCATTGGATGTTGATTGGAATGCTTATTATGGCTTTTCAAATGCAGCAGCTTTTAGCGCCAGTTCCCATGATGCTTATAAATTTGATGTTGTAATGCATAACAATTTC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College of Bioresource Sciences, Laboratory of Veterinary Epizootiology; 1866 Kameino, Fujisawa, Kanagawa 252-0880
Japan
2022-12-15
FCoV/I/JP15/Fe/35/2015
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,225
GenBank
1
Japan:Niigata
Japan
Felis catus
null
2015-08-15
null
null
Feline coronavirus FCoV/I/JP15/Fe/35/2015 RNA, nearly complete genome
GATTGGACTGGTTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACATTGGGTGCTGTTAAACCTGGTGATGCTGTTGTCACTAGTATGAGTGCTGGCAAGGGTGTGAAATTCTTTGCTAATAGTGTACTCCAATATGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCTGTTTGGAAAGTTATTAAAACTTTCACTGTTAATGAGACTGTTTGCACCACTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATTAAACCAGAGAGTACTTCACCTGTTTCATGCTCCATTAAGAGGGCTTTTATCACAGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGATTGTATTGTCACGGGAAAGCTGGATCTTAGTACTAACCTGTTTGGTAGTGCTGACCTACTTTTTAAGAAAACACCCTGGTTTGTACAAAAGTGTGGTGCGATTTTTGCTGATGCTTGGAAAGTTGTTGAAGAACTGCTTTGTTCTCTTAAACTTACATACAAGCAAATTTATGATGTAGTGGCATCACTTTGTACTTCTGCTTTTACTATTATGGACTACAAACCTGTGTTTGTAGTCACATCTAATAGTGTTAGGGATCTCGTTGACAAGTGTGTTAAAATTCTTGTGAAGGCCTTTGATGTCTTCGCACAGACAATTACAATTGCAGGTGTAGAGGCTAAGTGCTTTGTGCTTGGCTCTAAATACTTGCTTTTTAACAACGCACTTGTCAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGGCAGAAGGGTCTTGATAGTGCATTCTTTGCCACTAATTTAATTGGTGCTACTGTTAATGTGACACCACAAAGGACTGAGGCTGCCAATATTAGTTTGAACAAAGTAGACGATGTTGTCACGCCAGGTGAAGGTTATATTGTCATTGTTGGCGATATGGCTTTTTACAAGAGTGGCGAGTATTACTTTATGATGGCAAGTCCTGATTCAGTCCTTGTTAATAATGTTTTTAAAGCAGCTCGAGTGCCGTCTTATAACATTGTCTACGATGTGAATGATGACACCAAGAGTAAGATGGTTGTTAAAATTGGAACATCGTTTGACTTTGATGGTGACCGCGATGCTGCTATTGTTAAGGTTAATGACTTACTTGTTGAGTTCAGACAGGAAAAGATCTGTTTCAGAGCACTTAAGGATGGTGAAAACATCTTAGTTGAGGCATACCTTAAGAAATACAAGATGCCAGTTTGTCTTAAAAACCATGTCGGTTTATGGGACATTATAAGACGTGATTCTGATAAGAAGGGTTTTCTTGACATTTTCAATCATCTTAATGAATTGGAGGATGTAAAGGACACAAAGATTCAGGCTATCAAGGACATCCTGTGCCCTGATCTTCTACTTGAATTAGATTTTGGTGCCATCTGGTATAAATGTATGCCCACATGCTCTGACACATCTGTCTTAAGTAATGTTAAAATCATGCTAGGTAATGGTGTTAAAGTAGTCTGTGATGGTTGTCACAGTTTGGCTAACCGCCTAACAATTAATTACAGCAGACTCTGCGACACAGCTCGTAAGGATGTTGAAATAGGCGGTATACCATTTTCCACTTTTAAAACACCGTCTAGCAGCTTCATTGACATGAAAGACGCCATTTACTCTGTAGTTGAATACGGTAAAGCGTTTTCTTTTAAGACTGCAAGTGTGCCTGTAACCAATAGTGGCACTGTCACAACTGATGATTGGGCAGATCCCATTTTGTTGGAACCTGCAGATTATGTAGAACCTAAGGATAATGGTGATGTAATTGTCATTGCTGGATACACCTTTTACAAGGATGAAGATGATCATTTTTATCCATATGGTTCTGGCATGGTCGTGCAGAAGATGTACAATAAGATGGGTGGTGGCGACAAGTCAGTTTCATTCTCAGATAGTGTCAATGTTAAAGAGATACAACCTGTTACGCGTGTCAGGCTAGAGTTTGAGTTTGACAATGAAGTGGTAACACAAGTGCTTGAAAAAGTCATTGGTACTAAATATAAATTCACAGGTACGACTTGGGAAGAGTTTGAAGACTCTATCTCTGAGGAACTTGACAAGATATTTGATACGCTTGCTGAACAGGGTGTAGAACTTGAAGGCTACTTCATTTATGACACATGTGGTGGATTTGACATCAACAATCCGGATGGTGTTATGATTTCACAGTATGATCTTAACACATCTGTTGATGACAAAAGTGACTCCGACGCTAGCGTGGAAGACACATCTTCGATTTCTGACAACGACGCTGTTGAACAAATTGAAGAAGAGATTGTCTCAACTGCTGCTGTTGAAGATATTTCCACCGTAGAAGAAGAAACTGTAGTCGTTGCCGATGTTCAAGATTGTGTTGAGCAAGTTCCTCTTGCAAAAGATAGTGTTAACCCCACTGAACAACTCTCCTCCGTAGAGGAAAAAGTTGAAATCTCTGCTAAAAATGATCCTTGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAATTTTCTTTGACACCATTTAGGACTACAAATCTTAATGGTAAAATCATACTTAAACAACAAGACAATAATTGTTGGGTAAACGCCTGCTGTTACCAATTGCAGGCCTTTGATTTCTTTAATCATGATTTGTGGGAGGCCTTTAAGAAAGAGGATGTTATGCCTTTCGTGAACTTTTGTTATGCAGCTCTAACTTTGAAGCAGGGTGATTCAGGGGATGCAGAATATCTATTGGAGATGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTTACACTTAGTGCTAAGTGTGGCTGTGGTGTTAAAGAGATAGTTTTAGAACGAACTGTATTTAAGCTCACACCTCTTAAGAATGAGTTTAAATATGGTGTCTGTGGTGACTGTAAGCAAATTAACATGTGTAGGTTTGCCAGCGTGGAAGGTTCAGGTGTTTTTGTTCATGATAGAATTGAAAAACAAACACCTGTGTCACAATTTATTGTAGAACCTACTATGCATGCAGTTTACACAGGTACAACACAGAGTGGTCATTATATGATTGAAGATTGCATTCATGATTACTGTGTGGATGGTATGGGAATTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACGTCCACTTTATTTCTTAATGCAAATGTAATGACAGGAGAGTCTAAAACTATAAGCAAACCACCTGCACCAGCTAAGAAAGAATACGTTGAAGAATGTCAAAGTCCTAAAGCTCTTATACTACCCTTTTACACAGCTGGAAAAATTGCCTTTTACCAAGGAGATCTTGATGTTTTGATTAACTTTCTTGAACCTGACGTCGTAGTCAACGCTGCTAATGGTGATCTTAGACACACAGGTGGCTCTGCTAGGGCTATTGACGTATTCACGGGTGGTAAGTTGACAAAACGTTCTAAAGAATACCTTAAATCTAACAAACCAATAGCTCCTGGTAATGCTGTGCTTTTTGAAAATGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTGAATGCTGTAGGACCACGTAGTGGTGATAGTAGAGTTGAAGGTAAACTCTGTAATGTTTATAAAGCAATTGCCAAGTGTGATGGTAAGATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATATTCAAAGTCAAACTGGAAGTTTCATTACAGTGTTTACTTAAAACTGTCACAGATAGAGATTTAAATGTCTTTGTTTACACTGACCAAGAGAGAATTACCATAGAAAATTTCTTCAATGGTACCATTCCCGTCACGGTAACAGAAGACACAGTGAATCAAAAGCGTGTGTCTGTAGCACTTGATAAAACTTATGGTGAACAACTCAAAGGTACAGTTGTTATTAAAGATAAAGATGTCACTAACCAGTTGCCAAATGTGTCAGATGCCGGTGAAAAAGTCGTTAAGGCATTGGATGTTGATTGGAGTGCTTATTATGGCTTTCCAAATGCAGCTGCTTTTAGCGCTAGTTCCCATGATGCTTATAAATTTGAAGTTGTAACACATAACAACTTCATTGTTCACAAGCAAACTGATAACAATTGTTGGGTTAATGCAATTTGTTTAGCATTACAAAGACTTAAACCAACATGGAAGTTTCCTGGTGTTAAAAGTTTGTGGGATGCATTTCTCACTCGTAAAACTGCTGGATTTGTCCATATGCTATATTACATTTCAGGCTTAAAGAAAGGACAACCTGGTGATGCTGAGTTGACTTTACATAAGCTTGGTGAGTTGATGTCGAGTGATAGTGAGGTTACTGTCACACATACAACTGCATGTGATAAGTGCGCAAAAGTTGAAACCTTTACCGGACCTGTGGTAGCAGCACCCCTTCTGGTTTATGGCACTGATGAAACTTGTGTTCATGGTGTGAGTGTCAATGTTAAAGTGACAAGTGTTAGAGGTACAGTGGCTATCACTTCTTTAATAGGTCCTGTAGTGGGAGATGTCATTGATGCAACTGGTTACATCTGTTACACTGGTTTGAATTCACGTGGCCATTACACATACTATGATAATCGTAACTGTTTAATGGTCGATGCTGAAAAGGCCTACCATTTTGAGAAAAATCTTTTACAGGTTACGACAGCCATCGCTAGTAATTTTGTTGTTGAAGCATCTAAGATGGAGACTTCGCCTAAGAGCCAAGTTAAAGAACCAATCAAGACTCGTGTTTTTAGTGAGGTTGAAGAAATCCCTAAAACTATAGTGCCCGAGTCTAAATTGTTGGCTATTGAGAGTGGTGCAGATTATACAATCTCGACACTCGGTAAATATGCTGACATGTTCTTTATGACTGGTGATAAGATCCTTAGACTTCTCCTTGAAATCTTTAAATATTTATTGGTTGTTTTTATGTGTCTTAGAAAATCTAAAATGCCTAAAGTTAAAGTAAAACCACCACATGTATTTAAAGACCTAGGTGCTAAAGTTAGAACATTGAATTACGTAAGACAGTTGAATAGACCTGCTCTATGGCGCTATGCAAAACTAGTGTTACTTTTAATAGCATT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21,083
ON595853.1
Feline coronavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-1
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,293
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2017
SAMN28578128
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate FPV-1, complete genome
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Feline coronavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-2
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,260
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2017
SAMN28578133
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate FPV-2, complete genome
CTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTCACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACTTAGTTTGGTAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGGCGCGCCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTATCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCCTTTCCGTAACGTACTGCAGGAAATTAAGTACTGCTACCGTAGCGGTTTTGATGGCTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCCGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTGCAAGGCTTTATCGTTAAAGCTAACTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCCCGTACCGGAAATGGCGCCATATATGTAGACCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCGGTTATCGAAGGTGAGTTTAAGGATTACTTCGGTGATGAGGACGTTATCATCTATGAAGGAGAGGAGTATCATTGTGCTTGGTTAACTGTGCGCGATGAAAAACCTTTGTGTCAACAAAATCTCCTCACAATAAGGGAAATCCAATACAACCTGGACATCCCACATAAGTTGCCAAATTGTGCTGTTAGAGAAGTAGCACCACCAGTCAAGAAAAACTCTAAAGTTGTTCTCTCCGAAGAGTATAGGAAGATCTATGACATCTTCGGTTCACCATTTATGGGCAATGGAGACAGTCTTAACAAGTGTTTTGCTAGTCTCCACTTCATCGCTGCTACTCTTAAGTGTCCTTGTGGTGCTGAAAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGATTTAAGACCGCTTGTTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACATTGGGTGCTGTTAAGCCAGGTGATGCTGTTATCACTAGCATGAGTGCTGGCAAGGGTGTAAAATTCTTTGCTAATAGCGTGCTCCAATATGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCTGTTTGGAAAGTTGTTAAAACTTTCACTGTTAGTGAGACTGTTTGCACCACTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATTAAACCAGAGAGTACTTCGCCTGTTTCATGCTCCATTAAGAAAGCTTTCATCACTGGCGAAGTTGATGATGCAGTCCATGACTGTATTATCACGGGAAAGTTGGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAGTGCTAACCTGCTTTTTAAGAAGACGCCCTGGTTTGTGCAAAAGTGTGGTGCAATTTTTGCTGATGCTTGGAAAGTTGTTGAGGAACTGCTTTGTTCCCTTAAACTTACATACAAGCAAATTTACGATGTGGTGGCATCTCTCTGCACTTCTGCTTTTACTATTATGGATTACAAACCTGTGTTTGTAGTTTCATCTAATAGTGTTAAGGATCTCGTTGACAAGTGTGTTAAAATTCTTGCGAAGGCTTTTGATGTTTTCACACAGACTATTACAATTGCAGGTGTAGAGGCCAAGTGCTTTGTGCTTGGTTCTAAATACTTGCTTTTTAATAATGCACTTGTCAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGACAAAAAGGTCTTGATAGTGCTTTCTTTGCCACTAATTTGGTTGGTGCTACTGTCAATGTGACACCACAAAGGACTGAGGCAGCCAATATTAGTTTGAATAAAGTGGATGACGTTGTTACACCAGGTGAAGGTCATATCGTCATCATTGGTGATATGGCTTTTTACAAGAGTGAAGAATATTATTTTATGATGGCAAGCCCTGATTCGGTCCTTGTTAATAATGTTTTTAAAGCAGCTCGTGTGCCTTCTTACAACATCGATTATGATGTTGATGATGACACTAAGAGTAAGATGTTAGTTAAGCTTGGAACATCATTTGACTTTGATGGTGATCTCGATGCTGCTATTGTTAAGGTTAATGATTTACTTGTAGAGTTTAGGCAAGAAAAGTTGTGTTTCAGAGCACTTAAGGATGGTGAAACCATCGTGGTTGAGGCATACCTTAAGAAGTACAAAATGCCTGTTTGCCTCAAAAACCATGTTGGTTTATGGGACATTGTAAGACGCGATTCTGATAAGAAGGGTTTTCTTTACACTTTCAACCATCTTAATGAGTTGGATGATGTCAAGGACACAAAAATTCAGGCCATTAAAAATATTCTTTGTCCTGACCTTCTGCTTGAATTAGACTTTGGTGCAATCTGGTATAGATGTATGCCCACATGCTCTGACACATCTGTCTTAAGTAATGTTAAAATTATGCTAGGTAATGGTGTTAAAGTGGTTTGTGATGGTTGTCACAGTTTGGCTAACCGTCTAACAGTAAACTATAGCAAACTATGTGACACTGCCCGTAAAGATGTTGAAATTGGTGGAATACCATTTACCACGTTTAAGACACCAGTTAGCCGCTTCATTGACATGAGAGATGCCATTTATTCTGTAGTTGAATACGGTGAGGCTTTCTCTTTTAAGAATGCAAGTGTGCCTGTAACTAATAGTAGTATTGTCAAAAATGACGACTGGTCAGAACCCATTTTGTTGGAACCTGCGGATTATGTTGAACCTAAGGACAATGGCGATGTAATTGTCATTGCTGGATACACCTTCTACAAGGATGAAGATGACCATTTCTATCCATATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTACAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCAGTCTCATTTGCAGACAATATTAGCGTTAAAGAGATACAACCTGTTACACGTGTCAGGCTAGAGTTTGAGTTTGATAATGAAGTGGTAACACAGGTGCTTGAAAAAGTCATTGGTACTAAATACAAGTTTACAGGTACAACTTGGGAGGAGTTTGAAGATGCTATCTCAGAAGAACTTGACAGAATCTTTGACACGCTTTCTGAACAGGGTGTGGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACATGTGGTGGCTTTAACATTAATAATCCAGATGGTATTATGATTTCACAATACGATCTCAACACAGATGTTGATGACAAAAGCGACTCTGATGTAAGCGTGGAGGATGTCTCTTCGCCTTCTGACAATGAAGATGTTGAGCAAATTGAAGAAGATGTTGTTTCAACTGCTAATGCTGAAGATTCTGTCGAACAAGTTTCTCCTGTGGAGGAAAACAGTGGTGAACGGTTTTCCGCAGTAGAAGAAAATGCTGAAGTCTCTGCTAAAAATGACCCGTGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGTCACCTTTTAGGACAACAGATCTTAATGGTAAAATTATACTTAAACAACAAGATAATAATTGTTGGGTAAATGCCTGCTGTTACCAATTGCAAGCCTTTGATTTCTTCAAGCATGATCTGTGGGACAATTTTAAGAATGGCGATGTTATGCCCTTCGTGAATTTTTGTTATGCAGCCTTGACTTTACAGCAGGGTGCATCTGGAGATGCAGAATACCTTTTGGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTCACACTTAGTGCTAAGTGTGGCTGTGGTGTTAAAGAGATAGTTTTAGAACGAACTGTGTTTAAACTCACACCTCTTAAGAGTGAGTTTAAATATGGTGTTTGTGGTGATTGTAAACAAATTAATATTTGTAAGTTTGCTAGTGTGGAAGGTTCTGGTGTTTTTGTTCATGATAGAATAGAAAAACAAACACCAGAGTCACAATTCATTGTGACGCCTACTATGCATGCAGTTTACACAGGTACGTCACAGAATGGTCATTATATGATTGAAGATTGCACTCATGATTACTGTGTGGATGGTATGGGAATCAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACTTTGTTTCTTAATGCAAATGTAATGACAGCTGAATCTAAAACTAGAATTGAATCACATGTGCCCGCTAAGGATACAGCAGAAGAACGTCAAAGTCCTAAAGATATCTTAACACCCTTTTATAAGGCGGGAAAAGTTTCATTTTACCAAGGAGATTTGGATGTTTTGATTAACTTTCTTGAGCCTGATGTCGTTGTTAATGCTGCTAATGGCGATCTTAGGCATGTAGGTGGCGTTGCTAAAGCCATTGATGTGTTTACAGGCGGTAAGTTAACAAAACGCTCTAAAGAATACCTTAAATCCAATAAATCAATAGCTCCTGGTAACGCTGTGCTTTTTGAAAATGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTGAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGACAGTAGAGTTGAAGGTAAACTCTGTAATGTTTATAAAGCAATTGCTAAGTGTGACGGCAAAATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATTTTTAAAGTCAAGCTGGAAGTCTCATTGCAGTGTCTACTCAAAACTGTCACAGATAGAGAGTTAAATGTCTTTGTTTACACTGACCAAGAGAGAATTACTATAGAAAATTTCTTCAATGGTACTATCCCTGTCAAGGTAACGGAAGACACTGTGAATCAAAAGCGTGTGTCTGTAGCACTTGATAAGACTTATGGTGAGCAACTTAAAGGAACTGTTGTTATTAAAGACAAAGACGTTACTAACCAGTTGCCAAGTGTGTCAGATGCTGGTGAAAAAGTCGTTAAGGCATTGGATGTTGATTGGAATGCTTATTACGGCTTTTCAAATTCAGCAGCTTTTAGTGCCAGTTCTCATGATGCTTATCAATTTGAGGTTGTAACACATAACAACTT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21,814
ON595855.1
Feline coronavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-3
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,287
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2017
SAMN28578112
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate FPV-3, complete genome
GCTACACTCACTTTACTTTAAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCCTTCAGTTTGGCAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGGCGCACCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTACCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCCTTTCCGTGATGTGCTGCAGGACATTAAGTACTGCTACCGTAACGGATTTGATGGCTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGCCGCGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTAGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTTCTCCTTACCGAACCGTCCGTCATGTTGCAAGGCTTTATTGTTATAGCCAATTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCCCGTACTGGAAATGGTGCCATATATGTGGACCAATACATGTGTGGTGCTGATGGCAAGCCAGTCATCGAAGGTGAGTTTAAGGATTATTTCGGTGATGAGGACACTATCATTTATGAGGGAGAGGAGTATCATTGCGCATGGTTAACTGTGCGCGATGAAAAACCTTTGTGTCAACAAAACCTCTTCACAATTAGGGAAATCCAATACAATCTGGATATTCCACATAAGTTGCCAAATTGTGCTATCAGAGAAGTAGCACCACCAGTCAAGAAGAACTCCAAGATTGTTCTTTCTGAAGAGTATAGAAAACTCTATGACATCTTCGGTTCACCATTTATGGGTAATGGAGACAGTCTTAACAAGTGTTTTGACAGCCTCCATTTCATCGCTGCTACTCTTAAGTGTCCTTGTGGTGCTGAGAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGATTTAAGACTGCTTGCTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACATTGGGTGCTGTTAAGCCAGGTGATGCTGTTATCACTAGCATGAGTGCTGGCAAGGGTGTAAAATTCTTTGCTAATAGTGTGCTCCAATACGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCTGTTTGGAAAGTTATTAAAACTTTCACTGTTAATGAGACTGTTTGCACCACTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATTAAACCAGAGAGTACTTCACCTGTTTCATGCTCTATTAAGAGAGCTTTCATCACAGGTGAAGTTGATGATGCGGTCCATGATTGTATTATCACTGGAAAGTTGGATCTTAGTACTAATCTCTTTGGTAGTGCTAACCTGCTTTTTAAGAAAACACCCTGGTTTGTGCAAAAATGTGGCGCGATTTTTTCTGATGCTTGGAAAGTTGTTGAGGAACTGATTTGTTCTCTTAAACTTACATACAAGCAGGTTTATGATGTAGTGGCATCACTTTGCACTTCCGCCTTTACTATTATGGACTACAAACCTGTGTTTGTAGTTTCATCTAACAGTGTTAAAGACCTCGTTGACAAGTGTGTTAAAATTCTTGTGAAAGCATTTGATGTTTTCACACAGACTATTACAATTGCAGGTTTGGAGGCTAAGTGTTTCATACTTGGTTCTAAGTACCTGCTTTTTAACAACGCACTTGTCAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGAGACAGAAAGGTCTTGATAGTGCATTCTTTGCTACTAATTTAATTGGTGCTACTGCTAATGTGACACCACAAAGGACTGATGCTGCTAACATTAGCCTAAATAAAGTAGATGATGTTGTTACACCTGGTGAAGGCCATATTGTCATTATTGGCGATATGGCTTTTTACAAGAGTGGAGAGTACTACTTTATGATGGCAAGTCCAGACTCAGTCCTCATTAACAATGTTTTTAAAGCAGCTCGAGTGCCATCTTATAACATCATTTATGATGTGGACGATGACACCAAGAGTAAGATGTTAGTTAAAGTCGGAACATCATTTGACTTTGATGGTGACCTCGATGCTGCTATTGCTAAGGTTAATGACTTACTTATTGAGTTTAGACAAGAAAAGTTGTGTTTCAGAGCACTTAAGGATGGTGAAAACATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAGAAATACAGAATGCCAGTTTGTCTTAAAAACCATGTTGGTTTGTGGGACATCATAAGACGTGATGCTGATAAGAAGGGTTTTCTTGACACTTTCAATCATCTTAATGAATTGGAGGATGTCAAAGACACAAAGATTCAGACCATTAAAAATATTCTTTGTCCCGACCTTCTGCTTGAATTGGACTTTGGTGCAATCTGGTATAGATGTATGCCAACCTGCTCTGATGTGTCTATTTTGGGTAATGTTAAAATTATGCTAGGTAATGGTGTTAAAGTGATTTGTGACGGCTGTCACGGCTTTGCCAACCGTTTAACAGTTAATTACAGCAAACTCTGTGATACAGCTCGTAAAGACATTGAAATTGGTGGTATACCGTTTTCTACCTTTAAAACACCATCTAGCAGTTTTATTGATATGAAAGATGCTATCTACTCTGTAGTTGAATACGGCGAAGCATTTTCTTTTAAGACTGCAAGTGTGCCTGTAACTAATAGTGGCACCATCACAACTGATGATTGGTCAGATCCCATCTTGTTAGAACCTGCAGATTATGTTGAACCTAAAGATAATGGCGATGTGATTGTCATCGCTGGATACACCTTTTACAAGGATGAAGATGATCATTTTTATCCATATGGTTCAGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTATAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCTGTTTCATTTTCAGATGAAGTTAATGTTAAAGAGATAGAAACTGTTACACGTGTCAGGCTAGAATTTGAGTTTGACAATGAGGTGGTAACACAAGTGCTTGAAAAAGTCATTGGTACAAAATATAAGTTTATAGGTACCACTTGGGAAGAGTTTGAGGAGTCTATTTCTGAGAAACTTGATAACATTTTTGACACGCTTGCTGAAAAGGGTGTAGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACATGTGGTGGATTTGACATTAACAACCCAGATGGCGTTATGATTTCACAGTACGATCTTAACACAGCTGCTGATGACAAAAGCAACTCTGATGCAAGCGTGGAAGATATCTCTTCGATTTCTGACAATGAAGATATTGAACAAATTGAAGAAGAAAATGTCTCAACTGCTGATGTCGAAGATGTTTCATCTGTAGAAGAGGAAACTGTAGCAGTTGCAGACGTTGAAGATTCTACCGAACAAGTTTCTCTCGTTGAAGAACATGTTTTTGCTGCAAACCCTGACGAGCCACTCTCCTCTGTAGAGGAAAAGGTTGAAGTTTCTGCTAAAAACGATCCATGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGACACCATTCAGGACAACAAATCTTAATGGTAAAATCATACTTAAACAACAAGATAATAATTGTTGGATGAACGCTTGCTGTTATCAGTTGCAAGCCTTTGATTTCTTTAACCATGATTTGTGGGAGGCTTTTAAGAAAGATGATGTCATGCCTTTCGTGAATTTTTGTTATGCAGCTCTTACTTTGAAGCAGGGCGACTCGGGGGATGCAGAATATCTTTTGGAGACGCTGCTCAATGATTATAGCACAGCTAAAGTTGTACTTAGTGCTAAGTGCGGCTGTGGTATTAAAGAGATAGTTTTAGAAAGAACTGTATTTAAGCTCACACCTCTTAAGAGTGAGTTTAAATATGGTGTCTGCGGTGACTGTAAGCAAATTAACATGTGTAAGTTTGCTAGCGTGGAAGGTTCAGGTGTTTTTGTTCATGATAGAATTGAAAAACAAACACCTGTGACACAATTTGTTGTGAGATCTATTATGCATGCAGTTTACACAGGTACAACGCAGAATGGTCATTATATGATTGAAGATTGCATTCACGATTATTGTGTGGATGGTATGGGAATTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACGTTGTTTCTTAATGCAAACGTAATGACAATTGAATCTAAAACTATGGTTGATCCACCCGTTCCCGTAGAAGAACGTCAAAGTCCTAAAGAACTTATACTACCCTTTTATAAAGCGGGAAAAGTCTCATTTTACCAAGGAGATTTAGATGTTTTGATTAACTTCCTTGAGCCTGACGTCGTTGTTAACGCTGCTAATGGTGATCTTAAACACATGGGTGGCGTTGCTAAGGCTATCGATGTGTTCACGGGTGGTAGATTAACAAAGCGTTCTAAAGAATACCTTAAGTCTAACAAGTCAATAGCTCCTGGTAATGCTGTGCTTTTTGAAAATGTACTTGAGCATCTTAGTGTGCTGAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGACAGTAGAATCGAAGGTAAACTCTGTAATGTCTACAAAGCAGTTGCTAAGTGTGACGGTGAAATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATCTTTAAAGTCAAGCTGGAAGTGTCATTGCAGTGTCTACTTAAGACTGTTACAGACAGAGAATTAAATGTCTTTGTTTACACTGACCAAGAGAGGATTGCCATAGAAAATTTCTTCAATGGTACTATCCCCGTCAAGGTAACAGAAGACACTGTGAATCAAAAGCGTGTGTCCGTAGCACTTGATAAAACTTATGGTGAGCAACTCAAAGGAACTGTTGTTATTAAAGACAAAGATGTTACCAACCAGTTGCCAAATGTGTCAGATGCCGGTGAAAAAGTTGTTAAGGCATTGGATGTTGATTGGAATGCTTACTATGGTTTCTCAAATGCAGC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21,815
ON595856.1
Feline coronavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-4
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,333
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2017
SAMN28578121
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate FPV-4, complete genome
TCTTCCGATCTGGAGGGAGGACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTTTGCTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACCTAGTTTGGCAATCACTCCTTGGAACGGGGTTGAGAGAACGGTGCACCAGGGTTCCGCCTCTGTTTGGTAAGTCGCCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACATTTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTACCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCCTTTCCGTGTCGTTTTGCAGGAGATCAAAAACTGCTATCGTAACGGTTTTGATGGCTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCCGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTGCAAGGCTTTATCGTTAAAGCTAGCTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAGGTTGCCCGTACTGGCAACGGTGCCATATATGTAGATCAATACATGTGTGGTGCTGATGGGAAACCAGTTATTGCAGGCGATTTTAAGGATTATTTCGGTGATGAGGATGTTATCATCTATGAAGGGGAGGAGTATCATTGTGCCTGGCTAACAGTGCGCGATGAAAAACCTTTATGTCAACAAACTCTCCTCACAATTCAGGAAATCCAATACAACATGGATGTCCCACATAAGTTGCCAAATTGTGCTATCAGACAGTTAGCACCACCAGTCAAGAAGAATTCTAAGGTTGTTCTTTCCGAAGAGTATAGCAAGATTTATGACATCTTTGGCTCACCATTTATGGGTAATGGGGACAGTCTTAACAAGTGTTTTGACAGCCTCCATTTCATTGCTGCCACTCTTAAGTGTCCTTGCGGTGCTGAAAGCAGTGGTGTTGGTGACTGGACTGGTTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTCACGGCAAAGTAAAAGGTGTCACATTAGGTGTTGTTAAACCAGGTGATGCTGTTATCACTAGCATGAGTGCTGGCAAGGGTGTAAAATTCTTTGCTAATAGTGTACTCCAATATGCTGGTGATGTGGAAAATGTCTCTGTTTGGAAAGTGATTAAAACTTTCACTGTTAATGAGACTGTTTGCACCACTGATTTTAAAGGCGAATTGAACGACTTCCTCAAACCAGAGAGTACTTCGCATGTTTCATGCTCCATTAAGAGAGCTTTTATCACTGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGATTGTATCATCACGGGTAAGTTAGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAGTGCTAACTTGCTTTTTAAGAAAATACCTTGGTTTGTGCAAAAGTGTGGTGCGATTTTTGCTGATGCTTGGAAAGTTGTTGAGGAACTGCTTTGTTCGCTCAAACTTACATACAAGCAAATTTACGATGTGGTGGCATCTCTTTGCACCTCTGCTTTCACTATTATGGACTACAAACCTGTGTTTGTAGTTTCATCTAATAGTGTTAGGGACCTCGTTGACAAGTGTGTTAAAATTCTTGTGAAAGCTTTTGATGTCTTCACACAGACTATTACAATTGCAGGTGTGGAGGCCAAGTGCTTTGTGCTTGGTTCTAAATACTTGCTTTTTAACAATGCACTTGTCAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGACAAAAAGGTCTTGATAGTGCATTCTTTGCCACTAATTTGGTTGGTGCTACTGTTAATGTGACACCACAAAGGACTGAGGCAGCCAACATTAGTTTGAACAAAGTAGACGATGTTGTCACACCAGGTACAGGTCATATTGTCGTTATTGGCGATATGGCTTTCTACAAGAGTGAAGAGTACTATTTTATGATGGCAAGCCCTGATTCGGTCCTTGTTAATAATGTTTTTAAAGCAGCTCGAGTGCCATCTTATAACATTGTTTACGATGTGGATGATGCTACCAAGAGTGATATGACATCTAAAATTGGAGCATCATTCGAATTTGATGGTGACGCGGATGCTGCTATTGCTAAGGTTAATGACTTACTTGTTGAGTTCAGACAAGAAAAACTTTGTTTTAGAGCACTTAAGGATGGTGAAAGTATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAGAAATACAAAATGCCAATGTGTCTCAAAAATCATGTTGGTTTATGGGACATCATAAGAAAAGATTCTGATAAGAGGGGTTTTCTTGACACTTTCAATCATCTTAATGAATTGGAGGACGTCAAGGATATAAAAATTCAGGCTATTAAGAACATTTTGTGTCCTGACCTTCTACTTGAATTAGACTTTGGTGCTATTTGGTACAGATGTATGCCGACCTGCTCTGACACTTCTATATTGAGTAATGTTAAAATCATGTTGGGTAGTGGTGTTAAAGTGGTTTGTGATGGTTGTCACAGCTTTGCTAATCGTCTAACGATTAACTACAACAAACTCTGTGACACCGCTCGCAAGGATATTGAAATTGGTGGCATACCCTTTTCCACCTTTAAAACACCATCTAGCAGTTTTATTGATATGAAAGATGCTATCTACTCCGTAATTGAGTACGGCGAAGCATTCTCTTTCAAGACTGCAAGTGTTCCTGTAAATAATAGTGGTACTGTAAAAAATGATGACTGGTCAGACCCCATCTTGTTAGAACCTGCAGATTATGTTGAACCTAAAGACAATGGCGATGTAATTGTCATTGCTGGATACACTTTTTACAAGGATGAAGATGATCATTTCTATCCATATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTACAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCAGTTGCGTTTTCAGATAATGTCGATGTTAGAGAGATACAACCTGTTACACGTGTCAGGCTCGAATTCGAGTTTGATAATGAGGTTGTAACACAAGTGCTTGAAAAGGTCATTGGTACTAAATACAAGTTCACAGGCACAACTTGGGAAGAGTTTGAAGAGGCTATCTCTGAGGAACTTGATAAGATCTTTGATACGCTTGCTGAACAAGGTGTAGAACTTGAAGGTTACTTCATTTACGACACATGTGGCGGATTTGACATTAATAACCCAGATGGTGTTATGATTTCACAGTACGATCTTAACACAGCTGTTGATGTCAAAAGCGACTCTGATTTAAGTGTGGAAGACACTTCTGCGATTTCTGACAACGAAGATGTTGAACGAATTGGAGAAGAGACTGTCTCAACTGCTGATGTTGAAGATGTTTCATCTATAGAAGAGGAAACTGTAGCAGTCGTAAATGTTGACGACTCTATTGATCAAGTTACTATTGTAGAGTGTAACCCTGACAAGCAACTTTCCCCATTAGAGGAAAAAGCTGAAACCTCTGCTAAGAATGATCCATGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGCAACCTTTTAAGACAACAAATCTTAATGGTAAAATCATCCTTAAACAACAGGACAATAACTGTTGGGTGAATGCTTGCTGTTACCAATTGCAAGCCTTCGACTTTTTTAAGCATGATTTATGGGATAGTTTTAAGAATGGTGATGTTATGCCTTTTGTGAATTTTTGTTATGCATCTTTGACTTTACAGCAGGGTGCATCTGGAGATGCAGAGTATCTCTTGGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTTGTTCTTAATGCCAAGTGTGGCTGTGGTGATAAAGAGATCGTTTTGGAGAGGACCGTGTTCAAACTTACTCCACTTAAGAGTGAGTTTAAATATGGTGTCTGTGGTGACTGTAAACAAATCAACATGTGTAAATTTGCGAGTGTAGAGGGATCTGGTGTTTTTGTCCATGATAGAATAGAGAAACAAACGCCAGTGTCACAATTTGTTGTGAAGCCTGTCATGCATGCAGTTTACACAGGTACATCACAGAATGGTCATTATATGATTGAAGATTGCATTCATGATTACTGTGTGGATGGTATGGGACTTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTATACATCCACTCTGTTTCTTAATGTAAATGTAATGACAGCTGAATCTAAAAATAGAATTGAACCACATGTGCCCGCTAAGGATAAGTGTGTAGCAGAAGAACGTCAAAGTCCTAAAGATATCTTAACACCCTTTTATAAGGCGGGAAAAGTTTCATTTTACCAAGGAGATTTGGATATTTTGATTAACTTTCTTGAGCCTGACGTCGTTGTCAACGCAGCTAATGGTGATCTTAGGCACTTGGGTGGCGTTGCTAAAGCTCTTGATGTGTTTACAGGCGGTAAGTTAACAAAATGCTCTAAAGAATACCTTAAATCCAATAAACCAATAGCTCCTGGTAATGCTGTGCTTTTTGAAAATGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTAAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGATAGTAGAGTTGAAGGCAAACTTTGTAATGTTTATAAAGCAATTGCCAAGTGTGAAGGTAAAATATTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATTTTCAAAGTCAAACTCGAAACATCACTGCAGTGTTTAATTAAGACTGTCACTGATAGGGATTTGAATGTCTTCGTTTACACTGACCATGAGAGAACTACCGTAGAAAATTTTTTCAAAGGTACTATCCCAGTCAAGGTAACGGAAGACACTGTAAATCACAAACGTGTGTCTGTGGCACTCGATAAAACTTATGGTGAACAGCTTAAAGGGACTGTTGTTATTAAAGATAAAGATGTCACTAACCAGTTGCCTAATGTGTCTGACATTGGTGAAAAAATTGTCAAGGCTTTAGATATTGACTGGAGCGCATATTATG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Feline coronavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-5
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,347
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2017
SAMN28578114
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate FPV-5, complete genome
ACTCTTCCGATCTAGGGCCTCTTCCGATCTGAGGGGAGGGGTCCCCTCTTCCGATCTGAGGAGGAGGGACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACCCAGTTTGGCAATCACTCCTTGGAACGGGGTTGAGAGAACGGCGCACCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTATCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCATTTCCGTGACGTACTGCAGGAAATTAAGTACTGCTATCGTAACGGTTTTGATGGCTATGTCTTCGTGCCTGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCCGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTACAAGGCTTTATCGTTAAAGCTAATTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAGATTGCCCGTACTGGCAACGGTGCCATATATGTAGATCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATTGAAGGCGATTTTAAGGATTATTTCGGTGATGAGGATGTTATCATCTATGAAGGGGAGGAATACCATTGTGCCTGGCTAACAGTGCGCGATGAAAAACCTTTGTGTCAACAAACTCTCCTTACAATTCAGGAAATCCAATACAACTTGGATTTCCCACATAAGTTGCCAAATGGTGCTGTCAGAGAGGTAGCACCACCAGTCAAGAAGAACTCTAAGGTTGTTCTTTCCGAAGAGTATAGCAAACTTTATGACATCTTCGGTTCACCATTTATGGGTAATGGGGACAGTCTTAACAAGTGTTTTGACAGCCTCCATTTCATTGCTGCCACTCTTAAGTGTCCTTGCGGTGCTGAAAGTGGTGGTGTTGGTGACTGGACTGGTTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTCACGGCAAAGTAAAAGGTGTCACATTAGGTGTTGTTAAACCAGGTGATGCTGTTATCACTAGCATGAGTGCTGGCAAGGGTGTAAAATTCTTTGCTAATAGTGTACTCCAATATGCTGGTGATGTGGAAAATGTCTCTGTTTGGAAAGTGATTAAAACTTTCACTGTTAATGAGACTGTTTGCACCACTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCAGAGAGTACTTCGCCTGTTTCATGCTCCATTAAGAGAGCCTTTATTACTGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGATTGTATCATCACGGGTAAGTTAGATCTTAGTACTAATCTTTTTGGTAGTGCTAACTTGCTTTTTAAGAAAACACCTTGGTTTGTGCAGAAGTGTGGTGCGATCTTTGTTGATGCTTGGAAAGTTGTTGAGGAACTGCTTTGTTCACTCAAACTTACATACAAGCAAATTTACGATGTGGTGGCATCTCTCTGCACCTCTGCTTTCACTATTATGGACTACAAACCTGTGTTTGTAGTTTCATCTAATAGTGTTAAGGATCTTGTTGACAAGTGTGTTAAAATTCTTGTGAAGGCTTTTGATGTCTTCACACAGACTATTAAAATTGCAGGTGTAGAGGCCAAGTGTTTTGTGCTTGGTTCTAAATACTTGCTTTTTAACAATGCACTTGTCAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGACAAAAAGGTCTTGATAGTGCATTCTTTGCCACTAATTTGGTCGGTGCCACTGTCAATGTGACACCACAAAGGACTGAGGCAGCCAACATTAGTTTGAATAAAGTAGACGATGTTGTCACACCAGGTGCAGGTCACATTGTCGTTATTGGCGATATGGCTTTCTACAAGAGTGAAGAGTACTATTTTATGATGGCAAGTCCTGATTCGGTCCTTGTTAACAATGTTTTTAAAGCAGCTCGAGTGCCATCTTATAACATTGTTTACGATGTGGATGATGCTACCAAGAGTAATATGTTATCTAAAATTGGAGCATCATTCGAATTTGATGGTGACGCGAATGCTGCTATTGCTAAGGTTAATGACTTACTTGTTGAGTTCAGACAAGAAAAACTTTGTTTTAGAGCACTTAAGGATGGTGAAAGTATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAGAAATATAAAATGCCAATTTGTCTCAAAAATCATGTTGGTTTATGGGACATCATAAGAAAAGATTCTGATAAGAAGGGTTTTCTTGACACTTTCAACCATCTTAATGAATTGAAGGACGTCAAGGATATAAAAATTCAGGCTATTAAGAACATTCTGTGTCCTGACCTTCTACTTGAATTAGACTTTGGTGCTATTTGGTACAGATGTATGCCGACCTGCTCTGACACTTCTACATTGAGTAATGTTAAAATCATGTTGGGTAGTGGTGTTAAAGTGGTTTGTGATGGTTGTCACAGTTTTGCTAATCGTCTAACGATTAACTACAACAAGCTCTGTGACACCGCTCGCAAGGACATTGAAATTGGTGGCATACCGTTTTCCACCTTTAAAACACCATCTAGCAGTTTCATTGATATGAAAGATGCTATCTACTCCGTAGTTGAGTACGGCGAAGCATTCTCTTTTAAGACTGCAAGTGTTCCTGTAAATAATAGTGGTACTGTCAAAGATGATGACTGGTCAGACCCCATTTTGTTAGAACCTGCAGATTATGTTGAACCTAAAGACAATGGCGATGTAATTGTCATTGCTGGATACACCTTTTACAAGGATGAAGATGATCATTTCTATCCATATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTACAATAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCAGTTTCGTTTTCAGATAATGTCAATGTTAAAGAGATAGAACCTATTACACGTGTCAAGCTCGAATTCGAGTTTGATAATGAGGTTGTAACACAAGTGCTTGAAAAGGTCATTGGTACTAAATATAAGTTTACAGGCACAACTTGGGAAGAGTTTGAAGATGCTATCTCTGAGAAACTTGATAAGATCTTTGATACGCTTGCTGAACAAGGTGTAGAACTTGAAGGTTACTTCATTTACGACACATGTGGTGGATTTGACATTAACAACCCAGATGGTGTTATGATTTCACAGTACGATCTTAACACAGCTGTTGATGTCAAAAGCGACTCTGATGCAAGTGTGGAAGACACTTCTTCGATTTCTGACAACGAAGATGTTGAACGAATTGAAGAAGAGACTGTCTCAATAGAAGAGGAAACTGTAGCAGTCGTAAATGTTGACGACTCTATTGATCAAGTTACCATTGTAGAGTGTAGCCCTGAAGAGCAACTTTCCCCATTAGAGGAAAAAGCTGAAACTTCTGCCAAGAATGATCCATGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGCAACCTTTTAAGACAACAAATCTTAATGGTAAAATCATCCTTAAACAACAGGACAATAACTGTTGGGTGAACGCTTGCTGTTACCAATTGCAAGCCTTCGACTTCTTTAAGCATGATTTATGGGATAGTTTTAAGAATGGTGATGTTATGCCTTTTGTGAACTTTTGTTATGCAGCTTTGACTTTACAGCAGGGTGCTTCTGGAGATGCAGAGTATCTCTTGGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTTGTTCTTAATGCCAAGTGTGGCTGTGGTAATAAAGAGATCGTTTTGGAGAGGACCGTGTTCAAACTTACTCCACTTAAGAGTGAGTTTAAATATGGTGTCTGTGGTGATTGTAAACAAATCAACATGTGTAAATTTGCAAGTGTAGAGGGATCTGGTGTTTTTGTCCATGATAGAATAGAGAAACAAACGCCAGTGGCACAATTTATTGTGACGCCTAACATGCATGCAGTTTACACAGGTACATCACAGAATGGTCATTATATGATTGAAGATTGCATTCATGATTACTGTGTGGATGGTATGGGAATTAAACCTCGTAAACACAAGTTTTACACATCCACTTTGTTTCTTAATGTAAATGTAATGACAGCTGAATCTAAAACTAGAATTGAAACACATGTGCCCGCTAAGGATGAGTGTGTAGCAGAAGAATGTCAAAGTCCTAAAGATATCTTAACACCCTTTTATAAGGCGGGTAAAGTTTCATTTTACCAAGGAGATTTGGACTTTTTGATTAACTTTCTTGAGCCTGACATCGTTGTTAATGCCGCTAATGGTGATCTTAAGCACTTAGGTGGCGTTGCTAAAGCTCTTGATGTGTTTACAGGCGGTAAGTTAACAAAACGCTCTAAAGAATACCTTAAATCCAATAAGTCAATAGCTCCTGGTAATGCTGTGCTTTTTGAAAATGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTAAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGATAGTAGAATTGAAGGTAAACTTTGTAATGTTTATAAAGCAATTGCTAAGTGTGAGGGTAAAATATTAACACCACTTATTAGTATTGGTGTTTTCAATGTTAAACTTGAAACATCATTGCAATGTTTACTTAAAACTATCAATGATAGGGATTTGAATGTCTTCGTTTACACTGACCGTGAGAGAACTACCGTAGAAAATTTTTTCAATGGTACTATCCCTGTCAAAGTAACAGAAGACACTGTGAATCATAAACGTGTGTCTGTGTCACTTGATAAAACCTACGGTGAGCAACTCAAAGGAACTGTTGTTATTAAAGATAAAGATGTCACTAACCAGTTGCCTAATGTGTCCGACGTCGGTGAAAAAATCGTCAAGGTTTTAGACA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Feline coronavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
FPV-6
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,334
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2017
SAMN28578125
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate FPV-6, complete genome
GGGGGAGGGACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACCCAGTTTGGCAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGGTGCGCCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGCCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTACCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCTTTTCCGTGACGTACTGCAGGAAATTAAACACTGCTACCGTAACGGTTTTGATGGCTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTATTTTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTTCTTCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTGCAAGGCTTTATTGTTAAGGCTAACTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATCGCACGTACTGGGAATGGTGTCATATATGTAGATCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATTGATGGCGAATTTAAGGATTATTTCGGTGATGAGGACGTTATCTTTTATGAAGGGGAAGAGTATCATTGCGCCTGGTCAACTGTGCGCGATGATAAACCTTTGTGTCAACAGACCCTTCTTACAATAAGGGAAATCCAATACAATCTGGATATCCCACATAAGTTGCCAAATTGTGCTATTAGGGAAGTAGCACCACCAGTCAAGAAGAACTCTAAAGTTGTTCTCTCTGAAGAGTATAGGAAGATCTATGACATCTTCGGTTCACCATTTATGGGCAATGGAGACAGTCTTAACAAGTGTTTTGCTAGTCTCCATTTCATCGCTGCTACTCTTAAGTGTCCTTGTGGTGCTGAAAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGGTTTAAGACCGCCTGTTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACATTGGGTTCTGTTAAGCCAGGTGATGCTGTTATCACTAGCATGAGTGCTGGCAAAGGTGTAAAATTCTTTGCTAATAGTGTGCTCCAATATGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCTGTCTGGAAAGTTGTTAAAACTTTCACTGTTAATGAGAATGTTGGCACCACTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATTAAACCAGAGAGTACTTCGCCTGTCTCATGCTCCATTAAGAGAGCTTTCATTACTGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGACTGTATTATTACGGGAAAGTTGGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAGTGCTGACCTGCTTTTTAAGAAGACACCCTGGTTTGTGCAAAAGTGTGGTGCAATTTTTGCTGATGCTTGGAAAGTTGTTGAGGAACTGCTTTGTTCTCTTAAACTTACATACAAGCAAATTTATGATGTAGTGGCATCTCTCTGCACTTCTGCCTTTACTATTATGGACTACAAACCTGTGTTTGTAGTTTCATCTAATAGTGTTAAGGATCTTGTTGACAAGTGTGTTAAAATTCTTGTGAAGGCTTTTGATGTCTTCACACAGACAATTACAATTGCAGGTGTGGAGGCTAAATGCTTCATTTTTGGTTCTAAATACCTGCTTTTTAACAATGCACTTGTCAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGACAGAAAGGTCTTGATAGTGCATTCTTTGCCACTAATTTGGTTGGTGCCACTGCTAATGTGACACCACAAAGGACTGAGGCAGCCAACATTAGTTTGAATAAAGTAGACGATGTTGTCACACCAGGCGAGGGTCATATTGTCATTGTAGGCGATATGGCTTTTTACAAGAGTGAGGAGTACTACTTTATGATGGCAAGCCCTTATTCGGTCCTTGTCAATAATGTTTTTAAAGCAGCCCGAGTGCCATCCTATAACATTGTTTACAATGTGGATGATGCTACCAAGATTAATATGTCATCTAAAATTGGAGCATCATTCGAATTTGATGGTGATGTGGACGCTGCTATTGCTAAGGTTAATGATTTACTTGTTGAGTTCAGACAAGAGAAGCTTTGTTTCAGAGCACTTAAGGATGGTGAAAGTATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAGAAATACAAAATGCCAACTTGTCTCAAAAATCATGTTGGTTTATGGGACATCATAAGACGCGATTCTGACAAGAAAGGTTTTCTTGACACCTTCAGTCATCTTAATGAATTGGAGGATGTCAAGGATGTAAAAATTCAGGCTATAAAAAATATTCTTTGTCCTGATCTTCTGTTAGAATTGGATTTTGGTGCTATATGGTACAGATGTATGCCAACCTGCTCTGACACCTCTATATTGAGTAATGTTAAAATTATGCTAGGTAGTGGTGTTAAAGTAATTTGCGACGGTGGTCACAACCTTGCTAACCGTTTAACAATTAATTACAACAAACTTTGTGACACAGCTCGTAAAGATGTTGAAATTGGTGGTCTACCATTTTCCACATTTAAAACACCATCCAGCAGTTTTATTGACATGAAAGATGCTATTTATTCCGTAGTTGAATATGGTGAGGCATTCTCTTTTAAGACTGCAAGTGTGCCTGTAACTAATAGTGGTACTGTCAAAAATGACGACTGGTCCGATCCCATTTTGTTAGAACCTGCAGATTATGTTGAACCTAAAAACAATGGCGATGTAATTGTCATTGCTGGATACACATTTTACAAGGATGAAGATGATCATTTCTATCCATATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTATAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCAGTTTCGTTTTCAGATAGTGTCAATGTTAAAGAGATACAACCTGTTACACGTGTCAAGCTAGAGTTTGAGTTTGACAATGAGGTGGTAACACAGGTGCTTGAAAAGGTCATTGGTACTAAATATAAGTTCACGGGCACAACCTGGGAAGAGTTTGAAGATGCTATCTCTGAGGAACTTGATAAGATATTTGATACGCTTGCAGAACAGGGTGTAGAACTTGAAGGTTACTTCATCTACGACACCTGTGGTGGATTTGACATTAACAATCCAGATGGTGTTATGATCTCACAGTATGATCTTAACACAGACGCTGATGAAACAGCTGATTCTGATGTAAGCGTGCAAGACGTTTCTTCAACTTCTGACAACGAAGATGTTGAACAAATTGAAGAAGAGGATGTCTCAAATGTTGAAGAGGATGTCTCAAATGTTGATGTTGAAGATGTTTCATCTCTAGAGGAGGGAATTGTAGCAGTTGCAAACGCTGATGATTCTGCCAAACACGTCACCCTTGTAGAGGATAACCCTGACGAGCAACTTGCCTCGGTAGATGACACAGTTGAAGCCGCTGCTAAAAATGACCCATGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAAACTAAACCTGTCTTGCCATCTTTTAAGGTGACAGATCTTAATGGTAAAATCATCCTTAAACAACAAGATAACAATTGCTGGGTAAACGCTTGCTGTTATCAGCTGCAAGCTTTTGACTTCTTTAATCATGATTTGTGGGATGGTTTTAAGAAAGGTGATGTTATGCCTTTTGTGAATTTCTGTTATGCAGCTCTGACTTTGAAGCAGGGTGACTCTGGAGATGCAGAATACCTTTTGGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTGGTTCTTAGTGCCAAGTGCGGCTGTGGTGTTAAAGAGATAGTTCTGGAGAGAACTGTATTTAAGCTCACACCTTTTAAGAACGAGTTTAAATATGGTGTCTGTGGTGATTGTAAACAAATCAACATGTGTAAATTTGCAAGTGTAGAGGGATCTGGTGTTTTTGTCCATGATAGAATAGAAAAACAAACATCAGCGTCACAATTTGTTGTGAAGCCTACTATGCATGCAGTTTACACGGGTACAACACAGAGCGGTCATTATATGATTGAAGATTGCATTCATGATTACTGCGTGGATGGTATGGGAATTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACTCTGTTTCTTAATGCGAATGTAATGACAGCTGAATCCAAAACTATGGTTGGAACAACTACACCTGTAAAGGATAGTAGTATAGAAGAACGTCAAAGTCCTAAAAACCTCCTAACACCGTTTTATACGGCAGGTAAGGTTTCATTTTACAAAGGAGATTTAGATGTTTTGATCAATTTTCTTGAGCCAGATGTTGTTGTTAATGCTGCCAATGGTGACCTTAGGCACACAGGGGGTGTTGCTAAGGCTATCGATCTATTCACAGGTGGTAAGTTGACAAAGCGCTCTAAGGAATATCTTAAATCCAATAAGTCAATAGTTCCTGGTAATGCTGTACTCTTTGAAAGTGTAATTGAGCATCTTAGTGTGTTAAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGATAGTAGAGTTGAAGGCAAACTTTGTAACGTTTATAAAGCAATTGCCAATTGTGAAGGTAAAATATTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATTTTCAAAGTCAAACTCGAAACATCACTGCAGTGTTTAATTAAGACTATCACCAATAGGGATTTGAATGTCTTCGTTTACACTGACCATGAGAGAGCTGCCGTAGAAAATTTCTTCAAAGGTACTATCCCAGTCAAGGTAACGGAAGACACTGTAAATCACAAACGTGTGTCTGTGACACTTGATAAAACTTATGGTGAACAACTTAAAGGGACCGTTGTTATTAAAGATAAAGATGTTACTAACCAGTTGCCTAATGTGTCTGACGTTGGTGAAAAAATCGTCAAGGCTCTAGACATTGACTGGAGCGCA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ON595862.1
Feline coronavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-1
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,314
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578134
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate HC-1, complete genome
AGGAGAGGGAAGAGCTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCATGGCTATAACTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCATTCAGTTTGGCAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGGCGCGCCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGCTCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTATCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCCTTTCCGTGACGTACTGCAGGAAATTAAGTACTGCTATCGTAATGGTTTTGATGGCTATGTTTTCGTACCTGAATACCGTCGTGACCTGGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCCGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTGCAAGGCTTTATCGTTAAAGCTAACTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAGGTTGCCCGTACTGGCAACGGTGTCATATATGTAGATCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATTGAAGGCGATTTTAAGGATTATTTCGGTGATGAGGATGTTATCATCTATGAAGGAGAGGAGTACCATTGTGCATGGCTAACAGTGCGCGATGAAAAACCTTTATGTCAACAAACTCTCCTCACGATTCAGGAAATCCAATACAACATGGATGTCCCACATAAGTTGCCAAATTGTGCTATCAGAGAAGTAGCACCACCAGTCAAGAAAAACTCTAAGGTTGTTCTTTCCGAAGAGTATAGAAAACTTTATGACATCTTCGGCTCACCATTTATGGGTAATGGGGACAGTCTTAACAAGTGTTTTGACAGCCTCCATTTCATTGCTGCTACTCTTAAGTGTCCTTGTGGTGCTGAAAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGATTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACATTGGGTGCTATCAAGCCAGGTGATGCTGTTATCACTAGTATGAGTGCTGGCAAGGGCGTGAAATTCTTTGCTAATAGTGTACTCCAATATGCTGGTGATGTGGAAAATGTCTCTGTTTGGAAAGTGATTAAGACATTCACTGTTAATGAGACTGTTTGCACCACTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCAGAGAGTACTTCGCCTGTTTCATGCTCCATTAAGAGAGCTTTTATCACTGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGATTGTATCATCACGGGGAAGTTAGACCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAGTGCTAACCTACTTTTTAAGAAGACGCCTTGGTTTGTGCAAAAATGTGGTGCGATTTTTGCTGATGCTTGGAAAGTTGTTGAGGAACTGCTTTGTTCGCTCCAACTCACATACAAGCAAATTTACGATGTGGTGGCATCTCTCTGCACCTCTGCTTTCACTATTATGGATTACAAACCTGTGTTTGTGGTTTCATCTAATAGTGTTAAGGGTCTTGTTGACAAGTGTGTTAAAATTCTTGTGAAGGCTTTTGATGTCTTCACACAAACCATTACAATTGCAGGTGTAGAGGCCAAGTGCTTTGTGCTTGGTTCTAAATACTTGCTTTTTAATAATGCACTTGTCAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGACAAAAAGGCCTTGATAGTGCATTCTTTGCCACTAATTTGGTTGGTGCTACTGTCAATGTGACACCACGAAGGACTGAGGCAGCCAACATTAGTTTGAACAAAGTAGACGATGTTGTCACACCAGGTGCAGGTCATATTGTCGTTATTGGCGATATGGCTTTCTACAAGAGTGAAGAGTACTATTTTATGATGGCAAGTCCTGATTCGGTCCTTGTTAATAATGTTTTTAAAGCAGCTCGAGTGCCATCTTATAACATTGTTTACGATGTGGATGATGCTACCAAGAGTAATATGTTATCTAAAATTGGAGCATCATTCGAATTTGATGGTGACGCGGATGCTGTTATTGCTAAGGTTAATGACTTACTTGTTGAGTTCAGACAAGAAAAACTTTGTTTTAGAGCACTTAAGGATGGTGAAAGTATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAGAAATATAAAATGCCAATTTGTCTCAAAAATCACGTTGGTTTATGGGACATCATAAGAAAAGATTCTGATAAGAAGGGCTTTCTTGACACTTTCAATCATCTTAATGAATTGGAGGACGTCAAGGATATAAAAATTCAGGCTATTAAGAATATTTTGTGTCCTGACCTTCTACTTGAATTAGACTTTGGCGCTATTTGGTACAGATGTATGCCGACTTGCTCTGACACTTCTATATTGAGTAATGTTAAAATCATGTTAGGTAGCGGTGTTAAAGTGGTTTGTGATGGTTGTCACAGTTTTGCTAATCGTCTAACAATTAACTACAACAAACTCTGTGACACGGCTCGCAAGGACATTAAAATTGGTGGCATACCGTTTTCCACTTTTAAAACACCATCTAACAGTTTCATTGATATGAAAGATGCTATTTACTCTGTAGTTGAGTACGGCGAAGCTTTCTCTTTCAAGACTGCAAGTGTTCCTGTAAATAATAGTGGTACTGTCAAAAATGATGACTGGTCAGACCCTATCTTGTTAGAACCGGCAGATTATGTTGAACCTAAAGACAATGGCGATGTAATTGTCATTGCTGGATACACCTTTTACAAGGATGAAGATGATCATTTCTATCCATATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTACAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCAGTTTCTTTCTCTGATAATGTTAGTGTTAAAGAGATAAAACCTGTTACATGTGTCAGGCTCGAATTTGAATTTGATAATGAGGTTGTAACACAAGTGCTTGAAAAGGTCATTGGTACTAAATATAAGTTCACAGGCACAACTTGGGAAGATTTTGAAGATGCTATCTCTGATGAACTTGATAAGATCTTTGATACGCTTGCGGAACAAGGTATAGAACTTGAAGGTTACTTCATTTACGACACATGTGGCGGATTTGACATTAATAACCCAGATGGTGTTATGATTTCACAGTACGATCTTAACACAGCCATTGATGTCAAAAGCGACACTGATGCAAGTGTGGAAGACACTTCTTCGATTTCTGACAACGAAGATGTTGAACGAATTGAAGAAGAGACTGTCTCAAATGCTGATGTTGAAGATGTTTCATCTATAGAAGAGGAAACTGTAGCAGTCGTAAATGTTGACGACCCTATTGATCAAGTTACCAGTGTGGAGTGTAACCCTGACGAGCCACCTTCCTCATTAGAGGAAAAAGCTGAAACCTCTGCCAAGAATGATCCATGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGCAACCTTTTAAGACAACAAATCTTAATGGTAAAATCATCCTTAAACAACAAGACAATAATTGTTGGGTGAACGCTTGCTGTTACCAATTGCAAGCCTTCGCCTTCTTTAATCATGATTTATGGGATGGTTTTAAGAAAGGTGATGTTATGCCTTTTGTGAATTTTTGTTATGCAGCTCTAACCTTGAAGCAGGGTGATTCAGGGGATGCAGAATACCTTTTGGAGACGATGCTCAATGATTACATTAGCGCTAAAGTCACACTTAGTGCTAAGTGTGGCTGTGGTATTAAAGAGATAGTTTTAGAAAGAACTGTGTTTAAGCTCACACCTCTTAAGAATGAGTTTAAATATGGCGTCTGTGGTGACTGTAAGCAAATTAACATGTGTAAGTTTGCTAGTGTTGAAGGTTCTGGTGTTTTTGTTCATGACAGGATTGAAAAACAAACACCTGTGTCACACTTTATTGTGGCACCTACTATGCATGCAGTTTACACAGGTACAACACAGAATGGTCATTATATGGTTGAAGATTGCATTCATGGTTACTGTGTGGATGGTATGGGAATTAAACCGCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACTTTGTTTCTTAATGCAAATGTAATGATAGCTGAATCTAAAACTAGAATTGAACCACATATGCCCGCTAAGGATAAGTGTGTAGCAGAAGAGCGTCAAAGTCCTAAAGATGTCTTAACACCCTTTTATAAGGCGGGAAAAGTTTCATTTTACCAAGGAGATTTGGATGTTCTGATTAACTTTCTCGAGCCTGACGTCGTTGTTAATGCCGCTAATGGTGATCTTAAGCACTTAGGTGGCGTTGCTAAAGTTCTTGATGTGTTTACAGGCGGTAGGTTAACAAAACGCTCTAAAGAATACCTTAAATCCAATAAATCAATAGCTCCTGGTAACGCTGTGCTTTTTGAAAATGTACTTGAACATCTTAGTGTGTTAAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGATAGTAGAGTTGAAGGTAAACTTTGTAATGTTTATAAAGCAATTGCTAAGTGTGAGGGTAAAATATTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATTTTCAATGTTAAACTTGAAACATCATTGCAGTGTTTACTTAAAACTATCACTGATAGGGATTTGAATGTCTTCGTTTACACTGACCATGAGAGAACTACCGTAGAAAATTTTTTCAATGGTACTATCCCAGTCAAAGTAACAGAAGACACTGTGAATCACAAACGTGTGTCTGTGGCACTTGATAAAACCTACGGTGAGCAACTCAAAGGAACTGTTGTTATTAAAGATAAAGATGTCACTAACCAGTTGCCTAATGTGTCTGACGTTGGTGAAAAAATCGTCAAGGCTTTAGACATTGATTGGAGTGCACATTATGGTTTTTC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Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-5
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,288
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578166
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate HC-5, complete genome
GGAAGAGGAGACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACATCAGTTTGGCAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGACGCACCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTACCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCCTTTCCGTGACGTGTTGCAGGACATTAAGCACTGCTACCGCAACGGTTTTGAGGGTTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTTTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTGCAGGGTTTCATTGTTAGAGCTAACTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCCCGTACTGGAAATGGCGCCATATATGTAGACCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATCGAAGGTGAGTTTAAGGACTACTTCGGTGATGAGGACGTTATCATTTATGAAGGAGAAGAGTATCATTGTGCCTGGTTAACTGTGCGCGATGAAAAACCTTTGTGTCAACAAACTCTCCTCACAATTAGGGAAATCCAATACAATATGGATATCCCACATAAGTTGCCAAATTGTGCTATTAGAGAGGTAGCACCGCCAGTCAAGAAGAACTCTAAAGTTGTTCTTTCTGAAGATTACAGAAAACTTTATGATGTCTTCGGTTCACCATTTATGAGTAATGGGGATAGTCTTAACAAGTGTTTTGACAGCCTCCATTTCATCGCTGCTACTCTTAAGTGTCCTTGCGGTGCTGAGAGTAGTGGTGTCGGTGATTGGACTGGATTTAAGACAGCTTGTTGTGGTCTTCGTGGCAAAGTTAAAGGTGTCACATTGGGTGCTGTTAAGCCAGGTGATGCTGTTATCACTAGCATGAGTGCTGGCAAGGGTGTAAAATTCTTTGCTAATAGTGTGCTCCAATACGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCTGTTTGGAAAGTTATTAAAACTTTCACTGTTAACGAGACTGTTTGCACCACTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATTAAACCAGAGAGTACTTCACCTGTTTCATGCTCTATTAAGAGAGCTTTCATCACAGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGATTGTATTATCACGGGAAAGTTGGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAGTGCTAACCTTCTTTTTAAGAAAACGCCCTGGTTTGTGCAAAAGTGTGGTGCGATTTTTGCTGATGCGTGGAAAGTTGTTGAGGAACTGCTCTGTTCGCTCAAACTTACATACAAGCAAATTTACGATGTGGTGGCATCTCTCTGCACTTCAGCGTTCACTATTATGGACTACAAACCTGTGTTTGTAGTATCGTCTAATAGTGTTAAAGACCTTGTTGACAAGTGTGTTAAGATTCTTGTGAAAGCTTTTGATGTCTTCACACAGACTATCACAATTGCAGGTGTAGAGGCCAAGTGCTTTGTGCTTGGTTCTAAATACTTGCTTTTTAACAATGCACTTGTTAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGACAAAAAGGCCTTGATAGTGCATTCTTTGCCACTAACCTGGTCGGTGCCACTGTTAATGTGACACCACAAAGGACTGAAGCAGCCAACATTAGTTTGAACAAAGTAGACGATGTAGTCACACCAGGTGTGGGTCATATTGTCATTGTTGGCGATATGGCTTTCTACAAGAGTGAAGAGTACTATTTTATGATGGCAAGCCCTGATTCGGTCCTTGTTAATAACGTTTTTAAAGCAGCTCGAGTGCCATCTTATAACATTGTTTACAATGTGGATGATGCTACCAAGAGTAATATGTTATCTAAAATTGGAGCATCATTCGAATTTGATGGTGATGTGGATGCTGCTATTGCTAAGGTTAATGACTTACTTGTTGAGTTCAGACAAGAAAAACTTTGTTTCAGAGCACTTAAGGATGGTGAGAGTATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAAAAATACAAAATGCCAACCTGTCTCAAAAATCATGTTGGTTTATGGGACATCATAAGACGCGATTCTGACAAGAAGGGGTTTCTTGACACTTTCAGCCAGCTTAATGAATTGGAGGATGTCAAGGATGTAAAAATTCAGGCTATCAAAAATATTCTTTGTCCTGACCTTCTGTTAGAATTGGATTTTGGTGCCATTTGGTACAGATGTATGCCTACCTGCTCTGACACCTCTATCTTGGGTAATGTTAAAATTATGCTAGGTAATGGTGTTAAAGTCATTTGCGACGGTGGTCACAACCTTGCTAACCGTTTAACAATTAATTACAACAAACTTTGTGACACAGCTCGTAACGATGTTGAAATTGGTGGTCTACCATTTTCCACATTTAAAACACCATCTAGCAGTTTTATTGATATGAAAGATGCTATTTATTCCGTAGTTGAACACGGTGAAGCATTCTCTTTTAAGACTGCAAGTGTGCCTGTAATTAATAGTGGTACTGTAAAAACTGATGATTGGTCAGAACCCATTTTGTTGGAGCCTGCAGATTATGTTGAACCTAAAAACAATGGCGATGTAGTTGTCATTGCTGGCTATACATTTTACAGGGATGAAGATGACCATTTTTATCCGTATGGTTCTGGAATGGTTGTGCAGAAGATGTACAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCAGTTTCATTTTCAGATAGTGTCAATGTTAAAGAGATACAACCTGTTACACGTGTCAAACTAGAGTTTGAGTTTGACAACGAAGTGGTAACAAAAGTGCTTGAAAAAGTCATTGGCACTAATTATAAGTTTACAGGTACAACTTGGGAAGAATTTGAAGTTTCTATCTCTGAGGAACTTGACAACATCTTCGACACGCTTGCTGAACAGGGTGTAGAACTTGAAGGTTACTTCATCTACGACACCTGTGGTGGTTTTGACATTAACAACCCCGACGGTATTATGATTTCACAGTACGATCTTAACATAGCTGTTGATGATAATAACGACTCTGATGCAAGTGTGGAAGACACTTCTTCGATTTCTGACAACGAAGATGTTGAACAAATTGAAGAAGAGACTGTTTTAACTGTTGATGTTGAAGATGTTTCATCTATAGAAAAGGAAACTGTAGTAGTTGCAAAAGCTGATGATTCTAACCCTGACGAGCAACTTTCCTCAGTTGAGGAAAAAGCTGAAAGCTCTGCCAAGAATGATCCATGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGCCACCTTTTAAGATAACAAATCTTAATGGTAAAATCATCCTTAAACAACAGGACAATAATTGTTGGGTGAATGCTTGCTGTTACCAATTGCAAGCCTTCGACTTCTTTAATCATGATTTATGGGATGGTTTTAAGAAAGGTGATGTTATGCCTTTTGTGAATTTTTGTTACGTAGCTCTGACTTTGAAGCAGGGTGATTCAGGGGATGCAGAATACCTTTTGGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTCACACTTAGTGCTAAGTGTGGCTGTGGTGTTAAAGAGATAGTTTTAGAACGAACTGTATTTAAGCTCACACCTCTTAAGAATGAGTTTAAATACGGCGTTTGTGGTGACTGTAAGCAAATTAATATGTGTAAGTTTGCTAGTGTGGAAGGTTCTGGTGTTTTTGTTCATGATAGAATTGAAAAACAAACACCAGAGTCACAATTTATTGTGACACCTGCTATGCATGCAGTTTACACAGGTACAACACAGAGCGGTCATTACATGATTGAAGATTGCATTCATGATTATTGTGTGGATGGTATGGGAATTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACGTTGTTTCTTAATGCAAACGTAATGACGGCTGAATCTAAAACTATGGTTGAACCACCTGATCCCGTAGAGGCTAAGTGCTTAGAAGAATGTCAAAGTCCTAAAGAACTTATACAACCCTTTTATAAAGCGGGAAAAGTTTCATTTTACCACGGAGATTTAGATGTTTTGATTAACTTTCTTGAGCCAGATGTTGTTGTTAATGCTGCTAATGGTGACCTTAGGCACACAGGGGGTGTTGCTAGGGCTATCGATGTATTCACAGGTGGCAAGTTAACAAAACGCTCTAAAGAATATCTTAAATCTAACAAAACAATAGCTCCTGGTAATGCTGTGCTTTTTGAAAACGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTGAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGACAGTAGAGTTGAAGGTAAACTCTGTAATGTCTACAAAGCAGTTGCTAAGTGTGATGGTAAGATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATCTTTAAAGTCAAGCTGGAAGTTTCATTGCAGTGTCTACTTAAAACTGTCACAGATAGAGAGTTAAATGTCTTTGTTTACACTGACCAAGAGAGAATTACCATAAAAAATTTTTTCAATGGTACCATCCCTGTCAAGGTAACAGAAGACACTGTGAATCAAAAGCGTGTGTCTGTAGCACTTGATAAAACTTATGGTGAGCAACTCAAAGGAACTGTTGTTATTAAGGATAAAGATGTCACTAACCAGTTGCCAAGTGTGTCAGATGCCGGTGAAAAAATTGTTAAGGCATTGGATGTTGATTGGACTGCTTACTATGGTTTTCCAAATGCAGCAGCTTTTAGCGCCAGTTCACATG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University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-6
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,299
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578153
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate HC-6, complete genome
AAGGAGAAGAGAAAGAAAGGAGAACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTTTGCTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACCAGTTTGGCAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGGCGCACCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAGTTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACCACCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCCTTTCCGTGCCGTGTTGCAGGACATCAAGTACTGCTACCGTAACGGTTTTGATGGCTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGCCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTGCAGGGTTTCATTGTTAGATCCAACTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAGTTGCCCGTACTGGGAATGGCGCCATATATGTAGACCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATTGAAGGTGAGTTTAAGGACTACTTCGGTGATGAGGACGTTATCATTTATGAAGGAGAAGAGTATCATTGTGCCTGGACAACTGTGCGCGATGAAAAACCTTTATGTCAACAAACTCTCCTCACAATTAGGGAAATCCAATACAATCTGGATATCCCTCATAAGTTGCCAAATTGTGCTATTAGAGAGGTAGCACCGCCAGTCAAGAAGAACTCTAAAGTTGTTCTTTCCGAAGAGTACAGAAAACTTTATGACATCTTCGGTTCACCATTTATGAGTAACGGAGACAGTCTTAATAAGTGTTTTGACAATCTCCACTTCATCGCTGCTGCTCTTAAGTGTCCTTGTGGCGCTGAAAGTAGTGGTGTTGGTGACTGGACTGGCTTTAGGACAGCTTGTTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACACTGGGTGCTGTTAAGCCAGGTGATGCTGTTGTCACTAGTATGAGTGCTGGCAAGGGTGTGAAATTCTTTGCCAATAGTGTGCTCCAATATGCCGGTGATGTGGAAAATGTCTCCATTTGGAAGGTTATTAAAACCTTCACTGTTAATGAGACCATTTGCACCACTGATTTTGAAGGCGAATTGAATGACTTCATTAAACCAGAGAGTACTTCACCTGTTTCATGCTCCATTAAGAGGGCATTCATCACTGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGATTGTATCATCACTGGAAAGTTAGATCTTAGTATTAACCTTTTTGGTAATGCTAACTTGCTTTTTAAGAAAACACCCTGGTTCGTGCAAAAGTGTGGTGCGATTTTTGCTGATGCGTGGAAAGTTGTTGAAGAACTGCTTTGTTCTCTCAAACTTACATACAAGCAAATTTATGATGTAGTGGCTTCACTTTGCACTTCAGCGTTCACTATTATGGACTACAAACCTGTGTTTGTAGTATCGTCTAATAGTGTTAAAGACCTTGTTGACAAGTGTGTTAAGATTCTTGTGAAAGCTTTTGATGTCTTCACACAGACCATCACAATTGCAGGTGTAGAGGCCAAGTGCTTTGTGCTTGGTTCTAAATACTTGCTTTTTAACAATGCACTTGTTAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGACAAAAAGGCCTTGATAGTGCATTCTTTGCCACTAACCTGGTCGGTGCCACTGTTAATGTGACACCACAAAGGACTGAAGCAGCCAACATTAGTTTGAACAAAGTAGACGATGTAGTCACACCAGGTGTGGGTCATATTGTCATTGTTGGCGATATGGCTTTCTACAAGAGTGAAGAGTACTATTTTATGATGGCAAGCCCTGATTCGGTCCTTGTTAATAACGTTTTTAAAGCAGCTCGAGTGCCATCTTATAACATTGTTTACAATGTGGATGATGCTACCAAGAGTAATATGTTATCTAAAATTGGAGCATCATTCGAATTTGATGGTGATGTGGATGCTGCTATTGCTAAGGTTAATGACTTACTTGTTGAGTTCAGACAAGAAAAACTTTGTTTCAGAGCACTTAAGGATGGTGAGAGTATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAAAAATACAAAATGCCAACCTGTCTCAAAAATCATGTTGGTTTATGGGACATCATAAGACGCGATTCTGACAAGAAGGGGTTTCTTGACACTTTCAGCCAGCTTAATGAATTGGAGGATGTCAAGGATGTAAAAATTCAGGCTATCAAAAATATTCTTTGTCCTGACCTTCTGTTAGAATTGGATTTTGGTGCCATTTGGTACAGATGTATGCCTACCTGCTCTGACACCTCTATCTTGGGTAATGTTAAAATTATGCTAGGTAATGGTGTTAAAGTCATTTGCGACGGTGGTCACAACCTTGCTAACCGTTTAACAATTAATTACAACAAACTTTGTGACACAGCTCGTAACGATGTTGAAATTGGTGGTCTACCATTTTCCACATTTAAAACACCATCTAGCAGTTTTATTGACATGAAAGATGCTATTTATTCCGTAGTTGAATACGGTGAAGCATTCTCTTTTAAGACTGCAAGTGTGCCTGTAATTAATAGTGGTACTGTAAAAACTGATGATTGGTCAGAACCCATTTTGTTGGAGCCTGCAGATTATGTTGAACCTAAAAACAATGGCGATGTAGTTGTCATTGCTGGCTATACATTTTACAGGGATGAAGATGACCATTTTTATCCGTATGGTTCTGGAATGGTTGTGCAGAAGATGTACAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCAGTTTCATTTTCAGATAGTGTCAATGTTAAAGAGATACAACCTGTTACACGTGTCAAACTAGAGTTTGAGTTTGACAACGAAGTGGTAACAAAAGTGCTTGAAAAAGTCATTGGCACTAATTATAAGTTTACAGGTACAACTTGGGAAGAATTTGAAGTTTCTATCTCTGAGGAACTTGACAACATCTTCGACACGCTTGCTGAACAGGGTGTAGAACTTGAAGGTTACTTCATCTACGACACCTGTGGTGGTTTTGACATTAACAACCCCGACGGTATTATGATTTCACAGTACGATCTTAACATAGCTGTTGATGATAATAACGACTCTGATGCAAGTGTGGAAGACACTTCTTCGATTTCTGACAACGAAGATGTTGAACAAATTGAAGAAGAGACTGTTTTAACTGTTGATGTTGAAGATGTTTCATCTATAGAAAAGGAAACTGTAGTAGTTGCAAAAGCTGATGATTCTAACCCTGACGAGCAACTTTCCTCAGTAGAGGAAAAAGCTGAAAGCTCTGCCAAGAATGATCCATGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGCCACCTTTTAAGATAACTAATCTTAATGGTAAAATCATCCTTAAACAACAGGACAATAATTGTTGGGTGAATGCTTGCTGTTACCAATTGCAAGCCTTCGACTTCTTTAATCATGATTTATGGGATGGTTTTAAGAAAGGTGATGTTATGCCTTTTGTGAATTTTTGTTACGCAGCTCTGACTTTGAAGCAGGGTGATTCAGGGGATGCAGAATACCTTTTGGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTCACACTTAGTGCTAAGTGTGGCTGTGGTGTTAAAGAGATAGTTTTAGAACGAACTGTATTTAAGCTCACACCTCTTAAGAATGAGTTTAAATACGGCGTTTGTGGTGACTGTAAGCAAATTAATGTGTGTAAGTTTGCTAGTGTGGAAGGTTCTGGTGTTTTTGTTCATGATAGAATTGAAAAACAAACACCAGAGTCACAATTTATTGTGACACCTGCTATGCATGCAGTTTACACAGGTACAACACAGAGCGGTCATTACATGATTGAAGATTGCATTCATGATTATTGTGTGGATGGTATGGGAATTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACGTTGTTTCTTAATGCAAACGTAATGACGGCTGAATCTAAAACTATGGTTGAACCACCTGATCCCGTAGAGGCTAAGTGCTTAGAAGAATGTCAAAGTCCTAAAGAACTTATACAACCCTTTTATAAAGCGGGAAAAGTTTCATTTTACCACGGAGATTTAGATGTTTTGATTAACTTTCTTGAGCCAGATGTTGTTGTTAATGCTGCTAATGGTGACCTTAGGCACACAGGGGGTGTTGCTAGGGCTATCGATGTATTCACAGGTGGCAAGTTAACAAAACGCTCTAAAGAATATCTTAAATCTAACAAAACAATAGCTCCTGGTAATGCTGTGCTTTTTGAAAACGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTGAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGACAGTAGAGTTGAAGGTAAACTCTGTAATGTCTACAAAGCAGTTGCTAAGTGTGATGGTAAGATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATCTTTAAAGTCAAGCTGGAAGTTTCATTGCAGTGTCTACTTAAAACTGTCACAGATAGAGAGTTAAATGTCTTTGTTTACACTGACCAAGAGAGAATTACCATAAAAAATTTTTTCAATGGTACCATCCCTGTCAAGGTAACAGAAGACACTGTGAATCAAAAGCGTGTGTCTGTAGCACTTGATAAAACTTATGGTGAGCAACTCAAAGGAACTGTTGTTATTAAGGATAAAGATGTCACTAACCAGTTGCCAAGTGTGTCAGATGCCGGTGAAAAAATTGTTAAGGCATTGGATGTTGATTGGACTGCTTACTATGGTTTTCCAAATGCAGCAGCTTTTAGCGC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Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-7
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,296
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578159
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate HC-7, complete genome
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Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-8
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,265
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578154
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate HC-8, complete genome
CGATCTGGAGAGAGAAAGGGACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACATCAGTTTGGCAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGACGCACCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTACCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCCTTTCCGTGACGTGTTGCAGGACATTAAGCACTGCTACCGCAACGGTTTTGAGGGTTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTTTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTGCAGGGTTTCATTGTTAGAGCTAACTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCCCGTACTGGAAATGGCGCCATATATGTAGACCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATCGAAGGTGAGTTTAAGGACTACTTCGGTGATGAGGACGTTATCATTTATGAAGGAGAAGAGTATCATTGTGCCTGGTTAACTGTGCGCGATGAAAAACCTTTGTGTCAACAAACTCTCCTCACAATTAGGGAAATCCAATACAATATGGATATCCCACATAAGTTGCCAAATTGTGCTATTAGAGAGGTAGCACCGCCAGTCAAGAAGAACTCTAAAGTTGTTCTTTCTGAAGATTACAGAAAACTTTATGATGTCTTCGGTTCACCATTTATGAGTAATGGGGATAGTCTTAACAAGTGTTTTGCTAGTCTCCACTTCATCGCTGCTGCTCTTAAGTGTCCTTGTGGCGCTGAAAGTAGTGGTGTTGGTGACTGGACTGGCTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACACTGGGTGCTGTTAAGCCGGGTGATGCTGTTGTCACTAGCATGAGTGCTGGCAAGGGTGTAAAATTCTTTGCCAATAGTGTGCTCCAATATGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCTGTTTGGAAAGTTGTTAAAACTTTCACTGTTAGTGAGACTGTTTGCACCACTGATTTTGAAGGCGAATTTAACGACTTCATTAAACCAGAGAGTACTTCGCCTGTTTCATGCTCCATTAAGAAAGCTTTTATCACTGGCGAAGTTGATGATGCAGTCCATGACTGTATTATCACGGGAAAGTTGGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAGTGCTAACCTGCTTTTTAAGAAGACGCCCTGGTTTGTGCAAAAGTGTGGTGCAATTTTTGCTGATGCTTGGAAAGTTGTTGAGGAACTGCTTTGTTCCCTTAAACTTACATACAAGCAAATTTACGATGTGGTGGCATCTCTCTGCACTTCTGCTTTTACTATTATGGATTACAAACCTGTGTTTGTAGTTTCATCTAATAGTGTTAAGGATCTCGTTGACAAGTGTGTTAAAATTCTTGCGAAGGCTTTTGATGTTTTCACACAGACTATTACAATCGCAGGTGTAGAGGCCAAGTGCTTTGTGCTTGGTTCTAAATACTTGCTTTTTAATAATGCACTTGTCAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGACAGAAGGGTCTTGATAGTGCATTCTTTGCCACTAATTTAATTGGTGCTACTGTTAATGTTACACCACAGAGGACTGAGGCTGCTAACATTAGTCTGAATAAAGTAGATGATGTTGTTACACCAGGTGTAGGTCATATCGTCATCATTGGTGATATGGCTTTTTACAAGAGTGAAGAATATTATTTTATGATGGCAAGCCCTGATTCGGTCCTTGTTAATAACGTTTTTAAAGCAGCTCGAGTGCCATCTTATAACATTGTTTACAATGTGGATGATGCTACCAAGAGTGATATGTTATCTAAAATTGGAGCATCATTCGAATTTGATGGTGATGTGGATGCTGCTATTGCTAAGGTTAATGACTTACTTGTTGAGTTCAGACGAGAAAAACTTTGTTTTAGAGCACTTAAGGATGGTGAGAGTATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAGAAATACAAAATGCCAATCTGTCTCAAAAATCACATTGGTTTATGGGACATCATAAGACGCGATTCTGACAAGAAGGGGTTTCTTGACACTTTCAGCCAGCTTAATGAATTGGAAGATGTCAAGGATGTAAAAATTCAGGCCATTAAAAACATTCTTTGTCCTGACCTTCTGCTTGAATTAGACTTTGGTGCAATCTGGTATAGATGTATGCCCACATGCTCTGACACATCTGTCTTAAGTAATGTCAAAATTATGCTAGGTAATGGTGTTAAAGTGGTTTGTGATGGTTGTCACAGTTTGGCTAACCGTTTAACAGTTAACTATAGCAAACTGTGTGACACTGCCCGTAAAGATGTTGAAATTGGTGGAATACCATTTACCACGTTTAAGACACCAGTTAGCCGCTTCATTGACATGAGAGATGCCATTTATTCTGTAGTTGAATACGGTGAGGCATTATCTTTTAAGAATGCAAGTGTGCCTGTAACTAATAGTAGTATTGTCAAAAATGACGACTGGTCAGAACCCATTTTGTTGGAACCTGCGGACTATGTTGAACCTAAGGACAATGGCGATGTAATTGTCATTGCTGGATACACCTTTTATAAGGATGAAGATGATCATTTTTATCCATATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTACAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCAGTCTCATTTGCAGACAATGTTAGTGTTAAAGAGATACAACCTGTTACACGTGTCAGGCTAGAGTTTGAGTTTGACAATGAAGTGGTAACACAGGTGCTTGAAAAAGTCATTGGTACTAAATACAAGTTTACAGGTACAACTTGGGAGGAGTTTGAAGATGCTATCACAGCAGAACTTGACAGAATCTTTGACACGCTTGCTGAACAGGGTGTGCAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACATGCGGTGGCTTTGACATTAATAATCCAGATGGTGTTATGATCTCACAATATGATCTTAATACAGCTGTTGATGACAAAAGCGACTCTGATATAAGCGTGGAAGACATCTCTTCGCCTTCTGACAATGAAGATGTTGAGCAAATTGAAGAAGATGTTGTTGCAACTGCTAATGTTGAAGATTTTGTCGAACAAGTTTCTCCTGTGGAGGAAAACAGTGGTGAACGGTTTTCCGCAGTAGAAGAAAATGTTGAAGTCTCTGCCAAAGATGACCCGTGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGTCACCTTTTAGAACAACAGATCTTAATGGTAAAATTATACTTAAACAACAAGATAACAATTGTTGGGTTAATGCTTGCTGTTACCAACTGCAAGCCTTTGATTTCTTCAAGCATGATCTGTGGGACAATTTTAAGAATGGCGATGTCATGCCTTTCGTGAATTTTTGTTATGCAGCCTTGACTTTACAGCAGGGTGCATCTGGAGATGCAGAATACCTTTTGGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTCACACTTAGTGCTAAGTGTGGCTGTGGTGTTAAAGAGATAGTTTTAGAACGCACTGTGTTTAAACTCACACCTCTTAAGAATGAGTTTAAATATGGTGTTTGTGGTGATTGTAAACAAATTAACATGTGTAAGTTTGCTAGTGTAGAAGGTTCTGGTGTTTTTGTTCATGATAGAATAGAAAAACAAACACCAGAGTCACAATTCATTGTGACGCCTACCATGCATGCAGTTTACACAGGTACGTTACAGAATGGTCATTACATGGTTGAAGATTGCATTCATGATTACTGTGTGGATGGTATGGGAATTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACTTTGTTTCTTAATGCAAATGTAATGACAGCTGAATCTAAAACTAAAATTGAACCGCATGTGCCCGCTAAGGATGTAGCAGAAGAACCTCAAAGTCCTAAAGATATCTTAACACCCTTTTATAAGGCGGGAAAAGTTTCATTCTACCAAGGAGAGTTGGATGTTTTGATTAACTTTCTTGAACCTGACGTCGTTGTTAATGCTGCTAATGGCGATCTTAGGCATGTGGGTGGCGTTGCTAAAGCCATTGATATGTTTACAGGTGGTAAGTTAACAAAACGCTCTAAAGCATACCTTAAATCCAATAGCTCAATAGCTCCTGGTAACGCTGTGCTTTTTGAAAATGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTGAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGACAGTAGAGTTGAAGGTAAACTCTGTAATGTTTATAAAGCAATTGCTAAGTGTGACGGCAAAATACTAACACCACTTATTAGTGTCGGTATTTTTAAAGTCAAGCTGGAGGTCTCATTGCAGTGTCTACTTAAAACTGTCACAGATAGAGAGTTAAACGTCTTTGTTTACACTGACCAAGAGAGAGTTACTATAGAAAATTTCTTCAATGGTACTATCCCTGTCAAGGTAACGGAAGACACTGTGAATCAAAAGCGTGTGTCTGTAGCACTTGATAAGACTTATGGTGAGCAACTTAAAGGAACTGTTGTTATTAAAGACAAAGACGTCACTAACCAGTTGCCAAGTGTGTCAGATGCTGGTGAAAAAGTCGTTAAGGCATTGGATGTTGATTGGAATGCTTACTACGGCTTTTCAAATGCAGCAGCTTTTAGTGCCAGCTCCCATGAAGCTTTTCAGTTT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Feline coronavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-9
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,271
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578135
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate HC-9, complete genome
GAGAGGGAGAACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACCCAGTTTGGTAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGGCGCACCAGGGTTCCGCCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTACCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCCTTTCCGTGACGTACTGCATGAAATTAAGTACTGCTACCGTAACGGTTTTGATGGCTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTCCTTCTTACCGAACCTTCCGTCATGCTGCAAGGCTTTATTGTTAGAGCCAATTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAGTGGCCCGTACTGGAAATGGCGTCACATATGTAGATCAATATATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATTGAGGGTGAGTTTAAGGATTACTTCGGTGATGAGGACATTATCATCTATGAAGGAGAGGAGTACCATTGCGCTTGGTTAACTGTGCGCGATGAAAAACCTTTGTGTCAACAAAATCTCCTTACAATTAGGGAAATCCAATACAATCTGGACATCCCTCATAAGTTGCCAAATTGTGCTATTAGACAAGTAGCACCACCAGTCAAGAAGAACTCTAAGGTTGTTCTTTCTGAAGAGTATAGAAAACTCTATGACATCTTCGGTTCACCATTTATGGGCAATGGAGACAGTCTTAACAAGTGTTTTGCTAGTCTCCATTTCATCGCTGCTACTCTTAAGTGTCCTTGTGGTGCTGAGAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGATTTAAGACCGCTTGTTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACATTAGGTGCTGTTAAGCCAGGTGATGCTGTCATCACTAGCATGAGTGCTGGCAAGGGTGTAAAATTCTTTGCTAATAGTGTGCTCCAATATGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCTGTTTGGAAAGTTATTAAAACTTTCACTGTTAATGAGACTGTTTGCACCACTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCAGAGAGTACTTCACCTGTTTCATGCTCCATTAAGAGAGCTTTCATCACTGGTGAAGTCAATGATGCAGTCCATGACTGTATTATCACGGGAAAGTTGGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAGTGCTAACCTGCTTTTTAAGAAGACACCCTGGTTTGTGCAAAGGTGCGGTGCAATTTTTGCTGATGCTTGGAAAGTTGTTGAGGAACTGCTTTGTTCTCTTAAACTCACATACAAGCAAATCTACGACGTAGTGGCATCACTCTGCACTTCTGCCTTTACTATTATGGATTACAAACCTGTGTTTGTGGTTTCATCTAATAGTGTCAAGAGTCTTGTTGACAAGTGTATCAAAATTCTTGCGAAAGCCTTTGATGTTTTCACACAGACAATTACAATTGCAGGTGTGGAGGCTAAGTGTTTTGTGCTTGGTTCTAAATACTTGCTTTTTAACAACGCACTTGTCAAGCTTGTCAGTGTTAAGATACTCGGCAAGAGACAGAAGGGTCTTGATAGTGCATTCTTTGCCACTAATTTGGTCGGTGCTACTGTCAATGTGACACCACAAAGGACTGAGGCAGCCAACATTAGTTTGAACAAAGTAGATGATGTTGTTACACCAGGTGAAGGTCATATTGTCATTATTGGCGATATGGCTTTTTACAAGAGTGATGAGTACTATTTTATGATGGCAAGCCCCGATTCGGTCCTTGTTAATAATGTTTTTAAAGCAGCTCGCGTGCCGTCTTACAACATCGATTACGATGTTGATGATGATACCAAGAGTAAGATGTTAGTTAAAATTGGAACATCATTTGATTTTGATGGTGATCTCGATGCTGCTATTGTTAAGGTTAATGACCTACTTATTGGATTCAGACAGGAAAAGTTGTGTTTCAGAGCACTTAAGAATGGTGAAAACATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAGAAGTACAAAGTGCCAGCTTGTCTTAAAAACCATGTCGGTTTGTGGGACATTATAAGACGCGATTCTGATAAGAAGGGTTTTCTTGACACTTTCAATCATCTTAATGAATTGGATGATGTCAAGGATGTAAAAATTCAGGCCATTAGAAACATTCTTTGCCCTGACCTTCTGTTAGAATTAGATTTTGGTGCAATTTGGTATAGATGTATGCCAACCTGCTCTGACGTGTCTATCTTGAGTAATGTTAAAATCGTGCTAGGTAATGGTGTTAAAGTGATTTGTGACGGCTGCCATAGTTTTGCTAACCGTTTAACGATTAATTACAACAAACTGTGTGATACAGCTCGTAAAGATGTAGAAATTGGTGGTATACCTTTTTCTACCTTTAAAACACCATCTAGCAGCTTCATTGACATGAAAGATGCCATTTATTCTGTAGTTGAATACGGTGAAGCATTCTCCTTTAAGACTGCAAGTGTGCCTGTAACTAATAGTGGCACTGTCACAACTGACGATTGGTCAGATCCCATTTTGTTAGAACCTGCAGATTATGTAGAACCTAAAGATAATGGTGATGTAATTGTTATTGCTGGATACACCTTCTATAAAGATGAAGATGATCATTTCTATCCATATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTACAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCAGTTTCATTTTCAGATAATGTCAATGTCAAAGAGATACAGCCTGTTACACGTGTCAAGCTAGAATTTGAGTTTGACAATGAGGTGGTAACGCAGGTGCTCGAAAAGGTCATTGGTACTAAATACAAGTTCGCGGGCACAACTTGGGAAGATTTTGAAGAGGCTATCTCTGAAGAACTTGACAGAATCTTTGACACGCTTGCTGAACAGGGTGTAGAACTTGAAGGTTATTTCATTTACGACACCTGTGGTGAGTTTGACATCAATAATCCAGATGGTGTTATGATTTCACAGTATGACCTTAACACAGATGTTGACGTCAAAAGCAACTCCGACACAAGCGTGGAAGATACCTCTTCGATTTCTGACGATGAAGCGGTTGAACAAGTTGAAGAAGAGAATGTCTCAACCGTTGATGTAGAAGCTGTGTCCTCTGTAGAACAAGTTACCACTGTAGAGGATAACTCTGAAGAGCAACTTGCCTCAGTAGAGGAAAAAATTGAAGTCTCTGCTAAAAATGATCCATGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGACACCATTCAGGACAACAAATCTTAATGGTAAAATCATACTTAAACAACAAGATAATAATTGTTGGGTAAATGCTTGCTGCTATCAATTGCAAGCGCTTGATTTTTTCAACCATGAGTTGTGGGATGGTTTTAAGAAAGGTTATGTTATGCCTTTTGTAGACTTTTGCTATGCAGCTTTAACTTTGAAGCAGGGTGATTCAGGGGATGCAGAATACCTTTTGGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTCACACTTAGTGCTAAGTGTGGCTGTGGTGTTAAAGAGATAGTTTTAGAGCGAACTGTGTTTAAACTCACACCTCTTAAGAATGAGTTTAAATATGGTGTTTGTGGTGATTGTAAACAAATTAATATGTGTAAGTTTGCTAGTGTGGAAGGTTCTGGTGTTTTTGTTCATGATAGAATTGAAAAACAAACACCAGAGTCACAATTCATTGTGACGCCTGTCATGCACGCAGTTTACACAGGTACAACACAGAGTGGTCATTACATGATTGACGATTGCATTCAAGATTACTGTGTGGATGGTATGGGAATTAAGCCTCGTAAACATAGATTTTACACATCCACTTTGTTTCTTAATGCAAGTGTAGCTAAATCTAAGACCACGGTTGAACCACTTGTTCCCGGAAAGGAAGAATGTGTAGAAGACCGTCAAAGTCCTAAAAGTCCTATATTACCCTTTCATACAGCGGGAAAAGTTTCATTTTACCAAGGAGATTTAGATGTTCTGATTAACTTCATTGAACCTGACGTCATAGTTAACGCTGCTAATGGCGACCTTAGGCACACAGGTGGCGTTGCCAAAGCCATTGACGTGTTCACAGGCGGTAAGTTGACGAAACGTTCTAAAGAATATCTTAGCACTAATAAATCAATAGCTCCTGGTAATGCTGTACTTTTTGAAAACGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTGAATGCTGTAGGACCACGTAGTGGTGACAGTAGAGTTGAAGGTAAACTCTGTAATGTCTACAAGGCAATTGCCAAGTGTGATGGCAAAATACTCACACCACTTATTAGTGTCGGTATTTTTAAAGTCAAGCTGGAAGTTTCATTGCAGTGTTTACTTAAAACTGTCACAGACAGAGAGTTGAATGTCTTTGTTTACACTGACCAAGAGAGAACTACTATAGAAAATTTTTTCAATGGTACTATCCCTGTCAAGGTAACGGAAGACACTGTGAATCAAAAGCGTGTGTCTGTAGCACTTGATAAGACTTATGGTGAGCAACTTAAAGGAACTGTTGTTATTAAAGACAAAGACGTTACTAACCAGTTGCCAAGTGTGTCAGATGCTGGTGAAAAAGTCGTTAAGGCATTGGATGTTGATTGGAATGCTTATTACGGCTTTTCAAATGCAGCAGCTTTTAGTGCCAGCTCCCACGAAGCTTATAAGTTTGAAGTTGT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21,824
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Feline coronavirus
Van Brussel,K., Wang,X., Shi,M., Carrai,M., Feng,S., Li,J., Holmes,E.C., Beatty,J.A., Barrs,V.R.
University of Sydney, Science
Australia
2022-11-30
HC-10
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,258
GenBank
null
Australia
Australia
Felis catus
feces
2018
SAMN28578160
PRJNA841246
MAG: Feline coronavirus isolate HC-10, complete genome
TTCCGATCTGGGAGGACGGGACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGAAACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACATCAGTTTGGCAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGACGCACCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTACCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCCTTTCCGTGACGTGTTGCAGGACATTAAGCACTGCTACCGCAACGGTTTTGAGGGTTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTTTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTGCAGGGTTTCATTGTTAGAGCTAACTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCCCGTACTGGAAATGGCGCCATATATGTAGACCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATCGAAGGTGAGTTTAAGGACTACTTCGGTGATGAGGACGTTATCATTTACGAAGGAGAAGAGTATCATTGTGCCTGGTTAACTGTGCGCGATGAAAAACCTTTGTGTCAACAAACTCTCCTCACAATTAGGGAAATCCAATACAATATGGATATCCCACATAAGTTGCCAAATTGTGCTATTAGAGAGGTAGCACCGCCAGTCAAGAAGAACTCTAAAGTTGTTCTTTCTGAAGATTACAGAAAACTTTATGATGTCTTCGGTTCACCATTTATGAGTAATGGGGATAGTCTTAACAAGTGTTTTGCTAGTCTCCACTTCATCGCTGCTGCTCTTAAGTGTCCTTGTGGCGCTGAAAGTAGTGGTGTTGGTGACTGGACTGGCTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACACTGGGTGCTGTTAAGCCGGGTGATGCTGTTGTCACTAGCATGAGTGCTGGCAAGGGTGTAAAATTCTTTGCCAATAGTGTGCTCCAATATGCTGGTGATGTGGAAAATGTCTCCATTTGGAAGGTTGTTAAAACCTTCACTGTTAATGAGACCGTTTGCACCACTGACTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCGTTAAACCAGAGAGTACTTCACCTGTTTCATGCTCCATTAAGAGGGCATTCATCACTGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGATTGTATCATCACGGGAAAGTTAGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAATGCTAACTTGCTTTTTAAGAAAACACCCTGGTTTGTGCAAAAGTGTGGTGCGATCTTTGCTGATGCTTGGAAGATCGTTGAGGAACTGCTCTGTTCGCTCAAACTTACATACAGGCAAATTTATGATGTAGTGGCATCTCTCTGCACTTCTGCTTTTACTATTATGGATTACAAACCTGTGTTTGTAGTTTCATCTAATAGTGTTAAGGATCTAGTTGACAAGTGTGTTAAAATTCTTTCGAAGGCTTTTGATGTCTTCACACAGACTATTACAATTGCAGGTGTGGAGGCCAAGTGCTTTGTGCTTGGTTCTAAATACTTGCTCTTTAACAACGCACTTGTTAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGACAAAAAGGCCTTGATAGTGCATTCTTTGCCACTAACCTAATTGGTGCCACTGTTAATGTGACACCACAAAGGACTGAGGCAGCCAACATTAGTTTGAATAAAGTAGACGATGTTGTCACACCAGGTGCGGGTCATATCGTCGTTGTTGGCGACATGGCTTTCTACAAGAGTGAAGAGTACTATTTTATGATGGCAAGCCCTGATTCGGTCCTTGTTAATAACGTTTTTAAAGCAGCTCGAGTGCCATCTTATAACATTGTTTACAATGTGGATGATGCTACCAAGAGTGATATGTTATCTAAAATTGGAACATCATTCGAATTTGATGGTGATGTGGATGCTGCTATTGCTAAGGTTAATGACTTACTTGTTGAGTTCAGACGAGAAAAACTTTGTTTTAGAGCACTTAAGGATGGTGAGAGTATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAGAAATACAAAATGCCAATCTGTCTCAAAAATCACATTGGTTTATGGGACATCATAAGACGCGATTCTGACAAGAAGGGGTTTCTTGACACTTTCAGCCAGCTTAATGAATTGGAAGATGTCAAGGATGTAAAAATTCAGGCCATTAAAAACATTCTTTGTCCTGACCTTCTGCTTGAATTAGACTTTGGTGCAATCTGGTATAGATGTATGCCCACATGCTCTGACACATCTGTCTTAAGTAATGTCAAAATTATGCTAGGTAATGGTGTTAAAGTGGTTTGTGATGGTTGTCACAGTTTGGCTAACCGTTTAACAGTTAACTATAGCAAACTGTGTGACACTGCCCGTAAAGATGTTGAAATTGGTGGAATACCATTTACCACGTTTAAGACACCAGTTAGCCGCTTCATTGACATGAGAGATGCCATTTATTCTGTAGTTGAATACGGTGAGGCATTATCTTTTAAGAATGCAAGTGTGCCTGTAACTAATAGTAGTATTGTCAAAAATGACGACTGGTCAGAACCCATTTTGTTGGAACCTGCGGACTATGTTGAACCTAAGGACAATGGCGATGTAATTGTCATTGCTGGATACACCTTTTATAAGGATGAAGATGATCATTTTTATCCATATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTACAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCAGTCTCATTTGCAGACAATGTTAGTGTTAAAGAGATACAACCTATTACACGTGTCAGGCTAGAGTTTGAGTTTGACAATGAAGTGGTAACACAGGTGCTTGAAAAAGTCATTGGTACTAAATACAAGTTTACAGGTACAACTTGGGAGGAGTTTGAAGATGCTATCACAGCAGAACTTGACAGAATCTTTGACACGCTTGCTGAACAGGGTGTGCAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACATGCGGTGGCTTTGACATTAATAATCCAGATGGTGTTATGATCTCACAATATGATCTTAATACAGCTGTTGATGACAAAAGCGACTCTGATATAAGCGTGGAAGACATCTCTTCGCCTTCTGACAATGAAGATGTTGAGCAAATTGAAGAAGATGTTGTTGCAACTGCTAATGTTGAAGATTTTGTCGAACAAGTTTCTCCTGTGGAGGAAAACAGTGGTGAACGGTTTTCCGCAGTAGAAGAAAATGTTGAAGTCTCTGCCAAAGATGACCCGTGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCCTTGTCACCTTTTAGAACAACAGATCTTAATGGTAAAATTATACTTAAACAACAAGATAACAATTGTTGGGTTAATGCTTGCTGTTACCAACTGCAAGCCTTTGATTTCTTCAAGCATGATCTGTGGGACAATTTTAAGAATGGCGATGTCATGCCTTTCGTGAATTTTTGTTATGCAGCCTTGACTTTACAGCAGGGTGCATCTGGAGATGCAGAATACCTTTTGGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTCACACTTAGTGCTAAGTGTGGCTGTGGTGTTAAAGAGATAGTTTTAGAACGCACTGTGTTTAAACTCACACCTCTTAAGAATGAGTTTAAATATGGTGTTTGTGGTGATTGTAAACAAATTAACATGTGTAAGTTTGCTAGTGTGGAAGGTTCTGGTGTTTTTGTTCATGATAGAATAGAAAAACAAACACCAGAGTCACAATTCATTGTGACGCCTACCATGCATGCAGTTTACACAGGTACGTTACAGAATGGTCATTACATGGTTGAAGATTGCATTCATGATTACTGTGTGGATGGTATGGGAATTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACTTTGTTTCTTAATGCAAATGTAATGACAGCTGAATCTAAAACTAAAATTGAACTGCATGTGCCCGCTAAGGATGTAGCAGAAGAACCTCAAAGTCCTAAAGATATCTTAACACCCTTTTATAAGGCGGGAAAAGTTTCATTCTACCAAGGAGAGTTGGATGTTTTGATTAACTTTCTTGAACCTGACGTCGTTGTTAATGCTGCTAATGGCGATCTTAGGCATGTGGGTGGCGTTGCTAAAGCCATTGATATGTTTACAGGTGGTAAGTTAACAAAACGCTCTAAAGCATACCTTAAATCCAATAGCTCAATAGCTCCTGGTAACGCTGTGCTTTTTGAAAATGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTGAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGACAGTAGAGTTGAAGGTAAACTCTGTAATGTTTATAAAGCAATTGCTAAGTGTGACGGCAAAATACTAACACCACTTATTAGTGTCGGTATTTTTAAAGTCAAGCTGGAGGTCTCATTGCAGTGTCTACTTAAAACTGTCACAGATAGAGAGTTAAACGTCTTTGTTTACACTGACCAAGAGAGAGTTACTATAGAAAATTTCTTCAATGGTACTATCCCTGTCAAGGTAACGGAAGACACTGTGAATCAAAAGCGTGTGTCTGTAGCACTTGATAAGACTTATGGTGAGCAACTTAAAGGAACTGTTGTTATTAAAGACAAAGACGTCACTAACCAGTTGCCAAGTGTGTCAGATGCTGGTGAAAAAGTCGTTAAGGCATTGGATGTTGATTGGAATGCTTACTACGGCTTTTCAAATGCAGCAGCTTTTAGTGCCAGCTCCCATGAAGCTTTTCAGTTT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21,825
MW308128.1
Feline coronavirus
Tekes,G., Ehmann,R., Hain,T., Ziebuhr,J.
Justus Liebig University Giessen, Institute of Medical Virology
Germany
2022-04-17
VP1a
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,294
GenBank
null
Germany: Kassel
Germany
Felis catus
null
2006
null
null
Feline coronavirus isolate VP1a, complete genome
ACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGACACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACCCAGTTTGGCAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGGCGCGCCAGGGTTCCGCCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTATCAAGTCAACGTGCCTAGCCTTCCTTTCCGTGACGTACTGCATGACATTAAGTACTGCTATCGTAACGGTTTTGGTGGCTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGCCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGTTGCAGGGCTTTATTGTTAGAGCCAATTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCCCGTACTGGAAACGGTGCCATATATGTAGACCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATTGAAGGTGAGTTTAAGGATTATTTCGGTGATGAGGACGTTATCATCTATGAAGGAGAGGAGTACCATTGTGCATGGCTAACTGTGCGCGATGAAAAACCTTTGTGTCAACAAACTCTCCTCACAATTAGGGAAATCCAATATAATCTGGACGTCCCACACAAGTTGCCAAATTGTGCTATTAGAGAAGTAGCACCACCAGTCAAGAAGAACTCTAAGGTTGTTCTATCTGAAGAGTATAGAAAACTCTATGACATCTTTGGTTCACCATTTATGGGCAATGGGGACAGTCTTAACAAGTGTTTTGACAGCCTCCACTTCATTGCTGCCACTCTTAAGTGTCCGTGTGGCGCTGAAAGTAGTGGTGTTGGTGACTGGACTGGTTTTAAGACTGCTTGCTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACACTAGGTGCTGTCAAACCTGGTGATGCTGTTATCACTAGCATGAGTGCTGGCAAGGGTGTAAAATTCTTTGCTAATACTGTGCTCCAATATGCTGGTGATGTGGAAAGTGTCTCTGTTTGGAAAGTGATTAAGACTTTCACTGTTAACGAGACCGTTTGCACCAATGATTTTGAAGGAGAATTGAACGACTTCATTAAACCAGAGAGTACTTCACCTGTTTCATGCTCCATTAAGAGAGCTTTCATCACCGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGATTGTATTATCACTGGAAAGTTGGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAGTGCTAACCTACTTTTTAAGAAAACACCCTGGTTTGTGCAAAAGTGTGGTGCAATTTTCACTGATGCTTGGAAAGTTATTGAAGAACTGCTTTGTTCTCTTAAACTTACGTACAAGCAAATCTATGATGTAGTGGCATCACTTTGCACTACTGCTTTCACTATTATGGACTACAAACCTGTGTTTGTGGTGTCGTCTAATAGTGTCAAGGACCTCGTCGACAAGTGTGTTAAGATTCTTGTGAAAGCCTTTGATGTCTTCACACAAACAATTACAATCGCAGGTGTAGAAGCTAAGTGTTTTATCCTTGGTTCTAAGTACTTGCTTTTTAATAATGCACTTGTTAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGCGGCAAAAAGGTCTTGATAGTGCATTTTTTGCTACTAATTTGATTGGTGCTACTGTTAATGTGACACCACGACGAACTGAGGCTGCTAACATTAGTTTGAATAAAGTAGATGATGTTGTCACACCAGGTGAAGGTCATATTGTCATCATTGGTGATATGGCTTTTTACAAGAGTGAAGAATATTACTTTATGATGGCAAGCCCTGATTCGGTCCTTGTTAATAATGTTTTTAAAGCAGCTCGAGTGCCATCTTATAACATTGTTTATGATGTTGATGACGACACCAAGAATAAAATGGTAGTTAAAATTGGAACAACATTTGATTTTGATGGTGACCTCGATGCTGCTATTGCTAAGGTTAATGACTTACTTGTTGAGTTTAAACAAGAAAAGTTGTGTTTCAGAGCACTTAAGGATGGTGAAAACATCTTGGTTGAGGCATACCTTAAGAAGTACAGAATGCCAGTGTGTCTTAAAAACCATGTTGGCTTGTGGGACATTATAAGACGTGATTCTGATAAGAAGGGATTTCTTGACACTTTCAATCATCTTAATGAATTGGAGGATGTCAAGGATGTAAAAATTCAGGCCATTAAAAACATTCTTTGTCCTGATCTTCTGCTTGAATTGGACTTTGGTGCAATATGGTACAGATGTATGCCAACCTGCTCAGATGTGTCTATTTTGGGTAATGTTAAAATTATGCTAGGTAATGGTGTTAAAGTGATTTGTGATGGCTGTCATAGCTTTGCTAATCGTCTAACAATTAACTATAATAAACTGTGTGATACAGCTCGTAAAGACATTGAAATTGGTGGTATACCATTTTCCACCTTTAAAACACCATCTAGCAATTTCATTGATATGAAAGATGCCATTTATTCTGTAATTGAATACGGTGAGGCATTCTCATTTAAGACTGCAAGTGTGCCCGTAACTAATAGTGGTACTGTGAAAAATGACGACTGGTCAGATCCCATTTTGTTAGAACCTGCAGATTATGTTGAACCTAAAGACAATGGCGATGTAATTGTCATTGCTGGATACACCTTTTACAAGGATGAAGATGATCATTTTTATCCATATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTATAACAAGATGGGTGGTGGTGACAAGTCGGTTTCGTTTTCAGATAATGTTGATGTTAAAGAGATAACACCTGTTACACGTGTTAAGCTCGAGTTTGAGTTTGACAATGAAGTGGTAACACAGGTGCTTGAAAAAGTTATTGGTACTAAATATAAGTTCATGGGCACAACTTGGGAAGAGTTTGAAGATGCTATCTCTGAGGAACTTGATAAGATATTTGACACGCTTGCTGAACAAGGTGTAGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACTTGTGGTGGATTTGACATTAACAACCCAGATGGTGTTATGATCTCACAGTATGATCTTAACACAGATGCTGATGATAAAACTGAATCCGATGCAAGTGTGGAAGACATCTCTTCGATTTCTGACAATGAAGATGTTGAACAAATCGATGAGAATAATGATTCAGCTGTGGCTGCTGAAGGTGTTTCATCTGTAGAAGGAGAGATTTCAGTTGCCAATGTTGAAGAATTTGTTGAACAAGTTTCTCTTGTAGAGGAAAGTAGTGTTTTGACTCCCGTTGTATTAGAAGAAAAAGTTGCAGTCCCTGCTAAAAATGACCCGTGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACAACCTAAACCTTCATCGACACCATTTAAGACAACAAATCTTAATGGTAAAATCATACTTAAACAACAAGATAATAATTGTTGGATAAACGCTTGCTGTTATCAATTGCAAGCCTTTGATTTCTTCAACCACGATTTGTGGGATGGTTTTAAGAATGATGATATTATGCCTTTCGTTAATTTTTGTTATGCAGCTCTGACTTTGAAGCAGGGTGATTCAGGGGATGCAGAATACCTTTTGGAGATGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTCACACTTAGTGCTAAGTGTGGCTGTGGTGTTAAAGAGATAGTTTTAGAACGAACTGTGTTTAAGCTCACACCTCTTAGGAATGAGTTTAAATATGGTGTCTGTGGTGACTGTAAGCAAATTAATATGTGTAAATTTGCTAGCGTGGAGGGTTCAGGTGTTTTTGTTCATGACAGAATTGAAAAACAAACACCTGAATCACAATTTATTGTGACACCTACTATGCATGCAGTTTACACAGGTACAACACAGAATGGTCATTACATGATTGATGATTGCATTCATGATTATTGTGTGGATGGTATGGGAATTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACTTTGTTTCTTAATGCAAACGTAATGACAGCGGAGTCTAAAATTATAGTTGAACCACCTGTGCCCGTAAAGGATAATTGCTTAGAAGAATGTCAAAGTCCTAAAGCTCTTGTATTACCCTTTTATAAAGCGGGAAGAATCTCATTTTACCAAGGAGATTTAGACGTTTTGATTAATTTTCTTGAGCCCGACGTCATTGTTAACGCTGCTAATGGTGATCTTAAACACATGGGTGGAGCTGCTAAAGCTATTGATGTATTCACAGGTGGTAAGTTAACAAAACGTTCTAAAGAATACCTTAAGTCTAACAAAGCCATAGCTCCTGGTAATGCTGTGCTTTTTGAAAATGTACTTGAGCATCTTAGTGTGTTGAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGACAGTAGAGTCGAAGGTAAACTCTGTAATGTCTACAAAGCAATTGCTACGTGTGATGGTAAGATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATCTTTAAAGTTAAGCTGGAAGTCTCATTGCAGTGTCTACTTAAAACTGTCACAGATAGAGCTTTAGATGTCTTTGTTTACACTGACCAGGAGAGAATTGCCATAGAAAATTTTTTCAATGGTACTATTCCTGTCAAGGTAACGGAAGACAATGTGAATCAAAAGCGTGTGTCTGTAGCACTTGATAAAACTTATGGTGAGCAACTTAAAGGAACCGTTGTTATTAAAGACAAAGACGTCACCAACCAGTTGCCAAGTGTGTCAGATGTTGGTGAACGAGTTGTTAAAGCATTGGATGTTGATTGGAATGCTTACTATGGTTTCTCAAATGCAGCGGCTTTTAGT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China
China
Felis catus
abdominal cavity
2016
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Feline coronavirus strain ZJU1617, complete genome
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Feline coronavirus
Zheng,X., Lu,S., Zhu,G.
Key Laboratory of Animal Virology Ministry of Agriculture, College of Animal Science
China
2021-03-10
null
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,303
GenBank
null
China
China
Felis catus
abdominal cavity
2017-09
null
null
Feline coronavirus strain ZJU1709, complete genome
ACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATAACTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTCTCTATGACACCATAGAAGACAAGCGTTGATTATTTCACTCAGTTTGGCAATCACTCCTAGGAACGGGGTTGAGAGAACGGCGCGCCAGGGTTCCGCCCCTGTTTGGTAAGTCGTCTAGTATTAGCTGCGGCGGTTCCGCCCGTCGTAGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTTAAGATCCTCGTTAATGAGGACTATCAAGTCAACGTGCCTAACCTTCCTTTCCGTGACGTGCTGCAGGAAATTAAGTATTGCTACCGTAACGGTTTTGATGGCTATGTTTTCGTGCCTGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTGGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTTCTCCTTACCGAACCTTCCGTCATGCTGCAGGGTTTCATTGTTAGAGCCAACTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCCCGTACTGGAAATGGTGCCATATATGTAGATCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAGCCAGTTATTGACGGTGAGTTTAAGGACTACTTCGGTGATGAGGACGTTATCATCTATGAAGGAGAGGAGTACCATTGTGCCTGGCTAACAGTGCGCGATGAAAAACCTTTGTGTCAACAAACTCTCCTCACAATTAGGGAAATCCAATACAACATGGATATTCCACATAAGTTGCCAAATTGTGCTATCAGAGAGGTAGCACCACCAGTCAAGAAGAACTCTAAGGTTGTTCTTTCTGAAGAGTATAAAAAGCTCTATGACATCTTCGGTTCACCATTTATGGGCAATGGGGACAGTCTTAACAAGTGTTTTGACAGCCTCCATTTCATTGCTGCCACCCTTAAGTGTCCTTGTGGATCTGAAAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGTTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTCATGGCAAAGTTAAAGGTGTCACATTAGGTGCTGTTAAACCAGGTGATGCTGTTATCACTAGCATGAGTGCCGGCAAGGGTGTAAAATTCTTTGCTAATAGTGTACTCCAACATGCTGGTGATGTGGAAAATGTCTCTGTTTGGAAAGTGATTAAAACTTTCACTGTTAATGAGACTGTTAGCACCGCTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCAGAGAGTACTTCACCTGTTTCATGCTCCATTAAGAGAGCTTTCATCACAGGTGAAGTTGATGATGCAGTCCATGATTGTATTATCACGGGAAAGTTGGACCTTAGTACTAATCTGTTTGGTAGTGCTAACCTACTTTTTACGAAAACACCCTGGTTTGTGCAAAAGTGTGGTGCGATCTTTGCTGATGCTTGGAAAGTTATTGAAGAACTGCTTTGTTCTCTTAAACTTACATACAAGCAAATTTATGATGTAGTGGCATCACTTTGCACTTCTGCCTTCACTATTATGGACTACAAGCCTGTGTTTGTAGTATCGTCTAATAGTGTCAAGGATCTCGTCGACAAGTGTGTTAAGATTCTTGTGAAGGCCTTTGATGTCTTCACACAGACAATTACCATTGCAGGTGTAGAGGCTAAGTGCTTTATCCTTGGTTCTAAATACTTGCTTTTTAATAACGCACTTGTCAAGCTTGTCAGTGTTAAAATACTTGGCAAGAGACAGAAAGGTCTTGATAGTGCATTCTTTGCTACTAACTTAATTGGTGCTACTGTCAACGTGACACCACAGAGGACTGAGGCTGCTAACATTAGCCTGAATAAGGTGGATGATGTTGTTACACCAGGTGAGGGTCATATTGTCATAATTGGTGATATGGCTTTTTACAAGAGTGATGAATACTATTTTATGATGGCAAGCCCTGACTCGGTCCTTGTTAATAATGTCTTTAAAGCAGCTCGTGTGCCGTCTTACAACATTGATTATGATGTGGATGATGACACCAAGAGTAAAATGGTAGTTAAAATTGGAACATCATTTGACTTTGATGGTGACCTAGATGCTGCTATTGTTAAGTTTAATGACTTACTTGTTGAGTTTAGACAAGAAAAGTTGTGTTTCAGAGCACTTAAGGATGGTAAAAACATCTTAGTTGAGGCATACCTTAAGAAATACAAAATGCCAGTTTGTCTTAAAAACCATGTTGGGTTGTGGGACATCATAAGGCGCGATTCTGATAAGAAGGGTTTTCTTGACACTTTCAATCATCTTAATGAATTGGAGAATGTCAAGGATACAAAAATTCAGGCTATCAAAAATATTCTCTGTCCTGACCTTCTACTGGAATTGGATTTTGGTGCAATCTGGTATAGATGCATGCCAACATGTTCAGACATATCCATCCTAGGCAATGTTAGAATTATGCTAGGCAATGGTGTTAAAGTGTTTTGCGAGGGCTGTAACAGTCTTGCCAAACGTTTAACAGTTAGTTACAGCAAACTGTGTGACACAGCTCGTAAAGACATTGAAATTGGTGGTTTACCATTTTCTACCTTTAAAACACCAGCTAGCAGTTTCATTGACATGAAAGATGCTATTTATTCTGTAGTTGAATATGGTGAAGCATTTTCTTTTAAGACTGCAAGTGTGCCCGTAACTAATAGTGGCACTGTGATAACTGACGACTGGTCAGATCCTATTTTGTTAGAACCTGCAGACTATGTTGAACCTAAAGATAATGGCGATGTAATTGTCATTGCTGGATACACCTTCTACAAGGATGAAGATGATCATTTTTATCCATATGGTTCTGGCATGGTTGTGCAGAAGATGTACAACAAGATGGGTGGTGGTAACAAATCAGTTTCCTTCTCAGATGATGTTAATGTTAGAGAGATCGAACCTGTTACACGTGTCAGGCTAGAATTTGAGTTTGACAATGAGGTTGTAACACAGGTTCTTGAAAAAGTCATTGGTACCAAATATAAGTTTACAGGTACCACCTGGGAAGAGTTTGAAGATTCTATCTCTGAGAAACTTGACAACATCTTTGATAAGCTTGCAGAACAGGGTGTAGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACATGTGGTGGATTTGACATTAACAATCCAGATGGTATTATGATCTCACAGTACGATCTTAACACAGATGTTGATGACAAAACTGACTCTGATGCAAGCGTGGAAGACACTGCTTCAATTTCTGACAATGAAGATGTTGAACAAATTGTAGAAGAGACCGTCTCAACTGCCGATGTAGAAGAGGTTTCATCTGTAGAAGAAGAAATTGTAAACGTTGAGAACCCTGCTGAACAAGTCACCCTTGTAGAGGCTAACCTTGATGTGCAACTTTCTGCAGCAGAGGAAAAAGCTGAAGTCACAGCTAGAAATGATCCGTGGGCTGCTGCTGTTGATGAACAGGAAGCTGAACTACCTAAACCTTCCTCGATACCATTCAAGACGACAAATCTTAATGGTAAAATCATACTTAAACAACAAGATAACAATTGTTGGATAAATGCTTGCTGTTACCAACTGCAAGCCTTTGATTTCTTTAATCATGATCTGTGGGAGGCTTTTAAAAAGGGTGATGTCATGCCTTTCGTGAACTTTTGTTATGCAGCCTTAACTTTGAAGCAGGGTGATTCAGGGGATGCAGAATACCTTTTAGAGACGATGCTCAATGATTATAGTACAGCTAAAGTTACACTTAGTGCTAAGTGCGGCTGTGGTGTTAAAGAACTAGTTTTAGAACGAACTGTATTTAAGCTCACACCTCTTAAGAGTGAGTTTAAATATGGTGTCTGTGGTGACTGTAAACAAATTAACATGTGTAAGTTTGCAAGCGTTGAAGGCTCTGGTGTTTTTGTTCATGATAGAATTGAAAAACAAACACCTGTATCACAGTTCATTGTGACACCCACTATGCATGCAGTTTACACAGGTACAACACAGAGTGGCCATTACATGATAGAAGATTGCATTCATGATTACTGCGTGGATGGTATGGGAATTAAACCTCGTAAACATAAGTTTTACACATCCACGTTGTTTCTTAATGCAAATGTAATGACAGCTGAATCTAAAACTAGAGTTGAACCAACTGTACCCGCTAAGGATGAGTGTGTAGAAGAAGAACGTCAAAGTCCTAAAGACCTTTTAACACCCTTTTACAAAGCGGGCAAAGTTTTATTTTACCAGGGAGATTTGGATGTTTTGATTAACTTTCTTGAGCCCGACGTCGTTGTTAACGCTGCTAATGGTGATCTTAAGCACGTAGGTGGCGTTGCTAAAGCTATCGATGTATTCACGGGTGGCAAGTTAACAAAACGCTCCAAGGAGTATCTCAAATCCAATAAATCAATAGCTCCTGGTAATGCCGTGCTTTTTGAAAATGTGCTTGAGCATCTTAGCGTGTTGAATGCTGTAGGACCACGTAATGGTGACAGTAGAGTTGAAGGTAAGCTCTGCAATGTTTACAAAGCAATTGCTAAGTGTGACGGTAAAATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATTTTCAAAGTCAAACTGGAAGTTTCATTGCAGTGTTTACTTAAAACTGTCACAGATAGAGAATTAAATGTCTTCGTTTACACTGACCAAGAGAGAGTTTCCATAGAAAATTTTTTCAATGGTACTATTCCTGTCAAGGTAACGGAAGACAATGTGAATCAAAAGCGTGTGTCTGTAGCACTTGATAAAACCTATGGTGAGCAACTCAAAGGAACTGTTGTTATTAAAGATAAAGATGTTACTAACCAGTTGCCTAGTGTATCAGATGCTGGTGAGAAGGTTGTTAAAGCGCTTGATGTTGATTGGAATGCACATTATGGTTTCCCAAATGCAGCAGCTTTTAGTGCC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43,508
MW030108.1
Feline coronavirus
Wang,G., Peng,G.
Huazhong Agricultural University, State Key Laboratory of Agricultural Microbiology
China
2021-02-17
QS
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
29,234
GenBank
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China
China
Felis catus
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2018-05
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Feline coronavirus isolate QS, complete genome
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National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
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11,700
RefSeq
2
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PRJNA485481
Feline foamy virus DNA, complete genome
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4,243
MW389244.1
Feline foamy virus
Aso,S., Sakaguchi,S., Hashimoto-Gotoh,A., Miyazawa,T.
Institute for Frontier Life and Medical Sciences, Kyoto University, Lab. of Virus-Host Coevolution
Japan
2021-08-08
159
Feline foamy virus
Felispumavirus
Retroviridae
ssRNA-RT
11,683
GenBank
null
Japan
Japan
Felis catus
null
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null
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Feline foamy virus isolate 159, complete genome
GAATTCTCATAGAGGAGAATACTCCCTACTGCCATCTAGTGACGATGAGGAAGAAGAAATGTCAGAAAGAGAGGAATTATTGTGCCATATAAATCAATGTCAACAAAAGCTTTTTTATCCCGGAGGGACGACTGATGTCCTTGGAATAGAAAGCAATATTTGGCTCACTAAATTTGTTAATATTAAATTTCCTAAAGGAACAAAAGTGATACTTCCTGATGGAAGAAAATTCATAGCCTGTGATCCTGAGCTAAAACCATTATTGCAGGAATTGAAATTCTTGGATAGGGCAACATCTGAGTCATCTGACTCTGAATAGAAGGCCTGAATTTACCTAGATTGTGCAACTTTGTCCGAGGTGGCAGAGTGGTTATGTATCTGTCATACTCGGGGAAAGTTTTGTCTTTACATGTTCAAGACATATAAAGGGTGGAAAAATATATTCCTGACTAAACTTCCTGGGGACTAGAGGTGTGGAAACTTTGCTGCCTCTGCTTCACGGGAAGTTTTTGGTTCGAATCCTTTTTTAAGTACTTAGTTAAAATAAGTAGTGAATAAGTTACTCTCGTTCATGTATTCATATCGAAACCATGTATCCTTTAAAACCATGTATTCTTTAGTCATTTAGATACTTAGAGTATGAAAAAAGAAACTGCAATAGTAACTATCAATGTTAGTAAACAAAGTACAGCTTAGTCATCTGATGATGTCACGAGAAGAGAACCTAGAAGAGAAGAACAACTTTCGGCATGCAACAGAGCGGGAGCTTGGTGTAGGAGCTAAGTCACCGTCTTACATCTAGAGCCTACTCTTCTTGAACTGTTCGAATCCTATTTTTGGAACTCTTACATCATCTTTAAGAGACTGAAAAACGTGACTCGTACACAGGAAGCTCCTTTAGGGTAGAGGAAGCGTTCTAATCTCCTATCTTAAAGGGTTGCTTCATTTAAGGTTCGAAACTGTGTACTGGAAGTAGATTTTGCATAACTTTAAACTTTTAGTTGCATGTTTCTGATATTAGCAGCATATAAAAGGGTTATGGTAGATTGTACGGGAGCTCTTCTCACAGACTTGGCTGCGTCCAGGGTGAGATTGAGACTCTCCAGCTTGGGTAAGATTTTGATATGTATTTTGCTTGAATATTATTTGCCTTGCTCAAAAATTAAATAAATTGGCTTTTCTTTCACTCAATTGAAGCTTCATATAATTATATTATTGTCTGAAGCCAGAACTCATATGAGTGGTGTTTCTCTATTCTTGGGGAAAAGTGTTCTTCTATTTGAAAGTGTTAGAGCTACTAAATGAAGAACTAATCTATCCCAGGTATAGGCCACGACAGTTGGCGCCCAACGTGGGGCTCGATTGAGTGAAATTTAAATTAAGCTGAGGAGAACAATCCCTAGGGACCTTACCTTACTGAGGAAGGATGGCTCGAGAATTAAATCCTCTTCAATTACAGCAACTGTATATAAATAATGGCTTACAACCTAATCCAGGACATGGAGATGTTATTGCTGTCAGATTTACAGGAGGACCTTGGGGTCCCGGTGATAGATGGGCCAGAGTGGCAATACGATTACAAGATAACACAGGACAACCTTTACAGGTTCCTGGATATGATTTGGAACCTGGGATAATAAATTTGAGAGAAGATATCTTGATAGCAGGGCCATATAATCTAATAAGAACTGCCTTTTTGGACTTAGAGCCTGCAAGAGGACCTGAAAGACATGGTCCTTTTGGGGATGGCAGATTACAGCCTGGAGATGGTTTATCTGAAGGGTTTCAACCTATCACTGATGAAGAAATACAAGCAGAAGTAGGAACTATTGGTGCTGCTAGAAATGAGATAAGATTATTACGAGAAGCTTTACAGAGATTACAAGCTGGAGGTGTGGGTAGACCTATACCAGGAGCAATTTTACAACCACAACCAGTAATAGGGCCTGTAATACCAATTAATCATCTTAGGTCGGTTATTGGTAATACTCCATCAAATCCACGAGATGTCGCCCTATGGCTTGGAAGATCTACAGCCGCTATTGAAGGGGTATTTCCCATAGTGGACCAAATTACCCGTATGAGGGTAGTCAATGCCTTAGTAGCATCTCATCCCGGCCTAACATTAACTGAGAACGAGGCCGGAAGCTGGAACGCTGCCATATCAGCTTTATGGAGAAAAGCTCACGGTGCTGCAGCTCAGCATGAATTGGCAGGAGTATTAAGTGATATTAATAAAAAGGAAGGTATACAAACTGCATTCAACCTAGGAATGCAATTTACAGATGGAAACTGGTCCTTAGTATGGGGAATAATCAGGACTCTTTTACCAGGACAAGCCCTGGTAACCAATGCTCAGTCACAATTTGACCTAATGGGAGATGATATACAACGAGCGGAGAATTTCCCCAGGGTCATTAATAATTTATACACCATGCTGGGCCTTAATATACACGGGCAGAGCATTAGACCACGGGTACAAACACAGCAGCAACAACCTCGATCACGAAACCAGGGACGATCTCAACAAGGTCAATTAAATCAGCCAAGACCCCAAAATAGAAATAACCAATCTTATAGACCCCCTAGACAACAACAGCAACACTCTGATGTTCCCGAACAGAGAGATCAAAGAGGACCGTTACAACCTCCTCGTGGAAGTGGAGGAGGATATAATTTCAGAAGAAATCCGCAGCAGCCTCAGCGCTACGGCCAAGGACCACCAGGACCAAACCCGTACCGACGATTCGGAGACGGCGGTAATCCTCAACAGCAGGGACCACCACCAAACCGAGGGCCTGATCAAGGACCTCGGCCAGGAGGCAATCCCAGAGGAGGAGGAAGAGGTCAAGGTCCAAGAAATGGAGGAGGAAGCGCTGCCGCAGTACATACAGTAAAAGCGTCCGAAAACGAAACTAAAAATGGATCTGCTGAAGCCGTTGACGGTGGAAAGAAAGGGGGTAAAGATTAAAGGTTACTGGGACTCCCAAGCCGATATTACCTGTGTTCCAAAGGACTTGCTTCAAGAAGAAGAACCTGTTAGGCAGCAAAATGTGACAACTATACATGGAACGCAGGAAGAAGATGTATACTATGTAAATTTAAAAGTAGATGGTAGAAGAATTAATACAGAAGTAATAGGGACAACTTTAGACTATGCTATCATAACTCCTGGAGATGCACCTTGGATTTTGAAAAAACCTTTAGAATTAACTATTAAACTGGATTTAGAAGAGCAACAAAGGACTTTACTTAACAATTCCATTTTATCTAAAAAAGGGAAAGAAGAATTAAAACAATTGTTTGAGAAATATAATGCCTTGTGGCAAAGCTGGGAGAATCAGGTGGGTCATAGAAAAATTAGGCCACATAAAATAGCAACTGGTACGGTAAAACCCACACCTCAGAAACAGTATCATATTAATCCAAAAGCAAAACCTGATATCCAGATTGTAATTAATGATTTACTAAAACAAGGGGTACTAATTCAAAAAGAAAGTACTATGAATACTCCTGTCTACCCAGTACCCAAGCCAAATGGCCGCTGGAGAATGGTACTGGACTACAGAGCAGTAAATAAAGTCACACCTTTGATAGCTGTACAAAATCAACACTCGTATGGAATTTTAGGAAGCCTTTTTAAAGGTAAATATAAAACTACAATTGATTTATCCAATGGTTTCTGGGCACACCCCATTGTCCCAGAGGATTATTGGATTACTGCATTCACTTGGCAAGGAAAACAATATTGTTGGACTGTTTTACCACAAGGCTTTCTGAATAGCCCTGGATTGTTTACTGGAGATGTTGTGGACCTCCTGCAGGGGATTCCCAATGTGGAAGTCTATGTGGATGACGTATATATTAGTCATGACTCTGAAAAAGAACATTTGGAATATCTGGATATTTTGTTTAACAGATTAAAAGAAGCAGGATATATAGTATCTCTCAAAAAATCCAATATTGCCAATTCTATTGTGGATTTTCTTGGCTTTCAGATAACTAATGAAGGCCGAGGCCTAACAGATACTTTTAAAGAAAAATTGGAAAATATTACTGCCCCTACCACTCTTAAACAATTGCAAAGCATACTAGGTCTTTTAAATTTTGCCAGGAATTTTATTCCTGATTTTACTGAATTAATTACTCCTTTATATGCATTGATACCAAGGTCTACCAAGAATTATGTTCCTTGGCAAATGGAACATTCAACCACTCTGGAAACTTTAATTGCTAAACTCAATGAAGCAGAATATTTGCAAGGAAGAAGGGGAGATAAAACATTGATCATGAAAGTTAATGCTAGTTATACAACAGGATATATAAGATATTATAATGAAGGGGAAAAGAAGCCAATTTCCTATGTAAGTATAGTGTTCAGCAAAACTGAATTGAAATTTACTGAACTAGAGAAATTGCTGACCACTGTGCACAAGGGTCTTTTAAAGGCCTTGGACTTGTCAATGGGGCAAAACATTCATGTTTATTCCCCCATTGTATCTATGCAAAATATTCAAAAAACACCACAGACTGCTAAAAAGGCTTTGGCCTCTCGATGGTTGAGTTGGCTTTCTTATTTGGAAGATCCGAGAATTAGATTCTTTTATGATCCACAGATGCCTGCTCTAAAAGATTTGCCTGCTGTAGACATAGGAGGAAATAATAAAAAACATCCTAGCAATTTTCAACATATATTTTATACTGATGGATCTGCTATCACGTCCCCTACTAAAGAGGGACACTTGAACGCTGGAATGGGAATAGTTTATTTTATAAATAAAGATGGAAATTTACAAAAGCAACAGGAATGGTCCATTAGTTTGGGAAATCATACAGCACAATTTGCAGAAATAGCTGCTTTTGAGTTTGCTCTTAAAAAATGTTTGCCTTTGGGAGGAAACATTCTTGTGGTTACTGACAGCAATTATGTTGCAAAAGCATATAATGAGGAACTTGATGTTTGGGCCTCTAATGGCTTTGTGAATAACAGGAAGAAACCT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39,536
MW349910.1
Feline foamy virus
Sumiyoshi,A., Miyazawa,T.
Institute for Frontier Life and Medical Science, Kyoto University, Research Center for Infectious Diseases
Japan
2021-08-02
null
Feline foamy virus
Felispumavirus
Retroviridae
ssRNA-RT
11,638
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Prionailurus bengalensis
null
null
null
null
Feline foamy virus strain NV138, complete genome
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39,749
MW349911.1
Feline foamy virus
Sumiyoshi,A., Miyazawa,T.
Institute for Frontier Life and Medical Science, Kyoto University, Research Center for Infectious Diseases
Japan
2021-08-02
null
Feline foamy virus
Felispumavirus
Retroviridae
ssRNA-RT
11,638
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Prionailurus bengalensis
null
null
null
null
Feline foamy virus strain SV201, complete genome
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39,750
MW349912.1
Feline foamy virus
Sumiyoshi,A., Miyazawa,T.
Institute for Frontier Life and Medical Science, Kyoto University, Research Center for Infectious Diseases
Japan
2021-08-02
null
Feline foamy virus
Felispumavirus
Retroviridae
ssRNA-RT
11,643
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Felis catus
null
null
null
null
Feline foamy virus strain VN114, complete genome
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39,751
MW349913.1
Feline foamy virus
Sumiyoshi,A., Miyazawa,T.
Institute for Frontier Life and Medical Science, Kyoto University, Research Center for Infectious Diseases
Japan
2021-08-02
null
Feline foamy virus
Felispumavirus
Retroviridae
ssRNA-RT
11,642
GenBank
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Viet Nam
Viet Nam
Felis catus
null
null
null
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Feline foamy virus strain VN119, complete genome
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39,752
MW349914.1
Feline foamy virus
Sumiyoshi,A., Miyazawa,T.
Institute for Frontier Life and Medical Science, Kyoto University, Research Center for Infectious Diseases
Japan
2021-08-02
null
Feline foamy virus
Felispumavirus
Retroviridae
ssRNA-RT
11,650
GenBank
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Viet Nam
Viet Nam
Felis catus
null
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null
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Feline foamy virus strain VN150, complete genome
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39,753
MW349915.1
Feline foamy virus
Sumiyoshi,A., Miyazawa,T.
Institute for Frontier Life and Medical Science, Kyoto University, Research Center for Infectious Diseases
Japan
2021-08-02
null
Feline foamy virus
Felispumavirus
Retroviridae
ssRNA-RT
11,633
GenBank
null
Viet Nam
Viet Nam
Felis catus
null
null
null
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Feline foamy virus strain Sammy-1, complete genome
TCTCACAGAGGAGAATACTCTCTGCTGCCATCTAGTGATGATGAAGAAGAAGAAATGTCGGAGAGGGAGGAATTATTGTGTCATATAAATCAATGTCAACAAAAGCTCTTTTATCCCGGAGGGACCACTGATGTCCTTGGAATGGAGAGCAATGATTGGCTTACTAAATTTGTTAATACTAAATTTCCTAAAGGAACAAAAGTGATACTTCCTGACGGAAGAAAATTTATAGCCTGTGATCCTGAGCTAAAGCCATTATTGCAGGAATTGAAGTTCTTGGATAGGGCAACATCTGAGTCATCTGACTCTGAATAGAAAGCCTGAATTTACCTGGATTGTGCAACTTTGTCCGAGGTGGCAGAGTGGTTATGTATCTGTCATACTCGGGGAAAGTTTTGTCTTTACATGTTCAAGACATATAAAAGGTAGAAAAATATATTCCTGACTAAACTTCCTGGGGACTAGAGGTGTGGAAACTTTGCTGCCTCTGCTTCACGGGAAGTTTTTGGTTCGAATCCTTTTTGGGTACTTAGTTAAGAAAAGTAATGAATAAGTTACTCTCGTTCATACATTCATATCGAAACCATGTATCCTTTAGTCATTTAGATACTTAGAATATAAGAAAAGAAACTGCAATTGTAACTATCAATATTAGTAAACAAAGTACAGCTCATTGTTATCTGATGATGTCACAAAAAGAAGACCTAGAAGAGAAGAACAATTTTCGGCATGCAGTAGAGCGGGAGCTTGGTGTAGGAGCTAAGTCACCGTCTTACATCTAGAGCCTACTCTTCTTGAACTGTTCGAATCCTATTTTTGGAACTCTTACATCACCTTTAAGAGACTGAAAAACGTGACTTGTACACAGGAAGCTCCTTTAGGGTAGAGGAAATGTTCTAATTTCCTATCTTAAAGGGTTGCTTCATTTAAGGTTCGAAACTGTGTACTGAAAGTAGATTTTGCATAACTTTAAACTTTTAGTTGCATGTTTCTGATATTAGAAGCATATAAAAGGGTTATGGTAGATTGTACGGGAGCTCTTCTCACAGACTTGGCTGCGTCCAGGGTGAGATTGAGACTCTCCAGCTTGGGTAAGATTTTGATATGTATTTTGCTTGAATACTTTTGCCTTGCTCAAGATTAATAAATTGATTTTTCTTTCACTCAATTGAAGCTTCATATAATTATATTATTGTCTGAAGCCAGAACTCACATGAGTGGTGTTTCTCTATTCCTGGGGAAAAGTGTTCTTCTATTTGAAAGTGTTAGAGCTACTAAGTGAAGGACTAACCTATCCCAGGTATAGGCCGCGACAGTTGGCGCCCAACGTGGGGCTCGATTGAGTGAAATATAAATTAAGCTGAGGAGAATAATCCCTAGGGACCTTACCTTACTGAGGAAGGATGGCTCGAGAATTAAATCCTCTCCAATTACAGCAACTGTATATAAATAATGGTTTACAACCTAATCCAGGACATGGAGACGTTATTGCTGTCAGATTTACAGGAGGACCTTGGGGTCCAGGTGATAGATGGGCTAGAGTGGCAATACGATTACAAGATAATACAGGGCAACCTTTACAGGTTCCTGGGTATGACTTGGAACCTGGGATAATAAATCTGAGAGAGGATATTTTGATAGCAGGACCATATAATTTGATAAGAACTGCCTTTTTGGACTTAGAGCCTGCCAGAGGACCTGAGAGACATGGTCCTTTTGGAGATGGCCGATTACAGCCTGGAGATGGATTATCTGAAGGGTTTCAACCTATCACTGATGAAGAAATACAAGCAGAAGTAGGAGCTATTGGTGCTGCCAGGAATGAGATAAGATTATTACGAGAAGCTTTGCAAAGATTACAAGTTGGAGGTGTGGGTAGACCTATACCAGGAGCAATTTTACAGCCACAACCAGTAATAGGGCCAGTAATACCGATTAATCATCTCAGGTCGGTTATTGGTAATACTCCACCTAATCCAAGAGATGTCGCCCTATGGCTTGGTAGATCTACAGCCGCCATTGAAGGAGTATTTCCCATAGTGGACCAAATCACCCGTATGAGGGTAGTTAATGCCTTAGTAGCATCTCATCCTGGCCTAACATTGACTGAGAATGAGGCCGGAAGCTGGAACGCTGCCATATCAGCTTTATGGAGGAAAGCTCACGGTGCTGCAGCTCAGCATGAATTAGCAGGAGTATTAAGTGATATTAATAAAAAGGAAGGCATACAAACTGCATTCAACCTAGGAATGCAATTTACAGATGGAAACTGGTCCTTAGTATGGGGAATAATCAGGACTCTTTTACCAGGACAAGCCCTAGTAACCAATGCTCAGTCACAATTTGACCTAATGGGAGATGATATACAACGAGCAGAAAATTTCCCCAGGGTCATTAACAATCTATACACTATGCTGGGCCTCAATATACATGGGCAAAGCATTAGACCACGGGTGCAAACACAGCCACAACAGACTCGACCCCGGAACCCGGGACGATCTCCACAAGGTCAATTAAATCAGCCAAGACCCCAAAATAGAACTAACCAATCTTATAGACCCCCTAGACAACAACAGCAACATTCTGATGTTCCTGAACAGAGAGATCCGAGAGGACCGTCGCAACCTCCTCGTGGAAGTGGAGGAGGATATAATTTTAGAAGAAATCCGCAGCAGCCTCAGCGCTACGGCCAAGGACCACCAGGACCAAACCCGTACCGACGATTCGGAGACGGCGGTAATCCTCAACAGCAGGGACCACCACCGAACCGAGGGCCTGATCAAGGACCTCGGCCAGGAGGTAACCCCAGAGGAGGAGGAAGAGGTCAAGGTCCAAGAAATGGAGGAGGAAGCGCTGCCGCAGTACACACAGTAAAAGCGTCCGAAAACGAAACTAAAAATGGATCTGCTGAAGCCATTGACAGTGGAAAGAAAGGGGGCAAAGATTAAAGGTTACTGGGACTCTCAAGCTGATATTACCTGTGTTCCAAAGGACTTACTTCAAGGAGAAGAGCCTGTTAGGCAACAAAATGTGACAACTATACATGGAACGCAGGAAGAGGATGTATATTATGTAGAATTAAAAATAGATGGTAAAAGAATTAATACAGAAGTAATAGGGACAACTTTGGACTATGCTATTATAACTCCTGGAGATATACCTTGGATTTTGAAGAAACCCTTAGAATTAACTATTAAATTGGATTTAGAAGAGCAACAAAGGACTTTACTTAGTAATTCTGTCTTATCTAAAAAGGGGAAAGAAGAATTAAAACGATTATTTGAAAAATATAATGCCTTGTGGCAAAGTTGGGAAAATCAGGTGGGTTATAGAAAAATTAGGCCACATAAAATAGCAACTGGTACGGTAAAACCCACACCTCAGAAACAGTATCATATCAATCCAAAAGCGAAGCCTGACATTCAGATTGTAATTAATGATTTATTAAAACAAAGAGTACTAATTCAAAAGGAAAGTGTAATGAACACTCCTGTCTACCCAGTACCCAAGCCAAATGGCCGATGGAGAATGGTATTAGACTATAGAGCAGTAAATAAAGTCACACCTTTGATAGCTGTACAAAATCAACACTCGTATGGAATTTTAGGAAGTCTTTTTAAAGGCAAATATAAAACCACAATTGATTTATCCAATGGTTTCTGGGCACACCCCATTGTCCCAGAGGATTATTGGATTACTGCATTTACTTGGCAGGGAAAACAATATTGCTGGACTGTTTTACCACAAGGCTTTCTGAATAGCCCTGGGCTGTTTACTGGAGATGTTGTAGACCTTCTACAGGATATTCCCAATGTGGAAATCTATGTGGATGATGTATATATTAGTCATGATTCTGAAAAAGAACATTTGGAGTATCTGGATATTTTGTTTAATAGATTAAAAGAAGCAGGATATATAGTATCTCTTAAAAAGTCCAATATTGCCAATTCTACTGTGGATTTTCTTGGTTTTCAGATCACTAATGAAGGCCGAGGCTTAACAGATACTTTTAAGGAAAAACTGGAAAATATTACTGCCCCTACCACTCTTAAACAATTACAAAGCATATTAGGTCTTCTAAATTTTGCCAGAAATTTTATTCCTGACTTTACTGAGCTAATTGCTCCTTTATATGCATTGATACCAAAGTCTACCAAGAATTATGTTCCTTGGCAGGCAGAGCATTCAACCACTCTGAAGACTTTAATTGCTAAACTCAATAGGGCAGAATATTTGCAAGGAAGAAAGGGAGATAAAGCATTAATCATGAAAGTTAATGCTAGTTATACAACAGGATATATAAGGTATTATAATGAAGGGGAAAAGAAACCAATTTCCTATGTGAGTATAGTGTTCAGCAAAACTGAATTAAAATTTACTGAACTAGAGAAATTGCTGACCACTATGCACAAGGGTCTTCTAAAGGCCTTGGATTTATCAATGGGGCAAAACATTTATGTTTATTCCCCCATTGTATCCATGCAAAATATTCAAAAAACACCACAGACTGCTAAAAAGGCTTTGGCCTCTCGGTGGTTAAGTTGGCTTTCTTATTTAGAAGATCCGAGAATTAGATTCTTTTATGATCCACAGATGCCTGCTCTAAAAGACTTGCCTGCTGTAGATACCGGAAAAGATAATAAAAAGCATCCTAGCAATTTTCAACATATATTTTATACTGATGGATCTGCTATCACGTCCCCTACTAAAGAGGGACACTTGAACGCTGGAATGGGAATAGTTTATTTTATAAACAAAGATGGAGACTTACAAAAGCAACAGGAATGGTCTATCAGTTTGGGGAATCATACAGCACAATTTGCAGAAATAGCTGCCTTTGAATTCGCCTTTAAGAAATGTTTATCCTTGGGAGGAAACATTCTTGTGGTTACTGACAGCAATTATGTAGCAAAAGCATATAATGAGGAACTTGATGTTTGGGCCTCTAATGGCTTTGTGAATAACAGGAAGAAACCTTTGAAACATATTAGTAAATGGAA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AAAGAATGGTGCCTGTATAGCCTTGATTCTGACCATGATCCCCTTTGGAATCCAAAAATAACTGTTCGTAGACATAGAAATCTTTTACCTTATTGTATGAGGCCCCTACTCATCTGGATGAATTATATTTCTCATAATCCTCTTACACAGCAATGTATTATGATGAAAACTTTGAATATGCTTTGGAGAGCACAAGCTGATGATCCAAGTGATGTTGCTTCCCTGCATCCCAGAGTCAAAGTTTTTAAAGCATCTCATTTTGACATATTTGGAAGTGCCTCTGGGAACAGGGAGGAGAGGGTGTCATGGGCTGAAGAGAATTCTCAGAGAGGAGAATACTCTCTGCTGCCATCTAGTGATGATGAAGAAGAAGAAATGTCGGAGAGGGAGGAATTATTGTGTCATATAAATCAATGTCAACAAAAGCTCTTTTATCCCGGAGGGACCACTGATGTCCTTGGAATGGAGAGCAATGATTGGCTTACTAAATTTGTTAATACTAAATTTCCTAAAGGAACAAAAGTGATACTTCCTGACGGAAGAAAATTTATAGCCTGTGATCCTGAGCTAAAGCCATTATTGCAGGAATTGAAGTTCTTGGATAGGGCAACATCTGAATCATCTGACTCTGAATAGAAAGCCTGAATTTACCTGGATTGTGCAACTTTGTCCGAGGTGGCAGAGTGGTTATGTATCTGTCATACTCGGGGAAAGTTTTGTCTTTACATGTTCAAGACATATAAAAGGTAGAAAAATATATTCCTGACTAAACTTCCTGGGGACTAGAGGTGTGGAAACTTTGCTGCCTCTGCTTCACGGGAAGTTTTTGGTTCGAATCCTTTTTGGGTACTTAGTTAAGAAAAGTAATGAATAAGTTACTCTCGTTCATACATTCATATCGAAACCATGTATCCTTTAGTCATTTAGATACTTAGAATATAAGAAAAGAAACTGCAATTGTAACTATCAATATTAGTAAACAAAGTACAGCTCATTGTTATCTGATGATGTCACAAAAAGAAGACCTAGAAGAGAAGAACAATTTTCGGCATGCAGTAGAGCGGGAGCTTGGTGTAGGAGCTAAGTCACCGTCTTACATCTAGAGCCTACTCTTCTTGAACTGTTCGAATCCTATTTTTGGAACTCTTACATCACCTTTAAGAGACTGAAAAACGTGACTTGTACACAGGAAGCTCCTTTAGGGTAGAGGAAATGTTCTAATCTCCTATCTTAAAGGGTTGCTTCATTTAAGGTTCGAAACTGTGTACTGGAAGTAGATTTTGCATAACTTTAAACTTTTAGTTGCATGTTTCTGATATTAGAAGCATATAAAAGGGTTATGGTAGATTGTACGGGAGCTCTTCTCACAGACTTGGCTGCGTCCAGGGTGAGATTGAGACTCTCCAGCTTGGGTAAGATTTTGATATGTATTTTGCTTGAATACTTTTGCCTTGCTCAAAGATTAATAAATTGATTTTTCTTTCACTCAATTGAAGCTTCATATAATTATATTATTGTCTGAAGCCAGAACTCACATGAGTGGTGTTTCTCTATTCCTGGGGAAAAGTGTTCTTCTATTTGAAAGTGTTAGAGCTACTAAGTGAAGGACTAACCTATCCCAGGTATAGGCCGC
39,754
MH633409.1
Feline foamy virus
Kraberger,S., Gagne,E., Malmberg,J., Logan,K., Alldredge,M., Crooks,K., VandeWoude,S.
Colorado State University, Department of Microbiology, Immunology & Pathology
USA
2019-09-30
X132
Feline foamy virus
Felispumavirus
Retroviridae
ssRNA-RT
11,680
GenBank
null
USA
USA
Puma concolor
blood
2006-04-19
null
null
Feline foamy virus isolate X132, complete genome
GAATTCTCACAGAGGAGAATACTCTCTGCTGCCATCTAGTGACGATGAGGAAGAAGAAATGTCAGAAAGAGAGGAATTATTGTGCCATATAAATCAATGTCAACAAAAGCTCTTTTATCCCGGAGGGACGACTGATGTCCTTGGAATGGAAAGCAATGTTTGGCTCACTAAATTTGTTAATATTAAATTTCCTAAAGGAACAAAAGTGATACTTCCTGATGGAAGAAAATTCATAGCCTGTGATTCTGAGCTAAAACCATTATTGCAGGAATTGAAATTCTTGGATAGGGCAACATCTGAGTCATCTGACTCTGAATAAGAAAGCCTGAATTTACCTGGATTGTGCAACTTTGTCCGAGGTGGCAGAGTGGTTATGTATCTGTCATACTCGGGGAAAGTTTTGTCTTTACATGTTCAAGACATATAAAGGGTGGAAAAATATATTCCTGACTAAACTTCCTGGGGACTAGAGGTGTGGAAACTTTGCTGTCTCTGCTTCACGGGAAGTTTTTGGTTCGAATCCTTTTTTAGGTACTTAGTTAAGATAAGTAGTGAATAAGTTACTCTCGTTCATGTATTCATATCGAAACCATGTATCTTTTGAAACCATGTATTCTTTAGTCATTTAGATACTTAGAGTATGAGAAAAGAAACTGCAATAGTAATTATCAATGTTAGTAAACAAAGTACAGCATAGTCATCTGATGATGTCACGAGAAGAGAACCTAGAAGAGAAGAACAACTTTCGGCATGCAACAGAGCGGGAGCTTGGTGTAGGAGCTAAGTCACCGTCTTACATCTAGAGCCTACTCTTCTTGAACTGTTCGAATCCTATTTTTGGAACTCTTACATCATCTTTAAGAGACTGAAAAACGTGACTCGTGCACAGGAAGCTCCTTTAGGGTAGAGGAAATGTTCTAATCTCCTATCTTAAAGGGTTGCTTCATTTAAGGTTCGAAACTGTGTACTGGAAGTAGATTTTGCATAACTTTAAACTTTTAGTTGCATGTTTCTGATATTAGCAGCATATAAAAGGGTTATGGTAGATTGTACGGGAGCTCTTCTCACAGACTTGGCTGCGTCCAGGGTGAGATTGAGACTCTCCAGCTTGGGTAAGATTTTGAGATGTATTTTGCTTGAATATTTCTGCCTTGCTCAAAGATTAAATAAATTGGATTTTCTTTCACTCAATTGAAGCTTCATATAATTATATTATTGTCTGAAGCCAGAACTCACATGAGTGGTGTTTCTCTATTCCTGGGGAAAAGTGTTCTTCTATTTGAAAGTGTTAGAGCTACTAAATGAAGGACTAACCTATCCCAGGTATAGACCACGACAGTTGGCGCCCAACGTGGGGCCCGATTGAGTGAAACATAAATTAAGCTGAGGAGAATAATCCCTAGGGACCTTACCTTACTGAGGAAGGATGGCTCGAGAATTAAATCCCCTTCAATTACAGCAACTGTATATAAATAATGGCTTACAGCCTAATCCAGGACATGGAGATGTTATTGCTGTCAGATTTACAGGAGGACCTTGGGGTCCCGGTGATAGATGGGCTAGAGTGGCAATACGATTACAAGATAACACAGGACAACCTTTACAGGTTCCTGGATATGATTTGGAACCTGGGATAATAAATTTGAGAGAAGATATCTTGATAGCAGGGCCATATAATCTAATAAGAACTGCCTTTTTGGACTTAGAGCCTACCAGAGGACCTGAAAGACATGGTCCTTTTGGGGATGGCAGATTACAGCCTGGAGATGGTTTATCTGAAGGGTTTCAACCTATCACTGATGAAGAGATGCAAGCAGAAGTAGGAACTATTGGTGCTGCTAGAAATGAGATAAGATTATTACGAGAAGCCGTACAGAGATTACAGGTTGGAGGTGTGGGTAGACCTTTACCAGGAGCAATTATACAACCACAACCAGTAATAGGGCCCGTAATACCAATTAATCATCTTAGGTCGGTTATTGGCAATACTCCACCAAATCCACGAGATGTCGCCCTATGGCTTGGAAGATCTACAGCCGCTATTGAAGGAGTATTTCCCATAGTGGACCAAATTACCCGTATGAGGGTAGTTAATGCCTTAGTAGCATCTCATCCCGGCCTAACATTAACTGAGAATGAGGCCGGAAGCTGGAACGCTGCCATATCAGCTTTATGGAGAAAAGCTCACGGTGCTGCAGCTCAGCATGAATTGGCAGGAGTATTAAGTGATATTAATAAAAAGGAAGGTATACAAACTGCATTCAACCTAGGAATGCAATTTACAGATGGAAACTGGTCCTTAGTATGGGGAATAATCAGGACTCTTTTACCAGGCCAAGCCCTGGTAACCAATGCTCAGTCACAATTTGGCCTAATGGGAGATGATATACAACGAGCGGAGAATTTCCCCAGGGTCATTAATAATTTATACACCATGCTGGGCCTTAATATACACGGGCAGAGCATTAGACCACGGGTACAAACACAGCAGCAACAACCTCGATCCCGAAACCAGGGACGATCTCAACAAGGTCAACTAAATCAGCCAAGACCCCAAAATAGAAATAACCAATCTTATAGACCCCCTAGACAACAACAGCAACACTCTGATGTTCCCGAACAGAGAGATCAAAGAGGACCGTCACAACCTCCTCGTGGAAGTGGAGGAGGATATAATTTCAGAAGAAATCCGCAGCAGCCTCAGCGTTACGGCCAAGGACCACCAGGACCAAACCCGTACCGACGATTCGGAGACGGCGGTAATCCTCAACAGCAGGGACCACCACCGAACCGAGGGCCTGATCAAGGACCTCGGCCAGGAGGCAATCCCAGAGGAGGAGGAAGAAGTCAAGGTCCAAGAAATGGAGGAGGAAGCGCTGCCGCTGTACATACAGTAAAAGCGTCCAAAAACGAAACTAAAAATGGATCTGCTGAAGCCGTTGACGGTGGAAAGAAAGGGGGTAAAGATTAAAGGTTACTGGGACTCCCAAGCCGATATTACCTGTGTTCCAAAGGATTTGCTTCAAAAAGAAGAACCTATTAGGCAACAAAATGTGACAACTATACATGGAACGCAGAAAGAAGATGTATACTATGTAAATTTAAAAATAGATGGTAGAAGAATTAATACAGAAGTAATAGGGACAACTTTAGACTATGCTATCATAACTCCTGGAGATGCACCTTGGATTTTGAAAAAACCTTTAGAATTAACTATTAAACTGAATTTAGAAGAGCAACAAAGGACTTTACTTAACAATTCCATTTTATCTAAAAAAGGGAAAGAAGAATTAAAACGATTGTTTGAGAAATATAATGCCTTGTGGCAAAGCTGGGAGAATCAGGTGGGTCATAGAAAAATTAGGCCACATAAAATAGCAACTGGTACGGTAAAACCCACACCTCAGAAACAGTATCATATTAATCCAAAAGCAAAACCTGATATCCAGATTGTAATTAATGATTTACTAAAACAAGGGGTACTAATTCAAAAAGAAAGTACTATGAATACTCCTGTCTACCCAGTACCCAAGCCAAATGGCCGCTGGAGAATGGTACTGGACTATAGAGCAGTAAATAAAGTCACACCTTTGATAGCTGTACAAAATCAACACTCATATGGAATTTTAGGAAGTCTTTTTAAAGGCAAATATAAAACCACAATTGATTTATCCAATGGTTTCTGGGCACACCCCATTGTCCCAGAGGATTATTGGATTACTGCATTCACTTGGCAAGGAAAACAATATTGTTGGACTGTTTTACCACAAGGCTTTCTGAATAGCCCTGGGTTGTTTACTGGAGATGTTGTAGACCTTTTACAGGGAATTCCCAATGTGGAAGTCTATGTGGATGATGTATATATTAGTCATGATTCTGAAAAGGAACATTTGGAATATCTAGAAATTTTGTTTAATAGATTAAATGAAGCAGGATATATAGTATCTCTCAAAAAATCCAATATTGCCAATTCTAGTGTGGATTTTCTTGGCTTTCAGATAACTAATGAAGGCCGAGGCCTAACAGATACTTTTAAAGAAAAATTGGAGAATATTACTGCCCCTACCACTCTTAAACAATTGCAAAGCATACTAGGTCTTTTAAATTTTGCCAGGAATTTTATTCCTGATTTTACTGAATTAATTGCTCCTTTATATGCATTGATACCAAAGTCTACCAAGAACTATGTTCCTTGGCAAATAGAACATTCAACCACTCTGGAAACTTTAATTGCTAAACTCAATGAGGCAGAATATTTGCAAGGAAGAAGGGGAGATAAAACATTAATCATGAAAGTTAATGCTAGTTATACAACAGGATATATAAGGTATTATAATGAAGGGGAAAAGAAGCCAATTTCCTATGTAAGTATAGTGTTCAGCAAAACTGAATTGAAATTCACTGAACTAGAGAAATTGCTGACCACTGTGCACAAGGGTCTTTTAAAGGCCTTGGACTTATCAATGGGGCAAAACATTCATGTTTATTCCCCCATTGTATCCATGCAAAATATTCAAAAAACACCGCAGACTGCTAAAAAGGCTTTGGCCTCTCGATGGTTGAGTTGGCTTTCTTATTTGGAAGATCCGAGAATTAGATTCTTTTATGATCCACAGATGCCTGCTCTAAAAGATTTGCCTGCTGTGAACATAGGAGAAAATAATAAAAAACATCCTAGCAATTTTCAACATATATTTTATACTGATGGATCTGCTATCACGTCCCCTACTAAAGAAGGACACTTAAACGCTGGAATGGGAATAGTTTATTTTATAAACAGAGATGGAAATTTACAAAAGCAACAGGAATGGTCCATTAGTTTGGGAAATCATACAGCACAATTTGCAGAAATAGCTGCTTTTGAGTTTGCCCTTAAAAAATGTTTGCCTTTGGGAAGAAACATTCTTGTGGTTACTGACAGCAATTATGTTGCAAAAGCATATAATGAGGAACTTGATGTTTGGGCCTCTAATGGCTTTGTGAATAACAGGAAGAAACCT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59,264
MH633410.1
Feline foamy virus
Kraberger,S., Gagne,E., Malmberg,J., Logan,K., Alldredge,M., Crooks,K., VandeWoude,S.
Colorado State University, Department of Microbiology, Immunology & Pathology
USA
2019-09-30
X135
Feline foamy virus
Felispumavirus
Retroviridae
ssRNA-RT
11,650
GenBank
null
USA
USA
Puma concolor
blood
2006-12-14
null
null
Feline foamy virus isolate X135, complete genome
GAATTCTCACAGAGGAGAATACTCTCTGCTGCCATCTAGTGACGATGAGGAAGAAGAAATGTCAGAAAGAGAGGAATTATTGTGTCATATAAATCAATGTCAACAAAAGCTCTTTTATCCCGGAGGGACCACTGATGTCCTTGGAATGGAGAGCAATAATTGGCTTACTAAATTTGTTAATACCAAATTTCCTAAAGGAACAAAAGTGATACTTCCTGACGGAAGAAAATTTATAGCCTGTGATCCTGAATTAAAACCATTATTGCAGGAGCTAAAGTTCTTGGATAGGGCAACATCTGAGTCATCTGACTCTGAATAGAAAGCCCGAATTTACCTGGATTGTGTAACTTTGTCCGAGGTGGCAGAGTGGTTATGTATCTGTCATACTCGGGGAAAGTTTTGCCTTTACATGTTCAAGACATATAAAGGGTAGAAAAATATATTCCTGACTAAACTTCCTGGGGACTAGAGGTGTGGAAACTTTGCTGCCTCTGCTTCTCGGGAAGTTTTTGGTTCGAATCCTCTTTTAGGTACTTAGTTAAGATAAGTAGTGAATAAGTTACTCTCGTTCATGTACTCATATCGAAACCATGTATTCTTTAGTCATTTAGATACTTAGGGTATGAGAAAAGAAACTGTAATGGTAACTATCAATGTTAGTAAACAAAGTATAGCTTAATCATCTGATGATGTCACGAGAAGAGGACCTAGAAGAGAAGAACAACTTTCGGCATGTAACAGAGCGGGAGCTTGGTGTAGGAGCTAAGTCACCGTCTTACATCTAGAGCCTACTCTTCTTGAACTGTTCGAATCCTATTTTTGGAACTCTTACATCACCTTTAAGAGACTGAAAAACGTGACTCGTACACAGGAAGCTCCTTTAGGGTAGAGGAAATGTTCTAATCTCCTATCTTAAAGGGTTGCTTCATTTAAGGTTCGAAACTGTGTACTGAAAGTAGATTTTGCATAACTTTAAACTTTTAGTTGCATGTTTCTGATATTAGCAGCATATAAAAGGGCTATGGTAGATTGTACGGGAGCTCTTCTCACAGACTTGGCTGAGTCCAGGGTGAGATTGAGACTCTCCAGCTTGGGTAAGATTTTGATATGTATTTTGCTTGAATATTTTTGCCTTGCTCAAAGATTAAATAAATTGGATTTTCTTTCACTCAATTGAAGCTTCATATAATTATATTATTGTCTGAAGCCAGAACTCACTTGAGTGGTGTTTCTCTATTCCTGGGGAAAAGTGTTCTTCTATTTGAAAGTGTTAGAGCTACTAAATGAAGAACTAACCTATCCCAGGTATAGACCACGACAGTTGGCGCCCAACGTGGGGCCCGATTGAGTGAAATTTAAATTAAGCTGAGGAGAATAATCCCTAGGGACCTTACCTTACTGAGGAAGGATGGCTCGAGAATTAAACCCTCTTCAATTGCAGCAACTGTATATAAATAATGGTTTACAACCTAATCCAGGACATGGAGATGTTATTGCTGTCAGATTTACAGGAGGACCTTGGGGTCCAGGTGATAGGTGGGCTAAAGTGGCAATACGATTACAAGATAACACAGGACAACCTTTACAGGTTCCTGGATATGATTTGGAACCTGGGATAATAAATCTGAGAGAAGATATCTTGATAGCAAGGCCGTATAATTTAATAAGAACCGCCTTCTTGGACTTAGAGCCTGCCAAAGGACCTGAAAGACATGGTCCTTTTGGAGATGGTAGATTACAGCCTGGAGATGGTTTATCTGAAGGGTTTCAACCTATCACTGATGAAGAAATGCAAACAGAAGTAGGAACTATTGGTGCAGCTAGAAATGAGATAAGATTATTACGAGAAGCTTTACAGAGATTGCAAGTTGGAGGTGTGGGTAGACCTATACCAGGAGCAATCTTACAGCCACAACCAGTAATAGGGCCAATAATACCGATTAATCATCTTAGGTCGGTTATTGGTAATACCCCACCAAATCCACGAGATGTCGCCCTATGGCTTGGAAGATCTACAGCCGCTATTGAAGGAGTATTTCCCATAGTGGACCAAGTCACCCGTATGAGGGTAGTTAATGCTTTAGTAGCATCCCATCCCGGCCTAACATTGACTGAGAATGAGGCCGGAAGCTGGAACGCTGCCATATCAGCTTTATGGAGAAAAGCTCACGGTGCTGCAGCCCAACATGAATTGGCAGGAGTATTAAGTGATATTAATAAAAAGGAAGGCATACAAACTGCATTTAATCTGGGGATGCAATTTACAGATGGAAACTGGTCCTTAGTATGGGGAATAATCAGGACTCTCTTACCGGGACAAGCCCTGGTAACCAATGCTCAGTCACAATTTGACCTAATGGGAGATGATATACAACGAGCAGAAAATTTCCCCAGGGTCATTAATAATCTATATACTATGCTGGGCCTTAATATACATGGACAAAGCATTAGGCCACGGGTACAAACACAGCCACAGCAGGCTCGATCTCGGAACCAGGGACGATCTCAACAAGGTCAACTAAATCAGCCAAGACCCCAAAATAGAAATAACCAATCTTATAGACCCCCTAGACAACAACAGCAACACTCTGATGTTCCCGAACAGAGAGATCAGAGAGGACCGTCGCAACCTCCTCGTGGAAGTGGAGGAGGATATAATTTTAGAAGAAATCCGCAGCAGCCTCAGCGTTACGGCCAAGGACCACCAGGACCAAACCCATACCGACGATTCGGAGACGGCGGTAATCCTCAACAGCAGGGACCACCACCGAACCGAGGGCCTGATCAAGGACCTCGGCCAGGAGGCAATCCCAGAGGAGGAGGAAGAGGTCAAGGTCCAAGAAATGGAGGAAGAAACGCTGCCGCAGTACATACAGTAAAAGCGTCCGAAAACGAAACTAAAAATGGATCTGCTGAAGCCGCTGACGGTGGAAAGAAAGGGGGTAAAGATTAAAGGTTACTGGGACTCCCAAGCCGATATTACCTGTGTTCCAAAGGACTTGCTTCAAGAAGAAGAACCTGTTAGGCAGCAAAATGTGACAACTATACATGGAACGCAGGAAGAAGATGTATATTATGTAAATTTAAAAATAGATGGTAGAAGGATTAATACAGAAGTAATAGGGACAGCTTTGGACTATGCTATCATAACTCCTGGAGATGCACCTTGGATTTTGAAAAAACCTTTAGAATTAACTATTAAACTAGATTTAGAAGAGCAACAAAGGACTTTACTTAATAATTCCATTTTATCTAAAAAAGGAAAGGAAGAATTAAAACGATTATTTGAAAAATATAGTGCCTTATGGCAAAGTTGGGAGAATCAGGTGGGTTATAGAAAAATTAGGCCACATAAAATAGCAACTGGTACGGTAAAACCCACACCTCAGAAACAGTATCATATTAATCCAAAGGCAAAACCTGACATTCAGATTGTGATTAATGATTTACTAAAACAAGGGGTACTAATTCAAAAGGAAAGTACTATGAACACTCCTGTCTACCCAGTACCCAAGCCAAATGGTCGCTGGAGAATGGTACTGGACTACAGAGCGGTAAATAAAGTCACACCTTTGATAGCTGTACAAAATCAACACTCGTATGGAATTTTAGGAAGTCTTTTTAAAGGTAGATATAAAACTACAATTGATTTATCCAATGGTTTCTGGGCACACCCCATTGTCCCAGAGGATTATTGGATTACTGCATTCACTTGGCAAGGAAAACAATATTGTTGGACTGTTTTACCACAAGGTTTTTTAAACAGCCCTGGGCTGTTTACTGGAGATGTTGTAGATCTTCTACAGGGAATTCCCAACGTGGAAGTTTATGTGGATGATGTATATATTAGTCATGATTCTGAAAAAGAACATTTGGAATATCTGGAAATTTTGTTTAATAGATTAAATGAAGCGGGATATATAGTATCTCTTAAAAAATCCAATATTGCCAATTCTATTGTGGATTTTCTTGGTTTTCAGATTACTAATGAAGGCCGAGGCCTAACAGATACTTTTAAAGAAAAGTTGGAAAATATTACTGCCCCTACCACTCTTAAACAATTACAAAGCATATTAGGTCTTCTAAATTTTGCCAGAAATTTTATTCCTGACTTTACTGAGCTAATAGCTCCTTTATATGCATTGATACCAAAGTCTACCAAGAATTATGTTCCTTGGCAAACAGAACACTCAACCACTCTGGAAACTTTAATTGCTAAACTCAATGAGGCAGAATATTTGCAAGGAAGAAGGGGAGATAAAACATTGATCATGAAAGTTAATGCTAGTTATACAACAGGATATATAAGGTATTATAATGAAGGGGAAAAGAAGCCAATTTCCTATGTAAGTATAGTGTTCAGCAAAACTGAATTGAAATTTACTGAACTAGAGAAATTGCTGACCACTATACACAAGGGTCTTTTAAAGGCCTTGGACTTGTCAATGGGGCAAAACATTCATGTTTATTCCCCCATTGTATCCATGCACAATATTCAAAAAACACCACAGACTGCTAAAAAGGCTTTGGCCTCTCGATGGTTGAGTTGGCTTTCTTATTTGGAAGATCCAAGAATTAGGTTCTTTTATGATCCACAGATGCCTGCTCTAAAAGATTTGCCTGCTGTAGACATAGGAGAAAATAATAAAAAACATCCTAGCAATTTTCAACATATATTTTATACTGATGGATCTGCTATCACGTCCCCTACTAAAGAGGGACACTTAAATGCTGGAATGGGAATAGTTTATTTTATGAATAAAGATGGAAATTTACAAAAGCAACAGGAATGGTCAATTAGTTTGGGGAATCATACAGCACAATTTGCAGAAATAGCTGCTTTTGAGTTTGCCCTTAAAAAATGTTTGCCTTTGGGAGGAAACATTCTTGTGGTTACTGACAGCAATTATGTTGCAAAAGCATATAATGAGGAACTTGATGTTTGGGCCTCTAATGGCTTTGTGAATAACAGGAAGAAACCTTTGAAACATATTAGTAAA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