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Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
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Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
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Paramyxoviridae
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|
China
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Mammalian orthorubulavirus 5 strain SH/2015/122/PIV5, complete genome
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| 41,551
|
MT890699.1
|
Mammalian orthorubulavirus 5
|
Cheng,S., Sun,D., Chen,Z.
|
Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2021-06-14
| null |
Orthorubulavirus mammalis
|
Orthorubulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,246
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2015-12
| null | null |
Mammalian orthorubulavirus 5 strain HuB/YC/2015/PIV5, complete genome
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| 41,552
|
MT890700.1
|
Mammalian orthorubulavirus 5
|
Cheng,S., Sun,D., Chen,Z.
|
Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2021-06-14
| null |
Orthorubulavirus mammalis
|
Orthorubulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,246
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2015-12
| null | null |
Mammalian orthorubulavirus 5 strain JX/2015/1221/PIV5, complete genome
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| 41,553
|
MN604146.1
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Mammalian orthorubulavirus 5
|
Xie,J., Tong,P., Zhang,A., Zhang,L., Song,X., Kuang,L.
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Xinjiang Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
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2020-02-12
|
XJ033
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Orthorubulavirus mammalis
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Orthorubulavirus
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Paramyxoviridae
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ssRNA(-)
| 15,246
|
GenBank
| 1
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China
|
China
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Equus caballus
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feces
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2018
| null | null |
Mammalian orthorubulavirus 5 isolate XJ033, complete genome
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| 53,929
|
MN735204.1
|
Mammalian orthorubulavirus 5
|
Hierweger,M.M., Werder,S., Seuberlich,T.
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University of Bern, DCR-VPH
|
Switzerland
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2020-01-27
|
CH19-MMH
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Orthorubulavirus mammalis
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Orthorubulavirus
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Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,246
|
GenBank
| 1
|
Switzerland
|
Switzerland
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Bos taurus
|
brain
|
1998
| null | null |
Mammalian orthorubulavirus 5 isolate CH19-MMH, complete genome
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| 54,422
|
MK593539.1
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Mammalian orthorubulavirus 5
|
Feehan,B.J., Penin,A.A., Mukhin,A.N., Kumar,D., Moskvina,A.S., Khametova,K.M., Yuzhakov,A.G., Musienko,M.I., Zaberezhny,A.D., Aliper,T.I., Marthaler,D., Alekseev,K.P., Nepoklonov,E.A.
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Kansas State University, Veterinary Diagnostic Laboratory
|
USA
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2019-12-26
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RUS/Moskva/2015
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Orthorubulavirus mammalis
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Orthorubulavirus
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Paramyxoviridae
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ssRNA(-)
| 15,218
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GenBank
| 1
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Russia
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Russia
| null | null |
2015-11
| null | null |
Mammalian orthorubulavirus 5 isolate RUS/Moskva/2015, complete genome
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| 57,161
|
MK028670.1
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Mammalian orthorubulavirus 5
|
Jiang,N., Sun,D.
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Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases, Heilongjiang Bayi Agricultural University
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China
|
2019-05-07
| null |
Orthorubulavirus mammalis
|
Orthorubulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,246
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2015-12
| null | null |
Mammalian orthorubulavirus 5 strain SH/2015/1202, complete genome
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| 62,918
|
MG921602.1
|
Mammalian orthorubulavirus 5
|
Wang,X., Chen,W., Xiang,R., Li,L., Chen,J., Zhong,R., Xiang,H.
|
Institute of Animal Health, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Lab of Zoonsis
|
China
|
2019-02-17
| null |
Orthorubulavirus mammalis
|
Orthorubulavirus
|
Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,246
|
GenBank
| null |
China
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China
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Pholidota
| null |
2017-03-17
| null | null |
Mammalian orthorubulavirus 5 strain PIV5-GD18, complete genome
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| 65,209
|
MH362816.1
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Mammalian orthorubulavirus 5
|
Chen,A., Huo,L., Li,B., Wu,J., Chen,W., Luo,M.
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Guangzhou Zoo, South China Agricultural University
|
China
|
2018-06-06
| null |
Orthorubulavirus mammalis
|
Orthorubulavirus
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Paramyxoviridae
|
ssRNA(-)
| 15,246
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Pholidota
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lung
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2018
| null | null |
Mammalian orthorubulavirus 5 strain CAN, complete genome
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| 70,478
|
MH370862.1
|
Mammalian orthorubulavirus 5
|
Chen,A., Huo,L., Li,B., Wu,J., Cheng,S., Chen,W., Luo,M.
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Guangzhou Zoo, South China Agricultural University
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China
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2018-06-06
| null |
Orthorubulavirus mammalis
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Orthorubulavirus
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Paramyxoviridae
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ssRNA(-)
| 15,246
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Panthera tigris tigris
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lung
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2018
| null | null |
Mammalian orthorubulavirus 5 strain HMZ, complete genome
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| 70,480
|
MF170889.1
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Mammalian orthorubulavirus 5
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Oh,W.T., Chung,H.C., Park,B.K.
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Seoul National University, Department of Veterinary Medicine Virology Lab, College of Veterinary Medicine and Research Institute for Veterinary Science
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South Korea
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2018-04-23
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PF-1
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Orthorubulavirus mammalis
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Orthorubulavirus
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Paramyxoviridae
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ssRNA(-)
| 15,246
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GenBank
| null |
South Korea
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South Korea
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Sus scrofa
| null |
2017-03-07
| null | null |
Mammalian orthorubulavirus 5 strain Rigel, complete genome
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| 71,031
|
NC_077806.1
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Mammarenavirus choriomeningitidis
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Grande-Perez,A., Gomez-Mariano,G., Lowenstein,P.R., Domingo,E.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-06
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
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ssRNA(+/-)
| 7,228
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
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Lymphocytic choriomeningitis virus Armstrong 53b segment RNA L, complete sequence
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CGCACCGGGGATCCTAGGCGTTTAGTTGCGCTGTTTGGTTGCACAACTTTCTTCGTGAGGCTGTCAGAAGTGGACCTGGCTGATAGCGATGGGTCAAGGCAAGTCCAGAGAGGAGAAAGGCACCAATAGTACAAACAGGGCCGAAATCCTACCAGATACCACCTATCTTGGCCCTTTAAGCTGCAAATCTTGCTGGCAGAAATTTGACAGCTTGGTAAGATGCCATGACCACTACCTTTGCAGGCACTGTTTAAACCTTCTGCTGTCAGTATCCGACAGGTGTCCTCTTTGTAAATATCCATTACCAACCAGATTGAAGATATCAACAGCCCCAAGCTCTCCACCTCCCTACGAAGAGTAACACCGTCCGGCCCCGGCCCCGACAAACAGCCCAGCACAAGGGAACCGCACGTCGCCCAACGCACACAGACACAGCACCCAACACAGAACACGCACACACACACACACACACACCCACACGCACGCGCCCCCACCACCGGGGGGCGCCCCCCCCCGGGGGGCGGCCCCCCGGGAGCCCGGGCGGAGCCCCACGGAGATGCCCATCAGTCGATGTCCTCGGCCACCGACCCGCCCAGCCAATCGTCGCAGGACCTCCCCTTGAGTCTAAACCTGCCCCCCACTGTTTCATACATCAAAGTGCTCCTAGATTTGCTAAAACAAAGTCTGCAATCCTTAAAGGCGAACCAGTCTGGCAAAAGCGACAGTGGAATCAGCAGAATAGATCTGTCTATACATAGTTCCTGGAGGATTACACTTATCTCTGAACCCAACAAATGTTCACCAGTTCTGAATCGATGCAGGAAGAGGTTCCCAAGGACATCACTAATCTTTTCATAGCCCTCAAGTCCTGCTAGAAAGACTTTCATGTCCTTGGTCTCCAGCTTCACAATGATATTTTGGACAAGGTTTCTTCCTTCAAAAAGGGCACCCATCTTTACAGTCAGTGGCACAGGCTCCCACTCAGGTCCAACTCTCTCAAAGTCAATAGATCTAATCCCATCCAGTATTCTTTTGGAGCCCAACAACTCAAGCTCAAGAGAATCACCAAGTATCAAGGGATCTTCCATGTAATCCTCAAACTCTTCAGATCTGATATCAAAGACACCATCGTTCACCTTGAAGACAGAGTCTGTCCTCAGTAAGTGGAGGCATTCATCCAACATTCTTCTATCTATCTCACCCTTAAAGAGGTGAGAGCATGATAAAAGTTCAGCCACACCTGGATTCTGTAATTGGCACCTAACCAAGAATATCAATGAAAATTTCCTTAAACAGTCAGTATTATTCTGATTGTGCGTAAAGTCCACTGAAATTGAAAACTCCAATACCCCTTTTGTGTAGTTGAGCATGTAGTCCCACAGATCCTTTAAGGATTTAAATGCCTTTGGGTTTGTCAGGCCCTGCCTAATCAACATGGCAGCATTACACACAACATCTCCCATTCGGTAAGAGAACCACCCAAAACCAAACTGCAAATCATTCCTAAACATAGGCCTCTCCACATTTTTGTTCACCACCTTTGAGACAAATGATTGAAAGGGGCCCAGTGCCTCAGCACCATCTTCAGATGGCATCATTTCTTTATGAGGGAACCATGAAAAATTGCCTAATGTCCTGGTTGTTGCAACAAATTCTCGAACAAATGATTCAAAATACACCTGTTTTAAGAAGTTCTTGCAGACATCCCTCGTGCTAACAACAAATTCATCAACCAGACTGGAGTCAGATCGCTGATGAGAATTGGCAAGGTCAGAAAACAGAACAGTGTAATGTTCATCCCTTTTCCACTTAACAACATGAGAAATGAGTGACAAGGATTCTGAGTTAATATCAATTAAAACACAGAGGTCAAGGAATTTAATTCTGGGACTCCACCTCATGTTTTTTGAGCTCATGTCAGACATAAATGGAAGAAGCTGATCCTCAAAGATCTTGGGATATAACCGCCTCACAGATTGAATCACTTGGTTCAAATTCACTTTGTCCTCCAGTAGCCTTGAGCTCTCAGGCTTTCTTGCTACATAATCACATGGGTTTAAGTGCTTAAGAGTTAGGTTCTCACTGTTATTCTTCCCTTTGGTCGGTTCTGCTAGGACCCAAACACCCAACTCAAAAGAGTTGCTCAATGAAATACAAATGTAGTCCCAAAGAAGAGGCCTTAAAAGGCATATATGATCACGGTGGGCTTCTGGATGAGACTGTTTGTCACAAATGTACAGCGTTATACCATCCCGATTGCAAACTCTTGTCACATGATCATCTGTGGTTAGATCCTCAAGCAGCTTTTTGATATACAGATTTTCCCTATTTTTGTTTCTCACACACCTGCTTCCTAGAGTTTTGCAAAGGCCTATAAAGCCAGATGAGATACAACTCTGGAAAGCTGACTTGTTGATTGCTTCTGACAGCAGCTTCTGTGCACCCCTTGTGAATTTACTACAAAGTTTGTTCTGGAGTGTCTTGATCAATGATGGGATTCTTTCCTCTTGGAAAGTCATCACTGATGGATAAACCACCTTTTGTCTTAAAACCATCCTTAATGGGAACATTTCATTCAAATTCAACCAGTTAACATCTGCTAACTGATTCAGATCTTCTTCAAGACCGAGGAGGTCTCCCAATTGAAGAATGGCCTCCTTTTTATCTCTGTTAAATAGGTCTAAGAAAAATTCTTCATTAAATTCACCATTTTTGAGCTTATGATGCAGTTTCCTTACAAGCTTTCTTACAACCTTTGTTTCATTAGGACACAGTTCCTCAATGAGTCTTTGTATTCTGTAACCTCTAGAACCATCCAGCCAATCTTTCACATCAGTGTTGGTATTCAGTAGAAATGGATCCAAAGGGAAATTGGCATACTTTAGGAGGTCCAGTGTTCTCCTTTGGATACTATTAACTAGGGAGACTGGGACGCCATTTGCGATGGCTTGATCTGCAATTGTATCTATTGTTTCACAAAGTTGATGTGGCTCTTTACACTTGACATTGTGTAGCGCTGCAGATACAAACTTTGTGAGAAGAGGGACTTCCTCCCCCCATACATAGAATCTAGATTTAAATTCTGCAGCGAACCTCCCAGCCACACTTTTTGGGCTGATAAATTTGTTTAACAAGCCGCTCAGATGAGATTGGAATTCCAACAGGACAAGGACTTCCTCCGGATCACTTACAACCAGGTCACTCAGCCTCCTATCAAATAAAGTGATCTGATCATCACTTGATGTGTAAGCCTCTGGTCTTTCGCCAAAGATAACACCAATGCAGTAGTTGATGAACCTCTCGCTAAGCAAACCATAGAAGTCAGAAGCATTATGCAAGATTCCCTGCCCCATATCAATAAGGCTGGATATATGGGATGGCACTATCCCCATTTCAAAATATTGTCTGAAAATTCTCTCAGTAACAGTTGTTTCTGAACCCCTGAGAAGTTTTAGCTTCGACTTGACATATGATTTCATCATTGCATTCACAACAGGAAAGGGGACCTCGACAAGCTTATGCATGTGCCAAGTTAACAAAGTGCTAACATGATCTTTCCCGGAACGCACATACTGGTCATCACCTAGTTTGAGATTTTGTAGAAACATTAAGAACAAAAATGGGCACATCATTGGTCCCCATTTGCTGTGATCCATACTATAGTTTAAGAACCCTTCCCGCACATTGATAGTCATTGACAAGATTGCATTTTCAAATTCCTTATCATTGTTTAAACAGGAGCCTGAAAAGAAACTTGAAAAAGACTCAAAATAATCTTCTATTAACCTTGTGAACATTTTTGTCCTCAAATCTCCAATATAGAGTTCTCTATTTCCCCCAACCTGCTCTTTATAAGATAGTGCAAATTTCAGCCTTCCAGAGTCAGGACCTACTGAGGTGTATGATGTTGGTGATTCTTCTGAGTAGAAGCACAGATTTTTCAAAGCAGCACTCATACATTTTGTCAACGACAGAGCTTTACTAAGGGACTCAGAATTACTTTCCCTCTCACTGATTCTCACGTCTTCTTCCAGTTTGTCCCAGTCAAATTTGAAATTCAAGCCTTGCCTTTGCATATGCCTGTATTTCCCTGAGTACGCATTTGCATTCATTTGCAACAGAATCATCTTCATGCAAGAAAACCAATCATTCTCAGAAAAGAACTTTCTACAAAGGTTTTTTGCCATCTCATCGAGGCCACACTGATCTTTAATGACTGAGGTGAAATACAAAGGTGACAGCTCTGTGGAACCCTCAACAGCCTCACAGATAAATTTCATGTCATCATTGGTTAGACATGATGGGTCAAAGTCTTCTACTAAATGGAAAGATATTTCTGACAAGATAACTTTTCTTAAGTGAGCCATCTTCCCTGTTAGAATAAGCTGTAAATGATGTAGTCCTTTTGTATTTGTAAGTTTTTCTCCATCTCCTTTGTCATTGGCCCTCCTACCTCTTCTGTACCGTGCTATTGTGGTGTTGACCTTTTCTTCGAGACTTTTGAAGAAGCTTGTCTCTTCTTCTCCATCAAAACATATTTCTGCCAGGTTGTCTTCCGATCTCCCTGTCTCTTCTCCCTTGGAACCGATGACCAATCTAGAGACTAACTTGGAAACTTTATATTCATAGTCTGAGTGGCTCAACTTATACTTTTGTTTTCTTACGAAACTCTCCGTAATTTGACTCACAGCACTAACAAGCAATTTGTTAAAGTCATATTCCAGAAGTCGTTCTCCATTTAGATGCTTATTAACCACCACACTTTTGTTACTAGCAAGATCTAATGCTGTCGCACATCCAGAGTTAGTCATGGGATCTAGGCTGTTTAGCTTCTTCTCTCCTTTGAAAATTAAAGTGCCGTTGTTAAATGAAGACACCATTAGGCTAAAGGCTTCCAGATTAACACCTGGAGTTGTATGCTGACAGTCAATTTCTTTACTAGTGAATCTCTTCATTTGCTCATAGAACACACATTCTTCCTCAGGAGTGATTGCTTCCTTGGGGTTGACAAAAAAACCAAATTGACTTTTGGGCTCAAAGAACTTTTCAAAACATTTTATCTGATCTGTTAGCCTGTCAGGGGTCTCCTTTGTGATCAAATGACACAGGTATGACACATTCAACATAAATTTAAATTTTGCACTCAACAACACCTTCTCACCAGTACCAAAAATAGTTTTTATTAGGAATCTAAGCAGCTTATACACCACCTTCTCAGCAGGTGTGATCAGATCCTCCCTCAACTTATCCATTAATGATGTAGATGAGAAATCTGACACTATTGCCATCACCAAATATCTGACACTCTGTACCTGCTTTTGATTTCTCTTTGTTGGGTTGGTGAGCATTAGCAACAATAGGGTCCTCAGTGCAACCTCAATGTCGGTGAGACAGTCTTTCAAATCAGGACATGATCTAATCCATGAAATCATGATGTCTATCATATTGTATAAGACCTCATCTGAAAAAATTGGTAAAAAGAACCTTTTAGGATCTGCATAGAAGGAAATTAAATGACCATCCGGGCCTTGTATGGAGTAGCACCTTGAAGATTCTCCAGTCTTCTGGTATAATAGGTGGTATTCTTCAGAGTCCAGTTTTATTACTTGGCAAAACACTTCTTTGCATTCTACCACTTGATATCTCACAGACCCTATTTGATTTTGCCTTAGTCTAGCAACTGAGCTAGTTTTCATACTGTTTGTTAAGGCCAGACAAACAGATGATAATCTTCTCAGGCTCTGTATGTTCTTCAGCTGCTCTGTGCTGGGTTGGAAATTGTAATCTTCAAACTTCGTATAATACATTATCGGGTGAGCTCCAATTTTCATAAAGTTCTCAAATTCAGTGAATGGTATGTGGCATTCTTGCTCAAGGTGTTCAGACAGTCCGTAATGCTCGAAACTCAGTCCCACCACTAACAGGCATTTTTGAATTTTTGCAATGAACTCACTAATAGACGCCCTAAACAATTCCTCAAAAGACACCTTTCTAAACACCTTTGACTTTTTTCTATTCCTCAAAAGTCTAATGAACTCCTCTTTAGTGCTGTGAAAGCTTACCAGCCTATCATTCACACTACTATAGCAACAACCCACCCAGTGTTTATCATTTTTTAACCCTTTGAATTTCGACTGTTTTATCAATGAGGAAAGACACAAAACATCCAGATTTAACAACTGTCTCCTTCTAGTATTCAACAGTTTCAAACTCTTGACTTTGTTTAACATAGAGAGGAGCCTCTCATATTCAGTGCTAGTCTCACTTCCCCTTTCGTGCCCATGGGTCTCTGCAGTTATGAATCTCATCAAAGGACAGGATTCCACTGCCTCCCTGCTTAATGTTAAGATATCATCACTATCAGCAAGGTTTTCATAGAGCTCAGAGAATTCCTTGATCAAGCCTTCAGGGTTTACTTTCTGAAAGTTTCTCTTTAATTTCCCACTTTCTAAATCTCTTCTAAACCTGCTGAAAAGAGAGTTTATTCCAAAAACCACATCATCACAGCTCATGTTGGGGTTGATGCCTTCGTGGCACATCCTCATAATTTCATCATTATGAGTTGACCTCGCATCTTTCAGAATTTTCATAGAGTCCATACCGGAGCGCTTGTCGATAGTAGTCTTCAGGGACTCACAGAGTCTAAAATATTCAGACTCTTCAAAGACTTTCTCATTTTGGTTAGAATACTCCAAAAGTTTGAATAAAAGGTCTCTAAATTTGAAGTTTGCCCACTCTGGCATAAAACTATTATCATAATCACAACGACCATCTACTATTGGAACTAATGTGACACCCGCAACAGCAAGGTCTTCCCTGATGCATGCCAATTTGTTAGTGTCCTCTATAAATTTCTTCTCAAAACTGGCTGGAGTGCTCCTAACAAAACACTCAAGAAGAATGAGAGAATTGTCTATCAGCTTGTAACCATCAGGAATGATAAGTGGTAGTCCTGGGCATACAATTCCAGACTCCACCAAAATTGTTTCCACAGACTTATCGTCGTGGTTGTGTGTGCAGCCACTCTTGTCTGCACTGTCTATTTCAATGCAGCGTGACAGCAACTTGAGTCCCTCAATCAGAACCATTCTGGGTTCCCTTTGTCCCAGAAAGTTGAGTTTCTGCCTTGACAACCTCTCATCCTGTTCTATATAGTTTAAACATAACTCTCTCAATTCTGAGATGATTTCATCCATTGCGCATCAAAAAGCCTAGGATCCTCGGTGCG
| 47
|
NC_004291.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Salvato,M., Shimomaye,E., Oldstone,M.B.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-02
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,680
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Lymphocytic choriomeningitis virus segment L, complete sequence
|
CGCACCGAGGATCCTAGGCTTTTTGATGCGCAATGGATGAAATCATCTCAGAATTGAGAGAGTTATGTTTAAACTATATAGAACAGGATGAGAGGTTGTCAAGGCAGAAACTCAACTTTCTGGGACAAAGGGAACCCAGAATGGTTCTGATTGAGGGACTCAAGTTGCTGTCACGCTGCATTGAAATAGACAGTGCAGACAAGAGTGGCTGCACACACAACCACGACGATAAGTCTGTGGAAACAATTTTGGTGGAGTCTGGAATTGTATGCCCAGGACTACCACTTATCATTCCTGATGGTTACAAGCTGATAGACAATTCTCTCATTCTTCTTGAGTGTTTTGTTAGGAGCTCACCAGCCAGTTTTGAGAAGAAATTTATAGAGGACACTAACAAATTGGCATGCATCAGGGAAGACCTTGCTGTTGCGGGTGTCACATTAGTTCCAATAGTAGATGGTCGTTGTGATTATGATAATAGTTTTATGCCAGAGTGGGCAAACTTCAAATTTAGAGACCTTTTATTCAAACTTTTGGAGTATTCTAACCAAAATGAGAAAGTCTTTGAAGAGTCTGAATATTTTAGACTCTGTGAGTCCCTGAAGACTACTATCGACAAGCGCTCCGGTATGGACTCTATGAAAATTCTGAAAGATGCGAGGTCAACTCACAATGATGAAATTATGAGGATGTGCCACGAAGGCATCAACCCCAACATGAGCTGTGATGATGTGGTTTTTGGAATAAACTCTCTTTTCAGCAGGTTTAGAAGAGATTTAGAAAGTGGGAAATTAAAGAGAAACTTTCAGAAAGTAAACCCTGAAGGCTTGATCAAGGAATTCTCTGAGCTCTATGAAAACCTTGCTGATAGTGATGATATCTTAACATTAAGCAGGGAGGCAGTCGAATCCTGTCCTTTGATGAGATTCATAACTGCAGAGACCCATGGGCACGAAAGGGGAAGTGAGACTAGCACTGAATATGAGAGGCTCCTCTCTATGTTAAACAAAGTCAAGAGTTTGAAACTGTTGAATACTAGAAGGAGACAGTTGTTAAATCTGGATGTTTTGTGTCTTTCCTCATTGATAAAACAGTCGAAATTCAAAGGGTTAAAAAATGATAAACACTGGGTGGGTTGTTGCTATAGTAGTGTGAATGATAGGCTGGTAAGCTTTCACAGCACTAAAGAGGAGTTCATTAGACTTTTGAGGAATAGAAAAAAGTCAAAGGTGTTTAGAAAGGTGTCTTTTGAGGAATTGTTTAGGGCGTCTATTAGTGAGTTCATTGCAAAAATTCAAAAATGCCTGTTAGTGGTGGGACTGAGTTTCGAGCATTACGGACTGTCTGAACACCTTGAGCAAGAATGCCACATACCATTCACTGAATTTGAGAACTTTATGAAAATTGGAGCTCACCCGATAATGTATTATACGAAGTTTGAAGATTACAATTTCCAACCCAGCACAGAGCAGCTGAAGAACATACAGAGCCTGAGAAGATTATCATCTGTTTGTCTGGCCTTAACAAACAGTATGAAAACTAGCTCAGTTGCTAGACTAAGGCAAAATCAAATAGGGTCTGTGAGATATCAAGTGGTAGAATGCAAAGAAGTGTTTTGCCAAGTAATAAAACTGGACTCTGAAGAATACCACCTATTATACCAGAAGACTGGAGAATCTTCAAGGTGCTACTCCATACAAGGCCCGGATGGTCATTTAATTTCCTTCTATGCAGATCCTAAAAGGTTCTTTTTACCAATTTTTTCAGATGAGGTCTTATACAATATGATAGACATCATGATTTCATGGATTAGATCATGTCCTGATTTGAAAGACTGTCTCACCGACATTGAGGTTGCACTGAGGACCCTATTGTTGCTAATGCTCACCAACCCAACAAAGAGAAATCAAAAGCAGGTACAGAGTGTCAGATATTTGGTGATGGCAATAGTGTCAGATTTTTCATCTACATCATTAATGGATAAGTTGAGGGAGGATCTGATCACACCTGCTGAGAAGGTGGTGTATAAGCTGCTTAGATTCCTAATAAAAACTATTTTTGGTACTGGTGAGAAGGTGTTGTTGAGTGCAAAATTTAAATTTATGTTGAATGTGTCATACCTGTGTCATTTGATCACAAAGGAGACCCCTGACAGGCTAACAGATCAGATAAAATGTTTTGAAAAGTTCTTTGAGCCCAAAAGTCAATTTGGTTTTTTTGTCAACCCCAAGGAAGCAATCACTCCTGAGGAAGAATGTGTGTTCTATGAGCAAATGAAGAGATTCACTAGTAAAGAAATTGACTGTCAGCATACAACTCCAGGTGTTAATCTGGAAGCCTTTAGCCTAATGGTGTCTTCATTTAACAACGGCACTTTAATTTTCAAAGGAGAGAAGAAGCTAAACAGCCTAGATCCCATGACTAACTCTGGATGTGCGACAGCATTAGATCTTGCTAGTAACAAAAGTGTGGTGGTTAATAAGCATCTAAATGGAGAACGACTTCTGGAATATGACTTTAACAAATTGCTTGTTAGTGCTGTGAGTCAAATTACGGAGAGTTTCGTAAGAAAACAAAAGTATAAGTTGAGCCACTCAGACTATGAATATAAAGTTTCCAAGTTAGTCTCTAGATTGGTCATCGGTTCCAAGGGAGAAGAGACAGGGAGATCGGAAGACAACCTGGCAGAAATATGTTTTGATGGAGAAGAAGAGACAAGCTTCTTCAAAAGTCTCGAAGAAAAGGTCAACACCACAATAGCACGGTACAGAAGAGGTAGGAGGGCCAATGACAAAGGAGATGGAGAAAAACTTACAAATACAAAAGGACTACATCATTTACAGCTTATTCTAACAGGGAAGATGGCTCACTTAAGAAAAGTTATCTTGTCAGAAATATCTTTCCATTTAGTAGAAGACTTTGACCCATCATGTCTAACCAATGATGACATGAAATTTATCTGTGAGGCTGTTGAGGGTTCCACAGAGCTGTCACCTTTGTATTTCACCTCAGTCATTAAAGATCAGTGTGGCCTCGATGAGATGGCAAAAAACCTTTGTAGAAAGTTCTTTTCTGAGAATGATTGGTTTTCTTGCATGAAGATGATTCTGTTGCAAATGAATGCAAATGCGTACTCAGGGAAATACAGGCATATGCAAAGGCAAGGCTTGAATTTCAAATTTGACTGGGACAAACTGGAAGAAGACGTGAGAATCAGTGAGAGGGAAAGTAATTCTGAGTCCCTTAGTAAAGCTCTGTCGTTGACAAAATGTATGAGTGCTGCTTTGAAAAATCTGTGCTTCTACTCAGAAGAATCACCAACATCATACACCTCAGTAGGTCCTGACTCTGGAAGGCTGAAATTTGCACTATCTTATAAAGAGCAGGTTGGGGGAAATAGAGAACTCTATATTGGAGATTTGAGGACAAAAATGTTCACAAGGTTAATAGAAGATTATTTTGAGTCTTTTTCAAGTTTCTTTTCAGGCTCCTGTTTAAACAATGATAAGGAATTTGAAAATGCAATCTTGTCAATGACTATCAATGTGCGGGAAGGGTTCTTAAACTATAGTATGGATCACAGCAAATGGGGACCAATGATGTGCCCATTTTTGTTCTTAATGTTTCTACAAAATCTCAAACTAGGTGATGACCAGTATGTGCGTTCCGGGAAAGATCATGTTAGCACTTTGTTAACTTGGCACATGCATAAGCTTGTCGAGGTCCCCTTTCCTGTTGTGAATGCAATGATGAAATCATATGTCAAGTCGAAGCTAAAACTTCTCAGGGGTTCAGAAACAACTGTTACTGAGAGAATTTTCAGACAATATTTTGAAATGGGGATAGTGCCATCCCATATATCCAGCCTTATTGATATGGGGCAGGGAATCTTGCATAATGCTTCTGACTTCTATGGTTTGCTTAGCGAGAGGTTCATCAACTACTGCATTGGTGTTATCTTTGGCGAAAGACCAGAGGCTTACACATCAAGTGATGATCAGATCACTTTATTTGATAGGAGGCTGAGTGACCTGGTTGTAAGTGATCCGGAGGAAGTCCTTGTCCTGTTGGAATTCCAATCTCATCTGAGCGGCTTGTTAAACAAATTTATCAGCCCAAAAAGTGTGGCTGGGAGGTTCGCTGCAGAATTTAAATCTAGATTCTATGTATGGGGGGAGGAAGTCCCTCTTCTCACAAAGTTTGTATCTGCAGCGCTACACAATGTCAAGTGTAAAGAGCCACATCAACTTTGTGAAACAATAGATACAATTGCAGATCAAGCCATCGCAAATGGCGTCCCAGTCTCCCTAGTTAATAGTATCCAAAGGAGAACACTGGACCTCCTAAAGTATGCCAATTTCCCTTTGGATCCATTTCTACTGAATACCAACACTGATGTGAAAGATTGGCTGGATGGTTCTAGAGGTTACAGAATACAAAGACTCATTGAGGAACTGTGTCCTAATGAAACAAAGGTTGTAAGAAAGCTTGTAAGGAAACTGCATCATAAGCTCAAAAATGGTGAATTTAATGAAGAATTTTTCTTAGACCTATTTAACAGAGATAAAACGGAGGCCATTCTTCAATTGGGAGACCTCCTCGGTCTTGAAGAAGATCTGAATCAGTTAGCAGATGTTAACTGGTTGAATTTGAATGAAATGTTCCCATTAAGGATGGTTTTAAGACAAAAGGTGGTTTATCCATCAGTGATGACTTTCCAAGAGGAAAGAATCCCATCATTGATCAAGACACTCCAGAACAAACTTTGTAGTAAATTCACAAGGGGTGCACAGAAGCTGCTGTCAGAAGCAATCAACAAGTCAGCTTTCCAGAGTTGTATCTCATCTGGCTTTATAGGCCTTTGCAAAACTCTAGGAAGCAGGTGTGTGAGAAACAAAAATAGGGAAAATCTGTATATCAAAAAGCTGCTTGAGGATCTAACCACAGATGATCATGTGACAAGAGTTTGCAATCGGGATGGTATAACGCTGTACATTTGTGACAAACAGTCTCATCCAGAAGCCCACCGTGATCATATATGCCTTTTAAGGCCTCTTCTTTGGGACTACATTTGTATTTCATTGAGCAACTCTTTTGAGTTGGGTGTTTGGGTCCTAGCAGAACCGACCAAAGGGAAGAATAACAGTGAGAACCTAACTCTTAAGCACTTAAACCCATGTGATTATGTAGCAAGAAAGCCTGAGAGCTCAAGGCTACTGGAGGACAAAGTGAATTTGAACCAAGTGATTCAATCTGTGAGGCGGCTATATCCCAAGATCTTTGAGGATCAGCTTCTTCCATTTATGTCTGACATGAGCTCAAAAAACATGAGGTGGAGTCCCAGAATTAAATTCCTTGACCTCTGTGTTTTAATTGATATTAACTCAGAATCCTTGTCACTCATTTCTCATGTTGTTAAGTGGAAAAGGGATGAACATTACACTGTTCTGTTTTCTGACCTTGCCAATTCTCATCAGCGATCTGACTCCAGTCTGGTTGATGAATTTGTTGTTAGCACGAGGGATGTCTGCAAGAACTTCTTAAAACAGGTGTATTTTGAATCATTTGTTCGAGAATTTGTTGCAACAACCAGGACATTAGGCAATTTTTCATGGTTCCCTCATAAAGAAATGATGCCATCTGAAGATGGTGCTGAGGCACTGGGCCCCTTTCAATCATTTGTCTCAAAGGTGGTGAACAAAAATGTGGAGAGGCCTATGTTTAGGAATGATTTGCAGTTTGGTTTTGGGTGGTTCTCTTACCGAATGGGAGATGTTGTGTGTAATGCTGCCATGTTGATTAGGCAGGGCCTGACAAACCCAAAGGCATTTAAATCCTTAAAGGATCTGTGGGACTACATGCTCAACTACACAAAAGGGGTATTGGAGTTTTCAATTTCAGTGGACTTTACGCACAATCAGAATAATACTGACTGTTTAAGGAAATTTTCATTGATATTCTTGGTTAGGTGCCAATTACAGAATCCAGGTGTGGCTGAACTTTTATCATGCTCTCACCTCTTTAAGGGTGAGATAGATAGAAGAATGTTGGATGAATGCCTCCACTTACTGAGGACAGACTCTGTCTTCAAGGTGAACGATGGTGTCTTTGATATCAGATCTGAAGAGTTTGAGGATTACATGGAAGATCCCTTGATACTTGGTGATTCTCTTGAGCTTGAGTTGTTGGGCTCCAAAAGAATACTGGATGGGATTAGATCTATTGACTTTGAGAGAGTTGGACCTGAGTGGGAGCCTGTGCCACTGACTGTAAAGATGGGTGCCCTTTTTGAAGGAAGAAACCTTGTCCAAAATATCATTGTGAAGCTGGAGACCAAGGACATGAAAGTCTTTCTAGCAGGACTTGAGGGCTATGAAAAGATTAGTGATGTCCTTGGGAACCTCTTCCTGCATCGATTCAGAACTGGTGAACATTTGTTGGGTTCAGAGATAAGTGTAATCCTCCAGGAACTATGTATAGACAGATCTATTCTGCTGATTCCACTGTCGCTTTTGCCAGACTGGTTCGCCTTTAAGGATTGCAGACTTTGTTTTAGCAAATCTAGGAGCACTTTGATGTATGAAATAGTGGGGGGCAGGTTTAGACTCAAGGGGAGGTCCTGCGACGATTGGCTAGGCGGGTCGGTGGCCGAGGACATCGACTGATGGGCATCTCCTGGG
| 9,009
|
OR645477.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Pyke,A.T.
|
Queensland Health Forensic and Scientific Services, Public Health Virology
|
Australia
|
2023-10-31
|
QLD_37029S
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,200
|
GenBank
| null |
Australia: Queensland
|
Australia
|
Homo sapiens
| null |
2021
| null | null |
Mammarenavirus choriomeningitidis isolate QLD_37029S segment L, complete sequence
|
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| 11,430
|
ON236642.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Liu,Z., Li,L., Wang,D., Zhang,L., Liang,X., Wang,Z., Wei,F., Fan,S.
|
Jilin Agricultural University, College of Life Science
|
China
|
2023-07-03
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,241
|
GenBank
| 1
|
China: Dunhua,Jilin
|
China
|
Bos taurus
| null |
2021-04-28
| null | null |
Mammarenavirus choriomeningitidis strain JL-DH01 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCGTTTAGTTGCGCTAGTTTGCTGTACAACTTCCTTGTGCGAAACTACTGGCAGCAGGCCAGACTGTCAACCATGGGTCAGGGAAAATCCCGGGAGAAGAGAGACACCAGCAACACAGACAGAGCTGAAATTCTGCCGGACACCACATATCTTGGTCCTCTGAATTGCAAGTCATGTTGGCAAAGGTTTGACAGCTTGGTCAGGTGTCATGATCACTACTTATGCAGACACTGTCTAAATCTCCTGTTGTCTGTCTCTGACAGATGCCCCCTCTGCAAGTATCCCCTGCCAACCAAACTGAGAATGTCAACAGCCCCAAGCTCGCCTCCTCCATACGAGGAGTGATAGTCCCAAAAACCCGACGACAACACTCAGCCCCACACACAGGTCGAAACACACAGACACACACACACACACAAACACACACACAAAGCCCAACACAGAAAACCAAGGCAAACACACACACCCACAAACCCACACCCACGCGCCCCCCACACCGGGGGGCGCCCCCCCGGGGGGTGGCCCCCCGGGGGCCCGGGCGGAGCCCCGCGGAGTCGCCGATCAGTCGATCTCCTCCGCCACCGGCCCGGACAGCCAGTCATCACAGGACTTCCCCTTGAGTCTGAATCTACCCCCGACCGTCTCATACATCACTGTGTTCTTTGACTTACTAAAACAAAGTCTGCAGTCCTTGAAGGTGAACCAGTCTGGAACAAATGATAGTGGCGTCAGCAACACGGACCTGTCTATGCACAGCTCTTGGAGAATTATAGATATCTCTGATCCCATCATGTGCTCACCAGTTTTAAAACGATGCAGGAGGAGACTGCCGAGAACCTCACCAACTCTGTCATAACCATCAAGTTCCGCCAAGAAAACCCTCATATCTTTCGTCTCCAGCTTCACGAGAATGTTCTGGACAAAATTCCTCCCTTCAAAAAGGGCACCCATCCTTATAGTCAGAGGTACAGGCTCCCACTCAGGCCCAACCCTCTCAAAATCGAGAGATCTAACCCCATCTAGTATCTTTCTGGACCCTATTAACTCAAGCTCTAGAGAATCACCAAGTGTTAAAGGGTCTTCCATATAATCCTCAAATTCTTCGGACCTGATGTCAAAGACACCATCACTCACCCTGAAGATGGAATCTGATCTTAATAGATTCAGGCACTCATCCAGCAACCTCCTGTCAACTTCACCTTTGAAGAGATGAGAACATGATAAAAACTCAGCGATGCCTGGGCTCTGCAGTTGGCATTTCACCAAAAAAATCAGTGAGAATTTTCTCAGACAGTCAGTATTGTTTTGATTATGTGTAAAATCAACTGTAATTGAAAACTCCAATATTCCCTTGGTATTATCAAGCATATAATCCCATAAACCCTTCAAGGATTTAAACATCTTTGGATTTGTCAAGCCCTGCCTAACCAGCATAGCAGTGTTGCAGACAATATCCCCCACTTTGTAGGAGAACCACCCAAAGCCAAACTGCAGGTCATCTTTGAACATGGGCCTTTCAATATTCTTATTGACTACTTTTAAGATGAATGATTGAAAAGGTCCTAGTGCCTCAGCACCGTCTTCAGATGGCATCATATCTTTATGGGGGAACCATGAAAAGCTGCCTAAGGTCCTGGCTGTTGCAACGAATTCTCGCACAAAAGACTCAAAGTACACCTGCTTCAAAAAGTTTTTACAAACATCCCTTGTGCTAACAACAAATTCATCAACAAGGCTTGAGTCAGATCGCTGATGAGAATTAGCAAGGTCTGAGAATAGTACAGTATAATGTTCATCTCTCTTCCATTTAACAACGTGAGAAATAAGTGATAAGGACTCTGAGTTAATGTCAATCAACACACAAAGGTCAAGAAATTTGATTCTGGGACTCCATCTCATGTTTTTTGAACTCATGTCTGACATGAACGGAAGTAACTGGTCCTCAAAAATCTTAGGATATAACCGCCTCACAGATTGAATCACATGATTCAAACTAACTTTGTCCTCAAGCAGTCTTGAGCCTTCAGGTTTTCTTGCCACATAATCACACGGGTTCAATTGCTTGAGGCTTAAATTCTCACCACCCTTCCCCTTCACAGGCTCTGCCAAGACCCAAACACCCAATTCAAAAGAGTTGCTCAAGGAGATGCAGATGTAATCCCAAAGGATGGGCCTTAAGAAACTAATGTGGTCACTGTTGGCTTGTGGGTGGTCCTGCCTGTCACAGACGTACAGCATTATACCATCATGCTTCTGAACCTTTATCACATGCTCATCAACAGCTAGATCTTCAAGCACCTTCCTTATGTACAGATTCTCTCTGTTTTTATTTCTCACGCATCTGCTTCCCAGAGTCTTACACAGACCTATGAAACCGGATGATACACAACTCTGGAAAGCTGACTTGTTAATCGCTTCTGATAGTAGCTTTTGTGCACCCCTCGTGAACTTACTACAGAGCTTATTCTGGAGTGTCTTTATTAATGAAGGGATTCTTTCTTCTTGGAAAGTCATCACCGATGGATAAACCACTTTTTGTCTCAAAACCATCCTCAGCGGGAACATCTCGTTTAAGTTCAACCAATTAATATTTGCTAGTTGACTTAAATCTTCCTCAAACCCTAAGATGTTCGCTAACTGAAGAATGGCCTCTTTCTTTTCTCTATTGAAAAGATCCAAGAAGAACTCCTCATTAAATTCGCCGTTCTTAATCTTGTGGTGCAACTTCCTCACAAGTTTTCTCATAACTTTTGTTTCATCAGGACACAATTCCTCAATGAGCCTTTGGATTCTATAACCTCTTGAGCCGTCCAGCCAGTCCTTCACATCAGTGTTTGTATTCAACAAGAATGGATCCAGAGGAAAGTTGGCATATCTTAGGAGGTCCAATGTTCTCCCCTGGATACAGTTCACTAATGATACTGGGACACCATTCGCAACTGCTTGATCAGCAATTGTGTCTATGGTTTCACAGAGTTGGTGTGGCTCTTTACACTTAACATTATGTAGCGCTGCAGACACAAATTTTGTGAGAAGAGGGACCTCCTCCCCCCATACATAAAATCTAGATTTAAATTCAGCGGCAAAGCGCCCAACTACACTTTTAGGACTGATGAATTTATTAAGCAAACCACTTAAATGAGAATGAAATTCCAGTAGAACAAGTACCTCCTCTGGGTCACTATCTACCAGCTCACTTATTCTTTTGTCAAATAGAGTGATTTGATCATCACTTGATGTGTAGGCCTCTGGTCTTTCACCAAAGATAACACCAATGCAATAGTTGATGAATCTCTCACTGATTAAGCCGTAAAAGTCAGAGGCATTATGTAAGATCCCCTGTCCCATATCAATGAGGCTGGATATATGGGATGGAACCACTCCTCTTTCAAAGTACTCTCTAAAGATCCTTTCAGTGACAGTTGTCTCTGAACCCCTAAGAAGCTTTAGTTTTGATTTAACATATGACTTCATCATTGCATTCACAACAGGAAAAGGAACCTCAACAAGTTTATGCATGTGCCAGGTTAGTAGAGTGCTGACATGATCTTTCCCAGAGCGCACATATTGGTCATCACCCAGTTTCAAATTCTGGAGAAGCATAAGGAACAAAAATGGGCACATCATAGGTCCCCACTTACTATGATCCATACTGTAATTTAGAAACCCTTCTCTCACATTGATGGTCATTGACAGTATTGCATTTTCAAATTCTTTGTCATTGTTTAAACATGAGCCCGAAAAGAAACTGGAAAAGGACTCAAAATAGTCTTCTACTAGTCTTGTGAACATCTTTGTCCTCAAGTCACCAATGTAAAGCTCTCTGTTTCCTCCAACTTGCTCTTTATAAGACAATGCAAACTTCAGTCTTCCGGAATCAGGCCCAACTGAGGTATATGATGTTGGTGATTCTTCTGAATAAAAACACAAGTTTTTTAAGGCAGCACTCATGCATTTCGTCAATGACAGGGCCTTACTTAAAGACTCAGAATTGCTCTCCCTTTCACTAATTCTCACGTCTTCTTCCAATTTGTCCCAGTCAAACTTGAAATTCAGGCCCTGCCTCTGCATATGTCTGTATTTCCCTGAGTATGCGTTTGCATTCATCTGCAATAGAATCATCTTCAAACAGGAAAACCAGTCACCCTCTGAAAAGAACTTTCTGCAGAGATTCTTTGCCATCTCATCCAAGCCACACTGTTCTTTGGTAGATGGAGTGAAATACAATGATGATAGTTCTGTGGAACCTTCAACAGCCTCACATACAAATTTCATATCATCATTAGTAAGATAAGATGGGTCAAAGTCTTCCACTAGATGGAAAGATATCTCTGACAGAATTATTTTCCTTAGGTAAGCCATCTTGCCTGACAAAACAGTTTGAAGATGATGTAGTCCCTTTGTGTTTTTCAATCCTTCCTCGTCTTCTCCCCCACTCACCTTCTTGCTTTTCCTGTACTGAGTTATTGTGGAGTTGACCTTGTCTTCTAAACCTTTGAAAAAGTTTGTCTCCTCCTCTCCTTCAAAACAAATATCTTCTGAATCACCTTCTAATTTCCCCGCTTCAGATTCTTTAGAACCGATGACCAATCTGGAGACCAACTTTGAGACCTTGTATTCATAATCTGAATGATGCAATTTGTACTTCTGCTTTCTCATAAAGCCCTCTGTGATCTGACTCACAGCACTAACAAGTAATTTATTAAAATCATATTGTAAAAGCCGTTCCCCATTCAGATGTTTATTAACAACCACGCTTTTATTGCTGGCAAGATCTAAAGCTGTTGCACACCCAGAATTGGTCATTGGGTCCAAGCTATTGAGCTTTTTCTCCCCTTTGAAGATTAGTGTGCCGTTATTGAATGAGGAGACCATCAAACTAAAAACCTCTAAATTAACACCTGGGCTTGTACTCTGACAGTCAATTTCTTTACTAGTGAACTTTTTCATTTGCTCATAAAAGACACACTCTTCTTCAGGAGT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| 14,799
|
ON236644.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Liu,Z., Li,L., Wang,D., Zhang,L., Liang,X., Wang,Z., Wei,F., Fan,S.
|
Jilin Agricultural University, College of Life Science
|
China
|
2023-07-03
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,241
|
GenBank
| 1
|
China: Dunhua,Jilin
|
China
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Bos taurus
| null |
2021-04-28
| null | null |
Mammarenavirus choriomeningitidis strain JL-DH02 segment L, complete sequence
|
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| 14,800
|
OP958777.2
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mehl,C., Wylezich,C., Geiger,C., Schauerte,N., Matz-Rensing,K., Nesseler,A., Hoper,D., Linnenbrink,M., Beer,M., Heckel,G., Ulrich,R.G., Friedrich-Loeffler-Institut,Io.D.V.
|
Friedrich Loeffler Institut, Institute of Diagnostic Virology
|
Germany
|
2023-03-07
|
211011664_L5409
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,204
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Leontopithecus rosalia
|
brain
|
2022
| null | null |
Mammarenavirus choriomeningitidis isolate 211011664_L5409 segment L, complete sequence
|
CTAGGCGTTAATTTGCGCTTCTTTGTAGACAACCTTGTTATCCAAAAGATTGCCTCTCAGGCACAGTGCTGTCATGGGGCAGGCAAAAACCAAAAAGATAAGGCCCTCCGAAGACGAGGACAGAGCAGAAGTCCTGCCCGATGCAACCTATCTTGGTCCTCTAAATTGCAAGTCATGCTGGCAAAGATTTGACAGTCTAGTCAGGTGTCATGACCATTACTTATGTAGACAATGTCTGAACCTCTTACTAACGGTCTCAGACAGATGCCCTCTCTGCAAACATCCTCTTCCCACAAGGCTGAGGGTGTCACCAGCCCCCAGCTCACCTCCTCCTTACGAAGAATGAACAATCGAGAAGCCCGACCGCCCCCACCAGCCCCACACACCCAGTCCCCGCACACGACAACCACGCAAACACACACACAGACACGCACACACACACACCCAGACACCACAAACCCCGGCAAAAGCCACCGAAACACGACACCCACCCTCAGCCCAGCCCCCCACGCGCGGGGGGCCCCCCGGGGGGACCCCCCCGGGGGGCTCGCGGGCGCCGCTCAGTCTATGTCCTGCACTGATGGCTCTTCTAACCAGTCATCACAGGATCTTCCCTTAAGCCTGTACCTCCCACTCACTGTCTCAAACATGATAGTGTCCTTTGACTTGCTATAGCAAAGTCTGCAGTCTCTAAAAGAAAACCAATCTGGCACATTCTTCAGTGGTGAGAGTAAAGTGGACCTTGTGATGTGCAGTTCCTGAAGGATGGCATTAATGTCTGAGTTTACTAAATGCTCACCTGTTCTGAACCTGTGCAGGAAGAGGTCACCAAGCACATCATTAGCTCTTACATAACCTTCCAGTTCGGCTAACATAACTTTAAGGTCTTTGGTCTCCAGATTAACCACAATGTTTTGAACAAAGTTTCTTCCTTCAAAAAAGGCACCACATTTGACAGTTAGGGGCACAGGCTCCCACTCAGGTCCAACCCTATCAAAGTCAAAAGACTTAACGTCACTCAAAATATTGTTAGACCCCAACAGTTCCAACTCAACAGAATCACCTAGTATGACTGGGTCGGTCATATAATCTTCAAATTCTTCCGATCTAATGTCGAATATGCTGCTCTTAGACTTGAATATAGGATCTGTTCTCAACAAGCTGAGACATTCATCTAACAGTCTTCTGTCTACCTCACCCTTGAACATATAATTGCATGACAAGAACTCAGCAACACCTGGATCAAGTAATCTACATCTCACTGTGAACATCAATGAAAATCTCCTTAGGTGCTCTGTATTGTTTTGGTTATGTGTGAAATCAACAGTTAACGTAAATTCCAATAGACCTTTTGTGTGGTTGAGGAAATACTCCCACAAATCTTTCAGTGTCCTAAATGTCCTTGAGTTTGCCATACCCTGCTTTATTAGCATGGCTGCATTGCAAACTATATCCCCCAAACGATAAGAAAACCATCCGTACCCGAACTGTAGGTCAGTCTTGTACATAGGCCTCTCAACATCTTTATTCACCACTTTCAGCACAAATGATTGAAGCGGTCCCATAGCCTCTGCCCCATCCTCGGAGGGCATCATGTCACGGTGAGGGAACCATGAAAAGTTCCCCAACGTTCGGGATGTAACCACAAATTCTCGAACAAATGACTCAAAATACACTTGTTTTAAGAAGTTTTTACACACATCCCTTGTGCTAACCACAAACTCATCAGTTAAGCTTGAGTCAGTACGCTGGTGTGAATTGACAAGGTCTGAAAAAAGAACTGTGTAATGCTCATCCCTTTTCCACTTCACCATGTGTGAAATGAGTGACAGTGATTCTGAGTTTATGTCAATCAGTACACATAAATCAAGGAATTTGATTCGAGGGCTCCACCTCATATTCTTTGAGCTCTGATCTGACATAAATGGTAAAAGTTGTTCTTCAAAGATCTGAGGGTACAGCCTTCTAACAGATTGTAAAACATGGTTCAAATTGACTTTGTCCTCTAAAAGCCTTGAACTTTCAGGTTTCCTAGCAACATAGTCACAAGCGTTGAGTTGCTTTGGTACCAGTTTCACAACCTCCCTTGCTTTAATGGGTTCTGCTAGCACCCACACACCTAGCTCGAATGAATTACTTAGGGAAACACAGATGTAATCCCAGAGGAGGGGCCTTAAGAGACTTATGTGACAGAGATTAGGTTCTGGATGTGTGTGTTTGTCACAGATGTATAAAACCATATCCTCACCTTTCTGAACCCTCGAGACATGGTTATCTCGGGATAGATCTTCTAAAACTCTTTTTATATACAGATTCTCTTTATCTTTATTTCTTATACATCTGCTCCCCAAAGTTTTGCAGAGACCTATAAAGCCTGAAGAAATGCAACTCTGGAAAGCTGACTTATTTATGGCTTCTGAGAGTAGCTTCTGTGCCCCTCTAGTAAACTTAGAACATAGTTTGTTTTGAAGAGTTTTTATTAATGAGGGCACTTTCTCTTCTTGAAAGCTCATCACTGACGGATACACCACTTTTTGTCTTAATACCATCCTCATGGGAAACATCTCATTAAGATTCAACCAATTGATGTTGGCGATATCATTTATGTCATCTTCTATACCAAGAATTTCTGCAAGCTGTAGAATAGCATCTTTCTTATCTCTGTTAAAAAGATCCAAGAAGAATTCTTCATTGAATTCTCCATTTTTCAACTTGTGATGCAGTCTTCTTATCAACTTCCTCATCACCTTTGTCTCTTGTGGACACAAGTTCTCAATCAGCCTTTGAATTCTATAACCCCTAGACCCATCCAACCAATCCTTCACATCTGTGTTTATGTTCAACAAGAAAGGGTCCAATGGAAAATTCGCATATTTTAATAGATCCAATGTCCTCTTTTGAATGCAATTAACCAGTGCAATAGGTACGCCGTTTGCGACAGCCTGATCAGCAATTGTGTCAATAGTCTCACATAACTGATGGGGTTCCTTGCACTTTATGTTATGCAAAGCAGCTGACACAAACTTTGTGAGAAGAGGCACCTCTTCTCCCCAGACATAAAACCGTGACTTAAATTCAGCTGCAAACCTACCGACAACACTCTTGGGACTAATAAACTTGTTTAGAAGCCCGCTCAAATGGGAATGGAATTCCAGTAAAGTGAGAACTTCCTCTGGGTCTCTATCAACCAACTCACTTAGTTTTTTGTCAAACAGAGTGATTTGATCATCACTTGATGTAAAAGCATCTGGTCTTTCACCAAAGATGACACCGATACAGTAGTTGATAAACCTCTCACTGACCAGTCCATAGAAGTCAGAGGCATTGTGCAAGATCCCCTGCCCCATATCAATGAGACTGGAGATGTGTGAAGGGACAACTCCTGAATCAAAATAACTCCTAAAGATTTCCTCCGTTGCTGTTGTCTGCGTCCCCTTTAAAAGTTTTAATTTAGCCTTAACATAAGACTTCATTAATGCATTGACAACAGGGAATGGGACCTCCACAAGTTTGTGCATGTGCCAAGTCAATAAGGTGCTTACATGGTCTTTGCCAGACTTAACATACTGATCATCACCTAGACGGAGATTCTGTAATAGCATCAGGAATAAGAATGGGCACATCATTGGGCCCCATTTGCTATGGTCCATACTATAGTTTAGGAGTCCTTCCCTTACATTTATAGTCATAGATAAGATTGCATTTTCAAATTCCCTCTCATTGTTAAGACAAGAACCTGAGAAGAAACTTGAGAAAGATTCGAAGTAATCTTCCACAAGCCTTGTGAACATCTTTGTTCTCAGATCACCAATATAGAGTTCCCTGTTTCCTCCAACTTGCTCTTTGTAAGATAGCGCGAATTTCAACCTTCCTGAATCAGGACCTACAGAGGTGTAGGATGTAGGGGACTCCTCTGAGTAAAAACATAGATTCTTCAAAGCAGCACTCAAGCACTTTGTCAATGACAGGGCCTTGCTTAGCGACTCAGAATTGCTCTCTCTTTCACTAATCCTTACATCTTCCTCCAGTTTATCCCAGTCAAACTTGAAGTTCAAACCTTGCCTCTGCATGTGCCTATACTTGCCTGAGTATGCATTAGCATTCATCTGTAGCAATATCATCTTCAGACATGAAAACCAATCCCCTTCTGAAAAAAACTTCCTGCAAAGATTCATTGCCATCTCATCCAATCCGCACTGCTCTTTAACTGTGTGGGTAAAATAGAGTGAAGAGAGCTCTGCACACCCCTCAACAGCTTCACAAACAAACTTCATGTCATCAGGTGAAAGGCAGCATGGGTCAAAGTCCTCCACCAGATGAAATGAAATTTCTGACAGAATGATCTTTCTCAAATAGGATGATTTCCCTGTCAAGACCATCTGTAAATGATGTAGACCCTTGGCCCCCTTCCCTCTTTCTAACTCTTTCAGTTGTTCAATAGTTGTCTTTTTTCCATAGTTGGATATTGTTGACTTCACTTTGCTTTCCATTTCCTTAAAGAAGAGTGTCTCCTCTTCCCCTTCAAAATAAGTCTCATCCACACTAGTTTCTTTATTCTCACTGTGTCCCTTTTCTGAGCCAAGAACCAACCTAGACACCAATTTGGACACCTTGTACTCATAATCACTATGCTTCAATTTATATTTGGTTTTTCTAACAAACCCCTCAGTAATCTGACTAACAGCACTAACAAGCAGTTTGTTAAAGTCATACTCAAGAAGACGTTCTCCATTCAAGTGTTTGTTAACGACAACACTCTTATTACTCGCCAAATCCAGTGCTGTGGCACAACCAGAATTTGTCATAGGGTCTAAGTTGTTAAGCTTTTTCTCTCCTTTGTAAATCAATGTGCCATTGTTGAAAGAGGAAACCATGAGACTGAAGGCCTCTAAATTCACACCTGGGACTACTGTTTGACAGCCTACGTCCTTGCTAACAAACTTTTTCATCTGCTCRAGAAAGGCTTCTTCTTCCTGGGGTGAAATTGTCTCTTTTGGGTT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| 17,643
|
OP958779.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mehl,C., Wylezich,C., Geiger,C., Schauerte,N., Matz-Rensing,K., Nesseler,A., Hoper,D., Linnenbrink,M., Beer,M., Heckel,G., Ulrich,R.G., Friedrich-Loeffler-Institut,Io.D.V.
|
Friedrich Loeffler Institut, Institute of Diagnostic Virology
|
Germany
|
2023-03-07
|
KS22-089_L5718
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,200
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Mus musculus domesticus
|
kidney, abdominal cavity
|
2022
| null | null |
Mammarenavirus choriomeningitidis isolate KS22-089_L5718 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCACTTATTTGCGCTATTTAGTAGCCAATACTACTTCCACAAATCCACCAGAGTTGACAAAACCACCAACCATGGGCCAAAACAATTCCAAGAGAGAAGAGGACACCAGCAATGTAGACAGAGCTGAGATTCTGCCAGATGCCACCTACCTTGGTCCTCTAAACTGTAAATCATGTTGGCAGAGATTTGATAGTCTGGTGAGGTGTCATGACCACTACCTTTGCAGGCATTGTCTGAATCTGCTGCTGACAGTTTCTGACAGATGCCCTCTTTGCAAACACCAACTGCCAACCAGGCTGAGAATATCAACAGCTCCAAGCTCACCACCTCCCTACGAAGAGTGACGCCCCAAGACACCAGCAGGCAGCCCAACAAAGGGAGCCACACACAGACCGACACACAGAGACCGGGGACCCACCGCAAGACACACACACACGCACGCGAGCACACCCACACGCACGCGCCCCCCACACCAGGGGGCGCCCCCCCGGGGGGGACGCCCCCCGGGGCCCGGCCGGAGCCCAGTGGAGACGCCCACTAGTCGATTTCCTCGACCCCCGATTCAGTCAGCCAGTTGTCACAGGACTTCCCTTTAAGTCTGAACCTGCCCCCAGCTGTTTCATACATCACTGTGTTCTTTGACTTACTAAAACAGAGTCTGCAATCTTTAAAGGTGAACCAGTCTGGTACAAATGATAGCGGCAACAGCATAACAGATTTATTCATATGCAACTCTTGAAGAGTCACGCCTATATCTGAACCAGATAGATGTTCTCCAGTTCTGAATCGATGCAGAAGGAGATTGCCAAGAGTATCAGCGATCCTCTCATATCCTTCAAGTTCTGCTAAAAAGACCTTTATGTCCTTAGTTTCCAGCTTCACAAGGATATTTTGAACAAAACTCTTTCCTTCAAAGAGGGCACCCAATTTTACAGTCAGTGGAACAGGCTCCCATTCAGGACCAACTCTTTCGAAATCAAGAGACTTAATCCCATCCAGTATCCATCTAGAGCCGTTCAGTTCAAGCTCAAGAGAATCACCAAGTATCAAAGGGTCTTCCATATAATCTTTAAATACTTCAGACCTCACATCAAAAACAGCATCATTCACCTCAAAGATGGGATCTGTTCTAAGCAAGTGAAGGCACTCATCCAACAATCTTCTGTCCACCTCACCCTTAAAAAAGTAAGAGCATGACAAAAACTCAGCCACACCTGGACTCAATAATTGACACTTTACTAGTAGAATCAATGAAAATCTCCGTAGGCAGTCTGTGTTATTCTGATTATGTGTAAAATCCACTGTAATTGTAAGCTCTAATACTCCTTCTGTATTGATGAGCATGTGGTCCCATAGATCCTTCAAAGATTTAAATGTCCTTGATTCTGTTAATCCCTGCTTGATGAGCACAGTAGCATTGCATATAGCATCCTCTATCCAGTAAGAGAACCATCCATACCCAAACTGCAAATCATCCCTAAACATAGGTCTTTCTATACCTTTGTTTACCACCTTTAAAACAAAAGATTGAAACGGGCCTAGTGCTTCTGCGCCATCCTCAGATGGCATCATGCTCTTATGAGGGAACCATGAAAAACTGCCTAGCGTCCTGGTTGTTACAACAATCTCTCGCACAAATGACTCAAAGTACACTTGTTTTAAAAAATTTTTGCAAACATCCCTTGTGCTAACAACAAACTCATCAACCAGACTTGAATCAGACCGCTGGTGAGAGTTTATGAGATCAGAAAACAAAACAGTGTAATGTTCATCCCTTTTCCACTTGACAACATGGGAAATAAGTGATAGGGATTCTGAATTAATGTCAATCAGCACACAGAGGTCAAGAAATTTAATTCTGGGACTCCATCTCATGTTTTTTGAGCTCATGTCAGACATAAATGGAAGCAGCTGATCCTCAAAAACTTTGGGGTATAATCGCCTTACAGACTGAATCACATGGTTCAAACTCACCTTATCTTCTAGCAGCCTTGAACTCTCAGGTTTCCTTGACACATAATCACAAGGGTTTAAGTGCTTGAGACCTGAATTCTCATTAATTTTCCCCATCACAGGTTCCGCCAAGACCCAAACACCTAACTCAAAAGAATTGCTTAGTGAAATGCAGATATAGTCCCAAAGAAGAGGTCTTAAGAAACTAATGTGATCACGATGAGCCTCTGGGTGACTTTGCGTATCACAAGTATACAGCATTATGCCATCATGTTTATAAACTCTTGTCACATGTTCATCTGCTGTTAAATCCTCGAGAACCTTTTTTATATACAAGTTTCCTCTATTCTTATCTCTTACACATCTGCTCCCTAGAGTCTTGCAAAGGCCTATGAAACCTGAAGAAATGCAACTTTGAAAAGCTGATTTATTAATTGCCTCTGATAAAAGCTTCTGAGCACCTCTTGTGAACTTGCTGCAAAGTTTGTTTTGAAGTGTTTTAATCAATGAAGGGATTCTCTCCTCTTGGTAGCCCATCACTGACGGGTAAACCACTTTCTGTCTTAGAACCATTCTTAATGGGAACATTTCATTCAAATTTAACCAATTGATATTCGCCAACTCACTTAAATCCTCTTCAAAATCAAATATTTCTCCCAATTGAAGAATAGCTTCCTTTTTATTTCTATTAAAAAGATCCATGAAAAAGTCCTCATTTAATTCACCATTTTTAAGCTTATGATGCAACTTCCTCACAAGCCTTCTTATGATCTTGGCTTCATCAGGACATAATTCCTCAATAAGCCTTTGAATTCTATAACCTCTAGAGCCATCCAGCCAGTCTTTCACATCAGTGTTGGTGTTTAACAAGAATGGATCCAATGGGAAGTTGGCATATTTCAAAAGATCCAGTGTCCTCCTCTGAATGCAATTCACCAAAGAAACCGGGACACCATTTGCGACAGCCTGATCAGCAATTGTGTCTATTGTTTCACAGAGCTGGTGTGGTTCTTTGCACTTAACATTGTGTAATGCTGCAGACACAAATTTTGTTAAGAGGGGAACTTCTTCCCCCCACACATAAAATCTAGATTTAAATTCCGCTGCAAATCGCCCAACCACACTTTTTGGACTGACAAATTTGTTTAATAGTCCGCTCAAGTAAGAGTGAAATTCCAACAAGACAAGAACTTCTTTTGGATCAGTATCAACCAGCTCACTTAGTCTTCTATCAAACAAAGTGATCTGATCATCACTTGAGGTATAAGCTTCTGGTCTCTCACCAAAAATGACACCTATGCAATAGTTGATGAACCTCTCACTAATCAAACCATAAAAGTCAGAAGCATTATGCAAGATTCCCTGTCCCATGTCAATGAGACTAGATATATGGGATGGCACAACTCCCATCTCAAAATATTCTCTAAAGATTCTTTCAGTAACGGTTGTCTCTGTACCCCTAAGGAGCTTCAGCTTAGATTTAACATATGACTTCATCATTGCACTCACAACAGGAAAGGGTACCTCAACAAGTTTATGCATGTGCCAAGTTAATAATGTGCTAACGTGATCCTTACCTGAACGCACATATTGGTCATCACCTAGTTTGAGATTCTGAAGGAGCATTAAAAACAAAAATGGGCACATCATTGGTCCCCACTTACTGTGATCCATGCTATAGTTTAATAAACCCTCTCGTACATTAATGGTCATTGATAAGATTGCATTTTCAAATTCTTTATCATTATTCAAACATGAACCTGAAAAGAAACTACAAAAGGATTCAAAATAGTCTTCTATCAATCTTGTGAACATCTTTGTCCTTAAATCTCCAATATACAGCTCTCTATTTCCCCCAACCTGCTCCTTGTAAGATAATGCAAATTTCAATCTTCCAGAATCAGGACCAACTGAGGTGTATGATGTTGGTGATTCTTCTGAGTAGAAACACAAGTTCTTCAAAGCAGCACTCATACATCTTGTCAATGATAGGGCCTTGCTTAGAGACTCAGAATTGCTTTCTCTCTCACTAATTCTCACATCCTCTTCCAATTTATTCCAGTCAAATTTAAAGTTTAAGCCTTGTCGCTGCACATGCCTGTATTTCCCTGAGTATGTGTTTGCATTCATCTGCAGTAAGATCATCTTCATACATGAGAACCAATCACCCTCTGAAAAAAACTTTCTACAAAGGTTCTGTGCCATTTCATCCAGGCCACATTGTTCCTTAATAGCTGAAGTGAAGTATAGCGGTGACAATTCTTTAGAGCCCTCTACAGCCTCACACACAAACTTCATGTCACCATCTGTAAGGCAAGATGGATCAAAGTCTTCTACTAGGTGGAAGGAAATTTCTGACAGAATGATCTTCCTCAAATGAGCCATTTCACCTGATAGGACAACCTGGAGATGATGTAGTCCTTTTGTATTTTGAAGCTTCTCCCCACCCCAGCTTCCATCATCTTTCCGACCTCTTTTGTACTGCGTTATTGTGGAGTTCACCCTACCTTCTAGAGCCTTGAAAAATCTTGTCTCTTCTTCCCCTTCAAAACACACGCCCTCCAAATCATTTTCCATTTTCTTCACCTCTGCTTTCTTAGTACCTATCACCAATTTAGAGACTAACTTTGAGACCTTATACTCATAGTCTGAGTGGCTCAATTTGTACTTCTGCTTCCTCATAAAGCCTTCTGAAATCTGACTCACAGCACTAACGAGCAGTTTATTGAAATCATATTCTAGAAGTCGTTCTCCATTTAGATGTTTATTAACAACCACACTTTTGTTGCTAGCAAGATCCAGTGCTGTTGCACATCCAGAGTTAGTCATGGGATCCAGGTTGCTGAGTTTCTTCTCCCTATTAAATATTAAGGTACCATTGTTGAATGAAGACACCATCATGCCAAAAACCTCTAAGTTAACACCTGGAATTACCTGCTGGCAGCCGATCTTTTTACTTGTAAACTTCCTCATCTGTTCATAGAAAACACACTCTTCTTCAGGAGTGATCATCTCCTTAGGGTTGATAAA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| 17,644
|
OP958781.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mehl,C., Wylezich,C., Geiger,C., Schauerte,N., Matz-Rensing,K., Nesseler,A., Hoper,D., Linnenbrink,M., Beer,M., Heckel,G., Ulrich,R.G., Friedrich-Loeffler-Institut,Io.D.V.
|
Friedrich Loeffler Institut, Institute of Diagnostic Virology
|
Germany
|
2023-03-07
|
KS22-098_L5719
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,221
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Mus musculus domesticus
|
kidney, abdominal cavity
|
2022
| null | null |
Mammarenavirus choriomeningitidis isolate KS22-098_L5719 segment L, complete sequence
|
CGGGGATCCTAGGCGTTAATTTGCGCTTCTTTGTGGACAACCTTGTTATCCAAAAGATTGCCTCTCAGGCACAGTGCTGTCATGGGACAGGCAAAAACCAAAAAGATAAGGCCCTCTGAGGATGAGGACAGAGCAGAGGTCCTGCCCGATGCAACCTATCTTGGTCCTCTAAATTGCAAGTCATGCTGGCAAAGATTTGACAGTCTAGTCAGGTGTCATGATCATTACTTATGTAGACAATGTCTGAACCTCTTACTAACGGTCTCAGACAGATGCCCTCTCTGCAAACATCCTCTTCCCACGAGGCTAAGGGTGTCACCAGTCCCCAGCTCACCCCCTCCCTACGAAGGATGATCAACCGAGAAGCCCGACTGCCCCCACCAGTCCCACACACCCAGTCCCCGCACACGACAACCACGCAGACACACACGCAGACACGCACACACACACACCCAGACACCACAAACCCCGGCGAAAGCCACCGAAACACGACACCCACCCTCAGCCCAGCCCCCCACGCGCGGGGGGCCCCCCGGGGGGACCCCCCCAGGGGGCTCGCGAGCGCTGCTCAGTCTATGTCCTGCACCGATGGCTCTTCCAGCCAATCATCACAGGATCTTCCTTTGAGCCTGTACCTCCCACCCACTGTCTCAAACATGATAGTGTCCTTTGACTTGCTATAGCAAAGTCTACAGTCTCTAAAGGAAAACCAATCTGGCACATTCTTCAGTGGTGAGAGTAAAGTGGACCTTGTGATGTGCAGTTCCTGAAGGATGGCGTTAATCTCTGAGTTTACTAAGTGCTCACCTGTTCTGAATCTGTGCAGGAGGAGGTCACCAAGCACATCATTAGCTCTTGCATAACCTTCCAGTTCGGCCAACATAACTTTAAGATCCTTGGTCTCCAAATTAACCACAATGTTTTGAACAAAGTTTCTTCCTTCAAAAAAGGCACCACATTTGACAGTCAGGGGCACAGGCTCCCACTCAGGTCCAACCCTATCAAAGTCAAAAGACTTGACGTCACTCAAAATATTGTTAGACCCCAACAGTTCCAACTCAATAGAATCACCTAGTATGACTGGGTCGATCATATAATCCTCAAATTCTTCTGATCTAATGTCAAATATGCTGCTTTTAGACTTGAATATAGGATCTGTTCTCAACAAGCTAAGACATTCATCTAACAGTCTTCTGTCTACCTCACCCTTGAACATATAGTTGCATGACAAGAACTCAGCAACACCTGGATCAAGTAATCTACATCTCACTGTGAACATCAATGAAAATCTCCTTAGGTGCTCTGTATTGTTTTGGTTATGTGTGAAATCAACACTTAACGTAAATTCCAATAGACCTTTTGTGTGGTTGAGGAAATACTCCCACATATCTTTCAATGTCCTAAATGTCCTTGAGTTTGCCATACCCTGCTTTATTAGCATAGCTGCATTGCAAACTATATCCCCCAAACGATAAGAAAACCATCCGTACCCGAATTGTAGGTCAGTCTTGTACATAGGTCTCTCAACATCCTTATTCACCACTTTCAGCACAAATGATTGAAGCGGTCCCATAGCCTCTGCCCCATCCTCGGAGGGCATCATGTCACGGTGAGGGAACCACGAGAAGTTCCCCAACGTTCGGGATGTAACCACAAATTCTCGAACAAATGACTCAAAATACACTTGTTTTAAGAAGTTTTTACACACATCCCTTGTGCTAACCACAAACTCATCAGTTAAGCTTGAGTCAGTACGCTGGTGTGAATTGACAAGGTCTGAAAAAAGAACTGTGTAATGCTCATCCCTTTTCCACTTCACCATGTGTGAAATGAGTGACAGTGATTCTGAGTTTATGTCAATCAATACACATAAGTCAAGGAATTTAATTCGAGGACTCCACCTCATATTCTTTGAGCTCTGATCTGACATAAATGGTAAAAGTTGTTCTTCAAAGATCTGGGGGTACAGCCTTCTAACGGATTGTAAAACATGGTTCAAATTGACTTTATCCTCTAAAAGCCTTGAGCTCTCAGGTTTCCTAGCAACATAGTCACAAGCGTTGAGTTGCTTTGGTACCAGTTTCACAACCTCCCTTGCTTTAATAGGTTCTGCTAATACCCACACACCTAGCTCGAATGAATTACTTAGGGAAACACAGATGTAATCCCAGAGGAGGGGCCTTAAGAGACTTATGTGACAGAGATTGGGTTCTGGGTGTGTGTGTTTATCACAGATGTATAAAAACATATCCTCACCTTTCTGAACCCTCGAAACATGATTATCTTGGGATAAATCTTCTAAAACTCTTTTTATATAAAGATTCTCTTTATCTTTATTTCTTATGCATCTGCTCCCCAAAGTTTTGCAGAGACCTATGAAGCCTGAAGAAATRCAACTCTGGAAAGCTGACTTATTTATGGCTTCTGAGAGTAGCTTCTGTGCCCCTCTAGTAAATTTAGAACACAGTTTGTTTTGAAGAGTTTTTATCAATGAGGGCACTTTTTCTTCTTGAAAGCTCATCACTGACGGATACACCACTTTTTGTCTTAATACCATCCTCATGGGAAACATCTCATTAAGATTCAACCAGTTGATGTTGGCGATATCATTTATGTCATCTTCTATACCAAGAATTTCTGCAAGCTGTAGAATAGCACCTTTCTTATCTCTGTTAAAAAGATCCAAGAAGAATTCTTCATTGAATTCTCCATTTTTTAACTTGTGATGCAGTCTTCTTATCAACTTCCTCATCACCTTTGTCTCTTGTGGACACAAGTTCTCAATCAGCCTTTGAATTCTATAACCCCTAGACCCATCCAACCAATCCTTCACATCTGTGCTTATGTTCAATAAGAAAGGGTCCAATGGAAAATTCGCATATTTTAATAAATCCAATGTCCTCTTTTGAATGCAATTAACCAATGCGACAGGTACGCCGTTTGCAACAGCCTGATCAGCAATTGTGTCAATAGTCTCACATAACTGATGGGGTTCCTTGCACTTTATGTTATGCAAAGCAGCTGACACAAATTTTGTGAGAAGAGGCACCTCTTCTCCCCAGACATAAAACCGTGACTTAAATTCAGCTGCAAACCTACCGACAACACTCTTGGGACTAATAAACTTGTTTAGAAGCCCGCTCAAATGGGAATGGAATTCCAGTAAAGTGAGAACTTCCTCTGGGTCTCTATCAACCAACTCACTTAGTTTTTTGTCAAACAGAGTGATTTGATCATCACTTGATGTAAAAGCATCTGGTCTTTCACCAAATATGACACCGATACAGTAGTTAATGAACCTCTCACTGACTAGTCCATAAAAGTCAGAGGCGTTGTGCAAGATCCCCTGCCCCATATCAATGAGGCTAGAGATATGTGAAGGGACAACTCCTGAATCAAAATAACTCCTAAAGATTTCTTCCGTTGCTGTTGTCTGCGTCCCTTTTAAAAGTTTTAACTTAGCCTTAACATAGGACTTCATTAATGCATTGACAACAGGGAATGGGACCTCCACAAGTTTGTGCATGTGCCAAGTCAATAAAGTGCTTACGTGGTCTTTGCCAGACTTAACATACTGATCATCACCTAGACGGAGATTCTGTAATAGCATCAGGAATAGGAATGGGCACATCATTGGGCCCCATTTGCTATGGTCCATACTATAGTTTAGGAGTCCTTCCCTTACATTTATAGTCATAGATAAGATTGCATTTTCAAACTCCCTCTCATTGTTAAGACAAGAACCTGAGAAGAAACTTGAGAAAGATTCGAAGTAATCTTCCACAAGCCTTGTGAACATCTTTGTTCTCAGATCACCAATATAGAGCTCCCTGTTTCCTCCAACTTGCTCTTTGTAAGATAGCGCAAATTTCAACCTTCCTGAATCAGGACCTACAGAAGTGTAGGATGTAGGGGACTCCTCTGAGTAAAAACACAGATTTTTCAAGGCAGCACTCAAGCACTTTGTCAATGACAAGGCCTTGCTTAGCGATTCAGRATTGCTCTCTCTTTCACTAATCCTTACATCTTCCTCCAACTTATCCCAGTCAAACTTGAAGTTCAAACCTTGCCTCTGCATGTGCCTATATTTGCCTGAGTATGCATTAGCATTCATCTGTAGCAATATCATCTTCAGACATGAAAACCAGTCCCCTTCTGAGAAAAACTTCCTGCAAAGATTCATTGCCATCTCATCCAATCCGCACTGCTCTTTAACTGTGTGGGTAAAATAGAGTGAAGAGAGCTCTGGACACTCTTCAACAGCTTCACAAACAAACTTCATGTCATCAGGTGAAAGGCAGCATGGGTCAAAATCCTCCACCAGATGGAATGAGATTTCTGACAGAATGATCTTTCTCAAATAGGATGACTTCCCTGTCAAGACCATCTGTAAATGATGCAGACCCTTGGCCCCCTTCCCTCTTTCTAACTCTTTCAGTTGTTCAATAGTTGTTCTTTTTCCATAGTTGGATATTGTTGACTTCACTTTATTTTCCATTTCCTTAAAGAAGAGTGTCTCCTCTTCCCCCTCAAAATAAGTCTCATCCACACTAGTTTCTTTATTCTCACTGTGTCCCTTTTCTGAGCCAAGGACTAACCTAGACACCAGTTTGGATACCTTGTACTCATAATCACTGTGTTTCAATTTATATTTGGTTTTTCTAACAAACCCTTCAGTAATCTGACTAACAGCACTAACAAGCAGTTTGTTAAAATCATACTCAAGAAGACGTTCTCCATTTAAGTGTTTGTTAACGACAACACTCTTATTACTCGCCAAATCCAGTGCTGTGGCACAACCAGAATTTGTCATAGGGTCTAAGTTGTTAAGCTTTTTCTCTCCTTTGTAAATCAATGTGCCGTTGTTGAAAGAGGAAACCATGAGACTAAAGGCCTCTAAATTCACACCAGGGACTACTGTCTGACAGCCTACGTCCTTGCTAACAAACTTTTTCATCTGCTCAAGAAAAGCTTCCTCTTCCTGGGGTGAAATTGTCTCT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| 17,645
|
LC413284.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Taniguchi,S., Yoshikawa,T., Shimojima,M., Fukushi,S., Kurosu,T., Tani,H., Fukuma,A., Kato,F., Nakayama,E., Maeki,T., Tajima,S., Lim,C.-K., Ebihara,H., Kyuwa,S., Morikawa,S., Saijo,M.
|
JAPAN, Department of Virology I; 1-23-1 Toyama, Shinjuku, Tokyo 162-8640
|
Japan
|
2019-12-27
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,231
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Mammarenavirus choriomeningitidis WE-NIID viral cRNA, complete genome, segment L
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCGTTTAGTTGCGCTGCTTTATTGCACAGCTTCACTCTGCTAAACTATCAGGAACTGACCGATCATCAGCCATGGGCCAAGGCAAGTCCAAAGAAGAAAGGGACACCAGCAATACAGGCAGAGCAGAGCTTTTGCCAGACACCACCTATCTTGGTCCTCTAAATTGTAAATCATGTTGGCAGAAATTTGACAGCTTGGTTAGATGCCATGACCACTATCTTTGCAGACACTGTCTGAATCTCCTGCTGTCAGTTTCCGACAGATGTCCTCTCTGTAAGTATCCACTGCCAACCAAACTGAAGGTGTCAACAGTCCCAAGCTCCCCACCTCCCTATGAGGAGTAACGCCCCAGACCTCGACACAGCAGGCCACCCAACGCAGAAAAACCACACACAAGCCGGCACACACAGACACAGCAACCAGCACAAAGCGCACGAACACACACACACACACACACACACTCTCACCCACGCGCCCCCCCGCACCGCCGGGGGGGCGCCCCCCGGGGGGCAGCCCCCCGGGGGCCCGGGCAGGGCCCCGCGGAGATGCCGGCTAGTCGATCTCCTCGGCCACCTGCTCCGCCAGCCAATCGTCACAGGATTTCCCCTTGAGTCTGAACCTGCCCCCAGTTGTCTCATACATTACAGTGTTCTTTGACCTGCTGAAGCAGAGCCTACAATCTCTGAAGGTGAACCAATCTGGCACAAAAGATAATGGTGTCAGCATGACGGATCTGTCCATGCAGAGCTCCTGAAGAACTGTACTTATTTCTGACTCCATCAAGTGCTCACCAGTTCTGAATCGGTGCAGGAGGAGGCTGCCGAGGACATCACCAATTTTTCCATAGCCCTCGAGCTCTGCCAGAAAGACCCTCATGTCCTTTGTCTCTAATTTCACAGAGATATTCTGAACAAAGTTCCTCCCCTCAAAGAGGGCACCCTTCCTTATGGTCAGAGGCACAGGTTCCCACTCAGGCCCTATCCTCTCAAAGTCAGTAGATTTGATCTCATTCAGAATCCTTCTAGAACCTATCAGTTCAAGTTCTAGTGAATCACCAAGTGTCAAAGGGTCTTCCATGTAATCTTCAAACTCTTCAGACCTAATGTCAAAGACTCCATCATTCGCTTTAAAGATGGAGTCTGTCCTCAACAGATTGAGACACTCATCTAATAATCTCCTGTCAACCTCACCTTTGAAGAAATGAGAGCATGATAAGTAATCAGCTACACCTGGACTCTGTAATTGGCATTTAACCACAAAGATCAATGAAAATTTCTTCAAGCAGTCAGTGTTGTTCTGGTTGTGTGTGAAATCCACTGTGATTGAGAACTCCAATATCCCCTCTGTGCTGCTGAGCATGTAATCCCACAGATCTCTTAAAGATTTAAATGCTTTTGGATCTGTCAAACCCTGCTTAATTAACATAGCGGCATTACACACAACATCCCCCACACGGTAAGAGAACCATCCAAAACCAAACTGCAAGTCATTCCTAAACATGGGCCTCTCTATATTTTTGTTCACCACTTTCAAAATGAATGATTGGAAGGGTCCCAGTGCTTCAGCGCCATCTTCAGATGGCATCATGTCCTTATGGGGGAACCATGAAAAGTTACCTAAGGTCCTAGCTGTTGCAACAAACTCTCGTACAAATGATTCGAAATACACTTGCTTCAAAAAGTTCTTGCAGACATCCCTTGTGCTAACAACAAATTCATCAACTAAACTTGAGTCTGACCGTTGGTGAGAGTTGACGAGATCAGAAAACAGCACAGTGTAATGTTCGTCCCTCTTCCATTTGACAACATGAGAAATGAGTGACAAAGACTCTGAGTTGATGTCAATCAGCACACAGAGGTCAAGGAATTTAATCCTGGGACTCCATCTCATATTTTTTGAGCTCACATCAGACATGAATGGGAGCAACTGATCCTCAAAGATTTTGGGGTACAGTCGCCTCACAGATTGAATTACATGATTCAAACTCACTTTATCCTCTAGTAGTCTCGAACTCTCAGGTTTTCTTGCTACATAATCACATGGATTTAAGTGCCTAACAGCCAAATTACTCTCGTTCTTTCCTTTCACAGGTTCTGCTAAAACCCAAACACCCAGCTCAAAAGAGTTGCTCAATGAGATGCAAATGTAGTCCCAGAGAAGGGGCCTCAAAAGGTTGATGTGGTCACGGTGAGCCTCTGGGTGTCTCTGCTTGTCGCAAATGTACAACATCACACCATCTTGTTTGTGAACCCTTGTGACATGCTCATCCATGGTCAGATCTTCAAGCACCTTTCTGATATACATATTTTCCCTGTTTTTATTTCTCACACACCTACTTCCTAAAGTCTTACAGAGACCTATAAAGCCGGATGAGACACAACTCTGAAAAGCTGATTTGTTGATTGCCTCTGACAGCAGCTTCTGTGCACCTCTTGTGAACTTACTACAAAGCTTATTTTGGAGTGTTTTAATCAATGAGGGGATCTTTTCCTCTTGAAAGGTCATTACTGATGGGTAAACCACTTTTTGTCTCAGAACCATCCTCAATGGGAACATTTCATTCAGATTCAACCAATTGATGCTTGCCAACTCATTAAGATCATCCTCAAGACCAAGAATCTCTCCCAATTGAAGGATGGCCTCTTTCTTTTCCCTGTTGAAGAGGTCTAGAAAAAATTCCTCGTTACATTCACCGTTCTTGAGTTTGTGATGTAGTCTTCTTACAAGTTTTCTCATGATCTTTGTTTCACTGGGACACAATTCTTCAATGAGTCTTTGGATTCTATAACCTCTAGAACCATCTAACCAATCCTTTACATCAGTGTGAGTGTTTAACAAGAATGGATCTAAAGGGAAATTAGCATATTTCAAGAGATCCAGTGTCCTCCTCTGGATACAGTTTACTAAAAAAACTGGGACTCCATTTGCTATAGCTTGATCAGCAATCGTATCTATTGTCTCACAAAGTTGATGCGGTTCTTTACACTTAACATTGTGTAGTGCCGCAGACACAAATTTCGTGAGGAGAGGGACCTCCTCCCCCCACACATAAAATCTGGATTTGAATTCCGCTGCAAACCGCCCAACCACACTTTTTGGACTGATGAACTTGTTCAACAAACCACTCAAGTGAGAGTGGAATTCCAGCAAGACAAGGACTTCTTCTGGGTCACTATCAACTAAGTCACTCAATCTCTTGTCAAATAAAGTGATCTGATCATCACTTGATGTATAGGCTTCTGGCCTCTCTCCAAAAATGACACCAATACAATAATTGATAAACCTTTCACTAATTAAACCGTAAAAATCAGAAGCATTGTGTAGGATCCCCTGTCCCATGTCAATGAGACTAGATATGTGGGATGGCACCACCCCCATTTCAAAATACTCTCTAAAGATTCTCTCTGTAACAGTCGTTCCTGACCCTTTGAGAAGCTTGAGTTTTGATTTAACATATGATTTCATCATTGCATTCACAACAGGGAAGGGGACTTCAACAAGTTTATGCATATGCCAAGTCAACAAGGTGCTAACATGATCTTTTCCAGAACGCACGTACTGATCATCACCCAGTTTGAGATTTTGGAGAAGCATTAAGAATAGGAATGGGCACATCATCGGTCCCCATTTGCTGTGATCCATGCTGTAGTTTAACAACCCTTCTCTCACATTGATAGTCATTGACAAGATTGCATTTTCAAACTCTTTGTCATTGTTTAAACAAGATCCTGAAAAGAAACTAGAAAAGGATTCAAAATAATCTTCTACCAATCTTGTGAACATTTTTGTCCTCAAATCCCCAATGTAAAGCTCTCTATTTCCCCCAACCTGCTCTTTGTATGACAATGCAAACTTTAGTCTCCCAGAGTCAGGGCCAACTGAAGTGTATGATGTTGGTGATTCTTCTGAGTAAAAACACAGATTCTTTAGAGCAGCACTCATGCATTTTGTCAATGAAAGGGCCTTACTTAGAGATTCAGAATTGCTTTCCCTTTCACTAATTCTCACATCTTCTTCCAATTTGTCCCAGTCAAATTTAAAATTTAAGCTCTGCCTCTGCATGTGTCTGTACTTCCCTGAATACGCATTTGCATTCATCTGTAACAAGATCATCTTCATACATGAGAACCAATCACCCTCTGAGAAGAACTTTCTACAGAGGTTTCTTGCCATCTCGTCCAGACCACATTGTTCTTTGACAGCTGATGTAAAATACAATGGTGACAGTTCTGTTGAACCTTCAACAGCCTCACAAATAAACCTCATGTCGTCATTGGTGAGACAGGATGGATCAAAGTCCTCTACTAGATGAAATGAAATTTCTGATAAAATGACCTTCCTCAGATAAGCTCTTTTACCTGACAAAACAATCTGAAGGTGGTGTAGTCCTTTTGTGTTCTTGAATTCTCCCTCCCCTTGCCCTTCATTAAGCCTAGTGCCCCTATTATACCGTGTTATTGTGGAGTTGACCTTATCTTCTAAACTCCTAAAAAAACTTGTCTCCTCCTCCCCCTCGAAACACACATCTACCGGATCATCTTCCAATTTGTCTACTTCTGTTTTCCTGGAACCGATGACTAATCTAGAGACAAGCTTTGAGACCTTATATTCGTAATCTGAGTGTCTCAGCTTATACTTTTGTTTCCTCATGAAGCCCTCTGTAATTTGGCTCACAGCACTAACAAGCAATTTGTTAAAATCATACTCCAAAAGCCGTTCTCCATTCAGATGTTTATTGACAACCACACTTTTGTTGCTTGCGAGATCTAATGCTGTCGCACATCCAGAGTTGGTCATGGGGTCCAGATTGTTGAGCCTTTTCTCTCCTTTTAGGATTAAGGTGCCATTGTTGAATGAAGATACCATCATGCTAAAGATCTCTAAATTAACACCAGGGGTTGAATGCTGACAATCAATATCTTTACCGGTGAACTTCCTCATTTGTTCATAAAAAACACATTCCTCTTCGGGTGTGATTGTTTCCTTAGGGTTGACAAAGAAACCAAACTCACTCTTGGGCTCAAAGAACTTTTCAAAACATTTTATCTGATCTGTCAATCTATCAGGGGTCTCCTTTGTGATCAAATGACACAGGTATGACACATTCAACATAAACTTGAATTTTGCACTTAATAACACCTTTTCACCAGTACCAAAAATTGTCCTAATCAAAAACCGAAGCAGCCTGTACACCACTTTCTCGGCAGGTGTGATTAGATCCTCCTTCAACTTATCCATTAATGAGGTCGATGAAAAGTCTGAGACGATGGCCATCACTAAATACCTAATATTTTGAACCTGCTTTTGATTTCTCTTTGTTGGGTTGGTGAGCATCAGTAGGATTAATGTCCTTAGTGCAGTCTCAATGTCAATAAGAGAATCTTTCAAGTCAGGGCATGACCTAATCCATGAAATCATTGTGTCTATCATGTTGTGCAACACCTCATCTGAAAAAATTGGTAAAAAGAACCTTTTTGGATCTGCGTAAAAGGAAATCAAGTGACCATCCGGACCTTGTATGGAATAACACCTCGAGGATTCTCCAGTTTTCTGATATAGTAGATGATACTCTTCGGAATCCAGTTTTATTATCTGGCAAAACACCTCTTTGCACTCCACCACTTGATATCTCACAGACCCCAGTTGGTTCTGTCTCAACCTGGCAACTGAGCTTGTTTTCATGCTGTTTGTTAGAGCCAAACAAACAGATGACAGTTTTCTCAAACTCTGTAAACCCCTCAATTGCTCTATGTTAGGCTGGAAAGTGTAATCTTCAAATTTTGTGTAATGCATTACAGGATGAGTCCCGGCTCTCACAAAGTTCTCAAATTCAGCAAATGGTATATGGCATTCTTGCACGAGGCATTCTGATAGTCCATAATGCTCAAAACTAAGTCCCACTGCTGATAGGCATTTCTGGATTTTTGCTATGAACTCATTTATGGATACCCTAAAAAGCTCATCAAGAGATGCTTTTTTGTGCACTCTTGACTTTCTTCTGTTCTTCAAAAGTCTGATGAATTCTTCTTTGGTACTTTGAAGGCTCACAAGCCTATCATTCACACTACTGTAGCAACAACCAACCCAATGTTTATCATTTTCCAACCCTTTGGAAATTGACTGCTTAATAAGTGAAGAAAGACATAAGACATCTAAGTTCAGCAGCTGTCTCCTTCTAGTGTTTAATAATTTTAAGCTTTTCACCTTGTTCAACATAGAGAGTAGCCTTTCATACTCAGTGTTAGCATCGCTTCCTCTCTCATGCCCATGGGTCTCTGCTGTAATGAACCTCATTAAGGGGCAGGATTCAACTGCCTCTTTGCTCAACATTAATATGTCATCATTATCAGTAAGGGTTTCATAAAGTTCAGAGAATTCCTTGATTAAGCCCCCAGGGCTGACCTTTTGGAAATTCCTTTTGAGTTTCCCATTTAGCAGGTCCCTCCTAAACCTGCCAAAAAAGGAATTTATGCCAAAGACCACATCATCGCAACTCATGTTGGGGTTGACACCATCGTGGCACATTTTCATAATCTCATCGTTATGAAATGATCTTGCGTCTTTCAAAATTTTCATTGAGTCCATGCCGGAACGTTTGTCAACAGTGGTCTTAAGAGACTCACAGAGCCTGAAGTACTCAGACTCCTCAAAAACTTTCTCATCTTGACTAGAATACTCCAAAAGTTTAAATAGGAGGTCTCTGAACTTAAAATTCACCCATTCTGGCATGAAACTGTTATCATAATCACAACGACCATCCACTATTGGAACCAGTGTGATGCCTGCAACAGCAAGATCTTCTTTGATGCATGCTAGTTTGTTGGTGTCCTCAATGAACTTCTTTTCAAAACTAGCTGGTGTGCTTCTAACAAAACATTCAAGAAGAATAAGGGAATTGTCAATCAACTTATAACCATCAGGGATGATGAGTGGCAGTCCTGGACACACAATCCCAGAGTCTATTAGGATTGTTTCAACAGATTTGTCGTCGTGGTTGTGTATGCAACCACTTTTGTCTGCACTGTCTATCTCTATACAGCGTGATAACAATTTGAGTCCCTCAATTAGCACCATTCTGGGTTCTCTTTGTCCCAGGAAGTTGAGTTTTTGCCTTGACAGCCTCTCGTCCTGTTCTATGTAATTTAGACACAACTCTCTCAGATCTGCAATAGTTTCATCCATTGCGCATCAAAAAGCCTAGGATCCTCGGTGCG
| 57,148
|
JF912084.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Yama,I.N., Cazaux,B., Britton-Davidian,J., Moureau,G., Thirion,L., de Lamballerie,X., Dobigny,G., Charrel,R.N., Yama,N.I., Charrel,R.
|
University of Aix-Marseille, UMR 190 Emergence des Pathologies Virales
|
France
|
2012-06-21
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,228
|
GenBank
| 1
|
France
|
France
|
Mus musculus
| null |
2009-10
| null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain HP65-2009/1 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCGTTTTGTTGCGCTATTGAGCTGTACAACTTTTCTCTGTAGAGTGGCTATAAGCAGTCCAGACCACCAGCCATGGGCCAAGGCAAGTCCAAAGAAAAGAGAGACACCGGCAACACAGGCAGAGCCGAGATTCTGCCGGACACCACCTACTTGGGCCCCCTAAACTGTAAGTCATGTTGGCAGAGATTTGACAGTTTGATCAGGTGCCATGACCACTATCTTTGTAGACACTGCTTAAATCTTCTACTGTCAGTCTCCGACAGATGCCCCCTCTGCAAATACCCATTGCCCACCAAGCTGATGATATCAACAGCCCCAAGCTCACCACCCCCCTACGAGGAGTGACGTCGCCAGATCAACGCTGGCAGCCCGCCGCAGGAAGAAAACACACAGACCGACACACACAAACACAGCATCCCACACAGGACACACGCACACACGCAGGCAGACACACTCCCACGCCCAACCCCCCCACACACACCGGGGGGGGCGCCCCCCGGGGGGGCGACGCCCCCCGGGGGTCGGGGTGGATCCCGCGGGAGACACCGCTCAGTCGATCTCCTCAACCACCGATCCACCCAACCAATAATAACAGGACTTCCCCTTGAGTCTAAACCTGCCCCCAACTGTCTCATACATAATTGTGGCTTTTGACTTACTGAAACAGAGCCTACAATCTTTAAAGGTGAGCCAATCCGGCACCAATGACAATGGCACCAAGAGGACAGATCTGTCCATATGCAACTCTTGAAGAATCACACTTATCTCCGAACTCGGAAGATGCTCACCAGTCCTAAATCTATGTAGGAGAAGGTTTCCGAGAACATCACTGATCCTCTCATAGCCCTCAAGTTCTGCCAAAAAGACCTTCATATCCTTGGTCTCCAACCTCACAAGTATATTCTGAACAAAGCTCCTCCCTTCAAAAAGAGCACCCATCCTCACAGTCAGAGGCACAGGTTCCCAGTCAGGCCCAATCCTCTCAAAATCAGAGGATCTAATCCCTTCCAACATCCTTCTAGAACCCACCAACTCAAGCTCAAAGGAATCGCCAAGTATCAAAGGGTCTTCCATGTAATCCTCAAACTCTTCAGACCTGATGTCAAAAACACTGTCATTCATTTTGAAGATTGAGTCTGTCCTTAGTAAATGAAGACACTCATCTAGCAATCTGCTATCCACTTCACCTTTATAGAGGTGAGAACACGACAAGAGCTCTGCTACACTTGGAGCCTGTAACTGACACTTCACTAAGAAGATCAATGAGAATTTCCTTAAACAATCGGCATTGTTTTGATTGTGTGTGAAGTCCACCGTAACTGAAAACTCCATAATTCCCTCTGTATTTGTAAGCATGTAGTCCCACAGATCCCTTAAAGACCCAAATGCCTTTGAGTTTGTCAGACCCTGCTTGATCAACATTGCAGCATTGCACACAATCTCTCCCATCCGATAAGAGAACCACCCGAAACCAAACTGTAAATCACTCCTGAACATGGGCCTCTCTACATCTCTGTTCACTACTTTCAACACAAATGACTGAAAGGGTCCTAGTGCTTCAGCACCATCCTCAGACGGCATCATGTCTTTATGAGGAAACCATGAAAAATTCCCTAAAGTTCTGGTTGTTGCCACAAACTCTCGCACAAATGATTCGAAGTACACCTGTTTTAAAAAGTTTTTGCAGACATCCCTTGTACTAATAACAAATTCATCAACCAGACTTGAATCTGACCGCTGATGAGAGCTGGTGAGATCTGAGAACAAAACTGTGTAATGTTCGTCTCTTTTCCACTTAACAACGTGAGAGATAAGTGACAAAGACTCTGAGTTAATATCAATCAGCACACAGAGATCAAGGAATTTGATCCTAGGGCTCCATCTCATGTTTTTCGAGCTCATGTCTGACATGAACGGCAACAACTGATCTTCAAAGATCTTTGGGTACAGTCGTCTTACAGACTGTATTACATGGTTTAGACTCACTTTATCCTCCAACAGCCTTGAGCTCTCAGGCTTACTCGCAACATAATCACATCGGTACAAGTGGTTAAGAGTTGATGTTTTCTTATTCTCTCCTTTTATAGGTTCTGCAAGCACCCAGACACCCAACTCAAAGGAATTGCTTAGTGAAATGCAAATGTAGTCCCAAAGAAGAGGCCTCAAAAGACTGACATGATCACGATGAGCTTCTGGATGGGTTTGTCTATCACATATGTACAGTGTTACACCATCCTGTTTTATGACCCTCACTATATGTTCATCTGTGGCCAAGTCTTCAAGTACCTTTTTGATATACAGATTTTCCTTATTCTTGTTCCTCACACATCTACTCCCTAGTGTCTTGCAAAGACCTATGAAACCAGATGAAATACAACTCTGGAAAGCTGACTTATTGATCGCTTCTGATAACAATTTTTGTGCACCCCTTGTAAACTTACTACAAAGCTTGTTCTGGAGTGTCTTAATCAATGTAGGCTTCCTTTCCTCTTGGAAAGTCATCTTTGGTGGATTAACCACTTTATGCATCAAAACCATTCTCAATGGGAACATTTCGCTCAGGTTCAACCAATTGATGATTGCTAAGAGCGTTAGATCCTCCTCAAGACCAAGGATTTCTGTCAGTTGAAGAATAGCTTCGTAAAATTCTCTGTTAAAAATTTCTAGAAAAAATTCTTCAATAGATTCACAATTTTTAAGCTTATGGAGTATCCTCCTCACAAGTTTCCTCACAACCTTCGTTTCATCGGGACACAATTCTACAATAAGTCTTTGAATTCTATAACCCCTAGAACCATCTAACCAATCCTTCACATCAGTGTTGACATTCAATAAGAAAGGGTCCAGAGGGAAGTTAGCATATTTCAGGAGGTTTAGTGTTCTCCTCTGAATGTGATTTACCAAAGAAACTGGAACACCATTTGCAATAGCCTGATCAGCAATTGTGTCTATTGTCTCACAAAGTTGATGCGGTTCTTTGCACTTTACATTGTGCAATGCTGCAGACACAAACTTCGTGAGAAGAGGAACCTCTTCCCCCCATACATAAAATCTAGACTTAAACTCTGCAGCAAACCGCCCTACTACGCTTTTTGGACTGATAAACTTATTTAACAAGCCACTCAAATGAGAATGAAACTCTAACAAGACAAGAACTTCCTCTGGGTCATTATCGACTAACTCACTTAATTTTCTATCAAATAATGTAATCTGATCATCACTTGATGTATAGGCCTCTGGCCTCTCACCAAAGATGACTCCAATACAATAGTTAATAAACCTCTCACTAATTAAGCCATAAAAATCAGAGGCATTGTGCAAGATTCCTTGTCCCATGTCAATGAGGCTAGATATGTGAGATGGCACTATTCCCAGTTCAAAATATTCTCTAAAGATCCTTTCAGTAATAGTCGTCTCTGTCCCCCTGAGAAGCTTCAGTTTTGACTTGACATATGATTTCATCATCGCACTCACAACAGGGAAAGGGACCTCAACAAGTTTGTGCATATGCCAAGTAAGCAAGGTGCTAACATGATCCTTCCCAGAACGAATGTACTGGTCATCACCAAGTTTGAGGTTTTGAAGAAGCATTAAAAACAAGAATGGGCACATCATTGGTCCCCACTTGCTGTGATCCATACTGTAGTTTAGGAACCCTTCTCGCACATTAAAAGTCATCGACAAGATTGCGTTTTCAAATTCTTTATCATTGTTTAAACAGGAACCTGAGAAAAAGCTGGAAAATGACTCAAAATAATCTTCCACCAGTCTTGTGAACATTTTTGTTCTTAAGTCCCCAATATAAAGTTCTCTATTTCCTCCAACCTGCTCTTTGTAAGATAGTGCAAACTTCAGTCTTCCAGAATCAGGGCCAACTGAGGTATACGATGTGGGTGATTCTTCTGAGTAAAAACACAGGTTCTTCAAAGCAGCACTCATACACTTCGTTAGAGATAAAGCTTTACTTAAAGACTCAGAATTGCTTTCCCTTTCACTAATCCTCACGTCTTCTTCTAGTTTATCCCTGTCAAATTTGAAATTCAGACCCTGCCTTTGCATGTGTCTGTATTTCCCTGAGTATGCATTTGCATTCATTTGCAACAAGATCATCTTCATACATGAAAACCAATCACCCTCTGAAAAAAACTTCCTACAAAGGTTCTTTGCCATTTCATCTAGACCACACTGTTCTTTAACTACTGAAGTGAAATACAGTGATGACAGCTCTGAAGAACCCTCAACTGCCTCACATATAAACCTCATGTCATCATTAGTAAGGCAGGTTGGGTCAAAGTCCTCTACAAGATGAAAGGATATTTCTGATAGGATGACTTTCCTCAAGTAAGCCAATTTGCCTGACAAAACAATCTGAAGGTGATGCAGCCCTTTTGTGTCTTTGACCTTCTCCCCAATTTCCCCCCCATCAACTTTTTCAAGCCTCCTATACCGTGTTATTGTGGAATCAACCTTGTGTTTCAGATTCTTAAAAAAACTAGTTTCTTCCTCTCCTTCAAAGAGCACATTTGACGGATCGCCTTCTAATTTCCCTTCCTCCGTTACCTTAGAACCTATGACCAGTCTGGAAACTAACTTTGAGACCTTATACTCGTAATCTGAGTGGCTTAACTTGTACTTCTGTTTTCTCATAAAGCCTTCTGAAATCTGGCTCACAGCACTAACAAGTAGTTTGTTAAAATCATATTCCAGGAGCCGTTCTCCATTCAGATGCTTATTGACCACCACACTCTTATTACTAGCAAGATCTAGTGCTGTCGCACATCCAGAGTTGGTCATAGGGTCTAGTTTGTTAAGCCTTTTTTCCCCTTTTAAAATCAAAGTGCCATTGTTGAATGAAGAAACCATCATGCTGAAAGCTTCTAAATTAACACCTGGAACTGTGCTCTGACAATCAACCTCCTTGCCAGTAAACTTTTTCATTTGCTCATAAAAAACACACTCTTCTTCAGGAGTCATTGCTTCTTTTGGGTTGACAAAAAAGCCAAACTCGCTTTTAGGCTCAAGGAACTTTTCAAAGCATTTGGTCTGATCTGTTAACCTATCAGGGGTCTCTTTTGTGATTAAATGACAGAAGTATGAAACATTCAACATGAACTTAAACTTTGCACTCAACAACACCTTCTCACCAGCACCAAAAATGGTTTTTATCAAAAATCTGAGTAACCTATAAACCACCTTTTCAGCAGCTGTAATTAGGTCCTCCCTCAGTTTATCCATCAAAGATGTCGAAGAAAAGTCTGAGACAATAGCCATTACAAGGTATCTGATATTCTGAACCTGCTTTTGATTCCTCTTTGTTGGATTGGTGAGCATAAGCAACAAAAGGGTTCTCAGTGCAGTCTCAATATCAACAAGACAATCTTTTAAGTCAGGACATGATCTGATCCATGAAATCATAGTGTCAACCATACTGTATAACACTTCATCTGAAAAGAATGGTAAAAAGAATCTCTTTGGATCTGCATAAAAAGAAACAAGATGACCGTTCGGGCCTTGTATAGAGTAGCATCTTGAAGATTCTCCAGTTTTTTGGTATAGTAGATGGTACTCTTCAGAATCTAATTTTATCACTTGACAAAACACTTCTTTGCATTCCACAACTTGATACCTCACAGACCCCAACTGGTTTTGTCTTAGTCTAGCAATTGAGCTTGTTTTCATACTATTTGTTAATGCTAAACAAACAGATGACAATCTTTTTAAACTCTGTGCAGCCCTTAATTGCTCTGCATTAGGCTGAAAGTTATAATCCTCAAATTTTGTATAATACATTAAAGGATGAGTCCCAGCTCTCATGAAACTCTCAAACTCAGTGAATGGCACATGGCACTCATGCTCAAGGTGTTCAGACAATCCGTAGTGCCCGAAGCTTAGTCCCACCACTGACAAACATTTCTGAACTTTTATGATAAACTCATTTATGGACACTGTAAACAACTCTTCAAGAGATACTCTTCTGAAGGTTTTGGACCTTCTTCTGTTCCTCAAAAGCTTGATGAATTCTTCTTTGGTACTATGGAAACTCACCAACCTGTCATTCACACTACTGTAGCAACAACCAACCCAATGCTTGTCATCTTTTTTAAACTGTGACTTTGAGTGTTTTATCAATGAAGAGAGACATAAGACATCCAGGTTCAGCAATTGCCTCCTCCTGGTATTCAGTAACTTTAAGCTTTTGACTTTGTTCAGCATGGAGAGAAGCCTTTCATATTCAGTACTAGCCTCACCCCCTCTCTTGTACCCATAAGTCTCCGCTGTAACAAACCTCATCAAAGGACAAGACTCTACTGCCTCCTTACTTAATATTGAAATGTTATCATTATCAGGAAGGGTATCGTAAAGTTCCGAAAATTCTTTGATTAAGCCTTCAGGGCTGATTTTCTTAAAGTTTCTTTTGAGTTTCCCACTCTCTAAGTCTCTTCTAAACCTACTAAATAGAGAATTTATGCCAAAGACCACATCATCACAGCTCATGCTGGGATTTACACCATCATGACACATCCTCATAATCTCATCATTGTGATGTGATCTTGCATCCTTTAAAATTTTCATAGAGTCCATACCAGAGCGCTTATCAACAGTGGTCTTAAGAGATTCACAGAGTCTGAAGTACTCAGACTCCTCAAAGATTTTCTCATCCTGGCTAGAAAACTCCAGAAGTTTGAATAGGAGGTCTCTAAACTTAAAGTTCACCCATTCTGGCATGAAGCTGTTGTCATAGTCGCAGCGACCATCCACTATTGGAACCAATGTTATGCCTGCGACAGCAAGGTCTTCTTTAATGCATGCCAATTTGTTGGTATCTTCTATGAATTTCTTTTCAAAGCTGGCCGGTGTGCTCCTAACAAAGCATTCAAGAAGAATAAGAGAACTGTCAATCAGCTTATAACCATCAGGAATGATGAGTGGCAACCCTGGGCATATAACCCCTGATTCAATTAGGATTGCTTCAACAGACTTGTCATCATGGTTATGTATACAGCCGCTCTTGTCTGCACTGTCTATCTCTATGCAACGTGACAGCAACTTGAGCCCCTCAATCAACACCATTCTGGGTTCCCTCTGCCCCAAAAAGTTGAGTTTTTGTCTTGACAATCTCTCATCCTGTTCTATGTAGTTTAGACACAACTCCCTCAACTCTGAAATAATCTCATCCATTGCGCATCAAAAAGCCTAGGATCCTCGGTGCG
| 96,876
|
FJ607019.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Albarino,C.G., Palacios,G., Khristova,M.L., Erickson,B.R., Carroll,S.A., Comer,J.A., Hui,J., Briese,T., St George,K., Ksiazek,T.G., Lipkin,W.I., Nichol,S.T., Khristova,M.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Special Pathogens Branch
|
USA
|
2010-07-13
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,286
|
GenBank
| 1
|
USA: California
|
USA
|
Homo sapiens
|
cerebrospinal fluid
|
2003
| null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain 810366 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCGTTTAGTTGCGCAGGTTGGGCATACACCCTTCAAAGAAACCCAGAGTCGAGAAAGCCAACAGCAAGCCGAACTTTCAACCATGGGCCAGGGCAAGTCAAAGGAGGAGACAGCTAACAGCAGTGTCGGAAGAGCAGAACTTCTACCGGATGCTACATATCTTGGACCTCTGAATTGCAAGTCATGTTGGCAGAAGGTTGATAGCCTGGTTAGATGCCATGATCACTACTTATGTAGACATTGTCTGAACCTCCTGCTGACTGTCTCGGACAGATGCCCCCTATGCAAGCATGTGCTACCCACCAAGTTGAAGGTCTCAACTGTCCCCAGCTCACCTCCCCCCTATGAAGAATAACAACCCAAGACAGGAACAGGACAGCCGAACCACCGCGAAGCACACCACACACAAGCGGAAGGCAAGGAGACAACCCCCAGGCACACACCAACACAGGACCCACACACAGACAAACACACACAAACACAACACCGAGCACACAACAAACAACCACACCCACACCCAACACGCGCCCCCCGCGGGGCGCGCGCCCCCCCCCATGCGGGGGGAGGGGGAGGAGGGAGAGCGGGGGAGCCCCCGCAGCGGCGCCGATCAGTCGATCTCCACAATCGTTGCCCCGGCAAGCCAGTCTTCACAGGACTTCCCCTTGAGCCTAAACCTCCCTCCAACAGTTTCAAACATCACTGTGTTCTTAGTCTTACTATAACAGAGTTCACAGTCCTTAAAAGAGAACCAGTCGGGCACATGCATCATGGGCAACAGCAAGACAGACCTTGACATACACAATTCTCGGAGGACCCAGTCAACCTCTGAGCTCATTAAATGTTCACCTGTTCTAAACCTATGGAGAAGCAAATTGCTAAGAACATCCTCAAATTTCTCATAGCCTTCAAGCTCTGCCAAAAAAACTCTTAAATCTTTTGTCTCTAATTTGACAAGAATGTTTTGAACAAACTTCCTCCCTTCATAAAGAGCACCCATTTTAAAGGTTAATGGCACAGGGTCCCACTCAGGCCCAACTCTCTCAAAATCAATGGATTTTATATCATCCAAGATTTTTCTAGAACCTACTAGCTCAAGTTCAATAGAGTCACCAAGTATCAGAGGGTCCACCATGTAGTCCTCGAGCTCATCAGACCTAATATCAAAAACGTTATTGTTCACCTTGAAAGTTGAGTCTGTCCTTAACAAATTGAGACATTCATCTAGTAACCTTCTGTCCACCTCACCCTTAAAAAAGTGAGAACATGACAAAAATCTGGCCACACCAGGGCTTTGGAGCTCACTCTTCACCACAAGGATTAAAGAAAACTTCCTCAGACAGTCTGTGTTATTTTGGTTGTGTGTAAAGTCCACTGTAACTGTGAACTCTAACACACCACTCGTATAGTTGAGGAGATAGTCCCATAACTCTCTTAATGATTTAAATGCCTTTGAACTAATTAGACCCTGTTTGACCAGCAAAGCAGCATTGCACATAGCCTCACCCACTCGATAAGAAAACCATCCAAATCCAAACTGCAAGTCATCTCTAAACATGGGCCTCTCTACATTTTTGTTCACCACTTTTAACACAAAGGATTGAAAGGGACCTAAAGCCTCAGCACCGTCCTCAGAAGGCATCATACCTCTGTGTGGGAACCATGAAAAATTACCTAGTGTCCTAGATGTTATGACAAACTCTCTAACAAACGATTCAAAATACACCTGTTTTAAGAAATTTTTGCAAATATCCCTTGTGCTCACAACAAACTCATCTGTCAGGCTCGAATCAGTCCGCTGATGTGACTTGACAAGATCAGAGAAGAGGACTGTGTAGTGTTCATCCCTCTTCCACTTCACAACGTGTGATATAAGTGATAGAGACTCTGAATTTATGTCAATCAACACACAAAGGTCAAGGAATTTTATCCGGGGACTCCATCTCATACTTTTTGAGCTCAAGTCAGACATGAATGGAAGTAATTGATCTTCAAACACCTTGGGATATAACCTTCTCACAGATTGGATCACATGATTCAAACTTACCTTGTCTTCTAATAACCTTGAACTTTCAGGCTTTCTAGCGACATAATCACATGGGTTCAAATGTTTTAAACCGGTGTCCTTGAGACATTTCCCTTTCACAGGTTCAGCCAAAACCCAAACACCCAACTCAAATGAATTACTCAGTGAAATACAAATGTAGTCCCAGAGAAGAGGTCTTAAAAGGCCTACATGGTCTAGGTCAGGCTCAGGGTGACTCAGCTTATCACAAATATAGAGTGGTATTTCATCCTGAGTTTGAATTCTTGATATGTTTCCATCAGCAGCAACATCCTCAAGAACTCTTTTTATATACAAATTTTCTCTATTCTTGTTTCTCACACATCTGCTTCCCAATGTCTTACACAAACCTATGAAACCAGATGATATACAACTCTGAAAAGCTGATTTATTTATAGCTTCTGATAACAGCTTCTGTGCTCCTCTTGTAAATTTACTGCAGAGCTTGCTCTGAAGCGTCTTTATCAGTGTTGGGATTCTTTCCTCTTGGAAAGTCATTGTCGATGGGTAGATGACTTTCTGCCTTAACACCATTCTCAGCGGGAACATTTCATTTAAATTCAACCAGTTTATATCTGCTATACGGTTTAAATCTTCCTCAAATTTCAAGACCTCACCTAGCTGAAGGATAGCTTCTTTCTTCTCCTTATTGAACAACTCTAAAAGAAATTCTTCGTTAAATTCTCCATTCTTGAGCTTGTGGTGTAGTCTCCTGATTAGTTTCCTAACCGTTTTTGTCTCATTTGGGCATAGCCTCTCGATGAGCCTTTGAATTCGATAACCTCTAGATCCATCCAACCAGTCCTTCACATCGGCATCAGCATTTAACAAGAAGGGGTCTAAAGGAAAGTTTGCGTACTTCAAAAGATCTAATGTCCTTTTCTGTATGGTGTTAACTAGGGAAACCGGCACACCATTAGCGACAGCCTGATCTGCAATTGTGTCTATTGTTTCACAGAGTTGATGTGGCTCTTTGCACTTTACATTATGTAGAGCGGCAGAGACAAATTTAGTCAACAAGGGAACCTCCTCACCCCAAACATAAAACCTTGACTTGAACTCTGCTGCAAATCTCCCAACCACACTTTTGGGACTGACGAATTTGTTCAACAAACCACTCAGATGAGAGTGAAACTCTAATAAGAGCAAGATTTCGTCTGGATCAGTGTCGACCATTTCACTTGATCTTCTATGAAAAAGGGTGATTTGATCATCGCTAGATGTGTACGCTTCCGGTCTTTCACCAAATATTACACCAATGCAGTAATTAATAAATCTTTCACTGATTAAGCCATAGAAATCAGATGCGTTATGCAAGATTCCCTGACCCATGTCAATAAGGCTGGAGATGTGAGATGGGACAATCCCTGCTTCAAAATAATCTCTGAATATCCTTTCTGTTTCAGTTGTCTGTGTGCCGCTCAAAAGTTTTAGCTTTGACTTGACATATGACTTCATCATCGCACTTACAACAGGAAAGGGAACCTCAACCAGCTTGTGCATGTGCCAGGTTAACAGGGTGCTGACATGATCTTTGCCAGACCGAACATATTGATCATCACCCAACTTGAGATTTTGCAGAAGCATGAGGAACAAAAATGGACACATCATGGGTCCCCACTTACTGTGATCCATACTATAATTCAGGAACCCTTCTCGCACATTGATGGTCATTAACAGAATTGCGTTCTCAAACTCCTTCTCGTTATTCAAGCATGAGCCCGAAAAGAAACTGGTGAATGATTCAAAATAGTCTTCCACTAATCTTGTAAACATCTTTGTTCTTAAATCACCAATATAGAGTTCTCTATTTCCCCCAACTTGTTCTTTGTAGGACAGCGCGAATTTCAGCCTTCCAGAATCAGGACCCACTGAAGTGTAAGAGGTTGGAGACTCTTCTGAATAAAAACATAAGTTTTTTAAAGCTGCACTCATACATTTTGTCAATGATAAAGCCTTGCTCAAAGATTCAGAATTACTTTCCCTCTCGCTAATCCTCACCTCCTCCTCCAACCTATCCCAGTCAAACTTAAAATTCAAACCTTGTCTTTGTACATGCCTATACTTTCCTGAGTAGGCGTTCGCATTCATCTGTAGTAGAATCATTTTCATACATGAGAACCAATCGCTGTCAGAAAAAAACTTTCTACATAAATTCCTTGCCATTTCGTCTAAAGCACATTGATCTTTAACTGTTGGTGTGAAATACAATGATGACAGCTCTGTGGAACTTTCAATAGCTTCACACAAAAATCTCATGTCATCTTGACTGATGCAAGATGGATCGAAGTCTTCAACTTGATGGAATGATATTTCAGAAAGGATAATCTTCCTTAAGTGACTCATGCTACCAGACAGAACAGTTTGGAGATGATGCAATCCCCTCAATTCTTTAACCCCTTCTACATTCCGCCCTCCTTCACCTGCCTTATCCTTGCTAAAATGTGTTATTGTAGAATTTACCCTGCCCTCCAATTCCTTAAAAAAACTGGTTTCCTCTTCTCCCTCAAAGCATGTACTCACAGAATCACTTCCGTTCCTCATTGACTCTGACTCTCTGGACCCGACGACCAGCTTAGAAACCAGTTTTGACACCTTGTACTCATAATCTGAGTGACTTAATTTAAACCTCTGTTTCCTTATGAACGATTCTGTGATCTGGCTCACAGCACTTACAAGTAGTTTGTTAAAGTTGTACTCCAATAATCGTTCTCCATTCAAATGCTTATTCACAACCACACTTTTGTTGCTTGCAAGGTCCAGTGCTGTTGCGCAGCCAGAGTTGGTCATGGGATCCAGATTACTAAGCTTTTTTTCCCCTTTGAATATCAAAGTCCCGTTATTGAATGAAGAAACCATTAAACTAAAGACCTCCAGGTTGACACCTGGGGTTGTCTGTTGACAGTCCACCTCCTTGCTGA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| 100,790
|
FJ607020.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Albarino,C.G., Palacios,G., Khristova,M.L., Erickson,B.R., Carroll,S.A., Comer,J.A., Hui,J., Briese,T., St George,K., Ksiazek,T.G., Lipkin,W.I., Nichol,S.T., Khristova,M.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Special Pathogens Branch
|
USA
|
2010-07-13
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,251
|
GenBank
| 1
|
USA: Georgia
|
USA
|
Homo sapiens
|
cerebrospinal fluid
|
1984
| null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain 810935 segment L, complete sequence
|
CGCACAGTGGATCCTAGGCTTTATTGTTTGCGCCACCAAAGTGCCTGATCTTGGTGTGTTTTCACAACCTGAACCTGACCAATTAACGACCCAGGGCTGAGAGAACCATGGGGCAAGCAAGATCAAAGAGTTCGAAGGAGGTCCCTGACAACATGGACAGGGCAGAAATGCTGCCAGACGCTACATATTTGGGGCCTCTCAACTGCAAGTCATGTTGGCAAAAGTTCGACAGCCTAGTGAGGTGCCATGATCATTACCTGTGCAGACACTGTCTGAACCTGCTGCTCACGGTGTCAGACAGGTGCCCTCTCTGCAAGTATCCACTGCCAACAAGACTCAAAGTGTCAACCGCTCCAAGCTCTCCTCCTCCCTACCAAGAGTAAAGGGCAGCCCACAGGAGGAGAGGAGAAGACCCACCACACACAAACACACACAGACACCCAAACCCACACACAGGGCCACAGCCCCAGCCAGCCCAGCGGCCCACAGGGGCGCAGGCCCAAACAGACCCACACACACAGGGCCCCCCTCGGGGGGCCCCCCCCCCGGGGGGGCGCCCCCCCGGGGGGCGCGTGGCGTCCCCGGGACCGCTCACTCGATGTCCTGGATCTGTGGGACAGCCAGCCAGTCCTCGCAGGATCTCCCCTTGAGCCTGAACCTTCCCCCTGTTGTCTCATACATAATTGTTTGCTTTGACTTACTATAACAAAGTCTGCAATCTTTGAATGAAAACCAATCAGGAACACTCATCAATGGCTGCAGGAGCACTGATTTGGGAATATGTAATTCCTGGAGAATAACGTCCAACTGTGAATTCATGAGGTGTTCACCTGTTCTATACCTGTGCAAAAACAAGTGGGATAGGACCTCATCAAATCTTAAATATCCCTCAAGCTCAGCAATGAAGACCTTTAAATCTTTGGTCTCTAAGTTCACCATAATGTTTTGAACACAGTTCCTTCCTTCATAAAGAACGCCAGATCTCACAGTGAGCGGCACAGGCTCCCATTCAGGACCCACTCTGTTAAAATCATGGGATCTTGCATCACTCAGTATTTTGTCAGACCCAATCAGCTCCAACTCTACTGACTCGCCCAGCACCATAGGGTCCACCATGTAGTCCTCAAACTCATCGGATCTGATAAGGAAAACATAATCCTTAGACTTGAACACTGAGTCTGTTCTTAAGAGGCACAAGCATTCATCCAAAAGCCTTCTATCCACTTCACCCTTGAAGAGGTAGGTGCACGACAGGAACTCTGCCAAAGCTTGGCCAAGTAACTTGCACTTAACTATAAATAACAATGAAAATTTCCTTAAACAATCAGTGTTGTTCTGGTTATGTGTGAAATCCACAGAGATTGTGAATTCCATAATACCATCAGTGTAGTTGAGAGTGTAGTCCCACAAATCCTTTAATGCGCGAAAAGACCCTGGGTTTACCAACCCCTGCCTGATCAACATAGCAGCAGTGCAGACAACCTCTCCCAATCGATAAGAGAACCAACCGAACCCGAATTGAAGGTCAGTCTTAAACATAGGTCTCTCAATGTTTTTATTAACCACCTTCAGCACAAAGGACTGAAAAGGTCCCATAGCCTCTGCACCATCTTCAGAGGGCATCATATCTCTGTGAGGAAACCATGAAAAATTACCAAGTGTCCTCGATGTTATGACAAATTCTCTAACAAATGATTCAAAGTACACCTGCTTCAAAAAGTTCTTGCACACATCTCTTGTGCTCACAACCAATTCATCGGTAAGGCTTGAATCAGAACGTTGATGTGAGTTTACAAGGTCTGAGAAAAGGACTGTGTAGTGCTCATCTCTTTTCCACTTCACAATATGTGATATTAGTGATAATGATTCAGAATTTATGTCAATAAGCACACAAAGGTCAAGGAACTTTATTCTAGGGCTCCATCTCATGTTCTTAGAGCTTTGGTCAGACATGAATGGCAAAAGCTGATCTTCAAAAACTTTAGGATACAATCTTCTGACTGATTGTATTACATGATTCAAGTTAATCTTATCTTCAAGCAGCCTAGAACTTTCAGGCTTTCTTGCAACATAATCACAGGGATTTAGATGTTTAAGCACTGTACCACTTGTCTTTCTCGCCTCTTGTGGTTCAGCCAAGACCCAGACACCCAATTCAAAGGAATTACTCAGAGAAACACATGTATAATCCCAAAGGAGCGGTCTCAACAGGCTTATGTGATCAGGTTGCGGGTCGGAGTATTTTGATCTGTCACACACATAAAGTGTTACATCATGACTTGTGTGAACTCTCACCACCTTATCATCTTTTGCTAAATCCTCCAACACTTTCTTGATGTACAAGTTTTCCCTGTTCCTATTTCTTACACATCTACTCCCTAGAGTTTTGCAGAGGCCTATGAAACCTGAAGATATGCAACTCTGAAAGGCTGACTTGTTTATAGCTTCTGACAAGAGCTTCTGCGCCCCTCTGGTGAACTTGCTACAAAGCTTGTTTTGCAAAGTCTTGATCAAGGAAGGCACCCTCTCCTCCTGAAAGTTCATTGTTGATGGGTACACCACTTTTTGTCTTAAAACCATCCTAATGGGGTACAGCTCATTCAGGTTTAGCCAGTTAAGATTGACCAATTCACTCATATCATCTTCTAAGCCCAACATTTCTGCAAGCTGCAAGACGGCTTCCCTTTTGTCTCTGTTAAACAGGTCTAAAAAGAACTCTTCATTAAACTCCCCGTTTTTAAGTTTATGATGTAACAGCCTCACCAACTTCCTGATAGTCTTTGTCTCATTGGGGCATAGGTCCTCAATTAACCTTTGGACCCTATACCCCCTGGAGCCATCCAACCAGTCTTTTACGTCAGTGTTGGTATTGAGGAGGAAGGGGTCCATAGGAAAATTTGCATATTTTAGGAGATTCAATGTCCTCATCTGTATGGTGTTAACTAAATGGATAGGAACACCATTGGCAACAGCTTGGTCTGCAATTGTATCTATTGTTTCACAGAGTTGGTGAGGTTCTTTACACTTCACATTATGCAATGCAGCTGATACAAACTTAGTAAGCAGTGGAACCTCTTCTCCCCACACATAAAACCTTGACTTAAACTCTGCTGCGAACCGACCCACTACACTTTTGGGGCTTATAAATTTATTCAGAAGGCCGCTCAAGTGAGAGTGGAATTCTAGTAAGATAAGAATTTCTTCTGGATGACTGTCCACCATTTCACTTAGCTTCTTATCGAACAGTGTGATTTGATCATCACTTGAAGTGTATGCTTCTGGTCTTTCACCAAAAATTACACCAATACAATAATTAATAAATCTTTCAGTAACCAGCCCATAAAAATCGGAAGCATTATGGAGGATCCCTTGTCCCATATCAATAAGACTAGATATGTGAGATGGCACAATGCCTCGTTCAAAATAGTTTCTGAAGATCTCCTCTGTCACGGTTGTTTGTGAACCCCTCAAGAGCTTCAACTTAGCCTTCACATAAGACTTCATCAACGCGCTGACAACAGGAAAGGGAACTTCAACGAGCTTATGCATGTGCCACGTCAGTAAAGTGCTAACATGATCTTTCCCAGACCTCACGTATTGATCATCACCTAATCGAAGATTCTGCAGCAACATTAAAAACAGGAAAGGGCACATCATTGGGCCCCACTTGCTGTGATCCAAGCTATAATTGAGGAGTCCCTCTCTTACATTTATAGTCATTGATAGTATTGCATTCTCGAATTCTTTTTCATTATTTAAACATGAACCTGAGAAAAAACTTGTGAAAGACTCAAAATAATCTTCTACAAGTCTTGTAAACATCTTAGTTCTCAGATCACCAATATAAAGCTCCCTGTTTCCACCAACCTGCTCTTTGTAAGAAAGCGCAAATTTCAATCTTCCAGAATCCGGGCCCACTGAAGTGTAAGACGTCGGAGACTCCTCTGAATAGAAACATAAGTTTTTTAGGGCTGCACTCATACATTTTGTCAACGATAAGGCCTTACTAAGTGATTCTGAATTGCTTTCTCTCTCACTAATCCTGACTTCATCTTCTAACTTGTCCCAGTCAAACTTAAAGTTCAGACCCTGTCTTTGAACATGCCTGTATTTGCCTGAGTATGAGTTGGCATTCATTTGTAAGAGTACCATTTTCATACAAGAAAACCAATCTTCTTCTGAAAAGAACTTTCTACTGAGGTTTTTGGCCATTTCATCAAGGCCACACTGTTCCTTAACATGCTGAGTGAAGTAAATCGCAGACAAATTTGAGTTTCCTTCAACCGCCTCACACACATGTCTCATCTCTTCAAGTGTCAAACATGAAGGGTCAAAATCTTCAACCAAGTGGAATGATATTTCTGACAAAATCAATTTCCTCAAATGAGCAAGGTTCCCAGTGAGGGCTATCTGCAAGTGGTGCAATCCTTTTGCATCCTCAACTCCTTTAGAACCTTGATGTTGTGCTATAGCTGAACTACTCTTGTAAGACGCAATCGTAGCATTCACTCTGCTTTCTAACTCTTTAAAAAAGTTGGACTCTTCTACACCCTCAAAGTGGGCTTGTTCAAGGCTGGCATTTTCTTTCTTTGAGTGTGCCTCAGAACCCAAGACCAACTTAGAGACTAACTTAGAAACTTTGTATTCATAATCAGAGTGGCTCAGTTTGTACTTTTGTTTTCTAACAAACCCTTCTGTTATTTGACTAACTGCACTAACAAGCAACTTGTTGAAATCATATTCTAACAGACGTTCTCCGTTGAGGTGCTTGTTTACAACAACACTCTTATTACTCGCAAGGTCTAGTGCAGTAGCACAGCCTGAATTTGTCATAGGGTCTAAGCTGTTGAGCCTTTTCTCTCCCTTATAAATAAGTGTCCCGTTGTTGAATGATGATACCATGAGGCTAAAAGCTTCTAAATTCACACCTGGAACCACTGCTTGACAATCTATCTCTTTGCTAACAAATTTTCTCATCTGCTCGTTGAAAACGTCTTCTT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| 100,791
|
FJ607021.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Albarino,C.G., Palacios,G., Khristova,M.L., Erickson,B.R., Carroll,S.A., Comer,J.A., Hui,J., Briese,T., St George,K., Ksiazek,T.G., Lipkin,W.I., Nichol,S.T., Khristova,M.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Special Pathogens Branch
|
USA
|
2010-07-13
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,238
|
GenBank
| 1
|
USA: Rhode Island
|
USA
|
Cricetinae
|
kidney, abdominal cavity
|
2005
| null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain 200501927 segment L, complete sequence
|
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| 100,792
|
FJ607022.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Albarino,C.G., Palacios,G., Khristova,M.L., Erickson,B.R., Carroll,S.A., Comer,J.A., Hui,J., Briese,T., St George,K., Ksiazek,T.G., Lipkin,W.I., Nichol,S.T., Khristova,M.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Special Pathogens Branch
|
USA
|
2010-07-13
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,194
|
GenBank
| 1
|
USA: Massachusetts
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
|
2008
| null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain 811316 segment L, complete sequence
|
CGCACAGTGGATCCTAGGCATTTTGTTGCGCTATTTTATAGTGCAGATTTCTCTTGTAGGACCATCATAAACAAGCCAAGCCATCACCCATGGGCCAAGGCAAGTCCAAGATGGAGAGGGACAGCAGCAACATGAACAGGGCTGAGATTCTGCCGGACACCACCTACCTTGGCCCTCTGAACTGCAAGTCATGCTGGCAAAGATTTGATAGTTTGGTTAGATGCCATGACCACTATCTCTGCAGACACTGTCTAAATCTCCTGCTGTCAGTCTCTGACAGATGCCCTCTCTGCAAACATCCACTGCCGACCAAACTGCGGGTGTCAACAGCTCCGAGCTCACCTCCCCCCTACGAGGAGTGACACAAGAGACCCACACGCAGACCAACACACACACACCCAGCACCCCTCACAGAACACGAACACAAACACCCAAACACACACCCACACCCACACGCCCCCAACCAGGGGGGCGCCCCCCCCGGGGGGCGGCCCCCCCGGGGGCCCGGGCGGAGCCCCACGGGGAGACCCATCACTCGATCTCCTCCACCATCATCCCAGCCAGCCAATCCTCACAAGACTTCCCCTTGAGTCTGAACCTACCTCCAACTGTCTCATACATTATTGTGTTTTTTGATTTGCTAAAGCAGAGTCTACAGTCCTTGAAGGTGAACCAGTCTGGCACAGACGACAATGGTACTAACAGAACAGATCTGTCTATGCACAACTCTTGCAAAATTGTGCTTATTTCCGACCCCTGTAGATGCTCACCAGTTCTAAATCGATGTAGTAGAAGACTTCCGAGGACGTCACCGATTTTCTCATAGCCTTCAAGCTCTGCCAAAAAAACTCTCATATCCTTAGTCTCCAATTTCACAACGATGTTTTGGACAAGGTTCCTTCCCTCAAAGAGAGCACCCGTCTTCACAGTCAGAGGCACAGGCTCCCATTCAGGCCCAATTCTCTCAAAATCAAGGGACTTGATCCCGTCCAGTATTTTTCTGGAGCCTGTTAACTCAAGCTCAAGAGAGTCTCCGAGTATCAAGGGGTCCTCCATGTAGTCCTCAAATTCTTCAGACCTAATGTCGAAAACACCATCATTTACCTTGAAGATAGGGTCTGTTCTCAATAAGTGGAGGCACTCATCTAACAATCTCCTGTCCACTTCGCCTTTAAAAAGGTGAGAACAAGATAAGAACTTAGCCACACCTGGGCTTTGCAATTGACATCTTACCAAAAAAATCAATGAAAACTTTCTCAAGCAATCAGTATTGTTCTGATTGTGTGTGAAGTCCACTGTGACTGAAAACTCCAACACTCCCTTTGTGTTGTTTATCATGTAGTCCCACAAATCTCTTAAAGATTTGAATGCTTTCGGATTCACCAAACCCTGTTTGATTAGCATAGCTGCATTGCACACAATGTCCCCTAAGCGATAAGAGAACCATCCGAAGCCAAACTGCAAATCGTTCCTAAACATAGGCCTTTCCACATTTTTGTTCACCACTTTCAAGATGAATGACTGAAAGGGCCCCAATGCTTCAGCACCATCTTCAGATGGCATCATGTCTTTGTGAGGGAACCATGAGAAACTTCCTAGAGTCCTGGCTGTTGCAACAAATTCTCGTACAAAGGACTCGAAATAGACCTGTTTTAAAAAGTTCTTGCAGACATCCCTTGTGCTAACAACAAATTCATCAACCAAGCTTGAATCGGAACGTTGATGAGAACTTACAAGGTCAGAAAATAAAACAGTGTAGTGTTCATCCCTCTTCCACTTAACAACATGAGATATGAGTGATAGGGATTCTGAGTTGATATCAATTAGTACACAGAGATCAAGGAACTTGATCCTGGGGCTCCACCTCATATTTTTTGAACTCATATCAGACATAAAAGGAAGTAGCTGGTCCTCATAGATTCTGGGATACAAACGCCTTACAGATTGAATTACATGGTTTAAACTTATTTTATCCTCCAGTAGCCTTGAACTCTCAGGTTTCCTTGCTACATAATCACATGGATTTAAGTGCTTAAGGCTTAAACTTACTTCATTCTTTCCCTTTATAGGTTCTGCTAAGACCCAAACACCCAACTCAAATGAATTACTAAGTGAAGTGCAAATATAATCCCAAAGAAGGGGCCTCAAAAGACTAACATGATCACGGTGAGCTTCTGGGTGGCTCTGCTTGTCACAAATATACAACATTATGCCATCACGCTTGTAGATTCTTGTCACATGCTCATCCATAGCTAGATCTTCAAGCACCTTTCTGATGTACAGATTCTCTCTGCTTTTATTTCTCACACATCTACTCCCCAAAGTCTTACAAAGGCCTATAAAGCCTGATGAAATACAGCTCTGAAAAGCTGATTTGTTGATTGCTTCTGATAACAACTTTTGTGCACCTCTTGTGAACTTACTGCAGAGCTTATTTTGTAATGTCTTGATCAACGAAGGGATTTTCTCTTCTTGGAAAGTCATCACTGACGGGTATACCACTTTCTGCCTCAAAACCATTCTCAATGGGAACATCTCATTTAAATTTAACCAATTGATGTTTGCCAACTGGTCCATATCCTCCTCAAAACCAAGGATGTCTCCCAACTGAAGGATGGCTTCTTTCTTGTCTCTATTGAAAAGGTCTAAGAAGAATTCCTCGTTAAACTCACCATTCTTGAGTTTATGATGTAATCTTCTCACAAGTTTTCTCACCACCTTTGTCTCATTAGGACATAACTCTTCAATGAGCCTTTGAATTCTATAACCTCTGGAGCCATCTAGCCAGTCCTTAACATCAGTATTGGTGTTTAGTAAAAATGGATCCAAAGGAAAGTTAGCGTATCTCAAGAGGTCCAATGTCCTCCTCTGGATGCAGTTTACTAACGAAACCGGAACACCATTCGCAATGGCTTGATCAGCAATCGTGTCTATTGTCTCACAGAGTTGGTGTGGCTCCTTGCACTTAACATTATGCAATGCTGCTGACACAAACTTTGTGAGGAGCGGGACCTCTTCCCCCCACACATAAAATCTAGATTTAAATTCTGCAGCAAACCGCCCCACCACACTCTTTGGACTGATGAACTTATTCAGCAAACCACTCAAATGAGAATGAAACTCTAGCAGGACAAGAACTTCTTCTGGGTCACTGTCAACTAATTCACTAATTCTCTTGTCAAACAAGGTGATCTGATCGTCACTTGATGTGTAAGACTCTGGCCTTTCACCAAAAATAACACCAATACAATAATTAATGAACCTCTCACTGATTAAGCCGTAAAAATCAGAAGCATTGTGCAAGATTCCCTGTCCCATGTCAATGAGGCTACTTATGTGAGAAGGCACTATCCCTAATTCAAAATATTCTCGAAAGATTCTTTCAGTGATGGTTGTTTCTGACCCCCTGAGAAGTTTCAGTTTTGATTTAACATATGACTTCATCATTGCATTCACAACAGGGAAAGGAACCTCAACAAGTTTATGCATGTGCCAGGTTAGCAAGGTACTAACATGATCCTTCCCAGAACGCACATACTGATCATCACCCAGCTTAAGATTCTGAAGGAGCATCAGAAATAAAAATGGGCACATCATCGGCCCCCACTTGCTATGATCCATACTGTAGTTCAATAACCCTTCTCGTACATTGATAGTCATAGATAGGATCGCATTTTCAAACTCTTTGTCATTGTTCAAACATGAACCCGAGAAAAAGCTGGAAAAGGATTCAAAATAATCCTCTATTAGCCTTGTAAACATTTTTGTTCTTAAGTCCCCAATATAGAGTTCCCTATTTCCTCCCACTTGCTCCTTGTATGACAATGCAAACTTCAGCCTTCCAGAATCAGGACCGACTGAAGTGTAGGACGTTGGTGATTCCTCTGAATAAAAGCACAGATTTTTTAAAGCAGCACTCATACATTTTGTCATTGATAAAGCTTTACTTAGAGACTCAGAATTGCTTTCCCTTTCACTAATTCTCACGTCTTCTTCTAATTTATCCCAGTCAAATTTGAAATTAAGGCCCTGCCTCTGCATGTGTCTATACTTCCCTGAGTATGCATTTGCATTCATTTGTAACAGAATCATCTTCATGCACGAAAACCAATCACTTTCTGAAAAGAATTTCCTACAAAGATTTTGTGCCATCTCATCAAGACCACATTGCCCCTTGACTGTAGAAGTGAAGTACAATGGTGACAGTTCTGCAGAAGATTCAACAGCCTCACAGATAAACCTCATATCATCATTGGTGAGACAGGATGGGTCAAAATCTTCTACTAGGTGAAAAGAAATTTCTGATAAAATGACCTTTCTCAAATAAGCCATTTTGCCTGATAATATAGTCTGAAGGTGATGTAATCCCCTTGCATTTTTAAGCCCCACCTCATCCTCCCCTTCACAGACCTTTTTAGTCCTTTCATACTGCTTTATTGTAGAGTTAACCTTATCTTCCAGGTTCCTAAAGAAACTTGTCTCTTCTTCCCCTTCAAAACATATGTCCACCGAACCACCATCCAATTTCCCTGCTTCTGTCTCTTTGGAACCCATGACCAATCTAGATACTAACTTTGAAACTTTGTACTCATAATCTAAATGGTTCAACTTGTACTTCTGCTTTCTCATGAAGCCTTCTGTAATCTGACTTACAGCACTAACGAGTAACTTATTGAAATCATATTCTAGAAGCCGTTCTCCATTTAGATGCTTATTTACAACCACACTTTTGTTGCTGGCAAGGTCTAATGCTGTCGCACACCCAGAGTTAGTCATGGGGTCCAGGCTATTGAGCCTCTTCTCCCCTTTTAAAATTAAAGTGCCATTGTTGAACGAGGACACCATCATGCTAAAGGCCTCTAAGTTAACACCTGGGGTTGCACGCTGACAGTTTATTTCTTTCCCAGTGAATTTCTTCATTTGTTCATAAAAAATGCACTCTTCCTCGGGGGTAATTGATTCTTTAGGGTTTACAAAGAAACCAAACTCACCTTTAGGTT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| 100,793
|
FJ607023.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Albarino,C.G., Palacios,G., Khristova,M.L., Erickson,B.R., Carroll,S.A., Comer,J.A., Hui,J., Briese,T., St George,K., Ksiazek,T.G., Lipkin,W.I., Nichol,S.T., Khristova,M.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Special Pathogens Branch
|
USA
|
2010-07-13
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,221
|
GenBank
| 1
|
USA: Michigan
|
USA
|
Mus musculus
|
spleen, abdominal cavity
|
2005
| null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain 810885 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCGTTTAGTTGCGCTTTTTGCTGCACATTTCTTGTTTGTGAGATTATTGGGCACAAATCAAGCCATCAGTCATGGGCCAGAGCAAATCCAGAGGGGAAAGGGGCAGCAGCAGCATGAACAGAGCCGAAATTCTGCCAGACACCACCTATCTTGGTCCTCTGAATTGTAAATCATGCTGGCAGAAGTTCGACAGCCTGGTCAGGTGTCATGACCACTATCTTTGCAGACACTGCCTGAATCTTCTGCTGTCAGTATCCGACAGATGCCCTCTCTGCAAGCACCCACTACCAACCAAACTGAGAATCTCAACAGCCCCGAGCTCTCCGCCTCCCTACGAGGAGTGAACCCAGCGTTCACCGGAGGCAAGCGACCCCACGAAGGAAGACCAAACCCAGACCAGCACAAACAAACACAGCACACAGCACAGAGCACACACACACAGACACACACGCACACCCACACCCACACACCCCCAGCGCCGGGGGCGCCCCCCCCGGGGGGCGGCCCCCCGGGAGCCCAGCGGGGCCCCACGGAGACGCCGATCAGTCGATCTCCTCGGCCGCCGGGCCAGCCAGCCAGTCATCACAGGACTTCCCCTTGAGTCTGAATCTACCCCCCACCGTTTCATACATGATGGAGTTCCTTGACCTACTGAAACAGAGTCGACAATCTTTAAAGGTGAACCAATCTGGCACTGATGACAGTGGCACCAAAAGGATGGACTTGTCTATACACAGTTCCTGAAGAATTGCACCTATGTCTGATCCTGGCAGATGTTCACCAGTTCTGAATCTATGCAGGAGAAGACTACCAAGGACTTCACCAATCTTCTCATAACCTTCAAGTTCCGCTAGAAACACTCTCATATCCTTGGTTTCCAGTCTCACAAAGATATTCTGAACAAGGTTCTTCCCCTCAAAAAGAGCACCGACCCTCACAGTCAGAGGCACTGGCTCCCATTCAGGCCCTACTCTCTCAAAATCAAGAGATTTAACCCCGTCCAACACTCCTCTAGAACCTATTAATTCAAGCTCAAGGGAGTCTCCTAGTATCAGAGGATCTTCCATATAGTCCTCAAACTCTTCAGACCTAATATCGAAAACACCATCATTCACCTTGAAGATTGAGTCTGTCCTCAATAGGTGGAGGCACTCATCCAACAATCTCCTGTCTACCTCACCTTTGAAGAGGCGGGAGCATGACAGGAATTTGGCAACACCTGCACTTTGTAACTGACATTTGACTACAAAGATCAATGAGAATTTCTTTAAGCAATCAGTGTTGTTTTGATTGTGTGTGAAATCCACTGTAATTGAGAACTCCAGTACTCCTCTTGTATTGCTGAGCATATAATCCCATAAATCTTTCAAGGACTTAAACGCTTTAGGGTTTGTCAAACCCTGCTTGACCAACATAGCAGCATTACACACAATGTCTCCCACCCGATAAGAGAACCAACCAAAACCAAATTGCAAATCATTTCTGAACATGGGCCTCTCTATGTTTTTGTTCACCACTTTTAGAACAAATGATTGGAAGGGTCCTAAAGCTTCAGCACCGTCTTCAGATGGCATCATACCCTTGTGAGGGAACCATGAAAAGTTACCTAAAGTCCTTGTTGTTGCAACAAATTCTCGGACAAATGACTCAAAATACACCTGCTTCAAAAAATTCTTGCAAACGTCTCTTGTGCTAACAACAAATTCATCAGTCAGACTTGAATCAGATCGTTGGTGAGAGTTAGCAAGATCAGAAAAGAGGACAGTGTAGTGCTCATCCCTCTTCCATTTTACGACATGTGAAATGAGTGATAGAGACTCTGAGTTGATATCAATTAACACACAAAGGTCAAGGAACTTAATCCTGGGACTCCATCTCATGTTTTTTGAACTTATATCAGACATAAATGGAAGCAATTGATCCTCAAAGATTTTAGGGTACAACCGCCTCACAGACTGAATCACATGATTTAAACTCACCTTATCTTCTAGTAATCTAGAACTCTCAGGCTTTCTTGCTACATAATCACATGGATTCAGGTGATTAAGAGTAAAGTTTCTGTCATTCTTCCCTGTCACAGGTTCTGCTAAGACCCAGACACCTAGCTCAAAAGAATTGCTCAATGAAATGCAGATGTAATCCCAGAGAAGGGGCCTCAGAAGACTGATGTGATCAGAGTGGGCATCTGGATGACTTCGCCTATCACAGATGTACAGCGCCACACCATCGTGTTTTTGAATTCTTGTAACATGCTCATCCGTTGCCAAATCTTCAAGTACCTTTTTTATGTACAAATTTTCTCTGTTCTTATTTCTTACACACCTACTCCCTAAAGTCTTACAAAGACCTATAAACCCAGATGAAATGCAGCTTTGAAAAGCTGATTTGTTGATTGCCTCTGATAATAGCTTCTGTGCACCTCTTGTGAACTTACTGCAAAGCTTGTTTTGGAGTGTCTTGATTAGTGAAGGGATTCTTTCTTCTTGGAAAGTCATCACTGAAGGATAAACCACCTTTTGCCTTAAAACCATCCTCAATGGAAACATCTCATTTAAATTTAACCAGTTGATATTTGCCAGTTGGTCCAGGTCTTCATCAAGACCAAGGATGTCTCCTAATTGAAGCATAGCTTCCTTTTTTTCTCTATTGAAAAGGTCCAAGAAAAATTCCTCGTTGAACTCTCCATTTTTGAGTTTATGATGTAGTTTTCTTACAAGTTTTCTTATGACCCTTGTCTCACTAGGACACAATTCTTCAATAAGTCTTTGGATTCTATAACCTCTAGAACCATCTAACCAGTCCTTCACATCAGTATTAGTGTTTAACAGAAATGGATCTAAAGGGAAGTTAGCATATCTTAATAGGTCCAAAGTCCTCCTTTGAATGGAGTTTACCAGAAAAACTGGAACGCCATTTGCAATAGCTTGATCAGCGATTGTATCTATCGTCTCACAGAGTTGATGCGGTTCTTTGCATTTGACATTATGCAGTGCTGCAGACACAAACTTAGTGAGAAGAGGGACCTCTTCCCCCCACACATAAAATCTAGATTTGAACTCTGCAGCAAATCGCCCAACAACACTCTTTGGGCTGATAAACTTATTTAATAGACCACTCAAATGAGAATGGAACTCCAATAAGACGAGGACTTCTTCTGGATCACTATCCACCAGCTCACTTAATCTTCTATCAAATAAGGTGATCTGATCATCACTTGACGTATAAGCTTCTGGTCTTTCTCCAAAAATAACACCAATACAATAGTTGATGAATCTCTCACTAATCAAGCCATAAAAATCAGAAGCATTGTGCAGAATTCCCTGCCCCATGTCAATAAGACTAGATATATGGGATGGCACTATCCCCATTTCAAAGTATTCTCTGAAGATTCTTTCAGTGACTGTTGTTTCTGAACCCCTAAGAAGCTTTAATTTTGATTTAACATATGACTTCATCATGGCACTCACAACAGGGAAGGGTACTTCAACAAGCTTATGCATGTGCCAAGTTAGCAGAGTGCTGACATGATCTTTCCCAGTACGCACATATTGATCATCACCCAGTTTGAGATTTTGAAGAAGCATCAGAAACAAGAATGGACACATCATTGGTCCCCATTTACTGTGATCCATACTGTAGTTCAGAAACCCCTCTCGCACATTAATGGTCATTGACAACACTGCGTTTTCAAATTCTTTGTCGTTGTTCAAACATGAACCTGAGAAGAAACTAGAAAAGGATTCAAAATAATCCTCTATCAACCTTGTGAACATTTTTGTCCTCAAGTCTCCAATATAAAGCTCTCTATTTCCCCCGACCTGCTCTTTGTAAGAAAGTGCGAACTTCAGTCTTCCAGAGTCAGGACCAACTGAGGTGTATGATGTTGGTGATTCTTCTGAATAAAAGCACAAGTTCTTTAAAGCAGCACTCATACACTTTGTCAGAGACAAAGCCTTGCTTAGAGATTCGGAGTTGCTCTCTCTCTCACTAATTCTTGCGTCCTCTTCTAACTTGTCCCAGTCAAATTTGAAGTTTAAACCCTGCCTTTGCATGTGTCTGTATTTACCTGAGTATGCATTTGCATTCATTTGCAACAAAATCATCTTCATGCATGAAAACCAATCACACTCTGAAAAAAACTTTCTACAAAGATTCATTGCCATCTCATCCAGACCACATTGTTCCTTAACAGCTGAAGTGAAATACAACGATGACAGTTCTGTGGATCCTTCAACAGCCTCACATATGAACTTCATGTCTTCATTAGTTAGGCAAGATGGATCAAAGTCTTCCACTAAGTGAAAAGAAATTTCTGACAGAATGACCTTTCTTAAATAAGCCATTTTGCCTGACAAAACAGTCTGAAGATGATGCAATCCCTTTGTGTTTTTAAGATCAACCCCATCTTCTCCTTCATTTGCCTTCCTGCTTCTCTTATATCGCGTTATTGTGACATCAACCCTGTCTTTTAAACCCTTAAAGAAACTTGTCTCTTCTTCTCCTTCAAAACACACATCTGCTGGGTCATCCCCCGGTTTCTCTACTCCTCCTCCATTAGAGCCAATAACCAATCTGGAAACCAACTTTGATACCTTATACTCATAATCTGAGTGATTCAACTTGTACTTCTGTTTTCTTATAAAACCCTCTGTGATCTGGCTCACAGCACTAACAAGTAGCTTATTGAAATCATATTCTAAAAGCCGTTCTCCATTCAGGTGCTTATTGACAACCACACTCTTGTTGCTTGCAAGATCTAGTGCTGTCGCACAACCGGAGTTGGTCATGGGGTCCAGACTATTAAGCTTTTTCTCTCCTTTGAAAATCAATGTACCGTTATTGAACGATGATACCATCAGACTGAAGGCCTCTAAGTTAACACCTGGAGTTGTGTTCTGACAATCAATCTCTTTACTAGTGAACTTCTTCATCTGTTCATAAAAAACACATTCCTCCTCAGGGGTGATTGCTTCTTTAGGGTTA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| 100,794
|
FJ607024.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Albarino,C.G., Palacios,G., Khristova,M.L., Erickson,B.R., Carroll,S.A., Comer,J.A., Hui,J., Briese,T., St George,K., Ksiazek,T.G., Lipkin,W.I., Nichol,S.T., Khristova,M.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Special Pathogens Branch
|
USA
|
2010-07-13
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,228
|
GenBank
| 1
|
USA: New York
|
USA
|
Homo sapiens
|
cerebrospinal fluid
|
1947
| null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain Douglas strain (4707) segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCGTTTAGTTGCGCTATTTAGTTGCACAACCTTTCTTTGTGAGGCTATTAGAGACAGACAGCACTATCAATTATGGGCCAGGGCAAATCCAAGGAGAAGAGAGACACCAGTGATGCCAATAGAGCTGAGATTCTACCAGACACCACCTATCTTGGACCGCTAAACTGCAAGTCATGCTGGCAAAAGTTTGACAGCTTGGTCAGATGCCATGACCACTACCTGTGCAGAAATTGTCTGAATCTCCTGCTATCGGTCTCTGATAGATGTCCCCTCTGCAAACATCCACTGCCAACTAAATTAAGGGTATCAACAGTCCCAAGTTCGCCACCTCCCTACGAGGAGTGACGCCCCCACACCCACATCGGCAGTCCAACAAAGGAAGGACACACACAAGCCAGCACACACAGACACAGCATCCAACACAAAACACACACACACACGCACACACACACACTCCCACACCCACGCGCCCCCCACCCCTCGGGGGGCGCGCCCCCCGGGGGGGGGCGGCCCCCCGGAGGCCCGGGCAGAGCCGCACGGAGACGTCGATCAGTCGATCTCCTCAGCCATCAACCCAGTCAGCCAGTCGTCGCAGGACTTACCCTTGAGTCTGAACCTGCCCCCAACTGTTTCATACATCACTGTGTTCTTTGACTTACTGTAACAGAGTCTACAATCTTTAAAGGTGAACCAATCTGGCACAAATGACAATGGCATCAATAAGACGGATCTATCCATGCGCAACTCCTGAAGGATCGTACTTATCTCTGATCCCATCAAATGCTCACCAGTCCTGAATCGATGCAAAAGAAGGCTGCCGAGGATGTCACTAATCCTATCATAACCTTCAAGTTCCGCCAAAAAGACCCTCATATCTTTAGTTTCCAACTTCACAAGAATGTTTTGAACAAAGTTTCTCCCTTCAAAGAGAGCACCCATTCTCACAGTCAGAGGCACAGGTTCCCATTCAGGTCCGACTCTTTCAAAATCAAGGGATTTGATTCCATCGAGTATCTTCCTAGAGCCTATCAGCTCAAGCTCAAGGGAGTCACCGAGTATTAAGGGGTCTTCCATATAATCTTCAAACTCCTGAGATCTGATGTCAAAAACACCATTATTAGTTCTGAAAATAGGGTCTGTTCTTAATAAGTTGAGACACTCATCCAACAATCTCCTGTCTACTTCACCTTTGAAGAGGTGAGAGCATGACAAAAACTCAGCTACACCTAAACTCTGTAATTGGCATTTTATTAAAAGGATCAATGAAAATTTCCTTAGGCAGTCAGTGTTATTTTGGTTGTGTGTGAAGTCCACTGTGATTGAAAACTCCAACACTCCTTTTGTGTAATTGAGCATATAGTCCCACAGGTCTCTCACAGATTTAAATAATCTTGGATTTGTCAGACCTTGCTTAACTAACATGGCAGCGTTACACACTATATCTCCCATTCGGTAAGAGAACCACCCAAAACCGAACTGCAAATCATTCCTAAACATAGGCCTCTCTATATTTTTATTCACCACTTTTAAAACAAATGATTGGAAAGGCCCCAATGCTTCAGCGCCATCTTCAGATGGCATCATGTCTTTATGAGGGAACCACGAGAAACTTCCTAAAGTTCTAGTCGTTGCAACAAATTCTCGCACAAATGATTCAAAATACACCTGTTTCAAAAAGTTTTTACAAACATCCCTTGTGCTAACAACAAATTCATCAACCAGACTTGAATCAGACCGTTGATGGGAATTGGTGAGTTCAGAAAATAGGACAGTATAATGCTCATCCCTCTTCCACTTAACAACATGAGAAATGAGCGATAAGGACTCTGAGTTAATGTCAATCAATACACAAAGGTCAAGGAATTTGATCCTGGGACTCCACCTCATATTTTTTGAGCTCATATCAGACATGAATGGAAGTAGCTGGTCCTCGAAGATTTTGGGGTACAATCTCCTCACAGATTGAATCACATGGTTCAAACTTATTTTGTCCTCCAGCAGTCTGGAGCTTTCAGGTTTCCTTGCTACATAATCACATGGGTTAAGATGCCTAAGACTTGAAGTTTTATCACTCTTCCCTTTCACAGGTTCTGCCAAGACCCAAACACCCAATTCAAAAGAATTGCTCAGTGAGATGCAAATATAGTCCCAGAGAAGGGGCCTTAGGAAATTGACATGATCACGGTGAGCTTCTGGGTGAGTCTGTTTATCACACATATATAACATTATGCCACCATTTTTATGAAGTTTTGTCACATGCTCATCCACAGCTAGGTCCTCAAGCACTTTCCTGATATACAGGTTTTCCCTGTTTTTGTTTCTCACACATCTACTTCCCAGAGTCTTGCAAAGACCTATAAAGCCAGATGAGACACAACTCTGAAAGGCTGACTTATTGATTGCCTCTGATAGTAACTTCTGTGCACCCCTTGTGAACTTGCTACAAAGCTTATTTTGGAGCGTTTTAATCAATGAAGGGATCCTTTCTTCTTGAAAAGTCATCACTGATGGATAAACCACTTTTTGCCTCAAAACCATTCTTAATGGGAACATCTCATTTAAGTTCAACCAGTTGATGTTTGCTAATTGATTTAGATCTTCTCCCAGACCAAGGATATCTCCTAGTTGAAGGATTGCCTCTTTCTTATCTCTATTGAAAAGGTCTAGGAAAAATTCTTCGTTGAATTCACCATTCTTGAGTTTATGATGAAGCTTCCTCACAAGCTTTCTTATGACCTTTGTTTCACTAGGACACAATTCTTCAATAATTCTCTGGATCCTATATCCTCTGGAGCCATCTAGCCAATCCTTCACATCACTATTGATGTTCAATAGAAATGGGTTTAAAGGGAAGTTGGCATATTTTAAAAGATCTAGTGTCCTCTTCTGGATACAGTTTACTAAAGAAACTGGGACACCATTCGCAACAGCTTGATCGGCGATTGTGTCTATTGTCTCGCAAAGCTGATGCGGTTCCTTGCACTTAACGTTATGTAGCGCTGCAGAAACAAACTTTGTGAGGAGAGGAACTTCCTCCCCCCACACATAAAATCTAGATTTGAACTCTGCGGCAAACCGTCCAACCACACTTTTAGGACTGATGAACTTGTTTAATAACCCACTCAAGTGAGAATGAAATTCTAGTAAGACAAGAACTTCTTCAGGGTCACTATCAACCAATTCGCTTAATCTCCTATCAAATAAGGTGATTTGATCATCACTTGATGTGTAAGCTTCTGGCCTCTCACCAAAGATGACACCAATACAATAGTTGATGAACCTTTCACTAATTAAGCCATAAAAATCTGAAGCATTGTGCAATATTCCTTGTCCCATGTCAATGAGACTAGATATGTGGGATGGTACTATTCCCATTTGAAAGTATTCTCTAAAGATCCTTTCAGTAACAGTTGTTTCTGAGCCCTTGAGAAGCTTCAGCTTTGACTTGACATATGATTTCATCATTGCACTCACAACAGGGAAGGGGACCTCAACAAGTTTATGCATGTGCCAAGTTAATAAAGTGCTGACATGATCCTTCCCAGAACGCACATATTGGTCATCACCAAGTTTGAGGTTTTGAAGTAGCATTAGAAATAAAAATGGGCACATCATCGGTCCCCATTTACTGTGATCCATGCTGTAGTTTAAAAAGCCTTCTCGCACATTGATAGTCATTGATAGGATTGCATTTTCAAATTCTTTGTCATTGTTTAAACATGAGCCTGAAAAGAAACTAGAAAAGGACTCAAAATAGTCCTCTATTAATCTTGTGAACATTTTTGTCCTTAAGTCTCCAATATAGAGTTCTCTATTTCCTCCAACCTGCTCCTTGTAAGACAATGCAAACTTCAGCCTTCCGGAATCAGGACCAACTGAAGTGTATGATGTTGGTGACTCCTCTGAATAAAAGCATAGGTTCTTTAAGGCAGCACTCATACACTTTGTTAATGTTAGAGCCTTGCTTAAAGACTCAGAATTGCTCTCCCTCTCACTAATTCTCACGTCTTCTTCCAATTTATCCCAGTCAAATTTGAAATTCAACCCCTGCCTTTGCATATGCCTGTACTTCCCAGAATATGCATTTGCATTCATCTGTAACAGAATCATCTTCATACATGAAAACCAATCACCCTCTGAAAAGAACTTTCTACAAAGGTTTTTTGCCATTTCATCTAGACCACATTGTTCCTTGACAGCTGAAGTGAAATATAGTGGTGATAGTTCTATAGAGCCCTCAACAGCCTCACATATGAACCTCATGTCATCATTGGTGAGACAGGTTGGATCAAAGTCTTCCACTAAGTGAAAAGATATTTCTGACAAAATGACCTTCCTCAAATAAGCCATTTTGCCTGACAAAACAATTTGAAGGTGATGTAGTCCTTTCGTGTTTTTTAATTCCTCTCCATCTTCCCCCTCATCAACCTTCTTACCTCTTCTGTACTGTGTTATTGTGGAGTTAACCTTGGTTTCCAGATTCTTGAAAAAATCTGTCTCTTCTTCTCCCTCAAAGCACACATCTACTGGATCACATTCCAGTTTCCCTGCCTCCACTCCCTTGGAACTGATGACCAATCTTGACACCAGCTTTGAGACTTTGTACTCATAATCAGAGTGATTCAATTTATACTTCTGCTTCCTCATGAAACCCTCTGTAATTTGACTCACAGCACTAACAAGTAATTTGTTGAAATCATATTCCAGGAGCCGTTCTCCATTTAGATGTTTATTGACAACCACACTTTTGTTGCTGGCAAGATCTAATGCTGTTGCACATCCAGAGTTGGTCATAGGGTCCAGGCTATTGAGCTTCTTTTCCCCTTTAAAGATCAAAGTACCATTATTAAATGAGGACACCATCATGCTAAAGGCCTCTAAGTTAACACCTGGGGTTGTGTGCTGACAATCAATCTCCTTACTGGTGAATTTTCTCATTTGTTCATAAAAGACACTTTCTTCTTCAGGGGTGATTGCTTCCTT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| 100,795
|
FJ607025.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Albarino,C.G., Palacios,G., Khristova,M.L., Erickson,B.R., Carroll,S.A., Comer,J.A., Hui,J., Briese,T., St George,K., Ksiazek,T.G., Lipkin,W.I., Nichol,S.T., Khristova,M.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Special Pathogens Branch
|
USA
|
2010-07-13
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,226
|
GenBank
| 1
|
USA: New York
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
1935
| null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain WE substrain UBC No. 57135 segment L, complete sequence
|
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| 100,796
|
FJ607026.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Albarino,C.G., Palacios,G., Khristova,M.L., Erickson,B.R., Carroll,S.A., Comer,J.A., Hui,J., Briese,T., St George,K., Ksiazek,T.G., Lipkin,W.I., Nichol,S.T., Khristova,M.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Special Pathogens Branch
|
USA
|
2010-07-13
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,238
|
GenBank
| 1
|
USA: Ohio
|
USA
|
Cricetinae
|
kidney, abdominal cavity
|
2005
| null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain 200504261 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCGTTTAGTTGCGCTATTTTGTTGTGCTAATTTGTTACACAACCCTACTCTGTGAGGCTGTCAGAGATAGACCAAACCATCAACCATGGGCCAGGGCAAGTCCAAGGGAGAGAAGGACACCAACAACGCAAACCGAGCAGAGCTCTTGCCAGATGCCACCTATCTTGGCCCTCTAAATTGCAAATCATGTTGGCAGAAATTTGATAGCCTAGTTAGATGCCATGATCATTATCTCTGCAGACACTGCCTCAACCTCCTATTGTCAGTATCTGACAGATGCCCTCTCTGTAAACACCCACTGCCAACCAAACTAAGAGTGTCAGCAGCTCCGAGCTCACCACCTCCCTACGAGGAGTGACGCCCCGAGTCCCAGCACCAGCAGGCGACCCGAGACGGGAGAACCACACACAGGCCAGCACACACAAACACACCACCCACCACAGGACACACACGCACACACACTCACACACACCCACACCCAAGCGCCCCCGGCACCGCCGGGGGCGCCCCCCGGGGGGGCCCCCCCGGGGGCCCGGGCGGAGCCCGGCAGGAGCACCAACTAGTCTATCTCCTCGACCACTGGCCCCGCCAGCCAATCATCACAGGACTTCCCCTTGAGTCTAAATCTGCCCCCAACTGTCTCATACATTACCGTGTTCTTTGATTTGCTGTAGCAGAGTCTACAATCTTTGAAGGTAAACCAATCTGGAACAAAAGACAATGGCCTCAACATGATGGATTTGTCCACATGCAGCTCCTGAAGAACTGCACTTATTTCTGACCCCAACAAGTGCTCACCAGTTCTGAATCGGTGCAAGAAAAGATTGCCCAGAACGTCACCAATCTTTTCATAGCCTTCAAGTTCTGCCAAGAAAACCCTCATGTCCTTGGTCTCCAACTTCACAAGGACATTCTGAACAAAGTTTCTCCCCTCAAAAAGAGCGCCCATCCTCACAGTCAAAGGCACAGGCTCCCACTCAGGTCCAATTCTCTCAAAGTCAATAGATCTAATCTCGTTCAATATTCCCCTGGAACCCACCAGTTCAAGTTCAAGAGAATCACCAAGTGTCAAAGAGTCCTCCATATAATCCTCAAATTCATCGGATCTGATATCAAAAACTCCATCATTCATCCTAAACACAGAGTCTGTCCTCAACAGATGGAGACACTCATCCAACAACCTCCTGTCCACCTCACCTTTGAAGAAATGGGAGCAAGACAGGAACTCTGCTACACCTGGGCTTTGTAACTGGCACTTCACTACAAAAATCAATGAAAACTTCCTCAAGCAGTCAGTATTGTTCTGATTGTGTGTAAAATCTACTGTAATTGAGAACTCCAACACCCCCCTTGTGTTGTTGAGCATATAATCCCATAGATCTCTTAAAGATTTAAATGCTTTTGGTTCTGTCAAGCCCTGCTTAATTAGCATAGCAGCATTACACACAATATCTCCTACTCGATAAGAAAACCAACCAAAACCAAACTGCAAGTCATTCCTAAACATAGGCCTCTCTATATTTTTGTTAACCACCTTTAAAATAAATGATTGGAAAGGTCCCAATGCTTCAGCGCCGTCCTCAGATGGCATCATGTCTCTATGAGGAAACCATGAGAAACTGCCTAAGGTTCTACTTGTTGCAACAAATTCTCGTATGAATGATTCAAAATATATTTGCTTTAGAAAGTTCTTACAAACATCCCTTGTGCTAACAACAAACTCATCTACTAAACTTGAGTCAGACCGTTGATGAGAGTTAACGAGATCAGAAAACAGCACAGTGTAATGCTCGTCCCTCTTCCATTTGACAACATGAGAAATGAGTGACAAAGACTCTGAATTGATATCAATCAACACGCAAAGGTCTAAGAATTTAATCCTGGGACTCCATCTCATGTTTTTTGAGCTCACATCAGACATGAATGGGAGCAGCTGGTCCTCAAAGATTTTGGGATACAATCGCCTCACAGATTGGATTACATGATTCAAACTTACTTTATCTTCCAACAATCTTGAGCTTTCAGGCTTTCTTGCCACATAATCACATGGGTTTAAGTGTTTAACACTTAAACTCTTCTCATTCTTCCCCTTCACAGGCTCTGCTAGAACCCAGACACCCAATTCAAAGGAATTGCTCAATGAGATGCAGATATAGTCCCAAAGAAGAGGCCTCAAAAGGCTGATGTGATCATGGTGAGCCTCTGGGTGACTCTGTCTGTCCAAGATGTATAACATTATACCATCATTATTCTGAACCCCTACAATATGATCATCCATGGCTAAGTCTTCAAGCACTTTCCTAATATAGAGGTTTTCCCTGTTTCTGTTTCTCACACACCTGCTTCCCAGAGTCTTACAGAGGCCAATGAAACCGGATGAGACACAACTCTGGAAAGCAGACTTGTTGATTGCTTCAGACAATAATTTCTGTGCACCCCTTGTGAATTTACTGCAGAGCTTATTCTGGAGTGTTTTAATCAGTGAGGGTACCTTTTCTTCTTGAAAGGTCATTACTGATGGATAAACCACTTTTTGCCTTAAAACCATCCTCATCGGGAACATTTCATTTAAATTTAACCAATTGATGTTTGCCAATTGACTGAGGTCCTCTTCAAGACCAAGAACATCTCCTAATTGAAGGATAGCTTCTCTCTTGTCCCTATTGAAAAGGTCTAGAAAAAATTCTTCGTTGAATTCACCATTCTTGAGTTTATGGTGTAGTCTTCTTACAAGCTTTCTTATGATCTTTGTTTCACTAGGGCACAATTGTTCAATGAGTCTTTGAATCCTATACCCCCTGGAGCCATCTAACCAGTCTTTCACATCAGTGTGAATGTTTAACAAAAATGGATCTAAAGGGAAATTGGCATATTTCAAGAGATCCAATGTCCTCTTCTGAATACAATTCACTAAAGAAACTGGGACTCCATTCGCTATGGCTTGGTCAGCAATCGTGTCTATTGTTTCACAAAGTTGATGCGGTTCCTTGCACTTAACATTGTGCAATGCTGCAGACACAAATTTGGTGAGAAGAGGGACTTCTTCCCCCCATACATAAAATCTGGATTTAAATTCCGCAGCAAACCGCCCAACTACACTTTTTGGACTGATGAATTTGTTCAGTAAACCACTCAAATGAGAATGGAATTCTAGCAAGACAAGAACTTCTTCTGGGTCACTATCAACTAATTCACTCAATTTTCTGTCAAATAAAGTGATCTGATCATCACTTGATGTGTAGGCTTCTGGCCTCTCTCCGAAGATGACACCAATACAATAGTTGATGAACCTCTCACTAATCAAACCATAAAAGTCAGAGGCATTGTGTAGGATTCCCTGTCCCATGTCAATAAGACTGGATATATGAGATGGCACCACCCCCATTTCAAAATATTCTCTAAAGATCCTCTCAGTAACAGTTGTTTCTGAACCCTTGAGAAGCTTGAGTTTTGATTTAACATATGACTTCATCATTGCATTTACAACAGGAAAAGGAACCTCAACGAGTTTGTGCATGTGCCAAGTTAGCAGAGTGCTAACATGATCCTTTCCAGAACGCACATATTGATCATCACCAAGTTTGAGATTCTGAAGGAGCATTAGAAATAGAAATGGACACATCATCGGACCCCATTTACTGTGGTCCATGCTGTAATTTAACAATCCTTCTCGTACGTTGATGGTCATTGACAATATTGCATTTTCAAATTCTTTATCGTTGTTCAAACAGGAACCTGAGAAGAAGCTGGAAAAAGACTCAAAATAATCCTCCACCAATCTTGTAAACATTTTTGTTCTCAAGTCACCGATGTAAAGCTCTCTATTTCCCCCAACTTGCTCTTTGTAAGATAGTGCGAACTTTAGTCTTCCAGAATCAGGACCAACAGAAGTGTATGATGTCGGTGACTCTTCTGAGTAAAAGCACAGGTTCTTCAAGGCAGCACTCATGCATTTTGTCAATGACAGAGCCTTGCTTAGAGACTCAGAATTACTCTCTCTTTCACTAATTCTTACATCTTCTTCTAATTTGTCCCAATCGAATTTAAAGTTCAAGCCCTGCCTTTGCATGTGTCTGTATTTCCCTGAATATGCATTTGCATTCATTTGTAATAAAATCATTTTCATGCATGAAAACCAATCACCCTCTGAAAAAAACTTTCTACAAAGATTTTTTGCCATCTCATCCAGACCACATTGTTCTTTGACAGCTGAAGTGAAGTACAATGGTGATAGTTCCGTAGAACTCTCAACAGCCTCACAAATGTACCTCATATCATCACTAGTAAGACAAGATGGGTCAAAATCCTCTACTAGGTGAAATGATATCTCTGACAAAATTATCTTCCTTAAATGGGCCATTTTACCTGATAGGATGACCTGAAGGTGGTGCAGTCCTTTAGTATCTTTAAGTTCTCTCTCACCCTGTCCCTCATTGGGTTTTCTGCCACCATCATATCGTATTATTGTAGAATTAACTTTATTTTCTAAATCCCTAAAGAAACTTGTCTCTTCTTCTCCTTCAAAACATACATCTATCAAGTCACCCTCTGTTTTTTCTGTTTCTGTTCCTTTAGAACCAATGACTAACCTGGAAACAAGCTTTGAGACCTTATACTCGTAATCTGAATGTTTCAATTTATACTTCTGTTTTCTCATAAAACCTTCTGTGATTTGGCTCACAGCACTAACAAGTAGTTTATTAAAATCATATTCTAAAAGCCGTTCTCCATTTAGGTGCTTGTTGACAACCACACTTTTATTACTCGCAAGATCTAATGCTGTTGCACATCCAGAGTTGGTCATGGGGTCCAGGCTATTGAGCTTTTTCTCTCCTTTAAATATTAGGGTGCCATTGTTAAATGAAGACACCATCATACTGAAGGCCTGTAAGTTAACACCCGGGGTTGAATGCTGACAGTCAATATCCTTGCCGGTAAACTTCTTCATTTGCTCATAAAAGACACATTCTTCCTCAGGAGTGA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| 100,797
|
FJ607027.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Albarino,C.G., Palacios,G., Khristova,M.L., Erickson,B.R., Carroll,S.A., Comer,J.A., Hui,J., Briese,T., St George,K., Ksiazek,T.G., Lipkin,W.I., Nichol,S.T., Khristova,M.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Special Pathogens Branch
|
USA
|
2010-07-13
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,184
|
GenBank
| 1
|
USA: Wisconsin
|
USA
|
Homo sapiens
|
cerebrospinal fluid
|
2003
| null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain 810362 segment L, complete sequence
|
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| 100,798
|
DQ868484.1
|
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Emonet,S., De Lamballerie,X., Charrel,R.M.
|
Faculte de Medecine de Marseille, Unite des Virus Emergents
|
France
|
2009-07-31
| null |
Mammarenavirus choriomeningitidis
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,219
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Lymphocytic choriomeningitis virus strain CH-5692 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCGGTTTGTTGCGCTGTTTAGTGGCCTACATCTCCTTCACAAGACCACCAGAGCACAGCAAGTCACTAGCCATGGGTCAAGGTAAATCCAAGGGGGAAAGAGAAATCAGCAGTGCGCAAAGGGCTGAGATTCTGCCAGACACCACATATCTTGGTCCTCTAAACTGCAAGTCATGCTGGCAGAGGTTTGACAGCTTAGTGAGGTGCCATGATCACTACCTCTGCAGACATTGTCTGAATCTGCTGCTGTCAGTCTCCGACAGATGTCCCCTCTGCAAACACCAGTTGCCGACCAAACTGAAGATATCGACAGCCCCAAGCTCACCACCTCCCTACGAGGCGTGAAGCCCCCTGAGCAACAGCAAGCGGCCCAGCAAAAGGGACCCACACACAGACCAACACGCACAGACGGGGAGCCCCCCAGAACACACACACACACATAGAAGCACACCCACACCCACACACCCCCCACACCCGGGGGGCGCCCCCCCGGGGGGGACGCCCCCGGGGGCCCGGCCGGGGCCCGGCGGAGACGCCCATTACTCGATCTCCTCGACCTCCGTCCCGGCTAGCCAGTCGTCGCAGGACTTCCCCTTGAGTCTGAATCTGCCCCCAACTGTCTCATACATCACTGTGTTCTTTGACTTACTAAAACAGAGTCTGCAGTCTTTGAATGTGAACCAGTCCGGTACAAATGACAGCGGCAACAACATAACAGATCTGTCCATGTGCAATTCCCGAAGGGTCACACCTATTTCTGAACCCGACAGATGCTCACCGGTTCTGAATCGATGCAGAAGAAGATTGCCAAGAACATCAGTGGTCCTCTCATACCCATCAAGTTCTGCCAGAAAAACCCTCATGTCCTTAGTCTCCAGCTTCACATGAATGTTTTGAACAAGGTTTCTCCCCTCAAAAAGAGCACCCATCTTCACAGTCAGTGGAACAGGCTCCCATTCAGGGCCAACTCTTTCGAAATCAAGGGATTTGATCCCATCTAACATCTTTTTAGAGCCTATTAATTCAACCTCGAGACAATCACCAAGTATCAAAGGGTCTTCCATATAGTCCTCAAATTCTTCTGATCTAACATCAAGAACAGCATTATTCACCTTAAAGATGGGGTCTGTTCTAAGCAAGTGAAGGCACTCATCCAGTAATCTTCTGTCCACCTCACCCTTGAAGAGGTGAGAACATGACAAGAGCTCGGCTACACCTGGACCTAATAATTGACACTTCACTAATAAAATCAATGAAAACCTCCGTAAACAATCTGTATTGTTTTGGTTGTGTGAGAAATCCACTGTGATTGAGAGCTCTAGCACTCCCTCTGTGTAAGTGAGCATATAGTCCCACAGATCCTTTAAAGATTTAAATGCCCTTGAGTCTGTTAGCCCTTGCTTAATCAACATGGCAGCATTGCACACAATATCCCCCATTCGGTAAGAGAACCACCCAAACCCAAACTGCAAATCACTTCTAAACATAGGTCTCTCTACACTTCTGTTCACCACTTTTAAAACAAAAGATTGAAAAGGGCCCAGCGCTTCAGCACCATCTTCAGATGGCATCATGTCTTTATGAGGAAACCATGAAAAATTACCCAACGTCCTGGTTGTTGCAACAAACTCTCGCACAAATGACTCAAAATACACTTGTTTTAAAAAGTTTTTACAAACATCCCTTGTGCTAACAACAAATTCATCAACCAGACTTGAATCAGACCGTTGATGAGAATTAGTGAGATCAGAAAATAAAACAGTGTAATGTTCATCTCTTTTCCACTTAACAACATGAGAAATGAGTGATAAGGACTCTGAGTTGATGTCAATCAGCACACAGAGATCAAGGAATTTGATTCTGGGACTCCATCTCATGTTTTTTGAGCTCATATCAGACATAAACGGAAGAAGCTGATCCTCAAAAACTTTAGGGTATAAGCGCCTCACAGATTGAATCACATGGTTCAAACTCACCTTGTCCTCCAGCAATCTTGAGCTCTCAGGTTTCCTTGCCACATAATCACAAGGGTTTAAGTGTTTGACGCTTGAATTCTCACTGTTCTTCCCCATCACAGGTTCCGCCAGGACCCAGACACCCAGCTCGAAAGAGTTGCTTAGTGAAATGCAGATGTAGTCCCAAAGAAGAGGTCTTAGGAAACTGGTGTGATCACGATGATTCTCTAAATCACTTTGTTTATCATAAATATACAGCATTATGCCATCATGTTTTTGAATTCTTGTCACATGTTCATCTGTTGACAGATCTTCAAGAACCTTCTTAATATACAAGTTCTCCCTATTCCCATTTCTCACACACCTGCTCCCCAAAGTCTTACAAAGACCTATGAAGCCTGAAGAAATGCAACTTTGAAAAGCTGATTTGTTAATCGCCTCTGACAAAAGCTTCTGTGCACCTCTTGTGAATTTGCTGCAAAGTTTGTTTTGGAGTGTCTTAATCAATGAAGGAATTCTCTCTTCTTGGAAAGTCATCACTGATGGGTAGACCACTTTCTGCCTCAAAACCATTCTTAACGGGAACATTTCATTCAGATTTAACCAATTGATGTTTGCCAACTGACTTAAGTCTTCTCCAAAATCAAGGATTTCCCCCAGTTGAAGAATAGCCTCTTTTTTATTTCTATTGAAGAGGTCCATAAAAAACTCTTCATTAAATTCACCATTTTTGAGCTTATGATGCAACTTCCTTACAAGCTTTCTTATGATTTTAGTTTCACCAGGGCACAGTTCTTCAATGAGCCTCTGAATCCTATAACCTCTAGAACCATCCAGCCAATCTTTTACATCAGTAGTGGTGTTTAGCAAAAATGGATCCAATGGGAAGTTGGCATATTTTAAGAGAGCCAGTGTCCTCTTCTGAATGCAGTTCACTAAAGAGACCGGAACACCATTCGCAACGGCTTGATCAGCAATTGTGTCTATTGTTTCACAAAGTTGATGCGGCTCTTTACACTTTACATTATGTAGTGCTGCGGACACAAATTTTGTTAAGAGGGGAACCTCTTCTCCCCACACATAAAATCTAGATTTAAATTCCGCCGCAAACCGTCCAACCACACTTTTTGGACTGACAAATTTGTTTAGCAATCCGCTCAAATGAGAGTGAAATTCCAACAAGACAAGAACTTCTTCTGGATCAGTTTCAACCAATTCACTTAGTCTTCTATCAAATAAAGTGACCTGATCATCACTTGATGTGTAAGCTTCTGGTCTCTCACCAAAGATAACACCTATACAATAATTGATGAACCTCTCACTAATCATACCATAAAAATCAGAAGCATTATGCAAAATTCCCTGTCCCATGTCAATAAGGCTAGATATGTGGGATGGCACCACCCCCATTTCAAAATATTCTCTGAAAATTCTCTCTGTGACGGTTGTCTCTGAACCTCTGAGGAGTTTCAACTTTGATTTAACATATGACTTCATCATTGCACTCACAACAGGAAAAGGAACCTCAACAAGTTTGTGCATGTGCCAAGTTAATAGGGTGCTAACGTGATCCTTTCCGGAGCGCACATACTGGTCATCACCCAGTTTAAGGTTTTGAAGGAGCATCAGGAACAAAAATGGGCACATCATTGGTCCCCATTTACTGTGATCCATACTGTAGTTTAGGAACCCTTCTCGCACATTGATGGTCATTGACAGGATTGCATTTTCAAATTCTTTGTCATTGTTCAGACATGAACCTGAAAAAAAGCTAGAAAAGGATTCAAAATAGTCCTCTATCAGTCTAGTGAACATTTTTGTCCTCAGGTCTCCAATGTATAGCTCCCTGTTTCCCCCAACCTGTTCCTTATAAGATAATGCAAATTTTAGCCTCCCAGAATCAGGGCCGACAGAAGTGTATGATGTTGGTGATTCTTCTGAGTAGAAACACAAATTCTTCAAAGCGGCACTCATGCATTTTGTCAGTGATAGGGCCCTACTCAGAGACTCAGAATTGCTTTCCCTCTCGCTGATTCTCACGTCCTCTTCTAACTTACCCCAATCAAATCTAAAATTCAAGCCTTGTCGTTGTAGATGTCTATATTTCCCTGAATACGCGTTAGCATTCATCTGTAGTAAAATCATCTTCATACATGAGAACCAATCACCTTCTGAAAAAAACTTTCTACAAAGGTTTTGTGCCATTTCATCCAGGCCACATTGTTCCCTGACAGCTGAAGTGAAATATAGTGGTGACAACTCTTCAGAACCTTCAACAGCCTCACACACAAACTTCATATCATCATTTGTAAGACAAGATGGGTCAAAATCTTCCACTAAATGGTAAGATATTTCAGACAAAATGACCTTCCTCAAGTGAGCCATTTTACCTGACAGAGCAACCTGAAGATGATGCAGTCCTTTTACATTTTGAAGCGTTCCCCCTCCCTCTCCTTTGTTTCCCTTCCAGCCTTTCTTATACTGCATTATTGTGGAGCTCACCTTGTCTTCTAGAGCCTTAAAAAATTTTGTTTCCTCTACCCCTTCAAAAAAACATGCACCTGTTGGTTCATCCTCTGGTTTCTCTACCTCTGCCCTACTGGTACCTATCACCAACTTAGAGACCAGCTTTGAAACCTTATACTCATAGTCTGAGTGGTTCAATTTGTACCTCTGCTTCCTCATAAAACCCTCTGTAATCTGACTCACAGCACTGACGAGCAGTTTATTGAAATCATATTCTAGAAGCCGTTCCCCATTTAGGTGTTTGTTGACAACTACACTTTTGTTGCTAGCAAGGTCCAATGCTGTTGCACACCCAGAGTTGGTCATGGGGTCCAGGCTACTGAGTTTCTTCTCCCCCTTAAATATTAAGGTGCCATTGTTGAATGAAGACACCATCATACTAAAAGCCTCTAAATTAACACCTGGGGTTGTTCTCTGACAGTCGGCCTCTTTGCTTGTGAACTTCTTCATCTGTTCGTAAAAAACACACTCCTCTTCGGGAGTGATCGCTTCTTTAGGGTTGA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| 102,501
|
NC_005082.1
|
Mammarenavirus guanaritoense
|
Bowen,M.D., Thurman,K., Minor,E., Meyer,R.F., Malfatti,S.A., Do,L.H., Smith,K.L., McCready,P.M., Chain,P.S.G.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-08-30
| null |
Mammarenavirus guanaritoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,081
|
RefSeq
| null | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Guanarito virus segment L, complete genome
|
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| 8,465
|
KR260719.1
|
Mammarenavirus guanaritoense
|
Aguilar,P.V., Tesh,R.B., Ksaizek,T.G., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
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University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2015-09-19
| null |
Mammarenavirus guanaritoense
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,101
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Homo sapiens
| null |
2008-01-01
|
SAMN03381367
|
PRJNA257008
|
Guanarito mammarenavirus strain 308573 segment L, complete sequence
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|
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|
Mammarenavirus guanaritoense
|
Aguilar,P.V., Tesh,R.B., Ksaizek,T.G., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2015-09-19
| null |
Mammarenavirus guanaritoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,955
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Homo sapiens
| null |
2005-01-01
|
SAMN03381368
|
PRJNA257008
|
Guanarito mammarenavirus strain 260456 segment L, complete sequence
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| 85,652
|
KR260723.1
|
Mammarenavirus guanaritoense
|
Aguilar,P.V., Tesh,R.B., Ksaizek,T.G., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2015-09-19
| null |
Mammarenavirus guanaritoense
|
Mammarenavirus
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Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,102
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Homo sapiens
| null |
2009-01-01
|
SAMN03381369
|
PRJNA257008
|
Guanarito mammarenavirus strain 329330 segment L, complete sequence
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Mammarenavirus guanaritoense
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Aguilar,P.V., Tesh,R.B., Ksaizek,T.G., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
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University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
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USA
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2015-09-19
| null |
Mammarenavirus guanaritoense
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
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| null |
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PRJNA257008
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Guanarito mammarenavirus strain CFF106 segment L, complete sequence
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| 85,654
|
KR260727.1
|
Mammarenavirus guanaritoense
|
Aguilar,P.V., Tesh,R.B., Ksaizek,T.G., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
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University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2015-09-19
| null |
Mammarenavirus guanaritoense
|
Mammarenavirus
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Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,100
|
GenBank
| null |
Venezuela
|
Venezuela
|
Homo sapiens
| null |
1997-09-02
|
SAMN03381371
|
PRJNA257008
|
Mammarenavirus guanaritoense strain S-26764 segment L, complete sequence
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| 85,655
|
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|
Mammarenavirus guanaritoense
|
Aguilar,P.V., Tesh,R.B., Ksaizek,T.G., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
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University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2015-09-19
| null |
Mammarenavirus guanaritoense
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,082
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Homo sapiens
| null |
2011-01-01
|
SAMN03381372
|
PRJNA257008
|
Guanarito mammarenavirus strain 362273 segment L, complete sequence
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| 85,656
|
AY216504.2
|
Mammarenavirus guanaritoense
|
Charrel,R.N., Lemasson,J.J., Garbutt,M., Khelifa,R., De Micco,P., Feldmann,H., de Lamballerie,X., Emonet,S., de Micco,P., Lemasson,J.-J.
|
Universite de la Mediterranee, Unite des Virus Emergents (EA3292, IFR48, IRD UR034)
|
France
|
2004-01-05
| null |
Mammarenavirus guanaritoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,081
|
GenBank
| 2
|
Venezuela
|
Venezuela
| null | null | null | null | null |
Guanarito virus strain INH-95551 segment L, complete sequence
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CGCACAGTGGATCCTAGGCGAAATTTGACAATGGATGAAAAAGTCTTTGTTTTGAAAGATTTTATCAGAAGACAAGTGCCTGACATACCTGAACTGTCTTATCAGAAGGAGGCATTACTTTCTCAAGTCGAAGTACCAATGGTCTTAACAGAGGGCTTCAAGCTCCTATCATGCCTGGTCGAGATTGAATCCTGCAGGAAGAATTCTTGTGAGTGCAACTTTGAACAGAAATTTGTTGATACAATACTCTCTGAAAATGGGGTGGTTGCACCCACACTACCAAAGGTGATACCTGACGGTTACAGGTTCTTCAATAAGACATTGATACTCCTTGAAACATTTGTCCGTGTGAATCCTGAAGAGTTTGAAAAGAAGTGGAAAACCGACATGGCAAAATTGCTTAGTTTAAAAGAGGACATTCACAGAACGGGTATTACACTGGTTCCTGTGGTTGACGGTAGAGGCAACTACAACACAGATTTGCTGCCAGATTGGGCGACTGAAAGATTCAGATGGTTGCTTATTGATCTGCTGAGAGAATCAAGAGGAGCTCCTACAATGGAGATTGAGGATCAGGAGTACCATAGGTTGATTCATAGCCTCTCTAAAACAAGTAATCAGAGCCTCGGGTTTGAAAATATAGAATGCTTAAAAAGGGTTCATCTGAATTATGAGGAAAGACTCAATGAGCAATTGCTTAAAGACATTGTGGGAGAAGTTAGGGAATCCAAGATTAGGGAAGAGTTGATCAAATTGAAAACTTGGTACAGAGAAGAAATCTACAGGAAAGGCCTTGGGAATTTTGTTCAGACAGATAGAAAGTCCCTACTACAGACTTTGGTGTTGTCGAGTGCCCACTCTGACTCATTGGCCCCTGAGTGTCCCATGTGCTGTAGTAAAATCCTTGACTTATGTTATCAACTCTCAATGAGAATTGCAAACCAAACATCACTGGAGAATAATTTTGATGAACCTCCTCTTCCCACAACCCAGATAGAAAAAGTTTATCTGTCATTGTTATCAGCGTGCAATAAGATAAAAGGAAAGAAAGTGTTTAACACCAGAAGAAACACACTTCTATTTTTGGACTTAATCATTTTGAACTTTGTGGCACATGTTTATAAGACACAACCTTCTGAAATGGAAACCTTGAAAAAAGCAGGTCTGATTATCGGTGAGATGTTATTACTTCCCAACGACAGGGTTTTAGATATTTTGGTTGCAAGGAGGCTTCTATTGAAGAAAGTTGAGTCCTGCTGCAATTGGTTGGACAGGTGTAGACATTTGTTAAGGAAAGAAGAGCCTGTTCTATGGGACTGTGTGTCAGAGTTCACAAATGTTCCAGACTTTGAGTTGTTGCTATCTTTAGCTGAGGAGCTCTGTTCAGAGAAGCCTGTTATGCACTACAAACCTCCAAGTTCATTGATTGGCGATTGTGCCCATAAGGACCTGATGTCAATGTCAGATGGAGAGTTTGAGAGTTTATTTAAATGTCTGTCGCATATATCACTTTCTCTCGTAAATTCAATGAAGACATCATTCTCTTCCAGACTTCTAGTAAATGAAAAGGATTATAAGAGATACTATGGCACAGTTAGATTAAAAGAATGCTATGTGCAGAGGTTCTTTTTAAGAGAAGGCTTGTATGGGCTTTTATTTTACCAAAAAACAGGTGAGAAATCACGTTGTTACTCCCTTTACCTTTCTGATAAAGGGAACCTTGTAGAACTTGGATCTTTTTATTCTGATCCTAAACGATTCTTTTTGCCCATATTCTCTGAATTTGTGCTTCTAGCTACATGCGCAGAGATGTTAAGCTGGTTAGATTTTGATGAGAAGTTGGTTGACGCAGTAACCCCCTTATTGAAAATCCTGGTTTTAAGTATATTGAGTTCACCAACAAAAAGGAGTCAAACATTTCTACAAGGATTAAGGTATTTCATCATGGCGTATGTCAATCAGGCCCATCATATCCAATTGATGAGCAAGTTGGCTGTTGAATGCAAATCAGCCTCAGATGTTTTAATTCAGAGGCTTAGTGTAAAAATTGTGGATATGGTGTTAAGTGATGGTTCTGATCCAGACATGCATATGACGAGGAAGTTTAAGTTTGTCTTAAATGTAAGTTACTTATGTCATTTGATCACAAAAGAAACTCCAGATAGACTCACAGATCAAATTAAGTGTTTTGAGAAATTCATGGAACCAAAACTAGAGTTTGGTAGTCTCATTGTTAACCCATCTTTAAATGGCTTTCTGTCTAAGGAACAAGAAGATGTCATGATTGAGGGTGTAGAGAAGTTCTTCTCAAAAGAGCTTCTTACTGTGGAAGATTTAAAGAGACCAGGGGTTTCTAGAGAGCTACTGAGTTATTGTGTGTCACTTTTTAACAAGGGAAGGCTAAGAGTTAATGGTACATTGGGTACAGACCCCTATAGACCCAGTTTCACAAGCACTGCATTAGACTTATCTAGCAACAAGAGTGTTGTTATTCCGAAATTAAACGAAGTGGGAGAGATTGTGTCGGAATACGACAAACAAAAATTGGTTTCCACTTGCATTACTTCAATGGCAGAAAGATTTAAGACAAAGGGAAGGTATAATCTAGATCCCGATACAATCGACTTTCTGATTATGAGGAACTTGACTAATCTTTTGTCTGCAAGAAAACTTGACAGCAGCAAGAAGGAAGAGTTGTCATTGTTATATGAGCACTTGTCTGAAGATGTCATGAAAGCATTTGAAGAGATAAAGTATGAAGTTGAGATCACTTTAAGCAAAATGAGGCTCTCAAGGGAACTTGAGTGTGGCCACAAAAAACCATGTACACTGGAAGGTGTGTGGGCACCCTTCAATGTCTTGAAAGTAATTAGGAGTGAGACAAGTGTTCATGAAATTAGGGATTTTGATCCTGACCTCTTGGGGGAAGATGTCTATGAAAAGTTATGTGTGGCTGTTTATGATTCTCCATTAAGACCTACCTTCTTTTTGGAAAAGCCTCTTGACATCTGTCCATTGGAACTCCTACTGAAAAACTTAACAACAAAATCTTATGAAGATGATGAATTCTTTGATTGTTTCAAGTACATCCTGATTCAAGCAGGATTTGATCAGAGGTTAGGGGCTTATGAACATAAAAATAGGTCCAGATTGGGGCTCTCAGAGGAAGCTTTTAGGCTAAAGGAGGATGTGAGAGTGAGCAATAGACAGAGTAATTCAGAAGCCATAGCTGACAGACTAGACAAGAGTTTCTTCACCAGTGCTGCTCTAAGGAACTTGTGCTTTTATTCGGAGGAATCCCCAACAGAGTACACATGTATTAGCCCAAATGTGGGTAATTTGAAATTTGGTTTGAGTTACAAAGAGCAAGTTGGTTCAAATAGAGAACTTTACGTAGGTGACTTAAACACAAAGATGATGACAAGATTAGTTGAAGACTTTACTGAGGCAGTGGCTAACTCAATGAATTACACATGTCTTAACTCTGAAAAAGAGTTTGAGAGGGCAATCTGTGATATGAAGATGGCTGTGAACAATGGGGACCTGTGCTGTTCTCTAGATCATTCAAAATGGGGCCCTTTCATGAGTCCAGCTCTTTTTCATGCATTCTTTGGAGCTCTTAAGTTTAAAATTAGTAAGACAGGTGAACAAGTAGATCTCGGGCCAGTTCTAAATGTGTTAAAGTGGCATTTACATAAAGCTGTAGAAGTACCAATCAGTGTTGCTGAGGCATATTGCACAGGCATGTTGAAAAGAAGGTTGGGTTTAATGAGTTTAAGCTGCCAATCAGTGTGTGAAGAGTTCTTTCACCAGAAATTATTATTAGAAGAAGGAGTGCCCAGTCATATTATGTCTGTCTTAGACATGGGACAGGGCATACTTCACAATTCATCTGATCTTTATGGTTTGATTACTGAGCAATTCATAAACTACTGTTTGGATTTCCTCTTTGACGTGATACCGGTGTCTTACACGTCTAGTGATGATCAGATCACAACGTTCAAATTGCCAACTATGTCTTCAAGTGAAGATGGGTTAGACGGTTTTGATTGGTTAGAGCTTTTATGTTTCCACGATTTTTTGTCCTCAAAATTCAACAAATTTGTGAGCCCCAAGAGTGTTTCTGGGACTTTTGTTGCTGAGTTTAAATCAAGGTTCTTTGTCATGGGTGAGGAAACACCTCTGTTAACCAAGTTTGTATCTGCAGCATTGCATAATGTCAAGTGTAAAACTCCAACACAACTTGCTGAAACTATTGATACGATTTGTGATCAATGTGTGGCTAATGGTGTCGGAATTGAAATTGTCACAAAAATATCAGAAAGAGTGAACAGGTTAATTAGGTACTCTGGTTACCCTCAAACGCCCTTTCTTGCTGTTGAAAAACAAGATGTTAAGGACTGGACTGATGGCTCAAGAGGTTACAGATTACAAAGGAATATTGAACACTACCTACAAGGGAGTGAACAATTGGAATTTGTGAGGAAGTGCGCAAAAAAGGTTTTGTTAAAAATAAAGAAAGGGCAAGTTTTTGAGGAATACTTAGTTCAGCTAATAGGGAAAGATGGGGATGATGCTTTGAAAGGCTTTTTGTCTTATGCAGGCTGTGAATCAGATGAAATTAAGGATGTCCTTAAGTACCGCTGGCTAAATTTATCTGCAAATGGTGACTTAAGGCTTGTGTTGAGGACAAAACTTATGTCAACAAGAAGGGTGCTTGAAAGAGAGCAAATTCCAACTCTTATCAAGACGTTACAGTCAAAACTCTCAAAAAATTTTACAAAAGGAGTCAAGAAAATTCTGGCAGAATCAATCAACAAGTCAGCGTTCCAATCATCTGTTGCTTCAGGTTTCATCGGTTTTTGTAAGAGTATGGGTAGCAAGTGTGTTAGAGATGGCAGTGGAGGTTTCATGTACATTCGTGAGGTTTTAAATAAGCAGAGGGTATGTCCCTGTGAGATATGTGCACAAAACCCTGGGATCATTTTTTGTTCTGATGC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| 110,030
|
AY358024.2
|
Mammarenavirus guanaritoense
|
Bowen,M.D., Thurman,K., Minor,E., Meyer,R.F., Malfatti,S.A., Do,L.H., Smith,K.L., McCready,P.M., Chain,P.S.G.
|
Lawrence Livermore National Laboratory, Viral Sequencing Group
|
USA
|
2003-08-24
| null |
Mammarenavirus guanaritoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,081
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Guanarito virus strain INH-95551 segment L, complete sequence
|
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| 110,270
|
NC_005080.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Bowen,M.D., Thurman,K., Minor,E., Meyer,R.F., Malfatti,S.A., Do,L.H., Smith,K.L., McCready,P.M., Chain,P.S.G.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-08-30
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,114
|
RefSeq
| null | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Junin virus segment L, complete genome
|
GCGCACAGTGGATCCTAGGCGTAACTTCATCATTAAATCTCAGATTCTGCTCTGAGTGTGACTTACTGCGAAGAGGCAGACAAATGGGCAACTGCAACGGGGCATCCAAGTCTAACCAGCCAGACTCCTCAAGAGCCACACAGCCAGCCGCAGAATTTAGGAGGGTAGCTCACAGCAGTCTATATGGTAGATATAACTGTAAGTGCTGCTGGTTTGCTGATACCAATTTGATAACCTGTAATGATCACTACCTTTGTTTAAGGTGCCATCAGGGTATGTTAAGGAATTCAGATCTCTGCAATATCTGCTGGAAGCCCCTGCCCACCACAATCACAGTACCGGTGGAGCCAACAGCACCACCACCATAGGCAGACTGCACAGGGTCAGACCCGACCCCCCGGGGGGCCCCCATGGGGACCCCCCGTGGGGGAACCCCGGGGGTGATGCGCCATTAGTCAATGTCTTTGATCTCGACTTTGTGCTTCAGTGGCCTGCATGTCACCCCTTTCAATCTGAACTGCCCTTGGGGATCTGATATCAGCAGGTCATTTAAAGATCTGCTGAATGCCACCTTGAAATTTGAGAATTCCAACCAGTCACCAAATTTATCAAGTGAACGGATCAACTGCTCTTTGTGTAGATCATAAACGAGGACAAAGTCCTCTTGCTGAAATAATATTGTTTGTGATGTTGTTTTTAGATAAGGCCATAGTTGGCTTAATAAGGTTTCCACACTATCAATGTCCTCTAGTGCTCCAATTGCCTTGACTATGACATCCCCAGACAACTCAACTCTATATGTTGACAACCTTTCATTACCTCTGTAAAAGATACCCTCTTTCAAGACAAGAGGTTCTCCTGGGTTATCTGGCCCAATGAGGTCATATGCATACTTGTTACTTAGTTCAGAATAAAAGTCACCAAAGTTGAACTTAACATGGCTCAGAATATTGTCATCATTTGTCGCAGCGTAGCCTGCATCAATAAACAAGCCAGCTAGGTCAAAGCTCTCATGGCCTGTGAACAATGGTAGGCTAGCGATAACCAGTGCACCATCCAACAATGAGTGGCTTCCCTCAGACCCAGAAACACATTGACTCATTGCATCCACATTCAGCTCTAATTCAGGGGTACCGACATCATCCACTCCTAGTGAACTGACAATGGTGTAACTGTACACCATCTTTCTTCTAAGTTTAAATTTTGTCGAAACTCGTGTGTGTTCTACTTGAATGATCAATTTTAGTTTCACAGCTTCTTGGCAAGCAACATTGCGCAACACAGTGTGCAGGTCCATCATGTCTTCCTGAGGCAACAAGGAGATGTTGTCAACAGAGACACCCTCAAGGAAAACCTTGATATTATCAAAGCTAGAAACTACATAACCCATTGCAATGTCTTCAACAAACATTGCTCTTGATACTTTATTATTCCTAATTGACAAGGTAAAATCTGTGAGTTCAGCTAGATCTACTTGACTGTCATCTTCTAGATCTAGAACTTCATTGAACCAAAAGAAGGATTTGAGACACGATGTTGACATGACTAGTGGGTTTATCATCGAAGATAAGACAACTTGCACCATGAAGTTCCTGCAAACTTGCTGTGGGCTGATGCCAACTTCCCAATTTGTATACTCTGACTGTCTAACATGGGCTGAAGCGCAATCACTCTGTTTCACAATATAAACATTATTATCTCTTACTTTCAATAAGTGACTTATAATCCCTAAGTTTTCATTCATCATGTCTAGAGCCACACAGACATCTAGAAACTTGAGTCTTCCACTATCCAAAGATCTGTTCACTTGAAGATCATTCATAAAGGGTGCCAAATGTTCTTCAAATAGTTTGGGGTAATTTCTTCGTATAGAATGCAATACATGGTTCATGCCTAATTGGTCTTCTATCTGTCGTACTGCTTTGGGTTTAACAGCCCAGAAGAAATTCTTATTACATAAGACCAGAGGGGCCTGTGGACTCTTAATAGCAGAAAACACCCACTCCCCTAACTCACAGGCATTTGTCAGCACCAAAGAGAAGTAATCCCACAAAATTGGTTTAGAAAATTGGTTAACTTCTTTAAGTGATTTTTGACAGTAAATAACTTTAGGCTTTCTCTCACAAATTCCACAAAGACATGGCATTATTCGAGTAAATATGTCCTTTATATACAGAAATCCGCCTTTACCATCCCTAACACACTTACTCCCCATACTCTTACAAAACCCAATGAAGCCTGAGGCAACAGAAGACTGAAATGCAGATTTGTTGATTGACTCTGCCAAGATCTTCTTCACGCCTTTTGTGAAATTTCTTGACAGCCTGGACTGTATTGTCCTTATCAATGTTGGCATCTCTTCTTTCTCTAACACTCTTCGACTTGTCATGAGTTTGGTCCTCAAGACCAACCTCAAGTCCCCAAAGCTCGCTAAATTGACCCATCTGTAGTCTAGAGTTTGTCTGATTTCATCTTCACTACACCCGGCATATTGCAGGAATCCGGATAAAGCCTCATCCCCTCCCCTGCTTATCAAGTTGATAAGGTTTTCCTCAAAGATTTTGCCTCTCTTAATGTCATTAAACACTTTCCTCGCGCAGTTCCTTATAAACATTGTCTCCTTATCATCAGAAAAAATAGCTTCAATTTTCCTCTGTAGACGGTACCCTCTAGACCCATCAACCCAGTCTTTGACATCTTGTTCTTCAATAGCTCCAAACGGAGTCTCTCTGTATCCAGAGTATCTAATCAATTGGTTGACTCTAATGGAAATCTTTGACACTATATGAGTGCTAACCCCATTAGCAATACATTGATCACAAATTGTGTCTATAGTCTCTGACAGTTGTGTTGGAGTTTTACACTTAACATTGTGTAGAGCAGCAGACACAAACTTGGTGAGTAAAGGAGTCTCTTCACCCATGACAAAAAATCTTGACTTAAACTCAGCAACAAAAGTTCCTATCACACTCTTTGGGCTGATAAACTTGTTTAATTTAGAAGATAAGAATTCATGGAAGCACACCATTTCCAGCAGTTCTGTCCTGTCTTGAAACTTTTCATCACTAAGGCAAGGAATTTTTATAAGGCTAACCTGGTCATCGCTGGAGGTATAAGTGACAGGTATCACATCATACAATAAGTCAAGTGCATAACACAGAAATTGTTCAGTAATTAGCCCATATAAATCTGATGTGTTGTGCAAGATTCCCTGGCCCATGTCCAAGACAGACATTATATGGCTGGGGACCTGGTCCCTTGACTGCAGATACTGGTGAAAAAACTCTTCACCAACACTAGTACAGTCACAACCCATTAAACCTAAAGATCTCTTCAATTTCCCTACACAGTAGGCTTCTGCAACATTAATTGGAACTTCAACGACCTTATGAAGATGCCATTTGAGAATGTTCATTACTGGTTCAAGATTCACCTTTGTTCTATCTCTGGGATTCTTCAATTCTAATGTGTACAAAAAAGAAAGGAAAAGTGCTGGGCTCATAGTTGGTCCCCATTTGGAGTGGTCATATGAACAGGACAAGTCACCATTGTTAACAGCCATTTTCATATCACAGATTGCACGTTCGAATTCCTTTTCTGAATTCAAGCATGTGTATCTCATTGAACTACCCACAGCTTCTGAGAAGTCTTCAACTAACCTGGTCATCAGCTTAGTGTTGAGGTCTCCCACATACAGTTCTCTATTTGAGCCAACCTGCTCCTTATAACTTAGTCCAAATTTCAAGTTCCCTGTATTTGAGCTGATGCTTGTGAACTCTGTAGGAGAGTCGTCTGAATAGAAACATAAATTCCGTAGGGCTGCATTTGTAAAATAACTTTTGTCTAGCTTATCAGCAATGGCTTCAGAATTGCTTTCCCTGGTACTAAGCCGAACCTCATCCTTTAGTCTCAGAACTTCACTGGAAAAGCCCAATCTAGATCTACTTCTATGCTCATAACTACCCAATTTCTGATCATAATGTCCTTGAATTAAAAGATACTTGAAGCATTCAAAGAATTCATCTTCTTGGTAGGCTATTGTTGTCAAATTTTTTAATAACAAACCCAAAGGGCAGATGTCCTGCGGTGCTTCAAGAAAATAAGTCAATTTAAATGGAGATAGATAAACAGCATCACATAACTCTTTATACACATCAGACCTGAGCACATCTGGATCAAAATCCTTCACCTCATGCATTGACACCTCTGCTTTAATCTCTCTCAACACTCCAAAAGGGGCCCACAATGACTCAAGAGACTCTCGCTCATCAACAGATAGATTCTTTGATTTCAACTTGGTGATCTCAACTTTTGTCCCCTCACTATTAGCCATCTTGGCTAGTGTCATTTGTACGTCATTTCTAATACCCTCAAAGGCCCTTACTTGATCCTCTGTTAAACTCTCATACATCACTGATAATTCTTCTTGATTGGTTCTGGTTCTTGAACCGGTGCTCACAAGACCTGTTAGATTTTTTAATATTAAGTAGTCCATGGAATCAGGATCAAGATTATACCTGCCTTTTGTTTTAAACCTCTCAGCCATAGTAGAAACGCATGTTGAAACAAGTTTCTCCTTATCATAAACAGAAAGAATATTTCCAAGTTCGTCGAGCTTGGGGATTACCACACTTTTATTGCTTGACAGATCCAGAGCTGTGCTAGTGATGTTAGGCCTGTAGGGATTGCTTTTCAGTTCACCTGTAACTTTAAGTCTTCCTCTATTGAAGAGAGAAATGCAGAAGGACAAAATCTCTTTACACACTCCTGGAATTTGAGTATCTGAGGAAGTCTTAGCCTCTTTGGAAAAGAATCTGTCCAATCCTCTTATCATGGTGTCCTCTTGTTCCAGTGTTAGACTCCCACTTAGAGGGGGGTTTACAACAACACAATCAAACTTGACTTTGGGCTCAATAAACTTCTCAAAACACTTTATTTGATCTGTCAGGCGATCAGGTGTCTCTTTGGTTACCAAGTGACACAGATAACTAACATTTAAT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| 8,464
|
OL774852.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Davis,C., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,104
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
|
1976
| null | null |
Argentinian mammarenavirus strain P3790 Espindola segment L, complete sequence
|
CGGGGATCCTAGGCGTAACTTCATCACTAAAATCTCAGATTCTGTTCTGAGTGTGACCCACTGCGAAGAGGTAGACAAATGGGCAACTGCAACGGGGCATCCAAGTCCAACCAGCCAGACTCCTCAAGAGTCACACAGCCAGCCGCAGAATTCAGGAGGGTAGCCCACAGCAGTCTATATGGTAGATACAACTGTAAGTGCTGCTGGTTTGCTGATACCAATCTGATAACCTGTAATGATCACTACCTTTGTTTAAGGTGCCATCAGATTATGTTAAGGAATTCAGATCTCTGCAATATCTGCTGGAAGCCCCTACCCACCACAATCACAGTGCCTGTGGAACCAACAGCACCACCACCATAGGTAAACTGCACAGGGTCAGACCCGACCCCCCGGGGGGCCCCCATGGGGACCCCCCGTGGGGGAACCCCGGGGGTGATGCACTATTAATCAATGTCTTTGATCTCGACTTTGTGCTTCAGTGGCCTGCACGTCACCCCTTTCAATCTGAATTGCCCTTGGGGATCCGATATCAGCAGGTCATTCAAAGATCTGCTGAATGCTACCTTGAAATTTGAGAATTCCAACCAGTCACCAAATTTATCAAGTGAACGGATTAACTGCTCTTTATGTAGATCATAAACGAGGACAAAGTCCTCTTGCTGAAACAATATCGTTTGGGATGTTGTTTTTAGATAAGGCCATAGTTGGCTTAATAAGGTTTCCACACTATCAATGTCCTCTAGTGCCCCAATTGCCTTGACTATAACATCCCCAGACAACTCAACTCTATATGTTGACAGCCTTTCATTACCTCTGTAAAAGATACCCTCTTTCAAAACAAGAGGTTCCCCTGGGTTATCTGGCCCAATGAGGTCATATGCATACTTGTTACCAAGTTCAGAGTGAAAGTCACCAAAGTTGAACTTAACATGACCCAGAATATTATCATCATTTGTCAAAGCGTAGCCTGCATCAATAAATAAGCCAGCTAGGTCAAAGCTCTCATGGCCTGTGAACAATGGTAGGCTAGCAATAACCAGTGCACCATCTAACAATGAGTGGTTTCCCTCAGACCCAGAAACACATTGACTCATTGCATCCACATTCAGCTCTAATTCAGGGGTACTGACATCATCCACTCTTAGTGAACTGATAATGGTGTAACTGTACACCATCTTTCTTCTAAGTTTAAATTTTGTCGAAACTCGTGTGTGTTCCACTTGAATGATCAATTTTAGTTTCACAGCTTCATGGCAAGCTACATTGCGCAACACAGTGTGCAGGTCCATCATGTCTTCCTGAGGCAACAAGGAGATGTTGTCAACAGACACACTCTCAAGGAAAACCTTGATATTATCAAAGCTAGAAACTACATAACCCATTGCAATGTCTTCAACAAACATTGCTCTTGACACTTTATTATTCCTAATTGATAAGGTGAAATCTGTGAGTTCAGCTAGATCTACTTGACTGTCATCTTCTAGATCTAGAACTTCATTGAACCAAAAGAAGGATTTGAGACACGATGTTGACATGACCAGTGGGTTTATCATCGAAGATAAGACGACTTGCACCATGAAGTTCCTGCAAACTTGTTGTGGGCTGATGCCAACTTCCCAATTTGTATACTCTGACTGTCTAACATGGGCTGAAGCGCAGTCACTCTGTTTCACAATATAAACATTATTATCCCTTACCTTCAATAAGTGACTTATAATCCCTAAGTTCTCATTCATCATGTCTAGAGCCACACAGACATCCAAGAACTTGAGTCTTCCACTGTCCAAAGATCTGTTCACTTGAAGATCATTCATAAAGGGTGCCAAATGTTCTTCAAATAGTTTGGGGTAATTTCTTCGTATAGAATGCAATACATGGTTCATGCCTAATTGGTCTTCTATTTGTCGTACTGCTTTGGGTTTAACAGCCCAAAAGAAATTCTTATTACATAAGACCAAAGGGGCTTGTGGACTCTTAACAGCAGAAAACACCCACTCCCCTAACTCACAGGCATTTGTCAGCACCAAAGAGAAGTAATCCCACAAAATTGGTTTAGAAAATTGATTAACTTCTTGAAGTGATTTTTGACAGTAAATAACTTTAGGCTTTCTCTCACAAACTCCACAAAGACATGGTATTATTCTAGTAAATATGTCCTTTATGTACAAAAATCCGCCTTTGCCATCCCTAACACACTTACTCCCCATACTCTTACAAAACCCAATAAAGCCTGAGGCAACAGAAGACTGAAATGCAGATTTGTTGATGGACTCTGCCAAGATCTTCTTCACACCTTTTGTAAAATTTCTTGACAGCCTGGACTGTATTGTCTTTATCAACGTTGGCATCTCTTCTTTCTCTAACACTCTTCGACTTGTCATGAGTTTAGTCCTCAAGACCAACCTCAAGTCCCCGAAGCTCGCCAAATTGACCCATCTGTAGTCTAGAGTTTGTCTGATTTCATCTTCACTACACCCGGCATATTGCAGGAATCCGGACAAAGCCTCATCCCCTCCCCTGCTTATCAAGTTGATAAGGTTTTCCTCAAAGATTTTGCCCCTCTTAATGTCATTAAACACTTTCCTCGCGCAATTCCTTATAAACATTGTCTCCTTATCATCAGAAAAAATAGCTTCAATTTTCCTCTGTAGACGGTACCCTCTAGATCCGTCAACCCAGTCTTTGACATCTTGTTCTTCAATAGCTCCAAACGGAGTCTCCCTGTATCCAGAGTATCTGATCAATTGGTTGACTCTAATGGAAATCTTTGAAACTATATGAGTGCTAACCCCATTAGCAATACATTGATCACAAATTGTGTCTATAGTCTCTGACAGTTGTGTTGGAGTTTTACACTTGACATTGTGTAGAGCAGCAGACACAAACTTGGTGAGTAAAGGAGTCTCCTCACCCATGACAAAAAATCTTGACTTAAACTCAGCAACAAAGGTTCCTATCACACTCTTTGGGCTGATGAACTTGTTTAATTTAGATGATAAGAATTCATGGAAGCACACCATTTCCAGCAGTTCTGTTCTGTCTTGACACTTTTCATCACTAAGGCAAGGAATCTTTATAAGGCTAACCTGGTCATCACTGGAGGTATAAGTGACAGGTATCACATCATACAATAAGTCAAGTGCATAACACAGAAATTGTTCAGTGATTAGCCCATATAAATCTGATGTGTTGTGCAAGATTCCCTGCCCCATGTCCAAGACAGACATTATATGGCTGGGGACTTGGTCCCTTGACTGCAGATACTGGTGAAAGAACTCTTCACCAACACTAGTGCAGTCACAACCCATTAAACCTAAAGATCTCTTCAATTTCCCTACACAGTAGGCTTCTGCAACATTAATTGGAACTTCAACGACCTTATGAAGATGCCATTTGAGAATGTTCATTACTGGCTCAAGATTCACCTTTGTTCTATCTCTAGGATTCTTCAATTCTAATGTGTGCAGAAAAGAAAGGAAAAGTGCTGGGCTCATAGTTGGTCCCCATTTGGAGTGGTCATATGAACAGGACAAGTCACCATTGTTAACAGCCATTTTCATATCACAGATTGCACGTTCGAATTCCTTTTCTGAATTCAAGCATGTGTATCTCATTGAACTACCCACAGCTTCTGAGAAGTCTTCAACTAACCTGGTCATCAGCTTAGTGTTGAGGTCTCCCACATACAGTTCTCTATTTGAGCCAACCTGCTCCTTATAACTTAGTCCAAATTTCAAGTTCCCTGTATTTGAGCTGATGCTTGTGAACTCTGTAGGAGAGTCGTCTGAATAGAAACATAAATTTCGTAGGGCTGCGTTTGTAAAATAACTTTTGTCTAGCTTATCAGCAATGGCTTCAGAATTACTTTCCCTGGTACTAAGCCGAACCTCATCCTTTAGTTTCAAAACTTCACTGGAAAAACCCAATCTAGATCTACTTCTATGCTCATAGCTACCCAATTTTTGATCATAATGTCCTTGAATTAAAAGATACTTGAAGCATTCAAAGAATTCTTCTTCTTGGTAGGCTATTGTTGTCAAATTTTTTAATAACAAACCCAAAGGGCAGATGTCCTGCGGTGCTTCAAGGAAATAAGTCAATTTATATGGAGATAGATAAACAGCATCACATAACTCTTTATACACATCAGACCTGAACACATCTGGATCAAAATCCTTCACCTCATGCATTGACACCTCTGCTTTAATCTCTCTCAACACTCCAAAAGGAGCCCACAATGACTCAAGAGACTCTCGCTCATCAACAGATAGATTCTTTGATTTCAACTTGGTGGTCTCAACTTTTGACCCCTTGCTATTAGCCATCTTAGTTAGTGTCATTTGTACATCATTTCTGATACCCTCAAAGGCCCTCACTTGATCCTCTGTTAAACTCTCATACATCATTGACAATTCTTCTTGATTGGTTCTAGTTCTTGAACCGGTGCTCACAAGACCTGTTAGATTTTTTAATATTAAGTAGTCCATGGAATCAGGATCAAGATTATACCTGCCTTTTGTTTTAAACCTCTCAGCCATAGTAGAAACACATGTTGAAACAAGTTTCTCCTTATCATAAACAGAAAGAATATTTCCAAGTTCGTCGAGCTTAGGGATCACCACACTTTTGTTGCTTGACAAATCCAGAGCTGTGCTAGTGATGTTAGGTCTATAAGGATTGCTTTTCAGCTCACCTGTAACTTTAAGTCTTCCTCTATTGAAGAGAGAAATGCAGAAGGACAAGATCTCTTTACACACTCCTGGAATCTGAGTATCTGAGGAACTCTTAGCCTCTTTGGAAAAGAATCTGTCCAATCCTCTTATCATGATGTCCTCTTGTTCTAGAGTTAGACTCCCATTTAAAGGGGGGTTTACAACAACACAATCAAACTTGACTTTGGGCTCAATAAACTTCTCAAAACACTTTATTTGATCTGTCAGGCGATCAGGTGTCTCTTTGGTTACCAAGTGACACAAATAACTAACATTCAATAGATA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| 21,254
|
OL774854.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Davis,C., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,087
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
|
blood
| null | null | null |
Argentinian mammarenavirus strain P3827 Coronel segment L, complete sequence
|
GGATCCTAGGCGTAACTTCATCACTAAAACTTAGATTCTGTTCTGAGTGTGACTCATTGCAAAGAGGTAGACAGATGGGCAACTGTAATGGGGTATCTAAGTCCAACCAGCCAGACTCCCCAAGAGTCACACAGCCAGCCGCAGAATTTAGGAGGGTAGCTCACAGCAGTCTATATGGTAGATACAATTGCAAGTGCTGCTGGTTTGCTGACACCAACTTGATAACCTGTAATGATCACTATCTTTGTTTAAGGTGTCATCAGGTTATGTTGAGAAATTCAGATCTCTGCAATATCTGCTGGAAACCCCTGCCCACCGCAATCACAGTACCGGTGGAGCCAACAGCACCACCACCATAGGCAAACTGCACAGGGTCAGGCCTGACCCCCCGTGGGGCCCCCATGGGGACCCCCCGTGGGGGAACCCCGGGGGTGATGTGCTATTAATCAATATCCTTAATCTCGACTTTGTGCTTCAGTGGTCTGCATGTCACCCCCTTCAATCTGAATTGCCCTTGGGGATCTGATATCAGCAGGTCATTTAAAGATCTGCTGAATGCTACCCTGAAATTTGAAAACCCCAACCAATCACCAAACTTTTCAAGTGAACGGATCAACTGCTCTTTGTGTAGATCATAAACAAGGACAAAGTCTTCTTGCTGAAATAATATTGTTTGAGATGTTGTTTTTAGATAAGGCCATAATTGGCTTAATAGGGTTTCCACACTGTCAATGTCCTCTAGTGCTCCAATTGCCTTGACTATGACATCCCCAGACAACTCAACTCTATATGTTGACAACCTCTCATTGCCTCTGTAAAAGACACCCTCTTTCAAGACAAGAGGTTCTCCTGGGTTATCTGGCCCAATGAGGTCATATGCATACTTATTGCTTAGTTCAGAATGGTGGTCACCAAAGTTGAACTTAACATGGCTCAGAATATTGTCATCATTTGTCATAGCATAGCCTGCATCAATAAATAAGCCAGCTAGGTCAAAGTTCTCATGGCCTGTGAATAATGGTAGGTTAGCAATAACTAGTGCACCATCTAATAATGAGTGGTCTCCCTCAGACCCAGAAACACATTGACTCATTGCATCCACATTTAACTCCAATTCAGGGGTGCTGACATCATCCATTCTCAGTGAACTGATAATGGTGTAATTATACACCATCTTTCTTCTAAGTTTAAACTTTGTCGAAACTCGTGTGTGTTCTACTTGAATGATTAATTTTAGTTTCACAACCCCTTGGCAAGCAACATTGTGCAACATAGTGTGCAGGTCAAACACATCTTCCCGAGGCAACAAGGGGACACCATCAACAGAGACCCCCTCAAGGAAGACCTTGATGTTGTCAAAGCTAGAAACTACATAACCCATTGCAATGTCTTCAACAAACATTGCTCTTGATACTTTATTATTCCTTATTGACAGGGTGAAATCTGTGAGTTCAGCTAGATCTACTTGACTATCATCTTCTAGATCCAGAACCTCATTGAACCAAAAGAAGGATTTGAGACATGATGTTGACATGACCAGTGGGTTTATCATCGAAGACAAGACAACTTGTACCATAAAATTCCTGCAAACTTGTTGTGGACTGATACCAACTTCCCAATTTGTATACTCTGATTGTCTGACATGGGCTGAGGCACAGTCACTCTGTTTCACAATATAAACATTATTATCCCTTACTTTCAATAAGTGACTTATAATCCCTAAGTTCTCATTCATCATATCTAGAGCCACACAGACATCTAAAAACTTGAGTCTACCACTATCCAGAGATCTGTTTACTTGAAGATCATTCATAAAGGGTGCCAAATGTTCTTCAAATAATTTGGGGTAATTTCTCCGTATAGAGTGCAATACATGGTTCATGCCTAATTGGTCTTCTATCTGTCGCACTGCTTTGGGTTTAACAGCCCAGAAGAAATTCTTATTACATAAGACTAGAGGGGCTTGTGGACTTTTAACCGCAGAAAACACCCACTCCCCTAACTCACAGGCATTTGTCAGCACCAGAGAGAAGTAATCCCACAAAATTGGCTTGGAAAATTGATTAACTTCTTGAAGTGATTTTTGACAGTAAATGACTTTAGGCTTTTTCTCACAAATCCCACAAAGACATGGCATTATTCGAGTGAATATGTCCTTTATATACAGAAATCCACCTTTACCATCTCTAACACATTTACTCCCCATACTTTTACAAAACCCAATGAAGCCTGAGGCAACAGATGACTGGAATGCAGATTTGTTGATCGATTCTGCCAGGATCTTCTTCACACCTTTTGTGAAGTTCCTTGACAACCTGGACTGTATTGTCTTTATCAATGTTGGCATCTCTTCCTTCTCCAACACTCTTCGACTTGTCATGAGTTTGGTCCTTAAAACCAACCTCAAGTCCCCGAAGCTCGCCAAATTAACCCATCTGTAATCTAGAGTTTGTCTAATCTCATCTTCACTACACCCGGCATATTGCAGAAATCCAGATAAAGCTTCATCCCCTCCCCTGCTTATCAAGTTGATAAGGTTTTCCTCAAAAATTTTGCCTCTCTTAATGTCATTAAACACTTTCCTTGCACAATTCCTTATAAACATTGTCTCCTTATCATCAGAAAATATGGCCTCAATTTTCCTCTGCAGACGGTACCCTCTGGACCCATCAACCCAGTCTTTGACATCTTGTTCCTCAATAGCTCCAAATGGGGTCTCCCTGTATCCAGAGTATCTAATCAATTGGTTGACTCTAATGGAAATCTTTGACACTATGTGAGTGCTAACCCCATTAGCAATACATTGGTCACAAATTGTGTCTATAGTCTCTGACAGTTGTGTTGGAGTTTTACACTTAACATTGTGCAGAGCAGCAGACACAAACTTGGTGAGTAAAGGAGTTTCTTCACCCATGACAAAAAATCTTGACTTGAACTCAGCAACAAAAGTTCCTATTACACTCTTTGGGCTGATGAACTTGTTCAATTTAGATGATAGGAATTCATGGAAGCACACCATTTCCAGCAGTTCTGTCCTATCTTGACACTTTTCATCACTAAGGCAAGGAATTTTTATGAGGCTAACCTGATCATCGCTAGAGGTGTAAGTAACAGGTATCACATCATACAATAAGTCAAGTGCGTAACACAGAAATTGTTCAGTAATTAGCCCATACAAATCTGATGTGTTGTGTAAGATTCCCTGCCCCATGTCCAAGACTGACATTATATGACTGGGAACCTGGTCCCTTGACTGTAGATACTGGTGAAAAAACTCTTCACCAACACTAGTACAGTCACAACCCATTAAACCTAAAGATCTCTTCAATTTCCCCACACAGTAGGCTTCTGCAACATTAATTGGAACTTCAACGACTTTGTGAAGGTGCCATTTGAGTATGTTCATTACTGGTTCAAGATTCACTTTTGTTCTATCTCTGGGATTCCTTAATTCTAATGTGTGTAAAAAAGAAAGAAAAAGTGCTGGGCTCATAGTCGGTCCCCATTTGGAGTGGTCATATGAACAGGACAAGTCGCCATTATTAACAGCCATCTTCATATCACAGATTGCACGTTCGAATTCCTTTTCTGAATTCAAACATGTGTATCTCATTGAACTGCCCACAGCTTCTGAGAAATCTTCAACTAACCTGGTCATCAGTTTGGTGTTGAGGTCTCCCACATACAATTCTCTATTTGAACCAACCTGCTCCTTATAACTCAGTCCAAATTTCAAGTTCCCTGTATTTGAGCTGATGCTTGTGAATTCTGTAGGAGAGTCATCTGAATAGAAACATAAATTCCGTAATGCTGCATTTGTGAAATAACTTTTGTCTAGCTTATCTGCAATGGCTTCAGAATTGCTTTCCCTGGTACTAAGCCGAACCTCATCCTTCAGTTTCAAAACCTCACTGGAAAAACCCAATCTAGATCTACTTCTATGCTCATAACTGCCCAATTTCTGATCATAGTGTCCTTGAATTAGAAGATACTTGAAGCATTCAAAGAACTCATCTTCTTGGTAAGCTACTGTTGTCAAATTTTTTAACAGCAAACCCAAAGGGCAGATGTCCTGTGGTGCTTCAAGAAAATAAGCCAATTTAAATGGAGATAGATAAACCGCATCGCATAACTCTTTATACACATCAGGCCTGAGCACATCTGGATCAAAGTCCTTCACTTCATGCATTGAAACCTCTGCTTTAATCTCTCTCAACACTCCGAAAGGAGCCCACAATGACTCAAGAGACTCTCGCCCATTAACAGACAGATTCTCTGACTTCAACTTAGTGGTCTCAGCTTTTGTCCCCTCACTATTGGCCATTTTGGCTAGTGTCATTTGCACGTCATTTCTGATACCCTCAAAGGCTCTTACTTGATCCTCTGTTAAACTCTCATACATCGCTGACAATTCTTCCTGATTGGTTCTGGATCTTGAACCGGTGCTTACAAGACCCGTTAGATTTCTCAATATTAGGTAGTCCATGGAATCAGGATCAAGATTGTATCTACCTTTTGTTTTAAACCTCTCAGCCATAGTAGAGACACATGTTGAAACAAGTTTTTCCTTATCATAGACAGAAAGGATGTTTCCAAGTTCGTCGAGTTTGGGGATCACCACGCTTTTATTGCTTGATAGATCCAGAGCTGTGCTAGTGATGTTAGGCCTGTAGGGATTGTTCTTCAGCTCACCTGTAACTTTAAGCCTTCCTTTATTAAAGAGAGAGATGCAGAAAGACAAGATCTCTTTACACACTCCTGGAATTTGAGTATCTGAGGAAGTCTTAGCCTCTTTGGAAAAGAATTTGTCCAATCCTCTTATCATGGTGTCCTCCTGTTCCAGTGTTAGACTCCCACTTAGAGGGGGGTTCACAACAACACAACCAAACTTGACTTTGGGCTCAATAAACTTCTCAAAACACTTTATTTGATCTGTCAGGCGATCAGGTGTCTCTTTGGTTACCAAGTGACACAAATAACTAACATTTAATAGATATTTA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| 21,255
|
KR260731.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Aguilar,P.V., Tesh,R.B., Ksaizek,T.G., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2015-09-19
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,113
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Homo sapiens
| null |
1976-01-01
|
SAMN03381373
|
PRJNA257008
|
Junin mammarenavirus strain P3406_Ledesma segment L, complete sequence
|
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| 85,657
|
KR260733.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Aguilar,P.V., Tesh,R.B., Ksaizek,T.G., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2015-09-19
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,082
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Homo sapiens
| null |
1976-01-01
|
SAMN03381374
|
PRJNA257008
|
Junin mammarenavirus strain P2290_Ledesma segment L, complete sequence
|
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| 85,658
|
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|
Mammarenavirus juninense
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University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2015-09-19
| null |
Mammarenavirus juninense
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
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ssRNA(+/-)
| 7,112
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Homo sapiens
| null |
1977-06-02
|
SAMN03381375
|
PRJNA257008
|
Junin mammarenavirus strain P3766 segment L, complete sequence
|
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| 85,659
|
JN801477.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Bjornson,Z., Gire,S.K., Honko,A., Hensley,L., Sabeti,P.
|
Harvard University, Organismic and Evolutionary Biology
|
USA
|
2012-02-20
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,113
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
1992-04-17
| null | null |
Junin virus strain Rumero segment L, complete sequence
|
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| 97,505
|
JN714130.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Gire,S.K., Honko,A., Hensley,L., Sabeti,P.
|
Harvard University, Organismic and Evolutionary Biology
|
USA
|
2012-02-18
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,114
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Junin virus strain P3790 segment L, complete sequence
|
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| 97,516
|
JF799977.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Albarino,C.G., Bird,B.H., Chakrabarti,A.K., Dodd,K.A., Flint,M., Bergeron,E., White,D.M., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2011-08-08
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,114
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Junin virus strain XJ17 segment L, complete sequence
|
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| 98,388
|
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|
Mammarenavirus juninense
|
Albarino,C.G., Bird,B.H., Chakrabarti,A.K., Dodd,K.A., Flint,M., Bergeron,E., White,D.M., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
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2011-08-08
| null |
Mammarenavirus juninense
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
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ssRNA(+/-)
| 7,114
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Junin virus strain XJ34 segment L, complete sequence
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| 98,389
|
JF799979.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Albarino,C.G., Bird,B.H., Chakrabarti,A.K., Dodd,K.A., Flint,M., Bergeron,E., White,D.M., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2011-08-08
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,114
|
GenBank
| 1
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Junin virus strain XJ39 segment L, complete sequence
|
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Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
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USA
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2011-08-08
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Mammarenavirus juninense
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Junin virus strain XJ48 segment L, complete sequence
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| 98,391
|
HQ126698.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Albarino,C.G., Bird,B.H., Chakrabarti,A.K., Dodd,K.A., White,D.M., Bergeron,E., Shrivastava-Ranjan,P., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2011-04-13
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,114
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Junin virus strain Candid1-wt segment L, complete sequence
|
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|
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|
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|
Albarino,C.G., Bird,B.H., Chakrabarti,A.K., Dodd,K.A., White,D.M., Bergeron,E., Shrivastava-Ranjan,P., Nichol,S.T.
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Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
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USA
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2011-04-13
| null |
Mammarenavirus juninense
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
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ssRNA(+/-)
| 7,114
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Junin virus strain Candid1-rec segment L, complete sequence
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| 99,455
|
DQ489718.2
|
Mammarenavirus juninense
|
Goni,S.E., Iserte,J.A., Ghiringhelli,D.P., Romanowski,V., Lozano,M.E., Ambrosio,A.M.
|
UNQ, LIGBCM-Dto. CyT
|
Argentina
|
2006-07-01
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,114
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
| null | null | null | null | null |
Junin virus strain XJ#44 segment L, complete sequence
|
CGCACAGTGGATCCTAGGCGTAACTTCATCATTAAAATCTCAGATTCTGCTCTGAGTGTGACTTACTGCGAAGAGGCAGACAAATGGGCAACTGCAACGGGGCATCCAAGTCTAACCAGCCAGACTCCTCAAGAGCCACACAGCCAGCCGCAGAATTTAGGAGGGTAGCTCACAGCAGTCTATATGGTAGATATAACTGTAAGTGCTGCTGGTTTGCTGATACCAATTTGATAACCTGTAATGATCACTACCTTTGTTTAAGGTGCCATCAGGGTATGTTAAGGAATTCAGATCTCTGCAATATCTGCTGGAAGCCCCTGCCCACCACAATCACAGTACCGGTGGAGCCAACAGCACCACCACCATAGGCAGACTGCACAGGGTCAGACCCGACCCCCCGGGGGGCCCCCATGGGGACCCCCCGTGGGGGAACCCCGGGGGTGATGCGCCATTAGTCAATGTCTTTGATCTCGACTTTGTGCTTCAGTGGCCTGCATGTCACCCCTTTCAATCTGAACTGCCCTTGGGGATCTGATATCAGCAGGTCATTTAAAGATCTGCTGAATGCCACCTTGAAATTTGAGAATTCCAACCAGTCACCAAATTTATCAAGTGAACGGATCAACTGCTCTTTGTGTAGATCATAAACGAGGACAAAGTCCTCTTGCTGAAATAATATTGTTTGTGATGTTGTTTTTAGATAAGGCCATAGTTGGCTTAATAAGGTTTCCACACTATCAATGTCCTCTAGTGCTCCAATTGCCTTGACTATGACATCCCCAGACAACTCAACTCTATATGTTGACAACCTTTCATTACCTCTGTAAAAGATACCCTCTTTCAAGACAAGAGGTTCTCCTGGGTTATCTGGCCCAATTAGGTCATATGCATACTTGTTACTTAGTTCAGAATAAAAGTCACCAAAGTTGAACTTAACATGGCTCAGAATATTGTCATCATTTGTCGCAGCGTAGCCTGCATCAATAAACAAGCCAGCTAGGTCAAAGCTCTCATGGCCTGTGAACAATGGTAGGCTAGCGATAACCAGTGCACCATCCAACAATGAGTGGCTTCCCTCAGACCCAGAAACACATTGACTCATTGCATCCACATTCAGCTCTAATTCAGGGGTACCGACATCATCCACTCCTAGTGAACTGACAATGGTGTAACTGTACACCATCTTTCTTCTAAGTTTAAATTTTGTCGAAACTCGTGTGTGTTCTACTTGAATGATCAATTTTAGTTTCACAGCTTCTTGGCAAGCAACATTGCGCAACACAGTGTGCAGGTCCATCATGTCTTCCTGAGGCAACAAGGAGATGTTGTCAACAGAGACACCCTCAAGGAAAACCTTGATATTATCAAAGCTAGAAACTACATAACCCATTGCAATGTCTTCAACAAACATTGCTCTTGATACTTTATTATTCCTAATTGACAAGGTAAAATCTGTGAGTTCAGCTAGATCTACTTGACTGTCATCTTCTAGATCTAGAACTTCATTGAACCAAAAGAAGGATTTGAGACACGATGTTGACATGACTAGTGGGTTTATCATCGAAGATAAGACAACTTGCACCATGAAGTTCCTGCAAACTTGCTGTGGGCTGATGCCAACTTCCCAATTTGTATACTCTGACTGTCTAACATGGGCTGAAGCGCAATCACTCTGTTTCACAATATAAACATTATTATCTCTTACTTTCAATAAGTGACTTATAATCCCTAAGTTTTCATTCATCATGTCTAGAGCCACACAGACATCTAGAAACTTGAGTCTTCCACTATCCAAAGATCTGTTCACTTGAAGATCATTCATAAAGGGTGCCAAATGTTCTTCAAATAGTTTGGGGTAATTTCTTCGTATAGAATGCAATACATGGTTCATGCCTAATTGGTCTTCTATCTGTCGTACTGCTTTGGGTTTAACAGCCCAGAAGAAATTCTTATTACATAAGACCAGAGGGGCCTGTGGACTCTTAATAGCAGAAAACACCCACTCCCCTAACTCACAGGCATTTGTCAGCACCAAAGAGAAGTAATCCCACAAAATTGGTTTAGAAAATTGGTTAACTTCTTTAAGTGATTTTTGACAGTAAATAACTTTAGGCTTTCTCTCACAAATTCCACAAAGACATGGCATTATTCGAGTAAATATGTCCTTTATATACAGAAATCCGCCTTTACCATCCCTAACACACTTACTCCCCATACTCTTACAAAACCCAATGAAGCCTGAGGCAACAGAAGACTGAAATGCAGATTTGTTGATTGACTCTGCCAAGATCTTCTTCACGCCTTTTGTGAAATTTCTTGACAGCCTGGACTGTATTGTCCTTATCAATGTTGGCATCTCTTCTTTCTCTAACACTCTTCGACTTGTCATGAGTTTGGTCCTCAAGACCAACCTCAAGTCCCCAAAGCTCGCTAAATTGACCCATCTGTAGTCTAGAGTTTGTCTGATTTCATCTTCACTACACCCGGCATATTGCAGGAATCCGGATAAAGCCTCATCCCCTCCCCTGCTTATCAAGTTGATAAGGTTTTCCTCAAAGATTTTGCCTCTCTTAATGTCATTGAACACTTTCCTCGCGCAGTTCCTTATAAACATTGTCTCCTTATCATCAGAAAAAATAGCTTCAATTTTCCTCTGTAGACGGTACCCTCTAGACCCATCAACCCAGTCTTTGACATCTTGTTCTTCAATAGCTCCAAACGGAGTCTCTCTGTATCCAGAGTATCTAATCAATTGGTTGACTCTAATGGAAATCTTTGACACTATATGAGTGCTAACCCCATTAGCAATACATTGATCACAAATTGTGTCTATGGTCTCTGACAGTTGTGTTGGAGTTTTACACTTAACGTTGTGTAGAGCAGCAGACACAAACTTGGTGAGTAAAGGAGTCTCTTCACCCATGACAAAAAATCTTGACTTAAACTCAGCAACAAAAGTTCCTATCACACTCTTTGGGCTGATAAACTTGTTTAATTTAGAAGATAAGAATTCATGGAAGCACACCATTTCCAGCAGTTCTGTCCTGTCTTGAAACTTTTCATCACTAAGGCAAGGAATTTTTATAAGGCTAACCTGGTCATCGCTGGAGGTATAAGTGACAGGTATCACATCATACAATAAGTCAAGTGCATAACACAGAAATTGTTCAGTAATTAGCCCATATAAATCTGATGTGTTGTGCAAGATTCCCTGGCCCATGTCCAAGACAGACATTATATGGCTGGGGACCTGGTCCCTTGACTGCAGATACTGGTGAAAAAACTCTTCACCAACACTAGTACAGTCACAACCCATTAAACCTAAAGATCTCTTCAATTTCCCTACACAGTAGGCTTCTGCAACATTAATTGGAACTTCAACGACCTTATGAAGATGCCATTTGAGAATGTTCATTACTGGTTCAAGATTCACCTTTGTTCTATCTCTGGGATTCTTCAATTCTAATGTGTACAAAAAAGAAAGGAAAAGTGCTGGGCTCATAGTTGGTCCCCATTTGGAGTGGTCATATGAACAGGACAAGTCACCATTGTTAACAGCCATTTTCATATCACAGATTGCACGTTCGAATTCCTTTTCTGAATTCAAGCATGTGTATTTCATTGAACTACCCACAGCTTCTGAGAAGTCTTCAACTAACCTGGTCATCAGCTTAGTGTTGAGGTCTCCCACATACAGTTCTCTATTTGAGCCAACCTGCTCCTTATAACTTAGTCCAAATTTCAAGTTCCCTGTATTTGAGCTGATGCTTGTGAACTCTGTAGGAGAGTCGTCTGAATAGAAACATAAATTCCGTAGGGCTGCATTTGTAAAATAACTTTTGTCTAGCTTATCAGCAATGGCTTCAGAATTGCTTTCCCTGGTACTAAGCCGAACCTCATCCTTTAGTCTCAGAACTTCACTGGAAAAGCCCAATCTAGATCTACTTCTATGCTCATAACTACCCAATTTCTGATCATAATGTCCTTGAATTAAAAGATACTTGAAGCATTCAAAGAATTCATCTTCTTGGTAGGCTATTGTTGTCAAATTTTTTAATAACAAACCCAAAGGGCAGATGTCCTGCGGTGCTTCAAGAAAATAAGTCAATTTAAATGGAGATAGATAAACAGCATCACATAACTCTTTATACACATCAGACCTGAGCACATCTGGATCAAAATCCTTCACCTCATGCATTGACACCTCTGCTTTAATCTCTCTCAACACTCCAAAAGGGGCCCACAATGACTCAAGAGACTCTCGCTCATCAACAGATAGATTCTTTGATTTCAGCTTGGTGATCTCAACTTTTGTCCCCTCACCATTAGCCATCTTGGCTAGTGTCATTTGTACGTCATTTCTAATACCCTCAAAGGCCCTTACTTGATCCTCTGTTAAACTCTCATACATCACTGATAATTCTTCTTGATTGGTTCTGGTTCCTGAACCGGTGCTCACAAGACCTGTTAGATTTTTTAATATTAAGTAGTCCATGGAATCAGGATCAAGATTATACCTGCCTTTTGTTTTAAACCTCTCAGCCATAGTAGAAACGCATGTTGAAACAAGTTTCTCCTTATCATAAACAGAAAGAATATTTCCAAGTTCGTCGAGCTTGGGGATTACCACACTTTTATTGCTTGACAGATCCAGAGCTGTGCTAGTGATGTTAGGCCTGTAGGGATTGCTTTTCAGTTCACCTGTAACTTTAAGTCTTCCTCTATTGAAGAGAGAAATGCAGAAGGACAAAATCTCTTTACACACTCCTGGAATTTGAGTATCTGAGGAAGTCTTAGCCTCTTTGGAAAAGAATCTGTCCAATCCTCTTATCATGGTGTCCTCTTGTTCCAGTGTTAGACTCCCACTTAGAGGGGGGTTTACAACAACACAATCAAACTTGACTTTGGGCTCAATAAACTTCTCAAAACACTTTATTTGATCTGTCAGGCGATCAGGTGTCTCTTTGGTTACCAAGTGACACAGATAACTAACATTTAAT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| 108,108
|
AY819707.2
|
Mammarenavirus juninense
|
Goni,S.E., Iserte,J.A., Ambrosio,A.M., Romanowski,V., Ghiringhelli,P.D., Lozano,M.E.
|
Universidad Nacional de Quilmes, LIGBCM, Dto de C y T
|
Argentina
|
2004-11-28
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,114
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Junin virus strain Candid #1 segment L, complete sequence
|
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| 109,344
|
AY746354.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Walton,A.H., Droll,D.A., Chambers,T.J.
|
Saint Louis University School of Medicine, Molecular Microbiology and Immunology
|
USA
|
2004-09-22
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,114
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
| null | null | null | null | null |
Junin virus strain Candid-1 segment L, complete sequence
|
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| 109,518
|
AY619640.1
|
Mammarenavirus juninense
|
Hajjaj,A., Chain,P.S.G., Do,L.H., Smith,K.L., Imbro,P.M., Malfatti,S.A., Jahrling,P.B., Geisbert,J., Ibrahim,M.S.
|
Lawrence Livermore National Laboratory, Viral Sequencing Group
|
USA
|
2004-06-08
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,113
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Junin virus strain Rumero segment L, complete sequence
|
CGCACAGTGGATCCTAGGCGTAACTTCATCACTAAAATCTCAGATTCTGTTCTGAGTGTGACTTACTGTGAAGAGGCAGACAAATGGGCAACTGCAACGGGGCATCCAAGTCAAACCAGCCAGACTCTTCAAGGGTCACACAGCCAGCCGCAGAATTCAGGAGGGTGGCTCACAGCAGTCTATATGGTAGATACAACTGCAAGTGCTGCTGGTTTGCTGACACCAATCTGATAACCTGCAATGATCACTACCTTTGTTTAAGGTGCCATCAGGTTATGTTAAGGAATTCGGACCTCTGCAATATCTGTTGGAAGCCCCTACCTACCACAATCACAGTGCCGGTGGAGCCAACAGCACCACCACCATAGGCAGACTGCACAGGGTCAGACCTGACCCCCCGGGGGGCCCCCATGGGGACCCCCCGTGGGGGAACCCGGGGGTGATGTACTATTAATCAATGTCTTTGATCTCGACTTTGTGCTTCAGTGGCCTGCACGTCACCCCTTTTAATCTGAATTGCCCTTGGGGATCTGATACCAGCAGGTCATTTAAAGATCTACTGAATGCTACTTTGAAATTTGAGAATTCCAACCAGTCACCAAATTTATCAAGTGAACGGACCAACTGCTCTTTGTGTAGATCATAAACGAGGACAAAGTCCTCTTGCTGAAACAATATTGTCTGGGATGTTGTTTTTAGATAAGGCCATAGTTGGCATAATAAGGTTTCCACACTATCAATGTCCTCTAGTGCTCCAATTGCCTTGACTATAACATCCCCAGACAACTCAACTTTATATGTTGACAGCCTTTCATTACCTCTGTAAAAGATACCCTCTTTCAAAACAAGAGGTTCCCCTGGGTTATTTGGCCCAATGAGGTCATATGCATACTTGTTACCTAGTTCAGAATAAAAGTCACCAAAGTTTAACTTAACATGGCTCAGAATATTGTCATCATTTGTCACAGCGTAGCCTGCATCAATAAACAAGCCAGCTAGGTCAAAGCTCTCATGGCCTGTGAACAATGGTAGGCTAGCAATAACTAGTGCACCATCTAACAATGAGTGGTTTCCCTCAGACCCAGAAACACATTGACTCATTGCATCCACATTCAACTCTAATTCAGGGGTACTGACATCATCCACTCTTAGTGAACTGACAATGGTGTAGCTGTACACCATCTTTCTTCTAAGTTTAAATTTTGTCGAAACTCGTGTGTGTTCCACTTGAATGATCAATTTTAGTTTCACAGCTTCTTGGCAAGCAACATTGCGCAACACAGTGTGCAGGTCTATCATGTCTTCCTGAGGCAACAAGGAGATGTTGTCAACAGAGACACTCTCTAGGAAAACCTTGATATTATCAAAGCTAGAAACTACATAGCCCATTGCAATGTCTTCAACAAACATTGCTCTTGATACTTTGTTATTCTTAATTGACAAGGTGAAATCCGTGAGTTCAGCTAGATCTACTTGACTGTCATCTTCTAGATCCAGAACTTCATTGAACCAAAAGAAGGATTTGAGACACGATGTTGACATGACCAGTGGGTTTATCATCGAAGACAAGACAACTTGCACCATGAAGTTCCTGCAAACTTGCTGTGGGCTAATGCCAACTTCCCAATTTGTATACTCTGACTGTCTGACATGGGCTGAAGCGCAGTCACTCTGTTTCACAATATAAACATTATTATCCCTCACCTTTAATAAGTGACTTATGATCCCTAAGTTCTCATTCATCATGTCTAGAGCTACACAGACATCCAAAAACTTGAGTCTTCCACTGTCTAAAGATCTGTTCACTTGAAGATCATTCATAAAGGGTGCCAAATGTTCTTCAAATAGTTTGGGGTAATTTCTTCGTATAGAATGCAATACATGGTTCATGCCTAATTGGTCTTCTATTTGTCGTACTGCTTTGGGTTTAACAGCCCAAAAGAAATTCTTATTACATAAGACCAGAGGGGCTTGTGGACTCTTAACAGCAGAAAACACCCACTCCCCTAGCTCACAGGCATTTGTCAGCACCAAAGAGAAGTAATCCCACAAAATTGGTTTAGAAAATTGGTTAACTTCTTGAAGTGATTTTTGACAGTAGATAACTTTAGGCTTTTTCTCACAAATTTCACAAAGACATGGCATTATTCGAGTAAATATGTCCTTTATATACAAAAATCCGCCTTTACCATCCCTAACACACTTACTCCCCATACTCTTACAAAACCCAATAAAGCCTGAGGCAACAGAAGACTGAAATGCAGATTTGTTGATAGACTCTGCCAAGATCTTCTTCACGCCTTTTGTGAAATTTCTTGACAGCCTGGACTGTATTGTCTTTATCAACGTTGGCATCTCTTCTTTCTCTAACACTCTTCGACTTGTCATGAGTTTGGTCCTCAAGACCAACCTCAAGTCCCCGAAGCTTGCCAAATTGACCCATCTGTAGTCTAGAGTTCGTCTGATTTCATCTTCACTACACCCGGCATATTGCAGGAATCCGGACAAGGCCTCATCCCCTCCCCTGCTTATCAAGTTGATAAGGTTTTCCTCAAAGATTTTGCCTTTCTTAATGTCATTAAACACTTTCCTCGCGCAATTCCTTATAAACATTGTCTCCTTATCATCAGAAAAAATAGCTTCAATTTTCCTCTGTAGACGGTACCCTCTAGACCCGTCAACCCAGTCTTTGACATCCTGTTCTTCAATAGCTCCAAATGGAGTCTCCCTGTATCCGGAGTATCTGATCAATTGGTTGACTCTAATGGAAATCTTTGAAACTATATGAGTGCTAACCCCATTAGCAATACATTGATCACAAATTGTGTCTATGGTCTCTGACAGTTGTGTTGGAGTTTTACACTTAACATTGTGTAGAGCAGCAGACACAAACTTGGTGAGTAAAGGAGTTTCTTCACCCATGACAAAAAATCTTGACTTAAACTCAGCAACAAAGGTTCCTATCACACTCTTTGGGCTGATAAACTTGTTTAATTTAGATGATAAGAATTCATGGAAGCACACCATTTCCAGCAGTTCTGTTCTGTCTTGACACTTTTCATCACTAAGGCAAGGAATCTTTATAAGGCTAACCTGGTCATCACTGGAGGTATAAGTGACAGGTATCACATCATACAATAAGTCAAGTGCATAACACAGAAATTGTTCAGTAATCAGCCCATATAAATCTGATGTGTTGTGCAAGATTCCCTGCCCCATGTCCAAGACAGACATTATATGGCTAGGGACCTGGTCCCTTGACTGCAGATACTGGTGAAAGAACTCTTCACCAACACTAGTACAGTCACAACCCATTAAACCTAAAGATCTCTTCAATTTCCCTACACAGTAGGCTTCTGCAACATTAATTGGAACTTCAACTACCTTATGAAGATGCCATTTGAGAATATTCATTACTGGTTCAAGATTCACCTTTGTTCTATCTCTGGGATTCTTCAATTCTAATGTGTACAAAAAAGAAAGGAAAAGTGCTGGGCTCATAGTTGGTCCCCATTTGGAGTGGTCATATGAACAGGACAAGTCACCATTGTTAACAGCCATCTTCATATCACAGATTGCACGTTCAAATTCCTTTTCTGAATTCAAGCATGTGTATCTCATTGAACTACCCACAGCTTCTGAGAAGTCTTCAACTAACCTGGTCATCAGCTTAGTGTTGAGGTCTCCCACATACAGTTCTCTATTTGAGCCAACCTGCTCTTTATAACTTAGTCCAAATTTCAAGTTCCCTGTATTTGAGCTGATGCTTGTAAATTCTGTAGGAGAGTCGTCTGAATAGAAACATAAATTCCGTAGGGCTGCGTTTGTAAAATAACTTTTGTCTAGCTTATCAGCAATGGCCTCAGAATTGCTTTCCCTGGTACTAAGCCGAACCTCATCCTTTAGTTTCAGAACTTCACTGGAAAAGCCCAATCTAGATCTACTTCTATGCTCATAACTACCCAATTTCTGATCATAATGTCCTTGAATTAAAAGATACTTGAAGCATTCAAAGAATTCATCTTCTTGGTAGGCTATTGTTGTCAAATTTTTTAATAACAAACCCAAAGGGCAGATATCCTGCGGTGCTTCAAGGAAATAAGTCAATTTAAATGGAGATAGATAAACAGCATCACATAACTCTTTATACACATCAGACCTGAACACATCTGGATCAAAATCCTTCACCTCATGCATTGACACCTCTGCTTTAATCTCTCTCAACACTCCAAAAGGGGCCCACAATGACTCAAGAGACTCTCGCTCATCAACAGATAGATTCTTTGATTTCAACTTGGTGGTCTCAACTTTTGACCCCTCACTATTAGCCATCTTAGCTAGTGTCATTTGCACGTCATTTCTGATACCCTCAAAGGCCCTTACTTGATCCTCTGTTAAACTCTCATACATCATTGACAATTCTTCTTGATTGGTTCTAGTTCTAGAACCGGTGCTCACAAGACCTGTTAGATTTTTTAATATTAAATAGTCCATGGAATCAGGATCAAGATTATACCTGCCTTTTGTTTTGAATCTCTCAGCCATGGTAGAAACACATGTTGAAACAAGTTTCTCCTTATCATAAACAGAGAGAATATTTCCAAGTTCGTCGAGCTTGGGGATCACCACACTTTTATTGCTTGACAAATCCAAAGCTGTGCTAGTGATGTTAGGTCTGTAGGGATTGCTTTTCAGCTCACCTGTAACTTTAAGTCTTCCTCTATTGAAGAGAGAAATGCAGAAAGACAAGATCTCTTTACACACTCCTGGAATTTGAGTATCTGAGGAAGTCTTAGCCTCTTTGGAAAAGAATCTGTCCAATCCTCTTATCATGATGTCCTCTTGTTCCAGTGTTAGACTCCCATTTAAAGGGGGGTTTACAACAACACAATCAAACTTGACTTTGGGCTCAATAAACTTCTCAAAACACTTTATTTGATCTGTCAGCCGATCAGGTGTCTCTTTGGTTACCAAGTGACACAAATAACTAACATTCAATA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| 109,711
|
AY216507.2
|
Mammarenavirus juninense
|
Charrel,R.N., Lemasson,J.J., Garbutt,M., Khelifa,R., De Micco,P., Feldmann,H., de Lamballerie,X., Emonet,S., de Micco,P., Lemasson,J.-J.
|
Universite de la Mediterranee, Unite des Virus Emergents (EA3292, IFR48, IRD UR034)
|
France
|
2004-01-05
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,113
|
GenBank
| 2
|
Argentina
|
Argentina
| null | null | null | null | null |
Junin virus strain MC2 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCGGCACTTGAGCATGGAGGAATCAGTGAATGAAATAAAAAACCTTATTAGAAAGCATTTTCCAGAAAGACAGGAATTAGCATACCAAAGGGACATCTTTTTATCTCAACATCACCCCAGCTCTCTGTTGTTGGAAGGGTTCAAGCTTCTGTCAAGTTTAGTAGAGCTTGAGTCCTGTGAGGCACATGCCTGTCAGATCAATTCAGATCAGAAGTTTGTTGATGTGATTCTGTCTGACCATGGCATACTATGTCCCACCCTCCCAAAAGTCATTCCGGATGGTTTTAAACTCACAGGGAAAACACTCATCCTGTTGGAAACCTTTGTTAGAGTCAATCCTGATGAATTTGAGAAAAAATGGAAGAGTGACATGTCAAAGCTCTTAAACCTAAAGTCCGATCTATTGAGGGCAGGGATTACGTTGGTTCCTGTAGTTGATGGCAGATCTAGCTACAGCAATAGATTCCTTGCTGATTGGGTTGTTGAAAGAGTTCGGTGGCTACTGATTGACATCCTAAAGAAATCAAAATTTATGCAAGAGATTAATATTGAAGAACAAGAATACCAGCGATTAATTCATAGTTTGTCCAATACAAAAAACCAGAGCTTGGGATTAGAAAACATTGAATGTTTGAAAAAGAATTCTTTGGGTTATGATGAGAGATTAAATGAATCCCTTTTTGTTGGGGTTAGAGGAGACATTAGAGAATCTGTTATAAGAGAAGAACTCATAAAGTTAAGGTTTTGGTTTAAGAAGGAGATTTTTGACAAGCAGTTGGGGAAATTCAAATTTTCACAAAAATCTAACCTTATAAATGACTTGGTCTCATTAGGAAGCCACAAAGACAGTGATGTGCCCAGCTGCCCTTTTTGTGCAAACAAGTTGATGGATGTGGTCTACTCTATCGCATCGCATCCAATAGATGAAGTCAACATGAAAAGCCAGTCAGATGAGAATTCTATATCTATTGATGCTGTAGAGAGGTGTTATCTTCAAGCCCTTTCCGTCTGTAACAAAGTGAAAGGTCTAAAAGTTTTCAACACCAGGAGAAATACTTTACTGTTTCTGGATTTAGTTTTACTCAATTTACTTTGTGATCTTTTTAAAAAGCATGATGATGCAATTGTAAGGCTAAGAAATGCAGGAATAGTTGTTGGACAAATGTTAATGTTAGTCAATGACAGACTTCTAGATATTCTGGAGGCGATTAAATTAATAAGGAAGAAATTGATGACCAGCCCCAAGTGGGTTCAAATGTGTTCCAGAACATTGAAGAACTCTCATCAAGATCTCTGGTCACAGCTGGAAAAACTAATAAAACACCCTGATATGGATAGCATGATGATCTTAGCTCAGGCACTTGTTTCTGACAGACCAGTGATGAGATATACTATTGACAGAGAATCTGAGAAAATCTGTAGACATCAGCCATTCAGCAGTTTAGTGGAAGGTGAGCAGAAGAAATTATTTAGGATTTTGTCCTCCATTTCCCTTGCATTGGTCAACTCAATGAAGACATCATTTTCCTCCCGATTGTTGATCAATGAAAGAGAGTATTCTAGATACTTTGGAAATGTTAGACTAAGAGAGTGTTATGTACAAAGATTTCATCTGATAAAGAACACATTTGGTCTCTTGTTTTACCAAAAAACAGGTGAGAAGTCAAGGTGCTATTCTATCTATCTATCTATCAATGGGGTGTTGGAAGAACAAGGCTCTTTTTACTGTGATCCAAAGAGATTTTTCCTGCCTATATTTTCGGAGGATGTGTTAATTGAAATGTGTGAGGAAATGACCAGCTGGTTGGATTTTAGCCACGAACTCATGACAATGACAAGGCCAACATTAAGATTGTTAGTGTTGGCTGTGCTCTGTTCCCCTTCCAAAAGGAACCAGACATTTTTACAAGGTCTAAGATATTTCTTGATGGCATATGCAAATCAAATCCATCATGTGGATTTGATGTCAAAGCTAAGGGTCGACTGCATGTCTGGATCAGAGGTGCTGATTCAGAGGATGGCTGTGGAACTTTTCCAGACAATTTTGAGTGAAGGGGAAGATGCAGATCTTTACTTTGCAAGAAGGTTCAAATATCTATTGAATGTTAGTTATTTGTGTCACTTGGTAACCAAAGAGACACCTGATCGGCTGACAGATCAAATAAAGTGTTTTGAGAAGTTTATTGAGCCCAAAGTCAAGTTTGATTGTGTTGTTGTAAACCCCCCTTTAAATGGGAGTCTAACACTGGAACAAGAGGACATCATGATAAGAGGATTGGACAGATTCTTTTCCAAAGAGGCTAAGACTTCCTCAGATACTCAAATTCCAGGAGTGAGTAAAGAGATCTTGTCTTTCTGCATTTCTCTCTTCAATAGAGGAAGACTTAAAGTTACAGGTGAGCTGAAAAGCAATCCCTACAGACCTAACATCACTAGCACAGCTTTGGATTTGTCAAGCAATAAAAGTGTGGTGATCCCCAAGCTCGACGAACTTGGAAATATTCTCTCTGTTTATGATAAGGAGAAACTTGTTTCAACATGTGTTTCTACCATGGCTGAGAGATTCAAAACAAAAGGCAGGTATAATCTTGATCCTGATTCCATGGACTATTTAATATTAAAAAATCTAACAGGTCTTGTGAGCACCGGTTCTAGAACTAGAACCAATCAAGAAGAATTGTCAATGATGTATGAGAGTTTAACAGAGGATCAAGTAAGGGCCTTTGAGGGTATCAGAAATGACGTGCAAATGACACTAGCTAAGATGGCTAATAGTGAGGGGTCAAAAGTTGAGACCACCAAGTTGAAATCAAAGAATCTATCTGTTGATGAGCGAGAGTCTCTTGAGTCATTGTGGGCCCCTTTTGGAGTGTTGAGAGAGATTAAAGCAGAGGTGTCAATGCATGAGGTGAAGGATTTTGATCCAGATGTGTTCAGGTCTGATGTGTATAAAGAGTTATGTGATGCTGTTTATCTATCTCCATTTAAATTGACTTATTTCCTTGAAGCACCGCAGGATATCTGCCCTTTGGGTTTGTTATTAAAAAATTTGACAACAATAGCCTACCAAGAAGATGAATTCTTTGAATGCTTCAAGTATCTTTTAATTCAAGGACATTATGATCAGAAATTGGGTAGTTATGAGCATAGAAGTAGATCTAGATTGGGCTTTTCCAGTGAAGTTCTGAAACTAAAGGATGAGGTTCGGCTTAGTACCAGGGAAAGCAATTCTGAGGCCATTGCTGATAAGCTAGACAAAAGTTATTTTACAAACGCAGCCCTACGGAATTTATGTTTCTATTCAGACGACTCTCCTACAGAATTTACAAGCATCAGCTCAAATACAGGGAACTTGAAATTTGGACTAAGTTATAAAGAGCAGGTTGGCTCAAATAGAGAACTGTATGTGGGAGACCTCAACACTAAGCTGATGACCAGGTTAGTTGAAGACTTCTCAGAAGCTGTGGGTAGTTCAATGAGATACACATGCTTGAATTCAGAAAAGGAATTTGAACGTGCAATCTGTGATATGAAGATGGCTGTTAACAATGGTGACTTGTCCTGTTCATATGACCACTCCAAATGGGGACCAACTATGAGCCCAGCACTTTTCCTTTCTTTTTTGTACACATTAGAATTGAAGAATCCCAGAGATAGAACAAAGGTGAATCTTGAACCAGTAATGAATATTCTCAAATGGCATCTTCATAAGGTAGTTGAAGTTCCAATTAATGTTGCAGAAGCCTACTGTGTAGGGAAATTGAAGAGATCTTTAGGTTTAATGGGTTGTGACTGTACTAGTGTTGGTGAAGAGTTCTTTCACCAGTATCTGCAGTCAAGGGACCAGGTCCCTAGCCATATAATGTCTGTCTTGGACATGGGGCAGGGAATCTTGCACAACACATCAGATTTATATGGGCTGATTACTGAACAATTTCTGTGTTATGCACTTGACTTATTGTATGATGTGATACCTGTCACTTATACCTCCAGTGATGACCAGGTTAGCCTTATAAAGATTCCTTGCCTTAGTGATGAAAAGTGTCAAGACAGAACAGAACTGCTGGAAATGGTGTGCTTCCATGAATTCTTATCATCTAAATTAAACAAGTTTATCAGCCCAAAGAGTGTGATAGGAACCTTTGTTGCTGAGTTTAAGTCAAGATTTTTTGTCATGGGTGAAGAAACTCCTTTACTCACCAAGTTTGTGTCTGCTGCTCTACACAATGTTAAGTGTAAAACTCCAACACAACTGTCAGAGACCATAGACACAATTTGTGATCAATGTATTGCTAATGGGGTTAGCACTCATATAGTTTCAAAGATTTCCATTAGAGTCAACCAATTGATCAGATACTCCGGATACAGGGAGACTCCATTTGGAGCTATTGAAGAACAGGATGTCAAAGACTGGGTTGACGGGTCTAGAGGGTACCGTCTACAGAGGAAAATTGAAGCTATTTTTTCTGATGATAAGGAGACAATGTTTATAAGGAATTGCGCGAGGAAAGTGTTTAATGACATTAAGAAAGGCAAAATCTTTGAGGAAAACCTTATCAACTTGATAAGCAGGGGAGGGGATGAGGCCTTGTCCGGATTCCTGCAATATGCCGGGTGTAGTGAAGATGAAATCAGACGAACTCTAGACTACAGATGGGTCAATTTGGCAAGCTTCGGGGACTTGAGGTTGGTCTTGAGGACCAAACTCATGACAAGTCGAAGAGTGTTAGAGAAAGAAGAGATGCCAACGTTGATAAAGACAATACAGTCCAGGCTGTCAAGAAATTTCACAAAAGGCGTGAAGAAGATCTTGGCAGAGTCTATCAACAAATCTGCATTTCAGTCTTCTGTTGCCTCAGGCTTTATTGGGTTTTGTAAGAGTATGGGGAGTAAGTGTGTTAGGGATGGTAAAGGCGGATTTTTGTATATAAAGGACATATTTACTCGAATAATGCCATGTCTTTGTGAAATTTGTGAGAAAAA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| 110,033
|
AY358022.2
|
Mammarenavirus juninense
|
Bowen,M.D., Thurman,K., Minor,E., Meyer,R.F., Malfatti,S.A., Do,L.H., Smith,K.L., McCready,P.M., Chain,P.S.G.
|
Lawrence Livermore National Laboratory, Viral Sequencing Group
|
USA
|
2003-08-24
| null |
Mammarenavirus juninense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,114
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Junin virus strain XJ13 segment L, complete sequence
|
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| 110,269
|
NC_004297.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Djavani,M., Lukashevich,I.S., Sanchez,A., Nichol,S.T., Salvato,M.S., Lukashevich,I.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1998-03-17
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,279
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Lassa virus segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCAATTTGGTTGTCTTTTTTTGAGGCCTTGTGCGCTGTACTTCTCCAAATGGGAAACAAGCAAGCCAAAGCCCCAGAATCAAAAGACAGTCCGAGAGCCAGCCTGATCCCAGATGCCACACATCTAGGGCCACAGTTCTGTAAGAGCTGCTGGTTCGAAAACAAGGGCCTGGTTGAGTGCAACAACCACTATCTGTGTCTCAACTGCCTCACCTTACTTCTAAGTGTCAGCAACAGGTGTCCCATTTGCAAGATGCCTCTCCCCACAAAACTGAGACCATCAGCCGCTCCAACAGCACCTCCAACCGGAGCAGCGGACAGCATCAGACCCCCACCCTACAGTCCCTGAATCTCCCACCGACCCCCACCACTCCCATCCTCCCCCCGACACCCCCCGGGGGGACCCCCCGCCGGGGGCCCCCCCGGGGGAGCCAACCATCACCAAAAAACTACTCAATGTCTTCGATGCATTCATCCTTCCTAGTCAGCTCCTCACATGTTCTGCCCTTCAATCTCAATTTACCACCACTTGATTGTACCATCACCTTTCCCCTTGACTTACTATAACAGAGAGCATAACCCTTGAACTCCACCCAGTTGTCCACTGCCTCAAGAACCGCACTCAAGATCCCCTCACAACTCGGCGCTGCAGCCCTAAGTGTGGAGACAATGTCCACCCCTGACCACTGCATCCTTAACCCCAGCCTGTCTATCATCATATCACTCAATGCCCCAATCAGCAGGTCAGACGAAGTGTCCCCAACCTCTCTCACAAATATCTCAAGATCCTGGTCTTGTATAACAGGTGTAAAGGATGCCAATTTCTTTCCACATTCCCACAAGCCTCCCCTATGCACAACCAGGGGGGTTGGTTCAGTGCAAGGACCCACCAATACAAAGTCATACTCCGTAAACTGCAACCTTTCCATATCAACAACAATCTCAACAGGGGTCACATGCCCTAGTTGATTTGTGTCAATTAAAAACTCATTAATGATCTCGGTGTCAACATACCATGCTGATTTGCCCTTGAAAGTAGGTCCTGACAAAACCAGTCTCCAACAGTCTGACAAGACACACGGACTCACTGCACCTGAGTACATAACGGTTACATCATGTACTAGATACTTGGCCTGTTGATTCATTGAGCCAGTATACTCAAGGTGGATGGCAAAGCTTTCCTTAAAACTAGCATCTTGACTTTTAACACGGAACCTCACTGTCTGACTCAGTTTTGCAGACCCTGGAGGTAGTGAAGCTACGGCATCAAAGAAATCCTCCAATGAGTCAAACTTAGGATCAACTAAACCTGATGCGATCAATTGATTTTGATTGAATCTAGCTGGCTCAATATCAAAGTCTATCCAAGCATAACCCATCATCAGATCATGCTTAAACATTGGCCTTTCAACACCTTTGTGAATAACTTTCTCTACAAATGAAGAAAATGGACCCATTCTATGCAACCCTTCACCCTCTGGAACTGATGTCTTGTGTGGAAACCACGTGAAGGACCCCAATGTTCTTGTAGTCGCAACAAATGGTCTCACGTAAGACTCAAAATAAATTTGCCTCATGAAATTGTCAACAGCATCACTAGTGCTCACTACTCTTTCTTCCACCATGGGTTCATGTGTCCTACTGTGAGACAACCTCAATTCAGATGATAACACAATGTAATGTTCCTCTCTTTTCCATTTTACTATGTGTGAGACAAGAGACAAGGCTTCACAGTTAACATCCAACGCTACACAGAGATCTAGAAATTTTATTCTGGGTGACCACTTCATTTTGGTTGACGCTAGATCGCTCATGAATGGTAATATGTGTTTCTCAAACACTGATGGGTACAGCCTTCTTAAAGAATGAATGATGTGATTCAAACCAACCCTATCCTCCAATAGTTTTGATGCAGTTGGCTTTAAGGGAAAATAGTCACAAGGGTTATGTTTGAAAAAATCAAACACCTTAACTGTCTTAGGTTCCCCTAAGACCCATGCACCCAGTTCTATTGCAGTTGATAAGGAGATGCACATATAATCCCATAACAAGGGTCTGAAATAACTGACCACACTTTCACCTCCACTTCCATTTCTAAGTTCTAGCGGAACTTGCCAATATTGAATGCCATTAGAATTTGTCAACAATTTGATTCCCTTGACATCAGAAATCAGAGACTGAATGGACTTAATATACAGATTCTCTTTATTTGGTCCCCGAACACATTTGCTACCCAATGTTCTGCACAATCCTACAAAGCCAGATGCAATGGAACTTTGGAATGCAGATTTGTTGATAGCTTCAGACAGCAATTTTTGCGCACCTCGAGTGAAAGTGGAAGACAACTTATTTTGGATTGTTTTGACAATGGTAGGAATCTTCTCATCATCTAGGTTCACAGCACCTGAATATATTATCTTTTGTCTCAACACCATTCTTAAAGGATGATGCGCAGCCAAGTTTAGCCAAGAATACTCAAGGTCAGACTCAGATGGGGGCTCAACATCCAACAGCTCACAAAGATTTCTTAGTGATGAGAGGTGCTCACTAGACAAATAGTTTGTTGTGAACTCTTCATGGAGTTGCCCAGTCTTCAACCTATTGTACAGTTTTCTTAACATAGATCTAATCTTGCTGCAAGCATTAGGAATCAATCCCTCTATTTGCCTCATAATCCTATAACTACGGTTGCCATCTACCCAGTCTCTAACATCTGTCTCGCAATTCAATAAGAATGGGTCAATAGGGTATCTTGCATATTGCAAAGGATTTAAGGTTCTTTTCTGTATTAGATTACATAAGTGAACAGGGACACCATTCGCAACCGACTGATCAATGATTGTGTCAATTGTTTCTGCCAGTTGGTGTGGCTCTTTACACTTTATATTGTGAAGAGCTGCTGCAACGAACTTTGTCAATAATGGCACTTCATCTCCCCAAACAAAAAATCTAGATTTAAACTCTGCAACAAACCTGCCAATGACACTTTTAGGGCTCACAAACTTATTGAGTTGATCACTCATATAATAGTGGAACTCTATTAGAGTCCTAAATTCTTCTGGGTCTCTTTGCAAAAGCTCTGTGAGAGATTGATCAAAGAGAGAAATCTGATCATCACTAGAGGTATAAGCATCTATCGTACCACCGCATATACAACTGATAGCATAATTAATGAACCTCTCTGAAATGAGGGCATAAAAATCTGATGTGTTGTGTAATATTCCTTGACCCATGTCAAGTATTGAACTGATGTGAGAAGGCACTACACCAGCTTGGAAATTAGAGTAAAAGAAATCTTCTGTTATTGACTGTTTAGTTTTCTTCCTTAACCCTAGTTGGGCTTTAATGAAAGACTTCATCATGGCTGTCACCACATTAAAAGGTATTTCCACCATTTTGTGCATATGCCACATAAGTAGGGTTGAGAGATAGTCCCTCCCTTTTATGTCAGCTTGCAAGTCCTTTGAGAGGAAAATTAAATTCTGTAAGACAGTCAAGAACAAAAATGGACACATCATTGGGCCCCACTTACTATGATCCATGCTATAAGACACATGTGCCAATGAAACATTCAATTTCATGGAAAGGATAGCATTTTCAAATTCCTTCTCGTTGTTCAGGCAACTCCCTGATAACTGTAGGCTTATAGCTTCAAAGTAATCTTCTATAAGTCTAGTAAACATCTTTGTTCTAAGATCACCAATATATAATTCTCTGTTACCACCCACTTGTTCTTTATATGACAAAGAAAACTTAAGCCTTCCTGTATCAGGTCCCACTGAGTCATAAGATTGTGGCGACTCTTGGCTATAAAAACACAAATTCTTTAACATTGCTGTGGTACAGTTTGTCAGTGACAGAGCCTTACTAAGTGCCTCTGAATTGCTCTCCCTTTCACTAATTCTTACATCATCAGAGAGTTTACCCATATCAAACTTGAAATTAAGGTTCCTTGACTTATAATGAGTGTACCTCCCCATAAGTGTATTCGCATTCATGATCAAGAGTATGGACTTAAAACACTGAAAGTATTCATGGTTAAAGTATGTCCTTGTTGACACTGCCTTTGTCAACTCTCCAATAGGACACTGTGACATATGTCCACAGTAAAAATACTTCTGCTTCAATCTACTATTCTCATAGACAGCATTACAGAATTCTTCATAAAATTTACCTGGTAAGATATCATGATCAAACTCCTCAACCATGTGATTGGATAATTCACCCTTGATCAACCTAATGTAAAACTTATTTGAGACAATCTCATCTAGATCATTTATTGATGGTTGGCCATCACCATTAGGGCCTGAGCCTAGCTTGACAGGTTCCCTATACTGATCAACAATTTTTTCAACAGTCTCCTTTAGCTGATCAAAATAATCGCTTGCACCTCCATCGAGCAAAATTTCGTCTAGGTCAGCCCCATCAGCATCACTTTTGAGCTGCCCAGATCCTAGAACCAAATTGCTCATTGCCTGCTGAACTTTGTACTCATAGTCCTGCTTGTTGAGAAGGTACTTTCCTTTCCTTGAGAAGACTTCAGTGAGCTGCGACACGGCCAGTGCTGTGAGCTTATTGAAGTCATAGTTTAATATTCTAGAACCATCTGTGTATTTATTAACAACAACACTTTTCTTGCTGGCTAAATCCAAGGCTGCACTGCCACTGGTGATGAGAGGATCTTTGATTTCCCTTTTTACTTCCCTCTCCTTAAATAGTGAACCATTGTTAAAAGAGGATGTAAGAAGAGATAAATACTTCTTTGAAACACCAGGCCTTTTATAATCTGGTCCCTCGATAGTTGTGCATCCATCTTTACTTAAAAACTTTTTTGCATTGTAGACCATGTCATCCAATTCTTCCTCAGTGGCTGTGTCTGCAGGATTAGTGCTCACATGACCAAATCTCACCTTTGGTTCCAGAAACTTCTCAAAACATTTTATCTGATCTGTCAATCTATCTGGTGTTTCTTTCGTAATGAAGTGGCACATGTAGGAAACATTCAAAATGAACTTGAACCTATTAGTCATCATGCTCTTCACATCCTCAGATAAAACCAGATTCATTAATGTCCTTATTAACCTATAGAGCAGGAACTCAACATCAGTGATTAATTCTTCCCTTATTTTGTCAATGAGGTCCTTATGATGATAATCTGATAGATAAGCCATTACAAAGTACCTAAGATTTTGGAGGAGCTTTTGAGAACGTTTACTGGGGTGAGCTAAAATTAAAACCAGGATCATCTTTGTCAGAGACCTGATATTGTTCAACTGCCCTTCCAGCTCATTGCAATCTTCTATCCAAGAAATCATAGTGCTTATTGTTGTTTGTAAAACCTCAGCTGAAAATATTGCTGGAAAATATCTTTTAGGATCAGCATAAAATGAGCACACCTCACCAACTTTGTTATCATTAATAGCATAGCACTTCGAGCACTCCCCTGTCTTTTGATAAATCAGTTGTAATTCAGTGTTACCCAATGAAAACTCTTGACAATATGCTTCTTTGCATCTGACCACTTGATACCTTGCGGGTCCAAATTCATTCTGTCTCAGCTTTACGGTAGAAGAAGTTTTCATAGAGTTCACCAAAGCGAGGCTCAATGAGGAAAGTCTCTCTAAGTCAGTGGTTCCCAGTAGTTCCACATCCCCCATCACATAAGGGAATGTTTCTTCCTCTGTTCTCTGATAACTGATTGTTGGGACAACTCCGGAGACATCAAAGTCCATAATCAAATCATAGCTGTTAAGGCAGATCACCTCCATATCAATTTTATAGTGGTCCACACTGATCCCAACATCCTTTAAAGCAGTGGTGGCCTTCAAAATGGTTTTCTGGAATATTGAATTGAGGATTTGATTCTTACTCAAACACTGGGAGGACTGTGTGATTCTAGATCTTAGCCTGTTGCCTCGCTCTCCCCATTTCTCGAGATCCCTCTTTGTTGCCTCCAAAGAAACTAGTCTATCTTTAACTCTTAAGAAGCAAGACCCCAACCACCCTTTTAAACACTTTTGTTTCATCAGGTCATGCTTACTTGCAAGGAGAATTAGTGCATCAAAAATTAATAGAAGTTTCCTCCTTGTGTTCAATATCCTCAAAGATTTTACTTTATTTAGGAATGATCTCCAGCATTGAACCTGACATTCTCCAATAGTTTGGTTTCCCCTTTTTTCATTCCCCTCATCAACATTTGCATACAAAAATCTCAATATTGGTGATGCTCTCTTGAACTGGTAAATTAAGTGTTCGATATTGTCTTCTGCAACTACCTTATCAGCGTACAAATTGTTAAGCTCATTAAGTAACTGGCTCTTATCAACCTTTAAAAACTGACCTTCTATCTCTCCTTTCCTCAATCTGTTCCTAAACACTTGATACTCCTCTTCGATCTGCAGCTTTACCTCATGAGCTGTTAATTTATTATTGATGCCCTGGTGGCATGAGGCAATCACTTCCTCATAATGATTAGAGCGATTGTCCATCAGAACATTTAAACTCTCCACCCCTGATAATCTACCCGAAGTCATGAATAAAGATTCACAGAGTCTGCTATACTCTGACTCTTCAAAAAGTGAATTACTCTCCTGTGCATACTTTAAAAGTGAGAAGAGCGTATCCCTCAACTTATCATTGACCCAGTCAGGTATTTGTTCATTGTAGAATGATGTTCTCCCGTCTATAAGTGGTATTAAATTGATGTCGACACTCTTCAGGTCTTCTTTCAGCTGCTCTAATTTTTTGAAGTCCTCAATGTACTTCTGCTCAAAGTTAGCAGGAGATGATCTAACAAAACACTCCAGCAGTATTAGAACATTGCCCGTCAGTTTGTAACCGTCCGGGTACCACAAACATAGTGAAGGTGTCAAGATTCCATGGTCATGGAGAATTCTTTCCACAGATTTGTCCTCACTGTTATGCTCGCAACCATTTGCGTTGCAAGAATCAACCTCAATACAGAGGGACAAGAGTTTCAACCCTTCCATTAATAGCATCCTAGGCTCTGTCTGCACAAGAAATGCTAACTTCTGTCTTGACAATCTCTCGTTGTCCACTAGGTATTTTGATACTAAGTCTTTGACACAGGCTATGTCTTCCTCCATGTTTAGCTGCAGGTATGATGTTCAGAACCCTCAGAACATGTGGTCTGCTAGAGCAACAGTTCGCTATGGGATAGGGTCCCGTAGGGGCACAGAAGACACAAGAGGCAATTAAAGACAATTAAATAAGATAGCCTTAATGCCTAGGATCCTCGGTGCG
| 8,812
|
OL774856.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Davis,C., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,286
|
GenBank
| null |
Sierra Leone
|
Sierra Leone
|
Homo sapiens
| null |
2003
| null | null |
Lassa mammarenavirus strain D501 segment L, complete sequence
|
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| 21,256
|
OL774858.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Davis,C., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
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ssRNA(+/-)
| 7,183
|
GenBank
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Nigeria
|
Nigeria
|
Homo sapiens
|
blood
|
2009
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Lassa mammarenavirus strain P09/282 segment L, complete sequence
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| 21,257
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OL774862.1
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Mammarenavirus lassaense
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Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Davis,C., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
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University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
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United Kingdom
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2022-12-10
| null |
Mammarenavirus lassaense
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
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ssRNA(+/-)
| 7,242
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GenBank
| null |
Mali
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Mali
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Homo sapiens
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blood
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2009-02
| null | null |
Lassa mammarenavirus strain Mali 2009 segment L, complete sequence
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| 21,258
|
OM791219.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-13
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,275
|
GenBank
| null |
Sierra Leone: Barlie
|
Sierra Leone
|
Mastomys natalensis
| null |
2020-02-05
| null |
PRJNA780418
|
Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis/SLE/2020/Barlie-00512 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCAATTTGGTTGTTCTTTTTTGAAGCCTTTTGTGTTCAACTCCACCCAATGGGCAACAAACAAACCAAGGCTCCAGAAACAAAAGACAGCCCAAGGGCCAGTCTGATCCCAGATGCCACGCATCTTGGGCCACAGTTCTGTAAGAGCTGTTGGTTCGAGAACAAGGGCTTAGTCGAGTGCAATAATCACTACCTATGCCTCAACTGTCTCACCCTACTCTTGAGTGTCAGCAGCAGGTGCCCCATCTGCAAAATGCCTCTTCCCACAAGGCTGAGGCCATCAGCTGTCCCAACAGCACCTCCAGCCAGGACAGGAGACAGCATCAGACCCCCACCCTATAGTCCCTGAACCGCCCACCAACTCCCACCACCCTCACTCCCCCCGACACCCCCCGGGGGGACCCCCCGCCGGGGGCCCCCCCGGGGGAGCCAGCCACCTCCAAGGAATCACTCAATATCCTCAACATGCTCGTCCGCTTCAGTCAACTCTTCACATGTCCTGCCCTTTAATCTTAGTCTGCCACTGCTTGATTGCACCATCACCCTCCTCTTTGACTTGCTGTAGCAGAGAGCATAACCCTTGAATTCCACCCAATTGTCCACCGCCTCAAGAACCGCACTCAGGATCTCTGCACTATCTGGTACTGCAGCTCTCAGTGTGGAGACAATGTCTACCCCTGACCACTGCATCCTTAACCCCAGCCTGTCTATCATCATGTCACTCAGCGCCCCAATCAACAGGTCAGTTGAAGTGTCCCCAACCTCTTTCACAAATATCTCAAGATCCTGATCCTGTATAACAGGTGAAAAAGATGCCAATTTCTTCTCACATTCCCACAAACTTCCCCTGTTGACAACCAGAGGGACTGGTTCAGTGCAAGGGCCTACCAAAACAAAGTCATACTCCGTAAACTGCAGCTTCTCCATATCAACAACAATTTCAACAGGAGTCACATACCCCAGTTGATTTGTGTCAACCAAAAACTCATTGATGACCTCAGTATCAACATACCATGCTGATTTGCCTTTAAAAGTGGGTCCTGACAAAACCAGCCTCCAACAGTCTGACAAAACACATGGGCTTACTGCACCAGAATACATGGCAACTAAGTCATGCACCAGATATTTGGCTTGATGATTCATCGAGCCAGTATAATCAAGATGGATGGCAAAGCTTTCCTTAAAACTAGCATCTTGACTTTTGATACGAAACCTTACTGTCTGACTCAGTTTTGCAGATCCCGAAGGCAATGACGCAACAGCATCGAAGAAATCCTCTAATGAATCAAACTTGGAATCAACCAAACCCGATGCAATCAATTGATTTTGATTAAATCTGGCTGGTTCAATGTCAAAGTCTATCCAGGCATAACCCATCATCAGATCATGTTTGAACATTGGTCTTTCAATACCTTTGTGAATAACTTTCTCCACGAATGAAGAAAATGGACCCATTCTATGCAATCCTTCACCCTCTGGAACCGATGTTTTATGTGGAAACCACGTGAAGGACCCTAGTGTTCTCGTTGTTGCAACAAATGGTCTCACATAGGACTCAAAATAAATCTGCCTCATAAAGTTGTCAACAGCATCACTGGTACTTACCACCCTTTCCTCCACCATGGGCTCATGTGTTCTAGTATGGGACAATCTCAATTCAGATGATAACACAATGTAATGTTCTTCTCTCTTCCACTTTACTATGTGTGAGACAAGAGATAAGGCCTCACAGTTAACATCCAATGCTACGCAGAGATCCAGAAATTTTATCCTGGGTGACCACTTCATTTTGGTTGATGCTAAATCACTCATAAATGGCAATATGTGCTTTTCAAACACAGATGGGTACAACCTTCTCAAGGAATGAATGATATGATTCAAGCCAACCCTATCCTCCAATAATTTTGATGCAGTTGGCTTCAAAGGGAAATAGTCACAAGGATTGTGTTTGAAAAAGTCCAGTGCCTTGGTCGTCTTTGGTTCACCTAGGACCCATGCACCCAGTTCTATTGCAGTTGACAGGGAAATGCACATATAATCCCATAATAAGGGTCTGAAGTAACCAACCACACTTTCACTCCCACTTCTAAGGCCCAATGGAACCCGCCAGTATTGAACACCATTGGGACTTGTCAACAATTCGATCCCCTGGACACCAGAGATTAAAGACTGTATAGACTTAATGTACAGATTCTCTTTGTTTGGCCCCCGTACGCACTTGCTACCCAATGTTCTGCATAAACCTACAAAGCCAGATGCAATAGAACTTTGAAATGCAGATTTGTTGATAGCTTCAGACAACAATTTTTGTGCACCCCGAGTGAAGGTAGAAGATAACTTATTTTGGATCGTCTTGACAATAGTGGGAATTTTCTCATCATCTAAGTTCACAGCACCTGAATATATTATCTTTTGCCTCAATACCATCCTTAAAGGATGGTGTGCAGCCAAATTTAGCCAAGAATACTCAAGGTCAGACTCAGATGGGGGCTCAACATTTAGCAGTTCGCAGAGATTTCTTAGTGAAGAGAGGTGCTCACTAGACAGATAGTTTGTTGTGAACTCCTCATGGAGTTGTCCAGTTTTCAACCTATTGTACAGCTTTCTTAACATGGATCTAATCTTGCCACAAGCATCAGGAATTAATCCCTCTATTTGCCTCATAATCCTGTAACTACGGTTGCCATCTACCCAATCTCTGACATCTGTCTCACAGTTCAATAAGAATGGATCAATAGGGTATCTAGCATACTGTAGAAGGCTTAAGGTTCTTTTCTGTATTAGGTTGCACAGCTGAACAGGGACACCATTTGCAACTGACTGATCAATAATTGTATCGATTGTTTCTGCCAACTGGTGTGGCTCTTTACACTTAATATTATGAAGGGCTGCAGCAACAAATTTTGTTAATAATGGCACTTCATCTCCCCAAACAAAGAACCTAGATTTGAATTCTGCAACAAACCTGCCAATAACACTTTTAGGGCTTACAAACTTGTTGAGTTGATCACTCATGTAATAATGAAATTCCATCAGGGTCCTGAATTCCTCTGGGTCCCTTTGTAATAATTCTGTGAGAGCTTGATCAAAGAGGGAAATTTGATCATCACTGGAGGTGTAAGCATCTATTGTGCCACCACATATGCAACTAATTGCATAATTAATGAACCTCTCTGAAATGAGGGCATAAAAATCTGATGTGTTGTGCAATATTCCTTGACCCATGTCAAGTATTGAACTAATGTGAGAAGGCACCACACCAATTTGGAAATTGGAATAGAAGAAGTCCTCTGTTATTGATTGTTTAGTCTTTTTTCTTAACCCCAGCTGAGCTTTAATGAATGACTTCATCATGGCCGACACCACATTGAATGGAATTTCCACCAATTTGTGCATGTGCCACATAAGTAGGGTTGAAAGGTAGTCTCTCCCTTTGATGTCAGCTTGCAGGTCTTTTGAAAGAAATATCAAGTTTTGTAAAACAGTCAGAAATAAAAATGGACACATCATCGGACCCCATTTACTGTGATCCATGCTATAAGAAACATGTGCCAAAGAAACATTCAATTTCATGGATAGGATGGCATTTTCAAACTCCTTTTCGTTATTCAAACAGCTCCCTGATAACTGCAGGCTTAGAGCTTCAAAGTAGTCTTCTATAAGTCTAGTGAACATTTTCGTCCTAAGATCACCAATGTACAGTTCTCTGTTGCCACCAACTTGTTCCTTATATGATAAAGAGAATTTAAGCCTCCCTGTATCAGGCCCTATTGAATCATAAGACTGAGGTGACTCTTGGCTATAAAAACATAAGTTCTTTAACATTGCTGTTGTGCAGTTTGTTAATGATAAAGCCTTACTGAGTGCTTCTGAGTTACTTTCCCTTTCACTGATTCTCACATCATCAGAGAGTTTGCCCATATCAAACTTGAAATTGAGGTTTCTTGACTTATAGTGAGTGTACCTCCCCATAAGTGTATTTGCATTCATAATCAAAAGTATAGACTTGAAACATTGAAAGTACTCATGATCAAAGTATGTCCTTGTTGAAACTGCTTTTGTTAACTCCCCGATTGGACATTGTGACATATGTCCACAGTAGAAATATTTCTCCTTCAGCCTACTATTTTCATAAACAGCATTACAAAATTCCTCATAAAACTTATCTGGTAAGACATCATGATCAAAATCCTCAACCATATGGTTGGATAATTCACCCTTGATCAACCTGATGTGAAACTTGTTTGAAACAATTTCATCTAGGTCACTTATTGACGGCCGGTTCCCATCATTGGGGCATGAGCTCAGTTTGACAGGCTCCCTGTACTGATCAACAATTCTCTCGACGGTATCCCTCAGCTGATCAAAGTAAATGCTTGCGCCGCCATCGAGCAGAATTTCATCTAGGTCAGCCCTATCAACATCACTTTTGTGCTGCCCGGACCCTAGAACTAGATTGCTCATTGCCTGTTGCACTTTATACTCATAGTCCTGCTTGTTGAGGAGGTGTTTTCCCTTCCTTGAAAAGACTTCAGTGAGTTGTGACACAGCCAATGCCGTGAGCTTATTGAAGTCATAGTTTAATATCCTAGATCCATCTGTGTATTTGTTGACAACAACACTTTTATTGCTAGCTAAATCTAAGGCTGTAGCACAGCCACTTGTGATGAGGGGGTCTCTAATTTCTTTCTTTACTTCCTTTTCCTTAAACAGTGAACCATTGTTGAAAGAAGATGTGAGGAGGGATAAGAACTTCTTAGAGACACCAGGGCTTTTATAATTGGGTCCTTTAATGCTTGTACACCCCTCTTTGCTCAAAAACTTCCTTGCGTTGTAAACCATGTCATCCAGCTCTTCCTCCGTGGCTGTGTCTGCAGGATTAATACTTACGTGACCAAATTTCACTTTTGGCTCAAGAAACTTCTCAAAACATTTTATCTGGTCTGTCAACCTATCTGGTGTCTCCTTTGTGATGAAATGGCAC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| 28,868
|
OM791225.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-13
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,280
|
GenBank
| null |
Sierra Leone: Kamasseh
|
Sierra Leone
|
Mastomys erythroleucus
| null |
2019-04-17
| null |
PRJNA780418
|
Mammarenavirus lassaense strain M.erythroleucus/SLE/2019/Kamasseh-08476 segment L, complete sequence
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|
OM791229.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-13
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
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Arenaviridae
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ssRNA(+/-)
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|
GenBank
| null |
Sierra Leone: Kapethe
|
Sierra Leone
|
Mastomys natalensis
| null |
2019-05-29
| null |
PRJNA780418
|
Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis/SLE/2019/Kapethe-08499 segment L, complete sequence
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Mammarenavirus lassaense
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Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
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University of Glasgow, Centre for Virus Research
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2022-07-13
| null |
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Mammarenavirus
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Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis/SLE/2019/Kapethe-08503 segment L, complete sequence
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| 28,871
|
OM735969.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,279
|
GenBank
| null |
Sierra Leone: Bafodia
|
Sierra Leone
|
Mastomys natalensis
| null |
2019-11-06
| null |
PRJNA780418
|
Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis-wt/SLE/2019/Bafodia-00303 segment L, complete sequence
|
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|
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|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
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Arenaviridae
|
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|
GenBank
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Sierra Leone
|
Mastomys natalensis
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2019-10-27
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Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis-wt/SLE/2019/Largo-00292 segment L, complete sequence
|
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| 29,166
|
OM735973.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,285
|
GenBank
| null |
Sierra Leone: Largo
|
Sierra Leone
|
Mastomys natalensis
| null |
2019-10-27
| null |
PRJNA780418
|
Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis-wt/SLE/2019/Largo-00291 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCAATTTGGTTGTTCTTTTTTGAGGCCTTGTGCGCTGAACTCCTCCAAATGGGAAACAAGCAAGCCAAAGCCCCAGAACCAAAGGACAGCCCGAGAGCCAGCCTGATCCCAGATGCCACACATCTAGGGCCGCAGTTCTGCAAGAGCTGTTGGTTCGAAAACAAGGGCCTAGTTGAGTGCAACAACCACTATCTGTGTCTCAACTGCCTCACCCTACTCTTAAGCGTCAGCAACAGGTGCCCCATTTGCAAGATGCCCCTCCCTACAAAACTGAGACCATCAGTTGCTCCAACGGCGCCCCCATCCGGAGCAGCGGACAGCACCAGACCCCCACCCTACAGTCCCTAAACATCCCACCGACCCCCACCACCTCCATCCTCCCCCCGACACCCCCCGGGGGGACCCCCCGCCGGGGGCCCCCCCGGGGGAGCCAACCATCACCAGGAGACTACTCAATGTCCTCAATGCATTCATCCTTCCAGGTCAACTCCTCACATGTTCTGCCCTTCAATCTTAATTTACCACCACTTGACTGTACCATCACCTTCCCCTTTGACTTACTATAACAGAGAGCATAACCTTTGAACTCCACCCAGTTGTCCACTGCCTCAAGAACCGCACTCAAGATTCCCTCACAATTCGGCGCTGCAGCTCCAAGTGTGGAGACAATGTCCACCCCCGACCACTGCACCCTCAACCCCAGTCTGTCTATCATCATATCACTCAACGCCCCAATCAATAGGTCAGACGAAGTGTCCCCAACCTCTCTCACAAACACTTCAAGATCCTGATCTTGTATAACAGGTGTAAAGGATGCCAATTTCTTTCCACATTCCCACAAGCCTCCCCTATGCACAACCAGAGGGGCTGGCTCAGTACAAGGACCCACCAATACAAAGTCATACTCCGTAAACTGCAGCTTTTCCATATCAACAATAATCTCAACAGGGGTCACACACCCTAGTTGATTTGTGTCAATTAAAAATTCATTAATGATCTCTGTGTCAATATACCATGCTGATTTGCCCTTGAAAGTAGGTCCTGACAAGACCAGTCTCCAACAGTCTGACAAGACACACGGACTCACTGCACCTGAGTACATAACGGTAACATCTTGTACTAAATACTTGGCCTGTTGATTCATTGAGCCAACATACTCAAGGTGGATGGCAAAGCTTTCCTTAAAACTAGCGTCCTGACTCTTAACACGGAATCTCACTGTCTGGCTCAGTTTTGCAGACCCTGGAGGTAGTGAAGCCACGGCATCAAAGAAATCCTCCAATGAGTCAAATTTTGGGTCAACTAAACCTGATGCGATCAATTGATTTTGATTGAATCTAGCTGGCTCAATATCAAAGTCTATCCAAGCATAACCCATCATCAGATCATGTTTAAACATTGGCCTTTCAACACCTTTATGAATAACTTTCTCTACAAATGAAGAGAATGGACCCATTCTATGCAACCCTTCACCCTCTGGAACTGATGTCTTGTGTGGAAACCACGTAAAGGAACCCAATGTTCTTGTAGTCGCAACAAATGGTCTCACATAAGACTCAAAATAAATTTGCCTCATGAAATTGTCAACAGCATCACTAGTGCTCACAACTCTTTCCTCCACCATGGGTTCATGTGTCCTACTGTGAGACAACCTCAATTCAGATGATAACACAATGTAATGTTCCTCTCTTTTCCATTTCACTATATGTGAGACAAGGGACAAGGCTTCACAGTTAACATCCAACGCTACACAGAGATCTAGAAATTTTATTCTAGGTGACCACTTCATTTTGCTTGACGCTAGATCACTCATGAATGGTAATATATGTTTCTCAAACACTGATGGGTACAATCTTCTCAGAGAATGAATGATGTGATTCAAACCAACCCTATCCTCCAATAATTTTGATGCAGTTGGCTTTAAGGGGAAATAGTCACAAGGGTTATGCTTGAAAAAATCCAACACCTTAACTGTCTTAGGTTCCCCTAAAACCCATGCACCCAGTTCTATTGCAGTTGATAAAGAGATGCACATATAATCCCATAACAAGGGTCTGAAATAACTGACCACACTTTCACTTCCACTCCCGTTTCTAAGTTCTAGCGGAACCTGCCAATATTGAATGCCATTAGGATTTGTCAACAATTTGATTCCCTTGACATCAGAAATTAGAGACTGAATGGACTTAATATACAGATTCTCTTTATTTGGTCCCCGAACACATTTGCTACCCAGTGTTCTGCATAATCCCACAAAGCCAGATGCAATGGAACTCTGGAATGCAGACTTGTTGATAGCTTCAGATAGCAATTTTTGCGCACCTCGAGTGAAAGTGGAAGACAACTTATTTTGGATTGTTTTGACAATGGTAGGAATCTTCTCATCATCTAGGTTCACAGCACCTGAGTATATTATCTTTTGTCTCAACACCATTCTTAAAGGATGATGCGCAGCCAAATTTAACCAAGAATACTCAAGGTCAGACTCTGATGGGGGCTCAACATCCAACAGCTCACAGAGATTTCTTAGTGAAGAAAGGTGCTCACTAGACAAATAGTTTGTTGTGAACTCTTCATGAAGTTGCCCAGTCTTCAACCTATTGTATAGTTTTCTCAACATAGATCTAATCTTGCTGCAAGCATTAGGAATCAATCCCTCTATTTGCCTCATAATTCTGTAACTACGGTTGCCATCTACCCAGTCTCTGACATCTGTCTCGCAATTCAATAAGAATGGGTCAATAGGGTATCTTGCATATTGTAATAGACTTAAGGTTCTTTTCTGTATTAAATTGCATAAGTGAACAGGAACACCATTCGCAACCGACTGATCAATGATTGTGTCGATTGTTTCTGCCAGTTGGTGTGGCTCTTTACACTTTATATTGTGAAGAGCTGCTGCAACGAACTTTGTCAATAATGGCACCTCATCTCCCCAAACAAAAAATCTAGATTTAAACTCTGCAACAAACCTGCCAATGACACTCTTAGGGCTCACAAACTTATTGAGTTGATCACTCATATAATAGTGGAACTCTAATAGAGTCCTAAATTCTTCTGGGTCTCTTTGCAAAAGCTCTGTGAGAGATTGATCAAAGAGAGAAATTTGATCATCACTAGAGGTATAAGCATCTATCGTACCACCACATATACAACTGATAGCATAATTAATAAACCTCTCTGAAATGAGGGCATAAAAATCTGATGTGTTGTGTAATATTCCTTGACCCATGTCAAGTATTGAACTGATGTGAGAAGGCACAATACCGACCTGGAAATTAGAGTAAAAGAAATCCTCTGTTATTGACTGTTTAGTTTTCTTCCTTAACCCTAGTTGAGCTTTAATGAAGGATTTCATCATAGCTGTCACCACATTAAAAGGTATTTCCACCATTTTGTGCATATGCCACATAAGTAGGGTTGAGAGATAGTCCCTCCCTTTAATATCAGCTTGTAGGTCTTTTGAAAGAAAAATTAAATTCTGCAAAACAGTCAGGAATAAAAATGGACACATCATTGGGCCCCACTTACTATGATCCATGCTATAGGACACATGTGCCAATGAAACATTCAATTTCATGGAAAGGATAGCATTTTCAAATTCCTTCTCGCTGTTCAGGCAACTTCCTGATAACTGTAGGCTTAGAGCTTCAAAGTAATCTTCTATAAGTCTAGTAAACATCTTTGTCCTAAGATCACCAATATATAATTCTCTGTTGCCACCCACTTGTTCTTTATATGACAAAGAAAACTTAAGCCTTCCCGTGTCAGGTCCCACTGAGTTATAAGATTGCGGGGACTCCTGGCTATAGAAACACAAATTCTTTAACATTGCTGTGGTACAGTTTGTCAGTGACAGAGCCTTACTAAGTGCTTCTGAGTTGCTCTCCCTTTCACTAATTCTTACATCATCAGAGAGCCTACCCATATCAAACTTAAAATTAAGGTTCCTTGATTTGTAATGAGTGTACCTACCCATAAGTGTATTTGCATTCATGATCAACAGTATGGACTTAAAACACTGAAAGTATTCACGGTTAAAGTATGTCCTTGTTGACACTGCCTTTGTCAACTCCCCAATAGGACACTGTGACATATGTCCACAGTAAAAATACTTTTCTTTCAATCTACCATTCTCATAGACAGCATTACAGAAATCTTCATAAAATTTGCCTGGCAAGATATCATGATCAAAGTCCTCAACCATGTGATTAGACAATTCACCCTTGATCAACCTAATGTAAAACTTGTTTGAGATGATCTCATCTAAATCATTTATTGATGGCTGGCCATCACCATTGAGGCCTAAGCCTGGCTTGACTGGTTCCCTATACTGATCAACAATTTTTTCAACAGTCTCCTTTAGCTGATCAAAATAATCGCTTGCACCTCCATCGAGCAAAATTTCATCTAGGTCAGCCCTATCAGCATCACTTTTAGGCTGCCCAGATCCTAGAACCAAATTGCTCATTGCCTGCTGAACTTTGTATTCATAGTCTTGCTTGTTGAGAAGGTACTTTCCTTTTCTTGAGAAGACTTCAGTGAGCTGCGACACGGCCAGTGCTGTGAGCTTATTGAAGTCATAGTTTAATATTCTAGAACCATCTGTGTATTTATTAACAACAACACTTTTGTTGCTGGCTAAATCCAAGGCTGTGGCACAGCCACTGGTGATGAGAGGATCTTTGATTTCCCTTTTTACCTCCCTCTCCTTAAATAGTGAACCATTATTAAAAGAGGATGTAAGAAGAGATAAATACTTCTTTGAAACACCAGGTCTTTTATAGTCTGGTCCTTCGACACTTGTGCATCCTTCTTTACTTAAAAACTTTTTTGCATTGTAGACCATATCATCCAATTCTTCCTCAGTGGCTGTGTCTGCAGGATTGATGCTCACATGACCAAATCTCACCTTTGGTTCCAGAAACTTCTCAAAACATTTTATCTGATCTGTCAATCTATCTGGTGTTTCTTTCGTGATGA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| 29,167
|
OM735975.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
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Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,240
|
GenBank
| null |
Sierra Leone: Barlie
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Sierra Leone
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Lophuromys sikapusi
| null |
2019-10-11
| null |
PRJNA780418
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Mammarenavirus lassaense strain L.sikapusi-wt/SLE/2019/Barlie-00241 segment L, complete sequence
|
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| 29,168
|
OM735977.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,282
|
GenBank
| null |
Sierra Leone: Kapethe
|
Sierra Leone
|
Mastomys natalensis
| null |
2019-10-03
| null |
PRJNA780418
|
Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis-wt/SLE/2019/Kapethe-00217 segment L, complete sequence
|
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|
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|
Mammarenavirus lassaense
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Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
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University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
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Arenaviridae
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PRJNA780418
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Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis-wt/SLE/2019/Kapethe-00214 segment L, complete sequence
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| 29,170
|
OM735981.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,279
|
GenBank
| null |
Sierra Leone: Bafodia
|
Sierra Leone
|
Mastomys natalensis
| null |
2019-09-08
| null |
PRJNA780418
|
Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis-wt/SLE/2019/Bafodia-00204 segment L, complete sequence
|
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Mammarenavirus lassaense
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Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
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University of Glasgow, Centre for Virus Research
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|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
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Mammarenavirus
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|
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Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis-wt/SLE/2019/Bafodia-00187 segment L, complete sequence
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| 29,172
|
OM735987.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,276
|
GenBank
| null |
Sierra Leone: Bafodia
|
Sierra Leone
|
Mastomys natalensis
| null |
2019-09-07
| null |
PRJNA780418
|
Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis-wt/SLE/2019/Bafodia-00106 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCAATTGGTTGTTGTTCTCCTTTGAGGCCTATCACTTTGAACTCCAACAAATGGGGAACAAACAAGCGAAGGCTTCAGAACCAAAGAACAGCCCAAGAGCCAGTCTGATTCCAGATGCTACACACCTAGGGCCACAATTCTGCAAAAGCTGCTGGTTTGAAAACAAGGGCCTGGTCGAGTGCAACAATCACTATCTGTGTCTCAACTGCCTCACTCTACTTCTGAGTGTCAGCAGCAGGTGTCCCATCTGCAAAATGCCCCTCCCAACAAAACTGAGGCCATCAGCCGTCCCAACAGCACCCCCAGCCAGAGCAGCGGACAGCATCAGACCACCACCCTACAGCCCCTGAACCCCCCAACAACCCCACCATCCTTCCTCCCCCCGACACCCCCCGGGGGGACCCCCCGCCGGGGGCCCCCCCGGGGGGGATCAACCACCTCCAGAGATCTACTCGATGTCCTCAATGCGCTCGTCCCTCTCGGTTAGTTCCTCACATGTTCTGCCCTTCAATCTCAATTTGCCACTACTAGACTGCACCATCACCCTCTTTTTTGATTTGCTGTAGCAGAGAGCATAACCCTTGAACTCCACCCAATTGTCCACTGCCTCAAGAACTGCACTCAGAACCCCCGTGCTGTTCGGTGCCGCAGCCTTCAGCGTGGAGACGATGTCCAGCCCTGACCACTGCATCCTCAACCCAAGCCTATCCGACATCATGTTACTTAACGTCTCAGTCAATAGGTCAGATGAGGTGTCCCCAACCTCTCTCACAAACATCTCGAGATCCTGATCTTGTATAATGGGCGTGAAAGACGCCAACTTCTTGTCACATTCCCATAGACCCCCCCTATATACAACCAGTGGGACTGGCTCAGCACAAGGGCCCACTAATACAAAGTCATACTCTGTGAATTGCAACTTCTCAATGTCAACAATAATTTCAACAGGGGTCACATGCCCTAGTTGATTTGTGTCAACCAAGAACTCATTGACAACCTCAGTGTCAACATACCATGCTGACCTACCCTTAAAAGTGGGTCCCGACAAAACCAACCTCCAACAATCTGTCAAGACACATGGACTCACTGCACCAGAATACATAACGATCACATCATGCACTAAGTACTTGGTCTGCTGATTTATTGAACCAGTGTATTCAAGGTGGATGGCGAAACTTTCCTTGAAACTAGCATCTTGACTCTTTATGCGGAACCTCACTGTCTGACTCAATTTTGCAGATCCTGGGGGCAACGAGGCAACAGCATCGAAGAAATCTTCTAATGATTCAAACTTAGAATCAACTAAACCTGACGCAATTAGTTGATTTTGGTTAAACCTGGCTGGTTCAATGTCAAAATCTATCCAGGCATAACCCATCATCAAATCATGTTTGAACATCGGTCTTTCAATACCTTTATGAATAACCTTTTCTACGAATGAAGAAAATGGACCCATTCTTTGCAATCCCTCACCCTCCGGGACCGATGTCTTATGTGGAAACCACGTGAAGGATCCCAATGTTCTTGTTGTCGCAACAAATGGTCTTACATAAGATTCAAAGTAGATTTGCCTCATGAAATTGTCAACAGCATCACTAGTACTCACCACTCTTTCTTCCACCATTGGTTCATGTGTTCTGGTGTGAGATAGCCTTAATTCAGATGACAATACAATGTAATGTTCCTCTCTCTTCCACTTAACTATATGTGAAACAAGAGACAGAGCCTCACAATTGACATCCAATGCCACACAAAGATCCAGAAATTTTATTCTGGGTGACCACTTCATCTTGGTTGATGCTAAATCACTCATAAATGGTAATATGTGTTTCTCAAACACAGACGGGTACAACCTTCTTAGGGAATGAATGATGTGGTTTAGGCCAACTCTATCCTCCAATAGTTTTGATGCAGTTGGTTTCAAAGGAAAATAATCACAAGAGTTGTGCTTAAAAAACTCCAATGCCTTAACCATCTTGGGTTCTCCCAAAACCCATGCACCTAATTCTATTGCAGTTGACAAGGAGATGCACATATAATCCCACAACAAGGGTCTAAAGTAACTAATCACAGTTTCATTTCCATTTCTAAGGTCTAGTGGGACTTTCCAATATTGAACACCACTGGAATTGGTCAATAATTCAATTCTCTGAACATCAGAGATTAGAGACTGGATAGACTTAATATACAGATTCTCCTTATTTGGCCCTCGAACACATTTGCTACCCAATGTCCTACACAATCCAACAAAACCAGATGCAATGGAACTCTGAAATGCAGACTTGTTTATAGCTTCGGATAATAATTTTTGTGCACCCCTAGTGAAGGTAGAGGACAACTTATTTTGAACCGTCTTGACAATAGTGGGAATCTTTTCATCATCCAGGTTCACAGCACCTGAGTATATTATCTTCTGCCTCAACACCATTCTTAAAGGATGATGCGCAGCCAGATTTAACCAAGAATACTCAAGATCAGATTCAGACGGGGGCTCGACATCCAGCAACTCACATAGGTTTCTTAGTGAGGAGATGTGCTCACTAGACAAGTAGTTTGTTGTGAATTCTTCATGAAGTTGCCCAGTCTTCAATCTATTGTAAAGTTTTCTTAACATGGATCTAATCTTGCTACAAGCACTAGGAATTAATCCTTCTATTTGCCTCATAATTCTATAACTACGGTTGCCATCCACCCAATCTCTAACATCTGTCTCACAATTCAACAAGAACGGATCAATGGGGTATCTAGCATATTGCAAAAGACTCAAGGTCCTTTTCTGTATTAGATTGCACAAATGAACAGGGACACCATTTGCAACTGATTGATCAATGATAGTGTCGATTGTTTCCGCTAGTTGATGTGGCTCCTTGCATTTTATGTTATGAAGGGCTGCAGCAACAAATTTTGTTAACAATGGTACCTCATCTCCCCAGACAAAAAATCTAGATTTAAATTCTGCAACAAACCTACCAATGACACTCTTCGGGCTCACAAACTTGTTGAGTTGGTCACTCATGTAATAGTGGAACTCCATTAGAGTCCTAAATTCTTCTGGGTCTCTTTGCAAGAGCTCTGTGAGAGTTTGATCAAAGAGGGAGATTTGATCATCACTAGAAGTGTAAGCATCTATTGTGCCACCACATATGCAACTGATTGCATAATTGATGAACCTCTCTGAAATGAGGGCGTAAAAGTCTGATGTGTTGTGTAATATTCCCTGACCCATGTCAAGTATTGAACTGATATGGGAGGGCACCACGCCGATTTGAAAATTGGAGTAGAAGAAATCTTCTGTTATTGACTGTGTAGTTTTTTTCCTCAACCCCAATTGAGCTTTAATAAACGACTTCATCATAGCTGACACCACATTGAAGGGTATTTCCACCATCTTGTGCATGTGCCACATAAGCAAAGTTGAAAGGTAGTCCCTCCCCTTTATGTCAGCTTGTAAGTCCTTTGAAAGGAAAATCAAGTTCTGCAGGACAGTCAAGAACAGGAATGGGCACATCATTGGGCCCCACTTACTATGATCCATACTATAAGAGACATGTGCCAAGGAAACATTCAGTTTCATGGAAAGGATGGCATTTTCAAATTCCTTTTCATTGTTCAAACAACTCCCTGATAATTGTAGACTCAGTGCTTCAAAGTAATCCTCTATAAGTCTAGTGAACATCTTTGTCCTAAGATCACCAATATACAACTCTCTGTTGCCACCAACTTGTTCCTTATATGATAAAGAAAATTTGAGCCTCCCTGTGTCAGGACCTACTGAGTTATAAGACTGCGGTGATTCCTGGCTGTAAAAACACAAGTTCTTTAACATTGCTGTAGTGCAATTTGTTAATGACAGAGCTTTACTAAGTGCTTCCGAGTTACTTTCCCTTTCACTAATCCTAATGTCATCGGAGAGTTTGCCCATATCAAACTTAAAATTAAGGTTTCTTGACTTATAATGAGTATACCGCCCCATGAGTCTGTTTGCATTCATGATCAAGAGAATAGATTTAAAACACTGAAAGTATTCATGATCAAAGTATGTCCTAGTTGACACTGCCTTTGTCAACTCCCCAATAGGACATTGTGACATGTGTCCACAGTAAAAGTACTTCCCCTTCAACTCATCATTCTCATAGACGGCATCACAAAATTCCTTGTAGAAGTTATCTGGTAATACATCGTGATCAAAATCCTCAACCATATGATTTGATAGTTCACCCTTAATCAACCTAATATAAAATTTGTTTGAGACAATCTCATCCAGATCATTAATTGAAGGCTGATTATTGCCATCAGGGTCTGAGCCCGGTTTGACAGGTTGCCTATACTCATCAACAATTTTCTCAACAGTCTCCTTCAGCTGATTGAAATAGACACTTGCACCTCCATCAAGCAAAATTTCATCTAGATCAGCTTCACCAACATCAGCTTTATGTTGTCGAGACCCTAGAACTAAATTGCTCATAGCCTGTTGCACCTTATATTCATAGTCCTGTTTGTTAAGAAGATGTTTTCCTTTCCTTGAAAAAACTTCAGTGAGCTGTGACACGGCCAATGCCGTGAGCTTATTAAAGTCATAGTTTAATATCCTAGATCCATCTGTGTATTTATTAACAACAACACTCTTATTACTAGCTAAATCTAAGGCTGTAGCACAACCACTAGTGATAAGGGGGTCTCTGATTTCCTTCTTCACCTCCCTTTCCTTGAATAGTGAACCATTATTAAAGGAGGATGTGAGGAGGGATAAAAACTTCTTTGAGACACCAGGCCTTTTGTAGTTTGGTCCCTCGACGCTTGTACATCCAGCCTTACTCAAAAACTTTTTTGCATTGTAAACCACATCATCCAACTCGTCCCTTGTGGCTGTATCTTCAGGGTTGACACTCACATGGCCAAATCTTACCTTTGGTTCCAGGAACTTCTCAAAACATTTTATCTGGTCTGTTAGTCTATCTGGTGTTTCCTTTGTGATAAAGTGGC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| 29,173
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|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
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|
GenBank
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|
Sierra Leone
|
Mastomys natalensis
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Mammarenavirus lassaense strain M.natalensis-wt/SLE/2019/Makump-00052 segment L, complete sequence
|
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| 29,174
|
OM735991.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Ghersi,B., Vucak,M., Nichols,J., Bangura,J., Davison,A.J., Bird,B.
|
University of Glasgow, Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-07-02
| null |
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,265
|
GenBank
| null |
Sierra Leone: Barlie
|
Sierra Leone
|
Lophuromys sikapusi
| null |
2019-07-13
| null |
PRJNA780418
|
Mammarenavirus lassaense strain L.sikapusi-wt/SLE/2019/Barlie-00019 segment L, complete sequence
|
CGCACCGGGGATCCTAGGCAATTTGGTTGTTCTCTTTTTAAACCTTGTTTACTGCATTCCACCAAATGGGGAACAAGCAAGCCAAAGCACCAGGAGCAAGAGACAGTCCGAGAGCCAGTCTGATCCCAGATGCCACACACTTAGGACCACAATTCTGTAGGAGCTGCTGGTTTGAAAACAAGGGTCTGGTCGAGTGCAACAATCACTATCTGTGTCTCAACTGCCTCACCCTACTTTTAAGTGTCAGCAGCAGGTGTCCTATCTGTAAGATGCCCCTCCCCACAAGACTGAGACCATCGGTTGCCCCAACGGCACCCCCAGTCGGGGCAGGGAGCAACACCAGACCCCCGCCCTACAGCCCCTGAACTGTCCACCAATCCCCACCACCCTTCCTACCCCCCGACACCCCCCGGGGGGACCCCCCGCCGGGGGCCCCCCCGGGGGAGCCAGTCACCCTCGAAGGACTACTCAATGTCTTCAACGCGTTCATTCTCCTCAGCCAACTCCTTACATGTTCTACCTTTCAGTCTTAATTTGCCGCTACTTGATTGCACCATCACCATCTTTTTTGATTTACTATAGCAAAGAGCATAACCCTTGAACTCCACCCAATTGTCCACTGCTTCAAGAACTGCACTCAAGACTTCTGCACCATTTGGCATTGCAGCCCTCAGCACGGAAACAATGTCCACTCCTGACCACTGCATTCTTAACCTCAGCCTATCTATCATCATGCCACTTAATGCCTCAATCAACAAGTCAGATGAAGTGTCCCGAACTTCTCTCACAAACATGTCGAGGTCCTGATCCTGTATAACAGGTGTGAAGGATGCCAACTTCTTTCCACATTCCCACAAGCATCCTCTGTGTACAACTAGAGGAACTGGTTCAGTACAAGGGCCCACCAGTACAAAGTCATGCTCTACAAACTGCAGCTTTTCTATGTCAACAACAATCTCAATAGGAGTCACATGCCCCAATTGATTTGTATCAACCAAAAACTCATTAATAACTTCAGTGTCGATAAACAACGCTGATTTACCCCTAAAAGTGGGTCCTGACAGAACCAGCCTCCAACAGTCTGACAAGACACATGGACTTACTGCACCAGAATACATGGCAGTTACATCATGCACTAAATACTTGTCCTGTTGATTTATTGAGCCAGTGTAATCAAGGTGAATGGCAAAGCTTTCTTTGAAACTAGCATCTTGACTTTTAATACGGAATCTCACTGTCTGACTCAGTTTTGCAGACCCTGGAGGCAGTGACGCAACAGCATTGATAAACTCCTCCAATGATTCAAACTTAGAGTCAACTAAGCCTGATGCAATTAGTTGGTTTTGGTTTAACCTGGCCGGTTCAATGTCAAAGTCTATCCAGGCATAGCCCATCATCAAATCATGTTTAAACATTGGCCTTTCAATACCTTTGTAAATGACTTTCTCCACGAATGAAGAGAATGGACCCATTCTTTGTAATCCTTCACCCTCTGGTATCGACGTCTTATGTGGGAACCACGTAAAGGACCCCAATGTTCTCGTTGTCGCAACAAATGGCCTCACATAAGACTCAAAGTAAATTTGCCTCATAAAATTGTCAACAGCATCACCAGTACTCACCACCCTTTCCTCTACCATGGGTTCATGTGTCCTAGTGTGAGACAACCTCAATTCAGATGACAACACTATGTAATGTTCTTCTCTCTTCCATTTTACTATGTGTGAAACAAGAGATAAGGCTTCACAATTAACATCTAATGCCACACAAAGATCCAAAAATTTTATTCTAGGTGACCACTTCATTCTGGTTGATGCTAAATCGCTCATGAATGGTAATATATGTCTTTCGAATACGGATGGGTACAGCCTTCTTAAGGAATGAATGATGTGATTTAGGCCAACCCTATCCTCCAACAATTTTGATGCAGTTGGCTTCAAAGGAAAATAGTCACAAGGATTGTGTTTGAAAAAGTTCAGTACTTTGGCTGTCCTCGGTTCCCCTAAAACCCATGCACCCAATTCTATTGCAGTTGACAAGGAAATGCACATATAATCCCACAATAAGGGTCTGAAGTAACTGATTATGCTATCATTTCCATATCTAAGGTTCAACGGAACTCGCCAATATTGAACACCATTGGTATTTGTCAACAGTTCGATCCCCTGGACATCAGAAATTAAAGACTGTATGGACTTAATGTACAGATTCTCTTTATTTGGCCCCCGAATACATTTACTACCCAATGTTCTACATAAACCTACAAAGCCAGATGCAATAGAACTTTGGAACGCAGATTTGTTGATAGCTTCAGACAATAATTTCTGTGCTCCTCGAGTGAAAGTGGAAGACAACTTATTTTGGATCGTCTTAACGATAGTGGGAATTTTCTCATCATCTAGGTTGACAGCACCTGAATATATTATCTTTTGCCTTAATACCATCCTTAGAGGGTGATGTGCAGCTAGATTCAACCAAGAATATTCAAGGTCAGACTCAGATGGGGGTTCAACATCTAATAGCTCACAGAGATTCCTTAGTGAGGAGAGATGCTCACTGGACAGGTAGTTTGTTGTGAACTCCTCATGGAGCTGCCCAGTCTTCAATCTATTGTACAACTTTCTTAACATGGATCTGATCTTGCTGCAAGCATCAGGAATTAACCCCTCTATTTGTCTCATGATCCTGTAACTGCGGTTACCATCTACCCAATCTCTGACATCTGTCTCGCAATTCAGCAAGAATGGGTCAATGGGGTATCTAGCATATTGCAAAAGGTTCAAGGTCCTTATTTGTATCAAATTGCATAGATGAACAGGGACACCATTCGCAACTGACTGATCAATGATTGTGTCAATTGTTTCTGCTAGTTGGTGAGGCTCTTTGCATTTTATGTTGTGAAGGGCTGCAGCAACAAATTTTGTTAATAATGGCACTTCATCCCCCCAAACAAAGAATCTAGATTTGAATTCTGCAACAAATCTGCCAATAACACTTTTAGGGCTCACAAACTTATTGAGTTGATCACTCATGTAATAGTGAAACTCTATTAAAGTCTTAAATTCTTCTGGATCTCTTTGCAGAAGCTCTGTGAGATTCTGATCAAAAAGGGAGATTTGATCATCACTAGAGGTATAAGCATCTATTGTACCACCACACACACAACTTATAGCATAATTAATGAACCTTTCTGAGATGAGGGCATAAAAGTCTGATGTGTTATGCAAAATTCCCTGACCCATGTCAAGTATTGAACTGACATGAGAAGGTACCACACCGATTTGGAAATTAGAATAGAAAAAATCTTCTGTTACTGACTGTTTAGTTTTCTTCCTTAGCCCCAGTTGAGCCTTAATGTATGATTTCATCATAGCTGATACTACATTGAAAGGTATCTCTACCATTTTGTGCATGTGCCACATGAGCAGGGTTGAGAGGTAGTCCCTCCCTTTAATGTCTGCTTGCAAATCCTTTGAAAGGAATATTAAATTCTGTAAAACAGTCAAAAACAGAAATGGGCACATCATTGGGCCCCACTTGCTATGATCCATACTGTAAGAGACATTTGCTAAGGAGACATTCAACTTCATAGAAAGTATAGCATTTTCAAATTCCTTCTCGTTGTTTAAGCAGCTCCCTGATAACTGTAGACTTAGAGCTTCAAAATAATCCTCTATGAGTCTAGTAAACATCTTTGTCCTAAGATCACCAATGTACAACTCTCTGTTACCACCAACTTGTTCCTTATATGATAGAGAGAATTTGAGCCTCCCAGTGTCCGGTCCTACTGAGTTGTAAGACTGCGGCGACTCTTGACTGTAAAAACACAAGTTCTTCAACATTGCCGTGGTACAATTTGTCAATGACAAAGCTTTACTAAGTGCTTCTGAGTTACTCTCCCTTTCACTAATTCTCACATCATCAGAGAGCTTGCCCACATCAAACTTGAAATTTAGATTTCTTGACTTATAATGAGTGTACTTCCCCATAAGTCTATTTGCGTTCATAATCAAAAGAATAGACTTAAAACACTGGAAGTATTCACGATCTAAGTATGTCCTTGTTGAGACTGCCTTTGTCAACTCCCCAATGGGGCATTGTGACATATGTCCACAGTAAAAATACTTCTCTTTCAACCTGCTATTCTCATAGACAGCATTGCAGAACTCCTCATAGAATATGTCTGGTAAAACACCATGATCAAAGTCCTCAACCATGTGATTGGATAGTTCACCCTTGATCAATCTAATATAAAACTTGTTTGAGACAATCACATCTAGATCATTTATTGATGGCTGACTATCATCATTAAGGCCTGAGCCTTGTTTAACAGGTTCTCTATACTGATCAACAATTTTTTCAACAGTCTCTTTCAGCTGATCAAAATAAATGCTTGCACCCCCATCAAGCAAAATTTCGTCTAGGTCAGCTTTATCGACATTGCTTTTGTCTTGCCCAGACCCTAGAACTAGATTACTCATTGCCTGTTGCACTTTGTACTCATAGTCCTGTTTGTTGAGAAGGTATTTTCCCTTCTTCGAGAAAACTTCAGTGAGTTGTGACACGGCCAGTGCTGTGAGCTTATTGAAATCATAGTTCAATATTCTGGAACCATCTGTGAATTTATTAACAACAACACTCTTATTGCTAGCCAGGTCCAAAGCTGTGGCACAGCCACTAGTGATAAGGGGGTCTCTGATCTCCCTCCTCACTTCCCTTTCCTTGAATAGTGAGCCATTATTAAAGGAAGATGTAAGAAGAGATAAGAACTTTTTTGAAACACCAGGCTTCTTATAGTTTGGCCCCTCAGTGCTTGTGCATCCATCTTTACTCAAAAACCTTTTTGCATTGTAAACCATGTCATCCAGTTCCTCCTCCGTAGCTGTATCTGCAGGGTTAATGCTTACATGACCAAACTCCAGTTTTGGTTCAAGAAATTTTTCAAAACATTTTATCTGATCTGTCAACCTGTCTGGTGTTTCCTTTGTGATAAAGTGGCA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| 29,175
|
OM140826.1
|
Mammarenavirus lassaense
|
Spengler,J.R., Kainulainen,M.H., Welch,S.R., Coleman-McCray,J.A.D., Harmon,J.R., Condrey,J.A., Scholte,F.E.M., Nichol,S.T., Montgomery,J.M., Albarino,C.G., Spiropoulou,C.F.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2022-02-19
|
813877
|
Mammarenavirus lassaense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,277
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Homo sapiens
| null |
1989
| null | null |
Lassa mammarenavirus isolate 813877 segment L, complete sequence
|
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| 32,844
|
NC_005079.1
|
Mammarenavirus machupoense
|
Bowen,M.D., Thurman,K., Minor,E., Meyer,R.F., Malfatti,S.A., Do,L.H., Smith,K.L., McCready,P.M., Chain,P.S.G.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-08-30
| null |
Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,196
|
RefSeq
| null | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Machupo virus segment L, complete genome
|
GCGCACAGTGGATCCTAGGCGTAACTAGATCAAGTTTTGCTGAGTAAAATTTTAAACACATTGAGTATCCGTGCAAGACAGCGCAGAGCTCCCCACAATGGGCAACTGCAATAAGCCTCCCAAGAGGCCTCCCAACACACAAACATCATCCAACCAACCCTCAGCAGAGTTCAGGAGAACAGCCCCACCCAGTCTCTATGGTCGCTACAACTGCAAATGCTGTTGGTTTGCCGACACAAACTTGATTACATGTAACGACCACTACTTGTGCCTGAGATGTCATCAAACAATGCTCAGGAATTCTGAACTCTGTCACATATGCTGGAAACCACTACCGACATCCATCACAGTTCCCGTGGAGCCAAGTGCCCCCCCACCATGAACATCCCCAAACTCGGTCCACAAGACCCCCGGGGGGCCCCAACGGGGCCCCCACGGGGGATCCCCGGGGGTCTTGGGCTGCGTCACTCAATGTCCTCCACTTGGGGCGTGCTTGCCAGGGGTCTACACATCACACCCTTCAGTCTGAATGACCCCTGGGTGTCTGATATCACAAGCTCTTTGAGTGATTTACTATAGGCAACCTTAAAGTTGGTAAATTCGATCCATTCGCCAAAGCTTTCAATTGATTTTGTGAGCTGTTTCTTGTACAAATCATGAACAATGGTGAAATCTTCCTGTTGAAACAAAATAACCTGTGATGTTGCTTTCAAATAAGGCCACAGTTGGTGCAGCATAGAAACAACACTCTCATCATCTTCTAGGGCCCCCAATGCTTTCACCACAAGATCACCTGTAAACTCTACTTTATATGTGGACAGTCTCTCACCTCCCACATAGAAGGCACCATCCTTCAAGACCAACGGGTCTTCTTGGTTTTCAGGTCCCGAGAGCCTGTAGGAATATTTGTCACTCAACTCTGGGGAAAATCCACCTAAATCCAAGGTAACATTTCTCATTAAGAAATTATCATTTGAGCCAGCCAGATTTGACTCGATTAACATTGCAGCCAAATCAAAACTGGCCTGCCCAGTAAATAATGGGAGGCTTGCAACAACCGACACACCATCCAGCAGCATATGGTTTCCTCCTGACCCAGACACAGACTGATCGACTGCCACCACCTTCAAAATAACCTCTTTGTTCTGGATCTCTCCTACATCCATTATGCATTCCAAAGAGAAACTATACACCATTTTTCTCTTCAACTTGAACTTCGTTGACATTCTTACATGATCGATCTGCACCACTAGGCCCACAATGACATTCTCAGCCTTCAATCCAAACAATTCACCTATATCAGGAGCCTTCTCCTGAGGCGGCAATTGAACACCATCAACCATCACGTTGCTTAACGAGATTCTAACACCCTCGAAGTTAGAGACAACATACCCCATTGCGATATCCTCCACAAACATAGCTCTGGAAACATTTTGATTCTTAACCATTAAGGCAAAGTCAGTCAATTCTGCTAACTCAATTTGACTATCATCCTCTAGCTCTAGGACTTCATTGAACCAGAAAAATGACTTCAGACAAGATGTTGAAAGGACTAATGGGTTTACCATTGAAGATAGGACCAGCTGGGTCTTGAAGTTTGTGCAAATCTGCTGCGGACTAAGTCCTAATTCCCAATCTGTGTAGCTTGACTGCCTTATGTGTGCTAAGGCACAATCACTTTGTTTAACTATGTAAACACTGTTGTCTCTGGTCTTCAACAGGTGACTGATGATACCAAGGTTTTCATTCATCATGTCTAAAGCAATGCAGACATCCAGAAATTTTAGCCTCCCGCTATCCATTGTTCTGCTGACCTGAAGATCATTCATAAATGGAGTCAAGTGTTCGTCAAAAAGAACTGGATAATTTCTCCTTATAGATTGCAGAACATGGTTCATTCCCAGTTGGTCTTCAATTTGTCTCACCACTTTAGGCTTCACAGCCCAAAAAAAGTTTTGGTTGTTCAACACCAATGGCTTTTGGGGCTCTTTAACTGTGGAAAACACCCACTCTCCAAGTTCACATGCATTTGTTAGGACTAATGAAAAATAATCCCACAAAATAGGTTTTGAAAACTGACTCACTTTGTTAAGTGAGTTGTTGCAATATATGATCTTGGGCTTTAACGCACATATTTCACATGTACAAGCACTTACACCTGAATACACTTCTTTTATGTATAAGAATCCCCCTTTCCCATCTCTAACGCACTTGCTACCCATGCTTTTGCAGAACCCAATAAAACCTGAGGCAACGGATGACTGGAAAGCTGACTTATTAATTGACTCAGCAAGGATCTTCTTAACTCCTTTTGTGAAGTTTCTGGAAAGTTTGGATTGCAAGGTTTTAATTAAAGTTGGCACTTCCTCCCTTTCAAGAACTCTTCTACTTGTCATCAACTTTGTCCTCAAAACTAACCTAAGATCTCCAAAACTTGATAAATTCACCCATCTATAGTTCAACACGCGATTAACTTCTTGTTCACTGCAACCTGCATACTGTAAAAAACCAGTCAAGGCCTCATCACCACCTCTACCAATCAAATTGATCAGATTCTCCTCAAATATTCTGCCACGCTTTATATCATTAAAAACCTTTCTGGCACAGTTCCTAATAAAAGAGGTTTCCTTGTCATCATGAAAGATAGCTTCAATCTTTCTCTGTAGACGGTAACCCCTTGAGCCATCCACCCAGTCTTTCACATCTTGATCTTCAATAGCCCCAAAGGGGGTCTCTCCATATCCGGAGTATCTAATTAATTGGTTAACTCGCTTAGATATTCTTGTCACTATTTTGGTGCTGACTCCATTTGCAATGCATTGATCACAGATGGTATCTATAGTTTCTGACAATTGTGTGGGTGTTTTACACTTTACATTGTGTAAAGCTGCAGCAACAAACTTTGTGAGCAATGGTGTTTCTTCACCCATGACAAAAAATCTTGATTTGAACTCTGCGACAAAAGTCCCGATGACACTCTTGGGGCTGACAAACTTATTCAATTTAGATGACAGAAACTCATGGAAGCAGATCATCTCGAGCCACTCCGCAGCATCTGAACCCCCTTCTATATCCAGAGAAGGTGTCTTGATAAGAGTGATCTGATCGTCACTAGAGGTATATGACACAGGGATTACATCATACAAAAGATCGAGTGCATAACACAAAAATTGCTCTGTGATTAATCCATACAAATCAGAAGTGTTATGTAGTATCCCTTGCCCCATGTCCAAAACAGACATAATGTGACTAGGAATCTGACCATTTAACTGCATGGTCTGATGGAAGAATTCTTCACTCAAACTGGTGGAACCGCAGCCCATCAATCCAAGGGACCTTTTTAGCTTTCCAATACAGTAGGCTTCAGCCACATTGATAGGCACTTCTACAACTTTGTGAAGGTGCCATTTCAGTATACTTTTAACAGAATCAAGATCAATTTTTGACCTGTCAACAGGGGTTCTCAATTCCAGCATTTGTAATAATGCCAGGAAAAGTGCAGGACTCATTGTTGGACCCCATTTTGAGTGATCATAAGAACATGACAAATCACCATTATTCACTGCCATCTTCATGTCACAAATGGCCCGTTCAAATTCTTTTTCAGAGTTCAGACAGGTGTACTTCATAGAATTCCCTACAGCTTCAGAAAAATCCTCCACCAATCTTGTCATCAGTTTTGTGTTGAGGTCTCCTACATAGAGCTCTCTGTTTGAACCCACCTGTTCCTTATAACTTAGACCAAATTTAAGGTTTCCTGAGTTGGAACTAATGCTTGTGAACTCAGTGGGCGAATCTTCAGAATAAAAACACAGATTCCTTAATGCGGCATTGGTGAAGTAACTTTTATCCAACTTGTCTGCAATCGCCTCTGAGTTGCTTTCTCTTATACTAAGTCTAACCTCGTCTTTGAGTCTTAATGTCTCATCGGTGAAACCCAGTCTAGATCTGCTTTTGTGCTCATAACTTCCTAGTTTTTGATCAAAGTGACCTTGTATCAAGAGGTATTTAAAACACATAAAATACTCTTCGTCCACATAACTTGATGTGGTCAGATTTTTCAGCAGCAACCCCAAGGGACAGACATCAAGTACTCCCTCAAGGAAGAAGTTGCATTTTTCTGACGATTTGTAAACTGCGTCACACAACTCCTTGTACACTTCAGGAGGAAGAACATCTGGGTCAAAATCCTTGACTTCGTGTAACGATACTTCAGCTCTAATCTCTTTCATCACCCCAAAAGGTGACCACAAATTGTCCAAAGGATTATTCCCATTTTTTACTGAATTATCAGCTCGGCCGAGATTTTTAGTTCTTGTGTTCACACTGTTGTCAGCCATCTTGGCTAAGGCAACTTGTACATCATGTTTAATTTCGTTGAATGATTCAACCTGTTCTTCTGTTAACGCCTCGTACATTAAAGACAATTCTTCTTGAGTACTCTTAGCTTTCGGCCCTGCACTCACCAAACCTGTCAGATTTTTTAGAATCAAATAGTCAGTTGAATCTGGATCTAGATTGTACCTTCCTTTGGTTTTAAACCTCTCTGCCATAGAGGAAACACATGCTGACACTAGTTTTTCCTTGTCATAGGTGGAGAGGATGTTGCCTAACTCATCTAGTTTTGGTATAACAACACTCTTGTTACTTGATAAGTCCAAAGCAGTACTTGTTATATTAGGTCTAAAGGGATTATTTTTAAGCTCCCCAGAAACCTTTAACTTTCCCCTATTAAACAAAGACACACAATAATTTAAGAGTTCTTTACACACACCTGGTGTCTGCACATCCTCAGTGTCCCTTAAGGATTTTGAAAAAAACTTCTTTAAACCATTTATCATAATGTCTTCCTGATCTACAGTCAGCTTTCCATTTAGAGATGGGTTCACCACAGCACATCCAAACTTAACTTTGGGCTCAATGAACTTCTCAAAACATTTCATCTGATCTGTTAATCGGTCAGGCGTTTCTTTTGTGATTAAATGGCAAAGGTAACTAAC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| 8,463
|
MT015969.1
|
Mammarenavirus machupoense
|
Johnson,D.M., Jokinen,J.D., Wang,M., Pfeffer,T., Tretyakova,I., Carrion,R. Jr., Griffiths,A., Pushko,P., Lukashevich,I.S., Jokinen,J., Carrion,R.
|
National Emerging Infectious Diseases Laboratories, Boston University, Microbiology
|
USA
|
2020-03-29
| null |
Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,196
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
| null | null |
2014-06-03
| null | null |
Mammarenavirus machupoense strain Carvallo segment L, complete sequence
|
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Mammarenavirus machupoense
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Aguilar,P.V., Tesh,R.B., Ksiazek,T.G., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
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Mammarenavirus machupoense
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Bolivia
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Mammarenavirus machupoense
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Bolivia
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Mammarenavirus machupoense isolate 930060_Chicava segment L, complete sequence
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| 77,623
|
KU978786.1
|
Mammarenavirus machupoense
|
Rossi,S.L., Guerbois,M., Forrester,N.L., Ksiazek,T., Hari,K., Lin,D., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2017-03-25
|
Calomys 221600
|
Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
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| 7,143
|
GenBank
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Bolivia
|
Bolivia
|
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| null |
1965-01-01
|
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|
PRJNA257008
|
Mammarenavirus machupoense isolate Calomys 221600 segment L, complete sequence
|
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Mammarenavirus machupoense
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Mammarenavirus machupoense
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Mammarenavirus
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Bolivia
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Mammarenavirus machupoense isolate 9430069 segment L, complete sequence
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|
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Mammarenavirus machupoense
|
Rossi,S.L., Guerbois,M., Forrester,N.L., Ksiazek,T., Hari,K., Lin,D., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2017-03-25
|
9530537
|
Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
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GenBank
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Bolivia
|
Bolivia
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| null |
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|
Mammarenavirus machupoense isolate 9530537 segment L, complete sequence
|
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|
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University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
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|
Calomys 14795
|
Mammarenavirus machupoense
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Mammarenavirus
|
Arenaviridae
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GenBank
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Bolivia
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Calomys callosus
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Mammarenavirus machupoense isolate Calomys 14795 segment L, complete sequence
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| 77,627
|
KU978790.1
|
Mammarenavirus machupoense
|
Rossi,S.L., Guerbois,M., Forrester,N.L., Ksiazek,T., Hari,K., Lin,D., Weaver,S.C.
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University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2017-03-25
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Calomys 9301012
|
Mammarenavirus machupoense
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
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ssRNA(+/-)
| 7,122
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GenBank
| null |
Bolivia
|
Bolivia
|
Calomys callosus
| null |
1993-01-01
|
SAMN04363497
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PRJNA257008
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Mammarenavirus machupoense isolate Calomys 9301012 segment L, complete sequence
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| 77,628
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|
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University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
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USA
|
2017-03-25
|
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Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
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GenBank
| null |
Bolivia
|
Bolivia
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| null | null |
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Mammarenavirus machupoense isolate OBT2102 segment L, complete sequence
|
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| 77,629
|
KU978805.1
|
Mammarenavirus machupoense
|
Aguilar,P.V., Tesh,R.B., Ksaizek,T.G., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2017-03-25
|
SPB201004275
|
Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
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| 7,173
|
GenBank
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Bolivia
|
Bolivia
|
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| null |
2010-03-10
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SAMN03381376
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|
Mammarenavirus machupoense isolate SPB201004275 segment L, complete sequence
|
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| 77,631
|
KM198593.1
|
Mammarenavirus machupoense
|
Patterson,M., Seregin,A., Huang,C., Kolokoltsova,O., Smith,J., Miller,M., Yun,N., Poussard,A., Grant,A., Tigabu,B., Walker,A., Paessler,S.
|
University of Texas Medical Branch, Experimental Pathology
|
USA
|
2014-07-27
| null |
Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,123
|
GenBank
| 1
|
USA: University of Texas Medical Branch, Galveston, TX
|
USA
| null | null |
2012-07-09
| null | null |
Machupo virus strain Carvallo segment L, complete sequence
|
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| 89,345
|
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|
Mammarenavirus machupoense
|
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|
Lawrence Livermore National Laboratory, Viral Sequencing Group
|
USA
|
2004-06-15
| null |
Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
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|
GenBank
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Mammarenavirus
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Arenaviridae
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GenBank
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Machupo virus strain Carvallo segment L, complete sequence
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CGCACAGTGGATCCTAGGCGTAACTAGATCAAGTTTTGCTGAGTAAAATTTTAAACACATTGAGTATCCGTGCAAGACAGCGCAGAGCTCCCCACAATGGGCAACTGCAATAAGCCTCCCAAGAGGCCTCCCAACACACAAACATCATCCAACCAACCCTCAGCAGAGTTCAGGAGAACAGCCCCACCCAGTCTCTATGGTCGCTACAACTGCAAATGCTGTTGGTTTGCCGACACAAACTTGATTACATGTAACGACCACTACTTGTGCCTGAGATGTCATCAAACAATGCTCAGGAATTCTGAACTCTGTCACATATGCTGGAAACCACTACCGACATCCATCACAGTTCCCGTGGAGCCAAGTGCCCCCCCACCATGAACATCCCCAAACTCGGTCCACAAGACCCCCGGGGGGCCCCAACGGGGCCCCCACGGGGGATCCCCGGGGGTCTTGGGCTGCGTCACTCAATGTCCTCCACTTGGGGCGTGCTTGCCAGGGGTCTACACATCACACCCTTCAGTCTGAATGACCCCTGGGTGTCTGATATCACAAGCTCTTTGAGTGATTTACTATAGGCAACCTTAAAGTTGGTAAATTCGATCCATTCGCCAAAGCTTTCAATTGATTTTGTGAGCTGTTTCTTGTACAAATCATGAACAATGGTGAAATCTTCCTGTTGAAACAAAATAACCTGTGATGTTGCTTTCAAATAAGGCCACAGTTGGTGCAGCATAGAAACAACACTCTCATCATCTTCTAGGGCCCCCAATGCTTTCACCACAAGATCACCTGTAAACTCTACTTTATATGTGGACAGTCTCTCACCTCCCACATAGAAGGCACCATCCTTCAAGACCAACGGGTCTTCTTGGTTTTCAGGTCCCGAGAGCCTGTAGGAATATTTGTCACTCAACTCTGGGGAAAATCCACCTAAATCCAAGGTAACATTTCTCATTAAGAAATTATCATTTGAGCCAGCCAGATTTGACTCGATTAACATTGCAGCCAAATCAAAACTGGCCTGCCCAGTAAATAATGGGAGGCTTGCAACAACCGACACACCATCCAGCAGCATATGGTTTCCTCCTGACCCAGACACAGACTGATCGACTGCCACCACCTTCAAAATAACCTCTTTGTTCTGGATCTCTCCTACATCCATTATGCATTCCAAAGAGAAACTATACACCATTTTTCTCTTCAACTTGAACTTCGTTGACATTCTTACATGATCGATCTGCACCACTAGGCCCACAATGACATTCTCAGCCTTCAATCCAAACAATTCACCTATATCAGGAGCCTTCTCCTGAGGCGGCAATTGAACACCATCAACCATCACGTTGCTTAACGAGATTCTAACACCCTCGAAGTTAGAGACAACATACCCCATTGCGATATCCTCCACAAACATAGCTCTGGAAACATTTTGATTCTTAACCATTAAGGCAAAGTCAGTCAATTCTGCTAACTCAATTTGACTATCATCCTCTAGCTCTAGGACTTCATTGAACCAGAAAAATGACTTCAGACAAGATGTTGAAAGGACTAATGGGTTTACCATTGAAGATAGGACCAGCTGGGTCTTGAAGTTTGTGCAAATCTGCTGCGGACTAAGTCCTAATTCCCAATCTGTGTAGCTTGACTGCCTTATGTGTGCTAAGGCACAATCACTTTGTTTAACTATGTAAACACTGTTGTCTCTGGTCTTCAACAGGTGACTGATGATACCAAGGTTTTCATTCATCATGTCTAAAGCAATGCAGACATCCAGAAATTTTAGCCTCCCGCTATCCATTGTTCTGCTGACCTGAAGATCATTCATAAATGGAGTCAAGTGTTCGTCAAAAAGAACTGGATAATTTCTCCTTATAGATTGCAGAACATGGTTCATTCCCAGTTGGTCTTCAATTTGTCTCACCACTTTAGGCTTCACAGCCCAAAAAAAGTTTTGGTTGTTCAACACCAATGGCTTTTGGGGCTCTTTAACTGTGGAAAACACCCACTCTCCAAGTTCACATGCATTTGTTAGGACTAATGAAAAATAATCCCACAAAATAGGTTTTGAAAACTGACTCACTTTGTTAAGTGAGTTGTTGCAATATATGATCTTGGGCTTTAACGCACATATTTCACATGTACAAGCACTTACACCTGAATACACTTCTTTTATGTATAAGAATCCCCCTTTCCCATCTCTAACGCACTTGCTACCCATGCTTTTGCAGAACCCAATAAAACCTGAGGCAACGGATGACTGGAAAGCTGACTTATTAATTGACTCAGCAAGGATCTTCTTAACTCCTTTTGTGAAGTTTCTGGAAAGTTTGGATTGCAAGGTTTTAATTAAAGTTGGCACTTCCTCCCTTTCAAGAACTCTTCTACTTGTCATCAACTTTGTCCTCAAAACTAACCTAAGATCTCCAAAACTTGATAAATTCACCCATCTATAGTTCAACACGCGATTAACTTCTTGTTCACTGCAACCTGCATACTGTAAAAAACCAGTCAAGGCCTCATCACCACCTCTACCAATCAAATTGATCAGATTCTCCTCAAATATTCTGCCACGCTTTATATCATTAAAAACCTTTCTGGCACAGTTCCTAATAAAAGAGGTTTCCTTGTCATCATGAAAGATAGCTTCAATCTTTCTCTGTAGACGGTAACCCCTTGAGCCATCCACCCAGTCTTTCACATCTTGATCTTCAATAGCCCCAAAGGGGGTCTCTCCATATCCGGAGTATCTAATTAATTGGTTAACTCGCTTAGATATTCTTGTCACTATTTTGGTGCTGACTCCATTTGCAATGCATTGATCACAGATGGTATCTATAGTTTCTGACAATTGTGTGGGTGTTTTACACTTTACATTGTGTAAAGCTGCAGCAACAAACTTTGTGAGCAATGGTGTTTCTTCACCCATGACAAAAAATCTTGATTTGAACTCTGCGACAAAAGTCCCGATGACACTCTTGGGACTGACAAACTTATTCAATTTAGATGACAGAAACTCATGGAAGCAGATCATCTCGAGCCACTCCGCAGCATCTGAACCCCCTTCTATATCCAGAGAAGGTGTCTTGATAAGAGTGATCTGATCGTCACTAGAGGTATATGACACAGGGATTACATCATACAAAAGATCGAGTGCATAACACAAAAATTGCTCTGTGATTAATCCATACAAATCAGAAGTGTTATGTAGTATCCCTTGCCCCATGTCCAAAACAGACATAATGTGACTAGGAATCTGACCATTTAACTGCATGGTCTGATGGAAGAATTCTTCACTCAAACTGGTGGAACCGCAGCCCATCAATCCAAGGGACCTTTTTAGCTTTCCAATACAGTAGGCTTCAGCCACATTGATAGGCACTTCTACAACTTTGTGAAGGTGCCATTTCAGTATACTTTTAACAGAATCAAGATCAATTTTTGACCTGTCAACAGGGGTTCTCAATTCCAGCATTTGTAATAATGCCAGGAAAAGTGCAGGACTCATTGTTGGACCCCATTTTGAGTGATCATAAGAACATGACAAATCACCATTATTCACTGCCATCTTCATGTCACAAATGGCCCGTTCAAATTCTTTTTCAGAGTTCAGACAGGTGTACTTCATAGAATTCCCTACAGCTTCAGAAAAATCCTCCACCAATCTTGTCATCAGTTTTGTGTTGAGGTCTCCTACATAGAGCTCTCTGTTTGAACCCACCTGTTCCTTATAACTTAGACCAAATTTAAGGTTTCCTGAGTTGGAACTAATGCTTGTGAACTCAGTGGGCGAATCTTCAGAATAAAAACACAGATTCCTTAATGCGGCATTGGTGAAGTAACTTTTATCCAACTTGTCTGCAATCGCCTCTGAGTTGCTTTCTCTTATACTAAGTCTAACCTCGTCTTTGAGTCTTAATGTCTCATCGGTGAAACCCAGTCTAGATCTGCTTTTGTGCTCATAACTTCCTAGTTTTTGATCAAAGTGACCTTGTATCAAGAGGTATTTAAAACACATAAAATACTCTTCGTCCACATAACTTGATGTGGTCAGATTTTTCAGCAGCAACCCCAAGGGACAGACATCAAGTACTCCCTCAAGGAAGAAGTTGCATTTTTCTGACGATTTGTAAACTGCGTCACACAACTCCTTGTACACCTCAGGAGGAAGAACATCTGGGTCAAAATCCTTGACTTCGTGTAACGATACTTCAGCTCTAATCTCTTTCATCACCCCAAAAGGTGACCACAAATTGTCCAAAGGATTATTCCCATTTTTTACTGAATTATCAGCTCGGCCGAGATTTTTAGTTCTTGTGTTCACACTGTTGTCAGCCATCTTGGCTAAGGCAACTTGTACATCATGTTTAATTTCGTTGAATGATTCAACCTGTTCTTCTGTTAACGCCTCGTACATTAAAGACAATTCTTCTTGAGTACTCTTAGCTTTCGGCCCTGCACTCACCAAACCTGTCAGATTTTTTAGAATCAAATAGTCAGTTGAATCTGGATCTAGATTGTACCTTCCTTTGGTTTTAAACCTCTCTGCCATAGAGGAAACACATGCTGACACTAGTTTTTCCTTGTCATAGGTGGAGAGGATGTTGCCTAACTCATCTAGTTTTGGTATAACAACACTCTTGTTACTTGATAAGTCCAAAGCAGTACTTGTTATATTAGGTCTAAAGGGATTATTTTTAAGCTCCCCAGAAACCTTTAACTTTCCCCTATTAAACAAAGACACACAATAATTTAAGAGTTCTTTACACACACCTGGTGTCTGCACATCCTCAGTGTCCCTTAAGGATTTTGAAAAAAACTTCTTTAAACCATTTATCATAATGTCTTCCTGATCTACAGTCAGCTTTCCATTTAGAGATGGGTTCACCACAGCACATCCAAACTTAACTTTGGGCTCAATGAACTTCTCAAAACACTTGATCTGATCTGTTAATCGGTCAGGCGTTTCTTTTGTGATTAAATGGCAAAGGTAACTAACA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| 109,712
|
AY619644.1
|
Mammarenavirus machupoense
|
Hajjaj,A., Chain,P.S.G., Do,L.H., Smith,K.L., Imbro,P.M., Malfatti,S.A., Jahrling,P.B., Geisbert,J., Ibrahim,M.S.
|
Lawrence Livermore National Laboratory, Viral Sequencing Group
|
USA
|
2004-06-08
| null |
Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,138
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Machupo virus strain Mallele segment L, complete sequence
|
CGCACAGTGGATCCTAGGCGTAACTAGATCAAGTTTTTACTGAGTACTGAATAAATATAAACATATTGAGCATCCAGCCAATCTGTGCAAGACAGCACAGAGCCTCCCACAATGGGCAACTGCAATAAGCCTCTCAAGAGGCCTCCCAACACACAAACAACACCCAACCAACCTTCAGCAGAGTTCAGAAGAACAGCCCCACCCAGTCTCTACGGTCGCTATAACTGTAAATGTTGTTGGTTTGCCGACACAAATCTGATCACATGCAATGACCACTATTTGTGCCTGAGATGTCATCAAACAATGCTCAGGAACTCTGAACTCTGTCATATATGTTGGAAACCACTACCGACATCCATCATAGTTCCTGTAGAGCCAAGCGCTCCCCCACCATGACCAACCACAAACCCGGTCCATCAGACCCCCGGGGGGCCCCAACGGGGCCCCCACGGGGGATCCCCGGGGGTGTTGGGCTGCGTCACTCGATGTCCTCCACTCGAGGCATGCCTGCCAGGGGTCTGCACATCACACCCTTCAATCTGAATGACCCCTGGATGTCTGATATCACAAGCTCTTTGAGTGATTTACTATAGGCAACCTTAAAGTTGGTGAATTCAATCCATTCACCAAAACTTTCTATTGACTTTGTAAGCTGTTCCTTATACAGATCATGGACAATGGTGAAATCCTCCTGTTGAAACAAAATAACCTGTGATGTTGCCTTTAAATAAGGCCACAGATGGTGCAGCATGGAAACAATACCTTCATCATCTTCTAGGGCCCCCAATGCTTTCACTATCACATCACCTGTAAACTCCACTTTATACGTGGACAGTCTTTCACCTCCCACATAAAAGGCACCATCCTTCAAGACCAACGGATCTTCTTGGTTTTCAGGTCCTGAGAGCCTGTAGGAGTATTTGTCACTCAACTCCAGAGAAAATTCACCTAAATCCAAGGTAACATGCCTCATCAAAAAGCTGTCATTTGAACCAGCCAGATTTGATTCGATCAACATTGCAGCTAAATCAAAACTGGCCTGCCCGGTGAACAATGGAAGGCCTGCAACAACCGATACACCATCCAATAGCATATGGTTTCCTCCTGACCCAGACACAGACTGATCGACTGCCACCACCTTCAAGTTGACTTCCTTGTTCCGGATCTCTCCCACATCCATTATGCATTCCAAAGAAAAGCTGTACACCATTTTTCTCTTTAACTTGAACTTCGTAGACATCCTTGCATGATCAATTTGCACCACTAAGCCTACAGTAATATTCTCAGCCTTAATTCCAAACAATTCACCTACATCAGGGGCTTTTTCCTGGGGTGGCAATTGAACACCATCAACCACCACGCTGCTTAATGAGATTCTGACACCCTCGAAGTTGGAGACAACATAACCCATTGCGATATCCTCCACAAACATAGCTCTGGTAACATTGTGATTTTTAACCATTAAGGCAAAGTCAGTTAATTCTGCTAACTCAATTTGACTATCATCCTCTAGTTCTAGGACTTCATTGAACCAGAAAAATGATTTCAAACAAGATGTTGAAAGGACTAATGGGTTTACCATTGACGATAGGACCAGTTGAGTTTTGAAATTTGTACAGATTTGCTGGGGACTAAGTCCCAATTCCCAGTCAGTGTAGCTCGATTGCCTTGTGTGTGCTGAAGCACAATCGCTTTGTTTGACTATGTAAACACTGTTATCTCTGGTCTTCAACAGGTGACTAATGATGCCAAGGTTTTCATTCATCATGTCTAAAGCAATGCAAACATCCAGAAATTTTAGCCTCCCACTATCCATTGTTCTGCTGACCTGAAGGTCATTCATAAATGGAGCCAAGTGTTCATCAAAAAGAACTGGATAATTTCTCCTTATAGATTGCAGGACATGATTCATCCCCAGTTGGTCCTCAATTTGTCTCACCACTTTAGGCTTCACAGCCCAAAAGAAGTTTTGGTTGTTCAACACCAGCGGCTTTTGGGGCTCTTTAACTGTAGAAAATACCCACTCTCCAAGCTCACATGCGTTTGTTAGGACCAATGAGAAATAATCCCACAAAATAGGCTTTGAAAACTGGCTCACTTTATCAAGTGAATTGTTGCAATATATGATCTTGGGCTTCAACGCACATATTTCACATGTGCAAGTACTCACACCTGAGTACACTTCTTTTATGTATAAGAATCCTCCTTTCCCATCTCTAACACACTTGCTGCCCATACTTTTGCAGAACCCAATAAACCCCGAGGCAACAGATGACTGGAAAGCTGACTTATTAATTGACTCAGCAAGGATCTTCTTAACTCCTTTTGTGAAGTTTCTGGAAAGTTTGGACTGCAAGGTTTTAATTAAAGTTGGCACTTCTTCCCTTTCAAGAACTCTTCTACTTGTCATCAACTTTGTCCTCAAAACTAGTCTAAGATCTCCAAAACTTGATAAGTTCACCCATCTATAGTTTAACACGCGACTAACTTCTTGTTCACTACAGCCTGCATACTGCAAAAAACCAGTCAAGGCCTCATCACCACCCCTACCAATCAAACTAATCAAATTCTCTTCAAATATTCTGCCTCGTTTTATATCATTAAAAACCTTTCTAGCACAGTTCCTGATGAAAGAGGTTTCCTTGTCATCCTGAAAAATAGCTTCAATTTTCCTTTGTAGACGGTAACCCCTTGTGCCATCAACCCAGTCCTTCACATCTTGATCCTCAATAGCCCCAAAAGGGGTTTCCCCATACCCAGAGTATCTAATCAGTTGGTTGACTCGCTTAGATATTCTGGACACTATTTTAGTGCTGACTCCATTTGCAATGCATTGATCACAGATAGTATCTATAGTCTCTGACAATTGTGTGGGTGTCTTACACTTCACATTATGTAAGGCTGCAGCAACAAACTTTGTGAGCAATGGTGTTTCTTCACCCATGACAAAGAATCTTGATTTGAACTCTGCGACAAAAGTCCCGATGACACTTTTGGGACTGACAAACTTGTTTAATTTAGATGACAGAAACTCATGGAAGCAGATCATTTCGAGCCACTCTGCAGCATTTGAACCCTCCTCTACATCTAGAGAAGGTGTCTTGATTAGAGTAATCTGATCATCACTAGAGGTGTATGACACAGGGATCACGTCATACAAGAGATCGAGTGCATAACACAAAAATTGCTCCGTAATTAATCCATACAAATCAGAAGTGTTGTGTAGTATCCCTTGCCCCATGTCCAAAACAGACATAATGTGACTGGGAATCTGACCATTTAACTGCATGGTCTGGTGGAAGAACTCTTCACTCAGACTGGTGGAACCGCAGCCCATCAATCCAAGGGACCTTTTTAGCTTTCCAGTACAGTAGGCTTCAGCCACATTAATAGGCACTTCCACAACTTTGTGAAGATGCCATTTCAGTATACTTTTAACAGAATCAAGATCTATTTTTGACCTGTCAACAGGGGTTCTCAATTCCAGCATTTGTAATAATGCTAGGAAAAGTGCAGGACTCATTGTTGGACCCCATTTTGAGTGATCATAAGAACATGACAAATCACCATTGTTCACCGCCATCTTCATATCACAAATTGCCCGTTCAAATTCTTTTTCAGAATTCAGACAGGTGTACCTCATAGAATTCCCTACAGCTTCTGAAAAGTCCTCCACCAACCTTGTCATCAGTTTTGTGTTAAGGTCTCCCACATAGAGCTCTCTGTTTGAACCCACTTGTTCTTTATAACTCAGGCCAAATTTGAGGTTCCCTGAGTTGGAACTAATGCTTGTGAACTCAGTGGGTGAGTCTTCAGAATAAAAGCACAAATTCCTTAATGCTGCATTGGTAAAGTAGCTTTTATCCAACTTATCTGCAATCGCCTCCGAATTGCTTTCTCTTATACTGAGTCTAACCTCGTCTTTGAGTCTCAGTGTCTCATCGGTGAAACCTAGTCTAGATCTACTTTTGTGCTCATAACTTCCCAGTTTTTGATCAAAGTGGCCTTGTATCAAGAGGTACTTAAAACACATGAAATACTCTTCATCTTTATAACTTGATGTGGTCAGGTTTTTTAGCAGTAACCCCAAGGGACAGACATCTAGTACTTCCTCAAGGAAGTAATTGTATTTTTCTGACGATGTGTAAACTGCGTCACATAACTCCTTGTACATCTCAGGACGAAGTACGTCTGGGTCAAAATCCTTTACTTCATGTAACGACACTTCAGCTCTAATCTCTTTCATCACACCAAAAGGAGACCACAAATTGTCTAAAGGACTATTTCCACTTTTTACTGAGTTGTTAGCTTGGCCGAGGTTTTTAGAACTTATCTTCACACTGTTGTCAGCCATCTTGGCTAAGGCAACTTGTACATCATGCTTAATTTCGTTAAATGATTCAACCTGTTCTTCTGTTAACGCCTCATACATCAAAGACAGTTCTTCTTGACTGCTCTTAGCTTTTGGCCCTGCACTCACCAGACCAGTTAGATTTTTTAGAATTAAATAGTCAGTTGACTCTGGATCCAGATTGTATCTCCCTTTGGTTTTGAACCTTTCTGCTAAAGAGGAAACACATGCTGACACCAGTTTTTCCTTGTCATAGGTAGAGAGGATGTTGCCTAACTCATCTAGTTTTGGTATGACAACACTCTTATTACTTGATAGGTCCAGAGCAGTACTTGTTATATTGGGTCTAAAGGGATTGTTTTTAAGCTCCCCAGAAACCTTTAACTTTCCCCTATTAAACAGAGACACACAGTAGTTTAAGAGTTCTTTACACACACCTGGTGTCTGCACATCTTCAGTGTCCCTTAAAGATTTTGAAAAGAACTTCCTTAGACCACTAATCATGGTGTCTTCCTGATCTACAGTCAGTTTTCCATTCAGAGATGGGTTCACCACAGCACATCCAAATTTAACTTTAGGCTCAATGAATTTCTCAAAACACTTGATTTGATCTGTTAGTCGATCAGGCGTTTCTTTTGTGATTAAATGGCAAAGATAACTAACATTTAGCAAGTATTTAAATCTTCTTGAGAAAAACAAGCTTGCATCTGACTCACCACCAAGAAGCCTAATAAAGAGTCCCACTGCAAGCCTTTGAACCACCACTTCTGAACTTGACTTGCATTCCACTACCAATTTAGATATCAGGTCGACATGATGGATCTGGTTGGCAAAGGCCATCAGAAAGTATCTCAATCCTTGTAAAAAGGTTTGATTCCTTTTTGACGGGGAACAGAGTATGGCCAGGACTAACAACCTCAATGTGGGCCCGGTGTCGTTCACCAGCCCGGCATCAAAATCCAACCAGCTTGTCATTTCCTCACACATCCCAGCTAAAACCTCATCGGAAAAAACAGGCAAGAAGAATCTCTTTGGATCACAGTAAAATGAACCCTGTTCTGACATCACACCATTATCAGACAGATAAATTGAATAACACCTTGACCTTTCACCTGTTTTTTGATAAAAGAGAAAACCAACTAAACCCTCAGCCAAATAAAACCTTTGAACATAACACTCTCTGAGTCTAACATTACCAAAGTACTTAGAAAATTCTCTTTCATTTACAAGCAACCTTGATGAAAAGGATGTCTTCATAGAATTAATTAGTGACAAAGATATTGAGGACAAAGTTTTAAATAATCTCATTTGCTCAAAACAAGACATCTCCTGGTACAATCTATGTTTACAAGTCTTGTCAGAGCCTCTTTCCACTGAATACCTCATAATTGGTCTGTCTGAGACAAGGTGTTGGGCTATTAGAATCAAGCTGTTGAAGTCTGGTTGTTTTATCAAAGTGCCTAAGTAATGCCATATTTCTGGATGTGATCTCTCTAGAATCCTTGAACAATTCTTGACCCAATTTGGATTAGTCCCAATCTTTTTTCTAATAAGCTTGACAGCCTCCAAAATGTCCAACACTCTATCATTCACTAACATAATCATCTGACCCACTACCAATCCCGATTTCCTCAAACTCTCAATCGCACCCTGGCAACTGCTACTGATGTCAACCATCAGATTTAACATTATGAGGTCTAAGAATAGCAGAGTGTTCCTCCTGGTATTAAAGACTTTCAAACCCTTTATCTTATTACACAAGGATAAGATGCTAAGGTAATGTTTTTCTACATTAGAGTGTGTGGTATTCAACTGCTGGCTCACTGTATCTGTGCCATCGGTCCTTTCAACATAGCTAAGAGTCACATTGTAAACAATTTCCATCAGCTTATTGTTGCAGAAGGGACAGTTTGACACATCACTATCTAGATGAGCACCTAAACCCGATAGGGACTTCAGTAACTCCCTTCTGTCAGTCAACTTAAATTTACCTAGACCCTTGCTGAAGACCTCATCCTTGAACCACAATTTCAGTTTGATAAGTTCTTCTCTCACTGTCGACTCTCTAACATCTCCTTTCAGACCAACAAACAATGATTCATTCAACCTCTCATCATAATCTAGAGAATTCCTTTTCAAGCATTCTAGATTTTCCAACCCCAAGCTTTGATTCTTGACGTTTGATAGACTATGAATTAATCGTTGATATTCCTGGTCCTCAATATCAATGTCAAGCATAGATTTGGATGCTTTCAAAATCTCAATAAGCAACCATCTTATTCTTTCAATCACCCAGTCAGCAACAAATCTGTTATTGTAATTGCTTCTGCCATCAACTATAGGAACTAGAGTCACACCCGACTTTTGTAAGTCATGCTTCAGGTTCAAAAGCTTTGACATGTCAGCTTTCCATTTCTTCTCGAATTCATCTGGGTTCACTCTCACAAAGGTCTCTAGCAAAATTAGAGTTTTTCCAGTTAGTTTGAACCCATCGGGGATCACCTTTGGTAAGGTTGGACATAAAATCCCGTTATCAGATAGTATTACATCTACAAATCTTTGATCGGTGTTTGCTTGGCAGGCGTGTGCTTCGCAGGACTCAAGTTCAACAAGGCTAGAGAGCAGCTTGAAGCCTTCAGTGAGCAAGGGACTGGGATGAACCTGAGATAGAAATGTGACCTTTTGATGTACAAGTTCGCACCTCTCAGGAATATGTTTTCTAATGAGCCCTTTCAATTCTTGGACACATTCATCCATGGCCAAGTGTCGCCTAGGATCCACTGTGCG
| 109,713
|
AY216511.2
|
Mammarenavirus machupoense
|
Charrel,R.N., Lemasson,J.J., Garbutt,M., Khelifa,R., De Micco,P., Feldmann,H., de Lamballerie,X., Emonet,S., de Micco,P., Lemasson,J.-J.
|
Universite de la Mediterranee, Unite des Virus Emergents (EA3292, IFR48, IRD UR034)
|
France
|
2004-01-05
| null |
Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,123
|
GenBank
| 2
|
Bolivia
|
Bolivia
| null | null | null | null | null |
Machupo virus strain Carvallo segment L, complete sequence
|
CGCACCGRGGATCCTAGGCGACACTTGGCCATGGATGAATATGTCCAAGAGTTGAAAGGGCTTATTAGAAAGCACATTCCTGAGAGGTGCGAGTTTGGACATCAAAAGGTCACATTCCTATCTCAGGTGCATCCCAGTCCCTTGCTCACAGAAGGCTTCAAGTTGCTCTCTAGTCTTGTTGAACTTGAGTCCTGTGAAGCACACGCCTGCCAGGCAAACACTGATCAAAGATTCGTAGATGTAATACTATCTGACAATGGGATTTTATGTCCAACTTTACCAAAGGTGATCCCCGATGGGTTCAAATTAACTGGGAAAACCCTAATTCTGCTGGAGACCTTTGTAAGAGTAAACCCAGATGAGTTCGAGAAGAAATGGAAAGCTGACATGTCAAAGCTTTTAAACCTGAAGCATGACCTGCAAAAGTCGGGCGTGACTTTGGTTCCTATTGTTGATGGCAGGAGCAATTACAACAATAGATTTGTTGCTGATTGGGTGATTGAAAGAATAAGATGGTTGCTTATCGAGATTTTGAAAGCATCCAAATCCATGCTTGAGATTGATATTGAGGACCAGGAATATCAACGATTAATTCATAGTCTATCAAACGTTAAGAATCAAAGCTTGGGGTTGGAAAACCTAGAACATTTGAAAAGGAATTCTTTAGATTATGATGAGAGGTTGAATGAGTCATTGTTTATTGGTTTGAAAGGAGACATTAGAGAGTCGACAGTGAGGGAAGAACTCATCAAACTTAAATTGTGGTTCAAGGATGAGGTCTTCAGCAAAGGTCTGGGCAAATTCAAATTGACTGACAGAAGGGAATTATTAGAGTCCCTATCGAGCTTAGGTGCTCATCTAGATAGTGATGTGTCAAGCTGTCCCTTTTGTAACAATAAGTTGATGGAAATTGTTTACAATGTGACCTTTAGCTGTGTTGAAAGGACCGATGGTGTAGCCACAGTGGACCAGCAGTTTAGCACCACACACTCTAACATAGAAAAACATTACCTTAGTGTCTTATCTTTGTGCAATAAAATAAAGGGGTTGAAGGTCTTTAACACCAGAAGAAACACCCTACTATTCTTAGATCTCATAATGGTTAATTTGATGGTTGACATTAGTGACAGTTGCCAGGACGCGATTGAAAGTTTGAGAAAATCGGGATTGATAGTGGGTCAGATGGTTATGTTAGTGAATGATAGAGTGCTGGACATTTTGGAGGCTGTTAAACTCATCAGAAAAAAGATTGGGACTAATCCCAATTGGGTCAAGAATTGTTCAAAAATTCTAGAGAGATCACATCCAGAAATATGGCATCACTTAAGCACTTTGATAAAGCAACCAGACTTCAATAGCTTGATTTCAATAGCCCAACATCTTGTCTCAGATAGACCAATTATGAGGTATTCAGTGGAAAGAGGCTCTGATAAGATTTGTAGACATAAATTGTTCCAGGAGATGTCTAGCTTTGAGCAAATGAGGTTATTCAAGACTTTGTCCTCAATATCCTTGTCACTAATCAATTCTATGAAGACATCCTTTTCTTCAAGATTGCTTGTGAATGAGAGAGAATTTTCTAAGTACTTTGGTAATGTTAGACTCAGAGAGTGTTATGCCCAAAGGTTTTATTTGGCTGAGAGTTTAGTTGGCTTTCTTTTCTATCAGAAGACAGGTGAAAGGTCCAGGTGTTATTCAGTTTATTTATCTGATAACGGTGTGATGTCAGAACAGGGTTCATTTTATTGTGATCCAAAGAGATTCTTCTTGCCTGTTTTTTCTGATGAAGTTTTGGCTGGAATGTGTGAGGAAATGACAAGCTGGCTGGATTTTGACACCGGATTAATGAATGACACTGGGCCCATATTAAGGTTGTTAGTTCTGGCTATACTCTGCTCCCCATCAAAGAGGAATCAAACCTTTCTACAAGGATTAAGATACTTTTTAATGGCTTTTGCTAACCAAATTCATCATATCGACCTGACATCTAAATTGGTAGTGGAATGCAAGTCAAGTTCAGAAGTGGTGGTTCAAAGGCTTGCAGTGGGACTCTTCATTAGACTACTTAGTGGTGAGTCAGATGCAAGTTTATTTTTCTCAAGAAGATTCAAATATCTGCTAAATGTTAGTTACCTTTGCCATTTAATCACAAAAGAAACGCCTGACCGATTAACAGATCAGATCAAGTGTTTTGAGAAGTTCATTGAGCCCAAAGTTAAGTTTGGATGTGCTGTGGTGAACCCATCTCTAAATGGAAAGCTGACTGTAGATCAGGAAGACATTATGATAAATGGTTTAAAGAAGTTTTTTTCAAAATCCTTAAGGGACACTGAGGATGTGCAGACACCAGGTGTGTGTAAAGAACTCTTAAATTATTGTGTGTCTTTGTTTAATAGGGGAAAGTTAAAGGTTTCTGGGGAGCTTAAAAATAATCCCTTTAGACCTAATATAACAAGTACTGCTTTGGACTTATCAAGTAACAAGAGTGTTGTTATACCAAAACTAGATGAGTTAGGCAACATCCTCTCCACCTATGACAAGGAAAAACTAGTGTCAGCATGTGTTTCCTCTATGGCAGAGAGGTTTAAAACCAAAGGAAGGTACAATCTAGATCCAGATTCAACTGACTATTTGATTCTAAAAAATCTGACAGGTTTGGTGAGTGCAGGGCCGAAAGCTAAGAGTACTCAAGAAGAATTGTCTTTAATGTACGAGGCGTTAACAGAAGAACAGGTTGAATCATTCAACGAAATTAAACATGATGTACAAGTTGCCTTAGCCAAGATGGCTGACAACAGTGTGAACACAAGAACTAAAAATCTCGGCCGAGCTGATAATTCAGTAAAAAATGGGAATAATCCTTTGGACAATTTGTGGTCACCTTTTGGGGTGATGAAAGAGATTAGAGCTGAAGTATCGTTACACGAAGTCAAGGATTTTGACCCAGATGTTCTTCCTCCTGAGGTGTACAAGGAGTTGTGTGACGCAGTTTACAAATCGTCAGAAAAATGCAACTTCTTCCTTGAGGGAGTACTTGATGTCTGTCCCTTGGGGTTGCTGCTGAAAAATCTGACCACATCAAGTTATGTGGACGAAGAGTATTTTATGTGTTTTAAATACCTCTTGATACAAGGTCACTTTGATCAAAAACTAGGAAGTTATGAGCACAAAAGCAGATCTAGACTGGGTTTCACCGATGAGACATTAAGACTCAAAGACGAGGTTAGACTTAGTATAAGAGAAAGCAACTCAGAGGCGATTGCAGACAAGTTGGATAAAAGTTACTTCACCAATGCCGCATTAAGGAATCTGTGTTTTTATTCTGAAGATTCGCCCACTGAGTTCACAAGCATTAGTTCCAACTCAGGAAACCTTAAATTTGGTCTAAGTTATAAGGAACAGGTGGGTTCAAACAGAGAGCTCTATGTAGGAGACCTCAACACAAAACTGATGACAAGATTGGTGGAGGATTTTTCTGAAGCTGTAGGGAATTCTATGAAGTACACCTGTCTGAACTCTGAAAAAGAATTTGAACGGGCCATTTGTGACATGAAGATGGCAGTGAATAATGGTGATTTGTCATGTTCTTATGATCACTCAAAATGGGGTCCAACAATGAGTCCTGCACTTTTCCTGGCATTATTACAAATGCTGGAATTGAGAACCCCTGTTGACAGGTCAAAAATTGATCTTGATTCTGTTAAAAGTATACTGAAATGGCACCTTCACAAAGTTGTAGAAGTGCCTATCAATGTGGCTGAAGCCTACTGTATTGGAAAGCTAAAAAGGTCCCTTGGATTGATGGGCTGCGGTTCCACCAGTTTGAGTGAAGAATTCTTCCATCAGACCATGCAGTTAAATGGTCAGATTCCTAGTCACATTATGTCTGTTTTGGACATGGGGCAAGGGATACTACATAACACTTCTGATTTGTATGGATTAATCACAGAGCAATTTTTGTGTTATGCACTCGATCTTTTGTATGATGTAATCCCTGTGTCATATACCTCTAGTGACGATCAGATCACTCTTATCAAGACACCTTCTCTGGATATAGAAGGGGGTTCAGATGCTGCGGAGTGGCTCGAGATGATCTGCTTCCATGAGTTTCTGTCATCTAAATTGAATAAGTTTGTCAGTCCCAAGAGTGTCATCGGGACTTTTGTCGCAGAGTTCAAATCAAGATTTTTTGTCATGGGTGAAGAAACACCATTGCTCACAAAGTTTGTTGCTGCAGCTTTACACAATGTAAAGTGTAAAACACCCACACAATTGTCAGAAACTATAGATACCATCTGTGATCAATGCATTGCAAATGGAGTCAGCACCAAAATAGTGACAAGAATATCTAAGCGAGTTAACCAATTAATTAGATACTCCGGATATGGAGAGACCCCCTTTGGGGCTATTGAAGATCAAGATGTGAAAGACTGGGTGGATGGCTCAAGGGGTTACCGTCTACAGAGAAAGATTGAAGCTATCTTTCATGATGACAAGGAAACCTCTTTTATTAGGAACTGTGCCAGAAAGGTTTTTAATGATATAAAGCGTGGCAGAATATTTGAGGAGAATCTGATCAATTTGATTGGTAGAGGTGGTGATGAGGCCTTGACTGGTTTTTTACAGTATGCAGGTTGCAGTGAACAAGAAGTTAATCGCGTGTTGAACTATAGATGGGTGAATTTATCAAGTTTTGGAGATCTTAGGTTAGTTTTGAGGACAAAGTTGATGACAAGTAGAAGAGTTCTTGAAAGGGAGGAAGTGCCAACTTTAATTAAAACCTTGCAATCCAAACTTTCCAGAAACTTCACAAAAGGAGTTAAGAAGATCCTTGCTGAGTCAATTAATAAGTCAGCTTTCCAGTCATCCGTTGCCTCAGGTTTTATTGGGTTCTGCAAAAGCATGGGTAGCAAGTGCGTTAGAGATGGGAAAGGGGGATTCTTATACATAAAAGAAGTGTATTCAGGTGTAAGTGCTTGTACATGTGAAATATGTGCGTT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| 110,034
|
AY358021.2
|
Mammarenavirus machupoense
|
Bowen,M.D., Thurman,K., Minor,E., Meyer,R.F., Malfatti,S.A., Do,L.H., Smith,K.L., McCready,P.M., Chain,P.S.G.
|
Lawrence Livermore National Laboratory, Viral Sequencing Group
|
USA
|
2003-08-24
| null |
Mammarenavirus machupoense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,196
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Machupo virus strain Carvallo segment L, complete sequence
|
GCGCACAGTGGATCCTAGGCGTAACTAGATCAAGTTTTGCTGAGTAAAATTTTAAACACATTGAGTATCCGTGCAAGACAGCGCAGAGCTCCCCACAATGGGCAACTGCAATAAGCCTCCCAAGAGGCCTCCCAACACACAAACATCATCCAACCAACCCTCAGCAGAGTTCAGGAGAACAGCCCCACCCAGTCTCTATGGTCGCTACAACTGCAAATGCTGTTGGTTTGCCGACACAAACTTGATTACATGTAACGACCACTACTTGTGCCTGAGATGTCATCAAACAATGCTCAGGAATTCTGAACTCTGTCACATATGCTGGAAACCACTACCGACATCCATCACAGTTCCCGTGGAGCCAAGTGCCCCCCCACCATGAACATCCCCAAACTCGGTCCACAAGACCCCCGGGGGGCCCCAACGGGGCCCCCACGGGGGATCCCCGGGGGTCTTGGGCTGCGTCACTCAATGTCCTCCACTTGGGGCGTGCTTGCCAGGGGTCTACACATCACACCCTTCAGTCTGAATGACCCCTGGGTGTCTGATATCACAAGCTCTTTGAGTGATTTACTATAGGCAACCTTAAAGTTGGTAAATTCGATCCATTCGCCAAAGCTTTCAATTGATTTTGTGAGCTGTTTCTTGTACAAATCATGAACAATGGTGAAATCTTCCTGTTGAAACAAAATAACCTGTGATGTTGCTTTCAAATAAGGCCACAGTTGGTGCAGCATAGAAACAACACTCTCATCATCTTCTAGGGCCCCCAATGCTTTCACCACAAGATCACCTGTAAACTCTACTTTATATGTGGACAGTCTCTCACCTCCCACATAGAAGGCACCATCCTTCAAGACCAACGGGTCTTCTTGGTTTTCAGGTCCCGAGAGCCTGTAGGAATATTTGTCACTCAACTCTGGGGAAAATCCACCTAAATCCAAGGTAACATTTCTCATTAAGAAATTATCATTTGAGCCAGCCAGATTTGACTCGATTAACATTGCAGCCAAATCAAAACTGGCCTGCCCAGTAAATAATGGGAGGCTTGCAACAACCGACACACCATCCAGCAGCATATGGTTTCCTCCTGACCCAGACACAGACTGATCGACTGCCACCACCTTCAAAATAACCTCTTTGTTCTGGATCTCTCCTACATCCATTATGCATTCCAAAGAGAAACTATACACCATTTTTCTCTTCAACTTGAACTTCGTTGACATTCTTACATGATCGATCTGCACCACTAGGCCCACAATGACATTCTCAGCCTTCAATCCAAACAATTCACCTATATCAGGAGCCTTCTCCTGAGGCGGCAATTGAACACCATCAACCATCACGTTGCTTAACGAGATTCTAACACCCTCGAAGTTAGAGACAACATACCCCATTGCGATATCCTCCACAAACATAGCTCTGGAAACATTTTGATTCTTAACCATTAAGGCAAAGTCAGTCAATTCTGCTAACTCAATTTGACTATCATCCTCTAGCTCTAGGACTTCATTGAACCAGAAAAATGACTTCAGACAAGATGTTGAAAGGACTAATGGGTTTACCATTGAAGATAGGACCAGCTGGGTCTTGAAGTTTGTGCAAATCTGCTGCGGACTAAGTCCTAATTCCCAATCTGTGTAGCTTGACTGCCTTATGTGTGCTAAGGCACAATCACTTTGTTTAACTATGTAAACACTGTTGTCTCTGGTCTTCAACAGGTGACTGATGATACCAAGGTTTTCATTCATCATGTCTAAAGCAATGCAGACATCCAGAAATTTTAGCCTCCCGCTATCCATTGTTCTGCTGACCTGAAGATCATTCATAAATGGAGTCAAGTGTTCGTCAAAAAGAACTGGATAATTTCTCCTTATAGATTGCAGAACATGGTTCATTCCCAGTTGGTCTTCAATTTGTCTCACCACTTTAGGCTTCACAGCCCAAAAAAAGTTTTGGTTGTTCAACACCAATGGCTTTTGGGGCTCTTTAACTGTGGAAAACACCCACTCTCCAAGTTCACATGCATTTGTTAGGACTAATGAAAAATAATCCCACAAAATAGGTTTTGAAAACTGACTCACTTTGTTAAGTGAGTTGTTGCAATATATGATCTTGGGCTTTAACGCACATATTTCACATGTACAAGCACTTACACCTGAATACACTTCTTTTATGTATAAGAATCCCCCTTTCCCATCTCTAACGCACTTGCTACCCATGCTTTTGCAGAACCCAATAAAACCTGAGGCAACGGATGACTGGAAAGCTGACTTATTAATTGACTCAGCAAGGATCTTCTTAACTCCTTTTGTGAAGTTTCTGGAAAGTTTGGATTGCAAGGTTTTAATTAAAGTTGGCACTTCCTCCCTTTCAAGAACTCTTCTACTTGTCATCAACTTTGTCCTCAAAACTAACCTAAGATCTCCAAAACTTGATAAATTCACCCATCTATAGTTCAACACGCGATTAACTTCTTGTTCACTGCAACCTGCATACTGTAAAAAACCAGTCAAGGCCTCATCACCACCTCTACCAATCAAATTGATCAGATTCTCCTCAAATATTCTGCCACGCTTTATATCATTAAAAACCTTTCTGGCACAGTTCCTAATAAAAGAGGTTTCCTTGTCATCATGAAAGATAGCTTCAATCTTTCTCTGTAGACGGTAACCCCTTGAGCCATCCACCCAGTCTTTCACATCTTGATCTTCAATAGCCCCAAAGGGGGTCTCTCCATATCCGGAGTATCTAATTAATTGGTTAACTCGCTTAGATATTCTTGTCACTATTTTGGTGCTGACTCCATTTGCAATGCATTGATCACAGATGGTATCTATAGTTTCTGACAATTGTGTGGGTGTTTTACACTTTACATTGTGTAAAGCTGCAGCAACAAACTTTGTGAGCAATGGTGTTTCTTCACCCATGACAAAAAATCTTGATTTGAACTCTGCGACAAAAGTCCCGATGACACTCTTGGGGCTGACAAACTTATTCAATTTAGATGACAGAAACTCATGGAAGCAGATCATCTCGAGCCACTCCGCAGCATCTGAACCCCCTTCTATATCCAGAGAAGGTGTCTTGATAAGAGTGATCTGATCGTCACTAGAGGTATATGACACAGGGATTACATCATACAAAAGATCGAGTGCATAACACAAAAATTGCTCTGTGATTAATCCATACAAATCAGAAGTGTTATGTAGTATCCCTTGCCCCATGTCCAAAACAGACATAATGTGACTAGGAATCTGACCATTTAACTGCATGGTCTGATGGAAGAATTCTTCACTCAAACTGGTGGAACCGCAGCCCATCAATCCAAGGGACCTTTTTAGCTTTCCAATACAGTAGGCTTCAGCCACATTGATAGGCACTTCTACAACTTTGTGAAGGTGCCATTTCAGTATACTTTTAACAGAATCAAGATCAATTTTTGACCTGTCAACAGGGGTTCTCAATTCCAGCATTTGTAATAATGCCAGGAAAAGTGCAGGACTCATTGTTGGACCCCATTTTGAGTGATCATAAGAACATGACAAATCACCATTATTCACTGCCATCTTCATGTCACAAATGGCCCGTTCAAATTCTTTTTCAGAGTTCAGACAGGTGTACTTCATAGAATTCCCTACAGCTTCAGAAAAATCCTCCACCAATCTTGTCATCAGTTTTGTGTTGAGGTCTCCTACATAGAGCTCTCTGTTTGAACCCACCTGTTCCTTATAACTTAGACCAAATTTAAGGTTTCCTGAGTTGGAACTAATGCTTGTGAACTCAGTGGGCGAATCTTCAGAATAAAAACACAGATTCCTTAATGCGGCATTGGTGAAGTAACTTTTATCCAACTTGTCTGCAATCGCCTCTGAGTTGCTTTCTCTTATACTAAGTCTAACCTCGTCTTTGAGTCTTAATGTCTCATCGGTGAAACCCAGTCTAGATCTGCTTTTGTGCTCATAACTTCCTAGTTTTTGATCAAAGTGACCTTGTATCAAGAGGTATTTAAAACACATAAAATACTCTTCGTCCACATAACTTGATGTGGTCAGATTTTTCAGCAGCAACCCCAAGGGACAGACATCAAGTACTCCCTCAAGGAAGAAGTTGCATTTTTCTGACGATTTGTAAACTGCGTCACACAACTCCTTGTACACTTCAGGAGGAAGAACATCTGGGTCAAAATCCTTGACTTCGTGTAACGATACTTCAGCTCTAATCTCTTTCATCACCCCAAAAGGTGACCACAAATTGTCCAAAGGATTATTCCCATTTTTTACTGAATTATCAGCTCGGCCGAGATTTTTAGTTCTTGTGTTCACACTGTTGTCAGCCATCTTGGCTAAGGCAACTTGTACATCATGTTTAATTTCGTTGAATGATTCAACCTGTTCTTCTGTTAACGCCTCGTACATTAAAGACAATTCTTCTTGAGTACTCTTAGCTTTCGGCCCTGCACTCACCAAACCTGTCAGATTTTTTAGAATCAAATAGTCAGTTGAATCTGGATCTAGATTGTACCTTCCTTTGGTTTTAAACCTCTCTGCCATAGAGGAAACACATGCTGACACTAGTTTTTCCTTGTCATAGGTGGAGAGGATGTTGCCTAACTCATCTAGTTTTGGTATAACAACACTCTTGTTACTTGATAAGTCCAAAGCAGTACTTGTTATATTAGGTCTAAAGGGATTATTTTTAAGCTCCCCAGAAACCTTTAACTTTCCCCTATTAAACAAAGACACACAATAATTTAAGAGTTCTTTACACACACCTGGTGTCTGCACATCCTCAGTGTCCCTTAAGGATTTTGAAAAAAACTTCTTTAAACCATTTATCATAATGTCTTCCTGATCTACAGTCAGCTTTCCATTTAGAGATGGGTTCACCACAGCACATCCAAACTTAACTTTGGGCTCAATGAACTTCTCAAAACATTTCATCTGATCTGTTAATCGGTCAGGCGTTTCTTTTGTGATTAAATGGCAAAGGTAACTAAC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| 110,268
|
NC_004292.1
|
Mammarenavirus tacaribeense
|
Iapalucci,S., Lopez,N., Rey,O., Zakin,M.M., Cohen,G.N., Franze-Fernandez,M.T., Lopez,R., Lucero,M., Ochoa,A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-03
| null |
Mammarenavirus tacaribeense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,102
|
RefSeq
| 2
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Tacaribe virus segment L, complete sequence
|
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| 8,975
|
ON648817.1
|
Mammarenavirus tacaribeense
|
Goes,L.G., Fischer,C., Campos,A., Drexler,J.F.
|
Charite - Universitatsmedizin Berlin, Institute of Virology
|
Germany
|
2022-11-21
|
A354_Art_pla_BRA_2011
|
Mammarenavirus tacaribeense
|
Mammarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 7,059
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Artibeus planirostris
|
feces, abdominal cavity
|
2011
| null | null |
Tacaribe mammarenavirus isolate A354_Art_pla_BRA_2011 segment L, complete sequence
|
TAGGCGTTACGTGCACTCTTCTTTATTGGGGTACATTTCACAAAACTCTCCAAGCATGGGCAACTGCAATCGAACTCAGAAGTCCAGTCCGTGCTCTTCCGATCTCGAGAAGCCACCACAAGCAGCAGAATTCAGAAGAATGGCAGAGCCCAGTCTGTATGGGAGATACAATTGTAAATGCTGTTGGTTTGCTGACAAAAACTTGATAACCTGTAGTGACCATTACCTTTGTCTAAGATGTCACCAAATCATGCTGAGAAACTCAGAACTGTGCAACATCTGCTGGAAGCCTTTGCCAACATCTATAAGAGTTCCACTGGAGGCAAGCGCTCCGGATCTGTAACCAACAACAAATCAGGTCACTGACCTCCCGGGGGGCCCCCAAGGGGGCCCCCCGTGGGGGTGACCCCCGGGGGAGTTTGGGCTCTACTCAATGTCCTCTACAACGTTTCTCCTGGCTAGAGGTCTGCACATAATGCCTCTCAACCTCAAGGACCCCTGGTTGTCAGACACAACAAGGTCCTTCAGGGATTTGCTGTATGCCACCTTGAAGTTTACAAATTCAACCCAGTCCCCGATCAGCTCCAGGGATCTAATCAAGCCAGATCTATGTAAATCATAGACAAGAATAAAGTCTTCTTGTTGGAATAGTATTATCTGTGCGGTTGATTTTAAATAAGGCCAGAGTTGGTTTAGCAAAGCATTAACATCTTCAGGGTCATCCAATGCACCAATTGCCTTTACTATTATGTCGCCAGTCAACTCCACTCTGTAAGTGGAAATTTTCTCAGTTCCCACAAAAAAGTTGCCATCTCTTAACACCAATGGCTCCCCCTGGTCAACTGGTCCATTGAGTGTATAAGCATACTTGTCACTTAATTCAGACAAAAATCCACCAAAGTTGAATTTTACATCCGTCAGGACTAGGTTGTCATTTGTTTCCACAAGATCTGCATTCATCATCAAGGAAGCCATGTTGAAAGTGCCCTGACCTGCAAATATAGGAAGTCCTGCAATCATGGAAACTCCATCCAGCAAGAGGTGACTTCCTCCTGACCCTGACACTGACTGCGTCACATTCACCACCTGCAGCTCTACACTTGCTTCTTTAAGATCAATGACTTTGGAAACACACGTCACATTAAATGAATAAGTCATCTTCCTTTTAAACCTGTACTTAGTTGATGTTCTAGAATGTTCCACCTGGATCAAAAATCTCAAGTCACAGTCCTCATGGTCACCAAATCTCCCAAGAAGGTCCAGCAGATCACTGATGTGTTCACCTGGAACCAGTGGATGTCCTCCAATTATGATTTTATCAATATACATTCTGACATCCTCGAGATTTGAAATCACATAGCCCATTGCTATGTCCTCAATAAACATCGCTCTACTGATCTTCTGATCCCTAACTAAGAAGGTGAAATCTGTCAACTCACCCAGTTCAATCTGACCGTCATCTTCCAGTTCTAAAACTTCGTTGAACCAAAAAAACGACTTTAAGCAAGAAGTTGACATCACTAAAGGGTTCACCATCGATGACAGGATGATTTGAACCATAAAATTGCAACAAACCTGTTGAGGACTCAACCCGACTTCCTTGTCTATGTAATCAGATTGCCTAACGTGCGCCATGGCACAGTCACTCTGTTTAACTATGTAGACACTATTGTCTCTGGCTTTCAGTAGATGACTGACGATGCCTAGATTCTCATTCATCAAATCCAGTGCTATGCAAACATCTAAAAATTTCAACTTCCTCCCATCCAGTGTTCTATTCACCTGCAAATCACTCATAAAGGGAGACAGATGTTCGTCAAACATTTTTGGGTAATTTTTCCGAATGGAATACAATACATGGTTCATACCTAGTTGGTCTTCTAATTGACGAACAACTCTAGGCTTGACAGCCCAGAACAGATTTCTGTTACTTAACACCACAGGGATTTGTGGCTCTTTCACAGATGAGAACACCCACTCCCCTATTTCACAAGCATTGGTTAAAACTAAAGAAAAGTAATCCCAAAGAACAGGTTTGGAAAATTTATCAATTTTTTCTAGTGAGGATCTGCAGTAAATCACACCTCTTTTCACATTGCACACTTCACACAGACAAGGTTTAACTTTTGCATAAATATCTTTAATGTAAAGGAAACCGCCCTCACCGTCTCTGACACATTTGCTACCCATACTTTTACAAAACCCTATAAATCCGGATGCCACTGAAGACTGGAATGCAGATTTGTTTATGGATTCTGCTAGGATCTTTTTAACACCCTTTGTAAAGTTTCTTGACAACCTAGACTGTAATGTTTTGATCAGTGTTGGCACCTCTTCTCTCTCAAGAACCCTTCTGCTTGTCATTAGCTTGGTCCTCAACACTAGTCTTAGGTCGCCAAAGCTTGACAAATTCACCCATCTAAAGCCTAAGGCATGCATAATATCTTGTTCTGAGCAACTTGAATAACGCAAGAACCCCACAAGAGCGTCATCACCACCTCTACCAATAAGACTGATCAGGTTTTCCTCAAAAACTTTACCTCTTTTTATATCATTAAAAACTCTCTTTGCACAACCTCTGATAAAGCCTGTCATCTTATCATCAGCAAATATAGACTCAATCTTCCTTTGCAGTCGGTAACCTCTCGTTCCGTCCACCCAATCCTTAACATCTTGTTTTTCAACAGCACCAAAAGGGGTTTCTTTAAAACCAGAGTATTTGATCAGTTGGTTCACCCTTTGAGAGATCTTTGAGACAATTTGGACACCAACACCATTTGCAATACACTGGTCACAGATGGTGTCTATTGTTTCTGACAATTGTGTTGGTGTTTTGCATTTCACATTGTGCAATGCCGCAGCAACAAACTTAGTCAACAGCGGAGTTTCTTCCCCCATCACAAAGAACCTTGATTTGAATTCAGCAACAAAGGTGCCGGCTACACTTTTAGGGCTGACAAATTTGTTCAATTTTGAGGAGAGGAACTCATGAAAACACAACATTTCCAACCACTCATTATTGACTTGATCATCATCTGAAGCACAAGGCAATTTAATAAGTGTAACCTGGTCATCGCTAGAAGTGTAGGAAGTAGGAATGACATCGTACAGTAAATCTAACACATAATTCAAGAACTGTTCTGTTATTAATCCATACAAATCAGACATGTTGTGTAGTATGCCCTGACCCATATCTAGAACAGACATTATGTGACTTGGTATCTCTCCTTGGACTTGCATGAATTGGTGGAAGAATTCTTCTCCCACACTTGAGCTACCACAACCCATCAACCCTAAGCTCCTTTTTAAATTTCCAGTACAGTAAGCCTCAGCAACATTCACCGGTACTTCTATAACCTTGTGGAGGTGCCATCTCAGCACATTTAAGACTGGCTCAAGATTAATAATGTTCCTCTCTTTAGGAGTCCTAAGTTCCAAGAATTGAAGAAATGTCAAGAAAAGCGCAGGACTCATGGTTGGCCCCCATTTAGAGTGATCAAGAGAACATGATAGATCACCATTGTTCACCGCTAACTTCATATCACAAATGGCTCTATCAAACTCTTTTTCTGAGTTGAGACATGTATACCTCATAGAACTGCCAACTGCCTCTGCAAAGTCTTCAACTAACCTTGTTATCAGCTTAGTGTTGAGATCCCCAACGTAAAGTTCCCTATTGGAACCCACTTGCTCCTTGTAACTTAGGCCAAACTTTAAGTTACCATTATTTGAGCTAATACTGGTAAACTCAGTAGGAGAATCATCAGAGTAAAAGCACAGGTTCCTCAATGCCGCATTGGTGAAATAACTCCTATCCAGCTTATCTGCTATAGCTTCAGAATTGCTCTCTCTCATGCTAAGTCTCACTTCATCCTTCATTCTCAGTGCCTCATTGGTGAAACCTAGCCTGGATCTGCTCATATGTTCATAACTTCCTAGCTTTTGATCATAATGACCTTGTATCAATAAGTATTTGAAGCACTCAAAATACTCTTCATCAAAATATGCAGAAGTAGTGAGATTTTTCAGAAGCAATCCCAGAGGACAAACTTCTAAAGGTTTCTCCAAGAAATACTCTAGTTTGCTTGAAGAGTAATAGATTACATCACATAGCTCTTTATATAAGTCTGAAGCGAGCACATCGGGATCAAAGTCCTTCACCTCGTGAAGTGAAACCTCTGTTTTAATTTCTCTCATAATTCCAAAGGGACCCCAAAGTTCTTCGAGTGTGCTTGCGCTGCTTCCAAGCTTACCTTCTCTCTTGTCCGGACTTAGACTGACATTTCCCGACTTGGAATCCTTCATTTTAACCATTGCTAATTGCACGGAGTTTTTTATGTCATTGAAAGCCTCTACTTGTTCTTCTGTTAACCCTTCAAACATCATTGATAGCTCTTCACAGTCTCTCTGGGTTTTGGAGCCAACACTAACAAGCCCGGTTAAGTTTTTTAGTATCAAGTAATCTAATGTGTTTGGATCAATATTGTATCTTCCTTTTGTTTTGAACCTTTCTGCCATGGAAGAAACACAAGAAGAAATCATCTTTTCTCTGTCATACACAGAAAGGACATTCCCGAGTTCATCTAGTTTTGGTACTACTACGCTCTTATTGCTAGAAAGGTCTAGAGCGGTGCTGGTGATGTTTGGCTTGAATGGGTCATTCTTGAGTTCACCTGTTACTTTCAGTTTTCCCTTATTAAATAGTGAGATGCAGTAACTCAACAGTTCTCTACTAACCCCTGGTGATTTGGTGTCAGAACAGTCCTTGAGGATTTTTGAATAAAATTTGTCCAGCCCATTTAACATCACTCCCTCTTGTACTTCTGTTAGTTGACCATTTAAGGATGGGTTGACTACAACACAGTTAAAATCTATTTTAGGTTCAATGAACTTCTCAAAGCATTTAATTTGGTCTGTTAATCTGTCAGGTGTCTCTTTTGTTATTAAATGACAGAGGTAACTCACATTTAGAAGATACTTGAACCTCCTAGCAAAGTAGGGGTCCGAATCAACACCCTCCCCAAGAAGACATTGGAAAAGATCCACCGCTAGCCTCTGAACTGTGATTTCAGATCCAGACAGACATTCTACTTTTAATTTGGATAGCAGATCCACGTGGTGGAATTGATTTGAATATGCCATCAAAAAATACCTTAGCCCTTGTAGAAATACTTGATTTCTTTTTGATGGGGCGCATAAAATGCTTAGCAATAAAAGTCTTAGTTTCTCTTTGGATATCCCCATAAGTTCATTATTGAAGTCCAACCAGGTTGTCATCTCATCACACATCTCAACCAACACTTCCTGTGAGAAGATTGGCAGAAAGAATCTTTTTGGGTCACAGTAAAAAGAGCCTTTCTCGATAAGAACACCATCCTCACATGTGTAAATTGAGTAGCATCTTGAACGCTCACCTGTTTTTTGATAAAAAAGAATAACAATCAGCCCATCAGTTAAAAAGAATCTCTGTTGGTAACACTCTCTTAGTCTCACGTTGCCAAAATATCTTGAGTATTCTCTTTCATTAATAAGCAACCTTGATGAAAACGAGGTTTTCATGGAATTTATCAAGGAAAGAGACACTGAGGAGAGTATTCTGAAGGCTTCAACCTGTTCAGCATCAGACATCGTGTGAAACTTCTTATGTTTACAATCAGTATTGAGATTCCCCTCAGCAGAGTATCTCATAATGGGTCTGTCAGAGGATATTGTCTGAGCTATTGATATTAGTTTGGACAAATCAGGGTGCCTTGCCCACACCGATATCTGTGACCAGATGTCTTGTTGAGTCCTTCTCAAGATTTTAGAGCAATTCTGCACCCACTTAACATTGGTTTCTATTTTCTTTTTTATTAATTTTACTGCCTCCAAAAAATCCAGGGCTCTGTCATTGACCAGTGTGACCATTTGCCCTAGAATGAGACCAGACCTTTTCAGAGAATTCAGTGCTTCGGGGTTGGCTGTGAATAGATCATCTAAAAAATTCACCATGATGAGATCCAGAAAAAGCAGTGTGTTCCTTCGGGTGTTAAAGACTTTCAACCCCTTGATCTTATTGCAAATCGATAACACACCTAAATAGGCCTTTTCATGAGGGCAGGCAACACATTGATCTAACTCAGAGTTTGATTTCTCTTCGTTCTGCCTCTTTAGTGCTGTGAAAGTCAAACTATAGATTATGTCCATAAACTTGTTGACACAAAAAGGACAGTCTGAGGTGGTGTTATCCTCATGTTTACCTAACCTAGTTAAATTATTCAGAAGCTCTGATCTGTTGGTCTTTTTGAACTTTCCCAAACCCCTGTCAAAAACTTCCTTTTTGTACCAGAGTCTTAATTTCATCAATTCTTCCCTAATCACAGATTCCCGAACATCGCCTTTGACTCCAACGAATAATGACCTAGCCAGCCTGTCATCATATTCCAAAAGGTTCCTTTTGAGACACTCTATGTTCTCAAATCCTAGACTTTGATTACGAACGTTCGAAAGACTGTGTATCAGACGTTGATATTCTTGATCTTCAATGTCAATCTCCGCAGAGGATCGGGATTTTCGCAAAATTTCAATTAACAACCATCTGATTCTCTCTACCACCCATTCAGGAGTGAACCTGTTAGAATAATTGGTTCTGCCGTCAACAACAGGAACAAGTGTGATGCCTGACCTCAAAAGGTCTTGTTTGAGGTTTAGTAGTTTTGTCATATCACTCTTCCACTTCCTTTCAAATTCATCTGGGTTGACTCTTACAAATGTCTCCAGTAATATTAGTGTTTTCCCAGTGAGCTTAAATCCATCAGGTATCACTTTGGGGAGAGTGGGACACGGGATTCCATGATCACTGAGGATTACATCAACATATTTCTGGCAGGTGTTCAGGTGGCATGCATGAGACTCACAAGACTCCAACTCCACAAGGTTAGAGAGAAGCTTGAAACCTTCTTGGAGTAATGATCCTGAATGACATTGTGACAGAAAAGCATCTTTCTGATGGGCAAACTCATGCCTATTTGGAATGTGTTTTCTGACCAGGTCTTTGAGTTCAGAAACAGTTTCATCCAT
| 22,100
|
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