Dataset Viewer (First 5GB)
Auto-converted to Parquet Duplicate
sequence
string
label
int64
CTCCCTCCATATCCATAAAACAAGTCGTTTTGGAAAATGGCACGGTCTCCAAAGTCTAACTTTGACTTTTTGTTTTTTATAAAAATATTTATCAAAAAGTGCTATAAATATATTTTTGTGAAAGTATTTTTAAGACAAATCTATTCATATGGTTTTTATATTTTTAAACTCAAAAACTTAAAAGTTATTCATGATTTATAATCCTAATGTTTGATCCAAACCTTGTCCAAAATAACTTGTTTTATGGGTACAGAGGGAGTACTACTCAAAGCTTCTAGCATAGTATAAGTAATAACGCAGTGAACATGGGAAATAGAAGT...
1
AGTATGCGCCATATTTTATATATAGTGACCGATCTGGAGTTCATAGTTTGGGCAAGAAATTGCCATGTGATTGACGTTTAGGCCTCACCCATGTGGCCTGTTTTTGGTCGGAAAATAAAACTGCCTTGTGGTTCCCCAAAAACATCGTCAATGTGCTTGGTGTGCGCCCTAGCTAGACATCCACTTGGTGATGATTAGTATTACCACAAATTTAAAAATACAACCAGTCAAGGTTTGTATGTCAACACTACTAGCTGTGTTTATGTTGGACAACAGTCGCAGGCTAAGCAGCCGACGGCTATATTATTTTCTGAATTTAA...
1
GATGGTGGCATGCCTCCGAAATTTAAGCACAACTAAAAGTATATTTGGGACTTGGCAGATACTAGTATAAGTTTATACGGAGTTGTATACGTTTAGTCAAAAACGAAAGAATATATTAGTAGTAGCAGTAGTAGCATGTACGCTAGCATACACGGTCAACGAATAGCACGGATCGCGGAAGAAGACGACGACGAGGTCTGCAGAGATAGCGATAGCGACGACCCGCGCCCGGGGTGCGCAACTGGCCAGACACGCCAGCGACCGTCTCAGAGAAGCTGCAGCTTGCAAGCGACCGTCTCGTTACGAGTCAAGTGGCACTA...
1
GCTATTTCATCGCTATGTGCATGCACACCGGTACATGAGACAAACGACGTCCTATACAAAATTTTGTCACAGCCCCCAAGCCTCCTGCACATACGCACACAGAGCCACCGCCGGCCTCTTCCTCCTGCCCACCACCGCTAGCTATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGTCGTCAGTACTGATCTGTGCAGCACCAGGGGACTGGATCGATCGGAGAGCTGTGCTGTGAGAGCGCAGCAGGTTTCAGCACGCACATGCACGGCAGCGCACAGCGCCGGCCATGCATATATGCATCGCCTCAGG...
1
TTAAAAAGAAATTATTGGCTATCAATGTCAATATACATAAGAAAAAACAAACACTATAGTGAAAAATTATGTAAGAGAGATATTTCTAAAAGATCATGTTAGATTAGTTATTTATAAGTCGCTAGCTATTCGATCTCTCTTTTTTTATAATCAATAAAAGTGTTACTTTTAAATTATTTTTATATCTCATTTAGCTGGCTATTTGTAATATATTATTAAAAACGTTCTCATAGTCAATAATTTTTTTTTCTAGACTACCGTTAGGGACGCCTAAGACATTCCAAGATTCTGCGCACGTGGACCGACAACCTTCCTCACAC...
1
AGAGACAATGACAACCCCTATCAAGGACAAAGTCGATCCTCCTGGAGGGCTTTACGATCTGACAGAATTGCTTGATGTGGATTTGTCTAGCTACCCAGCCAAGGTTCCTGCAATCACCGATGTAAGAAAACAATGATCAAGCTTGATGAGATGGGCTATTAGTAGGTGTTGCAATTGGGGGAAATCGTGATTTTTGTTGAAGAGTTACCATAGTTAACATTGTAAAAATGTGTGTATTACTTGTTCTGATTTTTCCCCATTGAAAGGGGGTTTATTCATTGTCAGCAACTGCTGCCACACGGCCTCATTCACCCTGCTCT...
1
AATCAACTGGGGAACTTCGGGGCAAAACATCATTTTAGGGGGCAATCATTTAGCATTCGAGAATCATCAAGGGGGCTCATTATAAGCAACCAAGGATATACAAAGGGCTGCAAATCTCTGCCAAACTGCAGCCTTTCTATAAGTTAAACGCTTGTTAGAAACTGCAAAACTGTACAACAAAGAGAGAAGAGGATCTACTTTGGCGAAGTTAACTCTGAACAACGAACAGGATTAATCCGCTAGGCTAGACTCAACTACCGCCATGAAAGGCGCAAAAGCCCTCATTGCATATGAGACCACGCTGAATCCAGGATCTTCAT...
1
GTAGCGTCCATACTGTGATGTTGTTTGTTAATCGATTCACACGCACAGGGTCTCTGTGAGCAATGCAAATCGATCCGGTTTCAGGACATGTTGCAAGGTGTAAAAAAGCATTGGAGATTTGGAGAACACAAAAAGCGAAAACTAAAGGAGTGCACGGTAGACGGACTAGTACATACAATGACAAAAAGGACTGACTTTATGTGCCCAAGCTTTGCAAGGGTCCAACACGCAAAACAAGCGCCTCCGCCCACTTTTCCCCTCCATGCCTCCGGCCGCTCGTGACGCCACACCACACTAGCCGTCCAGCCCTCCCGGTCTCG...
1
ATCATTTTTATATTCCATTTCATGCTTGGCATTAGAAATTGGATCTTTGAAATACATCGTTTATCATGCAGGGTATGTTACTAAACATAATATTGAATGATCGGTTAGTTCTGTTTAGCCATTATTCAGTCAAAACAACCGATTAAACAAAAATAACATACTATCATGTAATATTTTAATAAATAAGTTAAATAACCATTTAGGCGAACAATAATATAATGTCATAACGAAGTTTGGTTCTAGATATAGAAGAGTTGATGGCTATGAAAAACATCCTAAAACTATCTAATGGATTGTCAAAACTCAAAAGCTAAGAAAAA...
1
TATTCAAAATCAAAGTCATCGTCAAAATTTGACCAGAGAGTGCAAGCAGTTTCCAACAGGTGCAGCAATGTAGTGCAAAGCAGCCAAGAAGCTTCCATCCAGTCTAATAAAGGAAAGGCTATCTGATCCCTCAGGCGGACCTTTTTTTTTCTAAAGTCCGGATCGGGTTAGTTGACGTGCAAGAATGGGTCTCCTTTGTTTCTTGGTGAACCATTCTGGTACTAAAACCCACATGACCCAGCCAAACTACAAAGCTGAAGCGTGGGGACAGCACCAACTGAATCACAAGGACAAAAGTTCTTCAAGAACAAAAGTCTGGC...
1
GTCTTGTGAAAGTAATTCCTGAACAACAAATCTACTGGTTATTGATGACTTGGATGGTATGTAAGAATAATACTAAAAAGTGGCACAAATAAAGAATTTGTCAGAACAGGATTTCCATAAAAAGCAATGTATGGTAGCATTCAAATTAGATTCATGGAGCACGTAGTCAACTAGGCATGATAAAGGCATCGGCGTGGTTTGCCTTTTCTCAGCTGACATGTCAGTAGGCCACACCATCAGATGAAAAGGAATTTCAAATACTATTATACTACAACCTCAAAACCAAGCAGGTCTATAATTGATGATGGACCACCAGAACT...
1
TCCAGTGCAGCGCGGTCCACGGGCCACGGCTGGTGGGTTCGGCCTCGGCGACGGACCCCAGAGACACCACCAGAAAAGGAGGGAGGGGGCCTCAAAACCCAACGAAACCGACGCGGACAAGTGGAAAAGTCACGGTTTCTGCCAACACACGCCGAGTGGACGGGGGCCCTTTATTCCCAGTCGCCGGCGCCCAGCGGCGAGCAGACCGTGCGACCCGTTAAAAAAAAAAAATACGCGTCCAAGCTTCTCCTCGAGTCCCTTGACCCAACTCGAGCCTTGCGTGTGTCTCTAAAATAAAAATAGCGCCCGAATCGTACGCC...
1
AAATATAAACCCATTCTCACCTGTGCATGTATACCTACTTGAGAATCCAATCCATTAAATACATTTCAACTTTAACACTAGCAGGTCTACACAGGCCTTGTTTAGATCTAAAAAGATTTTGGATTTTTGACACTGTAGCATTTTTATTTTTATTTGACAAACATTGTCCAATCATAGAGTAACTAGGCTTAAAAGATTTGTCTCACGATTCACAGACAAACTATACAATTAGTTTTTGTCTTCATCTATATTTAATGCTCCATGCATGTACCGCTAGATTCGATGTGACGGAAGATCTTGAAAAGTTTTTTGTTTTTTGG...
1
AGCAGAACTAAACCTAACTACATGAGGTGTGAGTGTGTGATTGCTGACCTGCTAGACATCCAAAGGAGATGCTAGTTTGGAGGATCATGTAGGTTAAGCTAAATGAATAGGGGTGTTTAGTGGACCTAAAGCGTTATTAGTACCAATAACAAAACAATTGACAATATTATATTGATACCCCCAATGAAAAAGCTATAGCGGTGACATAGCAAGCTATTTAGAACCCTAAGTGCAATGGATGAAATGTCAAAGCATCTAAAGTTTTTCATTGATGGTGACTGGTGAGAGATACCTCAATCATGTGTTGTCCTTTAGATGCA...
1
AGTCTTGTAATAGGGTAGCCCATGAATTGGCTATTCTAGGTAGTTCTTGTGATCCAGGTGATGAACCGATTGTGGTTGTTATTCTAACACATATTCAGTATGTAATTGTTGATAATTCAACTTTTGTTTTGAGTAATGAAAATTTATGTTTCTCCTAAAAAAAGATTGGAAGTAGCTTTTGGAAACTCTTAGAGTCTTAGAGATGCTTTAACATGAACACATGTCCTCGCTTCCAAGAAGATGCATTAGCAATGGACGACTGTATAGATAGGTCACTTACTATTCACACATTATTCATAGAAGTTTTTTTTTCCTATCTC...
1
TCATCCTAGATCCAAGAAGTAATCTAAAGCTCTACATCAAGGTGCAAATCTACAACATCACTTCGGTCATCATGGCAGAAACTGCGGCTATGGCTTTTGCAGCCAAAGCTTCTTCTATGCTTCAGATTGAGGAAGTTTCTTTCCTCACTGACAGCCAACTCCTGGTAAACTACTTCAATGGTCCTGACCTCAATCATCCACCACATTGAGATGCAAAGCCTTTCACTCAAAGATTCATAAACTCAGTGTCCAACAAAAGGATCCAAGGCCTTGTTTAGTTCCCAGAAAATTTTGCAAAACTTTTCACATTCCCTGTCACA...
1
TGGCGAGGAAGAGATGAATCTCTCGGTGCAAAGGACGACGTCTCGCCCTATATTTATACACGCGTCTTACACAGCAAATAGGCAAGCAATCAATCACCGTATTATGGAAACTCCGCGCACCCGCAAGGGTTGAAGCGGGAAATCGCTGGACCATTCACACGCATGTCGTGCGTGCGCGCCCATTGGCCCCGCCGGCCCGGCCCGGCGAGGCGAGGCAAGCGAGCGCGCACGCGCGTGTGGTTCTTCCTTTTCCTCTCCCCAATTGCTTCAACAAGATGGAGGTAGCTCAACTTTTTAAGTTGGCATCACTCCACTTGAAG...
1
AACATATGGCCATACTGTTTCTTTGGCCATCTTTAAGAAATGTCAAATAGGAACTTCTGCATAAAAAAAAAAAACTTCATCGGTAACTTTCATGGCAGATGGTTCCTGGGACATTTCCATTTTTTTATGTCAAGTTAATTACTTACTATAGCGTTGTTTTGTTCGTAGGTGGTGGAAGCGGCCATGAACCTGCCCATGCTGGATTTGTTGGGCCAGGGATGTTGACCGCTGCTGTTTCTGGAGATGTTTTTGCTTCTCCACCTGTTGATTCTATTTTAGCTGTATGTTTCTTTTTCGTAAAACTATGTCTAGCTTCTTAA...
1
AAGCAAGAGCAAAGGAGCGATGAAGCTAGGGTCCGAATCGCGAGGAAGACGGTGAGGTCGTGGCGGTTACCCTGTCGCCGTTGGCCTGGGGAAACTGGAGGGAAGAGATGTTAGTTGGGGTTTGACTGACCCCGGCTTATATAGAGGCCCGTCGCCGACCAAAACAGATGGCAGAATTGACCTGTTTCTCCTGGTTAGTGAGACAGAGCCTCCTACAAAACAGGACAAGAGTTTGTTCACAGTTAATAACTGAATCTTCCGCAAAATAATAATAATAGATGAAGCAACATTTCCGATAAAAAGAAACATTGAGCCACCAC...
1
CATCATCAGCTGGAGGTGGACAAGCTCACACATGCACTAGGCAAGTGTTATATTAGTGAGGCCAAGTGGGATAATGTCTAAGTAATCACTTTCCTTGAATAAGGAAGGTCTAGGGTATGCACCGAAGAAGGACAAGAAAGCATTTGCTCCTCACAAAACTACTTTCTTTTTCAAATATGCAGGAGAGTTGTGCATCATTATATTAGAAGATAGAATGGTCTGAGTACAAAATGGTTCCATAGCTTGGGTTAGTTTCTTTTGTTACATTCAAGCCCTTCATAAAACTACTTTTGTGACAAAAAAAATGGAGTATAAGGGTG...
1
GAAGGGAAAAAATAAAATAAAAGTTTGATTATCCAATTAATTTTGTGGTGACAGATCTGAAACTTTAAAGCACGGATCAGCAGTAGCTGAACCGAACCTCATCAAGAGCAGCCAAGAACATGTCATCAGCAGGTCGGTAGCAAGTTGAGTTAAAAATAAGACAGAGGGATCGGTGGCAAGTTGACACGGCACTGAGTGTAGATATTTTCATGTGCTAGTGCAGAAGTTAACCGCATGTAAAAAGCTAGGGCACAACACTTAGGAGGTGTTTGGCACTGCTCCACGAACTCTGCTCCACAAACTCCACCATGGAGCAGCTC...
1
ATAATGACAGCCCACTAGAAACCCAGCGATGCGGCCCATTAAGCTACCGACTAGGAGTCCAGCTCGAGAGCCTGACTATTAAATGCGGAATGCCTGATGGTACCTTGGCACCTTGCTTAACTTAACCTATGCCATATAACTAGATCTCCTTGATGCCCATACCTGATTTCCATCCGCCAACACACACAACAATGCTCTCAAGTCCATTTACCCATGTCCCATGACGATTTACACACTACTAATAATTGTAATTCGTAGGAGTACAATGCCCTGTGTATAATAAGGCGGCCAATAAGCCGGGGCAGACCGCACTAGCTAGT...
1
TTTGATGGTGAGGCGGATGTTGTTGATTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTTTCGCTATCATCGTATCAATTTGCCTGGTTACTCACTCCGGTTACATACACTATATAAACGTAGTGGCACGTTGTTTTTGTAGTCGGCCAATTTTGACTGTTTAAGTGATTGTTTGGTTAAATAATGGCTAAACGACAAGTAATCAAATCCGTTTAGGGGCACAGCGATATTTTCCTAATCTATATTTGTTCTTTTTAATACAATCGGTAACTCTCTTGTTTGTTTTGTTTTAATAAATAAAAAATTAAGAAAATGA...
1
GCTCCAAATACTTTATTTGGGTTCTTCATGTTTCATAATGTCTCCGAGAATTTTCCCCGAATTTTTAGAGCTTTCGAAGTATTTTCGCGGCATAAATAGTAATTCTGGACTTTTGTAGGATTATTTTATCGACAAAAATAACTAATTCCGAAAATAATAAATCCTTCAGTTTATCTCAACGCTCAGCCCATGATCTCAAAGGCCAATATATTTATTTGCTAGTGGGCTTTAATAATTAATTAGGCCTATTAGTAAAGATCAAGGTTGCAAATCAATTAGTACCATATCGCTAGTTGACGTGGAGTTAGAAAGTTTCTCTC...
1
End of preview. Expand in Data Studio

Full Conservation Within Andropogoneae

This dataset contains 8,192 bp Sorghum bicolor v3 sequence windows for the Evolutionary_constraint split from kuleshov-group/cross-species-single-nucleotide-annotation.

Columns:

  • sequence: 8,192 bp DNA sequence window.
  • label: original binary conservation label.

The source coordinates match:

/workdir/jz963/genomes/Sorghum_bicolor_v3.1.1/assembly/Sbicolor_454_v3.0.1.fa

Window definition:

chrom:pos-4095 through chrom:pos+4096, so the original center base is at position 4096 using 1-based sequence indexing.

Downloads last month
68