Koushul's picture
Add xenium_skin_mixed sample13 SpaceTravLR outputs (no perturbations) (part 8)
8c93514 verified
Raw
History Blame Contribute Delete
2.62 kB
format spacetravlr_training_log v1
gene Acvr2a
seed_only false
per_cell_cnn_export true
cnn_epochs_config 10
learning_rate 0.0002
lasso_n_iter_max 100
lasso_tol 0.0001
# summary: cluster_id, n_cells, n_modulators, lasso_r2, lasso_train_mse, lasso_fista_iters, lasso_converged, cnn_epochs_ran, cnn_mse_first, cnn_mse_last
cluster_id n_cells n_modulators lasso_r2 lasso_train_mse lasso_fista_iters lasso_converged cnn_epochs_ran cnn_mse_first cnn_mse_last
0 263 636 0.956319 0.000235 100 false 10 0.000733 0.000323
1 752 636 0.708597 0.000059 100 false 10 0.000184 0.000078
2 4234 636 0.725168 0.000288 100 false 10 0.000970 0.000496
3 3435 636 0.565913 0.000080 100 false 10 0.000088 0.000085
4 77 636 0.196656 0.000017 100 false 10 0.000989 0.000096
5 220 636 0.648711 0.000046 100 false 10 0.000070 0.000051
6 2395 636 0.776468 0.000094 100 false 10 0.000190 0.000102
7 14 636 0.195357 0.000021 100 false 10 0.000269 0.000030
8 534 636 0.750437 0.000030 100 false 10 0.000099 0.000053
9 232 636 0.785258 0.000021 100 false 10 0.000025 0.000023
10 108 636 0.904967 0.000062 100 false 10 0.000073 0.000061
# cnn_mse_by_epoch: cluster_id, epoch, train_mse
cluster_id epoch train_mse
0 0 0.000733
0 1 0.000599
0 2 0.000501
0 3 0.000432
0 4 0.000386
0 5 0.000356
0 6 0.000337
0 7 0.000326
0 8 0.000322
0 9 0.000323
1 0 0.000184
1 1 0.000160
1 2 0.000139
1 3 0.000121
1 4 0.000107
1 5 0.000096
1 6 0.000089
1 7 0.000083
1 8 0.000080
1 9 0.000078
2 0 0.000970
2 1 0.000757
2 2 0.000598
2 3 0.000494
2 4 0.000443
2 5 0.000435
2 6 0.000455
2 7 0.000480
2 8 0.000495
2 9 0.000496
3 0 0.000088
3 1 0.000087
3 2 0.000087
3 3 0.000087
3 4 0.000086
3 5 0.000086
3 6 0.000086
3 7 0.000085
3 8 0.000085
3 9 0.000085
4 0 0.000989
4 1 0.000713
4 2 0.000472
4 3 0.000277
4 4 0.000136
4 5 0.000052
4 6 0.000020
4 7 0.000027
4 8 0.000059
4 9 0.000096
5 0 0.000070
5 1 0.000062
5 2 0.000056
5 3 0.000052
5 4 0.000051
5 5 0.000051
5 6 0.000051
5 7 0.000052
5 8 0.000052
5 9 0.000051
6 0 0.000190
6 1 0.000166
6 2 0.000145
6 3 0.000129
6 4 0.000117
6 5 0.000109
6 6 0.000104
6 7 0.000101
6 8 0.000101
6 9 0.000102
7 0 0.000269
7 1 0.000210
7 2 0.000156
7 3 0.000110
7 4 0.000074
7 5 0.000047
7 6 0.000031
7 7 0.000024
7 8 0.000024
7 9 0.000030
8 0 0.000099
8 1 0.000090
8 2 0.000082
8 3 0.000075
8 4 0.000070
8 5 0.000065
8 6 0.000061
8 7 0.000058
8 8 0.000055
8 9 0.000053
9 0 0.000025
9 1 0.000025
9 2 0.000024
9 3 0.000024
9 4 0.000024
9 5 0.000023
9 6 0.000023
9 7 0.000023
9 8 0.000023
9 9 0.000023
10 0 0.000073
10 1 0.000071
10 2 0.000069
10 3 0.000067
10 4 0.000066
10 5 0.000064
10 6 0.000063
10 7 0.000062
10 8 0.000061
10 9 0.000061