Datasets:
Min275
/
RNA_LLPS_data

Dataset card Data Studio Files
xet
 Community
1
RPS ID
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5
10
Event type
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6 values
Gene symbol
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1
25
Natural/Synthetic
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Full length/Truncated isoform
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Scaffold RNA
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Organism
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Genomic location
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36
Gene ID
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18
Gene type
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Transcript ID
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18
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Condensate
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Evidence type
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5
205k
RPS_83672
Expression
MATN2
Natural
Full length
No
Homo sapiens
chr8:97869064-98036724(+)
ENSG00000132561
protein_coding
ENST00000254898
protein_coding
Stress granule
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83673
Expression
MATN3
Natural
Full length
No
Homo sapiens
chr2:19992052-20012668(-)
ENSG00000132031
protein_coding
ENST00000407540
protein_coding
Stress granule
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83674
Expression
MATR3P2
Natural
Full length
No
Homo sapiens
chr3:181146233-181146463(+)
ENSG00000242140
processed_pseudogene
ENST00000487828
processed_pseudogene
Paraspeckle
High throughput (LLPS perturbation)
GACTATACAATCCCAGATGAGTATAGAATTGGACCATATCAGCCCAATGTTCCTGTTGGTATGGACTATGTGATACCTAAAACAGGGTTTTACGGTAAGCTGTGTTCATTCTTTTATACAAATGAAGAAGTTGCAAAGAATACTCATTGCAGCAGCCTTCCTCATTATCAGAAATTAAATAAATTTCTGAATAAATTGGCAGAAGAATGCAGACAGAAGAAGAAAACTTAA
RPS_83675
Expression
MAVS
Natural
Full length
No
Homo sapiens
chr20:3846834-3876118(+)
ENSG00000088888
protein_coding
ENST00000428216
protein_coding
RNP granule
High throughput (LLPS enrichment)
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Expression
MBD2
Natural
Full length
No
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protein_coding
ENST00000256429
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P-body
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83678
Expression
MBD3
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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ENST00000434436
protein_coding
RNP granule
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RPS_83679
Expression
MBD3L1
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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protein_coding
ENST00000595891
protein_coding
Stress granule
High throughput (LLPS perturbation)
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RPS_83680
Expression
MBD3L2B
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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protein_coding
ENST00000636986
protein_coding
Stress granule
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83681
Expression
MBD3L3
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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protein_coding
ENST00000333843
protein_coding
Stress granule
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83682
Expression
MBD4
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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ENSG00000129071
protein_coding
ENST00000429544
protein_coding
P-body
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83683
Expression
MBD5
Natural
Full length
No
Homo sapiens
chr2:148021091-148516971(+)
ENSG00000204406
protein_coding
ENST00000642680
protein_coding
P-body
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83684
Expression
MBIP
Natural
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No
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RPS_83685
Expression
MBL1P
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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lncRNA
Paraspeckle
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RPS_83686
Expression
MBL2
Natural
Full length
No
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protein_coding
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RPS_83687
Expression
MBLAC2
Natural
Full length
No
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RPS_83694
Expression
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Natural
Full length
No
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protein_coding
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protein_coding
P-body
High throughput (LLPS enrichment)
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Natural
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Expression
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Natural
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RPS_83697
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RPS_83698
Expression
MBTPS1
Natural
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No
Homo sapiens
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ENST00000343411
protein_coding
Stress granule
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RPS_83699
Expression
MBTPS1-DT
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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lncRNA
ENST00000565382
lncRNA
Stress granule
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RPS_83700
Expression
MC1R
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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ENSG00000258839
protein_coding
ENST00000555147
protein_coding
Paraspeckle
High throughput (LLPS perturbation)
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RPS_83701
Expression
MCAT
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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protein_coding
ENST00000290429
protein_coding
Stress granule
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83702
Expression
MCC
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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RPS_83707
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Natural
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MCHR2
Natural
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No
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RPS_83712
Expression
MCIDAS
Natural
Full length
No
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RPS_83713
Expression
MCL1
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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RPS_83714
Expression
MCL1
Natural
Full length
No
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ENST00000369026
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High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83715
Expression
MCM10
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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ENST00000378714
protein_coding
P-body
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RPS_83716
Expression
MCM2
Natural
Full length
No
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protein_coding
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RPS_83717
Expression
MCM3
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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protein_coding
ENST00000596288
protein_coding
P-body
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RPS_83718
Expression
MCM3AP
Natural
Full length
No
Homo sapiens
chr21:46235133-46285611(-)
ENSG00000160294
protein_coding
ENST00000291688
protein_coding
P-body
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Expression
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Natural
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RPS_83727
Expression
MCOLN2
Natural
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protein_coding
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RPS_83728
Expression
MCOLN3
Natural
Full length
No
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protein_coding
ENST00000370589
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Paraspeckle
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Natural
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Natural
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MCTP2
Natural
Full length
No
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MDK
Natural
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No
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Natural
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P-body
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RPS_83746
Expression
MDN1
Natural
Full length
No
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protein_coding
ENST00000369393
protein_coding
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High throughput (LLPS enrichment)
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ME1
Natural
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Homo sapiens
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ME2
Natural
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No
Homo sapiens
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High throughput (LLPS enrichment)
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CAGTAAACCTGTCTGAATGTACCTGTATACGTTTCAAAAACACCCCCCCCCCACTGAATCCCTGTAACCTATTTATTATATAAAGAGTTTGCCTTATAAATTTACATAAAAATGTCCGTTTGTGTCTTTTGTTGTAAAAATCAAGTGATTTTTTCATAAGGTTCTTTTACTATTGGAAAAGATGGGCAGCACGCAGTTTTATTTTATTTTTGTAAGTTTTTTAATACATGTGAAAGCAAAGAATACTCAGCATGCCTTTCTAAGTGACGCGTTTGCACCTTTTGTTGGGAAGTACTGTATCCTGTGCTGTTAGCATTCTCGATAAATCTCTCTGTGAAAGTGA
RPS_83756
Expression
MECP2
Natural
Full length
No
Homo sapiens
chrX:154021573-154097717(-)
ENSG00000169057
protein_coding
ENST00000453960
protein_coding
RNP granule
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83757
Expression
MED1
Natural
Full length
No
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P-body
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MED12
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P-body
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Expression
MED12L
Natural
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No
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protein_coding
RNP granule
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83762
Expression
MED13
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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protein_coding
ENST00000397786
protein_coding
P-body
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83763
Expression
MED13
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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ENSG00000108510
protein_coding
ENST00000397786
protein_coding
RNP granule
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83764
Expression
MED13L
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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protein_coding
ENST00000281928
protein_coding
RNP granule
High throughput (LLPS enrichment)
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RPS_83770
Expression
MED23
Natural
Full length
No
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protein_coding
ENST00000368068
protein_coding
RNP granule
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RPS_83771
Expression
MED26
Natural
Full length
No
Homo sapiens
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ENSG00000105085
protein_coding
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protein_coding
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