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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC11277157
RNA was reverse transcribed into cDNA (1 μg) and used in the PCR reaction.
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PMC10419319
The animals were fed a standard chow diet (Purina Co., Seoul, Republic of Korea) and given free access to drinking water.
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PMC5673955
Levels of hTERT expression were normalized relative to the expression of reference gene 18S. (
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PMC4360730
The integration of the three ontologies uses three relationships: is_a, part_of and derives_from.
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PMC11394730
Within healthy cells, intracellular glucose is phosphorylated by hexokinase to produce glucose-6-phosphate, which is then transformed into 3-carbon pyruvate, producing ATP and NADH.
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PMC11335267
In this study we carried out a comprehensive assessment of metabolic alterations in Alx3 deficiency.
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PMC11724582
However, this pathway needs to be further supplemented with relevant experimental validation in subsequently derived subjects to enrich the research.
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PMC9429973
For an in vivo study we used a bioluminescent imaging (BLI)-based orthotopic mouse model of AML, carrying non-targeting, ATP1B1 or ATP1B3 knockout guides.
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PMC9429973
Resulting images were used to train and validate an AI algorithm for the recognition of different bone marrow cell lineages.
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PMC9119314
The P. falciparum (3D7) and P. knowlesi (A1-H.1) parasites were grown in human A red blood cells (National Health Blood and Transplant, United Kingdom).
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PMC11699042
Specifically, we performed RNA sequencing (RNASeq) using NextSeq 500 (Illumina) on 11 A-673, five HeLa, and five MCF-7 strains.
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PMC11422497
P < 0.05, **P < 0.01, na: no statistical significance.
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PMC5673955
CD4 T cells were seeded at 5 × 10 cell/ml and cultured in 25 cm flasks in cell medium RPMI 1640 (Thermo Fisher Scientific Inc., Waltham, MA) supplemented with 10% FBS (Fetal Bovine Serum, Thermo Fisher Scientific Inc., Waltham, MA), penicillin (50 U/mL; Sigma‐Aldrich, St. Louis, MO), and streptomycin (50 mg/mL; Sigma‐Aldrich) with 5 μg/mL anti‐CD28 (eBioscience Inc., San Diego, CA), 5 μg/mL anti‐CD3 MAbs (MedBioSpectr, Moscow, Russia), and 100 U/mL rHu IL‐2 (R&D Systems, Minneapolis, MN).
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PMC8751435
By contrast, number of shrinking cell with irregular membrane (yellow arrow), which is indicated as early apoptosis, is gradually reduced by CME in concentration‐dependent manner.
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PMC11406030
For instance, checkpoint inhibitors, expected to be the next significant improvement in ovarian cancer treatment, are effective in only 30% of patients and lead to severe side effects, including dermatologic, gastrointestinal, hepatic, and endocrine toxicity.
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PMC9596868
All the cell lines were stained with Hoechst 33342, Trihydrochloride (Thermo Fischer) stain to check for mycoplasma.
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PMC11687167
A study to explore the precise role of PCSK9 in lung cancer cell apoptosis confirmed that PCSK9 siRNA had antitumor activity and induces increased apoptosis in A549 cells.
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PMC11622247
We have developed a method to improve the brightness of fluorogenic hybridization probes (FIT probes) by introducing auxiliary dyes that serve as light harvesters.
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PMC11472639
Representative gating strategies can be seen in Supplementary Fig. 1.
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PMC11098378
All media additionally contained 1% non-essential amino acids, 1% L-glutamine, and 1% antibiotic/antimycotic (Gibco).
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PMC5386478
The fluorescent secondary antibody (rabbit anti-mouse IgG antibody conjugated with FITC; 1 : 100) was added and incubated for 1 h at 4 °C.
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PMC11543935
The metabolic activity of treated HCC-827 cells decreased by 44 % compared to the controls, whereas NIH3T3 cells exhibited a 49 % reduction.
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PMC9688728
Both biological and technical variations can discredit the reliability of obtained data in omics studies.
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PMC11594074
Similarly, in MDA-MB-468 cells, a slight dose-dependent decrease in populations in the G2/M phase, namely, 19.3%, 12.8%, 8.8%, and 5.1%, respectively, could also be observed.
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PMC10440586
CD99 affects the morphology and migration of glioma cells through the regulation of actin-related genes .
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PMC11279598
However, further investigation is needed to better understand which constituents of MH may underlie its antitumor activity and aid in the development of new anticancer and/or chemopreventive drugs.
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PMC5673955
Activation of β‐Gal during cultivation with RrA is compliant with inhibition of cell cycle in S and G2/M phase, indicating replicative senescence of the cells.
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PMC9428827
Taking into account the CD8 preferential expansion demonstrated in vivo, we can speculate that when different lymphocyte populations are present and compete for the cytokine, mutein is captured preferentially by the CD8 cells, which express a high level of the dimeric βγc IL-2R form.
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PMC11388384
Furthermore, whereas the cytoneme length distribution was unchanged in the Myo10 cells, the median cytoneme in ATV(+)-Espin cells was ~1.5-fold longer than in wild-type cells (Fig. 1D).
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PMC11596967
These peptides range from 2 to 68 residues, with MWs between approximately 210 Da and 7440 Da.
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PMC11052306
All dendrimers display potent antitumor activity in the micromolar range, lower than those observed with the non-substituted derivatives.
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PMC9545474
Interestingly, the 18‐electron bidentate S,O‐pyrithione complex with similar steric hindrance [(η‐p‐cymene)Ru(pyrithionato)Cl] exhibits a EC50 value of 3.81±0.06 μM against MCF‐7 cell line, which is of the same order of magnitude than the 18‐electron complexes 5–8, but much better than the corresponding O,O‐ ligand.
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PMC11496728
Compared with CHO-WT cells, the transient expression of pCMV-SEAP, pCMV-SEAP-1, and pCMV-SEAP-2 was increased by 1.74-, 1.75-, and 1.71-fold, respectively, and the stable expression of pCMV-IL3 was increased by 1.85-, 1.93-, and 2.16-fold.
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PMC11745600
Since the Ins1 gene is characterized by lower expression levels in isolated islets from NOG pancreata compared with the Ins2 gene (Figure S1, SDC, http://links.lww.com/TP/D122), we expected to observe a milder manifestation of diabetes in mice with the C96Y mutation in the Ins1 gene compared with those with the mutation in the Ins2 gene (Figure 1A).
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PMC10890055
After 14 days, the difference between the variants with and without G418 was less profound and, surprisingly, was statistically significant both at the restrictive temperature and the permissive temperatures of 39.5 °C and 34 °C, respectively.
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PMC7642379
Whereas certain experimental steps are more efficient in adherent mode, e.g. chemical transfection and viral infection, the ability to increase the volumetric cell density by growth in suspension without cell clump formation, which results in oxygen limitations, is a key step from a manufacturing perspective.
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PMC7171147
Furthermore, knocking down AMPK expression in ES2 cells using shRNAs also resulted in loss of FAO enzyme expression (Fig. S4I) suggesting that AMPK acts as an upstream regulator of FAO.Fig.
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PMC10522430
Cells procured from the CO2 incubator underwent meticulous examination to confirm their uncontaminated status.
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Furthermore, enucleated MSCs were prevented from proliferating and stably engrafting in host tissues, thereby diminishing unwanted side effects after systemic use of MSCs.
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PMC11575040
In this study, two potential targets of miR-1270, CD276 and CENPM, were identified through in silico analysis.
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PMC11766309
Thus, novel immunotherapy targets, which can serve as potential prognostic and predictive indicators of virus-driven cancer, need to be identified by pan-cancer expression analysis.
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PMC7171147
These data suggest that high levels of FAO are associated with poor prognosis in ovarian cancer.
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PMC5916734
Sequencing of the cloned PCR product revealed approximately the same level of homology between the vkorc1 gene from Chinese hamster and the murine and human vkorc1 genes (Fig. 2C).
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PMC8540611
The proportion of cells in early apoptosis in control HL-60 (NT) was 7.4%; in control CEM-SS it was 4.2%.
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P ≤ .01, ***P ≤ .001.
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Injection volume: 20 μL. Temperature: 30 °C.
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PMC8526701
Oncogenic mapping has revealed that these BRD-associated proteins are highly dysregulated in cancers .
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PMC9454852
To figure out calpain activation, t-BOC-loaded cells were treated with 100 µM BOLD-100 alone or in the presence of the calpain inhibitor PD150606.
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Bioassays were performed in triplicate.
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Then, RT2 Profiler™ PCR Array Human Drug Transporters were performed as previously described .
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All statistical data with error bars are presented as the mean ± standard deviation (SD), and all experiments were independently repeated at least three times or more than six mice.
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PMC11794568
WB analysis of the protein levels of TFAM, PGC1α and NRF1 in cutaneous melanoma cells overexpressing and knocking down CRIP1. (
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PMC10158546
To the best of our knowledge, penicillin is not known to inhibit prion infection.
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Representative images of each fork type are shown.
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The mice were deeply anaesthetized with isoflurane and transcardially perfused with ice-cold 0.9% NaCl followed by 4% paraformaldehyde.
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It exhibits an average lifetime of 10 nanoseconds and can react with almost any biomolecule, such as nuclear DNA, mitochondrial DNA, proteins, and membrane lipids .
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PMC9592219
IHC analysis confirmed a higher level of TOP2A in HCC (Figures 2(a) and 2(b)).
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PMC9429973
The ORR to Ru-D regime was 86.7% (13/15), with 13.3% (2/15) in complete response (CR), 73.3% (11/15) in partial response (PR), and 13.3% (2/15) in no response (NR).
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PMC9919300
Cell viability was measured by MTT (3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide) using 1× 10 cells seeded in a 96-well microplate.
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PMC11788920
The statistical analyses of these data are reported in Supplementary Table S5 for the WT and Supplementary Table S6 for the GQ-mutant construct.
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PMC11106977
Fig. 6Strategy for targeting O-GlcNAcylation in the treatment of bone diseasesOSMI-1, PUGNAc, and Thiamet-G mediated O-GlcNacylation can inhibit osteoclast differentiation and may have potential use in the future for preventing or treating osteoclast-activated bone diseases.
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PMC11180402
Antibodies targeting MMP-2(Cat#sc-13594), E2F1(Cat#sc-251), HSF1(Cat#sc-17757), SOX2(Cat#sc-365823), Elk-1(Cat#sc-365876), Sp1(Cat#sc-420), DNMT3a(Cat#sc-373905), and GAPDH(Cat#sc-32233) were sourced from Santa Cruz Biotechnology (Santa Cruz, CA, USA); antibodies against MMP-9(Cat#10,375–2-AP) were purchased from Proteintech Group (Chicago, IL, USA); additionally, antibodies for DNMT3b(Cat#GTX129127), DNMT1(Cat#GTX116011), TET1(Cat#GTX124207), and TET2(Cat#GTX124205) were acquired from Gene Tex (Irvine, CA, USA); and specific antibodies targeting p-STAT3 Ser727(Cat#9134) and PTEN(Cat#9188) were obtained from Cell Signaling Technology (Beverly, MA, USA).
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PMC9429973
Two-year probability of unresolved neutropenia was 26% vs 78% vs 100% in patients no LO/LL, LO and LL, respectively (P<10-4).
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PMC11144200
For the purpose to examine the tumor’s effector T-cell infiltration and tumor cell viability.
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PMC9429973
Identified cells were further classified by the algorithm into 6 different lineage classes with an overall accuracy of 92.6%.
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PMC2196094
Fragments originating from cDNA clones encoding the major CTMC proteases in the mouse, MMCP-4, -5, -6 , -7, and the mouse MC carboxypeptidase A were used as probes to isolate cDNA clones for the corresponding rat proteases.
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PMC11201245
3.0.6.6) software (Agilent Technologies Inc., Santa Clara, CA, USA).
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PMC9220170
ER stress in these cancer cells leads to activation of MAP kinases, which can activate apoptotic signaling by upregulating pro-apoptotic genes through transactivation of specific transcription factors or by directly modulating the activity of mitochondrial pro- and anti-apoptotic proteins through various phosphorylation events.
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PMC11200978
Standard compensation techniques were tested using single-channel controls but ultimately unnecessary given the resolution of these fluorochromes.
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PMC11610461
and “***” indicate p < 0.05, p < 0.01 and p < 0.001, respectively.
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PMC9429973
The third patient, 3.5 years old with ALL, had hypertrophic cardiomyopathy from birth due to inherited Noonan syndrome.
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PMC11367146
For interpretation of the references to colour in this figure legend, the reader is referred to the Web version of this article.)Fig.
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PMC11194678
Cells overexpressing mCherry-HTTexon1-Q25 (modeling the WT state with repeats of CAG < 35) were used as a control where no obvious aggregation was observed (Fig. S5 A).
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PMC11612315
Two-way ANOVA followed by the Bonferroni multiple comparison test (*p < 0.05, vehicle + CAP group compared with the exendin 20–29 [20 μg] group; p < 0.05, p < 0.01, vehicle + CAP group compared with the BCTC [0.5 μg] + CAP) group.
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PMC11742231
After preprocessing, the GDSC dataset contained 172,114 drug–cell pairs derived from 223 drugs and 948 cell lines.
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PMC8389560
Incubation of A-172 cells with 5 µg/mL SeNP also increased the expression of mitogen-activated kinase genes in MAP3K5 and MAPK-8 cells by 2.5 times.
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PMC6182045
Additionally, the use of an ion exchange column removes additional cost and documentation associated with production and maintenance of affinity chromatography resins under cGMP standards.
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PMC11680391
Does the level of agreement in mutual communication between the herd veterinarian and dairy farmer affect the BTSCC.
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42% patients were exitus.
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PMC10926885
According to Bartl et al., stabilising dynein accelerated the growth of various tumours.
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In a single-nucleotide polymorphism (SNP) of GFI1, GFI1-36N, the amino acid serine (S) is replaced by asparagine (N) at position 36.
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PMC11627060
These findings align with prior studies exploring the apoptotic pathways mediated by TQ-BSA NPs.
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PMC11285179
The tissue was washed with PBS, then chopped and incubated in an enzyme digestion solution for 40 min at 37 °C.
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PMC7305184
The absorbance of formazan (reduced MTS tetrazolium compound) was measured with a spectrofluorometer (Tecan Infinite M200, Tecan, Austria) at 490 nm.
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Cleavage of PARP by caspase‐3 inactivates the DNA repair ability of PARP .
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PMC11640419
However, over the past decade, it has become increasingly evident that their relationship is more intricate and nuanced than previously assumed.
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PMC8316344
NS non-significance; ***P < 0.001; ****P < 0.0001.
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PMC10048572
STR profiles were then analyzed using GeneMapper Software (v. 4-0).
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In this context, topical application was selected to ensure targeted PpIX production within the skin.
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Furthermore, compound 17 (Figure 6) and doxorubicin showed potential synergistic efficacy.
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Ethanol (Simulants A, C, and D1) interfered with the neutral red uptake (NRU) assay at concentrations above 0.5% v/v, showing no changes in cell viability despite increasing concentrations.
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They upregulate the activity of TP53, which increases the tumor suppressor activity (Thoenen et al., 2019).
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PMC11093197
Meanwhile, phosphorylation of c‐Myc at threonine 58 (pT52) by GSK3β leads to dephosphorylation of Ser62 by protein phosphatase 2A‐B56α (PP2AB56α), further causing proteasomal degradation following ubiquitination by SCF‐Fbw7 E3 ligase.
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The effects of knockdown were evaluated by qPCR and WB.
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Cells were trypsinized, centrifuged and the pellet was washed with 1 mL of DPBS 1X.
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In particular, a strong alteration of the localization pattern was observed for anillin, Alix, CEP55, MKLP2, and spastin.
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PMC11026382
b Structural location of epistatic clusters for DHFR to TYMS Q33S.
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PMC11407042
Refresh the medium every 2 days.
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In remarkable concordance with our data, it was previously shown that Aβ42 treatment of primary mouse neurons causes an increase in neuronal COL6A1 that is neuroprotective and mediated by TGF-β1 (ref. ).
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Further information on research design is available in the Nature Portfolio Reporting Summary linked to this article.
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