OTAR3088/CeLLaTe-V1-cleaned-split · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 311	tags listlengths 2 311
[ "4", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "Liu", "and", "colleagues", "have", "described", "10", "small-molecule", "inhibitors", "of", "ERK1/2", "which", "were", "developed", "recently", "and", "have", "undergone", "clinical", "trials", "in", "cancer", "patients", "[", "75", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Overall", ",", "the", "EC50", "values", "of", "the", "raw", "extract", "of", "cembran", "pine", "bark", "in", "the", "DPPH", "and", "reducing", "power", "assays", "fall", "within", "the", "range", "of", "values", "reported", "for", "other", "polar", "coni...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "these", "analyses", "all", "genes", "whose", "gene", "symbols", "could", "be", "mapped", "to", "ENTREZ", "Ids", "using", "the", "org", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "complex", "was", "subsequently", "incubated", "with", "sheared", "chromatin", "that", "contained", "the", "LTR-bound", "proteins", "for", "dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", "immunoprecipitation", ",", "following", "with", "mass", "spectrometry", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Regardless", ",", "the", "dual-acting", "nature", "of", "KL-2", "in", "enhancing", "latency", "reactivation", "in", "some", "circumstances", "(", "i.e.", ",", "if", "Tat", "is", "present", ")", "and", "inhibiting", "latency", "reactivation", "in", "others", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ "It", "will", "be", "essential", "to", "identify", "other", "partners", "that", "are", "associated", "with", "CYTOR", "lncRNA", "and", "control", "HIV", "promoter", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Nonparametric", "(", "paired", ")", "Wilcoxon", "test", "was", "performed", "to", "compare", "the", "ranks", "of", "two", "matched", "samples", "(", "e.g.", ",", "before", "and", "after", "treatment", "with", "APG-1387", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "They", "have", "received", "increasing", "recognition", "because", "they", "specifically", "activate", "the", "non-canonical", "NFKB", "pathway,23,24,25", "which", "naturally", "exhibits", "higher", "functional", "selectivity", "and", "more", "confined", "proinflammatory...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Mechanically", ",", "the", "sustained", "activation", "of", "the", "AKT", "pathway", "in", "both", "HEK293", "and", "M059", "K", "cells", "and", "the", "activation", "of", "the", "ERK1/2", "pathway", "in", "M059", "K", "cells", "(", "Figure", "1", "K", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Thus", ",", "these", "results", "demonstrated", "that", "PRMT3", "is", "an", "HIV-1", "LTR", "binding", "factor", ",", "which", "is", "further", "enhanced", "in", "the", "presence", "of", "Tat", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Luciferase", "activity", "was", "measured", "in", "duplicate", ",", "while", "other", "experiments", "were", "performed", "in", "triplicate", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "findings", "also", "underscore", "the", "need", "to", "combine", "bivalent", "SMs", "with", "other", "therapeutics", "to", "improve", "the", "reactivation", "and", "elimination", "of", "VRs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Combinatorial", "approaches", "to", "dissect", "the", "genetic", "underpinnings", "of", "HIV-1", "latency", "and", "discover", "new", ",", "synergistic", "drug", "interactions", "should", "be", "prioritized", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Effects", "of", "CYTOR", "on", "HIV", "infection", "and", "latency", "establishment", "were", "also", "confirmed", "in", "stimulated", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "(", "Fig", "3", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Angiotensin", "II", "and", "aldosterone", "did", "not", "modulate", "VEGF-A", "levels", ",", "proving", "the", "dominant", "role", "of", "hypoxia", "in", "the", "regulation", "of", "the", "growth", "factors", "'", "expression", "and", "secretion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "TEAD4", "has", "also", "been", "demonstrated", "to", "interact", "with", "P-TEFb", ",", "which", "is", "the", "core", "transcriptional", "component", "of", "the", "Super", "Elongation", "Complex", "(", "SEC", ")", "essential", "for", "Tat-...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "the", "ectopically", "expressed", "MYT1L", "increased", "the", "luciferase", "activity", "of", "the", "wild-type", "CXCR1", "promoter/luciferase", "reporter", "in", "HEK-293", "and", "M059", "K", "cells", "with", "the", "normal", "expression", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ "Similarly", ",", "recent", "studies", "utilizing", "the", "PRMT3", "inhibitor", ",", "SGC707", "treatment", ",", "or", "PRMT3", "knockout", "mice", "have", "revealed", "PRMT3", "’s", "facilitation", "of", "HSV-1", "infection30", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "CYTOR", "is", "an", "important", "regulator", "of", "TCR-induced", "actin", "polymerization", "in", "T", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "Experimental", "evidence", ",", "however", ",", "is", "required", "and", "further", "research", "with", "experimental", "evidence", "remains", "to", "be", "performed", "in", "the", "future", "to", "confirm", "the", "possible", "suppression", "of", "immune", "ev...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "contributing", "role", "of", "MYT1L", "in", "carcinogenesis", "remains", "poorly", "understood", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Based", "on", "its", "anti-inflammatory", ",", "antioxidant", ",", "and", "apoptosis-modulating", "potential", ",", "polydatin", "displays", "diverse", "biological", "activities", "(", "anticancer", ",", "antidiabetic", ",", "antimicrobial", ",", "cardioprotective", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "The", "fact", "that", "the", "central", "memory", "subset", "has", "been", "shown", "to", "require", "strong", "TCR-mediated", "signaling", "for", "maintenance", "suggests", "a", "more", "important", "role", "of", "the", "canonical", "NFKB", "pathway", "in", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "effect", "was", "not", "due", "to", "a", "decrease", "in", "total", "STAT1", "protein", "levels", ",", "indicating", "that", "curcumin", "selectively", "inhibits", "STAT1", "activation", "rather", "than", "its", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Similar", "phenotypic", "alterations", "were", "also", "noted", "in", "HEK293", "cells", "in", "response", "to", "ectopic", "MYT1L", "(", "Figure", "1E", "–", "G", ",", "I", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "IL-8", "and/or", "GROα", "bind", "to", "CXCR1", ",", "eventually", "promoting", "glioblastoma", "proliferation", "via", "the", "ERK1/2", "pathway", "that", "can", "be", "blocked", "by", "CXCR1", "siRNA", "(", "Figure", "4J", ",", "K", ")", ",", "suggesting"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "...
[ "We", "found", "that", "knock-out", "of", "SEC", "components", "from", "activated", ",", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "from", "12", "independent", "donors", "did", "not", "inhibit", "viral", "replication", ",", "suggesting", "that", "the", "SEC", "is...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "SHH", "signaling", ",", "which", "is", "involved", "in", "cell", "differentiation", "and", "tissue", "patterning", ",", "may", "be", "more", "sensitive", "to", "metabolic", "perturbations", "with", "a", "more", "dynamic", "regulation", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cells", "were", "transfected", "with", "the", "plasmid", "expressing", "sgPRMT3", "by", "using", "Lipofectamine", "3000", "(", "Invitrogen", ")", "according", "to", "the", "manufacturer", "’s", "protocol", "." ]	[ "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "latter", "findings", "are", "consistent", "with", "earlier", "studies", "reporting", "increased", "cytotoxic", "activity", "for", "the", "methoxylated", "analogs", "of", "resveratrol", "compared", "to", "resveratrol", "itself", "[", "75", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PCYT2", "expression", "levels", "were", "lower", "in", "HepG2", "than", "in", "L02", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O" ]
[ "Extending", "these", "studies", "to", "primary", "Müller", "cells", "in", "future", "research", "would", "provide", "a", "more", "physiologically", "relevant", "system", ",", "helping", "to", "validate", "and", "refine", "our", "findings", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "KL-2", "was", "sufficient", "to", "boost", "viral", "replication", "in", "activated", ",", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", ",", "in", "and", "of", "itself", "it", "displayed", "minimal", "reactivation", "potential", "in", "both", "cell", "line...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellT...
[ "Furthermore", ",", "DNA-PK", "is", "a", "master", "kinase", "of", "the", "proliferative/progenitor", "subtype", "of", "glioblastoma", ",", "guiding", "targeted", "cancer", "therapy", "[", "57", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "suggest", "that", "curcumin", "may", "serve", "as", "a", "therapeutic", "adjuvant", "in", "NSCLC", ",", "potentially", "improving", "immune", "checkpoint", "inhibitor", "(", "ICI", ")", "efficacy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Still", ",", "this", "connection", "between", "transcriptional", "elongation", "and", "initiation", "has", "yet", "to", "be", "fully", "understood", "in", "the", "context", "of", "HIV-1", "transcription", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", "to", "our", "findings", ",", "Dar", "et", "al.", "(", "2016", ")", "reported", "a", "strong", "antioxidant", "potential", "for", "resveratroloside", "in", "the", "DPPH", "assay", "(", "IC50", "=", "14.0", "μg/mL", ")", "[", "47", "]", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "retaining", "genes", "with", "nonzero", "total", "read", "count", "and", "with", "more", "than", "10", "reads", "in", "total", "between", "all", "samples", ",", "we", "fitted", "a", "model", "that", "included", "all", "treatments", "to", "account",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Cells", "were", "fixed", "with", "1", "%", "formaldehyde", "for", "15", " ", "min", "at", "room", "temperature", "and", "0.125", " ", "M", "Glycine", "for", "5", " ", "min", "to", "quench", "unreacted", "formaldehyde", "at", "room", "temperature", "." ]	[ "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PI", ",", "a", "viability", "dye", "excluded", "by", "healthy", "and", "early", "apoptotic", "cells", "with", "intact", "membranes", ",", "stains", "the", "DNA", "of", "late", "apoptotic", "and", "necrotic", "cells", "with", "compromised", "membranes", ",", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "conclusion", ",", "our", "study", "provides", "novel", "evidence", "that", "IFN-γ", "induces", "PD-L1", "expression", "in", "NSCLC", "cells", "via", "STAT1", "activation", "and", "that", "curcumin", "effectively", "inhibits", "this", "process", "by", "sup...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Previous", "research", "reported", "that", "elevated", "p53", "expression", "and", "a", "higher", "Bax/Bcl-2", "ratio", "correlate", "with", "increased", "tumor", "sensitivity", "to", "anticancer", "therapies", "[", "23", "]", ",", "further", "supporting", "the",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "previous", "reports", "have", "indicated", "that", "PCYT2", "is", "present", "only", "in", "the", "endoplasmic", "reticulum", "of", "hepatocytes", "[", "14,34", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "peptides", "were", "dissolved", "in", "0.1", "%", "formic", "acid", "(", "FA", ")", "with", "2", "%", "acetonitrile", "and", "separated", "on", "an", "RP-HPLC", "analytical", "column", "(", "75", " ", "μm", " ", "×", " ", "25", " ", "cm", ")"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Some", "of", "the", "molecules", "analyzed", "in", "this", "manuscript", "can", "be", "molecular", "targets", "in", "cancer", "therapy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "analysis", "show", "that", "different", "transcriptional", "profiles", "exist", "in", "cells", "where", "HIV", "is", "activated", "versus", "cells", "where", "it", "remains", "latent", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "relative", "expression", "levels", "of", "PD-L1", ",", "STAT1", ",", "and", "ISGs", "(", "ISG15", "and", "SOCS1", ")", "were", "normalized", "to", "the", "housekeeping", "gene", "GAPDH", "and", "analyzed", "using", "the", "2^", "−", " ", "ΔΔCt", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Resveratroloside", "(", "1", ")", "and", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "are", "not", "the", "sole", "stilbenes", "that", "cause", "tumor", "cell", "death", "by", "triggering", "non-apoptotic", "mechanisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Membranes", "were", "blocked", "with", "5", "%", "BSA", "in", "Tris-buffered", "saline", "with", "0.1", "%", "Tween-", "20", "(", "TBST", ")", "for", "1", "h", "at", "room", "temperature", "to", "prevent", "non-specific", "binding", "and", "incubated", "o...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "By", "inducing", "the", "expression", "of", "immunosuppressive", "factors", ",", "however", ",", "tumor", "HIF-1", "signaling", "subdues", "both", "the", "innate", "and", "adaptive", "immune", "responses", ",", "thereby", "shielding", "the", "tumor", "from", "i...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "function", "of", "MYT1L", "is", "DNA-PK-dependent", ",", "highlighting", "a", "key", "role", "of", "DNA-PK", "modulating", "the", "transcriptional", "activity", "of", "MYT1L", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Conversely", ",", "the", "enforced", "expression", "of", "MYT1L", "inhibited", "cell", "proliferation", "and", "induced", "a", "G1", "cell", "cycle", "arrest", "(", "Figure", "2E", "–", "G", ")", ",", "suggesting", "a", "tumor", "suppressor", "role", "of", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...
[ "mRNAs", "coding", "for", "proteins", "of", "the", "RAAS", "indeed", "exhibited", "differential", "expression", "patterns", "in", "the", "presence", "of", "either", "angiotensin", "II", "or", "aldosterone", "when", "cells", "were", "cultured", "under", "hyperglyce...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Materials", "and", "methods", "Statistical", "analysis", "The", "data", "were", "described", "as", "mean", " ", "±", " ", "standard", "deviation", "(", "SD", ")", "and", "the", "statistical", "significance", "was", "determined", "by", "one-way", "ANOVA", "bef...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Material", "and", "methods", "Western", "blot", "analysis", "Total", "protein", "lysates", "were", "extracted", "from", "treated", "A549", "cells", "using", "ice-cold", "radioimmunoprecipitation", "assay", "(", "RIPA", ")", "buffer", "supplemented", "with", "protea...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...
[ "This", "suggests", "that", "these", "cells", "are", "engaging", "in", "pathways", "associated", "with", "cellular", "dedifferentiation", "and", "potential", "reprogramming", "towards", "a", "progenitor", "state", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "observations", "indicate", "that", "the", "severity", "and", "fluctuation", "of", "glucose", "stress", "influence", "SHH", "signaling", "pathways", ",", "affecting", "the", "balance", "between", "neuroprotection", "and", "gliosis", "in", "the", "retina", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]
[ "Exposure", "of", "cells", "to", "these", "conditions", "seemed", "to", "not", "result", "in", "induction", "of", "cellular", "stress", ",", "which", "may", "adversely", "affect", "the", "outcome", "of", "the", "investigations", ",", "since", "expression", "of...	[ "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Paclitaxel", ",", "another", "cornerstone", "treatment", ",", "acts", "by", "stabilizing", "microtubules", ",", "causing", "prolonged", "G2/M", "mitotic", "arrest", "and", "promoting", "apoptosis", "through", "a", "p53-independent", "pathway", "involving", "cyclin", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "\n", "Source", "paper", ":", "PMC11419360" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "total", "protein", "lysate", "prepared", "from", "human", "adult", "brain", "normal", "tissues", "was", "purchased", "from", "BioChain", "(", "Newark", ",", "CA", ",", "USA", ")", "and", "served", "as", "a", "normal", "control", "for", "human", "ce...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O" ]
[ "Even", "if", "transcriptional", "reactivation", "is", "achieved", ",", "it", "is", "unlikely", "this", "is", "sufficient", "to", "result", "in", "the", "clearance", "of", "these", "infected", "cells", "without", "additional", "immune", "augmentation", "such", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", ...
[ "Spin", "at", "700", " ", "×", " ", "g", "at", "4", " ", "°", "C", "for", "3", " ", "min", "to", "pellet", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O" ]
[ "Changes", "in", "histone", "activation", "marks", "around", "the", "viral", "promoter", "in", "CYTOR-depleted", "cells", "also", "imply", "that", "CYTOR", "activates", "the", "proviral", "gene", "expression", "(", "Fig", "4", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "ART", "is", "not", "curative", "and", "does", "not", "meaningfully", "impact", "persistent", "viral", "reservoirs", "(", "VRs", ")", "of", "latently", "infected", "cells", "that", "comprise", "CD4", "+", "T", " ", "cells", "and", "myeloid", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "For", "accurate", "quantification", "of", "apoptotic", "populations", ",", "a", "specific", "gating", "strategy", "was", "applied", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "e", "Proteins", "showing", "over", "1.5-fold", "enrichment", "relative", "to", "the", "control", "sample", "identified", "from", "3", "×", "Flag-dCas9", "immunoprecipitation", "following", "by", "mass", "spectrometry", "analysis", "were", "listed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Following", "20–25", "d", ",", "the", "tumors", "achieved", "a", "certain", "size", "and", "the", "micewere", "anesthetized", "with", "isopentane", "and", "sacrificed", ";", "the", "tumors", "were", "collected", "for", "follow-up", "evaluation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "peptide", "and", "protein", "identifications", "were", "filtered", "by", "PD", "to", "control", "the", "false", "discovery", "rate", "(", "FDR", ")", " ", "", "", "", "Generation", "of", "stable", "knockout", "cell", "line", "", "", "", "sg...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...
[ "Results", "The", "DCM", "fraction", "exhibited", "dose-dependent", "cytotoxicity", "in", "HeLa", "cells", ",", "with", "an", "IC50", "value", "of", "135.6", " ", "µg/mL", "and", "a", "selectivity", "index", "(", "SI", ")", "of", "2.72", "relative", "to", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O" ]
[ "HeLa", "cells", "were", "used", "for", "this", "purpose", "as", "they", "have", "advantages", "over", "other", "tumor", "cell", "lines", ",", "for", "example", ",", "high", "adaptive", "capacity", "and", "proliferation", "rate", "[", "38", "]", "." ]	[ "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "the", "impact", "of", "Mueller", "cells", "on", "angiotensin", "II-mediated", "inflammatory", "responses", "observed", "in", "the", "early", "development", "of", "RVO", "is", "likely", "low", "when", "hypoxia", "plays", "a", "dominant", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...
[ "This", "study", "was", "designed", "to", "determine", "the", "effect", "of", "Endostar", "in", "inhibiting", "HIF-1", "and", "promoting", "MHC", "class", "I", "expression", "on", "lung", "cancer", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "et", "Zucc", ".", "," ]	[ "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "fact", ",", "cleavage", "of", "SMAC/DIABLO", "exposes", "the", "N-terminal", "motif", "Ala-Val-Pro-Ile", ",", "which", "binds", "specifically", "to", "baculovirus", "intermediate", "repeat", "domains", "2", "and", "3", "of", "IAP", "proteins", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "a", "transcription", "factor", ",", "the", "transcriptional", "targets", "of", "MYT1L", ",", "unfortunately", ",", "remain", "largely", "unknown", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "On", "the", "other", "hand", ",", "glycosylation", "and", "methylation", "of", "the", "stilbene", "hydroxyl", "groups", "might", "enhance", "other", "bioactivities", "such", "as", "tyrosinase", "inhibitory", "activity", "[", "48", "]", "and", "anticancer", "act...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Chemokines", "are", "a", "superfamily", "of", "small", "(", "about", "8", "to", "14", "kDa", ")", "cytokine-like", "proteins", "that", "selectively", "regulate", "the", "recruitment", "and", "trafficking", "of", "leukocytes", "to", "inflammatory", "sites", "thr...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "instance", ",", "in", "metastatic", "colorectal", "cancer", "(", "CRC", ")", ",", "PCYT2", "is", "significantly", "downregulated", "and", "functions", "as", "a", "tumor", "metastasis", "inhibitor", "[", "25", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "By", "halting", "cells", "in", "the", "G0/G1", "phase", ",", "the", "A.", "incana", "DCM", "fraction", "appears", "to", "block", "progression", "to", "DNA", "synthesis", ",", "which", "could", "lead", "to", "senescence", "or", "cell", "death", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "\n", "Source", "paper", ":", "PMC12118871" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Nonparametric", "(", "unpaired", ")", "Mann-Whitney", "’s", "U-test", "(", "two-tailed", ")", "was", "conducted", "to", "compare", "ranks", "between", "two", "experimental", "groups", "(", "e.g.", ",", "treated", "with", "vehicle", "or", "with", "APG-1387", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Selected", "ions", "were", "sequentially", "fragmented", "by", "HCD", "with", "30", "%", "normalized", "collision", "energy", ",", "specified", "isolated", "windows", "1.6", " ", "m/z", ",", "and", "15,000", "resolutions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Introduction", "Hepatocellular", "carcinoma", "(", "HCC", ")", "is", "an", "exceedingly", "fatal", "malignancies", ",", "with", "mortalities", "that", "approximate", "the", "incidence", "rates", "worldwide", "[", "1", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Unlike", "IL-8", ",", "GROα", "more", "selectively", "binds", "to", "the", "CXCR2", "receptor", ",", "while", "the", "affinity", "to", "CXCR1", "is", "significantly", "lower", "[", "55", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "these", "defects", "may", "also", "offer", "cancer", "cells", "opportunities", "to", "evolve", "a", "dependency", "on", "a", "non-oncogene", "addiction", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Alternatively", ",", "a", "“", "Block", "and", "Lock", "”", "approach", "frees", "infected", "individuals", "from", "ART", "by", "silencing", "HIV", "transcription", "and", "inducing", "a", "deep", "state", "of", "latency", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PRMT3", "was", "significantly", "enriched", "at", "LTR-luciferase", "reporter", "region", "(", "Fig.", " ", "1f", ")", ",", "which", "can", "be", "further", "increased", "in", "the", "presence", "of", "Tat", "(", "Fig.", " ", "1", "g", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Accordingly", ",", "we", "propose", "a", "model", "where", "CYTOR", "exerts", "its", "effects", "on", "global", "gene", "expression", "and", "promotes", "HIV", "gene", "expression", "by", "both", "direct", "and", "indirect", "effects", "(", "Fig", "7", ")",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "significant", "gaps", "still", "remain", "in", "our", "knowledge", "about", "the", "mechanistic", "roles", "that", "lncRNAs", "play", "in", "CD4", "T", "cell", "activation", "and", "HIV", "latency", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "p21", ",", "a", "well-known", "CDK", "inhibitor", ",", "was", "down-regulated", "in", "HEK293", "and", "M059", "K", "cells", "in", "response", "to", "MYT1L", "(", "Figure", "1", "K", ")", ",", "which", "may", "also", "contribute", "t...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pycnogenol", ",", "a", "standardized", "extract", "obtained", "from", "the", "bark", "of", "French", "maritime", "pine", "(", "Pinus", "maritima", "Lam", ".", ")", "," ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "is", "not", "to", "say", "that", "the", "SEC", "is", "never", "required", "for", "viral", "transcription", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Significantly", ",", "upon", "T", "cell", "stimulation", ",", "depletion", "of", "CYTOR", "promoted", "entry", "of", "HIV", "into", "a", "latent", "state", ",", "while", "its", "over-expression", "delayed", "entry", "into", "latency", "and", "enhanced", "late...	[ "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "result", "was", "independently", "verified", "using", "KL-2", ",", "which", "inhibits", "the", "interaction", "between", "CCNT1", "(", "P-TEFb", ")", "and", "AFF1/4", "(", "of", "the", "larger", "SEC", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "bioinformatics", "analysis", "The", "MYT1L", "binding", "sites", "in", "the", "CXCR1", "promoter", "were", "predicted", "using", "Zinc", "Finger", "Protein-DNA", "Scoring", "Form", ",", "a", "DNA", "binding", "site", "predictor", "for", "Cys2His2", "zinc", "fin...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Previous", "studies", "have", "shown", "that", "PCYT2", "is", "highly", "specific", ",", "and", "is", "present", "only", "in", "the", "rough", "endoplasmic", "reticulum", "of", "eukaryotes", "[", "14", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Surprisingly", ",", "in", "M059J", "cells", "with", "loss", "of", "DNA-PK", "function", "(", "Supplementary", "Figure", "S4", ")", ",", "the", "enforced", "expression", "of", "MYT1L", "failed", "to", "induce", "CXCR1", "transcription", "(", "Figure", "3C", ...	[ "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...
[ "Taken", "together", ",", "these", "results", "highlight", "the", "importance", "of", "evaluating", "the", "potential", "effects", "of", "SMs", "on", "various", "immune", "subsets", "known", "to", "be", "susceptible", "to", "HIV", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "4", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "Liu", "and", "colleagues", "have", "described", "10", "small-molecule", "inhibitors", "of", "ERK1/2", "which", "were", "developed", "recently", "and", "have", "undergone", "clinical", "trials", "in", "cancer", "patients", "[", "75", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Overall", ",", "the", "EC50", "values", "of", "the", "raw", "extract", "of", "cembran", "pine", "bark", "in", "the", "DPPH", "and", "reducing", "power", "assays", "fall", "within", "the", "range", "of", "values", "reported", "for", "other", "polar", "coni...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "these", "analyses", "all", "genes", "whose", "gene", "symbols", "could", "be", "mapped", "to", "ENTREZ", "Ids", "using", "the", "org", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "complex", "was", "subsequently", "incubated", "with", "sheared", "chromatin", "that", "contained", "the", "LTR-bound", "proteins", "for", "dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", "immunoprecipitation", ",", "following", "with", "mass", "spectrometry", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Regardless", ",", "the", "dual-acting", "nature", "of", "KL-2", "in", "enhancing", "latency", "reactivation", "in", "some", "circumstances", "(", "i.e.", ",", "if", "Tat", "is", "present", ")", "and", "inhibiting", "latency", "reactivation", "in", "others", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ "It", "will", "be", "essential", "to", "identify", "other", "partners", "that", "are", "associated", "with", "CYTOR", "lncRNA", "and", "control", "HIV", "promoter", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Nonparametric", "(", "paired", ")", "Wilcoxon", "test", "was", "performed", "to", "compare", "the", "ranks", "of", "two", "matched", "samples", "(", "e.g.", ",", "before", "and", "after", "treatment", "with", "APG-1387", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "They", "have", "received", "increasing", "recognition", "because", "they", "specifically", "activate", "the", "non-canonical", "NFKB", "pathway,23,24,25", "which", "naturally", "exhibits", "higher", "functional", "selectivity", "and", "more", "confined", "proinflammatory...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Mechanically", ",", "the", "sustained", "activation", "of", "the", "AKT", "pathway", "in", "both", "HEK293", "and", "M059", "K", "cells", "and", "the", "activation", "of", "the", "ERK1/2", "pathway", "in", "M059", "K", "cells", "(", "Figure", "1", "K", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Thus", ",", "these", "results", "demonstrated", "that", "PRMT3", "is", "an", "HIV-1", "LTR", "binding", "factor", ",", "which", "is", "further", "enhanced", "in", "the", "presence", "of", "Tat", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Luciferase", "activity", "was", "measured", "in", "duplicate", ",", "while", "other", "experiments", "were", "performed", "in", "triplicate", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "findings", "also", "underscore", "the", "need", "to", "combine", "bivalent", "SMs", "with", "other", "therapeutics", "to", "improve", "the", "reactivation", "and", "elimination", "of", "VRs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Combinatorial", "approaches", "to", "dissect", "the", "genetic", "underpinnings", "of", "HIV-1", "latency", "and", "discover", "new", ",", "synergistic", "drug", "interactions", "should", "be", "prioritized", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Effects", "of", "CYTOR", "on", "HIV", "infection", "and", "latency", "establishment", "were", "also", "confirmed", "in", "stimulated", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "(", "Fig", "3", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Angiotensin", "II", "and", "aldosterone", "did", "not", "modulate", "VEGF-A", "levels", ",", "proving", "the", "dominant", "role", "of", "hypoxia", "in", "the", "regulation", "of", "the", "growth", "factors", "'", "expression", "and", "secretion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "TEAD4", "has", "also", "been", "demonstrated", "to", "interact", "with", "P-TEFb", ",", "which", "is", "the", "core", "transcriptional", "component", "of", "the", "Super", "Elongation", "Complex", "(", "SEC", ")", "essential", "for", "Tat-...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "the", "ectopically", "expressed", "MYT1L", "increased", "the", "luciferase", "activity", "of", "the", "wild-type", "CXCR1", "promoter/luciferase", "reporter", "in", "HEK-293", "and", "M059", "K", "cells", "with", "the", "normal", "expression", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ "Similarly", ",", "recent", "studies", "utilizing", "the", "PRMT3", "inhibitor", ",", "SGC707", "treatment", ",", "or", "PRMT3", "knockout", "mice", "have", "revealed", "PRMT3", "’s", "facilitation", "of", "HSV-1", "infection30", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "CYTOR", "is", "an", "important", "regulator", "of", "TCR-induced", "actin", "polymerization", "in", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "Experimental", "evidence", ",", "however", ",", "is", "required", "and", "further", "research", "with", "experimental", "evidence", "remains", "to", "be", "performed", "in", "the", "future", "to", "confirm", "the", "possible", "suppression", "of", "immune", "ev...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "contributing", "role", "of", "MYT1L", "in", "carcinogenesis", "remains", "poorly", "understood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Based", "on", "its", "anti-inflammatory", ",", "antioxidant", ",", "and", "apoptosis-modulating", "potential", ",", "polydatin", "displays", "diverse", "biological", "activities", "(", "anticancer", ",", "antidiabetic", ",", "antimicrobial", ",", "cardioprotective", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "The", "fact", "that", "the", "central", "memory", "subset", "has", "been", "shown", "to", "require", "strong", "TCR-mediated", "signaling", "for", "maintenance", "suggests", "a", "more", "important", "role", "of", "the", "canonical", "NFKB", "pathway", "in", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "effect", "was", "not", "due", "to", "a", "decrease", "in", "total", "STAT1", "protein", "levels", ",", "indicating", "that", "curcumin", "selectively", "inhibits", "STAT1", "activation", "rather", "than", "its", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Similar", "phenotypic", "alterations", "were", "also", "noted", "in", "HEK293", "cells", "in", "response", "to", "ectopic", "MYT1L", "(", "Figure", "1E", "–", "G", ",", "I", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL-8", "and/or", "GROα", "bind", "to", "CXCR1", ",", "eventually", "promoting", "glioblastoma", "proliferation", "via", "the", "ERK1/2", "pathway", "that", "can", "be", "blocked", "by", "CXCR1", "siRNA", "(", "Figure", "4J", ",", "K", ")", ",", "suggesting"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "...

[ "We", "found", "that", "knock-out", "of", "SEC", "components", "from", "activated", ",", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "from", "12", "independent", "donors", "did", "not", "inhibit", "viral", "replication", ",", "suggesting", "that", "the", "SEC", "is...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "SHH", "signaling", ",", "which", "is", "involved", "in", "cell", "differentiation", "and", "tissue", "patterning", ",", "may", "be", "more", "sensitive", "to", "metabolic", "perturbations", "with", "a", "more", "dynamic", "regulation", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cells", "were", "transfected", "with", "the", "plasmid", "expressing", "sgPRMT3", "by", "using", "Lipofectamine", "3000", "(", "Invitrogen", ")", "according", "to", "the", "manufacturer", "’s", "protocol", "." ]

[ "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "latter", "findings", "are", "consistent", "with", "earlier", "studies", "reporting", "increased", "cytotoxic", "activity", "for", "the", "methoxylated", "analogs", "of", "resveratrol", "compared", "to", "resveratrol", "itself", "[", "75", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PCYT2", "expression", "levels", "were", "lower", "in", "HepG2", "than", "in", "L02", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O" ]

[ "Extending", "these", "studies", "to", "primary", "Müller", "cells", "in", "future", "research", "would", "provide", "a", "more", "physiologically", "relevant", "system", ",", "helping", "to", "validate", "and", "refine", "our", "findings", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "KL-2", "was", "sufficient", "to", "boost", "viral", "replication", "in", "activated", ",", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", ",", "in", "and", "of", "itself", "it", "displayed", "minimal", "reactivation", "potential", "in", "both", "cell", "line...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellT...

[ "Furthermore", ",", "DNA-PK", "is", "a", "master", "kinase", "of", "the", "proliferative/progenitor", "subtype", "of", "glioblastoma", ",", "guiding", "targeted", "cancer", "therapy", "[", "57", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "suggest", "that", "curcumin", "may", "serve", "as", "a", "therapeutic", "adjuvant", "in", "NSCLC", ",", "potentially", "improving", "immune", "checkpoint", "inhibitor", "(", "ICI", ")", "efficacy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Still", ",", "this", "connection", "between", "transcriptional", "elongation", "and", "initiation", "has", "yet", "to", "be", "fully", "understood", "in", "the", "context", "of", "HIV-1", "transcription", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", "to", "our", "findings", ",", "Dar", "et", "al.", "(", "2016", ")", "reported", "a", "strong", "antioxidant", "potential", "for", "resveratroloside", "in", "the", "DPPH", "assay", "(", "IC50", "=", "14.0", "μg/mL", ")", "[", "47", "]", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "retaining", "genes", "with", "nonzero", "total", "read", "count", "and", "with", "more", "than", "10", "reads", "in", "total", "between", "all", "samples", ",", "we", "fitted", "a", "model", "that", "included", "all", "treatments", "to", "account",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Cells", "were", "fixed", "with", "1", "%", "formaldehyde", "for", "15", " ", "min", "at", "room", "temperature", "and", "0.125", " ", "M", "Glycine", "for", "5", " ", "min", "to", "quench", "unreacted", "formaldehyde", "at", "room", "temperature", "." ]

[ "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PI", ",", "a", "viability", "dye", "excluded", "by", "healthy", "and", "early", "apoptotic", "cells", "with", "intact", "membranes", ",", "stains", "the", "DNA", "of", "late", "apoptotic", "and", "necrotic", "cells", "with", "compromised", "membranes", ",", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conclusion", ",", "our", "study", "provides", "novel", "evidence", "that", "IFN-γ", "induces", "PD-L1", "expression", "in", "NSCLC", "cells", "via", "STAT1", "activation", "and", "that", "curcumin", "effectively", "inhibits", "this", "process", "by", "sup...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Previous", "research", "reported", "that", "elevated", "p53", "expression", "and", "a", "higher", "Bax/Bcl-2", "ratio", "correlate", "with", "increased", "tumor", "sensitivity", "to", "anticancer", "therapies", "[", "23", "]", ",", "further", "supporting", "the",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "previous", "reports", "have", "indicated", "that", "PCYT2", "is", "present", "only", "in", "the", "endoplasmic", "reticulum", "of", "hepatocytes", "[", "14,34", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "peptides", "were", "dissolved", "in", "0.1", "%", "formic", "acid", "(", "FA", ")", "with", "2", "%", "acetonitrile", "and", "separated", "on", "an", "RP-HPLC", "analytical", "column", "(", "75", " ", "μm", " ", "×", " ", "25", " ", "cm", ")"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Some", "of", "the", "molecules", "analyzed", "in", "this", "manuscript", "can", "be", "molecular", "targets", "in", "cancer", "therapy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "analysis", "show", "that", "different", "transcriptional", "profiles", "exist", "in", "cells", "where", "HIV", "is", "activated", "versus", "cells", "where", "it", "remains", "latent", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "relative", "expression", "levels", "of", "PD-L1", ",", "STAT1", ",", "and", "ISGs", "(", "ISG15", "and", "SOCS1", ")", "were", "normalized", "to", "the", "housekeeping", "gene", "GAPDH", "and", "analyzed", "using", "the", "2^", "−", " ", "ΔΔCt", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Resveratroloside", "(", "1", ")", "and", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "are", "not", "the", "sole", "stilbenes", "that", "cause", "tumor", "cell", "death", "by", "triggering", "non-apoptotic", "mechanisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Membranes", "were", "blocked", "with", "5", "%", "BSA", "in", "Tris-buffered", "saline", "with", "0.1", "%", "Tween-", "20", "(", "TBST", ")", "for", "1", "h", "at", "room", "temperature", "to", "prevent", "non-specific", "binding", "and", "incubated", "o...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "By", "inducing", "the", "expression", "of", "immunosuppressive", "factors", ",", "however", ",", "tumor", "HIF-1", "signaling", "subdues", "both", "the", "innate", "and", "adaptive", "immune", "responses", ",", "thereby", "shielding", "the", "tumor", "from", "i...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "function", "of", "MYT1L", "is", "DNA-PK-dependent", ",", "highlighting", "a", "key", "role", "of", "DNA-PK", "modulating", "the", "transcriptional", "activity", "of", "MYT1L", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Conversely", ",", "the", "enforced", "expression", "of", "MYT1L", "inhibited", "cell", "proliferation", "and", "induced", "a", "G1", "cell", "cycle", "arrest", "(", "Figure", "2E", "–", "G", ")", ",", "suggesting", "a", "tumor", "suppressor", "role", "of", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...

[ "mRNAs", "coding", "for", "proteins", "of", "the", "RAAS", "indeed", "exhibited", "differential", "expression", "patterns", "in", "the", "presence", "of", "either", "angiotensin", "II", "or", "aldosterone", "when", "cells", "were", "cultured", "under", "hyperglyce...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Materials", "and", "methods", "Statistical", "analysis", "The", "data", "were", "described", "as", "mean", " ", "±", " ", "standard", "deviation", "(", "SD", ")", "and", "the", "statistical", "significance", "was", "determined", "by", "one-way", "ANOVA", "bef...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Material", "and", "methods", "Western", "blot", "analysis", "Total", "protein", "lysates", "were", "extracted", "from", "treated", "A549", "cells", "using", "ice-cold", "radioimmunoprecipitation", "assay", "(", "RIPA", ")", "buffer", "supplemented", "with", "protea...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...

[ "This", "suggests", "that", "these", "cells", "are", "engaging", "in", "pathways", "associated", "with", "cellular", "dedifferentiation", "and", "potential", "reprogramming", "towards", "a", "progenitor", "state", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "observations", "indicate", "that", "the", "severity", "and", "fluctuation", "of", "glucose", "stress", "influence", "SHH", "signaling", "pathways", ",", "affecting", "the", "balance", "between", "neuroprotection", "and", "gliosis", "in", "the", "retina", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]

[ "Exposure", "of", "cells", "to", "these", "conditions", "seemed", "to", "not", "result", "in", "induction", "of", "cellular", "stress", ",", "which", "may", "adversely", "affect", "the", "outcome", "of", "the", "investigations", ",", "since", "expression", "of...

[ "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Paclitaxel", ",", "another", "cornerstone", "treatment", ",", "acts", "by", "stabilizing", "microtubules", ",", "causing", "prolonged", "G2/M", "mitotic", "arrest", "and", "promoting", "apoptosis", "through", "a", "p53-independent", "pathway", "involving", "cyclin", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "\n", "Source", "paper", ":", "PMC11419360" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "total", "protein", "lysate", "prepared", "from", "human", "adult", "brain", "normal", "tissues", "was", "purchased", "from", "BioChain", "(", "Newark", ",", "CA", ",", "USA", ")", "and", "served", "as", "a", "normal", "control", "for", "human", "ce...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O" ]

[ "Even", "if", "transcriptional", "reactivation", "is", "achieved", ",", "it", "is", "unlikely", "this", "is", "sufficient", "to", "result", "in", "the", "clearance", "of", "these", "infected", "cells", "without", "additional", "immune", "augmentation", "such", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", ...

[ "Spin", "at", "700", " ", "×", " ", "g", "at", "4", " ", "°", "C", "for", "3", " ", "min", "to", "pellet", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O" ]

[ "Changes", "in", "histone", "activation", "marks", "around", "the", "viral", "promoter", "in", "CYTOR-depleted", "cells", "also", "imply", "that", "CYTOR", "activates", "the", "proviral", "gene", "expression", "(", "Fig", "4", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "ART", "is", "not", "curative", "and", "does", "not", "meaningfully", "impact", "persistent", "viral", "reservoirs", "(", "VRs", ")", "of", "latently", "infected", "cells", "that", "comprise", "CD4", "+", "T", " ", "cells", "and", "myeloid", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "For", "accurate", "quantification", "of", "apoptotic", "populations", ",", "a", "specific", "gating", "strategy", "was", "applied", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "e", "Proteins", "showing", "over", "1.5-fold", "enrichment", "relative", "to", "the", "control", "sample", "identified", "from", "3", "×", "Flag-dCas9", "immunoprecipitation", "following", "by", "mass", "spectrometry", "analysis", "were", "listed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Following", "20–25", "d", ",", "the", "tumors", "achieved", "a", "certain", "size", "and", "the", "micewere", "anesthetized", "with", "isopentane", "and", "sacrificed", ";", "the", "tumors", "were", "collected", "for", "follow-up", "evaluation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "peptide", "and", "protein", "identifications", "were", "filtered", "by", "PD", "to", "control", "the", "false", "discovery", "rate", "(", "FDR", ")", " ", "*", "*", "*", "Generation", "of", "stable", "knockout", "cell", "line", "*", "*", "*", "sg...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...

[ "Results", "The", "DCM", "fraction", "exhibited", "dose-dependent", "cytotoxicity", "in", "HeLa", "cells", ",", "with", "an", "IC50", "value", "of", "135.6", " ", "µg/mL", "and", "a", "selectivity", "index", "(", "SI", ")", "of", "2.72", "relative", "to", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O" ]

[ "HeLa", "cells", "were", "used", "for", "this", "purpose", "as", "they", "have", "advantages", "over", "other", "tumor", "cell", "lines", ",", "for", "example", ",", "high", "adaptive", "capacity", "and", "proliferation", "rate", "[", "38", "]", "." ]

[ "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "the", "impact", "of", "Mueller", "cells", "on", "angiotensin", "II-mediated", "inflammatory", "responses", "observed", "in", "the", "early", "development", "of", "RVO", "is", "likely", "low", "when", "hypoxia", "plays", "a", "dominant", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...

[ "This", "study", "was", "designed", "to", "determine", "the", "effect", "of", "Endostar", "in", "inhibiting", "HIF-1", "and", "promoting", "MHC", "class", "I", "expression", "on", "lung", "cancer", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "et", "Zucc", ".", "," ]

[ "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "fact", ",", "cleavage", "of", "SMAC/DIABLO", "exposes", "the", "N-terminal", "motif", "Ala-Val-Pro-Ile", ",", "which", "binds", "specifically", "to", "baculovirus", "intermediate", "repeat", "domains", "2", "and", "3", "of", "IAP", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "a", "transcription", "factor", ",", "the", "transcriptional", "targets", "of", "MYT1L", ",", "unfortunately", ",", "remain", "largely", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "On", "the", "other", "hand", ",", "glycosylation", "and", "methylation", "of", "the", "stilbene", "hydroxyl", "groups", "might", "enhance", "other", "bioactivities", "such", "as", "tyrosinase", "inhibitory", "activity", "[", "48", "]", "and", "anticancer", "act...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Chemokines", "are", "a", "superfamily", "of", "small", "(", "about", "8", "to", "14", "kDa", ")", "cytokine-like", "proteins", "that", "selectively", "regulate", "the", "recruitment", "and", "trafficking", "of", "leukocytes", "to", "inflammatory", "sites", "thr...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "instance", ",", "in", "metastatic", "colorectal", "cancer", "(", "CRC", ")", ",", "PCYT2", "is", "significantly", "downregulated", "and", "functions", "as", "a", "tumor", "metastasis", "inhibitor", "[", "25", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "By", "halting", "cells", "in", "the", "G0/G1", "phase", ",", "the", "A.", "incana", "DCM", "fraction", "appears", "to", "block", "progression", "to", "DNA", "synthesis", ",", "which", "could", "lead", "to", "senescence", "or", "cell", "death", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "\n", "Source", "paper", ":", "PMC12118871" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Nonparametric", "(", "unpaired", ")", "Mann-Whitney", "’s", "U-test", "(", "two-tailed", ")", "was", "conducted", "to", "compare", "ranks", "between", "two", "experimental", "groups", "(", "e.g.", ",", "treated", "with", "vehicle", "or", "with", "APG-1387", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Selected", "ions", "were", "sequentially", "fragmented", "by", "HCD", "with", "30", "%", "normalized", "collision", "energy", ",", "specified", "isolated", "windows", "1.6", " ", "m/z", ",", "and", "15,000", "resolutions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Introduction", "Hepatocellular", "carcinoma", "(", "HCC", ")", "is", "an", "exceedingly", "fatal", "malignancies", ",", "with", "mortalities", "that", "approximate", "the", "incidence", "rates", "worldwide", "[", "1", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Unlike", "IL-8", ",", "GROα", "more", "selectively", "binds", "to", "the", "CXCR2", "receptor", ",", "while", "the", "affinity", "to", "CXCR1", "is", "significantly", "lower", "[", "55", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "these", "defects", "may", "also", "offer", "cancer", "cells", "opportunities", "to", "evolve", "a", "dependency", "on", "a", "non-oncogene", "addiction", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Alternatively", ",", "a", "“", "Block", "and", "Lock", "”", "approach", "frees", "infected", "individuals", "from", "ART", "by", "silencing", "HIV", "transcription", "and", "inducing", "a", "deep", "state", "of", "latency", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PRMT3", "was", "significantly", "enriched", "at", "LTR-luciferase", "reporter", "region", "(", "Fig.", " ", "1f", ")", ",", "which", "can", "be", "further", "increased", "in", "the", "presence", "of", "Tat", "(", "Fig.", " ", "1", "g", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Accordingly", ",", "we", "propose", "a", "model", "where", "CYTOR", "exerts", "its", "effects", "on", "global", "gene", "expression", "and", "promotes", "HIV", "gene", "expression", "by", "both", "direct", "and", "indirect", "effects", "(", "Fig", "7", ")",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "significant", "gaps", "still", "remain", "in", "our", "knowledge", "about", "the", "mechanistic", "roles", "that", "lncRNAs", "play", "in", "CD4", "T", "cell", "activation", "and", "HIV", "latency", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "p21", ",", "a", "well-known", "CDK", "inhibitor", ",", "was", "down-regulated", "in", "HEK293", "and", "M059", "K", "cells", "in", "response", "to", "MYT1L", "(", "Figure", "1", "K", ")", ",", "which", "may", "also", "contribute", "t...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pycnogenol", ",", "a", "standardized", "extract", "obtained", "from", "the", "bark", "of", "French", "maritime", "pine", "(", "Pinus", "maritima", "Lam", ".", ")", "," ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "is", "not", "to", "say", "that", "the", "SEC", "is", "never", "required", "for", "viral", "transcription", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Significantly", ",", "upon", "T", "cell", "stimulation", ",", "depletion", "of", "CYTOR", "promoted", "entry", "of", "HIV", "into", "a", "latent", "state", ",", "while", "its", "over-expression", "delayed", "entry", "into", "latency", "and", "enhanced", "late...

[ "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "result", "was", "independently", "verified", "using", "KL-2", ",", "which", "inhibits", "the", "interaction", "between", "CCNT1", "(", "P-TEFb", ")", "and", "AFF1/4", "(", "of", "the", "larger", "SEC", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "bioinformatics", "analysis", "The", "MYT1L", "binding", "sites", "in", "the", "CXCR1", "promoter", "were", "predicted", "using", "Zinc", "Finger", "Protein-DNA", "Scoring", "Form", ",", "a", "DNA", "binding", "site", "predictor", "for", "Cys2His2", "zinc", "fin...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Previous", "studies", "have", "shown", "that", "PCYT2", "is", "highly", "specific", ",", "and", "is", "present", "only", "in", "the", "rough", "endoplasmic", "reticulum", "of", "eukaryotes", "[", "14", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Surprisingly", ",", "in", "M059J", "cells", "with", "loss", "of", "DNA-PK", "function", "(", "Supplementary", "Figure", "S4", ")", ",", "the", "enforced", "expression", "of", "MYT1L", "failed", "to", "induce", "CXCR1", "transcription", "(", "Figure", "3C", ...

[ "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...

[ "Taken", "together", ",", "these", "results", "highlight", "the", "importance", "of", "evaluating", "the", "potential", "effects", "of", "SMs", "on", "various", "immune", "subsets", "known", "to", "be", "susceptible", "to", "HIV", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]