update of meta infomation

hg38_6k_factors_list.txt

@@ -7,6 +7,7 @@ AGO2
 AHR
 AHRR
 ALKBH3
+Anp32e
 APOBEC3B
 AR
 ARID1A
@@ -28,7 +29,6 @@ ATF2
 ATF3
 ATF4
 ATF5
-ATF7IP
 ATOH1
 ATRX
 AUTS2
@@ -50,22 +50,23 @@ BCLAF1
 BCOR
 BDP1
 BHLHE40
-BIRA
 BMI1
 BPTF
 BRCA1
 BRD1
+BRD1-S
 BRD2
 BRD3
 BRD4
+BRD4-NUT
 BRD7
 BRD9
 BRDU
 BRF1
 BRF2
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-C17ORF49
-C17ORF96
+C17orf49
+C17orf96
 CAMTA2
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 CASP8AP2
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 CEBPD
 CEBPG
 CEBPZ
+CENPA
 CENPC
+CFP1
 CHAMP1
 CHD1
 CHD2
@@ -105,7 +108,6 @@ CHD4
 CHD5
 CHD7
 CHD8
-CHRM2
 CIITA
 CLOCK
 CNOT3
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 CTBP2
 CTCF
 CTCFL
+CTNNB
 CTNNB1
 CUX1
 DACOR1
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 DUX4
 DYRK1A
 E2F1
+E2F1_mutant
 E2F2
 E2F3
 E2F4
@@ -159,6 +163,7 @@ E2F7
 E2F8
 EBF1
 EBF3
+EBNA2
 EBNA3
 EBNA3C
 EED
@@ -178,12 +183,13 @@ ELK4
 ELL2
 EMSY
 EMX1
+ENL-FKBP
 EOMES
 EP300
 EP400
 EPAS1
 EPC1
-EPO
+EPCAM
 ERCC2
 ERCC3
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 ERG
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 ETV5
 ETV6
 ETV7
-EWSR1
 EZH1
 EZH2
 FAM208A
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 FOSL1
 FOSL2
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+FOXA1/2
 FOXA2
 FOXD2
 FOXD3
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 FUS
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 FXR2
-GABP
 GABPA
 GATA1
 GATA2
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 GRHL2
 GRHL3
 GRIP1
-GRP20
 GTF2A2
 GTF2B
 GTF2E2
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 INTS11
 INTS12
 INTS3
-IRAK1
-IRAK4
 IRF1
 IRF2
 IRF3
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 JUN
 JUNB
 JUND
-KAT2B
+KAT2A
 KAT5
 KAT7
 KAT8
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 MAFG
 MAFK
 MAML3
-MAPK1
 MAX
 MAZ
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-MBD1_ISOFORM2
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 MBD2
 MBD3
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 MBTD1
 MCM3
 MCM7
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 METTL14
 MGEA5
 MIER1
+MIF
 MITF
 MKL1
 MKL2
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 MYNN
 MYOD1
 MYOG
-MYT1
 MZF1
 NANOG
 NBN
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 NELFE
 NEUROD1
 NEUROG2
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 NOTCH1
 NPAT
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-NR0B2
 NR1H2
 NR1H3
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 NUP153
 NUP98
 NUP98-HOXA9
+NUT
 OGT
 ORC2
 OSR2
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 OVOL3
 PAF1
 PATZ1
-PAX3
+PAX3-FOXO1A
 PAX5
 PAX6
+PAX7
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 PBX2
 PBX3
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 PHIP
 PHOX2B
 PIAS1
+PIAS1/2/3
 PITX1
 PITX3
 PKNOX1
 PLRG1
-PMEL
 PML
 POLR2A
-POLR2APHOSPHOS5
 POLR2B
 POLR2H
 POLR2M
@@ -545,7 +546,6 @@ POU3F2
 POU5F1
 PPARD
 PPARG
-PR
 PRAME
 PRDM1
 PRDM10
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 REL
 RELA
 RELB
-REPIN1
 REST
+REXO1
 RFX1
 RFX2
 RFX5
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 RNF2
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 RPA2
-RPE
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 RUNX1T1
 RUNX2
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 RUVBL1
 RUVBL2
 RXRA
+RXRA/B/G
 RXRG
 RYBP
 SALL4
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 STAT5
 STAT5A
 STAT5B
+SUMO-2/3
 SUMO1
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+SUMO2/3
 SUPT20H
 SUPT5H
 SUZ12
-T
 TAF1
 TAF3
 TAF7
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 TBX21
 TBX3
 TBX5
+TBXT
 TCF12
 TCF21
+TCF3
 TCF4
 TCF7
 TCF7L1
 TCF7L2
 TDRD3
+TEAD
 TEAD1
-TEAD1, TEAD4
 TEAD2
 TEAD4
 TERC
@@ -722,7 +725,6 @@ TOX4
 TP53
 TP63
 TP73
-TRAF7
 TRIM22
 TRIM24
 TRIM25
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 TSC22D4
 TSHZ1
 TTF1
-U2AF1
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 UBTF
 UHRF2
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 WWTR1
 XBP1
 XRCC4
-XRN2
 YAP1
 YBX1
 YBX3
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 ZBTB17
 ZBTB18
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 ZBTB26
 ZBTB33
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 ZNF10
 ZNF100
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 ZNF124
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 ZNF133
 ZNF134
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 ZTA
 ZXDB
 ZXDC
-ZZZ3
+ZZZ3

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@@ -1,3 +1,3 @@
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hg38_6k_regulators_list.txt

@@ -1,3 +1,4 @@
+5hmC
 ADNP
 AEBP2
 AFF1
@@ -7,6 +8,7 @@ AGO2
 AHR
 AHRR
 ALKBH3
+Anp32e
 APOBEC3B
 AR
 ARID1A
@@ -29,7 +31,6 @@ ATF2
 ATF3
 ATF4
 ATF5
-ATF7IP
 ATOH1
 ATRX
 AUTS2
@@ -51,14 +52,15 @@ BCLAF1
 BCOR
 BDP1
 BHLHE40
-BIRA
 BMI1
 BPTF
 BRCA1
 BRD1
+BRD1-S
 BRD2
 BRD3
 BRD4
+BRD4-NUT
 BRD7
 BRD9
 BRDU
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 CEBPZ
 CENPA
 CENPC
+CFP1
 CHAMP1
 CHD1
 CHD2
@@ -107,7 +110,6 @@ CHD4
 CHD5
 CHD7
 CHD8
-CHRM2
 CIITA
 CLOCK
 CNOT3
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 CTBP2
 CTCF
 CTCFL
+CTNNB
 CTNNB1
 CUX1
 DACOR1
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 DLX2
 DLX4
 DLX6
+DNase
 DNMT1
 DNMT3A
 DNMT3B
-DNase
 DPF1
 DPF2
 DR1
@@ -153,6 +156,7 @@ DROSHA
 DUX4
 DYRK1A
 E2F1
+E2F1_mutant
 E2F2
 E2F3
 E2F4
@@ -162,6 +166,7 @@ E2F7
 E2F8
 EBF1
 EBF3
+EBNA2
 EBNA3
 EBNA3C
 EED
@@ -181,12 +186,13 @@ ELK4
 ELL2
 EMSY
 EMX1
+ENL-FKBP
 EOMES
 EP300
 EP400
 EPAS1
 EPC1
-EPO
+EPCAM
 ERCC2
 ERCC3
 ERCC6
@@ -194,6 +200,7 @@ ERF
 ERG
 ESCO2
 ESR1
+ESR2
 ESRRA
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 ETS2
@@ -202,7 +209,6 @@ ETV4
 ETV5
 ETV6
 ETV7
-EWSR1
 EZH1
 EZH2
 FAIRE
@@ -215,6 +221,7 @@ FOS
 FOSL1
 FOSL2
 FOXA1
+FOXA1/2
 FOXA2
 FOXD2
 FOXD3
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 FUS
 FXR1
 FXR2
-GABP
 GABPA
 GATA1
 GATA2
@@ -259,7 +265,6 @@ GRHL1
 GRHL2
 GRHL3
 GRIP1
-GRP20
 GTF2A2
 GTF2B
 GTF2E2
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 GTF3C5
 GUCY1B3
 H1.0
-H1.2
 H1.4
 H2A
 H2A.Bbd
+H2A.Z
+H2A.Zac
 H2AFX
 H2AFY
-H2AFY2
 H2AK119ub
 H2AK5ac
-H2AK9ac
 H2AX
 H2AZ
-H2AZK4ac, H2AZK7ac, H2AZK11ac
 H2AZac
+H2AZK4ac, H2AZK7ac, H2AZK11ac
 H2BK120ac
 H2BK120ub
 H2BK12ac
@@ -292,8 +296,10 @@ H2BK20ac
 H2BK5ac
 H2Bub
 H3
+H3-T45ph
 H3.3
 H3.3,H2A.Z
+H3ac
 H3F3A
 H3F3B
 H3K122ac
@@ -305,6 +311,7 @@ H3K23me2
 H3K27ac
 H3K27me1
 H3K27me3
+H3K27me3/H3K4me3
 H3K36ac
 H3K36me1
 H3K36me2
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 H3K79me1
 H3K79me2
 H3K79me3
-H3K9K14ac
+H3K9/14ac
 H3K9ac
+H3K9K14ac
 H3K9me1
 H3K9me2
 H3K9me3
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 H3R26Cit
-H3T
-H3ac
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+H3T6ph
+H3Y
 H4
+H4ac
 H4K12ac
 H4K16ac
 H4K20me1
@@ -334,7 +345,7 @@ H4K5ac
 H4K5ac, H4K8ac, H4K12ac, H4K16ac
 H4K8ac
 H4K91ac
-H4ac
+H4TetraAc
 HBP1
 HCFC1
 HCFC1R1
@@ -356,6 +367,8 @@ HIC1
 HIF1A
 HINFP
 HIRA
+Histone Lysine Acetylation
+Histone Lysine Crotonylation
 HLF
 HLTF
 HMBOX1
@@ -382,8 +395,6 @@ HOXC9
 HOXD11
 HSF1
 HSF2
-Histone Lysine Acetylation
-Histone Lysine Crotonylation
 ICE1
 ICE2
 ID2
@@ -393,12 +404,11 @@ IKZF2
 ING2
 ING5
 INO80
+Input
 INSM2
 INTS11
 INTS12
 INTS3
-IRAK1
-IRAK4
 IRF1
 IRF2
 IRF3
@@ -413,7 +423,7 @@ JMJD6
 JUN
 JUNB
 JUND
-KAT2B
+KAT2A
 KAT5
 KAT7
 KAT8
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 LMX1B
 LRWD1
 LYL1
+macroH2A1
+macroH2A2
 MAF
 MAFB
 MAFF
 MAFG
 MAFK
 MAML3
-MAPK1
 MAX
 MAZ
-MBD1_isoform1
-MBD1_isoform2
+MBD1
 MBD2
 MBD3
 MBD4
-MBOAT4
 MBTD1
 MCM3
 MCM7
@@ -496,6 +505,7 @@ MEPCE
 METTL14
 MGEA5
 MIER1
+MIF
 MITF
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 MKL2
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 MYNN
 MYOD1
 MYOG
-MYT1
 MZF1
 NANOG
 NBN
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 NELFE
 NEUROD1
 NEUROG2
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 NFATC1
 NFATC3
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 NOTCH1
 NPAT
 NR0B1
-NR0B2
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 NR1H3
 NR2C2
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 NUP98
 NUP98-HOXA9
+NUT
 OGT
 ORC2
 OSR2
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 OVOL3
 PAF1
 PATZ1
-PAX3
+PAX3-FOXO1A
 PAX5
 PAX6
+PAX7
 PBX1
 PBX2
 PBX3
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 PHIP
 PHOX2B
 PIAS1
+PIAS1/2/3
 PITX1
 PITX3
 PKNOX1
 PLRG1
-PMEL
 PML
 POLR2A
-POLR2AphosphoS5
 POLR2B
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 POLR2M
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 POU5F1
 PPARD
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-PR
 PRAME
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 PRDM10
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 REL
 RELA
 RELB
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 REST
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 RFX5
 RFX7
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 RNF2
 RORA
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-RPE
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 RUNX1T1
 RUNX2
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 RUVBL2
 RXRA
+RXRA/B/G
 RXRG
 RYBP
 SALL4
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 STAT5
 STAT5A
 STAT5B
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 SUMO1
 SUMO2
+SUMO2/3
 SUPT20H
 SUPT5H
 SUZ12
-T
 TAF1
 TAF3
 TAF7
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 TBX3
 TBX5
+TBXT
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 TCF21
+TCF3
 TCF4
 TCF7
 TCF7L1
 TCF7L2
 TDRD3
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-TEAD1, TEAD4
 TEAD2
 TEAD4
 TERC
@@ -794,7 +807,6 @@ TOX4
 TP53
 TP63
 TP73
-TRAF7
 TRIM22
 TRIM24
 TRIM25
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 TSC22D4
 TSHZ1
 TTF1
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 UBTF
 UHRF2
 USF1
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 WWTR1
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 YBX1
 YBX3
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