TongjiZhanglab commited on
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721c67a
·
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1 Parent(s): 9dfcf30

Update regulator list of mouse

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Files changed (1) hide show
  1. mm10_5k_regulators_list.txt +53 -58
mm10_5k_regulators_list.txt CHANGED
@@ -1,5 +1,3 @@
1
- 8wg16
2
- abcc9
3
  acss2
4
  actb
5
  aebp2
@@ -17,7 +15,7 @@ ascl1
17
  ascl2
18
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19
  asxl1
20
- atacseq
21
  atf2
22
  atf3
23
  atf4
@@ -39,19 +37,17 @@ bcl6
39
  bhlha15
40
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41
  bhlhe41
42
- bira
43
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44
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46
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47
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48
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49
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51
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75
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77
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78
- clk1
79
  clock
80
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81
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90
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91
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92
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96
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97
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127
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128
  ell3
129
  elob
 
130
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131
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133
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135
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139
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148
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150
- fam60a
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152
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155
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158
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160
  foxd3
@@ -163,6 +158,7 @@ foxg1
163
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164
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165
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166
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167
  foxp3
168
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@@ -171,6 +167,7 @@ gata2
171
  gata3
172
  gata4
173
  gata6
 
174
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175
  gfi1b
176
  gli1
@@ -194,8 +191,8 @@ h2a1
194
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195
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196
  h2afy2
197
- h2ak119
198
  h2ak119ub
 
199
  h2ak9ac
200
  h2aub1
201
  h2ax
@@ -210,7 +207,7 @@ h2bub
210
  h2bub1
211
  h3
212
  h3.1
213
- h3.1,h3.2
214
  h3.2
215
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216
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@@ -229,7 +226,6 @@ h3k36me2
229
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230
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231
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232
- h3k4m2
233
  h3k4me1
234
  h3k4me2
235
  h3k4me3
@@ -240,7 +236,7 @@ h3k79me1
240
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241
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242
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243
- h3k9ac,h3k14ac
244
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245
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246
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@@ -251,6 +247,7 @@ h3r2me2s
251
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252
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253
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254
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255
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256
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@@ -267,15 +264,14 @@ hcfc1
267
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268
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269
  hdac3
270
- hdac9
271
  hells
272
  hexim1
273
  hey1
274
  hif1a
275
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276
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277
- histonelysineacetylation
278
- histonelysinecrotonylation
279
  hlf
280
  hmga1
281
  hmga2
@@ -304,6 +300,7 @@ irf3
304
  irf4
305
  irf7
306
  irf8
 
307
  isl1
308
  jarid2
309
  jmjd6
@@ -311,6 +308,7 @@ jun
311
  junb
312
  jund
313
  kansl3
 
314
  kat2b
315
  kat5
316
  kat8
@@ -329,7 +327,6 @@ kdm5c
329
  kdm6a
330
  kdm6b
331
  klf1
332
- klf15
333
  klf3
334
  klf4
335
  klf5
@@ -338,7 +335,7 @@ kmt2a
338
  kmt2b
339
  kmt2c
340
  kmt2d
341
- lbr
342
  ldb1
343
  leo1
344
  lhx2
@@ -369,12 +366,11 @@ mef2c
369
  mef2d
370
  meis1
371
  men1
372
- mettl3
373
  mitf
374
- mkl2
375
  mllt3
376
  morc3
377
- msin3a
378
  msl1
379
  msl2
380
  mta2
@@ -388,7 +384,6 @@ myf5
388
  myo1c
389
  myod1
390
  myog
391
- mzf1
392
  nacc1
393
  nanog
394
  ncapd3
@@ -415,12 +410,12 @@ nfya
415
  nfyb
416
  nfyc
417
  nipbl
418
- nkx21
419
- nkx22
420
- nkx25
421
- nkx31
422
- nkx32
423
- nkx61
424
  nlrc5
425
  nono
426
  notch1
@@ -442,7 +437,9 @@ nsl1
442
  nucks1
443
  nup153
444
  nup98
 
445
  nup98–phf23
 
446
  obox1
447
  ogt
448
  olig2
@@ -456,15 +453,18 @@ parp1
456
  parp14
457
  pax3
458
  pax5
 
459
  pax6
460
  pax7
461
  paxip1
462
  pbrm1
463
  pbx1
 
464
  pbx3
465
  pcgf2
466
  pcgf6
467
  pdx1
 
468
  phc1
469
  phf19
470
  phf5a
@@ -475,7 +475,8 @@ phox2a
475
  phrf1
476
  pitx1
477
  pknox1
478
- pknox1,pknox2
 
479
  pml
480
  polr2a
481
  polr2b
@@ -491,7 +492,6 @@ pou5f1
491
  ppara
492
  pparg
493
  ppargc1a
494
- pr
495
  prdm1
496
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497
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@@ -500,6 +500,7 @@ prdm16
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  prdm4
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  prdm5
502
  prdm9
 
503
  prox1
504
  psmb1
505
  ptf1a
@@ -510,8 +511,8 @@ rad51
510
  rag1
511
  rag2
512
  rara
 
513
  rarg
514
- rb
515
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516
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517
  rbfox2
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522
  rel
523
  rela
524
  relb
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- repin1
526
  rest
527
  rfx2
528
- rfx5
529
  rfx6
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  rnf2
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532
  rorc
533
  rpa
534
- rpc4
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536
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  runx3
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539
  ruvbl2
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  rxra
 
541
  rxrg
542
  rybp
543
  sall1
@@ -548,7 +547,6 @@ sap30
548
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549
  satb2
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551
- setd1a
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@@ -556,15 +554,14 @@ shox2
556
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557
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  sin3b
 
559
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  six1
561
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562
  six4
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- slc5a5
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565
- smad15
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  smad2
567
- smad23
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  smad3
569
  smad4
570
  smarca4
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- spns1
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610
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618
  t
619
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  taf7l
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  tal1
 
627
  tbp
628
- tbr2
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  tbx20
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  tfap2c
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  tfe3
 
653
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  tgif2
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659
  tlx1
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- tmprss4
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662
  top2a
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- tp53
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- tp63
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  trim28
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  trim33
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- trim63
 
669
  twist1
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  ubiquitin
671
  ubtf
 
672
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  usp16
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@@ -680,27 +677,25 @@ wt1
680
  xbp1
681
  yap1
682
  yy1
683
- zacn
684
  zbtb16
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  zbtb2
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  zc3h11a
 
688
  zfp281
 
 
 
689
  zfp568
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  zfp57
 
691
  zfp932
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- znf322a
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- znf335
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- znf384
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- znf91
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- zscan5b
 
 
 
1
  acss2
2
  actb
3
  aebp2
 
15
  ascl2
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  ash2l
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  asxl1
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  atf2
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  atf3
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  atf4
 
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39
  bhlhe41
 
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45
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  btaf1
 
47
  capg
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  cbfb
50
+ cbx1
51
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  cbx5
 
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  chd4
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  chd8
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  crebbp
 
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  ezh2
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144
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  foxp3
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267
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+ histone lysine crotonylation
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  msl2
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387
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492
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493
  pparg
494
  ppargc1a
 
495
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496
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500
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+ prop1
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505
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506
  ptf1a
 
511
  rag1
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513
  rara
514
+ rarb
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  rarg
 
516
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517
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  rbfox2
 
523
  rel
524
  rela
525
  relb
 
526
  rest
527
  rfx2
 
528
  rfx6
529
  rnf2
530
  rora
531
  rorc
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  rpa
 
533
  runx1
534
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  ruvbl1
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538
  rxra
539
+ rxra/b/g
540
  rxrg
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  rybp
542
  sall1
 
547
  satb1
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549
  scml2
 
550
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551
  sf1
552
  sfmbt1
 
554
  sim2
555
  sin3a
556
  sin3b
557
+ sinhcaf
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  sirt1
559
  six1
560
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561
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562
  smad1
 
563
  smad2
564
+ smad2/3
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587
  spi1
588
  spib
589
  spin1
 
590
  src
591
  srebf1
592
  srf
 
606
  stat6
607
  sumo1
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609
+ supt5
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+ supt6
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  suv39h1
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  suv39h2
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  suz12
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+ syt-ssx2
615
  t
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621
  taf7l
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  tal1
624
+ tasor
625
  tbp
 
626
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647
  tfap2c
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+ tfiih
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  thrb
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  tle
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658
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  top2b
 
 
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+ trp53
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677
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680
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701
+ zscan5b