extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "Embryonic", "stem", "cell", "-", "derived", "trophoblast", "differentiation", ":", "a", "comparative", "review", "of", "the", "biology", ",", "function", ",", "and", "signaling", "mechanisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "development", "of", "the", "placenta", "is", "imperative", "for", "successful", "pregnancy", "establishment", ",", "yet", "the", "earliest", "differentiation", "events", "of", "the", "blastocyst", "-", "derived", "trophectoderm", "that", "forms", "the", "p...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Human", "embryonic", "stem", "cells", "(", "hESC", ")", "display", "a", "unique", "ability", "to", "form", "trophoblast", "cells", "when", "induced", "to", "differentiate", "either", "by", "the", "addition", "of", "exogenous", "BMP4", "or", "by", "the", "fo...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "mouse", "trophoblast", "stem", "cells", "(", "TSC", ")", "have", "been", "isolated", "from", "blastocyst", "outgrowths", ",", "mouse", "ESC", "do", "not", "spontaneously", "differentiate", "into", "trophoblast", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "review", ",", "we", "focus", "on", "addressing", "the", "similarities", "and", "differences", "between", "mouse", "TSC", "differentiation", "and", "hESC", "-", "derived", "trophoblast", "differentiation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "discuss", "the", "functional", "and", "mechanistic", "diversity", "that", "is", "found", "in", "different", "species", "models", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "central", "importance", "are", "the", "unique", "signaling", "events", "that", "trigger", "downstream", "gene", "expression", "that", "create", "specific", "cellular", "fate", "decisions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "support", "the", "idea", "that", "we", "must", "understand", "the", "nuances", "that", "hESC", "differentiation", "models", "display", "so", "that", "investigators", "can", "choose", "the", "appropriate", "model", "system", "to", "fit", "experimental", "n...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Small", "-", "scale", "heat", "detection", "using", "catalytic", "microengines", "irradiated", "by", "laser", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "demonstrate", "a", "novel", "approach", "to", "modulating", "the", "motion", "speed", "of", "catalytic", "microtubular", "engines", "via", "laser", "irradiation", "/", "heating", "with", "regard", "to", "small", "-", "scale", "heat", "detection", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Laser", "irradiation", "on", "the", "engines", "leads", "to", "a", "thermal", "heating", "effect", "and", "thus", "enhances", "the", "engine", "speed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "During", "a", "laser", "on", "/", "off", "period", ",", "the", "motion", "behaviour", "of", "a", "microengine", "can", "be", "repeatable", "and", "reversible", ",", "demonstrating", "a", "regulation", "of", "motion", "speeds", "triggered", "by", "laser", "i...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Also", ",", "the", "engine", "velocity", "exhibits", "a", "linear", "dependence", "on", "laser", "power", "in", "various", "fuel", "concentrations", ",", "which", "implies", "an", "application", "potential", "as", "local", "heat", "sensors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "work", "may", "hold", "great", "promise", "in", "applications", "such", "as", "lab", "on", "a", "chip", ",", "micro", "/", "nano", "factories", ",", "and", "environmental", "detection", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "evolution", "of", "RuBisCO", "stability", "at", "the", "thermal", "limit", "of", "photoautotrophy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "long", "-", "standing", "question", "in", "evolutionary", "biology", "is", "how", "organisms", "adapt", "to", "novel", "environments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "North", "American", "hot", "springs", ",", "diversification", "of", "a", "clade", "of", "the", "cyanobacterium", "Synechococcus", "into", "hotter", "environments", "has", "resulted", "in", "the", "unique", "innovation", "of", "a", "light", "-", "driven", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Here", ",", "we", "investigated", "the", "evolution", "of", "thermostability", "of", "the", "Calvin", "cycle", "enzyme", "ribulose", "-", "1", ",", "5", "-", "bisphosphate", "carboxylase", "/", "oxygenase", "(", "RuBisCO", ")", "during", "Synechococcus", "div...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Circular", "dichroism", "thermal", "scans", "revealed", "that", "the", "RuBisCO", "of", "the", "most", "thermotolerant", "Synechococcus", "lineage", "is", "more", "stable", "than", "those", "of", "other", "lineages", "or", "of", "resurrected", "ancestral", "enzym...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "site", "-", "directed", "mutagenesis", ",", "we", "next", "identified", "four", "amino", "acid", "substitutions", "that", "together", "increased", "stability", "and", "activity", "of", "this", "enzyme", "at", "higher", "temperatures", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "are", "clustered", "near", "critical", "subunit", "interfaces", "distant", "from", "the", "active", "site", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Each", "of", "the", "four", "amino", "acids", "is", "also", "observed", "in", "a", "less", "thermostable", "Synechococcus", "RuBisCO", ",", "and", "the", "impact", "on", "stability", "of", "three", "of", "these", "appears", "to", "be", "epistatic", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recombination", "analyses", "that", "allow", "for", "recurrent", "mutation", "as", "well", "as", "patterns", "of", "synonymous", "variation", "surrounding", "these", "sites", "suggest", "that", "the", "evolution", "of", "a", "more", "thermostable", "RuBisCO", "ma...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "provide", "insights", "on", "the", "molecular", "evolutionary", "processes", "that", "shape", "niche", "differentiation", "and", "ecosystem", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "New", "oral", "anticoagulants", ":", "comparative", "pharmacology", "with", "vitamin", "K", "antagonists", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "New", "oral", "anticoagulants", "(", "OACs", ")", "that", "directly", "inhibit", "Factor", "Xa", "(", "FXa", ")", "or", "thrombin", "have", "been", "developed", "for", "the", "long", "-", "term", "prevention", "of", "thromboembolic", "disorders", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "novel", "agents", "provide", "numerous", "benefits", "over", "older", "vitamin", "K", "antagonists", "(", "VKAs", ")", "due", "to", "major", "pharmacological", "differences", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "VKAs", "are", "economical", "and", "very", "well", "characterized", ",", "but", "have", "important", "limitations", "that", "can", "outweigh", "these", "advantages", ",", "such", "as", "slow", "onset", "of", "action", ",", "narrow", "therapeutic", "window", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "VKA", "-", "associated", "dietary", "precautions", ",", "monitoring", "and", "dosing", "adjustments", "to", "maintain", "international", "normalized", "ratio", "(", "INR", ")", "within", "therapeutic", "range", ",", "and", "bridging", "therapy", ",", "are", "in...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "may", "lead", "to", "increased", "bleeding", "risk", "or", "reduced", "anticoagulation", "and", "increased", "risk", "of", "thrombotic", "events", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "new", "OACs", "have", "rapid", "onset", "of", "action", ",", "low", "potential", "for", "food", "and", "drug", "interactions", ",", "and", "predictable", "anticoagulant", "effect", "that", "removes", "the", "need", "for", "routine", "monitoring", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "FXa", "inhibitors", ",", "e", ".", "g", ".", "rivaroxaban", "and", "apixaban", ",", "are", "potent", ",", "oral", "direct", "inhibitors", "of", "prothrombinase", "-", "bound", ",", "clot", "-", "associated", "or", "free", "FXa", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "agents", "have", "a", "rapid", "onset", "of", "action", ",", "a", "wide", "therapeutic", "window", ",", "little", "or", "no", "interaction", "with", "food", "and", "other", "drugs", ",", "minimal", "inter", "-", "patient", "variability", ",", "and...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Since", "both", "are", "substrates", ",", "co", "-", "administration", "of", "rivaroxaban", "and", "apixaban", "with", "strong", "cytochrome", "P450", "(", "CYP", ")", "3A4", "and", "permeability", "glycoprotein", "(", "P", "-", "gp", ")", "inhibitors", "an...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...
[ "Although", "parenteral", "oral", "direct", "thrombin", "inhibitors", "(", "DTIs", ")", ",", "such", "as", "argatroban", "and", "bivalirudin", ",", "have", "been", "on", "the", "market", "for", "years", ",", "DTIs", "such", "as", "dabigatran", "are", "novel"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Dabigatran", "etexilate", "is", "a", "low", "-", "molecular", "-", "weight", "non", "-", "active", "pro", "-", "drug", "that", "is", "administered", "orally", "and", "converted", "rapidly", "to", "its", "active", "form", ",", "dabigatran", "-", "-", "a", ...	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Dabigatran", "has", "an", "advantage", "over", "the", "indirect", "thrombin", "inhibitors", ",", "unfractionated", "heparin", "and", "low", "-", "molecular", "-", "weight", "heparin", ",", "in", "that", "it", "inhibits", "free", "and", "fibrin", "-", "bound",...	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "reversible", "binding", "of", "dabigatran", "may", "provide", "safer", "and", "more", "predictable", "anticoagulant", "treatment", "than", "seen", "with", "irreversible", ",", "non", "-", "covalent", "thrombin", "inhibitors", ",", "e", ".", "g", ".", "...	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Dabigatran", "shows", "a", "very", "low", "potential", "for", "drug", "-", "drug", "interactions", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "co", "-", "administration", "of", "dabigatran", "etexilate", "with", "other", "anticoagulants", "and", "antiplatelet", "agents", "can", "increase", "the", "bleeding", "risk", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "the", "new", "agents", "are", "pharmacologically", "better", "than", "VKAs", "-", "-", "particularly", "in", "terms", "of", "fixed", "dosing", ",", "rapid", "onset", "of", "action", ",", "no", "INR", "monitoring", "and", "lower", "risk", "of", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMI...
[ "The", "risk", "of", "metabolic", "drug", "-", "drug", "interactions", "also", "appears", "to", "differ", "between", "OACs", ":", "VKAs", ">", "rivaroxaban", ">", "apixaban", ">", "dabigatran", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "The", "convenience", "of", "the", "new", "OACs", "has", "translated", "into", "improvements", "in", "efficacy", "and", "safety", "as", "shown", "in", "phase", "III", "randomized", "trials", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "new", "anticoagulants", "so", "far", "offer", "the", "greatest", "promise", "and", "opportunity", "for", "the", "replacement", "of", "VKAs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fluorescent", "live", "-", "cell", "imaging", "of", "metabolically", "incorporated", "unnatural", "cyclopropene", "-", "mannosamine", "derivatives", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Sugar", "coated", ":", "We", "recently", "developed", "methylcyclopropenes", "as", "low", "-", "molecular", "-", "weight", "tetrazine", "coupling", "partners", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "demonstrate", "that", "methylcyclopropenes", "can", "meet", "the", "stringent", "steric", "demands", "required", "for", "metabolic", "imaging", "of", "unnatural", "mannosamines", "on", "live", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "sequential", "azide", "-", "alkyne", "chemistry", ",", "we", "also", "demonstrate", "multicolor", "imaging", "of", "two", "different", "metabolically", "incorporated", "unnatural", "sugars", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Microwave", "spectroscopic", "and", "atoms", "in", "molecules", "theoretical", "investigations", "on", "the", "Ar", ".", ".", ".", "propargyl", "alcohol", "complex", ":", "Ar", ".", ".", ".", "H", "-", "O", ",", "Ar", ".", ".", ".", "pi", ",", "and", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL"...
[ "The", "structure", "of", "the", "Ar", ".", ".", ".", "propargyl", "alcohol", "(", "Ar", ".", ".", ".", "PA", ")", "complex", "is", "determined", "from", "the", "rotational", "spectra", "of", "the", "parent", "complex", "and", "its", "two", "deuterated",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL...
[ "The", "spectra", "confirm", "a", "geometry", "in", "which", "PA", "exists", "in", "the", "gauche", "form", "with", "Ar", "located", "in", "between", "-", "OH", "and", "-", "C", "=", "C", "-", "H", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "All", "a", ",", "b", "and", "c", "types", "of", "transitions", "show", "small", "splitting", "due", "to", "some", "large", "-", "amplitude", "motion", "dominated", "by", "C", "-", "OH", "torsion", ",", "as", "in", "the", "monomer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Splittings", "in", "a", "-", "and", "b", "-", "type", "transitions", "are", "of", "the", "order", "of", "a", "few", "kilohertz", ",", "whereas", "splitting", "in", "the", "c", "-", "type", "transitions", "is", "relatively", "larger", "(", "0", ".", "9...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "The", "assignments", "are", "well", "supported", "by", "ab", "initio", "calculations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Atoms", "in", "molecules", "(", "AIM", ")", "and", "electrostatic", "potential", "calculations", "are", "used", "to", "explore", "the", "nature", "of", "the", "interactions", "in", "this", "complex", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "AIM", "calculations", "not", "only", "reveal", "the", "expected", "O", "-", "H", ".", ".", ".", "Ar", "and", "pi", ".", ".", ".", "Ar", "interactions", "in", "the", "Ar", ".", ".", ".", "gauche", "-", "PA", "complex", ",", "but", "also", "novel", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", ...
[ "Similar", "interactions", "are", "also", "present", "in", "the", "Ar", ".", ".", ".", "methanol", "complex", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Smoothened", "is", "a", "fully", "competent", "activator", "of", "the", "heterotrimeric", "G", "protein", "G", "(", "i", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Smoothened", "(", "Smo", ")", "is", "a", "7", "-", "transmembrane", "protein", "essential", "to", "the", "activation", "of", "Gli", "transcription", "factors", "(", "Gli", ")", "by", "hedgehog", "morphogens", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "structure", "of", "Smo", "implies", "interactions", "with", "heterotrimeric", "G", "proteins", ",", "but", "the", "degree", "to", "which", "G", "proteins", "participate", "in", "the", "actions", "of", "hedgehogs", "remains", "controversial", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "posit", "that", "the", "G", "(", "i", ")", "family", "of", "G", "proteins", "provides", "to", "hedgehogs", "the", "ability", "to", "expand", "well", "beyond", "the", "bounds", "of", "Gli", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "regard", ",", "we", "evaluate", "here", "the", "efficacy", "of", "Smo", "as", "it", "relates", "to", "the", "activation", "of", "G", "(", "i", ")", ",", "by", "comparing", "Smo", "with", "the", "5", "-", "hydroxytryptamine", "(", "1A", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL"...
[ "We", "find", "that", "with", "use", "of", "[", "(", "35", ")", "S", "]", "guanosine", "5", "'", "-", "(", "3", "-", "O", "-", "thio", ")", "triphosphate", ",", "first", ",", "with", "forms", "of", "G", "(", "i", ")", "endogenous", "to", "human...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I...
[ "This", "finding", "is", "true", "regardless", "of", "subtype", "of", "G", "(", "i", ")", "(", "e", ".", "g", ".", ",", "G", "(", "i2", ")", ",", "G", "(", "o", ")", ",", "and", "G", "(", "z", ")", ")", "tested", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "also", "find", "that", "Smo", "endogenous", "to", "HEK", "-", "293", "cells", ",", "ostensibly", "through", "inhibition", "of", "adenylyl", "cyclase", ",", "decreases", "intracellular", "levels", "of", "cAMP", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "The", "results", "indicate", "that", "Smo", "is", "a", "receptor", "that", "can", "engage", "not", "only", "Gli", "but", "also", "other", "more", "immediate", "effectors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "3D", "nanoscale", "chemical", "imaging", "of", "the", "distribution", "of", "aluminum", "coordination", "environments", "in", "zeolites", "with", "soft", "X", "-", "ray", "microscopy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Which", "side", "are", "you", "on", "?" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Scanning", "transmission", "X", "-", "ray", "microscopy", "is", "used", "for", "the", "first", "time", "to", "elucidate", "the", "coordination", "and", "distribution", "of", "aluminum", "in", "industrial", "-", "relevant", "zeolites", "at", "the", "single", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Extended", "regions", "of", "a", "few", "hundred", "nanometers", ",", "rich", "in", "higher", "aluminum", "coordination", "environments", ",", "are", "heterogeneously", "embedded", "within", "the", "zeolite", "particle", ",", "before", "and", "after", "a", "ste...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Structural", "aspects", "of", "gut", "peptides", "with", "therapeutic", "potential", "for", "type", "2", "diabetes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Gut", "hormones", "represent", "a", "niche", "subset", "of", "pharmacologically", "active", "agents", "that", "are", "rapidly", "gaining", "importance", "in", "medicine", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Due", "to", "their", "exceptional", "specificity", "for", "their", "receptors", ",", "these", "hormones", "along", "with", "their", "analogues", "have", "attracted", "considerable", "pharmaceutical", "interest", "for", "the", "treatment", "of", "human", "disorders"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "With", "the", "recent", "advances", "in", "the", "structural", "biology", ",", "a", "significant", "amount", "of", "structural", "information", "for", "these", "hormones", "is", "now", "available", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "Minireview", "presents", "an", "overview", "of", "the", "structural", "aspects", "of", "these", "hormones", ",", "which", "have", "roles", "in", "physiological", "processes", "such", "as", "insulin", "secretion", ",", "as", "well", "as", "a", "discuss...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Electron", "doping", "by", "charge", "transfer", "at", "LaFeO3", "/", "Sm2CuO4", "epitaxial", "interfaces", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "X", "-", "ray", "absorption", "spectroscopy", "and", "electron", "energy", "loss", "spectroscopy", "with", "atomic", "-", "scale", "spatial", "resolution", ",", "experimental", "evidence", "for", "charge", "transfer", "at", "the", "interface", "between",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "As", "a", "consequence", "of", "the", "charge", "transfer", ",", "the", "Sm2", "CuO4", "is", "doped", "with", "electrons", "and", "thus", "epitaxial", "Sm2", "CuO4", "/", "LaFeO3", "heterostructures", "become", "metallic", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Conformational", "dynamics", "of", "the", "human", "propeller", "telomeric", "DNA", "quadruplex", "on", "a", "microsecond", "time", "scale", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "human", "telomeric", "DNA", "sequence", "with", "four", "repeats", "can", "fold", "into", "a", "parallel", "-", "stranded", "propeller", "-", "type", "topology", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "NMR", "structures", "solved", "under", "molecular", "crowding", "experiments", "correlate", "with", "the", "crystal", "structures", "found", "with", "crystal", "-", "packing", "interactions", "that", "are", "effectively", "equivalent", "to", "molecular", "crowding", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "topology", "has", "been", "used", "for", "rationalization", "of", "ligand", "design", "and", "occurs", "experimentally", "in", "a", "number", "of", "complexes", "with", "a", "diversity", "of", "ligands", ",", "at", "least", "in", "the", "crystalline",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "G", "-", "quartet", "stems", "have", "been", "well", "characterized", ",", "the", "interactions", "of", "the", "TTA", "loop", "with", "the", "G", "-", "quartets", "are", "much", "less", "defined", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "better", "understand", "the", "conformational", "variability", "and", "structural", "dynamics", "of", "the", "propeller", "-", "type", "topology", ",", "we", "performed", "molecular", "dynamics", "simulations", "in", "explicit", "solvent", "up", "to", "1", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "analysis", "provides", "a", "detailed", "atomistic", "account", "of", "the", "dynamic", "nature", "of", "the", "TTA", "loops", "highlighting", "their", "interactions", "with", "the", "G", "-", "quartets", "including", "formation", "of", "an", "A", ":",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "present", "a", "threshold", "in", "quadruplex", "simulations", ",", "with", "regards", "to", "understanding", "the", "flexible", "nature", "of", "the", "sugar", "-", "phosphate", "backbone", "in", "formation", "of", "unusual", "architecture", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "this", "study", "stresses", "the", "importance", "of", "simulation", "time", "in", "sampling", "conformational", "space", "for", "this", "topology", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "ParseCNV", "integrative", "copy", "number", "variation", "association", "software", "with", "quality", "tracking", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "number", "of", "copy", "number", "variation", "(", "CNV", ")", "calling", "algorithms", "exist", ";", "however", ",", "comprehensive", "software", "tools", "for", "CNV", "association", "studies", "are", "lacking", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "describe", "ParseCNV", ",", "unique", "software", "that", "takes", "CNV", "calls", "and", "creates", "probe", "-", "based", "statistics", "for", "CNV", "occurrence", "in", "both", "case", "-", "control", "design", "and", "in", "family", "based", "stud...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "CNVRs", "are", "defined", "in", "a", "dynamic", "manner", "to", "allow", "for", "a", "complex", "CNV", "overlap", "while", "maintaining", "precise", "association", "region", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "this", "approach", ",", "we", "avoid", "failure", "to", "converge", "and", "non", "-", "monotonic", "curve", "fitting", "weaknesses", "of", "programs", ",", "such", "as", "CNVtools", "and", "CNVassoc", ",", "and", "although", "Plink", "is", "easy",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Existing", "CNV", "association", "methods", "do", "not", "provide", "any", "quality", "tracking", "information", "to", "filter", "confident", "associations", ",", "a", "key", "issue", "which", "is", "fully", "addressed", "by", "ParseCNV", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "uncertainty", "in", "CNV", "calls", "underlying", "CNV", "associations", "is", "evaluated", "to", "verify", "significant", "results", ",", "including", "CNV", "overlap", "profiles", ",", "genomic", "context", ",", "number", "of", "probes"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "optimal", "quality", "control", "parameters", "are", "followed", "using", "ParseCNV", ",", "90", "%", "of", "CNVs", "validate", "by", "polymerase", "chain", "reaction", ",", "an", "often", "problematic", "stage", "because", "of", "inadequate", "signific...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "ParseCNV", "is", "freely", "available", "at", "http", ":", "/", "/", "parsecnv", ".", "sourceforge", ".", "net", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Dietary", "exposure", "of", "mink", "(", "Mustela", "vison", ")", "to", "fish", "from", "the", "upper", "Hudson", "River", ",", "New", "York", ",", "USA", ":", "effects", "on", "reproduction", "and", "offspring", "growth", "and", "mortality", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "effects", "of", "feeding", "farm", "-", "raised", "mink", "(", "Mustela", "vison", ")", "diets", "containing", "polychlorinated", "biphenyl", "(", "PCB", ")", "-", "contaminated", "fish", "from", "the", "upper", "Hudson", "River", "(", "New", "York",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...
[ "Diets", "contained", "2", ".", "5", "to", "20", "%", "Hudson", "River", "fish", ",", "providing", "0", ".", "72", "to", "6", ".", "1", "micro", "g", "sum", "PCBs", "/", "g", "feed", "(", "4", ".", "8", "-", "38", "pg", "toxic", "equivalents", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "percentage", "of", "stillborn", "kits", "per", "litter", "was", "significantly", "increased", "by", "dietary", "concentrations", "of", "4", ".", "5", "micro", "g", "sum", "PCBs", "/", "g", "feed", "(", "28", "pg", "TEQWHO", "2005", "/", "g", "fee...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Embryonic", "stem", "cell", "-", "derived", "trophoblast", "differentiation", ":", "a", "comparative", "review", "of", "the", "biology", ",", "function", ",", "and", "signaling", "mechanisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "development", "of", "the", "placenta", "is", "imperative", "for", "successful", "pregnancy", "establishment", ",", "yet", "the", "earliest", "differentiation", "events", "of", "the", "blastocyst", "-", "derived", "trophectoderm", "that", "forms", "the", "p...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Human", "embryonic", "stem", "cells", "(", "hESC", ")", "display", "a", "unique", "ability", "to", "form", "trophoblast", "cells", "when", "induced", "to", "differentiate", "either", "by", "the", "addition", "of", "exogenous", "BMP4", "or", "by", "the", "fo...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "mouse", "trophoblast", "stem", "cells", "(", "TSC", ")", "have", "been", "isolated", "from", "blastocyst", "outgrowths", ",", "mouse", "ESC", "do", "not", "spontaneously", "differentiate", "into", "trophoblast", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "review", ",", "we", "focus", "on", "addressing", "the", "similarities", "and", "differences", "between", "mouse", "TSC", "differentiation", "and", "hESC", "-", "derived", "trophoblast", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "discuss", "the", "functional", "and", "mechanistic", "diversity", "that", "is", "found", "in", "different", "species", "models", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Of", "central", "importance", "are", "the", "unique", "signaling", "events", "that", "trigger", "downstream", "gene", "expression", "that", "create", "specific", "cellular", "fate", "decisions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "support", "the", "idea", "that", "we", "must", "understand", "the", "nuances", "that", "hESC", "differentiation", "models", "display", "so", "that", "investigators", "can", "choose", "the", "appropriate", "model", "system", "to", "fit", "experimental", "n...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Small", "-", "scale", "heat", "detection", "using", "catalytic", "microengines", "irradiated", "by", "laser", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "demonstrate", "a", "novel", "approach", "to", "modulating", "the", "motion", "speed", "of", "catalytic", "microtubular", "engines", "via", "laser", "irradiation", "/", "heating", "with", "regard", "to", "small", "-", "scale", "heat", "detection", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Laser", "irradiation", "on", "the", "engines", "leads", "to", "a", "thermal", "heating", "effect", "and", "thus", "enhances", "the", "engine", "speed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "During", "a", "laser", "on", "/", "off", "period", ",", "the", "motion", "behaviour", "of", "a", "microengine", "can", "be", "repeatable", "and", "reversible", ",", "demonstrating", "a", "regulation", "of", "motion", "speeds", "triggered", "by", "laser", "i...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Also", ",", "the", "engine", "velocity", "exhibits", "a", "linear", "dependence", "on", "laser", "power", "in", "various", "fuel", "concentrations", ",", "which", "implies", "an", "application", "potential", "as", "local", "heat", "sensors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "work", "may", "hold", "great", "promise", "in", "applications", "such", "as", "lab", "on", "a", "chip", ",", "micro", "/", "nano", "factories", ",", "and", "environmental", "detection", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "evolution", "of", "RuBisCO", "stability", "at", "the", "thermal", "limit", "of", "photoautotrophy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "long", "-", "standing", "question", "in", "evolutionary", "biology", "is", "how", "organisms", "adapt", "to", "novel", "environments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "North", "American", "hot", "springs", ",", "diversification", "of", "a", "clade", "of", "the", "cyanobacterium", "Synechococcus", "into", "hotter", "environments", "has", "resulted", "in", "the", "unique", "innovation", "of", "a", "light", "-", "driven", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Here", ",", "we", "investigated", "the", "evolution", "of", "thermostability", "of", "the", "Calvin", "cycle", "enzyme", "ribulose", "-", "1", ",", "5", "-", "bisphosphate", "carboxylase", "/", "oxygenase", "(", "RuBisCO", ")", "during", "Synechococcus", "div...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Circular", "dichroism", "thermal", "scans", "revealed", "that", "the", "RuBisCO", "of", "the", "most", "thermotolerant", "Synechococcus", "lineage", "is", "more", "stable", "than", "those", "of", "other", "lineages", "or", "of", "resurrected", "ancestral", "enzym...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "site", "-", "directed", "mutagenesis", ",", "we", "next", "identified", "four", "amino", "acid", "substitutions", "that", "together", "increased", "stability", "and", "activity", "of", "this", "enzyme", "at", "higher", "temperatures", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "are", "clustered", "near", "critical", "subunit", "interfaces", "distant", "from", "the", "active", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Each", "of", "the", "four", "amino", "acids", "is", "also", "observed", "in", "a", "less", "thermostable", "Synechococcus", "RuBisCO", ",", "and", "the", "impact", "on", "stability", "of", "three", "of", "these", "appears", "to", "be", "epistatic", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recombination", "analyses", "that", "allow", "for", "recurrent", "mutation", "as", "well", "as", "patterns", "of", "synonymous", "variation", "surrounding", "these", "sites", "suggest", "that", "the", "evolution", "of", "a", "more", "thermostable", "RuBisCO", "ma...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "provide", "insights", "on", "the", "molecular", "evolutionary", "processes", "that", "shape", "niche", "differentiation", "and", "ecosystem", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "New", "oral", "anticoagulants", ":", "comparative", "pharmacology", "with", "vitamin", "K", "antagonists", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "New", "oral", "anticoagulants", "(", "OACs", ")", "that", "directly", "inhibit", "Factor", "Xa", "(", "FXa", ")", "or", "thrombin", "have", "been", "developed", "for", "the", "long", "-", "term", "prevention", "of", "thromboembolic", "disorders", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "novel", "agents", "provide", "numerous", "benefits", "over", "older", "vitamin", "K", "antagonists", "(", "VKAs", ")", "due", "to", "major", "pharmacological", "differences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "VKAs", "are", "economical", "and", "very", "well", "characterized", ",", "but", "have", "important", "limitations", "that", "can", "outweigh", "these", "advantages", ",", "such", "as", "slow", "onset", "of", "action", ",", "narrow", "therapeutic", "window", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "VKA", "-", "associated", "dietary", "precautions", ",", "monitoring", "and", "dosing", "adjustments", "to", "maintain", "international", "normalized", "ratio", "(", "INR", ")", "within", "therapeutic", "range", ",", "and", "bridging", "therapy", ",", "are", "in...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "may", "lead", "to", "increased", "bleeding", "risk", "or", "reduced", "anticoagulation", "and", "increased", "risk", "of", "thrombotic", "events", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "new", "OACs", "have", "rapid", "onset", "of", "action", ",", "low", "potential", "for", "food", "and", "drug", "interactions", ",", "and", "predictable", "anticoagulant", "effect", "that", "removes", "the", "need", "for", "routine", "monitoring", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "FXa", "inhibitors", ",", "e", ".", "g", ".", "rivaroxaban", "and", "apixaban", ",", "are", "potent", ",", "oral", "direct", "inhibitors", "of", "prothrombinase", "-", "bound", ",", "clot", "-", "associated", "or", "free", "FXa", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "agents", "have", "a", "rapid", "onset", "of", "action", ",", "a", "wide", "therapeutic", "window", ",", "little", "or", "no", "interaction", "with", "food", "and", "other", "drugs", ",", "minimal", "inter", "-", "patient", "variability", ",", "and...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Since", "both", "are", "substrates", ",", "co", "-", "administration", "of", "rivaroxaban", "and", "apixaban", "with", "strong", "cytochrome", "P450", "(", "CYP", ")", "3A4", "and", "permeability", "glycoprotein", "(", "P", "-", "gp", ")", "inhibitors", "an...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...

[ "Although", "parenteral", "oral", "direct", "thrombin", "inhibitors", "(", "DTIs", ")", ",", "such", "as", "argatroban", "and", "bivalirudin", ",", "have", "been", "on", "the", "market", "for", "years", ",", "DTIs", "such", "as", "dabigatran", "are", "novel"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dabigatran", "etexilate", "is", "a", "low", "-", "molecular", "-", "weight", "non", "-", "active", "pro", "-", "drug", "that", "is", "administered", "orally", "and", "converted", "rapidly", "to", "its", "active", "form", ",", "dabigatran", "-", "-", "a", ...

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dabigatran", "has", "an", "advantage", "over", "the", "indirect", "thrombin", "inhibitors", ",", "unfractionated", "heparin", "and", "low", "-", "molecular", "-", "weight", "heparin", ",", "in", "that", "it", "inhibits", "free", "and", "fibrin", "-", "bound",...

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "reversible", "binding", "of", "dabigatran", "may", "provide", "safer", "and", "more", "predictable", "anticoagulant", "treatment", "than", "seen", "with", "irreversible", ",", "non", "-", "covalent", "thrombin", "inhibitors", ",", "e", ".", "g", ".", "...

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dabigatran", "shows", "a", "very", "low", "potential", "for", "drug", "-", "drug", "interactions", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "co", "-", "administration", "of", "dabigatran", "etexilate", "with", "other", "anticoagulants", "and", "antiplatelet", "agents", "can", "increase", "the", "bleeding", "risk", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "the", "new", "agents", "are", "pharmacologically", "better", "than", "VKAs", "-", "-", "particularly", "in", "terms", "of", "fixed", "dosing", ",", "rapid", "onset", "of", "action", ",", "no", "INR", "monitoring", "and", "lower", "risk", "of", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMI...

[ "The", "risk", "of", "metabolic", "drug", "-", "drug", "interactions", "also", "appears", "to", "differ", "between", "OACs", ":", "VKAs", ">", "rivaroxaban", ">", "apixaban", ">", "dabigatran", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "The", "convenience", "of", "the", "new", "OACs", "has", "translated", "into", "improvements", "in", "efficacy", "and", "safety", "as", "shown", "in", "phase", "III", "randomized", "trials", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "new", "anticoagulants", "so", "far", "offer", "the", "greatest", "promise", "and", "opportunity", "for", "the", "replacement", "of", "VKAs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fluorescent", "live", "-", "cell", "imaging", "of", "metabolically", "incorporated", "unnatural", "cyclopropene", "-", "mannosamine", "derivatives", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Sugar", "coated", ":", "We", "recently", "developed", "methylcyclopropenes", "as", "low", "-", "molecular", "-", "weight", "tetrazine", "coupling", "partners", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "demonstrate", "that", "methylcyclopropenes", "can", "meet", "the", "stringent", "steric", "demands", "required", "for", "metabolic", "imaging", "of", "unnatural", "mannosamines", "on", "live", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "sequential", "azide", "-", "alkyne", "chemistry", ",", "we", "also", "demonstrate", "multicolor", "imaging", "of", "two", "different", "metabolically", "incorporated", "unnatural", "sugars", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Microwave", "spectroscopic", "and", "atoms", "in", "molecules", "theoretical", "investigations", "on", "the", "Ar", ".", ".", ".", "propargyl", "alcohol", "complex", ":", "Ar", ".", ".", ".", "H", "-", "O", ",", "Ar", ".", ".", ".", "pi", ",", "and", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL"...

[ "The", "structure", "of", "the", "Ar", ".", ".", ".", "propargyl", "alcohol", "(", "Ar", ".", ".", ".", "PA", ")", "complex", "is", "determined", "from", "the", "rotational", "spectra", "of", "the", "parent", "complex", "and", "its", "two", "deuterated",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL...

[ "The", "spectra", "confirm", "a", "geometry", "in", "which", "PA", "exists", "in", "the", "gauche", "form", "with", "Ar", "located", "in", "between", "-", "OH", "and", "-", "C", "=", "C", "-", "H", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "All", "a", ",", "b", "and", "c", "types", "of", "transitions", "show", "small", "splitting", "due", "to", "some", "large", "-", "amplitude", "motion", "dominated", "by", "C", "-", "OH", "torsion", ",", "as", "in", "the", "monomer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Splittings", "in", "a", "-", "and", "b", "-", "type", "transitions", "are", "of", "the", "order", "of", "a", "few", "kilohertz", ",", "whereas", "splitting", "in", "the", "c", "-", "type", "transitions", "is", "relatively", "larger", "(", "0", ".", "9...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "The", "assignments", "are", "well", "supported", "by", "ab", "initio", "calculations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Atoms", "in", "molecules", "(", "AIM", ")", "and", "electrostatic", "potential", "calculations", "are", "used", "to", "explore", "the", "nature", "of", "the", "interactions", "in", "this", "complex", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "AIM", "calculations", "not", "only", "reveal", "the", "expected", "O", "-", "H", ".", ".", ".", "Ar", "and", "pi", ".", ".", ".", "Ar", "interactions", "in", "the", "Ar", ".", ".", ".", "gauche", "-", "PA", "complex", ",", "but", "also", "novel", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", ...

[ "Similar", "interactions", "are", "also", "present", "in", "the", "Ar", ".", ".", ".", "methanol", "complex", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Smoothened", "is", "a", "fully", "competent", "activator", "of", "the", "heterotrimeric", "G", "protein", "G", "(", "i", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Smoothened", "(", "Smo", ")", "is", "a", "7", "-", "transmembrane", "protein", "essential", "to", "the", "activation", "of", "Gli", "transcription", "factors", "(", "Gli", ")", "by", "hedgehog", "morphogens", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "structure", "of", "Smo", "implies", "interactions", "with", "heterotrimeric", "G", "proteins", ",", "but", "the", "degree", "to", "which", "G", "proteins", "participate", "in", "the", "actions", "of", "hedgehogs", "remains", "controversial", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "posit", "that", "the", "G", "(", "i", ")", "family", "of", "G", "proteins", "provides", "to", "hedgehogs", "the", "ability", "to", "expand", "well", "beyond", "the", "bounds", "of", "Gli", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "regard", ",", "we", "evaluate", "here", "the", "efficacy", "of", "Smo", "as", "it", "relates", "to", "the", "activation", "of", "G", "(", "i", ")", ",", "by", "comparing", "Smo", "with", "the", "5", "-", "hydroxytryptamine", "(", "1A", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL"...

[ "We", "find", "that", "with", "use", "of", "[", "(", "35", ")", "S", "]", "guanosine", "5", "'", "-", "(", "3", "-", "O", "-", "thio", ")", "triphosphate", ",", "first", ",", "with", "forms", "of", "G", "(", "i", ")", "endogenous", "to", "human...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I...

[ "This", "finding", "is", "true", "regardless", "of", "subtype", "of", "G", "(", "i", ")", "(", "e", ".", "g", ".", ",", "G", "(", "i2", ")", ",", "G", "(", "o", ")", ",", "and", "G", "(", "z", ")", ")", "tested", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "find", "that", "Smo", "endogenous", "to", "HEK", "-", "293", "cells", ",", "ostensibly", "through", "inhibition", "of", "adenylyl", "cyclase", ",", "decreases", "intracellular", "levels", "of", "cAMP", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "The", "results", "indicate", "that", "Smo", "is", "a", "receptor", "that", "can", "engage", "not", "only", "Gli", "but", "also", "other", "more", "immediate", "effectors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "3D", "nanoscale", "chemical", "imaging", "of", "the", "distribution", "of", "aluminum", "coordination", "environments", "in", "zeolites", "with", "soft", "X", "-", "ray", "microscopy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Which", "side", "are", "you", "on", "?" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Scanning", "transmission", "X", "-", "ray", "microscopy", "is", "used", "for", "the", "first", "time", "to", "elucidate", "the", "coordination", "and", "distribution", "of", "aluminum", "in", "industrial", "-", "relevant", "zeolites", "at", "the", "single", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Extended", "regions", "of", "a", "few", "hundred", "nanometers", ",", "rich", "in", "higher", "aluminum", "coordination", "environments", ",", "are", "heterogeneously", "embedded", "within", "the", "zeolite", "particle", ",", "before", "and", "after", "a", "ste...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Structural", "aspects", "of", "gut", "peptides", "with", "therapeutic", "potential", "for", "type", "2", "diabetes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Gut", "hormones", "represent", "a", "niche", "subset", "of", "pharmacologically", "active", "agents", "that", "are", "rapidly", "gaining", "importance", "in", "medicine", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Due", "to", "their", "exceptional", "specificity", "for", "their", "receptors", ",", "these", "hormones", "along", "with", "their", "analogues", "have", "attracted", "considerable", "pharmaceutical", "interest", "for", "the", "treatment", "of", "human", "disorders"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "With", "the", "recent", "advances", "in", "the", "structural", "biology", ",", "a", "significant", "amount", "of", "structural", "information", "for", "these", "hormones", "is", "now", "available", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "Minireview", "presents", "an", "overview", "of", "the", "structural", "aspects", "of", "these", "hormones", ",", "which", "have", "roles", "in", "physiological", "processes", "such", "as", "insulin", "secretion", ",", "as", "well", "as", "a", "discuss...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Electron", "doping", "by", "charge", "transfer", "at", "LaFeO3", "/", "Sm2CuO4", "epitaxial", "interfaces", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "X", "-", "ray", "absorption", "spectroscopy", "and", "electron", "energy", "loss", "spectroscopy", "with", "atomic", "-", "scale", "spatial", "resolution", ",", "experimental", "evidence", "for", "charge", "transfer", "at", "the", "interface", "between",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "As", "a", "consequence", "of", "the", "charge", "transfer", ",", "the", "Sm2", "CuO4", "is", "doped", "with", "electrons", "and", "thus", "epitaxial", "Sm2", "CuO4", "/", "LaFeO3", "heterostructures", "become", "metallic", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Conformational", "dynamics", "of", "the", "human", "propeller", "telomeric", "DNA", "quadruplex", "on", "a", "microsecond", "time", "scale", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "human", "telomeric", "DNA", "sequence", "with", "four", "repeats", "can", "fold", "into", "a", "parallel", "-", "stranded", "propeller", "-", "type", "topology", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "NMR", "structures", "solved", "under", "molecular", "crowding", "experiments", "correlate", "with", "the", "crystal", "structures", "found", "with", "crystal", "-", "packing", "interactions", "that", "are", "effectively", "equivalent", "to", "molecular", "crowding", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "topology", "has", "been", "used", "for", "rationalization", "of", "ligand", "design", "and", "occurs", "experimentally", "in", "a", "number", "of", "complexes", "with", "a", "diversity", "of", "ligands", ",", "at", "least", "in", "the", "crystalline",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "G", "-", "quartet", "stems", "have", "been", "well", "characterized", ",", "the", "interactions", "of", "the", "TTA", "loop", "with", "the", "G", "-", "quartets", "are", "much", "less", "defined", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "better", "understand", "the", "conformational", "variability", "and", "structural", "dynamics", "of", "the", "propeller", "-", "type", "topology", ",", "we", "performed", "molecular", "dynamics", "simulations", "in", "explicit", "solvent", "up", "to", "1", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "analysis", "provides", "a", "detailed", "atomistic", "account", "of", "the", "dynamic", "nature", "of", "the", "TTA", "loops", "highlighting", "their", "interactions", "with", "the", "G", "-", "quartets", "including", "formation", "of", "an", "A", ":",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "present", "a", "threshold", "in", "quadruplex", "simulations", ",", "with", "regards", "to", "understanding", "the", "flexible", "nature", "of", "the", "sugar", "-", "phosphate", "backbone", "in", "formation", "of", "unusual", "architecture", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "this", "study", "stresses", "the", "importance", "of", "simulation", "time", "in", "sampling", "conformational", "space", "for", "this", "topology", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "ParseCNV", "integrative", "copy", "number", "variation", "association", "software", "with", "quality", "tracking", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "number", "of", "copy", "number", "variation", "(", "CNV", ")", "calling", "algorithms", "exist", ";", "however", ",", "comprehensive", "software", "tools", "for", "CNV", "association", "studies", "are", "lacking", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "describe", "ParseCNV", ",", "unique", "software", "that", "takes", "CNV", "calls", "and", "creates", "probe", "-", "based", "statistics", "for", "CNV", "occurrence", "in", "both", "case", "-", "control", "design", "and", "in", "family", "based", "stud...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "CNVRs", "are", "defined", "in", "a", "dynamic", "manner", "to", "allow", "for", "a", "complex", "CNV", "overlap", "while", "maintaining", "precise", "association", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "this", "approach", ",", "we", "avoid", "failure", "to", "converge", "and", "non", "-", "monotonic", "curve", "fitting", "weaknesses", "of", "programs", ",", "such", "as", "CNVtools", "and", "CNVassoc", ",", "and", "although", "Plink", "is", "easy",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Existing", "CNV", "association", "methods", "do", "not", "provide", "any", "quality", "tracking", "information", "to", "filter", "confident", "associations", ",", "a", "key", "issue", "which", "is", "fully", "addressed", "by", "ParseCNV", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "uncertainty", "in", "CNV", "calls", "underlying", "CNV", "associations", "is", "evaluated", "to", "verify", "significant", "results", ",", "including", "CNV", "overlap", "profiles", ",", "genomic", "context", ",", "number", "of", "probes"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "optimal", "quality", "control", "parameters", "are", "followed", "using", "ParseCNV", ",", "90", "%", "of", "CNVs", "validate", "by", "polymerase", "chain", "reaction", ",", "an", "often", "problematic", "stage", "because", "of", "inadequate", "signific...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "ParseCNV", "is", "freely", "available", "at", "http", ":", "/", "/", "parsecnv", ".", "sourceforge", ".", "net", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dietary", "exposure", "of", "mink", "(", "Mustela", "vison", ")", "to", "fish", "from", "the", "upper", "Hudson", "River", ",", "New", "York", ",", "USA", ":", "effects", "on", "reproduction", "and", "offspring", "growth", "and", "mortality", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "effects", "of", "feeding", "farm", "-", "raised", "mink", "(", "Mustela", "vison", ")", "diets", "containing", "polychlorinated", "biphenyl", "(", "PCB", ")", "-", "contaminated", "fish", "from", "the", "upper", "Hudson", "River", "(", "New", "York",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...

[ "Diets", "contained", "2", ".", "5", "to", "20", "%", "Hudson", "River", "fish", ",", "providing", "0", ".", "72", "to", "6", ".", "1", "micro", "g", "sum", "PCBs", "/", "g", "feed", "(", "4", ".", "8", "-", "38", "pg", "toxic", "equivalents", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "percentage", "of", "stillborn", "kits", "per", "litter", "was", "significantly", "increased", "by", "dietary", "concentrations", "of", "4", ".", "5", "micro", "g", "sum", "PCBs", "/", "g", "feed", "(", "28", "pg", "TEQWHO", "2005", "/", "g", "fee...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]