tokens
listlengths
2
298
ner_tags
listlengths
2
298
[ "Effects", "of", "DNA", "methylation", "on", "nucleosome", "stability", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Methylation", "of", "DNA", "at", "CpG", "dinucleotides", "represents", "one", "of", "the", "most", "important", "epigenetic", "mechanisms", "involved", "in", "the", "control", "of", "gene", "expression", "in", "vertebrate", "cells", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "report", ",", "we", "conducted", "nucleosome", "reconstitution", "experiments", "in", "conjunction", "with", "high", "-", "throughput", "sequencing", "on", "572", "KB", "of", "human", "DNA", "and", "668", "KB", "of", "mouse", "DNA", "that", "w...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "The", "results", "demonstrated", "that", "a", "subset", "of", "nucleosomes", "positioned", "by", "nucleotide", "sequence", "was", "sensitive", "to", "methylation", "where", "the", "modification", "increased", "the", "affinity", "of", "these", "sequences", "for", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "features", "that", "distinguished", "these", "nucleosomes", "from", "the", "bulk", "of", "the", "methylation", "-", "insensitive", "nucleosomes", "were", "an", "increase", "in", "the", "frequency", "of", "CpG", "dinucleotides", "and", "a", "unique", "rot...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...
[ "These", "methylation", "-", "sensitive", "nucleosomes", "were", "preferentially", "associated", "with", "exons", "as", "compared", "to", "introns", "while", "unmethylated", "CpG", "islands", "near", "transcription", "start", "sites", "became", "enriched", "in", "nu...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "of", "this", "study", "suggest", "that", "the", "effects", "of", "DNA", "methylation", "on", "nucleosome", "stability", "in", "vitro", "can", "recapitulate", "what", "has", "been", "observed", "in", "the", "cell", "and", "provide", "a", "d...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Quantitative", "purity", "-", "activity", "relationships", "of", "natural", "products", ":", "the", "case", "of", "anti", "-", "tuberculosis", "active", "triterpenes", "from", "Oplopanax", "horridus", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "study", "provides", "an", "extension", "of", "the", "previously", "developed", "concept", "of", "purity", "-", "activity", "relationships", "(", "PARs", ")", "and", "enables", "the", "quantitative", "evaluation", "of", "the", "effects", "of", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "anti", "-", "tuberculosis", "active", "triterpenes", "from", "the", "Alaskan", "ethnobotanical", "Oplopanax", "horridus", "were", "selected", "as", "a", "case", "for", "the", "development", "of", "the", "quantitative", "PAR", "(", "QPAR", ")", "concept",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "residual", "complexity", "of", "the", "purified", "triterpenes", "was", "initially", "evaluated", "by", "1D", "-", "and", "2D", "-", "NMR", "and", "identified", "as", "a", "combination", "of", "structurally", "related", "and", "unrelated", "impurities", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "a", "biochemometric", "approach", ",", "the", "qHNMR", "purity", "and", "anti", "-", "TB", "activity", "of", "successive", "chromatographic", "fractions", "of", "O", ".", "horridus", "triterpenes", "were", "correlated", "by", "linear", "regression", "a...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "demonstrate", "that", "impurities", ",", "such", "as", "widely", "occurring", "monoglycerides", ",", "can", "have", "a", "profound", "impact", "on", "the", "observed", "antimycobacterial", "activity", "of", "triterpene", "-", "enriched", "fracti...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "QPAR", "concept", "is", "shown", "to", "be", "capable", "of", "providing", "a", "quantitative", "assessment", "in", "situations", "where", "residually", "complex", "constitution", "contributes", "toward", "the", "biological", "activity", "of", "natural", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "comparison", "of", "the", "signalling", "properties", "of", "two", "tyramine", "receptors", "from", "Drosophila", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "invertebrates", ",", "the", "phenolamines", ",", "tyramine", "and", "octopamine", ",", "mediate", "many", "functional", "roles", "usually", "associated", "with", "the", "catecholamines", ",", "noradrenaline", "and", "adrenaline", ",", "in", "vertebrates", "...
[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "alpha", "-", "and", "beta", "-", "adrenergic", "classes", "of", "insect", "octopamine", "receptor", "are", "better", "activated", "by", "octopamine", "than", "tyramine", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Similarly", ",", "the", "Tyramine", "1", "subgroup", "of", "receptors", "(", "or", "Octopamine", "/", "Tyramine", "receptors", ")", "are", "better", "activated", "by", "tyramine", "than", "octopamine", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "However", ",", "recently", ",", "a", "new", "Tyramine", "2", "subgroup", "of", "receptors", "was", "identified", ",", "which", "appears", "to", "be", "activated", "highly", "preferentially", "by", "tyramine", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "We", "examined", "immunocytochemically", "the", "ability", "of", "CG7431", ",", "the", "founding", "member", "of", "this", "subgroup", "from", "Drosophila", "melanogaster", ",", "to", "be", "internalized", "in", "transfected", "Chinese", "hamster", "ovary", "(", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "was", "only", "internalized", "after", "activation", "by", "tyramine", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Conversely", ",", "the", "structurally", "related", "receptor", ",", "CG16766", ",", "was", "internalized", "by", "a", "number", "of", "biogenic", "amines", ",", "including", "octopamine", ",", "dopamine", ",", "noradrenaline", ",", "adrenaline", ",", "which", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "...
[ "Studies", "with", "synthetic", "agonists", "and", "antagonists", "confirm", "that", "CG16766", "has", "a", "different", "pharmacological", "profile", "to", "that", "of", "CG7431", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Species", "orthologues", "of", "CG16766", "were", "only", "found", "in", "Drosophila", "species", ",", "whereas", "orthologues", "of", "CG7431", "could", "be", "identified", "in", "the", "genomes", "of", "a", "number", "of", "insect", "species", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "propose", "that", "CG16766", "represents", "a", "new", "group", "of", "tyramine", "receptors", ",", "which", "we", "have", "designated", "the", "Tyramine", "3", "receptors", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "Formaldehyde", "metabolism", "and", "formaldehyde", "-", "induced", "stimulation", "of", "lactate", "production", "and", "glutathione", "export", "in", "cultured", "neurons", "." ]
[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Formaldehyde", "is", "endogenously", "produced", "in", "the", "human", "body", "and", "brain", "levels", "of", "this", "compound", "are", "elevated", "in", "neurodegenerative", "conditions", "." ]
[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "the", "toxic", "potential", "of", "an", "excess", "of", "formaldehyde", "has", "been", "studied", ",", "little", "is", "known", "on", "the", "molecular", "mechanisms", "underlying", "its", "neurotoxicity", "as", "well", "as", "on", "the", "ability...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "To", "address", "these", "topics", ",", "we", "have", "used", "cerebellar", "granule", "neuron", "cultures", "as", "model", "system", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "cultures", "express", "mRNAs", "of", "various", "enzymes", "that", "are", "involved", "in", "formaldehyde", "metabolism", "and", "were", "remarkably", "resistant", "toward", "acute", "formaldehyde", "toxicity", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Cerebellar", "granule", "neurons", "metabolized", "formaldehyde", "with", "a", "rate", "of", "around", "200", "nmol", "/", "(", "h", "x", "mg", ")", "which", "was", "accompanied", "by", "significant", "increases", "in", "the", "cellular", "and", "extracellula...
[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "formaldehyde", "application", "significantly", "increased", "glucose", "consumption", ",", "almost", "doubled", "the", "rate", "of", "lactate", "release", "from", "viable", "neurons", "and", "strongly", "accelerated", "the", "export", "of", ...
[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "The", "latter", "process", "was", "completely", "prevented", "by", "inhibition", "of", "the", "known", "glutathione", "exporter", "multidrug", "resistance", "protein", "1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "data", "indicate", "that", "cerebellar", "granule", "neurons", "are", "capable", "of", "metabolizing", "formaldehyde", "and", "that", "the", "neuronal", "glycolysis", "and", "glutathione", "export", "are", "severely", "affected", "by", "the", "presence", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Formulation", "and", "characterization", "of", "Brucea", "javanica", "oil", "microemulsion", "for", "improving", "safety", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Abstract", "Objective", ":", "This", "study", "engaged", "in", "investigation", "of", "optimal", "formulation", ",", "characteristics", "analysis", "of", "Brucea", "javanica", "oil", "microemulsion", "(", "BJOM", ")", "in", "order", "to", "address", "safety", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Methods", ":", "Pseudo", "-", "ternary", "phase", "diagram", "techniques", "were", "used", "to", "determine", "the", "appropriate", "ratio", "of", "surfactant", ",", "cosurfactant", "and", "oil", "phases", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Subsequent", "stability", "testing", "of", "BJOM", "was", "performed", "by", "dilution", ",", "centrifugation", "and", "accelerated", "stability", "testing", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "were", "expounded", "through", "additional", "assessment", "utilizing", "the", "classical", "thermostat", "method", "to", "establish", "the", "shelf", "life", "of", "the", "material", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "were", "utilized", "to", "evaluate", "the", "safety", "of", "BJOM", "by", "haemolytic", ",", "irritative", "and", "allergic", "testing", "in", "vitro", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "the", "cytotoxicity", "of", "BJOM", "was", "examined", "using", "the", "tetrazolium", "salt", "3", "-", "(", "4", ",", "5", "-", "dimethylthiazol", "-", "2", "-", "yl", ")", "-", "2", ",", "5", "-", "diphenyltetrazolium", "bromi...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMI...
[ "Results", ":", "The", "most", "suitable", "method", "of", "preparation", "for", "BJOM", "was", "found", "to", "be", "a", "one", "to", "one", "ratio", "(", "K", "(", "m", ")", "1", ":", "1", ")", "of", "Solutol", "HS15", "surfactant", "matched", "wit...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "microemulsion", "droplets", "of", "BJOM", "possessed", "a", "spherical", "shape", ",", "uniform", "size", "and", "average", "diameter", "of", "23", ".", "8", "nm", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "expiration", "date", "of", "BJOM", "was", "found", "to", "be", "568", "d", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "safety", "study", "demonstrated", "no", "hemolysis", "activity", "at", "the", "experimental", "BJOM", "concentrations", ";", "however", ",", "mild", "hemolysis", "was", "observed", "at", "higher", "concentrations", "of", "Brucea", "javanica", "oil", "emuls...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Irritation", "observed", "upon", "BJOM", "treatment", "can", "be", "primarily", "attributed", "to", "Brucea", "javanica", "oil", "(", "BJO", ")", "with", "little", "influence", "of", "BJOM", "excipients", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "BJOM", "caused", "no", "observed", "hypersensitivity", "or", "other", "visible", "allergic", "reactions", "in", "guinea", "pigs", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "anticancer", "activity", "curves", "of", "BJOM", "and", "BJOE", "demonstrate", "that", "both", "BJOM", "and", "BJOE", "inhibit", "Hela", "cells", ",", "with", "BJOM", "demonstrating", "significantly", "more", "dramatic", "anticancer", "activity", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Conclusion", ":", "An", "optimal", "formulation", "of", "BJOM", "superior", "to", "commercially", "available", "products", "and", "safe", "for", "medical", "application", "such", "as", "intravenous", "injection", "has", "been", "outlined", "along", "with", "its",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Solution", "structure", ",", "dynamics", "and", "binding", "studies", "of", "a", "family", "11", "carbohydrate", "-", "binding", "module", "from", "Clostridium", "thermocellum", "(", "CtCBM11", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Non", "-", "catalytic", "cellulosomal", "CBMs", "(", "carbohydrate", "-", "binding", "modules", ")", "are", "responsible", "for", "increasing", "the", "catalytic", "efficiency", "of", "cellulosic", "enzymes", "by", "selectively", "putting", "the", "substrate", "(...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "study", "we", "carried", "out", "an", "atomistic", "rationalization", "of", "the", "molecular", "determinants", "of", "ligand", "specificity", "for", "a", "family", "11", "CBM", "from", "thermophilic", "Clostridium", "thermocellum", "[", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "determined", "the", "NMR", "solution", "structure", "of", "CtCBM11", "at", "25", "degrees", "C", "and", "50", "degrees", "C", "and", "derived", "information", "on", "the", "residues", "of", "the", "protein", "that", "are", "involved", "in", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", ...
[ "We", "obtained", "models", "of", "the", "CtCBM11", "-", "cellohexaose", "and", "CtCBM11", "-", "cellotetraose", "complexes", "by", "docking", "in", "accordance", "with", "the", "NMR", "experimental", "data", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Specific", "ligand", "-", "protein", "CH", "-", "pi", "and", "Van", "der", "Waals", "interactions", "were", "found", "to", "be", "determinant", "for", "the", "stability", "of", "the", "complexes", "and", "for", "defining", "specificity", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "the", "order", "parameters", "derived", "from", "backbone", "dynamics", "analysis", "in", "the", "presence", "and", "absence", "of", "ligand", "and", "at", "25", "degrees", "C", "and", "50", "degrees", "C", ",", "we", "determined", "that", "the", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "data", "in", "combination", "with", "the", "negative", "binding", "entropy", "calculated", "from", "ITC", "(", "isothermal", "titration", "calorimetry", ")", "studies", "supports", "a", "selection", "mechanism", "where", "a", "rigid", "protein", "selects"...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Phthalocyanine", "-", "Peptide", "Conjugates", ":", "Receptor", "-", "Targeting", "Bifunctional", "Agents", "for", "Imaging", "and", "Photodynamic", "Therapy", "." ]
[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "synthesis", "of", "a", "series", "of", "new", "zinc", "phthalocyanine", "-", "peptide", "conjugates", "targeting", "the", "gastrin", "-", "releasing", "peptide", "(", "GRP", ")", "and", "integrin", "receptors", "is", "reported", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Two", "alternative", "synthetic", "methods", "based", "on", "Sonogashira", "cross", "-", "coupling", "of", "an", "iodinated", "zinc", "phthalocyanine", "with", "acetylenic", "bombesin", "or", "arginine", "-", "glycine", "-", "aspartic", "acid", "(", "RGD", ")",...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ "The", "water", "-", "soluble", "conjugates", "were", "screened", "for", "their", "photodynamic", "efficacy", "against", "several", "cancer", "cell", "lines", "expressing", "different", "levels", "of", "GRP", "and", "integrin", "receptors", ",", "and", "their", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Variations", "in", "photocytotoxicity", "between", "the", "conjugates", "correlate", "to", "differences", "in", "hydrophobicity", "as", "well", "as", "receptor", "-", "mediated", "cell", "uptake", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "case", "of", "the", "phthalocyanine", "-", "bombesin", "conjugate", ",", "competition", "experiments", "confirm", "the", "involvement", "of", "the", "GRP", "receptor", "in", "both", "the", "phototherapeutic", "activity", "as", "well", "as", "intrac...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "warrant", "further", "in", "vivo", "studies", "to", "evaluate", "the", "potential", "of", "this", "conjugate", "as", "photosensitizer", "for", "photodynamic", "therapy", "(", "PDT", ")", "of", "cancers", "overexpressing", "the", "GRP", "rec...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Chemical", "synthesis", "and", "characterization", "of", "epicatechin", "glucuronides", "and", "sulfates", ":", "bioanalytical", "standards", "for", "epicatechin", "metabolite", "identification", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "monoglucuronides", "and", "sulfates", "of", "epicatechin", ",", "3", "'", "-", "O", "-", "methylepicatechin", ",", "and", "4", "'", "-", "O", "-", "methylepicatechin", ",", "respectively", ",", "were", "synthesized", "as", "authentic", "bioanalytical",...
[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Reversed", "-", "phase", "HPLC", "methods", "capable", "of", "baseline", "separation", "of", "the", "glucuronides", "and", "sulfates", "have", "been", "developed", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "the", "epicatechin", "glucuronides", "and", "sulfates", "were", "stable", "in", "the", "solid", "state", "when", "stored", "under", "ambient", "conditions", "and", "in", "aqueous", "solution", "when", "stored", "refrigerated", "." ]
[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "should", "prove", "invaluable", "to", "the", "research", "community", "as", "analytical", "standards", "as", "well", "as", "in", "future", "studies", "of", "the", "biological", "and", "pharmacological", "effects", "of", "epicatechin", "in", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "Flavone", "tetraglycosides", "and", "benzyl", "alcohol", "glycosides", "from", "the", "Mongolian", "medicinal", "plant", "Dracocephalum", "ruyschiana", "." ]
[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "From", "an", "extract", "of", "the", "aerial", "parts", "of", "Dracocephalum", "ruyschiana", ",", "five", "new", "flavone", "tetraglycosides", ",", "five", "new", "benzyl", "alcohol", "glycosides", ",", "and", "19", "known", "compounds", "were", "isolated", "...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "tetraglycosides", "contain", "a", "7", "-", "O", "-", "beta", "-", "d", "-", "glucopyranosyl", "-", "(", "1", "-->", "2", ")", "-", "beta", "-", "d", "-", "glucopyranosyl", "-", "(", "1", "-->", "2", ")", "-", "[", "alpha", "-", "l", "-...
[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", ...
[ "The", "benzyl", "alcohol", "glycosides", "had", "acyl", "groups", "on", "their", "glycosyl", "or", "aglycone", "moieties", "." ]
[ "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "compounds", "were", "tested", "for", "antioxidant", "activity", "using", "DPPH", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Although", "the", "new", "compounds", "were", "not", "active", ",", "phenylpropanoylquinic", "acid", "derivatives", "were", "revealed", "as", "radical", "scavengers", "in", "D", ".", "ruyschiana", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Inactivation", "of", "Lrp5", "in", "osteocytes", "reduces", "young", "'", "s", "modulus", "and", "responsiveness", "to", "the", "mechanical", "loading", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Low", "-", "density", "-", "lipoprotein", "receptor", "-", "related", "protein", "5", "(", "Lrp5", ")", "is", "a", "co", "-", "receptor", "in", "Wnt", "signaling", ",", "which", "plays", "a", "critical", "role", "in", "development", "and", "maintenance", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Osteoporosis", "-", "pseudoglioma", "syndrome", ",", "for", "instance", ",", "arises", "from", "loss", "-", "of", "-", "function", "mutations", "in", "Lrp5", ",", "and", "global", "deletion", "of", "Lrp5", "in", "mice", "results", "in", "significantly", "lo...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Since", "osteocytes", "are", "proposed", "to", "act", "as", "a", "mechanosensor", "in", "the", "bone", ",", "we", "addressed", "a", "question", "whether", "a", "conditional", "loss", "-", "of", "-", "function", "mutation", "of", "Lrp5", "selective", "to", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Loading", "was", "applied", "to", "the", "right", "ulna", "for", "3", "min", "(", "360", "cycles", "at", "2Hz", ")", "at", "a", "peak", "force", "of", "2", ".", "65", "N", "for", "3", "consecutive", "days", ",", "and", "the", "contralateral", "ulna"...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Young", "'", "s", "modulus", "was", "determined", "using", "a", "midshaft", "section", "of", "the", "femur", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "showed", "that", "compared", "to", "age", "-", "matched", "littermate", "controls", ",", "mice", "lacking", "Lrp5", "in", "osteocytes", "exhibited", "smaller", "skeletal", "size", "with", "reduced", "bone", "mineral", "density", "and", "conten...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Compared", "to", "controls", ",", "Lrp5", "deletion", "in", "osteocytes", "also", "led", "to", "a", "4", ".", "6", "-", "fold", "reduction", "in", "Young", "'", "s", "modulus", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "response", "to", "ulna", "loading", ",", "mineralizing", "surface", ",", "mineral", "apposition", "rate", ",", "and", "bone", "formation", "rate", "were", "diminished", "in", "mice", "lacking", "Lrp5", "in", "osteocytes", "by", "52", "%", ",", "85", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Collectively", ",", "the", "results", "support", "the", "notion", "that", "the", "loss", "-", "of", "-", "function", "mutation", "of", "Lrp5", "in", "osteocytes", "causes", "suppression", "of", "mechanoresponsiveness", "and", "reduces", "bone", "mass", "and", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "summary", ",", "Lrp5", "-", "mediated", "Wnt", "signaling", "significantly", "contributes", "to", "maintenance", "of", "mechanical", "properties", "and", "bone", "mass", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Male", "mice", "housed", "in", "groups", "engage", "in", "frequent", "fighting", "and", "show", "a", "lower", "response", "to", "additional", "bone", "loading", "than", "females", "or", "individually", "housed", "males", "that", "do", "not", "fight", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Experiments", "to", "investigate", "bone", "'", "s", "physiological", "adaptation", "to", "mechanical", "loading", "frequently", "employ", "models", "that", "apply", "dynamic", "loads", "to", "bones", "in", "vivo", "and", "assess", "the", "changes", "in", "mass...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "axiomatic", "that", "bones", "will", "only", "show", "an", "adaptive", "response", "if", "the", "applied", "artificial", "loading", "environment", "differs", "in", "a", "significant", "way", "from", "that", "to", "which", "the", "bones", "have", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "generally", "assumed", "that", "this", "normal", "loading", "is", "similar", "between", "experimental", "groups", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "study", "reported", "here", "we", "found", "that", "this", "was", "not", "always", "the", "case", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Male", "and", "female", "17", "-", "week", "-", "old", "C57BL", "/", "6", "mice", "were", "housed", "in", "groups", "of", "six", ",", "and", "a", "single", "episode", "(", "40", "cycles", ")", "of", "non", "-", "invasive", "axial", "loading", ",", ...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "This", "engendered", "an", "adaptive", "increase", "in", "bone", "mass", "in", "females", ",", "but", "not", "males", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Observation", "revealed", "the", "main", "difference", "in", "behaviour", "between", "males", "and", "females", "was", "that", "males", "were", "involved", "in", "fights", "1", ".", "3", "times", "per", "hour", ",", "whereas", "the", "females", "never", "fo...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "therefore", "housed", "all", "mice", "individually", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "females", ",", "there", "was", "a", "similar", "significant", "osteogenic", "response", "to", "loading", "in", "cortical", "and", "trabecular", "bone", "of", "both", "grouped", "and", "individual", "mice", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "in", "males", ",", "adaptive", "increases", "in", "the", "loaded", "compared", "with", "non", "-", "loaded", "control", "bones", "was", "only", "apparent", "in", "animals", "housed", "individually", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "interpretation", "of", "these", "findings", "is", "that", "the", "frequent", "vigorous", "fighting", "that", "occurs", "between", "young", "adult", "males", "housed", "in", "groups", "could", "be", "sufficient", "to", "engender", "peak", "strains", "and"...
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "indicates", "the", "importance", "of", "ensuring", "that", "physical", "activity", "is", "consistent", "between", "groups", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Reducing", "the", "background", "level", "of", "the", "naturally", "engendered", "strain", "environment", "allows", "adaptive", "responses", "to", "artificial", "loading", "to", "be", "demonstrated", "at", "lower", "loads", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]