extraordinarylab/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "&", "Thoms", "." ]	[ "O", "O", "O" ]
[ "is", "a", "plant", "widely", "distributed", "in", "Malaysia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "aim", "of", "this", "study", "is", "to", "identify", "compounds", "from", "the", "roots", "of", "G", ".", "macrophyllus", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "ground", "roots", "were", "extracted", "with", "aqueous", "methanol", "and", "partitioned", "sequentially", "with", "n", "-", "hexane", ",", "chloroform", "and", "butanol", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Purification", "from", "this", "extracts", "afforded", "six", "compounds", "with", "two", "new", "compounds", ",", "namely", "goniolandrene", "-", "A", "(", "1", ")", ",", "-", "B", "(", "2", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "The", "absolute", "configuration", "of", "goniolandrene", "B", "(", "2", ")", "was", "established", "by", "circular", "dichrosim", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "compounds", "were", "cytotoxic", "against", "the", "P388", "cells", "with", "IC50", "values", "ranging", "from", "0", ".", "42", "to", "160", "mu", "M", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Goniothalamin", "(", "3", ")", "exhibited", "the", "highest", "inhibition", "of", "0", ".", "42", "mu", "M", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Electromagnetic", "-", "pulse", "-", "induced", "activation", "of", "p38", "MAPK", "pathway", "and", "disruption", "of", "blood", "-", "retinal", "barrier", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "blood", "-", "retinal", "barrier", "(", "BRB", ")", "is", "critical", "for", "maintaining", "retina", "homeostasis", "and", "low", "permeability", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "we", "evaluated", "the", "effects", "of", "electromagnetic", "pulse", "(", "EMP", ")", "exposure", "on", "the", "permeability", "of", "BRB", ",", "alterations", "of", "tight", "junction", "(", "TJ", ")", "proteins", "of", "BRB", "and", "if", "any", ",", "involvement", "of", "mitogen", "-", "activated", "protein", "kinase", "(", "MAPK", ")", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Male", "Sprague", "-", "Dawley", "(", "SD", ")", "rats", "and", "RF", "/", "6A", "cells", "which", "were", "pretreated", "with", "or", "without", "MAPKs", "inhibitors", "were", "sham", "exposed", "or", "exposed", "to", "EMP", "at", "200kV", "/", "m", "for", "200", "pulses", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "alteration", "of", "BRB", "permeability", "was", "examined", "through", "fluorescence", "microscope", "and", "quantitatively", "assessed", "using", "Evans", "blue", "(", "EB", ")", "and", "endogenous", "albumin", "as", "tracers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "expressions", "of", "TJ", "proteins", "and", "some", "signaling", "molecules", "of", "MAPK", "pathway", "were", "measured", "by", "Western", "blots", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "observations", "were", "that", "EMP", "exposure", "resulted", "in", "increased", "BRB", "permeability", "concurrent", "with", "the", "decreased", "expressions", "of", "occludin", "and", "claudin", "-", "5", ",", "which", "were", "correlated", "with", "the", "increased", "expressions", "of", "phospho", "-", "p38", ",", "phospho", "-", "JNK", "and", "phospho", "-", "ERK", "and", "could", "be", "blocked", "when", "pretreated", "with", "p38", "MAPK", "inhibitor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "the", "results", "suggested", "that", "the", "alterations", "of", "occludin", "and", "claudin", "-", "5", "may", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "disruption", "of", "TJs", ",", "which", "may", "lead", "to", "the", "transient", "breakdown", "of", "BRB", "after", "EMP", "exposure", "with", "the", "involvement", "of", "p38", "MAPK", "pathway", "through", "phosphorylation", "of", "signaling", "molecules", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Suppression", "of", "nuclear", "factor", "erythroid", "2", "-", "related", "factor", "2", "via", "extracellular", "signal", "-", "regulated", "kinase", "contributes", "to", "bleomycin", "-", "induced", "oxidative", "stress", "and", "fibrogenesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pulmonary", "fibrosis", "is", "a", "serious", "and", "irreversible", "lung", "injury", "with", "obscure", "etiologic", "mechanisms", "and", "no", "effective", "treatment", "to", "date", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "explored", "a", "crucial", "link", "between", "oxidative", "stress", "and", "pulmonary", "fibrogenesis", ",", "focusing", "on", "nuclear", "factor", "erythroid", "2", "-", "related", "factor", "2", "(", "Nrf2", ")", ",", "a", "core", "transcription", "factor", "in", "antioxidative", "regulation", "systems", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Treatment", "of", "C57", "BL", "/", "6", "mice", "with", "bleomycin", "increased", "fibroblast", "viability", "and", "collagen", "production", "and", "significantly", "downregulated", "Nrf2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "prominent", "oxidative", "stress", "was", "indicated", "by", "changes", "in", "superoxide", "dismutase", ",", "catalase", "activity", ",", "and", "glutathione", "and", "thiobarbituric", "acid", "-", "reactive", "substance", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "a", "cell", "-", "based", "model", ",", "bleomycin", "suppressed", "Nrf2", "activation", "via", "extracellular", "signal", "-", "related", "kinase", "phosphorylation", ",", "enhancing", "intracellular", "reactive", "oxygen", "species", "in", "lung", "fibroblasts", "and", "stimulating", "abnormal", "cell", "proliferation", "and", "collagen", "secretion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "confirm", "this", "novel", "mechanism", "of", "bleomycin", "-", "induced", "fibrogenesis", ",", "we", "attempted", "to", "upregulate", "Nrf2", "and", "related", "antioxidant", "proteins", "in", "bleomycin", "-", "treated", "fibroblasts", "using", "a", "putative", "Nrf2", "activator", ",", "caffeic", "acid", "phenethyl", "ester", ",", "and", "the", "results", "showed", "that", "bleomycin", "-", "induced", "fibroblast", "proliferation", "and", "collagen", "content", "were", "attenuated", "through", "improved", "redox", "balance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Collectively", ",", "these", "results", "disclose", "a", "potential", "regulatory", "mechanism", "in", "pulmonary", "fibrosis", "that", "will", "aid", "the", "development", "of", "new", "therapies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Proteomic", "Analysis", "of", "Arsenic", "-", "Exposed", "Zebrafish", "(", "Danio", "rerio", ")", "Identifies", "Altered", "Expression", "in", "Proteins", "Involved", "in", "Fibrosis", "and", "Lipid", "Uptake", "in", "a", "Gender", "-", "Specific", "Manner", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "zebrafish", "(", "Danio", "rerio", ")", "was", "used", "to", "investigate", "protein", "expression", "in", "the", "liver", "following", "arsenic", "exposure", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Several", "disorders", "have", "been", "linked", "to", "arsenic", "exposure", ",", "including", "cancer", ",", "diabetes", ",", "and", "cardiovascular", "disease", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "mechanisms", "of", "arsenic", "toxicity", "are", "poorly", "understood", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Prior", "studies", "have", "described", "altered", "gene", "expression", ",", "inflammation", ",", "and", "mitogenic", "signaling", "in", "acute", "or", "chronic", "exposure", "models", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "proteomic", "approach", "was", "employed", "to", "investigate", "arsenic", "-", "induced", "alteration", "in", "the", "zebrafish", "liver", "proteome", "following", "a", "7", "-", "day", "exposure", "to", "50", "ppb", "sodium", "arsenite", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "Over", "740", "unique", "proteins", "were", "identified", ",", "with", "fewer", "than", "2", "%", "showing", "differential", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Molecular", "pathway", "analysis", "software", "identified", "lipid", "metabolism", "and", "transport", "as", "potential", "molecular", "targets", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Immunoblots", "were", "used", "to", "confirm", "protein", "expression", "changes", ",", "whereas", "qPCR", "was", "employed", "to", "investigate", "gene", "expression", "changes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Overall", ",", "25", "proteins", "were", "differentially", "expressed", "in", "a", "gender", "-", "specific", "manner", ",", "11", "in", "males", "and", "14", "in", "females", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "these", "25", ",", "a", "single", "protein", ",", "hydroxysteroid", "dehydrogenase", "like", "2", ",", "showed", "decreased", "expression", "in", "both", "males", "and", "females", "following", "arsenic", "exposure", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "indicate", "that", "protein", "expression", "is", "altered", "following", "arsenic", "exposure", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "The", "changes", "presented", "here", "seem", "to", "be", "most", "prevalent", "in", "lipid", "transport", "and", "metabolic", "pathways", ",", "suggesting", "a", "potential", "increase", "in", "fibrosis", "in", "males", "and", "decreased", "lipid", "accumulation", "and", "uptake", "in", "females", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Additional", "Histopathologic", "Examination", "of", "the", "Lungs", "from", "a", "3", "-", "Month", "Inhalation", "Toxicity", "Study", "with", "Multiwall", "Carbon", "Nanotubes", "in", "Rats", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "hazard", "assessment", "of", "multiwalled", "carbon", "nanotubes", "(", "MWCNTs", ")", ",", "a", "90", "-", "day", "inhalation", "toxicity", "study", "has", "been", "performed", "with", "Nanocyl", "NC", "7000", "in", "accordance", "with", "OECD", "413", "test", "guideline", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "MWCNTs", "produced", "no", "systemic", "toxicity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "increased", "lung", "weights", ",", "multifocal", "granulomatous", "inflammation", ",", "diffuse", "histiocytic", "and", "neutrophilic", "infiltrates", ",", "and", "intra", "-", "alveolar", "lipoproteinosis", "were", "observed", "in", "lung", "and", "lung", "-", "associated", "lymph", "nodes", "at", "0", ".", "5", "and", "2", ".", "5mg", "/", "m", "(", "3", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Additional", "investigations", "of", "the", "lungs", "were", "performed", ",", "including", "special", "stains", "for", "examination", "of", "connective", "tissue", ",", "and", "electron", "microscopy", "was", "performed", "to", "determine", "the", "location", "of", "the", "MWCNTs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "alveolar", "walls", "revealed", "no", "increase", "of", "collagen", "fibers", ",", "whereas", "within", "the", "microgranulomas", "a", "slight", "increase", "of", "collagen", "fibers", "was", "observed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "pleura", "did", "not", "reveal", "any", "increase", "in", "collagen", "fibers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Only", "a", "slight", "increase", "in", "reticulin", "fibers", "in", "the", "alveolar", "walls", "in", "animals", "of", "the", "0", ".", "5", "and", "2", ".", "5mg", "/", "m", "(", "3", ")", "concentration", "group", "was", "noted", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "0", ".", "1mg", "/", "m", "(", "3", ")", "group", ",", "the", "only", "animal", "revealing", "minimal", "granulomas", "exhibited", "a", "minimal", "increase", "in", "collagen", "within", "the", "granuloma", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "No", "increase", "in", "reticulin", "was", "observed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Electron", "microscopy", "demonstrated", "entangled", "MWCNTs", "within", "alveolar", "macrophages", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Occasionally", "electron", "dense", "particles", "/", "detritus", "were", "observed", "within", "membrane", "-", "bound", "vesicles", "(", "interpreted", "as", "phagosomes", ")", ",", "which", "could", "represent", "degraded", "MWCNTs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "If", "so", ",", "MWCNTs", "were", "degradable", "by", "alveolar", "macrophages", "and", "not", "persistent", "within", "the", "lung", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Inhalation", "of", "MWCNTs", "caused", "granulomatous", "inflammation", "within", "the", "lung", "parenchyma", "but", "not", "the", "pleura", "in", "any", "of", "the", "concentration", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "there", "are", "some", "similarities", "to", "effects", "caused", "by", "inhaled", "asbestos", ",", "but", "the", "hallmark", "effects", ",", "namely", "pleural", "inflammation", "and", "/", "or", "fibrosis", "leading", "to", "mesotheliomas", ",", "are", "absent", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Assessment", "of", "the", "role", "of", "flavonoids", "for", "inducing", "osteoblast", "differentiation", "in", "isolated", "mouse", "bone", "marrow", "derived", "mesenchymal", "stem", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Quercetin", "and", "rutin", "are", "common", "flavonoids", "in", "fruit", "and", "vegetables", ",", "and", "have", "been", "reported", "to", "affect", "bone", "development", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "effect", "of", "flavonoids", "on", "osteoblast", "differentiation", "remains", "a", "matter", "of", "controversy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "study", ",", "mouse", "bone", "marrow", "mesenchymal", "stem", "cells", "(", "BMMSCs", ")", "were", "isolated", "and", "characterized", "for", "their", "use", "in", "osteoblast", "differentiation", "using", "two", "flavonoids", ",", "quercetin", "and", "rutin", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "BMMSCs", "were", "cultured", "in", "various", "concentrations", "of", "quercetin", "and", "rutin", "during", "the", "osteoblast", "differentiation", "period", "of", "10", "days", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "quercetin", "and", "rutin", "were", "found", "to", "up", "regulate", "the", "osteoblast", "differentiation", "in", "dose", "dependent", "manner", ",", "albeit", "to", "lesser", "extent", "in", "case", "of", "former", "than", "that", "of", "latter", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Quercetin", "and", "rutin", "also", "increased", "alkaline", "phosphatase", "activity", "by", "about", "150", "and", "240", "%", "and", "demonstrated", "mineralization", "up", "to", "110", "and", "200", "%", "respectively", "as", "compared", "to", "control", "(", "which", "was", "considered", "as", "100", "%", ")", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Further", ",", "both", "the", "flavonoids", "were", "also", "found", "to", "increase", "the", "expression", "of", "some", "of", "the", "prominent", "markers", "for", "differentiation", "of", "osteoblast", "like", "osteopontin", ",", "osterix", ",", "RunX2", ",", "osteoprotegerin", "and", "osteocalcin", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "current", "data", "suggests", "that", "certain", "classes", "of", "flavonoids", "like", "rutin", "and", "quercetin", "can", "be", "used", "in", "the", "cure", "and", "management", "of", "osteodegenerative", "disorders", "due", "to", "their", "osteoblast", "specific", "differentiation", "activities", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Quantification", "of", "the", "Young", "'", "s", "modulus", "of", "the", "primary", "plant", "cell", "wall", "using", "Bending", "-", "Lab", "-", "On", "-", "Chip", "(", "BLOC", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Biomechanical", "and", "mathematical", "modeling", "of", "plant", "developmental", "processes", "requires", "quantitative", "information", "about", "the", "structural", "and", "mechanical", "properties", "of", "living", "cells", ",", "tissues", "and", "cellular", "components", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "crucial", "mechanical", "property", "of", "plant", "cells", "is", "the", "mechanical", "stiffness", "or", "Young", "'", "s", "modulus", "of", "its", "cell", "wall", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Measuring", "this", "property", "in", "situ", "at", "single", "cell", "wall", "level", "is", "technically", "challenging", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "a", "bending", "test", "is", "implemented", "in", "a", "chip", ",", "called", "Bending", "-", "Lab", "-", "On", "-", "a", "-", "Chip", "(", "BLOC", ")", ",", "to", "quantify", "this", "biomechanical", "property", "for", "a", "widely", "investigated", "cellular", "model", "system", ",", "the", "pollen", "tube", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pollen", "along", "with", "culture", "medium", "is", "introduced", "into", "a", "microfluidic", "chip", "and", "the", "growing", "pollen", "tube", "is", "exposed", "to", "a", "bending", "force", "created", "through", "fluid", "loading", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "flexural", "rigidity", "of", "the", "pollen", "tube", "and", "the", "Young", "'", "s", "modulus", "of", "the", "cell", "wall", "are", "estimated", "through", "finite", "element", "modeling", "of", "the", "observed", "fluid", "-", "structure", "interaction", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "average", "value", "of", "350", "MPa", "was", "experimentally", "estimated", "for", "the", "Young", "'", "s", "modulus", "in", "longitudinal", "direction", "of", "the", "cell", "wall", "of", "Camellia", "pollen", "tubes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "value", "is", "in", "agreement", "with", "the", "result", "of", "an", "independent", "method", "based", "on", "cellular", "shrinkage", "after", "plasmolysis", "and", "with", "the", "mechanical", "properties", "of", "in", "vitro", "reconstituted", "cellulose", "-", "callose", "material", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therapeutic", "Cleavage", "of", "Anti", "-", "Aquaporin", "-", "4", "Autoantibody", "in", "Neuromyelitis", "Optica", "by", "an", "Igg", "-", "Selective", "Proteinase", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Neuromyelitis", "optica", "(", "NMO", ")", "is", "an", "inflammatory", "demyelinating", "disease", "of", "the", "central", "nervous", "system", "caused", "by", "binding", "of", "pathogenic", "IgG", "autoantibodies", "(", "NMO", "-", "IgG", ")", "to", "astrocyte", "water", "channel", "aquaporin", "-", "4", "(", "AQP4", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Astrocyte", "damage", "and", "downstream", "inflammation", "require", "NMO", "-", "IgG", "effector", "function", "to", "initiate", "complement", "-", "dependent", "cytotoxicity", "(", "CDC", ")", "and", "antibody", "-", "dependent", "cell", "-", "mediated", "cytotoxicity", "(", "ADCC", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "evaluated", "the", "potential", "therapeutic", "utility", "of", "the", "bacterial", "enzyme", "IdeS", "(", "IgG", "-", "degrading", "enzyme", "of", "Streptococcus", "pyogenes", ")", ",", "which", "selectively", "cleaves", "IgG", "antibodies", "to", "yield", "Fc", "and", "F", "(", "ab", "'", ")", "2", "fragments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "AQP4", "-", "expressing", "cell", "cultures", ",", "IdeS", "treatment", "of", "monoclonal", "NMO", "-", "IgGs", "and", "NMO", "patient", "sera", "abolished", "CDC", "and", "ADCC", ",", "even", "when", "IdeS", "was", "added", "after", "NMO", "-", "IgG", "was", "bound", "to", "AQP4", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Binding", "of", "NMO", "-", "IgG", "to", "AQP4", "was", "similar", "to", "that", "of", "the", "NMO", "-", "F", "(", "ab", "'", ")", "2", "generated", "by", "IdeS", "cleavage", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "NMO", "-", "F", "(", "ab", "'", ")", "2", "competitively", "displaced", "pathogenic", "NMO", "-", "IgG", ",", "preventing", "cytotoxicity", ",", "and", "the", "Fc", "fragments", "generated", "by", "IdeS", "cleavage", "reduced", "CDC", "and", "ADCC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "IdeS", "efficiently", "cleaved", "NMO", "-", "IgG", "in", "mice", "in", "vivo", ",", "and", "greatly", "reduced", "NMO", "lesions", "in", "mice", "administered", "NMO", "-", "IgG", "and", "human", "complement", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "IgG", "-", "selective", "cleavage", "by", "IdeS", "thus", "neutralizes", "NMO", "-", "IgG", "pathogenicity", ",", "and", "yields", "therapeutic", "F", "(", "ab", "'", ")", "2", "and", "Fc", "fragments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "IdeS", "treatment", ",", "by", "therapeutic", "apheresis", "or", "direct", "administration", ",", "may", "be", "beneficial", "in", "NMO", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Structure", "-", "based", "Identification", "of", "OATP1B1", "/", "3", "Inhibitors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Several", "recent", "studies", "show", "that", "inhibition", "of", "the", "hepatic", "transport", "proteins", "organic", "-", "anion", "transporting", "polypeptide", "1B1", "(", "OATP1B1", ")", "and", "1B3", "(", "OATP1B3", ")", "can", "result", "in", "clinically", "relevant", "drug", "-", "drug", "interactions", "(", "DDI", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "avoid", "late", "-", "stage", "development", "drug", "failures", "due", "to", "OATP1B", "-", "mediated", "DDI", ",", "predictive", "in", "vitro", "and", "in", "silico", "methods", "should", "be", "implemented", "at", "an", "early", "stage", "of", "the", "drug", "candidate", "evaluation", "process", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "study", ",", "we", "first", "developed", "a", "high", "-", "throughput", "in", "vitro", "transporter", "inhibition", "assay", "for", "the", "OATP1B", "subfamily", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "total", "of", "2000", "compounds", "were", "tested", "as", "potential", "modulators", "of", "the", "uptake", "of", "the", "OATP1B", "substrate", "sodium", "fluorescein", ",", "in", "OATP1B1", "or", "1B3", "-", "transfected", "CHO", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "At", "an", "equimolar", "substrate", "-", "inhibitor", "concentration", "of", "10", "mu", "M", ",", "212", "and", "139", "molecules", "were", "identified", "as", "OATP1B1", "and", "OATP1B3", "inhibitors", ",", "respectively", "(", "min", "50", "%", "inhibition", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "69", "compounds", ",", "previously", "not", "identified", "as", "OATP1B", "inhibitors", ",", "concentration", "dependent", "inhibition", "was", "also", "determined", ",", "yielding", "Ki", "values", "ranging", "from", "0", ".", "06", "to", "6", ".", "5", "mu", "M", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Based", "on", "these", "in", "vitro", "data", ",", "we", "subsequently", "developed", "a", "proteochemometrics", "-", "based", "in", "silico", "model", ",", "which", "predicted", "OATP1B", "inhibitors", "in", "the", "test", "group", "(", "20", "%", "of", "the", "dataset", ")", "with", "high", "specificity", "(", "86", "%", ")", "and", "sensitivity", "(", "78", "%", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "several", "physicochemical", "compound", "properties", "and", "substructures", "related", "to", "OATP1B1", "/", "1B3", "inhibition", "or", "inactivity", "were", "identified", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Finally", ",", "model", "performance", "was", "prospectively", "verified", "with", "a", "set", "of", "54", "compounds", "not", "included", "in", "the", "original", "dataset", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "validation", "indicated", "that", "80", "%", "and", "74", "%", "of", "the", "compounds", "were", "correctly", "classified", "for", "OATP1B1", "and", "OATP1B3", "inhibition", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pomalidomide", ":", "first", "global", "approval", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pomalidomide", "(", "Pomalyst", "(", "(R)", ")", ")", "is", "a", "small", "molecule", "analogue", "of", "thalidomide", "under", "development", "with", "Celgene", "Corporation", "for", "the", "oral", "treatment", "of", "haematological", "and", "connective", "tissue", "diseases", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pomalidomide", "has", "been", "approved", "in", "the", "USA", "and", "is", "awaiting", "approval", "in", "the", "EU", "for", "use", "with", "low", "-", "dose", "dexamethasone", "for", "the", "treatment", "of", "relapsed", "and", "refractory", "multiple", "myeloma", "that", "has", "progressed", "following", "at", "least", "two", "prior", "therapies", ",", "including", "lenalidomide", "and", "bortezomib", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "The", "efficacy", "and", "safety", "of", "pomalidomide", "as", "monotherapy", "in", "patients", "with", "relapsed", "and", "refractory", "multiple", "myeloma", "has", "also", "been", "evaluated", "in", "a", "phase", "III", "trial", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "agent", "is", "in", "phase", "III", "clinical", "development", "for", "the", "treatment", "of", "myelofibrosis", "and", "in", "phase", "II", "development", "for", "systemic", "sclerosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pomalidomide", "is", "also", "being", "investigated", "in", "patients", "with", "amyloidosis", ",", "prostate", "cancer", ",", "small", "cell", "lung", "cancer", ",", "pancreatic", "cancer", ",", "graft", "-", "versus", "-", "host", "disease", ",", "and", "Waldenstrom", "'", "s", "macroglobulinaemia", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "article", "summarizes", "the", "milestones", "in", "the", "development", "of", "pomalidomide", "leading", "to", "this", "first", "global", "approval", "for", "relapsed", "and", "refractory", "multiple", "myeloma", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "S", "-", "nitrosation", "of", "glutathione", "transferase", "P1", "-", "1", "is", "controlled", "by", "the", "conformation", "of", "a", "dynamic", "active", "-", "site", "helix", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "S", "-", "nitrosation", "is", "a", "post", "-", "translational", "modification", "of", "protein", "cysteine", "residues", "which", "occurs", "in", "response", "to", "cellular", "oxidative", "stress", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "&", "Thoms", "." ]

[ "O", "O", "O" ]

[ "is", "a", "plant", "widely", "distributed", "in", "Malaysia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "aim", "of", "this", "study", "is", "to", "identify", "compounds", "from", "the", "roots", "of", "G", ".", "macrophyllus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "ground", "roots", "were", "extracted", "with", "aqueous", "methanol", "and", "partitioned", "sequentially", "with", "n", "-", "hexane", ",", "chloroform", "and", "butanol", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Purification", "from", "this", "extracts", "afforded", "six", "compounds", "with", "two", "new", "compounds", ",", "namely", "goniolandrene", "-", "A", "(", "1", ")", ",", "-", "B", "(", "2", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "The", "absolute", "configuration", "of", "goniolandrene", "B", "(", "2", ")", "was", "established", "by", "circular", "dichrosim", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "compounds", "were", "cytotoxic", "against", "the", "P388", "cells", "with", "IC50", "values", "ranging", "from", "0", ".", "42", "to", "160", "mu", "M", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Goniothalamin", "(", "3", ")", "exhibited", "the", "highest", "inhibition", "of", "0", ".", "42", "mu", "M", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Electromagnetic", "-", "pulse", "-", "induced", "activation", "of", "p38", "MAPK", "pathway", "and", "disruption", "of", "blood", "-", "retinal", "barrier", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "blood", "-", "retinal", "barrier", "(", "BRB", ")", "is", "critical", "for", "maintaining", "retina", "homeostasis", "and", "low", "permeability", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "evaluated", "the", "effects", "of", "electromagnetic", "pulse", "(", "EMP", ")", "exposure", "on", "the", "permeability", "of", "BRB", ",", "alterations", "of", "tight", "junction", "(", "TJ", ")", "proteins", "of", "BRB", "and", "if", "any", ",", "involvement", "of", "mitogen", "-", "activated", "protein", "kinase", "(", "MAPK", ")", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Male", "Sprague", "-", "Dawley", "(", "SD", ")", "rats", "and", "RF", "/", "6A", "cells", "which", "were", "pretreated", "with", "or", "without", "MAPKs", "inhibitors", "were", "sham", "exposed", "or", "exposed", "to", "EMP", "at", "200kV", "/", "m", "for", "200", "pulses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "alteration", "of", "BRB", "permeability", "was", "examined", "through", "fluorescence", "microscope", "and", "quantitatively", "assessed", "using", "Evans", "blue", "(", "EB", ")", "and", "endogenous", "albumin", "as", "tracers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "expressions", "of", "TJ", "proteins", "and", "some", "signaling", "molecules", "of", "MAPK", "pathway", "were", "measured", "by", "Western", "blots", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "observations", "were", "that", "EMP", "exposure", "resulted", "in", "increased", "BRB", "permeability", "concurrent", "with", "the", "decreased", "expressions", "of", "occludin", "and", "claudin", "-", "5", ",", "which", "were", "correlated", "with", "the", "increased", "expressions", "of", "phospho", "-", "p38", ",", "phospho", "-", "JNK", "and", "phospho", "-", "ERK", "and", "could", "be", "blocked", "when", "pretreated", "with", "p38", "MAPK", "inhibitor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "the", "results", "suggested", "that", "the", "alterations", "of", "occludin", "and", "claudin", "-", "5", "may", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "disruption", "of", "TJs", ",", "which", "may", "lead", "to", "the", "transient", "breakdown", "of", "BRB", "after", "EMP", "exposure", "with", "the", "involvement", "of", "p38", "MAPK", "pathway", "through", "phosphorylation", "of", "signaling", "molecules", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Suppression", "of", "nuclear", "factor", "erythroid", "2", "-", "related", "factor", "2", "via", "extracellular", "signal", "-", "regulated", "kinase", "contributes", "to", "bleomycin", "-", "induced", "oxidative", "stress", "and", "fibrogenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pulmonary", "fibrosis", "is", "a", "serious", "and", "irreversible", "lung", "injury", "with", "obscure", "etiologic", "mechanisms", "and", "no", "effective", "treatment", "to", "date", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "explored", "a", "crucial", "link", "between", "oxidative", "stress", "and", "pulmonary", "fibrogenesis", ",", "focusing", "on", "nuclear", "factor", "erythroid", "2", "-", "related", "factor", "2", "(", "Nrf2", ")", ",", "a", "core", "transcription", "factor", "in", "antioxidative", "regulation", "systems", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Treatment", "of", "C57", "BL", "/", "6", "mice", "with", "bleomycin", "increased", "fibroblast", "viability", "and", "collagen", "production", "and", "significantly", "downregulated", "Nrf2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "prominent", "oxidative", "stress", "was", "indicated", "by", "changes", "in", "superoxide", "dismutase", ",", "catalase", "activity", ",", "and", "glutathione", "and", "thiobarbituric", "acid", "-", "reactive", "substance", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "a", "cell", "-", "based", "model", ",", "bleomycin", "suppressed", "Nrf2", "activation", "via", "extracellular", "signal", "-", "related", "kinase", "phosphorylation", ",", "enhancing", "intracellular", "reactive", "oxygen", "species", "in", "lung", "fibroblasts", "and", "stimulating", "abnormal", "cell", "proliferation", "and", "collagen", "secretion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "confirm", "this", "novel", "mechanism", "of", "bleomycin", "-", "induced", "fibrogenesis", ",", "we", "attempted", "to", "upregulate", "Nrf2", "and", "related", "antioxidant", "proteins", "in", "bleomycin", "-", "treated", "fibroblasts", "using", "a", "putative", "Nrf2", "activator", ",", "caffeic", "acid", "phenethyl", "ester", ",", "and", "the", "results", "showed", "that", "bleomycin", "-", "induced", "fibroblast", "proliferation", "and", "collagen", "content", "were", "attenuated", "through", "improved", "redox", "balance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Collectively", ",", "these", "results", "disclose", "a", "potential", "regulatory", "mechanism", "in", "pulmonary", "fibrosis", "that", "will", "aid", "the", "development", "of", "new", "therapies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Proteomic", "Analysis", "of", "Arsenic", "-", "Exposed", "Zebrafish", "(", "Danio", "rerio", ")", "Identifies", "Altered", "Expression", "in", "Proteins", "Involved", "in", "Fibrosis", "and", "Lipid", "Uptake", "in", "a", "Gender", "-", "Specific", "Manner", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "zebrafish", "(", "Danio", "rerio", ")", "was", "used", "to", "investigate", "protein", "expression", "in", "the", "liver", "following", "arsenic", "exposure", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Several", "disorders", "have", "been", "linked", "to", "arsenic", "exposure", ",", "including", "cancer", ",", "diabetes", ",", "and", "cardiovascular", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "mechanisms", "of", "arsenic", "toxicity", "are", "poorly", "understood", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Prior", "studies", "have", "described", "altered", "gene", "expression", ",", "inflammation", ",", "and", "mitogenic", "signaling", "in", "acute", "or", "chronic", "exposure", "models", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "proteomic", "approach", "was", "employed", "to", "investigate", "arsenic", "-", "induced", "alteration", "in", "the", "zebrafish", "liver", "proteome", "following", "a", "7", "-", "day", "exposure", "to", "50", "ppb", "sodium", "arsenite", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "Over", "740", "unique", "proteins", "were", "identified", ",", "with", "fewer", "than", "2", "%", "showing", "differential", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Molecular", "pathway", "analysis", "software", "identified", "lipid", "metabolism", "and", "transport", "as", "potential", "molecular", "targets", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Immunoblots", "were", "used", "to", "confirm", "protein", "expression", "changes", ",", "whereas", "qPCR", "was", "employed", "to", "investigate", "gene", "expression", "changes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Overall", ",", "25", "proteins", "were", "differentially", "expressed", "in", "a", "gender", "-", "specific", "manner", ",", "11", "in", "males", "and", "14", "in", "females", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Of", "these", "25", ",", "a", "single", "protein", ",", "hydroxysteroid", "dehydrogenase", "like", "2", ",", "showed", "decreased", "expression", "in", "both", "males", "and", "females", "following", "arsenic", "exposure", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "indicate", "that", "protein", "expression", "is", "altered", "following", "arsenic", "exposure", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "The", "changes", "presented", "here", "seem", "to", "be", "most", "prevalent", "in", "lipid", "transport", "and", "metabolic", "pathways", ",", "suggesting", "a", "potential", "increase", "in", "fibrosis", "in", "males", "and", "decreased", "lipid", "accumulation", "and", "uptake", "in", "females", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Additional", "Histopathologic", "Examination", "of", "the", "Lungs", "from", "a", "3", "-", "Month", "Inhalation", "Toxicity", "Study", "with", "Multiwall", "Carbon", "Nanotubes", "in", "Rats", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "hazard", "assessment", "of", "multiwalled", "carbon", "nanotubes", "(", "MWCNTs", ")", ",", "a", "90", "-", "day", "inhalation", "toxicity", "study", "has", "been", "performed", "with", "Nanocyl", "NC", "7000", "in", "accordance", "with", "OECD", "413", "test", "guideline", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "MWCNTs", "produced", "no", "systemic", "toxicity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "increased", "lung", "weights", ",", "multifocal", "granulomatous", "inflammation", ",", "diffuse", "histiocytic", "and", "neutrophilic", "infiltrates", ",", "and", "intra", "-", "alveolar", "lipoproteinosis", "were", "observed", "in", "lung", "and", "lung", "-", "associated", "lymph", "nodes", "at", "0", ".", "5", "and", "2", ".", "5mg", "/", "m", "(", "3", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Additional", "investigations", "of", "the", "lungs", "were", "performed", ",", "including", "special", "stains", "for", "examination", "of", "connective", "tissue", ",", "and", "electron", "microscopy", "was", "performed", "to", "determine", "the", "location", "of", "the", "MWCNTs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "alveolar", "walls", "revealed", "no", "increase", "of", "collagen", "fibers", ",", "whereas", "within", "the", "microgranulomas", "a", "slight", "increase", "of", "collagen", "fibers", "was", "observed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "pleura", "did", "not", "reveal", "any", "increase", "in", "collagen", "fibers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Only", "a", "slight", "increase", "in", "reticulin", "fibers", "in", "the", "alveolar", "walls", "in", "animals", "of", "the", "0", ".", "5", "and", "2", ".", "5mg", "/", "m", "(", "3", ")", "concentration", "group", "was", "noted", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "0", ".", "1mg", "/", "m", "(", "3", ")", "group", ",", "the", "only", "animal", "revealing", "minimal", "granulomas", "exhibited", "a", "minimal", "increase", "in", "collagen", "within", "the", "granuloma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "No", "increase", "in", "reticulin", "was", "observed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Electron", "microscopy", "demonstrated", "entangled", "MWCNTs", "within", "alveolar", "macrophages", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Occasionally", "electron", "dense", "particles", "/", "detritus", "were", "observed", "within", "membrane", "-", "bound", "vesicles", "(", "interpreted", "as", "phagosomes", ")", ",", "which", "could", "represent", "degraded", "MWCNTs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "If", "so", ",", "MWCNTs", "were", "degradable", "by", "alveolar", "macrophages", "and", "not", "persistent", "within", "the", "lung", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Inhalation", "of", "MWCNTs", "caused", "granulomatous", "inflammation", "within", "the", "lung", "parenchyma", "but", "not", "the", "pleura", "in", "any", "of", "the", "concentration", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "there", "are", "some", "similarities", "to", "effects", "caused", "by", "inhaled", "asbestos", ",", "but", "the", "hallmark", "effects", ",", "namely", "pleural", "inflammation", "and", "/", "or", "fibrosis", "leading", "to", "mesotheliomas", ",", "are", "absent", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Assessment", "of", "the", "role", "of", "flavonoids", "for", "inducing", "osteoblast", "differentiation", "in", "isolated", "mouse", "bone", "marrow", "derived", "mesenchymal", "stem", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Quercetin", "and", "rutin", "are", "common", "flavonoids", "in", "fruit", "and", "vegetables", ",", "and", "have", "been", "reported", "to", "affect", "bone", "development", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "effect", "of", "flavonoids", "on", "osteoblast", "differentiation", "remains", "a", "matter", "of", "controversy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "present", "study", ",", "mouse", "bone", "marrow", "mesenchymal", "stem", "cells", "(", "BMMSCs", ")", "were", "isolated", "and", "characterized", "for", "their", "use", "in", "osteoblast", "differentiation", "using", "two", "flavonoids", ",", "quercetin", "and", "rutin", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "BMMSCs", "were", "cultured", "in", "various", "concentrations", "of", "quercetin", "and", "rutin", "during", "the", "osteoblast", "differentiation", "period", "of", "10", "days", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "quercetin", "and", "rutin", "were", "found", "to", "up", "regulate", "the", "osteoblast", "differentiation", "in", "dose", "dependent", "manner", ",", "albeit", "to", "lesser", "extent", "in", "case", "of", "former", "than", "that", "of", "latter", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Quercetin", "and", "rutin", "also", "increased", "alkaline", "phosphatase", "activity", "by", "about", "150", "and", "240", "%", "and", "demonstrated", "mineralization", "up", "to", "110", "and", "200", "%", "respectively", "as", "compared", "to", "control", "(", "which", "was", "considered", "as", "100", "%", ")", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Further", ",", "both", "the", "flavonoids", "were", "also", "found", "to", "increase", "the", "expression", "of", "some", "of", "the", "prominent", "markers", "for", "differentiation", "of", "osteoblast", "like", "osteopontin", ",", "osterix", ",", "RunX2", ",", "osteoprotegerin", "and", "osteocalcin", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "current", "data", "suggests", "that", "certain", "classes", "of", "flavonoids", "like", "rutin", "and", "quercetin", "can", "be", "used", "in", "the", "cure", "and", "management", "of", "osteodegenerative", "disorders", "due", "to", "their", "osteoblast", "specific", "differentiation", "activities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Quantification", "of", "the", "Young", "'", "s", "modulus", "of", "the", "primary", "plant", "cell", "wall", "using", "Bending", "-", "Lab", "-", "On", "-", "Chip", "(", "BLOC", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Biomechanical", "and", "mathematical", "modeling", "of", "plant", "developmental", "processes", "requires", "quantitative", "information", "about", "the", "structural", "and", "mechanical", "properties", "of", "living", "cells", ",", "tissues", "and", "cellular", "components", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "crucial", "mechanical", "property", "of", "plant", "cells", "is", "the", "mechanical", "stiffness", "or", "Young", "'", "s", "modulus", "of", "its", "cell", "wall", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Measuring", "this", "property", "in", "situ", "at", "single", "cell", "wall", "level", "is", "technically", "challenging", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "a", "bending", "test", "is", "implemented", "in", "a", "chip", ",", "called", "Bending", "-", "Lab", "-", "On", "-", "a", "-", "Chip", "(", "BLOC", ")", ",", "to", "quantify", "this", "biomechanical", "property", "for", "a", "widely", "investigated", "cellular", "model", "system", ",", "the", "pollen", "tube", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pollen", "along", "with", "culture", "medium", "is", "introduced", "into", "a", "microfluidic", "chip", "and", "the", "growing", "pollen", "tube", "is", "exposed", "to", "a", "bending", "force", "created", "through", "fluid", "loading", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "flexural", "rigidity", "of", "the", "pollen", "tube", "and", "the", "Young", "'", "s", "modulus", "of", "the", "cell", "wall", "are", "estimated", "through", "finite", "element", "modeling", "of", "the", "observed", "fluid", "-", "structure", "interaction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "average", "value", "of", "350", "MPa", "was", "experimentally", "estimated", "for", "the", "Young", "'", "s", "modulus", "in", "longitudinal", "direction", "of", "the", "cell", "wall", "of", "Camellia", "pollen", "tubes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "value", "is", "in", "agreement", "with", "the", "result", "of", "an", "independent", "method", "based", "on", "cellular", "shrinkage", "after", "plasmolysis", "and", "with", "the", "mechanical", "properties", "of", "in", "vitro", "reconstituted", "cellulose", "-", "callose", "material", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therapeutic", "Cleavage", "of", "Anti", "-", "Aquaporin", "-", "4", "Autoantibody", "in", "Neuromyelitis", "Optica", "by", "an", "Igg", "-", "Selective", "Proteinase", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Neuromyelitis", "optica", "(", "NMO", ")", "is", "an", "inflammatory", "demyelinating", "disease", "of", "the", "central", "nervous", "system", "caused", "by", "binding", "of", "pathogenic", "IgG", "autoantibodies", "(", "NMO", "-", "IgG", ")", "to", "astrocyte", "water", "channel", "aquaporin", "-", "4", "(", "AQP4", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Astrocyte", "damage", "and", "downstream", "inflammation", "require", "NMO", "-", "IgG", "effector", "function", "to", "initiate", "complement", "-", "dependent", "cytotoxicity", "(", "CDC", ")", "and", "antibody", "-", "dependent", "cell", "-", "mediated", "cytotoxicity", "(", "ADCC", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "evaluated", "the", "potential", "therapeutic", "utility", "of", "the", "bacterial", "enzyme", "IdeS", "(", "IgG", "-", "degrading", "enzyme", "of", "Streptococcus", "pyogenes", ")", ",", "which", "selectively", "cleaves", "IgG", "antibodies", "to", "yield", "Fc", "and", "F", "(", "ab", "'", ")", "2", "fragments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "AQP4", "-", "expressing", "cell", "cultures", ",", "IdeS", "treatment", "of", "monoclonal", "NMO", "-", "IgGs", "and", "NMO", "patient", "sera", "abolished", "CDC", "and", "ADCC", ",", "even", "when", "IdeS", "was", "added", "after", "NMO", "-", "IgG", "was", "bound", "to", "AQP4", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Binding", "of", "NMO", "-", "IgG", "to", "AQP4", "was", "similar", "to", "that", "of", "the", "NMO", "-", "F", "(", "ab", "'", ")", "2", "generated", "by", "IdeS", "cleavage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "NMO", "-", "F", "(", "ab", "'", ")", "2", "competitively", "displaced", "pathogenic", "NMO", "-", "IgG", ",", "preventing", "cytotoxicity", ",", "and", "the", "Fc", "fragments", "generated", "by", "IdeS", "cleavage", "reduced", "CDC", "and", "ADCC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IdeS", "efficiently", "cleaved", "NMO", "-", "IgG", "in", "mice", "in", "vivo", ",", "and", "greatly", "reduced", "NMO", "lesions", "in", "mice", "administered", "NMO", "-", "IgG", "and", "human", "complement", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IgG", "-", "selective", "cleavage", "by", "IdeS", "thus", "neutralizes", "NMO", "-", "IgG", "pathogenicity", ",", "and", "yields", "therapeutic", "F", "(", "ab", "'", ")", "2", "and", "Fc", "fragments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IdeS", "treatment", ",", "by", "therapeutic", "apheresis", "or", "direct", "administration", ",", "may", "be", "beneficial", "in", "NMO", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Structure", "-", "based", "Identification", "of", "OATP1B1", "/", "3", "Inhibitors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Several", "recent", "studies", "show", "that", "inhibition", "of", "the", "hepatic", "transport", "proteins", "organic", "-", "anion", "transporting", "polypeptide", "1B1", "(", "OATP1B1", ")", "and", "1B3", "(", "OATP1B3", ")", "can", "result", "in", "clinically", "relevant", "drug", "-", "drug", "interactions", "(", "DDI", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "avoid", "late", "-", "stage", "development", "drug", "failures", "due", "to", "OATP1B", "-", "mediated", "DDI", ",", "predictive", "in", "vitro", "and", "in", "silico", "methods", "should", "be", "implemented", "at", "an", "early", "stage", "of", "the", "drug", "candidate", "evaluation", "process", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "present", "study", ",", "we", "first", "developed", "a", "high", "-", "throughput", "in", "vitro", "transporter", "inhibition", "assay", "for", "the", "OATP1B", "subfamily", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "total", "of", "2000", "compounds", "were", "tested", "as", "potential", "modulators", "of", "the", "uptake", "of", "the", "OATP1B", "substrate", "sodium", "fluorescein", ",", "in", "OATP1B1", "or", "1B3", "-", "transfected", "CHO", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "At", "an", "equimolar", "substrate", "-", "inhibitor", "concentration", "of", "10", "mu", "M", ",", "212", "and", "139", "molecules", "were", "identified", "as", "OATP1B1", "and", "OATP1B3", "inhibitors", ",", "respectively", "(", "min", "50", "%", "inhibition", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "69", "compounds", ",", "previously", "not", "identified", "as", "OATP1B", "inhibitors", ",", "concentration", "dependent", "inhibition", "was", "also", "determined", ",", "yielding", "Ki", "values", "ranging", "from", "0", ".", "06", "to", "6", ".", "5", "mu", "M", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Based", "on", "these", "in", "vitro", "data", ",", "we", "subsequently", "developed", "a", "proteochemometrics", "-", "based", "in", "silico", "model", ",", "which", "predicted", "OATP1B", "inhibitors", "in", "the", "test", "group", "(", "20", "%", "of", "the", "dataset", ")", "with", "high", "specificity", "(", "86", "%", ")", "and", "sensitivity", "(", "78", "%", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "several", "physicochemical", "compound", "properties", "and", "substructures", "related", "to", "OATP1B1", "/", "1B3", "inhibition", "or", "inactivity", "were", "identified", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "model", "performance", "was", "prospectively", "verified", "with", "a", "set", "of", "54", "compounds", "not", "included", "in", "the", "original", "dataset", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "validation", "indicated", "that", "80", "%", "and", "74", "%", "of", "the", "compounds", "were", "correctly", "classified", "for", "OATP1B1", "and", "OATP1B3", "inhibition", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pomalidomide", ":", "first", "global", "approval", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pomalidomide", "(", "Pomalyst", "(", "(R)", ")", ")", "is", "a", "small", "molecule", "analogue", "of", "thalidomide", "under", "development", "with", "Celgene", "Corporation", "for", "the", "oral", "treatment", "of", "haematological", "and", "connective", "tissue", "diseases", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pomalidomide", "has", "been", "approved", "in", "the", "USA", "and", "is", "awaiting", "approval", "in", "the", "EU", "for", "use", "with", "low", "-", "dose", "dexamethasone", "for", "the", "treatment", "of", "relapsed", "and", "refractory", "multiple", "myeloma", "that", "has", "progressed", "following", "at", "least", "two", "prior", "therapies", ",", "including", "lenalidomide", "and", "bortezomib", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "The", "efficacy", "and", "safety", "of", "pomalidomide", "as", "monotherapy", "in", "patients", "with", "relapsed", "and", "refractory", "multiple", "myeloma", "has", "also", "been", "evaluated", "in", "a", "phase", "III", "trial", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "agent", "is", "in", "phase", "III", "clinical", "development", "for", "the", "treatment", "of", "myelofibrosis", "and", "in", "phase", "II", "development", "for", "systemic", "sclerosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pomalidomide", "is", "also", "being", "investigated", "in", "patients", "with", "amyloidosis", ",", "prostate", "cancer", ",", "small", "cell", "lung", "cancer", ",", "pancreatic", "cancer", ",", "graft", "-", "versus", "-", "host", "disease", ",", "and", "Waldenstrom", "'", "s", "macroglobulinaemia", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "article", "summarizes", "the", "milestones", "in", "the", "development", "of", "pomalidomide", "leading", "to", "this", "first", "global", "approval", "for", "relapsed", "and", "refractory", "multiple", "myeloma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "S", "-", "nitrosation", "of", "glutathione", "transferase", "P1", "-", "1", "is", "controlled", "by", "the", "conformation", "of", "a", "dynamic", "active", "-", "site", "helix", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "S", "-", "nitrosation", "is", "a", "post", "-", "translational", "modification", "of", "protein", "cysteine", "residues", "which", "occurs", "in", "response", "to", "cellular", "oxidative", "stress", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]