Datasets:

ktgiahieu
/

maccrobat2018_2020

Modalities:

Text

Formats:

Size:

Libraries:

License:

Dataset card Data Studio Files Files and versions

xet

Community

Dataset Viewer

Auto-converted to Parquet Duplicate

Split (1)

train · 400 rows

tokens sequence	tags sequence
[ "A", "68", "-", "year", "-", "old", "female", "nonsmoker", ",", "nondrinker", "with", "a", "medical", "history", "of", "hypertension", "presented", "with", "new", "-", "onset", "painless", "jaundice", "and", "pruritus", ",", "a", "three", "-", "month", "hi...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "B-History", "O", "B-History", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease_disorder", "B-Clinical_event", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Sign_symptom", "O", "O", "B-Duration", "I-Duration",...
[ "A", "14", "-", "month", "-", "old", "boy", "was", "referred", "to", "our", "hospital", "from", "another", "hospital", "because", "of", "dilated", "and", "hypertrophied", "left", "ventricle", "(", "LV", ")", ",", "neutropenia", ",", "and", "developmental", ...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "B-Clinical_event", "O", "O", "B-Nonbiological_location", "B-Nonbiological_location", "I-Nonbiological_location", "I-Nonbiological_location", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Sign_symptom", "B-Biological_struc...
[ "Our", "patient", "was", "a", "68", "-", "year", "-", "old", "woman", "with", "chronic", "obstructive", "pulmonary", "disease", ".", "\n", "She", "had", "no", "history", "of", "gastroesophageal", "reflux", "disease", "or", "esophageal", "disorders", "but", "...	[ "O", "O", "O", "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", "O", "O", "O", "O"...
[ "We", "present", "a", "case", "of", "pancreatic", "tumor", "without", "a", "history", "of", "trauma", "or", "panceratitis", ".", "\n", "A", "47", "-", "year", "-", "old", "Tunisian", "man", "with", "a", "history", "of", "Crohn", "'s", "disease", "was", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Personal_background", "B-Sex", "O", "O", "O", "O", "B-History", "I-History", "I-History", "O", "B-Clinical_event", "O...
[ "A", "41", "-", "year", "-", "old", "Caucasian", "woman", "underwent", "a", "primary", "double", "lung", "transplantation", "for", "cystic", "fibrosis", "in", "2006", ".", "\n", "Her", "medical", "history", "was", "otherwise", "unremarkable", "and", "the", "...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Personal_background", "B-Sex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Date", "O", "O", "O", "B-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", "O", "O", "O", "O", "O", "O"...
[ "A", "54", "year", "-", "old", "diabetic", "woman", "complained", "of", "blurred", "vision", "in", "the", "left", "eye", "for", "5", "days", "without", "scalp", "tenderness", "or", "headache", ".", "\n", "Visual", "acuity", "(", "VA", ")", "was", "20/20"...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-History", "B-Sex", "O", "O", "B-Sign_symptom", "I-Sign_symptom", "O", "O", "B-Biological_structure", "I-Biological_structure", "O", "B-Duration", "I-Duration", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Sign_symptom", "O", "O", "...
[ "This", "is", "a", "53", "-", "year", "-", "old", "male", "patient", "who", "went", "to", "our", "hospital", "with", "chief", "complaint", "of", "massive", "gum", "bleeding", "for", "1", "day", ".", "\n", "The", "patient", "had", "a", "history", "of", ...	[ "O", "O", "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Duration", "I-Duration", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B...
[ "A", "65", "-", "year", "old", "female", "was", "admitted", "with", "progressive", "dysphagia", "for", "2", "months", "and", "5", "kg", "weight", "loss", ".", "\n", "Her", "past", "medical", "history", "was", "significant", "for", "osteoporosis", "treated", ...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "B-Clinical_event", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Duration", "I-Duration", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "I-Sign_symptom", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-History", "O", "O", ...
[ "A", "58", "-", "year", "-", "old", "cotton", "farmer", "was", "presented", "to", "the", "West", "China", "Hospital", "of", "Sichuan", "University", "because", "of", "an", "over", "1", "-", "month", "history", "of", "recurrent", "fever", "(", "between", ...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Occupation", "I-Occupation", "O", "O", "O", "O", "B-Nonbiological_location", "I-Nonbiological_location", "I-Nonbiological_location", "I-Nonbiological_location", "I-Nonbiological_location", "I-Nonbiological_location", "O", "O"...
[ "A", "18", "-", "year", "-", "old", "man", "presented", "with", "a", "history", "of", "a", "palpable", "lump", "in", "the", "presternal", "area", ",", "which", "was", "found", "incidentally", "after", "weight", "reduction", ".", "\n", "The", "patient", "...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "B-Clinical_event", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "O", "B-Biological_structure", "I-Biological_structure", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "I-Sign_symptom", "O", ...
[ "A", "23", "-", "year", "-", "old", "woman", "with", "a", "history", "of", "carnitine", "deficiency", "presented", "with", "exertional", "dyspnea", "and", "fatigue", ".", "\n", "She", "was", "first", "diagnosed", "with", "nonischemic", "cardiomyopathy", "at", ...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "O", "O", "O", "B-Disease_disorder", "I-Disease_disorder", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Sign_symptom", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease_disorder", "O", "B-Age", "...
[ "A", "50", "-", "year", "-", "old", "lady", "presented", "with", "complaints", "of", "pain", "abdomen", "and", "jaundice", "for", "one", "and", "a", "half", "months", ";", "she", "also", "complained", "of", "intermittent", "type", "of", "fever", "in", "t...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "B-Clinical_event", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "B-Biological_structure", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Duration", "I-Duration", "I-Duration", "I-Duration", "I-Duration", "O", "O", "O", "O", "O", "O"...
[ "A", "68", "-", "year", "-", "old", "female", "smoker", "with", "a", "history", "of", "pulmonary", "embolism", "and", "diabetes", "mellitus", "was", "diagnosed", "with", "Stage", "IIIB", "(", "T4N2M0", ")", "squamous", "NSCLC", ".", "\n", "She", "was", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease_disorder", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Therapeutic_procedure", "O", "B-Medication", "O", ...
[ "A", "54", "-", "year", "-", "old", "patient", "was", "admitted", "for", "fever", ",", "diarrhea", ",", "and", "acute", "renal", "failure", ".", "\n", "He", "had", "no", "significant", "medical", "history", ",", "did", "not", "take", "any", "medication",...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "O", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Sign_symptom", "O", "O", "O", "B-Disease_disorder", "I-Disease_disorder", "O", "O", "O", "O", "B-History", "I-History", "I-History", "I-History", "O", "O", "O", "...
[ "A", "60", "-", "year", "-", "old", "woman", "patient", "was", "admitted", "to", "our", "hospital", "on", "Feb.", "18", ",", "2016", "because", "of", "frequent", "episodes", "of", "hemoptysis", "for", "2", "weeks", ".", "\n", "In", "the", "previous", "...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "O", "B-Clinical_event", "O", "O", "O", "O", "B-Date", "I-Date", "I-Date", "I-Date", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Duration", "I-Duration", "O", "O", "O", "O", "B-Date",...
[ "A", "female", "outpatient", "in", "her", "50s", "had", "routinely", "visited", "our", "hospital", "because", "of", "liver", "cirrhosis", "resulting", "from", "hepatitis", "B", "virus", "and", "biliary", "duct", "stones", ".", "\n", "At", "65", "years", "of"...	[ "O", "B-Sex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Clinical_event", "O", "B-Nonbiological_location", "O", "O", "B-Disease_disorder", "I-Disease_disorder", "O", "O", "B-Disease_disorder", "I-Disease_disorder", "I-Disease_disorder", "O", "B-Disease_disorder", "I-Disease_disorde...
[ "A", "63", "-", "year", "-", "old", "woman", "with", "no", "known", "cardiac", "history", "presented", "with", "a", "sudden", "onset", "of", "dyspnea", "requiring", "intubation", "and", "ventilatory", "support", "out", "of", "hospital", ".", "\n", "She", "...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "B-History", "I-History", "I-History", "I-History", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Therapeutic_procedure", "O", "B-Therapeutic_procedure", "I-Therapeutic_procedure", "B-Nonbiologi...
[ "Our", "patient", "was", "a", "50", "-", "year", "old", "man", "with", "bicuspid", "aortic", "valve", "insufficiency", "and", "ascending", "aorta", "dilatation", ".", "\n", "He", "had", "undergone", "a", "free", "-", "hand", "aortic", "homograft", "implantat...	[ "O", "O", "O", "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "O", "B-Sign_symptom", "I-Sign_symptom", "I-Sign_symptom", "O", "O", "B-Sign_symptom", "I-Sign_symptom", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Therapeutic_procedure", "I-The...
[ "A", "52", "-", "year", "-", "old", "man", "(", "body", "surface", "area", ":", "1.3", "m2", ")", "known", "to", "have", "dilated", "cardiomyopathy", "(", "DCM", ")", ",", "was", "admitted", "for", "worsening", "heart", "failure", "(", "NYHA", "class",...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease_disorder", "I-Disease_disorder", "O", "B-Disease_disorder", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease_disorder", "I-Disease_disorder",...
[ "A", "63", "-", "year", "-", "old", "male", "patient", "without", "smoking", "or", "drinking", "history", "was", "admitted", "on", "June", "11", ",", "2014", ".", "\n", "His", "major", "complaints", "were", "gradually", "aggravated", "dysphagia", "and", "f...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "B-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", "O", "O", "B-Date", "I-Date", "I-Date", "I-Date", "I-Date", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-S...
[ "The", "patient", ",", "a", "9", "year", "-", "old", "Caucasian", "female", ",", "was", "first", "diagnosed", "with", "medulloblastoma", "at", "age", "3", "years", ".", "\n", "Treatment", "included", "surgical", "resection", "of", "the", "tumor", "followed",...	[ "O", "O", "O", "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Personal_background", "B-Sex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease_disorder", "O", "B-Date", "I-Date", "I-Date", "O", "O", "B-Therapeutic_procedure", "O", "B-Therapeutic_procedure", "I-Therapeutic_procedure"...
[ "A", "21", "-", "year", "-", "old", "male", "presented", "with", "a", "2", "-", "year", "history", "of", "progressive", "shortness", "of", "breath", "on", "exertion", "and", "dry", "cough", ".", "\n", "At", "physical", "examination", ",", "auscultation", ...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "B-Clinical_event", "O", "O", "B-Duration", "I-Duration", "I-Duration", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "I-Sign_symptom", "I-Sign_symptom", "O", "B-Detailed_description", "O", "B-Sign_symptom", "I-Sign_symptom"...
[ "A", "20", "-", "year", "-", "old", "male", "with", "cystic", "fibrosis", "was", "transferred", "to", "Houston", "Methodist", "Hospital", "in", "January", "2013", "to", "be", "evaluated", "for", "lung", "and", "kidney", "transplant", ".", "\n", "Patients", ...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "B-History", "I-History", "O", "B-Clinical_event", "O", "B-Nonbiological_location", "I-Nonbiological_location", "I-Nonbiological_location", "O", "B-Date", "I-Date", "O", "O", "B-Clinical_event", "O", "O", ...
[ "A", "73", "-", "year", "-", "old", "woman", "was", "initially", "referred", "19", "months", "prior", "to", "the", "current", "presentation", ",", "at", "which", "time", "fluorescein", "and", "indocyanine", "green", "angiography", "showed", "a", "medium", "-...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "O", "O", "B-Clinical_event", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Disease_disorder", "O", "O", "B-Biolo...
[ "A", "69", "-", "year", "-", "old", "man", "became", "aware", "of", "the", "onset", "of", "exertional", "dyspnea", "in", "July", "2010", ".", "\n", "He", "had", "a", "history", "of", "smoking", "for", "more", "than", "40", "years", ",", "20", "cigare...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Sign_symptom", "O", "B-Date", "I-Date", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", "I-History", ...
[ "A", "19", "-", "year", "-", "old", "man", "presented", "at", "the", "emergency", "department", ",", "12", "h", "after", "insertion", "of", "a", "high", "pressure", "container", "with", "tanning", "spray", "into", "his", "rectum", ".", "\n", "A", "plain"...	[ "O", "B-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "I-Age", "B-Sex", "B-Clinical_event", "O", "O", "B-Nonbiological_location", "I-Nonbiological_location", "O", "O", "O", "O", "B-Activity", "O", "O", "B-Detailed_description", "I-Detailed_description", "I-Detailed_description", "O", ...

End of preview. Expand in Data Studio

Modified dataset from: Caufield, J. Harry (2019): MACCROBAT. figshare. Dataset. https://doi.org/10.6084/m9.figshare.9764942.v2

Example training notebook: https://colab.research.google.com/drive/1OzCY782KJSF0FBDS0d1CoMhfp3-RtJMV?usp=sharing

Labels:

0: B-Activity
1: B-Administration
2: B-Age
3: B-Area
4: B-Biological_attribute
5: B-Biological_structure
6: B-Clinical_event
7: B-Color
8: B-Coreference
9: B-Date
10: B-Detailed_description
11: B-Diagnostic_procedure
12: B-Disease_disorder
13: B-Distance
14: B-Dosage
15: B-Duration
16: B-Family_history
17: B-Frequency
18: B-Height
19: B-History
20: B-Lab_value
21: B-Mass
22: B-Medication
23: B-Nonbiological_location
24: B-Occupation
25: B-Other_entity
26: B-Other_event
27: B-Outcome
28: B-Personal_background
29: B-Qualitative_concept
30: B-Quantitative_concept
31: B-Severity
32: B-Sex
33: B-Shape
34: B-Sign_symptom
35: B-Subject
36: B-Texture
37: B-Therapeutic_procedure
38: B-Time
39: B-Volume
40: B-Weight
41: I-Activity
42: I-Administration
43: I-Age
44: I-Area
45: I-Biological_attribute
46: I-Biological_structure
47: I-Clinical_event
48: I-Color
49: I-Coreference
50: I-Date
51: I-Detailed_description
52: I-Diagnostic_procedure
53: I-Disease_disorder
54: I-Distance
55: I-Dosage
56: I-Duration
57: I-Family_history
58: I-Frequency
59: I-Height
60: I-History
61: I-Lab_value
62: I-Mass
63: I-Medication
64: I-Nonbiological_location
65: I-Occupation
66: I-Other_entity
67: I-Other_event
68: I-Outcome
69: I-Personal_background
70: I-Qualitative_concept
71: I-Quantitative_concept
72: I-Severity
73: I-Shape
74: I-Sign_symptom
75: I-Subject
76: I-Texture
77: I-Therapeutic_procedure
78: I-Time
79: I-Volume
80: I-Weight
81: O

Downloads last month: 41

Size of downloaded dataset files:

3.8 MB

Size of the auto-converted Parquet files:

543 kB

Number of rows:

400

Models trained or fine-tuned on ktgiahieu/maccrobat2018_2020