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bpRNA_PDB_397 | GGGUAGAGUAUAAUUAGUCUUCGGACUUCCUUAUACUUAUCC | ((.(...(((((..((((((..))))))...)))))..).)) | SSISIIISSSSSIISSSSSSHHSSSSSSIIISSSSSIISISS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_398 | GGAAUUUAUGAGUACGUAGAGUAUAAUUAGUCUUCGGACUUCCUUAUACUUAUAUACUUAUAGAUUCC | (((((((((((((((....((((((..((((((..))))))...))))).).).)))))))))))))) | SSSSSSSSSSSSSSSIIIISSSSSSIISSSSSSHHSSSSSSIIISSSSSBSISBSSSSSSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_399 | GGUGAGUACGUAGAGUAUACUUCGGUAUACUUAUAUACUUACC | ((((((((...(.((((((((..)))))))).)..)))))))) | SSSSSSSSIIISISSSSSSSSHHSSSSSSSSISIISSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
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bpRNA_PDB_401 | GGUAGUUUUGGCAUGACUCUACC | (((((((((.....))))))))) | SSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_402 | GGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACCAUGCCUG | (((((((((((((.[[[[[).)))))))(((((((((....)))))))))))))).........]]]]]. | SSSSSSSSSSSSSHHHHHHSBSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKN |
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bpRNA_PDB_404 | GGGCAGAAGGUACCCCAUUGUAUGGGAUCUGAUCUGCCC | ((((((((((.(((((((...)))))))))).))))))) | SSSSSSSSSSBSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSBSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
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bpRNA_PDB_408 | GGACGUUAAAAGGCUUCGGCCUACGUCC | (((((..(...((((..)))).)))))) | SSSSSBBSIIISSSSHHSSSSISSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_409 | UCUCGGCCUUUUGGCUAAGA | ((((((((....)))))))) | SSSSSSSSHHHHSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_410 | GGUUUGCCUUUUGGCUUACC | ((((((((....)))))))) | SSSSSSSSHHHHSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
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bpRNA_PDB_419 | GGAGUGCCUGAGCUGUGGCACUCC | (((((((((.....).)))))))) | SSSSSSSSSHHHHHSBSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
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bpRNA_PDB_422 | GGUUGCGGGUCUCGCAACC | ((((((((..).))))))) | SSSSSSSSHHSBSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
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bpRNA_PDB_430 | ACUUGGUUUAGGUAAUGAGU | ((((.(((....)).))))) | SSSSBSSSHHHHSSBSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_431 | GCUGACCAGCUAUGAGGUCAUACAUCGUCAUAGCAC | ..[[[[[.(((((((]]]]].......))))))).. | EEEEEEEESSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSSSSEE | NNKKKKKNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_435 | GACAUAUUAUCGCGUGGAUAAGGGCACGCAGGUUUUUACGGGCAACGGUAAAUGUCCGAUUAUGUCC | (((((([..(((((((.{{{.{{)))))))(....<])((((((}}()}}}))))))..))))))>. | SSSSSSMMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSIISSIIISSSSSSMMSSSSSSEE | NNNNNNKNNNNNNNNNNKKKNKKNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNKKNNKKKNNNNNNNNNNNNNNKN |
bpRNA_PDB_438 | GGCGCAUCGGCGCC | (((((....))))) | SSSSSHHHHSSSSS | NNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_441 | GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCGAGUCCGGGCACCA | ((((((((((.(...........)))).))))))).... | SSSSSSSSSSBSHHHHHHHHHHHSSSSBSSSSSSSEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_443 | UCCGAAGUGCAACGGGAAAAUGCACU | (((((......))))..)........ | SSSSSHHHHHHSSSSBBSEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_446 | CGCGUCACCUCGAGCAAGUCGC | ...................... | EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_450 | GUGGUCUGAUGAGGCC | ................ | EEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_454 | gUUAAUCAUGCUCGGGUAAUCGCUGCGGCCGGUUUCGGCCGUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACGGUGCUGAGAUGCCCGUAGUGUUCGUGGAAACACGAgCGAGAAACCCAAAUGAUGGUaGGGGCACCUUCCCGAAGGAAAUGAACGGAGGGAAGGACAGGCGGCGCAUGCAGCCUGUAGAUAGAUGAUUACCGCCGGAGUACGAGGCGCAAAGCCGCUUGCAGuACGAAGGUACAGAACAUGGCUUAUAGAGCAUGAUUAAC | .((((((((((((([[[[[[[.(((((((((....))))))))).{.(<((.((((((((((((((.((([..).))))))...................)))))..((((...........))))..(((((((()(((.]....)))..)))))))(((((((........)))))))[(....].]]]]]]]((((.((..........................)).)))).}>..))))))))).).)))))))))))). | ESSSSSSSSSSSSSMMMMMMMMSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSMMMSBSSBSSSSSSSSSSSSSSBSSSHHHSBSSSSSSBBBBBBBBBBBBBBBBBBBSSSSSMMSSSSHHHHHHHHHHHSSSSMMSSSSSSSSSSSSHHHHHHSSSMMSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSMSIIIIIIIIIIIIISSSSISSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSISSSSIIIIISSSSSSSSSMSBSSSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNKNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_455 | gGCCGACGGAGGCGCGCCCGAGAUGAGUAGGCUGUCCCAUCAGGGGAGGAAUCGGGGACGGCUGAAAGGCGAGGGCGCCGAAGGGUGCAGAGUUCCUCCCGCUCUGCAUGCCUGGGGGUAUGGGGAAUACCCAUACCACUGUCACGGAGGUCUCUCCGUGGAGAGCCGUCGGUc | ((((((((((((.((((((((((.((.(((((.(((((.[((.{{{{{{).].)))))).)))))))[)))))))))))..((((((((((((.}}}}}}))))))))).)))((((((((((((]..))))))))))))(((((((((....)))))))))).)))))))))) | SSSSSSSSSSSSBSSSSSSSSSSISSBSSSSSISSSSSBBSSHHHHHHHSBBBSSSSSSISSSSSSSISSSSSSSSSSSMMSSSSSSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSSBSSSSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSBSSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNKKKKKKNNKNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_472 | GUUCCCGAAAGGAUGGCGGAAACGCCAGAUGCCUUGUAACCGAAAGGGGGAAU | ((((((.((((((((((((..)))))))...)))))...(((..))))))))) | SSSSSSMSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSBBBSSSSSMMMSSSHHSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_485 | CUGGGUCGCAGUAACCCCAGUUAACAAAACAAG | ((((([.{<<{....))))).......].}}>> | SSSSSHHHHHHHHHHSSSSSEEEEEEEEEEEEE | NNNNNKNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKK |
bpRNA_PDB_494 | GGCUUCGCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGACGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGCGGAGCCG | ((((((((....(.(((((((((.[[[[)))...)))))))(((..(((....))).)))...(]]]]((((((..))))))..))))))))). | SSSSSSSSMMMMSBSSSSSSSSSHHHHHSSSBBBSSSSSSSSSSIISSSHHHHSSSISSSMMMSIIIISSSSSSHHSSSSSSIISSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_499 | GGUCGgGUAGUGAGgGCCUUGGUCAGACGCAGCGGGCGUGCUUGUGGACUGCUUGGUGGGGCUUGCUCUGCUAGGCGGACUACUUGCGUGCCUUGUUGUAGACGGCCUUGGUaGGUCUCUUGUAGACCgucgCUUGCUACaauuaaCGAUC | (((((.((((((((.(((..((((.((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))))))..)))))))).))))..))).((((.......))))....))))))))......))))) | SSSSSISSSSSSSSMSSSIISSSSISSSSSSSSISSSSSSSISSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSISSSSSSSIISSSSSSSSISSSSIISSSMSSSSHHHHHHHSSSSMMMMSSSSSSSSIIIIIISSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_511 | GGCUUCAUAUAAUCCGAAUGAUAUGGUUUCGGAGCUUCCACCAAGAGCCUUAAACUCUUGACUAUGGAGUC | ((((((((([..(((((((.{{{.{{)))))))(.....])((((((}}..}}}))))))..))))))))) | SSSSSSSSSMMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSMMSSSSSSSSS | NNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKKKNKKNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNKKNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_512 | UAGGGUUAGGGU | ..[{(...]}). | EEEESHHHHHSE | NNKKNNNNKKNN |
bpRNA_PDB_513 | AGAGAAGAUUUUUUUU | ................ | EEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_514 | AGAGAAGAUCUUCUCU | ................ | EEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_516 | GGACGAGGAGCGUUGCAAGCGAAAGCCCAGGCUAGUCCGUUCAAACGGCGCUCA | ...[[[[((((((({[.((((..)))).)(]]]]]......).)))))).}... | EEEEEEESSSSSSSIIISSSSHHSSSSISSHHHHHHHHHHHSMSSSSSSEEEEE | NNNKKKKNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNKNNN |
bpRNA_PDB_517 | GGUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA | ((((((((......)))))))). | SSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_520 | GGCGUGUAUGUGGGGAAACCCUGAUUGAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUGGUUGUCAAUCGCC | ((((((((((((((......(((((....)))))))))))))))..((((((....)))))))))) | SSSSSSSSSSSSSSBBBBBBSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSMMSSSSSSHHHHSSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_522 | UGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGXGUG | .(((((..()(((..)))...))))). | ESSSSSMMSSSSSHHSSSMMMSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_523 | GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGCGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA | (((((..[((((((((((((..((.((((((((.(.{{{{{).])))))))).)).(((..)))))).))))))))).}}}}}))))). | SSSSSIIISSSSSSSSSSSSMMSSISSSSSSSSISHHHHHHSIISSSSSSSSISSMSSSHHSSSSSSBSSSSSSSSSIIIIIISSSSSE | NNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNN |
bpRNA_PDB_524 | GGACAGAGUAGGUAAACGUGCGUAAAGUGCCUGAGGGACGGGGAGUUGUCCUCAGGACGAACACCGAAAGGUGGCGGUACGUUUACCGCAUCUCGCUGUUC | .........((((((((((((((..((.(((((((((.(.[[[[.)..))))))))).)).(((((..)))))))).)))))))))))..]]]]....... | EEEEEEEEESSSSSSSSSSSSSSMMSSISSSSSSSSSISHHHHHHSIISSSSSSSSSISSMSSSSSHHSSSSSSSSBSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNN |
bpRNA_PDB_527 | cCUCCCGGGAGAGCCGCUAAGGGGGAAACUCUAUGCGGUACUGCCUGAUAGGGUGCUUGCGAGUGCCCCGGGAGGuCUCGUAGa | (((((((((((.((((((()((((....))))).)))))[))(((((.])))))((..[[[[[.))))))))))).]]]]]... | SSSSSSSSSSSISSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSBSSSSSISSSSSSSHHSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSSSSSEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNKNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNN |
bpRNA_PDB_530 | UGAGCUUCGGCUC | ............. | EEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_535 | gGACCCGGCUAACGCUGGGUCC | ((((((((((..)))))))))) | SSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_541 | GGCGAAGAACCGGGGAGCC | ................... | EEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_544 | GUUAUAUGUGCCCGGCACGGGUGCAGUCUCUAGGGUGUGAGAGUCCCACUGUGAAAGCAGAAAAGUAACAUAGCCUCACGCGAGGGUGUCCGUGGGGCGACAUGGAAUCUGAAGAAAGCGGACGGCACCUUCGGUCUGUGGGGAACACGCAUCUCAUAAGGCGCGGUAUCAAUGGAUGAGUUUUUGCAUAACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCCGGAGGUCUGGGGAAACAGAAGUCAGAAGUCGUAAUACCCCGCUGUUCGCA... | [[[[...{[{((((({(.(((((((((((.((((((<..)..)))))(((((((<.AAAAAA.)))))))((((((.((((.(((((.(((((((..))))))))))))..]}.{)))).))))))((((((((((((.((...))...(.((.....([((..(((((((((((((((((((.].]]]].)))))).))))>aaaaaa....)))))))))..)))...)).))))))...)))))))>.))))))))))))}}})))))(((((((((..)))))))))..(.(((((.((.(.(((.(....).)))... | EEEEEEEEEESSSSSISBSSSSSSSSSSSMSSSSSSHHHSBBSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSSSISSSSISSSSSBSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSIIIIIISSSSISSSSSSSSSSSSSSSSSSMSSHHHSSMMMSISSIIIIISBSSIISSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSBSSSSBBBBBBBBBBBSSSSSSSSSIISSSIIISSISSSSSSBBBSSSSSSSMMSSSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSMMSISSSSSBSSBSISSSISHHHHSISSS... | KKKKNNNKKKNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKNNNNNNNNNNNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN... |
bpRNA_PDB_550 | GGUGCCCGGCAGGGGUGCAGGCUGUAGGGUGGGUGAGAGUCCCUGUCUGGGCAGACAGAAGUAAUAGCCAGACGCAAGGGAGUCCGUGGGUGGCGACAUGGAAUCUGAAGGAAGCGGACGACCAACGUUCUGUGGGAGGAACACUUAAUUCAAGGCAGGGUAUCAAUGGAUGGGUUUGUUUGCAUAACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCGGGGUCUGGCUGGAAACAGAAGUCGAAGGCAUACUACCCAGCCUGUUCGCAGGGG... | .[[{((((({(..(((((((.((.((((((<..)..))))).((((...<<<<<<....)))).(..((..(((((((((..(((((((..))))))).))))..]})[))))..))..)(((...(.((((.((.[.))...(((.(]...([((...(..(.(((((.((.((((.]......)))).).).))..>>>>>>...))).)...)..)))..).)))))))....)...)))>.)).))))))).)]}])))))(..((((((..))))))..)....((((.(.((.(((((.(....).))))))))... | EEEESSSSSISIISSSSSSSISSMSSSSSSHHHSBBSSSSSMSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSMSIISSIISSSSSSSSSIISSSSSSSHHSSSSSSSISSSSBBBBSBSSSSIISSIISSSSIIISISSSSMSSHHHSSMMMSSSISIIIISBSSIIISIISISSSSSISSISSSSHHHHHHHHSSSSISBSISSBBBBBBBBBBBSSSISIIISIISSSIISISSSSSSSIIIISIIISSSMMSSISSSSSSSISIIISSSSSSIISSSSSSHHSSSSSSIISXXXXSSSSISBSSBSSSSSISHHHHSISSSSSSSS... | NKKKNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNKNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN... |
bpRNA_PDB_567 | CUGCUGGCUAAGGCAUGAAAGUGCUAUGCCUGCUG | ((((.((([.(((((((..))))))])))).)))) | SSSSISSSBBSSSSSSSHHSSSSSSBSSSSISSSS | NNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_568 | GGUUAAAGCCUUAUGGUCGCUACCAUUGCACUCCGGUAGCGUUAAAAGGGAAGACGGGUGAGAAUCCCGCGCAGCCCCCGCUACUGUGAGGGAGGACGAAGCCCUAGUAAGCCACUGCCGAAAGGUGGGAAGGCAGGGUGGAGGAUGAGUCCCGAGCCAGGAGACCUGCCAUAAGGUUUUAGAAGUUCGCCUUCGGGGGGAAGGUGAACA | .....(.(((((((([((((((((..........)))))))(..])(.....(.(((((...)..)))))[[(({{{{{{))(((((..(((((.((((...(((.....(((.((((((..))))))...)))).))..)))...).))))).)]])))).....)).)))))))))......((.(.((((}}}}}.})))).).)). | EEEEESBSSSSSSSSISSSSSSSSHHHHHHHHHHSSSSSSSSHHHSSMMMMMSBSSSSSHHHSBBSSSSSMMSSHHHHHHSSSSSSSIISSSSSISSSSIIISSSBBBBBSSSISSSSSSHHSSSSSSIIISSSSBSSIISSSBBBSISSSSSISBBSSSSMMMMMSSISSSSSSSSSXXXXXXSSISISSSSHHHHHHHSSSSISISSE | NNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNKNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_570 | GGAACCGCGAAAGCGGUUCCACGACGAUACUUAUUUCCUUUGAUCGUCGUUAUUACUGGCUUCGGCCACAAAGGAGA | (((((((((..)))))))))(((((((((......[[[[[.)))))))))....(.(((((..)))))).]]]]].. | SSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSSSSSSXXXXSBSSSSSHHSSSSSSEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNN |
bpRNA_PDB_572 | GCCCCUGCCUGCCUGCAGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCUGCCUGCCUGCCUGGGC | ((((..((((((((((((((()(((((..)))))).)))))))))))))..)))) | SSSSIISSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSBSSSSSSSSSSSSSIISSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_591 | CCGCCUAACACUGCCAAUGCCGGUCCCAAGCCCGGAUAAAAGUGGAGGGGGCGG | (((((..((((([[(...)((((({{{{)]])))).....)))))}}}}))))) | SSSSSIISSSSSMMSHHHSSSSSSHHHHSBBSSSSMMMMMSSSSSIIIISSSSS | NNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNKKKKNKKNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNN |
bpRNA_PDB_592 | GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGGUCCGA | (((((....((((....))))(((..((((((.[[[[[.))).))).)))..(((((....))))))))))((((((..))))))......]]]]]. | SSSSSMMMMSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSHHHHHHHSSSBSSSISSSMMSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKN |
bpRNA_PDB_593 | UUAGCUCGCCAGUUAGCGAGGUCUGUCUCGACACGACAGAUAAUCGGGUGCAACUCCCGCCCCUCUUCCGAGGGUCAUCGGAACCa | ...[((((([[{...)))))(((((((.......)))))))...(((((]}.)].))))[[[..(((((((]]].].)))))).). | EEEESSSSSHHHHHHSSSSSSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSXXXSSSSSHHHSBBSSSSXXXXXSSSSSSSHHHHHHSSSSSSBSE | NNNKNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNKNNNNNKKKNNNNNNNNNKKKNKNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_595 | cAUCCGGUAUCCCAAGACAAUCUUCGGGUUGGGUUGGGAAGUAUCAUGGCUAAUCACCAUGAUGCAAUCGGGUUGAACACUUAAUUGGGUUAAAACGGUGGGGGACGAUCCCGUAACAUCCGUCCUAACGGCGACAGACUGCACGGCCCUGCCUCUUAGGUGUGUCCAAUGAacAGUCGUUCCGAAAGGAAG | [.[(((({..((((((((((((....))))))))))))..((((((((((..{{{))))))))))..))))((((((((((...)((((((][.(((((.(((...}}}))).....).))))((...])).....<<<<<]()))))))((((...))))))))))))).}.>>>>>.((((....)))). | EEESSSSMMMSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSMMSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSSSSMMSSSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSMMMSSSSSISSSHHHHHHSSSIIIIISBSSSSSSHHHHSSMMMMMMMMMMMSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSSSSMMMMMMMMMSSSSHHHHSSSSE | KNKNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKKNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_598 | GGGUCAGAUCGGCGAAAGUCGCCACUUCGCCGAGGAGUGCAAUCUGUGAGGCCCCAGGAGGACUGGGU | ..[[((((((((((..))))).(]((((.....)))).)].)))))(.)...((((((...)))))). | EEEESSSSSSSSSSHHSSSSSMSISSSSHHHHHSSSSISMMSSSSSSHSMMMSSSSSSHHHSSSSSSE | NNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_600 | GCGCUGAAUUCCCUGAAGGGAAACGGGGGACCCAAUCUUCAGGGGUGAAUCCCACGUAAGUGGGUAGGGCUAGUCUCUUUCGGCCCGAACCCGUCAGCUAACCUCGUAAGCGUGGAAAGAGGga | .(((((..(((((....)))))(((((((..((........((((((..(((((((..)))))))(((((([..{{{{{{{)))))))))))..).))..))))))))))))].}}}}}}}... | ESSSSSMMSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSIISSIIIIIIIISSSSSSMMSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSBBSISSIISSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKKKKNNN |
bpRNA_PDB_602 | GGAUCGCUGAACCCGAAAGGGGCGGGGGACCCAGAAAUGGGGCGAAUCUCUUCCGAAAGGAAGAGUAGGGUUACUCCUUCGACCCGAGCCCGUCAGCUAACCUCGCAAGCGUCCGAAGGAGAAUCaa | ....(((((............(((((((...(......((((((..((((((((....))))))))(((((([{{{{{{{)))))))))))..).)...))))))))))))]..}}}}}}}...... | EEEESSSSSBBBBBBBBBBBBSSSSSSSIIISIIIIIISSSSSSMMSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSSSSSBBSISIIISSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNKKKKKKKNNNNNN |
bpRNA_PDB_604 | GGCGCUGUGUCGCAAUCUGCGAAGGGCGUCGUCGGCCCGAGCGGUAGUAAGCAGGGAACUCACCUCCAAUGAAACACAUUGUCGUAGCAGUUGACUACUGUUAUGUGAUUGGUAGAGGCUAAGUGACGGUAUUGGCGUAAGCCAAUACCGCGGCACAGCACAAGCCCGCUUGCGAGAUUACAGCGC | .(.(((((.((..((.(((((..((((.......)))).)))))))(((((([((((.(((((((((((((.....)))))..(((((((.......)))))))....))))).)))(((].(((((((..((((......))))..)))..)))))))....))))))))))..))..))))).) | ESISSSSSISSMMSSBSSSSSIISSSSHHHHHHHSSSSISSSSSSSSSSSSSBSSSSMSSSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSMMMMSSSSSBSSSSSSBBSSSSSSSIISSSSHHHHHHSSSSIISSSBBSSSSSSSMMMMSSSSSSSSSSMMSSIISSSSSIS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_606 | AGAGAAGAAAGGGAAAUUUUUUUUUUUUUUUU | ................................ | EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_607 | CGCXAAUUAGCG | ............ | EEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNN |
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bpRNA_PDB_611 | GAGCAACUUAGGAUUUUAGGCUCCCCGGCGUGUCUCGAACCAUGCCGGGCAACCCAUAGGGGGCUGGCGGUCCCUGUGCGGUCAAAAUUCAUCCGCCGGAG | [[[[[.(...((((((..]]]]](((((((((......)))))))))...(((((((((((........))))))).)))).))))))...........). | EEEEEESIIISSSSSSMMMMMMMSSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSSSMMMSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSBSSSSMSSSSSSIIIIIIIIIIISE | KKKKKNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_614 | GGGAAGAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUCUUCCC | ((((((((([..(((((((.{{..{{)))))))(.....])((((((}}...}}))))))..))))))))) | SSSSSSSSSMMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSMMSSSSSSSSS | NNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKKNNKKNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNKKNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_616 | uGCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGGUAACGAAUCGACAGAAGGUGCACGGUc | .(((((((((((((((((...[[[[[.)))))(.)(((((...]]]]]...))))))))))(..((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))). | ESSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSSSHSSSSSSHHHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSBBSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_619 | GGGUCGUGACUGGCGAACAGGUGGGAAACCACCGGGGAGCGACCCUUGCCGCCCGCCUGGGCAA | ((((((((((([......((((((...])))))))))))))))))(((((.........))))) | SSSSSSSSSSSBBBBBBBSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSS | NNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_622 | GACGAUAUCGAGCAUCAAGAGUGAAUAUCGUC | (((((((((((((.....))))).)))))))) | SSSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSBSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_624 | CCUGAGUUCAAUUCUAGCG | ................... | EEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_630 | CGCGAAUUXXCG | ............ | EEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_631 | UUUUUAAUGAAGCCACAGGCUGUGAGGGUCCUAAGCCCCUAAUUCAGAAGGGAA | .(((..((((([[(((((.)))))((((({{{.)]]))))..))))))}}}.)) | ESSSBBSSSSSMMSSSSSHSSSSSSSSSSHHHHSBBSSSSMMSSSSSSBBBBSS | NNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNKKKNNKKNNNNNNNNNNNNKKKNNN |
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bpRNA_PDB_644 | AUGCGCCCAGAUAGGGUGUUAAGUCAAGUAGUUUAAGGUACUACUCUGUAAGAUAACACAGAAAACAGCCAACCUAACCGAAAAGCGAAAGCUGAUACGGGAACAGAGCACGGUUGGAAAGCGAUGAGUUACCUAAAGACAAUCGGGUACGACUGAGUCGCAAUGUUAAUCAGAUAUAAGGUAUAAGUUGUGUUUACUGAACGCAAGUUUCUAAUUUCGGUUAUGUGUCGAUAGAGGAAAGUGUCUGAAACCUCUAGUACAAAGAAAGGUAAGUUAUGGUUGUGGACUUAUCUGUUAUCACCACAUUUGUACAAUCUGUA... | .........(....[....(.(((.............()........(..........)......(...(((((..(.(....((......)).....)...).....]..)))))...(..(.....(..........[...........)......)..)..)......(((.................................(((...(...................(.(......]........).)....((.......(((.(.(().........).).)))................)).......(((... | EEEEEEEEESIIIIIIIIISISSSMMMMMMMMMMMMMSSMMMMMMMMSHHHHHHHHHHSMMMMMMSMMMSSSSSIISISIIIISSHHHHHHSSIIIIISIIISIIIIIIIISSSSSMMMSIISIIIIISHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSIIIIIISIISMMSMMMMMMSSSIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIISSSIIISMMMMMMMMMMMMMMMMMMMSISHHHHHHHHHHHHHHHSISMMMMSSIIIIIIISSSISISSSBBBBBBBBBSISISSSIIIIIIIIIIIIIIIISSMMMMMMMSSS... | NNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN... |
bpRNA_PDB_645 | NNNGACUUAAGUC | ............. | EEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_646 | GGGAUCUGUCACCCCAUUGAUCGCCUUCGGGCUGAUCUGGCUGGCUAGGCGGGUCCC | (((((((((((((((...((((((((..)))).)))).))..))..))))))))))) | SSSSSSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSHHSSSSBSSSSISSBBSSBBSSSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_647 | GUGUGCCCGGCAUGGGUGCAGUCUAUAGGGUGAGAGUCCCGAACUGUGAAGGCAGAAGUAACAGUUAGCCUAACGCAACUGCGCCGUGGCGACAUGGCGUGGGAAGGAAGCGGACGGCAAACCUUCGGUCUGAGGAACACGAACUUCAUAUGAGGCUAGGUAUCAAUGGAUGAGUUUGCAUaACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCCGGGGAGGUCUGGAAACAGAAGUCAGCAGAAGUCAUAGUACCCUGUUCgCAGGGGAAGG... | [[[[{((((({(.(((((((((((.((((((<..)..)))))(((((((<AAAAAAA.)))))))(((((..(((((((((((((((((..))))))))))))..]})[))))..)))))((((((..(((((((.[.)))..(((((]..(([(((.(((((((((((((((((((.]......)))))).))))>aaaaaaa...))))))))).)))).)))))))))).....))))))>.))))))))))))]}])))))(((((((((..)))))))))(..(..((((.((.(((((((....))))))))))... | EEEEESSSSSISBSSSSSSSSSSSMSSSSSSHHHSBBSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSSIISSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSBBBBSBSSSSIISSSSSSSSSSSIISSSSSSSHHHSSSMMSSSSSBBBSSBSSSISSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSBSSSSBBBBBBBBBBBSSSSSSSSSISSSSBSSSSSSSSSSIIIIISSSSSSMMSSSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSMMSIISSSSBSSBSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSS... | KKKKKNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNKNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN... |
bpRNA_PDB_649 | AACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGU | [[[[..{((((.(((]]]]....)))})))) | EEEEEEESSSSISSSHHHHHHHHSSSISSSS | KKKKNNKNNNNNNNNKKKKNNNNNNNKNNNN |
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bpRNA_PDB_651 | GGGUGUACUUAACGUUUGCUUCGGCAAACUACAUCC | ((((((.....(.(((((((..)))))))))))))) | SSSSSSBBBBBSBSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_652 | aGCGGGGcGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGcUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGuUCAAAUCCGGCCCCCGCUACC | ((((((([.((((][...{<..))))(((((((.....)))))))...]((((((}>.)..))))))))))))... | SSSSSSSMMSSSSHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSMMMMSSSSSSHHHSBBSSSSSSSSSSSSEEE | NNNNNNNKNNNNNKKNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_653 | GGCAGCCAGAAGAGCACGUAUACGCAAGGCUGUC | (((((((((.)[.((..(.)..])).)))))))) | SSSSSSSSSHSMMSSIISHSIIISSMSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_654 | GAUAACUGAAUCGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCGACAUUAUC | (.(((.((..(((((()(((((..)))))).))))))))).) | SISSSBSSBBSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSBSSSSSSSSSIS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_655 | GCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGC | .......................... | EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_656 | GGUGGGGACGACCCCACC | (((((((....))))))) | SSSSSSSHHHHSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_663 | GUCUAAAGUUUGCUAGGGUUCCGCGUCAuAGGUGGUCUGGUCCAAGAGCAAACGGCUUUCACAAAGCCACACGGAAGGAUAAAAGCCUGGGAGAU | ......(((((((((((...((((((((.)))))..).)).))))[.))))))(((((.....)))))){](((.(((((..)).))).}))).. | EEEEEESSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSHSSSSSBBSBSSISSSSBBSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSSXXSSSISSSSSHHSSBSSSIISSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNN |
bpRNA_PDB_664 | GGGUCAGGCCGGCGAAAGUCGCCACAGUUUGGGGAAAGCUGUGCAGCCUGUAACCCCCCCACGAAAGUGGG | ..[.((((((((((..))))).(((((((.{{{{.){))))))].)))))}..}}}}((((((..)))))) | EEEESSSSSSSSSSHHSSSSSMSSSSSSSHHHHHHSBSSSSSSMMSSSSSXXXXXXXSSSSSSHHSSSSSS | NNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNKNNNNNNKNNNNNNKNNKKKKNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_665 | GGUGACUAGGGUUCCGGCGAAAGCCGGUCCGAGAGUUACCGACCGCCGAAAGGCGGUUACACGGCGGGAAAAAAGCCCGGGAGGA | (((((((((((..((((((..)))))))))))[.)))))).(((((((..)))))))..{](((.((((....).))).})))() | SSSSSSSSSSSBBSSSSSSHHSSSSSSSSSSSBBSSSSSSXSSSSSSSHHSSSSSSSXXXXSSSISSSSHHHHSBSSSIISSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNN |
bpRNA_PDB_666 | GGACAUAAGGAAAACCUAUGUCC | (((((((.((....))))))))) | SSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_PDB_667 | GGUGUUGACUGUUGAAUCUCAUGGCAACACC | (((((((.((...(.)......))))))))) | SSSSSSSBSSIIISHSIIIIIISSSSSSSSS | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_RFAM_3 | UCUGGUGAUUUUAGCGAAGUGGUCACACCUGUUCCCAUCUCGAACACAGAAGUUAAGCACUUUAGCGGCGACAAUAUCUAGCCACGCGCUAGUGAAGAUAGUUCAUCGCCAGGU | .((((((((....((.(((((...((..((((((.......))..))))..))....)))))..))(((.((..(.((.....(()).....)).).)).))).)))))))).. | ESSSSSSSSMMMMSSISSSSSIIISSIISSSSSSHHHHHHHSSBBSSSSIISSIIIISSSSSIISSSSSISSIISISSIIIIISSSSIIIIISSISISSISSSMSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
bpRNA_RFAM_5 | UCUGGUGAUGAUGUUCUUUAGGGUAACACCCGUUCCCAUUCCGAACACGACGGUUAAGCCUUUAGAAGCCGAUGGUACUGCACGGGAGACUGUGUGGGAGAGUAGGUGGUCGCCAGGU | .((((((((....((..(((((...((..((((((.......))..))))..))....)))))..))(((.((..(.((....((....)).....)).).)).))).)))))))).. | ESSSSSSSSMMMMSSIISSSSSIIISSIISSSSSSHHHHHHHSSBBSSSSIISSIIIISSSSSIISSSSSISSIISISSIIIISSHHHHSSIIIIISSISISSISSSMSSSSSSSSEE | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN |
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