id
stringlengths
12
30
sequence
stringlengths
12
4.38k
secondary_structure
stringlengths
12
4.38k
bpRNA_RFAM_29286
AAACGUUCAACUCGUUGCAUAGCGAGCCGCAUCUCGAUUUAAGCCAAGGAACGGGGACUUAAA
...(((((.(((((........)))))..........[[[[[[[[...))))).]].]]]]]]
bpRNA_RFAM_29458
ACGUUCAUCCCAGAGCCAGCUCGAAGCAUUCUUGCCAUCGAUAACUGGCUCGCCAUAGGGACGCAGCAACCUAACGAUGGAACGGGCGUUAGG
.(((((.(((((............................................)))))........[[[[[.[...)))))..]].]]]]
bpRNA_RFAM_2952
GAGACCAUACUAUACAGAAUCAUUUCUGCAGUAUGUAUCUCGUAAUUCCCAUCAAAUUGGUAGAGAUGCCAUCCGCGAUGAGUGGGAGACGGGCGGGCCGCGAGCGUGAAACAGUCCUUUCGAGGACUUGAUGACCGCACGGAGCCGAUGAAUUUUUGGAGCCGUAGUGGCCAGCUCUUCUGAGCGGA
.((((((((((...(((((....))))).)))))).))))......(((((......))))).........(((((..............(((((((((((..(((.......(((((....)))))........)))..(((((((.........)))))))..).))))))))))......)))))
bpRNA_RFAM_2954
AAGACUAUACUUUCAGGGAUCAUUUCUAUAGUUGUUGACUAGAGAAGGUUCUCUGAACGUGUAGGGCACCGAAAGCCACGAGGAGGAGGCGCAGCGUUCUCUCCUGAGCGUGAAGCCGGCUCUAGGUGUUGCUUUUCUGCAACUGCCUUUUGCCAUUGAUGAUCGUUUUUCUCUUCCUUUUUGGAUGAGUAAGAGGGAGAGGACGCAGUCUGAGUGGU
.((((((((((..(((((.....))))).)))))).))))........(((.((......))))).........(((((..............((((((((((((..(((.......((((..(((((((((......))))).))))..)))).........)))..(((((((((.....))))))).))..)))))))))))).......)))))
bpRNA_RFAM_29545
UGACGUUGAGCCCACUACGGGCUGCAUAAAUUCCGGCCAGGCAACGGGGGCCGGUU
...(((((..(((......)))........[[[[[[[[...))))).]].]]]]]]
bpRNA_RFAM_29587
GCACGUUUAUCCUUUCGGACGCAUGAAGCUCAAUCAGGAAACGGGGAUUGAGU
...(((((..((.....))........[[[[[[[[...))))).]].]]]]]]
bpRNA_RFAM_29600
GUACGUUCAUCGCAUUCGCCUACCAGGACAAGUUACCAGUAGUGAAUGACGACGCAGGCAACCUACUCAUGGAACGGGGGGUAGGU
...(((((.(((...................................)).).........[[[[[[[[...))))).]].]]]]]]
bpRNA_RFAM_29609
UCACGUUCAUCUCAUCUCCGGCGAGGCGCAAUUCGACUCAAGCCAUGGAAUGGUGACCUGAG
...(((((.(((((.......)))))..........[[[[[[[[...))))).]].]]]]]]
bpRNA_RFAM_29678
CAACGUUCACUUUGCUGAUACGCAAAGCGCAUCACACCUCAGGCCAUGGAACGGGGACCUGGG
...(((((.(((((........)))))..........[[[[[[[[...))))).]].]]]]]]
bpRNA_RFAM_29684
AAACGUUGAACCGAUAGUUGUCGGUUGCAGUUAGAGCCAGGUCACGCAACGGGGUCCUGGU
...(((((.(((((......)))))..........[[[[[[[[...))))).]].]]]]]]
bpRNA_RFAM_2970
GAGAUCAUACUUCACAGAAUCAUUUCUGUAGUAUGUAUUUCUUCGCUGUUAGCGAAAAUGCGACGGAGCGCAGCCGCGAUGAUGUGGCAGGGCGUCAUCUCCAGAGCGGGAAGAAGUGUGUCAUCCUCACUCCUACAGUGUGGGUGUCAUACUUGAUGACUGCGUGGAGAACCUUGAAUUAGGUUUUCCGGAAGGAGUUGACGCGUGCUGAGCGGU
.((((((((((...(((((....))))).)))))).))))....(((....)).....................[[[..............[[[[[[[[[[[[..(((.....((((((((....(((((.......)))))....))))))))......)))....(((((.((.....)))))))...)...]]]]]]]]]].......]]]]]
bpRNA_RFAM_2977
AAGACUAUACUUUUAGGGAUCAUUUCUAUAGUCUCUGAACUGAGAAAUGUUUUUCUGAACUUGGUCGGUUUCGCCAGCCACGAGGAGGAGACAGAGCGGUUCCUUCUGAGCGUGAAGCGGGCUGUGGGUGUUGCCAUCUGUGCAAGAGCUCACAGCCAUUGAUGAUCGUUCUUCCUCUCCUUUAUGGGGAGGUGGAGGGAGGAACCGCAUUCUGAGUGGU
.((((((((((..(((((.....))))).))))))..)))).......(((..((......)))))..........(((((..............((((((((((((..(((.......((((..(((((((((.......))))).))))..)))).........)))..(((((((((.....)))))))))..)))))))))))).......)))))
bpRNA_RFAM_29792
CCCUAGCCCAGAUAGUAAUGGAAAUCCCACGCUUUUGGGCGUGGAUUGCAAUGGAUAGCUGGAAAUAGC
........(((.((...((...((((.((((((....))))))))))...))...)).)))........
bpRNA_RFAM_29809
GCUUAGCCCCGAUUGAAGUGGCAUCCUUUUUAAUUGUCAGUUCGAGUGAAUUUGUGAAGAAUGAGUAAAUUUGUAUCGAGAACAAAUUAAAAAGAUAUAACGGAAAGCGGGAAUUAGC
........(((.((...((...((((..((..(((.....(((..................................)))...)))...)).))))...))...)).)))........
bpRNA_RFAM_29834
AUUUGCAUGCGUUAGGGAUUGCAAUGAUAUCCUUUUGCUGUGAAUUCGGAUCCAUCUGCAAAGAAGAUGCAAAUUUAGAUCGAAAACACAGCAAAAGAUAAAACGAAAAGCCCGCUCGAAC
..............(((.((...((...((((..((((((((............................................)))))))).))))...))...)).)))........
bpRNA_RFAM_29836
AUAUUGCGUUAAGGAUAGUAGUGAAAAUCCUUUUUGUGGUUUUUUUCGCUUUCGCGAAAACUGCCUUCAAAAAGAUUGCAACGGAUAGCCUGUUAAAAC
...........(((.((...((...((((..(((((.(((......................)))..))))).))))...))...)).)))........
bpRNA_RFAM_29866
UUUUAGCCCAGAUAGCAGUGAAAAUCCUUUUGCUUUUUUUCUUUAGAAAAGCAAAAGAUUGUAACGUAUAGCUGGAUUAGCU
........(((.((...((...((((..((((((((...........)))))))).))))...))...)).)))........
bpRNA_RFAM_29868
UAUUAGCCCCGAUUGCAGUGGAAAGCUUUUUGAAAUCUCGUUACAUUUUUUCUUGCUAAAAAAGAGCGACGGUAGGAGCUCCUUUUUUUGCUUAGAAAAAAGUAAACGAGAGGAAAAAACUUGUAACGAAAAGCGGGAAAUAGC
..........(.((...((...(((((((((.....(((....................................................................)))...)))))..))...))...)).)))........
bpRNA_RFAM_2987
AAGACUGUACUUUCUAGGAUCAUUUCUAUAGUACACGUCCCGUCUUUCUUCUCCAAAGAAGACAACCGCAUCAACCAUGAGGAGGAUUAAUAACGUUCUUUCCUGAGCGGGAAGCGGGCGAUAUUGUUCCAGUCUGGAAUGAUAUUGUCAUUGAUGACCGUUCUCGUUGUACUAUUGCAGUAUUUCGGGAGGGAAGGAACGUAUUCUGAGUGGU
.((((((((((...(((((....))))).)))))).)))).....(((((.....))))).............(((((..............((((((((((((..(((.......((((.....(((((.....))))).....)))).........)))...((((.(..........)..))))...)))))))))))).......)))))
bpRNA_RFAM_29875
AGCUAGCCCUGAUGGAAGUGGAAAUCCUUUAUACACUAAACAGGUUUUUAAAAACCUGUUUAGUGUAUAAAGAUUGUAACGACAGCAGGAAUAUGG
........(((.((...((...((((..((((((((..........................)))))))).))))...))..)).)))........
bpRNA_RFAM_29894
UUCUAGCCCCGAUUGAAGCGAAAAUCCUGUCAUUGCUAAAAAAAUAUUGCUGUUUUAUUGUUUUGUUUCUGCAAUGACAGAUUGUAGUGUAAAGCGGGAGAAUGU
........(((.((...((...((((..((((((((..................................)))))))).))))...))...)).)))........
bpRNA_RFAM_29896
ACAAUGCCGCGUAAGGGAUAGUAGUGGAAAUCCUUUUUGAGAGGAACGAACAAAAAGAUUGUAACGAAUAGCCCGACCCGCU
...............((.((...((...((((.((((((........)))...)).))))...))...)).)))........
bpRNA_RFAM_29918
GUUUAGCCCCGAUUGUAGCCGAUAUCCUUUGUGAGGUACGAACAAAGAUAAAGGCGAAAAGCGGGAAAAUGG
.........((.((...((...((((..((((..........))).))))...))...)).)))........
bpRNA_RFAM_29954
ACCUAGCCCCGAUAGAAGUAGAAAUCCUUUUUUGUUUUUUCUUUAAAAACAAAAAAGAUUGUAAGGAAUAGCGGGAUUAGCU
........(((.((...((...((((..((((((((...........)))))))).))))...))...)).)))........
bpRNA_RFAM_29976
CAACUAAAUCCACCCUUGCGGGUGGGUGAAAUAUUGCUUCGCAAUAUGAAAUACGCUUUCAGCGUAUGAAAUCGCUG
.......((((((((....))))))))...((((((.....))))))...(((((((...)))))))..........
bpRNA_RFAM_29984
CAGUGAAAUUCGUUCCUACGGAACGAGUGAAAUAUCUUCGAUGUGAAAUAUUUGCCUCGCAAAUGUGAGAUAUGCCUGCGGCAUAUGAAGGAACG
.......((((((((.....))))))))...................((((((.......))))))...(((((((...))))))).........
bpRNA_RFAM_30004
CAAUGUCAUUCGCCGUUGGCGAGUGACAUCUGACUUUGUCAGGUGAAAUCGUCCUGUCGGACGGUGAAAUUGCCC
.......((((((((.))))))))...((((((.....))))))...(((((((....)))))))..........
bpRNA_RFAM_30063
GAGCGCAUUGGAAGCUGUAAUCUAGGGGCGGCAGCGUG
.......(((((........))))).............
bpRNA_RFAM_30079
UAGUGCACUGGUAGCUAUUGAGCCAGGGGCGGUAGCAUU
.......(((((.........))))).............
bpRNA_RFAM_3009
AAGACUAUACUUUCAGGGAUCAUUUCUAUAGUUGUUAACUAGGACAUGUGUUUCUAAAGUGUGGAGUCUUCCAAACCACGAUGAUGAUUCUUGAUACUCUUUUCUGAGCCUGAAUCAGAUGCAGAGAAAUGAUUUAAUUCAUAUUCUCUGUAUCUUUGAUGAAUGUUCCUUGUUGUCUCUUACAACAUAGGAGGAAAAUAGUAUGAUCUGAGUGGU
.((((((((((..(((((.....))))).)))))).)))).......(((..((......))))).........(((((..............((((((((((((..(((.......((((..(((((((((......))))).))))..)))).........)))...(((((((......))))).))..)))))))))))).......)))))
bpRNA_RFAM_30138
GGAGUGUCAUGAUAUGGGGACUUCGUGUUUCCUUGUCUAGCUCUGUGUUUCCUAGUCUAUUUAAUCAUAGGCUAGG
..(((.....(((...((((.........)))..)))..)))).......(((((((((........)))))))))
bpRNA_RFAM_30174
GGGUGUUACGAUGUUGGAGAAAUCCUAGUCUAGCCCACGGCGAGUUUUUAACUUGC
.(((.....(((...(((.....))..)))..))))....(((((......)))))
bpRNA_RFAM_30186
AGGGCGUUAUGAUGAUGGCAUUUAUUUGCCAAGUCUAGUCCUAAGGUUAUGUUAGCACCACAGCAUAAC
..(((.....(((...((((.......)))..)))..)))).....(((((((.........)))))))
bpRNA_RFAM_30190
UGAGUUCAUUUGAACCUGGUGAUCUAUUGUCCAUCGGAUUCUGCAUAAAAGCCAAAGAC
.......((..((((((((((..........)))))))).))..)).............
bpRNA_RFAM_30193
GUUUGUCAGCAAAAUCUGUGGGAUAUAUUGUCCCCAUAGGCUUUGUAAGCAACGAAACA
.......(.(..((((((((((..........))))))))))..)).............
bpRNA_RFAM_30206
AAUUGAUUGUUUGUUAUGAUAUAUUGUCCAUAGCAGACUUGAUAAAAGCAAAAA
........((((((((((..........))))))))))................
bpRNA_RFAM_30208
AUUUGUCGUGUGCUUUAUUUGAAAUAUUGUCCAAAUAGAAGCUUACAGCAGUUAAAUCA
.......((..((((((((((..........)))))))).))..)).............
bpRNA_RFAM_30222
GAUCAAACUAAAGACGUUGGAAUUUAUGAAUAACAUCUGAAUCGGAAUACUAGCUUGUCCUAGGAUCCAUAUUCACUGCGACAUAGAUUC
....................((((((((.........(((((.(((...((((......))))..)))..)))))......)))))))).
bpRNA_RFAM_30224
GAUCAAACUUAAGGACGUGGUGGCCUGUCAGUAACUACUGAAUCGGAAUGCUGCUCACGCAGAAUCCAUAUUCACUGCGCGACGGGCCA
.....................((((((((.........(((((.(((...((((....))))..)))..)))))......)))))))).
bpRNA_RFAM_30236
CAGGAAAAAAUUUCAUGGAGAUUAUUCCUGUUAAGUAACAGAGUGGAAGAAAUUUAAAGAAUAA
.(((((..................)))))...................................
bpRNA_RFAM_30271
UGUAGCCAUCGGGCCGUCCGCUUAGCGGACGGCGCCGAUUCCGG
..........((((..(((((...)))))....)))).......
bpRNA_RFAM_30275
UGCGCCCACUUCGUCCUCUGUACAGAGCAGACCCAACGAAACCCGC
..........((((..(((((.....)))))....)))).......
bpRNA_RFAM_30278
ACUCUUUUUGGUUUCAUUCAGUUGAAACCCUCAAGCGAGUACGCCGUAAGACGCAAGCGCAGGCGGAAAACU
.........(((((((......)))))))............((((................)))).......
bpRNA_RFAM_30279
AUAUUUUAUGACUUCAUUCAAUUGAAGUCCUCAAAGUGAGUACGUCGUAAGAUCGAAGCGCUGACGGAAAACU
.........(((((((......))))))).............((((................)))).......
bpRNA_RFAM_3032
AACUUCCUGGGGUGUGCGCCAGUCGGUGAUGUCCCUGAGCCGAUACGCACAACCACGGGGGUUGCACGUUGGGGCCGGUGUGCAUGUCCGCCUGACGGAAAGCCUUAACGCCUCCUGCAACCUCCACCUUGAACUUUCGGGUUCAAGGGCUAAACCGACAGCGGCACGCCGGGAAGUCA
..(((((((((((((.(((...........((((.((((((...............(((.(((((....(((((((.....((...((((......)))..)).....))))))).))))).)))..............)))))).))))..........)))))))))))))))))..
bpRNA_RFAM_3033
GGAAAGCUGCUGUGUUGGUGACUGCCAAUAAAGUUUUUUGAUCUAUGCUUUGAGUUUAAGGGCGUUAACCAGCUAUCGUGGUAGUAAACCGAGCUUGUACUCGGAAACAGAAACGAUAAGCGGUCGAUACCCACCUGGUUCUUCCAGGUCAUAAACUGAGGUAAAACGGCACGGCGGUUUUUCA
.((((((((((((((.(((..............((((.(((.(................(((.(((((...(((((((.....((...(((((......)))))..)).....)))).)))..))))).)))..............))))).)))).........))))))))))))))))...
bpRNA_RFAM_3034
ACAACUCUAGGGUGUUCGCCAGUACGUCUAUUCCCCUGCCGAUACUUAAACUUAUGGAUGUGUUCUGUAUAUUUUGAGUGUAUGCCCACCUUGAGUGGGAAAUCCAUUAAGUGUACGUCGCGUCCACCUUGAACUCUUCGGGUUCAGGGUAACGACCAUGCAACAGCAUCUCGGGAGUGUUU
.((((((((((((((.(((..............(((((.(...............(((.(((((...(((((((.....((...(((((.....)))))..)).....))))))).))))).)))...............)))).)))).............))))))).))))))))....
bpRNA_RFAM_30357
UCACUUUUUCUAUCCUUGGAGCAACGGGUCUAAUCACCUUACCGAGACUAUCCAAGUAAAAUACGUCUCUCAUACCUCUGGUGGAGGGUGCCAGAGGAAUACUUCAUACA
...............(((((..............................)))))...................(((((((.........))))))).............
bpRNA_RFAM_3041
UUAACCCUGGGGUGUGCGUCAGUGAAUGAACGUCCCCGAGCCGAUAAGCAAAUACCCAGGAUCUGCUUUUAUUAGCUAUUGAGCAUGCUCAGCUCGACUGAGAAGCCUACGGUUAAUGUUGCCGAUCCACCUUGAACUUCUGGUUCAAGGGCAUUAUUUCGCAACGGCACCUUGGGGAACUU
.((((((((((((((.(((............((((.((((((................(((.(((((...(((((((.....((...(((((.....)))))..))....)))))))..))))).))).............)))))).))))...........)))))))))))))))))..
bpRNA_RFAM_3042
AGAGUCCUAAUGUGUUCGUUGUUUCACCUGACAUUUUGACCUAACAUUAUUCCUUCGGGAGCCCGGAUUUCCUUGCGGCGUAAACGCCUCUGGCUAGGGGACUUACAAAAGCGGGAAUAGGGCACCCACCUGCUGAGUGCGGGUUCAAAACGAAGGCAUCCAAGGCGACGGCACAAUUGGGACUCUU
.((((((((((((((.(((............((((.(((.(...............(((.(((((....(((((((.....((...(((((....)))))..))......))))))..))))).)))..............)))))).))))...............))))))).)))))))))...
bpRNA_RFAM_3044
UCUUGCCUGGGGUGUGCGUUACGAGUUACGUCCCUGAGCCGAUAAUUUGAAACUUUGAGUUGGACAUCUAACGCUGGUGAGCAAGCUUACCCUAAUUUAAUUAGGAGUAAGAAGCCUAAAAGCAGUUAAGUUUGACUCCCUUGAACCGACUGGUUCAAGGACCAUUACUGGUAGCGGCAUCUCGGGUCUUUA
.((((((((((((((.(((..........((((.((((((................(((.(((((....(((.((.....((...(((((................)))))..)).....)))))))..))))).))).............)))))).))))...........)))))))))))))))....
bpRNA_RFAM_3045
CGUCCUCGGCCGUGUUCGAUAGCGGAUUCUUACAUUUGCCCUGACCCUAAUUAACGACCCCGGGCUCGUUACUCCUUGUUGGUGUGCAUGUCCGCCCCGGUUGCGGAAAGCCCGAUGCGAGGUUCGCUGGCCCACCUGAUCCUUGGGAUCAAGGUCGUUUGGUCCGCAACGGCACGGCGGAGGACUC
.((((((((((((((.(((.................((((.((((((..............(((.(((((...(((((((.....((...(((((.......)))))..))....)))))))..))))).)))............)))))).))))............)))))))))))))))))..
bpRNA_RFAM_30475
GAUAAUUAAAAUACUCCCCAAACCGAGACCUACAGGGAGAAUAAAUUACGUCUCUCAUAUCCGUAAGUGAAGGGAUUUACGGAAAUAUAAGUUUCG
.............(((((..............).))))......................(((((((........)))))))..............
bpRNA_RFAM_3048
UUGCGGCUGCCCGAUACGUCAGGAACAUUAUCCCCGGGGCCUUACGCAUUCCCUUGGGAGCUGUCCCUGCGCUGGGCCGUGGUCCGUUGCAAACGGCGCCCACCUACAUAGUAGGUUUCCCGGGAUUGCAAAUCCAACGGUCGGGCGGCUGCACG
.((((((((((((((.(((...........((((.((((((..............(((.(((((....(((((((........)))))))..))))).)))............))).))).))))...........)))))))))))))))))..
bpRNA_RFAM_30527
UAAUCAUUUGUAACACGCCUCACCGGGACUAAACAGCGUGUCUAAAAAACAGUCUCUAAUAUCCACUCGCAAGGGUAGAGUGGAGAUACUACUACCU
.............(((((...............).))))......................(((((((.........))))))).............
bpRNA_RFAM_30532
UAUCGUGACACUUGUCGGCUUACCGAGACUCAACGUCGACAAUAAACAUUAGUCUCUCAUACCUCUCCUUCAGGGUGGAGAGGAAUAUUCUUUUCG
..............(((((.(...........).)))))......................(((((((........))))))).............
bpRNA_RFAM_3059
AAAACCCUGUGGUGUUCGUGUGACCCGGUGAAAGGUUGAGCCAACACCAAAAAUAAGGGAGCCUGGGCUUUGGCAGUGGAUUGUAGGCCGCCUCGUCGCGGAAACAUGAAGCUGCCAAGAGGGCACCCACUUUGUGAGGACGGGUUCAAAACCUACCGGUAGGCACGGCACUAUGGGGUUUUU
..(((((((((((((.(((.............((((((((((..............(((.(((((.....(((((((.....((...((((.......)))..)).....)))))))..))))).)))..............)))))).).)))..........)))))))))))))))))..
bpRNA_RFAM_30748
UUACAACACACACGCUCCCCGUAAACCAAGACCUAUAGGGAGGAUAAAUUACGUCUUUUCUUACCCUUCAUAUACCCGUACUU
..............(((((.(..............).))))).........................................
bpRNA_RFAM_30749
UGACCUACUAUUCCCCCUAACCGAGAUCAUGGGGUUAAAAUAUCUCUCAUAUCCGCCAGUAAAGGGAUUGGUGGAAAUAAUCGUAUCG
.............(((((...........)))))..................(((((((........)))))))..............
bpRNA_RFAM_30756
GCUCAUCGUAUCAUCCCCCAAACCAAGACCAAGGGGUUAUAAUGUCUUUUUAUCCACCAGUGAAGGGAUUGGUGGAAAUAUCGUAUCGC
............(((((...............)))))................(((((((........)))))))..............
bpRNA_RFAM_30768
UCACCUUUUCAUUCUGUCGCCUCACCAAGACUAAACAGCGACAUUAAAUAACAGUCUUUCAUACCUCUGCUUAGGGUGCAGAGGAAUAGUAACUCCA
...............(((((...............).))))......................(((((((.......))))))).............
bpRNA_RFAM_3078
GAAACCCUAAUGUAUUCGAUAUAGUUCCUGAUAUUUUUGAACCGAACAAUUUUUUAUACCUAGGGAGCUUGGAGUUCCGGCGCGGCGCACAUGCCUUCACACGAGGAAGUGCAAACCGUUAGACAGAGCACCCACCUGCUUUAAUUGAGAGCGGGUUCAAAGGAAGGGAAUCCUAAACGGUACGAUUGGGGUUUCU
..(((((((((((((.(((..............((((((((((...................(((.(((((.....(((((((.....((...((((......)))..)).....)))))))..))))).)))....................)))))))))).............))))))).))))))))))..
bpRNA_RFAM_30780
UAAUGUGUUGCAAACACGCCUCACCAAGACUAAACAGCGUGUCUAAACAACAGUCUUUCAUACCUCAGAUGGAGGGUGUCUGAGGAAUAUUAAUACCG
...............(((((.............).)))).......................(((((((.........))))))).............
bpRNA_RFAM_30801
AGCUGGCACAGGCUGUAAUAUCGUGUGCCCUAGACCUGGUAGCAAUACACAGGGACGGAAGCCUUCUCGCUACAAGAAGCACUCAAUCACUACCCGCAAGGAUGCAGAUAGCAAACGCCGCUAUUUGAUUGUUU
.....(((((.............)))))........(((((.....)).)))..........((((.........)))).....((((.....((....)).....((((((.......)))))).))).)...
bpRNA_RFAM_30803
GACUCGCACAGGUCAAUUUCAUGUGCCUAGAGACAACCGGAUAAUAACGGGGACGGAAGCCUCACCGCGCUAGUGAGCACUCAAUCAGUAUCCUUAACAGGACCACGAUCGCAAAUUGCCGCGGUUUGAUUGUUU
.....(((((...........)))))..........(((((...)).)))..........((((.........)))).....((((.....((......)).....((((((........)))))).))).)...
bpRNA_RFAM_30805
GCCGCGCACAGGCGACCAUUACGUGCCCUUAAACCCUGGUCUACUUGAAUCACAGGGGAUGGAAGUUCCGACAUUAGCAACGGAGAUAUAGUUCACUACCCCACCAGAUGAGUUAUGGGAUAUGCCUUCAUACAACCCAUUUGAACUAUAG
.....(((((...........)))))........(((((((.....)).))..)))..........((((..........))))....((((((...................((((((................)))))).))))))...
bpRNA_RFAM_30810
AGCCCCCACCGGCGAAGAUAUGGUGGACUUGGACCUGGCACAGCAGUAGCGCAGGGAAAUGAAUGUCCGUUUGACGGCGGAGACUCGUGUCACUACCUUCGGAUGCAGAUCAGAUAUGCCUAAUGAACUGAUUUGACACGUUU
.....(((((...........)))))........(((((((....)).)).)))...........((((........))))....((((((................((((((..............)))))).))))))...
bpRNA_RFAM_30812
GGGCAGUGACACCCAGUCGUUAUGUCACCCUAAAGCUGGACUUAGAGUCACAGUCAUGGAAAUUCUGGGCAGUAGCAGAGACUUGCAGUCACUAACCAAUAGGAUGCCGUUGGAUGUUGCUACCCAACUGACUCA
.....(((((.............))))).......(((((((...)))).)))..........((((........))))....(((.(((.....((....))......((((...........)))).))))))
bpRNA_RFAM_30824
AUGCUCCUUUGUUGUGUUAAGCGUUGGCAGACAUCUGAACCCCGCCCUAGCGGUUCAGACCUUAAACCCCGAACUUCUCCCUCCCCAUACGAAGCUCGGGGUUUUUUUUGCCCAAAA
.................................((((((((..........))))))))....((((((((((((((.............))))))))))).)))............
bpRNA_RFAM_30848
GUAACGGUCACCGCAAGGUCCCUGCCACAAGGGCAGGCUGUCUUACGCGGCUCGCGCGUCGAGUCGCAACCCGGCAACGCCGGCUUCAACAAAACCCGCCGGACUUCGAUCCGGC
.........(((....))).((((((.....))))))........(((((((((.....)))))))))..((((.....))))..............((((((......))))))
bpRNA_RFAM_3085
AUUUCUCUGAGGUGUUCGCCAGCGGGUCAGUCCCUUGAGCCGAUAUUUCAUACCACAAGAAUGUGGCUAUUCCUGACCGGUGCGCAUGCUCGGCUUGUCCGAGAAGCCUUAAGGUCUCGACGCUACGUUCACCUUGAACCAAGGGUUCAAGGGUUACAGCCUGCGGCGGCAUCUCGGAGAUCCU
.((((((((((((((.(((............((((((((((.................(((.(((((....(((((((.....((...(((((.....)))))..)).....)))))))..))))).))).............))))))))))............)))))))))))))))))..
bpRNA_RFAM_30854
GUAUCGGUCACCGAAAGGUUUCCGGUAUUUGAACCGGACAGACUUCCGCGGUUCGCUCGACGAGCCGCAACCGGCGCAGGCCGGAUUCGUUAAACCCGCCGGGACUACACCGGC
.........(((....))).((((((......))))))........(((((((((.....))))))))).((((......))))..............((((........))))
bpRNA_RFAM_30872
ACACAGCGACAGGCUGUUGAGAGCCGCCUCAGAGGCGGCGCUGUGAGACGGCCUGACGGUGU
.........(((((((((....(((((.......))))).......))))))))).......
bpRNA_RFAM_30886
GGGAGCGGUGAUCCCUCUCCCCAAAGCUAUAUAAGGCGCGAGCGCCCAUCCACCCCAAGCGCCCAUAUGGCUCGAGCCGUCCGGUUGUCCCCCCGGACGGCUC
.((((.........)))).....(.(((((((..(((((...................))))).)))))))).(((((((((((........)))))))))))
bpRNA_RFAM_30951
CAUCAACAUCAAGAGAAAGAUUGGGUUCUUCUCCAACCUGCUAACUCAGGCAAGGUGGAAUAAAAGAUGUGGUUAACCAACAAUUAAAUGAGGUAAU
.....(((((......((((.......))))(((..(((((([[[[[[))).))).)))......)))))..((.....)).......]]]]]]...
bpRNA_RFAM_30954
GUCGAAUAUCACGAGAAGGAUUUAUAUCCUCUCCAACCUGCCAACUCCGGCAAGGUGGAAAAAUGAUAUGGCGUUCAGCAAUCAUAGGAGGAAAU
.....(((((....(.(((((....))))))(((..(((((([[[[[[))).))).))).....)))))..(......).......]]]]]]...
bpRNA_RFAM_30961
UCCAAGCAUCAGGAGUGGCCUUGCGAAAGCGGGGUCCGGCAACCUGGUUUGGAGAAGCCAAGGUGCCUUGGAUGCUGUGACAGAAUUCUGUUACGGUGACCGAUGUGCGAAUGUUUACAUUCGAACAGAAUUUCUCUCG
.....(((((....(.(((((..........))))))(((..((((((.[[[[[[.))).))).)))..................................))))).((((........)))).........]]]]]].
bpRNA_RFAM_30974
AUAGAGCAUUAAGAGCAGGGUUAAAUCCCUCUCCAACCUGCCAACUCCGGCAAGGUGGAAAAAAUGAUGCGGUUAACCAACAAACAUAGGAGUACAA
.....(((((......((((.......))))(((..(((((([[[[[[))).))).)))......)))))..((.....)).......]]]]]]...
bpRNA_RFAM_31004
GUAGUACAUCACGAGCGACCAACAGGUCCGGCAACCGGGAUUUCCCACGGUGCCAUUUCGCGAAAUGCGAAAGAUGUGGCUACGCCAACAGGCGUAGCAACGGGCUGGCUCAGU
.....(((((.....(.(((....))))..((..((((([[[[[.).))).)))..................))))).((((............)))).........].]]]].
bpRNA_RFAM_31078
AUUAUUCAUCAAGAGUAAGAUUAAUUUCUUCUCCAACCUGCCAGCUCCGGCAAGGUGGAAAAAUGAUGAGGCAAUCAGCAAUAUAGGAGAAAGG
.....(((((......((((.......))))(((..(((((([[[[[[))).))).))).....)))))..(......)......]]]]]]...
bpRNA_RFAM_31200
AUCCAACAUCAAGAGUGACUCAGCAAUGAGUACAGCAACCGAGCCAGCCAGGCCGCGGUGCUUCCCGCCAGGGGAUGUGAUGCACGAAAGUGUAUAAAAACUUCUGGCCCU
.....(((((....(.(((((......))))))(((..((((((.[[[[[.))).))).)))...........)))))..((...........))........].]]]]..
bpRNA_RFAM_31207
GCCAUGCAUCCAGAGUAGGAGCUAGCUCCUCGCCAACCUGCAACUCCAAAGCAAGGUGGCCAAAUGAUGCGGCAAUCGCAACCAAUUGGAGAACA
.....(((((....(.(((((....))))))(((..(((((([[[[[[.))).))).))).....)))))..(.....).......]]]]]]...
bpRNA_RFAM_31223
CACCAUCAUCAAGAAUGCAGAAGAACACUGCAUACCAACCGAGCAGCCAAGCAGCGGUGGUCAAUCGAUGAGGACCAAAAACGUCAAAAAAAUGGAAAUCA
.....(((((....((((((.......))))))(((..(((((([[[[[[))).))).))).....))))).((((.....)))).........]]]]]].
bpRNA_RFAM_31267
AAGAUGCAUUAAGAAAGGGGUUAUCCCUGCCAACCUGCAUACCGUGCGAAGGUGGUAAUAUAUGCGGCCAAAAAGGCAAAAAUUAGGUCUCA
.....(((((....(.(((((.))))))(((..(((((([[[[[)))..))).)))....)))))..((......))......].]]]]...
bpRNA_RFAM_3130
AAAUUGCUGUGGUAUACGAAUCCACAUAUAAGUGUUGACCGACUAAUUUUUGUAUUAUCGGGAGACAGAGGUCUAUUAACAGUGUGCAGGCUGGCUCACCCAGAAGCAACUGAAGUUAGUAGCGAGUCGCCCACCUGCUUUUUUACGUCGCGGGUUCAAUACAAACUGUGGAUCAUCGGUACCAAUACAGCAUCCA
.(((.((((((((((.(((............(((((((.(...................(((.(((((.....(((((((.....((...((((......)))..)).......)))))))..))))).)))....................)))))))))).............)))))))...))))))).)..
bpRNA_RFAM_31305
AAGGGGCAUCAAGAGGGGUUCGUCCCCACCAACCGCCCACUCCGGGAACGGUGGUUAAUCGAUGCGCCAUAGGCCCUGCUGCGCAGGUAUGGAACAAAAAGGAGAUAU
.....(((((.....(((......)))(((..(((((([[[[[)))..))).))).....))))).((((..................)))).......].]]]]...
bpRNA_RFAM_31306
CGACUGCAUCAAGAGGGGCAUAGCCCCACCAACCGCCCACUCCGGGAACGGUGGUCCAAAUGAUGCGCCAAUGGCUCUGCAUUGCAGACAUGGAACAUAAAGGAGACCU
.....(((((.....((((....))))(((..(((((([[[[[)))..))).)))......)))))...((....................)).......].]]]]...
bpRNA_RFAM_3131
AGAGAACUGCUGUGUUGGUGACAGCCUUUCUCUAGUGCUCUGAUCUGACUCUCUUUCGACAUGGGGUGACUGUCGUGCUGGUGCCGUAAACCGGUCUCGUAACCGGAAACGAAUCCUCUCGAAAUCUUUCGCCCCUUCUGGUAACUCCAGGUCGACCACAGAUUGGCGCACGGCAUGGUGGUUCAACC
.((((((((((((((.(((................((((.((((((................(((.(((((...(((((((....((...(((((......)))))..)).......)))))))..))))).))).............))))))))))...........)))))))))))))))))..
bpRNA_RFAM_31318
UCGAAACAUCAAGAGCAGUAUUAAUCUGCACCAACCGAGCACGACAGCCACGGUGGUCAAGAUACGAUGUGGAAAUAAGUUUAAUUUCAAAAAUAAGUCUUUAUGA
.....(((((.....((((.....).)))(((..(((((([[[[[[))).))).)))........))))).((((.........)))).........]]]]]]...
bpRNA_RFAM_31325
GUUCAACAUCAGGAGUUGGACAGUAGUGUCCACGCCAACCUGCCUACUCGGGCAAGGUGGUAUCGCUUAUGCAGAUGGGGCCUUUAAACAAGGUAACCAAACGAGUCCCU
.....(((((....(.(((((......))))))(((..(((((([[[[[[))).))).)))............))))).((((.......)))).......]]]]]]...
bpRNA_RFAM_31327
CUUCAGCAUCAAGAGUUGGGCCGACGCCCAGCGCCAACCUGCUUCCCGAGCAAGGUGGCUUUCUUCCUUCGGAAGAAGAUGUGGCCGGUCCGGCAACUAAACGGGACAAG
.....(((((....(.(((((....)))).))(((..((((((.[[[[))).))).)))..................))))).((((...)))).......]]]].....
bpRNA_RFAM_31358
UCCAAAGAGGACGAUUUGACUGAUUGCAACCUCUCGAAAAAAGUGCUAAAAUGUAUGCC
.....(((((...(((.....)))[[[[.))))).........]]].]...........
bpRNA_RFAM_31428
CAAUUAGGGGAAAGAUUUGGCUGCUUGCGACCUCGUUUUCAUGUUCGAAAACAUAAACGCUAAAACAGUGUAC
.....(((((....(((.....)))[[[[.)))))......................]]].]...........
bpRNA_RFAM_31433
AUUAAAGUGGACUGAUUUGCGAUGCUAUGUCAAAAAUAGCGGGAUUGCAACCACGUAAAAAAAAGUGCUAAUGUUUCUACA
.....(((((....(((.........................)))[[[[.)))))..........]]].]...........
bpRNA_RFAM_31456
UUUCCAGAGGACAGAUUUGACUGAUUGCAACCUCUGAUCCGGAAUUGAGCCGGACCACCAAAAAUGCUAAAGCAGUUUGC
.....(((((....(((.....)))[[[[.))))).............................]]].]...........
bpRNA_RFAM_31470
CCGCUGUCACAACGGCUUCCUGGCGUGGCGGCUAAACCAUUUUAUCGGAGCA
...(((((((..(((....)))..))))))).....................
bpRNA_RFAM_31482
UGAAACUUAUAACGGCUACCUGAAGUAAGUUUUUUUAUAAACGGAGCA
...(((((((..(((....)))..))))))).................
bpRNA_RFAM_31490
UGUCCCCCUCAACGGCUUCCUGACGAGGCGGGCUUAACAAAACGGAGCA
...(((((((..(((....)))..))))).)).................
bpRNA_RFAM_315
UCCGGCGAUCAUAUCUUAAAGGUUAUACCUGUUCCCAUUCCGAACACAGCAGUCAAGCUUUAAGAGCCGAUGAUAGUGCCCACCAGCGUGAAAGUAGGUCUUGCCGGAU
.((((((((....((.(((((...((..((((((.......))..))))..))....))))).))(((.((..(.((....)).....)..).)).)).))))))))..
bpRNA_RFAM_31524
UGUUGCAUCGCGCAACAUGCCAAUGUCCUGGUGAUUUGAGAGGGACGCCUUCGGGUAAUCGCAUGCCAAUGUCACCUUAGCCUGAGAGGUGACGCCUUCGGGCGGUACCCUCGUUAACCUUUGAAAAUGGGGAUCGCAACAGAGUUGCGGUAAGGUCUCU
..((((......))))..............((((((..........(((....)))))))))................((.(...........(((....))))).)........((((((..............(((.......)))...))))))...