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id stringlengths 17 44 | sequence stringlengths 30 1.85k | secondary_structure stringlengths 30 1.85k | family stringclasses 8 values | subfamily stringclasses 39 values |
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group_I_intron-IB1-Sja.m.COX1,1_p1 | GUUCUUCGGUCAAGGAUGGCCGUUGUUAAUUGUAAAAUUAACUUUAUAUUGAGCUAUAUGCGAGAAAUUUUAUGUAUUCACAAUAAUGUUAGUUACUAUUUUUUUAAGUCUUUAUUUCUUUAAAGCCAAUCUAGUUAAAAAAUUAACAUUAGUAAGAAAUAAUUCGCAGAUAACCAAACACUAUUUAUUUUCAUCUUCUUUAAAUCAUACUUUGAUUUUUAGGAGAUUUAAAUGUAGUUUAGUAGGAAUCUCAGAGACUACACGCUCAACAACCAAUUUUANNNNNUAGAAUUGGUUGAAAAAAUAGUCCAACAUUACAGCUAUCUAUUAAUGACUAAAUAAUUCAAUAGUCUAGAUUAAUUAUACUUUAAUCAUCAUUAAUAUGUUAGCAUUAAACCCCUACAUCCUGAGG | ......((((((.((())))))..(((((((....)))))))......((((((....((((((..(((((.(((....))).(((((((((((((((..((.......(((((......)))))..))..))))....).))))))))))....)))))..))))))(((..((....(((((..((((..(((((((..((((((.....))))))..)))))))..)))))))))......)).)))...(.(((((...))))))((((((((((((.....))))))))))))......)))))).........((((..(((((((((........................................)))))))))...))))..............)))..... | group_I_intron | IB1 |
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group_I_intron-IB4-Spo.m.COX1,2_p10 | AUCCAGAGGUCAAUUUAAUAGGCCUCUUAACGUUGCUAUAUGCUGGAACUACUUGANNNNNUGUUUUAAAUACUCCAAGAAAAACACCAGAUUAGUGUUUAUUUUUAUAGUAAAAAUGUUAAAACAAUUAAGUAUAUCAGCAGGUAACCUUUUGAAUAAGGGAACCUCAGAGACUUUACGCAACGAAAUCACAACAAANNNNNUUUGUUGAGAUUUAAAAUAAAGUCCUAACAAGGGUAUAAAGCUUUUGAGUGUUAAAAAGAAUAAAUCACCUUUUGGGUGAUUUUUUUUCAUUAACCAAAAUUUAUUGUUAUAUUUUA | ....((((((.......(((())))))...((((((....((((((...(((((((.....(((((((((((((..(((((((((((.......)))))).)))))..))))....).)))))))).)))))))..))))))(((..((((......))))..)))...(.(((((...))))))(((((.(((((((.....))))))).)))))......))))))((((((((((.....)))))))...(((((..((((.((((((((.....)))))))).))))..)))))...).....)).))))...... | group_I_intron | IB4 |
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group_I_intron-IC1-Acy.S1506-2 | AAGGUUUGAAGUAAGAAAUCCUUCCUUUGGGUGACGCUUAUGAGAAGCCUUUGUGGCCCCGCAAGGGGUAUCCGCCGCGACUAUAAAGAAUGGGAAGCGGGUAUUAAAUCGCAAGUCGGCAGCCAGCUGUGCUGCUGGCCACACUUUCGAAUUGCGGGAACACCCUAAAGCACGCCUCUACCAACCGGCUUGAAGAAAUUCACCUGGGGCCAAUGAUAACGACAUUGGGUAAGGUAAGAAUGAGGUUUGAUGAGAACCGCUAUGGUUUGAAAUGGGCAAUCCGCAGCCAACCCCUAAGGCGAGUCCUGCUAUGGGAGAGGUUCACAGACUAAGUGGAAGUGGGCUGGAUUUCCAGCUUAAGAUAUAGUCGGGCCUGGCGCGAAAGCGCCCGGGAAAGGUCACAGAAAUCGUAACAAAACCGUUCCGUAGGUGAACC | (((((((.....................................)))))))(((((((((....))))(((((((.....((((.....))))...))))))).....))))).(((((((((.......)))))))))..((((((((...((((((....(((.....((.(((((((((..((((..((((....)))).))))..((((((.......))))))....)))).....))))).))....(((((.....))))).....)))...))))))(((.....((...(..........)...))...)))...(.(((((..))))))))((((((....)))))).......))))))((((((((((....))).)))))....((.((.......)).))....))................ | group_I_intron | IC1 |
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group_I_intron-IC3-Ade.c.trnL | UUGGUAUGGAAACAUACUAAGUGAUAACUUUCAAAUUCAGAGAAACCCUGGAAUUAAAAAUGGGCAAUCCUGAGCCAAAUCCUGUUUUUAGAAAACAAAUCAAAAUCAAAUAAAGGGUUCAGAAAGCAAGAAUAAAAAAGGAUAGGUGCAGAGACUCAAUGGAAGCUGUUCUAACGAAUAGNNNNNUUGGACGAGAAUAAAGAUAGAGUCCCAUUAUACAUGUCAAUAUCAAUACCGACAAAAAUGAAAUUUAUAGUAAGAGGAAAAU | ((((((((....)))))))).......((((((...((((.((..(((.............)))...))))))(((..(((((.((((((.........((..((((........))))..)).........))))))))))).)))...(.(((((..)))))).((((((......(((.....)))....))))))......))))))(.((.(((.((((............))))...............))).)))...... | group_I_intron | IC3 |
group_I_intron-IC3-Afe.c.trnL | UUGGUAUGGAAACAUACUAAGUGAUAACUUUCAAAUUCAGAGAAACCCUGGAAUUAAAAAUGGGCAAUCCUGAGCCAAAUCCUGUUUUUAGAAAACAAAUCAAAAUCAAAUAAAGGGUUCAGAAAGCAAGAAUAAAAAAGGAUAGGUGCAGAGACUCAAUGGAAGCUGUUCUAACGAAUAGNNNNNUUGGACGAGAAUAAAGAUAGAGUCCCAUUAUACAUGUCAAUAUCAAUACCGACAAAAAUGAAAUUUAUAGUAAGAGGAAAAU | ((((((((....)))))))).......((((((...((((.((..(((.............)))...))))))(((..(((((.((((((.........((..((((........))))..)).........))))))))))).)))...(.(((((..)))))).((((((......(((.....)))....))))))......))))))(.((.(((.((((............))))...............))).)))...... | group_I_intron | IC3 |
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group_I_intron-IC1-Agr.S516-1 | CUGGUUAACAUAGCAGCCAGAUGUUGAUAUCAUACAAUGCAUGAGAGAGAGUACUAUUAGUGCUCUCUUGUUGUGGUGUGUGAUAUUGGCAGAAAGUUGGAGAUAAGCACCAACUGUACAACCGUAAAUUGCGGGAAACCCCUAAAGCCUAUUCUACCGCGGCUAUGAGGAUGACUCAUAGUGCAGCAGGUGCGGAUAACGCCCACCGGAUGGUAAUAACGAAUAGGAUGACCUUNNNNNAAGGUCACAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCUCCCAUAUGUUGGGAGAAGGUUCAGAGACUAUAAUCGGAUGGGCGCAAGCUUAAGGUAUAGUCCACUCCCACUUCGAAAGAGGUGCUAUAAAGCUAUUAAGAAGUUUGCUUACUUCCUAGGGUUUUAUAGAUCCGUUGCUUGUAUACAAUAUACGUGUAUACAUCAAUACCCCAAGAGGAAAUGCUUGGUUGGAAGGAUGGUAGCAAGGGCCAGCAGCCGCGGU | (((((..........))))).(((((((((((((((.((((...((((((((((.....))))))))))..)))).))))))))))))))).(.((((((.(.....).)))))).).((.(((.....((((((....(((.....(((((((((((((.((((((((.....))))))))...)).((((.((......))))))....)))....).))))))).(((((((.....)))))))....)))...))))))(((...(((((.......)))))..)))...(.(((((....))).))(((....))).......)))))).((..((((((....))))))((((((((((.(((.(((((......))))).)))))))))))))((((((((..((((((((.......)))))))).)))).(((((((........)))))..))..)))).......))................ | group_I_intron | IC1 |
group_I_intron-IC1-Agr.S516-2 | CUGGUUAACAUAUUAUCAGCCAGAUGUUGAUAUCAUACUACACACACAACAGAGUACUACUAGUGCUGCUCUCUUGUUGUUGUGGGUGUGUGAUAUUGGCAGAAAGUUGGAGAUAAGCACCAACUGUACACCGUAAAUUGCGGGAAACCCCUAAAGCCUAUUCUACCGCGGCUAUGAGGAUGACUCAUAGUGCAGCAGGUGUGGAUAACGCCCACCGGAUGGUAAUAACGAAUAGGAUGACCUUNNNNNAAGGUCGCAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCUCCCAUAUGCUGGGAGAAGGUUCAGAGACUAUAAUCGGAUGGGCGCAAGCUUAAGGUAUAGUCCACUCCCACUUCGAAAGAGGUGCUAUAAAACUAUUAAGAAGUUUGCUUACUUCCUAGGGUUUUAUAGAUCCGUUGCUUGUAUAUAUACAACAUACGUGAGUGUGUGGUGUAUACAUCAAUACCCCCAAGGAAAUGCUUGGUUGGAAGAUGGUAGCAAGGGCCAGCAGCCGCGGU | (((((.............))))).((((((((((((((....((((((((((((((.((....)).))))))...))))).)))...))))))))))))))...((((((.........)))))).((..(.((....((((((....(((.....(((((((((((((.((((((((.....))))))))...)).((((.((......))))))....)))....).))))))).(((((((.....)))))))....)))...))))))(((...((((((.....))))))..)))...(.(((((..)).)..))(((....))).......)))))).((..((((((....))))))((((((((((.....(((((......)))))....))))))))))....(((((.....(((((((.((((((....)))))).)))))))((((....((.(((((......)))))..))..))))))))).))................ | group_I_intron | IC1 |
group_I_intron-IC3-Aha.b.trnR_p1 | CAGGAUUCCUUGUUUAACAACUGGGCGUUGCAAUCGGAAACGGUGCAACGGAUCUGCUCAAAGUCGGGGAACGCUACGGCGCGCGUGCGUUGCCAAUCCCGAGCCAAGCCCCUGCCAAGGAAGGUGUAGAGACUGGAUGGGCAGCGCUAAGGGCCUUCAGCGCCUAAGGUGAAGGGACAGUCCAGACCACGAAGCCGAAGGGCGGCGGUGAAAGCCGAAGUGGUAUGAAUCCUGGGG | .......(((.(((....)))())).((((((.(((....)))))))))....((((((....((((((...((...(((((....)))))))...))))))(((...((........))..)))...(.(((((...))))))((((..((((.......))))..))))......))))))..(((((...(((....)))..((((....))))..)))))...)......... | group_I_intron | IC3 |
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Subsets and Splits
RNA Sequence & Family Statistics
Provides comprehensive statistical summary of protein sequence lengths and hierarchical distribution across families and subfamilies, revealing important dataset structure and abundance patterns for bioinformatics research.