Hugging Face's logo

Datasets:
scikit-fingerprints
/
MoleculeACE_chembl236_ki

Tasks:
Tabular Classification
Graph Machine Learning
Text Classification
Modalities:
Text
Formats:
csv
Size:
1K - 10K
Tags:
chemistry
biology
medical
Libraries:
Datasets
pandas
License:
Dataset card Data Studio Files
xet
 Community
Dataset Viewer
Auto-converted to Parquet Duplicate
SMILES
stringlengths
26
366
Ki
float64
-5
2
CC(c1ccccc1)N1CC[C@H]1[C@@H](N)c1cccc(Cl)c1
-4.592399
O=C(CCC(=O)NCC(=O)N[C@@H]1CC[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3CC2CC2)[C@H]1O5)NCC(=O)N[C@@H]1CC[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3CC2CC2)[C@H]1O5
-0.892095
Cc1ccc(C(c2ccc(C)cc2)N2CC[C@H]2[C@H](N)c2cccc(Cl)c2)cc1
-3.699924
O=C(CCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H]1CC[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3CC2CC2)[C@H]1O5)NCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H]1CC[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3CC2CC2)[C@H]1O5
-0.80618
COc1ccc([C@H](N)[C@@H]2CCN2C(c2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-3.465234
N[C@H](c1cccc(Cl)c1)[C@@H]1CCN1C(c1ccc(F)cc1)c1ccc(F)cc1
-3.870989
N[C@H](c1cccc(Cl)c1)[C@@H]1CCN1C(c1cccc(Cl)c1)c1cccc(Cl)c1
-3.432809
CN1CC[C@]2(c3cccc(O)c3)Cc3ccccc3C[C@]2(C)C1
-2.346353
N[C@@H](c1ccc(Cl)cc1)[C@@H]1CCN1C(c1ccccc1)c1ccccc1
-3.158061
O=C(CCC(=O)N[C@@H]1CC[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3CC2CC2)[C@H]1O5)N[C@@H]1CC[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3CC2CC2)[C@H]1O5
-1.079181
N[C@H](c1cccc(C(F)(F)F)c1)[C@H]1CCN1C(c1ccccc1)c1ccccc1
-3.52009
Cc1ccc([C@H](N)[C@@H]2CCN2C(c2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-3.268578
CCCCC(CCCC)N1CC[C@H]1[C@@H](N)c1cccc(Cl)c1
-4.502154
N[C@H](c1cccc(Cl)c1)[C@@H]1CCN1C(c1cccc(F)c1)c1cccc(F)c1
-3.680063
CC(=O)N[C@@H]1CC[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3C)[C@H]1O5
-2.845098
O=C(CCC(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H]1CC[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3CC2CC2)[C@H]1O5)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H]1CC[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3CC2CC2)[C@H]1O5
-0.690196
Cc1ccc([C@H](N)[C@@H]2CCN2C(c2ccccc2)c2ccccc2)cc1F
-2.802089
N[C@@H](c1cc(F)cc(F)c1)[C@@H]1CCN1C(c1ccccc1)c1ccccc1
-3.97923
N[C@H](c1cccc(Cl)c1)[C@@H]1CCN1C(c1ccc(Cl)cc1)c1ccc(Cl)cc1
-3.700098
N[C@H](c1cccc(Cl)c1)[C@@H]1CCN1C(c1ccc(Br)cc1)c1ccc(Br)cc1
-3.697839
CC(=O)N[C@@H]1CC[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3CC2CC2)[C@H]1O5
-1.579784
C[C@]12Cc3ccccc3C[C@@]1(c1cccc(O)c1)CCN(CCc1ccccc1)C2
-2.264818
N[C@@H](c1cccc(Cl)c1)[C@@H]1CCN1C(c1ccccc1)c1ccccc1
-3.921374
N[C@@H](c1ccc(Oc2ccccc2)cc1)[C@@H]1CCN1C(c1ccccc1)c1ccccc1
-3.88773
N[C@@H](c1cccc(F)c1)[C@@H]1CCN1C(c1ccccc1)c1ccccc1
-3.465829
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3c2cccn2C)c2ccccc2)cc1
-1.317436
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O
-0.929419
CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(N)=O
-3.829947
O=C1[C@@H](Cc2ccccc2)C[C@@]2(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]2(CCN3CC2CC2)[C@H]1O5
0.920819
CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(N)=O
-4.269513
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CC=C(C)C)c2cccc(O)c2)cc1
-0.305351
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2cccs2)c2ccc(OC)cc2)cc1
-0.120574
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2ccccc2Cl)c2cccc(OC)c2)cc1
-0.823474
CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(N)=O
-4.100371
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2ccccc2Cl)c2ccc(OC)cc2)cc1
-0.753583
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2[nH]cnc2C)c2ccccc2)cc1
-1.201397
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCO)c2ccccc2)cc1
-1.417804
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O
-4.176091
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O
-1.380211
NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1
-4.39794
O=C(NC1CC1)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-1.30103
O=C(NC1CCCCC1)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-2.965672
C=CCN1C2CCC1CC(=C(c1ccc(C(=O)NCC)cc1)c1cccc(OC)c1)C2
-0.161368
O=C(Nc1ccccc1)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-3.180986
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2c[nH]cn2)c2ccccc2)cc1
-0.588832
Cc1cc(O)cc(C)c1C[C@H](N)[C@@H](O)C/C=C/[C@H](O)[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)O[C@@H](Cc1ccccc1)C(N)=O
-1.322219
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2cccc(OC)c2)cc1
-1.296446
Cc1cc(O)cc(C)c1C[C@H](N)[C@@H](O)C/C=C/[C@H](O)[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@H](CO)Cc1ccccc1
-1.732394
Cn1c2c(c3c1[C@@H]1Oc4c(O)ccc5c4[C@@]14CCN(CC1CC1)[C@H](C5)[C@]4(O)C3)C[C@@]1(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4[C@@]1(CCN3CC1CC1)[C@H]2O5
-1.763428
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2c[nH]c3ccccc23)c2ccccc2)cc1
-1.374748
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3)c2ccc(O)cc2)cc1
-0.653213
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(N)=O
-3.509203
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2ccccc2Cl)c2cccc(O)c2)cc1
-0.320146
COCCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-2.012837
CNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-1.113943
O=C(Nc1nccs1)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-1.694868
CCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(N)=O
-4.149219
O=C(NCCF)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-1.50515
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-1.089905
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCOc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-1.802089
NC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-1.555094
CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(N)=O
-4.178977
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2cccs2)c2cccc(O)c2)cc1
0.818156
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(N)=O
-4.209515
Oc1ccc2c3c1O[C@H]1C4(CC[C@@]5(O)[C@@H](C2)N(CC2CC2)CC[C@]315)Oc1ccccc1O4
-1.176091
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(N)=O
-4.120574
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2ccccn2)c2ccccc2)cc1
0.065502
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3)c2cccc(OC)c2)cc1
-1.119256
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2cccc(O)c2)cc1
-0.617
Oc1ccc2c3c1O[C@H]1C4=C(C[C@@]5(O)[C@@H](C2)N(CC2CC2)CC[C@]315)C(c1ccccc1)C1=C(O4)[C@@H]2Oc3c(O)ccc4c3[C@@]23CCN(CC2CC2)[C@H](C4)[C@]3(O)C1
-1
CCCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-1.342423
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2ccccc2Cl)c2ccc(O)cc2)cc1
0.031517
CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O
-0.62941
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(N)=O
-4.130334
Cc1cc(O)cc(C)c1C[C@H](N)[C@@H](O)C/C=C/[C@H](O)[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)OCCc1ccccc1
-1.748188
CC(C)(C)NC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-2.546543
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(N)=O
-0.487138
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O
-0.919078
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CC=C(C)C)c2cccc(OC)c2)cc1
0.142668
C=CCN1C2CCC1CC(=C(c1ccc(C(=O)NCC)cc1)c1cccc(O)c1)C2
0.415669
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2cccs2)c2ccc(O)cc2)cc1
0.60206
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccc(O)cc2)cc1
-0.892095
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccc(OC)cc2)cc1
-1.052694
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@H](CCCN=C(N)N)C(N)=O
-3.780317
CCCCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3CCc2ccccc2)c2ccccc2)cc1
-1.692847
CCNC(=O)c1ccc(/C(=C2\C[C@@H]3CC[C@H](C2)N3)c2ccccc2)cc1
-0.738781
CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O
-0.991226
CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O
-0.959041
CCNC(=O)c1ccc(C(=C2CC3CCC(C2)N3Cc2cccs2)c2cccc(OC)c2)cc1
0.29243
CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O
-0.986772
Cc1cc(O)cc(C)c1C[C@H](N)[C@@H](O)C/C=C/[C@H](O)[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)O[C@H](CO)Cc1ccccc1
-1.230449
Oc1ccc2c3c1O[C@H]1c4sc5c(c4C[C@@]4(O)[C@@H](C2)N(CC2CC2)CC[C@]314)C[C@@]1(O)[C@H]2Cc3ccc(O)c4c3[C@@]1(CCN2CC1CC1)[C@H]5O4
-1.886491
NC1=NC([C@]2(N)CC[C@@]3(O)[C@H]4Cc5ccc(O)c6c5C3(CCN4CC3CC3)[C@H]2O6)=N[C@]12CC[C@@]1(O)[C@H]3Cc4ccc(O)c5c4C1(CCN3CC1CC1)[C@H]2O5
-2.262451
CCC(=O)NCCc1ccc2[nH]c3c(c2c1)C[C@@]1(O)C2Cc4ccc(O)c5c4[C@@]1(CCN2CC1CC1)[C@H]3O5
-0.494155
CCCCC(=N)NCCc1ccc2[nH]c3c(c2c1)C[C@@]1(O)C2Cc4ccc(O)c5c4[C@@]1(CCN2CC1CC1)[C@H]3O5
-1.582291
COc1ccc2c3c1O[C@H]1c4[nH]c5ccccc5c4C[C@@]4(O)[C@@H](C2)N(CC2CC2)CC[C@]314
-1.60206
CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(=O)N[C@H](C(=O)O)[C@@H](C)O
-1.146128
CCCCNC(=O)NCCc1ccc2[nH]c3c(c2c1)C[C@@]1(O)C2Cc4ccc(O)c5c4[C@@]1(CCN2CC1CC1)[C@H]3O5
-0.414973
CCC(=N)NCCc1ccc2[nH]c3c(c2c1)C[C@@]1(O)C2Cc4ccc(O)c5c4[C@@]1(CCN2CC1CC1)[C@H]3O5
-1.337659
CCCCC(=O)NCCc1ccc2[nH]c3c(c2c1)C[C@@]1(O)C2Cc4ccc(O)c5c4[C@@]1(CCN2CC1CC1)[C@H]3O5
-0.884795
End of preview. Expand in Data Studio

MoleculeACE ChEMBL236 Ki

ChEMBL236 dataset, originally part of ChEMBL database [1], processed in MoleculeACE [2] for activity cliff evaluation. It is intended to be use through scikit-fingerprints library.

The task is to predict the inhibitor constant (Ki) of molecules against the Delta-type opioid receptor target.

Characteristic Description
Tasks 1
Task type regression
Total samples 2598
Recommended split activity_cliff
Recommended metric RMSE

References

[1] B. Zdrazil et al., “The ChEMBL Database in 2023: a drug discovery platform spanning multiple bioactivity data types and time periods,” Nucleic Acids Research, vol. 52, no. D1, Nov. 2023, doi: https://doi.org/10.1093/nar/gkad1004. ‌

[2] D. van Tilborg, A. Alenicheva, and F. Grisoni, “Exposing the Limitations of Molecular Machine Learning with Activity Cliffs,” Journal of Chemical Information and Modeling, vol. 62, no. 23, pp. 5938–5951, Dec. 2022, doi: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c01073. ‌
Downloads last month
102
Size of downloaded dataset files:
250 kB
Size of the auto-converted Parquet files:
75.6 kB
Number of rows:
2,598