Spaces:
Sleeping
Sleeping
File size: 18,452 Bytes
2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 87c3fc4 1469b0c 2bb0244 1469b0c 8ba3a76 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 87c3fc4 2bb0244 87c3fc4 2bb0244 87c3fc4 2bb0244 87c3fc4 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c 2bb0244 1469b0c | 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 | # =====================================================
# 1. FIX sqlite3 CHO CHROMA (pysqlite3 hack)
# =====================================================
__import__("pysqlite3")
import sys
sys.modules["sqlite3"] = sys.modules.pop("pysqlite3")
# =====================================================
# 2. IMPORTS
# =====================================================
import os
import logging
import traceback
import gradio as gr
import pandas as pd
import docx2txt
from langchain_google_genai import ChatGoogleGenerativeAI
from langchain_chroma import Chroma
from langchain_community.document_loaders import PyPDFLoader
from langchain_text_splitters import RecursiveCharacterTextSplitter
from langchain_community.retrievers import BM25Retriever
from langchain.retrievers.ensemble import EnsembleRetriever
from langchain.chains import create_retrieval_chain, create_history_aware_retriever
from langchain.chains.combine_documents import create_stuff_documents_chain
from langchain_core.prompts import ChatPromptTemplate, MessagesPlaceholder
from langchain_core.messages import HumanMessage, AIMessage
from langchain_core.documents import Document
from langchain_huggingface import HuggingFaceEmbeddings
# =====================================================
# 3. CẤU HÌNH CHUNG
# =====================================================
# Lấy API key từ biến môi trường
GOOGLE_API_KEY = os.getenv("GOOGLE_API_KEY")
DATA_PATH = "medical_data" # thư mục chứa tài liệu
DB_PATH = "chroma_db" # thư mục chứa database Chroma
# Số lượt đối thoại gần nhất gửi vào LLM (mỗi lượt gồm 1 user + 1 bot)
MAX_HISTORY_TURNS = 6
# Chọn chiến lược truy vấn:
USE_BM25 = True # True = dùng hybrid (BM25 + Vector), False = chỉ dùng Vector
USE_MMR = True # True = dùng MMR cho retriever vector
# Logging cơ bản
logging.basicConfig(
level=logging.INFO,
format="%(asctime)s [%(levelname)s] %(message)s",
)
# =====================================================
# 4. HÀM LOAD TÀI LIỆU ĐA ĐỊNH DẠNG (PDF, DOCX, EXCEL, CSV, TXT, MD)
# =====================================================
def load_documents_from_folder(folder_path: str) -> list[Document]:
"""
Quét thư mục (kể cả subfolder), đọc các file hỗ trợ và trả về list Document.
"""
logging.info(f"--- Bắt đầu quét thư mục: {folder_path} ---")
documents: list[Document] = []
if not os.path.exists(folder_path):
os.makedirs(folder_path, exist_ok=True)
logging.warning(f"Thư mục {folder_path} chưa tồn tại. Đã tạo mới, tạm thời chưa có tài liệu.")
return []
for root, _, files in os.walk(folder_path):
for filename in files:
file_path = os.path.join(root, filename)
filename_lower = filename.lower()
try:
# 1. PDF
if filename_lower.endswith(".pdf"):
logging.info(f"-> Đang xử lý PDF: {file_path}")
loader = PyPDFLoader(file_path)
docs = loader.load() # mỗi trang = 1 Document
# Thêm metadata source gọn (chỉ tên file)
for d in docs:
d.metadata["source"] = filename
documents.extend(docs)
# 2. DOCX
elif filename_lower.endswith(".docx"):
logging.info(f"-> Đang xử lý Word: {file_path}")
text = docx2txt.process(file_path)
if text and text.strip():
documents.append(
Document(
page_content=text,
metadata={"source": filename}
)
)
else:
logging.warning(f"File Word rỗng: {filename}")
# 3. EXCEL (XLS, XLSX)
elif filename_lower.endswith((".xlsx", ".xls")):
logging.info(f"-> Đang xử lý Excel: {file_path}")
try:
df = pd.read_excel(file_path)
text_data = ""
for _, row in df.iterrows():
row_str = " | ".join(
f"{col}: {val}"
for col, val in row.items()
if pd.notna(val)
)
if row_str:
text_data += row_str + "\n"
if text_data.strip():
documents.append(
Document(
page_content=text_data,
metadata={"source": filename}
)
)
else:
logging.warning(f"File Excel rỗng: {filename}")
except Exception as e:
logging.error(f"Lỗi đọc Excel {filename}: {e}")
# 4. CSV
elif filename_lower.endswith(".csv"):
logging.info(f"-> Đang xử lý CSV: {file_path}")
try:
df = pd.read_csv(file_path)
text_data = ""
for _, row in df.iterrows():
row_str = " | ".join(
f"{col}: {val}"
for col, val in row.items()
if pd.notna(val)
)
if row_str:
text_data += row_str + "\n"
if text_data.strip():
documents.append(
Document(
page_content=text_data,
metadata={"source": filename}
)
)
else:
logging.warning(f"File CSV rỗng: {filename}")
except Exception as e:
logging.error(f"Lỗi đọc CSV {filename}: {e}")
# 5. TEXT / MARKDOWN
elif filename_lower.endswith((".txt", ".md")):
logging.info(f"-> Đang xử lý Text/Markdown: {file_path}")
text = ""
try:
with open(file_path, "r", encoding="utf-8") as f:
text = f.read()
except UnicodeDecodeError:
logging.warning(f"Encoding UTF-8 thất bại, thử Latin-1 cho {filename}")
with open(file_path, "r", encoding="latin-1") as f:
text = f.read()
if text and text.strip():
documents.append(
Document(
page_content=text,
metadata={"source": filename}
)
)
else:
logging.info(f"-> Bỏ qua file không hỗ trợ: {file_path}")
except Exception as e:
logging.error(f"❌ LỖI khi đọc file {filename}: {e}")
logging.debug(traceback.format_exc())
logging.info(f"--- Hoàn tất load tài liệu. Tổng số Document: {len(documents)} ---")
return documents
# =====================================================
# 5. XÂY DỰNG VECTORSTORE + RETRIEVER
# =====================================================
def build_vectorstore_and_corpus(embedding_model):
"""
- Nếu đã có DB Chroma: load lên.
- Nếu chưa: đọc folder, split, tạo DB mới.
Trả về (vectorstore, splits).
"""
from shutil import rmtree
splits: list[Document] = []
vectorstore = None
# TH1: có DB cũ
if os.path.exists(DB_PATH) and os.listdir(DB_PATH):
try:
logging.info("--- Tìm thấy ChromaDB cũ, đang load... ---")
vectorstore = Chroma(
persist_directory=DB_PATH,
embedding_function=embedding_model
)
existing = vectorstore.get()
if existing.get("documents"):
for text, meta in zip(existing["documents"], existing["metadatas"]):
splits.append(Document(page_content=text, metadata=meta))
logging.info(f"Tải lại corpus từ DB, tổng số chunk: {len(splits)}")
else:
logging.warning("ChromaDB không chứa documents. Sẽ rebuild.")
splits = []
except Exception as e:
logging.error(f"Lỗi đọc DB cũ: {e}. Xóa và rebuild lại.")
logging.debug(traceback.format_exc())
rmtree(DB_PATH, ignore_errors=True)
splits = []
vectorstore = None
# TH2: chưa có dữ liệu trong splits → đọc file gốc, split và tạo DB mới
if not splits:
logging.info("--- Đang đọc tài liệu gốc để tạo index mới... ---")
documents = load_documents_from_folder(DATA_PATH)
if not documents:
logging.error("Không tìm thấy tài liệu nào trong thư mục medical_data.")
return None, []
# Chunking
text_splitter = RecursiveCharacterTextSplitter(
chunk_size=800, # nhỏ hơn cho câu trả lời cụ thể hơn
chunk_overlap=150
)
splits = text_splitter.split_documents(documents)
logging.info(f"Đã split thành {len(splits)} chunks.")
# Tạo Chroma mới
logging.info("--- Đang mã hoá embedding vào ChromaDB... ---")
vectorstore = Chroma.from_documents(
documents=splits,
embedding=embedding_model,
persist_directory=DB_PATH
)
return vectorstore, splits
def get_retriever():
"""
Khởi tạo retriever:
- Load hoặc tạo ChromaDB.
- Tuỳ cấu hình: dùng hybrid (BM25 + Vector) hoặc chỉ Vector.
- Có thể dùng MMR để tăng đa dạng context.
"""
logging.info("--- Đang tải model Embedding (HuggingFace) ---")
embedding_model = HuggingFaceEmbeddings(
model_name="sentence-transformers/paraphrase-multilingual-MiniLM-L12-v2"
)
vectorstore, splits = build_vectorstore_and_corpus(embedding_model)
if vectorstore is None or not splits:
logging.error("Không thể khởi tạo retriever vì không có dữ liệu.")
return None
# Vector retriever (có thể dùng MMR)
if USE_MMR:
logging.info("Sử dụng Vector Retriever với MMR.")
chroma_retriever = vectorstore.as_retriever(
search_type="mmr",
search_kwargs={"k": 8, "lambda_mult": 0.7}
)
else:
logging.info("Sử dụng Vector Retriever với similarity search.")
chroma_retriever = vectorstore.as_retriever(
search_kwargs={"k": 8}
)
# Nếu không muốn dùng BM25 -> trả về luôn retriever vector
if not USE_BM25:
logging.info("Chỉ dùng retriever Vector (không dùng BM25).")
return chroma_retriever
# Tạo BM25 retriever từ corpus
logging.info("Khởi tạo BM25 Retriever từ corpus (hybrid search).")
bm25_retriever = BM25Retriever.from_documents(splits)
bm25_retriever.k = 8
# Ensemble retriever: BM25 + Vector
ensemble_retriever = EnsembleRetriever(
retrievers=[bm25_retriever, chroma_retriever],
weights=[0.4, 0.6]
)
logging.info("Đã khởi tạo Ensemble Retriever (BM25 + Vector).")
return ensemble_retriever
# =====================================================
# 6. LỚP CHATBOT DEEPMED
# =====================================================
class DeepMedBot:
def __init__(self):
self.retriever = None
self.rag_chain = None
self.ready = False
if not GOOGLE_API_KEY:
logging.error("GOOGLE_API_KEY chưa được thiết lập trong biến môi trường.")
return
try:
self.retriever = get_retriever()
if self.retriever is None:
logging.error("Không khởi tạo được retriever.")
return
self.llm = ChatGoogleGenerativeAI(
model="gemini-2.5-flash", # có thể đổi sang model mạnh hơn nếu muốn
temperature=0.3,
google_api_key=GOOGLE_API_KEY
)
self._build_chains()
self.ready = True
logging.info("--- DeepMedBot đã sẵn sàng ---")
except Exception as e:
logging.error(f"Lỗi khởi tạo DeepMedBot: {e}")
logging.debug(traceback.format_exc())
self.ready = False
def _build_chains(self):
# 1. Prompt contextualize question
contextualize_q_system_prompt = (
"Dựa trên lịch sử trò chuyện và câu hỏi mới nhất của người dùng, "
"nếu câu hỏi liên quan đến ngữ cảnh trước đó, hãy viết lại nó thành một câu hỏi độc lập đầy đủ ý nghĩa. "
"Nếu không liên quan, giữ nguyên câu hỏi gốc. KHÔNG trả lời câu hỏi, chỉ viết lại."
)
contextualize_q_prompt = ChatPromptTemplate.from_messages([
("system", contextualize_q_system_prompt),
MessagesPlaceholder("chat_history"),
("human", "{input}"),
])
history_aware_retriever = create_history_aware_retriever(
self.llm, self.retriever, contextualize_q_prompt
)
# 2. Prompt trả lời y khoa an toàn
qa_system_prompt = (
"Bạn là trợ lý y tế DeepMed. Bạn hỗ trợ giải thích thông tin y khoa dựa trên tài liệu được cung cấp (Context) "
"và kiến thức y khoa chung của bạn.\n\n"
"QUY TẮC AN TOÀN:\n"
"- Nếu Context không đủ để trả lời chính xác, hãy nói bạn không chắc chắn và khuyên người dùng hỏi bác sĩ.\n"
"- Ưu tiên sử dụng thông tin trong Context. Nếu có mâu thuẫn giữa Context và hiểu biết của bạn, "
"hãy nói rõ và khuyên tham khảo nguồn chính thống mới nhất.\n\n"
"CÁCH TRẢ LỜI:\n"
"- Trả lời ngắn gọn, dễ hiểu.\n"
"- Nếu phù hợp, chia câu trả lời thành các mục: Tóm tắt, Chi tiết, Lưu ý.\n\n"
"Context:\n{context}"
)
qa_prompt = ChatPromptTemplate.from_messages([
("system", qa_system_prompt),
MessagesPlaceholder("chat_history"),
("human", "{input}"),
])
question_answer_chain = create_stuff_documents_chain(self.llm, qa_prompt)
# 3. Gộp thành RAG chain
self.rag_chain = create_retrieval_chain(
history_aware_retriever,
question_answer_chain
)
def chat(self, message: str, history: list[list[str]]):
"""
Hàm dùng cho Gradio:
- history: list[[user_msg, bot_msg], ...]
"""
if not self.ready:
return "❗ Hệ thống chưa sẵn sàng. Vui lòng kiểm tra lại API key và dữ liệu (medical_data)."
# Giới hạn lịch sử gửi vào LLM cho đỡ nặng
if len(history) > MAX_HISTORY_TURNS:
history = history[-MAX_HISTORY_TURNS:]
# Chuyển lịch sử Gradio sang LangChain messages
chat_history = []
for user_msg, bot_msg in history:
chat_history.append(HumanMessage(content=user_msg))
chat_history.append(AIMessage(content=bot_msg))
try:
response = self.rag_chain.invoke({
"input": message,
"chat_history": chat_history
})
answer = response.get("answer", "")
# Xử lý trích dẫn nguồn
references_text = self._build_references_text(response)
if references_text:
answer += "\n\n---\n📚 **Tài liệu tham khảo:**\n" + references_text
return answer
except Exception as e:
logging.error(f"Lỗi khi xử lý chat: {e}")
logging.debug(traceback.format_exc())
return "🤖 Xin lỗi, hệ thống gặp lỗi nội bộ. Bạn hãy thử lại sau ít phút."
@staticmethod
def _build_references_text(response) -> str:
"""
Gom nguồn trích dẫn:
- Gộp theo tên file.
- Nếu có số trang, liệt kê danh sách trang.
"""
from collections import defaultdict
if "context" not in response:
return ""
source_pages = defaultdict(set) # {source_name: {page1, page2, ...}}
for doc in response["context"]:
src = os.path.basename(doc.metadata.get("source", "Tài liệu không tên"))
page = doc.metadata.get("page", None)
if page is not None:
source_pages[src].add(page + 1)
else:
# Đảm bảo vẫn tạo key nếu chưa có trang
_ = source_pages[src]
lines = []
for src, pages in source_pages.items():
if pages:
pages_str = ", ".join(str(p) for p in sorted(pages))
lines.append(f"- {src} (Trang {pages_str})")
else:
lines.append(f"- {src}")
return "\n".join(lines)
bot = DeepMedBot()
def gradio_chat(message, history):
return bot.chat(message, history)
demo = gr.ChatInterface(
fn=gradio_chat,
title="🏥 DeepMed AI Pro - Trợ lý Y tế tại Trung Tâm Y Tế khu vực Thanh Ba",
description=(
"Chatbot hỗ trợ tra cứu thông tin y khoa từ kho tài liệu nội bộ.\n"
),
)
if __name__ == "__main__":
demo.launch() |