RAMTUNET-AgenticAI / README.md
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metadata
title: GBM Agentic AI v5  Neuro-Oncology Analysis
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🧠 Agentic AI v5 FIXED — GBM Multi-Modal Analysis

12 agents IA | RCMTUNetV4 | Digital Twin | Dempster-Shafer

Modèles HuggingFace utilisés

Repo Contenu
mayoula/RAMTUNET_VLM rcmt_unet_v4_final.pth + RAG WHO CNS 2021
mayoula/digital-twin-glioma-final ml_clinical_model.joblib + Gompertz
mayoula/RAMTUNET-AgenticAI Images PNG pré-calculées (mode démo)

Utilisation

  1. Uploadez les 4 modalités IRM au format NIfTI (.nii ou .nii.gz)
  2. Renseignez les informations patient (âge, KPS, ID)
  3. Cliquez sur Lancer l'analyse complète (GPU requis)
  4. Sans GPU → utilisez Charger la démo pour voir les résultats pré-calculés

Format IRM requis

  • Format : NIfTI .nii ou .nii.gz
  • Résolution : 1 mm isotropique
  • Modalités : FLAIR · T1 · T1CE (gadolinium) · T2
  • Orientation : BraTS 2021 standard (240×240×155 voxels recommandés)
  • Pré-traitement : skull stripping + co-registration recommandés

Corrections appliquées (v5 FIXED)

FIX Description
FIX-1 Image PNG 3-plans transmise au VLM (LLaVA-Med)
FIX-2 PDE Fisher-KPP tenseur réel → infiltration réelle
FIX-3 Consensus Dempster-Shafer mathématique strict
FIX-4 Dice/HD95 réels depuis evaluation_metrics.json
FIX-5 features=(24,48,96,192) synchronisé tous notebooks
FIX-6 Chargement joblib robuste (AttributeError géré)
FIX-7 FEATURE_COLS_V27 synchronisé notebook digital-twin
FIX-8 Prompt ACP identique notebook VLM cellule 9

Secrets requis (Space Settings → Variables and secrets)

HF_TOKEN       = hf_xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
GROQ_API_KEY   = gsk_xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx

Hardware recommandé

  • Minimum : t4-small (GPU 16 GB VRAM) — segmentation + DT
  • Recommandé : a10g-small (GPU 24 GB VRAM) — pipeline complet avec LLaVA-Med
  • CPU only : mode démo uniquement (images pré-calculées depuis HF repo)