HPP eval_agent — v2(纵向 + E3 + 数据驱动亚组)

因果验证引擎(cev)+ HPP 合成伪数据集。v2 是 v1 的更新版:把数据从"单时间点横截面"升级为"纵向多期",并让下游 planner 能规划纵向/剂量反应分析、且按数据自发发现亚组。

Causal-validation engine (cev) + a synthetic HPP pseudo-dataset. v2 upgrades the data from single-timepoint cross-sectional to longitudinal, and unlocks longitudinal / dose-response planning plus data-driven subgroup discovery in the downstream planner.

v1 → v2 改了什么(3 件事)

1. 纵向伪数据集(v11) — pseudo_dataset_v11_longitudinal/

32 张队列横截面表从"每人 1 行"扩成跨 research_stage 的多行:00_00_visit(基线)/01_00_visit(≈+2y)/02_00_visit(≈+4y),带真实随访流失(100% / 60% / 34%)。
events.parquet 重建,覆盖全部 3000 参与者 × 各自随访期。
schema/dtype 与 v1 严格一致;stage0 与 v1 基线逐字相同。
构建脚本 build_v11_longitudinal.py(seed=20260618,可复现);漂移为中性 AR(1),非真实纵向效应。

2. E3-纵向接入(planner 切片) — validation_agent/core/feasibility_judge.py + cev/core/planner.py

feasibility 新增 longitudinal 块:角色表 ≥2 个时间点 → E3 可行(e3_change / e3_lmm),与横截面 E1 推断独立、不冲突。
planner 新增确定性 single_timepoint 门控 + 提示词:多时间点时规划纵向 / within-subject 变化的 dose_response(T5)。

3. 数据驱动亚组发现(退役固定 D01–D09 白名单) — validation_agent/core/data_inventory.py

通用扫描所有 cohort 重叠的扁平表,按数据属性(基数 / 分层规模 / dtype)发现可分层字段,产出 subgroup_candidates(无任何实体名清单)。
效果:planner 自发提出绝经状态 / 体成分 / 合并症等分层(此前缺失)。

仓库内容

目录	说明
`cev/`, `validation_agent/`, `orchestrator/`	代码:因果验证引擎 + 下游管线
`pseudo_dataset_v11_longitudinal/`	纵向伪数据集(v11)
`metadata/`, `casual_edges_0529/`	字段字典 / 元数据 + 边(edge)输入
`cev/runs_v11_*`, `cev/runs_v10_batch/`	运行结果(intent_battery / feasibility / data_inventory)
`docs/`	下游管线设计(SPEC / REBUILD_DESIGN / B0–B11 / validation_agent 设计)
`build_v11_longitudinal.py`	纵向数据集构建脚本(可复现)

重要说明 / 限制

目前是 planner 切片(planner slice):只"规划"分析,不执行统计。 e1_logistic / e3_lmm 等估计器尚未在执行层接入(validators/registry.py 仅 e1_logistic)。
数据是合成的(pseudo),非真实 HPP 参与者。 随访值是种子化 AR(1) 漂移,不含真实纵向效应 → 适合测管线/结构,不适合估计真实效应量。
提示词改动后,回放测试 fixtures 需用 regenerate_fixtures.py 重录(已知,非回归)。
旧固定亚组目录 D01–D09 暂保留为兼容子集,尚未彻底删除。

快速复现

# 1) 重建纵向数据集(需要 v1 的 pseudo_dataset_v10 作为输入源)
python build_v11_longitudinal.py            # seed=20260618 → pseudo_dataset_v11_longitudinal/

# 2) 跑单条边的 planner 切片(需 ANTHROPIC_API_KEY + claude CLI)
python -m cev.cli run-edge --pmid 22683134 \
  --edge_id "EV-2012-PerreaultPreDiabetesRegression#23" --out-root cev/runs_v11_e3

v2 发布:2026-06-19。v1(eval_agent,横截面/单时间点基线 —— v10 批量分析报告所基于的版本)请保持冻结以便前后对照。