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|
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|
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|
Universidad Nacional de Colombia sede Medellin, Biociencias
|
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|
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|
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|
Potato yellow vein virus
|
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|
Closteroviridae
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|
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Colombia
|
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|
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|
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|
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2020-07-01
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Colombia
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2020-07-01
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Potato yellow vein virus
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Crinivirus
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Closteroviridae
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Colombia
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Solanum quitoense
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2018
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Potato yellow vein virus isolate PYVV_quitoense_M6 segment RNA 2, complete sequence
|
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| 48,680
|
MN088360.1
|
Potato yellow vein virus
|
Gallo,Y., Gutierrez,P., Marin,M.
|
Universidad Nacional de Colombia sede Medellin, Biociencias
|
Colombia
|
2020-02-12
|
PYVV/Antioquia/May5
|
Potato yellow vein virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,829
|
GenBank
| null |
Colombia
|
Colombia
|
Solanum lycopersicum
| null |
2018
| null | null |
Potato yellow vein virus isolate PYVV/Antioquia/May5 segment RNA1, complete sequence
|
CTATTAGCTTTCCAGCGAAATAGTACTTGAAATCAACAGGTTGCCGCTGCTAGTCAGTTTCAACCATTTTCAGATTGCCGCTGCCAGTCAGTTTCAATCACACAAACCAAAACAAACCAAACCACACAAGGCTTGCCAGTACCCTAAACTGATCTTAATTATGAGCCTCATAAACAACCACTGTGGCAAAGTGGGCAACTCCACCCCCCTCTCCGGGAAATTGTCGTTGTACCATTATACCCCCATAGGAAAAACCATAAAAAAATATTTAAAGTGCAATAAAATCAGTACCAGAAACTTTCATGATGTTGAAAGGTTGAAAGTGCTGTACTCGTATTTTAATATTCAAATAAGAAAGTACAAGAGGATGCCAGCAGTAATTAGGCATAAATTTGGAGCAGATTATTTGTCCATCAATAAATTCATAGACTCACTAATGCAAACTGAAGTGGGTTCTAAAGAAAAATCTGAGCCAGTTGTTAATGAGGTGATTTCAGGAACCACAGTGTATGGTGATGGATATAAAGTCATCCGATATGGAAATCCTCTCTTTGTAGATGTTTTTATATATTTTAATAGGTATGATGATGATAATCCTGATTTCAAATACAGGATTTTGTTTTCTAATAAAGATAAAAATAATAACCGTCGGAATGAGGTCATGTGTTCCGTGGACCATAAAGTCGGCGAAATCAAAGAATTCTGCCGCAAATTTACTCTATTCTCGAGTCTGTCCAGCAACCAGTTTCAAGCTCAATGCTTACTGCTGTCAGTAGTAGAGAAGATCCCACAGTTCAAAAGTCTAGTACGCTATCATGAGAATAGTGTCTTCAAGACGAACATGAAATACATCAGAGAAAAATTCAAAAGATTGTCTGATGATATGAAATCTCTATTGGATAGAGGTGTTAAAGTCGGCAAGAAGAACTCGCCGAAGAGAGAAGTCCAAACTCCATACAAAGCTGACTATCCATATGACGTCAAGTTGACAATCTCGGACTGCGGGGAAGAACAATTTGTGATAAAACACAAATCCGGAAAAGAAAAACTGGTGAGAAATGATGGTAATTCTCTCAAGAATCTGTACAATGCTACCTTATACCAAGGGTACTACATTCTCCACGAAGCTGCGAGAACACCATTCGGCTCCAGATTCAAGTCACACCAGAATGAATACTGCTGGATGGACGCCTTCGCTGTCGATGGAAGGAAGATTCCAGATCGCGTGATACCATACCCTAGACTCAAGTTGAGATATCTGCTTTCATTAGGTATGGGTCATATACTACGTGGAAAGATGGAGGTCATCAGTGATAAAATTGTTCACTTCGACCCACGTATATCCCGCAACACTAAGAAAGTCAACCCAGAATTCATGGTTGGTATGAAACTAGATGGATCAGCGGGAATAAGCACTGGCAATTTAGACACATTCTTTGACGATATATGTGATGGCATCATGCAACAGACCACCGTTAGAGCGGAGAATGATCTGACTACTAATGTTATCAGACGTGTATCGAACATGCTGAATGAGAAACTTTCAGTCAAACGTGAACTGATAGTAAAAGTATGTTTGACTTCAGCTGAGAAGAAGATGTTGTGCGAAGTATTTCCAGACATTGTAATTGGTTTTGAAGACAAGTCTTACTCGTCTCACGCGTTGTTCACGGCCATGAGAGACTGTGAAAATTACTACATGTCAAAGAAGTTTTCGTGTAAGAACTTTATTGACGCTGGAGGTGACGTAGTACGCTACCTGAAAACAGATGCCAGACACGTGCATGTCTGTGCTCCTGTGGTTGACATAAAAGACTCAGCTAGGCAAATGCGTCGTAGTAGTCAGATCGACAACCTACGAGGGGTGACTGAGACCATCACTATGTGCAACAAATTGTGCCAAGACTGCGATGTGGAATCACAGAATATAGTCGCCGTCCAAGTTTATGATATGAGCCTGAACGATATGGCAGATAGCATTAGGTCTCATAAAAGTAAAACATTCGACTTCTCAATTATAATTCCGCCAGAGATAATGGAAGAAGATTGTGATGTAAATTTGTTTAATGGCAGTCTGAGGGTGAAGTCAGAAAAGGACAAGATTCACTATCTGTACGGCAAGGCTGGTGAAGTATACTCTCATGATATACAACCACTGAGAGATATCTTGCAAACTCAGATTTTCTGTAGACATGGGGTTATATACAAAAAGACTCTGGAGATGTCTCGTAATGGATTGCACTTCTTTTCAGTGATACCGTGTGAGAACTTCAAACCCGGGACATATTCAGTATCAACTTACTACTCTAAGTCCGAGACTGGCACCGTGCTTATGAGCATACCTGATAAAGACAGATTCGGTGAAACTGTCAACCATAAAGTCAGAGTTGATAGATCTATAGTAACCCACCTGATAGAATATGTCATGAACTCAGCTCTCCGTGTAGATGACAAAGCTGTTGAATACTTGATATCTCAATTCCGATCTAGGAAGAATATATCTATCAAAGGGGGTAAAGTGGTGCAGATACCGTTCGACCTTCCAATGAACTTATATCCAGGGTTTCTAGGGATCATTTTGGGTGAAGGATTAAGGTTGAGAGAAAAGTCAATGTACTTTGCTAAGGTTAGTTATTACAAACATTACATGCCCTCAATATTTGTGGTCATCATGGCACTACTCAACCGATTAATTAACACTGCTAGGAGGAATGCCTATAAAGTATGCTTGAGTGTGTTACGCTCCTTTTGTTCCGAAGATTTCATTAACGATATGATATTCGGAGACAAAAGAATTCGTGAGTTGGACGAGATCGTTGAATTCAAACAGACTATAACTGTGATCGGAGAAAAAGGCGTTCAAAACGTTATGAAGAACTCGTTTGACAGATTCATCAAAGAATCCGATGAACGGATTTTTGATGTGGACAAAAATTTATATCCAATAGACGAAAAGTTTTCGCATGATGAGTATGAAGTCATGAGAGAATTGATCTCAAGTGGTGGTGGTGCGTCAGAAGGTTTTCAGTTCATAGATTTCAGTGCTTACTCAAAAATCTTCAACTGTGTTTCAAAAGTCTTTAGTACTCCCAAAGCAGTTAGTGATGTCGCAGGTCTCATCAGCAAGTTGATATCGTATCTCCTGACAAAGGGTCTAAATACCTTGACTGGGATCAAAGAACTCATAATTTCATTGATCAAAATGATTCGGAAAGGGGTGTCGTCTGGGTCAGAAGCGTTGAAAGGTGTTATAAACAGATGCAAAAATAGAGTAAATAATATGGTCAAGAACAAAGAAGATGACATCCTCAACAAACTCGAAAAGTTCTTGGAGGAAGATGATGAAGTAGATAATACTAAATCGTCTTTAGTTCGCAGAAGAGCAAAAACTCCACGTAATTCGGTGAGTAATAGCAAAGAACTCACAAACAGCACTGTGTTGGTGAGTAACTTGCTTTACAAAGATGGGAAATATCTTCTTGGTACTTACATCACGCAGACTCCGAAATGGTTTAGCTTTGACATTCCATCAGTGAACAAATTCGAAGAAGAACAGACAGAAAGCCTATTAGATGATTATTTGAACACCTCCTTTGATCTGGTGTCTCTAGGCGGGGGTAGTAAGATCTCACCAATTGGAAAATTTCTTCAAAAACTTCGCATTTTATTGAAGAAATTGAAATTGAGAGTCATTCAGATGTATCGGAGATCGTTTGACATTTTCGACGGCTGCAAGGAGATTTGTGTAGATGGAATGAATTTGCTAAAACTCTTCTTTCTCGATACAGATACGATAGACTTGCTGATCAAAGGGTCTAGCTGTATCCTTTCATATGTCATCACAAGTCTCATCTTTGGTGGCTTCAAAATAAGTAAGGTGCTATTCATGACCTTATTCGTATTCTCTATAAAGCTTTCGGGAATAGAGAAGAAATATATAGGTTACGATTGGATAACTTCTCAATTATCAGATAACTTGTTTGCCGGACATCTGAGCAATCTGAGTTACATTCCAACGAAATTTTTGTTTAGGAGGTATATTGAATCTAAATTGAAAGTTTCTGGTTCAAAATCTGCGATTATATCTGAGCAATGTAAAGATCTTATAGCCAAAGATTTGGGTTATAGAAAATATGCTGAATATGTGACACCGAACATGATAAAGATCATTGGTATGATCTCACTGATGTTCAGCTTGAACTTCCCGATCTTTACTCTCAACATGATTATTATACTGACATTACTGAATGACTTGTCAAAATATCTGAAGACAGTAGTTGTCAACATGAATGTCCACTTGAGTTACGCTTCAATTCTTGAGAAGTCCAACAGTTCAGAGCGATTCAGAAAATTGAAGAATATACTGAGACATAAATTCGAAACCAAGAAGAAAGAGGATTCAATGCGAGATGAAGATGGCTTTGATCCGCAAACTAGAGTGGGTTTCAAACAAGACTCCAATGATGAGGATATTGAAGTAGTTTTCGACTACGATGGATCCTATACTGAGACCAGGAAACCGACTACCTGTAATGCAGCTAGTACCTCCGGGAAGATAGATTGGGCCGACCTTGAAAACGATTCCGTAGAAAGTTTAGATGATGAAAATCTTAACTTCTCAAAGTTGGTACCTACTAGTGATCGAAGTAAAATTTGTCCGAAGACACAAGTTGGATTGAGCAACGTGATTTTGACTTATCCATCATCCGCTTCAGTGATGTTTTTGGAAAGTACCAATGAAGTGACCAACTGTCTTAATGAGTTCTACTATCTAGAGACACAGAGACTGTCAATTGAACTTGGGAAGATTGATAATCTTGTCAGAACATTCAACAGTATATACAATGAATCAATGAAGTTTAAAGATGCGGTGTGGCATCTTCGTAACAGAATGGATGATTCAACAATATACATTTCAAATAACGGTAAGGAATGGCACAGATTGAAAAGAGGAGATGTGGATTTCAAGTTATTGGAGGGAAGTACAAAATTCGACTTGA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| 53,921
|
MN088361.1
|
Potato yellow vein virus
|
Gallo,Y., Gutierrez,P., Marin,M.
|
Universidad Nacional de Colombia sede Medellin, Biociencias
|
Colombia
|
2020-02-12
|
PYVV/Antioquia/May5
|
Potato yellow vein virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 5,296
|
GenBank
| null |
Colombia
|
Colombia
|
Solanum lycopersicum
| null |
2018
| null | null |
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|
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Potato yellow vein virus
|
Sierra,A., Gallo,Y., Estrada,M., Gutierrez,P., Marin,M.
|
Universidad Nacional de Colombia sede Medellin, Biociencias
|
Colombia
|
2020-01-01
|
C
|
Potato yellow vein virus
|
Crinivirus
|
Closteroviridae
|
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|
GenBank
| null |
Colombia
|
Colombia
|
Solanum tuberosum
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2018-04-01
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Potato yellow vein virus isolate C segment RNA1, complete sequence
|
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|
Potato yellow vein virus
|
Sierra,A., Gallo,Y., Estrada,M., Gutierrez,P., Marin,M.
|
Universidad Nacional de Colombia sede Medellin, Biociencias
|
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|
2020-01-01
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
Powassan virus
|
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|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-07-26
| null |
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
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| 10,839
|
RefSeq
| 1
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| 9,011
|
OP244702.1
|
Powassan virus
|
Lange,R.E., Dupuis,A.P., Ciota,A.T.
|
New York State Department of Health, Arbovirology Laboratories
|
USA
|
2023-04-04
|
19065-059
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,248
|
GenBank
| null |
USA: New York
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2019
| null | null |
Powassan virus isolate 19065-059, complete genome
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| 16,918
|
OP265689.1
|
Powassan virus
|
Lange,R.E., Maffei,J.G., Koetzner,C.A., Ngo,K., Dupuis,A.P., Prusinski,M.A., Backenson,B., Vogel,C.B.F., Grubaugh,N.D., Kramer,L.D., Ciota,A.T.
|
New York State Department of Health, Arbovirology Laboratories
|
USA
|
2023-04-04
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75-1702
|
Orthoflavivirus powassanense
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Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,248
|
GenBank
| null |
USA: New York
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
1975
| null | null |
Powassan virus isolate 75-1702, complete genome
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ATGATGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGCAAGCTTAAAGTGACCGCAAATAAGTCGCGACCAGCAACGAGCCCAATGCCAAAGGGCTTCGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATTCTTTGGCACGCCGTGACAGGCACGGCCAGACCCCCAGTGCTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCACTGCGCCAGGCGGAGGCTGCTCTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATCGGGAACTTGATGCAGAGTCTTCATATGAGAGGGCGTCGCAGGTCAGGTGTGGACTGGACTTGGACTTTTTTGACGATGGCGTTGATGACCATGGCCATGGCAACCACCATCCACCGGGACAGGGAAGGATACATGGTTATGCGGGCCAGCGGAAGGGACGCTGCAAGCCAGGTCAGAGTACAAAACGGAACGTGTGTCATTCTGGCAACAGACATGGGGGAGTGGTGTGAAGATTCAATCACCTACTCTTGCGTCACGATTGACCAGGAGGAAGAACCTGTTGACGTGGATTGCTTCTGCCGAGGTGTTGATAGGGTTAAGTTGGAGTATGGGCGTTGTGGAAGGCAAGCTGGATTTAGGGGAAAGAGGTCCGTGGTTATTCCAACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGTCATGCATGGCTTAAAGGTGACAATATCCGAGATCATGTCACCCGAGTCGAGGGCTGGATGTGGAAGAACAAGCTTCTAACTGTCGCCATTGTGGCCTTGGCTTGGCTTATGGTTGATAGTTGGATGGCCAGAGTGACAGTCATCCTCTTGGCGTTGAGTCTGGGACCAGTGTACGCCACGAGGTGCACGCATCTTGAGAACAGAGATTTCGTGACAGGAACTCAAGGGACCACTAGAGTGTCCCTAGTCTTGGAACTTGGAGGTTGCGTGACCATCACAGCTGAGGGCAAGCCATCCATTGACGTATGGCTTGAGGACATCTTTCAGGAAAGCCCGGCCGAAACCAGAGAGTATTGCCTGCACGCCAAACTGACCAACACAAAAGTGGAGGCTCGTTGTCCTACCACCGGACCGGCAACACTTCCGGAGGAGCATCAGGCTAACATGGTGTGCAAGAGAGACCAAAGTGACCGCGGATGGGGGAACCACTGCGGGTTTTTTGGGAAAGGCAGCATAGTGGCTTGTGCAAAGTTCGAATGTGAGGAAGCAAAAAAGGCTGTAGGCCATGTTTATGACTCCACAAAGATCATATATGTTGTCAAGGTTGAGCCTCACACAGGGGATTACCTGGCTGCAAATGAGACCAACTCAAACAGGAAGTCAGCACAGTTCACAGTGGCATCTGAGAAAGTGATCCTGCGGCTCGGCGACTATGGAGATGTGTCGCTGACGTGTAAAGTGGCAAGTGGGATTGATGTCGCCCAAACTGTGGTGATGTCACTCGGCGGCAGTAAGGACCACCTGCCTTCTGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTTGAGGACTTGGCTTTACCCTGGAAACACAAGGACAACCAAGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAATTTGGACCACCACATGCTGTGAAAATGGATGTTTTCAATCTGGGGGACCAGACTGCCGTGCTGCTCAAATCGCTGGCAGGAGTTCCGCTGGCCAGTGTGGAAGGCCAGAAATACCACCTGAAAAGCGGCCATGTCACTTGTGATGTAGGACTGGAAAAGCTGAAACTGAAGGGCACAACCTACTCCGTGTGTGACAAAGCAAAGTTCAAATGGAAGAGGGTTCCTGTGGACAGCGGTCATGACACAGTGGTTATGGAGGTGTCATACACAGGAAGCGACAAGCCATGTCGGATCCCGGTGCGGGCTGTGGCACATGGTGTCCCAGCGGTCAATGTGGCCATGCTCATAACCCCCAACCCGACCATTGAAACAAGTGGTGGCGGATTCATAGAGATGCAGTTGCCACCAGGGGACAACATCATCTATGTGGGAGACTTGAGCCAGCAGTGGTTTCAGAAAGGTAGCACTATTGGTAGAATGTTTGAAAAAACCCGTAGGGGATTGGAAAGGCTCTCTGTGGTTGGGGAACATGCATGGGACTTTGGCTCAGTAGGCGGGATATTGTCTTCTGTGGGGAAGGCAATCCACACAGTGTTGGGGGGAGCTTTCAACACCCTCTTTGGGGGGGTTGGATTCATCCCTAAGATGCTGCTGGGGGTCGCTCTGGTCTGGCTAGGGCTCAATGCCAGAAATCCAACAATGTCCATGACGTTCCTTGCTGTGGGGGCTTTGACATTGATGATGACAATGGGAGTTGGGGCAGATTATGGATGTGCAATTGACCCAGAAAGGATGGAAATCCGTTGTGGAGAGGGGCTTGTCGTGTGGAAAGAGGTGTCGGAATGGTATGATGGTTACGCTTATCATCCAGAATCACCTGACACGCTTGCACAGGCTCTTAGAGAGGCATTTGAAAGAGGTGTCTGTGGGGTCGTGCCCCAAAACAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGAAGTACTGCCCCAGAACTCAATTTGGTGTTGAGTGAGGGAGAAGCAAACCTGACCATTGTGGTGGACAAAACAGATCCGGCAGACTACAGAGGAGGCACCCCCATGGTTCTAAAGAAAACTGGAAAAGAGAGCAAGGTGTCTTGGAAGAGCTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTTCCCGACAGCCCCAGGCGTATGATGATGGGGGTTGACGGAGTCGGGGAGTGTCCCCTGTATAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGTGTGGGCCTACGCACGAAAGTTTTCCTGGACCTGCGTGGTGACGCCTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGAGCAGCCGTGAAGAATGGCAAAGCCATCCACACGGACCAAAGCATGTGGATGAGCTCCTTTCGGAATGATACGGGCACGTACATCCATGAGCTCATTCTCACCGACCTCAGGAATTGTACATGGCCAGCAAGCCACACTATCGACAATGATGGAGTTGTGGACTCCCATCTTTTCCTGCCAGTTACCCTTGCTGGGCCCAGGTCAAAGTATAACAGGATACCTGGGTACAGTGAACAAACAAAAGGACCATGGGACCAGACTCCTCTCAGAGTGGTCCGGGACCATTGCCCCGGAACAAGTGTGAGGATTGACAGTCATTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGTGGAAAGATCATTCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCCTGTGAGCTGCCACCAGTGACGTTCCGCAGTGGCACGGATTGCTGGTATGCCATGGAGATCAGGCCAGTCCACTCGCAGGGTGGCCTGGTGCGATCCATGGTCGTGGCTGACAACGGCGCCTTGCTTAGTGAGGGAGGAATCCCTGGTTTGGTGGCAGTGTTCGTATTGATGGAATTCCTTTTGAGAAGGCGTCCGGGATCTGTCATGTCCATCTTGTGGGGAGGTATATTAATGCTGGGCTTGTTGGTCACAGGTCTCGTGAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTACATCATAGCAGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAATTAGGACCAGAGACTATGGTTCTTGTGATGCTGCAGGCGGTCTTCAACATGCGTACATGTTATCTCATGGGGTTTCTTGTCAAGAAGGTGATCACCACACGCGAGGTGGTGACTGTTTACTTCTTGCTCCTGGTCCTTGAGATGGGGATACCGGAGATGAACCTCGGACACCTCTGGGAATGGGCTGATGCACTGGCCATGGGGCTGCTCATAATCAAGGCCAGCGCGATGGAAGATCGTAGAGGCCTGGGATTCTTGCTGGCTGGGCTCATGACACAAAGACATCTGGTCGCTGTCCATCATGGCTTGATGGTATTTCTCACTGTGGCTTTGGCGGTGGTGGGACGAAATATTTACAATGGACAAAAAGAGAGGAAAGGACTGTGTTTCACAATCCCCCTGGCCTCACTGCTTGGTGGCTCCGGCTCCGGATTGCGCATGCTGGCCTTATGGAAATGTCTTGGGGGTCGTGGCAGACGGAGTCTCAGTGAGCCCCTTACTGTAGTGGGGGTTATGTTGGCCATGGCCAGTGGACTACTACGACATTCATCCCAAGAGGCTCTTTTGGCCCTTTCTGCAGGATCCTTTCTCATCTTGATGTTGATCCTGGGGACCCGTAGGCTCCAGCTGACAGCGGAATGGGCCGGAGTGGTGGAGTGGGACCCTGAGCTGGTCAATGAAGGAGGTGAGGTGAGCTTGAAGGTCAGACAGGATGCCATGGGGAACTTGCACCTGACAGAGGTAGAACGGGAGGAACGCCGTTTGGCCTTATGGCTTGTGTTCGGCCTACTGGCGTCGGCTTGTCACTGGTCCGGAATACTGGTCACAATGGGGGCTTGGACAGCTTACGAACTTTTCTCATCCACGCGGAGAACTGATTTGGTCTTCTCAGGGCAGTTGCCTGATCAAGGGGAAAAACGTTCTTTTGACATCAAGGAAGGTGTGTACCGCATATATGCCCCCGGGTTCTTCTGGGGTTATCGCCAGATAGGTGTGGGATATGGAACAAAAGGAGTCTTGCACACCATGTGGCATGTAACAAGAGGAGCCGCCCTCAGTGTGGAGGGAGCTATATCAGGACCATACTGGGCGGATGTACGTGAAGATGTGGTCTGTTATGGGGGGGCCTGGGGCTTAGACAAAAAATGGGGAGGTGAAGTCGTTCAGGTACATGCATTCCCTCCGGACAGTGGACATAAAGTCCATCAATGCCAGCCAGGAAAGTTAAACCTTGAGGGAGGGAGAGTTCTGGGGGCCATCCCGATAGACCTTCCACGTGGCACTTCAGGCAGCCCGATCATTAATGCACAGGGAGATGTGCTGGGTCTGTACGGCAATGGTCTGAAATCAAATGATGTCTACATCAGTAGTATCGCTCAGGGCAATGTCGAAAAGAGTCGCCCTGA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| 16,920
|
OP265690.1
|
Powassan virus
|
Lange,R.E., Maffei,J.G., Koetzner,C.A., Ngo,K., Dupuis,A.P., Prusinski,M.A., Backenson,B., Vogel,C.B.F., Grubaugh,N.D., Kramer,L.D., Ciota,A.T.
|
New York State Department of Health, Arbovirology Laboratories
|
USA
|
2023-04-04
|
46-001
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,245
|
GenBank
| null |
USA: New York
|
USA
|
Ixodes cookei
| null |
2018
| null | null |
Powassan virus isolate 46-001, complete genome
|
ATGACCACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGCAAGCTTAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACCAGCAACGAGCCCAATGCCAAAGGGCTTCGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATTCTTTGGCACGCCGTGACAGGCACGGCCAGACCCCCAGTGCTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCACTGCGCCAGGCGGAGGCTGCTCTGAAGAAGATAAAGAGAGTCATCGGGAACTTGATGCAGAGCCTTCACATGAGAGGGCGCCGCAGGTCAGGTGTGGACTGGACTTGGACTTTTTTGACGATGGCGTTGATGACCATGGCCATGGCAACCACCATCCACCGGGACAGGGAAGGATACATGGTTATGCGGGCCAGTGGAAGGGACGCTGCAAGCCAGGTCAGGGTACAAAACGGAACGTGCGTCATCCTGGCAACAGACATGGGAGAGTGGTGTGAAGATTCAATCACCTACTCTTGCGTCACGATTGATCAGGAGGAAGAACCTGTCGACGTGGACTGCTTTTGCCGAGGTGTTGATAGAGTTAAGTTAGAGTATGGACGCTGTGGAAGGCAAGCTGGATCTAGGGGGAAAAGGTCCGTGGTCATTCCAACACATGCACAAAAGGACATGGTCGGGCGAGGTCATGCATGGCTTAAAGGTGACAATATCCGAGATCATGTCACCCGAGTCGAGGGCTGGATGTGGAAGAACAAGCTTCTAACTGCCGCCATTGTGGCCTTGGCTTGGCTCATGGTTGATGGTTGGATGGTTAGAGTGACTGTTATCCTCTTGGCGTTGAGTCTGGGGCCAGTGTACGCCACGAGGTGCACGCATCTTGAGAACAGAGATTTTGTGACAGGAACTCAAGGGACCACCAGAGTGTCCCTGGTCCTGGAACTTGGAGGCTGCGTGACTATCACAGCTGAGGGCAAGCCATCCATTGATGTATGGCTCGAAGACATCTTTCAGGAAAGCCCGGCTGAAACCAGAGAATACTGCCTGCATGCCAAATTGACCAACACAAAAGTAGAGGCTCGCTGTCCCACCACCGGACCAGCGACACTTCCGGAGGAGCATCAGCCTAATATGGTGTGCAAGAGAGACCAAAGCGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGGTTTTTTGGGAAAGGCAGCATAGTGGCTTGTGCAAAGTTTGAATGTGAGGAAGCAAAAAGGGCTGTGGGCCACGTCTACGACTCCACAAAGATCACGTATGTTGTCAAGGCTGAGCCCCATACAGGGGATTACTTGGCTGCAAATGAGACCAATTCAAACAGGAAATCAGCACAGTTTACGGTGGCATCCGAGAAAGTGATCCTGCGGCTCGGCGACTACGGAGATGTGTCACTGACGTGTAAAGTGGCAAGTGGGATTGATGTCGCCCAAACTGTGGTGATGTCACTCGGCAGCAGCAAGGACCACCTGCCTTCTGCATGGCAAGTGCACCGTGATTGGTTTGAGGACTTGGCCCTGCCCTGGAAACACAAGGACAACCAAGATTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAATTTGGACCACCACATGCTGTGAAAATGGACGTTTTCAATTTGGGGGACCAGACGGCTGTGCTGCTCAAATCGCTGGCAGGAGTCCCGCTGGCCAGTGTGGAGGGCCAAAAATATCACCTGAAAAGCGGCCATGTTACTTGTGATGTGGGACTGGAAAAGTTGAAACTGAAAGGCACAACCTACTCCATGTGTGACAAAGCAAAGTTCAAATGGAAGAGAGTTCCTGTGGACAGCGGCCATGACACAGTAGTCATGGAGGTGTCATACACAGGAAGCGACAAGCCCTGTCGGATCCCGGTGCGGGCCGTGGCACATGGTGTCCCAGCGGTTAATGTAGCCATGCTCATAACCCCCAACCCAACCATTGAAACAAATGGTGGCGGATTCATAGAAATGCAGCTGCCACCAGGGGATAACATTATCTATGTGGGAGACCTTAGCCAGCAGTGGTTTCAGAAAGGCAGTACTATTGGTAGAATGTTTGAAAAAACCCGCAGGGGATTGGAAAGGCTCTCTGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGCTCAGTAGGCGGGGTATTGTCTTCTGTGGGGAAGGCAATCCACACGGTGCTGGGTGGAGCTTTCAACACCCTTTTTGGGGGGGTTGGATTCATCCCTAAGATGCTGCTGGGGGTTGCTCTGGTCTGGTTGGGACTAAATGCCAGGAATCCAACGATGTCCATGACGTTTCTTGCTGTGGGGGCCTTGACACTGATGATGACAATGGGAGTTGGGGCAGACTATGGATGTGCCATTGACCCAGAAAGGATGGAAATCCGCTGTGGAGAAGGGCTTGTTGTGTGGAAAGAGGTGTCGGAATGGTATGACGGCTACGCCTATCATCCAGAATCACCGGACACGCTTGCACAGGCTCTTAGAGAGGCCTTTGAAAGAGGCGTTTGTGGGGTCGTGCCCCAAAACAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGAAGCACTGCTCCGGAGCTCAACTTGGTGCTGAGTGAGGGAGAAGCAAACTTGACCATCGTGGTAGATAAAACAGATCCGGCAGACTATAGGGGAGGCACTCCCATGGTTCTAAAGAAGACTGGAAAAGAGAGCAAGGTGTCCTGGAAGAGCTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTTCCTGATAGCCCCAGGCGCATGATGATGGGGGTTGACGGAGTTGGGGAGTGCCCCTTGTATAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAGTTTGGAGTGGGCCTACGCACGAAAGTGTTCTTGGATCTGCGTGGTGAAGCTTCAAAAGAGTGTGATACAGGAGTGATGGGAGCAGCCGTGAAGAATGGCAAAGCCATCCACACGGATCAAAGTATGTGGATGAGCTCCTTTCGGAATGACACGGGCACGTACATCCATGAGCTCATTCTCACCGACCTCAGGAACTGCACATGGCCAGCAAGTCACACTATTGATAATGATGGAGTTTTAGACTCCCATCTTTTCTTGCCAGTCACCCTTGCTGGGCCCAGGTCAAAGTACAACAGGATACCTGGGTACAGTGAACAAGTGAGAGGACCATGGGACCAGACTCCTCTGAGGGTGGTCCGGGACCATTGCCCTGGAACAAGTGTGAGGATTGACAGCCACTGTGACAAGAGAGGAGCTTCAGTCAGAAGCACCACAGAAAGTGGAAAGATCATTCCAGAGTGGTGCTGCCGGGCCTGTGAGCTACCACCGGTGACATTCCGCAGTGGCACGGATTGCTGGTACGCCATGGAAATCAGGCCAGTCCACTCGCAGGGCGGCTTGGTGCGTTCCATGGTAGTGGCTGACAATGGTGCCTTGCTTAGTGAGGGAGGAGTTCCTGGTTTAGTGGCAGTGTTTGTATTGATGGAATTCCTTTTGAGGAGGCGTCCGGGATCTGTCATGTCCATCTTGTGGGGAGGCATATTAATGCTGGGCTTGCTGGTCACGGGCCTCGTGAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTATGTCATAGCAGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAATTGGGACCAGAGACCATGGTTCTTGTGATGCTGCAGGCGGTCTTCAACATGCGCACATGCTATCTCATGGGTTTTCTTGTCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTCTACTTCTTGCTATTGGTCCTTGAGATGGGGATACCGGAGATGAACCTCGGACACCTCTGGGAATGGGCTGATGCGCTGGCCATGGGGTTGCTCATAATCAAGGCCAGCGCAATGGAAGATCGCAGAGGTTTGGGATTCCTGCTGGCTGGGCTCATGACACAAAGACACTTGGTCGCTGTCCATCATGGTTTGATAGTATTTCTCACTGTGGCCTTGGCGGTAGTGGGACGGAATATCTACAATGGACAAAAAGAGAGGAAAGGACTGTGTTTCACAGTCCCCCTGGCCTCACTACTTGGTGGCTCCGGCTCCGGATTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGTCTTGGGGGTCGTGGTAGACGGAGCCTCAGTGAGCCCCTTACCGTGGTGGGGGTCATGTTGGCCATGGCCAGTGGACTACTACGACATTCATCCCAAGAGGCTCTTTTGGCCCTTTCTGCAGGATCCTTTCTCATTTTGATGCTGATCCTGGGGACCCGTAGACTCCAGCTAACGGCGGAATGGGCCGGAGTGGTGGAGTGGAACCCTGAGCTGGTCAATGAGGGAGGTGAGGTAAGCTTGAAGGTCAGACAGGATGCCATGGGGAACTTGCACTTGACAGAGGTGGAACGGGAGGAGCGCCGTTTGGCCTTATGGCTTGTGTTCGGCCTACTGGCATCGGCTTATCATTGGTCCGGAATATTGGTCACAATGGGGGCCTGGACAGTTTATGAGCTTTTCTCATCCACGCGGAGAACTGATCTGGTTTTTTCAGGGCAGTTGCCTGACCAAGGGGAAAAACGTTCCTTTGACATCAAAGAAGGCGTATACCGTATATACGCCCCTGGGCTCTTCTGGGGTTACCGCCAGATAGGTGTGGGGTATGGAACGAAAGGAGTCTTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCCGCCCTCAGCGTGGAGGGGGCCATATCAGGACCATACTGGGCGGATGTGCGTGAAGACGTGGTCTGCTATGGGGGGGCCTGGGGCTTGGACAAAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTACACGCATTCCCTCCGGACAGTGGACACAAAATCCATCAATGCCAGCCAGGAAAGCTGAACCTTGAGGGGGGGAGAGTTCTGGGGGCCATCCCGATAGACCTCCCACGTGGTACTTCAGGTAGCCCGATCATCAATGCACAGGGAGATGTGCTGGGTCTGTACGGCAATGGTCTGAAATCAAATGATGTTTACATCAGTAGCATTGCTCAGGGCAGTGTTGAAAAAAGTCGCCCTGAGAT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CTCACATGGAAGACAAGCAGACAGTGGATGAGTGGAGAGACATCCCCTACCTGCCAAAAACACAGGACCTGGTATGTTCCTCACTTGTTGGGAGAAAGGAGAGGGCAGAATGGGCTAAGAACATCTGGGGCTCAGTGGAGAAGGTCAGGAAGCTCATTGGACCAGAAGACTACAGAGACTACTTATCAAGCATGGACAGACATGACCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCGATAATCTAA
| 16,921
|
OP265691.1
|
Powassan virus
|
Lange,R.E., Maffei,J.G., Koetzner,C.A., Ngo,K., Dupuis,A.P., Prusinski,M.A., Backenson,B., Vogel,C.B.F., Grubaugh,N.D., Kramer,L.D., Ciota,A.T.
|
New York State Department of Health, Arbovirology Laboratories
|
USA
|
2023-04-04
|
63-002
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,248
|
GenBank
| null |
USA: New York
|
USA
|
Ixodes cookei
| null |
2018
| null | null |
Powassan virus isolate 63-002, complete genome
|
ATGATGACCACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGCAAGCTTAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGGCCAGCAACGAGCCCAATGCCAAAGGGCTTCGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATTCTTTGGCACGCCGTGACAGGCACGGCCAGACCCCCAGTGCTAAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCATTGCGCCAAGCGGAGGCTGCTTTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATCGGGAACCTGATGCAGAGTCTTCACATGAGAGGGCGTCGCAGGTCAGGTGTGGACTGGACTTGGACTTTTTTGACGATGGCGTTGATGACTATGGCCATGGCAACCACCATCCACCGGGACAGGGAAGGATATATGGTTATGCGGGCCAGTGGAAGGGACGCTGCAAGCCAGGTTAGAGTACAAAACGGAACGTGTGTCATTCTGGCAACAGACATGGGAGAGTGGTGTGAAGATTCAATCACCTACTCTTGTGTCACGATTGACCAGGAGGAAGAACCTGTTGACGTGGACTGCTTCTGCCGGGGTGTTGATAGGGTTAAGTTGGAGTATGGGCGTTGTGGAAGGCAAGCTGGATCTAGGGGAAAAAGGTCCGTGGTTATTCCAACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGCCATGCTTGGCTCAAAGGTGACAACATCCGAGATCATGTCACTCGAGTCGAGGGCTGGATGTGGAAGAACAAGCTTCTAACTGTCGCCATTGTGGCTTTGGCTTGGCTTATGGTTGATAGTTGGATGGCCAGAGTGACAGTCATCCTCTTGGCGTTGAGTCTGGGACCAGTGTATGCCACGAGATGCACGCACCTTGAGAACAGAGATTTCGTGACAGGAACTCAAGGGACCACTAGAGTGTCCCTAGTCCTGGAACTTGGAGGTTGTGTGACCATCACAGCTGAGGGCAAGCCATCCATTGACGTATGGCTCGAGGACATCTTTCAGGAAAGCCCGGCTGAAACCAGAGAATATTGCCTGCACGCCAAATTGACCAATACAAAAGTGGAGGCTCGTTGTCCTACCACCGGACCGGCGACACTTCCGGAGGAGCATCAGGCTAACATGGTGTGTAAGAGAGACCAAAGTGACCGCGGGTGGGGGAACCACTGCGGGTTTTTTGGGAAAGGCAGCATAGTGGCTTGTGCAAAGTTCGAATGTGAGGAAGCAAAAAAGGTTGTAGGCCATGTTTATGACTCCACAAAGATCACATATGTTGTCAAGGTTGAGCCTCACACAGGGGATTATTTGGCTGCAAATGAGACCAACTCAAACAGGAAGTCAGCACAGTTTACGGTGGCATCTGAGAAAGTGATCCTGCGGCTCGGCGRTTACGGAGATGTGTCGCTGACGTGTAAAGTGGCAAGTGGGATTGATGTCGCCCAAACTGTGGTGATGTCACTCGGCAGTAGCAAGGATCACCTGCCTTCTGCATGGCAGGTGCACCGTGACTGGTTTGAGGACTTGGCTTTGCCCTGGAAACACAAGGACAACCAAGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTCGTGGAATTTGGACCACCACATGCTGTGAAAATGGATGTTTTCAATCTGGGGGACCAGACTGCCGTGTTGCTCAAATCGCTGGCAGGAGTTCCGCTGGCCAGTGTGGAAGGACAGAAATACCACCTGAAAAGCGGCCACGTCACTTGCGATGTAGGACTGGAAAAGCTGAAACTGAAAGGCACAACCTACTCCATGTGTGACAAAGCAAAATTCAAATGGAAGAGAGTTCCTGTGGACAGCGGTCATGACACAGTGGTCATGGAAGTGTCATACACAGGAAGCGACAAGCCATGTCGGATCCCGGTGCGGGCTGTGGCACATGGTGTCCCAGCGGTCAATGTGGCCATGCTCATAACCCCCAACCCGACCATTGAGACAAATGGTGGCGGATTCATAGAGATGCAGTTGCCACCAGGGGACAACATCATCTATGTGGGAGACCTTAGCCAGCAGTGGTTTCAGAAAGGTAGTACCATTGGTAGAATGTTTGAAAAAACCCGCAAGGGTTTGGAAAGGCTCTCTGTGGTTGGGGAACATGCATGGGACTTTGGCTCAGTGGGCGGGATACTGTCTTCTGTGGGGAAGGCAATCCACACAGTGCTGGGAGGAGCTTTCAACACCCTCTTCGGGGGGGTTGGATTTATCCCTAAAATGCTGCTGGGGGTCGCTCTGGTCTGGCTGGGGCTTAATGCCAGAAATCCAACAATGTCCATGACGTTTCTTGCTGTGGGGGCTTTGACACTGATGATGACAATGGGAGTTGGGGCAGATTATGGATGCGCAATTGACCCAGAAAGGATGGAAATCCGTTGTGGAGAAGGGCTTGTCGTGTGGAAAGAGGTGTCGGAATGGTATGACGGTTACGCTTATCATCCAGAATCACCTGACACGCTTGCACAGGCTCTTAGAGAGGCATTTGAAAGAGGCGTTTGTGGGGTCGTGCCCCAAAACAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGAAGCACCGCCCCAGAACTCAATTTGGTGTTGAGTGAAGGAGAAGCAAACCTGACCATTGTGGTGGACAAAACAGATCCGGCAGATTACAGAGGAGGCACCCCCATGGTTCTAAAGAAAACTGGAAAAGAAAGCAAGGTGTCTTGGAAGAGCTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTTCCTGACAGCCCCAGGCGCATGATGATGGGGGTTGACGGAGTTGGGGAGTGTCCCTTGTATAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGTGTGGGCCTACGCACGAAAGTTTTCTTGGACCTGCGTGGTGACGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGAGCAGCCGTGAAGAATGGCAAAGCCATCCACACGGACCAAAGTATGTGGATGAGCTCCTTTCGGAATGACACGGGCACGTACATCCATGAGCTCATTCTCACCGACCTCAGGAACTGTACATGGCCACCAAGTCACACTATCGACAATGATGGAGTTGTGGATTCCCATCTTTTCCTGCCAGTTACCCTTGCTGGGCCCAGGTCAAAGTACAACAGGATACCTGGGTACAGTGAACAAACAAAAGGACCATGGGACCAGACCCCCCTCAGAGTGGTCCGGGACCATTGCCCCGGAACAAGTGTGAGGATTGACAGTCATTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGTGGAAAGATCATCCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCCTGTGAGCTACCACCAGTGACGTTCCGCAGTGGCACGGATTGCTGGTATGCTATGGAGATCAGGCCAGTCCACTCGCAGGGTGGCCTGGTGCGTTCCATGGTAGTGGCTGACAACGGCGCCTTACTTAGCGAGGGAGGAGTCCCTGGCTTGGTGGCAGTGTTCGTATTGATGGAATTCCTTTTGAGAAGGCGTCCGGGATCTGTCATGTCCATCTTGTGGGGAGGCATACTAATGCTGGGCTTGTTGGTCACAGGTCTCGTGAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTACATCATAGCAGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAATTGGGACCAGAGACCATGGTTCTCGTGATGCTGCAGGCGGTTTTCAACATGCGCACATGTTATCTCATGGGGTTTCTTGTCAAGAAGGTGATCACCACACGCGAGGTGGTGACTGTTTACTTTCTGCTCCTGGTCCTTGAGATGGGGATACCGGAGATGAACCTCGGACACCTCTGGGAATGGGCTGATGCACTGGCCATGGGGTTGCTTATAATCAAGGCCAGCGCGATGGAAGATCGTAGAGGCCTGGGATTTCTGCTGGCTGGGCTTATGACACAAAGACATCTGGTCGCTGTCCATCATGGCTTGATAATATTTCTCACCGTGGCTTTGGCGGTGGTGGGACGAAACATTTACAATGGACAAAAAGAGAGGAAAGGACTGTGTTTCACAGTCCCCCTGGCCTCACTGCTTGGTGGCCCCGGCTCCGGATTGCGCATGCTGGCTTTATGGAAATGTCTTGGGGGTCATGGTAGACGGAGTCTTAGTGAGCCCCTTACTGTAGTGGGGGTTATGTTGGCCATGGCCAGTGGATTGTTACGACATTCATCCCAAGAGGCTCTTTTGGCCCTTTCAGCAGGATCCTTTCTCATTTTGATGTTGATCCTGGGGACCCGTAGACTCCAGCTAACGGCGGAATGGGCCGGAGTGGCGGAGTGGGACCCTGAGCTGGTTAATGAGGGAGGTGAGGTTAGCTTGAAGGTTAGACAGGATGCCATGGGGAACTTGCATTTGACAGAGGTAGAACGGGAGGAACGCCGTTTGGCCTTATGGCTTGTGTTCGGCCTACTGGCATCGGCCTATCACTGGTCCGGAATACTGGTCACAATGGGGGCTTGGACGGCTTACGAACTTTTCTCGTCCACGCGGAGAACTGATCTGGTCTTCTCAGGGCAGTTGCCTGATCAAGGGGAGAAACGCTCTTTTGACATCAAGGAAGGCGTGTACCGCATATACGCCCCCGGGCTCTTCTGGGGCTATCGCCAGATAGGTGTGGGATATGGAACGAAAGGAGTCTTGCACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCCGCCCTCAGTGTGGAGGGAGCCATATCAGGACCATACTGGGCGGATGTACGTGAAGATGTGGTCTGTTATGGGGGGGCCTGGGGCTTGGACAAAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTACATGCATTCCCTCCGGACAGTGGGCATAAAATCCATCAATGCCAGCCAGGAAAGTTGAACCTTGAGGGAGGGAGAGTTCTGGGGGCCATCCCGATAGACCTTCCACGTGGCACTTCAGGCAGCCCGATCATTAATGCACAGGGAGATGTGCTGGGCCTGTACGGCAATGGTCTGAAATCAAATGATGTCTACATCAGTAGCATTGCTCAGGGCAATGTCGAAAAGAGTCGCCCTGA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| 16,922
|
OP265692.1
|
Powassan virus
|
Lange,R.E., Maffei,J.G., Koetzner,C.A., Ngo,K., Dupuis,A.P., Prusinski,M.A., Backenson,B., Vogel,C.B.F., Grubaugh,N.D., Kramer,L.D., Ciota,A.T.
|
New York State Department of Health, Arbovirology Laboratories
|
USA
|
2023-04-04
|
IPS-001
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,699
|
GenBank
| null |
USA: Massachusetts
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
1994
| null | null |
Powassan virus isolate IPS-001, complete genome
|
ATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACCAGCAACAAGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTTTGGCATGCCATGACAGGCACGGCCAGGACCCCAGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCATTACGCCAAGCGGAATCTGCGTTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATTGGAAACTTGATGCAGAGCCTCCACATGAGGGGACGTCGCAGATCAGGCGTCGACTGGACATGGACTTTCTTGGTAATGGCTTTGATGGCTATGGCCATGGCGACCTCCATCCATCGGGATAAAGAGGGATATATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCCGCAAGCCAAGTCAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTCATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACCATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGATTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTAGAGTACGGACGCTGTGGAAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCGTGGCTCAAGGGTGATAACATCCGAGATCATGTTACCCGCGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCTGTCGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATACGCCACGAGATGCACACACCTTGAGAACAGGGACTTTGTGACAGGAGTACAGGGAACCACTAGAGTATCCCTGGTTCTGGAGCTTGGAGGATGTGTGACCATTACTGCTGAAGGCAAGCCATCTATTGATGTATGGCTGGAGGACATTTTTCAAGAAAGTCCTGCTGAAACCAGAGAATACTGTTTACACGCCAAGCTCTCCAACACGAAAGTAGAGGCTCGTTGCCCCACCACCGGGCCAGCTACGCTTCCAGAGGAACACCAGGCCAACATGGTGTGCAAGAGAGACCAGAGTGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGATTTTTTGGGAAAGGAAGCATAGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGCGAGGAAGCAAAAAAGGCAGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACGTACGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACGGGGGACTACCAAGCTGCAAATGAAACCAACGAGAACAGGAAAACGGCCCAGTTCACGGTGGCATCTGAGAAGGTGATCTTAAATCTAGGAGACTATGGAGATGTATCATTGACATGTAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGCAGCAAAGATCACCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGAAGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACACAAAGACAATCAGGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTTGGGCCGCCTCATGCAGTGAAAATGGATATCTTCAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTTTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGCGTGGACAACCAGAAATATCACCTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGACTTGAAAAGCTGAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCCATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAGTGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGCCATGACACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACGGGAAGCGACAAGCCCTGCCGGATTCCGGTACGAGCAGTGGCACATGGTGTCCCGACAATTAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATTGAAACAAGTGGAGGAGGATTTATAGAGATGCAGTTGCCACCGGGGGACAACATCATCTATGTGGGGGACCTAAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGTACCATAGGTAGAATGCTCGAAAAGACCCGTAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGCGGAATCCTGTCGTCAGTGGGGAAAGCCGTTCACACAGTGTTGGGAGGGGCGTTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTCAACGCTAGGAATCCAACAATGTCCATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGTTTTGACCCTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGTGCAGTTGATCCAGAGAGGATGGAAATCCGATGTGGAGAAGGCCTAGTTGTGTGGAAAGAGGTATCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACGCTAGCGCAGGCCCTCCGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAGAATAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGGAGCACCACTCCGGAGCTCAATTTGGTGTTGAGTGAAGGAGAGGCGAATCTGACCATCGTGGTAGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCCCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTGCCCGAAAGTCCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCCTACGCACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGAGAGGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCTGTGAAGAACGGCAAGGCCATTCACACGGACCAGAGCATGTGGATGAGTTCCTTCCGGAATGATACTGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTTACTGACCTTCGAAACTGTACATGGCCAGCAAGTCACACCATTGACAACGACGGAGTCTTGGACTCCCGTCTTTTTCTGCCTGTCACTCTCGCTGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATACAGCGAGCAAACGAAAGGGCCATGGGACCAGACCCCTCTGAGGGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGNGGAAAGATCATCCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCTTGTGAATTACCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGATTGTTGGTATGCCATGGAGATTAGACCGGTTCACTCACAGGGTGGCTTGGTTCGATCCATGGTAATGGCTGACAACGGTGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAACCCCTGGACTGGTGGCGGTATTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTCACATCCATTCTGTGGGGAGGCATACTCATGCTGGGCTTGCTTGTTACAGGGCTTGTTAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTACATCATAGCGGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAGCTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCAGTTTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCATTGGGTTTCTCGCCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTCTTGGTCTTAGAGATGGGGATACCAGAAATGAACTTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGACTCATTGGCCATGGGACTACTCATAATTAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGTCTAGGATTCTTATTGGCTGGGCTCATGACACAACGACATCTGACTGCTGTTCACCATGGATTAATAGTATTCCTCACTGTGGCTCTGGCGGTGGTGGGACGAAGCATCTACAACGGGCAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTTACCATCCCCTTGGCCTCGCTATTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGCCTGGGTGGTCGTGGCAGACGAAGTCTGAGTGAGCCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTAGCAATGGCTAGTGGGCTGCTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTCTACTGGTCCTCTCGGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATTTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGACTGGCTGAATGGAACCCTGAGTTGGTCAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGACGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAGGTGGAACGGGAGGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTGGCATTTGGCTTGCTAGCTTCGGCTTTCCATTGGTCCGGAATACTGGTGACAATGGGGGCATGGACACTGTATGAGCTCTTCTCATCAGCACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAATTGTCTGACCATGGGGAGAAACGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCGTATGGGGTCACCGTCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTTAGTGTGGAAGGGGCCGTCTCGGGACCATATTGGGCGGATGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTATGGAGGTGCCTGGAGCTTGGAAGGAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCACCAGACAGTGGACATAAAGTTCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACTTACCTCGTGGAACCTCAGGCAGCCCAATCATCAACGCACAAGGGGTTGTGTTGGGTCTCTACGGTAACGGTCTGAAATCCAATGATGTTTACATCAGCAGCATCGCTCAAGGTAGCGTTGAGAAAAGCCGACCAGA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ACCCTCACATGGAAAACAAACAAATGGTGGATGAATGGAGAGATATTCCCTACCTACCAAAGACACAGGATCTGGTATGTTCCTCACTTGTTGGAAGGAAGGAAAGGGCTGAATGGGCCAAGAACATCTGGGGCTCAGTGGAAAAGGTGAGGAAACTTATTGGAGCAGAGGAATACAGAGACTATTTGGCAAACATGGACAGACATGATCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAACTAGCACAACCANAATCAGAAGAAACCCACTACAGGGGGTGATGTGGCAGCGCACCACGACATCGTGACGGGAAGAGGTCGTCCCCGACGCATCATCTCTCTAGGGCATTTTCGTGAGACCCTCATGGCTGTGAAGGGGCATCAGCCGTGTAGTAAGAAGGCCCCGACCTACTGCGGCAGCACACACAGTGACGGGAAGTTGGTCGCTCCCGACGCAGTTAGGTCAGAGAAAATTTTGTGAGACCAAAAGGCCTCCTGGAAGGCTCACCAGGAGTTAGGCCATTCTAGAGCCCCCGGGCATAACTCGGGAGGAGGGGGGAAGACAATTGGCAATCTTCCCCGGGATTTTTCCGCCTCCTATACTAAATTTCCCCCAGGAAACTGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCGCCATCCAGGCACAGATAGCCTGACAAGGAGATGG
| 16,923
|
OP265693.1
|
Powassan virus
|
Lange,R.E., Maffei,J.G., Koetzner,C.A., Ngo,K., Dupuis,A.P., Prusinski,M.A., Backenson,B., Vogel,C.B.F., Grubaugh,N.D., Kramer,L.D., Ciota,A.T.
|
New York State Department of Health, Arbovirology Laboratories
|
USA
|
2023-04-04
|
11T-1190
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,248
|
GenBank
| null |
USA: New York
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2011
| null | null |
Powassan virus isolate 11T-1190, complete genome
|
ATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACCAGCAACAAGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTTTGGCATGCCATGACAGGCACGGCCAGGACCCCAGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCATTACGCCAAGCGGAATCTGCGTTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATTGGAAACTTGATGCAGAGCCTCCACATGAGGGGACGTCGCAGATCAGGCGTCGACTGGACATGGACTTTCTTGGTAATGGCTTTGATGGCTATGGCCATGGCGACCTCCATCCATCGGGATAAAGAGGGATATATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCCGCAAGCCAAGTCAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTCATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACCATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGATTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTAGAGTACGGACGCTGTGGAAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTTATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCGTGGCTCAAGGGTGATAACATCCGAGATCATGTTACCCGCGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCTGTCGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATACGCCACGAGATGCACACACCTTGAGAACAGGGACTTTGTAACAGGAGTACAGGGAACCACTAGGGTATCCCTGGTTCTGGAGCTTGGAGGATGTGTGACCATTACTGCTGAAGGCAAGCCATCTATTGATGTATGGCTGGAGGACATTTTTCAAGAAAGTCCTGCTGAAACCAGAGAATACTGTTTACACGCCAAGCTCTCCAACACGAAAGTAGAGGCTCGTTGCCCCACCACCGGGCCAGCCACGCTTCCAGAGGAACACCAGGCCAACATGGTGTGCAAGAGAGACCAGAGTGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGATTTTTTGGGAAAGGAAGCATAGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGCGAGGAAGCAAAAAAGGCTGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACGTACGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACGGGGGACTACCAAGCTGCAAATGAAACCAACGAGAACAGGAAAACGGCCCAGTTCACGGTGGCATCTGAGAAGGTGATTTTAAATTTAGGAGACTATGGAGATGTGTCATTGACATGTAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGCAACAAAGATCACCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGAAGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACACAAAGACAATCAGGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTTGGGCCGCCTCATGCAGTGAAAATGGATATCTTCAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTTTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGCGTGGACAACCAGAAATATCACCTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGACTTGAAAAACTAAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCCATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAGTGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGTCATGACACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACGGGAAGTGACAAGCCCTGCCGGATTCCGGTACGAGCAGTGGCACATGGTGTCCCGACAATTAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATCGAAACAAGTGGAGGAGGATTTATAGAGATGCAGTTGCCACCGGGGGACAACATCATCTATGTGGGGGACCTAAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGTACCATAGGTAGAATGCTCGAAAAGACCCGTAAGGGTTTGGAGAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGTGGAATCCTGTCGTCAGTGGGGAAAGCCGTTCACACAGTGTTGGGAGGGGCGTTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTCAACGCTAGGAATCCAACAATGTCCATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGTTTTGACCCTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGTGCAGTTGATCCAGAGAGGATGGAAATCCGATGTGGAGAAGGCCTAGTTGTGTGGAAAGAGGTATCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACGCTGGCGCAGGCCCTCCGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAGAATAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTGGTGTTGAGTGAAGGAGAGGCGAATCTGACCATCGTGGTAGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCCCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAAAGTTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTCCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCCTACGCACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGAGGAGAGGCTTCAAGAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGATGTCGTGAAGAACGGCAAGGCCATTCACACGGATCAGAGCATGTGGATGAGTTCCTTCCGGAATGATACTGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTTACTGACCTTCGAAACTGTACATGGCCAGCAAGTCACACCATTGACAACGACGGAGTCTTGGACTCCCGTCTTTTTCTGCCTGTCACTCTCGCTGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATACAGCGAGCAAACGAAAGGGCCATGGGACCAGACCCCTCTGAGGGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGCGGAAAGATCATTCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCTTGTGAATTACCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGATTGTTGGTATGCCATGGAGATTAGACCGGTTCACTCACAGGGTGGCTTGGTTCGATCCATGGTAATGGCTGACAACGGTGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAACCCCTGGACTGGTGGCGGTATTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTTACATCCATTCTGTGGGGAGGCATACTCATGCTGGGCTTGCTTGTTACAGGGCTTGTAGGAGTGGAGGAGATTGTACGCTACTTCATAGCAGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAGCTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCAGTTTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCATTGGGTTTCTCGTCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTCTTGGTCCTAGAGATGGGGATACCAGAAATGAACTTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGACTCATTGGCCATGGGACTACTCATAATCAAAGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGTCTAGGATTCTTATTGGCTGGGCTCATGACACAACGACATCTGACTGCTGTTCACCATGGATTAATAGTATTCCTCACTGTGGCTCTGGCGGTGGTGGGACGAAGCATCTACAACGGGCAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTTACCATCCCCTTGGCCTCGCTATTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGCCTGGGTGGTCGTGGCAGACGAAGTCTGAGTGAGCCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTAGCAATGGCTAGTGGGCTGTTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTCTACTGGTCCTCTCGGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATCTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGACTGGCTGAATGGAACCCTGAGTTGGTTAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGACGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAGGTGGAACGGGAGGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTGGCATTTGGCTTGCTAGCTTCGGCTTTCCATTGGTCCGGAATACTGGTGACAATGGGGGCATGGACACTGTATGAGCTCTTCTCATCAGCACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAATTGTCTGACCATGGGGAGAAACGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCGTATGGGGTCACCGTCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTTAGTGTGGAGGGGGCCGTCTCGGGACCATATTGGGCGGATGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTATGGAGGTGCCTGGAGCTTGGAAGGAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCACCAGACAGTGGACATAAAGTTCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACTTACCTCGTGGAACCTCAGGCAGCCCAATCATCAACGCACAAGGGGTTGTGTTGGGTCTCTACGGTAACGGTCTGAAATCCAATGATGTTTACATCAGCAGCATCGCTCAAGGTAGCGTTGAGAAAAGCCGACCAGA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ACCCTCACATGGAAAACAAACAAATGGTGGATGAATGGAGAGATATTCCCTACCTACCAAAGACACAGGATCTGGTATGTTCCTCACTTGTTGGAAGGAAGGAAAGGGCTGAATGGGCCAAGAACATCTGGGGCTCAGTGGAAAAGGTGAGGAAACTCATTGGAGCAGAGGAATACAGAGACTATTTGGCAAACATGGACAGACATGATCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAA
| 16,924
|
OP265694.1
|
Powassan virus
|
Lange,R.E., Maffei,J.G., Koetzner,C.A., Ngo,K., Dupuis,A.P., Prusinski,M.A., Backenson,B., Vogel,C.B.F., Grubaugh,N.D., Kramer,L.D., Ciota,A.T.
|
New York State Department of Health, Arbovirology Laboratories
|
USA
|
2023-04-04
|
11087-123
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,248
|
GenBank
| null |
USA: New York
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2011
| null | null |
Powassan virus isolate 11087-123, complete genome
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ATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCCAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACCAGCAACAAGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTTTGGCATGCCATGACAGGCACGGCCAGGACCCCAGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCATTACGCCAAGCGGAATCTGCGTTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATTGGAAACTTGATGCAGAGCCTCCACATGAGGGGACGTCGCAGATCAGGCGTCGACTGGACATGGACTTTCTTGATAATGGCTTTGATGGCTATGGCCATGGCGACCTCCATCCATCGGGATAAAGAGGGATATATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCCGCAAGCCAAGTCAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTCATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAGGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACCATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGATTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTAGAGTACGGACGCTGTGGAAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCGTGGCTCAAGGGTGATAACATCCGAGATCATGTTACCCGCGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCTGTCGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATACGCCACGAGATGCACACACCTTGAGAACAGGGACTTTGTAACAGGAGTACAGGGAACCACTAGGGTATCCCTGGTTCTGGAGCTTGGAGGATGTGTGACCATTACTGCTGAAGGCAAGCCATCTATTGATGTATGGCTGGAGGACATTTTTCAAGAAAGTCCTGCTGAAACCAGAGAATACTGTTTACACGCCAAGCTCTCCAACACGAAAGTAGAGGCTCGTTGCCCCACCACCGGGCCAGCCACGCTTCCAGAGGAACACCAGGCCAACATGGTGTGCAAGAGAGACCAGAGTGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGATTTTTTGGGAAAGGAAGCATAGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGCGAGGAAGCAAAAAAGGCTGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACGTACGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACGGGGGACTACCAAGCTGCAAATGAAACCAACGAGAACAGGAAAACGGCCCAGTTCACGGTGGCATCTGAGAAGGTGATTTTAAATCTAGGAGACTATGGAGATGTGTCATTGACATGTAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGCAACAAAGATCACCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGAAGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACACAAAGACAATCAGGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTTGGGCCGCCTCATGCAGTGAAAATGGATATCTTCAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTTTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGCGTGGACAACCAGAAATATCACCTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGACTTGAAAAACTAAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCCATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAGTGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGTCATGACACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACGGGAAGTGACAAGCCCTGCCGGATTCCGGTACGAGCAGTGGCACATGGTGTCCCGACAATTAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATCGAAACAAGTGGAGGAGGATTTATAGAGATGCAGTTGCCACCGGGGGACAACATCATCTATGTGGGGGACCTAAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGTACCATAGGTAGAATGCTCGAAAAGACCCGTAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGTGGAATCCTGTCGTCAGTGGGGAAAGCCGTTCACACAGTGTTGGGAGGGGCGTTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTCAACGCTAGGAATCCAACAATGTCCATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGTTTTGACCCTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGTGCAGTTGATCCAGAGAGGATGGAAATCCGATGTGGAGAAGGCCTAGTTGTGTGGAAAGAGGTATCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACGCTGGCGCAGGCCCTCCGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAGAATAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTGGTGTTGAGTGAAGGAGAGGCGAATCTGACCATCGTGGTAGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCCCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAAAGTTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTCCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCCTACGCACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGAGGAGAGGCTTCAAGAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCTGTGAAGAACGGCAAGGCCATTCACACGGATCAGAGCATGTGGATGAGTTCCTTCCGGAATGATACTGACACGTACATTCAGGAGCTCATTCTTACTGACCTTCGAAACTGTACATGGCCAGCAAGTCACACCATTGACAACGACGGAGTCTTGGACTCCCGTCTTTTTCTGCCTGTCACTCTCGCTGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATACAGCGAGCAAACGAAAGGGCCATGGGACCAGACCCCTCTGAGGGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGCGGAAAGATCATCCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCTTGTGAATTACCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGATTGTTGGTATGCCATGGAGATTAGACCGGTTCACTCACAGGGTGGCTTGGTTCGATCCATGGTAATGGCTGACAACGGTGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAACCCCTGGACTGGTGGCGGTATTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTTACATCCATTCTGTGGGGAGGCATACTCATGCTGGGCTTGCTTGTTACAGGGCTTGTTAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTACATCATAGCGGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAGCTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCAGTTTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCATTGGGTTTCTCGTCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTCTTGGTCCTAGAGATGGGGATACCAGAAATGAACTTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGACTCATTGGCCATGGGACTACTCATAATCAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGGAAAGGTCTAGGATTCTTATTGGCTGGGCTCATGACACAACGACATCTGACTGCTGTTCACCATGGATTAATAGTATTCCTCACTGTGGCTCTGGCGGTGGTGGGACGAAGCATCTACAACGGGCAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTTACCATCCCCTTGGCCTCGCTATTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGCCTGGGCGGTCGTGGCAGACGAAGTCTGAGTGAGCCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTAGCAATGGCTAGTGGGCTGTTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTCTACTGGTCCTCTCGGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATCTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGACTGGCTGAATGGAACCCTGAGTTGGTTAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGACGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAGGTGGAACGGGAGGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTGGCATTTGGCTTGCTAGCTTCGGCTTTCCATTGGTCCGGAATACTGGTGACAATGGGGGCATGGACACTGTATGAGCTCTTCTCATCAGCACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAATTGTCTGACCATGGGGAGAAACGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCGTATGGGGTCACCGTCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTTAGTGTGGAGGGGGCCGTCTCGGGACCATATTGGGCGGATGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTATGGAGGTGCCTGGAGCTTGGAAGGAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCACCAGACAGTGGACATAAAGTTCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACTTACCTCGTGGAACCTCAGGCAGCCCAATCATCAACGCACAAGGGGTTGTGTTGGGTCTCTACGGTAACGGTCTGAAATCCAATGATGTTTACATCAGCAGCATCGCTCAAGGTAGCGTTGAGAAAAGCCGACCAGA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ACCCTCACATGGAAAACAAACAAATGGTGGATGAATGGAGAGATATTCCCTACCTACCAAAGACACAGGATCTGGTATGTTCCTCACTTGTTGGAAGGAAGGAAAGGGCTGAATGGGCCAAGAACATCTGGGGCTCAGTGGAAAAGGTGAGGAAACTCATTGGAGCGGAGGAATACAGAGACTATTTGGCAAACATGGACAGACATGATCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAA
| 16,925
|
OP265695.1
|
Powassan virus
|
Lange,R.E., Maffei,J.G., Koetzner,C.A., Ngo,K., Dupuis,A.P., Prusinski,M.A., Backenson,B., Vogel,C.B.F., Grubaugh,N.D., Kramer,L.D., Ciota,A.T.
|
New York State Department of Health, Arbovirology Laboratories
|
USA
|
2023-04-04
|
18071-054
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,248
|
GenBank
| null |
USA: New York
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2018
| null | null |
Powassan virus isolate 18071-054, complete genome
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ATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACCAGCAACAAGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTTTGGCATGCCATGACAGGCACGGCCAGGACCCCAGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCATTACGCCAAGCGGAATCTGCGTTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATTGGAAACTTGATGCAGAGCCTCCACATGAGGGGACGTCGCAGATCAGGCGTCGACTGGACATGGACTTTCTTGGTAATGGCTTTGATGGCTATGGCCATGGCGACCTCCATCCATCGGGATAAAGAGGGATATATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCCGCAAGCCAAGTCAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTCATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACCATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGATTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTAGAGTACGGACGCTGTGGAAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCGTGGCTCAAGGGTGATAACATCCGAGATCATGTTACCCGCGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCTGTCGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATACGCCACGAGATGCACACACCTTGAGAACAGGGACTTTGTAACAGGAGTACAGGGAACCACTAGGGTATCCCTGGTTCTGGAGCTTGGAGGATGTGTGACCATTACTGCTGAAGGCAAGCCATCCATTGATGTATGGCTGGAGGACATTTTCCAAGAAAGTCCTGCTGAAACCAGAGAATACTGTTTACACGCCAAGCTCTCCAACACGAAAGTAGAGGCTCGTTGCCCCACCACCGGGCCAGCCACGCTTCCAGAGGAACACCAGGCCAACATGGTGTGCAAGAGAGACCAGAGTGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGATTTTTTGGGAAAGGAAGCATAGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGCGAGGAGGCAAAAAAGGCTGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACGTACGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACGGGGGACTACCAAGCTGCAAATGAAACCAACGAGAACAGGAAAACGGCCCAGTTCACGGTGGCATCTGAGAAGGTGATTTTAAATCTAGGAGACTATGGAGATGTGTCATTGACATGTAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGCAACAAAGATCACCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGAAGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACACAAAGACAATCAGGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTTGGGCCGCCTCATGCAGTGAAAATGGATATCTTCAATCTGGGGGATCAGACCGCTGTTTTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGCGTGGACAACCAGAAATATCACCTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGACTTGAAAAGCTAAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCCATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAGTGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGTCATGACACGGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACGGGAAGTGACAAGCCCTGCCGGATTCCGGTACGAGCAGTGGCACATGGTGTCCCGACAATTAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATCGAAACAAGTGGAGGAGGATTTATAGAGATGCAGTTGCCACCGGGGGACAACATCATCTATGTGGGGGACCTAAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGTACCATAGGTAGAATGCTCGAAAAGACCCGCAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGTGGAATCCTGTCGTCAGTGGGGAAAGCCGTTCACACAGTGTTGGGAGGGGCGTTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTCAACGCTAGGAATCCAACAATGTCCATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGTTTTGACCCTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGTGCAGTTGATCCAGAGAGGATGGAAATCCGATGTGGAGAAGGCCTAGTTGTGTGGAAAGAGGTATCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACGCTGGCGCAGGCCCTCCGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAGAATAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTGGTGTTGAGTGAAGGAGAGGCGAATCTGACCATCGTGGTAGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCCCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTCCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCCTACGCACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGAGAGGCTTCAAGAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCTGTGAAGAACGGCAAGGCCATTCACACGGATCAGAGCATGTGGATGAGTTCCTTCCGGAATGATACTGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTTACTGACCTTCGAAACTGTACATGGCCAGCAAGTCACACCATTGACAACGACGGAGTCTTGGACTCCCGTCTTTTTCTGCCTGTCACTCTCGCTGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATACAGCGAGCAAACGAAAGGGCCATGGGACCAGACCCCTCTGAGGGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGCGGAAAGATCATCCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCTTGTGAATTACCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGATTGTTGGTATGCCATGGAGATTAGACCGGTTCACTCACAGGGTGGCTTGGTTCGATCCATGGTAATGGCTGACAACGGTGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAACCCCTGGACTGGTGGCGGTATTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTTACATCCATTCTGTGGGGAGGCATACTCATGCTGGGCTTGCTTGTTACAGGGCTTGTTAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTACATCATAGCGGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAGCTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCAGTTTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCATTGGGTTTCTCGTCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTCTTGGTCCTAGAGATGGGGATACCAGAGATGAACTTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGACTCATTGGCCATGGGACTACTCATAATCAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGTCTAGGATTCTTATTGGCTGGGCTCATGACACAACGACATCTGACTGCTGTTCACCATGGATTAATAGTATTCCTCACTGTGGCTCTGGCGGTGGTGGGACGAAGCATCTACAACGGGCAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTTACCATCCCCTTGGCCTCGCTATTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGCCTGGGTGGTCGTGGCAGACGAAGTCTGAGTGAGCCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTAGCAATGGCTAGTGGGCTGTTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTCTACTGGTCCTCTCGGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATCTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGACTGGCTGAATGGAACCCTGAGTTGGTTAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGACGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAGGTGGAACGGGAGGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTGGCATTTGGCTTGCTAGCTTCGGCTTTCCATTGGTCCGGAATACTGGTGACAATGGGGGCATGGACACTGTATGAGCTCTTCTCATCAGCACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAATTGTCTGACCATGGGGAGAAACGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCGTATGGGGTCACCGTCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTTAGTGTGGAGGGGGCCGTCTCGGGACCATATTGGGCGGATGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTATGGAGGTGCCTGGAGCTTGGAAGGAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCACCAGACAGTGGACATAAAGTTCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACTTACCTCGTGGAACCTCAGGCAGCCCAATCATCAACGCACAAGGGGTTGTGTTGGGTCTCTACGGTAACGGTCTGAAATCCAATGATGTTTACATCAGCAGCATCGCTCAAGGTAGCGTTGAGAAAAGCCGACCAGA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| 16,926
|
OP037817.1
|
Powassan virus
|
Carpio,K.L., Thompson,J.K., Widen,S.G., Smith,J.K., Juelich,T.L., Clements,D.E., Freiberg,A.N., Barrett,A.D.T.
|
University of Texas Medical Branch, Biochemistry, Cellular, and Molecular Biology
|
USA
|
2023-03-13
|
POWV LB
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,838
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Powassan virus isolate POWV LB, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGTGTGCGGGTGCTTTAGTCAGTGTCCGCAGCGTTCTGTTGAACGTGAGTGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTTATGATGACCACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGCAAGCTTAAAGTGACCGCAAATAAGTCGCGACCAGCAACGAGCCCAATGCCAAAGGGCTTCGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATTCTTTGGCACGCCGTGACAGGCACGGCCAGACCCCCAGTGCTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCACTGCGCCAGGCGGAGGCTGTTCTGAAGAAGATAAAGAGAGTTATCGGGAACTTGATGCAGAGCCTTCACATGAGAGGGCGTCGCAGGTCAGGTGTGGACTGGACTTGGATTTTTTTGACGATGGCGTTGATGACCATGGCCATGGCAACCACCATCCACCGGGACAGGGAAGGATACATGGTTATGCGGGCCAGTGGAAGGGACGCTGCAAGCCAGGTCAGGGTACAAAACGGAACGTGCGTCATCCTGGCAACAGACATGGGAGAGTGGTGTGAAGATTCAATCACCTACTCTTGCGTCACGATTGACCAGGAGGAAGAACCCGTTGACGTGGACTGCTTCTGCCGAGGTGTTGATAGGGTTAAGTTAGAGTATGGACGCTGTGGAAGGCAAGCTGGATCTAGGGGGAAAAGGTCTGTGGTCATTCCAACACATGCACAAAAAGACATGGTCGGGCGAGGTCATGCATGGCTTAAAGGTGACAATATTCGAGATCATGTCACCCGAGTCGAGGGCTGGATGTGGAAGAACAAGCTTCTAACTGCCGCCATTGTGGCCTTGGCTTGGCTCATGGTTGATAGTTGGATGGCCAGAGTGACTGTCATCCTCTTGGCGTTGAGTCTAGGGCCAGTGTACGCCACGAGGTGCACGCATCTTGAGAACAGAGATTTTGTGACAGGAACTCAAGGGACCACCAGAGTGTCCCTAGTTTTGGAACTTGGAGGCTGCGTGACCATCACAGCTGAGGGCAAGCCATCCATTGATGTATGGCTCGAAGACATTTTTCAGGAAAGCCCGGCTGAAACCAGAGAATACTGCCTGCACGCCAAATTGACCAACACAAAAGTGGAGGCTCGCTGTCCAACCACTGGACCGGCGACACTTCCGGAGGAGCATCAGGCTAATATGGTGTGCAAGAGAGACCAAAGCGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGGTTTTTTGGGAAGGGCAGTATAGTGGCTTGTGCAAAGTTTGAATGCGAGGAAGCAAAAAAAGCTGTGGGCCACGTCCATGACTCCACAAAGATCACGTATGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACAGGGGATTACTTGGCTGCAAATGAGACCAATTCAAACAGGAAATCAGCACAGTTTACGGTGGCATCCGAGAAAGTGATCCTGCGGCTCGGCGACTATGGAGATGTGTCGCTGACGTGTAAAGTGGCAAGTGGGATTGATGTCGCCCAAACTGTGGTGATGTCACTCGACAGCAGCAAGGACCACCTGCCTTCTGCATGGCAAGTGCACCGTGACTGGTTTGAGGACTTGGCGCTGCCCTGGAAACACAAGGACAACCAAGATTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAATTTGGACCACCACATGCTGTGAAAATGGATGTTTTCAATCTGGGGGACCAGACGGCTGTGCTGCTCAAATCACTGGCAGGAGTTCCGCTGGCCAGTGTGGAGGGCCAGAAATACCACCTGAAAAGCGGCCATGTTACTTGTGATGTGGGACTGGAAAAGCTGAAACTGAAAGGCACAACCTACTCCATGTGTGACAAAGCAAAGTTCAAATGGAAGAGAGTTCCTGTGGACAGCGGCCATGACACAGTAGTCATGGAGGTATCATACACAGGAAGCGACAAGCCATGTCGGATCCCGGTGCGGGCTGTGGCACATGGTGTCCCAGCGGTTAATGTAGCCATGCTCATAACCCCCAATCCAACCATTGAAACAAATGGTGGCGGATTCATAGAAATGCAGCTGCCACCAGGGGATAACATCATCTATGTGGGAGACCTTAGCCAGCAGTGGTTTCAGAAAGGCAGTACCATTGGTAGAATGTTTGAAAAAACCCGCAGGGGATTGGAAAGGCTCTCTGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGCTCAGTAGGCGGGGTACTGTCTTCTGTGGGGAAGGCAATCCACACGGTGCTGGGGGGAGCTTTCAACACCCTTTTTGGGGGGGTTGGATTCATCCCTAAGATGCTGCTGGGGGTTGCTCTGGTCTGGTTGGGACTAAATGCCAGGAATCCAACGATGTCCATGACGTTTCTTGCTGTGGGGGCTTTGACACTGATGATGACAATGGGAGTTGGGGCAGATTATGGATGTGCCATTGACCCAGAAAGGATGGAAATCCGCTGTGGAGAAGGGCTTGTTGTGTGGAAAGAGGTGTCGGAATGGTATGACGGCTACGCCTATCACCCAGAATCACCTGACACGCTTGCACAGGCTCTCAGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCGTTTGTGGGGTCGTGCCCCAAAACAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGAAGCACTGCTCCGGAACTCAACTTGGTGCTGAGTGAGGGAGAAGCAAACTTGACCATCGTGGTAGACAAAACAGATCCGGCAGACTATAGGGGAGGCACTCCCATGGTTCTAAAGAAGACTGGAAAAGAGAGCAAGGTGTCCTGGAAGAGCTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTTCCTGATAGCCCCAGGCGCATGATGATGGGGGTTGACGGAGTTGGGGAGTGCCCCTTGTATAGGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAGTTTGGAGTGGGCCTACGCACGAAAGTGTTCTTGGATCTGCGTGGTGAAGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGAGCAGCCGTGAAGAATGGAAAAGCCATCCACACGGACCAAAGTATGTGGATGAGCTCCTTTCGGAATGACACGGGCACGTACATCCATGAGCTTATTCTCACTGATCTCAGGAACTGCACATGGCCAGCAAGTCACACTATTGATAATGATGGAGTTTTAGACTCCCATCTTTTCTTGCCAGTCACCCTTGCTGGGCCCAGGTCAAAGTACAACAGGATACCTGGGTACAGTGAACAAGTAAGAGGACCATGGGACCAGACTCCTCTGAGGGTGGTCCGGGACCATTGCCCTGGAACAAGTGTGAGGATTGACAGCCATTGTGACAAGAGAGGAGCTTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGTGGAAAGATCATTCCAGAGTGGTGCTGCCGGGCCTGTGAGCTACCACCGGTGACATTCCGTAGTGGCACGGATTGTTGGTACGCTATGGAAATCAGGCCAGTCCATTCGCAGGGCGGCTTGGTGCGTTCCATGGTAGTGGCTGACAATGGTGCCTTGCTTAGTGAGGGAGGAGTTCCTGGTCTAGTGGCAGTGTTTGTATTGATGGAATTCCTTTTGAGAAGGCGTCCGGGATCTGTCACGTCCATTTTGTGGGGAGGCATACTAATGCTGGGCTTGCTGGTCACGGGTCTCGTGAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTATGTCATAGCAGTTGGGGTCACTTTCCACTTGGAATTGGGACCAGAGACCATGGTTCTTGTGATGCTGCAGGCGGTCTTCAACATGCGCACATGTTATCTCATGGGGTTTCTTGTCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCTTGCTATTGGTCCTTGAGATGGGGATACCGGAGATGAACTTCGGACACCTCTGGGAATGGGCTGATGCACTGGCCATGGGGTTGCTCATAATCAAGGCCAGTGCGATGGAAGATCGCAGAGGTTTGGGATTCTTGCTGGCTGGGCTCATGACACAAAGACACCTAGTCGCTGTCCATCATGGTTTGATGGTATTTCTCACTGTGGCCTTGGCGGTAGTGGGACGGAATATCTACAATGGACAAAAAGAGAGGAAAGGACTGTGTTTCACAGTCCCCCTGGCCTCACTACTTGGTGGCTCCGGCTCCGGATTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGTCTTGGGGGTCGTGGCAGACGGAGCCTCAGTGAGCCCCTTACTGTGGTGGGGGTCATGCTGGCCATGGCCAGTGGACTACTACGACATTCATCCCAAGAGGCTCTTTTGGCCCTTTCTGCAGGATCCTTTCTCATTTTGATGCTGATCCTGGGGACCCGTAGACTCCAGCTAACGGCGGAATGGGCCGGAGTGGTGGAGTGGAACCCTGAGTTGGTCAATGAGGGAGGTGAGGTAAGCTTGAAGGTCAGACAGGATGCCATGGGGAACTTGCACTTGACAGAGGTGGAACGGGAGGAGCGTCGTTTGGCCTTATGGCTTGTGTTCGGCCTACTGGCATCGGCTTATCATTGGTCCGGAATATTGGTCACAATGGGGGCTTGGACAGTTTATGAGCTCTTCTCATCCACGCGGAGAACTGACCTGGTTTTTTCAGGGCAGTTGCCTGACCAAGGGGAAAAACGTTCCTTTGACATCAAGGAAGGCGTATACCGCATATACGCCCCTGGGCTCTTCTGGGGTTACCGCCAGATAGGTGTGGGATATGGAACGAAAGGAGTCTTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCCGCCCTCAGCGTGGAGGGGGCCACATCAGGACCATACTGGGCGGATGTGCGTGAAGACGTGGTCTGCTATGGGGGGGCCTGGGGCTTGGACAAAAAATGGGGAGGCGAAGTCGTTCAGGTACACGCATTCCCTCCGGACAGTGGACACAAAATCCATCAATGCCAGCCAGGAAAGCTGAACCTTGAGGGGGGGAGAGTTCTGGGGGCCATCCCGATAGACCTCCCACGTGGTACTTCAGGTAGCCC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CCGTGAGTTGGGTTCCCATGGGTCGCACCACTTGGAGCATCCACGCGAGTGGTGAATGGATGACAACAGAAGACATGCTGCGCATCTGGAACAAAGTCTGGATTTTGGACAACCCTCACATGGAAGATAAGCAGACAGTGGATGAGTGGAGAGACATCCCCTATCTGCCAAAAACACAGGACCTGGTATGTTCCTCACTTGTTGGGAGAAAGGAGAGGGCAGAATGGGCTAAGAACATCTGGGGCTCAGTGGAGAAGGTCAGGAAGCTCATTGGACCAGAAGACTACAGAGACTACTTATCAAGCATGGACAGACATGACCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCGATAATCTAAACTAGCATGACTGAACAGTCAAAAGAACCCTAACACAGGGGATGGTGTGGCAGCGCACAACGACATCGTGACGGGAGTGGGTCGCCCCCGACGCACCATCCTCTTGGGAAAAATTTTCGTGAGACCCTCACGGCTGGCAAAGGGCACCAGTCGTGTAGTAAGAAGGCCCTGGCCCAGTGCGGCAGCACACTCAGTGACGGGAAAGTGGTCGCTCCCGACGTAACTGGGTAAAAACGAACTTTGTGAGACCAAAAGGCCTCCTGGAAGGCTCACCAGGAGTTAGGCCGTTTAGGAGCCCCCGAGCATAACTCGGGAGGAGGGAGGAAGAAAATTGGCAATCTTCCTCGGGATTTTTCCGCCTCCTATACTAAATTTCCCCCAGGAAACTGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCACCATCCAGGCACAGATAGCCTGACAAGGAGATGGTGTGTGACTCGGAAAAACACCCGC
| 17,590
|
OP037823.1
|
Powassan virus
|
Carpio,K.L., Thompson,J.K., Widen,S.G., Smith,J.K., Juelich,T.L., Clements,D.E., Freiberg,A.N., Barrett,A.D.T.
|
University of Texas Medical Branch, Biochemistry, Cellular, and Molecular Biology
|
USA
|
2023-03-13
|
POW LEIV-5530
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,840
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Powassan virus isolate POW LEIV-5530, complete genome
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TGTCTTTTTCTTGCACGTGTGTGCGGGTGCTTTAGTCAGTGTCCGCAGCGTTCTGTTGAACGTGAGTGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTTATGATGACCACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGCAAGCTTAAAGTGACCGCAAATAAGTCGCGACCAGCAACGAGCCCAATGCCAAAGGGCTTCGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATTCTTTGGCACGCCGTGACAGGCACGGCCAGACCCCCAGTGCTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCACTGCGCCAGGCGGAGGCTGTTCTGAAGAAGATAAAGAGAGTTATCGGGAACTTGATGCAGAGCCTTCACATGAGAGGGCGTCGCAGGTCAGGTGTGGACTGGACTTGGATTTTTTTGACGATGGCGTTGATGACCATGGCCATGGCAACCACCATCCACCGGGACAGGGAAGGATACATGGTTATGCGGGCCAGTGGAAGGGACGCTGCAAGCCAGGTCAGGGTACAAAACGGAACGTGCGTCATCCTGGCAACAGACATGGGAGAGTGGTGTGAAGATTCAATCACCTACTCTTGCGTCACGATTGACCAGGAGGAAGAACCCGTTGACGTGGACTGCTTCTGCCGAGGTGTTGATAGGGTTAAGTTAGAGTATGGACGCTGTGGAAGGCAAGCTGGATCTAGGGGGAAAAGGTCTGTGGTCATTCCAACACATGCACAAAAAGACATGGTCGGGCGAGGTCATGCATGGCTTAAAGGTGACAATATTCGAGATCATGTCACCCGAGTCGAGGGCTGGATGTGGAAGAACAAGCTTCTAACTGCCGCCATTGTGGCCTTGGCTTGGCTCATGGTTGATAGTTGGATGGCCAGAGTGACTGTCATCCTCTTGGCGTTGAGTCTAGGGCCAGTGTACGCCACGAGGTGCACGCATCTTGAGAACAGAGATTTTGTGACAGGAACTCAAGGGACCACCAGAGTGTCCCTAGTTTTGGAACTTGGAGGCTGCGTGACCATCACAGCTGAGGGCAAGCCATCCATTGATGTATGGCTCGAAGACATTTTTCAGGAAAGCCCGGCTGAAACCAGAGAATACTGCCTGCACGCCAAATTGACCAACACAAAAGTGGAGGCTCGCTGTCCAACCACTGGACCGGCGACACTTCCGGAGGAGCATCAGGCTAATATGGTGTGCAAGAGAGACCAAAGCGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGGTTTTTTGGGAAGGGCAGTATAGTGGCTTGTGCAAAGTTTGAATGCGAGGAAGCAAAAAAAGCTGTGGGCCACGTCTATGACTCCACAAAGATCACGTATGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACAGGGGATTACTTGGCTGCAAATGAGACCAATTCAAACAGGAAATCAGCACAGTTTACGGTGGCATCCGAGAAAGTGATCCTGCGGCTCGGCGACTATGGAGATGTGTCGCTGACGTGTAAAGTGGCAAGTGGGATTGATGTCGCCCAAACTGTGGTGATGTCACTCGACAGCAGCAAGGACCACCTGCCTTCTGCATGGCAAGTGCACCGTGACTGGTTTGAGGACTTGGCGCTGCCCTGGAAACACAAGGACAACCAAGATTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAATTTGGACCACCACATGCTGTGAAAATGGATGTTTTCAATCTGGGGGACCAGACGGCTGTGCTGCTCAAATCACTGGCAGGAGTTCCGCTGGCCAGTGTGGAGGGCCAGAAATACCACCTGAAAAGCGGCCATGTTACTTGTGATGTGGGACTGGAAAAGCTGAAACTGAAAGGCACAACCTACTCCATGTGTGACAAAGCAAAGTTCAAATGGAAGAGAGTTCCTGTGGACAGCGGCCATGACACAGTAGTCATGGAGGTATCATACACAGGAAGCGACAAGCCATGTCGGATCCCGGTGCGGGCTGTGGCACATGGTGTCCCAGCGGTTAATGTAGCCATGCTCATAACCCCCAATCCAACCATTGAAACAAATGGTGGCGGATTCATAGAAATGCAGCTGCCACCAGGGGATAACATCATCTATGTGGGAGACCTTAGCCAGCAGTGGTTTCAGAAAGGCAGTACCATTGGTAGAATGTTTGAAAAAACCCGCAGGGGATTGGAAAGGCTCTCTGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGCTCAGTAGGCGGGGTACTGTCTTCTGTGGGGAAGGCAATCCACACGGTGCTGGGGGGAGCTTTCAACACCCTTTTTGGGGGGGTTGGATTCATCCCTAAGATGCTGCTGGGGGTTGCTCTGGTCTGGTTGGGACTAAATGCCAGGAATCCAACGATGTCCATGACGTTTCTTGCTGTGGGGGCTTTGACACTGATGATGACAATGGGAGTTGGGGCAGATTATGGATGTGCCATTGACCCAGAAAGGATGGAAATCCGCTGTGGAGAAGGGCTTGTTGTGTGGAAAGAGGTGTCGGAATGGTATGACGGCTACGCCTATCACCCAGAATCACCTGACACGCTTGCACAGGCTCTCAGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCGTTTGTGGGGTCGTGCCCCAAAACAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGAAGCACTGCTCCGGAACTCAACTTGGTGCTGAGTGAGGGAGAAGCAAACTTGACCATCGTGGTAGACAAAACAGATCCGGCAGACTATAGGGGAGGCACTCCCATGGTTCTAAAGAAGACTGGAAAAGAGAGCAAGGTGTCCTGGAAGAGCTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTTCCTGATAGCCCCAGGCGCATGATGATGGGGGTTGACGGAGTTGGGGAGTGCCCCTTGTATAGGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAGTTTGGAGTGGGCCTACGCACGAAAGTGTTCTTGGATCTGCGTGGTGAAGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGAGCAGCCGTGAAGAATGGAAAAGCCATCCACACGGACCAAAGTATGTGGATGAGCTCCTTTCGGAATGACACGGGCACGTACATCCATGAGCTTATTCTCACTGATCTCAGGAACTGCACATGGCCAGCAAGTCACACTATTGATAATGATGGAGTTTTAGACTCCCATCTTTTCTTGCCAGTCACCCTTGCTGGGCCCAGGTCAAAGTACAACAGGATACCTGGGTACAGTGAACAAGTAAGAGGACCATGGGACCAGACTCCTCTGAGGGTGGTCCGGGACCATTGCCCTGGAACAAGTGTGAGGATTGACAGCCATTGTGACAAGAGAGGAGCTTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGTGGAAAGATCATTCCAGAGTGGTGCTGCCGGGCCTGTGAGCTACCACCGGTGACATTCCGTAGTGGCACGGATTGTTGGTACGCTATGGAAATCAGGCCAGTCCATTCGCAGGGCGGCTTGGTGCGTTCCATGGTAGTGGCTGACAATGGTGCCTTGCTTAGTGAGGGAGGAGTTCCTGGTCTAGTGGCAGTGTTTGTATTGATGGAATTCCTTTTGAGAAGGCGTCCGGGATCTGTCACGTCCATTTTGTGGGGAGGCATACTAATGCTGGGCTTGCTGGTCACGGGTCTCGTGAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTATGTCATAGCAGTTGGGGTCACTTTCCACTTGGAATTGGGACCAGAGACCATGGTTCTTGTGATGCTGCAGGCGGTCTTCAACATGCGCACATGTTATCTCATGGGGTTTCTTGTCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCTTGCTATTGGTCCTTGAGATGGGGATACCGGAGATGAACTTCGGACACCTCTGGGAATGGGCTGATGCACTGGCCATGGGGTTGCTCATAATCAAGGCCAGTGCGATGGAAGATCGCAGAGGTTTGGGATTCTTGCTGGCTGGGCTCATGACACAAAGACACCTAGTCGCTGTCCATCATGGTTTGATGGTATTTCTCACTGTGGCCTTGGCGGTAGTGGGACGGAATATCTACAATGGACAAAAAGAGAGGAAAGGACTGTGTTTCACAGTCCCCCTGGCCTCACTACTTGGTGGCTCCGGCTCCGGATTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGTCTTGGGGGTCGTGGCAGACGGAGCCTCAGTGAGCCCCTTACTGTGGTGGGGGTCATGCTGGCCATGGCCAGTGGACTACTACGACATTCATCCCAAGAGGCTCTTTTGGCCCTTTCTGCAGGATCCTTTCTCATTTTGATGCTGATCCTGGGGACCCGTAGACTCCAGCTAACGGCGGAATGGGCCGGAGTGGTGGAGTGGAACCCTGAGTTGGTCAATGAGGGAGGTGAGGTAAGCTTGAAGGTCAGACAGGATGCCATGGGGAACTTGCACTTGACAGAGGTGGAACGGGAGGAGCGTCGTTTGGCCTTATGGCTTGTGTTCGGCCTACTGGCATCGGCTTATCATTGGTCCGGAATATTGGTCACAATGGGGGCTTGGACAGTTTATGAGCTCTTCTCATCCACGCGGAGAACTGACCTGGTTTTTTCAGGGCAGTTGCCTGACCAAGGGGAAAAACGTTCCTTTGACATCAAGGAAGGCGTATACCGCATATACGCCCCTGGGCTCTTCTGGGGTTACCGCCAGATAGGTGTGGGATATGGAACGAAAGGAGTCTTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCCGCCCTCAGCGTGGAGGGGGCCACATCAGGACCATACTGGGCGGATGTGCGTGAAGACGTGGTCTGCTATGGGGGGGCCTGGGGCTTGGACAAAAAATGGGGAGGCGAAGTCGTTCAGGTACACGCATTCCCTCCGGACAGTGGACACAAAATCCATCAATGCCAGCCAGGAAAGCTGAACCTTGAGGGGGGGAGAGTTCTGGGGGCCATCCCGATAGACCTCCCACGTGGTACTTCAGGTAGC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TCCCGTGAGTTGGGTTCCCATGGGTCGCACCACTTGGAGCATCCACGCGAGTGGTGAATGGATGACAACAGAAGACATGCTGCGCATCTGGAACAAAGTCTGGATTTTGGACAACCCTCACATGGAAGATAAGCAGACAGTGGATGAGTGGAGAGACATCCCCTATCTGCCAAAAACACAGGACCTGGTATGTTCCTCACTTGTTGGGAGAAAGGAGAGGGCAGAATGGGCTAAGAACATCTGGGGCTCAGTGGAGAAGGTCAGGAAGCTCATTGGACCAGAAGACTACAGAGACTACTTATCAAGCATGGACAGACATGACCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCGATAATCTAAACTAGCATGACTGAACAGTCAAAAGAACCCTAACACAGGGGATGGTGTGGCAGCGCACAACGACATCGTGACGGGAGTGGGTCGCCCCCGACGCACCATCCTCTTGGGAAAAATTTTCGTGAGACCCTCACGGCTGGCAAAGGGCACCAGTCGTGTAGTAAGAAGGCCCTGGCCCAGTGCGGCAGCACACTCAGTGACGGGAAAGTGGTCGCTCCCGACGTAACTGGGTAAAAACGAACTTTGTGAGACCAAAAGGCCTCCTGGAAGGCTCACCAGGAGTTAGGCCGTTTAGGAGCCCCCGAGCATAACTCGGGAGGAGGGAGGAAGAAAATTGGCAATCTTCCTCGGGATTTTTCCGCCTCCTATACTAAATTTCCCCCAGGAAACTGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCACCATCCAGGCACAGATAGCCTGACAAGGAGATGGTGTGTGACTCGGAAAAACACCCGC
| 17,596
|
OL695841.1
|
Powassan virus
|
Jaeger,A.S., Vogels,C.B.F., Grubaugh,N.D., Bold,T.D., Aliota,M.T.
|
University of Minnesota, Twin Cities, Veterinary and Biomedical Sciences
|
USA
|
2022-07-16
|
PV320
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,808
|
GenBank
| null |
USA: MN
|
USA
|
Homo sapiens
|
cerebrospinal fluid
|
2020-06
| null | null |
Powassan virus isolate PV320, complete genome
|
GGCACTTTAGTCAGTGTCCGCGGCGTTCTTTTGAACGTGAGTGTGTTGAGRAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTCATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACTAGCAACAGGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTATGGCATGCCGTGACAGGCACGGCCAGGACCCCGGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCACTACGCCAAGCGGAATCCGCTCTGAAGAAGATCAAGAAAGTGATCGGAAACTTGATGCAGAGTCTCCACATGAGAGGACGTCGCAGATCAGGCGTTGACTGGACATGGACCTTCTTAGTTATGGCTTTGATGACTATGGCCATGGCAACTTCCATCCATCGGGATAGAGAGGGATACATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCAGCAAGTCAAGTTAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTTATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACGATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGAYTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTGGAGTACGGACGCTGTGGTAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCATGGCTCAAGGGTGACAACATTCGAGATCATGTTACCCGTGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCCGTAGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATAYGCCACGAGATGCACGCACCTTGAGAACAGGGACTTTGTAACAGGAGTACAGGGAACCACTAGGGTGTCCCTGGTTCTGGAGCTTGGGGGATGTGTGACCATCACTGCTGAGGGCAAGCCGTCCATTGACGTATGGTTGGAGGACATTTTCCAAGAAAGTCCCGCTGAAACCAGAGAATACTGCCTACACGCCAAGCTTTCCAATACAAAAGTAGAGGCTCGCTGCCCTACCACTGGGCCAGCTACGCTTCCAGAGGAGCACCAGGCCAACATGGTGTGTAAGAGAGACCAGAGCGACCGCGGATGGGGAAACCACTGTGGATTTTTCGGGAAAGGAAGCATMGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGTGAGGAAGCAAAAAAGGCTGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACATATGTTGTCAAGGTCGAGCCCCATACGGGGGATTACCAAGCTGCAAATGAGACCAATGAGAACAGGAAAACGGCACAGTTCACAGTGGCATCCGAGAAGGTGATCTTGGGCCTAGGAGACTATGGAGATGTGTCATTGACATGCAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGTAGCAAAGATCATCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGARGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACATAAAGATAATCAAGATTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTCGGGCCACCTCATGCTGTAAAAATGGACATCTTTAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTCTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGTGTGGACAACCAGAAATATCACTTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGGCTTGAAAAGTTGAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCTATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAATGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGTCATGAYACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACAGGGAGTGACAAGCCCTGCCGAATTCCAGTGCGAGCAGTGGCGCACGGTGCCCCGACAATCAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATTGAAACAAGTGGAGGAGGATTCATAGAGATGCAGTTGCCACCTGGGGACAACATTATCTATGTGGGGGATCTTAGTCAGCAGTGGTTTCAGAAAGGCAGCACCATAGGTAGAATGTTCGAAAAGACTCGCAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACACGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGTGGAATCCTGTCGTCAGTTGGAAAGGCCATCCATACGGTGTTGGGGGGGGCATTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTTAACGCTAGGAATCCAACAATGTCTATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGCCCTGACCTTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGCGCAGTTGATCCAGAAAGGATGGAAATTCGCTGCGGAGAAGGSCTWGTTGTGTGGAAAGAGGTATCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACACTTGCGCAGGCCCTCAGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAAAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTAGTGTTGAGCGAAGGAGAGGCAAACCTGACTATCGTGGTRGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCTCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAATCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTCCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCTTACGTACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGGGAAGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGATTGATGGGGGCAGCCGTGAAGAATGGYAAGGCCATTCACACGGACCAGAGCATGTGGATGAGCTCCTTCCGGAATGATACCGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTCACTGATCTTCGAAAYTGTACATGGCCGGCAAGCCACACCATCGATAATGATGGAGTCTTGGACTCTCGTCTTTTCCTGCCGGTTACTCTCGCCGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATATAGTGAGCAAACGAAAGGGCCGTGGGATCAGACCCCTCTGAGAGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTYAGAAGCACCACAGAAAGCGGGAAAATCATCCCAGAGTGGTGCTGCCGAGCTTGTGAACTGCCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGACTGTTGGTATGCCATGGAGATCAGACCGGTTCACTCGCAGGGTGGCCTGGTTAGATCTATGGTAATGGCTGACAACGGCGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAGTCCCTGGACTGGTGGCGGTGTTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTCACATCTATTTTATGGGGAGGTATACTCATGCTGGGTTTGCTTGTTACAGGGCTTGTAGGAGTGGAGGAGATTGTACGCTACTTCATAGCAGTTGGGATCACCTTCCACCTGGAGTTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCRGTYTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCACTGGGTTTCTCACTAAGAAGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTTTTGGTCCTGGAGATGGGGATACCAGAAATGAACCTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGATTCGTTGGCCATGGGACTACTCATAATYAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGCTTGGGATTCCTATTGGCTGGGCTCATGACACAGCGACACCTGACTGCTGTTCACCATGGATTGATAGTATTCCTCACTGTGGCTTTGGCCGTGGTGGGACGAAACATCTACAACGGACAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTCACCATCCCCTTGGCCTCGCTACTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTACGCATGTTAGCCTTGTGGGAATGCCTGAGGGGCCATGGCAGACGAAGTCTGAGTGAACCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTGGCAATGGCTAGTGGACTGCTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTTTACTGGTCCTCTCTGCTGGCTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATTTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGATTGGCTGAGTGGAACCCTGAATTGGTCAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGATGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAAGTGGAACGGGAAGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTAGTGTTTGGTTTGCTGGCTTCGGCCTTCCATTGGTCTGGAATATTGGTGACAATGGGRGCATGGACACTCTATGAGCTCCTCTCGTCAACACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAACTGTCCGACCACGGGGAGAGCAGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCTTATGGGGACACCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACTAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTCAGTGTGGAGGGAGCCGTTTCAGGACCATATTGGGCCGACGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTACGGAGGTGCCTGGAGCCTGGAAGGAAAATGGGGAGGCGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCCCCAGACAGTGGACACAAAGTCCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACCTACCCCGTGGTACCTCAGGCAGCCCAATCATCAACGCACAAGGGATTG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CGCACCACCTGGAGCATCCATGCGAGTGGTGAATGGATGACGACAGAAGACATGCTACGCATCTGGAACAAGGTTTGGATCTTGGACAACCCTCACATGGAAGACAAACAAACAGTGGATGAATGGAGAGACATTCCCTACCTACCAAAGACACAGGATCTGGTGTGCTCCTCACTTGTTGGAAGGAAGGAAAGGGCGGAATGGGCCAAGAACATYTGGGGTTCAGTGGAAAAGGTGAGGAAACTCATTGGAGCAGAGGACTACAGAGACTAYTTGGCAAACATGGACAGACATGACTTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAACTAGCACAACCATAATCAAGAGAAACCCGCTATAGGGGGTGATGTGGCAGCGCACCACGACATCGTGACGGGAAAAGGTCGTCCCCGACGCATCATCCCTCTAGGGCATTTTCGTGAGACCCTCACGGCTGTGAAAGGGCATCAGTCGTGTAGTAAGAAGGCCCTGGCCTACTGCGGCAGCACACACAGTGACGGGAAATTGGTCGCTCCCGACGCAGTTAGGTCAAAGAGAAATTTGTGAGACCAAAAGGCCTCCTGGAAGGCTCACCAGGAGTTAGGCCATTYTAGAGCCCCCGGGCATAACTCGGGAGGAGGGGGGAAGACAATTGGCAATCTTCCCCGGGATTTTTCCGCCTCCTATACCAAATTTCCCCCAGGAAACTGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCGCCATCCAGGCACAGACAGCCTGACAAGGAGATGGTGTGTGACTCGGAAARACACC
| 28,796
|
OL695842.1
|
Powassan virus
|
Jaeger,A.S., Vogels,C.B.F., Grubaugh,N.D., Aliota,M.T.
|
University of Minnesota, Twin Cities, Veterinary and Biomedical Sciences
|
USA
|
2022-07-16
|
PV318
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,727
|
GenBank
| null |
USA: MN
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2019-06
| null | null |
Powassan virus isolate PV318, complete genome
|
GTGTTGAGRAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTCATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACTAGCAACAGGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTATGGCATGCCGTGACAGGCACGGCCAGGACCCCGGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCACTACGCCAAGCGGAATCCGCTCTGAAGAAGATCAAGAAAGTGATCGGAAACTTGATGCAGAGTCTCCACATGAGAGGACGTCGCAGATCAGGCGTTGACTGGACATGGACCTTCTTAGTTATGGCTTTGATGACTATGGCCATGGCAACTTCCATCCATCGGGATAGAGAGGGATACATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCAGCAAGTCAAGTTAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTTATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACGATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGAYTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTGGAGTACGGACGCTGTGGTAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCATGGCTCAAGGGTGACAACATGCGAGATCATGTTACCCGTGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCCGTAGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATAYGCCACGAGATGCACGCACCTTGAGAACAGGGACTTTGTAACAGGAGTACAGGGGACCACTAGGGTGTCCCTGGTTCTGGAGCTTGGGGGATGTGTGACCATCACTGCTGAGGGCAAGCCGTCCATTGACGTATGGCTGGAGGACATTTTCCAAGAAAGTCCCGCTGAAACCAGAGAATACTGTCTACACGCCAAGCTTTCCAATACAAAAGTAGAGGCTCGCTGCCCTACCACTGGGCCAGCTACGCTTCCAGAGGARCACCAGGCCAACATGGTGTGTAAGAGAGACCAGAGCGACCGCGGATGGGGAAACCACTGTGGATTTTTCGGGAAAGGAAGCATCGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGTGAGGAAGCAAAAAAGGCTGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACATATGTTGTCAAGGTCGAGCCCCATACGGGGGATTACCAAGCTGCAAATGAGACCAATGAGAACAGGAAAACGGCACAGTTTACAGTGGCATCCGAGAAGGTGATCTTGGACCTAGGAGACTATGGAGATGTGTCATTGACATGCAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGTAGCAAAGATCATCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGARGACCTAGCCCTGCCTTGGAAATATAAAGACAATCAAGATTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAATTCGGGCCACCTCATGCTGTAAAAATGGACATCTTTAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTTTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGTGTGGACAACCAGAAATATCACTTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGRCTTGAAAAGTTGAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCTATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAATGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGTCATGAYACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACAGGGAGTGACAAGCCCTGCCGAATTCCAGTGCGAGCAGTGGCGCACGGTGTCCCGACAATCAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATTGAAACAAGTGGAGGAGGATTCATAGAGATGCAGTTGCCACCTGGGGACAACATTATCTATGTGGGGGATCTTAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGYACCATAGGTAGAATGTTCGAAAAGACTCGCAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACACGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGTGGAATCCTGTCGTCAGTTGGAAAGGCCATCCATACGGTGTTGGGGGGGGCATTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTTAACGCTAGGAATCCAACAATGTCTATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGCCCTGACCTTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGCGCAGTTGATCCAGAAAGGATGGAAATTCGCTGCGGAGAAGGSCTWGTTGTGTGGAAAGAGGTATCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACACTTGCGCAGGCCCTCAGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAAAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTAGTGTTGAGCGAAGGAGAGGCAAACCTGACTATCGTGGTRGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCTCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAATCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTCCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCTTACGTACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGGGAAGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCTGTGAAGAATGGCAAGGCCATTCACACGGAYCAGAGCATGTGGATGAGCTCCTTTCGGAATGATACCGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTCACTGATCTTCGAAAYTGTACATGGCCGGCAAGCCACACCATCGATAATGATGGAGTCTTGGACTCTCGTCTTTTCCTGCCGGTTACTCTCGCCGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATATAGTGAGCAAACGAAAGGGCCGTGGGATCAGACCCCTCTGAGAGTGATCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTYAGAAGCACCACAGAAAGCGGGAAAATCATCCCAGAGTGGTGCTGCCGAGCTTGTGAACTGCCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGAYTGTTGGTATGCCATGGAGATCAGACCGGTTCACTCGCAGGGTGGCCTGGTTAGATCTATGGTAATGGCTGACAACGGCGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAGTCCCTGGACTGGTGGCGGTGTTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTCACATCTATTTTATGGGGAGGTATACTCATGCTGGGTTTGCTTGTTACAGGGCTTGTAGGAGTGGAGGAGATTGTACGCTACTTCATAGCAGTTGGGATCACCTTCCACCTGGAGTTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCRGTYTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCACTGGGTTTCTCACTAAGAAGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTTTTGGTCCTGGAGATGGGGATACCAGAAATGAACCTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGATTCGTTGGCCATGGGACTACTCATAATTAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGTTTGGGATTCCTATTGGCTGGGCTCATGACACAGCGACACCTGACTGCTGTTCACCATGGATTGATAGTATTCCTCACTGTGGCTTTGGCCGTGGTGGGACGAAACATCTACAACGGACAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTCACCATCCCTTTGGCCTCGCTACTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTACGCATGTTAGCCTTGTGGGAATGCCTGAGGGGCCATGGCAGACGAAGTCTGAGTGAACCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTGGCAATGGCTAGTGGACTGCTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTTTACTGGTCCTCTCTGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATTTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGATTGGCTGAGTGGAACCCTGAATTGGTCAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGATGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAAGTGGAACGGGAAGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTAGTGTTTGGTTTGCTGGCTTCGGCCTTCCATTGGTCTGGAATATTGGTGACAATGGGRGCATGGACACTCTATGAGCTCCTCTCGTCAACACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAACTGTCCGACCACGGGGAGAGCAGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCTTATGGGGTCACCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTCAGTGTGGAAGGAGCCGTTTCAGGACCATATTGGGCCGACGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTACGGAGGTGCCTGGAGCCTGGAAGGAAAATGGGGAGGCGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCCCCAGACAGTGGACACAAAGTCCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACCTACCCCGTGGTACCTCAGGCAGCCCAATCATCAACGCACAAGGGATTGTGCTGGGTCTTTACGGTAACGGTCTGAAATCAAATGATGTTT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ACAGAAGACATGCTACGCATCTGGAACAAGGTTTGGATCTTGGACAACCCTCACATGGAAGACAAACAAACAGTGGATGAATGGAGAGACATTCCCTACCTACCAAAGACACAGGATCTGGTGTGCTCCTCACTTGTTGGAAGGAGGGAAAGAGCGGAATGGGCCAAGAACATYTGGGGTTCAGTGGAAAAGGTGAGGAAACTCATTGGAGCAGAGGACTACAGAGACTAYTTGGCAAACATGGACAGACATGACTTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAACCAGCACAACCATAATCAAGAGAAACCCGCTATAGGGGGTGATGTGGCAGCGCACCACGACATCGTGACGGGAAAAGGTCGTCCCCGACGCATCATCCCTCTAGGGCATTTTCGTGAGACCCTCACGGCTGTGAAAGGGCATCAGTCGTGTAGTAAGAAGGCCCTGGCCTACTGCGGCAGCACACATAGTGACGGGAAATTGGTCGCTCCCGACGCAGTTAGGTCAAAGAGAAATTTGTGAGACCAAAAGGCCTCCTGGAAGGCTCACCAGGAGTTAGGCCATTCTAGAGCCCCCGGGCATAACTCGGGAGGAGGGGGGAAGACAATTGGCAATCTTCCCCGGGATTTTTCCGCCTCCTATACCAAATTTCCCCCAGGAAACTGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCGCCATCCAGGCACAGAC
| 28,797
|
OL695843.1
|
Powassan virus
|
Jaeger,A.S., Vogels,C.B.F., Grubaugh,N.D., Aliota,M.T.
|
University of Minnesota, Twin Cities, Veterinary and Biomedical Sciences
|
USA
|
2022-07-16
|
PV315
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,727
|
GenBank
| null |
USA: MN
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2019-06
| null | null |
Powassan virus isolate PV315, complete genome
|
GTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTCATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACTAGCAACAGGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTATGGCATGCCGTGACAGGCACGGCCAGGACCCCGGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCACTACGCCAAGCGGAATCCGCTCTGAAGAAGATCAAGAAAGTGATCGGAAACTTGATGCAGAGTCTCCACATGAGAGGACGTCGCAGATCAGGCGTTGACTGGACATGGACCTTCTTAGTTATGGCTTTGATGACTATGGCCATGGCAACTTCCATCCATCGGGATAGAGAGGGATACATGGTTATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCAGCAAGTCAAGTTAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTTATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACGATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGAYTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTGGAGTACGGACGCTGTGGTAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCATGGCTCAAGGGTGACAACATTCGAGATCATGTTACCCGTGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCCGTAGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATAYGCCACGAGATGCACGCACCTTGAGAACAGGGACTTTGTAACAGGAGTACAGGGAACCACTAGGGTGTCCCTGGTTCTGGAGCTTGGGGGATGTGTGACCATCACAGCTGAGGGCAAGCCGTCCATTGACGTATGGCTGGAGGACATTTTCCAAGAAAGTCCCGCTGAAACCAGAGAATACTGTCTACACGCCAAGCTTTCCAATACAAAAGTAGAGGCTCGCTGCCCTACCACTGGGCCAGCTACGCTTCCAGAGGARCACCAGGCCAACATGGTGTGTAAGAGAGACCAGAGCGACCGCGGATGGGGAAACCACTGTGGATTTTTCGGGAAAGGAAGCATCGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGTGAGGAAGCAAAAAAGGCTGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACATATGTTGTCAAGGTCGAGCCCCATACGGGGGATTACCAAGCTGCAAATGAGACCAATGAGAACAGGAAAACGGCACAGTTCACAGTGGCATCCGAGAAGGTGATCTTGGACCTAGGAGACTATGGAGATGTGTCATTGACATGCAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGTAGCAAAGATCATCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGARGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACATAAAGATAATCAAGATTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTCGGGCCACCTCATGCTGTAAAAATGGACATCTTTAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTCTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGTGTGGACAACCAGAAATATCACTTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGRCTTGAAAAGTTGAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCTATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAATGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGTCATGAYACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACAGGGAGTGACAAGCCCTGCCGAATTCCAGTGCGAGCAGTGGCGCACGGTGTCCCGACAATCAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATTGAAACAAGTGGAGGAGGATTCATAGAGATGCAGTTGCCACCTGGGGACAACATTATCTATGTGGGGGATCTTAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGYACCATAGGTAGAATGTTCGAAAAGACTCGCAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACACGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGTGGAATCCTGTCGTCAGTTGGAAAGGCCATCCATACGGTGTTGGGGGGGGCATTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTTAACGCTAGGAATCCAACAATGTCTATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGCCCTGACCTTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGCGCAGTTGATCCAGAAAGGATGGAAATTCGCTGCGGAGAAGGSCTWGTTGTGTGGAAAGAGGTATCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACACTTGCGCAGGCCCTCAGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAAAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTAGTGTTGAGCGAAGGAGAGGCAAACCTGACTATCGTGGTRGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCTCTGAAGAAAACTGGAAAGGGGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAATCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTCCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCTTACGTACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGGGAAGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCCGTGAAGAATGGCAAGGCCATTCACACGGAYCAGAGCATGTGGATGAGCTCCTTCCGGAATGATACCGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTCACTGATCTTCGAAAYTGTACATGGCCGGCAAGCCACACCATCGATAATGATGGAGTCTTGGACTCTCGTCTTTTCCTGCCGGTTACTCTCGCCGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATATAGTGAGCAAACGAAAGGGCCGTGGGATCAGACCCCTCTGAGAGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTYAGAAGCACCACAGAAAGCGGGAAAATCATCCCAGAGTGGTGCTGCCGAGCTTGTGAACTGCCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGAYTGTTGGTATGCCATGGAGATCAGACCGGTTCACTCGCAGGGTGGCCTGGTTAGATCTATGGTAATGGCTGACAACGGCGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAGTCCCTGGACTGGTGGCGGTGTTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTAAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTCACATCTGTTTTATGGGGAGGTATACTCATGCTGGGTTTGCTTGTTACAGGGCTTGTAGGAGTGGAGGAGATTGTACGCTACTTCATAGCAGTTGGGATCACCTTCCACCTGGAGTTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCRGTYTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCACTGGGTTTCTCGCTAAGAAGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTTTTGGTCCTGGAGATGGGGATACCAGAAATGAACCTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGATTCGTTGGCCATGGGACTACTCATAATYAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGCTTGGGATTCCTATTGGCTGGGCTCATGACACAGCGACACCTGACTGCTGTTCACCATGGATTGATAGTATTCCTCACTGTGGCTTTGGCCGTGGTGGGACGAAACATCTACAACGGACAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTCACCATCCCTTTGGCCTCGCTACTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTACGCATGTTAGCCTTGTGGGAATGCCTGAGGGGCCATGGCAGACGAAGTCTGAGTGAACCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTGGCAATGGCTAGTGGACTGCTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTTTACTGGTCCTCTCTGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATTTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGATTGGCTGAGTGGAACCCTGAATTGGTCAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGATGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAAGTGGAACGGGAAGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTAGTGTTTGGTTTGCTGGCTTCGGCCTTCCATTGGTCTGGAATATTGGTGACAATGGGRGCATGGACACTCTATGAGCTCCTCTCGTCAACACGTAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAACTGTCCGACCACGGGGAGAGCAGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCTTATGGGGTCACCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTCAGTGTGGAAGGAGCCGTTTCAGGACCATATTGGGCCGACGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTACGGAGGTGCCTGGAGCCTGGAAGGAAAATGGGGAGGCGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCCCCAGACAGTGGACACAAAGTCCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACCTACCCCGTGGTACCTCAGGCAGCCCAATCATCAACGCACAAGGGATTGTGCTGGGTCTTTACGGTAACGGTCTGAAATCAAATGATGTTT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ACAGAAGACATGCTACGCATCTGGAACAAGGCTTGGATCTTGGACAACCCTCACATGGAAGACAAACAAACAGTGGATGAATGGAGAGACATTCCCTACCTACCAAAGACACAGGATCTGGTGTGCTCCTCACTTGTTGGAAGGAAGGAAAGGGCGGAATGGGCCAAGAACATYTGGGGTTCAGTGGAAAAGGTGAGGAAACTCATTGGAGCAGAGGACTACAGAGACTAYTTGGCAAACATGGACAGACATGACTTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAACTAGCACAACCATAATCAAGAGAAACCCGCTATAGGGGGTGATGTGGCAGCGCACCACGACATCGTGACGGGAAAAGGTCGTCCCCGACGCATCATCCCTCTAGGGCATTTTCGTGAGACCCTCACGGCTGTGAAAGGGCATCAGTCGTGTAGTAAGAAGGCCCTGGCCTACTGCGGCAGCACACACAGTGACGGGAAATTGGTCGCTCCCGACGCAGTTAGGTCAAAGAGAAATTTGTGAGACCAAAAGGCCTCCTGGAAGGCTCACCAGGAGTTAGGCCATTYTAGAGCCCCCGGGCATAACTCGGGAGGAGGGGGGAAGACAATTGGCAATCTTCCCCGGGATTTTTCCGCCTCCTATACCAAATTTCCCCCAGGAAACTGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCGCCATCCAGGCACAGAC
| 28,798
|
OL695844.1
|
Powassan virus
|
Jaeger,A.S., Vogels,C.B.F., Grubaugh,N.D., Aliota,M.T.
|
University of Minnesota, Twin Cities, Veterinary and Biomedical Sciences
|
USA
|
2022-07-16
|
PV316
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,689
|
GenBank
| null |
USA: MN
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2019-06
| null | null |
Powassan virus isolate PV316, complete genome
|
GTGTTGAGRAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTCATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACTAGCAACAGGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTATGGCATGCCGTGACAGGCACGGCCAGGACCCCGGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCACTACGCCAAGCGGAATCCGCTCTGAAGAAGATCAAGAAAGTGATCGGAAACTTGATGCAGAGTCTCCACATGAGAGGACGTCGCAGATCAGGCGTTGACTGGACATGGACCTTCTTAGTTATGGCTTTGATGACTATGGCCATGGCAACTTCCATCCATCGGGATAGAGAGGGATACATGGTTATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCAGCAAGTCAAGTTAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTTATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACGATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGACTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTGGAGTACGGACGCTGTGGTAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCATGGCTCAAGGGTGACAACATTCGAGATCATGTTACCCGTGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCCGTAGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCYGTATAYGCCACGAGATGCACGCACCTTGAGAACAGGGACTTTGTAACAGGAGTACAGGGAACCACTAGGGTGTCCCTGGTTCTGGAGCTTGGGGGATGTGTGACCATCACAGCTGAGGGCAAGCCGTCCATTGACGTATGGCTGGAGGACATTTTCCAAGAAAGTCCCGCTGAAACCAGAGAATACTGTCTACACGCCAAGCTTTCCAATACAAAAGTAGAGGCTCGCTGCCCTACCACTGGGCCAGCTACGCTTCCAGAGGARCACCAGGCCAACATGGTGTGTAAGAGAGACCAGAGCGACCGCGGATGGGGAAACCACTGTGGATTTTTCGGGAAAGGAAGCATMGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGTGAGGAAGCAAAAAAGGCTGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACATATGTTGTCAAGGTCGAGCCCCATACGGGGGATTACCAAGCTGCAAATGAGACCAATGAGAACAGGAAAACGGCACAGTTCACAGTGGCATCCGAGAAGGTGATCTTGGACCTAGGAGACTATGGAGATGTGTCATTGACATGCAAGGTGGCAAGYGGAATTGATGTCRCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGTAGCAAAGATCATCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGARGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACATAAAGATAATCAAGATTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTCGGGCCACCTCATGCTGTAAAAATGGACATCTTTAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTCTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGTGTGGACAACCAGAAATATCACTTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGRCTTGAAAAGTTGAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCTATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAATGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGTCATGAYACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACAGGGAGTGACAAGCCCTGCCGAATTCCAGTGCGAGCAGTGGCGCACGGTGTCCCGACAATCAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATTGAAACAAGTGGAGGAGGATTCATAGAGATGCAGTTGCCACCTGGGGACAACATTATCTATGTGGGGGATCTTAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGYACCATAGGTAGAATGTTCGAAAAGACTCGCAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACACGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGTGGAATCCTGTCGTCAGTTGGAAAGGCCATCCATACGGTGTTGGGGGGGGCATTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGTCTTGGTGTGGTTGGGGCTTAACGCTAGGAATCCAACAATGTCTATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGCCCTGACCTTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGCGCAGTTGATCCAGAAAGGATGGAAATTCGCTGCGGAGAAGGSCTWGTTGTGTGGAAAGAGGTATCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACACTTGCGCAGGCCCTCAGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAAAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTAGTGTTGAGCGAAGGAGAGGCAAACCTGACTATCGTGGTRGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCTCTGAAGAAAACTGGAAAGGGGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAATCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTCCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCTTACGTACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGGGAAGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCCGTGAAGAATGGCAAGGCCATTCACACGGAYCAGAGCATGTGGATGAGCTCCTTCCGAAATGATACCGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTCACTGATCTTCGAAAYTGTACATGGCCGGCAAGCCACACCATCGATAATGATGGAGTCTTGGACTCTCGTCTTTTCCTGCCGGTTACTCTCGCCGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATATAGTGAGCAAACGAAAGGGCCGTGGGATCAGACCCCTCTGAGAGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTYAGAAGCACCACAGAAAGCGGGAAAATCATCCCAGAGTGGTGCTGCCGAGCTTGTGAACTGCCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGACTGTTGGTATGCCATGGAGATCAGACCGGTTCACTCGCAGGGTGGCCTGGTTAGATCTATGGTAATGGCTGACAACGGCGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAGTCCCTGGACTGGTGGCGGTGTTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTCACATCTGTTTTATGGGGAGGTATACTCATGCTGGGTTTGCTTGTTACAGGGCTTGTAGGAGTGGAGGAGATTGTACGCTACTTCATAGCAGTTGGGATCACCTTCCACCTGGAGTTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCRGTYTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCACTGGGTTTCTCGCTAAGAAGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTTTTGGTCCTGGAGATGGGGATACCAGAAATGAACCTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGATTCGTTGGCCATGGGACTACTCATAATYAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGCTTGGGATTCCTATTGGCTGGGCTCATGACACAGCGACACCTGACTGCTGTTCACCATGGATTGATAGTATTCCTCACTGTGGCTTTGGCCGTGGTGGGACGAAACATCTACAACGGACAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTCACCATCCCTTTGGCCTCGCTACTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTACGCATGTTAGCCTTGTGGGAATGCCTGAGGGGCCATGGCAGACGAAGTCTGAGTGAACCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTGGCAATGGCTAGTGGACTGCTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTTTACTGGTCCTCTCTGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATTTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGATTGGCTGAGTGGAACCCTGAATTGGTCAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGATGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAAGTGGAACGGGAAGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTAGTGTTTGGTTTGCTGGCTTCGGCCTTCCATTGGTCTGGAATATTGGTGACAATGGGRGCATGGACACTCTATGAGCTCCTCTCGTCAACACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAACTGTCCGACCACGGGGAGAGCAGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCTTATGGGGTCACCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTCAGTGTGGAAGGAGCCGTTTCAGGACCATATTGGGCCGACGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTACGGAGGTGCCTGGAGCCTGGAAGGAAAATGGGGAGGCGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCCCCAGACAGTGGACACAAAGTCCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCKAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACCTACCCCGTGGTACCTCAGGCAGCCCAATCATCAACGCACAAGGGATTGTGCTGGGTCTTTACGGTAACGGTCTGAAATCAAATGATGTTT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ACAGAAGACATGCTACGCATCTGGAACAAGGTTTGGATCTTGGACAACCCTCACATGGAAGACAAACAAACAGTGGATGAATGGAGAGACATTCCCTACCTACCAAAGACACAGGATCTGGTGTGCTCCTCACTTGTTGGAAGGAAGGAAAGGGCGGAATGGGCCAAGAACATYTGGGGTTCAGTGGAAAAGGTGAGGAAACTCATTGGAGCAGAGGACTACAGAGACTAYTTGGCAAACATGGACAGACATGACTTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAACTAGCACAACCNATGATCAAGAGAAACCCGCTATAGGGGGTGATGTGGCAGCGCACCACGACATCGTGACGGGAAAAGGTCGTCCCCGACGCATCATCCCTCTAGGGCATTTTCGTGAGACCCTCACGGCTGTGAAAGGGCATCAGTCGTGTAGTAAGAAGGCCCTGGCCTACTGCGGCAGCACACACAGTGACGGGAAATTGGTCGCTCCCGACGCAGTTAGGTCAAAGAGAAATTTGTGAGACCAAAAGGCCTCCTGGAAGGCTCACCAGGAGTTAGGCCATTCTAGAGCCCCCGGGCATAACTCGGGAGGAGGGGGGAAGACAATTGGCAATCTTCCCCGGGATTTTTCCGCCTCCTATACCAAATTTCCCCCAGGAAACTGGGGGGGCGG
| 28,799
|
OL704116.1
|
Powassan virus
|
Vogels,C.B.F., Anderson,J.F., Armstrong,P.M., Grubaugh,N.D.
|
Yale School of Public Health, Epidemiology of Microbial Diseases
|
USA
|
2022-07-06
|
P1734
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,812
|
GenBank
| null |
USA: Bridgeport, CT
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2014-10-29
| null |
PRJNA889421
|
Powassan virus isolate P1734, complete genome
|
TTCTTGCACGTGTGTGTGGGCACTTTAGTCAGTGTCCGCGGCGTTCTTTTGAACGTGAGTGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTCATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACCAGCAACAAGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTTTGGCATGCCATGACAGGCACGGCCAGGACCCCAGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCATTACGCCAAGCGGAATCTGCGTTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATTGGAAACTTGATGCAGAGCCTCCACATGAGGGGACGTCGCAGATCAGGCGTCGACTGGACATGGACTTTCTTGGTAATGGCTTTGATGGCTATGGCCATGGCGACCTCCATCCATCGGGATAAAGAGGGATATATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCCGCAAGCCAAGTCAGAGTCCAAAACGGAACATGCGTCATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACCATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGATTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTAGAGTACGGACGCTGTGGAAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCGTGGCTCAAGGGTGATAACATCCGAGATCATGTTACCCGCGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCTGTCGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATACGCCACGAGATGCACACACCTTGAGAACAGGGACTTTGTAACAGGAGTACAGGGAACCACTAGGGTATCCCTGGTTCTGGAGCTTGGAGGATGTGTGACCATTACTGCTGAAGGCAAGCCATCTATTGATGTATGGCTGGAGGACATTTTTCAAGAAAGTCCTGCTGAAACCAGAGAATACTGTTTACACGCCAAGCTCTCCAACACGAAAGTAGAGGCTCGTTGCCCCACCACCGGGCCAGCCACGCTTCCAGAGGAACACCAGGCCAACATGGTGTGCAAGAGAGACCAGAGTGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGATTTTTTGGGAAAGGAAGCATAGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGCGAGGAAGCAAAAAAGGCTGTAGGCCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACGTACGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACGGGGGACTACCAAGCTGCAAATGAAACCAACGAGAACAGGAAAACGGCCCAGTTCACGGTGGCATCTGAGAAGGTGATTTTAAATCTAGGAGACTATGGAGATGTCTCATTGACATGTAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGCAACAAAGATCACCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGAAGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACACAAAGACAATCAGGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTTGGGCCGCCCCATGCAGTGAAAATGGATATCTTCAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTCTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGCGTGGACAACCAGAAATATCACCTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGACTTGAAAAGCTAAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCCATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAGTGGAAAAGAGTTCCCGTGGACAGTGGTCATGACACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACGGGAAGTGACAAGCCCTGCCGGATTCCGGTACGAGCAGTGGCACATGGTGTCCCGACAATTAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATCGAAACAAGTGGAGGAGGATTTATAGAGATGCAGTTGCCACCGGGGGACAACATCATCTATGTGGGGGACCTAAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGTACCATAGGTAGAATGCTCGAAAAGACCCGTAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGTGGAATCCTGTCGTCAGTGGGGAAAGCCGTTCACACAGTGTTGGGAGGGGCGTTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTCAACGCTAGGAATCCAACAATGTCCATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGTTTTGACCCTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGTGCAGTTGATCCAGAGAGGATGGAAATCCGATGTGGAGAAGGCCTAGTTGTGTGGAAAGAGGTATCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACGCTGGCGCAGGCCCTCCGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAGAATAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTGGTGTTGAGTGAAGGAGAGGCGAATCTGACCATCGTGGTAGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCCCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTCCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGAGTTGGCCTACGCACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGAGAGGCTTCAAGAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCTGTGAAGAACGGCAAGGCCATTCACACGGATCAGAGCATGTGGATGAGTTCCTTCCGGAATGATACTGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTTACTGACCTTCGAAACTGTACATGGCCAGCAAGTCACACCATTGACAACGACGGAGTCTTGGACTCCCGTCTTTTTCTGCCTGTCACTCTCGCTGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATACAGCGAGCAAACGAAAGGGCCATGGGACCAGACCCCTCTGAGGGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGCGGAAAGATCATCCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCTTGTGAATTACCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGATTGTTGGTATGCCATGGAGATTAGACCGGTTCACTCACAGGGTGGCTTGGTTCGATCCATGGTAATGGCTGACAACGGTGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAATCCCTGGACTGGTGGCGGTATTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGCTACATCCATTCTGTGGGGAGGCATACTCATGCTGGGCTTGCTTGTTACAGGGCTTGTTAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTACATCATAGCGGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAGCTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCAGTTTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCATTGGGTTTCTCGTCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTCTTGGTCCTAGAGATGGGGATACCAGAGATGAACTTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGACTCATTGGCCATGGGACTACTCATAATCAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGTCTAGGATTCTTATTGGCTGGGCTCATGACACAACGACATCTGACTGCTGTTCACCATGGATTAATAGTATTCCTCACTGTGGCTCTGGCGGTGGTGGGACGAAGCATCTACAACGGGCAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTTACCATCCCCTTGGCCTCGCTATTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGCCTGGGTGGTCGTGGCAGACGAAGTCTGAGTGAGCCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTAGCAATGGCTAGTGGGCTGTTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTCTACTGGTCCTCTCGGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATCTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGACTGGTTGAATGGAACCCTGAGTTGGTTAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGACGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAGGTGGAACGGGAGGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTGGCATTTGGCTTGCTAGCTTCGGCTTTCCATTGGTCCGGAATACTGGTGACAATGGGGGCATGGACACTGTATGAGCTCTTCTCATCAGCACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAATTGTCTGACCATGGGGAGAAACGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCGTATGGGGTCACCGTCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTTAGTGTGGAGGGGGCCGTCTCGGGACCATATTGGGCGGATGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTATGGAGGTGCCTGGAGCTTGGAAGGAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCACCAGACAGTGGACATAAAGTTCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACTTACCTCGTGGAACCTCAGGCAGCCCAATCA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AACTGGGTTCCGATGGGCCGCACCACCTGGAGCATCCATGCGAGTGGTGAGTGGATGACGACAGAAGACATGCTACGCATCTGGAACAAGGTCTGGATTTTGGACAACCCTCACATGGAAAACAAACAAATGGTGGATGAATGGAGAGATATTCCCTACTTGCCAAAGACACAGGATCTGGTATGTTCCTCACTTGTTGGAAGGAAGGAAAGGGCTGAATGGGCCAAGAACATCTGGGGCTCAGTGGAAAAGGTGAGGAAACTCATTGGAGCAGAGGAATACAGAGACTATTTGGCAAACATGGACAGACATGATCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAACTAGCACAACCAAATAATCAGAAGAAACCCACTACAGGGGGTGATGTGGCAGCGCACCACGACATCGTGACGGGAAGAGGTCGTCCCCGACGCATCATCTCTCTAGGGCATTTTCGTGAGACCCTCATGGCTGCTAAAGGGGCATCAGCCGTGTAGTAAGAAGGCCCCGACCTACTGCGGCAGCACACACAGTGACGGGAAGTTGGTCGCTCCCGACGCAGTTAGGTCAGAAAAAATTTTGTGAGACCAAAAGGCCTCCTGGAAGGCTCACCAGGAGTTAGGCCATTCTAGAGCCCCCGGGCATAACTCGGGAGGAGGGGGGAAGACAATTGGCAATCTTCCCCGGGATTTTTCCGCCTCCTATACTAAATTTCCCCCAGGAAACTGGGGGGGCGGTTCTTGTTYTYCCKGAGCCACCGCCATCCAGGCACAGATAGCCTGACAAGGAGATGGTGAG
| 28,903
|
OL704117.1
|
Powassan virus
|
Vogels,C.B.F., Anderson,J.F., Armstrong,P.M., Grubaugh,N.D.
|
Yale School of Public Health, Epidemiology of Microbial Diseases
|
USA
|
2022-07-06
|
P1735
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,802
|
GenBank
| null |
USA: Bridgeport, CT
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2014-10-29
| null |
PRJNA889421
|
Powassan virus isolate P1735, complete genome
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TTCTTGCACGTGTGTGTGGGCACTTTAGTCAGTGTCCGCGGCGTTCTTTTGAACGTGAGTGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTCATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACCAGCAACAAGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTTTGGCATGCCATGACAGGCACGGCCAGGACCCCAGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCATTACGCCAAGCGGAATCTGCGTTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATTGGAAACTTGATGCAGAGCCTCCACATGAGGGGACGTCGCAGATCAGGCGTCGACTGGACATGGACTTTCTTGGTAATGGCTTTGATGGCTATGGCCATGGCGACCTCCATCCATCGGGATAAAGAGGGATATATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCCGCAAGCCAAGTCAGAGTCCAAAACGGAACATGCGTCATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACCATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGATTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTAGAGTACGGACGCTGTGGAAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCGTGGCTCAAGGGTGATAACATCCGAGATCATGTTACCCGCGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCTGTCGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATACGCCACGAGATGCACACACCTTGAGAACAGGGACTTTGTAACAGGAGTACAGGGAACCACTAGGGTATCCCTGGTTCTGGAGCTTGGAGGATGTGTGACCATTACTGCTGAAGGCAAGCCATCTATTGATGTATGGCTGGAGGACATTTTTCAAGAAAGTCCTGCTGAAACCAGAGAATACTGTTTACACGCCAAGCTCTCCAACACGAAAGTAGAGGCTCGTTGCCCCACCACCGGGCCAGCCACGCTTCCAGAGGAACACCAGGCCAACATGGTGTGCAAGAGAGACCAGAGTGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGATTTTTTGGGAAAGGAAGCATAGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGCGAGGAAGCAAAAAAGGCTGTAGGCCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACGTACGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACGGGGGACTACCAAGCTGCAAATGAAACCAACGAGAACAGGAAAACGGCCCAGTTCACGGTGGCATCTGAGAAGGTGATTTTAAATCTAGGAGACTATGGAGATGTCTCATTGACATGTAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGCAACAAAGATCACCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGAAGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACACAAAGACAATCAGGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTTGGGCCGCCCCATGCAGTGAAAATGGATATCTTCAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTCTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGCGTGGACAACCAGAAATATCACCTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGACTTGAAAAGCTAAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCCATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAGTGGAAAAGAGTTCCCGTGGACAGTGGTCATGACACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACGGGAAGTGACAAGCCCTGCCGGATTCCGGTACGAGCAGTGGCACATGGTGTCCCGACAATTAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATCGAAACAAGTGGAGGAGGATTTATAGAGATGCAGTTGCCACCGGGGGACAACATCATCTATGTGGGGGACCTAAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGTACCATAGGTAGAATGCTCGAAAAGACCCGTAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGTGGAATCCTGTCGTCAGTGGGGAAAGCCGTTCACACAGTGTTGGGAGGGGCGTTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTCAACGCTAGGAATCCAACAATGTCCATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGTTTTGACCCTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGTGCAGTTGATCCAGAGAGGATGGAAATCCGATGTGGAGAAGGCCTAGTTGTGTGGAAAGAGGTATCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACGCTGGCGCAGGCCCTCCGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAGAATAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTGGTGTTGAGTGAAGGAGAGGCGAATCTGACCATCGTGGTAGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCCCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTCCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGAGTTGGCCTACGCACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGAGAGGCTTCAAGAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCTGTGAAGAACGGCAAGGCCATTCACACGGATCAGAGCATGTGGATGAGTTCCTTCCGGAATGATACTGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTTACTGACCTTCGAAACTGTACATGGCCAGCAAGTCACACCATTGACAACGACGGAGTCTTGGACTCCCGTCTTTTTCTGCCTGTCACTCTCGCTGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATACAGCGAGCAAACGAAAGGGCCATGGGACCAGACCCCTCTGAGGGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGCGGAAAGATCATCCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCTTGTGAATTACCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGATTGTTGGTATGCCATGGAGATTAGACCGGTTCACTCACAGGGTGGCTTGGTTCGATCCATGGTAATGGCTGACAACGGTGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAATCCCTGGACTGGTGGCGGTATTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGCTACATCCATTCTGTGGGGAGGCATACTCATGCTGGGCTTGCTTGTTACAGGGCTTGTTAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTACATCATAGCGGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAGCTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCAGTTTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCATTGGGTTTCTCGTCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTCTTGGTCCTAGAGATGGGGATACCAGAGATGAACTTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGACTCATTGGCCATGGGACTACTCATAATCAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGTCTAGGATTCTTATTGGCTGGGCTCATGACACAACGACATCTGACTGCTGTTCACCATGGATTAATAGTATTCCTCACTGTGGCTCTGGCGGTGGTGGGACGAAGCATCTACAACGGGCAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTTACCATCCCCTTGGCCTCGCTATTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGCCTGGGTGGTCGTGGCAGACGAAGTCTGAGTGAGCCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTAGCAATGGCTAGTGGGCTGTTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTCTACTGGTCCTCTCGGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATCTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGACTGGTTGAATGGAACCCTGAGTTGGTTAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGACGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAGGTGGAACGGGAGGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTGGCATTTGGCTTGCTAGCTTCGGCTTTCCATTGGTCCGGAATACTGGTGACAATGGGGGCATGGACACTGTATGAGCTCTTCTCATCAGCACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAATTGTCTGACCATGGGGAGAAACGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCGTATGGGGTCACCGTCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTTAGTGTGGAGGGGGCCGTCTCGGGACCATATTGGGCGGATGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTATGGAGGTGCCTGGAGCTTGGAAGGAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCACCAGACAGTGGACATAAAGTTCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACTTACCTCGTGGAACCTCAGGCAGCCCAATCA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| 28,904
|
OL704118.1
|
Powassan virus
|
Vogels,C.B.F., Anderson,J.F., Armstrong,P.M., Grubaugh,N.D.
|
Yale School of Public Health, Epidemiology of Microbial Diseases
|
USA
|
2022-07-06
|
P1663
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,805
|
GenBank
| null |
USA: North Branford, CT
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2014-10-30
| null |
PRJNA889421
|
Powassan virus isolate P1663, complete genome
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TTTCTTGCACGTGKGYGYGGACACTTWAKTMAGTGTCCRCGGCGTTCCTTTGAACGTGAGTGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTCATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACCAGCAACAAGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTTTGGCATGCCATGACAGGCACGGCCAGGACCCCAGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCATTACGCCAAGCGGAATCTGCGTTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATTGGAAACTTGATGCAGAGCCTCCACATGAGGGGACGTCGCAGATCAGGCGTCGACTGGACATGGACTTTCTTGGTAATGGCTTTGATGGCTATGGCCATGGCGACCTCCATCCATCGGGATAAAGAGGGATATATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCCGCAAGCCAAGTCAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTCATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACCATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGATTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTAGAGTACGGACGCTGTGGAAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCGTGGCTCAAGGGTGATAACATCCGAGATCATGTTACCCGCGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCTGTCGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATACGCCACGAGATGCACACACCTTGAGAACAGGGACTTTGTGACAGGAGTACAGGGAACCACTAGAGTATCCCTGGTTCTGGAGCTTGGAGGATGTGTGACCATTACTGCTGAAGGCAAGCCATCTATTGATGTATGGCTGGAGGACATTTTTCAAGAAAGTCCTGCTGAAACCAGAGAATACTGTTTACACGCCAAGCTCTCCAACACGAAAGTAGAGGCTCGTTGCCCCACCACCGGGCCAGCTACGCTTCCAGAGGAACACCAGGCCAACATGGTGTGCAAGAGAGACCAGAGTGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGATTTTTTGGGAAAGGAAGCATAGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGCGAGGAAGCAAAAAAGGCGGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACGTACGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACGGGGGACTACCAAGCTGCAAATGAAACCAACGAGAACAGGAAAATGGCCCAGTTCACGGTGGCATCTGAGAAGGTGATCTTAAATCTAGGAGACTATGGAGATGTATCATTGACATGCAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGCAGCAAAGATCACCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGAAGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACACAAAGACAATCAGGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTTGGGCCGCCTCATGCAGTGAAAATGGATATCTTCAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTTTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGCGTGGACAACCAGAAATATCACCTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGACTTGAAAAGCTGAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCCATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAGTGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGTCATGACACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACGGGAAGTGACAAGCCCTGCCGGATTCCGGTACGAGCAGTGGCACATGGTGTCCCGACAATTAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATTGAAACAAGTGGAGGAGGATTTATAGAGATGCAGTTGCCACCGGGGGACAACATCATCTATGTGGGGGACCTAAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGTACCATAGGTAGAATGCTCGAAAAGACCCGTAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGCGGAATCCTGTCGTCAGTGGGGAAAGCCGTTCACACAGTGTTGGGAGGGGCGTTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTCAACGCTAGGAATCCAACAATGTCCATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGTTTTGACCCTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGTGCAGTTGATCCAGAGAGGATGGAAATCCGATGTGGGGAAGGCCTAGTTGTGTGGAAAGAGGTGTCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACGCTGGCGCAGGCCCTCCGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAGAATAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTGGTGTTGAGTGAAGGAGAGGCGAATCTGACCATCGTGGTAGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCCCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTTCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCCTACGCACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGAGAGGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCTGTGAAGAACGGCAAGGCCATTCACACGGACCAGAGCATGTGGATGAGTTCCTTCCGGAATGATACTGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTCACTGACCTTCGAAACTGTACATGGCCAGCAAGTCACACCATTGACAACGACGGAGTCTTGGACTCCCGTCTTTTTCTGCCTGTCACTCTCGCTGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATACAGCGAGCAAACGAAAGGGCCATGGGACCAGACCCCTCTGAGGGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGCGGAAAGATCATCCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCTTGTGAATTACCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGATTGTTGGTATGCCATGGAGATTAGACCGGTTCACTCACAGGGTGGCTTGGTTCGATCCATGGTAATGGCTGACAACGGTGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAACCCCTGGACTGGTGGCGGTATTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTCACATCCATTCTGTGGGGAGGCATACTCATGCTGGGCTTGCTTGTTACAGGGCTTGTTAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTACATCATAGCGGTTGGGATCACTTTCCATTTGGAGCTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCAGTTTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCATTGGGTTTCTCGCCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTCTTGGTCCTAGAGATGGGGATACCAGAAATGAACTTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGACTCATTGGCCATGGGACTACTCATAATTAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGTCTAGGATTCTTATTGGCTGGGCTCATGACACAACGACATCTGACTGCTGTTCACCATGGATTAATAGTATTCCTCACTGTGGCTCTGGCGGTGGTGGGACGAAGCATCTACAACGGGCAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTTACCATCCCCTTGGCCTCGCTATTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGCCTGGGTGGTCGTGGCAGACGAAGTCTGAGTGAGCCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTAGCAATGGCTAGTGGGCTGCTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTCTACTGGTCCTCTCGGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATTTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGACTGGCTGAATGGAACCCTGAGTTGGTCAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGACGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAGGTGGAACGGGAGGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTGGCATTTGGCTTGCTAGCTTCGGCTTTCCATTGGTCCGGAATACTAGTGACAATGGGGGCATGGACACTGTATGAGCTCTTCTCATCAGCACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAATTGTCTGACCATGGGGAGAAACGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCGTATGGGGTCACCGTCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTTAGTGTGGAGGGGGCCGTTTCGGGACCATATTGGGCGGATGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTATGGAGGTGCCTGGAGCTTGGAAGGAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCACCAGACAGTGGACATAAAGTTCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACTTACCTCGTGGAACCTCAGGCAGCCCAATC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GAACTGGGTTCCGATGGGCCGCACCACCTGGAGCATCCATGCGAGTGGTGAGTGGATGACGACAGAAGACATGCTACGCATCTGGAACAAGGTCTGGATTTTGGACAACCCTCACATGGAAAACAAACAAATGGTGGATGAATGGAGAGATATTCCCTACCTACCAAAGACACAGGATCTGGTATGTTCCTCACTTGTTGGAAGGAAGGAAAGGGCTGAATGGGCCAAGAACATCTGGGGCTCAGTGGAAAAGGTGAGGAAACTTATTGGAGCAGAGGAATACAGAGACTATTTGGCAAACATGGACAGACATGATCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAACTAGCACAACCAAATAATCAGAAGAAACCCACTACAGGGGGTGATGTGGCAGCGCACCACGACATCGTGACGGGAAGAGGTCGTCCCCGACGCATCATCTCTCTAGGGCATTTTCGTGAGACCCTCATGGCTGCTAAAGGGGCATCAGCCGTGTAGTAAGAAGGCCCCGACCTACTGCGGCAGCACACACAGTGACGGGAAGTTGGTCGCTCCCGACGCAGTTAGGTCAGAGAAAATTTTGTGAGACCAAAAGGCCTCCTGGAAGGCTCACCAGGAGTTAGGCCATTCTAGAGCCCCCGGGCATAACTCGGGAGGAGGGGGGAAGACAATTGGCAATCTTCCCCGGGATTTTTCCGCCTCCTATACTAAATTTCCCCCAGGAAACTGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCYGAGCCACCGCCATCCAGGCACAGATAGCCTGACAAGGAG
| 28,905
|
OL704119.1
|
Powassan virus
|
Vogels,C.B.F., Anderson,J.F., Armstrong,P.M., Grubaugh,N.D.
|
Yale School of Public Health, Epidemiology of Microbial Diseases
|
USA
|
2022-07-06
|
P1665
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,811
|
GenBank
| null |
USA: North Branford, CT
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2014-10-30
| null |
PRJNA889421
|
Powassan virus isolate P1665, complete genome
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TTTCTTGCACGTGKGYGYGGACACTTWAKTMAGTGTCCRCGGCGTTCCTTTGAACGTGAGTGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTCATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACCAGCAACAAGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTTTGGCATGCCATGACAGGCACGGCCAGGACCCCAGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCATTACGCCAAGCGGAATCTGCGTTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATTGGAAACTTGATGCAGAGCCTCCACATGAGGGGACGCCGCAGATCAGGCGTCGACTGGACATGGACTTTCTTGGTAATGGCTTTGATGGCTATGGCCATGGCGACCTCCATCCATCGGGATAAAGAGGGATATATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCCGCAAGCCAAGTCAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTCATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACCATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGATTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTAGAGTACGGACGCTGTGGAAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCGTGGCTCAAGGGTGATAACATCCGAGATCATGTTACCCGCGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCTGTCGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATACGCCACGAGATGCACACACCTTGAGAACAGGGACTTTGTGACAGGAGTACAGGGAACCACTAGAGTATCCCTGGTTCTGGAGCTTGGAGGATGTGTGACCATTACTGCTGAAGGCAAGCCATCTATTGATGTATGGCTGGAGGACATTTTTCAAGAAAGTCCTGCTGAAACCAGAGAATACTGTTTACACGCCAAGCTCTCCAACACGAAAGTAGAGGCTCGTTGCCCCACCACCGGGCCAGCTACGCTTCCAGAGGAACACCAGGCCAACATGGTGTGCAAGAGAGACCAGAGTGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGATTTTTTGGGAAAGGAAGCATAGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGCGAGGAAGCAAAAAAGGCGGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACGTACGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACGGGGGACTACCAAGCTGCAAATGAAACCAACGAGAACAGGAAAACGGCCCAGTTCACGGTGGCATCTGAGAAGGTGATCTTAAATCTAGGAGACTATGGAGATGTATCATTGACATGCAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGCAGCAAAGATCACCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGAAGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACACAAAGACAATCAGGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTTGGGCCGCCTCATGCAGTGAAAATGGATATCTTCAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTTTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGCGTGGACAACCAGAAATATCACCTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGACTTGAAAAGCTGAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCCATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAGTGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGTCATGACACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACGGGAAGTGACAAGCCCTGCCGGATTCCGGTACGAGCAGTGGCACATGGTGTCCCGACAATTAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATTGAAACAAGTGGAGGAGGATTTATAGAGATGCAGTTGCCACCGGGGGACAACATCATCTATGTGGGGGACCTAAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGTACCATAGGTAGAATGCTCGAAAAGACCCGTAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGCGGAATCCTGTCGTCAGTGGGGAAAGCCGTTCACACAGTGTTGGGAGGGGCGTTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTCAACGCTAGGAATCCAACAATGTCCATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGTTTTGACCCTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGTGCAGTTGATCCAGAGAGGATGGAAATCCGATGTGGAGAAGGCCTAGTTGTGTGGAAAGAGGTGTCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACGCTGGCGCAGGCCCTCCGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAGAATAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTGGTGTTGAGTGAAGGAGAGGCGAATCTGACCATCGTGGTAGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCCCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTTCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCCTACGCACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGAGAGGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCTGTGAAGAACGGCAAGGCCATTCACACGGACCAGAGCATGTGGATGAGTTCCTTCCGGAATGATACTGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTCACTGACCTTCGAAACTGTACATGGCCAGCAAGTCACACCATTGACAACGACGGAGTCTTGGACTCCCGTCTTTTTCTGCCTGTCACTCTCGCTGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATACAGCGAGCAAACGAAAGGGCCATGGGACCAGACCCCTCTGAGGGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGCGGAAAGATCATCCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCTTGTGAATTACCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGATTGTTGGTATGCCATGGAGATTAGACCGGTTCACTCACAGGGTGGCTTGGTTCGATCCATGGTAATGGCTGACAACGGTGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAACCCCTGGACTGGTGGCGGTATTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTCACATCCATTCTGTGGGGAGGCATACTCATGCTGGGCTTGCTTGTTACAGGGCTTGTTAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTACATCATAGCGGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAGCTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCAGTTTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCATTGGGTTTCTCGCCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTCTTGGTCCTAGAGATGGGGATACCAGAAATGAACTTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGACTCATTGGCCATGGGACTACTCATAATTAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGTCTAGGATTCTTATTGGCTGGGCTCATGACACAACGACATCTGACTGCTGTTCACCATGGATTAATAGTATTCCTCACTGTGGCTCTGGCGGTGGTGGGACGAAGCATCTACAACGGGCAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTTACCATCCCCTTGGCCTCGCTATTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGCCTGGGTGGTCGTGGCAGACGAAGTCTGAGTGAGCCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTAGCAATGGCTAGTGGGCTGCTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTCTACTGGTCCTCTCGGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATTTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGACTGGCTGAATGGAACCCTGAGTTGGTCAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGACGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAGGTGGAACGGGAGGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTGGCATTTGGCTTGCTAGCTTCGGCTTTCCATTGGTCCGGAATACTAGTGACAATGGGGGCATGGACACTGTATGAGCTCTTCTCATCAGCACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAATTGTCTGACCATGGGGAGAAACGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCGTATGGGGTCACCGTCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTTAGTGTGGAGGGGGCCGTTTCGGGACCATATTGGGCGGATGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTATGGAGGTGCCTGGAGCTTGGAAGGAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCACCAGACAGTGGACATAAAGTTCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACTTACCTCGTGGAACCTCAGGCAGCCCAATC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GAACTGGGTTCCGATGGGCCGCACCACCTGGAGCATCCATGCGAGTGGTGAGTGGATGACGACAGAAGACATGCTACGCATCTGGAACAAGGTCTGGATTTTGGACAACCCTCACATGGAAAACAAACAAATGGTGGATGAATGGAGAGATATTCCCTACCTACCAAAGACACAGGATCTGGTATGTTCCTCACTTGTTGGAAGGAAGGAAAGGGCTGAATGGGCCAAGAACATCTGGGGCTCAGTGGAAAAGGTGAGGAAACTTATTGGAGCAGAGGAATACAGAGACTATTTGGCAAACATGGACAGACATGATCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAACTAGCACAACCAAATAATCAGAAGAAACCCACTACAGGGGGTGATGTGGCAGCGCACCACGACATCGTGACGGGAAGAGGTCGTCCCCGACGCATCATCTCTCTAGGGCATTTTCGTGAGACCCTCATGGCTGCTAAAGGGGCATCAGCCGTGTAGTAAGAAGGCCCCGACCTACTGCGGCAGCACACACAGTGACGGGAAGTTGGTCGCTCCCGACGCAGTTAGGTCAGAGAAAATTTTGTGAGACCAAAAGGCCTCCTGGAAGGCTCACCAGGAGTTAGGCCATTCTAGAGCCCCCGGGCATAACTCGGGAGGAGGGGGGAAGACAATTGGCAATCTTCCCCGGGATTTTTCCGCCTCCTATACTAAATTTCCCCCAGGAAACTGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCYGAGCCACCGCCATCCAGGCACAGATAGCCTGACAAGGAGATGGTG
| 28,906
|
OL704120.1
|
Powassan virus
|
Vogels,C.B.F., Anderson,J.F., Armstrong,P.M., Grubaugh,N.D.
|
Yale School of Public Health, Epidemiology of Microbial Diseases
|
USA
|
2022-07-06
|
P1666
|
Orthoflavivirus powassanense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,809
|
GenBank
| null |
USA: North Branford, CT
|
USA
|
Ixodes scapularis
| null |
2014-10-30
| null |
PRJNA889421
|
Powassan virus isolate P1666, complete genome
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TTCTTGCACGTGKGYGTGGACACTTWAKTCAGTGTCCGCGGCGTTCCTTTGAACGTGAGTGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGAGTGGTCATGGTGACTACTTCTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAAGCGAAAGCTGAAAGTGACCGCAAACAAGTCGCGACCAGCAACAAGCCCAATGCCAAAGGGTTTTGTGCTGTCGCGCATGCTGGGGATCCTTTGGCATGCCATGACAGGCACGGCCAGGACCCCAGTGTTGAAAATGTTCTGGAAAACGGTACCATTACGCCAAGCGGAATCTGCGTTGAAGAAGATCAAGAGAGTCATTGGAAACTTGATGCAGAGCCTCCACATGAGGGGACGCCGCAGATCAGGCGTCGACTGGACATGGACTTTCTTGGTAATGGCTTTGATGGCTATGGCCATGGCGACCTCCATCCATCGGGATAAAGAGGGATATATGGTCATGCGAGCTAGCGGAAGAGATGCCGCAAGCCAAGTCAGAGTTCAAAACGGAACATGCGTCATTTTGGCAACGGACATGGGAGAATGGTGTGAAGATTCAATAACCTACTCCTGTGTTACCATTGACCAGGAAGAAGAACCTGTTGATGTGGATTGTTTTTGCCGAGGTGTTGACAGAGTCAAGTTAGAGTACGGACGCTGTGGAAGACAGGCTGGATTCAGGGGGAGAAGGTCTGTGGTCATCCCGACACATGCACAAAAGGACATGGTTGGGCGAGGACACGCGTGGCTCAAGGGTGATAACATCCGAGATCATGTTACCCGCGTCGAGGGCTGGATGTGGAAAAACAAGCTCTTGACAGTTGCTGTCGTGGCTTTGGCTTGGCTCATGCTGGATAGTTGGATGGCTAGGGTGACTGTGATCCTTCTGGCGCTGAGCCTTGGGCCTGTATACGCCACGAGATGCACACACCTTGAGAACAGGGACTTTGTGACAGGAGTACAGGGAACCACTAGAGTATCCCTGGTTCTGGAGCTTGGAGGATGTGTGACCATTACTGCTGAAGGCAAGCCATCTATTGATGTATGGCTGGAGGACATTTTTCAAGAAAGTCCTGCTGAAACCAGAGAATACTGTTTACACGCCAAGCTCTCCAACACGAAAGTAGAGGCTCGTTGCCCCACCACCGGGCCAGCTACGCTTCCAGAGGAACACCAGGCCAACATGGTGTGCAAGAGAGACCAGAGTGACCGTGGATGGGGAAACCACTGCGGATTTTTTGGGAAAGGAAGCATAGTGGCCTGTGCCAAGTTTGAATGCGAGGAAGCAAAAAAGGCGGTAGGTCATGTTTATGACTCAACAAAAATCACGTACGTTGTCAAGGTTGAGCCCCACACGGGGGACTACCAAGCTGCAAATGAAACCAACGAGAACAGGAAAACGGCCCAGTTCACGGTGGCATCTGAGAAGGTGATCTTAAATCTAGGAGACTATGGAGATGTATCATTGACATGCAAGGTGGCAAGTGGAATTGATGTCGCCCAGACTGTGGTGATGTCGCTTGGCAGCAGCAAAGATCACCTGCCTTCGGCATGGCAGGTGCATCGTGACTGGTTCGAAGACCTAGCCCTGCCTTGGAAACACAAAGACAATCAGGACTGGAACAGTGTGGAGAAACTTGTGGAGTTTGGGCCGCCTCATGCAGTGAAAATGGATATCTTCAATCTGGGGGATCAGACTGCTGTTTTGCTCAAATCACTGGCTGGAGTCCCACTGGCAAGCGTGGACAACCAGAAATATCACCTGAAAAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGACTTGAAAAGCTGAAGCTGAAAGGCACAACTTACTCCATGTGTGACAAAACAAAGTTCAAGTGGAAAAGAGTTCCTGTGGACAGTGGTCATGACACAGTGGTCATGGAGGTGTCTTACACGGGAAGTGACAAGCCCTGCCGGATTCCGGTACGAGCAGTGGCACATGGTGTCCCGACAATTAATGTGGCCATGCTCATTACCCCCAACCCAACCATTGAAACAAGTGGAGGAGGATTTATAGAGATGCAGTTGCCACCGGGGGACAACATCATCTATGTGGGGGACCTAAGTCAGCAGTGGTTCCAGAAAGGCAGTACCATAGGTAGAATGCTCGAAAAGACCCGTAAGGGTTTGGAAAGACTCTCAGTGGTTGGAGAACATGCATGGGACTTTGGTTCAGTGGGCGGAATCCTGTCGTCAGTGGGGAAAGCCGTTCACACAGTGTTGGGAGGGGCGTTCAACACCCTTTTTGGGGGAGTTGGGTTCATCCCTAAGATGCTGTTGGGAGTCGCCTTGGTGTGGTTGGGGCTCAACGCTAGGAATCCAACAATGTCCATGACTTTTCTTGCCGTGGGGGTTTTGACCCTGATGATGACAATGGGAGTCGGAGCAGACTATGGATGTGCAGTTGATCCAGAGAGGATGGAAATCCGATGTGGAGAAGGCCTAGTTGTGTGGAAAGAGGTGTCGGAGTGGTATGACGGCTATGCTTACCATCCGGAATCACCAGACACGCTGGCGCAGGCCCTCCGAGAGGCCTTTGAGAGAGGCATCTGTGGAGTTGTGCCCCAGAATAGACTTGAAATGGCCATGTGGAGGAGCACCGCTCCGGAGCTCAATTTGGTGTTGAGTGAAGGAGAGGCGAATCTGACCATCGTGGTAGACAAGACAGATCCAGCAGATTACAGAGGAGGCACTCCAATGGCCCTGAAGAAAACTGGAAAGGAGAGTAAGGTGTCATGGAAGAGTTGGGGCAAGTCAATCTTGTGGAGTGTGCCTGAAAGTTCTAGGCGCATGATGATGGGGGTTGATGGAGCTGGGGAGTGCCCCCTGCACAAGAGAGCAACAGGAGTGTTCACAGTGGCAGAATTTGGGGTTGGCCTACGCACAAAGGTGTTTTTAGACCTGCGTGGAGAGGCTTCAAAAGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCAGCTGTGAAGAACGGCAAGGCCATTCACACGGACCAGAGCATGTGGATGAGTTCCTTCCGGAATGATACTGGCACGTACATTCAGGAGCTCATTCTCACTGACCTTCGAAACTGTACATGGCCAGCAAGTCACACCATTGACAACGACGGAGTCTTGGACTCCCGTCTTTTTCTGCCTGTCACTCTCGCTGGGCCCCGTTCAAAATACAACAGAATACCTGGATACAGCGAGCAAACGAAAGGGCCATGGGACCAGACCCCTCTGAGGGTGGTCCGGGATCATTGCCCTGGAACAAGCGTGAAGATTGACAGTCAGTGTGACAAGAGAGGAGCCTCAGTTAGAAGCACCACAGAAAGCGGAAAGATCATCCCAGAGTGGTGCTGTCGGGCTTGTGAATTACCACCGGTGACGTTCCGCAGCGGCACAGATTGTTGGTATGCCATGGAGATTAGACCGGTTCACTCACAGGGTGGCTTGGTTCGATCCATGGTAATGGCTGACAACGGTGCGATGCTCAGCGAGGGGGGAACCCCTGGACTGGTGGCGGTATTTGTCCTGATGGAGTTCTTGTTGAGAAGGCGTCCGGGTTCTGTCACATCCATTCTGTGGGGAGGCATACTCATGCTGGGCTTGCTTGTTACAGGGCTTGTTAGAGTGGAGGAGATCGTGCGCTACATCATAGCGGTTGGGATCACTTTCCACTTGGAGCTGGGACCAGAGATCATGGCCCTTGTGATGCTGCAGGCAGTTTTTAGCATGCGCACATGCTATCTCATTGGGTTTCTCGCCAAGAGGGTGATCACCACACGTGAGGTGGTGACTGTTTACTTCCTACTCTTGGTCCTAGAGATGGGGATACCAGAAATGAACTTTGGACATTTATGGGAGTGGGCTGACTCATTGGCCATGGGACTACTCATAATTAAGGCAAGCTCGATGGAAGACCGAAAAGGTCTAGGATTCTTATTGGCTGGGCTCATGACACAACGACATCTGACTGCTGTTCACCATGGATTAATAGTATTCCTCACTGTGGCTCTGGCGGTGGTGGGACGAAGCATCTACAACGGGCAAAAAGAGAGGAAAGGATTAAGCTTTACCATCCCCTTGGCCTCGCTATTGGGGGGGCCTGGATCTGGCTTGCGCATGCTGGCCTTGTGGGAATGCCTGGGTGGTCGTGGCAGACGAAGTCTGAGTGAGCCCCTAACTGTGGTGGGGGTCATGTTAGCAATGGCTAGTGGGCTGCTGCGTCATTCTTCCCAGGAGGCTCTACTGGTCCTCTCGGCTGGTTCCTTTCTCATTCTGATGTTGATTTTGGGGACTCGCAGACTCCAGTTGACGGCGGAATGGGCGGGACTGGCTGAATGGAACCCTGAGTTGGTCAACGAGGGGGGTGAGGTTAGCCTAAAGGTCAGGCAGGACGCCATGGGGAACTTGCACTTGACGGAGGTGGAACGGGAGGAGCGCAGGCTGGCACTGTGGCTGGCATTTGGCTTGCTAGCTTCGGCTTTCCATTGGTCCGGAATACTAGTGACAATGGGGGCATGGACACTGTATGAGCTCTTCTCATCAGCACGCAGAACTGACCTTGTATTCTCAGGGCAATTGTCTGACCATGGGGAGAAACGGCCTTTTGACATCAAAGATGGCGTCTATCGCATATACGCCCCTGGACTCGTATGGGGTCACCGTCAGATTGGAGTGGGGTATGGAACAAAAGGAGTCCTACACACCATGTGGCATGTGACAAGAGGAGCGGCTCTTAGTGTGGAGGGGGCCGTTTCGGGACCATATTGGGCGGATGTGCGTGAGGACGTGGTCTGTTATGGAGGTGCCTGGAGCTTGGAAGGAAAATGGGGAGGTGAAGTTGTTCAGGTCCATGCTTTTCCACCAGACAGTGGACATAAAGTTCATCAATGCCAACCAGGGAAACTGAATCTTGAGGGAGGGCGAGTCATGGGGGCCATCCCAATAGACTTACCTCGTGGAACCTCAGGCAGCCCAATCA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| 28,907
|
MK892480.1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Tp1_25_DCM_11456_1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 32,101
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null |
2009-12-15
|
SAMEA2619791
|
PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Tp1_25_DCM_11456_1, complete genome
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| 60,524
|
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|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Unbinned_5179_contig-100_4
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 29,781
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null |
2011-05-31
|
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|
PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_5179_contig-100_4, complete genome
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| 60,525
|
MK892484.1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Unbinned_4026_contig-100_1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 33,315
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null |
2010-11-04
|
SAMEA2621285
|
PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_4026_contig-100_1, complete genome
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| 60,526
|
MK892486.1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Unbinned_3818_contig-100_0
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 38,069
|
GenBank
| 1
| null | null |
Bacteria
| null |
2010-09-07
|
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|
PRJNA477650
|
MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_3818_contig-100_0, complete genome
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| 60,527
|
MK892487.1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Unbinned_4052_contig-100_1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 43,896
|
GenBank
| 1
| null | null |
Bacteria
| null |
2011-07-27
|
SAMEA2622705
|
PRJNA477650
|
MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_4052_contig-100_1, complete genome
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MK892488.1
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
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Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
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Ohio State University, Department of Microbiology
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USA
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2019-07-29
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Tp1_72_DCM_111220_1
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 58,393
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GenBank
| 1
| null | null |
Bacteria
| null |
2010-07-07
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SAMEA2620812
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PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Tp1_72_DCM_111220_1, complete genome
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CCGATCCGATTCGGGAGGGGAGTGCTTCTGTAGTGATAGTAGAATCCCATGCGTGAGCGATTTCTACTATATTTTTTCAAAAAAAATTTTCCACAAAAAATTTACAAATAACACTTTAATAAGTTATATTTAGCACATGAGCCTGTTAGAAAACGAAGCAGTTGAAGTAACTGATGAAGATAGAACAGAGTTGCAATCCCATTTTCCTTACGCGGGGGTTCGTTTATCCGAGCTTTCGGTCCAAGAAGAAAGGTTAATTTTATTTTATCTAAAAGGAATGAGTAAAGCGGCCGCGGGCCGTGCAGCGGGGTACCGTAACCAGGATTCCGTGTATGAGGTTTTTAAAAGACCTACCATTGTAAAGGCGGTCGATTATCTACGGTCCGAGATGCGTGAAGAAGTAAAATTTGACCGCACTACTGCGACTACTATGTATTTAGAAGCACATAGAAAATCTGCAAACGCGACGGAAGAAAAAAATGTCGTCGATTCTTTATGCAAGCTTCACGGTCTATTTGCACCTGAGCAAGCAACACAGGTTAATATTAATGTAGATAATTTAGAGAGACTCGAGCGTATGTCAGATTCTGAATTATTAAAAATAGCAGGATCTGAGACAAATTACTTAGAGCCAAGCAAGGAGGATAAAAGTGTCAACTAAATATAAACAAGCGGCAGATGCTAGGAGAGTAAAAAGAACAACTACCCATACGCAGATTTCTCAAAATAAAGATGGAAGTATGAAGCTTACTCCTATAAAAGGGAAACTAACTGGATTAGCTAAACCTAGTGGAAACACTTAAGCTCGTTATGGATATTGTTTTTGGAATAGCTTTACTTATTGGCTTAGCTTTTTTTGCCTATATGGGTAGTGTTATGGTTTCAGAGCAAAAGGAGAAAAGAAATGCCAAAAGTAGGAAAGAAAAAGTTCCCGTACACAAAAAAGGGAAAAGCGGCAGCAAAAAAAGCAAGAAAGCAAAAAAGTAAAAGGTATTAATGCCAGATTTACAAAAGCTCGAATGCTACAAGTGCAAGAAGCTATTAGCTGAAAATCTTGTATTGCCCAAAGGGCTCTGTGTGTATTGCGCAGCGGATGAAGCGGACGAGTTGCCTAAACCTCCACCAGCGGACCCCGGTCCAGATCAAAAAGAACTAGATGCACAAGCTCGTGCAGAAAAAGAACTGGCGATGCGTGTATTGTCCAGAAAACGTCTTCTACCCTTTGTAGAAAAATTTAATCCTGATTACCAAGCAGGTTGGGTCCATAAAGATATTTGCCAACGATTGGAGAAATTTAGTCAAGATGTGGCTGATCAGAAATCCCCAAGACTGATGCTGTTTATGCCTCCGAGGCATGGGAAGTCAACTCTGGCTAGTGTGGCTTTTCCTGCTTGGCATTTAGGAAAAAACCCAAAACATGAATTTATTAGTTGTTCGTATTCGGGCTCCTTAGCTATGAGTTTCTCAAGGAAGGTTCGTCAATTATTAAGGGAACCTAACTATAAAAATGTTTTTGAAAAAACAAAACTAGATAAAGATTCGCAGTCTATCGAATCCTGGTTAACGACCCAAGGGGGTGGTTATGTCGCGGCCGGTGTTGGTGGTGGTATTACAGGTAAAGGTGCAAATATATTATTAATTGATGACCCGGTAAAAAACAGAGAAGATGCTGAATCTGAAAACAACCGCGAAGCGACGTGGGACTGGTATACCTCTACAGCATATACCCGACTATCCCCCGGTGGAGGTATACTAGTTATTCTTACTAGATGGCATGATGATGATTTAGCTGGCCGTTTATTGCAACATGCGGAAGATGGCGCAGATGAATGGGAAGTGGTCAAATATCCAGCAGTAGCAGAAGAAGATGAAGAATTTAGAAAAACAGGCGAACCATTACACCCAGAAAGATACAACCTAGAATCTTTAGAAATGATACAAAAAGCGATTGGTCCAAGGGACTGGACCGCGCTATACCAACAGAACCCAGTATCAGATGAAGGTGACTATTTTACTAGGGACATGGTTAAATATTATGAACCCGAAGAAATTGAATATGACAGATTACGATATTATTGTGCGTGGGACTTGGCTATAGGACAAAGAGAAAGGAACGATTTTTCTGTTGGGGTTGTAGTTGGAGTAGATGAATATGATAATATGTTTGTAGTTGATGCTGTACGTGGGAAGTATGACGGATTCGAGCTTGTAGAAAAGATCCTGGATTTGTACGAACAGTGGCGACCGGGAATCGTGGGGATAGAACGTGGTCATATCGAAATGGCTATTGGTCCTTTCCTAGAGAAACGTGTAGCAGAACGTAAATTACATTCTGCTTATTTTAAGGATTTAAAAGTTGGGCGACGAGATAAAGAAGCTAGAGCTAGAGCAATTCAAGGTAGAATGCAACAAGGCATGGTATACTTTCCGAAGGACGCAATTTGGACCGGCCCAATGGTGGCTGAACTTCTTCGTTTTCCTAATGGGGTCAATGATGACCAAGTTGATGCTTTGGCCTGGGTGGGTTTAATGATGGTTGAGTTTGCAACTTTTTATGAGAGGCCTGAGCATATACCTTCTTGGCGAGATAGGTTAAGATATATTGCGAAAGACAAAAAGAGTAAAACTGCAATGAGCGCATAATGGCATATAAAAAGACAAAAAAGAAACTAACAAAAGCTGAAGAACTTACTTTAGCAAAAAACCAATGGAACTCTTACGTTCGTGCCCGAGATGCTGGGCATGATGATTTTATTGAAATGGCAAAAAAGTGTGATGCCTATTATAGAGGAGACCAGTGGGATACGTTCGATATGCAACAGCTCGACGACCAAGGGCGGCCAGCTCTAACTATTAATACTATATTACCTACCATTAATGCTGTACTTGGAGAACAGAGTGCTAAAAAAGCAGATATTCAATTTAAACCTAGAGGGGGTGGCCACCAAGCCATTGCTGATGTACTCACTAAAGTTTATGCGCAGATATCAGATAATAATAAATTAGATTGGGTAGAAGCTCAGGTATTCCAAGATGGGTTAATACAAGATAGGGGTTGGTTCGATGTACGTATAGATTTTGATGATCATGTTATGGGGGAAGTACGCATAGAGTCGAAAGACCCATTAGATATTCTTATTGACCCAGACGCAAAACATTATGACCCAAGAACTTGGAATGAAATATTTGAAACCAAGTGGATGAGCTTAGATGAGATAGAAGAAATATACGGGCAAGAAAAAGCGGATAAGCTAAGACTATTAGCAGAGACTGGTACTACTTTAGGTGCTGATTCTATGGAATTTGAAGAAGTACGATATGGAGATACAGACCAGAATGAGTATGGCAATCAAATGCCAAATGACCCAGAAAATGCACGTATGCTTAAATCTATTAGAGTATTAGAAAGACAATATTATAGATTAGATGATTGTATGTTTTTTGTTGACCCTGTTACAGGGGATAAAAGACAAGTACCTGGGAATTGGGGGAAAAAGAAAAGAGAAGATTTTGCTACGCAGTTTGGTTTAGCAATAATAGAGAAAAAAATTCGGAAGGTCCGTTGGACAGTGTCCGCAGATACAGTTGTCCTTTTTGATGATTGGTCCCCTTATAAACATTTTACTTTAGTTCCTTATTTTCCGTATTTTAGGCGTGGAAAACCTTTTGGAATGGTACGAAATCTCCTATCCCCTCAGGAGCAGCTAAACAAAATAACATCCCAAGAGCTTCACATTGTAAATACTACGGCAAATAGTGGTTGGATTGTGGAGTCAGGGTCTCTATCTGGTATGAATGCGGATGATCTAGAAGAGCATGGTGCAGAAACTGGCTTAGTATTAGAGTTTAATCGTGGCTCCACACCTCCAGCCAAAATTCCACCAAACCAGATTCCTACAGGTTTAGATAGGTTAGGGCAAAAAGCCTCTGCAAACATTAAACAAATTAGTGGAATTTCTGATGCAATGCTTGGTATGGACAGCCCAGAAGTTTCAGGAGTAGCAATTAATGCTAAGCAAAATAGGGGTTCTTTAATGCTACAAGTACCTTTAGATAACTTAGCTAAAACTAGACAATACTTAGCAGAGAAAATATTAAATTTAGTGCAAGCTTTTTATACAGAAGAAAGAATTATACAAGTGACAGATGAATCTGACCCTTATAAAACAAGTCAACCAATGATGGTCAATGAAATGACCCCAGAAGGAGAAGTTATTAATAGTTTAACAATTGGAGAGTATGACGTTATTGTTGGTACTGCTCCTGCTAGAGATAACTTTGATGAAATGCAATTTGCTGAGGCTATTGAGCTTCGAGGGGTTGGAGTACCAATACCAAATGATATGATTGTGGAGTACTCACACTTATCACGTAAAGCAGATATTGCAGATAGAATTAGACAACTGGAAGGCACAGCCCCTCCAACAGAAGAACAGTTACAATTACAACAATTCCAAATGGAATCACAGATACGAGCTACTCAGCTAGAAATTGCTAAATTAGAAGCTGAAGTCACTAGAACACAGACTGAGTCTGCCTTGAATGTAGCTAAGGTAGAACAGGCTGAAGCAGATCCACAGTTGAAGGTTGCAGAGTTACAGAGTAAACTACAAGCGAAACGTGAGGAATTGGAGCTTCGTGAACGTTTATCAAATATGACAAACGCCATGAGGCAACAACAAACTGAAGTTGCAGCAGCATCTAAGATGGCAGCTGCGGCCATGAAAACCACAGGAGGTAATGAATAATGGCAAAAAAGAAGAAAGCGAAAGCACCCGAAGTCGAAGATAATTTAGATGTTGTCTATGACGGTATCCCAGGAGCAGATAAAGTAACAGATGAAGACGTTAAACCTTTTGATGTTGATCTGAATTTTGAAGAAGAACCTAAAGCAGAAGACGCGGAAGAAGTCACGGAGGAAGAAGAAGTTGAAGAAGCAGAAGAGTCAGAGCCAGAACAGGCTGAAGAAGAATCACCAGAAGGGGAAGAGCCGGAGGGAG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| 60,529
|
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|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Unbinned_3556_contig-100_1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 34,632
|
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| 1
| null | null | null | null |
2011-04-15
|
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|
PRJNA477650
|
MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_3556_contig-100_1, complete genome
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
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Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
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Ohio State University, Department of Microbiology
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USA
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2019-07-29
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GOV_bin_3250
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 31,258
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GenBank
| 1
| null | null | null | null |
2011-04-22
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SAMEA2622242
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PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate GOV_bin_3250, complete genome
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GATTCAAACACTTTGAATCCCGCCTCTTTTACACGGGTCAAAATGTGCGGATATGCGTCGGGGCTTAATGGGATTCTCATGACATAACGCCTATAGTTAGATTGACAGAACTTTGTGAAGGGTTCCAACGCACAGCCAAGATCATCGCTCTGCGATTGCTGTAAGTGTCTGCAGCACCCTCACGTAGTCCATAAATATACATACTAGATATCTCAATGATATCGCCAGCGGTTAGCAGACAATGCTTTTCAGTCACTGTTAGACTCAACTCTTCATATGGCTCCGCATCCCATCGCCGCATCCGAGTTAGGTCGGCATTTGCTTGTGTTGGCTGTATCGGACTATCCACACGATAAACAAGCCGCAAATCCCTCGAGATTTCTGTGCTTGTGGGTAGTATCGGAATACTGTTGCCGCTAAATGAAACATCTTGAATTAATCCTGTTGTATTGTTGAAGGTTCTGATCGTGCTCTTGCTGAATACTGTTGATTGTGTGGGGCTGTATAATGTGTGTGAGTCTATGCTGATTATATCCCGATCAGTGATGTGATCTTTGACTGTGAACCAGTTTGCTTGATTTGGATTTTGACAGACACGCCAAGATAATTGATTTTGATCCCAAACTGGCCACATACCCATATTTAATACAGCATCTAAAAACGTTGTAATGTTGCCGGGTTCTGAGATCAGCAATTCGATCTCATGTGTGCCGCTAGAAGTAGCCCATGCAAGGTTGTAGTATTTATTGAGATTCTGAAGATTGAACAAATTAGGATTGAACTTGACACCGAGCGCCCATGATGCGGGATAGTCATCGAAAGCGCCCTGTGTGCCGTCTCCTGTACTCATGACAAGCCGAGCAAATACATAATCGGGACGCCCTCGAAGCCTTGCCAAACTTGTTACAACGTCATTGATCGCCAGTGTAGTAATTGAGGCTGTACTTGGATATTTTCCAGTTGCTGCAATCGTTAAAAATCCAGCCGTTCCGCTTGTGCTTGTTTTGCTTGACCATGTGTAATAGTCGATCGTGCCTGCGCTAACGTCCTCTACTTTGATCATTCCATTTTGACCCGTCTCTTTTTCGAAGATCGTAATGTCATCAAGATAAAGATCAGCACTGCTCGAAAAATTAAAATTTTGTGTTACTTTTGCCGTCTGTCCTGCATAATACCAAAATTGAGATTCTGTTGCTTTGCTGGTTAGTCTTGCCTGCATCAGTGTCAAGAAGTCGACAAACTCCAAACGCCACAAGCCCCGCCCGCCCGTGATGCCTCTAAGTTGCCCAATACAGACACGATTGCGCAGCCCATCCCTAATCATATGCAACTCAGCCACTGCGCCACGTCTAGGGAAATCCATCAAGGGGCGCAGATCGCCCGCAACTGTAACAGTAAATCCGCCAAAGTTTACAGACCATCTCTGCGGCGTTACTTGCACACTGTCGATCGTAACGTCTGCATTTGCAAGGGCGATCTCTGTGCTCATGCTAATTTGATCGGCGTTTGGACTCATGTTGTAATCCTTACTTGTTGCTAAGAACTTGAGTACATAAGAGATCACTTTTGCGGGCTTGTCTAGGCTGTTAATAAATGATTGTGTCCATGCCATGCTAGCCGCCTATTATTGGATTGAATCCACCGCCGCCAAATGAAGGCGCTAAACTTTCTCGTATGTCTGTTAACGGCGTTGCTCTTGTCATTCCATCAAGAGAGACTCCGGCACCTTGTCGACCTCCTGATGTACTGCCAGCAAGCGATCGCCCAATAGACACGCCTGATTCTCCAACTGTGTCAGGATGTGCGGCGTATAATGTCACATAGTCCACTACAAGCCGTATAGAAAGCGAGAACAATCGCCCGCCTTCGTTTGTGACTATTGCCTGCCCTATGTCGCTCTGTGGTCGTTTTAAGACTGGATAGAAACGATAATGTCGCATGAAAGCAGGCTGATCATATTGGAATCGTACAGGATTCACGGTGTCAACGTCTCCGCCCTGTGCTGTGGCATTGCTCACAGTCTGCATTTTCACAATCTCTTGTATCATTGCGGGGCTACTTGTCTCAATCGTGCAATAGTCGCCAACGGCTGGCGTTGCGCTGGTCCCTGTAAAGTTTTGGAATGGATTTGCATAAATAGGAATTTTTGTGCTGTTGTTGTTCAATGTGCCGCGTATTGGAAAACAAAATGCTTTATCATCATCCGCAGCAAACGACACAGAGAAGCCCCGATCAAGATGATTCTGCAGAGCATGGAACTGAATTGCAAGATCTTCGCCTCCAATCATGCGATCACGCTGTATAGTTACGATCTCTTGAGTCCTACCAACAGATCTTTGTATTGAGCCAGTCAGAGAGACAGCATCAACAGCCTCAACGGATATATCAGAGAACATCTCGCCCAATGCCTCTCCGAGATCTATTGTGACCAGTGAAGCGCCATTCAATGCGCCAAATGGCTCAGGTGTGAAATAAAACTTTGCATTGCCCATTATCTGCCCCCGAATAGACTGCTTGACGATGTGCCGAATTGATTATTGAATCTGATTTCTATCTCTCTCACAAGAGCGTCAACAGCATTGCGATCCACAACGGCGCTGTTAATGTTGATCGTCATGCCGCCGCCTGTGGTGTTGTTCAGTTGACGATCGACTTGCTGCGGACGTTGTCCACTTTGCGGCACGACAAACTCGCCACGGTGTAGCATAGCGAGACCGTCTTGCATCCCTGTGAATCTGATCCCACCTTGCGCACTAGGTACGAATCGACCGCCGCCCATGAATGATGCCGACACATCACGATCAAAAAAGTCAACGATTGCACTGCGCCTACGATCTCGCCGCTCTTCTCGTGTTGTACTTTGAAGAAATGCAAACGCATCTTTGATTCCATCTATTAAGTTTACAAATAGCAATTGTATTCCATCGACAAACGCCTCAGCAATAGCGATCCCAAGTTGTGGAGCGATTGACAAAAGCAACTCCGGCAAGAATGCGATCCCAACTTTGATAGCCTCAGCCTGTGCCAATGCCTCTTTTCGTATTTGGTCCGGTCCTTTTTCAATTACTTGCTCGCCTATCCCTTGTACAACACTTGTGAACGCCCCCGCCAAAGGTGAAACAAGGCCAACAATAGCCGCCGCGTCAAGACTGGCAACGATCGAAACTTTTTCAAATGCGCCTGAAAGACCTTTTTGCAACCCTTCGGCATCTCCCAGTTTTTCAAATGCGTTTGAAATGCCTTCTTGTGCAAATCCTTTTAGTCCCTCTTGCCTAATATTTTTAAATGTATTTCGTATATTTTCAACTTTTCGGAGCATCGATTCAAGTTGTCCTGTCGGCTTGATAAACAAATCGCTTGTAATGTTTGCCAGTACATTAATTGACCTAACAATCAGATCAGTTTCTTTTTTCAGTCGCTCCGCCTCTTTGCGCCTTTGCTCTCCTTCTTTTCTGATTCTATCTGCTTCCTTTTGTGCTCGAGCCGCTTCTTTTGCTGCAATGGCGTCTTGCTTGGCTTGCTCTTCGTCTAATAGTTGATTCCGCAATTTGGTGAGTTCAACCAGTGCAGCATTTGCTCCTTCAATATCACCCGAGATCTCAGCAAGATCAAAAAGTTTCTCGGCTTGCTGTTCATATGTTGCATTGATTTGACCCACTGCATCCAATTGAGCAAACTGCGCTTTTTCAAGTATCTGCTGGATCTGCTCTTGTGCTTTGAGTGCCTTTGCCTGTTCCCTGTCTTTTTGTCGCTGTATCTCCGCTTCTCTTCTTAGTCTATCCTGTCTCGCCTTTTCTCTTTCTGCACGCTGTCTTTCTTGCTCATTGATTTGCGCCGTTTGAAGTAAGATTTGCTCGTATTGCCTTTGCTGCCCACTAATTGCAAGAACCTCCTCTTGTGCAGTTTGCAATCGTGTTTTGTCAATCTGTTGAGTCTCCTCAAGAGTCGACAGGCGCTTTCTTGCTTGATCTTCTTGAAAAGTTATATCTTCAAACTGTTGCGGCGCGCCTGCGATTCTTTGAGTCAACGATTGCTCTATTGCCCGCTCTTCTTTCATCAATGCAATTTGTAGTCTCAACTGTGCGATCTGTTCTGCACGGGCTGCAATTGTGTCTTGAATTGCCTGCTCTTGTTGCTTTTGTGATTCTGTCGCATCTTTACCAAATTGCGTGGCTGTTTGTGTGGCTGCTCTTTGATCTGCCTCAAACTGTGTAATTTGTCCCGTCAATAGTTGAAGATTTATTCTCGCCTGATCCACTTGCTGATAAAAGCCGATTAGAGATTGTGCGGCGTCATCTGCGCTTTTTGTCTGCTCTTCAATTACTTTGTTAGTTCGTTCGATTACATCTGCAAGTTCTTGTTCTCTAGCCTCTGCCTCTTCTGCCTCTCTTTGAAACTCAAAGATCGCCGCACCCGCTGCAACTGCGATTGTTGCAGTAATAGCAAAAGCAGGGTTTAAGAATCCAGTCAAGGCCCGCCCTGTTGCCTCTGCAATACTTGCACCGTCAGAGATTGTAAAGAATAGCGACCCGAGCGCAGGAGATAGAGCGCTCGCACCTTGCCCCAAATCGGCAAAAGTCCCATCAAGATCTCGCCCTGCTCTTCTCAGATTCCGAGCCTGACTAGATGTCTGTTTTGCTTGTGTCTCTATGCGCTTCAATCCTTGCACGGCCTGTTTGCTTGAAGTATCCAGCCGGTCAAAGTTTTGACTTGCCTCTTTTGCCTCGTTGCCCGTCTTGTCAAGTGCAGCCTGTGCGCCCTTTGCATCTACTTTCAACACATATTGTACAACTGTATCAGCCATCTTTTGATCCTCTGTTATGCGCCTATCATAGCCGATTATATCAAGACTAGCACAGAAGAGATTTTCAACCTATTATATCGATCAAGTCAGTCAGTGAGACAGTCGGCTGTACGCCCGTCTTTTTGTATCGCTTCAATAGTCGATTCATGCGAGCGCCTCTGTGCTTGATACACTTCAGGCAGATCATTAAATCGAA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| 60,531
|
MK892495.1
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
GOV_bin_4342
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 41,480
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null |
2011-07-27
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SAMEA2622705
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PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate GOV_bin_4342, complete genome
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| 60,532
|
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|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Unbinned_4098_contig-100_0
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
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dsDNA
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| 1
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2010-04-04
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PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_4098_contig-100_0, complete genome
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| 60,533
|
MK892497.1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Tp1_137_MES_0-0d2_C2305949_1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 41,805
|
GenBank
| 1
| null | null |
Bacteria
| null |
2011-12-02
|
SAMEA2623290
|
PRJNA477650
|
MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Tp1_137_MES_0-0d2_C2305949_1, complete genome
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| 60,534
|
MK892500.1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Unbinned_4_contig-100_0
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 39,600
|
GenBank
| 1
| null | null |
Bacteria
| null |
2010-01-11
|
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PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_4_contig-100_0, partial genome
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| 60,535
|
MK892501.1
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
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2019-07-29
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GOV_bin_406
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 53,190
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GenBank
| 1
| null | null | null | null |
2011-05-31
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SAMEA2622497
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PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate GOV_bin_406, complete genome
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| 60,536
|
MK892507.1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
GOV_bin_655
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 57,767
|
GenBank
| 1
| null | null |
Bacteria
| null |
2010-03-30
|
SAMEA2620227
|
PRJNA477650
|
MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate GOV_bin_655, complete genome
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| 60,537
|
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|
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|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
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2019-07-29
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
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GenBank
| 1
| null | null | null | null |
2010-07-12
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PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_4388_contig-100_0, complete genome
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| 60,538
|
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|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Unbinned_2716_contig-100_1
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
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| 1
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2010-09-21
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|
MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_2716_contig-100_1, complete genome
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PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_4350_contig-100_2, complete genome
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MK892515.1
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
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Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
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Ohio State University, Department of Microbiology
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USA
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2019-07-29
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GOV_bin_1174
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 33,141
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GenBank
| 1
| null | null | null | null |
2010-03-18
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SAMEA2620078
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PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate GOV_bin_1174, complete genome
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| 60,541
|
MK892519.1
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
GOV_bin_2390
|
Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 28,866
|
GenBank
| 1
| null | null |
Bacteria
| null |
2011-08-04
|
SAMEA2622788
|
PRJNA477650
|
MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate GOV_bin_2390, complete genome
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|
Roux,S., Brum,J.R., Dutilh,B.E., Sunagawa,S., Duhaime,M.B., Loy,A., Poulos,B.T., Solonenko,N., Lara,E., Poulain,J., Pesant,S., Kandels-Lewis,S., Dimier,C., Picheral,M., Searson,S., Cruaud,C., Alberti,A., Duarte,C.M., Gasol,J.M., Vaque,D., Bork,P., Acinas,S.G., Wincker,P., Sullivan,M.B.
|
Ohio State University, Department of Microbiology
|
USA
|
2019-07-29
|
Unbinned_400_contig-100_4
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Prokaryotic dsDNA virus sp.
| null | null |
dsDNA
| 29,668
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GenBank
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2011-08-09
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SAMEA2622852
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PRJNA477650
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MAG: Prokaryotic dsDNA virus sp. isolate Unbinned_400_contig-100_4, complete genome
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| 60,543
|
OR066200.1
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Kurucay,H.N., Gumusova,S.
|
Ondokuz Mayis University, Department of Virology, Faculty of Veterinary Medicine
|
Turkey
|
2023-12-15
|
TR.CPV.SAMSUN.01
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,323
|
GenBank
| null |
Turkey
|
Turkey
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2022
| null | null |
Protoparvovirus carnivoran1 isolate TR.CPV.SAMSUN.01, complete genome
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|
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|
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|
Kurucay,H.N., Gumusova,S.
|
Ondokuz Mayis University, Department of Virology, Faculty of Veterinary Medicine
|
Turkey
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2023-12-15
|
TR.CPV.SAMSUN.02
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Protoparvovirus carnivoran1
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
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| 5,323
|
GenBank
| null |
Turkey
|
Turkey
|
Canis lupus familiaris
|
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|
2022
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Protoparvovirus carnivoran1 isolate TR.CPV.SAMSUN.02, complete genome
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|
OR066202.1
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Kurucay,H.N., Gumusova,S.
|
Ondokuz Mayis University, Department of Virology, Faculty of Veterinary Medicine
|
Turkey
|
2023-12-15
|
TR.CPV.SAMSUN.03
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,323
|
GenBank
| null |
Turkey
|
Turkey
|
Canis lupus familiaris
|
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| 10,228
|
OR066203.1
|
Protoparvovirus carnivoran1
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Kurucay,H.N., Gumusova,S.
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Ondokuz Mayis University, Department of Virology, Faculty of Veterinary Medicine
|
Turkey
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2023-12-15
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TR.CPV.SAMSUN.04
|
Protoparvovirus carnivoran1
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Protoparvovirus
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Parvoviridae
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ssDNA(+/-)
| 5,323
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GenBank
| null |
Turkey
|
Turkey
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Canis lupus familiaris
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feces
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2022
| null | null |
Protoparvovirus carnivoran1 isolate TR.CPV.SAMSUN.04, complete genome
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| 10,229
|
OR066204.1
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Kurucay,H.N., Gumusova,S.
|
Ondokuz Mayis University, Department of Virology, Faculty of Veterinary Medicine
|
Turkey
|
2023-12-15
|
TR.CPV.SAMSUN.05
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,323
|
GenBank
| null |
Turkey
|
Turkey
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2022
| null | null |
Protoparvovirus carnivoran1 isolate TR.CPV.SAMSUN.05, complete genome
|
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| 10,230
|
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|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Kurucay,H.N., Gumusova,S.
|
Ondokuz Mayis University, Department of Virology, Faculty of Veterinary Medicine
|
Turkey
|
2023-12-15
|
TR.CPV.SAMSUN.06
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Protoparvovirus
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Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,323
|
GenBank
| null |
Turkey
|
Turkey
|
Canis lupus familiaris
|
feces
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2022
| null | null |
Protoparvovirus carnivoran1 isolate TR.CPV.SAMSUN.06, complete genome
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ATTCTTTAGAACCAACAAACCAAATTCACGTACGTATGACGTGATGACCCGCTGCGCGCGCTGCCTACGGCAGTCACACATCATACGTACGCTCCTTGGTCAGTTGGTTCTAAAGAATGATAGGCGGTTTGTGTGTTTAAACTTGGGCGGGAAAAGGTGGCGGGCTAATTGTGGGCGTGGTTAAAGGTATAAAAGACAAACCATAGACCGTTACTGACATTCGCTTCTTGTCTTTGACAGAGTGAACCTCTCTTACTCTGACTAACCAACCATGTCTGGCAACCAGTATACTGAGGAAGTTATGGAGGGAGTAAATTGGTTAAAGAAACATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGTTTGTTTTTAAATGTGACAACGTCCAACTAAATGGAAAGGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGAGCTAACATCTTTAATTAGAGGAGCACAAACAGCAATGGATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCGGAAGTTGATAGTCTCGCCAAAAAGCAAGTACAAACTTTTGATGCATTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAGAACCAAATGAATGTGTTTGGTTTATTCAACATGAATGGGGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAGAACTTACAACAAGCAACTGGTAAATGGCTACGCAGACAAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGGTAAACCTAACACCAACTGAAAAGATTAAGCTCAGAGAAATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATATTAACATACAGACATAAGCAAACAAAAAAAGACTATGTTAAAATGGTTCATTTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTGTCCACATGACAAAAGAAAGTGGCTATTTTTTAAGTACTGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAGTATCAAGACAGACAAATTGTCAGCACACTTTACACTGAACAAATGAAACCAGAAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGCGGGAGAATTCAAACTAAAAAGGAAGTGTCAATCAAATGTACTTTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAGACTGGATGATGTTACAACCAGATAGTTATATTGAAATGATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGAAATTTGTACTTTGACTTTAGCAAGAACAAAAACAGCATTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAATACTAAACTAACTAACTTTGATCTTGCAAATTCTAGAACATGTCAAATTTTTAGAATGCACGGATGGAATTGGATTAAAGTTTGTCACGCTATAGCATGTGTTTTAAATAGACAAGGTGGTAAAAGAAATACAGTTCTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAGCCATAGCACAAGCTGTGGGTAATGTTGGTTGTTATAATGCAGCAAATGTAAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAATAAAAATTTAATTTGGATTGAAGAAGCTGGTAACTTTGGTCAACAAGTTAATCAATTTAAAGCAATCTGTTCTGGACAAACAATTAGAATTGATCAAAAAGGTAAAGGAAGTAAGCAAATTGAACCAACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAAAATATAACAATTGTGAGAATTGGATGTGAAGAAAGACCTGAACATACACAACCAATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGTTAGTATGTAAGCTTCCAGGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTAGTTAAACATGGTTATGAATCAACCATGGCTAACTATACACATCATTGGGGAAAAGTACCAGAATGGGATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTCACCAGGTTGCAAAGACTTAAAGACACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGACGTAGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACAATCAAACCAACTTGGCGTTACTCACAAAGACGTGCAAGCGAGTCCAACGTGGTCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACAATTGGAAGAAGATTTTCGAGACGACTTGGATTAAGGTACGATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAGAGGTAAGGGTGTGTTAGTAAAGTGGGGGGAGGGGAAAGATTTAATGACTTAACTAAGTATGTGTTTTTTTATAGGACTTGTGCCTCCAGGTTATAAATATCTTGGGCCTGGGAACAGTCTTGACCAAGGAGAACCAACTAACCCTTCTGACGCCGCTGCAAAAGAACACGACGAAGCTTACGCTGCTTATCTTCGCTCTGGTAAAAACCCATACTTATATTTCTCGCCAGCAGATCAACGCTTTATAGATCAAACTAAGGACGCTAAAGATTGGGGGGGGAAAATAGGACATTATTTTTTTAGAGCTAAAAAGGCAATTGCTCCAGTATTAACTGATACACCAGATCATCCATCAACATCAAGACCAACAAAACCAACTAAAAGAAGTAAACCACCACCTCATATTTTCATCAATCTTGCAAAAAAAAAAAAAGCCGGTGCAGGACAAGTAAAAAGAGACAATCTTGCACCAATGAGTGATGGAGCAGTTCAACCAGACGGTTGTCAACCTGCTGTCAGAAATGAAAGAGCTACAGGATCTGGGAACGGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTCAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCAAGCAGACTTGTACATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATATGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATATTCATGCACAAATTGTAACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGACAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCTATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTGCACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAACCATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAATCTGAAGGAGCTACTAACTTTGGTGATATAGGAGTTCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTGACTCAAATGGGAAATACAAACTATATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCATCTACACAAGGGCCATTTAAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCAAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACAACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAAACACCTGAGAGATTTACATATATAGCACATCAAGATACAGGAAGATATCCAGAAGGAGATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACGAATGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGGAGGTAAAACAGGAATTAACTATACCAATATATTTAATACTTATGGTCCTTTAACTGCATTAAATAATGTACCACCAGTTTATCCAAATGGTCAAATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAATAATTGTCCTGGTCAATTATTTGTAAAAGTTGCGCCTAATCTAACAAATGAATATGATCCTGATGCATCTGCTAATATGTCAAGAATTGTAACTTACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTCTCATACTTGGAATCCAATTCAACAAATGAGTATCAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGTATGAAAATTGTATATGAAAAATCTCAACTAGCACCTAGAAAATTATATTAACATACTTACTATGGTTTTTATGTTTTTTTAATTTCCACTACCACCTGGAAAAATTAAATTAAAAAACTTACTATGGTTTTTATGTTTATTACATATTATTTTAAGATTAATTAAATACAGCATAGAAATATTGTACGCGTATTTGATATAGGATTTAGAAGTTTGTTAGATGGTATACAATACCTGTAAGAAATAGAAGAACATTTAGATCATAGTTAGTAGGTTTGTTATATGATATAAAATAACTGTAAGAAGTAGTAGAACATTTATATCATAGTTAGTAGGTTTGTTATATGGTATACAATAACTGTAAGAAATAGAAGAACATTTAGATCATAGTTAGTAGTTTGTTTTATAAAATGTATTGTAAACCATTAATGTATGTTGTTATGGTGTGGGTGGTTGGTTGGTTTGCCCTTAGAATATGTTAAGGACCAAAAAAATCAATAAAAGACATTTA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| 10,231
|
OR437363.1
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Taniwaki,S.A., Santana-Clavijo,N.F., Galvis-Estevez,C.C., Reyes-Romero,D.P., Yamakawa,A.C., Araujo,J.P. Jr., Brandao,P.E.
|
University of Sao Paulo, Department of Preventive Veterinary Medicine and Animal Health
|
Brazil
|
2023-10-03
|
CPV2a/Simona/2014
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,051
|
GenBank
| null |
Colombia: Bogota
|
Colombia
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2014
| null | null |
Protoparvovirus carnivoran1 isolate CPV2a/Simona/2014, complete genome
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TACTGATGTTGTGTATCTCCCACCCACCCCCCCCTTAAAGACAGAATGATA
| 12,454
|
OR437364.1
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Taniwaki,S.A., Santana-Clavijo,N.F., Galvis-Estevez,C.C., Reyes-Romero,D.P., Yamakawa,A.C., Araujo,J.P. Jr., Brandao,P.E.
|
University of Sao Paulo, Department of Preventive Veterinary Medicine and Animal Health
|
Brazil
|
2023-10-03
|
CPV2a/Bongoo/2016
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,051
|
GenBank
| null |
Colombia: Bogota
|
Colombia
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2016
| null | null |
Protoparvovirus carnivoran1 isolate CPV2a/Bongoo/2016, complete genome
|
TTAGAACCAACTGACCAAGGAGCGTACGTATGACGTGTGACTGCCGTAGGCAGCGCGCGCAGCGCGCGTCATCACGTCATACGTACGCTCCTTGGTCAGTTGGTTCTAAAGAATGATAGGCGGTTTGTGTGTTTAAACTTGGGCGGGAAAAGGTGGCGGGCTAATTGTGGGCGTGGTTAAAGGTATAAAAGACAAACCATAGACCGTTACTGACATTCGCTTCTTGTCTTTGACAGAGTGAACCTCTCTTACTTTGACTAACCATGTCTGGCAACCAGTATACTGAGGAAGTTATGGAGGGAGTAAATTGGTTAAAGAAACATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGTTTGTTTTTAAATGTGACAACGTCCAACTAAATGGAAAGGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGAGCTAACATCTTTGATTAGAGGAGCACAAACAGCAATGGATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCGGAAGTTGATAGTCTCGCCAAAAAGCAAGTACAAACTTTTGATGCATTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAGAACCAAATGAATGTGTTTGGTTTATTCAACATGAATGGGGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAGAACTTACAACAAGCAACTGGTAAATGGCTACGCAGACAAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGATAAACTTAACACCAACTGAAAAAATTAAGCTCAGAGAAATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATTTTAACATACAGACATAAGCAAACAAAAAAAGACTATGTTAAAATGGTTCATTTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTGTCCACATGACAAAAGAAAGTGGCTATTTTTTAAGTACTGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAGTATCAAGACAGACAAATTGTCAGCACACTTTACACTGAACAAATGAAACCAGAAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGCGGGAGAATTCAAACTAAAAAGGAAGTGTCAATCAAATGTACTTTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAGACTGGATGATGTTACAACCAGATAGTTATATTGAAATGATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGAAATTTGTACTTTGACTTTAGCAAGAACAAAAACAGCATTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAAAACTAAACTAACTAACTTTGATCTTGTAAAATCTAGAACATGTCAAATTTTTAGAATGCACGGATGGAATTGGATTAAAGTTTGTCACGCTATAGCATGTGTTTTAAATAGACAAGGTGGTAAAAGAAATACAGTTCTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAGCCATAGCACAAGCTGTGGGTAATGTTGGTTGTTATAATGCAGCAAATGTAAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAATAAAAATTTAATTTGGATTGAAGAAGCTGGTAACTTTGGTCAGCAAGTTAATCAATTTAAAGCAATCTGTTCTGGACAAACAATTAGAATTGATCAAAAAGGTAAAGGAAGTAAGCAAATTGAACCAACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAAAATATAACAATTGTGAGAATTGGATGTGAAGAAAGACCTGAACATACACAACCAATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGTTAGTATGTAAGCTTCCAGGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTAGTTAAACATGGTTATGAATCAACCATGGCTAACTATACACATCATTGGGGAAAAGTACCAGAATGGGATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTCACCAGGTTGCAAAGACTTAGAGATACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCCAACTCCTCTGACTCCGGACGTAGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACAATCAAACCAACTTGGCGTTACTCACAAAGACGTGCAAGCGAGTCCGACATGGTCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACAATTGGAAGAAGATTTTCGAGACGACTTGGATTAAGGTACGATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAGAGGTAAGGGTGTGTTAGTAAAGTGGGGGGAGGGGAAAGATTTAATAACTTAACTAAGTATGTGTTTTTTTTTATAGGACTTGTGCCTCCAGGTTATAAATATCTTGGGCCTGGGAACAGTCTTGACCAAGGAGAACCAACTAACCCTTCTGACGCCGCTGCAAAAGAACACGACGAAGCTTACGCTGCTTATCTTCGCTCTGGTAAAAACCCATACTTATATTTTTCGCCAGCAGATCAACGCTTTATAGATCAAACTAAGGACGCTAAAGATTGGGGGGGGAAAATAGGACATTATTTTTTTAGAGCTAAAAAGGCAATTGCTCCAGTATTAACTGATACACCAGATCATCCATCAACATCAAGACCAACAAAACCAACTAAAAGAAGTAAACCACCACCTCATATTTTCATCAATCTTGCAAAAAAAAAAAAAGCCGGTGCAGGACAAGTAAAAAGAGACAATCTTGCACCAATGAGTGATGGAGCAGTACAACCAGACGGTGGTCAACCTGCTGTCAGAAATGAAAGAGCTACAGGATCTGGGAACGGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTCAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCAAGCAGACTTGTACATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCACAAATTGTAACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAATTGCACTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCTATGAGATCTGAAACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGTACACCAACAAATATATACCATGGCACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTATACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTTTTTTGATTGTAAACCATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAAATGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAATACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAAGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTAAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCAAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACAACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAAACGCCTGAGAGATTTACATATATAGCACATCAAGATACAGGAAGATACCCAGAAGGAGATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAAATGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGGAGGTAAAACAGGAATTAACTATACTAATATATTTAATACTTATGGTCCTTTAACTGCATTAAATAATGTACCACCAGTTTATCCAAATGGTCAAATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAATAATTGTCCTGGTCAATTATTTGTAAAAGTTGCGCCTAATTTAACAAATGAATATGATCCTGATTCATCTGCTAATATGTCAAGAATTGTAACTTACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTCTCATACTTGGAATCCAATTCAACAAATGAGTATTAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGCATGAAAATTGTATATGAAAAATCTCAACTAGCACCTAGAAAATTATATTAACATACTTACTATGTTTTTATGTTTATTACATATTATTTTAAGATTAATTAAATTACAGCATAGAAATATTGTACTTGTATTTGATATAGGATTTAGAAGGTTTGTTGTATGGTATACAATAACTGTAAGAAATAGAAGAACATTTAGATCATAGTTAGTAGTTTGTTTTATAAAATGTGCTGTAAACCATTAATGTATGTTGTTACGGTGTGGGTGGTTGGTTGGTTTGCCCTTAGAATATGTTAAGGACCAAAAAAATCAATAAAAGACATTTAAAACTAAATGGCCTCGTATACTGTCTATAAGGTGAACTAACCTTACCATAAGTATCAATCTGTCTTTAAGGGGGGGTGGGTGGGAGATGCACAACATCAGTAGACTGACTGGCCTGGTTGGTTGCTCTGCTTAATCAACCAGACCGCTACGCGGTCTGGTTGATTAAGCGCAACCAACCAGGCCAGTCAGTCTACTGATGTTGTGCATCTCCCACCCACCCCCCCTTAAAGACAGATTGATA
| 12,455
|
OR437365.1
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Taniwaki,S.A., Santana-Clavijo,N.F., Galvis-Estevez,C.C., Reyes-Romero,D.P., Yamakawa,A.C., Araujo,J.P. Jr., Brandao,P.E.
|
University of Sao Paulo, Department of Preventive Veterinary Medicine and Animal Health
|
Brazil
|
2023-10-03
|
CPV2a/Romina/2018
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Protoparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,050
|
GenBank
| null |
Colombia: Bogota
|
Colombia
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2018
| null | null |
Protoparvovirus carnivoran1 isolate CPV2a/Romina/2018, complete genome
|
TTAGAACCAACTGACCAAGGAGCGTACGTATGACGTGTGACTGCCGTAGGCAGCGCGCGCAGCGCGCGTCATCACGTCATACGTACGCTCCTTGGTCAGTTGGTTCTAAAGAATGATAGGCGGTTTGTGTGTTTAAACTTGGGCGGGAAAAGGTGGCGGGCTAATTGTGGGCGTGGTTAAAGGTATAAAAGACAAACCATAGACCGTTACTGACATTCGCTTCTTGTCTTTGACAGAGTGAACCTCTCTTACTTTGACTAACCATGTCTGGCAACCAGTATACTGAGGAAGTTATGGAGGGAGTGAATTGGTTAAAGAAGCATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGTTTGTTTTTAAATGTGACAACGTCCAACTAAATGGAAAGGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGAGCTAACATCTTTGATTAGAGGAGCACAAACAGCAATGGATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCGGAAGTTGATAGTCTCGCCAAAAAGCAAGTACAAACTTTTGATGCATTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAGAACCAAATGAATGTGTTTGGTTTATTCAACATGAATGGGGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAGAACTTACAACAAGCAACTGGTAAATGGCTACGCAGACAAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGGTAAACTTAACACCAACTGAAAAGATTAAGCTCAGAGAAATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATTTTAACGTACAGACATAAGCAAACAAAAAAAGACTATGTTAAAATGGTTCATTTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTGTCCACATGACAAAAGAAAGTGGCTATTTTTTAAGTACTGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAGTATCAAGACAGACAAATTGTCAGCACACTTTACACTGAACAAATGAAACCAGAAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGCGGGAGAATTCAAACTAAAAAGGAAGTGTCAATCAAATGTACTTTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAGACTGGATGATGTTACAACCAGATAGTTATATTGAAATGATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGAAATTTGTACTTTGACTTTAGCAAGAACAAAAACAGCATTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAAAACTAAACTAACTAACTTTGATCTTGCAAAATCTAGAACATGTCAAATTTTTAGAATGCACGGATGGAATTGGATTAAAGTTTGTCACGCTATAGCATGTGTTTTAAATAGACAAGGTGGTAAAAGAAATACAGTTCTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAGCCATAGCACAAGCTGTGGGTAATGTTGGTTGTTATAATGCAGCAAATGTAAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAATAAAAATTTAATTTGGATTGAAGAAGCTGGTAACTTTGGTCAGCAAGTTAATCAATTTAAAGCAATCTGTTCTGGACAAACAATTAGAATTGATCAAAAAGGTAAAGGAAGTAAGCAAATTGAACCAACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAAAATATAACAATTGTGAGAATTGGATGTGAAGAAAGACCTGAACATACACAACCAATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGTTAGTATGTAAGCTTCCAGGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTAGTTAAACATGGTTATGAATCAACCATGGCTAACTATACACATCATTGGGGAAAAGTACCAGAATGGGATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTCACCAGGTTGCAAAGACTTAGAGATACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAATTCCAACTCCTCTGACTCCGGACGTAGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACAATCAAACCAACTTGGCGTTACTCACAAAGACGTGCAAGCGAGTCCGACATGGTCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACAATTGGAAGAAGATTTTCGAGACGACTTGGATTAAGGTACGATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAGAGGTAAGGGTGTGTTAGTAAAGTGGGGGGAGGGGAAAGATTTAATAACTTAACTAAGTATGTGTTTTTTTTATAGGACTTGTGCCTCCAGGTTATAAATATCTTGGGCCTGGGAACAGTCTTGACCAAGGAGAACCAACTAACCCTTCTGACGCCGCTGCAAAAGAACACGACGAAGCTTACGCTGCTTATCTTCGCTCTGGTAAAAACCCATACTTATATTTTTCGCCAGCAGATCAACGCTTTATAGATCAAACTAAGGACGCTAAAGATTGGGGGGGGAAAATAGGACATTATTTTTTTAGAGCTAAAAAGGCAATTGCTCCAGTATTAACTGATACACCAGATCATCCATCAACATCAAGACCAACAAAACCAACTAAAAGAAGTAAACCACCACCTCATATTTTCATCAATCTTGCAAAAAAAAAAAAAGCCGGTGCAGGACAAGTAAAAAGAGACAATCTTGCACCAATGAGTGATGGAGCAGTACAACCAGACGGTGGTCAACCTGCTGTCAGAAATGAAAGAGCTACAGGATCTGGGAACGGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTCAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCAAGCAGACTTGTACATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCACAAATTGTAACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAATTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCTATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGTACACCAACAAATATATACCATGGCACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTATACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTTCTTTGATTGTAAACCATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAAATGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAATACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAAGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTAAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCACAAACAGATGAAAATCAAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACAACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAAACGCCTGAGAGATTTACATACATAGCACATCAAGATACAGGAAGATACCCAGAAGGAGATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAAATGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGGAGGTAAAACAGGAATTAACTATACTAATATATTTAATACTTATGGTCCTTTAACTGCATTAAATAATGTACCACCAGTTTATCCAAATGGTCAAATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAATAATTGTCCTGGTCAATTATTTGTAAAAGTTGCGCCTAATTTAACAAATGAATATGATCCTGATTCATCTGCTAATATGTCAAGAATTGTAACTTACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTCTCATACTTGGAATCCAATTCAACAAATGAGTATTAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGCATGAAAATTGTATATGAAAAATCTCAACTAGCACCTAGAAAATTATATTAACATACTTACTATGTTTTTATGTTTATTACATATTATTTTAAGATTAATTAAATTACAGCATAGAAATATTGTACTTGTATTTGATATAGGATTTAGAAGGTTTGTTGTATGGTATACAATAACTGTAAGAAATAGAAGAACATTTAGATCATAGTTAGTAGTTTGTTTTATAAAATGTGCTGTAAACCATTAATGTATGTTGTTATGGTGTGGGTGGTTGGTTGGTTTGCCCTTAGAATATGTTAAGGACCAAAAAAATCAATAAAAGACATTTAAAACTAAATGGCCTCGTATACTGTCTATAAGGTGAACTAACCTTACCATAAGTATCAATCTGTCTTTAAGGGGGGGTGGGTGGGAGATGCACAACATCAGTAGACTGACTGGCCTGGTTGGTTGCTCTGCTTAATCAACCAGACCGCTACGCGGTCTGGTTGATTAAGCGCAACCAACCAGGCCAGTCAGTCTACTGATGTTGTGCATCTCCCACCCACCCCCCCTTAAAGACAGATTGATA
| 12,456
|
OR437366.1
|
Protoparvovirus carnivoran1
|
Taniwaki,S.A., Santana-Clavijo,N.F., Galvis-Estevez,C.C., Reyes-Romero,D.P., Yamakawa,A.C., Araujo,J.P. Jr., Brandao,P.E.
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University of Sao Paulo, Department of Preventive Veterinary Medicine and Animal Health
|
Brazil
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2023-10-03
|
CPV2a/Jade2014
|
Protoparvovirus carnivoran1
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Protoparvovirus
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Parvoviridae
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ssDNA(+/-)
| 5,050
|
GenBank
| null |
Colombia: Bogota
|
Colombia
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Canis lupus familiaris
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feces
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2014
| null | null |
Protoparvovirus carnivoran1 isolate CPV2a/Jade2014, complete genome
|
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| 12,457
|
NC_039077.1
|
Prunus virus F
|
Villamor,D.E., Pillai,S.S., Eastwell,K.C., Villamor,D.E.V.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2018-08-24
|
8816-v1
|
Fabavirus pruni
|
Fabavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,165
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Prunus virus F isolate 8816-v1 segment RNA1 polyprotein 1 gene, complete cds
|
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CTGTGCATGATTCCATCAAAACACAGTTTAATGGGGAAGTTATCCAAAGAGAAATGGCCAAGCTCCACATAACTATCACGGATGGGGTAGACAAAACTCTTCCACACCTGGCATTTCGAAGACTGCAAAATTGCGATTTTTTGAAGCGTTCCTTCAAAATGCAAGATGGTTTATGGGTAGGACCCATGGAGAAGGAAAGTTTGTGGGGGCAGTTGCACTATGTTAACACCAAGAACCTTGAGATGAAGGAGGCTTACCTCACCAATTTGGAGTCTGTTTTGCGAGAACTTTTTCTACATAGCAAACAAGACTGTATGAACTTGCGACGAAAGGCCTTGAACATCTCTTGGATCAATTTGGGTGATCTTCCGTCGCTTGATAAGATTGAGAGTTTTTTTACGGAGCAGAGAGGAGAGACTAGACCCTACAACCTGGTCTGTGATTTGATGCTCAATACAGCGTTGCTTGGGCCCTTGAATGATCCGAACGAAAAGCTGTCTCAGAATATGCTTGAGATACTTCCCAATTTGTGGGTTTCTGGTTCTAAGACCTACCTTGCTGAGCCAAATGACTATGTTGTTTGGCTCAATCATTATGGAAGAAAAGACAATTCTCTTGTTTTGCGTTTTCCATCTGGAACTGGGAGGGGTGGTCTTCCGACAAAAAATTGGCTCGAAGAAAACTATCTGAGAAAATCCTCCAATGTGTACAAATTGCTGAAGGAGGCTTATGTTGCTCACAGGCGTATAGTTTTCATATCGCCCAACGACAATGTAGTGGGATTGGTTTTTCTCACTCTCTTTGCGGCACGTTGTGGTGCTATCAAGAGGGAGGATTCGAATGTCTTGCTTACAGTAGCTATGAATCAAACCAAAAGTTTGGGTTACCTTCCCAGTGAGATGGGAGATTATTTTTAACTCTCTCGTTTCCCAACATCGTCTCGTTTTCTGATATCGTATAATCAGAACTACCAGAAGTTTTCTGGTGTGCCGGCGGACACTTATTCTGTTTGGTTCTTCAGACCTGCTTGTTGGTTCAAGTAACCAATCCTCTCGTTGGATTTCGAGCCCCACCTGGGTTATGGTTTTATTTTGTTTGTGTTGTTTTCTCTCCTTTTGTTTGTCTGTAACTTTTGTTGAGAATTGGTGAAAGCCCAATCGGACAC
| 4,204
|
MK834285.1
|
Prunus virus F
|
Tahzima,R., Foucart,Y., Peusens,G., Belien,T., Massart,S., De Jonghe,K.
|
Flanders Research for Agricultural and Fisheries (ILVO), Department of Plant Virology / Plant Sciences
|
Belgium
|
2019-07-17
|
GBVC_PrVF001
|
Fabavirus pruni
|
Fabavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,150
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Prunus avium
| null |
2018
| null | null |
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|
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| 61,711
|
MK834287.1
|
Prunus virus F
|
Tahzima,R., Foucart,Y., Peusens,G., Belien,T., Massart,S., De Jonghe,K.
|
Flanders Research for Agricultural and Fisheries (ILVO), Department of Plant Virology / Plant Sciences
|
Belgium
|
2019-07-17
|
GBVC_PrVF002
|
Fabavirus pruni
|
Fabavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,150
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Prunus avium
| null |
2018
| null | null |
Prunus virus F isolate GBVC_PrVF002 segment RNA1, complete sequence
|
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| 61,712
|
MH998208.1
|
Prunus virus F
|
James,D., Phelan,J., Sanderson,D.
|
Canadian Food Inspection Agency Centre for Plant Health, Tree Fruit Research
|
Canada
|
2019-01-15
|
Stac-3B_C3
|
Fabavirus pruni
|
Fabavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,165
|
GenBank
| null |
Canada: Okanagan Valley, British Columbia
|
Canada
|
Prunus avium
|
plant leaf
|
2016-06-06
| null | null |
Prunus virus F isolate Stac-3B_C3 segment RNA1, complete sequence
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TGTTTAAGAGATTAAACAACCGCTTTCGATACCAGCTTCTTTTCTTACAGCTTTCGTTCTCAAGCTTGCTTTCGCGCAAATTGTTTCTGTTGCTATAGTGGTTACTCGCTGCCTTCATTGGTTACCAAAGCCCACTATTTCCAACTTTGCTTTTGCGACACCTTTTTGTTCTCTTGATCACCTGTGCTTATTCCTAATGGCTTTTCCCTTGTTTGTTGATACCTATGAGCATGTTGCAAAATATGACAAGAAATATTATGGATCTTTTCCAGCCACCTTTACTTTGATTGCTGGAGGCGGAGTGATCGATCTTGAGGAAATGTTTTCTGGAGTCCGCAAACTAAAGCGCCATCTGACGCTACATCGAATGTTTGCGGGCTGTGTTCTGGGCATAGAAGTTGCTGAGCGTGACTGGAATAAATATCCATATCTTCTTCTGGACGAGGTGGTGGACATCCTGGAAGCAAGTGACCTGGCCAAGATTGGCGTTGCTGACATGTATACTTTCATCAGAGGTTGCATGTTCCATTACCTTGATGCTGAGTTTGTTTGTGACAAATATCACAAGCTGCTACAAACTCCTTCTGAAACTTCACTTGCACAAGGACTTATGTCCTCGTGTGCGTCTTTTGCTAGGAAGCTTCCTAGCATTGTTTATGAAAAATGCACAGATGCAGCTGCTTTCTGTGTGAAATCTGTTTGGACCGTTTTAGAGGATTGTTTCAATAAGGCCTTTGGTAGCTTTTGCCCACATGTGTATAATGTTTTGGGCTGGGTTACAAAAGCTTTCCAATCTTTCAAACTCTGGGCGGAGCATATAGTTGAAAATTCTTTTTCCTGGCTCTGCTGTGCTCGTGACAGTGTAGTTATGGGCCTTGCTTTGACGAGCATGACATGCTTGGTTGCTCTAGTTGAGCGTTTTCTGGTTGCCACAGGACTTATGACAGCAGCTTTGGGTCTTCCAGCTATGTTCCTGACGTTTGCTGTTGGAGCTATATGTGGATATAAAGCTCTTGTTTCAGCAGCTGGTGCTAATGAGAATGGGTATGCTGCTGCTCTTGTTGACATGGTCAAAGGATCATGCATGGCACTCTTAAATTCATTGTGGCCTTCCCTCAATGTTGACATCCAAAACAAGATGTATGACATTAAGAAGGTTGCTAAGGAAGAAGGTAGGGCAAAGGCTATAAAGCGCCACCAGGAGAAAATTGGGCGATCTGAACCCTTTTCAACTGAGGAACATCTTCAGCAACAATGGGAAGATTTCATTCATTATCGTCCTTCGATTTTCACTGATGACCCCCAGAATTGGGTGTTCAGACAACAATATTGGGACAATCAGAGTGATAATGCTCAGTTTTCTCCTATTAGTGTTCTGGAAACCGTTGCTGCTTCAGTTTCAAGCTGGAATTCCAGCACTCTTGTTGGAGTGGGAAGAACATGTGCAGCTTTTTCACAGATCAAGAATGGAGTATCAGCATTGAAAGATATTTTGGCCTACATATGTGGCAAGCTGTATGATTGTGCTGATAGCGTGTTTGGGTTGCAATCCGCAATACTCAATGATGCTGCAGTCTTGCTCGGTCAGGATTTGCCCTCTTGGCTCAAGGAATGTGATGCTATGGTCGACTATATGCACTTGTTTGCTGTAGCTCCGCGAGACGTCATTGATCGCATGCAAAAGCTTCTCAGCCTTGGGAGGCAAATGCGATCTGTTTTTATTAGCAGCGAGCGCAGAGGCTCTGCTCAGGTTCTTTCACTGATAACAAAGGCTATTGATAAACTGGAGACCCTCTATCATGGAGCCATACTTGCAGGGTCGAATTTACCGCGCAAGGCCCCTTTCTTTTTGTTTCTTACTGGGGAATCAGGAGTTGGGAAAAGCTCCTTAACGCAGAGGCTGACACGCGACTGGCTGGTTCATCATGAACTAGGACAAGACTGCAGATACGCACGCAATTCCCAAGACCCATTCTGGTCTGGGTATCGCCGGCAAGCAGTCGTCACGTATGATGACTTTGGAGCCATTGTCAAAGAGCCTTCGGATGAAAGTGAAATAATTCCTATTGTTTCACGGGATCCCATGTCTCTTAACATGGCTAGCTTGGAAGAAAAAGGAATGTTCTTTGATAGCAGACTACTCGTGGCTAGTAGTAATTTTCTAGCTCCCAGCCCCAATTCCCAAGTTCATGACAATGATGCCTATGCTCGTAGGCGCCACCTTGTCGTGCAGGTGGAGCTCAAGAGGGGCATTCCCTATAATCCAAACGTTCCGACTGAGAATCAGCGGTATATTGTCCGAGCCACAAAAGCTCCCTATACGATCGCTGAAACCTTTGAGACTTACGAAGATCTCTGGACACACTTCCTCAACAAATTTGACGAACATGAGGAGGGTGAACAGCAGTTTTTGAAGTCACTTTCGATTCCCTCAGGAAACCAAAGCACGGCTATGCAGGCTATATTTGCTGCTAGCACTTTCATGTTGGCGTATGCGCCTGGCTCGATTCAGGCACACATCACAACTCAGATGAAAGAGATGCACTATCTGGCTGTTAGAAAGGGCATCTTGTATGTGTGGGGTGCCAACGATGAATTGCAACGTGTTGATCTTAAGGGTATCGCAGATGCTGAAGACATTCGTCGTGCAGAAAGGGACAGTTTCAGATCAGCACTGCAGTTTGAATATGTGCTGCGCGCTTTTCCCGATCTAAACCCTCTGGCTGTGCATTATACAATGGAAATTATTAAGCATGGTTGGCTTAATGAAGATCTTACTGTTGGCAATAACTGTCCTGATGACTACACGAGGAAACTCCTTGAGAGTTTTCCTGAATGGATGCGCCAGTACATGTTTATACTTTCTGAGGCACACCTGACAGCAGAGAAGAAACCCTTCTTTCAGGATCTACTCACTGATTTCAAACAACAGGTGTGCCGCCTTTATGCCACGGACTTCAACAGGTGGAACCCGATCCTCAAGATAGCCTTTGGCTGTGTGTTAGCCATAGCTGTTGGAGGAACGGTTTACTCACTTTTTTCCTCATTGTGGCAATGTGGAACAGGAGCAAAGTTCATGGTGGCAGCCACCACAACTTTTGCAGCAGGACAGAGTGTGCCTCCTAATCGGCAAGAGGTCACAGAATATAAATTTCGCAATGTACCTTTTAGGTCCAAGCACTGGAGTAAAGGGCAAGCATGTTATGGGGATTCTGCCAATTGGATAATGGACAAATGTATGGCGAGTCTCACTTATGGCAGTTATGTTGCCCAAGTGTGTGTTTTGCCGGGGAACCAGTTGGTGGGTGTGAATCACTTTTTAAGAGTGATACCCACTAACACAACTGTCAAGATCCAGTCAGGTCAAGGTGACTATTGGATCACGTGGAACAAAGCCAAACTTGTTTGTTCCCAGGATAGTGAATTGGCTGTCTACCGATGCTCCCAGGTTAGACAAGTTCCACAGAGTGTGCTAGATAGATGCATTTTTGATGTGGAGAGGGATCTGCCCAGGAAGTTTGAAGCTACATTCTTGTCCTATAAATACTTCTTGGACTCACAGCAGTTTGTTCCTGAGATCGCTAAGATAGATGTGGATGTTCGTTCTACGTCCCATTCAGTTATGGTTGGATCTTATGTGAGACAGATACCTCGCTTCATGACCTATGAGGCAAACACTATAGATGGTGATTGTGGCTCTCTCATTGTGGCTATGAAAGAAGGAAAAGCGTGCCTCGTGGGCTTACACATTTCAGGTGTCAACGGTTATGGGATCGCTGGGTTTCTTCCTTTTGTGCACCAGAGCTCTCAAGGTCAGTTTGATCCGGGAATGTATTCTCGTGTTGAAGAATTTGAGGTGTCTGCGCCCCTTGGAAATGGCTGTTACCAGGTTGGTTTTTTAAAACCTGAGGATCGTTTTCGCATATCCACCAAATCCAGTTTGGTGGAAACACCAATTGAGTGGCATTTGGAAACTCCTTGTGAGAAAATACCTAGTGTCATCACAAAAAATGATCCTCGCTTGCTTGGCACAGAACATGTTGATTTCAATCCTTACTACTCCGGTATGGAAAAGTACTCACAGGAAGCTGGACCCTTTGACCAAGATATTCTAGGTGCTGTGTGTAATGAGATCGTTGAGGAGTGGAAGGATGCTTCTTCCCACTTTACATTTGAGGATGCCACTTTGGATGAAGCTATCAATGGTGTTGAAAATTTGGACTACTTTGATTCACTTGTTATTGGAACCTCAGAGGGGTATCCTTACGTGCTTGAACGAGAGAGAAATCAGAAGGGCAAGTCACGATATCTGGAGGGAGAAGTTGGGAGTCTGAGAATACAGCCCGACTCAAAAGTTGCCAAGGATGTCTCTTCATTGTATGAAGAATGTGCCAATCAGGTGCCGGAGTTGGTGGGAATCGAGTGTCCTAAAGACGAGAAAGTCAAGCGTGCCAAGGTTTTTGGGAAGCCCAAGACCAGACTTTTTACAGTTTTGCCGATGTCATACAATCTTGTTGTGCGTATGAAGTTTTTACGCTTCGTTCGGTTTCTCATGAAAAGAAGGGATGTGCTACCTTGTCAGGTTGGTATTAACCCTTATAGTCGGGAATGGGATAGAGTTGCTTCAACACTCCTGGAAAGAGGAGAGAATATTCTTTGCTGTGACTATTCCCGGTTTGATGGTTTTTTGCCCAAGAGTATTATGGCCAGAATCGCAGGCATGATTAATTCTTTGTGTGGAGGTTCTCAAACAGATTGCTCCCAACGAGAAAATCTTCTGATGGCATGTGTTGGTCGATTTGCCATTTGTGACAAAGTGCTCTATCGTGTGGAGAATGGAATTCCGTCTGGTTTTCCTTTAACAGTCATCCTGAACTGCATTCTGAATGAGATACTTGTTAGATATGTGTATAGGCAGACATTCAAAGAAAATCCTGTGGTGGCAAGTTCCTTTCGGGATTTGGTGTCCATGGTTGTCTACGGAGATGACAACCTCATTT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| 65,726
|
MH998213.1
|
Prunus virus F
|
James,D., Phelan,J., Sanderson,D.
|
Canadian Food Inspection Agency Centre for Plant Health, Tree Fruit Research
|
Canada
|
2019-01-15
|
Stac-4B_C19
|
Fabavirus pruni
|
Fabavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,159
|
GenBank
| null |
Canada: Okanagan Valley, British Columbia
|
Canada
|
Prunus avium
|
plant leaf
|
2016-06-06
| null | null |
Prunus virus F isolate Stac-4B_C19 segment RNA1, complete sequence
|
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| 65,731
|
MH998214.1
|
Prunus virus F
|
James,D., Phelan,J., Sanderson,D.
|
Canadian Food Inspection Agency Centre for Plant Health, Tree Fruit Research
|
Canada
|
2019-01-15
|
Stac-4B_C24
|
Fabavirus pruni
|
Fabavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,160
|
GenBank
| null |
Canada: Okanagan Valley, British Columbia
|
Canada
|
Prunus avium
|
plant leaf
|
2016-06-06
| null | null |
Prunus virus F isolate Stac-4B_C24 segment RNA1, complete sequence
|
ATTAAACAACCGCTTTCGTTACCAGCTTTCTTCTTAAAGCTTTCGTTTCCAAGCCTTCTTTCACACAAACTGTTGACATTGAACTAGTGGTTACTCGCTGCCTTTTGGTTACCAAAGCCCACTATATTCAACTTGATCGTTTGTGTTGATTTTCTTTTCTCGCCTTTCTAGACCTGTTCTTCTCTTATTTTGCTCTAAATGGCTTTCCCTCTGTTTGTTGACACTTATGAACATGTTGCAAAGCATGATCAGAAGTACTATGGCTCCTTTCCAGCTACCTTTACCTTGGTCGCTGGAGGTGGTGTCATCGATTTGGAAGAAATGTTTTCTGGGGTTCGCAAACTGAAGCGTCATTTGACGCTTCATCGTATGTTTGCGGGCTGTGTTTTGGGCATAGAGGTTGCTGAACGTGATTGGGACGAACATCCTTATCTTCTCCTGGATGAGGTTGTAGACATTCTGGAGTCCAGCGGCTTGGCCAAAATTGGCGTTGCCGAGATGTACACCTTTATCAGAGGTTGTATGTTTCATTATCTTGATGCTGAATTTATTTGTGATAAATATCACAAATTGTTGAACATTCCATCTGACACTTCATTGGCACAAGGACTTATTTCCTCATGTGCATCTTTTGCTAGGAAGCTTCCTAGCGTGATATATGAAAAGTGCACAGATGCAGCTGCTTTTTGTGTGCGATCTGTCTGGACTGTGCTAGAGGATTGCTTCAACAAGGCCTTTGGTAGTTTCTGTCCTCATGTTTATAATGTCCTGAGTTGGGTAAAGAAAGCTTTCCAATCTTTTAAACTCTGGGCAGAACATATAGTAGAGAACTCCTTCTCTTGGCTTTGTTGTGCTCGTGATAGTGTTGTTATGGGCCTTGCTCTAACAAGCATGACATGTCTGGTTGCTCTTGTTGAGCGTTTTTTAGTTGCTACAGGTCTTATGACAGCTGCTTTAGGTCTTCCAGCTATGTTTTTGACATTTGCTGTGGGATCCATCTGTGGCTACAAAGCTCTTGTGTCAGCAGCCAATGCCAATGAAAATGGGTGCGCTGCTGCTCTCGTTGACATGGTTAAAGGTTCATGCATGTCACTTCTGAACTCATTATGGCCTTCACTCCAAACTGATGTCCAAAATAAATTGTACGAAATTAAAAAGGCTGCTAAGGAGGAAGGCAGAGCCAAAGCCATCAAGCGCCATCAAGATAAAATTGGGCGTTCTGAACCCTTTTCCACTGAGGAGCACCTTGCACAACAGTGGGAGGACTTTATGCATTATCGTCCGTCAATCTTCACAGATGACCCTCAAAACTGGGTGTTTAGACAGCAGTATTGGGATAACCAGGAAAGCAACGCTCAGTTTTCACCGATCAATGTCTTGGAAACTGTTGCTGCTTCTGTATCCAGCTGGAACTCCAGTACCTTGGTGGGAATAGGCAGAACATGTGCTGCATTTTCACAAATCAAAAATGGAGTTTCAGCACTCAAGGACATACTGGCTTATATATGTGGCAAGCTGTACGACTGTGCTGATAGTGTTTTTGGATTACAGTCTGCCATACTCAATGATGCTGCTGTTTTGCTTGGGCAAGATTTGCCTTCCTGGCTTAAAGAGTGTGATGCCATGGTTGATTACATGCATTTGTTTGCAGTGGCACCTCGCGACGTAATTGATCGCATGCAAAAGCTTTTGAGCCTTGGAAGACAGATGCGTTCTGTCTTTATTAGCAGTGAGCGCAGAGGGTCCGCTCAAGTTCTTTCACTCATATCAAAGGCAATTGATAAGCTGGAAACCCTCTATCATGGAGCTATACTTGCAGGATCAAACCTGCCGCGAAAAGCTCCTTTTTTCCTTTTCCTTACTGGTGAGTCGGGAGTGGGAAAGAGTTCCCTGACACAGAGATTGACGCGTGATTGGCTGGTTCATTATGAACTTGGCCAAGATTGCAGATATGCGCGCAATTCTCAGGACCCTTTTTGGTCAGGGTATCGCCGTCAGGCCGTTGTTACTTATGATGACTTTGGAGCCATTGTGAAAGAGCCTTCGGATGAGAGTGAAATAATTCCTATTGTTTCACGTGACCCTATGTCACTCAATATGGCTAGTCTGGAGGAAAAAGGAATGTTCTTTGATAGCAGACTGCTTGTGGCCAGTAGCAATTTCTTGGCCCCCAGCCCCAACTCCCAAATTCATGACAGCGATGCCTATGCTCGCAGACGACATCTTGTCGTGCAAGTGGAGCTCAAAAGAGGTGTTCCTTATAATCCAAATTCCCCTACTGAAAATCAGCGATATGTAATTCGAGCTACTAAAGCTCCTTACACTATTGCTGAAACTTTTGAGACTTATGAAGATCTCTGGACGCACTTCCTCAATAAATTTGATGAACATGAGGAAGGCGAACAGCAATTTTTGAAGTCACTCTCAATTCCAGCTGGGAATCAGAGTACGGCCATGCAGGCCATATTTGCTGCGAGCACCTTTATGCTGGCGTATGCACCTGGTTCGATCCAGGCACATATTACCACCCAGATGAAAGAAATGCACTATCTGGCTGTGAGGAAAGGCATATTGTACGTCTGGGGTGCTAATGATGAACTGCAGCGCGTTGATTTAAAAGGGATTGCAGATGCTGAGGACATTCGGCGTGCTGAAAGAGATAGTTTTAGATCAGCACTTCAGTTTGAATATGTGCTGCGTGCATTTCCTGACCTGAATCCTCTGGCAGTGCACTACACCATGGAGATTATTAAGCATGGATGGCTCAATGAAGATCTCACTGTTGGTAGCAATTGCCCAGATGACTATACAAGAAAGCTTCTTGAGAGTTTTCCTGAATGGATGCGCCAGTATATGTTCATACTTTCAGAAGCGCATCTTACAGCAGAGAAGAAGCCTTTCTTCCAAGATTTGCTCACTGATTTCAAGCAACAGGTGTGCCGCCTGTATGCTACTGATTTCAATAGGTGGAATCCTATTTTGAAGATAGCTTTTGGTTGTGTTCTGGCCATAGCTGTTGGCGGCACAGTATACTCACTTTTTTCCTCACTGTGGCAGTGCGGAACGGGAGCTAAATTTATGGTGGCAGCCACTACAACGTTTGCAGCAGGGCAGAGTGTACCACCCAACAGACAGGAGGTCACAGAATATAAGTTCAGAAATGTACCCTTTAGATCCAAACATTGGAGCAAGGGGCAAGCTTGTTATGGAGATTCTGCCAATTGGATAATGGACAAATGCATGGCAAGTCTCACATATGGTAGTTATGTTGCACAGGTTTGTGTCTTGCCTGGCAATCAGCTAGTCGGGGTAAATCATTTTCTACGGGTTATACCTACGAACACAACTGTGAAGATACAATCTGGCCAAGGTGACTACTGGATTACATGGAACAAATCTAAACTCACCTGTCCCCAGGACAGTGAACTTGCAGTTTATCGCTGTTCCCAAATTAGACAAGTTCCGCAAAGTGTGTTGGATAGATGCATTTTTGATGTGGAAAGAGATCTTCCTAGGAAGTTTGAAGCGACGTTCTTGTCCTACAAATATTTCCTTGATTCACAGCAATTTGTGCCCGAAATTGCCAAGGTGGATGTGGATGTGCGTTCCACATCCCATTCAGTTATGGTGGGTTCCTATGTGAGACAGATACCTCGTTTTATGACTTATGAGGCGAATACCATAGATGGCGACTGTGGTTCTCTCATAGTTGCCATGAAAGATGGGAAAGCATGCCTTGTGGGTCTTCATATTTCAGGCATGAATGGTTACGGGGTTGCTGGTTTCCTTCCTTTTGTGCATGTGAGTTCACAAGGACAATTCAATCCAGGAATGTATGACCGCGTTGAGGAATTTGAGGTGTCTGCACCTCTTGGAAATGGCTGCTATCAGGTGGGTTTTCTAAAACCTGAAGATCGCTTTCGCATATCTACCAAATCCAGTCTAGTGGAAACACCACTTGAATGGCAGCTGGAGACTCCCTGCGAAAAGATTCCCAGCGTCATTACTAAGAATGACCCGCGCCTACTCGGCACTGAGCATGTGGATTTTAATCCATATTATTCTGGTATGGAAAAATATTCACAAGAAGCTGGGCCTTTTGACCAAGAAGTGCTTAGTGCTGTTTGCAATGAAATTGTGGAGGAATGGAAAGATGCCTCCTCTCATTTTACGTTTGAAGACGCAACTTTGGACGAGGCCATCAATGGTGTCGAAAATTTGGATTATTTTGATTCTCTCGTGATAGGAACGTCTGAAGGCTACCCTTATGTTCTAGAAAGAGAGAGGAACCAGAAGGGCAAGTCTCGATATCTGGAGGGTGAAGTGGGAAGCTTGAAGATACAGCCTAACTCCAAAGTTGCCAAGGATGTTTCTTCACTTTATGAAGAGTGCATTAGTCAAGTGCCAGAATTGGTTGGGATTGAGTGTCCCAAGGACGAAAAGGTCAAACGCACCAAGGTTTTTGGGAAGCCCAAAACTAGACTTTTCACGGTGTTGCCTATGTCCTACAACCTGGTTGTGCGTATGAAATTTTTGCGATTTGTCCGGTTTCTCATGAAAAAGAGGGATGTGCTACCTTGTCAGGTTGGCATAAACCCTTATAGTCGAGAGTGGGGCAGAATTGCTTCCACGCTCTTGGAGAAAGGAGAGAATATATTGTGCTGTGATTATTCTCGATTTGATGGGTTTTTGCCCAAAAGTATCATGATCAAAATTGCAGGCATGATCAATTCCTTGTGTGGGGGTTCTCAAAATGATTGTGCCCAACGAGAAAATCTTTTGATGGCCTGTGTTGGTAGATTCGCCATTTGTGACAAGGTGCTTTATCGCGTGGAGAATGGAATACCATCTGGCTTTCCACTGACGGTTATTTTAAATTGCATACTGAATGAAATACTTGTCAGGTATGTGTACAGACAGACTTTCAAGGAAAATCCAGTGGTTGCAAGTTCTTTTCGAGATTTTGTGTCAATGGTTGTGTATGGGGATGACAATCTTATTTCTGTGCATGATTCTATCAAAACACAGTTCAATGGAGAGGTTGTTCAGAGAGAAATGGCTAAATTGCACATAACCATAACTGATGGTGTAGATAAGACCTTGCCACATTTAGCGTTTCGGAAGTTGCAAAATTGCGATTTTCTAAAACGTTCTTTCAGGATGCAGAATGGTATATGGGTGGGGCCTATGGAAAAGGAAAGCCTCTGGGGCCAGTTGCACTATGTCAATACAAAGAACCTGGAAATGAAAGAGGCTTATCTTACCAACTTGGAGTCTGTTTTGCGGGAGCTTTTCTTACATAGCAAGCAAGAGTGTATGGAATTGCGTCGCAAGGCTTTGAAAATTTCTTGGATTGGCTTGGGTGACCTTCCATCATTGGACAAGATTGAAAGTTTCTTCACAGAACAACGTGGAGAGACCAAACCATATAATCTTGTTTGTGACTTGATGCTTAACACAGCACTACTTGGACCATTAAACAACCCAGAGGAAAAATTATCTCAAAACATGCTTGAAATACTTCCAAATCTGTGGGTTTCTGGTTCTAAAACATATCTTGCGGAACCAAATGACTATGTTGTTTGGCTCAATCATTATGGAAAAAAGGACAATTCACTGGTTCTGCGTTTTCCATCCGGGACTGGAAGAGGTGGTCTTCCAACGAAAATTTGGCTCGAAGAAAACTATCTGAGGAAGTCCTCAAATGTTTACAAATTGTTGAAAGAGGCTTATCTTTCCAACAGGCGAGTTGTGTTTATATCGCCCAATGACAACGTGGTGGGTCTTGTTTTTCTCACCCTGTTTGCTGCGCGTTGTGGTGCTATTAAGAGGGAAGATTCCAATGTTTTACTTACTGTGGCCATGAATCAAACCAAGAGCCTGGGTTATCTTCCTGCGGAGATGGAAGACTATTTTTAGTCTCATCTTATTCCTTTCGTTTTCTGATATCGTATAATCAGAACTACTGGAGATGTTCCAGTGTGTTGACAGACACTTATCCTGTTTGGCTCTTCAAGCCTGCTTGTTGATTTAAGTAATCATCCCTCTCATTGGATTTTGAGCCCAGCCTGGGTTATGGCTTTGTTCTATTTGTGTTGTTTTCTCTTCCCTAACTTGTTTGTGGTTTCTGTTGAGAATTGGTGAAAGCCCAATCGAACAC
| 65,732
|
KX192388.1
|
Prunus virus F
|
Koloniuk,I., Sarkisova,T., Petrzik,K., Lenz,O., Pribylova,J., Franova,J., Spak,J., Lotos,L., Beta,C., Katsiani,A., Candresse,T., Maliogka,V.
|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2018-04-19
|
SwC-43_1a
|
Fabavirus pruni
|
Fabavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,161
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Prunus avium
|
plant leaf
|
2014-06-02
| null | null |
Prunus virus F isolate SwC-43_1a segment 1, complete sequence
|
TGTTTAAGAGATTAAACAACCGCTTTCGTTACCGGCTTCTTCTCTTTTTCAACAGCTTTCATTTCAAAGCTTTCTTTCGCGCAAATCGTTTTCGTTGTCATAGTGGTTACTCGCTGCCTTCATTGGTTACCAAAGCCCACTATTTTCAACTTTACCTTTGCGTTACCCTTCCATTTTCTTGGTCGTTTGTATTCATTTCAAATGGCTTTCCCTCTGTTTGTTGATACCTATGAACATGTTGCGAAATACGACAAGAAGTACTATGGATCTTTTCCAGCTACTTTTACTTTAGTCGCTGGAGGTGGGGTAGTTGATCTCGAGGAAATGTTTTCTGGAGTTCGCAAACTGAAACGCCATCTGACGTTGCATCGTATGTTTGCGGGCTGCGTTTTGGGCATAGAAGTTGCTGAGCGTGATTGGGATGAGCATCCATATCTTCTTTTGGATGAAGTTGTGGATATTCTGGAAGCAAGTGACTTGGCTAAGATCAGTGTTGCTGATATGTATACTTTTATCAGAGGATGCATGTTTCACTACCTTGACGCTGAGTTCGTTTGTGATAAATATCACAAATTGTTGCAAACTCCCTCTGAAACTTCACTTGCACAGGGGCTTATGTCTTCGTGTGCATCTTTTGCTAGGAAGCTTCCTAGCATTGTTTATGAGAAATGCACAGATGCAGCTGCTTTCTGTGTGAAATCCGTTTGGACTGTGTTGGAAGACTGTTTCAACAAGGCTTTTGGTAGCTTTTGCCCGCATGTTTATAGTGTTTTGGGTTGGGTAACAAAAGCTTTCCAATCTTTTAAACTTTGGGCAGAACATATAGTGGAAAGTTCCTTTTCCTGGCTTTGTTGTGCTCGTGATAGTGTTGTTATGGGTCTTGCCTTGACGAGCATGACATGTTTAGTCGCTCTTGTTGAGCGTTTTCTGGTTGCTACGGGACTCATGACAGCAGCCTTAGGCCTCCCAGCTATGTTTTTGACGTTTGCTGTTGGAGCTATATGTGGATACAAAGCTCTTGTTTCAGCGGCTAGTGCCAATGAGAATGGATATGCTGCTGCTCTTGTTGACATGGTCAAGGGATCATGTATGACACTCCTGAACTCATTGTGGCCTTCTCTTAATGTTGACATTCAAAATAAAATGTATGACATTAAAAAGGTTGCTAAGGAGGAGGGTAGAGCAAAAGCCATAAAACGCCATCAAGAGAAAATTGGGCGATCTGAGCCTTTCTCTACTGAAGAACATCTTCAACAGCAATGGGAGGACTTCATTCATTATCGTCCTTCGATTTTTACAGATGACCCTCAGAATTGGGTGTTTAGACAGAAATATTGGGATAATCAAAATGATAATGCTCAATTTTCTCCGATCAATGTCTTGGAAACTGTTGCTGCCTCAGTTTCGAGCTGGAACTCCAGTACTCTTGTTGGCGTTGGAAGAACGTGTGCAGCTTTCTCTCAGATTAAGAATGGGGTGTCAGCACTCAAAGATATCCTGGCTTACATATGTGGCAAGTTGTACGATTGTGCTGACAGTGTTTTTGGATTGCAGTCTGCAATACTCAATGATGCTGCTGTTTTACTTGGCCAGGATTTGCCCTCCTGGCTTAAGGAGTGTGATGCCATGGTTGACTACATGCATTTATTTGCCGTGGCACCACGTGATGTTATTGATCGCATGCAGAAACTTCTCAGTCTTGGGAGGCAGATGCGGTCTGTTTTCATCAGTAGCGAGCGTAGGGGTTCTGCTCAGGTTCTTTCGTTGATATCAAAGGCGATTGACAAGCTGGAAACCCTTTACCATGGAGCTATACTTGCTGGGTCAAATTTGCCGCGCAAAGCCCCCTTCTTCCTGTTTCTTACAGGGGAATCAGGTGTGGGCAAAAGCTCCCTGACGCAGAGGCTGACGCGTGATTGGTTGGTTCATCATGAGCTTGGTCAAGATTGCAGATATGCTCGCAATTCCCAGGATCCTTTTTGGTCTGGGTATCGTCGCCAGGCAGTTGTTACCTATGATGACTTTGGGGCTATCGTGAAGGAACCTTCAGATGAGAGTGAAATAATTCCTATTGTTTCACGTGATCCTATGTCTCTCAACATGGCTAGTCTGGAAGAGAAGGGAATGTTTTTTGATAGCAGATTGCTTGTGGCTAGTAGCAATTTCCTGGCCCCTAGTCCCAATTCCCAAATTCACGATAATGACGCCTATGCTCGTAGGCGGCATCTTGTTGTGCAGGTGGAGCTTAAGAGAGGTGTTCCATATAATCCAAATGCCCCAACTGAGAACCAGCGGTATGTTGTACGAGCTACAAAAGCTCCTTACACAATCACCGAAACCTTTGAAACTTACGAAGATCTCTGGACACACTTCCTCAATAAATTTGATGAACATGAGGAAGGTGAACAGCAATTTTTGAAGTCACTTTCGATTCCCTCAGGGAACCAGAGTACAGCCATGCAAGCTATATTTGCTGCTAGTACTTTCATGTTGGCGTATGCACCTGGTTCAATCCAGGCACATATAACGACCCAAATGAAGGAGATGCACTATTTGGCCGTTAGAAAGGGCGTTTTGTACGTGTGGGGTGCCAACGATGAACTACAGCGTGTTGATCTGAAAGGTATTGCAGACGCTGAGGATATCCGTCGTGCGGAGAGAGACAGCTTCAGATCTGCATTGCAATTTGAATATGTGCTTCGTGCTTTCCCTGATTTGAACCCTTTGGCTGTGCATTATACGATGGAAATTATTAAGCATGGTTGGCTCAATGAAGATCTCTCTGTTGGCAATAACTGTCCTGACGATTACACAAGAAAGCTCCTTGAGAGTTTTCCTGAGTGGATGCGTCAGTACATGTTTATACTTTCTGAGGCTCACTTGACGGCGGAGAAGAAACCTTTCTTCCAGGATTTGCTCACTGACTTTAAACAACAAGTTTGTCGTTTATATGCCACGGATTTTAATAGATGGAATCCCATTCTAAAGATAGCTTTTGGCTGCGTGTTGGCCATAGCTGTTGGAGGAACGGTTTATTCACTTTTTTCCTCATTGTGGCAATGTGGAACAGGAGCAAAATTTATGGTGGCAGCCACTACCACTTTTGCGGCAGGACAGAGCGTTCCACCTAATCGACAAGAAGTTACGGAATACAAGTTCCGTAATGTGCCTTTTAGGTCTAAGCATTGGAGCAAGGGACAGGCTTGTTATGGAGATTCTGCCAACTGGATAATGGACAAGTGCATGGCAAGCCTTACCTATGGTAGCTATGTTGCCCAAGTATGTGTTCTACCAGGAAATCAACTGGTAGGTGTGAATCACTTTTTACGAGTGATACCTACCAACACCACAGTTAAGATTCAATCTGGGCAAGGCGATTATTGGATTACATGGAACAAAGCCAAGCTTGTCTGTTCTCAAGATAGTGAATTGGCTATCTACCGTTGTCCTCAGGTTAGACAGGTCCCACAGAGTGTGCTGGACAGATGCATCTTCGATGTGGAAAGGGACTTACCCAAGAAATTTGAAGCCACTTTTTTGTCCTACAAATATTTCTTGGATTCACAGCAATTCGTTCCCGAAATTGCCAAGATAGATGTGGATGTTCGTTCCACATCTCATTCAGTCATGGTTGGCTCTTATGTGAGACAGATACCTCGTTTCATGACCTACGAGGCAAACACTATAGATGGCGACTGTGGTTCCCTTATTGTGGCAATGAAGGAAGGAAAGGCATGTCTTGTGGGTTTGCATATTTCAGGTGTCAATGGTTATGGAATCGCTGGATTCCTTCCCTTTGTGCATCAGAGTTCTCAGGGCCAGTTTGATCCAGGGATGTATTCTCGTGTGGAAGAATTTGAAGTTTCTGCACCTCTTGGGAATGGTTGTTACCAGGTTGGCTTTTTGAAGCCTGAGGATCGTTTTCGTATATCTACCAAATCCAGTTTGGTGGAAACACCACTCGAGTGGCACCTGGAGACTCCCTGTGAAAAGATACCCAGCGTTATCACGAAGAATGATCCTCGTCTGCTTGGCACAGAACATGTTGACTTCAACCCCTACTACTCTGGTATGGAGAAGTACTCACAGGAAGCTGGGCCCTTTGATCAGGACATTTTGGGAGCTGTGTGTAATGAAATTGTCGAGGAGTGGAAAGATGCCTCTTCCCATTTCACATTTGAAGATGCCACCTTGGATGAGGCTATCAATGGTGTCGAAGATTTGGATTACTTTGACTCTCTAGTGATAGGGACTTCGGAAGGTTATCCCTACGTTCTTGAGAGGGAAAGAAATCAGAAAGGTAAGTCACGATACTTGGAAGGTGAAGTTGGAAGCCTGAGAATACAACCCAATTCAAAAGTTGCTAAGGACGTTTCTTCACTCTATGAAGAATGTGCCAATCAGGTACCAGAGTTGGTGGGAATCGAGTGTCCCAAGGATGAAAAGGTGAAACGTGCCAAGGTTTTTGGAAAGCCCAAGACCAGACTCTTCACGGTTTTGCCAATGTCATATAACCTGGTCGTACGCATGAAATTTTTGCGCTTCGTTCGATTTCTCATGAAAAGAAGAGACGTGCTACCTTGCCAAGTTGGCATAAATCCTTATAGTCGGGAGTGGGATAGAGTTGCTTCAACGCTCTTAGAGAGAGGAGAAAATATACTCTGCTGTGACTATTCTCGATTTGATGGTTTTTTGCCCAAGAGCATTATGGCCAGGATTGCAGGCATGATTAATTCCCTTTGTGGGGGTTCTCAAGTGGATTGTTCTCAACGAGAGAATCTATTGATGGCATGTGTGGGTCGGTTTGCTATTTGTGACAAGGTTCTTTACCGTGTGGAAAACGGAATTCCATCTGGTTTTCCTCTGACAGTGATCCTGAATTGTATTCTGAACGAAATACTTGTCAGATATGTGTATAGGCAGACATTTAGGGGAAACCCTGTGGTAGCAAGTTCTTTTCGGGACTTGGTTTCTATGGTTGTCTATGGAGATGATAACCT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| 71,064
|
KX192389.1
|
Prunus virus F
|
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|
Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2018-04-19
|
SwC-43_1b
|
Fabavirus pruni
|
Fabavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,163
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Prunus avium
|
plant leaf
|
2014-06-02
| null | null |
Prunus virus F isolate SwC-43_1b segment 1, complete sequence
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Institute of Plant Molecular Biology, Plant Virology
|
Czech Republic
|
2018-04-19
|
SwC-43_1c
|
Fabavirus pruni
|
Fabavirus
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Secoviridae
|
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| 6,132
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| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
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Prunus avium
|
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|
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|
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| 71,066
|
NC_024686.1
|
Prunus virus T
|
Marais,A., Faure,C., Mustafayev,E., Barone,M., Alioto,D., Candresse,T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-08-13
|
Aze239
|
Prunus virus T
|
Tepovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,835
|
RefSeq
| 1
|
Azerbaijan
|
Azerbaijan
|
Prunus domestica
| null |
2011
| null |
PRJNA485481
|
Prunus virus T isolate Aze239, complete genome
|
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CTAAAGTCAACTTCTCGAAAGAGCCCATGTTCTGTGGGTGGAGGATGACCCCTTACGGCATCGTCAAGGAGCCCAAACTTGTTTTGGAAAGGTTCAAGATTGCGGAGGAAAGGGGTTGTTTCAAGGAGTGTTTGATTAACTATTGCTTGGAGGTTTCCTTTGCCTACAGATTAGGTGAGAGGCTGTACGATGTGATTAAGAACATTCAGGATAAGCAGGCCTTGGTGAGAATTGTCGTGAAGAACAAGAAATTCCTTCCAAAAAAGATTAGAAAGGAATTTGAGTCTTTTGACCATGAGTTTGGTGGATGTGGGTCAGTTCAGGAGGAAGGTGAATGCGACAGGGTCCATCGCTTCGGCTGTGGACTCGAGTGCAATATATAAACTGTCCCCTTTCCACGCTCTGCAGTCTGACACTTACGTTAGAAAATCAGAGTTCAAAGTCAAAATGCAGCAAACCGGTGAGCGTGGGGTGGCTTGTATGTCTGTGCCACTGTTTGATGATCATGACAAACAGACTATCCGTGAATCCAAAATGCCGTATGTACATATAGCAGTAGTGTTGATTCAGATTTCATGCTTGTTTGACTGGGCCATTTCTGAAGGAATGGAGGGTACATTTGCTCTGATGGACACCCTTTTCGATAACGTTCAGGACAATGTCATAAGGGCCTGTCACTTCAGGTTTGAGGAAGGCCGAGCTGCTTGTTGCTTCAAGTTGAACTTTCCGATATGTGCTGAGGACGCTTTGAAGGGTCGGCCCATAGTTCCCTATATCAAGGTTGTCGGTGCCAACGTTAGAGAAGGGCTGAGGGGCTTCTCTGTATCTGTGGGTACAATTTTTTCCCTGAACAAAACAGAGTTCCCATCTGTGCCTATGAAAATTGATCATGACTTTGTCAACATTGTTGGCACTGAATTCCTTCCAAAGGAGAAATTAAGTGAGCTGACTTGCGAGGAGATCTCTGATTCTTTCCAGAGACTGCAAACTTTGCCGAAGCCTGTCACTGCCTCACTTCCGAGAGGGAGAAAGGAGCCAACCAGGATTAGGGATTACTCCGTTATGTCAAGCTCTGGGTGTTTGATTGAGAAGGATGGGTCTAACAAAGAAGGAAAGGTCGGAAATGCGACGGGAGGTCGACGCTCTGTTGATAACAAAGTTCAAACCTCAAGTAAAACAGGGCCAGCAGTTCTCAGACGCTGCTCAAGCTTTTCTCAAGGAGATGATCTTTGGGAACATAGCACTGAAGGGAGCAAGCGAACAAACAGAGTTCGAAGATCAGGAAGTGTCAAGCGGCTGGTTCGTTCCGGGGTTAGGGGGGCGCCACGGGCAGATGGACCCGGAAAAGGAATTTCCAGGGGAGGAGAACAAAGCTCTTCGGGACGGAGCTTACAGATTCAAGGTGAATTTCTTCAGTCTGGTTCAGAGTCTGATAGCGCTGCTTAGAGGCAGCAATAACGTTTTTGTAAATAATAAACCGTTTAGGCGTTTGTGTGTGGCCTATGCATCCGAGGCCAAGGCTTATCTAGAAGCCAAGAAAGTGGATGGCGAGTTTTCAAATCTGGTGCTCAAAATGCCTGCTACATGTAAGCATGCACCGGAAGTGTGTTTCGATTTCAATGAAGGTTTGGACGTCCTGCGTCTTACTGACGTGCAGGCTCAGACCATGCAGAGGCTCTCTCGTAGGCTTTTCGCCACGGAATTGAAGAAGCGTGAGTCTGAGAGGTCTGTGGCAGATCACATTGGTGATCAAGTTTAGTTTGGTCCAGGTTACTATAAATCTGGCGGCTTAGCTTTAACTTAATAAAGTATGCTTTCTGTTTAAGAATTTTCAG
| 6,444
|
MW331539.1
|
Prunus virus T
|
Costa,L.C., Hu,X., Malapi-Wight,M., Foster,J., McFarland,C., Hurtado-Gonzales,O.P.
|
Animal and Plant Health Inspection Service - APHIS/PGQP, United States Department of Agriculture - USDA
|
USA
|
2021-07-02
|
PGQP1_PrVT
|
Prunus virus T
|
Tepovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,847
|
GenBank
| null |
Kyrgyzstan
|
Kyrgyzstan
|
Pyrus communis
|
plant leaf
|
2019-03
| null | null |
Prunus virus T isolate PGQP1_PrVT, complete genome
|
AGACCACAGCAGGGACAACTGTGTGATTCCAAAGAGAAATATCTTTAAGATAATGGCTTTCTCATACCGGACACCCGCAGAAGAGTTCCTCTCCACTTTACCATCAACCTCACAGGAAACAGTCAGCGAATATGCACTTAAGTCACTCAAGGATCAGGAAAAAGCTTCAAGCCATAACTATTCTTATCACTTGACTGACACGCAAAAAAGCTTCTGTTCCAAGGTTGGTGTTCCCCTCTCTGTACATAGCTTCATGGTTCATCCGCACCCTTACTGTAAGACCATGGAGAATTTCATTCTGCATGACAATCTTTTTCATTATAGGAATTTGATAGAAATTTATGTTTCAATAAAGGAGGAAAAGGTTAGTTTATTGAATAGGAGTAGAGGTTTGAATTTTCACAGGGTTTTGAATAGATGTGTTGCTGATAGGGACAATTTGAGATATAGGAATTGTGTGAGCAGATCCTTCTTTGTCAACAGTAACAATTTCGCTTCCAACCAATCCAAATCATGGTTCTTTCATGATGAGCTTCACCACTGGGATGTGAACGAATTCGCTAGCTTTTTGGGGAACTTCAAACCAAAAAGGGTCATAGCTTCATGCGTGCTTCCAGTGGAGGTTTTCAGTTCTGATGAGTCTTGCAACCCCAGCTTTTACAGATACTCAATCCATAAGAGGGATAGATCACAGGTGGAATTCACCTTTTTCCCTGACAGCAGCAAAGAAAGTTCCTATTTTCAGAAAAGTTCTGACTGGATATTCAAATTCAAGCACTTTGAAGTAGGAAGTGAGAATTACACCCTTTCTTTTCTGAGATCGATCAAGTGCCACCATTTGATTCTGATTGAGAAAGGGAAACTGGAAACCAATGATTTTTACATTTCAGATGAAGCTGAATGCGCATCTTTGCGGATGTTTGGAACCGCAGTGGCTGGGAAAATTGCTGCCCCAATAAGGGTAGAAGTGCTGAAAAGGGAGATGATATACCTTCTGAGCCTCAAGAAAAGCGATATGAATTCTGCTGCCGCCAAGTTAAGACAGCTCTCCCAAGAGGACTATCATCCGCAGGAGCTGTGTTTCTTTCTGAACCTTGCCGGGAGAATCGAGAGTTGCAAGGGGATCTTCAAAGACAGGGGACTAGTCTCGACTATCGTCGATTGTTTCGCTCAGATGTTTCCAAACAGAATTGCAAGGTGGATGTCCCCGACTACTGATGAGAATTCTTTCCTGCAACTGATATCCAGCATGGAGGGCATGAAATTGACAATCAAAAGAGAGTCATATCCAGTCGAAAATTTCTTTGAATTTGATGTCAAGGATGGCCTTGATGAACAGTTTGTGCTTGACTTGATGGATGGTAAAATGTTTGGGTCTGTTTCGGAAAAACTGGACACCTCTTACTCGGTCAGAACTTCCGGTAACCGGAACTTTGTCCTTCTTGATTTCAAACAGAGGAAATGGGCCAGGTTGGCAGAGAAAGAGGAAGAGGAACCATCGGCACCAAAAGAGATCCCTGGCGAGACACAGGAGCTGTCACCTGAAGAGGCTCGATTTTATTACGGGATTCCAGGAATGAAAAGGGCCGTTCACTGCAATCTGGAATGGAGTAGAGGGAAAAGGGCATTCCAGAAGAAAAAAGACCCAATCTTCATAACCAATTTCGCACACTGGAGTCTTCCAAAAAGAAAGAATGGAATTAGAGAAGTGGAGATGTGGGATGCTGAGGAAGAACGGACCACAGATCGATTCGTGGAAGGATTTGATCCTGAGACGTATATGGGTTCCAGTTCAAGTTCAAGTGCAGAGACCGAAGGGCTTGGCTCAGGAGAGAATGAAGATGATGCACAGATGACCTCAGGGGAGGAGGAGGAGGAATGCAATTATATTAATGGCAAATTTTCTCCGAATGACGCATTCATTGAGTCACTGGAAATGCTTCTGAACTCCAGAGCCGCGTATCTCCATGGTGGTAGGCGAACAATTCTTTTCTCTACAGTTACTGGCCTTGATTACGGGTTCGGACCCCACAGATACAAGCAAGTCCCTTGCATTTTCATGGAAGATTTGCTTAAAAAAGTAGGTTTTAACAGTTGCTTGGCCCAGATCTACAAGGCCGGGGGTTCTGTTGGCGCTCACTTTGATGATGAAAAGGTGTATGATGATGATGAAATCCTCACGTGGAATCTGAAGGGCGAAGCAGATTTTTCTCTGTTCAAGAAAGGGGGAACCGAATCTGTGCATCTAGGGCCAAATCAGATTTTGATCATGCCAAAAGGATGTTCGAGAAGTGAGAACAAGTTCAAGCACTCAGTTGAGAACTGCACAGAAGGACGTATCTCCATAACCTTCAGACACCAAAAGAGGTTCATGAATGGGGAACCCGTCGAAGTGGAGAACTTCAAAAGACAGATGATTGAACTGCCAGACAATCTACGTGATCTGATTTCAAAGATGTCGAATGCATGCTTCTTTGACTGTCTAGCTGACCACCTGTGCATGGATAGAAATGCTGTTTTCAATCTCCTTTATGACCAGGATAGATCTGTTCTAACTAACGTGGTTGAGGACAAAGGCTTCACTTTGGCTGAGGTAATAGATCACCTCACGAATCTAGATGTTCCTGGCAGAATAGTGAGCAATGGTGAGGTTGTAAATTACCTGGAAAAGGGGTCATTCAAACCAATAGATTTGCTTATCAGGGATGGGCACATCGGTTTGAATGTGCAGCACAATGTGCTCTATAACACGAAGGAGATCAGGATCGACGAGTTGATCGGAGCCGACATTGTTGCACCTCACTTCTCTGTGGAGAGAGCAAGGGTATTGGTAAAGTCAATGATGGAAGGGATGACCGGAGTTCTGCTGAACAGATTTAAATATGCTTTCAATGAGCTGCTCCCAAGGAATGGAAACAAGGTGATGTGCATATCGGGATTTGCTGGTTCTGGAAAATCAAGGGCTCTACAGGGTGTATGTGCCAACGTCCTGAATAAGAAAAGTGTGATCCTGAGCAGTCCAAGAAAAAATCTTCTCAGGGACTGGGAATCAAAGATAGATGAGAAGCTGAAGGGAAAGAAACGCTTAATCAAACTCAAGACCTTTGAACTGGCCATCAGCGCCATCACAAGAATGGTCAAAGCTGAGCAGGATGCCAAATTGACGGTTATCATTGATGAAGTAACGCTCCTTCCGGGAGGTTACCTGGATCTAGTGAATAGTCTTATCCCAGAAGGATCAACCATCATCCTACTCTTTGATCCATTGCAATCGCATTATTACTCAAGGTCTGATGTGAGTGTCAACTTGGGACCTGTCCTCACACCTTTGTTCGGTCAAGAATTTAGGTATAGAGGTTTTTCGTACAGATTCCCAAAGTTGTTTGATTTGGAAGAGTTTGAGTTTGGGCAGGGCGAGATCGATCAGAATCACATGAGGATTTTTGCTCAACCTCAAGCTGTGAGAGAGGCTATTAAGAAGCCTGTGTTTCTCTGTCCCAGTGAAGAAAAAAGATGCGAACTTTCAAACTTTGGAGAGGCATACACGTTCGGGACAAGTCAAGGTCTCACTTTTGACTTTGTCTGCATATCAATTGATATGGATGGTTCTGTGACATCGGATTTTCACTGGATGGTGGCCCTTACTCGAGCGAGGAAAGGTTTCTGCTTCCTCACATGCGCATCAGTTAGTATGAGAACTTTCATGGACAGTAACAAGGCAAAGTTGATAGGGAAAGTTCTAAAGAAAGAACAAATTTCCAAGAAGTTTTGGTGGAACTTGGGAGGCAGAGCTTTGGAGGGAGCAAGAGCTGTGAAAAAGGAGGAATTTTCAAAGCTCGGGAAAACCAGGGAAGAGTTCGAGGAGGCACTGGAGGGCGACCCTTGGCTCAAGGGCATGCTGAATTACCTTGAAGGAGATGACGCAAGAGACCCGTTGCCTGACGAGCCGATTCGGAAAGAGAGTCCTCCCAGAACTCATTTGATGATTGCTCCAGTTGAACATCAATTCGCCGAAGAGATGCACCTGTTAAAAGCCAGAGAATTCAGGGAGTTCAGGAATTCCAATTTGTGGTCTGAGCAGTTTGATGACGCGAGGAAAACAAGGAAGGTCATTCACAACAGAGCTGAGACCTTTGAACAGATCTACCCGTCACACAAAAACTCAGACACATTGACCTTCTGGGCCGCAATAAAGAAAAGAATGAAAATGTCTGACCCATACTCAGAAAGGAGGAAGTTGGAGAGATGCATGCCTATTGGCGAGAATCTATGTCGAATCTTTGTGGAAGAGTATGGACTCAAGAGAGGTGTGCAAGTGGACATAGAGAGCACTGAGAGAGAATTCTTACTTAAAAGAGTTGAAAAGGCAAAGAAGATGATTGAAGCTCACTCTGAAAGGTCAGACCCCGACTGGATGGTTAATCATTTCTTCTTATTTATGAAAACTCAGCTGTGCACCAAGTTTGAAAAAAGGTTCGCTGACGCAAAAGCCGGGCAAACTTTGGCGTGCTTCTCGCATCAGGTTCTAGCTAGATTTGGGGTTCCTATCAGAGTGGCTGAAAAAAAATTAAGGGTGCAGCTTGGTGAAAATATCTATATACACTCTGGAAAGCAGCTAGATGAACTCAATGAATGGTGCATCAAGTTTTCCAAAGGTTTTGGGACAGATTCTGATTACGAAAGCTTTGATCGGTCACAAGATGCTCTTGTTCTAGCTTTTGAAATCCATCTGCTTAAATTTCTGGGATGGAGTGCTGATCAGGTTGAGGATTACACAGCACTGAAATTGAGATTGGGGTGCCGATTGGGCTACCTTGCAATAATGAGGTTCACCGGGGAGTTTGGCACCTTCTTTCTTAACACATGTTGCAACATGTTGTTCACATGTCTGAGGTATAAAATAAATAGAAGGACCCCAATTGCTTTCGCTGGTGATGATATGTTTAGCCCAGGACGTCTTGAGGTGAGAAAGGACAGAGAGTTTCTTCTGAATCGGTTTA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| 40,765
|
MW331540.1
|
Prunus virus T
|
Costa,L.C., Hu,X., Malapi-Wight,M., Foster,J., McFarland,C., Hurtado-Gonzales,O.P.
|
Animal and Plant Health Inspection Service - APHIS/PGQP, United States Department of Agriculture - USDA
|
USA
|
2021-07-02
|
PGQP2_PrVT
|
Prunus virus T
|
Tepovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,841
|
GenBank
| null |
Kyrgyzstan
|
Kyrgyzstan
|
Pyrus communis
|
plant leaf
|
2019-03
| null | null |
Prunus virus T isolate PGQP2_PrVT, complete genome
|
AGACCACAGCAGGAACAACTGTGTGATTCCAAAGAGAAATATCTTCAAGATAATGGCTTTCTCATACCGGACACCCGCAGAAGAGTTCCTCTCCACTTTGCCGTCAACCTCACAGGAAACAATTAGTGAATATGCACTTAAGTCACTCAAGGACCAGGAAAAGGCTTCAAGCCATAACTATTCCTATCACTTGACTGACACGCAAAAAAGCTTTTGTTCCAAGGTTGGTGTTCCCCTCTCTGTACATAGCTTCATGGTTCATCCGCACCCTTACTGTAAGACCATGGAGAATTTTATTCTGCATGACAATCTTTTTCATTATAGGAATTTGATAGAAATTTATGTTTCGATAAAGGAGGAAAAGGTTAGTTTGTTAAATAGGAGTAGGGGTTTGAATTTTCACAGGGTTTTGAATAGATGTGTTGCTGATAGGGACAATTTAAGATATAGGAATTGTGTAAGCAGATCCTTCTTTGTCAACAACAACAATTTCGCTCCCAACCAATCCAAATCATGGTTCTTTCATGATGAGCTTCACCACTGGGATGTGAACGAATTCGCTAGCTTTTTAGGGAACTTCAAACCAAAAAGGGTCATAGCTTCATGCGTGCTTCCAGTGGAGGTTTTCAGTTCTGATGAGTCTTGCAACCCCAGCTTTTACAAATACTCAATCCACAAGAGGGATAGATCACAGGTGGAATTCACTTTTTTCCCTGATAGCAGCAAAGAAAGTTCCTATTTCCAGAAAAGTTCTGACTGGATATTCAGATTCAAGCACTTTGAAATAGGAAGTGAGAACTACACCCTTTCTTTTCTGAGATCAATCAAGTGCCACCATTTGATTCTAATTGAAAAAGGGAAACTGGAAACCAATGATTTTTACATTTCAGATGAGGCTGAATGCGCATCTTTGCGAATGTTTGGGACCGCGGTGGCTGGGAAAATTGCTGCCCCAATAAGGGTGGAAGTGCTAAAAAGGGAGATGATATACCTTCTGAGCCTCAAGAAAAGCGACATGAATTCTGCCGCCGCCAAGTTAAGACAGCTCTCCCAAGAGGACTATCATCCGCAGGAGCTGTGTTTCTTTCTGAACCTTGCCGGGAGGATCGAGAGTTGCAAGGGGATCTTTAAAGACAGGGGACTAGTCTCGACCATCGTTGATTGTTTCGCTCAGATGTTTCCAAACAGAATTGCAAGGTGGATGTCCCCAACTACTGATGAGAATTCTTTCCTGCAACTGATATCCAGCATGGAGGGCATGAAACTAACAATCAAAAGAGAGTCATATCCAGTCGAGAGCTTCTTTGAATTTGATGTCAAGGATGGCCTTGATGAACAGTTTGTGCTTGACTTGATGGATGGTAAAATGTTTGGGTCTGTTTCGGAAAAACTGGATACCTCTTACTCGGTCAAAACTTCCGGTAACTGGAACTTTGTCCTCCTTGATTTCAAACAGAGGAAATGGGCCAGGTTGGCAGAGAAAGAGGAAAAGGAACCATCGGCACCAAGAGAGATCCCTGGCGAGACACAGGAGCTGTCACCTGAGGAGGCTCGATTTTATTACGGGATTCCAGGAATGAAAAGGGCCGTTCACTGCAATCTGGAATGGAGCAGGGGGAAAAGGGCATTTCAAAAGAAAAAAGACCCAATCTTCATAACCAATTTCGCACACTGGAGTCTTCCAAGAAAGGATGGAATTAGAGAAGTGGAGATGTGGGATGCTGAGGAAGAACGAACCACAGATCAATTCGTGGAAGGGTTTAATCCTGAGACGTGTATGGGTTCCAGTTCAAGTTCGGAGGCAGAGACCGAAAAGCTTGGCTCAGGGGGGAGTGGAGATGATGCACAGATGACCTCAGGGGAGGAGGAGGAGGAATGCAATTACATTAATGGCAAATTTTCTCCGAATGACACATTCATTGAGTCATTGGAAATGCTTCTGAGCTCCAGGGCCGCATATCTCCATGGTGGTAGGCGAACAATTCTTTTCTCCACAGTTACTGGCCTTGATTACGGGTTCGGGCCCCACAGATACAAGCAAGTCCCTTGCAATTTCATGGAAGATTTGCTCAAAAAGGTAGGTTTTAATAGTTGCTTGGCCCAGATCTACAAGGCCGGGGGTTCTGTTGGCGCTCACTTTGATGATGAAAAGGTGTATGATGATGATGAAATCCTCACGTGGAATCTGAAGGGTGAAGCAGACTTTTCTCTGTTTAAGAAAGGGGGAACCGAATCTGTACATCTAGGACCAAATCAGATTTTGATCATGCCAAAGGGATGTTCAAGAGGTGAGAACAGATTCAAGCACTCAGTTGAGAACTGCACAGAAGGACGTATCTCCATAACCTTTAGACACCAAAAGAGGTTCATGAATGGGGAACCCGTCGAAGTGGAGAACTTCAAAAGACAGATGATTGAACTGCCAGACAATCTATGCGATCTAATTTCAAAGATGTCGAATGCATGTTTCTTTGACTGTCTAGCTGACCACCTGTGCATGGATAGAAATGCTGTTTTCAATCTCCTTTATGACCAGGATAGATCTGTTCTGACTAACGTAATTGAGGACAAAGGCTTCACTTTGGCAGAAGTGATAGATCACCTCACGAATCTAGATGTTCCTGGCAGAATAGTGAGCAATGGTGAGGTTGTAAATTACCTGGAAAAGGGGTCATTCAAACCAATAGATTTGCTCATCAGGGATGGGCACATCGGTTTGAACGTGCAGCACAATGTGCTCTACAACACGAAGGAGATCAGGATTGACGAGTTGATCGGAGCCGACATTGTTGCACCTCACTTCTCGGTGGAGAGAGCAAGGGTATTGGTGAAGTCAATGATGGAAGGGATGACCGGAGTTCTGCTGAACAGATTTAAATATGCTTTCAATGAGCTACTCCCAAGGAATGGAAATAAGGTGATGTGCATATCGGGATTTGCTGGTTCTGGAAAATCAAGGGCTCTGCAGGGTGTATGTGCCAACGTTCTGAACAAGAAAAGCGTGATCCTGAGTAGTCCAAGGAAAAACCTTCTCAGGGACTGGGAATCAAAGATAGATGAGAAGCTAAAGGGAAAGAAACGCTTGATCAAACTCAAGACCTTTGAACTGGCCATTAGCGCCATCACGAGAATGGTCAAAGCTGAGCAGGATGCCAAATTGACGGTCATCATCGATGAAGTAACGCTCCTTCCGGGAGGCTACCTGGATCTAGTGAATAGTCTTATCCCAGAAGGGTCAACCATCATCCTACTCTTTGATCCATTGCAATCGCATTATTACTCAAGGTCTGATGTGAGCGTCAATTTGGGACCTGTTCTCACACCCTTGTTCGGTCAAGAATTTAGGTATAGAGGTTTTTCATACAGATTCCCAAAGTTGTTTGATTTGGAAGAGTTTGAGTTTGGGCAGGGTGAGGTCGATCAGAATCACATGAGGATCTTTGCTCAACCTCAAGCTGTGAGAGAGGCTATCAAGAAGCCTGTGTTTCTCTGTCCCAGTGAGGAAAAAAGATGCGAACTTTCTAACTTTGGAGAGGCATACACGTTCGGGACAAGTCAAGGTCTCACTTTTGACTTTGTTTGCATATCAATTGATATGGATGGTTCTGTGACATCGGATTTTCACTGGATGGTGGCCCTCACTCGAGCAAGGAAAGGTTTCTGCTTCCTCACATGCGCATCAGTTAGTATGAGAACTTTCATGGACAGTAACAAGGCAAAGTTGATAGGGAAAGTTCTAAAGAAAGAACAAATTTCCAAGAAGTTTTGGTGGAACTTGGGAGGCAGAGCTTTGGAGGGAGCAAGAACTGTGAAAAAAGAGGAATTCTCAAAGCTTGGGAAAACCAGGGAAGAGTTTGAGGAGGCACTGGAGGGCGACCCCTGGCTCAAGGGCATGCTGAATTACCTTGAAGGAGATGACGCAAGAGACCCGTTGCCTGACGAGCCGATTCGGAAAGAGAGTCCTCCCAGAACTCATCTGATGATTGCTCCAGTTGAACATCAATTCGCCGAAGAGATGCACCTGTTAAAAGCCAGAGAATTCAGGGAGTTCAGGAATTCCAATTTGTGGTCTGAGCAATTTGATGACGCGAGGAAAACAAGAAAAGTCATTCACAACAGAGCTGAGACCTTTGAACAGATTTACCCGTCACACAAAAACTCAGACACATTGACCTTCTGGGCCGCAATAAAGAAAAGAATGAAAATGTCTGACCCATACTCAGAAAGGAGGAAGTTGGAGAGATGCATGCCTATCGGCGAGAATCTGTGTCGGATCTTTGTGGAAGAGTATGGACTCAAGAGAGGGGTGCAAGTGGACATAGAGAGCACTGAAAGAGAATTCTTGCTTAAAAGAGTTGAAAAGGCAAAGAAGATGATTGAAGCTCACTCTGAAAGGTCAGACCCCGACTGGATGGTCAATCATTTCTTCTTATTCATGAAAACTCAGCTGTGCACCAAATTTGAAAAAAGGTTCGCTGACGCAAAAGCCGGGCAAACTTTGGCGTGCTTCTCACATCAGGTTCTAGCTAGATTTGGGGTTCCTATCAGAGTGGCTGAAAAAAAGTTAAGGGTGCAGCTTGGTGAAAATGTCTACATACACTCTGGAAAGCAGCTGGATGAACTCAATGAATGGTGCATCAAGTTTTCCACAGGTTTTGGGACAGATTCTGATTACGAAAGTTTTGATCGGTCACAAGATGCTCTTGTTCTAGCTTTTGAAATCCATTTGCTAAGATTTCTGGGATGGAGTACTGACCAGGTTGAGGATTACACAGCACTGAAATTGAGATTGGGGTGCCGATTGGGCTACCTTGCAATAATGAGGTTCACCGGGGAGTTTGGCACCTTCTTTCTTAACACATGTTGCAACATGTTGTTCACATGTCTGAGGTATAAAATAAACAGAAGGACCCCAATAGCTTTCGCTGGTGATGATATGTTTAGTCCAGGGCGTCTTGAAGTGAGAAAGGATAGAGAGTTTCTTCTGAATCGGTTTAGCT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| 40,766
|
KF700262.1
|
Prunus virus T
|
Marais,A., Faure,C., Mustafayev,E., Barone,M., Alioto,D., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2014-08-03
|
C21
|
Prunus virus T
|
Tepovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,847
|
GenBank
| 1
|
Italy
|
Italy
|
Prunus avium
| null |
2012
| null | null |
Prunus virus T isolate C21, complete genome
|
GATAAACTGACCACAGCAGAAACTCCTGTGTGATTTCAAAGAGAAAAATCTTTAAGATTATGGCTTTCTCATACCGAACACCTGCAGAAGAGTTTCTCTCTACTCTACCTTCAACCTCACAGGAATTAGTAAGCAAATATGCCGTCAAGTCACTTGAAAATCAGGAAAAGGCTTCCAGCCATAATTACTCCTATCACTTGACTGACACTCAAAAAAATTTTTGTTCCTCGGTTGGAGTTCCACTCTCTGTACATAACTTCATGGTCCATCCCCATCCTTACTGCAAAACCATGGAGAATTTTATTTTGCACGATAATTTGTTTCATTATAGGCATTTAGTAAGTATTTATGTGTCAATTAAAGAAGAGAAGGTTAGTTTATTAAATAGAAGTCAAGGTCTCAATTTCCACAGGGTCATTAATAGGTGTGTTGCAGACATGGACAAATTGAGATATAGGAACTATGTAAATAGGAGTTTTTTTGAAAACAAAAATAACTTCATTCCAAATCAATCCAAATCTTGGTTCTTCCATGATGAATTGCACCATTGGACCGTCAATGAGATGTCTGACTTTCTCCATAACTTCAAACCAGAAAGGGTTTTAGCGTCATGTGTACTTCCAGTGGAGGTGTTCAGCTCAGATGAATCATGCAACCCGAGTTTTTATAAGTATCAGATTCATGGGAGGTGTAGAGGCGTTGTCGAATTCACTTTCTATCCAGATGGAAGTCGAGAAAGTTCTTATTACCAGAAAAGTTCGGACTGGATTTTCAAATATAAACACTTTGAAATTGGCGGGGAAATCTACACCCTTTCTTTTCTTAGGTCAATTAAGTGTCATCATCTAATTTTGATTGAAAGGGGCAGGCTGGAGACAAATAGGTTTTTCATTTCTGACTCCGCAGAGTGCGCATCCCTCAAAATGTTTGGCACTGCCGTTGCTGGAAAGATATGCGCACCCATACGAGTTGAAGTTCTGAAGAGGGAGATGATTTATCTACTCAGTTTGAAAAAAAGTGACATGAATTCCGCCGCAGCCAAATTGAGGCAGCTATCACAGGAGGATTATCATCCACAGGAACTTTGTTTCTTCCTAAACCTTGCTGGACGTATTGAAAGTGTGAAAGGTATTTTCAAAGATAGAGGCTTGGTGTCCACCATCATGGATTGTTTTGCTAAAGCCTTTCCAAACAGGTTGGCCAGATGGATGTCAAACACCATTGACGAGAACTCTTTTCTCCAGCTTATTTCAAGCATGGAGGGTATGAAGTTAAGTGTGGAAAGAGTGACTTTCCCGGTTGAAAATTTTTTTGAATTCAATGTCAAAGATGGGATTGACGAGCAGTACATTCTCGATTTGATGGATGAAAAATTCTCTGGTGTGGGTGATCCACAACCAGACACTTCATATTCAGTCAAAGTCTCAAGAAACAAAAACTACATTCTCACGGATTTTAAGGCAAAGAAATGGGAGAGGCTGGCTGATAAAGAAAGTAAAGAAATCACAACTAGGGTGGACATCCCTGGAGAAATGTACGAAATCTCTTTAGAAGAGGCAAGGTTCTTCTCTGGTTTGGTAGGGAAAAGGAACACCATGTTTCATGAAATAAAAGAAGGTGAAATGGATGGGATTTTTTTTAAGAGGAGAGATCCAATCTTCCTGACTAACTTTGAACACTGGAAGTTACCAGTCAAGAAAGGCATCAGGGAGGTGACCATGAAAGATGCCTTCCAAGCAGAAGAACAAGCAGAAGATATGCCTCCAGAGGAACAATTCAAACCAAAAGAAGAAGAACGAGCAGACTCCTGTGGGTCTGAGGAGGAAGAAGAGGAGCTAGAGAGACACAATGAAATGGATCTTTCTAGTGATGATGAAGAAGAATGCACTTTCATTAGTGGAAAATTCTCTCCAAATGAAAGTTTTCTGGATTCCCTTAGAATGATGTTGAATTCAAAAGCCGCATATCCACATGGGGGGAGGAGAACCATGTTGTTTTCTACTGTGACTGGATTGGACTATGGTTTTGGCCCACACAGATATGAACAGGTCAAGTGTGACTTCATGGAAGAATTGTTAAAAAAAACAGGGTTTAACAGCTGTTTGGCTCAGAAGTATGAAGAAGGAGGGAGCATTGGCCCACATTTTGACGACGAAAGGGTTTACGATGATGATGAGATTCTCACGTGGAACGTGGAAGGGGAAGCAGATTTTGTTATGCTCAAAAGAGAGGGAACCGAAATAGTTCATTTAACACCTGGAAGTGTGGTCCTTATGCCTAAAGGAAGTTCTAGAGGTCCGGAGAAATTCAAGCATTCTGTGCACGGTTGTACAAAGGGTCGTGTTTCCATAACGTTCAGGCATCAAAAAAGGTTTATGAATGGAGATCCAGTAGAAATTGAGAACTACAAAAGGACTCAAATGGAGATTCCTGAAAACTTGGATGAAATGATAAAAAAAATGTCCAATGCATGTTTTCTTGATTGTCTTGCTGATCATCTTGCCATGAATCGGAATGGTGTTTTTAATCTTCTTTTTGACCAGGATAGATCTGTGCTCACCAATGTGGTGGAAGATAAAGGCTTCACTCTGGCCGAAGTGATTGACCATCTTACGAATCTGGACATTCCTGGAAGGATCGTTTCGAGCGGCGAGGTCATAAACTACCTGGAAAAGGGCTCTTTCAAACCCATTGATTTAATGATGAGGGATGGCCACATTGGACTAAATGTCCAGCACCAGGTTCTTTACAATTCCAAAGATATTCGGGTAGAAGACTTGATTGGAGCCGACGTGATCAAACCAAACTTCAGTGTTGAGAGAGCAAGAAAACTAGTCAAATCAATGATGGAGGGCTTAACCGGGGTTGTGTTGAATAGGTTCAAATATGCTTTCAATGAGCTCCTACCTCACCATGGAAATAAGGTCATGTGCATAGCAGGTTTTGCTGGTTCAGGTAAATCTAGAGCTCTGCAGGGCGTGTGCTCGAGTGTTCTCAACAAGAAAAATGTGATTTTAAGTAGTCCAAGAAAAAATCTGTTGAGGGATTGGGAGAGCAAGATTGGTGACAAACTGAAAGGAAAAGAAATGCATATCAAACTGCGAACCTTTGAATTGGCAGTGAGCGCTATCACGAGAATGGTCCTAAAGGAGGGAGATGTTAAACTGACGGTCATCATTGACGAGGTCACTCTTCTACCTGGGGGCTACATTGATCTCATTAACAGTTTGATACCTGAGGGGTCCACGATCATTCTGCTGTTTGATCCGTTACAGTCACACTACTACTCAAAGATGGACGTAAGTGCAAACTTAGGTCCAGTTTTAACTCCAATCTTTGGACAAGAGTATAGGTACAGAGGTTATACCTACAGATTCCCGGAGCTATTCAAAGTAGAGGGGTTTGAGTTTGGGAAAGGGGAAATAGACAAAAATCACATGAGAATATTTGCACAGCCACAAGCCGTTCGTGAAGCAGTGAAAAAACCTGTATTCCTGTGCCCGAGTGAGGACAAGAGAAATGAACTATCTAACTTTGGAGAGGCCTACACTTTCGGCACAAGTCAGGGTTTGACTTTCGATTTCGTATGCATTTCTCTAGACATGGATGGCTCTGTTACCTCGGACTTTCATTGGATGGTGGCCTTGACCAGAGCTAGAAAAGGTTTCTGCTTCCTCACATGTGCGTCAACCAGTCTAAGAAACTTCAAAGAAAGCAATAGAGCTAAGTTGATCGGGAAAGTTCTAAACAAGGAGATCATTTCAAAGAAGTTCTGGTGGAATCTTGGAGGACGTGCTCTGGACAATGCAAGATGTGTGGACAAGGATGAATTTGTGAAGTTGGGCAAGACAAGAGAAGAGTTTGAGGAAGCGTTAGGGGGTGATCCCTGGTTAAAAGGCTTGCTTAACTACTTGGAAGGTGATGATGCTAAAGATCCGGAACCCGAGGAACCGGTGAGGAAAGACAGTCCTCCAAGAACTCATTTGATGCTCGCCCCAGTGGAACATCAGTTTGCAGAGGAAATGCATCTGTTGAAAGCCCGTGAATTTAGAGAATTCAGGAATTCGAATATGTGGTCTGACCAATTTGATGATTCAAGGAAAACCAGAAAAGTCATTCACAACAGAGCGGAGACTTTTGAACAAATATATCCATCACATAAAAACTCCGATACTCTTACTTTCTGGGCCGCTATCAAGAAACGAATCAAAATGTCGGATCCCTTTTCCGAAAGAAGAAAACTGGAACGGTGTATGCCAATTGGCGAAAATTTGTGCAAGATCTTCATTGAGGAATACGGTTTGAAAAGGGGAGTCATCGTGGATGTTGAGAGCACAGAGAGAGAGTTTCTACTAAAGAGAGTGGAGAAGGCGAAGAAAATGATTGAGGCCCATTCTGAACGTTCAGACCCAGATTGGCTGGTGAATCACTTCTTTCTTTTTATGAAAACTCAACTCTGCACCAAGTTTGAAAAACGTTTTTCTGACGCCAAAGCTGGTCAAACACTTGCATGTTTTTCACATCAGGTGTTAGCTAGGTTCGGGGTGCCAATAAGAATTGCGGAGAAAAGATTGAGGTCGCAGTTAAATGACAACATATACATCCATTCTGGAAAACAATTGGACGAACTGAATGAATGGTGCATTAGGTACTCCCAAGGGTATGGGACAGATTCTGACTATGAAAGTTTCGATAGATCACAAGATGCCCTTGTTTTGGCTTTTGAAATACATCTGTTGCGTTTTCTTGGTTGGAACACAGATCTAATCGATGATTATGTGGCAATCAAGTTGAGGTTGGGGTGCAGACTAGGTTATTTGGCGATCATGAGGTTCACTGGTGAATTCGGCACTTTCTTCCTGAATACATGTTGTAACATGCTTTTTACATGTCTGAGGTACAAAATTAACAGGAGAACCCCAATAGCTTTTGCTGGTGACGACATGTTCAGCCCTGGGAGGCTGGAGGTTAGAAGAGATAGAGAGTTTCTCTTGAACAGA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| 89,299
|
KF700263.1
|
Prunus virus T
|
Marais,A., Faure,C., Mustafayev,E., Barone,M., Alioto,D., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2014-08-03
|
Aze239
|
Prunus virus T
|
Tepovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,835
|
GenBank
| 1
|
Azerbaijan
|
Azerbaijan
|
Prunus domestica
| null |
2011
| null | null |
Prunus virus T isolate Aze239, complete genome
|
GGGCAGGAACAACTGTGTGATTCCAAAGAGAAATATCTTCAAGATAATGGCTTTCTCATACCGGACACCCGCAGAAGAGTTCCTCTCAAAATTACCATCAGCCTCACAAGAAACAGTTGACGAATATGCGCTCAGGTCACTTAGAGATCAGGAAAAGGCCTCAAGCCGTAATTATTCCTATCATTTAACAGACACGCAAAAGAGCTTCTGTTCCAAGGTTGGTGTTCCGCTTTCTGTGAATAACTTCATGGTTCATCCACACCCTTACTGTAAAACCATGGAGAATTTTTTACTGCATGATAATCTGTTTCACTATAGGAATTTAATAGATACATATGTTTCAATTAAAGAAGAGAAGGTCGGTTTGTTAAATAGAAGTAGGGGCTTGAACTTTCATAGAGTCATAAATAGATGTGTCGCAGATAGGGATAATATTAGGTACAAGAATTGTGTGAGTAAATCTTTCTTTGAGGACACCAGAAACCACGCTCCCAACCAATCCAAATCATGGTTCTTTCACGATGAACTCCACCACTGGGACGTCAATGAATTTGCAGATTTTCTTGGGAATTTCAAACCTAAAAAGGTTATTGCATCATGTGTTTTCCCAGTTGAAGTTTTTAGCTCGGATGAATCCTGTAACCCTAGTTTTTACAGGTATTTGATTCACGAGAAAAAAAAAGGGGAGGTGCGGTTCACTTTTTTTCCTGATGGCAGCAAAGAAAGTTCTTACTTTCAAAGAAGCTCTGACTGGATATTCAGGTTCAAATATTTTGAAATTGGGAGTGAGATCTACACCCTCTCCTTTTTGAGATCTATAAAGTGCCATCACCTGATCCTTATCGAGAAAGGCAAACTGGAGACCAACGATTATTACATCTCCGATGAGGCCGAGTGTGCATCTCTCAGGATGTTTGGAACTGCAGTGGCCGGCAAAATAACTGCGCCAATAAGGGTTGAGGTCCTCAAAAGAGAGATGATTTACCTCCTGAGCCTGAAAAAGAGTGATATGAACTCAGCTGCGGCAAAACTAAGACAGCTATCACAGGAAGATTATCACCCACAGGAGCTGTGTTTTTTTTTGAATCTGGCAGGGAGAATTGAAAGCGTCAAGGGGATTTTTAAGGACAGGGGTCTGGTGAGCACCGTCATTGATTGCTTTGCCCAAACATTCCCAGACAGGATAGCAAGATGGATTTCCAAGACAACTGATGAGAATTCATTTTTGAGGCTAATTTCGAGCATGGAGGGAATGAAACTAACCATCAAAAGAGAATCCTTTCCAGTTGAAAATTTTCTGGAATTTGACGTCAAGGATGGAATTAGTGAACAGTTCATTCTGGATTTGATGGAGGAGAAGATGTCTGGAGGGACTGATGCTAAAATGGACACGTCCTATTCTGTGGCCACATCCAGGAACAAGAATTTCGTTCTCTTGGACTTCAAGCAGAGGAAATGGGCCAGGTTGGCTGAGAAGGAGGAAAAGGAACCTGAACAGAGGATTGAAATACCGGGCGAGATCCAGGAGCTATCATTCGAGGAAGCCCGATTTTACCATGGGATCCCCGGTATGAAGAGAGCTTTCGATAGTCGGGTTGAACATGATAGTATAACCGGCTCTTTTACAAAGAGAAGGGACCCTGTTTTACTGACCAATTATGCTCACTGGGGACTCCCAAAAAGGGAAGGAATAAGAGAGGTAGTGATGTGGGACGCTGAAGAGGAGATCAGTCAAAAAGAAGGAGGTCTCAAGGTTATGGAGGGAGTGATCCACCCCAACACTTTATCCTCTGATTGCGCAGAAGATTCAGAATCGTGTGGATCTGTATCTGGTAATGATGAATCCATGTCTAGTGAGGAAAAGGAGGAGTGTGAGTACATAAATGGAAGGTTTTCTCCCAATGGGTCTTTCGTTGAATCTTTGAGTATGTTGTTGAATTCAAAGGCTGCTTACCTGCATGGAGGAAGAAAGACTATTTTGTTCTCCACGGTCACTGGCTTGGATTATGGGTTTGGTCCCCACAAATACAAACAGATTCCATGTGACTTCATGGAGGACCTGTTGAAGAAAGTTGGATTCAACAGCTGTCTCGCTCAGATGTATGGAGAAGGAGGTTCAATTGGGGCCCATTATGACGACGAGAAGGTGTATGATGACGATGAGATCCTGACGTGGAATTTGGAGGGTGAAGCAGATTTCACAATGTTTAAAAAAACCGGAACTGAGTCAGTGCATCTCACACGGAACCAAGTTCTCGTCATGCCAAAGGGATGTTCCCGCGGGGAGGAAAAATTCAAGCATGCGGTTGAAAACTGCACTGAGGGAAGAATATCCATCACTTTCAGACATCAAAAGAGGTTCATGAACGGTGAGCCAGTTGAAATTGAAAATTTTAAGAGGAGCTTCATCCAGCTTCCGGACAATTTATGTGATCTTATCTCGAAGATGTCCAACGCCTGTTTTTTGGATTGCCTTGCTGATCATCTGTGCATGAACAGAAGCGCTGTATTCAATCTGTTGTTCGACCAGGACAAATCTGTGATCACCAATGTGTTGGAAGACAAAGGATTCACACTGTCAGAGGTTATCGATCATTTGATGAACCTGGACATTCCTGGAAGAATTGTCAGCAATGGGGAAGTGATTAATTATCTGGAAAAAGGGTCTTTCAAACCCATTGATCTTTTAATGAGGGATGGGCACATTGGGCTCAATGTTCAACACGATGTCCTTTACGATACAAAAGAGGTGAAAGTGGAAGAACTGATCGGCGCTGACATCATCAGACCGCACTTCAGTGTGGAAAGGGCAAGGGTCCTAGTCAAATCGATGATGGAAGGAATGACAGGGGTGATCCTGAATAGATTCAAACATGCCTTCAACGAATTGCTTCCTCGCCACGAAAATAGGGTTATGTGCATCGCTGGTTTTGCTGGGTCTGGGAAATCAAGGGCTCTTCAAGGTGTTTGTGCAAGCGTTCTAAACAAAAAAAATGTCATATTGAGCAGCCCAAGGAAAAACCTTCTCAGGGATTGGGAGTCAAAAATAGATGAGAAGCTTAAAGGAAAAGAGAGACTCATTAAGCTGAAAACTTTCGAGTTGGCCATCAGTGCAATCACAAGGATGGTCAAGAAGGAGCAGGATGGCAAACTAACAGTCATCATTGACGAAGCGACGCTGCTACCAGGAGGTTATCTGGACTTGGTAAATTCTTTGGTCCCTGAGGGCTCCACAATTATACTATTATTTGATCCTCTTCAGTCGCACTACTACTCCAAATCAGATGTCAGGGTCAATCTTGGACCTGTGTTGACACCTATTTTTGGGCAGGAATTCAGATACAGAGGTTATTCATATAGATTCCCAAAGCTCTTTGACCTAGAGGATTTCGAGTATGGACATGGGGATGTGGATCCGAACCACATGAGAGTGTTTGCGCAACCTCAGGCTGTGAGGGAGGCGATCAAAAGACCAGTGTTCCTATGTCCAAGTGACGACAAGAGGAGTGAGCTATCCAATTTTGGGGAGGCTTACACGTTTGGAACAAGCCAGGGTCTCACGTTTGACTTTGTTTGCATATCCATTGACATGGATGGAAGTGTCACATCTGACTTTCATTGGATGGTCGCTCTGACTAGGGCAAGAAGAGGTTTTTGTTTCCTAACGTGTGCTTCCACCAGCATGAGAACTTTCATGGATAACAACAGGGCCAAACTCATTGGAAAGGTGCTAAAGAAAGAACAGATCTCAAAAAAATTCTGGTGGAATCTCGGAGGTCGAGCACTGGAAGGAGCAAGGGCTGTCAAAAAAGACGAATTTTCGAAGCTCGGAAAAACGAGAGAGGAATTCGAGGAGTCTCTGGAGGGAGACCCCTGGCTGAAAGGCATGCTGAACTATCTAGAGGGTGATGATGCTAATGATCCTGAACCGGAAGAACCGATAAGAAAAGACAGCCCTCCGAGGACTCATCTTATGATTGCACCAGTTGAGCACCAATTCGCTGAGGAGATGCATCTCTTGAGGGCAAGAGAATTTCGGGAGTTTAGGAACTCAAACTTGTGGTCGGAGCAATTTGATGACTGCAGGAAAACCAGAAAGGTCATTCACAACAGAGCGGAGACCTTTGAACAGATATACCCCTCTCATAAGAACTCAGATACATTGACCTTCTGGGCCGCAATTAAAAAAAGAATGAAGATGTCCGACCCCTACTCAGAAAGAAGGAAGTTGGAAAGATGCATGCCTGTGGGTGAAAATCTTTGCAGGCTCTTTGTTGAAGAATACGGGTTGAAAAGAGGGTGGCAGGTGGATATTGAGAGCACTGAAAGAGAATTCCTACTGAAGAGGGTCGAGAAGGCGAAGAAGATGATAGAAGCACATTCTGAGCGATCAGATCCAGATTGGATGGTAAACCATTTCTTCTTGTTCATGAAAACCCAGTTGTGCACAAAATTCGAAAAGAGATTTTCTGACGCCAAGGCAGGTCAAACTCTGGCTTGTTTCTCTCATCAGGTTCTCGCGAGGTTCGGGGTTCCAATAAGAGTGGCAGAGAAGAAACTCAGGGCACAGCTTGGGGAGAACATCTACATTCATTCAGGGAAGCAGCTCGACGAGTTAAATGAGTGGTGCATGGGATATGCAAAAGGCTACGGAACCGACTCTGACTACGAGAGCTTTGATAGATCACAGGACGCCCTCATCCTCGCTTTCGAGTTACATTTGCTTCGGTTCCTAGGTTGGAGTGTTGATCAGGTGGAAGATTATGTCACTCTCAAACTCAGGCTTGGCTGTCGCCTTGGGTATTTAGCAATAATGAGATTCACTGGAGAGTTCGGGACATTCTTTCTGAACACATGCTGCAACATGCTTTTCACATGTTTGAGGTACAAGATCAACAAAAACACGCCAATTGCCTTCGCTGGTGATGACATGTTTAGCCCTGGAAGGTTGGAGGTGAGGAGGGACAGGGAATTCCTCCTTAACAGATTCAGTTTGAAAGCTAAAGTCAACTTCTCGAAAGAGCCCATGTTCTGTGGGTGGAGGATGACCCCTTACGGCATCGTCAAGGAGCCCAAACTTGTTTTGGAAAGGTTCAAGATTGCGGAGGAAAGGGGTTGTTTCAAGGAGTGTTTGATTAACTATTGCTTGGAGGTTTCCTTTGCCTACAGATTAGGTGAGAGGCTGTACGATGTGATTAAGAACATTCAGGATAAGCAGGCCTTGGTGAGAATTGTCGTGAAGAACAAGAAATTCCTTCCAAAAAAGATTAGAAAGGAATTTGAGTCTTTTGACCATGAGTTTGGTGGATGTGGGTCAGTTCAGGAGGAAGGTGAATGCGACAGGGTCCATCGCTTCGGCTGTGGACTCGAGTGCAATATATAAACTGTCCCCTTTCCACGCTCTGCAGTCTGACACTTACGTTAGAAAATCAGAGTTCAAAGTCAAAATGCAGCAAACCGGTGAGCGTGGGGTGGCTTGTATGTCTGTGCCACTGTTTGATGATCATGACAAACAGACTATCCGTGAATCCAAAATGCCGTATGTACATATAGCAGTAGTGTTGATTCAGATTTCATGCTTGTTTGACTGGGCCATTTCTGAAGGAATGGAGGGTACATTTGCTCTGATGGACACCCTTTTCGATAACGTTCAGGACAATGTCATAAGGGCCTGTCACTTCAGGTTTGAGGAAGGCCGAGCTGCTTGTTGCTTCAAGTTGAACTTTCCGATATGTGCTGAGGACGCTTTGAAGGGTCGGCCCATAGTTCCCTATATCAAGGTTGTCGGTGCCAACGTTAGAGAAGGGCTGAGGGGCTTCTCTGTATCTGTGGGTACAATTTTTTCCCTGAACAAAACAGAGTTCCCATCTGTGCCTATGAAAATTGATCATGACTTTGTCAACATTGTTGGCACTGAATTCCTTCCAAAGGAGAAATTAAGTGAGCTGACTTGCGAGGAGATCTCTGATTCTTTCCAGAGACTGCAAACTTTGCCGAAGCCTGTCACTGCCTCACTTCCGAGAGGGAGAAAGGAGCCAACCAGGATTAGGGATTACTCCGTTATGTCAAGCTCTGGGTGTTTGATTGAGAAGGATGGGTCTAACAAAGAAGGAAAGGTCGGAAATGCGACGGGAGGTCGACGCTCTGTTGATAACAAAGTTCAAACCTCAAGTAAAACAGGGCCAGCAGTTCTCAGACGCTGCTCAAGCTTTTCTCAAGGAGATGATCTTTGGGAACATAGCACTGAAGGGAGCAAGCGAACAAACAGAGTTCGAAGATCAGGAAGTGTCAAGCGGCTGGTTCGTTCCGGGGTTAGGGGGGCGCCACGGGCAGATGGACCCGGAAAAGGAATTTCCAGGGGAGGAGAACAAAGCTCTTCGGGACGGAGCTTACAGATTCAAGGTGAATTTCTTCAGTCTGGTTCAGAGTCTGATAGCGCTGCTTAGAGGCAGCAATAACGTTTTTGTAAATAATAAACCGTTTAGGCGTTTGTGTGTGGCCTATGCATCCGAGGCCAAGGCTTATCTAGAAGCCAAGAAAGTGGATGGCGAGTTTTCAAATCTGGTGCTCAAAATGCCTGCTACATGTAAGCATGCACCGGAAGTGTGTTTCGATTTCAATGAAGGTTTGGACGTCCTGCGTCTTACTGACGTGCAGGCTCAGACCATGCAGAGGCTCTCTCGTAGGCTTTTCGCCACGGAATTGAAGAAGCGTGAGTCTGAGAGGTCTGTGGCAGATCACATTGGTGATCAAGTTTAGTTTGGTCCAGGTTACTATAAATCTGGCGGCTTAGCTTTAACTTAATAAAGTATGCTTTCTGTTTAAGAATTTTCAG
| 89,300
|
MN531106.1
|
Puma lentivirus
|
Malmberg,J.L., Lee,J.S., Gagne,R.B., Kraberger,S., Kechejian,S., Roelke,M., McBride,R., Onorato,D., Cunningham,M., Crooks,K.R., VandeWoude,S., Malmberg,J.
|
University of Wyoming, Wyoming State Veterinary Laboratory, Veterinary Science
|
USA
|
2020-03-07
|
Pco732
|
Puma lentivirus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,108
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Puma concolor
| null |
2011
| null | null |
Puma lentivirus isolate Pco732, complete genome
|
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| 53,620
|
MN531107.1
|
Puma lentivirus
|
Malmberg,J.L., Lee,J.S., Gagne,R.B., Kraberger,S., Kechejian,S., Roelke,M., McBride,R., Onorato,D., Cunningham,M., Crooks,K.R., VandeWoude,S., Malmberg,J.
|
University of Wyoming, Wyoming State Veterinary Laboratory, Veterinary Science
|
USA
|
2020-03-07
|
P1123
|
Puma lentivirus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,108
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Puma concolor
| null |
2011
| null | null |
Puma lentivirus isolate P1123, complete genome
|
ATGGGGAATGAGTCAGGGAAAGAGGAGAGAGTAATTGCAAAAAGGTGCACCAATGTTGTGACAGGCAGTGGGGGGAAGAGTCCCAAATATTCCATAGGCAATATAAGATGGGCTATGAGATTTGCCTTGGTAGCTACAGGACGAGACCCTCAGGTTAGTCCCACATCTGTGGAAGACCTGAGAGAACTTATTGCAGACTTAGCAGAAAAAGAAGATAAATTTGGGGGAAGTAAAGAGCTTACTTGTGCAATAAAGACTTTAAAAGTGTTAGTAATGGCAGGATGTCTAAATATGAAATGTGCTAATACAGACTCAGCTATACATCTATTTAAAATATTGGGACTGGAAGCCAGACCATCAAAGAAAGAAGGAATTGAAAAGGAAGAACCAGCTCAAGTGGCTCCTATAGTAGCAGGACCCATGGGAGCTACATATACAGCATTTAATCCAAGAACAGTAGCCATTTGGATGGAAAAAGCTAGAGAGGGTATACATAGTGAAGAAGCTATTTTGTGGTTTACAGCATTCTCCACAGACTTAACACCTACCGACATGGCACAATTGCTTATGTCAGCTCCAGGATGTGCTGCAGATAAAGAACTAATAGATCAAAAGCTGAAGGAACTGACTAGAGAATATGAGAGGACACATCCTTCAGATGGTCCCAGGCCTCTGCCATATCCTACTGCAGCAGAAATAATGGGAATCGGAATCCCTCAAGAACAACAGGCTATGGCTCACTTTGAGCCTGCTAGAAGGCAATGTAGAGAGTGGTATTTAATAGCCTTAAATGAATTAAGAAAAATTAGAGCAGGAGCACCAAGAGCAGTCTCTGTTAAACAAGGACCTAAAGAGCTATATTCAGAATTTGTAGATAGACTATTTAAGCAAATAGAAGCAGAATCTGCTCCTCAGGATGTCAAACAATATTTAAAGGATTCATTAAGTATAAGTAATGCAAATCCAGAGTGTAAAAGAGCAATGAGTCACCTTAGACCAGAAGACAAATTGGAAGACAAGATTAGGGCTTGCCAAGATATAGGGTCAACAACATACAAGATGAATATGCTTGCACAAGCGTTACAACAAGTTAGGGTACAGCAAGTGCAAGTAAAACCTCGAGGTGCTCCAGGACCACAAAGAAAGAAAGGGCCTCTCAAATGTTTTAACTGTGGAAAAATTGGACATATGGCAAAAATGTGTAAAGCTCCTAAGAGATGCAATAAATGTGGAAAACTAGGTCATATTAGTACAGACTGCTTTCAAATGTTCTCGGGAAACGGGAAACAGGGGGGAGCTGCAACCCCCCAGAGAAATCAAATGCAGGTACAACAGTCTACGTTGCCAACAGCACCTCCATTGGAGGAGATTCCACTCCTCCAGTTGTAAAAGCAATTTGGGAAATGAACACACGACCCCGTGTTGAGGCCTGGATAAATGGAAAAAAGATTAATTTTTTATTAGATTCAGGGGCTGATATCTCAGTAATAAATTTAAAAGATTGGAATCAAGGTCAGGCTATTAAAGAAGGGCCTCAACATATGACAGGGGTTGGGGGAGTGCAAAATGGGATGAGGTATTCTAATGTGCATATAGAGATTCATACAGAAAATGAAGGAAAATGTTGTAATGGTTATATGTGTGTCCTTCCACAGAATAATTTAGTAGATAATTTATTAGGTAGAGATAATTTACAAAAACTAGGTATAAGAATGGTAATGGCAATGATTTCTGATAAAATACCAATCGTTAAAGCAAGGATGAAAGATCCAAATAATGGACCAAGAGTCAAACAATGGCCATTATCAAAAGAAAAAATAGAGGCTCTGACAGAAATAGTAGAAAGATTAGAAAAGGAAGGAAAAGTAGGGAGAGCTGATCCCAATAATCCTTGGAATACTCCCGTATTTTGTATAAAAAAGAGATCAGGAAAGTGGAGAATGTTAATTGATTTTAGGGAGCTTAATGCAAAAACTGAGAAAGGAGCAGAAGTGCAGTTGGGGTTACCCCATCCATCTGGATTACAGAAAAGAAAGAATGTAACAGTCCTGGATATAGGAGATGCCTATTTTACAATCCCCTTGGATCCAGATTATCAACCATATACAGCATTTACTTTGCCATCTAAAAACAATCAAAGCCCAGGAAGAAGATATATTTGGAAATCTCTTCCTCAGGGGTGGCTTTTAAGTCCTTTGATCTATCAAAGTACTTTAGATAATATTTTACAACCTTTTAGACAAAAATATGGAAAAGAAATTGATATATATCAATATATGGATGATATTTACATTGGTTCAGATAAAGAAGTGAAGACACATAGGAAAATAGTACAAGAATTAAGGGAATTACTTTTATGGTGGGGATTTGAAACACCAGAAGATAAACTACAAGAGGCACCACCTTATAAATGGATGGGATATGAACTCCATCCCAATGGGTGGAAAATTCAAACAGCAAAGTTGGAAATACCTGAAAACCCCACTTTAAATGAACTGCAAAAGTTAGTAGGAAAAATTAATTGGGCGACTCAAATAATAGGAGGGTTGCCTATTAAAAATTTGACTGAAATGATGAAAGGCAATCCCGACTTAAATTCAAAAAGAGAATGGACTTCTGAAGCTAGACAAGAGGCAGAACAGGCAAAAGAAGCTATAGAAAATCTGCCTAATGGAAACTATTATGACAAAAATAAAGAATTATATGCTATTTTGAGTATTAGTGGTCCATTACAAATAAGTTATATGGTCTATCAGTTAGAGGGGATTAAAAAACTTCCTTTATGGTATGGGAGAATGAATAGAGTTAAGAGAAAAATAGAAAATACTTGTGATATTGCTATGAGAGCTATAAATAAGATTAAAGAAGAGACTGTAATTAGGTTGGGGAGAGAGCCACTCTATCAAATTCCTTGCTCAAAAGAGAATTGGGAAAGTTATATTCAGACTAGTAGGTATCTAAAAAATGTCCCTCCTCAAGTGGAATTTATTAATAGTAGTCTGATGATAGAAAGACATTTAGCATGTTTAATGGAGGACCCCATACAAGATGAAGAAGCAGAAACATGGTATATTGATGGAGGAAGGAAAAAGGGACAAAAGGCAAGAGCAGGATGGTGGAAAAATAACCAGGAATGGCAAATAATGGAAATAGAAGGATCTAATCAAGTAGCAGAAGCACAAGCTTTAAATATGGCATTAAAGTCAGGGCCAGAAAAGATGAATATTATAACAGATAGCCAATATATATATAATATGGTAAGAGCAAGGCCAGAACCCAATGACTCCCTGTGGAAAGAAATTGTAGAAGAACTTCAAAGAAAAGAGAAAATCTTTATTGATTGGGTTCCTGGACACAGAGGCATCCCAGGAAATAAGGAAATAGATGAATTAGTACAATGTAACATGATTATTGAAGGAGCAGGAATACTTCAAAAAAGAGAAGAAGATGCAGGTTATGATCTTATAGCATCAGAAAGGATGTATTTTCTTCCTTCAGAAACAAGAAAAGTTCCTATAGATTGTAAAATGGAATTGCCTCCTGGGACAGTCGGTCTAGTACTAGGAAAATCATCTATAGGATGTAAAGGATTAGATGTATTAGGAGGAGTAATAGATTCAGGATACAGAGGAGAGATATCAGTAATTATGATGAATTCTTCAAAAAAGGGGCAATGGATAGAACAAGGCCAAAAAATAGCTCAATTACTTATTATGCCAGTACAGCATGAAATATTGGAACAAGGAAAAGTACAAATGAACTCAGAAAGAGGAGAACAAGGATTTGGTAGTACAGGAGCATTTGCATTGCAGTCCTGGATGGATTATATAGAACAAGCAGAAATAGAGCATGAAAAGTTTCATACAGATGAAAAGACATTGCAAGAGAAGTTTGGATTACCTAAGGTAGTAGCTAATGAAATTTTGCAGAAATGTACAATCTGCAGAATGACAGGAACAGGAAGTGGAAACAGAGGAGGGAAATTAAAGATGGGACCTGGAGTATGGCAGGTAGACTGTACTCATCTTGAAGGACAAATAATATTAGTAGCCATTAATGTGGAATCAGGATTACTATGGACAAAATTATTAAAACAAGAGACAGCTAAAGAAACAGTATTAGCTGTATTAGAATTAGTACAGACACATAACGTTGTGGAAATACAAACAGATAATGGACCCAATTTTGCAAATTCAAGGATGGAAGGGTTAACAGCATTTTTAGGAATATATCATAAATATGGAATTCCATTGAATCCACAAAGTCAAGCATTAGTAGAAAATGTTAATAGCACTTTAAAAAGTTGGATAAAGAAGTTTAGACCAGAAGTAGAAACTTTACAGGCAGCAGTAGCATTAGCTACATTTGCTCTAAATAAAAAAAGAAAGGGTAATATAGGGGGTATGTCTCCCTATGAACTATATATATGGCAGGAAAACAACTTAATACAACAATACTACTCCAATATCATATTTAAAAAATTTGGCACGAAACAATGGATATATTATAAGGACATTAAAGATAAGGAGTGGAAGGGCCCAGTAGAAGTTCTCTATTGGGGCGAAGGCTCAGTTTTGATAAAAGATCCTGAAAGAGGACTTTTCTTAGTTCCTAATAGGAGGATTCGAAGAGTACCTCCCCCTCAAGAATTAGAGGTAAGTGATGCAACCGTACAGAGTACAGAGTAGTAAAAGAAATATGAGATACCTTAAAGAAAATAATTGTTCAGGAGATCAAATTCAACACTTTAAGAATAAATTAGCTTTGCAGGAGTTAAAATGGATTAGAAAGTTGCGATGGGTAGAAGGTATTTTATGGTCATTCCATACTAGAGAATGGCACTGTGATATGGTCAAAGAATTGGTAGCAGGGACAGGACCTTTAAAATTATATTGTTATGTATCACATCCCATATGGAAAAGATACAGACCTACCTTCCAATGGAATCAACAATGGCCTTATGGTAATTTATGGTTGACAGAAAAGTATATGTGGGAAGT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| 53,621
|
MN531108.1
|
Puma lentivirus
|
Malmberg,J.L., Lee,J.S., Gagne,R.B., Kraberger,S., Kechejian,S., Roelke,M., McBride,R., Onorato,D., Cunningham,M., Crooks,K.R., VandeWoude,S., Malmberg,J.
|
University of Wyoming, Wyoming State Veterinary Laboratory, Veterinary Science
|
USA
|
2020-03-07
|
P901
|
Puma lentivirus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,108
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Puma concolor
| null |
2011
| null | null |
Puma lentivirus isolate P901, complete genome
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| 53,622
|
MN531109.1
|
Puma lentivirus
|
Malmberg,J.L., Lee,J.S., Gagne,R.B., Kraberger,S., Kechejian,S., Roelke,M., McBride,R., Onorato,D., Cunningham,M., Crooks,K.R., VandeWoude,S., Malmberg,J.
|
University of Wyoming, Wyoming State Veterinary Laboratory, Veterinary Science
|
USA
|
2020-03-07
|
P1124
|
Puma lentivirus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,108
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Puma concolor
| null |
2011
| null | null |
Puma lentivirus isolate P1124, complete genome
|
ATGGGGAATGAGTCAGGGAAAGAGGAGAGAGTAATTGCAAAAAGGTGCACCAATGTTGTGACAGGCAGTGGGGGGAAGAGTCCCAAATATTCCATAGGCAATATAAGATGGGCTATGAGATTTGCCTTGGTAGCTACAGGACGAGACCCTCAGGTTAGTCCCACATCTGTGGAAGACCTGAGAGAACTTATTGCAGACTTAGCAGAAAAAGAAGATAAATTTGGGGGAAGTAAAGAGCTTACTTGTGCAATGAAGACTTTAAAAGTGTTAGTAATAGCAGGATGTCTAAATATGAAATGTGCTAATACAGACTCAGCTATATATCTATTTAAAATATTGGGACTGGAAGCCAGACCATCAAAGAAAGAAGGAATTGAAAAGGAAGAACCAGCTCAAGTGGCTCCTATAGTAGCAGGACCCATGGGAGCTACATATACAGCATTTAATCCAAGAACAGTAGCCATTTGGATGGAAAAAGCTAGAGAGGGTATACATAGTGAAGAAGCTATTTTGTGGTTTACAGCATTCTCCACAGACTTAACACCTACCGACATGGCACAATTGCTTATGTCAGCTCCAGGATGTGCTGCAGATAAAGAACTAATAGATCAAAAGCTGAAGGAACTGACTAGAGAATATGAGAGGACACATCCTTCAGATGGTCCCAGGCCTCTGCCATATCCTACTGCAGCAGAAATAATGGGAATCGGAATCCCTCAAGAACAACAGGCTATGGCTCACTTTGAGCCTGCTAGAAGGCAATGTAGAGAGTGGTATTTAATAGCCTTAAATGAATTAAGAAAAATTAGAGCAGGAGCACCAAGAGCAGTCTCTGTTAAACAAGGACCTAAAGAGCTATATTCAGAATTTGTAGATAGACTATTTAAGCAAATAGAAGCAGAATCTGCTCCTCAGGATGTCAAACAATATTTAAAGGATTCATTAAGTATAAGTAATGCAAATCCAGAGTGTAAAAGAGCAATGAGTCACCTTAGACCAGAAGACAAATTGGAAGACAAGATTAGGGCTTGCCAAGATATAGGGTCAACAACATACAAGATGAATATGCTTGCACAAGCGTTACAACAAGTTAGGGTACAGCAAGTGCAAGTAAAACCTCGAGGTGCTCCAGGACCACAAAGAAAGAAAGGGCCTCTCAAATGTTTTAACTGTGGAAAAATTGGACATATGGCAAAAATGTGTAAAGCTCCTAAGAGATGCAATAAATGTGGAAAACTAGGTCATATTAGTACAGACTGCTTTCAAATGTTCTCGGGAAACGGGAAACAGGGGGGAGCTGCAACCCCCCAGAGAAATCAAATGCAGGTACAACAGTCTACGTTGCCAACAGCACCTCCATTGGAGGAGATTCCACTCCTCCAGTTGTAAAAGCAATTTGGGAAATGAACACACGACCCCGTGTTGAGGCCTGGATAAATGGAAAAAAGATTAATTTTTTATTAGATTCAGGGGCTGATATCTCAGTAATAAATTTAAAAGATTGGAATCAAGGTCAGGCTATTAAAGAAGGGCCTCAACATATGACAGGAGTTGGGGGAGTGCAAAATGGGATGAGGTATTCTAATGTGCATATAGAAATTCATACAGAAAATGAAGGAAAATGTTGTAATGGTTATATGTGTGTCCTTCCACAAAATAATTTAGTAGATAATTTATTAGGTAGAGATAATTTACAAAAACTAGGTATAAGAATGGTAATGGCAATGATTTCTGATAAAATACCAATCGTTAAAGCAAGGATGAAAGATCCAAATAATGGACCAAGAGTCAAACAATGGCCATTATCAAAAGAAAAAATAGAGGCTCTGACAGAAATAGTAGAAAGATTAGAAAAGGAAGGAAAAGTAGGGAGAGCTGATCCCAATAATCCTTGGAATACTCCCGTATTTTGTATAAAAAAGAGATCAGGAAAGTGGAGAATGTTAATTGATTTTAGGGAGCTTAATGCAAAAACTGAGAAAGGAGCAGAAGTGCAGTTGGGGTTACCCCATCCATCTGGATTACAGAAAAGAAAGAATGTAACAGTCCTGGATATAGGAGATGCCTATTTTACAATCCCCTTGGATCCAGATTATCAACCATATACAGCATTTACTTTGCCATCTAAAAACAATCAAAGCCCAGGAAGAAGATATATTTGGAAATCTCTTCCTCAGGGGTGGCTTTTAAGTCCTTTGATCTATCAAAGTACTTTAGATAATATTTTACAACCTTTTAGACAAAAATATGGAAAAGAAATTGATATATATCAATATATGGATGATATTTACATTGGTTCAGATAAAGAAGTGAAGACACATAGGAAAATAGTTCAAGAATTAAGGGAATTACTTTTATGGTGGGGATTTGAAACACCAGAAGATAAACTACAAGAGGCACCACCTTATAAATGGATGGGATATGAACTCCATCCCAATGGGTGGAAAATTCAAACAGCAAAGTTGGAAATACCTGAAAACCCCACTTTAAATGAACTGCAAAAGTTAGTAGGAAAAATTAATTGGGCGACTCAAATAATAGGAGGGTTGCCTATTAAGAATTTGACTGAAATGATGAAAGGCAATCCCGACTTAAATTCAAAAAGAGAATGGACTTCTGAAGCTAGACAAGAGGCAGAACAGGCAAAAGAAGCTATAGAAAATCTGCCTAATGGAAACTATTATGACAAAAATAAAGAATTATATGCTATTTTGAGTATTAGTGGTCCATTACAAATAAGTTATATGGTCTATCAGTTAGAGGGGATTAAAAAACTTCCTTTATGGTATGGGAGAATGAATAGAGTTAAGAGAAAAATAGAAAATACTTGTGATATTGCTATGAGAGCTATAAATAAGATTAAAGAAGAGACTGTAATTAGGTTGGGGAGAGAGCCACTCTATCAAATTCCTTGCTCAAAAGAGAATTGGGAAAGTTATATTCAGACTAGTAGGTATCTAAAAAATATCCCTCCTCAAGTGGAATTTATTAATAGTAGTCTGATGATAGAAAGACATTTAGCATGTTTAATGGAGGACCCCATACAAGATGAAGAAGCAGAAACATGGTATATTGATGGAGGAAGGAAAAAGGGACAAAAGGCAAGAGCAGGATGGTGGAAAAATAACCAGGAATGGCAAATAATGGAAATAGAAGGATCTAATCAAGTAGCAGAAGCACAAGCTTTAAATATGGCATTAAAGTCAGGGCCAGAAAAGATGAATATTATAACAGATAGCCAATATATATATAATATGGTAAGAGCAAGGCCAGAACCCAATGACTCCCTGTGGAAAGAAATTGTAGAAGAACTTCAAAGAAAAGAGAAAATCTTTATTGATTGGGTTCCTGGACACAGAGGCATCCCAGGAAATAAGGAAATAGATGAATTAGTACAATGTAACATGATTATTGAAGGAGCAGGAATATTTCAAAAAAGAGAAGAAGATGCAGGTTATGATCTTATAGCATCAGAAAAGATGTATTTTCTTCCTTCAGAAACAAGAAAAGTTCCTATAGATTGTAAAATGGAATTGCCTCCTGGGACAGTCGGTCTAGTACTAGGAAAATCATCTATAGGATGTAAAGGATTAGATGTATTAGGAGGAGTAATAGATTCAGGATACAGAGGAGAGATATCAGTAATTATGATGAATTCTTCAAAAAAGGGGCAATGGATAGAACAAGGCCAAAAAATAGCTCAATTACTTATTATGCCAGTACAGCATGAAATATTGGAACAAGGAAAAGTACAAATGAACTCAGAAAGAGGAGAACAAGGATTTGGTAGTACAGGAGCATTTGCATTGCAGTCCTGGATGGATTATATAGAACAAGCAGAAATAGAGCATGAAAAGTTTCATACAGATGAAAAGACATTGCAAGAGAAGTTTGGATTACCTAAGGTAGTAGCTAATGAAATTTTGCAGAAATGTACAATCTGCAGAATGACAGGAATAGGAAGTGGAAACAGAGGAGGGAAATTAAAGATGGGACCTGGAGTATGGCAGGTAGACTGTACTCATCTTGAAGGACAAATAATATTAGTAGCCATTAATGTGGAATCAGGATTACTATGGACAAAATTATTAAAACAAGAGACAGCTAAAGAAACAGTATTAGCTGTATTAGAATTAGTACAGACACATAACGTTGTGGAAATACAAACAGATAATGGACCCAATTTTGCAAACTCAAGGATGGAAGGGTTAACAGCATTTTTAGGAATATATCATAAATATGGAATTCCATTGAATCCACAAAGTCAAGCATTAGTAGAAAATGTTAATAGCACTTTAAAAAGTTGGATAAAGAAGTTTAGACCAGAAGTAGAAACTTTACAGGCAGCAGTAGCATTAGCTACATTTGCTCTAAATAAAAAAAGAAAGGGTAATATAGGGGGTATGTCTCCCTATGAACTATATATATGGCAGGAAAACAACTTAATACAACAATACTACTCCAATATCATATTTAAAAAATTTGGCACGAAACAATGGATATATTATAAGGACATTAAAGATAAGGTGTGGAAGGGCCCAGTAGAAGTTCTCTATTGGGGCGAAGGCTCAGTTTTGATAAAAGATCCTGAAAGAGGACTTTTCTTAGTCCCTAATAGGAGGATTCGAAGAGTACCTCCCCCTCAAGAATTAGAGGTAAGTGATGCAACCGTACAGAGTACAGAGTAGTAAAAGAAATATGAGATACCTTAAAGAAAATAATTGCTCAGAAGATCAAATTCAACACTTTAAGAATAAATTAGCTTTGCAGGAGTTAAAATGGATTAGAAAGTTGCGATGGGTAGAAGGCATTTTGTGGTCATTCCATACGAGAGAATGGCACTGTGATATGGTCAAAGAATTGGTAGCAGGGACAGGACCTTTAAAATTATATTGTTATGTATCACATCCCATATGGAAAAGATACAGACCTACCTTCCAATGGAATCAACAATGGCCTTATGGTAATTTATGGTTGACAGAAAAGTATATGTGGGAAGT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| 53,623
|
MN531110.1
|
Puma lentivirus
|
Malmberg,J.L., Lee,J.S., Gagne,R.B., Kraberger,S., Kechejian,S., Roelke,M., McBride,R., Onorato,D., Cunningham,M., Crooks,K.R., VandeWoude,S., Malmberg,J.
|
University of Wyoming, Wyoming State Veterinary Laboratory, Veterinary Science
|
USA
|
2020-03-07
|
P1094
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Puma lentivirus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,108
|
GenBank
| 1
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USA
|
USA
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Puma concolor
| null |
2011
| null | null |
Puma lentivirus isolate P1094, complete genome
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| 53,624
|
MN531111.1
|
Puma lentivirus
|
Malmberg,J.L., Lee,J.S., Gagne,R.B., Kraberger,S., Kechejian,S., Roelke,M., McBride,R., Onorato,D., Cunningham,M., Crooks,K.R., VandeWoude,S., Malmberg,J.
|
University of Wyoming, Wyoming State Veterinary Laboratory, Veterinary Science
|
USA
|
2020-03-07
|
P910
|
Puma lentivirus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,108
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Puma concolor
| null |
2011
| null | null |
Puma lentivirus isolate P910, complete genome
|
ATGGGGAATGAGTCAGGGAAAGAGGAGAGAGTAATTGCAAAAAGGTGCACCAATGTTGTGACAGGCAGTGGGGGGAAGAGTCCCAAATATTCCATAGGCAATATAAGATGGGCTATGAGATTTGCCTTGGTAGCTACAGGACGAGACCCTCAGGTTAGTCCCACATCTGTGGAAGACCTGAGAGAACTTATTGCAGACTTAGCAGAAAAAGAAGATAAATTTGGGGGAAGTAAAGAGCTTACTTGTGCAATAAAGACTTTAAAAGTGTTAGTAATAGCAGGATGTCTAAATATGAAATGTGCTAATACAGACTCAGCTATACATCTATTTAAAATATTGGGACTGGAAGCCAGACCATCAAAGAAAGAAGGAATTGAAAAGGAAGAACCAGCTCAAGTGGCTCCTATAGTAGCAGGACCCATGGGAGCTACATATACAGCATTTAATCCAAGAACAGTAGCCATTTGGATGGAAAAAGCTAGAGAGGGTATACATAGTGAAGAAGCTATTTTGTGGTTTACAGCATTCTCCACAGACTTAACACCTACCGACATGGCACAATTGCTTATGTCAGCTCCAGGATGTGCTGCAGATAAAGAACTAATAGATCAAAAGCTGAAGGAACTGACTAAAGAATATGAGAGGACACATCCTTCAGATGGTCCCAGGCCTCTGCCATATCCTACTGCAGCAGAAATAATGGGAATCGGAATCCCTCAAGAACAACAGGCTATGGCTCACTTTGAGCCTGCTAGAAGGCAATGTAGAGAGTGGTATTTAATAGCCTTAAATGAATTAAGAAAAATTAGAGCAGGAGCACCAAGAGCAGTCTCTGTTAAACAAGGACCTAAAGAGCTATATTCAGAATTTGTAGATAGACTATTTAAGCAAATAGAAGCAGAATCTGCTCCTCAGGATGTCAAACAATATTTAAAGGATTCATTAAGTATAAGTAATGCAAATCCAGAGTGTAAAAGAGCAATGAGTCACCTTAGACCAGAAGACAAATTGGAAGACAAGATTAGGGCTTGCCAAGATATAGGGTCAACAACATACAAGATGAATATGCTTGCACAAGCGTTACAACAAGTTAGGGTACAGCAAGTGCAAGTAAAACCTCGAGGTGCTCCAGGACCACAAAGAAAGAAAGGGCCTCTCAAATGTTTTAACTGTGGAAAAATTGGACATATGGCAAAAATGTGTAAAGCTCCTAAGAGATGCAATAAATGTGGAAAACTAGGTCATATTAGTACAGACTGCTTTCAAATGTTCTCGGGAAACGGGAAACAGGGGGGAGCTGCAACCCCCCAGAGAAATCAAATGCAGGTACAACAGTCTACGTTGCCAACAGCACCTCCATTGGAGGAGATTCCACTCCTCCAGTTGTAAAAGCAATTTGGGAAATGAACACACGACCCCGTGTTGAGGCCTGGATAAATGGAAAAAAGATTAATTTTTTATTAGATTCAGGGGCTGATATCTCAGTAATAAATTTAAAAGATTGGAATCAAGGTCAGGCTATTAAAGAAGGGCCTCAACATATGACAGGGGTTGGGGGAGTGCAAAATGGGATGAGGTATTCTAATGTGCATATAGAAATTCATACAGAAAATGAAGGAAAATGTTGTAATGGTTATATGTGTGTCCTTCCACAAAATAATTTAGTAGATAATTTATTAGGTAGAGATAATTTACAAAAACTAGGTATAAGAATGGTAATGGCAATGATTTCTGATAAAATACCAATCGTTAAAGCAAGGATGAAAGATCCAAATAATGGACCAAGAGTCAAACAATGGCCATTATCAAAAGAAAAAATAGAGGCTCTGACAGAAATAGTAGAAAGATTAGAAAAGGAAGGAAAAGTAGGGAGAGCTGATCCCAATAATCCTTGGAATACTCCCGTATTTTGTATAAAAAAGAGATCAGGAAAGTGGAGAATGTTAATTGATTTTAGGGAGCTTAATGCAAAAACTGAGAAAGGAGCAGAAGTGCAGTTGGGGTTACCCCATCCATCTGGATTACAGAAAAGAAAGAATGTAACAGTCCTGGATATAGGAGATGCCTATTTTACAATCCCCTTGGATCCAGATTATCAACCATATACAGCATTTACTTTGCCATCTAAAAACAATCAAAGCCCAGGAAGAAGATATATTTGGAAATCTCTTCCTCAGGGGTGGCTTTTAAGTCCTTTGATCTATCAAAGTACTTTAGATAATATTTTACAACCTTTTAGACAAAAATATGGAAAAGAAATTGATATATATCAATATATGGATGATATTTACATTGGTTCAGATAAAGAAGTGAAGACACATAGGAAAATAGTTCAAGAATTAAGGGAATTACTTTTATGGTGGGGATTTGAAACACCAGAAGATAAACTACAAGAGGCACCACCTTATAAATGGATGGGATATGAACTCCATCCCAATGGGTGGAAAATTCAAACAGCAAAGTTGGAAATACCTAAAAACCCCACTTTAAATGAACTGCAAAAGTTAGTAGGAAAAATTAATTGGGCGACTCAAATAATAGGAGGGTTGCCTATTAAAAATTTGACTGAAATGATGAAAGGCAATCCCGACTTAAATTCAAAAAGAGAATGGACTTCTGAAGCTAGACAAGAGGCAGAACAGGCAAAAGAAGCTATAGAAAATCTGCCTAATGGAAACTATTATGACAAAAATAAAGAATTATATGCTATTTTGAGTATTAGTGGTCCATTACAAATAAGTTATATGGTCTATCAGTTAGAGGGGATTAAAAAACTTCCTTTATGGTATGGGAGAATGAATAGAGTTAAGAGAAAAATAGAAAATACTTGTGATATTGCTATGAGAGCTATAAATAAGATTAAAGAAGAGACTGTAATTAGGTTGGGGAGAGAGCCACTCTATCAAATTCCTTGCTCAAAAGAGAATTGGGAAAGTTATATTCAGACTAGTAGGTATCTAAAAAATGTCCCTCCTCAAGTGGAATTTATTAATAGTAGTCTGATGATAGAAAGACATTTAGCATGTTTAATGGAGGACCCCATACAAGATGAAGAAGCAGAAACATGGTATATTGATGGAGGAAGGAAAAAGGGACAAAAGGCAAGAGCAGGATGGTGGAAAAATAACCAGGAATGGCAAATAATGGAAATAGAAGGATCTAATCAAGTAGCAGAAGCACAAGCTTTAAATATGGCATTAAAGTCAGGGCCAGAAAAGATGAATATTATAACAGATAGCCAATATATATATAATATGGTAAGAGCAAGGCCAGAACCCAATGACTCCCTGTGGAAAGAAATTGTAGAAGAACTTCAAAGAAAAGAGAAAATCTTTATTGATTGGGTTCCTGGACACAGAGGCATCCCAGGAAATAAGGAAATAGATGAATTAGTACAATGTAACATGATTATTGAAGGAGCAGGAATACTTCAAAAAAGAGAAGAAGATGCAGGTTATGATCTTATAGCATCAGAAAAGATGTATTTTCTTCCTTCAGAAACAAGAAAAGTTCCTATAGATTGTAAAATGGAATTGCCTCCTGGGACAGTCGGTCTAGTACTAGGAAAATCATCTATAGGATGTAAAGGATTAGATGTATTAGGAGGAGTAATAGATTCAGGATACAGAGGAGAGATATCAGTAATTATGATGAATTCTTCAAAAAAGGGGCAATGGATAGAACAAGGCCAAAAAATAGCTCAATTACTTATTATGCCAGTACAGCATGAAATATTGGAACAAGGAAAAGTACAAATGAACTCAGAAAGAGGAGAACAAGGATTTGGTAGTACAGGAGCATTTGCATTGCAGTCCTGGATGGATTATATAGAACAGGCAGAAATAGAGCATGAAAAGTTTCATACAGATGAAAAGACATTGCAAGAGAAGTTTGGATTACCTAAGGTAGTAGCTAATGAAATTTTGCAGAAATGTACAATCTGCAGAATGACAGGAATAGGAAGTGGAAACAGAGGAGGGAAATTAAAGATGGGACCTGGAGTATGGCAGGTAGACTGTACTCATCTTGAAGGACAAATAATATTAGTAGCCATTAATGTGGAATCAGGATTACTATGGACAAAATTATTAAAACAAGAGACAGCTAAAGAAACAGTATTAGCTGTATTAGAATTAGTACAGACACATAACGTTGTGGAAATACAAACAGATAATGGACCCAATTTTGCAAATTCAAGGATGGAAGGGTTAACAGCATTTTTAGGAATATATCATAAATATGGAATTCCATTGAATCCACAAAGTCAAGCATTAGTAGAAAATGTTAATAGCACTTTAAAAAGTTGGATAAAGAAGTTTAGACCAGAGGTAGAAACTTTACAGGCAGCAGTAGCATTAGCTACATTTGCTCTAAATAAAAAAAGAAAGGGTAATATAGGGGGTATGTCTCCCTATGAACTATATATATGGCAGGAAAACAACTTAATACAACAATACTACTCCAATATCATATTTAAAAAATTTGGCACGAAACAATGGATATATTATAAGGACATTAAAGATAAGGTGTGGAAGGGCCCAGTAGAAGTTCTCTATTGGGGCGAAGGCTCAGTTTTGATAAAAGATCCTGAAAGAGGACTTTTCTTAGTCCCTAATAGGAGGATTCGAAGAGTACCTCCCCCTCAAGAATTAGAGGTAAGTGATGCAACCGTACAGAGTACAGAGTAGTAAAAGAAATATGAGATACCTTAAAGAAAATAATTGCTCAGAAGATCAAATTCAACACTTTAAGAATAAATTAGCTTTGCAGGAGTTAAAATGGATTAGAAAGTTGCGATGGGTAGAAGGTATTTTGTGGTCATTCCATACTAGAGAATGGCACTGTGATATGGTCAAAGAATTGGTAGCAGGGACAGGACCTTTAAAATTATATTGTTATGTATCACATCCCATATGGAAAAGATACAGACCTACCTTCCAATGGAATCAACAATGGCCTTATGGTAATTTATGGTTGACAGAAAAGTATATGTGGGAAGT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| 53,625
|
MN531112.1
|
Puma lentivirus
|
Malmberg,J.L., Lee,J.S., Gagne,R.B., Kraberger,S., Kechejian,S., Roelke,M., McBride,R., Onorato,D., Cunningham,M., Crooks,K.R., VandeWoude,S., Malmberg,J.
|
University of Wyoming, Wyoming State Veterinary Laboratory, Veterinary Science
|
USA
|
2020-03-07
|
P1033
|
Puma lentivirus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,108
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Puma concolor
| null |
2011
| null | null |
Puma lentivirus isolate P1033, complete genome
|
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| 53,626
|
NC_012671.1
|
Quang Binh virus
|
Blitvich,B.J., Firth,A.E., Wills,N.M., Miller,C.L., Atkins,J.F., Crabtree,M.B., Nga,P.T., Miller,B.R.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2009-05-11
|
VN180
|
Quang Binh virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,865
|
RefSeq
| 3
|
Viet Nam
|
Viet Nam
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2002-08
| null |
PRJNA485481
|
Quang Binh virus, complete genome
|
TAGTTTTTAAAAACTTCAGCTTGGTTAAGTCACTGGTTGATTAAGCCTATCTATTACAGCTAAAGTTGTTTATAATTTGCTACTTTATTACCTCTGGTACTAACGTGGCGCTATGAAGAAGAAGGAGTCTGGAGTGGTGGAGAGAGGACGTGGAACGCGTCCTCCTGCCAATCGTGGAGGAGGAGCTCCTCCGAAGAAGGAGAGAGATCGAGGAGGCCAAAAGGTCTCGCTCCCTGGGACTTCAAGCTCCATCGGATCGGACCGTGGCAAACGGGTCAAGGGACTCGGCGGACGAAAGGGACTGCTCGGCAAGCTGGGGCTGGGATGGGGGTCTTTTTTACAGAAAGACATCATCCAAGCCATCATGCACCTGGTCCTAGTCCTACACGCCCTGTTCATGTCCATTGACCAACGCTTTAAGGCGCTCACCCGGCGGGTGCGCGCCCTCGAGAATCGACGATCTGCCAATCCCCTACTGCTCGCCACTATCATCTGCGCGGTCGCCACCTTGTGTGGCACCATGGTGATCGACATGCAAGTGTCCTCCGCTAAAGGCGTGCAAATTTACGAAGGGAAAACAAACCGGACTGACTACTTGCACTTGTTCAAGCTTCCAAAAGATGGATGTTGGAACGGAGTGCTGGTTTCCAAACACTGTCCTAAGGTCGGCGACTTGGCCAAGGACTTGGAGGCCACTGACTGCGGATCTACATGGAGCGAATTCACACTGCGATATAATCGATGTGTGGGAAAGAAGCGCGTCAAGCGGGCTACCGAACAACCGAAAGCGGACCTACTTGCGGAGATGGAGATGGTAACGTTCAAGACCATCCGTCAAAACAAGACGATTTTCATTATCGCTCTGCTCTGTGTTGCCGTTGCAAAGAGATGGCCTACTTGGGTCGTCATTGTTCTTGCAATTGGCACATGGTCTACCGTCAAAGGAGAATTTGTGGAACCATTGTACACGCTGAAAGCGGAGCGAATGACCATGATGCAAACGATCGTTCGTCCGGAAGAGGGGTACGTTATCGCTACCCCAAACGGACTTGTTGAACTGCGGACTAGTGCTGCCACCATCTTGGGAGGCCAATGGCTTCGTGAGCTTCTAGTTGACTGCCAGGTCAATGCCACCTACTCAACGGATGTGTGTCCTGGAGGTTCTCAGCTTAATATGGCAGAGATATCATCCAAGGAGCGGGTTTGCACTACGCAACCGTACAACCGCGGGTGGGGGACCGGATGCTTCAAGTGGGGAATTGGTTTTGTTGGTACATGCGTTGAACTCCATTGTGAAGAAGGGTACAACGTGTCGTCCATTGCACGATCCGCCATCATCATGAACATCACGGCGAGTTTCCACTCTGTCAGTGACACCCAGCAGTTGCTAGGTGACATACCAGTCACCTTCCGATTTGCTAAGCTCGGAAACGCGGCTATGACTTGTCGCTTGGAATCAGAGCAACTCCTGCTTGATTATTACCACGTTACCGGCAACAAACGCGAAGGACTATTCCTGCGGTCCCAGGTGGACAATTGGCCTGGAGTCATATCGTCTTCTGGGGGACGAGCTGGATTAGAGAAGGTCGTTGTTTGGGGAGACACGAAAGCCAATGAGATATTGGTTAAACACGTCATGGAACCCCAGCTTGAGTGGGATAATGCCATTCCTACACATGCGGGCTTCCGTGACGTTGCTTTCGTGTGTCAAATAATGCTGGATAAACTGGTCAGCGGAGCGTTCCGCGATTGCCAAGGATTAAAATCATCGGTGTTTGTTCAGAGTGGCTTTGGATACAGTGGGGTTGTTATCACCACGCTGTTGCAACCAACGAACGAGAGCTGCTCACTCAACATGGTGTGTCATGGATGTCAGTTGCTATCGACGAAAATGGTGTTTGGGGCTGGAAAACCAACGTCCCGTGCCTTCGTCGGCTGTGGGAACCACACTGGTTCACTCTTGATTGGCGGTGCATCTGTCCCCATTGAATGTGTGATGAACCCCATCTCTCAAGGATGGAGGCTAACCCGACACGTTGTGGACAAGTACCGACGATTCGGAGTACCAGGAGTTGCAGGAGTTTGGCGCGATTTCGTTGGAGGCTTCTCCCTCGGGAACCTGATAACCAACTCGACGTTGCTCGTCCTCCTAGCAGCGCTGGCATTCCTCGACAAGCGTGTTGTGGTGCTCCTGCTAGTCTGTGGATACTTCTACTACACACGTGCTGATGTGGGTTGTGGATTTGATCCCGACAGGAAGATCATGTCGTGCGGTACTGGTGGCTTCGTGTGGAAGAGCATTTCCCAATGGCCTGTGAACGATCACTCTGTCCAGCTTGAAGACGACGCTGTTGTGGTGTCACTTGTAACGGAACAACTGAAGACCACAAACAAGGTTTGCCTTATGTGTGAGGATGTCCTACAATGTGCGGCTGCCCGAAGTGTTGTCAAGAGAATCACTCACGTCAACAACGAGCTTGTCTATGCGAACACAACCCTGTCTTACGGGAGGGTTTTTCCTCGAGTGAAGAAAAGTGTCCATGGTGTGAAGATTGGGGACATAACGATGCAGCTCGCCTTGGCTACCCTTGACGGCACGCTGGACGACGCCGAATTGGGACACCTGACAAGTGGATTCTTTTCACGAGGAAAACAAAACGAGACTGTTGACCACAAGGTTGTCCGCGTCATCACGAGTGGCAGTGAGTATAAGAAGGTTTGTTCTCAGGCATTCGCATTGCAGTATGGCTTTGTGCGATTTTCGCGCAAGGTGTACGGATCAAACGTGGTCGTGAAACCGGTTGAGAAACCGAGTGAAGCGTGCCCGACGTACCTGGCCGGTTCATATGTTAAGAACGATGTCGGAGGGTACACTGATGGCATGATGTGGATGCGTAGCCGTAAGGTGAATGGCTCATGGGAGATGTTCGAGCTTGAGACGACCCAAAGCCACCAATGCATTTGGCCACAGGAGTACACATTTGATCTCACGACTCACAACGATAGTACATTGTTTATGCCAGCCCATTACGGAGCGCCGATGTCCAAAGCCAACCACATCCCTGGGTACGGAACTCAACACGAGTTCCCGTGGTACAAGGCCGAGATAAAATTGCGGCAGGGACCAGTTCCTGGAACTGAAGTGGAGTCCATGGACTCGTGCGATGGTAGTGGATCAGCGGTCAAAGTGGACCCTGCCATTGCAAAGAAGTGGTGCTGCAAAGGATGTTTGGCCAATGATCGCAAGCCCATTCACTTCATCGTGGATGGTGACTTCTTTTACCCAATGGAAATACGACCAATGACTGCGCATTCAAAGCTCATCATCGAGAACGAGGGTGTTGAAATAGACGAGATGGATCAGATGTTCCCAAAAACCGTCTCTCCAATCCCTGGAGCTGAAGCTTTGCTTCAGGATTTCCGGGACAGCCTGCCAGTAGATGGATCTTCTCCTTTACTGGTGGGCGTGCTTCTACACCTGCTAACAATTCGGACTCGACACCGATGGGGCCAACGCACAATCGGTACCTGGCTGCTATTCGTAGTTTTTGGTATACCTGCTGGAAGCTGGGTCGGTTGGTCGTGGATGGGCTTGTCTTACTCGCTCGCCGCTGTGCCCAATGGAAGCGCACTTCTTGTGCATTTTTGGCTTGCTTTGCAGTTCTCAACATCACATTTGTTTTTCCTAGGTTGGTTGTTGCGCAAACGCGTCGAGTCATCTATCGAATACGCATTAACCGTGTTCGCCGCCGAATGGGTAATTTTGAAATTACAAATGTTGATCAAACAAGCATCCCACCTCGAGCACGTCCTGTTCCCTCTGTACGTGAAGTTGGCACTCAGTATGAGATCCCAGTTTGCCCCTGTGGACAGCATGATTGCCCTGAATTACGTGGTGACGCACCCGTTGATGGCGGCCCTGGTGAGCCTCGGTGTTGCCCTGGTGATCTTTGTTACACACGTCTGCGCGAATTGGAGGCGGTCTCCAAACTTGTGGAAGAGTGGACTTCGGGCTTCGAAGCGATCAGCTCTATTGGGCGTGTACTTTGTAGTGTTGTACGTGGTTTCAGTCTTACTGCGATTCACGGGTCTGGAGAGCTCTGCCGTCGCTGTGTTCCTGGGGGGTCTGCTGATCGGACTAGTGACCAGGCTGGTTCCTCCGACGAAATATGTACTTGTCCCGGTGCCGGGTACGAGCGTGCCGAGCAACTGCGAAGAATCATTCACAAGACTACCGCCAGGATTAGAAGGTGTCTACGGACCCAGTGGAGTGGAATTCCTGAACTACACTGATGTGGGATTGGTTTCCGTTGCAATCCTGATGTTCACGGGCTGCCTCGGTGTGACGCTCATGAACCCATTGTTGGGTATCACGTCCATGCTCTTCTGCTGGTTTACTGAAGCATACGTGTGGTTGCCGAGGTTGATCTTCGGCACGAGCAATCGCCGCTCTGGGGTGAACGACGTTCTGCTAGCCCCTCCTGTCTACGCGGACGAGATTGATGTTGAAAGCGACTTTGGACACATACCGGATGGAACTTACAGGATAGTGGCCCATTGCACCTTTTTCAAGTATCACACAGGAGCCGGCTATGCCAAAGGTGGTGTTTTCCACACACTATGGCATGTCACATCAGGAGCTTGTGTCTACTGGGAGGGCAGAGCGGTTCGTATGCACTCGGCTGACATCTACCGCGACATGGCGTCGTATGGTGGCCCATGGAACATCACCGAGTCAAACGAGGCATCTGTTATTGTCCGCGTGGTCGAAAGCGACAACAGCGTATCCTGCGTGCGGTGTTCCACGGCCCAACTAAAAATCAATGGTGAAACTGTGTCGGTGATTGGAAAGGACTTTGGACGCGGCTCATCTGGATCCCCCATCCATTCTTTGGATGGCAGGGTTGTCGGCTTGTATGGCTATGGCTTCCACATTGGATGGGAATACTTTTCTATCATCACAAGTGGAGAAGTTGCCATGGCCGCAGAAATAGCCGAGG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| 7,690
|
OQ139646.1
|
Quang Binh virus
|
Tang,X., Li,R., Qi,Y., Li,W., Liu,Z., Wu,J., Tang,X.M., Li,R.T., Li,W.Y., Wu,J.H.
|
Guizhou Medical University, Key Laboratory of Modern Pathogen Biology and Characteristics, Basic Medical College
|
China
|
2023-10-29
|
GZ21m081
|
Quang Binh virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,831
|
GenBank
| 1
|
China: Guizhou
|
China
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2021-07-10
| null | null |
Quang Binh virus isolate GZ21m081, complete genome
|
CATCTAGCGACCTCCACTGGTTGATTAAGCCTATATATTACAGCTAAAGTTGTTTATAATTTTGCTACTTTATTACCTCTGGTATTAACGTAGCGCTATGAAGAAGAAGGAGTCTGGAGTGGTAGAGAGAGGGCGCAAAGAGCGTCCCCCTGCCAATCGCGGAGGAAGAGCTCCTCCGAAGAAGGAGAGAGATCGAGGAGGCCAAATGGTCTCGCTTCGTGGGACTTCAGGTTCCATCGGATCGGGCCGTGGTAAGCAAGTCAAAGGACCTGGCGGACGGAATGGACTGCTAGGTAAGTTGGGGCTAGGATGGGGGTCTTTCCTACAGAAAGATATCATCCAAGCCATCATGCACCTGGTCCTAGTCCTCCATGCCCTGTTCATGTCCATTGACCAACGCTTCAAGGCACTCACCCGTCGTGTGCGCGCCCTTGAGAATCGACGATCTGCCAATCCCTTACTGCTCGCCACTATCATCTGCGCGGCTGCCACTCTGTGTGGCACTATGGTGATCGACATGCAAGTGTCCTCGGCCAAAGGCGTGCAAATCTACGAGGGAAAAACAAATCGAACTGACTACCTGCACTTGTTCAAACTCCCCAAGGATGGATGTTGGAATGGAGTGCTGGTTTCTAAACACTGCCCCAAGGTTGGCGATCTTGCCAAGGACTTGGAGGCTACTGATTGCGGATCAACATGGAGTGAGTTCACGCTACGATACAATCGATGTGTGGGAAAGAAGCGAGTCAAGCGGGCAGCCGAACAACCAAAAACGGACCTGCTTGCAGAAATGGAAATGGTAACGTTCAAGACTATTCGCCAGAACAAGACGATTTTCATTATCGCTCTGCTTTGTGTTGCCGTTGCGAAGAGGTGGCCCACCTGGGTTGTCATTGTTCTTGCGATTGGCACATGGTCCACCGTCAAAGGAGAATTCGTGGAACCATTGTACACGCTGAAGGCGGAGCAGATGACCATGATGCAAACGATCGTTCGTCCGGAAGAGGGGTATGTTATTGCCACCCCGAACGGGCTTGTCGAACTGCGGACTAGTGCTGCCATTATCTTGGGAGGTCAATGGCTTCGCGAGCTTCTGGTTGACTGTCAGGTCAATGCCACCTACTCTACGGATGTGTGCCCCGGAGGTTCTCAGCTCAACATGGCAGAGATATCATCTAGGGAACGGGTTTGCACTACGCAACCATACAACCGTGGATGGGGAACTGGATGCTTTAAGTGGGGAATTGGCTTCGTTGGCACATGCGTTGAACTCCATTGTGAAGAAGGGTATAACGTATCGTCCATTGCGCGGTCCGCCATCGTCATGAACATCACAGCTAGTTTTCACTCTGTTAGTGATACCCAACAACTGCTAGGTGACATACCGGTCACTTTCCGGTTTGCTAAGCTTGGAAACGCGGCCATGACCTGCCGCTTGGAATCGGAGCAGCTTCTGCTTGATTACTACCATGTTACCGGCAACAAACGCGAAGGACTGTTCCTGCGGTCCCAGGTGGACAATTGGCCTGGAGTCATTTCGTCCTCTGGGGGACGAGCTGGATTAGAGAAAGTCGTCGTTTGGGGAGACACGAAAGCCAATGAGATATTGGTTAAACACGTCATGGAACCCCAGCTTGAGTGGGATAATGCTATCCCCACACATGCGGGTTTCCGTGACGTTGCTTTCGTGTGTCAAATAATGCTGGACAAACTGGTCAGCGGAGCGTTCCGTGATTGCCAAGGGCTGAAATCATCGGTGTTCGTGCAGAGTGGTTTTGGATACAGCGGAGTCGTTGTCACCACGCTGTTGCAACCAACAAACGAGAGCTGCTCACTCAACATGGTATGTCATGGATGTCAGTTGCTAGCGACGAAGATGGTGTTCGGTGCTGGAAAATCAACGTCCCGAGCCTTTGTCGGTTGTGGAAACCACACTGGCTCACTCGTTATCGGAGGAGCAGCCGTTCCCATTGAATGTGTGATGAATCCCATCTCCCAAGGGTGGAGGCTAACCCGGCATGTTGTGGACAAGTACCGACGATTCGGAGTACCAGGAGTTGCGGGGGTGTGGCACGATTTCGTGGGAGGTTTCTCCCTCGGGAATCTGATAACCAACTCGACATTGCTGGTTCTCCTAGCAGCGTTGGCATTCCTCGACAAACGTGTCGTGGTGTTGCTGCTGGTTTGTGGATATTTTTACTACACTCGGGCTGATGTGGGTTGTGGATTTGATCCCGACAGGAAGATCATGTCGTGCGGCACTGGCGGCTTTGTGTGGAAGAGTATCTCACAATGGCCTGTGAACGACCACTCTGTTCAGCTTGAAGACGATGCTGTTGTGGTGTCACTTGTGACTGAGCAACTAAAAACCACAAATAAGGTATGCCTCATGTGTGAGGATGTCCTCCAATGTGCGGCTGCCCGAAGCGTGGTCAAGAGAATCACTCACGTCAACAACGAGCTCGTCTATGCGAACACGACCTTATCGTACGGAAAGGTGTTTCCTCGCGTGAAGAAAAGTGTTCATGGTGTGAAGATTGGTGACATAACAATGCAACTCGCTCTGGCGACCCTTGATGGCAAGCTAGACGACACGGAGTTAGGGCATCTCACAAGTGGATTCTTCTCACGTGGAACGCAAAACGAGACTGTTGACCACAAGGTTGTCCGAGTTGTCACAAGCGGCAGCGAGTACAAGAAAGTGTGCTCTCAAGCGTTCGCGTTGCAGTATGGTTTTGTGCGATTTTCACGCAAAGTGTATGGATCAAACGTGGTTGTGAAGCCGGTTGAGAAACCGAGTGAGGCGTGCCCGACGTACCTGGCTGGTTCATACGTGAAAAACGATGTTGGAGGGTACACTGACGGCATGATGTGGATGCGTAGCCGCAAGGTGAATGGCTCATGGGAACTATTCGAACTGGAGACGACCCAAAGCCACCAGTGCATTTGGCCACAGGAATACACATTTGATCTCACGACTCACAACGACAGCACGCTGTTCATGCCAGCTCATTACGGAGCGCCGATGTCCAAGGCCAACCACATTCCTGGATACGGGACCCAACACGAATTCCCGTGGTACAAGGCGGAAATAAAGCTGCGGCAAGGACCCGTTCCCGGAACAGAAGTGGAGTCCATGGATTCGTGCGATGATAGTGGATCGGCGGTCAAAGTGGATCCTGCCATTGCAAAAAAGTGGTGCTGCAAAGGATGTTTGGCCAATGAGCGGAAGCCAATCCACTTTATCGTGGATGGTGACTTCTTTTATCCAATGGAAATACGACCAATGACTGCCCACTCAAAACTCATCATCGAGAACGAGGGCGTTGAGATAAATGAGATGGATCAGATGTTCCCGAAGACCGTTTCTCCAATCCCTGGAGCTGAAGCTTTGCTTCAGGATTTCCGGGACAGCCTGCCAGTAGATGGATCTTCTCCTTTACTGGTGGGCGTGCTTCTACACCTGCTAACAATTCGGACTCGACACCGCTGGGGTCAACGCACAATCGGTACCTGGCTGCTATTCGTAGTTTTTGGCATACCTGTTGGAGGTTGGCTCGGTTGGTCGTGGATGGGCTTGTCTTACTCGCTCGCCGCTGTGCCCAATGGAAGCGCGCTTCTTATACATTTCTGGCTTGCTTTGCAGTTCTCAACATCACATTTGTTTTTCCTAGGGTGGTTGTTACGCAAGCGCGTCGAATCATCTATCGAATACGCGTTAACCGTGTTCGCCGTCGAATGGGTAATCTTGAAATTACAAATGTTGATCAAACAAGCATCCCACCTCGAGCACGTCCTGTTCCCTCTGTACGTGAAGTTGGCACTCAGTGTGAGATCCCAGTTTGCTCCTGTGGACAGCATGATTGCCCTGAATTACGTGGTGACGCACCCGTTGATGGCATGTCTGGTGAGCCTCGGTGTTGCCCTGGTGATCTTTGTTACACACGTCTGCGTGAATTGGAGGCGGTCTCCAAACTTGTGGAAGAGTGGACTTCGGGCTTCGAAGCAATCAGTGCTATTGGGCGTGTACTTTGTAGTGTTGTACGTGGTTTCAGTCTTACTGCGATTCACGGGTCTGGAGAGCTCTGCCGTCGCTGTGTTCCTGGGTGGTCTGCTGATCGGACTAGTGACCAGGCTGGTACCTCCGACGAAATATGTACTTGTCCCGGTGCCGGGTACGAGCGTGCCGAGCAACTGCGAAGAATCATTCACAAAACTACCGCCAGGATTAGAAGGTGTCTACGGACCCAATGGAGTGGAATTCCTGAACTACACTGATGTGGGATTGGTTTCCTTTGCAGTCTTGATGTTTTCAGGTGGTCTCGGCCTAACGTTGATGAATCCATGGTTGGGAATCACGTCCATGCTCTTTTGCTGGTTCACTGAAGCCTACGTGTGGTTGCCAAGGTTGATCTTCGGTACAAGCAATCGCCGCTCTGGAGTTAACGATGTCCTGCTGGCACCTCCTGTTTATGCGGATGAGATTGACATTGAAAGTGACTTTGGACACATCCCGGATGGAACCTACAGAGTAGTGGCCCACTGCACGTTCTTCAAGTATCACACAGGAGCTGGATATGCCAGAGGTGGTGTTTTTCACACACTATGGCACGTCACATCAGGAGCCTGTGTATACTGGGAGGGCAGAGCGGTCCGAATGCATTCGGCTGACATCTACCGCGACATGGCATCGTATGGTGGCCCATGGAACATCACCGAGTCGAACGAAGCCTCTGTCATCGTCCGTGTGGTCGAGAGCGACAACAGCGTGTCCTGTGTGCGATGTTCCACAGCCCAACTAAAGATCAACGGCGAAACCGTGTCGGTGATTGGAAAGGACTTTGGGCGCGGCTCATCTGGATCTCCCATCCACTCGTTGGATGGTAGAGTTGTCGGCCTGTATGGTTACGGTTTCCACATCGGATGGGAGTATTTCTCCATCATCACGAGCGGAGAAGTCGCCATGGCCGCAGAGGTAGCCGAGGAAGCCGGATCAACAC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ATAGCGTGCGGCAGTCTGATTGGCGAACGTGACAGAGCCTCATGGTCCAAGAACATTGTGGCTACTGTTGAAACAGCTCGGAAGATCATTGAGCAGGAGAATGGGAGCCAGAAATTTCCTGACGGACTACAAATCCTCGGGAGATACAAGAACCACCAGGACCCCGTGTTCGGGTAACCTAGCTGTCGAACCATGCTAGGTAGGAGGTAGAGCCGAAAACTCTACCATTTTAGCGCAAGGAAGGGAAGCTTGAGGCTACCTTAGGTGGTGACGACACCTCGCCCCCAGTCTCCCAGGTTGGGGATCATACAACCTCGTGGGCTACCGCCCCCGCAAGGAGGGACGTGCCTTTCACGTCTCTGGGAGTTGACGACTCTCCGGCCCCAGTTCCTAGGTCCAGGAAGGATCCCGTGGCGCTGAAAGGGCGCTAAACAAGCTTGGTATCTTGGTAACTACCACTGGATGTTTTCCAGCCCGCGCAAGGAAGGACACGTGAATGACGTTTCCTTGGGAGTTGACGACTCTCCGCCCCCAGTCCCCAGGTCAGGGCATGACCCCGTGGTGTTGAAAGGACACTAAACAAGCTTGGCATCTTGGCAACTGCCACCGCAAGGGAGAGGGATCCCCTCTCGGGTGTAGACGACACCCCGGCCCCAGTCCCCTAGGTCATGGGAAAAACTGACCCCGAAGTGCTGCAAGGGCACTAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATCGAGTATCCGGGTGAGTGACGCCACCCCCCGAAATGTGTATTGTGACAGGCATGCTCACAGCAGCAAATCTCCACCGTTGGTGGAGGTCGCTAGATG
| 11,444
|
OQ139647.1
|
Quang Binh virus
|
Tang,X., Li,R., Qi,Y., Li,W., Liu,Z., Wu,J., Tang,X.M., Li,R.T., Li,W.Y., Wu,J.H.
|
Guizhou Medical University, Key Laboratory of Modern Pathogen Biology and Characteristics, Basic Medical College
|
China
|
2023-10-29
|
GZ21m120
|
Quang Binh virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,787
|
GenBank
| 1
|
China: Guizhou
|
China
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2021-08-04
| null | null |
Quang Binh virus isolate GZ21m120, complete genome
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CATCTAGCGACCTCCACTGGTTGATTAAGCCTATATATTACAGCTAAAGTTGTTTATAATTTTGCTACTTTATTACCTCTGGTATTAACGTAGCGCTATGAAGAAGAAGGAGTCTGGAGTGGTAGAGAGAGGGCGCAAAGAGCGTCCCCCTGCCAATCGCGGAGGAAGAGCTCCTCCGAAGAAGGAGAGAGATCGAGGAGGCCAAATGGTCTCGCTTCGTGGGACTTCAGGTTCCATCGGATCGGGCCGTGGTAAGCAAGTCAAAGGACCCGGCGGACGGAATGGACTGCTAGGTAAGTTGGGGCTAGGATGGGGGTCTTTTCTACAGAAAGACATCATCCAAGCCATCATGCACCTGGTTCTAGTCCTCCATGCCCTGTTCATGTCCATTGACCAACGCTTTAAGGCGCTCACCCGTCGTGTGCGCGCCCTTGAGAATCGACGATCTGCCAATCCCTTACTGCTCGCCACTATCATCTGCGCTGCTGCCACTCTGTGTGGCACTATGGTGATCGACATGCAAGTGTCCTCGGCCAAAGGCGTGCAAATCTACGAGGGGAAAACAAATCGAACTGACTACCTGCACTTGTTCAAACTCCCCAAGGATGGATGTTGGAATGGAGTGCTGGTTTCTAAACACTGCCCCAAGGTTGGCGATCTTGCCAAGGACTTGGAGGCTACTGATTGCGGATCAACATGGAGTGAGTTCACGCTACGATACAATCGATGTGTGGGAAAGAAGCGAGTCAAGCGGGCAGCCGAACAACCAAAAACGGACCTGCTTGCGGAAATGGAAATGGTAACGTTCAAGACTATTCGCCAGAACAAGACGATTTTCATTATCGCTCTGCTTTGTGTTGCCGTTGCGAAGAGGTGGCCCACCTGGGTTGTCATTGTTCTTGCGATTGGCACATGGTCCACCGTCAAAGGAGAATTCGTGGAACCATTGTACACGCTGAAGGCGGAGCAGATGACCATGATGCAAACGATCGTTCGTCCGGAAGAGGGGTATGTTATTGCCACCCCGAACGGACTTGTCGAACTGCGGACTAGTGCTGCCATTATCTTGGGAGGTCAATGGCTTCGCGAGCTTCTGGTTGACTGTCAGGTCAATGCCACCTACTCTACGGATGTGTGCCCTGGAGGTTCTCAGCTCAACATGGCAGAGATATCATCTAGGGAGCGGGTTTGCACTACGCAACCATACAACCGTGGATGGGGAACCGGATGCTTTAAGTGGGGAATTGGTTTCGTTGGCACATGCGTTGAACTCCATTGTGAAGAAGGGTATAACGTATCGTCCATCGCGCGGTCCGCCATCGTCATGAACATCACAGCTAGTTTTCACTCTGTTAGTGATACCCAACAACTGCTAGGTGACATACCGGTCACTTTCCGGTTTGCTAAGCTTGGAAACGCGGCCATGACCTGCCGCTTGGAATCGGAGCAGCTTCTGCTTGATTACTACCATGTTACCGGCAACAAACGCGAAGGACTGTTCCTGCGGTCCCAGGTGGACAATTGGCCTGGAGTCATTTCGTCCTCTGGGGGACGAGCTGGATTAGAGAAAGTCGTCGTTTGGGGAGACACGAAAGCCAATGAGATATTGGTTAAACACGTTATGGAACCCCAGCTTGAGTGGGATAATGCTATCCCTACACATGCGGGCTTCCGTGACGTCGCTTTCGTGTGTCAAATAATGCTGGACAAACTGGTCAGCGGAGCGTTCCGTGATTGCCAAGGGCTGAAATCATCGGTGTTCGTGCAGAGTGGTTTTGGATACAGCGGAGTTGTTGTCACCACGCTGTTGCAACCAACAAACGAGAGCTGCTCACTCAACATGGTATGTCATGGATGTCAGTTGCTAGCGACGAAGATGGTGTTCGGTGCTGGAAAATCAACGTCCCGAGCCTTTGTCGGTTGTGGAAACCACACTGGCTCACTCGTTATCGGAGGAGCAGCCGTTCCCATTGAATGTGTGATGAATCCCATCTCCCAAGGGTGGAGGCTAACCCGGCATGTTGTGGACAAGTACCGGCGATTCGGAGTACCAGGAGTTGCGGGGGTGTGGCACGATTTCGTGGGAGGTTTCTCCCTCGGGAATCTGATAACCAACTCGACATTGCTGGTTCTCTTAGCAGCGTTGGCATTCCTCGACAAACGTGTCGTGGTGCTGCTGCTGGTTTGTGGATATTTTTACTACACTCGGGCTGATGTGGGCTGTGGATTTGATCCTGACAGGAAGATCATGTCGTGCGGCACTGGTGGCTTTGTGTGGAAGAGTATCTCACAATGGCCTGTGAACGACCACTCTGTTCAGCTTGAAGACGATGCTGTTGTGGTGTCACTTGTGACTGAGCAACTAAAAACCACAAATAAGGTTTGCCTCATGTGTGAGGATGTCCTCCAATGTGCGGCTGCCCGAAGCGTGGTCAAGAGAATTACTCACGTCAACAACGAGCTCGTCTATGCGAACACAACCTTATCGTACGGAAAGGTGTTTCCTCGCGTGAAGAAAAGTGTTCATGGTGTGAAGATTGGTGACATAACAATGCAACTCGCTCTGGCGACCCTTGATGGCAAGCTAGACGACACGGAGCTAGGGCATCTCACAAGTGGATTCTTCTCACGTGGAACGCAAAACGAGACTGTTGACCACAAGGTTGTCCGAGTTGTCACAAGCGGCAGCGAGTACAAGAAAGTGTGCTCTCAAGCGTTCGCGTTGCAGTATGGTTTTGTGCGATTTTCACGCAAAGTGTATGGATCAAACGTGGTCGTGAAGCCGGTTGAGAAACCGAGTGAGGCGTGCCCGACGTACCTGGCTGGTTCATACGTGAAAAACGATGTTGGAGGGTACACTGACGGCATGATGTGGATGCGTAGCCGCAAGGTGAATGGCTCATGGGAACTATTCGAACTGGAGACGACCCAAAGCCACCAGTGCATTTGGCCACAGGAATACACATTTGATCTCACGACTCACAACGACAGCACGCTGTTTATGCCAGCTCATTACGGAGCGCCGATGTCCAAGGCCAACCACATTCCTGGATACGGGACCCAACACGAATTCCCGTGGTACAAGGCGGAAATAAAGCTGCGGCAAGGACCCGTTCCCGGAACAGAAGTGGAGTCCATGGATTCGTGCGATGATAGTGGATCAGCGGTCAAAGTGGATCCTGCCATTGCGAAAAAGTGGTGCTGCAAAGGATGTTTGGCCAATGAGCGGAAGCCAATCCACTTTATCGTGGATGGTGACTTCTTTTATCCAATGGAAATACGACCAATGACTGCCCACTCAAAACTCATCATCGAGAACGAGGGCGTTGAGATAAACGAGATGGATCAGATGTTCCCGAAGACCGTTTCTCCAATCCCTGGAGCTGAAGCTTTGATTCAGGATTTCCGGGACAGCCTGCCAGTAGATGGATCTTCTCCTTTACTGGTGGGCGTGCTTCTACACCTGCTAACAGTTCGGACTCGACACCGCTGGGGTCAACGCACAATCGGTACCTGGCTGCTATTCGTAGTTTTTGGCATACCTGTTGGAGGTTGGCTCGGTTGGTCGTGGATGGGCTTGTCTTACTCGCTCGCCGCTGTGCCCAATGGAAGCGCACTTCTTATACATTTCTGGCTTGCTTTGCAGTTCTCAACATCACATTTGTTTTTCCTAGGGTGGTTGTTACGCAAGCGCGTCGAATCATCTATCGAATACGCGTTAACCGTGTTCGCCGTCGAATGGGTAATCTTGAAATTACAAATGTTGATTAAACAAGCATCCCACCTCGAGCACGTCCTGTTCCCTCTGTACGTGAAGTTGGCACTCAGTGTGAGATCCCAGTTTGCTCCTGTGGACAGCATGATTGCCCTGAATTACGTGGTGACGCACCCGTTGATGGCATGCCTGGTGAGCCTCGGTGTTGCCCTGGTGATCTTTGTTACACACGTCTGCGTGAATTGGAGGCGGTCTCCAAACTTGTGGAAGAGTGGACTTCGGGCTTCGAAGCAATCAGTGCTATTGGGCGTGTACTTTGTAGTGTTGTACGTGGTTTCAGTCTTACTGCGATTCACGGGTCTGGAGAGCTCTGCCGTCGCTGTGTTCCTGGGTGGTCTGCTGATCGGGCTAGTGACCAGGCTGGTACCTCCGACGAAATATGTACTTGTCCCGGTGCCGGGTACGAACGTGCCGAGCAACTGCGAAGAATCATTCACAAAACTACCGCCAGGATTAGAAGGTGTCTACGGACCCAATGGAGTGGAATTCCTGAACTACACTGATGTGGGGCTGGTCTCCTTTGCAGTCTTGATGTTTTCAGGTGGTCTCGGCCTAACGTTGATGAATCCATGGTTGGGAATCACGTCCATGCTCTTTTGCTGGTTCACTGAAGCCTACGTGTGGTTGCCAAGGTTGATCTTCGGTACAAGCAATCGCCGCTCTGGAGTTAACGATGTCCTGCTGGCACCTCCTGTTTATGCGGATGAGATTGACATTGAAAGTGACTTTGGACACATCCCGGACGGAACCTACAGAGTGGTGGCTCACTGCACGTTCTTCAAGTATCACACAGGAGCTGGGTATGCCAGAGGTGGTGTCTTTCACACACTATGGCACGTCACATCAGGAGCCTGTGTTTACTGGGAGGGCAGAGCGGTTCGAATGCATTCGGCTGACATCTACCGCGACATGGCATCGTATGGTGGCCCATGGAACATCACCGAGTCGAACGAAGCCTCTGTCATCGTCCGTGTGGTCGAGAGCGACAACAGCGTGTCCTGTGTGCGATGTTCCACAGCCCAACTAAAGATCAACGGCGAAACCGTGTCGGTGATTGGAAAGGACTTTGGGCGCGGCTCATCTGGATCTCCCATTCACTCGTTGGATGGTAGAGTTGTCGGCCTGTATGGTTACGGTTTCCACATCGGATGGGAGTATTTCTCCATCATCACGAGCGGAGAAGTCGCCATGGCCGCAGAGGTAGCCGAGGAAGCCGGATCAACAC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ATAGCGTGCGGCAGTCTGATTGGCGAACGTGACAGAGCCTCATGGTCCAAGAACATTGTGGCTACTGTTGAAACAGCTCGGAAGATCATTGAGCAGGAGAATGGGAGCCAGAAATTTCCTGACGGACTACAAATCCTCGGGAGATACAAGAACCACCAGGACCCCGTGTTCGGGTAACCTAGCTGTCGAACCATGCTAGGTAGGAGGTAGAGCCGAAAACTCTACCATTTTAGCGCAAGGAAGGGAAGCTTGAGGCTACCTTAGGTGGTGACGACACCTCGCCCCCAGTCTCCCAGGTTGGGGATCATACAACCTCGTGGGCTACCGCCCCCGCAAGGAGGGACGTGCCTTTCACGTCTCTGGGAGTTGACGACTCTCCGGCCCCAGTTCCTAGGTCCAGGAAGGATCCCGTGGCGCTGAAAGGGCGCTAAACAAGCTTGGTATCTTGGTAACTACCACTGGATGTTTTCCAGCCCGCGCAAGGAAGGACACGTGAATGACGTTTCCTTGGGAGTTGACGACTCTCCGCCCCCAGTCCCCAGGTCAGGGCATGACCCCGTGGTGTTGAAAGGACACTAAACAAGCTTGGCATCTTGGCAACTGCCACCGCAAGGGAGAGGGATCCCCTCTCGGGTGTAGACGACACCCCGGCCCCAGTCCCCTAGGTCATGGGAAAAACTGACCCCGAAGTGCTGCAAGGGCACTAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATCGAGTATCCGGGTGAGTGACGCCACCCCCCGAAATGTGTGGAGGTCGCTAGAT
| 11,445
|
OQ139648.1
|
Quang Binh virus
|
Tang,X., Li,R., Qi,Y., Li,W., Liu,Z., Wu,J., Tang,X.M., Li,R.T., Li,W.Y., Wu,J.H.
|
Guizhou Medical University, Key Laboratory of Modern Pathogen Biology and Characteristics, Basic Medical College
|
China
|
2023-10-29
|
GZ21m167
|
Quang Binh virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,829
|
GenBank
| 1
|
China: Guizhou
|
China
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2021-07-31
| null | null |
Quang Binh virus isolate GZ21m167, complete genome
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GGGGAGTTTTTAAAAACTTCAGCTTGGTTAAGTCACTGGTTGATTAAGCCTATATATTACAGCTAAAGTTGTTTATAATTTTGCTACTTTATTACCTCTGGTATTAACGTAGCGCTATGAAGAAGAAGGAGTCTGGAGTGGTAGAGAGAGGGCGCAAAGAGCGTCCCCCTGCCAATCGCGGAGGAAGAGCTCCTCCGAAGAAGGAGAGAGATCGAGGAGGCCAAATGGTCTCGCTTCGTGGGACTTCAGGTTCCATCGGATCGGGCCGTGGTAAGCAAGTCAAAGGACCCGGCGGACGGAATGGACTGCTAGGTAAGTTGGGGCTAGGATGGGGGTCTTTCCTACAGAAAGACATCATCCAAGCCATCATGCACCTGGTTTTAGTCCTCCATGCCCTGTTCATGTCCATTGACCAACGCTTTAAGGCGCTCACCCGTCGTGTGCGCGCCCTTGAGAATCGACGATCTGCCAATCCCTTACTGCTCGCCACTATCATCTGTGCGGCTGCCACTCTGTGTGGCACTATGGTGATCGACATGCAAGTGTCCTCGGCCAAGGGCGTGCAGGTCTACGAGGGGAAAACAAATCGAACTGACTACCTGCACTTGTTCAAACTCCCCAAGGATGGGTGTTGGAATGGAGTGCTGGTTTCCAAACACTGCCCCAAGGTTGGCGATCTTGCCAAGGACTTGGAGGCTACTGATTGCGGATCAACATGGAGTGAGTTCACGCCACGATACAATCGATGTGTGGGAAAAAAGCGTGTCAAGCGGGCAGCCGAACAACCAAAAACGGACCTGCTTGCGGAAATGGAAATGGTAACGTTCAAGACTATTCGCCAGAACAAGACGATTTTCATTATCGCTCTGCTTTGTGTTGCCGTTGCGAAGAGGTGGCCCACCTGGGTTGTCATTGTTCTTGCGATTGGCACATGGTCCACCGTCAAAGGAGAATTCGTGGAACCATTGTACACGCTGAAGGCGGAGCAGATGACCATGATGCAAACGATCGTTCGTCCGGAAGAGGGGTATGTTATTGCCACCCCGAACGGACTTGTCGAACTGCGGACTAGTGCTGCCATTATCTTGGGAGGTCAATGGCTTCGCGAGCTTCTGGTTGACTGTCAGGTCAATGCCACCTACTCTACGGATGTGTGCCCTGGAGGTTCTCAGCTCAACATGGCAGAGATATCATCTAGGGAACGGGTTTGCACTACGCAACCATACAACCGTGGATGGGGAACCGGATGCTTTAAGTGGGGAATTGGTTTCGTTGGCACATGCGTTGAACTCCATTGTGAAGAAGGGTATAACGTATCGTCCATCGCGCGGTCCGCCATCGTCATGAACATTACAGCTAGTTTTCACTCTGTTAGTGATACCCAACAACTGCTAGGTGACATACCGGTCACTTTCCGGTTTGCTAAGCTTGGAAACGCGGCCATGACCTGCCGCTTGGAATCGGAGCAGCTTCTGCTTGATTACTACCATGTTACCGGCAACAAACGCGAAGGACTGTTCCTGCGGTCCCAGGTGGACAATTGGCCTGGAGTCATTTCGTCCTCTGGGGGACGAGCTGGATTAGAGAAAGTCGTCGTTTGGGGAGACACGAAAGCCAATGAGATATTGGTTAAACACGTCATGGAACCCCAGCTTGAGTGGGATAATGCTATCCCCACACATGCGGGTTTCCGTGACGTTGCTTTCGTGTGTCAAATAATGCTGGATAAACTGGTCAGCGGAGCGTTCCGTGATTGCCAAGGGCTGAAATCATCGGTGTTCGTGCAGAGTGGTTTTGGATACAGCGGAGTCGTTGTCACCACGCTGTTGCAACCAACAAACGAGAGCTGCTCACTCAACATGGTATGCCATGGATGTCAGTTGCTAGCGACGAAGATGGTGTTCGGTGCTGGAAAATCAACGTCCCGAGCCTTTGTCGGTTGTGGAAACCACACTGGCTCACTCGTTATCGGAGGAGCAGCCGTTCCCATTGAATGTGTGATGAATCCCATCTCCCAAGGGTGGAGGCTAACCCGGCATGTTGTGGACAAGTACCGACGATTCGGAGTACCAGGAGTTGCGGGGGTGTGGCACGATTTCGTGGGAGGTTTCTCCCTCGGGAATCTGATAACCAACTCGACATTGCTGGTTCTCTTAGCAGCGTTGGCATTCCTCGACAAACGTGTCGTGGTGCTGCTGCTGGTTTGTGGATATTTTTACTACACTCGGGCTGATGTGGGCTGTGGATTTGATCCTGACAGGAAGATCATGTCGTGCGGCACTGGTGGCTTTGTGTGGAAGAGTATCTCACAATGGCCTGTGAACGACCACTCTGTTCAGCTTGAAGACGATGCTGTTGTGGTGTCACTTGTGACTGAGCAACTAAAAACCACAAATAAGGTTTGCCTCATGTGTGAGGATGTCCTCCAATGTGCGGCTGCCCGAAGCGTGGTCAAGAGAATTACTCACGTCAACAACGAGCTCGTCTATGCGAACACAACCTTATCGTACGGAAAGGTGTTTCCTCGCGTGAAGAAAAGTGTTCATGGTGTGAAGATTGGTGACATAACAATGCAACTCGCTCTGGCGACCCTTGATGGCAAGCTAGACGACACGGAGCTAGGGCATCTCACAAGTGGATTCTTCTCACGTGGAACGCAAAATGAGACTGTTGACCACAAGGTTGTCCGAGTCGTCACAAGCGGCAGCGAGTACAAGAAAGTGTGCTCTCAAGCGTTCGCGTTGCAGTATGGTTTTGTGCGATTTTCACGCAAAGTGTATGGATCAAACGTGGTCGTGAAGCCGGTTGAGAAACCGAGTGAGGCGTGCCCGACGTACCTGGCTGGTTCATACGTGAAAAACGATGTTGGAGGGTACACTGACGGCATGATGTGGATGCGTAGCCGCAAGGTGAATGGCTCATGGGAACTATTCGAACTGGAGACGACCCAAAGCCACCAGTGCATTTGGCCACAGGAATACACATTTGATCTCACGACTCACAACGACAGCACGCTGTTCATGCCAGCTCATTACGGAGCGCCGATGTCCAAGGCCAACCACATTCCTGGATACGGGACCCAACACGAATTCCCGTGGTACAAGGCGGAAATAAAGCTGCGGCAAGGACCCGTTCCCGGAACAGAAGTGGAGTCCATGGATTCGTGCGATGATAGTGGATCAGCGGTCAAAGTGGATCCTGCCATTGCGAAAAAGTGGTGCTGCAAAGGATGTTTGGCCAATGAGCGGAAGCCAATCCACTTTATCGTGGATGGTGACTTCTTTTATCCAATGGAAATACGACCAATGACTGCCCACTCAAAACTCATCATCGAGAACGAGGGCGTTGAGATAAACGAGATGGATCAGATGTTCCCGAAGACCGTTTCTCCAATCCCTGGAGCTGAAGCTTTGCTTCAGGATTTCCGGGACAGCCTGCCAGTAGATGGATCTTCTCCTTTACTGGTGGGCGTGCTTCTACACCTGCTAACAATTCGGACTCGACACCGCTGGGGTCAACGCACAATCGGTACCTGGCTGCTATTCGTAGTTTTTGGCATACCTGTTGGAGGTTGGCTCGGTTGGTCGTGGATGGGCTTGTCTTACTCGCTCGCCGCTGTGCCCAATGGAAGCGCACTTCTTATACATTTCTGGCTTGCTTTGCAGTTCTCAACATCACATTTGTTTTTCCTAGGGTGGTTGTTACGCAAGCGCGTCGAATCATCTATCGAATACGCGTTAACCGTGTTCGCCGTCGAATGGGTAATCTTGAAATTACAAATGTTGATCAAACAAGCATCCCACCTCGAGCACGTCCTGTTCCCTCTGTACGTGAAGTTGGCACTCAGTGTGAGATCCCAGTTTGCTCCTGTGGACAGCATGATTGCCCTGAATTACGTGGTGACGCACCCGTTGATGGCATGCCTGGTGAGCCTCGGTGTTGCCCTGGTGATCTTTGTTACACACGTCTGCGTGAATTGGAGGCGGTCTCCAAACTTGTGGAAGAGTGGACTTCGGGCTTCGAAGCAATCAGTGCTATTGGGCGTGTACTTTGTAGTGTTGTACGTGGTTTCAGTCTTACTGCGATTCACGGGTCTGGAGAGCTCTGCCGTCGCTGTGTTCCTGGGTGGTCTGCTGATCGGGCTAGTGACCAGGCTGGTACCTCCGACGAAATATGTACTTGTCCCGGTGCCGGGTACGAGCGTGCCGAGCAACTGCGAAGAATCATTCACAAAACTACCGCCAGGATTAGAAGGTGTCTACGGACCCAATGGAGTGGAATTCCTGAACTACACTGATGTGGGATTGGTCTCCTTTGCAGTCTTGATGTTTTCAGGTGGTCTCGGCCTAACGTTGATGAATCCATGGTTGGGAATCACGTCCATGCTCTTTTGCTGGTTCACTGAAGCCTACGTGTGGTTGCCAAGGTTGATCTTCGGTACAAGCAATCGCCGCTCTGGAGTTAACGATGTCCTGCTGGCACCTCCTGTTTATGCGGATGAGATTGACATTGAAAGTGACTTTGGACACATCCCGGATGGAACCTACAGAGTGGTGGCTCACTGCACGTTCTTCAAGTATCACACAGGAGCTGGATATGCCAGAGGTGGTGTCTTTCACACACTATGGCACGTCACATCAGGAGCCTGTGTTTACTGGGAGGGCAGAGCGGTTCGAATGCATTCGGCTGACATCTACCGCGACATGGCATCGTATGGTGGCCCATGGAACATCACCGAGTCGAACGAAGCCTCTGTCATTGTCCGTGTTGTCGAGAGCGACAACAGCGTGTCCTGTGTGCGATGTTCCACAGCCCAACTAAAGATCAACGGCGAAACCGTGTCGGTGATTGGAAAGGACTTTGGGCGCGGCTCATCTGGATCTCCCATTCACTCGTTGGATGGTAGAGTTGTCGGCCTGTATGGTTACGGTTTTCACATCGGATGGGAGTATTTCTCCATCATCACGAGCGGAGAAGTCGCCATGGCCGCAGAGGTAGCC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| 11,446
|
MW452275.1
|
Quang Binh virus
|
Kang,Y.
|
Wuxi Children's Hospital, Department of Pediatric Laboratory
|
China
|
2021-04-21
| null |
Quang Binh virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,813
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2018-07-25
| null | null |
Quang Binh virus strain YX594, complete genome
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CTTCAGCTTGGTTAAGTCACTGGTTGATTAAGCCTATATATTACAGCTAAAGTTGTTTATAATTTTGCTACTTTATTACCTCTGGTATTAACGTAGCGCTATGAAGAAGAAGGAGTCTGGAGTGGTAGAGAGAGGGCGCAAAGAGCGTCCCCCTGCCAATCGCGGAGGAAGAGCTCCTCCGAAGAAGGAGAGAGATCGAGGAGGCCAAATGGCCTCGCTTCGTGGGACTTCAGGTTCCATCGGATCGGGCCGTGGTAAGCAAGTCAAAGGACCCGGCGGACGGAAAGGACTGCTAGGTAAGTTGGGGCTAGGATGGGGATCTTTCCTACAGAAAGACATCATCCAAGCCATCATGCACCTGGTTCTAGTCCTCCATGCCCTGTTCATGTCCATTGACCAACGCTTTAAGGCGCTCACCCGTCGTGTGCGCGCCCTTGAGAATCGACGATCTGCCAATCCCTTACTGCTCGCCACTATCATCTGCGCGGCTGCCACTCTGTGTGGCACTATGGTGATCGACATGCAAGTGTCCTCGGCCAAAGGCGTGCAAATCTACGAGGGGAAAACAAATCGAACTGACTACCTGCACTTGTTCAAACTCCCCAAGGATGGATGTTGGAATGGAGTGCTGGTTTCTAAACACTGCCCCAAGGTTGGCGATCTTGCCAAGGACTTGGAGGCTACTGATTGCGGATCAACATGGAGTGAGTTCACGCTACGATACAATCGATGTGTGGGGAAGAAGCGAGTCAAGCGGGCAGCCGAACAACCAAAAACGGACCTGCTTGCGGAAATGGAAATGGTAACGTTCAAGACTATTCGCCAGAACAAAACGATTTTCATTATCGCTCTGCTTTGTGTTGCCGTTGCGAAGAGGTGGCCCACCTGGGTTGTCATTGTTCTTGCGATTGGCACATGGTCCACCGTCAAAGGAGAATTCGTGGAACCATTGTACACGCTGAAGGCGGAGCAGATGACCATGATGCAAACGATCGTTCGTCCGGAAGAGGGGTATGTTATTGCCACCCCGAACGGACTTGTCGAACTGCGGACTAGTGCTGCCATTATCTTGGGAGGTCAATGGCTTCGCGAGCTTCTGGTTGACTGTCAGGTCAATGCCACCTACTCTACGGATGTGTGCCCCGGAGGTTCTCAGCTCAACATGGCAGAGATATCATCTAGGGAACGGGTTTGCACTACGCAACCATACAACCGTGGATGGGGAACTGGATGCTTTAAGTGGGGAATTGGTTTCGTTGGCACATGCGTTGAACTTCATTGTGAAGAAGGGTATAACGTATCGTCCATCGCGCGGTCCGCCATCGTCATGAACATCACAGCTAGTTTTCACTCTGTTAGTGATACCCAACAACTGCTAGGTGATATACCGGTTACTTTCCGGTTTGCTAAGCTTGGAAACGCGGCCATGACCTGCCGCTTGGAATCGGAGCAGCTTCTGCTTGATTACTACCATGTTACCGGCAACAAACGCGAAGGACTGTTCCTGCGGTCCCAGGTGGACAATTGGCCTGGAGTCATTTCGTCCTCTGGGGGACGAGCTGGATTAGAGAAAGTCGTCGTTTGGGGAGACACGAAAGCCAATGAGATATTGGTTAAACACGTCATGGAACCCCAGCTTGAGTGGGATAATGCTATCCCCACACATGCGGGTTTCCGTGACGTTGCTTTCGTGTGTCAAATAATGCTGGATAAACTGGTCAGCGGAGCGTTCCGTGATTGCCAAGGGCTGAAATCATCGGTGTTCGTGCAGAGTGGTTTTGGATACAGCGGAGTCGTTGTCACCACGCTGTTGCAACCAACAAACGAGAGCTGCTCACTCAACATGGTATGTCATGGATGTCAGTTACTAGCAACGAAGATGGTGTTCGGTGCTGGAAAATCAACGTCCCGAGCCTTTGTCGGTTGTGGAAACCACACTGGCTCACTCGTTATCGGAGGAGCAGCCGTTCCCATTGAATGTGTGATGAATCCCATCTCCCAAGGGTGGAGGCTAACCCGGCATGTTGTGGACAAGTACCGACGATTCGGAGTACCAGGGGTTGCGGGGGTGTGGCACGATTTCGTGGGAGGTTTCTCCCTCGGAAATCTGATAACCAACTCGACATTGCTGGTTCTCCTAGCAGCGTTGGCATTTCTCGACAAACGTGTCGTGGTGTTGCTGCTGGTTTGTGGATATTTTTACTACACTCGGGCTGATGTGGGCTGTGGATTTGATCCTGACAGAAAGATCATGTCGTGCGGCACTGGCGGCTTTGTGTGGAAGAGTATCTCACAATGGCCTGTGAACGACCACTCTGTTCAGCTTGAAGACGATGCTGTTGTGGTGTCACTTGTGACTGAGCAACTAAAAACCACAAATAAGGTTTGCCTCATGTGTGAGGATGTCCTCCAATGTGCGGCTGCCCGAAGCGTGGTCAAGAGAATCACTCACGTCAACAACGAGCTCGTCTATGCGAACACGACCTTATCGTACGGAAAGGTGTTTCCTCGCGTGAAGAAAAGTGTTCATGGTGTGAAGATTGGTGACATAACAATGCAACTTGCTCTGGCGACCCTTGATGGCAAGCTGGATGACACGGAGCTAGGGCATCTCACAAGTGGATTCTTCTCACGTGGAACGCAAAACGAGACTGTTGACCACAAGGTTGTCCGAGTTGTCACAAGCGGCAGCGAGTACAAGAAAGTGTGCTCTCAAGCGTTCGCGTTGCAGTATGGTTTTGTGCGATTTTCACGCAAAGTGTATGGATCAAATGTGGTTGTGAAGCCGGTTGAGAAACCGAGTGAGGCGTGCCCGACGTATCTGGCTGGTTCATACGTGAAAAACGATGTTGGAGGGTACACTGACGGCATGATGTGGATGCGTAGCCGCAAGGTGAATGGCTCATGGGAACTATTCGAACTGGAGACGACCCAAAGCCACCAGTGCATTTGGCCACAGGAATACACATTTGATCTCACGACTCACAACGACAGCACGCTGTTCATGCCAGCTCATTACGGAGCGCCGATGTCCAAGGCCAACCACATTCCTGGATACGGGACCCAACATGAATTCCCGTGGTACAAGGCGGAAATAAAGCTGCGGCAAGGACCCGTTCCCGGAACAGAAGTGGAGTCCATGGATTCGTGCGATGATAGTGGATCAGCGGTCAAAGTGGATCCTGCCATTGCGAAAAAGTGGTGCTGCAAAGGATGTTTGGCCAATGAGCGGAAGCCAATCCACTTTATCGTGGATGGTGACTTCTTTTATCCAATGGAAATACGACCAATGACCGCCCACTCAAAACTCATCATCGAAAACGAGGGCGTTGAGATAAACGAGATGGATCAGATGTTTCCGAAGACCGTTTCTCCAATCCCTGGAGCTGAAGCTTTGCTTCAGGATTTCCGGGACAGCCTGCCAGTAGATGGATCTTCTCCTTTACTGGTGGGCGTGCTTCTACACCTGCTAACAATTCGGACTCGACACCGCTGGGGTCAACGCACAATCGGTACCTGGCTGCTATTCGTGGTTTTTGGCATACCTGTTGGAGGTTGGCTCGGTTGGTCGTGGATGGGCTTGTCTTACTCGCTCGCCGCTGTGCCCAATGGAAGCGCGCTTCTTATACATTTCTGGCTTGCTTTGCAGTTCTCAACATCACATTTGTTTTTCCTAGGGTGGTTGTTACGCAAGCGCGTCGAATCATCTATCGAATACGCGTTAACCGTGTTCGCCGTCGAATGGGTAATCTTGAAATTACAAATGTTGATCAAACAAGCATCCCACCTCGAGCACGTCCTGTTCCCTCTGTACGTGAAGTTGGCACTCAGTGTGAGATCCCAGTTTGCTCCTGTGGACAGCATGATTGCCCTGAATTACGTGGTGACGCACCCGTTGACGGCATGCCTGGTGAGCCTCGGTGTTGCCCTGGTGATCTTTGTTACACACGTCTGCGTGAATTGGAGGCGGTCTCCAAACTTGTGGAAGAGTGGACTTCGGGCTTCGAAGCAATCAGTGCTATTGGGCGTGTACTTTGTAGTGTTGTACGTGGTTTCAGTCTTACTGCGATTCACGGGTCTGGAGAGCTCTGCCGTCGCTGTGTTCCTGGGTGGTCTGCTGATCGGACTAGTGACCAGGCTGGTACCTCCGACGAAATATGTACTTGTCCCGGTGCCGGGTACGAGCGTGCCGAGCAACTGCGAAGAATCATTCACAAAACTACCGCCAGGATTAGAAGGTGTCTACGGACCCAATGGAGTGGAATTCCTGAACTACACTGATGTGGGATTGGTTTCCTTTGCAGTCTTGATGTTTTCAGGTGGTCTCGGCCTAACGTTGATGAATCCATGGTTGGGAATCACGTCCATGCTCTTTTGCTGGTTCACTGAAGCCTACGTGTGGTTGCCAAGGTTGATCTTCGGTACAAGCAACCGCCGCTCTGGAGTTAACGATGTCCTGCTGGCACCTCCTGTTTATGCGGATGAGATTGACATTGAAAGTGACTTTGGACACATCCCGGATGGAACCTACAGAGTGGTGGCCCACTGCACATTCTTCAAGTATCACACAGGAGCTGGATATGCCAGAGGTGGTGTCTTTCACACACTATGGCACGTCACATCAGGAGCCTGTGTTTACTGGGAGGGCAGAGCGGTCCGAATGCATTCGGCTGACATCTACCGCGACATGGCATCGTATGGTGGCCCATGGAACATCACCGAGTCGAACGAAGCCTCTGTCATCGTCCGTGTGGTCGAGAGCGACAACAGCGTGTCCTGTGTGCGATGTTCCACAGCCCAACTAAAGATCAACGGCGAAACCGTGTCGGTGATTGGAAAGGACTTTGGGCGCGGCTCATCTGGATCTCCCATTCACTCGTTGGATGGTAGAGTTGTCGGCCTGTATGGTTACGGTTTCCACATCGGATGGGAATATTTCTCCATCATCACGAGCGGAGAAGTCGCCATGGCCGCAGAGGTAGCCGAGGAAGCCGGATCAA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GACATAGCGTGCGGCAGTCTGATTGGCGAACGTGACAGAGCCTCATGGTCCAAGAACATTGTGGCTACTGTTGAAACAGCTCGGAAGATCATTGAACAGGAGAATGGGAGCCAGAAATTTCCTGACGGACTACAAATCCTCGGGAGATACAAGAACCACCAGGACCCCGTGTTCGGGTAACCTAGCTGTCGAACCATGCTAGGTAGGAGGTAGAGCCGAAAACTCTACCATTTTAGCGCAAGGAAGGGAAGCTTGAGGCTACCTTAGGTGGTGACGACACCTCGCCCCCAGTCTCCCAGGTTGGGGATCATGTAACCTCGTGGGCTACCGCCCCCGCAAGGAGGGACGTGCTTTTCACGTCTCTGGGAGTTGACGACTCTCCGGCCCCAGTTCCTAGGTCCAGGAAGGATCCCGTGGCGCTGAAAGGGCGCTAAACAAGCTTGGTATCTTGGTAACTACCACTGGATGTTTTCCAGCCCGCGCAAGGAAGGACACGTGAATGACGTTTCCTTGGGAGTTGACGACTCTCCGCCCCCAGTCCCCAGGTCAGGGCATGACCCCGTGGTGTTGGAAGGACACTAAACAAGCTTGGCATCTTGGCAACTGCCACCGCAAGGGAGAGGGATCCCCTCTCGGGTGCAGACGACACCCCGGCCCCAGTCCCCTAGGTCATGGGAAAAACTGACCCCGAAGTGCTGCAAGGGCACTAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATCGAGTATCCGGGTGAGTGACGCCACCCCCCGAAATGTGTATTGTGACAGGCATGCTCGCAGCAGCAAATCTCCACC
| 42,488
|
MH827523.1
|
Quang Binh virus
|
De,W., Qi,T.Qi., Sheng,L.Bai., Xin,Z., Huan,Z., Feng,S.Jiu.
|
Guangdong Provincial Center for Disease Control and Prevention, Insititue of Pathogenic Microbiology
|
China
|
2019-07-31
|
LZ17046/China/2017
|
Quang Binh virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,844
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2017-04-25
| null | null |
Quang Binh virus isolate LZ17046/China/2017, complete genome
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CGGCAGTTTGATTGGCGAACGTGACAGAGCTGCGTGGTCCAAGAACATCGTGGCCACTGTTGAGACAGCCCGGAAGATCATCGAACAGGAGAATGGAAGCCAGAAATTTCCCGATGGACTCCAAATCCTGGGGAGATACAAAGTTCACCAGGATCCCGTGTTCGGGTAACTTAGCCGCCGAAGGAGGTTAGGTAGGAGGTAGAGCCGAAAACTCTACCATTTCAGCGCAAGGAAGGGAAGCTTGAGGCTACCTTAGGTGGTGACGACACCTCGCCCCCAGTCTCCCGGGTTGGGGATGGTACAACCTCGTTGGGCTACCGCCCCCGCAAGGAAGGGTGTGCGTTTCACGCCCCTGGGAGTTAACGATTCTCCGGCCCCAGTTCCTAGGTCCAGGGAGGGCCCCGTGGCGCTGAAAGGGCGCTGAACAAGCTTGGTATCTTGGCAACTACCACTGGATGGTTTCCAGCCCGCGCAAGGAAGGACATGTAAATCACGTGTCCTTGGGAGTTGACGACTCTCCGCCCCCAGTCCCCAGGTCAGGGTATGACCCCGTGGTGTTGAAAGGACACTAAACAAGCTTGGCATCTTGGCAACTGCCACCGCAAGGGAGAGGGATCCCCTCTCGGGTTTGGACGACACCCCGGCCCCAGTCCCCTAGGTCATGGGAAAAACTGACCCCGAAGTGCTGCAAGGGCACTAATCACCGCAAGGTGAGGGCGCACAGGATCGAGTATCCGGGTGAGTGACGCCACCCCCCGAAATGTGTATTGTGACAGGCTTGCTCGCAGCAGCAAATCTCCACCGTTAGGAGATTTGTTGTGAGCATTGCCTTGTCTACGTCTAA
| 60,465
|
MH827524.1
|
Quang Binh virus
|
De,W., Qi,T.Qi., Sheng,L.Bai., Xin,Z., Huan,Z., Feng,S.Jiu.
|
Guangdong Provincial Center for Disease Control and Prevention, Insititue of Pathogenic Microbiology
|
China
|
2019-07-31
|
JM17156/China/2017
|
Quang Binh virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,891
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2017-05-17
| null | null |
Quang Binh virus isolate JM17156/China/2017, complete genome
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| 60,466
|
FJ644291.1
|
Quang Binh virus
|
Crabtree,M.B., Nga,P.T., Miller,B.R.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-Borne Infectious Diseases
|
USA
|
2009-05-06
|
VN180
|
Quang Binh virus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,865
|
GenBank
| 1
|
Viet Nam
|
Viet Nam
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2002-08
| null | null |
Quang Binh virus isolate VN180, complete genome
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TAGTTTTTAAAAACTTCAGCTTGGTTAAGTCACTGGTTGATTAAGCCTATCTATTACAGCTAAAGTTGTTTATAATTTGCTACTTTATTACCTCTGGTACTAACGTGGCGCTATGAAGAAGAAGGAGTCTGGAGTGGTGGAGAGAGGACGTGGAACGCGTCCTCCTGCCAATCGTGGAGGAGGAGCTCCTCCGAAGAAGGAGAGAGATCGAGGAGGCCAAAAGGTCTCGCTCCCTGGGACTTCAAGCTCCATCGGATCGGACCGTGGCAAACGGGTCAAGGGACTCGGCGGACGAAAGGGACTGCTCGGCAAGCTGGGGCTGGGATGGGGGTCTTTTTTACAGAAAGACATCATCCAAGCCATCATGCACCTGGTCCTAGTCCTACACGCCCTGTTCATGTCCATTGACCAACGCTTTAAGGCGCTCACCCGGCGGGTGCGCGCCCTCGAGAATCGACGATCTGCCAATCCCCTACTGCTCGCCACTATCATCTGCGCGGTCGCCACCTTGTGTGGCACCATGGTGATCGACATGCAAGTGTCCTCCGCTAAAGGCGTGCAAATTTACGAAGGGAAAACAAACCGGACTGACTACTTGCACTTGTTCAAGCTTCCAAAAGATGGATGTTGGAACGGAGTGCTGGTTTCCAAACACTGTCCTAAGGTCGGCGACTTGGCCAAGGACTTGGAGGCCACTGACTGCGGATCTACATGGAGCGAATTCACACTGCGATATAATCGATGTGTGGGAAAGAAGCGCGTCAAGCGGGCTACCGAACAACCGAAAGCGGACCTACTTGCGGAGATGGAGATGGTAACGTTCAAGACCATCCGTCAAAACAAGACGATTTTCATTATCGCTCTGCTCTGTGTTGCCGTTGCAAAGAGATGGCCTACTTGGGTCGTCATTGTTCTTGCAATTGGCACATGGTCTACCGTCAAAGGAGAATTTGTGGAACCATTGTACACGCTGAAAGCGGAGCGAATGACCATGATGCAAACGATCGTTCGTCCGGAAGAGGGGTACGTTATCGCTACCCCAAACGGACTTGTTGAACTGCGGACTAGTGCTGCCACCATCTTGGGAGGCCAATGGCTTCGTGAGCTTCTAGTTGACTGCCAGGTCAATGCCACCTACTCAACGGATGTGTGTCCTGGAGGTTCTCAGCTTAATATGGCAGAGATATCATCCAAGGAGCGGGTTTGCACTACGCAACCGTACAACCGCGGGTGGGGGACCGGATGCTTCAAGTGGGGAATTGGTTTTGTTGGTACATGCGTTGAACTCCATTGTGAAGAAGGGTACAACGTGTCGTCCATTGCACGATCCGCCATCATCATGAACATCACGGCGAGTTTCCACTCTGTCAGTGACACCCAGCAGTTGCTAGGTGACATACCAGTCACCTTCCGATTTGCTAAGCTCGGAAACGCGGCTATGACTTGTCGCTTGGAATCAGAGCAACTCCTGCTTGATTATTACCACGTTACCGGCAACAAACGCGAAGGACTATTCCTGCGGTCCCAGGTGGACAATTGGCCTGGAGTCATATCGTCTTCTGGGGGACGAGCTGGATTAGAGAAGGTCGTTGTTTGGGGAGACACGAAAGCCAATGAGATATTGGTTAAACACGTCATGGAACCCCAGCTTGAGTGGGATAATGCCATTCCTACACATGCGGGCTTCCGTGACGTTGCTTTCGTGTGTCAAATAATGCTGGATAAACTGGTCAGCGGAGCGTTCCGCGATTGCCAAGGATTAAAATCATCGGTGTTTGTTCAGAGTGGCTTTGGATACAGTGGGGTTGTTATCACCACGCTGTTGCAACCAACGAACGAGAGCTGCTCACTCAACATGGTGTGTCATGGATGTCAGTTGCTATCGACGAAAATGGTGTTTGGGGCTGGAAAACCAACGTCCCGTGCCTTCGTCGGCTGTGGGAACCACACTGGTTCACTCTTGATTGGCGGTGCATCTGTCCCCATTGAATGTGTGATGAACCCCATCTCTCAAGGATGGAGGCTAACCCGACACGTTGTGGACAAGTACCGACGATTCGGAGTACCAGGAGTTGCAGGAGTTTGGCGCGATTTCGTTGGAGGCTTCTCCCTCGGGAACCTGATAACCAACTCGACGTTGCTCGTCCTCCTAGCAGCGCTGGCATTCCTCGACAAGCGTGTTGTGGTGCTCCTGCTAGTCTGTGGATACTTCTACTACACACGTGCTGATGTGGGTTGTGGATTTGATCCCGACAGGAAGATCATGTCGTGCGGTACTGGTGGCTTCGTGTGGAAGAGCATTTCCCAATGGCCTGTGAACGATCACTCTGTCCAGCTTGAAGACGACGCTGTTGTGGTGTCACTTGTAACGGAACAACTGAAGACCACAAACAAGGTTTGCCTTATGTGTGAGGATGTCCTACAATGTGCGGCTGCCCGAAGTGTTGTCAAGAGAATCACTCACGTCAACAACGAGCTTGTCTATGCGAACACAACCCTGTCTTACGGGAGGGTTTTTCCTCGAGTGAAGAAAAGTGTCCATGGTGTGAAGATTGGGGACATAACGATGCAGCTCGCCTTGGCTACCCTTGACGGCACGCTGGACGACGCCGAATTGGGACACCTGACAAGTGGATTCTTTTCACGAGGAAAACAAAACGAGACTGTTGACCACAAGGTTGTCCGCGTCATCACGAGTGGCAGTGAGTATAAGAAGGTTTGTTCTCAGGCATTCGCATTGCAGTATGGCTTTGTGCGATTTTCGCGCAAGGTGTACGGATCAAACGTGGTCGTGAAACCGGTTGAGAAACCGAGTGAAGCGTGCCCGACGTACCTGGCCGGTTCATATGTTAAGAACGATGTCGGAGGGTACACTGATGGCATGATGTGGATGCGTAGCCGTAAGGTGAATGGCTCATGGGAGATGTTCGAGCTTGAGACGACCCAAAGCCACCAATGCATTTGGCCACAGGAGTACACATTTGATCTCACGACTCACAACGATAGTACATTGTTTATGCCAGCCCATTACGGAGCGCCGATGTCCAAAGCCAACCACATCCCTGGGTACGGAACTCAACACGAGTTCCCGTGGTACAAGGCCGAGATAAAATTGCGGCAGGGACCAGTTCCTGGAACTGAAGTGGAGTCCATGGACTCGTGCGATGGTAGTGGATCAGCGGTCAAAGTGGACCCTGCCATTGCAAAGAAGTGGTGCTGCAAAGGATGTTTGGCCAATGATCGCAAGCCCATTCACTTCATCGTGGATGGTGACTTCTTTTACCCAATGGAAATACGACCAATGACTGCGCATTCAAAGCTCATCATCGAGAACGAGGGTGTTGAAATAGACGAGATGGATCAGATGTTCCCAAAAACCGTCTCTCCAATCCCTGGAGCTGAAGCTTTGCTTCAGGATTTCCGGGACAGCCTGCCAGTAGATGGATCTTCTCCTTTACTGGTGGGCGTGCTTCTACACCTGCTAACAATTCGGACTCGACACCGATGGGGCCAACGCACAATCGGTACCTGGCTGCTATTCGTAGTTTTTGGTATACCTGCTGGAAGCTGGGTCGGTTGGTCGTGGATGGGCTTGTCTTACTCGCTCGCCGCTGTGCCCAATGGAAGCGCACTTCTTGTGCATTTTTGGCTTGCTTTGCAGTTCTCAACATCACATTTGTTTTTCCTAGGTTGGTTGTTGCGCAAACGCGTCGAGTCATCTATCGAATACGCATTAACCGTGTTCGCCGCCGAATGGGTAATTTTGAAATTACAAATGTTGATCAAACAAGCATCCCACCTCGAGCACGTCCTGTTCCCTCTGTACGTGAAGTTGGCACTCAGTATGAGATCCCAGTTTGCCCCTGTGGACAGCATGATTGCCCTGAATTACGTGGTGACGCACCCGTTGATGGCGGCCCTGGTGAGCCTCGGTGTTGCCCTGGTGATCTTTGTTACACACGTCTGCGCGAATTGGAGGCGGTCTCCAAACTTGTGGAAGAGTGGACTTCGGGCTTCGAAGCGATCAGCTCTATTGGGCGTGTACTTTGTAGTGTTGTACGTGGTTTCAGTCTTACTGCGATTCACGGGTCTGGAGAGCTCTGCCGTCGCTGTGTTCCTGGGGGGTCTGCTGATCGGACTAGTGACCAGGCTGGTTCCTCCGACGAAATATGTACTTGTCCCGGTGCCGGGTACGAGCGTGCCGAGCAACTGCGAAGAATCATTCACAAGACTACCGCCAGGATTAGAAGGTGTCTACGGACCCAGTGGAGTGGAATTCCTGAACTACACTGATGTGGGATTGGTTTCCGTTGCAATCCTGATGTTCACGGGCTGCCTCGGTGTGACGCTCATGAACCCATTGTTGGGTATCACGTCCATGCTCTTCTGCTGGTTTACTGAAGCATACGTGTGGTTGCCGAGGTTGATCTTCGGCACGAGCAATCGCCGCTCTGGGGTGAACGACGTTCTGCTAGCCCCTCCTGTCTACGCGGACGAGATTGATGTTGAAAGCGACTTTGGACACATACCGGATGGAACTTACAGGATAGTGGCCCATTGCACCTTTTTCAAGTATCACACAGGAGCCGGCTATGCCAAAGGTGGTGTTTTCCACACACTATGGCATGTCACATCAGGAGCTTGTGTCTACTGGGAGGGCAGAGCGGTTCGTATGCACTCGGCTGACATCTACCGCGACATGGCGTCGTATGGTGGCCCATGGAACATCACCGAGTCAAACGAGGCATCTGTTATTGTCCGCGTGGTCGAAAGCGACAACAGCGTATCCTGCGTGCGGTGTTCCACGGCCCAACTAAAAATCAATGGTGAAACTGTGTCGGTGATTGGAAAGGACTTTGGACGCGGCTCATCTGGATCCCCCATCCATTCTTTGGATGGCAGGGTTGTCGGCTTGTATGGCTATGGCTTCCACATTGGATGGGAATACTTTTCTATCATCACAAGTGGAGAAGTTGCCATGGCCGCAGAAATAGCCGAGG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| 103,104
|
NC_009889.1
|
RD114 retrovirus
|
Ghani,K., Caron,M.-C., Caruso,M.
|
Laval University, Medical Biology
|
Canada
|
2007-10-05
|
SC3C
|
RD114 retrovirus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,406
|
RefSeq
| null |
USA
|
USA
| null | null | null | null |
PRJNA485481
|
RD114 retrovirus, complete genome
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RD114 retrovirus DNA, complete genome, strain: UCL
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| 96,921
|
AB559882.1
|
RD114 retrovirus
|
Yoshikawa,R., Sato,E., Igarashi,T., Miyazawa,T.
|
Institute for Virus Research; 53 Shogoin-Kawaracho, Sakyo-ku, Kyoto, Kyoto 606-8507
|
Japan
|
2010-09-09
| null |
RD114 retrovirus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,315
|
GenBank
| 1
| null | null |
Homo sapiens
| null | null | null | null |
RD114 retrovirus proviral DNA, complete genome, strain: CRT1
|
TGAGAAGTCAGAACCCCCCACCTTTGCTACATAAATAACCGCTTTCATTTCGCTTCTGTAAAACCGCTTATGCGCCCCACCCTAGCCGGAAAGTCCCCAGCCGCTACGCAACCCGGGCCCCGAGTTGCATCAGCCGCTTCGCAACCCGGGCTCCGAGTTGCATCAGCCGAAAGAAACTTCATTTCCCAAGCTTCCCCGGGACGAAATTACCCACAACCCCAACCACCACCGAGCAGAGAGCCTATCGCCAGCCTGTATGCAAATGTAACTCAAAATGGTATAAAAGACCTGTAACCCCGTTTATCGGGGCTCTCCCGCTTTCTAACACTGGGGAGCCCTGGTGCACCAGTAAAGACTCTCTGCCGACGTCGGAGTGCCGCGTGGTTCTTTGCGCCAACTCTCATTCCATAGGGCCTAGGAGTTTGGCTCCTAACATTTGGTGCATTGGCCGGGAAACCGAGGGAAGGCAAGAGAACCCCGGCCCCGTCGGTGGATGACTCTCCGGCCCGGGCCACTGACGGACTGACTGAAGACAGACTTCTGTGCCTTTGTCTGCACACAGGTATTGTGTTCTATGTTTTGTCTCTGAACTGTGAATTCTGAGGCCGGCCGGCCACCTCCGTAGGAGTGTTGAAGGAGGACAGACGTGTCCTGAACCTTCACACCCCAGCCCCGAGGGACGCCTCGGTGGTGTTTGTAGGGGAGAACTGACAAGTTCGTCAGACTCCCCAAATCCGTAGGCAGGCCTCCCCTGCCATCTGAATCTGAATACTGGCCGCGGCTCCTTGGTTATTGTCTAGTCTGTGTTGTCTGGTCTGTGTCGACATTGTAGTCATCTTTGTGTATGTGTGTGTAAGTGTGCTGGTGTGGACGCGTGGACAGGACAGGACGACACAGCCATGGGACAGACATTGACTACTCCTCTAACTTTGACTCTGACTCATTTCTCGGACGTCCAAGCAAGAGCTCACAATCTTTCCCTTGAGGTTCGGAAAGGTCGATGGCGAACTTATTGTTCATCAGAGTGGCCCACCCTATCCGTAGGGTGGCCCCGGGATGGGACTTTTGACCTCTCTATTATATTACAGGTTAAGACGAAGGTAATGGATCCCGGACCACGAGGTCATCCAGATCAAATAGCCTATATCCTCACGTGGGAGGATCTCATTCGGAATCCTCCGGCATGGGTGAAACCCTTCCTCCCTTCCTGCCCCCTATCTCAGTCTACCCTTCTCCCCCTGAAAACCTCAAAAGACCGAGCCTCAACCCAACCTTCAGCCCCACCCAAACCGCCCAAACCAGTTCTTCCTGATGAGTCCCAAAAGGACCCTCCTCTCCTAGACGCTTTGTCCTCGCCGCCTCACAACCCCCTCCTACAGCCTCCACCCTATAATCCGCCCCTGGCCCCCGCCTTGACCCCGGTGGGCCCTACGTCCCCTCCTGCCTCCAGCTCCTCCTCCCTCTCCCCAACTTCTTCCCCCGCCTGTACGTCAGCCCCGTCCTCTACCCCAGCCCCACCCGATCTAACTCCCCAGACCCCACCTCAGACCCCCCGCCTCCGTCTCCGGCGATTGGATGACCCAAACGGCCCTCCCACTTGGCAATCTTCCCTGTTTCCTCTTCGGACAGTCAACCGGACTGTCCAATATTGGCCATTCTCTGCCTCCGATCTTTATAATTGGAAAACTCATAACCCTTCCTTTTCCCAAGAACCCCAGGCCCTAACCTCACTGATAGAATCCATCCTCCTCACACACCAGCCCACCTGGGACGACTGCCAGCAACTCCTACAGGTCCTTTTGACTACAGAGGAAAGGCAACGAGTTCTCCTGGAGGCCCGGAAAAATGTGCCAGGGCCTGGAGGCTTTCCAACCCAGCTCCCCAATGAAATAGATGAGGGGTTTCCCCTTACTCGCCCGGACTGGGACTATGAAACGGCTCCAGGTAGGGAGAGTCTCCGAATCTATCGCCAGGCTCTGTTGGCGGGTCTCAAGGGGGCAGGAAAACGGCCCACCAATTTGGCCAAGGTAAGAACTATAATTCAAGGAAAAGAGGAAAGCCCCGCAGCCTTTATGGAACGGCTTCTAGAGGGGTTTCGGATGTATACTCCATTTAACCCCGAAGCTCCAGAACATAAGGCTACAGTGGCCATGTCGTTCATAGATCAGGCAGCATCCGATATAAAAGGAAAACTCCAAAGGTTAGATGGGATCCAAACCTATGGGTTGCAAGAACTAGTTAGGGAGGCAGAAAAGGTATATAACAAGAGGGAAACTCCAGAAGAAAAGGAGGCTAGGCTAGCAAAAGAGCAGGAAGCACGGGAGGAACGAAGAGATCGAAAGAGAGATAAACATCTAACTAAAATCCTGGCAGCTGTAGTGACAGAAAATAGAACAGGAAAGTCAGGGGAAACGAAGAGGCGGCCCAAAATAGAAAAAGACCAATGTGCCTATTGCAAAGAGCGCGGGCACTGGATCAAAGACTGCCCTAAGCGCCCTAGAGACTCAAAGAAATCTACCCCCGTACTCACCTTGGGCGAAGAGAGCGAGTAGGGACGTCAGGGCTCTGGAGCCCCCCCCGAGCCCCGGCTAACTTTATCTGTAGGGGGGCATCCCACCACCTTCCTGGTGGACACGGGAGCTCAACACTCGGTCTTAACCAAGGCAAATGGGCCCCTGTCCTCGCGTACCTCCTGGGTCCAAGGAGCGACAGGAAGGAAAATTCACAAATGGACTAACCGCCGCACGGTTGACCTAGGGCAAGGGACAGTGACACACTCCTTTCTGGTGGTACCCGAATGCCCGTACCCCCTTCTGGGACGAGACCTCCTGACCAAGCTTGGAGCCCAGATACACTTCTCCGAAACGGGGGCCCAAGTGCTAAACCGGGATGGCCAGCCTATCCAAGTCTTGACTGTGTCCTTACACGACGAACATAGACTTTTTGAAACCCCGGTCACCACTAACCTCCTCGAAGCCTGGCTGCAGGACTTTCCCCAGGCCTGGGCAGAAACGGGAGGGCTCGGTCGAGCCAAATGTCAGGCCCCAATCATAATTGACCTAAAGCCCACGGCAATGCCTGTATCTATCAGACAGTATCCCATGAGCAAGGAGGCTCATATGGGCATTCAGCCACACATTACCAGGTTTCTAGAGCTTGGGGTCCTGCGACCTTGCCGCTCACCTTGGAATACCCCTCTCTTACCAGTGAAAAAACCTGGTACTCGGGACTACAGGCCCGTCCAAGACTTAAGGGAAGTCAACAAAAGGACTATGGATATCCATCCTACGGTCCCCAATCCCTATAACTTGCTCAGCACTCTGAGCCCAGACCGCACCTGGTACACAGTACTGGACCTAAAAGATGCATTCTTTTGCTTACCCTTGGCCCCCCAGAGCCAGGAACTGTTTGCTTTCGAATGGAGGGACCCTGAAAGAGGAATCTCAGGCCAATTAACCTGGACCCGCTTACCCCAAGGGTTCAAAAACTCCCCCACTCTCTTTGATGAGGCTCTCCACAGGGACCTAACTGACTTCCGGACTCAACACCCAGAAGTAACTCTACTCCAATATGTGGATGACCTTCTTCTGGCCGCCCCCACAGAGGAAGCCTGCACACGAGGTACCAAACATCTGCTTCGAGAATTGGGAGACAAAGGATACCGGGCATCCGCTAAGAAGGCCCAGATTTGCCAAACCAAAGTAACCTATCTGGGGTACATACTAAGTGAGGGGAAAAGATGGCTCACCCCTGGGCGAATAGAAACTGTGGCTCGCATTCCGCCGCCCCAGAGCCCCAGAGAGGTACGTGAATTCCTGGGAACTGCTGGGTTCTGTCGCTTATGGATACCTGGGTTCGCTGAGCTAGCCGCCCCCCTCTATGCCCTCACGAAAGAGAGTGCACCCTTCACCTGGCAGGAAAAACATCAGTCAGCCTTTGAGGCCCTAAAAGAGGCCCTCCTTTCCGCCCCGGCTCTCGGGTTGCCAGACACCTCCAAGCCCTTTACCCTCTTCATAGACGAGAAACAAGGAATTGCCAAAGGAGTTCTAACCCAAAAACTAGGGCCCTGGAAGAGACCAGTAGCATACCTGTCCAAAAAGTTGGACCCTGTGGCAGCGGGGTGGCCCCCATGTCTTCGTATCATGGCAGCCACTGCTATGCTGGTCAAGGACTCTGCCAAATTAACCCTTGGACAGCCACTAACTGTTATCACCCCGCATGCTTTAGAGGCCATAGTGCGGCAACCACCAGACCGATGGATAACCAACGCACGCCTAACTCACTACCAGGCCCTCCTACTGGACACAGACCGCGTCCAATTTGGACCTCCGGTTACCTTGAACCCTGCCACGTTGCTACCGGCACCGAAAGACCAACAGAGCGCACACGATTGTCGGCAAGTACTGGCTGAGACCCATGGGACACGGGAAGATCTTAAAGATCAAGAGCTCCCAGATGCGGATCACTCTTGGTATACGGACGGGAGCAGTTACATCGACTCAGGTACCCGGAGGGCGGGAGCGGCGGTAGTAGATGGCCACCACATCATATGGGCACAATCACTACCTCCTGGCACGTCTGCCCAAAAGGCTGAGCTGATAGCACTCACCAAGGCCCTAGAGCTATCCGAAGGGAAAAAGGCTAACATATATACAGATAGCCGATATGCCTTTGCAACGGCTCATACACATGGGAGTATTTATGAAAGAAGGGGCCTACTAACCTCAGAAGGAAAAGAAATTAAAAATAAAGCTGAAATCATTGCATTATTAAAGGCCCTTTTTCTTCCCCGGAGAGTAGCCATAATTCATTGCCCCGGGCATCAGAAAGGACAAGACCCAATTGCAACAGGAAATAGACAGGCAGACCAAGTAGCCAGGCAAGTCGCTGTGGCAGAAACGTTGACTTTGACCACAAAGCTTGAAGAAACCAATCTTACGACCAACAAATATGCTTACACCCCAGAAGACCAGGAAGAGGCAAAGGCCATAGGGGCTATA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| 100,219
|
EU030001.1
|
RD114 retrovirus
|
Ghani,K., Caron,M.-C., Caruso,M.
|
Laval University, Medical Biology
|
Canada
|
2007-08-05
|
SC3C
|
RD114 retrovirus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,406
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null | null | null | null |
RD114 retrovirus isolate SC3C, complete genome
|
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| 107,019
|
NC_017083.1
|
Rabbit coronavirus HKU14
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Yip,C.C., Fan,R.Y., Huang,Y., Wang,M., Guo,R., Lam,C.S., Tsang,A.K., Lai,K.K., Chan,K.H., Che,X.Y., Zheng,B.J., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Yip,C.C.Y., Fan,R.Y.Y., Guo,R.T., Lam,C.S.F., Lai,K.K.Y.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2012-07-10
| null |
Rabbit coronavirus HKU14
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 31,100
|
RefSeq
| 1
|
China
|
China
|
Oryctolagus cuniculus
| null |
2006
| null |
PRJNA485481
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Rabbit coronavirus HKU14, complete genome
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| 7,283
|
JN874559.1
|
Rabbit coronavirus HKU14
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Yip,C.C., Fan,R.Y., Huang,Y., Wang,M., Guo,R., Lam,C.S., Tsang,A.K., Lai,K.K., Chan,K.H., Che,X.Y., Zheng,B.J., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Yip,C.C.Y., Fan,R.Y.Y., Guo,R.T., Lam,C.S.F., Lai,K.K.Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
Hong Kong
|
2012-03-26
| null |
Rabbit coronavirus HKU14
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 31,100
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Oryctolagus cuniculus
| null |
2006
| null | null |
Rabbit coronavirus HKU14 strain HKU14-1, complete genome
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| 97,326
|
JN874560.1
|
Rabbit coronavirus HKU14
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Yip,C.C., Fan,R.Y., Huang,Y., Wang,M., Guo,R., Lam,C.S., Tsang,A.K., Lai,K.K., Chan,K.H., Che,X.Y., Zheng,B.J., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Yip,C.C.Y., Fan,R.Y.Y., Guo,R.T., Lam,C.S.F., Lai,K.K.Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
Hong Kong
|
2012-03-26
| null |
Rabbit coronavirus HKU14
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 31,116
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Oryctolagus cuniculus
| null |
2007
| null | null |
Rabbit coronavirus HKU14 strain HKU14-3, complete genome
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| 97,327
|
JN874561.1
|
Rabbit coronavirus HKU14
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Yip,C.C., Fan,R.Y., Huang,Y., Wang,M., Guo,R., Lam,C.S., Tsang,A.K., Lai,K.K., Chan,K.H., Che,X.Y., Zheng,B.J., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Yip,C.C.Y., Fan,R.Y.Y., Guo,R.T., Lam,C.S.F., Lai,K.K.Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
Hong Kong
|
2012-03-26
| null |
Rabbit coronavirus HKU14
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 31,096
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Oryctolagus cuniculus
| null |
2007
| null | null |
Rabbit coronavirus HKU14 strain HKU14-8, complete genome
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| 97,328
|
JN874562.1
|
Rabbit coronavirus HKU14
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Yip,C.C., Fan,R.Y., Huang,Y., Wang,M., Guo,R., Lam,C.S., Tsang,A.K., Lai,K.K., Chan,K.H., Che,X.Y., Zheng,B.J., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Yip,C.C.Y., Fan,R.Y.Y., Guo,R.T., Lam,C.S.F., Lai,K.K.Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
Hong Kong
|
2012-03-26
| null |
Rabbit coronavirus HKU14
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,904
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Oryctolagus cuniculus
| null |
2007
| null | null |
Rabbit coronavirus HKU14 strain HKU14-10, complete genome
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| 97,329
|
NC_001543.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Meyers,G., Wirblich,C., Thiel,H.J., Thumfart,J.O.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-03
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,437
|
RefSeq
| 2
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Rabbit hemorrhagic disease virus-FRG, complete genome
|
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| 8,961
|
OR488784.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Fitzner,A.
|
National Veterinary Research Institute, Department of Foot and Mouth Disease
|
Poland
|
2023-10-10
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,438
|
GenBank
| null |
Poland
|
Poland
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2022
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus strain WAE, complete genome
|
ATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTGTTCTCCCAGCGAAGAAACCTTTAAGTTACTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCACCCGGGAAACTGGCTTGGCCAGTCTTCCTGGACCAAAACGAAAATGAAGGGCCTCTGGAGACATGTGGCAAGTGTGGCAAATGGCTTAATGGATTCGGTGTTTTCGGATTAGAGGATCTCGGTGAAGTTTGCTTATGTTCCTTGACTAAGCATCAACACAAATTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCGCACATACACGACTGCGGTCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTCAAACACTACAAGGCATTGAACAGGGTCATTCCCTGTGCTTACCGGTTCAGTGAAAGAGTCCCCACCCCTATTTTTGAGGGTGAGGTTGATGACTTGTTCGTTGAACTTGGGGCACCAACCAGCATGGGCTTCATGGACAAGAAGCTGCTCAAGAAAGGCAAGAAACTGATGGACAAGTTTGTCGACGTTGACGAGCCCTGTCTGACATCAAAGGACGCCAGCCTCCTCGACTCTATTGCTTCTGACAGCACCATACGCGCGAAGCTGGAAGAGGAGTATGGTGTTGAGATGGTGCAGGCAGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGAAACCTTAGACTTGCTTTAGACAACCGGCCTGCTAACCCCATGACTTGGTACACCAAGCTCGGCAACATCACGGAAAAAGGAAAACAGTGGGCGAGGAAAATTGTTCATGGTGCCCACCGAGTTACTGACCCCCTGAAAACTTTGGCCTCAATCTTATTAGTTGGTCTACACAACGCTATTGCTGTGGACACAACTGTGATGTTGTCAACGTTCAAACCTGTAAACCTGCTGGCTATCCTCATGGATTGGACTAATGATTTAACCGGATTCATCACCACGCTTGTAAGGCTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTTAACTTAATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAAGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGTTTTGACTTGCTCAAAAGACTGTTCGACACATTTGAGGACTCTGTCCCCACAGGACCAACCGCAGGCTGCCTCATCTTCATGGCTTTCGTTTTTTCCACTGTTGTAGGGTACTTGCCAAACAACAGTGTGATCGCAACCTTTATGAAGGGCGCTGGTAAGCTCACAACGTTTGCAGGGGTGGTCGGCGCCATCCGAACACTGTGGATCACCATCAACCAACACATGGTAGCCAAGGACCTCACCAGCATACAACAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCGACGTTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGCTGCCTCTGCTCAGACTTAGAGAACACACTGACAAATAGGTGCACCCTGCCATCATACAACCAACATCTCGGAATCTTGAATGCTTCCCAGAAGGTCATAAGTGACCTGCACACCATGGTTCTTGGGAAGATCAACATGACAAAGCAGAGACCGCAGCCTGTTGCTGTTATTTTTAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACCTACTTGGTCCATAGGCTTGCGCGAGACTTGGGCTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTCGACCATTTTGACTCATATACAGGTGAGGAGGTAGCTATTGCGGATGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTGTTCATCCAAATGGTCAATACAAACCCGTGCCCACTCAACTGTGACAAGGCCGAGAACAAGAACAAGGTCTTTAACTCAAGGTACTTACTGTGCACAACAAACTCCAACATGATACTGAACGCGACTCACCCTCGTGCTGGCGCGTTCTACAGGAGAGTCATGATTGTTGAAGCGCGAAACAAAGCTGTTGAAAGCTGGCAGAACACTAGACATGGCTCCAAGCCAGGGAAATCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTTACTTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTGCCCCAGGGTTTGTATTTGTCGGGGAGAAACTGGTAAAATCACAGGTTGCACCCAGGGAGTACAAATACAGTGAGCTCCTGGACTTGATCAAAAGTGAGCACCCTGATGTGGCCACATTCGAGGGTGCCAATAAGTTCAACTTCATTTACCCAGACGCCCAATTCGAACAGGCGCTTCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTCATGTATGGATGTGTAGCAAGGCTTGCAAAGAATTTTGTTGAAGACATCCCATATAACCAAGTTCACATATCAAAGGTGAGTGACCCCAAGATTGACGGGTGTGTGGAGTACCAGTGCAAGTTCCAACATCTCTGGCGTATGGTCCCACAGTTTGTCTTGGGGTGTGTGAACATGACGAACCAACTTGGCACCCCTTTGACCCAGCAACAGTTGGACAGGATCACCAATGGGGTTGAGGGTGTCACCGTCACAACGGTGAACAACATTCTGCCATTCCACTCACAAACCACACTCATAAACCCCTCTTTCATCAAGCTGATTTGGGCAGTGAGGAGACACCTCAAGGGACTCAGTGGTGTGACCAAGGTGGCTCAGTTCATTTGGCGTGTCATGACTAACCCAGTGGATGCCTATGGCACCCTTGTCAGAACACTTACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGACGATCCAGTTTCAACAACGATAATATGTTCCAACTGCACAATCCAGATCCACTCTTGTGGTGGACTACTTGTGAGGTATTCAAGAGACCCTGCCCCCGTGGCATCGGACAACGTTGACCGTGGTGACCAAGGTGTTGACGTGTTCACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGGCAGATTGCCCACCTATTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTCAACCTTGCGACCATGGCAGCACTGGGTGCTGTCGCCACAAAGGCTTTCCAGGGTGTGAAGGGCAAGACAAAACGCGGCCGTGGTGCAAGAATAAACTTGGGGAATGACGAGTACGATGAGTGGCAGGCTGCGCGCAGAGAGTTCGTCAATGCACATGACATGACTGCAGAGGAGTATCTTGCCATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCATCATGTTCAGGAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGATCAAGCCACCATTGTCGGCAGAGGTGGAGTGAGGAACGAGGTTATTCGCACTAGGGCTAGGCAGGCCCCAAAAGGGCCAAAAACACTGGACGACGGTGGTTTTTATGATAATGACTACGAAGGCCTGCCAGGATTTATGAGGCACAACGGCAGTGGTTGGATGATTCACATAGGCAATGGGTTATACATATCTAACACCCACACTGCCCGGTCGAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGTTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAGGGGGAGGCAATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAAGGAACCCCAGTTAGTGATTGGAAGAAGTCCCCCATCACAACTTATGGCATCAAGAAAACCTTGTCAGACTCCACCAAAATTGACGTGCTAGCGTACGACGGTTGCACACAGACGACCCATGGGGACTGTGGGCTCCCGTTGTATGATTCTAGCGGGAAGGTCGTTGCCATACACACCGGTAAACTACTGGGGTTCTCAAAGATGTGCACATTGATTGACCTCACCGTGACAAAGGGGGTGTATGAGACATCAAACTTTTTCTGTGGCGAACCGATCGACTATAGGGGCATTACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCCAGGCCCCCTGTTAGTGGAACTAGGTATGCCAGGGTCCCAGGTGTGCCAGATGAGTACAAGACTGGCTACAGGCCAGCCAATCTCGGGCGCGGTGACCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTGAAGAATCTGCAGGTTTACCAGCAAGAACCCAAACTTGACAAGGTGGACGAGTTCATTGAGCGGGCAGCTGCCGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTTCTAACCAAGGGAGAGCGGCAGTCAAACTTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGTCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCATGTGAAAGATGGGGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAGTGCTGGAGTGTTGCCAACTCTGGCAAGGCTCTCCACCACATATACGCGTGTGGACTAAAAGATGAGCTCAGGCCCCTTGACAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAAAGACTGTTGTGGGGCTGCGACGTTGGCGTTGCTGTGTGTGCCGCAGCCGTTTTCCACAACATATGCTACAAACTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCTATTGCAGTTGGCGTTGACATGACATCCCGTGATGTTGATGTTATCATTAACAACCTCACCGCCAAAGCCAGTGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAATGGGATTCCACCATGTCACCATGTGTTGTCAGGCTGGCCATCGACATCTTGGCCGACTGCTGTGAACAGACGGAACTCACCAAGAGTGTAGTGCTCACACTAAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGATGCCATGATTGTGCAAACCAAGCGTGGTCTCCCAAGTGGTATGCCCTTCACCTCGGTCATCAACTCTATTTGTCATTGGTTGCTTTGGTCTGCAGCTGTCTACAAGTCCTGCGCCGAGATCGGTCTACACTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTCTATACATATGGTGATGACGGCGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCCGCTATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTGTCACCCACTGCCGCGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTTTTGAAGCGTACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTGGGTATCAAA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| 12,119
|
LC749420.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Tanikawa,T., Watanabe,S., Mikami,O., Miyazaki,A.
|
National Institute of Animal Health; 3-1-5 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-0856
|
Japan
|
2023-04-05
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,437
|
GenBank
| 1
|
Japan:Tokyo
|
Japan
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2000
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus RHDVa/Tokyo-2/2000 RNA, complete genome
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| 16,870
|
LC749421.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Tanikawa,T., Watanabe,S., Mikami,O., Miyazaki,A.
|
National Institute of Animal Health; 3-1-5 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-0856
|
Japan
|
2023-04-05
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,437
|
GenBank
| 1
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Japan:Hokkaido
|
Japan
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Oryctolagus cuniculus
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liver, abdominal cavity
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2002
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus RHDVa/Hokkaido-5/2002 RNA, complete genome
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GTGAAAGTTATGGCGGTTATGTCGCGCCTTATTGGCATGACTACTGCTATTCTACCAGAAAAGAAACCCCTTAGTTTCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCAACTGGGGAACTGGCTTGGCCAGTTTTCCTAGGACAAAACGAGAATGAAGGACTTCTGGAGATATGTGACAAATGTGGCAAATGGCTTAATGGATTTGGTAATTTCGGACTGGAGGATCTCGGCAACGTCTGTTTGTGTTCCATAACCCAGCAGAAGCATAAGTTTGGACCTGTTTGCCTGTGCAATCGTGCCTATATACACGACTGCGGCCGTTGGCGACGCCGCAGTCGTTTCTTGAAGCATTACAAGGCGTTGAACAAGGTCATCCCCTGTGCTTACCGGTTTGATGAGGACTCTTCCCCCCCTGTTTTTGAAGGGGAAGTTGACGACCTGTTTGTTGAACTAGGGGCACCGACCAGCATGGGTTTCATGGATAAGAAACTACTCAAAAAGGGCAAAAAGCTGATGGACAAGTTTGTTGACGTTGACGAACCCTGTTTGACATCAAGAGACGCCGGCCTCCTCGATTCCATTGCTTCAGACAACACCATACGTGCAAAGCTGGAAGAGGAATATGGTGTTGAAATGGTGCAGGCAGCGCGTGACAGGAAAGACTTCATGAAAAACCTCAGGCTCGCCTTGGACAATCGACCAGCAAACCCTGTGACCTGGTACACCAAGCTTGGCAACATCACCGACAAAGGAAAGCAGTGGGCGAAGAAGGTTGTTTATGGTGCCTGTAAAGTGACTGAACCCCTGAAAACGTTGGCTTCAATATTGCTAGTTGGCCTCCACAATGTCATTGCCGTGGACACAACAGTTATGTTGTCGACGTTTAAGCCCGTGAATCTATTAGCAATCCTCATGGACTGGACCAACGACTTGACCGGCTTTGTTACCACACTTGTGAGGTTACTGGAATTGTATGGTGTGATTCAGGCAACTGTCAACTTGATAATTGAGGGTGTGAAAAGCTTTTGGGACAAGGTAATTTGTGCAACGGACCGTTGCTTTGACTTGCTTAAGAGGTTGTTTGACACGTTTGAGGACTCCGTTCCCACGGGCCCAACTGCTGGCTGCCTCATCTTCATGGCCTTTGTCTTTTCCACTGTTGTCGGGTACTTACCCAACAACAACGTAATCACGACTTTTATGAAGGGTGCTGGCAAGCTCACGACCTTTGCAGGGGTTATTGGTGCCATTCGAACACTGTGGATCACTATTAATCAGCATATGGTGGCCAAGGATCTTACCAGCATACAGCAGAAAGTTATGACAGTTGTAAAAATGGCCAACGAAGCGGCAACGCTGGACCAACTCGAGATTGTCAGTTGCCTCTGTTCAGACTTGGAGAACACATTGACAAACAGGTGCACCCTACCATCATACAACCAACATCTTGGGATCTTAAATGCATCTCAAAAGGTTGTGAGTGACTTACACACTATGGTCCTTGGGAAAATCAACATGACAAAGCAGAGACCACAGCCTGTGGCTGTCATCTTCAAAGGAGCCCCAGGCATCGGCAAAACTCACTTGGTTCACAGGATCGCAAGGGATTTGGGTTGTCAGCATCCTAGCACAATCAATTTTGGCCTCGACCACTTCGACTCATACACAGGTGAGGAGGTGGCTATTGCAGATGAGTTCAACACTTGTGGTGATGGGGAGAGTTGGGTCGAGCTGTTCATTCAAATGATCAACACAAACCCATGTCCACTCAATTGTGACAAGGTTGAGAACAAGAACAAGGTTTTCAACTCAAAGTACTTACTGTGCACAACAAACTCCAACACAATACTGAATGCGACACACCCTCGTGCTGGCGCATTTTACAGGAGGGTTCTTATCGTTGAAGCACGCAACAAAGCCGTTGAAAGTTGGCAAGCCACCAGACATGGTTCTAGGCCGGGTAAGTCTTGCTACAGCAAGGACATGTCACACCTAACCTTTCAGGTTTACCCCCACAACATGCCTGCTCCAGGATTCGTGTTTGTTGGGGACAAGTTGGTGAAGTCTCAGGTTGCACCTAGGGAGTACAAGTATAGTGAACTCTTGGATTTAATCAAAAGTGAGCATCCTGATGTGGCCTCGTTCGAAGGCGCTAACAAATTCAACTTCATCTACCCAGACGCCCAATACGAGCAGGCGCTTCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTTATGTATGGGTGTGTGGCGAGACTTGCAAAGAACTTTGTTGACGACATCCCGTACAACCAAGTCCACATTTCGAAAGCGAGCGACCCAAAGATTGACGGGTGTGTAGAGTACCAGTGCAAATTTCAACACCTTTGGCGCATGGTCCCCCAGTTTGTACTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAGCTTGGCACACCTTTAACTCAACAGCAGTTGGACCGGATCACCAATGGGGTTGAGGGTGTCACTGTCACAACGGTAAACAACATCTTGCCGTTCCACTCACAGACCACGCTCATAAACCCCTCTTTCATTAAATTGATTTGGGCAGTCAGGAAGCATCTCAAGGGGCTTAGCGGTGTGACCAAGGTAGCTCAATTCATCTGGCGTGTCATGACCAACCCAGTAGACGCCTATGGATCCCTGGTTAGAACTCTCACCGGAGCTGCCACCTTCTCAGACGACCCAGTTTCCACGACAATCATCTGCTCCAACTGCACAATTCAAATCCACTCCTGCGGTGGGCTGCTCGTTAGGTATTCAAGAGACCCTGTTCCCGTGGCGTCAGACAATGTCGATCGCGGTGACCAGGGTGTTGATGTGTTCACCGACCCTAACCTCATCTCTGGGTACAGCTGGAGGCAGATCGCGCACTTGTTTGTTGAGGTGATTTCACACCTGTGCGCAAACCACCTTGTCAACCTTGCAACTATGGCAGCCCTTGGTGCAGTTGCAACGAAAGCCTTCCAGGGCGTGAAGGGCAAAACAAAGCGTGGTCGCGGAGCAAGGGTAAACTTAGGTAACGACGAGTACGATGAATGGCAGGCTGCACGCAGAGACTTCGTCAATGCGCACGACATGACTGCAGAGGAGTATCTTGCGATGAAGAACAAGGCTGCCATGGGGAGTGATGACCAGGACTCCGTCATGTTTAGGAGCTGGTGGACACGGAGACAACTGAGGCCTGACGAGGATCAGGTCACCATTGTAGGTAGGGGTGGAGTAAGAAATGAAGTCATCCGTACCAGAGCCAGGCAGGTTCCAAAGGGACCAAAAACACTAGACGATGGTGGTTTCTACGACAATGACTACGAGGGCCTGCCTGGTTTTATGAGACACAATGGCAGTGGTTGGATGATCCATATAGGGAACGGACTGTACATCTCCAACACCCACACTGCTAGGTCAAGTTGCTCAGAGATTGTCACATGCTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTCAAGGGCGAGACAATCCGCAGTGTTGCTCAGATTGCTGAAGGCACTCCAGTTTGTGATTGGAAGAAATCTCCGATCTCGACCTATGGCATCAAGAAAACACTGTCAGACTCCACCAAGATTGACGTGCTGGCGTACGATGGTTGCACGCAGACCACCCACGGGGACTGTGGGCTACCATTGTATGATTCTAGTGGGAAGGTTGTCGCCATACACACTGGTAAGCTGCTAGGGTTCTCAAAGATGTGTACATTGGTTGACCTCACCATCACAAAGGGAGTTTATGAAACATCGAATTTTTTCTGTGGCGAGCCGATCGACTACAGGGGAATCACCGCACACAGGCTTGTTGGCGCAGAACCCAGACCTCCGGTCAGTGGAACCAGGTATGCTAGGGTTCCAGGTGTTCCCGACGAGTACAGGACTGGGTACAGGCCAGCCAACCTTGGTCGCGGTGATCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATCGCAGTGAAGAGCTTGCAGGTCTACCAACAGGAACCAAAGCTTGACAAGGTGGATGAGTTTATTGAGCGGGCAGCTGCCGACGTTTTGGGTTACTTACGCTTCCTAACCAAGGGGGAGCGTCAGGTAAACCTGAACTTCAAAGCCGCGTTCAACACACTTGACTTGTCAACGTCTTGCGGACCCTTTGTTCCAGGGAAGAAGATTGACCATGTAAAAGATGGAGTGATGGACCAGGCTCTGGCCAAGCACCTTTACAAGTGCTGGAGCGTTGCCAACTCCGGTAAAGCCCTTCATCACATATACGCGTGTGGGTTGAAGGATGAGCTCAGGCCTCTTGACAAGGTGAAGGAGGGGAAAAAGAGGTTATTGTGGGGCTGTGATGTCGGTGTCGCTGTGTGCGCTGCTGCTGTCTTCCACAACATATGCTACAAGCTGAAGATGGTTGCGCGGTTTGGTCCCATTGCAGTCGGCGTTGACATGACATCCCGTGATGTTGACGTCATCATTAACAACCTCACCGCCAAAGCCAGCGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAGTGGGACTCCACTATGTCACCGTGCGTTGTTAGGTTGGCAATCGACATCTTAGCTGACTGTTGTGAACAGACGGAACTCACCAAAAGCGTCGTACTCACACTAAAGTCCCACCCCATGACTATACTTGACGCCATGATCGTGCAGACCAAACGTGGCCTCCCGAGTGGCATGCCCTTCACTTCGGTCATCAACTCTATCTGCCATTGGCTACTTTGGTCTGCAGCCGTTTACAAATCTTGTGCTGAGATTGGTCTGCACTGCTCCAACCTGTATGAGGATGCCCCATTCTACACGTACGGTGACGACGGCGTGTATGCCATGACTCCGATGATGGTGAGCCTCTTGCCTGCAATAATAGAGAACTTGAAAGACTACGGCTTGTCTCCCACTGCCGCAGACAAAACAGAGTTTATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAGATCTCGTTTCTGAAGCGCACTTTTGAGCTCACGGACATCGGGTG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