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|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LC749422.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Tanikawa,T., Watanabe,S., Mikami,O., Miyazaki,A.
|
National Institute of Animal Health; 3-1-5 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-0856
|
Japan
|
2023-04-05
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,446
|
GenBank
| 1
|
Japan:Ehime
|
Japan
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2019
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus RHDV2/Ehime-1/2019 RNA, complete genome
|
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GGTTTCAAAACTGGACAAGTCCAGCATACTCAGGCAGTTAGAGTGGAGCAAAACAACATCCAGACACATGGTGATTGAGGAGACATATGACTTGGCCAAAGAAGAACGTGGTGTGCAGCTAGAGGAATTGCAAGTTGCTGCTGCCGCACATGGTCAGGAATTTTTCAACTTTGTTCGTAAAGAGCTTGAGCGACAGCAGGCGTACACCCAGTTCAGTGTTTACAGCTACGATACTGCTAGAAAGATACTTGCAGATCGTAAGAGAGTCGTCTCGGTAGTACCTGACGATGATTTTGTGAATGTTATGGAGGGCAAAGCCCGCGCGGCGCCGCAAGGCGAGACAGCGGGCACTGCTACCACAGCATCGGTCCCTGGAACCACAACCGACGGTATGGACCCTGGTGTTGTGGCCACTACTAGTGTGGTCACCACCGAGAACGCGTCCACGTCGATTGCAACGGCGGGGATTGGCGGTCCACCCCAACAGGTGGACCAACAAGAAACTTGGAGGACAAACTTTTACTACAATGATGTTTTTACATGGTCAGTTGCAGACGCCCCGGGCAACATCCTGTACACTGTCCAACACTCGCCACAAAACAACCCGTTCACAGCTGTTCTAAGTCAAATGTACGCTGGCTGGGCCGGTGGCATGCAATTCCGGTTTATAGTCGCTGGGTCAGGTGTCTTCGGTGGGCGTCTGGTTGCAGCGGTTATACCACCGGGCATTGAGATTGGGCCGGGTTTGGAAGTCAGACAATTCCCCCATGTTGTCATTGACGCTCGTTCACTCGAACCAGTCACCATCACCATGCCGGACTTGCGTCCTAACATGTACCACCCGACAGGTAACCCTGGCCTCGTTCCCACGTTGGTCCTGAGCGTTTACAACAACCTCATCAATCCATTTGGTGGATCCACGAGCGCGATCCAGGTCACGGTGGAAACAAGGCCCAGTGAGGACTTTGAGTTTGTGATGATCCGTGCCCCCTCCAGTAAGACCGTTGATTCGATCTCGCCCGCAGATCTCCTCACAACCCCGGTCCTCGCTGGGGTTGGTACCGACAACAGATGGAATGGTGAGATAGTTGGGCTGCAGCCAGTCCCCGGTGGGTTCTCTACGTGCAACAGACATTGGAACTTAAATGGTAGCACATTTGGATGGTCAAGCCCGCGGTTTGCCGCCATTGACCACGACAAAGGCAACGCAAGTTTCCCTGGGAGCAGTTCGTCAAATGTGCTTGAGCTTTGGTATGCTAGTGCCGGGTCTGCAGCTGACAACCCCATCTCCCAAATTGCTCCAGATGGTTTCCCTGACATGTCATTTGTACCCTTTAGCGGCACCACCATCCCTACCGCAGGGTGGGTCGGGTTCGGTGGGATCTGGAACAGCAATAATGGTGCCCCCTACGTCACGACCGTGCAGGCTTATGAGTTGGGCTTTGCCACCGGAGCACCGAGCAACCCTCAACCTACCACCACCACTTCAGGGGCTCAGATTGTTGCCAAGTCCATCTATGGCGTTGCAAATGGCATAAACCAGACAACAGCCGGGTTGTTTGTGATGGCAGCGGGTGTCATATCCACCCCAAACAGTAGTGCCACCACGTACACACCTCAGCCAAACAGGATTGTCAATGCACCTGGCACCCCTGCTGCCGCTCCTATTGGCAAGAACACACCCATCATGTTCGCGTCTGTTGTTAGGCGCACCGGCGACATCAACGCTGAGGCCGGTTCAACTAACGGAACCCAGTATGGCGCGGGATCACAGCCACTGCCGGTGACAGTTGGACTTTCACTGAACAATTACTCATCGGCACTTGTGCCTGGGCAATTCTTTGTTTGGCAGCTGAACTTCGCTTCCGGCTTCATGGAACTTGGCTTAAGTGTTGATGGATACTTCTATGCGGGAACAGGGGCTTCAGCCACCCTCATTGACCTGTCAGAACTTGTTGACATCCGCCCTGTGGGACCCAGACCGTCCACAAGCACGCTCGTGTACAACTTGGGGGGCACAACCAATGGCTTTTCTTATGTCTGAATTTGTTGGACTTGGACTTGCAGGTGCCAGCGTTTTGAGCAGTGCTCTGCTCCGCAGGCAGGAGTTGCAATTACAAAAACAAGCTTTAGAAAATGGGTTGGTATTAAAGGCCAATCAGTTGAGTAGATTAGGCTTTAATCCTAATGAAGTTAAGAGTATGATTGTAGGTAGTAATTTTAGTGGCAATGTTAAGTTAAGTAATATGCATAATGATGCTAGTGTAGTTAGTGCTTATAGTGTGTATAATCCTGCCAGTAATGGCATTAGGAAGAAAATCAAAAGCTTTAATGATAGTGTTAAGGTTTATAATACCACTGGCGAATCCAGTGCTTGATTAGAATTGGCTTAAATTTAATTGGTTTAGTTTGAATTTAATTGGCTTTATAGTTTAGAGTAAGCTAT
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|
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|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Tanikawa,T., Watanabe,S., Mikami,O., Miyazaki,A.
|
National Institute of Animal Health; 3-1-5 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-0856
|
Japan
|
2023-04-05
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,446
|
GenBank
| 1
|
Japan:Ibaraki
|
Japan
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2019
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus RHDV2/Ibaraki-1/2019 RNA, complete genome
|
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| 16,873
|
LC749424.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Tanikawa,T., Watanabe,S., Mikami,O., Miyazaki,A.
|
National Institute of Animal Health; 3-1-5 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-0856
|
Japan
|
2023-04-05
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,446
|
GenBank
| 1
|
Japan:Tochigi
|
Japan
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus RHDV2/Tochigi-1/2020 RNA, complete genome
|
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| 16,874
|
LC749425.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Tanikawa,T., Watanabe,S., Mikami,O., Miyazaki,A.
|
National Institute of Animal Health; 3-1-5 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-0856
|
Japan
|
2023-04-05
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,446
|
GenBank
| 1
|
Japan:Chiba
|
Japan
|
Oryctolagus cuniculus
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liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus RHDV2/Chiba-1/2020 RNA, complete genome
|
GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCCTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGAAAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCACCCAGGAAACTGGCTTGGCCAGTCTTCCTGGACCAAAACGAGAAAGAAGGACTTCTGGAGACATGCAACAAATGTGGGAAATGGCTGAATGGATTCGGCGTTTTCGGACTAGAGGACCTCGGTGAAGTTTGCCTATGCTTTGTGAACAAACAGCAACACAAATTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTTAAACACTACAAGGCATTGAACAAAGTTATCCCCTGTGCTTACCGGTTCGACGAAAGAATCCCCAACCCCATCTTTGAGGGTGAGGTTGACGACCTGTTTGTTGAACTTGGGGCGCCAACCAGCATGGGCTTTATGGACAAGAAACTGCTTAAGAAAGGTAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTCGACATTGACGAGCCCTGTTTAACGTCAAAGGACGCCAGTCTTCTCGACTTCATTGCTTCTGATAACACCATACGTGCGAAGCTGGAGGAGGAGTATGGCGTTGAGATGGTACAGGCAGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGGAACCTCAGGCTCGCTTTGGACAACCGGCCCGCTAACCCTGTGACTTGGTACACTAAGCTCGGCAACATCACAGAAAAAGGAAAACAGTGGGCAAAGAAGATTGTTTATGGTGCTCACAGGGTCACTGATCCTCTGAAAACGTTGGCCTCAATCTTACTGGTTGGTCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACGGTGATGTTATCAACGTTTAAGCCTGTAAACCTACTGGCTATTCTCATGGACTGGACTAACGACTTGACTGGGTTCATCACCACGCTTGTGAGGTTACTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTCAACTTGATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGATAAGGTGGTCTGTGCAACGGAGCGTTGCTTTGACTTGCTCAAAAGGCTGTTTGACACATTCGAGGACTCCGTTCCCACAGGACCAACCGCAGGCTGCCTTATCTTCATGGCTTTCGTCTTCTCCACTGTCGTGGGGTACTTGCCTAACAATAGTGTAATCACAACCTTTATGAAGGGTGCTGGCAAACTCACAACGTTTGCAGGGGTGGTTGGTGCCATCCGGACGTTGTGGATTACCATCAACCAACATATGGTGGCTAAGGACCTCACCAGCATACAGCAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCCAATGAGGCAGCAACGTTGAACCAGCTTGAGATCGTTAGTTGCCTCTGTTCAGACTTGGAGAACACACTGACGAACAGGTGCACCCTGCCATCATACAACCAACACCTTGGAATCTTGAATGCATCCCAGAAGGTCATAAGTGACCTACACACCATGGTCCTTGGAAAGATTAATATGACAAAGCAGAGACCACAGCCTGTGGCTGTTATCTTTAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACTTACTTGGTCCACAGGCTTGCGCGAGACTTGGGTTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATACACAGGAGAGGAAGTGGCTATTGCGGATGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTATTCATCCAAATGGTCAACACAAATCCGTGCCCACTCAATTGTGATAAAGCTGAGAACAAAAACAAGGTCTTCAACTCAAAGTATTTGCTGTGCACAACAAACTCCAGCATGATACTGAACGCGACACATCCTCGTGCTGGCGCATTTTACAGAAGGGTCATGATTGTTGAAGCGCGAAACAAGGCCGTCGAGAGCTGGCAGAACACTAGACACGGTTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTCTCCTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTGCCCCGGGGTTTGTGTTCGTTGGGGAGAAACTGGTGAAGTCACAGGTAGCACCCAGAGAGTACAAGTACAGTGAACTTTTGGACCTGATTAAGAGCGAGCACCCCGATGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAACAAGTTCAACTTCATCTACCCAGACGCTCAATACGAGCAGGCACTCCTTATGTGGAAACAGTACTTTGTTATGTATGGATGCGTAGCAAGGCTTGCAAAGAGCTTTGTTGAGGACATCCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCCAAAATTGGCGGGTGCGTGGAGTATCAGTGCAAGTTCCAGCATCTTTGGCGCATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAACTTGGCACCCCCTTAACTCAGCAACAGTTGGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGCGTCACCGTCACAACGGTGAACAACATCCTGCCGTTCCATTCACAGACCACACTCATAAACCCCTCCTTCATTAAGCTGATTTGGGCAGTGAGAAAGCACCTCAAAGGGCTTAGTGGTGTGACTAAGGTGGCTCAATTCATTTGGCGTGTCATGACCAACCCGATAGACGCCTATGGCACCCTTGTCAGGACGCTCACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGATGACCCGGTTTCAACAACAATAATTTGTTCTAACTGCACAATCCAAATCCACTCTTGCGGTGGGTTGCTTGTGAGGTATTCAAGGGACCCTGCCCCCGTAGCGTCAGACAACGTTGACCGTGGTGACCAAGGTGTTGACGTGTTCACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGGCAGATTGCTCACTTGTTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACTATGGCAGCACTGGGCGCTGTTGCGACGAAGGCTTTCCAGGGCGTGAAAGGCAAGACAAAACGCGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACCTGGGGAACGATGAGTACGACGAGTGGCAAGCCGCGCGTAGAGAATTCGTCAACGCACATGACATGACTGCAGAGGAATATCTCGCCATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCATCATGTTCAGAAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACCATTGTCGGTAAGGGTGGAGTGAGGAACGAGGTCATCCGCACCAGAGCTAGACAGACCCCAAAAGGGCCAAAAACTCTGGATGACGGTGGCTTCTATGACAATGACTATGAGGGTCTGCCAGGATTTATGAGACACAATGGCAGTGGTTGGATGATTCACATAGGCAACGGGTTGTACATATCTAACACCCACACCGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGCTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAAGGTGAGGCGATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAGGGGACCCCAGTTAGTGACTGGAAAAAGTCACCCATCACAACCTATGGCATTAAGAAAACCTTGTCAGATTCCACCAAAATTGACGTACTGGCGTATGACGGTTGCACCCAGACAACCCATGGGGACTGCGGGCTCCCGTTGTATGATTCCAGCGGGAAGATTGTCGCCATACACACTGGCAAGCTACTGGGGTTTTCAAAGATGTGCACACTGATCGATCTTACCGTGACAAAAGGGGTGTATGAAACATCAAACTTTTTCTGCGGTGAACCGATTGATTACAGGGGCATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCTAGGCCCCCTGTCAGTGGGACTAGGTATGCCAGGGTCCCGGGTGTGCCAGATGAGTATAAGACTGGTTACAGGCCGGCAAATCTTGGGCGCGGTGATCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTAAAGAACCTGCAGGTTTACCAACAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGATGAGTTCATTGAGCGGGCGGCTGCTGACGTTTTGGGCTACTTGCGATTTCTAACCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGCCCCTTTGTTCCAGGGAAGAAGATTGACCACGTGAAAGACGGAGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAGTGTTGGAGTGTTGCCAACTCAGGCAAGGCCCTCCACCACATATACGCATGTGGACTGAAAGATGAACTCAGGCCCCTTGACAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTTGGCGTTGCCGTGTGTGCCGCGGCCGTTTTCCACAACATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCCATTGCAGTTGGCGTCGACATGACATCCCGTGACGTCGACGTCATAATCAACAACCTCACCGCCAAGGCCAGCGACTTCCTGTGTTTGGACTACTCAAAGTGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTGGTTAGGCTGGCCATTGACATCTTGGCTGACTGTTGTGAGCAGACGGAACTCACCAAGAGCGTTGTGCTCACACTGAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGACGCTATGATTGTGCAAACCAAACGTGGCCTTCCAAGTGGCATGCCCTTTACCTCGGTCATCAACTCTATTTGTCATTGGTTGCTTTGGTCCGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATTGGCCTACATTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTCTATACGTATGGTGATGACGGCGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCTGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTATCACCCACTGCCACGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAGCAAAATTTCATTTTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTG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| 16,875
|
OM973948.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lozano,L., Sachman,B., de la Rosa,D.
|
Center of Genomic Sciences, Evolutionary Genomics
|
Mexico
|
2023-01-01
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,521
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Oryctolagus cuniculus
| null |
2020-03-04
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus strain Senasica_20, complete genome
|
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| 19,797
|
MZ224015.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O., Goolia,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
|
Canada
|
2022-09-19
|
AB/Canada/WIN-AH-2021-FMA-0002
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,466
|
GenBank
| null |
Canada: Lethbridge, AB
|
Canada
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2021-03-25
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus isolate AB/Canada/WIN-AH-2021-FMA-0002, complete genome
|
AAAGTTATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCTTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCACCCGGGACACTGGCTTGGCCAGTTTTCCCGGACCAAAACGAAAATGAAGGACCTCTGGAGATATGCGGCAAATGTGGCAAATGGCTTAATGGATTCGGTGTTTTCGGACTAGAGGATCTCGGTGAAGTTTGCTTATGTTCTTTGACTAATCATCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTCAAACACTACAAAGCATTGAACAGAGTCATTCCCTGTGCCTACCGGTTTAGTGAAAGAGTCCCCACCCCTATTTTTGAGGGTGAGGTTGACGACTTGTTTGTTGAGCTTGGGGCACCAACCAGCATGGGCTTCATAGACAAGAAGCTACTCAAGAAAGGCAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTTGACGTTGACGAGCCCTGTTTGACATCAAAGGACGCCAGCCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAGCACCATACGCGCGAAGCTGGAAGAAGAGTATGGTGTTGAAATGGTGCAGGCGGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGAAACCTTAGACTTGCTTTGGACAACCGGCCTGCTAACCCCATGACTTGGTACACCAAGCTCGGTAACATCACGGAAAAAGGGAAACAGTGGGCGAAGAAGATTGTTTATGGTGCTCACAGAGTCACTGACCCCCTGAAAACTTTGGCCTCAATCTTACTAGTTGGCCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACAGTGATGTTGTCAACGTTCAAACCTGTAAACCTGCTGGCTATCCTCATGGATTGGACTAATGACTTAACTGGATTCATTACCACGCTTGTAAGACTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTTAATTTAATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAAGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGTTTTGACTTGCTCAAAAGACTGTTCGACACATTTGAGGAGTCTGTCCCCACAGGACCAACTGCAGGCTGTCTCATCTTCATGGCTTTTGTCTTTTCCACTGTTGTGGGGTACTTGCCAAACAACAGTGTGATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGTAAGCTCACAACGTTTGCAGGAGTGGTCGGCGCCATCCGAACACTGTGGATCACCATCAACCAACACATGGTAGCCAAGGACCTCACCAGCATACAACAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCGACGTTGGACCAACTTGAGATCGTTAGCTGCCTCTGCTCAGACTTGGAAAACACACTGACAAATAGGTGCACCCTACCATCATACAACCAACATCTCGGGATCTTGAATGCTTCCCAAAAGGTCATAAGTGACTTACACACCATGGTTCTTGGGAAGATCAACATGACAAAGCAGAGACCGCAGCCTGTTGCTGTTATTTTTAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACCTATTTGGTCCACAGGCTTGCGCGAGACTTGGGCTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTCGGCCTTGACCATTTTGACTCATATACAGGTGAGGAGGTAGCTATTGCAGATGAGTTCAATACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTGTTCATCCAGATGGTCAATACAAACCCGTGCCCACTCAACTGTGACAAGGCCGAGAACAAGAACAAGGTCTTTAACTCAAGGTACTTACTGTGCACAACAAACTCCAACATGATACTGAACGCGACTCACCCTCGTGCTGGTGCGTTCTATAGGAGAGTCATGATTGTTGAAGCGCGAAACAAAGCTGTTGAAAGCTGGCAGAACACTAGACACGGCTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTTACTTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTACTCCAGGATTTGTATTTGTCGGGGAGAAACTGGTCAAGTCACAGGTTGTACCCAGGGAGTACAAATACAGTGAGCTCTTGGACTTGATCAAAAGTGAGCACCCTGATGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAATAAGTTCAACTTCATTTACCCAGACGCCCAATTCGAACAGGCGCTCCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTTATGTACGGATGTGTAGCAAGACTTGCAAAGAATTTTGTTGAAGACATTCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCCAAGATTGACGGGTGTGTGGAGTACCAGTGCAAGTTCCAACATCTCTGGCGTATGGTCCCACAGTTTGTTCTGGGGTGTGTGAACATGACGAACCAACTTGGCACCCCCTTGACCCAGCGACAGTTAGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGTGTCACCGTCACAACGGTGAACAATATCCTGCCATTCCATTCACAAACCACACTCATAAATCCCTCTTTCATAAAGCTGATTTGGGCAGTGAGGAAGCACCTCAAGGGACTCAGTGGTGTGACCAAGGTGGCCCAGTTCATTTGGCGTGTCATGACTAACCCAGTGGATGCCTATGGCACCCTTGTCAGAACACTTACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGACGACCCAGTTTCAACAACGATAATATGTTCCAACTGCACAATCCAAATCCACTCTTGCGGTGGGTTGCTTGTGAGGTATTCAAGAGACCCTGCCCCCGTGGCATCAGACAATGTCGACCGTGGTGATCAAGGTGTTGACGTGTTTACTGACCCCAATCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGACAGATTGCCCACTTATTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACCATGGCTGCACTGGGTGCTGTCGCTACAAAGGCTTTCCAGGGTGTGAAGGGCAAGACAAAACGTGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACTTGGGGAATGACGAGTACGATGAGTGGCAAGCTGCGCGCAGAGAATTCGTTAACGCACATGACATGACTGCAGAAGAGTATCTTGCCATGAAAAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCGTCATGTTTAGGAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACTATTGTCGGCAGAGGTGGAGTGAGGAACGAAGTCATTCGCACTAGGGCTAGGCAGGCCCCAAAAGGGCCAAAAACACTGGACGACGGTGGTTTTTATGACAATGACTATGAAGGCCTGCCAGGATTTATGAGGCACAACGGCAGTGGTTGGATGATTCACATAGGCAATGGGTTGTACATATCCAACACCCACACTGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGTTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAGGGGGAGGCAATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAAGGAACCCCAGTTAGTGATTGGAAGAAGTCCCCCATCACAACTTATGGCATCAAGAAAACCTTGTCAGACTCCACCAAAATTGACGTACTAGCATATGACGGTTGTACACAGACGACTCATGGGGACTGTGGGCTCCCGTTGTATGATTCTAGCGGGAAGATTGTTGCCATACACACCGGCAAACTACTAGGGTTCTCAAAGATGTGCACATTGATTGACCTCACCGTGACAAAGGGGGTGTATGAGACATCAAACTTCTTCTGTGGTGAACCGATCGACTACAGGGGCATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCCAGGCCCCCTGTTAGTGGAACTAGGTATGCCAGGGTCCCAGGTGTGCCAGATGAGTACAAGACTGGTTACAGGCCAGCCAATCTTGGGCGCGGTGATCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTGAAGAACCTGCAGGTTTACCAGCAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGACGAGTTCATTGAGCGGGCAGCTGCCGACGTTTTGGGCTACTTGCGTTTCCTAACCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGTCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCATGTGAAAGACGGGGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAGTGCTGGAGTGTTGCCAACTCTGGCAAGGCTCTCCACCACATATACGCGTGTGGATTAAAAGATGAGCTCAGACCCCTTGACAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTTGGCGTTGCTGTGTGTGCCGCAGCCGTTTTCCACAACATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCTATCGCAGTTGGCGTTGACATGACATCCCGTGATGTTGACGTTATCATTAACAACCTCACCGCCAAAGCCAGTGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAATGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTTGTCAGGCTGGCCATTGACATCTTGGCTGACTGCTGTGAACAGACGGAACTCACCAAGAGTGTGGTGCTCACACTAAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGATGCCATGATTGTGCAAACTAAGCGTGGCCTCCCAAGTGGTATGCCCTTCACCTCGGTCATCAACTCTATCTGCCATTGGCTGCTTTGGTCTGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATCGGCCTACACTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTCTATACATATGGTGATGACGGTGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCCGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTGTCACCCACTGCCGCGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTTTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTGGGT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| 24,469
|
MW789232.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O.
|
Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
|
Canada
|
2022-06-01
|
RHD/04/19
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,473
|
GenBank
| null |
Ghana: Burma Camp
|
Ghana
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
| null | null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus strain RHDV2-S4, complete genome
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| 30,415
|
MW789233.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O.
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Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
|
Canada
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2022-06-01
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RHD/05/19
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Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,473
|
GenBank
| null |
Ghana: Kaneshie
|
Ghana
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Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
| null | null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus strain RHDV2-S5, complete genome
|
GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCCTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGAAAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCGCCCGGGAAACTGGCTTGGCCAGTCTTCTTGGACCAAAACGAGAAAGATGGACTTCTGGAGACATGCAACAAATGTGGTAAATGGCTGAATGGATTCGGCGTTTTCGGACTAGAGGACCTCGGTGAAGTTTGCCTATGCTCTGTGAACAAACAGCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTTAAACATTACAAGGCATTGAACAAAGTCATCCCCTGTGCTTACCGGTTCGATGAAAGAATCCCCAACCCCATCTTTGAGGGTGAGGTTGACGACCTGTTTGTTGAGCTTGGGGCGCCAACCAGCATGGGCTTTATGGACAAGAAACTGCTTAAGAAAGGTAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTCGACATTGACGAGCCCTGTTTGACGTCGAAGGACGCCAGTCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAACACCATACGTGCAAAGCTGGAGGAGGAGTATGGCGTTGAGATGGTACAGGCAGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGGAACCTCAGGCTCGCTTTGGACAACCGGCCCGCTAACCCTGTGACTTGGTACACTAAGCTCGGCAACATCACAGAAAAAGGAAAACAGTGGGCAAAGAAGATTGTTTATGGTGCTCACAGGGTCACTGACCCCCTGAAGACGTTGGCCTCAATTTTACTGGTTGGTCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACGGTGATGTTATCAACGTTTAAGCCTGTAAACCTACTGGCTATTCTCATGGACTGGACCAACGACTTGACTGGGTTTATTACCACGCTTGTGAGGTTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTCAACTTGATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAGGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGCTTTGACTTGCTCAAAAGGCTGTTTGACACATTCGAGGACTCCGTCCCCACAGGACCAACCGCAGGCTGCCTTATCTTCATGGCTTTTGTCTTCTCCACTGTCGTGGGGTACTTGCCTAACAATAGTGTAATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGCAAACTCACAACGTTTGCAGGGGTGGTTGGTGCCATCCGGACGTTGTGGATTACCATCAACCAACATATGGTGGCTAAGGACCTCACCAGCATACAGCAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCAACATTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGTTGCCTCTGTTCAGACTTGGAGAACACACTGACGAACAGGTGCACCCTGCCATCATACAACCAACACCTTGGAATCTTAAATGCATCTCAGAAGGTCATAAGTGACCTACACACCATGGTTCTTGGAAAGATTAATATGACAAAGCAGAGACCACAGCCTGTGGCTGTTATCTTCAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACTCATTTGGTCCACAGACTTGCGCGAGACTTAGGTTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATACACAGGAGAGGAAGTGGCTATTGCGGATGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTATTCATCCAAATGGTCAACACAAATCCGTGCCCACTCAATTGTGACAAAGCTGAGAACAAAAACAAGGTCTTCAACTCAAAGTATTTGCTGTGTACAACAAACTCCAGCATGATACTGAACGCGACACATCCTCGTGCTGGCGCGTTTTACAGAAGGGTCATGATCGTTGAAGCGCGAAACAAGGCCGTCGAGAGCTGGCAGAACACTAGACACGGTTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTCTCCTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTGCCCCGGGGTTTGTGTTCGTTGGGGAGAAACTGGTGAAGTCACAGGTAGCACCCAGAGAGTACAAGTACAGTGAACTTCTGGACCTGATTAAGAGCGAGCACCCCGACGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAACAAGTTCAACTTCATCTACCCAGATGCTCAATACGAGCAAGCACTCCTTATGTGGAAACAGTACTTTGTCATGTATGGATGCGTAGCAAGGCTTGCAAAGAGCTTTGTTGAAGACATCCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCTAAAATTGGCGGGTGCGTGGAGTATCAGTGCAAGTTCCAGCATCTTTGGCGCATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAACTTGGCACCCCCTTAACCCAGCAACAGTTGGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGCGTCACCGTCACAACGGTGAATAACATCCTGCCGTTCCATTCACAAACCACACTCATAAACCCCTCCTTCATTAAGCTGATTTGGGCAGTGAGAAAGCACCTCAAGGGGTTTAGTGGTGTGACTAAGGTGGCTCAATTCATTTGGCGCGTCATGACCAACCCGGTGGACGCCTATGGCACCCTTGTCAGGACGCTCACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGATGACCCGGTTTCAACAACAATAATTTGTTCTAACTGCACAATCCAAATCCACTCCTGCGGTGGGTTGCTTGTGAGGTATTCAAGGGACCCTGCCCCCGTAGCGTCAGACAACGTTGACCGTGGTGACCAAGGTGTTGACGTGTTCACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGGCAGATTGCTCATTTGTTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACTATGGCAGCACTGGGCGCTGTTGCGACGAAGGCTTTCCAGGGCGTGAAAGGCAAGACAAAGCGCGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACCTGGGGAACGATGAGTATGACGAGTGGCAAGCCGCGCGTAGAGAATTCGTCAACGCACATGACATGACTGCAGAGGAATATCTCGCCATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCATCATGTTCAGAAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACCATTGTCGGTAAGGGTGGAGTGAGGAACGAGGTCATCCGCACCAGAGCTAGACAGACCCCAAAAGGGCCAAAGAACCTGGATGATGGTGGCTTCTATGACAATGACTATGAGGGCCTGCCAGGATTCATGAGGCACAATGGCAGTGGCTGGATGATTCACATAGGCAACGGGTTGTACATATCTAACACCCACACCGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGCTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAAGGTGAGGCGATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAGGGGACCCCAGTTAGTGACTGGAAAAAGTCACCCATCACAACCTATGGCATTAAGAAAACCTTGTCAGATTCCACCAAAATTGACGTACTGGCGTATGACGGTTGCACCCAGACAACCCATGGGGACTGCGGGCTCCCGTTGTATGACTCCAGCGGGAAAATTGTCGCCATACACACTGGCAAGCTACTGGGGTTTTCAAAGATGTGCACACTGATCGATCTTACCGTGACAAAAGGGGTGTATGAAACGTCAAACTTTTACTGTGGTGAACCGATTGACTACAGGGGCATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCTAGGCCCCCTGTCAGCGGGACTAGGTATGCCAGGGTCCCGGGTGTGCCAGATGAATATAAGACTGGTTACAGGCCGGCAAATCTTGGGCGCGGTGACCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTAAAGAACCTGCAGGTTTACCAACAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGATGAGTTCATCGAGCGGGCGGCTGCTGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTTCTAGTCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGCCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCACGTGAAAGACGGAGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAATGTTGGAGTGTTGCCAACTCAGGCAAGGCCCTCCACCACATATACGCATGTGGACTGAAAGATGAACTCAGGCCCCTTGACAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTCGGCGTTGCCGTGTGTGCCGCGGCCGTTTTCCACAATATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCCATTGCAGTTGGCGTCGACATGACATCCCGTGATGTCGACGTCATAATCAACAACCTCACCGCCAAGGCCAGCGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAGTGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTGGTTAGGCTGGCCATTGACATTTTGGCTGACTGTTGTGAGCAGACGGAACTCACCAAGAGCGTTGTGCTCACACTGAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGACGCTATGATTGTGCAAACCAAACGTGGCCTCCCGAGTGGTATGCCCTTTACCTCGGTCATCAACTCTATTTGTCATTGGTTGCTTTGGTCCGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATTGGCCTACATTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTTTATACGTATGGTGATGACGGCGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCTGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTATCACCTACTGCCACGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTCTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTG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| 30,416
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MW789234.1
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Rabbit hemorrhagic disease virus
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Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O.
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Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
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Canada
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2022-06-01
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RHD/07/19
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Rabbit hemorrhagic disease virus
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Lagovirus
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Caliciviridae
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ssRNA(+)
| 7,472
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GenBank
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Ghana: Dansoman
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Ghana
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Oryctolagus cuniculus
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liver, abdominal cavity
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Rabbit hemorrhagic disease virus strain RHDV2-S7, complete genome
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| 30,417
|
MW789235.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O.
|
Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
|
Canada
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2022-06-01
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RHD/10/19
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,473
|
GenBank
| null |
Ghana: James Town
|
Ghana
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Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
| null | null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus strain RHDV2-S10, complete genome
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GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCCTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGAAAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCGCCCGGGAAACTGGCTTGGCCAGTCTTCTTGGACCAAAACGAGAAAGATGGACTTCTGGAGACATGCAACAAATGTGGTAAATGGCTGAATGGATTCGGCGTTTTCGGACTAGAGGACCTCGGTGAAGTTTGCCTATGCTCTGTGAACAAACAGCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTTAAACATTACAAGGCATTGAACAAAGTCATCCCCTGTGCTTACCGGTTCGATGAAAGAATCCCCAACCCCATCTTTGAGGGTGAGGTTGACGACCTGTTTGTTGAGCTTGGGGCGCCAACCAGCATGGGCTTTATGGACAAGAAACTGCTTAAGAAAGGTAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTCGACATTGACGAGCCCTGTTTGACGTCGAAGGACGCCAGTCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAACACCATACGTGCGAAGCTGGAGGAGGAGTATGGCGTTGAGATGGTACAGGCAGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGGAACCTCAGGCTCGCTTTGGACAACCGGCCCGCTAACCCTGTGACTTGGTACACTAAGCTCGGCAACATCACAGAAAAAGGAAAACAGTGGGCAAAGAAGATTGTTTATGGTGCTCACAGGGTCACTGACCCCCTGAAGACGTTGGCCTCAATTTTACTGGTTGGTCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACGGTGATGTTATCAACGTTTAAGCCTGTAAACCTACTGGCTATTCTCATGGACTGGACCAACGACTTGACTGGGTTTGTTACCACGCTTGTGAGGTTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTCAACTTGATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAGGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGCTTTGACTTGCTCAAAAGGCTGTTTGACACATTCGAGGACTCCGTCCCCACAGGACCAACCGCAGGCTGCCTTATCTTCATGGCTTTTGTCTTCTCCACTGTCGTGGGGTACTTGCCTAACAATAGTGTAATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGCAAACTCACAACGTTTGCAGGGGTGGTTGGTGCCATCCGGACGTTGTGGATTACCATCAACCAACATATGGTGGCTAAGGACCTCACCAGCATACAGCAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCAACATTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGTTGCCTCTGTTCAGACTTGGAGAACACACTGACGAACAGGTGCACCCTGCCATCGTACAACCAACACCTTGGAATCTTAAATGCATCTCAGAAGGTCATAAGTGACCTACACACCATGGTTCTTGGAAAGATTAATATGACAAAGCAGAGACCACAGCCTGTGGCTGTTATCTTCAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACTCATTTGGTCCACAGACTTGCGCGAGACTTAGGTTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATACACAGGAGAGGAAGTGGCTATTGCGGATGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTATTCATCCAAATGGTCAACACAAATCCGTGCCCACTCAATTGTGACAAAGCTGAGAACAAAAACAAGGTCTTCAACTCAAAGTATTTGCTGTGTACAACAAACTCCAGCATGATACTGAACGCGACACATCCTCGTGCTGGCGCGTTTTACAGAAGGGTCATGATCGTTGAAGCGCGAAACAAGGCCGTCGAGAGCTGGCAGAACACTAGACACGGTTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTCTCCTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTGCCCCGGGGTTTGTGTTCGTTGGGGAGAAACTGGTGAAGTCACAGGTAGCACCCAGAGAGTACAAGTACAGTGAACTTCTGGACCTGATTAAGAGCGAGCACCCCGACGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAACAAGTTCAACTTCATCTACCCAGATGCTCAATACGAGCAAGCACTCCTTATGTGGAAACAGTACTTTGTCATGTATGGATGCGTAGCAAGGCTTGCAAAGAGCTTTGTTGAAGACATCCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCTAAAATTGGCGGGTGCGTGGAGTATCAGTGCAAGTTCCAGCATCTTTGGCGCATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAACTTGGCACCCCCTTAACCCAGCAACAGTTGGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGCGTCACCGTCACAACGGTGAATAACATCCTGCCGTTCCATTCACAAACCACACTCATAAACCCCTCCTTCATTAAGCTGATTTGGGCAGTGAGAAAGCACCTCAAGGGGCTTAGTGGTGTGACTAAGGTGGCTCAATTCATTTGGCGCGTCATGACCAACCCGGTGGACGCCTATGGCACCCTTGTCAGGACGCTCACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGATGACCCGGTTTCAACAACAATAATTTGTTCTAACTGCACAATCCAAATCCACTCCTGCGGTGGGTTGCTTGTGAGGTATTCAAGGGACCCTGCCCCCGTAGCGTCAGACAACGTTGACCGTGGTGACCAAGGTGTTGACGTGTTCACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGGCAGATTGCTCATTTGTTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACTATGGCAGCACTGGGCGCTGTTGCGACGAAGGCTTTCCAGGGCGTGAAAGGCAAGACAAAGCGCGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACCTGGGGAACGATGAGTATGACGAGTGGCAAGCCGCGCGTAGAGAATTCGTCAACGCACATGACATGACTGCAGAGGAATATCTCGCCATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCATCATGTTCAGAAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACCGTTGTCGGTAAGGGTGGAGTGAGGAACGAGGTCATCCGCACCAGAGCTAGACAGACCCCAAAAGGGCCAAAGAACCTGGATGACGGTGGCTTCTATGACAATGACTATGAGGGCCTGCCAGGATTCATGAGGCACAATGGCAGTGGCTGGATGATTCACATAGGCAACGGGTTGTACATATCTAACACCCACACCGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGCTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAAGGTGAGGCGATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAGGGGACCCCAGTTAGTGACTGGAAAAAGTCACCCATCACAACCTATGGCATTAAGAAAACCTTGTCAGATTCCACCAAAATTGACGTACTGGCGTATGACGGTTGCACCCAGACAACCCATGGGGACTGCGGGCTCCCGTTGTATGACTCCAGCGGGAAAATTGTCGCCATACACACTGGCAAGCTACTGGGGTTTTCAAAGATGTGCACACTGATCGATCTTACCGTGACAAAAGGGGTGTATGAAACGTCAAACTTTTACTGTGGTGAACCGATTGACTACAGGGGCATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCTAGGCCCCCTGTCAGCGGGACTAGGTATGCCAGGGTCCCGGGTGTGCCAGATGAATATAAGACTGGTTACAGGCCGGCAAATCTTGGGCGCGGTGACCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTAAAGAACCTGCAGGTTTACCAACAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGATGAGTTCATCGAGCGGGCGGCTGCTGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTTCTAGTCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGCCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCACGTGAAAGACGGAGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAATGTTGGAGTGTTGCCAACTCAGGCAAGGCCCTCCACCACATATACGCATGTGGACTGAAAGACGAACTCAGGCCCCTTGACAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTCGGCGTTGCCGTGTGTGCCGCGGCCGTTTTCCACAATATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCCATTGCAGTTGGCGTCGACATGACATCCCGTGATGTCGACGTCATAATCAACAACCTCACCGCCAAGGCCAGCGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAGTGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTGGTTAGGCTGGCCATTGACATTTTGGCTGACTGTTGTGAGCAGACGGAACTCACCAAGAGCGTTGTGCTCACACTGAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGACGCTATGATTGTGCAAACCAAACGTGGCCTCCCGAGTGGTATGCCCTTTACCTCGGTCATCAACTCTATTTGTCATTGGTTGCTTTGGTCCGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATTGGCCTACATTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTTTATACGTATGGTGATGACGGCGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCTGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTATCACCTACTGCCACGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTCTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTG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| 30,418
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MW789236.1
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Rabbit hemorrhagic disease virus
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Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O.
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Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
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Canada
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2022-06-01
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RHD/11/19
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Rabbit hemorrhagic disease virus
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Lagovirus
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Caliciviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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Ghana: Mamprobi
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Ghana
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Oryctolagus cuniculus
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liver, abdominal cavity
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Rabbit hemorrhagic disease virus strain RHDV2-S11, complete genome
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| 30,419
|
MW789237.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O.
|
Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
|
Canada
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2022-06-01
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RHD/12/19
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,473
|
GenBank
| null |
Ghana: East Legon
|
Ghana
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Oryctolagus cuniculus
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liver, abdominal cavity
| null | null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus strain RHDV2-S12, complete genome
|
GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCCTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGAAAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCGCCCGGGAAACTGGCTTGGCCAGTCTTCTTGGACCAAAACGAGAAAGATGGACTTCTGGAGACATGCAACAAATGTGGTAAATGGCTGAATGGATTCGGCGTTTTCGGACTAGAGGACCTCGGTGAAGTTTGCCTATGCTCTGTGAACAAACAGCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTTAAACATTACAAGGCATTGAACAAAGTCATCCCCTGTGCTTACCGGTTCGATGAAAGAATCCCCAACCCCATCTTTGAGGGTGAGGTTGACGACCTGTTTGTTGAGCTTGGGGCGCCAACCAGCATGGGCTTTATGGACAAGAAACTGCTTAAGAAAGGTAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTCGACATTGACGAGCCCTGTTTGACGTCGAAGGACGCCAGTCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAACACCATACGTGCGAAGCTGGAGGAGGAGTATGGCGTTGAGATGGTACAGGCAGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGGAACCTCAGGCTCGCTTTGGACAACCGGCCCGCTAACCCTGTGACTTGGTACACTAAGCTCGGCAACATCACAGAAAAAGGAAAACAGTGGGCAAAGAAGATTGTTTATGGTGCTCACAGGGTCACTGACCCCCTGAAGACGTTGGCCTCAATTTTACTGGTTGGTCTCCACAACGTTATTGCTGTGGACACAACGGTGATGTTATCAACGTTTAAGCCTGTAAACCTACTGGCTATTCTCATGGACTGGACCAACGACTTGACTGGGTTTATTACCACGCTTGTGAGGTTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTCAACTTGATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAGGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGCTTTGACTTGCTCAAAAGGCTGTTTGACACATTCGAGGACTCCGTCCCCACAGGACCAACCGCAGGCTGCCTTATCTTCATGGCTTTTGTCTTCTCCACTGTCGTGGGGTACTTGCCTAACAATAGTGTAATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGCAAACTCACAACGTTTGCAGGGGTGGTTGGTGCCATCCGGACGTTGTGGATTACCATCAACCAACATATGGTGGCTAAGGACCTCACCAGCATACAGCAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCAACATTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGTTGCCTCTGTTCAGACTTGGAGAACACACTGACGAACAGGTGCACCCTGCCATCATACAACCAACACCTTGGAATCTTAAATGCATCTCAGAAGGTCATAAGTGACCTACACACCATGGTTCTTGGAAAGATTAATATGACAAAGCAGAGACCACAGCCTGTGGCTGTTATCTTCAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACTCATTTGGTCCACAGACTTGCGCGAGACTTAGGTTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATACACAGGAGAGGAAGTGGCTATTGCGGATGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTATTCATCCAAATGGTCAACACAAATCCGTGCCCACTCAATTGTGACAAAGCTGAGAACAAAAACAAGGTCTTCAACTCAAAGTATTTGCTGTGTACAACAAACTCCAGCATGATACTGAACGCGACACATCCTCGTGCTGGCGCGTTTTACAGAAGGGTCATGATCGTTGAAGCGCGAAACAAGGCCGTCGAGAGCTGGCAGAACACTAGACACGGTTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTCTCCTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTGCCCCGGGGTTTGTGTTCGTTGGGGAGAAACTGGTGAAGTCACAGGTAGCACCCAGAGAGTACAAGTACAGTGAACTTCTGGACCTGATTAAGAGCGAGCACCCCGACGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAACAAGTTCAACTTCATCTACCCAGATGCTCAATACGAGCAAGCACTCCTTATGTGGAAACAGTACTTTGTCATGTATGGGTGCGTAGCAAGGCTTGCAAAGAGCTTTGTTGAAGACATCCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCTAAAATTGGCGGGTGCGTGGAGTATCAGTGCAAGTTCCAGCATCTTTGGCGCATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAACTTGGCACCCCCTTAACCCAGCAACAGTTGGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGCGTCACCGTCACAACGGTGAATAACATCCTGCCGTTCCATTCACAAACCACACTCATAAACCCCTCCTTCATTAAGCTGATTTGGGCAGTGAGAAAGCACCTCAAGGGGCTTAGTGGTGTGACTAAGGTGGCTCAATTCATTTGGCGCGTCATGACCAACCCGGTGGACGCCTATGGCACCCTTGTCAGGACGCTCACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGATGACCCGGTTTCAACAACAATAATTTGTTCTAACTGCACAATCCAAATCCACTCCTGCGGTGGGTTGCTTGTGAGGTATTCAAGGGACCCTGCCCCCGTAGCGTCAGACAACGTTGACCGTGGTGACCAAGGTGTTGACGTGTTCACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGGCAGATTGCTCATTTGTTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACTATGGTAGCACTGGGCGCTGTTGCGACGAAGGCTTTCCAGGGCGTGAAAGGCAAGACGAAGCGCGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACCTGGGGAACGATGAGTATGACGAGTGGCAAGCCGCGCGTAGAGAATTCGTCAACGCACATGACATGACTGCAGAGGAATATCTCGCCATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCATCATGTTCAGAAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACCATTGTCGGTAAGGGTGGAGTGAGGAACGAGGTCATCCGCACCAGAGCTAGACAGACCCCAAAAGGGCCAAAGAACCTGGATGACGGTGGCTTCTATGACAATGACTATGAGGGCCTGCCAGGATTCATGAGGCACAATGGCAGTGGCTGGATGATTCACATAGGCAACGGGTTGTACATATCTAACACCCACACCGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGCTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAAGGTGAGGCGATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAGGGGACCCCAGTTAGTGACTGGAAAAAGTCACCCATCACAACCTATGGCATTAAGAAAACCTTGTCAGATTCCACCAAAATTGACGTACTGGCGTATGACGGTTGCACCCAGACAACCCATGGGGACTGCGGGCTCCCGTTGTATGACTCCAGCGGGAAAATTGTCGCCATACACACTGGCAAGCTACTGGGGTTTTCAAAGATGTGCACACTGATCGATCTTACCGTGACAAAAGGGGTGTATGAAACGTCAAACTTTTACTGTGGTGAACCGATTGACTACAGGGGTATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCTAGGCCCCCTGTCAGCGGGACTAGGTATGCCAGGGTCCCGGGTGTGCCAGATGAATATAAGACTGGTTACAGGCCGGCAAATCTTGGGCGCGGTGACCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTAAAGAACCTGCAGGTTTACCAACAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGATGAGTTCATCGAGCGGGCGGCTGCTGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTTCTAGTCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCAGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGCCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCACGTGAAAGACGGAGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAATGTTGGAGTGTTGCCAACTCAGGCAAGGCCCTCCACCACATATACGCATGTGGACTGAAAGATGAACTCAGGCCCCTTGACAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTCGGCGTTGCCGTGTGTGCCGCGGCCGTTTTCCACAATATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCCATTGCAGTTGGCGTCGACATGACATCCCGTGATGTCGACGTCATAATCAACAACCTCACCGCCAAGGCCAGCGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAGTGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTGGTTAGGCTGGCCATTGACATTTTGGCTGACTGTTGTGAGCAGACGGAACTCACCAAGAGCGTTGTGCTCACACTGAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGACGCTATGATTGTGCAAACCAAACGTGGCCTCCCGAGTGGTATGCCCTTTACCTCGGTCATCAACTCTATTTGTCATTGGTTGCTTTGGTCCGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATTGGCCTACATTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTTTATACGTATGGTGATGACGGCGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCTGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTATCACCTACTGCCACGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTCTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTG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| 30,420
|
MW789238.1
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Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O.
|
Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
|
Canada
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2022-06-01
|
RHD/17/19
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,473
|
GenBank
| null |
Ghana: Teshie Tsuibleoo
|
Ghana
|
Oryctolagus cuniculus
|
lung
| null | null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus strain RHDV2-S17, complete genome
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| 30,421
|
MW789239.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O.
|
Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
|
Canada
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2022-06-01
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RHD/19/19
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,473
|
GenBank
| null |
Ghana: Kasoa
|
Ghana
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Oryctolagus cuniculus
|
spleen, abdominal cavity
| null | null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus strain RHDV2-S19, complete genome
|
GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCCTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGAAAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCGCCCGGGAAACTGGCTTGGCCAGTCTTCTTGGACCAAAACGAGAAAGATGGACTTCTGGAGACATGCAACAAATGTGGTAAATGGCTGAATGGATTCGGCGTTTTCGGACTAGAGGACCTCGGTGAAGTTTGCCTATGCTCTGTGAACAAACAGCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTTAAACATTACAAGGCATTGAACAAAGTCATCCCCTGTGCTTACCGGTTCGATGAAAGAATCCCCAACCCCATCTTTGAGGGTGAGGTTGACGACCTGTTTGTTGAGCTTGGGGCGCCAACCAGCATGGGCTTTATGGACAAGAAACTGCTTAAGAAAGGTAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTCGACATTGACGAGCCCTGTTTGACGTCGAAGGACGCCAGTCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAACACCATACGTGCGAAGCTGGAGGAGGAGTATGGCGTTGAGATGGTACAGGCAGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGGAACCTCAGGCTCGCTTTGGACAACCGGCCCGCTAACCCTGTGACTTGGTACACTAAGCTCGGCAACATCACAGAAAAAGGAAAACAGTGGGCAAAGAAGATTGTTTATGGTGCTCACAGGGTCACTGACCCCCTGAAGACGTTGGCCTCAATTTTACTGGTTGGTCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACGGTGATGTTATCAACGTTTAAGCCTGTAAACCTACTGGCTATTCTCATGGACTGGACCAACGACTTGACTGGGTTTATTACCACGCTTGTGAGGTTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTCAACTTGATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAGGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGCTTTGACTTGCTCAAAAGGCTGTTTGACACATTCGAGGACTCCGTCCCCACAGGACCAACCGCAGGCTGCCTTATCTTCATGGCTTTTGTCTTCTCCACTGTCGTGGGGTACTTGCCTAACAATAGTGTAATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGCAAACTCACAACGTTTGCAGGGGTGGTTGGTGCCATCCGGACGTTGTGGATTACCATCAACCAACATATGGTGGCTAAGGACCTCACCAGCATACAGCAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCAACATTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGTTGCCTCTGTTCAGACTTGGAGAACACACTGACGAACAGGTGCACCCTGCCATCATACAACCAACACCTTGGAATCTTGAATGCATCTCAGAAGGTCATAAGTGACCTACACACCATGGTTCTTGGAAAGATTAATATGACAAAGCAGAGACCACAGCCTGTGGCTGTTATCTTCAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACTCATTTGGTCCACAGACTTGCGCGAGACTTAGGTTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATACACAGGAGAGGAAGTGGCTATTGCGGATGAGTTCAACACTTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTATTCATCCAAATGGTCAACACAAATCCGTGCCCACTCAATTGTGACAAAGCTGAGAACAAAAACAAGGTCTTCAACTCAAAGTATTTGCTGTGTACAACAAACTCCAGCATGATACTGAACGCGACACATCCTCGTGCTGGCGCGTTTTACAGAAGGGTCATGATCGTTGAAGCGCGAAACAAGGCCGTCGAGAGCTGGCAGAACACTAGACACGGTTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTCTCCTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTGCCCCGGGGTTTGTGTTCGTTGGGGAGAAACTGGTGAAGTCACAGGTAGCACCCAGAGAGTACAAGTACAGTGAACTTCTGGACCTGATTAAGAGCGAGCACCCCGACGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAACAAGTTCAACTTCATCTACCCAGATGCTCAATACGAGCAAGCACTCCTTATGTGGAAACAGTACTTTGTCATGTATGGATGCGTAGCAAGGCTTGCAAAGAGCTTTGTTGAAGACATCCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCTAAAATTGGCGGGTGCGTGGAGTATCAGTGCAAGTTCCAGCATCTTTGGCGCATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAACTTGGCACCCCCTTAACCCAGCAACAGTTGGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGCGTCACCGTCACAACGGTGAATAACATCCTGCCGTTCCATTCACAAACCACACTCATAAACCCCTCCTTCATTAAGCTGATTTGGGCAGTGAGAAAGCACCTCAAGGGGTTTAGTGGTGTGACTAAGGTGGCTCAATTCATTTGGCGCGTCATGACCAACCCGGTGGACGCCTATGGCACCCTTGTCAGGACGCTCACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGATGACCCGGTTTCAACAACAATAATTTGTTCTAACTGCACAATCCAAATCCACTCCTGCGGTGGGTTGCTTGTGAGGTATTCAAGGGACCCTGCCCCCGTAGCGTCGGACAACGTTGACCGTGGTGACCAAGGTGTTGACGTGTTCACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGGCAGATTGCTCATTTGTTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACTATGGCAGCACTGGGCGCTGTTGCGACGAAGGCTTTCCAGGGCGTGAAAGGCAAGACAAAGCGCGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACCTGGGGAACGATGAGTATGACGAGTGGCAAGCCGCGCGTAGAGAATTCGTCAACGCACATGACATGACTGCAGAGGAATATCTCGCCATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCATCATGTTCAGAAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACCATTGTCGGTAAGGGTGGAGTGAGGAACGAGGTCATCCGCACCAGAGCTAGACAGACCCCAAAAGGGCCAAAGAACCTGGATGATGGTGGCTTCTATGACAATGACTATGAGGGCCTGCCAGGATTCATGAGGCACAATGGCAGTGGCTGGATGATTCACATAGGCAACGGGTTGTACATATCTAACACCCACACCGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGCTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAAGGTGAGGCGATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAGGGGACCCCAGTTAGTGACTGGAAAAAGTCACCCATCACAACCTATGGCATTAAGAAAACCTTGTCAGATTCCACCAAAATTGACGTACTGGCGTATGACGGTTGCACCCAGACAACCCATGGGGACTGCGGGCTCCCGTTGTATGACTCCAGCGGGAAAATTGTCGCCATACACACTGGCAAGCTACTGGGGTTTTCAAAGATGTGCACACTGATCGATCTTACCGTGACAAAAGGGGTGTATGAAACGTCAAACTTTTACTGTGGTGAACCGATTGACTACAGGGGCATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCTAGGCCCCCTGTCAGCGGGACTAGGTATGCCAGGGTCCCGGGTGTGCCAGATGAATATAAGACTGGTTACAGGCCGGCAAATCTTGGGCGCGGTGACCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTAAAGAACCTGCAGGTTTACCAACAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGATGAGTTCATCGAGCGGGCGGCTGCTGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTTCTAGTCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGCCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCACGTGAAAGACGGAGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAATGTTGGAGTGTTGCCAACTCAGGCAAGGCCCTCCACCACATATACGCATGTGGACTGAAAGATGAACTCAGGCCCCTTGACAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTCGGCGTTGCCGTGTGTGCCGCGGCCGTTTTCCACAATATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCCATTGCAGTTGGCGTCGACATGACATCCCGTGATGTCGACGTCATAATCAACAACCTCACCGCCAAGGCCAGCGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAGTGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTGGTTAGGCTGGCCATTGACATTTTGGCTGACTGTTGTGAGCAGACGGAACTCACCAAGAGCGTTGTGCTCACACTGAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGACGCTATGATTGTGCAAACCAAACGTGGCCTCCCGAGTGGTATGCCCTTTACCTCGGTCATCAACTCTATTTGTCATTGGTTGCTTTGGTCCGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATTGGCCTACATTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTTTATACGTATGGTGATGACGGCGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCTGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTATCACCTACTGCCACGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTCTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTG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| 30,422
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MW789240.1
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Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O.
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Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
|
Canada
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2022-06-01
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RHD/21/19
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,473
|
GenBank
| null |
Ghana: McCarthy Hill
|
Ghana
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Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
| null | null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus strain RHDV2-S21, complete genome
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| 30,423
|
MW789241.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O.
|
Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
|
Canada
|
2022-06-01
|
RHD/23/19
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,473
|
GenBank
| null |
Ghana: Anyaa
|
Ghana
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
| null | null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus strain RHDV2-S23, complete genome
|
GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCCTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGAAAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCGCCCGGGAAACTGGCTTGGCCAGTCTTCTTGGACCAAAACGAGAAAGATGGACTTCTGGAGACATGCAACAAATGTGGTAAATGGCTGAATGGATTCGGCGTTTTCGGACTAGAGGACCTCGGTGAAGTTTGCCTATGCTCTGTGAACAAACAGCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTTAAACATTACAAGGCATTGAACAAAGTCATCCCCTGTGCTTACCGGTTCGATGAAAGAATCCCCAACCCCATCTTTGAGGGTGAGGTTGACGACCTGTTTGTTGAGCTTGGGGCGCCAACCAGCATGGGCTTTATGGACAAGAAACTGCTTAAGAAAGGTATGAAACTAATGGACAAGTTTGTCGACATTGACGAGCCCTGTTTGACGTCGAAGGACGCCAGTCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAACACCATACGTGCGAAGCTGGAGGAGGAGTATGGCGTTGAGATGGTACAGGCAGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGGAACCTCAGGCTCGCTTTGGACAACCGGCCCGCTAACCCTGTGACTTGGTACACTAAGCTCGGCAACATCACAGAAAAAGGAAAACAGTGGGCAAAGAAGATTGTTTATGGTGCTCACAGGGTCACTGACCCCCTGAAGACGTTGGCCTCAATTTTACTGGTTGGTCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACGGTGATGTTATCAACGTTTAAGCCTGTAAACCTACTGGCTATTCTCATGGACTGGACCAACGACTTGACTGGGTTTATTACCACGCTTGTGAGGTTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTCAACTTGATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAGGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGCTTTGACTTGCTCAAAAGGCTGTTTGACACATTCGAGGACTCCGTCCCCACAGGACCAACCGCAGGCTGCCTTATCTTCATGGCTTTTGTCTTCTCCACTGTCGTGGGGTACTTGCCTAACAATAGTGTAATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGCAAACTCACAACGTTTGCAGGGGTGGTTGGTGCCATCCGGACGTTGTGGATTACCATCAACCAACATATGGTGGCTAAGGACCTCACCAGCATACAGCAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCAACATTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGTTGCCTCTGTTCAGACTTGGAGAACACACTGACGAACAGGTGCACCCTGCCATCATACAACCAACACCTTGGAATCTTGAATGCATCTCAGAAGGTCATAAGTGACCTACACACCATGGTTCTTGGAAAGATTAATATGACAAAGCAGAGACCACAGCCTGTGGCTGTTATCTTCAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACTCATTTGGTCCACAGACTTGCGCGAGACTTAGGTTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATACACAGGAGAGGAAGTGGCTATTGCGGATGAGTTCAACACTTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTATTCATCCAAATGGTCAACACAAATCCGTGCCCACTCAATTGTGACAAAGCTGAGAACAAAAACAAGGTCTTCAACTCAAAGTATTTGCTGTGTACAACAAACTCCAGCATGATACTGAACGCGACACATCCTCGTGCTGGCGCGTTTTACAGAAGGGTCATGATCGTTGAAGCGCGAAACAAGGCCGTCGAGAGCTGGCAGAACACTAGACACGGTTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTCTCCTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTGCCCCGGGGTTTGTGTTCGTTGGGGAGAAACTGGTGAAGTCACAGGTAGCACCCAGAGAGTACAAGTACAGTGAACTTCTGGACCTGATTAAGAGCGAGCACCCCGACGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAACAAGTTCAACTTCATCTACCCAGATGCTCAATACGAGCAAGCACTCCTTATGTGGAAACAGTACTTTGTCATGTATGGATGCGTAGCAAGGCTTGCAAAGAGCTTTGTTGAAGACATCCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCTAAAATTGGCGGGTGCGTGGAGTATCAGTGCAAGTTCCAGCATCTTTGGCGCATGGTCCCACAGTTTGTCTTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAACTTGGCACCCCCTTAACCCAGCAACAGTTGGACAGGATCACCAACGGAGTTGAGGGCGTCACCGTCACAACGGTGAATAACATCCTGCCGTTCCATTCACAAACCACACTCATAAACCCCTCCTTCATTAAGCTGATTTGGGCAGTGAGAAAGCACCTCAAGGGGTTTAGTGGTGTGACTAAGGTGGCTCAATTCATTTGGCGCGTCATGGCCAACCCGGTGGACGCCTATGGCACCCTTGTCAGGACGCTCACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGATGACCCGGTTTCAACAACAATAATTTGTTCTAACTGCACAATCCAAATCCACTCCTGCGGTGGGTTGCTTGTGAGGTATTCAAGGGACCCTGCCCCCGTAGCGTCGGACAACGTTGACCGTGGTGACCAAGGTGTTGACGTGTTCACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGGCAGATTGCTCATTTGTTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACTATGGCAGCACTGGGTGCTGTTGCGACGAAGGCTTTCCAGGGCGTGAAAGGCAAGACAAAGCGCGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACCTGGGGAACGATGAGTATGACGAGTGGCAAGCCGCGCGTAGAGAATTCGTCAACGCACATGACATGACTGCAGAGGAATATCTCGCCATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCATCATGTTCAGAAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACCATTGTCGGTAAGGGTGGAGTGAGGAACGAGGTCATCCGCACCAGAGCTAGACAGACCCCAAAAGGGCCAAAGAACCTGGATGATGGTGGCTTCTATGACAATGACTATGAGGGCCTGCCAGGATTCATGAGGCACAATGGCAGTGGCTGGATGATTCACATAGGCAACGGGTTGTACATATCTAACACCCACACCGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGCTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAAGGTGAGGCGATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAGGGGACCCCAGTTAGTGACTGGAAAAAGTCACCCATCACAACCTATGGCATTAAGAAAACCTTGTCAGATTCCACCAAAATTGACGTACTGGCGTATGACGGTTGCACCCAGACAACCCATGGGGACTGCGGGCTCCCGTTGTATGACTCCAGCGGGAAAATTGTCGCCATACACACTGGCAAGCTACTGGGGTTTTCAAAGATGTGCACACTGATCGATCTTACCGTGACAAAAGGGGTGTATGAAACGTCAAACTTTTACTGTGGTGAACCGATTGACTACAGGGGCATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCTAGGCCCCCTGTCAGCGGGACTAGGTATGCCAGGGTCCCGGGTGTGCCAGATGAATATAAGACTGGTTACAGGCCGGCAAATCTTGGGCGCGGTGACCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTAAAGAACCTGCAGGTTTACCAACAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGATGAGTTCATCGAGCGGGCGGCTGCTGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTTCTAGTCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGCCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCACGTGAAAGACGGAGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAATGTTGGAGTGTTGCCAACTCAGGCAAGGCCCTCCACCACATATACGCATGTGGACTGAAAGATGAACTCAGGCCCCTTGACAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTCGGCGTTGCCGTGTGTGCCGCGGCCGTTTTCCACAATATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCCATTGCAGTTGGCGTCGACATGACATCCCGTGATGTCGACGTCATAATCAACAACCTCACCGCCAAGGCCAGCGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAGTGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTGGTTAGGCTGGCCATTGACATTTTGGCTGACTGTTGTGAGCAGACGGAACTCACCAAGAGCGTTGTGCTCACACTGAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGACGCTATGATTGTGCAAACCAAACGTGGCCTCCCGAGTGGTATGCCCTTTACCTCGGTCATCAACTCTATTTGTCATTGGTTGCTTTGGTCCGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATTGGCCTACATTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTTTATACGTATGGTGATGACGGCGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCTGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTATCACCTACTGCCACGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTCTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTG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| 30,424
|
OR786311.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Li,X.
|
National Institutes for Food and Drug Control, Institute for Laboratory Animal Resources
|
China
|
2023-11-25
|
Beijing-NIFDC-ILAR2022-14
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,443
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2022
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate Beijing-NIFDC-ILAR2022-14, complete genome
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| 10,633
|
OR786312.1
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Rabbit hemorrhagic disease virus 2
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Li,X.
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National Institutes for Food and Drug Control, Institute for Laboratory Animal Resources
|
China
|
2023-11-25
|
Beijing-NIFDC-ILAR2022-62
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Rabbit hemorrhagic disease virus
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Lagovirus
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Caliciviridae
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ssRNA(+)
| 7,443
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Oryctolagus cuniculus
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liver, abdominal cavity
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2022
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate Beijing-NIFDC-ILAR2022-62, complete genome
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GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCACGCCTTGTCGGCATGACAACTGCTATTTTACCAGAAAAGAAACCCCTTAGTTTCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCCCCCTGTTGTATTCGGGCAACCGGGAAACTGGCTTGGCCAGTTTTCCTGGAACAAAACGAGAAGGAAGAACCTCTGGAGGCATGTGGCAAATGTGGCAAATGGCTCAACGGATTCGGCAACTTTGGACTGGAGGATCTCGGCAATGTCTGCTTGTGTTCCATAACCCAACAGAAACACAAATTTGGACCTGTTTGCCTGTGCAACCGTGCTTACATACACGACTGCGGTCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTCTTAAAGCACTACAAGGCATTAAACAAAGTTATCCCCTGTGCTTACCGGTTCAGTGAGGGTGTCCCTCCCCCAGTTTTTGAGGGGGAGGTCGACGATCTATTTGTTGAACTAGGTGCACCGACTAGCATGGGTTTTATGGACAAGAAATTGCTCAAGAAAGGTAAGAAGTTGATGGACAAGTTTGTTGACGTTGACGAGCCCTGTTTGACATCTAAGGATGCCAACCTCCTCGACTCCATTGCCTCAGACAACACCATACGAGCAAAACTGGAAGAGGAATATGGTGTTGAGATGGTGCAGGCAGCGCGTGATAGGAAAGACTTCATGAGAAACCTCAGGCTTGCTCTAGACAACCGACCTGCAAACCCCGTGACCTGGTACACCAAGCTCGGCAACATCACCGACAAAGGGAAACAGTGGGCAAAGAAGGTTGTTTATGGTGCCTGCAAAGTGACTGACCCCCTAAAGACGTTAGTTTCAATTTTACTGGTTGGTCTCCACAATGCCATCGCCGTGGACACAACAGTCATGTTGTCGACTTTCAAACCTGTGAACCTGTTGGCAATTCTCATGGACTGGACCAATGACTTGACTGGTTTCGTCACCACACTTGTGAGGTTACTGGAACTGTATGGTGTAGTGCAGGCAACTGTCAATCTTATAATTGAGGGTGTCAAAAGCTTTTGGGATAAAGTGGTTTGCGCAACAGACCGCTGCTTTGACTTGCTCAAGAGGTTGTTTGATACGTTTGAGGGCTCCGTCCCCACAGGACCAACTGCTGGTTGCCTTATCTTCATGGCCTTTGTTTTCTCAACTGTTGTCGGGTACCTACCCAACAACAACGTGATAACAACCTTTATGAAGGGTGCTGGTAAGCTCACGACCTTTGCAGGTGTCATTGGTGCCATCCGAACACTGTGGATTACTATCAACCAGCACATGGTTGCTAAGGACCTCACCAGTATACAACAGAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCCAACGAAGCGGCAACGCTGGACCAGCTTGAGATCGTCAGTTGCCTCTGTTCAGACTTGGAGAATACATTGACAAACAGGTGCACCTTACCGTCGTACAACCAACACCTTGGGATCTTGAATGCATCTCAGAAAGTCGTGAGCGACTTACACACAATGGTCCTTGGGAAGATCAACATGACTAAGCAGAGGCCACAGCCTGTGGCTGTCATCTTCAAAGGAGCCCCAGGGATCGGCAAGACATACTTGGTTCACAGGATCGCACGTGACCTAGGTTGCCAGCACCCCAGCACAATCAACTTTGGTCTTGACCACTTCGACTCGTACACGGGTGAGGAGGTCGCCATCGCGGATGAATTCAACACCTGTGGTGACGGGGAAAGTTGGGTTGAGTTGTTCATCCAAATGGTCAACACCAACCCTTGTCCGCTCAACTGTGACAAGGCTGAGAACAAGAACAAGGTTTTCAACTCAAAGTACTTGTTGTGCACAACAAACTCCAACATGATACTGAACGCAACACACCCCCGTGCTGGTGCATTTTACAGAAGGGTGTTGATTGTTGAAGCACGCAACAAAGCTGTTGAGAGCTGGCAAGCCACCAGACATGGCTCCAGGCCGGGAAAGTCTTGTTACAGTAAGGACATGTCACACCTGACCTTTCAAGTTTACCCCCACAACATGCCCGCCCCAGGATTCGTTTTCGTTGGGGACAAGTTGGTGAAATCCCAGGTTGCGCCCAGGGAGTACAAGTACAATGAACTTTTGGACCTGATCAAGAGCGAGCACCCTGACGTGGCCTCGTTTGAAGGTGCTAACAAGTTTAATTTCATTTACCCAGATGCCCAATATGAACAGGCGCTTCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTCATGTACGGGTGTGTGGCGAGACTAGCGAAGAACTTTGTGGAGGATATTCCGTACAACCAGGTCCACATTTCAAAAGCAAGCGACCCAAGGATTGACGGGTGTGTGGAGTACCAGTGTAAATTCCAGCACCTTTGGCGCATGGTCCCCCAGTTTGTCTTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAACTTGGCACACCCTTAACCCAACAACAGTTAGACAGGATCACCAATGGTGTTGAGGGCGTGACTGTCACAACGGTGAACAATATCTTACCGTTTCACTCACAAACTACGCTCATCAACCCCTCCTTCATTAAATTGATCTGGGCAGTCAGAAAGCACCTCAAGGGGCTCAGCGGCGTGACCAAGGTAGCTCAATTCATCTGGCGCGTCATGACCAACCCGGTGGACGCCTATGGAACCCTGGTTAGAACACTCACCGGAGCTGCCACCTTTTCAGACGACCCAGTCTCCACTACAATTATCTGCTCCAACTGCACAATCCAAATTCACTCCTGCGGTGGACTGCTCGTCAGGTACTCAAGAGACCCTGTACCCGTGGCGTCGGACAATGTTGACCGCGGTGACCAGGGTGTTGACGTGTTCACCGACCCCAACCTTATCTCTGGGTTTAGTTGGAGGCAGATTGCGCACCTGTTCGTTGAAGTGATCTCACACCTGTGCGCGAATCACCTTGTTAACCTTGCAACTGTGGCAGCCCTTGGTGCGGTTGCAACGAAGGCCTTCCAGGGCGTGAAAGGCAAGACAAAACGGGGTCGTGGTGCGAGGATTAATTTAGGAAATGACGAGTACGACGAGTGGCAAGCCGCTCGCAGGGAGTTCGTCAACGCACACGACATGACTGCAGAGGAATATCTTGCAATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGGAGTGACGACCAGGACTCTGTCATGTTCAGGAGCTGGTGGACACGGAGACAACTGAGACCTGAAGAGGACCAGGTTACCGTTATTGGTAGAGGTGGGGTGAGGAACGAGGTCATCCGCACCAGGGCCAGGCAGGCCCCGAAAGGGCCGAAAACACTGGATGACGGCGGTTTCTATGATAATGACTATGAGGGCCTACCTGGTTTCATGAGACACAATGGTAGTGGTTGGATGATTCACATAGGAAATGGACTGTACATCTCCAACACCCATACTGCCAGGTCAAGTTGCTCAGAGATCGTCACGTGCTCACCCACCACAGACCTGTGCCTCGTTAAGGGGGAGACGATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAAGGCACACCAGTTTGTGACTGGAAAAAGTCCCCCATTTCAACCTATGGCATCAAGAAGACACTGTCTGACTCCACCAAGATTGACGTACTGGCGTATGACGGCTGCACGCAGACCACCCACGGAGACTGTGGACTACCGTTGTACGACTCCAGTGGAAAGATTGTTGCCATACACACCGGAAAGCTGTTAGGGTTTTCAAAGATGTGCACATTGATAGATCTCACCGTCACAAAGGGCGTTTATGAAACATCTAACTTCTTCTGTGGTGAACCAATTGACTACAGAGGAATTACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAGCCTAGACCCCCCGTTAGCGGAACAAGGTATGCCAGGGTCCCAGGCGTGCCTGACGAGTACAAAACTGGGTATAGGCCAGCTAACCTTGGGCGCAGTGACCCGGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATCGCAGTGAAAAACTTGCAGATCTACCAGCAGGAACCAAAGCTTGACAAGGTTGATGAGTTCATTGAGCGGGCGGCTGCCGACGTTTTGGGCTATTTGCGTTTCTTAACCAAGGGGGAACGCCAGATGAACTTGAACTTCAAAGCCGCGTTTAACACACTGGACTTGTCGACATCCTGCGGACCCTTCGTCCCAGGAAAGAAGATTGACCATGTAAAAGACGGAGTGATGGACCAAGTGTTGGCTAAGCATCTCTACAAGTGTTGGAGCGTCGCCAACTCTGGTAAGGCACTTCACCACATATACGCATGTGGGCTGAAGGACGAACTCAGGCCTCTTGACAAGGTGAAGGAGGGGAAGAAGAGGCTGCTGTGGGGTTGTGATGTCGGTGTTGCCGTGTGTGCCGCTGCTGTTTTTCACAACATATGTTACAAGCTAAAGATGGTTGCGCGGTTTGGCCCCATTGCGGTTGGTGTCGACATGACGTCTCGCGACGTTGACGTCATCATCAACAACCTTACCTCCAAGGCTAGTGACTTCCTGTGTTTGGACTACTCAAAATGGGACTCCACCATGTCACCGTGTGTTGTCAGGTTGGCAATTGACATCTTGGCTGACTGCTGTGAGCAAACGGAACTCACCAAAAGCGTTGTTCTCACTCTAAAGTCCCATCCCATGACCATACTAGACGCCATGATTGTGCAGACTAAACGTGGCCTCCCCAGTGGCATGCCTTTCACTTCGGTCATCAACTCCATCTGCCATTGGTTACTCTGGTCTGCAGCTGTTTACAAGTCCTGTGCTGAGATTGGCCTACATTGTTCCAACCTGTATGAAGATGCCCCATTTTACACATATGGTGACGACGGCGTGTATGCTATGACTCCGATGATGGTAAGCCTCCTACCTGCTATAATAGAGAACTTGAGGGATTACGGCTTGTCACCCACTGCTGCAGACAAAACAGAATTTATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCGTTTTTAAAACGTACATTTGAGCTCACAGATATTGGGTG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| 10,634
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OR786313.1
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Rabbit hemorrhagic disease virus 2
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Li,X.
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National Institutes for Food and Drug Control, Institute for Laboratory Animal Resources
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China
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2023-11-25
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Beijing-NIFDC-ILAR2022-76
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Rabbit hemorrhagic disease virus
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Lagovirus
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Caliciviridae
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ssRNA(+)
| 7,443
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GenBank
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China
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China
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Oryctolagus cuniculus
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liver, abdominal cavity
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2022
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Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate Beijing-NIFDC-ILAR2022-76, complete genome
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| 10,635
|
OR423401.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Li,X.
|
National Institutes for Food and Drug Control, Institute for Laboratory Animal Resources
|
China
|
2023-10-02
|
Beijing-NIFDC-ILAR2022
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,443
|
GenBank
| null |
China: Beijing
|
China
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2022
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate Beijing-NIFDC-ILAR2022, complete genome
|
GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCACGCCTTGTCGGCATGACAACTGCTATTTTACCAGAAAAGAAACCCCTTAGTTTCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCCCCCTGTTGTATTCGGGCAACCGGGAAACTGGCTTGGCCAGTTTTCCTGGAACAAAACGAGAAGGAAGAACCTCTGGAGGCATGTGGCAAATGTGGCAAATGGCTCAACGGATTCGGCAACTTTGGACTGGAGGATCTCGGCAATGTCTGCTTGTGTTCCATAACCCAACAGAAACACAAATTTGGACCTGTTTGCCTGTGCAACCGTGCTTACATACACGACTGCGGTCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTCTTAAAGCACTACAAGGCATTGAACAAAGTTATCCCCTGTGCTTACCGGTTCAGTGAGGGTGTCCCTCCCCCAGTTTTTGAGGGGGAGGTCGACGATCTATTTGTTGAACTAGGTGCACCGACTAGCATGGGTTTTATGGACAAGAAATTGCTCAAGAAAGGTAAGAAGTTGATGGACAAGTTTGTTGACGTTGACGAGCCCTGTTTGACATCTAAGGATGCCAACCTCCTCGACTCCATTGCCTCAGACAACACCATACGAGCAAAACTGGAAGAGGAATATGGTGTTGAGATGGTGCAGGCAGCGCGTGATAGGAAAGACTTCATGAGAAACCTCAGGCTTGCTCTAGACAACCGACCTGCAAACCCCGTGACCTGGTACACCAAGCTCGGCAACATCACCGACAAAGGGAAACAGTGGGCAAAGAAGGTTGTTTATGGTGCCTGCAAAGTGACTGACCCCCTAAAGACGTTAGCTTCAATTTTACTGGTTGGTCTCCACAATGCCATCGCCGTGGACACAACAGTCATGTTGTCGACTTTCAAACCTGTGAACCTGTTGGCAATTCTCATGGACTGGACCAATGACTTGACTGGTTTCGTCACCACACTTGTGAGGTTACTGGAACTGTATGGTGTAGTGCAGGCAACTGTCAATCTTATAATTGAGGGTGTCAAAAGCTTTTGGGATAAAGTGGTTTGCGCAACAGACCGCTGCTTTGACTTGCTCAAGAGGTTGTTTGATACGTTTGAGGACTCCGTCCCCACAGGACCAACTGCTGGTTGCCTTATCTTCATGGCCTTTGTTTTCTCAACTGTTGTCGGGTACCTACCCAACAACAACGTGATAACAACCTTTATGAAGGGTGCTGGTAAGCTCACGACCTTTGCAGGTGTCATTGGTGCCATCCGAACACTGTGGATTACTATCAACCAGCACATGGTTGCTAAGGACCTCACCAGTATACAACAGAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCCAACGAAGCGGCAACGCTGGACCAGCTTGAGATCGTCAGTTGCCTCTGTTCAGACTTGGAGAATACATTGACAAACAGGTGTACCTTACCGTCATACAACCAACACCTTGGGATCTTGAATGCATCTCAGAAAGTCGTGAGCGACTTACACACAATGGTCCTTGGGAAGATCAACATGACTAAGCAGAGGCCACAGCCTGTGGCTGTCATCTTCAAAGGAGCCCCAGGGATCGGCAAGACATACTTGGTTCACAGGATCGCACGTGACCTAGGTTGCCAGCACCCCAGCACAATCAACTTTGGTCTTGACCACTTCGACTCGTACACGGGTGAGGAGGTCGCCATCGCGGATGAATTCAACACCTGTGGTGACGGGGAAAGTTGGGTTGAGTTGTTCATCCAAATGGTCAACACCAACCCTTGTCCGCTCAACTGTGACAAGGCTGAGAACAAGAACAAGGTTTTCAACTCAAAGTACTTGTTGTGCACAACAAACTCCAACATGATACTGAACGCAACACACCCCCGTGCTGGTGCATTTTACAGAAGGGTGTTGATTGTTGAAGCACGCAACAAAGCTGTTGAGAGCTGGCAAGCCACCAGACATGGCTCCAGGCCGGGAAAGTCTTGTTACAGTAAGGACATGTCACACCTGACCTTTCAAGTTTACCCCCACAACATGCCCGCCCCAGGATTCGTTTTCGTTGGGGACAAGTTGGTGAAATCCCAGGTTGCGCCCAGGGAGTACAAGTACAATGAACTTTTGGACCTGATCAAGAGCGAGCACCCTGACGTGGCCTCGTTTGAAGGTGCTAACAAGTTTAATTTCATTTACCCAGATGCCCAATATGAACAGGCGCTTCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTCATGTACGGGTGTGTGGCGAGACTAGCGAAGAACTTTGTGGAGGATATTCCGTACAACCAGGTCCACATTTCAAAAGCAAGCGACCCAAGGATTGACGGGTGTGTGGAGTACCAGTGTAAATTCCAGCACCTTTGGCGCATGGTCCCCCAGTTTGTCTTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAACTTGGCACACCCTTAACCCAACAACAGTTAGACAGGGTCACCAATGGTGTTGAGGGCGTGACTGTCACAACGGTGAACAATATCTTACCGTTTCACTCACAAACTACGCTCATCAACCCCTCCTTCATTAAATTGATCTGGGCAGTCAGAAAGCACCTCAAGGGGCTCAGCGGCGTGACCAAGGTAGCTCAATTCATCTGGCGCGTCATGACCAACCCGGTGGACGCCTATGGAACCCTGGTTAGAACACTCACCGGAGCTGCCACCTTTTCAGACGACCCAGTCTCCACTACAATTATCTGCTCCAACTGCACAATCCAAATTCACTCCTGCGGTGGACTGCTCGTCAGGTACTCAAGAGACCCTGTACCCGTGGCGTCGGACAATGTTGACCGCGGTGACCAGGGTGTTGACGTGTTCACCGACCCCAATCTTATCTCTGGGTTTAGTTGGAGGCAGATTGCGCACCTGTTCGTTGAAGTGATCTCACACCTGTGCGCGAATCACCTTGTTAACCTTGCAACTATGGCAGCCCTTGGTGCGGTTGCAACGAAGGCCTTCCAGGGCGTGAAAGGCAAGACAAAACGGGGTCGTGGTGCGAGGATTAATTTAGGAAATGACGAGTACGACGAGTGGCAAGCCGCTCGCAGGGAGTTCGTCAACGCACACGACATGACTGCAGAGGAATATCTTGCAATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGGAGTGACGACCAGGACTCTGTCATGTTCAGGAGCTGGTGGACACGGAGACAACTGAGACCTGAAGAGGACCAGGTTACCGTTATTGGTAGAGGTGGGGTGAGGAACGAGGTCATCCGCACCAGGGCCAGGCAGGCCCCGAAAGGGCCGAAAACACTGGATGACGGCGGTTTCTATGATAATGACTATGAGGGCCTACCTGGTTTCATGAGACACAATGGTAGTGGTTGGATGATTCACATAGGAAATGGACTGTACATCTCCAACACCCATACTGCTAGGTCAAGTTGCTCAGAGATCGTCACGTGCTCACCCACCACAGACCTGTGCCTCGTTAAGGGGGAGACGATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAAGGCACACCAGTTTGTGATTGGAAAAAGTCCCCCATTTCAACCTATGGCATCAAGAAGACACTGTCTGACTCCACCAAGATTGACGTTCTGGCGTATGACGGCTGCACGCAGACCACCCACGGAGACTGTGGACTACCGTTGTACGACTCCAGTGGAAAGATTGTTGCCATACACACCGGAAAGCTGTTAGGGTTTTCAAAGATGTGCACATTGATAGATCTCACCGTCACAAAGGGCGTTTATGAAACATCTAACTTCTTCTGTGGTGAACCAATTGACTACAGAGGAATTACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAGCCTAGACCCCCCGTTAGCGGAACAAGGTATGCCAGGGTCCCAGGCGTGCCTGACGAGTACAAAACTGGGTATAGGCCAGCTAACCTTGGGCGCAGTGACCCGGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATCGCAGTGAAAAACTTGCAGATCTACCAGCAGGAACCAAAGCTTGACAAGGTTGATGAGTTCATTGAGCGGGCGGCTGCCGACGTTTTGGGCTATTTGCGTTTCTTAACCAAGGGGGAACGCCAGATGAACTTGAACTTCAAAGCCGCGTTTAACACACTGGACTTGTCGACATCCTGCGGACCCTTCGTCCCAGGAAAGAAGATTGACCATGTAAAAGACGGAGTGATGGACCAAGTGTTGGCTAAGCATCTCTACAAGTGTTGGAGCGTCGCCAACTCTGGTAAGGCACTTCACCACATATACGCATGTGGGCTGAAGGACGAACTCAGGCCTCTTGACAAGGTGAAGGAGGGGAAGAAGAGGCTGCTGTGGGGTTGTGATGTCGGTGTTGCCGTGTGTGCCGCTGCTGTTTTTCACAACATATGTTACAAGCTAAAGATGGTTGCGCGGTTTGGCCCCATTGCGGTTGGTGTCGACATGACGTCTCGCGACGTTGACGTCATCATCAACAACCTTACCTCCAAGGCTAGTGACTTCCTGTGTTTGGACTACTCAAAATGGGACTCCACCATGTCACCGTGTGTTGTCAGGTTGGCAATTGACATCTTGGCTGACTGCTGTGAGCAAACGGAACTCACCAAAAGCGTTGTTCTCACTCTAAAGTCCCATCCCATGACCATACTAGACGCCATGATTGTGCAGACTAAACGTGGCCTCCCCAGTGGCATGCCTTTCACTTCGGTCATCAACTCCATCTGCCATTGGTTACTCTGGTCTGCAGCTGTTTACAAGTCCTGTGCTGAGATTGGCCTACATTGTTCCAACCTGTATGAAGATGCCCCATTTTACACATATGGTGACGACGGCGTGTATGCTATGACTCCGATGATGGTAAGCCTCCTACCTGCTATAATAGAGAACTTGAGGGATTACGGCTTGTCACCCACTGCTGCAGACAAAACAGAATTTATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCGTTTTTAAAACGCACATTTGAGCTCACAGATATTGGGTG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| 12,532
|
OQ570960.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Li,Y., Huang,J., Du,D., Su,L., Li,C.
|
College of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Southwest Minzu University
|
China
|
2023-05-01
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,443
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2022
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 strain SCMS-2022, complete genome
|
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| 16,303
|
OQ570961.1
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Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Li,Y., Huang,J., Du,D., Su,L., Li,C.
|
College of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Southwest Minzu University
|
China
|
2023-05-01
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,443
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2021
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 strain SDRZ-2021, complete genome
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GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCGCGCCTTATCGGCATGACAACTGCTATTTTACCAGAAAAGAAACCTCTCAGTTTCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCAACCGGGAAACTGGCTTGGCCAGTTTTCCTGGAACAAAACGAGAAGGAAGGACCTCTGGAGACATGTGGGAAATGTGGTAAATGGCTCAATGGATTCGGCAACTTTGGACTGGAGGATCTCGGCAATGTCTGCTTGTGTACCATAACCCAACAGAAACACAGATTTGGACCTGTTTGCCTGTGCAACCGTGCTTATATACACGACTGCGGTCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTCTTGAAGCACTACAAGGCATTGAACAAAGTTATCCCCTGTGCTTACCGGTTCAGCGAGAGTGTCCCTTCCCCAGTTTTTGAGGGGGAGGTCGACGACCTGTTTGTTGAGCTAGGTGCGCCAACTAGTATGGGTTTTATGGACAAGAAGTTGCTTAAGAAAGGCAAGAAGTTAATGGACAAATTTGTTGACGTTGATGAGCCCTGTTTGACATCAAAAGATGCCAACCTCCTCGACTCCATTGCCTCAGACAACACCATACGTGCGAAGTTGGAAGAGGAATATGGTGTCGAGATGGTGCAGGCAGCGCGTGACAGGAAAGACTTCATGAGAAACCTCAGGCTTGCTCTAGACAACCGACCTGCAAACCCCGTGACCTGGTACACCAAGCTCGGCAACATCACCGACAAAGGGAAACAGTGGGCAAAGAAGGTTGTCTATGGTGCCTGCAAAGTGACTGACCCCCTAAAGACGTTAGCTTCAATTTTGCTGGTTGGTCTTCACAATGCTATCGCCGTAGACACAACAGTCATGTTGTCGACTTTCAAGCCCGTGAACCTGTTGGCAATTCTCATGGACTGGACCAATGACTTGACCGGTTTCGTTACCACACTTGTGAGACTACTGGAACTGTATGGTGTGGTGCAGGCAACTGTCAACCTTATAATTGAGGGCGTCAAAGGCTTTTGGGACAAAGTGGTTTGCGCAACAGACCGCTGCTTTGACTTGCTCAAGAGGTTGTTTGACACGTTTGAGGACTCCGTCCCCACGGGACCAACTGCCGGTTGTCTCATCTTCATGGCCTTTGTTTTCTCAACTGTTGTCGGGTACCTACCCAACAACAACGTGATAACAACCTTCATGAAGGGTGCTGGTAAGCTCACGACCTTTGCAGGTGTCATTGGTGCCATCCGAACACTGTGGATTACTATCAACCAGCACATGGTGGCTAAGGACCTCACCAGTATACAACAGAAGGTTATGACAGTTGTGAAGATGGCTAATGAAGCGGCAACGCTGGACCAGCTTGAGATTGTTAGTTGCCTCTGCTCAGACTTGGAGAACACATTGACGAACAGGTGTACCTTACCGTCATACAACCAACACCTTGGGATCTTGAATGCATCTCAGAAAGTCGTGAGCGACTTGCACACGATGGTCCTTGGGAAAATCAACATGACTAAGCAGAGGCCACAGCCTGTGGCTGTCATCTTCAAAGGAGCCCCAGGCATCGGCAAGACCCACTTGGTTCACAGGATCGCACGTGACCTAGGTTGCCAGCACCCCAGCACAATCAACTTTGGCCTTGACCACTTTGACTCATATACAGGTGAGGAGGTCGCCATCGCGGACGAATTTAACACCTGTGGTGACGGGGAAAGTTGGGTTGAGTTATTCATCCAAATGGTCAACACCAACCCTTGCCCGCTCAACTGTGACAAGGCTGAGAACAAGAACAAGGTTTTCAACTCAAAGTACTTATTGTGCACAACTAACTCCAACATGATACTGAATGCAACACACCCCCGTGCTGGTGCATTTTACAGAAGAGTGTTGATTGTTGAAGCACGCAACAAAGCTGTTGAGAGCTGGCAAGCCACCAGACATGGCTCCAGGCCGGGGAAGTCTTGTTACAGCAAGGACATGTCACATCTGACCTTTCAAGTTTACCCCCACAACATGCCCGCCCCAGGATTCGTTTTTGTTGGGGATAAGTTGGTGAAATCCCAGGTTGCGCCTAGGGAGTATAAGTACAATGAACTTTTGGACCTGATCAAGAGCGAGCACCCTGATGTGGCCTCGTTTGAAGGTGCTAACAAATTTAACTTCATTTACCCAGACGCCCAATATGAACAGGCGCTTCTCATGTGGAAACAATACTTTGTCATGTACGGGTGTGTGGCGAGACTTGCGAAGAACTTTGTGGAGGATATTCCATACAACCAGGTCCACATTTCAAAAGCGAGTGACCCAAGGATTGACGGGTGTGTGGAGTACCAGTGTAAGTTTCAGCATCTGTGGCGCATGGTCCCCCAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAATATGACAAACCAGCTTGGCACACCCTTAACCCAACAGCAGTTAGACAGGATCACCAACGGTGTTGAGGGCGTGACTGTCACAACGGTGAACAACATCTTACCGTTTCACTCACAAACCACACTCATCAACCCCTCCTTCATTAAATTGATCTGGGCGGTCAGAAAGCACCTCAAGGGGCTTAGTGGCGTAACCAAGGTAGCTCAATTCATCTGGCGCGTCATGACCAACCCGGTGGACGCTTATGGGACCCTGGTTAGAACTCTCACCGGAGCTGCTACCTTTTCAGACAACCCAGTCTCCACCACAATCATCTGCTCCAACTGCACAATCCAAATCCACTCCTGTGGTGGACTTCTCGTCAGGTACTCAAGAGACCCTGTTCCCGTGGCGTCAGACAATGTCGACCGCGGTGACCAGGGTGTTGATGTGTTCACCGACCCCAATCTTATTTCCGGGTTTAGTTGGAGGCAGATTGCGCACCTGTTCGTTGAAGTGATCTCACACCTGTGCGCGAATCACCTTGTCAACCTTGCAACTATGGCAGCTCTTGGTGCGGTTGCAACGAAGGCCTTTCAGGGCGTAAAAGGCAAGACAAAACGGGGTCGTGGTGCGAGGGTGAACTTAGGAAATGACGAGTACGACGAGTGGCAAGCCGCTCGCAGGGAGTTCGTCAACGCGCACGACATGACTGCAGAGGAGTACCTTGCAATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGGAGTGACGATCAGGACTCTGTCATGTTCAGGAGCTGGTGGACACGGAGACAACTGAGGCCCGACGAGGACCAGGTCACCATTGTTGGTAGAGGCGGGGTGAGGAATGAGGTCATCCGCACCAGGGCCAGGCAGGCCCCAAAAGGGCCGAAAACACTAGACGACGGTGGTTTCTATGACAATGACTATGAGGGCCTGCCTGGTTTCATGAGACACAATGGTAGTGGCTGGATGATCCATATAGGAAATGGACTGTACATCTCCAATACCCACACTGCTAGGTCAAGTTGCTCAGAGATTGTCACGTGCTCACCCACCACAGACCTGTGCCTTGTTAAGGGCGAAACAATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCCGAAGGTACACCAGTTTGTGATTGGAAGAAGTCCCCAATTTCGACCTACGGCATCAAGAAGACACTGTCTGACTCCACCAAGATTGACGTGCTGGCGTATGACGGCTGCACACAGACCACCCACGGGGACTGCGGGCTCCCGTTGTATGACTCTAGTGGAAAGATTGTTGCCATACACACCGGCAAGCTACTGGGGTTCTCAAAGATGTGTACATTAATAGACCTCACTGTCACAAAAGGAGTTTACGAAACATCGAACTTTTACTGCGGCGAGCCAATCGACTATAGGGGCATTGTTGCACACAGGCTTGTTGGCGCGGAGCCCAGGCCCCCTGTCAGTGGAACCAGGTACGCTAGGGTTCCAGGCGTGCCTGACGAGTACAGGACCGGGTATAGGCCCGCCAACCTTGGGCGTAGTGACCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATCGCAGTGAAAAACTTGCAGGTCTACCAACAGGAGCCAAAACTTGACAAGGTTGATGAATTCATTGAACGAGCAGCTGCTGACGTCTTGGGCTACTTGCGCTTCCTAACCAAGGGGGAGCGTCAGGCGAACTTGAACTTCAAAGCTGCGTTCAACACACTGGACTTGTCAACATCATGTGGACCCTTTGTCCCAGGGAAAAAGATTGACCACGTGAAGGATGGGGTGATGGACCAAACTTTAGCCAAACACCTGTATAAATGCTGGAGCGTTGCCAACTCTGGTAAGGCACTCCACCACATATACGCGTGCGGGCTGAAGGATGAGCTCAGGCCTCTTGACAAGGTGAAGGAAGGGAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGTGATGTCGGTGTTGCCGTGTGCTCAGCTGCTGTTTTCCACAACATATGTTACAAGCTGAAGATGGTCGCCCGATTTGGACCCATTGCAGTCGGCGTCGATATGACATCTCGCGACGTCGACGTCATCATCAACAACCTCACTGCCAAAGCCAGCGACTTCTTGTGCTTGGACTACTCAAAGTGGGACTCCACTATGTCACCGTGTGTTGTTAGGTTGGCAATTGACATCTTGGCTGACTGTTGTGAACAGACGGAACTCACCAAAAGTGTTGTGCTCACACTAAAGTCCCACCCCATGACCATACTTGATGCCATGATCGTGCAAACAAAGCGCGGTCTCCCTAGTGGCATGCCCTTTACCTCGGTCATCAACTCCATTTGCCATTGGTTGCTCTGGTCTGCAGCCGTCTACAAGTCTTGTGCTGAGATTGGCCTACACTGTTCTAACTTGTACGAAGATGCCCCATTCTACACGTATGGTGACGACGGTGTGTACGCCATGACTCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCCGCTATAATAGACAACTTGAGGGACTACGGCTTGTCACCCACCGCTGCAGACAAAACAGAGTTCATAGACGTTTGCCCGCTCAACAAGATCTCATTCTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACGGACATCGGATG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| 16,304
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OQ570962.1
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Rabbit hemorrhagic disease virus 2
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Li,Y., Huang,J., Du,D., Su,L., Li,C.
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College of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Southwest Minzu University
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China
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2023-05-01
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
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Lagovirus
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Caliciviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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China
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China
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Oryctolagus cuniculus
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liver, abdominal cavity
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2022
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Rabbit hemorrhagic disease virus 2 strain AHFY-2022, complete genome
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| 16,305
|
OQ570963.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Li,Y., Huang,J., Du,D., Su,L., Li,C.
|
College of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Southwest Minzu University
|
China
|
2023-05-01
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
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ssRNA(+)
| 7,443
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2021
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 strain SCNJ-2021, complete genome
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GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCGCGCCTTATCGGCATGACAACTGCTATTTTACCAGAAAAGAAACCCCTTAGTTTCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCAACCGGGAAACTGGCTTGGCCAGTTTTCCTGGAACAAAACGAGAAAGAAGGACCTCTGGAGATATGTGGCAAATGTGGCAAATGGCTCAATGGATTTGGTAACTTTGGACTGGAGGATCTCGGCAATGTCTGCTTGTGTTCCATAACCCAACAGAAACACAAATTTGGACCTGTTTGTCTGTGCAATCGTGCTTACATACACGACTGCGGTCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTCTTAAAGCACTACAAGGCATTGAATAAAGTTATCCCTTGTGCTTACCGGTTCAGTGGGGGTTCCCCTCCCCCAGTTTTTGAGGGGGAGGTCGACGATCTGTTTGTTGAACTAGGTGCACCGACTAGCATGGGTTTCATGGACAAGAAATTGCTCAAGAAAGGTAAGAAGTTGATGGACAAATTTGTTGACGTTGACGAGCCCTGTTTGACATCAAAGGACGCCAACCTCCTCGACTCCATTGCCTCAGACAACACCATACGTGCAAAACTGGAAGAGGAATATGGTGTTGAGATGGTGCAGGCAGCGCGTGACAGGAAAGACTTCATGAGAAACCTCAGGCTTGCTCTAGACAACCGACCAGCAAACCCCGTGACCTGGTACACCAAGCTCGGCAACATCACCGACAAAGGGAAACAGTGGGCGAAGAAGGTTGTCTATGGTGCCTGCAAAGTGACTGATCCCCTAAAGACGTTAGCTTCAATTTTGCTAGTTGGTCTTCACAATGCCATCGCCGTGGACACAACAGTCATGTTGTCGACTTTCAAGCCCGTGAACCTGTTGGCAATTCTTATGGACTGGACCAATGACTTGACTGGTTTCGTCACCACACTTGTGAGGTTACTGGAACTGTATGGTGTAGTGCAGGCAACTGTCAATCTTATAATTGAGGGTGTCAAAAGCTTCTGGGATAAAGTGGTTTGCGCAACAGACCGCTGCTTTGACTTGCTCAAGAGGTTGTTTGACACGTTTGAAGAATCCGTCCCCACGGGACCAACTGCTGGTTGCCTCATCTTCATGGCCTTTGTTTTCTCAACTGTTGTCGGGTACCTACCCAACAATAACGTGATAACAACCTTCATGAAGGGTGCTGGTAAGCTAACGACCTTTGCAGGTGTCATCGGTGCCATCCGAACACTGTGGATCACTATCAACCAGCACATGGTGGCTAAGGACCTCACCAGCATACAACAGAAGGTTATGACAGTTGTAAAAATGGCCAATGAAGCGGCAACGCTGGACCAGCTTGAGATCGTCAGTTGTCTCTGTTCAGACTTGGAGAACACATTGACAAACAGGTGTACCTTACCATCATACAACCAACACCTTGGGATCTTGAATGCATCTCAGAAAGTCGTGAGCGACTTACACACAATGGTTCTTGGGAAGATCAACATGACCAAGCAGAGGCCACAGCCTGTGGCTGTCATCTTCAAAGGAGCCCCAGGGATCGGCAAGACCTATTTGGTTCACAGGATCGCACGTGATCTAGGTTGCCAGCACCCCAGCACAATCAACTTTGGTCTTGACCACTTCGACTCGTACACGGGTGAGGAGGTCGCCATCGCGGACGAATTTAACACCTGTGGTGACGGGGAAAGTTGGGTTGAATTATTCATCCAAATGGTCAACACCAACCCTTGCCCGCTCAACTGTGACAAGGCTGAGAACAAGAACAAGGTTTTCAACTCAAAGTACTTGTTGTGCACAACAAACTCCAATATGATACTGAATGCAACACACCCCCGTGCTGGTGCATTTTACAGAAGAGTGTTGATTGTTGAAGCACGCAACAAAGCTGTTGAGAGCTGGCAAGCTACCAGACATGGCTCCAGGCCGGGAAAGTCTTGTTACAGTAAGGACATGTCACACCTGACCTTTCAAGTTTACCCCCACAACATGCCCGCCCCAGGATTCGTTTTCGTTGGGGACAAGTTGGTGAAATCCCAGGTTGCGCCCAGGGAGTACAAGTACAATGAACTTTTGGACCTAATCAAGAGTGAGCACCCTGATGTGGCCTCGTTTGAAGGTGCTAACAAATTTAACTTCATTTACCCAGATGCCCAATATGAACAGGCGCTTCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTCATGTACGGGTGTGTAGCGAGACTTGCGAAGAACTTTGTGGAGGACATTCCGTACAACCAGGTCCACATTTCAAAAGCAAGCGACCCAAGGATTGATGGGTGTGTGGAGTACCAGTGTAAATTCCAGCACCTTTGGCGCATGGTCCCCCAGTTTGTCTTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAACTTGGTACACCCTTAACCCAACAACAGTTAGACAGGATCACCAACGGTGTTGAGGGCGTGACTGTCACAACGGTGAACAACATCTTACCGTTTCACTCACAAACTACGCTCATCAACCCCTCCTTCATCAAACTGATCTGGGCAGTCAGAAAGCATCTCAAGGGGCTCAGTGGCGTGACCAAGGTGGCTCAATTCATCTGGCGCGTCATGACCAACCCGGTGGACGCCTATGGAACCCTGGTTAGAACTCTCACCGGAGCTGCCACCTTCTCAGACGACCCAGTCTCCACTACAATTATCTGCTCCAACTGCACAATCCAAATCCACTCCTGCGGTGGGTTGCTCGTCAGATACTCAAGAGACCCTGCCCCCGTGGCGTCGGACAATGTTGACCGCGGCGACCAGGGTATTGACGTGTTCACCGACCCCAATCTTATCTCTGGGTTTAGTTGGAGGCAGATTGCGCACCTGTTCGTTGAAGTGATCTCACACCTGTGCGCGAATCACCTTGTCAACCTTGCAACCATGGCAGCCCTTGGTGCAGTTGCAACGAAGGCCTTCCAGGGCGTGAAAGGCAAGACAAAACGGGGTCGTGGTGCGAGGGTCAACTTGGGAAATGACGAGTACGACGAGTGGCAAGCCGCTCGCAGGGAGTTCGTCAACGCGCACGACATGACTGCAGAGGAATATCTTGCAATGAAGAACAAAGCTGCTATGGGGAGTGATGACCAGGACTCTGTCATGTTCAGGAGCTGGTGGACACGGAGGCAACTGAGACCTGAGGAGGACCAGGTTACCATTGTTGGTAGAGGTGGGGTGAGGAACGAGGTCATCCGCACCAGGGCCAGGCAGGCCCCGAAAGGGCCGAAAACACTGGATGACGGTGGTTTCTATGACAACGACTATGAGGGCCTGCCTGGCTTCATGAGACACAATGGTAGCGGCTGGATGATACACATAGGAAATGGACTGTACATCTCCAATACCCATACTGCTAGGTCAAGTTGCTCAGAGATCGTCACGTGCTCACCCACCACAGACCTGTGCCTCGTTAAGGGAGAGACGATTCGCAGCGTTGCCCAAATTGCTGAAGGCACACCAGTTTGTGACTGGAAAAAGTCCCCTATTTCAACCTATGGCATCAAGAAAACACTGTCTGACTCCACCAAGATTGACGTTCTGGCGTATGACGGCTGCACGCAGACCACCCACGGAGACTGTGGACTACCGTTGTATGATTCCAGTGGAAAGATTGTTGCCATACACACCGGAAAGCTGTTAGGGTTTTCAAAGATGTGCACATTGATAGATCTCACCGTCACAAAGGGCGTTTATGAAACATCTAACTTCTTCTGTGGTGAACCAATTGACTACAGAGGAATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGTGGAGCCTAGACCCCCCGTTAGTGGAACAAGGTATGCCAGGGTGCCAGGTGTGCCTGACGAGTACAAAACTGGGTATAGGCCAGCTAACCTTGGGCGCAGTGACCCGGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATCGCAGTGAAAAACTTGCAGATCTACCAGCAGGAACCAAAGCTTGACAAGGTTGATGAGTTCATTGAACGGGCGGCTGCCGACGTTTTGGGCTATTTGCGTTTCTTAACCAAGGGGGAACGCCAGATGAACTTGAACTTCAAAGCCGCGTTTAACACACTGGACTTGTCGACATCCTGCGGACCCTTCGTCCCAGGAAAGAAGATTGACCATGTAAAAGACGGAGTGATGGACCAAGTCTTGGCTAAGCATCTCTACAAGTGTTGGAGCGTCGCCAACTCCGGTAAGGCACTTCACCACATATACGCATGTGGGCTGAAGGACGAACTCAGGCCTCTTGACAAGGTGAAGGAGGGGAAGAAGAGGCTGCTGTGGGGTTGTGATGTCGGTGTTGCCGTGTGCGCCGCTGCTGTTTTTCACAACATATGTTACAAGCTAAAGATGGTTGCGCGGTTTGGTCCCATTGCGGTTGGTGTCGACATGACGTCCCGCGACGTTGACGTCATCATCAACAACCTCACCTCCAAGGCTAGTGACTTCCTGTGTTTGGACTACTCAAAATGGGACTCCACCATGTCACCGTGTGTTGTCAGGTTGGCAATTGACATCTTGGCTGACTGCTGTGAGCAAACGGAACTCACCAAAAGCGTTGTTCTCACGCTAAAGTCCCATCCCATGACCATACTTGACGCCATGATTGTGCAGACTAAACGTGGCCTCCCCAGTGGCATGCCTTTCACTTCGGTCATCAACTCCATCTGCCATTGGTTACTTTGGTCTGCAGCTGTTTACAAGTCCTGTGCTGAGATTGGCCTACATTGTTCCAACCTGTATGAAGATGCCCCATTTTACACGTATGGTGATGACGGCGTGTATGCCATGACTCCGATGATGGTAAGCCTCCTACCTGCTATAATAGAGAACTTGAGGGATTACGGCTTGTCACCTACTGCTGCAGACAAAACAGAGTTTATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCGTTTTTAAAACGCACATTTGAGCTTACAGATATTGGGTG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| 16,306
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OQ570964.1
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Rabbit hemorrhagic disease virus 2
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Li,Y., Huang,J., Du,D., Su,L., Li,C.
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College of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Southwest Minzu University
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China
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2023-05-01
| null |
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
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Caliciviridae
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ssRNA(+)
| 7,443
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GenBank
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China
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China
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Oryctolagus cuniculus
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liver, abdominal cavity
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2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 strain SCMS-2020, complete genome
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| 16,307
|
MT737965.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Qi,R., Meng,C., Li,H., Zhu,J., Miao,Q., Tang,J., Tang,A., Guo,H., Liu,C., Li,C., Chen,Z., Zhang,Q., Liu,G.
|
Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Innovation Team of Small animal Infectious Disease
|
China
|
2022-08-17
|
SC20-01
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,463
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Oryctolagus cuniculus
|
liver, abdominal cavity
|
2020-07-06
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate SC20-01, complete genome
|
GTGAAAGTTATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCCTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGAAAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCGCCCAGGAAACTGGCTTGGCCAGTCTTCCTGGATCAAAACGAGAAAGAAGGACTTCTGGATACATGCAACAAATGTGGTAAATGGTTGAATGGATTCGGCGTTTTCGGACTAGAGGACCTCGGTGAGGTTTGCCTATGCTCTGTGAACAAACAGCAACACAAGTTCGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTCAAACACTACAAGGCATTGAACAAAGTCATCCCCTGTGCTTACCGGTTCGATGAAAGAATCCCCAGCCCTATCTTTGAGGGTGAGGTTGACGACCTGTTTGTTGAGCTCGGGGCGCCAACTAGCATGGGCTTTATGGATAAGAAACTGCTTAAGAAAGGTAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTCGACATTGATGAACCCTGTTTGACGTCGAAGGACGCCAGTCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAACACCATACGTGCGAAGCTGGAGGAGGAGTATGGCGTTGAGATGGTACAGGCAGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGGAACCTCAGGCTCGCTTTGGACAACCGGCCCGCTAACCCTGTGACTTGGTACGCTAAGCTCGGCAACATCACAGAAAAAGGAAAACAGTGGGCAAAGAAGATTGTTTATGGTGCTCACAGGGTCACTGATCCCCTGAAAACGTTGGCCTCAATTTTACTGGTTGGTCTCCACAACACTATTGCTGTGGACACAACGGTGATGTTATCAACGTTTAAGCCTGTAAACCTACTGGCTATTCTCATGGACTGGACTAACGACTTGACTGGGTTCATCACCACGCTTGTGAGGTTACTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTCAACTTGATCATTGAAGGTGTGAAGAGTTTCTGGGACAAGGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGCTTTGACTTGCTCAAAAGGCTGTTTGACACATTCGAGGACTCCGTCCCCACAGGACCAACCGCAGGCTGCCTCATCTTTATGGCTTTTGTCTTCTCCACTGTCGTGGGGTACTTGCCTAACAATAGTGTAATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGCAAACTCACAACGTTTGCAGGGGTGGTTGGTGCCATCCGGACGTTGTGGGTTACCATCAACCAACATATGGTAGCTAAGGACCTCACCAGCATACAGCAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCAACGTTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGTTGCCTCTGTTCAGACTTGGAGAACACACTGACGAACAGGTGCACCCTGCCATCATACAACCAACACCTTGGAATCTTGAATGCATCTCAGAAGGTCATTAGTGACCTACACACCATGGTTCTTGGAAAGATTAATATGACAAAGCAGAGACCACAGCCTGTGGCTGTTATCTTTAAAGGATCCCCAGGCATTGGTAAAACTTATTTGGTCCACAGGCTTGCGCGAGACTTAGGTTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATATACAGGAGAGGAAGTGGCTATTGCGGATGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTATTTATCCAAATGGTCAACACAAACCCGTGCCCACTCAATTGTGATAAAGCTGAGAACAAAAACAAGGTCTTCAACTCAAAGTATTTACTGTGCACAACAAACTCCAGCATGATACTGAACGCGACACATCCTCGTGCTGGCGCGTTTTACAGAAGGGTCATGATCGTTGAAGTGCGAAACAAGGCCGTCGAGAGCTGGCAGAACACTAGACACGGTTCCAAGCCAGGGAAGTCATGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTCTCCTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTGCCCCGGGGTTTGTGTTCGTTGGGGAAAAACTGGTGAAGTCACAGGTAGCACCCAGAGAGTACAAGTACAGTGAACTTTTGGACCTGATTAAGAGCGAGCACCCCGATGTGGCCTCATTCGAAGGCGCCAACAAGTTCAACTTCATCTACCCAGACGCTCAATACGAGCAGGCACTCCTTATGTGGAAACAGTACTTTGTCATGTATGGATGCGTAGCAAGGCTTGCAAAGAGCTTTGTTGAAGACATCCCATACAACCAAGTTCACATATCAAGGGCAAGTGACCCCAAAATTGGCGGGTGCGTAGAGTATCAGTGCAAGTTCCAGCATCTTTGGCGCATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACAAACCAACTTGGCACCCCCTTAACTCAGCAACAGTTGGACAGGATCACCAACGGGGTTGAAGGCGTCACCGTCACAACGGTGAATAACATCCTACCGTTCCATTCACAAACCACACTCATAAACCCCTCCTTCATTAAGCTGATTTGGGCAGTGAGAAAGCACCTCAAGGGGCTTAGTGGTGTGACTAAGGTGGCTCAATTCATATGGCGTGTCATGACCAACCCGGTGGACGCCTACGGCACCCTTGTCAGGACGCTCACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGATGACCCGGTTTCAACAACAATAATTTGTTCTAACTGCACAATCCAAATTCACTCCTGCGGTGGGTTGCTTGTGAGGTATTCAAGGGACCCTGCCCCCGTAGCATCAGACAACGTTGACCGTGGTGACCAAGGTGTTGACGTCCTCACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGGCAGATTGCTCACTTGTTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCAACTATGGCAGCACTGGGCGCTGTTGCGACGAAGGCTTTCCAGGGCGTGAAAGGTAAGACAAAACGCGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACCTGGGGAACGATGAGTACGACGAGTGGCAAGCCGCGCGTAGAGAATTCGTCAACGCACATGACATGACTGCAGAGGAATATCTCGCCATGAAGAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCATCATGTTCAGAAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACCATTGTCGGTAAGGGTGGAGTGAGGAACGAGGTCATCCGCACCAGAGCTAGACAGACCCCAAAAGGGCCAAAAACCCTGGATGATGGTGGCGTCTATGACAATGACTATGAGGGCCTGCCAGGATTTATGAGGCACAATGGCAGTGGCTGGATGATTCACATAGGCAACGGGTTGTACATATCTAACACCCACACCGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGCTCACCCACTACTGACCTGTGCCTTGTTAAAGGTGAGGTGATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAGGGGACCCCAGTTAGTGACTGGAAAAAGTCACCCATCACAACCTATGGCATTAAGAAAACCTTGTCAGATTCCACCAAAATTGACGTGCTGGCGTATGACGGTTGCACCCAGACAACCCATGGGGACTGCGGGCTCCCGTTGTATGACTCTAGCGGGAAGATTGTCGCCATACACACTGGCAAGCTACTGGGGTTTTCAAAGATGTGCACACTGATCGATCTTACCGTGACAAAAGGGGTGTATGAAACATCAAGCTTTTTTTGTGGTGAACCGATTGATTACAGAGGCATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCTAGGCCCCCTGTCAGTGGGACTAGGTATGCCAGGGTCCCGGGTGTGCCAGACGAGTATAAGACTGGTTACAGGCCGGCAAATCTTGGGCGCGGTGACCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTAAAGAACCTACAGGTTTACCAACAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGACGAGTTCATCGAGCGGGCGGCTGCTGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTTCTAGTCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCAGCCTTCAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGCCCCTTTGTCCCGGGGAAGAAGATTGACCACGTGAAAGACGGAGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAGCATCTTTACAAATGTTGGAGTGTTGCCAACTCAGGCAAGGCCCTCCACCACATATACGCATGTGGACTGAAAGATGAACTCAGGCCCCTTGACAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTCGGCGTTGCCGTATGTGCCGCGGCCGTTTTCCACAACATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCCATTGCAGTTGGCGTCGACATGACTTCCCGTGATGTCGATGTCATAATCAACAATCTCACCGCCAAGGCCAGCGACTTCCTGTGTTTGGACTACTCAAAGTGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTGGTTAGGCTGGCCATTGACATTTTGGCTGACTGTTGTGAGCAGACGGAACTCACCAAGAGTGTTGTGCTCACACTGAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGACGCTATGATTGTGCAAACCAAACGTGGCCTTCCGAGTGGTATGCCCTTTACCTCGGTCATTAACTCTATTTGTCATTGGTTGCTTTGGTCCGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATTGGCCTACATTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTTTACACGTATGGTGATGACGGCGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCTGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTGTCACCCACTGCCGCGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTTTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATTGGGTGGGTGTCGAAGTTGGACAAGTCTAGTATACTTAGGCAGTTAGAATGGAGCAAAACAACATCTAGGCATATGGTGATTGAAGAGACGCATGACCTGGCCAAGGATGAACGTGGTGTGCAGCTCGAGGAGCTGCAGGTTGCTGCTGCCGCCCACGGCCAGGAATTCTTTGATTTTGTGTGCAAGGAGCTCAATCGACAACAAGCATACACACAGTTTAGTGTTTACAGCTACGATGCTGCCAGGAAGATACTAGCAGATCGGAAAAGAGTCGTCTCGGTGGTACCTGACGACGAGTTTGTGAATGTTATGGAGGGCAAAGCCCGCGCGACGCCGCAAGGCGAGACAGCGGGCACTGCTACCACAGCATCGGTCCCCGGAACCACAACCGACGGTATGGACCCTGGTGTTGTGGCCACCACCAGCGTGGTCACCACCGAGAACGCGTCCACGTCGATTGCAACGGCGGGGATCGGCGGTCCACCCCAACAAGTGGACCAACAAGAGACTTGGAGGACAAATTTCTACTATAATGATGTTTTTACATGGTCAGTTGCAGACGCCCCGGGCAACATCCTGTACACCGTTCAACACTCACCACAAAACAATCCGTTCACAGCTGTTCTAAGTCAAATGTACGCTGGCTGGGCCGGTGGCATGCAGTTCCGGTTCATAGTTGCTGGGTCAGGTGTCTTCGGTGGGCGTCTGGTCGCAGCGGTTATACCACCGGGCATTGAGATTGGGCCAGGTTTGGAAGTTAGACAATTCCCTCATGTTGTCATTGACGCTCGTTCACTCGAACCAGTCACCATCACCATGCCGGACTTGCGCCCCAACATGTACCACCCAACAGGCAACCCTGGCCTCGTTCCCACGTTGGTCCTGAGCGTTTACAACAACCTCATCAACCCATTTGGTGGATCCACGAGCGCAATCCAGGTCACGGTGGAAACAAGGCCCAGTGAGGACTTTGAGTTTGTGATGATCCGTGCCCCCTCCAGTAAGACCGTTGATTCGATCTCGCCCGCAGATCTCCTCACAACCCCAGTTCTCACTGGGGTTGGCACCGATAACAGATGGAATGGTGAGATAGTTGGGCTGCAACCAGTCCCCGGTGGGTTTTCTACGTGCAACAGACACTGGAACTTAAACGGTAGCACATATGGATGGTCAAGCCCGCGGTTTGCCGCCATTGACCACGACAGAGGCAACGCAAGTTTCCCTGGAAGCAGTTCGTCGAACGTGCTTGAGCTTTGGTATGCTAGTGCCGGGTCTGCAGCTGACAACCCCATCTCCCAAATTGCTCCAGATGGTTTCCCTGACATGTCATTTGTACCCTTCAGCGGTACCACCATCCCTACCGCAGGGTGGGTCGGGTTCGGTGGGATCTGGAACAGCAGTAATGGTGCCCCCTACGTCACGACCATGCAGGCTTATGAGTTGGGTTTTGCCACTGGAGTACCGAGCAACCCCAAACCCACCACCACCACTTCAGGGGCTCAGATTGTTGCCAAGTCCATCTATGGCGTTGCAAATGGCATAAACCAGACAACAGCCGGGTTGTTTGTGATGGCATCTGGTGTCATATCCACTCCAAACAGCAGTGCCACTACGTACACACCTCAGCCAAACAGGATTGTTAACGCACCTGGCACCCCTGCTGCCGCCCCTATTGGCAAGAACACACCCATCATGTTCGCGTCTGTTGTTAGGCGCACCGGCGACATCAACGCTGAGGCCGGTTCAACTAACGGAACCCAGTACGGCGCGGGATCACAACCGCTGCCGGTGACAATTGGACTTTCACTGAACAATTATTCATCGGCACTTATGCCTGGGCAGTTCTTCGTTTGGCAGCTAAACTTTGCTTCCGGCTTCATGGAACTTGGCTTGAGTGTTGATGGATACTTCTACGCGGGAACAGGGGCTTCAGCCGCCCTCATTGACCTGTCAGACCTTGTTGACATCCGCCCTGTGGGGCCCAGACCGTCCACAAGCACGCTTGTGTACAACTTGGGGGGCACAACCAATGGTTTTTCTTATGTCTGAATTTGTTGGACTAGGACTTGCAGGTGCCAGCGTTTTGAGCAGCGCTCTGCTCCGCAGGCAGGAGTTGCAATTACAAAAACAAGCTTTGGAAAACGGGTTGGTTTTAAAGGCCAATCAGTTGAGTAGATTAGGCTTTAATCCTAATGAAGTTAAGAGTATGATTGTAGGTAGTAATTTTAGTGGCAATGTTAAGTTAAGTAATATGCATAATGATGCTAGTGTAGTTAGTGCCTATAGTATGTATAATCCTGCTAGTAATGGTATTAGGAAGAAAATTAAAAGCTTTAATGATAGTGTTAAGGTTTATAATACCACTGGCGAGTCCAGTGCTTAATTAGGATTGGTTTAAATTTAATTGGTTTATGAATTTAATTAGCTTTATAGTTTAGAGTAAGCTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 26,734
|
MW926371.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Asin,J., Rejmanek,D., Clifford,D.L., Mikolon,A.B., Henderson,E.E., Nyaoke,A.C., Macias-Rioseco,M., Streitenberger,N., Beingesser,J., Woods,L.W., Lavazza,A., Capucci,L., Crossley,B., Uzal,F.A.
|
University of California, Davis, California Animal Health and Food Safety Laboratory
|
USA
|
2021-12-05
|
D2014044
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,369
|
GenBank
| 1
|
USA: California
|
USA
|
Sylvilagus audubonii
| null |
2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate D2014044, complete genome
|
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| 35,509
|
MW926372.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Asin,J., Rejmanek,D., Clifford,D.L., Mikolon,A.B., Henderson,E.E., Nyaoke,A.C., Macias-Rioseco,M., Streitenberger,N., Beingesser,J., Woods,L.W., Lavazza,A., Capucci,L., Crossley,B., Uzal,F.A.
|
University of California, Davis, California Animal Health and Food Safety Laboratory
|
USA
|
2021-12-05
|
D2014080
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,369
|
GenBank
| 1
|
USA: California
|
USA
|
Sylvilagus audubonii
| null |
2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate D2014080, complete genome
|
ATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCTTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCACCCGGGACACTGGCTTGGCCAGTCTTCCCGGACCAAAACGAAAATGAAGGACCTCTGGAGATATGCGGCAAATGTGGCAAATGGCTTAATGGATTCGGTGTTTTCGGACTAGAGGATCTCGGTGAAGTTTGCTTATGTTCTTTGACTAAGCATCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTCAAACACTACAAAGCATTGAACAGAGTCATTCCCTGTGCCTACCGGTTTAGTGAAAGAGTCCCCACCCCTATTTTTGAGGGTGAGGTTGACGACTTGTTTGTTGAGCTTGGGGCACCAACCAGCATGGGCTTCATAGACAAGAAGCTACTCAAGAAAGGCAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTTGACGTTGACGAGCCCTGTCTGACATCAAAGGACGCCAGCCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAGCACCATACGCGCGAAGCTGGAAGAGGAGTATGGTGTTGAAATGGTGCAGGCGGCACGGGACAGGAAAGACTTTATGAGAAACCTTAGACTTGCTTTGGACAACCGGCCTGCTAACCCCATGACTTGGTACACCAAGCTCGGTAACATCACGGAAAAAGGGAAACAGTGGGCGAAGAAGATTGTTTATGGTGCCCACAGAGTCACTGACCCCCTGAAAACTTTGGCCTCAATCTTATTAGTTGGCCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACAGTGATGTTATCAACGTTCAAACCTGTAAACCTGCTGGCTATCCTCATGGATTGGACTAACGACTTAACTGGATTCATTACCACGCTTGTAAGACTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTTAATTTGATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAAGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGTTTTGACTTGCTCAAAAGACTGTTCGATACATTTGAGGAGTCTGTCCCCACAGGACCAACTGCAGGCTGTCTCATCTTCATGGCTTTTGTCTTTTCCACTGTTGTGGGGTACTTGCCAAACAACAGTGTGATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGTAAGCTCACAACGTTTGCAGGAGTGATCGGCGCCATCCGAACACTGTGGATCACCATCAACCAACACATGGTAGCCAAGGACCTCACCAGCATACAACAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCGACGTTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGCTGCCTCTGCTCAGACTTGGAAAACACACTGACAAATAGGTGCACCCTACCATCATACAACCAACATCTCGGGATCTTGAATGCTTCCCAAAAGGTCATAAGTGACTTACACACCATGGTTCTTGGGAAGATCAACATGACAAAGCAGAGACCGCAACCTGTTGCTGTTATTTTTAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACCTATTTGGTCCACAGGCTTGCGCGAGACTTGGGCTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATATACAGGTGAGGAGGTAGCTATTGCAGATGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTGTTCATCCAGATGGTCAATACAAACCCGTGCCCACTCAACTGTGACAAGGCCGAGAACAAGAACAAGGTCTTTAACTCAAGGTACTTACTGTGCACAACAAACTCCAACATGATACTGAACGCGACTCACCCTCGTGCTGGTGCGTTCTACAGGAGAGTCATGATTGTTGAAGCGCGAAACAAAGCTGTTGAAAGCTGGCAGAACACTAGACACGGCTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTTACTTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTACCCCAGGATTTGTATTTGTCGGGGAGAAACTGGTGAAGTCACAGGTTGCACCCAGGGAGTACAAATACAGTGAGCTCTTGGATTTGATCAAAAGTGAGCACCCTGATGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAATAAGTTCAACTTCATTTACCCAGACGCCCAATTCGAACAGGCGCTCCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTTATGTATGGATGTGTAGCAAGACTTGCAAAGAATTTTGTTGAAGACATTCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCCAAGATTGACGGGTGTGTGGAGTACCAGTGCAAGTTCCAACATCTCTGGCGTATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACGAACCAACTTGGCACCCCCTTGACCCAGCGACAGTTAGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGTGTCACCGTCACAACGGTGAACAATATCCTGCCATTCCATTCACAAACCACACTCATAAATCCCTCTTTTATAAAGCTGATTTGGGCAGTGAGGAAGCACCTCAAGGGACTCAGTGGTGTGACCAAGGTGGCTCAGTTCATTTGGCGTGTCATGACTAACCCAGTGGATGCCTATGGCACCCTTGTCAGAACACTTACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGACGACCCAGTTTCAACAACGATAATATGTTCCAACTGCACAATCCAAATCCACTCTTGCGGTGGGCTGCTTGTGAGGTATTCAAGAGACCCTGCCCCCGTGGCATCAGACAATGTCGACCGTGGTGATCAAGGTGTTGACGTGTTTACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGACAGATTGCCCACTTATTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTCGCGACCATGGCTGCACTGGGTGCTGTCGCTACAAAGGCTTTCCAGGGTGTGAAGGGCAAGACAAAACGTGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACTTGGGGAATGACGAGTACGATGAATGGCAAGCTGCGCGCAGAGAATTCGTTAACGCACATGACATGACTGCAGAAGAGTATCTTGCCATGAAAAACAAAGCTGCTATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCGTCATGTTTAGGAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACTATTGTCGGCAGAGGTGGAGTGAGGAACGAAGTCATTCGCACTAGGGCTAGGCAGGCCCCAAAAGGGCCAAAAACACTGGACGACGGTGGTTTTTATGACAATGACTATGAAGGCCTGCCAGGATTTATGAGGCACAACGGTAGTGGTTGGATGATTCACATAGGCAATGGGTTGTACATATCCAACACCCACACTGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGTTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAGGGGGAGGCAATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAAGGAACCCCAGTTAGTGATTGGAAGAAGTCCCCCATCACAACTTATGGCATCAAGAAAACCTTGTCAGACTCCACAAAAATTGACGTACTAGCGTATGACGGTTGTACACAGACGACCCATGGGGACTGTGGGCTCCCGTTGTATGATTCTAGCGGGAAGATTGTTGCCATACACACCGGCAAACTACTAGGGTTCTCAAAGATGTGCACATTGATTGACCTCACCGTGACAAAGGGGGTGTATGAGACATCAAACTTCTTCTGTGGTGAACCGATCGACTACAGGGGCATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCCAGGCCCCCTGTTAGTGGAACTAGGTATGCCAGGGTCCCAGGTGTGCCAGATGAGTACAAGACTGGTTACAGGCCAGCCAATCTTGGGCGCGGTGATCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTGAAGAACCTGCAGGTTTACCAGCAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGACGAGTTCATTGAGCGGGCAGCTGCCGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTCCTAACCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGTCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCATGTGAAAGACGGGGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAGTGCTGGAGTGTTGCCAACTCTGGCAAGGCTCTCCACCACATATACGCGTGTGGATTGAAAGATGAGCTCAGACCCCTTGATAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTTGGCGTTGCTGTGTGTGCCGCAGCCGTTTTCCACAACATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCTATCGCAGTTGGCGTTGACATGACATCCCGTGATGTTGACGTTATCATTAACAACCTCACCGCCAAAGCCAGTGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAATGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTTGTCAGGCTGGCCATTGACATCTTGGCCGACTGCTGTGAACAGACGGAACTCACCAAGAGTGTGGTGCTCACACTAAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGATGCCATGATTGTGCAAACTAAGCGTGGCCTCCCAAGTGGTATGCCCTTCACCTCGGTCATCAACTCTATCTGCCATTGGCTGCTTTGGTCTGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATCGGCCTACACTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTCTATACATATGGTGATGACGGTGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCCGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTGTCACCCACTGCCGCGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTTTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGATATCGGGTGGGTATCAAA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| 35,510
|
MW926373.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Asin,J., Rejmanek,D., Clifford,D.L., Mikolon,A.B., Henderson,E.E., Nyaoke,A.C., Macias-Rioseco,M., Streitenberger,N., Beingesser,J., Woods,L.W., Lavazza,A., Capucci,L., Crossley,B., Uzal,F.A.
|
University of California, Davis, California Animal Health and Food Safety Laboratory
|
USA
|
2021-12-05
|
D2014271
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,369
|
GenBank
| 1
|
USA: California
|
USA
|
Lepus californicus
| null |
2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate D2014271, complete genome
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| 35,511
|
MW926374.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Asin,J., Rejmanek,D., Clifford,D.L., Mikolon,A.B., Henderson,E.E., Nyaoke,A.C., Macias-Rioseco,M., Streitenberger,N., Beingesser,J., Woods,L.W., Lavazza,A., Capucci,L., Crossley,B., Uzal,F.A.
|
University of California, Davis, California Animal Health and Food Safety Laboratory
|
USA
|
2021-12-05
|
D2100068
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,369
|
GenBank
| 1
|
USA: California
|
USA
|
Sylvilagus audubonii
| null |
2021
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate D2100068, complete genome
|
ATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCTTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCACCCGGGACACTGGCTTGGCCAGTTTTCCCGGACCAAAACGAAAATGAAGGACCTCTGGAGATATGCGGCAAATGTGGCAAATGGCTTAATGGATTCGGTGTTTTCGGACTAGAGGATCTCGGTGAAGTTTGCTTATGTTCTTTGACTAAGCATCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTCAAACACTACAAAGCATTGAACAGAGTCATTCCCTGTGCCTACCGGTTTAGTGAAAGAGTCCCCACCCCTATTTTTGAGGGTGAGGTTGACGACTTGTTTGTTGAGCTTGGGGCACCAACCAGCATGGGCTTCATAGACAAGAAGCTACTCAAGAAAGGCAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTTGACGTTGACGAGCCCTGTTTGACATCAAAGGACGCCAGCCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAGCACCATACGCGCGAAGCTGGAAGAGGAGTATGGTGTTGAAATGGTGCAGGCGGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGAAACCTTAGACTTGCTTTGGACAACCGGCCTGCTAACCCCATGACTTGGTACACCAAGCTCGGTAACATCACGGAAAAAGGGAAACAGTGGGCGAAGAAGATTGTTTATGGTGCCCACAGAGTCACTGACCCCCTGAAAACTTTAGCCTCAATCTTACTAGTTGGCCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACAGTGATGTTGTCAACGTTCAAACCTGTAAACCTACTGGCTATCCTCATGGATTGGACTAATGACTTAACTGGATTCATTACCACGCTTGTAAGACTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTTAATTTAATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAAGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGTTTTGACTTGCTCAAAAGACTGTTCGACACATTTGAGGAGTCTGTCCCCACAGGACCAACTGCAGGCTGTCTCATCTTCATGGCTTTTGTCTTTTCCACTGTTGTGGGGTACTTGCCAAACAACAGTGTGATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGTAAGCTCACAACGTTTGCAGGAGTGGTCGGCGCCATCCGAACACTGTGGATCACCATCAACCAACACATGGTAGCCAAGGACCTCACCAGCATACAACAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCGACGTTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGCTGCCTCTGCTCAGACTTGGAAAACACACTGACAAATAGGTGCACCCTACCATCATACAACCAACATCTCGGGATCTTGAATGCTTCCCAGAAGGTCATAAGTGACTTACACACCATGGTTCTTGGGAAGATCAACATGACAAAGCAGAGACCGCAGCCTGTTGCTGTTATTTTTAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACCTATTTGGTCCACAGGCTTGCGCGAGACTTGGGCTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATATACAGGTGAGGAGGTGGCTATTGCAGATGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTGTTCATCCAGATGGTCAATACAAACCCGTGCCCACTCAACTGTGACAAGGCCGAGAACAAGAACAAGGTCTTTAACTCAAGGTACTTACTGTGCACAACAAACTCCAACATGATACTGAACGCGACTCACCCCCGTGCTGGTGCGTTCTACAGGAGAGTCATGATTGTTGAAGCGCGAAACAAAGCTGTTGAAAGCTGGCAGAACACTAGACACGGCTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTTACTTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTACCCCAGGATTTGTATTTGTCGGGGAGAAACTGGTGAAGTCACAGGTTGTACCCAGGGAGTACAAATACAGTGAGCTCTTGGACTTGATCAAAAGTGAGCACCCTGATGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAATAAGTTCAACTTCATTTACCCAGACGCCCAATTCGAACAGGCGCTCCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTTATGTACGGATGTGTAGCAAGACTTGCAAAGAATTTTGTTGAAGACATTCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCCAAGATTGACGGGTGTGTGGAGTACCAGTGCAAGTTCCAACATCTCTGGCGTATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACGAACCAACTTGGCACCCCCTTGACCCAGCGACAGTTAGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGTGTCACCGTCACAACGGTGAACAATATCCTGCCATTCCATTCACAAACCACACTCATAAATCCCTCTTTTATAAAGCTGATTTGGGCAGTGAGGAAGCACCTCAAGGGACTCAGTGGTGTGACCAAGGTGGCCCAGTTCATTTGGCGTGTCATGACTAACCCAGTGGATGCCTATGGCACCCTTGTCAGAACACTTACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGACGACCCAGTTTCAACAACGATAATATGTTCCAACTGCACAATCCAAATCCACTCTTGCGGTGGGCTGCTTGTGAGGTATTCAAGAGACCCTGCCCCCGTGGCATCAGACAATGTCGACCGTGGTGATCAAGGTGTTGACGTGTTTACTGACCCCAACCTCATCTCTGGATTCAGTTGGAGACAGATTGCCCACTTATTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACCATGGCTGCACTGGGTGCTGTCGCTACAAAGGCTTTCCAGGGTGTGAAGGGCAAGACAAAATGTGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACTTGGGGAATGACGAGTACGATGAGTGGCAAGCTGCGCGCAGAGAATTCGTTAACGCACATGACATGACTGCAGAAGAGTATCTTGCCATGAAAAATAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCGTCATGTTTAGGAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACTATTGTCGGCAGAGGTGGAGTGAGGAACGAAGTCATTCGCACTAGGGCTAGGCAGGCCCCAAAAGGGCCAAAAACACTGGACGACGGTGGTTTTTATGACAATGACTATGAAGGCCTGCCAGGATTTATGAGGCACAACGGCAGTGGTTGGATGATTCACATAGGCAATGGGTTGTACATATCCAACACCCACACTGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGTTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAGGGGGAGGCAATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAAGGAACCCCAGTTAGTGATTGGAAGAAGTCCCCCATCACAACTTATGGCATCAAGAAAACCTTGTCAGACTCCACCAAAATTGACGTACTAGCGTATGACGGTTGTACACAGACGACCCATGGGGACTGTGGGCTCCCGTTGTATGATTCTAGCGGGAAGATTGTTGCCATACACACCGGCAAACTACTAGGGTTCTCAAAGATGTGCACATTGATTGACCTCACCGTGACAAAGGGGGTGTATGAGACATCAAACTTCTTCTGTGGTGAACCGATCGACTACAGGGGCATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCCAGGCCCCCTGTTAGTGGAACTAGGTATGCCAGGGTCCCAGGTGTGCCAGATGAGTACAAGACTGGTTACAGGCCAGCCAATCTTGGGCGCGGTGATCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTGAAGAACCTGCAGGTTTACCAGCAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGACGAGTTCATTGAGCGGGCAGCTGCCGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTCCTAACCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGTCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCATGTGAAAGACGGGGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAGTGCTGGAGTGTTGCCAACTCTGGCAAGGCTCTCCACCACATATACGCGTGTGGATTAAAAGATGAGCTCAGACCCCTTGATAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTTGGCGTTGCTGTGTGTGCCGCAGCCGTTTTCCACAACATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCTATCGCAGTTGGCGTTGACATGACATCCCGTGATGTTGACGTTATCATTAACAACCTCACCGCCAAAGCCAGTGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAATGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTTGTCAGGCTGGCCATTGACATCTTGGCCGACTGCTGTGAACAGACGGAACTCACCAAGAGTGTGGTGCTCACACTAAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGATGCCATGATTGTGCAAACTAAGCGTGGCCTCCCAAGTGGTATGCCCTTCACCTCGGTCATCAACTCTATCTGCCATTGGCTGCTTTGGTCTGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATCGGCCTACACTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTCTATACATATGGTGATGACGGTGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCCGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTGTCACCCACTGCCGCGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTTTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTGGGTATCAAA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| 35,512
|
MW926375.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Asin,J., Rejmanek,D., Clifford,D.L., Mikolon,A.B., Henderson,E.E., Nyaoke,A.C., Macias-Rioseco,M., Streitenberger,N., Beingesser,J., Woods,L.W., Lavazza,A., Capucci,L., Crossley,B., Uzal,F.A.
|
University of California, Davis, California Animal Health and Food Safety Laboratory
|
USA
|
2021-12-05
|
S2006894
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,369
|
GenBank
| 1
|
USA: California
|
USA
|
Oryctolagus cuniculus
| null |
2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate S2006894, complete genome
|
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| 35,513
|
MW926376.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Asin,J., Rejmanek,D., Clifford,D.L., Mikolon,A.B., Henderson,E.E., Nyaoke,A.C., Macias-Rioseco,M., Streitenberger,N., Beingesser,J., Woods,L.W., Lavazza,A., Capucci,L., Crossley,B., Uzal,F.A.
|
University of California, Davis, California Animal Health and Food Safety Laboratory
|
USA
|
2021-12-05
|
S2007194
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,369
|
GenBank
| 1
|
USA: California
|
USA
|
Oryctolagus cuniculus
| null |
2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate S2007194, complete genome
|
ATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCTTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCACCCGGGACACTGGCTTGGCCAGTCTTCCCGGACCAAAACGAAAATGAAGGACCTCTGGAGATATGCGGCAAATGTGGCAAATGGCTTAATGGATTCGGTGTTTTCGGACTAGAGGATCTCGGTGAAGTTTGCTTATGCTCTTTGGCTAAGCATCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTCAAACACTACAAAGCATTGAACAGAGTCATTCCCTGTGCCTACCGGTTTGGTGAAACAGTCCCCACCCCTATTTTTGAGGGTGAGGTTGACGACTTGTTTGTTGAGCTTGGGGCACCAACCAGCATGGGCTTCATAGACAAGAAGCTACTCAAGAAAGGCAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTTGACGTTGATGAGCCCTGTCTGACATCAAAGGACGCCAGCCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAGCACCATACGCGCGAAGCTGGAAGAGGAGTATGGTGTTGAAATGGTGCAGGCGGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGAAACCTTAGACTTGCTTTGGACAACCGGCCTGCTAACCCCATGACTTGGTACACCAAGCTCGGTAACATCACGGAAAAAGGGAAACAGTGGGCGAAGAAGATTGTTTATGGTGCCCACAGAGTCACTGACCCCCTGAAAACTTTGGCCTCAATCTTATTAGTTGGCCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACAGTGATGTTATCAACGTTCAAACCTGTAAACCTGCTGGCTATCCTCATGGATTGGACTAATGACTTAACTGGATTCATTACCACGCTTGTAAGGCTGCTAGAGTTGTACGGTGTTGTGCAGGCTACCGTTAATTTAATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAAGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGTTTTGACTTGCTCAAAAGACTGTTCGACACATTTGAGGAGTCTGTCCCTACAGGACCAACTGCAGGCTGTCTCATCTTCATGGCTTTTGTCTTTTCCACTGTTGTGGGGTACTTGCCAAACAACAGTGTGATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGTAAGCTCACAACGTTTGCAGGAGTGGTCGGCGCCATCCGAACACTGTGGATCACCATCAACCAACACATGGTAGCTAAGGACCTCACCAGCATACAACAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCGACGTTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGCTGCCTCTGCTCAGACTTGGAAAACACACTGACAAATAGGTGCACCCTGCCATCATACAACCAACATCTCGGGATCTTGAATGCTTCCCAGAAGGTCATAAGTGACTTACACACCATGGTTCTTGGGAAGATCAACATGACAAAGCAGAGACCGCAGCCTGTTGCTGTTATTTTTAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACCTATTTGGTCCACAGGCTTGCGCGAGACTTGGGCTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATATACAGGTGAGGAGGTAGCTATTGCAGATGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTGTTCATCCAGATGGTCAATACAAACCCGTGCCCACTCAACTGTGACAAGGCCGAGAACAAGAACAAGGTCTTTAACTCAAGGTACTTACTGTGCACAACAAACTCCAACATGATACTGAACGCGACTCACCCTCGTGCTGGTGCGTTCTACAGGAGAGTCATGATTGTTGAAGCGCGAAACAAAGCTGTTGAAAGCTGGCAGAACACTAGACACGGCTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTTACTTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTACCCCAGGATTTGTATTTGTCGGGGAGAAACTGGTGAAATCACAGGTTGTACCCAGGGAGTACAAATACAGTGAGCTCTTGGACTTGATCAAAAGTGAGCACCCTGATGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAATAAGTTCAACTTCATTTACCCAGACGCCCAATTCGAACAGGCGCTCCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTTATGTATGGATGTGTAGCAAGACTTGCAAAGAATTTTGTTGAAGACATTCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCCAAGATTGACGGGTGTGTGGAGTACCAGTGCAAGTTCCAACATCTCTGGCGTATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACGAACCAACTTGGCACCCCCTTGACCCAGCGACAGTTAGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGTGTCACCGTCACAACGGTGAACAATATCCTGCCATTCCATTCACAAACCACACTCATAAATCCCTCTTTTATAAAGCTGATTTGGGCAGTGAGGAAGCACCTCAAGGGACTCAGTGGTGTGACCAAGGTGGCCCAGTTCATTTGGCGTGTCATGACTAACCCAGTGGATGCCTATGGCACCCTTGTCAGAACACTTACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGACGACCCAGTTTCAACAACGATAATATGTTCCAACTGCACAATCCAAATCCACTCTTGCGGTGGGTTGCTTGTGAGGTATTCAAGAGACCCTGCCCCCGTGGCATCAGACAGTGTCGACCGTGGTGATCAAGGTGTTGACGTGTTTACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGACAGATTGCCCACTTATTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACCATGGCTGCACTGGGTGCTGTCGCCACAAAGGCTTTCCAGGGTGTGAAGGGCAAGACAAAACGTGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACTTGGGGAATGACGAGTACGATGAGTGGCAAGCTGCGCGCAGAGAGTTCGTTAACGCACATGACATGACTGCAGAAGAGTATCTTGCCATGAAAAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCGTCATGTTTAGGAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACTATTGTCGGCAGAGGTGGAGTGAGGAACGAAGTCATTCGCACTAGGGCTAGGCAGGCCCCAAAAGGGCCAAAAACACTGGACGATGGTGGTTTTTATGACAATGACTATGAAGGCCTGCCAGGATTTATGAGGCACAACGGCAGTGGTTGGATGATTCACATAGGCAATGGGTTATACATATCCAACACCCACACTGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGTTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAGGGGGAGGCAATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAAGGAACCCCAGTTAGTGATTGGAAGAAGTCCCCCATCACAACTTATGGCATCAAGAAAACCTTGTCAGACTCCACCAAAATTGACGTACTAGCGTATGACGGTTGTACACAGACGACCCATGGGGACTGTGGGCTCCCGTTGTATGATTCTAGCGGGAAGATTGTTGCCATACACACCGGCAAACTACTAGGGTTCTCAAAGATGTGCACATTGATTGACCTCACCGTGACAAAGGGGGTGTATGAGACATCAAACTTCTTCTGTGGTGAACCGATCGACTACAGGGGCATTACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCCAGGCCCCCTGTTAGTGGAACTAGGTATGCCAGGGTCCCAGGTGTGCCAGATGAGTACAAGACTGGTTACAGGCCAGCCAATCTTGGGCGCGGTGATCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTGAAGAACCTGCAGGTTTACCAGCAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGACGAGTTCATTGAGCGGGCAGCTGCCGACGTTTTGGGCTACTTGCGTTTCCTGACCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGTCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCATGTGAAAGACGGGGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAGTGCTGGAGTGTTGCCAACTCTGGCAAGGCTCTCCACCACATATACGCGTGTGGATTAAAAGATGAGCTCAGACCCCTTGACAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTTGGCGTTGCTGTGTGTGCCGCAGCCGTTTTCCACAACATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCTATCGCAGTTGGTGTTGACATGACATCCCGTGATGTTGACGTTATCATTAACAACCTCACCGCCAAAGCCAGTGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAATGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTTGTCAGGCTGGCCATTGACATCTTGGCCGACTGCTGTGAACAGACGGAACTCACCAAGAGTGTAGTGCTCACACTAAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGATGCCATGATTGTGCAAACTAAGCGTGGCCTCCCAAGTGGTATGCCCTTCACCTCGGTCATCAACTCTATTTGCCATTGGCTGCTTTGGTCTGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATCGGCCTACACTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTCTACACATATGGTGATGACGGTGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTAAGCCTCCTACCCGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTGTCACCCACTGCCGCGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTTTTGAAGCGCACCTTTGAGCTTACAGACATCGGGTGGGTATCAAA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| 35,514
|
MW926377.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Asin,J., Rejmanek,D., Clifford,D.L., Mikolon,A.B., Henderson,E.E., Nyaoke,A.C., Macias-Rioseco,M., Streitenberger,N., Beingesser,J., Woods,L.W., Lavazza,A., Capucci,L., Crossley,B., Uzal,F.A.
|
University of California, Davis, California Animal Health and Food Safety Laboratory
|
USA
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2021-12-05
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S2008982
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Rabbit hemorrhagic disease virus
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Lagovirus
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Caliciviridae
|
ssRNA(+)
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GenBank
| 1
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USA: California
|
USA
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Oryctolagus cuniculus
| null |
2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate S2008982, complete genome
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| 35,515
|
MW926378.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Asin,J., Rejmanek,D., Clifford,D.L., Mikolon,A.B., Henderson,E.E., Nyaoke,A.C., Macias-Rioseco,M., Streitenberger,N., Beingesser,J., Woods,L.W., Lavazza,A., Capucci,L., Crossley,B., Uzal,F.A.
|
University of California, Davis, California Animal Health and Food Safety Laboratory
|
USA
|
2021-12-05
|
S2009110
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,369
|
GenBank
| 1
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USA: California
|
USA
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Oryctolagus cuniculus
| null |
2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate S2009110, complete genome
|
ATGGCGGCTATGTCGCGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCTTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCACCCGGGACACTGGCTTGGCCAGTTTTCCCGGACCAAAACGAAAATGAAGGACCTCTGGAGATATGCGGCAAATGTGGCAAATGGCTTAATGGATTCGGTGTTTTCGGACTAGAGGATCTCGGTGAAGTTTGCTTATGTTCTTTGACTAAGCATCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTCAAACACTACAAAGCATTGAACAGAGTCATTCCCTGTGCCTACCGGTTTAGTGAAAGAGTCCCCACCCCTATTTTTGAGGGTGAGGTTGACGACTTGTTTGTTGAGCTTGGGGCACCAACCAGCATGGGCTTCATAGACAAGAAGCTACTCAAGAAAGGCAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTTGACGTTGACGAGCCCTGTCTGACATCAAAGGACGCCAGCCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAGCACCATACGCGCGAAGCTGGAAGAGGAGTATGGTGTTGAAATGGTGCAGGCGGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGAAACCTTAGACTTGCTTTGGACAACCGGCCTGCTAACCCCATGACTTGGTACACCAAGCTCGGTAACATCACGGAAAAAGGGAAACAGTGGGCGAAGAAGATTGTTTATGGTGCCCACAGAGTCACTGACCCCCTGAAAACTTTGGCCTCAATCTTACTAGTTGGCCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACAGTGATGTTATCAACGTTCAAACCTGTAAACCTGCTGGCTATCCTCATGGATTGGACTAATGACTTAACTGGATTCATTACCACGCTTGTAAGACTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTTAATTTAATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAAGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGTTTTGACTTGCTCAAAAGACTGTTCGACACATTTGAGGAGTCTGTCCCCACAGGACCAACTGCAGGCTGTCTCATCTTCATGGCTTTTGTCTTTTCCACTGTTGTGGGGTATTTGCCAAACAACAGTGTGATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGTAAGCTCACAACGTTTGCAGGAGTGGTCGGCGCCATCCGAACACTGTGGATCACCATCAACCAACACATGGTAGCCAAGGACCTCACCAGCATACAACAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCGACGTTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGCTGCCTCTGCTCAGACTTGGAAAACACACTGACAAATAGGTGCACCCTACCATCATACAACCAACATCTCGGGATCTTGAATGCTTCCCAGAAGGTCATAAGTGACTTACACACCATGGTTCTTGGGAAGATCAACATGACAAAGCAGAGACCGCAGCCTGTTGCTGTTATTTTTAAAGGAGCCCCAGGCATTGGAAAAACCTATTTGGTCCACAGGCTTGCGCGAGACTTGGGCTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATATACAGGTGAGGAGGTAGCTATTGCAGATGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTGTTCATCCAGATGATCAATACAAACCCGTGCCCACTCAACTGTGACAAGGCCGAGAACAAGAACAAGGTCTTTAACTCAAGGTACTTACTGTGCACAACAAACTCCAACATGATACTGAACGCGACTCACCCTCGTGCTGGCGCGTTCTACAGGAGAGTCATGATTGTTGAAGCGCGAAACAAAGCTGTTGAAAGCTGGCAGAACACTAGACACGGCTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTTACTTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCTACCCCAGGATTTGTATTTGTCGGGGAGAAACTGGTGAAGTCACAGGTTGTACCCAGGGAGTACAAATACAGTGAGCTCTTGGACTTGATCAAAAGTGAGCACCCTGATGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAATAAGTTCAACTTCATTTACCCAGACGCCCAATTCGAACAGGCGCTCCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTTATGTACGGATGTGTAGCAAGACTTGCAAAGAATTTTGTTGAAGACATTCCATACAACCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCCAAGATTGACGGGTGTGTGGAGTACCAGTGCAAGTTCCAACATCTCTGGCGTATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACGAACCAACTTGGCACCCCCTTGACCCAGCGACAGTTAGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGTGTCACCGTCACAACGGTGAACAATATCCTGCCATTCCATTCACAAACCACACTCATAAATCCCTCTTTTATAAAGCTGATTTGGGCAGTGAGGAAGCACCTCAAGGGACTCAGTGGTGTGACCAAGGTGGCCCAGTTCATTTGGCGTGTCATGACTAACCCAGTGGATGCCTATGGCACCCTTGTCAGAACACTTACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGACGACCCAGTTTCAACAACGATAATATGTTCCAACTGCACAATCCAAATCCACTCTTGCGGTGGGCTGCTTGTGAGGTATTCAAGAGACCCTGCCCCCGTGGCATCAGACAATGTCGACCGTGGTGATCAAGGTGTTGACGTGTTTACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGACAGATTGCCCACTTATTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACCATGGCTGCACTGGGTGCTGTCGCTACAAAGGCTTTCCAGGGTGTGAAGGGCAAGACAAAACGTGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACTTGGGGAATGACGAGTACGATGAGTGGCAAGCTGCGCGCAGAGAATTCGTTAACGCACATGACATGACTGCAGAAGAGTATCTTGCCATGAAAAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCGTCATGTTTAGGAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACTATTGTCGGCAGAGGTGGAGTGAGGAACGAAGTCATTCGCACTAGGGCTAGGCAGGCCCCAAAAGGGCCAAAAACACTGGACGACGGTGGTTTTTATGACAATGACTATGAAGGCCTGCCAGGATTTATGAGGCACAACGGCAGTGGTTGGATGATTCACATAGGCAATGGGTTGTACATATCCAACACCCACACTGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGTTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAGGGGGAGGCAATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAAGGAACCCCAGTTAGTGATTGGAAGAAGTCCCCCATCACAACTTATGGCATCAAGAAAACCTTGTCAGACTCCACCAAAATTGACGTACTAGCGTATGACGGTTGTACACAGACGACCCATGGGGACTGTGGGCTCCCGTTATATGATTCTAGCGGGAAGATTGTTGCCATACACACCGGCAAACTACTAGGGTTCTCAAAGATGTGCACATTGATTGACCTCACCGTGACAAGGGGGGTGTATGAGACATCAAACTTCTTCTGTGGTGAACCGATCGACTACAGGGGCATCACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCCAGGCCCCCTGTTAGTGGAACTAGGTATGCCAGGGTCCCAGGTGTGCCAGATGAGTACAAGACTGGTTACAGGCCAGCCAATCTTGGGCGCGGTGATCCAGACAGTGACAAATCACTCATGAACATTGCAGTGAAGAACCTGCAGGTTTACCAGCAAGAACCCAAGCTTAACAAGGTGGACGAGTTCATTGAGCGGGCAGCTGCCGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTCCTAACCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGTCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCATGTGAAAGACGGGGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAGTGCTGGAGTGTTGCCAACTCTGGCAAGGCTCTCCACCACATATACGCGTGTGGATTAAAAGATGAGCTCAGACCCCTTGATAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAAAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTTGGCGTTGCTGTGTGTGCCGCAGCCGTTTTCCACAACATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCTATCGCAGTTGGCGTTGACATGACATCCCGTGATGTTGACGTTATCATTAACAACCTCACCGCCAAAGCCAGTGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAATGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTTGTCAGGCTGGCCATTGACATCTTGGCCGACTGCTGTGAACAGACGGAACTCACCAAGAGTGTGGTGCTCACACTAAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGATGCCATGATTGTGCAAACTAAGCGTGGCCTCCCAAGTGGTATGCCCTTCACCTCGGTCATCAACTCTATCTGCCATTGGCTGCTTTGGTCTGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATCGGCCTACACTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTCTATACATATGGTGATGACGGTGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCCGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTGTCACCCACTGCCGCGGACAAGACGGAGCACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTTTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTGGGTATCAAA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| 35,516
|
MW926379.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Asin,J., Rejmanek,D., Clifford,D.L., Mikolon,A.B., Henderson,E.E., Nyaoke,A.C., Macias-Rioseco,M., Streitenberger,N., Beingesser,J., Woods,L.W., Lavazza,A., Capucci,L., Crossley,B., Uzal,F.A.
|
University of California, Davis, California Animal Health and Food Safety Laboratory
|
USA
|
2021-12-05
|
S2009752
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Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,369
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GenBank
| 1
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USA: California
|
USA
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Lepus californicus
| null |
2020
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate S2009752, complete genome
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| 35,517
|
MW926380.1
|
Rabbit hemorrhagic disease virus 2
|
Asin,J., Rejmanek,D., Clifford,D.L., Mikolon,A.B., Henderson,E.E., Nyaoke,A.C., Macias-Rioseco,M., Streitenberger,N., Beingesser,J., Woods,L.W., Lavazza,A., Capucci,L., Crossley,B., Uzal,F.A.
|
University of California, Davis, California Animal Health and Food Safety Laboratory
|
USA
|
2021-12-05
|
S2100208
|
Rabbit hemorrhagic disease virus
|
Lagovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,369
|
GenBank
| 1
|
USA: California
|
USA
|
Oryctolagus cuniculus
| null |
2021
| null | null |
Rabbit hemorrhagic disease virus 2 isolate S2100208, complete genome
|
ATGGCGGCTATGTCGTGCCTTACTGGCATGACAACTGCTATTCTCCCAGCGAAGAAACCTTTAAGTTGCTTCCTGGACCTCAGGGACAAGACCCCTCCCTGTTGTATTCGGGCACCCGGGACACTGGCTTGGCCAGTCTTCCCGGACCAAAACGAAAATGAAGGACCTCTGGAGATATGCGGCAAATGTGGCAAATGGCTTAATGGATTCGGTGTTTTCGGACTAGAGGATCTCGGTGAGGTTTGCTTATGTTCTTTGACTAAGCATCAACACAAGTTTGGACCCACCTGTTTGTGTAACCGTGCATACATACACGACTGCGGCCGCTGGCGGCGCCGCAGTCGTTTTCTCAAACACTACAAAGCATTGAACAGAGTCATTCCCTGTGCCTACCGGTTTAGTGAAAGAGTCCCCACCCCTATTTTTGAGGGTGAGGTTGACGACTTGTTTGTTGAGCTTGGGGCACCAACCAGCATGGGCTTCATAGACAAGAAGCTACTCAAGAAAGGCAAGAAACTAATGGACAAGTTTGTTGACGTTGACGAGCCCTGTCTGACATCAAAGGACGCCAGCCTTCTCGACTCTATTGCTTCTGACAGCACCATACGCGCGAAGCTGGAAGAGGAGTACGGTGTTGAAATGGTGCAGGCGGCACGGGACAGGAAAGACTTCATGAGAAACCTTAAACTTGCTTTGGACAACCGGCCTGCTAACCCCATGACTTGGTACACCAAGCTCGGTAACATCACGGAAAAAGGGAAACAGTGGGCGAAGAAGATTGTTTATGGTGCCCACAGAATCACTGACCCCCTGAAAACTTTGGCCTCAATCTTATTAGTTGGCCTCCACAACGCTATTGCTGTGGACACAACAGTGATGTTATCAACGTTCAAACCTGTAAACCTGCTGGCTATCCTCATGGATTGGACTAATGACTTAACTGGATTCATTACCACGCTTGTAAGACTGCTAGAGTTGTATGGTGTTGTGCAGGCTACCGTTAATTTAATCATTGAAGGTGTGAAGAGCTTCTGGGACAAAGTGGTCTGCGCAACGGAGCGTTGTTTTGACTTGCTCAAAAGACTGTTCGACACATTTGAGGAGTCTGTCCCCACAGGACCAACTGCAGGCTGTCTCATCTTCATGGCTTTTGTCTTTTCCACTGTTGTGGGGTACTTGCCAAACAACAGTGTGATCACAACCTTTATGAAGGGCGCTGGTAAGCTCACAACGTTTGCAGGAGTGGTCGGTGCCATCCGAACACTGTGGATCACCATCAACCAACACATGGTAGCCAAGGACCTCACCAGCATACAGCAAAAGGTTATGACAGTTGTGAAAATGGCTAATGAGGCAGCGACGTTGGACCAGCTTGAGATCGTTAGCTGCCTCTGCTCAGACTTGGAAAACACACTGACAAATAGGTGCACCCTACCATCATACAACCAACATCTCGGGATCTTGAATGCTTCCCAGAAGGTCATAAGTGACTTACACACCATGGTTCTTGGGAAGATCAACATGACAAAGCAGAGACCGCAGCCTGTTGCTGTTATTTTTAAAGGAGCCCCAGGCATTGGTAAAACCTATTTGGTCCACAGGCTTGCGCGAGACTTGGGCTGCCAACACCCAAGCACGATCAACTTTGGCCTTGACCATTTTGACTCATATACAGGTGAGGAGGTAGCTATTGCAGACGAGTTCAACACCTGTGGGGACGGGGAGAGTTGGGTTGAACTGTTCATCCAGATGGTTAATACAAACCCGTGCCCACTCAACTGTGACAAGGCCGAGAACAAGAACAAGGTCTTTAACTCAAGGTACTTACTGTGCACAACAAACTCCAACATGATACTGAACGCGACTCACCCTCGTGCTGGTGCGTTCTACAGGAGAGTCATGATTGTTGAAGCGCGAAACAAAGCTGTTGAAAGCTGGCAGAACACTAGACACGGCTCCAAGCCAGGGAAGTCGTGCTTCAGCAAGGACATGTCACACCTTACTTTCCAGGTGTACCCCCACAACATGCCCACCCCAGGATTTGTATTTGTCGGGGAGAAACTGGTGAAGTCACAGGTTGTACCCAGGGAGTACAAATACAGTGAGCTCTTGGACTTGATCAAAAGTGAGCACCCTGATGTGGCCTCATTCGAGGGTGCCAATAAGTTCAACTTCATTTACCCAGACGCCCAATTCGAACAGGCGCTCCTCATGTGGAAACAGTACTTTGTTATGTATGGATGTGTGGCAAGACTTGCAAAGAATTTTGTTGAAGACATTCCATACAATCAAGTTCACATATCAAAGGCAAGTGACCCCAAGATTGACGGGTGTGTGGAGTACCAGTGCAAGTTCCAACATCTCTGGCGTATGGTCCCACAGTTTGTTTTGGGGTGTGTGAACATGACGAACCAACTTGGCACCCCCTTGACCCAGCGACAGTTAGACAGGATCACCAACGGGGTTGAGGGTGTCACCGTCACAACGGTGAACAATATCCTGCCATTCCATTCACAAACCACACTCATAAATCCCTCTTTTATAAAGCTGATTTGGGCAGTGAGGAAGCACCTCAAGGGATTCAGTGGTGTGACCAAGGTGGCCCAGTTCATTTGGCGTGTCATGACTAACCCAGTGGATGCCTATGGCACCCTTGTCAGAACACTTACTGGGGCTGCCACCTTCTCGGACGACCCAGTTTCAACAACGATAATATGTTCCAACTGCACAATCCAAATCCACTCTTGCGGTGGGCTGCTTGTGAGGTATTCAAGAGACCCTGCCCCCGTGGCATCAGACAATGTCGACCGTGGTGATCAAGGTGTTGACGTGTTTACTGACCCCAACCTCATCTCTGGGTTCAGTTGGAGACAGATTGCCCACTTATTTGTTGAGGTGCTTTCCCACTTGTGCGCAAACCACCTTGTTAACCTTGCGACCATGGCTGCGCTGGGTGCTGTCGCTACAAAGGCTTTCCAGGGTGTGAAGGGCAAGACAAAACGTGGTCGTGGTGCAAGGGTAAACTTGGGGAATGACGAGTATGATGAGTGGCAAGCTGCGCGTAGAGAGTTCGTTAACGCACATGACATGACTGCAGAAGAGTATCTTGCCATGAAAAACAAAGCTGCCATGGGAAGTGACGACCAAGACTCCGTCATGTTTAGGAGTTGGTGGACCCGGAGGCAGTTGAGACCTGACGAGGACCAAGTCACTATTGTCGGCAGAGGTGGAGTGAGGAACGAAGTCATTCGCACTAGGGCTAGGCAGGCCCCAAAAGGGCCAAAAACACTGGACGACGGTGGTTTTTATGACAATGACTATGAAGGCCTGCCAGGATTTATGAGGCACAACGGCAGTGGTTGGATGATTCACATAGGCAATGGGTTGTACATATCCAATACCCACACTGCCCGGTCAAGCTGCTCAGAGATAGTCACATGTTCACCCACCACTGACCTGTGCCTTGTTAAGGGGGAGGCAATCCGCAGTGTTGCCCAAATTGCTGAAGGAACCCCAGTTAGTGATTGGAAGAAGTCCCCCATCACAACTTATGGCATCAAGAAAACCTTGTCAGACTCCACCAAAATTGACGTACTAGCGTATGACGGTTGTACACAGACGACCCATGGGGACTGTGGGCTCCCGTTGTATGATTCTAGCGGGAAGATTGTTGCCATACACACCGGCAAACTACTAGGGTTCTCAAAGATGTGCACATTGATTGACCTCACCGTGACAAAGGGGGTGTATGAGACATCAAACTTCTTCTGTGGTGAACCGATCGACTACAGAGGCATTACTGCGCACAGGCTTGTTGGTGCGGAACCCAGGCCCCCTGTTAGTGGAACTAGGTATGCCAGGGTCCCAGGTGTGCCAGATGAGTACAAGACTGGTTACAGGCCAGCCAATCTTGGGCGCGGTGATCCAGACAGTGACAAGTCACTCATGAACATTGCAGTGAAGAACCTGCAGGTTTACCAGCAAGAACCCAAGCTTGACAAGGTGGACGAGTTCATTGAGCGGGCAGCTGCCGACGTTTTGGGCTACTTGCGCTTCCTAACCAAGGGAGAGCGCCAGTCAAACCTGAACTTCAAGGCGGCTTTTAACACCCTAGACCTGTCCACCTCTTGTGGTCCCTTTGTTCCGGGGAAGAAGATTGACCATGTGAAAGACGGGGTGATGGACCAAGTCCTGGCAAAACATCTTTACAAGTGCTGGAGTGTTGCCAACTCTGGCAAGGCTCTCCACCACATATACGCGTGTGGGTTAAAAGATGAGCTCAGACCCCTTGATAAGGTGAAGGAGGGAAAGAAGAGGCTGTTGTGGGGCTGCGACGTTGGCGTTGCTGTGTGTGCCGCAGCCGTTTTCCACAACATATGCTACAAGCTGAAGATGGTCGCACGGTTTGGCCCTATCGCAGTTGGCGTTGACATGACATCCCGTGATGTTGACGTTATCATTAACAACCTCACCGCCAAAGCCAGTGACTTCCTGTGCTTGGACTACTCAAAATGGGACTCCACCATGTCACCATGTGTTGTCAGGCTGGCCATTGACATCTTGGCCGACTGCTGTGAACAGACGGAACTCACCAAGAGTGTGGTGCTCACACTAAAGTCTCACCCCATGACCATTCTCGATGCCATGATTGTGCAAACTAAGCGTGGCCTCCCAAGTGGTATGCCCTTCACCTCGGTCATCAACTCTATCTGCCATTGGCTGCTTTGGTCTGCAGCTGTTTACAAGTCCTGCGCTGAGATCGGCCTACACTGCTCCAACTTGTACGAGGACGCCCCATTCTATACATATGGTGATGACGGTGTGTACGCCATGACCCCAATGATGGTGAGCCTCCTGCCCGCCATAATAGACAACTTGAGGGACTATGGGTTGTCACCCACTGCCGCGGACAAGACGGAGTACATAGATGTTTGCCCGCTCAACAAAATTTCATTTTTGAAGCGCACCTTTGAGCTCACAGACATCGGGTGGGTATCAAA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| 35,518
|
NC_032479.1
|
Rasavirus sp.
|
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2016-12-29
|
16715_52_2
|
Rasavirus sp.
| null | null |
unknown
| 8,497
|
RefSeq
| null |
Viet Nam
|
Viet Nam
|
Rattus
|
feces
|
2014-06-10
| null |
PRJNA485481
|
Rasavirus sp. isolate 16715_52_2, complete genome
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| 78,888
|
KX673224.1
|
Rasavirus sp.
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Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
|
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
|
United Kingdom
|
2016-12-27
|
16715_3
|
Rasavirus sp.
| null | null |
unknown
| 9,580
|
GenBank
| null |
Viet Nam
|
Viet Nam
|
Rattus
|
feces
|
2014-11-12
| null | null |
Rasavirus sp. isolate 16715_3, complete genome
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| 78,889
|
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|
Rasavirus sp.
|
Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
|
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
|
United Kingdom
|
2016-12-27
|
16715_36
|
Rasavirus sp.
| null | null |
unknown
| 9,911
|
GenBank
| null |
Viet Nam
|
Viet Nam
|
Rattus
|
feces
|
2014-11-14
| null | null |
Rasavirus sp. isolate 16715_36, complete genome
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|
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|
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|
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|
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
|
United Kingdom
|
2016-12-27
|
16715_4
|
Rasavirus sp.
| null | null |
unknown
| 9,619
|
GenBank
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Viet Nam
|
Viet Nam
|
Rattus
|
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2014-11-12
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| 78,891
|
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Oude Munnink,B.B., Phan,M.V.T., Kellam,P., van der Hoek,L., Cotten,M.
|
Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Sanger Institute
|
United Kingdom
|
2016-12-27
|
16715_43
|
Rasavirus sp.
| null | null |
unknown
| 9,562
|
GenBank
| null |
Viet Nam
|
Viet Nam
|
Rattus
|
feces
|
2014-11-14
| null | null |
Rasavirus sp. isolate 16715_43, complete genome
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Viet Nam
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| 78,901
|
NC_003739.1
|
Raspberry bushy dwarf virus
|
Ziegler,A., Natsuaki,T., Mayo,M.A., Jolly,C.A., Murant,A.F.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-05-08
| null |
Idaeovirus rubi
|
Idaeovirus
|
Mayoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,449
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Raspberry bushy dwarf virus RNA 1, complete sequence
|
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ATATTGTGAAACAGAAGTTGGCTATTCTTGTACAGGTGCGCTATAATAAAGCTGCACCTAGTTTATATGATGCCCTTTGCACTGTGCATTGGGCATTATCTTCTAATACCAATTTCTCGAAGTTTTACACTGTTACTAACACTTCCAATGAAGTGCGAAGGAACAGAAGAGGTGTTAAGATTACTTAATACCATTTTAATTCTGCAGCATTTTCTTTTGACCGGCTTAGTAATAAGTCTTTGCCTGTCTCTTTTCAATGCTGTTATTGGTTTTAAAACCAAAAAGTATCTAAATCTTGAAGATTTAAAGATAAATCTTGAAAAGGAACTTTTCAAGCACAAAGTCTTGAATGAGTCTCTCTCAAGGAGACAAGGTTTCTTAAGCCTAGCTCACTAGGCTTAACTCCCAATTTGGGAGTTGTCCTTACGGACGTTTGCTGAGCAAACCCC
| 9,026
|
OR178941.1
|
Raspberry bushy dwarf virus
|
MacFarlane,S.A.
|
The James Hutton Institute, Cell and Molecular Sciences
| null |
2023-09-04
|
RB
|
Idaeovirus rubi
|
Idaeovirus
|
Mayoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,449
|
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
| null | null |
1984
| null | null |
Raspberry bushy dwarf virus isolate RB clone p2039 segment RNA1, complete sequence
|
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| 13,117
|
OR178943.1
|
Raspberry bushy dwarf virus
|
MacFarlane,S.A.
|
The James Hutton Institute, Cell and Molecular Sciences
| null |
2023-09-04
|
D200
|
Idaeovirus rubi
|
Idaeovirus
|
Mayoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,448
|
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
| null | null |
1984
| null | null |
Raspberry bushy dwarf virus isolate D200 clone p2038 segment RNA1, complete sequence
|
ATATTTGGTGTCTGGCTGTTTAAGCGATAAGAATCTGCTGGTCCGACATCTATCTCTTGGGTATCCTTATTGACTACGGGGATTGTTTACTTGAGATTTCTTATGGAGTGCTTAGATTTCTCCAAGCTGTGGTTTTCTACGGCTGCTGGTCTCCAGCAACGGTGCTATTATGACTGTGTTGCGTGGGAAAGCTTAGGTGATGACGATCTGTTGATCTTCTTTTCTGGCTTGAACCGCCTCATAAGTTCCGTTGCTGTTTCCTGTACCGGCGACGAAGATTTAGACTTCGTCGTGGACTCATGTAATGAGTTCGTTACGGGGAAAGACTTGAAGTCTTTCTTCGCTGCTGACTTCCCTGTTAGAGAGGTTAGTTCTGTGGGATGTATATCTCACTTTATTCCAGGTTCAGTTTCTGGACTGAATGTCTCGGACTTACTGGATAACCAGTTATATGGTTGTTCCGTGTTTTCCTCTGATTTCGAATCGAAACTGAGGGACATGCGGGATGCGGCCCTTTCTGATGCCGCGTCAGGTGTTTCGCAACTGGTTAGTTGCCATTTTGAGAAAGACGTAAGACACCTCTTGGCGGAGAATGCTAACTCCGTCAAGATCCCTGTACCTCAGAAACTCAGTGATGACGATATGAGGATTTTAAGGGATCACTTTCCTCGTTATGAGTTGAAGTTCACTCAGAACGTGGACGGCCCGCACAATATGGCCGCCGCTCATAGGTTGTTGGAGACTCATGATCTGTTGTCCAACTTCCCCGCGGATGCACCTATCTTAGATATAGGAGGCAATTGGTTTTCTCATTTTCGTTATGGGAGGTCCAATGTTCATAGTTGTTGCCCTATGCTAGATTTAAGGGACAATGAACGACATACTCATCGTTTAACGATGACTGAGAGTCTAATGTCCAGCTTGCGCCATCGCTATGCTGGTACAATTGATCTCGATCCCGACGCTCACCTTTCGCGGAAGGTGTCTGACTCTATGAAAGAGTTTTATAAGCGCTGGGCTGTACACCCTAAAGATCTAATTAGGTTGTACGCCGGTATACGTGACGGCAACTCACCGCTCTATTGTCACCATAAATTTGGTGTGTCATGGAACGATGTTTTATGGGAATCGGAGAGGAATAACTGCCTCACTATCCCAGAACCTGAGTGCCCCTTTAAAGCTAAGTATGCTATAATGGTGCACTCTGGTTATGACCTACCCCTGAAGGAGCTTATTGGGGGTATGGTACAACATGGCGTGGTCGAGTTGCATGGGACTATGATTGCTGATCCTGCTATGTTAGTCGCTACAAGTGGCTATATCCCTGCGCTGCGTTGCAACTGGGAGAAATCCAAAGGTCAAATTTGGTTTTCTTTCCGAGATGACAGCACAATGGGTTACAGGCATGACTGGGAGGTGTACTCTAAGTATTTGACTTCCACGGTCGTCTCTTGCGGTAAACACTTTTACGTGATGGAAAGAGACAAGTACAGGCACGGCGTGTTATTTTATAGCATAATTAAGTGTTCTGGATCCCTTCGTAAAGGGGATCATACTTTTTTCCACAATGCCTGGTTTCACGAGATGTACGACAAGTACATTATGAAAGTCCCCCTGGTAAAGGTAAAGGACTTAACCGGTGATGAAGGTTCCGTCGAGTGTTCCTGGCGTGAGGTTGTGATGTCTAGAAAACTTGTGGATAGGGTCATTGAGGTTTGCCTTAGGGGTGTAAAACCCATTAACTTTGGCAACTGTGATGACGCTGTTCACATGGATAATCTCCGGGTCATCCAGAACCATCTGCTGAGTCATTCACAAACACTGGTTTTAAATGGTAGTACCATTATTAGGGAGGAGGCGATACCTTTTAAAGATTTCTCTCCTGTATCCGTAACCATATATTTTGAAATATTGTTGACGAGATACAAGGAATCCCTATCTTTGGCTTGGTTTCACGCTGGTCTGGGTCCCGACTTTAAGTTGGGTTCTTGGGTATCCTCTTTAAAGAGGGTGTTCTACCGGATTCTAGGTTTCCCGGCCAATCTTCTAAAGTACGTTTTAAATGCACTTTTTAGATGTCACGACAAGGTTTCAGACATGGAGTTTGTGAAACCAGCTGTCGAGAAATTGACAGTATTAGAGAATACCTACATAGGGAAATCTCTAATGGGCGATTGTCCTACTCTAAAAGAGTATGATGATTCAGCCTTCTTCAACATATTGGAGAACGTGGGCAATGAGTTGTTTAACAACTCTAGTACCGATTCCGGAAAACCGGAAATACCCGAAATGACCATGACTGGTAATCCCAATGTGGTGATAGCTGAAGCTATCAGCTACTGTCGAGCTGAGGTCGATAGAATTGGAAAAAAGTGTGAGAGGATACTCCACGCTTACCAGGCCACTGGGAATTGCGGCGGGTACCTAAACGATACTGACAATGTAGGCGTGTTCGACAAGATGACGTCCTGGGTACAAAAACCCAAGGAGTTCGATCACGAATTCGGATGGGATGGCTCCTCCTTCATTAAATTGTCTTGGTTTGGGAAAATACCGGACTTTGTAGGAAGGTATTTAGTAGTGACTGATGGGACACGTGTAATGACAAATCTGAAATTCTCCCGTCAGTATGCTACTATTCCAGCAACCGTAACACCCACCATTAAATTGGTTGATGGTGTTACTGGATGTGGGAAAACGACTGAAATCGTTAGGCGTTACCGTCCTGGGATTTTAATCCTAAGTGTATGTAAGGCTAACGTGGACGAGATTAGGAAGAAATTGGTGGCCGTGGACTCGAAGTTCATTAGGACCGTTGATTCTTATCTTCTCAGCCCAAGTGTGACCGGAGGTTGTGACGAACTCTTCATAGATGAGTACGGTCTCTCGCATCCGGGCATTCTGTTATTGGCTATCCACGTTAGCGGAATCCGAAAGGTCACTCTCTTTGGTGACTCTGAACAGATTCCCTTTTGCAATCGCCTTGCCGATTTTCCTCTAAAGTACAACTCCGTTGAAGACGTGGGATTGAACTTTGACAGGGAAATTAGGTCTACTACTTATAGATGTCCTCAGGACATCACTTTGTCTTTACAAAAAATGTATAAGACAAAACCGATAAAAACGGTATCGACTGTTGAGAGTTCGATAACCATCAAACCGATAAAGAGCGAATTTGAAATTCCTCTACCTAACGCGTTTGATGGTCCTGTGTTGTACATATGCATGACTAAGCATGATGAAAGCCTTTTAAAGTTGCGTTGGGCCAAAGAGAACATTTCTAGCGATGTTCGAACGGTGCACGCGGCTCAAGGTTTGAGTTATAAGAACGTCGTGTATTTCAGGTTAACTCGTACCGACAACGATTTGTACACCAAGAAAAAGTTACCATATCATTTGGTGGCAATTTCTAGGCATACTGATAAAATCGTTTACTGTACCACAAAACCTGAAGACTCATCTGACTTTTCTCTATCTGCTCTAAAGAATACCATCAAAACCTCTCGGGATTTAACCCAGGAAGCTAGTGGTTCAGAGAGCTCTTATGCTGTTGTCTTCGAATCGAATTCGGAGGTAACCACAACCAAACCCGAGGTGTGTGAAAATGTTAGAAAAGCAGCTGAGATGAATTTTCCCGTTTCCTCTGACGCTTTATATCAGAAGGAAGTGCCCATTTATGGTGCAATACCCGACCCGAAGGGAAAAGCAAGTTACAATCCGGGTAGTGTTATCAGGGCCATAGAAGAATTGACCCCAGGTAACACCAGCATAGATACTGATGCTTTGGACGAACTGGTTGAAGTTGGTCCTATGAGTTTACAAGTTGGTAGTATAAGATGGGATGTCTCTAAGATATCACCTCGTTTGTTTACCAACAATAAATTCGCGATCCCACACCTACCGACTGGAGCCTTGTTGAGGCGTAACACAAGCAGTCGTCAGGTTGGACTGGCTATAGAAAAGCGAAACGCTAACGTCATGAATAGCCAAAAATACTTTGATCTGGAAAATTTGGCTAACAAGGCGGTGGAGAGATTTTTCGATTTCTTTATAGATATGGAGAAATTCTCGAAACTGCCAACTGGAGTCTTAGGCTCGAGTGCTGAACAGATACAAACATACCAGAATAAAACTGGTAACAAGGTGACGGACCCAGTCTGTGTTGCCTTATCCCCAATTCAAAAATATAAACACATGATTAAGAGGGATGTCAAATTTAATTTGACTGATGGTGCTCAAAGTGAATATACTAAAGCTGCCACCATTACTTATCATCAACCGGAGATAACTCAGGTTGCTACTGCCGTTTTTGGTCAGTTTAAAACTAGACTGTTGGCTTGTAGAAATAAGTTCTTAAATATACCTCTTGAACATGATAATGATTTAAGCGGATATCTAACCAAATACCATTTGGGGAGTGAAAACAATACTTTCACTGAAATTGACTTTTCTAAATTTGACAAAAGTCAAGGGGAGATCCATCAACTCATTCAGGATTTAATCCTGATAAGGTTTGGTTGTGACCCCGAATTTGTAGCCTTATGGTCCACCGCTCATAGAAGTTCTTCTATTTTCGATCAAAATGTTGGAATCGGCTTTAAGACTGATTTCCAAAGAAGAACGGGCGATGCTTTTACTTTTCTGGGAAACTCTTTGGTAACTGCCGCCATGCTGGCGTTTGTCATCAGTGATTCGGACAGGGAGAAGATTAGGTACATGTTGGTAGGTGGAGACGATTCTTTGATCTGCTCCTACGGTCCAATACAAGTACCTTTAGAACCATTGGGTGACATATTTAATATGTCGTGCAAGTTGGTACAACCAGCTTGTCCTTATTTCGCGTCTCGCTATTTGATTAGGAGAGGCGACGAAATTTTGTGTGTTCCCGACCCCTACAAACTATTAGTAAAGTTGGGGAGGAAAGACATTCCGGACAATCAAGCATCATTATGCGAGATACGTACCGGATTGGCCGATAGTGCCAAATATATCTTTGATGA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| 13,118
|
MW582777.1
|
Raspberry bushy dwarf virus
|
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
|
Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
Germany
|
2021-06-01
|
DSMZ PV-0053
|
Idaeovirus rubi
|
Idaeovirus
|
Mayoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,447
|
GenBank
| null | null | null |
Chenopodium quinoa
| null | null | null | null |
Raspberry bushy dwarf virus isolate DSMZ PV-0053 segment RNA 1, complete sequence
|
ATATTTGGTGTCTGGTTGTTTAAGCGATAAGAATCTGCTGACCTGACATCTATCTCTTGGGTATCCTTATTGACTACGGGGATTGTTTACTTGAGATTAATTATGGAGTGCTTAGATTTCTCCAAGCTGTGGTTTTCTACGGCTGCTGGTCTCCAGCAACGGTGCTATTACGACTGTGTCGCGTGGGAAAGCTTATGTGATGACGATCTGTTGACCTTCATTTCTGGCTTGAATCGCCTCATAGGTTCCGTTGCTGTTTCTTGTACCGGCGACGAAGATCTAGACTTCGTCGTGGACTCATGTAATGAGTTCGTTACGGGGAAAGACTTGAAGTCTTTCTTCGCTGCTGACTTCCCCATTAGAGAGGTCAGTTCTGTGGGATGTATATCTCACTTTATTCCAGGTTCGGTTTCTGGGCTGAATGTCTCAGACTTACTGGATAACCAGTTATATGGTTGTTCCGTGTTTTCCTCTGATTTCGAATCGAAACTGAGGGACATGCGGGATGCGGCCCTTTCTGATACCGCATCGGGTGTTTCGCAACTGGTTAGTTGCCATTTTGAGAAAGATGTCAGACACCTTTTGGCGGAGAATGCTAACTCTGTCAAGATCCCTGTGCCTCAGAAACTCAGTGATGATGATATGAGGATTTTAAGGGATCACTTTCCTCGTTATGAGTTGAAGTTCACTCAGAACGTGGACGGCCCACACAATATGGCCGCCGCTCATAGGTTGTTGGAGACTCATGATCTGTTGTCCAACTTCCCCGCGGATGCTCCTATCTTAGATATAGGGGGCAATTGGTTCTCTCATTTTCGTTATGGGAGGTCCAATGTTCATAGTTGTTGCCCTATGCTAGATTTAAGGGACAATGAACGACATACTCATCGTTTAACGATGACTGAGAGTCTAATGTCCAGCTTGCGCCATCGCTATGCTGGTACAATTGATCTCGATCCCGACGCTCATCTTTCGAGGAAGGTGTCTGACTCTATGAAAGAGTTTTATAAGCGTTGGGCTGTGCACCCTAAAGATTTAATTAGGTTGTACGCCGGTATACGTGACGGCAACTCATCGCTCTATTGTCACCATAAATTTGGTGTGTCATGGAACGATGTTTTATGGGAATCGGAGAGGAATAACTGCCTCACTATCCCAGAACCCGAGTGTGCTTTTAAAGCCAAGTATGCTATAATGGTGCACTCCGGTTATGACCTACCTCTGAAGGAACTTATTGGAGGCATGGTACAACATGGTGTGGTCGAGTTGCATGGGACTATGATTGCTGATCCTGCCATGTTAGTCGCTACAAGCGGTTATATCCCTGCGCTGCGTTGCAACTGGGAGAAATCCAAAGGTCAAATTTGGTTTTCTTTCCGGGATGACAGTACAATGGGTTACAGGCATGACTGGGAGGTGTACTCTAAGTATTTGACTTCCACAGTCGTCTCTTGTGGTAAACACTTTTACGTGATGGAGAGAGACAAATACAGGCACGGTGTGTTATTTTATAGCATAATTAAGTGCTCTGGATCCCTTCGTAAAGGGGATCACACTTTTTTCCATAATGCCTGGTTTCACGAGATGTACGATAAGTACATTATGAAAGTCCCCTTGGTAAAGGTAAAGGACTTAACTGGTGATGAAGGCTCCGTCGAGTGTTCTTGGCGTGAAGTTGTGATGTCTAGAAAACTTGTGGATAGAGTCATTGAGGTTTGCCTTAGGGGTGTAAAACCCATTAACTTTGGAAGTTGCGATGACGCTGTTCACATGGACAATCTCCGGATCATCCAGAACCATCTGCTGAGCCATTCACAAACACTGGTTTTAAATGGTAGTACCATTATTAGGGAGGAGGCGATACCTTTTAAAGATTTCTCTCCTGTGTCCGTAACCATATATTTTGAAATATTGTTAACGAGATACAAAGAGTCCCTATCCTTAGCCTGGTTTCACGCTGGTCTGGGTCCCGACTTTAAGTTGGGTTCTTGGGTATCCTCTTTAAAGAGGGTATTCTACCGGATTCTAGGTTTCCCGGCTAATCTTCTAAAGTACGTTTTAAACGCACTTTTTAGATGTCATGACAAGGTTTCAGACATGGAGTTTGTGAAACCCGCTGTCGAGAAATTGACAGTATTAGAGAATACCTACATAGGGAAATCTCTAATGGGCGACTGTCCTACTCTAAAAGAGTATGATGATTCGGCCTTCTTCAATATACTGGAGAATGTGGGCAATGAGTTGTTTAACAACTCTAGTACCGATTCCGGAAAACCGGAAACACCCGAAATGACCATGACTGGTAATCCCAATGTGGTGATAGCCGAGGCTATCAGCTACTGTCGAGCTGAGGTCGATAGAATTGGGAAGAAGTGTGAGAGAATACTCCACGCTTATCAGGCCACTGGGAATTGTGGCGGGTACCTAAACGATACTGACAATGTAGGCGTGTTCGATAAGATGACGTCCTGGGTACAAAAACCCAAGGAGTTCGATCACGAATTCGGATGGGATGGCTCCTCCTTCATTAAATTGTCTTGGTTTGGGAAAATACCGGACTTCGTAGGAAGGTATTTAGTAGTAACTGATGGGACGCGTGTAATGACAAATCTGAAATTCTCTCGTCAGTATGCTACTATTCCCGCAACCGTAACACCCACCATTAAATTGGTTGATGGTGTCACTGGATGTGGGAAAACGACTGAAATCGTTAGGCGTTATCGTCCTGGGATTTTAATCCTAAGTGTATGTAAGGCTAACGTGGATGAGATTAGGAAAAAATTGGCGGCCGTGGACTCGAAGTTCATTAGGACCGTTGATTCTTATCTTCTCAGCCCTAGTGTGACCGGAAATTGTGACGAACTCTTCATAGATGAGTATGGTCTCTCGCATCCGGGCATTCTGTTATTGGCTATCCACGTTAGCGGAATCCGAAAGGTCACTCTCTTTGGTGACTCTGAACAGATTCCTTTCTGCAATCGCCTTGCCGATTTTCCTCTAAAGTACAACTCCGTTGAAGACGTGGGATTGAACTTTGATAGGGAAATTAGGTCTACTACTTACAGATGCCCTCAGGACATCACTTTGTCTTTACAAAAAATGTATAAGACAAAACCGATAAAAACGGTATCGACTGTTGAAAGTTCGATAACCATCAAACCGATAAAGAGCGAATTTGAAATTCCCCTACCTAACGCGTTTGATGGTCCTGTGTTGTACATATGCATGACTAAGCATGATGAAAGCCTTTTAAAGTTGCGTTGGGCCAAAGAGAACATTTCTAGTGATGTTCGAACGGTGCATGCAGCTCAAGGTTTGAGTTATAAGAACGTCGTGTATTTCAGGTTAACTCGTACTGACAACGATTTGTATACCAAGAAAAAGCTACCATATCATTTGGTGGCAATTTCTAGGCATACAGATAAAATCGTTTACTGTACTACAAAACCCGAAGACTCATCTGACTTTTCTCTATCTGCTCTAAAAAATACCATCAAAACCTCTCGAGATTTAACCCAGGAGGCTAGTGGTTCAGAGAGCTCTTATGCCGTTGTCTTCGAATCAAATTCGGAGGTAACCACAACCAAACCTGAGGTATGTGAAAACGTTAGAAAAGCAGCTGAGATGAATTTTCCCGTTTCCTCTGACGCTCTATATCAGAAGGAAGTGCCCATTTATGGTGCAATACCCGACCCGAAGGGAAAAGCAAGTTACAATCCGGGTAGTGTTATCAGGGCCATAGAAGAATTGACCCCAGGTAACACCAGCATAGATACTGATGCTTTGGACGAACTGGTTGAAGTTGGTCCTATGAGTTTACAAGTTGGTAGTATAAGATGGGATGTTTCTAAGATATCACCCCGTTTATTTACCAACAATAAATTCGCAATTCCACACTTACCGACTGGAGCCTTGTTGAGGCGTAACACAAGCAGTCGTCAGGTTGGATTGGCTATAGAAAAGCGAAATGCTAATGTCATGAATAGCCAAAAATACTTTGATCTGGAAAATTTAGCCAACAAGGCGGTGGAGAGATTTTTCGATTTCTTTATAGATACGGAGAAATTCTCGAAACTGCCAACTGGAGTCTTAGGCTCGAGTGCTGAACAGATACAAACGTACCAGAATAAAACTGGTAACAAGGTGACGGACCCAGTCTGTGTTGCCTTATCCCCAATTCAAAAGTATAAACATATGATTAAGAGGGATGTCAAATTTAATTTGACTGATGGTGCTCAAAGTGAATATACTAAAGCTGCCACCATTACTTATCATCAACCAGAGATAACTCAGGTTGCTACTGCCATTTTTGGTCAGTTTAAAACTAGACTGTTGGCTTGTAGGAATAAGTTCTTAAATATACCTCTTGAACATGATAATGATTTAAGTGGATATTTAACCAAATACCATTTGGGGAGTGAAAACAATACTTTCACTGAAATTGATTTTTCTAAATTTGATAAAAGTCAAGGGGAAATCCATCAACTCATTCAGGATTTAATCCTGATAAAGTTTGGTTGTGATCCCGAATTTGTAGCCTTATGGTCCACCGCTCATAGAAGTTCTTCCATTTTCGATCAAAATGTCGGAATCGGCTTTAAGACTGATTTCCAAAGAAGAACGGGCGATGCTTTTACTTTTCTGGGAAACTCTTTGGTAACTGCCGCCATGCTGGCGTTTGTCATCAGTGACTCAGACAGGGAGAAGATTAGGTACATGTTGGTGGGTGGGGACGATTCTTTGATCTGCTCCTACGGTCCAATACAAGTACCCTTAGAACCATTGGGTGACATATTTAATATGTCGTGCAAGTTGGTGCAACCAGCTTGCCCTTATTTCGCGTCTCGCTATTTGATTAGGAGAGGTGACGAAATTTTATGTGTTCCTGACCCCTACAAACTGTTGGTAAAGTTGGGGAGGAAAGACATTCCGGACAATCAAGCATCATTATGCGAGATACGCACCGGATTGGCAGATAGTGCCAAATATATCTTTGATGA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| 41,703
|
MH802009.1
|
Raspberry bushy dwarf virus
|
Rott,M.E., Phelan,J., Boyes,I., Thornton,S., Belton,M., Rast,H.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2019-04-17
|
12G412
|
Idaeovirus rubi
|
Idaeovirus
|
Mayoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,432
|
GenBank
| null | null | null |
Vitis vinifera
| null |
2012
| null | null |
Raspberry bushy dwarf virus isolate 12G412 segment 1, complete sequence
|
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| 63,196
|
S51557.1
|
Raspberry bushy dwarf virus
|
Ziegler,A., Natsuaki,T., Mayo,M.A., Jolly,C.A., Murant,A.F.
| null | null |
1993-05-08
| null |
Idaeovirus rubi
|
Idaeovirus
|
Mayoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,449
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
RNA-1 segment: non-structural polyprotein [raspberry bushy dwarf virus RBDV, R15, Genomic RNA Complete, 5449 nt]
|
ATATTTGGTGTCTGGCTGTTTAAGCGATAAGAATCTGCTGGTCTGACATCTATCTCTTGGGTATCCTTATTGACTACGGGGATTGTTTACTTGAGATATTCTTATGGAGTGCTTAGATTTCTCCAAGCTGTGGTTTTCTACGGCCGCTGGTCTCCAGCAACGGTGCTATTATGACTGTGTTGCGTGGGAATGCCTAGGTGATGATGATCTACAGATCTTCATTTCTGGCCTGAACCGCCTCATAGAGTCCGTTGCTGTTTCTTGTACCGGCGACGAAGATTTGGACTTCGTCGTGGACTCATGTAATGAGTTCGTTACGGGGAGAGACTTGAAGTCTTTCTTCGCTGCTGACCTCCCTGTTAGAGAGGTCAGTTCTGTGGGATGTATATCTCACTTTATTCCAGGTTCGGTTTCTGGACTGAATGTCTCGGACTTGCTGGATAACCAGTTGTATGGTTGTTCTGTATTTTCCTCCGATTTCGAATCGAAGCTGAGGGATATACGGGATGCGGCCCTTTCTGATGCCGCGTCGGGTGTTTCGCAACTAGTTAGTTGCCATTTTGAAAAAGATGTTAGACACCTCTTGGCGGAGAATGCTAATTCCGTCAAGATCCCTGTACCTCAGAAACTCAGTGATGACGATATGAGGATTTTAAGGGATCACTTTCCTCGTTATGAGTTGAAGTTCACTCAGAACGTGGACGGCCCGCACAATATGGCCGCCGCTCATAGGTTGTTGGAGACTCATGATTTGTTGTCCAACTTCCCCGCGGATGCACCTATCTTAGATATAGGTGGCAATTGGTTTTCTCATTTCCGTTATGGGAGGTCCAATGTTCATAGTTGTTGCCCTATGCTAGATTTAAGGGACAATGAACGACATACTCATCGTTTAACGATGACTGAGAGTCTAATGTCCAGCTTGCGCCATCGCTATGCTGGTACAATTGATCTCGATCCCGACGCTCACCTTTCAAGGAAGGTGTCTGACTCTATGAAAGAGTTTTATAAGCGCTGGGCTGTACACCCTAAAGATTTAATTAGGTTGTACGCCGGCATACGTGACGGCAACTCATCGCTCTATTGTCACCATAAATTTGGTGTGTCATGGAACGATGTTTTATGGGAGTCGGAGAGGAATAACTGCCTCACTGTCCCGGAGCCTGAGTGCCCTTTTAAAGCTAAGTATGCTATAATGGTGCATTCCGGTTATGACCTACCTCTAAAGGAACTTATTGGAGGCATGGTACAACATGGCGTGGTCGAGTTGCATGGGACTATGATTGCTGATCCTGCTATGTTAGTCGCTACAAGTGGCTATATCCCTGCACTGCGTTGTAACTGGGAAAAATCCAAAGGTCAAATTTGGTTTTCTTTCCGAGATGACAGCACGATGGGTTACAGGCATGACTGGGAGGTGTACTCTAAGTATTTGACTTCCACAGTCGTCTCTTGCGGTAAGCACTTTTACGTGATGGAAAGAGACAAGTACAGACACGGTGTGTTATTTTATAGCATAATTAAGTGTTCTGGATCCCTTCGTAAAGGGGATCACACTTTTTTTCATAATGCCTGGTTTCACGAAATGTACGATAAGTACATTATGAAAGTCCCCTTGGTAAAGGTAAAGGACTTAACCGGTGATGAAGGTTCCGTCGAGTGTTCTTGGCGTGAAGTTGTGATGTCTAGGAAACTTGTGGATAGGGTCATTGAGGTTTGCCTTAGGGGTGTAAAACCCATTAACTTTGGAAACTGCGACGACGCTGTTCACATGGACAATCTCCGGATCATCCAGAACCATCTGCTGAGTCATTCGCAAACACTGGTTTTAAATGGTAGTACCATTATTAGGGAGGAGGCGATACCTTTTAAGGATTTCTCTCCTGTATCCGTGACCATATATTTTGAAATATTGTTGACGAGATACAAGGAATCCCTATCTTTGGCCTGGTTTCATGCTGGTCTGGGTCCCGACTTTAAGTTGGGCTCTTGGGTATCCTCTTTAAAGAGGGTGTTCTACCGGATTCTAGGTTTCCCGGCTAATCTTCTAAAGTACGTTTTAAACGCACTTTTTAGATGCCGTGACAAGGTTTCAGACATGGAGTTTGTGAAACCCGCTGTCGAAAAATTGACAGTGTTAGAGAATACCTATATAGGGAAATCTCTAATGGGCGATTGTCCTACTCTAAAAGAGTATGATGATTCGGCCTTCTTCAATATATTGGAGAATGTGGGCAATGAGTTGTTTAACAACTCTAGTACCGATTCCGGAAAACCGGAAACACCCGAAGTGACCATGACCGGTAATCCCAATGCAGTAATAGCTGAGGCTATCAGCTACTGTCGAGCTGAGGTCGATAGAATTGGGAAGAAGTGTGAGAGAATTCTCCATGCTTACCAGGCCACTGGGAATTGCGGCGGGTACCTAAACGATACTGACAATGTAGGTGTGTTCGATAAGATGACGTCCTGGGTACAAAAACCCAAGGAGTTCGATCACGAATTTGGATGGGATGGCTCCTCCTTTATTAAATTGTCTTGGTTTGGGAAAATACCGGACTTTGTAGGAAGGTATTTAGTAGTGACTGACGGGACACGTGTAACGACAAATTTGAAATTTTCTCGTCAGTATGCTACTATTCCAGCAACCGTAACACCCACCATTAAATTGGTTGATGGTGTTACTGGATGCGGGAAAACGACTGAGATCGTTAGGCGTTATCGTCCTGGGATTTTAATCCTAAGTGTATGTAAGGCTAACGTGGATGAGATTAGAAGAAAATTAGCGGCCGTGGACTCGAAGTTCATTAGAACCGTTGATTCTTATCTTCTCAGCCCGAGTGTGACCGGAAGCTGTGATGAACTCTTCATAGATGAGTATGGTCTCTCGCATCCGGGCATTCTGTTACTGGCTATCCATATTAGCGGAATCCGAAAGGTCACTCTCTTTGGTGACTCTGAACAGATTCCTTTTTGCAATCGCCTTGCTGATTTTCCTCTAAAATACAACTCCGTTGAAGACGTGGGATTGAACTTTGACAGGGAAATCAGGTCCACTACTTATAGATGCCCTCAGGACATCACTTTGTCTTTACAGAAAATGTATAAGACAAAACCGATAAAAACGGTATCGACTGTTGAAAGTTCGATAACCATCAAACCAATAAAGAGCGAATTTGAAATTCCTCTACCCAATGCGTTTGATGGTCCTGTGTTGTACATATGCATGACTAAGCATGATGAAAGCCTTTTAAAGTTGCGTTGGGCCAAAGAGAACATTTCTAGCGAAGTTCGAACGGTGCACGCAGCTCAAGGTTTGAGTTATAAGAACGTCGTGTATTTCAGGTTAACTCGTACTGATAACGATTTGTATACCAAGAGAAAACTACCATATCATTTGGTGGCAATTTCTAGGCATACTGATAAAATCGTTTACTGTACTACGAAACCTGAAGACTCATCTGATTTTTCTCTATCTGCTCTAAAAAATACCATCAAAACCTCTCGGGATTTAACCCAGGAGGCTAGTGGTTCAGAGAGCTCTTATGCTGTTGTCTTCGAATCAAATTCGGAGGTAACCGCAACCAAACCTGAGGTTTGTGAAAATGTTAGAAAAGCAGCTGAGATGAATTTTCCCGTTTCCTCTGACGCTTTATATCAGAAGGAAGTGCCCATTTATGGTGCAATACCCGACCCGAAGGGAAAAGCAAGTTACAATCCGGGTAGTGTTATCAGGGCCATAGAAGAATTGACCCCAGGTAACACCAGCATAGATACTGATGCTTTGGACGAACTAGTTGAAGTTGGTCCTATGAGTTTACAAGTTGGTAGTATAAGATGGGATGTCTCTAAGATATCACCTCGCTTGTTTACTAACAACAAATTCGCAGTTCCGCACCTACCGACTGGAGCCTTGTTAAGGCGTAACACGAGCAGTCGTCAGGTTGGATTGGCTATAGAAAAGCGAAACGCTAATGTCATGAATAGCCAAAAATATTTTGATCTGGAAAATTTAGCTAATAAGGCGGTAGAGAGATTTTTCGATTTCTTTATAGATATGGAGAAATTCTCAAAACTGCCAACTGGAGTCTTAGGCTCGAGTGCTGAACAGATACAAACGTACCAGAATAAAACTGGTAATAAGGTGACGGACCCAGTCTGTGTTGCCTTATCCCCAATTCAAAAATACAAACATATGATTAAGAGGGATGTCAAATTCAATTTGACTGATGGTGCTCAAAGTGAGTATACTAAAGCTGCCACCATTACTTATCATCAACCAGAGATAACTCAGGTTGCTACTGCCATTTTTGGTCAGTTTAAAACTAGACTGTTGGCTTGTAGAAATAAGTTCTTAAATATACCTCTTGAACATGATAATGATTTGAGCGGATATTTAACCAAATATCATTTGGGGAGTGAAAATAACACTTTCACTGAAATTGACTTTTCTAAATTCGATAAAAGTCAAGGGGAAATCCATCAACTCATTCAGGATTTAATCCTGATAAAGTTCGGTTGTGATCCCGAGTTTGTAGCCTTATGGTCTACCGCCCACAGAAGTTCTTCTATTTTCGATCAAAACGTTGGAATTGGTTTTAAAACTGATTTCCAAAGAAGAACGGGCGATGCTTTTACTTTTCTGGGAAACTCTTTGGTAACTGCCGCCATGCTGGCGTTTGTCATCAGTGACCCAGATAGGGAGAAGATTAGGTACATGTTGGTGGGTGGGGACGATTCTTTGATCTGCTCCTACGGTCCAATACAAGTACCTTTGGAACCATTGGGTGACATATTTAATATGTCTTGCAAGTTGGTACAACCAGCTTGTCCTTATTTCGCGTCTCGCTACTTGATTAGGAGAGGTGACGAAATTTTGTGTGTTCCCGACCCCTACAAACTTTTGGTGAAGTTGGGGAGGAAAGACGTCCCGGACAATCAAGCATCATTATGCGAGATACGTACCGGATTGGCAGATAGTGCCAAATATATCTTTGATG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| 112,105
|
NC_005266.1
|
Raspberry ringspot virus
|
Ebel,R., Schnabel,A., Reustle,G.M., Krczal,G., Wetzel,T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-12-03
| null |
Nepovirus rubi
|
Nepovirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 7,935
|
RefSeq
| 1
| null | null |
Vitis vinifera
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Raspberry ringspot virus RNA1, complete genome
|
TTTGTCTTTCATCTCAGTCTCATTGTTGAAGCTCACATATCTTTATCTCTTCTCGATATCTCTTCTTCAATCTCTCTATTTGTCGTGACAAAGCAAAGTTTACAGTTTTCTTATAATTGGTTAAAAACTGGTTACAATGGGGTGGACTTGCCCTGTTCAGGGGTGTATGTATTCCCGCTCCACTTGGAGCAATCGTGGCCTCAAGGAGGATGGTCTATCCTCCACCATGCGTTGTCCTGGTGCCATGTGTGGCGCCATGCTCGTCAGGTCGGAGCCCGTTCAAGCTCCAAAGGCTACTGTGGTGCCTCAAACCCCGGTTACTGCTGTCCGCCCCAAGAGGACAGTGGTTAGTGCGACACCCCTGCGTAAGCAGGATTGTGTCGTAGTGGTGGAGGTGGGGTTCCCAGCCCTACTCTCCCTGGAATACCCTGCACTTGCAGGAAGAGCTCGCCACACTGGCGAGTTTGACTCCGCGCTGCTCGCGCGAAAGCCCTCCAATGGGGGCACTGCTAGAGCACCTACCGGTTGGTTTAAACCGAGGGTTGTGCGCACACAACCTGCCAAGAAGGCACTCCCTTCTTGGGTTTCTGAGGCCCGCCGCCTAATAAAGGGGGCCTTGGAGGGGTCAAATGCGTTTGGCCCACGCTACTGCCGGGAGAAATTCCCGAAGGCCCGCCTTGTGTGGGTACTGGGTATGCTCTCAAAGAGCAGCCCTCCTTCAGTTGCCATTGGAAGGCAACTGAAGAAGAGTTTCCTGGCACTACAAGCTAGGATTGCCAGGGCACTGGCAAAGAAACAAAGTGCCCGTGCTGCACGCAGGCAAGAGGCCTGCAGGAAGATCCGCCTTGCTTTACAGCAGGCGAGGGGTATTGCCGCCCTAGAACGGCAACAGGCACGCCAGCTCTCTGGAGCTGGTCTGTATTCCGTGCGTTTGTGCACGAAGAGGGCTTTAAGCCCTATTGTGGAAGTGCCCAAGAGGCACAAGAAAAAGGCAATATCTTTGCCTTCTCCTGTTTCTGTACAGGAGTTTCCTGAGGGCCTTGTTGGTCCTAATTTTTGGGAGACATCTGGTCTCCTAAACTGCGTCGCCTCCCCGCAGCGAAGGGAGGATTTGGTCTTTCCCGTTTATGGGATTGACAGCTGCCGGACAGATCCGGAATACTTTGTGGTCGGGCCTAAAAGCCCTTCCAAAATCATGGGGGACACTAAACCCCGCCTGCCCACATGCCCTGCAGAGGCATTGAATTTATTGTGGGCTTCCAACCTTTTTGAGGACTGGGAGCTCGACATTATCGGGCAGATGGTCTCGGATGGCTTGTTGACCTCACAAGCCTTCCTTGATGGCTGTACCCTGGTCTCATATTACGGCCAGGAACAGATGGTGGACTCTTTCCACTGTCTTTTGCAGGATCCTGTTCCTGCTGAGGTTGCTGAGGCGCTAGCTGTTGATGTGCAGGCGCTGGATTTTGATGCTGTCTTTGGTTGTGGCATTTCAGATTTCCTTCGGGGAACTCGTGATGCCATGAAAGGATGGATCATGGATCCAGTTATTGCCAAGTCAACAACTTGGTGTAACACCATCATTGATAAGGTGCGTGCTTTATTTGATCAATATTTCGCACCATTTCATAAAATCATTGATGGTATGTCATACGTAAATTCACTGTGGGCCAAATGTAAAGAGTGGGCCCAGTCCGTGCTGAAGAATGGTTCACAACTGTTCTCTGTCATGTGGGAAACACATTGCGTGAGTTTTGTCATCATCATTACTTGTGCGTGTACCCTGCTGGTAGAAAATGTGTTGAAGGAACTCCGGTTGATATCACGTGTTGGTACCCTTACCAGCTGTGTTATATCCGGTGCTCTTGGGATACTAGGCTGCGGTTATATCCTTGCTAAGTGTGAGGATCTTGCTGTGGTATCTGCTAGTATTCGAGCCTTTCTCGGCGTGTTGCTGTGTCCTCCAACCATGGAGGCAGTGGATCTGAACCAGTCCTTGATTCCTGAGGAAATCCAAGCTACGAGCTGGACTGGTGTCGACAGAGTGCTGGGGGCACTGAATGCCGTTGGTTCCGGGTTGACAGGATTCAACACGGATACCATAATATATTGGGGCAGATTTGCCCAATCTTTTGACGGCATGAGACGGGGGAAGGATGCTGTGTGCGCTCTCGCAGCATGTCTTTTTGAAAAACTGGGCACGGTATATAATCGTGTAACAGGTAAGGAAGCAGCTTTTTTCCATGAGCTCTCCTCGCTTGTTTCCATTGATGTCCAGGGATGGTTGAACTCTTCACGCAGAGTGATGGCAGAATCTATAGCTTTTGCTAAATCTGACGCTGTCGCTTTTGCCACTGTGGAGAGACTGATAAATGATGGTGAGACCATCCAATTGACCGCTGCTTCTGCTCCAAAGTCCCACTCTATGCAGTTTGGTCAGATACTTGCTGAGCGCTTGAGGGAACTCCGTACTCTGCGGAATGATATGGCGCATGCTGGTTCCTTTGAGGGGCGTAGGTGTGTACCTTTCTGGTTGTACATCTATGGACCTCCGGGGGTGGGTAAAACCACTACCATGCATGAGTTTTCACAGGCTTTGTTGACGGCCTTCGAGTTTCCCTCAGACTCCCTAACATCCAAAAGTGCCACTGATAAGTACTGGTCACTCTATCGGCGCCAAGCTTTGGTGCAAATAGATGACCTGGGTGCTATCTCTGAGAGTGGTATGGAACAGGAAATGATGAATATCGTTTCCTCCGCCACATACAATCCTACCATGGCGGTTGCTAATGAAAAGACGACGCTTTTCGATAGCAAGTTCATTGTCTCAACGTCGAACAATTACTCTGCAGGCACTGACGCCAAGATACACGACCGGAAAGCTTTTAACCGGCGTCGCAGAGTGGTTATCAAAACCCGTGGGAAGGCGGGAGTGGCCTTCAATCCCCATGATAGCACTGCAGCAGCGGAGTTCTGTGTGGTGGAGAGGGATGATCGGGCAGAGACACCTATATGGGTGCAAAGTGGTGAGGCCCCTGATGATAAGGAACTATATTGGATGGATTTTCGCACAACTGTGGCTTATGTCATAGAGCAAGCTAGAATCCATCACAATGCAGAGGACATTGAGCAAGCCCAATATTCAATGAAACACAGCCGGACAAGACAATTGTACCAGGTGTGCGAGAATTACATTGGGGAAGTGAAAATGTCCGTGGCGAATTTTGTCCCTGGGGATATGTTGGGAGCTTGGAATCTGGAGCCCAAAGGCAGGTTCTTTTATTCATGTGTTGATGGTCGGGTTTATTCTTATGATCCCGAGCAGAAAGCCCATGATGAAGGACCGGTTGATAAGGCTCTAGATTTTGAGCAGATATGTTTGGAAAAGCTCTCCTACACCCTGCAGGCTGATATTCAGGGTGGGCCAAAATCTGCGACTGCTGGTATTTTTTTGCGGTCAATGGTTTCAGGAGAGTGTGCTGTGGAAAGTGTGGACAAGTTAAATAGGAGTGCATCTCGTGAGCACCTTATTTTCTTTAAAAACTTGTCCCTGGCTGATAGGGTGTATCTCCGCCTCGTACAAAAGCGCATTTTACAGCTTGCGATGGTAGGAGATCCCCTGGGATTGAGAAGTTACACAGTAATGATGGAGGGATTCCAAAATTCTTATAACTATGTTAAAGAGAATGGAGGGAGACTTCTGTTGATATTGTGTAGCTGCATGCTGTTGGGTATTGCCTGCTATACTTTTTTCAATGCATTGGCAATACTCATTGGTGGGACTTCAGTGGCTGCTGGCGCAGCTGCTATGGTTGACATTGGAGCGTGTGGTAGTACTTCTACCTATGCATCGGAATACGGCGCCAAGATGGGCCGTAGGAATATGCCACATCGTTCCAGGGAGATTCCTGCAGTCTGGTCTGAAGAGACTGGACATGATGAGAAATGGCAGCTGTGTGGTCTTCTGGAGACCTGCAGAAGTGACATGCCCGCAGTACATGTGAATCTTGTACCGGGTAATAAATTTGCCATAACTAAACACCAAGCCCAAGCCATCCCAGATGGTTCTTCTGTGGGTCTGAGTGTGGCAGGAAGGAGTTTCAGGACGTTCCAGTGGCGTGCTTCTGCACTTACGGAGTATGCTGAGAGCGAGATCTGTACGTACTTTGATAGCCGAATTCCCTCTTTGGGAAAACAGGCCATGAAAATGTACTCAGATTCCGATCTTGATGCCTTAAACGTCAAGTACTTTTCGACTCGTACACTGCATTTTAGGTTGGTGGATGATCAAGTCGAAAAGCGCCACTGGGACGCGGATGCGTGTGTTATATCAACCCCAAAAACCATTGTTTCTACTATCAATGGGGTGATATATCGGCAAGAAATACCCACAGCTATCACGTATAGACGTGAGAGTGTGAAACACGACTGCGGCGCGCTCGTTTTTACGGAAGTGCGTGGCAAACCGAAAGCTGTGGGTATGTTGGTTGGAACTTTAGGGGGAACGACATATGTGTGCAAATTTCCTCACATTGAGGTTGATGCTTTTGCATGTGTTCCCGACATCCGAGGATTCAATCTTGAAGCAGGAGTTTCTACTCTTGGCTATTCTAAACTTGGGTGGTTGGATAGGCGGCATCAGCCGCATAACAGTGAGAAGACTGAGTTCGTGCCCATACCGGAGAAATATCACATGGATGATGTTCCATGTAAGATACCGGCAGTGCTCAGTGCTAAAGACCCACGGTTGGCAGACATACCCCAATGTATGGGATACGATCCCTACAAACAAGGTATGGAAAAGTTTGCTCATCCCATGCAAGAAATTGATGAGCAACTCCTTGCCACCGTGTGTGATGAAATCGCCCAAGAGTTTCATGATGTGGGCGTGCGAGGGAGGATGGTCTCCATGGATGAGGCCATCAACGGACATCATAAATATGAGATCCCCTCGTTTTATGTTGAAGGTGCCAGTACCAGAGAGCTCAATGAGTTGCGTA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|
MZ220963.1
|
Raspberry ringspot virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2021-10-13
|
13C209
|
Nepovirus rubi
|
Nepovirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 7,915
|
GenBank
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Rubus
| null |
2013
| null | null |
Raspberry ringspot virus isolate 13C209 segment RNA1, complete sequence
|
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| 37,154
|
MZ220965.1
|
Raspberry ringspot virus
|
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|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
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|
2021-10-13
|
13C210
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Nepovirus rubi
|
Nepovirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 7,908
|
GenBank
| null | null | null |
Rubus
| null |
2013
| null | null |
Raspberry ringspot virus isolate 13C210 segment RNA1, complete sequence
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| 37,155
|
MN384981.1
|
Raspberry ringspot virus
|
Liefting,L., Tang,J., Veerakone,S.
|
Plant Health & Environment Laboratory, Ministry for Primary Industries, New Zealand
|
New Zealand
|
2020-04-26
|
Lavandula 'Grosso'
|
Nepovirus rubi
|
Nepovirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 7,930
|
GenBank
| null |
New Zealand
|
New Zealand
|
Nicotiana occidentalis
| null |
2015-11
| null | null |
Raspberry ringspot virus isolate Lavandula 'Grosso' segment RNA1, complete sequence
|
TTTGTCTTTCATCTCAGTCTCAATATACGAGCTCTCTCTCTCTCTCATGATTGACTTTGTATGCTCTCTCTCTCTCTTAGATTTGTTACGTTGTCTGGTTATAAAATTTCCATTAATTGTTTAAAATTTTAGTTTATTTGTTGTCACAACACTTGGCACTATGGGGTGGCATTGCCCCATCGAGGGCTGTTTGTACTTCCGCTCCGATTGGAGTCGGAGTGCTTTAAAAGAGGAAGGTATTTCCTTCTCCCTGCGTTGTCCTTCTTCTTGCTGCGGGGCTTTATTAGTTAGGCGGGAGCCCGTAAGCATCCCAAAGGCTACTGCGGTGCCTCAAACCCCGAAGAAAGTAAAGACTGGCCCCAAACCAGTGTTTACTGCTTCCAAACCCCTGCGGAAGCAGGCTATGGAAGTTGTTGTTGAGGTGGGGTCCCCAGCCCTCCTCTCCCTTGTATACCCTCCACTTGAGGGTCGTCCTCGTCATACTGGCGAGGGTCACACCGAGCTGCTCGCTCGAAGGCCTTCTAACGGAGGCGCTGCTAGAGCGCCTGCCGGCTGGTTTAAGTCGAGGGTTGTGAGCACACAACCTGCCCCACGGGTTTTGCCTGTGTGGGTTGCCGAGGCATGCCGCCTAATAAAGGCTGCCTTGAAGGGATCGAATGCTTTCGGTCCACGCTACTGCCGGGAGAAATTCTCGAGGGCTCGCCTCGTGTGGGTCTTGGGCATGCTATTAAAGCGTGCCCCACCATCTGTCGCCATGGGGCGACAGATAAAGAAGAGTTTCCTAGCACTACAAGCTAGGATTGCCAGGGCACTGGCAAAAAAACAGAGTGCCCGTGCTGCACGCAGGCATGAAGCCTGCAGGAGGATCCGGCTCGCTTGCCAGCAGGCAAGGGGCCTTGCTGCCTATGAGAGGCAGCAGAACCGCCAGATTTCTGGCGCAAGTTTGTATACCGTGCGTCTATGCACGAAGAGGGCATTTTGCCCTACTGTGGAAGCGCCCGTGCGGCGTTTTCCCAAAAAGAAAAAGGTGGTTTTCCCGCCTTCTCCTGCCTCTGTACAGGAGTTTCCTGAGGGCCTTGTTGGCCCCGCTTTTTGGGAGACATCTGGTCTCCTAAACTGTGTCGCCTCCCCACAGAGAAGGGAGGATTTGGTCATTCCCACCTATGGGATTGACAGCTGCCGGACAGATCCGGAAAACTTTGTGAGTGGGCCCAAAAGCCCCTCCAAGACTATGGGGGACTCCAAACCCCGTTTGCCCACATGCCCTTCAGAGGCATTGAACTTACTGTGGGCTTCCAATCTTTTTGAAGAATGGGAGCTCAACATAATGGGCGAGATGGTTGCCAAAGGCTTGTTGACCTCACAAGCTTTTTTAGATGGCTGCACCCTGGTCTCATACTATGGCCAGGAGCAAATGGTAGACACATTCCATTGCCTTTTGCAGGATGATGTCCCTACTGAGGTCTCTGAGGCACTTGCTGTCGATGTGCAGGCGCTGGATTTTGAAGCCATCTTTGGTTGTGGTATTTCTGATTTCCTCAGGGGAACAAGGGATGCCATGAAGGGGTGGATTTTTGACCCAGTGTTGACTAAATCGTCAACATGGTGTAACACCATTATCGATAAGGTGCGTGCATTATTTGATCAATTTTTTGCACCCTTTCGGAAAATCGTTGATGGTATGAGTTATATCAATTCACTGTGGGCTAAATGCAAAGAATGGGCTCAATCAGTACTCAAGAATGGCTCCAAGCTATTTTCTGTCATGTGGGAAACGCATTGTGTGAGTTTTATTATTATAATCACATGTGCGTGTACCTTGTTGGTTGAGAATGTGCTAAAGGAGCTGCGGTTGATTTCAAGAGTTGGTACTCTTACCGGCTGCGTTATCTCCGGAGCTCTGGGTATGCTAGGCTGTGGCATAATACTCACCAAGTGTGAGGATCTTGCCGTAGTTTCCGCTAGTATACGAGCCTTTCTTGGTGTTCTGTTGTGTCCTCCCACTATGGACGCAGTGGATTTGAATCAGACGCTCATCCCAGAAGAAGTGCAGGCTACAAGCTGGGTTGGAGTGGATCGGGTTTTAGGAGCCCTTAATGCCGTCGGTTCTGGATTGACTGGATTCAATACAGATACCATTATTTATTGGGGCCGTTTTGCCCAATCTTTTGACGGTATGAGACGAGGAAAGGATGCCATCTGCGCTTTGGCAGCCTACTTGTTCGAGAAGCTGGGCACTGTTTATAATCGTGTTACAGGTAAGGAGGCAGCTTTCTTCCATGAGCTGTCTTCTCTTGTTTCCATTGATGTCCAGGGATGGTTGAACTCTTCACGCAGAGTGATGGCAGAATCAATAGCATTTGCTAAATCTGATGCCGTCGCATTTGCAACCGTCGAACGACTGATAAACGACGGTGAAACCATCCAACTTACTGCAGCTTCTACGCCTAAATCGCATTCAATGCCATTTGGGCAGATTCTTGCAGAACGATTAAGGGAACTCCGTACTTTACGGAATGATATGGCTCATGCCGGCACCTGTGAAGGCCGCAGATGTGTACCCTTCTGGTTGTACATTTATGGTCCCCCAGGGGTTGGAAAAACCACAACCATGCATGAGTTTTCTCAGGCCCTGTTGACGGCCTTTGAGTTTCCTTCAGACTCCTTAACATCCAAAAGTGCCACTGACAAGTACTGGTCTTTGTATAGGCGGCAAGCGCTTGTACAAATTGACGATCTCGGAGCTATCTCCGAAAGTGGTATGGAACAGGAAATGATGAATATCATTTCTTCTGCTACATATAACCCTCAGATGGCAGTTGCTAACGAAAAGACGACGCTTTTCGATAGTAAGTTCATTGTTTCAACGTCGAATAATTACTCTGCTGGCACTGACGCGAGAATACATGACCGAAAGGCATTTAATCGTCGCCGCAGAGTGGTTATCAAGACCCGGGGGAAACGTGGAGTTGAATTTAACCCCCATGATAGCACAGCGGCTGCTGAGTTTTGTGTTGTCGCACGCGACGACAGAGCTGAGACGCCTATCTGGGTCCAGAGTGGCGAGGCTCCGGCGGACAAAGAGATGTATTGGATGGATTTCCGCACTACTGTCGCATATGTTATTGAACAAGCGAGAATCCACCATAACGCAGAAGACATTGAACAAGCCCAATTTTCAATGAAACACAGCCGTACAAGACAACTGTATCAGGTGTGTGAGAATTACGTTGGTGAAGTCAAAATGTCTGTTGCTAACTTTGTCCCTGGGGATATGTTGGGAGCTTTGAATCTAGAGGCTAAAGGTAGGTTTTTCTATTCCTGTGTCGATGGGAGGGTGTATTCATATGACCCTGAACAGAAAGCACATGATGAGGGACCTGTCGACAGATCTCTAGATTTCGAGCAGATTTGTTTAGAAAAACTCTCCTACACCTTGCAAGCTGACATACAAGGTGGACCAAAGTCCGCTACCGCGGGAATTTTTCTGCGTTCGCTGGTGTCAGGAGAGTGCGCTGTGGAAAGTGTGGACAAATTGAATAAGAGCGCCTCTAAGGAGCACTTAATCTTTTTCAAAAACTTGTCCCTGGCTGACAGAGTGTATCTCCGGCTTGTGCAAAAGCGTATATTGCAATTGGCCATGGTCGGAGATCCTCTTGGATTGCGCAGCTATACAGTGATGATGGAAGGCTTCCAGAAATCTTATAACTATGTTAAAGAGAATGGAGGAAGACTTTTGTTGATATTGTGTAGTTGTATGCTTCTTGGTATTGCCTGTTATACTTTTTTCAATGCATTGGCGATACTAATTGGTGGCACTTCTGTAGCAGCGGGAGCGGCTGCCATGGTTGATATTGGGGCATGCAGTAGCGTCTCCACTTATTCAACTGAATACGGCGCCAAGATGGGCCGTAGGAATATGCCACACCGCTCCAGAGAGATACAGGCTGTCTGGTCGGAAGAGACAGGCCAAGATGGGAAGTGGCAACTTTGTGGGCTCCTGGAAACATGCCGGAGTGATATGCCAGCTGTGCATGTCAATCTGGTGCCAGGGAATAAATTTGCCATAACCAAACATCAAGCCCAAGCCATACCTGATGGCTCTTCTGTGGGTTTGAGCGTGGCAGGAAGGAGCTTCCGAACTTTCCAATGGAGGGCCTCAGCTATCACTGAATATGCTGAGAGTGAAATTTGTACCTACTTTGATAGTAGGATACCATCCCTAGGAAAGCAGGCTATGAAAATGTATTCTGATGCCGATCTTGACTCACTGAATGTCAAGTATTTCTCCACCCGGACCTTACACTTCAGGTTGGTTGATGATCAGGTGGAGAAGCGGCACTGGGATGCAGATGCTAGTGTGATACAGACACCAAAAACCATTGTTTCTACTATAAATGGTGTCGTGTATCGGCAAGAGATACCCACTGCTATCACGTATCGACGTGAAAGTGTTAAACATGATTGTGGTGCGCTCGTGTTCACAGAAATACGTGGCAAGCCCAAAGTGGTGGGTATGTTGGTTGGCACTCTAGGAGGTACAACGTATGTCTGTAAGTTTCCAGCTATTGAAGTGGATGCTTATGCGTGTGTACCTGACATTCGAGGCTTTAATCTTGAGACTGGCGTTGCAACGCTGGGTTACTCTAAACTCGGATGGATCGATAGGCGGCACCAGCCGCATAATTCCGAAAAGACTGAGTTCGTGCCAATACCGGAGAAATATCACATGGAAGACGTTCCGTGTAAAATTCCGGCAGTGCTCAGTGCCAAGGATCCTCGCCTGGCTGACGTGCCTAATTGTGCAGGATATGATCCATACAAGAATGGTATGGAAAAGTTTGCTCATCCCATGCAAGATATTGATGAGCAACTCTTGGCTACGGTTTGTGATGAAATCGCCTGTGAATTTAAGGATGCAGGCGTACGAGGAAGGATGGTCTCCATGGACGAAGCTATCAATGGACATAGGAAAGAAGACATCCCCTCGTTCTTTGTCGAAGGCGCTAGCACTAATGATCTGAACAGATTGCGCACTTTGTGTGCAACTGAGGTCTGGGCCTGTGACAATGGGAGTAGCGTAGAGTTTGAGTATCCACGCGTGATTCCCACACCCGATCAATCCAAATGGAAGTGCAATCACGAGTGTAGTGGTATCGTGATTGAGGGCAATGATATCAACGATATTGCCAGTTTTGTCAAGCAGCGTCCTCCGTGTTGCGAAGAAATTTTCTTTGACGCACTTGACTTGACCACTTCTGAAGGCTACCCTTTGTTCCTGGATCGCCCTGCCGGTACTAAGGGCAAAGAAAGATTCTTCGAGGGTAGCGAAGGAAAGAAGTTCCTCATACCGGATTGTCCCTTAGAAATCCAGTTGCGAAAGGGTATTGAGGAGACTCATCTTGGCACTCCACAACTCATCATCAAAGAGAGTGCCAAGGATGAGTTACTTAAAGAAGGAAAGGTACTCCCTACCACTGGGATGCCTGGGACACGACTATTTTCGATTTGTCCTGCCTGGTACAACCTCGTTGTGCGTCAACACTTTGCGTATGTTGCAGAAAGTGTGCGTAAGCGTAGAAGAGTGCTAGCAAGTCAGGTTGGGTTAGTTGTCGGATCCCGTGAATGGGATGATCTTGCAGCGCGACTCCGGTCGAAAAAGAACGATAAAATGTATTGCTGCGATTATTCCAAGTTTGATGGGCTGATGACTCCCCAGATCGTCCATGCTATTACAAACATATATGAGCGTATGTTCAGTGGCAATGATGGGATGAGTCAGTTCCGGCAGAACCTACTGATGGGTATCTGCAACAGAATTTCAATTTGTGGCTCACAGGTCTACCGTGTTGAAGCTGGCATGCCTTCGGGTTTTGCCCTCACGGTTGATTTCAATTCAATTTTCAATGAAATTCTGGTTCGTTGCGCTTATCGGTCCCTTGTACCTGAAATAGAGCGACCTTTCTTTTCCAATAATGTAGTATTGGTGGTTTATGGTGATGATAATGTTTTGGGTGTCCATCCAAATGTTGAGCCTGCCTTTAATGGCAATACCATCAAGAGATACATGAAGGAGGAGCTAGGTGTCACTATCACTGATGGTGCCGATAAGCTGAGTCCTGTGATCGCAGCTCGACCACTAGAGCAATGCGAATTTTTGAAGCGTACATGGATCAAAGATCGACAGTATGGTCTATACCGGGCTCCTTTAGTGGAGACCAGTATTTATTCATGCATACGATATGTGCGCTTACAAAATTACGACTGGCAAATGCCCCTCTTGCAAAATGTTCAGGGCAGCTTGTATGAAGCCAGTCTGCATGGTCCCGAGATGCATGAGAAAATTTATAAGCATTTCTCAATGCATTTCCCAAAGTGGGTGGAAGAGCATGAGTTGGATACGTATGAACAATGTCGTACCCGATTCATTGCTGCAAAGAATGGAGATTTCAATTTCCACCCAGCTTCAGCACAGATGGGACATGCTTTCTCCCGACAGGCTGAGATTCAGGAGTTGTCTCAACCTCAAAATCCAAAACGCTGTTTTAAACTCCATGAGAAGATCTATGTCTGCGGTCCTGGCCACAATGATGTTGACTGTTTTTATGTTGATGTCAGGGTTGGAGGCAAGATCACTAAAGGGAAGGGGTTCCATATAGAGCCAGTGTTTACCGCTGGTTCCGGACAAATTGGAACACTTAAGTGGGCTTCATCTTTCCGCTCTTCCAGTAGATGTCCTTTAAGAGATACTGCTGTTGAAGCTTTTAAAGAGGATAATTGTGTCTATTTTAGAGACAATGGTGAGTTGATCAATGCTTGGTTGGCTGCCATAAATTTTGCTTCCTCTATAAATGCCGAGGGGTTAGATGGGCTCATACAAGTGTATCGTACATGTGGACCCACTCACATTAATGATCTCGCCTATTATTTTGAGGGAGGGGTTGTTGGTGTGCCAGCACCACCGCTTTTACGCACTTTTGGGGTTGATCCGGTGATATTGAACCGGTTATGTCCCAAGAGTGTCCTCGAATCGAGACCGCCACCATCACGCAGTGCAAATGTTTCAGCACATGGGCAGGTGCAGCAGTTCCTACTGCAAAATCCTGAACCATGTTTTATAGGCCTGCGTGATGGAGCAAAAATTGTCCATGGAATGAAATGCAAGGAAACTTGTAAAGGGCATATTGCTGTGGTGGATGTCGTGCGTGGTAGTTCTACTAATGTCAGGGCTGCTATGTTAGACGTCTTGAGGAGAGGATGTTATAATATCCAGTAGGTGCTGGATCTAAACAGGCAAGCCGGCAGACTTCGTGTGCTGCTACCACGGAACTACGTGGTTTCTTGGTATCCCCCTACCATGAAAGGGGTTGTCTGGAGCCAGAATCAAGAGAGGATACTACATGTTCCGTGAAATCGGTAATACGTTAAGTGCTAAACTCTGCGGCCCTTTGGGGGGGAATGGAGCAGATACCTGAAAGCCTCAGGTTCCGTGAAATCGGTATGATGTAACTCGCGTAAACTCTTCTCTGGAGTTCTGGGAGACGCTCTTCGGCTCCGAGTATAAACGAGCCTACCACAAGCTGTCCTCTATCAATTTAGGGGTAGAGAATTCTTGAGTCTAGACAACTCATAGATCCCAGCGGTACTGTTAATGGTGTTTCTTCTGGTGGTCACGTACCAGAACAGTATGACGTCCTTCCTATTTCAACAGTGAAATAGGGCTCTTTGCAGAGAGGGTCGGTGTAAAGGTGTGCTACGACTTGTTTCGTAGACATAATAAGCCACAATTTATCTGTATTTTAATGCTTTGTCGTGGCAGATGAGTCTTTACCTTCTGTTGCTCCCTCTAAGAGGTTGTGCCTTTAGCAAGCACACAAAAATATGCATTTGTTTTTGTTCTTAAGCTTCCCTAGTGTCGTTCTGTCCGAAC
| 51,737
|
AY310444.1
|
Raspberry ringspot virus
|
Wetzel,T., Ebel,R., Moury,B., Le Gall,O., Endisch,S., Reustle,G.M., Krczal,G., Schnabel,A.
|
Centrum Gruene Gentechnik, Staatliche Lehr- und Forschungsanstalt
|
Germany
|
2006-03-12
| null |
Nepovirus rubi
|
Nepovirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 7,935
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Raspberry ringspot virus grapevine strain RNA 1 complete sequence
|
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| 108,363
|
AY303787.1
|
Raspberry ringspot virus
|
Ebel,R., Schnabel,A., Reustle,G.M., Krczal,G., Wetzel,T.
|
Centrum Gruene Gentechnik, Staatliche Lehr- und Forschungsanstalt
|
Germany
|
2003-11-10
| null |
Nepovirus rubi
|
Nepovirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 7,935
|
GenBank
| 1
| null | null |
Vitis vinifera
| null | null | null | null |
Raspberry ringspot virus segment RNA1 complete sequence
|
TTTGTCTTTCATCTCAGTCTCATTGTTGAAGCTCACATATCTTTATCTCTTCTCGATATCTCTTCTTCAATCTCTCTATTTGTCGTGACAAAGCAAAGTTTACAGTTTTCTTATAATTGGTTAAAAACTGGTTACAATGGGGTGGACTTGCCCTGTTCAGGGGTGTATGTATTCCCGCTCCACTTGGAGCAATCGTGGCCTCAAGGAGGATGGTCTATCCTCCACCATGCGTTGTCCTGGTGCCATGTGTGGCGCCATGCTCGTCAGGTCGGAGCCCGTTCAAGCTCCAAAGGCTACTGTGGTGCCTCAAACCCCGGTTACTGCTGTCCGCCCCAAGAGGACAGTGGTTAGTGCGACACCCCTGCGTAAGCAGGATTGTGTCGTAGTGGTGGAGGTGGGGTTCCCAGCCCTACTCTCCCTGGAATACCCTGCACTTGCAGGAAGAGCTCGCCACACTGGCGAGTTTGACTCCGCGCTGCTCGCGCGAAAGCCCTCCAATGGGGGCACTGCTAGAGCACCTACCGGTTGGTTTAAACCGAGGGTTGTGCGCACACAACCTGCCAAGAAGGCACTCCCTTCTTGGGTTTCTGAGGCCCGCCGCCTAATAAAGGGGGCCTTGGAGGGGTCAAATGCGTTTGGCCCACGCTACTGCCGGGAGAAATTCCCGAAGGCCCGCCTTGTGTGGGTACTGGGTATGCTCTCAAAGAGCAGCCCTCCTTCAGTTGCCATTGGAAGGCAACTGAAGAAGAGTTTCCTGGCACTACAAGCTAGGATTGCCAGGGCACTGGCAAAGAAACAAAGTGCCCGTGCTGCACGCAGGCAAGAGGCCTGCAGGAAGATCCGCCTTGCTTTACAGCAGGCGAGGGGTATTGCCGCCCTAGAACGGCAACAGGCACGCCAGCTCTCTGGAGCTGGTCTGTATTCCGTGCGTTTGTGCACGAAGAGGGCTTTAAGCCCTATTGTGGAAGTGCCCAAGAGGCACAAGAAAAAGGCAATATCTTTGCCTTCTCCTGTTTCTGTACAGGAGTTTCCTGAGGGCCTTGTTGGTCCTAATTTTTGGGAGACATCTGGTCTCCTAAACTGCGTCGCCTCCCCGCAGCGAAGGGAGGATTTGGTCTTTCCCGTTTATGGGATTGACAGCTGCCGGACAGATCCGGAATACTTTGTGGTCGGGCCTAAAAGCCCTTCCAAAATCATGGGGGACACTAAACCCCGCCTGCCCACATGCCCTGCAGAGGCATTGAATTTATTGTGGGCTTCCAACCTTTTTGAGGACTGGGAGCTCGACATTATCGGGCAGATGGTCTCGGATGGCTTGTTGACCTCACAAGCCTTCCTTGATGGCTGTACCCTGGTCTCATATTACGGCCAGGAACAGATGGTGGACTCTTTCCACTGTCTTTTGCAGGATCCTGTTCCTGCTGAGGTTGCTGAGGCGCTAGCTGTTGATGTGCAGGCGCTGGATTTTGATGCTGTCTTTGGTTGTGGCATTTCAGATTTCCTTCGGGGAACTCGTGATGCCATGAAAGGATGGATCATGGATCCAGTTATTGCCAAGTCAACAACTTGGTGTAACACCATCATTGATAAGGTGCGTGCTTTATTTGATCAATATTTCGCACCATTTCATAAAATCATTGATGGTATGTCATACGTAAATTCACTGTGGGCCAAATGTAAAGAGTGGGCCCAGTCCGTGCTGAAGAATGGTTCACAACTGTTCTCTGTCATGTGGGAAACACATTGCGTGAGTTTTGTCATCATCATTACTTGTGCGTGTACCCTGCTGGTAGAAAATGTGTTGAAGGAACTCCGGTTGATATCACGTGTTGGTACCCTTACCAGCTGTGTTATATCCGGTGCTCTTGGGATACTAGGCTGCGGTTATATCCTTGCTAAGTGTGAGGATCTTGCTGTGGTATCTGCTAGTATTCGAGCCTTTCTCGGCGTGTTGCTGTGTCCTCCAACCATGGAGGCAGTGGATCTGAACCAGTCCTTGATTCCTGAGGAAATCCAAGCTACGAGCTGGACTGGTGTCGACAGAGTGCTGGGGGCACTGAATGCCGTTGGTTCCGGGTTGACAGGATTCAACACGGATACCATAATATATTGGGGCAGATTTGCCCAATCTTTTGACGGCATGAGACGGGGGAAGGATGCTGTGTGCGCTCTCGCAGCATGTCTTTTTGAAAAACTGGGCACGGTATATAATCGTGTAACAGGTAAGGAAGCAGCTTTTTTCCATGAGCTCTCCTCGCTTGTTTCCATTGATGTCCAGGGATGGTTGAACTCTTCACGCAGAGTGATGGCAGAATCTATAGCTTTTGCTAAATCTGACGCTGTCGCTTTTGCCACTGTGGAGAGACTGATAAATGATGGTGAGACCATCCAATTGACCGCTGCTTCTGCTCCAAAGTCCCACTCTATGCAGTTTGGTCAGATACTTGCTGAGCGCTTGAGGGAACTCCGTACTCTGCGGAATGATATGGCGCATGCTGGTTCCTTTGAGGGGCGTAGGTGTGTACCTTTCTGGTTGTACATCTATGGACCTCCGGGGGTGGGTAAAACCACTACCATGCATGAGTTTTCACAGGCTTTGTTGACGGCCTTCGAGTTTCCCTCAGACTCCCTAACATCCAAAAGTGCCACTGATAAGTACTGGTCACTCTATCGGCGCCAAGCTTTGGTGCAAATAGATGACCTGGGTGCTATCTCTGAGAGTGGTATGGAACAGGAAATGATGAATATCGTTTCCTCCGCCACATACAATCCTACCATGGCGGTTGCTAATGAAAAGACGACGCTTTTCGATAGCAAGTTCATTGTCTCAACGTCGAACAATTACTCTGCAGGCACTGACGCCAAGATACACGACCGGAAAGCTTTTAACCGGCGTCGCAGAGTGGTTATCAAAACCCGTGGGAAGGCGGGAGTGGCCTTCAATCCCCATGATAGCACTGCAGCAGCGGAGTTCTGTGTGGTGGAGAGGGATGATCGGGCAGAGACACCTATATGGGTGCAAAGTGGTGAGGCCCCTGATGATAAGGAACTATATTGGATGGATTTTCGCACAACTGTGGCTTATGTCATAGAGCAAGCTAGAATCCATCACAATGCAGAGGACATTGAGCAAGCCCAATATTCAATGAAACACAGCCGGACAAGACAATTGTACCAGGTGTGCGAGAATTACATTGGGGAAGTGAAAATGTCCGTGGCGAATTTTGTCCCTGGGGATATGTTGGGAGCTTGGAATCTGGAGCCCAAAGGCAGGTTCTTTTATTCATGTGTTGATGGTCGGGTTTATTCTTATGATCCCGAGCAGAAAGCCCATGATGAAGGACCGGTTGATAAGGCTCTAGATTTTGAGCAGATATGTTTGGAAAAGCTCTCCTACACCCTGCAGGCTGATATTCAGGGTGGGCCAAAATCTGCGACTGCTGGTATTTTTTTGCGGTCAATGGTTTCAGGAGAGTGTGCTGTGGAAAGTGTGGACAAGTTAAATAGGAGTGCATCTCGTGAGCACCTTATTTTCTTTAAAAACTTGTCCCTGGCTGATAGGGTGTATCTCCGCCTCGTACAAAAGCGCATTTTACAGCTTGCGATGGTAGGAGATCCCCTGGGATTGAGAAGTTACACAGTAATGATGGAGGGATTCCAAAATTCTTATAACTATGTTAAAGAGAATGGAGGGAGACTTCTGTTGATATTGTGTAGCTGCATGCTGTTGGGTATTGCCTGCTATACTTTTTTCAATGCATTGGCAATACTCATTGGTGGGACTTCAGTGGCTGCTGGCGCAGCTGCTATGGTTGACATTGGAGCGTGTGGTAGTACTTCTACCTATGCATCGGAATACGGCGCCAAGATGGGCCGTAGGAATATGCCACATCGTTCCAGGGAGATTCCTGCAGTCTGGTCTGAAGAGACTGGACATGATGAGAAATGGCAGCTGTGTGGTCTTCTGGAGACCTGCAGAAGTGACATGCCCGCAGTACATGTGAATCTTGTACCGGGTAATAAATTTGCCATAACTAAACACCAAGCCCAAGCCATCCCAGATGGTTCTTCTGTGGGTCTGAGTGTGGCAGGAAGGAGTTTCAGGACGTTCCAGTGGCGTGCTTCTGCACTTACGGAGTATGCTGAGAGCGAGATCTGTACGTACTTTGATAGCCGAATTCCCTCTTTGGGAAAACAGGCCATGAAAATGTACTCAGATTCCGATCTTGATGCCTTAAACGTCAAGTACTTTTCGACTCGTACACTGCATTTTAGGTTGGTGGATGATCAAGTCGAAAAGCGCCACTGGGACGCGGATGCGTGTGTTATATCAACCCCAAAAACCATTGTTTCTACTATCAATGGGGTGATATATCGGCAAGAAATACCCACAGCTATCACGTATAGACGTGAGAGTGTGAAACACGACTGCGGCGCGCTCGTTTTTACGGAAGTGCGTGGCAAACCGAAAGCTGTGGGTATGTTGGTTGGAACTTTAGGGGGAACGACATATGTGTGCAAATTTCCTCACATTGAGGTTGATGCTTTTGCATGTGTTCCCGACATCCGAGGATTCAATCTTGAAGCAGGAGTTTCTACTCTTGGCTATTCTAAACTTGGGTGGTTGGATAGGCGGCATCAGCCGCATAACAGTGAGAAGACTGAGTTCGTGCCCATACCGGAGAAATATCACATGGATGATGTTCCATGTAAGATACCGGCAGTGCTCAGTGCTAAAGACCCACGGTTGGCAGACATACCCCAATGTATGGGATACGATCCCTACAAACAAGGTATGGAAAAGTTTGCTCATCCCATGCAAGAAATTGATGAGCAACTCCTTGCCACCGTGTGTGATGAAATCGCCCAAGAGTTTCATGATGTGGGCGTGCGAGGGAGGATGGTCTCCATGGATGAGGCCATCAACGGACATCATAAATATGAGATCCCCTCGTTTTATGTTGAAGGTGCCAGTACCAGAGAGCTCAATGAGTTGCGTACTTCTTGCTCTGCTGAAGTCTGGTGCTGTGATCCCAGGAGTGATATTGAATTTGAATATCCTCGCATCATCCCTGGTCCCGTTGAATCCAAATGGAAGTGTGAGAGTACATGTTGTGGTTGTACTTTCAAAAGTGGTGGTACTGAGGCCATCATAAGTTTTGTCAAGGCGCGATCTCCATGCTGCGAAGAAATTTTCTTTGACGGCCTTGACTTAACCACTTCAGAGGGCTACCCTCTTTTCCTGGACCGCCCAGCTGGGGCAAAAGGAAAGGAAAGATTTTTTGAGGGTAGTGAAAATCAAAAGTTCCTCATACCGGATTGTCCGCTTGATGTACAGTTGAAGAAAGGTATTGAGGAGACTCATCTTGGCACGCCACAGCTCATTATTAAAGAGAGTGCTAAGGATGAGTTACTGAAAGAAGGGAAGGTTTTACCTTCCGAGGGGATGCCGGGAACACGATTGTTCTCCATTTGTCCTGCATGGTACAACATCGTTGTGCGCCAACACTTTGTATATATTGCTGAAAGTGTGCGCAAACGAAGACGTACTTTGTCTAGTCAGGTGGGAATTGTTGTGGGTTCTCGTGAGTGGGATGATCTTGCAGCTCGACTCAGGTCGAAAAAAAATGATAAGATGTACTGCTGCGATTATTCCAAGTTTGATGGGCTGATGACTCCCCAGATTGTCCATGCTATCACAAACATTTATGAGAGAATGTTTAGTGGTAATGACGGGATGAGTCAGTTCCGGCAGAACCTGCTGATGGGTATCTGTAATCGTATCTCTATCTGTGGATCACAAGTTTATAGGGTTGAAGCTGGCATGCCTTCTGGGTTTGCCTTGACTGTTGACTTCAACTCTATTTTTAATGAGATACTGGTCAGGTGTGCTTATCGCTCTCTTGTACCTGAGATTGAGAGACCTTTTTTTTCCAATAATGTGGTCCTGATTGTGTATGGCGATGATAATGTTTTGGGTATCCACCCAAACATTGAGTCTGCCTTTAATGGCAATGCAATTAAGGCCTACATGAAGGAGGAATTGGGGATTAAAATCACTGATGGTGCCGATAAGCTCAGCCCCGTTATTTGTGCTCGTCCTCTCGAGCAGTGTGAGTTTTTGAAGCGTACCTGGAGGAAAGACCGACAGTATGGACTATACCGGGCTCCACTTGTGGAGACTAGTATATACTCATGCTTACGTTACGTACGGCTTCAAAACTATGACTGGCAAGCTCCCCTCTTGCAGAATGTACAGGGGAGCCTTTATGAGGCTAGTCTACATGGTCCAGATATGCATGCGCGTATTTATAAACATTTTGCGACGCATTTCCCGAAGTGGGTGGAAGAGCATGAATTGTACACTTATGAACAGTGTCGCACACGATTCATTGCTGCTAAGAATGGAGATTTTAATTTCCATCCTGCTTCGGCACAAATGGGCCATGTTTTCTCCCAACAGACTGAGATTCAGGAGTTGTCTCAGTCTCAAAATCCAAAAAGATGCTTTCAACTCCACCCAAAAATCCACATCTGTGGTCCTGGACATAATGAACAAGACTGTTTTTATGTTGATGTCCGGGTGAAAGGAAAGATTACCAAGGGTAAGGGCTTCCATCATGCACCTGTTTTTTCCGCAGGTTCTGGCCAACTTGGTACTGTTAAATGGGCATCATCGTTCCGCTCATCATCAGCGTGTCCCATGAGGGATTTAGCTGTCGATGCTTTTAAACGGGGCGAATGTGTTTACTTCAGAGACAATGGTGAGTTAATCAATGCTTGGTTAGCCGCTATTAACTTTGGGATGTCCATTAATGCCGATGGGTTGGATGGCCTTCTTCAGGTCTATCGCAACCAGGGGCCAACACACCTCGATGATTTAAGTTTCTATTTTGAAGGTGGTGTTGTTGGTGTTCCAGCTCCTGCACACTTGATGGTTTATGGGACTGACACATCAATTCTCAATCGCTTGTGTCCCAAAACTGTTTTAGAAAGTGCCCCTCCTCCAGGACGTTCAAGCAACGTGAGTGAGCGCAGCCAGGTGCAAACATTCTTGCATATGAGTCCAAAACCTTGTTTTATAACACTCAAGGGCTCAGGTAAGGTTTGCCACGGTCTGCGCTGCAATAACTCATGTCGCGGCCACATTTCTTGTACTGATGTGGTTCGCAATTCTGCAGCCAATCAACGAGCTGCAATGCTGGATGTTCTGAGGAGGGGGTGCTACAATATCCAGTAGGAGCTGGATCTTTTCAGGCAAGCCGGCAGACTTCGTGTGCTGCTACCACGGAATTACGTGGTTTTAGCTGACACCTTACTGTCGTTTTATTATTTTGTTTTAGAATAATAATCGGCTAGTTTCGCCGAGAAGGAAACGTGCTGGAGCCACACCAAAATTCTGATACTATATGTTCCGTGAAATCGGTAATCAGATAAGTGCCAAACTCTACGACGCTTTGGGGGCGTATGAAGTAGATACCCTGTTAATAAAGGGTTCCGTGAAATCGGTATGTGGCAACTCTCTGAAACTCAGTCTCTAAGGTGTGGGAGCAACCCCTCGGCTCCGGGTTAATTGAGCCAACTAAAGCTGTGCCATGTGAGTTTGTGTTTTACACATGGCCCCTGTGAGTCTTGACAACTTGCAGGTTCAGCGGTACTGTTAAATGTCTTTCTTCTGGTGGTGACGTCCCAGAACAGTATGACGAGTTTTCCAATTTATCAGTAAATTGGAGCCGATTGCAGAGTCGGTGGTGTAAAAGTGTGCTACGGCTTGTTCCGTAGGCATAATAAGCCAAGATTATCTGTTTTAATGCTTTGAGTCATAGTTAGTTTTCTTTCTGTTGCTCCCTCTTTGAGGTTGTGCCTTTAGCAAGCACACAAAAATATGCATTTTATTTTGTTCTTAAGCTTCCGTAGTGTCCGTTCTGTCCGAAC
| 110,170
|
NC_029133.1
|
Rat bocavirus
|
Lau,S.K.P., Yeung,H.C., Li,K.S.M., Lam,C.S.F., Cai,J.P., Yuen,M.C., Wang,M., Zheng,B.J., Woo,P.C.Y., Yuen,K.Y.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2016-02-11
| null |
Bocaparvovirus rodent1
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,212
|
RefSeq
| null |
Hong Kong
|
Hong Kong
|
Rattus norvegicus
| null |
2010-09-15
| null |
PRJNA485481
|
Rat bocavirus strain HK1S, complete genome
|
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The University of Hong Kong, Microbiology
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|
Hong Kong
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|
Hong Kong
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The University of Hong Kong, Microbiology
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China
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2016-02-01
| null |
Bocaparvovirus rodent1
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Bocaparvovirus
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Parvoviridae
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ssDNA(+/-)
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GenBank
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Hong Kong
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Hong Kong
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Rattus norvegicus
| null |
2011-03-02
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Rat bocavirus strain HK2S, complete genome
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The University of Hong Kong, Microbiology
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|
Hong Kong
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Parvoviridae
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|
Hong Kong
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Lau,S.K.P., Yeung,H.C., Li,K.S.M., Lam,C.S.F., Cai,J.P., Yuen,M.C., Wang,M., Zheng,B.J., Woo,P.C.Y., Yuen,K.Y.
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The University of Hong Kong, Microbiology
|
China
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2016-02-01
| null |
Bocaparvovirus rodent1
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Bocaparvovirus
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Parvoviridae
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ssDNA(+/-)
| 5,211
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GenBank
| null |
Hong Kong
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Hong Kong
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Rattus norvegicus
| null |
2011-08-11
| null | null |
Rat bocavirus strain HK3S, complete genome
|
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| 83,886
|
NC_016442.1
|
Rattail cactus necrosis-associated virus
|
Kim,N.R., Hong,J.S., Song,Y.S., Chung,B.N., Park,J.W., Ryu,K.H.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2011-12-13
| null |
Rattail cactus necrosis-associated virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,506
|
RefSeq
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Disocactus flagelliformis
| null |
2010-08-01
| null |
PRJNA485481
|
Rattail cactus necrosis associated virus, complete genome
|
GTATTGTGTCTTTGTTGGTTACATTGACAACAATTTACATAAACACACACACATTTCATTTTCACAATGTCACAATTACAAAACTACGTTAACAAAATCAACAGTGGTGCTGGTGTTTCATCCCAGCACCTGTTATCCAACCTTGCTGAGAGGGTAGTCTATGATCAGGCCCTCGAAAGCACGGAAGCTCAAAAGAGGCGTCCGAAGTACCACTTTTCGAAGGTGGTTACTCCGGAACAGCAAAATCTGATCACCGGTGCGTACCCTGAATTCTCTATCAACTTCACCGGGACCTCTGCTTCTGTCCATGCTGTCGCTGGTGGGTTACGAGGTTTAGAACTGGAGCTTTTAATGACGCAGATTCCTTTCGGTGCTGCATGCTTCGATATTGGTGGTAATTATGTTCGGCACTTGCTTAAAGGCCGCTCCTACGTGCATTGTTGCAATCCCGTACTGAGTGTGCGCGACGGAGCCAGGTACGAATCGTACCGCGATGAGCTACGGAAAGTCTCGGCCCAAGGTGCACCGGTCGCTGGGTCGTGGGGTGTGCCAGGGCAAGGTGCCTCTTGCGTGCGTACTCGTTCTTTACAACCATATCAGGTTGCCGCTTTTGAAAGGTATTCTGTTAATCCACACGCTGTCGTATGCGACGACACTTTCCAAACCTGCAGTTTTCCACCACCGGCCCATGGGTGTACATATGCTGTTTTATTACATAGTCTGTATGATATTCCTGTTAATGAGTTAGGTCCCGCGCTACTTAGGAAGAATGTCCACGTGGCCTACGCAGCTTTTCATCTCTCTGAGGAGATGTTGTGGAAGGACGCCGACGGTATCTACCCTGTTAATGATATCGACGCGCAGTTCGAACGTAATGGCGATAGATTGGTCTTTCAATTCCGCAACGAAATGACCATCAATTATGAACACTCGTTCCGCAACGTCGCTGCTCATGCCCTTAAGACATTTTATCCAGCAGGTGAGGGGAAAATTTACTTTAAGGAGTTTTTGTGTCGTAGAGTCGGTACAGTCTTCGCCAAGTTTACGCTTGTAGATACCGCAAAGTTACATCGTTCTGTTTTCCATAGGTCTGTTGATGGGAGTGCTTTTATTGATGCTATGGACGAAGCTTTTGAATTCAAACGGGACGCGGCTCTTTTTGGAGCAGAGCGTCAACTTTTAAGGGATAAAGCTTCGCTTAGTTTGTGGTTTCCCCATGCGCATAATAAGGTTGAGATTCCTGTTTTCCGCGCATCAATGATCGGTAAGAAGAAGCTCAACACGTCCAAAATGCTGGTCGATAAAGACTTCTTCTATACCGTTTTTAATCACGTTATGGGCTATCAGGAGAAAAATCTCAACTTTCAAGTTGTGAATAACTTTGTCGAGTCGGTCGTTAGTAGGGTAGTTATTAACGGTACGTCCGTGCGTGCAGAATGGCAGGTTAGTAAAGATCTTATTTGTGATATTTCCCTTACTTTGCTTTTGCTTGTTCAGTTGCGTCGTTTGGAAAATAAAGAAATAATAAGTAAAATACCTTTAGCTAGTGACGGTTTCTGGTCTACCGTCACTAATAATATGTGTAAGTTTTTTAGTAATTTATGGCCAGATTTTCTCTCTTTTAGTGTCGAGCACGGTTGGCTCCAAGTTATCAATTCTAAATTGGTGGTTAAAGCACCGTCGGAGTTTTTAACTTTCGACGATTATCTTGTAATGGAGTACCGTGGAAGTTCAGACGGCACTGACGTCGTCGATGTCGACGCATTGATTGAAAACAGTGATAAACTTTACGCTGAAGTCGGCAGGTTGGCCCAACTCTTCCCAAATCTGTCTGTTGATGTGGGGAAATTCAGAGAGTTCTGCAACAATGAGAGGTTGTCGCCTGAGCACGTTGCTAAAGTTTTTGAGGCGATACAAAATGATCAAGTTGGGCTGACAGTTACTGGTGGCGGTAGTTTGGAACAGAACCTGGTAGAGGCGTGCAAGGTTGCTCCTTCGGTGGATAACGTTGTGGTGTGTAGCGAGAATGCCCCCGAAAGGTTTTTGCATGATGGCATTGTTAGTGGCAAACTCGTTCTACCGCTCAGCGGTTCTACAGCAAGTGAGCACAACTTCTGGTTTACTGACGATGATGGTAACGTCACTGATCTTTCAGATTTCCATATGTTACCAGCTGATGTTATTGCCAAGCCTCAGAAAATGGCAATCTTTTATAAAGGTTCTACAAAGCAGCAGCAGATGCTGAACTTCTTGGACTATATGGCTGCGAGCTTGTGTGCTACCGTCAACAACTTGCAGAGAGCTCTGAAACAATGGTGGGCTGGAGATGTTAAGAACCCGCGTGATATCGGGGTTTTTGATTGCGCCAAAGGCAAGTGGATTACTGAACCGGGTAAAAAGAATCACACATGGGGCGTCGCTCAATGTCATGACATGTCGATGCGCATAGTGTGCGTGGACTACATTGATGGGAAGATAATACCCGATGAAAGGTGGAAGGCTGTGGCGGTGTCTTCGGAAACAAAAGTTTATTCTTATCTCAAGATGCTGCACAATTTGAGAGGAACCTTGCGTGATGGTACCCCTCCTGAGCCTCAATGCTTCACTACTCTGTTCGATGGTGTTCCAGGGTGTGGGAAGACATCGGAGATTCTCCGGTCTTGTGATTTCTCAAAAGATCTGGTTTTGACCCCGACTAGGGAAGCCGCCCAGATGATACGACGACGTGCTAATGAAGCAGACAAGACGAGAAGGGCGGACGTGCACAACGTTCGGACTATCGACTCGTTCATCATGAACCCGTCTCGCTGTACTTTCGACGTCGTCTGGATGGATGAAGGCTTAATGTGTCATCCCGGTCTGATTTGGTTTTGCGCAGTGATGTCCCAATGTTCACAACTCAAAGTCTTTGGGGACACGAGGCAAATACCTTTCTTACCTAGGGTTGACAATTTTGATTTCCCTGACAGGCTTAAGACTCTCGGAGTGGACAAGGTTGAAGGTCGTTCTGTTACTCACAGATGCCCTACGGATGTGACTGTTTGGTTATCTGACGTCTATAAACGTACAGTCACCACCACTTCGAGTATTGATAGGTCAGTTAGTGTTCGACTTGTTCCAGGAAAGACGTGCTTTGACGCTAAATCTTTCCCTTTGCCTGGAAAGGTCATCACTTTCACACAGGCGGAGAAGTTTGATTTGCAAAAGGCTGGATATGAGAACGTTAGTTGTTTAGACGATGCTAACAAGACTAATAATCTTGTCAACACCGTCCATGAAATTCAGGGAGAGACGTATCCAGTTGTTTCTCTTGTTCGGTTGAACCCTCACCCCATAGGTATTATTAAGAAAGATGGACCACATATCGTTGTAGCTCTTAGTAGGCATACGCAAGCCCTTGTGTATTATACTGTCACTGCGGATGCCGTTGTTAATACTATAGATAGAATCAAGAGTGTTAACCCTTTTCTACTTGATATGTATAAACACGTAGGTGGTACCGCATAGCAATTAACGTGTCGTCCATTGCAAAGTCGTTCTAACATGTTCATACCTACTGCTAAGTTGGGTGATCCATCTGATTTACAATGCTTTTATGACAGGATCTTACCCAACAATTCGACTGTGCTCAACGACTATGACAGTTTCACCTTGAGAGTGAGAGACATTCATCTCAACTTGGACGATTGTAGACTCGACCTGTCAAAGGACGATCCAGCAATCTGTCGGAGGCAGTCGGGTTATCTGCGTCCCGTTCTTAGAACCGGTACGGAGAGACCTCGACAGCCCGGGCTCATTGAGAATGTCTTAGCTCTTATCAAGAGAAATTTCAATGCACCTCATCTTCTTGGAACTGTAGACGTCGATGCAATGGCCGACACCGTAGTGGATAAGTTTTTTAAAATTTTCTTCCCTGATGGTCTTGATGATTGTAGTAATAGGTTGATGTCTGAAGAGAGTTTCAATGATTGGGCCGCTCAACAGTTGCCCTCTACTCTAAGTAAATTAGAAGTTTTCGATCATATAGATTTGCCTGCTGTAGATGCCTATACTCATATTATTAAAAGAAGACCAAAAATAAAGCTTGATGACTCCATTTGTTCCTCGTATCCGGCGTTGCAGACCATCGTTCACCATTCTAAAGAAATCAACGCCATCTTTGGGCCGATTTTCAAGGAACTGACTCGAGCCTTTCTTTCCAGAGTCGATGCTACTAAGTTCTTATTCTACACCAGAAAGACTCCGGAGGACATCGAAGAATTTTTCTCCGACCTTCCTTCGGTTGATCAGACAGATGTCTATGAGCTCGATATCAGTAAATATGACAAATCCCAGAATGAACTGCACTGCGCCGTCGAGTATGCGGTATGGAAACGTCTTGGTTTCCATGGGTTTTTGGCGAAGGTCTGGGAACAGGGTCATAGAAGAACAGTTCTCCGCGACTTTATCGCTGGGATTAAGGCCGTCATTTGGTTTCAAAGGAAGAGTGGAGACGTCACAACTTTCATAGGTAATACTATTATTAATGCCGTAGCTATGTCTACCCTCCTCCCGTTGGAAAAGTGTGTTAAAGCAGCCTTTTGTGGTGACGATAGTGTCGTCTACTTACCCAAGGGTACGGTAGTCGGAGATATTCAAACAAAGGCAAACCTACAGTGGAACTTTGAAGCAAAACTTTTTAAAAAACAATACGGGTACTTCTGCGGCAGGTTCATCCTACCACATAGTACTGGCTGTGTTGTTTACCCCGATGTTCTCAAGGTCATTGCCAAACTGGGCACCAAGGACGTCACCGATTGGACGCATCTGGAAGAGTTGAGGGTCAGTATGTGTGATACCTATAAGCAATTAGGTAATAGTGCTTATTTAGATTTGCTTAAGGTAGCCATGTCTGAGGTTTATCCCTCAGTCGTGGACTTGCGTTTTGTAGTGTGTACACTGTGGAGGTATATAACTGATAAAGTGTTATTTAGGAGTTTATTTTTGGATTTATAGTCGCCATGTCTAGTTTGTGTGTTTCTGACCCGGCAGTGCTGCTTAGTCCCGAACTACACTTGAAAGTGCCTCAACTCAAATCTCTGGTTCAATTCTGGAAGAAACCTTTCAAAACGTGTAGTATTTCAATGTCGGATGTCATAAAGGTTGCAAGTAGCAACCCGTTATCTATTGCTGTAGATTTTTCTAGTGCCATGCCATCGGGTCCGCGTAACTTCAAGTATGTTTATATTTTGGCTGTAGTTCTGACTGGGAGATGGCATTTGTCTGAGTCCTGCCCTGGCGGTGCCACGTTTGTTTTGTATGATAAGCGTCTTTGTGGTAGAGCCGAGGGTATTTATGGTAGCTTTTTCTCTAAAGTGAGTGCTTCGAAGTTTCAAGTTAGGTTTTCCGTTGGTCATTCTATGACTGTTAATGACTTGCTTAGGAATCCTTTGCATTTGTGTTTTTCTTTAGAGTCGGTACCGTGTCAAGAGGGGTACGAACCGCTCTCGGTGGAGGTCTCTAGTTTACAACTCTTTACAGACTGTATACTAGAAGAGTCTCTTTCCGCGAAGTTGGTTAAATATCCCGCTCTATGTACAGATAATATGTCTGTTATTAGTAATGTTGATGATGTCATTTTCAAATTCAATAGTGTTTTGAACGTCGACAACGTTCCTAACAGTGTTAAGAATGTTGTCAAGTGTAATAAAGTCTTTAAGGGTCGTAGAAGTAGAGGTAAATGGGTTGGGTCGCAAAATGAAGTGGTCGTTAAAGACGGTACGAATGTAACGCCTCATCGTTTAATTGCGAAAGATGCCTTACATCAACGTACAACCGAAAGACTTCGTTTACCTGACCAGGTCATGGGTAGACCCCCAGCGTCTGATACAGTTTCTGAGCGATATGCAGACTCAGGCTTTCCAAGCACAGCAGTCTCGCACACAACTTCTGAACGAACTGTCGACGATGGTGGTCTACGGTCCGACCAAATCGGACCGTTTCCCTATAGATACGTACCTTATTAATATTACTAAAGGTGGTCTAAGTGCTTACTGGTTCGGTTTGACTCAGTCTGCGGATACAAAAGATCGCGTTTTCGAAGTTAGTGAAGCACGCGCTGTAACTAACGCTGAGTCTAAGCTGGCAACGCAACGTGTTGACGATGCCACCGTAGCTATAAGAAATGCTATTAAGAGTACTCTTAGTTATTTAATAGCTGGAGAAGATATTTATAGCAGGACGTCATTTGAAGCGGCGCTTGGCTGGATATGGCAGGAAAACCTTCCACCTCCACCTCAAACCGCTGCAAGTGACAGTCGTACTTAAGGATCTTTCTCAAAGTGTTTTTCCATTCGCTCTGTTAAATGGAACGTGGGTGTAACGATATACACCACAGTTTACCAGTCCTGTATAATCGAACTGGTTGTCGTCTGGAACTGCTACGTTAACGCCTTGTGTAGGTATTGCGTTGGCGACGTAAAACAGCAGGGTGGTTCGAATCCACCCTTACCCCGGGTAGGGGCCCA
| 7,403
|
KY348772.1
|
Rattail cactus necrosis-associated virus
|
Salgado,H., De La Torre Almaraz,R.
|
UBIPRO FES Iztacala UNAM, Laboratorio de Microbiologia
|
Mexico
|
2017-11-13
|
Noptunero-Mex
|
Rattail cactus necrosis-associated virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,459
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Opuntia albicarpa (nom. inval.)
| null |
2016-02
| null | null |
Rattail cactus necrosis-associated virus isolate Noptunero-Mex, complete genome
|
CTTTGTTGGATACATTGACAACAATTTACATAAACACACACACATTTCAAGTTCACAATGTCACAATTACAAAACTATGTTAACAAAATCAACACCGGTGCTGGTGTCTCATCCCAGCACTTGTTATCCAACCTTGCTGAGAGAGTAGTCTATGATCAGGCTCTCGAAAGCACGGAAGCTCAAAAGAGGCGCCCGAAGTATCACTTCTCAAAAGTGGTAACTCCGGAGCAGCAAAATCTGATCACCGGTGCATACCCTGAATTCTCTATCAATTTCACCGGGACTTCTGCTTCTGTCCATGCTGTCGCTGGTGGACTGAGAGGTTTGGAATTAGAACTTCTAATGACGCAGATTCCTTTCGGTGCCGCATGCTTTGATATTGGTGGTAACTATGTTCGACACCTACTCAAAGGTCGCTCCTATGTGCACTGTTGTAACCCTGTTCTAAGTGTTCGTGACGGAGCCAGGTACGAATCGTACCGCGATGAATTGCGGAAGGTTTCGGCCCAAGGGGCCCCAGTCGCAGGGTCTTGGGGGGTGCCAGGGCAAGGTGCTTCTTGTGTGCGTACTCGTTCTTTACAGCCGTATCAAGTTGCTGCTTTCGAAAGGTACTCTGTCAATCCACATGCTGTCGTTTGTGACGACACTTTCCAGACTTGCAGTTTTCCGCCTCCGGCTCATGGTTGTACGTATGCCGTTTTATTGCACAGTTTGTATGATATTCCTGTTCATGAATTAGGTCCTGCGTTACTTAGGAAGAACGTCCATGTTGCTTATGCAGCTTTTCATCTTTCCGAAGAGATGTTGTGGAAAGACGCCGACGGTATCTACCCTGTCAATGATATCGACGCGCAATTTGAACGTAGTGGTGACAGATTGGTCTTTCAGTTTCGCAACGAAATGACCATCAACTATGAGCATTCTTTCCGCAATGTCGCTGCCCATGCTCTTAAGACGTTCTATCCCGCGGGGGAGGGTAAAATTTATTTTAAAGAGTTTTTGTGTCGCAGAGTTGGTACAGTTTTCGCAAAGTTCACACTTGTGGATACAGCGAAAATGCATCGCTCTGTTTTCCATAAGTCCGTTGATGGGAGTGCTTTCATTAGTGCTATGGACGAGGCTTTTGAATTTAAACGAGACGCTGCTCTATTTGGGGCCGAACGTCAGCTCTTAAGAGACAAAGCTTCGCTCAGTTTATGGTTTCCCCATGCACATAACAAAGTTGAGATTCCTGTTTTCCGCGCTTCAATGATCGGTAAGAAGAAACTTAACACGTCTAAAATGCTGGTAGACAAAGATTTCTTCTATACCGTTTTTAATCATATTATGGGTTATCAAGAGAAAAATCTCAACTTCCAAGTTGTTAATAATTTCGTTGAGTCGGTTGTTAGTAGAGTAGTTATTAACGGTACTTCCGTGCGTGCTGAGTGGCAGGTCAGTAAAGACCTTATATGTGATATTTCCCTTACTTTGCTTTTGCTTGTACAGTTGCGTCGTTTGGAAAATAAAGAAATCATTAGTAAGGTTCCTTTAGCTAGTGACGGTTTCTGGTCCACCGTCACTAATAATATGTGCAAATTTTTCAGTGATTTATGGCCAGACTTTCTTTCTTTTAGTGTGGAACATGGATGGCTCCAAGTCATCAACTCCAAATTAGTGGTTAAAGCACCGTCGGAGTTTCTTACTTTCGACGATTATCTTGTCATGGAGTACCGTGGTAGTTCTGACGGCACTGATGTCGTTGATGTCGACACTCTGATTGAGAATAGTGACAAACTATATGCAGAGGTCGGCAGGTTGGCTCAAACTTTCCCAAATCTATCTGTTGATGTTGGGAAGTTTAGAGAATTTTGCAACAATGAGAGGTTGTCGCCTGAGCATGTCGCTAAAGTTTTCGAGGCGATACAGAATGACCAGGTTGGTTTGACGGTCACCGGTAACGGTAGTGTTGAACAGAACCTTGCTAAGGCATGCGAGGTTGCTCCTCCAATCGATAACGTTGTAGCGTGTAGCGAGAATGCCCCCGAAAGGTTTTTGCATGATGGCATTGTTAGTGGTAAACTCGTTCTACCGCTCAGCGGTTCTACTGCGAGTGAGCACAACTTTTGGTTTACTGATGATGATGGGAACGTTACCGACCTCTCCGATTTTCACATGTTGCCTGCAGACGTTATTGCTAAACCACAAAAGATGGCAATTTTCTATAAAGGTTCTACCAAACAGCAGCAAATGCTAAACTTTCTGGATTATATGGCTGCGAGTTTGTGCGCCACTGTCAATAATCTGCAAAGGGCTCTCAAGCAGTGGTGGGCAGGCGATGTCAGAAACCCTCGTGACGTTGGGGTTTTTGATTGCGTTAAGGGAAAATGGATTACTGAACCGGGCAAAAAGAATCACACATGGGGCGTCGCACAATGTCATGACATGTCGATGCGTATAGTGTGCGTGGATTACGTTGACGGGAAAATTGTGCCCGATGAAAGATGGAAGGCTGTGGCAGTGTCTTCGGAGACAAAGGTTTACTCTTATCTTAAGATGCTGCATAATTTGAGAGGAACTTTACGTGATGGTAACCCTCCTGAGCCGCAATGCTTTACCACGCTGTTTGATGGTGTACCAGGTTGTGGAAAGACGTCAGAGATCCTCCGATCGTGTGATTTTTCAAAAGATCTTGTTTTGACACCGACAAGGGAAGCAGCCCAGATGATACGACGACGTGCTAATGAAGCCGACAAGACGAGAAGGGCAGACGTACATAACGTCCGGACCATTGATTCTTTTATAATGAATCCTTCTCGTAGCACGTTCGATGTCGTTTGGGTTGATGAAGGTTTAATGTGTCACCCTGGTCTGATCTGGTTTTGCGCAGTGATGTCTCAATGCTCCCAACTCAAAGTTTTTGGGGACACACGGCAAATACCGTTTCTGCCTAGGGTTGACAATTTTGATTTCCCCGATAGGCTTAAGACTCTAGGAGTGGACAAGGTGGAAGGTCGTTCAGTCACTCACAGATGCCCCACAGATGTGACGGCCTGGTTATCTAATGTTTACAAACGTACTGTCACCACTACCTCGAGCATTGACAGGTCTGTCGGTGTCCGACTTGTGCCTGGGAAAACGTGTTTTGATGCAAAATCTTTACCTTTGCCCGGGAAAGTTATCACCTTCACACAAGCTGAGAAATTTGATTTGCAGAAGGCGGGATACGAAGACGTCAGTTGTCTGGATGATGTCAATAAGACTAATTGTCTCGTGAACACTGTTCATGAGATTCAAGGGGAGACGTATCCTGTTGTTTCTCTTGTTCGTCTGAATCCTCACCCTATTAGTATTATTAAAAAGGATGGACCTCACGTTGTTGTGGCTCTTAGTAGGCATACGCAAGCACTTGTGTATTATACTGTTACAGCGGATGCCGTTGTAGATACTATAGATAGAATTAAGAGTGTCAATCCCTTTTTATTAGACATGTACAAACATGTAGGTGGTACCGCATAGCAATTAACGTGTCGTCCATTGCAGAGTCGTTCCAATATGTTCTTACCTACGGCTAAGTTGGGTGATCCTTCCGATTTGCAATGTTTTTATGATAGAATTCTACCCAACAATTCAACCGTGCTCAATGACTATGATAGTTTCACCTTGAGAGTCAAAGACATCCATCTTAATTTGGACGATTGCAGGCTCGACTTGTCAAAAGACGATCCTGCGATTTGTCGAAGGCAATCTGGCTATCTTCGGCCCGTTCTTAGAACCGGTACGGAGAAACCCCGACAGCCTGGGCTCATCGAGAATGTCTTAGCTCTCATCAAGAGAAACTTCAATGCTCCTCATCTGCTTGGTACTGTGGACGTTGATGCAATGGCCGACACCGTAGTTGATAGGTTTTTTAAAATTTTTTTCCCAGAAGGTTTGGATGACTGTAGTAATAGGTTAATGTCTGAAGAGAGCTTTAATGATTGGGCCGCTCAACAGCTGCCCTCCACCTTAAATAAGTTAGAGGTTTTTGATCATATAGATTTGCCTGCTATAGATGCTTATACCCATATTATCAAAAGAAGACCAAAAATAAAGCTTGATGACTCTATTTGTTCCTCTTACCCGGCGTTGCAAACCATTGTTTATCATTCTAAAGAAATCAACGCCATTTTCGGGCCGATCTTCAAAGAGTTGACTAGAGCCTTCTTGTCTAGAGTTGATGCTACCAGGTTCTTGTTCTACACTAGAAAGACTCCGGAAGATATTGAGGAATTCTTCTCTAATCTTCCCCAAGTCGATCAGACAGATGTTTACGAACTTGACATCAGCAAATATGATAAATCCCAGAATGAGTTACATTGTGCTGTTGAGTACGCAGTGTGGAAACGTCTGGGTTTCCATGGGTTCTTGGCCAAAGTTTGGGAACAGGGTCACAGGAGGACAGTCCTACGCGATTTTATCGCCGGGATCAAGGCCGTCATTTGGTTTCAGAGGAAAAGTGGAGACGTCACAACTTTTATAGGTAATACTATTATTAATGCAGTAGCTATGTCCACTCTCCTTCCGTTGGAAAAATGTGTGAAAGCAGCCTTCTGCGGTGACGACAGCGTCGTCTACCTACCCAAGGGTACGGTAGTTGGCGATATTCAAACTAAGGCAAATTTACAATGGAACTTTGAGGCAAAGCTTTTCAAAAAACACTACGGGTACTTTTGTGGTAGGTTTATCTTACCACATAGTACCGGTTGTGTTGTTTACCCTGATGTCCTCAAAGTAATCGCCAAATTGGGTACTAAAGATGTCACCGACTGGAAGCATTTGGAGGAGGTGAGGGTTAGTATGTGTGATACTTATAAGCAATTAGGTAATAGTGCTTATTTAGATTTGCTTAAAGTAGCCATGTCTGAGGTTTATCCCTCGGTCGTTGACTTGCGTTTTGTAGTGTGTACATTGTGGAGGTATATTACTGATAAAGTGTTGTTTAAAAGTTTGTTTTTGGAGTTATAGTAGTTATGTCTAGTTTGTGTGTTTCTGATCCGGCGACGTTACTTAACCCTGAACTGCATTTGAAAGTACCTCAACTTAAGTCTCTGGTTCAGTTCTGGAAGAGGCCTTTCAAAACGTGCAGTATTTCAATGTCGGATGTCATTAAGGTAGCGAGTAGTAGTCCGTTGTCTATCGCTGTTGATTTTTCGAGTGCTATGCCATCTAGTCCACGTAATTTTAAGTATGTTTATATCTTAGCTGTGGTCTTAACTGGACGATGGCATTTGTCCGAGTCATGCCCCGGCGGTGCCACGTTTGTTTTGTATGATAGGCGTCTTTGTGGTAGAGCCGAGGGTATTTACGGTAGTTTCTTTTCTAAAGTAAGCGCTTCAAAGTTTCAAGTTAGGTTTTCTGTCGGTCATTCTATGACTGTTAACGATTTACTTAGAAATCCTTTACATTTGTGTTTTTCTTTAGAGTCAGTACCGTGTCAAGAAGGGTATGAACCGCTTTCGGTTGAGGTCTCTAGTTTACAACTTTTCACAGATTGTATACTCGAAGAATCTCTTTCCGCGAAGCTGGTAAAGTATCCTGCCTTATGTACAGACAATATGTCTGTCATTAGTAATGTTGATGATGTTATTTTCAAGTTTAATAGCGTCTTGAATGTCGACGGTGTTCCTAACTGTGTTAGGAACGTTGTCAAATGTAATAAAGTCTTTAAAGGTCGTAGGAATAGAGGTAAATGGGTCGGGTCCCAAAATGAAGTGGTCGTTAAAGACGGTACGAATGTAGCGTCTCATCGTTTAATTACGAAAGATGCCTTACATCAACGTACAACCGAAAGACTTCGTTTACCTGACCAGGTCATGGGTAGATCCCCAGCGTCTAATACAGTTTCTGAGCGATATGCAGACTCAGGCTTTTCAAGCCCAGCAGTCCCGCACACAACTTCTGAACGAACTGTCGACGATGGTGGTCTACGGTCCGACCAAGTCGGATCGTTTCCCTATAGATACGTATCTAATTAATATTACTAAAGGTGGTCTGAGTGCTTACTGGTTCGGCTTGACTCAGTCTGCTGATACAAAAGATCGCGTTTTCGAAGTTAGTGAAGCACGCGCTGTAACTAACGCTGAGTCTAAGTTGGCAACGCAACGTGTTGATGATGCCACCGTGGCTATAAGGAATGCTATTAAGAGTACTCTTAGTTATTTAATAGCTGGAGAAGATATTTATAGTAGGACGTCATTCGAGGCAGCACTTGGTTGGATATGGCAGGAAAACCTTCCACCTCCACCGAGTACCGCAGCGAGTAGCGGCCGGTAATATTATTACTTCTCAAAGTGTTTTTCCATTCGCTCTGTTAAATGGAACGTGGGTGTAACGATATACACCACAGTTTGCCAGTCCTGTTTAATCGAACTGGTTGTCGTCTGGAACTGCTACGTTAACGCCTTGTGTAGGTATTACGTTGGCGACGTAAAACAGCAG
| 73,885
|
KY348773.1
|
Rattail cactus necrosis-associated virus
|
Salgado,H., De La Torre Almaraz,R.
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UBIPRO FES Iztacala UNAM, Laboratorio de Microbiologia
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Mexico
|
2017-11-13
|
parviMex-1
|
Rattail cactus necrosis-associated virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,474
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Opuntia parviclada
| null |
2016-02-10
| null | null |
Rattail cactus necrosis-associated virus isolate parviMex-1, complete genome
|
GTTACATTGACAACAATTTACATAAACACACACACATTTTCATTTCACAATGTCACAATTACAAAACTACGTTAACAAAATCAACACTGGTGCTGGAGTTTCATCCCAGCACCTTTTATCCAACCTTGCTGAGAGGGTAGTCTATGATCAGGCTCTCGAAAGCACGGAAGCTCAAAAAAGGCGTCCGAAGTATCACTTTTCTAAGGTGGTAACTCCGGAACAGCAAAATCTGATCACCGGTGCGTACCCCGAATTTTCTATCAATTTCACCGGGACTTCTGCTTCTGTCCATGCTGTTGCTGGTGGGCTTCGAGGTTTGGAATTAGAGCTTTTAATGACACAAATTCCTTTCGGTGCCGCATGCTTCGATATCGGTGGTAACTATGTTCGGCATTTGCTCAAAGGTCGCTCCTATGTGCATTGTTGCAACCCTGTTCTAAGCGTTCGTGATGGTGCAAGGTATGAATCTTACCGCGATGAACTGCGGAAAGTTTCAGCCCAAGGAGCACCAGTCGCTGGGTCATGGGGTGTTCCGGGGCAGAGCGCCGCGTGTGTGCGCACTCGTTCTTTACAACCGTATCAAGTTGCCGCTTTCGAAAGGTATTCTGTTAATCCTCATGCCGTCGTCTGTGATGACACTTTCCAGACTTGCAGTTTCCCACCTCCGACTCATGGTTGTACATATGCTGTTTTATTACATAGTTTGTATGATATCCCCGTGCATGAACTAGGTCCCGCGTTACTCAGAAAGAATGTCCACGTTGCATACGCAGCTTTCCATCTATCCGAAGAGATGTTGTGGAAAGACGCAGACGGTATCTACCCTGTCAACGATATCGATGCGCAGTTTGAGCGTAATGGTGATAGGCTGGTCTTCCAATTTCGCAATGAAATGACCATCAATTACGAACATTCGTTCCGTAATGTCGCTGCTCATGCTCTGAAGACGTTCTATCCCGCGGGAGAGGGGAAAATCTATTTTAAAGAGTTTTTGTGTCGTAGAGTAGGTACAGTCTTTGCTAAGTTTACTCTTGTAGATACTGCTAAAATGCATCGTTCTGTTTTTCATAAGTCTGTAGATGGGAGTGCTTTTATCGACGCTATGGACGAGGCTTTCGAATTTAAACGAGACGCGGCTCTTTTCGGAGCTGAGCGTCAACTTTTGAGAGACAAAGCCTCGCTCAGTCTGTGGTTTCCTAACGCAAATAATAAAGTTGAGATTCCTGTTTTCCGTGCCTCGATGATCGGTAAGAAGAAACTTAATACTTCCAAAATGTTAGTCGATAAGGACTTCTTCTATACCGTCTTCAACCATGTTATGGGTTACCAAGAGAAAAATCTCAACTTCCAAGTTGTTAATAATTTTGTTGAGTCGGTCGTCAGTAGGGTAGTTATTAATGGCACATCCGTCCGTGCGGAGTGGCAAGTTAGTAAAGATCTTATTTGTGATATTTCTTTAACTTTGCTTTTGCTTGTGCAGTTGCGTCGTTTGGAAAATAAAGAAATTATTAGTAAAGTTCCTCTTGCTAGTGATGGCTTCTGGTCCACCGTCACTAACAACATGTGCAAATTTTTTAGTGGTTTGTGGCCAGATTTCCTTTCTTTTAGTGTGGAACATGGATGGCTTCAGGTCATCAACTCCAAACTGGTGGTCAAAGCGCCGTCGGAGTTTTTAACTTTTGACGACTATCTTGTTATGGAGTATCGCGGAAGCTCAGACGGCACTGATGTCGTCGACGTCGACACTCTGATTGAGAACAGTGATAAACTTTACTCAGAGGTCGGTAGGTTAGCCCAAATTTTCCCAAATTTGTCCGTTGATGTGGGGAAATTTAGAGACTTCTGCAACAATGAGAGGTTATCGCCCGAGCACGTTGCTAAAGTTTTTGAGGCGATACAAAATGATCAGGTTGGCTTGACGGTTACTGGCAGTGGTAGTCTAGAACAGAACCTGGCAAAGGCATGCGAGGTTGCTCCTCCGATCGATAATGTTGTAGTGTGCAGCGAGAGTGCCTCCGAAAGGTTTTTGCATGATGGCATTGTTAACGGCAAACTCGTTCTGCCACTCAGCGGTTCTACCGCGAGCGAGCACAACTTTTGGTTCACTGATGAGGATGGTAATGCTACTGATCTCTCTGACTTCCACATGTTACCGGCGGATGTCATTGCCAAACCTCAAAAGATGGCACTTTTCTACAAAGGTTCAACTAAGCAGCAACAGATGCTTAACTTCTTGGATTATATGGCTGCAAGTTTGTGTGCCACTGTTAATAATCTTCAGAGAGCTCTCAAGCAATGGTGGGCTGGTGATGTGAGGAATCCACGTGATGTTGGGGTTTTTGACTGCATTAAAGGCAAGTGGATTACCGAACCAGGCAAGAAGAATCATACGTGGGGCGTCGCTCAATGTCATGACATGTCGATGCGCATAGTCTGCGTTGATTATGTCGATGGAAAGATAGTGCCCGATGAAAGGTGGAAAGCTGTGGCAGTGTCCTCAGAAACAAAGGTTTATTCATATCTTAAGATGCTGCACAATTTGAGAGGGACTCTACATGATGGTAGCCCTCCTGAGCCTCGATGTTTTACTACATTGTTTGATGGTGTTCCTGGGTGTGGGAAAACGTCTGAAATCCTCCGGTCCTGTGATTTCTCTAAGGACCTTGTCTTGACGCCGACCAGGGAAGCCGCCCAGATGATACGGCGACGTGCTAATGAAGCTGACAAAACGAGACGCGCGGATGTGCATAACGTCCGAACAATTGATTCTTTCATCATGAACCCGTCTCGTTGTACTTTTGACACCGTCTGGGTTGACGAAGGTTTAATGTGTCATCCGGGTCTGATATGGTTTTGCGCAGTAATGTCCCAGTGTTCACAACTCAAAGTCTTTGGGGACACTAGGCAAATACCATTCTTACCCAGGGTCGACAATTTTGATTTCCCTGAAAGCCTCAAGACTCTTGGAGTAGATAAAGTGGAAGGTCGTTCAGTCACTCATAGGTGCCCTACGGATGTGACCGCCTGGTTATCAGACGTTTACAAACGTACGGTCACTACTACTTCAAGTGTTGATCGTTCTGTGAGTGTGCGGTTAGTCCCAGGGAGGACGTGTTTTGATGCTAAATCTTTACCCTTACCTGGAAAGGTCATCACGTTTACACAGGCGGAGAAATTTGATTTACAGAAAGCGGGATACGAGGACGTTAGTTGTCTGGACGATGTTAATAAGGCTAGCAGCCTTGTCAACACTGTCCATGAAATCCAAGGAGAGACGTATCCGGTTGTTTCCCTTGTCCGGTTGAATCCTCACCCTGTAAGTATTATTAAGAAAGACGGACCGCATGTAGTTGTAGCTCTCAGTAGGCATACGCAGGCTCTTGTGTATTATACTGTTACCGCGGATGCTGTTGTGAATACTATAGATAGAATTAAGAGTGTTAATCCCTTTCTACTAGATATGTACAAACATGTAGGTGGTACCGCATAGCAATTAACGTGTCGTCCATTGCAAAGTCGTTCGAATATGGTTTTACCTACTGCTAAGTTGGGCGATCCATCTGATTTACAGCATTTCTATGATAGAATTCTGCCCAACAATTCAACTGTGCTTAATGATTACGATAGTTTCACTCTGAGGGTAAGAGACATTCATCTCCATTTAGACGATTGCAGGCTAGATCTGTCGAAAGACGACCCAGCAATCTGTCGTAGGCAGTCGGGCTATCTCCGTCCCGTTCTTAGGACCGGCGCGGAAAAGCCGCGACAACCTGGGCTTATTGAGAATGTCTTGGCTCTCATCAAGCGAAACTTCAATGCTCCTCACCTGCTTGGAACCGTGGACGTCGATGCAATGGCCGACACCGTAGTTGGTAAGTTTTTTGAAATTTTCTTTCCAGATGGTTTAGATGATTGTAGTAATAGATTAATGTCTGAAGAAAGTTTTAATGATTGGGCTGCTCAACAGCTACCCTCTACTTTAAATAAGTTAGAAGTTTTCGATCACATAGATCTACCTGCTATAGATGCCTATACGCATATTATTAAAAGAAGACCAAAAATAAAGTTAGATGACTCCATTTGTTCCTCTTATCCGGCGTTGCAGACCATCGTTTATCATTCTAAAGAAATCAACGCCATTTTCGGGCCGATCTTCAAGGAACTCACCAGATCCTTTTTGTCCAGAGTCGATGCTACCAAGTTCTTGTTTTATACTAGGAAGACTCCAGAGGACATAGAGGAATTCTTTTCAGATCTTCCTCCGGTCGATCAGACTGATGTTTATGAGCTTGACATAAGCAAATATGACAAATCCCAGAACGAATTGCATTGTGCTATAGAGTATGCAGTATGGAAACGGCTTGGTTTCCATGGGTTCTTGGCTAAAGTCTGGGAACAAGGTCACAGGAGGACAGTTCTCCGCGATTTTATCGCTGGGATCAAGGCCGTCATTTGGTTTCAAAGGAAAAGTGGGGATGTCACAACTTTTATAGGTAATACTATTATTAATGCTGTAGCTATGTCTACCCTCCTTCCGTTGGAAAAGTGTGTCAAGGCAGCTTTTTGCGGTGACGATAGCGTCGTCTACTTACCCAAGGGTACTGTAGTCGGCGACATTCAAACTAAGGCGAACCTCCAGTGGAACTTTGAAGCAAAACTTTTCAAAAAACATTACGGGTACTTTTGCGGTAGGTTTATCTTACCACATAGTACCGGTTGTATTGTTTATCCCGATGTTCTTAAGGTGATTGCCAAACTGGGTACCAAAGACGTCACTGACTGGGCGCATTTGGAAGAGGTCAGGGTTAGTATGTGTGATACTTACAAGCAATTGGGTAATAGTGCTTATTTAGATTTGCTTAAGGTAGCCATGTCTGAGGTTTATCCCTCAGTCACTGACTTGCGTTTTGTTGTGTGTACATTGTGGAGGTATATTACTGATAAAGTGTTGTTTAAAAGTTTGTTCTTGGATTGTTAGTCGTTATGTCTAGTTTGTGTGT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| 73,886
|
KU854932.1
|
Rattail cactus necrosis-associated virus
|
Salgado Ortiz,H., De La Torre,R.A., Campos Contreras,J.E., Padilla Noriega,L., Sanchez-Navarro,J.A., Pallas,V.
|
Ubipro Fes Iztacala Unam, Laboratorio de Microbiologia
|
Mexico
|
2016-05-31
|
nopal verdura-2
|
Rattail cactus necrosis-associated virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,460
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Opuntia ficus-indica
| null |
2015-06-15
| null | null |
Rattail cactus necrosis-associated virus isolate nopal verdura-2, complete genome
|
CTTTGTTGGTTACATTGACAACAATTTACATAAACACACACACATTTCAAGTTCACAATGTCACAATTACAAAACTATGTTAACAAAATCAACACCGGTGCTGGTGTCTCATCCCAGCACTTGTTATCCAACCTTGCTGAGAGAGTAGTCTATGATCAGGCTCTCGAAAGCACGGAAGCTCAAAAGAGGCGCCCGAAGTATCACTTCTCAAAAGTGGTAACTCCGGAGCAGCAAAATCTGATCACCGGTGCATACCCTGAATTCTCTATCAATTTCACCGGGACTTCTGCTTCTGTCCATGCTGTCGCTGGTGGACTGAGAGGTTTGGAATTAGAACTTCTAATGACGCAGATTCCTTTCGGTGCCGCATGCTTTGATATTGGTGGTAACTATGTTCGACACCTACTCAAAGGTCGCTCCTATGTGCACTGTTGTAACCCTGTTCTAAGTGTTCGTGACGGAGCCAGGTACGAATCGTACCGCGATGAATTGCGGAAGGTTTCGGCCCAAGGGGCCCCAGTCGCAGGGTCTTGGGGGGTGCCAGGGCAAGGTGCTTCTTGTGTGCGTACTCGTTCTTTACAGCCGTATCAAGTTGCTGCTTTCGAAAGGTACTCTGTCAATCCACATGCTGTCGTTTGTGACGACACTTTCCAGACTTGCAGTTTTCCGCCTCCGGCTCATGGTTGTACGTATGCCGTTTTATTGCACAGTTTGTATGATATTCCTGTTCATGAATTAGGTCCTGCGTTACTTAGGAAGAACGTCCATGTTGCTTATGCAGCTTTTCATCTTTCCGAAGAGATGTTGTGGAAAGACGCCGACGGTATCTACCCTGTCAATGATATCGACGCGCAATTTGAACGTAGTGGTGACAGATTGGTCTTTCAGTTTCGCAACGAAATGACCATCAACTATGAGCATTCTTTCCGCAATGTCGCTGCCCATGCTCTTAAGACGTTCTATCCCGCGGGGGAGGGTAAAATTTATTTTAAAGAGTTTTTGTGTCGCAGAGTTGGTACAGTTTTCGCAAAGTTCACACTTGTGGATACAGCGAAAATGCATCGCTCTGTTTTCCATAAGTCCGTTGATGGGAGTGCTTTCATTAGTGCTATGGACGAGGCTTTTGAATTTAAACGAGACGCTGCTCTATTTGGGGCCGAACGTCAGCTCTTAAGAGACAAAGCTTCGCTCAGTTTATGGTTTCCCCATGCACATAACAAAGTTGAGATTCCTGTTTTCCGCGCTTCAATGATCGGTAAGAAGAAACTTAACACGTCTAAAATGCTGGTAGACAAAGATTTCTTCTATACCGTTTTTAATCATATTATGGGTTATCAAGAGAAAAATCTCAACTTCCAAGTTGTTAATAATTTCGTTGAGTCGGTTGTTAGTAGAGTAGTTATTAACGGTACTTCCGTGCGTGCTGAGTGGCAGGTCAGTAAAGACCTTATATGTGATATTTCCCTTACTTTGCTTTTGCTTGTACAGTTGCGTCGTTTGGAAAATAAAGAAATCATTAGTAAGGTTCCTTTAGCTAGTGACGGTTTCTGGTCCACCGTCACTAATAATATGTGCAAATTTTTCAGTGATTTATGGCCAGACTTTCTTTCTTTTAGTGTGGAACATGGATGGCTCCAAGTCATCAACTCCAAATTAGTGGTTAAAGCACCGTCGGAGTTTCTTACTTTCGACGATTATCTTGTCATGGAGTACCGTGGTAGTTCTGACGGCACTGATGTCGTTGATGTCGACACTCTGATTGAGAATAGTGACAAACTATATGCAGAGGTCGGCAGGTTGGCCAAACCTTCCCCAAATCTATCTGTTGATGTTGGGAAGTTTAGAGAATTTTGCAACAATGAGAGGTTGTCGCCTGAGCATGTCGCTAAAGTTTTCGAGGCGATACAGAATGACCAGGTTGGTTTGACGGTCACCGGTAACGGTAGTGTTGAACAGAACCTTGCTAAGGCATGCGAGGTTGCTCCTCCAATCGATAACGTTGTAGCGTGTAGCGAGAATGCCCCCGAAAGGTTTTTGCATGATGGCATTGTTAGTGGTAAACTCGTTCTACCGCTCAGCGGTTCTACTGCGAGTGAGCACAACTTTTGGTTTACTGATGATGATGGGAACGTTACCGACCTCTCCGATTTTCACATGTTGCCTGCAGACGTTATTGCTAAACCACAAAAGATGGCAATTTTCTATAAAGGTTCTACCAAACAGCAGCAAATGCTAAACTTTCTGGATTATATGGCTGCGAGTTTGTGCGCCACTGTCAATAATCTGCAAAGGGCTCTCAAGCAGTGGTGGGCAGGCGATGTCAGAAACCCTCGTGACGTTGGGGTTTTTGATTGCGTTAAGGGAAAATGGATTACTGAACCGGGCAAAAAGAATCACACATGGGGCGTCGCACAATGTCATGACATGTCGATGCGTATAGTGTGCGTGGATTACGTTGACGGGAAAATTGTGCCCGATGAAAGATGGAAGGCTGTGGCAGTGTCTTCGGAGACAAAGGTTTACTCTTATCTTAAGATGCTGCATAATTTGAGAGGAACTTTACGTGATGGTAACCCTCCTGAGCCGCAATGCTTTACCACGCTGTTTGATGGTGTACCAGGTTGTGGAAAGACGTCAGAGATCCTCCGATCGTGTGATTTTTCAAAAGATCTTGTTTTGACACCGACAAGGGAAGCAGCCCAGATGATACGACGACGTGCTAATGAAGCCGACAAGACGAGAAGGGCAGACGTACATAACGTCCGGACCATTGATTCTTTTATAATGAATCCTTCTCGTAGCACGTTCGATGTCGTTTGGGTTGATGAAGGTTTAATGTGTCACCCTGGTCTGATCTGGTTTTGCGCAGTGATGTCTCAATGCTCCCAACTCAAAGTTTTTGGGGACACACGGCAAATACCGTTTCTGCCTAGGGTTGACAATTTTGATTTCCCCGATAGGCTTAAGACTCTAGGAGTGGACAAGGTGGAAGGTCGTTCAGTCACTCACAGATGCCCCACAGATGTGACGGCCTGGTTATCTAATGTTTACAAACGTACTGTCACCACTACCTCGAGCATTGACAGGTCTGTCGGTGTCCGACTTGTGCCTGGGAAAACGTGTTTTGATGCAAAATCTTTACCTTTGCCCGGGAAAGTTATCACCTTCACACAAGCTGAGAAATTTGATTTGCAGAAGGCGGGATACGAAGACGTCAGTTGTCTGGATGATGTCAATAAGACTAATTGTCTCGTGAACACTGTTCATGAGATTCAAGGGGAGACGTATCCTGTTGTTTCTCTTGTTCGTCTGAATCCTCACCCTATTAGTATTATTAAAAAGGATGGACCTCACGTTGTTGTGGCTCTTAGTAGGCATACGCAAGCACTTGTGTATTATACTGTTACAGCGGATGCCGTTGTAGATACTATAGATAGAATTAAGAGTGTCAATCCCTTTTTATTAGACATGTACAAACATGTAGGTGGTACCGCATAGCAATTAACGTGTCGTCCATTGCAGAGTCGTTCCAATATGTTCTTACCTACGGCTAAGTTGGGTGATCCTTCCGATTTGCAATGTTTTTATGATAGAATTCTACCCAACAATTCAACCGTGCTCAATGACTATGATAGTTTCACCTTGAGAGTCAAAGACATCCATCTTAATTTGGACGATTGCAGGCTCGACTTGTCAAAAGACGATCCTGCGATTTGTCGAAGGCAATCTGGCTATCTTCGGCCCGTTCTTAGAACCGGTACGGAGAAACCCCGACAGCCTGGGCTCATCGAGAATGTCTTAGCTCTCATCAAGAGAAACTTCAATGCTCCTCATCTGCTTGGTACTGTGGACGTTGATGCAATGGCCGACACCGTAGTTGATAGGTTTTTTAAAATTTTTTTCCCAGAAGGTTTGGATGACTGTAGTAATAGGTTAATGTCTGAAGAGAGCTTTAATGATTGGGCCGCTCAACAGCTGCCCTCCACCTTAAATAAGTTAGAGGTTTTTGATCATATAGATTTGCCTGCTATAGATGCTTATACCCATATTATCAAAAGAAGACCAAAAATAAAGCTTGATGACTCTATTTGTTCCTCTTACCCGGCGTTGCAAACCATTGTTTATCATTCTAAAGAAATCAACGCCATTTTCGGGCCGATCTTCAAAGAGTTGACTAGAGCCTTCTTGTCTAGAGTTGATGCTACCAGGTTCTTGTTCTACACTAGAAAGACTCCGGAAGATATTGAGGAATTCTTCTCTAATCTTCCCCAAGTCGATCAGACAGATGTTTACGAACTTGACATCAGCAAATATGATAAATCCCAGAATGAGTTACATTGTGCTGTTGAGTACGCAGTGTGGAAACGTCTGGGTTTCCATGGGTTCTTGGCCAAAGTTTGGGAACAGGGTCACAGGAGGACAGTCCTACGCGATTTTATCGCCGGGATCAAGGCCGTCATTTGGTTTCAGAGGAAAAGTGGAGACGTCACAACTTTTATAGGTAATACTATTATTAATGCAGTAGCTATGTCCACTCTCCTTCCGTTGGAAAAATGTGTGAAAGCAGCCTTCTGCGGTGACGACAGCGTCGTCTACCTACCCAAGGGTACGGTAGTTGGCGATATTCAAACTAAGGCAAATTTACAATGGAACTTTGAGGCAAAGCTTTTCAAAAAACACTACGGGTACTTTTGTGGTAGGTTTATCTTACCACATAGTACCGGTTGTGTTGTTTACCCTGATGTCCTCAAAGTAATCGCCAAATTGGGTACTAAAGATGTCACCGACTGGAAGCATTTGGAGGAGGTGAGGGTTAGTATGTGTGATACTTATAAGCAATTAGGTAATAGTGCTTATTTAGATTTGCTTAAAGTAGCCATGTCTGAGGTTTATCCCTCGGTCGTTGACTTGCGTTTTGTAGTGTGTACATTGTGGAGGTATATTACTGATAAAGTGTTGTTTAAAAGTTTGTTTTTGGAGTTATAGTAGTTATGTCTAGT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| 81,854
|
JF729471.1
|
Rattail cactus necrosis-associated virus
|
Kim,N.R., Hong,J.S., Song,Y.S., Chung,B.N., Park,J.W., Ryu,K.H.
|
Seoul Women's University, Division of Environmental and Life Science
|
Korea
|
2011-12-12
| null |
Rattail cactus necrosis-associated virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,506
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Disocactus flagelliformis
| null |
2010-08-01
| null | null |
Rattail cactus necrosis associated virus, complete genome
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| 97,778
|
MH892420.1
|
Rattus norvegicus papillomavirus 2
|
Ling,Y., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2018-09-22
|
RPV2-OR01-zj
|
Iotapapillomavirus 1
|
Iotapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,722
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rattus
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oronasopharynx
|
2015
| null | null |
Rattus norvegicus papillomavirus 2 isolate RPV2-OR01-zj, complete genome
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AGGAATCTGCTGACACATCGTTTGTCTGTATTCGCACCGCCTCGGGTTTTGGGGGTGGAGCTGCCCACGAGGAGTTGGCACAGGTGGGGTTGGCAGAAGGGCTCGCACGCAATGTACTCGGATGCGATCCAGCTTACTCATTTAATCCGAGCTAGCAGCAGGGTGCGCACCTTCCTCGGTTTCAGTGCCAGCTACACCGAATTCGGTACGGCCTTTTTTTTTCTTCTTCTAACTTATCTATTCATATTTCTGGCTCGTTTCCTGTCCTGGACGTGCCCGGGACCGTTATTCATTTTGGTATGTTGATCCCCGCGGCGGTGGTAGGTTTCCCACGATTTTTATCCCCTTCGGTCTGGGATACAACAAACCGATATGGGTGTGAATGTTGGCAACAATCCTCTGTCTATACTTTCCGATCTCGAACCGGTACCGGTCAGGGACTATTTAAGCAAACGGTGGTGGTTATGGTTAACATATGAGACCTCAATGGAGAGGACCATCGAAGCCCTCCTAAAACGGCTGAACATCCCGAGAACAGATCTGCTCTTGCCCTGCACTTTCTGCGCCAAGTACCTGACTCAGGACGAGCTTACAGCCTTTGAATACAGTGACTTCAATCTTATTTGGAGACGGGGTAACGTATTCGGGGTGTGTGTTTCCTGTGCCCGGCTGTGTGCATCTTTAGACGTCCTCCAGCACCTCGGCAATAGCCTACCGGCTGTGGATGTGATAAACCGAGAGGGCAAAGGGCTGCAGGAGGTGGTGGTGCGCTGCCGTGTGTGCCTGCACAGACTGTCCTTTACTGAAAAACTGCAGGCGGCTGAGCGGTCGGAGTTGTTCGCACGGGTGAGAGGACGGTGGAGGGCTAGGTGCAGAATTTGCAAATTTGTGTAAAATGATTGGCCCTGAGACAACCAAAACCCTACCAAACGACCCAGACTTGGTCAGCCTGTATTGTGACGAAGTGCTAGAAGATGAGCCCATAGAGGCGGAGCAGAGTCGGGAGGAAGCCAACATCATTTATAGAGTGCTCATCGAGTGCCCTAAGTGTGACCGGATAATTCGGTTATTGTGCTCTGCCGACACAGCAAGTATTCGAGGACTTGAACTTCTTCTTCTAGGGGGACTGCAGATAATCTGCCCGCGCTGTGCCGAGAAACATGGACGACCTTGAAAGAGGTACTGAAGAAGGTTATAGTGGCTGGTTTCTTCGCGAGGCCGAGTGTAGTGACGGGTCGAGCGATGAGGAAGAACAGAATAACTCATTTGAATCTATTTCAGACTTTATAGACGATGGAACCGTTAATCAGGGGAATAGCCTACAGGCGTTTCAAAACCAATCGAAGGAGGAGACAGAGAGGCAAATTCAGGCGCTAAAACGAAAGTATATTCATTCCCCAGAAGCAGGAAACCTTAGTCCTAGGCTTAGAGCTATTTCAATCACACCAGAGAAGCAGAGGAGTAAGAGGAGACTCTTTGAGACAGACAGCGGTAACTGGTCAGACAGAAATGAAACTCAAGATTCTGCTGCAACGTCATTCGAGGTAGTTGGGGACTCTGCTGTGGCGGTCAGCGAAGCAGGGCATTCATTAAATCTGAATTTGCTGGGCTGTCATAACCGTCTTGCAAGGCTCTATGCTTTGGTTAAGGAGGCATATGGAGTGGGATTTAAGGAATTGACCAGGCAGTATAGAAGTGATAAGACGTGTAATCCGGACTGGGTATGTGCTACATTTTCTGTGCGGGAGGAGGTGCTTAATGCGGCTCGGGCCGCCATATTGCAGGCGTGTGAATATGTGCATATCCAGCATAGAGTTACAGTGCAGACACCCTGCACTCTCATGCTATTGCGGTTCAAACATGGGAAAAGCCGGGAAACGGTCAAGAAGTTCCTTACAGGTATATTGCATGTGGATCCTCTGTTGTGTTTATGTGACCCACCGAAAATACAGAGCGTGCCAGCTGCCCTCTACTGGTACAAGACCAGTATGTCACCAGCTACCTTTCATGACGGGGAGCTCCCCGACTGGGTCAAGAAGCAGACAGTGGTGTCGTGCTCCTTGGAAGACTCAAAATTCGATTTATCGGAGATGGTACAATGGGCTTATGATAATGGATACGAGGACGAGTGTACTATAGCTTATGAGTATGCCCGGAAAGCACTTGAGGATCCAAATGCAAATGCCTTTCTTGCCTCCAATTCCCAGGCTAAGCATGTTAAGGACTGCACGGTGATGGTCAGACACTATAAGAGGGCTGAAATGAAAAATATGTCAATGTCACAGTGGATACATAAATGCTGCAGTGAGGAGCAGGGAGGGGGCGATTGGAAACCAATATCTCTTTACCTTCGGAGCCAGGGGGTTGAAGTAGTCAGGTTTCTTGGAGCTATGAGGTACTGGCTGAAAGGAATACCAAAAAAAAACTGTATTGCAATATGTGGCCCCCCCAATACTGGCAAGAGCATGTTTTGCATGAGTCTGATTAAATTCCTGAAGGGGCGGGTACTATCATTTGCAAATAGTAAGAGCCATTTTTGGATGCAGCCTTTAGCAGAGGCGAAGCTTGTGTTACTTGATGATGCTACGAGAGCAACGTGGGACTACGTTGACACCTATCTAAGAAATGCGTTGGATGGGAATCCCTTATCTATTGACTGTAAATATAGGGCTCCAATGCAGATTAAGTGTCCTCCTATTCTCATTACCACTAATGAGGACATTAAGACAAACGACAGATGGCGGTACCTCCATAGCCGGGTAACTATGTTCTACTTCAACAACCCTCTCCAGCTTGATGGGAATGGGGATCCACAATACTGCTTTACAAATAGCCATTGGAAATCTTTTTTTGAAAGGTTGCAGAGGCCATTAGATCTGAGCGAGGACGAGGCAGAACAGGAAGATGGAGAGTCTGTGCAGCCGTTTGTCTGCAGTGCAAGAGGAACTGATGTGTATATATGAGGAGGGAGACAGTGCATTGTCCACACAGGTCAGACACTGGCAGCTAATCAGACAGGAGCAAGTACTGTTACATGCTGCGAGACAGCAAGGCCATACCCGTATAGGGATGCAGGCGGTTCCATCACTGGCCGCAACACAGGCCAATGCAAAGGCTGCTATTGAAATGCATCTGTTGTTACAATCGCTTTTACAGTCGCCATACTCTAAGGAGCCGTGGACCTTGAGCGATACGAGCAGAGACATGTATCTTGCGGCTCCGTGCCATACCCTTAAGAAGAGTGGACAAACAGTTGAGGTGATGTTTGATGGAAACCAGGACAATAGCATGCACTACACAAAGTGGAGACAGGTGTTCTATACAGATGAGAGGGGTGTGTGGAAGAGAGTCTCTTCATTCTGTGATGTTACAGGAATCTTCTTTGAGAAAAACGGACACCGTGAATACTATGTTCGGTTTGAGAAGGAAGCCATGCGATTCTCAGTAACCGGAACATGGGAAGCGGTGGACGAGGGGAAAATTTACACTAGTGTTGTCCCTGTTGCTAGCTCTACGCCGACGCCCGGACTTCCTGGAAGGCATCCGGTATCTGTTGACGGGGTACCCGCCGCAGGACATACCCGCACGGATTGGGACTCCATCAGGCACAGCCTATTTTCTTCGGGAGGAGGAAAAGGAGCTGGAGAGGAAGAAAAGGTCTACCCGCGAGCAGGCAACTCAGACCACAGCTACCACATCCCCACCAGCCCACCAGCCTTCGGAGGTGAGCAGCACAGAAGAGGATCCGGATCCGGAGCAGGAGTACCCGCACCCGCAGGAGACGTCTCCGAGGTACCACGGTCGCCCACTAAGGAGGACAAGAGCACCGAGCCCGTACCCAAGAGAGGGCCAGGGAGGCCGAGAAAAGGGGGACCGTCCACGTCCGGAGAGAGAACTCCCGACAGGGACACACGCCCCAAAAAACGACCCAGAGACCGCACCGGGGGATACCGAACCCGGAAACGAAAGCGGAACAAGCGGTGGGCGACACCACCAAGAGAGAGAGCACCCGACTACGTCGACCTCAACGCAACCAACAAAAACGACGGGAGGCCGAACGGCTCCGTTAACTGCAGTCCTCCTAGTCCAGACCCCCCCGACCTCTCCGCCATACCCCCGACCCCCGGGGTACGGGTGGCAGGACAGAGCAACACTCCTGGGACACCCCGAGCGGCCCCCACTCTCGTGGCAGTCGGCGACTCTGGACTCCCTCCTGCAACGCCTGCAGAGGGACTTCGAGCAGCAGCGCCAGGCTCAACTGATCGTTTACGACGTCCTCGGACAGGCCCTGGGCCTCCCTGCCTTCTGATTATTAAAGGTACACCTAACGGGGTAAAGTGCCTGAGATACAGACTTAAGACACATCACCACTCGCTGTTCCAGTACGTGAGCACCACCTGGCAGTGGGTACCGGCCAGCGGGTCGTCCAGAGTTGGCAGAGCACGGATTTTAGTTATGTGCAGTGACCAAACACAGAGGAACATATTTCTGGACACTGTGAAAATACCTGCAGGAATGACTGTGGAGCAGTGCAGCATGCTAGCTATTTAGGTCTTGCATTTCAGGTGGAGGGTACTAACGCACACAAATAAATTTTTTACTTTTTATACACATCCCACTAACTAACCCACCCTTTCCCTACTAACATGGCGCGTCATAAGCGCTCTACTGCCAAGTCCAGAGTACCGAGAGACTCGGCTACTAACATTTACCGCACATGTAAACAGGCCGGAACGTGTCCGCCTGATGTAATCAATAAAATTGAACACACGACCACCGCTGACAAGATTCTTCAATATGGAAGTGCAGGTGTATTTCTGGGGGGTCTTGGCATAGGTACAGGACGGGGCACAGGGGGAGCTACAGGCTATGTCCCTCTGGGGGAAACACCAGGTATCAATGTGGGTGCACGGCCTGTGCCACGTCCCAGCATACCCGTAGAGACAGTGGGCCCCCAGGACCTTTTTCCCGTTGATGCTATCCGGCCCACCGACCCCTCT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| 68,559
|
MH892421.1
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Rattus norvegicus papillomavirus 2
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Ling,Y., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
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2018-09-22
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RPV2-OR02-zj
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Iotapapillomavirus 1
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Iotapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,722
|
GenBank
| null |
China
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China
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Rattus
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oronasopharynx
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2015
| null | null |
Rattus norvegicus papillomavirus 2 isolate RPV2-OR02-zj, complete genome
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|
Rattus norvegicus papillomavirus 2
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Ling,Y., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
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2018-09-22
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RPV2-SK01-zj
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Iotapapillomavirus 1
|
Iotapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,716
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GenBank
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China
|
China
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Rattus
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skin
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2015
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Rattus norvegicus papillomavirus 2 isolate RPV2-SK01-zj, complete genome
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Rattus norvegicus papillomavirus 2
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Ling,Y., Zhang,W.
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Jiangsu University, School of Medicine
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China
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2018-09-22
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Iotapapillomavirus 1
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Iotapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,716
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GenBank
| null |
China
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China
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Rattus
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skin
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2015
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Rattus norvegicus papillomavirus 2 isolate RPV2-SK02-zj, complete genome
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| 68,562
|
MH892424.1
|
Rattus norvegicus papillomavirus 2
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Ling,Y., Zhang,W.
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Jiangsu University, School of Medicine
|
China
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2018-09-22
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RPV-fe02-zj
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Iotapapillomavirus 1
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Iotapapillomavirus
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Papillomaviridae
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dsDNA
| 7,722
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GenBank
| null |
China
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China
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Rattus
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feces
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2015
| null | null |
Rattus norvegicus papillomavirus 2 isolate RPV-fe02-zj, complete genome
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| 68,563
|
HQ625441.1
|
Rattus norvegicus papillomavirus 2
|
Schulz,E., Gottschling,M., Ulrich,R.G., Richter,D., Stockfleth,E., Nindl,I.
|
Clinic for Dermatlogy, Skin Cancer Center Charite (HTCC)
|
Germany
|
2011-06-20
| null |
Iotapapillomavirus 1
|
Iotapapillomavirus
|
Papillomaviridae
|
dsDNA
| 7,724
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Rattus norvegicus
| null | null | null | null |
Rattus norvegicus papillomavirus 2, complete genome
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Ehlers,B., Richter,D., Matuschka,F.R., Ulrich,R.G., Liebmann,S., Walter,C., Preugschass,H., Fischer,D.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
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2015-07-20
|
3690
|
Alphapolyomavirus ranorvegicus
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,318
|
RefSeq
| 1
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Germany
|
Germany
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|
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2005
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|
Rattus norvegicus polyomavirus 1 isolate 3690, complete genome
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Robert Koch Institute, FG12
|
Germany
|
2015-07-14
|
3671
|
Alphapolyomavirus ranorvegicus
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
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dsDNA
| 5,318
|
GenBank
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Germany
|
Germany
|
Rattus norvegicus
|
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|
2008
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|
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|
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|
Ehlers,B., Richter,D., Matuschka,F.R., Ulrich,R.G., Liebmann,S., Walter,C., Preugschass,H., Fischer,D.
|
Robert Koch Institute, FG12
|
Germany
|
2015-07-14
|
3687
|
Alphapolyomavirus ranorvegicus
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,318
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Rattus norvegicus
|
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|
2005
| null | null |
Rattus norvegicus polyomavirus 1 isolate 3687, complete genome
|
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|
Ehlers,B., Richter,D., Matuschka,F.R., Ulrich,R.G., Liebmann,S., Walter,C., Preugschass,H., Fischer,D.
|
Robert Koch Institute, FG12
|
Germany
|
2015-07-14
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3690
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Alphapolyomavirus ranorvegicus
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
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| 5,318
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GenBank
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Germany
|
Germany
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|
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2005
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|
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Rattus norvegicus polyomavirus 1
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Ehlers,B., Richter,D., Matuschka,F.R., Ulrich,R.G., Liebmann,S., Walter,C., Preugschass,H., Fischer,D.
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Robert Koch Institute, FG12
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Germany
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2015-07-14
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5700
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Alphapolyomavirus ranorvegicus
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Alphapolyomavirus
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Polyomaviridae
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GenBank
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Germany
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Rattus norvegicus
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2008
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Rattus norvegicus polyomavirus 1 isolate 5700, complete genome
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| 86,650
|
KR075945.1
|
Rattus norvegicus polyomavirus 1
|
Ehlers,B., Richter,D., Matuschka,F.R., Ulrich,R.G., Liebmann,S., Walter,C., Preugschass,H., Fischer,D.
|
Robert Koch Institute, FG12
|
Germany
|
2015-07-14
|
5704
|
Alphapolyomavirus ranorvegicus
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,318
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Rattus norvegicus
|
spleen, abdominal cavity
|
2008
| null | null |
Rattus norvegicus polyomavirus 1 isolate 5704, complete genome
|
GTTGTCTCTCTCAAGGTGAGGCTGCAAATGAGCTAGCAATGTGTGGGGTCGGCCCCAAAAGCCTCCGGTAACAGCTCCGCCCAAATTTTTTCTATTCTGGCAGGGTAGGGCCTCATTTACTCTTCTAGCCCCAAAAGCCTCTCTCCTTTACTTCAGAGGAAGGGTGGAGGCTAGGGGCCCCAAGCCTCTCTTATCTGTAGAAAAAAATATAGACCAGAGGGCGGTATCCTAGCAACCATACCCGGATGTGTCACTGTGGTTAGGCCACTTCCTCTTTAAGTGGCACTTGTCGGAGACTTGCTGACATCCTGCTTTCTGTTTGTTTCCCTAAGAAACCGACCTAAAACCCTGTCGGAGGCCGTTGAGAAGATTCTGAATCTACTCAAGTAAGTCGAAATGGGAGCCGCCATTTCAGTTATTATTGATTTGATTGCTACCGCCACCGAACTGTCCACGGCGACCGGATTTACAGTTGAGGCCGTACTTAGTGGCGAGGCCCTAGCCGCCATAGAGGCCCAAGTATCAACAATTGCTACAATGGAGGGTTTAGCGGCTGAATCAGCCTTAGCTTCTATGGGGATTACACCAGAAATGTATGCCATGATAAGCACTGTCCCTCCAACAGTAGAGGGTATTATTTCTGGTGCCGCTGGGACAGCTCATATTCTTCAAACTATTGCAGGTTCAGCATCACTAACTCTAGGAGTAATCTCGGGATTTAGAGACCAACAAGTCTCTATTGTGAATAGAAACATGGCGCTGATTCCCTGGAGACCTGAAGAATATTGGGACGTGCTTTTTCCTGGTGTTAATACAATTGCTCGGGGCTTAGATGTAGCACATGGGTGGGCCCATAGTCTGTTCCAGTCTGTTAGTAGACAAATATGGAGGACACTGTTTGAGGAAACAAGAGCAGCTATAGATTATGCTGTTAGAGATGTTACTATCAGACAGACCCATAGATTACTGGATGGTGTTGCTAGAATGTTGGAAAACACTAGATGGGTGGTCACCAATGCAGTGGAACAAGGTGGGCAAATTGTATCTGATGCTGTTCAAAATACTGGTCAACTTGTACTAACCGCTCCTGGCGAGGCCTACAGAGGTCTCAGAAATTATTATGCTGAATTACCAGGTGTTAATCCGGCCCAGAGGCAGCAGATGCTGAGAACTATAGAAAGGGAAAATGCTCAGCAAGCCCTGAGGACTGAGGTGGGGCGGGATGTTCAATCAGTCACACCGTCCCCCAAGTCTTCAGGGTTTACTGAGTCTGGCAACGTTATACAGAGATACATGCCTCCTGGAGGAGCCATGCAAAGAACCTGCCCTGACTGGATGCTTCCTCTGATTCTAGGACTCTACGGAGACATAAATCCCACTTGGCATTCTGTTATTGAGGAGGAATATGGCCCCCAAAAGAAAAGGCGTCGCCTCCAGTAGCAAATGTGCTACAGTGTGTGGGAAACCATGTCCTAGACCAGCACCTGTGCCTAAGTTAATAATGAGGGGAGGGATAAGTGTTCTAGATTTAGTTACAGGGGAAGATAGCATAACTACAGTAGAAGCATATCTGAATCCTAGAATGGGGCAAAACAAACCTGGACAGGGAACAGAGGGGCAGTACTATGGATTTTCACAATCTATCAAAGTGAATGATTCCTTAACTGAAGACAAGGTTGCAGCCAACCAGCTGCCTTATTACAGCATGGCCAAAATCCAGCTACCAAGCCTGAATGAGGATCTGACCTGTGACACACTGCAGATGTGGGAAGCTGTTTCTGTGAAAACAGAGGTTGTGGGAGTGGGATCCCTGCTCAATGTCCATGGCTATGGCTCCAGATCACAGAGCAAGGATATAGGAATAGCATTCCCAGTAGAGGGCACTACCTACCACATGTTTGCTGTTGGCGGCGAGCCATTAGACCTTCAGGGCCTTGTACAAAATTACAATGCAAGTTATGAGGGTGATATAATCAGCATAAAAACAATTACTGGGAAGGAGATGACCTCGACCAACCAAGTGCTTGATCCCAGTGCCAGGGCAAAGCTAGACAAGGATGGGAGGTATCCTATCGAAATCTGGGGCCCTGATCCAGCTAAAAATGAGAACTCCCGGTACTTTGGCAATTTCACAGGTGGCACACAAACACCGCCTGTTATGCAGTTCACAAACACCCTAACCACAGTGTTGCTTGATGAAAATGGAGTGGGCCCCTTGTGCAAGGGGGATGGGCTGTACCTCAGTGCTGCAGATGTGATGGGTTGGTGGATCGAATACAACAGTGCAGGATGGCACTGGAGGGGGCTTCCCAGATATTTTAATGTGACATTGAGAAAAAGATGGGTGAAAAACCCATATCCTGTAACCTCCCTGCTGCAGTCATTGTACAGCAACATGCTGCCCAAAATAGAGGGGCAACCAATGGAAGGTCCCGAGGGCCAGGTGGAAGAAGTGAGAGTATATGAAGGCCAAGAACCCATCCCAGGGGATCCCGATATCAATAGATATATTGATAAATATGGGCAGCAAAGAACCAAACCTGACATTCATATGAATTGAATAAACTTTATTGTTAAATCATTCAAGGGCCTCCTCCACTTCTTCAACAATCCCCTTAAGTGGGTCATCTCCATTTTCAATATTTAAGCACATATCAGCAAAGGTAGTCATTCCACACATGTCAGACAGAAGCTTCTTAGCATCCTTAACAGGATCTTGCAGAGAGGGGACAAAACAATCAGAGGGAACCTGCCATAGTAATGCCATAAACAGGGTGAGACCACTTTGACACACCCTATATTTGTTCATCCTTGGATTTTTCTCAAGTGCCTGAGCCAGATGTGGTTGCACAGTAAAGGTGTAGACATTCTGGAACCTGGCAAGTAATGTTCTTGGAAAGAAATACTCATTAGCTGTAACAATACAAGGCGGGAATATCTGGGATCTCTTGTTTACATGTTTTTTCTCCAGATTTACTTTTACACTTCCATCGAGGTGGTCTCTAAGGTTATCCAAGTTGCTGACTCCACTTCCAGACTGCAGGTCCTTATCTCTATCTCTATTAGCTACCTGTCCCTTTACATCTTCAAAGCAGCATGCAAACTTATCTATTGCACAGCCAAGTTCAAAGTTCAACTTATCTGAAGGGCAGTTTACATTGAGACAGACACCTCCAACTAAGTGCATAATTGCTGCAGCAAGACTAGTTTTGCCAGAGTTAATAGGCCCCTTGAACAGAACATTTCTTTTCTTAGGAATATTTTCTATAAATAATTTCAGGATATCCAGCAGCATAGAATCAAAGTTAGTAAAGAGACAATTATACCATGCAACTCCTGCAAGATAGATAAACCGATCCATGTTTCCTAGATCATTGAAATCTTGAAGAAACTTCTGGAATCTGTCTGCAAGTAATTCTTCTCTTGTGCATTCTAGTACTCTAAGCCTTTTCTTAGCAAGGACATTGTCTGCAGCTTGCTGACATATAGATTTCTGCTGTTTGCATTGGATAAATAGATCAGCATTGTTAGCATGGGTAGAGTGGTACTTCCAATGTACCCTTAGTCTAGGTATTTGCTCACTGCACTTCCTGCAAGTAGTTTCATCCTTTGCAAACTCACAATAATGTCCCATTATGAGTAGGGGATCATCCAGGTTATTTTCAAGAGCAAACTGGGTAACTAACTGCCAGTCAACCGTCTTCACTTCCTCTTTCTCATCTGTGAATTCAAATTGGTAAATCCCCGGCTTGTTTTCTTTCACAAGAGTAAACCCATTACTGTTAGAACTCATAGAATTATAACATTCCAAAGGTTTAGTAACAGCTTTGCACAGGAGGAAGCTAACAGTACAAAATCTGCAGCAATAGCTCTTTACAGCATTGACTCTGTGTTTTCCTGGTGTTATTATCAAAAGCAAGCTATCACCTTTAAAGCTAAATAAGGCCTTGAAATCTGGATTGTACTTTGCAATGTTATCATATAACACAGTTCCTTTTTCTCCTGTTGTATAGATCAGGAAACTATTTTGTGTCTTATTAGAGTATATAGCATTAGACACAAAGCTCCTAAGCACAGCAGGCATATCATCAGGAGTATGCCTATTAGGAGGCGGTTTCTTTGGGGTGGTCTGGGATGACTGGAATTCTCCCTCACTGGCATTAGTCTCCAGTTCCTCTGTGGAGTTGTAATACGAACCAAAGGTGGACTGGGAGCCTCCGGCAGGATCTGAAGGTATATTGGTGATATCAGGTTCTGGTATATGGGCTCCTCTCCCTCCATTTCCTGGTATATTGGCTCCTCCTGGTGCTGGTGGTTGATCTCTGCGTAGCTGCTTTCTTCCATGGTGCTCCGGTCCATTTGCATGTACACGCTTTCTGCTTGGTGGTGAGGGCTCGAGGGCGGTACTGGGCCCGGGTCTGGTGGGTGTTCTTGGAGATCCTGGTGGGCTAGAGGATATAGAAATAGGGGAGGCGGGGGCAGGGATATCATCCTCGGATGATGATCCCAACTCCTCACTGCAATAGAGGTCTCTCTCCCACTTCTCGAAAAACTCCTTCCACCACTTCTTCTGATTTTCACTGAAGCCTGCTGACCCGTAGGAGAATGACCAGTAGTGTCCAGTCTCGGGATTGTAGAACTGCTCAGGAGGCTGTCTGCTGGTAGAGGGATTAACATCCTGTAACAAACACAAATTATGCACACTTGTAGAAAGGAATATGTCCCCCCATTTAATACTTACCTACTGCAGGGTTGTAGATTTGGTGCACATCAATGTCCAGCCAATCCACTGGGATGTCTCCCAGAAATTCAGCATATAGGACCACAATGAAATTGTTTATTGGCAGCCCAAACCACAGGCTGAAACAATCCAGACAGTAGCATTCACCAAGAACTAGACATGGAGCAAGGCAGGCTTTCTTTAGGCCTCTGTGCTGGCGTCTCAGAGTGCATAATATGCAATTACATGTACTACAGGCCTTATTCTGTAGACAGGTAAT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| 86,651
|
KR075946.1
|
Rattus norvegicus polyomavirus 1
|
Ehlers,B., Richter,D., Matuschka,F.R., Ulrich,R.G., Liebmann,S., Walter,C., Preugschass,H., Fischer,D.
|
Robert Koch Institute, FG12
|
Germany
|
2015-07-14
|
5709
|
Alphapolyomavirus ranorvegicus
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,318
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Rattus norvegicus
|
spleen, abdominal cavity
|
2008
| null | null |
Rattus norvegicus polyomavirus 1 isolate 5709, complete genome
|
GTTGTCTCTCTCAAGGTGAGGCTGCAAATGAGCTAGCAATGTGTGGGGTCGGCCCCAAAAGCCTCCGGTAACAGCTCCGCCCAAATTTTTTCTATTCTGGCAGGGTAGGGCCTCATTTACTCTTCTAGCCCCAAAAGCCTCTCTCCTTTACTTCAGAGGAAGGGTGGAGGCTAGGGGCCCCAAGCCTCTCTTATCTGTAGAAAAAAATATAGACCAGAGGGCGGTATCCTAGCAACCATACCCGGATGTGTCACTGTGGTTAGGCCACTTCCTCTTTAAGTGGCACTTGTCGGAGACTTGCTGACATCCTGCTTTCTGTTTGTTTCCCTAAGAAACCGACCTAAAACCCTGTCGGAGGCCGTTGAGAAGATTCTGAATCTACTCAAGTAAGTCGAAATGGGAGCCGCCATTTCAGTTATTATTGATTTGATTGCTACCGCCACCGAACTGTCCACGGCGACCGGATTTACAGTTGAGGCCGTACTTAGTGGCGAGGCCCTAGCCGCCATAGAGGCCCAAGTATCAACAATTGCTACAATGGAGGGTTTAGCGGCTGAATCAGCCTTAGCTTCTATGGGGATTACACCAGAAATGTATGCCATGATAAGCACTGTCCCTCCAACAGTAGAGGGTATTATTTCTGGTGCCGCTGGGACAGCTCATATTCTTCAAACTATTGCAGGTTCAGCATCACTAACTCTAGGAGTAATCTCGGGATTTAGAGACCAACAAGTCTCTATTGTGAATAGAAACATGGCGCTGATTCCCTGGAGACCTGAAGAATATTGGGACGTGCTTTTTCCTGGTGTTAATACAATTGCTCGGGGCTTAGATGTAGCACATGGGTGGGCCCATAGTCTGTTCCAGTCTGTTAGTAGACAAATATGGAGGACACTGTTTGAGGAAACAAGAGCAGCTATAGATTATGCTGTTAGAGATGTTACTATCAGACAGACCCATAGATTACTGGATGGTGTTGCTAGAATGTTGGAAAACACTAGATGGGTGGTCACCAATGCAGTGGAACAAGGTGGGCAAATTGTATCTGATGCTGTTCAAAATACTGGTCAACTTGTACTAACCGCTCCTGGCGAGGCCTACAGAGGTCTCAGAAATTATTATGCTGAATTACCAGGTGTTAATCCGGCCCAGAGGCAGCAGATGCTGAGAACTATAGAAAGGGAAAATGCTCAGCAAGCCCTGAGGACTGAGGTGGGGCGGGATGTTCAATCAGTCACACCGTCCCCCAAGTCTTCAGGGTTTACTGAGTCTGGCAACGTTATACAGAGATACATGCCTCCTGGAGGAGCCATGCAAAGAACCTGCCCTGACTGGATGCTTCCTCTGATTCTAGGACTCTACGGAGACATAAATCCCACTTGGCATTCTGTTATTGAGGAGGAATATGGCCCCCAAAAGAAAAGGCGTCGCCTCCAGTAGCAAATGTGCTACAGTGTGTGGGAAACCATGTCCTAGACCAGCACCTGTGCCTAAGTTAATAATGAGGGGAGGGATAAGTGTTCTAGATTTAGTTACAGGGGAAGATAGCATAACTACAGTAGAAGCATATCTGAATCCTAGAATGGGGCAAAACAAACCTGGACAGGGAACAGAGGGGCAGTACTATGGATTTTCACAATCTATCAAAGTGAATGATTCCTTAACTGAAGACAAGGTTGCAGCCAACCAGCTGCCTTATTACAGCATGGCCAAAATCCAGCTACCAAGCCTGAATGAGGATCTGACCTGTGACACACTGCAGATGTGGGAAGCTGTTTCTGTGAAAACAGAGGTTGTGGGAGTGGGATCCCTGCTCAATGTCCATGGCTATGGCTCCAGATCACAGAGCAAGGATATAGGAATAGCATTCCCAGTAGAGGGCACTACCTACCACATGTTTGCTGTTGGCGGCGAGCCATTAGACCTTCAGGGCCTTGTACAAAATTACAATGCAAGTTATGAGGGTGATATAATCAGCATAAAAACAATTACTGGGAAGGAGATGACCTCGACCAACCAAGTGCTTGATCCCAGTGCCAGGGCAAAGCTAGACAAGGATGGGAGGTATCCTATCGAAATCTGGGGCCCTGATCCAGCTAAAAATGAGAACTCCCGGTACTTTGGCAATTTCACAGGTGGCACACAAACACCGCCTGTTATGCAGTTCACAAACACCCTAACCACAGTGTTGCTTGATGAAAATGGAGTGGGCCCCTTGTGCAAGGGGGATGGGCTGTACCTCAGTGCTGCAGATGTGATGGGTTGGTGGATCGAATACAACAGTGCAGGATGGCACTGGAGGGGGCTTCCCAGATATTTTAATGTGACATTGAGAAAAAGATGGGTGAAAAACCCATATCCTGTAACCTCCCTGCTGCAGTCATTGTACAGCAACATGCTGCCCAAAATAGAGGGGCAACCAATGGAAGGTCCCGAGGGCCAGGTGGAAGAAGTGAGAGTATATGAAGGCCAAGAACCCATCCCAGGGGATCCCGATATCAATAGATATATTGATAAATATGGGCAGCAAAGAACCAAACCTGACATTCATATGAATTGAATAAACTTTATTGTTAAATCATTCAAGGGCCTCCTCCACTTCTTCAACAATCCCCTTAAGTGGGTCATCTCCATTTTCAATATTTAAGCACATATCAGCAAAGGTAGTCATTCCACACATGTCAGACAGAAGCTTCTTAGCATCCTTAACAGGATCTTGCAGAGAGGGGACAAAACAATCAGAGGGAACCTGCCATAGTAATGCCATAAACAGGGTGAGACCACTTTGACACACCCTATATTTGTTCATCCTTGGATTTTTCTCAAGTGCCTGAGCCAGATGTGGTTGCACAGTAAAGGTGTAGACATTCTGGAACCTGGCAAGTAATGTTCTTGGAAAGAAATACTCATTAGCTGTAACAATACAAGGCGGGAATATCTGGGATCTCTTGTTTACATGTTTTTTCTCCAGATTTACTTTTACACTTCCATCGAGGTGGTCTCTAAGGTTATCCAAGTTGCTGACTCCACTTCCAGACTGCAGGTCCTTATCTCTATCTCTATTAGCTACCTGTCCCTTTACATCTTCAAAGCAGCATGCAAACTTATCTATTGCACAGCCAAGTTCAAAGTTCAACTTATCTGAAGGGCAGTTTACATTGAGACAGACACCTCCAACTAAGTGCATAATTGCTGCAGCAAGACTAGTTTTGCCAGAGTTAATAGGCCCCTTGAACAGAACATTTCTTTTCTTAGGAATATTTTCTATAAATAATTTCAGGATATCCAGCAGCATAGAATCAAAGTTAGTAAAGAGACAATTATACCATGCAACTCCTGCAAGATAGATAAACCGATCCATGTTTCCTAGATCATTGAAATCTTGAAGAAACTTCTGGAATCTGTCTGCAAGTAATTCTTCTCTTGTGCATTCTAGTACTCTAAGCCTTTTCTTAGCAAGGACATTGTCTGCAGCTTGCTGACATATAGATTTCTGCTGTTTGCATTGGATAAATAGATCAGCATTGTTAGCATGGGTAGAGTGGTACTTCCAATGTACCCTTAGTCTAGGTATTTGCTCACTGCACTTCCTGCAAGTAGTTTCATCCTTTGCAAACTCACAATAATGTCCCATTATGAGTAGGGGATCATCCAGGTTATTTTCAAGAGCAAACTGGGTAACTAACTGCCAGTCAACCGTCTTCACTTCCTCTTTCTCATCTGTGAATTCAAATTGGTAAATCCCCGGCTTGTTTTCTTTCACAAGAGTAAACCCATTACTGTTAGAACTCATAGAATTATAACATTCCAAAGGTTTAGTAACAGCTTTGCACAGGAGGAAGCTAACAGTACAAAATCTGCAGCAATAGCTCTTTACAGCATTGACTCTGTGTTTTCCTGGTGTTATTATCAAAAGCAAGCTATCACCTTTAAAGCTAAATAAGGCCTTGAAATCTGGATTGTACTTTGCAATGTTATCATATAACACAGTTCCTTTTTCTCCTGTTGTATAGATCAGGAAACTATTTTGTGTCTTATTAGAGTATATAGCATTAGACACAAAGCTCCTAAGCACAGCAGGCATATCATCAGGAGTATGCCTATTAGGAGGCGGTTTCTTTGGGGTGGTCTGGGATGACTGGAATTCTCCCTCACTGGCATTAGTCTCCAGTTCCTCTGTGGAGTTGTAATACGAACCAAAGGTGGACTGGGAGCCTCCGGCAGGATCTGAAGGTATATTGGTGATATCAGGTTCTGGTATATGGGCTCCTCTCCCTCCATTTCCTGGTATATTGGCTCCTCCTGGTGCTGGTGGTTGATCTCTGCGTAGCTGCTTTCTTCCATGGTGCTCCGGTCCATTTGCATGTACACGCTTTCTGCTTGGTGGTGAGGGCTCGAGGGCGGTACTGGGCCCGGGTCTGGTGGGTGTTCTTGGAGATCCTGGTGGGCTAGAGGATATAGAAATAGGGGAGGCGGGGGCAGGGATATCATCCTCGGATGATGATCCCAACTCCTCACTGCAATAGAGGTCTCTCTCCCACTTCTCGAAAAACTCCTTCCACCACTTCTTCTGATTTTCACTGAAGCCTGCTGACCCGTAGGAGAATGACCAGTAGTGTCCAGTCTCGGGATTGTAGAACTGCTCAGGAGGCTGTCTGCTGGTAGAGGGATTAACATCCTGTAACAAACACAAATTATGCACACTTGTAGAAAGGAATATGTCCCCCCATTTAATACTTACCTACTGCAGGGTTGTAGATTTGGTGCACATCAATGTCCAGCCAATCCACTGGGATGTCTCCCAGAAATTCAGCATATAGGACCACAATGAAATTGTTTATTGGCAGCCCAAACCACAGGCTGAAACAATCCAGACAGTAGCATTCACCAAGAACTAGACATGGAGCAAGGCAGGCTTTCTTTAGGCCTCTGTGCTGGCGTCTCAGAGTGCATAATATGCAATTACATGTACTACAGGCCTTATTCTGTAGACAGGTAAT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| 86,652
|
EU500826.1
|
Ravn virus - Ravn, Kenya, 1987
|
Warfield,K.L., Bradfute,S.B., Wells,J., Lofts,L., Cooper,M.T., Alves,D.A., Reed,D.K., VanTongeren,S.A., Mech,C.A., Bavari,S., Lofts,L.L.
|
United States Army Medical Research Institute of Infectious Diseases
|
USA
|
2009-02-28
|
R3
|
Orthomarburgvirus marburgense
|
Orthomarburgvirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 19,114
|
GenBank
| 1
|
Kenya
|
Kenya
| null | null |
1987
| null | null |
Lake Victoria marburgvirus - Ravn isolate R3, complete genome
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,114
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GenBank
| 1
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Kenya
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Kenya
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Homo sapiens
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blood
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1987
| null | null |
Lake Victoria marburgvirus - Ravn isolate R1, complete genome
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EU500828.1
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Ravn virus - Ravn, Kenya, 1987
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Warfield,K.L., Bradfute,S.B., Wells,J., Lofts,L.L., Cooper,M.T., Alves,D.A., Reed,D.K., VanTongeren,S.A., Mech,C.A., Bavari,S.
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United States Army Medical Research Institute of Infectious Diseases
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USA
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2009-02-28
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R2
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,114
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GenBank
| null |
Kenya
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Kenya
| null | null |
1987
| null | null |
Lake Victoria marburgvirus - Ravn isolate R2, complete genome
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Ravn virus - Ravn, Kenya, 1987
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Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
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GenBank
| 1
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Kenya
|
Kenya
| null | null |
1987
| null | null |
Lake Victoria marburgvirus - Ravn, complete genome
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USA
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2006-04-15
| null |
Orthomarburgvirus marburgense
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Orthomarburgvirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 19,114
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GenBank
| 1
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Kenya
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Kenya
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Homo sapiens
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blood
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1987
| null | null |
Lake Victoria marburgvirus - Ravn, complete genome
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Red-crowned crane parvovirus
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Yang,S., Wang,Y., Zhang,W.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-02-12
|
yc-7
|
Aveparvovirus gruiform1
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,515
|
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Grus japonensis
|
feces
|
2014-12
| null |
PRJNA485481
|
Red-crowned crane parvovirus isolate yc-7, complete genome
|
CACATTAACAGTCACGTGGTTAGTCATTAACCAGGCCATCTGGCAGGATATGATGTTCTTGCTTTCTACCAATCATCCATCCTCCATCCACCATTATCCATTAGCCCCACCCTCGACGTTCGCCCGAAGGGCGCGGCTTCGCCGCTGAACTAGAGGGTGGAGCTAATGGATAATGGTGGATGGAGGATGGATGATTGGTAGAAAGCAAGAACATCATATCCTGCCAGATGGCCTGGTTAATGATTAACCACGTGACTGTTAATGTGTAACCTGATTGGTCACCGTGACTGTGCATATATTGCGTATAAAAGGAGGAGCTCCTCAGTCGCCAGTCAGCTGCTGACTTGTTCAGAGCTCGAACTGGCCGCTCTTTTCGGAGCCGGATCCGGATCTACGTGGTCGCTGTCTCAGTTCCTGCCGAACCTCTCTGCCGGTAAGATGAGCCTTCCGACTCGCGGCGGTTTCACGGCGGTTTTCGCGCTTCCCGACTGCATTCAGGTCGAAAAGAAAATTTTTGACCTGCGTGCCGCCGCGAACGCGGGCTACACGAACCCCGAGACGGGCGAATTCGTGTGCAGCCGAATGCCGGTGGACCACGAGCTGCAGGAGGAATATAGGAGGTTTCACGAGAACCCGAATTGGGATCATTGCGAAAGCCCGTGGCTCCAGGTTCAGCAGAAGCTGCTGATGAGCGCGGTGCGGATAGAGACCTCGATGCAGCCTCACGCCAAGATATTCTGGCAGGCCGAGGAATCTACCAGCGGCAAGATCCACTTTCACGTTCTCTTTATCTCCGGGTTCACGTCCAAGAACATTTCCTGGACGATGAAACGGATGAGGCGGGAAATCGTTAAGGAGGCTAGCGAGCTGTACCACGCTTACTGTCCCGACATCAAAAAGGCGGGAATCTGGGGAGCTCTGAACAACATCAGCGCTGCCATGCTCAGTCTGAACAGGGGATACTCCCCGAAACTGGGCAAGAGCATACCTCAGCCGGTGAACCCTTACTCGTTCGCGAGGTACTACATGTACAACGAGGGGAAAAGGGTGCTGTACAGGTGGGCTACGCCTAACCTGATCGCCGACGGGCTGGTGACCAGCAAGCTCAACGCGCCCTTCACCATGGCCGCCGCTCAGGACGACGGGCCCGACGTATCCGTCGAGACCCTCAGACCGGGCGACACGCTCCCGGTCTCTTACGTGAGTACCGAATCGGACTGGGCGCGCGGCAGCGGGGACACGGTGATACAGACCGGGGTGATGGAAAAGCTGTGCATGGAGGCGCTGAGATTGTGCCGAGACGGGTGCATTTACAATCTGAGGGATTTCAAAATCAGACATCCCGACAAATTCATGCAGTTCGGGTCGCGGAGCCAGGGGATACCTAAACTGACTCAGACTATCCAACTTTACGTAGACACCATTGTTTCTGAGAGCACCGCCTGGGAAATCGCTAAGCAGGTTCACGGGGACGTGGACGTCGATTGTCTCGACGATAACAGGGTGGTTCAGCTCTGTACTTGGCAAGGGTACTCGCCCCGGTACGTGGCGCATACGCTGCTGTGCTGGCTGTCCGGTAACATGGGGAAAAAGAACACGGTCTACTTTTACGGTCCCGCCAACACGGGCAAGACCATGATGGCCGAGTCCATCTGCAAGATGGTCGGCATCTACGGGAACGTTAACCACAACAACGGCAACTTCCCGTTTAACGACTGTCACGGCAAAGCCGTGCTGTGGTGGGAGGAATGCACCATGAAGGAAGAGTACGTGGAGGCGGCAAAGTGCCTGATGGGAGGGTCTAGCGTCAGGGTAGACAAGAAGGGGGAAGACTCGGTCCTGATAGAAAAGACCCCGATGGTCATCACCAGCAACAACGACATTGCCGTGGTCGCGAGCCGGAACGCGGTCTCCGGCAATCACGAGGCGGCAATCAGGGCCCGCTGCCTGAGGTTCAACTTTAACAAGTGGCTGACCTCCAACTGGGGCGCGGTGACCGTCAGGGACATGTACCAGTTCCTGAGCTGGGGAGAGACCCTCGGGTCCCCGACCCTCGAGACGTACTTGCGGCTGAACGAGAAGTACGCGGACAAGCTCCCGTACAACCAGCCGAAAATTGAGCTGTGCGATCATTGTGTCCAACAGTTTACCTTCCGGGAGACGTTAACTCTGTGTCCCTCCTGCGGTGGGTGGACCCCCAAGAGTATCTCGGGGGATTCGACGAGTGGATACTGGAAAGGGGAGAGCGATCAAAGCTTGTACGACGCGGTGCGTTCCGAGCAGGTATGTGCGAGGATGCTGTAGAGTCTATACAGCGCGTGTATCCCCTACGCAGACTAACAGCCTCCTCTCGCACATAGGACGTGGAACTTCTAGCCGACGGAGACCGCTACAAGTACCAGTGGATCGAGAAGAGAGCGGGATTGACTCCGACCCAGAGCAGTCGGAAGAGAGACCGTCCCGCGTCTCCAGACAGTACATCCGCTGGTCCCTCGACCTCGACAAAGTGCTCGCGACTGACCTCTGAGGCCGACTCGACCTCCGGCTCGGGTGCGGACGGGTGTAACGGGTTTAGCTGTACTCTTAATGGAAGTTTTGGGGCGCTGGGTGGCCGATCGGTATATTGTGATCGCGGGCTACGCGTTGTGGATCCTAGCCTGGGTCCTAGTCTTACAGAGCTGTTTTGCGACGGGGAAGATATACGACCCGCGCGGTCATTACAAACTAGAAACTCATCAGTGCGGGGACGGGCCTCCGGGCGCTCCAGTAGTGAGGTCGCTGAGGTGGGGGCAGTGCACGACTCTCGACGGGGAAATTCGGTATCACCGTCTGACCGGGAAACGTCAGCCGCCGTTCTCGCCCTAAAGTGCGATGAACCCATGCCTGTGTCGCCTCCTCCGAGGACTCCGACTCCTCTACCGAAGGGGGATCGGAGTGCTCAGAGCATTGGAGCTCTGTCATGGGCTGATACAGCAAATAGATGGGTGGAGAGCCATGTGGGCAGATGGCGCATCGCTTTTAGTCTTTTTATGTCATGGCATGAGGCCAATATTGATAAAATCGATAGAGTTGCTAGTATGGTTACGGGTTCAGAACGCCTTACGATTCTCAGATTACTGGCGCCGGTAGTCTGCCACTACAAGTGCGCCATTAACCTGAGAGAGGCCATTATGGAGCACATGGTACACAGCGACTGGAGCACGGATGTAAACATCGACGTGCAATTAGAGCAGTGTATCCGGGTAGCGCAATCTGTCGAGCCGTTCGGGATATGGCAATGTATCGATCGGTTGGCCGCATTTTGTAACGCGCTCAATGTCCCGGCAGGTGCGACAGATGGGGAAGTGGACTCAGGCCGATTATGACGCGTACAATAACACTGTGTACTGGCTAAATAAATATTTGAAAGGCCCCAAGATAAACAACGCTAAAAAGCCTCAGCGTCAGTTGTCCGATAAACAGAAGGCTGACCGTAAACGGTATTTTATCACGCAGGCCAATAAAGCCAAGAAAGAGGGCATCAAGTTCGGTATCCCCAGCAAGAAAGACCACGAATCCTTTTTCAAAAATCACCAGGGGGCTGGTAAGAAGGCTACGCAGAAAACCAAACATCTCGATCCGACGCCGGACTCGGATCCTGACGAGGGTCCGGCCCCAAAAGTACCAAAAACAGACCTCGGAGGAGGCTACACCGCTGACGACCTCGAGGAGGCCATGGATCCGCGTAACGACGTCGAGATGGCAGCGGCCGATTCTTCGGCTGATGCTGCGGTGCCTATGTCTGACAGCCCATCCGGTGGAGGCGGAGGAGGAGGTGGGGGAGGCATAGGGGAGAGCACGGGGAACTGGACTTGTAACACGGTGTGGGGGAAAAACAGCATAATTACAAACGCTTCTAGACACTGCGTGTGCCTGACTAGAGATTTAGACATGTACAAAGCGATCGGGAATAAGGATAACGGGTTAGTGTTTGGAACCGAAAACAAAACCGCGTGGGTCGGGTGGTCGACCCCGTGGAACTATATAGATTACAATCAGATGTGCGTCCATTTCAGCCCACGGGACTGGCAGCGGTTGATAAACACCGCCAGTAAATGGCGTCCGCGTTCGGTCCACATTAAAATATTCAACATCCAAGTAATACAAAAAACTACTGTGAGCGACGGTACTCAATACTCAAACGATCTGACGGGGACAATTCAAATTTTCGCAGACGCTCAGGGCAGATATCCTAAGCTATTATACCCGTGCCAAACCACAATGATGGGTCCGTTCCCAAATCATATATATTACCTGCCACAGTACGCGTACACTACCGCATGCGACGGGCCGACGTCAAATCAAGACATAAACGCGTTACTTAATACAAACAGCGCGTTCTATTGTCTGGACGAAAGCCCGAGTGCAATGCTGCGCACCGGCAACGAGTGGTCGTGTCACTATACGTTCGACGACGACACCGGCTGGGTGCACAATACACGTTCGACTATACCAATATTCGAACGTGCTAATCCGCTGTACGATACTTGGCAAGTAGATCTAAGAGGGAACGACGCGTTAAGAGGACATTTCAGCTCGTGGAGACAGCCGTGGCTACCGGGACCGGTCATAAATATGACCGACGGAACTGCCGCTGGGGCGAACCTAAATACAATGCCAGGCGTAGACGTAGGGGCTTCGTATATGGGAATAGTACCAGGCCCCCCGATATGTCGCGCAGAAAACGATAAAGACGAGTACTTGCAAACGTTCTGGACTCCCAAGACAATCGGTCAAAACGAAGGAGACGTTAAAAACAGCCAAATAAATACAAGTACTGCGTATAAATCACAAGTGCCAACCGGCCGATTATGGGAGGTTAACGCGAGAGGACAGTATAAGGCCGCCAGTAGCCAGGGAAATGTAGCGGACCAACAATGGGCGGGATGCATACCGGGTATGATATGGGATAGGCGTCCAGCTACGTATTTCGATCCGATTTGGCAGGAAAAACCAATAAC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| 3,839
|
NC_040672.1
|
Red-crowned crane parvovirus
|
Yang,S., Wang,Y., Zhang,W.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-02-12
|
yc-8
|
Aveparvovirus gruiform1
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,456
|
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Grus japonensis
|
feces
|
2014-12
| null |
PRJNA485481
|
Red-crowned crane parvovirus isolate yc-8, complete genome
|
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TGCCGGGCATGATATGGGATCGCCGACCCGCAACATATTTCGATCCGATATGGCAGGAAAAACCAGAAACGGACGACAGCTTCATGTACGTCAGTCAGATGGGCGGATGCGCGGTCAGTGGAGCCCCCGGCCACATCTTCGTGAAAAACACGCCCAAACCGACAGGCGCGCAGAGCACGTACGTAGACGAATACTCGACATTCACGATAACGGTAACGATGGAATGGGAGTACGTGCCACACACTTACAGCCAGTGGAACTCGTACAAGACAGTATCGAATACGGAAGCGCAAGCGCAGGCGTATCTCGGTATGGTAAACGCGTCGGGCGTATACGTGACGGGGATGGACGGGGACAATCCGGTGGAGCTGCACGTGACGAAAAATTTACCTCGCGTGAATTGAAAGTCGTATACCGGTCAAAACGTCGCCATACGGGCTGTGTAATTATATAAAT
| 3,881
|
MZ352748.1
|
Red-crowned crane parvovirus
|
Chen,S., Yan,G., Deng,R., Liu,H., Huang,L.
|
Foshan University, School of Life Science and Engineering
|
China
|
2023-09-26
|
JL-20/10
|
Aveparvovirus gruiform1
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,459
|
GenBank
| null |
China: Jilin
|
China
|
Grus japonensis
|
feces
|
2020-10
| null | null |
Red-crowned crane parvovirus isolate JL-20/10, complete genome
|
CAGCTGTCTGGCGACTGAGGAGCTCCTCCTTTTATACGCAACATATGCACAGTCACGGTGACCAATCAGGTTACACATTAACAGTCACGTGGTTAATCATTAACCAGGCCATCTGGCAGGATATGATGTTCTTGCTTTCTACCAATCATCCATCCTCCATCCACCATTATCCATTAGCTCCACCCTCTAGTTCAGCGGCGAAGCCGCGCCCTTCGGGCGAACGTCGAGGGTGGAGCTAATGGATAATGGTGGATGGAGGATGGATGATTGGTAGAAAGCAAGAACATCATATCCTGCCAGATGGCCTGGTTAATGATTAACCACGTGACTGTTAATGTGTAACCTGATTGGTCACCGTGACTGTGCATATATTGCGTATAAAAGGAGGAGCTCCTCAGTCGCCAGTCAGCTGCTGACTTGTTCAGAGCTCGAACTGGCCGCTCTTTTCGGAGCCGGATCCGGATCTACGTGGTCGCTGTCTCAGTTCCTGCCGAACCTCTCTGCCGGTAAGATGAGCCTTCCGACTCGCGGCGGTTTCACGGCGGTTTTCGCGCTTCCCGACTGCATTCAGGTCGAAAAGAAAATTTTTGACCTGCGTGCCGCCGCGAACGCGGGCTACACGAACCCCGAGACGGGCGAATTCGTGTGCAGCCGAATGCCGGTGGACCACGAGCTGCAGGAGGAATATAGGAGGTTTCACGAGAACCCGAATTGGGATCATTGCGAAAGCCCGTGGCTCCAGGTTCAGCAGAAGCTGCTGATGAGCGCGGTGCGGATAGAGACCTCGATGCAGCCTCACGCCAAGATATTCTGGCAGGCCGAGGAATCTACCAACGGCAAGATCCACTTTCACGTTCTCTTTATCTCCGGGTTCACGTCCAAGAACATTTCCTGGACGATGAAACGGATGAGGCGGGAAATCGTTAAGGAGGGTAGCGAGCTGTACCACGCTTACTGTCCCGACATCAAAAAGGCGGGAATCTGGGGAGCTCTGAACAACATCGGCGCTGCCATGCTCACTCTGAACCGGGGATACTCCCCGAAACTGGGCCAGACCGTACCTCATCCGGTGAACCCTCACTCGTTCGCGAGGTACTACATGTACATCGAGGGGAATACGCCATTGTACAGGTGGGATTCTCTTAACCTGATATCAGACGGGCTGGTGACCAGCAAGCTCTACGCGCCATTCACCATGTCCTCCGCACAGGATTACGGGCCCGAAGTATACGTGGAGACCATCAGACCGGGTGACAAGCTACGGATCTCGTGCATGAGTCAGGAATCGGACTGGGCGCGCGGCAGCGGGGACACGGTGATACAGACCGGGGTGATGGAAAAGCTGTGCATGGAGGCATTGAGATTGTGCCGAGACGGGTGCATTTACAATCTGAGGGATTTCAAAATCAGACATCCCTACAAATTCAGGCAGTTGGGGTGGCGGAGGCAGGGGATACCTCAACTGACTCAAACTATCCATATTCAGGTAGACACCATTGTTTCTCAGAGCACCGCCTGGGAAATCGTTAAGCAGGTTCACGGGGACGAGGACGTCGATTGTCTCGACGATAACAGGGTGGTTCATCTCTATGCTTGGCAAGGGTACTCGCCCCGGTACGTGGCGCATACGCTGCTGTGTTGGCTGTCCGGTAACATGGGGAAAAAGAACACGGTCTACTTTTACGGGCCCGCCAACACGGGCAACACCATGATGTACGAGTCCATCTGCAAGATCGTCGCCATCTACGGGAACGTTAACCTCAACAACGGCAACTTCCCGTTTAACGACTGTCACGGCAAGGCCCTGCTGTGGTGGGAGGAATGCACAATGAAGGAGGAATACGTAGAGGCGGCAAAGTGCCTGATGGGAGGGTCTAGCGTCAGGGTAGACAAGAAGGGGGAAGACTCGGTCCTGATAGAAAAAACCCCGATGGTCATCACCAGCAACAACGACATTGCCGTGGTCGCGAGCCGGAACGCGGTCTCCGGCAATCACGAGGCGGCAATCAGGGCCCGCTGCCTGAGGTTCAACTTTAACAAGTGGCTGACCTCCAACTGGGGCGCGGTGACCGTCAGGGACATGTACCAGTTCCTGAGCTGGGGAGAGACCCTCGGGTCCCCGACCCTCGAGACGTACTTGCGGCTGAACGAGAAGTACGCGGACAAGCTCCCGTACAACCAGCCGAAAATTGAGCTGTGCGATCATTGTGTCCAACAGTTTACCTTCCGGGAGACGTTAACTCTGTGTCCCTCCTGCGGTGGGTGGACCCCCAAGAGTATCTCGGGGGATTCGACGAGTGGATACTGGAAAGGGGAGAGCGATCAAAGCTTGTACGACGCGGTGCGTTCCGAACAGGTATGTGCGAGGATGCTGTAGAGTCTATACAGCGCGTGTATCCCCTACGCAGACTAACAGCCTCCTCTCGCACATAGGACGTGGAACTTCTAGCCGACGGAGACCGCTACAAGTACCAGTGGATCGAGAAGAGAGCGGGATTGACTCCGACCCAGAACAGTCGGAAGAGAGACCGTCCCGCGTCTCCAGACAGTACATCCGCTGGTCCCTCGACCTCGACAAAGTGCTCACGACTGACCTCTGAGGCCGACTCGACCTCCGGCTCGGGTGCGGACGGGTGTAACGGGTTTAGCTGTACTCTTAATGGAAATTTTGGGGCGCTGGGTGGCCGATCGGTATATTGTGATCGCGGGCTACGCGTTGTGGATCCTAGCCTGGGTCCTAGTCTTACAGAGCTGTTTTGCGACGGGGAAGATATACGACCCGCGCGGTCATTACAAACTAGAAACTCATCAGTGCGGGGACGGGCCTCCGGGCGCTCCAGTAGTGAGGTCGCTGAGGTGGGGGCAGTGCACGACTCTCGACGGGGAAATTCGGTATCACCGTCTGACCGGGAAACGTCAGCCGCCGTTCTCGCCCTAAAGTGCGATGAACCCATGCCTGTGTCGCCTCCTCCGAGGACTCCGACTCCTCTACCGAAGGGGGATCGGAGTGCTCAGAGCATTGGAGCTCTGTCATGGGCTGATACAGCAAATAGATGGGTGGATAGCCATGTGGGCAGATGGCGCATCGCTTTTAGTCTTTTTATGTCATGGCATGAGGCCAATATTGATAAAATCGATAGAGTTGCTAGTATGGTTACGGGTTCAGAACGCCTTACGATTCTCAGATTACTGGCGCCGGTAGTCTGCCACTACAAGTGCGCCATTAACCTGAGAGAGGCCATTATGGAGCACATGGTACACAGCGACTGGAGCACGGATGTAAACATCGACGTGCAATTAGAGCAGTGTATCCGGGTAGCGCAATCTGTCGAGCCGTTCGGGATATGGCAATGTATCGATCGGTTGGCCGCATTTTGTAACGCGCTCAATGTCCCGGCAGGTGCGACAGATGGGGAAGTGGACTCAGGCCGATTATGACGCGTACAATAACACTGTGTACTGGCTAAATAAATATTTGAAAGGCCCCAAGATAAACAACGCTAAAAAGCCTCAGCGTCAGTTGTCCGATAAACAGAAGGCTGACCGTAAACGGTATTTTATCACGCAGGCCAATAAAGCCAAGAAAGAGGGCATCAAGTTCGGTATCCCCAGCAAGAAAGACCACGAATCCTTTTTCAAAAATCACCAGGGGGCTGGTAAGAAGGCTACGCAGAAAACCAAACATCTCGATCCGACGCCGGACTCGGATCCTGACGAGGGTCCGGCCCCAAAAGTACCAAAAACAGACCTCGGAGGAGGCTACACAGCTGACGACCTCGAGGCGGCCATGGATCCGCGTAACGACGTCGAGATGGCAGCGGCCGATTCTTCGGCTGATGCTGCGGTGCCTATGTCTGACAGCCCATCCGGTGGAGGCGGAGGAGGAGGTGGGGGAGGCATAGGGGAGAGCACGGGGAACTGGACTTGTGAAACTATATGGGGTAGCAATAGTATAATTACAAACGCTTCTAGACATTGCGTGTGTCTGACTAGAGATTTAGATAAATACACCGCGATCGGGAATAATTCGTTTACCGACCGGTTCGATAACGAGAACGCGACGCCGTGGGTAGGGTGGTCCACTCCATGGAACTATATCGATTTCAACCAAATGTGTATACACTTTAGCCCCAGAGACTGGCAACGATTAATAAACGGCGCCAGCAGGTGGAGGCCAAAGTCTGTGCACGTTAAAATATTCAATATACAAGTAATCCAAAAAACAACAACCGCAGATGGCGTTCAATATTCGAACGACCTGACGGGAACAATCCAGATATTTGCAGACTCTGCCGGCAAATATCCCAGATTAATGTATCCGTGTCAGACCACCATGATGGGCCCATTTCCGAACCAGGTGTACTATCTGCCCCAATACGCGTACACGACCGCGTGCGACGGACCGGAAAGCAACCAGCAGATAAACGCGCTGTTAAATCAATATAGCGCGTTTTACTGCCTAGACGAAAGCGCTAGCGCGATGTTAAGAACAGGGAACGAATGGTCGTGTCACTACACGTTCGGGGCAGACACCGATTGGGTGCATAATAGACGCAGCACGATCCCAATAAACGAGCGCGTCAACCCGCTGTACGATACGTGGCAGGTTAATCTAAGAGGAGACGACGCCAAACGCGGACATTTCGCGTCATGGCGCCAACCATGGTTACCAGGGCCGGTTATCAGTATAACAGATAGCACGGCATCAGACGCCGAACTGAACGTAAGCTCCGGCGTCGCAATCGGGCCTAGCTATATGGGGATAGTACCAGGACCGCCAATGTGCAGAGGGGAATCGTCGAAAGACGAGTACCTGCAAACGTTCTGGATACCTAAGAACGTAGGCATGAACGAGGGAGACGTTAAGAACGCACAAATATCAGCTAGCACAGCGTATAAAAAACAGGTACCCACCGGCAGACTATGGGAGGTAAACCCTAGGGGGTTGTATAGAGTAGGAGGAAATCAGGGAGCGTCGGAAGATAACAAATGGTCAGGCTGCGTGCCGGGCATGATATGGGATCGCCGACCCGCAACATATTTCGATCCGATATGGCAGGAAAAACCAGAAACGGACGACAGCTTCATGTACGTCAGTCAGATGGGCGGATGCGCGGTCAGTGGAGCCCCCGGCCACATCTTCGTGAAAAACACGCCCAAACCGACAGGCGCGCAGAGCACGTACGTAGACGAATACTCGACGTTCACGATAACGGTAACGATGGAATGGGAGTACGTGCCACACAATTACAGCCAGTGGAACTCGTACAAGACAATATCGAATACGGAAGCGCAAGCGCAGGCGTATCTCGGCATGGTAAACGCGTCGGGCGTATACGTGACGGGGATGGACGGGGACAATCCGGTGGAGCTGCACGTGACGAAGAATTTACCTCGCGTGAATTGAAAGTCGTATACCGGTCAAAACGTCGCCATACGGGCTGTGTAATTATATAAAT
| 12,698
|
OP094643.1
|
Red-crowned crane parvovirus
|
Liu,H., Huang,J., Lu,Z., Tang,T., Liang,X., Li,L., Sun,W., Bai,X.
|
School of Life Sciences and I Engineering, Foshan University
|
China
|
2023-02-12
|
JL-21/10
|
Aveparvovirus gruiform1
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,459
|
GenBank
| null |
China: Jilin
|
China
|
Grus japonensis
|
feces
|
2021-10
| null | null |
Red-crowned crane parvovirus isolate JL-21/10, complete genome
|
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| 18,387
|
KY312546.1
|
Red-crowned crane parvovirus
|
Yang,S., Wang,Y., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2018-02-04
|
yc-7
|
Aveparvovirus gruiform1
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,515
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Grus japonensis
|
feces
|
2014-12
| null | null |
Red-crowned crane parvovirus isolate yc-7, complete genome
|
CACATTAACAGTCACGTGGTTAGTCATTAACCAGGCCATCTGGCAGGATATGATGTTCTTGCTTTCTACCAATCATCCATCCTCCATCCACCATTATCCATTAGCCCCACCCTCGACGTTCGCCCGAAGGGCGCGGCTTCGCCGCTGAACTAGAGGGTGGAGCTAATGGATAATGGTGGATGGAGGATGGATGATTGGTAGAAAGCAAGAACATCATATCCTGCCAGATGGCCTGGTTAATGATTAACCACGTGACTGTTAATGTGTAACCTGATTGGTCACCGTGACTGTGCATATATTGCGTATAAAAGGAGGAGCTCCTCAGTCGCCAGTCAGCTGCTGACTTGTTCAGAGCTCGAACTGGCCGCTCTTTTCGGAGCCGGATCCGGATCTACGTGGTCGCTGTCTCAGTTCCTGCCGAACCTCTCTGCCGGTAAGATGAGCCTTCCGACTCGCGGCGGTTTCACGGCGGTTTTCGCGCTTCCCGACTGCATTCAGGTCGAAAAGAAAATTTTTGACCTGCGTGCCGCCGCGAACGCGGGCTACACGAACCCCGAGACGGGCGAATTCGTGTGCAGCCGAATGCCGGTGGACCACGAGCTGCAGGAGGAATATAGGAGGTTTCACGAGAACCCGAATTGGGATCATTGCGAAAGCCCGTGGCTCCAGGTTCAGCAGAAGCTGCTGATGAGCGCGGTGCGGATAGAGACCTCGATGCAGCCTCACGCCAAGATATTCTGGCAGGCCGAGGAATCTACCAGCGGCAAGATCCACTTTCACGTTCTCTTTATCTCCGGGTTCACGTCCAAGAACATTTCCTGGACGATGAAACGGATGAGGCGGGAAATCGTTAAGGAGGCTAGCGAGCTGTACCACGCTTACTGTCCCGACATCAAAAAGGCGGGAATCTGGGGAGCTCTGAACAACATCAGCGCTGCCATGCTCAGTCTGAACAGGGGATACTCCCCGAAACTGGGCAAGAGCATACCTCAGCCGGTGAACCCTTACTCGTTCGCGAGGTACTACATGTACAACGAGGGGAAAAGGGTGCTGTACAGGTGGGCTACGCCTAACCTGATCGCCGACGGGCTGGTGACCAGCAAGCTCAACGCGCCCTTCACCATGGCCGCCGCTCAGGACGACGGGCCCGACGTATCCGTCGAGACCCTCAGACCGGGCGACACGCTCCCGGTCTCTTACGTGAGTACCGAATCGGACTGGGCGCGCGGCAGCGGGGACACGGTGATACAGACCGGGGTGATGGAAAAGCTGTGCATGGAGGCGCTGAGATTGTGCCGAGACGGGTGCATTTACAATCTGAGGGATTTCAAAATCAGACATCCCGACAAATTCATGCAGTTCGGGTCGCGGAGCCAGGGGATACCTAAACTGACTCAGACTATCCAACTTTACGTAGACACCATTGTTTCTGAGAGCACCGCCTGGGAAATCGCTAAGCAGGTTCACGGGGACGTGGACGTCGATTGTCTCGACGATAACAGGGTGGTTCAGCTCTGTACTTGGCAAGGGTACTCGCCCCGGTACGTGGCGCATACGCTGCTGTGCTGGCTGTCCGGTAACATGGGGAAAAAGAACACGGTCTACTTTTACGGTCCCGCCAACACGGGCAAGACCATGATGGCCGAGTCCATCTGCAAGATGGTCGGCATCTACGGGAACGTTAACCACAACAACGGCAACTTCCCGTTTAACGACTGTCACGGCAAAGCCGTGCTGTGGTGGGAGGAATGCACCATGAAGGAAGAGTACGTGGAGGCGGCAAAGTGCCTGATGGGAGGGTCTAGCGTCAGGGTAGACAAGAAGGGGGAAGACTCGGTCCTGATAGAAAAGACCCCGATGGTCATCACCAGCAACAACGACATTGCCGTGGTCGCGAGCCGGAACGCGGTCTCCGGCAATCACGAGGCGGCAATCAGGGCCCGCTGCCTGAGGTTCAACTTTAACAAGTGGCTGACCTCCAACTGGGGCGCGGTGACCGTCAGGGACATGTACCAGTTCCTGAGCTGGGGAGAGACCCTCGGGTCCCCGACCCTCGAGACGTACTTGCGGCTGAACGAGAAGTACGCGGACAAGCTCCCGTACAACCAGCCGAAAATTGAGCTGTGCGATCATTGTGTCCAACAGTTTACCTTCCGGGAGACGTTAACTCTGTGTCCCTCCTGCGGTGGGTGGACCCCCAAGAGTATCTCGGGGGATTCGACGAGTGGATACTGGAAAGGGGAGAGCGATCAAAGCTTGTACGACGCGGTGCGTTCCGAGCAGGTATGTGCGAGGATGCTGTAGAGTCTATACAGCGCGTGTATCCCCTACGCAGACTAACAGCCTCCTCTCGCACATAGGACGTGGAACTTCTAGCCGACGGAGACCGCTACAAGTACCAGTGGATCGAGAAGAGAGCGGGATTGACTCCGACCCAGAGCAGTCGGAAGAGAGACCGTCCCGCGTCTCCAGACAGTACATCCGCTGGTCCCTCGACCTCGACAAAGTGCTCGCGACTGACCTCTGAGGCCGACTCGACCTCCGGCTCGGGTGCGGACGGGTGTAACGGGTTTAGCTGTACTCTTAATGGAAGTTTTGGGGCGCTGGGTGGCCGATCGGTATATTGTGATCGCGGGCTACGCGTTGTGGATCCTAGCCTGGGTCCTAGTCTTACAGAGCTGTTTTGCGACGGGGAAGATATACGACCCGCGCGGTCATTACAAACTAGAAACTCATCAGTGCGGGGACGGGCCTCCGGGCGCTCCAGTAGTGAGGTCGCTGAGGTGGGGGCAGTGCACGACTCTCGACGGGGAAATTCGGTATCACCGTCTGACCGGGAAACGTCAGCCGCCGTTCTCGCCCTAAAGTGCGATGAACCCATGCCTGTGTCGCCTCCTCCGAGGACTCCGACTCCTCTACCGAAGGGGGATCGGAGTGCTCAGAGCATTGGAGCTCTGTCATGGGCTGATACAGCAAATAGATGGGTGGAGAGCCATGTGGGCAGATGGCGCATCGCTTTTAGTCTTTTTATGTCATGGCATGAGGCCAATATTGATAAAATCGATAGAGTTGCTAGTATGGTTACGGGTTCAGAACGCCTTACGATTCTCAGATTACTGGCGCCGGTAGTCTGCCACTACAAGTGCGCCATTAACCTGAGAGAGGCCATTATGGAGCACATGGTACACAGCGACTGGAGCACGGATGTAAACATCGACGTGCAATTAGAGCAGTGTATCCGGGTAGCGCAATCTGTCGAGCCGTTCGGGATATGGCAATGTATCGATCGGTTGGCCGCATTTTGTAACGCGCTCAATGTCCCGGCAGGTGCGACAGATGGGGAAGTGGACTCAGGCCGATTATGACGCGTACAATAACACTGTGTACTGGCTAAATAAATATTTGAAAGGCCCCAAGATAAACAACGCTAAAAAGCCTCAGCGTCAGTTGTCCGATAAACAGAAGGCTGACCGTAAACGGTATTTTATCACGCAGGCCAATAAAGCCAAGAAAGAGGGCATCAAGTTCGGTATCCCCAGCAAGAAAGACCACGAATCCTTTTTCAAAAATCACCAGGGGGCTGGTAAGAAGGCTACGCAGAAAACCAAACATCTCGATCCGACGCCGGACTCGGATCCTGACGAGGGTCCGGCCCCAAAAGTACCAAAAACAGACCTCGGAGGAGGCTACACCGCTGACGACCTCGAGGAGGCCATGGATCCGCGTAACGACGTCGAGATGGCAGCGGCCGATTCTTCGGCTGATGCTGCGGTGCCTATGTCTGACAGCCCATCCGGTGGAGGCGGAGGAGGAGGTGGGGGAGGCATAGGGGAGAGCACGGGGAACTGGACTTGTAACACGGTGTGGGGGAAAAACAGCATAATTACAAACGCTTCTAGACACTGCGTGTGCCTGACTAGAGATTTAGACATGTACAAAGCGATCGGGAATAAGGATAACGGGTTAGTGTTTGGAACCGAAAACAAAACCGCGTGGGTCGGGTGGTCGACCCCGTGGAACTATATAGATTACAATCAGATGTGCGTCCATTTCAGCCCACGGGACTGGCAGCGGTTGATAAACACCGCCAGTAAATGGCGTCCGCGTTCGGTCCACATTAAAATATTCAACATCCAAGTAATACAAAAAACTACTGTGAGCGACGGTACTCAATACTCAAACGATCTGACGGGGACAATTCAAATTTTCGCAGACGCTCAGGGCAGATATCCTAAGCTATTATACCCGTGCCAAACCACAATGATGGGTCCGTTCCCAAATCATATATATTACCTGCCACAGTACGCGTACACTACCGCATGCGACGGGCCGACGTCAAATCAAGACATAAACGCGTTACTTAATACAAACAGCGCGTTCTATTGTCTGGACGAAAGCCCGAGTGCAATGCTGCGCACCGGCAACGAGTGGTCGTGTCACTATACGTTCGACGACGACACCGGCTGGGTGCACAATACACGTTCGACTATACCAATATTCGAACGTGCTAATCCGCTGTACGATACTTGGCAAGTAGATCTAAGAGGGAACGACGCGTTAAGAGGACATTTCAGCTCGTGGAGACAGCCGTGGCTACCGGGACCGGTCATAAATATGACCGACGGAACTGCCGCTGGGGCGAACCTAAATACAATGCCAGGCGTAGACGTAGGGGCTTCGTATATGGGAATAGTACCAGGCCCCCCGATATGTCGCGCAGAAAACGATAAAGACGAGTACTTGCAAACGTTCTGGACTCCCAAGACAATCGGTCAAAACGAAGGAGACGTTAAAAACAGCCAAATAAATACAAGTACTGCGTATAAATCACAAGTGCCAACCGGCCGATTATGGGAGGTTAACGCGAGAGGACAGTATAAGGCCGCCAGTAGCCAGGGAAATGTAGCGGACCAACAATGGGCGGGATGCATACCGGGTATGATATGGGATAGGCGTCCAGCTACGTATTTCGATCCGATTTGGCAGGAAAAACCAATAAC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| 72,240
|
KY312547.1
|
Red-crowned crane parvovirus
|
Yang,S., Wang,Y., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2018-02-04
|
yc-8
|
Aveparvovirus gruiform1
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,456
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Grus japonensis
|
feces
|
2014-12
| null | null |
Red-crowned crane parvovirus isolate yc-8, complete genome
|
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| 72,241
|
NC_009041.1
|
Rehmannia mosaic virus
|
Zhang,Z.C., Lei,C.Y., Zhang,L.F., Yang,X.X., Chen,R., Zhang,D.S., Zhang,Z., Lei,C., Zhang,L., Yang,X., Zhang,D.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2007-02-26
|
Henan
|
Rehmannia mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,395
|
RefSeq
| 1
|
China
|
China
|
Rehmannia glutinosa
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Rehmannia mosaic virus, complete genome
|
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| 8,001
|
LC571586.1
|
Rehmannia mosaic virus
|
Komiyama,N., Sakuta,K., Mikage,M., Shinohara,H., Iwanami,T., Negishi,H., Kim,O.K., Kim,O.
|
Department of Agriculture; 1737 Funako, Atsugi, Kanagawa 243-0034
|
Japan
|
2020-08-08
|
Jiou
|
Rehmannia mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,395
|
GenBank
| 1
|
Japan: Ishikawa
|
Japan
|
Rehmannia glutinosa
| null |
2017-11-17
| null | null |
Rehmannia mosaic virus Jiou RNA, complete genome
|
GTATTTTTTAACAACAATTACCAACAACAACAAACAATTAAACAACATTACAATCACTATTTACAACTACAATGGCATACACACAAACAGCTACCACATCTGCTTTGCTTGACACTGTCCGAGGTAACAACACCTTGGTCAATGATCTTGCAAAGCGTCGCTTGTACGACACAGCGGTTGAAGAGTTCAACGCTCGAGACCGTAGGCCAAAAATAAACTTTTCAAAAGCGATAAGCGAAGAACAGACTCTTATTGCTACACGGGCTTATCCGGAATTCCAAATTACATTTTACAATACCCAAAACGCTGTGCATTCACTTGCAGGCGGGTTGCGATCATTAGAATTGGAATACCTGATGATGCAAGTTCCGTATGGGTCACTGACTTATGATATCGGAGGGAACTTCGCATCGCATCTGTTCAAAGGACGGGCATACGTGCATTGTTGCATGCCAAATCTTGACGTCCGCGACATCATGCGGCACGAGAGCCAGAAGGACAGCATTGAATTATACCTTTCCAGGTTAGACAGAGGGAATAAAGTTGTTCCGAGCTTCCAGAAAGAAGCCTTCGACAGATATGCGGAATCTCCGCAGGATGTCGTTTGTCACAACACTTTCCAAACTTGTGAGCATCAGCATTTCCAGAACTCTGGCAGGGTGTATGCCATCGCGTTACACAGTATCTACGATATTCCTGCCGATGAATTTGGCGCTGCACTTCTAAGGAAAAATGTTCATACATGCTACGCTGCTTTCCACTTCGCCGAAGGTCTTCTTCTAGAAGATTCTTACGTCAACTTGGACGAAATCAACGCGTGTTTTATGCGTGATGGGGACAGGTTGACTTTTTCTTTTGCATCTGAGAGTACTCTTAATTATTCTCATAGCTACTCTAATATTTTAAAGTATGTGTGCAAAACCTACTTCCCAGCCTCTAATAGAGAGGTTTACATGAAGGAGTTTTTAGTTACCAGGGTTAACACCTGGTTTTGCAAGTTTTCTAGAATAGATACTTTTTTACTGTACAAAGGTGTGGCGCACAAGAGTGTGGATAGTGAGCAGTTTTATACTGCAATGGAGGATGCATGGCATTACAAAAAGACACTTGCGATGTGCAACAGCGAGAGAATCCTTCTAGAGGATTCCTCCTCAGTCAATTACTGGTTCCCAAAAATGAGGGACATGGTCATTGTGCCATTGTTCGACATATCTCTCGAGACCAGTAAAAGGACTCGCAGCGAGGTCTTAGTGTCCAAAGATTTTGTTTTTACTGTTCTCAACCACATCCGCACGTACCAGGCCAAAGCTCTAACTTACTCGAATGTGTTATCCTTCGTCGAATCAATTCGGTCGAGGGTGATCATTAATGGGGTAACAGCGAGGTCTGAGTGGGATGTTGATAAGTCACTTTTACCGAGTTTATCCATGACATTCTTCTTGCATACAAAACTTGCAGTTCTTAAAGACGATCTATTGATCCGCAAGTTCAGTCTCGGGCCCAAAACTGTATGTCAACACATATGGGATGAGATCTCATTGGCCTTTGGCAGCGCTTTCCCGTCGATTAAAGAAAGACTTTTGAACAGGAAACTGATCAAAGTGGCTGGCGACGCGTTAGAGATTAGGGTGCCTGATCTTTACGTAACATTCCACGATAGATTGGTGACCGAGTACAAAGCCTCGGTGGATATGCCTGCACTTGACATAAGGAAAAGGATGGAAGAAACTGAAACGATGTACAACGCGCTTTCAGAGTTGTCGGTTCTAAAAGAGTCTGACAAATTCGATGTTGATGTTTTTTCCCAGATGTGCCAAAAGTTGGAGGTAGACCCAATGACGGCCGCAAAGGTTATAGTGGCAGTGATGAGCAATGAGAGTGGTCTCACGCTCACGTTTGAACAACCAACAGAAGCTAACGTCGCATTGGCTTTGCATGATTCAGAGAAGGCTTCAGAAGGTGCACTTGTGGTCACCTCTCGTGATGTAGAAGAGCCCTCCATGAAAGGTTCGATGGCAAGGGGTGAGTTACAATTAGCTGGTCTTACCGGAGACCATCCGGAGTCAACCTATACTAGGAACGAGGAAATTGAGTCATTGGAGCAGTTTCATATGGCAACGGCAGAGTCTTTAATTCGCAAACAGATGAGCTCGATTGTGTACACAGGTCCGATTAAAGTTCAGCAAATGAAAAACTTTATCGATAGCCTGGTAGCATCACTATCTGCTGCGGTGTCGAATCTTGTCAAGATCCTAAAGGATACTGCTGCTATTGATTTAGAAACCCGTCAAAAGTTTGGAGTCTTCGACGTTGCGTCAAGGAAGTGGCTAATCAAACCCACTGCTAAGAGTCACGCATGGGGAGTGGTAGAAACTCACGCGAGGAAATACCATGTTGCACTTTTAGAGTATGACGAACAAGGGATAATTACATGCGATTCTTGGAGGAGAGTGGCGGTCAGTTCTGAATCTGTTGTTTACTCTGACATGGCCAAACTTAAAACTTTAAGGAAATTGCTTCATAATGGTGAACCACACGTAAGCACAGCAAGAGTTGTACTCGTGGATGGCGTCCCAGGGTGTGGAAAAACCAAAGAAATCCTTTCAAGAGTTAATTTCGAAGAGGATTTAATCTTAGTACCTGGGAAGCAAGCTGCTGAAATGATCAAGAGACGTGCAAACGCCTCAGGTGTTATCGTGGCCACGAAGGACAATGTAAGGACCGTAGACTCTTTCATGATGAATTACGGAAAGGCTACGCGCTGTCAGTTCAAGAGGCTGTTCATTGACGAAGGTCTAATGTTACACACTGGTTGTGTGAATTTTCTCGTGTCTATGTCTTTGTGCGAAATTGCATATGTTTATGGAGACACGCAGCAAATTCCGTATATCAACAGAGTTACAGGTTTCCCATACCCAGCCCATTTTGCTAAACTGGAAGTTGACGAAGTGGAGACGCGCAGAACTACTCTGCGTTGTCCTGCCGACGTCACTCATTATCTGAACAAAAGGTATGAAGGGTTTGTGATGAGTACATCGTCTGTCAAGAGATCCGTATCCCAAGAGATGGTGAGTGGTGCGGCGACCATCAACCCGATCTCCAAACCTTTGCATGGTAAGGTCTTGACCTTCACTCAGTCCGACAAGGAAGCTCTGCTTTCGAGAGGGTACTCTGACGTACATACTGTGCATGAGGTACAAGGAGAGACGTATAGCGATGTGTCTCTTGTGAGGTTAACCCCTACTCCTGTCTCGATCATCTCTGGTGACAGTCCTCATGTTTTGGTTGCTCTTTCGAGGCATACATGTTCACTTAAGTACTACACTGTTGTGATGGATCCCTTAGTTAGTATTATTAGAGATTTAGAAAAACTTAGCACTTTCTTGTTAGACATGTACAAAGTTGATGCTAGTACGCAATAGCAATTACAGATAGACTCGGTGTTTAAAGGTTCTAATCTTTTTGTGGCTGCTCCGAAGACTGGCGATATTTCCGATATGCAATTTTACTATGATAAGTGTCTCCCTGGGAATAGTACCATGATGAACAATTATGATGCTGTGACCATGAGGCTGACTGATATTTCATTGAATGTCAAAGATTGCATATTAGACATGTCCAAGTCTGTTGCAGCTCCGAAGGATTTACATTTTCCACTGATACCGATGGTACGGACGGCCGCCGAGATGCCGCGCCAAACTGGGCTATTGGAAAATTTGGTGGCAATGATAAAAAGAAACTTTAACGCACCCGAGTTGTCAGGAATTGTAGATATTGAGAATACTGCATCTTTGGTTGTAGATAGGTTTTTCGATAGTTACTTGCTTAAAGAAAAAAGAAAACCAAATAAAAATGTTTCTTTGTTCAGTAGAGAGTCTCTCAATAGATGGTTAGAAAAACAAGAGCAAGCGACTATTGGCCAACTTGCAGATTTCGATTTTGTCGACTTGCCCGCGGTTGATCAGTATAGGCACATGATAAAAGCACAACCTAAGCAGAAACTGGACACATCCATTCAATCGGAGTATCCTGCTCTGCAGACGATTGTGTACCACTCAAAGAAGATTAACGCGATTTTCGGCCCTTTGTTTAGTGAATTAACTAGACAGTTGCTCGACAGTGTGGACTCAAGCAGATTTCTGTTCTTTACACGAAAAACGCCAGCACAAATCGAGGAATTCTTCGGAGACCTTGATAGTCATGTGCCGATGGAAATTTTGGAGCTTGATATCTCAAAGTACGATAAATCTCAAAACGAATTTCACTGCGCTGTTGAGTACGAAATCTGGCGGAGACTAGGGTTCGAAGATTTCCTAGGAGAAGTTTGGAAACAAGGTCACAGGAAGACCACCCTCAAGGACTATACCGCAGGAATCAAAACTTGTATATGGTACCAGAGGAAGAGCGGTGACGTCACCACGTTCATTGGGAACACGGTGATCATCGCTGCATGCTTAGCTTCAATGCTCCCTATGGAAAAAATAATCAAAGGCGCCTTCTGCGGGGACGACAGTTTGCTCTATTTTCCGAAAGGATGCGAGTTCCCTGATGTACAACAAGCGGCAAATCTTATGTGGAATTTTGAAGCAAAACTGTTCAAAAAGCAATACGGGTACTTTTGCGGGAGGTACGTTATACATCACGACAGAGGGTGCATTGTCTATTACGACCCTCTAAAGTTGATCTCCAAGCTTGGTGCTAAACACATCAAAGATTGGGATCACTTAGAGGAATTCAGGAGGTCCCTTTGTGATGTTGCTGTTTCGTTGAACAATTGCGCGTACTACACGCAATTGGACGACGCGATCTGGGAGGTTCATAAAACCGCCCCGGCGGGTTCGTTTGTTTTTAAAAGTTTGGTAAAGTATCTGTCTGATAAGGTTCTTTTTAGAAGTTTATTTCTAGATGGCTCTAGTTGTTAAAGGGAAGGTGAATGTCGGTGAGTTTATTGACTTGACGAAAATGGAGAAATTGTTGCCGTCAATGTTCACACCAGTTAA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| 48,073
|
MG418836.1
|
Rehmannia mosaic virus
|
Kwon,S.-J., Cho,I.-S., Yoon,J.-Y., Jeong,B.-N.
|
National Institute of Horticultural and Herbal Science, Horticultural and Crop Herbal Environment Division
| null |
2018-03-13
|
RG
|
Rehmannia mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,395
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Rehmannia glutinosa
| null |
2016-09-23
| null | null |
Rehmannia mosaic virus isolate RG, complete genome
|
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| 71,829
|
MF348202.1
|
Rehmannia mosaic virus
|
Debat,H.J.
|
INTA, IPAVE-CIAP
|
Argentina
|
2018-03-11
|
NcaS
|
Rehmannia mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
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|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
| null | null |
2013-07-21
| null | null |
Rehmannia mosaic virus isolate NcaS, complete genome
|
AATTACCAACAACAACAAACAATTAAACAACATTACAATCACTATTTACAACTACAATGGCATACACACAGACAGCTACCACATCTGCTTTGCTCGACACTGTCCGAGGTAACAATACCTTGGTCAATGATCTTGCAAAGCGTCGTTTATACGACTCAGCGGTGGAAGAGTTTAACGCTCGAGACCGCAGGCCCAAAATAAACTTTTCAAAAGTGATAAGCGAGGAACAGACGCTTATTGCTACCAGGGCATATCCGGAATTCCAAATAACATTTTACAACACCCAAAACGCAGTGCATTCACTTGCAGGCGGGTTGCGATCATTGGAATTGGAATACCTGATGATGCAAGTTCCGTACGGTTCACTGACTTATGATATTGGAGGGAACTTTGCATCGCATCTGTTCAAAGGACGGGCATACGTGCATTGTTGCATGCCCAATCTTGACGTCCGCGACATCATGCGGCACGAGAGCCAGAAGGACAGCATTGAACTATATCTTTCCAGGCTTGACAGAGGGAACAAAGTCGTTCCGAGCTTCCAGAAAGAAGCTTTCGACAGATATGCGGAAAATCCACAGGATGTTGTTTGTCACAACACTTTCCAAACATGTGAGCATCAGCAATTCCAGAACTCTGGTAGAGTGTATGCCATCGCGCTGCACAGCATCTACGATATTCCTGCTGATGAATTTGGTGCAGCACTTCTAAGGAAAAATGTTCATACATGCTACGCTGCATTCCACTTCTCTGAAAATCTTCTTCTAGAAGATTCATATGTTAACTTGGACGAAATCAACGCGTGTTTCTCGCGTGATGGGGACAAGTTAACTTTTTCTTTTGCATCTGAGAGTACTCTTAGTTATTCGCATAGTTACTCTAATATTTTAAAGTATGTGTGCAAAACTTACTTCCCAGCCTCTAATAGAGAGGTGTACATGAAGGAGTTTTTAGTTACCAGGGTTAACACCTGGTTTTGTAAATTTTCTAGAATAGATACTTTTTTATTGTATAAAGGTGTAGCGCACAAGAGTGTAGATAGTGAGCAGTTTTATACTGCAATGGAGGATGCATGGCATTACAAAAAGACACTTGCGATGTGCAACAGTGAGAGAATCCTTCTTGAGGATTCCTCTTCAGTCAACTACTGGTTTCCAAAAATGAGGGACATGGTCATTGTACCATTGTTCGACATATCTCTTGAAACCTGTAAAAGAACCCGCAAGGAGGTCTTAGTGTCCAAAGACTTTGTATTTACAGTTCTCAATCATATACGTACATACCAGGCCAAAGCACTTACTTACTCGAATGTATTATCCTTCGTCGAATCAATTCGGTCAAGGGTAATCATTAATGGGGTAACCGCGAGGTCTGAGTGGGACGTTGATAAGTCGCTTTTGCAAAGTTTATCCATGACATTCTTCTTGCATACAAAACTTGCAGTTCTTAAAGATGATCTGTTGATCAGCAAGTTTAGTCTCGGGCCCAAAACTGTAAGCCAACATATATGGGATGAGATTTCATTGGCTTTTGGCAGTGCTTTCCCGTCGATAAAAGAAAGGCTTTTGAATAGGAAACTAATCAAAGTGGCTGGTGATGCGTTAGAGATTAGGGTGCCTGATCTTTACGTGACCTTCCACGACAGATTGGTAACCGAGTACAAAGCCTCGGTGGATATGCCTGCTCTTGATATAAGGAAAAGGATGGAAGAAACTGAAGTGATGTACAACGCTCTTTCTGAACTGTCGGTTCTAAAAGAGTCTGACAAATTCGATGTTGATGTTTTTTCCCAGATGTGCCAGAATTTGGAGGTGGACCCAATGACAGCCGCAAAGGTTATAGTGGCAGTGATGAGCAATGAGAGTGGTCTCACGCTCACGTTTGAAAAACCAACAGAAGCAAACGTCGCATTGGCTTTGCATGATTCAGAGAAGGCTTCAGAAGGTGCACTTGTGGTTACCTCTCGTGATGTGGAAGAGCCCTCCATGAAAGGTTCAATGGCAAGGGGTGAGTTACAATTAGCAGGTCTTATTGGTGACCATCCGGAGTCGTCCTATACAAGGAACGAGGAAATAGAGTCATTGGAGCAGTTTCATATGGCAACGGCAGAGTCGTTAATTCGCAAACAGATGAGCTCGATTGTGTACACAGGTCCGATTAAAGTTCAGCAAATGAAAAACTTTATCGATAGCCTGGTAGCATCACTATCTGCTGCGGTGTCGAATCTTGTCAAGATCCTAAAGGATACTGCTGCTATTGATCTCGAAACCCGTCAAAAGTTTGGAGTCTTCGACGTGGCGTCAAGGAAATGGCTAATCAAACCCACTGCTAAGAGTCACGCATGGGGAGTGGTGGAAACTCAAGCGAGGAAATACCATGTTGCACTTTTGGAGTACGATGAACAAGGGATAGTTACATGCGATTCTTGGAGGAGAGTAGCGGTCAGTTCAGAATCCGTCGTTTATTCTGACATGGCCAAACTTAAAACTCTGAGAAAATTGCTTCACAATGGTGAACCACAAGTTAGCACTGCAAGAGTTGTACTCGTGGACGGCGTCCCAGGGTGTGGAAAAACCAAAGAAATCCTTTCGAGAGTCAATTTTGAAGAGGATTTGATCTTAGTACCCGGGAAGCAAGCTGCTGAAATGATCAAGAGACGTGCGAACGCCTCAGGAGTTATCGTAGCCACGAAGGACAATGTAAGGACCGTTGATTCTTTCATGATGAATTACGGAAAAGTTGCACGCTGTCAGTTCAAGAGGTTGTTCATCGACGAAGGTTTAATGTTGCACACTGGTTGTGTGAATTTTCTCGTGTCTATGTCTTTGTGCGATATTGCATATGTTTACGGAGACACGCAGCAAATTCCATATATCAACAGAGTCACAGGTTTCCCATACCCAGCCCATTTTGCTAAACTGGAAGTGGACGAAGTGGAGACACGCAGAACTACTTTGCGTTGTCCTGCCGACGTCACTCACTATTTGAACAAAAGGTATGAAGGGTTTGTGATGAGCACTTCATCTGTCAAGAAATCTGTGTCCCAAGAGATGGTGAGTGGTGCGGCGACCATCAATCCAATCTCCAAGCCTTTGCACGGTAAGGTCTTAACTTTCACTCAGTCCGACAAGGAAGCTCTACTTTCGAGAGGGTACTCTGATGTACATACTGTACATGAGGTGCAAGGTGAGACGTATAATGATGTGTCTCTTGTGAGGTTGACCCCTACTCCTGTCTCGATCATCTCTAGTGACAGTCCTCATGTTTTGGTTGCTCTTTCAAGGCACACTTGTTCACTCAAGTACTACACTGTTGTGATGGATCCTTTAGTTAGTATCATTAGAGATTTAGAAAAGCTTAGTACTTACTTGTTAGACATGTACAAAGTAGATGCAGGCACGCAATAGCAATTACAGATAGACTCGGTGTTTAAAGGTTCTAATCTTTTTGTGGCCGCTCCGAAGACTGGCGATATTTCCGATATGCAATTTTACTATGATAAGTGTCTCCCTGGGAATAGTACCATGATGAATAATTATGATGCTGTGACCATGAGGTTGACTGACATTTCATTGAATGTCAAAGATTGCATATTGGACATGTCCAAGTCTGTTGCTGCTCCGAAAGATTCAAACATTCCACTGATACCGATGGTACGAACGGCCGCTGAAATGCCGCGCCAGACTGGACTATTGGAAAACTTAGTGGCGATGATAAAGAGAAACTTTAATGCACCCGAGTTGTCTGGAATTGTAGATATCGAGAATACTGCATCTTTAGTCGTAGACAAGTTTTTTGATAGCTATTTACTTAAAGAAAAGAGAAAACCAAATAAAAATGTTTCTTTGTTTAGTAGAGAGTCTCTCAATAGATGGTTAGAAAAACAGGAGCAAGCAACCATTGGCCAACTTGCTGATTTTGATTTTGTTGACTTGCCAGCGGTTGATCAGTACAGGCACATGATAAAAGCACAACCTAAGCAGAAACTGGACACATCCATTCAAACGGAGTATCCTGCTCTGCAAACGATTGTGTACCATTCAAAAAAGATCAACGCAATTTTTGGCCCTTTGTTCAGTGAGTTAACTAGACAGTTACTCGATAGCGTAGACTCAAGCAGATTTTTGTTCTTTACAAGAAAAACGCCGGCACAAATCGAGGAATTCTTTGGAGACCTTGATAGTCATGTGCCAATGGATGTTTTGGAGCTTGATATTTCGAAGTACGACAAATCTCAAAATGAATTTCATTGCGCTGTTGAGTACGAAATCTGGCGGAGACTAGGGTTCGAAGATTTCTTGGGAGAAGTTTGGAAACAAGGTCACAGGAAGACCACCCTCAAGGACTATACCGCAGGAATTAAAACCTGTATATGGTACCAGAGGAAAAGCGGTGACGTCACCACGTTCATTGGGAACACAGTGATCATCGCTGCATGCTTAGCTTCAATGCTTCCTATGGAGAAAATAATCAAAGGCGCCTTTTGCGGGGATGATAGTTTGCTTTACTTTCCGAAAGGATGCGAGTTCCCTGATGTACAGCAAGCGGCGAATCTTATGTGGAATTTTGAAGCAAAACTGTTCAAAAAGCAATACGGATACTTTTGTGGAAGGTACGTGATACATCACGACAGAGGGTGCATTGTTTATTACGACCCTTTAAAGTTGATCTCTAAGCTCGGTGCTAAACACATCAAGGATTGGGATCATTTAGAGGAATTCAGGAGGTCCCTTTGTGATGTTGCTGTTTCGTTGAACAATTGCGCGTACTACACGCAATTGGACGACGCGATCTGGGAGGTTCATAAAACCGCCCCGGCGGGTTCGTTTGTTTATAAAAGTTTGGTAAAGTATCTGTCAGATAAAGTTCTTTTCAGAAGTTTGTTTCTAGATGGCTCTAGTTGTTAATGGAAAGGTGAATGTCGGTGAGTTTATTGACTTGACGAAAATGGAGAAATTGTTGCCGTCAATGTTTACACCGGTTAAAAGTGTGATGTGCTC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| 71,842
|
KU133476.1
|
Rehmannia mosaic virus
|
Lim,S., Zhao,F., Yoo,R.H., Igori,D., Jeong,J.C., Lee,H.S., Kwak,S.S., Moon,J.S., Lee,H.-S., Kwak,S.-S.
|
Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, Plant Systems Engineering Research Center
| null |
2015-11-30
|
ES
|
Rehmannia mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,395
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
|
Rehmannia glutinosa
| null |
2014-05-20
| null | null |
Rehmannia mosaic virus isolate ES, complete genome
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