Accession
stringlengths 8
11
| Organism_Name
stringlengths 10
53
| Submitters
stringlengths 4
2.42k
⌀ | Organization
stringlengths 3
234
⌀ | Org_location
stringlengths 3
24
⌀ | Release_Date
stringlengths 10
10
| Isolate
stringlengths 1
75
⌀ | Species
stringlengths 10
53
⌀ | Genus
stringlengths 7
22
⌀ | Family
stringlengths 10
19
⌀ | Molecule_type
stringclasses 14
values | Length
int64 5k
95.4k
| Sequence_Type
stringclasses 2
values | Publications
float64 1
134
⌀ | Geo_Location
stringlengths 3
88
⌀ | Country
stringlengths 3
32
⌀ | Host
stringlengths 3
64
⌀ | Isolation_Source
stringlengths 3
31
⌀ | Collection_Date
stringlengths 4
10
⌀ | BioSample
stringlengths 12
14
⌀ | BioProject
stringlengths 9
23
⌀ | GenBank_Title
stringlengths 22
320
| Sequence
stringlengths 5k
95.4k
| __index_level_0__
int64 39
112k
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MZ447875.2
|
Rhinovirus C
|
Makhsous,N., Goya,S., Avendano,C., Kuypers,J., Jerome,K., Boeckh,M., Greninger,A., Waghmare,A.
|
University of Washington, Virology
|
USA
|
2021-08-08
|
HRV-C28/BAL12a/2013
|
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,003
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
|
lung
|
2013-01-11
| null | null |
Rhinovirus C strain BAL12a, complete genome
|
TAACATATAGAAGCTGGAACATACAGGCGAACAGGATGCCAACAATCCATGTTGGTTCACGCCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATTAGAGTGTTAAGCTTCTCGCGAGGCTGAAGCTTGATATGTCGTTATCCGCACAATTACTAAGCAGAGCCTAGTACCTCCTTGCTCTCTATATTGGCTGGTCGTTCCATCAGTAACCCCTGATAGACCTGGCAGATGGGGCTGGAAATTCCCCACTGGCGACAGTGTTCCAGCCCGCGTGGCTGCCTGTCCCCCTTCTTGGGGGAAAGCCATTATACAGACAAGGTGTGAAGAGCCGCGTTTGCTAATTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTACTGCATGGAAACCACCATGTGGGTAGTCGTAACGGGCAACTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATATTTTACTTTATCTCATGGTGACAACATATAGTGATAAATATATGTTGTTAACCATGGGCGCACAAGTGTCTAAGCAAAATACTGGATCTCACGAAAGTGCAATCAATGCCACTAATGGAGGTGTAATTAAATATTTTAACATTAATTATTACAGGGATTCTGCAAGTTCTGGGTTGACCAAACAAGATTTTTCACAAGATCCATCTAAGTTTACTCAACCTCTCGTTGACACATTGACAAATCCTGCTTTAATGTCCCCTTCAGTAGAAGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATCGGTAACTCCACAATCACTACCCAGGATGCTATAAACACAATCTTAGCTTATGGGGAATGGCCACAATATCTTTCTGACATTGACGCAACATCTGTTGACAAACCCACTCATCCCGAAACCTCGGCAGATAGATTCTACACTTTAGCCAGTGTAGAGTGGAATGTTAACTCTAAAGGTTGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTCTCAGGGACATGGGGATTTTTGGGCAAAACATGTACTACCACTCAATGGGAAGATCAGGTTACATAATACACACGCAATGCAATGCCACCAAATTCCACAGTGGAGCACTCCTAGTTGTCCTTATTCCAGAACATCAACTAGCTTACATAGGTRGTTCCAAAGTGGACGTAGCYTACAAACATACTCATCCTGGAGAGACCGGACACAAGATTGGTGAGAATGATCGGAGGCATGACAACCAACCAGATGAAGATCCATTCTACAATTGTAATGGTACACTTTTTGGTAACCTTACTATCTTTCCCCACCAGATTATCAATTTGAGAACAAACAACTCCAGTACAATTATAACACCATACATCAATTGTCAGCCTATGGATAATATGCTCAAGCACAACAACTTAACGTTGTTAATTGTGCCGCTAGTCACACTTAGAGCCAGCTCCACCACCCCACCAGTAGTATCTATAACTGTTACAATTGCACCATACAAGTCTGAGTTCTCAGGTGCTATGCAGCATCAAACACAAGGATTGCCCACACGTATCCCTAGTGGAGGTCAGCAGTTTATGACTACAGAAGATGAACAATCAGCTAACTTGCTCCCTGGATTCCATCCCAGCAAGAAAATACAGATTCCTGGCAAGATTACCAGTGTTCTCCACATGGCAAGGGTGGATTCATTTATGCCTATTAATAATATAAAAACTCAGGAGGGCAGTGTGAACATGTACCATATTACAGTTACTAGAAAGGGTACAAATAATGGGCTGATACTCACAATACCATTAGAGATGAGTAATACCCTCTTTTCCACTACACTGCTGGGTGAAGTACTCAACTACTTCACCAATTGGTCTGGTAGTGTAACCCTAACATTTATGTGTGTCTGTGACTCGTTCTCCACTGGTAAATTTCTCCTAGCTTACACACCACCAGGTGGCGCACATCCAAAGAACCGCAAGGAAGCCATGCTTGGTGTCCATATTATATGGGATCTGGGCTTGCAATCTTCATGCACTATGGTGGTACCATGGTTATCTTCAGGATTTTATAGAAGGACAGAATCAGATGATTACACACATGCTGGTTATGTGTCATTATGGCATCAGACTGATTTCATCCCATCATCATCACAGGTGACAGGAGGAGCAATCTTGGTTACTTGCAGCGGGTGCCCTGATCTGTCTGTTAGAATGTTGAGGGATACCCCAATGATGAAGCAAACCAATGATTTGCAAAATAATGATCCAATTGACACCTACGTCCATGATGTGCTTAATGAAGTAGTTGTGGTACCGGATACCAAACCATCAGGRCCCCAGCACACCACTAAACCCAGTGCTTTAGGTGCAATGGAGATAGGAGCCTCCAGTTCAGCCATTCCTGAATCAGTCATAGAAACTAGGTATGTAGTGAATGACAATACCAATGAAGAAGCTGAAATTGAGATGTTTCTAGGGCGGTCTGCATTATGGTCTAAATTAAATCTCACAGGTAAATTCGCCAAATGGAACATTAATTTCCAGGAACAGGCTAATATCAGAAAGAAATTTGAGCTCTTTACATACCTAAGGTTTGATATGGAGGTCACAATTGTTACCAATAATAAGGGTTTGATGCAGGTTATGTTCATTCCCCCAGGACTTAAGATCCCTAAAAATGACACCGACCGATTGTGGGATTCTGCATCAAATCCTAGTGTTTTCTTCCAACCCAAGAATGGATTCCCCCGTTTCACCATCCCTTTCACTGGATTAGCTTCAGCTTATTACATTTTCTATGATGGTTACACCACTAGAGATGTACCAGAAAGGAACAAATATGGTATTTCCCCAACAAATGACATGGGAACCCTGTGTTTCCGAGCTCTTGATGACTCGATTGATAGTCACATCAAAGTCTATATTAAACCAAAGCACATAACAGCTTGGATACCCAGACCACCTAGGGCTACTGAATACACTCATGCATACAGTACGAATTATCATTATAAGGAAAAGGATGCTTCAGAAGATACTTTAAAGAGCAGACACTTCATGGAATTTAGAACAGCAATTAAGAATGTGGGACCCAGTGACCTTTGTGTACATACTAAGGATGCTATATACACCTGTGCTCACCTCACTCATCCCAACGACAAAACAATCCTGTTGGCATTAACTGCAGATCTACAAGTTGATGCTTCAGACACACAAGGTCCAGATCACATACCTACTTGTGACTGCACACAAGCCTGCTACTACGCCAAGCATGCAGACAGATACTATCCAGTTAGCTTGACTTCACATGACTGGTATGAAATTCAGGAATCACAATTCTATCCAAAACATATACAGTATAACATCCTCATAGGAGAAGGTCCATGTAAACCCGGGGACTGTGGAGGCAAGCTACTCTGTAAGCACGGAGTGATAGGCATAATCACAGCAGGTGGTGAAGGGCATGTAGCATTCACAGACTTACGCCCATATGCTTGTCTCACCTCCCACCAGGGCATTGTTACTGATTATGTCAACCAACTCGGTGTTGCCTTCGGAGATGGTTTTTCCAGCAATATTAAAGACCACTTGACAGGATTGTGTACAACCATATCAGACAAGATCACCACCAGAGTTATCAAGTGGCTGATCCGAATTATCAGTGCCCTGACTATCATGATTAGAAATTCAACTGACACTGCAACAGTTTTAGCCACACTTGCCCTCTTAGGGTGCCATGGTTCTCCCTGGGCCTTCCTCAAAGACAAAATTTGCCAGTGGTTAAATATTCCCAAACCCCCATGTAGACAGGGAGAATCCTGGTTAAAGAAGTTCACTGAATGCTGTAATGCTGCTAAAGGTCTGGAATGGGTTGCTCAGAAGATAGGCAAGTTTATTGACTGGTTAAAAGAAAAACTCATACCAACAGTTCAAAGAAAGAAAGAAACCCTGGAACAATGCAGAAAGATAGGGCTATATGAGCAGCAAGTGCAGGGTTTCGCTCATTCTGATGCTGATGCCCAGCAACAGTTATTGGTGGAAGTATCCAAACTAAAAAGAGGCTTAGATGATCTTGCTCCATTATATGCTAGTGAAAATAAAAGAGTCACCAATATACAGAAAGATTTACAGCGTTTGACCGCGTATCAAAAGACTCACAGGCATGAACCTGTATGTTGCCTGATCCGAGGGTCACCTGGATGTGGTAAATCTTTGGTTACATCAATAATTGCACATGGTTTGACAAACGAGGCCAACATCTACTCACTACCACCAGATCCCAAACATTTTGATGGTTACAACCAGCAGGTAGTTGTGATTATGGATGATGTGGGACAAAACCCAGATGGAAAGGATCTCAGTATGTTTTGTCAGATGGTTTCTACTACTGAGTTCATAGTACCCATGGCAAGCATTGAAGACAAGGGGAGGTCATTTACTAGTCAGTATGTTCTTGCAAGCACTAATCTAGACTCTTTGACCCCACCAACCATCTCCATACCAGAAGCAATAAGCAGAAGATTTTTCCTAGATGCTGACTTACAGGTACTTAGCAAATATAGAACYTCAAATGGTTTGTTAGATGTGGCTAAGGCCTTACAACCATGTACAAAGTGCCCCAAACCTGCACACTACAAACAGTGTTGTCCAATACTATGTGGACAAGCACTGGTTTTAAGGGATAGGAGAACTTCAGCCAGCTACCCCATACTAGCAGTTGTTGAACAACTGAGGACAGAAAATGACACAAGAAGCAAGGTCAAAACCAATCTTAGAGCCATATTCCAGGGATTGGGTGATACCACACCACCAGGGTTCATAGTTGATTTGTTATCTAGTTCTAAGGACCCCAAGGTGATGGAATATTGTGTGGAGCAAGGATGGATGGGTAAAGCCTACTCAACAATAGAGAGAGACTTCAATTACGTGCAATATGCACTTAACTGTCTAGGTAGTCTTATTATAATCTTAGGAACCATATATGCTTTGTATAAGCTAATGTGCTTGACACAAGGAGCATATTCAGGAGTACCCACACCAGTAGTGAAAAAACCTGAACTCAGAAAAGCCACACTCCAGGGACCACAACATGAATTTATTAGGGCACTAGTGAAGAGAAACTGTCATGTGATCACCACCGATAAAGGTGAATTCAATCTACTTGGAATACATGATAATTGTGCTGTTGTCCCCACGCATGCTGAGTGTGGGGATTATGTGAATATTGATGGTAGAATGGTGAAAGTGCTGAAACAACAGGTTCTAACAGATATGGATGATGTAGACACTGAAATAACCTTAYTGTGGTTGGATCAGAATGAGAAATTTAGGGATATTAGAAGGTTCATTCCAGAACACCAACAGGAGTGGACGCACATGCACCTTGCAACTAACGTCACCAAATTCCCCATGATGGACGTGGAAGTGGGTGATGTAATACCATATGGTCAACTCAATCTCAGTGGAAACCCTACATGCAGGTTAATGAAGTATGATTACCCCACACGCCCTGGGCAATGCGGCGGTGTCATTCTAAACACTGGGAACATTGTCGCTATTCACGTTGGAGGCAATGGTAGAGTAGGGTACGGAGCAACCTTGTTGCGAAAGTATTTTGCTCAAGCCCAAGGTGACATATCCAAGAGAACAACAGCTAAAGATGCAGGCTACCACACTATCAACACCCCATCTAAGAGTAAGCTACACCCTAGTGTCTTTTATGACATCTTTCCAGGTTCTAAAGAACCAGCAGTTCTTAGTTCAAAAGATCCTAGACTGGAAGTGGATTTGGACACAGCCATATTTGCCAAGTACAAAGGTAATGTAGAAGTTAAATGGAATGAATACTTACAAACAGCAGTGGACCACTATGCAGCCCAGCTCTTCGTGTTGGACATAAACCCTGAACCCATAACAATGGAACAAGCAGTGTATGGAATAACAAACTTGGAGCCTTTGGATTTAACAACCAGTGCTGGATATCCATATGCTGCCCTTGGTATAAAGAAGAGGGATATTGTCAACAAGACTACCAGGGATGTAGTTAAATTACAACAAATGCTTGACCGCTATGGTGTTGATTTACCATACATTACATACTTAAAGGATGAACTGCGTAGTCCAGAAAAGATAAAGCTGGGTAAGACCAGGGCAATCGAGGCAGCTAGCCTCAATGACACTGTACAGTTCAGAATGATTTTTGGTAATCTCTTCTCCACATTCCATGCTAACCCAGGCATACTCACCGGATCCGCAGTTGGCTGCAACCCTGATATCTTCTGGTCCCAGTTGTATGCACTACTGGATGGTAGTTTATTAGCTTTTGATTACACCAATTATGATGGCAGTTTGCACCCAATATGGTTTGAAGCATTAGGTAAAGTTTTAGATCAGATAGGTTTTCCTGGGAGTCTGATGAAAAAGCTATGCAATACCACCCACATATACAAAGATCAGGTTTACATGGTGGAGGGAGGCATGCCTTCAGGGATTTGTGGAACCAGCATATTCAATACCATGATAAACAATATAATAATTAGAACTTTGATACTGGAAACCTACAAGGGAATAGATTTGGACAAGCTTAAAATGGTAGCATATGGTGATGATGTTTTGGCTTCATACCCTTTTCCTTTGGATGCAAAAGAGCTTTCTGAAACAGCAAAGAAGTATGGGCTTACCATCACCCCACCAGACAAATCCACAGAGTTCAAACCCATGACATGGGACAACGTTACTTTCCTCAAAAGAAAGTTTCGTCCTGATGACCGATACAGATTTCTCATCCACCCTGTGTACAGTATGGAGGATGTCCATGAATCAATCAGATGGACCAAGGATCCAAAAAACACTCAGGATCATGTGCGCTCATTGTGCCAACTGGCTTGGCATAATGGCAAAGAGTTGTATGACGAATTTCTTGAACGTGTTCGAACCTGCCCAGTGGGTAGACGCATACAACTTCCACCATATTCCAGCTTATACAGGCAATGGATAGATGAATTTATTTGAATGATATAGTATTATGTTTGCAGTAGGACTAGAT
| 39,569
|
MW679007.1
|
Rhinovirus C
|
Collins,C.L., Kraberger,S., Fontenele,R.S., Faleye,T.O.C., Sandrolini,H., Halden,R., Scotch,M., Varsani,A.
|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
|
2021-07-18
|
AZ6_4
|
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,952
|
GenBank
| null |
USA: Arizona, Tempe
|
USA
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2020-03-13
|
SAMN17914668
|
PRJNA701833
|
MAG: Rhinovirus C isolate AZ6_4, complete genome
|
AATTGCAACTTAGAAGTATTTTACATGAAGCCCAATAGGAAGCACCTTCCCCAGAGGTGTAGAGGGCAGGCACTTCTGTTACCCCGGGCGTGTGAATAGGCTTTACCCAAGGCTGAAGCTAAAGCGCTCGTTATCCGCACTACTACTGCGCAATGGCTAGTAGGACTCTGAATATGCTGTGTCGTTTCGCTCAGCAGTGAACCCCCCCTGTAGATCGGGGTAATGGGGCTACACAATCCCCACTGGCGACAGTGGTGTAGCCCGCGTGGTGCCCCGCCTGGGTCATAGACCCAGGACGCCACAGTATAGACAGGGTGTGAAGACCGGCGTGCGCTAGTTGTGAATCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCTAACCCTGCAGCCATTGCACACAAACCAGTGTGTTTATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGATGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTATTCTTTATTGTGTGCTTCTCATGGTTACAATTATAGTGTAATCATGGGTGCACAGGTGAGCAAACAGAATACTGGTTCGCATGAAAACTCTGTTTCAGCCTCTGGAGGATCAGTTATAAAATATTTTAACATCAATTACTACAAGGATTCTGCTAGTTCAGGTTTGACAAAACAAGACTTCTCTCAAGACCCCTCTAAGTTTACTCAACCTTTGGCAGAGGCACTGACAAACCCAGCACTAATGTCACCCAGTGTTGAGGCATGTGGATATTCTGATAGGCTAAAGCAAATCACTATCGGAAATTCTACAATCACTACCCAAGACAGTTTGAACACAGTTCTAGCTTATGGAGAATGGCCCCAATACTTATCTGATATAGATGCAACCTCTGTAGACAAACCGACCCACCCTGAAACATCTTCAGATAGATTCTATACTTTAGATAGTGTTGTGTGGAAACAATCCTCATTGGGGTGGTGGTGGAAACTTCCAGATTGTTTGGGAGAAATGGGGTTATTTGGCCAAAACATGTACTACCATTCAATGGGAAGATCAGGTTATATAGTACATGTCCAGTGTAATGCCACCAAATTTCATAGTGGGTGTCTTATAGTAGCCATTATCCCAGAGCACCAGATTGCGTATATCGGTGGTACTGGAGCTAGAGTCAAATATAAACATACCCACCCAGGTGATCAAGGACATGAGCTTAAAGTTTCAGTTGATAGAAGTGACCATCAACCAGATGAGGATCCCTTTTATAATTGCAATGGCACACTGCTGGGTAATATAACCATGTTCCCTCATCAGATGATCAATCTGCGTACAAATAACTCAGCTACTATTGTAATACCATATATAAATGCTGTACCCATGGACAACATGTTACGGCACAATAATGTTAGTTTGGTGATCATACCAATTGTCAACCTGAGAGCCAATGGCAATGTTGCCAACACATTGCCAATAACAGTAACCATTGCTCCGGAAAAGTCAGAGTTTTCTGGGGCTATGCAAACCCAAAAGCAAGGGCTACCAACCAGACTACCAAGTGGATCTCAACAATTTATGACTACTGAGGATGAGCAATCACCAAATATATTACCAGAATATAGCCCTACTAAAGAGATACATATCCCAGGCCAGATAACAAATATTCTACACATGGCTATGGTTCACTCTTTCATCCCTATGAATAATCAGCAAAAACACAAAGGGAAAACGGCTATTTATGGTGTTCAGGTGACCGCCCAGACAACACACAATGGTCTTATAGTTGCCATACCTTTGCAGATGGACAATACATTATTTAGTACCACTCTTTTAGGTGAAATTTTAAATTATTTTTCAAATTGGTCAGGGAGTATAAAAATAACATTTATGTGTGTATGTGACTCATTCAGTACTGGTAAATTTTTAATGGCCTATACTCCACCTGGGGGAAAATTACCTGAAACCAGAAAGGATGCCATGCTGGGAACACACCTCATTTGGGATCTGGGTTTACAATCATCATGTACTATGGTAATACCATGGATGAGCTCCACTTTCTATCGTCACACTAGATCAGACAAGTACACATCAGGTGGCTATGTTACCTTATGGTATCAGACGAACTTTGTTCCAAGCATGAATAGTGGTATAGGCGTTATACTAGCTACATGCTCAGGATGCAAAGATTTGTCTGTGAGAATGTTAAGAGACACACCGATGATTGAACAGCCTAGTAACAACATACAAAACCCTGTGGAGGACTTCATCGATGAGACTCTCAAAGAGGTGTTAGTTGTCCCAAACACACAACCATCAGGACCCACACACACAACCAAGCCAACGGCACTTGGTGCCATGGAGATAGGGGCAACATCTGATGCTACACCTGAATCGGTCATTGAAACCAGGTATGTTATCAACAATCATACAAATAATGAAGCATTAGTTGAAAACTTCCTTGGTAGGTCCGCACTGTGGACGAACCTAACACTGAGTGCAGGTTTTAAGAAATGGGAGATCAATTTCCAAGAGCAGGCGCACATAAGGAAGAAACTCGAGCTTTTCACCTACGTGCGCTTCGACATGGAAGTTACCATTGTAACCAATAACACAGGCTTGATGCAGATAATGTACTCACCACCAGGTATTGATCCCCCAGAAAGTGCAATAGATAAGAAATGGGATAATGCTACAAATCCTAGTGTCTTTTACCAGCCTAAGAGTGGTTTCCCCCGCTTTACTATACCCTTCACAGGTCTTGGCTCTGCATATTATATCTTTTATGATGGCTATGATGAAACTTCTGAAGATGCTCTAACCTATGGTATATCAGCAACCAATAATATGGGCACACTATGTTTTAGGGCTCTTGAGGATGAAGTGAAACAAACTGTTAAAGTATACATAAAACCCAAACATATCAAAGCATGGTGCCCACGACCACCACGTGCTGTGAATTATACCCATAAATACAGTACAGATTACCACATACCAGTTGAAGGAGGAGGTGGAGATCTTAGAGAAAGACATTACTTTACTTTCAGAGAAGACATCAAAACAGCAGGACCCAGTGATTTATTTGTGCACACCCAGGAGTTCATATATAAAAATGCCCACCTGACTACTCCAAATGATAATACTGTGTTATTGTCTTATAGTTCTGATTTACAAGTAGACACATCTAGCACACCAGGGCCGGATTTCATACCTACATGTGATTGCACAGAAGGGTGTTATTACTCACACTCTAAAGACAGATATTTTGTAATCAGGGTTAGGGCCTATGATTGGTATGAAGTTCAAGAAACCATCTACTACCCCAAACACATCCAATACAACATGCTTATTGGTGAAGGACATTGTCAACCAGGAGATTGTGGAGGTAAATTAATGTGTAAACATGGTGTTATTGGTATAATAACAGCAGGTGGGGACAATCATGTTGCCTTTACTGACCTAAGACCTTATAAGTTTTGTGCAACAACACAGGGCCCAGTTTCAGATTATCTTAATCAACTTGGTAATGCCTTTGGTGAAGGGTTCACACAGAACATCAAGGACAACTTTAATCACATATCCAGTAATATTCAGGATCAAATTACAGGAAAGATTCTTAAATGGTTCGTCCGTATCATCAGCGCGATGACCATTATGATTAGAAACAGCACAGATGTTCCTACAGTCTTAGCAACTCTTGCATTGTTAGGATGCCACCACTCACCATGGACATTTCTTAAGGATAAAATATGTAAATGGCTTGGAATCCCTAAACCGCCTTCCAAACAGGGTGATGGTTGGCTCAAAAAATTTACAGAGTGGTGTAATGCAGCTAAAGGATTAGAGTGGGTGGGTGTTAAAATCAGCAAGTTCATAGATTGGCTAAAGGAGAAATTGATCCCTGCTGTACAGAGTAAAAGAGACTTACTCAAAGAATGTAAAAAGATACCTTTATATCAGGAACAGATTAAGGCTTTTGCTCATGCCAAAGAAGATGCCCAGAATGAACTTATTGTAAATATAGACAAACTTAAGAAAGGTCTAGACCAATTAGCACCTCTGTATGCAGTAGAGAATAAAAAAGTCACAGAAATGCAAAAAGAATTGAAAAGGTTAAGCTCTTATAGAAGAACTCATCGCCATGAGCCAGTTTGCCTTCTTATACACGGAGTGCCTGGTTGCGGTAAGTCATTGACAACGACTGTTATAGCAAGGGGTTTAGCCACAGAATCTGAAATATACTCACTACCACCAGATCCCAAACACTTTGATGGATATGATCAACAGAAAGTTGTGATAATGGATGATGTAGGACAAAATCCAGATGGTCAAGATATGGGGTTATTTTGTCAGATGGTATCCACCACAGATTTCCATGTACCTATGGCTGCTATTGAAGATAAAGGTAAAAGTTTCACCAGTACTTATCTACTAGCTAGTACCAATCTACAACACTTGAATCCATCTACGGTCCAAACTCCAGATGCAGTGGATAGGAGATTTTTCTTGGATACAGACTTAAAAATTATGCCCAAGTTTGTTAATCAAGCTGGGATGCTTAACACTTCACAAGCACTTCAAGCATGCCAGAATTGTCCCAAGCCTAAATACTACAACCAGTGTTGCCCACTATTGTGTGGCAAGGCAGTTGTTCTATACAACCGCCGGACTCAAGCTAGTTACTCTATCAACATGGTTGTAGAACAAATGAGGGAAGAAGCAACAACCAGACTTAAGGTTAGACACAATTTAGATGCAATATTCCAAGGTCTAGGAGACTCTGAGACACCAGGCTTCATAATTGATTTGTTATCATCATCAAAAGATCCTAAAGTTATTCAATACTGTGAGGATAATGGCTTAATTTCACATGCAGAGAGTAGTATTGATAGACATATTAATCACACACACTACATTCTAAACTGCATAGGTAGTTTAATTATTATTTTGGGAACATTGTATGCCATATATAAATTGATGATAGCAACACAGGGACCATACACAGGATTGCCACAAACTAGTGTCAAGAAACCGGAGTTGAGGAGAGCAATACATCAGGGTCCCGAACATGAGTTTTTGTATGCAGTTATTAAAAGAAACTGTCATATAATTACCACAAATAAAGGTGATTTTAACTTATTAGGAATATATAATAATTGTGCAGTGATCCCAACTCATGCTAACTGTGGAGACACAGTACTTATTGATGGAAAGGAGATAAAAGTCCTCAAGCAGTCTATCATAACAGACTCCAATGATGTTGATACAGAAGTTACTATAATCTGGCTAGACAGGAATGAAAAATTCAGAGATATCAGGAGATTTATACCAGAAACCATACAAGAATGGCACCATACAAGATTAGCAACCAATGTCCCTAAATTCCCAATGTTCTTCGCTGATTTAGGTACGACTATACCTTATGGTGAAATTAACCTTAGTGGAAACCCTACCTGTAGACTCATGAAATATGATTACCCCACTAAACCAGGTCAGTGTGGTGCAGTGATAGGTAATACAGGAAATATAATTGGTATACATGTTGGAGGGAATGGAAGAGTTGGTTACTGTGCTGCTTTACTGAGGAAATACTTTAATGACACCCAGGGTGCTATCACACATGTCCAAGATGTTGGTGAAAGAGGATTACATCCAATCAATACCCCCAGCAAAAGCAAATTATATCCAAGTGTCTTCTATGATGTTTTCCCTGGCGTCAAACAACCTGCAGCCCTTAATCCAAGAGATCCAAGATTGGAAACAGATCTAGATACTACAGTACTATCAAAATATAAAGGTAACAAAGAAATAGAATATAACCAGTATATAGAAACAGCTGTAGATCATTACACAGCCCAATTATATGTGTTAGACATTGAACCTAAACCCCTTACATTAGAGCAAGCAGTGTATGGTATCACAAATCTTGAACCTCTAGACTTAACAACTAGTGCTGGCTTTCCATATGTAACTATGGGAATCAAGAAAAGGGATATCTTAAACAAGACCACTAGGGATGTTACAAAACTAGAAATGTGTCTAGAAAAGTATGGATTGGATTTACCATATATAACATTTCTTAAGGATGAGTTAAGAGCTCCAGAGAAAATAAAAGCTGGTAAGACACGAATCATAGAAGCTGCAAGCCTGAATGACACAACACACTTTAGACAGGTGTTTGGAAATCTTTTCAAAACTTTCCATGCCAATCCTGGTATTCTTACTGGTTCAGCTGTGGGATGTGACCCAGACATCTTTTGGTCGCAGATGTATGTAATGCTAGATGGTGAGTTACTTGCTTTTGATTATACAAATTATGATGGTAGTTTACACCCAGTGTGGTTCAAAGCTCTTGGTAAGGTTTTAGACAACTTAGGTTTTCCAGGAAATCTCATGACTAAGTTATGTAACACAACTCACATATACAAGAATAAAATCTACACCACAGAAGGGGGGATGCCATCTGGCATATGTGGTACGTCCATCTTTAACACCATGATCAACAACATCATAATGAGAACACTTGTTTTGGAAACTTATAAAAATATTGACTTAGATAGACTAAGAATTATAGCATATGGTGATGATGTTGTGGCAAGTTATCCAAGTAGGTTAGATCCAAAAGAAATAGCAATCACAGCCTCCAGATATGGATTAACCATCACCCCAGCAGATAAAAGTCAAGATTTTAAACCAGTGACTTGGGAAACTGTAACTTTTCTGAAAAGACACTTTGTACCAGACAAAGAATTCAAATTCTTGATACATCCTGTTTACTCAATGAGTGATGTGTATGAGTCTATTAGATGGACTAAAGATCCTAAGAATACACAGGATCATGTTAGGTCACTGTGCATATTAGCATGGCATAATGGTAAGGAGACTTATGAAGACTTTCTACAGAAGATAAGATCAACTTCAGTTGGAAAGACCTTGGCTTTACCACCATTCACACAGCTAAGGCAGCAGTGGCTTGATAATTTCATATAAAT
| 40,377
|
MW679009.1
|
Rhinovirus C
|
Collins,C.L., Kraberger,S., Fontenele,R.S., Faleye,T.O.C., Sandrolini,H., Halden,R., Scotch,M., Varsani,A.
|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
|
2021-07-18
|
AZ7_188
|
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,071
|
GenBank
| null |
USA: Arizona, Tempe
|
USA
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2020-03-16
|
SAMN17914669
|
PRJNA701833
|
MAG: Rhinovirus C isolate AZ7_188, complete genome
|
ACCCACACCGTCTACGGACGTAGTACTCTTGTATCTCGGTACATTTGTACGCCAGTTTTCCCTCCCTCCCCCTTTCACGTAACCTATAGAAGCTTGAACATACAGGCGAATAGGAAGCCAACAAACCATGTTGGTAAACGCCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTATTAGAGTGTTAGGCTTCTCACGAGGCTGAAGCTTGATATATCGTTACCCGCACAGTTACTAAGCAGAGCCTAGTAACACTTTGATCTCTATACTGGCTGGTCGCTCCGTCAGAAACCCCCTGACAGACCTGGCAGATGGGGCTGGAAATTCCCCACTGGTGACAGTGTTCCAGCCCGCGTGGCTGCCTGTCCCCCTTTCTTGGGGGAAAGCCAATATATAGACAAGGTGCCAAGAGCCGCGTTTGCTAATTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTATCGCATGGATTCCACCATGTAGGTAGTCGTAATGGGCAACTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATACCTTATTTTATCTCATGGTGACAACATATATTGATAAGTATATGTTGACCACCATGGGTGCACAAGTGTCCAAGCAAAACACTGGATCTCACGAAAATGCAATCAGTGCCAACAATGGAGGTGTGATTAAGTATTTCAATATTAACTACTATAAGGACTCTGCTAGCTCAGGTTTAACCAAACAGGATTTTTCTCAAGATCCGTCTAAGTTTACACAGCCTCTAGTTGACACATTGACAAACCCTGCTTTAATGTCTCCCTCAGTAGAAGCATGTGGATTTTCTGATAGGCTCAAACAAATCACTATCGGCAACTCCACAATTACTACCCAAGATGCTATACACACAGTTCTTGCTTATGGGGAATGGCCACAGTATCTTTCTGACATCGATGCTACATCAGTTGATAAACCCACACACCCAGAAACATCAGCGGATAGATTCTATACTTTAGCTAGTGTGGACTGGGATGGGAACTCCAAAGGTTGGTGGTGGAAGCTGCCAGATGCTTTAAAGGAGATGGGAATTTTCGGGCAAAATATGTACTATCACTCAATGGGAAGGTCAGGTTACATAATACACACACAGTGTAATGCTACTAAATTCCATAGTGGAGCACTCTTGGTTGTTCTTATACCAGAGCACCAGTTAGCATATATAGGTAGTGAGAAGGTAGATGTTGCTTATGAACACACACACCCTGGAGAAAATGGTCACAAGATAGGCGTTAACAAGTTAAGGGACAACTTTCAACCAGATGAGGATCCATTCTACAATTGTAATGGTACTCTTTTTGGTAACCTTACTATCTTCCCCCATCAGATTATCAATCTGAGGACAAATAATTCCAGTACAATTATAACACCATATATTAACTGTCAACCAATGGACAACATGCTCAAACATAACAACTTGACACTGTTAATAGTACCATTAGTTACACTCAGAGCCAGCATCACTACCACTCCTACAGTATCTATAACTGTTACAATAGCACCATATAAATCTGAGTTTTCCGGTGCTATGCAACATCAAACTCAGGGATTACCCACACGTATACCTAGTGGAGGGCAACAGTTTATGACCACAGAGGATGAGCAATCAGCCAACTTACTCCCTGGGTTCCATCCAAGTAAGAAGATACAAATTCCAGGCAAGATTACCAGTGTTCTTCACATGGCGAGGGTGGACTCTTTCATGCCCATCAACAATATACCAACCGAGGAAGGTAAGGTGAGTATGTACAACATTACCGTCACCCGCAAAGGCTCAAATAGCGGGCTCTTGCTCACCATACCGCTAGAGATGAGCAACACACTCTTTTCCACTACTCTACTAGGTGAAGTGCTTAATTACTTCACGAACTGGTCTGGTAGCATAACACTAACTTTCATGTGTGTATGTGATTCATTTTCCACTGGGAAATTTCTCTTAGCTTACACGCCACCAGGAGGGGCCCACCCAAAAAACCGCAAGGAAGCCATGCTTGGTGTTCACATCATATGGGATCTAGGCCTGCAATCTTCTTGCACAATGGTTGTACCATGGATGTCTTCAGGATTTTATCGTAGGACAGAGTCAGATAATTATACACATGCTGGCTATGTTTCACTGTGGTATCAAACAGACTTCATTCCATCTTCAACACAAGTAACCCAGGGGGCCATTCTAGTCACTTGCAGTGGGTGTCCTGATCTATCTGTAAGAATGTTAAGAGATACACCAATGATGAAACAAACCAACGAATTACAGAACAATGATCCCATTGACACATATGTCCATGATGTCCTCAATGAAGTTGTTGTGGTTCCAGATACCAAACCGTCGGGACCACAACATACCACTAGGCCCAGTGCATTGGGCGCAATGGAAATAGGAGCCTCCAGCTCAACCATCCCTGAGTCAGTAATAGAAACCAGATATGTAGTGAATGACAACACAAATGAGGAAGCTGAAATAGAGATGTTTTTGGGTCGTTCCGCCTTGTGGTCAAAGTTTAATCTAACTGGTAAATTTGCCAAGTGGGACATTAGTTTCCAGGAACAGGCTAGCATTAGGAAAAAGTTTGAACTTTTCACATATCTCAGATTTGACATGGAAGTTACAATTGTCACCAACAACGAGGGTCTAATGCAAGTGATGTTCATCCCTCCAGGACTTGAAAAACCCGCCAGTGATGCAGATCGACTATGGGACTCTGCATCCAACCCCAGTGTCTTTTTCCAACCCAAGAATGGGTTCCCTCGTTTCACCATCCCGTTCACTGGACTAGCCTCAGCTTATTACATCTTCTATGATGGATACACCACAAGAGAAGTACCCAGAGACAACACTTATGGCATCTCCCCAACTAATGATATGGGGACATTGTGTTTCCGATCATTAGATGATTCTGTCAATAGTCACATCAAGGTGTACATTAAACCAAAGCACATAACTGCTTGGATCCCTAGACCACCCAGAGCTACTGAGTATACCCACGCATACAGTACAAACTATCACTATAGAAAGAAAACTGAACCAGAACAAAATCTAAGGAATAGACACTTCATGAAATTTAGGGATGAGATCAAAACAACATATCCACTCGTTTCAGCAGGACCTAGCGATTTGTGTGTGCACACCAAAGATGCCATATACACATGTGCGCATCTCACCCAACCTAATGAAAACACAATTTTATTAGCATTGACAGCAGATCTACAAGTGGATGCCTCAGATACTCAAGGTCCAGACAACATACCAACATGTGATTGTACCCAAGCTTGCTACTACGCAAAGCATGCAGACAGATATTATCCTGTTAACCTGGTTGCACATGATTGGTATGAGATTCAAGAATCAGAGTACTATCCAAAACATATACAGTATAATATCCTGATAGGTGAAGGTCCTTGCAAGCCTGGGGATTGTGGGGGAAAACTACTCTGTAAACATGGTGTAATAGGGATAATCACAGCAGGTGGTGAGGGGCACGTGGCATTTACAGACTTACGACCATATGCATGCCTCACTTCCCACCAAGGCTTGGTAACTGACTATGTCAATCAATTGGGTGTTGCTTTTGGAGATGGATTCTCCAGCAATATTAAGGATCATTTAACAGGGTTGTGCACCTCAATATCAGATAAAATAACTACCAGGGTCATAAAATGGCTAATTAGAATCATTAGTGCCTTGACCATCATGATCAGGAATTCAAGTGACACTGCAACAATTCTAGCAACATTAGCACTTCTAGGGTGTCATGGATCCCCATGGGCTTTTCTTAAAGACAAAATATGTCAATGGTTAAACATCCCCAAGCCCCCATCTAGACAGGGAGAGTCCTGGCTAAAGAAATTCACAGAATGTTGCAATGCTGCCAAAGGTCTTGAGTGGGTCGCCCAGAAAATAGGCAAATTCATTGACTGGTTGAAAGAAAAACTTATACCCACAGTCCAAAGAAAGAGAGAAACTCTGGAACAGTGTAAAAAGATAGGGCTATATGAACAGCAGGTGCAAGGTTTTGCACATTCAGATGCTGATGCCCAACAACAGCTGATAGTAGAAATATCCAAATTGAAGAGAGGGTTGGACGATCTTGCCCCATTGTATGCTAGTGAGAATAAAAGGGTAACTAATATACAGAAAGATTTGCAGCGTCTGACAGCATACCAGAAAACCCACAGGCATGAACCCGTATGCTGCTTGATACGAGGACCACCTGGGTGTGGTAAGTCCTTGGTAACATCTATAATAGCACACGGATTAACTAATGAGGCCAATATATATTCATTGCCACCAGACCCCAAGCATTTTGATGGTTACAACCAACAGATGGTAGTGATTATGGATGATGTGGGTCAAAACCCCGATGGAAAAGATCTTAGTATGTTTTGTCAGATGGTTTCAACTACAGAATTTATTGTACCCATGGCAAGCATTGAAGATAAAGGTAGATCATTTACTAGCCATTATGTCCTTGCTAGTACCAACCTGGATTCTTTATCCCCTCCAACCATTACAATACCAGAGGCAATCAGCAGAAGGTTTTTCCTGGATACCGATTTACAAGTGCTTAGCAAATTTAAAACGCCAAATGGTTTGCTAGATGTGGCTAAGGCATTACAACCTTGTACAAAGTGTTCCAAACCTATGCACTACAAGCAGTGCTGCCCAATACTATGTGGCCAAGCATTAGTGTTGAAGGACAGAAGAACCTCAGCTAGTTATCCCTTATTGGCAGTGGTAGAACAACTCAGGGCAGAAAATGAGACGAGAGGCAAAGTCAAAACCAACCTCAGAGCTATATTCCAAGGGCTAGGAGACACCACGCCACCTGGTTTCATAGTAGATTTGTTATCTAGCTCAAAAGACCCCAAAGTGATGGAATACTGTGTGGAACAAGGATGGATGGGTAAAGCACATTCCACAATAGAGAGAGATTTCAATTATGTACAATATGCTCTTAATTGTTTAGGTAGTCTTATTATAATCTTAGGAACTATTTACGCACTGTATAAATTGATGTGTCTAACACAAGGTGCTTACTCTGGAAATCCAACGCCAGTGATTAAAAAGCCAGAACTCAGGAAAGCCACGTTGCAAGGACCACAGCATGAGTTCATCAGGGCACTCGTGAAGAGAAACTGCCATATAATCACAACAAGCAAGGGTGAGTTTAACCTACTTGGAGTGCATGATAACTGTGCTGTGGTTCCCACGCATGCCGAATGCGGGGAATTTGTCAATGTGGATGGTAGATTAGTGAAAGTATTGAAACAACAGATTTTAACAGATATGGATGATGTGGACACTGAAATCACTTTAATTTGGCTGGATCAAAATGAAAAATTCAGAGACATCAGAAGATTCATCCCAGAGCATCAACAGGAGTGGTCACACATGCACCTTGCAACTAACGTCACCAAATTCCCAATGTTAGATGTCGAGATTGGTGACGTGGTACCATATGGACAGCTTAACCTTAGTGGGAATCCTACATGTAGACTGATGAAATATGACTACCCTACGCGCCCTGGACAGTGTGGAGGGGTTATCTTAAATACAGGGAATGTGGTTGCCATCCATGTAGGGGGTAATGGTAGAGTAGGTTATGGAGCAGCGTTACTACGCAAATACTTTGCCCAAGCACAAGGTGACATCTGTAAAAGAACGGCAGCTAAAGATGCAGGTTACTATACCATCAATACCCCATCCAAAAGTAAATTGCACCCTAGTGTTTTCCATGACATCTTTCCTGGAACCAAGGAACCAGCAGCACTAAGTTCAAAGGATTCTAGATTAGAAGTGGATTTGGATACAGCTGTATTTTCCAAATACAAAGGTAATGTGACTGTTGAATGGAATGAACACCTACAAACAGCGGTGGACCATTATGCAGCACAGCTCTTTGTCCTGGATATCAACCCAGAACCAATCACAATGGAACAAGCAGTCTATGGTGTAACAAATTTAGAACCTCTGGATTTGACAACAAGTGCTGGTTACCCGTATGCTGCTTTTGGAATAAAGAAGAGGGACATTGTGAACAAGACTACTAGAGATGTAGTTAAATTGCAGGAAATGTTAGATCGATATGGTGTTGATTTGCCATACATCACATACCTGAAGGATGAACTACGCAGTCCAGAGAAAATAAGGCTGGGTAAGACCAGAGCAATTGAAGCAGCTAGCCTAAATGACACAGTACATTTTAGAATGATTTTTGGTAATCTTTTCTCCACCTTTCATGCTAACCCAGGCATATTGACAGGATCAGCAGTCGGTTGCAACCCCGATATTTTCTGGTCCCAGTTGTATGCATCATTAGATGGTAGTTTACTAGCTTTTGATTACACCAATTATGATGGTAGTTTGCATCCGATCTGGTTTGAGGCCTTGGGCAAGGTTTTAGATCAGATAGGGTTTCCTGGCAATCTAATGAAGAAATTATGTAATACTACTCATATATACAAAGATCAAGTTTACATGGTGGAGGGTGGCATGCCCTCAGGTATATGTGGAACCAGCATATTCAACACTATGATAAACAACATAATAATCAGGACATTAATACTAGAAACCTATAAAGGTATAGATTTAGATAAACTCAAGATGGTAGCTTACGGAGATGATGTGTTAGCTTCCTACCCCTTCCCCTTGGATGCAAAGGAACTCTCAGAGACAGCAAAGAAATATGGACTCACCATCACTCCACCTGATAAATCAACAGAGTTTAAACCAATGTCATGGGACAATGTCACCTTCCTGAAACGGAAATTCCGTCCCGATGACCGCTACAAGTTTCTTATACACCCTGTATATAGTATGGAGGATGTTCATGAATCAATCAGATGGACCAAAGATCCAAAGAACACTCAAGATCATGTACGCTCCTTGTGTCAGCTGGCCTGGCACAACGGAAAGGACCTATACGATGGGTTCCTTGAACAGATCCGGAGCTGCGCCGTGGGTAGGCGCTTGCAGCTTCCACCATACTCCAGTCTGTACAGGCAGTGGATAGATGAATTTATTTGATCG
| 40,379
|
MZ268666.1
|
Rhinovirus C
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2021-06-15
|
M6TYGH
|
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,106
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021
| null | null |
Rhinovirus C isolate M6TYGH, complete genome
|
TGCACCCACCCACACTGTCTACGGACGTTGTACACTTGTATTCCGGTACACTTGTACGCCAGTTTGCCACCCTATACACCCCGTAACAGTAGAAGTTTACACACACTCAGACCAATAGGGGGTGTTCATCCAGTTCACCCAGGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATAGGGGTGTTAGGTTTCACCCGAGGCCGAAGCTCTGATTGTCGTTATCCACACAACTACTGGACAAAGCTTAGTAACATCTTACGATGTAGCATGGTTGGTTGTTCCGCCAGTACCCCCTGGTAAACCTGGCAGATGGGGCTAGAAGTTCCTCACTGGTGACAGTGTTCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCTCCCTCACGGGAGAAGCCATCCTATTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTACGCTAGTTGTGATTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCTGCAGCCATTGCATGGAAGCCACCATGTGGATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCCTTTACTGACGTTTATGGTGACAATATATATATAACGTATATATTGTTCACCATGGGCGCTCAGGTATCTAGACAAACCACTGGGTCGCATGAGAACGCCATCACTGCTACCAATGGAGGCCTTATCAAATACTTCAACATAAACTATTACAAGGATTCGGCTAGTTCAGGTTTGGCTAAACAAGACTTCACTCAAGATCCATCCAAATTTACTCAACCCCTGGCAGAGGTTCTGACAAATCCAGCTCTTATGTCCCCAACCGTTGAAGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATTACTATCGGAAACTCCACTATCACTACACAGGATGCTCTTCATACAGTTCTAGCTTATGGAGAATGGCCTAGTTATTTGTCAGATCTTGATGCCACTTCAGTGGACAAACCCACACATCCGGAAACTTCATCGGACAGATTTTACACTCTTACCAGCGTGGAATGGAATGCTACTTCAAGCGGATGGTGGTGGAAACTTCCAGACGCCTTAAAAGACATGGGCATTTTTGGTCAAAACTTATATTACCACTCAATGGGTAGAGCAGGGTACATAATACACACACAATGTAATGCTACTAAATTCCACAGTGGAGCATTGATGGTTGTTTTAATACCTGAGCACCAGCTGGCATATGCTGGAGGTGCAAATGCCAGTGTTGGATATAAACACACTCATCCGGGTGAGGATGGTCATAAAATTGAGAAGCGAGGTTTCGATGACAACAAACCAGATGAAGACCCCTTCTTCAACTGCAATGGGACACTGTTTGGTAACCTTACTATATTCCCACACCAGATTATTAACCTTAGAACCAATAATTCCAGCACAATTATTAGCCCTTACATCAATTGCCAACCAATGGACAACATGCTAAAGCACAACAATCTTACACTACTGATAGTACCACTGGTTAAACTTACACCTGGAACTGGTGCCTCACCCAACGTGTCTATAACAGTGTCAATCGCACCATATAAATCAGAGTTTTCTGGTGCCATGGAGACACGTTATACAGTGCAACAACAGGGTTTACCCGTTCGCATGCCAAGTGGGTCCCAGCAATTTATGACTACTGAAGATGAACAATCACCCAACATGCTACCTGGTTACCACTCCAGCAAGAAAATACACATACCAGGTATGATCACAAATGTCTTGCATATGGCTAGAGTTGACTCCTTCATGCCTATCAACAACATCCGTTCCGAGATCGGCAAGGTATCAATTTACAATATACCAATATTAAGGAAAACTAACAATGATGGATTAATACTCTCCATACCCTTAGACATGAGTAATAGTCTATTTGCCACCACACTGTTGGGGGAAGTGCTGAATTACTTTACTAACTGGTCAGGTAGTATTACTCTTACTTTCATGTGTGTGTGTGATTCTTTCTCAACTGGAAAATTTTTGTTAGCGTACACCCCCCCAGGGGGAGCACATCCTGCCAACAGAAAACAGGCCATGTTAGGGGTGCATGTTGTTTGGGATCTGGGTCTACAATCATCATGTACCATGGTGATACCTTGGATATCTTCAGGATTTTATCGTAACACCAAATCTGATGACCACACTGAAGCAGGGTACGTTTCACTTTGGTACCAGACAGATTTCGTAACTACCACAACAGCAGGACAAGGTGCTATATTAGTTACTTGTAGTGGGTGCCCAGATATATCAGTCAGAATGTTAAGAGACACACCAATGATGAAACAAGATGATGATGAATTGCAGAATAATGACCCAATAGAGCAATTTGTGCATGATACACTAAATGAAGTTGTAGTAGTACCCAACACACAAGCTTCTGGACCTCAACACACCACACGGCCCAGTGCGTTAAGTGCAATGGAAATAGGAGCCTCCAGCACAGCTACCCCTGAATCCACACTAGAGACTAGGTATGTAGTGAATGATAACACAAATGAAGAAGCTGAAATAGAGATATTCTTGGGGAGATCAGCAATTTGGACCAAAAAGACCTTAAAACAAGGATTCTTGAAATGGAAGATAAGTTTCCAGGAACAAGCTCACATTAGGAAAAAGTTTGAGCTATTCACTTACCTCAGATTTGACATGGAAGTCACAATAGTCATTAACAACCAAGATCTAATGCAAATAATGTATATACCACCTGGTATAGCCATACCTGATGGTAAGGATGACAACAAGTGGGATTCAGCCTCCAACCCAAGTGTGTTTTACCAGCCCAAAAGTGGATTCCCCCGCTTCACAATACCCTTTACAGGCCTAGCCTCTGCATATTACATATTTTATGATGGTTACAGCAAGACAACTGGTGAACCTAGGGACACCTATGGTATCTCTCCTACCAATGATATGGGCACCTTGTGCTTCCGTTCACTGGAAGGAACAGGCAATGCAGAGGTGAGGGTCTATGTGAAACCAAAACACACTACAGCATGGATTCCCAGACCTCCCCGCGCTGTACAATACACACATACCTACAGTACGAACTACCACTACAAGAAGGAGGACGCCACCTTGGAGGACAGGCACTTCATACAACACAGAGAAGGCATCAAAATTTTGCAGAATGCGGGACCAAGTGATCTGCATGTCCATACTAAAGATGCTATCTATACATGTGCACACTTAACCACACCAAATGATAACACCATCCTGCTGGCCTACACAGCAGATCTGCAAGTTGATAGTAGTGAAACCAAGGGTCCAGATCACATTCCAGATTGTGATTGTACCTCAGGCTGTTATTATGTCAAACACTTAGATAGATACTGCCCAGTAACTTTAACTTCCCATGACTGGTACGAAATACAAGAATCAGATTACTACCCCAGACACATACAATACAATATCCTGATTGGTGAGGGTCCTTGCAAGCCTGGAGACTGCGGTGGCAAATTACTTTGTAAACATGGGGTCATAGGTATTGTCACCGCTGGTGGTGAAGGGCATGTAGCATTCACTGACTTACGCCCATACTCAAGTCTTTCCACTCATCAGGGAGTTATATCAGATTACTTCACTCAGTTGGGTGATGCTTTTGGTGAGGGTTTCACACACAATATAAAAGAACATTTCTCTAATCTGTCTTCAAACATTACTGATAAAATTACAGGCAAGGTAGTTAAATGGTTAGTGCGCATCATTAGTGCTCTCACTATCATGATTAGAAACTCAACAGACACAGCAACAATACTTGCCACCTTGGCGCTGTTAGGGTGTCAAAGCTCCCCATGGAATTTCCTCAAAAACAAGATATGCCAGTGGCTAGACATACCCAAACCCCCTTCCAAACAAGGTGACTCATGGATTAAGAAATTTACAGAATGCTGTAATGCAGCCAAGGGTTTAGAATGGGTTGCTATGAAAATTGGGAAATTTATTGATTGGTTAAAAGAAAAATTAATTCCCACAGTGCAACGGAAAAAGGAAACACTGGAACAATGCAAGAAACTGGCCCTCTATGAGGAGCAATGCAAGGGATTTTCCAAATCAGATGCCCAGGCCCAACAACAACTCATCATAGAAGTGGCTAAGCTGAAGAAAGGTCTAGATGAATTGGCACCTTTGTATGCTAGTGAGAACAAAAGAGCAACAGGAATTCAGAAAGAGCTACAACGCATGACTGCGTACCACAAAACACATCGACATGAACCAGTTTGTTGTCTAATACGTGGACAACCTGGATGTGGGAAATCACTAGTCACTTCAATCATTGCACGTGGACTTGCGTCAGAGGCTCATGTCTACTCACTGCCCCCAGATCCAAAATATTTTGATGGTTACGACCAACAGAAAGTTGTCATAATGGATGATATAGGGCAAAATCCAGATGGGAAAGATCTCAGCATGTTCTGTCAAATGGTTTCCACCACAGAATTCATAGTGCCAATGGCCAATATAGAAGAGAAGGGCAGATCGTTTACCAGTGAATACATCTTAGCCAGCACAAATCTTGATGCACTTACTCCACCTACAATAACTATTCCAGATGCAATCAAAAGGAGGTTCTTCATAGATGTGGATTTAGTTATTATTAGTAAGTTTAGAAACTCTAGTGGTCTTTTAGATACAGCAAAGGCACTACAACCTTGTGCTAATTGCCCCAAACCAGCCTGTTTTAAGCAATGCTGTCCCTTACTGTGTGGTCAAGCAGTTGTTCTGCAAGATAGGAGAAGCAAAGCTAGTTATCCTGTGAATGCAATAGTACAGCAACTCCAACATGAGAACTCAACGCGCAAGAAGGTGAAAGACAACCTAGAAGCCATATTCCAAGGATTGGGTGATCCAACCCCACCAGGTTTTATTGTGGACCTGTTGTCAGCTTCAAAAAACCCAAAGGTCATTGAATACTGTGTGGAACAAGGGTGGGTTGGTAAAGCAAACTCTACTGTTGAGAGAGACTTGAACTATGTTCACTACATACTAAATTGCCTGGGGAGTCTCATCCTCATACTAGGAACTATCTATGTGTTATACAAGTTAATGTGTTTTACCCAGGGTGCTTATAGTGGATTACCCAACCCGGTCCCAAAGAAACCAGAACTAAGAAAAGCAACATTACAGGGTCCCCAACATGAATTTATCCGGGCACTGATTAAAAGAAATTGTCATGTTTTGACCACAAAGAGGGGCGAATTCAATTTGCTCGGGATTCATGACAATTGTGCTGTTGTACCAACTCATGCTGAATGTGGAGATGTAGTTAACATAGATGGCAGGGACGTTAGAGTCCTGAAACAACAAATTTTAACCAACACAGATGATGTGGACACAGAAATAACACTACTATGGTTGGACCAAAATGAAAAGTTCAGGGACATCAGAAGGTTCATCCCCGAACACCAACAAGAATGGTGTAACATGCACTTAGCTACCAATGTCACTAAGTTCCCCATGTTAGACGTAGAGGTAGGTGAAGTTATTCCATATGGAGAATTGAACCTGAGCGGTAATCCCACTTGCCGTCTGATGAAATACAACTACCCTACAAGACCTGGACAATGTGGTGGAGTGATCCTAAACACAGGAAATGTTATTGCAATACATGTGGGTGGAAATGGGAAAGTCGGGTATGGAGCAGCACTACTGCGGAAATACTTTGCTGTTGCCCAAGGGGAAATTGTTAAGAGAGGACAAACTAAGGAATTGGGCCTTCAATCAGTTAACACTCCTACAAAAACTAAGCTACAACCAAGTGCTTTCTACCACATCTTCCCAGGGACCAAGGAACCAGCCCCACTACATGCCAGTGACCCCAGACTTGAAACAAACTTGGATCAGGCAGTTTTATCTAAGTACAAGGGTAATCCACAGGTTGAATGGAATGACTACATACAGACTGCAGTGGACCATTATGCTGCCCAACTATACACATTGGACATTAACCCAGAACCATTGACAATTGACCAAGCGGTTTATGGTATTGACAACCTTGAACCACTAGATATAACTACTAGTGCAGGCTATCCTTATGCCACCATGGGTATCAGGAAGAAGGACATTGTCAATAGAGTTGAAAAGAGTACTACAAGACTCCAAGAAATGATGGACCTATATGGAATTGACTTACCCTACATCACATACTTGAAAGATGAACTCAGAAGCCCAGAAAAGATTAAGAAGGGAAAGACTAGGGCCATAGAAGCTGCTAGCCTTAATGATACAGTTCATTTCCGAATGCTATTTGGGAATCTCTTCTCAACCTTTCATGCAAATCCTGGAATCCTGACTGGTTCTGCAGTAGGTTGCAACCCAGATATTTTCTGGTCACAATTGTATGCCACACTAGATGGGCACCTACTAGCCTTTGATTACTCAAACTATGATGGCAGTCTGCACCCCATATGGTTCAAAGCATTGGGCAAGGTCTTGACCTCACTGGGTTTCCCTGGTAATCTCATGGACAGATTATGTAACACAACACATATATACAGAGACCAAGTTTACTTAGTGGAAGGTGGTATGCCCTCAGGGATATGTGGCACCAGTATCTTTAATACTATGATGAATAACATAATAATAAGAACAATAGTACTGGAGACTTATAAATCAATAGATTTAGACAAACTAAAAATAGTTGCTTATGGTGATGATGTAATAGCATCCTACCCTTATCCTTTGGAACCCACACATATAGCAAAGACAGCAGCTAAATATGGATTGAATATCACCCCTCCAGATAAATCAGACAAATTTCAAGAAGTAACATGGGACAATGTGACCTTTCTCAAAAGAGCCTTTAAACCAGATGAGAAGTACAAATTTTTGATACACCCTGTCTACAGTATGGCTGATGTCTATGAATCAATACGGTGGACTAAAGACCCAAAGAACACACAAGATCATGTTAGATCACTGTGCTTACTAGCTTGGCACAATGGAAAGGAAAAATATGAGGAGTTTCTAACGAAGGTTAGGAGTTGCCATGTAGGGAAACAGCTTTATCTTCCCCCTTATCAAAGCTTGTACACACAGTGGCTTGATGAATTTATCTAATTACTAATAAATATAGTACAATGTTTAGATGAACAAAGTATTATAAAA
| 41,396
|
MZ268682.1
|
Rhinovirus C
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2021-06-15
|
469444
|
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,110
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021
| null | null |
Rhinovirus C isolate 469444, complete genome
|
CCACACCGTCTACGGACGTAGTACTCTTGTATCTCGGTACATTTGTACGCCAGTTTTCCCTCCCTCCCCCCTTTCACGTAACTTATAGAAGCTTGAACATACAGGCGAATAGGAAGCCAACAAACCATGTTGGTAAACGCCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTATTAGAGTGTTAGGCTTCTCACGAGGCTGAAGCTTGATATATCGTTACCCGCACAGTTACTAAGCAGAGCCTAGTAACACTTTGAACTCTATACTGGCTGGTCGCTCCGTCAGAAACCCCCTGACAGACCTGGCAGATGGGGCTGGAAATTCCCCACTGGTGACAGTGTTCCAGCCCGCGTGGCTGCCTGTCCCCCTTCCTTGGGGGAAAGCCAATATATAGACAAGGTGCCAAGAGCCGCGTTTGCTAATTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTATCGCATGGATTCCACCATGTAGGTAGTCGTAATGGGCAACTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATACCTTATTTTATCTCATGGTGACAACATATATTGATAAGTATATGTTGACCACCATGGGTGCACAAGTGTCCAAGCAAAACACTGGATCTCACGAAAATGCAATCAGCGCCAACAATGGAGGTGTGATCAAGTATTTCAATATTAACTACTATAAGGACTCTGCTAGCTCAGGTTTAACCAAACAGGATTTTTCTCAAGATCCGTCTAAGTTTACACAGCCCCTTGTTGACACATTGACAAACCCTGCTTTAATGTCTCCCTCAGTAGAAGCATGTGGATTTTCTGATAGGCTCAAACAAATCACTATCGGCAACTCCACAATTACTACCCAAGATGCTATACACACAGTTCTTGCTTATGGGGAATGGCCACAGTATCTTTCTGACATCGATGCTACATCAGTTGATAAACCCACACACCCAGAAACATCAGCGGATAGATTCTATACTTTAGCTAGTGTGGACTGGGATGGGAACTCCAAGGGTTGGTGGTGGAAGCTGCCAGATGCTTTAAAGGAGATGGGAATTTTCGGGCAAAATATGTACTATCACTCAATGGGAAGGTCAGGTTACATAATACACACACAGTGTAATGCTACCAAATTCCATAGTGGAGCACTCTTGGTTGTTCTTATACCAGAACACCAGTTAGCATATATAGGTAGTGAGAAGGTAGATGTTGCTTATGAACATACACACCCTGGAGAAAATGGTCACAAGATAGGTGTTAACAAATTAAGGGACAACTTTCAACCAGATGAGGATCCATTCTACAATTGTAATGGTACTCTTTTTGGTAACCTTACTATCTTCCCCCATCAGATTATCAATCTGAGGACAAATAATTCCAGTACAATTATAACACCATATATTAACTGTCAACCAATGGACAACATGCTCAAACATAATAACTTGACACTGTTAATAGTACCATTAGTCACACTCAGAGCCAGCATCACTACCACCCCTACAGTATCTATAACTGTTACAATAGCACCATATAAATCTGAGTTTTCCGGTGCTATGCAACATCAAACCCAGGGATTACCCACACGCATACCTAGTGGAGGGCAACAGTTTATGACCACAGAGGATGAGCAATCAGCCAACTTACTCCCTGGGTTCCATTCAAGTAAGAAGATACAAATTCCAGGCAAGATCACCAGTGTTCTTCACATGGCGAGGGTGGACTCTTTCATGCCCATTAACAATATACCAACCGAGGAAGGTAAGGTGAGTATGTACAATATTACCGTCACCCGCAAAGGCTCAAATAGCGGGCTCTTGCTCACCATACCGCTAGAGATGAGCAACACACTCTTTTCCACTACTCTACTAGGTGAAGTGCTTAATTACTTCACTAACTGGTCTGGTAGCATAACACTAACTTTCATGTGTGTATGTGATTCATTTTCCACCGGGAAATTTCTCTTAGCTTACACGCCACCAGGAGGGGCCCACCCAAAAAACCGCAAGGAAGCCATGCTTGGTGTTCACATCATATGGGATCTAGGCCTGCAATCTTCTTGCACAATGGTTGTACCATGGATGTCCTCAGGATTTTATCGTAGAACAGAGTCAGATAATTATACACATGCTGGCTACGTTTCACTATGGTACCAAACAGACTTCATTCCATCTTCAACACAAGTAACCCAGGGGGCCATTCTAGTCACTTGCAGTGGGTGTCCTGATCTATCTGTAAGAATGTTAAGAGATACACCAATGATGAAACAAACCAACGACTTACAGAACAATGATCCCATTGACACATATGTCCATGATGTCCTCAATGAGGTTGTTGTGGTTCCAGATACCAAACCGTCGGGACCACAACATACCACTAGACCCAGTGCATTGGGCGCAATGGAAATAGGAGCCTCTAGCTCAACCATCCCTGAGTCAGTAATAGAAACCAGATATGTAGTGAATGATAACACAAATGAGGAAGCTGAAATAGAGATGTTCTTGGGTCGTTCCGCCTTGTGGTCAAAGTTTAATCTAACTGGTAAATTTGCCAAGTGGGACATTAGTTTCCAGGAACAGGCCAGCATTAGGAAAAAGTTTGAACTTTTCACATATCTCAGATTTGACATGGAAGTTACAATTGTCACCAACAACGAGGGTCTAATGCAAGTCATGTTCATCCCCCCAGGACTTGAAAAACCCACCAGTGATGCAGATCGACTATGGGACTCTGCATCCAACCCCAGTGTCTTTTTCCAACCCAAGAATGGATTCCCTCGCTTCACCATCCCGTTCACTGGACTAGCCTCAGCTTATTACATCTTCTATGATGGATACACCACAAGAGAAGTACCCAGAGACAACACTTATGGCATCTCTCCAACTAATGATATGGGGACATTGTGTTTCCGATCATTAGATGATTCTGTCAATAGTCACATCAAGGTGTACATCAAACCAAAGCACATAACTGCTTGGATTCCTAGACCGCCCAGAGCTACTGAGTATACCCATGCATACAGTACAAACTATCACTACAGAAAGAAAACTGAACCAGAACAAAATCTAAGGAATAGACACTTCATGAAATTTAGGGATGAGATCAAAACAACATATCCACTCGTTTCAGCAGGGCCTAGTGATTTGTGTGTGCACACCAAAGATGCCATATACACATGTGCGCATCTCACCCAACCTAATGAAAACACAATTTTATTAGCATTGACAGCAGATCTACAAGTGGATGCCTCAGATACTCAAGGTCCAGACAACATACCTACATGTGATTGTACCCAAGCTTGCTACTACGCAAAGCATGCAGACAGATATTATCCTGTTAACCTGGTTGCACATGATTGGTATGAGATTCAAGAATCAGAGTACTATCCAAAACATATACAGTATAATATCCTGATAGGTGAAGGTCCTTGCAAGCCTGGGGATTGTGGGGGAAAACTACTCTGTAAGCATGGTGTAATAGGGATAATCACAGCAGGTGGTGAGGGGCACGTGGCATTTACAGACTTACGACCATATGCATGCCTCACTTCCCACCAAGGCTTGGTAACTGATTATGTCAATCAATTAGGTGTTGCTTTTGGAGATGGATTCTCCAGCAATATTAAGGATCATTTAACAGGGTTGTGCACCTCAATATCAGATAAAATAACTACCAGGGTCATAAAATGGCTAATTAGAATCATTAGTGCCTTGACCATTATGATTAGAAATTCAAGTGACACTGCAACAATTCTAGCAACATTAGCACTTCTAGGGTGTCATGGATCCCCATGGGCTTTTCTTAAAGACAAAATTTGTCAATGGTTAAACATCCCCAAGCCCCCATCTAGACAGGGAGAGTCCTGGCTAAAGAAATTCACAGAATGTTGCAATGCTGCCAAAGGTCTTGAGTGGGTCGCCCAGAAAATAGGCAAATTTATTGACTGGTTGAAAGAAAAACTTATACCTACAGTCCAAAGAAAGAGAGAAACTCTGGAACAGTGTAAAAAGATAGGGCTATATGAACAGCAGGTGCAAGGTTTTGCACATTCAGATGCTGATGCCCAACAACAACTGATAGTAGAAATATCCAAATTGAAGAGAGGGTTGGACGATCTTGCCCCATTGTATGCCAGTGAGAATAAAAGGGTAACCAATATACAGAAAGATTTGCAGCGTCTGACAGCATACCAGAAAACCCACAGGCATGAACCCGTATGCTGTTTGATACGAGGACCACCTGGGTGTGGTAAGTCCTTGGTAACATCTATAATAGCACACGGATTAACTAATGAGGCCAATATATATTCATTGCCACCAGACCCCAAGCATTTTGATGGTTACAACCAGCAGACGGTAGTGATTATGGATGATGTGGGTCAAAACCCCGATGGAAAAGATCTTAGTATGTTTTGTCAGATGGTTTCAACTACAGAATTTATTGTACCCATGGCAAGTATTGAAGATAAAGGTAGATCATTTACTAGCCATTATGTCCTTGCTAGTACCAATCTGGATTCTTTGTCCCCTCCAACCATTACAATACCAGAAGCAATCAGCAGGAGGTTTTTCCTGGATACCGACTTACAAGTGCTTAGCAAGTTTAAAACGCCGAATGGTTTGCTAGATGTGGCTAAGGCGTTACAACCTTGTACAAAGTGTTCCAAACCTATGCACTACAAGCAGTGCTGCCCAATACTATGTGGCCAAGCATTAGTATTGAAGGACAGAAGAACTTCAGCTAGTTATCCCTTATTGGCAGTGGTAGAACAACTCAGGGCAGAAAATGAGACGAGAGGCAAAGTCAAAACCAACCTCAGAGCTATATTCCAAGGGTTAGGAGACACCACGCCACCTGGTTTCATAGTAGATTTGTTATCCAGCTCAAAAGACCCCAAAGTGATGGAATACTGTGTGGAACAAGGATGGATGGGTAAAGCACATTCCACAATAGAGAGAGATTTCAATTATGTACAATATGCTCTTAATTGTTTAGGTAGTCTTATCATAATCTTAGGAACTATTTATGCACTGTATAAGTTGATGTGTCTAACACAAGGTGCTTACTCTGGAAATCCAACACCAGTGGTTAAAAAGCCAGAGCTCAGGAAAGCCACGTTGCAAGGACCACAGCATGAGTTCATCAGGGCACTCGTGAAGAGAAACTGTCATATAATCACAACAAGCAAGGGTGAGTTTAACCTACTTGGAGTGCATGATAACTGTGCTGTGGTTCCCACGCATGCCGAATGCGGGGAATTTGTCAATGTGGATGGTAGACTAGTGAAAGTGTTGAAACAACAGATTTTAACAGATATGGATGATGTGGACACTGAAATCACTTTAATTTGGCTGGATCAAAATGAAAAATTCAGAGACATCAGAAGATTCATCCCAGAGCATCAACAGGAGTGGTCACACATGCACCTTGCAACTAACGTCACCAAATTCCCAATGTTAGATGTCGAGATTGGTGACGTGGTACCATATGGACAGCTTAACCTTAGTGGAAATCCTACATGTAGACTGATGAAATATGACTACCCTACGCGCCCTGGACAGTGTGGAGGGGTTATCTTAAATACAGGGAATGTGGTTGCCATCCATGTGGGGGGTAATGGTAGAGTAGGCTACGGAGCAGCATTATTACGCAAATACTTTGCCCAAGCACAAGGTGACATCTGTAAAAGAACGGCAACTAAAGATGCAGGTTACTACACCATCAATACCCCATCCAAAAGTAAATTGCACCCTAGTGTTTTCTATGACATCTTTCCTGGAACCAAGGAACCAGCAGCACTAAGTTCAAAGGATTCTAGATTGGAAGTGGACTTAGATACAGCTGTATTCTCCAAATACAAAGGTAATGTAACTGTTGAATGGAATGAACACCTACAAACAGCGGTGGACCATTATGCAGCACAGCTCTTTGTCCTAGATATCAACCCAGAACCAATCACAATGGAACAAGCAGTCTATGGTGTAACAAATTTAGAACCTCTGGATCTAACAACAAGTGCTGGTTACCCGTATGCTGCTTTTGGAATAAAGAAGAGGGATATTGTGAACAAGACTACTAGAGATGTAGTTAAATTGCAGGAAATGTTAGATCGATATGGTGTTGATTTGCCATACATCACATACCTGAAGGATGAACTACGCAGTCCAGAGAAAATAAGGCTAGGTAAGACCAGAGCAATTGAAGCAGCTAGCCTAAATGATACAGTACATTTTAGAATGATTTTTGGTAATCTTTTCTCCACCTTTCATGCTAACCCAGGCATACTGACAGGATCAGCAGTCGGTTGCAACCCCGATGTTTTCTGGTCCCAGTTGTATGCATCATTGGATGGTAGTTTACTAGCTTTTGATTACACCAATTATGATGGTAGTTTGCATCCGATCTGGTTTGAAGCCTTGGGCAAGGTTTTAGATCAGATAGGGTTTCCTGGTAATCTAATGAAGAAATTATGTAATACTACTCATATATACAAAGATCAAGTTTACATGGTGGAGGGTGGTATGCCCTCAGGTATATGTGGAACCAGCATATTCAACACTATGATAAACAACATAATAATTAGGACATTAATACTAGAAACCTATAAAGGTATAGATTTAGATAAACTCAAGATGGTAGCTTATGGAGATGATGTGTTAGCTTCCTACCCCTTCCCCTTGGATGCAAAGGAACTCTCAGAGACAGCAAAGAAATATGGACTCACCATCACTCCACCTGATAAATCAACAGAGTTTAAACCAATGTCATGGGACAATGTCACCTTCCTGAAGCGGAAATTCCGTCCCGATGACCGCTACAAGTTTCTTATACACCCTGTATATAGTATGGAGGATGTTCATGAATCAATCAGATGGACTAAAGATCCAAAGAACACTCAAGATCATGTACGCTCCTTGTGTCAGCTGGCCTGGCACAACGGAAAGGACCTATACGACGGGTTTCTTGAGCAGATCCGGAGCTGCGCCGTGGGTAGGCGCTTGCAGCTTCCACCATACTCCAGTCTGTACAGGCAGTGGATAGATGAATTTATTTGAATGATATAATATTATGTTTGCATTAGAACTAGATATTATAAAA
| 41,411
|
MZ268701.1
|
Rhinovirus C
|
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2021-06-15
|
470961
|
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,069
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021
| null | null |
Rhinovirus C isolate 470961, complete genome
|
GTACACTTGTATTACGGTACATTTGTACGCCAGTTTGCCTCCCTTCCCTACCTCGTAACTTTAGAAGATACAACTATATGACAAATAGGAAGCCAACAAGCCATGTTGGTTATTGTCAAGCACTTCTGTTACCCCGGTACTAGGGTGTTAAACTTCCCCAGAGGTTGAAGCCCGATGTATCGTTATCCGCATGATTACTAAGCAGAGCCTAGTAACATCTTACTTTATATATGGGTTGGTCGCTCAGTCAGTTACCCCCTGATAGACCTGGCAGATGAGGCTGGAAACACCCCACTGGTAACAGTGTTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCCCCTCTTCTGAGGGGAAGCCCATATGTAGACAAGGTGAGAAGAGCCGCGTTTGCTAATCATGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTACTGCGTGGAAACCACCACGTGGGTAGTCGTAATGAGCAATTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTACCTTACATTGCTCATGGTTACAACATATATTAAATCGTATATGTTGTTCACCATGGGCGCACAAGTATCAAGACAAACTACTGGCTCACACGAGAGTGCTGTCAATGCCACAAATGGTGGTATCATCAAGTATTTTAACATCAATTACTATAGGGATTCAGCCAGTTCCGGCTTGACTAAGCAAGACTTTTCTCAAGATCCCTCTAAATTCACCCAACCCCTTGTTGACACACTCACTAACCCAGCCTTAATGTCACCTTCAGTAGAAGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATGGGAAACTCCACTATTACAACACAGGATGCCCTACATACTGTTCTTGCCTATGGAGAATGGCCTCAATACTTATCAGATCTTGATGCAACCTCTGTTGATAAACCCACACACCCTGAGACTTCCTCAGATAGATTTTACACTCTGTCCAGTGTTTCGTGGACCAACACATCAAAGGGTTGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTTTAAAGGATATGGGAGTCTTTGGGCAAAATCTTTATTACCATGCTATGGGGAGGGCTGGTTATATAATACACACACAATGTAATGCTACAAAATTCCACAGTGGTGCTTTATTAGTAGTCCTCATACCTGAGCATCAGTTGGCTTACATAGGTGCAGAAAAAGTTAACATTGCCTATGACCTTACACACCCAGGGGAAACAGGTCACGTTCTAGGTAGGAACACATCCAGAGGCAATAACAATCCCGATGAAGACCCTTTCTTCAATTGTAATGGTACACTTTTTGGCAACCTCACCATTTTTCCCCACCAGATTATTAACCTACGTACTAACAACTCCAGTACCATTATAACACCCTACATCAATTGTCAGCCGATGGACAATATGCTAAAGCATAACAATTTGACTCTCTTAATTGTTCCTCTTGTTAGACTTAGATTTGGCACGGAGGCTTCTCCTACAGTGTCAATAACTGTTACAATCGCACCTTATAAGTCTGAATTCTCTGGCGCTATGGAAACCCAAAAACACCAGGGGCTACCAACGCGCATGCCCAGTGGTGGTCAACAATTTATGACCACTGAAGATGAGCAATCGGCCAACTTACTACCAGGTTTTCATCCCAGTAAGAAGATCCACATACCTGGTATGATTACTAATGTGTTGCACATGGCTAGGGTGGATTCATTCATGCCAATACATAATATATCAACAAACATTGGGAAGATTGATATATATAGTCTACAAATTACTAAGAAACCTGCTGGCAATAATGATTTGTTGCTTACCATTCCATTAGACATTAGTAACACCCTATTCTCCACCACATTGTTGGGTGAGGTTCTCAACTACTTCGCAAATTGGTCTGGCAGTATATCCCTGACTTTTATGTGTGTGTGTGACTCTTTTTCAACTGGTAAGTTCCTATTAGCATATACACCCCCAGGCGGTGGGCATCCCACTACAAGAAAACAGGCAATGCTTGGTGTGCATGTAATTTGGGACCTGGGATTACAATCCTCATGCACTATGGTGGTACCATGGATGTCATCAGGATTTTACCGTAGAACCAAATCTGATGACTATACACATGCAGGTTATGTAACCTTGTGGTATCAAACAGACTTCATAACCACCTCAAATAATGTGGGAGAAATACTAGTTACTTGCAGTGGTTGCCCAGATCTCTCTGTTAGAATGTTAAGGGACACTCCCATGATGCAGCATGTCAATGACCTCCAAAACAATGATCCAGTGGACACATTTGTGCATGGTGTACTTGAAGAGGTTGTTGTTGTCCCAGACACACACGCTTCTGGACCACAACACACCACACGACCCAGTGCTCTGGGAGCCATGGAAATAGGAGCATCCAGCAACGCTATACCCGAGTCCGTTATGGAAACTCGGTATGTGGTCAATGACAACACCAATGAAGAGGCTGAGATCGAGATGTTCCTAGGAAGATCAGCTTTATGGAGCAAATTCTCTCTCACTGACAAACATGCCAAATGGGAGATTAACTTCCAAGAACAGGCACACATCAGGAAGAAGTTTGAGATGTTTACATATCTCCGCTTTGACATGGAGGTTACTATAGTTACAAACAACACAGGATTGATGCAAATCATGTATTTCCCACCTGGTCTCAAGGCTTCTGAAAACAAAGATGATCCTGTATGGAATTCAGCTTCTAATCCAAGTGTCTTCTTTCAATCCAAGAATGGTTTCCCTCGCTTTACAATACCTTTCACAGGCTTAGCATCAGCATACTACATGTTTTATGATGGGTATAGTAACAGAAAACGCCCCCAGGATAATGTGTATGGTATATCCCCCACTAATGACATGGGAACATTATGTTTCAGAGTGCTGGATGATGCTGATGGCACTAATATCATGGTGTATATAAAACCCAAACACATAACAGCATGGATACCTAGACCACCCAGAGCCACAGAATACACACACAAATACAGTACAAATTACCATGTTTCAGACTCTACTGAGACAGATGGATTGAAGGAGAAACACTTTATTAAGCCAAGAGAACACATAAAGAATGTTGGACCCAGTGATCAGTGTGTTCACACCAAAGATGCTATCTACACCTGTGCTCACTTAACTGAGCCTAATTCTGACACCATTCTCTTAGCCATCACTGCAGATTTGCAAGTTGATAGTACAGACACTCCAGGTCCAGATTTTATTCCAACTTGTGATTGTGTACAGGCATGTTATTACGCAAAACATGCTCAGAGATACTACCCTATCACAGTTACACCACATGACTGGTATGAGATCCAAGAATCACAGTACTACCCTAAACATATCCAGTACAACATACTAATTGGGGAAGGTCCCTGTGAACCAGGGGATTGTGGGGGCAAATTACTGTGTAGACATGGGGTGATAGGCATAATTACTGCTGGAGGTGATGGGCACGTAGCATTCACCGATCTTCGCCCATATGCTTGTCTAAGTGCACACCAGGGTTTGGTATCAGATTACGTCAACCAGCTTGGTGCAGCATTTGGTGACGGTTTTTCCAGTAACATTAAAGATCATCTAACAGGCCTATGTACAACAGTGTCTGACAAAATAACAGGTAAAGTCATCAAATGGCTAGTTAGAGTTATCAGTGCCCTCACCATCATGATTAGGAACTCAAGTGACACAGCAACTGTCTTAGCTACTCTTGCCTTGTTGGGGTGTCATGGCTCACCTTGGTCATTTTTAAAGGAGAAAATATGTCAATGGTTGGGGATACCTAGACCTCCAACCCGACAGGGGGAATCCTGGCTCAAGAAATTCACCGAATGTTGTAATGCTGCCAAGGGACTAGAATGGGTTGCACAGAAGATTGGCAAGTTTATTGATTGGCTAAAAGAAAAATTGATACCCACAGTGCAACGTAAGAAAGAGACTTTAGATCAGTGTAAAAAGATAGGACTCTACGAAGAACAAACAAAAGGCTTTTCCCATTCAGAGGCAGAGGCGCAACAGAGTCTAATTTTAGAAGTTGCAAAACTGAAGAGAGGTCTAGATGATTTAGCTCCTCTTTATGCTAGTGAAAATAAAAGGGTGACAATTATCCAGAAAGAATTACAGCGTTTATCTGCTTACCAGAAAACCCACAGACACGAACCAGTGTGTTGTTTGCTGCGAGGTCCTCCCGGGTGCGGTAAATCCTTAGTCACTTCCATTATAGCACATGGTCTAACCAATGAGGCAAATATCTACTCTCTGCCACCCGACCCCAAACACTTTGACGGGTACAATCAACAAACAGTGGTGATTATGGATGACGTAGGACAAAACCCTGATGGTAAAGATCTGAGTATGTTTTGTCAGATGGTGTCCACCACAGAATTCATAGTCCCAATGGCTAGCATAGAAGATAAGGGTAGAGCTTTCACCAGTCAATATGTCTTGGCTAGCACGAACTTAGATTCTCTTTCCCCCCCTACTGTGACAATACCAGAAGCAATTAGCAGAAGGTTCTACTTAGATGCTGATTTACAAGTCACAAGCAAATTCAAAGCACACAATGGATTATTAGATGTAGCAAAGGCCTTGCAACCTTGTGCTAAGTGTCCAAAGCCTAATCACTACAAACAGTGCTGTCCAATACTATGTGGGCAGGCTTTAGTCCTGAGAGATAGGAGGACATCAGCAAATTACCCATTACTGGCAGTAGTGGAACAACTTAGAATGGAGAACAACACTAGGGACAAAGTCAAGAGTAATCTCAGAGCCATCTTCCAGGGATTGGGCGATACAACACCCCCAGGTTTTATAGTGGACCTACTATCTAGCTCCAAGGATCCCAAAGTTATAGATTACTGTGTAGAGCAAGGTTGGGTGGGAAAAGCACAATCAACTATAGAGAGAGACTTTAATTATATACAATATGTTTTAAATTGTCTAGGTAGCTTGATAGTGATTTTAGGTACCATATATGCCCTTTACAAGCTTATGTGTTTAACACAAGGTGCTTACTCAGGGATACCAACTCCAGTAGCAAAGAGACCGGAGCTCAGGAAAGCCACTTTACAAGGGCCCCAGCATGAGTTCATACGAGCTCTTATCAAAAGAAATTGCCACATTATTACCACCACCAGAGGTGAATTCAACTTGCTGGGAATCCATGACAACTGTGCTGTTGTCCCCACTCATGCTGAATGTGGTGATATAGTTAATATAGATGGTAGAGAAGTGAAAGTAATCAAACAACAAATCTTAACCAATATGGATGATGTAGATACTGAGTTGACTTTACTATGGCTAGATCAGAACGAAAAGTTTAGGGACATCCGTAGGTTTATCCCCGAACATCAGCAGGAATGGACACACATGCACTTGGCCACTAATGTCACTAAGTTTCCAATGTTAGATGTAGAGATAGGTGATGTTGTACCATATGGAGAACTCTCCCTCAGTGGGAACCCTACATGTAGATTAATGAAGTACAATTATCCAACCCGCCCTGGTCAATGTGGTGGTGTCATCCTAAATACAGGGAACATAGTAGCTATTCATGTGGGTGGTAATGGCAAAGTTGGGTATGGAGCCACACTACTGCGTAAGTATTTCGCTCAGACCCAAGGAGATATAGTTAGAAAAGAAGCCACCCGTGATGCAGGGTATCACACTATAAACACACCTACCCAAACTAAGTTACAACCCAGTGTGTTTCATGACATTTTCCCAGGTTGCAAAGAACCAGCTGCTCTTAGTTCTCGCGATGAGAGGCTAGAAGTGGACTTAGATACAGCAGTTTTATCAAAGTATAAAGGGAATCCAGATGTAAAGTGGAATGAGTACATCCAAACAGCAGTGGATCATTATGCAGCTCAGTTGTTTGTACTTGAAATAAATCCAGAACCAATAACTATTGAACAAGCTGTGTATGGCATCACCAATCTGGAACCCCTAGACTTGAATACTAGTGCAGGTTATCCCTATGCTGCAATAGGAATAAAGAAAAAAGACATTATAAATAAAACTACAAAGGACACTGTAAAAATGCAAAAGATGCTGGATCAGTATGGGGTTGATTTACCCTACATAACATACCTAAAGGATGAACTTCGTAATCCTGAGAAGATTAAATTAGGGAAAACCAGAGCAATAGAAGCAGCAAGCCTGAATGATACAGTCCAATTTAGAATGATATTTGGTAATCTCTTCTCCACATTCCACGCCAACCCAGGTATCCTCACCGGATCAGCAGTAGGGTGTAACCCAGATGTGTTTTGGTCACAGATATATGCAATGCTAGAAGGGGAGTTATTGGCTTTTGATTACACAAATTATGATGGAAGCTTGCATCCTATCTGGTTTGAAGCTCTGGGGAAAGTACTTAACCAAATTGGCTTCCCTGGTTCTTTAATGAAAAGGCTTTGTAACACTACACATATATACAGGGATCAGGTGTACCATGTGGAGGGTGGGATGCCTTCTGGGATTTGTGGGACCAGTATATTCAACACCATGATCAACAACATAATAATAAGAACTTTAATCCTGGAAACATACAAAGGTATTGACTTGGACAAGTTGAAGATGATTGCCTATGGAGATGATGTATTGGCCTCATACCCTTATCCACTAGATGCTAGGGAGTTGTCCAACACAGCAAAGAAATATGGATTGACCATTACACCACCTGATAAATCAACTGAATTCAGACCCATGTCTTGGGACAATGTCACATTTCTGAAGAGATCTTTCCGTCCAGATAGCAAGTACCCTTTCTTGATACATCCAGTGTATAACATGACAGATGTGTATGAATCAATCAGATGGACAAAAGATCCGAAGAACACCCAGGATCACGTTCGGTCTCTGTGTTTGCTGGCATGGCATAATGGTGAAATGGAATACAACAAATTCTTGGACAAAATACGTAGTTGTCCAGTAGGTAGACGCCTACAGTTACCTCCATACACCAGTCTCTATAGACAGTGGATTGATGAATTCATTTAATATAATATAATGTTTGCAGTAGAACAAAATATTATAAAAAAAAAAAAAAA
| 41,429
|
MN369030.1
|
Rhinovirus C
|
Lin,M.J., Tait,A., Greninger,A.L.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
|
USA
|
2019-09-16
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,964
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null |
PRJNA338014
|
Rhinovirus C strain SC9810, complete genome
|
ATAGGGAGTGGTAAGCCATACCACTTGAGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCTCTAGAGGAATAGACCTTGCAAAGGGTTGAAGCCACGAAAGTCGTTATCCGCACACATACTACGCAAAGCTTAGTATTTCCTTGAAAGCTCGCCGGTTGGTCGCTCCGTTAATACCCCATTAACAGACCTGGCAGATGAGGCAGGAAGCTCCCCACTGGCGACAGTGTTCCTGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTCTCGGGTGTGAAGCCGACTAGTGGACAAGGTGAGAAGAGCCCCGTGTGCTATGTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACATCTGTTGCACACAATCCAGTGTGTAGGCAGTCGTAACGGGCAACTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTATTTCTTTCATGAATGCTTATGGTGACAATATCGAGTAATATTGTTACCATGGGCGCACAAGTGAGCAAGCAGAATGTTGGTTCGCATGAAAACACTGTCTCAGCCAGTAATGGTTCGGTTATCAAATATTTCAACATCAACTACTACAAAGACTCAGCAAGTTCAGGATTGAGCAAACAGGATTTCTCTCAAGACCCATCCAAATTTACACAGCCACTAGTGGATACTTTGACTAACCCTGCTCTTATGTCACCAACTGTGGAGGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTTAAGCAAATTACTATCGGAAACTCCACTATTACTACCCAGGACTCTTTAAACACCATTGCAGCATATGGAGAATGGCCCCAGTACTTATCAGATATGGATGCCACATCAGTAGACAAACCCACTCATCCTGAGACATCAGCCGATCGCTTTTACACCCTTGCCAGTGTTACTTGGACTTCCTCTTCACATGGTTGGTGGTGGAAACTCCCTGATGCACTGAAGGATATGGGGATCTTTGGACAAAATCTTTATTTCCACTCTCTAGGGAGAACTGGGTACATTATCCACACTCAGTGTAATGCCACCAAATTCCACAGTGGGGCTTTAATAGTTGCTGTGGTCCCCGAACACCAATTAGCTTACATTGGCGGTGTCAAAGCCAACGTTGGCTACGAGCACACGCATCCAGGGGAGACAGGCCACACTATCCTAGGACCAAACCCGAATAATGCACGGGGGGCTAACAATCCAGATGAAGACCCACTTTTTAATTGTAATGGTACTCTGTTAGGCAACCTTACAATCTTCCCCCATCAGTTAATCAATTTAAGAACAAATAACTCCAGTACTATAATAGTTCCTTACATCAACTGTGTACCGATGGACAACATGTTGAAGCACAACAACTTGTCACTCTTAATCATACCTCTTGTACCATTAAAACCTGGTAATAGTGGGGTTAACACAGTACCCATCACAGTATCCATAGCCCCACTCAAATCTGAGTTCTCAGGTGCAATGGAAACACGGTTTCAGGGTTTACCTACTCGCATACCTAGTGGTGGTCAACAATTTATGACCACCGAAGATGAACAATCAGCAAATTTATTACCAGGTTTCCATCCCACGAAGAAGATCCATATCCCAGGGTTAGTGACCAATATCATGCATATAGCCAGAGTGGATTCTTTCATTCCATTGAATAATATTGAGGGCCAAGTTGGGAGGGTCAGTATGTATTATGTGCCTGTCACAAAGAAGGTCAATGATGAGAGGATTCTAGTGTTGCCCTTGGAAATGAATAACACTTTGTTTTCTACAACTTTACTGGGAGAGGTTCTGAATTACTTCACAAACTGGTCAGGCAGCATAACCATCACATTTATGTGTGTCTGTGATGCATTTAGTACTGGAAAATTCCTACTAGCCTACACTCCACCAGGAGGAGCCCTACCAACCACACGCAAGCAAGCCATGCTAGGCGTTCATGTCATCTGGGATCTAGGTTTACAGTCTTCATGCACTATAGTGGTGCCATGGATATCATCAGGGTTTTATCGCCGTACCAAGGCAGATAATTACACAGAAGGGGGTTACGTGTCATTGTGGTACCAAACAGATTTTATACCATCTAATGGCACATCAGCTGGATCCATTGTGGCTACTTGCAGTGCATGCCCGGATATGTCCGCCAGAATGCTCAGAGATAGCCCAATGATGCAACAGAGCGGGACTTTGCAAAACAATGACCCAGTATCTAACTTTATAGATACAACCCTACAAGAGGTCCTTGTGGTTCCTGACACCAAACCCTCTGGTCCACAACACACTACTAAACCCACAGCCTTAGGGGCAATGGAGATTGGTGCATCCAGTGATGCCACACCAGAAGCAACCATCGAAACACGTTATGTCTACAATGATAACACCAATGCAGAAGCAGATGTGGAAATGTTTCTGGGTAGATCAGCAATTTGGGCTAATATCACACTCAATCAAGGGTTCTATAAATGGGATATTAACTTTCAGGAGCATGCACATGTTAGGAAAAAGTTCGAACTGTTCACCTATGTCAGATTTGATATGGAAGTTACAATTGTCACTAACAATACAGGGCTGATGCAAATTATGTTTGTCCCCCCAGGAATAGACTCTCCTACCTCAACCACTGACAGGAGATGGGATTCAGCTTCCAATCCAAGTGTCTTTTACCAGCCTAAATCAGGGTTCCCGAGGTTCACAATCCCCTTCACTGGGGTAGCGTCAGCATATTACATGTTCTATGATGGATATGCCACTACAGCCAAAACTGGAGATAACACTTATGGTATTGCCCCAACAAATGATATGGGTACTCTTTGCTTCAGAGCACTTGATGACACTGTGAAGAATGATGTTAAGGTGTTTGTCAAACCTAAACACATATCAGCATGGGTACCCCGACCTCCCAGAGCCACAGAGTACACGCATAAATACAGCACAAATTACCATTACAAACCAGATGGAGAGGGACACGCATTAACAGACAGACACTTCATTCAGAAGAGGAACAACATAAAGAATGTAGGTCCCAGTGACTTACATGTCCACACAAGAGATGCCATCTACACTTGTGCCCACCTAACCAAACCAAGTGACAAGACAATCCTGCTAGCCCTTACTGCAGACCTCCAAGTTGACAGCACTGACACACCGGGTAGCGACCACATACCATCGTGTGACTGCACCGTAGGGTGTTACTACTCAAAACACAATGACAGATATATTCCTGTAGAAGTCAAGCCCTATGATTGGTATGAAATCCAAGAGTCAGATTATTACCCCAAACATATTCAATATAATCTACTGATAGGTAATGGACCTAGTAGACCTGGAGATTGTGGTGGTAAGTTACTCTGTAAACACGGTGTGATTGGAATAATTACAGCTGGTGGTGACAACTTAGTTGCCTTCACCGATTTAAGGCCTTACTCATGCCTTTCCTCCCACCAAGGTGTAGTTTCAGACTACTTCACCCAATTAGGAAATGCCTTTGGTGAGGGCTTCACCACCAATATTCAAGACCATTTCAGTAAATTAGGACAATCTATTAATGATAAGCTCACATCTAAAGCTGTCAAGTGGTTAATCCGTGTTGTCAGTGCCCTTACAATTATGATCAGGAACAACTCAGACCTACCTACAGTGTTAGCCACCTTGGCACTGCTTGGGTGTAGTTCATCCCCGTGGTCCTTCCTCAAGGACAAAATCTGCAAGTGGTTGCAAATACCACGACCCCCATCCAAACAAAGCGATTCTTGGTTAAGGAAGTTCACAGAATGCTGTAATGCCGCTAAAGGCCTGGAGTGGATTAGTTTGAAGATTGGTAAGTTCATTGATTGGTTAAAGGAGAAGCTCATACCTACAGTACAAAAGAAGAAGGAAATTCTTGACAAATGCAAAAAGATCTCCCTTTTGGAAGAACAGGTGAATGGCTTTAGCTCTGCTGATTCAGAAGCACAACAACAGCTCATTGTAGAAGTGGATATACTCAAGAAGGGACTGGATGATTTAGCACCACTGTACGCTGCAGAGAATAAAAGAGTTACTAACATTCAGAAGAACCTCAAGCAACAGACAGCCTATCTTAAGACCCACAGGCACGAACCAGTGTGTTTGCTGTTACATGGAAATCCAGGGTGTGGAAAATCACTAGTTACCTCTGTAGTAGCACGTGGCCTCACCAGTGAAGCCCAAGTGTATTCTCTTCCCCCGGACCCCAAATATTTTGATGGGTATGATCAACAAGTGGTGGTTATAATGGATGATCTGGGCCAAAACCCGGATGGTAAAGACCTCAGCACCTTCTGTCAGATGATCTCCACTACTGACTTTATTGTCCCTATGGCATCCCTAGAAGACAAAGGTAAATCATTCACAAGTCAGTACGTGCTTGCAAGCACAAACCTAGATACCTTAACCCCTCCGACTGTTACACTCCCAGAAGCCATCAAGCGTCGCTTTTTCATGGATGCTGACTTAATCGTGACATCCAAATTCCGCAACAGTGCTGGATTGTTGGATGTGGCAAAAGCTTTGCAACCGTGTACACAATGTCCCAAACCAGACCATTACAAGGTGTGCTGCCCTATCCTCTGTGGACAAGCAGTGGTGATCCGAGACAGGAAAACCCAGATAAGCTATTCAGTCAATTCTGTGGTGGAACAACTTCGCAATGAGAATGATGTCAGGAGAAAGGTTAAACACAATCTAAATGCTATTTTCCAAGGTCTCGGGGATACACAACCACCAGGCTTTATTGTTGATCTCCTATCAGCTTCAAAAGACCCAAAAGTTCTAGAGTATTGTGTGGAACAGGGATGGGTGGGCAAGGCAACATCTACCATAGAAAGAGATTTCAACTATGTTCAATATCTGTTGAACTGCTTAGGAAGTTTAGTGCTTATCCTTGGAACAATATATGCCCTTTACAAATTAATGTGTCTGACCCAAGGCCCCTACTCAGGCCTCCCCAACCCTCCTTCCAAAAGGCCTGAACTGAGGAAAGCAACGCTGCAAGGACCTGAACATGAATTTATTAGAGCCTTAATTAAGAGGAACTGCCATATTGTAACTACTCCTAGAGGTGAGTTCAATTTACTGGGGATCCATGACAACTGTTGTGTGGTACCCACGCATGCTGAATGCGGAGAGACTGTGGATATAGATGGTAGGGAAGTCAAGGTCTTGAAACAACAGATTCTAACAGACATGCATGACACTGACACAGAAATTACACTCCTGTGGCTGGATCAGAATGAAAAATTTAGGGACATTAGAAGATTTATCCCTGAACACCAACAGGAGTGGACGAACATGCACCTAGCAACTAATGTTTCAAAGTTTCCAATGTTAGATGTGGAAATAGGGACAGTCATCCCATATGGTGAAATTAATCTAAGTGGCAATCCCACCTGCAGATTGATGAAATACAACTACCCTACAAAACCTGGTCAATGTGGTGGGGTTATTGCCAACACAGGTAATATTGTTGCTATCCATGTTGGGGGCAATGGGCGCGTTGGGTATGGTGCAGCTCTCTTGCGTAAGTACTTTGCTCAAGCCCAGGGAGACATAATAGCAAAACATAAAGTTGGAGTGGAAGGAATTTCACCAATTAACACCCCTAACAAGACCAAATTGCAACCCAGTGTATTCCATGATGTCTTTCCAGGTACCAAGGAACCTGCAGCCCTGACTAGAAAGGATCCACGGTTAGAGGTAGATCTTGATGCTGCAGTGTTCTCAAAGTACAAAGGCAACCCACCAGTGGCCTGGAATGATAATATCCAGGTGGCTGTCGACCATTATTCAGCCCAGCTATACATGTTGGACATAAACCCCAGCCCTTTAACTATGGAACAAGCAGTTTATGGTATTGAAAATCTAGAACCCCTGGACTTAACTACCAGTGCAGGATTCCCCTATGTTACTATGGGCATTAAGAAGAAGGATATTATAAATAAGGTTACAAAGGACACAACCAAGCTTCAAAATATGATAGATAGGTATGGTATAGATCTTCCATATGTTACTTATCTAAAGGATGAATTGAGAGCCCCTGAAAAGATCAAAATGGGGAAAACCCGAATAGTAGAAGCTGCTAGTTTGAATGATACAACCCATTTTCGGATGGTGTTTGGCAATCTCTTCAGCACCTTCCATGCTAATCCTGGTATCCTCACCGGCTCAGCTGTAGGTTGTAACCCAGATACATTCTGGTCCCAGATGTATGCCTCAATGGATGGAGAGTTGCTTGCTTTCGACTACACCAATTATGATGGTAGTTTGCACCCCATATGGTTCCAGGCCTTAGGTAAGGTGTTAAACAATCTTGGTTTTCCAGGGGAGTTAATGAGCAAGCTATGCAACACCACTCATATCTACAAGGATGACATCTATAGGGTGGAGGGTGGCATGCCATCTGGTATCTGTGGTACTAGCATTTTTAACACAATGATTAACAACATCATAATCAGAGTCCTAGTGTTAGATACTTATAAAAACATTGATCTGGACAAATTAAAGATTGTGGCATATGGGGATGATGTTGTGGCATCTTATCCCTATGAGTTGGATCCTAGTGAGATATCCAAGAGAGCTCAGCACTATGGCTTGACTATAACTCCACCTGACAAGGGAGAGACTTTCCAAAAGATGGACTGGTCCACAGTCACTTTCTTAAAGAGGCACTTCAAACCAGACACCAAGTACAAATTCTTGATACACCCAGTTTACAAGATGGAAGATGTCTATGAATCTATCAGATGGACCAAAGATCCCAAAAACACACAGGATCATGTTCATTCACTCTGCCTGCTAGCATGGCATAATGGTGAGGAAGTGTATGAAGAGTTCAGGAAGAAAATCAGATCAGTTCCTCTAGGGAGGATGCTCTATACACCACCATATTCCTTGCTGTACCGGCAGTGGATAGATCAGTTTATTTAGAATATAATACAATGTTTAGGTAGAACTTAGTAT
| 59,487
|
MN369031.1
|
Rhinovirus C
|
Lin,M.J., Tait,A., Greninger,A.L.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
|
USA
|
2019-09-16
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,076
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null |
PRJNA338014
|
Rhinovirus C strain SC9996, complete genome
|
TCCCACCACCAGGCACACAGTGCGTGGTACACTGGAATTTCGGTTCCTTTGTACGCCTGTTTTCCCACCCTCATGTTTGTTTGTCTTTACGCGTAACTTAGAAGCATTGCACACAGCTCAATAGGAATAGTCCATCCAGGACTGTTACGAGCAAGTACTTCTGTCTCCCCGGACGTGTGAATAGACCTCACCAAGGTTGAAGCTGTAGCGTTCGTTATCCGCTCATCTACTGCGCAAAGACTAGTAACTAACTGGAACCTTAATGGTGTTTCGCTCAGCAGTACCCCACTGTAGATCAGGGCAATGAGGCTACGCATCCCCCACTGGTGACAGTGGCGTAGCCTGCGTGGTGCCCTGCCCAGGTTTCGGCCTGGGACACCATTTTGATGACAGGGTGTGAAGACCGGCGTGCGCTAGGTGTGAATCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCTAACCCTGCAGCCATTGCATGTGATCCAACATGTGGATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGATGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCCAATTATTGTCTCATGGTTACAAATTTGTGTATCAAGTTTGTAACTATGGGTGCCCAAGTGAGTAAACAAAATGTTGGCTCGCACGAAAACTCTGTTTCCGCCACAGGAGGTTCAGTTATCAAGTATTTCAACATCAATTATTATAAGGATTCTGCTAGTTCGGGATTAACAAAACAAGATTTTTCACAGGATCCATCCAAATTTACACAACCCTTAGCTGAGGCATTAACAAACCCGGCACTTATGTCACCCAGTATTGAGGCTTGTGGATTCTCTGATAGGCTTAAACAAATCACTATCGGGAATTCAACAATAACAACCCAGGATACTTTACAAACAGTTCTTGCTTATGGTGAATGGCCTGAATACCTTTCAGCATTAGATGCCACATCAGTTGACAAACCCACTCACCCTGAAACATCTGCTGACCGCTTTTACACCCTCAGGAGTGTGCAGTGGGATGCTGTGTCAAAAGGGTGGTGGTGGAAGTTACCTGATTGTTTAAAAGAAATGGGAATCTTTGGTCAAAACATGTACTATCATTCCTTTGGTAGATCAGGCTTTCTAATCCATGTCCAGTGTAATGCAACTAAGTTTCACACGGGGTGTCTTGTTGTTGCAGTTATACCAGAACATCAGTTGTCATATGTGGGAGCAGCTGATAGTAAGGTGCGCTATGATCACACACACCCTGGAGAGAATGGACATACTTTTTCAACACCAACCAATTTTGGAGCCAACAACCCAGATGAAAACCCATTTTACTTGTGTAATGGTACTCTCTTTGGCAACATAACTGCTTACCCTCACCAGCTGATAAATCTGCGCACCAACAACTCATGCACCATTGTAGTGCCCTATGTGAATGCTGTACCCATGGATAACATGCTCAGACACAACAACTTGACCTTAATGATAGTTCCCATAGTACCTCTTAAGGCTGGGTTGGCTGGGTCGTCCACATTACCTATAACTATCACAATCGCCCCAACCAAATCTGAGTTTTCAGGTGCCATGCAAAAACAGCAAGGACTACCCACTCGGATGCCTAGTGGTGCACAACAGTTTATGACCACTGAGGATGAGCAATCAGCTAATATACTCCCAGAGTTTAGTCCTACTAAGCTTATACATATCCCAGGAAAGATAGATAGCATCCTACACATGGCCATGATAGAGTCTTTTATACCAATAAATAATATTCCAGGGCACTTGGGGAAGATTGAAATATATTCACTCCAGGTTACCAGAAATGAAAGTGAAAAGAATATACTAATTCTACCTCTAGAAATGGACAACACCCTCTTTTCATCCACACTTTTGGGCGAAGTTTTAAATTACTTCGCAAATTGGTCTGGCAGCATAACTATTACATTTATGTGTGTTTGTGATAGCTTTAGCACAGGGAAGTTTCTCGTAGCTTACACACCCCCAGGTGGCCGACCTCCAGAAAACCGCAAAGACGCAATGCTTGGTGTCCACATCATATGGGACTTGGGGCTGCAGTCATCTTGCTCCATTGTAGTTCCATGGATGTCTGCTGGGTTTTTCAGACACACAAAAACAGACAAATACTCATCTGGTGGCTATATAACCCTATGGAGACAAACAGACTTTGTGCCTGGATCAAATAATGGTATCGGGTATATTTTGGCAACCTGTTCAGGATGTCCAGATCTGTCCGTACGCATGCTAAGGGATACACCACTTATCAGTTACGCACAAAGTGCTACCCAAAATCCAGTGGAAACCTTCACAGAGGAGGTGCTTAAGGAAGTGTTAGTGGTTCCCAACACCCAACCAAGTGGCCCATCGCACACTGTGCAGCCAACAGCTCTCAGCGCACTTGAAATCGGAGCGTCTTCCACGGCTACGCCAGAAACAACCATAGAGACTAGGTATGTGATCAACAACCATGTGAATAATGAAGCATTAGTGGAAAATTTCCTTGGTAGGTCATCACTATGGGCAAATCTCACCCTAGACACTAATGGGTATGTCAAATGGGATATCAATTTCCAGGAACAAGCACAAATTAGGAAAAAACTAGAGATGTTCACTTATGCCCGTTTTGACATGGAAGTTACAGTGGTTACAAACAACAATGGACTTATGCAGATTATGTATGTACCACCAGGTGCCCCATCCCCAACAGCATATAATGACACAAAATGGGATGGAGCCTCTAACCCCAGTGTCTTCTATCAACCCAAAAGCGGATTCCCACGCTTTACCATCCCCTTCACTGGCCTAGGTTCCGCATATTACATATTCTATGATGGGTATGATGAAAATAACACCGGATCGACAGCGTATGGCACCACCATCTTCAATGACATGGGAAGGCTCTGCTTTCGGGCGTTAGAGGACACCACACAGAAGACTGTCAAAGTGTACATCAAGCCGAAACACATATCAGCATGGTGCCCGCGCCCACCACGGGCTACACAGTACCTTCATAAATACAGTCCTAATTATCACATCAAGAAAGTAGGTACCCAGGAGCTCACCGAAAACCATTACTTGACTTCGAGAGATGACATCAAGTCAGTGACCACTGTAGGACCTAGTGACTTATATGTGCACGCAGGTCACTATAAATACATTAATGCACATCTGACCAACAGCAACTCAGATACAATCCTACTGGCACTTACAGCAGACCTGCAAGTTGACTATACTGAAGAAAGGGGTCCGGATGTTGTTCCATCGTGTGACTGCATGGAGGGATGTTATTACTGTCACAGTCAAGACCGTTACTTCCCAGTGAAAGTCAAGGCGCATGAATGGTATGAGATCCAAGAGAGCCCGTATTACCCAAAACACATCCAGTACAATGTCCTGATCGGGGAGGGTCCCTGTGTGCCTGGTGACTGTGGTGGTAAACTCTTGTGTAAACATGGAGTTATTGGCATAATCACCGCCGGTGGATCAAATCATGTGGCATTCACAGACCTCAGGCCATATACCTTTGATGTACACCAAGGAATTGTCTCTGATTATGTTACCCAACTCGGTGGTGCATTCGGGGAGGGTTTCACCACAAACCTGAAGGACAGTTTCTCTTCTTTAGCTAGTCAAGTGCAGGATAAGATCACATCTAAAGTTATCAAATGGCTGATACGCATTATCAGTGCCCTCACAATCATGGTTAGAAATAGTGCAGACACCCCAACTGTTCTGGCTACACTCTCACTCTTGGGTTGCCATTCATCACCCTGGAACTTTCTCAAAACCAAGCTATGTGCGTGGCTTGGTGTCAACAGACCAGCACACAAGCAATCTGACTCTTGGCTCAAGAAGTTTACTGAATGGTGCAATGCAGCAAAAGGCTTGGAATGGATAGGCCACAAGATTAGTAAGTTCATAGAGTGGCTCAAGGATAAGCTTGTGCCAACTGTTCAGAGGAAGAGGGAAATCCTGGAAGAGTGTAAAAAGATTAACTTGTACCAGGAGCAGGTAAACGGTTACCCACAAGCAAGTGAGGATGCCCAGAACGAGCTATTAACAAATGTAGGGAAACTGAAGAAAGGGTTAGATACACTGGCTCCCTTATATGCTGCAGAGAACAAGAAGGTCACAGACATGCTCAAGCAACTTAAACAAATGAGTGCTTACAAAAGGGATCACCGTCAGGAACCAGTGTGTCTGCTAATACATGGTAGTCCAGGTACAGGGAAATCTTTAATCACAATGATGGTTGCTCGTGGCCTCACGAATGAAGGGGGTGTCTACTCCTTGCCCCCTGACCCAAAGCATTTCGATGGCTACAATCAACAACCCGTGGTTATTATGGATGACCTCGGGCAAAACCCTGATGGGCAAGATCTAAGCATGTTCTGTCAAATGGTTTCAAGCACCACCTTCGTCGTCCCGATGGCAGCACTAGAGGACAAGGGCCGAACTTTTACGAGCAAATACGTGCTGGCCAGTACAAATCTTTGCAATTTAACACCACCCACAATCACTATACCAGAAGCTATCAACAGGAGATTCTTCTTAGACACAGAAATAAAGATTTTGCAAGGCTACAGTACCCACGCAGGCCTTCTGAATGTCTCTAAAGCACTACAACCTTGCACTACATGTCCCAAGCCTCCGCATTACAAACATTGCTGTCCCATTTTGTGCGGTAAGGCTGTAGTCATGGTCAATAGAAGAACACAAGCCAGTTACTCAGTGAATATGATTGTTGAACAAATGCGTGAGGAATGCCAATCTAGGAAAAATGTTGGGGCAAATCTCCATGCTATATTCCAGGGGTTAAATAATGATGACACACCAGGGTTTATAGTTGACCTACTTTCAGCGTCCAAAGACCCGAAAGTAATACAGTACTGTGAAGAGCAAGGATGGATAGGACGCACAACTTCCACAATAGAAAGGGAAATAAACAAAATACAATACATTCTTAACTGCTTAGGTAGTTTAGTCTTAATTTTAGGAACACTCTATGCCTTGTACAAGTTAATGTGCATCGCTCAAGGTCCATATTCAGGAAATGCTCAACCAACCCTTAAGAGACCAGAATTACGGAAAGCAACACTGCAAGGGCCAGAGCATGAGTTCATACAAGCACTAGTCAGAAGAAATTGCCATGTGTTAACAACAAAAAGAGGGGAATTTAATTTGCTTGGAATACACGACAACTGTGCAGTTGTCCCCACCCATGCTGAATGTGGTGATGAAGTTAACATTGATGGGAGGATGGTTAAAGTACTCAAGCAACAAATATTAACTGACACCAATGATGTTGATACTGAAATTACCATACTGTGGTTAGACCAAAATGAAAAGTTCCGTGATATACGTAGATTCATCCCAGAGTATATACAGGAATGGTCCCACATGAAAATTGCAACAAATGTAACTAAATTCCCCATGTTCTGTGTAGATGTAGGCACTGCTATACCCTACGGTGAAGTGAGCCTGAGTGGAAACCCTACTTGTCGCCTACTAAAATATGACTACCCAACAAAGCCCGGCCAGTGTGGTGGCGTTATAGCCAATACAGGAAATATTATAGGAATCCATGTTGGTGGCAACGGGCGTGTGGGCTATTGTGCTGCCCTGTTAAGGCGATACTTTGCACAACCACAGGGTGAAATCACCAGTAAGAGAAATGTCACTGAAATTGGTTTGAGTCCAATTAATACACCCAGGAACACTAAACTTCAACCAAGTGTTTTCCATGACATTTTCCCTGGGAAGAAAGAACCAGCTGCACTACACCCAAGAGACCCCAGACTAGAAGTGGATTTGGACCAAGCAGTTATGTCTAAATATAAAGGCAACCCACATGTTGAGTTGAATTCATACATCACAACTGCAGCAGACCATTACGCCGCCCAACTGTTCTCCCTTGATATAAATCCACAACCAATTACTTTGGATCAAGCTGCCTATGGCATGGAAAACTTAGAAGGACTAGACCTCACCACTAGTGCTGGATTCCCCTATGTTACCAAGGGTATCAAGAAGAGAGACATACTGAACAAAACCACCAAAGACACAAGTAAGTTACAGTTAATGCTGGATACATACGGGCTTGATCTGCCGTATGTCACTTATCTGAAGGATGAGTTACGTAATCCAGATAAAATTAGAGCTGGTAAAACTAGGATCATAGAGGCTGCCAGTCTCAATGATACTGTACACTTTAGAATGGTGTTTGGTAACCTTTTCTCCACTTTCCATAAAAATCCAGGAATTGGAACTGGGTCTGCTGTTGGGTGTGACCCGGATGTGTTCTGGTCCCAAATTTATGCCAGTATGGATGGGAACTTGATGGCCTTTGACTACACCAACTTTGATGGCAGCATCCACCCTGTTTGGTTCAAAGCACTTGGACGCGTGCTTGATCAGCTAGGGTTTCCAGGAGAGCTAATGGACAAATTGTGCTACACCACCCACATATACAAGGATGCAGTGTACACAGTAGAAGGTGGTGTGCCATCTGGGATCTGTGGCACATCAATATTCAATACTATGCTAAATAATATTATCATTAGAGCTCTAGTACTGCAAACATACAGAGGAGTAGATTTAGACAAATTACGTATAATAGCCTATGGTGATGATGTGATTGTCTCCTACCCTTACCAATTGGAGCCAGAGGAAGTGTCAAATACTGGTAAATCTTATGGACTCACCATAACTCCAGCAGACAAAGGAGAGAAGTTCACACCCACAACTTGGGATAATCTAACATTCCTGAAGAGAGGGTTTAAACCAGATTCCAGATATCAATTTCTCATCCACCCAGTCTACCCAATGCAGGATATCTATGAATCCATCAGGTGGACACGTGACCCGAAAAACACCCAGGATCACGTGCGTTCCCTATGCCTTATGGCTTGGCATAATGGAAAGGAACAGTACAATGAATTCCTAGAGAAAATTAGGACAACTAGTGTTGGAAGGAATTTGGTTCTACCACCTTACAGTTATCTAGAACAACAATGGTTAGATAAATTCATATGAATAATATAATAAATTGACTGTGTAGGTTCAATATCTTAT
| 59,488
|
MN369033.1
|
Rhinovirus C
|
Lin,M.J., Tait,A., Greninger,A.L.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
|
USA
|
2019-09-16
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,120
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null |
PRJNA338014
|
Rhinovirus C strain SC9941, complete genome
|
TTAAAACTGGGTATAGGTTGTTCCCACCTGTACCACCCACGCGGTGTAGTGCTCCTGTATTCCGGTACACTTGCACGCCAGTTTGCCCTCCCTCCCTGTAACGTAGAAGAAATACGAACAGACCAATAGGGGATGGCGAACCACGCCGTTCAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATGCGAGGAATAGACCTTTCCAGGGGTTGAAGCCACAAGTGTCGTTACCCACATTGGTACTACACAGAGCCTAGTATCGCTCTAGAAACTTGTTGGTTGGTCGTTCAGCCATTTCCCATGGTAGACCTGGCAGATGAGGCAAGAGACTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTTGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTAATGGGTGTGAAGCCAATGAGTGGACAGGGTGTGAAGAGCCGCGTGTGCTACCAGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTATGGCATGCAATCCAGCATGTGCGTAGTCGTAATGAGTAATTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTATTCTCTTATGTCTTGCCTATGGTGACAATATTAAGTATTAATATTGCTACCATGGGCGCTCAGGTCAGCAGACAAAACAATGGCACACATGAGAGTGGTGTAACAGCCAGCAATGGATCAGTTATTAAGTATTTTAACATCAATTACTACAAAGATTCAGCAAGTTCTGGTTTGAGTCGTCAAGATTTTTCCCAGGATCCATCCAAATTTACCCAGCCCCTTGTGGATACACTTACAAACCCAGCACTTATGTCACCATCTATTGAAGCATGTGGATATTCTGATAGGCTCAAGCAAATCACTATCGGAAACTCCACAATCACAACACAAGACTCTCTACACACAGTACTTGCATATGGTGAATGGCCCACATACTTATCTGACATTGATGCAACATCCGTTGACAAACCTACTCACCCAGAAACATCAGCTGACAGATTCTACACTCTGGATAGTGTTGATTGGGAAGTAGGTTCTCATGGTTGGTGGTGGAAGCTGCCAGATGCTCTCAAAGACATGGGTGTGTTTGGTCAAAACATGTATTACCACTCAATGGGTAGATCAGGCTTCATAATTCATACACAGTGCAATGCAACCAAATTCCACAGTGGTGCACTCATAATTGCAGTGATACCAGAGCACCAACTTGCTTATGTAGGAGGGGTGAAAGTTAATATAGGATATGATCATACACACCCAGGGCAAAGTGGCCATCGAATACTTGGACCCAACCAATCAAATGACCGAGGTGGTGGTAAGCCAGATGAGGACCCACTGTTCAATTGCAACGGAACATTGTTGGGAAACATAACAATTTATCCACACCAAATTATAAATTTGAGGACCAACAACTCCAGCACAATAGTTGTGCCTTACATAAATTGTGTCCCTATGGACAATATGTTAAAACATAACAATCTGTCTTTAGTGGTTATCCCGTTAGTACCACTCCATCCAGGTTCTAGTAATATCAACTCTGTTCCAATTACTGTAACAATAGCACCTTATAAGTCAGAATTCTCAGGTGCCATGGAGGCTCAACGCCAAGGCTTACCAACACGTCTTCCTAGTGGTAGCCAACAATTCATGACAACTGAGGATGAGCAATCACCCAACATTCTACCTGGTTTCCATCCAAGTAAGAAAATACACATACCTGGTATGATTACAAATGTGATGCACATGGCTAGAGTGGATTCATTCATACCCATTAATAATATTAAAACAGAAGTTGGTAAGGTGAGCATGTACTATATCCCAGTGGTCAAAAAGACAACGACAGAAAAGATCCTTGTTCTGCCCTTAGAAATGAACAACACATTATTTGCTACAACTCTTTTAGGTGAGGTTCTAAACTACTATGCCAACTGGTCAGGGAGTATCACCATTACTTTCATGTGCGTGTGTGATGCATTCAGTACAGGAAAGTTTCTCGTTGCATACACACCACCAGGAGGTAAACTACCAGAAAACAGAAAACAGGCAATGTTAGGTGTTCACATCATATGGGATTTGGGCCTGCAGTCGTCTTGCACCATTGTGGTACCATGGATTTCATCCGGTTTCTACCGTCGCACTAGGGCAGACAGCTTCACCCACGGTGGATATGTCTCTTTGTGGTACCAGACAGCCTTTGTACCCCCAGTGAGTGGAGGGACAGGACGCATTCTTGCCACCTGTAGTGCTTGTCCCGACATGTCTGTTAGGATGCTACGGGACAGCCCAATGATGGAACAAAGCAATGAGTTGCAGAACAATGATGACCCAGTTGAGAACTTTGTGGAGTCCACCTTACAAGAGGTGTTGGTCGTACCGGACACGAAGCCCTCAGGACCTCAACACACAACAAAACCATCAATATTGGGTGCCATGGAGATTGGTGCTTCCAGTGACGCGACTCCAGAATCCACAATAGAGACTAGGTATGTATATAATACAAACACAAATGCAGAAGCAGATGTAGAAATGTTTCTAGGTAGATCTGCCCTTTGGGGCAAGGTAACACTTGAAAACCAATATGCCAAGTGGGAAATAAACTTTCAAGAACAGGCACACATCAGGAAAAAATTTGAGTTTTTCACTTACCTGAGATTTGACATGGAAATCACTATAGTAACCAGCAACACAGGGTTGATGCAAGTAATGTTCGTCCCACCGGGGATAGACCACCCTAAAACACATAATGACGGAAAATGGGACTCTGCTTCCAACCCCAGTGTGTTCTTCCAACCTAAATCAGGATTTCCTAGGTTTACCATCCCATTTACTGGATTAGCTTCAGCATACTACATGTTTTATGATGGATATGATAAACCCGAGGGTTCAGATGACAATGAATATGGAATTGCTCCCACCAATGACATGGGTATGTTATGCTTCAGGACCTTGGACAATAGTGGTGGAAATGATGTAAAGATATACGTCAAACCCAAGCACATAACGGCGTGGGTACCAAGACCACCAAGGGCAACACAGTACACCCATAAGTATAGTACAAACTATCATTACAAACCCAACTCTAGTGGGCCTGATCAACATGTGCTTAAAGACAGACACTTTATCACACCCAGGCCCCACATCAGCTCAGCAGGACCGAGCGACATGCTTGTGCACACAAAGGATGCAATTTACACGTGTGCACATCTAACCAACCCAACTGATGAAACCATACTCCTGGCATTGACTGCAGATCTACAAGTGGATAGCACAGATGTCCCAGGCCCCGATGTGATTCCATGTTGTGATTGCACAACTGGTTGCTACTACTCTAAAAGCAAAGATAGATACTTCCCAGTGGAGTGTGTTAGCCATGACTGGTATGAGATACAAGAATCTGACTACTATCCCAAACATATACAATATAACCTACTCATCGGGGAGGGACACTGTGAACCAGGTGACTGTGGAGGCAAGCTAATGTGCAAGCATGGTGTGATTGGTATGATTACTGCAGGTGGTGATAACCATGTTGCCTTCACTGATCTGCGCCCATACTCTAGCCTATCAGAACACCAAGGGGTTATTTCAGATTATTTCACCCAATTGGGTAATGCATTTGGTGAAGGCTTCACAACTAACATTCAAGACCACTTTTCCCAAGTCACCAAATCAATCTCTGACAAATTTACATCAAAGGCTATTAAATGGCTGGTGCGCATCATAAGCGCCCTTACAATTATGATTAGAAACAACTCAGACTTGCCTACCATACTTGCTACCCTGTCATTATTGGGGTGCAGTAGCTCACCATGGTCTTTCCTGAAGGACAAGATCTGCAACTGGCTTCAAATCCAGCGCCCTGCAAGTAAACAAAGTGATTCATGGTTGCGCAAATTCACAGAGTGTTGTAATGCAGCAAAAGGACTTGAATGGATCAGTATCAAGATTGGCAGGTTTATTGATTGGCTGAAAGGGAAACTAGTCCCTACTGTCCAGAGGAAAAGAGACACCCTAGATAGATGTAAGAAAATACCTCTCTTAGAGGAACAAGTAAATGGATTCAGTTCTGCTAGCTCAGAAGCACAACAACAGCTTATTGTGGAAGTTGATACTCTAAAGAAGGGTCTAGATGAGCTAGCACCATTATATGCCAGTGAGAATAAAAGAGTGACTAAGATTCAAAAAGATCTCAAACAATTATCAGCTTATCTGAAGAACCACAGGCATGAACCAGTTTGTTTATTATTGCATGGCAATCCAGGATGTGGAAAATCACTAGTCACAACCATAATCGCCAGGGGACTCACCCAAGAGGCGCAGGTATATTCACTACCACCTGATCCCAAATATTTTGACGGCTATGATCAGCAGCAGGTCGTCATATTAGATGATCTTGGACAAAATCCTGATGGTAAAGATTTGAGCACATTCTGTCAGATGGTATCAACAACTGATTTCATAGTACCTATGGCATCACTAGAAGACAAGGGCAAGTCCTTCACCAGTCAATATGTGCTTGCTAGCACTAATCTGGACACTTTGTCACCACCAACAGTCACAATACCTGAGGCCATAAAACGACGATTCTTCCTGGATGCCGACCTCATCACAACATCTAAGTTCAGAAACACTACAGGATTGCTAGATGTAGCAAAGGCACTGCAACCATGCACAGGTTGTCCCAAACCAGCACACTATAAGACATGCTGTCCTCTGTTGTGTGGCAAGGCAGTTGTAGTTCAGGACAGGAAAACAAAGGCAAATTTCTCAGTAAATACAATAGTAGAACAGTTGAGACACGAGAATGCCATCAGGAAAAAGGTTAAACACAACCTTGATGCAATATTCCAGGGTCTTGGTGACTCGGAAACACCAGGTTTTATAGTTGATCTACTATCTTCATCTAAGGACCCCAAAGTTATAGAATACTGTGCTGAACAGGGATGGATAGGTAAAGCAAACTCAACCATAGAGAGGGATTTCAATTATGTACACTACATGTTAAATTGCTTAGGTAGTCTAATCATTATCTTAGGAACTGTATATGCATTATACAAACTGATGTGTATGACTCAAGGGCCTTACACTGGTTTACCAAACCCCCAGACCAAAAGACCAGAACTCAGGAAAGCCACACTACAGGGTCCCGAGCATGAATTTGTCAGAGCTTTAATTAAAAGAAATTGTCATGTGATAACTACTTCAAAAGGGGAGTTCAACATGCTTGGAATCCATGATAACTGTGCAGTGGTGCCAACACACGCTGAATGTGGTGACTTTGTCACAATTGATGGTAGGGAAGTTAGGGTTCTCAAACAATGCATTCTCACTGACACAAATGACACAGATACTGAAATAACACTCCTCTGGTTAGATCAGAATGAAAAATTTAGGGACATTAGGAGGTTTATCCCAGAACACCAACGCGAATGGTCAGGTATGCACCTTGCTACAAATGTAACTAAATTCCCTATGCTAGATGTGGAGGTTGGTACTGTAATACCATATGGAGAGGTCAATCTTAGTGGTAATCCAACATGTCGGCTTCTCAAGTACAACTACCCTACAAAACCAGGGCAATGTGGTGGTGTCATTGCAAACACAGGAAACATAGTAGCGATCCATGTTGGTGGGAATGGACGTGTGGGATATGGAGCAGCATTGCTACGCAAATATTTCGCACAGTCTCAAGGTGAGATCACTGCTAAGCATGATGTTAGAGAGAAAGGCTTACCACAAATCAACACACCTAACAAAACAAAATTACAACCCAGTGTATTTTATGATGTTTTTCCAGGAGTGAAGGAACCAGCAGCTTTAAGCAATGGAGACCCACGGCTCGAGGTTGATCTCAGCACAGCTGTGTTAAGCAAGTACAAAGGTAACACACAAGTGGAGTGGAACGATAATATCCAGATTGCAGTTGACCACTACTCAGCTCAACTTTATATGCTAGATATTAACCCTCAACCATTAACCATGGAACAGGCAGTCTATGGCATAGAGCATCTGGAACCACTAGACCTCACCACTAGTGCAGGGTTCCCCTATGTAGCTATGGGCATAAAGAAAAAAGACATAGTCAATAAAGTGACAAAGGATGTAACCAAACTCCAGGAAATGATTGACAAATATGGAATAGACTTGCCTTATGTCACCTACCTGAAAGATGAATTGAGAGCTCCTGAGAAAATCAAGAAAGGGAAAACGAGAGCAATAGAGGCAGCTAGTATAAATGACACAACCCACTTTCGCATGGTGTTCGGTAACCTCTTTTCCGTGTTCCATGCTAATCCAGGTGTACTCACAGGCTCTGCAGTAGGTTGTAACCCTGATGTGTTCTGGTCTCAAATGTATGCATGTATGGATGGTGAGTTGCTTGCTTTTGACTACACAAACTATGATGGTAGTTTGCACCCAATCTGGTTCAAAGCACTGGGTAAAGTCTTGGATAATCTGGGCTTCCCAGGACACTTAGTAAATAGATTGTGCAACACAACACACATCTTTAAGAACTTAATTTACACAGTGGAAGGAGGTATGCCCTCTGGCATCTGTGGCACAAGTATTTTCAATACCATGATCAACAATATAATCATTAGAGTATTGGTTCTTGAAACATACAAGAACATAGATCTAGATAAGCTAAAGATTATAGCATATGGTGATGATGTGGTGGTGTCTTACCCTTTTGAACTAGATCCAATGGAAATTGCCAATAAAGCAGAGAGGTATGGGTTAACCATTACTCCACCAGACAAAGGCAGCACATTTCAGAAGATTGATTGGACAAATGTCACTTTCCTCAAAAGGCATTTCAAACCAGACACCAAATACAAATTCTTGATACATCCAGTGTACAAGATGGAGGATATCTATGAATCAATTAGGTGGACAAAAGACCCAAAAAATACACAAGACCATGTTCACTCATTATGTCTACTCGCATGGCACAATGGGGAGGAGGTTTATGAGAAGTTTAGGGAGAAAATCAGATCCACAAGTGTTGGCAAGGTTCTCTACACCCCACCTTACTCATTGTTGTACAGGCAGTGGATAGATCAATTCATATAAACAAGTAATATAATACAATGTTTGAGTAGAACTTAGTATTATAAAAAAAAA
| 59,490
|
MN306023.1
|
Rhinovirus C
|
Lin,M.J., Tait,A., Greninger,A.L.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
|
USA
|
2019-08-25
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,939
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null |
PRJNA338014
|
Rhinovirus C strain SC0323, complete genome
|
CCAATAGGTGGTGACCATCCAGGTCACTGACGGTCGAGCACTTCTGTTTCCCCGGTACCCTTGTATACGCTTCGCCCGAGGCGAAAAACGAGGTTATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGAGAAGCCTAGTAGCACTTTTGAAACCTATGGCTGGTCGCTCAACTGCATACCCAGCAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACACTCCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTATCGGGTGTGAAGCCAGAAAGTGGACAAGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTAGCTGTTGCATGCAACCCAGCATGTATGCAGTCGTAATGGGCAACTATGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTACTTTTCATTGCTTATGGTGACAATTGTAATTAATACGCTTGTTACCATGGGCGCACAAGTGTCTAGGCAAAGTGTCGGGAGTCACGAAACAATGATCCACGCTGGAACAGGAGCTGTAGTGAAATATTTTAATGTCAACTACTACAAGGATGCAGCAAGTTCCGGACTAACCAAACAGGATTTCTCTCAAGACCCTTCCAAGTTCACCCAACCTGTAGCAGATATCTTGTCAAATCCAGCATTAATGTCCCCTTCAATTGAAGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAACAAATCACTATCGGAAATTCCACTATCACAACACAGGATGCAGTCAACACAATTGTCGCATATGGAGAGTGGCCTAGTTACTTGTCAGATATGGATGCAACTTCAGTTGATAAACCCACCCACCCTGAAACTTCATCAGACAGATTCTATACGCTGAATAGTGTCACCTGGCAGGGTGGGTCGTTGGGTTGGTGGTGGAAGTTACCAGACTGTCTGAGAGACATGGGTGTTTTCGGACAGAACATGTATCATCATGCTATGGGAAGATCTGGATACATCATACATACTCAGTGTAATGCAACCAAATTCCACAGTGGGTGTTTGTTGGTGGCAGTAGTACCTGAGCATCAGTTGGCATACATCGGAGGTACTAACGCACAAGTGAAATATAAACATACACACCCAGGTGAACAGGGACACAGGATTGGTAGTAACTCAGAAAGAAATGAGAACCAACCAGATGAGAATCCGTTTTTTAACTGCAATGGAACATTGTTGGGAAACCTCACCATCTTCCCACACCAGCTCATAAACTTAAGGACAAACAATTCAAGTACTATTGTTGTACCCTACATCAACTGTACACCCATGGACAGCATGTTACGTCACAACAATGTGTCACTTGTCATCATACCAATCTGCCCTCTACGGGCTCCGGCAACGGCCCCCCAAACCCTGCCGATTACAATATCCATTGCCCCTATCAAGTCAGAATTCTCTGGCGCGAGACAATCCACAAAACAGGGACTACCAGTTAGAATGCCAAGTGGAGCCAATCAATTTATGACAACAGAAGATGAGCAATCACCCAACATACTCCCCAGCTTCCACTCCACTAAACAGATCCATATACCTGGTCAAATTAAAACGATCATGGATATGGCCCGTGTGGACTCCTTCATGCCCATAAACAATGTAAATCAATCTCAGGCAATAGGAATTTATTACATTCCAATATCAAACACACATAATGATAGGAGAATATTGGCCATACCACTAGACATGAGCAACACACTTTTCTCCACAACACTTTTAGGAGAAGTGCTAAACTATTATTCAAATTGGTCTGGATCAATAAAGCTCACATTCTTCTGTGTCTGTGATAGTTTCAGTACTGGTAAATTCTTAATAGCATACACCCCTCCAGGTGCCGACATCCCAGAGACGCGTCGTGACGCAATGCTTGGTACACACGTCGTGTGGGACCTGGGTCTCCAATCATCATGTCACCTCGTTGTACCCTGGATCAGCTCCCACTTCTTCAGAAGGACCAGGAAAGACAACTATACAGAAAGTGGATTTGTCACATTGTGGCATCAAACAGCATTTGTATCCAATGGAACTACAGGATCTATAATGGTCACTTGCTCTGCATGCTCTGACATGTCAGTTCGCATGTTACGAGACACACCTATGATGAGACAGGATGAAGACATTACCCAAAATCCAGTGGAAGAGTTTGTGGAACACACATTGAAAGAGGTTTTGGTGGTCCCAGACACTCAGGCCTCAGGACCTGTCCACACTACAAAACCACAAGCCCTAGGTGCTGTAGAAATAGGAGCAACTGCTGATGTGGGCCCAGAGACACTAATTGAAACAAGGTATGTAATGAATGATAATACAAATGCTGAGGCAACAGTAGAAAACTTTCTGGGAAGATCTGCCTTGTGGGCAAACCTAAAGTTGAACCAGGGTTTTAAAGAATGGAAGATAAATTTCCAAGAACACGCCCAAGTTAGGAAAAAGTTTGAAATGTTCACCTATGTTAGGTTTGATTTGGAAGTGACTATAGTCACCAACAACACAGGACTAATGCAAATTATGTTTGTACCCCCAGGGATTCCAGCTCCAAGTAGAAAGAATAGCAGGGAATGGGACACAGCTTCAAACCCCAGTGTTTTCTTCCAGCCAAACTCTGGGTTCCCAAGATTCACAATACCCTTTACAGGGTTAGGATCAGCATACTACATGTTTTATGATGGGTATGATGGTACTGATGCTACCAACACAAACTATGGAATTTCATTAACAAATGACATGGGAACCCTGTGTTTTCGGGCACTAGATGGGACTGAGGTGAGCGACATCAAAGTTTTTGCTAAGCCCAAACATACGGCTGCATGGATCCCCCGTCCACCTAGAGCAACTCAGTATTTGCACAAATTCAGCACCAATTACAACAAGCCAAAGACAAAGGGCAGCAATGAGTTAGAACCCAAGCATTTCCTTAAGTATAGAGATGACATCACAAGTGTTACTACTTTAGGACCCAGTGACATGTATGTTCACACAAAGGAAGCTATCTACAAGTGTGCACACTTGACTGAGCCTAACGAAAATACTATACTTCTGGCTATATCATCAGATCTTCAGGTTGACAGTACAAATGTTCCAGGTCCCGATAACATACCCACCTGCGACTGCACTACAGGCACTTATTACTGCAAGAGCAGGGACAGATACTACCCAATCAACCTAACACACCATAGTTGGTACATAATACAAGAATCTAGTTATTATCCAAAGCACATCCAGTATGACATACTGATTGGTGAAGGACCATGCTCTCCAGGAGATTGTGGTGGTAAGCTACTGTGTGTACATGGAACCATAGGAATGGTGACAGCAGGAGGAGAGAACCATGTTGCATTCATAGACTTGAGGAATTACAGTTCACTCAGTGAGCATCAAGGTATCACAGATTATGTCACACAATTAGGGAATGCATTTGGGGATGGGTTCACCAGCTCCATTAGAGAAACTCTGGTATCTGCCTGTGATGTGTCAGATAAGCTTACTGGAAAAATCATCAAGTGGACAATCAGGTTAATCAGTGCTCTATCAATCATAGTCAGAAACAGCACTGACACCCCCACCATTATAGCTACATTAGCATTACTTGGATGCTCTGGTTCACCGTGGCGCTACCTGAAAGACAAGGTTTGCAAGTGGTTAGGCATTGATCCACCGCCTAGCAGGCAGGGTGACTCATGGTTAAAGAAATTCACTGAGTTCTGCAATGCAGCCCGTGGGCTTGAATGGATTGGAGACAAGCTGTCCAAGTTCATTGATTGGCTAAAAGGAAAAATCTTGCCCACACTTCGCCGCAAATCAGACACACTCAAGGAGTGCAAGAAAATCCCATTATATAAGGAACAGGTCAAAGCCTTTGCCACTGCATCAGAGGAAGCGCAGGATGAATTGATAGTCAAAGTCAACAAGCTTGAAAAGGGACTCCAAGACCTTGCCCCATTGTATGCATGTGAAGCCAAACAAGTGCGTGAGATGTCCAGGGAGTTGCAACGCATGATGTGTTACAAGAAGACTCACAGAACAGAACCTGTTTGCATACTGCTGCATGGGCAACCAGGGTGTGGCAAATCCCTGGCTTCCAAGGTCATTGCTAGGGGTCTCACAAATGAAAGCAATGTTTATTCCTTGCCACCTGATCCCAAGTATTTTGATGGGTATAACCAACAGGAGGTGGTGATCATGGATGATGTTGGTCAGAACCCAGATGGGAAGGATCTAAGCTTGTTTTGCCAGATGGTCTCAAGTACTGAGTTCATAACACCAATGGCTAACCTTGAAGATAAGGGCAGAGCATTCACCAGTGATTATGTAATAGCTAGCACAAACATGACTGTCCTCACACCGCCCACTGTTTCATCACCCGAAGCTATAGATAGAAGATTTTTCTTAGATTGTGATGTTAAAATCATGCCAGCATACAATACAAACAACCTTCTGAATGTTGCCAAGGCTTTGTTACCATGTACTGATTGCCCAAAACCAGAGTTCTATAAGCAGTGTTGTCCTCTGACCTGCGGCAAGGCCCTAATTTTGCAGAACAAAAGAACAAAGGCTAGTTATTCTATTAACACCGTGGTGCAACAACTGCGGCAGGAAAAGAAAAACAGAAAGTGTGTAGAACACAATCTCACTGCTATATTTCAAGGATTAGGAGATGATTCAACACCAGGATTTATTGTGGACCTCCTTAGTGCCTCCAAAGACCCGAAAGTCATAGAGTTCTGTGAGAAAGAGGGATGGATCAAACAGTCAAAATACTCAAAGATTGAGCGTGATTTCAACTACGCACAATACTGTATCAACTGTGTGGGTAGTATAGTATTGATTCTAGGAACTGTTTATGCACTGTACAAACTGATGTGTATAGCACAAGGCCCCTATACTGGCTTGCCACAACCAAAACCAAGAAAACCAGAATTAAGAAAAGCTGTGATTCAAGGACCAGAACACGAATTTGGCATGGCCCTGATTAAAAGAAACTGTCACATAGCCACAACAGATAGAGGAGATTTCAATCTACTTGGTGTATATGACAATTGTGCAGTGATACCCACGCATGCTCAGCCAGAAGACACAATCTTGATTGATGGTGTTGAGACAAAGATTCTAAAACAAACAATTATTACAGATGAAAATGATGTAGACACAGAAATTACAATTTTGTGGTTAGATCGTAATGAAAAGTTTAGAGACATAAGAAGGTTCATACCGGATTACCAGAGAGATTGGCAGAGCATGCGCCTTGTAACCAATGTACCCAAATTTCCAATGCTGGACATAGAGGTAGGTGATGTTATACCATATGGGGATATAAACCTGAGTGGAAACCCAACAACTAGACTACTCAAGTATGACTACCCCACAAAACCAGGCCAATGCGGTGGAGTTATCTTGAACACAGGCAACATAGTGGGCATACATGTGGGGGGTAATGGTAGGGTAGGTTACTGTGCATCACTAACAAAGAGCTACTTTGCCTCCGCCCAGGGTGAAATAACCAACAAGTGTAAAGTACAAGATGTTGGTCTCAAACCTATCAACACACCAGAACACTCCAAGCTGCACCCTAGTGTGTTCTATGATATATTCCCTGGTGAGAAGGAACCTGCTGTGTTAACACAAAAAGACCCCAGACTGGAAACTGATCTGAAAACAGCTGTCCTATCCAAATACAAAGGAAATGTGGAAATTGAAATGAGTGAGAACATGCAGATTGCTGTAGAACACTACTCTGCCCAATTGTTCATGTTAGACATCAACCCAGAACCCATATCCCTAGAACAAGCTGTATATGGAATGGAGAATTTGGAACCACTCGATCTTACCACGAGTGCTGGATTTCCTTATGTTACTATGGGCATAAAGAAGAGGGACATCTTGAACAGGAATACAAAGGACATCACAAAACTTCAACAAATGATTGACACCTATGGACTTGACCTGCCATATGTAACCTATTTGAAAGATGAACTTCGTGCTCCCACTAAAGTGAAAGCAGGAAAAACAAGAGCTATTGAAGCAGCTAGTGTGAATGATACAGCAAACTTCAGAAGAGTGTTTGGCAATTTGTATGCTGGTTTTCATGCAAACCCAGGTATTCTAACTGGATCAGCTATAGGCTGTGATCCTGACATCTTCTGGTCACAACTATATGCTTCAATGGAAAAACATCTCCTGGTGTTTGATTATACAAATTATGATGGAAGCCTACATCCAGTGTGGTTTCAAGCACTTGAGCAACTCCTGAACAACTTGGGCTTTCCTGGTGAATTGGCATATAAGTTATGTAATACAACCCACATATATAAAGATGAGATATATACAGTAAAAGGAGGAATGCCCTCAGGAATTTCGGGAACTTCCATTTTCAACACAATAATAAACAACATAATAATCAGAACTCTGGTTTTGGACACATATAAAGGAATAGAATTGGACAAATTGAAAATTGTGGCATATGGTGATGATGTGATAGCTTCATATCCAGAAGAACTTGACCCAGCGCAAATTGCCATCTCTGGTCTCAAGTATGGGCTCACAATAACACCTGCTGACAAATCTGACCATTTTGTAAAAGTTGACTGGAGTAATGCTACATTTTTAAAGAGAGGGTTTCGTGTGGACAAGAGGTACAGTTTCCTTGTACACCCGGTTTTCCCAGAGAAAGAAATTTTTGAATCAATCAGATGGACTAGAGATCCAAAGAATACACAAGACCACGTGTATTCTCTATGTCTTTTGATGTGGCACAACGGTGAAGAACCGTATAAAGAGTTCATAAATAAAATTAGAAAGACAGAAGTGGGTCGTAGGTTGTATCTTCCACCGTACAATCTACTGGAACGCACTTGGATTGACAAATTCATCTAAATCTTTTAGCAATGTAGAAATCTACC
| 60,164
|
MN306026.1
|
Rhinovirus C
|
Lin,M.J., Tait,A., Greninger,A.L.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
|
USA
|
2019-08-25
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,724
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null |
PRJNA338014
|
Rhinovirus C strain SC0364, complete genome
|
CCCTAATGGGTGTGAAGCCAATGAGTGGACAGGGTGTGAAGAGCCGCGTGTGCTACCAGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTATGGCATGCAATCCAGCATGTGTGTAGTCGTAATGAGTAATTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTATTCTCTTATGCCTTGCCTATGGTGACAATATTAAGTATTAATATTGCTACCATGGGCGCCCAGGTCAGCAGACAAAACAATGGCACACATGAGAGTGGTGTAACAGCTAGCAATGGATCAGTCATTAAGTATTTTAACATCAACTACTACAAAGACTCAGCAAGTTCTGGTTTGAGTCGTCAAGATTTTTCTCAGGATCCATCCAAATTTACCCAGCCCCTTGTGGATACACTTACAAACCCAGCACTTATGTCACCATCTGTTGAGGCATGTGGATATTCTGATAGGCTCAAGCAAATCACTATCGGAAACTCCACAATTACAACACAAGACTCTCTACACACAGTACTTGCATATGGTGAATGGCCCACATACTTGTCTGACATTGATGCAACATCCGTTGACAAACCTACTCACCCAGAAACATCAGCTGACAGATTCTACACTCTGGATAGTGTTGATTGGGAAGTAGGTTCCCATGGTTGGTGGTGGAAGCTGCCAGATGCTCTCAAAGACATGGGTGTGTTTGGTCAAAACATGTATTACCACTCAATGGGTAGATCAGGCTTCATAATTCATACACAGTGCAATGCAACCAAATTCCACAGTGGTGCACTCATAATCGCAGTGATACCAGAGCACCAACTTGCTTATGTAGGGGGGGTGAAAGTTAATATAGGATATGATCACACACACCCAGGGCAAAGTGGTCATCGAATACTTGGACCTAACCAATCAAATGATCGAGGTGGTGGTAAGCCAGATGAGGACCCACTGTTCAACTGTAACGGAACATTGTTGGGAAACATAACAATTTATCCACACCAAATTATAAATTTGAGGACCAACAACTCCAGTACAATAGTTGTACCTTACATAAATTGTGTCCCTATGGACAATATGCTAAAACATAACAACCTGTCTTTAGTGGTTATCCCGTTGGTACCACTCCATCCAGGTTCTAGTAACATCAACTCTGTTCCAATTACTGTAACAATAGCACCTTATAAGTCAGAATTCTCAGGTGCCATGGAGGCTCAACGCCAAGGCTTACCAACACGTCTTCCTAGTGGTAGCCAACAATTCATGACAACTGAGGACGAGCAATCACCCAACATTCTACCTGGTTTCCATCCAAGTAAGAAAATACACATACCTGGTATGATTACAAATGTGATGCATATGGCTAGAGTGGATTCATTCATACCCATTAATAATATTAGAACAGAAGTTGGTAAGGTGAGCATGTACTACATCCCAGTGGTCAAAAAGACAACGACAGAAAAGATCCTTGTTCTACCTTTAGAAATGAACAACACATTATTTGCTACAACTCTTTTAGGTGAGGTTCTAAACTATTATGCCAACTGGTCAGGGAGTATCACCATCACTTTCATGTGCGTGTGTGATGCGTTCAGTACAGGAAAGTTTCTCGTCGCATACACACCACCAGGAGGTAAACTACCAGAAAACAGAAGACAGGCAATGTTAGGTGTTCACATCATATGGGATTTGGGCCTGCAGTCATCTTGCACCATTGTGGTACCATGGATTTCATCCGGTTTCTACCGTCGCACTAAGGCAGACAACTTCACCCACGGTGGATATGTCTCCTTGTGGTACCAGACAGCCTTTGTACCCCCAGTGAGTGGAGGGACAGGACGCATCCTTGCTACCTGTAGTGCTTGTCCCGACATGTCTGTTAGGATGTTGCGGGACAGCCCAATGATGGAACAAAGCAATGAGTTGCAGAACAATGATGACCCAGTTGAGAACTTTGTGGAGTCCACCTTACAAGAGGTGTTGGTCGTGCCGGACACGAAACCCTCAGGACCTCAACACACAACAAAACCATCAATATTGGGTGCCATGGAGATTGGCGCTTCCAGTGACGCAACTCCGGAATCCACAATAGAGACTAGGTATGTATATAATACAAACACAAATGCAGAAGCAGATGTAGAAATGTTTCTAGGTAGATCTGCCCTTTGGGGCAAGGTAACACTTGAAAACCAATATGCCAAGTGGGAAATAAACTTTCAAGAACAGGCACACATCAGGAAAAAATTTGAGTTTTTCACCTACCTGAGATTTGACATGGAAGTCACCATAGTAACCAGCAACACAGGGTTGATGCAAATAATGTTCGTCCCACCGGGGATAGACCACCCTAAAACACATAATGACGGAAAATGGGACTCTGCTTCCAACCCCAGTGTGTTCTTCCAACCTAAATCGGGATTTCCTAGGTTCACCATCCCATTCACTGGATTAGCTTCAGCATACTACATGTTTTATGATGGATATGATAAACCCGAGGGTTCAGATGACAATGAGTATGGAATTGCTCCCACCAATGACATGGGTATGTTATGCTTCAGAACCTTGGACAATAGTGGTGGAAATGATGTAAAGATATACGTCAAACCCAAGCACATAACGGCGTGGGTACCAAGACCACCAAGGGCAACACAGTACACCCACAAATATAGTACAAACTATCATTACAAACCCAACTCTAGTGGGCCTGATCAACATGTGCTTAAAGACAGACACTTTATCATACCCAGGCCCCACATCAGCTCAGCAGGACCGAGCGACATGTTTGTGCATACAAAAGATGCAATTTACACGTGTGCACATCTAACCAATCCAACTGATGAAACCATACTCCTGGCATTGACTGCAGATCTACAAGTGGATAGTACAAATGCCCCAGGTCCCGATGTGATTCCATGTTGTGATTGCACAACTGGTTGCTACTACTCTAAAAGCAAAGATAGATACTTTCCAGTGGAGTGTGTTAGTCATGACTGGTATGAGATACAAGAGTCTGACTACTATCCCAAACATATACAATATAATCTACTCATTGGGGAGGGACATTGTGAACCAGGTGACTGTGGAGGCAAGCTAATGTGTAAGCATGGTGTGATTGGTATGATTACTGCAGGTGGTGATAATCATGTTGCCTTCACTGATCTGCGCCCATACTCTAGCCTATCAGAACACCAAGGGGTTATTTCAGATTATTTTACCCAATTGGGTAACGCATTTGGTGAAGGCTTCACAACTAACATTCAAGACCACTTTTCCCAAGTCACCAAGTCAATCTCTGATAAATTTACATCAAAGGCTATTAAATGGCTGGTGCGCATCATAAGCGCCCTTACAATTATGATTAGAAACAACTCAGACTTGCCTACCATACTTGCTACCCTGTCATTATTGGGGTGCAGTAGCTCACCATGGTCTTTCCTGAAGGACAAGATCTGCAACTGGCTTCAAATCCAGCGCCCCGCAAGTAAACAAAGTGACTCATGGTTGCGCAAATTCACAGAGTGTTGTAATGCAGCAAAAGGACTTGAATGGATCAGTATCAAGATTGGCAAGTTCATTGATTGGCTGAAAGGGAAACTAATTCCTACTGTCCAGAGGAAAAGAGACACCCTAGATAGATGCAAGAAAATACCTCTCTTAGAAGAACAAGTAAATGGATTCAGTTCTGCTAGCTCAGAAGCACAACAACAGCTTATTGTGGAAGTTGATACTCTAAAGAAGGGTCTAGATGAACTAGCACCATTATATGCCAGTGAGAATAAAAGAGTGACTAAGATTCAAAAAGATCTCAAGCAATTATCAGCTTATCTAAAGAACCACAGGCATGAACCAGTTTGTTTATTATTACATGGCAATCCAGGATGTGGAAAATCACTAGTCACAACCATAATCGCCAGGGGACTCACCCAAGAGGCGCAGGTATATTCACTACCACCTGATCCCAAATACTTTGATGGCTATGATCAGCAGCAGGTTGTCATATTAGATGACCTTGGACAAAATCCTGATGGTAAAGATTTAAGCACATTCTGTCAGATGGTATCAACAACTGATTTCATAGTGCCCATGGCATCACTAGAAGACAAGGGCAAGTCCTTTACCAGCCAATATGTGCTTGCTAGCACTAACCTGGACACTTTGTCACCACCAACAGTCACAATACCTGAAGCCATAAAACGACGATTCTTCCTGGATGCCGACCTCATCACAACATCTAAGTTCAGAAACACTACAGGATTGCTAGATGTAGCAAAGGCACTACAACCATGCACAGGTTGCCCCAAACCAGCACACTATAAGACATGCTGTCCTCTGTTGTGTGGCAAGGCAGTTGTAGTTCAGGACAGGAAAACAAAGGCAAATTTCTCAGTGAATACAATAGTAGAACAGTTGAGACATGAGAATGCCATCAGGAAAAAGGTCAAACACAACCTTGATGCAATATTCCAGGGTCTTGGTGACTCGGAAACACCAGGTTTTATAGTTGATCTACTATCTTCATCCAAGGACCCCAAAGTTATAGAATACTGTGCTGAGCAGGGATGGATAGGTAAAGCAAACTCAACCATAGAGAGGGATTTCAATTATGTACACTACATGTTAAATTGTTTAGGCAGTCTAATCATTATCTTAGGAACTGTGTATGCATTATACAAACTGATGTGTATGACTCAAGGGCCTTACACTGGTTTACCAAACCCCCAAACCAAAAGACCAGAACTCAGGAAAGCCACACTACAGGGTCCCGAGCATGAATTTGTCAGGGCTTTAATTAAAAGAAACTGTCATGTGATAACTACTTCAAAAGGGGAGTTCAACATGCTTGGAATCCATGATAACTGTGCAGTGGTGCCAACACACGCCGAATGTGGTGACTTTGTCACGATTGATGGTAGGGAAGTCAGGGTTCTCAAACAATGCATTCTCACTGACACAAATGACACAGATACTGAAATAACACTCCTCTGGTTAGATCAGAATGAAAAATTTAGGGACATTAGGAGGTTTATCCCAGAACACCAACGCGAATGGTCAGGTATGCACCTTGCTACAAATGTAACTAAATTCCCTATGCTAGATGTGGAGGTTGGTACTGTTATACCATATGGAGAGGTCAATCTTAGTGGTAATCCAACATGTCGGCTTCTCAAGTACAACTATCCTACAAAACCAGGGCAATGTGGTGGTGTCATTGCAAACACAGGAAACATAGTAGCGATTCATGTTGGTGGGAATGGACGTGTGGGATATGGAGCAGCATTGCTACGCAAATATTTCGCACAGTCTCAAGGTGAGATCACTGCTAAGCATGATGTTAGAGAGAAAGGCTTACCACAAATCAACACACCTAACAAAACAAAATTACAACCCAGTGTATTTTATGATGTTTTTCCAGGAGTGAAGGAACCAGCAGCTTTAAGCAATGGAGACCCACGGCTCGAGGTTGATCTCAGCACATCTGTGTTAAGCAAGTACAAAGGTAACACACAAGTGGAGTGGAATGATAATATCCAGATTGCAGTTGACCACTACTCAGCTCAACTTTATATGCTAGATATTAACCCTCAACCATTAACCATGGAACAGGCAGTCTATGGCATAGAGCATCTAGAACCACTAGACCTCACCACTAGTGCAGGGTTCCCCTATGTAACCATGGGCATAAAGAAAAAAGACATAGTCAATAAAGTGACAAAGGATGTAACCAAACTCCAGGAAATGATTGACAAATATGGAATAGACTTGCCTTACGTCACCTACCTGAAAGATGAATTGAGAGCTCCTGAGAAAATCAAGAAAGGGAAAACGAGAGCAATAGAGGCAGCTAGTATAAATGACACAACCCACTTTCGCATGGTGTTTGGTAACCTCTTCTCCGTGTTCCATGCTAATCCAGGTGTACTCACAGGCTCTGCAGTAGGTTGTAACCCTGATGTGTTCTGGTCTCAAATGTATGCATGTATGGATGGTGAGTTGCTTGCTTTTGACTACACAAATTATGATGGCAGTTTGCACCCAATCTGGTTTAAAGCACTAGGTAAAGTCTTGGATAATCTGGGTTTCCCAGGACACTTAGTAAGTAGATTGTGCAACACAACACACATCTTTAAGAACTTAATTTATACAGTGGAAGGAGGTATGCCCTCTGGCATCTGTGGCACAAGTATCTTCAATACCATGATCAACAATATAATCATTAGAGTGTTGGTTCTTGAAACATACAAGAACATAGATCTAGATAAGCTAAAGATTATAGCATATGGTGATGATGTGGTGGTGTCTTACCCTTTTGAATTAGATCCAATGGAAATTGCCAATAAAGCGGAAAGGTATGGGTTAACCATCACTCCACCAGACAAAGGTAGCACATTTCAGAAGATTGATTGGACAAATGTCACTTTCCTCAAAAGGCATTTCAAACCAGACACCAAATACAAATTCTTGATACATCCAGTGTACAAGATGGAGGACATCTATGAATCAATTAGATGGACAAAGGACCCAAAAAATACACAAGACCATGTTCATTCATTGTGTCTACTCGCATGGCACAATGGGGAGGAGGTTTATGAGAAGTTTAGGGAGAAAATCAGATCCACAAGTGTTGGCAAGGTTCTCTACACCCCACCTTACTCATTGTTGTACAGGCAGTGGATAGATCAATTCATATAAACAAGCAATATAATACAATGTTTG
| 60,167
|
MN306035.1
|
Rhinovirus C
|
Lin,M.J., Tait,A., Greninger,A.L.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
|
USA
|
2019-08-25
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,053
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2019
|
SAMN28125209
|
PRJNA338014
|
Rhinovirus C strain SC0645, complete genome
|
CAGTTTGCCCTCCCTCCCTGTAACGTAGAAGTAATACGAACAGACCAATAGGGGATGGCGAACCACGCCGTTCGAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATGCGAGGAATAGACCCTTCCAGGGGTTGAAGCCACAAGTGTCGTTACCCACATTGGTACTACACAGAGCCTAGTATCGCTCTAGAAACTTGTTGGTTGGTCGTTCAGCCATTTCCCATGGTAGACCTGGCAGATGAGGCAAGAAATTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTTGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTAATGGGTGTGAAGCCAACGAGTGGACAGGGTGTGAAGAGCCGCGTGTGCTACCAGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTATGGCATGCAATCCAGTATGTTCGTAGTCGTAATGAGTAATTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTTTATTTTCTTATGTCTTGCCTATGGTGACAATATTAAGTATTAATATTGCTACCATGGGCGCTCAGGTCAGCAGACAAAACAATGGCACACATGAGAGTGGTGTAACAGCTAGCAATGGATCAGTCATTAAGTATTTTAATATTAATTACTACAAAGACTCAGCAAGTTCTGGTTTGAGTCGTCAAGATTTTTCTCAGGATCCATCCAAGTTTACCCAGCCCCTTGTGGATACACTTACAAACCCAGCACTTATGTCACCATCTGTTGAAGCATGTGGATATTCTGATAGGCTCAAGCAAATCACTATCGGAAACTCCACAATCACAACACAAGACTCTCTACACACAGTACTTGCATATGGTGAATGGCCCACATACTTGTCTGACATTGATGCAACATCCGTTGACAAACCTACTCACCCAGAAACATCAGCTGACAGATTCTATACTCTGGATAGTGTTGATTGGGAAGTGGGTTCTCATGGTTGGTGGTGGAAGCTGCCAGATGCTCTCAAAGACATGGGTGTGTTTGGTCAAAACATGTATTACCACTCAATGGGTAGATCAGGCTTCATAATTCATACACAGTGCAATGCAACCAAATTCCACAGTGGTGCACTCATAATCGCAGTGATACCAGAGCACCAACTTGCTTATGTAGGGGGGGTGAAAGTTAATATAGGATATGATCACACACACCCAGGGCAAAGTGGTCATCGAATACTTGGACCCAACCAATCAAATGACCGAGGTGGTGGTAAGCCAGATGAGGACCCACTGTTCAATTGCAACGGAACATTATTGGGAAACATAACAATTTATCCACACCAAATTATAAATTTGAGGACCAACAACTCCAGCACAATAGTTGTGCCTTACATAAATTGTGTCCCTATGGACAATATGCTAAAACATAACAATCTGTCTTTAGTGGTTATCCCGTTGGTGCCACTCCATCCAGGCTCTAGTAATATCAACTCTATTCCAATTACTGTAACAATAGCACCTTACAAGTCAGAATTCTCAGGTGCCATGGAGGCTCAACGCCAAGGCTTACCAACACGTCTTCCTAGTGGTAGCCAACAATTCATGACAACTGAGGACGAGCAATCACCCAACATTCTGCCTGGTTTCCATCCAAGTAAGAAAATACACATACCTGGTATGATTACAAATGTGATGCACATGGCTAGAGTGGATTCATTCATACCCATTAATAATATTAAAACAGAAGTTGGTAAGGTGAGCATGTATTACATCCCAGTGGTCAAAAAGACAACGACAGAAAAGATCCTTGTTCTGCCCTTAGAAATGAACAACACATTATTTGCTACAACTCTTTTAGGTGAGGTTCTAAACTACTATGCCAACTGGTCAGGGAGTATCACCATCACTTTCATGTGCGTGTGTGATGCGTTCAGCACGGGAAAGTTTCTCGTTGCATACACACCACCAGGAGGTAAACTACCAGAAAACAGAAAACAAGCAATGTTAGGTGTTCACATCATATGGGATTTGGGCCTGCAGTCGTCTTGCACTATTGTGGTACCATGGATTTCATCCGGTTTCTACCGTCGCACTAAGGCAGACAACTTCACCCACGGTGGATATGTCTCATTGTGGTACCAGACAGCCTTTGTACCCCCAGTGAGTGGAGGGACAGGACGCATTCTTGCTACCTGTAGTGCTTGTCCCGACATGTCTGTTAGGATGCTGCGGGACAGCCCAATGATGGAACAAAGCAATGAGTTGCAGAACAATGATGACCCAGTTGAGAACTTTGTGGAGTCCACCTTACAAGAGGTGTTGGTCGTGCCGGACACGAAGCCCTCAGGACCTCAACACACAACAAAACCATCAATATTGGGTGCCATGGAGATTGGTGCCTCCAGTGATGCAACCCCAGAATCTACAATAGAGACTAGGTATGTATATAATACAAACACAAATGCAGAAGCAGATGTAGAGATGTTTCTAGGTAGATCTGCCCTTTGGGGCAAGGTAACACTTGAAAACCAATATGCCAAATGGGAAATAAACTTTCAAGAACAGGCACACATCAGGAAAAAATTTGAGTTTTTCACCTATCTGAGATTTGACATGGAAATCACCATAGTGACCAACAACACAGGGTTGATGCAAATAATGTTCGTCCCACCAGGGATAGATCACCCTGAAACACATAATGACAGAAAATGGGACTCTGCTTCCAACCCCAGTGTGTTCTTCCAACCTAAATCAGGATTTCCTAGATTTACCATCCCATTTACTGGATTAGCTTCAGCATACTACATGTTTTATGATGGATATGATAAACCCGAGGGTTCAGATGACAATGAATATGGAATTGCTCCCACCAATAAGATGGGTTTGTTATGCTTCAGGACCTTGGACAATAGCGGTGGAAATGATGTAAAGATATACGTCAAACCCAAGCACATAACGGCGTGGGTGCCAAGACCACCAAGGGCAACACAGTACACCCATAAATATAGTACAAACTATCATTACAAACCCAACTCTAGTGGGCCTGATCAACATGTGCTTAAAGACAGACACTTTATCACACCCAGACTCCACATCAGCTCAGCAGGACCGAGCGACATGTTTGTGCACACAAAAGATGCAATTTACACGTGTGCACATCTAACCAATCCAACTGATGAAACCATACTCCTGGCATTGACCGCAGATCTACAAGTGGATAGTACAAATGTCCCAGGTCCCGATGTGATACCATGTTGTGATTGCACAACTGGTTGCTACTACTCTAAAAGCAAAGATAGATACTTTCCAGTGGAGTGTGTTAGCCATGACTGGTATGAAATACAAGAATCTGACTACTACCCCAAACATATACAATATAATCTACTCATTGGGGAGGGACACTGTGAACCAGGTGACTGTGGAGGCAAGCTAATGTGCAAGCATGGTGTGATTGGTATGATTACTGCAGGTGGTGATAACCATGTTGCCTTCACTGATCTGCGCCCATACTCTAGCCTATCAGAACACCAAGGGGTTATTTCGGATTATTTCACTCAATTGGGTAATGCATTTGGTGAAGGCTTCACAACCAACATTCAAGACCACTTTTCCCAAGTCACCAAGTCAATCTCTGATAAATTTACATCAAAGGCTATTAAATGGCTGGTGCGCATCATAAGCGCTCTTACAATTATGATTAGAAACAACTCAGACTTGCCTACCATACTTGCTACCCTGTCATTATTGGGGTGCAGTAGCTCACCATGGTCTTTCCTGAAGGACAAAATCTGCAACTGGCTTCAAATCCAGCGCCCCGCAAGTAAACAAAGTGATTCATGGCTGCGCAAGTTCACAGAGTGTTGTAATGCAGCAAAAGGACTTGAATGGATCAGTATCAAGATTGGCAAGTTTATTGATTGGTTGAAAGGGAAACTAGTCCCTACTGTCCAGAGGAAAAAAGACACCCTAGACAGGTGTAAGAAAATACCACTCTTAGAAGAACAAGTAAATGGATTCAGTTCTGCTAGCTCAGAAGCACAACAACAGCTTATTGTGGAAGTAGATACTCTAAAGAAGGGTCTAGATGAGCTAGCACCATTATATGCCAGTGAGAATAAAAGAGTGACTAAGATTCAAAAAGATCTCAAACAATTATCAGCTTATCTAAAGAACCACAGGCATGAACCAGTTTGTTTATTATTACATGGTAATCCAGGATGTGGAAAATCACTAGTCACAACTATAATCGCCAGGGGACTCACCCAAGAGGCGCAGGTATATTCACTACCACCTGATCCCAAATACTTTGACGGCTATGATCAGCAGCAGGTTGTCATATTAGATGATCTTGGACAAAATCCTGATGGTAAAGATTTAAGCACATTCTGTCAGATGGTATCAACAACTGATTTCATAGTGCCTATGGCATCACTAGAAGACAAGGGCAAGTCCTTCACTAGCCAATATGTGCTTGCTAGCACCAATCTGGACACTTTGTCACCACCAACAGTCACAATACCTGAGGCCATAAAACGACGATTCTTCCTGGATGCCGATCTCATCACAACATCTAAGTTCAGAAACACTACAGGATTGCTAGATGTAGCAAAGGCACTACAACCATGCACAGGTTGCCCCAAACCAGCACACTATAAGGCATGCTGTCCTCTGTTGTGTGGCAAGGCGGTTGTAGTACAGGACAGGAAAACAAAGGCAAATTTCTCAGTAAATACAATAGTAGAACAGTTGAGACATGAGAATGCCATCAGGAAAAAGGTTAAACACAACCTTGATGCAATATTCCAGGGCCTTGGTGACTCGGAAACACCAGGTTTTATAGTTGATCTACTATCTTCATCCAAGGACCCCAAAGTTATAGAATACTGTGCTGAACAGGGATGGATAGGTAAAGCAAACTCAACCATAGAGAGAGATTTCAATTATGTACACTACATGTTAAATTGTTTAGGTAGTCTAATCATTATCTTAGGAACTGTATATGCATTATACAAACTGATGTGTATGACTCAAGGGCCTTACACTGGCTTACCAAACCCCCAAACCAAAAGACCAGAACTCAGGAAAGCCACACTACAGGGTCCAGAGCATGAATTTGTCAGGGCTTTAATTAAAAGAAACTGTCATGTGATAACTACTTCAAAAGGGGAGTTCAATATGCTTGGAATCCATGATAACTGTGCGGTGGTGCCAACACACGCTGAGTGTGGTGACTTTGTCACAATTGATGGTAGGGAAGTCAGGGTTCTCAAACAATGCATTCTCACTGACACAAATGACACAGATACTGAAATAACACTCCTCTGGTTAGATCAGAATGAAAAATTCAGGGACATTAGGAGGTTTATCCCAGAACACCAACGCGAATGGTCAGGTATGCACCTTGCTACAAATGTAACTAAATTCCCTATGTTAGATGTGGAGGTTGGTACTGTAATACCATATGGAGAGGTCAATCTTAGTGGTAATCCAACATGTCGCCTTCTCAAGTATAACTATCCTACAAAACCAGGGCAATGTGGTGGTGTCATTGCAAACACAGGAAACATAGTAGCGATTCATGTTGGTGGAAATGGACGTGTGGGATATGGAGCAGCATTGCTACGCAAGTATTTCGCACAGTCTCAAGGTGAGATCACTGCTAGGCATGATGTTAGAGAGAAAGGCTTACCACAAATTAACACACCTAACAAAACAAAACTACAACCCAGTGTATTTTATGATGTTTTTCCAGGAGTGAAGGAACCAGCGGCTTTAAGCAATGGAGATCCACGGCTTGAGGTTGATCTCAGCACAGCTGTGTTAAGCAAGTACAAAGGTAACACACAAGTGGAGTGGAATGATAATATCCAGATTGCAGTTGACCACTACTCAGCTCAACTTTATATGCTAGATATTAACCCTCAACCATTAACCATGGAACAGGCAGTCTATGGCATAGAGCATCTGGAACCGCTAGACCTCACCACTAGTGCAGGATTCCCCTATGTAACTATGGGCATAAAGAAAAAAGACATAGTCAACAAAGTGACAAAGGATGTGACCAAACTCCAGGAAATGATTGACAAATATGGAATAGACTTACCCTATGTCACCTACCTGAAAGATGAATTGAGAGCTCCTGAGAAAATTAAGAAAGGGAAAACAAGAGCAATAGAGGCAGCTAGTATAAATGACACAACCCACTTTCGCATGGTGTTCGGTAACCTCTTTTCCGTGTTCCATGCTAATCCAGGTGTACTTACAGGCTCTGCAGTAGGTTGTAACCCTGATGTGTTCTGGTCTCAAATGTATGCATGTATGGATGGTGAGTTGCTTGCTTTTGACTACACAAACTATGATGGCAGTTTGCACCCAATCTGGTTTAAAGCACTAGGTAAAGTCTTGGATAATCTGGGTTTCCCAGGACATTTAGTAAGTAGATTGTGCAACACAACACATATCTTTAAGAACTTAATTTACACAGTGGAAGGAGGTATGCCCTCTGGCATCTGTGGCACAAGTATTTTCAATACCATGATTAACAATATAATCATTAGAGTGCTGGTTCTTGAAACATACAAGAACATAGATCTAGATAAGCTAAAGATTATAGCATATGGTGATGATGTGGTGGTGTCTTACCCTTTTGAATTAGATCCAATGGAAATTGCCAATAAAGCGGAAAGGTATGGGTTAACCATCACTCCACCAGACAAAGGCAGCACATTTCAGAAGATTGATTGGACAAATGTCACTTTCCTCAAAAGGCATTTCAAACCAGACACCAAATACAAATTCTTGATACATCCAGTGTACAAGATGGAGGATATCTATGAATCAATTAGATGGACAAAGGACCCAAAAAACACACAAGACCATGTTCACTCATTGTGTCTACTCGCATGGCACAATGGGGAGGAGATTTATGAGAAGTTTAGGGAGAAAATTAGATCCACAAGTGTTGGCAAGGTTCTCTACACCCCACCTTACTCATTGTTGTACAGGCAGTGGATAGATCAATTCATATAAACAAGTAATATAATACAATGTTTGAGTAGAACTTAGTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 60,176
|
MH330336.1
|
Rhinovirus C
|
Yadav,P.D.
|
National Institute of Virology, Maximum Containment Laboratory
|
India
|
2019-06-01
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,106
|
GenBank
| null |
India: Pune District, Maharashtra State
|
India
|
Homo sapiens
| null |
2013-02-01
| null | null |
Rhinovirus C strain NIV1722289, complete genome
|
GTGGGTTGCTCCCACCCACACTGTCTACGGACGTTGTACTCTTGTATTCCGGTACACTTGTACGCCAGTTTGCCACCCTAAATACCCCGTAACAATAGAAGTCTACGCACACTTAGACCAATAGGGGGGTGTTCATCCAGTTCACCCAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATAGGGGTGCTAGGCTTCACCCGAGGCCGAAGCTCTGATTGTCGTTATCCGCACAACTACTGGACAAAGCCTAGTAACACCCTACGATGTAGTATGGTTGGTTGTTCCGCCAGTATCCCCTGGTAAACCTGGCAGATGGGGCTAGAAGTTCCTCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCTCCCTCACGGGAGAAGCCATTCTACTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTACGCTAGTTGTGACTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCTGCAGCCATTACATGGAAGCCACCATGTGGATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTTACTGACGTTTATGGTGACAATATATATATAACGTATATATTGTTCACCATGGGCGCTCAAGTATCTAGACAAACCACTGGATCGCATGAGAATGCTATCACTGCTACCAATGGAGGCCTTATCAAGTATTTTAACATAAACTACTACAAGGATTCAGCTAGTTCAGGTTTGGCTAAACAAGATTTTACTCAAGATCCATCCAAATTTACTCAACCCCTGGCAGAGGTTTTAACAAATCCAGCACTTATGTCCCCGACTGTTGAGGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATTACTATTGGAAACTCCACTATCACTACACAGGATGCTCTTCACACAGTGCTGGCTTATGGTGAATGGCCCAGTTATTTATCTGATCTCGATGCCACTTCAGTAGACAAACCCACACACCCAGAGACTTCATCAGACAGATTTTACACCCTTACTAGCGTAGAATGGGATGCTTCTTCGAGCGGATGGTGGTGGAAGCTTCCAGACGCTCTAAAGGACATGGGAATTTTTGGCCAAAACTTGTACTACCACTCAATGGGTAGAGCAGGGTACATAATACATACACAATGTAATGCCACCAAATTCCACAGTGGGGCTTTGATGGTTGTTCTAATACCCGAGCATCAACTGGCGTATGCAGGTGGTGCAAATGCCAGTGTTGGGTACAAACACACTCACCCAGGTGAAAATGGTCATAAGATTGAGAAGCGCGGTTTTGATGACAACAAGCCAGATGAAGACCCCTTCTTTAACTGCAATGGAACACTGTTTGGCAATCTCACTATATTCCCACATCAGATTATTAATCTTAGAACCAATAATTCCAGTACAATCATTAGTCCTTACATTAATTGCCAGCCAATGGACAACATGCTTAAGCATAATAATCTCACATTGCTGATAGTGCCATTGGTTAAACTTACACCTGGAACTGGTGCCTCACCCAGTGTGTCTATAACAGTGTCAATTGCACCATATAAATCAGAGTTTTCTGGTGCCATGGAGACACGTTATACAGTACAACAACAGGGTCTACCTGTTCGCATGCCAAGTGGGTCCCAGCAATTCATGACAACTGAGGATGAACAATCACCCAACATGCTACCTGGCTACCATTCCAGCAAGAAAATACACATACCAGGTATGATCACAAACGTCCTGCACATGGCCAGAGTTGACTCCTTCATGCCTATCAACAACATCCGTACCGAGATTGGTAAGGTGTCAATATACAATATACCAATATTAAGGAAAACCAACAATGATGGATTAATACTCTCCATACCCTTGGATATGAGCAACAGTCTGTTTGCCACCACACTACTGGGGGAAGTGCTGAACTACTTTACTAACTGGTCAGGCAGTATTACTCTCACTTTCATGTGTGTGTGTGATTCTTTCTCAACTGGAAAATTCTTGTTAGCATACACCCCCCCTGGAGGAGCACACCCAGCCAGCAGAAAGCAAGCCATGTTAGGGGTACATGTTGTTTGGGATCTGGGTTTACAATCATCATGTACTATGGTAATACCTTGGATATCCTCTGGGTTTTATCGCAATACCAAATCTGATGACCACACTGAAGCAGGGTACGTTTCACTTTGGTACCAAACAGATTTTGTAACCACCACAACAGCAGGACAGGGTGCTATACTAGTTACTTGTAGTGGATGCCCGGATATATCAGTTAGAATGTTGAGAGACACACCAATGATGAAACAAGATGATGATATGCTGCAGAACAATGACCCAATAGAGCAATTTGTACATGACACACTAAATGAAGTTGTGGTGGTGCCCAACACACATGCCTCTGGACCTCAACATACCACACGACCCAGTGCATTGAGTGCAATGGAGATAGGGGCTTCTAGCACAGCCACTCCTGAGTCCACACTAGAGACTAGGTATGTGGTGAATGATAACACAAATGAAGAAGCTGAAATAGAAATATTCCTGGGGAGATCAGCAATTTGGACCAAAAGGGCTTTGAATGAAGGATTCTTGAAATGGAAAATAAGCTTTCAGGAACAGGCTCACATTAGGAAAAAGTTTGAACTGTTTACTTACCTCAGATTTGATATGGAAATCACAATAGTTATTAATAATCAAGATCTAATGCAGATAATGTATGTACCACCTGGTATAGCCACACCTGATAGCAAGGGTGACAACAAATGGGACTCAGCTTCTAATCCAAGTGTTTTCTATCAGCCTAAAAGTGGATTCCCCCGCTTCACAATACCCTTCACGGGCCTAGCCTCAGCTTATTACATGTTCTATGATGGTTATAGTAATACAACTGGTGAACCTAGGAATACCTATGGCATCTCTCCTACCAATGATATGGGTACCTTGTGCTTCCGCTCGTTAGAAGGGACAGGTAATGCAGAGGTGAGGGTCTATGTGAAACCAAAACATACTACAGCGTGGATCCCCAGGCCTCCTCGCGCTGTACAATACACACACACCTACAGTACAAACTACCACTACAAGAAGGGGGATGCCCCCTTGGAAGACAGACACTTTATACAACACAGAGAAGGCATCAAAATTCTGCAGAACACAGGTCCTAGTGATTTGTATGTCCACACTAAAGATGCCATCTATACATGTGCACATTTAACCAAACCAAATGACAACACTATCCTGTTGGCCTACACGGCAGATCTGCAAGTTGATAGCAGTGAAACTGAGGGTTCAGATCGCATCCCAGACTGTGATTGTACCTCAGGTTGTTACTATGTCAGACATTTGGATAGATACTGCCCAGTAACCCTAACTTCTCATGATTGGTATGAAATACAAGAGTCAAATTACTACCCCAAACATATACAATACAACATTTTGATTGGTGAGGGTCCTTGCAAACCTGGAGATTGTGGTGGTAAATTACTCTGTAAACATGGTGTCATAGGCATTGTCACCGCTGGTGGTGAGGGGCACGTGGCTTTCACTGATTTACGCCCATACTCAAGTCTCTCCACCCACCAGGGAATTGTATCAGATTACTTCACCCAATTGGGTGATGCCTTTGGTGAGGGCTTCACACATAATATAAAAGAGCATTTTTCTAATCTATCTTCAAACATTACTGATAAAATTACAGGCAAGGTAGTTAAATGGTTAGTGCGCATTATTAGTGCTCTCACTATTATGATTAGGAACTCAACAGACACAGCAACAATACTTGCTACTCTGGCGCTATTAGGGTGTCAGAGTTCCCCATGGAACTTCCTAAAAAATAAGATATGCCAATGGCTAGATATACCCAAACCCCCTTCCAAACAAGGTGATTCATGGATTAAGAAATTTACAGAATGTTGTAATGCAGCCAAAGGCTTAGAATGGGTTGCCATCAAAATAGGGAAATTTATTGACTGGTTGAAGGAAAAACTGATCCCCACAGTACAGCGGAAAAAGGAAACACTGGAACAATGCAAGAAACTGGCCCTTTATGAAGAGCAATGCAAAGGATTCTCCAAGTCAGATGCCCAGGCCCAACAACAACTCATCATAGAAGTAGCTAAGCTGAAGAAAGGTCTGGATGAGCTAGCACCTTTGTATGCTAGTGAGAATAAAAGAGCAACAGGAATCCAGAAAGAGCTGCAACGCATGACCGCGTACCACAAAACACATCGACATGAACCAGTCTGTTGTCTAATACGTGGACAACCTGGATGTGGGAAATCGCTGGTCACTTCAATCATTGCACGTGGGCTTGCATCAGAGGCTCATATTTACTCATTGCCCCCAGACCCAAAATATTTTGATGGTTACGATCAACAAAAGGTTGTTATAATGGATGATATAGGGCAAAATCCAGATGGGAAAGACCTCAGTATGTTCTGCCAAATGGTTTCCACCACAGAATTCATAGTACCAATGGCCAATATAGAAGAAAAGGGTAGGTCATTTACTAGTGAATACATTTTGGCCAGCACAAATCTTGATGCACTCACTCCACCCACAATAACCATTCCAGAGGCAATCAAAAGAAGGTTCTTTATAGATGTAGATTTAGTCATTATTAGCAAATTTAGAAATTCCAGTGGTCTTCTGGACACAGCAAAGGCACTCCAACCCTGCGCTAATTGCCCCAAACCAGCTTGCTTTAAGCAGTGTTGCCCCCTGCTGTGCGGTCAAGCAGTTGTTTTACAAGATAGAAGAAGTAAAGCCAATTACCCTGTGAATGCAATAGTACAGCAACTTCAACATGAAAACTCAACGCGCAAGAAAGTAAAAGACAATCTAGAAGCCATATTCCAAGGACTGGGTGACCTAACCCCCCCAGGGTTCATTGTGGATTTGCTGTCAGCTTCAAAAGACCCAAAAGTCATTGAGTACTGTGTAGAGCAAGGATGGGTTGGTAAAGCAAACTCTACCGTTGAAAGGGACTTAAACTATGTTCATTACATACTAAATTGTTTGGGGAGTCTCATCCTCATACTAGGGACTATTTATGTGTTGTATAAGTTAATGTGTTTCACCCAGGGTGCTTACAGCGGGTTACCTAACCCGGTTCCAAAGAAACCAGAACTAAGGAAAGCAACATTACAGGGCCCTCAACATGAATTTATCCGGGCATTGGTCAAGAGAAACTGTCACATCTTGACCACAAAAAGGGGCGAGTTCAATCTGCTCGGGATTCATGATAATTGTGCTGTTGTACCAACTCATGCTGAATGTGGAGATGTGGTTAACATAGATGGTAGGGACATTAAAGTCCTGAAACAACAAATTCTGACCAACACAGATGATGTGGATACAGAAATAACACTATTGTGGCTGGACCAAAATGAGAAGTTCAGAGACATCAGAAGGTTTATCCCAGAACACCAACAAGAATGGTGTAACATGCATTTAGCCACCAATGTTACCAAGTTCCCCATGTTAGACGTAGAGGTGGGTGAGGTCATCCCATATGGACAACTAAATTTAAGCGGCAATCCCACTTGCCGTTTAATGAAATACAACTATCCTACAAAACCTGGGCAATGTGGTGGAGTGATTCTAAATACGGGAAACATCATTGCAATACATGTGGGTGGAAATGGCAAAGTTGGGTATGGAGCAGCACTGCTGCGTAAATATTTTGCTGTTGCCCAGGGGGAAATTGTTAAGAGAGGACAAACTAAGGAATTAGGCTTTCAATCAGTTAACACTCCTACAAAAACAAAACTACAGCCAAGTGCTTTCTACCACATATTCCCAGGAACAAAAGAACCAGCCCCCTTGCATGCCAGTGATCCTAGACTCGAAACAAACTTGGACCAAGCAGTTTTATCTAAGTATAAAGGTAATCCACAGGTTGAGTGGAATGACTACATACAGACTGCTGTGGACCATTATGCTGCTCAGCTATACACACTAGATATTAACCCAGAACCACTTACAATTGACCAAGCAGTCTATGGTATTGACAACCTTGAACCATTAGATATAACCACTAGTGCAGGCTATCCTTATGCTACCATGGGTATCAGGAAGAAGGATATTGTCAATAGGGTTGAAAAGAGTACTACCAGACTTCAAGAAATGATGGATTTATATGGAATTGACTTACCCTACATTACATATTTGAAAGATGAACTCAGAAGCCCAGAGAAAATTAGGAAAGGGAAGACTAGGGCCATAGAAGCTGCTAGTCTCAATGACACAGTTCATTTCCGAATGCTATTTGGAAATCTCTTCTCAACTTTCCATGCAAACCCAGGGATCCTGACTGGCTCTGCGGTAGGTTGCAACCCTGACATTTTCTGGTCACAATTATATGCTACACTAGATGGGCATTTACTAGCTTTTGATTACACAAACTATGATGGTAGTCTGCATCCCATATGGTTTAAAGCATTGGGTAAGGTCTTGACTTCACTGGGTTTCCCTGGTAACCTCATGGACAGATTATGCAACACAACACATATATACAGAGACCAAGTCTACTTAGTGGAAGGTGGTATGCCCTCAGGGATATGTGGTACCAGCATCTTCAATACCATGATGAATAACATAATAATAAGAACAATAGTACTGGAGACTTATAAATCAATAGATTTAGACAAACTGAAAATAGTTGCTTATGGTGATGATGTGATAGCATCTTATCCTTATCCTTTGGATCCTACACATATAGCAGAAACAGCAGCCAGATATGGATTGAATATTACCCCTCCTGACAAATCAGATAAGTTTCAAGAAGTAACATGGGACAATGTGACCTTTCTCAAAAGAGCCTTCAGACCAGATGAGAAATACAAGTTTTTAATACACCCTGTCTACAGCATGACTGATGTCCATGAATCAATACGGTGGACCAAAGACCCAAAGAACACACAGGACCATGTCAGATCACTGTGCTTACTAGCTTGGCACAATGGAAAAGAAAAGTATGAGGAATTTCTAACAAAGGTAAGAAGTTGCCATGTGGGGAAACAGCTTTATCTTCCCCCTTATCAAAGCTTGTACACACAGTGGCTTGATGAATTTATCTAATTATTAGTAAATATAGTACAATGTTTAGAGGAACAAAGTAT
| 62,370
|
MG148341.1
|
Rhinovirus C
|
Langelier,C., White,C.V., Mourani,P., DeRisi,J.L.
|
University of California, San Francisco, Department of Medicine, Division of Infectious Diseases
|
USA
|
2017-10-23
|
CO03302015
|
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,056
|
GenBank
| null |
USA: Colorado
|
USA
| null |
lung
|
2015-03-30
| null | null |
Rhinovirus C isolate CO03302015 polyprotein mRNA, complete cds
|
ACCCAAGTGGTGTAGTACTCTTGTATTTCGGTACACTTGTACGCCAGTTTGCCACCCCTTCCCCAAGCGAACGTAGAAGCTTACAATCCCGGTCAATAGGAGGTGGTGAACCACACCACTTAAGACCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCTCAAGAGGAATATGCTTTGCAAAGGGCTGAAGCCCCGAGAGTCGTTATCCGCATACATACTACGCAAAGCCTAGTACTGTCCTGGAAGTCTGTTGGTTGGTCGCTCCGTCAATTCCCCATTGATAGACCTGGCAGATGAGGCAGGAAATCCCCCACTGGCGACAGTGTTCCTGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTCACGGGTGTGAAGCCAACTGATGGACAGGGTGAGAAGAGCCCCGTGTGCTATGTATGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTGCCGCACACAAACCAGTGTGTTGACAGTCGTAATGGGTAACTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTATTCTTTCAATTGATGCTTATGGTGACAACATCAAGTGATATTGTTACCATGGGCGCACAGGTCAGCAAGCAAAATGTTGGCTCACATGAGAATGTCGTCTCTGCTAACAATGGCTCAGTTATTAAATATTTCAACATCAATTATTACAAAGACTCAGCTAGCTCAGGTTTAAGTAAACAAGATTTTTCCCAAGATCCGTCCAAGTTCACTCAACCACTAGTTGACACTTTAACCAACCCTGCACTCATGTCACCGTCTGTAGAAGCTTGTGGGTTTTCCGATAGGTTAAAGCAAATCACTATCGGAAACTCCACGATCACAACACAGGACTCTATAAACACAGTTCTAGCATACGGTGAGTGGCCCCAGTATCTATCAGGCATTGATGCAACTTCAGTAGATAAACCCACACATCCCGAGACTTCAGCTGATAGATTCTACACCTTATCCAGTATTGAGTGGACATCCTCATCTTATGGCTGGTGGTGGAAGCTACCGGACGCATTGAAAGATATGGGTGTATTTGGGCAAAATTTATACTTTCATTCACTGGGGAGAACAGGGTATATTATTCACACCCAGTGTAATGCAACCAAATTCCACAGTGGGGCTTTATTAGTAGCAGTTGTCCCTGAACATCAGTTGGCATACATTGGGGTTGATGCCAATGTGGGATATGATCACACCCACCCCGGAGAAGAAGGGCATACTATCCGTGGACCCAGTCAAACCCATCCCAGAGGAGGCAATAATCCGGACGAGGATCCCTTCTTCAATTGCAATGGTACATTACTAGGGAATCTCACCATCTTCCCCCACCAGATAATTAATCTCAGGACAAATAACTCCAGTACTATAATTGTGCCATATATCAATTGTGTTCCAATGGATAATATGTTGAAACATAACAATCTATCACTACTGATCATCCCACTTGTACCTCTACGCCCAGGTAACGGTAGTGTCAACATGGTACCAATAACTGTGACCATAGCACCTTACAAATCTGAATTCTCAGGCGCAATGGAATCACGACATCAGGGCTTACCCACAAGGATACCCAGTGGAGGTCAACAATTCATGACCACTGAAGATGAACAGTCTGCAAATATACTCCCTGGGTTCCATCCCACCAAAAAGATTCACATACCAGGCTTGGTAACCAACATTATGCATATAGCTAGAGTGGATTCATTCATTCCCTTAAATAATGTTGGAGATCAAGTAGGGAAAGTTAGTATGTACTATGTGACAATTACAAAGAAGCCCAACAATGACAGGATTTTGGTACTACCCTTGGAGATGAATAACACACTGTTTTCCACCACCTTGCTAGGAGAGGTGTTGAATTACTATACCAACTGGTCAGGTAGCATAACCATTACATTCATGTGTGTTTGTGATGCATTTAGTACTGGTAAATTCCTGCTAGCATACACCCCCCCTGGAGGCGCCCTACCAGCCAATCGAAAGCAGGCAATGTTGGGTGTTCATGTCATTTGGGATCTGGGTCTACAGTCCTCTTGCACCATAGTAGTTCCATGGATATCATCTGGATTCTACCGTCGCACCAAAGCAGATGACTTCACTGAAGCAGGATATGTTACACTTTGGTACCAGACTGATTTTGTCCCATCCACTGGAGCTGGTGTTGGATCCATTCTCGCAACTTGTAGTGCTTGTCCAGATATGTCTGTTAGATTACTCAGAGACACCCCCATGATGCAACAGAGCGCTACTCTGCAAAACAATGACCCTGTTTCTGACTTCATTGATACGACCTTACAGGAAGTCTTGGTTGTTCCCGATACAAAACCATCAGGCCCACAACATACAACCAAACCCACAGCACTTAGTGCCATGGAGATTGGTGCTTCAAGTGATGCAACACCAGAAACTACTATTGAGACCCGCTACGTCTATAATGACAACACCAATGCAGAGGCAGACGTAGAAATGTTCTTGGGTAGATCTGCACTCTGGGCAAACATCAAACTCGCAAACGGGTTTTATAAATGGGATATAAATTTCCAGGAGCACGCACATGTTAGGAAGAAATTTGAGATGTTCACTTACCTCAGATTTGATATGGAAGTAACCATTGTCACAAACAACACAGGGTTAATGCAAATCATGTATGTACCTCCAGGAATTGTCCCCCCAGACAGTACTGATCATGGAAATTGGAATTCAGCCTCCAACCCCAGTGTCTTCTACCAACCCAAATCAGGGTTTCCTAGATTCACTATTCCATTCACAGGAATTGCATCAGCATACTACATGTTTTATGATGGATATGCCACAACCTCCAGTACAGGAACTAACACATATGGAATTGCCCCAACAAACCACATGGGCACACTATGTTTCAGAGCATTGGATGACCTCGACAGGAATGATGTTAAAGTATATGTTAAACCAAAACATATATCAGCATGGGTGCCTCGGCCTCCTAGAGCAACTGAGTACACTCATAAGTTCAGTACTAATTACTACTTTAAATCAAAAGAAAATGAGAACATCCTAGTACCAAAACACTTCATTAAACCAAGAGAAAACATAAAGAATGTAGGTCCTAGTGACTTGTGTGTTCACACCAAGGATGCAGTGTACACCTGTGCCCATTTGACACAACCAAATGACAACACCATTCTGTTAGCTTTGACTGCTGATCTTCAGGTTGATAGTGTTACTGCACCTGGCAGCGATTACATACCAGTATGTGACTGCACTGTTGGGTGTTACTATTCTAAGCATAGTGACAGATATATTCCAATAACTGTTAAACCTTATGACTGGTATGAGATCCAGGAATCAGATTACTACCCCAGACACATCCAATACAACCTACTTATAGGCAATGGCCCCTGTCGACCCGGAGATTGTGGCGGCAAATTGCTTTGCAGACACGGAGTTATTGGCATCATCACAGCCGGGGGTGACAATCTAGTTGCTTTCACTGACCTTAGGCCCTACTCCTGCTTATCCTCCCACCAGGGTGTAGTGTCAGATTACTTCACACAACTAGGAAATGCCTTTGGTGAGGGTTTTACTACAAACATACAGGACCACTTCAGTAAACTAGGGCAGACCATCAATGATAAAATCACTACAAAAGTTGTGAAGTGGTTAATTCGCATCATTAGTGCACTCACCATTATGATTAGGAACAATTCAGATCTCCCCACTGTACTGGCAACCTTGGCCTTACTGGGTTGTAGCTCCTCCCCATGGTCCTTCCTAAAAGATAAAATTTGTAAGTGGCTTCAGATACAAAGGCCCCCATCCAAACAGAGTGACTCGTGGTTGCGTAAGTTCACTGAATGCTGTAATGCAGCTAAAGGTTTGGAGTGGATTAGTATTAAAATAGGCAAGTTCATTGACTGGCTGAAGGAGAAGCTTATCCCTACTGTTCAAAAGAAAAAGGAAATCCTCAATAAGTGCAAAAAGATACCCTTGCTAGAGGAACAAGTCAATGGCTTCAGCTCAGCTGATTCAGAAGCTCAACAACAACTCATTGTTGAAGTCGACATCTTGAAGAAGGGATTAGATGACCTTGCACCACTTTATGCATCTGAGAACAAGAGAGTAACCAATATCCAAAAAAATCTTAAACAACAAACTGCTTATTTGAAAACCCACAGACATGAACCAGTCTGCCTGTTGTTACATGGTAACCCAGGTTGTGGTAAATCGTTGGTAACATCCATAATAGCACGTGGTTTAACTAGTGAAGCCCAAGTGTATTCACTACCTCCTGACCCGAAATACTTTGATGGTTATGATCAGCAAGCTGTGGTTATAATGGATGACCTAGGCCAAAACCCAGATGGTAAAGACCTCAGCACCTTTTGTCAGATGATCTCCACCACAGATTTTATTGTCCCAATGGCATCCTTGGAAGACAAGGGTAAATCCTTCACTAGTCAGTATGTTCTTGCCAGTACAAACCTAGATGCTTTAACACCTCCCACCATCACAATCCCTGAGGCCATCAAACGCAGATTCTTCATGGATGCTGACCTTGTAGTGACATCCAAATATCGCAACAACGTAGGCTTATTAGATGTAGCTAAAGCTCTACTACCATGTACCCAATGTCCTAAACCCCACCATTATAAAGTGTGTTGCCCCATTCTTTGTGGTCAAGCTGTAGTGGTTAGAGATAGAAAGACTCAAATCAGCTATTCTGTCAACTCCATTGTAGAACAACTTAGAAATGAGAATGATGTTAGGAGAAAAGTCAAGCATAACTTAAATGCCATCTTTCAAGGCTTAGGGGATACTCATCCACCAGGGTTCATAGTAGATCTCCTTTCAGCTTCAAAGGATCCCAAGGTTGTGGAGTATTGTGTCGAGCAAGGATGGGTAGGTAAGGCAGTGACAACTATAGAGAGGGACTTCAACTATATCCAGTATGTGCTAAATTGCTTGGGCAGTTTGGTGTTAATTCTTGGGACAATTTATGCACTTTACAAACTGATGTGCATGACCCAGGGCCCATACACAGGACTTCCCTCTGCTCCCCAAAAGAAACCTGAGTTGAGAAAGGCAACATTACAAGGTCCAGAACATGAGTTTATCAGAGCACTTATTAAAAGGAACTGTCACGTCATCACAACTCCTAGAGGGGAGTTTAACCTATTGGGGATACATGATAATTGTTGCGTAGTCCCAACCCACGCAGAGTGTGGAGATGTTGTAGACATTGATGGTAAGGAAGTGAAGGTGCTTAAACAACAAATACTAACAGATATGAATGATACAGACACAGAAATTACACTCCTATGGCTAGATCAGAATGAGAAATTTAGAGATATTAGAAGATTTATCCCAGAGCACCAACGGGAGTGGTCAAACATGCATCTAGCAACAAATGTCACAAAATTCCCTATGTTAGATGTAGAAGTAGGCAGTGTTATACCCTACGGGGAAATTAACTTGAGTGGTAACCCAACCTGTAGATTAATGAAGTATGATTACCCAACAAGACCCGGTCAGTGTGGTGGAGTGATTGTCAATACAGGAAACATTGTTGCCATACATGTAGGGGGGAATGGGCGTGTTGGCTATGGGGCATCCCTGCTACGCAAGTACTTTGCCCAAGCCCAGGGGGAAATAATATCTAAACATAAAGTTACCTCTGAAAACATCCAACCAATTAACACCCCAAATAAAACTAAATTACAACCCAGTGTCTTCCATGATATTTTCCCCGGAAACAAACAGCCAGCAGCTTTATCAAAGAATGATCCACGGTTGGAGGTCGACTTGGATACCGCGGTGTTCTCCAAGTACAAAGGAAACCCTCTCGTATCCTGGAATGACAACATCCAAATAGCAGTGGACCATTACTCAGCCCAGTTGTACATGCTAGATATCAATCCTAGTCCACTAACCATGGAGCAAGCAGTTTATGGTGTCCAAAATCTAGAACCATTGGATTTGACTACAAGTGCTGGATTCCCGTACGTCACCATGGGCATAAAAAAGAGAGACATAATAAACAAAGTGACTAAGGATGTAACAAAACTACAAGACATGATTGATAAGTATGGTATAGACTTGCCATATGTCACCTACCTAAAAGATGAGTTAAGAGCTCCAGAGAAGATCAAAATGGGAAAGACTCGAATAGTGGAAGCAGCTAGCTTGAATGACACCACCCACTTTCGAATGGTTTTTGGCAATCTCTTTAGCACTTTTCATGCTAACCCTGGTATCCTGACCGGATCAGCTGTGGGATGTAATCCAGACACCTTTTGGTCCCAGATGTATGCCTCCATGGATGGGGAATTACTTGCCTTTGATTACACAAACTATGATGGAAGCCTACACCCAGTGTGGTTCCAAGCCCTTGGCAAAGTTTTAGACAACTTGGGCTTCCCAGGGGAATTAATGATCAAATTATGTAACACAACACATATCTATAAAGATAACATCTACAGAGTAGAGGGTGGTATGCCATCAGGCATCTGTGGTACCAGTATCTTTAACACAATGATTAACAATATCATAATCAGAACTATTGTTTTGGACACTTACAAAAATATTGACCTGGATAAGCTTAAGATTATAGCTTATGGTGATGATGTTGTTGTATCCTATCCTTTTGAACTGGATCCCAGTGAAATTTCAAAAAGAGCACAATACTATGGTTTAACCATAACCCCCCCAGATAAGGGGGAGACATTTAAAAAGATGGATTGGTCTACAGTCACATTCCTCAAGAGACACTTCAAACCTGATTCCAAATACAAGTTTTTGATCCACCCAGTGTATAAAATGGAGGATGTGTATGAATCAATTAGGTGGACAAAAGATCCGAAAAATACCCAGGACCATGTCCATTCTCTCTGTCTGTTGGCATGGCACAATGGTGAAGAGGTGTATGAGGAGTTCAGAAATAAAATAAGATCAGTCCCGTTGGGGAAACAACTCTACACCCCACCATATTCCATGTTGTACAGGCAGTGGATAGATCAATTCATCTAGATTATACATATATAATACAATGTTTGTAGGTAG
| 74,275
|
KY369879.1
|
Rhinovirus C
|
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J.M., Shean,R.C., Jerome,K.R.
|
UW, Lab Medicine
|
USA
|
2017-01-15
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,097
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null |
PRJNA338014
|
Rhinovirus C strain SC983, complete genome
|
CACCGGCGAGCATACTGTGCGTTGTACACTGGAATTACGGTTCCTTTGTATGCCTGTTTTATGATCCCTTCCCCTCTTTTCTATCGTCTCCAATTTTCCACGTAACTTAGAAGCAAAGTACATGAGCCCAATAGGAGCGGCTAACCCATAGCCGTATAGGGCAAGCACTTCTGTTACCCCGGATGTGTGAATAGACTTCTCACGAGGTTGAAGCTGAAGCATTCGTTACCCGCACTTGTACTGCGCGGAAATTAGTAGCACTTTTGCCAGCTTCATGGCGTTTCGCTCAGCGTTTCCCCCACGCAGATCAGGGCAATGGGGCTACACAACCCCCACCGGCGACGGTGGTGTAGCCCGCGTGGTGCCCCGCCCGAGCTATCAGCTCGGGACGCCATGATGAAGACAGGGTGTGAAGGTTCGAGTGCGCTACAAGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCCGTAGCTGTGGTATGCATGCCAGCATAAACACAGTCGTAATGGGCAACTACGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTAAATTTGTCTTATGGTTACAGGTTTATGCAAATAGATCTGTAATCATGGGCGCTCAGGTGACTAAACAAAAAGTTGGATCACATGATAATACCATTGCAGCACAGAGTGGCTCGGTAGTCAAGTATTTCAACATCAATTACTACAAAGATGCTGCCAGTTCAGGGCTCTCTAAACAAGATTTCTCACAAGACCCATCTAAGTTTACACAACCGCTTGCCGATGTTCTGACAAACCCCGCGCTTATGTCACCCAGCATTGAAGCTTGCGGTTACTCTGACAGACTTAAGCAGATCACAATTGGAGACTCCACTATAACAACTCAAGACACCTTGAATAGTGTTGTGGCGTATGGAGAATGGCCTGAATACTTATCTGATATAGATGCCTCATCAATAGACAAGCCTACACACCCAGAAACATCAGCTGATAGATTTTATACCCTTGATAGTGTTGATTGGTCTGAAAACTCAACTGGATGGTGGTGGAAATTGCCAGACTGCCTGAGAGATATGGGTCTGTTTGGTCAGAATATGTATTATCATGCTATGGGGAGGACTGGTTACATTGTACACGTGCAGTGTAATGCAACCAAATTTCACAGTGGTTGTCTGATGGTAGCGGCTATACCAGAGCATCAGCTAGCATACATTGGTGGAGGTAATGCCAACGTTAAATACAAGCACACCCACCCAGGAGACAGAGGACACACTATGAGACCATCGGATGTACGAGGTGACAACAACCCAGATGAGGATCCCTTCTACTTGTGTAATGGCACACTGTTTGGAAACATACAGATTTATCCACACCAGATGATCAATTTGCGCACAAACAACTCAGCAACTTTGATCATACCTTACATCAACTGCTTGCCTATGGACAGCATGCTCAGACACAACAACATCTCTCTTGTGATAATTCCACTTGTCAGACTCAAGACGGGAGCAACTGGTAGCACAACTCTCCCCATAACAATCACTATTGCCCCCGATAAATCTGAATTCTCTGGCCCAATGCAAAACCAGAAGCAAGGTATACCAACCCGCATACCCAGTGGATCTCAGCAGTTTATGACTACAGAGGATGAGCAATCACCAAACATTCTACCTGAGTACAGTCCAACTAAAGTTGTACATATTCCAGGAGAAGTGACCAATCTGATACATCTTGCACAGGTAGAATCATTCATCCCTCTAAACAACATTAAACAACACGAGGGGAAGATTGACATCTACTCAGTCACAATCACAAGGAAACCCACTCGAGATCTTATTGTGACCATCCCACTGCAGATGGATAATGCATTGTTTGCAACCACACTCCTAGGTGAGATTCTTAACTACTATGCTAACTGGTCCGGGAGTGTTAGAATCACTTTCATGTGTGTGTGTGATGGATTCAGCACTGGAAAATTCCTTATGGCATACACTCCACCTGGTGGAACAGTACCAGCATCCAGAAAGCAAGCAATGTTGGGCCCACATGTGGTATGGGACTTAGGCCTACAATCCAGTTGTAGCATGGTAGCACCTTGGATATCCAGCACCTTCTTCCGCAGGACAAACTCAGACAACTACTCATCGGGTGGTTATATCACTCTGTGGTACCAGACAGACTTTGTCAGTGATAGTCCCAACAACAATGGAGTTATTGTAGCCACTTGTTCGGGGTGCCCAGATATATCCGTACGCATGCTGCGTGACACCCCCACTTTAGCATTCCCACGTTCCACACTCCAGAATCCAGTAGAAGATTTTATTGATACCACACTCAAAGAAGTGTTGGTTGTTCCAGACACGCACCCATCGGGACCTGTCCACACCACACGACCGACGGTGCTTGGAGCAATGGAAATTGGGGCAACACCAAACGTCCTACCAGAAGATGTAATTGAGACCAGATATGTGATCAATAACCATGTAAACAATGAAGCACTACTGGAAAATTTTCTTGGCCGCTCATCTCTGTGGGCAGAATTTCAGTTACAGAGTAAATTCAAGAAATGGGAAATCGATTTTCAGGAACAACCACAATTCAGAAGGAAAATAGAATTCTTCACATATGTGAGATTTGACATGGAAATCACTGTTGTTACAAATAACACAGGGTTGATGCAAATAATGTATGTGCCACCAGGTGCTAAAGCACCAACCACCCACAGTGACAATAAATGGGATGGTGCCTCAAACCCTAGTGTGTTTTACCAACCCAAGAGTGGATTTCCCCGTTTCACCATCCCCTTTACAGGTCTTGGATCAGCATATTATGTATTCTATGATGGGTATGATCAAGTTGGTAATGATGTGACCAAATATGGAATTTCCTCCACAAATGATATGGGCACCTTGTGTTTCAGAGCACTTGAGGATGAGCAGAATAATGATGTCAAAATTTTTGTAAAACCTAAGCATACTAGAGCATGGTGTCCCAGATCACCCCGAGCAACATCATACACTCACAAGTTCTCTCCCAATTACCATATTTCAGTAGGCCAGGATCAGCCCCTGGAGGTGGACCACTCCTTCACTTTCCGTACCGATATTAAGGAGCTCCAAACTGCGGGCCCAGGTGATCAATATGTTCACACCAAAGATGCTATTTACAGAAATGCCCATCTTGCTACTGCCAATGACAATACAATCTTGATAGCCCTGACATCAGATTTACAGGTAGATTACACAGATACGCCTGGTTCAGATTACATCCCAGAATGTGATTGTTTAGAAGGCTGCTATTACTGCAAATCACAAGACCGGTATTTCCCAATCAAATGTACTGCATATGATTGGTATGAAATCCAGGAGACATCCTACTACCCAAAGCATATCCAGTACAATATTTTGATAGGGGAAGGTCCAGCATTACCTGGTGACTGTGGCGGTAAGCTGCTTTGTAAGCATGGTGTGATCGGGATTCTCACTGCAGGAGGCGAGGGACACGCTGCCTTCACAGATCTAAGACCCTACCGTGATTTGAACGCACAACAGGGGCCAATAACTGATTACTTAACACAACTTGGCAACGCATTTGGTGAGGGCTTCACACAAAACATCAAAGATGGGTTTAATGATATAGGGAAGAACATCACAGACAAATTAACATCTAAAGTGTTTAAATGGCTCATTAGAATAATAAGTGCTCTCACCATCATGGTTAGAAACAGTGCTGACACTCCCACTGTGTTAGCTACATTAGCCCTACTAGGCTGCAGTAAATCTCCATGGACCTTTCTCAAAGATAAGATATGCAGCTGGCTTAATATTCCCAAGCCTCCAGGGCATCAGGGGGATAGTTGGTTGAAGAAATTTACTGAGTGCTGCAACGCAGCTAAAGGCCTAGAGTGGATTGGTGTAAAGATTAGCAAATTTATAGATTGGCTAAAAGAAAAACTTATACCAGCTGTCCAATCAAAGAAACAAACTCTCACTGAGTGCAAGAAGATCCCTCTCTACCAAGAACAAGTCAAGGGATACCCCTACGCATCTGAGGATGCTCAACGAGAGCTTTGTGTCAACATTGATAAACTCAAGAAAGGGCTGGACAGTTTGGCACCACTCTACGCAAAGGAAAACAAATTAGTGAGTGACATGCAAAAGCAACTCAAACAGATGTTCTCATACCAGAGATCACATAGGGTGGAACCCGTATGTGTGCTCATACATGGGAGCCCAGGTTCCGGTAAATCTTTAACCACAACCATTCTGTCCAGAGGGCTGGCTGGGGAGGCAGATATATACTCATTACCTCCAAATCCAAAACACTTTGATGGTTACACACAACAGAAAGTTGTCATCATGGATGATGTGGGGCAAAACCCAGATGGTGGTGACCTAAGTATTTTTTGTCAAATGGTTTCTACAACTGATTTCCATGTACCCATGGCAGCACTAGAAGATAAGGGTATGTGTTTTACTAGCGAGTATGTGTTAGCTAGCACAAACTTATCAAATCTTACACCTCCTACAGTTCAAATCCCAGAGGCACTACACAGGAGATTCTTCATGGACATGGATATCAAGATAATGCCAAACTTTTGCACCCCTACAGGAATGCTCAATACTGCAAAGGCCCTCTCTAAATGTGATGGTTGCCCAAGCCCTCCTCATTACAAGACATGCTGCCCCATGCTGTGTGGTAAAGCAATAGTTTTACAAGACAGGAAGACCAAAGTTAACTACTCAATAAACATGGTGGTTGCCCAGATCCGTGAAGAATTGTCAGGCAGGAAAAGTGTACAGCTAAACCTAAATAACATCTTCCAGGGATTGGGAGACAATGAGACACCAGGCTTTATTATAGACTTATTATCCTCATCAAAGGACCCAAAAGTTATCAGATACTGTGAGGAAAATGGATTAATAGGGAAAGCCAAATGTACAATTGAAAGAAATATTGACCACCTACAGTACACACTCAATTGTTTGGGTAGTTTAGTTATTATACTTGGTACTGTCTATGCACTCTACAAACTTATGTGTCTCACTCAAGGAGCATACTCTGGTTACACACAACCAGTAGCCAAGAAACCTGAACTGAGAAGAGCCACGGTGCAGGGTCCAGAACATGAATTCCTTTATGCTCTTATCAAAAGAAACTGCCACATTGCTACCACAGATCGTGGCGAGTTCAACATGCTGGGCATATATGACAACTGTGCAGTGTTGCCCACCCATGCAGAATGTGGTGAAACCCTTAATGTCGACGGCCGCGATATTAAGGTAATTAAAAGACAAATCTTGACCGACATGAATGATGTGGATACTGAGATTACACTCATATGGCTAGACCAGAATGAAAAGTTCAGGGACATCAGACGGTTTATACCGGAGAGCATACAAGAGTGGGACCATATGAAATTGGCCACAAATGTCACAAAATTTCCAATGTTACTGGTTGATGTGGGACAAGCCCAGCCCTATGGGGAGATAAACCTAAGTGGCAACCCAACATGCCGACTGCTTAAGTATGACTACCCCACGAGGCCCGGCCAGTGTGGAGGGGTTATTGGAAGCACTGGGCACATCATCGGCATCCATGTCGGTGGAAATGGTAGAGTGGGATATTGTGCAGCCTTACTTAGAAAGTACTTTGCCACTTCTCAGGGAGAAATTACTTCAAAAAAGAATGTGTCTGAAGCAAACCTACCCCCAATCAACACGCCTTCTTCATCCAAACTATATCCCAGTGTATTCTATGATACATTTCCTGGGAAAAAAGAACCAGCAGCTTTGCATCCAAAAGACAAGAGATTAGAAGCTGACCTAAACACAGCTGTGTTCAGCAAATATAAAGGTAATCTTCAGGTGGAGAGTAATCAGTACATTGATATTGCAGTGGATCATTATGCCGCGCAGTTGAGTGTGCTAAACATATCCCCTGAACCATTAACACTGGAACAAGCTGTGTGTGGCATAAAAAATTTGGAACCTCTTGACCTAACAACCAGTGCAGGATTCCCATACGTCACAATGGGGGTTAAAAAGAGGGACCTGGTGAACAAAACAACACGTGATGTGACTAAACTCCAGAAAATGATAGATAAATTTGGATTAGATCTCCCATACATCACTTACCTAAAAGATGAGCTCAGAGCACCAGAAAAGATCAAGGCTGGTAAGACCAGAATTATAGAAGCTAGTAGCATCAATGATACTGCTCATTTCCGCATGGTGTTCGGAAATTTATTTTCCACTTTCCATGCTAACCCAGGTGTGCTGACTGGTTCAGCAGTGGGATGTGACCCGGATGTATTCTGGTCACAAATACACTCTATGCTTGGAGGTGAGCTTCTAGCTTTTGACTACACTAATTACGATGGCAGCCTACATCCTGTGTGGTTCAAAGCCCTGGGTAAAGTCTTGGATCAACTTGGTTTTCCTGGTTCCATGATGGATAAACTGAGCAAAACAACTCATATTTATAAGGACACCATATACACCACTGAGGGCGGCATGCCTTCTGGCATCTGTGGGACATCCATATTTAATACAATGATTAACAATATCATTCTCAGAACAATTATCATAGAAACATACAAAAATATTGACTTAGACAAATTGAAAATAATAGCTTACGGGGATGACGTGATAGCATCATACCCGGAAAAACTCAACCCTAAAGAACTGGCCCTGACGGGTGCACGATATGGTCTCACCATAACGCCCGCAGATAAGTCAGAAGAGTTTACAGATATTAATTGGGACAATTTATCATTCCTCAAAAGGAAGTTCAGACCAGACCCTCAATATCCTTTCCTTATCCACCCTGTCTACTCTATGGATGATGTGTATGAATCCATCAGATGGACCCGTGATCCTAAGAACACTCAGGACCACGTGCGGTCGCTATGCCAACTTGCTTGGCACAATGGTAGGGAAGTGTACGAGACCTTCTTACAGAAAATTAGATCAGTTGAAGTTGGTCGGACACTAAACTTACCACCTTATTCATACTTGCATCACAGGTGGATAGATAATTTTATTTGATTGAACAATATAGTATACTATTTGGAGTAGAATAGATATAATA
| 78,633
|
KY369880.1
|
Rhinovirus C
|
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J.M., Shean,R.C., Jerome,K.R.
|
UW, Lab Medicine
|
USA
|
2017-01-15
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,071
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2016
|
SAMN28125222
|
PRJNA338014
|
Rhinovirus C strain SC261, complete genome
|
AAGTGGTGTAGTGCTCTTGTATTTCGGTACATTTGCACGCCAGTTTGCCACCCTTACCCTTTATGTAACTTAGAAGCTTACACAAAGACCAATAGGCGGTGGTAAACCCATACCACTAACGGTCAAACACTTCTGTTTCCCCGGCACGTGAGGAATAGGCTCCAAAAGGGCTGAAGCCACTAGTGTCGTTATCCGCATTGGTACTACGCAAAGCCTAGTATCAGCCTGAAAATTCCTTGGTTGGTCGCTCGGCCAGTTATCCCACTGGTAGACCTGGCAGATGAGGCAGGACTTACCCCACTGGCGACAGTGGTCCTGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCCTATGGGGTGTGAAGCCTAGGAACGGACAGGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTACCAATGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCTTACCCCGCAGCTGTTGCACACAATCCAGTGTGTATGCAGTCGTAATGAGCAATTGTGGGATGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTGTTTTTCTTTTATTTGCTTATGGTGACAATATTGATATTATCAGTGTTGTCATCATGGGTGCCCAGGTCAGTAAACAGAATGTTGGCTCACATGAAAGTGGAATATCAGCATCATCAGGTTCAGTCATAAAATATTTCAACATCAATTACTACAAAGACTCGGCTAGTAGTGGTTTAAGCAAACAAGACTTCTCCATGGACCCAGAGAAATTTACTAAGCCCTTAGCTGATGTCATGACCAATCCAGCATTAATGAGTCCAAGCATAGAGGCTTGTGGATTCTCCGATAGGCTCAAACAAATCACTATCGGTAGCTCCACAATAACAACACAGGACACTTTAAACACAGTCGTGGCTTATGGTGAATGGCCAGAATACCTGAAAGACACTGATGCGAGTGCTGTGGATAAACCTACTCATCCAGAAACGTCTACAGACCGTTTCTATACGCTCACAAGTGTGGAATGGCATGGCTCATCAAAGGGCTGGTGGTGGAAAATCCCAGATTGTCTTAAGGACATGGGCATGTTTGGCCAGAATATGTATTACCATGCTCTGGGACGCTCAGGCTACATCTTTCATGTACAGTGTAATGCCACTAAGTTTCACAGTGGTTTACTTCTTGTTGCTATTGTACCAGAGCACCAATTGGCATATATTGGTGGCACAAATGCAAATGTGGGGTATGATCACACTCATCCAGGTGAAGGGGGTCATGAAATTGGTAAGAACACTGAAAGAAACGACAAACAGCCTGACGAAGACCCGCTTTTCAATTGTAATGGTACTCTACTAGGAAATTTAACTATTTTCCCACATCAATTAATAAATCTGAGAACTAATAATTCAGCTACTATAGTGGTGCCTTACATAAACTGTGTTCCCATGGACAGTATGCTCAGACACAACAATATATCACTAGTCATCATACCACTTGTGCCACTACGTTCAGGATCTACACAAACTATTAACAGACTACCTATTACTATATCTATCGCGCCAGATAAGTCAGAATTTTCTGGCGCACGACAGAGTAACAAAGTGCAAGGCTTACCAGTGAGAATGCCTAGTGGTGCCCAACAGTTTATGACCACTGAAGATGAACAATCAGCAAATCTGTTACCTGGCTTTCATCCAACCCCCATAATGCACATACCAGGTGAGATTACAAATATCATGCATATGGCTAGAGTAGATTCTTTCATGCCAATTAATAACATTACAGACCAGAAGATAGATGTACCTATCTATAGTAGGACAGTGACCGCACGACCTGCTAGTAACAGTAGTGACCTTATACTAGCTATACCACTTGACATGAACAACACTTTGTTCTCCACTACACTACTAGGTGAAGTGCTAAATTACTTTTCTACTTGGGCAGGGAGCATCACATTGAGCTTTTTGTGTGTTTGTGATAGTTTTAGCACAGGTAAATTTCTCATAGCCTACACACCACCAGGGGGCGGACTTCCAAAGAATAGGAAAGAAGCAATGCTTGGTGTCCATGTTATATGGGATTTGGGACTACAATCAACATGCACCATTGTAGTACCATGGATAGCCCAGGGATACTACCGCCATACCAAAGCTGATAATTACACAGAATCAGGATATGTCACACTATGGTACCAAACAAATTTTGTTCCAGGTAGTGCTATAGCACAAGGCTCTATACTAGTCACATGTTCTGCATGTCCAGATATGGCAGTTCGCATGTTGCGTGACACTCCCATGATTACACAAGACAAGAACACCTTACAAAACCCTGTGGAGCAGTTTGTGGATAATGTCTTAGAGGAAGTTTTGGTTGTACCTAACACACAACCAAGTGGGCCAATTCACACTACTAAACCAACTGCACTGTCAGCAATGGAGATAGGAGCATCCTCAGATGTAAAACCAGAGGACATGATTGAGACACGCTATGTGGTGAATTCCAGAACTAATGGTGAAGCAACAATTGAAAATTTCTTGGGTAGATCAGCCTTGTGGGCTAATATAGATATGACAAATGGCTATGCCACATGGTCAATTACCTACCAGGGAAATGCCCAGATAAGGAAGAAATTAGAGCTTTTTACTTATGTTAGGTTTGATTTAGAAATTACAATTATAACCAGCAACTCCAGTTTAATGCAAATCATGTATGTACCACCAGGTGCTAAACCACCTAGCAACAATAACTCAGTGGAATGGAACACAGCCTCCAACCCAAGCATATTCTTTCAACCAGGAAATGGTTTCCCACGCTTTACTATACCCTTTACTGGCCTAGGATCAGCTTACTATATGTTCTATGATGGCTATGACAAAGTGAGTCATGATGAAGGAATATATGGAACTAGCGTAACCAATGATATGGGCAAATTGTGTTTCAGAACCCCAAACAACAATTCAGGAACTGATATTGTTAGAATATTTGGAAAACCAAAACACACACGTGCCTGGATTCCTCGACCACCGAGAGCAACAGAGTATACACATAAAGGTAGTACTAACTACAACAGGAGGGTGAATCCTAACTCTGAAGACAGTACACTCACCAGGGACCACTACATCAAAACCAGGGCAACAGTCACGACAGCTGGGCCTAGTGATATGTATGTACACACTAAAGAAGCTATCTACAGAAATGCTCACCTAACTAGTGCAAATGAACAAACCATACTTATAGCACTGACTGCAGACCTCCAAGTGGATGCAGCTGAGCACCCAGGTGATGACATCATACCTGATTGCGATTGCACTGTGGGTACATACTACTGCAAAAGCAAAGACCGCTATTATCCTGTGAGTGTGGTTTCACATGCTTGGTATCCAATAGAAGAATCCTCTTATTACCCAAAACATATACAGTACAACATACTTTTGGGTGAGGGCCCGTGTGAACCTGGAGATTGTGGCGGCAAGTTGCTCTGTAAACATGGTGTTATAGGAATAGTTACAGCTGGAGGAGAAGGCCATGTTGCTTTCACAGATCTAAGACCATACAGTAGCTTAGCGCACACACAGGGACCAATTAGTGACTACATAACACAATTAGGTAATGCATTTGGTACAGGCTTTACACAAACACTTGAAACTAATCTTAAAGAGACGTGTTCAGGCATGTTTGATGCAATAACATCAAAAACAGTAAAGTGGATCGTGCGCATAATAAGTGCGCTTACCATTGTGATCCGCAACAGCTCTGACACACCAACTGTTCTTGCTACAATGGCTTTGTTGGGGTGTACAGGTTCACCATGGCAATACCTTAAAACAAAACTGTGTGCTTGGCTAGGAGTGCAAAAACCTCCCTCAAAACAGAGTGACAGTTGGCTCAAGAAGTTCACTGAATGGTGTAATGCTGCAAAGGGACTAGAATGGATAGGATATAAAATAAGTAAATTTATTGACTGGTTGAAGGAAAAACTCATACCAACTGTGCAGAGAAAGAAGGATACCCTGCTTGAATGTAAGAAGTTAACCCTTTATGAAGATCAAGTCAAGGCTTTCCCCCAATCCTCAGAAACTTTTCAAAATGAACTAACCACAAAATTACAGGTCTTAAAGAAAAACCTAGACGACATGTGTCCCCTTTACGCTGTAGAAAATAAAAGAGTGACTAATATGCTCAAAGAAATCAAAACAATGACAGCATACAAGAAAACCCATCGCACGGAACCAGTGTGTATCCTAATACATGGTGGACCTGGATGTGGAAAGTCACTTGCTACTACAGTAATTGCCAGAGGTTTAGCAGACAGTGGGAATGTGTACTCACTGCCCCCAAACCCAAAACACTTTGATGGGTATTGCCAACAACAGGTAGTGATGATGGATGATTTAGGTCAAAACCCAGATGGACAAGACCTGGCAATGTTTTGTCAAATGGTTTCTACCACTGACTTTATAGTGCCTATGGCAGCATTAGAGGATAAAGGAAAAAGTTTCACTAGTGACTATGTGCTGGCTAGTACAAATTTGAACCAGTTGAGTCCCCCCACTATAACCATTCCAGAGGCAATTACACGTAGATTCTTCCTAGACGTAGATTTGAAAATAATGCCAGGATATAAGACTCATGCAGGATTACTAGATACAGCTAAAGCCTTGCAAGCATGTCCAGACTGTGCAAAACCACTCCATTACAAACAGTGTTGTCCACTTCTTTGTGGCAAAGCAATAATCCTCCAGAATAGGCGCACATCAGCGAGCCTTTCAATCAATATGGTCGTTTCACAACTGAGAGAAGAATCTACCACCAGAAAGAGGGTTCACACAAACTTGAATGCTATCTTCCAGGGTTTAGGAACAGATGAAACCCCAGGATTTATAATAGACTTACTTTCATCTTCCCGTGATCCTCGGGTTATTGAGTACTGTGAGAAAGAGGGACTGATTGTGAAAGCCACACACACCTTAGAAAAGAACTTAGAATATACACAGTATTGTTTAAATTGTTTAGGTAGCCTAATACTTATCTTGGGTACCATCTATGCTATATACAAGTTACTATGTGTGTCACAAGGGGCCTATTCAGGCAATGCAAATCCTGTTCCAAGAAAACCAGAACTTAGAAAGGCTGTCAAACAGGGTCCTGAACATGAGTTTGTACACTCTCTCATACGCAGGAACTGTCATGTTGCCACAACAAGCAGAGGAGACTTCAATCTCTTAGGTATACATGACAATTGTGCAGTTCTTCCAACACATGCAGAATGTGGTGATACCATTTTGATTGACAATATCCAGACCAAAGTTATCAAACAACAAATCATTACAGACAGCAACGATGTTGACACAGAGATCACAATAGTGTGGCTGGATAGAAATGAGAAATTTAGGGATATAAGAAGATTCATACCAGAGCATATAGAAGAATGGAGGAACATGAGATTGGCTACCAATGTACCTAAATTCCCTATGATGGATGTAGAGGTAGGTGATGTTACCCCTTATGGAGAAATCAACCTGAGTGGAAACTTGACATGCCGGCTGCTTAAGTACAACTACCCCACACAACCAGGCCAATGTGGAGCTGTTGTCGCTAATGTGGGCAATATAATTGCTATTCATGTGGGAGGCAATGGTAGAGTGGGTTATGGTGCTGCTCTCTTAAGAAAGTACTTTGCAGCAACGCAAGGTGAAATAACAACAAGAAAGTCAGTCAGAGATGTTGGCATGTCACCAATAAACACACCTTGCAAAACGAAACTATACCCCAGTGTTTTCTATGACATCTTTCCCGGAAAAAAAGAACCAGCTGCTCTAAATGACAAAGACCCTCGACTTGAAGTAAACCTAAAAGAAGCTGTTATGTCCAAATATAAAGGAAATAAGGGCTGCCAAATGAATGATTATGTACTAACAGCAGCAAAACACTATGCAGCCCAGTTGTTCCCCCTTGACATCAACCCTGAACCTATAACAATGGAACAAGCTGTGTATGGAACAGACTATTTGGAACCACTGGATCTAAATACCAGTGCTGGGTATCCATATGTTACACTAGGTGTTAAGAAAAAGGACATACTAAATCGCAACACTAAAGATTTATCCAAATTACAGCACATGATGGACCTCTATGGAATTGATCTACCCTATATCACTTACTTGAAAGATGAACTTAGAACACCAGAAAAGATTAGGTGTGGCAAAACTAGATGCATTGAAGCAGCAAGTATGAATGACACTGTGTATTTTCGCATGGTGTTTGGAAACTTATATGGTGCTTTCCACAAGAACCCAGGTGTACTGACTGGATCGGCTGTGGGATGTGATCCTGATGTCTTTTGGTCACAAATGAAAGCCACAATGGGGGAAAATATACTAGCCTTTGATTACACCAACTATGATGGAAGCTTGGATCCAATTTGGTTTGATGCTCTTAAAATTGTGCTCAATGAATTAGGTTTTGATGGTGAATTGACTGAAAAACTTAAGAAAACTACACATGTGTACAAAGATGAGGTCTACACAGTACTAGGAGGTATGCCATCAGGGACCTCTGGAACATCTGTGTTTAACACCATGATCAATAACATTATCATTAGAACTATAACCATTGAAACATATAAAAACATAGATTTGGATAAACTTAAGATAGTTGCTTATGGTGATGATGTGGTCATCTCATACCCAGATATGCTAGATGCAGCACAATTAGCTGATACTGGTTCCAAATATGGCCTAACTATAACACCTGCTGATAAGGGTACGGACTTCAAACAAGTCACCTGGGACACTGTCACCTTTCTCAAGAGAGGATTTAGAAATGACCCAAAATACCCTTTCTTGGTACACCCAGTATATCCAATGGAGGATGTTTTTGAATCAATCAGATGGACCAAGGACCCACGCAACACACAAGATCATGTAAATTCTCTGTGCCTACTAGCATGGCACAATGGAAAACAACAATATGATGACTTTATCCAAAAGGTCCGAACCACTTCTGTGGGCCGAACCTTGTACTTGCCACCGTATGAGTATTTGGAAAGGAGGTGGATAGACAAATTCATATGATTAGATATGGTATTCAAATTGCTCAGAATTGACT
| 78,634
|
KY369882.1
|
Rhinovirus C
|
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J.M., Shean,R.C., Jerome,K.R.
|
UW, Lab Medicine
|
USA
|
2017-01-15
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,082
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2016
|
SAMN28125227
|
PRJNA338014
|
Rhinovirus C strain SC9795, complete genome
|
AAGTGGTGTAGTGCTCTTGTATTTCGGTACATTTGCACGCCAGTTTGCCACCCCTACCCCTTATGTAACTTAGAAGCTTACACAAAGACCAATAGGCGGTGGTAAACCCATACCACTAACGGTCAAATACTTCTGTTTCCCCGGCACGTGAGGAATAGGCTCCAAAAGGGCTGAAGCCACTAGTGTCGTTATCCGCATTGGTACTACGCAAAGCCTAGTATCAGCCTGAAAATTCCTTGGTTGGTCGCTCGGCCAGTTATCCCACTGGTAGACCTGGTAGATGAGGCAGGACTTACCCCACTGGCGACAGTGGTCCTGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCCTATGGGGTGTGAAGCCTAGGAACGGACAGGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTACCAATGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCTTACCCCGCAGCTGTTGCACACAATCCAGTGTGTATGCAGTCGTAACGAGCAATTGTGGGATGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTGTTTTTCTTTTATTTGCTTATGGTGACAATATTGATATTATCAGTGTTGTCATCATGGGTGCCCAGGTCAGTAAACAGAATGTTGGCTCACATGAGAGTGGAATATCAGCATCATCAGGTTCAGTCATAAAATATTTTAACATCAATTACTACAAAGACTCGGCTAGTAGTGGTTTAAGCAAACAAGACTTTTCCATGGACCCAGAGAAATTTACTAAGCCTTTGGCTGATGTCATGACCAATCCAGCACTGATGAGTCCAAGTATAGAGGCTTGTGGATTCTCCGATAGGCTCAAACAAATCACTATCGGTAGCTCCACAATAACAACACAGGACACTTTAAACACAGTTGTGGCTTATGGTGAATGGCCAGAATACCTGAAAGACACTGATGCGAGCGCTGTGGATAAACCTACTCATCCAGAAACATCTACAGACCGTTTCTATACGCTCACAAGTGTAGAATGGCATGGCTCATCAAAGGGCTGGTGGTGGAAAATCCCAGATTGTCTTAAGGACATGGGCATGTTTGGCCAGAACATGTATTACCATGCTCTGGGGCGCTCAGGTTACATCCTTCATGTACAGTGCAATGCCACTAAGTTTCACAGTGGTCTACTTCTTGTTGCTATTGTACCAGAGCACCAATTGGCATACATTGGTGGCACAAATGCAAATGTGGGGTACAACCACACTCATCCAGGTGAAGGGGGTCATGAAATTGGTAAGAACACTGAAAGAAACGATAAACAGCCTGACGAAGACCCACTTTTCAATTGTAATGGTACTCTACTAGGAAATTTAACTATTTTCCCACATCAATTAATAAATCTGAGAACTAATAATTCAGCTACTATAGTGGTGCCTTATATAAACTGTGTTCCCATGGACAGTATGCTCAGACACAACAATATATCACTAGTCATCATACCACTTGTGCCACTACGTTCAGGATCTACACAAACTATTAACAGACTACCTATTACTATATCTATCGCACCAGATAAGTCAGAATTTTCTGGCGCACGACAGAGTAATAAAGTGCAAGGCTTACCAGTGAGAATGCCTAGTGGTGCCCAACAGTTTATGACCACTGAAGATGAACAATCAGCAAATCTGTTACCTGGTTTTCATCCAACCCCCATAATGCACATACCAGGTGAGATTACAAATGTCATGCATATGGCTAGAGTTGATTCTTTCATGCCAATTAATAACATTACAGACCAGAAAATAGATGTACCCATCTATAGTAGGACAGTGACCGCACGACCTGCTAGTAACAGTAGTGACCTCATACTAGCTATACCACTTGACATGAACAACACTTTGTTTTCCACTACACTACTGGGTGAAGTGCTGAATTACTTTTCTACTTGGGCAGGGAGCATCACATTGAGCTTTTTGTGTGTTTGTGATAGTTTTAGCACAGGTAAATTTCTCATAGCCTACACACCACCAGGAGGCGGACTTCCAAAGAACAGGAAGGAAGCAATGCTTGGTGTCCATGTCATATGGGATTTGGGACTACAATCGACATGCACCATTGTAGTACCATGGATAGCCCAGGGATACTACCGCCATACCAAAGCTGATAATTACACAGAATCAGGATATGTCACACTATGGTACCAAACAAATTTTGTTCCAGGTAGTGCTATAGCACAAGGCTCTATACTAGTCACATGTTCTGCATGTCCAGATATGGCAGTTCGCATGTTGCGTGACACTCCCATGATTACACAAGACAAGAACACCTTACAAAACCCTGTGGAACAGTTTGTAGATAATGTCTTAGAAGAAGTTTTAGTTGTACCTAACACACAACCAAGTGGGCCAACTCACACTACTAAACCAACTGCACTGTCAGCAATGGAGATAGGAGCATCCTCAGATGTGAAACCAGAGGACATGATTGAGACACGCTATGTGGTGAATTCCAGAACTAATGGTGAAGCAACAATTGAAAATTTCTTGGGTAGATCAGCCTTATGGGCTAATATAGATATGACAAATGGCTATGCCACATGGTCAATCACTTACCAGGGAAATGCCCAGATAAGGAAGAAATTAGAGCTTTTCACTTATGTTAGGTTTGATTTAGAAATTACAATTATAACCAGCAACTCCAGCTTAATGCAAATCATGTATGTACCACCAGGTGCTAAACCACCTAGCAACAATAACTCAGTGGAATGGAATACAGCCTCCAACCCAAGCATATTCTTTCAACCAGGAAATGGTTTCCCACGCTTTACTATACCCTTTACTGGCTTAGGATCAGCTTACTATATGTTCTATGATGGTTATGACAAAGTGAGTCATGATGAAGGAATATATGGAACTAGCGTAACCAATGATATGGGCAAATTGTGTTTCAGAACCCCAAACAACAATTCAGGAACTGATATTATTAGAATATTTGGAAAACCAAAACACACACGTGCCTGGATTCCTCGACCACCGAGAGCAACAGAGTACACACATAAAGATAGTACTAACTACAACAGGAAGGTGTATCCTAACTCTGAAGACAGTACACTCACCAGGGACCACTACATTAAAACCAGGGCAACAGTCACGACAGCTGGGCCTAGTGATATGTATGTACACACTAAAGAGGCTATCTACAGAAATGCTCACCTAACTAGTGCAAATGAACAAACCATACTTATAGCACTGACTGCAGACCTCCAAGTGGATGCAGCTGAGCACCCAGGTGATGACATCATACCTGATTGCGATTGCACTGTGGGTACATACTACTGCAAAAGCAAAGATCGCTATTATCCTGTGAGTGTGGTTTCACATGCTTGGTATCCAATAGAAGAATCCTCTTATTACCCAAAACATATACAGTACAACATACTTTTGGGTGAGGGCCCGTGTGAACCTGGAGATTGTGGCGGCAAGTTGCTCTGTAAACATGGTGTTATAGGGATAGTTACAGCTGGAGGGGAAGGTCATGTTGCCTTCACAGATCTAAGACCATACAGTAGCTTAGCACACACACAGGGACCAATTAGTGACTACATAACACAGTTAGGTAATGCATTTGGTACAGGCTTTACACAAACACTTGAAACTAATCTTAAAGAGACGTGTTCAGGCATGTTTGATGCAATAACATCAAAAACAGTAAAGTGGATCGTGCGCATAATAAGTGCGCTTACCATTGTGATCCGCAACAGCTCTGATACACCAACTATTCTCGCTACAATGGCTTTGTTGGGGTGTACAGGTTCACCATGGCAATACCTTAAAACAAAACTGTGTGCTTGGCTAGGAGTGCAAAAACCTCCCTCAAAACAGAGTGACAGTTGGCTCAAGAAGTTCACTGAATGGTGTAATGCTGCAAAGGGATTAGAATGGATAGGATATAAAATAAGTAAATTTATTGACTGGTTGAAGGAAAAACTCATACCAACTGTGCAGAGAAAGAAGGATACCCTGCTTGAATGTAAGAAGTTAACCCTTTATGAAGATCAAGTCAAGGCTTTCCCCCAATCCTCAGAAACTTTTCAAAATGAACTAACCACAAAATTACAGGTCTTAAAGAAGAACCTAGATGACATGTGTCCCCTTTACGCTGTAGAAAATAAAAGAGTGACTAATATGCTCAAAGAAATTAAAACAATGACAGCATATAAGAAAACCCATCGCACGGAACCAGTGTGCATCCTAATACATGGTGGACCTGGATGTGGAAAGTCACTTGCTACTACAGTAATTGCCAGAGGTTTAGCAGACAGTGGGAATGTGTACTCATTACCCCCAAACCCAAAACACTTTGATGGGTATTGTCAACAACAGGTAGTGATGATGGATGATTTAGGTCAAAACCCAGATGGACAAGACCTAGCGATGTTTTGTCAAATGGTTTCTACCACTGACTTTATAGTGCCTATGGCAGCATTAGAGGATAAAGGAAAAAGTTTCACTAGTGACTATGTGCTGGCTAGTACAAATTTGAACCAGTTGAGTCCCCCCACTATAACCATTCCAGAGGCAATTACACGTAGATTCTTCCTGGACGTAGATTTGAAAATAATGCCAGGATATAAGACTCATGCAGGATTACTAGATACAGCTAAAGCCTTGCAAGCATGTCCAGACTGTGCAAAACCACTCCATTACAAACAGTGTTGTCCACTTCTTTGTGGCAAAGCGATAATCCTCCAGAATAGGCGCACATCAGCGAGCCTTTCAATTAATATGGTTGTTTCACAACTGAGAGAAGAATCTACCACCAGAAAGAGGGTTCACACAAACTTAAATGCTATCTTCCAGGGTTTAGGATCAGATGAAACCCCAGGATTCATAATAGACTTACTTTCATCTTCCCGTGATCCTCGGGTTATTGAGTACTGTGAGAAAGAGGGACTGATTGTGAAAGCCACACACACCTTAGAAAAGAACTTAGAATATACACAGTATTGTTTAAATTGTTTAGGTAGCCTAATACTTATCTTGGGTACCATCTATGCTATATACAAGTTACTATGTGTGTCACAAGGGGCCTACTCAGGCAACGCAAATCCTGTTCCTAGAAAACCAGAACTTAGAAAGGCTGTTAAACAGGGTCCTGAACATGAGTTTGTACACTCTCTCATACGCAGGAACTGTCATGTTGCCACAACAAGTAGAGGAGACTTCAATCTCTTAGGTATACATGACAATTGTGCAGTTCTTCCAACACATGCAGAATGTGGTGATACCATTTTGATTGATAATATCCAGACCAAAGTTATCAAACAGCAAATCATTACAGACAGCAACGATGTTGACACAGAGATCACAATAGTGTGGCTGGATAGAAATGAAAAATTTAGAGATATAAGAAGATTCATACCAGAGCATATAGAAGAATGGAGGAACATGAGATTGGCTACCAATGTACCTAAATTCCCTATGATGGATGTAGAGGTAGGTGATGTCACCCCTTATGGAGAAATCAACCTGAGTGGAAACTTGACATGCCGACTGCTTAAGTACAACTACCCCACACAACCAGGCCAATGTGGAGCTGTTGTCGCTAATGTGGGCAATATAATTGCTATTCATGTGGGAGGCAATGGTAGAGTGGGTTATGGTGCCGCTCTCTTAAGAAAGTACTTTGCAGCAACACAAGGTGAAATAACAACAAGAAAGTCAGTTAGAGATGTTGGCATGTCACCAATAAACACACCTTGCAAAACGAAACTATACCCCAGTGTTTTCTATGACATCTTTCCCGGAAAAAAAGAACCAGCTGCTCTAAATGACAAAGACCCCCGACTTGAAGTAAACCTAAAAGAAGCTGTTATGTCCAAATATAAAGGAAATAAGGGTTGCCAAATGAATGATTATGTGTTAACAGCAGCAAAACATTACGCAGCCCAGTTGTTCCCCCTTGACATCAACCCTGAGCCTATAACAATGGAACAAGCTGTGTATGGAACAGACTATTTGGAACCACTGGATTTAAATACCAGCGCTGGGTATCCATATGTTACACTAGGTGTTAAGAAAAAGGACATACTAAATCGCAACACTAAAGATTTATCCAAGTTGCAGCACATGATGGACCTCTATGGAATTGATCTACCCTATATCACTTACTTGAAAGATGAACTTAGAGCACCAGAAAAGATTAGGTGTGGCAAAACTAGATGCATTGAAGCAGCAAGCATGAATGACACTGTGTATTTTCGCATGGTGTTTGGAAACTTGTATGGTGCTTTCCACAAGAACCCAGGTGTGCTGACTGGATCGGCTGTGGGATGTGATCCTGATGTCTTTTGGTCACAAATGAAAGCCACAATGGGGGAAAATATACTAGCCTTTGATTACACTAACTATGATGGAAGCTTGGATCCAATCTGGTTTGATGCTCTTAAAATTGTGCTCAATGAATTAGGTTTTGATGGTGAATTGACTGAAAAACTTAAGAAAACTACACATGTGTACAAAGATGAGGTCTACACAGTACTAGGAGGTATGCCATCAGGGACCTCTGGAACATCTGTGTTTAACACTATGATCAACAACATTATCATTAGAACTATAACCATTGAAACATATAAAAACATAGATTTGGATAAACTTAAGATAGTTGCCTATGGTGATGATGTGGTCATCTCATACCCAGATATGCTAGATGCAGCACAATTAGCTAATACTGGTTCCAAATATGGCCTAACTATAACACCTGCTGATAAGGGCACAGACTTCAAACAAGTCACCTGGGACACTGTCACCTTTCTCAAAAGAGGATTTAGGAATGACTCAAAATACCCTTTCTTGGTACATCCAGTATATCCAATGGAAGATGTTTTTGAATCAATCAGATGGACCAAAGATCCACGCAATACACAAGATCATGTAAATTCTCTGTGCCTACTAGCATGGCACAATGGAAAACAACAATATGATGACTTTATCCAAAAGGTCCGTACCACTTCTGTGGGCCGAACCTTGTACTTGCCACCGTATGAGTATTTGGAAAGGAGGTGGATAGACAAATTCATATGATTAGATATGGTATTCAAATTGCACAGAATTGACTATCATAAAATC
| 78,636
|
ON812485.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,485
|
GenBank
| null |
China:Yunnan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669616
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_1, complete genome
|
CCCGAAACCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCTGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTAGACATTGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACGTCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCGCTACTCTACACCCGCACTGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGATGGAGTGTTGCAGCCCTTGATGTTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATGGCAGCTATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGCCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGAACCATTGTATCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGATGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCGATGCTCCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCCTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAAACTCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCAAAAACAGAAGATGAGCTTTTTGGAGAAGACGACGAGGTTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGGGACGTCTCTGACTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCGACACGCCGGGTCAAGGTGCTCAAGACCGTGCGGGATGGTTCAAATCTGGAATTCCTCCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCGTTAATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCCCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAAAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATAGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTCAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCTGGTGGAGGACCCAGCGATGCCTCTCAGACGACAAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGCCATCAAAACTGAGGGGGAAGGAGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGACTGTCGGAACAGTCGAAACTCAGACCCTGGACCCTGACACATCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAAGATGTGAAAGACAAGGAGATGATCAAGGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAGATGAAAGATCAGGGCAATCTTGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTTTGATCCCGGCCATTGTGCCCCCCTTGGAGCCGGACACCCCTGTCGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGGGAAGAATGTGGCACCTATCAATGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCGAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCAACTCCTCCTATTAAAGGACCAGTGGAGCGTACACCTGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCCCTGACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCGGGTTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAATCTTATACCGGGGTCTTCGGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCACATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCCTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCCGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAATTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATTGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGACCCACCTCTAAGGGGAAGATCTGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTACTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATACAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTTACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATTCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCCTAGAATTAATCCAATTAAAATAATGGATTCTTCCTCTTACTTGAGAATGGCTGATGTATCCTAACGGAGTTCACCGCTTCTTACATTCTCCTTAGCGATCCGCATAATATTCCTGTTCTATCTCTTGTTCTTATTTTAGGATTTGCCGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGAAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGACGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCCTGGCGGAGGATACCGAACTCAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAGGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACTTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAACAAGCTCAGGGGAACTAGGATAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTCCAAGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGCGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGATACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACCTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTCCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACTTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGACCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGTCCTGGATGTCTGTATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTAATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAACCAGACTCAACCACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTATCATTTGGGCGACCAGATTTTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTGCGACTCCTTGAGCCCGTCTGTAATCTGCGCTTAGCGGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCAGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATTGTCTATTATGGAATCTTCCGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAGGTTGACGTTAAATATGCAAACGCTCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATCGTCCTGAAGCATGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAGCCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTGAATTGCACCTGGCCAACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTCCCACAGACAATAGATCCCGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAAAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAACTAGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGGGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGGAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTGTTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACCCGCAAGATTCTCGACTGCTCCGCTGGCCAGGGGAACAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTATGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTCCCCAAACTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGACTGGAAGGGCTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACGAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAACGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATCATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAATAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTAAAGCGATACTCACGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATTGCCAGTGCAGTGGCCGCGGTAGCAACTAGCTCCTTGACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCGGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTTTGACCCGATTCCTCATAAGGCAGTTTCCTGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAAAGACTTGGATTGATTACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAGCCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATCAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAGTCTTAGGATTATTTCAAAATTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCAGCTGAGCTGGCAGACAAATTGAGAAAAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTTCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGCTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTTGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACTACTTTCACCGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACGGAATCAACCAGCCTTTTCCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGAGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTAAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCTGGGCATAGGTACCGTTCATCACGACAAAGTAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTGGAGACCAGGCTGGCTGCTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAGACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACCATGCCGGATCTCACTACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAAGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCATCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTTTACGGATTTTACTGCGTCGATAATGATGGTAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCGACTCTGCTGAGTGCCGCTTACCATGTCCTCGAATGTCTCTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACATCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGGAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCAAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAACTGTGGCTCATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAAGACATCATCCATTATTACTGTGCTTTAGATTTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTCAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCCCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAGGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTGAGGTGTCTTTTGAAAATGATTCCGTTTGTCCAAGACTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGAGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCCTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAAAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTGCTGGATATGGAAGTGGTAGACGAGTTGTCCATTCAGCGAATTGTGACGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTTATGGAGCCCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTTATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTTAGAGAATTGCTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAGGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCACCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCTTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAGGGGGTCAGAAGAGATGGCTTGGTTCTAACCGTGTTGATCTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATCACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTATGGAATCCACGAAAAGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCTATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGAAAGGTGGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTTAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTGTCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTAAGGGATTTAGACTTCTCGAGATTTTAGGTCAGCACATTCCTCTCAAATTTAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTTGGTTTGTTTCATTGTGTTGCCCCGGAAGCATGTTAATATGATGTGTGTGTTTTACGTGCCGAAACTTCGATATTAAGAGGCACGCTCTCTAGTGGAGAATTCCGGGTGAACTTACTACACGGGGTTGTTTAACGCACATATAAATCTAATGGCACGTTCGGCTGGGTGACTCCGCGCTCTGACTCTTTGCGACAATGTGGAG
| 20,812
|
ON812498.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_2
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,276
|
GenBank
| null |
China:Sichuan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2018
|
SAMN28669543
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_2, complete genome
|
CCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACGCCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACTGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTCAAATCAGGGAACCTAGATATCGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACATCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAGGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCACTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGGAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGAGGAACGTTTGCTGACGGGGTGTTGCAGCCCTTAATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATTGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGTCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGTACCATTGTGTCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCAATGCTTCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCTTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAGACCCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCCAAAACAGAAGATGAGCTCTTTGGAGAAGACGACGAGGCTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGTCGGGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTCAAGGTACTCAAAACCGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTTCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCCCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCGGAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTTAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCCGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACAACTAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGAGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTCCCACAGGGTGTGCATCAATCCCCGGGGAAGACTACCTTGACTGTCGGAACAGTTAAAACTCAGACCATGGACCCTGACACGTCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGGAAGACAAGGAGATGATCAAAGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGATCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTTTGATCCCGGCCATCGTGCCCCCCTTAGAGCCGGACACCCCTGTTGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGAGAAGAATGTGGCACCTATCAACAAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCAAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCGACTCCTCCTATTAAAGGATCAGTGGAGCGTACACCCGCACCCACAGCTTCGTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCGGATTCCTTCCTGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAGTCTTATGCCGGGGTCTTCAGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGGGATTCTCATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAAGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATCGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGGAGATCCGTTCGTCGGGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTACTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACGGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTTACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCTTAGAATTAATCCAATGAAAATAATGGATTCTTCCTCTTGTTTGAGAATGGCTGATGCATCCTAGCTGAGTTCACTCCTTCTTACATTCCCCTTAGCAATACACATAATACTCCTGTTCTATCTCTTGTTCTTATTTTAGGATTTGCTGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGACAAGGCGGGAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTCAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACCTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGCAAGCTCAGGGGAACTAGGGTAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAGGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGAGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAATGGGACACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACTTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTTCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAATTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAAGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACCTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGATCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTATATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATTGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAACCGGACTCGACCACCTTGGCGACAGAGAAGTTAACAGAGGTCTACCATTTGGGCGACCAGATCCTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTGCGACTTCTTGAGCCCGTCTGCAATCTGCGCTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTCTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTAGCTCCGGGAGTCATCCACAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAGGTCATCGTCTATTATGGAATCTTTAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGATGTTAAATATGCAAACGCCCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCTTGAAGCACGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGATCAGATGGAGCCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCGACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTTCCACAGACGATAGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCCTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTCAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTGATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACTCGCAAGATTCTTGATTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTAGGAGGGCTGGAAGGACTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCCTGAGAGAATCTAAAATCCGAAACACGAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACCCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATAAACAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTAAAGCGATACTCCCGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCAGTAGCAACTAGTTCCCTAACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCAATGGAACGACAATGCTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCTGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAGTTTCCCGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAAAGACTTGGATTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATTAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTCTTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAATCTTAGGATTATTTCAAAACTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTTAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCGGCTGAGCTGGCAGACAAATTGAGACGCGATTCTTGGGGGGAAGGGATCGTTGCGACTACAGTCCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAGGAAGGATCAGTTCTTTGTTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTTGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACCACTTTCACTGAACGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGTCTTTTTCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACCCCCCTGTTAGAGCGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTGAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCCGGGCATAGGTACCGTTCCTCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCTAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTAGAGACCAAGCTGGCTGTTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACCATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCCTCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAGGGAGCTCTATACGGATTTTACTGCGTCGATAATGATGGCAGAAAGTCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTGCTGAGTGCCGCATACCATGTTCTTGAATGTCTTTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACACCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAATTGTGGCTTATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAGGACATCATCCATTATTACTGTGCATTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTCAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAAGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTCATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACTGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAAATGATTCCGTTTGTCCAAGATTGCATAGTCGGGGGAGATGGATCAGGGGGAATGACAGCTTGCCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCTTCGGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGGAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCATCTCACCGTGAACCTTATCGTGCTGGATATGGAAGTGGTAGATGAGTTGTCCATTCAGCAAATTGTGAAGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCTCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTCATTGAAGGGAAGATTCTAGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCGCCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAAGGGGTCAGAAGAGATGGCCTGGTTCTAACCGTGTTAATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTCCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTAGCGTGGAGTTACTCGGCCTACGGAATCCACGAGAGGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGGAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACCCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACTATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGCAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTATCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGACGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTAAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTGGGGGACTTAAACTTCTTGAGAATTTAAGTCAGCACATTCCTCTCAAATTCAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTT
| 20,825
|
ON812499.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_3
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,276
|
GenBank
| null |
China:Sichuan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28669544
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_3, complete genome
|
CCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTCAAATCAGGGAACCTAGATATCGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACATCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCACTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGACGGGGTGTTGCAGCCCTTAATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATGGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGTCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGTACCATTGTGTCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCAATGCTTCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTACTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCTTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAGACCCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCCAAAACAGAAGATGAGCTTTTTGGAGAAGACGACGAGGCTGCTCCGCTGGAACACATCCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGGGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTCAAGGTACTCAAAACCGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCTCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAGAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTTAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGGATGCTGGGAGCCGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAAACGACTAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGGGATGAAGATGAGGTAGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGACTGTCGGAACAGTTGAGACTCAGACCATGGACCCTGACACGTCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATCAGGATGTGGAAGACAAGGAGATGATCAAAGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGATCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTCTGATCCCGGCCATCGTGCCCCCCTTAGAGCCGGACACCCCTGTTGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGGAAAGAATGTGGCACCTATCAACGAGGAAGAAAGTAAACCCGGACCAAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGACTGGGACAGGACCGACTCCTCCTATTAAAGGGTCAGTGGAGCATACACCCGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCGGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCAGATTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAGTCTTATGCCGGGGTCTTCAGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCTAGAGATTCTCATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATCGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCGTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGAAGATCCGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTATTACTCCCACTCAGCACCGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTCACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCTTAGAATCAATCCAATGAAAATAATGGATTCTTCCTCTTGTTTGAGAATGGCTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCCCTTCTTACATTCCCCTTAGCAACACACATAATACTCCTGCTCTATCTCTTATTCTTATTTTAGGATTTGCTGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGGAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGGACTTAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACCTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGCAAGCTCAGGGGAACTAGGGTAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAGGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGAGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACGTCCCACTTCTATGAACAATGGGACACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACTTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTTCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACCTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGATCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCCGGATGTCTATATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAACCAGACTCGACTACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTACCATTTGGGCGACCAGATCCTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTACGACTCCTTGAGCCCGTCTGCAATCTGCGTTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGGATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATCTTCAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAGTATGCAAACGCCTTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCTTGAAGCACGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAACCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTGAATTGCACCTGGCCGACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGTTATGAGGTTCCACAGACGATCGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACTCGCAAGATTCTCGATTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGGCTAGAAGGACTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAGTCCAAAATTCGGAACACTAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAAAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCAATAACTCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTAAAGCGATACTCCCGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCAGTAGCAACTAGTTCCCTAACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTAGACGGTGCAACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCCGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAATTTCCCGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAGAGACTTGGATTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAGTTGCTTGAAAAACCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATTAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTATCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAATCTTAGGATTATTTCAAAACTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCGGCTGAATTGGCAGACAAATTGAGACGAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTCCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCATATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGTTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTCGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACCACTTTCACTGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTTCAGCCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGCGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTGAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCCGGGCATAGGTACCGTTCCTCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGTTTAGAGACCAAGCTGGCTGTTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGGAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACTATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCCTCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTATACGGATTTTACTGCGTCGATAATGACGGCAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCATATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTGCTGAGTGCCGCATACCATGTTCTCGAATGTCTTTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACACCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAACTGTGGCTCATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAGGACATCATCCATTATTACTGTGCATTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTCAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAGATGATCCCGTTTGTCCAAGATTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGGGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCTTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGTGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTGCTGGATATGGAAGTGGTAGATGAGTTGTCCATTCAGCAAATTGTGAAGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGTTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCTCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTTATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCGCCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAAGGGGTCAAAAGAGATGGCCTGGTTCTAACCGTGTTAATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTACGGAATCCACGAAAGGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGGAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACACCATGCCACCATTGGTCAGGTAATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAGACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTATCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCGAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCAGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTGGGGGACTTAAACTTCTTGAGAATTTAGGTCAGCACATTCCTCTCAAATTCAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTT
| 20,826
|
ON812500.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_4
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,283
|
GenBank
| null |
China:Sichuan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28688418
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_4, complete genome
|
AACCGAAACCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACGCCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACTGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAGCCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTAGATATCGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACATCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAATGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCACTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGGAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGACGGGGTGTTGCAGCCCTTAATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATTGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGTCCTTGGCAGCTAGTGAGAATGGGTACCATTGTGTCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCAATGCTTCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTACTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCTTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAGACCCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCCAAAACAGAAGATGAGCTCTTTGGAGAAGACGACGAGGCTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGTCGGGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTGAAGGTACTCAAGACCGTGCGGGATGGATCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTTCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCCCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAGAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTTAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAATCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCCGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACGACCAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGGGATGAAGATGAGGTAGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAGTCCGCTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGGCTGTCGGAACAGTTGAAACTCAGACCATGGACCCTGACACGTCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGGAAGACAAGGAGATGATCAAAGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGATCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTCTGATCCCGGCCATCGTGCCCCCCTTAGAGCCGGACACCCCTGTTGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGGGAAGAATGTGGCACCTATCAACGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCAAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCGACCCCTCCTATTAAAGGGTCAGTGGAGCGTACACCCGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCAGATTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAGTCTTATGCCGGGGTCTTCAGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCTCATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATCGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGAAGATCCGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCTCTTGAGGGTCCTCCCTTATTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACGGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTTACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGCCATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCTTAGAATCAATCCGATGGAAATAATGGATTCTTCCTCTTGTTTGAGAATGGCTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCCCTTCTTACATCCCCCTTAGCAACACACATAATACTCCTGCTCTATCTCTTATTCTTATTTTAGGATTTGCTGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGGAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTTAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACCTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGCAAGCTCAGGGGAACTAGGGTAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAGGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGAGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACGTCCCACTTCTATGAACAATGGGACACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACTTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTTCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACCTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGATCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTATATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATTGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTCAATCGTGCTGAACCAGACTCGACTACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTACCATTTGGGCGACCAGATCCTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTACGACTCCTTGAGCCCGTTTGCAATCTGCGTTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATCTTTAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAGTATGCAAACGCCCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCTTGAAGCACGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAACCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCGACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTTCCACAGACGATAGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATTGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGTTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTCCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACTCGCAAGATTCTCGATTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTATGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTCGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGGCTGGAAGGACTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAGTCCAAAATTCGGAACACTAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTAATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTAAAGCGATACTCCCGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCAGTAGCAACTAGTTCCCTAACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCCGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAATTTCCCGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTTTGGAAGAGACTTGGATTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAAAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCTCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATTAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAGATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTCTTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAATCTTAGGATTATTTCAAAACTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCGGCTGAATTGGCAGACAAATTGAGACGAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTCCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAGGAAGGATCAGTTCTTTGTTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTCGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACCACTTTCACTGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTCCAGCCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGCGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTGAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCCGGGCATAGGTACCGTTCCTCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTAGAGACCAAGCTGGCTGTTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACCATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCCTCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTCTACGGATTTTACTGCGTCGATAATGATGGCAGAAAGTCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCCACTCTGCTGAGTGCCGCATACCATGTTCTCGAATGTCTTTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACACCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAATTGTGGCTTATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAGGACATCATCCATTATTACTGTGCATTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTCAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAAGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTCATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAGATGATCCCGTTTGTCCAAGATTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGGGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCTTCGGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGGAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTTACCGTGAACCTCATCGTGCTGGATATGGAAGTGGTAGATGAGTTGTCCATTCAGCAAATTGTGAAGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCTCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTCATTGAAGGGAAGATTCTAGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCGCCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAAGGGGTCAGAAGAGATGGCCTGGTTCTAACCGTGTTAATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTACGGAATCCACGAAAGACTTCAATCCAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGGAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACCCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACTATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTATCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAAGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGAGTGTGGGGGACTTAAACCTCTTGAGAATTTAGGTCAGCACATTCCTCTCAAATTCAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTT
| 20,827
|
ON812501.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_5
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,275
|
GenBank
| null |
China:Sichuan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28669545
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_5, complete genome
|
CCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAGCCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTAGATATCGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACATCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAATGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCACTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACTGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGACGGGGTGTTGCAGCCCTTAATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATGGCAGCCATTGACATGTACCTGATGTACGACAAAGATAGTCCTTGGCAGCTAGTGAGAATGGGTACCATTGTGTCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCAATGCTTCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTACTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCTTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAGACCCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCCAAAACAGAAGATGAGCTTTTTGGAGAAGACGACGAGGTTGCTCAGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGAGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTCAAGGTACTCAAAACCGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGACTAACCTTCCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCTCTTCCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAGAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTTAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAATCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCCGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACGACCAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGGGATGAAGATGAGGTAGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAGTCCGCTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGGCTGTCGGAACAGTTGAAACTCAGACCATGGACCCTGACACGTCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGGAAGACAAGGAGATGATCAAAGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGATCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTCTGATCCCGGCCATCGTGCCCCCCTTAGAGCCGGACACCCCTGTTGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGGGAAGAATGTGGCACCTATCAACGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCAAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCGACCCCTCCTATTAAAGGGTCAGTGGAGCGTACACCCGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCAGATTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAGTCTTATGCCGGGGTCTTCAGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCTCATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATCGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGAAGATCCGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCTCTTGAGGGTCCTCCCTTATTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTCACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGCCATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCTTAGAATCAATCCGATGGAAATAATGGATTCTTCCTCTTGTTTGAGAATGGCTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCCCTTCTTACATCCCCCTTAGCAACACACATAATACTCCTGCTCTATCTCTTATTCTTATTTTAGGATTTGCTGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGGAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTTAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACCTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGCAAGCTCAGGGGAACTAGGGTAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAGGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGAGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACGTCCCACTTCTATGAACAATGGGACACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACTTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTTCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACCTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGATCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTATATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAATATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTCAATCGTGCTGAACCAGACTCGACTACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTACCATTTGGGCGACCAGATCCTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTACGACTCCTTGAGCCCGTTTGCAATCTGCGTTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATCTTTAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAGTATGCAAACGCCCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCTTGAAGCACGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAACCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCGACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTTCCACAGACGATAGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATTGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGTTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTCCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACTCGCAAGATTCTCGATTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTATGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTCGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGGCTGGAAGGACTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAGTCCAAAATTCGGAACACTAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTAATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTAAAGCGATACTCCCGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCAGTAGCAACTAGTTCCCTAACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCCGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAATTTCCCGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTTTGGAAGAGACTTGGATTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAAAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCTCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATTAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAGATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAATCTTAGGATTATTTCAAAACTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCGGCTGAATTGGCAGACAAATTGAGACGAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTCCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGTTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTCGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACCACTTTCACTGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTCCAGCCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGCGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTGAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCCGGGCATAGGTACCGTTCCTCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAGACTGTGAGCTTAGAGACCAAGCTGGCTGTTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACTATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCCTCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTCTACGGATTTTACTGCGTCGATAATGACGGCAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCCACTCTGCTGAGTGCCGCATACCATGTTCTCGAATGTCTTTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACACCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAACTGTGGCTTATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAGGACATCATCCATTATTACTGTGCATTGGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTCAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCCCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTACGTGTAAATGATCCTCTCATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAGATGATCCCGTTTGTCCAAGATTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGGGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTAGATCTAAGTGACCGACACCTCAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCTTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTACAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCTCCGTGAACCTCATCGTACTGGATATGGAAGTGGTAGATGAGTTGTCCATTCAGCAAATTGTGAAGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGCCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCTCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTCATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCGCCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGGGTTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAAGGGGTCAAAAGAGATGGCCTGGTTCTAACCGTGTTAATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTACGGAATCCACGAAAGACTTCAATCCAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGGAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTATCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAAGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGAGTGTGGGGGACTTAAACCTCTTGAGAATTTAGGTCAGCACATTCCTCTCAAATTCAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTT
| 20,828
|
ON812502.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_7
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,278
|
GenBank
| null |
China:Sichuan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28688420
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_7, complete genome
|
CCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTTGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTAGATATCGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACATCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCACTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGACGGGGTGTTGCAGCCCTTAATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATGGCTGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGTCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGTACCATTGTGTCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCAATGCTTCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCTTGATCAACAGATCCCCGTGGTCGGGAACCATGTGTAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACTACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAGACCCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCCAAAACAGAAGATGAGCTTTTTGGAGAAGACGACGAGGCTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGGGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTCAAAGTACTCAAAACTGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCTCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAGAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTTAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCCGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACGACTAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGGGATGAAGATGAGGTGGAGACTGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGACTGTCGGAACAGTTGAAACTCAGACCATGGACCCTGACACGTCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAATCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGGAAGACAAGGAGATGATCAAAGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGACCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTCTGATCCCAGCCATCGTGCCCCCCTTAGAGCCGGACACCCCTGTTGATCGAACCGTGAAAATAATCAAGGACCAGCTGTCGGAATGGGGGAAGAATGTGGCACCTATCAACGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCAAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCGACTCCTCCTATTAAAGGGTCAGTGGAGCGTACACCCGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGACCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTCTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCAGATTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAATCTTATACCGGGGTCTTCAGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGGGATTCTCATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATCCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATCGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGACCCACCTCTAAGGGGAAGATCCGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTATTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTCACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCTACAGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCTCCTTAGAATCAATCCAATGAAGATAATGGATTCTTCCTCTTGTTTGAGAATGACTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCCCTTCTTATATTCCCCTTAGCAACACACATAATACTCCTGTTCTATCTCTTATTCTTATTTTAGGATTTGCTGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGGAGATTAATGGATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTTAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTACAATGTCGACTACAACCTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGTAAGCTCAGGGGAACTAGGATAGCCGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTAACTGATTGGAAGCTCGTTCAGGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGAGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGACACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACTTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTTCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATAAAACAGGGTGTCTACCTTAACCTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGATCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTATATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAACCAGACTCGACTACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTACCATTTGGGCGACCAGATCCTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTACGACTCCTTGAGCCCGTTTGCAATCTGCGTTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATCTTTAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAATATGCAAACGCCCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCTTGAAGCACGAATTTGATCAGCAGAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAACCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCGACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTTCCACAGACGATAGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACTCGCAAGATTCTCGATTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCAGTCTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTAAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGGCTGGAAGGACTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACGAAAGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTGAAGCGATACTCCCGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCAGTAGCAACTAGTTCCCTAACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCGACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCCGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAATTTCCCGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAGAGACTTGGATTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCACTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTTAAAGCAGAAATTAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAATCTTAGGATTATTTCAAAACTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCGGCTGAGTTGGCAGACAAATTGAGACGAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTCCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGTTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTCGATTTCCCTCACGGCTTCCCAACCACTTTCACTGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACTTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTTCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGGACTCCCCTGTTAGAGCGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTGAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCCGGGCATAGGTACCGTTCCTCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATTGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTAGAGACCAAGCTAGCTGTTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACTATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCCTCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTATACGGATTTTACTGCGTCGATAATGACGGCAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTGCTGAGTGCCGCATACCATGTTCTCGAATGTCTTTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACGGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACACCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGATTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAACTGTGGCTTATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAGGACATCATCCATTATTACTGTGCATTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTCAACAAATCGTTCTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCTCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAGATGATCCCGTTTGTCCAAGATTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGGGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGTTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTCAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCTTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTTCTGGATATGGAAGTGGTAGATGAGTTGTCCATTCAGCAAATTGTGAAGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCGCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTTATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAGAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCGCCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAAGGGGTCAAAAGAGATGGCCTGGTTCTAACCGTGTTGATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTACGGAATCCACGAAAGGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGGAAGGTTGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGCAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTATCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGATTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTGGGGGACTTAAACTTCTTGAGAGTCTAGGTCAGCACATTCCTCTCCAATTCAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTTG
| 20,829
|
ON812503.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_8
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,282
|
GenBank
| null |
China:Sichuan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28669547
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_8, complete genome
|
CGATCTCCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTAGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTAGATATCGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACATCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCACTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGAAGCCGAATGATCAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGACGGGGTGTTGCAGCCCTTAATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATGGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGTCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGTACCATTGTGTCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCAATGCTTCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCTTGATCAACAGATCCCCGTGGTCGGGAACCATGTGTAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAGACCCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCCAAAACAGAAGATGAGCTTTTTGGAGAAGACGACGAGGCTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGGGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTCAAGGTACTCAAAACCGTGCGGGATGGCTCCAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCTCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCACGCGGAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTTAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCCGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACGACTAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGGGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAAGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGACTGTCGGAACAGTTGAAACTCAGACCATGGACCCTGACACGTCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGGAAGACAAGGAGATGATCAAAGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGATCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTCTGATCCCGGCCATCGTGCCCCCCTTAGAGCCGGACACCCCTGTTGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGGGAAGAATGTGGCACCTATTAACGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCAAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCGACTCCTCCTATTAAAGGGTCAGTGGAGCGTACACCCGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCAGATTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAATCTTATACCGGGGTCTTCAGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCTCATTCACCGCAGCCAGATGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATCCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATCGTCGGGCTAATGACTCTGAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGAAGATCCGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTATTACTCCCACTAAGCACGGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCACCTACTATTTTCACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACCGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCTTAGAATCAATCCAATGAAGATAATGGATTCTTCCTCCTGTGTGAGAATGGCTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCCCTTCTTATATTCCCCTTAGCAACACACATAATACTCCTGTTCTATCTCTTATTCTTATTTTAGGATTTGCTGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGGAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTTAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACCTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGCAAGCTCAGGGGAACTAGGATAGCTGCTCGATTTGAGCGAAACACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAGGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGAGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGACACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACTTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTCCGTGCCAAATGGCTCCAGGGAGAACCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAATTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACCTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGATCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTATATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAACCAGACTCGACTACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTACCATTTGGGCGACCAGATCCTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTACGACTCCTTGAGCCCGTCTGCAATCTGCGTTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATCTTTAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAATATGCAAACGCCCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCTTGAAGCACGAATTTGATCAGCAGAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAACCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCGACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTTCCACAGACGATAGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACTCGCAAGATTCTCGATTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTTGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCAGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGGGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGGCTGGAAGGACTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACGAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTGAAGCGATACTCCCGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCAGTAGCAACTAGTTCCCTAACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCCGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAATTTCCCGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAGAGACTTGGATTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTTAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATTAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAATCTTAGGATTATTTCAAAACTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCGGCTGAGTTGGCAGACAAATTGAGACGAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTCCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGTTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTCGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACCACTTTCACTGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTTCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGCGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTGAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCCGGCCATAGGTACCGTTCCTCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATTGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTAGAGACCAAGCTAGCTGTTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACTATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCCTCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTATACGGATTTTACTGCGTCGATAATGACGGCAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTGCTGAGTGCCGCATACCATGTTCTCGAATGTCTTTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACGGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACACCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAACTGTGGCTTATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAGGACATCATCCATTATTACTGTGCATTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTCAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTGCTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCTCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACATTATAAATTAAGGTGTCTTTTGAAGATGATCCCGTTTGTCCAAGATTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGGGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACAGACACCTCAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCTTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTTCTGGATATGGAAGTGGTAGATGAGTTGTCCATTCAGCAAATTGTGAAGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCGCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTTATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCCACAGAGCCCTATCCATTTCGCCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAAGGGGTCAAAAGAGATGGCCTGGTTCTAACCGTGTTGATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTACGGAATCCACGAAAGGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGGAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTGCGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTATCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGCAGGATTGTAGGGGACTTAAACTTCTTGAGAGTCTAGGTCAGCACATTCCTCTCCAATTCAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTT
| 20,830
|
ON812505.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_10
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,281
|
GenBank
| null |
China:Sichuan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28688421
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_10, complete genome
|
CACCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGAAACCTAGATATCGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACATCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCCCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCACTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGACGGGGTGTTGCAGCCCTTAATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATGGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGTCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGCACCATTGTGTCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCAATGCTTCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCTTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAGACCCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCCAAAACAGAAGATGAGCTTTTTGGAGAAGACGACGAGGCTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGGGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTCAAAGTACTCAAAACTGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCTCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCACGCAGAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTTAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCCGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACGACTAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGCCATCAAGACTGAGGGGGAAGGGGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGACTGTCGGAACAGTTGAAACTCAGACCATGGACCCTGACACGTCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGGAAGACAAGGAGATGATCAAAGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGATCATGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTCTGATCCCGGCCATCGTGCCCCCCTTAGAGCCGGACACCCCTGTTGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGGGAAGAATGTGGCACCTATTAACGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCAAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCGACTCCTCCTATTAAAGGGTCAGTGGAGCGTACACCCGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTCTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCAGATTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAATCTTATACCGGGGTCTTCAGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCTCATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATCGTCGGGCTAATGACTTTAAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGAAGATCCGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTATTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTACTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCACCTACTATTTTCACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACCGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCTTAGAATCAATCCAATGAAGATAATGGATTCTTCCTCTTGTGTGAGAATGGCTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCCCTTCTTACATTCCCCTTAGCAACATACATAATACTTCTGCTCTATCTCTTATTCTTATTTTAGGATTTGCTGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGGAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTTAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACCTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGTAAGCTCAGGGGAACTAGGATAGCCGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAGGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGAGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGACACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACTTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTCCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATAAAACAGGGTGTCTACCTTAACCTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGATCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTATATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAACCAGACTCGACTACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTACCATTTGGGCGACCAGATCCTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTACGACTCCTTGAGCCCGTCTGCAATCTGCGTTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATCTTCAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAATATGCAAACGCCCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCTTGAAGCACGAATTTGATCAGCAGAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAACCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCGACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTTCCACAGACGATAGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACTCGCAAGATTCTCGATTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTTGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCAGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGGGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGGCTGGAAGGACTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACGAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTGAAGCGATACTCCCGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCAGTAGCAACTAGTTCCCTAACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCGATGGAACGACAATGTTTCATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCCGTCCTTGGGGGGACCTCCGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAATTTCCCGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAGAGACTTGGATTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTTAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATTAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAATCTTAGGATTATTTCAAAACTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCGGCTGAGTTGGCAGACAAATTGAGACGAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTCCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGTTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTCGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACCACTTTCACTGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTTCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGCGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTGAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCCGGCCATAGGTACCGTTCCTCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATTGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTAGAGACCAAGCTAGCTGTTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACTATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCCTCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTATACGGATTTTATTGCGTCGATAATGACGGCAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTTCTGAGTGCCGCATACCATGTTCTCGAATGTCTTTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACACCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAACTGTGGCTTATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAGGACATCATCCATTATTACTGTGCATTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTCAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAGATGATCCCATTTGTCCAAGATTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGGGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTACTGGATCTAAGTGACCGACACCTCAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCTTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTTCTGGACATGGAAGTGGTAGATGAGTTGTCCATTCAGCAAATTGTGAAGAATCTCCGTGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCTCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTTATTGAAGGGAAGATTCTAGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCACCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAAGGGGTCAAAAGAGATGGCCTGGTTTTAACCGTGTTAATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGATCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTACGGAATCCACGAAAGGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGGAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACTATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGCAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTATCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTGGGGGACTTAAACTTCTTGAGAGTCTAGGTCAGCACATTCCTCTCAAATTCAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTTGGT
| 20,831
|
ON812506.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_11
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,270
|
GenBank
| null |
China:Sichuan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28688424
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_11, complete genome
|
CCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACGCCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCCTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTCAAATCAGGGAACCTAGATATCGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACATCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAGGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCACTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGGAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGAGGAACGTTTGCTGACGGGGTGTTGCAGCCCTTAATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATTGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGTCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGTACCATTGTGTCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCAATGCTTCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCTTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAGACCCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCCAAAACAGAAGATGAGCTCTTTGGAGAAGACGACGAGGCTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGTCGGGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTGAAGGTACTCAAGACCGTGCGGGATGGATCAAATCTAGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTTCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCCCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCGGAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTTAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCCGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACGACTAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGATATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGAGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTCCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAGACTACCTTGACTGTCGGAACAGTTGAAACTCAGACCATGGACCCTGACACGTCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGGAAGACAAGGAGATGATCAAAGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGATCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCAGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTTTGATCCCGGCCATCGTGCCCCCCTTAGAGCCGGACACCCCTGTTGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGAGAAGAATGTGGCACCTATCAACAAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCAAGCACTGAGAAGAAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCGACTCCTCCTATTAAAGGATCAGTGGAGCGTACACCCGCGCCCACAGCTTCGTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGTGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAGGGGGTTGACTGGCCCAGATTCCTTCCCGCCACGGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAGTCTTATGCCGGGGTCTTCAGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCTCATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAAGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATCGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGAAGATCCGTTCGTCGGGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTACTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGCTTGGTCAATCACGGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTCACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCTTAGAATTAATCCAATGAAAATAATGGATTCTTCCTCTTGTTTGAGAATGGCTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACTCCTTCTTACATTCCCCTTAGCAATACACATAATACTCCTGTTCTATCTCTTGTTCTTATTTTAGGATTTGCTGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGACAAAGCGGGAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTCAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACCTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGCAAGCTCAGGGGAACTAGAATAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAGGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGCGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGACACCCGGATGACTGAGATTGTTCTGCCGATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACCTGACAGGTAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTTCTTCGTGCCAAATGGCTTCAAGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAATTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAAGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACCTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGATCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTATATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATTGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAACCGGACTCGACCACCTTGGCGACAGAGAAGTTAACAGAGGTCTACCATTTGGGCGACCAAATCCTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTGCGACTTCTTGAGCCCGTCTGCAATCTGCGCTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTAGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAGGTCATCGTCTATTATGGAATCTTTAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGATGTTAAATATGCAAACGCCCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCTTGAAGCACGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGATCAGATGGAGCCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCGACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTTCCACAGACGATAGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCCTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTCAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTGATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACTCGCAAGATTCTTGATTGCTCTGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTAGGAGGGCTGGAAGGACTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCCTGAGAGAATCTAAAATCCGGAACACGAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCACGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACCCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATAAACAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTAAAGCGATACTCCCGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCAGTAGCAACTAGTTCCCTAACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCAATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCTGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAGTTTCCCGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAAAGACTTGGATTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATTAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTCTTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAATCTTAGGATTATTTCAAAACTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTTAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTATATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCGGCTGAGCTGGCAGACAAATTGAGACGCGATTCTTGGGGGGAAGGGATCGTTGCGACTACAGTCCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGTTCTGAATGTCCGAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTTGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACCACTTTCACTGAACGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGTCTTTTCCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACCCCCCTGTTAGAGCGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTGAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCCGGGCATAGGTACCGTTCCTCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCTAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTAGAGACCAAGCTGGCTGTTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACCATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCCTCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAGGGAGCTCTATACGGATTTTACTGCGTCGATAATGATGGCAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTGCTGAGTGCCGCATACCATGTTCTTGAATGTCTTTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACACCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTGTGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAATTGTGGCTTATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAGGACATCATCCATTATTACTGTGCATTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTCAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAAGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTCATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACTGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAAATGATTCCGTTTGTCCAAGATTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGGGGAATGACAGCTTGCCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCTTCGGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGGAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTTACCGTGAACCTCATCGTGCTGGATATGGAAGTGGTAGATGAGTTGTCCATTCAGCAAATTGTGAAGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCTCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTTTATCTGGTTGGTGTTGGACTCATTGAAGGGAAGATTCTAGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTCTCCATTTCGCCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAAGGGGTCAGAAGAGATGGCCTGGTTCTAACCGTGTTAATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTCCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGTTGGGAGTTTTTAGCGTGGAGTTACTCGGCCTACGGAATCCACGAGAGGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGGAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACCCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACTATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTACGGATTCATTTACGCAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTATCTCACACCGGGCTATTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTAAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTGGGGGACTTAAACTTCTTGAGAATTTAGGTCAGCACATTCCTCTCAAATTTAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACT
| 20,832
|
ON812507.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_12
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,276
|
GenBank
| null |
China:Sichuan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28697486
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_12, complete genome
|
ATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTAGATATCGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCACAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACATCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGTCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCACTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGACGGGGTGTTGCAGCCCTTAATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATGGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGTCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGTACCATTGTGTCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCAATGCTTCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCTTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGTAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAGACCCGGGAGGAAGCCGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCCAAAACAGAAGATGAGCTTTTTGGAGAAGACGACGAGGCTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGGGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTCAAGGTACTCAAAACCGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCTCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAGAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTTAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCCGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACGACTAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTACCAGGCGGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGGGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGACTGTCGGAACAGTTGAAACTCAGACCATGGACCCTGACACGTCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGGAAGACAAGGAGATGATCAAAGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGACCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTCTGATCCCAGCCATCGTGCCCCCCTTAGAGCCGGACACCCCTGTTGATCGAACCGTGAAAATAATCAAAGACCAGCTGTCGGAATGGGAGAAGAATGTGGCACCCATCAACGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCAAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCCACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCGACTCCCCCTATTAAAGGGTCAGTGGAGCGTACACCCGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTCTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCAGATTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAATCTTATACCGGGGTCTTCAGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGATGATTCTTCCTCCAGAGATTCTCATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGCCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATCCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATCGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGAAGATCCGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTATTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTCACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCTACAGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCTTAGAATCAATCCAATGAAGATAATGGATTCTTCCTCTTGTTTGAGAATGACTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCCCTTTTTACATTCCCCTTAGCAGCACACATAATACTCCTGTTCTATCTCTTATTCTTATTTTAGGATTTGCTGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGGAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTTAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACCTAAATTCACCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGTAAGCTCAGGGGAACTAGGATAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTTGTTCAGGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGAGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGACACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTAACAACTTTCTGGCATGACTTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTTCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATAAAACAGGGTGTCTACCTTAACCTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGATCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTATATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATTGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAACCAGACTCGACTACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTACCATTTGGGCGACCAGATCCTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTACGACTCCTTGAGCCCATTTGCAATCTGCGTTTAGCAGAGCTTGCCTCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATATTTAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAATATGCAAACGCCCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCTTGAAGCACGAATTTGATCAGCAGAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAACCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCGACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTTCCACAGACGATAGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGAACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAGTATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACTCGCAAGATTCTCGATTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCAGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGGCTGGAAGGACTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACGAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAACAACATGACCATTATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTGAAGCGATACTCCCGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCAGTAGCAACTAGTTCCCTAACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCGATGGAGCGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCCGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAATTTCCCGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAGAGACTTGGATTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCCAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTTAAAGCAGAAATTAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAATCTTAGGATTATTTCAAAACTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCGGCTGAGTTGGCAGACAAATTGAGACGAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTCCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGTTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTCGATTTCCCTCACGGCTTCCCAACCACTTTCACTGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACTTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTTCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGCGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTATCAAACGCCATCTTCGAAAACCTGAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCCGGGCATAGGTACCGTTCCTCACGACAAAGCAATGGGGGCTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATTGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTAGAGACCAAGCTAGCTGTTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACTATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCCTCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTATACGGATTTTACTGCGTCGATAATGACGGCAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTGCTGAGTGCCGCATACCATGTTCTCGAATGTCTTTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGTCTCCTCACGGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACACCTTACTAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGATTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAACTGTGGCTTATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTTTCCACAATACGACAGATCAAGGACATCATCCATTATTACTGTGCATTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTCAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCTCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAGATGATCCCGTTTGTCCAAGATTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGGGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTCAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCTTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTTCTGGATATGGAAGTGGTAGATGAGTTGTCCATTCAGCAAATTGTGAGGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCGCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTTATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTCTCCATTTCGCCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAAGGGGTCAAAAGAGATGGCCTGGTTCTAACCGTGTTAATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATCACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTACGGAATCCACGAAAGGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGGAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACTGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTCTTGTTAAGGATTCATTTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTATCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTGGGGGACTTAAACTTCTTGAGAGTCTAGGTCAGCACATTCCTCTCAAATTCAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTTG
| 20,833
|
ON812508.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_15
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,281
|
GenBank
| null |
China:Yunnan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669614
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_15, complete genome
|
CGAAACCATGATATTTGTAACTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTTGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTAGACATTGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACGTCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCGCTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGATGGGGTGTTGCAGCCCTTGATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATGGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGCCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGAACCATTGTATCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCGATGCTCCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCCTGATCAACAGATCCCCTTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAATGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGACGCTCGAAGGCTGATGTTCAAAACTCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAACAAAAACAGAAGATGAGCTTTTCGGAGAAGACGACGAGGCCGCCCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGAGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATTTTGGAGTGGGCAACGCGCCGGGTCAAGGTGCTCAAGACCGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCCCCTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAAAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTCAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCTGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCCCAGACGACAAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCATACCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGAGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGGCTGTCGGAACAGTTGAAACTCAGACCCTGGACCCTGACACATCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGAAAGACAAGGAGATGATCAAGGGGTACTTTGACTCTATGTTGCAGCAAATGAAAGATCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGATGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTTTGATCCCGGCCATTGTGCCCCCCTTGGAGCCGGACACCCCTGTCGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGGGAAGAATGTGGCACCTATCAACGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCGAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGAACAGGACCGACTCCTCCTATCAAAGGATCAGTGGAGCGTACACCTGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGGCGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAATTTAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCGGATTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAATCTTATACCGGGGTCTTCGGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCACATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTTAATTTTGACATAAGCGCTCGCTTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATTGTTGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGAAGATCCGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGCCCTCCCTTACTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTTACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACAGAGCACCGCCATTTGATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCCTAGAATTAATCCAATTAAAATAATGGATTCTTCCTCTTATTTGAGAATGGCTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCGCTTCTTATATTCCCCTTAGCGATACACATAATATTCCTGTTCTATCTCTTGTTCTTATTTTAGGATTTGCCGTGTCTTAGTCATTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGAAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTCAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTACCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACTTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGCAAGCTCAGAGGAACTAGGATAGCTGCTCGATTTGAGAGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAAGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGTGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGATACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACCTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTCCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACTTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGACCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTGTATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGATTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAATCAGACTCGACCACCTTGGCGGCAGAGAAGTTGACAGAGGTCTATCATTTGGGCGACCAGATCTTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTGCGACTCCTTGAGCCCGTCTGCAATCTGCGCTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCACAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATCTTCAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAATATGCAAACGCCCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCCTAAAGCACGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAGCCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCAACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTCCCACAGACGATAGATCCCGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCACTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTGATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACCCGCAAGATTCTCGACTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTTCCCAAATTGATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTTAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGACTGGAAGGGCTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACGAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAAGAGTTGGAGAAGGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGACTATCTAACATACAGCAAAGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTATCCTCATGAAGTAAAACGATACTCCCGGGTGACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCTGCGGTAGCAACTAGTTCCTTGACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCGGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACGTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAGTTTCCTGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAAAGACTTGGTGTGATCACAGGGAACTCTATCGTCAAACTGATTGCCCTAGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATCAGAAAAGGTCTTACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAGTCTTAGGATTATTTCAAAATTCCAGAACCATTCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCAGCTGAGCTGGCAGACAAATTGAGAAAAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCAACTACGGTTCCCCACCCTTATGAGCTGATTCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGCTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTTGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACTACTTTCACCGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTTCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGAGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATTTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTAAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCTGGGCATAGGTACCGTTCATCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTGGAGACCAAGCTGGCTGCTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAACTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACCATGCCGGATCTCACTACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCATCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTTTACGGATTTTACTGTGTCGATAATGATGGTAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTACGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTGCTGAGTGCCGCTTACCATGTCCTCGAATGTCTCTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACCGTGTTAAACAAGGAAAGCATCATGGGTCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACATCTTACCAAAAACACACTTGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGGGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAACTGTGGCTCATGCTCAAAGCAGTGTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAAGACATCATCCATTATTACTGTGCTTTGGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTTAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTCAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAAATGATTCCGTTTGTCCAAGACTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGAGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCTCCCAGTCCTCCTTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTGATGGATATGGAAGTGGTGGACGAGTTGTCCATTCAGCGAATTGTGACGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCCCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTTATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGGGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCACCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACAGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAGGGGGTCAGAAGAGATGGCTTGGTTCTCACCGTGTTGATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTATGGAATCCACGAAAAGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGAAAGGTAGGGAAATCTAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGCTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTGTCTCACACCGGGCTATTTGAGCCAGTCTTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTGGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGACTCGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGCACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTGGGGGACTTAGACTTCTTGAGATTTTAGGTCAGCACATTCCTCTCAAATTTAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTT
| 20,834
|
ON812509.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_16
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,283
|
GenBank
| null |
China:Yunnan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669615
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_16, complete genome
|
CCGAAACCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAAAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTAGATATTGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACGTCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCGCTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAAACTGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACATTTGCTGATGGGGTGTTGCAGCCCTTGATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACTTTCAGGGGGCTTATGGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGCCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGAACCATTGTATCACGCGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCGATGCTCCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCCTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACGACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAAACTCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGCCCAATCCGAGCAAAAACAGAAGATGAGCTCTTTGGAGAAGACGACGAGGTTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGGGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATTTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTCAAGGTGCTCAAGACCGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCTGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCCCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAATATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAAAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTCAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTAGGAGCTGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACGACAAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGAGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTAACTGTCGGAACAGCTGAAACTCAGACCTTGGACCCTGACACATCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGAAAGACAAGGAGATGATCAAGGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGATCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTTTGATCCCGGCCATTGTACCCCCCTTGGAGCCAGACACCCCTGTCGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGGAAAGAATGTGGCACCTATCAACGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCGAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGAACAGGACCGACTCCTCCTATTAAAGGATCAGTGGAGCGTACACCTGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAGCTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCGTCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCGGATTCCTTCCCGCCACAAGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAATCTTATACCGGGGTCTTCGGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCACATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGAGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATTGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGAAGATCTGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGGCCTCCCTTACTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCTATCACAGTCGATCGGGCACCTACTATTTTTACTGGGCAGTACATCGAACAGCTCATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTCGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATCCCGGTTCCTTTCCAGCTCTCCCCCTAGAATTAATCCAATTAAAATAATGGATTCTTCCTCTTATTTGAGAATGGCTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCGCTTCTTGCATTCCCCTTAGCGATACACATAATATTCCTGTTCTATCTCTTGTTCTTATTTTAGGATTTGCAGTGTTTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCTGAAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTCAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACTTAAATTCCCCACTGATCCGCGACCAAGCTGATGCCTTGCTTAGCAAGCTCAGGGGAACTAGGGTAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAAGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGCGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGATACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACCTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTCCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACTTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGACCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGAAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTATATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAATCAGACTCGACCACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTATCATTTAGGCGACCAGATCTTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAAGCTTTGCGACTCCTTGAGCCTGTCTGCAATCTGCGCTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATCTTCAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAATATGCAAACGCCTTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCCTGAAGCACGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAGCCAGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCAACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTCCCACAAACGATAGATCCCGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTACGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTAAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCGATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTGATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACCCGCAAGATTCTCGACTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAGTCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGACTGGAAGGGCTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACGAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAGGTAAAGCGATACTCTCGAGTTACATGTATTCCCAACGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCGGTAGCAACTAGTTCCTTGACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCTATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAAGCCATTCTCGACGGTGCCACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCGGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAGTTTCCTGATCCCGTTACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAAAGACTTGGTTTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATCGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGACTGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACGACTCTCCTCAAAGCAGAAATCAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTTTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACTTTCATTGGGATCACAGAAGGAGTTTTAGGATTATTTCAAAATTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCAGCTGAGCTGGCAGACAAATTGAGAAAAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTTCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGCTCTGAATGTCCAAGAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTTGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACTACTTTCACCGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTTCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGAGGGCAACTCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAACCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTAAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCTGGGCATAGGTACCGTTCATCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGACACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTGGAGACCAAGCTGGCTGCTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACCATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTTGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCATCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTTTACGGATTTTACTGCGTCGACAATGATGGTAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTTCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGTGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTGCTGAGTGCCGCTTACCATGTCCTCGAATGTCTCTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGTTAAACAAGGAAAGTATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACATCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAATTGTGGCTCATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAAGACATCATCCATTATTACTGTGCTTTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTTAACAAATCGTTTTTGGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAAGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTGGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAAATGATTCCGTTTGTCCAAGACTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGAGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCTCCCAGTCCTCCTTCAGCCATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCCTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTGATGGATATGGAAGTGGTAGACGAGTTGTCCATTCAGCGAATTGTGACGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCCCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTCATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACCAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCACCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTAGCTTCTGATCTCGCATTCACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAGGGGGTCAGAAGAGATGGCTTGGTTCTAACCGTGTTGATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCAGCTTATGGAATCCACGAAAAGCTTCAATCCAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGAAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATCTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTGTCTCACACCGGGCTATTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTAGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACATGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTGGGGGACTTAGACTTCTTGAGATTTTAGGTTAGCACATTCCTCTCAAATTTAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTTG
| 20,835
|
ON812510.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_19
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,914
|
GenBank
| null |
China:Yunnan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669622
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_19, complete genome
|
CATGATATTTGTAACTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATCATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTCAAATCAGGGAACCTAGATATTGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACGTCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCGCTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTGATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGATGGGGTGTTGCAGCCCTTGATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATGGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGATAAAGATAGCCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGAACCATTGTATCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCAATGCTTCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGCGCCGACTTCAGCCTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTACGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTAGAAGGCTGATGTTCAAAACTCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCAAAAACAGAAGATGAGCTTTTTGGAGAAGACGACGAGGTTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGGGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCAACACGCCGGGTCAAGGTGCTCAAGACCGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCGTTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCCCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTACTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAAAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTCAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCCGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACGACAAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGCCATCAAGACTGAGGGGGAAGGAGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCAAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGACTGTCGGAACAGTTGAAACTCAGACCTTGGACCCTGACACATCGCAGGAGAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCAATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGAAAGACAAGGAGATGATCAAGGGGTACTTTGATTCTATGTTGCAGCAAATGAAAGATCAAGGCAATCTGGCGTCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTTTGATCCCGGCCATTGTGCCCCCCTTGGAGCCGGACACCCCTGTCGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCAGAATGGGGGAAGAATGTGGCACCTATCAACGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCGAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCGACTCCTCCTATTAAAGGATCAGTGGAGCGTACACCTGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCTTTAACCGATCTAGTTAGAAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCGGATTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAACCTTATACCGGGGTCTTCTGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGACTCTTCCTCCAGAGATTCACATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCACGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAATGCTCGCTTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATTGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGAGGAAGATCTGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTACTACTCCCACTAAGTACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCGCCCACTATTTTTACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGGGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCCTAGAATTAATCCAATTAAAATAATGGATTCTTCCTCTTGTTTGAGAATGGCTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCCCTTCTTACATTCCCCTTAGCGACACACATAATATTCCTGTTCTATCTCTTGTTCTTATTTTAGGATTTACCGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGAAGATTGATAAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTCAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCGCACAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACTTAAATTCCCCACTTATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAGCAAGCTCAGGGGAACTAGGATAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAAGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGCGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGACACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACCTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTCCGTGCCACATGGCTTCAGGGAGAACCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACTTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGATCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTGTATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAATCAGACTCGACCACCCTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTATCATTTGGGCGACCAGATCTTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTACGACTCCTCGAGCCCGTCTGCAATCTGCGCTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCGCGCTTTAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCTAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATCTTTAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCTAAGAAAGTTGACGTTAAATATGCAAACGCCCTAGCCAGCGATCTTGCTTACATTGTCCTGAAGCACGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAGCCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCAACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCGTGCTATGAGGTCCCACAGACGATAGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACGGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACTCGCAAGATTCTCGACTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATTTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTGGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGACTGGAAGGGCTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACAAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACTAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCTCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCAATAACTCTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAACAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTAAAGCGATACTCCCGGGTTACATGTATTCCCAACGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCGGTAGCAACTAGTTCCTTGACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCGGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTTCTCATAAGGCAGTTTCCCGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAAAGACTTGGATTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTTAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATCAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAATCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCAGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAGTCTTAGGATTATTTCAAAATTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCAGCTGAGCTGGCAGACAAATTGAGAAAAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTTCCCCACCCTTATGAGCTGATTCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGCTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTTGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACTACTTTCACCGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTTCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGAGGGCAACTCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAATGCTATCTTCGAAAACCTAAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGTTGCCCTGGGCATAGGTACCGTTCATCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTGGAGACCAAGCTGGCTGCTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAGCTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACCATGCCAGATCTCACTACACTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCATCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTTTACGGATTTTACTGCGTCGATAATGATGGTAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGGATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTGCTGAGTGCCGCTTACCATGTCCTCGAATGTCTCTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACATCTTACCAAAAACACACTCGATTTGGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAACTGTGGCTCATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAGGACATCATCCATTATTACTGTGCTTTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCTGCAGTTCTTAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTGCTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAGGTTAGGCATGCAACCCAAGCTTTGCCCCTCTACAGACACATTCACCGTCACAAGGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACAGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGGGCACATTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAAATGATTCCGTTTGTCCAAGACTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGGGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTCAATAGCTTGCTGGACCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCTTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTGATGGATATGGAAGTGGTAGATGAGTTGTCCATTCAGCGAATTGTGACGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTCGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCCCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTTATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCGTACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCACCGAAAGATATGTGGATGGGAGTGCCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCCTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCACAGATCCAGAAGGGGGTCAGAAGAGATGGCTTGGTTCTGACCGTGTTGATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTATGGAATCCACGAAAAGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGAAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCTTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTGTCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACATGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTGGGGGACTTAGACTTCTTGAGATTTTAGGTTAGCACATTCCTCTCAAATTTAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGATTTTATTTGTTGTGGTTTCTTACATTTTGAACTCTATTGTTCAATTTGCATTTTGGACAAAGTTTGTTGATCACAGAGTACCTGTATGGCGTAAGTGTTACATGTCTCAGGCTTTTATTATAAATGACAACTTCATCTCGGATACCTAAGTCGCCTGGCATATAAATGAAATTCTGTATAAGCAGAAATATATTATATATCGTTTCATATTTTATTCTACGCGAGAGAATATATAGTTTTCTCGACTGTGGTCGCACTCTGTATATCATGATTCTTCACACGAGACTTTCCTAAATTGCTTCACCGATAAACTGTTGATCATTCATAATCACTATTTTTTTTTTCAACGTGCAAAGTAAGGCGATGACGTCGCGAGGCCATCAACGCGCACAACAGAACGCAAACATAGCGCGCTATATTTATGTTATTTTTTGCGCATCTGTTCCACTTGAATGCTTCAAGGTGCCATCTGTCACAGCGCCGTAGTATCGCGTGTCAAAGCTGACCTCAGTAACCTGAAACGGCGTTCTAGAAGCAATACACAAGAATGAGCTTGTAAGTCGCACTCGTTCACCATGTAAGACGACAGTGACTTTCCCAATTCGTTCTTTGTATACTGTGTGTCCTGAAAGAAAAATAGCTC
| 20,836
|
ON812511.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_20
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,273
|
GenBank
| null |
China:Yunnan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669623
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_20, complete genome
|
GATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCTGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTAGACATTGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACGTCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCGCTCCTCTACACCCGCACTGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGATGGGGTGTTGCAGCCCTTGATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGGCTTATAGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGCCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGAACCATTGTATCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCGATGCTCCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCCTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAAACTCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCAAAAACAGAAGATGAGCTTTTTGGAGAAGACGACGAAGTTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGGGACGTCTCCGACTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCGACACGCCGGGTCAAGGTGCTCAAGACCGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTCCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCGTTAATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCCCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAAAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATAGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTCAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCTGGTGGAGGACCCAGCGATGCCTCTCAGACGACAAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGCCATCAAGACTGAGGGGGAAGGAGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAATTGCCTTGACTGTCGGAACAGTTGAAACTCAGACCCTGGACCCTGACACATCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGAAAGACAAGGAGATGATCAAGGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAGATGAAAGATCAGGGCAATCTTGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTTTGATCCCGGCCATTGTGCCCCCCTTGGAGCCGGACACCCCTGTCGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCAGAATGGGGGAAGAATGTGGCACCTATCAATGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCGAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCAACTCCTCCTATTAAAGGATCAGTGGAGCGTACACCTGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCCCTGACCGATCTAGTTAGGAAGCATGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCGGGTTCTTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAATCTTATACCGGGGTCTTCGGGTTCTCAGGGAGAGTCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCACATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCCTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGAATGTCCGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAATTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATTGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGACCCACCTCTAAGGGGAAGATCTGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTATTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTTACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATTCCGGTTCCTTTCCAGCTCTCCCCCTAGAATTAATCCAATTAAAATAATGGATTCTTCCTCTTACTTGAGAATGGCTGATGTATCCTAACGGAGTTCACCGCTTCTTACATTCTCCTTAGCGATACGCATAATATTCCTGTTCTATCTCTTGTTCTTATTTTAGGATTTGCCGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGAAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTCAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAGGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACTTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAACAAGCTCAGGGGAACTAGGATAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTCCAAGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGCGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGATACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTTACAACTTTCTGGCATGACCTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTCCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATTATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACTTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGACCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGTCCTGGATGTCTGTATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCCTAATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAACCAGACTCAACCACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTATCATTTGGGCGACCAGATCTTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTGCGACTCCTTGAGCCCGTCTGTAATCTGCGCTTAGCGGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCCGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATTGTCTATTATGGAATCTTCCGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAATATGCAAACGCTCTAGCTAGTGATCTTGCTTACATCGTCCTGAAGCATGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAGCCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTGAATTGCACCTGGCCAACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTCCCACAGACAATAGATCCCGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAACTAGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGGGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTAAAAGGAGTAACCCGCAAGATTCTCGACTGCTCCGCTGGCCAGGGGAACAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACTGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTCCCCAAACTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTATGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGACTGGAAGGGCTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACGAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAATAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCACGAAGTAAAGCGATACTCACGGGTTACATGTATCCCCAATGATCAAATCCCCACAATTGCCAGTGCAGTGGCCGCGGTGGCAACTAGCTCCTTGACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCGGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAGTTTCCTGATCCCGTCACAGAATCCCTCAGCTTCTGGAAAAGACTTGGATTGATTACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAGCCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATCAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAGTCTTAGGATTATTTCAAAATTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCAGCTGAGCTGGCAGACAAATTGAGAAAAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTTCCTCACCCCTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGCTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCGGAACGAGAACGGGTAACAGTTGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACTACTTTCACCGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTCCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGAGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTAAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCTGGGCATAGGTACCGTTCATCACGACAAAGTAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTGGAGACCAGGCTGGCTGCTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAGACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACCATGCCGGATCTCACTACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAAGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCATCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTTTACGGATTTTACTGCGTCGATAATGATGGTAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCGACTCTGCTGAGTGCCGCTTACCATGTCCTCGAATGTCTCTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACATCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGGAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAACTGTGGCTCATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAAGACATCATCCATTATTACTGTGCTTTAGATTTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTGCTTAACAAATCGTTCTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCCCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAGGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTGAGGTGTCTTTTGAAAATGATTCCGTTTGTCCAAGATTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGAGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCCTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAAAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATCAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTGCTGGATATGGAAGTGGTAGACGAGTTGTCCATTCAGCGAATTGTGACGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTTATGGAGCCCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTTATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTTAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAGGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCACCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCTTGGGCCTCTTTTCTTCCCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAGGGGGTCAGAAGAGATGGCTTGGTTCTAACCGTGTTGATCTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATCACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGATTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTATGGAATCCACGAAAAGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCTATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGAAAGGTGGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTTAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCCTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTGTCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAATAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGCAGGGGATTTAGACTTCTCGAGATTTTAGGTCAGCACATTCCTCTCAAATTTAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTTG
| 20,837
|
ON812580.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_21
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,281
|
GenBank
| null |
China:Yunnan
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669617
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhipicephalus associated rhabdo-like virus isolate TIGMIC_21, complete genome
|
CGAAACCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCTGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAGAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTGGACATTGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACGTCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCGCTACTCTACACCCGCACTGCCCACGAAGAGTACATCAAGACCGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACGTTTGCTGATGGGGTGTTGCAGCCTTTGATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACCTTCAGGGGACTTATGGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGCCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGAACCATTGTATCACGTGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTATGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCGATGCTCCAGGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCCTGATCAACAGATCCCCGTGGTCCGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACAACCCGGTACATTGAGTGTGAAAATGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTAGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAAACTCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGTCCAATCCGAGCAAAAACAGAAGATGAGCTTTTTGGAGAAGACGACGAGGTTGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGGGACGTCTCTGACTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGATCACATCTTGGAGTGGGCGACACGCCGGGTCAAGGTGCTCAAGACCGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTCCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCGTTAATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCCCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAATATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAAAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATAGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTCAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTGGGAGCTGGTGGAGGACCCAGCGATGCCTCTCAGACGACAAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGCCATCAAGACTGAGGGGGAAGGAGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGACTGTCGGAACCGTTGAAACTCAGACCCTGGACCCTGACACATCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGAAAGACAAGGAGATGATCAAGGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAGATGAAAGATCAGGGCAATCTTGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTTTGATCCCGGCCATTGTGCCCCCCTTGGAGCCGGACACCCCTGTCGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGGGAAGAATGTGGCACCTATCAATGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCGAGCACTGAGAAGGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGGACAGGACCGACTCCTCCTATTAAAGGATCAGTGGAGCGTACACCTGCACCCACCGCTTCTTCTCCATCCCAGTCCCTGACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGGTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCATCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCGGGTTCCTTCCCGCCACAGGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAATCTTATACCGGGGTCTTCGGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCACATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAATGCTCGCCTAACCATTCGGATGGGCTATCACGGAATGTCCGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAATTCTTCCACGGGGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATTGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGACCCACCTCTAAGGGGAAGATCTGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGTCCTCCCTTACTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCGCCTACTATTTTTACTGGGCAGTACATCGAACAGCTTATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTTGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATTCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCCTAGAATTAATCCAATTAAAATAATGGATTCTTCCTCTTACTTAAGAATGGCTGATGTATCCTAACGAAGTTCACCGCTTCTTACATTCTCCTTAGCGATACGCATAATATTCCTGTTCTATCTCTTGTTCTTATTTTAGGATTTGCCGTGTCTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCGGAAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTCAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAGGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACTTAAATTCCCCACTGATCCGTGATCAAGCTGATGCCTTGCTTAACAAGCTCAGGGGAACTAGGATAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTCCAAGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGCGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGATACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACCTTCTGGCATGACCTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTCCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCATATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGTGTCTACCTTAACTTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGACCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGGAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGTCCTGGATGTCTGTATCTCAAGAAGGAAGAAAGGCTTCTAGACCGAAACATGGTCTTAATGTTGAAAGATACGTTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAACCAGACTCAACCACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTATCATTTGGGCGACCAGATCTTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTGCGACTCCTTGAGCCCGTCTGTAATCTGCGCTTAGCGGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTCTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAAGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATTGTCTATTATGGAATCTTCCGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTAGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAATATGCAAACGCTCTAGCCAGTGATCTTGCTTACATCGTCCTGAAGCATGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAGCCGGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTGAATTGCACCTGGCCTACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTCCCACAGACAATAGATCCCGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCATTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAACTAGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGGGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAACGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTAATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACCCGCAAGATTCTCGACTGCTCCGCTGGCCAGGGGAACAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTCCCCAAACTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGACTGGAAGGGCTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACTAAGGTCAGAGTCCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTGATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAGGAGTTGGAGAAAGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACTCTTGGGGCCAATAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGATTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAAGTAAAGCGATACTCACGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATTGCCAGTGCAGTGGCCGCGGTAGCAACTAGCTCCTTGACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCCATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCAACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACTTGGACCCGGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTAACCCGATTCCTCATAAGGCAATTTCCTGATCCCGTCACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAAAGACTTGGATTGATTACAGGAAACTCAATCGTCAAACTGATTGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGAATGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAGCCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACAACTCTCCTCAAAGCAGAAATCAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTCTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACCTTCATTGGGATCACAGAAGGAGTCTTAGGATTATTTCAAAATTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCAGCTGAGCTGGCAGACAAATTGAGAAAAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTTCCTCACCCCTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGCTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTTGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACTACTTTCACCGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTTCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGAGGGCAACCCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAATCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTAAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCTGGGCATAGGTACCGTTCATCACGACAAAGTAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGATACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTACCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTGGAGACCAGGCTGGCTGCTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAGACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACCATGCCGGATCTCACTACCCTAAAATCCTTGCAAGTCGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCATCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTTTACGGATTTTACTGCGTCGATAATGATGGTAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTGCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCGACTCTGCTGAGTGCCGCTTACCATGTCCTCGAATGTCTCTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGCTAAACAAGGAAAGCATCATGGGCCTCCTCACAGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACATCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGGAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAGCTGTGGCTCATGCTCAAAGCAGTCTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAAGACATCATCCATTATTACTGTGCTTTAGATTTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTTAACAAATCGTTTTTAGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCCCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAGGAAGAGGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTAGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTGAGGTGTCTTTTGAAAATGATTCCGTTTGTCCAAGACTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGAGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCCCCCAGTCCTCCCTCAGCTATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAAAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACTGTGAACCTCATCGTGCTGGATATGGAAGTGGTAGACGAGTTGTCCATTCAGCGAATTGTGACGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCACTGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTTATGGGGCCCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGGACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTTATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACTAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAGGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCACCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCTTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTTACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAGGGGGTCAGAAGAGATGGCTTGGTTCTAACCGTGTTGATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATCACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGCTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCGGCTTATGGAATCCACGAAAAGCTTCAATCTAAAATGTATCGCTCTATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGAAAGGTGGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTTAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGGATTCATTTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTGTCTCACACCGGGCTGTTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTGGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACGTGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTAGGGGATTTAGACTTCTCGAGATTTTAGGTCAGCACATTCCTCTCAAATTTAATCGAGAATATGCTGAGTACTAGACATTTACTGGTTTT
| 20,896
|
MH814974.1
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
|
Shen,S., Deng,F., Wu,H., Zhang,Y.Z.
|
Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, State Key Laboratory of Virology
|
China
|
2019-04-21
|
YNTV2
|
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,214
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2016
| null | null |
Rhipicephalus associated rhabdo-like virus, complete genome
|
GACGAACAAACCGAAACCATGATATTTGTAATTGATCTCCGGCTAACCCTTAACACCCCTACAACGAGAAGCATTATGACTTCCAAGAAACCAAAGAAAACACCGATCTACGGTGAGTCACTCTTCGGGGTGGCATCTTCCACCGAGATCTTCGAGGGTGTAACCGAACGCCGGCCTGCCCCAGAGACCCCTGACTTCCCTAGCGACTGGTTCGCCAGGAAACCGGAAAAGCCAACCTACACCATCTTGTGCTCTGCGGAAAAGACAGAGCTGAACAAGATGGTTTACGGAGGGCTTAAATCAGGGAACCTAGATATTGACTTGGCGGCCGAGTATCTCGTGTCTATCTTTCCCCAGATGAAAGGTAAAGCCAAGGATCAACCCTGGACGTCTTTCGGCGTGACCATCGCTGAAGCAGGAGCAGAGATCTCTCCATTGAGTCTCATCACAGTCGTCGAAGAAAAAAGGACAGCTCCAACTCCGGGCCAAATTCAGGCCTTCAACGGGTCTGACTTGTTTTTGGTTACCTCTCTTGCATGTGTTTACCGCCTAGCGCTACTCTACACCCGCACGGCCCACGAAGAGTACATCAAGACTGTCAGAAGCCGAATGATTAACGTTATGTCAGGTTCTGACATAGGGGGAACATTTGCTGATGGGGTGTTGCAGCCCTTGATGCTGAAAAAACGAGAATGGGCCACAAACAGAACTTTCAGGGGGCTTATGGCAGCCATTGACATGTACTTGATGTACGACAAAGATAGCCCTTGGCAGCTAGTGAGGATGGGAACCATTGTATCACGCGGGAAAGACTGTGCAGCCCTAGGAGACGTTCAAAGAATTGCTCGCTGCCTCAGTGTGTCTCCTTCGGATTCCCTGCTTTGGGTTTTTGAAACATCGATGCTCCAAGAACTACAATGGCTGACAGCTCGTGACGAAGAGCTGGGGAAATCTGAGAGTTATTACCACTATTGTGCCGACTTCAGCCTGATCAACAGATCCCCGTGGTCAGGAACCATGTGCAAGCAGATTCACCTGTGGGCCAACTGCACATGCATACTCCTACACTCAAACGAGGCCATGACGACTCGGTACATTGAGTGTGAAAACGTCACAGGAGTTGTGCACAATGCCATCATTGTGGCCTATGCCCACAGAGGAACCAGTGATGCTCGAAGGCTGATGTTCAAAACTCGGGAGGAAGCTGTGGCAGCACAGGCAAAGATGAACCGCCCAATCCGAGCAAAAACAGAAGATGAGCTTTTCGGAGAAGACGACGAGGCCGCTCCGCTGGAACACATTCCCGGAGTAGATGAGCCAATGGGCCGAGACGTCTCTGATTGGGTCAACTTCATGTTCGGACTCCACTGGATACTCCCCGGTCACATTTTGGAGTGGGCAACGCGCCGGGTCAAGGTGCTCAAGACCGTGCGGGATGGCTCAAATCTGGAATTCCTTCGGAAGTATCTCGAAGTTGGAGATTAACCTTCCATTGATCCAACAAGAGCTGTAAATACTGCTTCTCCCTTTCTTTCAAAATTGATCTCAGTATTTTGTCTGCTCAGTCAAGCAAAGAATCTCAGTGTTCCCTAGTCTCATGAAAAAAAGTAGCATCCCTACAGGATGTCAGATGGTAGACGCGAGTTGCCATATTTTCAAAGGGAGAAATTTGGATTTGGGCCTGGATTCAATAGAGCTTGTAGAATGCAAGCCAGCAACCAGAAGCTAGAGGGAATGCTAGGAGCTGGTGGAGGACCAAGCGATGCCTCTCAGACGACAAATCCAGGAGACATTGTTCACAAATTGCCGTATCAGGCAGAGACAGCTGCAGACATGGTCGCAGTCATCAAGACTGAGGGGGAAGGAGATGAAGATGAGGTGGAGACCGGGGGAGTTCACGAGGGACAGCTGCCGAATCCACTGGAGCCGGAGGGTGAGGTTCCACAGGGTGTGCATCAGTCCCCGGGGAAAACTACCTTGACTGTCGGAACAGCTGAAACTCAGACCTTGGACCCTGACACATCGCAGGAAAGTGAGGGAATTGACGGAGCTCACTCCATTATGATAAACCTGGATCCAAAACATAAGGATGTGAAAGACAAGGAGATGATCAAGGGGTACTTTGATTCCATGTTGCAGCAAATGAAAGATCAGGGCAATCTGGCATCAGGGGACGCGGAGATCATAGACGAGCACGTCAAAGTCACTTATACTTTGATCCCGGCCATTGTACCCCCCTTGGAGCCGGACACCCCTGTCGATCGAACCGTGAAAATAATCAATGACCAGCTGTCGGAATGGGGAAAGAATGTGGCACCTATCAACGAGGAAGAAAGTAAACCTGGACCGAGCACTGAGAAAGAGTCAACCCAGGCTCCCAAGCCTACAGTCACCTCGATTGGAACAGGACCGACTCCTCCTACTAAAGGATCAGTGGAGCGTACACCTGCACCCACAGCTTCTTCTCCATCCCAGTCTCTAACCGATCTAGTTAGGAAGCCTGTCACCTATGACCGACGTGGAGGAGGTTCAATCGCTGTGAGCCTTTTGCAACTCGGCATCAGCGCCGATACTGTCGCCAAGGGTCTAGCGTCCAAAGGAGTTCCAATCAAGACCTTTTTAGCTCGGTCTGAGTCGCAAAAGGCCTGGGCTTGTCTCATGCTGAGTGAGAGAGGGAAAAAGTTCAGGCTCACAGTGTTTCCACCCGAGAAATAAGGGGTTGACTGGCCCGGATTCCTTCCCGTCACAAGATCCGTGAAAAAAAGTAGCACCCTTACAATGCTTGCACGACTGAGGAATCTTATACCGGGGTCTTCGGGTTCTCAGGGAGAATCCTCGGGAGACGATTCTTCCTCCAGAGATTCACATTCACCGCAGCCAGAGGTGCCGCGAGGCCTGTGGATGCAAGTCAATTTTGACATAAACGCTCGCTTAACCATTCGAATGGGCTATCACGGGATGTCTGTTGCAGCCTTGATGAGAATGGGTCAGTTCTTCCACGGAGAGTATCAGGGGGAAGCTCATGCTCGAAGCCTCACAGCCTTTATTGTCGGGCTAATGACTCTAAGATCTTATGAAGATCCACCTCTAAGGGGAAGATCTGTTCGTCGCGCCATCTTTCAGGACATCATTTCCCTTGAGGGGCCTCCCTTACTACTCCCACTAAGCACTGCGGAGGTTTTTCGAGACACCTTCTATTGGAGATATAGAGGGGAAATGTATGTTTGGTCAATCACAGTCGATCGGGCACCTACTATTTTTACTGGGCAGTACATCGAACAGCTCATCCAACCTCATGAGAGAGAGACATTTGGTCACTGGGGAGTCCAATTCGTCAACTCCACAGAACACCGCCATTTAATCCCGGTCCCTTTCCAGCTCTCCCCCTAGAATTAATCCAATTAAAATAATGGATTCTTCCTCTTATTTGAGAATGGCTGATGTATCCTAGCTGAGTTCACCGCTTCTTGCATTCCCCTTAGCGATACACATAATATTCCTGTTCTATCTCTTGTTCTTATTTTAGGATTTGCCGTGTTTTAGTCACTTTAAGAAGTTGGGCAAAGCTGAAGATTGATGAATGCTCACTGCCCATGAAAAAAAGTAGCAACCCTCCAATGGAAGAAGAGGGCGAAAGCGAGCTTTTTGAAACTGACAAGTTTTATGAGGTTTCCTTGGCGGAGGATACCGAACTCAGTCTTGAAGATGTAGAAGCTTGTTTAAGTCAACTGCCGAAGTCCCATAACAGTCCTCTGTATAATGTCGACTACAACTTAAATTCCCCACTGATCCGCGACCAAGCTGATGCCTTGCTTAGCAAGCTCAGGGGAACTAGGGTAGCTGCTCGATTTGAGCGAAATACAACAATATACAAGCAGTACAAATCGCTCAGCGCCCAAGTCACTGATTGGAAGCTCGTTCAAGCCACAAATGGGTTTCATAAGTGGGCAGCGACCCGCGTTTTCCCTCGGGAAATGTCTACATCCCACTTCTATGAACAGTGGGATACCCGGATGACTGAGATTGTTCTTCCTATGGAGATAGTGACAACTTTCTGGCATGACCTGACAGGGAAGAAGCCTCCGTCCCCAGAATATCTCCTCCGTGCCAAATGGCTTCAGGGAGAGCCACAATATGACTGGCAGAAGAAACTCTTAAGCGAAGGGGAGAACTTCTGGTTCTTCCACATCATCACGCTCATCATGAACTCTAAAGACAAGGAGGAACGAGACAACTTAATTAAACAGGGCGTCTACCTTAACTTGACTTCTCTAAAAATAACATCTACTGCTAAGAAGGACCGGGGTTGCTATTTACTTGAAGGAAGCCATCCAGATTATGGTCGATTTTACGTGGGCCCTGGATGTCTATATCTCAAAAAGGAAGAAAGACTTCTAGACCGAAACATGGTCCTGATGTTGAAAGATACATTAATCGCCAGGTTCTGTTCAAAAATGTGCCTTCTTAATCGTGCTGAATCAGACTCGACCACCTTGGCGACAGAGAAGTTGACAGAGGTCTATCATTTGGGCGACCAGATCTTAAGAGAACTAGATTCCGATGGCTATAAGGCTTTGCGACTCCTTGAGCCTGTCTGCAATCTGCGCTTAGCAGAGCTTGCCGCGGCATATCGGCCTGAGATTCCTGTCTCGCCTCGCTTCAGAGAGTTTTTACTACGTGAAATAGCGGGACAAGAGGAGTTGGCTCCGGGAGTCATCCATAACTTCTTCTCCAGAATTATGACTGAAACCAGCTTTATACAAGTCATCGTCTATTATGGAATCTTCAGACACTGGGGACACCCTTTCATCGATTACTTGGCTGGACTCAATAAACTGCATGAGCAAGTCCAAGCCCCCAAGAAAGTTGACGTTAAATATGCAAACGCCTTAGCCAGTGATCTTGCTTACATTGTCCTGAAGCACGAATTTGATCAGCAAAAGAAGTGGTTTGTGGATCCTGACCAGATGGAGCCAGATGACCCGTTGAGAGACCATGTTCTAAATTGCACCTGGCCAACTCCGGTACAGATAGAGGATGTTGGGGACCGTTGGCATCTTCTTCCTCTCCTTCCTTGCTATGAGGTCCCACAGACGATAGATCCTGCTGTGTTGTATGCTGACAAAAGCCACTCTCCCAACTATGAAGAGATTTACAACCACATCGCATCAGGGACATCAGATCCCATTCCATCGAAGAAAGTGTTAATCACAGCCTTGAGAACGGAACAGAGGAACTTGCGTGAGTTTCTAAAGCTGGTCAATGACCGTGGGCTCCCTCGAGCCTGTCTCGCTATCGGGCTGAAAGGGAAAGAAAGAGAACTAAAGGAAATAGGAAGGTTCTTTTCTTTGATGACATGGGCTCTAAGGGAATATTTTGTCTCTACTGAGTATTTAATCAAAACTTACTTCGTTCCATTATTTGAGGGACTCACTATGGCTGATGATCTGAAAGGAGTAACCCGCAAGATTCTCGACTGCTCCGCTGGCCAGGGGAATAAAAACAGCTGTGATGTAGGGTTCGCCAATCATCTAGACTACGAGAAATGGAACAACCATCAACGGAAGGAATCAACTTCTCCTGTTTTTACCGTCATGGGGCAATTCCTAGGGCTTCCCAAATTAATAGCTAGGACACACGAATTTTTTGAACAAAGTTTTATCTACTACGGAGATCGCCCCGATTTGATGACCATCAAGGATGGAGAAATTGTCAATGTCGATGAAAACCAGAAAGTCTGCTGGAATGGTCAATTGGGAGGACTGGAAGGGCTTCGACAAAAAGGATGGAGCGTACTTAACCTTCTTGTAATCTTGAGAGAATCTAAAATTCGGAACACGAAGGTCAGAGTGCTTGCTCAAGGGGACAATCAAGTAATCTGCACAAAATACAAAATCCCCTCAAATCTTGATGTGAATGCCCATGCAGAAGAGTTGGAGAAGGTATTCACCAATAACATGACCATTATTGACTCGATAACTTTTGGGGCCAACAAGCTAGGATTAATCATCAATAAAAAAGAAACACTGATTGCATCAGACTATCTAACATACAGCAAGGTTCCGGTGTTTCGAGGCAACATCTACCCTCATGAGGTAAAGCGATACTCTCGGGTTACATGTATTCCCAATGATCAAATCCCCACAATCGCCAGTGCAGTGGCCGCGGTAGCAACTAGTTCCTTGACAGTTGCTCAGTTCAGCAATTCTCTCCTAAACCCTATGGCATGTTACTGTCTCTTCGGCACTATGGTCTTATCTATCCATCGATTTCACAGTCCCTTACTCAAAAAGGCCATTCTCGACGGTGCCACAGCGATGGAACGACAATGTTTTATGATAAGGGCTTTGTACCTGGACCCGGTCCTTGGGGGGACCTCTGGAACTTCTCTGACCCGATTCCTCATAAGGCAGTTTCCTGATCCCGTTACAGAATCTCTCAGCTTCTGGAAAAGACTTGGTTTGATCACAGGGAACTCAATCGTCAAACTGATCGCCCTGGAAGCCGGGCACCCCCCACTTGCTTCCAATCAGACTGACAACCTTTCTAAATTGCTTGAAAAACCTATGTCGCTCAACATTCCGAAGGGTCTCAGTGCCACGACTCTCCTCAAAGCAGAAATCAGAAAAGGTCTCACTGACAACCTTGATGAAATTCAGAATGTGATTGTCAGAGAGTCTTTACGGTACCAAAATGCCCAAGAAGCAAATATCAAAAACTTTCTATTGTCCGTTCGCCCCCTGTTCCCTCGATTCTTAAGTGAGTTTTACTCCGCAACTTTCATTGGGATCACAGAAGGAGTTTTAGGATTATTTCAAAATTCCAGAACCATCCGGAACACGCTTTCTCATAGATTCAACAAGCGAGTCAACACCCTTTTGACCCTTAGTGAGGCCCTTTGTGTGAAAACATCATCAAGAGCTGTGTATTGGCAGGGACATACAATGTGGCCTTGTTCAGCTGAGCTGGCAGACAAATTGAGAAAAGATTCTTGGGGGGAAGGCATCGTTGCGACTACGGTTCCTCACCCTTATGAGCTGATCCACTCGTATAAAGAAGGATCAGTTCTTTGCTCTGAATGTCCAAAAGGAATGCCAGAACGAGAACGGGTAACAGTTGACTTCCCTCACGGCTTCCCAACTACCTTCACCGAGCGAGGTCCGCTCTGTGCGTACCTAGGGTCTGCCACCACAGAATCAACCAGCCTTTTTCAACCATGGGAGAAGGAAGTTCGCACTCCCCTGTTAGAGAGGGCAACTCGTCTTCGAGTGGCTGTAAATTGGTTTGTTCGCGTGGGATCCAACCTGTCAAACGCCATCTTCGAAAACCTAAAGGCTCTCACAGGATGGGACTGGTTTGAGATGGAGAATGTATTTTACCGAACCGGCTGCCCTGGGCATAGGTACCGTTCATCACGACAAAGCAATGGGGGTTTCTCAGCTATTAGTCCCAACGGACCCATGTGGGTGATGGTCACAGCAGACACAATGCCCACAATAGGTAAAGACAACTATGATTTCATGTATCAATCTCTCATGCTGTATGCCCAAACTGTGAGCTTGGAGACCAAGCTGGCTGCTCGAAGCAGCGTCAAGTGTTACCACTTTCACATTCAGTGCAAAGGTTGTCTACGAGAACTCAAAGAATTCGAACTCGACACGACACAAACATTACAGCTCCCAGACGTGAGTGAAGTGGTCTCCTCCATGTCAGGGGGCACCATGCCGGATCTCACCACCCTAAAATCCTTGCAAGTTGCAGAGGGAAGCTGGGAGGATCTCACTCCATCTGAAAAATGTTTTCACATTGGAGTGGCACAAGGAGCTCTTTACGGATTTTACTGCGTCGATAATGATGGTAGAAAATCTGACACTGCATTGTTCCCCATCTCTCTGCTTCCCTACTTAGAGCCTCGTGCGTATCTTACTGGAATTTTGAAAGGCGTGTTGATGGCCGCAGCCTATGACACCATTTATCGTCGATTGTCTGTCTTACAACATCGACCCAAGTCAACTCTGCTGAGTGCCGCTTACCATGTCCTCGAATGTCTCTGTAAGGAACCTAGCTTCATCACAGTGTTAAACAAGGAAAGTATCATGGGCCTCCTCACGGACGAGGGTCACCGTGTGACACCGTCTTACCCCTCATCTGGAGTGCATCTGGGGGCAATGGGGCTGGGGTTCCTGAGCAGACATCTTACCAAAAACACACTCGATTTAGATCCTTGGAGAAGCTATTGGCGCCGAGTATGGATCTTTTCTGACTTTAAGTCCCCGAAACTGGTCGCTCTGATGCTGCTGGGTCACGAATTGTGGCTCATGCTCAAAGCAGTTTATGTGCCGAGAGCTCATCTCTCCACAATACGACAGATCAAAGATATCATCCATTATTACTGTGCTTTAGATCTGTCCCTCCACGTGAGTGAAACCCCCGCAGTTCTTAACAAATCGTTTTTGGGCCCTGTACTTAAAGCGGGATCATGGTGCTCTCGTGAGGTCAGGCATGCAACCCAAGCTCTGCCCCTCTACAGACATATTCACCGTCACAAAGAAGAAGACTGGGGTCAAGAGATTTGTGGGGGGCTAAAATCAATTCTACTTGATTATTCTTCGAGACCCACTGACCCAGTTAATGACGTGATCTTGGTCCGTGTAAATGATCCTCTTATATCAGGGCTCAGACCTTTCCAAATGGCCACCGGAGCACACTATAAGTTAAGGTGTCTTTTGAAAATGATTCCGTTTGTCCAAGACTGCATCGTCGGGGGAGATGGATCAGGAGGAATGACAGCTTGTCTGTTGCGAGAATTCAGATCGACGAGATGCATTTTTAATAGCTTGCTGGATCTAAGTGACCGACACCTTAGAGGAGTTGCTCCCAGTCCTCCTTCAGCCATAACTGCCTTGCCTTCTGGGATGAGAAACCGATGCGTCAATCTGCAGACAGCTTGGGAGAATCCTTGTGATCTCCGTGAGGAGGCGACTTGGAGCAACTTTGAGTGGCTAATTAGGATGAATCACCTCACCGTGAACCTCATCGTGATGGATATGGAGGTGGTAGACGAGTTGTCCATTCAGCGAATTGTGACGAATCTCCGCGAGTGGATCCACAAACTAATGAAGCCGAATGGGTGTCTTATATTCAAGCTGTACGGGACTCGAGAACAAGCACTCAATGGTCAGACTCTCTCTCTTCTTGGAAGCCTCTTCAAACAAACTCATGGGGCCCAAACCCAATTCAGCAGCTTTGGAACCTCTGAGTTCTATCTGGTTGGTGTTGGACTCATTGAAGGGAAGATTCTGGCTCCATACATTGAAACCAACTCTCTCAGAGAATTACTGGACTCCCTTGGGGCTGCAAAACATCCCAAAGAGGAGTTCAACAGAGCCCTATCCATTTCACCGAAAGACATGTGGATGGGAGTACCTCGCCAAATGCGACCCGATCCGGTTGTGGAATTCCTGGGCCTCTTTTCTTCTCTCGGATTGGAGACGGGAGTGGCTTCTGATCTCGCATTCACTATTCAAGCGCAGATCCAGAAGGGGGTCAGAAGAGATGGTTTGGTTCTAACCGTGTTGATTTTGCTCTCCAATGCAATTCTGCCCATTACCAGATGGATGCATCTCCCCATTGCTCCTCCTTCTGACCAACGACTTCAAAAACTCCTAAGTGGGTTCATGGGGTGTTGGGAGTTTTTGGCGTGGAGTTACTCAGCTTATGGAATCCACGAAAAGCTTCAATCCAAAATGTATCGCTCCATCACCTTCTGGTATCGAGCCAATCCTAGAAAGGTAGGGAAATCCAAAGGTCACTGCCTGGAATGGAGTTTCACTCCCATGCCTTGGCCCTTCAAACAGCTTCCCAAACTGGAACATCATGCCACCATTGGTCAGGTGATAAGAGTCTTTTCTTATTTTTGGCCGACTCGTGAAACAGCTCCTTTCTCAAGTTATAAACAACTTATGTTTTTGTTAAGAATTCATCTACGTAGCTTTAACAGAGGTCTTCGCCCAGAAGATGTGTTGTCTCACACCGGGCTATTTGAACCAGTCCTGGGGCCAAGACTCATTGAGGACTATCCTTGGATGGGAACAGTAGGGGGCAGGAAGTTCCGATTCCTCCCGGGGGATTTAGCTGCTGAGGAAGTGATGCACACATGGGAGGACTGAGTACATGAAAAAAAGTAGCTAATGTAGGATTGTGGGGGATTTAGA
| 63,169
|
ON391055.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-WZS7-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,968
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-WZS7-2020, complete genome
|
CACTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCAAGAGAGTCACTCCTTTTTTCTTTATCTCTTGCCACTGGGCTGGTTAATGGCACAGGTGTGGGACGGATTAATCCCTCCGTGACCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCTAGTCCAGTGGGCCCCCAAGGATTGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTGCCGGGACGGAACTCCCGGAGACTAGGTTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTAACCTAGTCTGGGCATGCCCACAGGGATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGTGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTTTTTTCAAATCAAATTCAAAAGGAAACTCTAAGCTTTTTTACCGCATGGTTTTCCATGCTGTTTTGTGTGAATGTGTGTATGTGTGTTGGGAATGGACGGCCTAGAGGCCGTGTTGTGAAGGGTGTGTATGTGGTGCATCCTAAGAAGACTGTGGACCAAGGTGTGCGTAGGAAACGTAGGCCCCGACGCGACCTGGGTGGCTGGAGGAGGTCAGCAATTGGCCCCATGGATCCTTATTTCCGGACAGCCGTCCAGGCCATTGCACCCAGTCCCGCCTACCCGTCTAGAGATCCCAGGAGACAATCTAGGTTTCTTGGTCACGTCATCGACGGCACACTGGGCTGGGTTACTGATGTGGTCCATCATGTGCCTCTCGTTGGTCCTTTGGTTGGTCACCCGCTGAGGATGGTGTGTAGGGTTGTAAGGTCCGGCGAGAACGCTATCAATTCCCTCACTGGCACTGTAGGTGTACATTTGTTTATTGTAGTCCTTCTATCCTGTCTGTGTCCTGCTACGGCAGTTTCCAATTGTTGCACTCCTGATCAAGTAGTATATTGCACTGAAGTAACCTGCGTCCATGAGACAGGTTGCATAATTTGTGAACAAAAGGATGACCAGGTGATATGTTGGTCTCCAGCTGGTCTACTGGTGTCTCATCCCCCTAACTACACAGGGATAGACCCATTTTTAACCCAACATATAGACTTTGTTGCTGGTACCACGTTCATCTGTGATTTGACCGGCATGCGGGAGGTATGTGGCGTGGCTGTGTTGTTATCCGCTACAGCCTTGGAACTTCTGCCCCGGCCAGTTAAGCTGAACACAACTGCAGATTGCTACTTGTTTATAGATTCAGGAGTTGATCCTCTTTTTGCTTCCTTCTTTACCTGGTTGGCTGAGGAATTTTCTACCATCACCGCCATACTTGACTTTATATCTAAGGTTCCTAGTGCTTTGGCTCATGCTTTCACTCGCAGTCATTTTCTTACAATGTGTAGCATTGCTGGATTGGCCCTTAATGGTAACATGGCTAAGGCTTTCGCTCTGGTTGTTTTGTACATAGAGGCGGCTGCTGCTGCTCCTATGTCTGTGGAGTCGTTAAAGTACCCGGAGCTGGGAGCTGGTTGCCCTTTGTTAAGCCGCCCTCCGAGGTGTGCGAATAGAACATCATTTGGGTCAACAATATATTGTTTCCACCCAAAATTTGGGTTCCAGCAATCTTCTCAAGGATGGCCTCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCTGGTGCTGCAACTATTAATAATTACACTAATTTGGCTTGCTGTACTCTTAGAGTCACCCCAGCATTTTGTCACAATTGCAGCTCAGATTGCAGTTGGGCGGACAAGAGACAGACTTTCGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTCTCGACTGCCTGTAGCCCTTCCGCCATAAGTGCTTTAGCCTCTGTGCTGCCCACCATAGCGCCGAGGCTGCCAAACCAGACTTGCATGCCCACTGTTGTAGCGGGGTTGTCAATCGGGCCACTAAAATCTCCTGGTCCGGCGAGTTACGTCAGCTTAGTACATGGGAGCTGGATAACTTACCATTACTACCCCCATAGATTGGCAAAGTTAGATTACAAACATTGGGCAAGACTTCCAGGAACCCCCCCTACATATCGGGGCTCTTGGATGACGGTCCCCAAGGGAATGTATAGCTCTAGGAAAGACATCTCCAGTGGCTTGGTCATCAAAGATAGGGCCAATCAAGACTATCAACTGCTCTTTTCCGGTGTTGGGACCTACATCATACCTGGAATTACAGAGCACGTGGTGATCATTGCTTTGTTAGCTGCATTTGGTGCCCGCTGGTGTTTGTTTCTCTATGCCATGTACAATTGGTTACCTGGAGCTTTTGCCTTCACCCCTGAGGTGATCGCGGCTACGGCGGCTTCACCGTGGGAAAACCCTGTAGTCAGAGCTGGAGTGTACTTTGCTTCCTTGTGGCGCTCCCCTCTTTCTATCCCACTCTGCGGGAATCTGGTTTCATTTTGTTTGCTATCCTTTTCTCATTATGCTCAGGCCTTTTCCACATCTGATATCCTATTTGCTGCTGGCTCTGTGACTCTATTTACTGCCTGGGCTGGGCTGTTTTCCCGCTTCATTCCCATGCTGTTGCTTACCCAATCCTACTTGCGTGTGAGGTTGGAGGCTTATACACGCTCTTGGCTTGATCGCTCCTTGTTGTTTGTGTGTGTGATTGTTATACCTCATGCTGTGTGGGATGTGTGTTTGGTCCTGTGGATCTGCTGGCTCCTGCTTGTAGTGGGAGGTCAGCTTGTCGTGTGTCTGTGGGGCCCAAAGAACAAGACTAGTTTGTACTTGTTGTTGACTAGGCTCAGGAAATGTGGATCCTGGTTTGCTAAGTTTGCGCGGCCCATTGTCATCTGGGCTGCCGGTGAGAATGGTGTGTTTTGGTTCGACCACATTGATGGAAGCTTGGACGGAGATTGGGAGTTCAAAGATCCCTATTTCCCGTTCCAAACGGAGGTTGAGGTGGCCCAAGACGTGGGACATAGGCTGGCATGCGGAGACCAGATTCGTGGCTTGCCTGTGTACGCGCGTTGTGGGTCTACCGTACGGGCAGGAATAGCACAGCTGCCCAGAGGTTGGAAGCGAACCATTCCATTTTCAGCAAAGATTACTAGCCAGAGGAATCAACTCAAAGCTCTGGCTTTGTGCTTGACCGGGGGTGACAGCAGCAGCTACCAAGGAACTGTAGCGGTTATAGGAACCCCCTTAAGATCCTGGATGGGTTTTGGTTGTTTGGGGTCTTTGTACACAGTCTATCACGGGGCCAGGACAAGATTGTTGGCGTCTCGAGATGGGCCTAGACCCCCCACCCTTGTCAATGCACAGGTTGATTTGGTCAAGTACCCACTGCCATCTGGTATGGAATGCCTAGACATCTGTGACTGCAATTGCACTGAGTTCTATTTGGTCACGCGATTAGGAAACTTGATCCCCTGCGTCCAGGTAGAGGGGAGGTTCTGTAACACAGCGCCTCTCACTCTGGCCGAGGCTAAGGGGAGTTCAGGAGCCCCGATTGTGTGTAAGTGTAAAAAGGTTAAGGCTATGTTCCTGTCATGCCGGAGCAGCCGCGGAGTCGTGAGCAGCTTTGGCGTGCACATGGTACAAAAGGACCAGGTGGCTGACAGTAGAGTGCTACCCTGTGGCGAGTTGGTTCCTCCCAATGTCCCCAGGAAAGGGCAGAAGAAAGTGGAGCGTTTGGTCGCCCCGACTGGGAGTGGGAAGACAACCAAATTGCCTATGAAGTACTACAGTGATGGCTACAGTGTGTTAGTGCTCAATCCGAGCGTAGCAACAACACGCTCGGTGGGGGAATATATGAAAACCGCCCACAAGGTAAATCCAAATATTAGAACTGGTGATGGGTGTATCAATAATGGGAGTCGACTTACATATAGTACATATGGCATGTTCTTGACGCAGCCCACGTTTCAGGACGACGTGATCATCTGCGACGAGGTACATGCGGTTGACCCCACAACCATATTGGGTATAGGTGCAGCTTTGGCTGCCTTTCAAAGTTCTGCTAAGGCTAAGTTACTCATCCTAGCTACAGCCACTCCCCCAGGAACGCCCATAACACCCCACCCCAATGTGACCACACAGGATTTGACCGAGGAAGGCGATATCCCTTTCCATGGAAGAAAAATCAAATTGGACAATCTAAAGAAAGGTAGACACCTGATTTTCACTCCTGGGAAAAAGCACTGTGACGCTATGGCAAGGGACCTAAACGACTTGGGGCTCAATGCCGTTGCGTACTACAGGGGTAAGGACGCTGGTGTCATTCCAAGGGAAGGCGACGTTGTCGTTGTCGCGACTGACGCCTTAATGACTGGTTACACTGGAAATTTTGATTCGGTCTATGACAGTTGCCTCCAAGTTGAAGCCCACTACGAATTGAACATGAACCCAACATTTTCACTATCAATTAGGACAAAAAATGCAGACGCGGTTACGCGGATGCAACGTAGGGGCCGGACCGGCAGGGGTAAACAAGGAACATATTACCAAGTAACACCACATTGCGCCACACATGGCATAGTTCCAACAGCTAATGTCATTGAGGCGTTTGATTCCGGATTGGCTTATTATGGTATGACTCCTGCAGAGGTAACCAAATTTCTCTCCTACTACAAAGAAGAATCAATGACTGCCGCATTCGACTGTAACATCCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTCATGACCCTCGGGTTCGTAGAACCCGCCATCCTAGAAAGGATGAAAAAGGAGGCAGAGAACTACACCTATCTGTATGCCGCACAGTACTCAGAGGCACAAGCTTGCGGCGCACAAGCCCCAAATGATAATAAAATTTGGAGGGGCTTGAAAGGGACAGCCCCCTTCCCCATCCTTTATGATCTGGAGGAGTATGATAACAGCCGCTGTCAAGGGTCCTCGAGAGCCGAGAGGATAGCGTCTTGTTTTCAGGAATACTTCTCTAACGGCCTTGTGACCTTGGCCGGAGTAGGACTGGCTGCTGCAGCAGTATTTACAGCCATTGACCTACTTGGGAATGTGTGCATAAAAAGGGTGTATGCATTCACGACCGACTCCTCAGCAGCACGTATAATTACACCAGGGGAACCGGACCCGACGGAGGCCTTGGAAGAGTGCTATAATTGGGATGGTTTTGCTGAGAGTGTCCAACGAGCTTCACATTGGCTGGCAGATAAGCTCGTTGAGGTCGGCCGAGCGGGAGGAGGAAAGCTGCGCTATGAAAGGTGGGCAGTTGATCACGTCCCACATGTCCTCGCCGCAATCCAATATTTTGCAGGGCTCACGTGTCTCCAGGATGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGTTTCGTGGGAGGGGTTCTTAGCCCTCTCCCACTGAAAGCCAACCTATTCCTTACTGCTTTAGGTGGCGCTTTTGCAACAAAGTTGACTACACAGCGTGGAGCAGCTGTGTTCGCCTTGGCGGGGGCTTTGGGGGCCACAACTGGCTCTCTGAGTCTCGGTAAGGTGGCTGTTAATGCGGCAGCCACTTACGGGGCAGCCACGGCTACATGTTTAGTGGTTCTCAAACTCATAGATGGTCAGATGCCCGAGATGAGTGAGCTGGCTTCGTTGGCGTTCAACCTGGCAAGCCCCGGTGCATGCATTGTAGGGGCAGGGTCCGCTCTGCTCATTGCATACTGCACTCGTACCGAGTCCCAGGTGTGGATGAATAGGTTGTTAGCCATGCTCCATCGGGGTACTAGTTGTGAGGACTACTTTGTTGCATCAACTACCTTGAGAACTAACATCATCAAGGTTTTGGAGCAAGCCAATTTGTGGGCCGTTTTTAAATGGCTCGCTAGCTGGCTTAATTCGCAGGACGAGGATCTGTGTACACCTAGAGGTGCGTTTATGGATTTCTTCCACTCAGTGGGACAGGTCCTTAGACTCATCGTCGAGGCTGTGCGCGGCTTCCTTGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTGAACTGTGACAGGGGGTACAGTGGCCTATGGGCTGGGTCTGGAATAGTCACATCCACGTGTGGGTGTGGGGCTGAAACGGTCTGGAATGTTCTAGAAGGGAAAGCTCATTGGGTAGCAGGGCCTCGGACCTGTTCATCTTGGTGGACCGGTCGAGTGCCTGTTAACAACTCCATGGTTGGCTGCCCACGGCCACGACCAGCCAGTTGGACCACAATGGCTGTCAACACAGGATTTAACTCTTATGTAACTTATGAGAGAAGAGGGGAGGACGTTTACGTCACCGGGATCTCCTCCCCAGCACAGGTGGTTGAAGCGGCAGTCCCTGACCTGATCAGTGCAGTAGCTGTAGATGGTGTCCAGGTCAAACCCTTTGGAGGAACTGGATGGAAAAAGGTTGGGAAATTTGACTGTCGATTCAGGAGAGGTGATAAGACAACAGACCTTAAGTTACCCTTCAAACTAGAACCTTGTAGGGAGCCCTACCGCGAGGTGGGGTGTCCTTTGCCGGACACCCTTCGGCAAGTGTCTCTAACCGAGCGGGTGATGAGCTTGGGCAAGGCGCAGCCTCCCCCCAAGCCAAAACCTGCTGGTTCCTATGACGGCACTCCAGCGGTGAAGAAGCCTACTGTCTATGATTCAGGCAGTGACATCGAATCCCCTGGAGACCTGATGAGGCAATTGTCTAAGGGCTACGGCAAGCTCAAAGAACTAGAAAAAGACCTCCCAAAACCTGTAGAAAGGTCAGATCCCTTGGAGGTTATCGAGGTGGCGTCCGACGACGACTCTTCCTCTGATGCCCCCATAGTGGCAGGCAAACCACAAAAACCACGCAAAGCGGGTAAAGTTATAGTCACCAAGGCCCTTCTGAACCCGCGTGCTCCATCTTTCGTGCCCAAAAAGGTGAAGCTGGCTAAGGGAGCTATCCCTCTGCCATGCATCCCACGGAAAGGTGAGACAAAAAGTGTGGAAGCCTATTCTTTGTTGTCCTCAAGTTGGGAGACCGCAAGCAGTAACGATTCGGCCTGTTCCTCTTGGTCATATGATTGGTCTTTGCCCAAATTAGTATACAAAGGATTCAAGAGAACAATATCAGCAGTCTCCACATACACATTTGGAATCATGAGGTACAAACCATTGGTGTACACTACAGACCCAAGTTCCATCAATGAGAGAATTAGGAAAGTTACCATAGAAAGGTCGCGCACTGAGTTTCCTGAGCTTAGGCGCGAAATCCAAAAGGCTAAGCAGAAAGTGAGGGACCTGAACCTAAGAGAGCTAGAATTAGAAGAAGCTCTGGCGCTAACGCCGAATAAGACGGCGAAAAGTGCTATCACTGGCGCCACTGGGAAGTCAATTAAGACACACCCAGCAGTTGTTCGGGAAGTTTACGATCTGCTGTCAAAGGGTGAGATTAGTAGGCCATGGAATGAGGTTAACATTATGCCAAAATCAGAGATATTTGTTTTGTCCCCAGATAAGCCTACAAAGAAACCCGCCCGCATTATAGCTTACCCTCACCTTGAAATGCGGGTGGTGGAGAAGATGGTCCTGGGAGAAATTGGGCCTACAGTGGTAAAGACTGTGTGCGGGCAAGCATACGGTTTTCTATCACCCCAGGAACGAGTTCAGAGACTGGTGTCCATGTGGAACTCCAAGGATGCTCCTTGTGGCTTCACGTGTGATACCACGTGCTTTGACTCTACCATCACACCAGAAGATATAGCAGCCGAATGTGAAATTTATGAGGCTGCTACCGCTGACCCCCAAACCAAAGCCAGAATTAGAACTCTCCACACTAATTTGTATCAGGGGGGTCCTATGATGATGCAAGGAACCTATGTAGGTGAGCGTCACTGTAGGGCTAGCGGTGTTTTTACTACTTCATCTTCCAATACTCTGACATGTTATCTCAAAGTATCAGCTGCAGCTAAGAAGGCTGGAATAAAAGATCCCAGCTTTTTAATAGCAGGGGATGATTGTGTCTGCATATTTGAGTCAGAAATGGACATGGACAAGAAACGGTTGGGCTTGTTCACGACCTACATGAAGCAGATGGGGGCACCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTACTATCATTTAGAACTGTTAGATAGCTGCTCTTCTAATGTGTCGCTGGCACAGACAACCAGCGGTCAATTCCACTATTCCACCAGAGATCCCAAGACTCCCTTGGGCAGGATTAGTGTAGAGGGCAAGGGGTTTAACCCTCTTGGCAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAATTATCCCGCTATTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTTTTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACATTAAAAACAATTACTTTTGATTGGTATGGAAATAATTACACAGTTCCTGTAGTTAAGATTCCCTATATAATAGAAGCCATACATGGGAAACCGTGTTGGCATATAAGGCAATATACAAGTAGGGAAGTTAATAGAACTAATCAGGCTTTAAAAGATTTGACAATTAGGCCTTTAAGATTTTATAAACGTGCGGCACGTCAAGTAGTGGCTCTGTGTAGGGCTCGGGGTGGTACCCTGAGATTCCTCGCAGACACTCTGCTAGCGTGGGTGCACGGCAGGACTGTGACGCTCGAGCCTAGAAAAGTTAGACAGGCTAGGGCTTTTAAATTTTGGGAGCCTTATGAACAAAATTTTGATGAAGATCCAATTGGTTTAAAAATAAATTGGCTGCTTATAGCAGCACTAATTGGCTCCATAATGTTAATTTGGTTTAAAGGTTAAATTTTAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCCCGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGTGGCTGGCACCAGAACCGTCTCGGGGTGCTGGCCTACTCCCCCTTCCGGCTTCGGGGCTTGGCAACCCCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAGGCG
| 26,719
|
ON391056.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-WZS6-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,959
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-WZS6-2020, complete genome
|
CTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCGAGAGAGTCACTCCTTTTCTTTTATCTCTCGCCACTGGGCTGGTTAATGGCACAGGTGTGGGACAGACTTAGTCTCTCCGTGACCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCTGGCTCAGTGGGCCCCCAAGGATTGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTGCCGGGACGGAACTCCCGGGGCTAGGATTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTAACCTAGTTTGGGCATGCCCACAGGAATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGCGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTTCTTTTAAACTCAAAAGGTAACTTTAAGTCTTGTACCGCATGGTTCGCCATGCTGTTTTGTATGAATGTGTGTATGCATGTGGGGAATGGTCGGCCGAGAGGCCGTGTGGTTAAAGGTGTGTATGTGGTTCACCCTAAGAAGACTGTGGACCAAGGTGTGCGGAGGAAGCGTAGGCCCCGACGCGACTTGGGTGGCTGGAGGAGGTCTGCTATAGGCCCCATGGATCCTTACTTCCGGACCGCCGTCCAAGCCATAGCACCCAGCCCCGCCTACCCGTCTCGTGACCCCAGGAGACAATCTAGGTTCCTTGGGCATGTCATAGATGGCACACTGGGTTGGGTGACAGATGTGGTCCACCATGTACCTCTCGTCGGGCCTTTGGTTGGCCACCCATTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTAAGGTCTGGTGAGAATGCTATCAATTCCCTTACTGGTACTGTTGGTGTACATTTGTTTGTCTTAGCACTTTTGTCTTGTCTTTGTCCTGCTTCTGCAGTTTCCAATTGTTGTACTCCTGATCAGGTGGTTTACTGCACTGAGGTCACCTGCGTCCATGAGACTGGATGCATAATATGTGAACAAAAGGATGACCAGGTGATATGTTGGACGCCGGCCGGTCTATTGGTGTCTCATCCCCCTAATTACACGGGAATAGACCCTTTTTTAACCCAACATATAGACTTTGTGGCTGGTACGACATTCATCTGTGATCTGACCGGTATGCGGGAGGTGTGTGGCGTAGCAGTGCTCTTGTCCGCTACAGCCTTGGAACTTCTGCCCCGGCCAGTTAAATTGAACACAACTGCAGATTGCTACCTGTTTATAGACTCAGGAGTTGATCCTCTTTTTGCTTCCTTCTTTACCTGGTTGGCTGAGGAATTTTCTACTATAACAGCTATTCTTGACTTCATTTCTAAGGTTCCTAGTGCGTTGGCTCATGCCTTCACACGCAGTCACTTTCTCACTATGTGTAGTATAGCTGGATTGGCCCTTAATGGTAACATGGCAAAAGCTTTCGCTCTGGTGGTGCTGTACATAGAGGCTGCCGCGGCAGCACCTATGAGTGTCCAGTCGTTAATGTACCCAGAGTTGGGGGCTGGATGCCCATTGCTGAGTCGCCCCCCGAGGTGTAACAACAGAACCTCGTTTGGCTCGACAATATATTGTTTCCACCCAAAATTCGGCTTTCAACAATCCAGTCGAGGATGGCCGCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGTGCTGCAACTATTAACAGTTATACTAATTTGGCCTGTTGTACATTGAGAGTCACCCCGGCTTTCTGTCATAATTGCAGCTCCGACTGCAGCTGGGCAGACAAAAGACAGACCTTTGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTCTCAACGGCCTGTGCTCCCAATGCTATTGCTGCCCTTGCCTCGGTTCTACCCTCCATAGGACCGAGGTTGCCCAACCAGACATGTATGCCCACTGTTGTAGCAGGGTTGTCAATAGGGCCACTGAAATCTCCTGGCCCCGCTAGTTATGTCAGCTTGGTACATGGGAGCTGGCTTACCTACCATTACTACCCTGAAAGATTGGCAAAGTTAGATTACAAACATTGGGCTAGATTGCCTGGGACCCCGCCTACCTATAGGGGGTCTTGGATGACAGTCCCCAAGGGAATGTATAGCTCCAGGAAAGATATCTCCAGCGGGTTGGTCATTAAGGATAGAGCCAATCAAGACTATCAACTGCTCTTCTCTGGTGTGGGGACCTATATTATACCAGGGATCACAGAGCACGTAGTGATCATAGCTTTATTAGCTGCTTTTGGAGCACGCTGGTGTTTGTTTCTGTATGCCATGTACAACTGGTTGCCTGGAGCTTTTGCTTTCACCCCTGAGGTGATAGCTGCCACGGCGTCGTCTCCGTGGGAGGACCCTGTGGTTAGAGCTGGAGTCTACTTCGCTTCCTTGTGGCGCTCCCCTCTTTCTATCCCACTCAGCGGGAATCTAGTCTCATTTTCTTTGTTGGCATTCTGCCATGGTGTCCAGGCTTTTTCCACATCTGACATCCTGTTTGCTGCTGGTTCGGTGACTTTATTTACTGCTTGGGCTGGACTTTTTTCTCGCTTTCTCCCTATGCTGTTGCTAACCCAATCCTATCTCCGCGTGAGGTTGGAAGCTTTTACTCGATCTTGGCTTGACCGCTCCTTGTTGTTTGTTTGTGTGATTGTGATACCTCATGCTGTTTGGGATGTGTGTTTGGTCCTATGGGTCTGCTGGCTTCTGTTAGTAGTTGGAGGACAGCTCGTTGTTAGTTTGTGGGGCCCTAAGGACAAAGCAAGCTTGCATTTGCTGCTTGCAAGACTCAGGAAATGTGGATCCTGGTTGTCAAGGAAATTGCGGCCTTTAGCAATCTGGGCCGCAGGAGAGAATGGTGTGTTCTGGTTTGACCATATAGATGGAAGCTTGGAGGGAGATTGGGAATTCAAGGATCCCTATTTCCCTTTCCAGACGGAGATTGAGGTGGCCCAGGACGTTGGGCATCGGCTGGCGTGCGGGGATCAGATCCGCGGACTGCCGGTTTATGCTCGTTGCGGGTCCACCGTGAGGGCAGGAATAGCACAGCTGCCCAGAGGATGGAAAAGAACGATACCCTTCTCTGCAAAAATTACCAGCCAGCGTAATCAGTTAAAGGCGTTGGCTTTATGCTTGACTGGGGGTGACAGCAGCAGCTACCAAGGAACTGTGGCGGTTATAGGCACCCCCCTGAGATCCTGGATGGGGTTTGGTTGTTTGGGGTCTTTGTACACAGTCTACCACGGGGCTAGAACAAGATTGCTTGCGTCTCGTGATGGACCTAGGCCTCCCACCCTAGTCAATGCCCAGGTTGATTTGGTCAAGTATCCACTACCATCTGGTTTTGAGTGTTTGGATGTATGTGACTGTAACTGCACTGAATTCTATTTGGTCACGCGGTTGGGGAACCTGATACCCTGCGTTCAGGTTGAGGGGAGGTTCTGTAACACGGCTCCTCTTACCTTAGCTGAGGCAAAGGGTAGTTCCGGTGCCCCAATTGTGTGTAAGTGTAGGAAAGTTAAGGCTATGTTTCTATCATGTCGCAGCAGCCGTGGAGTTGTCAGCAGCTTCGGCGTGCACATGATACAAAAGGACCAGGTGGCTGATTCTAGAGTGCTGCCCTGTGGCGAATTGGTACCTCCCAATGTTCCTAGAAAGGGGCAGAAGAAAGTGGAGCGGCTTGTGGCCCCTACTGGGAGCGGGAAGACTACCAAGTTGCCTATGAAGTACTACAGTGATGGCTACAGTGTGCTAGTGCTCAACCCGAGTGTAGCAACAACACGCTCGGTGGGGGAATATATGAAAACCGCACACAAGGTAAATCCAAATATCAGAACTGGTGATGGGTGTATCAACAATGGGAGTCGACTGACTTATAGTACATATGGTATGTTCCTCACACAGCCCACATTTCAAGACGATGTGATCATCTGTGATGAGGTGCACGCAGTTGACCCCACAACAATATTGGGCATAGGCGCTGCTCTCGCAGCTTTCCAAAGTTCTGCTAAGGCTAAGCTACTCATCCTAGCCACAGCCACTCCCCCAGGAACGCCCATAACACCTCACCCCAATGTAACCACCAAGGATTTGACCGATGAGGGCGATTTCCCTTTTCATGGTAGGAAAATAAAACTAGACAATTTGAAAAAGGGACGACACCTAATCTTCACTCCTGGGAAAAAGCATTGTGATGCCATGGCAAGAGACCTCAATGACCTTAATATCAATGCTGTGGCTTACTACAGGGGAAAGGATGCAGGTGTCATACCAAGAGAAGGTGATGTGGTAGTTGTTGCCACTGACGCCCTAATGACAGGTTACACTGGCAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGCCTGCAAGTTGAGGCCCACTATGAATTGAATATGAACCCAACATTTTCTCTTTCAATTAGGACTAAAAATGCAGACGCGGTTACGCGAATGCAACGTAGGGGCCGTACAGGCAGGGGGAAACAAGGCACGTATTATCAAGTAACACCACATTGCGCCACGCATGGCATAGTACCAACAGCTAATGTCATCGAGGCGTTTGATTCCGGATTGGCATATTACGGCATGACCCCTGCAGAGGTAACAAAATTTCTCTCCTTTTACAAAGAAGAATCAATGACAGCCGCATTCGACTGTAACATCCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTCATGACGCTCGGGTTTGTAGAACCCGCCATCCTAGAACGGATGAAAAAGGAAGCTGAAAACTACACCTATTTGTATGCTGCACAATACTCTGAGGCACAGGCGTGCGGCGCACAGGCCCCCAATGATAACAAGATTTGGCGGGGCCTGAAAGGGACTGCTCCTTTCCCCATCCTTTATGACTTGGAGGAGTACGACAACAGTCGCTGTCAAGGGTCTTCACGGGCTGAGAGGATAGCGTCTTGTTTCCAGGAGTACTTTTCCAATGGCCTGGTCACTCTGGCTGGGATAGGTCTAGCAACAGCAGCCGTATTTACGGCCATAGACCTACTTGGGAACGTGTGTATTAAAAGGGTATACACGTTCACTACCGACTCCTCAGCAGCACGAGTAATAACTCCGGGCGACCCTGACCCCACGGAAGCTCTGGAAGAGTGCTACAATTGGGATGGTTTTGCTGAGAATGTCCAACGAGCTTCACATTGGCTGGCTGATAAGCTCGTTGAGGTCGGTAGAGCAGGGGGAGGCAAGTCTCCCTATGAGAGATGGGCAGTAGATCATGTGCCCCATGTTCTCGCTGCTATACAGTATTTTGCAGGGCTCACGTGTCTGCAAGACGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGATTTGTGGGGGGAGTATTGAGTCCACTGCCCCTCAAGGCCAACCTATTCCTTACTGCATTAGGTGGCGCTTTTGCAACAAAACTCACCACACAGCGAGGAGCAGCTGTGTTTGCCCTGGCAGGGGCTTTGGGGGCCACAACTGGTTCTCTGAGTCTCGGTAAGGTAGCTGTTAATGCGGCAGCTACATATGGGGCTGCCACGGCAACTTGTTTGGTAGTTCTCAAGCTCATAGATGGTCAGATGCCCGATATGAGTGAGCTGGCTTCGTTGGCATTCAACCTTGCAAGCCCCGGTGCATGTATTGTGGGAGCAGGGTCCGCTCTGCTCATCGCGTACTGTACTCGGACCGAGTCTCAGGTTTGGATGAATCGATTGTTGGCCATGCTCCATCGGGGAACTAGCTGTGAGGACTATTTTGTTGCATCCACTACATTGAGGACCAACATCATCAAGGTTCTCGAGCAGGCAAACTTGTGGGCTGTTTTTAAATGGCTCGCGAGTTGGCTCAATTCGCAGGACGAGGATCTGTGCACTCCTCGAGGTGCGTTTATGGACTTCTTCCACTCTGTGGGACAGGTTCTAAGACTCATCGTCGAGGCCGTGCGCGGCTTTCTCGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTGAACTGTGACAGGGGGTACAGTGGTCTATGGGCTGGGTCTGGAATAGTCACATCCACATGTGGGTGTGGAGCCGAAACGGTTTGGAATGTTCTAGAAGGGAAAGCCCATTGGGTAGCAGGGCCCCGCACTTGTTCATCTTGGTGGACGGGTAGGGTGCCCGTAAACAACTCCATGGTTGGCTGCCCACGACCACGACCAGCCAGTTGGACCACAATGGCTGTCAACACAGGATTCAACTCATATGTGACTTATGAGAGACGGGGAGAGGACGTATATGTCACCGGGATCTCCTCCCCTGCCCAGGTAGTTGAGGCTGCAGTCCCCGACCTGATCAGCGCGGTCGCTGTAGATGGAGTCCAGGTTAAGCCCTTTGGTGGAACAGGTTGGAAAAAGGTTGGGAAATTTGACTGCCGCTTCAGGAGAGGTGATAAAACCACAGACCTTAAGTTACCCTTCAAATTGGAGCCTTGTAGGGAACCTTACCGTGAGGTTGGGTGTCCTTTACCAGATACTCTAAGGCAGGTGTCTCTGACCGAGTGGGTCATGAGCTTGGGCAAGGCTGCACCGCCGCCCAGGCCAAAACCAGCAGGTTCTTTTGACGGAATGCCGGCGGTCAAGAAGCCTACCATTTACGATTCTGGTAGTGACATCGAGTCGCCGGGAGACCTGATGAGACAGTTGTCTAAGGGTTATGGGAAGCTCAAAGAGTTGGAAAAAGACCTCCCTAAACCTGTGGAACGGTCAGATCCCCTTGAGGTAATAGAGGTCGCCTCGGATGACGAGTCTTCCTCTGATGCCCCATTGGTTAAGGACCAACCACAAAAACCACGCAAAGCGGGAAAAGTCATTGTCACCAAAGCCCTTTTGAACCCGCGTGCCCCCTCATTTGTCCCAAAGAAAGTTAAATTGGCCAAGGGAGCTGTCCCGCTACCTTGTGTGGCGCGGAAGGGGGAGACCAAAAGCGTGGAAGCCTATTCATTGTTGTCCTCTAGTTGGGAGACTGCTAGCAGTAACGATTCAGCCTGTTCTTCTTGGTCATATAATTGGTCCCTGCCAAAATTAGTTTATAAAGGATTCAAGAGAACAATTTCAGCAGTTTCCACTTACACATTTGGCATAATGAGGTACAAACCGTTGGTGTATACAACTGACCCAAGTTCCATCAACGAGAGAATTAGGAAAGTTACAATTGAAAGGACACGCACTGAGTTTCCTGAGCTCAGGCGTGAGATCCAAAAAGCCAAACAGAAAGTGAGGGACCTGAACCTAAGAGAGCTTGAATTGGATGAAGCTCTGGCGCTAACGCCCAATAAAACGGCGAAGAGTGCTATCACAGGCGCCACTGGGAAGTCGGTGAAGACCCACCCAGCAGTGGTTCGGGAAGTGTATGATCTGTTGTCACAAGGGAAAATAGAAAGGCCATGGAATGAGGTGAACATAATGCCTAAATCTGAGATTTTTGTTTTGTCACCAGAAAAGCCTACAAAGAAGCCCGCTCGCATCATTGCATACCCTCACCTTGAGATGCGAGTGGTGGAGAAAATGGTTCTGGGGGAAATTGGCCCTACGGTAGTGAAGACTGTGTGCGGACAAGCATATGGTTTCCTATCCCCCCAGGAGAGAGTGCAGAGACTGGTGTCGATGTGGAACTCCAAGGACGCTCCTTGTGGATTCACGTGTGATACCACGTGCTTTGACTCTACCATAACACCTGAAGACATTGCGGCCGAGTGTGAGATCTATGAAGCCGCCACCACAAACCCTGATACGAAAGCTAGGATTAGAACTCTCCACACTAATCTGTACCAGGGAGGCCCCATGGTGATGCAAGGAACCTACGTAGGTGAGCGTCATTGTAGGGCTAGTGGTGTCTTTACAACTTCATCTTCAAACACCTTGACATGTTATCTCAAAGTTTCTGCAGCAGCTAGGAAAGCTGGGATAAAAGACCCCAGTTTCTTAATAGCAGGGGACGATTGTGTCTGCATCTTTGAATCAGAAATGGGTAGAGACAAAGATCGGTTGGGCTTGTTCACTACCTACATGAAGCAGATGGGGGCGCCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTACTATCATCTTGAATTGTTAGATAGCTGCTCATCTAATGTGTCGCTGGCACAAACTACCAGCGGCCAATTCCACTATTCGACAAGGGATCCAAAAACACCGTTAGGTCGAATTAGTGTTGAGGGAAAGGGGTTCAACCCTCTAGGCAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAACTACCCCGCTGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTTTTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACACCAAAAACAATTACATTTGATTGGTATGGAAATAATTACACAGTTCCTGTTGTAAAAATTCCTTACATAATAGAAGCCATACATGGGAAACCTTGTTGGCATATTAGGCAATACACTAGTAGGGAAATTAACAGAACTAATCAGGCCCTAAAAGATTTGACAATTAGGCCACTAAGATTCTATAAACGTGCGGCCCGCCAAGTAGTTGCTCTGTGTAGAGCTCGAGGTGGAACCTTGAGATTTCTTGCAGATACGCTGTTGGCTTGGGTCCACGGCAGGACTGTGACGCTCGAGCCTCGTAAAGTTAAGCAGGCTAGAGCATTTAAATTTTGGGAGCCTTATGAACAAAATTTTGATGAGGATACAATTAGATTGAAAATGAATTGGCTGCTATTAGCGGCCCTAATTGGCTCCATACTTTTAATTTGGTTTAAAGGTTAAATTTTAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCACGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGAGTCTGGCGTCAGTAACCGTCTCGGGACGCTGGCTCACATCCCCTTCCGGCTTCGGGGCTTGGCAACCCCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAGG
| 26,720
|
ON391057.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-WZS5-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,963
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-WZS5-2020, complete genome
|
CACTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCAAAAGAGTCCCTCCTTTTTTTCCTTTATCTCTTGCCGCTGGGCTGGTTAATGGCACAGGTGTGGGACAGATTTATTCTCTCCGTGACCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCTAGCTCAGTGGGCCCCCAAGGAATGACAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTGCCGGGACGGAACTCCCGGGGCTAGGTTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTAACCTAGTTTGGGCATGCCCACAGGAATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGTGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTCTTTTTTAACCCAAAAAGTAACTTTAAGTCTTGTACCGCATGGTTCGCCATGCTGTTTTGTATGAATGTGTGCATGTGTGTTGGGAATGGTCGGCCGCGAGGCCGTGTTGTGAAAGGTGTGTATGTGGTGCACCCGAAGAAGACTGTGGACCAAGGTGTGCGGAGGAAGCGTAGGCCCCGACGCGACTTGGGTGGTTGGAGGAGGTCTGCAATAGGCCCCATGGATCCTTATTTCCGGACTGCCGTCCAAGCCATTGCGCCCAGCCCTGCCTACCCATCAAGAGATCCTAGAAGACAATCCAGGTTTCTTGGACATGTGATCGATGGCACACTGGGTTGGGTCACTGATGTAGTCCACCATGTACCTCTTGTTGGGCCTCTGGTTGGCCACCCGCTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTGAGGTCTGGCGAGAATGCTATAAATTCCCTCACTGGCACTGTTGGCGTGCATTTGTTTGTGTTGGCTCTTCTATCCTGCTTGTGTCCTGCTACAGCAGTCTCCAATTGTTGTACTCCTGATCAAGTGGTATACTGCACTGAGGTGACCTGTGTGCACGAAACAGGTTGCATCATTTGTGAACAGAAGGATGACCAGGTAGTATGTTGGTCGCCGGCTGGTCTATTGGTGTCTCATCCTCCAAATTATACGGGGATTGACCCATTTTTAACCCAACATATAGACTTTGTTGCTGGCACTACATTTATCTGTGATCTGACCGGGATGCGTGAGGTGTGTGGCGTTGCTGTGCTTCTATCCGCGACTGCCTTGGAACTCCTGCCCCGGCCAGTTAAATTTAACACCACTGCAGATTGCTACTTGTTTATAGATTCAGGGGTAGATCCTCTTTTTGCTTCCTTCTTTACCTGGTTGGCTGAGGAATTTTCTACTATCACGGCTATTCTTGACTTTATCTCTAAGGTGCCTAGTGCGTTAGCGCATGCTTTCACTCGCAGTCACTTTCTCACTATGTGTAGTATAGCTGGTTTGGCACTAAATGGTAACATGGCTAAGGCTTTTGCTCTGGTGGTTTTGTACATAGAGGCAGCTGCTGCTGCGCCTTTGCATGCTCAGTCGCTAAAGTACCCAGAGCTAGGACACGGCTGCCCCTTGTTGAAACGCCCCCCCAGGTGCGCCAATAGAACTTCTTTTGGAGCTACCATTTACTGCTTCCACCCCAAATTTGGTTTCCAGCCGTCTACACAAGGATGGCCTCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGAGCTGCAACAATTAATAATTACACTAATTTGGCTTGCTGTACTTTAAGAGTCACTCCAGCATTTTGTGATAATTGTAGCTCTGACTGCAGTTGGGCGGACAAGAGGCAGACTTTCGAAGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTTTCGACGGCCTGCGGTTCTTCCGCCATCTCTGCTCTAAGCACGGTGCTCACCACCACAGCTCCGAGACAGCTTAACCAGACTTGTATGCCCACTATTGTAGCGGGGTTGTCAATAGGACCTCTCAAACCTCCAGGCCCTGCAAGTTATGTCAGCTTGGTACATGGAAGCTGGATTACTTACCATTACTACCCCCATAGATTGGCTGAATTAGACTACAAGCATTGGGCTAGACTCCCTGGGACCCCTCCAACATATAGGGGGTCCTGGATGACTGTTCCCAAAGGAATGTATAGCTCCAGGAAAGACATATCCAGCGGTTTGGTCATCAAAGATAGGGCCAATCAAGACTATCAATTGCTCTTCTCAGGTGTGGGAACATATATTATACCTGGGATTACAGAGCATGTGGTGATCATAGCTTTGCTAGCTGCTTTTGGTGCCCGCTGGTGTTTGTTTCTTTACGCCATGTACAACTGGTTGCCTGGTGCTTTTGCCTTCACCCCTGAGGTGGTGGCTGCTACAGCTGCTTCTCCGTGGGAGGATCCTGTAGTAAGAGCTGGAGTCTACTTCGCCTCCTTGTGGCGCTCCCCTCTATCTATCCCACTCTGCGGGAACTTAGTCTCTTTTTGTCTATTAGCTTTTTCTCATAGTGTCCAGGCTTTTTCCACATCTGATGTCCTATTCGCTGCTGGTTCTGTGACTCTATTCACCGCCTGGGCAGGACTCTTTTCCCGCTTCATTCCTATGCTGTTGCTAACTCAATCCTACCTGCGTGTGAGGTTGGAGGCTTTTACTCGCTCTTGGCTTGATCGCTCTCTACTCTTTGTTTGTGTGATTGTGATACCTCATGCTGTGTGGGATGTGTGTTTGGTTCTCTGGGTGTGTTGGCTTCTGCTTGTGGTTGGAGGACACCTTGTTGTATGCCTGTGGGGACCTAAGGACAAAGCAAGTTTACATCTTTTGCTTGTCAGACTCAGGAAATGTGGATCCTGGTTGTCCAAATTAATAAGGCCTGTAGTAATCTGGGCTGCTGGTGAAAATGGAGTCTTCTGGTTCAATCATATTGATGGAAGCTTGGAGGGAGATTGGGAGTTTAAGGACCCCTACTACCCTTTCCAGACGGAGATTGAGGTGGCCCAGGATGTGGGTCGTAGACTAGCGTGCGGCGATCAAATCCGCGGCTTGCCGGTCTACGCCCGCTGTGGGTCTACTGTGAGGGCAGGAATAGCACAGCTGCCTAGAGGTTGGAAGAGGACTATACCGTTTTCAGCAAAAATAACCAGCCAGAGAAATCAGATCAAAGCTCTGGCTTTGTGCTTGACCGGGGGAGACAGCAGCAGCTACCAAGGCACTGTAGCGGTTATAGGAACCCCCTTGAGATCTTGGATGGGTTTTGGGTGTCTGGGGTCTTTGTACACAGTCTACCATGGGGCGCGAACTAGATTGTTGGCATCCCGTGATGGGCCTAGGCCTCCGACCCTGGTGAATGCCCAGGTAGATTTAGTCAAGTATCCACTACCATCTGGCATGGAATGTCTGGACATTTGTGACTGCAACTGCACTGAATTTTATTTGGTCACTCGGTTGGGGAACCTGATTCCTTGCGTGCAGGTTGAGGGGAGGTTCTGCAACACAGCGCCTTTAACCTTGGCTGAAGCGAAGGGTAGTTCAGGGGCTCCGATCGTGTGTAAGTGTAGGAAAGTTAAGGCTATGTTTTTGTCATGCCGGAGCAGTAGAGGTGTAGTGAGTAGCTTCGGTGTACACATGGTCCAGAAAGATCAGGTGGCAGACAGTAGAGTCCAACCCTGTGGCGAGTTGGTCCCTCCTAACGTCCCCAGGAAAGGGCAAAAGAAGGTAGAGAGGCTTGTTGCCCCCACTGGGAGTGGGAAGACCACCAAGTTGCCTATGAAGTACTACAGTGATGGCTACAGTGTGTTGGTGCTCAACCCGAGCGTCGCTACAACACGCTCGGTGGGGGAATACATGAAAACCGCTCACAAGGTAAATCCAAACATAAGAACTGGTGATGGATGCATTAACAATGGGAGTCGACTTACATACAGCACCTATGGCATGTTCTTGACACAACCCACATTCCAGGACGATGTGATCATCTGTGACGAGGTACATGCGGTTGATCCCACCACGATATTGGGTATAGGCGCGGCTCTCGCCGCCTTTCAAAGTTCTGCTAAGGCTAAGCTACTCATCCTAGCAACTGCCACTCCCCCAGGAACGCCCATTACTCCTCACCCCAATGTAACCACACAGGATCTGACCGATGAAGGCGATTTCCCCTTCCATGGTAGGAAAATCAAACTGGACAACATCAAGAAGGGCAGGCATCTTATTTTTACCCCTGGAAAGAAACACTGTGACACCATGGCCAGAGACCTCAATGATCTAGGTATCAATGCCGTGGCTTATTACCGGGGTAAGGATGCAGGTGTTATCCCTAGGGAGGGTGATGTCGTAGTAGTTGCGACTGACGCCTTGATGACTGGTTACACTGGAAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGCTTACAGGTTGAGGCCCACTACGAGTTGAACATGAACCCAACATTTTCATTGTCAATTCGGACCAAAAATGCAGACGCGGTTACGCGGATGCAACGTAGGGGCCGCACAGGCAGGGGCAAACAAGGAACCTATTACCAAGTAACACCACATTGTGCAACACATGGCATAGTCCCAACGGCTAATGTCATTGAAGCATTTGATTCTGGATTGGCTTATTATGGCATGACTCCTGCAGAAGTGACTAAATTTCTCTCCTATTACAAAGAAGAATCAATGACTGCCGCATTCGACTGCAACATTCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTTATGACACTCGGGTTCGTGGAACCCGCCATCCTGGAGAGGATGAAAAAGGAGGCAGAAAATTACACCTATCTTTATGCCGCACAGTACTCAGAGGCACAGGCGTGCGGCGCACAAGCCCCCAATGATAACAAGATATGGCGGGGCTTGAAGGGTACAGCTCCTTTCCCCATCCTTTATGATTTGGAGGAATATGATAACAGCCGCTGTCAAGGGTCTTCAAGAGCGGAGAGGATAGCGTCTTGTTTTCAGGAATATTTCTCCAACGGCCTTGTTACTCTGGCCGGAGTAGGTCTTGCTGCAGCAGCGGTATTTACAGCTATAGACCTACTAGGGAACGTGTGTATAAAAAGGGTGTACACGTTCACGACCGACTCCTCAGCAGCACGGGTCATTACACCAGGTGAGCCGGACCCCACGGAAGCCCTGGAAGAGTGCTACAACTGGGATGGTTTCGCTGAGAATGTCCAACGAGCTTCACATTGGCTGGCTGATAAGCTCGTTGAGGTTGGTCGCGCGGGAGGAGGAAAAATGAAGTATGAAAGGTGGGCCGTAGATCACGTTCCACACGTCCTCGCCGCTATCCAGTATTTTGCAGGGCTCACGTGTCTGCAGGACGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGTTTTGTGGGGGGAGTGTTAAGTCCTCTCCCACTAAAAGCCAACCTATTTCTTACTGCTTTAGGTGGCGCTTTTGCAACAAAGCTTACAACACAGCGTGGAGCAGCTGTGTTTGCCTTGGCAGGGGCTTTGGGGGCCGCTACCGGCTCCTTGAGTCTCGGTAAGGTGGCCGTTAATGCGGCGGCTACCTATGGGGCAGCCACGGCAACGTGCTTGGTGGTCCTCAAGCTCATAGATGGTCAGATGCCCGAGATGAGTGAGCTGGCTTCGTTGGCATTCAATCTTGCAAGCCCCGGTGCATGTATAGTGGGAGCTGGGTCCGCCCTGCTCATTGCTTACTGCACTAGGACCGAGTCTCAAGTTTGGATGAATAGATTGTTGGCCATGCTCCATCGGGGAACTAGCTGTGAGGACTATTTTGTTGCATCAACTACGTTGAGGACCAACATCATCAAGGTTCTCGAACAAGCCAATCTATGGGCTGTTTTTAAATGGCTTGCTAGTTGGCTCAATACGCAGGACGAGGATCTGTGTACCCCACGCGGTGCGTTTATGGACTTCTTCCACTCTGTGGGACAGGTCTTGCGACTCATCGTTGAGGCTGTGCGCGGCTTCCTCGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTGAACTGTGACAGGGGGTACAGCGGTCTATGGGCTGGGTCTGGGATTGTCACATCCACTTGTGGGTGTGGAGCCGAAACGGTCTGGAACATCCTTGAAGGGAAAGCCCATTGGGTGGCAGGGCCTCGGACCTGTTCATCTTGGTGGACTGGAAGAGTGCCTGTAAACAACTCCATGGTTGGCTGCCCGCGGCCGCGACCAGCCAGTTGGACCACAATGGCTGTCAACACAGGATTCAACTCATATGTTACCTATGAGAGAAGGGGGGAAGACGTTTACGTCACTGGGATCTCCTCCCCAGCTCAGGTTGTAGAGGCGGCAGTACCCGACTTGATCAGCGCTGTTGCTGTAGATGGCGTCCAGGTCAAGCCCTTTGGAGGCACTGGATGGAAGAAAGTTGGGAAGTTCGACTGCCGTTTCCGGAGAGGCGACAAGACAACAGACCTTAAGTTACCCTTTAAATTGGAACCTTGTAGGGAGCCGTACCGCGAGGTTGGCTGCCCTTTGCCGGACACTCTGAGGCAAGTTTCTCTTACCGAGCGGGTGATGAGCCTGGGTAAGGCTCAACCGCCCCCCAGGCCTAAGGCCGCAGGTTCGTATGACGGTACCCCAAGCGTGAAGAAACCCACCATCTATGATTCTGGTAGTGATATCGAATCGCCTGGGGACCTGATGAGACAATTGTCTAAGGGTTACGGCAAGCTCAAAGAATTAGAGAAGGACCTCCCAAAACCTGTAGAAAGATCTGATCCCCTGGAGGTTATCGAGGTGGCGTCGGACGACGACTCTTCCTCGGATGCCCCCCTGGTCAAGGACCAGCCACAGAAACCACGCAAGGCGGGTAAGGTAATAGTAACAAAGGCCCTACTCAACCCGCGTGCTCCTACCTTCGTGCCAAAGAAAGTAAAGATAGCAAAGGGGGCAGTCCCCTTGCCTTGTGTGGCACGTAAGGGAGAGACCAAGAGCGTGGAAGCCTATTCACTCTTGTCCTCAAGCTGGGAGACCGCAAGCAGTAACGATTCAGCCTGTTCATCTTGGTCATATGATTGGTCATTGCCAAAACTAGTTTACAAAGGTTTCAAGAGAACAATATCAGCAGTCTCCACATACACATTTGGCATTATGAGGTACAAGCCATTGGTGTACACAACTGACCCAAGTTCCATCAATGAGAGAATTAGGAAAGTTACAATAGAAAGGTCACGCACTGAGTTTCCTGAGCTTAGGCGTGAAATCCAGAAAGCTAAGCAGAAAGTGAGGGACCTGAACCTAAGAGAGCTAGAATTAGAGGAAGCTCTGGCGCTGACGCCAAACAAAACGGCGAAGAGTGCTATTACTGGCGCCACTGGGAAGTCTGTAAAGACTCACCCAGCAGTAGTTCAGGAAGTTTATGATCTGCTGTCAAAAGGTGAGATTAGTAGGCCCTGGAATGAAGTCAACATTATGCCTAAATCAGAGATATTTGTATTATCCCCAGAAAAGCCTACCAAGAAACCCGCTCGCATCATAGCATATCCCCACTTGGAGATGCGAGTAGTGGAGAAGATGGTCCTGGGAGAAATTGGGCCAACAGTGGTGAAGACCGTATGCGGTCCCGCGTATGGGTTTTTATCACCCCAGGAAAGGGTTCAGAGACTGGTGTCCATGTGGAACTCCAAGGACGCTCCTTGTGGCTTCACGTGTGATACCACGTGCTTTGACTCGACCATCACACCAGAGGATATAGCAGCTGAATGTGAAATTTATGAGGCTGCTGCCGCTGACCCCCAGACCAAAGCCAGGATTAGAACTCTCCACACTAGTCTTTATCAGGGGGGCCCGATGGTGATGCAAGGAACCTATGTAGGTGAGCGTCACTGTAGGGCAAGCGGAGTATTTACAACTTCCTCTTCCAATACTCTAACTTGTTATCTCAAAGTATCAGCTGCAGCTAAGAAAGCAGGAATTAAAGATCCTAGCTTCTTGATAGCAGGGGATGATTGTGTCTGCATTTTTGAATCTGAAATGGATATGGACAAGAAACGGTTGGGCTTGTTCACGACATACATGAAGCAGATGGGGGCGCCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTACTATCATTTAGAGTTATTAGATAGCTGCTCTTCTAATGTGTCGCTGGCACAAACATCCAGCGGCCAATTCCACTATTCCACTAGAGATCCAAAAACACCTTTGGGCAGAATAAGTGTAGAGGGAAAGGGGTTCAACCCTCTAGGCAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAATTACCCCGCAGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTTTTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACTCCAAAAACAATTACATTTGATTGGTATGGAAATAATTACACAGTTCCTGTAGTTAAAATTCCTTATATAATAGAAGCCATACATGGGAAACCGTGCTGGCATATTAGACAATATACAAGTAGGGAAATTAATAGAACTAATCAGGCATTAAAAGATTTAACAATTAGGCCATTAAGGTTTTATAAACGTGCAGCCCGCCAAGTGGTTGCTCTGTGCAGAGCTCGAGGTGGTACCTTGAGATTTCTGGCAGACACTCTACTAGCGTGGGTTCACGGCAGGACTGTGACGCTCGAGCCGCGTAAAGTTAGACAGGCTAGAGCTTTTAAATTTTGGGAGCCGTATGAACAAAATTTTGATGAAGATTCAATTAGGTTTAAAATGAATTGGCTGCTAGTTGCAGCACTAATTGGCTCCATATTCTTAATTTGGTTTAAAGGCTAAATTTAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCACGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGTGGCTAGCACCAGAACCGTCTCGGGGTGCTGGCCTACTCCCCCTTCCGGCTTCGAGGCTTGGCAACCTCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAGGCG
| 26,721
|
ON391058.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-WZS4-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,956
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-WZS4-2020, complete genome
|
CACTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCGAGAGAGTCACTCCTTTTCTTTTATCTCTCGCCACTGGGCTGGTTAATGGCACAGGTGTGGGACAGACTTAGTCTCTCCGTGACCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCTGGCTCAGTGGGCCCCCAAGGATTGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTGCCGGGACGGAACTCCCGGGGCTAGGATTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTAACCTAGTTTGGGCATGCCCACAGGAATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGCGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTTCTTTTAAACTCAAAAGGTAACTTTAAGTCTTGTACCGCATGGTTCGCCATGCTGTTTTGTATGAATGTGTGTATGCATGTGGGGAATGGTCGGCCGAGAGGCCGTGTGGTTAAAGGTGTGTATGTGGTTCACCCTAAGAAGACTGTGGACCAAGGTGTGCGGAGGAAGCGTAGGCCCCGACGCGACTTGGGTGGCTGGAGGAGGTCTGCTATAGGCCCCATGGATCCTTACTTCCGGACCGCCGTCCAAGCCATAGCACCCAGCCCCGCCTACCCGTCTCGTGACCCCAGGAGACAATCTAGGTTCCTTGGGCATGTCATAGATGGCACACTGGGTTGGGTGACAGATGTGGTCCACCATGTACCTCTCGTCGGGCCTTTGGTTGGCCACCCATTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTAAGGTCTGGTGAGAATGCTATCAATTCCCTTACTGGTACTGTTGGTGTACATTTGTTTGTCTTAGCACTTTTGTCTTGTCTTTGTCCTGCTTCTGCAGTTTCCAATTGTTGTACTCCTGATCAGGTGGTTTACTGCACTGAGGTCACCTGCGTCCATGAGACTGGATGCATAATATGTGAACAAAAGGATGACCAGGTGATATGTTGGACGCCGGCCGGTCTATTGGTGTCTCATCCCCCTAATTACACGGGAATAGACCCTTTTTTAACCCAACATATAGACTTTGTGGCTGGTACGACATTCATCTGTGATCTGACCGGTATGCGGGAGGTGTGTGGCGTAGCAGTGCTCTTGTCCGCTACAGCCTTGGAACTTCTGCCCCGGCCAGTTAAATTGAACACAACTGCAGATTGCTACCTGTTTATAGACTCAGGAGTTGATCCTCTTTTTGCTTCCTTCTTTACCTGGTTGGCTGAGGAATTTTCTACTATAACAGCTATTCTTGACTTCATTTCTAAGGTTCCTAGTGCGTTGGCTCATGCCTTCACACGCAGTCACTTTCTCACTATGTGTAGTATAGCTGGATTGGCCCTTAATGGTAACATGGCAAAAGCTTTCGCTCTGGTGGTGCTGTACATAGAGGCTGCCGCGGCAGCACCTATGAGTGTCCAGTCGTTAATGTACCCAGAGTTGGGGGCTGGATGCCCATTGCTGAGTCGCCCCCCGAGGTGTAACAACAGAACCTCGTTTGGCTCGACAATATATTGTTTCCACCCAAAATTCGGCTTTCAACAATCCAGTCGAGGATGGCCGCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGTGCTGCAACTATTAACAGTTATACTAATTTGGCCTGTTGTACATTGAGAGTCACCCCGGCTTTCTGTCATAATTGCAGCTCCGACTGCAGCTGGGCAGACAAAAGACAGACCTTTGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTCTCAACGGCCTGTGCTCCCAATGCTATTGCTGCCCTTGCCTCGGTTCTACCCTCCATAGGACCGAGGTTGCCCAACCAGACATGTATGCCCACTGTTGTAGCAGGGTTGTCAATAGGGCCACTGAAATCTCCTGGCCCCGCTAGTTATGTCAGCTTGGTACATGGGAGCTGGCTTACCTACCATTACTACCCTGAAAGATTGGCAAAGTTAGATTACAAACATTGGGCTAGATTGCCTGGGACCCCGCCTACCTATAGGGGGTCTTGGATGACAGTCCCCAAGGGAATGTATAGCTCCAGGAAAGATATCTCCAGCGGGTTGGTCATTAAGGATAGAGCCAATCAAGACTATCAACTGCTCTTCTCTGGCGTGGGGACCTATATTATACCAGGGATCACAGAGCACGTAGTGATCATAGCTTTATTAGCTGCTTTTGGAGCACGCTGGTGTTTGTTTCTGTATGCCATGTACAACTGGTTGCCTGGAGCTTTTGCTTTCACCCCTGAGGTGATAGCTGCCACGGCGTCGTCTCCGTGGGAGGACCCTGTGGTTAGAGCTGGAGTCTACTTCGCTTCCTTGTGGCGCTCCCCTCTTTCTATCCCACTCAGCGGGAATCTAGTCTCATTTTCTTTGTTGGCATTCTGCCATGGTGTCCAGGCTTTTTCCACATCTGACATCCTGTTTGCTGCTGGTTCGGTGACTTTATTTACTGCTTGGGCTGGACTTTTTTCTCGCTTTCTCCCTATGCTGTTGCTAACCCAATCCTATCTCCGCGTGAGGTTGGAAGCTTTTACTCGATCTTGGCTTGACCGCTCCTTGTTGTTTGTTTGTGTGATTGTGATACCTCATGCTGTTTGGGATGTGTGTTTGGTCCTATGGGTCTGCTGGCTTTTGTTAGTAGTTGGAGGACAGCTCGTTGTTAGTTTGTGGGGCCCTAAGGACAAAGCAAGCTTGCATTTGCTGCTTGCAAGACTCAGGAAATGTGGATCCTGGTTGTCAAGGAAATTGCGGCCTTTAGCAATCTGGGCCGCAGGAGAGAATGGTGTGTTCTGGTTTGACCATATAGATGGAAGCTTGGAGGGAGATTGGGAATTCAAGGATCCCTATTTCCCTTTCCAGACGGAGATTGAGGTGGCCCAGGACGTTGGGCATCGGCTGGCGTGCGGGGATCAGATCCGCGGACTGCCGGTTTATGCTCGTTGCGGGTCCACCGTGAGGGCAGGAATAGCACAGCTGCCCAGAGGATGGAAAAGAACGATACCCTTCTCTGCAAAAATTACCAGCCAGCGTAATCAGTTAAAGGCGTTGGCTTTATGCTTGACTGGGGGTGACAGCAGCAGCTACCAAGGAACTGTGGCGGTTATAGGCACCCCCCTGAGATCCTGGATGGGGTTTGGTTGTTTGGGGTCTTTGTACACAGTCTACCACGGGGCTAGAACAAGATTGCTTGCGTCTCGTGATGGACCTAGGCCTCCCACCCTAGTCAATGCCCAGGTTGATTTGGTCAAGTATCCACTACCATCTGGTTTTGAGTGTTTGGATGTATGTGACTGTAACTGCACTGAATTCTATTTGGTCACGCGGTTGGGGAACCTGATACCCTGCGTTCAGGTTGAGGGGAGGTTCTGTAACACGGCTCCTCTTACCTTAGCTGAGGCAAAGGGTAGTTCCGGTGCCCCAATTGTGTGTAAGTGTAGGAAAGTTAAGGCTATGTTTCTATCATGTCGCAGCAGCCGTGGAGTTGTCAGCAGCTTCGGCGTGCACATGATACAAAAGGACCAGGTGGCTGATTCTAGAGTGCTGCCCTGTGGCGAATTGGTACCTCCCAATGTTCCTAGAAAGGGGCAGAAGAAAGTGGAGCGGCTTGTGGCCCCTACTGGGAGCGGGAAGACTACCAAGTTGCCTATGAAGTACTACAGTGATGGCTACAGTGTGCTAGTGCTCAACCCGAGTGTAGCAACAACGCGCTCGGTGGGGGAATATATGAAAACCGCACACAAGGTAAATCCAAATATCAGAACTGGTGATGGGTGTATCAACAATGGGAGTCGACTGACTTATAGTACATATGGTATGTTCCTCACACAGCCCACATTTCAAGACGATGTGATCATCTGTGATGAGGTGCACGCAGTTGACCCCACAACAATATTGGGCATAGGCGCTGCTCTCGCAGCTTTCCAAAGTTCTGCTAAGGCTAAGCTACTCATCCTAGCCACAGCCACTCCCCCAGGAACGCCCATAACACCTCACCCCAATGTAACCACCAAGGATTTGACCGATGAGGGCGATTTCCCTTTTCATGGTAGGAAAATAAAACTAGACAATTTGAAAAAGGGACGACACCTAATCTTCACTCCTGGGAAAAAGCATTGTGATGCCATGGCAAGAGACCTCAATGACCTTAATATCAATGCTGTGGCTTACTACAGGGGAAAGGATGCAGGTGTCATACCAAGAGAAGGTGATGTGGTAGTTGTTGCCACTGACGCCCTAATGACAGGTTACACTGGCAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGCCTGCAAGTTGAGGCCCACTATGAATTGAATATGAACCCAACATTTTCTCTTTCAATTAGGACTAAAAATGCAGACGCGGTTACGCGAATGCAACGTAGGGGCCGTACAGGCAGGGGGAAACAAGGCACGTATTATCAAGTAACACCACATTGCGCCACGCATGGCATAGTACCAACAGCTAATGTCATCGAGGCGTTTGATTCCGGATTGGCATATTACGGCATGACCCCTGCAGAGGTAACAAAATTTCTCTCCTTTTACAAAGAAGAATCAATGACAGCCGCATTCGACTGTAACATCCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTCATGACGCTCGGGTTTGTAGAACCCGCCATCCTAGAACGGATGAAAAAGGAAGCTGAAAACTACACCTATTTGTATGCTGCACAATACTCTGAGGCACAGGCGTGCGGCGCACAGGCCCCCAATGATAACAAGATTTGGCGGGGCCTGAAAGGGACTGCTCCTTTCCCCATCCTTTATGACTTGGAGGAGTACGACAACAGTCGCTGTCAAGGGTCTTCACGGGCTGAGAGGATAGCGTCTTGTTTTCAGGAGTACTTTTCCAATGGCCTGGTCACTCTGGCTGGGATAGGTCTAGCAACAGCAGCCGTATTTACGGCCATAGACCTACTTGGGAACGTGTGTATTAAAAGGGTATACACGTTCACTACCGACTCCTCAGCAGCACGAGTAATAACTCCGGGCGACCCTGACCCCACGGAAGCTCTGGAAGAGTGCTACAATTGGGATGGTTTTGCTGAGAATGTCCAACGAGCTTCACATTGGCTGGCTGATAAGCTCGTTGAGGTCGGTAGAGCAGGGGGAGGCAAGTCTCCCTATGAGAGATGGGCAGTAGATCATGTGCCCCATGTTCTCGCTGCTATACAGTATTTTGCAGGGCTCACGTGTCTGCAAGACGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGATTTGTGGGGGGAGTATTGAGTCCACTGCCCCTCAAGGCCAACCTATTCCTTACTGCATTAGGTGGCGCTTTTGCAACAAAACTCACCACACAGCGAGGAGCAGCTGTGTTTGCCCTGGCAGGGGCTTTGGGGGCCACAACTGGTTCTCTGAGTCTCGGTAAGGTAGCTGTTAATGCGGCAGCTACATATGGGGCTGCCACGGCAACTTGTTTGGTAGTTCTCAAGCTCATAGATGGTCAGATGCCCGATATGAGTGAGCTGGCTTCGTTGGCATTCAACCTTGCAAGCCCCGGTGCATGTATTGTGGGAGCAGGGTCCGCTCTGCTCATCGCGTACTGTACTCGGACCGAGTCTCAGGTTTGGATGAATCGATTGTTGGCCATGCTCCATCGGGGAACTAGCTGTGAGGACTATTTTGTTGCATCCACTACATTGAGGACCAACATCATCAAGGTTCTCGAGCAGGCAAACTTGTGGGCTGTTTTTAAATGGCTCGCGAGTTGGCTCAATTCGCAGGACGAGGATCTGTGCACTCCTCGAGGTGCGTTTATGGACTTCTTCCACTCTGTGGGACAGGTTCTAAGACTCATCGTCGAGGCCGTGCGCGGCTTTCTCGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTGAACTGTGACAGGGGGTACAGTGGTCTATGGGCTGGGTCTGGAATAGTCACATCCACATGTGGGTGTGGAGCCGAAACGGTTTGGAATGTTCTAGAAGGGAAAGCCCATTGGGTAGCAGGGCCCCGCACTTGTTCATCTTGGTGGACGGGTAGGGTGCCCGTAAACAACTCCATGGTTGGCTGCCCACGACCACGACCAGCCAGTTGGACCACAATGGCTGTCAACACAGGATTCAACTCATATGTGACTTATGAGAGACGGGGAGAGGACGTATATGTCACCGGGATCTCCTCCCCTGCCCAGGTAGTTGAGGCTGCAGTCCCCGACCTGATCAGCGCGGTCGCTGTAGATGGAGTCCAGGTTAAGCCCTTTGGTGGAACAGGTTGGAAAAAGGTTGGGAAATTTGACTGCCGCTTCAGGAGAGGTGATAAAACCACAGACCTTAAGTTACCCTTCAAATTGGAGCCTTGTAGGGAACCTTACCGTGAGGTTGGGTGTCCTTTACCAGATACTCTAAGGCAGGTGTCTCTGACCGAGCGGGTCATGAGCTTGGGCAAGGCTGCACCGCCGCCCAGGCCAAAACCAGCAGGTTCTTTTGACGGAATGCCGGCGGTCAAGAAGCCTACCATTTACGATTCTGGTAGTGACATCGAGTCGCCGGGAGACCTGATGAGACAGTTGTCTAAGGGTTATGGGAAGCTCAAAGAGTTGGAAAAAGACCTCCCTAAACCTGTGGAACGGTCAGATCCCCTTGAGGTAATAGAGGTCGCCTCGGATGACGAGTCTTCCTCTGATGCCCCATTGGTTAAGGACCAACCACAAAAACCACGCAAAGCGGGAAAAGTCATTGTCACCAAAGCCCTTTTGAACCCGCGTGCCCCCTCATTTGTCCCAAAGAAAGTTAAATTGGCCAAGGGAGCTGTCCCGCTACCTTGTGTGGCGCGGAAGGGGGAGACCAAAAGCGTGGAAGCCTATTCACTGTTGTCCTCTAGTTGGGAGACTGCTAGCAGTAACGATTCAGCCTGTTCTTCTTGGTCATATAATTGGTCCCTGCCAAAATTAGTTTATAAAGGATTCAAGAGAACAATTTCAGCAGTTTCCACTTACACATTTGGCATAATGAGGTACAAACCGTTGGTGTATACAACTGACCCAAGTTCCATCAACGAGAGAATTAGGAAAGTTACAATTGAAAGGACACGCACTGAGTTTCCTGAGCTCAGGCGTGAGATCCAAAAAGCCAAACAGAAAGTGAGGGACCTGAACCTAAGAGAGCTTGAATTGGATGAAGCTCTGGCGCTAACGCCCAATAAAACGGCGAAGAGTGCTATCACAGGCGCCACTGGGAAGTCGGTGAAGACCCACCCAGCAGTGGTTCGGGAAGTGTATGATCTGTTGTCACAAGGGAAAATAGAAAGGCCATGGAATGAGGTGAACATAATGCCTAAATCTGAGATTTTTGTTTTGTCACCAGAAAAGCCTACAAAGAAGCCCGCTCGCATCATTGCATACCCTCACCTTGAGATGCGAGTGGTGGAGAAAATGGTTCTGGGGGAAATTGGCCCTACGGTAGTGAAGACTGTGTGCGGACAAGCATATGGTTTCCTATCCCCCCAGGAGAGAGTGCAGAGACTGGTGTCGATGTGGAACTCCAAGGACGCTCCTTGTGGATTCACGTGTGATACCACGTGCTTTGACTCTACCATAACACCTGAAGACATTGCGGCCGAGTGTGAGATCTATGAAGCCGCCACCACAAACCCTGATACGAAAGCTAGGATTAGAACTCTCCACACTAATCTGTACCAGGGAGGCCCCATGGTGATGCAAGGAACCTACGTAGGTGAGCGTCATTGTAGGGCTAGTGGTGTCTTTACAACTTCATCTTCAAACACCTTGACATGTTATCTCAAAGTTTCTGCAGCAGCTAGGAAAGCTGGGATAAAAGACCCCAGTTTCTTAATAGCAGGGGACGATTGTGTCTGCATCTTTGAATCAGAAATGGGTAGAGACAAAGATCGGTTGGGCTTGTTCACTACCTACATGAAGCAGATGGGGGCGCCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTACTATCATCTTGAATTGTTAGATAGCTGCTCATCTAATGTGTCGCTGGCACAAACTACCAGCGGCCAATTCCACTATTCGACAAGGGATCCAAAAACACCGTTAGGTCGAATTAGTGTTGAGGGAAAGGGGTTCAACCCTCTAGGCAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAACTACCCCGCTGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTTTTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACACCAAAAACAATTACATTTGATTGGTATGGAAATAATTACACAGTTCCTGTTGTAAAAATTCCTTACATAATAGAAGCCATACATGGGAAACCTTGTTGGCATATTAGGCAATACACTAGTAGGGAAATTAACAGAACTAATCAGGCCCTAAAAGATTTGACAATTAGGCCACTAAGATTCTATAAACGTGCGGCCCGCCAAGTAGTTGCTCTGTGTAGAGCTCGAGGTGGAACCTTGAGATTTCTTGCAGATACGCTGTTGGCTTGGGTCCACGGCAGGACTGTGACGCTCGAGCCTCGTAAAGTTAAGCAGGCTAGAGCATTTAAATTTTGGGAGCCTTATGAACAAAATTTTGATGAGGATACAATTAGATTGAAAATGAATTGGCTGCTGTTAGCGGCCCTAATTGGCTCCATACTTTTAATTTGGTTTAAAGGTTAAATTTTAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCACGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGAGTCTGGCGTCAGTAACCGTCTCGGGACGCTGGCTCACATCCCCTTCCGGCTTCGGGGCTTGGCAACCCCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTG
| 26,722
|
ON391059.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-WZS3-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,962
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-WZS3-2020, complete genome
|
CTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCAAGAGAGTCACTCCTTTTTTCTTTATCTCTTGCCGCTGGGCTGGTTAATGGCACAGGTGTGGGACAGATTTCATCTCTCCGTGACCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCCGGCTCAGTGGGCCCCCAAGGACTGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTGCCGGGACGGAACTCCCGGGGCATAGGATTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTAACCTAGTTTGGGCATGCCCACAGGAATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGTGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTCTTTTCAAAACCCATTAGTAACTTTAAGTCTTGTACCGCATGGTTCGCCATGCTGTTTTGTGTCAACGTATGTTTGTGTGTAGGGAATGGTCGACCACGGGGTCGAGTTGTGAAAGGTGTGTATGTGGTGCACCCTAAAAAGACTGTGGACCAAGGCGTGCGAAGGAAACGTAGGCCCCGACGCGACTTGGGCGGTTGGAGGAGATCGGCAATCGGTCCCATGGATCCTTACTTCCGGACCGCCGTCCAGGCCATAGCACCTAGCCCTGCCTACCCGTCTAGAGACCCAAGACGCCAATCAAGGTTTCTTGGTCATGTCATCGATGGCACGCTGGGGTGGGTGACTGATGTGGTCCATCATGTACCTCTTGTCGGCCCTCTAGTTGGCCACCCGTTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTGAGGTCCGGTGAGAATGCAATTAATTCCCTAACTGGCACCGTGGGTGTTCACTTGTTTGTTCTTGCTTTGTTTTCCTGCCTGTGTCCTGCTACGGCAGTGTCAAATTGTTGTACACCTGATCAAGTAGTTTACTGCACAGAGGTCACATGCGTTCATGAGACCGGCTGCATAATTTGTGAGCAAAAGGATGACCAGGTGATATGTTGGACTCCCGCAGGTCTATTGGTTTCTCATCCCCCAAACTACACCGGGATAGATCCCTTTCTAACCCAACATATAGACTTTGTGGCGGGCACTACATTCATCTGTGATCTGACCGGCATGCGAGAGGTGTGTGGCGTGGCTGTACTCCTATCTGCCACTGCCTTGGAACTCTTACCCCGGCCAGTTAAATTAAACACCACCGCAGATTGCTACTTGTTTATTGATTCAGGTGTTGATCCTCTATTTGCTTCCTTCTTTACCTGGTTGGCTGAGGAATTCTCTACTATCACTGCAATCCTTGACTTCATTTCGAAGATCCCTAGCGCTTTGGCTCACGCTTTCACCCGTAGTCATTTCCTAACAATGTGTAGTATAGCTGGGCTGGCTTTGAACGGCAACATGGCTAAGGCCTTTGCTCTGGTTGTGCTGTACATAGAGGCAGCAGCTGCTGCTCCTATGCCAGTAGGGTCGTTAAAGTATCCAGAGTTGGGTAGTGGTTGCCCTTTGCTGTCTAGACCGCCTAGATGTGCTAATAGGACTTCTTTTGGACGAGATATCTATTGTTTCCATCCAAAATTTGGTTTCCAGCGCTCTGACAAGGGTTGGCCTCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGAGCTGCAACAATTAACAATTATACAAATTTGGCTTGCTGTACATTGAGAGTTACCCCTGCCTTTTGTCACAATTGTAGCTCTGACTGCAGTTGGGCTGATCGCCGACAGACGTTCGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTCTCGACCGCCTGTAGTCCTGAGGCGATAGCCGCTTTAGCCTCGGTACTCCCCACCATAGCGCCGAGGTCGCCTAACCAGGCTTGTATGCCCACTGTTGTAGCAGGGTTGTCTATAGGCCCACTCAAATCTCCCGGGCCTGCAAGTTATGTCAGCTTGGTACATGGGAGCTGGCTGACTTACCATTACTACCCTGATAGATTGGCAAAGTTGGATTACAAACATTGGGCTAGATTGCCCGGGACCCCTCCTACATATCGGGGTTCCTGGATGACTGTCCCCAAAGGAATGTATAGCTCCAGGAAAGACATCTCCAGTGGTTTGGTCATCAAGGATAGAGCCAATCAAGACTATCAACTGCTCTTTTCCGGGGTAGGGACATACATAATTCCCGGGATCACAGAGCATGTGGTGATCATAGCTTTGTTAGCTGCTTTTGGTGCCCGCTGGTGCTTGTTTCTTTATGCCATGTACAACTGGTTGCCTGGTGCTTTTGCTTTCACTCCTGAGGTGATAGCAGCCACAGCCTCATCTCCGTGGGAGGATCCTGTGGTAAGAGCTGGAGTCTACTTCGCCTCCTTGTGGCGCTCCCCTCTTTCTATCCCACTCTGCGGGAATATAGTGTCCTTTGTTTTGCTGTCTTTCTGTCATTCTGTCCAAGCCTTTTCCACATCTGATATCCTGTTTGCCGCTGGCTCGGTTACTCTCTTTACTGCTTGGGCTGGGCTATTTTCTCGCTTCATTCCTATGTTGCTGTTAACTCAATCCTACTTGCGTGTTAGGCTGGAGGCTTATACTCGCTCTTGGCTTGATCGCTCCTTGTTGTTTGTCTGTGTTATTGTGATGCCTCACGCTGTGTGGGATGTGTGTTTGGTCTTGTGGGTGTGCTGGCTCCTACTTGTGGTGGGAGGTCAGTTGGTTGTTAGCCTATGGGGCCCTAAGGATAAAGCTAGCTTACATCTGCTGCTTGTGAGACTAAGAAAGTGTGGATCTTGGTTTTCCAAAAGAATGCGACCCTTGGTCATTTGGGCCGCTGGTGAGAATGGTGTGTTCTGGTTCGACCACATAGATGGAAGCTTGGAGGGTGATTGGGAGTTTAAGGATCCTTATTATCCCTTCCAGACGGAGATTGAGGTGGCCCAAGACGTTGGGCAGAAGCTGGCTTGTGGCGATCAGATTCGCGGCCTGCCGGTGTATGCTCGATGTGGGTCCACCGTCAGGGCAGGAATAGCACAACTGCCTCGTGGTTGGAAGAGGACTATACCATTTTCAGTTAAAATTACGAGCCAGAGGAATCAGCTTAAGTCTTTGGCTCTGTGCTTGACCGGGGGTGATGCCAGCAGCTACCAGGGAACCGTAGCAGTAATAGGGACCCCCTTAAGGTCTTGGATGGGGTTTGGATGTTTGGGGTCTTTGTACACGGTTTATCACGGAGCAAGGACCAGATTGTTAGCTTCGAGAGATGGACCAAGACCCCCTACCCTAGTTAATGCCCAAGTTGATTTGGTCAAGTACCCGTTGCCAACTGGTATGGAATGTTTGGACATCTGTGACTGTAACTGTACTGAGTTTTATTTGGTCACGCGGTTGGGGAACTTAATACCCTGCGTGCAGGTCGAGGGAAGGTTCTGTAATACGGCACCTTTAACCTTGGCTGAAGCAAAGGGTAGTTCAGGGGCTCCTATCGTGTGTAAATGCAAGAAGGTGAAAGCAATGTTCCTGTCGTGCCGTAGCAGCCGGGGTGTGGTCAGCAGTTTCGGTGTGCATATGGTACAAAAGGACCAGGTGGCTGATAGTCGAGTGCTGCCCTGTGGCGAGTTGGTCCCCCCAAATGTCCCACGGAAGGGCCAGAAAAAAGTGGAGCGGATTGTGGCCCCGACGGGGAGTGGGAAGACCACCAAGTTGCCTATGAAGTACTACAGTGATGGCTACAGTGTGTTAGTGCTCAATCCGAGCGTGGCTACAACACGCTCTGTGGGGGAATACATGAAAACTGCACATAAGGTAAATCCAAATATAAGAACTGGTGATGGATGCATAAACAATGGGAGTCGGCTGACTTACAGTACCTATGGAATGTTTCTCACACAACCCACGTTTCAGGATGACGTGATAATTTGTGATGAGGTGCATGCAGTTGACTCCACAACAATATTGGGTGTTGGCGCCGCTTTGGCTGCCTTTCAAAGTTCTGCTAAAGCCAAGCTACTCATCTTAGCAACGGCAACCCCCCCAGGAACGCCCATAACTCCTCACCCCAATGTGACCACAAAGGATTTGACCGACGAGGGCGATTTCCCTTTCCACGGTAGAAAAATACAATTGGACAATCTTAAAAAAGGTAGACATTTGATCTTTACACCAGGGAAGAAACACTGTGATGAAATGGCAAGAAATCTTAATGACCTGGGTATCAACTCCGTGGCTTACTACAGAGGCAAAGACGCGGGTGTTATACCGAGGGAAGGCGATGTTGTCGTAGTGGCAACTGACGCCCTAATGACTGGTTACACTGGAAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGTCTTCAGGTAGAGCCCCATTATGAATTGAATATGAACCCAACATTTTCACTTTCAATAAGAACCAAAAATGCAGATGCGGTTACGCGAATGCAACGAAGGGGCCGTACAGGTCGGGGAAAACATGGCACGTATTACCAGGTTACACCACATTGCGCCACTCATGGCATTGTTCCAACGGCGAATGTCATAGAGGCGTTTGATTCCGGATTGGCGTATTACGGCATGACCCCCGCTGAAGTCACTAAATTTCTCTCCTTTTACAAAGAAGAATCTATGACAGCCGCATTCGACTGTAACATACAGGAGTTTGCAGAGCTCTTCATGACACTCGGGTTTGTAGAACCCGCCATCCTAGAAAGAATGAAAAAGGAAGCAGAAAATTACACCTACCTCTATGCCGCACAGTACTCTGAGGCACAGGCGTGCGGCGCACAAGCTCCCAATGACAACAAAATATGGAGGGGCTTGAAGGGTACTGCTCCCTTCCCTATTCTTTATGACTTGGAGGAGTATGATAACAGCCGCTGTCAAGGGTCATCCAGAGCAGAAAGGATAGCGTCCTGTTTCCAGGAATACTTCTCCAACGGCCTAATCACTTTGGCCGGGGTGGGTCTTGCAACAGCTGCCGTTTTCACGGCAATAGACCTACTTGGGAATGTGTGTGTAAAAAAGGTGTACACATTCACTACCGACTCCTCAGCTGCACGGGTAATCACGCCAGGCGACCCTGACCCCACGGAAGCCTTGGAAGAGTGCTACAATTGGGATGGTTTTGCTGAGAGTGTCCAACGGGCTTCACATTGGCTGGCTGATAAGCTCGTTGAGGTCGGTAGAGCGGGGGGTGGTAGGTCGGCTCATGAGAGGTGGTTAGTCGACCATGTACCCCACGTCCTCGCTGCCATACAATACTTTGCAGGGCTCACGTGTCTGCAGGACGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGTTTTGTGGGAGGGGTGCTTAGTCCACTTCCTCTTAAAGCCAACCTATTCCTTACTGCTTTAGGTGGCGCATTTGCAACGAAGCTGACAACACAGCGTGGAGCAGCTGTGTTCGCCTTGGCTGGGGCTCTGGGGGCCACAACCGGTTCTCTTAGTCTCGGTAAGGTAGCTGTTAATGCGGCAGCTACTTATGGGGCAGCCACGGCTACATGTTTGGTAGTTCTCAAGCTCATAGATGGTCAGATGCCCGAGATGAGTGAGCTGGCTTCGTTGGCATTCAACCTTGCGAGCCCTGGTGCGTGCATTGTGGGAGCGGGGTCCGCCCTTCTCATAGCGTACTGCACTAGAACCGAGTCTCAAGTTTGGATGAATAGATTGTTAGCCATGCTCCATCGGGGAACTAGCTGTGAGGACTATTTCGTTGCATCAACCACCCTAAGGACCAATATCATCAAGGTCTTGGAGCAAGCCAACTTGTGGGCCGTTTTTAAATGGCTAGCTAGCTGGCTTAATTCGCAGGACGAGGATCTGTGCACGCCTCGCGGTGCGTTTATGGACTTCTTCCACTCTGTGGGACAGGTTCTTAGACTCATCGTGGAGGCGGTGCGCGGCTTCCTCGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTGAACTGTGACAGGGGGTACAGCGGTCTATGGGCTGGGTCTGGGATAGTCACGTCCACTTGTGGATGTGGGGCTGAAACAGTCTGGAATGTCCTTGAAGGTAAAGCTCATTGGGTGGCAGGGCCTCGTACGTGTTCATCATGGTGGACCGGGCGAGTGCCTGTGAACAACTCCATGGTAGGCTGCCCTCGACCGCGACCAGCCAGTTGGACCACAATGGCTGTCAACACAGGTTTCAACACATATGTGACTTATGAAAGAAAGGGGGAGGACGTATACGTCACTGGGATCTCCTCCCCGTCACAGGTTGTTGAGGCGGCGGTCCCCGACTTAATCAGCGCTGTTGCTGTAGATGGAGTCCAGGTCAAGCCCTTTGGTGGCACTGGATGGAAGAAAGTTGGGAAGTTTGATTGCCGCTTCAGGAGAGGTGATAAGACCACAGACCTTAAGTTACCTTTTAAACTTGAGCCTTGCAGGGAGCCCTACCGGGAGGTTGGGTGCCCTCTTCCTGACACTCTCAGGCAGGTGTCGTTGACCGAGCGGGTGATGAGCTTGGGAAAGGCTGCACCGCCTCCCAGGCCTAAGCCAGCTGGGTCGTATGATGGTAGCCCGGCGGTTAAAAAGCCAACTATCTATGATTCAGGTAGTGACATTGAATCGCCCGGAGACCTGATGCGGCAGCTGTCTAAGGGATATGGGAAGCTCAAGGAACTGGAGAAGGACCTCCCAAAACCTGTAGAAAGATCAGATCCCTTGGAGGTGATTGAAGTGGCATCGGACGACGATTCCTCTTCGGACGCCCCACTGGTGAAAGACCAACCACCAAAACCACGCAAAGCTGGGAAAGTGATTGTAACTAAAGCCCTCCTAAACCCAAGAGCCCCCACTTTCGTGCCCAAGAAGGTAAAGCTGGCGAAGGGAGCAGTCCCATTGCCATGTGTGGCAAGAAAAGGGGAGACCAAAAGCGTGGAAGCCTATTCTCTATTGTCCTCAAGTTGGGAGACTGCAAGCAGTAACGATTCAGCCTGTTCGTCTTGGTCCTATGATTGGTCATTGCCAAAGTTGGTATATAAGGGATTCAAGAGAACTATATCAGCAGTTTCCACTTACACTTTTGGCATAATGAGGTACAAACCATTGGTGTATACAACAGACCCAAATTCCATCAATGAGAGAATTAGAAAGGTTACAATTGAGAGAACGCGCACGGAGTTTCCTGAGCTCCGTCGCGAAATTAATAAGGCAAAGCAGAAAGTGAGGAACCTGAACCTGAGAGAGCTAGAAATTGATGAGGCTCTGGCACTAACCCCAAACAAGACTGCAAAGAGTGCAGTTACTGGTGCTACTGGGAAGTCTGTTAAGACCCACCCAGCTGTAGTTCGGGAAATTTATGAACTGCTGTCCAAAGGAGAAATACCAAGGCCCTGGAATGAAGTAAACATAATGCCAAAGTCAGAAATATTTGTGTTGTCTCCAGAGAAGCCTACTAAAAAACCCGCTCGCATCATAGCTTATCCTCACCTAGAGATGCGGGTAGTGGAGAAAATGGTATTGGGGGAAATTGGCCCTACGGTAGTGAAAACCGTGTGCGGTGACGCATACGGCTTCCTATCCCCCCAAGAACGAGTCCAGCGGCTGGTGGCCATGTGGAACTCCAAGGATGCACCTTGCGGCTTCACGTGTGACACTACCTGCTTCGACTCGACCATAACACCAGAGGATATAGCCGCTGAATGTGAAATTTATGAAGCGGCAACCTCCGACCCTCTGACCAAAGCCAGGATCAGAACTCTCCACACTGGTCTATATCAGGGGGGCCCAATGGTGATGCAGGGAACCTACGTAGGTGAGCGTCATTGTAGGGCAAGCGGAGTATTCACAACTTCTTCCTCTAACACCATGACATGCTATCTAAAAGTGTCAGCTGCAGCTAAGAAGGCTGGGATTAAGAGCCCCAGCTTCCTCATAGCAGGGGACGACTGTGTCTGCATATTTGAGTCAGAGATGGATATGGACAAGAAACGGTTAGGCTTGTTCACAACATACATGAAGCAGATGGGGGCGCCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTACTATCATTTAGAGTTGTTAGATAGCTGCTCGTCAAATGTGTCACTGGCACAAACATCCAGTGGCCAATTCCACTATTCTACTAGAGATCCAAAAACACCATTAGGCAGAATTAGTGTTGAGGGAAAGGGGTTCAACCCTCTTGGTAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAACTACCCCGCAGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTCTTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACTCCCAAAGCTATAACTTTTGATTGGTATGGAAACAATTACACAGTTCCTGTAGTTAAAATTCCTTACATAATTGAAGCCATACATGGGAGACCGTGTTGGCACATAATACAATATACTAGTAGGGAAATAAACAGAACAAATCAGGCATTAAAAGATTTAACAATTAGGCCTTTAAGATTTTATAAACGTGCTGCCCGGCAAGTGGTTGCTCTGTGTAGAGCTCGAGGTGGTACCTTGAGATTTCTCGCAGACACGCTACTCGCATGGGTGCACGGCAGGGCTGTGCGCCTTGAGCCTAGGAAAGTTAAACAGGCTAGGGCTTTTAAATTTTGGGAACCATATGAGCAAAATTTGGATGAAGATACAATTAGGTTAAAAATAAATTGGCTGCTTATAGCAGCACTAATTGGTTCTATAATGCTAATTTGGTTTAAAGGTTAAACATTAAAGTTTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCACGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGAGTCCGGCGTCAGAAACCGTCTCGGGACGTCGGACCACATCCCCTTCCGGCTTCGGGGCTTGGCAACCCCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAGGCG
| 26,723
|
ON391060.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-WZS2-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,963
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-WZS2-2020, complete genome
|
CACTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCGAGAGAGTCACTCCTTTTCTTTTATCTCTCGCCACTGGGCTGGTTAATGGCACAGGTGTGGGACAGACTTAGTCTCTCCGTGACCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCTGGCTCAGTGGGCCCCCAAGGATTGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTGCCGGGACGGAACTCCCGGGGCTAGGATTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTAACCTAGTTTGGGCATGCCCACAGGAATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGCGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTTCTTTTAAACTCAAAAGGTAACTTTAAGTCTTGTACCGCATGGTTCGCCATGCTGTTTTGTATGAATGTGTGTATGCATGTGGGGAATGGTCGGCCGAGAGGCCGTGTGGTTAAAGGTGTGTATGTGGTTCACCCTAAGAAGACTGTGGACCAAGGTGTGCGGAGGAAGCGTAGGCCCCGACGCGACTTGGGTGGCTGGAGGAGGTCTGCTATAGGCCCCATGGATCCTTACTTCCGGACCGCCGTCCAAGCCATAGCACCCAGCCCCGCCTACCCGTCTCGTGACCCCAGGAGACAATCTAGGTTCCTTGGGCATGTCATAGATGGCACACTGGGTTGGGTGACAGATGTGGTCCACCATGTACCTCTCGTCGGGCCTTTGGTTGGCCACCCATTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTAAGGTCTGGTGAGAATGCTATCAATTCCCTTACTGGTACTGTTGGTGTACATTTGTTTGTCTTAGCACTTTTGTCTTGTCTTTGTCCTGCTTCTGCAGTTTCCAATTGTTGTACTCCTGATCAGGTGGTTTACTGCACTGAGGTCACCTGCGTCCATGAGACTGGATGCATAATATGTGAACAAAAGGATGACCAGGTGATATGTTGGACGCCGGCCGGTCTATTGGTGTCTCATCCCCCTAATTACACGGGAATAGACCCTTTTTTAACCCAACATATAGACTTTGTGGCTGGTACGACATTCATCTGTGATCTGACCGGTATGCGGGAGGTGTGTGGCGTAGCAGTGCTCTTGTCCGCTACAGCCTTGGAACTTCTGCCCCGGCCAGTTAAATTGAACACAACTGCAGATTGCTACCTGTTTATAGACTCAGGAGTTGATCCTCTTTTTGCTTCCTTCTTTACCTGGTTGGCTGAGGAATTTTCTACTATAACAGCTATTCTTGACTTCATTTCTAAGGTTCCTAGTGCGTTGGCTCATGCCTTCACACGCAGTCACTTTCTCACTATGTGTAGTATAGCTGGATTGGCCCTTAATGGTAACATGGCAAAAGCTTTCGCTCTGGTGGTGCTGTACATAGAGGCTGCCGCGGCAGCACCTATGAGTGTCCAGTCGTTAATGTACCCAGAGTTGGGGGCTGGATGCCCATTGCTGAGTCGCCCCCCGAGGTGTAACAACAGAACCTCGTTTGGCTCGACAATATATTGTTTCCACCCAAAATTCGGCTTTCAACAATCCAGTCGAGGATGGCCGCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGTGCTGCAACTATTAACAGTTATACTAATTTGGCCTGTTGTACATTGAGAGTCACCCCGGCTTTCTGTCATAATTGCAGCTCCGACTGCAGCTGGGCAGACAAAAGACAGACCTTTGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTCTCAACGGCCTGTGCTCCCAATGCTATTGCTGCCCTTGCCTCGGTTCTACCCTCCATAGGACCGAGGTTGCCCAACCAGACATGTATGCCCACTGTTGTAGCAGGGTTGTCAATAGGGCCACTGAAATCTCCTGGCCCCGCTAGTTATGTCAGCTTGGTACATGGGAGCTGGCTTACCTACCATTACTACCCTGAAAGATTGGCAAAGTTAGATTACAAACATTGGGCTAGATTGCCTGGGACCCCGCCTACCTATAGGGGGTCTTGGATGACAGTCCCCAAGGGAATGTATAGCTCCAGGAAAGATATCTCCAGCGGGTTGGTCATTAAGGATAGAGCCAATCAAGACTATCAACTGCTCTTCTCTGGTGTGGGGACCTATATTATACCAGGGATCACAGAGCACGTAGTGATCATAGCTTTATTAGCTGCTTTTGGAGCACGCTGGTGTTTGTTTCTGTATGCCATGTACAACTGGTTGCCTGGAGCTTTTGCTTTCACCCCTGAGGTGATAGCTGCCACGGCGTCGTCTCCGTGGGAGGACCCTGTGGTTAGAGCTGGAGTCTACTTCGCTTCCTTGTGGCGCTCCCCTCTTTCTATCCCACTCAGCGGGAATCTAGTCTCATTTTCTTTGTTGGCATTCTGCCATGGTGTCCAGGCTTTTTCCACATCTGACATCCTGTTTGCTGCTGGTTCGGTGACTTTATTTACTGCTTGGGCTGGACTTTTTTCTCGCTTTCTCCCTATGCTGTTGCTAACCCAATCCTATCTCCGCGTGAGGTTGGAAGCTTTTACTCGATCTTGGCTTGACCGCTCCTTGTTGTTTGTTTGTGTGATTGTGATACCTCATGCTGTTTGGGATGTGTGTTTGGTCCTATGGGTCTGCTGGCTTCTGTTAGTAGTTGGAGGACAGCTCGTTGTTAGTTTGTGGGGCCCTAAGGACAAAGCAAGCTTGCATTTGCTGCTTGCAAGACTCAGGAAATGTGGATCCTGGTTGTCAAGGAAATTGCGGCCTTTAGCAATCTGGGCCGCAGGAGAGAATGGTGTGTTCTGGTTTGACCATATAGATGGAAGCTTGGAGGGAGATTGGGAATTCAAGGATCCCTATTTCCCTTTCCAGACGGAGATTGAGGTGGCCCAGGACGTTGGGCATCGGCTGGCGTGCGGGGATCAGATCCGCGGACTGCCGGTTTATGCTCGTTGCGGGTCCACCGTGAGGGCAGGAATAGCACAGCTGCCCAGAGGATGGAAAAGAACGATACCCTTCTCTGCAAAAATTACCAGCCAGCGTAATCAGTTAAAGGCGTTGGCTTTATGCTTGACTGGGGGTGACAGCAGCAGCTACCAAGGAACTGTGGCGGTTATAGGCACCCCCCTGAGATCCTGGATGGGGTTTGGTTGTTTGGGGTCTTTGTACACAGTCTACCACGGGGCTAGAACAAGATTGCTTGCGTCTCGTGATGGACCTAGGCCTCCCACCCTAGTCAATGCCCAGGTTGATTTGGTCAAGTATCCACTACCATCTGGTTTTGAGTGTTTGGATGTATGTGACTGTAACTGCACTGAATTCTATTTGGTCACGCGGTTGGGGAACCTGATACCCTGCGTTCAGGTTGAGGGGAGGTTCTGTAACACGGCTCCTCTTACCTTAGCTGAGGCAAAGGGTAGTTCCGGTGCCCCAATTGTGTGTAAGTGTAGGAAAGTTAAGGCTATGTTTCTATCATGTCGCAGCAGCCGTGGAGTTGTCAGCAGCTTCGGCGTGCACATGATACAAAAGGACCAGGTGGCTGATTCTAGAGTGCTGCCCTGTGGCGAATTGGTACCTCCCAATGTTCCTAGAAAGGGGCAGAAGAAAGTGGAGCGGCTTGTGGCCCCTACTGGGAGCGGGAAGACTACCAAGTTGCCTATGAAGTACTACAGTGATGGCTACAGTGTGCTAGTGCTCAACCCGAGTGTAGCAACAACGCGCTCGGTGGGGGAATATATGAAAACCGCACACAAGGTAAATCCAAATATCAGAACTGGTGATGGGTGTATCAACAATGGGAGTCGACTGACTTATAGTACATATGGTATGTTCCTCACACAGCCCACATTTCAAGACGATGTGATCATCTGTGATGAGGTGCACGCAGTTGACCCCACAACAATATTGGGCATAGGCGCTGCTCTCGCAGCTTTCCAAAGTTCTGCTAAGGCTAAGCTACTCATCCTAGCCACAGCCACTCCCCCAGGAACGCCCATAACACCTCACCCCAATGTAACCACCAAGGATTTGACCGATGAGGGCGATTTCCCTTTTCATGGTAGGAAAATAAAACTAGACAATTTGAAAAAGGGACGACACCTAATCTTCACTCCTGGGAAAAAGCATTGTGATGCCATGGCAAGAGACCTCAATGACCTTAATATCAATGCTGTGGCTTACTACAGGGGAAAGGATGCAGGTGTCATACCAAGAGAAGGTGATGTGGTAGTTGTTGCCACTGACGCCCTAATGACAGGTTACACTGGCAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGCCTGCAAGTTGAGGCCCACTATGAATTGAATATGAACCCAACATTTTCTCTTTCAATTAGGACTAAAAATGCAGACGCGGTTACGCGAATGCAACGTAGGGGCCGTACAGGCAGGGGGAAACAAGGCACGTATTATCAAGTAACACCACATTGCGCCACGCATGGCATAGTACCAACAGCTAATGTCATCGAGGCGTTTGATTCCGGATTGGCATATTACGGCATGACCCCTGCAGAGGTAACAAAATTTCTCTCCTTTTACAAAGAAGAATCAATGACAGCCGCATTCGACTGTAACATCCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTCATGACGCTCGGGTTTGTAGAACCCGCCATCCTAGAACGGATGAAAAAGGAAGCTGAAAACTACACCTATTTGTATGCTGCACAATACTCTGAGGCACAGGCGTGCGGCGCACAGGCCCCCAATGATAACAAGATTTGGCGGGGCCTGAAAGGGACTGCTCCTTTCCCCATCCTTTATGACTTGGAGGAGTACGACAACAGTCGCTGTCAAGGGTCTTCACGGGCTGAGAGGATAGCGTCTTGTTTCCAGGAGTACTTTTCCAATGGCCTGGTCACTCTGGCTGGGATAGGTCTAGCAACAGCAGCCGTATTTACGGCCATAGACCTACTTGGGAACGTGTGTATTAAAAGGGTATACACGTTCACTACCGACTCCTCAGCAGCACGAGTAATAACTCCGGGCGACCCTGACCCCACGGAAGCTCTGGAAGAGTGCTACAATTGGGATGGTTTTGCTGAGAATGTCCAACGAGCTTCACATTGGCTGGCTGATAAGCTCGTTGAGGTCGGTAGAGCAGGGGGAGGCAAGTCTCCCTATGAGAGATGGGCAGTAGATCATGTGCCCCATGTTCTCGCTGCTATACAGTATTTTGCAGGGCTCACGTGTCTGCAAGACGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGATTTGTGGGGGGAGTATTGAGTCCACTGCCCCTCAAGGCCAACCTATTCCTTACTGCATTAGGTGGCGCTTTTGCAACAAAACTCACCACACAGCGAGGAGCAGCTGTGTTTGCCCTGGCAGGGGCTTTGGGGGCCACAACTGGTTCTCTGAGTCTCGGTAAGGTAGCTGTTAATGCGGCAGCTACATATGGGGCTGCCACGGCAACTTGTTTGGTAGTTCTCAAGCTCATAGATGGTCAGATGCCCGATATGAGTGAGCTGGCTTCGTTGGCATTCAACCTTGCAAGCCCCGGTGCATGTATTGTGGGAGCAGGGTCCGCTCTGCTCATCGCGTACTGTACTCGGACCGAGTCTCAGGTTTGGATGAATCGATTGTTGGCCATGCTCCATCGGGGAACTAGCTGTGAGGACTATTTTGTTGCATCCACTACATTGAGGACCAACATCATCAAGGTTCTCGAGCAGGCAAACTTGTGGGCTGTTTTTAAATGGCTCGCGAGTTGGCTCAATTCGCAGGACGAGGATCTGTGCACTCCTCGAGGTGCGTTTATGGACTTCTTCCACTCTGTGGGACAGGTTCTAAGACTCATCGTCGAGGCCGTGCGCGGCTTTCTCGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTGAACTGTGACAGGGGGTACAGTGGTCTATGGGCTGGGTCTGGAATAGTCACATCCACATGTGGGTGTGGAGCCGAAACGGTTTGGAATGTTCTAGAAGGGAAAGCCCATTGGGTAGCAGGGCCCCGCACTTGTTCATCTTGGTGGACGGGTAGGGTGCCCGTAAACAACTCCATGGTTGGCTGCCCACGACCACGACCAGCCAGTTGGACCACAATGGCTGTCAACACAGGATTCAACTCATATGTGACTTATGAGAGACGGGGAGAGGACGTATATGTCACCGGGATCTCCTCCCCTGCCCAGGTAGTTGAGGCTGCAGTCCCCGACCTGATCAGCGCGGTCGCTGTAGATGGAGTCCAGGTTAAGCCCTTTGGTGGAACAGGTTGGAAAAAGGTTGGGAAATTTGACTGCCGCTTCAGGAGAGGTGATAAAACCACAGACCTTAAGTTACCCTTCAAATTGGAGCCTTGTAGGGAACCTTACCGTGAGGTTGGGTGTCCTTTACCAGATACTCTAAGGCAGGTGTCTCTGACCGAGCGGGTCATGAGCTTGGGCAAGGCTGCACCGCCGCCCAGGCCAAAACCAGCAGGTTCTTTTGACGGAATGCCGGCGGTCAAGAAGCCTACCATTTACGATTCTGGTAGTGACATCGAGTCGCCGGGAGACCTGATGAGACAGTTGTCTAAGGGTTATGGGAAGCTCAAAGAGTTGGAAAAAGACCTCCCTAAACCTGTGGAACGGTCAGATCCCCTTGAGGTAATAGAGGTCGCCTCGGATGACGAGTCTTCCTCTGATGCCCCATTGGTTAAGGACCAACCACAAAAACCACGCAAAGCGGGAAAAGTCATTGTCACCAAAGCCCTTTTGAACCCGCGTGCCCCCTCATTTGTCCCAAAGAAAGTTAAATTGGCCAAGGGAGCTGTCCCGCTACCTTGTGTGGCGCGGAAGGGGGAGACCAAAAGCGTGGAAGCCTATTCATTGTTGTCCTCTAGTTGGGAGACTGCTAGCAGTAACGATTCAGCCTGTTCTTCTTGGTCATATAATTGGTCCCTGCCAAAATTAGTTTATAAAGGATTCAAGAGAACAATTTCAGCAGTTTCCACTTACACATTTGGCATAATGAGGTACAAACCGTTGGTGTATACAACTGACCCAAGTTCCATCAACGAGAGAATTAGGAAAGTTACAATTGAAAGGACACGCACTGAGTTTCCTGAGCTCAGGCGTGAGATCCAAAAAGCCAAACAGAAAGTGAGGGACCTGAACCTAAGAGAGCTTGAATTGGATGAAGCTCTGGCGCTAACGCCCAATAAAACGGCGAAGAGTGCTATCACAGGCGCCACTGGGAAGTCGGTGAAGACCCACCCAGCAGTGGTTCGGGAAGTGTATGATCTGTTGTCACAAGGGAAAATAGAAAGGCCATGGAATGAGGTGAACATAATGCCTAAATCTGAGATTTTTGTTTTGTCACCAGAAAAGCCTACAAAGAAGCCCGCTCGCATCATTGCATACCCTCACCTTGAGATGCGAGTGGTGGAGAAAATGGTTCTGGGGGAAATTGGCCCTACGGTAGTGAAGACTGTGTGCGGACAAGCATATGGTTTCCTATCCCCCCAGGAGAGAGTGCAGAGACTGGTGTCGATGTGGAACTCCAAGGACGCTCCTTGTGGATTCACGTGTGATACCACGTGCTTTGACTCTACCATAACACCTGAAGACATTGCGGCCGAGTGTGAGATCTATGAAGCCGCCACCACAAACCCTGATACGAAAGCTAGGATTAGAACTCTCCACACTAATCTGTACCAGGGAGGCCCCATGGTGATGCAAGGAACCTACGTAGGTGAGCGTCATTGTAGGGCTAGTGGTGTCTTTACAACTTCATCTTCAAACACCTTGACATGTTATCTCAAAGTTTCTGCAGCAGCTAGGAAAGCTGGGATAAAAGACCCCAGTTTCTTAATAGCAGGGGACGATTGTGTCTGCATCTTTGAATCAGAAATGGGTAGAGACAAAGATCGGTTGGGCTTGTTCACTACCTACATGAAGCAGATGGGGGCGCCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTACTATCATCTTGAATTGTTAGATAGCTGCTCATCTAATGTGTCGCTGGCACAAACTACCAGCGGCCAATTCCACTATTCGACAAGGGATCCAAAAACACCGTTAGGTCGAATTAGTGTTGAGGGAAAGGGGTTCAACCCTCTAGGCAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAACTACCCCGCTGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTTTTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACACCAAAAACAATTACATTTGATTGGTATGGAAATAATTACACAGTTCCTGTTGTAAAAATTCCTTACATAATAGAAGCCATACATGGGAAACCTTGTTGGCATATTAGGCAATACACTAGTAGGGAAATTAACAGAACTAATCAGGCCCTAAAAGATTTGACAATTAGGCCACTAAGATTCTATAAACGTGCGGCCCGCCAAGTAGTTGCTCTGTGTAGAGCTCGAGGTGGAACCTTGAGATTTCTTGCAGATACGCTGTTGGCTTGGGTCCACGGCAGGACTGTGACGCTCGAGCCTCGTAAAGTTAAGCAGGCTAGAGCATTTAAATTTTGGGAGCCTTATGAACAAAATTTTGATGAGGATACAATTAGATTGAAAATGAATTGGCTGCTATTAGCGGCCCTAATTGGCTCCATACTTTTAATTTGGTTTAAAGGTTAAATTTTAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCACGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGAGTCTGGCGTCAGTAACCGTCTCGGGACGCTGGCTCACATCCCCTTCCGGCTTCGGGGCTTGGCAACCCCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAGGCG
| 26,724
|
ON391061.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-WZS1-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,958
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-WZS1-2020, complete genome
|
CACTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCAAGAGAGTCACTCCTTTTTTTCTTTATCTCTTGCCGCTGGGCTGGTTAATGGCACAGATGTGGGACAGGTTTTACCTCTCCGTGATCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCCGGTCCAGTGGGCCCCCAAGGATTGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTACCGGGACGGAACTCCCGGGGCTAGGATTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTAACCTAGTTTGGGCATGCCCATAGGGATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGTGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTCTTTTCAAAAACCCGTAACTTTAAGTCTTGTACCGCATGGTTTTCCATGCTGTTTTGTGTGAATGTGTGTATGTGTGTTGGGAATGGTCGGCCTCGCGGCCGAGTTGTGAAGGGTGTGTATGTGGTGCACCCAAAAAAGACGGTGGACCAAGGTGTGCGAAGGAAGCGTAGGCCCCGACGCGACTTGGGCGGCTGGAGGAGGTCTGCTATAGGCCCCATGGATCCTTATTTCCGGACAGCTGTTCAAGCCATTGCACCTAGTCCTGCCTACCCGTCTCGTGACCCCAGACGTCAATCTCGATTCTTGGGACATGTCATAGATGGCACACTGGGCTGGGTGACAGATGTTGTCCACCATGTACCTCTTGTAGGGCCTCTGGTTGGCCACCCACTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTGAGGTCAGGTGAGAATGCTATTAATTCCCTCACAGGCACTGTAGGTGTGCACTTGTTTATTCTTGCTCTTTTCTCCTGCTTGTGTCCTGCTACAGCAGTTTCAAATTGTTGCACCCCTGATCAGGTAGTATACTGCACTGAGGTAACATGCGTCCACGAGACCGGATGCATAATATGTGAGCAGAAGGATGACCAGGTGATATGCTGGGCCCCCGCAGGTCTATTGGTATCTCATCCCCCAAACTATACAGGGATAGATCCATTCTTAACCCAACATATAGATTTTGTTGCGGGGACTACGTTCATCTGTGATCTGACCGGGATGCGGGAGGTGTGCGGCGTAGCTGTGCTATTATCCGCTACAGCCTTGGAACTCCTACCCCGGCCGGTTAAATTGAACACAACTGCAGACTGCTATCTGTTCATTGACTCAGGGGTTGATCCTCTTTTTGCTTCCTTCTTTACCTGGTTGGCTGAGGAATTCTCTACTATCACGGCAATCCTTGACTTCATTTCGAAGGTCCCTAGCGCTTTGGCTCATGCTTTCACTCGAAGCCATTTCTTAACTATGTGTAGTATAGCTGGGTTGGCCCTTAATGGCAACATGGCGAAGGCTTTTGCTCTGGTGGTGTTGTACATTGAGGCTGCCGCGGCAGCCCCTATGTCAGTTGAGTCGTTAAAGTACCCAGAGTTAGGTGCCGGTTGCCCGTTGCTGTCTAGGCCCCCCAGATGTGCTAATAGAACTTCTTTTGGATCTACTATATACTGTTTCCACCCCAAATTTGGTTTCCAGCGCTCAGACAAGGGTTGGCCCCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGAGCTGCAACAATAAACAATTATACTAATTTGGCATGCTGCACTTTGCGAGTCACTCCAGCATTTTGTCACAATTGTAGCTCTGACTGCAGTTGGGCTGATAAGAGGCAGACGTTCGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTTTCGACCGCCTGCAGTCCTAATGCAATATCAGCTCTTGCCTCGGTGCTCCCCACCATAGCTCCGAGGTTGCCCAACCAGACTTGTATGCCCACTGTAGTCGCAGGGTTGTCAATCGGGCCTCTAAAATCTCCAGGTCCTGCTAGTTATGTTAGCTTAGTACATGGGAGCTGGCTTACTTACCATTACTACCCTCACAGGTTAGCAAAGTTAGACTACAAGCATTGGGCTAGGTTGCCCGGGACTCCCCCGACATATAGGGGTTCCTGGATGACAGTCCCCAAGGGAATGTACAGCTCCAGGAAAGACATCTCCAGCGGTTTGGTCATCAAAGATAGGGCTAACCAAGACTATCAATTGCTCTTTTCGGGGGTGGGGACTTACATCATACCCGGAATAACGGAGCATGTGGTGATCATAGCCTTGTTGGCTGCTTTCGGAGCACGCTGGTGTTTGTTTCTTTATGCCATGTACAACTGGTTGCCTGGGGCTTTTGCTTTCACGCCTGAAGTGATAGCCGCCACTGCGTCTTCTCCGTGGGAGGATCCAGTGGTGAGGGCTGGAGTGTACTTCGCCTCCTTGTGGCGCTCCCCCCTTTCAATCCCACTCTGCGGGAATCTAATCTCTTTTGCATTGCTGTCCTTTTGTCATGCTGTCCAGGCCTTTTCCACATCTGATATCCTGTTTGCTGCTGGTTCAGTGACTCTATTTACTGCCTGGGCTGGATTGTTTTCTCGCTTTATTCCCATGCTGTTGCTTACCCAGTCCTACTTGCGTGTTAGGTTGGAGGCATTTACTAGATCTTGGCTTGACCGCTCTTTGTTGTTTGTCTGTGTGATTGTGATACCTAACGCTGTGTGGGACGTGTGCTTGGTCCTTTGGGTCTGTTGGCTGTTGCTAGTCGTTGGAGGTCATCTTGCAGTATGTTTGTGGGGCCCTAAGGACAAGGCTAGTTTGCATTTGCTGCTAGTTAGACTCAGGAAGTGTGGATCCTGGTTATCAAAGAGAGTTCGGCCCTTGGTCATCTGGGCCGCAGGCGAGAATGGTGTGTTTTGGTTTGACCACATAGATGGAAGCTTGGAGGGGGAGTGGGAGTTTAAAGACCCCTATTTCCCATTCCAGACGGAGATTGAGGTGGCGCAGGATGTAGGTCAGAAGCTGGCTTGCGGCGATCAAATCCGCGGCTTGCCAGTTTATGCCAGGTCCGGCTCCACTGTTAGAGCGGGCATCGCACAGCTGCCCCGTGGTTGGAAAAGAACAATCCCATTCTCAGTCAAAATTACTAGCCAGAGGAATCAGCTTAAAGCTCTGGCTTTGTGCTTGACCGGGGGAGACAGCAGCAGCTACCAGGGAACCGTAGCAGTCATAGGAACCCCCTTGAGATCTTGGATGGGGTTTGGATGTTTGGGGTCTTTGTACACGGTCTACCATGGGGCAAGAACAAGGCTTCTCGCTTCCAGGGATGGGCCAAGACCTCCCACCCTAGTCAATTCCCAAGTTGATTTGGTCAAGTACCCGCTGCCAACTGGTATGGAATGTTTAGACATTTGTGACTGTAATTGTGCAGAGTTTTATTTGGTCACACGGCTGGGAAACCTAATTCCCTGCGTGCAGGTCGAGGGGAGGTTCTGCAACACTGCACCCCTAACCTTGGCTGAAGCTAAAGGAAGTTCTGGAGCCCCAATCGTGTGTAAGTGTAGGAAAGTGAAAGCCATGTTCCTCTCGTGCCGTAGTAGCCGCGGAGTTGTCAGCAGCTTCGGGGTGCATATGGTACAGAAAGACCAGGTGGCAGACAGCAGAGTACTACCCTGTGGCGAGTTAGTCCCTCCTAACGTACCCCGGAAGGGCCAGAAGAAAGTGGAGCGGATCGTGGCCCCAACGGGTAGTGGGAAGACTACAAAATTGCCTATGAAGTACTACAGTGATGGCTACAGTGTGTTAGTGCTCAACCCGAGCGTAGCAACAACCCGCTCGGTGGGGGAATACATGAAAACCGCCCATAAGGTAAACCCAAATATTAGAACTGGTGATGGCTGCATCAATAATGGGAGTCGACTGACTTACAGTACTTATGGAATGTTCCTCACACAGCCCACATTTCAGGACGATGTGATTATCTGTGACGAGGTGCATGCAGTTGACCCTACCACAATATTGGGTGTAGGGGCGGCACTTGCCGCCTTTCAAAGTTCTGCTAAGGCCAAGCTACTCATCCTAGCTACAGCCACTCCCCCAGGAACGCCCATAACGCCACACCCCAATGTGACCACAAAGGATTTGACCGATGAGGGCGACTTTCCCTTCCATGGTAGAAAGATAAAATTGGATAACTTAAAGAAAGGTAGACATCTCATCTTCACACCAGGGAAAAAGCATTGTGACCAAATGGCAAGAGATCTCAATGACCTTGGTATAAACGCAGTGGCTTACTATCGCGGTAAGGATGCTGGCGTAATACCTAAGGAAGGTGACGTGGTGGTAGTTGCCACCGACGCCCTAATGACTGGTTACACTGGAAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGTCTTCAGGTTGAGGCCCACTACGAATTGAACATGAACCCAACATTTTCATTATCAATTAGGACCAAAAATGCAGACGCGGTTACGCGGATGCAGCGTAGGGGCCGAACAGGTAGGGGGAAACATGGAACGTATTACCAAATTACACCACATTGCGCTACGCATGGCATTGTCCCAACGGCAAATGTCATCGAAGCGTTTGATTCCGGATTGGCTTATTACGGCATGACCCCCGCTGAAGTCACTAAATTTCTCTCCTATTACAAAGAAGAATCAATGACAGCCGCATTCGACTGTAACATCCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTCATGACTTTGGGCTTTGTAGAGCCTGCCATCCTTGAACAGATGAAAAAGGAAGCTGAGAATTACACCTATCTCTATGCCGCACAGTACTCTGAGGCAAAGGCGTGCGGCGCTCAGGCCCCCAACGACAACAAAATCTGGCGGGGCCTGAAAGGGACTGCTCCTTTCCCCATCTTGTATGATTTGGAGGAATATGATAACAGCCGCTGTCAAGGGTCGAGTAGAGCTGAGAGGATAGCGTCTTGTTTTCAGGAGTATTTCTCCAACGGCCTGGTGACATTGGCCGGAGTAGGTCTTGCGACAGCAGCCGTCTTCACGGCTATAGACCTGCTTGGGAACGTGTGTGTAAAAAAGATCTACACGTTCACTACCGACTCCTCAGCTGCACGAGTGATAACTCCAGGGGATCCGGACCCCACGGAGGCCCTGGAAGAGTGCTACAACTGGGATGGTTTCGCTGAGAGTGTCCAACGGGCTTCACATTGGCTGGCAGATAAGCTCGTTGAGGTCGGTAGAGCCGGAGGTGGAAAGTCGGCTCATGAAAGGTGGTTAGTCGACCATGTTCCCCACGTTCTGGCAGCAATTCAATACTTTGCAGGGCTCACGTGTCTCCAAGATGCGCCTGCGCTAGGGTCAGTCCTAGGATTTGTCGGGGGGGTTTTGAGTCCACTCCCCCTGAAGGCCAACCTATTCCTTACTGCTTTAGGTGGCGCTTTTGCAACAAAGCTCACAACACAGCGAGGAGCAGCTGTGTTCGCCTTGGCGGGGGCTCTGGGAGCCGCAACTGGTTCCCTCAGTCTCGGTAAGGTGGCCGTTAATGCGGCGGCTACTTATGGGGCAGCCACGGCGACATGCTTAGTAGTCCTCAAGCTCATAGATGGTCAGATGCCCGAAATGAGTGAGCTGGCCTCGTTGGCATTCAATCTTGCGAGCCCTGGTGCGTGCATTGTGGGGGCTGGCTCAGCTCTCCTCATTGCTTACTGCACTAGAACCGAGTCTCAAGTTTGGATGAATAGGTTGTTGGCTATGCTCCACAGGGGAACTAGCTGTGAGGACTATTTTGTTGCTTCAACCACACTAAGGACCAACATCATAAAAGTTTTGGAACAGGCCAACTTGTGGGCCGTGTTTAGATGGCTCGCAAGCTGGCTTAACTCGCAGGACGAGGATCTGTGTACCCCTCGAGGTGCGTTTATGGACTTTTTCCAATCAGTGGGACAGGTCCTTAGACTCATAGTAGAGGCGGTGCGCGGCTTCCTTGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTGAACTGTGACAGGGGGTACAGCGGTCTATGGGCTGGGTCTGGGATAGTCACATCCACTTGTGGGTGTGGGGCTGAGACAGTCTGGAATATCCTTGAAGGTAAAGCCCATTGGGTGGCAGGGCCTCGCACATGTTCATCTTGGTGGACTGGTAGAGTGCCCGTAAACAATTCCATGGTAGGCTGCCCACGACCGCGACCAGCCAGTTGGACCACAATGGCAGTTAACACAGGCTTTAACACATATGTAACCTATGAAAGGAAAGGGGAAGACGTTTATGTCACCGGGATCTCTTCCCCCTCACAGGTAGTAGAGGCTGCAGTCCCCGACCTGATCAGCGCAGTAGCTGTAGATGGTGTCCAGGTCAAGCCCTTTGGTGGAACTGGATGGAAGAAGGTAGGGAAGTTCGACTGCCGTTTCAGGAGAGGTGATAAGACAACAGACCTTAAGTTACCATTCAAATTGGAGCCTTGTAGGGAGCCCTATCGCGAGGTAGGCTGCCCTTTGCCAGACACCCTTAGGCAGGTGTCTCTGACCGAGCGGGTGATGAGTTTGGGTAAGGCAGAAGTGCCCCCCAGGCCAAAGCCCGCTGGGTCATATGATGGGACCCCGGCGGTTAAAAAGCCTACCATATACGATTCTGGTAGTGATATAGAATCGCCGGGCGACCTGATGAGGCAACTGACAAAGGGATATGGCAAGCTCAAAGAATTAGAAAAAGATCTCCCTAAACCTGTAGAAAGAACAGATCCCCTGGAGGTCATTGAGGTGGCATCTGACGATGACTCCTCATCTGACGCCCCATTGGTTAGTGGCCAACCAAAGAAACCACGCAAGGCGGGGAAGGTTATAGTCACCAAGGCCCTACTCAACCCGCGAGCTCCCACTTTTGTGCCAAAGAAGGTTAAGATCGCAAAGGGTGCGATTCCTTTGCCTTGTGTGGCGCGAAAGGGAGAGACCAAGAGCGTGGAAGCCTACTCCTTATTGTCCTCAAGTTGGGAAACTGCAAGCAGTAACGATTCAGCCTGTTCTTCTTGGTCATATGATTGGTCACTTCCAAAGTTAGTTTATAAAGGATTCAAGAGAACAATCTCAGCAGTCTCAACGTATACATTTGGAATTATGAGGTACAAACCATTGGTATATACAACAGACCCAAATTCTATCAATGAAAGGATTAGGAAAGTCACAATTGAAAGAACACGTACTGAGTTTCCTGAACTTAGACGTGAAATTAACAAAGCTAAGCAGAAGGTGAGGGACCTGAACCTAAGAGAGCTAGAAATAGAAGAGGCTCTGGCGCTGACACCAAACAAGACTGCAAAAAGCGCAGTAACTGGCGCCACTGGGAAGTCTGTGAAGACCCACCCAGCTGTAGTTCGGGAAGTTTATGATCTGCTGTCCAAAGGAACTATAAGTAGACCCTGGAATGAAGTTAACATCATGCCTAAATCAGAGATATTTGTGTTGACTCCAGAAAAGCCTACAAAGAAGCCCGCCCGCATCATTGCTTATCCCCACCTAGAGATGCGGGTAGTGGAGAAAATGGTCCTGGGGGAAATTGGGCCAACGGTAGTGAAGACTGTGTGCGGCAACGCGTACGGATTCCTATCACCCCAGGAGAGAGTTCAGAGACTGGTGTCAATGTGGAACTCAAAGGATGCGCCCTGCGGGTTCACGTGCGATACCACGTGCTTTGACTCAACAATCACACCAGAAGACATAGCTGCGGAGTGTGAAATCTATGAAGCAGCTACCGCCAATCCCGATACTAAAGCCAGGATCAGAACTCTCCACACTGGTCTGTATGCGGGAGGCCCCATGGTGATGCAAGGAACCTACGTGGGTGAGCGTCATTGTAGGGCCAGCGGTGTCTTTACTACATCATCATCAAATACCATGACATGCTATCTCAAGGTATCAGCAGCAGCTAAAAAAGCAGGAATTAAAGATCCTAGCTTTCTGATAGCGGGGGACGATTGTGTCTGCATATTTGAATCAGAAATGGATATGGACAAGAAGCGGTTGGGCTTGTTCACAACATACATGAAGCAGATGGGGGCACCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTATTACCATCTTGAGTTGTTAGATAGCTGCTCTTCAAATGTGTCACTAGCACAAACATCTAGTGGCCAATTCCACTATTCCACTAGGGATCCTAAAACTCCATTAGGTAGGATAAGTGTAGAGGGCAAGGGGTTTAACCCTCTAGGCAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAACTACCCCGCTGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTTTTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACACCTAAAACAATTACTTTTGATTGGTATGGAAACAACTATACAGTTCCTGTTATAAAAATACCCTACATTATAGAGGCCATACACGGGAAACCTTGTTGGCATATTATACAATATACAAGTAGGGAAATAAATAGAACAAATCAGGCACTAAAAGATTTAACAATTAGGCCATTAAGATTCTACAAACGTGCTGCTCGTCAAGTAGTTGCTCTGTGTAGAGCTCGAGGTGGTACCTTGAGATTCCTCGCAGACACGCTGCTTGCATGGGTGCACGGCAGGACTGTTAGGCTCGAGCCTCGAAAAGTTAAGCAGGCTAGAGCTTTTAAATTTTGGGAGCCATATGAACAAAATTTCGATGAAGATACAATTAGGTTTAAAATGAATTGGCTGCTAGTAGCAGCACTAATTGGCTCCATATTCTTAATTTGGTTTAAAGGCTAAAATTTAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCCCGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGGTCCGGCGTCAGAACCGTCTCGGGACGTCGGGCCAACCCCCCTTCCGGCTTCGAGGCTTGGCAACCTCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAGG
| 26,725
|
ON391062.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-DZ5-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,958
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-DZ5-2020, complete genome
|
CACTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCAAGAGAGTCACTCCTTTTTTCTTTATCTCTTGCCGCTGGGCTGGTTAATGGCACAGATGTGGGACAGGTATTATCCTCTCCGTGATCTGGTTGGCTGGAGTCTAATTAGCTCAGTGGGCCCCCAAGGACTGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTACCGGGACGGAACTCCCGGGACTAGGATTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTAACCTAGTTTGGGCATGCCCATAGGGATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGTGCTGCACGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTTTTTTCAAACCCTCGTAACTTTAAGTCTTGTACCGCATGGTTTTCCATGCTGTTTTGTGTGAATGTGTGTATGTGTGTTGGGAATGGCCGGCCTCGAGGCCGGGTTGTGAAGGGTGTGTATGTGGTGCACCCAAAGAAAACGGTGGATCAAGGTGTGCGAAGGAAGCGTAGGCCCCGACGCGACTTGGGTGGTTGGAGGAGGTCTGCCATAGGCCCCATGGATCCTTATTTCCGGACCGCCGTCCAAGCCATTGCCCCCAGCCCTGCCTACCCGTCCCGTGACCCCAGGCGTCAATCAAGATTCCTGGGACATGTCATAGACGGCACACTGGGCTGGGTGACAGATGTTGTCCACCATGTACCACTCGTCGGGCCTTTGGTTGGCCACCCATTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTAAGGTCTGGCGAGAATGCTATCAATTCCCTCACGGGCACCGTTGGAGTGCATTTGTTTGTGCTTGCTCTTCTCTCCTGCTTGTGTCCTGCTACAGCAGTGTCAAATTGTTGCACCCCTGACCAGGTAGTGTACTGCACTGAGGTTACATGCGTCCATGAGACCGGATGCATAATTTGTGAACAAAAGGATGACCAGGTGGTATGCTGGGCTCCCGCAGGTCTATTGGTGTCTCATCCCCCAAATTACACCGGGATAGACCCTTTTCTAACCCAACATATAGACTTTGTTGCGGGAACTACATTCATCTGTGATCTGACCGGGATGCGGGAGGTGTGTGGCGTAGCTGTGTTATTATCCGCTACAGCCTTGGAACTTCTGCCCAGGCCAGTTAAATTAAACACAACAGCAGATTGCTATCTGTTCATTGATTCAGGGGTTGATCCTCTTTTTGCTTCCTTCTTTACCTGGTTGGCTGAGGAATTTTCTACTATCACGGCAATCCTTGACTTCATTTCGAAGGTCCCTAGCGCTTTGGCTCATGCTTTCACTAGAAGCCATTTCCTTACTATGTGTAGTATAGCTGGGTTGGCTCTTAACGGTAACATGGCAAAGGCCTTTGCTCTGGTGGTGTTGTACATTGAAGCTGCAGCTGCGGCCCCAATGTCAGTGGAGTCGTTAAAATACCCAGAGCTTGGCGCCGGATGTCCGTTATTGTCTAGACCTCCCAGGTGTGCTAATAGAACTTCCTTTGGGTCTACTATCTACTGTTTTCATCCCAAATTTGGTTTCCAGCGCTCTGACAAGGGTTGGCCTCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGAGCTGCAACAATAAATAACTACACTAATTTGGCTTGCTGTACTTTACGAGTCACTCCAGCATTTTGTCACAATTGTAGCTCTGATTGCAGTTGGGCCGATAAGAGGCAAACGTTTGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTCTCGACCGCTTGCTCTCCAAATGCTATATCGGCACTTGCCTCGGTGCTCCCCACCATAGCCCCGAGGCTTCCCAACCAGACTTGCATGCCCACTGTGGTCGCGGGGTTGTCAATAGGCCCTCTCAAATCTCCGGGGCCGGCTAGTTACGTCAGCTTGGTACATGGCAGCTGGCTTACCTACCATTACTACCCCCACAGGTTAGCAAAGTTAGACTACAAGCATTGGGCTAGATTGCCCGGGACCCCCCCAACATATAGGGGTTCCTGGATGACGGTCCCTAAGGGAATGTACAGCTCTAGGAAAGACATCTCCAGTGGTTTGGTCATCAAGGATAGGGCTAACCAAGACTATCAACTGCTCTTTTCAGGCGTAGGGACTTATATCATACCTGGAATCACTGAGCATGTGGTGATCATTGCATTGTTGGCAGCTTTTGGAGCACGCTGGTGTTTGTTTCTGTATGCTATGTACAATTGGTTGCCTGGAGCTTTTGCTTTCACTCCTGAGGTGATTGCTGCCACTGCGTCTTCTCCGTGGGAGGATCCGGTGGTAAGGGCTGGCGTCTACTTCGCCTCCTTGTGGCGCTCACCCCTCTCAATCCCACTCTGCGGGAACTTAATCTCTTTTGTGTTGCTGTCTTTCTGCCACACTGTCCAAGCCTTTTCCACATCTGATATCCTGTTTGCTGCTGGTTCAGTGACTCTTTTTACTGCTTGGGCTGGATTATTTTCTCGCTTCATTCCCATGCTGTTGCTTACGCAATCCTATCTACGCGTTAGGTTGGAGGCATTTACTAGATCTTGGCTTGACCGCTCTTTGCTGTTTGTATGTGTGATTGTGATACCTAATGCTGTATGGGATGTGTGTTTAGTCCTGTGGGTCTGCTGGCTCTTGTTGGTTGTTGGAGGACATCTAGCAGTGTGTTTGTGGGGCCCAAAGGACAAGGCTAGTTTGTACTTACTACTGGTCAGACTAAGGAAATGTGGATCCTGGTTGTCAAAGAAGCTGCGGCCACTTATCATCTGGGCTGCAGGGGAGAACGGTGTGTTCTGGTTCGACCACATAGATGGAAGCTTGGAGGGCGAGTGGGAGTTTAAGGACCCCTACTTCCCCTTTCAAACGGAGGTTGAAGTGGCGCAGGATGTGGGGCAGAAACTAGCATGCGGCGATCAAATCCGCGGCTTGCCGGTGTATGCCAGATCCGGTTCCACTGTTAGAGCGGGCATAGCACAGCTGCCCCGTGGTTGGAAGAGGACCATTCCATTCTCTATAAAAGTAACCAGCCAGAGGAATCAGCTTAAAGCTCTGGCTTTATGCTTGACCGGGGGTGACAGCAGCAGCTACCAGGGAACCGTAGCAGTTATAGGAACCCCCTTAAGATCTTGGATGGGGTTTGGTTGTTTGGGGTCTTTGTACACAGTCTACCACGGAGCAAGGACTCGACTCCTCGCTTCTAGGGATGGACCTAGGCCCCCTACCCTAGTCAATTCCCAAGTTGATTTGGTCAAGTATCCCCTGCCAACTGGTATGGAGTGTTTGGACATATGCGACTGCAATTGTACAGAGTTCTATTTGGTCACGCGATTGGGAAACTTGATTCCTTGTGTGCAGGTTGAAGGGAGGTTCTGTAATACAGCGCCTCTAACTTTGGCCGAAGCAAAGGGAAGTTCTGGTGCCCCGATCGTGTGTAAATGCAAAAAGGTGAAAGCTATGTTCCTCTCATGCCGTAGCAGCCGTGGAGTTGTCAGCAGCTTCGGGGTGCATATGGTACAGAAAGACCAGGTGGCAGACAGCAGAGTACTACCCTGTGGTGAGTTAGTTCCTCCCAATGTGCCCCGCAAGGGCCAGAAGAAGGTTGAGCGGATTGTGGCCCCAACGGGTAGTGGGAAAACTACAAAATTGCCTATGAAGTACTACAGTGATGGCTACAGTGTGTTAGTACTCAACCCGAGCGTCGCAACAACTCGCTCGGTGGGGGAATACATGAAAACTGCACATAAAGTAAATCCAAATATTAGAACAGGTGATGGCTGTATTAACAATGGGAGTCGACTGACTTACAGTACCTATGGAATGTTCCTCACGCAACCCACATTTCAGGACGATGTGATAATTTGTGATGAGGTTCATGCAGTTGACCCCACTACAATATTGGGTGTAGGGGCAGCCTTAGCTGCCTTCCAAAGTTCTGCCAAAGCAAAGCTACTCATCCTAGCAACAGCTACTCCCCCAGGGACGCCCATAACGCCACACCCCAATGTGACCACAAAGGATTTGACCGATGAGGGTGATTTCCCCTTCCATGGTAGGAAAATACAATTGGATAATATCAAAAAAGGTAGACATCTCATTTTCACGCCAGGGAAAAAGCACTGTGATCAAATGGCAAGAGAACTCAATGATCTCAACATAAACGCGGTGGCATACTACCGCGGGAAAGATGCTGGTGTGATACCCAAGGAAGGTGATGTAGTGGTAGTAGCCACTGACGCCCTTATGACTGGTTACACTGGAAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGTCTTCAGGTTGAGGCCCACTACGAATTGAATATGAACCCAACTTTTTCATTGTCAATTAGAACAAAGAATGCAGACGCGGTTACGCGGATGCAGCGTAGGGGCCGTACTGGTAGGGGGAAACATGGAACATATTACCAAATTACACCACATTGCGCTACGCATGGCATTGTTCCAACGGCAAATGTCATCGAAGCGTTTGATTCCGGATTGGCGTATTATGGAATGACCCCTGCTGAAGTCACTAAATTTCTCTCCTATTACAAAGAAGAATCAATGACTGCCGCATTCGACTGTAACATCCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTCATGACATTAGGCTTTGTTGAGCCTGCCATCCTTGAGCAGATGAAAAAGGAAGCTGAAAATTACACCTACTTGTATGCTGCACAGTACTCTGAGGCAAAGGCGTGCGGCGCTCAGGATCCTAATGACAACAAAATTTGGAGGGGCCTAAAAGGGACTGCTCCTTTCCCCATCTTGTATGATTTGGAGGAGTATGATAACAGTCGCTGTCAAGGGTCGAGTAGAGCTGAAAGGATAGCGTCTTGTTTTCAGGAATACTTCTCCAACGGCCTGGTAACATTGGCCGGGGTAGGTCTTGCAACAGCGGCTGTATTTACAGCCATTGACCTACTTGGGAACGTGTGTGTTAAAAAGGTGTACACGTTCACTACCGATTCCTCAGCTGCACGAGTTATTACACCTGGAGATCCGGACCCCACGGAAGCTCTGGAAGAGTGCTATAATTGGGATGGTTTTGCTGAGAGTGTCCAACGAGCTTCACATTGGCTGGCTGATAAGCTCGTTGAGATCGGTAGAGCAGGAGGTGGGAAGTCGGCTCATGAAAGGTGGTTAGTCGACCATGTGCCCCACGTCCTCGCTGCAATTCAGTATTTTGCAGGGCTCACGTGTCTTCAGGATGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGTTTTGTGGGGGGAGTATTAAGCCCACTTCCCCTGAAGGCCAACCTATTTCTTACTGCTTTAGGTGGCGCTTTTGCAACAAAGCTCACAACACAGCGAGGAGCAGCTGTGTTCGCTCTGGCAGGGGCTCTGGGGGCTGCAACCGGCTCTCTTAGTCTTGGTAAGGTGGCCGTTAATGCGGCGGCTACTTATGGGGCAGCCACAGCGACATGTCTTGTAGTCCTCAAACTCATAGATGGTCAGATGCCCGAGATGAGTGAGCTGGCTTCGTTGGCATTCAATCTTGCGAGCCCTGGTGCATGCATTGTAGGGGCTGGATCAGCCCTTCTCATTGCTTACTGCACTAGAACCGAGTCTCAAGTTTGGATGAATAGGTTGTTAGCTATGCTCCACAGGGGAACTAGTTGTGAGGACTATTTTGTTGCATCAACCACATTAAGGACCAATATCATCAAGGTTCTTGAGCAAGCCAATTTGTGGGCCGTGTTTAAATGGCTAGCAAGCTGGCTTAATTCGCAGGACGAGGATCTGTGTACGCCTCGAGGTGCGTTTATGGATTTCTTCCATTCTGTGGGGCAAGTCCTTAGACTCATAGTAGAGGCAGTGCGCGGCTTCCTTGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTGAACTGTGACAGGGGGTACAGCGGTCTATGGGCTGGGTCTGGGATAGTCACGTCCACGTGTGGATGTGGGGCCGAAACGGTCTGGAATGTCCTTGAAGGTAAAGCCCATTGGGTAGCAGGGCCTCGAACTTGTTCATCTTGGTGGACTGGTAGAGTGCCTGTCAACAATTCCATGGTTGGCTGCCCACGGCCGCGTCCAGCCAGTTGGACCACAATGGCTGTCAACACAGGCTTTAACACTTATGTTACTTATGAAAGAAAAGGGGAAGACGTTTACGTCACAGGGATCTCCTCCCCCTCACAGGTAGTTGAAGCGGCAGTTCCGGACCTTATCAGCGCAGTCGCTGTAGATGGTGTCCAGGTCAAACCCTTTGGTGGAACTGGATGGAAAAAGGTAGGAAAGTTTGACTGCCGCTTTAGGAGAGGTGACAAGACAACAGACCTTAAGTTACCCTTCAAATTGGAACCTTGTAGGGAACCCTACCGAGAGGTGGGTTGCCCTTTGCCTGACACCCTAAGGCAAGTGTCTCTAACCGAGCGGGTAATGAGCTTGGGGAAGGCTCAATTGCCTCCCAGGCCCAAACCTGCTGGGTCATATGACGGAACCCCGGCGGTCAAGAAGCCTACCATATACGATTCTGGTAGTGATATTGAATCACCGGGTGACTTGATGAGGCAACTGTCTAAGGGTTACGGCAAGCTAAAAGAGTTAGAAAAGGACCTCCCTAAACCTGTAGAAAGAACAGATCCTCTGGAAGTCATTGAGGTGGCATCGGATGATGACTCTTCTTCTGACGTTCCATTGGTCGGTGACCAACCCAAGAAACCACGCAAGGCAGGGAAAGTTATAGTCACAAAAGCCCTACTTAACCCAAGAGCTCCTACTTTTGTGCCTAAAAAGGTCAAACTGGCTAAGGGTGCTGTCCCTCTGCCGTGCATTGCACGAAAAGGAGAAACAAAAAGCGTGGAAGCCTACTCCCTGTTGTCCTCAAGTTGGGAGACTGCAAGCAGTAACGATTCAGCCTGCTCCTCTTGGTCTTACGATTGGTCACTTCCAAAATTAGTCTACAAAGGCTTCAAGAGGACAATATCAGCAGTTTCCACATACACATTTGGTATTATGAGGTACAAACCATTGGTATACACCACAGACCCAAATTCTATCAATGAGAGGATTAGGAAAGTAACTATTGAAAGGACGCGCACTGAGTTTCCTGAACTTAGGCGTGAGATCAATAAAGCTAAGCAGAAGGTGAGGGACCTGAACCTAAGAGAGTTAGAACTAGAGGAAGCTCTGGCGCTGACACCTAACAAGACTGCAAAAAGCGCAGTGACAGGCGCCACCGGGAAGTCAATTAAGGCGCACCCGGCTGTTGTTCAGGAAGTCTATGATCTGCTGTCAAAGGGGGCTATAAGTAGGCCCTGGAATGAAGTCAACATCATGCCCAAATCTGAGATATTTGTATTAACTCCAGAGAAGCCTACAAAGAAACCAGCTCGCATCATTGCTTATCCCCACCTTGAGATGCGAGTGGTGGAGAAAATGGTCCTGGGGGAAATTGGACCAACGGTAGTGAAGACCGTTTGCGGGAACGCATACGGCTTCCTATCACCCCAGGAACGAGTGCAGAGACTGGTGTCCATGTGGAACTCCAAGGATGCTCCTTGTGGATTCACGTGTGATACAACGTGCTTTGACTCAACAATTACACCCGAAGATATAGCCGCTGAGTGTGAAATCTATGAAGCGGCCACTGCTAATCCCGATACAAAAGCCAGGATCAGAACTCTCCACACTGATCTATACGCGGGAGGCCCTATGGTGATGCAAGGAACCTATGTAGGTGAGCGTCATTGTAGGGCTAGCGGTGTCTTCACTACATCATCATCAAACACCATGACATGCTATCTCAAAGTGTCAGCAGCAGCTAAAAAGGCTGGGATTAGAGACCCCAGTTTCTTAATAGCAGGGGATGATTGTGTCTGCATATTTGAATCTGACATGGATATGGACAAGAAGCGGTTGGGCTTGTTCACAACATACATGAAGCAGATGGGGGCACCTCAAGGAGTAGTGCCCACCCCCTACTATCATTTGGAATTATTAGATAGCTGCTCTTCAAATGTGTCGCTAGCACAAACATCTAGCGGCCAATTCCACTATTCTACAAGGGATCCTAGAACACCATTAGGCAGAATTAGTGTTGAGGGTAAGGGGTTTAACCCTCTTGGGAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAACTACCCCGCTGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTTCTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACACCTAAAACAATTACATTTGATTGGTATGGAAATAATTATACGGTTCCTGTAATAAAAATACCCTACATTATAGAAGCCATACATGGGAAACCGTGTTGGCACATCATACAATACACCAGTAGGGAGATAAATAGAACAAATCAGGCACTTAAAGATTTAACAATCAGGCCATTAAGGTTTTATAAACGTGCAGCTCGTCAGGTGGTTGCTCTGTGTAGAGCTCGAGGTGGTACCTTGAGATTCCTCGCAGACACGCTACTTGCATGGGTGCACGGCAGGACCGTTAGGCTTGAGCCCAGAAAAGTTAAGCAGGCTAAAGCCTTCAAATTTTGGGAGCCATATGAACAAAATTTAGATGAGGATACAATTAGGTTTAAAATGAATTGGCTGCTTTTAGCAGCGCTAATTGGCTCCATATTTTTAATTTGGTTTAAAGGCTAAATTATAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCCCGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGGTCCGGCGTCAGAACCGTCTCGGGACGTCGGGCTTCACTCCCCTTCCGGCTTCGGGGCTTGGCAACCTCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAG
| 26,726
|
ON391063.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-DZ4-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,962
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-DZ4-2020, complete genome
|
CTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCAAGAGAGTCACTCCTTTTTTCTTTTATCTCTTGCCGCTGGGCTGGTTAATGGCACAGGTGTGGGACAGACTGAGTCTCTCCGTGACCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCTAGTCCAGTGGGCCCCCAAGGATTGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTGCCGGGACGGAACTCCCGGATGCTAGGGTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTTATGGTACCTAGTTTGGGCATGCCCACAGGGATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGTGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTCTTTTCAAACCCAAAAAGTAACTTTAAGTCTTGTACCGCATGGTTCTCCATGCTGTTTTGTATGAATGTGTGTCTGTGTGTGGGAAATGGGCGGCCGAGAGGCCGTGTGGTTAAAGGTGTGTATGTGGTGCACCCCAAAAAAACCGTGGACCAAGGTGTGCGAAGGAAGCGTAGGCCCCGACGCGACTTGGGCGGCTGGAGGAGGTCTGCTATAGGCCCCATGGATCCTTACTTCCGGACTGCCGTCCAAGCCATAGCGCCCAGTCCTGCCTACCCGTCTAGAGACCCCAGGCGTCAATCCAGATTCTTGGGTCATGTCATAGACGGCACATTAGGCTGGGTTACTGATGTTGTCCACCATGTGCCACTCGTTGGACCTTTGGTTGGCCACCCATTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTAAGGTCTGGTGAGAATGCTATAAATTCCCTCACGGGCACTGTTGGTGTCCATCTATTTGTTTTGGCAATTCTCTCCTGCTTGTGTCCTGCAACAGCAGTGTCAAATTGTTGTACTCCAGATCAAGTAGTGTACTGCACTGAAGTCACTTGTGTCCATGAGACCGGATGCATTATTTGTGAGCAAAAGGATGACCAGGTGGTTTGTTGGTCGCCGGCAGGTCTATTGGTGTCACATCCTCCTAATTATACGGGGATTGACCCTTTCTTAACCCAACATATAGACTTTGTTGCCGGTACTACATTCATCTGTGATCTGACCGGGATGCGAGAGGTGTGTGGCGTGGCGGTGCTCTTATCTGCTACAGCCTTGGAACTCTTGCCCAGGCCAGTTAAATTGAACACTACTGCAGATTGCTACTTGTTTATTGACTCTGGGGTAGATCCTCTCTTTGCTTCCTTTTTTACCTGGTTGGCTGAGGAATTCTCTACTATCACGGCCATTCTTGACTTTATTTCTAAAGTTCCTAGTGCCTTAGCTCATGCTTTTACTCGTAGTCATTTCCTAACTATGTGTAGTATTGCTGGATTGGCTCTAAATGGCAATATGGCGAAAGCTTTTGCTCTGGTGGTGCTCTATATAGAGGCTGCAGCCGCTGCCCCTATGAGCGTTGAGTCGTTAAAGTACCCGGAGCTTGGAGCTGGTTGCCCCCTGCTGAGCCGCCCTCCTCGGTGCGGCAACAGAACGTCATTTGGATCCACTATATATTGTTTCCACCCAAAATTTGGTTTCCAGCAGTCCTCTCAAGGTTGGCCTCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGAGCTGCAACAATAAATAGTTACACCAATTTAGCATGCTGCACTCTAAGAGTCACGCCAGCATTTTGTCATAATTGCAGCTCTGATTGCAGTTGGGCAGATAAGAGGCAGACGTTCGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTCTCGACCGCCTGTGCTCCCAATGCCATTAGTGCTTTAGCCTCGGTGCTCCCCACCATAGCGCCGAGATTGCCAAACCAGACTTGTATGCCCACTGTTGTAGCGGGGTTGTCCATAGGTCCGTTAAAATCTCCCGGGCCTGCCAGTTACGTCAGCTTAGTACATGGAAGCTGGATAACTTACCACTACTACCCCCATAGATTGGCAAAGTTGGACTACAAACATTGGGCCAGATTGCCAGGGACTCCTCCCACTTACAGGGGTTCCTGGATGACAGTCCCCAAGGGAATGTATAGCTCCAGGAAAGACATCTCCAGTGGTTTGGTCATTAAAGATAGAGCCAATCAAGACTATCAATTGCTCTTTTCCGGGGTGGGGACCTATATTATACCTGGAATTACAGAGCATGTAGTGATCATAGCTTTGTTAGCTGCTTTTGGTGCCCGCTGGTGCTTGTTTCTCTATGCCATGTACAATTGGTTGCCTGGCGCTTTTGCTTTCACTCCAGAGGTGATAGCGGCCACCGCGGCTTCTCCGTGGGAGGATCCGGTGGTGAGGGCTGGGGTGTACTTCGCTTCCTTGTGGCGCTCCCCCTTATCTATCCCACTCTGCGGGAATCTGATCTCTTTCATCCTTTTATCCTTTGCCCACTATGCTCAGGCTTTTTCCACATCTGATATCCTATTCGCTGCTGGTTCTGTGACTCTATTCACTGCTTGGGCCGGATTATTTTCCCGCTTTATTCCCATGCTGCTGCTTACTCAATCCTACTTGCGTGTGAGGTTGGAAGCTTTTACCCGTTCTTGGCTTGATCGCTCCCTGTTGTTTGTGTGTGTGATAGTAATACCTCATGCTGTGTGGGATGTGTGTTTGGTCCTCTGGGTGTGCTGGCTCCTGCTTGTAGTAGGAGGCCAGTTGGTTGTCTGTCTGTGGGGACCTAAGGATAAAGCAAGTTTACATCTATTGCTGCTTAGGCTTAGGAAATGTGGATCCTGGCTGTCAAAGGTCTTGCGACCCGTTGTCATCTGGGCCGCTGGAGAGAATGGTGTGTTTTGGTTCAACCACATTGATGGAAGCTTGGAAGGTGACTGGGAGTTCAAGGACCCCTATTTCCCTTTCCAGACGGAGGTTGAGGTGGCCCAGGACGTTGGGCACAAGCTGGCTTGCGGGGATCAAATCCGTGGCTTGCCAGTGTATGCTCGATGTGGGTCGACTGTTAAGGCAGGCATAGCGCAGCTGCCTAGAGGTTGGAAAAGGACCATACCATTCTCAGCTAAAATAACAAGCCAGAGGAACCAACTAAAAGCTCTGGCTTTGTGCTTGACTGGGGGAGACAGCAGCAGCTACCAAGGCACGGTGGCGGTTATAGGAACCCCCTTAAGATCCTGGATGGGGTTTGGTTGTTTGGGGTCTTTGTACACAGTCTATCACGGAGCCAGAACTAGGTTGCTGGCTTCTCGTGACGGACCTAGGCCCCCCACCCTAGTTAATGCCCAGGTAGATTTAGTCAAGTACCCTTTGCCATCTGGTATGGAATGTCTAGACATCTGTGATTGTAACTGCACTGAGTTTTATTTGGTCACGCGGTTGGGTAACTTGATACCTTGCGTCCAGGTCGAGGGCAGGTTCTGTAACACAGCGCCTCTCACCTTGGCCGAAGCAAAGGGTAGTTCAGGAGCCCCAATAGTGTGTAAGTGTAGGAAAGTCAAGGCTATGTTCCTGTCGTGCCGGAGCAGCCGCGGAGTCGTGAGCAGTTTTGGCGTGCACATGGTACAAAAAGACCAGGTGGCTGACAGTAGAGTACTGCCCTGTGGTGAGCTGGTTCCGCCCAATGTTCCAAGGAAGGGTCAGAAGAAGGTGGAGCGACTGGTGGCCCCGACTGGGAGTGGCAAAACCACAAAGTTGCCTATGAAGTACTATAGTGATGGCTACAGTGTGCTAGTGCTCAACCCGAGCGTCGCAACAACTCGCTCGGTGGGGGAATACATGAAAACCGCCCATAAAGTAAATCCAAATATAAGAACCGGTGATGGGTGTATTAACAATGGGAGTCGACTTACATACAGCACATATGGCATGTTCCTTACGCAGCCCACGTTTCAGGACGATGTGATCATCTGCGACGAGGTACATGCGGTTGACCCCACCACCATATTGGGTATAGGAGCGGCTTTGGCCGCTTTTCAAAGTTCCGCTAAGGCGAAGCTTCTCATCCTAGCTACAGCCACACCCCCAGGAACGCCCATAACACCTCACCCCAATGTGACCACACAGGATTTGACCGATGAGGGCGATTTCCCTTTCCACGGTAGAAAGATTAAATTGGACAATCTAAAAAAGGGTAGGCATCTGATTTTTACTCCTGGAAAGAAACATTGTGACACCATGGCTAGGGATTTAAATGACTTAGGTATCAATGCCGTAGCCTATTACAGGGGTAAGGATGCTGGTGTCATACCGAGGGAAGGTGACGTCGTCGTTGTGGCGACAGACGCCCTAATGACTGGTTACACTGGAAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGCCTCCAAGTTGAAGCCCACTACGAATTGAATATGAATCCAACATTTTCATTATCAATTAGGACTAAAAATGCAGACGCTGTTACGCGGATGCAGCGTAGGGGCCGCACAGGCAGGGGTAAGCAAGGGACATACTACCAAGTGACACCACATTGCGCCACGCATGGCATTGTTCCAACAGCTAATGTCATCGAGGCGTTTGATTCCGGATTGGCTTACTATGGCATGACCCCTGCGGAGGTGACCAAATTTCTCTCCTACTACAAAGAAGAATCAATGACTGCCGCATTCGACTGTAACATCCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTTATGACACTCGGGTTTGTTGAACCCGCCATCCTTGAGAGGATGAAAAAGGAAGCAGAGAATTACACCTACTTGTATGCCGCACAGTACTCTGAGGCACAGGCTTGCGGCGCCCAGGCTCCAAATGACAACAAAATTTGGCGGGGCCTGAAAGGGACAGCTCCTTTCCCCATCCTATATGATCTAGAGGAGTATGATAACAGCCGCTGTCAAGGGTCATCAAGAGCAGAAAGGATAGCGTCTTGTTTTCAGGAGTACTTCTCTAACGGCCTAGTAACATTGGCCGGAGTAGGCTTGGCTGCTGCAGCAGTTTTTACAGCCATAGACCTACTAGGGAACGTGTGTGTTAAAAGGGTGTACACGTTCACGACCGACTCCTCAGCTGCACGTGTCATTACTCCAGGTGAACCGGACCCCACGGAAGCCCTGGAGGAGTGCTACAATTGGGATGGTTTTGCTGAGAATGTCCAACGAGCTTCACATTGGCTGGCAGATAAGCTCGTTGAGGTCGGTCGCGCGGGAGGAGGCAAGCTGCGCTATGAAAGGTGGGCCGTAGATCACGTTCCACACGTCCTCGCCGCAATCCAATATTTTGCAGGGCTCACGTGTCTTCAAGACGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGGTTTGTGGGAGGGGTCTTGAGCCCTCTCCCACTGAAGGCCAACCTATTCCTTACTGCATTAGGTGGCGCTTTTGCAACAAAGCTTACAACACAGCGTGGAGCAGCTGTGTTTGCCTTGGCAGGGGCCTTGGGAGCCGCAACCGGTTCCCTGAGTCTTGGTAAGGTGGCTGTTAATGCGGCAGCCACCTATGGGGCAGCCACGGCAACTTGCTTGGTGGTTCTCAAGCTCATAGATGGTCAGATGCCCGAAATGAGTGAGCTGGCTTCGTTGGCATTCAACCTTGCGAGCCCTGGTGCATGTATCGTGGGAGCTGGGTCCGCCTTGCTCATCGCATACTGCACTCGTACCGAGTCTCAGGTTTGGATGAATAGATTGTTGGCCATGCTCCATCGGGGTACTAGCTGTGAGGACTATTTTGTTGCTTCAACAACTTTGAGGACCAATATCATCAAGGTTCTCGAACAAGCCAATTTATGGGCTGTTTTTAAATGGCTTGCAAGTTGGCTCAATTCGCAGGACGAGGATCTGTGCACCCCTCGCGGGGCTTTTATGGACTTCTTCCACTCTGTGGGACAGGTTCTGAGGCTGATCGTTGAGGCAGTGCGCGGCTTCCTTGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTAAACTGTGACAGGGGGTACAGCGGTCTATGGGCTGGGTCTGGGATTGTCACATCCACTTGTGGGTGTGGGGCCGAAACGGTCTGGAACATCCTAGAAGGGAAAGCCCATTGGGTGGCAGGGCCTCGGACGTGTTCATCTTGGTGGACTGGACGAGTGCCTGTTAACAACTCCATGGTAGGCTGCCCACGGCCGCGACCAGCCAGTTGGACCACAATGGCAGTTAACACAGGATTTAACTCATATGTCACTTATGAGAGAAGAGGGGAGGACGTTTACGTCACCGGGATCTCCTCCCCAGCACAGGTGGTTGAAGCTGCAGTCCCCGACTTGATAAGTGCTGTTGCAGTAGATGGCATCCAGGTCAAACCCTTTGGAGGAACTGGATGGAAGAAAGTTGGGAAATTCGACTGCCGCTTCCGGAGAGGCGACAAGACAACAGACCTAAAGTTACCCTTCAAACTGGAACCTTGCAGGGAGCCTTACCGCGAGGTTGGCTGTCCCTTGCCAGACACTCTCAGGCAAGTCTCTTTAACTGAGCGGGTTATGAGTTTGGGGAAGGCACAACCTCCCCAAAAACCAAAACCTGCCGGTTCGTATGATGGAACCCCTGCGGTAAAGAAGCCCACTGTCTACGATTCTGGCAGTGACATCGAGTCGCCGGGGGACCTGATGAGGCAATTGTCTAAGGGCTATGGTAAGCTCAAGGAATTGGAAAAGGACCTCCCTAAACCTGTAGAAAGAGCAGATCCGTTGGAGGTCATAGAGGTGGCATCCGATGATGACTCTTCTTCAGACGCTCCATTGGTACCTGGCAAACCACAAAAGCCACGCAAAGCGGGAAAGGTTATAGTCACCAAGGCCCTACTCAACCCGCGAGCGCCATCCTTTGTGCCCAAGAAGGTTAAGCTGGCTAAGGGAGCCGTTCCCTTGCCATGTGTGCCGAGGAAAGGCGAAACTAAAAGCGTGGAAGCCTATTCACTCTTGTCCTCAAGTTGGGAGACTGCAAGCAGTAACGATTCAGCCTGTTCATCTTGGTCATATGATTGGTCATTGCCCAAATTAGTTTACAAAGGATTTAAGAGAACAATTTCTGCAGTTTCCACTTATACATTTGGCATTATGAGGTACAAGCCATTGGTGTACACAACTGACCCCAGTTCCATCAATGAGCGAATTAGGAAAGTTACAATTGAAAGAACACGCATTGAGTTTCCTGAACTCAAGCGTGAGATTCAAAAAGCAAAGCAGAAAGTGAGGGACCTGAACCTAAGAGAGTTAGAACTAGAAGAGGCTCTGGCGCTAACGCCCAACAAACCGGCGAAAAGTGCTGTGACTGGCGCCACTGGGAAGTCTGTTAAGACGCACCCAGCAGTTGTTCGGGAAGTGTACGATCTGCTGTCCAAAGGTGAAATTTGTAGGCCATGGAATGAAGTAAACATTATGCCCAAATCAGAGATATTTGTTTTGACTCCAGATAAGCCTACTAAGAAACCTGCTCGCATCATAGCATATCCTCACCTTGAGATGCGGGTAGTGGAGAAAATGGTCCTGGGAGAAATTGGGCCCACAGTGGTAAAAACCGTTTGCGGCCAAGCTTACGGTTTTTTATCACCCCAGGAAAGAGTTCAGAGACTGGTGTCCATGTGGAACTCCAAGGATGCTCCTTGTGGCTTCACGTGTGATACCACGTGTTTTGACTCGACCATCACACCAGAAGACATCGCAGCCGAATGTGAAATTTATGAGGCTGCAGCCGCCGACCCCCAGACAAAAGCCAGAATTAGAACACTCCACACTAATTTATATCAGGGGGGCCCAATGATGATGCAAGGAACCTACGTAGGTGAGCGTCATTGTAGGGCAAGCGGTGTTTTCACAACATCATCTTCCAACACTCTGACATGTTATCTCAAAGTTTCAGCAGCAGCTAGAAAGGCTGGGATTAAAGACCCCAGTTTCCTTATAGCAGGGGATGACTGCGTCTGCATATTTGAATCAGAAATGGATATGGACAAGAAACGGTTGGGCTTGTTCACAACATACATGAAGCAGATGGGGGCGCCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTACTATCATCTAGAGTTGTTAGATAGCTGCTCATCCAATGTGTCGCTAGCACAAACAACTAGCGGCCAATTCCACTATTCCACCAGAGATCCCAAGACTCCCTTGGGACGGATTAGTGTTGAGGGTAAGGGGTTTAACCCTCTAGGCAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAACTACCCCGCTGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTTTTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACACCTAAACAAATAACATTTGATTGGTATGGAAATAATTATACAGTTCCTGTGGTAAAAATTCCCTACATAATTGAAGCCATACATGGAAAACCGTGTTGGCACATTAGGCAATACACTAGTAGGGAAATAAATAGAACTAATCAGGCTTTAAAAGATTTAACAATTAGGCCATTAAGATTTTATAAACGTGCAGCACGCCAAGTGGTCGCTCTGTGCAGAGCTCGAGGTGGTACCTTGAGATTTCTCGCAGACACGCTACTGGCGTGGGTGCATGGCAGGACTGTAACGCTCGAGCCTCGTAAAGTTAAGCAGGCTAGAGCATTCAAATTTTGGGAGCCTTATGAACAAAATTTAGATGAAGATACAATTAGGTTTAAAATGAATTGGCTGCTTGTCGCAGCACTAATTGGCTCCATAATGCTAATTTGGTTTAAAGGCTAAATTTTAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCACGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGTGGCCGGCACCAGAACCGTCTCGGGGTGCTGGCTCGATCCCCCTTCCGGCTTCGGGGCTTGGCAACCCCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAGGCG
| 26,727
|
ON391064.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-DZ3-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,961
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-DZ3-2020, complete genome
|
CTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCAAGAGAGTCACTCCTTTTTTCTTTATCTCTTGCCGCTGGGCTGGTTAATGGCACAGGTGTGGGACAGACTGAGTCTCTCCGTGACCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCTAGTCCAGTGGGCCCCCAAGGATTGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTGCCGGGACGGAACTCCCGGATGCTAGGGTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTACCTAGTTTTGGGCATGCCCACAGGGATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGTGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTCTTTTCAAACCCAAAAAGTAACTTTAAGTCTTGTACCGCATGGTTTTCCATGCTGTTTTGTGTGAATGTGTGTCTGTATGTGGGGAATGGGCGGCCGAGAGGCCGTGTGGTTAAAGGTGTGTATGTGGTGCACCCCAAAAAGACCGTGGACCAAGGTGTGCGAAGGAAGCGTAGGCCCCGACGCGACTTGGGCGGCTGGAGGAGGTCTGCTATAGGCCCCATGGATCCTTATTTCCGGACTGCCGTCCAGGCCATAGCGCCCAGTCCTGCCTACCCGTCTAGAGACCCCAGGCGTCAATCCAGATTCTTGGGCCATGTCATAGACGGCACACTAGGCTGGGTTACTGATGTTGTCCACCATGTGCCACTCGTTGGACCTTTGGTTGGCCACCCGTTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTAAGGTCTGGTGAGAATGCTATAAATTCCCTCACGGGCACTGTTGGTGTCCATCTATTTGTTTTGGCAATTCTTTCCTGCTTGTGTCCTGCAACAGCAGTGTCAAATTGTTGTACTCCAGATCAGGTAGTGTACTGCACTGAAGTCACTTGTGTCCATGAGACCGGATGCATTATTTGTGAACAAAAGGATGACCAGGTGGTTTGTTGGTCGCCGGCAGGTCTATTGGTGTCACATCCCCCCAATTATACGGGGATTGACCCTTTTTTAACCCAACATATAGACTTTGTTGCCGGTACTACATTCATCTGTGATCTGACCGGGATGCGAGAGGTGTGTGGCGTGGCGGTGCTCTTATCTGCCACAGCCTTGGAACTCTTGCCCAGGCCAGTTAAATTAAACACTACTGCAGATTGCTACTTGTTCATTGACTCTGGGGTAGATCCTCTCTTTGCTTCCTTCTTTACCTGGTTGGCTGAGGAATTTTCTACTATCACGGCCATTCTTGACTTCATTTCTAAAGTTCCTAGTGCCTTAGCTCATGCTTTTACTCGTAGTCATTTTCTAACTATGTGTAGTATTGCTGGATTGGCTCTAAATGGCAATATGGCAAAAGCTTTTGCTCTGGTGGTGCTCTATATAGAGGCTGCAGCTGCTGCCCCTATGAGCGTTGAGTCGTTAAAGTACCCAGAGCTTGGAGCTGGTTGCCCCCTGTTGAGCCGCCCTCCTCGGTGCGGCAACAGAACGTCATTTGGATCCACTATATATTGTTTCCACCCAAAATTTGGTTTCCAGCAATCCTCTCAAGGTTGGCCTCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGAGCTGCAACAATAAATAATTACACCAATTTAGCATGCTGTACTCTGAGAGTCACACCAGCATTTTGTCATAATTGCAGCTCTGATTGCAGTTGGGCAGATAGGAGGCAGACGTTCGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTCTCGACCGCTTGCAGCCCTAGTGCCATTAGTGCTTTAGCCTCGGTGCTCCCCACCATAGCACCGAGATTGCCAAACCAGACTTGTATGCCCACTGTTGTAGCGGGGTTGTCCATAGGTCCGTTAAAATCTCCCGGGCCTGCTAGTTACGTCAGCTTAGTACATGGAAGCTGGATAACTTATCATTATTACCCCCACAGATTGGCAAAGTTGGACTACAAACATTGGGCTAGATTGCCAGGGACTCCCCCCACTTACAGGGGTTCCTGGATGACAGTCCCCAAGGGAATGTATAGCTCCAGGAAAGACATCTCCAGTGGTTTGGTCATTAAGGATAGAGCCAATCAAGACTATCAATTGCTCTTTTCCGGGGTGGGGACCTACATTATACCTGGGATTACAGAGCATGTAGTGATCATAGCTTTGTTAGCTGCTTTTGGTGCCCGCTGGTGCTTGTTTCTCTATGCCATGTACAATTGGTTGCCTGGTGCTTTTGCTTTCACTCCTGAGGTGATAGCGGCCACCGCGGCTTCTCCGTGGGAGGATCCGGTGGTAAGGGCTGGGGTGTACTTTGCTTCCTTGTGGCGCTCCCCCTTGTCTATCCCACTCTGCGGGAATCTGATCTCTTTCATTCTTTTATCTTTTGTCCACTATGCTCAGGCTTTTTCCACATCTGATATCCTATTCGCTGCTGGTTCTGTGACTCTATTTACTGCTTGGGCTGGATTATTTTCCCGCTTTATTCCCATGCTGCTGCTTACTCAGTCCTACCTGCGTGTGAGGTTGGAAGCTTTTACTCGTTCTTGGCTTGATCGCTCCCTGTTGTTTGTGTGTGTAATAATAATACCTCATGCTGTGTGGGATGTGTGTTTGGTCCTCTGGGTGTGCTGGCTCCTACTCGTAGTGGGAGGCCAGTTGGTCGTCTGTTTGTGGGGACCTAAGGATAAAGCAAGTTTACACCTATTGCTGCTTAGGCTTAGGAAATGTGGATCCTGGCTGTCAAAGTTCTTGCGACCCGTTGTCATCTGGGCCGCTGGAGAGAATGGTGTGTTTTGGTTCGACCACATTGATGGAAGCTTGGAAGGTGATTGGGAGTTCAAGGACCCCTATTTCCCGTTCCAGACGGAGATTGAGGTGGCCCAGGACGTCGGGCACAAGCTGGCTTGCGGGGATCAAATCCGTGGCTTGCCAGTGTATGCTCGGTGTGGGTCGACTGTGAAGGCAGGCATAGCGCAGCTGCCTAGAGGTTGGAAAAGGACCATACCATTCTCAGCCAAAATAACAAGCCAGAGAAACCAATTGAAAGCTCTGGCTTTGTGCTTGACTGGGGGAGACAGCAGCAGCTACCAAGGCACGGTGGCGGTTATAGGAACCCCCCTGAGATCCTGGATGGGATTTGGTTGTTTGGGGTCTTTGTACACGGTCTATCACGGAGCCAGGACTAGGTTGCTGGCTTCTCGCGACGGACCTAGGCCCCCCACCCTAGTTAATGCCCAGGTAGATTTAGTCAAGTACCCTTTGCCATCTGGTATGGAATGTCTAGACATCTGTGATTGTAACTGCACTGAGTTTTATTTGGTCACGCGGTTGGGTAACTTGATACCTTGCGTCCAGGTTGAGGGCAGGTTCTGTAACACAGCACCTCTTACCTTAGCTGAGGCAAAGGGTAGTTCAGGAGCCCCAATAGTGTGTAAGTGTAGGAAAGTCAAGGCTATGTTCCTGTCATGCCGAAGCAGCCGCGGAGTCGTGAGCAGTTTTGGCGTGCACATGGTGCAAAAGGACCAGGTGGCTGATAGCAGAGTGCTGCCCTGTGGAGAGCTGGTTCCGCCTAATGTTCCTAGGAAGGGTCAGAAGAAGGTAGAGCGACTGGTGGCCCCGACTGGGAGTGGCAAAACCACAAAGTTGCCTATGAAGTACTATAGTGATGGCTACAGTGTGCTAGTGCTCAACCCGAGCGTCGCAACAACTCGCTCGGTGGGGGAATACATGAAAACCGCCCATAAAGTAAATCCAAATATAAGAACTGGTGATGGGTGTATTAACAATGGGAGTCGACTTACATACAGCACATATGGCATGTTCCTTACGCAGCCCACGTTCCAGGACGATGTGATCATCTGCGACGAGGTACATGCGGTTGACCCCACCACCATATTGGGTATAGGAGCGGCTCTGGCCGCTTTTCAAAGTTCTGCTAAGGCAAAGCTTCTCATCCTAGCTACAGCCACACCCCCAGGAACGCCCATAACACCTCACCCCAATGTGACCACACAGGATTTGACCGATGAGGGCGATTTCCCTTTCCACGGTAGGAAGATTAAATTGGACAATCTAAAAAAGGGTAGGCATCTGATTTTTACTCCTGGAAAGAAACATTGTGACACCATGGCTAGGGATTTAAATGACTTAGGCATTAATGCCGTGGCCTATTACAGGGGTAAGGATGCTGGTGTCATACCGAGGGAAGGTGACGTCGTCGTTGTGGCGACAGACGCCCTAATGACTGGTTACACTGGAAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGCCTCCAAGTTGAAGCCCACTACGAATTGAACATGAATCCAACATTTTCACTATCAATTAGGACTAAAAATGCAGACGCTGTTACGCGGATGCAGCGTAGGGGCCGCACAGGCAGGGGTAAGCAAGGGACATACTACCAAGTAACACCACATTGCGCCACGCATGGCATTGTTCCAACAGCTAATGTCATCGAGGCGTTTGATTCCGGATTGGCTTATTATGGCATGACCCCTGCGGAGGTGACCAAATTTCTCTCCTATTACAAAGAAGAATCAATGACTGCCGCATTCGACTGTAACATCCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTTATGACACTCGGGTTTGTTGAACCCGCCATCCTTGAGAGGATGAAAAAGGAAGCAGAAAATTACACCTATTTGTATGCCGCACAGTACTCTGAGGCACAAGCTTGCGGCGCCCAGGCCCCAAATGACAACAAAATCTGGCGAGGCCTGAAAGGGACAGCTCCTTTCCCCATCCTATATGATCTAGAGGAGTATGATAACAGCCGCTGTCAAGGGTCATCAAGAGCAGAAAGGATAGCGTCTTGTTTTCAGGAATACTTCTCTAATGGCCTAGTAACATTGGCCGGAGTAGGCTTGGCCGCTGCAGCAGTTTTTACGGCCATAGACCTACTAGGGAACGTGTGTGTTAAAAGGGTGTACACGTTCACGACCGACTCCTCAGCTGCACGTGTGATTACTCCAGGTGAACCGGACCCCACGGAAGCCCTGGAGGAGTGCTACAATTGGGATGGTTTTGCTGAGAATGTCCAACGGGCTTCACATTGGCTGGCTGATAAGCTCGTTGAGGTCGGTCGCGCGGGAGGAGGCAAGCTGCGCTATGAAAGGTGGGCCGTAGACCACGTTCCACACGTCCTCGCCGCAATCCAATATTTTGCAGGGCTCACGTGTCTCCAAGACGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGTTTTGTCGGAGGGGTCTTAAGCCCTCTCCCACTGAAGGCCAACCTATTCCTTACTGCATTAGGTGGCGCTTTTGCAACAAAGCTCACAACACAGCGTGGAGCAGCTGTGTTTGCCTTGGCAGGGGCCTTGGGAGCCGCAACCGGTTCCCTGAGTCTTGGTAAGGTGGCTGTTAATGCGGCAGCTACCTATGGGGCAGCCACGGCAACTTGCTTGGTGGTTCTCAAGCTCATAGATGGTCAGATGCCCGAAATGAGTGAGCTGGCTGCGTTGGCATTCAACCTTGCGAGCCCTGGTGCATGTATCGTGGGAGCTGGGTCCGCCCTGCTCATCGCATACTGCACTCGTACCGAGTCTCAGGTTTGGATGAATAGATTGTTGGCCATGCTCCATCGGGGTACTAGCTGTGAGGACTATTTTGTTGCTTCAACAACTTTGAGGACCAATATCATCAAGGTTCTTGAACAAGCCAATTTATGGGCTGTTTTTAAATGGCTTGCAAGTTGGCTTAATTCGCAGGACGAGGATCTGTGCACCCCTCGCGGAGCCTTTATGGACTTCTTCCACTCCGTGGGACAGGTTCTAAGGCTGATCGTTGAGGCGGTGCGCGGCTTCCTCGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTAAACTGTGACAGGGGGTACAGCGGTCTATGGGCTGGGTCTGGGATTGTCACATCCACTTGTGGGTGTGGGGCCGAAACGGTCTGGAACGTCCTAGAAGGGAAAGCCCATTGGGTGGCAGGGCCTCGGACGTGTTCATCTTGGTGGACTGGACGAGTGCCTGTTAACAACTCCATGGTAGGCTGCCCACGGCCGCGACCAGCCAGTTGGACCACAATGGCAGTTAACACAGGATTTAACTCATATGTCACTTATGAGAGAAGAGGGGAGGACGTTTATGTCACCGGGATCTCCTCCCCAGCACAGGTGGTTGAAGCTGCAGTCCCCGACTTGATAAGTGCTGTTGCAGTAGATGGCGTCCAGGTCAAACCCTTTGGAGGAACTGGATGGAAGAAAGTTGGGAAATTCGACTGCCGCTTCCGGAGAGGCGACAAGACAACAGACCTAAAGTTACCCTTCAAACTGGAACCTTGCAGGGAGCCTTACCGCGAGGTTGGCTGTCCCTTGCCAGACACTCTCAGGCAAGTCTCTTTAACTGAGCGGGTTATGAGTTTGGGGAAGGCACAACCTCCCCAAAAACCAAGACCCGCCGGTTCGTATGATGGAACCCCTGCGGTAAAGAAGCCTACTGTCTACGATTCTGGCAGTGACATCGAATCGCCGGGGGACCTGATGAGGCAACTGTCTAAGGGTTATGGTAAACTCAAGGAATTGGAAAAGGACCTCCCTAAACCTGTAGAAAGAACAGATCCCTTGGAGGTCATAGAGGTGGCATCCGATGATGACTCTTCTTCAGACGCTCCATTGGTACCAGGCAAGCCACAAAAGCCACGCAAAGCGGGAAAGGTTATAGTCACCAAGGCCCTACTCAACCCGCGAGCGCCATCCTTTGTGCCCAAGAAAGTTAAGCTGGCTAAGGGAGCTGTTCCCTTGCCATGTGTGCCAAGGAAAGGCGAAACCAAAAGCGTGGAAGCCTATTCACTCTTGTCCTCAAGCTGGGAGACTGCAAGCAGTAACGATTCAGCCTGTTCATCTTGGTCTTATGATTGGTCATTGCCTAAATTAGTTTATAAAGGATTTAAGAGAACAATTTCTGCAGTTTCCACTTACACATTTGGCATCATGAGGTACAAGCCATTGGTGTATACAACTGACCCCAGTTCCATCAATGAGAGAATTAGGAAAGTCACAATTGAAAGAACACGCATTGAGTTTCCTGAACTCAAGCGTGAGATCCAAAAAGCAAAGCAGAAAGTGAGGGACCTGAACCTAAGAGAGTTAGAACTAGAAGAGGCTCTGGCGCTAACGCCCAATAAAACGGCTAAAAGTGCTGTGACTGGCGCCACTGGGAAGTCTGTTAAGACGCACCCAGCAGTTGTTCGGGAAGTGTATGATCTGCTGTCCAAAGGTGAAATTTGTAGGCCGTGGAATGAAGTAAACATCATGCCCAAATCAGAGATATTTGTTTTAACCCCAGATAAGCCTACTAAGAAACCTGCTCGCATCATAGCATATCCTCACCTCGAGATGCGGGTGGTGGAGAAAATGGTCCTGGGAGAAATTGGGCCTACAGTGGTGAAGACCGTTTGCGGGCAAGCTTACGGATTTTTATCACCCCAGGAAAGAGTTCAGAGACTGGTGTCCATGTGGAACTCCAAGGACGCTCCTTGTGGTTTCACATGCGATACCACGTGTTTTGACTCGACCATTACACCAGAAGACATTGCAGCCGAATGTGAAATTTATGAGGCTGCAGCCGCTGACCCCCAGACAAAAGCCAGAATTAGAACACTCCACACTAATTTATACCAGGGGGGCCCAATGATGATGCAAGGAACCTATGTAGGTGAGCGTCATTGTAGGGCAAGCGGTGTTTTTACAACATCATCTTCCAACACTCTAACATGTTATCTCAAAGTTTCAGCAGCAGCTAGAAAGGCTGGGATTAAAGACCCCAGTTTCCTTATAGCAGGGGATGACTGCGTCTGCATATTTGAATCAGAAATGGATATGGACAAGAAACGGTTGGGCTTGTTCACAACATACATGAAGCAGATGGGGGCGCCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTACTATCACCTAGAGTTGTTAGATAGCTGCTCATCCAATGTGTCGCTAGCACAAACAACTAGCGGCCAATTCCACTATTCCACCAGAGATCCCAAGACTCCCTTGGGACGGATTAGTGTTGAGGGTAAGGGGTTCAACCCTCTAGGCAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAACTACCCCGCTGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTTTTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACACCTAAACAAATAACATTTGATTGGTATGGAAATAATTACACAGTTCCTGTAGTAAAAATTCCCTACATAATTGAAGCCATACATGGGAAACCGTGTTGGCACATTAGGCAATATACTAGTAGGGAAATAAACAGAACTAATCAGGCTTTAAAAGATTTAACAATTAGGCCATTAAGATTTTATAAACGTGCAGCACGCCAAGTAGTTGCTCTGTGTAGGGCTCGAGGTGGTACCTTGAGATTTCTCGCAGACACGCTGCTGGCTTGGGTGCACGGCAGGACTGTAACGCTTGAGCCTCGTAAAGTTAAGCAGGCTAGAGCATTTAAATTTTGGGAGCCTTATGAACAAAATTTAGATGAAGATACAATTAGGTTTAAAATGAATTGGCTGCTTGTTGCAGCACTAATTGGCTCCATAATGCTAATTTGGTTTAAAGGCTAAATTTTAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCACGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGTGGCCGGCACCAGAACCGTCTCGGGGTGCTGGCTCAACCCCCCTTCCGGCTTCGGGGCTTGGCAACCCCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAGGCG
| 26,728
|
ON391065.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-DZ2-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,961
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-DZ2-2020, complete genome
|
CACTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCAAGAGAGTCACTCCTTTTTTCTTTATCTCTTGCCGCTGGGCTGGTTAATGGCACAGGTGTGGGACGGGTTCATCCCCTCCGTGACCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCCGGTCCAGTGGGCCCCCAAGGAATGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTACCGGGACGGAACTCCCGGGACTAGGATTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTAACCTAGTTTGGGCATGCCCATAGGGATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCTTGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTTTTTTCAAAATCTCGCAACATTAAGTCATGTACCGCATGGTTCGCCATGCTGTTTTGTGTGAATGTGTGTATGTCTGTTGGGAATGGTAGGCCTCGCGGCCGAGTAGTGAAAGGTGTGTATGTGGTGCACCCCAAGAAAACAGTGGACCAAGGCGTGCGTAGAAAGCGTAGGCCCCGACGCGACTTGGGTGGCTGGAGGAGGTCAGCTATTGGCCCCATGGATCCTTACTTCCGGACGGCCGTCCAAGCCATTGCACCAAGTCCTGCCTACCCATCGCGTGACCCCAGGCGCCAATCAAGGTTCTTGGGACATGTCATAGATGGCACGCTAGGCTGGGTGACAGATGTGGTCCATCATGTTCCTCTTGTCGGGCCTCTTGTTGGCCACCCCTTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTGAGGTCCGGTGAGAATGCTATAAATTCCCTTACAGGTACTGTTGGTGTGCATTTGTTTGTGCTTGCTCTTTTGTCCTGTTTGTGTCCTGCTACAGCTATATCTAATTGTTGTACTCCAGATCAAGTGGTATACTGCACTGAGGTCACTTGCGTCCATGAGACCGGATGCATAATTTGTGAACAAAAGGATGACCAGGTGATATGCTGGGCCCCCGCAGGTCTATTGGTGTCGCATCCCCCAAATTATACGGGAATCGACCCCTTTTTAACCCAACATATAGACTTCGTTGCGGGGACTACATTCATCTGTGATCTGACCGGGATGCGAGAGGTGTGTGGCGTAGCTGTGTTATTGTCTGCTACTGCCTTGGAACTCTTGCCCCGGCCAGTTAAATTAAACACTACTGCTGATTGCTACTTGTTTATAGATTCTGGAGTTGATCCTCTATTTGCTTCCTTCTTTACCTGGTTGGCTGAGGAGTTTTCAACTATCACTGCAATCCTTGACTTCATCTCGAAGGTCCCTAGCGCTTTGGCTCATGCTTTCACTCGTAGCCATTTCCTCACTATGTGTAGCATAGCTGGGTTGGCCCTGAACGGCAATATGGCGAAGGCTTTTGCTCTGGTTATTTTGTACATTGAGGCAGCAGCTGCTGCCCCAATGTCGGTTGGGTCGTTAAGGTACCCGGAGCTTGGTGCTGGTTGCCCATTGCTTGACAGACCACCCAGATGTGGTAATAGGACTTCTCTTGGACCTACAATTTATTGTTTCCACCCTAAATTTGGTTTCCAGCGCTCTGACAAGGGTTGGCCTCAAGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGAGCTGCAACAATCAATAATTACACTAATTTAGCATGCTGTACTCTTAGAGTCACTCCAGCATTCTGTCATAATTGCAGCTCTGACTGCAGCTGGGCTGATCGCAGACAGACATTCGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTCTCGACTGCCTGTAGTTCAAATGCGATTAACTCATTGGCCTCGGTGCTCCCCACCATAGGGCCGAGGTTGCCAAACCAGACATGCATGCCCACTGTAGTTGCGGGGTTGTCAATTGGCCCTCTGAAATCTCCAGGGCCCGCTAGTTATGTCAGCTTGGTACATGGGAGTTGGCTAACTTATCATTACTACCCTACTAGGTTAGCAAAGTTAGACTACAAGCATTGGGCTAGATTGCCCGGGACCCCGCCAACATATAGGGGTTCCTGGATGACAGTCCCCAAAGGAATGTATAGCTCCAGGAAAGACATCTCCAGTGGTTTGGTCATCAAGGATAGAGCTAACCAAGACTATCAGCTGCTCTTCTCAGGTGTGGGGACTTACATTATACCTGGGATCACAGAGCATGTGGTGATCATAGCTTTATTGGCTGCCTTCGGTGCACGCTGGTGTTTGTTTCTGTATGCCCTGTACAACTGGTTGCCTGGAGCGTTTGCTTTCACGCCTGAAGTGATTGCTGCCACTGCGTCTTCTCCGTGGGAGGATCCGGTGGTCAGAGCTGGAGTCTACTTCGCCTCCTTGTGGCGCTCCCCTCTTTCTATCCCACTCTGCGGGAATCTCATCTCCTTCTTTCTTTTATCTTTTGCTCATGTTGTCCAGGCCTTTTCCACATCTGATATCCTATTTGCTGCTGGATCTGTGACTCTGTTTACTGCCTGGGCGGGGTTGTTTTCTCGCTTCATTCCAATGTTGCTTTTAACTCAATCCTACTTGCGCGTTAGGTTGGAGGCTTTTACCCGTTCCTGGCTTGATCGCTCACTCTTGTTTGTTTGTGTGATTGTCATACCTAAGGCTGTGTGGGATGTGTGTTTGGTTCTTTGGGTCTGTTGGCTGTTGCTTGTTGTTGGAGGACAGCTGGTTGTGTGTTTGTGGGGCCCGAAGGACAAGGCAAGCTTACATTTGCTGCTTGTTAGGCTCAAGAAATGTGGATCTTGGCTCTCAAAAAGGTTGCGCCCGATAGTCATCTGGGCCGCTGGAGAGAATGGAGTTTTCTGGTTCGACCACATAGATGGAAGCTTGGAAGGTGAGTGGGAGTTTAAAGACCCCTACTACCCATTTCAGACGGAGATTGAGGTGGCCCAAGATGTAGGGCAAAAGCTGGCTTGTGGAGATCAGATTCGCGGCTTGCCGGTGTATGCTAGATCTGGGTCTACCGTTAGGGCAGGAATTGCACAACTGCCTCGTGGTTGGAAGAGAACAATTCCATTTTCTGTAAAAATTACTAGTCAGAGAAATCAGTTGAAGTCTCTGGCTTTGTGCTTGACCGGGGGTGACGGCAGCAGCTACCAGGGAACCGTAGCAGTAATAGGCACCCCCCTAAGGTCTTGGATGGGGTTTGGATGCTTGGGGTCTTTGTACACAGTCTATCATGGGGCTAGAACTAGGTTGCTTGCCTCAAGAGATGGACCTAGACCCCCTACCCTTGTGAATGCCCAAGTGGATTTGGTCAAGTACCCTCTACCATCTGGCATGGAGTGTTTGGACATCTGTGATTGCAATTGTGCAGAGTTTTTCCTTGTCACGCGACTGGGGAACCTGATACCCTGCGTCCAGGTCGAAGGGAGGTTCTGCAACACGGCACCTCTTACTTTGGCTGAAGCGAAGGGTAGTTCGGGCGCTCCGATCGTTTGCAAGTGCAGAAAAGTGAAAGCAATGTTCCTTTCTTGCCGTAGCAGCCGAGGTGTTGTCAGCAGTTTTGGCGTGCATATGGTGCAGAAAGACCAGGTGGCAGACAGCAGAGTACTGCCCTGTGGCGAGTTGGTACCTCCCAACGTACCTCGAAAGGGCCAGAAGAAGGTAGAGCGAATTGTGGCCCCGACAGGGAGTGGGAAGACCACCAAGTTGCCTATGAAGTACTACAGTGACGGCTACAGTGTGCTAGTGCTCAATCCGAGCGTCGCAACAACACGCTCGGTGGGGGAATACATGAAAACCGCTCATAAGGTTAACCCAAATATTAGAACTGGTGATGGGTGCATTAATAATGGGAGTCGACTGACTTACAGTACCTATGGAATGTTCCTCACGCAGCCCACGTTTCAGGATGACGTGATCATCTGCGATGAGGTGCATGCAGTTGACCCTACAACCATATTGGGTGTTGGTGCAGCGCTGGCTGCCTTTCAAAGTTCTGCTAAAGCCAAGCTACTCATCTTAGCTACGGCTACTCCCCCAGGAACGCCCATAACACCCCACCCCAATGTAATCACAAAGGATTTGACCGAAGAGGGCGATTTCCCTTTCCATGGAAAGAAAATCAAGTTGGATAATCTCAAGAAGGGAAGGCATTTAATCTTTACCCCAGGGAAGAAACACTGTGACCAAATGGCAAGAGAGCTTAATGATCTTGGGATTAACGCGGTGGCCTATTACAGAGGCAAGGACGCCGGCGTGATACCAAGGGAAGGAGATGTCGTGGTTGTTGCCACTGACGCCCTCATGACTGGTTACACTGGAAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGTCTTCAGGTTGAGGCCCACTACGAATTGAATATGAACCCAACATTTTCACTTTCAATTAGGACCAAAAATGCAGACGCAGTTACGCGAATGCAACGTAGGGGCCGTACTGGTAGGGGCAAGCAAGGAACATATTACCAAATAACACCACATTGCGCGACGCATGGCATTGTTCCAACAGCGAATGTCATCGAAGCGTTTGATTCCGGATTGGCATATTATGGCATGACCCCTGCTGAAGTAACTAAATTTCTCTCCTATTATAAAGAAGAATCAATGACTGCCGCATTCGACTGCAACATTCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTTATGACTTTGGGCTTCGTGGAGCCCGCCATCCTAGAGAGGATGAAAAAGGAAGCAGAAAATTACACCTACTTGTATGCCGCACAGTACTCAGAGGCACAGGCGTGCGGCGCTCAGGCCCCCAATGACAACAAAATCTGGCGGGGCCTAAAGGGAACAGCTCCTTTCCCCATCCTGTATGATTTGGAGGAGTATGACAACAGTCGCTGTCAAGGGTCTTCTAGGGCTGAAAGGATAGCTTCTTGTTTCCAGGAATACTTCTCTAACGGCCTAGTGACTTTGGCCGGAGTAGGTCTAGCAACAGCGGCCGTATTCACGGCCATTGACCTGCTTGGGAACGTGTGTATTAAAAAGGTGTACACGTTCACTACCGACTCCTCAGCAGCACGAGTAATAACACCCGGAGACCCCGACCCCACGGAGGCTCTGGAAGAGTGCTACAATTGGGATGGTTTTGCTGAGAGTGTCCAACGGGCTTCACATTGGCTGGCTGATAAGCTCGTTGAGGTCGGTAGAGCCGGTGGGGGAAGGTCTGCCCATGAGAGGTGGTTGGTAGATCACGTCCCCCACGTCTTGGCTGCTATTCAATACTTTGCAGGGCTCACGTGTCTTCAAGACGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGATTTGTGGGAGGAGTGTTAAGTCCACTTCCCCTAAAAGCCAACCTATTTCTTACTGCATTAGGTGGCGCTTTTGCCACAAAGCTCACAACACAGCGAGGAGCAGCTGTGTTTGCCCTAGCAGGGGCTCTGGGAGCCGCAACCGGTTCCCTTAGTCTCGGTAAGGTGGCCGTTAATGCGGCGGCTACTTACGGGGCTGCTACGGCAACTTGCTTGGTGGTTCTCAAACTCATAGATGGTCAGATGCCCGAGATGAGTGAGCTGGCTTCGTTGGCATTCAATCTTGCGAGCCCTGGTGCATGCATAGTGGGGGCGGGATCCGCTCTCCTTATTGCATACTGCACAAGAACCGAGTCTCAAGTTTGGATGAATAGGTTGTTGGCCATGCTCCATCGGGGAACTAGTTGTGAGGACTACTTTGTGGCTTCCACCACGCTCAGGACTAACATCATCAAAGTTCTGGAGCAAGCCAACTTGTGGGCTGTTTTTAAATGGCTCGCGAGCTGGCTAAACTCGCAGGACGAGGATCTGTGCACTCCTCGAGGTGCGTTTATGGACTTCTTCCACTCAGTGGGACAGGTTCTTAGACTCATAGTAGAGGCGGTGCGCGGCTTCCTCGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTAAACTGTGACAGGGGGTACAGTGGCCTATGGGCTGGGTCTGGGATAGTCACATCCACGTGTGGGTGTGGGGCCGAAACGGTCTGGAATGTCCTTGAGGGTAAAGCTCATTGGGTGGCAGGGCCTCGCACCTGTTCATCTTGGTGGACAGGTAGAGTGCCTGTTAACAACTCCATGGTAGGCTGCCCACGGCCACGGCCAGCCAGTTGGACCACAATGGCTGTCAACACAGGCTTTAACACTTATGTAACTTATGAGAGGAAAGGGGAGGACGTATACGTCACTGGGATCTCTTCCCCCTCACAGGTTGTTGAAGCGGCAGTTCCGGACCTTATCAGCGCAGTTGCTGTAGATGGAGTCCAGGTTAAGCCCTTTGGTGGAACTGGATGGAAGAAGGTTGGGAAATTTGACTGCCGATTCAGGAGAGGTGATAAAACAACAGACCTCAAGTTGCCCTTTAAATTGGAACCTTGTAGGGAGCCCTACCGAGAGGTGGGTTGTCCCTTGCCTGACACTCTTAGACAGGTGTCGCTGACCGAGCGGGTAATGAGCTTGGGTAAGGCACAACTCCCTCCCAAGCCTAAGCCTGCGGGGTCGTATGATGGTTCTCCTGCGGTCAAGAAGCCCACTATCTACGATTCGGGTAGTGACATCGAGTCCCCGGGAGACCTGATGCGGCAGCTGTCAAAGGGTTACGGCAAACTAAAGGAATTGGAAAAAGACCTCCCAAAACCTGTTGAAAGGTCAGATCCCCTGGAAGTCATTGAGGTGGCGTCAGAAGATGACTCCTCATCAGACATCCCATTGGTGAGCGACCAACCAAAGAAACCACGCAAAGCGGGTAAAGTAATTGTAACCAAAGCCCTGCTTAACCCGCGAGCCCCCACTTTCGTGCCTAAGAAGGTTAAATTGGCCAAAGGGGCAGTGCCACTGCCTTGCATTGCGCGAAAAGGGGAGACAAAGAGCGTGGAAGCCTATTCCCTATTGTCCTCAAGTTGGGAGACCGCTAGCAGTAACGATTCAGCCTGTTCATCTTGGTCCTATGATTGGTCGTTGCCAAAATTAGTCTATAAAGGATTCAAGAGGACAATTTCAGCGGTTTCCACTTATACATTTGGCATTATGAGGTACAAACCATTGGTGTACACAACTGACCCAAGTTCCATCAATGAGAGGATTAGGAAAGTAACTATAGAAAGGACGCGTACTGAGTTTCCTGAGCTTAGACGCGAAATTAACAAAGCCAAGCAGAAGGTGAGGGGCCTGAATCTAAGAGAGCTAGAATTAGATGAAGCTCTGGCGCTGACGCCCAACAAGACGGCGAAAAGTGCAGTGACAGGCGCCACTGGGAAGTCTGTTAAGACCCACCCAGCTGTGGTTCAGGAAGTGTATAATCTGTTGTCTGCAGGGAAAATAGAGAGGCCCTGGAATGAAGTAAACATCATGCCCAAATCTGAGATTTTTGTTTTAACTCCAGAGAAGCCCACCAAAAAACCCGCTCGCATCATAGCTTACCCTCACTTAGAGATGCGAGTAGTGGAGAAGATGGTCCTGGGGGAAATTGGCCCCACGGTAGTGAAGACTGTGTGCGGAGACGCATACGGTTTCCTATCCCCCCAGGAAAGAGTTCAGAGGCTGGTGGCCATGTGGAACTCCAAGGACGCACCTTGTGGCTTTACGTGTGACACCACGTGCTTTGACTCTACCATTACACCAGAGGATATAGCAGCGGAGTGTGAGATCTATGAAGCTGCAACCACAAACCCCGATACTCGAGCCAGGATCAGAACCCTCCACACTGGTCTATATCAGGGGGGCCCGATGGTGATGCAGGGAACCTACGTGGGTGAGCGTCATTGTAGGGCAAGTGGTGTATTTACAACATCCTCATCTAACACCATGACATGCTATCTCAAAGTATCAGCAGCAGCAAAAAAAGCAGGGATTAGAGACCCTAGCTTCTTAATAGCAGGGGATGATTGCGTCTGCATTTTTGAATCTGACATGGATATGGACAAGAAACGGTTGGGCTTGTTCACAACATACATGAAGCAGATGGGGGCACCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTACTACCATTTGGAACTATTGGATAGCTGCTCCTCAAATGTGTCGTTGGCACAAACTTCCAGCGGCCAATTCCACTATTCTACAAGAGACCCAAGAACACCCTTGGGCAGGATTAGTGTTGAGGGAAAGGGGTTTAACCCTCTAGGGAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAATTATCCCGCAGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTAAAATTTTTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACACCTAAAACAATAACATTTGATTGGTATGGAAATAATTACACAGTTCCTGTGGTTAAGATTCCCTACATAATAGAAGCTATACACGGAAAACCGTGTTGGCACATAATTCAATATACTAGTAGGGAAATCAATAGAACTAATCAGGCATTAAAAGATTTAACAATTAGGCCATTAAGATTTTATAAACGTGCCGCACGTCAGGTGGTTGCTCTGTGCAGGGCTAGGGGTGGTACCCTTAGATTCCTGGCAGACACGCTACTTGCGTGGGTGCACGGCAGGACTGTGAGGCTTGAGCCTAGAAAAGTTAAACAGGCTAAAGCTTTTAAATTTTGGGAGCCTTATGAACAAAATTTAGATGATGATACAATTAGGTTTAAAATGAATTGGCTGCTTGTGGCAGCACTAATTGGCTCCATAATGCTAATTTGGTTTAAAGGCTAAATTTTAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCACGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGACCTGGCGTCAGAACCGTCTCGGGACGCTGGGTCATCCCCCTTCCGGCTTCGGGGCTTGGCAACCCCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAGGCGTTT
| 26,729
|
ON391066.1
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Jiang,J., Hao,Y., Li,X., Su,L., Liu,X., Chen,C., He,B., Zhao,Z., Mi,S., Gong,W., Tu,C.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-19
|
RPHV-DZ1-2020
|
Rhizomys pruinosus hepacivirus
|
Hepacivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 8,960
|
GenBank
| null |
China: Hainan
|
China
|
Rhizomys pruinosus
|
liver, abdominal cavity
|
2020
| null | null |
Rhizomys pruinosus hepacivirus isolate RPHV-DZ1-2020, complete genome
|
CACTCCCCTTGGGGAATGCGCCAGCCCTGGCCGTGTCGGACAGGGTAGCAAGAGAGTCACTCCTTTTTCCTTTTATCTCTTGCCGCTGGGCTGGTTAATGGCACAGGTGTGGGACAGATTCGTCTCTCCGTGACCTGGTTGGCTGGAGTCTAGCTAGCTCAGTGGGCCCCCAAGGATTGATAACCTGGAAGAGGGCTAACGTGAACTGCCGGGACGGAACTCCCGGGAACTAGGTTGAGCGCACCAGTAGACGCTTCGGCCTCTGATGCTGGGTTGGTAGCCGCCTTTATGGTAACCTAGTTTGGGCATGCCCACAGGAATCGGGGAAGGTGTTGGGTCGCCTCCTGCCTACTGCCTGATAGGGTCGTGCTGCGCGTCCAGGTTCTTGCAGCTGTATAACACTTATGGATTCTTTACTCTTTTCAAACCCAAAAAGTAACATTAAGTCTTGTACCGCATGGTTCGCCATGCTGTTTTGTGTGAATGTGTGTTTGTGTGTAGGGAATGGTCGGCCGCGAGGCCGAGTAGTTAAAGGTGTGTATGTGGTGCACCCCAAGAAAACAGTGGATCAAGGTGTGCGGAGGAAGCGTAGGCCCCGACGCGACCTGGGCGGTTGGAGGAGGTCTGCCATAGGCCCCATGGATCCTTACTTCCGGACTGCCGTCCAGGCCATTGCTCCTAGCCCTGCCTACCCGTCTAGAGACCCCAGGCGCCAGTCAAGGTTCCTGGGACATGTCATAGATGGCACACTGGGCTGGGTAACTGATGTTGTCCACCATGTCCCTCTCGTCGGGCCTCTGGTTGGCCACCCATTGAGGATGGTGTGTAGGGTGGTGAGGTCAGGTGAGAATGCAATAAATTCCCTTACCGGTACTGTTGGTGTCCATTTATTTGTCTTGGCTCTTTTATCCTGCTTGTGTCCTGCAACAGCAGTTTCAAATTGTTGTACCCCTGATCAAGTAGTCTACTGCACTGAAGTGACATGTGTCCATGAGACAGGTTGCATCATATGTGAGCAGAAGGATGACCAGGTAGTATGTTGGTCCCCGGCGGGTCTATTGGTATCGCATCCCCCTAATTATACCGGGATCGATCCCTTCTTAACCCAACATATAGACTTTGTCGCCGGGACTACATTTATCTGTGATCTGACCGGGATGCGAGAGGTGTGTGGCGTAGCTGTGTTGCTATCCGCTACAGCCTTGGAACTCTTGCCCAGGCCAGTTAAACTTAACACAACTGCAGATTGCTACTTGTTTATTGATTCAGGGGTTGATCCTCTCTTTGCTTCCTTTTTTACTTGGTTGGCTGAGGAGTTCTCTACTATCACGGCTATTCTTGATTTCATATCTAAAGTTCCTAGTGCTTTAGCTCATGCTTTCACTCGCAGTCATTTTCTCACCATGTGTAGTATTGCTGGTTTGGCCTTAAATGGAAACATGGCAAAAGCTTTCGCTCTGGTTGTGTTGTATATAGAGGCTGCTGCCGCAGCCCCTATGAATGTTGAGTCGCTAAAGTACCCGGAGCTTGGAAGTGGATGTCCCCTGTTGAGCCGCCCCCCACGGTGTCTTAACAGGACGTCTTTTGGTTCAACCATCTATTGTTTCCACCCTAAATTTGGCTTCCAGCCTTCTACTCAAGGATGGCCGCAGGGTAGTTGGTTCTGCGCCGGAGCTGCAACAATCAACAACTATACAAACTTGGCTTGCTGTACTTTGAGGGTTACTCCTGCCTTTTGTCATAATTGTAGCTCTGACTGCAGCTGGGCGGATAGGAGACAGACTTTCGAGGTGTGTGGCGCTTCTCCGGCGTTCTCGACGGCTTGTAGTCCATCTGCCATCAGTGCTTTGGCCAGGGTGCTGCCCACCACGGCACCGAGGCTGCCCAACCAAACTTGTATGCCCACTGTTGTTGCGGGGTTGTCTATAGGACCGCTTAAATCTCCCGGTCCTGCTAGTTATGTCAGCTTGGTACATGGAAGCTGGATTACTTACCATTACTACCCCCACAGATTGGCTAAATTAGACTACAGAAATTGGGCAAGATTACCCGGGACTCCACCCACTTATAGGGGCTCCTGGATGACTGTCCCCAAGGGAATGTATAGCTCCAGGAAAGACATCTCCAGTGGTTTGGTCATCAAGGATAGAGCCAATCAAGACTATCAACTGCTCTTTTCCGGCGTGGGGACCTACATCATTCCCGGAATTACAGAGCATGTGGTGATCATAGCTTTGTTAGCTGCATTCGGTGCCCGCTGGTGCTTGTTTCTGTATGCCATGTACAATTGGTTGCCTGGAGCTTTTGCTTTCACCCCTGAGGTGGTAGCTGCCACCGCTGCTTCTCCGTGGGAGGACCCGGTGGTTAGAGCTGGAGTGTACTTCGCCTCCTTGTGGCGCTCCCCTCTTTCTATCCCACTCTGCGGGAACGCAGTTTCCTTTTTCTTACTATCATTCTGCCACTATGCTCAAGCTTTCTCCACATCTGACATCCTATTCGCTGCTGGCTCAGTAACCCTATTTACTGCTTGGGCTGGACTGTTTTCTCGCTTCATTCCCATGCTGTTGCTAACTCAATCCTACTTACGTGTGAGGTTGGAGGCTTTTACACGTTCTTGGCTTGATCGCTCCCTACTGTTTGTGTGTGTGATTGTGATACCTCATGCTGTGTGGGATGTGTGTCTGGTTCTCTGGGTGTGTTGGCTCCTGCTAGTAGTGGGCGGCCATCTTGTTGTTCACCTTTGGGGACCAAAGGACAAAGCGAGCTTACATCTGTTGCTCGTTAGACTCAGGAAGTGTGGATCCTGGTTGTCAAGAAAGTTACGGCCCATCGTCATCTGGGCCGCTGGTGAGAATGGAGTCTTCTGGTTCGACCACATAGATGGAAGCTTGGAGGGTGAGTGGGAGTTCAAGGACCCCTACTTCCCCTTCCAGACGGAGGTTGAGGTGGCTCAAGACGTCGGTCACAAGCTGGCTTGCGGAGACCAGATCCGAGGCTTGCCAGTGTACGCGCGTTGCGGGTCCACTGTAAAGGCAGGGATAGCACAGCTGCCTCGAGGTTGGAAGAGGACTATACCATTCTCAGCAAAAATAACTAGCCAGAGGAATCAACTTAAAGCTTTGGCTTTGTGCTTGACTGGGGGAGACAGCAGCAGCTACCAGGGAACGGTGGCGGTTATAGGAACCCCCTTGAGATCCTGGATGGGTTTTGGTTGTTTGGGGTCTTTGTACACAGTCTACCATGGAGCCAGAACTAGATTGCTGGCATCCCGTGATGGACCTAGGCCCCCCACTCTTGTTAATGCCCAGGTTGATTTGGTCAAGTACCCACTGCCATCTGGTATGGAATGTTTGGACATCTGTGACTGCAACTGCACTGAATTTTATTTGGTCACGCGACTGGGGAATTTGATACCTTGCGTCCAAGTCGAAGGAAGGTTCTGTAACACGGCGCCTTTAACTTTGGCTGAAGCGAAGGGTAGCTCAGGTGCCCCCATAGTGTGTAAGTGTAGGAAGGTTAAGGCCATGTTTTTGTCATGCCGTAGCAGTAGAGGCGTGGTGAGCAGCTTCGGCGTGCACATGGTGCAGAAAGATCAGGTGGCTGATAGTAGAGTGCTACCCTGTGGCGAACTGGTGCCTCCCAACGTGCCCAGGAAGGGCCAAAAGAAAGTGGAGCGTCTTGTCGCCCCGACTGGGAGTGGGAAGACCACCAAGTTGCCTATGAAGTACTACAGTGATGGCTACAGTGTGTTAGTGCTCAACCCGAGCGTAGCAACAACGCGCTCGGTGGGGGAATACATGAAAACCGCCCATAAAGTAAATCCAAATATTAGAACTGGTGATGGATGCATCAACAATGGGAGTCGACTTACCTACAGCACTTATGGCATGTTTCTCACACAACCCACGTTTCAGGACGACGTGATCATCTGTGATGAGGTACATGCGGTTGACCCCACCACAATATTGGGTATAGGTGCAGCTCTCGCTGCCTTTCAAAGTTCCGCCAAGGCCAAGCTACTCATCCTAGCTACAGCAACTCCCCCTGGAACACCCATAACTCCTCACCCCAATGTGACCACACAGGATTTGACCGATGAGGGTGATTTCCCCTTCCATGGTAGAAAAATAAAATTGGACAATCTAAAAAAAGGCAGGCATCTGATATTTACTCCTGGGAAGAAACATTGTGACACTATGGCTAGAGATCTCAATGACCAAGGTATTAATGCAGTAGCCTATTACAGGGGTAAAGATGCTGGTGTCATACCAAGGGAGGGTGACGTCGTGGTAATAGCGACTGACGCCCTAATGACTGGTTACACTGGAAATTTTGATTCGGTCTATGATAGTTGCCTCCAGGTAGAAGCCCACTACGAGTTGAACATGAATCCAACATTTTCCCTATCAATCAGGACAAAAAATGCAGACGCAGTTACGCGGATGCAACGTAGGGGCCGAACAGGCAGGGGTAAGCATGGCACATACTATCAGGTAACACCACATTGCGCCACACATGGCATAGTCCCAACAGCTAATGTCATTGAGGCGTTTGATTCCGGCATAGCATATTATGGCATGACCCCTGCTGAGGTGGCAAAATTTCTCTCCTATTATAAAGAAGAATCAATGACTGCCGCATTCGACTGTAACATCCAAGAGTTTGCGGAGCTCTTTATGACTCTCGGGTTTGTGGAACCCGCCATCCTTGAAAGAATGAAAAAGGAGGCTGAAAATTACACCTACTTATATGCCGCACAGTACTCAGAGGCACAGGCGTGCGGCGCTCAGGCCCCAAATGACAATAAGATTTGGAGGGGCTTGAAAGGGACTGCCCCTTTCCCCATTCTTTATGACTTAGAGGAGTATGACAACAGTCGCTGTCAAGGGTCATCAAGGGCAGAGAGGATAGCGTCTTGTTTCCAGGAATACTTCTCTAACGGCCTAGTCACTTTGGCCGGAGTGGGTCTCGCTGCAGCTGCAGTATTTACAGCGATAGACCTACTGGGTAACGTGTGTATAAAAAGGGTATACACGTTCACGACCGATTCCTCAGCAGCACGTGTCATAACACCAGGCGAACCGGACCCCACGGAGGCCTTGGAGGAGTGCTACAATTGGGATGGTTTTGCTGAGAGTGTCCAACGAGCTTCACATTGGCTGGCTGATAAGCTCGTTGAGGTCGGTCGCGCGGGAGGAGGAAAGATGCGGTATGAAAGGTGGGCTGTCGACCACGTTCCGCACGTCCTCGCCGCGATTCAATATTTTGCAGGGCTCTCGTGTCTCCAAGACGCGCCTGCGCTAGGGTCTGTCCTAGGATTTGTGGGGGGGGTGCTCAGCCCCCTGCCTCTAAAAGCCAACCTATTCCTTACTGCTTTAGGTGGTGCATTTGCAACAAAGCTTACAACACAGCGAGGAGCAGCTGTGTTTGCCTTGGCAGGGGCTCTGGGGGCCGCAACCGGCTCCTTAAGTCTCGGTCGAGTGGCTGTTAATGCGGCAGCTACTTATGGGGCAGCCACGGCAACATGCTTGGTGGTTCTCAAGCTCATAGATGGTCAGATGCCCGAGATGAGTGAGCTGGCTTCGTTGGCATTCAATCTTGCGAGTCCTGGTGCATGTATCGTGGGAGCTGGGTCCGCCCTGCTCATCGCGTACTGCACCCGTACCGAGTCTCAAGTTTGGATGAATAGGTTATTAGCCATGCTCCACAGGGGAACTAGCTGTGAGGACTATTTTGTTGCATCAACAACTCTAAGGACCAACATCATCAAGGTCTTGGAACAAGCCAATTTGTGGGCTGTTTTTAAATGGCTAGCGAGTTGGCTAAATTCGCAGGACGAGGATCTGTGCACTCCTCGCGGTGCGTTTATGGACTTTTTCCACTCAGTGGGACAGGTCTTAAGGCTCATCGTTGAGGCGGTTCGCGGCTTCCTCGGACGTGTGTTCACGGTTCCTGCAATCCCTGTTTTAAACTGTGACAGGGGGTACAGCGGTCTATGGGCTGGGTCTGGGATTGTCACTTCCACTTGTGGTTGTGGGGCTGAAACAGTCTGGAACATCCTAGAAGGGAAAGCCCATTGGGTGGCAGGGCCTCGAACCTGTTCATCTTGGTGGACGGGCCGAGTGCCTGTAAACAACTCCATGGTTGGCTGCCCACGGCCGCGACCAGCCAGTTGGACCACAATGGCTGTCAACACAGGATTCAACTCATATGTCACCTATGAGAGAAGGGGAGAAGACGTTTACGTCACAGGGATCTCCTCCCCAGCACAGGTTGTAGAGGCGGCAGTGCCTGACCTTATCAGTGCAGTAGCTGTAGACGGAGTCCAGGTCAAACCCTTTGGTGGAACTGGATGGAGGAAGGTTGGGAAATTCGACTGCCGCTTCAGGAGAGGTGATAAGACCACAGACCTTAAGTTACCCTTCAAATTGGAGCCTTGTAGGGAGCCCTACAGGGAAGTGGGCTGCCCATTGCCTGACACTCTTCGACAGGTGTCTCTTACCGAACGGGTTATGAGTCTGGGGAAAGCTCAACCGCCCCCTAGGCCCAAACCTGCAGGGTCATATGACGGAACTCCGGCGGTGAAGAAACCCACTGTCTATGATTCAGGCAGTGATATTGAATCCCCGGGGGACCTGATGAGGCAATTGTCGAAGGGTTACAGCAAGCTCCAAGAATTAGAAAAAGACCTCCCTAAGCCTGTAGAAAGATCTGATCCCTTGGAGGTCATAGAGGTGGCGTCTGATGACGACTCATCCTCTGATGCTCCATTGGTTCCGGGCAAACCACAAAAACCACGTAAAGGGGGAAAAGTAATAGTTACAAAGGCCCTACTTAACCCTAGAGCTCCCACTTTTGTGCCGAAGAAAGTCAAGTTGGCTAAGGGGGCAGTCCCGCTGCCCTGTGTGGCTAGAAAAGGGGAGACCAAAAGCGTGGAAGCCTATTCACTCTTGTCCTCAAGTTGGGAGACTGCAAGCAGTAACGATTCAGCCTGTTCATCTTGGTCGTATGATTGGTCATTGCCCAAATTAGTGTACAAAGGATTCAAGAGAACTATATCAGCAGTTTCCACTTACACATTTGGTATTATGAGGTACAAGCCATTGGTGTACACAACAGACCCAAGTTCCATCAATGAGAGAATTAGGAAAGTCACAATTGAGAGAACACGCACTGAGTTTCCTGAGCTTAGGCGTGAAATCCAAAAAGCCAAGCAGAAAGTGAGGGACCTGAACCTAAGAGAGCTGGAATTAGATGAAGCTCTGGCGCTAACGCCCAATAAAACGGCGAAAAGTGCAATTACTGGCGCCACTGGGAAGTCTGTTAAGACCCACCCAGCTGTTGTTCGGGAAGTTTATGATCTGCTGTCTAAAGGAGAAATAAATAGGCCCTGGAATGAAGTAAACATCATGCCAAAATCTGAGATATTTGTTTTGTCCCCAGATAAGCCTACTAAGAAACCAGCTCGCATCATTGCTTACCCTCACCTTGAGATGCGAGTTGTGGAGAAGATGGTCCTGGGAGAAATTGGGCCAACAGTGGTGAAGACAGTGTGCGGACAGGCATACGGGTTTTTGTCACCCCAGGAAAGAGTTCAGAGACTGGTGTCCATGTGGAACTCCAAGGAAGCCCCTTGTGGATTCACGTGTGATACTACATGCTTTGACTCCACCATCACACCAGAGGATATAGCGGCAGAGTGTGAGATATACGAAGCCGCCGCCGCCAACCCTGATACTAAAGCCAGAATTAGAACTCTCCACACTAATTTGTATCAAGGGGGCCCTATGATGATGCAAGGAACCTATGTAGGTGAGCGTCATTGTCGGGCTAGCGGAGTTTTCACAACATCCTCTTCCAACACCCTAACTTGTTATCTCAAAGTATCAGCAGCTGCAAAAAAGGCAGGGATAAAGAACCCTAGCTTTCTTATAGCAGGGGATGACTGTGTCTGCATCTTTGAATCAGAAATGGATATGGACAAGAAACGGTTGGGCTTGTTCACAACATATATGAAGCAGATGGGGGCGCCTCAAGGAGTGGTGCCCACCCCCTACTATCATTTAGAGTTATTAGATAGCTGCTCTTCAAATGTGTCGCTAGCACAGACAACTAGCGGTCAATTCCACTATTCAACAAGAGATCCTAAAACACCTCTAGGACGGATTAGTGTAGAGGGCAAGGGGTTTAACCCTCTAGGCAGCATGTTAGGGTATCTGCTAGCAAACTACCCCGCTGTTTGGGTTTCGCGGGTGATAGCAGTTAAGTTTCTACAAGAATTGGCTAGTCAAGAAACACCAAAAACAATAACATTTGATTGGTATGGAAATAATTACACAGTTCCTGTTATTAAAATTCCCTACATCATAGAGGCCATTCACGGGAAACCGTGTTGGCATATAAGACAATATACTAGTAGAGAAATTAATAGAACTAATCAGGCTCTAAAAGATTTAACAATTCGGCCTTTACGGTTTTACAAACGTGCAGCTCGTCAGGTGGTTGCTCTGTGTAGGGCTCGGGGTGGTACCCTGAGATTCCTCGCAGACACGCTACTAGCATGGGTGCACGGCAGGACTGTGCAGCTCGAGCCTCGAAAAGTTAAGCAGGCTAGAGCTTTTAAATTTTGGGAGCCTTATGAACAAAATTTAGATGAAGATTCAATTGGTTTAAAAACAAATTGGCTGCTTCTTGCAGCACTAATTGGCTCCATATTTCTAATTTGGTTTAAAGGCTAAATTTTAATTAATTGATTCCATACGGGGCAGTGAACCTCTGATTATCATTGCAGAGGCACGGGGCTTGGCGACCCTCCCCCCACGAGCCAGGGCCGGCGTCAGAACCGTCTCGGGACGTCGGCTCATCCCCTTCCGGCTTCGGGGCTTGGCAACCCCGATTCTATCCGCCCGTACCAGGATACGTACCCCAATAGGGTCCTGGCCCGGTCTGGTTGCGAGGCG
| 26,730
|
NC_002792.2
|
Ribgrass mosaic virus
|
Chavan,R.R., Cohen,D., Blouin,A.G., Pearson,M.N.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2001-05-16
|
R14
|
Ribgrass mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,311
|
RefSeq
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Plantago major
| null |
2009-04-21
| null |
PRJNA485481
|
Ribgrass mosaic virus, complete genome
|
GTTTAGTTTTATTGCAACAACAACAACAAAATACAATAACAACAAACAAAATACAAACAACAACAACATGGCACAATTTCAGCAAACAATCGACATGCAAACTCTCCAAGCTGCTGCGGGACGCAACAGTCTGGTGAATGATTTGGCGTCTCGTCGCGTTTATGATAACGCGGTTGAGGAGCTGAATGCTCGTTCAAGACGTCCCAAGGTTCATTTCTCCAAAGCAGTGTCAACGGAACAGACCCTGATCGCAACAAACGCTTATCCGGAGTTCGAGATCTCTTTTACTCATACGCAATCTGCAGTGCATTCCTTGGCTGGAGGCCTCAGATCGCTTGAACTGGAGTATCTCATGATGCAAGTTCCATTTGGATCTTTGACGTATGATATTGGCGGTAACTTTTCTGCGCATCTTTTCAAAGGGCGCGATTATGTTCACTGCTGCATGCCTAATTTGGACGTGCGTGACATTGCTCGCCACGAGGGACACAAGGAAGCCATTCAAAGCTACATAAATCGTCTGGAGAGACAGCGGCGACCTGTGCCTGAATATCAGAAGGCAGCTTTCAATAATTACGCGGAGAATCCACGTTACGTTCATTGTGACCGTCCTTTTCAACAGTGTGAATTGACGACAGCAAATGGTACTGATACTTACGCTGTAGCGCTTCATAGCATTTATGACATCCCTGTTGAAGAGTTTGGTTCGGCGCTTCTCAGGAAGAACGTCAAGACTTGTTTCGCGGCTTTCCATTTCCACGAGAATATGCTTCTTGATTGTGACACTGTTACACTCGATGAAATCGGAGCAACTTTCCAGAGAGCTGGCGATAAACTGAGTTTTTTCTTCCATAATGAGAGCACTCTTAACTATACCCATAGCTTTAGTAATATAATAAAATATGTGTGTAAAACGTTCTTTCCAGCTAGTCAACGGTTTGTGTATCATAAGGAGTTCTTAGTTACTAGAGTCAATACTTGGTATTGTAAGTTTACTAGAGTGGATACTTTTACTCTGTTCCGTGGTGTGTATCATAATAATGTAGACTGCGAAGAGTTTTACAAGGCTATGGACGATGCGTGGGAGTACAAAAAGACGCTTGCGATGCTAAATGCAGAAAGAACCATTTTCAAGGATAACGCAGCGTTGAACTTTTGGTTCCCGAAAGTGAGGGATATGGTCATCGTCCCTCTTTTTGACGCGTCTATCACGTCTGGGAAAATGTCCAGGAGAGAAGTTATGGTGAACAAGGATTTCGTTTACACGGTCCTTAATCATATAAAGACGTACCAAGCCAAAGCTTTAACTTACGCAAACGTTCTGTCCTTCGTAGAGTCAATTAGGTCTAGAGTTATAATCAACGGTGTAACTGCCAGGTCTGAATGGGACACAGATAAGGCGATTCTAGGTCCTTTAGCGATGACATTTTTCCTTATAACAAAGTTGGGTCATGTACAGGATGAGATAATCCTGAAAAAGTTCCAGAAGTTCGACAGATCCACCAAAGAGTTAATTTGGTCCAGTCTCTGCGATGCCCTGATGGGGGTTATTCCCTCGGTCAAAGAGACTCTTGTTCGTGGTGGGTTTGTGAAAGTGGCAGAAGAGGCCTTAGAGATTAAGATCCCTGAATTGTACTGCACGTTCTCCGATAGATTGGTACTGCAGTATAAGAAAGCAGAAGAGTTTCAATCGTGCGACCTTTCCAAACCTCTAGAAGAATCTGAGAAGTATTACAACGCATTATCTGAGCTATCTGTGCTCGAGAATCTCGATTCATTTGATCTAGAGGCGTTTAAGACTTTGTGTCAGCAGAAAAACGTAGATCCGGATATGGCGGCTAAGGTAGTGGTGGCAATTATGAAGTGTGAGTTGACGTTGCCTTTCAAGAAGCCTACTGAAGAGGAAATCTCAGAGTCACTTAAAACCGAGGAGGCGAAAAGCGCGGAACGCGACGATGTGTTGAGCTTACGAAACGATGCTCCTTACCCATGTGTGAAAAATCTCGTAGAAGGTTCTGTACCAGCGTACGGAATATGTCCGAAAGGTGGTGGTTTCGACAAGTTTGATGTGGACATTGCCGATTTTCATCTCAAGAGTGTAGATGCAGTGAAGAGGGGGGCCATGATGTCTGCGGTGTATACAGGATCGATTAAAGTTCAACAGATGAAGAACTACATCGATTACTTAAGTGCGTCGCTGTCAGCAACTGTCTCCAATCTCTGTAAAGTGCTTAGAGATGTTCATGGTGCTGATCCAGAATCACAGGAGAAATCCGGAGTGTGGGACGTGAGGAGAGGACGATGGTTACTTAAACCAAACGCGAAGAGTCACGCTTGGGGAGTTGCTGAGGATGCCAACCACAAGTTGGTCATAGTATTGCTCAACTGGGATGAGGGGAAACCAGTCTGTGACGAGACATGGTTCCGAGTAGCTGTGTCAAGCGATTCTTTAGTGTACTCCGATATGGGAAAACTGAAGACGCTAACGTCCTGCTGTTTAGATGGAGAACCTCCGGAGCCGTACACAAAAGTGATTTTGGTTGACGGCGTTCCTGGATGTGGAAAGACGAAAGAGATTATCGAAAAGGTGAACTTCTCTGAGGATTTGATTTTAGTCCCTGGGAAAGAAGCCTCGAAGATGATTATCAGAAGGGCAAATCATGCCGGCGTGATGAGAGCAGACAAGGATAACGTAAGAACGGTAGATTCCTTTCTAATGCACCCTCCGAGGAGAGTGTTTAAGAGGTTATTTATCGACGAGGGGTTAATGCTGCACACCGGTTGTGTAAATTTCTTGCTACTATTATCGCATTGTGACGTGGCGTACGTGTATGGGGACACACAACAGATTCCGTTTATCTGTAGAGTTGCGAATTTCCCGTATCCTGCACACTTTGCAAAGCTTGTGGTGGATGAGAAGGAGGTCAGAAGAATCACGCTAAGATGCCCTGCTGATGTCACATTTTTCCTGAACAAGAAGTACGACGGGGCGGTAATGTGTACCAGCGCTGTAGAGAGGTCCGTAGGGGCAGAAGTGGTAAGAGGAAAAGGTGCTCTGAACCCGATAACTTTACCGTTGGAGGGAAAAATTTTGACCTTTACACAGGCTGACAAGTTCGAATTGTTGGAAAAGGGGTACACGGATGTGAACACTGTGCATGAGGTACAAGGGGAAACATACGAGAAGACAGCTATTGTTCGATTGACTTCGACTCCGTTAGGGATCATATCAAGAGCATCACCGCATGTGCTAGTGGCGCTGACAAGACACACAACGCGTTGTCGGTATTATACCGTTGTGTTAGACCCGATGGTAAGTGTGATCTCGGAAATGGAAAAGTTGTCAAACTTCATTCTCGATATGTACAAGGTCGAAGCTGGCATCCAATAGCAATTACAGATAGATGCAGTATTCAAAGGAACGAATCTTTTCGTTCAGACACCCAAGTCAGGCGATTGGCGAGATATGCAGTTCTATTATGACACTCTTCTTCCTGGAAACAGCACAATTCTTAATGAATTTGATGCCGTTACTATGAATTTGAGGGATATTTCCTTAAACGTCAAGGATTGCAGAATCGACTTCTCCAAGTCCGTGCAAATTCCCAAAGAGCAACCAAGTTTTCTCAAGCCTAAGATAAGAACCGCGGCAGAAATGCCAAGAACAGCAGGTTTGCTTGAAAATTTAGTCGCTATGATTAAAAGAAACATGAATGCACCGGATTTGACAGGGACGATTGACATAGAGGATACTGCATCATTGGTGGCTGAGAAGTTTTGGGACGCTTACATTGACAAGGAATTCAGTGGAACGAATAAAATGTCCTTAACAAGGGAAAGTTTTTCTAGATGGCTCTCTAAACAAGAGACGTCTACGATCGGTCAGCTGGCGGACTTCAACTTTGTAGATTTGCCGGCAGTGGATGAGTACAAGCATATGATCAAGAGCCAACCTAAACAAAAGTTAGACTTAAGCATTCAGGACGAATATCCTGCGTTGCAGACGATAGTCTATCACTCGAAAAAGATCAATGCGATTTTCGGTCCCATGTTTGCGGAACTTACGAGGATGCTGCTCGAGAGGGTGGATTCCTCAAAATTTCTGTTTTACACGAGGAAAACACCTGGTCAAATTGAAGAATTTTTCTCTGACCTTGACTCGACCCAGGCGATGGAAATTCTGGAACTCGACATCTCAAAGTACGATAAGTCACAAAACGAGTTTCACTGCGCTGTGGAGTATAAGATCTGGGAAAAGCTTGGGATAGATGAGTGGCTAGCAGAAGTGTGGAAGCAGGGACACAGGAAAACGACCTTGAAGGACTATACGGCCGGGATCAAAACGTGTCTTTGGTATCAAAGGAAAAGCGGTGATGTGTCAACCTTTATCGGTAACACTATAATCATTGCAACCTGTCTGAGTTCGATGATTCCGATGGACAAAGTGATTAAAGCAGCCTTTTGTGGGGATGACAGTTTAATTTATATCCCCAAAGGAATAGACTTGCCTGATATTCAGGCAGGTGCAAACCTTATGTGGAATTTCGAGGCTAAGCTTTTTAGGAAAAAGTATGGTTACTTCTGTGGTCGTTACGTGATTCACCATGATAGAGGAGCAATAGTATATTACGATCCACTTAAACTAATATCTAAGTTAGGTTGTAAACATATTAGGGATGTAGTCCATTTAGAAGAGTTACGTGAGTCTTTGTGTGATGTAACTAGTAACTTAAATAATTGTGCGTATTTTTCACAGTTGGATGAGGCCGTTGCCGAGGTTCATAAAACCGCGGTTGGCGGATCGTTTGCTTTTTGCAGTATAGTTAAATATTTGTCAGATAAAAGGTTGTTTAAAGATTTGTTTTTTGTTTGATAATGTCGATGGTCTCGTACGAGCCTAAGGTGAATGATTTTCTTTTTCTCACGAATAAGGAAAAGATACTCCCGAAAGCTCTTACTAGGTTGAAGACCGTGTCTATTAGTACTAAGGATATAATATCTGTCAAGGAGTCAGAGACTTTGTGTGATATAGATCTGTTAATTGATGTGCCATTAGATAAGTATAGATATGTGGGTATTTTAGGAGCTGTTTTTACAGGTGAGTGGCTTGTACCAGACTTCGTCAAAGGTGGAGTAACAATAAGCGTGATTGACAAGCGTCTGGTAAACTCCAAAGAGTGTGTAATCGGCACGTATAGAGCAGCGGCTAAAAGCAAGAGGTTCCAGTTCAAGCTGGTTCCAAATTACTTTGTGTCTACTGCGGACGCCAAGAGGAAACCGTGGCAGGTCCATGTGCGTATTCAGGATGTGAAGATAGAAGCCGGTTGGCAACCCTTGGCTCTGGAAGTTGTATCCGTTGCTATGGTCGCTAATAATGTGGTTATGAAGGGTTTGAGAGAAAAGATCATCGCGATAAGTGATCCGGACGTCGAAGGTTTCGAAGGAGTGGTTGACGATTTCGTTGATTCGGTCGAAGCATTTAGAGCGGTTGATAATTTCAGGAAAAAGAAAAGGAAGATAGGAGAAAAGGAAGCGGTAAGTAGGAATAAGTACAGACCGGAGAAACACGCCGGTCCTAATTCGTTATATATTAAAGAAGAAAATGTCTTACAACATCACGAGCTCGAATCAGTACCAGTACTTCGCAGCGGTGTGGGCAGAACCCACACCAATGCTTAATCAGTGCGTGTCGGCATTGTCACAGTCGTTTCAAACACAAGCGGGGAGAGATACTGTTAGGCAGCAATTCTCAAACTTGTTGAGTGCGATTGTGGCACCGAACCAGCGGTTCCCAGATACAGGGTTCCGGGTGTATGTTAATTCGGCGGTTATAAAGCCGTTATACGAGGCTCTTATGAAGTCCTTTGATACTAAAAATAGGATCATTGAGACGGAAGAGGAGTCACGCCCGTCAGCGTCTGAGGTAGCAAACGCAACACAGCGTGTTGATGATGCGACCGTCGCCATTAGAAGTCAAATTCAGCTTTTGCTGAATGAGCTTTCAAACGGACACGGTTATATGAACAGAGCGGAGTTCGAGGCTATATTGCCTTGGACTACGGCACCTGCTACTTGAGCGTGGTGCGCACGATAGCGCGCAGTGTTTTTCTCTCCACTTAAATCGAAGAGATAAACTTACGGTGTAAATCCGTAGGGGTGACGTAAACCAAATTACGTAATGTTTTGGGTTCCATTTAAATCGAAACCCCATATTTCCTGGATCACCTGTTAACGCACGTCGGACGTGTATTACAGTGGGAATATGTAAAAGTGAGAGGTTCGAATCCTCCCTAACCCCGGGTAGGGGCCCA
| 8,654
|
MT129775.1
|
Ribgrass mosaic virus
|
Mahar,J.E., Shi,M., Hall,R.N., Strive,T., Holmes,E.C.
|
University of Sydney, School of Life and Environmental Sciences
|
Australia
|
2020-03-12
| null |
Ribgrass mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,265
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
| null | null |
2017-02-02
| null | null |
Ribgrass mosaic virus strain GudgCC_DN40115-8, complete genome
|
CAACAACAACAAAATACAATAACAACAAACAAAATACAAACAACAACAACATGGCACAATTTCAACAAACAATCGACATGCAAACTCGTCAGGCTGCAGCGGGACGCAACAGCTTGGTGAATGATTTAGCATCTCGTCGTGTTTACGATAACGCGGTCGAGGAGCTGAATGCTCGTTCTAGACGTCCCAAAGTTTATTTCTCCAAAGCAGTGTCTACGGAACAGACCCTGATTGCAACAAATGCTTATCCGGAGTTTGAGATCACCTTCACTCATACGCAATCTGCAGTGCATTCTTTGGCCGGAGGCCTTCGATCACTTGAACTGGAGTATCTCATGATGCAAGTTCCATTTGGATCTCTGACGTATGATATCGGTGGAAACTTTTCAGCGCACCTTTTCAAAGGGCGTGATTACGTTCACTGCTGTATGCCTAATCTGGACGTGCGCGACATTGCTCGCCACGAAGGACACAAGGAAGCCATTCAGAGTTACATAAATCGCCTGGAAAAGCAACGGCGACCTGTACCTGAATATCAGAGGGCGGCTTTCAACAACTACGCGGAGAATCCACATTTCGTCCATTGTGACCGTCCTTTTCAACAGTGTGAATTGACGACAGCAAATGGTACTGATACTTATGCTGTAGCGCTTCATAGCATTTATGATATCCCTGTTGAAGAGTTTGGTTCAGCGCTTCTCAGAAAGAACGTAAAGACCTGTTTCGCAGCTTTCCATTTCCACGAGAACATGCTTCTCGATTGTGATACTGTCACTCTTGATGAAATCGGTGCAACCTTCCAGAGAGCAGGCGATAAACTGAGTTTTTTCTTCCATAATGAGAGCACTCTTAATTATACCCACAGTTTTAGTAATATAATTAAATATGTGTGTAAAACGTTTTTCCCCGCTAGTCAGCGGTTTGTGTATCATAAAGAGTTCTTAGTCACCAGAGTTAATACCTGGTACTGTAAGTTTACTAGAGTGGACACTTTTACTCTTTTCCGTGGTGTGTATCATAATAATGTAGACTGCGAAGAGTTTTACAAGGCTATGGACGATGCATGGGAGTACAAAAAGACGCTTGCGATGCTTAACGCAGAGAGAACCATTTTCAAAGACAACGCAGCGTTAAACTTTTGGTTCCCGAAAGTGAGGGACATGGTCATCGTTCCTCTTTTTGATGCATCTATCACGTCTGGAAAGATGTCTAGAAGAGAGGTTATGGTGAACAAGGATTTCGTTTACACGGTCCTTAATCATATAAAGACGTACCAAGCCAAAGCTTTAACTTACGCGAATGTTCTGTCCTTCGTAGAGTCGATTAGGTCTAGAGTTATAATTAATGGTGTCACTGCCAGGTCTGAATGGGACACAGACAAGGCGATTTTAGGTCCTTTAGCGATGACATTTTTCCTTATAACAAAGTTGGGTCATGTGCAGGATGAGATAATCCTGAAGAAGTTCCAAAAGTTCGACAGAACCACCAAAGAGCTAATTTGGTCCAGTCTCTGCGATGCCCTGATGGGGGTTATTCCCTCGGTCAAAGAGACTCTTGTTCGTGGTGGGTTTGTAAAAGTGGCCGAAGAGGCCTTAGAGATTAAGATCCCCGAATTGTACTGCACGTTCACTGACAGATTAGTACTGCAGTATAAGAAGGCTGAAGAGTTTCAATCGTGCGACCTTTCCAAACCTCTAGAAGAATCTGAGAAGTATTACAATGCATTATCTGAGCTATCGGTACTCGAGAATCTCGATTCTTTCGACTTAGAGGCGTTTAAGACTTTGTGTCAGCAGAAAAGCGTGGATCCGGATATGGCAGCCAAGGTGGTGGTGGCAATCATGAAATGTGAATTGACGTTGCCTTTCAGGAAACCTACAGAAGAGGAAATCTCGGAGTCGCTTAAAACCGAGGAGGCGAAAAATGTGGAGCGTGATGATGTATTGAGCTTACGAAATGATGCTCCTTACCCGTGTGTGAAAAATCTTGTAGAAGGTGCTGTACCGGCGTACGGAATATGTCCGAAAGGTGGTGGTTTCGACAAGTTTGATGTGGACATTGCCGATTTTCATCTCAAGAGTGTAGATGCAGTAAAGAAGGGGGCTATGATGTCTGCGGTGTATACAGGGTCGATCAAAGTTCAACAGATGAAGAACTACGTCGATTACTTAAGTGCGTCGCTGTCAGCTACGGTCTCTAATCTCTGTAAAGTGCTTAGAGATGTTCATGGTGCTGACCCAGAATCGCTGGAGAAATCTGGAGTGTGGGACGTGAGAAAAGGACGCTGGTTACTCAAACCTAATGCGAAAAGTCACGCTTGGGGAGTTGCAGAAGACGCCAACCACAAGTTGGTTATAGTATTGCTCAACTGGGATGAGGGAAAACCAGTTTGTGACGAGACATGGTTCAGAGTAGCTGTGTCAAGCGATTCTTTAGTGTACTCTGATATGGGAAAACTGAAGACGCTAACGTCCTGCTGTTTGGATGGAGAACCTCCGGAACCGAACGCGAAAGTAATTTTGGTTGACGGTGTTCCTGGTTGTGGAAAGACGAAAGAGATTATCGAGAAGGTGAACTTCTCCGAGGACTTAATTTTAGTCCCTGGGAAGGAAGCTTCGAAGATGATTATCAGAAGGGCAAATCATGCTGGTGTAGTGAGAGCGGATAGGGATAACGTGAGAACGGTAGATTCCTTCTTGATGCACCCTCCGAAGAGAGTGTTTAAGAGGTTATTTATCGACGAGGGGTTGATGCTACACACCGGTTGCGTTAATTTTCTGCTACTACTATCGCACTGCGACGTGGCGTACGTGTATGGGGACACACAACAGATTCCGTTTATCTGTAGAGTCGCGAATTTCCCGTATCCCGCTCACTTTGCGAAGCTTGTAGTGGACGAGAAGGAGGTCAGAAGAGTCACGTTAAGATGTCCCGCCGACGTTACATTTTTCTTGAACAAGAAGTATGACGGGGCAGTAATGTGTACAAGCGCCGTTGAAAGGTCTGTGAACGCGGAAGTGGTAAGAGGGAAAGGTGCATTAAACCCAATAACTTTACCGTTAGAGGGAAAAATCTTGACCTTCACACAAGCCGACAAGTTCGAAATGCTGGAAAAGGGTTACACGGATGTGAATACAGTGCACGAGGTGCAAGGGGAAACGTACGAGAAGACTTCCATTGTCCGATTGACATCGACTCCGTTAGAGATCATATCAAGAGCTTCACCACATGTGTTAGTGGCGTTGACAAGACACACAACTCGTTGTCGGTATTACACCGTTGTGTTGGACCCGATGGTAAATGTGATTTCTGAAATGGAGAAGTTGTCAAATTTCATTCTCGATATGTACAAGGTCGAAGCCGGCATCCAATAGCAATTACAGATAGATGCAGTATTCAAGGGAACGAATTTGTTCGTCCAGACACCTAAATCAGGAGATTGGCGAGACATGCAATTCTACTATGACACTCTTCTTCCTGGAAACAGCACTATTCTTAACGAATTTGATGCCGTTACTATGAATCTGAGGGATATTTCCTTAAACGTCAAGGATTGTAGAATCGACTTCTCAAAATCCGTGCAGATTCCCAAAGAGCAACCTTGTTTTCTCAAGCCCAAGATAAGAACTGCGGCAGAAATGCCGAGAACAGCAGGCTTGCTTGAAAATTTAGTTGCTATGATTAAAAGAAACATGAACGCGCCGGATTTGACGGGGACGATTGATATAGAGGATACTGCATCATTAGTGGCTGAGAAGTTTTGGGATGCGTACGTCGACAAAGAATTCAGTGGAACGAACAAAATGTCCTTAACTAGGGAAAGTTTTTCTAGATGGCTCTCCAAACAAGAGTCGTCTACAGTTGGTCAGCTAGCGGACTTCAACTTTGTAGATTTGCCGGCAGTTGATGAGTACAAGCATATGATCAAGAGCCAACCCAAGCAGAAGCTAGACTTAAGCATTCAGGACGAATATCCTGCACTGCAGACAATAGTCTATCACTCGAAAAAGATCAATGCTATCTTCGGTCCTATGTTTGCGGAACTTACGAGGATGCTGCTCGAGAGGGTGGACTCTTCAAAATTTCTGTTTTATACGAGGAAAACACCTGGGCAGATAGAAGAATTTTTCTCTGACCTTGATTCAACCCAGGCAATGGAAATTTTGGAACTCGACATCTCAAAGTACGACAAGTCACAAAACGAGTTTCATTGCGCTGTAGAGTATAAAATCTGGGAAAAACTTGGGATAGATGAGTGGTTAGCTGAAGTGTGGAAACAGGGACACAGGAAAACGACTTTGAAGGACTATACAGCAGGAATCAAAACGTGTCTTTGGTACCAAAGGAAGAGTGGTGATGTGTCTACCTTTATCGGTAACACTATTATCATTGCGACCTGTCTTAGTTCAATGATTCCAATGGACAAAGTGATCAAAGCAGCCTTTTGTGGGGACGACAGTTTAGTATATATTCCTAAGGGTATGGACTTGCCTGATATTCAGGCCGGTGCAAACCTCATGTGGAATTTCGAGGCAAAGCTTTTCAGGAAAAAGTATGGTTACTTCTGCGGTCGTTACGTTATTCACCATGATAGAGGAGCAATCGTATATTACGATCCGCTTAAACTGATATCTAAGTTAGGTAGTAAGCATATTAGAGATACAGTTCATTTAGAAGAGTTACGTGAGTCTTTGTGTGATGTAACTAGTAACTTAAATAATTGTGCGTATTTTTCACAGTTAGATGAGGCCGTTGCCGAGGTTCATAAAACCGCGGTAGGCGGATCGTTTGCTTTTTGTAGTATTGTTAAATATTTATCAGATAAGAGGTTGTTTAAAGATTTGTTTTTTGTTTGATAATGTCGATAGTTTCGTACGAACCTAAGGTGAACGATTTCCTTTTTCTCACGAATAAGGAAAAGATACTCCCGAAAGCTTTGACGAGACTTAAGACCGTGTCTATTAGTACTAAGGATATAATATCCGTTAAGGAGTCCGAGACTTTGTGTGACATAGACTTGTTAATTGATGTGCCATTAGATAAGTATAGATATGTGGGTATTCTAGGAGCTGTTTTTACAGGAGAGTGGCTTGTACCAGACTTTGTTAAGGGTGGTGTAACGATAAGCGTGATAGATAAGCGTCTGGTGAACTCTAAGGAGTGCGTGATCGGTACGTACAGAGCCGCAGCTAAAAGCAAGAGGTTCCAGTTCAAGCTGGTTCCAAATTACTTTGTGTCTACAGCGGACGCCAAGAGGAAACCATGGCAGGTTCATGTGCGTATTCAAGACGTAAAAATCGAGGCGGGTTGGCAGCCGTTGGCTCTGGAAGTAGTATCCGTTGCTATGGTCGCCAATAATGTGGTTATGAAGGGTTTGAGAGAAAAGATCATCGCGATAAGTGATCCGGACGTCGAAGGTTTCGAAGGCGTGGTTGACGAATTCGTCGATTCGGTTGAAGCATTTAAAGCGGTTGATAATTTCCGGAAAAAGAAAAGAAAGATAGGAGAAAAGAAAGTGGTAAGTAAGAATAAATACAGACCGGAGAAGTACGCCGGTCCTAATTCGTTATATATTAAAGAAGAAAATGTCTTACAACATCACGAGCTCGAATCAGTACCAGTACTTCGCAGCGGTGTGGGCAGAACCCACACCAATGCTTAATCAGTGCGTGTCGGCATTGTCACAGTCGTATCAAACACAATCCGGAAGAGATACTGTTAGACAGCAATTCTCAAACTTGTTGAGTACGATTGTGGCGCCAAACCAGCGGTTCCCAGATACAGGGTTCCGGGTGTACGTTAACTCGGCTGTTATAAAGCCGTTGTACGAGGCTCTTATGAAGTCTTTTGATACTAGAAATAGGATCATTGAAACAGAAGAGGAGTCACGTCCGTCAGCGTCTGAGGTAGCAAACGCAACACAGCGTGTTGATGATGCGACCGTCGCCATTAGAAGTCAAATTCAGCTTTTGCTGAATGAGCTTTCGAACGGACACGGTTATATGAACAGAGCGGAGTTCGAGGCTATATTGCCTTGGACTACGGCACCTGCTACTTGAGCGTAGTGTGCACGATAGCGCATAGTGTTTTTCTCTCCACTTTAATCGAAGAGATAAACTTACGGTGTAAATCCGTAGGGGTGACGTAAACCAAATTACGTAATGTTTATGGGTTCCATTTAAATCGAAACCCCATATTTCCTGGATCACCTATTAACGCACGTGTGACGTGTATTATAGTGGGAATATGTAAAAGTGAGAGGTCC
| 53,566
|
MT129780.1
|
Ribgrass mosaic virus
|
Mahar,J.E., Shi,M., Hall,R.N., Strive,T., Holmes,E.C.
|
University of Sydney, School of Life and Environmental Sciences
|
Australia
|
2020-03-12
| null |
Ribgrass mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,285
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
| null | null |
2017-01
| null | null |
Ribgrass mosaic virus strain GUNCC_DN54313-32, complete genome
|
CAACAACAACAAAATACAATAACAACAAACAAAATACAAACAACAACAACATGGCACAATTTCAACAAACAATCGACATGCAAACTCGTCAGGCTGCGGCGGGACGCAACAGCTTGGTGAATGATTTAGCATCTCGTCGCGTTTATGATAACGCGGTCGAGGAGCTGAATGCTCGTTCTAGACGTCCCAAAGTTTATTTCTCCAAAGCAGTGTCTACGGAACAGACCCTGATTGCAACAAATGCTTATCCGGAGTTTGAGATCACCTTCACTCATACGCAATCTGCAGTGCATTCTTTGGCCGGAGGCCTTCGATCACTTGAACTGGAGTATCTCATGATGCAAGTTCCATTTGGATCTCTGACGTACGATATCGGTGGAAACTTTTCAGCGCACCTTTTCAAAGGGCGTGATTACGTTCACTGCTGCATGCCTAATCTGGACGTGCGTGACATTGCTCGCCACGAAGGACACAAGGAAGCCATTCAGAGCTACATAAATCGCCTGGAAAAGCAGCGGCGACCTGTGCCTGAATATCAGAGGGCGGCTTTCAACAACTACGCGGAGAATCCACATTTCGTCCATTGTGACCGTCCTTTTCAACAGTGTGAATTGACGACAGCAAACGGTACTGATACTTATGCTGTAGCGCTTCATAGCATTTATGATATCCCTGTTGAAGAGTTTGGTTCTGCGCTTCTCAGAAAGAACGTAAAGACCTGTTTCGCAGCTTTCCATTTCCACGAGAACATGCTTCTCGATTGTGATACTGTCACTCTCGATGAAATCGGTGCAACCTTCCAGAGAGCAGGCGATAAACTGAGTTTTTTCTTCCATAATGAGAGCACTCTTAATTATACCCACAGTTTTAGTAATATAATTAAATATGTGTGTAAAACGTTTTTTCCCGCTAGTCAGCGGTTTGTGTATCATAAAGAGTTCTTAGTCACCAGAGTTAATACTTGGTACTGTAAGTTTACTAGAGTGGATACTTTTACTCTTTTCCGTGGTGTGTATCATAATAATGTAGACTGCGAAGAGTTTTACAAGGCTATGGACGATGCATGGGAGTACAAAAAGACGCTTGCGATGCTTAATGCAGAGAGAACCATTTTCAAGGATAACGCAGCGTTAAACTTTTGGTTCCCGAAAGTGAGGGATATGGTCATCGTTCCTCTTTTTGATGCATCTATTACGTCTGGAAAGATGTCTAGAAGAGAGGTTATGGTGAACAAGGATTTCGTTTACACGGTCCTTAATCATATAAAGACGTACCAAGCCAAAGCTTTAACTTACGCGAATGTACTGTCCTTCGTAGAGTCGATTAGGTCTAGAGTTATAATTAACGGTGTTACTGCCAGGTCTGAATGGGACACAGACAAGGCGATTTTAGGTCCTTTAGCGATGACATTTTTCCTTATAACAAAGTTGGGTCATGTGCAGGATGAGATAATCCTGAAGAAGTTCCAAAAGTTCGACAGAACCACCAAAGAGCTAATTTGGTCCAGTCTCTGCGATGCCCTGATGGGGGTTATTCCCTCGGTCAAAGAGACTCTTGTTCGTGGTGGGTTTGTAAAAGTGGCGGAAGAGGCCTTAGAGATTAAGATCCCCGAATTGTACTGCACGTTCTCTGACAGATTAATACTGCAGTATAAGAAGGCTGAAGAGTTTCAATCGTGCGACCTTTCCAAACCTCTAGAAGAATCTGAGAAGTATTACAATGCATTATCTGAGCTATCGGTGCTCGAGAATCTCGATTCTTTCGACTTAGAGGCGTTTAAGACTTTGTGTCAACAAAAATCCGTGGATCCGGATATGGCAGCCAAGGTGGTGGTGGCAATCATGAAGTGTGAATTGACGTTGCCTTTTAGGAAACCTACAGAAGAGGAAATCTCAGAGTCGCTTAAAACCGAGGAGGCGAAAAGTGTGGAGCGTGATGATGTATTGAGCTTACGAAATGATGCTCCTTACCCGTGTGTGAAAAATCTTGTAGAAGGTGCTGTACCGGCGTACGGAATATGTCCGAAAGGTGGTGGTTTCGACAAGTTTGATGTGGACATTGCCGATTTTCATCTCAAGAGTGTAGATGCAGTTAAAAAGGGGGCTATGATGTCCGCGGTGTACACGGGATCGATTAAGGTTCAACAGATGAAGAACTACGTCGATTACTTAAGTGCTTCGCTTTCAGCTACGGTTTCAAACCTCTGTAAGGTGCTCAGGGATGTTCATGGAGCTGATCCAGAATCACAGGAGAAATCTGGAGTGTGGGATGTCAGGAGAGGACGCTGGTTACTTAAACCTAATGCGAAGAGTCATGCATGGGGAGTGGCAGAAGATGCCAACCACAAGTTGGTTATTGTTTTGCTCAACTGGGATGACGGGAAGCCGGTCTGTGACGAAACATGGTTTAGGGTGGCTGTATCTAGTGATTCTTTGGTATACTCCGACATGGGAAAACTTAAGACGTTGACATCGTGCTGCCCGAATGGAGAACCCCCGGAACCGACTGCTAAAGTCATTTTAGTAGACGGTGTTCCAGGTTGTGGAAAAACGAAGGAGATTATCGAAAAGGTAAACTTTTCAGAGGACTTAATTTTAGTCCCAGGGAAGGAAGCTTCTAAGATGATCATCCGAAGGGCTAACCAAGCCGGTGTTATGAGAGCCGATAAGGATAACGTAAGAACGGTAGACTCATTCTTGATGCATCCTTCTAGGAGGGTATTCAAGAGGTTGTTTATCGATGAAGGTCTGATGCTGCACACAGGTTGTGTCAACTTTTTGTTACTTCTATCTCAATGTGATGTAGCGTACGTATATGGGGACACGCAACAGATTCCGTTCATTTGCAGAGTGGCAAACTTTCCGTATCCTGCACACTTTGCGAAACTTGTAACGAACGAAACGGAAGTCCGAAGAGTTACACTTAGATGCCCAGCTGATGTTACGTTCTTCCTTAACAAGAAGTATGATGGGGCGGTAATGTGTACCAGCACAGTTGAGAGATCCGTGAAGGCAGAAGTAGTGAGAGGGAAAGGCGCGTTTAACCCAATAACTTTACCGTTGGAGGGGAAGATTTTAACCTTTACACAAGCCGACAAGTTCGAGTTACTGGAGAAGGGTTACAAAGATGTGAACACAGTGCATGAGGTACAAGGTGAGACGTACGAGAAGACTGCGATTGTCCGATTAACATCGACTCCGTTAGAGATCATATCAAGAGCATCGCCACATGTTTTAGTGGCTTTGACAAGGCACACTACGCGTTGTAGGTACTACACCGTAGTTTTGGATCCAATGGTTAATGTGATTTCTGAAATGGAGAAATTGTCGAATTTCATTCTTGATATGTACAAAGTCGAAGCAGGGGTCCAATAGCAATTACAGGTCGATGCAGTATTCAAGGGAACGAATTTATTCGTTCAGACACCCAAGTCTGGTGATTGGCGAGATATGCAATTTTATTATGACACTCTTCTTCCCGGAAACAGTACTATTCTTAACGAATTTGATGCTGTTACGATGAATTTGAGGGATATTTCCTTAAACGTCAAAGATTGCAGAATCGACTTCTCCAAATCTGTGCAACTTCCTAAAGAACAACCTAGTTTTCTTAAACCTAAAATCAGAACTGCGGCAGAGATGCCGAGAACTGCAGGCTTGCTTGAAAACCTGGTTGCGATGATTAAAAGAAACATGAATGCACCGGATTTGACTGGGACGATTGATATTGAGGATACTGCATCATTAGTGGTCGAAAAGTTTTGGGATGCGTACGTTATCAAGGAATTCAGTGGAACAAATGAGATGGCTATGACAAGGGAAAGTTTTTCTAGATGGCTCTCTAAACAAGAGTCGTCTACAGTTGGTCAGTTAGCGGACTTTAACTTTGTGGATTTGCCGGCAGTGGATGAGTATAAGCATATGATCAAGAGCCAACCAAAGCAAAAGTTAGACTTGAGCATTCAAGATGAATATCCTGCATTGCAGACAATAGTCTATCACTCAAAAAAGATCAATGCAATTTTTGGTCCCATGTTTTCAGAACTTACGAGGATGCTACTTGAAAGAGTTGACTCTTCGAAATTTCTGTTTTATACCAGAAAAACACCAGCGCAGATAGAAGATTTCTTTTCTGACCTAGACTCAACCCAAGCAATGGAAATTCTGGAACTCGACATTTCGAAGTATGACAAGTCACAGAACGAGTTCCACTGTGCTGTAGAGTACAAGATCTGGGAAAAATTGGGAATTGACGAGTGGTTAGCTGAAGTGTGGAAACAAGGTCACAGGAAAACGACTTTGAAGGACTATACAGCAGGAATCAAGACATGCCTCTGGTATCAGAGGAAGAGCGGTGATGTGACAACTTTTATCGGTAACACTATCATCATCGCAGCTTGTCTAAGTTCTATGATTCCCATGGATAAAGTGATTAAAGCTGCCTTTTGTGGAGACGACAGTTTAATTTATATTCCTAAAGGTCTGGACTTGCCTGACATTCAGGCAGGCGCAAATCTAATGTGGAATTTTGAGGCTAAGCTTTTCAGGAAGAAGTATGGTTACTTCTGCGGTCGTTACGTTATTCATCATGATAGAGGAGCCATTGTATATTACGATCCACTTAAGCTAATATCCAAGTTAGGTAGTAAACATATTAGAGACGTAGCTCATTTAGAGGAGTTACGTGAGTCTTTGTGTGATGTAACTAGTAACTTAAATAATTGTGCGTATTTTTCACAGTTAGATGAGGCCGTTGCCGAGGTTCATAAAACCGCGGTTGGCGGATCGTTTGCTTTTTGTTGTATAATTAAATATTTATCAGATAAGAGGTTGTTTAGAGATTTGTTCTCTGTTTGATAATGTCGATAGTTTCGTATGAACCTAAGGTTAGTGACTTCCTTTCTCTTACGAAAAAGGAAGAGATCCTCCCTAAGGCTCTAACGAGGTTAAAGACTGTATCTATTAGTACTAAAGATATTATATCTATTAAAGAGTCTGAGTCTTTGTGTGATATAGATCTGTTAATCAATGTGCCATTAGATAAGTATAGGTATGTGGGTATTCTAGGAGCTGTTTTTACAGGTGAGTGGCTTGTGCCAGACTTTGTCAAGGGTGGTGTGACTATAAGTGTGATAGACAAGCGTCTAGTGAACTCTAAGGAGTGTGTGATTGGTACGTATAGAGCAGCTGCGAAGAGCAAGAGGTTTCAATTCAAATTGGTCCCGAATTACTTTGTGTCCACTGTGGACGCTAAGAGGAAACCGTGGCAGGTTCATGTGCGTATTCAAGATTTAAAAATTGAAGCAGGGTGGCAACCATTGGCGCTAGAAGTAGTGTCTGTTGCTATGGTCACCAACAATGTTGTTATGAAGGGTTTAAGAGAAAAGGTCGTCGCAATAAATGATCCGGACGTCGAAGGTTTCGAAGGTGTAGTTGACGAATTCGTCGATTCGGTTGCAGCATTTAAAGCGGTCGATAATTTCAGGAAAAAGAAAAAGAAAATTGGAGGAAGGGATGTGGTTAGTAAGTATAAATATAGACCGGAGAAGTACGCCGGTTCTGATTCGTTATATTTTAAAGAAGGAAATGTCTTACAAAATCACGAACCCGAATCAGTACCAATATTTCGCAGCGGTATGGGCGGAGCCCATATCAATGCTTAATCAGTGCGTATCGGCTTTGTCGCAATCGTACCAAACGCAAGCAGCGAGAGACACTGTTAGACAGCAATTTTCAAACTTGCTAAGTGCGGTTGTGACGCCGACCCAGCGGTTCCCAGAAACAGGGTCCCGGGTGTATGTTAATTCAGCGGTGATAAAGCCGCTTTATGAGGCTCTTATGAAGTCCTTTGATACTAGAAATAGGATCATTGAGACAGAAGAGGAGTCGCGTCCTTCAGCATCCGAAGTAGCTAACGCAACACAGCGTGTTGATGATGCGACCGTCGCTATTAGAAGTCAAATTCAGCTTCTGCTGAGTGAGCTTTCCAATGGACATGGTTATATGAACAGGGCAGAGTTTGAGGTTTTATTACCATGGGCTGCTGCGCCAGCTACTTAGGCGTGGTGCGCACGATAGCGCATAGTGTTTTTCTCTCCACTTAAATCGAAGAGATATACTTACGGTGTAAATCCGTAAGGGTGACGTAAACCAAATTACGTAATGTTTTGGGTTCCATTTAAATCGAAACCCCTTATTTCCTGGATCACCTGTTAACGCACGTTTGACGTGTATTACAGTGGGAATAAGTAAAAGTGAGAGGTTCGAATCCTCCCTAACCCCGGGG
| 53,567
|
JQ319720.1
|
Ribgrass mosaic virus
|
Chavan,R.R., Pearson,M.N.
|
University of Auckland, School of Biological sciences
|
New Zealand
|
2012-07-23
|
U597
|
Ribgrass mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,311
|
GenBank
| 1
|
New Zealand
|
New Zealand
|
Plantago major
| null |
2011-02-22
| null | null |
Ribgrass mosaic virus strain FSHS isolate U597, complete genome
|
GTTTAGTTTTATTGCAACAACAACAACAAAATACAATAACAACAAACAAAATACAAACAACAACAACATGGCACAATTTCAACAAACAGTCCACATGCAAACTCTCCAAGCTGCTGCGGGACGCAACAGTTTGGTGAATGATTTGGCTTCTCGTCATGTATATGACAACGCGGTTGAGGAGCTGAATGCTCGTTCCAGGCGTCCCAAAGTTCATTTCTCCAAAGCAGTGTCTACGGAACAGACCCTGATTGCAACAAATGCTTATCCGGAGTTTGAGATCTCTTTCACTCACACGCAATCTGCGGTGCATTCTTTGGCCGGAGGCCTTAGATCGCTAGAGCTGGAGTATCTCATGATGCAAGTTCCATTTGGATCTCTGACGTATGATATCGGCGGTAACTTTGCTGCGCACCTGTTCAAAGGGCGCGATTACGTGCACTGCTGTATGCCTAATCTAGATGTGCGTGATATTGCTCGTCACGAGGGACACAAGGAAGCCGTTCAAAGTTACATTAGTCGCCTCGAAAGGCAGCGGCGTCCTGTTCCAGGATATCAGAGGGCAGCTTTCAACAACTACGCGGAGAATCCACGGTTCGTTCATTGCGACCGTCCGTTTCAACAGTGTGAATTGACGACAGCAAACGGTACTGATACCTACGCTGTAGCGCTTCATAGTATATATGATATCCCTGTTGAAGAGTTTGGTTCAGCGCTTCTCAGGAAGAACGTTAAGACTTGTTTCGCAGCTTTCCACTTTCACGAGAATATGCTTCTCGATTGTGACACTGTTACACTCGACGAAATCGGGGCAACTTTCCAGAGAGCAGGCGACAAACTAAGTTTTTTCTTTCACAATGAGAGCACTCTTAATTATACCCATAGCTTTAATAATATAATTAAATATGTCTGTAAAACGTTCTTTCCGGCTAGTCAACGGTTCGTGTATCATAAGGAGTTCTTAGTTACTAGAGTTAATACTTGGTATTGTAAGTTTACTAGAGTAGATACTTTTACTCTTTTCCGTGGTGTGTATCATAATAACGTGGACTGCGAAGAGTTTTACAAGGCTATGGACGATGCGTGGGAGTACAAGAAGACGCTTGCGATGCTTAATGCTGAAAGAACTATCTTCAAGGATAATGCAGCGTTAAACTTTTGGTTCCCGAAAGTGAGAGATATGGTCATTGTTCCTCTTTTTGACGCATCTATTACGTCTGGAAAGATGTCTAGAAGAGAGGTTATGGTGAATAAGGATTTCGTTTATACGGTCCTCAACCATATAAAGACGTACCAAGCCAAAGCTTTAACTTACGCGAACGTTTTGTCCTTTGTCGAGTCGATTAGGTCAAGAGTCATAATTAACGGTGTCACTGCCAGGTCTGAATGGGACACAGACAAGGCGATTCTAGGTCCTTTAGCAATGACATTTTTCCTTATAACAAAGTTGGGTCATGTGCAGGATGAAATAATCCTGAAAAAGTTCCAGAAGTTTGACAGATCTACCAAAGAGCTAATTTGGACTAGTCTCTGCGATGCCCTAGTAGGGGTTATTCCCTCGGTCAAGGAGACTCTCGTTCGTGGTGGGTTTGTGAAGGTAGCGGAAGAGGCCTTAGAGATTAAAATCCCTGAATTGTACTGCACGTTTTCCGATAGATTGGTGCTGCAGTATAAAAGGGCGGAAGAGTTCCAATCGTGTGACCTTTCTAAACCTCTAGAAGAATCTGAGAAGTACTACAATGCGTTATCTGAGCTGTCAGTGCTCGAGAATCTCGATTCATTCGATTTAGAGGCGTTTAAAACCTTGTGTCAGCAGAAAAGCGTAGATCCGGATATGGCTGCTAAGGTAGTGGTGGCAATTATGAAGTGTGAATTGACGTTGCCTTTCAAGAAGCCTACTGAAGAGGAAATCTCAGAATCACTTAAGGTCGAGGAGGCGAAAAGTGCGGAGCATAACGATGTGTTGAGCTTGCGAAATGATGCTCCTTACCCGTGTGTGAAAAATCTCGTAGAGGGTTCTGTACCGGCTTACGGAATGTGTCCGAAAGGTGGTGGTTTCGACAAGTTCGATGTGGACATTGCCGATTTTCATCTCAAGAGTGTAGATGCAGTGAAAAGGGGGGCTATGATGTCCGCGGTGTATACAGGGTCGATTAAAGTTCAACAGATGAAGAACTATATCGATTACTTAAGTGCGTCGCTGTCAGCTACTGTTTCCAACCTCTGTAAAGTGCTTAGGGATGTTCATGGCGCTGATCCTGAATCGCAGGAGAAATCTGGAGTGTGGGATGTAAGAAGAGGACGCTGGTTGCTCAAACCGAACGCGAAAAGTCACGCTTGGGGAGTTGCGGAAGATGCCAACCACAAGTTGGTTATAGTATTGCTTAACTGGGATGAGGGGAAACCAGTTTGCGACGAGACATGGTTCAGGGTAGCTGTGTCGAGCGATTCTTTAGTGTACTCTGATATGGGAAAACTGAAGACGCTGACGTCTTGCTGTCTGGATGGAGAACCTCCGGAGCCGAACGCAAAGGTGATTTTGGTTGACGGTGTACCTGGCTGTGGAAAGACGAAGGAGATTATCGAAAAGGTGAATTTCTCTGAGGACTTGATTTTAGTCCCTGGGAAGGAGGCTTCGAAGATGATCATCAGAAGGGCAAATCACGCTGGTGTGATGAGAGCAGATAAAGATAACGTAAGAACGGTGGATTCCTTCTTGATGCACCCTCCGAGGAGAGTGTTTAAGAGGCTATTCATAGACGAAGGGTTGATGCTTCACACTGGTTGTGTTAACTTTTTGCTACTGCTGTCGCATTGTGACGTGGCGTACGTATACGGGGACACACAACAGATTCCGTTTATCTGTAGAGTCGCGAATTTCCCGTATCCCGCACATTTTGCAAGACTTGCGGTGGACGAGAAGGAGGTCAGAAGAACCACGCTGAGATGTCCCGCTGATGTCACGTTTTTCCTGAATAAGAAGTATGACGGGGCGGTGATGTGTACTAGCGCCGTTGAGAGATCTGTGAAGGCAGAAGTGGTGAGAGGGAAAGGTGCTTTTAACCCGATAACTTTACCGTTAGAGGGAAAAATTTTAACCTTTACACAGGCTGACAAGTTCGAGTTGCTGGAAAAGGGTTACGCGGATGTGAACACAGTGCATGAAGTGCAAGGGGAAACATACGAGAAGACTGCCATTGTTCGATTGACATCGACTCCGTTAGAGATTATATCAAGAGCATCACCGCATGTTTTGGTGGCGCTGACAAGACACACAACGCGCTGTCGGTATTACACTGTAGTGTTGGATCCGATGGTTAATGTGATCTCAGAAATGGAGAAGTTGTCGAATTTTATCCTCGATATGTACAAGGTCGAAGCCGGCATCCAATAGCAATTACAGATAGATGCAGTATTCAAGGGAACGAATTTGTTCGTTCAGACACCCAAGTCAGGCGATTGGCGAGATATGCAATTCTATTATGACACTCTTCTTCCTGGAAACAGCACTATTCTCAATGAATTTGACGCTGTTACTATGAATTTGAGGGATATTTCCTTAAACGTTAAGGATTGCAGAATCGACTTCTCCAAATCCGTGCAAATTCCCAAGGAACAGCCTAGTTTTCTCAAGCCTAAAATAAGAACCGCAGCAGAAATGCCAAGAACAGCAGGCTTACTTGAAAATCTAGTTGCTATGATTAAAAGAAACATGAATGCACCGGATCTAACTGGGACGATAGACATAGAGGATACTGCATCACTGGTAGCCGAAAAGTTTTGGGATGCTTACATCGACAAAGAATTCAGTGGAACGAATAAGATGTCCTTAACTAGGGAAAGTTTTTCTAGATGGCTCTCTAAACAAGAGTCGTTTACAGTTGGTCAGCTAGCGGATTTCAACTTTGTAGATTTGCCGGCAGTGGATGAGTACAAGCATATGATCAAGAGCCAACCTAAGCAGAAGTTAGATTTAAGTATCCAGGATGAATATCATGCATTACAGACAATAGTCTATCACTCAAAAAAGATCAATGCAATTTTCGGTCGGATGTTTGCGGAACTTACGAGGATGCTGCTTGAGAGGGTAGACTCTTCGAAGTTTCTGTTTTACACGAGAAAGACACCTGGGCAGATAGAAGAATTTTTCTCTGACCTTGATTCAACCCAGGCAATGGAAATTCTGGAACTCGACATTTCAAAGTACGACAAGTCACAAAACGAGTTTCATTGCGCTGTAGAGTATAAGATCTGGGAAAAACTTGGGATAGACGAGTGGTTAGCTGAGGTGTGGAAGCAGGGACACAGGAAGACGACTTTGAAGGACTATACAGCTGGAATCAAAACATGTTTATGGTACCAAAGGAAAAGTGGTGATGTGTCAACCTTTATCGGTAACACTATTATCATTGCAACCTGTCTGAGTTCGATGATTCCAATGGACAAAGTAATCAAAGCAGCCTTTTGCGGTGACGACAGTTTAGTTTATATTCCTAAAGGAATGGACTTGCCTGATATTCAGGCCGGTGCAAACCTTATGTGGAATTTCGAGGCGAAGCTTTTCAGGAAAAAGTATGGTTACTTCTGTGGTCGGTACGTTATTCACCATGATAGAGGAGCAATTGTATATTACGATCCGCTCAAACTAATATCTAAGTTAGGTTGTAAACATATTAGAGATGCAGTTCATTTAGAAGAGTTACGCGAGTCTTTGTGTGATGTAACTAGTAACTTAAATAATTGTGCGTATTTTTCACAGTTAGATGAGGCCGTTGCCGAGGTTCATAAAACCGCGGTAGGCGGATCGTTTGCTTTTTGTAGTATTGTTAAATATTTATCAGATAAGAGGTTGTTTAAAGATTTGTTTTTTGTTTGATAATGTCGATGGTTTCGTACGAACCGAAGGTGAATGATTTCCTCTTTCTCACGAATAAGGAAAAGATACTCCCGAAGGCTTTGACGAGATTGAAGACCGTGTCTATTAGTACTAAGGATGTAATATCTGTCAAGGAGTCTGAGACTTTGTGTGATATTGATTTGTTAATTGATGTGCCATTAGATAAGTATAGATATGTGGGTATTTTAGGAGCTGTTTTTACAGGTGAGTGGCTTGTACCAGACTTTGTCAAGGGTGGCGTAACAATAAGCGTGATAGACAAGCGTCTGGTGAACTCTAAGGAGTGTGTGATCGGTACGTACAGAGCTGCAGCCAAAAGTAAGAGGTTCCAGTTTAAGCTGGTTCCGAATTACTTTGTGTCTACTGCTGACGCGAAAAGGAAACCGTGGCAGGTTCATGTACGTATTCAAGATGTAAAGATAGAAGCAGGTTGGCAACCGTTGGCCCTGGAAGTAGTATCCGTTGCTATGGTCGCCAATAATGTGGTTATGAAGGGTTTGAGAGAAAAGATCATCGCGATAAGTGATCCGGACGGCGAAGGGTTCGAAGGCGTGGTTGACGAATTCGTCGATTCGGTTGAAGCATTTAAAGCGGTTGATAATTTCAGGAAAAAGAAAAGAAAGATAGGAGAAAAGGAAGTGGTAAGTAGGAATAAATATAGACCGGAGAAGCACGCCGGTCCGAATTCGTTATATATTAAAGAAGAAAATGTCTTACAACATCACGAGCTCGAATCAGTACCAGTACTTCGCAGCGGTGTGGGCAGAACCTACACCAATGCTTAATCAGTGCGTGTCGGCACTGTCACAGTCGTTTCAGACACAAGCAGGGAGAGACACTGTTAGACAGCAATTCTCAAACTTGTTGAGTGCGATTGTGGCGCCGAACCAGCGGTTCCCAGATACAGGGTTCCGGGTATATGTTAACTCGGCAGTTATAAAGCCGTTATACGAGGCTCTGATGAAGTCTTTTGATACTAAGAATAGGATCATTGAGACCGAAGAGGAGTCACGCCCGTCAGCGTCTGAGGTAGCAAACGCAACACAGCGTGTTGATGATGCAACCGTCGCCATTAGAAGTCAAATTCAGCTTCTGCTGAATGAGCTTTCAAACGGACACGGTTATATGAACAGAGCGGAGTTCGAGGCTATAGTGCCTTGGACTACGGCACCTGCTACTTAAGCGTGGTGTGCACGATAGCACACAGTGTTTTTCTCTCCACTTAAATCGAAGAGATATACTTACGGTGTAATTCCGCAAGGGTGACGTAAACCAAATTACGTAATGTTTTGGGTTCCATTTAAATCGAAACCCCATATTTCCTGGATCACCTGTTAACGCACGTTGGACGTGTATTACAGTGGGAATATGTAAAAGTGAGAGGTTCGAATCCTCCCTAACCCCGGGTAGGGGCCCA
| 96,627
|
HQ667978.1
|
Ribgrass mosaic virus
|
Chavan,R.R., Cohen,D., Blouin,A.G., Pearson,M.N.
|
The University of Auckland, School of Biological Sciences
|
New Zealand
|
2011-06-27
|
TP9-186-L9
|
Ribgrass mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,311
|
GenBank
| 1
|
New Zealand
|
New Zealand
|
Plantago major
| null |
2009-12-22
| null | null |
Ribgrass mosaic virus strain NZ-439 isolate TP9-186-L9, complete genome
|
GTTTAGTTTTATTGCAACAACAACAACAAAATACAATAACAACAAACAAAATACAAACAACAACAACATGGCACAATTTCAACAAACAGTTCACATGCAAACTCTCCAAGCTGCTGCGGGACGCAACAGTTTGGTGAATGATTTGGCTTCTCGTCATGTGTATGACAACGCGGTTGAGGAGCTGAATGCTCGTTCCAGGCGTCCCAAAGTTCATTTCTCCAAAGCAGTGTCTACGGAACAGACCCTGATTGCTACAAATGCTTATCCGGAGTTTGAGATCTCTTTCACTCACACGCAATCTGCGGTGCATTCTTTGGCCGGAGGCCTTAGATCGCTAGAGCTGGAGTATCTCATGATGCAAGTTCCATTTGGATCTCTGACGTATGATATCGGCGGTAACTTTGCTGCGCACCTGTTCAAAGGGCGCGATTACGTGCACTGCTGTATGCCTAATCTAGATGTGCGTGATATTGCTCGTCACGAGGGACACAAGGAAGCCGTTCAAAGTTACATTAGTCGCCTCGAAAGGCAGCGGCGACCTGTTCCAGGATATCAGAGGGCAGCTTTCAACAACTACGCGGAGAATCCACGGTTCGTTCATTGCGACCGTCCATTTCAACAGTGTGAATTGACGACAGCAAACGGTACTGATACCTACGCTGTAGCGCTTCATAGTATATATGATATCCCTGTTGAAGAGTTTGGTTCAGCGCTTCTCAGGAAGAACGTTAAGACTTGTTTCGCAGCTTTCCACTTTCACGAGAATATGCTTCTCGATTGTGACACTGTTACACTCGACGAAATCGGGGCAACTTTCCAGAGAGCAGGCGATAAACTAAGTTTTTTCTTTCACAATGAGAGCACTCTTAATTATACCCATAGCTTTAATAATATAATAAAATATGTCTGTAAAACGTTTTTTCCCGCTAGTCAACGATTCGTGTATCATAAGGAGTTCTTAGTTACTAGAGTCAATACTTGGTATTGTAAGTTTACTAGAGTAGATACTTTTACTCTTTTCCGTGGTGTGTATCATAATAACGTGGACTGCGAAGAGTTTTACAAGGCTATGGACGATGCGTGGGAGTACAAGAAGACGCTTGCGATGCTTAATGCTGAAAGAACTATCTTCAAGGATAACGCAGCGTTAAACTTTTGGTTCCCGAAAGTGAGAGATATGGTCATTGTTCCTCTTTTTGACGCATCTATTACGTCTGGAAAGATGTCTAGAAGAGAGGTTATGGTGAATAAGGATTTTGTTTATACGGTCCTCAACCATATAAAGACGTACCAAGCCAAAGCTTTAACTTACGCAAACGTTTTGTCCTTTGTCGAGTCGATTAGGTCAAGAGTCATAATTAACGGTGTCACTGCCAGGTCTGAATGGGACACAGACAAGGCGATTCTAGGTCCTTTAGCAATGACATTTTTCCTTATAACAAAGTTGGGTCATGTGCAGGATGAAATAATCCTGGAAAAGTTCCAGAAGTTTGACAGATCTACCAAAGAGCTAATTTGGACTAGTCTCTGCGATGCCCTGGTAGGGGTTATTCCCTCGGTCAAGGAGACTCTCGTTCGTGGTGGGTTTGTGAAGGTGGCGGAAGAGGCCTTAGAGATTAAAATCCCTGAATTGTACTGCACGTTTTCCGATAGATTGGTGCTACAGTATAAAAGGGCGGAAGAGTTCCAATCGTGTGACCTTTCCAAACCTCTAGAAGAATCTGAGAAGTACTACAATGCGTTATCTGAGCTGTCAGTGCTCGAGAATCTCGATTCATTCGATTTAGAGGCGTTTAAAACCTTGTGTCAGCAGAAAAGCGTAGATCCGGATATGGCTGCTAAGGTAGTGGTGGCAATTATGAAGTGTGAATTGACGTTGCCTTTCAAGAAGCCTACTGAAGAGGAAATCTCAGAGTCGCTTAAGACAGAAGAGGGGTCAAGCGCGGAGCATAAGGAAGTGTTGAGCTTACAAAATGACGCTCCATTCCCGTGTGTGAAAAATTTAGTAGAGGGTTCTGTACCAGCATATGGAATGTGTCCTAAAGGTGGTGGTTTCGACAAGTTGGATGTGGACATTGCCGATTTTCATCTCAAGAGTGTAGATGCAGTAAAAAGGGGAACTATGATGTCAGCGGTATACACAGGGTCTATTAAAGTTCAGCAAATGAAGAACTACATAGACTACTTAAGTGCATCGCTGTCAGCTACAGTCTCAAACCTCTGCAAGGTGCTTAGAGATGTTCATGGCGTTGACCCAGAGTCACAAGAGAAATCTGGAGTGTGGGACGTTAGAAGAGGACGCTGGTTACTTAAACCTAATGCTAAAAGTCACGCGTGGGGTGTGGCAGAAGACGCCAACCACAAGTTGGTTATTGTGTTGCTTAACTGGGACGACGGAAAGCCTGTTTGTGATGAAACATGGTTCAGGGTGGCTGTGTCAAGCGATTCCTTGATATACTCGGATATGGGTAAACTTAAGACGCTTACGTCTTGCAGTCCAAATGGTGAGCCACCGGAACCCAACGCCAAAGTAATTTTGGTCGGTGGTGTTCCCGGTTGTGGAAAGACGAAGGAGATTATCGAAAAGGTGAATTTCTCTGAGGACTTGATTTTAGTCCCTGGGAAGGAGGCTTCGAAGATGATCATCAGAAGGGCAAATCACGCTGGTGTGATGAGAGCAGATAAAGATAACGTGAGAACGGTGGATTCCTTTTTAATGCACCCTCCGAGGAGAGTGTTTAAGAGGCTATTTATAGACGAAGGGTTGATGCTGCACACTGGTTGTGTTAACTTTTTGCTACTGCTGTCGCATTGTGACGTGGCGTACGTATACGGGGATACACAACAGATTCCGTTTATCTGTAGAGTCGCGAATTTCCCGTATCCCGCACATTTTGCAAGACTTGCGGTAGACGAGAAGGAGGTCAGAAGAACCACGCTGAGATGTCCCGCTGATGTCACGTTTTTCCTGAATAAGAAGTATGACGGGGCGGTGATGTGTACTAGCGCCGTTGAGAGATCTGTGAAGGCAGAAGTGGTGAGAGGGAAAGGTGCTTTTAACCCGATAACTTTACCGTTAGAGGGAAAAATTTTAACCTTTACACAGGCTGACAAGTTCGAGTTGCTGGAAAAGGGTTACGCGGATGTGAACACAGTGCATGAAGTGCAAGGGGAAACATACGAGAAGACTGCCATTGTTCGATTGACATCGACTCCGTTAGAGATCATATCAAGAGCATCACCGCATGTTTTGGTGGCGCTGACGAGACACACAACGCGCTGTCGGTATTACACCGTAGTGTTGGATCCGATGGTTAACGTGATTTCAGAAATGGAGAAGTTGTCGAATTTTATCCTCGATATGTACAAGGTCGAAGCCGGCATCCAATAGCAATTACAGATAGATGCAGTATTCAAGGGAACGAATTTGTTCGTTCAGACACCCAAGTCAGGCGATTGGCGAGATATGCAATTCTATTATGACACTCTTCTTCCTGGAAACAGCACTATTCTCAATGAATTTGACGCTGTTACTATGAATTTGAGGGATATTTCCTTAAACGTTAAGGATTGCAGAATCGACTTCTCCAAATCCGTGCAAATTCCCAAGGAACAGCCTAGTTTTCTCAAGCCTAAAATAAGAACCGCAGCAGAAATGCCGAGAACAGCAGGCTTACTTGAAAATCTAGTTGCTATGATTAAAAGAAACATGAATGCACCGGATCTAACTGGGACGATAGACATAGAGGATACTGCATCACTGGTAGCCGAAAAGTTTTGGGATGCTTACATCGACAAAGAATTCAGTGGAACGAATAAGATGTCCTTAACTAGGGAAAGTTTTTCTAGATGGCTCTCTAAACAAGAGTCTTCTACAGTTGGTCAGCTAGCGGATTTCAACTTTGTAGATTTGCCGGCAGTGGATGAGTACAAGCATATGATCAAGAGCCAACCTAAGCAGAAGTTAGACTTAAGTATCCAGGACGAATATCCTGCCTTACAGACAATAGTCTATCACTCAAAAAAGATCAATGCTATTTTCGGTCCTATGTTTGCGGAACTTACGAGGATGCTGCTCGAGAGGGTAGACTCTTCGAAGTTTCTGTTTTACACGAGAAAGACACCTGGGCAGATAGAAGAATTTTTCTCTGACCTTGATTCAACCCAGGCAATGGAAATTCTGGAACTCGACATTTCAAAGTACGACAAGTCACAAAACGAGTTTCATTGCGCTGTAGAGTATAAGATCTGGGAAAAACTTGGGATAGACGAGTGGTTAGCTGAGGTGTGGAAGCAGGGACACAGGAAGACGACTTTGAAGGACTATACAGCTGGAATCAAAACATGTCTATGGTACCAAAGGAAAAGTGGTGATGTGTCAACCTTTATCGGTAACACTATTATCATTGCAACCTGTCTGAGTTCGATGATTCCAATGGACAAAGTGATCAAAGCAGCCTTTTGCGGTGACGACAGTTTAGTTTATATCCCTAAAGGAATGGACTTGCCTGATATTCAGGCCGGCGCAAACCTTATGTGGAACTTCGAGGCGAAGCTTTTCAGGAAAAAGTATGGTTACTTCTGTGGTCGGTACGTTATTCACCATGATAGAGGAGCAATTGTATATTACGATCCGCTCAAACTAATATCTAAGTTAGGTTGTAAACATATTAGAGATGTAGTTCATTTAGAAGAGTTACGCGAGTCTTTGTGTGATGTAACTAGTAACTTAAATAATTGTGCGTATTTTTTACAGTTAGATGAGGCCGTTGCCGAGGTTCATAAAACCGCGGTAGGCGGATCGTTTGCTTTTTGTAGTATTGTTAAATATTTATCAGATAAGAGGTTGTTTAAAGATTTGTTTTTTGTTTGATAATGTCGATGGTTTCGTACGAACCAAAGGTGAATGATTTCCTCTTTCTCACGAATAAGGAAAAGATACTCCCGAAGGCTCTGACGAGATTGAAGACCGTGTCTATTAGTACTAAGGATATAATATCTGTCAAGGAGTCTGAGACTTTGTGTGATATTGATTTGTTAATTGATGTGCCATTAGATAAGTATAGATATGTGGGTATTTTAGGAGCTGTTTTCACAGGTGAGTGGCTTGTACCAGACTTTGTCAAGGGTGGTGTGACAATAAGCGTGATAGACAAGCGTCTGGTGAACTCTAAGGAGTGTGTGATCGGTACGTACAGAGCTGCAGCCAAAAGTAAGAGGTTCCAGTTTAAGCTGGTTCCGAATTACTTTGTGTCTACTGCTGACGCGAAAAGGAAACCGTGGCAGGTTCATGTGCGTATTCAAGATGTAAAGATAGAAGCAGGTTGGCAACCGTTGGCCCTGGAAGTAGTATCCGTTGCTATGGTCGCCAATAATGTGGTTATGAAGGGTTTGAGAGAAAAGATCATCGCGATAAGTGATCCGGACGTCGAAGGTTTCGAAGGCGTGGTTGACGATTTCGTTGATTCGGTTGAAGCATTTAAAGCGGTTGATAATTTCAGGAAAAAGAAAAGAAAGATAGGAGAAAAGGAAGTGGTAAGTAGGAATAAATATAGACCGGAGAAGCACGCCGGTCCGAATTCGTTATATATTAAAGAAGAAAATGTCTTACAACATCACGAGCTCGAATCAGTACCAGTACTTCGCAGCGGTGTGGGCAGAACCCACACCAATGCTTAATCAGTGCGTGTCGGCATTGTCACAGTCGTTTCAGACACAAGCAGGGAGAGACACTGTTAGACAGCAATTCTCAAACTTGTTGAGTGCGATTGTGGCGCCGAACCAGCGGTTCCCAGATACAGGGTTCCGGGTATATGTTAACTCGGCGGTTATAAAGCCGTTATACGAGGCTCTGATGAAGTCTTTTGATACTAAGAATAGGATCATTGAGACCGAAGAGGAGTCACGCCCGTCAGCGTCTGAGGTAGCAAACGCAACACAGCGTGTTGATGATGCAACCGTCGCCATTAGAAGTCAAATTCAGCTTCTGCTGAATGAGCTTTCAAACGGACACGGTTATATGAACAGAGCGGAGTTCGAGGCTATAGTGCCTTGGACTACGGCACCTGCTACTTAAGCGTGGTGTGCACGATAGCACACAGTGTTTTTCTCTCCACTTAAATCGAAGAGATATACTTACGGTGTAATTCCGCAAGGGTGACGTAAACCAAATTACGTAATGTTTTGGGTTCCATTTAAATCGAAACCCCATATTTCCTGGATCACCTGTTAACGCACGTTGGACGTGTATTACAGTGGGAATATGTAAAAGTGAGAGGTTCGAATCCTCCCTAACCCCGGGTAGGGGCCCA
| 98,814
|
HQ667979.1
|
Ribgrass mosaic virus
|
Chavan,R.R., Cohen,D., Blouin,A.G., Pearson,M.N.
|
The University of Auckland, School of Biological Sciences
|
New Zealand
|
2011-06-27
|
R14
|
Ribgrass mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,311
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Plantago major
| null |
2009-04-21
| null | null |
Ribgrass mosaic virus strain Kons.1105 isolate R14, complete genome
|
GTTTAGTTTTATTGCAACAACAACAACAAAATACAATAACAACAAACAAAATACAAACAACAACAACATGGCACAATTTCAGCAAACAATCGACATGCAAACTCTCCAAGCTGCTGCGGGACGCAACAGTCTGGTGAATGATTTGGCGTCTCGTCGCGTTTATGATAACGCGGTTGAGGAGCTGAATGCTCGTTCAAGACGTCCCAAGGTTCATTTCTCCAAAGCAGTGTCAACGGAACAGACCCTGATCGCAACAAACGCTTATCCGGAGTTCGAGATCTCTTTTACTCATACGCAATCTGCAGTGCATTCCTTGGCTGGAGGCCTCAGATCGCTTGAACTGGAGTATCTCATGATGCAAGTTCCATTTGGATCTTTGACGTATGATATTGGCGGTAACTTTTCTGCGCATCTTTTCAAAGGGCGCGATTATGTTCACTGCTGCATGCCTAATTTGGACGTGCGTGACATTGCTCGCCACGAGGGACACAAGGAAGCCATTCAAAGCTACATAAATCGTCTGGAGAGACAGCGGCGACCTGTGCCTGAATATCAGAAGGCAGCTTTCAATAATTACGCGGAGAATCCACGTTACGTTCATTGTGACCGTCCTTTTCAACAGTGTGAATTGACGACAGCAAATGGTACTGATACTTACGCTGTAGCGCTTCATAGCATTTATGACATCCCTGTTGAAGAGTTTGGTTCGGCGCTTCTCAGGAAGAACGTCAAGACTTGTTTCGCGGCTTTCCATTTCCACGAGAATATGCTTCTTGATTGTGACACTGTTACACTCGATGAAATCGGAGCAACTTTCCAGAGAGCTGGCGATAAACTGAGTTTTTTCTTCCATAATGAGAGCACTCTTAACTATACCCATAGCTTTAGTAATATAATAAAATATGTGTGTAAAACGTTCTTTCCAGCTAGTCAACGGTTTGTGTATCATAAGGAGTTCTTAGTTACTAGAGTCAATACTTGGTATTGTAAGTTTACTAGAGTGGATACTTTTACTCTGTTCCGTGGTGTGTATCATAATAATGTAGACTGCGAAGAGTTTTACAAGGCTATGGACGATGCGTGGGAGTACAAAAAGACGCTTGCGATGCTAAATGCAGAAAGAACCATTTTCAAGGATAACGCAGCGTTGAACTTTTGGTTCCCGAAAGTGAGGGATATGGTCATCGTCCCTCTTTTTGACGCGTCTATCACGTCTGGGAAAATGTCCAGGAGAGAAGTTATGGTGAACAAGGATTTCGTTTACACGGTCCTTAATCATATAAAGACGTACCAAGCCAAAGCTTTAACTTACGCAAACGTTCTGTCCTTCGTAGAGTCAATTAGGTCTAGAGTTATAATCAACGGTGTAACTGCCAGGTCTGAATGGGACACAGATAAGGCGATTCTAGGTCCTTTAGCGATGACATTTTTCCTTATAACAAAGTTGGGTCATGTACAGGATGAGATAATCCTGAAAAAGTTCCAGAAGTTCGACAGATCCACCAAAGAGTTAATTTGGTCCAGTCTCTGCGATGCCCTGATGGGGGTTATTCCCTCGGTCAAAGAGACTCTTGTTCGTGGTGGGTTTGTGAAAGTGGCAGAAGAGGCCTTAGAGATTAAGATCCCTGAATTGTACTGCACGTTCTCCGATAGATTGGTACTGCAGTATAAGAAAGCAGAAGAGTTTCAATCGTGCGACCTTTCCAAACCTCTAGAAGAATCTGAGAAGTATTACAACGCATTATCTGAGCTATCTGTGCTCGAGAATCTCGATTCATTTGATCTAGAGGCGTTTAAGACTTTGTGTCAGCAGAAAAACGTAGATCCGGATATGGCGGCTAAGGTAGTGGTGGCAATTATGAAGTGTGAGTTGACGTTGCCTTTCAAGAAGCCTACTGAAGAGGAAATCTCAGAGTCACTTAAAACCGAGGAGGCGAAAAGCGCGGAACGCGACGATGTGTTGAGCTTACGAAACGATGCTCCTTACCCATGTGTGAAAAATCTCGTAGAAGGTTCTGTACCAGCGTACGGAATATGTCCGAAAGGTGGTGGTTTCGACAAGTTTGATGTGGACATTGCCGATTTTCATCTCAAGAGTGTAGATGCAGTGAAGAGGGGGGCCATGATGTCTGCGGTGTATACAGGATCGATTAAAGTTCAACAGATGAAGAACTACATCGATTACTTAAGTGCGTCGCTGTCAGCAACTGTCTCCAATCTCTGTAAAGTGCTTAGAGATGTTCATGGTGCTGATCCAGAATCACAGGAGAAATCCGGAGTGTGGGACGTGAGGAGAGGACGATGGTTACTTAAACCAAACGCGAAGAGTCACGCTTGGGGAGTTGCTGAGGATGCCAACCACAAGTTGGTCATAGTATTGCTCAACTGGGATGAGGGGAAACCAGTCTGTGACGAGACATGGTTCCGAGTAGCTGTGTCAAGCGATTCTTTAGTGTACTCCGATATGGGAAAACTGAAGACGCTAACGTCCTGCTGTTTAGATGGAGAACCTCCGGAGCCGTACACAAAAGTGATTTTGGTTGACGGCGTTCCTGGATGTGGAAAGACGAAAGAGATTATCGAAAAGGTGAACTTCTCTGAGGATTTGATTTTAGTCCCTGGGAAAGAAGCCTCGAAGATGATTATCAGAAGGGCAAATCATGCCGGCGTGATGAGAGCAGACAAGGATAACGTAAGAACGGTAGATTCCTTTCTAATGCACCCTCCGAGGAGAGTGTTTAAGAGGTTATTTATCGACGAGGGGTTAATGCTGCACACCGGTTGTGTAAATTTCTTGCTACTATTATCGCATTGTGACGTGGCGTACGTGTATGGGGACACACAACAGATTCCGTTTATCTGTAGAGTTGCGAATTTCCCGTATCCTGCACACTTTGCAAAGCTTGTGGTGGATGAGAAGGAGGTCAGAAGAATCACGCTAAGATGCCCTGCTGATGTCACATTTTTCCTGAACAAGAAGTACGACGGGGCGGTAATGTGTACCAGCGCTGTAGAGAGGTCCGTAGGGGCAGAAGTGGTAAGAGGAAAAGGTGCTCTGAACCCGATAACTTTACCGTTGGAGGGAAAAATTTTGACCTTTACACAGGCTGACAAGTTCGAATTGTTGGAAAAGGGGTACACGGATGTGAACACTGTGCATGAGGTACAAGGGGAAACATACGAGAAGACAGCTATTGTTCGATTGACTTCGACTCCGTTAGGGATCATATCAAGAGCATCACCGCATGTGCTAGTGGCGCTGACAAGACACACAACGCGTTGTCGGTATTATACCGTTGTGTTAGACCCGATGGTAAGTGTGATCTCGGAAATGGAAAAGTTGTCAAACTTCATTCTCGATATGTACAAGGTCGAAGCTGGCATCCAATAGCAATTACAGATAGATGCAGTATTCAAAGGAACGAATCTTTTCGTTCAGACACCCAAGTCAGGCGATTGGCGAGATATGCAGTTCTATTATGACACTCTTCTTCCTGGAAACAGCACAATTCTTAATGAATTTGATGCCGTTACTATGAATTTGAGGGATATTTCCTTAAACGTCAAGGATTGCAGAATCGACTTCTCCAAGTCCGTGCAAATTCCCAAAGAGCAACCAAGTTTTCTCAAGCCTAAGATAAGAACCGCGGCAGAAATGCCAAGAACAGCAGGTTTGCTTGAAAATTTAGTCGCTATGATTAAAAGAAACATGAATGCACCGGATTTGACAGGGACGATTGACATAGAGGATACTGCATCATTGGTGGCTGAGAAGTTTTGGGACGCTTACATTGACAAGGAATTCAGTGGAACGAATAAAATGTCCTTAACAAGGGAAAGTTTTTCTAGATGGCTCTCTAAACAAGAGACGTCTACGATCGGTCAGCTGGCGGACTTCAACTTTGTAGATTTGCCGGCAGTGGATGAGTACAAGCATATGATCAAGAGCCAACCTAAACAAAAGTTAGACTTAAGCATTCAGGACGAATATCCTGCGTTGCAGACGATAGTCTATCACTCGAAAAAGATCAATGCGATTTTCGGTCCCATGTTTGCGGAACTTACGAGGATGCTGCTCGAGAGGGTGGATTCCTCAAAATTTCTGTTTTACACGAGGAAAACACCTGGTCAAATTGAAGAATTTTTCTCTGACCTTGACTCGACCCAGGCGATGGAAATTCTGGAACTCGACATCTCAAAGTACGATAAGTCACAAAACGAGTTTCACTGCGCTGTGGAGTATAAGATCTGGGAAAAGCTTGGGATAGATGAGTGGCTAGCAGAAGTGTGGAAGCAGGGACACAGGAAAACGACCTTGAAGGACTATACGGCCGGGATCAAAACGTGTCTTTGGTATCAAAGGAAAAGCGGTGATGTGTCAACCTTTATCGGTAACACTATAATCATTGCAACCTGTCTGAGTTCGATGATTCCGATGGACAAAGTGATTAAAGCAGCCTTTTGTGGGGATGACAGTTTAATTTATATCCCCAAAGGAATAGACTTGCCTGATATTCAGGCAGGTGCAAACCTTATGTGGAATTTCGAGGCTAAGCTTTTTAGGAAAAAGTATGGTTACTTCTGTGGTCGTTACGTGATTCACCATGATAGAGGAGCAATAGTATATTACGATCCACTTAAACTAATATCTAAGTTAGGTTGTAAACATATTAGGGATGTAGTCCATTTAGAAGAGTTACGTGAGTCTTTGTGTGATGTAACTAGTAACTTAAATAATTGTGCGTATTTTTCACAGTTGGATGAGGCCGTTGCCGAGGTTCATAAAACCGCGGTTGGCGGATCGTTTGCTTTTTGCAGTATAGTTAAATATTTGTCAGATAAAAGGTTGTTTAAAGATTTGTTTTTTGTTTGATAATGTCGATGGTCTCGTACGAGCCTAAGGTGAATGATTTTCTTTTTCTCACGAATAAGGAAAAGATACTCCCGAAAGCTCTTACTAGGTTGAAGACCGTGTCTATTAGTACTAAGGATATAATATCTGTCAAGGAGTCAGAGACTTTGTGTGATATAGATCTGTTAATTGATGTGCCATTAGATAAGTATAGATATGTGGGTATTTTAGGAGCTGTTTTTACAGGTGAGTGGCTTGTACCAGACTTCGTCAAAGGTGGAGTAACAATAAGCGTGATTGACAAGCGTCTGGTAAACTCCAAAGAGTGTGTAATCGGCACGTATAGAGCAGCGGCTAAAAGCAAGAGGTTCCAGTTCAAGCTGGTTCCAAATTACTTTGTGTCTACTGCGGACGCCAAGAGGAAACCGTGGCAGGTCCATGTGCGTATTCAGGATGTGAAGATAGAAGCCGGTTGGCAACCCTTGGCTCTGGAAGTTGTATCCGTTGCTATGGTCGCTAATAATGTGGTTATGAAGGGTTTGAGAGAAAAGATCATCGCGATAAGTGATCCGGACGTCGAAGGTTTCGAAGGAGTGGTTGACGATTTCGTTGATTCGGTCGAAGCATTTAGAGCGGTTGATAATTTCAGGAAAAAGAAAAGGAAGATAGGAGAAAAGGAAGCGGTAAGTAGGAATAAGTACAGACCGGAGAAACACGCCGGTCCTAATTCGTTATATATTAAAGAAGAAAATGTCTTACAACATCACGAGCTCGAATCAGTACCAGTACTTCGCAGCGGTGTGGGCAGAACCCACACCAATGCTTAATCAGTGCGTGTCGGCATTGTCACAGTCGTTTCAAACACAAGCGGGGAGAGATACTGTTAGGCAGCAATTCTCAAACTTGTTGAGTGCGATTGTGGCACCGAACCAGCGGTTCCCAGATACAGGGTTCCGGGTGTATGTTAATTCGGCGGTTATAAAGCCGTTATACGAGGCTCTTATGAAGTCCTTTGATACTAAAAATAGGATCATTGAGACGGAAGAGGAGTCACGCCCGTCAGCGTCTGAGGTAGCAAACGCAACACAGCGTGTTGATGATGCGACCGTCGCCATTAGAAGTCAAATTCAGCTTTTGCTGAATGAGCTTTCAAACGGACACGGTTATATGAACAGAGCGGAGTTCGAGGCTATATTGCCTTGGACTACGGCACCTGCTACTTGAGCGTGGTGCGCACGATAGCGCGCAGTGTTTTTCTCTCCACTTAAATCGAAGAGATAAACTTACGGTGTAAATCCGTAGGGGTGACGTAAACCAAATTACGTAATGTTTTGGGTTCCATTTAAATCGAAACCCCATATTTCCTGGATCACCTGTTAACGCACGTCGGACGTGTATTACAGTGGGAATATGTAAAAGTGAGAGGTTCGAATCCTCCCTAACCCCGGGTAGGGGCCCA
| 98,815
|
HQ667980.1
|
Ribgrass mosaic virus
|
Chavan,R.R., Cohen,D., Blouin,A.G., Pearson,M.N.
|
The University of Auckland, School of Biological Sciences
|
New Zealand
|
2011-06-27
|
R14
|
Ribgrass mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,311
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Plantago
| null |
2009-04-21
| null | null |
Ribgrass mosaic virus strain Kons.1105-V2 isolate R14, complete genome
|
GTTTAGTTTTATTGCAACAACAACAACAAAATACAATAACAACAAACAAAATACAAACAACAACAACATGGCACAATTTCAGCAAACAATCGACATGCAAACTCTCCAAGCTGCTGCGGGACGCAACAGTCTGGTGAATGATTTGGCGTCTCGTCGCGTTTATGATAACGCGGTTGAGGAGCTGAATGCTCGTTCAAGACGTCCCAAGGTTCATTTCTCCAAAGCAGTGTCAACGGAACAGACCCTGATCGCAACAAACGCTTATCCGGAGTTCGAGATCTCTTTTACTCATACGCAATCTGCAGTGCATTCCTTGGCTGGAGGCCTCAGATCGCTTGAACTGGAGTATCTCATGATGCAAGTTCCATTTGGATCTTTGACGTATGATATTGGCGGTAACTTTTCTGCGCATCTTTTCAAAGGGCGCGATTATGTTCACTGCTGCATGCCTAATTTGGACGTGCGTGACATTGCTCGCCACGAGGGACACAAGGAAGCCATTCAAAGCTACATAAATCGTCTGGAGAGACAGCGGCGACCTGTGCCTGAATATCAGAAGGCAGCTTTCAATAATTACGCGGAGAATCCACGTTACGTTCATTGTGACCGTCCTTTTCAACAGTGTGAATTGACGACAGCAAATGGTACTGATACTTACGCTGTAGCGCTTCATAGCATTTATGACATCCCTGTTGAAGAGTTTGGTTCGGCGCTTCTCAGGAAGAACGTCAAGACTTGTTTCGCGGCTTTCCATTTCCACGAGAATATGCTTCTTGATTGTGACACTGTTACACTCGATGAAATCGGAGCAACTTTCCAGAGAGCTGGCGATAAACTGAGTTTTTTCTTCCATAATGAGAGCACTCTTAACTATACCCATAGCTTTAGTAATATAATAAAATATGTGTGTAAAACGTTCTTTCCAGCTAGTCAACGGTTTGTGTATCATAAGGAGTTCTTAGTTACTAGAGTCAATACTTGGTATTGTAAGTTTACTAGAGTGGATACTTTTACTCTGTTCCGTGGTGTGTATCATAATAATGTAGACTGCGAAGAGTTTTACAAGGCTATGGACGATGCGTGGGAGTACAAAAAGACGCTTGCGATGCTAAATGCAGAAAGAACCATTTTCAAGGATAACGCAGCGTTGAACTTTTGGTTCCCGAAAGTGAGGGATATGGTCATCGTCCCTCTTTTTGACGCGTCTATCACGTCTGGGAAAATGTCCAGGAGAGAAGTTATGGTGAACAAGGATTTCGTTTACACGGTCCTTAATCATATAAAGACGTACCAAGCCAAAGCTTTAACTTACGCAAACGTTCTGTCCTTCGTAGAGTCAATTAGGTCTAGAGTTATAATCAACGGTGTAACTGCCAGGTCTGAATGGGACACAGATAAGGCGATTCTAGGTCCTTTAGCGATGACATTTTTCCTTATAACAAAGTTGGGTCATGTACAGGATGAGATAATCCTGAAAAAGTTCCAGAAGTTCGACAGATCCACCAAAGAGTTAATTTGGTCCAGTCTCTGCGATGCCCTGATGGGGGTTATTCCCTCGGTCAAAGAGACTCTTGTTCGTGGTGGGTTTGTGAAAGTGGCAGAAGAGGCCTTAGAGATTAAGATCCCTGAATTGTACTGCACGTTCTCCGATAGATTGGTACTGCAGTATAAGAAAGCAGAAGAGTTTCAATCGTGCGACCTTTCCAAACCTCTAGAAGAATCTGAGAAGTATTACAACGCATTATCTGAGCTATCTGTGCTCGAGAATCTCGATTCATTTGATCTAGAGGCGTTTAAGACTTTGTGTCAGCAGAAAAACGTAGATCCGGATATGGCGGCTAAGGTAGTGGTGGCAATTATGAAGTGTGAGTTGACGTTGCCTTTCAAGAAGCCTACTGAAGAGGAAATCTCAGAGTCACTTAAAACCGAGGAGGCGAAAAGCGCGGAACGCGACGATGTGTTGAGCTTACGAAACGATGCTCCTTACCCATGTGTGAAAAATCTCGTAGAAGGTTCTGTACCAGCGTACGGAATATGTCCGAAAGGTGGTGGTTTCGACAAGTTTGATGTGGACATTGCCGATTTTCATCTCAAGAGTGTAGATGCAGTGAAGAGGGGGGCCATGATGTCTGCGGTGTATACAGGATCGATTAAAGTTCAACAGATGAAGAACTACATCGATTACTTAAGTGCGTCGCTGTCAGCAACTGTCTCCAATCTCTGTAAAGTGCTTAGAGATGTTCATGGTGCTGATCCAGAATCACAGGAGAAATCCGGAGTGTGGGACGTGAGGAGAGGACGATGGTTACTTAAACCAAACGCGAAGAGTCACGCTTGGGGAGTTGCTGAGGATGCCAACCACAAGTTGGTCATAGTATTGCTCAACTGGGATGAGGGGAAACCAGTCTGTGACGAGACATGGTTCCGAGTAGCTGTGTCAAGCGATTCTTTAGTGTACTCCGATATGGGAAAACTGAAGACGCTAACGTCCTGCTGTTTAGATGGAGAACCTCCGGAGCCGTACACAAAAGTGATTTTGGTTGACGGCGTTCCTGGATGTGGAAAGACGAAGGAGATTATCGAAAAGGTGAACTTCTCTGAGGATTTGATTTTAGTCCCTGGGAAAGAAGCCTCGAAGATGATTATCAGAAGGGCAAATCATGCCGGCGTGATGAGAGCAGACAAGGATAACGTAAGAACGGTAGATTCCTTTCTAATGCACCCTCCGAGGAGAGTGTTTAAGAGGTTATTTATCGACGAGGGGTTAATGCTGCACACCGGTTGTGTAAATTTCTTGCTACTATTATCGCATTGTGACGTGGCGTACGTGTATGGGGACACACAACAGATTCCGTTTATCTGTAGAGTTGCGAATTTCCCGTATCCTGCACACTTTGCAAAGCTTGTGGTGGATGAGAAGGAGGTCAGAAGAATCACGCTAAGATGCCCTGCTGATGTCACATTTTTCCTGAACAAGAAGTACGACGGGGCGGTAATGTGTACCAGCGCTGTAGAGAGGTCCGTAGGGGCAGAAGTGGTAAGAGGAAAAGGTGCTCTGAACCCGATAACTTTACCGTTGGAGGGAAAAATTTTGACCTTTACACAGGCTGACAAGTTCGAATTGTTGGAAAAGGGGTACACGGATGTGAACACTGTGCATGAGGTACAAGGGGAAACATACGAGAAGACAGCTATTGTTCGATTGACTTCGACTCCGTTAGGGATCATATCAAGAGCATCACCGCATGTGCTAGTGGCGCTGACAAGACACACAACGCGTTGTCGGTATTATACCGTTGTGTTAGACCCGATGGTAAGTGTGATCCCGGAAATGGAAAAGTTGTCAAACTTCATTCTCGATATGTACAAGGTCGAAGCTGGCATCCAATAGCAATTACAGATAGATGCAGTATTCAAAGGAACGAATCTTTTCGTTCAGACACCCAAGTCAGGCGATTGGCGAGATATGCAGTTCTACTATGACGCTCTTCTTCCTGGAAACAGCACAATTCTTAATGAATTTGATGCCGTTACTATGAATTTGAGGGATATTTCCTTAAACGTCAAGGATTGCAGAATCGACTTCTCCAAGTCCGTGCAAATTCCCAAAGAGCAACCAAGTTTTCTCAAGCCTAAGATAAGAACCGCGGCAGAAATGCCAAGAACAGCAGGTTTGCTTGAAAATTTAGTCGCTATGATTAAAAGAAACATGAATGCACCGGATTTGACAGGGACGATTGACATAGAGGATACTGCATCATTGGTGGCTGAGAAGTTTTGGGACGCTTACATTGACAAGGAATTCAGTGGAACGAATAAAATGTCCTTAACAAGGGAAAGTTTTTCTAGATGGCTCTCTAAACAAGAGACGTCTACGATCGGTCAGCTGGCGGACTTCAACTTTGTAGATTTGCCGGCAGTGGATGAGTACAAGCATATGATCAAGAGCCAACCTAAACAAAAGTTAGACTTAAGCATTCAGGACGAATATCCTGCGTTGCAGACGATAGTCTATCACTCGAAAAAGATCAATGCTATTTTCGGTCCCATGTTTGCGGAACTTACGAGGATGCTGCTCGAGAGGGTGGATTCCTCAAAATTTCTGTTTTACACGAGGAAAACACCTGGTCAAATTGAAGAATTTTTCTCTGACCTTGACTCGACCCAGGCGATGGAAATTCTGGAACTCGACATCTCAAAGTACGATAAGTCACAAAACGAGTTTCACTGCGCTGTGGAGTATAAGATCTGGGAAAAGCTTGGGATAGATGAGTGGCTAGCAGAAGTGTGGAAGCAGGGACACAGGAAAACGACCTTGAAGGACTATACGGCCGGGATCAAAACGTGTCTTTGGTATCAAAGGAAAAGCGGTGATGTGTCAACCTTTATCGGTAACACTATAATCATTGCAACCTGTCTGAGTTCGATGATTCCGATGGACAAAGTGATTAAAGCAGCCTTTTGTGGGGATGACAGTTTAATTTATATCCCCAAAGGAATAGACTTGCCTGATATTCAGGCAGGTGCAAACCTTATGTGGAATTTCGAGGCTAAGCTTTTTAGGAAAAAGTATGGTTACTTCTGTGGTCGTTACGTGATTCACCATGATAGAGGAGCAATAGTATATTACGATCCACTTAAACTAATATCTAAGTTAGGTTGTAAACATATTAGGGATGTAGTCCATTTAGAAGAGTTACGTGAGTCTTTGTGTGATGTAACTAGTAACTTAAATAATTGTGCGTATTTTTCACAGTTGGATGAGGCCGTTGCCGAGGTTCATAAAACCGCGGTTGGCGGATCGTTTGCTTTTTGCAGTATAGTTAAATATTTGTCAGATAAAAGGTTGTTTAAAGATTTGTTTTTTGTTTGATAATGTCGATGGTCTCGTACGAGCCTAAGGTGAATGATTTTCTTTTTCTCACGAATAAGGAAAAGATACTCCCGAAAGCTCTTACTAGGTTGAAGACCGTGTCTATTAGTACTAAGGATATAATATCTGTCAAGGAGTCAGAGACTTTGTGTGATATAGATCTGTTAATTGATGTGCCATTAGATAAGTATAGATATGTGGGTATTTTAGGAGCTGTTTTTACAGGTGAGTGGCTTGTACCAGACTTCGTCAAAGGTGGAGTAACAATAAGCGTGATTGACAAGCGTCTGGTAAACTCCAAAGAGTGTGTAATCGGCACGTATAGAGCAGCGGCTAAAAGCAAGAGGTTCCAGTTCAAGCTGGTTCCAAATTACTTTGTGTCTACTGCGGACGCCAAGAGGAAACCGTGGCAGGTCCATGTGCGTATTCAGGATGTGAAGATAGAAGCCGGTTGGCAACCCTTGGCTCTGGAAGTTGTATCCGTTGCTATGGTCGCCAATAATGTGGTTATGAAGGGTTTGAGAGAAAAGATCATCGCGATAAGTGATCCGGACGTCGAAGGTTTCGAAGGAGTGGTTGACGATTTCGTTGATTCGGTCGAAGCATTTAGAGCGGTTGATAATTTCAGGAAAAAGAAAAGGAAGATAGGAGAAAAGGAAGCGGTAAGTAGGAATAAGTACAGACCGGAGAAACACGCCGGTCCTAATTCGTTATATATTAAAGAAGAAAATGTCTTACAACATCACGAGCTCGAATCAGTACCAGTACTTCGCAGCGGTGTGGGCAGAACCCACACCAATGCTTAATCAGTGCGTGTCGGCATTGTCACAGTCGTTTCAAACACAAGCGGGGAGAGATACTGTTAGACAGCAATTCTCAAACTTGTTGAGTGCGATTGTGGCACCGAACCAGCGGTTCCCAGATACAGGGTTCCGGGTGTATGTTAATTCGGCGGTTATAAAGCCGTTATACGAGGCTCTTATGAAGTCCTTTGATACTAAAAATAGGATCATTGAGACGGAAGAGGAGTCACGCCCGTCAGCGTCTGAGGTAGCAAACGCAACACAGCGTGTTGATGATGCGACCGTCGCCATTAGAAGTCAAATTCAGCTTTTGCTGAATGAGCTTTCAAACGGACACGGTTATATGAACAGAGCGGAGTTCGAGGCTATATTGCCTTGGACTACGACACCTGCTACTTGAGCGTGGTGCGCACGATAGCGCGCAGTGTTTTTCTCTCCACTTAAATCGAAGAGATAAACTTACGGTGTAAATCCGTAGGGGTGACGTAAACCAAATTACGTAATGTTTTGGGTTCCATTTAAATCGAAACCCCATATTTCCTGGATCACCTGTTAACGCACGTCGGACGTGTATTACAGTGGGAATATGTAAAAGTGAGAGGTTCGAATCCTCCCTAACCCCGGGTAGGGGCCCA
| 98,816
|
GQ401365.1
|
Ribgrass mosaic virus
|
Chavan,R.R., Pearson,M.N., Cohen,D., Blouin,A.G.
|
The University of Auckland, School of Biological Sciences
|
New Zealand
|
2010-09-04
|
M2/A4
|
Ribgrass mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,311
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Actinidia chinensis
| null |
2003-12-23
| null | null |
Ribgrass mosaic virus strain RMV Actinidia-AC isolate M2/A4, complete genome
|
GTTTAGTTTTATTGCAACAACAACAACAAAATACAATAACAACAAACAAAATACAAACAACAACAACATGGCACAATTTCAACAAACAATCGACATGCAAACTCTCCAAGCTGCTGCGGGACGCAACAGTTTGGTGAATGATTTAGCGTCTCGTCGTGTTTACGATAATGCGGTCGAGGAGCTGAATGCTCGTTCTAGGCGTCCCAAGGTTCATTTCTCCAAAGCAGTGTCTACGGAACAGACCCTGATTGCAACAAATGCTTATCCGGAGTTTGAGATCTCCTTCACTCATACGCAATCTGCAGTGCATTCCTTAGCAGGAGGCCTTCGATCGCTTGAACTGGAGTATCTAATGATGCAAGTTCCATTCGGATCTCTGACGTACGATATCGGCGGCAACTTTTCTGCGCATCTTTTCAAGGGGCGCGACTACGTTCACTGCTGCATGCCTAACTTGGACGTGCGTGACATAGCTCGTCATGAAGGACACAAGGAAGCCATTCAAAGCTACATAAATCGCCTTGAGAGGCAGCGGCGACCTGTGCCGGAATATCAGAGGGCGGCTTTCAACAACTACGCGGAGAATCCACATTACGTTCATTGTGATCGTCCATTTCAACAGTGTGAATTGACGACGGCAAATGGTACTGATACCTACGCCGTGGCGCTTCATAGTATTTATGATATCCCTGTTGAAGAGTTTGGTTCAGCGCTTCTCAGAAAGAACGTTAAAACTTGTTTCGCGGCTTTCCATTTCCATGAGAATATGCTTCTAGATTGTGACACTGTTACACTTGATGAAATCGGAGCAACTTTCCAGAGAGCCGGCGATAAATTAAGTTTTTTCTTCCATAATGAGAGCACTCTTAATTATACCCATAGCTTTAGTAATATAATAAAATATGTGTGTAAAACGTTTTTCCCTGCAAGTCAAAGATTTGTATATCACAAGGAGTTCTTAGTTACTAGAGTCAATACTTGGTATTGTAAGTTTACTAGAGTGGATACTTTTACTCTTTTCCGTGGTGTGTATCATAATAATGTAGACTGCGAAGAGTTTTACAAGGCTATGGATGATGCGTGGGAGTATAAGAAGACGCTTGCGATGCTTAATGCAGAAAGAACCATTTTCAAGGATAACGCCGCGTTGAACTTCTGGTTTCCGAAAGTGAGGGACATGGTCATCGTTCCTCTTTTTGACGCATCCATTACGTCTGGAAAGATGTCTAGAAGAGAGGTTATGGTGAACAAGGACTTCGTTTACACAGTCCTTAATCACATAAAGACGTACCAAGCCAAAGCTTTAACTTACGCAAATGTTCTGTCCTTTGTAGAGTCAATTAGGTCCAGAGTCATAATTAACGGTGTTACTGCCAGATCTGAATGGGACACGGATAAGGCAATTCTAGGTCCACTGGCGATGACATTTTTCCTTATAACAAAGTTGGGTCATGTACAGGATGAGATAATCCTGAAGAAGTTCCAGATGTTCGACAGAACCACCAAAGAGTTGATTTGGTCCAGTCTCTGCGATGCCCTGATGGGGGTTATTCCCTCGGTCAAGGAGACTCTCGTTCGTGGTGGGTTTGTGAAAGTGGCGGAAGAGGCCTTAGAGATTAAGATCCCCGAACTGTACTGCACGTTCTCCGACAGATTTGTGCTACAGTACAAGAAGGCGGAAGAGTTTCAGTCGTGCGACCTTTCCAAACCTCTAGAGGAATCTGAGAAGTATTACAATGCATTATCTGAGCTATCGGTGCTCGAGAATCTCGATTCTTTTGACTTAGAGGCGTTTAAGACTTTGTGCCAGCAGAAAAGTGTAGACCCTGACATGGCAGCTAAGGTGGTGGTGGCAATTATGAAGTGTGAATTAACATTGCCTTTCAAGAAACCTACAGAAGAGGAAATCTCAGAGTCGCTTAAAACCGAGGAGGTAAAAAGTGCGGAGCGAAACGATGTGTTGAGCTTACGGAATGATGCTCCTTTCCCGTGTGTGAAAAATCTCGTAGAGGGTTCTGTGCCGGCGTATGGAATATGTCCGAAAGGTGGAGGTTTCGACAAGTTCGACGTGGATATAGCCGATTTTCATCTCAAGAGTGTAGATGCAGTGAAAAGGGGAGCTATGATGTCAGCAGTGTACACAGGATCGATTAAAGTTCAACAGATGAAGAACTATATCGATTACTTAAGTGCGTCGCTGTCAGCTACTGTCTCCAATCTCTGTAAAGTGCTTAGAGATGTTCATGGAGCCGATCCTGAGTCGCAGGAGAAATCTGGAGTGTGGGATGTGAGAAGAGGACGCTGGTTACTCAAACCGAACGCGAAAAGTCACGCTTGGGGAGTTGCGGAAGACGCCAACCACAAGTTGGTTATAGTATTGCTTAACTGGGATGAGGGGAAACCAGTTTGTGACGAAACATGGTTCAGAGTAGCTGTGTCGAGTGATTCTTTAGTGTACTCCGACATGGGAAAACTGAAGACGTTAACGTCCTGCTGTTTAGACGGTGAACCTCCGGAGCCAACCGCAAAGGTAATCTTGGTTGATGGTGTTCCCGGTTGTGGAAAGACGAAAGAGATTATCGAAAAGGTAAACTTTCAAGAGGACTTGATTCTGGTCCTTGGGAAGGAAGCTTCGAAGATGATTATCAGAAGGGCAAATCACGCAGGTGTGATGAGGGCGGATAAAGACAACGTTAGAACGGTGGATTCCTTCTTGATGCACCCTCCGAGGAGAGTGTTTAAGAGGTTATTCATTGACGAAGGGTTGATGCTTCACACTGGGTGTGTTAACTTTTTGCTACTACTATCGCACTGCGACGTGGCGTATGTGTATGGGGATACACAACAGATTCCGTTTATCTGTAGAGTTGCAAACTTCCCGTATCCTGCACACTTTGCAAAACTTGTAGTGGACGAGAAGGAGATCAGAAGAACTACGCTGAGGTGTCCTGCTGATGTCACATTTTTCTTGAACAAGAAGTACGACGGGGCGGTAATGTGTACCAGCGCCGTTGAAAGGTCTGTGAATGCGGAAGTGGTAAGAGGAAAAGGTGCTTTTAACCCAATAACTTTACCGTTAGAGGGAAAAATATTGACCTTTACTCAGGCTGACAAGTTCGAGTTGCTGGAAAAGGGTTACGCGGACGTGAACACAGTGCACGAGGTGCAAGGGGAAACATACGAGAAGACTGCTATCGTTCGATTGACATCGACTCCGTTAGAGATCATATCAAGAGCGTCACCACATGTTTTAGTGGCTCTGACTAGACACACAACGCGTTGTCGGTACTATACCGTTGTGTTGGATCCAATGGTTAATGTGATTTCGGAAATGGAAAAGTTGTCGAATTTTATTCTCGATATGTACAAGGTCGAAGCTGGCATCCAATAGCAATTACAGATAGATGCAGTATTCAAGGGAACGAATCTGTTCGTTCAGACACCCAAGTTAGGAGATTGGCGAGACATGCAATTCTATTATGACACTCTTCTCCCTGGAAACAGCACTATTCTTAACGAATTTGACGCTGTTACCATGAATTTGAGGGATATTTCCTTAAACGTCAAGGATTGCAGAATAGACTTCTCCAAATCTGTGCAAATTCCCAAGGAGCAACCAAGTTTTCTCAAGCCCAAAATAAGAACCGCGGCAGAAATGCCAAGAACTGCGGGCTTGCTAGAAAATCTAGTTGCCATGATTAAAAGAAACATGAATGCGCCGGATTTGACAGGGACGATTGATATAGAGGATACTGCATCACTGGTGGCCGAAAAGTTTTGGGATGCATACATTGACAAGGAGTTTAGTGGAACGAATAAAATGTCCTTAACTAGGGAAAGTTTTTCTAGATGGCTCTCTAGACAAGAGTCATCTACAGTTGGTCAGCTAGCGGATTTTAACTTTGTAGATTTGCCGGCAGTGGATGAGTACAAGCATATGATCAAGAGCCAACCAAAGCAGAAGTTAGACTTAAGCATTCAGGATGAATATCCTGCATTGCAGACAATAGTCTATCACTCGAAGAAGATCAATGCTATTTTCGGTCCTATGTTTGCAGAACTTACGAGGATGCTGCTCGAGAGAGTGGACTCTTCAAAATTTCTGTTTTACACGAGAAAAACACCTGGGCAAATAGAAGAATTTTTCTCTGACCTTGATTCAACCCAGGCGATGGAAATTCTGGAACTCGACATCTCAAAGTACGACAAGTCACAAAACGAGTTTCATTGCGCTGTAGAGTACAAGATCTGGGAAAAACTTGGGATAGATGAGTGGTTGGCTGAAGTGTGGAAACAGGGACACAGGAAAACGACTTTGAAGGACTATACGGCCGGAATCAAAACATGTCTTTGGTACCAAAGGAAAAGCGGTGATGTGTCAACCTTTATCGGTAACACTATTATCATTGCAACCTGTCTGAGTTCGATGATTCCGATGGACAAAGTGATTAAAGCAGCCTTTTGCGGAGACGACAGTTTAGTTTACATTCCCAAAGGTATGGACTTGCCTGATATTCAAGCCGGTGCAAACCTCATGTGGAATTTCGAGGCGAAGCTTTTCAGGAAAAAGTATGGTTACTTCTGCGGTCGTTACGTTATTCATCATGATAGAGGAGCAATTGTGTATTATGATCCGCTCAAACTAATATCTAAGTTAGGTTGTAAACATATTAGGGATTCAGTTCATTTAGAAGAGTTACGTGAGTCGTTGTGTGATGTAACTAGCAACTTAAATAATTGTGCGTATTTTTCACAGTTGGATGAGGCCGTTGCCGAGGTTCATAAAACCGCGGTAGGCGGATCGTTTGCTTTTTGTAGTATAATTAAATATTTATCAGATAAGAGGTTGTTCAAAGATTTGTTTTTTGTTTGATAATGTCGATGGTTTCGTATGAGCCCAAGGTGAATGATTTCCTTTTCCTCACGAATAAGGAAAAGATACTCCCGAAAGCTCTAACGAGACTTAAGACTGTGTCTATTAGTACTAAGGATATAATATCTGTCAAGGAGTCTGAGACTTTGTGTGATATAGATTTGTTAAATGATGTGCCATTAGATAAGTATAGATACGTGGGTATTTTAGGAGCTGTTTTTACAGGAGAGTGGCTTGTACCAGACTTTGTCAAGGGCGGAGTGACAATAAGCGTGATAGACAAGCGTCTGGTGAACTCTAAGGAATGTGTGATCGGTACGTACAGAGCAGCGGCCAAGAGCAAAAGGTTCCAGTTCAAACTGGTTCCGAATTACTTCGTGTCTACTGCAGACGCCAAGAGGAAACCGTGGCAAGTTCATGTGCGTATTCAAGACGTAAAGATAGAAGCGGGTTGGCAACCATTAGCTCTAGAAGTGGTATCCGTTGCTATGGTTGCTAATAATGTGGTTATGAAGGGTTTGAGAGAAAAGATCATCGCAATAAGTGATCCGGACGTCGAAGGTTTCGAAGGCGTGGTTGACGAATTCGTCGATTCGGTTGAAGCATTTAAAGCGGTTGACAATTTCAGGAAAAAGAAAAGGAAGATAGGAGGAAGTGAAGTAGTAAGTAAGAATAAATATAGACCGGAGAAGCACGCCGGTCCTAATTCGTTATATATTAAGGAAGAAAATGTCTTACAACATCACGAGCTCGAATCAGTACCAGTATTTCGCAGCGGTGTGGGCAGAGCCCACACCAATGCTTAATCAGTGCGTGTCGGCATTGTCACAGTCGTTTCAGACACAAGCAGGGAGAGATACTGTTAGACAGCAATTCTCAAACTTGTTGAGTGCGATTGTGGCGCCAAACCAGCGGTTCCCAGATACAGGGTTCCGGGTGTATGTTAATTCGGCGGTTATAAAGCCGTTATACGAGGCTCTTATGAAGTCTTTCGATACTAAAAATAGAATTATCGAGACGGAAGAGGAGTCACGCCCGTCAGCGTCTGAAGTAGCAAACGCAACACAGCGTGTTGATGATGCGACCGTCGCCATTAGAAGTCAAATTCAGCTTCTGCTGAATGAACTTTCAAATGGACACGGTTATATGAACAGAGCGGAGTTCGAGGCTATAGTGCCTTGGACTACGACACCTGCTACTTAAGCGTGGTGTGCACGATAGCGCACAGTGTTTTTCTCTCCACTTAAATCGAAGAGATATACCTACGGTGTAATTCCGTGGGGTGACGTAAACCAAATTACGTAATGTTTTGGGTTCCATTTAAATCGAAACCCCATATTTCCTGGATCGCCCTGTTAACGCACGTTGGACGTGTATTACAGTGGGAATATGTAAAAGCGAGAGGTTCGAATCCTCCCTAACCCCGGGTAGGGGCCCA
| 100,230
|
GQ401366.1
|
Ribgrass mosaic virus
|
Chavan,R.R., Pearson,M.N., Cohen,D., Blouin,A.G.
|
The University of Auckland, School of Biological Sciences
|
New Zealand
|
2010-09-04
|
M1/C
|
Ribgrass mosaic virus
|
Tobamovirus
|
Virgaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,311
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Actinidia deliciosa
| null |
2003-12-23
| null | null |
Ribgrass mosaic virus strain RMV Actinidia-AD isolate M1/C, complete genome
|
GTTTAGTTTTATTGCAACAACAACAACAAAATACAATAACAACAAACAAAATACAAACAACAACAACATGGCACAATTTCAACAAACAATCGACATGCAAACTCTCCAAGCTGCTGCGGGACGCAACAGTTTGGTGAATGATTTAGCGTCTCGTCGTGTTTACGATAATGCGGTCGAGGAGCTGAATGCTCGTTCTAGGCGTCCCAAGGTTCATTTCTCCAAAGCAGTGTCTACGGAACAGACCCTGATTGCAACAAATGCTTATCCGGAGTTTGAGATCTCCTTCACTCATACGCAATCTGCAGTGCATTCCTTAGCAGGAGGCCTTCGATCGCTTGAACTGGAGTATCTAATGATGCAAGTTCCATTCGGATCTCTGACGTACGATATCGGCGGCAACTTTTCTGCGCATCTTTTCAAGGGGCGCGACTACGTTCACTGCTGCATGCCTAACTTGGACGTGCGTGACATAGCTCGTCATGAAGGACACAAGGAAGCCATTCAAAGCTACATAAATCGCCTTGAGAGGCAGCGGCGACCTGTGCCGGAATATCAGAGGGCGGCTTTCAACAACTACGCGGAGAATCCACATTACGTTCATTGTGATCGTCCATTTCAACAGTGTGAATTGACGACGGCAAATGGTACTGATACCTACGCCGTGGCGCTTCATAGTATTTATGATATCCCTGTTGAAGAGTTTGGTTCAGCGCTTCTCAGAAAGAACGTTAAAACTTGTTTCGCGGCTTTCCATTTCCATGAGAATATGCTTCTAGATTGTGACACTGTTACACTTGATGAAATCGGAGCAACTTTCCAGAGAGCCGGCGATAAATTAAGTTTTTTCTTCCATAATGAGAGCACTCTTAATTATACCCATAGCTTTAGTAATATAATAAAATATGTGTGTAAAACGTTTTTCCCTGCAAGTCAAAGATTTGTATATCACAAGGAGTTCTTAGTTACTAGAGTCAATACTTGGTATTGTAAGTTTACTAGAGTGGATACTTTTACTCTTTTCCGTGGTGTGTATCATAATAATGTAGACTGCGAAGAGTTTTACAAGGCTATGGATGATGCGTGGGAGTATAAGAAGACGCTTGCGATGCTTAATGCAGAAAGAACCATTTTCAAGGATAACGCCGCGTTGAACTTCTGGTTTCCGAAAGTGAGGGACATGGTCATCGTTCCTCTTTTTGACGCATCCATTACGTCTGGAAAGATGTCTAGAAGAGAGGTTATGGTGAACAAGGACTTCGTTTACACAGTCCTTAATCACATAAAGACGTACCAAGCCAAAGCTTTAACTTACGCAAATGTTCTGTCCTTTGTAGAGTCAATTAGGTCCAGAGTCATAATTAACGGTGTTACTGCCAGATCTGAATGGGACACGGATAAGGCAATTCTAGGTCCACTGGCGATGACATTTTTCCTTATAACAAAGTTGGGTCATGTACAGGATGAGATAATCCTGAAGAAGTTCCAGATGTTCGACAGAACCACCAAAGAGTTGATTTGGTCCAGTCTCTGCGATGCCCTGATGGGGGTTATTCCCTCGGTCAAGGAGACTCTCGTTCGTGGTGGGTTTGTGAAAGTGGCGGAAGAGGCCTTAGAGATTAAGATCCCCGAACTGTACTGCACGTTCTCCGACAGATTTGTGCTACAGTACAAGAAGGCGGAAGAGTTTCAGTCGTGCGACCTTTCCAAACCTCTAGAGGAATCTGAGAAGTATTACAATGCATTATCTGAGCTATCGGTGCTCGAGAATCTCGATTCTTTTGACTTAGAGGCGTTTAAGACTTTGTGCCAGCAGAAAAGTGTAGACCCTGACATGGCAGCTAAGGTGGTGGTGGCAATTATGAAGTGTGAATTAACATTGCCTTTCAAGAAACCTACAGAAGAGGAAATCTCAGAGTCGCTTAAAACCGAGGAGGTAAAAAGTGCGGAGCGAAACGATGTGTTGAGCTTACGGAATGATGCTCCTTTCCCGTGTGTGAAAAATCTCGTAGAGGGTTCTGTGCCGGCGTATGGAATATGTCCGAAAGGTGGAGGTTTCGACAAGTTCGACGTGGATATAGCCGATTTTCATCTCAAGAGTGTAGATGCAGTGAAAAGGGGAGCTATGATGTCAGCAGTGTACACAGGATCGATTAAAGTTCAACAGATGAAGAACTATATCGATTACTTAAGTGCGTCGCTGTCAGCTACTGTCTCCAATCTCTGTAAAGTGCTTAGAGATGTTCATGGAGCCGATCCTGAGTCGCAGGAGAAATCTGGAGTGTGGGATGTGAGAAGAGGACGCTGGTTACTCAAACCGAACGCGAAAAGTCACGCTTGGGGAGTTGCGGAAGACGCCAACCACAAGTTGGTTATAGTATTGCTTAACTGGGATGAGGGGAAACCAGTTTGTGACGAAACATGGTTCAGAGTAGCTGTGTCGAGTGATTCTTTAGTGTACTCCGACATGGGAAAACTGAAGACGTTAACGTCCTGCTGTTTAGACGGTGAACCTCCGGAGCCAACCGCAAAGGTAATCTTGGTTGATGGTGTTCCCGGTTGTGGAAAGACGAAAGAGATTATCGAAAAGGTAAACTTTCAAGAGGACTTGATTCTGGTCCTTGGGAAGGAAGCTTCGAAGATGATTATCAGAAGGGCAAATCACGCAGGTGTGATGAGGGCGGATAAAGACAACGTTAGAACGGTGGATTCCTTCTTGATGCACCCTCCGAGGAGAGTGTTTAAGAGGTTATTCATTGACGAAGGGTTGATGCTTCACACTGGGTGTGTTAACTTTTTGCTACTACTATCGCACTGCGACGTGGCGTATGTGTATGGGGATACACAACAGATTCCGTTTATCTGTAGAGTTGCAAACTTCCCGTATCCTGCACACTTTGCAAAACTTGTAGTGGACGAGAAGGAGATCAGAAGAACTACGCTGAGGTGTCCTGCTGATGTCACATTTTTCTTGAACAAGAAGTACGACGGGGCGGTAATGTGTACCAGCGCCGTTGAAAGGTCTGTGAATGCGGAAGTGGTAAGAGGAAAAGGTGCTTTTAACCCAATAACTTTACCGTTAGAGGGAAAAATATTGACCTTTACTCAGGCTGACAAGTTCGAGTTGCTGGAAAAGGGTTACGCGGACGTGAACACAGTGCACGAGGTGCAAGGGGAAACATACGAGAAGACTGCTATCGTTCGATTGACATCGACTCCGTTAGAGATCATATCAAGAGCGTCACCACATGTTTTAGTGGCTCTGACTAGACACACAACGCGTTGTCGGTACTATACCGTTGTGTTGGATCCAATGGTTAATGTGATTTCGGAAATGGAAAAGTTGTCGAATTTTATTCTCGATATGTACAAGGTCGAAGCTGGCATCCAATAGCAATTACAGATAGATGCAGTATTCAAGGGAACGAATCTGTTCGTTCAGACACCCAAGTTAGGAGATTGGCGAGACATGCAATTCTATTATGACACTCTTCTCCCTGGAAACAGCACTATTCTTAACGAATTTGACGCTGTTACCATGAATTTGAGGGATATTTCCTTAAACGTCAAGGATTGCAGAATAGACTTCTCCAAATCTGTGCAAATTCCCAAGGAGCAACCAAGTTTTCTCAAGCCCAAAATAAGAACCGCGGCAGAAATGCCAAGAACTGCGGGCTTGCTAGAAAATCTAGTTGCCATGATTAAAAGAAACATGAATGCGCCGGATTTGACAGGGACGATTGATATAGAGGATACTGCATCACTGGTGGCCGAAAAGTTTTGGGATGCATACATTGACAAGGAGTTTAGTGGAACGAATAAAATGTCCTTAACTAGGGAAAGTTTTTCTAGATGGCTCTCTAGACAAGAGTCATCTACAGTTGGTCAGCTAGCGGATTTTAACTTTGTAGATTTGCCGGCAGTGGATGAGTACAAGCATATGATCAAGAGCCAACCAAAGCAGAAGTTAGACTTAAGCATTCAGGATGAATATCCTGCATTGCAGACAATAGTCTATCACTCGAAGAAGATCAATGCTATTTTCGGTCCTATGTTTGCAGAACTTACGAGGATGCTGCTCGAGAGAGTGGACTCTTCAAAATTTCTGTTTTACACGAGAAAAACACCTGGGCAAATAGAAGAATTTTTCTCTGACCTTGATTCAACCCAGGCGATGGAAATTCTGGAACTCGACATCTCAAAGTACGACAAGTCACAAAACGAGTTTCATTGCGCTGTAGAGTACAAGATCTGGGAAAAACTTGGGATAGATGAGTGGTTGGCTGAAGTGTGGAAACAGGGACACAGGAAAACGACTTTGAAGGACTATACGGCCGGAATCAAAACATGTCTTTGGTACCAAAGGAAAAGCGGTGATGTGTCAACCTTTATCGGTAACACTATTATCATTGCAACCTGTCTGAGTTCGATGATTCCGATGGACAAAGTGATTAAAGCAGCCTTTTGCGGAGACGACAGTTTAGTTTACATTCCCAAAGGTATGGACTTGCCTGATATTCAAGCCGGTGCAAACCTCATGTGGAATTTCGAGGCGAAGCTTTTCAGGAAAAAGTATGGTTACTTCTGCGGTCGTTACGTTATTCATCATGATAGAGGAGCAATTGTGTATTATGATCCGCTCAAACTAATATCTAAGTTAGGTTGTAAACATATTAGGGATTCAGTTCATTTAGAAGAGTTACGTGAGTCGTTGTGTGATGTAACTAGCAACTTAAATAATTGTGCGTATTTTTCACAGTTGGATGAGGCCGTTGCCGAGGTTCATAAAACCGCGGTAGGCGGATCGTTTGCTTTTTGTAGTATAATTAAATATTTATCAGATAAGAGGTTGTTCAAAGATTTGTTTTTTGTTTGATAATGTCGATGGTTTCGTATGAGCCCAAGGTGAATGATTTCCTTTTCCTCACGAATAAGGAAAAGATACTCCCGAAAGCTCTAACGAGACTTAAGACTGTGTCTATTAGTACTAAGGATATAATATCTGTCAAGGAGTCTGAGACTTTGTGTGATATAGATTTGTTAAATGATGTGCCATTAGATAAGTATAGATACGTGGGTATTTTAGGAGCTGTTTTTACAGGAGAGTGGCTTGTACCAGACTTTGTCAAGGGCGGAGTGACAATAAGCGTGATAGACAAGCGTCTGGTGAACTCTAAGGAATGTGTGATCGGTACGTACAGAGCAGCGGCCAAGAGCAAAAGGTTCCAGTTCAAACTGGTTCCGAATTACTTCGTGTCTACTGCAGACGCCAAGAGGAAACCGTGGCAAGTTCATGTGCGTATTCAAGACGTAAAGATAGAAGCGGGTTGGCAACCATTAGCTCTAGAAGTGGTATCCGTTGCTATGGTTGCTAATAATGTGGTTATGAAGGGTTTGAGAGAAAAGATCATCGCAATAAGTGATCCGGACGTCGAAGGTTTCGAAGGCGTGGTTGACGAATTCGTCGATTCGGTTGAAGCATTTAAAGCGGTTGACAATTTCAGGAAAAAGAAAAGGAAGATAGGAGGAAGTGAAGTAGTAAGTAAGAATAAATATAGACCGGAGAAGCACGCCGGTCCTAATTCGTTATATATTAAGGAAGAAAATGTCTTACAACATCACGAGCTCGAATCAGTACCAGTATTTCGCAGCGGTGTGGGCAGAGCCCACACCAATGCTTAATCAGTGCGTGTCGGCATTGTCACAGTCGTTTCAGACACAAGCAGGGAGAGATACTGTTAGACAGCAATTCTCAAACTTGTTGAGTGCGATTGTGGCGCCAAACCAGCGGTTCCCAGATACAGGGTTCCGGGTGTATGTTAATTCGGCGGTTATAAAGCCGTTATACGAGGCTCTTATGAAGTCTTTCGATACTAAAAATAGAATTATCGAGACGGAAGAGGAGTCACGCCCGTCAGCGTCTGAAGTAGCAAACGCAACACAGCGTGTTGATGATGCGACCGTCGCCATTAGAAGTCAAATTCAGCTTCTGCTGAATGAACTTTCAAATGGACACGGTTATATGAACAGAGCGGAGTTCGAGGCTATAGTGCCTTGGACTACGACACCTGCTACTTAAGCGTGGTGTGCACGATAGCGCACAGTGTTTTTCTCTCCACTTAAATCGAAGAGATATACCTACGGTGTAATTCCGTGGGGTGACGTAAACCAAATTACGTAATGTTTTGGGTTCCATTTAAATCGAAACCCCATATTTCCTGGATCGCCCTGTTAACGCACGTTGGACGTGTATTACAGTGGGAATATGTAAAAGCGAGAGGTTCGAATCCTCCCTAACCCCGGGTAGGGGCCCA
| 100,231
|
NC_040786.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Huang,J., Liu,C., Chen,B., Zhang,T., Zhou,G., Huang,J.L., Liu,C.H., Zhou,G.H.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-02-12
|
GD-LD
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
RefSeq
| 1
|
China
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2015-10
| null |
PRJNA485481
|
Rice stripe mosaic virus isolate GD-LD, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGACATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCTAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCGGACCCCGACGTTTCCGACGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGATTCAAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTACTGACCAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGACGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAATTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGAAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCCGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTGAATAACTATGCAGCCTACTGGTGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCCGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGCTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAGAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCGGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAGTCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGGTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATATGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCACGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGATAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATCATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTAGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGGTTGGGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAATGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACCTCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAATGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGCAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCTTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGGGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATTACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTGGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACCGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGATATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAGGGGAAACTGCTTGGATATTTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACTCTGAAGTTAGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTCTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTTGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAAACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATAATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATCTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTAGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAACGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACCTATGCTGTGCTATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCAGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGAGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCACCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAGCCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTAACCAAGAATGGGATTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTTTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAAAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATAGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGATCGTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCTGCAATACCATAGGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCGGTAAAAACATCCTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCCTATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAAGAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 3,928
|
MH720464.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
TP1
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Tianping
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-09-19
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate TP1, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGACATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCCGATGTTTCTGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGATTCAAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTACTGACCAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAAGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGACGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAATTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGGAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCCGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAGAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCATGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATAATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGTTTGAGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATACTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCTTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACCGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATCTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACTCTAAAGTTAGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAATCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTGTGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAGACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATAATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATTTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTAGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAATGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACCTATGCTGTGCGATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCAGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCATGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTACAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCTGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCTTGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCGCTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCCAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTAACCAAGAATTGGATTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGTCGTCTCTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACAGATCCCTTGGAGAAAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATAGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCGTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCGGTAAAAACATCCTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCCTATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAAGAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,483
|
MH720465.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
TP2
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Tianping
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-09-19
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate TP2, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGACATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTTGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCCGATGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGATTCAAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACTGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGCGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTACTGACCAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGACGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAATTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGGAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCATTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCCGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGCCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCCAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGACGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACCAAAGTGGCCCCCAAGAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTGGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCATGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATAATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGGTTGAGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCTTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACCGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATTTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCTTAGTTGAGACTCTGAAGTTAGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAATTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAGCAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAGACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATAATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATTTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTAGAGATAACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAATGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACCTATGCTGTGCGATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCAGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCAGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTGGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGGGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTAACCAAGAATGGGATTACAGCACTTATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTTTGATCAACTTGGCTTGGTATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAAAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATAGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCGTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCGGTAAAAACATCCTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCCTATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAAGAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAAATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATGAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,484
|
MH720466.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
LJ1
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Luojing
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-09-19
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate LJ1, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGATATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGATCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTATAAGGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCCGATGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGATTCAAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTACTGACCAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGACGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGGTGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAATTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGGAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCCGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCATATGAGGATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCAAAGCCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAGAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCAAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTGATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCATGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATAATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCCAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGGTTGAGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGCGGAACAATCTCTTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCGCACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCTTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCTATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATCGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACCGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATCTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACTCTGAAGTTAGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAAGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTATTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAACGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGATGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACTTGACACATATCCCTACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAGACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATAATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCGACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATTTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTAGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAATGAAGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACCTATGCTGTGCGATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACAGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCAGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATCGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACCGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACGTCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGAGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCTGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCCAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACGAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCTATGCACTACAAAGCTGATGTGAAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTAACCAAGAATGGGATTACAGCACTGATTAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTCTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACAGATCCCTTGGAGAAAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATAGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCGTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCGGTAAAAACATCCTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCCTATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAAGAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,485
|
MH720467.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
LJ2
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Luojing
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-09-19
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate LJ2, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGATATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGATCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTATAAGGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCCGATGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGATTCAAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTACTGACCAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGACGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGGTGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAATTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGGAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCCGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCATACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAGCCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCTGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCTAAAGACATCGGACGCTCCGGTCTTCCTGAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAGATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAGAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCACGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATAATTTCCATGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAGGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGGTTGGGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCTTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCACACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACCGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATTTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACTCTGAAGTTAGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAGACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCTAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCTAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATAATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATCTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTAGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAATGAGGACCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACCTATGCTGTGCGATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCAGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAAGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCTTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTGGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCTGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTTCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTGGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTAACCAAGAATGGGATTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGGGAGAAGAGTGTGGCGTCCTTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAAAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATCGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCGTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCGGTAAAAACATCTTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCCTATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAAGAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGCATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAAGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGGTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,486
|
MH720468.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
SG1
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Songgui
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-09-19
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate SG1, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGATATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCCGATGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGATTCAAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAGAAGTTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTACTGACCAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGACGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCCGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGACGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAATTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGGAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCGTCCGCAGGGGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACTGAGAAGGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGGCGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACACACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAATCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAGGGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCTTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTGATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGGGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCATGACAAAAAAGATCTTGACAGTGACGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATAATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGGTTGAGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCTTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCATCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCTATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACTGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATGTTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACCGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATCTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGATACTCTGAAGTTAGAATATGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTATGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAAATAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAGCAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTGTCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATTCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAGACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATAATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATTTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTAGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAAGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAATGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACCTATGCTGTGCGATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGGCATCTGATGGGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCAGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTTAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATTAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCTGTCACCGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCAGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTAACCAAGAATGGGATTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTTTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAAAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATAGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCGTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCGGTAAAAACATCCTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCAGTATCATCCTATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAAGAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAAATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,487
|
MH720469.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
SG2
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Songgui
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-09-19
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate SG2, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGATATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAGGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCCGATGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCCTATGAGGCTATCGGAGATGAGGATTCAAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAGGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTCTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGTTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTACTGACCAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGTTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGACGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAATTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGGAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCCGCAGGTGAGTATTCGTCGGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGGCGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCAGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCAGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAAATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAAGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAGGGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGCAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTGATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGGGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCATGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATAATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGGTTGAGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCTTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCTATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCGAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACCGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATCTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGATACTCTGAAGTTAGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTGTCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAGACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATAATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATTTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTAGAGATCACAAATACATTGGAGACATTTAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAATGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACCTATGCTGTGCGATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGACCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCAGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCAAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTCGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACCGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAAATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGAAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTAACCAAGAATGGGATTACAACACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTCTGATCAACTTGGCTTGGAACAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACAGATCCCTTGGAGAAAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATAGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCGTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGACCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCGGTAAAAACATCCTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTGTTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCCTATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCATCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAAGAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,488
|
MH720470.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
WZ9
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Wuzhou
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-06-11
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate WZ9, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGACATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCCGACGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGACTCGAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTGCTGACTAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGATGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAGTTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGGAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCCGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAAGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAAAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAATGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCACGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCGTCAATAATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCAAGGTTGAGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTATCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCCGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCCTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACATCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTGAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACTGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAACTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATTTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACTCTGAAGTTGGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTAGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAGACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATCATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATCTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTGGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTCTCCAATGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAACGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACTTATGCTGTGCGATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCGGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTCTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTGACCAAGAATGGGGTTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTTTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAGAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATCGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCTTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCAGTAAAAACATCTTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCATATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAATAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,489
|
MH720471.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
WZ12
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Wuzhou
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-06-11
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate WZ12, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGACATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCCGACGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGACTCGAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTGCTGACTAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGATGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAGTTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGGAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCTGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAAGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAAAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAATGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCACGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCGTCAATAATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCAAGGTTGAGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTATCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCCGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCCTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACATCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTGAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACTGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAACTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATTTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACTCTGAAGTTGGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTAGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAGACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATCATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATCTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTGGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTCTCCAATGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAACGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACTTATGCTGTGCGATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCGGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTCTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTGACCAAGAATGGGGTTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTTTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAGAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATCGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCTTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCAGTAAAAACATCTTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCATATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAATAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,490
|
MH720472.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
HZ5
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Hezhou
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-06-11
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate HZ5, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGACATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCCGACGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGACTCGAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTGCTGACTAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGATGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAGTTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGGAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCTGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAAGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAAAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAATGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCACGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCGTCAATAATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCAAGGTTGAGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTATCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCCGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCCTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACATCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTGAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACTGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAACTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATTTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACTCTGAAGTTGGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTAGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAGACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATCATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATCTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTGGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTCTCCAATGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAACGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACTTATGCTGTGCGATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCGGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTCTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTGACCAAGAATGGGGTTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTTTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAGAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATCGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCTTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCAGTAAAAACATCTTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCATATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAATAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,491
|
MH720473.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
HZ7
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Hezhou
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-06-11
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate HZ7, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGACATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCCGACGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGACTCGAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTGCTGACTAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGATGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAGTTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGGAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCTGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTGAATAACTATGCAGCCTACTGGTGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCCGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAGAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCGGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGATTGATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAGTCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGGTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATATGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCACGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGATAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATCATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGGTTGGGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAATGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACCTCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCTTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGGGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATTACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTGGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACTGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGATATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAGGGGAAACTGCTTGGATATTTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACTCTGAAGTTGGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTTGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAGACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATCATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATCTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTGGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAATGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACTTATGCTGTGCTATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCGGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTYTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAGCCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTGACCAAGAATGGGGTTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTTTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAGAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATCGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCTTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCAGTAAAAACATCTTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCATATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAATAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,492
|
MH720474.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
LS
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Linshui
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-05-12
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate LS, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGACATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTAGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCAGACGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGATTCAAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTACTGACCAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGACGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAATTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGAAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTGCGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCCGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAGCATCATGTTTGGATAGAATGTGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTTCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAACCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAGAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCAAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACTGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGACACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCACGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTCGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATAATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGGTTGAGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAGGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGAGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCGTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTGGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGTCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTAGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCGAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACCGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGATTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATTTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACACTGAAGTTAGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACAGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAAACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATAATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATCTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTAGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAACGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACCTATGCTGTGCTATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATCGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCAGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTCGTCTTGAGGCCAATTAATCTAGTTAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGGCTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGGGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTAACCAAGAATGGGATTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTTTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAAAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATCGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCGTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCAGTAAAAACATCTTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCCTATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAAGAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTACCCGAGTCCTTGAATGAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,493
|
MH720475.1
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Zhou,G.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2018-12-02
|
TM
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| null |
China: Timeng
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2017-05-12
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate TM, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGACATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTAGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCCAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCTGACCCAGACGTTTCCGATGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGATTCAAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTACTGACCAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGACGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAATTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGAAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTGCGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCCGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAGCATCATGTTTGGATAGAATGTGACTCCTCTAAATAACTATGCAGCCTACTGGCGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTTCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCAGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAACCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGTTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAGAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCAAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCAGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAATCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGCTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGACACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATACGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCACGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTCGGAGAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATAATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTGGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGGTTGAGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAGGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAAAGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGAGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACATCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAGTGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGTAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCGTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTGGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGTCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGAGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATCACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTCGGGGACTCACTTTTAGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCGAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACCGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGAGATGATTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAAGGGAAACTGCTTGGATATTTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACACTGAAGTTAGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACAGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTTTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTCGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAAACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATAATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATCTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTAGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAACGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACCTATGCTGTGCTATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATCGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCAGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTCGTCTTGAGGCCAATTAATCTAGTTAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGGGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGGCTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGGGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCATCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAACCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTAACCAAGAATGGGATTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTTTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAAAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATCGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGACCGTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCAGCAATACCATAAGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCAGTAAAAACATCTTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCCTATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAAGAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTACCCGAGTCCTTGAATGAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 66,494
|
KX525586.2
|
Rice stripe mosaic virus
|
Yang,X., Huang,J., Liu,C., Chen,B., Zhang,T., Zhou,G., Huang,J.L., Liu,C.H., Zhou,G.H.
|
South China Agricultural University, Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control
|
China
|
2017-01-24
|
GD-LD
|
Cytorhabdovirus oryzae
|
Cytorhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,774
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Oryza sativa
| null |
2015-10
| null | null |
Rice stripe mosaic virus isolate GD-LD, complete genome
|
AAGGAAGTTGCGTTGCGAACGCAACATTAAAATGTTGACATAACCCACCTTATCATAACAAAAGAAAAACGAGACCGCCAAGTCTTAAAATGGCAACCGACAAGTCTTTTGAGGAGAAGCTGAGCCTGGTTCCTGAGAACACTAAGCTATATTCAATATCTCCTGAGGCATATTCAGATGATAAGTTTGATAAGGCCAATTGCTACAAGCTAGAGAAGAGGTCTGAATATGAGCTAACTAGGCTCTACAAAGGACTAGTCCGGGACTTAGGGAATTCTTCCCCCTCCACTTATGCAGTCGAGAGATTGCTAGTCTTGGCAAGCCATCTGTATGAGACCAAGAAAGGGTCTTCTAACTTCTTCTTGACCGATTACCTGCCTAAGACAACATCAACAGCAAATCTTGATGCAGGCTTTTTGGCAAAGCTGAAAGAGACCCCTAAGGCCTCGGACCCCGACGTTTCCGACGTGACAGAAGTCAAGACAGCTAAGGCTACTCTAGACTCTGCTACAACTGATGCGGATACTAAAAAGGCCGCTTATGAGGCTATCGGAGATGAGGATTCAAAGAAGGCTGAGAAGGCTACAGCAAACACTGCCTGGATTGCTGCCCAAGAGGCCCAGAAGAAGGCTCAGAGTGCCTATGATAAGGCAGTTTCGAATGCGAAGAAGGCCTCAAGGAAAACTACCTCTGGAAAAAGCTTGTTCGGGGATGCAGGGGAGACAGTCACAGATGAGTCTAAGGTAGTGGAAGAGGTTGGAGAGGGGAAGAAGAAGTTTGGACCCTTCTTAGCTGCTTACTTGATGAGGCTACTGACCAAAATAGCATCCAATGTCACAGAGTCATGGGAGCATATGAAAGGAATGTATAAGAACTTTTATGGTTATGATGCTCCTTCAGACCTGAACTGTCCCGAGGCAGGATTCCTTGAGCAACTGAAGTCTGAGCTTAACAAGGATAGAAGGGCGGCTACCTCATGGGTCAAAATAGTAGCAGAGGCAGATAATAAGTTGGATCAATCTACAGCCGAGGCTGGGATTCTCCGCTATGTGGCTGTCCTCCCTCTTGCATATTCTGGGATGCATGCGATGAAGTTGTTCATGGACGTCAAGATGCTGACCAAACTCACCAGCAACTACTTGATTGGTGCCATGAGGAGCCCTCTGACCAAGGATGCATTAGATGCAATCATGGATATCTTGATCTCGTTTGAGTCCACTACAAAGACTAAGAAGTCGGAGAAGTTCCGGTTTGCTAGGATTGTGAGTACTCAATTCTTTCAATCCCTCCAGACCAAGAATTGCAAAGAGCTGGTCTATCTGATGGTTCAGATAATTGCTGAGTACAGAAAAGCAGAGGGGGTCAGGGATCCCATGAACATTGCTGGATTAGATGACATCTCTAGCAGGAACAAGAAGAAGTTGAATAAAGCAGTACGGATAATACTGGCAGAAGCTCCAAAGGCATCCGCAGGTGAGTATTCGTCAGCCATGAAGAAGGCTTTCCTGGATGACGAAGAGGATGATACAGCCAAGACCAGGTCCATCTTCCAGACCAAGGCTTAAGGAACATCATGTTTGGATAGAATATGACTCCTCTGAATAACTATGCAGCCTACTGGTGAGTCTTTGTGTGTTATATAAGAAAAACGAGACCGTCAGGTCAATAATGAGTGTGCCAGAGGATACTCCCTTCAGATCGTACTCCAGCATCTTTGACGACTCCGACTTTGTCCAACCACAGCCCATGTCCTTCAAAGCGACCAAGGAGTCAGAGAGCCTTCCTGAGACAGAGAAAGAAGATATGTCGACTGAATACCTCTCTGAACCACTGAGGACCAAGTCAGGTAAGAAGAACAGACGGAGGAAGGGAAAGGACCTAAAATCTCTCTTCACTCAAGAAGCTGGACTCCCGGCTCCAGAAGCAGACAGTGTCCTCCCCGAATCGTCTCCGTATGAGAATGATAACGCACAGTTGGAGCTACCCAAGCCCATTCTAAAGACATCAGACGCTCCGGTCTTCCTAAGAGAGAAGGATCTTAGTAAAGAATTTGCTGCAGCCTGCAAGACTAATGGGATTCTCCCAAGGGATGAATGGAAGTCATCTGTAGCAGCCAAGTATCATGCAGAGGAAGGGAAAATGACCAAACGAGACATCTCGTTAATCGTATTTGGAATGGAGCTTTACAAGAGATACAATGTGGAATCTGAGGTATCAACTTTGTTCACTTCATTGGTGACTGAGCTGCAGGGGATAAAGGTTGCTGCTAAGGAGTTGAATGATACCCGGGAGGTCCTCACTAAGATTCCAGGAGAAATTGTGTCTGCTGTCAAGGCAGGGGTAAAGGAGGGGACCGAGATGGGGATGGATTATATAGAGACTAGAACTAAAGTGGCCCCCAAGAGTGCTCCTAAAGTGGACATCTCCAAGCCGATGAGTAGTAAGATGATGGAGCAGCAGGATGAGAGTTCTGATGAGTCCTCAGATAATGAGAGTGAGGAGAGTGAGGAAGAATCCTTTGAGACAAAGGCTGCAATCTTCTTAGCTTTGATAAAGGTTCCGGAGGAAGAGAGAGACAACGCAATAGTCCTTATGGCCTTGAGGGCAGTGATATCTGACAGTGAGCTGAATCAGGCAATTAGGAATGACAGAATCTCCTCCTCAGTAGCAGATATGTACCATCAAAAGATATCTGACAAGGCTAGGGAATTGATGGGAAAGGGAAAGACCAACAAGAGGGCCAAGCAGCCTAAATCCTCTAAGTATGCATCGGATTACTATGATGATGCACTGTGAGTAATCAGTTACTACCTGTGTGGCAATGTCGGAACTGTACTTACCTATATATTGATAATCGTCTGTGATCTTGTGCCTTTAATTGCTGCAGTATTATAGCTTAAAATAATCTAGTTACCAATGCTCTATTTTCGTACTTAAGTGCCATGTTGCCTGCCTTTACCAAAGTAGTCTAGTGTGCTCTATTTAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGAAGATCATCTGCAGTACTGGGATCTTCAATGAAGAGAAAGGGTTCCCCCTCCCCAACCTCCTCAACAGTCCCTTGATGAAGCAGGAGATCATGACGGTCAAGTACTTGAGGTTTCAGTATATCCCTATTATGACCAGCAACCCCTCGAGTTCATTGACTATTGACATTAAAGATACTCGACTGGTCAATTGGGATAATAGGTCGATTTTCCAGGTCAAAATATTCGGGGATGTTCAAAGCTCATTTATTGTATCGGGTCTACAGCCTTATTCAGCTAGAGACCGTTGCCCTTATCTCCTCTCCCTTTCAGTAAACGCAGGGAAGGTTGTTCCAGGGACCAAATATGGCATCTTAAAATCTTATGCTGTGTACACATCTAAAGACTCAGGGATAATTTCGTCACAGATCTCTGTAAAACTTGAAAGGTCCCCACGTGACTACTTCTTGAAGAGGTCTAAGGAGCACGACAAAAAAGATCTTGACAGTGATGTCTCATTCAAGATGTGTCGCCATGTCAAGTTTGCTACTTGAAGCTTGGATAGGATGGGCAGCTGAATGTTGTCGGGGTGATGTTTTCCTTATGAATATCTTCAATCATTTCCCTGGAGGGAGAAACAGTTGATCTCTAGGAGGACGCAAGGGCTCACTACTAGCATGTGCTTGCCAGGTTGGGGTTTTATGCCTATCATGGTTTAGCCTAAATAAGAAAAACGAGACCATCATGGCCGTTCCGTGGACTGAGGTTAAAGACTCCAAGTACTTGGCAACTAAGATGTCTGTTACCCTGATCATGGAGATGAATGAAGATACACCTCTAAAGTATCCTTCTTACAACGCATTCGAGAGCATCTTTAAAAGGCTAGCAGAACCAGAATGCGCAGCACCCCAAGTGGCCGCATGGTTTACTTGGTTCCTAAGAGAGGCAAAGGACATCTACTATCTGGAAGTGAGTAACAAGGAAACTGCCCAATACGGACCAACTAAAGTCTATAAACTTCAGTGTCCAGCCTACCTCTTATCCCGAGTGACAGGAGGATCACAGCTTGATTATACCTCTCTTATAGGTAGCAAGGTGATGACTGAGAAAGATCGGGGGATCCCAGTCAGAACACTCTATATTACTGGAGGGGGTACCTCATTCAGAGTCATCAACGAGGAGACAGCCAACCAGTTCATCATAAATGATAATGCTGTCCGCCTACCAGGAGAATGCAAGGTGGATGGAGGAAGTATAATCTGGAGTTAGAATTTCAAGAAAACTAAACAATAATGAACAAGTGGAACAATCTCGTGTAGTGTATTAGGTGTCCTCTTTAACTAAAGTTAAATAAGAAAAACGAGACCCGCAAGGATCTTAAGATAACAAGATGATGAGGATTTCGGTCTTTCTCTTGATGCTCTGCTGGCTCCCTGTCAGCCTGACCTTCTTCGACAAATCACACATTCCTATAACCACATGTGATAAGAATCTAATGAGTCCTATCCCTTGGAGAACTTACTGCATAGAGGAGTGTGGAATCCGGAATGTAATAGGTGATAAGCTGGATCTGTTTATCTACAATAGGTCTGACAGTGGGAAAGTACAGCTGGCTGACTGCAGGAAGTACAAGATCAGACAGACCTTCACCAAGACTTGGACATTCTCGACATTCAAAGGGGCGATAGAGACAGAGGAGCTAATGCCTAATTATGCAGAGTGTGAATCCACCTGGAGAGATCTGTGCAACTCTGGACCGTGCAGTACCACAACTCCGGTGATCCCTGAGGAATACCATTGGGCTTCTGACACCACGAAGGAGGTCATCTATGTATCTATAGATGCATACCAGAAAACTGTTGCATTCCAGGATCCTAGTGGTGATATCCAGCTCCTAGTCCATGGGGTGATCATAGATGGGAGCCAGTCTGGTTATGTTCAACCCAGCAAAGATCTCATCACTATGTGGGATAAGGTTGAGTTACAAGATGAATGCCCTTGGTCAACGGGAAATTCTCTTTCGTGTTCTACGTCTGATGAGGGAATTTCATACTACTGTGCTGGGAAAGGGCTAGTACTGACCAACATCAGTACGGTGACTGATACCAGATGTGACAACAACCCGCACCTAATGACATCAGGGCACCATGTGATTTTTAGGGTGAAGAAGGCATCAGACCCGAATGCGACTCTCAGCAGGACAGCTCAAATAGTGCTGGACAGGGGGTCAGAAGAGGCCGAGATTGTAGATAGTGTTAATAAGGCGTTGCTGGATAGAGATTCCATCAGGTGTGCAAGCTCATGTCTCGCCTTTGATTACACCATCTCCAAGCCTCAGATGTTTGGCAACCAATTGGCGCTACCTTATAAGGGGTCTTTTCTCCCTTGCAACATACTGCCTAATTGTCGGGTTGTCTTCCCAGTCAAGTATTGCAGCTCTCCTCCGATGATTCTGGTAGAATGTACCGGCACTATGACATGGTGGAATATTACTGGAGATTACACGATCAGACCCACCTATTGCCACATGAACCAGTCGGCGACCAAGATTAAGACATCTATATCCTTTATGACAACAAATGGGAGAGTCTTAGTGAATGAGTCTGGCGCTTATCCTGTCTCCCGTGAAATAGGAAATACGTTCCAGGTCGGACATGTCATAGAGCCTAGCTCCATGATAGAGGTGACTGATCCACTTAATGTTAGGATAGATGACACCTTAGTCACACCAGAGTCCCATACTATATCTAATATCACTTCAGTGGGGGACTCACTTTTGGATACAATGGTTGAGACCGTGAAAGGTATCGGTCGCTTCATATCCCATGAGGTCAGGATAGTGGTTTTTGGTGTTCTGACTCTTTTTATATTATATCTGTCGTTTAAATATTTGTTCGCTAAGAAGAAGAGCAGAGTGCCGCACCCTAAAGTTGTCTATACAAAACCCACATCTGAAGGACCAGTGATCTATGACACCGAATATACTATAGAAAGTGACTAATAAAAAACAGAGACCAACATGGAGTTCAATTGGCCTTGGGGACAGAACAGTGAAACGGAAATCACCAAGAATCTCCGCTTTGAGGACATTAAGGTGATGGCCATAATAATACTAGTCTGGGTGAAGTGTCTTCTCATCTACCATTTCAAGAGGAAAATAAGGCGACTAAGATCTCTATTGATAAAAGGATCCTCACAATGGGTACTGCATGATGCCTAACTCATTAGGAAGATCTGATATGAGTTTTTATCCTGCCTTATCCTTCTAATTAAGAAAAACGAGACCGCCATCATGGACCTTGATGACGGTGGTCTATGGAGACGTGCTAGGGGTCTGGGGGATTATCACCTGAGGTCTGCTCTGGTGACCCCCTCCTTAGAGCGTTTCCGCAGTCGAAAGGGAAGGCACCGTGAACAACTGTGCTTTGATAGGATGAAATCACTAGGCTGGATGTTGAGGTGGGTAGATCAGGGGAAACTGCTTGGATATTTAATGGTAGAAGCCAACAAATCTTTACCAAAATCCATTGCAAACCAGGAACTCCTAGTTGAGACTCTGAAGTTAGAATACGGATGTCTTAGACAGATAATCATGACGGATGGAGACCTCCATGATCAGGTGATCTCTTATCTAGACAGGAAGTCTATCTCTACCCATTACACCCATGGTAGGGAGGTCTTTCAGGAAGCCTTGATAGTTGTCATGGCACTTTCTTCAGGGAGAGAACCACCAGATCATGTCAATAACTTGGGTTATGAAATGCTGAATGAAGAACTTGAAGTGCCCGTGGTCAGAACCTATGGCGTAATCTTCTATCTCTTTGGGGACTTGATCTACGTAAAGTATCCGGAGGAAGAGGGCATGATCACACTGGACATGTTCAGAAACCTGACAGATAAATTCTCTGAGAGGGAGAATATTATGATTGCAACTCAACTAGGAACTGAGATCCTTCAAGAGATATACCCTTCTGAGACAGTGCTCAAAACAGTCTTCTCTCTTTGGGACAAAGGTCTATTGAAAGAGGGAAATGACTTTTACACAGTGGTAAAGACATTTGAAGCAATCATAAATGGGATGTTGATCAAGAACAATGACGGAACATACTATGATCCTTCAGCATACCTCCGAGAAACTATCATGGGGCTGCCAGTACGACTGAGGGATTATGCACAGACGTTAGTGAGTTACTTAGACTCTCTCCCCTTTAATCCACACCACCTATCTCAGATTGGGGGGTTGTTTCGGTTGTGGGGACACCCCATAGTAGATCCTAACGCTGGGGTCAGAAAGGTAAGGCTTCTGGGAACAGCTGATAAGATGAACCTGACACATATCCCCACCCTAGCAGAGCGGAAATTCAAGGAGATCTTCTACCTGTCGTATTATGAAAAGCATAGAGTCTATCCTAATCATAACTTGAATGGAGAAATTGAAGGAAGCTATTTGCTCTCTCAGCTTGCACAAATGGCTCTGGTTAATCCCAAGCATGCAAATTACTCACTAGTAGACTGGGATTCAGTCAACACACTAGAGACCTTTCCCTTTCCTAAATCATTCAACCTGTCTCTTATTATAGCGGATAAAGCTGTAAGTCCGAACAGAGAAGAATGGTTGGAATTGAGACGTAAGGGAGGAACTCAGATGGATCCGCACATTAGAAGAGGGCCTCTGAAGGCTATGAAAGACGGAGTAATCGATTGTGAGAAACTATTGAGGAAGATAAACCGTAACCCGTCCGGTTTAGCTAAGAAACATAGGATCATTGGACTGTACCCAAAGGAGAGAGAAGAAAATATGGTTCCCAGGATGTTTGCATTAATGTCCTTTGACATGAGAGCTTTCTCAGTGGTCTCTGAATCCATGATAGCAGATCACATCATTCCTCATATAGAAGGTGTCACAATGACGAAGAGCATGTTGGCCCTCCAGAAAGAGATGATAATTTCAACTAAAAGCCAGGCCTCCTCAACCCAGTCAGACAGTATAACCTTCTGTCTTAATATTGACTTTGAAAAGTGGAACCTTAACTTCCGAAGATGGATGACGGAGGGGGTATTCAGAGAAATGGGGCGATTGTTCGGACTTCCAGAGATATTCAATCGGACTTATGACATCTTCAAGAAATCCATCATTTATCTAGCAGATGGAAGCTTCGACCTCTTGCTGACAGATGAGTTGGAAATAGAACCAGGGACCAATCCAGATTGCGCATACACCGGTCATGTTGGGGGGTTTGAGGGATTGAGGCAGAAAGGATGGACAGTCTTCACAGCGGTCTTAATCTCTTCCATCTGCGATGAAATGGGGATCAAGACTCATCTAATGGGGCAAGGTGATAACCAGGTTTTGATGCTGACCATCTACTCAAGAGCTGCTAGAGAGACGGGGGATTTGAAATCAGCACCAGCAGTACTAGAGATCACAAATACATTGGAGACATTCAAGAGCAGACTAGTCTCACTCTTTGCTAATCTTGGATTGCCTATAAAACCACTAGAGACCTGGGTCTCAGAGGAATTGTTTGCCTATGGCAAGACTCCAATATACCGAGCAGTCCCCCTTGCAATGAGTCTCAAGCGAATCTCTAGAGTTTTTGCGTTTTCCAACGAGGATCTAATGACCTTGTCTAATGCGTTAGGTGCTATCTCTGCGAATGCACAAGCTGCATCCATGTGCGATGTCCATCCGATGGTGTCATATGCCATAGCAAAGTGGCAACACCTATGCTGTGCTATAATCTTCTCCAACTATCATCCGCTATGCGGGTGTGCTCCACATGTCTCAGGAGAGGAATGGGCAATAAAGCTACGACTTCCGTCAGGAAAGAAGATTCAAGAGACATCTGATGAGGAGATAGACGAAAGAGATCTGATGAAACTAATAGTGACCATACCTCGAAGCTTAGGAGGTTATAATACCCTGACTCTGTATGAGATGATCATGAGAGGATTTTCTGACCCAGTCTCTAGGGACATGTGCTGGCTATTCGCAATTGCCAGTGAATCAACAGGAAAACTTCGAGGTTATCTGATAAACTGGATTAAACCAATCGTGTCTCCGGAAGTAAATGCTCAGCATCTCATTCAGGATCCCACGGCACTCAATTTGCTAGTACCCCCTAATGCTACATCAGTTATTAAGAGGATGATAGACAAATCACTCGAAGCACTCCCAAAGAGATCTCAGTTCGCAGTATGGTTCTCTGAGATCCTAGAGATCTCAGGGGACAAGGAAATCTCAAAGTTAGCAGAGGCCTTGACCAGGACAGATTCCCTGAACCCCCGTTTCCTTCACGACATTCTGGGGGCCACTCTTTATGGATACTGCACGGCTATAACTAGTAAAGTTGACAAGACAGTGACCTTATCTCGGATGGCACTAGCGTCTAAGGATGTTGTTGGAGCTCTAATCAAGGGGGAGATGAGACTTTACTCCTATTTCGGATGGAGAACCTTGCAATCGAGAGGCTTACCTCTGACCACCAGATGTCCCAATAAGTGGGTGCGGATAATTAGGGATATCTCATGGCAAAAACAAATTAAGGCTGTTAGCGTTCCGTATCCTACTCATTTCTTATCAGAGGATATTTCAGAGACTGATAGGCCCGATTCCTGGATTGAGTGCTATATTGATGATGCCCCGACATCTGACAGAAGTTGCATGATCTATTCGACAGGAAAAGCTCTGCCGTACTTGGGTAGTGTCACTAGAGAAAAACTGACAACTCGAGGTGCAAAGGCGGCCTATGGAACTGAACCTCTTGTATTGAGGCCAATTAATCTAGTCAGAACTATAGGTTGGTTCATTGAAGAGGATAGCAATTTTGCTGAATTGATCAAGATGCTACTGGGAGCCGTCACAGATCTTCCCATAGAGGAGGTACTCTATATCCCAGAAATGGTGAGTGGCTCTATGGCACATAGATACCTAGATATGTCAACACAGCATGGATCTTTGTGGATGCCTCTTTATGGTCCTGCCACTTTTCTCCATATGAGCACTAATACTTTTGTGCAGTACCTGAAGGGGACAGAAAATGTCACTTTGCACTTTCAGTGTGTCATGGGCTTAATTCAGTATGCTATAGTCAACAAAGCTCTAGGAGAATGTCCCACAAAGAGAATGACGAGATTCTTCCGATCATGCCCTGACTGTATAGTTCCCATTGATGATACGTTGGAGGACTTGCCTGAGGTCCCTTCGCTAGATCTCATCCCTGAGAGGACCACAAACCCTTATCTCTACCTCAAGAAGGAGAAGATTGAACTGAATGTTAGGCATCGACTTGCAGTGATAAATGAGATCCGGGTAATAGCTAGGGATGAGATAGAAGAGACTCCCCTGTTGGCTAACAATACTCTGGAGGACGTGATGAGTTTGAGGGCAGCTCAGAGAATATTCTACACAGCCAAAGGAAAGGAGGCACAGTGGGACTTGCAGACTGCTGATCGAGAGGGGTACTTAAAACTGGATTTCGTGAGCGTAATCAGGAAGATTATAGGACACCTCTTTGTAATGGAATCAGAGACGTTAAAAGCCGGGTCAGACTACCCTACTTTCCAGTTACAGCAGAGAAGGATCATGCGGCGCGTTAGGCAGTCAGATACATCTAACTTTGTCCACTTAGGAGGGTTCTTCTGCTGGCAAGAGAGCATTGCGAGGATACAGAAACTGAAGTGGTCAGTGATGCCTGCCACATTCCCTATCACTGCAGAATCAGTGTCACTGGCAGCTAAGATGAGTCTAATAGGGGCAATGACTAGCGGGCTAACACCTAAGAGATGTGATGGTGTTCTGGCCGAAAACTTAATCCCGGATGTCACAAGGCAAGCAAAGAACATCATATGCCTGGACAAAGTGTTCCAAAGCAGATGTGATTACTGCTATACTGCAGCAATGACAAATAGGTGGTCAGACTCGATAAACTCCGACAGCATATTCAATATGAGATGTGAGAGAGGCCATACCATTCTGTCCCCGAGAATGTTGCATCAATTGAGGCGAACTATCTTGCCTGAAGGAGCCCTATACACTTTGGCTGTCAGAGTGGTTCACCAAAGCCCTCCTGAAGCATCACAACCTCTTCAGATCACCCCATGCAGGCGAGAGAGATATCAAATCTTGAGTGAAGCTGACATGCCTAGACAAACTGGCTACTCGGGGGTCTATAGAAGGCCTACCAATCAAATCTGCATGTATACAGAGGTTGAATTGGCAAAGAAGTACAGGTTGCCAACTAATTCATTATACAGGATCCTTGACTTACACGACTGCTTCTTCAGTCAGAAACTCATGGACACAAGGGGCAACATTTTAGTGGTCGGAGACGGGTATGGATACAGCTCCTTGCTAACCAAGTGCTTGAACCCAGACAGGAATGTAGTGAGCTGGACCTATATTGAGCCATCTGAGGCACTTCCACATAGCCTGAGAATCTCTAAGCCTCCAATGCACTACAAAGCTGATGTGCAGATAGATTCTAGCCCTTCAATTGACAGAATCTCCGACATACATAACTCCTCATACCCGGATGAGTTCGCTAAAGTGGTAACCAAGAATGGGATTACAGCACTGATCAGTGACATTGAAACTGTGTATGTCTCTGGAGAGAAGAGTGTGGCGTCTTTGATCAACTTGGCTTGGAATAACCAGATCCAATTAGGAGCACTCAAGTTGGAATTGATGACGGATCCCTTGGAGAAAGTCGTAGAATATGCCCACAATGCTTACCAAAGATGGGAATTATTCACTCTACCAGGCGCCAATCTCGGAGGAGGGGTACTATACATAGGTTTCTACGGTAGAAGAGAGAAGTTGACTGGGTACATCATTCCCCATTCAGGAGTTGAGACCTTGATGGATAGGTTGGCAACTGAGGTAGATGAGGATAGAGGAAGATTGAGAGCAGAGGATCGTGATCGGTGGGAGCAGTTGGATACAATGGAAAGCAAAATACATCTGCTGCAATACCATAGGATGAGGCTCGATCTATGGTTCGGATCTGCTTATCTGAGTGGTTATCTCTCAGAGGATATGACTGAGTTCTTTTACTCGGTAAAAACATCCTACAGACCACCTGCAATCTCATGGGAGAAAGGGAACCAGGCCAGATACCTCTATGGCAGCAGGGAAGAGATCTTATTCATGAGCATGATCACAGTGGCACTATCATCCTATCTAGAGGACCAGGATGTCTTAAGAGAGTTCCTTTCTTCCTCAGGGTGGAAACTCCAGTGGAAGAAGGATAAGAAGAATCCGAGGCATTGGTCCCCGTATTTGGAGCGGAGTGACTCTCAACTAGTCTGGAAAAAGAACAAAGCCATGATTTTCAAACTGGTATCAGTTCTGAGAGGATCAAAGCCGAGAGAAGAATATAAGATGGGAAAAGCATCTGACTCCATAGTTTTCAGATACATTCCGAGGAAGGTAAGGGAAGGAGAAGTTCCCCTGTGCTTCCCGATCTCTAAGGTGGCCTCAATGTCGGTATAAGAAAAACGAGACCTTCATCATGGATGATTTAATGGTCTATAGCCTTTGGGCTCTGCTGCAATGGGGTTTGCCTGCGGATACAGCCAGATACATAATCTCACTGAGGATGGAAGAAGACTACTGGGAAGAGATGAATGAACATGAGCAGTGGGACGGGTACGAGTCTTGGGATGATACTGATTGGCAGTATCCGAGTCCTTGAATAAGTCAGTATGTGACAATTTAGAAAAAACGATTACCTTACTGTTGACTTTAAAGAACACTGTTATGTTGTGTTCGCAACACACAACTTCCTT
| 78,475
|
NC_038775.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Lozano,I., Morales,F., Morales,F.J., Martinez,A.K.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2018-08-24
| null |
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,634
|
RefSeq
| null | null | null |
Oryza sativa
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Rice stripe necrosis virus segment RNA1, complete sequence
|
CATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAATAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCTCAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTGAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAAGTTCTTAGGAACATCCTTATTGAGATTGCAGCAATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGCAACTTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAATATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTTCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAACGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTACCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACTACTATCACTTTGATGTTGAATGCATCTGAGAAAGCTATTTTACAACGTGAACTGGGGTATGTGCCATTGTACAAACCTCGAGGCAAACCCCCGCGGGATCACGCTGTACTTGCTGCGTTGCGCGAGGCAATAAGGCAGGATTATGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGGACGTCTATCAAAACTTTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTAAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCACTATCATTTTTCTGCCTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAAATTGCCAATATGGAACGTCAGGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAGAGATGGGGGTTACATTGTTACTAAGAGAGTTGAAAACACCAACTTTGAATATGAACGTGTGGCTTCAGGCGATTTGGAGAACATAGTGGAAATTGCAAAAGGCCTGGCGGCTTCCAAACGCACCAGTAAACAACTTAAAGGAATGCGGGTTAGGCCAGCGCCCGGTGCGCTTTACACTGACTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCCGACCATTTTCTATTTACCAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAAGTCTACACCCAACTTGTTTTTGAAGATGTTGGCTATAATTTTTCCCCCGAGGATTGGTTGGATTGGTTTGCCCGTACCGATGCTAAATTTGGTGTCGGTTATATGGCTTTGCCTATTCAACTAATGTGCGACACGTATCCGCAGTCTGATTACTATAACTATTTTGAGATGGATGCATATAGTTCTCTCCTTGCTGATAGCAAGGGTAAGCTAACCATGCATCCTGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTCGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGTAAGAGAATTTCCATGATGTCTGGTTCTTCGGACAATGGGTATGCCCACTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCTGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAACCTTGTTCGAGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACCCGCGTCGATCGTGCTAGTTTTATTTTCCGCACCATTGCACTGCGTCCTGAAGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTGGCTCGCGCCTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGACCCTTTGCCTTACTTTCCAGTTATGAAGTACGAGTTTGATGTCAGTGTTGCATACGGTGTTGCTATTGCCGAAAGATCGTTGTCGATTCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTTGGTTACTAAGGAGCTTGTGGCGAAATGGAGATTGCCGCTGGGTCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTGTATTATTACACTATGTTCTTACGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGGGAGCTTAATTGGGCGAAGAAACTTCAGGTTGCTGTTTCTAATCTTGCACAAAATATATTGGAACCTGTTTCCTTCTTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAAATGGCTGATCAAATTGTGAAGACTCCCACTCAAAAGGTTTATCAATTCGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTTGGAGACGGTTGGGAGAAACACGCTGAGCTCACTAATTCCTTCCTCGATCCTGGTTGTACCTTACCTGAAGGAATCACCGTTGACGAATGGATGGAAATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTGAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACACATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTCTGACTTCTCCTCTGGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGCTGCGTAACGATGAGGATTTAGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACTAGGTGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGTAATGCGGGTAGTCAAGTTATTGAGTGTCATCACAAACTTGATTCCAGTTACACTTTTGAAATGTCCCAGAAGGAGATAGACGATCTGAGAAACGATATGTTGCAAGAATCAAACCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCAATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTCTGGAGTATATTAAGGGCGTTCCTGGGACTGGAAAATCCTTTCTGATTCGTGCTTTAGCCGATCCTGTTCGCGACCTCGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGCGACTATCAGAATCAAGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTTACGATTTTTGTTGACGAGTTCACAGCTTATGACTGGAGGCTTTTGGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTACCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAAGGTATATCAATTTTGAATAAGTTGAAACCTTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCCGTCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCTGTGTCTGACGTTGTTTCTGGGTTTGTTAACCGTCCACTGTCTGAATTTCAACCACTCGTCTCTGATCCCGAATGTCGTTACAAAATTATTCATTACACGGAGGCGACTGGAAGGGCTCTGCTAGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGGTCTAATCAGGGTTCTACCCATGATTATGTCGCGCTTCCTGTCACCGTTGCCGATGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTGAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAAGAAATGATCATATTTACTGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCTCTTGTCATGCCGCCTGAAGCGGTCCAGGCCTCTGATTATAATTTACGATTGTATTTAGGTCTGGAAACGCCACAAAAAGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTAGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCTCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCATCTGGTGTCATCCCCAGGAGGGTTATTGATGTTGCCAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTGAACACCACTTTTGATGTCATTAAGGCGAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAATTAAGGCCTTTTGTACATGGGCGCGGTCTTCCCGTATGTCAACATGGGACGACTGCATCATGTTCGCTAAGGGGTTACGTGTGGCCATTCAATTGCAGGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTTGGAGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTATGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAACCAGAACCAATTGTCGACATTTTGGATGATAAAAGAATCACATTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAGGAAGTTGAAATTCCCCCAGCTGTGAATCATGATGTTGTACTGCATGACAATGGTTTTTCGGTTCACCCTACTTTGGAAGAACCAGTGTTACACATTGAGACTGCTGAGTCTAGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATCGAGCAGGAACCCGAACAAGTTGAAATTGATCTTAAAGACGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTTTGAAGAATTTGTTACAAAACGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAGTCTTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTTAGAGGGGTTCGTGCCACCACAGTTGACGAATTACCTCAGCGCTTTGTGGATTATGCTACCGAGTTTGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATGTCCATATTCCGGGTACTCAGTACCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCCTATACTCTCCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATACGATCGCGACTATTTTAATCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGACAAATTTGTCACTGGAGTTGTGTCTGGCGATATCATTTCACCATTGAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCACAGTTATATTTCAAGAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAAGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGGAAAGTTTCCATGTTGCCCTCTTTTCAAATGCAAAAAATAGCTAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACTCCGAACATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGACAAAATTGTGGAAAGGGCGCTTGCTGATATGGTCATTAAAAATTATTCTGCCCAAATGGACGTGGAGTACACTGTCAACGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTTAAGGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCCACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTTATGATCGCTTTCCGTGTTTTGAACGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTGGTCTATGACAATGGGATGTCAGAAAAGGAGTTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTCTGTTCCCGGGGTCGCTGTCAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCTTGCGATTCTGGTCAAGGTCCCTTTACCCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTATGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTCCTAGACTGGTATTTCTCTTTTAGAGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTTAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGGGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAATTCCTTTTTAAGAGGGGATGGCCCTTTTTGTATGGCGATCAAGGGTGACGATGGTTTCAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAATAAAGATATTGTCCAAGCTGTTAAGGACTTTACCCCTTTGGAATTTAAATTGGATATTAATGTTCCGCTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGCGCAATGTACCCAAATATTGTTCGCAAGGCGATAAAAATTTCTACGCATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAGTCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTTTGCTTAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGACATGCAACGTGTTTTGGATTCTATCACGTCGGTAGCTTCCATTTCACGTTCCCAATTCGAAGAAGGTTTCCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTCAATGGTCAAGATCGGACTTGTTTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAATGCCAGGGCTGATTTAAATGAGTGAATGTTCTACTCTAATTACGATAATGCAATATTAAATGAATAACCAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTGATACTCTGGGTTTAGTCGACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTGTCTATACACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 4,128
|
OR679036.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Quadros,A.F.F., Rodrigues,L.A., Schurt,D.A., Mello,R.N.
|
Universidade Federal de Vicosa, Bioagro
| null |
2023-11-01
|
BR-RR-2022
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,624
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate BR-RR-2022 segment RNA1, complete sequence
|
CAATCTCACCCGTCATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAATAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCTCAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTGAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAACATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCACTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTACTTGCTGCTTTACGTGAGGCAATAAGGCAGGATTATGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTTTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAGATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAGAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAGAGAGTTGAAAACACCAACTTTGAATATGAACGTGTGGCTTCAGGCGATTTGGAGAACATAGTGGAAATTGCAAAAGGCCTGGCGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCAGCACCCGGTGCGCTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCTGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAGGTCTACACCCAACTTGTTTTCGAAGATGTCGGCTACAATTTTTCTCCTGAAGACTGGTTGGATTGGTTTGCCCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTACATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTCGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGCTCTTCGGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTCGTTCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTCATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTGGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTTATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCGTACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATCCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTTGGTTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGACTGCCGTTGGGTCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGCTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTGTCTAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCCTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGACCAAATTGTAAAAACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTTGGAGACGGTTGGGAGAAGCACGCTGAACTTACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGTTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTCTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGATTCTAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAATCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGTGGCCCTGGGACTGGAAAATCCTTTTTGATTCGTGCTTTAGCTGATCCTGTTCGTGACCTTGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTCACGATTTTTGTTGACGAGTTCACGGCTTATGACTGGAGGCTTTTAGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTGTCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCTGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCTGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCGACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCATGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGATGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTGAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAAGAAATGATCATATTTACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCCGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCGAGGAGGGTTATTGATGTTGCCAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACTACTTTCGATGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAGTTAAGGACTTTTGTGCATGGGCGCGGTCTTCTCGTATGTCAACATGGGATGACTGCATCATGTTTGCTAAGGGGTTGCGTGTGGCTATTCAGTTGAATGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTCGGTGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTACGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAGCCAGAACCAATTGTCGATATTTTGGATGATAAAAGAATCACTCTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAAGAGGTCGAAATTCCCCCAGTTGTGAATCATGATGTTGTATTGCATGACAATGGGTTTTCGGTTCACCCTACATTGGAAGAACCAGTTTTACACATTGAGACTGTTGAATCTGGAGTAACCGAGATTGAAGAAGTGATTGAACAAGAACCTGGACAAGTCGAAATTGATCTTAAAGATGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTCTGAAGAATTTGTTACAGAATGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGGATCCTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTCAGGGGGGTTCGTGCCACTACAGTTGACGAGTTGCCTCAGCGATTTGTAGATTATGCCACCGAGTTCGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATATTCATATTCCGGGTACTCAGTATCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCTTACACTCTTCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATATGATCGCGATTATTTTAACCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGATAAATTCGTCACTGGGGTTGTGTCCGGCGATATCATATCACCATTAAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGCTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCCTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACCCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAAGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAACGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTCTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGACTCTGGTCAAGGTCCCTTCACTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTATGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTTCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAATTCTTTTTTAAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAATAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTGGATTCTATTACGTCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCCCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTGTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCAACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTGTCC
| 11,408
|
OR558326.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Souza,D.D.
|
Universidade Federal de Vicosa, Departamento de Fitopatologia
|
Brazil
|
2023-10-21
|
UFGEm/2020-2
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,621
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Oryza sativa
| null |
2020-03
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate UFGEm/2020-2 segment RNA1, complete sequence
|
CAATCTCACCCGTCATAGACGAAACGAAATCGGACTGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAATAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCTCAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTGAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAACATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCACTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTACTTGCTGCTTTACGTGAGGCAATAAGGCAGGATTATGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGGACTTCTATCAAAACTTTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAGATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAGAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAGAGAGTTGAAAACACCAACTTTGAATATGAACGTGTGGCTTCAGGCGATTTGGAGAACATAGTGGAAATTGCAAAAGGCCTGGCGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGGATGCGGGTTAGGCCAGCACCCGGTGCGCTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCTGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAGGTCTACACCCAACTTGTTTTCGAAGATGTCGGCTACAATTTTTCTCCTGAGGACTGGTTGGATTGGTTTGCCCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTACATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTCGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGCTCTTCGGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTCGTTCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTCATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTGGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTTATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCGTACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATCCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTTGGTTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGACTGCCGTTGGGTCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTGTCTAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCCTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGACCAAATTGTAAAAACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTTGGAGACGGTTGGGAGAAGCACGCTGAACTTACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGTTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTCTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGATTCTAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAATCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGTGGCCCTGGGACTGGAAAATCCTTTTTGATTCGTGCTTTAGCTGATCCTGTTCGTGACCTTGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTCACGATTTTTGTTGACGAGTTCACGGCTTATGACTGGAGGCTTTTAGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAATTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTGTCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCTGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCTGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCGACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCATGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGATGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTGAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAAGAAATGATCATATTTACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCCGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCGAGGAGGGTTATTGATGTTGCCAAGGTTAAAAACGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACTACTTTCGATGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAGTTAAGGACTTTTGTGCATGGGCGCGGTCTTCTCGTATGTCAACATGGGATGACTGCATCATGTTTGCTAAGGGGTTGCGTGTGGCTATTCAGTTGAATGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTCGGTGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTACGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAGCCAGAACCAATTGTCGATATTTTGGATGATAAAAGAATCACTCTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAAGAGGTCGAAATTCCCCCAGTTGTGAATCATGATGTTGTATTGCATGACAATGGGTTTTCGGTTCACCCTACATTGGAAGAACCAGTTTTACACATTGAGACTGTTGAATCTGGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATTGAACAAGAACCTGGACAAGTCGAAATTGATCTTAAAGATGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTCTGAAGAATTTGTTACAGAATGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAATCCTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTCAGGGGGGTTCGTGCCACTACAGTTGACGAGTTGCCTCAGCGATTTGTAGATTATGCCACCGAGTTCGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATATTCATATTCCGGGTACTCAGTATCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCTTACACTCTTCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATATGATCGCGATTATTTTAACCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGATAAATTCGTCACTGGGGTTGTGTCCGGCGATATCATATCACCATTAAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGCTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCCTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACCCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAAGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAACGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTCTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGACTCTGGTCAAGGTCCCTTCACTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTATGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTTCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGGGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAATTCTTTTTTAAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAATAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGGATGATATGCAACGTGTTTTGGATTCTATTACGTCAGTAGCTTCCATCTCACGTTCCCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTGTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCAACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTG
| 11,821
|
MW147222.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Bagayoko,I., Celli,M.G., Romay,G., Poulicard,N., Pinel-Galzi,A., Julian,C., Filloux,D., Roumagnac,P., Sereme,D., Bragard,C., Hebrard,E.
|
CONICET - UFYMA, Instituto de Patologia Vegetal (IPAVE), Centro de Investigaciones Agropecuarias (CIAP), INTA, Phytovirology
|
Argentina
|
2021-05-10
|
Cor18
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,617
|
GenBank
| 1
|
Argentina
|
Argentina
|
Oryza sativa
| null |
2018
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate Cor18 segment RNA 1, complete sequence
|
CATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAATAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCTCAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTGAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAACATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCACTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTACTTGCTGCTTTACGTGAGGCAATAAGGCAGGATTATGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTTTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAGATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAGAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAGAGAGTTGAAAACACCAACTTTGAATATGAACGTGTGGCTTCAGGCGATTTGGAGAACATAGTGGAAATTGCAAAAGGCCTGGCGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCAGCACCCGGTGCGCTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCTGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAGGTCTACACCCAACTTGTTTTCGAAGATGTCGGCTACAATTTTTCTCCTGAGGACTGGTTGGATTGGTTTGCCCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTACATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTCGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGCTCTTCGGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTCGTTCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTCATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTGGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTTATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCGTACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTGTCAATCCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTTGGTTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGACTGCCGTTGGGTCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTGTCTAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCCTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGACCAAATTGTAAAAACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTTGGAGACGGTTGGGAGAAGCACGCTGAACTTACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGTTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTCTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGATTCTAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAATCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGTGGCCCTGGGACTGGAAAATCCTTTTTGATTCGTGCTTTAGCTGATCCTGTTCGTGACCTTGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTCACGATTTTTGTTGACGAGTTCACGGCTTATGACTGGAGGCTTTTACCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTGTCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCTGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCTGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCGACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCATGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGATGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTGAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAAGAAATGATCATATTTACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCCGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCGAGGAGGGTTATTGATGTTGCCAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACTACTTTCGATGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAGTTAAGGACTTTTGTGCATGGGCGCGGTCTTCTCGTATGTCAACATGGGATGACTGCATCATGTTTGCTAAGGGGTTGCGTGTGGCTATTCAGTTGAATGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTCGGTGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTACGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAGCCAGAACCAATTGTCGATATTTTGGATGATAAAAGAATCACTCTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAAGAGGTCGAAATTCCCCCAGTTGTGAATCATGATGTTGTATTGCATGACAATGGGTTTTCGGTTCACCCTACATTGGAAGAACCAGTTTTACACATTGAGACTGTTGAATCTGGAGTGACCGAAATTGAAGAAGTGATTGAACAAGAACCTGGACAAGTCGAAATTGATCTTAAAGATGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTCTGAAGAATTTGTTACAGAATGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAATCCTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTCAGGGGGGTTCGTGCCACTACAGTTGACGAGTTGCCTCAGCGATTTGTAGATTATGCCACCGAGTTCGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATATTCATATTCCGGGTACTCAGTATCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCTTACACTCTTCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATATGATCGCGATTATTTTAACCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGATAAATTCGTCACTGGGGTTGTGTCCGGCGATATCATATCACCATTAAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGCTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCCTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACCCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAAGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCCAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAACGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTCTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGACTCTGGTCAAGGTCCCTTCACTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTATGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTTCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACTTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAATTCTTTTTTAAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAATAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTGGATTCTATTACGTCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCCCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGATCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTGTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCAACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTGTCTCAAAAA
| 42,187
|
MW187592.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Bagayoko,I., Celli,M.G., Romay,G., Poulicard,N., Pinel-Galzi,A., Julian,C., Filloux,D., Roumagnac,P., Sereme,D., Bragard,C., Hebrard,E., Tucker,M., Conteh,A.B.
|
IRD, UMR IPME
|
France
|
2021-05-10
|
SL254
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,571
|
GenBank
| 1
|
Sierra Leone
|
Sierra Leone
|
Oryza sativa
| null |
2019
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate SL254 segment RNA1, complete sequence
|
TAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAATAATTTCTCCCCTGATGCCATGGAAGCTATTGCCTACGGCATGACTTGCTATGCTCAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTGAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAAGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAATATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAAACGCTTATTTAGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAACGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTTAAAGCCTCTACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCACTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTACTTGCTGCTTTGCGTGAGGCAATAAGGCAGGATTATGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTTTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGAAATGGATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAAATTGCAAATATGGAACGTCAAGAGAAGGAACTTATGCGCGCGCTTAGAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAGAGAGTTGAAAACACCAACTTTGAATATGAACGCGTGGCTTCAGGCGATTTGGAGAACATAGTGGAAATTGCAAAAAGCCTGGCGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTTAAAGGAATGCGGGTTAGGCCAGCGCCCGGTGCACTTTACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCCGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTCACAGGACAGGTCTACACCCAACTTGTTTTCGAAGATGTCGGCTACAATTTTTCTCCTGAGGATTGGTTGGATTGGTTTGCCCGTACTGACGCTAAATTTGGTGTCGGTTATATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGCGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTTGAAATGGATGCGTACAGTTCCCTCCTTGCCGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGGGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGTTCTTCGGACAATGGATACGCTCATTTAAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCCTTTTCTCTTGAGGTCAATCTTGTTCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTTATTTTTTGCACTATTGCGTTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTAGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAAGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTTATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCATACGGTGTCGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATTCAAAACGTTGGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTTGTTTACCAAGGACCTTGTGCCGAAATGGAGACTGCCGTTGGGTCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTTTCTAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCCTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGATCAAATTGTAAAAACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTTGGAGACGGTTGGGAGAAGCACGCTGAACTCACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGTTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGATGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACACATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGTATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTTTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACTAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGATTCCAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGATATGTTGCAAGAATCGAATCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGCGGCCCTGGGACTGGAAAATCCTTTTTGATTCGTGCTTTAGCTGATCCTGTTCGTGACCTCGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTTACGATTTTTGTTGACGAGTTCACAGCTTATGACTGGAGGCTTTTGGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCTTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCCGTCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCTGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCTGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTACACGGAGGCGACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCATGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGATGCCCCATTGCTTCGGAATGAACAGTTAAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAGGAAATGATCATATTTACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCTGATTATAATTTGCGGTTATATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAAGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTATAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAACGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCTAGGAGGGTTATTGATGTTGCCAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAACACCACTTTTGACGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAGTTAAGGACTTTTGTGCATGGGCGCGGTCTTCTCGTATGTCAACATGGGATGACTGCATCATGTTTGCTAAGGGGTTGCGTGTGGCTATTCAGTTGAATGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTCGGTGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTACGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAGCCAGAACCAATTGTCGACATTTTGGATGATAAAAGAATCACGTTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAAGAGGTCGAAATTTCCCCAGTTGTGAATCATGATGTTGTGTTGCATGACAATGGGTTTTCGGTTCACCCTACATTGGAAGAACCAGTCTTACATATTGAGACTGTTAAATCTGGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATTGAACAAGAACCTGGACAAGTTGAAATTGATCTTAAAGATGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCCCACGATTCTCTGAAGAATTTGTTACAGTATGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAGTCCTTTGAGGGTATTTATGGTGGAAAACGCAAGGAACCAGTCAGGGGGGTTCGTGCCACTACAGTTGACGAGTTGCCTCAGCGATTTGTAGATTATGCCACCGAGTTCGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCGAATATTCATATTCCGGGTACTCAGTATCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCTTACACTCTTCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATACGATCGCGATTATTTTAACCAGGCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGACAAATTCGTCACTGGGGTTGTGTCCGGCGATATCGTGTCACCATTGAATTTAAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGTTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCTTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACTCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTAGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATATACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAGGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAATGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTCTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGATTCTGGTCAAGGTCCCTTCACTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTATGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTCCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGAGAACATTACATTATGCAATCTAAGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTGTTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAATTCTTTTTTAAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAATAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCTATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTGGATTCTATTACGTCAGTAGCTTCTATTTCACGTTCTCAATTTGAAGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTAGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATCTGAACGAGTGAGTGTTCGGTTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCAACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATA
| 42,188
|
MW117944.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Bagayoko,I., Celli,M.G., Romay,G., Poulicard,N., Pinel-Galzi,A., Julian,C., Filloux,D., Roumagnac,P., Sereme,D., Bragard,C., Hebrard,E., Giovanni Celli,M., Mahillon,M., Decroes,A., Legreve,A.
|
UCLouvain, ELIM
|
Belgium
|
2021-05-09
|
BF01Bama
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,617
|
GenBank
| 1
|
Burkina Faso
|
Burkina Faso
|
Oryza sativa
| null |
2016-01-01
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate BF01Bama segment RNA1, complete sequence
|
CATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTCACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAACAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCACAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTAAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAATATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCGCTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTCTTTGCTGCTCTGCGTGAGGCAATAAGGCAGGATTACGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTCTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAAATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAAAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAATGGGTTGAAAACTCCAACTTTGAATATGAACCCCTGGCTTCAGGCCATTTGGAAAACATAATGGAAATTGCAAAAAGCCTGGGGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCACCACCCGGTGCGTTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCCGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAAGTCTACACCCAACTTGTTTTTGAAGATGTTGGCTATAATTTTTCCCCCGAGGATTGGTTGGATTGGTTTGCTCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTATATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTTGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGTTCTTCAGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTTGTCCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTTATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTAGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTCATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCATACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATTCAAAACTATTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTGGGTTACTAAGGAGCTTGTGGCGAAATGGAGATTGCCGTTGGGCCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTTTCCAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCTTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGATCAAATTGCAAATACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTCGGAGACGGTTGGGAGAAGCATGCTGAACTCACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGCTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTTTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGACTCCAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAACCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGCGGCCCTGGGACTGGAAAATCTTTTTTGATTCGTGCTTTAGCCGATCCTGTTCGTGACCTCGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTTACGATTTTTGTTGACGAGTTCACAGCTTATGACTGGAGGCTTTTGGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTATCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCCGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCCGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCAACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCACGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGACGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTAAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAGGAAATGATCATATTCACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCTGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCTAGGAGGGTTATTGATGTCGCTAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACCACTTTCGACGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAATTAAGGCCTTTTGTACATGGGCGCGGTCTTCCCGTATGTCAACATGGGACGACTGCATCATGTTCGCTAAGGGGTTACGTGTGGCCATTCGATTGCAGGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTTGGAGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTATGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAACCAGAACCAATTGTCGACATTTTGGATGATAAAAGAATCACATTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAGGAAGTTGAAATTCCCCCAGCTGTGAATCATGATGTTGTACTGCATGACAATGGTTTTTCGGTTCACCCTACTTTGGAAGAACCAGTGTTACACATTGAGACTGCTGAGTCTAGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATCGAGCAGGAACCCGAACAAGTTGAAATTGATCTTAAAGACGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTTTGAAGAATTTGTTACAAAACGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAGTCTTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTTAGAGGGGTTCGTGCCACCACAGTTGACGAATTACCTCAGCGCTTTGTGGATTATGCTACCGAGTTTGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATGTCCATATTCCGGGTACTCAGTACCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCCTATACTCTCCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATACGATCGCGACTATTTTAATCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGACAAATTTGTCACTGGAGTTGTGTCTGGCGATATCATTTCACCATTGAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGTTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCTTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACTCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAGGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAATGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTTTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGATTCTGGTCAAGGTCCCTTCATTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTACGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTCCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAACTCCTTTTTGAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAACAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTAGATTCTATTACATCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCTCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTCTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCGACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTGTCTATATAC
| 42,220
|
MW117945.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Bagayoko,I., Celli,M.G., Romay,G., Poulicard,N., Pinel-Galzi,A., Julian,C., Filloux,D., Roumagnac,P., Sereme,D., Bragard,C., Hebrard,E., Giovanni Celli,M., Mahillon,M., Decroes,A., Legreve,A.
|
UCLouvain, ELIM
|
Belgium
|
2021-05-09
|
BF02Bama
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,617
|
GenBank
| 1
|
Burkina Faso
|
Burkina Faso
|
Oryza sativa
| null |
2016-01-01
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate BF02Bama segment RNA1, complete sequence
|
CATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTCACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAACAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCACAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTAAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAATATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCGCTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTCTTTGCTGCTCTGCGTGAGGCAATAAGGCAGGATTACGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTCTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAAATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAAAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAAAGGGTTGAAAACTCCAACTTTGAATATGAACCCCTGGCTTCAGGCCATTTGGAAAACATAATGGAAATTGCAAAAAGCCTAGGGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCACCACCCGGTGCGTTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCCGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAAGTCTACACCCAACTTGTTTTTGAAGATGTTGGCTATAATTTTTCCCCCGAGGATTGGTTGGATTGGTTTGCTCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTATATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTTGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGTATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGTTCTTCAGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTTGTCCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTTATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTAGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTCATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCATACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATTCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTGTGGCTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGATTGCCGTTGGGCCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTTTCCAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCTTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGATCAAATTGCAAATACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTCGGAGACGGTTGGGAGAAGCATGCTGAACTCACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGCTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCACTTTGCAGGCTATGGCTTCAATACCTCTTAACGCTTTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGACTCCAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAACCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGCGGCCCTGGGACTGGAAAATCTTTTTTGATTCGTGCTTTAGCCGATCCTGTTCGTGACCTCGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTTACGATTTTTGTTGACGAGTTCACAGCTTATGACTGGAGGCTTTTGGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTATCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCCGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCCGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCAACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCACGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGACGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTAAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAGGAAATGATCATATTCACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCTGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCTAGGAGGGTTATTGATGTCGCTAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACCACTTTCGACGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAATTAAGGCCTTTTGTACATGGGCGCGGTCTTCCCGTATGTCAACATGGGACGACTGCATCATGTTCGCTAAGGGGTTACGTGTGGCCATTCGATTGCAGGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTTGGAGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTATGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAACCAGAACCAATTGTCGACATTTTGGATGATAAAAGAATCACATTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAGGAAGTTGAAATTCCCCCAGCTGTGAATCATGATGTTGTACTGCATGACAATGGTTTTTCGGTTCACCCTACTTTGGAAGAACCAGTGTTACACATTGAGACTGCTGAGTCTAGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATCGAGCAGGAACCCGAACAAGTTGAAATTGATCTTAAAGACGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTTTGAAGAATTTGTTACAAAACGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAGTCTTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTTAGAGGGGTTCGTGCCACCACAGTTGACGAATTACCTCAGCGCTTTGTGGATTATGCTACCGAGTTTGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATGTCCATATTCCGGGTACTCAGTACCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCCTATACTCTCCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATACGATCGCGACTATTTTAATCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGACAAATTTGTCACTGGAGTTGTGTCTGGCGATATCATTTCACCATTGAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGTTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCTTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACTCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAGGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAATGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTTTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGATTCTGGTCAAGGTCCCTTCATTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTACGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTCCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAACTCCTTTTTGAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAACAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTAGATTCTATTACATCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCTCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTCTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCGACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTGTCTATATAC
| 42,221
|
MW117946.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Bagayoko,I., Celli,M.G., Romay,G., Poulicard,N., Pinel-Galzi,A., Julian,C., Filloux,D., Roumagnac,P., Sereme,D., Bragard,C., Hebrard,E., Giovanni Celli,M., Mahillon,M., Decroes,A., Legreve,A.
|
UCLouvain, ELIM
|
Belgium
|
2021-05-09
|
BF03Bama
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,617
|
GenBank
| 1
|
Burkina Faso
|
Burkina Faso
|
Oryza sativa
| null |
2016-01-01
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate BF03Bama segment RNA1, complete sequence
|
CATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTCACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAACAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCACAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTAAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAATATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCGCTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTCTTTGCTGCTCTGCGTGAGGCAATAAGGCAGGATTACGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTCTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAAATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAAAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAAAGGGTTGAAAACTCCAACTTTGAATATGAACCCCTGGCTTCAGGCCATTTGGAAAACATAATGGAAATTGCAAAAAGCCTAGGGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCACCACCCGGTGCGTTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCCGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAAGTCTACACCCAACTTGTTTTTGAAGATGTTGGCTATAATTTTTCCCCCGAGGATTGGTTGGATTGGTTTGCTCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTATATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTTGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGTTCTTCAGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTTGTCCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTTATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTAGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTCATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCATACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATTCAAAACTATTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTGTGGTTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGATTGCCGTTGGGCCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTTTCCAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCTTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGATCAAATTGCAAATACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTCGGAGACGGTTGGGAGAAGCATGCTGAACTCACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGCTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATCCCTCTTAACGCTTTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGACTCCAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAACCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGCGGCCCTGGGACTGGAAAATCTTTTTTGATTCGTGCTTTAGCCGATCCTGTTCGTGACCTCGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTTACGATTTTTGTTGACGAGTTCACAGCTTATGACTGGAGGCTTTTGGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTATCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCCGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCCGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCAACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCACGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGACGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTAAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAGGAAATGATCATATTCACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCTGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCTAGGAGGGTTATTGATGTCGCTAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACCACTTTCGACGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAATTAAGGCCTTTTGTACATGGGCGCGGTCTTCCCGTATGTCAACATGGGACGACTGCATCATGTTCGCTAAGGGGTTACGTGTGGCCATTCGATTGCAGGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTTGGAGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTATGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAACCAGAACCAATTGTCGACATTTTGGATGATAAAAGAATCACATTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAGGAAGTTGAAATTCCCCCAGCTGTGAATCATGATGTTGTACTGCATGACAATGGTTTTTCGGTTCACCCTACTTTGGAAGAACCAGTGTTACACATTGAGACTGCTGAGTCTAGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATCGAGCAGGAACCCGAACAAGTTGAAATTGATCTTAAAGACGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTTTGAAGAATTTGTTACAAAACGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAGTCTTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTTAGAGGGGTTCGTGCCACCACAGTTGACGAATTACCTCAGCGCTTTGTGGATTATGCTACCGAGTTTGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATGTCCATATTCCGGGTACTCAGTACCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCCTATACTCTCCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATACGATCGCGACTATTTTAATCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGACAAATTTGTCACTGGAGTTGTGTCTGGCGATATCATTTCACCATTGAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGTTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCTTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACTCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAGGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAATGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTTTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGATTCTGGTCAAGGTCCCTTCATTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTACGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTCCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAACTCCTTTTTGAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAACAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTAGATTCTATTACATCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCTCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTCTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCGACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTGTCTATATAC
| 42,222
|
MW117947.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Bagayoko,I., Celli,M.G., Romay,G., Poulicard,N., Pinel-Galzi,A., Julian,C., Filloux,D., Roumagnac,P., Sereme,D., Bragard,C., Hebrard,E., Giovanni Celli,M., Mahillon,M., Decroes,A., Legreve,A.
|
UCLouvain, ELIM
|
Belgium
|
2021-05-09
|
ML02San
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,617
|
GenBank
| 1
|
Mali
|
Mali
|
Oryza sativa
| null |
2016-01-06
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate ML02San segment RNA1, complete sequence
|
CATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTGAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAACAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCACAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTAAATATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGGAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAATATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCGCTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTCTTTGCTGCTCTGCGTGAGGCAATAAGGCAGGATTACGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTCTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAAATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAAAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAAAGGGTTGAAAACTCCAACTTTGAATATGAACCCCTGGCTTCAGGCCATTTGGAAAACATAATGGAAATTGCAAAAAGCCTGGGGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCACCACCCGGTGCGTTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCCGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAAGTCTACACCCAACTTGTTTTTGAAGATGTTGGCTATAATTTTTCCCCCGAGGATTGGTTGGATTGGTTTGCTCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTATATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTTGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGTTCTTCAGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTTGTCCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTTATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTAGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTCATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCATACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATTCAAAACTCTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTGTGGTTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGATTGCCGTTGGGCCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTTTCCAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCTTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGATCAAATTGTAAAAACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTCGGAGACGGTTGGGAGAAGCATGCTGAACTCACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGCTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCACTTTGCAGGCTATGGCTTCAATCCCTCTTAACGCTTTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGACTCCAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAACCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGCGGCCCTGGGACTGGAAAATCTTTTTTGATTCGTGCTTTAGCCGATCCTGTTCGTGACCTCGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTTACGATTTTTGTTGACGAGTTCACAGCTTATGACTGGAGGCTTTTGGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTATCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCCGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCCGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCAACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCACGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGACGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTAAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAGGAAATGATCATATTCACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCTGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCTAGGAGGGTTATTGATGTCGCTAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACCACTTTCGACGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAATTAAGGCCTTTTGTACATGGGCGCGGTCTTCCCGTATGTCAACATGGGACGACTGCATCATGTTCGCTAAGGGGTTACGTGTGGCCATTCGATTGCAGGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTTGGAGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTATGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAACCAGAACCAATTGTCGACATTTTGGATGATAAAAGAATCACATTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAGGAAGTTGAAATTCCCCCAGCTGTGAATCATGATGTTGTACTGCATGACAATGGTTTTTCGGTTCACCCTACTTTGGAAGAACCAGTGTTACACATTGAGACTGCTGAGTCTAGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATCGAGCAGGAACCCGAACAAGTTGAAATTGATCTTAAAGACGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTTTGAAGAATTTGTTACAAAACGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAGTCTTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTTAGAGGGGTTCGTGCCACCACAGTTGACGAATTACCTCAGCGCTTTGTGGATTATGCTACCGAGTTTGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATGTCCATATTCCGGGTACTCAGTACCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCCTATACTCTCCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATACGATCGCGACTATTTTAATCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGACAAATTTGTCACTGGAGTTGTGTCTGGCGATATCATTTCACCATTGAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGTTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCTTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACTCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAGGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAATGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTTTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGATTCTGGTCAAGGTCCCTTCATTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTACGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTCCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAACTCCTTTTTGAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAACAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTAGATTCTATTACATCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCTCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTCTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCGACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTGTCTATACAC
| 42,223
|
MW117948.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Bagayoko,I., Celli,M.G., Romay,G., Poulicard,N., Pinel-Galzi,A., Julian,C., Filloux,D., Roumagnac,P., Sereme,D., Bragard,C., Hebrard,E., Giovanni Celli,M., Mahillon,M., Decroes,A., Legreve,A.
|
UCLouvain, ELIM
|
Belgium
|
2021-05-09
|
ML01San
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,617
|
GenBank
| 1
|
Mali
|
Mali
|
Oryza sativa
| null |
2016-01-06
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate ML01San segment RNA1, complete sequence
|
CATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAACAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCACAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTAAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGGAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAATATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCGCTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTCTTTGCTGCTCTGCGTGAGGCAATAAGGCAGGATTACGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTCTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAAATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAAAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAAAGGGTTGAAAACTCCAACTTTGAATATGAACCCCTGGCTTCAGGCCATTTGGAAAACATAATGGAAATTGCAAAAAGCCTGGGGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCACCACCCGGTGCGTTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCCGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAAGTCTACACCCAACTTGTTTTTGAAGATGTTGGCTATAATTTTTCCCCCGAGGATTGGTTGGATTGGTTTGCTCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTATATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTTGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGTTCTTCAGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTTGTCCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTTATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTAGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTCATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCATACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATTCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTCTGGTTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGATTGCCGTTGGGCCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTTTCCAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCTTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGATCAAATTGTAAAAACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTCGGAGACGGTTGGGAGAAGCATGCTGAACTCACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGCTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCACTTTGCAGGCTATGGCTTCAATCCCTCTTAACGCTTTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGACTCCAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAACCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGCGGCCCTGGGACTGGAAAATCTTTTTTGATTCGTGCTTTAGCCGATCCTGTTCGTGACCTCGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTTACGATTTTTGTTGACGAGTTCACAGCTTATGACTGGAGGCTTTTGGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTATCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCCGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCCGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCAACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCACGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGACGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTAAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAGGAAATGATCATATTCACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCTGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCTAGGAGGGTTATTGATGTCGCTAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACCACTTTCGACGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAATTAAGGCCTTTTGTACATGGGCGCGGTCTTCCCGTATGTCAACATGGGACGACTGCATCATGTTCGCTAAGGGGTTACGTGTGGCCATTCGATTGCAGGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTTGGAGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTATGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAACCAGAACCAATTGTCGACATTTTGGATGATAAAAGAATCACATTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAGGAAGTTGAAATTCCCCCAGCTGTGAATCATGATGTTGTACTGCATGACAATGGTTTTTCGGTTCACCCTACTTTGGAAGAACCAGTGTTACACATTGAGACTGCTGAGTCTAGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATCGAGCAGGAACCCGAACAAGTTGAAATTGATCTTAAAGACGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTTTGAAGAATTTGTTACAAAACGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAGTCTTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTTAGAGGGGTTCGTGCCACCACAGTTGACGAATTACCTCAGCGCTTTGTGGATTATGCTACCGAGTTTGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATGTCCATATTCCGGGTACTCAGTACCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCCTATACTCTCCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATACGATCGCGACTATTTTAATCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGACAAATTTGTCACTGGAGTTGTGTCTGGCGATATCATTTCACCATTGAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGTTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCTTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACTCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAGGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAATGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTTTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGATTCTGGTCAAGGTCCCTTCATTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTACGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTCCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAACTCCTTTTTGAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAACAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTAGATTCTATTACATCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCTCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTCTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCGACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTGTCTATACAC
| 42,224
|
MT507288.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Souza,D.D., Dianese,E.C., Mello,R.N., Coelho,A.S.G.
|
Universidade Federal de Goias, Setor de Fitossanidade
| null |
2020-10-19
|
UFGEm/2020-1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,621
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Oryza sativa
| null |
2020-01
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate UFGEm/2020-1 segment RNA1, complete sequence
|
CAATCTCACCCGTCATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAATAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCTCAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTGAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAACATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCACTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTACTTGCTGCTTTACGTGAGGCAATAAGGCAGGATTATGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTTTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAGATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAGAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAGAGAGTTGAAAACACCAACTTTGAATATGAACGTGTGGCTTCAGGCGATTTGGAGAACATAGTGGAAATTGCAAAAGGCCTGGCGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCAGCACCCGGTGCGCTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCTGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAGGTCTACACCCAACTTGTTTTCGAAGATGTCGGCTACAATTTTTCTCCTGAGGACTGGTTGGATTGGTTTGCCCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTACATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTCGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGCTCTTCGGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTCGTTCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTCATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTGGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTTATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCGTACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATCCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTTGGTTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGACTGCCGTTGGGTCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCGAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTGTCTAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCCTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGACCAAATTGTTAAAACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTTGGAGACGGTTGGGAGAAGCACGCTGAACTTACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGTTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTCTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGATTCTAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAATCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGTGGCCCTGGGACTGGAAAATCCTTTTTGATTCGTGCTTTAGCTGATCCTGTTCGTGACCTTGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTCACGATTTTTGTTGACGAGTTCACGGCTTATGACTGGAGGCTTTTAGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTGTCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCTGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCTGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCGACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCATGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGATGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTGAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAAGAAATGATCATATTTACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCCGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCGAGGAGGGTTATTGATGTTGCCAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACTACTTTCGATGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAGTTAAGGACTTTTGTGCATGGGCGCGGTCTTCTCGTATGTCAACATGGGATGACTGCATCATGTTTGCTAAGGGGTTGCGTGTGGCTATTCAGTTGAATGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTCGGTGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTACGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAGCCAGAACCAATTGTCGATATTTTGGATGATAAAAGAATCACTCTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAAGAGGTCGAAATTCCCCCAGTTGTGAATCATGATGTTGTATTGCATGACAATGGGTTTTCGGTTCACCCTACATTGGAAGAACCAGTTTTACACATTGAGACTGTTGAATCTGGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATTGAACAAGAACCTGGACAAGTCGAAATTGATCTTAAAGATGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTCTGAAGAATTTGTTACAGAATGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAATCCTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTCAGGGGGTTTCGTGCCACTACAGTTGACGAGTTGCCTCAGCGATTTGTAGATTATGCCACCGAGTTCGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATATTCATATTCCGGGTACTCAGTATCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCTTACACTCTTCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATATGATCGCGATTATTTTAACCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGATAAATTCGTCACTGGGGTTGTGTCCGGCGATATCATATCACCATTAAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGCTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCCTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACCCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAAGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAACGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTCTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGACTCTGGTCAAGGTCCCTTCACTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTATGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTTCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAATTCTTTTTTAAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAATAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATTAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTGGATTCTATTACGTCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCCCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTGTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCAACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGT
| 46,360
|
MT270127.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Pereira,F.S., Stempkowski,L.A., Lau,D., Mattos,L., Mar,T.B., Nascimento,S.C., Casa,R.T., Silva,F.N.
|
Universidade do Estado de Santa Catarina, Agronomy
|
Brazil
|
2020-09-26
|
BR:LE01:19
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,620
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Oryza sativa
| null |
2019
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate BR:LE01:19 segment RNA 1, complete sequence
|
CATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCCTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAATAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCTCAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTGAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTTCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAACATAGCAGTGTCATGTCAATCGTTTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCACTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTACTTGCTGCTTTACGTGAGGCAATAAGGCAGGATTATGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTTTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAGATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAGAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAGAGAGTTGAAAACACCAACTTTGAATATGAACGTGTGGCTTCAGGCGATTTGGAGAACATAGTGGAAATTGCAAAAGGCCTGGCGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCAGCACCCGGTGCGCTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCTGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAGGTCTACACCCAACTTGTTTTCGAAGATGTCGGCTACAATTTTTCTCCTGAGGACTGGTTGGATTGGTTTGCCCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTACATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTCGAAATGGATGCATATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGCTCTTCGGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTCGTTCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTCATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTGGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTTATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCGTACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATCCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTTGGTTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGACTGCCGTTGGGTCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTGTCTAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCCTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGACCAAATTGTAAAAACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTTGGAGACGGTTGGGAGAAGCACGCTGAACTTACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGTTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTCTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGATTCTAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAATCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGTGGCCCTGGGACTGGAAAATCCTTTTTGATTCGTGCTTTAGCTGATCCTGTTCGTGACCTTGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTCACGATTTTTGTTGACGAGTTCACGGCTTATGACTGGAGGCTTTTAGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTGTCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCTGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCTGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCGACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCATGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGATGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTGAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAAGAAATGATCATATTTACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCCGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCGAGGAGGGTTATTGATGTTGCCAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACTACTTTCGATGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAGTTAAGGACTTTTGTGCATGGGCGCGGTCTTCTCGTATGTCAACATGGGATGACTGCATCATGTTTGCTAAGGGGTTGCGTGTGGCTATTCAGTTGAATGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTCGGTGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTACGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAGCCAGAACCAATTGTCGATATTTTGGATGATAAAAGAATCACTCTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAAGAGGTCGAAATTCCCCCAGTTGTGAATCATGATGTTGTATTGCATGACAATGGGTTTTCGGTTCATCCTACATTGGAAGAACCAGTTTTACACATTGAGACTGTTGAATCTGGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATTGAACAAGAACCTGGACAAGTCGAAATTGATCTTAAAGATGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTCTGAAGAATTTGTTACAGAATGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAATCCTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTCAGGGGGGTTCGTGCCACTACAGTTGACGAGTTGCCTCAGCGATTTGTAGATTATGCCACCGAGTTCGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATATTCATATTCCGGGTACTCAGTATCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCTTACACTCTTCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATATGATCGCGATTATTTTAACCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGATAAATTCGTCACTGGGGTTGTGTCCGGCGATATCATATCACCATTAAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGCTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCCTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACCCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAAGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAACGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTCTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGACTCTGGTCAAGGTCCCTTCACTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTATGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTTCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAATTCTTTTTTAAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAATAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTGGATTCTATTACGTCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCCCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTGTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCAACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTATAGACACACAAA
| 46,888
|
MT270129.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Pereira,F.S., Stempkowski,L.A., Lau,D., Mattos,L., Mar,T.B., Nascimento,S.C., Casa,R.T., Silva,F.N.
|
Universidade do Estado de Santa Catarina, Agronomy
|
Brazil
|
2020-09-26
|
BR:TT01:19
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,620
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Oryza sativa
| null |
2019
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate BR:TT01:19 segment RNA 1, complete sequence
|
CATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCCTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAATAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCTCAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTGAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAACATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCACTGTATAAACCTCGAGGTAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTACTTGCTGCTTTACGTGAGGCAATAAGGCAGGATTATGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTTTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAGATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAGAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAGAGAGTTGAAAACACCAACTTTGAATATGAACGTGTGGCTTCAGGCGATTTGGAGAACATAGTGGAAATTGCAAAAGGCCTGGCGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCAGCACCCGGTGCGCTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCTGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAGGTCTACACCCAACTTGTTTTCGAAGATGTCGGCTACAATTTTTCTCCTGAGGACTGGTTGGATTGGTTTGCCCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTACATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTCGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGCTCTTCGGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTCGTTCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTCATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTGGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTTATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCGTACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATCCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTTGGTTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGACTGCCGTTGGGTCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTGTCTAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCCTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGACCAAATTGTAAAAACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTTGGAGACGGTTGGGAGAAGCACGCTGAACTTACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGTTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTCTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGATTCTAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAATCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGTGGCCCTGGGACTGGAAAATCCTTTTTGATTCGTGCTTTAGCTGATCCTGTTCGTGACCTTGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTCACGATTTTTGTTGACGAGTTCACGGCTTATGACTGGAGGCTTTTAGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTGTCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCTGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCTGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCGACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCATGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGATGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTGAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAAGAAATGATCATATTTACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCCGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCGAGGAGGGTTATTGATGTTGCCAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACTACTTTCGATGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAGTTAAGGACTTTTGTGCATGGGCGCGGTCTTCTCGTATGTCAACATGGGATGACTGCATCATGTTTGCTAAGGGGTTGCGTGTGGCTATTCAGTTGAATGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTCGGTGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTACGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAGCCAGAACCAATTGTCGATATTTTGGATGATAAAAGAATCACTCTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAAGAGGTCGAAATTCCCCCAGTTGTGAATCATGATGTTGTATTGCATGACAATGGGTTTTCGGTTCACCCTACATTGGAAGAACCAGTTTTACACATTGAGACTGTTGAATCTGGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATTGAACAAGAACCTGGACAAGTCGAAATTGATCTTAAAGATGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTCTGAAGAATTTGTTACAGAATGAATATTCCGACCAGTTCGTTAATTGGGTATGTTTCTCTGAATCCTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTCAGGGGGGTTCGTGCCACTACAGTTGACGAGTTGCCTCAGCGATTTGTAGATTATGCCACCGAGTTCGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATATTCATATTCCGGGTACTCAGTATCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCTTACACTCTTCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATATGATCGCGATTATTTTAACCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGATAAATTCGTCACTGGGGTTGTGTCTGGCGATATCATATCACCATTAAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGCTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCCTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACCCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAAGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAACGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTCTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGACTCTGGTCAAGGTCCCTTCACTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTATGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTTCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAATTCTTTTTTAAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAATAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTGGATTCTATTACGTCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCCCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTGTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCAACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTATAGACACACAAA
| 46,889
|
MT027255.1
|
Rice stripe necrosis virus
|
Queiroz,A.P., Carvalho,R.C.P., Santos,F.M.B., Reis,L.N.A., Melo,F.L., Silva,L.A., Alves,G.B., Campos,F.S., Ribeiro,B.M., Aguiar,R.W.S.
|
Federal University of Tocantins, Graduate Program in Plant Production
|
Brazil
|
2020-05-02
|
UFT/2019
|
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 7,021
|
GenBank
| null |
Brazil: Tocantins state
|
Brazil
|
Oryza sativa
| null |
2019-01
| null | null |
Rice stripe necrosis virus isolate UFT/2019 segment RNA 1, complete sequence
|
ACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCACAATCTCACCCGTCATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAATAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCTCAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTGAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAGGTTCTTAGGAACATCCTCATTGAGATTGCAGCGATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGTAACCTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAACATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTCCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAATGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTATCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACCACTATCACTTTGATGTTAAATGCATCTGAGAAAGCTATTCTGCAACGTGAGCTGGGGTATGTGCCACTGTATAAACCTCGAGGCAAGCCCCCGCGAGATCACGCTGTACTTGCTGCTTTACGTGAGGCAATAAGGCAGGATTATGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGAACTTCTATCAAAACTTTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTTAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCATTATCATTTTTCTGCTTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAGATTGCCAATATGGAACGTCAAGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAGAGATGGGGGTTATATTGTTACCAAGAGAGTTGAAAACACCAACTTTGAATATGAACGTGTGGCTTCAGGCGATTTGGAGAACATAGTGGAAATTGCAAAAGGCCTGGCGGCTTCCAAACGCACCAGCAAACAACTCAAAGGAATGCGGGTTAGGCCAGCACCCGGTGCGCTATACACTGATTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCTGACCATTTTCTGTTTACTAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAGGTCTACACCCAACTTGTTTTCGAAGATGTCGGCTACAATTTTTCTCCTGAGGACTGGTTGGATTGGTTTGCCCGTACTGACGCCAAATTTGGTGTCGGTTACATGGCTTTGCCTATTCAACTGATGTGTGACACGTATCCCCAGTCTGATTATTATAATTATTTCGAAATGGATGCGTATAGTTCCCTCCTTGCTGATAAGAAGGGTAAGCTAACTATGCATCCCGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTTGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGCAAAAGGATTTCCATGATGTCTGGCTCTTCGGACAATGGATACGCTCATTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCGGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAATCTCGTTCGTGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACTCGCGTCGATCGCGCTAGTTTCATTTTCCGCACTATTGCATTGCGCCCTGAGGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTGGCTCGTGCTTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGATCCCTTGCCTTATTTTCCAGTTATGAAATATGAGTTTGATGTCAGTGTTGCGTACGGTGTTGCTATTGCTGAAAGATCGTTATCAATCCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTTGGTTACTAAGGAACTTGTGGCGAAATGGAGACTGCCGTTGGGTCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTATATTATTACACTATGTTCTTGCGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGAGAGCTTAATTGGGCGAAGAAGCTTCAGGTTGCTGTGTCTAATCTTGCACAAAATATATTAGAACCTGTTTCCTTTCTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAGATGGCTGACCAAATTGTAAAAACTCCCAGTCAAAAGGTTTATCAGTTTGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTTGGAGACGGTTGGGAGAAGCACGCTGAACTTACTAATTCCTTCCTTGATCCTGGTTGTACTTTACCTGAAGGAATTACCGTTGACGAATGGATGGAGATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTAAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACATATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTCTGACTTCTCCTCTAGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGTTACGTAATGATGAGGATTTGGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACCAGATGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGGAATGCGGGTAGTCAGGTTATTGAGTGCCATCACAAACTTGATTCTAGTTATACTTTTGAGATGTCCCAGAAGGAAATAGATGATCTGAGAAACGACATGTTGCAAGAATCGAATCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCGATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTTTGGAGTATATTAAGGGTGGCCCTGGGACTGGAAAATCCTTTTTGATTCGTGCTTTAGCTGATCCTGTTCGTGACCTTGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGTGACTATCAGAATCAGGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTCACGATTTTTGTTGACGAGTTCACGGCTTATGACTGGAGGCTTTTAGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTATCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAGGGTATATCAATTTTGACTAAGTTGAAACCCTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCTGTCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCCGTGTCTGATGTTGTTTCTGGGTTTGTTAATCGTCCGCTGTCTGAATTTCAGCCACTCGTCTCTGATCCTGAGTGTCGTTACAAAATTATTCATTATACGGAGGCGACTGGAAGGGCTCTGCTGGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGATCTAATCAGGGTTCTACCCATGATTATGTTGCGCTTCCTGTTACCGTTGCCGATGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTGAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAAGAAATGATCATATTTACCGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCCCTTGTCATGCCACCTGAAGCGGTCCAGGCCTCCGATTATAATTTGCGGTTGTATTTGGGTCTGGAAACGCCACAAAAGGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTCGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCCCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCGTCTGGTGTTATTCCGAGGAGGGTTATTGATGTTGCCAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTAAATACTACTTTCGATGTCATCAAGGCAAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAGTTAAGGACTTTTGTGCATGGGCGCGGTCTTCTCGTATGTCAACATGGGATGACTGCATCATGTTTGCTAAGGGGTTGCGTGTGGCTATTCAGTTGAATGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTCGGTGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTACGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAGCCAGAACCAATTGTCGATATTTTGGATGATAAAAGAATCACTCTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAAGAGGTCGAAATTCCCCCAGTTGTGAATCATGATGTTGTATTGCATGACAATGGGTTTTCGGTTCACCCTACATTGGAAGAACCAGTTTTACACATTGAGACTGTTGAATCTGGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATTGAACAAGAACCTGGACAAGTCGAAATTGATCTTAAAGATGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTCTGAAGAATTTGTTACAGAATGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAATCCTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTCAGGGGGGTTCGTGCCACTACAGTTGACGAGTTGCCTCAGCGATTTGTAGATTATGCCACCGAGTTCGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATATTCATATTCCGGGTACTCAGTATCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCTTACACTCTTCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATATGATCGCGATTATTTTAACCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGATAAATTCGTCACTGGGGTTGTGTCCGGCGATATCATATCACCATTAAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCTCAGCTATATTTTAAAAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAGGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGAAAAGTTTCCATGCTACCCTCTTTCCAAATGCAAAAAATAGCCAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACCCCGAATATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGATAAAATTGTGGAAAGGGCCCTTGCTGATATGGTTATTAAAAATTACTCTGCCCAAATGGATGTGGAATACACTGTCAATGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTCAAAGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCTACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTCATGATTGCTTTCCGTGTCTTGAACGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTCGTCTATGACAATGGGATGTCAGAGAAGGAATTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTCTGTTCCCGGGGTCGCTGTTAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCCTGCGACTCTGGTCAAGGTCCCTTCACTCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTATGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTTCTAGATTGGTATTTCTCTTTTAGGGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTCAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGAGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAATTCTTTTTTAAGAGGTGATGGTCCCTTTTGCATGGCGATTAAGGGTGATGATGGTTTTAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAATAAAGATATTGTTCAGGCTGTTAAGGCCTTTACCCCTTTGGAGTTTAAATTGGATATCAATGTTCCGTTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGTGCGATGTATCCAAATATTGTTCGCAAGGCTATAAAAATTTCCACACATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAATCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTCTGCCCAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGATATGCAACGTGTTTTGGATTCTATTACGTCAGTAGCTTCCATTTCACGTTCCCAATTTGAGGAAGGGTTTCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTTAATGGTCAAGATCGGACTTGTCTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAACGCCAGGGCTGATTTGAACGAGTAAGTGTTCGATTCTAATAATAATAATATAATAATACTAAATAAATAAACAAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTAATACTCTGGGTTTAGTCAACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 50,717
|
EU099844.3
|
Rice stripe necrosis virus
|
Lozano,I., Morales,F., Morales,F.J., Martinez,A.K.
|
CIAT, Unit of Virology
|
Colombia
|
2007-09-10
| null |
Rice stripe necrosis virus
|
Benyvirus
|
Benyviridae
|
ssRNA(+)
| 6,634
|
GenBank
| null | null | null |
Oryza sativa
| null | null | null | null |
Rice stripe necrosis virus segment RNA1, complete sequence
|
CATAGACGAAACGAAATCGGACCGACCCCGGGAGTGGCCCATTATACTGACATCATTAAAGAAAGTTCAGTGAGAGCGGGTTCACCTAAGGTAACGGCGAAGAGTATCGTTTCAACTTCTCCAATGGCGTGTCTTACAGCGTATGAGATTGCTCTTTTATCCGAGCGTGAAGATGAATTTCTTCGCGGCCTTGAGAATAATTTCTCCCCTGATGCTATGGAAGCTATTGCCTATGGCATGACTTGCTATGCTCAGTGGGTGGATGATTTCAAGAGGTTCAACGCTAGGGTGAAAATAGGAGGGTTGCTGAGTGCAGCATACCGGAAGCGCATTTCCCAGTTCACTGGCCCTATCAGTGCGGAAGTTCTTAGGAACATCCTTATTGAGATTGCAGCAATTGCTAGCAATGCTAGGGTTTGTGCTACTCGGGTTCGGTTGTCTGGTCTTCTCTTTGATAGGGCCAGCAACTTGATTCACGTTGGTGCTAAGCATATGTCGACACTGCAGGCTTGCATCACCGATTTGAATATAGCAGTGTCATGTCAATCGTCTGGAGTTCCTTATTTGGTTGGTGCTATCTCTGCGGCGCATATGCAAGAAATGGCAAGGGCAAGCGAAGGTGCTAACGTTGCTAGTGCCGACATGATTGAATCTTACCAGATGGAAGTCAAAGCCTCCACTACTATCACTTTGATGTTGAATGCATCTGAGAAAGCTATTTTACAACGTGAACTGGGGTATGTGCCATTGTACAAACCTCGAGGCAAACCCCCGCGGGATCACGCTGTACTTGCTGCGTTGCGCGAGGCAATAAGGCAGGATTATGATGCAACTTATGGTGTGGCTAGGACGTCTATCAAAACTTTAGTTGTCGGTGCTGCGGCTCGTGAGGTAAAACGTTATTGTTCGAATCCTATGGTTCACTATCATTTTTCTGCCTCTGAGCCTAAAGATATGAATCGCATTGCCATCGAGTTTTTAAAGGAGTCTACAAGGACAAAAATTGCCAATATGGAACGTCAGGAGAAAGAACTTATGCGCGCGCTTAGAGATGGGGGTTACATTGTTACTAAGAGAGTTGAAAACACCAACTTTGAATATGAACGTGTGGCTTCAGGCGATTTGGAGAACATAGTGGAAATTGCAAAAGGCCTGGCGGCTTCCAAACGCACCAGTAAACAACTTAAAGGAATGCGGGTTAGGCCAGCGCCCGGTGCGCTTTACACTGACTCTGTTAGGAAGACACTGGAATTTATGACTATAGCCAAGGATGTTGCTGAAGAGAATAAAATCCCCGACCATTTTCTATTTACCAAGCCAGATTGTGCCGTTACAGGACAAGTCTACACCCAACTTGTTTTTGAAGATGTTGGCTATAATTTTTCCCCCGAGGATTGGTTGGATTGGTTTGCCCGTACCGATGCTAAATTTGGTGTCGGTTATATGGCTTTGCCTATTCAACTAATGTGCGACACGTATCCGCAGTCTGATTACTATAACTATTTTGAGATGGATGCATATAGTTCTCTCCTTGCTGATAGCAAGGGTAAGCTAACCATGCATCCTGTTCCTAATTATCAGGCCGATTACGGAGTCGCCAGTTCTTGGGAGGGAGATATAGACGGTTATGCTGAGATTTTTGGTGCAGACAAAATTTGGCATGGTAGTAAGAGAATTTCCATGATGTCTGGTTCTTCGGACAATGGGTATGCCCACTTGAAAGAGTGTTGGGGAACATTGTTTAGATCTCCTGTTATTTCTGATAAAAGGTTTCCTTTTTCTCTTGAGGTCAACCTTGTTCGAGGCTATGGTTGTTTGGCTATGTTCAGGCTTACCCGCGTCGATCGTGCTAGTTTTATTTTCCGCACCATTGCACTGCGTCCTGAAGAGGAGTATGTCCTGATTTTGGATTTGCCTAAAGTGGCTCGCGCCTATGAAAAGAAAGGAATAGCTGCTATGGCCGACCCTTTGCCTTACTTTCCAGTTATGAAGTACGAGTTTGATGTCAGTGTTGCATACGGTGTTGCTATTGCCGAAAGATCGTTGTCGATTCAAAACTTTTGTTCTTTCACCCGTTCACATATTTCAGGTGTTAGTTTGGTTACTAAGGAGCTTGTGGCGAAATGGAGATTGCCGCTGGGTCAATTACCTGAATTTTCATATGCGGTGTATTATTACACTATGTTCTTACGTGGTCATTGTCAAAAGGTTATTGATGAAGTGGCGAACAGGGAGCTTAATTGGGCGAAGAAACTTCAGGTTGCTGTTTCTAATCTTGCACAAAATATATTGGAACCTGTTTCCTTCTTGTGGACATGGTTGTTTGTTAGGAAAATGGCTGATCAAATTGTGAAGACTCCCACTCAAAAGGTTTATCAATTCGATGCCACCAAAAAGAACATGTACATCCCTCATTTTGGAGACGGTTGGGAGAAACACGCTGAGCTCACTAATTCCTTCCTCGATCCTGGTTGTACCTTACCTGAAGGAATCACCGTTGACGAATGGATGGAAATGCCTGAAGATGTTCGTGTTCTACATGCTTTGAATGTGTCTGGTGCCACGGAACAACACATTGCTGATTACAAAGGTGTCAGCATTTTGCAGGCTATGGCTTCAATTCCTCTTAACGCTCTGACTTCTCCTCTGGAAAATTTTTTATCAAATGGAGGAAAGCTGCGTAACGATGAGGATTTAGCCGAAGCTTTGAGGGCTCAATATAAATGGCAGTCAGGCAAGTTGACTAGGTGTATGGTGTGCACTATGTTGAATGGTAATGCGGGTAGTCAAGTTATTGAGTGTCATCACAAACTTGATTCCAGTTACACTTTTGAAATGTCCCAGAAGGAGATAGACGATCTGAGAAACGATATGTTGCAAGAATCAAACCTTCAAGGTAATGAATTTGGTGCTCTCTTGAAGCGTGTTCGCAAGTTAATCCCAATAGCTCCCTTCAAGAAAACTGTTCGTCTGGAGTATATTAAGGGCGTTCCTGGGACTGGAAAATCCTTTCTGATTCGTGCTTTAGCCGATCCTGTTCGCGACCTCGTTGTTGCCCCCTTTTTGAAGCTGCGTAGCGACTATCAGAATCAAGGACCCGTGGGTGGAGAGACGACTTGGAATTTTCATACCCAACACAAAGCTCTGGAGCAATCAGGTAAACTTACGATTTTTGTTGACGAGTTCACAGCTTATGACTGGAGGCTTTTGGCTGTACTTGTGCATAGGTGTGGTGCAGAAACAGTTTACCTCGTCGGTGACGAGCAACAAACTGGTATCCGCGAGTCCGAAAATGAAGGTATATCAATTTTGAATAAGTTGAAACCTTCGGATTATTCCATGCATGTGCCGTTGTTCAACTATCGGAATCCGAGAAAAGATGTGTCCGTCATCAATCATTTGTTTGGAACCAGAATGATTCCTGTGTCTGACGTTGTTTCTGGGTTTGTTAACCGTCCACTGTCTGAATTTCAACCACTCGTCTCTGATCCCGAATGTCGTTACAAAATTATTCATTACACGGAGGCGACTGGAAGGGCTCTGCTAGCAGGTATGACTACCGAGTTGAAAACGACGGTGCGGTCTAATCAGGGTTCTACCCATGATTATGTCGCGCTTCCTGTCACCGTTGCCGATGCCCCATTGCTTCGGAATGAGCAGTTGAATTTGGTCGCCATTTCTAGACATAAAAAAGAAATGATCATATTTACTGATGTTGGAAGTGAGTCTGCTGGTCATGGGTTGGCCAAATCTCTTGTCATGCCGCCTGAAGCGGTCCAGGCCTCTGATTATAATTTACGATTGTATTTAGGTCTGGAAACGCCACAAAAAGGGAAATTTGCGACTTCTGAATCTGAATTTGCGGCCAGTTTTAGAAAGTTGGTTGAAAGGTACAATGGATATTTGGCTCCTGGAGAAGAAAATGACGCACCATCTGGTGTCATCCCCAGGAGGGTTATTGATGTTGCCAAGGTTAAAAATGAGCTTGCTGGTCAGTACAAAACGGTTGATTTTGATCTTGCCGCGAGAGATAACAATTGTTTGGTTGTCGCTCTCGCTCTTGCTCTGAACACCACTTTTGATGTCATTAAGGCGAAGATGTTAGCGTCTTCTGAAATTAAGGCCTTTTGTACATGGGCGCGGTCTTCCCGTATGTCAACATGGGACGACTGCATCATGTTCGCTAAGGGGTTACGTGTGGCCATTCAATTGCAGGTCACTAAACCTTCTGGCACATCTGTCCTTAGTTTTGGAGATTCTGATGTCAACGTCGTGTTGGCTTATGAAGAACATAAGAAAGGGGAAGGTCATTTCAGTTATGTTAAGCCCAAGCCTCAACCAGAACCAATTGTCGACATTTTGGATGATAAAAGAATCACATTACGGAATGGTCAGTTCGAAATTGAGGAAGTTGAAATTCCCCCAGCTGTGAATCATGATGTTGTACTGCATGACAATGGTTTTTCGGTTCACCCTACTTTGGAAGAACCAGTGTTACACATTGAGACTGCTGAGTCTAGAGTGACCGAGATTGAAGAAGTGATCGAGCAGGAACCCGAACAAGTTGAAATTGATCTTAAAGACGATGCTAGTATCCAGTCTGTTGATTCTCACGATTCTTTGAAGAATTTGTTACAAAACGAATATTCCGACCAGTTCGCTAATTGGGTATGTTTCTCTGAGTCTTTTGAGGGTATTTATGGCGGAAAACGCAAGGAACCAGTTAGAGGGGTTCGTGCCACCACAGTTGACGAATTACCTCAGCGCTTTGTGGATTATGCTACCGAGTTTGTCCCTAGAATGTTGTCAGCCATTCCTGCAAATGTCCATATTCCGGGTACTCAGTACCCCGAGGCTCGTGTCCAACCTGTGTATGATGCCTATACTCTCCTTAGAGATTTTGATCTCTATAATGGTGCGTTGGAATACGATCGCGACTATTTTAATCAGTCTGCTGCCAATGTTGTTGGGGACAAATTTGTCACTGGAGTTGTGTCTGGCGATATCATTTCACCATTGAATTTGAGGGGACATCCGGTTAACACAATTCAGACGTACAGATCTCTTATGGTTGGTCCGTCACAGTTATATTTCAAGAATAACCGGTTTCAAGAGTTGCAAGTTCAACAAGCAAGGTATTTGTTTAGGAAAGTTTCCATGTTGCCCTCTTTTCAAATGCAAAAAATAGCTAGAATGGTTGCCACTAACTTTGTTACTGAGTGTTTGACTCCGAACATCGCAGATGTCTTCAGAAATGATAATCTCGACAAAATTGTGGAAAGGGCGCTTGCTGATATGGTCATTAAAAATTATTCTGCCCAAATGGACGTGGAGTACACTGTCAACGCCAGAGTTTATCGCTTTCAACTTAAGGACATTGAAAAGCCTGTCAAAGAACCCACTGTTGACATGGCCAAAGCTGGTCAGGGCATTCTTGCCTGGTCCAAGGAGGCTCATGTCAAGTTTATGATCGCTTTCCGTGTTTTGAACGATATGCTATTAAAATCTGTCAAAGAAAATGTGGTCTATGACAATGGGATGTCAGAAAAGGAGTTTACTGATAAAATCAATTCAGCTATGAGTTCTGTTCCCGGGGTCGCTGTCAATGGTGTCATTGACGCTGCTGCTTGCGATTCTGGTCAAGGTCCCTTTACCCAGTTGGTCGAGAGGTATATTTATGAACTTATGGGCATCTCTGATTTTTTCCTAGACTGGTATTTCTCTTTTAGAGAACATTACATTATGCAATCTAGGTATGTTAGGGCACACATGACGTATGTCAAAACTAGTGGGGAACCTGGAACCTTATTGGGCAACACCATTCTTATGGGAGCACTTATGAATTCCTTTTTAAGAGGGGATGGCCCTTTTTGTATGGCGATCAAGGGTGACGATGGTTTCAAAAGACAAATGAACTTGCGTGTTAATAAAGATATTGTCCAAGCTGTTAAGGACTTTACCCCTTTGGAATTTAAATTGGATATTAATGTTCCGCTGACGTTTTGTGGTTACGCTCTTGTTGGTGGCGCAATGTACCCAAATATTGTTCGCAAGGCGATAAAAATTTCTACGCATCGATTCAAGTCTTACGAACATTTCACAGAGTATCAAGAGTCCCTCAGAGATTGGTTGAACAGTTTGCTTAAAGATCCCATTAATAGGGCTATATTTTTACATGTTAATGCAGAACTTGCCGGAAAAGGAATGAATGACATGCAACGTGTTTTGGATTCTATCACGTCGGTAGCTTCCATTTCACGTTCCCAATTCGAAGAAGGTTTCCAAGAAAGAACAACAGATGTTGGTGAAATACCTGTGTTCAATGGTCAAGATCGGACTTGTTTGGATACTAAGATTGTAACAGCCTTTGGTGACCCTGTTGATGTGTTTATAAGGAAAAATGCCAGGGCTGATTTAAATGAGTGAATGTTCTACTCTAATTACGATAATGCAATATTAAATGAATAACCAATTTGTGGGTTTTAAAACCCTCTGGTCTAGATGTTGGGACCACCTAGGAGGTGATACTCTGGGTTTAGTCGACATCGTGGAGTTGGGTGTACTGAGTGTGAGTTGTATCAGTATTTATTAGCCCGTTTGTGTGTCTATACACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 106,884
|
NC_001914.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Hay,J.M., Jones,M.C., Blakebrough,M.L., Dasgupta,I., Davies,J.W., Hull,R.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1991-06-04
|
Philippines
|
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 8,002
|
RefSeq
| 1
| null |
Philippines
| null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Rice tungro bacilliform virus, complete genome
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGAACTTTAAGGGAAAAATAGAATACAATCTAGTCAAACTAATTACATAAGTTCCAAAGAGGGATCTTATTTCTCAAAATATTGAGTCACGTTACGAAAAACTTGAATTCTTAGACTTAGCAGTCTGGGGAAAAGAGAAAAAACAAAAATATTTACTATCTACCGATAATATTAGCTTTTATTGTTACTTTGATACTAGTAAAACTAGTGAATCAGAAAGAAAGCATACCTTTCATTCTGATAATAAGCAACTCAATAGTATTGTAGACCTTATTATTAAGCATTCTGAAAAAACCAAAAATATTAAGGAAGAATTAGAAAAATATAGTCAGTTCCTAGATAAGATATTAGATTTAAAACCTACTAAAAAACAAGTTGAAAAACTATTAGAAAATCAAAACTTAATTAGCAAGAACTTTGATTATATCAAAGAACAAAACACTCAACTAGAAAAATCCCTAAGAAAAACAGTTAAGTTAGAAGACTCCATTAATACTCTATTAGTAGAAATACAACAAGCTAGACCTAAGGAAGTAGAATTAAGAACTCTTAAAATAGCAGAACAGAACTCTAAGGCAATAGAAAAATTTGAGCAAGAAATTAAGGACTTAAGAGAAATCCTGGAATTCCTTAAGCATCAAGCTACATGAGCGCTGATTACCCAACTTTCAAGGAAGCCCTTGAAAAGTTTAAAAACCTAGAATCAGATACAGCCGGAAAAGATAAGTTTAATTGGGTATTTACTCTAGAAAATATAAAGTCAGCCGCGGACGTAAATTTAGCATCTAAGGGTTTAGTACAACTTTACGCTTTACAAGAAATTGATAAAAAGATTAATAATCTTACAACCCAAGTTAGTAAGTTACCTACAACTAGTGGAAGTAGTTCAGCAGGAGCTATAGTACCTGCAGGTAGTAACACCCAAGGTCAGTACAAAGCACCACCTAAGAAAGGAATTAAAAGAAAATATCCAGCATGAGCCTTAGACCATTTACTGGTACTTCTAGAACTATAACCCAAGATTCAACCTCTGAATCTAATATAAAAAAGGGAAAAAACTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAGAAGTAGATGTTAATCAAGAAGTAGAAAACTTTGATTGGAAAAAACTATCAGGAATTAAACCTAATAAACTATATGAGAAAAATTGGCAAGAAAAAGTTAAGTTAAAACAACAATCTATAGTTTCAGCATATAAAGAAGAAGCTATTAGTGTAACTCATAATGCATATACTACTACTTTATTTCCACAAGAAGTAATTAAAAATGTTAAGAATCAGGGAAAACTTTATTATCATATAGGCATGATGGCCATAGGAGTTAAAGGACTTCATAGAAGAAAAATAGGAACTAAAGTCATGATAATGTTTTATGATGATAGTTTCGGCAAAGCTAGAGAAGCTAGCATTGGATCAATAGAAATGGATATGAACGCCGGTTGTGGAGTATTCTACTCCTGCCCCGACTTTGCAAAATATATTAAAGATTTATCACACCTTAAGATAGGGATACAAACCCTAGGATATGAAAATTATGAAGGAAAAAATCTTTCGGTAGCAATCAAAACTATAGGAAGATTGACCACCAATATACAGTCAAAATATAAGATAAATGTAAAAGATATTGTAGAACAGATATCATCACAAGGAATCATTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACACCTAGATGGGAATGAATGGGATCTTAGTAAATTCTTAAACCATGAAAACACAAGTAGAGTCCCAACCAAAGCCTTAATATATCAAAATCTACAAGGAGGAGAATCCTTAAGATTTTCAAATTATAAGCAAACTAGAATGCATGATCCAACTGAAAATAATTCAGATGAAGATGAAGATTTAAAAATCTTAGGAGAACAACTAAATATTAAAATGGCAAGATTTTACACAATGCAAACCCCAGAAGAAGAATTACGAGAAGTAATTCAACAATTAGAAAGAGAAAAACAAGCCATGATAGCAAAACTAGAAGCTAAAATGAAAGAGTCATCCAAAATGGCAATAGTAGAAGATAATTTCAATCCAAATAACGAATATCTAGAAGATACATATTCTGAATATGAAGATCTAGAATTCGAGAAATTAGGATTAACTGGATGGGAAGACTTAGATCAGGATTCCATAGAAACCGAAGAAATAACTGAATGGGAAAATCCTAATCAAGTACTTCATAGAGAAATTAGAGCATATAAATCAGTATCCGAACAAATAGAAGATATATTCGGAGAACTACTAAAGGAACACGGAAACTATGATATGGCCCTCAAAAACCTAGAAGAAAAATACGACCTAGATAAAATAGAAAAGGCCAAATCTATAGAAGAAATAGCTAAGTCATCTACATCGTCAGAAATTAGGCCAACTAAACGACCTAAAGAAGAACAAACAGCCTATGAAGATGATATGAGAGATGATTGGAAAAGAAAAGAATTAACAGTAAATCCCATAGAAGCCTCAAAAGATAGAAATTTTGAAAGAATAGGAAGTTCATATAAGAAAAACTTTTACCCTAGTAGAAGTGAGATATTAAACTTAGATAACGTTCCCCCACAATTTTACTATGACCAGCTAGTAACCTGGGAAGGAATAGTTAAAAATGAATGGGAAGCACGTAAGAAAGATGGGATGGATATGTGGTCTTGGATGGATGGTAGAATAACAGGATTAGTGTTATATTTAGTCCAAGATTGGATATCTAAAAATCAGGCAGCTTACAATGATATAAAATCTAGAGGTGATAGACCTGAAAACTTCGTAAAAATGGTAAAAGATAGGTTCTTAATAGAAGATCCTACAGATGAAAGAAGAACAGCACTACAAAGGTTAGCACAAAGAGAATTAGAAGCCTTAAACTGCGAAGATCCTACTAAAATTCAACCATTTATGGCTGAATATCTTAAGAAAGCCTCAGAAGCCAAAAAAGGATTTGATGTAGTTTATGTAGAAAGACTCTTTGATAGACTACCAGAAGCAGTAGGAAAGGTAGTAAAAGCGGACTTTGTTAAAGACGGTAATTCCTATGAAGCAGGAATAGGAATAGCAGTTTCATATATATCCACATGGATGAGAGCAAAATGCATTAAGGAAACAGAAGCTAAAACTCAAAAGAAAGCATCCTTAGCATTCTGTAGATCCATATATACTATAGGAGATTATAAGAAACGAAAAATCCTAAAAAGAGTTACAAACTATAACAAAAATAGGAGAAAAAACTATGTCAGAAGACCAAGTATTAAGAAAAAATGTAGATGTTATATCTGTCAAGATGAAAATCACCTGGCTAATAGATGTCCTAGAAGATATACTAATCAGGCTAGAGCAAGTCTAATAGATGGATTAGACGAAGATATAGTATCTATAGCATCAGATGACGAGGATATTGAAAATTTCCTTGAAATAATAGAACTTGATGAATTTATAGCACATTCTAGTCAAGAACATGAACATACATGGGAAATCGGAGGAAAGAAAGATAAGGTATGTGAAATTTGCAGTTATTTTACGGATTATAATAAAACTGTTAGTTGTAAAACTTGTGAAACCCAATACTGCAAAACATGTTCTGATCAACTAGCACTAGAAGTGACAGAAGTCAAAAAACCTACAAAAGAAGAAACAATGATAGACGACCTAAAATTAAATGTTAAAAATCTAGAATTTAGAGTCACCATTCTAGAACATAAGGTAGAAATGCAGAATCTTCAAGATAAATTCGAAACTATGCAAATTAGAAATAAATCAGAAATAACAGAAATACCAACAACCTCATTAGCTATGAGAGCAAATGAATCAAACTACATAAAAACATCAATTAATAAAACTGCAGGTTGTTATGTAGAAACAAAAATCTCATTCAACAATGAAAATAGAATCATAACAGCTCTAATAGATTCGGGTTCAACACATAATATAATATGTCCAACATTGATACCAGCATCATGGATTAATAATACACATAGAGAAATTATAATGTTTGCTGTAGACAATAGCAAATATAATCTGAATCAAGAGCTAATAGATGATATAAAATTACAATTCCAAGAAGTTGACGAAACTTTTGGAATAAAATATAAATTAGGACAAACCTATGTAGCACCTAAGCCAACAAAAACATTTATAATAGGACACAGATTCCTTACAAATGAAAATGGTAGTGTTACAATCCATAAAGATTATATAACTATACAAAAAACTACGGGAATATACCCAACAGCCAGACATGAACTTAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACGCCCGCCATTATTTTCAAACATTCCTGAAACCTATAACAAAATTCCTCATTTGCATTCATATCAGCCTCAACCAATATTAGGATATAAGAATGAAATAGGAAATCAAAGTTTAATCACTATGGTGAAAGAATTAGAAGCACTTGGATTCATAGGAGATGACATTACTAAAAATAGAACAACGTGGGTATGTGACTTCAAAATCATAAACCCAGATATTAATATAACTTGTGCAACAATTCCATACACACCAGCAGATAAAGAAGTATTTGAAAAACAAATTAAGGAGCTACTAGATAATAAGTTAATCAAGAAAGCTGATCCAACATGCAGGCATAGAACAGCAGCATTTATAGTAAGAAACCATTCTGAAGAAGTAGCTCAGAAACCTCGAATAGTCTATAACTATAAACGTTTAAATGATAATATGCATACAGATCCTTTTAATATTCCTCATAAGATTTCAATGATTAATCTAATACAGAAAGCTAATATATTTTCTAAGTTTGATTTAAAAGCAGGATTTCATCATATGAAATTAAAAGATGATTTCAAAGATTGGACTACTTTTACATGCTCAGAAGGATTATATACTTGGAACGTCTGTCCATTTGGTATAGCTAACGCTCCTTGTGCATTTCAAAGATTTATGCAGGAATCCTTTGGAGATTTAAAGTTTGCATTATTATATATAGATGATATACTTATTGCATCTAATAACGAAAAAGAGCATATAGAACATCTTAAGATTTTCTTTAATAGAGTAAAAGAAGTAGGATGTGTTCTTAGTAAGAAAAAATCAAAAATGTTTCTTAAAGAAGTAGAATATCTTGGAGTAGAAATTAAAGAAGGAAAGATTAGTCTTCAGCCGCATATAGTTGATAAGATCAAAAAATTTGATAAAAATAAACTCAACACCCTAAAGGGACTACAAGCATATCTAGGGTTACTCAATTATGCCAGAGGATACATCAAAGACCTATCAAAGCTAGTAGGACCACTTTATAAAAAGACAGGAAAAAATGGGCAAAGAATCTTTAACAAAGAAGATTGGAATATCATCTTTAAGATAGAAAGAGAGGTATCAAAGATAAAGCCTTTAGAAAGACCTAAAGAAACCGACTACATCATTATAGAGACAGATGCGTCAGAAGAAGGCTGGGGAGCAGTCTTAGTCTGTAAGCCAGATAAATATAGTGGCAAGGACACTGAGAAAATAGCAGGATATGCATCAGGAAACTTTGGAGAGAAGAAAACCTGGACTAGTTTAGATTATGAAATAGAAGCTATAAATGAAGCCCTAAACAAGTTCCAGATATACTTAGACAAAGATTTTACAATTAGAACTGATTGTGAAGCAATAGTGAAGGGGATAAAAACAGAAGACTATAAAAAGAGATCAAAGACCAGATGGATCAAGTTAAGAGATAATCTCTTAAAGGATGGATACAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAGGGAAACAAAAACTTTTTACCAAACTTCTTATCCCGTGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAACCCCGATTCTACGGAATCATATTCTATAGATTCGTCAGAATCAATTCCACTATATATCGATTCGAAAGAATCACATTCTATAGAGTCTGATGACTCAATTCCACTATACAGGGACAAGCTTCTTCCTCTAGTCGAAAGGCTAAAGGAAAAGAGTGCCTAACTAAGATCGGAGGCATCACCATGAATATAGAGTACCCGTACTCAATCCACATAATAGACAAGAACAAGGTTCCGATCTACGATCAAGGAAATCTCTTCCACACTGAGAAGTCCTCAAGACTTTCACATGTGTCCAGAGGTTTGCTGGATCATCTCTTTACTTTTTCGTCTGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACATATTAGCCGATTATCTTTACCTATTAGAAAGTGAGAGAGAGTCATATAAAAATGAGTGGATTAGCTTGAAGGATCAAGTTAGTCTTCTACAAAAACAAAATAGTGAGTTGAGAGCTAGGATAGCCACCAACAAAGAAATAATAGAGGGACTGAGAGAGCCAGTTAAAAAGCCAATATACACAACCCAGGATAAAGAGAGGCTCCGTGTTTTCTTTTGCGAAGAAAGAAGCATGGAATATATATATTATCATATAAAAAGGCTAGCTCAGCAGAGCTATTATTCCCACCTAAATAATTTACAGAAGGATTGTGAACCCTTTAGAGGGGTCTACATGTCTTTCTTAACTAATGTTAAATTCCTAGTATTATGTGAAGCTGGATACTGGACTGTACCAGATATAGAAACTAATACTACAGAGTCTATATTAAGTCTATCCCAGAAGAAAGGAGAAGATCTTCTACAAAAGGGAGTAGTAATATTTAATGAGCTTGAAGGAGGATATCAGCTTTCTCCAAGGTTTATTGGAGACCTTTATGCTCATGGTTTTATTAAACAAATAAACTTCACGACCAAGGTTCCTGAAGGATTGCCGCCAATCATAGCGGAAAAACTTCAAGACTACAAGTTCCCTGGATCAAACACCGTCTTAATAGAACGAGAAATTCCTCGCTGGAACTTTAATGAAATGAAGAGAGAGACACAGATGAGGACCAACTTATATATCTTCAAGAATTATCGCTGTTTCTATGGTTATTCACCATTAAGGCCATACGAACCTATAACTCCTGAAGAATTTGGGTTTGATTACTACAGTTGGGAAAATATGGTTGATGAAGACGAAGGAGAAGTTGTATACATCTCCAAGTATACTAAGATTATCAAAGTCACTAAAGAGCATGCATGGGCTTGGCCAGAACATGATGGAGACACAATGTCCTGCACCACATCAATAGAAGATGAATGGATCCATCGTATGGACAATGCTTAAAGAAGCTTTATCAAAAGCAACTTTAAGTACGAATCAATAAAGAAGGACCAGAAGATATAAAGCGGGAACATCTTCACATGCTACCACATGGCTAGCATCTTTACTTTAGCATCTCTATTATTGTAAGAGTGTGTAATGACCAGTGTGCCCCTGGACTCCAGTATATAAGGAGCACCAGAGTAGTGTAATAGATCATCGATCAAGCAAGCGAGAGCTCAAACTTCTAAGAGAGCAAGAGAGGAGCTTATCCTCTCAACCCCTCTTCAAGAAGCAAAGGCGATCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTAATATGTTTGTACTTATGATTGTATTTCTCAAAACCTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTTATATTTATCCTACACCCTTGTGATAAAACATGAAGTCATACTCGTTCTAAGATTAAGTGTTCTAAAAATACTTCGAAGCATTGAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAAAAGTACCGTCAGGCCGTGTTATGGCAAGGGAAGAAGTACCATGAATACCCTATAGATGTTAGAAGGAAGATAAGAACTAAGTATCTTATGAACAATGGGTAGCTGATTTCTGATTATCATTAACAAGTATCGTTATAATCCATAAGCTTTGAAAGATCTGCTAGTGTGGATACCAAAAGGCTGTCGTGGTTCGCCCAGTCGACGGATGAGGTCATAAACGAAGCACTAGTAGGTAACTAAGAGGCTTAGGGATGAAGCAACGAGAAAAGTTAGGGGGGTGCCTAGAAA
| 9,069
|
MK552377.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Kannan,M., Bunawan,H., Mohamad Saad,M., Baharum,S.N.
|
Universiti Kebangsaan Malaysia, Institute of Systems Biology
|
Malaysia
|
2019-03-16
|
Seberang Perai
|
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 8,000
|
GenBank
| null |
Malaysia
|
Malaysia
|
Oryza sativa
| null |
2018-05-16
| null | null |
Rice tungro bacilliform virus isolate Seberang Perai, complete genome
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGAACTTTAAGGGAAAATAGAATACAATCGAGTCAAACTAATTACATAAGTTCCAAAGAGGGATCTTACTTCTCAAAATATTGAGTCACGTTACGAAAAACTTGAATTCTTAGACTTAGCAGTCTGGGGAAAAGAGAAAAAACAAAAATATTGTTTATCTACTGATAATATTAGTTTTTATTGCTACTTTGATAATAGTAAAACTAGTGAGTCAGAAAGAAAGCATACCTTTCATTCTGATAATAAGCAACTCAATAGTATTGTAGATCTTATTATTAAGCATTCTGAAAAAACCAAAAATATTAAGGAAGAATTAGAAAAATATAGTCAGTTCCTAGATAAGATATTAGACTTAAAACCTACCAAAAAACAAATTGAAAAATTATTGGAAAACCAAAATATAATCAACAAAAACTTTGATTATATCAAAGAACAAAACGCTCAACTAGAAAAATCCCTAAGAAAAACAGTTAAGCTAGAAGACTCTATTAATACTTTATTAGTAGAAATACAACAAGCTAGACCTAAGGAAGTAGAGTTGAGAACTCTTAAAATAGCAGAACAAAATTCTAAGGCAATAGAAAAATTTGAACAAGAGATTAAGGACCTAAGAGAAATCTTAGAATACCTTAAGTATCAATCTACATGAGCGCTGATTATCCAACTTTCAAGGAAGCCCTTGAAAAATTTAAAAACCTAGAATCAGAAACAGCTGCTAAGGATAAGTTTAATTGGGTATTTACTCTAGAAAATATAAAAACAACTGCAGACGTAAATCTAGCATCTAAAGGTCTAGTACAATTATACGCTTTGCAAGAAATTGATAAGAAGATAAATAATCTTACAACACAAGTTAGTAAGTTACCTACAACTAGTGGAAGTAGTTCAGCAGGAGCTATAGTACCTGCGGGAAGTAACACCCAAGGTCAATATAAAGCACCACCTAAGAAAGGAATTAAAAGAAAATATCCAGCATGAGTCTTAGACCGTTTACTGGTACTTCTAGAACTATAACCCAAGATTCAACCTCAGAATCTAATATTAAAAAGGGAAAAAATTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAGGAAGTAGACGTTAATCAAGATGTAGAAAACTTTGATTGGAAAAAACTATCAGGAATTAAACCTAATAAATTATATGAGAAAAATTGGCAAGAAAAAGTTAAGCTAAAACAACAATCTATAGTTTCAGCATATAAGGAAGAAGCCATTAGCGTAACGCATAATGCATACACTACTACTTTATTTCCTCAAGAAGTAATTAAAAATGTTAAAAATCAGGGAAAACTTTATTATCATATAGGCATGATGGCCATAGGAGTTAAAGGACTTCATAGAAGAAAAATAGGAACTAAAGTCATGATAATGTTTTATGATGATAGTTTCGGGAAAGCTAGAGAAGCTAGCATTGGATCAATAGAGATGGATATGAATGCAGGGTGTGGAGTATTCTACTCCTGTCCCGACTTTGCTAAATATATTAAAGATTTATCACATCTTAAGATAGGAATACAAACCCTAGGATATGAAAATTATGAAGGAAAAAACCTTTCGGTAGCTATCAAAACTATAGGAAGATTGACAACTAATATACAGTCAAAATATAAGATAAACGTAAAAGATATTGTAGAACAAATATCGTCACAAGGAATTATTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACACTTAGATGGGAATGAATGGGATCTTAGTAAATTCTTAAACCAAGAAAACACTAGTAGAGTCCCAACCAAAGCCTTAATATACCAGAACCTACATGGAGGAGAATCTTTAAGATTTTCAAACTATAAGCAAACTAGAATGCATGACCCTACTGAAAATAATTCAGACGAAGATGAAGATTTAAAAATTTTAGGAGAACAACTAAACATTAAAATGGCAAGATTCTATACAATGGAAACTCCAGAAGAAGAATTAAGAGCAGTAATCCAACAACTTGAAAGAGAAAAACAAGCCATGTTAGAAAAATTAGAAGCTAAAATAAAAGAATCATCTAAAATGGCGATAGTAGAAGATAATTTCAACCCAAATAATGAATATTTAGAAGATTCATATTCTGAATATGAAGATCTAGAGTTTGAAAGACTAGGATTAACCGGATGGGAAGACCTAGATCAGGATTCCATGGAAACTGAAGAAATAACTGAATGGGAAAATCCTAATCAAGTACTTCATAGAGAAATCAGAGCATACAAATCAGTATCAGAACAAATAGAAGATATATTTGGAGAATTGTTAAAAGAACATGGAAACTATGATATGGCTCTTAAAAATCTAGAAGAAAAATACGATCTAGACAAAATAGAGAAGGCCAAATCTATAGAAGAAATAGCTAAGTCATCTACATCATCAGAAATTAGGCCAACCAAACGACCTAAAGAAGAACAAACAGCTTATGAAGATGATATGAGGGATGATTGGAAAAGAAAAGAATTAACAGCAAACCCCATAGAAGCCTCAAAAGATAGAAATTTCGAAAGAATAGGAGGATCCTATAAGAAAAACTTTTATCCTAGTAGAAGTGAAATATTAAATTTAGATAACGTTCCCCCACAATTTTACTATGACCAATTAGTAACTTGGGAAGGAATAGTTAAAAACGAATGGGAAGCAAGAAAAAAGGATGGAATGGATATGTGGTCTTGGATGGATGGTAGAATAACAGGGTTAGTTCTATATTTAGTCCAAGACTGGATATCTAAAAATCAGGCAGCCTACAATGATATAAAATCTAGAGGAGATAGACCTGAAAACTTTGTTAAAATGGTAAAAGATAGATTCTTAATAGAAGATCCTACAGATGAAAGAAGAACAGCATTACAAAGGTTAGCGCAAAGAGAATTAGAAGCTTTAAATTGCGAAGATCCTACAAAAATTCAACCATTTATGGCTGAATACCTTAAAAAGGCTTCAGAAGCTAAGAAAGGATTTGATATAGTATACGTAGAAAGACTCTTCGATAGATTACCAGAAGCAGTAGGAAAAGTGGTAAAAGCTGACTTTGTTAAAGATGGTAATTCCTATGAAGCAGGAATAGGAATAGCGGTTTCATATATATCCACATGGATGAGAGCAAAATGCATTAAGGAAACAGAAGCTAAAACTCAAAAGAAAGCATCCTTAGCATTTTGTAGATCCATATATACCATAGGAGATTATAAGAAACGAAAAATCTTAAAAAGGGTTACAAACTATAATAAAAATAGAAGAAAAAACTATGTCAGAAGACCTAGTATCAAGAAAAAATGTAGATGTTATATCTGCCAGGATGAAAATCATCTAGCTAATAGATGCCCCAGAAGATATACCAATCAGGCTAGAGCAAGTTTAATAGATGGGTTAGACGAGGATATAGTATCAATAGCATCAGATGATGAAGATATTGAAAACTTCCTTGAAATAATAGAACTTGATGAATTTATAGCACATTCTAGTCAGGAACATGAACATACTTGGGAAATTGGAGGAAAGAAGGATAAGGTATGTGAAATATGCAGTTATTTTACAGATTATAATAAAACTGTTAGCTGTAAAATTTGTGAAACCCAATACTGCAAAACATGTTCTGATCAACTAGCAATAGAAGTAAGAGAAATTAAGAAACCCACAAAAGAAGAAGAAATGATAGAAGATTTAAAATTAAATGTTAAGAATCTAGAATTTAGGGTTACTATTCTAGAACATAAGGCAGAAATGCAAAATTTACAAGATAAGTTCGAAACAATGCAAATTAGAAATAAATCAGAAATAACAGAAATACCAACAACTTCATTAGCTATGAGAGCAAATGAATCAAATTACATAAAAACATCAATTAATAAAACCGCCGGTTGTTATGTAGAAACAAAAATCTCATTTAATAACGAAAATAGAATCATAACAGCACTAATAGATTCCGGTTCAACACATAATATAATATGTCCAACATTAATACCAGCATCATGGATTAATAGTACACATAGAGAAATTATTATGTTCGCTGTAGATAACAGCAAATACAATCTAAATCAGGAATTAATAGATGATATAAAACTACAATTCCAAGAAGTTGATGAAACTTTTGGAATAAAATATAAATTAGGACAAACCTATGTAGCACCTAAACCTACAAAAACTTTCATAATCGGACACAGATTCCTTACAAATGAAAATGGTAGTGTTACAATTCATAAAGATTATATAACTATACAAAAAACTACAGGAATATACCCAACAGCAAGACACGAACTTAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACGCCCGCCATTATTTTCGAACATTCCTGAAACTTACAATAAAATTCCTCCTTTACATTCATACCAACCGATAATAGGATACAAGAATGAAATAGGAGATCAAAGTTTAATAACTATGATAAAAGAGTTAGAAGCACTTGGATTTATAGGAGATGACATCACAAAAAATAGAACGACATGGGTATGTGATTTCAAAATCATAAATCCAGATATTAACATCACTTGTGCAACAATTCCATATACACCAGCAGATAAAGAGGTATTTGAGAAGCAGATAAGAGAATTACTAGATAACAAGCTGATAAAGAAAGCAAGTCCAACTTGTAGACATAGAACAGCTGCATTCATAGTAAGAAATCATGCTGAAGAAGTAGCACAAAAGCCAAGAATAGTTTATAACTATAAAAGGATAAATGATAATATGCATACAGATCCGTTTAATATACCCCATAAGATTTCTATGATCAATCTCATACAGAAAGCTAATATATTTTCTAAGTTTGATCTAAAAGCAGGATTTCATCACATGAAACTTAAAGAAGATTTCAAAGATTGGACCACATTTACTTGTTCTGAAGGATTATTTACTTGGAACGTCTGTCCATTTGGTATAGCTAATGCTCCTTGTGCATTTCAAAGATTTATGCAGGAATCCTTTGGAGATTTAAAATTTGCATTATTATATATTGATGACATACTCATTGCATCAAGCAATGAACAAGAACATATTAAGCATCTGAAGATATTCTTCAATAGAGTAAAAGAAGTAGGATGTGTTCTTAGTAAGAAAAAATCAAAAATGTTTCTAAAAGAAGTAGAATATTTAGGAGTTGAGATAAAAGAAGGAAAGATCAGCCTTCAGCCACATATAGTAGAAAAAATCAAAAGATTCGATAAAAGCAAGTTGAGTACCCTAAAAGGCCTACAAGCATATCTAGGATTACTCAATTATGCTAGAAGCTACATTAAAGACCTATCAAAGCTAGTAGGACCACTATATAAAAAGACTGGAAAGAGTGGGCAGAGAAGCTTTAATAAAGAAGATTGGAATATAATCTTTAAAATAGAAAGAGAGATATCAAAAATAAAGCCACTAGAAAGGCCTAAAGAATCAGACTACATAATAATTGAAACCGATGCATCAGAAGAAGGTTGGGGAGCAGTCTTACTCTGCAAACCAGATAAATATGCTAGTAAAGATACTGAAAAAATAGCAGGCTATGCATCAGGAAACTTTGGAGAAAAGAAGACTTGGACTAGTTTAGATTATGAAATAGAAGCTATAAATGAAGCGCTAAACAAGTTCCAGATATATTTAGACAAAGACTTTACAATCAGAACAGACTGTGAAGCAATAGTAAAAGGGATAAAAACAGAAGATTATAAGAAAAGATCTAAGACTAGATGGATCAAGTTAAGAGATAACCTTCTGAAAGATGGTTATAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAGGGAACAAAAAACTTTTTACCAAACTTCCTATCCCGTGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAACCCCGATTCTATTGAATCATATTCTATAGATTCGCAAGAATCAATTCCACTATATATAGATTCGAAAGAATCACATTCTATAGAGTCTAATGACTCAATTCCACTATACAGGGACAAGCTCCTTCCTCTAGTCGAAAGACTAAAGGAGAAAAGTGCTTAACCAAGATTGGAGGCATCACCATGAATATAGAGTACCCGTACTCAATCCACATAATAGACAAAAACAAGGTTCCGATCTACGATCAAGGAAATCTCTTCCACACTGAGAAGTCTGCAAGACTTTCACACGTGTCCAGAGGTTTGCTGGATCATCTTTTTACTTTTTCGTCTGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACATATTAGCAGATTATCTTTACCTATTAGAAAGTGAGAGAGAGTCATATAAAAATGAGTGGATTAGCCTGAATGATCAGGTTAGTACTCTACAAAAACAAAATAGTGAGCTGAGAGCTAGGATAGCCACAAATAAAGAAATAATAGAGGGACTGAGAGAACCAGTTAAAAAGCCAATATACACAACCCAAGATAAAGAGAGGCTCCGTGTCTTCTTTTGCGAAGAAAGAAGCATGGAATATATATATTATCATATAAAAAGACTAGCTCAGCAGAGCTATTATTCTCATCTAAATAAATTACAGAAGGAATGCGAACCCTTTCGAGGGATCTACATGTCTTTCTTAACTAATGTTAAATTTCTAGTACTATGTGAAGCTGGATACTGGACCGTTCCAGATATAGAAGACACTACTACAGAGTCTTTATTAAGTTTATCTCAGAAGAAAGGAGAAGATCTACTACAAAAAGGAGTGGTAATATTTAATGAGCTTGAAGGAGGTTATCAACTCTCTCCAAGATTCATTGGAGACCTTTATGCTCATGGTTTTATTAAACAAATAAACTTCACAACCAAGGTTCCTGAAGGGTTACCGCCAATCATAGCGGAAAAACTTCAAGACTATAAGTTCCCTGGATCAAACACAGTTTTAATAGAACGAGAGATTCCTCGCTGGAATTTTAATGAAATGAAAAGAGAAACACAGATGAGGACCAATTTATATATCTTCAAGAATTATCGTTGTTTCTATGGCTATTCACCATTAAGGCCATATGAACCTATAACTCCTGAAGAATTTGGGTTTGATTACTATAGTTGGGAAAACATGGTTGAAGAAGACGAAGGAGAAGTAGTATACATCTCCAAGAATACTAAGATTATTAAGGTCACCAGAGAACATGCATGGGCTTGGCCAGAACATGACGGAGATACAATGTCCTGCACCACATCAATAGAAGAAGACTGGATCCATCGTATGGACAATGCTTAAAGAAGCTTTCTCAAAAGCAACTTTAAGAAGGAATCAATAAAGAAGGACCAGAAGATATAAAGCGGGAACATCTTCACATGCTACCCCGTGACAAGCATCTTTACTTTAGCATCTTTGCTTTACAATTATTAAGAGTGTGTAAAGACCAGTGTGCCCTTAGGCTCCAGTATATAAGGAGCACCAAGGTATTGTAATAGGCATTGAAGCAAGCAAGCGAGAGCCAAAACTTCTAAGAGAGCAAGAGAGGAGCTGATCCTCTCACCCCTCTTCAAGAAGCAAAGGCGATCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTAATATGTTTGTACTTATGATTGTATTTCTCAAAAACCTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTTATATTTATCCTACACCCTTGTGATAAAATATGAAGTCATACTCGTTCTAAGATTAAATGTTCTAAGAATACTTCGAAGCATTGAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAAAAGTACCGTCAGGCCGTGTTATGGCAAGGGAAGAAGTACCATGAATACCCTATAGATGTTAGAAGGAAGGTAAGAACTAAGTATCTTATGAACAATGGGTAGCTGATTTCTGATTATCATTAACAAGTATCGTTATAATCTCTAAGCTTTGAAAGATTTACTAGTGTGGATACCAAAAGGCTGTCGTGGTTCGCCCAGTCGACGGATGAGGTCATAAACGAAGCACTAGTAGGTAACTAAGAGGCTTAGGGATGAGCAACGAGAAAGGTTAGGGGGGTGCCTAGAAA
| 64,646
|
JX255736.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Mathur,S., Dasgupta,I.
|
University of Delhi South Campus, Plant Molecular Biology
|
India
|
2012-09-03
|
Punjab
|
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,931
|
GenBank
| 1
|
India
|
India
| null | null |
1998
| null | null |
Rice tungro bacilliform virus isolate Punjab, complete genome
|
TGGTATCAGAGCAATGTTCGAACTTTAAGGGAAATTTTGATACAAACTTATACATACATTTACATATGTTCTGAAGAGGAATCTTATTTTCTCAAATATTGAGTCACGTCTTGAAAAACTTGGATTTCTAGATTTAGCAATTTGGGGATCACCAAAAACACAAAAATATAGTCTATCTACTGAAAATATAGCTTTTTATTGTTACTTTCATAAGTCTGAAAACACATCCACTACTGGACATAATCACACCTTTCATTCTGATAATAAGCAACTTAATACTATTGTAGATCTAATAGTAAAACACGCAGAAAAAACTAAAAATATTAAGGAAGAACTAGATAACTATAGTAAGTTACTAGAAAAGATATTAGAACTAAAACCCACTAAGAAGCAAATAGAAAAACTTTTGGAAAACCAAAACACTATAAACCAGAACTTTGATTATATCAAAGAGCAAAACTCTCAGATTGAAAAATCTTTGAGAAAAACTAATAAATTAGAAGATTCTATAAATACCTTGCTTGTGGAAATACAGCAAGCTAGACCTAAAGAAGTAGAACTTCGTACCCTTAAAATAGCAGAACAAAACTCTAAAGCTATAGAAAAATTTGAAAAAGAAATACAAGATCTAAGAGAAATCTTAGAATATCTTAAGCACCAATCTACATGAGTGCTGATTATCCTACCTTTAAGGAAGCCTTAGAAAAGTTTAAGGATTTAGAGTCTGAAACAGCAAACAAAGATAAATTTGGCTGGGTTTTTACTCTTCAAGGGATAAAGACAACAGCAGACGTAAATCTAGCATCTAAAGGACTAGTACAACTTTACGCTTTACAAGAAATCGATAAGAAAATAAATCATTTATCTGCACAAGTCGGCAAGATACCTACAACTAGTGGTAGCAGTAGTTCAGCAGGAGCCATAGTACCTGCAGGAAGTAATACCCAAGGTCAGTATAAAGCACCACCTAAGAAAGGAATTAAAAGGAAGTACCCAGGATGAGTCTTAGACCGTTTAGCGGTACCTCTAGAACTCTAACTCAAGATTCAGCTAGTGAATCTAACATTAAAAAAGGAAAATCTTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAGAAATAGATGTTGCTAAAGAAATAGAAAACTTTGATTGGAATAAACTATCTGGTATAAAATCTAATAAACTTTATGAGAAAAATTGGCAAGAAAAAGCCAAATTAAAACAACAATCAATAATCTCTGCTTATAAAGAAGAAGCTATTAGTGTCACAACTAATGCTTTCATCACTTCATTATTTCCTAATGAAGTTATAAAAAATGTTAAGAATCAAGGAAAACTTTATTATCATATAGGCATGATGGCCATAGGAATTAAAGGATTACATAGAAAGAAAATAGGTACTAAAGTAATGGTAATGTTTTATGATGATAGCTTTGGAAAAGCCAAAGAAGCTAGTATAGGATCAATAGAAATGGATATGAATGCAGGTTGTGGAGTATTTTACTCTTGCCCTGATTTTGCCAAATATATAAAAGACCTATCCCACCTTAAGATAGGAATTCAGACCTTAGGATATGAAAATTATGAAGGAAAAAATCTTTCCATAGCCATAAAAACTATAGGAAGACTAACAACAAACATCCAGGCTAGATATAAAATGAATGTTAAAAATATAGTAGAACAAATATCATCCCAAGGAATAACTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACACTTAGATGGGAATGAATGGAATTTAAGTAAATTTATGATTCAGGAAGGAACAAGTAGAGTTCCTAGCAAAGCCTTAATATATCAGAATCTGCATGGAGGAGAATCACTTAGATTTTCAAACTACACACAAACCAAAATGCATGATCCAACAGAAATAAATTCTGATGAAGATGAAGATTTAAAAATTCTAGGAGAACAATTAAATGCCAAAATGGCAACCCTTCAAGAAGAAACCCTAGAACAAAAATTAGAACGCATAAAAGAAGAAAAGAAACAACTACTAGTAAAACTAGAAGCCAAAAAGAAGGAAATAGAATTAAAATCCTTAAAAATGGCGGTCATAGAAGATGACTTTAACCCAAACAACGAATATCTAGATGACTCATATTCTGAATTAGAAGATTTAGAATTCGAACAATTAGGATTAACTGGTTGGGAAGATCTAGACCAAGAAAGTCTAGAAACAGAAGAAGTCACTGAATGGGAAAACCCAAACCAAGTCCTAACTAGAGAAATAAAAGCCTTTAAATCAGTATCTGAACAAATAGAAGATATATTTGGAGAATTATTAAAAGAACATGGAAATTATGACATGGCCCTAAAAAATCTTGAAGAAAGATATGATTTAAGAAACTTAGAAGGAGCCAAAAACCTAGAAGAAATAGCTAAAGCATCCACATCAAAAATGATGGATGTAAAACCAGTAAAAAGACCAAAAGAAGAACAAACAGCATATGAGGATGATATGAGAGATGATTGGAGGAGAAAAGAATTAACAGCCAATCCAGAAGTATCCTCAAAAGATAGAAATTTTGAAAGAATAGGAGGATCATATAAGAAAAACTTTTACCCCAGTAAAAGTGAAATCCTAAACCTAGACCATGTACCCCCACAATTCTACTATGACCAAATCATAACTTGGGAAGGAATAGTAAAAAACGAATGGGAAGCAAGGAAAAAGGATGGTATGGACATGTGGTCCTGGATGGATGGAAGAATAACAGGAATGGTTTTATATCTAATACAAGATTGGATATCTAAAAACCAAGCCGCTTATAATGATATAAAGTCTCGAGGAGATAGACCAGAAAATTTCGTAAAAATGGTTAAAGATAGATTCTTAATAGAAGATCCTACAGACGAGCGAAGAACAGCCTTACAAAGACTAGCTCTAAGAGAATTAGAAGCTTTAAATTGTGAGGATCCAGTTAAAATTCAGCCATTTATGGCAGAATATCTTAAGAAAGCTGCCGAAGCTAAAAAAGGATTTGATGTCATATATGTCGAAAGACTATTTGATAGACTTCCTGAGGCAGTAGGAAAACTAATAAAAAAGGAATTTCTAGATGCAGGAAATTCATATGAAGCAGGTATAGGAGTAGCTGTTTCATACATATCTACATGGATGAGATTAAAATGCATAAAAGAAACAGAAGCTAAAACACAAAAGAAAGCATCATTAGCATTCTGTCGATCCATATATACTATAGGAGATTATAAGAAAAGAAAAACATTAAAACGTGTTACAAATTATAATCGAAATAAAAGAAAAAATTATGTTAGAAAACCTAATATAAAAAGAAAGTGTAGGTGTTATATTTGCCAGGATGAAAACCACCTAGCAAACAGATGTCCTAGAAGATATGTCAATCAAGCTAGAGCCAGCATGATTGAGGGATTAGAAGAAGATATAGTTTCCATAGCTTCAGATGATGAAGACTATGAGAACTTCTTTGAAATAATAGAACTAGAAGAGTTTTTGAGTAAATCAGGACAACAAGATCACGAGCACACCTGGGAAACAGGAGGTAAGAAAGAAAAAACTTGTGATATTTGTGATTATTATACTGATTTCAATAAAACCATAGTATGCAAAACATGTGAAATACAATATTGTACTACTTGTGCTAATCAACTTGGTATAGAAGTAGAAAAAACATATAAGAAATCTAGAGAAGAAGAATTATATGATGAATTAAGAAAAACAGTTGTCAACCTAGATCTAAGATTGACAATAGTTGAACATAAACTAGAAATGAATAAATTACAAGAACAATTTGATTCCTTGCAATTATCTAAAGAACCTAGTTCTTCAGAAACTATAAAAGCTTTAGCTATGCAAGCAAAAGAATCAAATTTTATAAAAACAAATATAAATAGAACAGCAGGATGTTATGTAGAGGTTAAATTAACTTTCTTAAATAACTCAAAAATAACCACTGCATTAATAGATTCAGGATCAACACATAATATTATCTGTCCCTTATTGGTACCAGAAATATGGGTCAAAAGCCTGAATTTAGATATTGTTATGACAACAATAGATAACAGCAAATATAGCTTAAATCGAGGATTACATGATGACGTAAAAATACAATTTAAAGAAGTAGATGAAAGTTTTGGAATAAAATACAGTTTGGGACAAACATATGTTGCCCCTAAACCAACTGGAACTTTCATAATTGGACATAGATTTATGACCAGTGAACATGGTAGTATTACAATTCATAAAGATTACGTTACAATCCAAAAAACTACGGGAATCTACCCCACAGCTCGTCATGAACTCAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACAAAGACCCCTATTTTCAAACATTCCAGAAACCTACAACAAAATTCCAAAATTATATGGGTATAAGAGTGAAATAGAAGATAAAAACCTACTTACTCTTATAAAAGAGTTAGAATATTTGGGATATATAGGCGATGATATAACAAAAAATAAAACCAATTGGGTATGTGACTTCAAAATCATTAACCCAGATATAAACATCACTTGTAACACAATCCCATATACCCCAGCAGACAAAGAAGTCTTTGAAAAACAAATCAAAGAACTCTTGGATAATAAGTTAATAAGGAAAGCAAGTCCTACTTGCAGACATAGAACTGCAGCTTTTGTAGTAAGAAACCATTCTGAGGAAGTAGCACAGAAGCCTCGAATAGTTTATAACTATAAAAGACTGAATGATAATATGGTTACAGATCCTTTCAATATTCCACATAAAATCTCTATGATAAATTTATTACAGAGAGCTAGAATATTCTCTAAGTTCGACTTGAAAGCAGGGTTTCATCATATGAAACTTAAAGAAGATTTTAAAGATTGGACAACCTTTACTTGTTCTGAAGGATTATATACTTGGAATGTCTGTCCATTTGGTATAGCTAACGCTCCATGCGCATTTCAAAGATTTATGCAGGAATCCTTTGGAGATTTAAAGTTTGCATTATTATACATAGATGACATCTTAATTGCATCAAGTAATGAACAAGAGCATATTAAGCATCTTAAGTTATTCTTCACTAGAGTTAAAGAAGTAGGTTGTGTCCTTAGTAAGAAAAAATCAAAAATGTTCCTGAAAGAAGTAGAATACTTAGGAGTGGAGATAAAAGAAGGAAAGATTAGCTTACAACCACACATAGTGGAAAAGATAAAGAAGTTTGATAAAAGCAAGTTGAGTACCCTAAAGGGATTACAGGCATATCTAGGCCTACTCAATTATGCTAGAGGATACATTAAAGACCTATCAAAGTTGGTAGGACCACTATATAAAAAGACTGGCAAGAGTGGCCAGCGAACCTTTAATAAAGAAGATTGGAATATAATTTTTAAGATAGAAAGAGAAGTTGATAAGATTAAACCTTTAAGTAGACCAGAAGAATCTGACTACATAATAATAGAGACAGATGCATCAGAAGAAGGATGGGGAGCAGTCTTAATCTGCAAACCTGATAAATATGCTAGCAAAGATACTGAAAAGATAGCAGGTTATGCATCAGGAAACTTTGGAGAAAAGAAGACCTGGACTAGTTTAGATTATGAGATCGAAGCTATAAACGAAGCATTAAATAAGTTTCAGATATATTTAGATAGAGACTTTACAATCAGAACAGATTGTGAGGCAATAGTTAAAGGCATAAAAACAGAAGATTACAAAAAGAGATCCAAGACAAGATGGATTAAACTAAGAGATAATCTTCTTAAAGATGGATACAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAAGGAAACAAAAACTTTTTGCCAAACTTCCTATCCCGCGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAACACGGCTTCAATTATAGAATCTTCGGATTCACGATCTTCAACTATAGAATCTTCGGATTCACAGTCTTCAATTAAAGAATCTTTGGATTCACGGACTCCAACTAAAGAATCTTCGGATTCATCTTGCAGGATAAAACTTCATCCTCTGTCCTCAAGGCAGAAGGTGAAAGGCGAGTAATCGCTAAAGTTCTTGGCGTTTCCATCAATAAAGAGTGTTCATACTCAATCCACCATCTCGGCAAAAACCGAGTCCCCATATATAAACAGGGAAACCTGTTCCACAGTGAGTTTACTGGTAGGCTTAGCCACTTATCAAACGGTCTTATAGACCACCTTTTTACATTTTCTGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACCTTATATCAGAGCATATCTACAATAAAGAATTTGAAATACAGACCTATAGTCTCGAGTGTGAGAAACTAAGAGAGCAGGTTAGCCACTTAAAAAATACTATTGAAACACAAAAACAACAGATAAGAGAGATGAGAGATAAAATTGAGGGACTGAGAGAGCCACTCAAAAAGCCCATATACACAACCCAGGATAAGGAAGCACTTCGTAACTTCTTTTGCAAAGAAAGAAGCATGGAGTACATTTATCACCACATAAAGAGGTTAGCTCGAGAGAGCTATTACTCACATCTAAATAAACTTCAGAAAGATATGGAATTCCTTAGGGGATTTTACTTATCTTTCTTAACAAATGTCAAGTTTCTAGTTCTCTTTGAGACTGGACTCTGGACAACTGAAAATATTGAAAGCCACTTCTTCAACAACAGCAGTCTCTTCATAACCCAGGAAGAAGGAGAAAGGCAGATGACAAAAGGATTGCTAGAAAAGAACAGTGAAGATGAAGCTGGAAGATACATCCTGACATCAGGATTTGTGTCTGACCTATACGCTCATGGATTCATAAAACAGATAAACTTCACTAATAAACTCCCAGAAGGTATTCCTTTAGTCATAAGAGAAAAGATAATGCAGTATAAATTCCCAGGAGCAAATACTATCTTAATTGAGAAAGAAATCCCAAAATGGGACTTTGATCTCATGAAGAGAAGCACAACATTCAGGACTCAGATTTACATTCTCCAAGGACATAGAAACTTTTATGGATTTTCACCCATAAAATCCTATGAACCCATTACACCCGAAGAGTTCGGAATAGAATATTACAGCTGGGAACAGATCTATGAAGATGATGAAGCAGACGTCGTCTATCAATCAATAAGCACCAGAATCTCTAAAGTTGTAAGGGAGTATGCTTGGCCATGTGATGACAGCGACATCATGTCCTGCACTACCTCAATGGAAGAAGAATATGCCCACAGGCTGGAGGCATAAAGAGATGCTCCAAAGATAAAAGAACAGAGCATCAAAGCATCAATAAAAGAAGACTGAAGACATAAAGGAGGAATCCACTTTAAATTATTGTACCTCTACAATTATTGTACGAAATGTCTAGACTACCCCTGAACCCTCCTATATAAGGAGAAGTAGTCTGCATGTAATAGGCATCGAATCCGAAATACACACACCCAGAGTAGCACACACTTCCACGAGAGCAAGAGAAGAGCTGATCTTCTCACTTCCTCTCCAAAGAAGGATTAGCTGCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTAATATGTATTGTATTATGTTTGTATCATCAAGAACTTATCCGCCGCATGAATAAAGCTCTATATTGTTGTTTACACTCCTTCGATAAGATATGAAGCCATACTCGTTTCTTAATCAATAGTTCTAAGTTAATTCTAGCATGAAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAGAAGTACCGTCAGGGCGTGTGATGCCAAGGGAACAAGTACCATGAATACCCTAATAAGTGCTAGAAGGAAGATAAGAACTAACGAAACAAGGAACATTTGGTAGCTGGTTTCTGATTATCATTATCAAGTAGCTCTTCCTCATCACGAAAACTGCAAAGGCCTGCCAACCCTAGGCTGAAACAGTGACTAGGCCGAGGAATTGCGAAAAGATAGGGGGGTGCCCGCATC
| 96,297
|
HQ385226.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Sharma,S., Rabindran,R., Robin,S., Dasgupta,I.
|
University of Delhi South Campus, Department of Plant Molecular Biology
|
India
|
2011-02-01
|
Kanyakumari
|
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,934
|
GenBank
| 1
|
India:Kanyakumari
|
India
|
Oryza sativa
| null |
2007-12
| null | null |
Rice tungro bacilliform virus isolate Kanyakumari, complete genome
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGAACTTTAAGGGAAATTTTGATACAAACTTATACATACATTTACATATGTTCTGAAGAGGGATCTTACTTTCTCAAATATTGAGTCACGTCTTGAAAAACTTGGATTTCTAGATTTAGCAATTTGGGGATCACCAAAAACACAAAAATATAGTCTATCTACTGAAAATATAGCCTTTTATTGTTACTTTCATAAGCCTGAAAACACATCCACTACTGGACATAATCACACCTTTCATTCTGATAACAAGCAACTTAATACTATCGTAGATTTAATAGTTAAGCACGCAGAAAAAACCAAAAATATTAAGGAAGAACTAGATAACTATAGTAAGTTACTAGAAAAGATCTTAGAACTAAAGCCTACTAAGAAGCAAATAGAAAAACTTTTGGAAAACCAAAACACCATAAACCAGAACTTTGATTATATCAAAGAGCAAAACTCTCAAATTGAAAAATCTTTGAGAAAAACGAATAAATTAGAAGACTCTATAAACACCTTGCTTATAGAAATACAGCAAGCTAGACCTAAAGAAGTAGAACTTCGTACTCTTAAAATAGCAGAACAAAACTCTAAAGCTATAGAAAAATTTGAAAAAGAAATACAAGATCTAAGAGAAATCTTAGAATATCTTAAGCACCAATCTACATGAGTGCTGATTATCCTACCTTTAAGGAAGCCTTAGAAAAATTTAAGGATTTAGAGTCTGAAACAGCAAACAAAGATAAGTTTGGCTGGGTTTTTACTCTTCAAGGGATAAAAACAACAGCAGACGTAAATCTAGCATCTAAAGGACTAGTACAACTTTACGCTTTACAAGAAATCGATAAGAAAATAAATAATTTATCTGCACAAGTTGGTAAAATACCTACAACTAGTGGTAGCAGTAGTTCAGCAGGAGCCATAGTACCTGCAGGAAGTAATACCCAAGGTCAGTATAAAGCACCACCTAAGAAGGGAATTAAAAGAAAGTATCCAGGATGAGTCTTAGACCGTTTAGCGGTACCTCTAGAACTCTAACTCAAGATTCAGCTAGTGAATCTAATATTAAAAAAGGAAAATCTTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAGAAATAGATGTTGCTAAGGAAATAGAAAACTTTGATTGGAATAAATTATCTGGTATAAAATCAAATAAACTTTATGAGAAAAATTGGCAAGAAAAAGCCAAATTAAAACAACAATCAATAATTTCTGCATATAAAGAAGAAGCTATTAGTGTCACGACTAATGCCTTCATTACTTCATTATTCCCTAATGAAGTCATAAAAAATGTTAAGAATCAAGGAAAACTTTATTATCATATAGGCATGATGGCCATAGGAATTAAGGGATTACATAGAAAGAAAATTGGCACTAAAGTAATGGTAATGTTTTATGATGATAGCTTTGGGAAAGCCAAAGAAGCTAGTATAGGATCAATAGAAATGGATATGAATGCAGGTTGCGGAGTATTTTACTCTTGCCCTGACTTCGCTAAATATATAAAAGACCTATCCCATCTCAAGATAGGAATTCAGACCCTAGGATATGAAAATTATGAAGGAAAAAATCTTTCCATAGCCATAAAAACTATAGGAAGATTAACAACAAATATCCAGGCTAGATATAAAATGAATGTCAAAGATATAGTTGAACAAATATCATCCCAAGGAATAACTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACATTTAGATGGGAATGAATGGAACTTAAGTAAATTCATGATACAGGAAGGAACAAGTAGGGTTCCTAGTAAAGCCCTAATATATCAAAATCTGCGTGGAGGGGAATCACTTAGGTTTTCAAACTATGCACAAACTAAAATGCACGATCCAACAGAAATAAATTCTGATGAAGATGAAGATTTGAAAATTCTAGGAGAACAATTAAATGCCAAAATGGCAACATTTCAAGAAGAAACCCTAGAACAAAAATTAGAACGCATAAAAGAAGAAAAGAAACAACTTCTAGCAAAACTAGAAGCTAAAAAGAAAGAAATTGAATCAAAATCCTTAAAAATGGCAGTCATAGAAGATGACTTTAACCCAAACAACGAATATCTAGACGATTCATATTCTGAATTAGAAGATCTAGAATTCGAACAATTAGGATTAACTGGTTGGGAAGATCTAGACCAAGAAAGTCTAGAAACAGAAGAAATTACTGAATGGGAAAACCCAAACCAAGTCCTAACTAGAGAAATCAAAGCCTTTAAATCAGTCTCTGAACAAATAGAAGATATATTCGGAGAATTATTAAAAGAACATGGAAATTATGACATGGCCCTAAAAAATTTAGAGGAAAGATATGATCTAAAAAACTTAGAAGGAGTCAAAAATTTAGAAGAAATAGCTAAAGCATCCACATCAAAAATGATGGATGTAAAACCAGTAAAAAGACCAAAAGAAGAACAAACGGCATATGAAGATGATATGAGAGATGATTGGAGAAGAAAAGAGTTAACAGCCAATCCAGAAGTATCTTCAAAAGATAGAAACTTCGAAAGAATAGGAGGATCATATAAGAAAAACTTTTACCCAAGTAAAAGTGAAATCCTAAACCTAGATCATGTACCCCCACAATTTTACTATGACCAAATCATAACTTGGGAAGGAATAGTAAAAAACGAATGGGAAGCCAGAAAAAAGGATGGAATGGACATGTGGTCTTGGATGGATGGAAGAATAACAGGAATGGTTTTATATCTAATACAAGATTGGATATCTAAAAACCAAGCCGCCTATAATGATATAAAATCTCGAGGAGATAGACCAGAAAACTTCGTAAAAATGGTAAAAGATAGGTTCTTAATAGAAGATCCTACAGATGAAAGAAGAACAGCCCTACAAAGGTTAGCCCTAAGGGAATTAGAAGCCTTAAACTGTGAAGATCCAGTTAAAATTCAGCCATTTATGGCAGAATACCTTAAGAAAGCTGCTGAAGCTAAAAAAGGATTTGATGTCATATATGTCGAAAGACTATTTGACAGACTTCCTGAAGCAGTAGGAAAACTAATAAAAAAGGAATTTCTAGATGCAGGAAATTCATATGAAGCAGGCATAGGAGTAGCTGTTTCATACATATCTACATGGATGAGATTAAAATGCATAAAAGAAACAGAAGCTAAAACACAAAAGAAAGCATCATTAGCATTCTGTCGATCTATATATACTATAGGAGATTATAAGAAAAGAAAAACACCAAAACGTGTTACGAACTATAATAGAAACAAAAGGAAGAATTATGCTAGAAAACCTAACATAAAAAGAAAGTGTAGGTGTTATATTTGCCAGGATGAAAACCACCTAGCAAACAGATGCCCTAGAAGATATGTCAATCAAGCTAGAGCGAGCATGATTGAAGGATTAGAGGAAGATATAGTTTCCATAGCTTCAGACGATGAAGACTATGAGAACTTTTTTGAAATAATTGAATTAGAAGAATTTTTAAGTAAATCAGGACAACAAGATCACGAGCACACCTGGGAAACAGGAGGTAAGAAAGAAAAAACTTGTGATATTTGTGATTATTATACTGATTTCAATAAAACCATAGTATGCAAAACATGTGAAATACAATATTGTACTACTTGCGCTAATCAACTTGGTATAGAAGTAGAAAAAACATATAAGAAATCTAGAGAAGAAGAATTATGTGATGAATTAAGAAAAACAATCGTCAATCTAGATCTAAGGTTGACAATAGTTGAACATAAACTAGAAATGAATAAATTACAAGAACAATTTGATTCCTTGCAATTATCTAAAGAACCTAGTTCTTCAGAAACCATAAAAGCCTTAGCCATGCAAGCAAAAGAATCAAATTTCATAAAAACTAACATTAATAGAACAGCAGGATGTTATGTAGAAGTTAAATTAACTTTCCTAAATAATTCAAAAATAACCACTGCATTAATAGATTCCGGTTCAACACATAATATTATCTGTCCATTATTGGTACCAGAAATATGGGTTAAAAGCCTGAACTTAGATATTGTTATGACCACAATAGACAACAGTAAATATAGCCTCAACAGAGGACTACATGATGAAGTAAAAATACAATTTAAAGAAGTCGATGAAAGTTTTGGGATAAAATACAGTTTGGGACAAACATATGTTGCCCCTAAACCAACTGGAACTTTCATAATTGGACATAGATTTATGACCAGTGAACATGGTAGTATTACAATTCATAAAGACTATGTTACAATCCAAAAAACCACGGGAATCTACCCCACTGCTCGTCATGAACTCAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACAAAGACCCCTATTTTCAAACATTCCAGAAACCTACAACAAAATTCCAAAATTATACGGGTATAAGAGTGAAATAGAAGATAAAAATTTACTTACTCTTATTAAAGAACTAGAATATTTGGGATATATCGGAGACGATATAACAAAAAATAAAACTAATTGGGTATGTGACTTCAAAATCATTAACCCAGATATAAATATCACTTGCAACACAATCCCATATACCCCAGCAGATAAAGAAGTCTTTGAAAAACAAATCAAAGAACTGTTAGATAACAAGTTAATAAGGAAAGCAAGTCCTACTTGCAGACATAGAACTGCAGCATTTGTAGTAAGAAACCACTCTGAAGAAGTAGCACAAAAACCAAGAATAGTTTATAACTACAAAAGATTAAATGATAATATGGTTACAGATCCTTTTAATATCCCACATAAGATTTCTATGATAAATCTATTACAAAGAGCTAGGATATTCTCTAAATTTGATTTGAAAGCAGGATTTCATCATATGAAACTTAAAGAAGATTTTAAAGATTGGACAACTTTTACTTGTTCTGAAGGATTATATACTTGGAATGTCTGTCCATTTGGTATAGCTAACGCTCCATGTGCATTTCAAAGATTTATGCAGGAATCCTTTGGAGATTTAAAGTTTGCATTATTATACATAGATGACATCCTAATTGCATCAAGTAATGAACAAGAGCATATTAAGCACCTTAAGTTATTCTTTACTAGAGTTAAGGAAGTAGGTTGTGTCCTTAGCAAGAAAAAATCAAAAATGTTCCTAAAAGAAGTGGAATACTTAGGAGTGGAGATAAAGGAAGGAAAGATTAGCCTACAACCACACATAGTGGAAAAGATAAAGAAGTTTGATAAGAGCAAGTTGAGTACCCTAAAGGGATTACAGGCATATCTAGGCCTACTCAATTATGCTAGAGGATACATTAAAGACCTATCAAAGTTGGTAGGACCACTATATAAAAAGACTGGCAAGAGTGGCCAACGAACCTTTAATAAAGAAGATTGGAATATAATCTTTAAGATAGAAAGAGAAGTTGATAAGATTAAACCTTTAAGTAGACCAGAAGAATCTGACTACATAATAATAGAGACAGATGCATCAGAAGAAGGATGGGGAGCAGTCTTAATTTGCAAACCTGATAAATATGCTAGCAAAGATACTGAAAAGATAGCAGGTTATGCATCAGGAAACTTTGGAGAAAAGAAGACTTGGACTAGTTTAGATTATGAGATCGAAGCTATAAACGAAGCATTAAATAAGTTTCAGATATATTTGGATAGAGACTTTACAATTAGAACAGATTGTGAGGCAATAGTCAAAGGCATAAAAACAGAAGATTACAAAAAGAGATCCAAGACAAGATGGATCAAACTGAGAGATAATCTTCTTAAAGATGGATACAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAAGGAAACAAAAACTTTTTGCCAAACTTCCTATCCCGCGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAACACGACTTCAACTATAGAATCTTCGGATTCACGATCTTCAACTATAGAATCTTCGGATTCACAGTCTTCAATTAAAGAATCTTTAGATTCATGGACTCCAACTAAAGAATCTTCGGATTCATCTTGCAGGATAAAACTTCATCCTCTGTCTTCAAGGCAGAAGGTGAAAGGCGAGTAATCGCTAAAGTACACGGTGTTTCCATCAATAAAGAGTGCCCATACTCAATCCACCACCTCGGTAAAAACCGAGTCCCCATATATAAACAGGGAAACCTGTTTCACAGTGAGTTTACTGGTAGGCTTAGCCACTTATCAAACGGTCTTATAGATCATCTTTTTACATTTTCAGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACCTTATATCAGAGCATATCTACAATAAAGAATTTGAAATACAGACCTATAGTCTTGAGTGTGAGAAATTAAGAGAGCAGGTTAGCCACTTAAAAAATACTGTTGAAACACAAAAACAACAGTTAAGAGAGATGAGAGATAAACTAGAGGGACTGAGAGAGCCACTCAAAAAGCCTATATACACAACCCAGGATAAGGAAGCACTTCGTAACTTCTTTTGCAAAGAAAGAAGTATGGAGTACATTTATCACCACATAAAGAGGTTAGCTCGAGAGAGCTATTATTCACATCTGAATAAACTTCAGAAGGATATGGAATTCCTCAGGGGATTCTACTTATCTTTCTTAACGAACGTCAAGTTTCTAGTTCTCTTTGAGACTGGACTCTGGACAACTGAAAATATCGAAAGTCACTTCTTCAACAATAGCAGTCTCTTCATAACCCAGGAAGAAGGAGAAAGGCAGATGACAAAAGGATTGCTAGAAAAGAACAGTGAAGATGAAGCTGGAAGATACATTCTGACATCAGGATTTGTGTCTGACCTATACGCCCATGGATTCATAAAACAGATAAACTTCACTAATAAGCTCCCAGAAGGCATTCCATTAGTCATAAGAGAAAAAATAATGCAGTATAAGTTCCCAGGAGCAAATACTATCTTAATTGAGAAAGAAATCCCAAAATGGGACTTTGATCTCATGAAAAGAAGCACAACATTCAGAACTCAGATTTACATTCTCCAAGGTCATAGAAACTTTTATGGATTTTCACCCATAAAATCCTATGAACCCATTACACCCGAAGAGTTCGGAATAGAATATTACAGCTGGGAACAAATCTATGAAGATGACGAAGCAGACGTTGTCTATCAATCAATAAGCACCAGAATCTCCAAAGTTGTAAGGGAGTATGCTTGGCCATGTGATGACAGCGACATCATGTCCTGCACCACCTCAATGGAAGAAGAATATGCCCACAGGCTGGAGGCATAAAGAGATGATCCAAAGATAAAGGAACAAAGCAGCAAAGCATCAATAAAAGAAGACTGAAGACATAAAGGGGGAATCCACTTTAAATTATTGTACCTCTACAATTATTGTAAGAGTGTGTAAAATCTAGCCTACCCCTGAACACTCCTATATAAGGAGAAGTAGTCTGCATGTAATAGGCATTCGAAATCCACACACCCAGAGTAGCACACACTTCCACAAGAGCAAGAGAAGAGCTGATCTTCTCACCTCCTCTCCAAAGAAGGATTAGCTGCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTCATATGTATTGTATCATGTTTGTATCATCAAGAACTTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTATATTGTTGTTTACACTCCTTAGATAAGATATGAAGCCATACCCGTTTCTTAAATCAATAGTTCTAAGATAATTCTAGCATGAAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAGAAGTACCGTCAGGGCGTGTGATGCCAAGGGAACAAGTACCATGAATACCCTAATAAGTGCTAGAGGGAAGATAAGAACTAACGAAATAAGGAACATTTGGTAGCTGGTTTCTTATTATCATTATCAAGTAGCTCTTCCTCATCACGAAAACTGCAAAGGCCTGCCAACCCTAGGCTGAAACAGTGACTAGGCCGAGGAATTGCGAAAAGATAGGGGGGGTGCCTACATC
| 99,742
|
FN377814.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Banerjee,A., Roy,S., Tarafdar,J., Senapati,B.K.
|
to the INSDC. Roy S., Department of Plant Breeding, Faculty of Agriculture, BCKV State Agriculture University, Mohanpur, West Bengal, India-741252
|
India
|
2009-05-08
|
Chinsura West Bengal
|
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,928
|
GenBank
| 1
|
India:Chinsura, West Bengal
|
India
| null | null |
2008-04
| null | null |
Rice tungro bacilliform virus, complete genome, isolate Chinsura West Bengal
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGACTTAAGGGAGTTTTGATACAACTTATACATACATTTACATATGTTCTAAAGAGGAATCTTATTTTCTCAAATATTGAGTCACGTCTTGAAAAACTTGGATTTCTAGATTTAGCAATTTGGGGATCACCAAAAACACAAAAATATAGTCTATCTACTGAAAATATAGCCTTTTATTGCTACTTTCATAAACCTGAAAACACATCCACTACTGGACATAATCACACCTTTCATTCTGATAATAAGCAACTTAATACTATTGTAGATCTAATAGTAAAACACGCAGAAAAAACCAAAAATATTAAGGAAGAACTAGATAACTATAGTAAGTTACTAGAAAAGATCTTAGAACTTAAACCTACTAAGAAGCAAATAGAAAAACTTTTGGAAAACCAAAATACTATAAACCAGAACTTTGATTATATCAAAGAACAGAACTCTCAGATTGAAAAATCTTTGAGAAAAACCAATAAACTAGAAGACTCTATAAATTCCTTGCTTATAGAAATTACAGCAAGCAAGACCAAAGAAGTAGAACTTCTAAAATATAGTTATCTTAAATTGCAAACAAATCTAAAGATTATAGAAAAATTTGAAAAAGAAATACAAGATCTAAGAGAAATCTTAGAATATCTCAAGCACCAATCTACATGAGTGCTGATTATCCTACCTTTAAGGAAGCCTTAGAAAAATTTAAGGATTTAGAGTCTGAAACAGCAAACAAAGATAAGTTTGGCTGGGTTTTTACTCTTCAAGGGATAAAAACAACAGCAGACGTAAATCTAGCGTCTAAAGGACTAGTACAACTTTACGCTTTACAAGAAATCGATAAGAAAATAAATAATTTATCTGCACAAGTTGGTAAGATACCTACAACTAGTGGTAGCAGTAGTTCAGCAGGAGCCATAGTACCTGCAGGAAGTAATACCCAAGGTCAGTATAAAGCACCACCTAAGAAAGGAATTAAAAGGAAGTATCCAGGATGAGTCTTAGACCGTTTAGCGGTACCTCTAAAACTCTAACTCAAGATTCAGCTAGTGAATCTAATATTAAAAAAGGAAAATCTTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAAGAATAGATGTTGCTAAGGAAATAGAAAACTTTGATTGGAATAAATTATCTGGTATAAAATCTAATAAACTTTATGAGAAAAATTGGCAAGAAAAGGCCAAATTAAAACAACAATCAATAATCTCGGCTTATAAAGAAGAAGCTATTAGTGTTACAACTAATGCTTTCATCACTTCATTATTCCCCAATGAAGTTATAAAAAATGTTAAGAATCAAGGAAAACTTTACTATCATATAGGCATGATGGCCATAGGAATTAAAGGATTACATAGAAAGAAAATAGGTACTAAAGTAATGGTAATGTTTTATGATGATAGCTTTGGTAAAGCTAAAGAAGCTAGTATAGGATCAATAGAAATGGATATGAATGCAGGTTGCGGAGTATTTTACTCTTGCCCTGATTTTGCCAAATATATAAAAGACCTATCCCATCTTAAGATAGGAATACAAACCCTAGGATATGAAAATTATGAGGGGAAAAATCTTTCCATAGCCATAAAAACTATAGGAAGATTAACAACAAATATCCAGGCTAGATATAAAATGAATGTCAAAGATATAGTTGAACAAATATCATCCCAAGGAATAACTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACATTTAGATGGGAATGAATGGAATTTAAGTAAATTTATGATTCAAGAAGGAACAAGTAGAGTTCCTAGTAAAGCCCTAATATATCAAAATCTGCATGGAGGAGAATCACTTAGATTTTCAAACTATACACAAACCAAAATGCATGATCCAACAGAAATAAATTCTGATGAAGATGAAGATTTAAAAATTTTAGGAGAACAATTAAATGCCAAAATGGCAACCCTTCAAGAAGAAACCTTAGAACAAAAATTAGAACGAATAAAAAGGGAAAAGAAACAAGTTCTAGCAAAGTTAGAAGCTAAAAAGAATGAAATTGAATCAAATCCTTACAAAATGGCAGTCATAGAAGATGACTTTAACCCAAACAACGAATATCTAGATGATTCATATTCTGAATTAGAAGATCTAGAATTCGAACAATTAGGATTAACTGGTTGGGAAGACCTAGACCAAGAAAGTCTAGAAACAGAAGAAATCACTGAATGGGAAAACCCAAACCAAGTCCTAACTAGAGAAATTAAAGCCTTCAAATCAGTCTCCGAACAAATAGAAGATATATTTGGAGAATTATTAAAAGAACATGGAAATTATGACATGGCCCTTAAAAATCTAGAAGAAAGATATGATTTAAAAAATTTAGAAGGAGCCAAAAACCTAGAAGAAATAGCTAAAGCATCCACATCAAAAATGATGGATGTAAAACCAGTAAAAAGACCAAAAGAAGAACAAACAGCATACGAAGATGATATGAGAGATGATTGGAGAAGAAAAGAATTAACAACCAATCCAGAAGTGTCCTCAAAAGATAGAAACTTTGTAAAAATAGGAGGATCATATAAGAAAACTTTCTACCCCAGTAAAAGTGAAATCCTAAACCTAGATCATGTACCCCCACAATTCTACTATGACCAAATCATAACTTGGGAAGGAATAGTAAAAAACGAATGGGAAGCAAGAAAAAAGGATGGTATGGACATGTGGTCTTGGATGGATGGAAGAATAACAGGTATGGTTTTATATCTAATACAAGATTGGATATCTAAAAACCAAGCCGCTTACAATGATATAAAATCTCGAGGAGATAGGCCAGAAAATTTCGTAAAAATGGTAAAAGATAGGTTCTTAATAGAAGATCCTACAGATGAAAGAAGAACAGCCTTACAAAGATTAGCTCTAAGAGAATTAGAAGCTTTAAATTGTGAGGATCCAGTTAAAATTCAGCCATTTATGGCAGAATATCTTAAGAAAGCTGCCGAAGCTAAAAAAGGATTTGATGTCATATATGTCGAAAGACTATTGGACAGACTTCCTGAGGCAGTAGGAAAACTAATAGCCACAGGATTTCTAGATGCAGGAAATTCATATGAAGCAGGCATAGGAGTAGCTGTTTCATATATTTCTACATGGATGAGATTAAAATGCATAAAAGAAACAGAAGCTAAAACACAAAAGAAAGCATCCTTAGCATTCTGTCGATCCATATACACTATAGGAGATTATAAGAAAAGAAAAACACTAAAACGTGTTACGAACTATAATAGAAACAAAAGGAAGAATTATGTTAGAAAACCTAACATAAAAAGGAAGTGTAGATGTTATATTTGCCAGGATGAAAACCACCTAGCAAACAGATGTCCAAGAAGATATGTCAATCAAGCTAGAGCTAGCATGATTGAAGGATTAGAAGAAGATATAGTTTCCATAGCTTCAGATGATGAAGACTATGAGAACTTCTTTGAAATAATCGAACTAGAAGAGTTTTTGAGTAAATCAGGACAACAAGATCACGAGCACACCTGGGAAACAGGAGGTAAGAAAGAAAAAACTTGTGATATTTGTGATTACTATACTGATTTCATTAAAACCATAGTATGCAAAACATGTGAAATACAATACTGTACTACTTGTGCCAATCAATTAGGTATAGAAGTAGAAAAAACATATAAGAAATCTAGAGAAGAAGAATTATATGATGAATTAAGAAAAACAGTTGTCAACCTAGATCTAAGATTGACAATAGTTGAACATAAACTAGAAATGAATAAATTACAAGAACAATTTGATTCTCTGCAATTATCTAAAGAACCTAGTTCTTCAGAAACTATAAAAGCTTTAGCTATGCAAGCAAAAGAATCAAATTTCATAAAAACTAATATTAATAGAACAGCAGGATGTTATGTAGAAGTTAAATTAACCTTCTTAAACAACTCAAAAATAACTACTGCATTAATAGATTCAGGTTCAACACATAATATTATCTGCCCAAATTTGGTACCAGAAATATGGGTTAAAAGCATCGATCTCGATATTGTTATGACCACAATAGACACAAGCAAATATAGCTTAAATAGAGGATTGCATGATGAAGTAAAAATACAGTTTAAAGAAGTTGATGAAAGTTTTGGAATAAAATATAGTTTGGGACAAACATATGTTGCCCCTAAACCAACTGGAACTTTCATAATTGGACATAGATTTATGACTAGTGAACATGGTAGTATTACAATTCATAAAGACTATGTTACAATCCAAAAAACTACGGGAATTTACCCCACTGCTCGTCATGAACTCAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACAAAGACCCCTATTTTCAAACATTCCAGAAACCTACAACAAAATTCCAAAATTATATGGATATAAGAGTGAAATAGAAGATAAAAATTTACTTACTCTTATAAAAGAGTTAGAATATTTGGGATATATAGGAGATGACATAACAAAAAATAAAACTAATTGGGTATGTGACTTCAAAATCATTAACCCAGATATAAATATCACTTGCAACACAATCCCATATACCCCAGCAGATAAAGAAGTTTTTGAAAAACAAATCAAAGAACTTTTAGATAATAAGTTAATAAGGAAAGCAAGTCCTACTTGTAGACATAGAACTGCAGCATTTATAGTAAGAAACCATTCTGAGGAAGTAGCACAGAAGCCTAGAATAGTTTATAACTATAAAAGATTAAATGATAATATGGTTACAGATCCTTTCAATATTCCACATAAGATTTCTATGATAAATCTATTACAAAAAGCTAGGATATTCTCTAAGTTTGATTTAAAAGCAGGATTTCATCATATGAAACTTAAAGAAGATTTTAAAGATTGGACAACCTTTACTTGTTCTGAAGGATTATATACTTGGAATGTCTGTCCATTTGGTATAGCTAACGCTCCATGTGCATTTCAAAGATTTATGCAGGAATCCTTTGGAGATTTAAAGTTTGCATTATTATACATAGATGACATCTTAATTGCATCAAGTAATGAACAAGAGCATATTAAGCATCTTAAGTTATTCTTTACTAGAGTTAAGGAAGTAGGTTGTGTCCTTAGTAAGAAAAAATCAAAAATGTTCCTAAAAGAAGTAGAATACTTAGGAGTGGAGATAAAGGAAGGAAAGATTAGCCTGCAACCACACATAGTAGAAAAGATAAAGAAGTTCGATAAAAGCAAGTTGAGTACCCTAAAGGGATTACAGGCATATCTAGGCCTACTTAATTATGCTAGAGGATACATTAAAGACCTATCCAAGTTGGTAGGACCACTATATAAAAAGACTGGCAAGAGTGGCCAGCGAACCTTTAATAAAGAAGATTGGAATATAATCTTTAAGATAGAAAGAGAAGTTGATAAGATTAAACCTTTGAATAGACCAGAAGAATCTGACTACATTATAATAGAGACAGATGCATCAGAAGAGGAGGGGGGAGCAGTCTTAATCTGCAAACCTGATAAATATGCTAGCAAAGATACTGAAAAGATAGCAGGTTATGCATCAGGAAACTTTGGAGAAAAGAAGACTTGGACTAGTTTAGATTATGAGATCGAAGCTATAAACGAAGCATTAAATAAATTTCAGATATATTTAGATAGGGACTTTACAATTAGAACAGACTGTGAGGCAATAGTTAAAGGCATAAAAACAGAAGATTACAAAAAGAGATCCAAGACAAGATGGATTAAACTAAGAGATAATCTTCTTAAAGATGGATATAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAAGGAAACAAAAACTTTTTGCCAAACTTCCTATCCCGTGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAACACGGCTTCAATTATAGAATCTTCGGATTCACGATCTTCAACTATAGAATCTTCGGATTCACAGTCTTCAATTAAAGAATCTTTGGATTCACGGACTCCAACTAAAGAATCTTCGGATTCACCTTGCAGGATAAAGCTTCATCCTCTGTCTTCAAGGCAGAAGGTGAAAGGCGAGTAATCGCTAAAGTTCACGGTGTTTCCATCAATAAAGAGTGCCCATACTCAATCCATCACCTCGGTAAAAACCGAGTCCCCATATATAAACAGGGAAACCTGTTCCACAGTGAGTTTACTGGTAGGCTTAGCCACTTATCAAATGGTCTTATAGACCACCTTTTTACATTTTCAGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACCTCATATCAGAGCATCTCTATAATAAAGAGTTTGAAATACAAACCTATAGTCTTGAGTGTGAGAAATTAAGAGAACAGGTTAGCCACTTAAAAAACACTGTTGAAATACAAAAACAACAGTTAAGAGAGATGAAAGATAAACTAGAGGGACTGAGAGAACCACTTAAAAAGCCTATATACACAACCCAAGATAAGGAAGCACTTCGTAACTTCTTCTGCAAAGAAAGAAGTATGGAGTATATTTTTCATCACATAAAGAGGTTAGCTCGCGAGAGCTATTACCCGCACCTTAATAAACTACAGAAGGATATGGAATTCCTCAGGGGATTCTACTTATCTTTCTTAACGAACGTCAAGTTTCTAGTTCTCTTTGAAACTGGACTCTGGACAACTGAAAATATTGAAAGTCACTTCTTCAACAACAGTAGTCTCTTCATAACCCAGGAAGAAGGAGAAAGGCAGATGACAAAAGGATTGCTAGAAAAGAACAGTGAAGATGAAGCTGGAAGATACATCCTGACATCAGGATTTGTGTCGGACCTATACGCTCATGGATTCATAAAACAGATAAACTTCACTAATAAGCTTCCAGAAGGCATTCCATTAGTCATAAGAGAAAAGATAATGCAGTATAAATTCCCAGGAGCAAATACTATCTTAATTGAGAAAGAAATCCCAAAATGGGACTTTGATCTCATGAAGAGAAGCACAACATTCAGAACTCAGATCTACATTCTCCAAGGTCATAGAAACTTTTATGGATTTTCACCCATAAAATCCTATGAACCCATTACACCTGAAGAGTTCGGAATAGAATATTACAGCTGGGAACAAATCTATGAAGATGACGAAGCAGACGTTGTCTATCAATCAATAAGCACCAGAATCTCTAAGTTGGAAAGGGAGTATGCTTGGCCATGTGATGACAGCGACATCATGTCCTGCACCACTTCAATGGAAGAAGAATATGCCCACAGGCTGGAGGCATAAAGAAATGACTCAAAGATAAAGGAACAAAGCATCAAAGCATCAATAAAAGAAGACTGAAGGAGGAATCCACTTTAAATTATTGTACCTCTACAATTATTGTAAGAGTGTGTAATGTCTAGTCTACCCCTGAACACTCCTATATAAGGAGAAGTAGTCTGCATGTAATAGGCATTCGAGATCCACACACCCAGAGTAGCACACACTTCCACGAGAACAAGAGAAGAGCTGATCTTCTCACCTCCTCTTCAAAGAAGGATTAGCTGCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTAATATGTATTGTATCATGTTTGTATCATCAAAAACTTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTATATTGTTGTTTACACTCCTTCGATAAGATATGAAGCCATACTCGTTTCTTAAATCAATAGTTCTAAGTTAATTCTAGCATGAAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAGAAGTACCGCCAGGGCGTGTGATGCCAAGGGAACAAGTACCATGAATACCCTAATAAGTGCTAGAAGGAAGATAAGAACTAACGAAATAAGGAACATTTGGTAGCTGGTTTCTTATTATCATTATCAAGTAGCTCTTCCTCATCACGAAAACTGCAAAGGCCTGCCAACCTTAGGCTGAAACAGTGACTAGGCCGAGGAATTGCGAAAAGATAGGGGGGGTGCCTACATC
| 103,103
|
AF220561.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Nathwong,B., Ratanakarn,W., Chettanachit,D.
|
Plant Genetic Engineering Unit (BIOTEC, NSTDA)
|
Thailand
|
2002-01-01
| null |
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 8,010
|
GenBank
| null |
Thailand
|
Thailand
| null | null | null | null | null |
Rice tungro bacilliform virus Chainat isolate, complete genome
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGAACTTTAAGGGAAAATAGAATACAATCTAGTCAAACTAATTACATAAGTTCTGAAGAGGAATCTTACTTCTCAAAATATTGAGTCGCGTTACGAAAAACTTGAATTCTTAGACTTAGCAGTCTGGGGAAAAGAGAAAAAACAAAAATATTTATTATCTACTGATAATATTAGCTTTTATTGTTACTTTGATACTAGTAAAACCAGTGAATCAGAAAGGAAGCATACCTTTCATTCTGATAATAAGCAACTTAATAGTATTGTAGATCTTATTATTAAGCATTCTGAAAAAACCAAAAATATTAAGGAAGAATTAGAAAAATATAGCCAGTTCTTAGATAAGATATTAGACTTAAAACCTACTAAAAAACAAGTTGAAAAACTACTAGAAAATCAAAACTTAATTAGCAAAAATTTTGATTATATTAAAGAACAAAACGCTCAGCTAGAAAAATCCCTAAGAAAAACAGTTAAGTTAGAAGACTCTATTAATACTCTATTAGTAGAAATACAACAAGCTAGACCGAAGGAAGTAGAATTAAGAACTCTTAAGATAGCAGAACAAAACTCTAAGGCAATAGAAAAATTTGAACAAGAAATTAAGGATCTAAGAGAAATACTAGAATACCTCAAGCACCAATCTACATGAGCGCTGATTATCCAACTTTCAAGGAAGCCCTTGAAAAGTTCAAAAATCTAGAATCAGACACAGCCGCTAAAGATAAGTTTAATTGGGTATTTACCTTAGAAAATATAAAAACAACTGCAGACGTAAATCTAGCATCTAAGGGATTAGTACAACTTTACGCTTTACAAGAAATTGATAAAAAGATAAATAATCTTACAGCTCAAGTTAGTAAGTTACCTACAACTAGTGGAAGTAGTTCAGCAGGAACTATAGTACCCGCAGGAAGTAACACCCAAGGTCAATATAAAGCACCACCTAAAAAAGGAATTAAGAGAAAATATCCAGCATGAGTCTTAGACCATTTACTGGCACTTCTAGAACTATAACCCAAGATTCAACCTCTGAATCTAATATTAAAAAAGGGAAAAATTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAGAAGTAGATGTTAATCAAGATGTAGAAAACTTTGATTGGAAAAAATTATCAGGAATTAAACCTAATAAACTATATGAGAAAAATTGGCAAGAAAAGGTTAAGTTAAAACAACAATCTATAGTTTCGGCATATAAAGAAGAAGCTATTAGTGTAACCCATAATGCATATACTACTACTTTATTTCCACAAGAAGTAATTAAAAATGTTAAGAATCAGGGAAAATTATATTACCATATAGGCATGATGGCCATAGGAGTTAAAGGACTTAAAGGACTTCATAGAAGAAAAATAGGAACTAAAGTCATGATAATGTTTTATGATGATAGTTTCGGCAAAGCTAGAGAAGCTAGCATTGGATCAATAGAAATGGATATGAACGCAGGTTGCGGAGTATTCTACTCCTGCCCCGACTTTGCCAAATATATTAAAGATTTATCACATCTTAAGATAGGGATACAAACCCTAGGATATGAAAATTATGAAGGAAAAAACCTTTCGGTAGCAATCAAGACTATAGGAAGATTAACTACCAATATACAATCAAAATATAAGATAAATGTAAAAGATATTGTAGAACAAATATCATCACAAGGAATCATTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACACTTAGATGGGAATGAATGGGATCTTAGTAAGTTCTTAAATCAGGAAAACACAAGTAGAGTCCCAACTAAAGCCTTAATATATCAAAATCTACATGGAGGAGAATCTCTAAGATTTTCAAACTATAAGCAAACTAGAATGCATGATCCTACTGAAAATAATTCAGATGAGGATGAAGATTTAAAAATCTTAGGAGAACAACTAAATATTAAAATGGCAAGATTTTATACTATGGAAACTCCGGAAGAAGAATTAAGAGCAGCAGTTCAACAATTAGAAAAGGAAAAACAAGCCATGATAGAAAAATTAGAAGCTAAAATGAAAGAATCATCAAAAATGGCAATAGTAGAAGATAACTTCAATCCAAACAATGAATATCTAGAGGATACATATTCTGAATATGAAGATTTAGAATTTGAAAGATTAGGATTAACCGGATGGGAAGACCTGGATCAGGACTCCATAGAAACCGAAGAAATAACTGAATGGGAAAATCCTAACCAAGTTCTTCATAGAGAAATTAAAGCCTATAAATCAGTATCAGAACAAATAGAAGATATATTTGGAGAATTATTAAAAGAACATGGAAACTATGATATGGCCCTTAAAAACCTAGAAGAAAAATATGATCTAGATAAAATAGAAAAGGCCAAATCTATAGAAGAAATAGCTAAATCATCCACATCATCAGAAATTAGGCCAACTAAACGTCCTAAAGAAGAACAAACAGCCTATGAAGATGACATGAGAGATGATTGGAAAAGAAAAGAATTAACAGTAAATCCCATAGAAGCCTCAAAAGATAGGAATTTTGAAAGAATAGGAAGTTCTTATAAGAAAAATTTCTATCCCAGCAGAAGTGAAATATTAAACTTAGATAACGTTCCCCCACAATTTTACTATGACCAACTAGTAACCTGGGAGGGAATAGTTAAAAATGAATGGGAAGCACGTAAGAAAGATGGGATGGATATGTGGTCTTGGATGGATGGTAGGATAACAGGATTAGTTTTATATTTAGTCCAAGATTGGATATCTAAAAATCAGGCAGCTTATAATGATATAAAATCTAGAGGAGATAGACCAGAAAACTTTGTAAAAATGGTAAAAGATAGATTCTTAATAGAAGACCCAACAGATGAAAGAAGAACAGCACTACAAAGGTTAGCACAAAGAGAATTAGAAGCCTTAAATTGCGAAGATCCTACTAAAATTCAACCATTTATGGCTGAATATTTTAAAAAAGCTTCAGAAGCCAAGAAAGGATTCGATATAGTTTATGTAGAAAGACTTTTCGATAGATTACCAGAAGCAGTAGGAAAAGTAGTAAAAGCCGACTTTGTCAAAGATGGTAATTCCTATGAAGCAGGAATAGGAATAGCGGTTTCATATATATCCACATGGATGAGAGCAAAATGCATTAAGGAAACAGAAGCTAAAACTCAAAAGAAAGCATCCTTAGCATTCTGTAGATCCATATATACTATAGGAGATTATAAGAAACGAAAAATCTTAAAAAGAGTAACAAATTATAATAAAAATAGGAGGAAAAACTATGTCAGAAGACCCAGTATAAAGAAAAAATGTAGATGTTATATCTGTCAAGATGAAAATCATCTAGCCAATAGATGTCCTAGAAGATATACCAATCAGGCTAGAGCAAGTCTAATAGATGGGTTAGATGAAGATATAGTATCCATAGCATCAGATGATGAAGATATTGAAAATTTCCTTGAAATAATAGAACTTGATGAGTTTATAGCACATTCTAGTCAAGAACATGAACATACATGGGAAGTTGGAGGAAAGAAAGATAAGGTATGTGAAATATGCAGTTATTTTACAGACTATAATAAAACTGTTAGCTGTAAAATTTGTGAAACTCAATATTGCAAAACATGTTCTGATCAATTAGCTATAGAAGTAAGAGAAGTTAAAAAACCTACCAAAGAAGAAGAAATGCTAGAAGATTTAAAATTAAATGTTAAAAACCTAGAATTTAGAGTCACTATTCTAGAACATAAGGCAGAAATGCAAAATATACAAGATAAATTTGAAGCAATGCAAATTAGAAGTAAACCAGAAATAACAGAAATACCAACAACTTCATTAGCTATGAGAGCAAATGAATCAAATTATATAAAAACATCAATTAATAAAACTGCAGGATGTTATGTAGAAACAAAAATCTCATTTAATAATGAAAATAGAATCATAACAGCACTAATAGATTCTGGTTCAACACATAATATAATATGTCCAACCTTAATCCCAGCATCATGGATTAATAGCACACATAGAGAAATCATTATGTTTGCCGTAGATAATAGCAAATATAATTTAAATCAAGAACTAATAGATGATATAAAATTACAATTCCAAGAAGTTGATGAAACCTTTGGAATAAAATATAAATTAGGACAAACCTACGTAGCACCTAAGCCAACTAAAACATTCATAATAGGACATAGGTTCCTTACAAATGAAAATGGTAGTGTTACAATCCATAAAGATTACATAACTATACAAAAAACTACTGGAATATACCCAACAGCCCGGCATGAACTTAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACGCCCGCCATTATTTTCAAACATTCCTGAAACCTACAACAAAATTCCTCATTTACATTCGTATCAACCACCCATATTAGGATATAAGAATGAAATAGGGAATCAGAGTTTAATCACTATGGTAAAAGAGTTAGAAGCACTTGGATTCATAGGAGATGATATAACAAAAAATAGAACAAATTGGGTATGTGACTTCAAAATTATAAACCCAGATATTAATATAACCTGTGCAACAATTCCATATACACCAGCAGATAAAGAAGTATTTGAAAAACAGATAAAAGAATTACTAGATAATAAGTTAATCAAGAAAGCCGATCCGACATGCAGACACAGAACAGCAGCATTCATAGTAAGAAATCATTCTGAGGAAGTAGCTCAGAAACCTCGAATAGTCTATAACTATAAACGTTTGAATGACAATATGCATACAGATCCTTTTAATATACCTCATAAGATTTCAATGATCAATCTGATACAGAAAGCTAATATATTTTCTAAGTTTGATTTAAAAGCAGGATTTCATCATATGAAACTAAAAGATGATTTCAAAGATTGGACTACTTTTACCTGCTCAGAAGGACTATATACTTGGAACGTCTGTCCATTTGGTATAGCTAACGCTCCTTGTGCATTTCAAAGATTTATGCAGGAATCCTTTGGAGATTTAAAGTTTGCTTTATTATATATAGATGACATACTTATTGCATCCAATAATGAAAAAGAACATATAGAGCATCTTAAGATTTTCTTTAATAGAGTAAAAGAGATAGGATGTGTTCTTAGTAAGAAAAAATCAAAGATGTTTCTAAAAGAAGTAGAGTATCTTGGAGTAGAAATTAAAGAAGGTAAGATCAACCTTCAGCCACATATAGTTGATAAGATCAAAAAATTTGATAAAAATAAGCTCAATACTTTAAAAGGACTACAAGCATATTTGGGATTACTCAATTATGCCAGAGGATATATTAAAGACCTATCAAAACTAGTAGGACCACTTTATAAAAAGACAGGAAAGAATGGGCAAAGAATTTTTAACAAAGAAGATTGGAATATTATCTTTAAGATAGAAAGAGAGGTATCAAAGATAAAGCCTTTAGAAAGACCCAAAGAAACCGACTACATCATTATAGAGACAGATGCGTCAGAAGAAGGATGGGGAGCAGTCTTAATCTGTAAGCCAGATAAATATAGTGGAAAAGACACTGAAAAAATAGCAGGGTATGCATCAGGAAACTTTGGAGAAAAGAAAACATGGACTAGTTTAGATTATGAGATAGAAGCCATAAATGAAGCCTTAAACAAGTTCCAAATATATTTAGACAAAGATTTTACAATCAGAACAGATTGTGAAGCAATAGTAAAAGGGATAAAAACTGAAGACTATAAAAAGAGATCAAAAACAAGGTGGATCAAGTTAAGAGATAACCTCTTAAAAGATGGTTACAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAGGGAAACAAAAACTTTTTACCAAACTTCTTATCCCGCGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAACCCCGATTCTACGGAATCATATTCTATAGATTCGTCAGAATCAATTCCACTATATATCGATTCGAAAGAATCACATTCTATAGAGTCTGATGACTCAATTCCACTATACAGGGACAAGCTTCTTCCTCTAGTCGAAAGACTAAAGGAGAAAAGTGCTTAACTAAGATCGGAGGCATCACCATGAATATAGAGTACCCGTACTCAATCCACATAATAGACAAGAACAAGGTTCCGATCTACGATCAAGGAAATCTCTTCCACACTGAGAAGTCTGCAAGACTTTCACATGAGTCTAGAGGTTTGCTAGATCATCTCTTTACTTTTTCGTCTGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACATATTAGCCGATTATCTTTACCTATTAGAAAGTGAGAGAGAGTCATATAAAAATGAGTGGATTAGCCTGAATGATCAGGTTAGTCTTCTACAAAAACAAAATAGTGAGTTGAGGGCTAGGATAGCCACCAATAAAGAAATAATAGAGGGACTGAGAGAGCCAGTTAAAAAGCCAATATACACAACCCAAGATAAAGAGAGGCTCCGTGTTTTCTTTTGCGAAGAAAGAAGCATGGAATATATATACTATCATATAAAGAGGCTAGCTCAACAGAGCTATTATTCTCATCTAAATAAGTTACAGAAGGATTGTGAGCCCTTTCGAGGGATCTACATGTCTTTCTTAACTAATGTTAAATTCCTAGTACTATGTGAAGCCGGATACTGGACTGTTCCAGATATAGAAACTAATACTACAGAATCTTTATTAAGCTTATCTCAGAAGAAAGGAGAAGATCTGCTACAAAAGGGAGTGGTAATATTTAATGAGCTTGAAGGAGGATATCAACTTTCTCCAAGATTCATTGGAGACCTTTATGCTCATGGTTTTATTAAACAAATAAACTTCACAACCAAGGTTCCTGAAGGATTACCGCCAATCATAGCGGAAAAACTTCAAGACTATAAGTTTCCCGGATCAAACACCGTCTTAATAGAACGAGAGATTCCTCGCTGGAATTTTAATGAAATGAAGAGAGAAACGCAGATGAGGACTAATCTATATATCTTCAAGAATTATCGCTGTTTCTATGGCTATTCACCATTAAGGCCATATGAACCTATAACTCCTGAAGAATTTGGGTTTGATTACTACAGTTGGGAAAATATGGTTGAAGAAGACGAAGGAGAAGTAGTCTACATCTCCAAGAATACTAAGATTATCAAAGTTACTAAAGAGCATGCATGGGCTTGGCCAGAACGTGACGGGGATACAATGTCCTGCAGCACATCAATAGAAGACGAATGGATCCATCGTATGGACAATGCTTAAAGTAGCTTTTTCTAAAGCAACTTTAAGTGCGAATCAATAAAGAAGGACCAGAAGATATAAAGCGGGAACATCGTCATGTGCTACCTCGTGGCTAGCATCTTTAGCATCTTTACTTTACAATTATTGTAAGCATGGGTAATGACCAATGTACCCCTGGACTCCAGTATATAAGGAGCCCTAGAGTATTGTAATGGATCATCGATCAAGCAAGCGAGAGCTCAACTTCTAAAAGAGAGCAAGAGAGGAGCTTATCCTCTCAACCCCTCTTCAAGAAGCAAAGGCGATCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTAATATGTTTGTACTTAAGATTGTATTTCTCAAAACCTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTTATATTCATCCTACACCCTTGTGATAAAACATGAAGTCATACCCGTTCAAAGATTAAATGTTCTAAGAATACTTCGAAGCATTGAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAAAAGTACCGTCAGGCCGTGTTATGGCAAGGGAAGAAGTACCATGAATACCCTATAGATGTTAGAAGGAAGGTAAGAACTAAGTATCTTATGAACAATGGGTAGCTGATTTCTGATTATCATTAACAAGTATCGTTATAATCTATAAGCTTTGAAAGATCTGCTAGTGTGGATACCAAAAGGCTGTCGTGGTTCGCCCAGTCGACGGATGAGGTTATAAACGAAGCACTAGTAGGTAACTAAGAGGCTTAGGGATGAGTAACGAGAAAAGTTAGGGGGGTGCCTAGAAA
| 110,880
|
AJ314596.2
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Nath,N., Mathur,S., Dasgupta,I.
|
Dasgupta I., Department of Plant Molecular Biology, Department of Plant Molecular Biology, University of Dehi South Campus, Benito Juarez Road, New Delhi 110 021
|
India
|
2001-06-09
|
West Bengal
|
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,934
|
GenBank
| 1
|
India:West Bengal
|
India
| null | null | null | null | null |
Rice tungro bacilliform virus complete genome, isolate West Bengal
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGAACTTTAAGGGAAATTTTGATACAAACTTATACATACATTTACATATGTTCTGAAGAGGGATCTTACTTTCTCAAATATTGAGTCACGTCTTGAAAAACTTGGATTTCTAGATTTAGCAATTTGGGGATCACCAAAAACACAAAAATATAGTCTATCTACTGAAAATATAGCCTTTTATTGTTACTTTCATAAGCCTGAAAACACATCCACTACTGGACATAATCACACCTTTCATTCTGATAACAAGCAACTTAATACTATCGTAGATTTAATAGTTAAGCACGCAGAAAAAACCAAAAATATTAAGGAAGAACTAGATAACTATAGTAAGTTACTAGAAAAGATCTTAGAACTAAAGCCTACTAAGAAGCAAATAGAAAAACTTTTGGAAAACCAAAACACCATAAACCAGAACTTTGATTATATCAAAGAGCAAAACTCTCAAATTGAAAAATCTTTGAGAAAAACGAATAAATTAGAAGACTCTATAAACACCTTGCTTATAGAAATACAGCAAGCTAGACCTAAAGAAGTAGAACTTCGTACTCTTAAAATAGCAGAACAAAACTCTAAAGCTATAGAAAAATTTGAAAAAGAAATACAAGATCTAAGAGAAATCTTAGAATATCTTAAGCACCAATCTACATGAGTGCTGATTATCCTACCTTTAAGGAAGCCTTAGAAAAATTTAAGGATTTAGAGTCTGAAACAGCAAACAAAGATAAGTTTGGCTGGGTTTTTACTCTTCAAGGGATAAAAACAACAGCAGACGTAAATCTAGCATCTAAAGGACTAGTACAACTTTACGCTTTACAAGAAATCGATAAGAAAATAAATAATTTATCTGCACAAGTTGGTAAAATACCTACAACTAGTGGTAGCAGTAGTTCAGCAGGAGCCATAGTACCTGCAGGAAGTAATACCCAAGGTCAGTATAAAGCACCACCTAAGAAGGGAATTAAAAGAAAGTATCCAGGATGAGTCTTAGACCGTTTAGCGGTACCTCTAGAACTCTAACTCAAGATTCAGCTAGTGAATCTAATATTAAAAAAGGAAAATCTTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAGAAATAGATGTTGCTAAGGAAATAGAAAACTTTGATTGGAATAAATTATCTGGTATAAAATCAAATAAACTTTATGAGAAAAATTGGCAAGAAAAAGCCAAATTAAAACAACAATCAATAATTTCTGCATATAAAGAAGAAGCTATTAGTGTCACGACTAATGCCTTCATTACTTCATTATTCCCTAATGAAGTCATAAAAAATGTTAAGAATCAAGGAAAACTTTATTATCATATAGGCATGATGGCCATAGGAATTAAGGGATTACATAGAAAGAAAATTGGCACTAAAGTAATGGTAATGTTTTATGATGATAGCTTTGGGAAAGCCAAAGAAGCTAGTATAGGATCAATAGAAATGGATATGAATGCAGGTTGCGGAGTATTTTACTCTTGCCCTGACTTCGCTAAATATATAAAAGACCTATCCCATCTCAAGATAGGAATTCAGACCCTAGGATATGAAAATTATGAAGGAAAAAATCTTTCCATAGCCATAAAAACTATAGGAAGATTAACAACAAATATCCAGGCTAGATATAAAATGAATGTCAAAGATATAGTTGAACAAATATCATCCCAAGGAATAACTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACATTTAGATGGGAATGAATGGAATTTAAGTAAATTTATGACTCAGGAAGGAACAAGTAGAGTTCCTAGTAAAGCCTTAATATATCAAAACTTGCATGGAGGAGAATCACTTAGATTTTCAAATTATTCACAAACCAAAATGCACGATCCAGCAGAAATAAATTCTGATGAAGATGAAGATTTAAAAATTTTAGGAGAACAATTGAATGTTAAAATGGCAACTTTTCAAGAAGAAACCCTAGAACAAAAATTAGAACGAATAAAAGAAGAAAAGAAACAACTTCTAGCAAAGTTAGAAGCTAAAAAGAAAGAAATTGAATCAAAATCTTTAAAAATGGCAGTCATAGAAGATGACTTTAACCCAAACAACGAATATCTAGATGATTCATACTCTGAATTAGAAGATCTAGAATTCGAACAATTAGGATTAACTGGTTGGGAAGACCTAGATCAAGAAAGTCTAGAAACAGAAGAAATCACTGAATGGGAAAACCCAAACCAAGTCCTAACTAGAGAAATAAAAGCTTTTAAATCAGTCTCCGAACAAATAGAAGATATATTTGGAGAATTATTAAAAGAACATGGAAATTATGATATGGCCCTTAAAAATCTAGAAGAAAGATATGATTTAAAAAACCTAGAAGGAGCCAAAAACTTAGAGGAAATAGCTAAAGCATCCACATCAAAAATGATGGATGTAAAACCAGTGAAAAGACCAAAAGAAGAACAGACAGCATACGAAGATGATATGAGAGATGATTGGAGAAGAAAAGAATTAACAACCAATCCAGAAGTGTCCTCAAAAGATAGAAACTTTGAAAGAATAGGAGGATCATATAAGAAAAACTTTTACCCCAGTAAAAGTGAAATCCTAAACTTAGACCATGTACCCCCACAGTTCTACTATGACCAAATCATAACTTGGGAAGGAATAGTAAAAAACGAATGGGAAGCAAGAAAAAAGGATGGTATGGACATGTGGTCTTGGATGGATGGAAGAATAACAGGAATGGTTTTATATCTAATACAAGATTGGATATCTAAAAACCAAGCCGCTTACAATGATATAAAATCTCGAGGAGATAGACCAGAAAATTTCGTGAAAATGGTAAAAGATAGGTTCTTGATAGAAGNCCCTACAGATGAACGAAGAACAGCCTTACAAAGATTAGCTCTAAGAGAATTAGAAGCTTTAAATTGTGAGGATCCAGTTAAGATTCAGCCATTTATGGCAGAATACCTTAAGAAAGCTGCCGAAGCTAAAAAAGGATTCGATGTCATATATGTCGAAAGACTATTTGACAGACTTCCTGAGGCAGTAGGAAAACTAATAAAAAAGGAATTTCTAGACGCAGGAAATTCATATGAAGCAGGCATAGGAGTAGCTGTTTCATACATATCCACATGGATGAGATTAAAATGCATAAAAGAAACAGAAGCTAAAACACAAAAGAAAGCATCATTAGCATTCTGTCGATCTATATATACTATAGGAGATTATAAGAAAAGAAAAACACTAAAACGTGTTACGAACTATAATAGAAACAAAAGGAAGAATTATGTTAGAAAACCCAACATAAAAAGAAAGTGTAGATGTTATATTTGCCAGGATGAAAACCACCTAGCAAATAGATGTCCTAGAAGATATGTCAATCAAGCCAGAGCAAGCATGATTGAGGGATTAGAAGAAGATATAGTTTCCATAGCTTCAGATGATGAAGACTATGAGAACTTCTTTGAAATAATTGAACTAGAAGAGTTTTTAAGTAAATCAGGACAACAAGATCACGAGCACACCTGGGAAACAGGAGGTAAGAAAGAAAAAACTTGTGATATTTGTGATTATTATACTGATTTCAACAAAACCATAGTATGCAAAACATGTGAAATACAATATTGTACTACTTGTGCTAATCAACTTGGTATAGAAGTAGAAAAAACATATAAAAAATCTAGAGAAGAAGAGTTATATGATGAACTAAGAAAAACAGTTGTCAATCTAGATCTAAGATTGACAATAGTTGAACATAAACTAGAAATGAATAAATTACAAGAACAATTTGATTCCTTGCAATTATCTAAAGAACCTAGTTCTTCAGAAACCATAAAAGCTTTAGCTATGCAAGCAAAAGAATCAAATTTCATAAAAACAAACATAAATAGAACAGCAGGTTGTTATGTAGAAGTTAAACTAACCTTCCTAAATAACTCAAAAATAACCACTGCATTAATAGATTCAGGTTCTACACACAATATTATCTGTCCATTATTGGTACCAGAAATATGGGTTAAAAGCCTGAACTTAGATATTGTTATGACCACAATAGACAACAGTAAATATAGCCTCAACAGAGGACTACATGATGAAGTAAAAATACAATTTAAAGAAGTCGATGAAAGTTTTGGGATAAAATACAGTTTGGGACAAACATATGTTGCCCCTAAACCAACTGGAACTTTCATAATTGGACATAGATTTATGACCAGTGAACATGGTAGTATTACAATTCATAAAGACTATGTTACAATCCAAAAAACCACGGGAATCTACCCCACTGCTCGTCATGAACTCAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACAAAGACCCCTATTTTCAAACATTCCAGAAACCTACAACAAAATTCCAAAATTATACGGGTATAAGAGTGAAATAGAAGATAAAAATTTACTTACTCTTATTAAAGAACTAGAATATTTGGGATATATCGGAGACGATATAACAAAAAATAAAACTAATTGGGTATGTGACTTCAAAATCATTAACCCAGATATAAATATCACTTGCAACACAATCCCATATACCCCAGCAGATAAAGAAGTCTTTGAAAAACAAATCAAAGAACTGTTAGATAACAAGTTAATAAGGAAAGCAAGTCCTACTTGCAGACATAGAACTGCAGCATTTGTAGTAAGAAACCACTCTGAAGAAGTAGCACAAAAACCAAGAATAGTTTATAACTACAAAAGATTAAATGATAATATGGTTACAGATCCTTTTAATATCCCACATAAGATTTCTATGATAAATCTATTACAAAGAGCTAGGATATTCTCTAAATTTGATTTGAAAGCAGGATTTCATCATATGAAACTTAAAGAAGATTTTAAAGATTGGACAACTTTTACTTGTTCTGAAGGATTATATACTTGGAATGTCTGTCCATTTGGTATAGCTAACGCTCCATGTGCATTTCAAAGATTTATGCAGGAATCCTTTGGAGATTTAAAGTTTGCATTATTATACATAGATGACATCCTAATTGCATCAAGTAATGAACAAGAGCATATTAAGCACCTTAAGTTATTCTTTACTAGAGTTAAGGAAGTAGGTTGTGTCCTTAGCAAGAAAAAATCAAAAATGTTCCTAAAAGAAGTGGAATACTTAGGAGTGGAGATAAAGGAAGGAAAGATTAGCCTACAACCACACATAGTGGAAAAGATAAAGAAGTTTGATAAGAGCAAGTTGAGTACCCTAAAGGGATTACAGGCATATCTAGGCCTACTCAATTATGCTAGAGGATACATTAAAGACCTATCAAAGTTGGTAGGACCACTATATAAAAAGACTGGCAAGAGTGGCCAACGAACCTTTAATAAAGAAGATTGGAATATAATCTTTAAGATAGAAAGAGAAGTTGATAAGATTAAACCTTTAAGTAGACCAGAAGAATCTGACTACATAATAATAGAGACAGATGCATCAGAAGAAGGATGGGGAGCAGTCTTAATTTGCAAACCTGATAAATATGCTAGCAAAGATACTGAAAAGATAGCAGGTTATGCATCAGGAAACTTTGGAGAAAAGAAGACTTGGACTAGTTTAGATTATGAGATCGAAGCTATAAACGAAGCATTAAATAAGTTTCAGATATATTTGGATAGAGACTTTACAATTAGAACAGATTGTGAGGCAATAGTCAAAGGCATAAAAACAGAAGATTACAAAAAGAGATCCAAGACAAGATGGATCAAACTGAGAGATAATCTTCTTAAAGATGGATACAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAAGGAAACAAAAACTTTTTGCCAAACTTCCTATCCCGCGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAACACGACTTCAACTATAGAATCTTCGGATTCACGATCTTCAACTATAGAATCTTCGGATTCACAGTCTTCAATTAAAGAATCTTTAGATTCATGGACTCCAACTAAAGAATCTTCGGATTCATCTTGCAGGATAAAACTTCATCCTCTGTCTTCAAGGCAGAAGGTGAAAGGCGAGTAATCGCTAAAGTACACGGTGTTTCCATCAATAAAGAGTGCCCATACTCAATCCACCACCTCGGTAAAAACCGAGTCCCCATATATAAACAGGGAAACCTGTTTCACAGTGAGTTTACTGGTAGGCTTAGCCACTTATCAAACGGTCTTATAGATCATCTTTTTACATTTTCAGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACCTTATATCAGAGCATATCTACAATAAAGAATTTGAAATACAGACCTATAGTCTTGAGTGTGAGAAATTAAGAGAGCAGGTTAGCCACTTAAAANATACTGTTGAAACACAAAAACAACAGTTAAGAGAGATGAGAGATAAACTAGAGGGACTGAGAGAGCCACTCAAAAAGCCTATATACACAACCCAGGATAAGGAAGCACTTCGTAACTTCTTTTGCAAAGAAAGAAGTATGGAGTACATTTATCACCACATAAAGAGGTTAGCTCGAGAGAGCTATTATTCACATCTGAATAAACTTCAGAAGGATATGGAATTCCTCAGGGGATTCTACTTATCTTTCTTAACGAACGTCAAGTTTCTAGTTCTCTTTGAGACTGGACTCTGGACAACTGAAAATATCGAAAGTCACTTCTTCAACAATAGCAGTCTCTTCATAACCCAGGAAGAAGGAGAAAGGCAGATGACAAAAGGATTGCTAGAAAAGAACAGTGAAGATGAAGCTGGAAGATACATTCTGACATCAGGATTTGTGTCTGACCTATACGCCCATGGATTCATAAAACAGATAAACTTCACTAATAAGCTCCCAGAAGGCATTCCATTAGTCATAAGAGAAAAAATAATGCAGTATAAGTTCCCAGGAGCAAATACTATCTTAATTGAGAAAGAAATCCCAAAATGGGACTTTGATCTCATGAAAAGAAGCACAACATTCAGAACTCAGATTTACATTCTCCAAGGTCATAGAAACTTTTATGGATTTTCACCCATAAAATCCTATGAACCCATTACACCCGAAGAGTTCGGAATAGAATATTACAGCTGGGAACAAATCTATGAAGATGACGAAGCAGACGTTGTCTATCAATCAATAAGCACCAGAATCTCCAAAGTTGTAAGGGAGTATGCTTGGCCATGTGATGACAGCGACATCATGTCCTGCACCACCTCAATGGAAGAAGAATATGCCCACAGGCTGGAGGCATAAAGAGATGATCCAAAGATAAAGGAACAAAGCAGCAAAGCATCAATAAAAGAAGACTGAAGACATAAAGGGGGAATCCACTTTAAATTATTGTACCTCTACAATTATTGTAAGAGTGTGTAAAATCTAGCCTACCCCTGAACACTCCTATATAAGGAGAAGTAGTCTGCATGTAATAGGCATTCGAAATCCACACACCCAGAGTAGCACACACTTCCACAAGAGCAAGAGAAGAGCTGATCTTCTCACCTCCTCTTCAAAGAAGGATTAGCTGCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTCATATGTATTGTATCATGTTTGTATCATCAAGAACTTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTATATTGTTGTTTACACTCCTTAGATAAGATATGAAGCCATACCCGTTTCTTAAATCAATAGTTCTAAGATAATTCTAGCATGAAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAGAAGTACCGTCAGGGCGTGTGATGCCAAGGGAACAAGTACCATGAATACCCTAATAAGTGCTAGAGGGAAGATAAGAACTAACGAAATAAGGAACATTTGGTAGCTGGTTTCTTATTATCATTATCAAGTAGCTCTTCCTCATCACGAAAACTGCAAAGGCCTGCCAACCCTAGGCTGAAACAGTGACTAGGCCGAGGAATTGCGAAAAGATAGGGGGGGTGCCTACATC
| 111,096
|
AF113830.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Cabauatan,P.Q., Melcher,U., Ishikawa,K., Omura,T., Hibino,H., Koganezawa,H., Azzam,O.
|
International Rice Research Institute, Entomology and Plant Pathology
|
Philippines
|
1999-05-14
| null |
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 8,006
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
| null | null | null | null | null |
Rice tungro bacilliform virus strain RTBV-G1, complete genome
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGAACTTTAAGGGAAAATAGAATACAATCTAGTCAAACTAATTACATAAGTTCCGAAGAGGAATCTTATTTCTCAAAACATTGAGTCACGATACGAAAAACTTGAATTCTTAGACTTAGCAGTCTGGGGAAAAGAGAAAAAACAAAAATATTTACTATCTACCGATAATATTAGCTTTTATTGTTACTTTGATACTAGTAAAACTAGTGAATCAGAAAGAAAGCATACCTTTCATTCTGATAATAAGCAACTTAATAGTATTGTAGATCTTATTATTAAGCATTCTGAAAAAACCAAAAATATTAAGGAAGAATTAGAAAAATATAGTCAGTTCCTAGATAAGATATTAGATTTAAAACCTACTAAAAAACAAGTCGAAAAACTATTAGAAAATCAAAACTTAATTAGCAAGAACTTTGATTATATCAAAGAACAAAACACTCAGCTAGAAAAATCACTAAGAAAAACAGTTAAGTTAGAAGACTCCATTAATACTTTATTAGTAGAAATACAACAAGCTAGACCTAAGGAAGTAGAATTAAGGACTCTTAAAATAGCAGAGCAGAACTCTAAGGCAATAGAAAAATTTGAACAAGAAATTAAGGATCTAAGAGAAATCTTAGAATACCTTAAGCACCAATCTACATGAGCGCTGATTATCCAACTTTCAAGGAAGCCCTTGAAAAATTTAAAAACCTAGAATCAGATACAGTTTCTAAAGATAAGTTTAATTGGGTATTTACTTTAGAAAATATAAAAACAACTGCAGACGTAAACCTAGCATCTAAAGGATTAGTACAACTTTACGCCCTACAAGAAATTGATAAAAAGATAAATAATCTTACAGCCCAAGTAAGTAAGTTACCTACAACTAGTGGAAGTAGTTCAGCAGGAGCTATAGTACCTGCAGGTAGTAACACCCAGGGTCAATATAAAGCACCACCTAAGAAAGGAATTAAAAGAAAATATCCAGCATGAGTCTTAGACCATTTACTGGTACTTCTAGAACTATAACCCAAGATTCAACTTCTGAATCTAATATAAAAAAGGGAAAAAATTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAGAAGTAGATGTTAATCAGGAAGTAGAAAACTTTGATTGGAAAAAATTATCAGGTATTAAACCTAATAAATTATATGAGAAAAACTGGCAAGAAAAGGTTAAGTTAAAGCAACAATCTATAGTTTCAGCATATAAAGAGGAAGCTATTAGCGTAACTCATAATGCATATACTACTACTTTATTTCCACAAGAAGTAATTAAGAATGTTAAAAATCAGGGAAAACTTTATTATCATATAGGCATGATGGCCATAGGAGTTAAAGGACTTCATAGAAGAAAAATAGGAACTAAAGTTATGATAATGTTCTATGATGATAGTTTCGGTAAAGCTAGAGAAGCTAGCATCGGATCAATAGAAATGGATATGAACGCCGGTTGCGGAGTATTTTACTCCTGCCCCGACTTTGCAAAATATATTAAAGATTTATCACATCTTAAGATAGGGATACAAACCCTAGGATATGAAAACTATGAAGGAAAAAACCTTTCAGTAGCAATCAAAACTATAGGAAGATTAACCACCAATATACAATCAAAATATAAGATAAATGTGAAAGATATTGTGGAACAAATATCATCACAAGGAATCATTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACACTTAGATGGAAATGAATGGGATCTAAGTAAATTCCTAAACCATGAAAACACAAGTAGAGTCCCAACCAAAGCCTTTATATATCAGAATCTACAAGGAGGAGAATCCTTAAGATTCTCAAACTATAAGCAAACTAGAATGCATGATCCTACTGAGAATAATTCAGATGAGGATGAAGATTTAAAAATCTTAGGAGAACAATTAAACATTAAAATGGCAAGATTTTACACAATGCAAACCCCAGAGGAAGAATTACTAGAAGTAATTCAACAATTAGAAAGAGAAAAACAAGCCATGATAGAAAAACTAGAAGCCAAAATGAAAGAATCATCCAAAATGGCGATAGTAGAAGATAATTTCAACCCAAACAATGAATATCTAGAAGATACATATTCCGAATATGAAGACCTAGAATTTGAAAAATTAGGACTAACTGGATGGGAAGACTTAGACCAGGATTCCATAGAAACCGAAGAAATAACCGAATGGGAAAATCCTAATCGGGTACTTCATAGAGAAATTAGAGCATACAAATCAGTCTCTGAACAAATAGAAGATATATTTGGAGAATTACTAAAAGAACATGGAAACTATGATATGGCCCTTAAAAACTTAGAAGAAAAATATGACCTAGACAAAATAGAAAAAGCCCAATCTATAGAAGAAATAGCCAAATCATCTACATCGTCAGAAATTAGGCCAACTAAACGACCTAAAGAAGAACAAACAGCCTATGAAGATGATATGAGAGATGACTGGAAAAGAAAGGAATTAACAGTAAATCCTGTAGAAGCCTCAAAGGATAGAAACTTTGAAAGAATAGGATCATCCTATAAGAAGAACTTTTACCCTAGTCGAAGTGAAATATTAAACCTAGATAATGTTCCCCCACAATTTTATTACGACCAATTAGTAACATGGGAAGGAATAGTTAAAAATGAATGGGAAGCACGAAAGAAAGACGGCATGGATATGTGGTCTTGGATGGATGGAAGAATAACAGGATTAGTCCTATACTTAGTCCAAGATTGGATAGCTAAAAATCAAGCCGCCTACAATGATATAAAATCTAGAGGTGATAGACCTGAAAACTTCGTAAAAATGGTAAAAGATAGGTTCTTAATAGAAGATCCTACAGATGAAAGAAGAACTGCATTACAAAGGTTAGCACAAAGAGAATTAGAAGCCTTAAACTGCGAAGATCCTACGAAAATTCAACCATTTATGGCTGAATATCTTAAGAAAGCCTCAGAAGCCAAAAAAGGATTCGATGTAGTTTATGTAGAAAGACTCTTTGATAGACTACCAGAAGCAGTAGGAAAGGTAGTAAAGGCTGACTTTGTCAAAGATGGTAATTCCTATGAAGCAGGAATAGGAATAGCAGTTTCATACATATCTACATGGATGAGAGCAAAATGCATTAAGGAAACAGAAGCTAAAACCCATAAGAAAGCATCTTTAGCATTCTGCAGATCCATATATACTATAGGAGACTATAAGAAACGAAAAATCCTAAAAAGAGTTACAAATTATAATAAAAATAGGAGAAAGAACTACGTCAGAAGACCTAGTATTAAGAAAAAATGTAGATGTTATATCTGTCAAGATGAGAATCACCTAGCCAATAGATGTCCTAGAAGATATACCAATCAGGCTAGAGCAAGTCTAATAGATGGATTAGATGAAGATATAGTATCAATAGCATCAGACGATGAAGATATCGAAAATTTCCTTGAAATAATAGAACTTGATGAGTTTATAGCACATTCTAGTCAGGAACACGAACATACATGGGAAATTGGAGGAAAGAAAGATAAGGTATGTGAAATATGCAGTTATTTTACAGACTATAATAAAACTGTTAGTTGTAAAATTTGTGAAACCCAATACTGCAAAACATGTGCTGATCAACTCGCAATAGACGTAAGAGAAGTTAAAAAACCTACCAAAGAAGAATCAATGATAGAAGATTTAAAATTAAATGTCAAAAATCTAGAATTTAGAGTCACCATTCTAGAACATAAAGCAGAAATGCAAAAGCTTCAAGACAAATTTGAAACTATGCAAATTAGAAATAAACCAGAAATGACAGAAATATCAGAAGCAACAACTTCATTAGCTATGCGAGCAAATGAATCAAATTATATAAAAACATCAATTAATAAAACTGCAGGATGTTATGTAGAAACAAAAATCTCATTTAATAATGAGAATCGAATCATAACAGCATTAATAGATTCAGGTTCAACACATAACATAATCTGTCCAACATTAATACCAGCATCATGGATTAATAATACACATAGAGAAATTATTATGTTTGCTGTGGATAATAGCAAATATAATCTGAATCAAGAATTAATAGACGATATCAAATTACAATTTCAAGAAGTTGATGAAACTTTTGGAATAAAATATAAATTAGGACAAACTTATGTAGCACCTAAACCAACAAAAACATTCATAATAGGACATAGATTCCTTACAAATGAAAATGGTAGTGTTACAATTCATAAAGACTATATAACTATACAGAAAACTACTGGCATATACCCAACAGCCAGACATGAACTTAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACGACCGCCATTATTTTCAAACATTCCTGAAACTTATAACAAAATTCCTCATTTGCATTCATATCAGGCTCAACCTATATTAAGTTATAAGAATGAAATAGGAAATCAGAGTTTAATTACTATGGTTAAGGAGTTAGAAGCACTTGGATTTATCGGAGATGATATTACTAAAAATAGGACAACATGGGTATGTGACTTTAAAATCATAAACCCAGACATTAATATAACTTGTGCAACAATTCCATATACACCAGCAGATAAAGAAGTATTTGAAAAACAAATTAAAGAATTATTAGATAATAAGTTAATTAAGAAAGCTGATCCAACATGTAGGCATAGAACAGCAGCATTTATAGTAAGAAATCATTCTGAAGAAGTAGCTCAGAAACCTCGAATAGTTTATAACTATAAACGCTTGAATGATAATATGCATACAGATCCTTTTAATATTCCTCATAAGATTTCAATGATTAATCTGATACAGAAAGCTAATATATTTTCTAAGTTTGATCTGAAAGCAGGATTTCATCATATGAAACTAAAAGATGATTTCAAAGATTGGACTACTTTTACATGCTCAGAAGGATTATATACTTGGAACGTCTGTCCTTTTGGTATAGCCAATGCTCCATGTGCATTTCAAAGATTCATGCAAGAGTCATTTGGAGATTTAAAGTTTACATTATTATACATTGATGACATACTTATTGCATCTAACAATGAAAAAGAGCATATAGAACATCTTAAGATTTTCTTTAATAGAGTAAAAGAGATAGGATGTGTTCTTAGTAAGAAAAAATCAAAAATGTTTCTAAAAGAAGTAGAATATCTTGGAGTAGAAATTAAAGAAGGAAAGATTAGCCTTCAGCCACATATAGTTGATAAAATTAAAAAATTTGATAAGAATAAGCTCAATACTTTTAAAGGACTACAAGCATATCTAGGATTACTCAATTATGCCAGAGGATATATCAAAAACCTATCAAAGTTAGTAGGACCACTTTACAAAAAGACAGGAAAGAATGGGCAAAGAATCTTTAACAAAGAAGATTGGAATATAATCTTTAAAATAGAAAGAGAGGTATCAAAGATAAAGCCTTTAGAAAGACCTAAAGAAACCGACTACATCATTATAGAAACAGATGCTTCAGAAGAAGGCTGGGGAGCAGTCTTAGTCTGTAAGCCAGATAAATATAGTGGCAAAGACACTGAAAAAATAGCAGGCTATGCATCAGGAAACTTTGGAGAAAAGAAAACCTGGACTAGTTTAGATTATGAAATAGAAGCCATAAATGAAGCCCTAAACAAGTTCCAGATATACTTAGACAAAGATTTTACAATCAGAACTGATTGTGAAGCAATAGTGAAAGGAATAAAAACAGAAGACTATAAGAAGAGATCAAAGACCAGATGGATCAAGTTAAGAGATAATCTCTTAAAAGATGGCTACAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAGGGTAACAAAAATTTTTTACCAAACTTCTTATCCCGTGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAATCCCGATTCTACGGAATCATATTCTATAGATTCGTCAGAATCAATTCCACTATATAACGATTCGAAAGAATCACATTCTATAGAGTCTGATGACTCAATTCCACTATACAGGGACAAGCTTCTTCCTCTAGTCGAAAGGCTAAAGGAGAAAAGTGCCTAACTAAGATCGGAGGCATCACCATGAATATAGAGTACCCGTACTCAATCCACATAATAGACAAGAACAAGGTTCCGATCTACGATCAAGGAAATCTCTTCCACACTGAGAAGTCTGCGAGACTTTCACATGTGTCCAGAGGTTTGCTGGATCATCTCTTTACTTTTTCGTCTGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACATATTAGCCGATTATCTTTACCTACTAGAAAGTGAGAGAGAGTCATATAGAAATGAGTGGATTAGCCTGAGTGATCAGGTTAGTCTCCTACAAAAACAAAATAGTGAGTTGAGAGCTAGGATAGCCACTAATAAAGAGATAATAGAGGGACTGAGAGAGCCAGTCAAAAAGCCAATATACACAACCCAGGATAAAGAGAGGCTCCGTGTCTTCTTTTGCGAAGAAAGAAGCATGGAATATATATACTATCATATAAAAAGGCTAGCTCAGCAGAGCTATTATTCCCACCTAAATAAGTTACAGAAGGATTGCGAGCCCTTTCGAGGGATCTACATGTCTTTCTTAACTAATGTTAAATTTCTAGTATTATGTGAAGCCGGATACTGGACTGTACCAGATATAGAAACTAATACCACAGAGTCTTTATTAAGTCTATCTCAGAAGAAAGGAAAAGATCTTCTGCAAAAGGGAGTGGTAATATTTAATGAGCTTGAAGGAGGATATCAACTTTCTCCAAGGTTCATTGGAGACCTTTATGCTCATGGTTTTATTAAACAAATAAACTTCACGACCAAGGTTCCTGAAGGATTGCCGCCAATCATAGCGGAAAAACTTCAAGACTATAAGTTCCCTGGATCAAACACAGTCTTAATAGAACGAGAGATTCCTCGCTGGAACTTTAATGAAATGAAAAGAGAGACACAGATGAGGACCAATTTATATATCTTCAAGAATTATCGATGCTTCTATGGCTATTCACCATTAAGGCCATATGAACCTATAACTCCTGAAGAATTTGGGTTTGATTACTACAGTTGGGAAAATATGGTTGATGAAGACAAAGGAGAAGTAGTATACATCTCCAAAAATACTAAGATTATTAAAGTCACTAGAGAGCATGCATGGGCTTGGCCAGAACATGATGGAGGTACAATGTCCTGCACCACATCAATAGAAGACGAATGGATCCACCGTATGGACAATGCTTAAAGAAGCTTTATCAAAAACAACTTTAAGTACGAATCAATAAAGAAGGACCAGAAGATATAAAGCGGGAACATCTTCACATGCTACCACATGGCTAGCATCTTTACTTTAGCATCTCTATTATTGTAAGAGTGTGTAATGACCAGTGTGCCCCTGGACTCCAGTATATAAGGAGCACCAGAGTATTGTAATAGATCATCGATCAAGCAAGCGAGAGCTAAAACTTCTAAGAGAGCAAGAGAGGAGCTTATCCTCTCAACCCCTCTTCAAGAAGCAAAGGCGATCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTAATATGTTTGTACTTATGATTGTATTTCTCAAAACCTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTTATATTCATCCTACACCCTTGTGATAAAACATGAAGTCATACTCGTTCTAAGATTAAGTGTTCTAAAAATACTTCGAAGCATTGAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAAAAGTACCGTCAGGCCGTGTTATGGCAAGGGAAGAAGTACCATGAATACCCTATAAATGTTAGAAGGAAGATAAGAACTAAGTATCTTATGAACAATGAGTAGCTGATTTCTGATTATCATTAACAAGTATCGTTATAATCCATAAGCTTTGAAAGATCTGCTAGTGTGGATACCAAAAGGCTGTCGTGGTTCGCCCAGTCGACGGATGAGGTTATAAACGAAGCACTAGTAGGTAACTAAGAGGCTTAGGGATGAGCAACGAGAAAAGTTAGGGGGGTGCCTAGAAA
| 111,528
|
AF113831.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Cabauatan,P.Q., Melcher,U., Ishikawa,K., Omura,T., Hibino,H., Koganezawa,H., Azzam,O.
|
International Rice Research Institute, Entomology and Plant Pathology
|
Philippines
|
1999-05-14
| null |
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 8,001
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
| null | null | null | null | null |
Rice tungro bacilliform virus strain RTBV-G2, complete genome
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGAACTTTAAGGGAAAAATAGAATACAATCTAGTCAAACTAATTACATAAGTTCCAAAGAGGGATCTTATTTCTCAAAATATTGAGTCACGTTACGAAAAACTTGAATTCTTAGACTTAGCAGTCTGGGGAAAAGAGAAAAAACAAAAATATTTACTATCTACCGATAATATTAGCTTTTACTGTTACTTTGATACTAGTAAAACCAGTGAATCAGAAAGAAAGCATACCTTTCATTCTGATAATAAGCAACTCAATAGTATTGTAGACCTTATTATTAAGCATTCTGAAAAGACCAAAAATATTAAGGAAGAATTAGAAAAATATAGTCAGTTCCTAGATAAGATATTAGATTTAAAACCTACTAAAAAACAAGTTGAAAAACTATTAGAAAATCAAAACTTAATTAGCAAGAACTTTGATTATATCAAAGAACAAAACACTCAACTAGAAAAATCCCTAAGAAAAACAGTTAAGTTAGAAGACTCCATTAATACTCTATTAGTAGAAATACAACAAGCTAGACCTAAGGAAGTAGAATTAAGAACTCTTAAAATAGCAGAACAGAACTCTAAGGCAATAGAAAAATTTGAGCAAGAAATTAAGGACTTAAGAGAAATCCTGGAATTCCTTAAGCATCAAGCTACATGAGCGCTGATTACCCAACTTTCAAGGAAGCCCTTGAAAAGTTTAAAAACCTAGAATCAGATACAGCCGGAAAAGATAAGTTTAATTGGGTATTTACTCTAGAAAATATAAAGTCAGCCGCGGACGTAAATTTAGCATCTAAGGGTTTAGTACAACTTTACGCTTTACAAGAAATTGATAAAAAGATTAATAATCTTACAACCCAAGTTAGTAAGTTACCTACAACTAGTGGAAGTAGTTCAGCAGGAGCTATAGTACCTGCAGGTAGTAACACCCAAGGTCAGTACAAAGCACCACCTAAGAAAGGAATTAAAAGAAAATATCCAGCATGAGCCTTAGACCATTTACTGGTACTTCTAGAACTATAACCCAAGATTTAACCTCTGAATCTAATATAAAAAAGGGAAAAAACTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAGAAATAGATGTTAATCAAGAAGTAGAAAACTTTGATTGGAAAAAACTATCAGGAATTAAACCTAATAAACTATATGAGAAAAATTGGCAAGAAAAGGTTAAGTTAAAACAACAATCCATAGTCTCAGCATATAAAGAAGAAGCTATTAGTGTAACTCATAATGCATATACTACTACTTTATTTCCACAAGAAGTAATTAAAAATGTTAAGAATCAGGGAAAACTTTATTATCATATAGGCATGATGGCCATAGGAGTTAAAGGACTTCATAGAAGAAAAATAGGAACTAAAGTCATGATTATGTTTTATGATGATAGTTTCGGTAAAGCTAGAAAAGCTAGCATTGGATCAATAGAAATGGATATGAACGCCGGTTGTGGAGTGTTCTACTCCTGCCCCGACTTTGCAAAATATATCAAAGATTTATCACACCTTAAGATAGGGATACAAACCCTAGGATATGAAAATTATGAAGGAAAAAACCTTTCGGTAGCAATCAAAACTATAGGAAGATTGACCACCAATATACAGTCAAAGTATAAGATAAATGTGAAAGATATTGTAGAACAGATATCATCACAAGGAATCATTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACACCTAGATGGGAATGAATGGGATCTTAGTAAATTCTTAAACCATGAAAACACAAGTAGAGTCCCAACCAAAGCCTTAATATATCAGAATCTACAAGGAGGGGAATCCTTAAGATTTTCAAATTATAAGCAAACTAGAATGCATGATCCAACTGAAAATAATTCAGATGAAGATGAAGATTTAAAAATCCTAGGAGAACAACTAAATATTAAAATGGCAAGATTTTACACAATGCAAACCCCAGAAGAAGAATTACGAGAAGTAATTCAACAATTAGAAAGAGAAAAACAAGCCATGATAGCAAAACTAGAAGCTAAAATGAAAGAGTCATCTAAAATGGCAATAGTAGAAGATAATTTCAATCCAAATAACGAATATCTAGAAGATACATATTCTGAATATGAAGATCTAGAATTCGAGAAATTAGGATTAACCGGATGGGAAGACTTAGATCAGGATTCCATAGAAACCGAAGAAATAACTGAATGGGGAAATCCTAATCAAGTACTTCATAGAGAAATTAGAGCATATAAATCAGTATCCGAACAAATAGAAGATATATTCGGAGAACTACTAAAAGAACACGGAAATTATGATATGGCCCTCAAAAACCTAGAAGAAAAATACGACCTAGATAAAATAGAAAAGGCCAAATCTATAGAAGAAATAGCTAAGTCATCTACATCGTCAGAAATTAGGCCAACTAAACGACCTAAAGAAGAACAAACAGCCTATGAAGATGATATGAGAGATGATTGGAAAAGAAAAGAATTAACAGTAAATCCCATAGAAGCCTCAAAAGATAGAAATTTTGAAAGAATAGGAAGTTCATATAAGAAAAACTTTTACCCTAGTAGAAGTGAAATATTAAACCTAGATAATGTTCCCCCACAGTTTTACTATGACCAACTAGTAACCTGGGAAGGAATAGTTAAAAATGAATGGGAAGCACGTAAGAAAGATGGGATGGATATGTGGTCTTGGATGGACGGAAGAATAACAGGATTAGTGTTATATTTAGTCCAAGATTGGATATCTAAAAATCAGGCAGCCTATAATGATATAAAATCTAGAGGTGATAGACCTGAAAACTTCGTAAAAATGGTAAAAGATAGGTTCTTAATAGAAGATCCTACAGATGAAAGAAGAACAGCATTACAAAGGTTAGCACAAAGAGAATTAGAAGCCTTAAACTGCGAAGATCCCACTAAAATTCAACCATTTATGGCTGAATACCTTAAGAAAGCCTCAGAAGCCAAAAAAGGATTTGATGTAGTTTATGTAGAAAGACTCTTTGATAGACTACCAGAAGCAGTAGGAAAGGTAGTAAAAGCGGACTTTGTCAAAGACGGTAATTCCTATGAAGCAGGAATAGGAATAGCAGTTTCATATATATCCACATGGATGAGAGCAAAATGCATTAAGGAAACAGAAGCTAAAACTCAAAAGAAAGCATCCTTAGCATTCTGTAGATCCATATATACTATAGGAGATTATAAGAAACGAAAAATCCTAAAAAAAGTTACAAACTATAATAAAAATAGGAGAAAAAACTATGTCAGAAGACCTAGCATTAAGAAAAAATGTAGGTGTTATATCTGTCAAGATGAAAATCACCTAGCTAATAGATGTCCTAGACGATATACTAATCAGGCTAGAGCAAGTCTAATAGATGGATTAGACGAAGATATAGTATCCATAGCATCAGATGACGAGGATATTGAAAATTTCCTTGAAATAATAGAACTTGATGAATTTATAGCACATTCTAGTCAAGAACATGAACATACATGGGAAATCGGAGGAAAGAAAGATAAGGTATGTGAAATTTGCAGTTATTTTACGGATTATAATAAAACTGTTAGTTGTAAAACTTGTGAAACCCAATATTGCAAAACATGTTCTGATCAACTAGCACTAGAAGTAACAGAAGTCAAAAAACCTACAAAAGAAGAAACAATGATAGACGACCTAAAATTAAATGTTAAAAATCTAGAATTTAGAGTCACCATTCTAGAACATAAGGTAGAAATGCAGAATCTTCAAGATAAATTCGAAACTATGCAAATTAGAAATAAATCAGAAATAACAGAAATACCAACAACCTCATTAGCTATGAGAGCAAATGAATCAAATTATATAAAAACATCAATTAATAAAACTGCAGGATGTTATGTAGAAACAAAAATCTCATTTAATAATGAGAATAGAATCATAACAGCACTAATAGATTCAGGATCAACACATAATATAATATGTCCAACATTGATACCAGCATCATGGATTAATAATACACATAGAGAAATTATAATGTTCGCTGTAGACAATAGCAAATATAATCTGAATCAAGAATTAATAGATGATATAAAATTACAATTCCAAGAAGTTGATGAAACTTTTGGAATAAAATATAAATTAGGACAAACCTATGTAGCACCTAAGCCAACAAAAACATTTATAATAGGACACAGATTCCTTACAAATGAAAATGGTAGTGTTACAATCCATAAAGATTATATAACTATACAAAAAACTACGGGAATATACCCAACAGCCAGACACGAACTTAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACGCCCGCCATTATTTTCAAACATTCCTGAAACCTATAACAAAATTCCTCATTTGCATTCATATCAGCCTCAACCAATATTAGGATATAAGAATGAAATAGGAAATCAAAGTTTAATCACTATGGTGAAAGAATTAGAAGCACTTGGATTCATAGGAGATGACATTACTAAAAACAGAACAACGTGGGTATGTGACTTCAAAATCATAAACCCAGATATTAATATAACTTGTGCAACAATTCCATACACACCAGCAGATAAAGAAGTATTTGAAAAACAAATTAAGGAGCTACTAGATAATAAGTTAATCAAGAAAGCCGATCCAACATGTAGGCATAGAACAGCAGCATTTATAGTAAGAAATCATTCTGAAGAAGTAGCTCAGAAACCTCGAATAGTCTATAACTATAAACGATTGAATGATAATATGCATACAGATCCTTTTAATATTCCTCATAAGATTTCAATGATTAATCTAATACAGAAAGCTAATATATTTTCTAAGTTTGATTTAAAAGCAGGATTTCATCATATGAAATTAAAAGATGATTTCAAAGATTGGACTACTTTTACATGCTCAGAAGGATTATATACTTGGAACGTCTGTCCATTTGGTATAGCTAACGCTCCTTGTGCATTTCAAAGATTTATGCAGGAATCCTTTGGAGATTTAAAGTTTGCATTATTATATATAGATGACATACTTATTGCATCTAATAACGAAAAAGAGCATATAGAACATCTTAAGATTTTCTTTAATAGAGTAAAAGAAATAGGATGTGTTCTTAGTAAGAAAAAATCAAAAATGTTTCTTAAAGAAGTAGAATATCTTGGAGTAGAAATTAAAGAAGGAAAAATTAGCCTTCAGCCCCATATAGTTGATAAGATCAAAAAATTCGATAAGAATAAACTCAACACTTTAAAAGGACTGCAAGCATATTTAGGGTTACTCAATTATGCCAGAGGATACATCAAAGACCTATCAAAGCTAGTAGGACCACTTTATAAAAAGACAGGAAAAAATGGGCAAAGAATCTTTAACAAAGAAGATTGGAATATCATCTTTAAGATAGAAAGAGAGGTATCAAAGATAAAGCCTTTAGAAAGACCTAAAGAAACCGACTACATCATTATAGAGACAGATGCGTCAGAAGAAGGCTGGGGAGCAGTCTTAGTCTGTAAGCCAGATAAATATAGTGGCAAGGACACTGAGAAAATAGCAGGATATGCATCAGGAAACTTTGGAGAGAAGAAAACCTGGACTAGTTTAGATTATGAAATAGAAGCTATAAATGAAGCCCTAAACAAGTTCCAGATATATTTAGATAAAGATTTTACAATCAGAACTGATTGTGAAGCAATAGTGAAAGGGATAAAAACAGAAGATTATAAAAAGAGATCAAAAACAAGGTGGATCAAGTTAAGAGATAATCTCTTAAAGGATGGATACAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAGGGAAACAAAAACTTTTTACCAAACTTCTTATCCCGTGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAACCCCGATTCTACGGAATCATATTCTATAGATTCGTCAGAATCAATTCCACTATATATCGATTCGAAAGAATCACATTCTATAGAGTCTAATGACTCAATTCCACTATACAGGGACAAGCTTCTTCCTCTAGTCGAAAGGCTAAAGGAAAAGAGTGCCTAACTAAGATCGGAGGCATCACCATGAATATAGAGTACCCGTACTCAATCCACATAATAGACAAGAACAAGGTTCCGATCTACGATCAAGGAAATCTCTTCCACACTGAGAAGTCCGCAAGACTTTCACATGTGTCCAGAGGTTTGCTGGATCATCTCTTTACTTTTTCGTCTGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACATATTAGCCGATTATCTTTACCTATTAGAAAGTGAGAGAGAGTCATATAAAAATGAGTGGATTAGCTTGAAGGATCAAGTTAGTCTTCTACAAAAACAAAATAGTGAGTTGAGAGCTAGGATAGCCACCAACAAAGAAATAATAGAAGGACTGAGAGAGCCAGTTAAAAAGCCAATATACACAACCCAGGATAAAGAGAGGCTCCGTGTTTTCTTTTGCGAAGAAAGAAGCATGGAATATATATATTATCATATAAAAAGGCTAGCTCAGCAGAGCTATTATTCCCACCTAAATAAATTACAGAAGGATTGTGAACCCTTTCGAGGGGTCTACATGTCTTTCTTAACTAATGTTAAGTTCCTAGTATTATGTGAAGCTGGATACTGGACTGTACCAGATATAGAAACTAATACTACAGAGTCTATATTAAGTCTATCCCAGAAGAAAGGAGAAGATCTTCTACAAAAGGGAGTAGTAATATTTAATGAGCTTGAAGGAGGATATCAACTCTCTCCAAGGTTTATTGGAGACCTTTATGCTCATGGCTTTATTAAACAAATAAACTTCACGACCAAGGTTCCTGAAGGACTGCCGCCAATCATAGCGGAAAAACTTCAAGACTACAAGTTCCCTGGATCAAACACCGTCTTAATAGAACGAGAGATTCCTCGCTGGAATTTTAATGAAATGAAAAGAGAAACACAGATGAGGACCAATTTATATATCTTCAAGAATTATCGTTGTTTCTATGGCTATTCACCTTTAAGGCCATATGAACCTATAACTCCTGAAGAATTCGGGTTTGATTACTATAGTTGGGAAAATATGGTTGATGAAGACGAAGGAGAAGTAGTATATATCTCCAAGACTACTAAAATCATCAAAGTTACTAGAGAGCATGCATGGGCCTGGCCAGAACATGATGGAGATACAATGTCCTGCACCACATCAATAGAATACGAATGGATCCATCGTATGGACAATGCTTAAAGAAGCTTTATCTAAAGCAACTTTAAGTACGAATCAATAAAGAAGGACCAGAAGATATAAAGCGGGAACATCTTCACATGCTACCACATGGCTAGCATCTTTACTTTAGCATCTCTATTATTGTAAGGATGTGTAATGACTAGTGTGCCCCTGGACTCCAGTATATAAGGAGCACCAGAGTATTGTAAGAGATCATCGATCAAGCAAGCGAGAGCTCAAACTTCTAAGAGAGCAAGAGAGGAGCTTATCCTCTCAACCCCTCTTCAAGAAGCAAAGGCGATCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTAATATGTTTGTACTTATGATTGTATTTCTCAAAACCTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTTATATTTATCCTACACCCTTGTGATAAAACATGAAGTCATACTCGTTCTAAGATTAAGTGTTCTAAAAATACTTCGAAGCATTGAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAAAAGTACCGTCAGGCCGTGTTATGGCAAGGGAAGAAGTACCATGAATACCCTATAGATGTTAGAAGGAAGATAAGAACTAAGTATCTTATGAACAATGGGTAGCTGATTTCTGACTATCATTAACAAGTATCGTTATAATCCATAAGCTTTGAAAGATCTGCTAGTGTGGATACCAAAAGGCTGTCGTGGTTCGCCCAGTCGACGGATGAGGTCATAAACGAAGCACTAGTAGGTAACTAAGAGGCTTAGGGATGAGCAACGAGAAAAGTTAGGGGGGTGCCTAGAAA
| 111,529
|
AF113832.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Cabauatan,P.Q., Melcher,U., Ishikawa,K., Omura,T., Hibino,H., Koganezawa,H., Azzam,O.
|
International Rice Research Institute, Entomology and Plant Pathology
|
Philippines
|
1999-05-14
| null |
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 8,005
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Rice tungro bacilliform virus strain RTBV-Ic, complete genome
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGAACTTTAAGGGAAATAGAATACAATCTAGTCAAACTAATTACATAAGTTCCGAAGAGGAATCTTATTTCTTAAAACATTGAGTCACGATACGAAAAACTTGAATTCTTAGACTTAGCAGTCTGGGGAAAAGAGAAAAAACAAAAATATTTACTATCTACCGATAATATTAGCTTTTATTGTTACTTTGATACTAGTAAAACTAGTGAATCAGAAAGAAAGCATACCTTTCATTCTGATAATAAGCAACTTAATAGTATTGTAGATCTTATTATTAAGCATTCTGAAAAAACCAAAAATATTAAGGAAGAATTAGAAAAATATAGTCAGTTCCTAGATAAGATATTAGATTTAAAACCTACTAAAAAACAAGTCGAAAAACTATTAGAAAATCAAAACTTAATTAGCAAGAACTTTGATTATATCAAAGAACAAAACACTCAGCTAGAAAAATCACTAAGAAAAACAGTTAAGTTAGAAGACTCCATTAATACTTTATTAGTAGAAATACAACAAGCTAGACCTAAGGAAGTAGAATTAAGGACTCTTAAAATAGCAGAGCAGAACTCTAAGGCAATAGAAAAATTTGAACAAGAAATTAAGGATCTAAGAGAAATCTTAGAATACCTTAAGCACCAATCTACATGAGCGCTGATTATCCAACTTTCAAGGAAGCCCTTGAAAAATTTAAAAACCTAGAATCAGATACAGCTTCTAAAGATAAGTTTAATTGGGTATTTACTTTAGAAAATATAAAAACAACTGCAGACGTAAACCTAGCATCTAAAGGATTAGTACAACTTTACGCCCTACAAGAAATTGATAAAAAGATAAATAATCTTACAGCCCAAGTAAGTAAGTTACCTACAACTAGTGGAAGTAGTTCAGCAGGAGCCATAGTACCTGCAGGAAGTAACACTCAAGGTCAATATAAAGCACCACCTAAAAAAGGAATTAAAAGAAAATATCCAGCATGAGTCTTAGACCATTTACGGGCACTTCTAGAACTATAACTCAAGATTCAACTTCTGAATCTAATATAAAAAAGGGAAAAAATTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAGAAGTAGATGTTAATCAGGAAGTAGAAAACTTTGATTGGAAAAAATTATCAGGTATTAAACCTAATAAATTATATGAGAAAAACTGGCAAGAAAAGGTTAAGTTAAAGCAACAATCTATAGTTTCAGCATATAAAGAGGAAGCTATTAGCGTAACTCATAATGCATATACTACTACTTTATTTCCACAAGAAGTAATTAAGAATGTTAAAAATCAGGGAAAACTTTATTATCATATAGGCATGATGGCCATAGGAGTTAAAGGACTTCATAGAAGAAAAATAGGAACTAAAGTTATGATAATGTTCTATGATGATAGTTTCGGTAAAGCTAGAGAAGCTAGCATAGGATCAATAGAAATGGATATGAACGCCGGTTGCGGAGTATTTTACTCCTGCCCCGACTTTGCAAAATACATTAAAGATTTATCACATCTTAAGATAGGGATACAAACCCTAGGATATGAAAACTATGAAGGAAAAAACCTTTCAGTAGCAATCAAAACTATAGGAAGATTAACCACTAATATACAATCAAAATATAAGATAAATGTGAAAGATATTGTGGAACAAATATCATCACAAGGAATCATTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACACTTAGATGGAAATGAATGGGATCTAAGTAAATTCCTAAACCATGAAAACACAAGTAGAGTCCCAACCAAAGCCTTAATATATCAGAATCTACAAGGAGGAGAATCCTTAAGATTCTCAAACTATAAGCAAACTAGAATGCATGATCCTATTGAGAATAATTCAGATGAGGATGAAAATTTAAAAATCTTAGGAGAACAATTAAACATTAAAATGGCAAGATTTTACACAATGCAAACCCCAGAGGAAGAATTACTAGAAGTAATTCAACAATTAGAAAGAGAAAAACAAGCCATGATAGAAAAACTAGAAGCCAAAATGAAAGAATCATCCAAAATGGCGATAGTAGAAGATAATTTCAACCCAAACAATGAATATCTAGAAGATACATATTCCGAATATGAAGACCTAGAATTTGAAAAATTAGGACTAACTGGATGGGAAGACTTAGACCAGGATTCCATAGAAACCGAAGAAATAACCGAATGGGAAAATCCTAATCAGGTACTTCATAGAGAAATTAGAGCATACAAATCAGTCTCTGAACAAATAGAAGATATATTTGGGGAATTACTAAAAGAACATGGAAACTATGATATGGCCCTTAAAAACTTAGAAGAAAAATATGACCTAGACAAAATAGAAAAGGCCAAATCTATAGAAGAAATAGCCAAATCATCTACATCGTCAGAAATTAGGCCAACTAAACGACCTAAAGAAGAACAAACAGCCTATGAAGATGATATGAGAGATGACTGGAAAAGAAAGGAGTTAACAGTAAATCCTGTAGAAGCCTCAAAGGATAGAAACTTTGAAAGAATAGGATCATCCTATAAGAAGAACTTTTACCCTAGTCGAAGTGAAATATTAAACCTAGATAATGTTCCCCCACAATTTTATTACGACCAATTAGTAACATGGGAAGGAATAGTTAAAAATGAATGGGAAGCACGAAAGAAAGACGGCATGGATATGTGGTCTTGGATGGATGGAAGAATAACAGGATTAGTCCTATACTTAGTCCAAGATTGGATAGCTAAAAATCAAGCCGCCTACAATGATATAAAATCTAGAGGTGATAGACCTGAAAACTTCGTAAAAATGGTAAAAGATAGGTTCTTAATAGAAGATCCTACAGATGAAAGAAGAACTGCATTACAAAGGTTAGCACAAAGAGAATTAGAAGCCTTAAACTGCGAAGATCCTACGAAAATTCAACCATTTATGGCTGAATATCTTAAGAAAGCCTCAGAAGCCAAAAAAGGATTCGATGTAGTTTATGTAGAAAGACTCTTTGATAGACTACCAGAAGCAGTAGGAAAGGTAGTAAAGGCTGACTTTGTCAAAGATGGTAATTCCTATGAAGCAGGAATAGGAATAGCAGTTTCATACATATCTACATGGATGAGAGCAAAATGCATTAAGGAAACAGAAGCTAAAACCCAAAAGAAAGCATCTTTAGCATTCTGCAGATCCATATATACTATAGGAGACTATAAGAAACGAAAAATCCTAAAAAGAGTTACAAATTATAATAAAAATAGGAGAAAGAACTACGTCAGAAGACCTAGTATTAAGAAAAAATGTAGATGTTATATCTGTCAAGATGAGAATCACCTAGCCAATAGATGTCCTAGAAGATATACCAATCAGGCTAGAGCAAGTCTAATAGATGGATTAGATGAAGATATAGTATCAATAGCATCAGACGATGAAGATATCGAAAATTTCCTTGAAATAATAGAACTTGATGAGTTTATAGCACATTCTAGTCAGGAACACGAACATACATGGGAAATTGGAGGAAAGAAAGATAAGGTATGTGAAATATGCAGTTATTTTACAGACTATAATAAAACTGTTAGTTGTAAAATTTGTGAAACCCAATACTGCAAAACATGTGCTGATCAACTCGCAATAGACGTAAGAGAAATTAAAAAACCTACCAAAGAAGAATCAATGATAGAAGATTTAAAATTAAATGTCAAAAATCTAGAATTTAGAGTCACCATTCTAGAACATAAAGCAGAAATGCAAAATCTTCAAGACAAATTTGAAACTATGCAAATTAGAAATAAACCAGAAATAACAGAAATATCAGAAGCAACAACTTCATTAGCTATGCGAGCAAATGAATCAAAGTATATAAAAACATCAATTAATAAAACTGCAGGATGTTATGTAGAAACAAAAATCTCATTTAATAATGAGAATCGAATCATAACAGCATTAATAGATTCAGGTTCAACACATAACATAATCTGTCCAACATTAATACCAGCATCATGGATTAATAATACACATAGAGAAATTATTATGTTTGCTGTGGATAATAGCAAATATAATCTGAATCAAGAATTAATAGACGATATCAAATTACAATTTCAAGAAGTTGATGAAACTTTTGGAATAAAATATAAATTAGGACAAACTTATGTAGCACCTAAACCAACAAAAACATTCATAATAGGACATAGATTCCTTACAAATGAAAATGGTAGTGTTACAATTCATAAAGACTATATAACTATACAGAAAACTACTGGCATATACCCAACAGCTAGACATGAACTTAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACGACCGCCATTATTTTCAAACATTCCTGAAACTTATAACAAAATTCCTCATTTGCATTCATATCAGCCTCAACCTATATTAAGTTATAAGAATGAAATAGGAAATCAGAGTTTAATTACTATGGTTAAGGAGTTAGAAGCACTTGGATTTATCGGAGATGATATTACTAAAAATAGGACAACATGGGTATGTGACTTTAAAATCATAAACCCAGACATTAATATAACTTGTGCAACAATTCCATATACACCAGCAGATAAAGAAGTATTTGAAAAACAAATTAAAGAATTATTAGATAATAAGTTAATTAAGAAAGCTGATCCAACATGTAGGCATAGAACAGCAGCATTTATAGTAAGAAATCATTCTGAAGAAGTAGCTCAGAAACCTCGAATAGTTTATAACTATAAACGCTTGAATGATAATATGCATACAGATCCTTTTAATATTCCTCATAAGATTTCAATGATTAATCTGATACAGAAAGCTAATATATTTTCTAAGTTTGATCTGAAAGCAGGATTTCATCATATGAAACTAAAAGATGATTTCAAAGATTGGACTACTTTTACATGCTCAGAAGGATTATATACTTGGAACGTCTGTCCTTTTGGTATAGCCAATGCTCCATGTGCATTTCAAAGATTCATGCAAGAGTCATTTGGAGATTTAAAGTTTACATTATTATACATAGATGACATACTTATTGCATCTAACAATGAAAAAGAGCATATAGAACATCTTAAGATTTTCTTTAATAGAGTAAAAGAGATAGGATGTGTTCTTAGTAAGAAAAAATCAAAAATGTTTCTAAAAGAAGTAGAATATCTTGGAGTAGAAATTAAAGAAGGAAAGATTAGCCTTCAGCCACATATAGTTGATAAAATTAAAAAATTTGATAAGAATAAGCTCAATACTTTAAAAGGACTACAAGCATATCTAGGATTACTCAATTATGCCAGAGGATATATCAAAGACCTATCAAAGTTAGTAGGACCACTTTACAAAAAGACAGGAAAGAATGGGCAAAGAATCTTTAACAAAGAAGATTGGAATATAATCTTTAAAATAGAAAGAGAGGTATCAAAGATAAAGCCTTTAGAAAGACCTAAAGAAACCGACTACATCATTATAGAAACAGATGCTTCAGAAGAAGGCTGGGGAGCAGTCTTAGTCTGTAAGCCAGATAAATATAGTGGCAAAGACACTGAAAAAATAGCAGGCTATGCATCAGGAAACTTTGGAGAAAAGAAAACCTGGACTAGTTTAGATTATGAAATAGAAGCCATAAATGAAGCCCTAAACAAGTTCCAGATATACTTAGACAAAGATTTTACAATCAGAACTGATTGTGAAGCAATAGTGAAAGGAATAAAAACAGAAGACTATAAGAAGAGATCAAAGACCAGATGGATCAAGTTAAGAGATAATCTCTTAAAAGATGGTTACAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAGGGTAACAAAAATTTTTTACCAAACTTCTTATCCCGTGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAATCCCGATTCTACGGAATCATATTCTATAGATTCGTCAGAATCAATTCCACTATATAACGATTCGAAAGAATCACATTCTATAGAGTCTGATGACTCAATTCCACTATACAGGGACAAGCTTCTTCCTCTAGTCGAAAGGCTAAAGGAGAAAAGTGCCTAACTAAGATCGGAGGCATCACCATGAATATAGAGTACCCGTACTCAATCCACATAATAGACAAGAACAAGGTTCCGATCTACGATCAAGGAAATCTCTTCCACACTGAGAAGTCTGCGAGACTTTCACATGTGTCCAGAGGTTTGCTGGATCATCTCTTTACTTTTTCGTCTGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACATATTAGCCGATTATCTTTACCTACTAGAAAGTGAGAGAGAGTCATATAGAAATGAGTGGATTAGCCTGAGTGATCAGGTTAGTCTCCTACAAAAACAAAATAGTGAGTTGAGAGCTAGGATAGCCACTAATAAAGAGATAATAGAGGGACTGAGAGAGCCAGTCAAAAAGCCAATATACACAACCCAGGATAAAGAGAGGCTCCGCGTCTTCTTTTGCGAAGAAAGAAGCATGGAATATATATACTATCATATAAAAAGGCTAGCTCAGCAGAGCTATTATTCCCACCTAAATAAGTTACAGAAGGATTGCGAGCCCTTTCGAGGGGTCTACATGTCTTTCTTAACTAATGTTAAATTTCTAGTATTATGTGAAGCCGGATACTGGACTGTACCAGATATAGAAACTAATACCACAGAGTCTTTATTAAGTCTATCTCAGAAGAAAGGAAAAGATCTTCTGCAAAAGGGAGTGGTAATATTTAATGAGCTTGAAGGAGGATATCAACTTTCTCCAAGGTTCATTGGAGACCTTTATGCTCATGGTTTTATTAAACAAATAAACTTCACGACCAAGGTTCCTGAAGGATTGCCGCCAATCATAGCGGAAAAACTTCAAGACTATAAGTTCCCTGGATCAAACACAGTCTTAATAGAACGAGAGATTCCTCGCTGGAACTTTAATGAAATGAAAAGAGAGACACAGATGAGGACCAATTTATATATCTTCAAGAATTATCGATGCTTCTATGGCTATTCACCATTAAGGCCATATGAACCTATAACTCCTGAAGAATTTGGGTTTGATTACTACAGTTGGGAAAATATGGTTGATGAAGACGAAGGAGAAGTAGTATACATCTCCAAAAATACTAAGATTATTAAAGTCACTAGAGAGCATGTATGGGCTTGGCCAGAACATGATGGAGATACAATGTCCTGCACCACATCAATAGAAGACGAATGGATCCACCGTATGGAAAATGCTTAAAGAAGCTTTATCAAAAGCAACTTTAAGTACGAATCAATAAAGAAGGACCAGAAGATATAAAGCGGGAACATCTTCACATGCTACCACATGGCTAGCATCTTTACTTTAGCATCTCTATTATTGTAAGAGTGTGTAATGACCAGTGTGCCCCTGGACTCCAGTATATAAGGAGCACCAGAGTATTGTAATAGATCATCGATCAAGCAAGCGAGAGCTAAAACTTCTAAGAGAGCAAGAGAGGAGCTTATCCTCTCAACCCCTCTTCAAGAAGCAAAGGCGATCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTAATATGTTTGTACTTATCATTGTATTTCTCAAAACCTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTTATATTCATCCTACACCCTTGTGATAAAACATGAAGTCATACTCGTTCTAAGATTAAGTGTTCTAAAAATACTTCGAAGCATTGAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAAAAGTACCGTCAGGCCGTGTTATGGCAAGGGAAGAAGTACCATGAATACCCTATAAATGTTAGAAGGAAGATAAGAACTAAGTATCTTATGAACAATGAGTAGCTGATTTCTGATATTCATTGACAAGTATCGTTATAATCCATAAGCTTTGAAAGATCTGCTAGTGTGGATACCAAAAGGCTGTCGTGGTTCGCCCAGTCGACGGATGAGGTTATAAACGAAGCACTAGTAGGTAACTAAGAGGCTTAGGGATGAGCAACGAGAAAAGTTAGGGGGGTGCCTAGAAA
| 111,530
|
AF076470.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Marmey,P., Bothner,B., Jacquot,E., de Kochko,A., Ong,C.A., Yot,P., Siuzdak,G., Beachy,R.N., Fauquet,C.M., Brizard,J.P., Fauquet,C.
|
ILTAB/ORSTOM/TSRI, Cell Biology
|
USA
|
1998-07-28
| null |
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 8,016
|
GenBank
| 1
|
Malaysia
|
Malaysia
| null | null | null | null | null |
Rice tungro bacilliform virus Serdang strain, complete genome
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGAACTTTAAGGGAAAACATGAATACAATCTAGTCGAACTAATTACATAAGTTCCAAAGAGGAATCTTACTTCTCAAAATATTGAGTCTCGTTACGAAAAACTTGAATTCTTAGATTTAGCAGTCTGGGGAAAAGAGAAAAAACAAAAATATTGTTTATCTACTGATAATATTAGTTTTTATTGGTATTTTGATACCAGTAAAACTAGTGAGTCGGAAAGAAAGCATACCTTTCATTCTGATAATAAGCAACTTAATAGTATTGGAGATCTTATTATTAAGCATTCTGAAAAAACCAAAAATATTAAGGAAGAAATTAGAAAATATAGCCAGTTCCTAGATAAGATATTAGATTTAAAACCTTCTAAAAACCAAATTGAAAAATTATTGGAAATCCAAAATATAATCCACAAAAACTTTGATTATATCAAAGAACAAAACGCTCAGCTAGAAAAATCCTTAAGAAAGCCAGTTAAGCTAGAAGACTCTATTAATACTTTACTAGTAGAAATACAACAAGCTAGACCTAAGGAAGTAGAATTAAGAACTCTTAAAATAGCAGAACAAAACTCTAAGGCAATAGAAAAATTTGAACAGGAAATTAAGGACCTAAGAGAAATCTTAGAATACCTTAAGCACCAATCTACATGAGCGCTGATTATCCAACTTTCAAGGAAGCCCTTGAAAAGTTTAAAAACTTAGAATCAGATACAGCCGCTAAAGATAAGTTTAATTGGGTATTTACTCTAGAAAATATAAAAACAACTGCAGACATAAATCTAGCATCTAAAGGTTTAGTACAACTATACGCTTTACAAGAAATTGATAAAACAGATGATATTCTTACAACCCAAGTTAGTAAGTTACCTACAACTAGTGGAATTAGTTCAGCAGGAGCTATAGTACCTGCAGGAAGTAACACCCAAGGTCAATATAAAGCACCACCTAAGAAGGGAATTAAAAGAAAATATCCAGCATGAATATAAGACCATTTAATGGTACTTCTAGAACTATAAACCAAGATTCAACCTCTGAATCTAATATTAAAAAAGGAAAAAATTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAGAAGTAGACGTTAATCAAGATGTAGAAAACTTTGATTGGAAAAAATTATCAGGGATTAAACCTAATAAGCTATATGAGAAAAATTGGCAAGAAAAGGTTAAATTAAAACAACAATCTATAGTTTCAGCATATAAAGAAGAAGCCATTAGCGTAACGCATAATGCATATACTACTACTTTATTTCCTCAAGAAGTAATTAAAAACGTTAAAAATCAGGGAAAACTTTATTACCATATAGGCATGATGGCCATAGGAGTTAAAGGACTTCATAGAAGAAAAATAGGAACTAAAGTCATGATAATGTCTTATGATGATAGTTTCGGTAAAGCTAGAGAAGCTAGCATTGGATCAATAGAAATGGATATGAATGCAGGTTGCGGAGTATTCTACTCCTGTCCCGACTTTGCAAAATATATTAAAGATTTATCACATCTTAAGATAGGAATACAAACCCTAGGATATGAAAATTATGAAGGAAAAAACCTTTCAGTAGCAATCAAAACTATAGGGAGATTGACCACAAATATACAGTCAAAATATAAGATAAATGTGAAAGATATTGTAGAACAAATATCGTCACAAGGAATTATTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACACTTGGATGGGAATGAATGGGATCTTAGTAAATTCTTAAATCAAGAAAACACAAGTAGAGTCCCGACCAAAGCCCTAATATATCAGAATTTGCATGGAGGAGAATCTTTAAGATTTTCAAACTATAAGCAAACTAGAATGCATGATCTGACTGAAAATAATTCAGACGAAGATGAAGATTTAAAAATCTTAGGAGAACAACTAAACATCAAAATGGCAAGATTCTATACAATGGAAACGCCAGAAGAAGAATTAAGAGCAGTAATCCAACAATTAGAAAGAGAAAAACAAGCCATGGTAGAAAAATTAGAAGCTAAGATGAAAGAATCATCTAAAATGGCAATAGTAGAAGATAATTTTAACCCAAACAACGAATATCTAGAAGATACATATTCTGAGTACGAAGATCTAGAATTTGAAAGGTTAGGATTAACTGGATGGGAAGATTTAGACCAGGACTCTTTAGAAACCAAAGAAATAACTGAATGGGAAAATCCTAATCAGGTACTCCATAGAGAAATTAGAGCATATAAATCAGTATCAGAACAAATAGAAGATATATTTGGAGAACTATTAAAAGAACATGGAAACTACGATATGGCCCTTAAAAACCTAGAAGAAAAATATGATTTAGATAAAATAGAAAAGGCCAAATCTATAGAAGAAATAGCTAAGTCATCCACATCATCAGAAATAAGGCCAACCAAACGACCTAAAGAAGAACAAACAGCTTATGAAGATGATATGAGGGATGATTGGAAAAGAAAAGAATTAACAGTAAATCCCATAGAAGCCTCAAAGGATAGAAACTTTGAAAGAATAGGAGGATCCTATAAGAAAAACTTTTATCCTAGTAGGAGTGAAATATTAAACTTAGATAACGTTCCCCCACAATTTTACTATGACCAATTAGTAACCTGGGAAGGAATAGTAAAAAATGAATGGGAAGCACGAAAAAAGGATGGAATGGATATGTGGTCTTGGATGGACGGTAGAATAACAGGATTAGTTCTATATTTAGTCCAAGATTGGATTTCTAAAAATCAAGCAGCCTACAATGATATAAAATCTAGAGGAGATAGACCTGAAAACTTTGTTAAAATGGTAAAAGATAGGTTCTTAATAGAAGATCCTACAGATGAAAGGAGAACGGCACTACAAAGGTTAGCACAAAGAGAATTAGAAGCCTTAAATTGCGAAGATCCTACCAAAATTCAACCATTTATGGCTGAATATCTTAAGAAAGCTTCAGAAGCTAAGAAAGGATTTGATATAATTTACGTAGAAAGACTCTTCGATAGATTACCCGAGGCAGTAGGAAAGGTAGTAAAAGCCGACTTTGTCAAAGATGGTAATTCTTATGAAGCAGGAATAGGAATAGCTGTTTCATATATATCTACATGGATGAGAGCAAAATGCATCAAAGAAACAGAAGCTAAAACTCAAAAGAAAGCATCACTAGCATTTTGTAGATCCATATATACCATAGGAGATTATAAGAAACGAAAAATTTTAAAAAGAGTCACAAACTATAATAAAAATAGAAGAAAAAACTATGTTAGAAGACCGAGTATCAAGAAAAAATGTAGATGTTATATCTGCCAGGATGAAAATCATCTAGCTAATAGATGCCCTAGAAGATATACCAATCAGGCTAGAGCAAGTATAATAGAAGGATTAGACGAAGATATAGTATCTATAGCATCAGATGATGAAGATATCGAAAATTTCCTCGAAATAATAGAACTTGATGAATTTATAGCACATTCTAGTCAAGAACATGAACATACATGGGAAATTGGAGGAAAGAAAGATAAGGTATGTGAAATATGCAGTTATTTTACAGATTATAATAAAACTGTTAGCTGTAAAATCTGTGAAACTCAATACTGTAAAACATGTTCTGATCAACTAGCAATAGAAGTAAGAGAAATTAAAAAACCCACAAAAGAAGAAGAAATGATAGAAGATCTAAAATTAAATGTTAAAAATCTAGAATTTAGAGTTACTATCCTAGAACATAAAGCAGAAATGCAACATATACAAGATAAATTTGAAGCAATGCAAATTAGAAACAAACCAGAAATAACAGAAATATCAGAAGCAACGACTTCATTAGCTATGAGAGCAAATGAATCAAACTATATAAAAACATCAATTAATAAAACCGCCGGTTGTTATGTCGAAACAAAAATCTCATTTAATAATGAAAATAGAATCATAACAGCACTAATAGATTCCGGTTCAACACATAATATAATATGTCCAACATTAATACCAGCATCTTGGATTAATAGCACGCATAGAGAAATTATAATGTTTGCCGTAGATAATAGCAAATACAACCTGAATCAAGAATTAATAGATGATATAAAACTACAATTCCAAGAAGTTGATGAAACTTTTGGAATAAAATATAAATTAGGACAAACCTATGTAGCACCTAAACCAACAAAAACCTTCATAATAGGACATCGATTCCTCACAAATGAAAATGGTAGTGTTACAATTCATAAAGACTATATAACTATACAAAAAACTACAGGCATATACCCAACAGCCAGGCATGAGCTTAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACGCCCGCCATTATTTTCAAACATTCCTGAAACCTACAATAAGATTCCTCCTCTACATTCATATCAACCGATAATAGGATATAAGAATGAAATAGGAGATCAAAGTTTAATAACTATGATAAAAGAGTTAGAAGCACTTGGATTTATAGGAGATGACATCACAAAAAATAGAACAACATGGGTATGTGATTTCAAAATCATAAATCCAGATATTAACATCACTTGTGCAACAATTCCATATACACCAGCAGATAAAGAAATATTTGAGAAGCAGATAAAAGAATTACTGGATAATAAGCTAATAAAGAAAGCAAGTCCAACTTGTAGACATAGAACAGCTGCATTCATAGTAAGAAATCATGCTGAAGAAGTAGCACAAAAACCAAGGATAGTTTATAATTATAAAAGGTTAAATGATAATATGCATACAGATCCGTTTAATATACCTCATAAGATTTCTATGATTAATCTTATACAGAAAGCTAATATATTCTCTAAGTTTGATCTAAAGGCAGGATTTCATCATATGAAACTTAAAGAAGATTTCAAAGATTGGACAACTTTTACTTGTTCTGAAGGATTATTTACATGGAATGTCTGTCCATTTGGTATAGCTAATGCTCCTTGTGCATTTCAAAGATTTATGCAGGAATCCTTCGGAGATTTAAAATTTGCATTATTATATATTGATGATATACTCATTGCATCAAGCAATGAACAAGAACATATTAAGCATCTAAAGATATTCTTCAATAGAGTTAAAGAAGTAGGATGCGTGCTTAGCAAGAGAAAATCAAAAATGTTCCTAAAAGAAGTAGAATATTTAGGAGTTGAGATAAAAGAAGGAAAGATCAGCCTTCAGCCACATATAGTAGAAAAAATCAAAAGATTCGATAAAAGCAAGTTGAGTACCCTAAAAGGCCTACAAGCATATCTAGGATTACTCAATTATGCTAGAAGCTACATTAAAGACTTATCAAAGCTAGTAGGACCACTATATAAAAAGACTGGAAAGAGTGGGCAGAGAAGCTTTAATAAAGAAGATTGGAATATAATCTTTAAAATAGAAAGAGAGATATCAAAGATAAAGCCACTAGAGAGGCCTAAAGAATCAGACTACATAATAATTGAGACCGATGCATCAGAAGAAGGTTGGGGAGCAGTCTTACTCTGCAAACCAGATAAATATGCTAGTAAAGATACTGAAAAAATAGCAGGCTATGCATCAGGAAACTTTGGAGAAAAGAAGACTTGGACTAGTTTAGATTATGAAATAGAAGCTATAAATGAAGCGCTAAACAAGTTCCAGATATATTTAGACAAAGATTTTACAATCAGAACAGACTGTGAAGCAATAGTAAAAGGAATAAAAACAGAAGATTATAAGAAGAGATCTAAGACTAGATGGATCAAGTTAAGAGATAACCTTCTGAAAGATGGTTATAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAAGGAACAAAAAACTTTTTACCAAACTTCTTATCCCGCGAGGGAGATTTTATTTTAAAATGTCTTCAAAATCCCGATTCTATTGAATCACATTCTATAGATTCGCAAGAATCAGTTCCACTATATATTGATTCGAAAGAATCACATTCTATAGAGTCTGATGACTCAATTCCACTATACAGGGACAAGCTTCTTCCTCTAGTCGAAAGGCTAAAGGAGAAAAGTGCTTAACCAAGATTGGAGGCATCACCATGAATATAGAGTACCCGTACTCAATCCACATAATAGACAAAAACAAGGTTCCGATCTACGATCAAGGAAATCTCTTCCACACTGAGAAGTCTGCAAGACTTTCACACGTGTCCAGAGGTTTGCTAGATCATCTCTTTACTTTTTCATCTGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACATATTAGCCGATTATCTTTACCTATTAGAAAGTGAGAGAGAGTCATATAAAAATGAGTGGATTAGCCTGAATGATCAGGTTAGTACTCTACAAAAACAAAATAGTGAGCTGAGAGCTAGGATAGCCACAAATAAAGAAATAATAGAGGGACTGAGAGAGCCAGTTAAAAAGCCAATATACACAACCCAAGATAAAGAGAGGCTCCGTGTCTTCTTTTGCGAAGAAAGAAGCATGGAATATATATATTATCATATAAAAAGACTAGCTCAGCAGAGCTATTACTCCCATTTAAATAAATTACAGAAGGATTGCGAACCCTTTCGAGGGGTTTATATGTCTTTCTTAACTAATGTTAAATTCCTAGTACTATGTGAAGCTGGATACTGGACCGTTCCAGATATAGAAGACAATACTACAGAGTCTTTATTAAGTTTATCTCAGAAGAAAGGAGAAGATTTACTACAAAAAGGAGTGGTAATATTTAATGAGCTTGAAGGAGGTTATCAACTTTCTCCAAGATTCATTGGAGACCTTTATGCTCATGGCTTTATTAAACAAATAAACTTCACAACCAAGGTTCCTGAAGGATTACCGCCAATCATAGCGGAAAAACTTCAAGACTATAAGTTCCCTGGATCAAACACAGTTTTAATAGAACGAGAGATTCCTCGCTGGAATTTTAATGAAATGAAGAGAGAAACACAGATGAGGACCAACTTATATATCTTCAAGAATTATCGTTGTTTCTATGGCTATTCACCATTAAGGCCATATGAACCCATAACTCCTGAAGAATTTGGGTTTGATTACTATAGCTGGGAAAATATGGTTGAAGAAGACAAGGAGGAAGTAGTATACATCTCCAAGAATACTAAGGATTATAAGGTCACCAAAGAGCATGCATGGGCTTGGCCAGAACATGACGGAGATACAATGTCCTGCAGTACATCAATAGGAGAAGAATGGATCCATCGTATGGCCAATGCTTAAAGTAGCTTTAACTAAAGCAACTTTGGGCAGGAATCAATAAAGAAGGACCAGAAGATATAAAGCGGGAACATCTTCACATGCTACCTCGTGGCAAGCATCTTTGCTTTAGCATCTTTGCTTTACAATTATTGTAAGAGTGTGTAAAGACCAGTGTGCCCTTAGGCTCCAGTATATAAGGAGCACCAAGGTATTGTAATAAGCATTCGAAATCGATCAAGCAAGCGAGAGCCAAAACTTCTAAGAGAGCAAGAGAGGAGCTTATCCTCTCACCCCTCTTCAAGAAGCAAAGGCGATCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTAATATGTTTGTACTTATGATTGTATTTCTCAAAAACCTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTTATATTTATCCTACACCCTTGTGATAAAATATGAAGTCATACTCGTTCTAAGATTAAATGTTCTAAGAATACTTCGAAGCATTGAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAAAAGTACCGTCAGGCCCGTGTTATGGCAAGGGAAGAAGTACCATGAATACCCTATAGATGTTAGAAGGAAGGTAAGAACTAAGTATCTTATGAACAATGAGTAGCTGATTTCTGATTATCAGTAACAAGTATCGTTACAATCTATAAGCTTTGAAAGATCTATTAGTGTGGATACCAAAAGGCTGTCGTGGTTCGCCCAGTCGACGGATGAGGTCATAAACGAAGCACTAGTGGGTAACTAAGAGGCTTAGGGATGAGCTACGAGAAAAGTTAGGGGGGTGCCTAGAAA
| 111,631
|
D10774.1
|
Rice tungro bacilliform virus
|
Kano,H., Koizumi,M., Noda,H., Hibino,H., Ishikawa,K., Omura,T., Cabauatan,P.Q., Koganezawa,H.
|
Toshihiro Omura, National Agricultural Research Center, Laboratory of Virology; Kannondai 3-1-1, Tsukuba, Ibaraki 305-8666
|
Japan
|
1993-04-29
| null |
Tungrovirus oryzae
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 8,002
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Rice tungro bacilliform virus DNA, complete genome
|
TGGTATCAGAGCGATGTTCGAACTTTAAGGGAAAAATAGAATACAATCTAGTCAAACTAATTACATAAGTTCCGAAGAGGGATCTTATTTCTCAAAATATTGAGTCACGTTACGAAAAACTTGAATTCTTAGACTTAGCAGTCTGGGGAAAAGAGAAAAAACAAAAATATTTACTATCTACCGATAATATTAGCTTTTATTGTTACTTTGATACTAGTAAAACTAGTGAATCAGAAAGAAAGCATACCTTTCATTCTGATAATAAGCAACTCAATAGTATTGTAGACCTTATTATTAAGCATTCTGAAAAAACCAAAAATATTAAGGAAGAATTAGAAAAATATAGTCAGTTCCTAGATAAGATTTTAGATCTAAAGCCTACTAAAAAACAAGTCGAAAAACTATTAGAAAATCAAAACTTAATTAGCAAGAACTTTGATTATATCAAAGAACAAAACACTCAACTAGAAAAATCCCTAAGAAAAACAGTTAAGTTAGAAGACTCCATTAATACTCTATTAGTAGAAATACAACAAGCTAGACCTAAGGAAGTAGAATTAAGAACTCTTAAGATAGCAGAACAAAACTCTAAAGCAATAGAAAAATTTGAGCAAGAAATTAAGGATCTAAGAGGAATCTTAGAATACCTTAAGCATCAAGCTACATGAGCGCTGATTATCCAACTTTCAAGGAAGCCCTTGAAAAGTTTAAAAACCTAGAATCAGATACAGCCGGAAAAGATAAGTTTAATTGGGTATTTACTCTAGAAAATATAAAGTCAGCTGCGGACGTAAATTTAGCATCTAAGGGTTTAGTACAACTTTATGCTTTACAAGAAATTGATAAAAAGATTAATAATCTTACAACCCAAGTTAGTAAGTTACCTACAACTAGTGGAAGTAGTTCAGCAGGAGCTATAGTACCTGCAGGTAGTAACACCCAAGGTCAGTACAAAGCACCACCTAAGAAAGGAATTAAGAGAAAATATCCAGCATGAATATTAGACCATTTACTGGTACTTCTAGAACTATAACCCAAGATTCAACCTCTGAATCTAATATAAAAAAGGGAAAAAACTCAACAAAAAGAGAATTAATAGAAGAAGTAGATGTTAATCAAGAAGTAGAAAACTTTGATTGGAAAAAACTATCAGGAATTAAACCTAATAAACTATATGAGAAAAATTGGCAAGAAAAAGTTAAGTTAAAACAACAATCTATAGTTTCAGCATATAAAGAAGAAGCTATTAGTGTAACTCATAATGCATATACTACTACTTTATTTCCACAAGAAGTAATTAAAAATGTTAAGAATCAGGGAAAACTTTATTATCATATAGGCATGATGGCCATAGGAGTTAAAGGACTTCATAGAAGAAAAATAGGAACTAAAGTCATGATAATGTTTTATGATGATAGTTTCGGTAAAGCTAGGGAAGCTAGCATTGGATCGATAGAAATGGATATGAACGCCGGTTGTGGAGTGTTCTACTCCTGCCCTGACTTTGCAAAATATATTAAAGATTTATCACACCTTAAGATAGGGATACAAACCCTAGGATATGAAAATTATGAAGGAAAAAACCTTTCGGTAGCAATCAAAACTATAGGAAGATTGACCACCAATATACAGTCAAAATATAAGATAAATGTGAAAGATATTGTAGAACAGATATCATCACAAGGAATCATTATGGTAGCACCCATGGAAATAGATTCATCACACCTAGATGGGAATGAATGGGATCTTAGTAAATTCTTAAACCATGAAAACACAAGTAGAGTCCCAACCAAAGCCCTAATATATCAGAATCTACAAGGAGGAGAATCCTTAAGATTTTCAAATTATAAGCAAACTAGAATGCATGATCCTACTGAAAACAATTCAGATGAAGATGAAGATTTAAAAATCTTAGGAGAACAACTAAATATTAAAATGGCAAGATTTTACACAATGCAAACCCCAGAAGAAGAATTACGAGAAGTAATTCAACAATTAGAAAGAGAAAAACAAGCCATGATAGCAAAACTAGAAGCTAAAATGAAAGAGTCATCTAAAATGGCAATAGTAGAAGATAATTTCAATCCAAATAACGAATATCTAGAAGATACATATTCTGAATATGAAGATCTAGAATTCGAGAAATTAGGATTAACTGGATGGGAAGACTTAGATCAGGATTCCATAGAAACCGAAGAAATAACTGAATGGGAAAATCCTAATCAAGTACTTCATAGAGAAATTAGAGCATATAAATCAGTATCTGAACAAATAGAAGATATATTTGGAGAACTATTAAAAGAACACGGAAACTATGATATGGCCCTTAAAAACCTAGAAGAAAAATACGACTTAGATAAAATAGAAAAGGCCAAATCTATAGAAGAAATAGCTAAATCATCTACATCATCAGAAATTAGGCCAACCAAAAGACCTAAAGAAGAACAAACAGCCTATGAAGATGATATGAGAGATGATTGGAAAAGAAAAGAATTAACAGTAAATCCTATAGAAGCCTCAAAAGATAGAAATTTTGAAAGAATAGGAAGTACATATAAGAAAAACTTTTACCCTAGTAGAAGTGAAATATTAAACTTAGATAACGTTCCCCCACAATTTTACTATGACCAGCTAGTAACCTGGGAAGGAATAGTTAAAAATGAATGGGAAGCACGTAAGAAAGATGGGATGGATATGTGGTCTTGGATGGATGGTAGAATAACAGGATTAGTGTTATATTTAGTCCAAGATTGGATATCTAAAAATCAGGCAGCCTATAATGATATAAAATCTAGAGGTGATAGACCTGAAAACTTCGTAAAAATGGTAAAAGATAGGTTCTTAATAGAAGATCCTACAGATGAAAGAAGAACAGCATTACAAAGGTTAGCACAAAGAGAATTAGAAGCCTTAAACTGCGAAGATCCTACTAAAATTCAACCATTTATGGCTGAATATCTTAAGAAAGCATCAGAAGCCAAAAAAGGATTTGATGTAGTTTATGTAGAAAGACTCTTTGATAGACTACCAGAAGCAGTAGGAAAGGTAGTAAAAGCGGACTTTGTCAAAGACGGTAATTCCTATGAAGCAGGAATAGGAATAGCAGTTTCATATATATCTACATGGATGAGAGCAAAATGCATTAAGGAAACAGAAGCTAAAACTCAAAAGAAAGCATCCTTAGCATTCTGTAGATCCATATATACTATAGGAGATTATAAGAAACGAAAAATCCTAAAAAGAGTTACAAACTATAATAAAAATAGGAGAAAAAACTATGTCAGAAGACCTAGCATTAAGAAAAAATGCAGATGTTATATCTGTCAAGATGAAAACCACCTAGCTAATAGATGTCCTAGAAGATATACTAATCAGGCTAGAGCAAGTCTAATAGATGGATTAGACGAAGATATAGTATCTATAGCATCAGATGACGAGGATATTGAAAATTTCCTTGAAATAATAGAACTTGATGAATTTATAGCACATTCTAGTCAAGAACATGAACATACATGGGAAATCGGAGGAAAGAAAGATAAGGTATGTGAAATTTGCAGTTATTTTACGGATTATAATAAAACTGTTAGCTGCAAAACCTGTGAAACCCAATACTGCAAAACATGTTCTGATCAACTAGCACTAGAAGTAACAGAAGTCAAAAAACCTACAAAAGAAGAAACAATGATAAGCGACCTAAAATTAAATGTTAAAAATCTAGAATTTAGAGTCACCATTCTAGAACATAAGGTAGAAATGCAGAATCTTCAAGATAAATTCGAAACTATGCAAATTAGAAATAAATCAGAAATAACAGAAATACCAACAACCTCATTAGCTATGAGAGCAAATGAATCAAATTATATAAAAACATCAATTAATAAAACTGCAGGATGTTATGTAGAAACAAAAATTTCATTTAACAATGAAAACAGAATCATAACAGCCCTAATAGACTCAGGATCAACACATAATATAATATGTCCAACATTGATACCAGCATCATGGATTAATACTACACATAGAGAAATTATAATGTTTGCTGTAGATAATAGCAAATATAATCTGAATCAAGAATTAATAGATGATATCAAATTACAATTCCAAGAAGTTGATGAAACTTTTGGAATAAAATATAAATTAGGACAAACCTATGTAGCACCTCAGCCAACAAAAACATTTATAATAGGACACAGATTCCTTACAAATGAAAATGGTAGTGTTACAATCCATAAAGATTATATAACTATACAAAAAACTACAGGAATATACCCAACAGCCAGACACGAACTTAAATCAGAGTTTGCGCGAAAGCATGGTGGACGCCCGCCATTATTTTCAAACATTCCTGAAATCTATAACAAAATTCCTCAGTTGCATTCATATCAGCCTCAACCAATATTAGGATATAAGAATGAAATAGGAAATCAAAGTTTACTCACTATGGTGAAAGAATTAGAAGCACTTGGATTCATAGGAGATGACATTACTAAAAACAGAACAACGTGGGTATGTGACTTCAAAATCATAAACCCAGATATTAATATAACTTGTGCAACAATTCCATACACACCAGCAGATAAAGAAGTATTTGAAAAACAAATTAAAGAACTACTAGATAATAAGTTAATCAAGAAAGCTGATCCAACATGCAGGCATAGAACAGCAGCATTTATAGTAAGAAACCATTCTGAAGAAGTAGCTCAGAAACCTCGAATAGTCTATAACTATAAACGTTTGAATGATAATATGCATACAGATCCTTTTAATATTCCTCATAAGATTTCAATGATTAATCTAATACAGAAAGCTAATATATTTTCTAAGTTTGATTTAAAAGCAGGATTTCATCATATGAAATTAAAAGATGATTTCAAAGATTGGACTACTTTTACATGCTCAGAAGGATTATATACTTGGAACGTCTGTCCATTTGGTATAGCTAACGCCCCTTGTGCATTTCAAAGATTTATGCAGGAATCCTTTGGAGATTTAAAGTTTGCATTATTATATATAGATGACATACTTATTGCATCTAATAACGAAAAAGAGCATATAGAACATCTTAAGATTTTCTTTAATAGAGTAAAAGAAGTAGGATGTGTTCTTAGTAAGAAAAAATCAAAAATGTTTCTTAAAGAAGTAGAATATCTTGGAGTAGAAATTAAAGAAGGAAAGATTAGTCTTCAGCCGCATATAGTTAATAAGATCAAAAAATTTGATAAAAATAAACTCAACACCCTAAAGGGACTACAAGCATATCTAGGGTTACTCAATTATGCCAGAGGATACATCAAAGACCTATCAAAGCTAGTAGGACCACTTTATAAAAAGACAGGAAAAAATGGGCAAAGAATCTTTAACAAAGAAGATTGGAATATCATCTTTAAGATAGAAAGAGAGGTATCAAAGATAAAGCCTTTAGAAAGACCTAAAGAAACCGACTACATCATTATAGAGACAGATGCGTCAGAAGAAGGCTGGGGAGCAGTCTTAGTCTGTAAGCCAGATAAATATAGTGGCAAGGACACTGAGAAAATAGCAGGGTATGCATCAGGAAACTTTGGAGAGAAGAAAACCTGGACTAGTTTAGATTATGAAATAGAAGCTATAAATGAAGCCCTAAACAAGTTCCAGATATACTTAGACAAAGATTTTACAATCAGAACTGATTGTGAAGCAATAGTGAAAGGGATAAAAACAGAAGATTATAAAAAGAGATCAAAAACCAGATGGATTAAGTTAAGAGATAACCTCTTAAAAGATGGATACAAGCCTACCTTTGAGCATATCAAGGGAAACAAAAACTTTTTACCAAACTTCTTATCCCGTGAGGGAGATTTTATTTTAAAATATCTTCAAAACCCCGATTCTACGGAATCATATTCTATAGATTCGTCAGAATCAATTCCACTATATATCGATTCAAAAGAATCACATTCTATAGAGTCTGATGACTCAATTCCACTATACAGGGACAAGCTTCTTCCTCTAGTCGAAAGGCTAAAGGAAAAGAGTGCCTAACTAAGGTCGGAGGCATCACCATGAATATAGAGTACCCGTACTCAATCCACATAATAGACAAGAACAAGGTTCCGATCTACGATCAAGGAAATCTCTTCCACACTGAGAAGTCTGCAAGACTTTCACATGTGTCCAGAGGTTTGCTGGATCATCTCTTTACTTTTTCGTCTGATAATACTGAGCGAGTTAGGAAGCTCCACATATTAGCCGATTATCTTTACCTATTAGAAAGTGAGAGAGAGTCATATAAAAATGAGTGGATTAGCTTGAATGATCAAGTTAGTCTTCTACAAAAACAAAATAGTGAGTTGAGAGCTAGGATAGCCACCAACAAAGAAATAATAGAGGGACTGAGAGAGCCAGTTAAAAAGCCAATATACACAACCCAGGATAAAGAGAGGCTCCGTGTTTTCTTTTGCGAAGAAAGAAGCATGGAATATATATATTATCATATAAAAAGGCTAGCTCAGCAGAGCTATTATTCCCACCTAAATAAATTACAGAAGGATTGTGAACCCTTTCGAGGGGTCTACATGTCTTTCTTAACTAATGTTAAATTCCTAGTATTATGTGAAGCTGGATACTGGACTGTACCAGATATAGAAACTAATACTACAGAGTCTTTATTAAGTCTATCCCAGAAGAAAGGAGAAGATCTTCTACAAAAGGGAGTAGTAATATTTAATGAGCTTGAAGGAGGATATCAGCTTTCTCCAAGATTCATTGGAGACCTTTATGCTCATGGTTTTATTAAACAAATAAACTTCACAACCAAGGTTCCTGAAGGGCTACCGCCAATCATAGCGGAAAAACTTCAAGACTATAAGTTTCCCGGATCAAATACCGTCTTAATAGAACGAGAGATTCCTCGCTGGAACTTCAATGAAATGAAAAGAGAAACACAGATGAGGACCAACTTATATATCTTCAAGAATTATCGCTGTTTCTATGGCTATTCACCATTAAGGCCATACGAACCTATAACTCCTGAAGAATTTGGGTTTGATTACTACAGTTGGGATAATATGGTTGATGAAGACGAAGGAGAAATTGTATACATCTCCAAGTATACTAAGATTATCAAAGTCACTAAAGAGCATGCATGGGCTTGGCCAGAACATGATGGAGACACAATGTCCTGCACCACATCAATAGAAGATGAATGGATCCATCGTATGGACAATGCTTAAAGAAGCTTTATCTAAAGCAACTTTAAGTACGAATCAATAAAGAAGGACCAGAAGATATAAAGCGGGAACATCTTCACATGCTACCACATGGCTAGCATCTTTACTTTAGCATCTCTATTATTGTAAGAGTGTGTAATGACCAGTGTGCCCCTGGACTCCAGTATATAAGGAGCACCAGAGTATTGTAATAGATCATCGATCAAGCAAGCGAGAGCTCAAACTTCTAAGAGAGCAAGAGAGGAGCTTATCCTCTCAACCCCTCTTCAAGAAGCAAAGGCGATCAATGGCTCAGGTCAGTGAGTAGTCGTCTTTAAGGTTCCTCTAGGAACCTCTGTGTAATATGTTTGTACTTATGATTGTATTTCTCAAAACCTATCCGCTGCATGAATAAAGCTCTTATATTTATCCTACACCCTTGTGATAAAACATGAAGTCATACTCGTTCTAAGATTAAGTGTTCTAAAAAATACTTCGAAGCATTGAAAAGGGGGCTAAAGGGGGAAAAAGTACCGTCAGGCCGTGTTATGGCAAGGGAAGAAGTACCATGAATACCCTATAGATGTTAGAAGGAAGATAAGAACTAAGTATCTTATGAACAATGGGTAGCTGATTTCTGATTATCATTAACAAGTACCGTTATAATCCATAAGCTTTGAAAGATCTGCTAGTGTGGATACCAAAAGGCTGTCGTGGTTCGCCCAGTCGACGGATGAGGTCATAAACGAAGCACTAGTAGGTAACTAAGAGGCTTAGGGATGAGCAACGAGAAAAGTTAGGGGGGTGCCTAGAAA
| 112,121
|
NC_001632.1
|
Rice tungro spherical virus
|
Shen,P., Kaniewska,M., Smith,C., Beachy,R.N.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-03
| null |
Waikavirus oryzae
|
Waikavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 12,226
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Rice tungro spherical virus, complete genome
|
TGAAAATTGGGGTATAGAGATACCCCAAATCAATTGCCTTATGGCCGCTTGCGAGTAGTCGCCATATAGGTGTTGCCGAAACATGTGAAAGGATTCACAAACTACTCATCCATTGAAGATTGATGAACATCTCATGATTTTCCGATTAGTGTCTGACGTAGCACAGAACACTTAGTATGCACACAGGGCTTCCCTGTCCCTCTGCTAAGCTAGTAATGCGAAATCAGTTTGCCGTGCACACTGGGCTTCCTGGTCCCTCCGGCTATTCAAACACTTAGACGAAATAGTGAGTTTGCCATGCACACTGGGCTTCCTGGTCCCTCTGGCTTTAAAATTGTTCAGATATCTGATTTGGTTGTGGTGTATTCCAGTTTTCTGGTTTCCCACTTGGCCGAGTGAGTAGTTGAGCTAGCAATATATTCCGGTCGGGCGGATACTATTGTTAGTGTGTCTCCGAGTAGCGTGTGTAGGCGCACCTAGTTTCTTACGCATAAGAATTCCGTTTGCATCAGCAATGCAGAGCTTTCTTCTTTCGTCTAAAAATCAAGCGAAGTTGTTACACGCTGGTTTAGAGTTTGTTGGAGGTGTCCGGTGTGCTCACCAGGGCTGGGTTAGTGGTAAGGCGGTTGTATTTTGTAACTATTGTAATTTTGCACATAGATTGTATAGATTTTATACTAAGAATCATTGTGTTTTAAATAAAGAACTATTGAAAATCTCTGTGGAAGGTCTTTTGTGTCATTGTATAGAGCAGGCCTTTTTATTTAGACGATTTTACGATCGACGATTTGCTTGGCAAAGGAAATATGCAAAGGGGTTTCTATTTGATAATCTGTCTATCCCTTTCGATGATTGCGCTCTTTGTCCTAATGCTGGCACTCGTCTTTCGCAAACCGGTGTTAGTCATGATCACTTTGTGTGTAATTATGTTGAGCATCTTTTTGAATGTGCTAGCTTTAGTCGTGAGACCGGAGGAAAATTTTTCCGAGCTTGTAGCGAGGGTTGGCACTGGAACGCCACTTGCACGACTTGCGGAGCGTCGTGTAGATTTGCCAACCCGCGGGAGAATATAGTGATAGCTATTTTTATGAACTTTCTTCGTGTAATGTATGATGGTAACAAATATTATGTTTCTTTGCATTGTGATACTGAGTGGATACCTGTACATCCTCTTTTTGCGCGACTAGTTCTGATGGTTCGAGGGTTTGCGCCGCTGGATAATAGCCATGTCATTGAGGAGGACGAGATGGACATTTGTGGACACTCATCAGAGGTTACATATGAAGATCCATCAAAATTTGCCTTCACGCACCAGCATGTTACGCGTGGAGTGGGCATGGGACATTTGGCCTTTTGCAGGGATGCCAATGGAGTAGACAGAGGCGAGCATAAGTTTTATCTACATGGCCCTTTTGATTTGAAAATGACGCATGCCATGTTTAGAGTGTTCATGATTTTGCTCAACTGTCATGGGTACGTTCAATCCGAGTTCAGAGATGAGTTTCCAGATATCAAGGACCGCTCCTTGTGTGGATTGTTGTCAGTTGCTGGATTACGGGGAGTTAATGTATCTTGCAATGAAGAATTCATCCATTTGCACTCACAGTTCCACAATGGTTCCTTCAGATCTCAGAGGCCAATCCCTATGGTGTATGCCGAGCCAGAGATGTACCCGCCACTTGGATATGTGCACCTCACTGAAAGTTGGGTACCGCGCGGTCGGCTGTTGATAGATGATTTGCCATCGCTCATGAGCAGAGTGTACGCTGAAAGTTCCCAGGCGCAAGCAGGCGAAATATATGAAGAGACATTTGATGAGGATGATTTATTTGAGCTTGATGGTGAAGAGGGCACAAGCACACGCGGTCTCTTGGATCTTGGAAGGAGACTTGGCGGTCTACTATTGGGTGCCACGAAGTGCGTGAAAGGTTTGCACTCTGTCATTGAGTGGCCAGTCGATGTGCTCACAAAGGAGGCTGAGGATCTTGGGACGTGGCTTGCTGATAACAAGAAATATGTCAGTGAATCAACTTGGAGTTGTCAGGTCTGCCCTGAGGTGCAAGATGCTTTGGAGAAATCCATGCGAGAGCAAGCAAAACTGAATGCTCAAATGATCAGTGGCATTAAGAAGTTGGCCACAACCATGGATTCGGCCACATTGAAGCTGAGAGACAATCTGAAGGAGTTAGAGCAGAGAATTAGTGTGCTGGAACAAGGTGCAGATGATACGCAGCAAGTGCGCATTACTAATCTGGAGAACTTTTGTGAGGATGCTGCAAAAGCTTTTGAGGCACTGCGCAACGACATTGAAGCCCTCAAGAAGAAGCCAGCACAGAGCGTGACACCATTGCCATCACCTTCAGGAAACTCAGGCACAGCTGGTGAACAGCGCCCTCCCCCTAGACGGAGACGGAGACCCCCCGTAGTTGAGATGTCTGAGGCGCAAGCTGGCGAAACGGTCATTGTGGGAGGTGATGAAGAGCAAGAGGCCCACCAGGATAGTAGTGTTGCAGCAGCTGGACCCGCTGACGAACATAATGCCATGCTGCAGAAGATTTACCTTGGCTCTTTTAAATGGAAGGTGTCCGATGGGGGGGGTTCAATTCTCAAAACCTTTTCCCTTCCGTCCGATATATGGGCTGCCAACGACAGGATGAAGAATTTCCTCAGCTATTTCCAGTATTACACTTGCGAGGGAATGACATTTACGCTCACAATTACCAGCATTGGGTTGCATGGAGGCACGCTGCTCGTAGCCTGGGATGCCTTGAGTAGTGCCACACGAAGAGGGATTGTTTCAATGATACAGCTGAGTAACCTCCCTTCAATGACGTTGCATGCGAGTGGGAGTTCTATTGGCACGCTCACTGTGACCTCTCCTGCGATTCAACACCAGATTTGCACATCAGGAAGTGAAGGCTCTCTAGCTAACTTGGGCTCGCTTGTGATTTCAGTAGCAAATGTGCTGTGTGCCGACTCTGCATCGGCCCAGGAACTTAATGTCAATGCTTGGGTACAGTTCAACAAGCCCAAGCTTAGTTATTGGACAGCACAACATTCAATTGCACAGAGCGGGGGTTTTGAAGAGTCTCAAGATTTGGGTGATTTGCAGGCCATAATAGCGACTGGAAAGTGGTCCACTACGAGCGATAAGAATTTGATGGAAATTATTGTTCACCCCACCGCTTGTTATGTGTCGGAGAAATTAATTTATCAGACCAACTTGAGTGTTGTGGCTCACATGTTTGCCAAATGGTCTGGATCTATGAGGTACACATTTGTTTTTGGAGCTTCGATGTTTGATAGGGGCAAGATAATGGTGAGTGCTGTTCCAGTACAGTTTAGAAATTCAAAGCTCACTCTATCACAAATGGCAGCATTTCCCTCAATGGTGTGCGATTTGAGCATGGAGACGAGGGAGTTCACTTTCGAGGTTCCATACATTTCCATCGGCAAGATGAGCTTGGTTTGCAAAGATTATCTTTTTGATATCTCCTCTTATAATGCTGACTTGGTTGTGAGCCGACTGCATGTGATGATCTTGGATCCCCTCGTGAAGACTGGAAATGCATCGAACTCAATAGGCTTTTATGTCGTTGCTGGGCCTGGCAAGGGTTTTAAACTGCATCAAATGTGCGGGGTCAAGAGCCAATTTGCTCATGATGTGCTGACCGCACAGGATTTTGGAAGAAGCCTATCATGCTCGCGTCTCCTTGGCAATGGGTTCAAAGAATGGTGCTCCCGAGAATCGCTGTTGATGAGAGTTCCTCTGAAGAGTGGCAAGAAACGAGCCTTCAAGTACGCTGTGACTCCCCGAATGCGAACACTGCCTCCTGAAGCCACAAGCCTTAGTTGGTTGAGCCAAATTTTCGTTGAATGGCGTGGATCTCTGACTTACACCATCCACGTTCAATCTGGATCTGCTATCCAGCATTCGTACATGCGCATCTGGTATGACCCCAATGGCAAAACTGATGAAAAGGAGGTCAAATTTCTTGACAGTGCACATCCACCAGCAGGGATCAAGGTGTATCATTGGGACCTCAAAATAGGAGATAGCTTTCGCTTCACCGTCCCATACTGCGCTAGAACGGAGAAATTGCAGATCCCAAAAGCTTATGCGTCAACGCCATACGAGTGGCTCACGATGTACAACGGGGCGGTGACTTTTGATTTGCGTAGTGGTGCCGACATGGAGCTTTTTGTCTCAATTGCTGGGGGAGACGATTTTGAAATGTTCGAACAGACAGTGCCCCCAAAATGCGGCTCAGTGAGTGATTCGTACACTGTCCTATCATATGCGGATGACGTTAAGAGCGTGACGGAGGTGCCGAATAAGACCACGTATCTGGCAGATGAGCAACCAACAACCTCAGCACCTCGTACATCTATTGTGAACACTGAGGATGATCCGCCAACTGAAGGGGAGATTGCGAGAACTACGAATGGAACCCTTGTGCAGTATCGTGGAGGAGCTTGGAAACCAATGGTGGAACGCACGCCGACGATGTCGAAGAAGCAAGTGGGCCCGGAGCTTACGGTGTCAGATCCTCAAATGTATAAGTGCATCAAAAACATGAACAAAAACGTCAAGATTCTGACCGACAGACAGTGCACTGCAAAGTTGGCAAATATAGTGGACTCAGCCCAGGAGCTTGTTGGAAGTAATAGCACTTTTGTTGAGGATTTGGCAGTGGGCGCCAAGCAGATCCGGAAATTTGGAGAGAGCCTAGACGTTTTCGAGGGAAGTATGAGTGCTGCAAAGACTGCTGAGTTAATTGACAACACGCACGCAGCCTTCTCCGGGCCAGCTGATGGGAGCCCAATTTCAAACGTCGTGCAATTGTTGCTGCCTATGCTTTCCTCAATCAAAGGCATGTCTGGAAAAATGGAGAGTAAGATGGCCTCATTGACTGCAATGTTCCAACCATGTAAGAAAGCGATTACACATTTGATTGAGAGGTCCTTCCCATACTTGGCATGCAAAGGCTTCAAAACAGACAAGTGGATTTGGGCAGCCTTGGCTTCTATTCTTGTTGGAGCAGCACTCTTGCATTACTACCGCTCAGATCTCAAATTTGTAAAGAAATGGTCCGTGATGTGTATGATTATTTGGGCCCCACTATTAGCAGAGAAAGCTTACCATCTTGGGACGTGGATTAAAGAGAAATTTCTCAAAAGTCTCCCAAGAACAAGAACGATCAAAGACTCGTGCCGTAAACACTCTTTGGCAGGCGCGTTCGAATGCTTGGCATCAGCCTCTTGTGCTTACATTAAGGACAATTGGGCTAAGACGATGTCAAGTCTTTTAACGATACTAAGTGTAGTAGCGAGTCTTGTTATGTGGGGAAAGATTCCAGATGATAAAGAGATCACAAGCTTTGCGGACAAATTCCACAGCATAGGGAAGAAAGGCAGATCCATCACGAATATAATTGGCGGGTTTGAAAAGATTACTTCAGTGTGCAAGAAATGGAGCGAGACCCTGGTTAGTTGGATCGTGTCGAACGTGAGCGGTGGCATTCCGAAGGAGGACCTAGCAATGACTGCGTACCTGGGCTTCAAGATTCATGACTGGGTTAGAGAAACGCGCGATATGGCTCTTATGGAAAATCGCTTTCGAGGCTTTGGTGGAGATGAGCACTTGGTCAAAGTAAGACGACTTTATGGACATTCACTCAAAATTGATAATGCGCTCATGGAAAAACAGATAGTTCCAGATATGCAGTTGAGCCTCATAATCAAAGAATGTCGTCAAAAATGCCTTGAGCTAATGAATGAGAGTTACACGTACAAAGGAATGAAGCAATCTCGCATCGATCCGCTACATGTGTGTATGCTTGGTGCGCCTGGAGTCGGAAAGTCCACAATTGCTCATGTGGTCATCAACCATTTGCTGGATCACAGAGGAGAGCCTGAAGTCGATAGAATTTACACGAGATCGTGCGCAGACGCTTATTGGAGCAATTATCATCAAGAGCCAGTTATATTATACGATGATCTTGGCGCCATCAAGAGCAACCTGCGACTGTCGGACTATGCTGAGATCATGGGTATTAAAACTAATGATCCTTTTTCCGTACCCATGGCGGCCGTCGAAGATAAGGGTAAACACTGTACCAGCAAATATGTATTCTCGTGCACCAATGTTTTGAATTTGGACGATACTGGGGATGTGGTAACTAAGATGGCATACTATAGGCGACGCAATGTTCTTGTCAAGGTTGAAAGAGATCCTGACGTTCCCAAGAATGAGGCCAATCCCACTGAGGGCCTGGTGTTTACTGTGCTAGGCCATGATCAAAATTGTCAAGGAGATCCTCAATTTGTGGTGAAAGAGAATTGGGACGAGCCTTTTCTGCGCGAAGTCGATACTGAAGGGTGGCGGTTTGAGCGCGTTGAATACAGAACGTTTCTAAGGTTCTTGTGCATGTACACAGATGCATATATGTATAGCCAGGAACAAGTGCTTCAGGGAATTAAAACGTTCAAGATGAATCCTTTTGCGCCCGAGCCCGAGTTTGCGCAAGCCCAGAATGGAGAGGCCGCTGAGTGTGAGATCGTCGAGGAGATGCAGGAAGTGCCAGGGGAGGCCCCGCAAGAAGCGAAGGAACTTGTCAAGATTGAGACCGCGCCAAATATGGACGAGCTAGTAGAGGCCTTTAATAAGCTGAGAGTGACTCCAGGGCACCTGAATGATATTTTGAGAGATGGATCAGGTTGCTACATTGACGAGTGGGCAATAGCTGGACCTCGGTGGCTGAGCTTTCATGAGTTGTTACCATTTACCTGTGGTTGTCATCATACTAGGGTGTGTGATTTTAACATTGTATATAATAATATGTGTAAAGCTGTTAGGAGCCAGAGTGTACATTTTAAGTATAGAGCCAATCAGGCTATTAAATATGCATATACTCATAAGTTGCATTCACAGTGTAGATATAGTATAGATTTTGAGAAACTTCGTGAGTGCAATCCCTTGGACGTTTTTGTTTGTGTTTTATCCAAGTATACGGCAGATGACCATTCTTTTGAGCGACGATGTCCAAAGAAGATGAACGTGGTGAGGATGCAGAGGCCGCCAGTTTTTGAGCTTAAGATGCGGCCCCCTAGTGATAGTGTGGTTGTTGAGGACGAGCAAGGCCAGCGTATTTTTGAGTGGCCCCATTTGTACATATTTTTGCGATATAGAGCCATCGAGTTTAAGGATGACAAAGGCTCCCTGACTGTGAGGGAAGATGCTGGTGCTGACGTGTGCCCATGGAATGAATTCCTGAAATTGCCGTGGCTGGATGGTGACCAACTCAAATCTGTGTTGCCAGCACATTTACATCGGATGGTGCAAGCACGCTTAGAACAGGTGGAGATAATGGAAGAGAATGGAAATTACAGTGGAGAGATGAGAAACGCAATTGCTGAAATCAAGGAGTACTTGGACCAGGATCACCAGTGGGTTGCTGCGTTGGTTTTAGTGGCATGTGCCGTGAAAGAACGACGAAGAATGACGCATGACAAATTGCACCGGAAAAGTTTCAATGCTCTGGATAAATTGGATGCATGGTATACCACAACTGCGCCTAAGACTTCAAAGAAGATGAAAATCTTATTGGCTATTGGCGCGAGTGTTGCTGTGGCTGGAGTTGCTGTTGGGGCCGTGATTTTACTGCAGAAAACCAATTTGTTTGGCTCCAAAGAAGATGAAGAGATTGAAGGAGAAGAAGGTGAGACACAGGCCAGTGGAGCACATGAGTCAGACGGAATAGTGACACAGCACCTCAAAAGAGACATTCGGCCAAAAATGAGAGTGACTTACACAGACCACCATGTTGCTGAGGCACATGAGGAGAAAGATGCCGAGAAGCCACGTAAGTCTGGCAATCCAACCAGAAAGAGCTATTTAGGTTTGTCGCCAGGGTTTGCTGAAAGAGGAATGGGCGTCACATATGAAGAGCACACGCCTTTGAAAGATGCGTTACTTGATGAAAGCAACAAGGTGTTCAGGCGCAAAATCGTGGCTTCAGTGGAAAGTGCTGTGAAACAAGGCGGCAAGGCCTCAAAAGATACTGTGTTGTCACAAATAGGCGATTGGCAAGATAAGGTTAAGGCCACTGGAGTAATAGCGGCTAGACAGTTGGAAGCAAGTGGAAGTTTGAAGAAAATTCACAATCTAAACTCCAGGAGGACCAGCAGCCATGTCATGCCAGGACTCGTTGTTCATGATGGCGCGTTTGAGAGATCTGATGAAGTGGATGCTGAGTTGCACCGTATAACAATTGATGAAGTGAAGTCCTGTCCAAAAATGATCAAGGAAGGTGTTTCTACCCTGTCAGTAAAGAAAGCATCAGTTGGCATGTTGGCACTCCAGAAAGCTGAGTCACAGTTGTCCTTTCCGTTTACATCACGTGCTGGGGTCGATAGAGATTTGAGCATGACCAATTTGATTGACACCCACATGGCAGGAATGAGCTGCATAATCATTAGCGAATTGGGCAATGTGTTCAGGACCTTTGGTGTGTTGCGCTTGTGTGGTACTTACGTATGCATGCCCGCACACTACTTGGACGAGATAACGAGCGAACACACACTGTACTTCGTGTGCCCAAGCAAAATCACACAGATTCAGCTGGAACGACATCGAGTATGCTTGGTGAACGGATTTCAAGAGACGGTTGTGTGGGATCTTGGACCCTCAGTGCCACCCAGTCGGAATTATATTGACTTCATTGCAAATGCAGACGATTGGAAGAATTATAAGGCAACAAGTGGAGCGCTAGTTATGTCAAAGTATTCAGTGGATAGCATGCTTCAGTGCGTACACTTCTTGGATAGTATTGAATTGACAGAGGCAAATGTTTCGGTGCCCACTAGTTATTACGAGGCAAATGGAGGGATTCACACCATCATCTCTGGTCTGAGATACAGAGTGCACTGTATGCCAGGATTTTGCGGACGTGCCATTATGAGAGCTGATGCGACTTGTTTCAGGAAGATAATAGGAATGCACGTCAGTGGACTACGCAACAAGTGTATGGGATATGCTGAAACATTGACTCAGGAACATCTGATGCAAGCCATTGAGACATTGAAGGAAACAGGCCTACTGAAGCATATACCAAAAGGCGCAATTGGAGCAGGTGAGGAGAAACTTCCGGAGCACTCTAAGAAGCAAAGCTTGTCGCTTGAGGGCAAAGGTAATCTTGGAATTGTTGGCCAGCTGACCGCACAATTGGTGCCCACATCTGTTACCAAGACCACGATTTGCAAGAGCATGATTCATGGATTGATTGGTGAAATTAAAACAGAGCCCTCAGTTCTTTCAGCCTGGGACAGACGACTACCGTTTCCACCTGGTGAATGGGATCCAATGAAAGATGCGGTTAAGAAGTATGGTTCCTATATTTTGCCATTCCCAACAGAGGAGATTCAAGAAGTGGAGAATTTTCTGATAAAGAAATTCAGGCGGAAAGAAAATTCAAGAAGAACTCGAAACGTGAATTCATTGGAAGTTGGCATTAATGGCATTGATGGCTCAGACTTCTGGTCCCCAATAGAGATGAAGACGTCGCCTGGATATCCATACATTTTGAAAAGACCAAGTGGCGCGCAGGGAAAGAAGTACTTGTTTGAGGAGCTGGAACCCTATCCGTCAGGTCGACCTAAATATGCCATGAAGGACCCAGAGCTGATCGAGAACTATGAGCGAATAAAAGAGGAAGTGACAAGCGGTGTGAAACCTAGTATCATGACAATGGAGTGCCTCAAGGATGAAAGAAGAAAACTGGCAAAAATTTATGAGAAACCAGCAACTCGCACGTTCACCATTCTGTCCCCTGAGGTCAATATCCTGTTTAGACAATATTTTGGAGATTTTGCAGCCATGGTGATGAGCACGCGACGAGAGCACTTCTCTCAGGTAGGGATTAATCCAGAAAGCATGGAGTGGTCTGATTTGATAAACTCTTTGTTGAGAGTCAATACTAAAGGATTTGCTGGTGATTATTCAAAATTTGACGGCATTGGATCGCCAGCCATTTACCATTCCATAGTCAACGTCGTGAATGCTTGGTACAATGACGGAGAAGTTAATGCAAGAGCACGCCATAGTCTAATATCTTCGATAGTACACCGGGATGGAATCTGTGGTGATCTAATATTGAGATATTCACAGGGAATGCCTTCAGGCTTTGCAATGACAGTCATTTTCAATTCCTTTGTGAACTATTATTTTATGGCTCTAGCATGGATGAGCACGGTTGGATCAAGTCTCCTGAGTCCACAAGGCAGTTGCAAGGATTTTGACACTTATTGTAAGATTGTTGCGTACGGGGATGATAACGTTGTATCTGTTCATGAGGAATTTCTCGACGTGTATAATTTGCAAACAGTTGCCGCTTATCTCAGTCACTTTGGGGTTACGTATACAGACGGAGACAAAAACCCAATACACATGAGCAAGCCATATGAGGATATCACTAAGATGAGCTTTTTGAAGCGAGGTTTTGAGAGAGTGGAGTCCTCTGGCTTTCTTTGGAAGGCCCCTCTGGATAAGACGAGCATTGAGGAGCGTTTGAACTGGATCCGGGACTGTCCAACACCTGTGGAAGCACTGGAACAAAACATTGAGAGTGCGTTACATGAGGCTGCCATCCATGGAAGAGATTATTTTGATGATTTGGTACGACGATTGAATAGTGCACTAACGAGAGTGATGCTTCCTCCAACAGACATCTCATTTGAGGAGTGTCAAGCTCGATGGTGGGCGAGTGTGACTGGCGCCCTTAGGGCTGCTGATTACACATCGCTCGTCAGGCGAGCGAGCTCTGGACATGTGGAGTTTAATAAGAAATATCGAGACATGTTCAGACAACAAGATTTGCCACTCAAGGAAATATTGATGAAATCAAAACCAGTGGCGCTTCTTGACTTGGAGGTGTAATTATGGCACCTCCTCACACGGGCGAAGGAAAAGTCCTTGAGAATGTATCACACTAGTTGTGGTCGGTTGCGTGATTTCAAAGATGACGAGCTGTAAAGTGGTGGTGTAACAAATCTTAGTAAGGAAGAAGACTGGAGAAGTATAAGTCGGCACTCGAGTGTCCCTAGGTGGGGCCGGGGTGATGCTGGGGGATATTGCGCTTTAAACGCAGCGTGAGCGAACCCACCGCAGCTGAAAGGTCTACCCTGAACAGGTTGAATCCGCACACAACAGCAGATATCATCGGTGAATGTGGCCAACACGTAACTCGATTCTATGCTAGTGGTGAGCTCTTCAGGACTGACTACTGTACCTCATTAGAGGAGCCGGGGGCAACCCTTGCCGTGCATGGACACGGCACACAAACCTTGACACAGGTTTTAAAATATAGGTCAGTCTATGCCGGACTTGAATGGCACTGTTATCTGGTAATGTATATACTACTTCGCCAATAAACACTCCTGATGGAGAGGTTCCATCACCCTTCACCCATGTATATTGTTAGGGTGTCGTATGTGTACATAATAAGTTTTATTATTTTTCTTGTTGTGTCTGATCCAAGTTATAGTAAGGATACCATTCTTGTGCTAAGATGGGAAGTAACGCTTGGCTGTGAAATAGTGGTAGAGTGGAGACTCTTAGAGTCATTCACCATGAATGAACTTCACGGGCATGAGAGTCACCCTACGCACGAGAGTGGCGGACTAAGCTAGGCTTTGGGGTAATAACTTTCCCAATCGGGTTGTGCTCGTAGATGATTTGACTTGTCAACGGGCCCCCTTATTGTGACGGTGCTTACCCAGGTACTTTCACCAGTTTCATTCCTTAATTGGACTTCTGGGAGAGGCCGTGCCTTAGGCACTTACTACGATTTGTTTCAACCCGTGGTCACGGACACTTGACCCGTCTTTCGAGAGATGGAAGGCGCCCTCTTTGGGGTTTTTCTCTTTGTGTTGTAAAGTACAGAGAAGTTATTGAAGACCCTCGGGGTTTAAAATAATTTCTAGCTAACGTATATATATAATGATGATATATGTTATGTGAAAATGTTGTGATCGTTATCCTATACGGCACACCCAGTCTTGTAAAGCTGGGACCCACATCACACATCAGGAAGTTGAAACCAATGACGATGGTGGCACAATGCCAACCGGTTGGTACTTACCTACTGTGTATCTCAAGTGTGGGGTAATAGAGTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 8,971
|
KC794785.1
|
Rice tungro spherical virus
|
Sailaja,B., Anjum,N., Patil,Y.K., Agarwal,S., Malathi,P., Krishnaveni,D., Balachandran,S.M., Viraktamath,B.C., Mangrauthia,S.K.
|
Directorate of Rice Research, Biotechnology Section
|
India
|
2013-11-06
|
AP
|
Waikavirus oryzae
|
Waikavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 12,171
|
GenBank
| 1
|
India: Andhra Pradesh
|
India
|
Oryza sativa
| null |
2012-01-01
| null | null |
Rice tungro spherical virus isolate AP, complete genome
|
TGAAAATTGGGGTATAGAGATACCCCAAATCAATTGCCTTATGGCCGCTTGCGAGTAACGCCATATAGGTGTTGCCGAAACATGTGAAAGGATTCACAAACTACTCATCCATTGAGGATTGATGAACATCTCATGATTTTCTGATATGTGTCTGACGTAGCACAGAACACTTAGTATGCACACAGGGCTTCCCTGTCCCTCTGCTAAGCTAGTAATGTGAAATCAGTTTGCCGTGTACACTGGGCTTCCTGGTCCCTCCGGCTATTCAAACACTTAGACGAAATAGTGAGTTTGCCATGCACACTGGGCTTCCTGGTCCCCCTGGCTTTAAAATTGTTCAGATATCCAATTTGGTTGTGGTGTATTCCAGTCTTTCTGGTTTCCCACTTGGCTGAGTGAGTAGTTGAGCTAGCAATACATTCCGGTCGGGCGGATACTATTGTTAGTGTGTCTCCGAGTAGCGTGTGTAGGCGCACCTAGTTTCTTACGCATAAGAATTCCGTTTGCATCAGCAATGCAGAGCTTTCTTCTTTCGTCTAAAAATCAAGCGAAGTTGTTACACGCTGGTTTAGAGTTTGTTGGAGGTGTCCGGTGTGCTCACCAGGGCTGGGTTAGTGGTAAGGCGGTTGTGTTTTGTAACTATTGTAATTTTGCGCATAGATTGTATAGATTTTATACTAAAAATCATTGTGTCTTAAATAAAGAAACTATTGAAAATCTTTGTGGAAGGTCTTTTGTGTCATTGTATAGAGCAGGCCTTCTATTAGACGATTTTACTGTTGACGATTTGCTCGGTAAAGGGAAGTATGCAAAGGGTTCTATTGATAATTTGTCTATCCCTTTCAATGATTGCGCTCTTTGTCCTAATGCTGGCACTCGTCTTTCGCAAACCGGTGCTGCTCATGATCACTTTGTGTGTAATTATGTTGAGCATCTTTTTGAATGTGCTAGCTTTAGTCGTGAAACCGGAGGAAAATTTTTCCGAGCTTGTAGCGAGGGTTGGCACTGGAACGCCACTTGCACGACTTGCGGAGCGTCGTGTAGATTTGCCAACCCGCGGGAGAATATAGTAATAGCCATTTTTATGAATTTTCTTCGAGTAATGTATGATGGTAATAGGTATTACGTTTCTTTGCATTGTGATACTGAGTGGGTGCCTGTGCATCCTTTGTTCGCACGATTGGTCTTGATGGTCCGAGGTTTTGCGCCACTGGACAACAGCCATGTCATTGAGGAAGACGAGATGGACATATGCGGTCATCCATCAGAAGTTACGTATGATGATCCATCAAAATTTGCCTTCACGCACCAGCACGTTACGCGTGGAGTGGGCATGGGACATTTGGCTTTTTGCAGAGATGCCAGTGGAGTTGACAGAGGTGAGCATAAATTTTATCTGCATGGCCCCTTTGATTTGCGGATGACGCATGCCATGTTCAGAGTGTTTATGATTTTGCTCAATTGTCACGGATATGTCCAATCTGAGTTTAGGGAGGAGTTTCCGGAAGTTAAGGATCGCTCCCTGTGCGCGCTACTGTCAGTTGCTGGGTTGCGGGGAGTTAATATTTCCTGCAATGAGGAGTTCATTCACTTGCACTCGCAGTTTCACAATGGCTCCTTCAGGTCGCAGAGGCCAATCCCCATGGTGTACGCGGAACCAGAAATGTACCCGCCATTAGGGTATGTGCAACTTACTGAAAGCTGGGTTCCACGTGGTCGCGTGATGATAGACGATTTGCCATCGCTCATGAGCAGAGTGTACGCTGAAAGTTCCCAGGCGCATGCAGGTGAAATATATGAGGAAACATTTGACGAGGATGATTTATTTGAGCTTGGAGATGAAGAGGGCACGAGCACGCGTGGTCTCCTGGATCTTGGAAGGAGACTTGGGGGTTTGCTGCTGGGAGCTACAAAATGTGTGAAAGGATTGCATGCTGTGATTGAATGGCCAGTAGATGTGCTTACAAAAGAAGCTGAGGACCTTGGAACATGGCTTGCCGATAACAAGAAATACGTCAGTGAGTCCACGTGGAGCTGCCAGGTGTGTCCTGAAGTGCAAGATGCCTTAGAGAAATCGATGCGGGGGCAAGCAAAATTGAATGCCCAAATGATTGGTGGTATCAAGAAGTTGGCCACGACTATGGATTCGGCTACATCAAAGATGAGGGACAGTTTCAAAGAACTGGAACGGAGAATTAGTGTGCTGGAACAAGGTGTGGATGAAACGCAGCAAGCGCGCATCACTAATCTGGAGAACTTTTGTGAGGATGCGGCCAAGGCTTTTGAGGCACTGCGCGCTGACATTGACGCCCTCAAGGAGAAACCAGCGCAAAGCGTAACACCGTTGCCATCGCCTTCCGGAAATTCAGGCACAGCTGGAGAACAACGCCCTCCCCCGAGACGAAGACCTCCTGTAGTCGAGATGTCTGAGGCACAAGCTGGTGAGACTGTTATTGTGGGTGGTGATGAGGAGCAAGAGGCTCATCAGGATAGTAGCATTGCAGCGGCTGGACCCACTGATGAACATAATGCCATGTTGCAAAAGATCTACCTCGGCTCCTTTAAATGGAAGGTATCAGATGGAGGGGGTTCAATTCTCAAAACCTTTTCCCTCCCATCGGACATATGGGCTGCCAATGACAGGATGAAAAATTTCCTCAGCTACTTTCAGTATTACACTTGTGAGGGAATGGCATTTACGCTCACGATTACTAGCATTGGTTTGCATGGAGGAACGCTGCTTGTAGCCTGGGATGCCCTGAGTAGTGCGACACGAAGGGGAATCGTTTCGATGATACAGCTGAGCAATCTCCCCTCAATGACATTGCATGCAAGTGGGAGCTCTATTGGCACCTTGACTGTGACTTCTCCGGCTATTCAACATCAGATTTGCACGTCAGGAAGTGAAGGCTCTATAGCGAATTTGGGCTCTCTTGTGATCTCCGTTGCGAATGTGTTGTGCGCTGATTCAGCTTCAGCTCAAGAACTTAATGTTAACGCTTGGGTGCAGTTTGACAAGCCTAAGCTCAGTTATTGGACGGCACAACATACGATCGCACAGAGCGGAGGTTTTGAGGAATCGCAGGATTTGGGCGATCTACAGGCCATAATTGCCACTGGGAAATGGTCCACCACGAGCGATAAAAACCTGATGGGAATTATTGTTCACCCCACTGCGTGCTACGTGTCGGAAAAGCTGATATATCAGACCAATTTGAGTGTTGTGGCTCACATGTTTGCTAAATGGTCTGGATCAATGAGGTACACATTTGTTTTTGGGGCTTCAATGTTTGACAGGGGAAAGATAATGGTGAGTGCTGTTCCGGTGCAATTTAGAAATTCAAAACTCACTCTATCACAAATGGCAGCATTTCCCTCAATGGTGTGTGATCTGAGTGTGGAGACGAGAGAGTTCACTTTTGAAGTGCCATACATTTCCATCGGCAAAATGAGTTTGGTTTGCAAAGATTATCTTTTTGACATTTCTTCTTACAATGCCGATTTGGTTGTGAGCCGACTGCATGTGATGATTCTGGATCCCCTGGTGAAAACTGGAAATGCGTCAAATTCAATAGGCTTTTATGTTGTTGCTGGGCCGGGAAAAGATTTTAAATTGCATCAGATGTGCGGGGTCAAGAGCCAATTTGCTCATGATGTGCTGACCGCACAGGACTTTGGAAGGAGCCTAACGTGTTCGCGTCTCCTTGGAAATGGATTTAAAGAATGGTGTTCCCGCGAGTCGTTGTTGATGAGGGTTCCTCTAAAGAATGGGAAGAAACGAGCCTTCAAGTATGCTGTGACCCCCCGCATGCGAACGCTGCCCCCTGAAGCCACAAGCCTTAGCTGGTTGAGCCAAATTTTTGTTGAATGGCGTGGATCTTTGACTTATACTATTCACGTTCAATCAGGATCCGCTATTCAACACTCGTACATGCGTATCTGGTATGACCCCAATGGCAAAACTGATGAGAAGGAGGTCAAATTTCTTGACAGCGCGCATCCACCAGCAGGGATTAAAGTGTATCACTGGGACCTCAAGATAGGAGACTGCTTTCGCTTCACTGTCCCTTACTGTGCAAGAACGGAGAAATTGCAGATCCCAAAGGCTTATGCGTCAACACCGTACGAGTGGCTCACGATGTACAATGGAGCGGTGACTTTTGATTTGCGCAGTGGTGCCGACATGGAGCTCTTCGTCTCGATCGCTGGAGGAGATGATTTTGAGATGTTTGAACAGACCGTGCCTCCAAAATGTGGTTCAGTGAGCGACTCATACACTGTCCTATCATATGCAGACGATGTTAAGAGCGTGACGGAAGTGCCGAACAAGACCACGTACTTGGCAGATGAGCAACCAACCACCTCGGCACCTCGTACGTCTACTGTGGATACCGACGAGGACCCACCGACTGAGGGAGAGATCGCGAGGACTTCGAATGGAACTCTTGTGCAGTACCGTGGAGGAGCGTGGAAGCCAATGGTGGAACGTGCGCCAACGATGTCGAAGAAGCAAGTGGGTCCAGAGCTTGAGGTGTCAGACCCTCACATGTACAAGTGCATTAAGAATATGAACAAGGATGTGAAGGTTTTGACCGACAGACAATGCACCGCGAAGTTGGCAGACATAGTGGACTCAGCCCAGGAGCTTGTTGGAAGCAATAGCACTTTTGTTGAGGATTTGGCAGTGGGCGCCAAACAAATTCGCAAATTTGGAGAGAGCCTAGATGTTTTCGAGGGAAGTATGAGTGCTGCAAAGACTGCTGAGCTAATTGACAACACGCATGCAGCTTTCTCTGGGCCAGCTGATGGGAGTCCGATCTCAAACGTTGTGCAATTGTTGCTGCCCATGCTCTCCTCAATCAAAGGTATGTCTGGGAAAATGGAGAGCAAGATGGCCTCGCTGACTGCAATGTTCCAACCATGTAAGAAAGCGGTTACACATTTAATTGAGAGGTCCTTCCCATACTTGGCATGCAAAGGCTTCAAAACAGACAAGTGGATTTGGGCAGCCTTGGCTTCTATTCTGGTTGGAGCAGCACTCTTGCATTATTACCGCTCAGACCTCAAATTTGTGAAGAAATGGTCCGTGATGTGTATGATTATTTGGGCCCCACTATTAGCGGAGAAAGCTTATCATCTTGGGACGTGGATTAAGGAAAAATTTCTCAAAAGTCTCCCAAGAACAAGAACGATCAAAGACTCGTGCCGTAAACACTCTTTGGCAGGCGCGTTCGAATGCTTGGCATCAGCCTCTTGTGCTTATATTAAGGATAATTGGGCTAAGACGATGTCGAGTCTTTTAACGATACTAAGTGTAGTAGCGAGTCTTGTTATGTGGGGGAAGATACCAGATGACAAAGAAATCACAAGCTTTGCGGACAAATTCCACAGCATAGGGAAGAAAGGCAGATCTATCACGAATATAATTGGCGGGTTTGAGAAGATAACTTCAGTGTGCAAGAAGTGGAGCGAAACTCTGGTTGGCTGGATCGTATCAAGTGTGAGCGGTGGCATACCAAAGGAGGACCTGGCGATGACTGCGTACTTGGGCTTCAAGATTCATGACTGGGTCAGAGAGACGCGCGATATGGCTCTTATGGAAAATCGCTTTAAGGGCTTTGGAGGAGATGAGCACCTGGTTAGAGTAAGACGGCTTTATGGACACTCACTTAAAATTGACAATGCGCTCATGGAAAAACAAATTGTACCAGACATGCAGTTGAGCCTTATAATCAAAGAGTGCCGTCAAAAGTGCCTCGAGCTGATGAATGAGAGTTACACGTATAAAGGAATGAAGCAATCTCGCATCGACCCTCTGCATGTGTGTATGCTTGGCGCGCCTGGTGTTGGAAAATCCACGATCGCCCACGTGGTCATCAACAATTTGCTGGATCATAGAGGAGAGCCAGAAGTCGACAGAATCTACACAAGGTGCTGTGCAGACGCCTATTGGAGTAATTATCATCAAGAGCCAGTTATACTGTACGACGATCTTGGCGCTATTAAGAGCGACTTGCGACTTTCGGACTATGCTGAAATCATGGGTATCAAGACTAACGATCCTTTTTCTGTACCCATGGCAGCTGTTGAGGACAAGGGCAAACACTGTACCAGCAAATACGTGTTTTCGTGCACCAATGTTCTGAATCTGGACGACACTGGGGATGTGGTGACTAAAATGGCATACTACAGGCGGCGCAATGTTCTCGTTAAGGTTGAGAGAGATCCTGATGTCCCTAAGAATGAGGCTAATCCTACTGAGGGCCTGGTGTTTACTGTGCTAGGCCATGATCAAAATTGTCAAGGAGATCCTCAATTTGTAGTAAAAGAGAATTGGGACGAACCTTTCCTGCGCGAAGTTGATACTGAAGGGTGGCGATTTGAACGCGTTGAATATAGAACGTTCTTAAGGTTCTTGTGCATGTACACGGATGCATATATGTATAGCCAGGAACAAGTGCTTCAGGGAATTAAAACGTTTAAGATGAACCCTTTTGCGCCCGAGCCTGAGTTCGCGCAAGCTCAGAGTGGAGAAGCTGCTGAGTGTGAGATTGTTGAGGAGACACAGGAAGTGCCAGGGGAGGCTCCGCAGGAAGCAAAGGAAATTGCTAAGCTTGAGACCGCGCCGAATATGGATGAACTAGTAGAGGCCTTCAACAAGCTGAGAGTGACTCCAGGACATCTGAATGAGATTTTGAGAGATGGATCAGGATGCTATATTGACGAGTGGGCAATAGCTGGACCACGGTGGCTGAGCTTCCATGAGTTGTTACCATTTACCTGTGGTTGTCATCATACTAGGGTGTGCGATTTTAATATTGTATACAATAATATGTGTAAAGCTGTTAGGAGCCAGAGTGTACATTTTAAGTATAGGGCTAATCAGGCTATTAAATATGCATATACTCATAAATTGCATTCGCAGTGTAGATATAGCATAGACTTTGAGAAACTTCGTGAGTGCAATCCCTTGGACGTTTTTGTTTGTGTTTTGTCCAAGTATACGGCAGATGATCATTCTTTTGAGCGACGATGTCCGAAGAAGATGAACGTGGTGAGGATGCAGAGGCCGCCTGTTTTTGAGCTCAAGATGCGACCCCCAAGTGATAGCGTGGTCGTTGAAGATGATCGAGGTCAGCGTGTTTTTGAGTGGCCCCACTTGTACACATTTTTGCGATATAGGGCCATCGAGTTTAAGGATGATAAAGGCTCCCTGACTGTGAGAGAAGATGCCAGCGCTGACGTGTGCCCGTGGAACGAATTCTTGAAGTTGCCGTGGCTTGATGGTGACCAACTTAAATCTGTGTTGCCAGCACATTTACATCGGATGGTACAAGCGCGCTTGGAACAGGTGGAGATAATGGAGGAGAATGAAGCTTACAGCGGAGAAATGAAGAACGCGATTGCTGAGATTAAAGAGTATTTGGATCAGGATCACCAGTGGGTTGCTGCATTGGTTTTGGTAGCATGTGCTGTGAAAGAACGACGAAGAATGACGCATGATAAGTTACACCGGAAAAGTTTTAACGCTTTGGATAAACTGGACAAATGGTATACTACAACTGCGCCTAAAACTTCGAAGAAGATGAAAATTCTACTGGCCATTGGTGCAAGCGTTGCAGTAGATGGAGTTGCTGTTGGAGCCGTGATTTTACTGCAGAAGACTAATTTGTTTGGCTCTAAAGAGGATGAGGAGATTGAAGGAGAAGAAGGTGAGACACAGGCTAGTGGAGCACATGAATCAGACGGAATAGTGACACAGCACCTCAAAAGAGATATTCGGCCAAAAATGAGGGTGACTTACACAGACCATCATGTTGCTGAGGCACATGAGGAGAAAGGCGCCGAGAAGTCACGTAAGCCTGGCAATCCAGCTAGAAAGAGCTATTTAGGCTTGTCGCCAGGCTTTGCTGAAAGAGGAATGGGCGTTACATATGAAGAGCACACACCTTTAAAAGATGCACTACTTGATGAAAGCAACAAGGTGTTTAGGCGCAAAATTGTGGCTTCAGTGGAAAGTGCTGTGAAACAGGGCGGCAAGGCCTCAAAGGACTCTGTGTTGTCGCAAATAAGTGAATGGCAAGATAAGGTTAGGGCCACTGGGGTGATAGCGGCAAGACAGTTGGAAGCGAGCGGAAGCTTGAAGAAAATTCACAATCTTAACTCCAGGAGAACCAGTAGTCATGTCATGCCAGGGCTCGTCGTTCATGATGGTACGTTTGAAAGGTCTGACGAAGTAGATGCCGAGTTGCACCGCATAACTATTGATGAAGTGAAGTCCTGTCCGAAAATGATCAAGGAAGGGGTTTCTACCCTATCAGTGAAGAAAGCGTCGGTTGGCATGTTAGCACTCCAGAAAGCTGAATCGCAGTTGTCCTTTCCGTTCACATCACGTGCCGGGGTTGATAGAGATTTAAGCATGACCAATTTGATTGACACTCACATGGCAGGAATGAGCTGTATTATCATAAGTGAACTGGGCAACGTGTTCAGGACCTTTGGTGTGTTGCGCCTGTGTGGTACTTACGTATGTATGCCTGCACACTATTTGGACGAAATTACGAGTGAACACACATTGTACTTCGTGTGCCCAAGCAAGGTCACACAGATTCAGTTGGAACGACATCGAGTATGCCTGGTGAATGGATTTCAAGAAACAGTGGTGTGGGATCTTGGTCCTTCAGTGCCACCCAGTCGCAATTATATTGACTTTATCGCGAATGCTGACGACTGGAAGAATTACAAGGCAACAAGTGGAGCGCTAGTCATGTCAAAATATTCAGTGGACAGTATGCTTCAGTGTGTGCATTTCTTGGACAGTATTGAATTGACAGAGGCAAATGTTTCAGTGCCCACTAGTTACTATGAGGCAAATGGAGGAATACACACCATTATTTCTGGTCTGAGATATAGAGTTCACTGTATGCCAGGATTTTGTGGAGCTGCCATTATGAGAGCTGATGCGACCTGTTTTCAGGAAGATAATTGGAATGCACGTCAGTGGGCTACGCAACAAATGTATGGGATATGCCGAAACATTGACTCAGGAACACTTAATGCAGCCATTGAAACATTGAAGGAGACAGGTCTAATGAAGCACATACCGAGAGGTGCGATTGGAGCGGGTGAGGAAAAACTTCCAGAGCATTCTAAGAAACAAAGTTTATCGCTCGATGGAAAAGGCAACCTTGGAATTGTTGGCCAGTTACCAGCGCAATTGGTGCCCACTTCTGTTACCAAGACAACGATTTGCAAGAGCATGATCCATGGATTGATAGGTGAGATTAAAACAGAGCCCTCGGTTCTCTCAGCCTGGGACAGACGATTACCATTTCCACCTGGCGAGTGGGACCCAATGAAAGATGCGGTTAAGAAGTATGGTTCCTACATTTTGCCATTTCCAACAGAGGAGATTCAAGAAGTGGAAAACTTTCTCATAAAGAAATTCAAGCGGAAAGAGAATTCAAGAAGAACACGAAACGTGAATTCATTGGAAGTCGGCATTAATGGTATCGATGGCTCAGATTTCTGGTCTCCGATAGAGATGAAAACGTCACCAGGATATCCATACATTTTGAAAAGACCAAGTGGCGCACAGGGCAAGAAGTATCTATTTGAGGAGTTGGAACCATATCCGTCAGGACGGCCCAAATATGCCATGAAGGACCCGGAGCTGATTGAGAGTTACGAGCGAATCAAAGAGGAAGTGACAAGTGGTGTGAAACCCAGTATCATGACAATGGGGTGCCTCAAGGATGAAAGGAGAAAATTGGCAAAAATTTACGAGAAACCAGCAACCCGCACATTCACTATTTTGTCCCCTGAAGTTAACATTCTGTTCAGGCAATATTTTGGGGATTTTGCAGCCATGGTGATGAGCACGCGACGAGAGCACTTCTCTCAGGTTGGGATCAACCCAGAAAGTATGGAGTGGTCCGATTTGATAAATTCTCTGTTGAGAGTCAATACTAAAGGATTTGCTGGTGATTATTCAAAATTTGATGGCATTGGATCGCCAGCCATTTACCACTCCATAGTTAACGTTGTGAACGCTTGGTACGATGACGGAGAGGTTAATGCAAGAGCACGCCATAGTTTGATATCCTCGATAGTACATCGGGATGGAATCTGTGGTGATTTGATACTGAGATACTCACAAGGGATGCCTTCTGGTTTTGCGATGACGGTTATTTTTAACTCCTTTGTGAACTATTACTTTATGGCTCTAGCATGGATGAGCACAGTTGGGTCGAGTCTCCTGAGTCCACAAGGCAGCTGTAAAGATTTTGACACTTATTGTAAAATTGTTGCATACGGGGATGATAATGTTGCGTCTGTTCATGAGGAATTTCTCGATGTGTACAATTTGCAAACAGTTGCTGCTTATCTCAGTCATTTTGGGGTTACATATACAGATGGAGACAAGAACCCAATACATATGAGTAAGCCATATGAGGATATCACCAAAATGAGTTTCTTGAAACGAGGCTTTGAAAGGGTTGAGTCTTCTGGATTTTTATGGAAAGCTCCTCTGGACAAGACAAGTATAGAAGAGCGATTGAATTGGATTCGAGATTGCCCTACACCTGTGGAAGCATTGGAACAGAACATTGAGAGTGCACTACATGAGGCTGCCATTCATGGCAGAGATTATTTTGATGATTTAGTGCAACGCTTGAATAGTGCGTTGAGAAGAGTGATGCTCCCTCCAACAGATATTACATTTGAGGAGTGTCAGGCTCGATGGTGGGCGAGTGTGACTGGTGATGCTCTAAGAGCAGCCGATTACACCTCGCTTGTCAAGCGAGCGAGTTCTGGACATGTAGAATTTAATAAGAAGTATCGAGACATGTTCAGACAACAAGATTTGCCGCTTAAGGAGATATTGATAAAATCAAAACCAGTGGCACTTCTTGACCTGGAGGTGTAATTATTACGCCTCCTCACACGGGCGAAGGAAAATCCATGAGAATGTATCACACTAGTTTAAATCGGTTGCGTGATTTCAAAGATGACGAGCTGTAAAGTGGTGGTGTAACCAGTCTTAGTAAGGAAGAAGACTGGAGAAGTATAAGTCGGCACTCGAGTGTCCCTTATTGGGACCGGAGTGATGCTGGGGGATATTGCGCTTTAAACGCAGCGTGAGCGAACCCACCGCAGCTGAAAGGTCTACCCTGAACAGGTCGAATCCACACACAACAGCAGACATCATCCGCGAATGTGGCCAACACGCAGTTTGATTTTAGGCTAGTGATGAACTCTTCGGGACTGAGTACTGTACCTCATTAGAGGAGCCGGGGGCAACCCTTGCCGTGCATGGACACGGCACACAAACCTTGACACAGGTTTTAAAATATAGGTCAGTCTATGCCGGACTTGAATGGCACTGTTATTTGGTAACGTATATATTGTCAAACCAATAAACACTCCTGATGGAGAGGTTCCATCACCCTTCACCCATGTATATTGTCAGGGTGTCGTATGTGTACATAATAAGTTTTATTATTTTTCTTGTTGTGTCTGATCCAAGTTATAGTAAGGATACCATTCTTGTGCTAAGATGGGAAGTAACGCTTGGCTGTGAATTAGTGGCAGAGTGGAGACTCTTAGAGTCACTCACCATGATTGAAATTCATGGGCATGAGAGTCACCCTATGCGTGAGAGTGGCAGACTAAGCTAGGCTTTGGGGTAATAACTTTCCCAATCGGGGTTGTGCTCGTAGATGATTCGATTTGTCAATGGGCCCCCTTATTGTGACGGTGCTTACCCAGGTACTTTCACCAGTTTCATTCCTTAACCGGACTTCTGGGAGAGGCCGTGCCCAAAGCACTTGCTACAACTTGTTTCAACCCGTGGTCACGGACACTAGACCCGTCTTTCGAGAGATGGAAGGCGCCCTCTTTGGGGTTTTTCTCTTTGTGTTGTAAAGTACAGAGAAGTTATTGAAGACCCCTCGGGGTTTAAAATAATTTCTAGCTAACGTATATATATAGTGATGATGTATGTTATGTGAAAATGTTGTGATCGTTATCCTATACGGCACACCCAGTCTTGTAAAGCTGGGACCCACATCACACATCGGGAAGTTGAAACCAATGACGATGGTGGCACAATGCCAACCGGTTGGTACTTACCTACTGTGTATCTCAAGTGTAATCACTAGTGAATTC
| 92,740
|
AM234048.1
|
Rice tungro spherical virus
|
Verma,V., Dasgupta,I., Tandon,V.
|
Tandon V., Department of Plant Molecular Biology, University of Delhi, South Campus, UDSC, Benito Juarez Road, New Delhi
|
India
|
2006-05-02
| null |
Waikavirus oryzae
|
Waikavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 12,174
|
GenBank
| 1
|
India:Orissa
|
India
|
Oryza sativa
| null | null | null | null |
Rice tungro spherical virus complete genome, Orissa isolate
|
TGAAAATTGGGGTATAGAGATACCCCAAATCAATTGCCTTATGGCCGCTTGCGAGTAGTCGCCATATAGGTGTTGCCGAAACATGTGAAAGGATTCACAAACTACTCACCCATTGAGGATTGATGAACATCTCATGATTTTCTGATTCGTGTCTGACGTAGCACAGAACGCTTAGTATGCACACAGGGCTTCCTTGTCCCTCTGCTAAGTTAGTAATGTGAAATCAGTTTGCCGTGCACACTGGGCTTCCTGGTCCCTCCGGCTATTCAAACACTTAGATGAAATAGTGAGTTTGCCATGCACACTGGGCTTCCTGGTCCCTCTGGCTTTAAAATTGTTCAGATATCCAATTTGGTTGTGGTGTATTCCAGTTTTTCTGGTTTCCCACTTGGCTGAGTGAGTAGTTGAGCTAGCAATATATTCCGGACGGGCGGATACTATTGCTAGTGTGTCTCCGAGTAGCGTGTGTAGGTGCACCTAGTTTCTTACGCATAAGAATTCCGTTTGCATCAGCAATGCAGAGCTTTCTTCTTTCGTCTAAAAATCAAGCGAAGTTGTTACACGCTGGTTTAGAGTTTGTTGGAGGTGTCCGGTGTGCTCACCAGGGCTGGGTTAGTGGTAAGGCGGTTGTATTTTGTAACTATTGTAATTTTGCACATAGATTGTATAGGTTTTATACTAAGAATCATTGTGTTTTAAATAAGGAAACTATTGAAAATCTTTGTGGAAGGTCTTTTGTGTCATTGTATAGAGCAGGCCTTTTGTTAGACGATTTTACGATCGACGATTTGCTTGGCAAAGGGAAATATGCAAAGGGTTCTATTGATAATCTGTCTATCCCTTTCGATGATTGCGCTCTTTGTCCTAATGCTGGCACTCGTCTTTCGCAAACCGGTGTTAGTCATGATCACTTTGTGTGTAATTATGTTGAGCATCTTTTTGAATGTGCTAGCTTTAGTCGTGAAACCGGAGGAAAATTTTTCCGAGCTTGTAGCGAGGGTCGGCACTGGAACGCCACTTGCACGACTTGCGGAGCGTCGTGTAGATTTGCCAACCCGCGGGAGAATATAGTTATAGCGATTTTTATGAATTTTCTTCGTGTGATGTATGATGGTAATAAGTATTATGTATCTTTACATTGTGATACTGAGTGGATTCCCGTGCACCCTCTTTTTGCACGATTGGTTTTAATGGTTCGTGGATTTGCGCCATTGGACAATAGCCATGTTATTGAGGAAGATGAGATGGATATATGTGGTCATCCGTCCGAGGTTACATATGATGACCCATCAAACTACGCCTTCACGCATCAACATGTTACGCGTGGAGTGGGCATGGGCCACTTGGCATTTTGCAGGGATGCCAACGGGGTGGATAGAGGTGAGCACAAGTTTTATCTGCACGGGCCTTTTGATCTTAAAATGACGCATGCCATGTTCAGAGTGTTCATGATTTTGCTTAATTGCCATGGATATGTCCAGTCCGAGTTTCGAGAGGAGCACCCTGCAGTTAAGGACCGCTCTTTGTGCGCATTGTTGTCAGTCGCTGGTCTGCGAGGAGTTAATATAGCCTGCAATGAGGAGTTTATTCATTTGCACTCGCAGTTTCATAATGGCTCTTTTAGATCCCAGCGGCCAATTCCAATGGTGTATGCTGAACCAGAGATGTACCCGCCACTGGAGTATGTGCGCCTCACTGAAAGCTGGGTACCGCGGGGCCGCGTAATGATTGATGATCTGCCATCGCTTCTGAGCAGAGTGTATGCCGAAAGTTCACAAGCGCATGCTGGTGAAATATATGAGGAGATATATGATGAAGATGATTTGTTTGAGCTCGGAGATGGTGAGGGTACAAGTACGCGTGGCCTTTTGGATCTTGGCAGGCGGTTTGGAGGATTGCTTTTGGGAGCCACAAAATGTGTGAAGGGATTGCACGCTGTGATTGAGTGGCCAGTAGATGTGCTCACAAAGGAGGCTGAGGATCTTGGAACGTGGCTTGCTGATAACAAGAAATACGTCAGTGAGTCAACTTGGAGTTGCCAGGTGTGCCCTGAGGTGCAAGATGCTTTGGAGAAATCAATGCGGGAGCAGGCTAAGCTGAACGCCCAAATGATTGGTGGCATCAAGAAGTTGGCCACGACCATGGATTCAGCCACGTCAAAGTTGAGAGACAGCCTCAAAGAATTGGAGAGGAGAATTGGTGTGCTAGAACAGGGCGTAGACGAGACGCAGCAGGCACGCATTACTAATCTGGAAAATTTTTGTGAGGATGCTTCTAAAGCTTTTGAGGCAATGCGTGCTGATATTGATGCCCTTAAGAAGAAACCAGCTCAGAGTGTGACACCATTGCCATCGCCTTCTGGAAATTCAGGTACAGCTGGAGAACAACGCCCTCCCCCAAGACGAAGACCTCCTGTAGTTGAGATGTCTGAGGCACAAGCTGGTGAGACAGTTATTGTGGGCGGTGACGAGGAGCAAGAGGCCCATCAGGATAGTAGCATTGCAGCAGCTGGACCCACTGATGAACATAACGCTATGCTGCAAAAGATTTATCTTGGCTCCTTTAAGTGGAAGGTATCAGATGGAGGGGGTTCAATTCTCAAAACCTTCTCCCTCCCATCAGACATATGGGCTGCCAATGACAGGATGAAAAATTTCCTCAGCTACTTTCAGTATTACACTTGTGAGGGAATGACATTTACGCTCACGATCACTAGTATTGGTCTGCATGGAGGAACGCTGCTTGTAGCCTGGGATGCCTTGAGTAGTGCGACAAGAAGGGGAATCGTTTCGATGATACAGCTGAGCAACCTCCCCTCAATGACATTGCATGCAAGTGGGAGCTCTATTGGCACTTTGACTGTGACTTCTCCGGCAATTCAACATCAGATCTGCACGTCAGGAAGTGAAGGCTCTATAGCGAATTTGGGCTCTCTCGTGATCTCCGTTGCGAACGTATTGTGCGCCGACTCAGCTTCAGCCCAGGAACTTAATGTCAACGCTTGGGTGCAGTTCGACAAGCCCAAGCTCAGTTATTGGACGGCACAACACACGATTGCACAGAGCGGAGGTTTTGAGGAAACGCAGGATTTGGGCGATCTACAGGCCATAATTGCCACTGGGAAATGGTCCACTACGAGTGATAAGAATTTGATGGAGATTATTGTTCACCCCACTGCGTGCTACGTGTCGGAAAAACTGATATACCAGACCAATTTGAGCGTTGTGGCTCACATGTTTGCCAAATGGTCTGGATCAATGAAGTACACGTTTGTTTTTGGAGCTTCGCTGTTTGACAGGGGAAAGATAATGGTGAGCGCTGTTCCAGTACAGTTCAGAAATTCAAAGCTCACACTATCACAAATGGCAGCGTTTCCCTCGATGGTGTGCGATCTGAGCGTGGATACACGGGAGTTTACATTTGAGGTGCCATACATTTCTATCGGCAAAATGAGTTTGGTTTGTAAAGATTATCTTTTTGACATTTCTTCCTACAATGCCGATTTGGTTGTGAGCCGTCTGCATGTGATGATCCTGGATCCCTTGGTGAAGACTGGAAATGCGTCCAATTCGATAGGCTTTTATGTAGTTGCTGGGCCTGGCAAAGATTTCAAATTGCACCAAATGTGCGGGGTCAAGAGCCAATTTGCTCATGATGTGCTGACCGCACAAGATTTTGGGAGAAGCCTAACATGTTCGCGTCTTCTTGGCAATGGATTTAAAGAATGGTGCTCCCGAGAGTCATTGTTGATGAGGGTCCCTCTTAAAAATGGAAAGAAACGAGCCTTCAAGTATGCCGTGACTCCCCGGATGCGAACTCTGCCTCCTGAAGCCACAAGTCTTAGCTGGTTGAGCCAAATTTTTGTTGAGTGGCGCGGATCTTTGACTTACACTATTCACGTCCAATCTGGGTCCGCTATTCAACACTCGTATATGCGCATCTGGTATGACCCCAATGGCAAAACTGATGAAAAGGAGGTCAAATTTCTTGACAGCGCGCATCCACCAGCAGGGATCAAAGTGTACCACTGGGACCTCAAAATAGGAGACTGCTTTCGCTTCACTGTCCCATACTGTGCAAGAACAGAGAAATTGCAGATCCCAAAGGCTTATGCGTCAACACCGTACGAGTGGCTCACGATGTACAATGGAGCGGTGACTTTTGATTTGCGCAGTGGTGCCGACATGGAGCTCTTCGTCTCGATCGCTGGAGGAGATGATTTTGAGATGTTTGAACAGACCGTGCCTCCAAAATGTGGTTCAGTGAGCGACTCATACACTGTCCTATCATATGCAGACGATGTTAAGAGCGTGACGGAAGTGCCGAACAAGACCACGTACTTGGCAGATGAGCAACCAACCACCTCGGCACCTCGTACGTCTACTGTGGATACCGACGAGGACCCACCGACTGAGGGAGAGATCGCGAGGACTTCGAATGGAACTCTTGTGCAGTACCGTGGAGGAGCGTGGAAGCCAATGGTGGAACGTGCGCCAACGATGTCGAAGAAGCAAGTGGGTCCAGAGCTTGAGGTGTCAGACCCTCACATGTACAAGTGCATTAAGAATATGAACAAGAATGTGAAGGTTTTGACTGATAGACAGTGCACCGCGAAGTTGGCAGACATAGTGGACTCAGCCCAAGAGCTCGTTGGAAGCAATAGCACTTTTGTCGAGGATTTGGCAGTGGGCGCCAAGCAGATCCGGAAATTTGGAGAGAGCCTAGACGTTTTCGAGGGAAGTATGAGTGCTGCAAAGACCGCTGAGCTAATTGACAACACACATGCGGCTTTCTCTGGACCAGCTGATGGGAGTCCGATCTCAAACGTTGTGCAATTGTTGCTGCCCATGCTTTCCTCAATCAAAGGCATGTCTGGGAAAATGGAGAGCAAGATGGCCTCGCTGACTGCAATGTTCCAACCATGTAAGAAAGCGATTACACATTTAATTGAGAGGTCCTTCCCATATTTGGCATGCAAAGGCTTCAAAACAGACAAGTGGATTTGGGCAGCCCTGGCTTCTATCCTGGTTGGAGCAGCGCTCTTGCATTATTACCGCTCAGACCTCAAATTTGTGAAGAAATGGTCCGTGATGTGCATGATTATTTGGGCCCCACTATTAGCGGAGAAAGCTTATCATCTTGGGACGTGGATTAAGGAAAAATTTCTCAAAAGTCTCCCAAGAACAAGAACGATTAAAGACTCGTGCCGTAAACACTCTTTGGCAGGCGCGTTCGAATGCTTGGCATCAGCCTCTTGTGCTTATATTAAGGATAATTGGGCTAAGACGATGTCGAGTCTTTTAACGATACTAAGTGTAGTAGCGAGTCTTGTTATGTGGGGAAAAATACCAGATGATAAAGAAATCACAAGTTTTGCGGACAAATTCCACAGCATAGGGAAGAAAGGCAGATCTATCACGAACATAATTGGCGGGTTTGAGAAGATAACTTCAGTGTGCAAGAAGTGGAGCGAAACTTTGGTTGGTTGGATCGTGTCAAACGTGAGCGGTGGCATACCAAAGGAGGACTTGGCGATGACTGCGTACCTGGGCTTCAAGATTCATGACTGGGTTAGAGAGACGCGCGATATGGCTCTTATGGAAAATCGCTTTCAGGGCTTTGGTGGAGATGAGCACCTGGTCAGAGTAAGACGGCTTTACGGACACTCACTTAAAATTGATAATGCGCTCATGGAAAAACAAATCGTACCAGACATGCAGCTGAGCCTTATAATCAAAGAATGCCGTCAAAAGTGCCTCGAGCTGATGAATGAGAGTTACACGTATAAGGGAATGAAGCAATCTCGCATCGACCCTTTGCACGTGTGTATGCTTGGCGCACCTGGTGTTGGAAAGTCCACAATTGCTCATGTGGTCATCAACAATTTGCTGGATCATAGAGGAGAGCCGGAAGTCGACAGAATTTACACAAGGTGCTGCGCAGATGCCTATTGGAGCAATTATCATCAAGAGCCAGTTATATTGTACGACGATCTTGGAGCCATCAAGAGCGACTTACGACTTTCAGACTACGCTGAAATCATGGGTATTAAGACCAATGATCCTTTCTCTGTACCCATGGCAGCTGTCGAGGATAAGGGCAAACACTGTACCAGCAAATATGTGTTTTCGTGCACCAATGTTTTGAATCTGGATGACACTGGGGATGTGGTGACGAAAATGGCATACTACAGGCGGCGCAACGTTCTCGTTAAGGTCGAGAGAGACCCTGATGTCCCCAAGAATGAGGCAAACCCCACTGAGGGCCTGGTGTTTACTGTGCTAGGCCATGATCAAAATTGTCAAGGAGATCCTCAATTTGCGGTGAAAGAGAATTGGGATGAACCTTTTCTGCGCGAAGTTGATACTGAAGGGTGGCGTTTTGAGCGCGTTGAATATAGAACGTTTTTAAGGTTCTTGTGCATGCACACAGATGCATACATGTATAGCCAGGAACAAGTGCTTCAGGGAATTAAAACGTTTAAGATGAACCCTTTTGCGCCCGAGCCTGAGTTCGCGCAAGCCCAGAGTGGAGAAGCTGCTGAGTGTGAGATCGTTGAGGAGACGCAGGAAGTGCCAGGGGAGACTCCGCAGGAAGCAAAGGAAATTGCCAAGATTGAGACTGCACCGAATACGGATGAACTAGTAGAGGCCTTCAACAAGCTGAGAGTGACTCCAGGACATCTGAATGAGATTTTGAGAGACGAATCAGGATGCTATATTGACGAGTGGGCAATAGCTGGACCACGGTGGCTGAGCTTTCATGAGTTGTTACCATTTACCTGTGGTTGTCATCATACTAGGGTGTGCGATTTTAATATTGTATACAATAATATGTGTAAAGCTGTTAGGAGCCAGAGTGTACATTTTAAGTATAGGGCTAATCAGGCTATTAAATATGCATATACTCATAAGTTGCATTCGCAGTGTAGATATAGCATAGACTTTGAGAAACTTCGTGAGTGCAATCCCTTGGACGTTTTTGTTTGTGTTTTGTCCAAGTATACGGCAGATGATCATTCTTTTGAGCGACGATGTCCAAAGAAGATGAACGTGGTGAGGATGCAGAGGCCGCCTGTTTTTGAGCTTAAGATGCGGCCCCCGAGCGATAGTGTGGTTGTTGAAGATGATCGAGGTCAGCGTGTTTTTGAGTGGCCCCACTTGTACACATTTCTGCGATATAGGGCCATCGAGTTTAAGGATGATAAAGGCTCCCTGACTGTGAGAGAAGATGCCAGCGCTGACGTGTGCCCGTGGAACGAATTCCTGAAGTTGCCGTGGCTTGATGGTGACCAACTTAAATCTGTATTGCCAGCACATTTACATCGGATGGTGCAAGCGCGCTTGGAACAGGTGGAAATAATGGAGGAGAATGGAAATTACAGTGGAGAAATGAAGAATGCGATTGCTGAGATCAAAGAGTACTTAGACCAGGACCACCAGTGGGTTGCTGCATTGGTTTTAGTGGCATGTGCTGTGAAAGAACGACGAAGAATGACGCATGATAAGTTACATCGGAAAAGTTTCAACGCTCTGGATAAATTGGACAAATGGTATACTACAACTGCGCCTAAAACTTCGAAGAAGATGAAAATTCTACTGGCCATTGGTGCAAGCGTTGCAGTAGCTGGAGTTGCTGTTGGAGCCGTGATTTTACTGCAGAAGACTAATTTGTTTGGCTCTAAAGAGGATGAGGAGATTGAAGGAGAAGAAGGTGAAACACAGGCTAGTGGAGCACATGAATCAGACGGAATAGTGACACAGCACCTCAAAAGAGATATTCGGCCAAAAATGAGGGTGACTTACACAGACCATCATGTCGCTGAGGCACATGAGGAGAAAGGCGCCGAGAAGTCGCGTAAGCCTGGCAATCCAGCTAGAAAGAGCTATTTAGGCTTGTCGCCAGGCTTTGCTGAGAGAGGAATGGGCGTTACATATGAAGAGCATACACCTTTAAAAGATGCACTACTTGATGAAAGCAACAAGGTGTTTAGGCGCAAAATTGTGGCTTCAGTGGAAAGTGCTGTGAAGCAGGGCGGCAAGGCCTCAAAGGATTCTGTGTTGTCACAAATAAGTGAATGGCAAGATAAGGTTAGGGCCACTGGAGTGATAGCAGCAAGACAGTTGGAAGCGAGCGGAAGCTTGAAGAAAATTCACAATCTTAACTCCAGGAGAACCAGTAGTCATGTCATGCCAGGGCTCGTTGTTCATGATGGTACGTTCGAAAGATCTGATGAAGTAGATGCCGAGTTGCACCGCATAACGATTGATGAAGTGAAGTCCTGTCCAAAAATGATCAAGGAAGGGGTTTCTACCCTATCAGTGAAAAAAGCGTCGGTTGGCATGCTAGCACTCCAGAAAGCTGAATCGCAGTTGTCCTTTCCGTTCACATCACGTGCCGGGGTTGATAGAGATTTAAGCATGACCAATTTGATTGATACTCACATGGCAGGAATGAGCTGTATTATTATAAGTGAACTGGGCAACGTGTTTAGGACCTTTGGTGTGTTGCGCCTGTGTGGTACTTACGTATGCATGCCTGCACACTATTTGGACGAAATTACGAGTGAACACACATTGTACTTCGTGTGCCCAAGCAAGATCACACAGATTCAGTTGGAACGACATCGAGTATGCCTGGTGAATGGATTTCAAGAAACAGTGGTGTGGGATCTTGGACCTTCAGTGCTACCCAGTCGCAATTATATTGACTTTATCGCGAATGCTGACGACTGGAAGAATTACAAGGCAACAAGTGGAGCGCTAGTCATGTCAAAATATTCAGTGGATAGTATGCTTCAGTGTGTGCATTTCTTGGACAGTATTGAATTGACAGAGGCAAACGTTTCAGTGCCCACTAGTTACTACGAGGCAAATGGAGGAATACACACCATTATTTCTGGTCTGAGATATAGAGTTCACTGTATGCCAGGATTTTGTGGAGCTGCCATTATGAGAGCTGATGCGACCTGTTTCAGGAAAATAATTGGAATGCACGTCAGTGGGCTACGCAACAAATGTATGGGATATGCCGAAACATTGACTCAGGAACACTTAATGCAGGCCATTGAAACATTGAAGAAGACAGGTCTAATGAAGCACATACCGAGAGGTGCGATTGGAGCGGGTGAGGAAAAACTTCCAGAGCATTCTAAGAAACAAAGTTTATCGCTCGATGGAAAAGGCAACCTTGGAATTGTTGGCCAGTTACCAGCGCAATTGGTGCCCACTTCTGTTACCAAGACAACGATTTGCAAGAGCATGATCCATGGATTGATAGGTGAGATTAAAACAGAGCCCTCGGTTCTCTCAGCCTGGGACAGACGCTTACCATTTCCACCTGGCGAGTGGGACCCAATGAAAGATGCGGTTAAGAAGTATGGTTCCTACATTTTGCCATTTCCAACAGAAGAGATTCAAGAAGTGGAAAACTTTCTCATAAAGAAATTCAAGCGGAAAGAAAATTCAAGAAGAACACGAAATGTGAATTCATTGGAAGTTGGCATTAACGGTATCGATGGCTCAGATTTCTGGTCTCCGATAGAGATGAAAACGTCACCAGGATATCCTTACATTTTGAAAAGACCAAGTGGCGCACAGGGCAAGAAGTATCTATTTGAGGAGTTAGAACCGTATCCGTCAGGACGGCCCAAATATGCCATGAAGGACCCGGAGCTGATCGAGAGCTACGAGCGAATCAAAGAGGAAGTGACGAGTGGTGTAAAACCCAGTATCATGACAATGGAGTGCCTCAAGGATGAAAGGAGAAAACTGGCAAAAATTTACGAGAAACCAGCAACCCGCACATTCACTATTTTGTCCCCTGAAGTTAACATTCTGTTCAGGCAATATTTTGGGGATTTTGCAGCCATGGTGATGAGCACGCGACGAGAGCACTTCTCTCAGGTTGGGATCAACCCAGAAAGTATGGAGTGGTCTGATTTGATAAATTCTCTGTTGAGAGTCAACACTAAAGGATTTGCTGGTGATTATTCAAAATTTGATGGCATTGGATCGCCAGCCATTTACCACTCCATAGTTAACGTTGTGGACGCTTGGTACGATGATGGAGAGGTTAATGCAAGAGCACGCCATAGTTTGATATCCTCGATAGTACATCGGGATGGAATCTGTGGTGATTTGATACTGAGATACTCACAAGGGATGCCTTCTGGTTTTGCGATGACGGTTATTTTTAATTCCTTTGTGAACTATTACTTTATGGCTCTAGCATGGATGAGCACAGTTGGGTCGAGTCTCTTGAGTCCACAAGGCAGCTGTAAAGATTTTGACACTTATTGTAAAATTGTCGCATACGGGGATGATAATGTTGTGTCTGTTCATGAGGAATTTCTCGATGTGTACAATTTGCAAACAGTTGCTGCTTATCTCAGTCATTTTGGGGTTACATACACAGATGGAGACAAGAACCCAATACACATGAGTAAGCCATATGAGGATATCACCAAGATGAGTTTCTTGAAACGAGGCTTTGAAAGGGTTGAGTCTTCTGGATTTTTATGGAAAGCTCCTCTGGACAAGACGAGTATAGAAGAGCGATTGAATTGGATTCGAGATTGCCCTACGCCTGTGGAAGCGTTGGAACAGAATATTGAGAGCGCGCTACATGAGGCTGCCATTCATGGCAGAGATTATTTTGATGATTTAGTGCAACGCTTGAATAGTGCGTTGAAAAGAGTGATGCTCCCTCCAACAGATATTACATTTGAGGAGTGTCAAGCTCGATGGTGGGCGAGTGTGACTGGTGATGCTCTAAGAGCAGCCGATTACACCTCGCTTGTCAAGCGAGCAAGTTCTGGACATGTGGAATTTAATAAGAAGTATCGAGACATGTTCAGACAACAAGATTTGCCGCTTAAGGAAATATTGATAAAATCGAAACCAGTGGCACTTCTTGACCTGGAGGTGTAATTAGTACGCCTCCTCACACGGGCGAAGAAAAAGTCCATGAGAATGTATCACACTAGTTTAAATCGGTTGCGTGATTTCAAAGATGACGAGCTGTAAAGTGGTGGTGTAACAAGTCTTAGTAAGGAAGAAGACTGGAGAAGTATAAGTCGGCACTCGAGTGTCCCTTATTGGGACCGGAGTGATGCTGGGGGATATTGCGCTTTAAACGCAGCGTGAGCGAACCCACCGCAGCTGAAAGGTCTACCCTGAACAGGTTGAATCCACACACAACAGCAGACATCATCCGCGAATGTGGCCAACACGCAATTTGATTTTAGGCTAGTGATGAACTCTTCGGGACCGAGTACTGTACCTCATTAGAGGAGCCGGGGGCAACCCTTGCCGTGCATCGACACGGCACACAAACCTTGACACAGGTTTTAAAATATAGGTCAGTCTATGCCGGACTTGAATGGCACTGTTATTTGGTAACGTATATATTGTCAAACCAATAAACACTCCTGATGGAGAGGTTCCATCACCCTTCACCCGTGTATATTGTCAGGGTGTCGTATGTGTACATAATAAGTTTTATTATTTTTCTTGTTGTGTCTGATCCAAGTTATAGTAAGGATACCATTCTTGTGCTAAGATGGGAAGTAACGCTTGGCTGTGAATTAGTGGCAGAGTGGAGACTCTTAGAGTCACTCACCATGATTGAAATTCACGGGCATGAGAGTCACCCTATGCATGTGAGTGGCGGACTAAGCTAGGCTTTGGGGTAATAACTTTCCCAATCGGGGTTGTGCTCGTAGATGATTCGTTTTGTCAACGGGCCCCCTTATTGTGACGGTGCTTACCCAGGTACTTTCACCAGTTTCATTCCTTAACCGGACTTCTGGGAGAGGCCGTGCCCAAAGCACTTGCTACAACTTGTTTCAACCCGTGGTCACGGACACTTGACCCGTCTTTCGAGAGATGGAAGGCGCCCTCTTTGGGGTTTTTCTCTTTGTGTTGTAAAGTACAGAGAAGTTATTGAAGACCCCTCGGGGTTTAAAATAATTTCTAGCTAACGTATATATATAGTGATGATATATGTTATGTGAAAATGTTGTGATCGTTATCCTATACGGCACACCCAGTCTTGTAAAGCTGGGACCCACATCACACTTCAGGAAGTTGAAACCAATGACGATGGTGGCACAATGCCGACCGGTTGGTACTTACCTACTGTGTATCTCAAGTGTGTGGGGTAATAGAGTAC
| 108,216
|
AM234049.1
|
Rice tungro spherical virus
|
Verma,V., Dasgupta,I., Tandon,V.
|
Tandon V., Department of Plant Molecular Biology, University of Delhi, South Campus, UDSC, Benito Juarez Road, New Delhi
|
India
|
2006-05-02
| null |
Waikavirus oryzae
|
Waikavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 12,174
|
GenBank
| 1
|
India:West Bengal
|
India
|
Oryza sativa
| null | null | null | null |
Rice tungro spherical virus complete genome, West Bengal isolate
|
TGAAAATTGGGGTATAGAGATACCCCAAATCAATTGCCTTATGGCCGCTTGCGAGTAGTCGCCATATAGGTGTTGCCGAAACATGTGAAAGGATTCACAAACTACTCATCCATTGAGGATTGATGAACATCTCATGATTTTCTGATTCGTGTCTGACGTAGCACAGAACACTTAGTATGCACACAGGGCTTCCCTGTCCCTCTGCTAAGTTAGTAATGTGAAATCAGTTTGCCGTGCACACTGGGCTTCCTGGTCCCTCCGGCTATTCAAACACTTAGATGAAATAGTGAGTTTGCCATGCACACTGGGCTTCCTGGTCCCTCTGGCTTTAAAATTGTTCAGATATCCAATTTGGTTGTGGTGTATTCCAGTTTATCTGGTTTCCCACTTGGCTGAGTGAGTAGTTGAGCTAGCAATACATTCCGGACGGGCGGATACTATTGTTAGTGTGTCTCCGAGTAGCGTGTGTAGGCGCACCTAGTTTCTTACGCATAAGAATTCCGTTTGCATCAGCAATGCAGAGCTTTCTTCTTTCGTCTAAAAATCAAGCGAAGTTGTTACACGCTGGTTTAGAGTTTGTTGGAGGTGTCCGGTGTGCTCACCAGGGCTGGGTTAGTGGTAAGGCGGTTGTATTTTGTAACTATTGTAATTTTGCACATAGATTGTATAGGTTTTATACTAAGAATCATTGTGTTTTAAATAAGGAAACTATTGAAAATCTTTGTGGAAGGTCTTTTGTGTCATTGTATAGAGCAGGCCTTTTGTTAGACGATTTTACGATCGACGATTTGCTTGGCAAAGGGAAATATGCAAAGGGTTCTATTGATAATCTGTCTATCCCTTTCGATGATTGCGCTCTTTGTCCTAATGCTGGCACTCGTCTTTCGCAAACCGGTGTTAGTCATGATCACTTTGTGTGTAATTATGTTGAGCATCTTTTTGAATGTGCTAGCTTTAGTCGTGAAACCGGAGGAAAATTTTTCCGAGCTTGTAGCGAGGGTTGGCACTGGAACGCCACTTGCACGACTTGCGGAGCGTCGTGTAGATTTGCCAACCCGCGGGAGAATATAGTCATAGCGATTTTTATGAATTTTCTTCGAGTGATGTATGATGGTAATAAGTATTATGTATCTTTACATTGTGATACTGAGTGGATTCCCGTGCACCCTCTTTTTGCACGATTGGTTTTAATGGTTCGTGGATTTGCGCCATTGGATAATAGCCATGTAATTGAGGAAGATGAGATGGATATATGTGGTCATCCGTCCGAGGTTACATATGATGACCCATCAAATTACGCCTTCACGCATCAACATGTTACGCGTGGAGTGGGCATGGGCCACTTGGCATTTTGCAGGGATGCCAACGGGGTGGACAGAGGCGAGCACAAGTTTTATCTGCATGGGCCCTTTGACCTTAAAATGACGCATGCCATGTTTAGAGTGTTCATGATTTTGCTCAATTGCCATGGATATGTCCAGTCCGAGTTTCGAGAGGAGCACCCTGCAGTTAAGGACCGCTCTTTGTGCGCATTGTTGTCAGTCGCTGGTCTGCGAGGAGTTAATATAGCCTGCAACGAGGAGTTTATTCATTTGCACTCGCAGTTTCACAATGGCTCTTTTAGATCCCAGCGGCCAATTCCAATGGTGTATGCTGAACCAGAGATGTACCCGCCACTGGAATATGTGCGCCTCACTGAAAGCTGGGTACCGCGGGGCCGTGTAATGATTGACGATTTGCCATCGCTCATGAGTAGGGTGTATGCTGAGAGTTCCCAACCGCATGCAGGTGAAATATACGAGGAAGTGTTTGATGAGGATGACTTGTTTGAGCTTGGAGATGATGAGGGCACAAGCACGCGTGGTCTCCTGGACCTTGGAAGGAGACTTGGTGGTTTGTTGTTGGGCGCTACAAAATGCGTGAAAGGGTTGCATGCTGTGATTGAGTGGCCAGTTGATGTGCTGACGAAGGAGGCCGAGGATCTTGGAACGTGGCTTGCCGATAATAAGAAATATGTCAGTGAGTCGACTTGGAGCTGCCAGGTGTGTCCTGAGGTGCAAGATGCTTTGGAGAAATCAATGCGGGAGCAGGCAAAATTGAATGCCCAAATGATTGGCGGCATCAAGAAGCTGGCCACAACCATGGATTCGGCCACGTCAAAGTTGAGAGATAGCCTCAAAGAATTGGAACGGAGAATTAGTGTGCTGGAACAAGGCGTGGACGAGACACAGCAGGCACGCATTACCAATTTGGAGAACTTTTGTGAGGATGCGGCCAAGGCTTTTGAAGTATTGCGCGCTGATATTGATGCCCTTAAGAAGAAACCAGCGCAGAGTGTGACACCACTGCCATCGCCTTCCGGGAATTCAGGTACGGCCGGAGAACAGCGCCCTCCTCCAAGACGGAGGCCTCCTGTAGTTGAGATGTCTGAGGCACAAGCTGGTGAGACAGTCATTGTGGGCGGCGATGAGGAGCAAGAGGCCCATCGGGATAGTAGCGTTGCAGCATCTGGACCCACCGATGAACATAACGCTATGCTGCAAAAGATTTACCTTGGCTCCTTTAAATGGAAGGTATCGGATGGAGGGGGTTCAATTCTTAAAACCTTTTCCCTTCCATCAGACATATGGGCTGCCAATGACAGGATGAAAAATTTCCTCAGCTACTTTCAGTACTACACTTGTGAGGGAATGACATTCACGCTCACGATTACTAGCATTGGTTTACATGGAGGAACATTACTTGTAGCCTGGGATGCCTTGAGTAGCGCGACACGAAGAGGAATCGTTTCGATGATACAGCTGAGCAACCTCCCCTCAATGACGCTGCATGCAAGTGGGAGCTCCATTGGCACTTTGACTGTGACTTCTCCAGCAATTCAACACCAGATCTGCACGTCAGGAAGTGAAGGCTCTATAGCAAATTTGGGCTCTCTTGTGATCTCCGTTGCGAACGTGCTGTGTGCCGATTCAGCTTCAGCCCAAGAACTTAATGTTAATGCTTGGGTGCAGTTTGACAAGCCCAAGCTTAGTTATTGGACGGCACAACATTCGATTGCACAGAGCGGAGGCTTCGAGGAATCGCAGGATTTGGGTGATTTACAGGCCATAATCGCCACTGGGAAATGGTCCACAACGAGTGATAAGAATTTGATGGAGATTATTGTTCACCCCACTGCGTGCTACGTGTCGGAAAAACTGATATACCAGACCAATTTGAGCGTTGTGGCCCACATGTTTGCCAAATGGTCTGGATCAATGAAGTACACGTTTGTTTTTGGAGCTTCGCTGTTTGACAGGGGAAAGATAATGGTGAGCGCTGTTCCAGTGCAGTTCAGAAATTCAAAGCTCACACTATCACAAATGGCAGCGTTTCCCTCGATGGTGTGCGATCTGAGCGTGGATACACGGGAGTTTACATTTGAGGTGCCATACATTTCTATCGGCAAAATGAGTTTGGTTTGTAAAGATTATCTTTTTGACATTTCTTCCTACAATGCCGATTTGGTAGTGAGCCGTTTGCATGTGATGATCCTGGATCCCTTGGTGAAGACTGGAAATGCGTCCAATTCGATAGGCTTTTATGTAGTTGCTGGGCCTGGCAGAGATTTCAAATTGCACCAAATGTGCGGGGTCAAGAGCCAATTCGCTCATGATGTGCTGACCGCACAAGATTTTGGGAGAAGCCTAACGTGTTCGCGTCTTCTTGGCAAGGGATTTAAAGAATGGTGCTCCCGAGAGTCGTTGTTGATGAGAGTCCCTCTTAAAAATGGAAAGAAACGAGCCTTCAAGTATGCCGTGACTCCCCGGATGCGAACACTGCCTCCTGAAGCCACAAGCCTTAGCTGGTTGAGCCAAATTTTTGTTGAGTGGCGCGGATCTCTGACTTATACTATTCATGTCCAATCTGGATCCGCTATTCAACACTCGTACATGCGCATCTGGTATGACCCCAATGGAAAAACTGATGAAAAGGAGGTCAAATTTCTTGACAGCGCGCATCCACCAGCAGGGATCAAAGTGTACCACTGGGACCTCAAAATAGGAGACTGCTTTCGCTTCACCGTCCCATACTGTGCAAGAACAGAGAAATTGCAGATCCCAAAGGCTTATGCGTCAACACCGTACGAGTGGCTCACGATGTACAATGGAGCGGTGACTTTTGATTCGCGCAGTGGTGCCGACATGGAGCTCTTCGTCTCGATCGCTGGAGGAGATGATTTTGAGATGTTTGAACAGACCGTGCCTCCAAAATGTGGTTCAGTGAGCGACTCATACACTGTCCTATCATACGCAGACGATGTTAAGAGCGTGACGGAAGTGCCGAACAAGACCACGTATTTGGCGGATGAGCAACCAACAACCTCGGCACCTCGTATGTCTACTGTGGATACCGACGAGGACCCACCGACCGAGGGAGAGATCGCGAGGACTTCAAATGGAACTCTTGTGCAGTACCGTGGAGGAGCGTGGAAGCCAATGGTGGAACGTGCGCCAACGATGTCGAAGAAGCAAGTGGGTCCGGAGCTTGAGGTGTCAGACCCTCACATGTACAAGTGCATTAAGAATATGAACAAGAATGTGAAGGTTTTGACTGATAGACAGTGCACCGCGAAGTTGGCAGACATAGTGGACTCAGCCCAGGAGCTTGTTGGAAGCAATAGCACTTTTGTCGAGGATTTGGCTGTGGGCGCCAAACAAATTCGCAAATTTGGAGAGAGCCTAGATGTTTTCGAGGGAAGTATGAGTGCTGCAAAGACTGCTGAGCTAATTGACAACACGCATGCAGCTTTCTCTGGGCCAGCTGATGGGAGTCCGATCTCAAACGTTGTGCAATTGTTGCTGCCCATGCTCTCCTCAATCAAAGGTATGTCTGGGAAAATGGAGAGCAAGATGGCCTCGCTGACTGCAATGTTCCAACCATGTAAGAAAGCGATTACACATTTAATTGAGAGGTCCTTCCCATACTTGGCATGCAAAGGCTTCAAAACAGACAAGTGGATTTGGGCAGCCTTGGCTTCTATTCTGGTTGGAGCAGCACTCTTGCATTATTACCGCTCAGACCTCAAATTTGTGAAGAAATGGTCCGTGATGTGTATGATTATTTGGGCCCCACTATTAGCGGAGAAAGCTTATCATCTTGGGACGTGGATTAAGGAAAAATTTCTCAAAAGTCTCCCAAGAACAAGAACGATCAAAGACTCGTGCCGTAAACACTCTTTGGCAGGCGCGTTCGAATGCTTGGCATCAGCCTCTTGTGCTTATATTAAGGATAATTGGGCTAAGACGATGTCGAGTCTTTTAACGATACTAAGTGTAGTAGCGAGTCTTGTTATGTGGGGGAAGATACCAGATGATAAAGAAATCACAAACTTTGCGGACAAATTCCACAGCATAGGGAAGAAAGGCAGATCTATCACAAACATAATTGGCGGGTTTGAGAAGATAACTTCAGTGTGCAAGAAGTGGAGCGAAACTCTGGTTGGCTGGATTGTGTCAAACGTGAGCGGTAGCATACCAAAGGAGGACCTGGCGATGACTGCGTACTTGGGCTTCAAGATTCACGATTGGGTCAGAGAGACGCGCGATATGGCTCTTATGGAAAATCGCTTTCAGGGCTTTGGAGGAGATGAGCATCTGGTTAGAGTAAGACGGCTTTATGGACACTCACTTAAAATTGATAATGCGCTCATGGAAAAACAAATTGTACCAGACATGCAGTTGAGCCTTATAATCAAAGAATGCCGTCAAAAGTGCCTCGAGCTGATGAATGAGAGTTACACGTATAAAGGAATGAAGCAATCTCGCATCGACCCTCTGCATGTGTGTATGCTTGGCGCGCCTGGTGTTGGAAAATCCACGATCGCCCACGTGGTCATCAACAATTTGCTGGATCATAGAGGAGAGCCAGAAGTCGACAGAATCTACACAAGGTGCTGTGCAGACGCCTATTGGAGCAATTATCATCAAGAGCCAGTTATACTGTATGACGATCTTGGCGCTATTAAGAGCAACTTACGACTTTCGGACTATGCCGAGATCATGGGTATTAAAACTAATGATCCTTTCTCTGTACCCATGGCAGCTGTCGAGGACAAGGGCAAACACTGTACCAGCAAATACGTGTTTTCGTGCACCAATGTTCTGAATCTGGACGACACTGGGGATGTGGTGACTAAAATGGCATACTACAGGCGGCGCAATGTTCTCGTTAAGGTTGAGAGAGATCCTGATGTCCCTAAGAACGAGGCTAATCCTACTGAGGGCCTGGTGTTTACTGTGCTAGGCCATGATCAAAATTGTCAAGGAGATCCTCAATTTGTAGTGAAAGAGAATTGGGACGAGCCTTTTCTGCGCGAGGTTGATACTGAAGGGTGGCGATTTGAGCGCGTTGAATATAGAACGTTCTTAAGGTTCTTGTGCATGTACACAGATGCATACATGTACAGCCAGGAACAAGTGCTTCAGGGAATTAAAACGTTCAAGATGAACCCTTTTGCGCCCGAGCCTGAGTTCGCGCAAGCCCAGAGTGGAGAGGCTGCTGAGTGTGAGATCGTTGAGGAGACGCAGGAAGTGCCAGGGGAGGCTCCGCAGGAAGCGAAGGGAATTGCCAAGATTGAGACTGCACCGAATATGGATGAACTAGTAGAGGCCTTCAACAAGCTGAGAGTGACTCCAGGACATCTGAATGAGATCTTGAGAGATGGATCGGGATGCTACATTGACGAGTGGGCAATAGCTGGACCACGGTGGCTGAGCTTCCATGAGTTGTTACCATTTACCTGTGGTTGTCATCATACTAGGGTGTGTGATTTTAACATTGTATACAATAATATGTGTAAAGCTGTTAGGAACCAGAGTGTACATTTTAAGTATAGGGCTAATCAGGCTATTAAATATGCATATACTCATAAGTTGCATTCACAGTGTAGATATAGTATAGATTTTGAGAAACTTCGTGAGTGTAATCCCTTGGACGTTTTTGTTTGTGTTTTGTCCAAGTATACGGCAGATGATCATTCTTTTGAGCGACGATGTCCAAAGAAGATGAATGTGGTGAGGATGCAAAGGCCGCCTGTTTTTGAGCTTAAGATGCGGCCCCCGAGCGATAGTGTGGTTGCTGAAGATGATCGAGGTCAGCGTGTTTTTGAGTGGCCCCACCTGTACACATTTTTGCGATATAGGGCCATCGAGTTTAAGGATGACAAAGGCTCCCTGACTGTGAGAGAAGATGCCAGCGCTGACGTGTGCCCGTGGAACGAATTCTTGAAGTTGCCGTGGCTTGATGGTGACCAACTTAAATCTGTATTGCCAGCACATTTACATCGGATGGTACAAGCGCGCTTGGAACAGGTGGAGATAATGGAGGAGAACGGAAATTACAGCGGAGAAATGAAGAACGCGATTGCTGAGATAAAAGAGTATTTGGATCAGGATCACCAGTGGGTTGCTGCATTGGTTTTGGTAGCATGTGCTGTGAAAGAACGACGGAGAATGACGCATGATAAGTTACATCGGAAAAGTTTCAACGCTCTGGATAAACTGGACAAATGGTATACTACAACTGCGCCTAAAACTTCGAAGAAGATGAAAATTCTACTGGCCATTGGTGCAAGCGTTGCAGTAGCTGGAGTTGCTGTTGGAGCCGTGATTTTACTGCAGAAGACTAATTTGTTTGGCTCTAAAGAGGATGAGGAGATTGAAGGAGAAGAAGGTGAGACACAGGCCAGTGGAGCACATGAATCAGACGGAATTGTGACACAGCACCTCAAAAGAGATATTCGGCCAAAAATGAGGGTGACTTACACAGACCATCATGTTGCTGAGGCACATGAGGAGAAAGGCGCCGAAAAGTCACGTAAGCCTGGCAATCCAGCTAGAAAGAGCTATTTAGGCTTGTCGCCAGGCTTCGCTGAAAGAGGAATGGGCGTTACATATGAAGAGCACACACCTTTAAAAGATGCACTACTTGATGAAAGCAACAAGGTGTTTAGGCGCAAAATTGTGGCTTCAGTGGAAAGTGCTGTGAAACAGGGCGGCAAGGCCTCAAAGGATTCTGTGTTGTCACAAATAAGTGAATGGCAAGATAAGGTTAAGGCCACTGGAGTAATAGCAGCAAGACAGTTGGAAGCGAGCGGAAGCTTGAAGAAAATTCACAATCTTAACTCCAGGAGAACCAGTAGTCATGTCATGCCAGGGCTCGTCGTTCATGATGGTACGTTTGAAAGATCTGATGAAGTAGATGCCGAGTTGCACCGCATAACTATTGATGAAGTGAAGTCCTGTCCGAAAATGATCAAGGAAGGGGTTTCTACCCTATCAGTGAAGAAAGCGTCGGTTGGCATGCTAGCTCTCCAGAAAGCTGAATCGCAGTTGTCCTTTCCGTTCACATCACGTGCCGGGGTTGATAGAGATTTAAGCATGACCAATTTGATTGATACTCACATGGCAGGAATGAGCTGTATTATCATAAGTGAACTGGGCAACGTATTTAGGACCTTTGGTGTGTTGCGTCTGTGTGGTACTTACGTATGCATGCCTGCACACTATTTGGACGAAATTACGAGTGAACACACATTGTACTTCGTGTGCCCTAGCAAGATCACACAGATTCAATTGGAACGACATCGGGTATGCTTGGTGAATGGATTTCAAGAAACAGTGGTGTGGGATCTTGGACCTTCAGTGCCACCCAGTCGCAATTATATTGACTTTATCGCGAATGCTGACGACTGGAAGAATTACAAGGCAACAAGTGGAGCGCTTGTCATGTCAAAATATTCGGTGGATAGTATGCTTCAGTGTGTGCATTTCTTGGACAGTATTGAATTGACAGAGGCAAATGTTTCAGTGCCCACTAGTTACTATGAGGCAAATGGAGGAATACACACCATTATTTCTGGTCTGAGATATAGAGTTCACTGTATGCCAGGATTTTGTGGAGCTGCCATCATGAGAGCTGATGCGACCTGTTTCAGGAAGATAATTGGAATGCACGTCAGTGGGCTACGCAACAAATGTATGGGATATGCTGAAACATTGACTCAGGAACACTTAATGCAGGCCATTGAAACATTGAAGAAGACAGGTCTAATGAAGCACATACCGAGAGGTGCGATTGGAGCGGGTGAGGAAAAACTTCCAGAGCATTCTAAGAAACAAAGTTTATCGCTCGATGGAAAAGGCAACCTTGGAATTGTTGGCCAGTTACCAGCGCAATTGGTGCCCACTTCTGTTACCAAGACAACGATTTGCAAGAGCATGATCCATGGATTGATAGGTGAGATTAAAACAGAGCCCTCGGTTCTCTCAGCCTGGGACAGACGATTACCATTTCCACCTGGCGAGTGGGACCCAATGAAAGATGCGGTTAAGAAGTATGGTTCCTACATTTTGCCATTTCCAACAGAAGAGATTCAAGAAGTGGAAAACTTCCTCATAAAGAAATTCAAGCGGAAAGAAAATTCAAGAAGAACACGAAATGTGAATTCATTGGAAGTTGGCATTAACGGCATCGATGGCTCAGATTTCTGGTCTCCGATAGAGATGAAAACGTCACCAGGATATCCATACATTTTGAAAAGACCAAGTGGCGCACAGGGCAAGAAGTATCTATTTGAGGAGTTGGAACCATATCCGTCAGGACGGCCCAAATATGCCATGAAGGACCCGGAGCTGATCGAGAGTTACGAGCGAATCAAAGAGGAAGTGACAAGTGGTGTAAAACCCAGTATCATGACAATGGAGTGCCTCAAGGACGAAAGGAGAAAACTGGCAAAAATTTACGAGAAACCAGCAACCCGCACATTCACTATTTTGTCCCCTGAAGTTAACATTCTGTTCAGGCAATATTTTGGGGATTTTGCAGCCATGGTGATGAGCACGCGACGAGAGCACTTCTCTCAGGTTGGGATCAACCCAGAAAGCATGGAGTGGTCTGATTTGATAAATTCTCTGTTGAGAGTCAATACTAAAGGATTTGCTGGTGATTATTCAAAATTTGATGGCATTGGATCGCCAGCCATTTACCACTCCATAGTTAACGTTGTGGACGCTTGGTACGATGATGGAGAGGTTAACGCAAGAGCACGCCATAGTCTGATATCCTCGATAGTACATCGGGATGGAATCTGTGGTGATTTGATACTGAGATACTCACAAGGGATGCCTTCCGGTTTTGCGATGACGGTTATTTTTAATTCCTTTGTGAACTATTACTTTATGGCTCTAGCATGGATGAGCACAGTTGGGTCGAGTCTCTTGAGTCCACAAGGCAGCTGTAAAGATTTTGACACTTATTGTAAGATTGTCGCATACGGGGATGATAATGTTGTGTCTGTTCATGAGGAATTTCTCGATGTATACAATTTGCAAACAGTTGCTGCTTATCTCAGTCATTTTGGGGTTACATATACAGATGGAGACAAGAACCCAATACACATGAGTAAGCCATATGAGGATATCACCAAGATGAGTTTCTTGAAACGAGGCTTTGAAAGGGTTGAGTCTTCTGGATTTTTATGGAAAGCTCCTCTGGACAAGACGAGTATAGAAGAGCGATTGAATTGGATTCGAGATTGCCCTACACCTGTGGAAGCGTTGGAACAGAATATTGAGAGCGCGCTACATGAGGCTGCCATTCATGGCAGAGATTATTTTGATGATTTAGTGCAACGCTTAAATAGTGCGTTGAGAAGAGTGATGCTCCCTCCAACAGATATTACATTTGAGGAGTGTCAAGCTCGATGGTGGGCGAGTGTGACTGGTGATGCTCTAAGAGCAGCCGATTACACCTCGCTTGTCAAGCGAGCAAGTTCTGGACATGTGGAGTTTAATAAGAAGTATCGAGACATGTTCAGACAACAAGATTTGCCGCTTAAGGAAATATTGATAAAATCGAAACCAGTGGCACTTCTTGACTTGGAGGTGTAATTATTACGCCTCCTCACACGGGCAAAGGAAAAGTCCATGAGAATGTATCACACTAGTTTAAATCGGTTGCGTGATTTCAAAGATGACGAGCTGTAAAGTGGTGGTGTAACAAGTCTTAGTAAGGAAGAAGACTGGAGAAGTATAAGTCGGCACTCGAGTGTCCCTTATTGGGACCGGAGTGATGCTGGGGGATATTGCGCTTTAAACGCAGCGTGAGCGAACCCACCGCAGCTGAAAGGTCTACCCTGAACAGGTTGAATCCACACACAACAGCAGACATCATCCGCGAATGTGGCCAACACGCAATTTGATTTTAGGCTAGTGATGAACTCTTCGGGACTGAGTACTGTACCTCAATAGAGGAGCCGGGGGCAACCCTTGCCGTGCATGGACACGGCACACAAACCTTGACACAGGTTTTAAAACATAGGTCAGTCTATGCCGGACTTGAATGGCACTGTTATTTGGTAACGTATATATTGTCAAACCAATAAACACTCCTGATGGAGAGGTTCCATCACCCTTCACCCATGTATATTGTCAGGGTGTCGTATGTGTACATAACAAGTTTTACTATTTTTCTTGTTGTGTCTGATCCAAGTTATAGTAAGGATACCATTCTTGTGCTAAGATGGGAAGTAACGCTTGGCTGTGAATTAGTGGCAGAGTGGAGACTCTTAGAGTCACTCACCATGATTGAAATTCACGGGCATGAGAGTCACCCTATGTATGAAAGTGGCGGACTAAGCTAGGCTTTGGGGTAATAACTTTCCCAATCGGGGTTGTGCTCGTAGATGATTCGATTTGTCAACGGGCCCCCTTATTGTGACGGTGCTTACCCAGGCACTTTCACCAGTTTCATTCCTTAACCGGACTTCTGGGAGAGGCCGTGCCCAAAGCACTTGCTACAACTTGTTTCAACCCGTGGTCACGGACACTTGACCCGTCTTTCGAGAGATGGAAGGCGCCCTCTTTGGGGTTTTTCTCTTTGTGTTGTAAAGTACAGAGAAGTTATTGAAGACCCCTCGGGGTTTAAAATAATTTCTAGCTAACATATATATATAGTGATGATATATGTTATGTGAAAATGTTGTGATCGTTATCCTATACGGCACACCCAGTCTTGTAAAGCTGGGACCCACATCACACATCAGGAAGTTGAAACCAATGACGATGGTGGCACAATGCCAACCGGTTGGTACTTACCTACTGTGTATCTCAAGTGTGTGGGGTAATAGAGTAC
| 108,217
|
AB064963.1
|
Rice tungro spherical virus
|
Isogai,M., Cabauatan,P.Q., Masuta,C., Uyeda,I., Azzam,O.
|
Masamiti Isogai, Iwate University, Plant Pathology Laboratory, Faculty of Agriculture; Ueda 3-chome, Morioka, Iwate 020-8550
|
Japan
|
2001-07-07
| null |
Waikavirus oryzae
|
Waikavirus
|
Secoviridae
|
ssRNA(+)
| 12,171
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Rice tungro spherical virus genomic RNA, complete genome, strain:Vt6
|
TGAAAATTGGGGTATAGAGATACCCCAAATCAATTGCCTTATGGCCGCTTGCGAGTAGTCGCCATATAGGTGTTGCCAAAACATGTGAAAGGGTTCACAAACCACTCATCCATTGAGGATTGATGAGCATCTCATGATTTTCCGATTCGTGTCTGACGTAGCACAGAACACTTAGTATGCACACAGGGCTTCCCTGTCCCTCTGCTAAGTTAGTAATGTGAAATCAGTTTGCCGTGCACACTGGGCTTCCTGGTCCCTCCGGCTATTCAAACACTTAGACGAAATAGTGAGTTTGCCATGCACACTGGGCTTCCTGGTCTCTCTGGCTTTAAAATTGTTCAGATATCTGATTTGGTTGTGGTGTATTCCAGTTTTCTGGTTTCCCACTTGGTTGAGTGAGTGGTTGAGCTAGCAGAAAATATTCCGGTGGGGCGGATAAAACTGTTAGTGTGTCTCCGAGTAGCGTGTGTAGGCGCACCTAGTTTCTTACGCATAAGAATTCCGTTTGCATCAGCAATGCAGAGCTTTCTTCTTTCGTCTAAAAATCAAGCGAAGTTGTTACACGCTGGTTTAGAGTTTGTTGGAGGTGTCCGGTGTGCTCACCAGGGCTGGGTTAGTGGTAAGGCTGTTGTGTTTTGTAACTATTGTAATTTTGCACATAGATTATATAGATTTTATACTAAGAATCATTGTGTTTTAAATAAAGAAACTATTGAAAATCTTTGTGGAAGGTCTTTTGTGTCATTGTATAGAGCAGGCCTTTTATTAGACGATTTTACGATCGACGATTTGCTTGGCAAAGGAAAATATGCAAAGGGTTCTATTGATAATCTGTCTATCCCTTTCGATGATTGCGCTCTTTGTCCTAATGCTGGCACTCGTCTTTCGCAAACCGGTGTTAGTCATGATCACTTTGTGTGTAATTATGTTGAGCATCTTTTTGAATGTGCTAGCTTTAGTCGTGAAACCGGAGGAAAATTTATCCGAGCTTGTAGCAAGGGTTGGCACTGGAACGCCACTTGCACGACTTGCGGAGCGTCGTGTAGATTTGCCAACCCGCGGGAGAATGTAGTAATAGCAATTTTTATGAATTTTCTTCGTGTAATGTATGATGGTAATAAGTATTATGTATCTTTGCATTGTGATACTGAGTGGATTCCCGTGCACCCTCTTTTTGCACGATTAGTTTTGATGGTTCGTGGATTTGCGCCATTGGACAATAGCCATGTTATTGAGGAGGATGAGATGGATATATGTGGTCATCCGTCTGAAGTTACATATGATGACCCATCAAATTATGCCTTCTCACATCAACATGTGACGCGCGGAGTGGGCATGGGCCATCTGGCATTTTGCAGAGATGCCAATGGAGTGGACAGAGGCGAGCACAAGTTTTATCTGCATGGGCCTTTTGATCTTAAGATGACGCATGCTATGTTCAGAGTGTTCATGATCTTGCTTAATTGCCATGGATACGTTCAATCTGAGTTCAGAGAGGAGCACCCTGCAGTTAAGGACCGCTCCTTGTGCGCATTGCTGTCAGTCGCTGGTCTGCGAGGAGTTAATATAGCCTGCAATGAGGAATTCATCCATTTGCACTCGCAGTTTCACAATGGCTCTTTTAGATCCCAGCGACCAATTCCTATGGTATATGCTGAACCAGAGATGTATCCACCATTGGAGTATGTGCGTCTAACAGAAAGTTGGGTGCCGCGGGGCCGCGTAATGATAGATGATCTACCATCACTTCTGAGTAGAGTGTATGCTGAGAGTTCACAACCACATGCTGGTGAAATATATGAGGAGATATTTGATGAAGATGATTTATTTGAACTCGGAGATGATGAGGGTACAAGTACGCGTGGCCTATTGGATCTTGGCAGGCGGCTCGGAGGTTTGCTTCTGGGAGCTACGAAATGTGTGAAAGGTTTGCACGCTGTGATTGAGTGGCCAGTGGATGTGCTCACAAAGGAGGCTGAGGATCTTGGAACGTGGCTTGCTGATAACAAGAAATATGTCAGTGAGTCGACTTGGAGCTGCCAGGTGTGTCCTGAGGTGCAAGATGCTCTGGAAAAATCGATGCGGGAGCAGGCGAAACTGAATGCTCAAGTGATTGGTGGCATTAAGAAGTTGGCCACGACCATGGATTCGGCTACGTCAAAATTGAAAGATAGTCTCAAAGAACTGGAACGGCGAATTAGCGTACTGGAACAGGGCGTAGATGAGACGCAACAGGCGCGTATTACCAATTTGGAGAACTTCTGTGAGGACGCAGCCAAAGCTTTTGATGCATTGCGTGCTGATATCGATGCCCTAAAGAAGAAACCAGCGCAGAGTGTGACGCCATTGCCGTCGCCTTCCGGAAATTCAGGTACAGCTGGCGAACAACGTCCACCTCCAAGACGGAGACCTCCCGTGGTCGAGATGTCCGAGGCACAAGCTGGTGAGACAGTTATTGTGGGTGGTGATGAAGAGCAAGAGGCCCATCAGGATAGTAGTGTTGCAGCAGCTGGACCCACTGATGAACATAACGCCATGCTGCAAAAGATCTACCTTGGTTCTTTTAAGTGGAAAGTATCTGATGGGGGGGGTTCAATTCTCAAAACCTTCTCTCTCCCATCTGACATATGGGCTGCCAATGATAGGATGAAGAATTTCCTCAGCTATTTCCAGTATTATACTTGTGAGGGAATGACATTTACGCTCACGATCACCAGCATTGGATTGCATGGAGGTACGCTGCTTGTAGCCTGGGATGCCTTGAGTAGTGCAACACGGAGAGGAATCGTTTCAATGATACAGCTGAGCAATCTCCCCTCAATGACGCTGCATGCAAGCGGAAGCTCTATTGGTACGCTTACTGTGACTTCTCCTGCGATTCAACATCAGATTTGTACGTCAGGAAGTGAAGGCTCCATAGCTAATTTGGGCTCCCTCGTGATTTCTGTTGCAAATGTGCTGTGTGCTGATTCTGCATCAGCTCAAGAACTTAACGTCAACGCTTGGGTACAATTTGACAAGCCCAAGCTCAGCTACTGGACAGCACAACATACGATTGCGCAGAGCGGGGGTTTCGAAGAGTCACAAGACTTGGGTGATTTGCAGGCCATAATAGCAACTGGAAAATGGTCCACTACGAGCGACAAAAACCTGATGGAGATCATCGTTCATCCCACTGCGTGTTACGTGTCGGAGAAATTGATATACCAGACCAACTTGAGTGTTGTGGCTCACATGTTTGCCAAATGGTCTGGATCTATGAAGTACACGTTTGTTTTTGGAGCCTCAATGTTCGACAGGGGGAAGATAATGGTGAGTGCTGTTCCAGTGCAATTTAGAAATTCAAAGCTCACCCTATCGCAAATGGCAGCGTTCCCTTCAATGGTATGCGATCTGAGTGTGGAAACGAGGGAGTTCACTTTTGAGGTGCCATACATTTCCATCGGCAAAATGAGCTTGGTTTGCAAGGATTATCTTTTTGACATTTCTTCATACAATGCCGATTTGGTTGTGAGCCGACTGCATGTGATGATTCTGGATCCCCTGGTGAAGACTGGAAATGCGTCTAATTCAATAGGCTTTTATGTTGTTGCCGGACCTGGCAAGGATTTCAAACTGCATCAAATGTGCGGGGTCAAGAGCCAATTTGCTCATGATGTGCTGACCGCACAGGACTTTGGAAGAAGCCTATCATGTTCGCGTCTTCTTGGCAATGGGTTTAAGGAATGGTGCTCTCGAGAATCGTTGTTGATGAGGATCCCCCTTAAAAATGGGAAGAAACGAGCCTTCAAGTATGCTGTGACCCCCCGGATGCGAACACTGCCTCCTGAAGCCACGAGTCTTAGCTGGTTGAGCCAAATTTTTGTTGAATGGCGTGGATCCCTGACTTATACTATTCACGTTCAATCTGGGTCCGCTATCCAGCACTCATACATGCGCATCTGGTACGATCCCAATGGGAAAACTGATGAGAAGGAGATCAAGTTTCTTGACAGTGCGCATCCACCGGCAGGGATCAAGGTGTATCATTGGGACCTCAAAATAGGAGATAGCTTTCGCTTCACTGTCCCGTATTGTGCGAGAACAGAGAAATTGCAGATCCCAAAGGCTTATGCATCAACACCGTATGAGTGGCTCACGATGTACAATGGGGCGGTGACTATCGATTTGCGTAGTGGTGCCGACATGGAGCTATTTGTCTCGATTGCTGGGGGAGACGATTTTGAGATGTTCGAACAGACCGTGCCTCCAAAATGTGGCTCAGTGAGTGACTCATACACCGTCCTGTCGTATGCGGATGATATTAAGAGTGTGACGGAGGTACCGAACAAGACCACATATTTGGCAGATGAGCAACCAACAACCTCAGCACCTCGCACATCTACTGTGGACACCGAGGAAGACCCGCCAACGGAAGGAGAGATTGCAAGAACTTCAAATGGAACCCTCGTACAATATCGTGGAGGAGCCTGGAAGCCAATGGTGGAACGTACGCCAACGATGTCGAAGAAACAAGTAGGCCCAGAGCTTGTGGCGTCAGATTCCCACATGTACAAGTGCATTAAAAACATGAATAAGAATGTTAAGATTCTGACTGATAGGCAATGCACTGCAAAATTGGCTGACATAGTGGATTCAACCCAGGGACTTGTGGGGAGTAACAGTACCTTTGTCGAGGATCTGGCAGTGGGCGCCAAGCAAATTCGGAAATTTGGTGAGAGCCTGGAGGTTTTTGAAGGAAGTATGAGCGCTGCTAAAACTGCTGAGCTGATTGACAACACGCACGCAGCTTTCTCAGGGCCAGCGGATGGGAGCCCAATTTCAAATGTCGTGCAATTGCTGCTGCCTATGCTCTCCTCAATTAAAGGCATGTCTGGGAAAATGGAAAGTAAGATGGCTTCACTGACTGCAATGTTCCAACCATGCAAGAAGGCAATCACACATTTAATTGAGAGGTCCTTCCCATATTTGGCGTGTAAAGGCTTTAAAACAGACAAGTGGATTTGGGCAGCCTTGGCTTCTATTCTGGTTGGAGCAGCACTCTTACATTACTATCGCTCAGATCTCAAATTTGTGAAGAAATGGTCCGTGATGTGCATGATTATTTGGGCCCCGCTATTAGCGGAGAAAGCTTACCACCTTGGGACGTGGATTAAGGAAAAATTTTTGAAAAGTCTCCCAAGAACAAGAACGATCAAAGACTCGTGCCGTAAACACTCTTTGGCAGGCGCGTTCGAATGCTTGGCATCAGCCTCTTGTGCTTATATTAAGGACAATTGGGCTAAGACGATGTCGAGTCTTTTAACGATACTAAGTGTAGTAGCGAGTCTTGTTATGTGGGGAAAGATACCAGATGATAAGGAAATCACAAGCTTTGCGGACAAATTCCACAGCATAGGGAAGAAGGGCAGATCTATCACAAACATAATCGGCGGGTTTGAGAAAATAACTTCAGTGTGCAAGAAGTGGAGCGAAACATTGGTTGGTTGGATCGTATCAAATGTGAGTGGAGGCATTCCAAAGGAGGACTTGGCGATGACTGCGTATTTGGGCTTTAAGATTCACGACTGGGTCAGAGAAACGCGCGATATGGCTCTTATGGAAAATCGCTTTCAGGGCTTTGGTGGAGATGAGCACCTAGTCAGAGTAAGACGGCTTTATGGACACTCACTTAAGATTGATAATGCGCTCATGGAAAAACAAATAGTTCCAGACATGCAGTTGAGCCTCATAATCAAAGAATGCCGTCAAAAATGCCTTGAGCTGATGAATGAGAGTTACACGTACAAGGGAATGAAACAATCTCGCATTGACCCTTTGCATGTGTGTATGCTTGGTGCGCCTGGAGTCGGAAAGTCCACAATTGCTCATGTGGTTATCAACAATTTGCTGGATCATAGAGGAGAGCCAGAAGTCGACAGAATTTACACAAGATGCTGTGCAGACGCTTATTGGAGCAATTATCATCAAGAGCCAGTTATATTGTACGACGATCTTGGCGCCATCAAGAGTAACTTGCGGCTGTCGGACTATGCTGAAATCATGGGTATCAAAACAAACGACCCTTTTTCTGTACCTATGGCGGCCGTCGAGGACAAGGGCAAGCACTGTACCAGCAAATATGTGTTCTCGTGCACCAATGTTTTGAATCTGGACGATACTGGGGATGTGGTGACCAAGATGGCATACTATAGGCGACGCAACGTCCTTGTTAAGGTCGAGAGAGATCCTGATGTCCCTAAAAATGAGGCTAATCCCACTGAGGGCCTGGTGTTTACTGTGCTTGGCCATGATCAAAATTGTCAAGGTGATCCTCAGTTTGTGGTGAAAGAGAATTGGGACGAGCCCTTTTTGCGCGAGGTTGATACTGAAGGGTGGCGATTTGAGCGTGTTGAATACAGAACGTTTCTAAGGTTCTTGTGTATGTATACAGATGCATATATGTATAGCCAAGAACAAGTGCTTCAGGGAATTAAAACGTTCAAGATGAATCCTTTCGCACCCGAGCCTGAGTTTGCGCAAGCCCAGAGTGGAGAAGCTGCTGAGTGTGAGATCGTTGAGGAGACGCAGGAAATACCAGGGGAGGCTCCACAGGAAGTAAAGGAACTTGCTAAGATTGAGACTGCGCCAAATATGGATGAACTAGTAGAGGCCTTCAACAAGCTGAGAGTGACTCCAGGGCATCTGAATGAAATTTTGAGAGACGGATCAGGGTGCTATATAGACGAGTGGGCAATAGCTGGACCACGGTGGCTGAGCTTCCATGAGTTGTTACCATTTACCTGTGGTTGTCATCATACTAGGGTGTGCGATTTTAATATTGTGTATAATAATATGTGTAAAGCTGTTAGGAGCCAGAGTGTACATTTTAAGTATAGGGCTAATCAGGCTATTAAGTACGCGTATACTCACAAGTTGCATTCGCAGTGTAGATATAGTATAGATTTTGAGAAACTTCGTGAGTGCAATCCCTTGGACGTTTTTGTTTGTGTTTTGTCCAAGTACACGGCAGATGACCATTCTTTTGAGCGAAGATGTCCGAAAAAGATGAATGTGGTGAGGATGCAGAGGCCGCCTGTTTTTGAGCTTAAGATGCGGCCCCCAAGTGACAGTGTAGTTGTTGAGGATGATCAAGGTCAGCGTGCCTTTGAGTGGCCCCACTTGTACACATTTTTGCGATATAGGGCCATTGAATTTAAGGATGATAAAGGCTCCCTAACTGTGAGAGAAGACGCTAGCGCTGACGTGTGCCCATGGAATGAATTCTTGAAGTTGCCGTGGCTTGATGGTGATCAACTCAAATCCGTATTGCCGGCACATTTACATCGGATGGTACAGGCGCGCTTGGAGCAAGTGGAGATAATGGAGGAGAATGGAAATTACAGTGGAGAGATGAGGAATGCGATTGCTGAGATCAAAGAGTATTTGGATCAGGACCACCAGTGGGTTGCTGCATTGGTTTTAGTGGCATGTGCTGTGAAGGAACGACGGAAAATGACGCATGATAAGTTACATCGGAAGAGTTTCAACGCTCTGGATAGGCTGGACAAATGGTACACCACGACTGCGCCCAAAACCTCAAAGAAGATGAAAATCCTATTGGCCATCGGCGCGAGCGTGGCAGTAGCCGGAGTTGCCGTTGGAGCCGTGATTTTACTGCAGAAAACTAATCTTTTTGGCTCAAAAGAAGATGAAGAGATTGAAGGAGAAGAAGGTGAAACACAAGCTAGTGGAGCACATGAATCAGACGGCATAGTGACACAGCACCTCAAGAGAGATATAAGACCAAAAATGAGAGTGACCTACACAGACCACCATGTTGCCGAAGCACATGAGGAAAAAAGTACTGAGAAGCCACGCAAGCCTGGTAATCCAACCAGAAAGAACTTTTTAGGCTTGTCGCCAGGGTTTGCTGAAAGAGGAATGGGCGTTACATATGAAGAACACACACCTTTGAAAGATGCGTTACTTGATGAAAGCAACAAGGTGTTCAGGCGCAAAATCGTGGCTTCAGTGGAAAGTGCTGTGAAACAGGGCGGCAAGGCATCAAAAGATTCTGTGTTGTCACAAATAAGCGAATGGCAAGATAAGGTTAGGGCCACTGGAGTGATAGCAGCCAGACAGTTGGAAGCGAGTGGAAGCTTGAAGAAAATTCACAATCTTAACTCCAGGAGGACCAGTAGTCATGTCATGCCGGGGCTCGTTGTTCATGATGGCACGTTCGAAAGATCTGATGAAGTGGATGCTGAGTTGCACCGTATAACTATTGATGAAGTGAAGTCCTGCCCAAAAATGATCAAGGAAGGAGTTTCCACCCTATCAGTAAAGAAAGCGTCAGTTGGCGTGTTGGCACTCCAGAAAGCTGAGTCGCAGTTGTCCTTCCCGTTTACATCACGCGCTGGGGTTGACAGAGATTTAAGCATGACCAATTTGATCGATACCCACATGGCAGGAATGAGCTGTATTATCATAAGTGAACTGGGCAACGTGTTTAGAACTTTCGGTGTATTGCGCTTGTGTGGAACTTACGTGTGCATGCCCGCACACTATTTGGACGAGATAACGAGTGAACACACGTTGTACTTTGTGTGCCCAAGCAAAATCACTCAGATTCAGCTGGAACGACATCGAGTATGCCTGGTGAATGGATTTCAAGAAACAGTTGTGTGGGATCTTGGACCTTCAGTGCCACCCAGTCGGAATTATATTGACTTTACTGCTAAAGCAGATGACTGGAAGAATTACAAGGCAACAAGTGGAGCACTAGTCATGTCAAAATATTTAGTGGACAGCATGCTTCAGTGTGTGCATTTCTTAGACAGTATTGAGCTGACGGAAGCAAACGTGTCGGTGCCCACTAGTTATTATGAGGCAAATGGAGGGATACACACTATTATTTCTGGTCTGAGGTATAGAGTTCATTGCATGCCAGGATTTTGTGGAGCTGCTATTATGAGAGCTGATGCAACTTGCTACAGAAAGATAATAGGAATGCACGTCAGCGGTTTGCGTAATAAGTGTATGGGCTATGCGGAAACATTGACTCAGGAACATCTGATGCGGGCCATTGAAACGCTGAAAGAAACGGGCCTACTGAAGCACATACCAAGAGGAGCAATTGGAGCAGGTGAGGAGAAACTTCCAGAACACTCTAAGAAGCAAAGTTTGTCGCTTGAGGGAAAAGGTAATCTCGGAATTGTTGGCCAGCTACCAGCACAATTGGTGCCCACATCTGTCACCAAGACCACGATTTGTAAGAGCATGATTCATGGATTGATTGGTGAAATTAAAACAGAGCCTTCAGTTCTCTCAGCTTGGGACAGACGACTGCCATTTCCGCCCGGTGAATGGGATCCGATGAAAGACGCAGTTAAGAAGTACGGTTCCTATATCTTGCCATTCCCGACGGAGGAGATTCAAGAAGTGGAAAATTTTCTGATAAAGAAATTCAGACGGAAGGAAAATTCAAGAAGAACTCGAAATGTGAATTCACTGGAAGTTGGCATTAATGGCATCGATGGCTCAGATTTCTGGTCCCCAATAGAGATGAAAACATCGCCTGGATATCCATATATTTTGAAGAGACCAAGTGGTGCGCAGGGTAAGAAGTATTTGTTCGAAGAGTTGGAGCCCTATCCGTCAGGCCGACCCAAATATGCCATGAAAGACCCAGAGCTGATTGAGAATTACGAGCGAATCAAAGAGGAAGTGACAAGCGGCGTGAAACCCAGTATCATGACAATGGAGTGCCTCAAGGATGAAAGAAGAAAACTGGCAAAAATTTACGAGAAACCAGCAACTCGCACATTCACTATTCTGTCCCCTGAGGTCAATATTCTGTTTAGACAATATTTTGGGGATTTCGCAGCCATGGTGATGAGCACACGACGAGAACACTTCTCTCAGGTAGGAATTAACCCAGAAAGCATGGAGTGGTCAGACTTGATAAACTCTTTGTTGAGAGTCAATACCAAAGGATTTGCTGGCGATTATTCAAAGTTTGATGGCATTGGATCACCAGCCATTTACCATTCCATAGTCAACGTCGTGAATGCTTGGTACGATGACGGAGAAGTTAATGCAAGAGCACGCCATAGTTTGATATCCTCGATAGTACATCGGGATGGAATCTGTGGTGATCTGATATTGAGATATTCACAGGGAATGCCTTCTGGTTTTGCGATGACAGTTATTTTCAATTCCTTTGTGAACTATTATTTTATGGCTCTAGCATGGATGAGCACGGTTGGATCAAGTCTCCTGAGCCCACAAGGCAGTTGCAAAGATTTTGATACTTATTGTAAGATTGTTGCATATGGGGATGATAATGTTGTATCTGTTCATGAGGAATTTCTCGACGTGTACAACTTGCAAACGGTTGCTGCCTACCTCAGTCATTTTGGGGTCACATATACAGATGGAGACAAGAACCCTATACATATGAGTAAGCCGTATGAAGACATCACTAAGATGAGTTTCTTGAAACGAGGCTTTGAGAGAGTGGAGTCTTCTGGTTTTCTTTGGAAAGCTCCCCTGGACAAAACAAGTATCGAGGAGCGTCTGAATTGGATTCGGGACTGTCCTACACCTGTGGAGGCGCTGGAACAAAATATTGAGAGTGCACTGCATGAGGCTGCCATTCATGGAAGAGATTATTTTGATGACTTGGTGCAACGATTGAATAGTGCGCTGAAGAGAGTGATGCTTCCTCCAACGGATATTTCATTCGAGGAGTGTCAAGCCCGATGGTGGGCGAGTGTGACCGGTGATGCCCTCAGGGCTGCCGATTACTCGTCGCTTGTCAGGCGGGCAAGTTCTGGACATGTGGAGTTCAATAAGAAATACCGGGACATGTTCAGACAACAAGATTTGCCACTTAAGGAAATATTGATGAAATCAAAACCAGTGGCGCTTCTTGACCTGGAGGTGTAATTTAAACACCTCCTCACACGGGCGAAGGAAAAGTCTTTGAGAATGTATCACACTAGCTGTGGTCGGTTGCGCGATTTCAAAGATGACGAGCTGTAAAGTGGTGGTGTAACAAGTCTTAGTAAGGAAGAAGACTGGAGAAGTATAAGTCGGCACTCGAGCGTCCCTAGTTGGGGCCGGGGTGATGCTGGGGGATATTGCGCTTTAAACGCAGCGTGAGCGAACCCACCGCGGCCGAAAGGTCTACCCTGAACAGGTTGAATCCACACACAACAGCAGATATCATCGGCGAATGTGGCCAACACGTAATTTGATTCTATGCTAGTGATGAGCTCTTCAGGACAGAGTACTGTACCTCATTAGAGGAGCCGGGGGCAACCTTGCCGTGCATGGACACGGCACACAAACCTTGACACAGGTTTTAAAATATAGGTCAGTCTATGCCGGACTTGAATGGCACTGTTATCTGGTAACGTATGTAATAATTTGCCAATAAACACTCCTGATGGAGAGGTTCCATCACCCTTCACCCATGTATATTGCTAGGGTGTCGTATGTGTACATGATAAGTTTTATTGTTTTTCTTGTTGTGTCTGATCCAAGTTATAGTAAGGATACCATTTTTGTGCTAAGATGGGAAGTAACGCTTGGCTGTGAATTAGTGGTAGAGTGGAGACTCTTAGAGTCACTCACCACGATTGAACTTCACAGGTATGAGAGTCACCCTATGCATGAGAGTGGCGGACTAAGCTAGGCTTTGGGGTAATAACTTTCCCAATCGGGGTTGTGCTTGTAGATGATTCAATTCATTAACAGGCCCCCTTATTGTGACGGTGCTTACCCAGGTTCTTTCACCAGTTTCATTCCTTAATTGGACTTCTGGGAGAGGCCGTGCCTAAAGCACTTGCTATAATTTGTTTCAACCCGTGGTCACGGACACTTGACCCGTCTTTCGAGAGATGGAAGGCGCCCTCTTTGGGGTTTTTCTCTTTGTGTTGTAAAGTACAGAGAAGTTATTGAAGACCCCTCGGGGTTAAAATAATTTCTAGCTAATGTATATATATATTGATGATATATGTTATGTGAAAATGTTGTGATCGTTATCCTATACGACACACCCAGTCTTGTAAAGCTGGGACCCACATCACACATCAGGAAGTTGAAACCAATGACGATGGTGGCACAATGCCAACCGGTTGGTACTTACCTACTGTGTATCTCAAGTGTGGGGTAATAGAGTAC
| 111,080
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.