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|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
KY798005.1
|
Reston ebolavirus
|
Albarino,C.G., Wiggleton Guerrero,L., Jenks,H.M., Chakrabarti,A.K., Ksiazek,T.G., Rollin,P.E., Nichol,S.T., Guerrero,L.W.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2017-06-07
|
USA_VA_1989_(811952)
|
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,881
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Macaca fascicularis
|
blood
|
1989
| null | null |
Reston ebolavirus isolate USA_VA_1989_(811952), complete genome
|
GGACACACAAAAAGAAAAAAGGTTTTTTAAGACTTTTTGTGTGCGAGTAACTATGAGGAAGATTAACAGTTTTCCTCAGTTTAAGATATACACTGAAATTGAGATTGAGATTCTCCTCTTTGCTATTCTGTAACTTTCCCTGGTTGTGACAATTGAATCAGTTTTATCTATTACCAATTACCATCAACATGGTATGTCTAGTGATCTTGGGACTCTTCTTCATCTGGTTTTTCCTAGAGCTCTGAATCCATTTTGCGAGAAGTTCATCCAAACGACCCAGTGTCTGAAAATACAAAAGGTTCCCCTTTCCGTCAAGTTTAAGGGGTTGTTTTGATTGTGTGTAGATTTTATAATCCTAGAGTGCCAAGGAGTTGCGTGTCATCATTGATTGGGAAGATCAAGGAAACAATTTGTTCCAATAATATCGTACATCTTGACTAAGTCGAACAAGGGGAAGTCGATATGGATCGTGGGACCAGAAGAATCTGGGTGTCGCAAAATCAAGGTGATACTGATTTAGATTATCATAAAATTTTGACAGCTGGCCTTACTGTTCAACAGGGAATTGTCAGGCAGAAAATAATTTCTGTATATCTTGTTGATAACTTGGAGGCTATGTGTCAATTGGTAATACAAGCCTTTGAGGCCGGAATTGATTTCCAAGAAAATGCCGACAGCTTCCTTCTGATGCTTTGCCTACATCATGCTTACCAAGGTGACTATAAATTGTTCTTGGAGAGCAATGCTGTACAGTATTTGGAAGGTCATGGATTCAAATTTGAGCTCCGGAAGAAGGACGGTGTCAATCGGCTCGAGGAATTGCTTCCTGCTGCAACGAGTGGAAAAAACATCAGGCGTACGTTGGCCGCACTGCCTGAAGAGGAGACTACAGAAGCAAATGCAGGGCAATTTCTCTCATTTGCGAGTTTGTTTCTTCCCAAACTGGTTGTGGGAGAGAAGGCTTGCTTGGAAAAAGTCCAGCGACAAATTCAGGTTCATGCAGAACAGGGTTTAATTCAATATCCCACTGCATGGCAATCAGTTGGACACATGATGGTAATCTTCAGATTGATGAGGACTAATTTCTTGATTAAATATTTACTGATCCACCAGGGTATGCATATGGTAGCTGGCCACGATGCCAATGATGCTGTCATTGCTAATTCAGTTGCTCAGGCTCGCTTTTCAGGACTCCTAATTGTCAAAACCGTTCTTGATCATATTCTGCAAAAAACCGACCAAGGAGTAAGACTTCACCCTTTGGCCCGAACAGCCAAAGTGCGTAATGAGGTTAATGCATTTAAGGCCGCCCTAAGCTCACTTGCTAAGCATGGGGAATATGCCCCTTTTGCTCGCCTTCTCAATCTCTCGGGAGTTAACAACCTAGAACATGGTCTCTACCCACAGTTATCAGCAATTGCTCTTGGAGTTGCCACAGCACATGGTAGCACCCTTGCAGGAGTTAATGTTGGTGAGCAGTATCAGCAGCTTAGAGAGGCTGCCACTGAAGCTGAGAAGCAACTCCAACAATATGCTGAGTCCAGAGAACTCGACAGCCTAGGCCTGGACGATCAGGAAAGAAGAATACTAATGAACTTCCATCAGAAGAAAAACGAAATTAGTTTCCAGCAGACCAATGCAATGGTAACCCTTAGGAAAGAGCGACTGGCTAAATTAACAGAAGCTATAACGCTGGCCTCAAGACCTAACCTCGGGTCTAGACAAGACGACGGCAATGAAATACCGTTCCCTGGGCCTATAAGCAACAACCCAGACCAAGATCATCTGGAGGATGATCCTAGAGACTCCAGAGACACCATCATTCCTAATGGTGCAATTGACCCCGAGGATGGTGATTTTGAAAATTACAATGGCTATCATGATGATGAAGTTGGGACGGCAGGTGACTTGGTCCTGTTCGATCTTGACGATCATGAGGATGACAATAAAGCTTTTGAGCCACAGGACAGCTCGCCACAATCCCAAAGGGAAATAGAGAGAGAAAGATTAATTCATCCACCCCCAGGCAACAACAAGGACGACAATCGAGCCTCAGACAACAATCAACAATCAGCAGATTCTGAGGAACAAGGAGGTCAATACAACTGGCACCGAGGCCCAGAACGTACGACCGCCAATCGAAGACTCTCACCAGTGCACGAAGAGGACACCCTTATGGATCAAGGCGATGATGATCCCTCAAGCTTACCTCCGCTGGAATCTGATGATGACGATGCATCAAGTAGCCAACAAGATCCCGATTATACAGCTGTTGCCCCTCCTGCTCCTGTATACCGCAGTGCAGAAGCCCACGAGCCTCCCCACAAATCCTCGAACGAGCCAGCTGAAACATCACAATTGAATGAAGACCCTGATATCGGTCAATCAAAGTCTATGCAAAAATTAGAAGAGACATATCACCATCTGCTGAGAACTCAAGGTCCATTTGAAGCCATCAATTATTATCACATGATGAAGGATGAGCCGGTAATATTTAGCACTGATGATGGGAAGGAATACACCTACCCGGATTCACTTGAGGAAGCCTATCCTCCATGGCTCACCGAGAAAGAACGACTGGACAAAGAGAATCGCTACATTTACATAAATAATCAACAGTTCTTCTGGCCTGTCATGAGTCCCAGAGACAAATTTCTTGCAATCTTGCAGCACCATCAGTAACCACAGCACAAAGCGCGGTCCACTTCGTAAAGCTAAATACACTTAAGACTTGACCGATTCATCTACAAAAACTAATCCATTATAACTTATTAGTGCTACTTTTCTATAAGTGATTCTTAATCTAAGGCCATTAAGAGTTTAAGTAATATACATATACACTTACACCGGTCTATCCAAGATGTGGCTCAATGTTCTTGATTTGAACATAGTCATAAGGGGATAAATAATACTTTATATTTCTGATTGTGGATTGACCCATTCTGCTTAAAATGCTTCGCCCATTGAAAATGTGATCTAATAGATAGCCCTGACTAGACAAATTAAGAAAAACATTTGATGAAGATTAAAACCTTCATCGCCAGTAAATGATTATATTGTCTGTAGGCAGGTGTTTACTCCACCTTAAATTTGGAAATATCCTACCTTAGGACCATTGTCAAGAGGTGCATAGGCATTACCACCCTTGAGAACATGTACAATAATAAATTGAAGGTATGTTCAGGCCCAGAAACGACTGGATGGATTTCTGAGCAACTTATGACAGGTAAGATTCCAGTAACTGATATATTCATTGATATTGATAACAAGCCAGATCAAATGGAAGTCCGACTCAAACCATCATCAAGGAGCTCAACAAGAACTTGTACAAGTAGCAGTCAGACGGAGGTCAACTATGTACCTCTCCTTAAAAAGGTTGAGGATACATTAACTATGCTAGTGAATGCCACCAGTCGTCAGAATGCTGCAATCGAGGCCCTTGAAAACCGCCTCAGCACACTTGAGAGTAGCTTAAAGCCAATCCAAGACATGGGTAAAGTGATTTCATCATTGAATCGCAGTTGTGCCGAAATGGTTGCAAAATATGATCTTCTAGTTATGACAACTGGACGGGCTACTTCAACTGCAGCTGCAGTAGATGCGTATTGGAAAGAGCACAAACAGCCACCACCAGGGCCAGCGTTGTATGAAGAGAATGCGCTTAAAGGAAAAATCGATGATCCAAACAGCTATGTACCAGATGCTGTGCAAGAGGCTTACAAGAACCTTGACAGTACATCGACCCTGACCGAGGAAAATTTTGGGAAACCTTATATATCTGCTAAAGACCTGAAGGAGATCATGTATGATCATCTACCTGGTTTTGGGACTGCCTTTCACCAACTTGTTCAAGTGATTTGTAAAATAGGAAAGGATAACAACCTTTTGGACACAATCCATGCTGAGTTCCAGGCAAGTCTAGCAGATGGTGACTCTCCCCAATGTGCACTCATACAGATAACCAAAAGGGTCCCAATCTTTCAGGATGTGCCGCCCCCGATAATCCATATTAGATCCCGTGGTGACATCCCACGAGCATGCCAAAAGAGTCTCCGACCAGCACCACCATCACCCAAAATTGATCGTGGTTGGGTTTGTTTGTTTAAGATGCAAGATGGTAAAACGCTTGGACTTAAGATCTAAGAATCAAGATTTATTTAACAAGGCAAGCCACAACCTTAGATGGAACCTCAGCCAGACTATTGAACTATTGACGCTGTTGATGATAATATATAATTAATGGTCTTATTTGAATATGACAACATCTTGCTTCTTGTTCTGCCTTGTAGCTCTTTGAATTGGAAGATCATTCCAAACTTACAAACATGCACAAGATGTTATGGTTTAGCAAAGAATTGATAGGAGTACTGGTATATAATGTAAATATAACAAGTGATGAAGATTAAGAAAAACCAGTCGGTATTTTCCAGACTTGGCATTTCTTATCTTCATCTTCTAAAGTGAGATATTTTATCATCAAAAAATGAGGCGCGGAGTGTTACCAACGGCTCCTCCAGCATATAATGATATTGCATACCCTATGAGCATACTCCCAACCCGACCAAGTGTCATAGTCAATGAGACCAAATCAGATGTACTGGCAGTGCCAGGGGCAGATGTTCCATCAAACTCCATGAGACCAGTGGCTGATGATAACATTGATCACTCAAGCCATACTCCAAGCGGAGTAGCTTCTGCCTTTATATTGGAAGCTACAGTGAATGTAATTTCGGGAACAAAAGTCCTGATGAAGCAAATACCTATTTGGCTTCCACTGGGTGTAGCTGATCAGAAGATATACAGCTTTGATTCAACAACAGCCGCAATTATGTTGGCTTCCTACACAGTGACACACTTCGGGAAGATATCTAACCCGCTGGTACGTGTCAACAGGCTAGGCCCAGGAATACCCGATCATCCGCTACGACTCCTAAGGTTGGGCAATCAGGCATTCCTTCAAGAGTTTGTTCTTCCACCAGTCCAGCTTCCCCAGTATTTCA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AGAATGTCTCAACAAAAAAGGCTCAAATGCTTATGTCTCAGTTGCAGTCAAAGATCAAGTGGTCAGTGCTTGGCCTAATACTTCTCGAATAAGTTGGACAATAGGGAGTGGTGTCCCCTATATAGGGTCAAGAACCGAGGATAAAATCGGACAGCCTGCTATCAAGCCGCGATGCCCTTCATCTGCCCTCAAGGAGGCTATAGAATTAGCATCAAGGCTCACTTGGGTTACACAAGGAGGTTCTAATAGTGAACAATTAATCCGGCCTTTCTTGGAAGCGAGAGTCAACCTTAGTGTCAGTGAAGTCCTGCAAATGACACCATCACATTATTCAGGAAATATTGTCCATCGATATAACGACCAATACAGCCCGCACTCATTTATGGCGAATCGCATGAGCAATACTGCGACCCGTCTCATAGTGTCAACTAATACACTTGGAGAATTTTCAGGTGGAGGGCAGGCCGCCAGGGATAGCAATATAATTTTCCAGAATGTTATAAATTTAGCAGTTGCCCTTTATGATATTAGATTCCGGAATACAAACACCTCTGATATAAGGCATAATAGGGCTCATCTTCACCTGACAGAGTGCTGTACTAAAGAGGTCCCGGCCCAGTATTTGACATATACAAGTGCACTTAATCTGGATTTAAGCCGTTATCGTGATAATGAACTAATATATGACTCAAATCCACTGAAGGGAGGATTGAACTGCAATTTAACAATAGATAGTCCTTTAGTGAAGGGTCCTAGGCTTAACATGATTGAAGATGATCTTCTCCGCTTTCCACACCTTTCTGGATGGGAGTTAGCGAAAACGGTGGTACAATCCATCATCTCAGACAATAGCAACTCATCAACAGATCCAATCAGTAGCGGAGAAACACGCTCTTTCACAACTCATTTTCTCACTTACCCTCAGATTGGCCTTCTTTACAGTTTCGGAGCAGTATTATGCTTTTATCTAGGCAATACTATCCTATGGACTAAAAAACTTGATTACGAACAGTTTCTATATTATTTGCATAACCAGCTGCACAACTTACCTCATCGAGCACTCCGTGTTTTTAAACCAACATTTAAGCATGCCAGTGTGATGTCCCGATTAATGGAAATTGATTCTAACTTCTCAATTTATATTGGCGGGACATCTGGAGATCGAGGGCTGTCTGATGCTGCTCGACTGTTTCTTCGGACAGCAATCGCGAGTTTTTTACAATTTCTTAAAAGCTGGATCATCGATCGCCAAAAGACAATTCCTTTATGGATAGTATATCCGCTTGAAGGTCAACAGCCGGAATCCATCAATGAATTTCTACATAAAATTTTGGGTCTGCTCAAACAAGGCCCCAAAAGTATTCCAAAGGAGGTCAGCATCCAAAATGATGGACATTTGGATTTGGCAGAAAATAATTATGTTTACAATAGTAAGAGCACTGCTAGTAATTTCTTCCATGCATCCTTAGCTTACTGGAGAAGTAGGAAATCTCGGAAAACTCAAGACCATAATGATTTCTCAAGAGGGGATGGAACACTTACAGAACCCGTGCGTAAGTTTTCAAGCAATCATCAGTCAGATGAAAAGTACTACAATGTGACATGTGGAAAGTCACCGAAGCCGCAAGAACGCAAAGACTTCTCGCAATACAGACTCAGCAATAACGGGCAAACAATGAGTAATCATCGTAAGAAAGGGAAGTTCCACAAGTGGAATCCCTGCAAAATGTTAATGGAGAGTCAAAGGGGAACTGTTCTAACAGAGGGTGACTACTTTCAAAACAATACTCCACCAACAGATGATGTATCAAGTCCTCACCGACTCATTCTACCATTTTTTAAATTGGGAAATCACAACCATGCACATGATCAAGATGCCCAAGAATTGATGAATCAAAATATTAAACAGTACCTACATCAGCTAAGGTCTATGTTGGACACCACTATATATTGTAGATTCACAGGGATTGTCTCATCCATGCATTACAAATTGGACGAAGTTCTTCTAGAATACAATAGTTTCGATTCAGCTATCACATTAGCTGAAGGTGAGGGGTCAGGGGCTCTATTACTTTTGCAAAAATATAGTACAAGGTTATTATTTTTGAACACATTGGCAACAGAACACAGTATAGAATCAGAAGTTGTATCAGGTTTTTCTACTCCGAGAATGTTGTTACCAATAATGCAAAAGGTTCATGAAGGACAAGTCACTGTTATCTTAAATAATTCAGCAAGTCAGATAACTGACATAACTAGCTCAATGTGGTTAAGTAATCAAAAATATAATCTACCTTGTCAAGTTGAAATCATTACGATGGATGCTGAAACAACAGAGAACTTAAACAGGTCCCAACTCTACCGAGCAGTATATAACTTAATACTTGATCACATTGATCCGCAGTATCTCAAGGTGGTGGTACTCAAAGTATTTCTGAGTGATATAGAAGGAATATTATGGATTAATGATTACTTGGCTCCATTATTCGGGGCTGGTTACTTGATTAAACCGATTACATCAAGTGCCCGGTCAAGTGAATGGTACCTTTGCTTATCAAATTTGATATCTACTAACAGGAGATCGGCCCATCAGACTCACAAGGCATGTCTTGGTGTTATCAGAGATGCTTTGCAAGCACAAGTCCAGCGAGGCGTGTACTGGTTGAGTCACATCGCACAGTATGCTACAAAGAATCTCCATTGTGAATACATAGGCCTTGGTTTCCCATCTCTAGAAAAGGTCCTATATCACAGGTATAATCTAGTTGATACTGGACTCGGTCCATTGTCGTCAGTTATTAGACATTTAACTAACCTCCAGGCAGAGATACGAGACTTAGTATTAGATTATAACCTGATGAGGGAGAGTCGCACTCAAACGTACCATTTTATTAAGACTGCAAAAGGCAGAATCACAAAGTTAGTCAATGACTTTCTGAAGTTTTCTTTAATTGTCCAGGCACTCAAAAATAATTCTTCTTGGTATACTGAGCTTAAAAAATTACCTGAGGTTATTAATGTGTGTAATCGATTTTATCATACTCACAATTGCGAATGTCAGGAAAAATTCTTTGTCCAGACGCTTTATTTACAACGCCTACGCGATGCAGAAATCAAGCTAATTGAACGCCTTACCGGGTTAATGCGATTTTATCCAGAAGGGTTAATATATTCCAATCACACATAGGTACTAAATCATCATAGTATGAGGAATAAGATAATGATAATTCCTGACGACAGTTTTAGTTCCGATTCTAAGTATATCGGAAGAGAGTATGCCAATCTTAATTGTTAGAGGTAACAAGCTATTAGTTATTACTTATTGATAAGAATACACTTTATCATAGCGTAACACATCATAACTTTATAACGATTTTGCATTTCTAATCCTAGTATTTATTAGAATGTACTACCAGAGAAATGACCCCAGTTCCTATCTTTAAATAATGATTGTGTGTATTAAATTATTAGTTTATTAGGTTTATGAGTTGGTTACACAGTGAGTATTAGTAATTGAGGATTATGTAGATAGGTAATCTAACACTGAATCACCCATCTGATGTCACCATATCCAAATGTTGTGCTAGTCGCATTTAAACATGCTATCTTCAGTTAAGTAACATAGACTGAAAATGCTAAGAAGAGATTGGAGTAAAAGTATAAAATAAATTTAATTAAACTTCAAAGTGATTAAATGATAATGATCTTGGGAACTCGATATGACCTCAAGTCAAAAATAATGTCAATATAATTGTTTAGTAATATGAGTGATAATGTAAATTTTGATAACTAACTAGCTTTAGTAGTTAAGATCAAATGCAAACATTATAAGAATGTTAAGCGCACACAAAAACATTATAAAAAACCAATTTTTTCCTTTT
| 76,178
|
KY798006.1
|
Reston ebolavirus
|
Albarino,C.G., Wiggleton Guerrero,L., Jenks,H.M., Chakrabarti,A.K., Ksiazek,T.G., Rollin,P.E., Nichol,S.T., Guerrero,L.W.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2017-06-07
|
USA_VA_1989_(813168)
|
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,883
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
|
1989
| null | null |
Reston ebolavirus isolate USA_VA_1989_(813168), complete genome
|
GGACACACAAAAAGAAAAAAGGTTTTTTAAGACTTTTTGTGTGCGAGTAACTATGAGGAAGATTAACAGTTTTCCTCAGTTTAAGATATACACTGAAATTGAGATTGAGATTCTCCTCTTTGCTATTCTGTAACTTTCCCTGGTTGTGACAATTGAATCAGTTTTATCTATTACCAATTACCATCAACATGGTATGTCTAGTGATCTTGGGACTCTTCTTCATCTGGTTTTTCCTAGAGCTCTGAATCCATTTTGCGAGAAGTTCATCCAAACGACCCAGTGTCTGAAAATACAAAAGGTTCCCCTTTCCGTCAAGTTTAAGGGGTTGTTTTGATTGTGTGTAGATTTTATAATCCTAGAGTGCCAAGGAGTTGCGTGCCATCATTGATTGGGAAGATCAAGGAAACAATTTGTTCCAATAATATCGTACATCTTGACTAAGTCGAACAAGGGGAAGTCGATATGGATCGTGGGACCAGGAGAATCTGGGTGTCGCAAAATCAAGGTGATACTGATTTAGATTATCATAAAATTTTGACAGCTGGCCTTACTGTTCAACAGGGAATTGTCAGGCAGAAAATAATTTCTGTATATCTTGTTGATAACTTGGAGGCTATGTGTCAATTGGTAATACAAGCCTTTGAGGCCGGAATTGATTTCCAAGAAAATGCCGACAGCTTCCTTCTGATGCTTTGCCTACATCATGCTTACCAAGGTGACTATAAATTGTTCTTGGAGAGCAATGCTGTACAGTATTTGGAAGGTCATGGATTCAAATTTGAGCTCCGGAAGAAGGACGGTGTCAATCGGCTCGAGGAATTGCTTCCTGCTGCAACGAGTGGAAAAAACATCAGGCGTACGTTGGCCGCACTGCCTGAAGAGGAGACTACAGAAGCAAATGCAGGGCAATTTCTCTCATTTGCGAGTTTGTTTCTTCCCAAACTGGTTGTGGGAGAGAAGGCTTGCTTGGAAAAAGTCCAGCGACAAATTCAGGTTCATGCAGAACAGGGTTTAATTCAATATCCCACTGCATGGCAATCAGTTGGACACATGATGGTAATCTTCAGATTGATGAGGACTAATTTCTTGATTAAATATTTACTGATCCACCAGGGTATGCATATGGTAGCTGGCCACGATGCCAATGATGCTGTCATTGCTAATTCAGTTGCTCAGGCTCGCTTTTCAGGACTCCTAATTGTCAAAACCGTTCTTGATCATATTCTGCAAAAAACCGACCAAGGAGTAAGACTTCACCCTTTGGCCCGAACAGCCAAAGTGCGTAATGAGGTTAATGCATTTAAGGCCGCCCTAAGCTCACTTGCTAAGCATGGGGAATATGCCCCTTTTGCTCGCCTTCTCAATCTCTCGGGAGTTAACAACCTAGAACATGGTCTCTACCCACAGTTATCAGCAATTGCTCTTGGAGTTGCCACAGCACATGGTAGCACCCTTGCAGGAGTTAATGTTGGTGAGCAGTATCAGCAGCTTAGAGAGGCTGCCACTGAAGCTGAGAAGCAACTCCAACAATATGCTGAGTCCAGAGAACTCGACAGCCTAGGCCTGGACGATCAGGAAAGAAGAATACTAATGAACTTCCATCAGAAGAAAAACGAAATTAGTTTCCAGCAGACCAATGCAATGGTAACCCTTAGGAAAGAGCGACTGGCTAAATTAACAGAAGCTATAACGCTGGCCTCAAGACCTAACCTCGGGTCTAGACAAGACGACGGCAATGAAATACCGTTCCCTGGGCCTATAAGCAACAACCCAGACCAAGATCATCTGGAGGATGATCCTAGAGACTCCAGAGACACCATCATTCCTAATGGTGCAATTGACCCCGAGGATGGTGATTTTGAAAATTACAATGGCTATCATGATGATGAAGTTGGGACGGCAGGTGACTTGGTCCTGTTCGATCTTGACGATCATGAGGATGACAATAAAGCTTTTGAGCCACAGGACAGCTCGCCACAATCCCAAAGGGAAATAGAGAGAGAAAGATTAATTCATCCACCCCCAGGCAACAACAAGGACGACAATCGAGCCTCAGACAACAATCAACAATCAGCAGATTCTGAGGAACAAGGAGGTCAATACAACTGGCACCGAGGCCCAGAACGTACGACCGCCAATCGAAGACTCTCACCAGTGCACGAAGAGGACACCCTTATGGATCAAGGCGATGATGATCCCTCAAGCTTACCTCCGCTGGAATCTGATGATGACGATGCATCAAGTAGCCAACAAGATCCCGATTATACAGCTGTTGCCCCTCCTGCTCCTGTATACCGCAGTGCAGAAGCCCACGAGCCTCCCCACAAATCCTCGAACGAGCCAGCTGAAACATCACAATTGAATGAAGACCCTGATATCGGTCAATCAAAGTCTATGCAAAAATTAGAAGAGACATATCACCATCTGCTGAGAACTCAAGGTCCATTTGAAGCCATCAATTATTATCACATGATGAAGGATGAGCCGGTAATATTTAGCACTGATGATGGGAAGGAATACACCTACCCGGATTCACTTGAGGAAGCCTATCCTCCATGGCTCACCGAGAAAGAACGACTGGACAAAGAGAATCGCTACATTTACATAAATAATCAACAGTTCTTCTGGCCTGTCATGAGTCCCAGAGACAAATTTCTTGCAATCTTGCAGCACCATCAGTAACCACAGCACAAAGCGCGGTCCACTTCGTAAAGCTAAATACACTTAAGACTTGACCGATTCATCTACAAAAACTAATCCATTATAACTTATTAGTGCTACTTTTCTATAAGTGATTCTTAATCTAAGGCCATTAAGAGTTTAAGTAATATACATATACACTTACACCGGTCTATCCAAGATGTGGCTCAATGTTCTTGATTTGAACATAGTCATAAGGGGATAAATAATACTTTATATTTCTGATTGTGGATTGACCCATTCTGCTTAAAATGCTTCGCCCATTGAAAATGTGATCTAATAGATAGCCCTGACTAGACAAATTAAGAAAAACATTTGATGAAGATTAAAACCTTCATCGCCAGTAAATGATTGTATTGTCTGTAGGCAGGTGTTTACTCCACCTTAAATTTGGAAATATCCTACCTTAGGACCATTGTCAAGAGGTGCATAGGCATTACCACCCTTGAGAACATGTACAATAATAAATTGAAGGTATGTTCAGGCCCAGAAACGACTGGATGGATTTCTGAGCAACTTATGACAGGTAAGATTCCAGTAACTGATATATTCATTGATATTGATAACAAGCCAGATCAAATGGAAGTCCGACTCAAACCATCATCAAGGAGCTCAACAAGAACTTGTACAAGTAGCAGTCAGACGGAGGTCAACTATGTACCTCTCCTTAAAAAGGTTGAGGATACATTAACTATGCTAGTGAATGCCACCAGTCGTCAGAATGCTGCAATCGAGGCCCTTGAAAACCGCCTCAGCACACTTGAGAGTAGCTTAAAGCCAATCCAAGACATGGGTAAAGTGATTTCATCATTGAATCGCAGTTGTGCCGAAATGGTTGCAAAATATGATCTTCTAGTTATGACAACTGGACGGGCTACTTCAACTGCAGCTGCAGTAGATGCGTATTGGAAAGAGCACAAACAGCCACCACCAGGGCCAGCGTTGTATGAAGAGAATGCGCTTAAAGGAAAAATCGATGATCCAAACAGCTATGTACCAGATGCTGTGCAAGAGGCTTACAAGAACCTTGACAGTACATCGACCCTGACCGAGGAAAATTTTGGGAAACCTTATATATCTGCTAAAGACCTGAAGGAGATCATGTATGATCATCTACCTGGTTTTGGGACTGCCTTTCACCAACTTGTTCAAGTGATTTGTAAAATAGGAAAGGATAACAACCTTTTGGACACAATCCATGCTGAGTTCCAGGCAAGTCTAGCAGATGGTGACTCTCCCCAATGTGCACTCATACAGATAACCAAAAGGGTCCCAATCTTTCAGGATGTGCCGCCCCCGATAATCCATATTAGATCCCGTGGTGACATCCCACGAGCATGCCAAAAGAGTCTCCGACCAGCACCACCATCACCCAAAATTGATCGTGGTTGGGTTTGTTTGTTTAAGATGCAAGATGGTAAAACGCTTGGACTTAAGATCTAAGAATCAAGATTTATTTAACAAGGCAAGCCACAACCTTAGATGGAACCTCAGCCAGACTATTGAACTATTGACGCTGTTGATGATAATATATAATTAATGGTCTTATTTGAATATGACAACATCTTGCTTCTTGTTCTGCCTTGTAGCTCTTTGAATTGGAAGATCATTCCAAACTTACAAACATGCACAAGATGTTATGGTTTAGCAAAGAATTGATAGGAGTACTGGTATATAATGTAAATATAACAAGTGATGAAGATTAAGAAAAACCAGTCGGTATTTTCCAGACTTGGCATTTCTTATCTTCATCTTCTAAAGTGAGATATTTTATCATCAAAAAATGAGGCGCGGAGTGTTACCAACGGCTCCTCCAGCATATAATGATATTGCATACCCTATGAGCATACTCCCAACCCGACCAAGTGTCATAGTCAATGAGACCAAATCAGATGTACTGGCAGTGCCAGGGGCAGATGTTCCATCAAACTCCATGAGACCAGTGGCTGATGATAACATTGATCACTCAAGCCATACTCCAAGCGGAGTAGCTTCTGCCTTTATATTGGAAGCTACAGTGAATGTAATTTCGGGAACAAAAGTCCTGATGAAGCAAATACCTATTTGGCTTCCACTGGGTGTAGCTGATCAGAAGATATACAGCTTTGATTCAACAACAGCCGCAATTATGTTGGCTTCCTACACAGTGACACACTTCGGGAAGATATCTAACCCGCTGGTACGTGTCAACAGGCTAGGCCCAGGAATACCCGATCATCCGCTACGACTCCTAAGGTTGGGTAATCAGGCATTCCTTCAAGAGTTTGTTCTTCCACCAGTCCAGCTTCCCCAGTATTTCA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| 76,179
|
KY798007.1
|
Reston ebolavirus
|
Albarino,C.G., Wiggleton Guerrero,L., Jenks,H.M., Chakrabarti,A.K., Ksiazek,T.G., Rollin,P.E., Nichol,S.T., Guerrero,L.W.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2017-06-07
|
ITA_1992_(806679)
|
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,872
|
GenBank
| 1
|
Italy
|
Italy
|
Macaca fascicularis
|
blood
|
1992
| null | null |
Reston ebolavirus isolate ITA_1992_(806679), complete genome
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| 76,180
|
KY798008.1
|
Reston ebolavirus
|
Albarino,C.G., Wiggleton Guerrero,L., Jenks,H.M., Chakrabarti,A.K., Ksiazek,T.G., Rollin,P.E., Nichol,S.T., Guerrero,L.W.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2017-06-07
|
PHL_1992_(806676)
|
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,875
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
|
Macaca fascicularis
|
liver, abdominal cavity
|
1992
| null | null |
Reston ebolavirus isolate PHL_1992_(806676), complete genome
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| 76,181
|
KY798009.1
|
Reston ebolavirus
|
Albarino,C.G., Wiggleton Guerrero,L., Jenks,H.M., Chakrabarti,A.K., Ksiazek,T.G., Rollin,P.E., Nichol,S.T., Guerrero,L.W.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2017-06-07
|
USA_TX_1996_(807334)
|
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,879
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Macaca fascicularis
|
liver, abdominal cavity
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1996
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Reston ebolavirus isolate USA_TX_1996_(807334), complete genome
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| 76,182
|
KY798010.1
|
Reston ebolavirus
|
Albarino,C.G., Wiggleton Guerrero,L., Jenks,H.M., Chakrabarti,A.K., Ksiazek,T.G., Rollin,P.E., Nichol,S.T., Guerrero,L.W.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2017-06-07
|
PHL_A_2008_(811411)
|
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,879
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
|
Sus scrofa
|
lung
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2008
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Reston ebolavirus isolate PHL_A_2008_(811411), complete genome
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| 76,183
|
KY798011.1
|
Reston ebolavirus
|
Albarino,C.G., Wiggleton Guerrero,L., Jenks,H.M., Chakrabarti,A.K., Ksiazek,T.G., Rollin,P.E., Nichol,S.T., Guerrero,L.W.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2017-06-07
|
PHL_A_2008_(811412)
|
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,868
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
|
Sus scrofa
|
lymph
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2008
| null | null |
Reston ebolavirus isolate PHL_A_2008_(811412), complete genome
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| 76,184
|
KY798012.1
|
Reston ebolavirus
|
Albarino,C.G., Wiggleton Guerrero,L., Jenks,H.M., Chakrabarti,A.K., Ksiazek,T.G., Rollin,P.E., Nichol,S.T., Guerrero,L.W.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2017-06-07
|
PHL_A_2009_(813161)
|
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,879
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
|
Sus scrofa
|
lung
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2009
| null | null |
Reston ebolavirus isolate PHL_A_2009_(813161), complete genome
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| 76,185
|
KY008770.1
|
Reston ebolavirus
|
Cornish,J.P., Diaz,L., Ricklefs,S.M., Kanakabandi,K., Sword,J., Jahrling,P.B., Kuhn,J.H., Porcella,S.F., Johnson,R.F.
|
National Institute of Allergy and Infectious Diseases, Emerging Viral Pathogens Section
|
USA
|
2016-11-05
| null |
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,891
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Macaca fascicularis
| null |
1989
| null | null |
Reston ebolavirus strain Reston virus/M.fascicularis-tc/USA/1989/Philippines89-AZ-1435, complete genome
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| 79,466
|
JX477165.1
|
Reston ebolavirus
|
Carroll,S.A., Towner,J.S., Sealy,T.K., McMullan,L.K., Khristova,M.L., Burt,F.J., Swanepoel,R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control & Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2013-01-25
|
RESTV/Sus-wt/PHL/2009/09A Farm A
|
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,887
|
GenBank
| 1
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Philippines
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Philippines
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Sus scrofa
| null |
2009
| null | null |
Reston ebolavirus isolate RESTV/Sus-wt/PHL/2009/09A Farm A, complete genome
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CGGACACACAAAAAGAAAAAAGATTTTTTAAGACTTTTTGTGTGCGAGTAACTATGAGGAAGATTAACAGTTTTCCTCAGTTTAAGATATACACTGAAATTGAGATTGAGATTCTCCTCTTTGCTATTCTGTAACTTTCCCTGGTTGTAACAATTGAATCAGTTTTATCTATTACCAATTACCATCAACAAGGTATATCTAGTGATCTTGGGACTCTTCTTCATCTGGTTTTTCCTAGAGCTCTGAATCCATTTTGCGAGAAGTTCATCCAAACGATTCAGTGTCTGAAAATATAAAAGGTTCCCCTTTCCGTCAAGTTTAAGGGGTTGTTTTGATTGTGTGTAGATCTTATAATCCTAGAGTGCCAAGGAGTTGCGTGTCATCATTGATTGGGAAGATCAGGAAAACAATCTATTCCAATAATATCGTACATCTTGACTAAGTTAAACAAGGGGAAGTCGATATGGATCGTGGGACCAGAAGAATCTGGGTGTCGCAAAATCAAGGTGATACTGATTTAGATTATCATAAAATTTTGACAGCTGGCCTCACTGTTCAACAAGGAATTGTCAGGCAGAAAATAATTTCTGTATATCTTGTTGATAACTTGGAGGCTATGTGTCAATTGGTAATACAAGCCTTTGAGGCCGGAATTGATTTCCAAGAAAATGCCGACAGCTTCCTTCTGATGCTTTGCCTACATCATGCTTACCAAGGTGATTATAAATTGTTCTTGGAGAGCAATGCCGTACAGTATTTGGAAGGTCATGGATTCAAATTTGAGCTCCGGAAGAGGGACGGTGTCAATCGGCTCGAGGAATTGCTTCCTGCTGCAACGAGTGGAAAAAACATCAGGCGTACGTTGGCCGCATTGCCTGAAGAGGAGACTACAGAAGCAAATGCAGGGCAATTTCTCTCATTTGCGAGTTTGTTTCTTCCCAAACTGGTTGTGGGAGAAAAGGCTTGCTTGGAAAAAGTCCAGCGACAAATTCAGGTTCATGCAGAACAGGGTTTAATTCAATATCCCACTGCATGGCAATCAGTTGGACACATGATGGTAATCTTTAGATTGATGAGGACTAATTTCTTGATTAAATATTTACTGATCCACCAGGGCATGCATATGGTAGCTGGCCACGATGCCAATGATGCTGTCATTGCTAATTCAGTTGCTCAGGCTCGCTTTTCAGGACTCCTAATTGTCAAAACCGTTCTTGACCATATTCTGCAAAAAACCGACCAAGGAGTAAGACTTCACCCTTTGGCCCGAACAGCCAAAGTGCGTAATGAGGTTAATGCATTTAAGGCCGCCCTAAGCTCACTTGCTAAGCACGGGGAATATGCCCCTTTTGCTCGCCTTCTCAATCTCTCGGGAGTTAACAACCTTGAACATGGTCTCTACCCACAGTTATCAGCAATTGCTCTTGGAGTTGCCACAGCACATGGTAGCACCCTTGCAGGAGTTAATGTTGGTGAGCAGTATCAGCAGCTCAGAGAGGCTGCCACTGAAGCTGAGAAGCAACTCCAACAATATGCTGAGTCCAGAGAACTCGACAGCCTAGGCCTAGACGATCAGGAAAGAAGAATACTAATGAACTTCCATCAGAAGAAAAATGAAATTAGTTTCCAGCAGACCAATGCAATGGTCACCCTTAGGAAAGAGCGACTGGCTAAATTAACAGAAGCTATAACGCTGGCTTCAAGACCTAACCTCGGGTCTAGACAAGACGACGACAATGAAATACCGTTTCCTGGGCCTATAAGCAACAACCCAGACCAAGATCATCTGGAGGATGATCCCATAGACTCCAGAGACACCATCATTCCTAATAGTGCAATTGACCCCGAGGATGGTGATTTTGAAAATTACAATGGCTATCATGATGATGAAGTTGGGACGGCAGGTGACTTGGTCCTGTTCGATCTTGACGATCATGAGGATGACAATAAAGCTTTTGAGCCACAGGACAGCTCACCACAATCCCAAAGGGGAATAGAGAGAGAAAGATTAATTCATCCACCCCTAGGCAACAACAAGGACGACAATCGGGCTTCAGACAACAATCAACAATCAGCAGATTCTGAGGAACAAGAAGATCGATACAACAGGCACCGAGGCCCAGAACGTACGACCGCCAATCGAAGACTCTCACCAGTGTACGAGGAGGACACCCTTATAGATCAAGGCGATGATGATCCCTCAGGCCCACCTCCGCTGGAATCTGATGATGACGATGCATCAAGTAGCCAACAAGATCCAGATTATACAGCTGTTGCCCCTCCTGCTCCTGTATACCGCAGTGCAGAAGCCCACGAGCCTCCCCACAAATCCTCGAACGAGCCAGCTGAAACATCACAATTGAATGAAGACCCTGATATCGGTCAATCAAAGTCTATGCAAAAATTAGAAGAGACATATCACCATCTGCTGAGAACTCAAGGTCCATTTGAAGCCATCAATTATTATCACATGATGAAGGATGAGCCGGTAATATTTAGCACTGATGATGGGAAGGAATACACCTACCCGGATTCACTTGAGGAAGCCTATCCTCCATGGCTCACCGAGAAAGAACGACTGGACAATGAGAATCGATACATTTACATAAATAATCAACAGTTCTTCTGGCCTGTCATGAGTCCCAGAGATAAGTTTCTTGCAATCTTGCAGCACCATCAGTAACCACAGCACAAAGCGCGGTCCACTTCGTAAAGCTAAATACACTTAAGACTTGACCAATTCATCTACAAAAACTAATCCATTATAACTGATTAGTGCTACTTTTCTATAAGTGATTCTTAATCTAAGGCCATTAAGAGTTTAAGCAATATACATATGTACTTACACTGGTTTATCCAAGATGTGGCTCAATGTTCTTAATTTGAACATAGTTATAAGGGGATAAATAATACTTTATATTTCTGATTGTGGATTGACCCATTCTGCTTAAAATGCTTTGCCCGTTAAAAATGTGATCTAATAGATAGCCCTGACTAGCAAAATTAAGAAAAACATTTGATGAAGATTAAAACCTTCATCGCCAGTAAATGATCATATTGTCTGTAGACAGGTGTTTACTCCACCTCAAAGTCGGAAATATCCTACCTTAGGACCATTGTCAAGAGGTGCATAGGCATTACCATCCTTGAGAATATGTACAATAATAAATTGAAGATATGTTCAGGCCCAGAAACGACTGGATGGATTTCTGAGCAACTAATGACAGGTAAGATTCCAGTAACTGATATATTCATTGATATTGATAACAAGCCAGATCAAATGGAAGTCCGACTCAAACCATCATCAAGGAGCTCAACAAGAACTTGTACAAGTAGCAGTCAGACGGAGGCCAACTATGTACCTCTTCTTAAAAAGGTTGAGGATACATTAACTATGCTAGTGAGTGCCACCAGTCGTCAGAATGCTGCAATCGAGGCCCTTGAAAACCGCCTCAGCACACTTGAGAGTAGCTTAAAGCCAATCCAAGACATGGGTAAAGTGATTTCATCATTGAATCGCAGTTGTGCCGAAATGGTGGCAAAATATGATCTTCTAGTTATGACAACTGGACGGGCTACTTCAACTGCAGCTGCAGTAGATGCGTACTGGAAAGAGCACAAACAGCCACCACCAGGGCCAGCATTGTATGAAGAGAATGCGCTAAAAGGAAAAATCGATGATCCAAACAGCTATGTACCAGATGCTGTGCAGGAGGCTTACAAGAACCTTGACAGTACATCGACCCTGACCGAGGAAAATTTTGGGAAACCTTATATATCTGCTAAAGATCTGAAGGAGATCATGTATGATCATCTACCTGGTTTTGGGACTGCCTTTCACCAACTTGTTCAAGTGATTTGTAAAATAGGAAAGGATAACAACCTTTTGGACACAATTCATGCTGAGTTCCAGGCAAGTCTAGCAGATGGTGACTCTCCCCAATGTGCACTCATACAGATAACCAAAAGAGTCCCAATCTTTCAGGATGTGCCGCCCCCGACAATCCACATTAGATCTCGTGGTGATATCCCACGAGCATGCCAAAAGAGTCTCCGACCAGCACCACCATCACCCAAAATTGATCGTGGTTGGGTTTGTTTGTTTAAGATGCAAGATGGTAAAACGCTTGGACTTAAGATCTAAGGATCAAGATTTATTTAACAAGGCAAGCCACAACCTTAGACGGAACCTCAGCCAGACCATTGAACTATTAACGCTGTTGATGATAATATATAATTAATGGTCATATTTGAATATGATAACATCTTGCTTCTTGTTCTGTCTTGTAGCTCTTTGAATTGGAAGATCATTCCAGACGTACAAACATGCACAAGATGTTATGGTTTAGCAAAGAATTGATAGGAGTACTGGTATATAATGTAAATATAACAAGTGATGAAGATTAAGAAAAACCAGTCAGGATTTTCCAGACTTGGCATTTCTTATCTTCATCTTCTAAAGTGAGATACTTTATCATCAAAAAATGAGGCGCGGAGTGTTACCAACGGCTCCCCCAGCATATAATGATATTACATACCCTATGAGCATACTCCCAACCCGACCAAGTGTCATAGTCAATGAGACCAAGTCAGATGTACTGGCAGTGCCAGGGGCAGATGTTCCATCAAACTCCATGAGACCAGTGGCTGATGATAACATTGATCACTCAAGCCATACTCCAAGCGGAGTAGCTTCTGCCTTTATATTAGAAGCTACAGTGAATGTAATTTCGGGAACAAAAGTCCTGATGAAGCAAATACCTATTTGGCTTCCACTGGGTGTAGCCGATCAGAAGATATACAGCTTTGATTCAACAACAGCCGCAATTATGTTGGCTTCCTACACAGTGACACACTTCGGGAAGATATCTAGCCCGCTGGTACGTGTCAACAGGCTAGGCCCAGGAATACCCGATCATCCGCTACGACTCCTAAGGTTGGGCAATCAGGCATTCCTTCAAGAGTTTGTTCTTCCACCAGTCCAGCTTCCCCAGTATTTC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| 95,310
|
JX477166.1
|
Reston ebolavirus
|
Carroll,S.A., Towner,J.S., Sealy,T.K., McMullan,L.K., Khristova,M.L., Burt,F.J., Swanepoel,R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control & Prevention, Viral Special Pathogens Branch
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USA
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2013-01-25
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RESTV/M.fascicularis-tc/PHL-USA/1996/Ferlite, Philippines/Alice, TX
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Orthoebolavirus restonense
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Orthoebolavirus
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Filoviridae
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ssRNA(-)
| 18,891
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GenBank
| 1
|
USA: Texas
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USA
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Primates
| null |
1996
| null | null |
Reston ebolavirus isolate RESTV/M.fascicularis-tc/PHL-USA/1996/Ferlite, Philippines/Alice, TX, complete genome
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CGGACACACAAAAAGAAAAAAGGTTTTTTAAGATTTTTTGTGTGCGAGTAACTATGAGGAAGATTAACAGTTTTCCTCAGTTTAAGGTATACACTGAAATTGAGATTGAGATTCTCCTCTTTGCTATTCTGTAACTTTCCCTGGTTGTGACAATTGAATCAGTTTTATCTATTACCAATTACCATCAACATGGTATGTCTAGTGATCTTGGGACTCTTCTTCATCTGGTTTTTCCTAGAGCTCTGAATCTATTTTGTGAGAAGTTCATCCAAACGACCCAGTGTCTGAAAATACAAGAGGTTCCCCTTTCCGTCAAGTTTAAGGGGTTGTTTTGATTGTGTGTAGATTTTATAATCCTAGAGTGCCAAGGAGTTGCGTGTCATCATTAATTGGGAAGATCAAGGAAACAATTTGTTCCAATAATATCGTACATCTTGACTAAGTCGAACAAGGGGAAGTCGATATGGATCGTGGGACCAGAAGAATCTGGGTGTCGCAAAATCAAGGTGATACTGATTTAGATTATCATAAAATTTTGACAGCTGGCCTTACTGTTCAACAGGGAATTGTCAGGCAGAAAATAATTTCTGTATATCTTGTTGATAACTTGGAGGCTATGTGTCAATTGGTAATACAAGCCTTTGAGGCCGGAATTGATTTCCAAGAAAATGCCGACAGCTTCCTTCTGATGCTTTGCCTACATCATGCTTACCAAGGTGACTATAAATTGTTCTTGGAGAGCAATGCTGTACAGTATTTGGAAGGTCATGGATTCAAATTTGAGCTCCGGAAGAAGGACGGTGTCAATCGGCTCGAGGAATTGCTTCCTGCTGCAACGAGTGGAAAAAACATCAGGCGTACGTTGGCCGCACTGCCTGAAGAGGAGACTACAGAAGCAAATGCAGGGCAATTTCTCTCATTTGCGAGTTTGTTTCTTCCCAAACTGGTTGTGGGAGAGAAGGCTTGCTTGGAAAAAGTCCAGCGACAAATTCAGGTTCATGCAGAACAGGGTTTAATTCAATATCCCACTGCATGGCAATCAGTTGGACACATGATGGTAATCTTCAGATTGATGAGGACTAATTTCTTGATTAAATATTTACTGATCCACCAGGGTATGCATATGGTAGCTGGCCACGATGCCAATGATGCTGTCATTGCTAATTCAGTTGCTCAGGCTCGCTTTTCAGGACTCCTAATTGTCAAAACCGTTCTTGATCATATTCTGCAGAAAACCGACCAAGGAGTAAGACTTCACCCTTTGGCCCGAACAGCCAAAGTGCGTAATGAGGTTAATGCATTTAAGGCCGCCCTAAGCTCACTTGCTAAGCATGGGGAATATGCCCCTTTTGCTCGCCTTCTCAATCTCTCGGGAGTTAACAACCTAGAACATGGTCTCTACCCACAGTTATCAGCAATTGCTCTTGGAGTTGCCACAGCACATGGTAGCACCCTTGCAGGAGTTAATGTTGGTGAGCAGTATCAGCAGCTTAGAGAGGCTGCCACTGAAGCTGAGAAGCAACTCCAACAATATGCTGAGTCCAGAGAACTCGACAGCCTAGGCCTAGACGATCAGGAAAGAAGAATACTAATGAACTTCCATCAGAAGAAAAATGAAATTAGTTTCCAGCAGACCAATGCAATGGTAACCCTTAGGAAAGAGCGACTGGCCAAATTAACAGAAGCTATAACGCTGGCCTCAAGACCTAACCTCGGGTCTAGACAAGACGACGACAATGAAATACCGTTCCCTGGGCCTATAAGCAACAACCCAGACCAAGATCATCTGGAGGATGATCCTAGAGACTCCAGAGACACTATCATTCCTAATAGTGCAATTGACCCCGAGGATGGTGATTTTGAAAATTACAATGGCTATCATGATGATGAAGTTGGGACGGCAGGTGACTTGGTCTTGTTCGATCTTGACGATCATGAGGATGACAATAAAGCTTTTGAGCTACAGGACAGCTCACCACAATCCCAAAGGGAAATAGAGAGAGAAAGATTAATTCATCCACCCCCAGGCAACAACAAGGACGACAATCGGGCCTCAGACAACAATCAACAATCAGCAGATTCTGAGGAACAAGAAGGTCAATACAACAGGCACCGAGGCCCAGAACGTACGACCGCCAATCGAAGACTCTCACCAGTGCACGAAGAGGACACCCCTATAGATCAAGGCGATGATGATCCCTCAAGCCCACCTCCGCTGGAATCTGATGATGACGATGCATCAAGTAGCCAACAAGATCCCGATTATACAGCTGTTGCCCCTCCTGCTCCTGTATACCGCAGTGCAGAAGCCCACGAGCCTCCCCACAAATCCTCGAACGAGCCAGCTGAAACATCACAATTGAATGAAGACCCTGATATCGGTCAATCAAAGTCTATGCAAAAATTAGAAGAGACATATCACCATCTGCTGAGAACTCAAGGTCCATTTGAAGCTATCAATTATTATCACATGATGAAGGATGAGCCGGTAATATTTAGCACTGATGATGGGAAGGAATACACCTACCCGGATTCACTTGAGGAAGCCTATCCTCCATGGCTCACCGAGAAAGAACGACTGGACAATGAAAATCGATACATTTACATAAATAATCAACAGTTCTTCTGGCCTGTCATGAGTCCCAGAGACAAATTTCTTGCAATCTTGCAGCACCATCAGTAACCACAGCACAAAGCGCGGTCCACTTCGTAAAGCTAAATACACTTAAAGCTTGACCGATTCATCTACAAAAACTAATCCATTATAACTTATTAGTGCTACTTTTCTATAAGTGATTCTCAATCTAAGGCCATTAAGAGTTTAAGCAATATACATATACACTTACACCGGTCTATCCAAGATGTGGCTCAATGTTCTTAATTTGAACATAGTCATAAGGGGATAAATAATACTTTATATTTCTGATTGTGGATTGACCCATTCTGCTTAAAATGCTTCGCCCATTAAAAATGTGATCTAATAGATAGCCCTGACTAGACCAATTAAGAAAAACATTTGATGAAGATTAAAACCTTCATCGCCAGTAAATGATTATATTGTCTGTAGGCAGGTGTTTACTCCACCTTAAAGTCGGAAATATCCTACCTTAGGACCATTGTTAAGAGGTGCATAGGCATTACCATCCTTGAGAACATGTATAATAATAAATTGAAGATATGTTCAGGCCCAGAAACAACTGGATGGATTTCTGAGCAACTAATGACAGGTAAGATTCCAGTAACTGATATATTCATTGATATTGATAACAAGCCAGATCAAATGGAAGTCCGGCTCAAACCATCATCAAGGAGCTCAACCAGAACTTGTACAAGTAGCAGTCAGACGGAGGTCAACTATGTACCTCTCCTTAAAAAGGTTGAGGATACATTAACTATGCTAGTGAGTGCAACCAGTCGTCAGAATGCTGCAATCGAGGCCCTTGAAAACCGCCTCAGCACACTTGAGAGTAGCTTAAAGCCAATCCAAGACATGGGTAAAGTGATTTCATCATTGAATCGCAGTTGTGCCGAAATGGTGGCAAAATATGATCTTCTAGTTATGACAACTGGACGGGCTACTTCAACCGCAGCTGCAGTAGATGCGTACTGGAAAGAGCACAAACAGCCACCACCAGGGCCAGCGTTGTATGAAGAGAATGCGCTTAAAGGAAAAATCGATGATCCAAACAGCTATGTACCAGATGCTGTGCAGGAGGCTTACAAGAACCTTGACAGTACATCGACCCTGACCGAGGAAAATTTTGGGAAACCTTATATATCTGCTAAAGATCTGAAGGAGATCATGTATGATCATCTACCTGGTTTTGGGACTGCCTTTCACCAACTTGTTCAAGTGATTTGTAAAATAGGAAAGGATAACAACCTCTTGGACACAATCCATGCTGAGTTCCAGGCAAGTCTAGCAGATGGTGACTCTCCCCAATGTGCACTCATACAGATAACCAAAAGAGTCCCAATCTTTCAGGATGTGCCGCCCCCGACAATCCACATTAGATCCCGTGGTGATATCCCACGAGCATGCCAAAAGAGTCTCCGACCAGCACCACCATCACCCAAAATTGATCGTGGTTGGGTTTGTTTGTTTAAGATGCAAGATGGTAAAACGCTTGGACTTAAGATCTAAGGATCAAGATTTATTTAACAAGGCAAGCCACAACCTTAGATAGAACCTCAGCCAGACTATTGAACTATTGACGCTGTTGATGATAATATATAATTAATGGTCATATTTGAATATGACAACATCTTGCTTCTTGTTTTGCCTTGTATCTCTTTGAGTTGGAAGATCATTCCAAACTTACAAACATGCACAAGATGTTATGGTTTAGCAAAGAATTGATAGGAGTACTGGTATATAATGTAAATATAACAAGTGATGAAGATTAAGAAAAACCAGTCGGTATTTTCCAGACTTGGCATTTCTTATCTTCATCTTCTAAAGTGAGATATTTTATCATCAAAAAATGAGACGCGGAGTGTTACCAACGGCTCCTCCAGCATATAATGATATTGCATACTCTATGAGCATACTCCCAACCCGACCAAGTGTCATAGTCAATGAGACCAAATCAGATGTACTGGCAGTGCCAGGAGCAGATGTTCCATCAAACTCCATGAGACCAGTGGCTGATGATAACATTGATCACTCAAGCCATACTCCAAGCGGAGTAGCTTCTGCCTTTATATTGGAAGCTAAAGTGAATGTAATTTCGGGAACAAAAGTCCTGATGAAGCAAATACCTATTTGGCTTCCACTGGGTGTAGCTGATCAGAAGATATACAGCTTTGATTCAACAACAGCCGCAATTATGTTGGCTTCCTACACAGTGACACACTTCGGGAAGATATCTAACCCGCTGGTACGTGTCAACAGGCTAGGCCCAGGAATACCCGATCATCCGCTACGACTCCTAAGGTTGGGCAATCAGGCATTCCTTCAAGAGTTTGTTCTTCCACCAGTCCAGCTTCCCCAGTATTTC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| 95,311
|
AY769362.1
|
Reston ebolavirus
|
Boehmann,Y., Enterlein,S., Randolf,A., Muhlberger,E., Muehlberger,E.I.
|
Philipps-University Marburg, Institute of Virology
|
Germany
|
2004-11-07
| null |
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,895
|
GenBank
| 1
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Reston ebolavirus strain Pennsylvania, complete genome
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| 109,413
|
AF522874.1
|
Reston ebolavirus
|
Groseth,A., Stroher,U., Theriault,S., Feldmann,H., Stroeher,U.
|
Canadian Science Centre for Human and Animal Health, Special Pathogens Program
|
Canada
|
2002-09-04
| null |
Orthoebolavirus restonense
|
Orthoebolavirus
|
Filoviridae
|
ssRNA(-)
| 18,891
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Reston Ebola virus strain Pennsylvania, complete genome
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| 110,664
|
NC_006934.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Wang,Y., Cui,Z.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-04-07
| null |
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
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Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,295
|
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null | null | null |
PRJNA485481
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Reticuloendotheliosis virus strain HA9901 from China, complete genome
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| 8,262
|
OM864267.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Wang,Y.
|
Shandong Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-12-20
|
SD2101
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2021-01-01
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate SD2101, complete genome
|
AATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGAATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGGAATAGCGCTGGCTCGCTAACTGCCATATTAGCTTCTGTAATCATGCTTGCTTGCCTTAGCCGCCATTGTACTTGATATATTTCGCTGATATCATTTCTCGGAGTCGGCATCAAGAGCAGGCTCATAGACCATAAAAGGAAATGTTTGTTGAAGGCAAGCATCAGACCACTTGCACCATCCAATCACGAACAAACACGAGATCGAACTATCATACTGAGCCAATGGTTGTAAAGGGCAGATGCTATCCTCCAATGAGGGAAAATGTCATGCAACATCCTGTAAGCGGCTATATAAGCCAGGTGCATCTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACACATTGTTGTGACGTGCGGCCCAGATTCGAATCTGTAATAAAAGCTTTTTCTTCTATATCCCCAGATTGGCAGTGAGAGGAGATTTTGTTCGTGGTGTTGGCTGGCCTACTGGGTGGGGTAGGGATCCGGACTGAATCCGTAGTATTTCGGTACAACATTTGGGGGCTCGTCCGGGATTACTCCCCATCGGCAGAGGTGCCTACTGTTTCTTCGAACTCCGGCGCCGGTAAGTAAGTGCTTGATTTTGGTACCTCGCGAGGGCTTGGGAGGATCGGAGTGGCGGGGCGCTGCCGGGAAGCTCCACCTCCGCTCAGCAGGGGACGCCCTGGTCTGAGCTCTGTGGTATCTGATTGTTGTTGAACCGTCTCTAAGACGGTGATACTATAAGTCGTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCTTGTGTTTGTTCGTCACTTGTCGACAGCGCCCTGCGAATTGGTGTACCCACACCGCGCGGCTTGCGAATAATACTTTGGAGAGTCTTTTGCCTCCAGTGTCTTCCGTTTGTACTCGTCCTCCTCTCCCTCTCCGGCCGGGATGGGACAGGCAGGATCGAAGGGGCTTTTAACCCCTCTAGAGTGCATTCTGAAGAACTTCTCTGACTTTAAGAAGAGGGCGGGAGACTATGGGGAGGATGTGGATTCGTTTACCCTGCGCAAGTTATGTGAGTTTGAATGGCCCACGTTTGGCGTGGGGTGGCCGAAGGAAGGGACTCTAGACTTTAGGGTGGTAGCCGCGGTCAGGAATATAGTTTTTGGGAATCCAGGGCATCCAGACCAGGTAATATATATAACCGTCTGGATAGATATAACCATAGAAAGGCCTAAATACTTGAAAGATTGCGGGTGTAAACCCACAGGACCCTCTAAAGTTCTGTTAGCTAGCCTAAAAGTTAATCCCAGGCGGCCCGTGCTCCCCTCAGCCCCAGAAAGCCCCCCTCGGATGAGGAGGGCTCAGTTCCTGGATGAGAGACCTCTCTCTCCGGCCCCAGCCCCTCCACCTCCATATCCTGAGGTACCTGCCATTGCAGAGGAAGGTGAGGAGGGGCAACAACCAGACTCTACTGTAATGGCGAGCCCTCCCCACACCCGAAGTGGGTTAGAGTTCGGAGCACAAGGGCCGTCAGGGATGTACCCCCTTAGGGAAACTGGGGAACGGGATATGGGTGGTCGCCCCATGAGAACATATGTCCCATTCACCACCTCGGATCTGTATAATTGGAAAAACCAAAACCCATCATTCTCCCAGGCTCCAGATGAAGTAATTAGCCTATTAGAATCCGTTTTCTATACACACCAGCCTACCTGGGATGATTGCCAGCAACTCCTCCGTACCCTGTTTACGACGGAGGAGAGGGAGAGGGTGAGGACAGAAAGTAGGCGGGAGGTCAGGAATGATCAGGGAGTACAGGTCACTGACGAGCGAGAAATAGAAGCCCAGTTCCCAGCTGCTCGGCCCGACTGGGATCCTAACACAGGGAGAGGAAACGACAATCTAGAACGATATCGCCAGATCCTGCTGAGGGGGCTCCGGGCAGCGGCACGGAAACCCACCAATCTTTCTAAAATAACTGAGGTTCGGCAGGGGGCGGACGAAAGTCCTACAGCTTACCTGGAGAGACTCTATCAGGCTTATCGGACCTGGTCCCCCATAGATCCAAGGGCACCCGAGAATCAGGCTGCCATAGTCATTCAATTTGTATCTCAATCCGCGCCCGATATTAGGAAGAAAATCCAAAAGATAGATGGGTTCCAGGGGAAATTTCTCTCCGAGTTAGTAGCTATTGCCCAGAAGGTTTTCGACCAACGGGAAGACCCAGCCAAGGCAACTCACGAACTCATTCAGAAGATGGCCAAGGTACTACTCGCCCAGGAGAGTAGAGCGGAGAGAGGAAGTAAGAGGACGCCTCCGGGTAAGGGACGCCCGCCTTTGGGGAAAAACCAATGCGCGTACTGTAAGGAGGAGGGACATTGGAAGAAGAACTGTCCAAAACTCGTAAGCGGGGCAACCCCAGTGTTGGTAGAAGAATTACAATAGGGCCGTCAGGGTTCTTCCGCCCTCCGTGAACCCAGGCTAAAAATTAAAGTAGGGGGGCAAATAATAGATTTTCTAGTAGATACGGGAGCGACCCATTCTGTAGTGCAGAAACCTGTGGGGCCTATGTCTAAAGAATCTGTAGCAATTATCGGGGCTACTGGGAACATACGGAATTACCCTAAGTCTGAAGGGCGTCTTGTGGACCTAGGGAGGGGACTAGTGACTCATTCGTTTCTAGTGATTCCTGAGTGCCCAGACCCACTATTGGGGAGGGATCTATTACAGAAGCTAAGGGCTACCAACTCGTTCACCGGGGAAGGGCCCCCCGAAATACGGACAGAAGGGAAACTATTGGTAACGGCTCCCCTGGAAGAGGAATACCGTTTGTTTTTAGAGGCGCCGATACAAAATGTTACGCTGCTAGAGCAGTGGAAACGGGAAATCCCGAAAGTCTGGGCCGAGATAAATCCCCCGGGGTTGGCATCCACACAAGCCCCCATTCATGTCCAGCTATTAAGTACCGCCCTACCTGTGAGGGTAAGACAGTATCCTATTACCCTGGAGGCAAAACGAAGCCTGCGCGAAACTATTCGCAAATTCAGAGCAGCGGGCATCCTGAGACCCGTCCACTCCCCCTGGAACACTCCCCTCCTCCCTGTGCGAAAGTCCGGCACGTCCGAGTATCGGATGGTTCAAGATTTAAGGGAAGTAAACAAGAGAGTAGAGACTATTCACCCAACTGTCCCTAACCCATACACCCTCCTCAGCCTATTACCCCCTGACCGAATATGGTATTCTGTTTTGGACCTGAAAGACGCCTTTTTCTGCATCCCTCTGGCCCCTGAGTCGCAATTGATCTTCGCATTCGAGTGGGCAGATGCGGAGGAAGGAGAATCAGGGCAACTAACCTGGACTAGGCTACCTCAGGGTTTTAAGAACTCACCCACCCTTTTTGATGAAGCCCTTAACAGGGATCTGCAGGGATTTCGACTTGATCACCCTTTCGTTTCCCTCCTTCAGTATGTAGACGACTTACTTATTGCGGCTGATACACAAGCCGCATGCCTGAGTGCCACCCGAGACTTACTCATGACTTTAGCGGAGCTGGGGTACCGGGTTTCAGGGAAGAAGGCCCAGCTCTGTCAAGAGGAAGTCACATACTTGGGGTTCAAGATCCATAAGGGATCACGGACCCTATCAAATAGCCGAACTCAGGCTATTCTTCAGATACCAGTACCGAAAACCAAAAGGCAGGTGCGCGAATTTTTAGGTACAATTGGGTACTGCAGGCTTTGGATCCCGGGGTTTGCCGAACTCGCCCAGCCCCTATATGCGGCAACGCGGGGGGGAAATGATCCTTTAGTGTGGGGCGAAAAAGAGGAAGAAGCGTTCCAGAGCTTGAAACTAGCCCTCACACAGCCACCAGCTTTGGCCCTGCCCTCCCTAGATAAGCCTTTCCAGCTCTTCGTAGAAGAAACAGGCGGGGCGGCCAAGGGAGTGCTCACACAGGCCCTCGGTCCATGGAAAAGACCCGTAGCCTACTTATCCAAAAGGCTGGACCCTGTGGCAGCTGGCTGGCCCCGGTGCCTCCGAGCCATTGCGGCAGCCGCTCTTCTCACAAGAGAAGCCTCTAAACTTACCTTCGGGCAGGACATAGAGATCACTTCGTCCCATAACTTGGAGAGTTTGCTGCGATCCCCTCCTGACAGGTGGCTGACCAATGCTCGCATCACGCAGTACCAGGTACTGCTCCTGGACCCTCCCCGAGTGCGCTTTAAGCAGACTGCGGCCCTCAATCCGGCTACCCTGTTACCCGAGACAGACGATACGCTGCCAATACACCATTGCCTGGACACTTTAGATTCTCTGACCTCCACCCGCCCCGACCTGACGGATCAGCCCCTGGCACAAGCGGAAGCCACCCTGTTCACTGACGGCAGCAGCTACATACGAGACGGAAAACGATACACCGGTGCAGCAGTGGTAACTCTGGACTCTGTTATTTGGGCAGAACCCCTCCCAATTGGAACATCAGCCCAGAAAGCAGAATTGATCGCACTAACAAAGGCCCTGGAATGGAGCAAGGACAAGAGCGTCAACATCTACACGGATAGCCGTTATGCATTCGCCACTCTACACGTCCATGGGATGATCTACAGAGAAAGGGGACTGTTGACAGCAGGGGGGAAGGCTATCAAAAACGCCCCCGAAATTCTAGCCTTGCTGACCGCGGTCTGGCTACCTAAACGGGTAGCTGTGATGCATTGCAAGGGACACCAGAAAGACGATGCACCCACATCAACTGGTAACCGACGGGCAGATGAGGTGGCTCGAGAAGTAGCTATACGTCCTTTGAGCACCCAGGCCACCATCTCCGATGCACCGGATATGCCAGATACCGAAACCCCTCAGTATTCGCATGTAGAGGAGGCTCTAGGACATCGACTAAGGGGGACCAAAGACCCTGCTGGGTGGTGGCACCTTCCTGACGGGCGCCTCTTGCTTCCCAGAGCAGTGGGGAGAAAGGTCCTAGAGCAAACTCACAGAGCCACACATTTGGGTGAATC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| 20,322
|
OK631657.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
CHACON,R.D. Sr., ASTOLFI-FERREIRA,C.S., PIANTINO,A.J. Sr.
|
University of Sao Paulo, Pathology
| null |
2022-05-08
| null |
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Gallus gallus
| null |
2014
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus strain USP-586, complete genome
|
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| 30,860
|
OK631658.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
CHACON,R.D. Sr., ASTOLFI-FERREIRA,C.S., PIANTINO,A.J. Sr.
|
University of Sao Paulo, Pathology
| null |
2022-05-08
| null |
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Gallus gallus
| null |
2018
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus strain USP-976, complete genome
|
AATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGAATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGGAATAGCGCTGGCTCGCTAACTGCCATATTAGCTTCTGTAATCATGCTTGCTTGCCTTAGCCGCCATTGTACTTGATATATTTCGCTGATATCATTTCTCGGAATCGGCATCAAGAGCAGGCTCATAAACCATAAAAGGAAATGTTTGTTGAAGGCAAGCATCAGACCACTTGCACCATCCAATCACGAACAAACACGAGATCGAACTATCATACTGAGCCAATGGTTGTAAAGGGCAGATGCTATCCTCCAATGAGGGAAAATGTCATGCAACATCCTGTAAGCGGCTATATAAGCCAGGTGCATCTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACACATTGTTGTGACGTGCGGCCCAGATTCGAATCTGTAATAAAAGCTTTTTCTTCTATATCCTCAGATTGGCAGTGAGAGGAGATTTTGTTCGTGGTGTTGGCTGGCCTACTGGGTGGGGTAGGGATCCGGACTGAATCCGTAGTATTTCGGTACAACATTTGGGGGCTCGTCCGGGATTCCTCCCCATCGGCAGAGGTGCCTACTGTTTCTTCGAACTCCGGCGCCGGTAAGTAAGTACTTGATTTTGGTACCTCGCGAGGGTTTGGGAGGATCGGAGTGGCGGGACGCTGCCGGGAAGCTCCACCTCCGCTCAGCAGGGGACGCCCTGGTCTGAGCTCTGTGGTATCTGATTGTTGTTGAACCGTCTCTAAGACGGTGATACTATAAGTCGTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCTTGTGTTTGTTCGTCACTTGTCGACAGCGCCCTGCGAATTGGTGTACCCACACCGCGCGGCTTGCGAATAATACTTTGGAGAGTCTTTTGCCTCCAGTGTCTTCCGTTTGTACTCGTCCTCCTCTCCCTCTCCGGCCGGGATGGGACAGGCAGGATCGAAGGGGCTTTTAACCCCTCTAGAGTGCATTCTGAAGAACTTCTCTGACTTTAAGAAGAGGGCGGGAGACTATGGGGAGGATGTGGATTCGTTTACCCTGCGCAAGTTATGTGAGTTGGAATGGCCCACGTTTGGCGTGGGGTGGCCGAAGGAAGGGACTCTAGACTTTAGGGTGGTAGCCGCGGTCAGGAATATAGTTTTTGGGAATCCAGGGCATCCAGACCAGGTAATATATATAACCGTCTGGATAGATATAACCATAGAAAGGCCTAAATACTTGAAAGATTGCGGGTGTAAACCCACAGGACCCTCTAAAGTTCTGTTAGCTAGCCAAAAAGTTAATCCCAGGCGGCCCGTGCTCCCCTCAGCCCCAGAAAGCCCCCCTCGGATGAGGAGGGCTCAATTCCTGGATGAGAGACCTCTCTCTCCGGCCCCAGCCCCTCCACCTCCATATCCTGAGGTACCTGCCATTGCAGAGGAAGGTGAGGAGGGGCAACAACCAGACTCTACTGTAATGGCGAGCCCTCCCCACACCCGAAGTGGGTTAGAGTTCGGAGCACAAGGGCCGTCAGGGATGTACCCCCTTAGGGAAACTGGGGAACGGGATATGGGTGGTCGCCCCATGAGAACATATGTCCCATTCACCACCTCGGATCTGTATAATTGGAAAAACCAAAACCCATCATTCTCCCAGGCTCCAGATGAAGTAATTAGCCTATTAGAATCCGTTTTCTATACACACCAGCCTACCTGGGATGATTGCCAGCAACTCCTCCGTACCCTGTTTACGACGGAGGAGAGGGAGAGGGTGAGGACAGAAAGTAGGCGGGAGGTCAGGAATGATCAGGGAGTACAGGTCACTGACGAGCGAGAAATAGAAGCCCAGTTCCCAGCTACTCGGCCCGACTGGGATCCTAACACAGGGAGAGGAAACGACAATCTAGAACGATATCGCCAGATCTTGCTGAGGGGGCTCCGGGCAGCGGCACGGAAACCCACCAATCTTTCTAAAATAACTGAGGTTCGGCAGGGGGCGGACGAAAGTCCTACAGCTTACCTGGAGAGACTCTATCAGGCTTATCGGACCTGGTCCCCCATAGATCCAAGGGCACCCGAGAATCAGGCTGCCATAGTCATTCAATTTGTATCTCAATCCGCGCCCGATATTAGGAAGAAAATCCAAAAGATAGATGGGTTCCAGGGGAAATCTCTCTCCGAGTTAGTAGCTATTGCCCAGAAGGTTTTCGACCAACGGGAAGACCCAGCCAAGGCAACTCACGAACTCACTCAGAAGATGGCCAAGGTACTACTCGCCCAGGAGAGTAGAGCGGAGAGAGGAAGTAAGAAGACGCCTCCGGGTAAGGGACGCCCGCCTTTGGGGAAAAACCAATGCGCGTACTGTAAGGAGGAGGGACATTGGAAGAAGAACTGTCCAAAACTCGTAAGCGGGGCAACCCCAGTGTTGGTAGAAGAATTACAATAGGGCCGTCAGGGTTCTTCCGCCCTCCGTGAACCCAGGCTAAAAGTTAAAGTAGGGGGGCAAATAATAGATTTTCTAGTAGATACGGGAGCGACCCATTCTGTAGTGCAGAAACCTGTGGGGCCTATGTCTAAAGAATCTGTAGCAATTATCGGGGCTACTGGGAACATACGGAATTACCCTAAGTCTGAAGGGCGTCTTGTGGACCTAGGGAGGGGACTAGTGACTCATTCATTTCTAGTGATTCCTGAGTGCCCAGACCCACTATTGGGGAGGGATCTATTACAGAAGCTAAGGGCTACCATCTCGTTCACCGGGGAAGGGCCCCCCGAAATACGGACAGAAGGGAAACTATTGGTAACGGCTCCCCTGGAAGAGGAATACCGTTTGTTTTTAGAGGCGCCGATACAAAATGTTACGCTGCTAGAGCAGTGGAAACGGGAAATCCCGAAAGTCTGGGCCGAGATAAATCCCCCGGGGTTGGCATCCACACAAGCCCCCATTCATGTCCAGCTATTAAGTACCGCCCTACCTGTGAGGGTAAGACAGTATCCTATTACCCTGGAGGCAAAACGAAGCCTGCGCGAAACTATTCGCAAATTCAGAGCAGCGGGCATCCTGAGACCCGTCCACTCCCCCTGGAACACTCCCCTCCTCCCTGTGCGAAAGTCCGGCACGTCCGAGTATCGGATGGTTCAAGATTTAAGGGAAGTAAACAAGAGAGTAGAGACTATTCACCCAACTGTCCCTAACCCATACACCCTCCTCAGCCTATTACCCCCTGACCGAATATGGTATTCTGTTTTGGACCTGAAAGACGCCTTTTTCTGCATCCCTCTGGCCCCTGAGTCGCAATTGATCTTCGCATTCGAGTGGGCAGATGCGGAGGAAGGAGAATCAGGGCAACTAACCTGGACTAGGCTACCTCAGGGTTTTAAGAACTCACCCACCCTTTTTGATGAAGCCCTTAACAGGGATCTGCAGGGATTTCGACTTGATCACCCTTTCGTTTCCCTCCTTCAGTATGTAGACGACTTACTTATTGCGGCTGATACACAAGCCGCATGCCTGAGTGCCACCCGAGACTTACTCATGACTTTAGCGGAGCTGGGGTACCGGGTTTCAGGGAAGAAGGCCCAGCTCTGTCAAGAGGAAGTCACATACTTGGGGTTCAAGATCCATAAGGGATCACGGACCCTATCAAATAGCCGAACTCAGGCTATTCTTCAGATACCAGTACCGAAAACCAAAAGGCAGGTGCGCGAATTTTTAGGTACAATTGGGTACTGCAGGCTTTGGATCCCGGGGTTTGCCGAACTTGCCCAGCCCCTATATGCGGCAACGCGGGGGGGAAATGATCCTTTAGTGTGGGGCGAAAAAGAGGAAGAAGCGTTCCAGAGCTTGAAACTAGCCCTCACACAGCCACCAGCTTTGGCCCTGCCCTCCCTAGATAAGCCTTTCCAGCTCTTCGTAGAAGAAACAGGCGGGGCGGCCAAGGGAGTGCTCACACAGGCCCTCGGTCCATGGAAAAGACCCGTAGCCTACTTATCCAAAAGGCTGGACCCTGTGGCAGCTGGCTGGCCCCGGTGCCTCCGAGCCATTGCGGCAGCCGCTCTTCTCACAAGAGAAGCCTCTAAACTTACCTTCGGGCAGGACATAGAGATCACTTCGTCCCATAACTTGGAGAGTTTGCTGCGATCCCCTCCTGACAGGTGGCTGACCAATGCTCGCATCACGCAGTACCAGGTACTGCTCCTGGACCCTCCCCGAGTGCGCTTTAAGCAGACTGCGGCCCTCAATCCGGCTACCCTGTTACCCGAGACAGACGATACGCTGCCAATACACCATTGCCTGGACACTTTAGATTCTCTGACCTCCACCCGCCCCGACCTGACGGATCAGCCCCTGGCACAAGCGGAAGCCACCCTGTTCACTGACGGCAGCAGCTACATACGAGACGGAAAACGATACACCGGTGCAGCAGTGGTAACTCTGGACTCTGTTATTTGGGCAGAACCCCTCCCAATTGGAACATCAGCCCAGAAAGCAGAATTGATCGCACTAACAAAGGCCCTGGAATGGAGCAAGGACAAGAGCGTCAACATCTACACGGATAGCCGTTATGCATTCGCCACTCTACACGTCCATGGGATGATCTACAGAGAAAGGGGACTGTTGACAGCAGGGGGGAAGGCTATCAAAAACGCCCCCGAAATTCTAGCCTTGCTGACCGCGGTCTGGCTACCTAAACGGGTAGCTGTGATGCATTGCAAGGGACACCAGAAAGACGATGCACCCACATCAACTGGTAACCGACGGGCAGATGAGGTGGCTCGAGAAGTAGCTATACGTCCTTTGAGCACCCAGGCCACCATCTCCGATGCACCGGATATGCCAGATACCGAAACCCCTCAGTATTCGCATGTAGAGGAGGCTCTAGGACATCGACTAAGGGGGACCAAAGACCCTGCTGGGTGGTGGCACCTTCCTGACGGGCGCCTCTTGCTTCCCAGAGCAGTGGGGAGAAAGGTCCTAGAGCAAACTCACAGAGCCACACATTTGGGTGAATC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| 30,861
|
MW326782.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Wang,M.
|
Northeast Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-04-19
|
HLJR0201
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
|
kidney, abdominal cavity
|
2020-08-24
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate HLJR0201, complete genome
|
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| 31,193
|
MZ833509.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Zhang,Y.
|
Shandong Agricultural University, Animal Science And Technology
|
China
|
2021-10-03
| null |
Reticuloendotheliosis virus
|
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|
Retroviridae
|
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|
GenBank
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China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2019-03-20
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus, complete genome
|
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| 37,525
|
MW046294.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Li,M., Wang,P., Li,Q., Deng,Q., Shi,M., Mo,M., Wei,T., Huang,T., Wei,P., Wang,P.K.
|
Guangxi University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2021-07-28
|
GD20R1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2020
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate GD20R1, complete genome
|
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| 40,040
|
MW046295.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Li,M., Wang,P., Li,Q., Deng,Q., Shi,M., Mo,M., Wei,T., Huang,T., Wei,P., Wang,P.K.
|
Guangxi University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2021-07-28
|
GX19NNR1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2019
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate GX19NNR1, complete genome
|
AATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGAATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGGAATAGCGCTGGCTCGCTAACTGCCATATTAGCTTCTGTAATCATGCTTGCTTGCCTTAGCCGCCATTGTACTTGATATATTTCGCTGATATCATTTCTCGGAATCGGCATCAAGAGCAGGCTCATAAACCATAAAAGGAAATGTTTGTTGAAGGCAAGCATCAGACCACTTGCACCATCCAATCACGAACAAACACGAGATCGAACTATCATACTGAGCCAATGGTTGTAAAGGGCAGATGCTATCCTCCAATGAGGGAAAATGTCATGCAACATCCTGTAAGCGGCTATATAAGCCAGGTGTATCTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACACATTGTTGTGACGTGCGGCCCAGATTCGAATCTGTAATAAAAGCTTTTTCTTCTATATCCTCAGATTGGCAGTGAGAGGAGATTTTGTTCGTGGTGTTGGCTGGCCTACTGGGTGGGGTAGGGATCCGGACTGAATCCGTAGTATTTCGGTACAACATTTGGGGGCTCGTCCGGGATTCCTCCCCATCGGCAGAGGTGCCTACTGTTTCTTCGAACTCCGGCGCCGGTAAGTAAGTGCTTGATTTTGGTACCTCGCGAGGGTTTGGGAGGATCGGAGTGGCGGGACGCTGCCGGGAAGCTCCACCTCCGCTCAGCAGGGGACGCCCTGGTCTGAGCTCTGTGGTATCTGATTGTTGTTGAACCGTCTCTAAGACGGTGATACTATAAGTCGTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCTTGTGTTTGTTCGTCACTTGTCGACAGCGCCCTGCGAATTGGTGTACCCACACCGCGCGGCTTGCGAATAATACTTTGGAGAGTCTTTTGCCTCCAGTGTCTTCCGTTTGTACTCGTCCTCCTCTCCCTCTCCGGCCGGGATGGGACAGGCAGGATCGAAGGGGCTTTTAACCCCTCTAGAGTGCATTCTGAAGAACTTCTCTGACTTTAAGAAGAGGGCGGGAGACTATGGGGAGGATGTGGATTCGTTTACCCTGCGCAAGTTATGTGAGTTTGAATGGCCCACGTTTGGCGTGGGGTGGCCGAAGGAAGGGACTCTAGACTTTAGGGTGGTAGCCGCGGTCAGGAATATAGTTTTTGGGAATCCAGGGCATCCAGACCAGGTAATATATATAACCGTCTGGATAGATATAACCATAGAAAGGCCTAAATACTTGAAAGATTGCGGGTGTAAACCCACAGGACCCTCTAAAGTTCTGTTAGCTAGCCAAAAAGTTAATCCCAGGCGGCCCGTGCTCCCCTCAGCCCCAGAAAGCCCCCCTCGGATGAGGAGGGCTCAATTCCTGGATGAGAGACCTCTCTCTCCGGCCCCAGCCCCTCCACCTCCATATCCTGAGGTACCTGCCATTGCAGAGGAAGGTGAGGAGGGGCAACAACCAGGCTCTACTGTAATGGCGAGCCCTCCCCACACCCGAAGTGGGTTAGAGTTCGGAGCACAAGGGCCGTCAGGGATGTACCCCCTTAGGGAAACTGGGGAACGGGATATGGGTGGTCGCCCCATGAGAACATATGTCCCATTCACCACCTCGGATCTGTATAATTGGAAAAACCAAAACCCATCATTCTCCCAGGCTCCAGATGAAGTAATTAGCCTATTAGAATCCGTTTTCTATACACACCAGCCTACCTGGGATGATTGCCAGCAACTCCTCCGTACCCTGTTTACGACGGAGGAGAGGGAGAGGGTGAGGACAGAAAGTAGGCGGGAGGTCAGGAATGATCAGGGAGTACAGGTCACTGACGAGCGAGAAATAGAAGCCCAGTTCCCAGCTACTCGGCCCGTCTGGGATCCTAACACAGGGAGAGGAAACGACAATCTAGAACGATATCGCCAGATCTTGCTGAGGGGGCTCCGGGCAGCGGCACGGAAACCCACCAATCTTTCTAAAATAACTGAGGTTCGGCAGGGGGCGGACGAAAGTCCTACAGCTTACCTGGAGAGACTCTATCAGGCTTATCGGACCTGGTCCCCCATAGATCCAAGGGCACCCGAGAATCAGGCTGCCATAGTCATTCAATTTGTATCTCAATCCGCGCCCGATATTAGGAAGAAAATCCAAAAGATAGATGGGTTCCAGGGGAAATCTCTCTCCGAGTTAGTAGCTATTGCCCAGAAGGTTTTCGACCAACGGGAAGACCCAGCCAAGGCAACTCACGAACTCACTCAGAAGATGGCCAAGGTACTACTCGCCCAGGAGAGTAGAGCGGAGAGAGGAAGTAAGAAGACGCCTCCGGGTAAGGGACGCCCGCCTTTGGGGAAAAACCAATGCGCGTACTGTAAGGAGGAGGGACATTGGAAGAAGAACTGTCCAAAACTCGTAAGCGGGGCAACCCCAGTGTTGGTAGAAGAATTACAATAGGGCCGTCAGGGTTCTTCCGCCCTCCGTGAACCCAGGCTAAAAGTTAAAGTAGGGGGGCAAATAATAGATTTTCTAGTAGATACGGGAGCGACCCATTCTGTAGTGCAGAAACCTGTGGGGCCTATGTCTAAAGAATCTGTAGCAATTATCGGGGCTACTGGGAACATACGGAATTACCCTAAGTCTGAAGGGCGTCTTGTGGACCTAGGGAGGGGACTAGTGACTCATTCATTTCTAGTGATTCCTGAGTGCCCAGACCCACTATTGGGGAGGGATCTATTACAGAAGCTAAGGGCTACCATCTCGTTCACCGGGGAAGGGCCCCCCGAAATACGGACAGAAGGGAAACTATTGGTAACGGCTCCCCTGGAAGAGGAATACCGTTTGTTTTTAGAGGCGCCGATACAAAATGTTACGCTGCTAGAGCAGTGGAAACGGGAAATCCCGAAAGTCTGGGCCGAGATAAATCCCCCGGGGTTGGCATCCACACAAGCCCCCATTCATGTCCAGCTATTAAGTACCGCCCTACCTGTGAGGGTAAGACAGTATCCTATTACCCTGGAGGCAAAACGAAGCCTGCGCGAAACTATTCGCAAATTCAGAGCAGCGGGCATCCTGAGACCCGTCCACTCCCCCTGGAACACTCCCCTCCTCCCTGTGCGAAAGTCCGGCACGTCCGAGTATCGGATGGTTCAAGATTTAAGGGAAGTAAACAAGAGAGTAGAGACTATTCACCCAACTGTCCCTAACCCATACACCCTCCTCAGCCTATTACCCCCTGACCGAATATGGTATTCTGTTTTGGACCTGAAAGACGCCTTTTTCTGCATCCCTCTGGCCCCTGAGTCGCAATTGATCTTCGCATTCGAGTGGGCCGATGCGGGGGAAGGAGAATCAGGGCAACTAACCTGGACTAGGCTACCTCAGGGTTTTAAGAACTCACCCACCCTTTTTGATGAAGCCCTTAACAGGGATCTGCAGGGATTTCGACTTGATCACCCTTTCGTTTCCCTCCTTCAGTATGTAGACGACTTACTTATTGCGGCTGATACACAAGCCGCATGCCTGAGTGCCACCCGAGACTTACTCATGACTTTAGCGGAGCTGGGGTACCGGGTTTCAGGGAAGAAGGCCCAGCTCTGTCAAGAGGAAGTCACATACTTGGGGTTCAAGATCCATAAGGGATCACGGACCCTATCAAATAGCCGAACTCAGGCTATTCTTCAGATACCAGTACCGAAAACCAAAAGGCAGGTGCGCGAATTTTTAGGTACAATTGGGTACTGCAGGCTTTGGATCCCGGGGTTTGCCGAACTTGCCCAGCCCCTATATGCGGCAACGCGGGGGGGAAATGATCCTTTAGTGTGGGGCGAAAAAGAGGAAGAAGCGTTCCAGAGCTTGAAACTAGCCCTCACACAGCCACCAGCTTTGGCCCTGCCCTCCCTAGATAAGCCTTTCCAGCTCTTCGTAGAAGAAACAGGCGGGGCGGCCAAGGGAGTGCTCACACAGGCCCTCGGTCCATGGAAAAGACCCGTAGCCTACTTATCCAAAAGGCTGGACCCTGTGGCAGCTGGCTGGCCCCGGTGCCTCCGAGCCATTGCGGCAGCCGCTCTTCTCACAAGAGAAGCCTCTAAACTTACCTTCGGGCAGGACATAGAGATCACTTCGTCCCATAACTTGGAGAGTTTGCTGCGATCCCCTCCTGACAGGTGGCTGACCAATGCTCGCATCACGCAGTACCAGGTACTGCTCCTGGACCCTCCCCGAGTGCGCTTTAAGCAGACTGCGGCCCTCAATCCGGCTACCCTGTTACCCGAGACAGACGATACGCTGCCAATACACCATTGCCTGGACACTTTAGATTCTCTGACCTCCACCCGCCCCGACCTGACGGATCAGCCCCTGGCACAAGCGGAAGCCACCCTGTTCACTGACGGCAGCAGCTACATACGAGACGGAAAACGATACACCGGTGCAGCAGTGGTAACTCTGGACTCTGTTATTTGGGCAGAACCCCTCCCAATTGGAACATCAGCCCAGAAAGCAGAATTGATCGCACTAACAAAGGCCCTGGAATGGAGCAAGGACAAGAGCGTCAACATCTACACGGATAGCCGTTATGCATTCGCCACTCTACACGTCCATGGGATGATCTACAGAGAAAGGGGACTGTTGACAGCATGGGGGAAGGCTATCAAAAACGCCCCCGAAATTCTAGCCTTGCTGACCGCGGTCTGGCTACCTAAACGGGTAGCTGTGATGCATTGCAAGGGACACCAGAAAGACGATGCACCCACATCAACTGGTAACCGACGGGCAGATGAGGTGGCTCGAGAAGTAGCTATACGTCCTTTGAGCACCCAGGCCACCATCTCCGATGCACCGGATATGCCAGATACCGAAACCCCTCAGTATTCGCATGTAGAGGAGGCTCTAGGACATCGACTAAGGGGGACCAAAGACCCTGCTGGGTGGTGGCACCTTCCTGACGGGCGCCTCTTGCTTCCCAGAGCAGTGGGGAGAAAGGTCCTAGAGCAAACTCACAGAGCCACACATTTGGGTGAATC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| 40,041
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MW046296.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Li,M., Wang,P., Li,Q., Deng,Q., Shi,M., Mo,M., Wei,T., Huang,T., Wei,P., Wang,P.K.
|
Guangxi University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2021-07-28
|
GX19YLR1
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Reticuloendotheliosis virus
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Gammaretrovirus
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Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
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GenBank
| 1
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China
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China
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Gallus gallus
| null |
2019
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate GX19YLR1, complete genome
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| 40,042
|
MW046297.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Li,M., Wang,P., Li,Q., Deng,Q., Shi,M., Mo,M., Wei,T., Huang,T., Wei,P., Wang,P.K.
|
Guangxi University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2021-07-28
|
GX18NNR1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2018
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate GX18NNR1, complete genome
|
AATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGAATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGGAATAGCGCTGGCTCGCTAACTGCCATATTAGCTTCTGTAATCATGCTTGCTTGCCTTAGCCGCCATTGTACTTGATATATTTCGCTGATATCATTTCTCGGAATCGGCATCAAGAGCAGGCTCATAAACCATAAAAGGAAATGTTTGTTGAAGGCAAGCATCAGACCACTTGCACCATCCGATCACGAACAAACACGAGATCGAACTATCATACTGAGCCAATGGTTGTAAAGGGCAGATGCTATCCTCCAATGAGGGAAAATGTCATGCAACATCCTGTAAGCGGCTATATAAGCCAGGTGCATCTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACACATTGTTGTGACGTGCGGCCCAGATTCGAATCTGTAATAAAAGCTTTTTCTTCTATATCCTCAGATTGGCAGTGAGAGGAGATTTTGTTCGTGGTGTTGGCTGGCCTACTGGGTGGGGTAGGGATCCGGACTGAATCCGTAGTATTTCGGTACAACATTTGGGGGCTCGTCCGGGATCCCTCCCCATCGGCAGAGGTGCCTACTGTTTCTTCGAACTCCGGCGCCGGTAAGTAAGTACTTGATTTTGGTACCTCGCGAGGGTTTGGGAGGATCGGAGTGGCGGGACGCTGCCGGGAAGCTCCACCTCCGCTCAGCAGGGGACGCCCTGGTCTGAGCTCTGTGGTATCTGATTGTTGTTGAACCGTCTCTAAGACGGTGATACTATAAGTCGTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCTTGTGTTTGTTCGTCACTTGTCGACAGCGCCCTGCGAATTGGTGTACCCACACCGCGCGGCTTGCGAATAATACTTTGGAGAGTCTTTTGCCTCCAGTGTCTTCCGTTTGTACTCGTCCTCCTCTCCCTCTCCGGCCGGGATGGGACAGGCAGGATCGAAGGGGCTTTTAACCCCTCTAGAGTGCATTCTGAAGAACTTCTCTGACTTTAGGAAGAGGGCGGGAGACTATGGGGAGGATGTGGATTCGTTTACCCTGCGCAAGTTATGTGAGTTGGAATGGCCCACGTTTGACGTGGGGTGGCCGAAGGAAGGGACTCTAGACTTTAGGGTGGTAGCCGCGGTCAGGAATATAGTTTTTGGGAATCCAGGGCATCCAGACCAGGTAATATATATAACCGTCTGGATAGATATAACCATAGAAAGGCCTAAATACTTGAAAGATTGCGGGTGTAAACCCACAGGGCCCTCTAAAGTTCTGTTAGCTAGCCAAAAAGTTAATCCCAGGCGGCCCGTGCTCCCCTCAGCCCCAGAAAGCCCCCCTCGGATGAGGAGGGCTCAATTCCTGGATGAGAGACCTCTCTCTCCGGCCCCAGCCCCTCCACCTCCATATCCTGAGGTACCTGCCATTGCAGAGGAAGGTGAGGAGGGGCAACAACCAGACTCTACTGTAATGGCGAGCCCTCCCCACACCCGAAGTGGGTTAGAGTTCGGAGCACAAGGGCCGTCAGGGATGTACCCCCTTAGGGAAACTGGGGAACGGGATATGGGTGGTCGCCCCATGAGAACATATGTCCCATTCACCACCTCGGATCTGTATAATTGGAAAAACCAAAACCCATCATTCTCCCAGGCTCCAGATGAAGTAATTAGCCTATTAGAATCCGTTTTCTATACACACCAGCCTACCTGGGATGATTGCCAGCAACTCCTCCGTACCCTGTTTACGACGGAGGAGAGGGAGAGGGTGAGGACAGAAAGTAGGCGGGAGGTCAGGAATGATCAGGGAGTACAGGTTACTGACGAGCGAGAAATAGAAGCCCAGTTCCCAACTACTCGGCCCGACTGGGATCCTAACACAGGGAGAGGAAACGACAATCTAGAACGATATCGCCAGATCTTGCTGAGGGGGCTCCGGGCAGCGGCACGGAAACCCACCAATCTTTCTAAAATAACTGAGGTTCGGCAGGGGGCGGACGAAAGTCCTACGGCTTACCTGGAGAGACTCTATCAGGCTTATCGGACCTGGTCCCCCATAGATCCAAGGGCACCCGAGAATCAGGCTGCCATAGTCATTCAATTTGTATCTCAATCCGCGCCCGATATTAGGAAGAAAATCCAAAAGATAGATGGGTTCCAGGGGAAATCTCTCTCCGAGTTAGTAGCTATTGCCCAGAAGGTTTTCGACCAACGGGAAGACCCAGCCAAGGCAACTCACGAACTCACTCAGAAGATGGCCAAGGTACTACTCGCCCAGGAGAGTAGAGCGGAGAGAGGAAGTAAGAAGACGCCTCCGGGTAAGGGACGCCCGCCTTTGGGGAAAAACCAATGCGCGTACTGTAAGGAGGAGGGACATTGGAAGAAGAACTGTCCAAAACTCGTAAGCGGGGCAACCCCAGTGTTGGTAGAAGAATTACAATAGGGCCGTCAGGGTTCTTCCGCCCTCCGTGAACCCAGGCTAAAAATTAAAGTAGGGGGGCAAATAATAGATTTTCTAGTAGATACGGGAGCGACCCATTCTGTAGTGCAGAAACCTGTGGGGCCTATGTCTAAAGAATCTGTAGCAATTATCGGGGCTACTGGGAACATACGGAATTACCCTAAGTCTGAAGGGCGTCTTGTGGACCTAGGGAGGGGACTAGTGACTCATTCATTTCTAGTGATTCCTGAGTGCCCAGACCCACTATTGGGGAGGGATCTATTACAGAAGCTAAGGGCTACCATCTCGTTCACCGGGGAAGGGCCCCCCGAAATACGGACAGAAGGGAAACTATTGGTAACGGCTCCCCTGGAAGAGGAATACCGTTTGTTTTTAGAGGCGCCGATACAAAATGTTACGCTGCTAGAGCAGTGGAAACGGGAAATCCCGAAAGTCTGGGCCGAGATAAATCCCCCGGGGTTGGCATCCACACAAGCCCCCATTCATGTCCAGCTATTAAGTACCGCCCTACCTGTGAGGGTAAGACAGTATCCTATTACCCTGGAGGCAAAACGAAGCCTGCGCGAAACTATTCGCAAATTCAGAGCAGCGGGCATCCTGAGACCCGTCCACTCCCCCTGGAACACTCCCCTCCTCCCTGTGCGAAAGTCCGGCACGTCCGAGTATCGGATGGTTCAAGATTTAAGGGAAGTAAACAAGAGAGTAGAGACTATTCACCCAACTGTCCCTAACCCATACACCCTCCTCAGCCTATTACCCCCTGACCGAATATGGTATTCTGTTTTGGACCTGAAAGACGCCTTTTTCTGCATCCCTCTGGCCCCTGAGTCGCAATTGATCTTCGCATTCGAGTGGGCCGATGCGGAGGAAGGAGAATCAGGGCAACTAACCTGGACTAGGCTACCTCAGGGTTTTAAGAACTCACCCACCCTTTTTGATGAAGCCCTTAACAGGGATCTGCAGGGATTTCGACTTGATCACCCTTTCGTTTCCCTCCTTCAGTATGTAGACGACTTACTTATTGCGGCTGATACACAAGCCGCATGCCTGAGTGCCACCCGAGACTTACTCATGACTTTAGCGGAGCTGGGGTACCGGGTTTCAGGGAAGAAGGCCCAGCTCTGTCAAGAGGAAGTCACATACTTGGGGTTCAAGATCCATAAGGGATCACGGACCCTATCAAATAGCCGAACTCAGGCTATTCTTCAGATACCAGTACCGAAAACCAAAAGGCAGGTGCGCGAATTTTTAGGTACAATTGGGTACTGCAGGCTTTGGATCCCGGGGTTTGCCGAGCTTGCCCAGCCCCTATATGCGGCAACGCGGGGGGGAAATGATCCTTTAGTGTGGGGCGAAAAAGAGGAAGAAGCGTTCCAGAGCTTGAAACTAGCCCTCACACAGCCACCAGCTTTGGCCCTGCCCTCCCTAGATAAGCCTTTCCAGCTCTTCGTAGAAGAAACAGGCGGGGCGGCCAAGGGAGTGCTCACACAGGCCCTCGGTCCATGGAAAAGACCCGTAGCCTACTTATCCAAAAGGCTGGACCCTGTGGCAGCTGGCTGGCCCCGGTGCCTCCGAGCCATTGCGGCAGCCGCTCTTCTCACAAGAGAAGCCTCTAAACTTACCTTCGGGCAGGACATAGAGATCACTTCGTCCCATAACTTGGAGAGTTTGCTGCGATCCCCTCCTGACAGGTGGCTGACCAATGCTCGCATCACGCAGTACCAGGTACTGCTCCTGGACCCTCCCCGAGTGCGCTTTAAGCAGACTGCGGCCCTCAATCCGGCTACCCTGTTACCCGAGACAGACGATACGCTGCCAATACACCATTGCCTGGACACTTTAGATTCTCTGACCTCCACCCGCCCCGACCTGACGGATCAGCCCCTGGCACAAGCGGAAGCCACCCTGTTCACTGACGGCAGCAGCTACATACGAGACGGAAAACGATACACCGGTGCAGCAGTGGTAACTCTGGACTCTGTTATTTGGGCAGAACCCCTCCCAATTGGAACATCAGCCCAGAAAGCAGAATTGATCGCACTAACAAAGGCCCTGGAATGGAGCAAGGACAAGAGCGTCAACATCTACACGGATAGCCGTTATGCATTCGCCACTCTACACGTCCATGGGATGATCTACAGAGAAAGGGGACTGTTGACAGCAGGGGGGAAGGCTATCAAAAACGCCCCCGAAATTCTAGCCTTGCTGACCGCGGTCTGGCTACCTAAACGGGTAGCTGTGATGCATTGCAAGGGACACCAGAAAGACGATGCACCCACATCAACTGGTAACCGACGGGCAGATGAGGTGGCTCGAGAAGTAGCTATACGTCCTTTGAGCACCCAGGCCACCATCTCCGATGCACCGGATATGCCAGATACCGAAACCCCTCAGTATTCGCATGTAGAGGAGGCTCTAGGACATCGACTAAGGGGGACCAAAGACCCTGCTGGGTGGTGGCACCTTCCTGACGGGCGCCTCTTGCTTCCCAGAGCAGTGGGGAGAAAGGTCCTAGAGCAAACGCACAGAGCCACACATTTGGGTGAATC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| 40,043
|
MN812764.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Liu,J., Li,H., Liu,B., Zhao,B., Zhang,P., Yu,X., Ning,Z., Liu,J.X., Li,H.Z., Ning,Z.Y.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-04-19
| null |
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,238
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Cairina moschata
| null |
2019-06
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus strain CH-GD2019, complete genome
|
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| 51,844
|
MF631845.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Thontiravong,A., Wannaratana,S., Sasipreeyajan,J.
|
Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Department of Veterinary Microbiology
|
Thailand
|
2019-08-11
|
REV-TH/CBI/2013/CU-1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| null |
Thailand
|
Thailand
|
Gallus gallus
| null |
2013-12-24
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate REV-TH/CBI/2013/CU-1, complete genome
|
AATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGAATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGGAATAGCGCTGGCTCGCTAACTGCCATATTAGCTTCTGTAATCATGCTTGCTTGCCTTAGCCGCCATTGTACTTGATATATTTCGCTGATATCATTTCTCGGAATCGGCATCAAGAGCAGGCTCATAAACCATAAAAGGAAATGTTTGTTGAAGGCAAGCATCAGACCACTTGCACCATCCAATCACGAACAAACACGAGATCGAACTATCATACTGAGCCAATGGTTGTAAAGGGCAGATGCTATCCTCCAATGAGGGAAAATGTCATGCAACATCCTGTAAGCGGCTATATAAGCCAGGTGCATCTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACACATTGTTGTGACGTGCGGCCCAGATTCGAATCTGTAATAAAAGCTTTTTCTTCTATATCCTCAGATTGGCAGTGAGAGGAGATTTTGTTCGTGGTGTTGGCTGGCCTACTGGGTGGGGTAGGGATCCGGACTGAATCCGTAGTATTTCGGTACAACATTTGGGGGCTCGTCCGGGATTCCTCCCCATCGGCAGAGGTGCCTACTGTTTCTTCGAACTCCGGCGCCGGTAAGTAAGTGCTTGATTTTGGTACCTCGCGAGGGTTTGGGAGGATCGGAGTGGCGGGACGCTGCCGGGAAGCTCCACCTCCGCTCAGCAGGGGACGCCCTGGTCTGAGCTCTGTGGTATCTGATTGTTGTTGAACCGTCTCTAAGACGGTGATACTATAAGTCGTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCTTGTGTTTGTTCGTCACTTGTCGACAGCGCCCTGCGAATTGGTGTACCCACACCGCGCGGCTTGCGAATAATACTTTGGAGAGTCTTTTGCCTCCAGTGTCTTCCGTTTGTACTCGTCCTCCTCTCCCTCTCCGGCCGGGATGGGACAGGCAGGATCGAAGGGGCTTTTAACCCCTCTAGAGTGCATTCTGAAGAACTTCTCTGACTTTAAGAAGAGGGCGGGAGACTATGGGGAGGATGTGGATTCGTTTACCCTGCGCAAGTTATGTGAGTTTGAATGGCCCACGTTTGGCGTGGGGTGGCCGAAGGAAGGGACTCTAGACTTTAGGGTGGTAGCCGCGGTCAGGAATATAGTTTTTGGGAATCCAGGGCATCCAGACCAGGTAATATATATAACCGTCTGGATAGATATAACCATAGAAAGGCCTAAATACTTGAAAGATTGCGGGTGTAAACCCACAGGACCCTCTAAAGTTCTGTTAGCTAGCCAAAAAGTTAATCCCAGGCGGCCCGTGCTCCCCTCAGCCCCAGAAAGCCCCCCTCGGATGAGGAGGGCTCAATTCCTGGATGAGAGACCTCTCTCTCCGGCCCCAGCCCCTCCACCTCCATATCCTGAGGTACCTGCCATTGCAGAGGAAGGTGAGGAGGGGCAACAACCAGACTCTACTGTAATGGCGAGCCCTCCCCACACCCGAAGTGGGTTAGAGTTCGGAGCACAAGGGCCGTCAGGGATGTACCCCCTTAGGGAAACTGGGGAACGGGATATGGGTGGTCGCCCCATGAGAACATATGTCCCATTCACCACCTCGGATCTGTATAATTGGAAAAACCAAAACCCATCATTCTCCCAGGCTCCAGATGAAGTAATTAGCCTATTAGAATCCGTTTTCTATACACACCAGCCTACCTGGGATGATTGCCAGCAACTCCTCCGTACCCTGTTTACGACGGAGGAGAGGGAGAGGGTGAGGACAGAAAGTAGGCGGGAGGTCAGGAATGATCAGGGAGTACAGGTCACTGACGAGCGAGAAATAGAAGCCCAGTTCCCAGCTACTCGGCCCGACTGGGATCCTAACACAGGGAGAGGAAACGACAATCTAGAACGATATCGCCAGATCTTGCTGAGGGGGCTCCGGGCAGCGGCACGGAAACCCACCAATCTTTCTAAAATAACTGAGGTTCGGCAGGGGGCGGACGAAAGTCCTACAGCTTACCTGGAGAGACTCTATCAGGCTTATCGGACCTGGTCCCCCATAGATCCAAGGGCACCCGAGAATCAGGCTGCCATAGTCATTCAATTTGTATCTCAATCCGCGCCCGATATTAGGAAGAAAATCCAAAAGATAGATGGGTTCCAGGGGAAATCTCTCTCCGAGTTAGTAGCTATTGCCCAGAAGGTTTTCGACCAACGGGAAGACCCAGCCAAGGCAACTCACGAACTCACTCAGAAGATGGCCAAGGTACTACTCGCCCAGGAGAGTAGAGCGGAGAGAGGAAGTAAGAAGACGCCTCCGGGTAAGGGACGCCCGCCTTTGGGGAAAAACCAATGCGCGTACTGTAAGGAGGAGGGACATTGGAAGAAGAACTGTCCAAAACTCGTAAGCGGGGCAACCCCAGTGTTGGTAGAAGAATTACAATAGGGCCGTCAGGGTTCTTCCGCCCTCCGTGAACCCAGGCTAAAAATTAAAGTAGGGGGGCAAATAATAGATTTTCTAGTAGATACGGGAGCGACCCATTCTGTAGTGCAGAAACCTGTGGGGCCTATGTCTAAAGAATCTGTAGCAATTATCGGGGCTACTGGGAACATACGGAATTACCCTAAGTCTGAAGGGCGTCTTGTGGACCTAGGGAGGGGACTAGTGACTCATTCATTTCTAGTGATTCCTGAGTGCCCAGACCCACTATTGGGGAGGGATCTATTACAGAAGCTAAGGGCTACCATCTCGTTCACCGGGGAAGGGCCCCCCGAAATACGGACAGAAGGGAAACTATTGGTAACGGCTCCCCTGGAAGAGGAATACCGTTTGTTTTTAGAGGCGCCGATACAAAATGTTACGCTGCTAGAGCAGTGGAAACGGGAAATCCCGAAAGTCTGGGCCGAGATAAATCCCCCGGGGTTGGCATCCACACAAGCCCCCATTCATGTCCAGCTATTAAGTACCGCCCTACCTGTGAGGGTAAGACAGTATCCTATTACCCTGGAGGCAAAACGAAGCCTGCGCGAAACTATTCGCAAATTCAGAGCAGCGGGCATCCTGAGACCCGTCCACTCCCCCTGGAACACTCCCCTCCTCCCTGTGCGAAAGTCCGGCACGTCCGAGTATCGGATGGTTCAAGATTTAAGGGAAGTAAACAAGAGAGTAGAGACTATTCACCCAACTGTCCCTAACCCATACACCCTCCTCAGCCTATTACCCCCTGACCGAATATGGTATTCTGTTTTGGACCTGAAAGACGCCTTTTTCTGCATCCCTCTGGCCCCTGAGTCGCAATTGATCTTCGCATTCGAGTGGGCAGATGCGGAGGAAGGAGAATCAGGGCAACTAACCTGGACTAGGCTACCTCAGGGTTTTAAGAACTCACCCACCCTTTTTGATGAAGCCCTTAACAGGGATCTGCAGGGATTTCGACTTGATCACCCTTTCGTTTCCCTCCTTCAGTATGTAGACGACTTACTTATTGCGGCTGATACACAAGCCGCATGCCTGAGTGCCACCCGAGACTTACTCATGACTTTAGCGGAGCTGGGGTACCGGGTTTCAGGGAAGAAGGCCCAGCTCTGTCAAGAGGAAGTCACATACTTGGGGTTCAAGATCCATAAGGGATCACGGACCCTATCAAATAGCCGAACTCAGGCTATTCTTCAGATACCAGTACCGAAAACCAAAAGGCAGGTGCGCGAATTTTTAGGTACAATTGGGTACTGCAGGCTTTGGATCCCGGGGTTTGCCGAACTTGCCCAGCCCCTATATGCGGCAACGCGGGGGGGAAATGATCCTTTAGTGTGGGGCGAAAAAGAGGAAGAAGCGTTCCAGAGCTTGAAACTAGCCCTCACACAGCCACCAGCTTTGGCCCTGCCCTCCCTAGATAAGCCTTTCCAGCTCTTCGTAGAAGAAACAGGCGGGGCGGCCAAGGGAGTGCTCACACAGGCCCTCGGTCCATGGAAAAGACCCGTAGCCTACTTATCCAAAAGGCTGGACCCTGTGGCAGCTGGCTGGCCCCGGTGCCTCCGAGCCATTGCGGCAGCCGCTCTTCTCACAAGAGAAGCCTCTAAACTTACCTTCGGGCAGGACATAGAGATCACTTCGTCCCATAACTTGGAGAGTTTGCTGCGATCCCCTCCTGACAGGTGGCTGACCAATGCTCGCATCACGCAGTACCAGGTACTGCTCCTGGACCCTCCCCGAGTGCGCTTTAAGCAGACTGCGGCCCTCAATCCGGCTACCCTGTTACCCGAGACAGACGATACGCTGCCAATACACCATTGCCTGGACACTTTAGATTCTCTGACCTCCACCCGCCCCGACCTGACGGATCAGCCCCTGGCACAAGCGGAAGCCACCCTGTTCACTGACGGCAGCAGCTACATACGAGACGGAAAACGATACACCGGTGCAGCAGTGGTAACTCTGGACTCTGTTATTTGGGCAGAACCCCTCCCAATTGGAACATCAGCCCAGAAAGCAGAATTGATCGCACTAACAAAGGCCCTGGAATGGAGCAAGGACAAGAGCGTCAACATCTACACGGATAGCCGTTATGCATTCGCCACTCTACACGTCCATGGGATGATCTACAGAGAAAGGGGACTGTTGACAGCAGGGGGGAAGGCTATCAAAAACGCCCCCGAAATTCTAGCCTTGCTGACCGCGGTCTGGCTACCTAAACGGGTAGCTGTGATGCATTGCAAGGGACACCAGAAAGACGATGCACCCACATCAACTGGTAACCGACGGGCAGATGAGGTGGCTCGAGAAGTAGCTATACGTCCTTTGAGCACCCAGGCCACCATCTCCGATGCACCGGATATGCCAGATACCGAAACCCCTCAGTATTCGCATGTAGAGGAGGCTCTAGGACATCGACTAAGGGGGACCAAAGACCCTGCTGGGTGGTGGCACCTTCCTGACGGGCGCCTCTTGCTTCCCAGAGCAGTGGGGAGAAAGGTCCTAGAGCAAACTCACAGAGCCACACATTTGGGTGAATC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| 60,335
|
MG471384.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Xu,A., Zhong,Q., Huo,C., Zhang,G., Hu,Y.
|
China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
| null |
2018-09-03
| null |
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,293
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2015
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus strain BJ1503, complete genome
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| 68,805
|
KY581581.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Liang,X., Yang,Y., Gu,Y., Xiao,W.
|
Yangtze University, College of Animal Science
|
China
|
2018-01-28
|
HB2015021
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,285
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2015-10-15
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate HB2015021, complete genome
|
AATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGAATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGGAATAGCGCTGGCTCGCTAACTGCCATATTAGCTTCTGTAATCATGCTTGCTTGCCTTAGCCGCCATTGTACTTGATATATTTCGCTGATATCATTTCTCGGAATCGGCATCAAGAGCAGGCTCATAAACCATAAAAGGAAATGTTTGTTGAAGGCAAGCATCAGACCACTTGCACCATCCAATCACGAACAAACACGAGATCGAACTATCATACTGAGCCAATGGTTGTAAAGGGCAGATGCTATCCTCCAATGAGGGAAAATGTCATGCAACATCCTGTAAGCGGCTATATAAGCCAGGTGCATCTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACACATTGTTGTGACGTGCGGCCCAGATTCGAATCTGTAATAAAAGCTTTTTCTTCTATATCCTCAGATTGGCAGTGAGAGGAGATTTTGTTCGTGGTGTTGGCTGGCCTACTGGGTGGGGTAGGGATCCGGACTGAGTCCGTAGTATTTCGGTACAACATTTGGGGGCTCGTCCGGGATTCCTCCCCATCGGCAGAGGTGCCTACTGTTTCTTCGAACTCCGGCGCCGGTAAGTAAGTACTTGATTTTGGTACCTCGCGAGGGTTTGGGAGGATCGGAGTGGCGGGACGCTGCCGGGAAGCTCCACCTCCGCTCAGCAGGGGACGCCCTGGTCTGAGCTCTGTGGTATCTGATTGTTGTTGAACCGTCTCTAAGACGGTGATACTATAAGTCGTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCTTGTGTTTGTTCGTCACTTGTCGACAGCGCCCTGCGAATTGGTGTACCCACACCGCGCGGCTTGCGAATAATACTTTGGAGAGTCTTTTGCCTCCAGTGTCTTCCGTTTGTACTCGTCCTCCTCTCCCTCTCCGGCCGGGATGGGACAGGCAGGATCGAAGGGGCTTTTAACCCCTCTAGAGTGCATTCTGAAGAACTTCTCTGACTTTAAGAAGAGGGCGGGAGACTATGGGGAGGATGTGGATTCGTTTACCCTGCGCAAGTTATGTGAGTTGGAATGGCCCACGTTTGACGTGGGGTGGCCGAAGGAAGGGACTCTAGACTTTAGGGTGGTAGCCGCGGTCAGGAATATAGTTTTTGGGAATCCAGGGCATCCAGACCAGGTAATATATATAACCGTCTGGATAGATATAACCATAGAAAGGCCTAAATACTTGAAAGATTGCGGGTGTAAACCCACAGGACCCTCTAAAGTTCTGTTAGCTAGCCAAAAAGTTAATCCCAGGCGGCCCGTGCTCCCCTCAGCCCCAGAAAGCCCCCCTCGGATGAGGAGGGCTCAATTCCTGGATGAGAGACCTCTCTCTCCGGCCCCAGCCCCTCCACCTCCATATCCTGAGGTACCTGCCATTGCAGAGGAAGGTGAGGAGGGGCAACAACCAGACTCTACTGTAATGGCGAGCCCTCCCCACACCCGAAGTGGGTTAGAGTTCGGAGCACAAGGGCCGTCAGGGATGTACCCCCTTAGGGAAACTGGGGAACGGGATATGGGTGGTCGCCCTATGAGAACATATGTCCCATTCACCACCTCGGATCTGTATAATTGGAAAAACCAAAACCCATCATTCTCCCAGGCTCCAGATGAAGTAATTAGCCTATTAGAATCCGTTTTCTATACACACCAGCCTACCTGGGATGATTGCCAGCAACTCCTCCGTACCCTGTTTACGACGGAGGAGAGGGAGAGGGTGAGGACAGAAAGTAGGCGGGAGGTCAGGAATGATCAGGGAGTACAGGTCACTGACGAGCGAGAAATAGAAGCCCAGTTCCCAGCTACTCGGCCCGACTGGGATCCTAACACAGGGAGAGGAAACGACAATCTAGAACGATATCGCCAGATCTTGCTGAGGGGGCTCCGGGCAGCGGCACGGAAACCCACCAATCTTTCTAAAATAACTGAGGTTCGGCAGGGGGCGGACGAAAGTCCTACAGCTTACCTGGAGAGACTCTATCAGGCTTATCGGACCTGGTCCCCCATAGATCCAAGGGCACCCGAGAATCAGGCTGCCATAGTCATTCAATTTGTATCTCAATCCGCGCCCGATATTAGGAAGAAAATCCAAAAGATAGATGGGTTCCAGGGGAAATCTCTCTCCGAGTTAGTAGCTATTGCCCAGAAGGTTTTCGACCAACGGGAAGACCCAGCCAAGGCAACTCACGAACTCACTCAGAAGATGGCCAAGGTACTACTCGCCCAGGAGAGTAGAGCGGAGAGAGGAAGTAAGAAGACGCCTCCGGGTAAGGGACGCCCGCCTTTGGGGAAAAACCAATGCGCGTACTGTAAGGAGGAGGGACATTGGAAGAAGAACTGTCCAAAACTCGTAAGCGGGGCAACCCCAGTGTTGGTAGAAGAATTACAATAGGGCCGTCAGGGTTCTTCCGCCCTCCGTGAACCCAGGCTAAAAGTTAAAGTAGGGGGGCAAATAATAGATTTTCTAGTAGATACGGGAGCGACCCATTCTGTAGTGCAGAAACCTGTGGGGCCTATGTCTAAAGAATCTGTAGCAATTATCGGGGCTACTGGGAACATACGGAATTACCCTAAGTCTGAAGGGCATCTTGTGGACCTAGGGAGGGGACTAGTGACTCATTCATTTCTAGTGATTCCTGAGTGCCCAGACCCACTATTGGGGAGGGATCTATTACAGAAGCTAAGGGCTACCATCTCGTTCACCGGGGAAGGGCCCCCCGAAATACGGACAGAAGGGAAACTATTGGTAACGGCTCCCCTGGAAGAGGAATACCGTTTGTTTTTAGAGGCGCCGATACAAAATGTTACGCTGCTAGAGCAGTGGAAACGGGAAATCCCGAAAGTCTGGGCCGAGATAATCCCCCCGGGGTTGGCATCCACACAAGCCCCCATTCATGTCCAGCTATTAAGTACCGCCCTACCTGTGAGGGTAAGACAGTATCCTATTACCCTGGAGGCAAAACGAAGCCTGCGCGAAACTATTCGCAAATTCAGAGCAGCGGGCATCCTGAGACCCGTCCACTCCCCCTGGAACACTCCCCTCCTCCCTGTGCGAAAGTCCGGCACGTCCGAATATCGGATGGTTCAAGATTTAAGGGAAGTAAACAAGAGAGTAGAGACTATTCACCCAACTGTCCCTAACCCATACACCCTCCTCAGCCTATTACCCCCTGACCGAATATGGTATTCTGTTTTGGACCTGAAAGACGCCTTTTTCTGCATCCCTCTGGCCCCTGAGTCGCAATTGATCTTCGCATTCGAGTGGGCAGATGCGGAGGAAGGAGAATCAGGGCAACTAACCTGGACTAGGCTACCTCAGGGTTTTAAGAACTCACCCACCCTTTTTGATGAAGCCCTTAACAGGGATCTGCAGGGATTTCGACTTGATCACCCTTTCGTTTCCCTCCTTCAGTATGTAGACGACTTACTTATTGCGGCTGATACACAAGCCGCATGCCTGAGTGCCACCCGAGACTTACTCATGACTTTAGCGGAGCTGGGGTACCGGGTTTCAGGGAAGAAGGCCCAGCTCTGTCAAGAGGAAGTCACATACTTGGGGTTCAAGATCCATAAGGGATCACGGACCCTATCAAATAGCCGAACTCAGGCTATTCTTCAGATACCAGTACCGAAAACCAAAAGGCAGGTGCGCGAATTTTTAGGTACAATTGGGTACTGCAGGCTTTGGATCCCGGGGTTTGCCGAACTTGCCCAGCCCCTATATGCGGCAACGCGGGGGGGAAATGATCCTTTAGTGTGGGGCGAAAAAGAGGAAGAAGCGCTCCAGAGCTTGAAACTAGCCCTCACACAGCCACCAGCTTTGGCCCTGCCCTCCCTAGATAAGCCTTTCCAGCTCTTCGTAGAAGAAACAGGCGGGGCGGCCAAGGGAGTGCTCACACAGGCCCTCGGTCCATGGAAAAGACCCGTAGCCTACTTATCCAAAAGGCTGGACCCTGTGGCAGCTGGCTGGCCCCGGTGCCTCCGAGCCATTGCGGCAGCCGCTCTTCTCACAAGAGAAGCCTCTAAACTTACCTTCGGGCAGGACATAGAGATCACTTCGTCCCATAACTTGGAGAGTTTGCTACGATCCCCTCCTGACAGGTGGCTGACCAATGCTCGCATCACGCAGTACCAGGTACTGCTCCTGGACCCTCCCCGAGTGCGCTTTAAGCAGACTGCGGCCCTCAATCCGGCTACCCTGTTACCCGAGACAGACGATACGCTGCCAATACACCATTGCCTGGACACTTTAGATTCTCTGACCTCCACCCGCCACGACCTGACGGATCAGCCCCTGGCACAAGCGGAAGCCACCCTGTTCACTGACGGCAGCAGCTACATACGAGACGGAAAACGATACACCGGTGCAGCAGTGGTAACTCTGGGCTCTGTTATTTGGGCAGAACCCCTCCCAATTGGAACATCAGCCCAGAAAGCAGAATTGATCGCACTAACAAAGGCCCTGGAATGGAGCAAGGACAAGAGCGTCAACATCTACACGGATAGCCGTTATGCATTCGCCACTCTACACGTCCATGGGATGATCTACAGAGAAAGGGGACTGTTGACAGCAGGGGGGAAGGCTATCAAAAACGCCCCCGAAATTCTAGCCTTGCTGACCGCGGTCTGGCTACCTAAACGGGTAGCTGTGATGCATTGCAAGGGACACCAGAAAGACGATGCACCCACATCAACTGGTAACCGACGGGCAGATGAGGTGGCTCGAGAAGTAGCTATACGTCCTTTGAGCACCCAGGCCACCATCTCCGATGCACCGGATATGCCAGATACCGAAACCCCTCAGTATTCGCATGTAGAGGAGGCTCTAGGACATCGACTAAGGGGGGCCAAAGACCCTGCTGGGTGGTGGCACCTTCCTGACGGGCGCCTCTTGCTTCCCAGAGCAGTGGGGAGAAAGGTCCTAGAGCAAACTCACAGAGCCACACATTTGGGTGAATC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| 72,499
|
MF185397.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Su,Q.
|
Shandong Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2017-10-05
| null |
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
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|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
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Reticuloendotheliosis virus strain SDAUR-S1, complete genome
|
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| 74,449
|
KX278301.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Cui,S., Li,Y.
|
Shandong Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2016-09-07
| null |
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,362
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null |
2016-03
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus strain IBD-C1605, complete genome
|
AATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGGAATAGTGCTGGCTCGCTAACTGCTATATTAGCTTCTGTACACATGCTTGCTTGCCTTAGCCGCCATTGTACTTGATATGCCATTTCTCGGAATCGGCATCAAGTCTCGCTTCTCGGAATCGGCATCAAGTTTCGCTTCTCGAAATCGGCGTCATTTCTCGGCATCGAGAGCAAGCTCATAAACCATAAAAGGAAATGTGTATTGAAGGCAAGCATCAGACCACTTGCGCCATCCAATCACGAACGAACACGAGATCGGACTATCATACTGAGCCAATGGTTGTAAAGGGCAGATGCTACTCTCCAATGAGGGAAAATGTCATGTAACACCCTGTAAGCTGTAAGCGGCTATATAAGCCGGGTACATCTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACACATTGTTGTTGTGACGTGCGGCCCAGATTCGAATCTGTAATAAAACCTTTTTTTTTCTGAATCCTCAGATTGGCAGTGAGAGGAGATTTTGTTCGTGGTGTTGGCTCGCCTACTGGGTGGGCGCAGGGATCCGGACTGAATCCGTAGTACTTCGGTACAACATTTGGGGGCTCGTCCGGGATACCCTCCCCATCGGCAGAGGTGCCTACTGTTTCTTCGAACTCCGGCGCCGGTAAGTAAGTGCTTGATTTTGGTACCTCGCGAGGGTTTGGGAGGATCGGAGTGGCGGGACGCTGCCGGGAAGCTCCACCTCCGCTCAGCAGGGGACGCCCTGGTCTGAGCTCTGTGGTATCTGATTGTTGTTGAACCGCCTCTAAGACGGTGATACTATAAGTCGTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCTTGTGTTTGTTCGTCACTTGTCGACAGCGCCCTGCGAATTGGTGTACCCACACCGCGGGGCTTGCGAATAATACTTTGGAGAGTCTTTTGCCTCCAGTGTCTTCCGTTTGTACTCGTCCTCCTCTCCCTCTCCGGCCGGGATGGGACAGGCAGGATCGAAGGGGCTTTTAACCCCTCTAGAGTGCATTCTGAAGAACTTCTCTGACTTTAAGAAGAGGGCGGGAGACTATGGGGAGGATGTGGATTCGTTTACCCTTCGCAAGTTATGTGAGTTTGAATGGCCCACGTTTGGCGTGGGGTGGCCGAAAGAAGGGACTCTAGACTTTAGGGTGGTAGCCGCGGTCAGGAATATAGTTTTTGGGAATCCAGGGCATCCAGACCAGGTAATATATATAACCGTCTGGATAGATATAACCATAGAAAGGCCTAAATACTTGAAAGATTGCGGGTGTAAACCCACAGGACCCTCTAAAGTTCTGTTAGCTAGCCAAAAAGTTAATCCCAGGCGGCCCGTGCTCCCCTCAGCCCCAAGAAGCCCGCCTCGGATAAGGGAGGCTCAATTCCTGATGAAGAGACCTCTCTCTCGGGCCCCAGCCTCTCCACCTCCATATCTGAGTACTGCATGCAAAGAAGGTAGGAGGCCACAACCAGACTCTACTGTAATGGCGAGCCCTCCCCTCACCCGAAGTGGGTTAGAGTTCGGAGCACAAGGGCCGTCAGGGATGTACCCCCTTAGGGAAACTGGGGAACGGGATATGACTGGTCGCCCCATGAGAACATATGTTCCATTCACCACCTCGGATCTGTATAATTGGAAAAACCAAAACCCATCATTCTCCCAGGCTCCAGATGAAGTAATTAGCCTATTAGAATCCGTTTTCTACACACACCAGCCTACCTGGGATGATTGCCAGCAACTCCTCCGTACCCTGTTCACGACGGAGGAAAGGGAGAGGGTAAGGACAGAAAGTAGGCGGGAGGTCAGGAATGATCAGGGAGTACAGGTCACTGACGAGCGAGAAGTAGAAGCCCAGTTCCCAGCGACTCGGCCCGACTGGGATCCTAACACAGGGAGAGGAAACGATAATCTAGAACGATATCGCCAGATCTTGCTACGGGGGCTTCGGGCAGCGGCACGGAAACCCACTAATCTGTCTAAAATAACTGAGGTTCGGCAGGGGGCGGACGAAAGTCCCACAGCTTACCTGGAGAGACTCTATCAGGCTTATCGGACCTGGTCCCCCATAGATCCAAGGGCACCCGAGAATCAGGCTGCCATAGTCATTCAATTTGTATCTCAATCCGCACCCGATATTAGGAAGAAAATCCAAAAGATAGATGGGTTCCAAGGGAAATCTCTCTCCGAGTTAGTAGCTATTGCTCAGAAGGTTTTCGACCAACGGGAAGACCCAGCCAAAGCAACTCACGAACTCACCCAGAAGATGGCCAAAGTACTACTCGCCCAGGAGAGTAGAGCGGAGAGAGGAAGTAAGAAGACGCCTCCGGGTAAGGGACGCCCGCCTTTGGGGAAAAACCAATGCGCGTACTGTAAGGAGGAGGGACATTGGAAGAAGAACTGTCCAAAACTCGTAAGCGGGGCAGCCCCAGTATTGGTAGAGGAATTACAATAGGGCCGTCAGGGTTCTCCCGCCCTCCGTGAACCCAGGCTAAAAGTTAAGGTAGGGGGGCAAGTAATTGATTTTCTAGTAGATACGGGAGCGACCCATTCTGTGGTGCAGAAACCTGTGGGGCCTATGTCTAAAGAATCTGTAGCAATTATAGGGGCTACTGGGAACATACGGAATTACCCTAAGTCTGAAGGGCGTCTTGTGGACCTAGGGAGGGGACTAGTGACTCATTCCTTTCTGGTGATTCCTGAGTGCCCAGACCCGCTACTGGGGAGGGATCTATTACAGAAGCTAAGGGCTACCATCTCGTTCACCGGGGAAGGGCCCCCCGAAATACGGACAGAAGGGAAACTATTGGTAACGGCTCCCCTAGAAGAGGAATACCGTTTGTTTTTAGAGGCGCCGATACAGAATGTTACGCTGCTAGAGCAGTGGAAACGGGAAATCCCGAAAGTCTGGGCCGAGATAAATCCCCCGGGGTTGGCATCCACACAAGCCCCCATTCATGTCCAGCTATTAAGTACCGCCCTACCTGTGAGGGTAAGACAGTATCCTATTACCTTGGAGGCAAGACGAAGCCTGCGCGAAACTATTCGCAAATTCAGAGCAGCGGGCATCCTGAGACCCGTCCACTCCCCCTGGAACACTCCTCTCCTCCCTGTGCGAAAGCCCGGCACGTCCGAATATCGGATGGTTCAAGATTTAAGAGAAGTAAACAAGAGAGTAGAGACTATCCACCCAACTGTCCCTAACCCGTATACCCTCCTCAGCCTACTACCCCCTGACCGAACATGGTATTCTGTTTTGGACCTGAAAGACGCCTTTTTCTGCATCCCTCTGGCCCCTAAGTCGCAATTGATCTTCGCATTCGAGTGGACAGATGCGGAGGAAGGGGAATCAGGGCAGCTAACCTGGACAAGGCTACCTCAGGGTTTTAAGAACTCACCCACCCTTTTTGATGAAGCCCTTAATAGGGATCTGCAGGGATTTCGACTTGACCACCCTTCCGTTTCCCTCCTTCAGTATGTAGATGACTTACTTATTGCGGCTGACACACAAGCCGCATGCCTGAGTGCCACCCGAGACTTACTCATGACTTTAGCGGAGTTGGGGTACCGGGTTTCAGGGAAAAAGGCCCAGCTCTGTCAAGAGGAAGTCACATACTTGGGATTCAAGATCCATAAGGGATCACGGACCCTATCAAATAGCCGAACTCAGGCTATTCTTCAGATACCAGTACCGAAAACCAAAAGGCAAGTGCGCGAATTTTTAGGTACAATTGGGTACTGCAGACTTTGGATCCCGGGGTTCGCTGAACTTGCTCAGCCCCTATATGCGGCAACGCGGGGGGGAAATGATCCTTTAGAGTGGGGCGAAAAAGAGGAAGAGGCGTTCCAGAGTTTGAAGCTAGCCCTCACACAGCCACCAGCTTTGGCCCTGCCCTCCCTAGACAAGCCTTTCCAGCTCTTCATAGAAGAAACAGGCGGGGCGGCCAAGGGAGTGCTCACACAGGCCCTCGGTCCATGGAAAAGACCCGTAGCCTACTTATCCAAAAGGCTGGACCCTGTGGCAGCTGGCTGGCCCCGGTGCCTCCGAGCCATTGCGGCAGCCGCTCTTCTCACAAGAGAAGCCTCTAAACTTACCTTCGGGCAGGACATAGAGATCACCTCGTCTCATAACTTGGAGAGTTTGCTGCGATCCCCTCCTGACAGGTGGCTGACCAATGCTCGCATCACGCAGTACCAGGTACTTCTTCTGGACCCTCCCCGAGTGCGCTTCAAGCAGACTGCGGCCCTCAATCCGGCTACCCTGTTACCCGAGACAGACGATACGCTGCCAATACACCATTGCCTGGACACTTTAGATTCTCTGACCTCCACCCGCCCCGACCTGACGGATCAGCCCCTGGCTCAAGCAGAAGCCACCTTGTTCACTGACGGCAGCAGCTACATCCGAGACGGAAAACGATACGCCGGTGCAGCAGTAGTGACTCTGGACTCTGTTATCTGGGCAGAACCTCTCCCAATTGGAACATCAGCCCAGAAAGCAGAATTGATCGCACTAACAAAGGCCCTGGAATGGAGCAAGGACAAGAGCGTCAACATCTACACGGATAGCCGTTATGCATTCGCCACTCTACACGTCCATGGGATGATCTACAAGGAAAGGGGACTGTTGACAGCAGGAGGAAAAGCTATCAAGAACGCCCCCGAAATTTTAGCCCTGCTGACCGCGGTCTGGCTACCTAAACGGGTAGCTGTGATGCATTGTAGGGGACACCAGAAAGACGACGCGCCCACATCAGCTGGTAACCGACGGGCAGATGAGGTGGCTCGCGATGTAGCTATACGTCCTTTGAGCATCCAAGCCACCGTCTCCGATGCACCGGATATGCCAGATACCGAAACCCCTCAGTATTCGCATATAGAGGAGGCTCTAGGACATCGACTAAGGGGGACCAAAGACCCTGCTGGGTGGTGGCACCTTCCTGACGGGCGCCTCTTGCTTCCCAGAGCAGTGGGGAGAAAGGTCCTA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| 80,027
|
KU204702.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Zhai,S.L., Chen,S.N., Lin,T., Wen,X.H., Wei,W.K., Lv,D.H., Chen,R.A., Zhai,S.-L.
|
Animal Disease Diagnostic Center, Institute of Animal Health, Guangdong Academy of Agricultural Sciences
|
China
|
2016-05-15
|
GDBL1401
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| 1
|
China: Guangdong
|
China
|
Columbidae
| null |
2014-04
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate GDBL1401, complete genome
|
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| 81,943
|
KU204703.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Zhai,S.L., Chen,S.N., Lin,T., Wen,X.H., Wei,W.K., Lv,D.H., Chen,R.A., Zhai,S.-L.
|
Animal Disease Diagnostic Center, Institute of Animal Health, Guangdong Academy of Agricultural Sciences
|
China
|
2016-05-15
|
GDBL1402
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| 1
|
China: Guangdong
|
China
|
Columbidae
| null |
2014-04
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate GDBL1402, complete genome
|
AATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGAATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGGAATAGCGCTGGCTCGCTAACTGCCATATTAGCTCCTGTAATCATGCTTGCTTGCCTTAGCCGCCATTGTACTTGATACATTTCGCTGATATCATTTCTCGGAATCGGCATCAAGAGCAGGCTCATAAACCATAAAAGGAAATGTTTGTTGAAGGCAAGCATCAGACCACTTGCACCATCCAATCACGAACAAACACGAGATCGAACTATCATACTGAGCCAATGGTTGTAAAGGGCAGATGCTATCCTCCAATGAGGGAAAATGTCATGCAACATCCTGTAAGCGGCTATATAAGCCAGGTGCATCTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACACATTGTTGTGACGTGCGGCCCAGATTCGAATCTGTAATAAAAGCTTTTTCTTCTATATCCTCAGATTGGCAGTGAGAGGAGATTTTGTTCGTGGTGTTGGCTGGCCTACTGGGTGGGGTAGGGATCCGGACTGAATCCGTAGTATTTCTGTACAACATTTGGGGGCTCGTCCGGGATTCCTCCCCATCGGCAGAGGTGCCTACTGTTTCTTCGAACTCCGGCGCCGGTAAGTAAGTGCTTGATTTTGGTACCTCGCGAGGGTTTGGGAGGATCGGAGTGGCGGGACGCTGCCGGGAAGCTCCACCTCCGCTCAGCAGGGGACGCCCTGGTCTGAGCTCTGTGGTATCTGATTGTTGTTGAACCGTCTCTAAGACGGTGATACTATAAGTCGTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCTTGTGTTTGTTCGTCACTTGTCGACAGCGCCCTGCGAATTGGTGTACCCACACCGCGCGGCTTGCGAATAATACTTTGGAGAGTCTTTTGCCTCCAGTGTCTTCCGTTTGTACTCGTCCTCCTCTCCCTCTCCGGCCGGGATGGGACAGGCAGGATCGAAGGGGCTTTTAACCCCTCTAGAGTGCATTCTGAAGAACTTCTCTGACTTTAAGAAGAGGGCGGGAGACTATGGGGAGGATGTGGATTCGTTTACCCTTCGCAAGTTATGTGAGTTTGAATGGCCCACGTTTGGCGTGGGGTGGCCGAAGGAAGGGACTCTAGACTTTAGGGTGGTAGCCGCGGTCAGGAATATAGTTTTTGGGAATCCAGGGCATCCAGACCAGGTAATATATATAACCGTCTGGATAGATATAACCATAGAAAGGCCTAAATACTTGAAAGATTGCGGGTGTAAACCCACAGGACCCTCTAAAGTTCTGTTAGCTAGCCAAAAAGTTAATCCCAGGCGGCCCGTGCTCCCCTCAGCCCCAGAAAGCCCCCCTCGGATGAGGAGGGCTCAATTCCTGGATGAGAGACCTCTCTCTCCGGCCCCAGCCCCTCCACCTCCATATCCTGAGGTACCTGCCATTGCAGAGGAAGGTGAGGAGGGGCAACAACCAGACTCTACTGTAATGGCGAGCCCTCCCCACACCCGAAGTGGGTTAGAGTTCGGAGCACAAGGGCCGTCAGGGATGTACCCCCTTAGGGAAACTGGGGAACGGGATATGGGTGGTCGCCCCATGAGAACATATGTCCCATTCACCACCTCGGATCTGTATAATTGGAAAAACCAAAACCCATCATTCTCCCAGGCTCCAGATGAAGTAATTAGCCTATTAGAATCCGTTTTCTATACACACCAGCCTACCTGGGATGATTGCCAGCAACTCCTCCGTACCCTGTTTACGACGGAGGAGAGGGAGAGGGTGAGGACAGAAAGTAGGCGGGAGGTCAGGAATGATCAGGGAGTACAGGTCACTGACGAGCGAGAAATAGAAGCCCAGTTCCCAGCTACTCGGCCCGACTGGGATCCTAACACAGGGAGAGGAAACGACAATCTAGAACGATATCGCCAGATCTTGCTGAGGGGGCTCCGGGCAGCGGCACGGAAACCCACCAATCTTTCTAAAATAACTGAGGTTCGGCAGGGGGCGGACGAAAGTCCTACAGCTTACCTGGAGAGACTCTATCAGGCTTATCGGACCTGGTCCCCCATAGATCCAAGGGCACCCGAGAATCAGGCTGCCATAGTCATTCAATTTGTATCTCAATCCGCGCCCGATATTAGGAAGAAAATCCAAAAGATAGATGGGTTCCAGGGGAAATCTCTCTCCGAGTTAGTAGCTATTGCCCAGAAGGTTTTCGACCAACGGGAAGACCCAGCCAAGGCAACTCACGAACTCACTCAGAAGATGGCCAAGGTACTACTCGCCCAGGAGAGTAGAGCGGAGAGAGGAAGTAAGAAGACGCCTCCGGGTAAGGGACGCCCGCCTTTGGGGAAAAACCAATGCGCGTACTGTAAGGAGGAGGGACATTGGAAGAAGAACTGTCCAAAACTCGTAAGCGGGGCAACCCCAGTGTTGGTAGAAGAATTACAATAGGGCCGTCAGGGTTCTTCCGCCCTCCGTGAACCCAGGCTAAAAATTAAAGTAGGGGGGCAAATAATAGATTTTCTAGTAGATACGGGAGCGACCCATTCTGTAGTGCAGAAACCTGTGGGGCCCATGTCTAAAGAATCTGTAGCAATTATCGGGGCTACTGGGAACATACGGAATTACCCTAAGTCTGAAGGGCGTCTTGTGGACCTAGGGAGGGGACTAGTGACTCATTCATTTCTAGTGATTCCTGAGTGCCCAGACCCACTATTGGGGAGGGATCTATTACAGAAGCTAAGGGCTACCATCTCGTTCACCGGGGAAGGGCCCCCCGAAATACGGACAGAAGGGAAACTATTGGTAACGGCTCCCCTGGAAGAGGAATACCGTTTGTTTTTAGAGGCGCCGATACAAAATGTTACGCTGCTAGAGCAGTGGAAACGGGAAATCCCGAAAGTCTGGGCCGAGATAAATCCCCCGGGGTTGGCATCCACACAAGCCCCCATTCATGTCCAGCTATTAAGTACCGCCCTACCTGTGAGGGTAAGACAGTATCCTATTACCCTGGAGGCAAAACGAAGCCTGCGCGAAACTATTCGCAAATTCAGAGCAGCGGGCATCCTGAGACCCGTCCACTCCCCCTGGAACACTCCCCTCCTCCCTGTGCGAAAGTCCGGCACGTCCGAGTATCGGATGGTTCAAGATTTAAGGGAAGTAAACAAGAGAGTAGAGACTATTCACCCAACTGTCCCTAACCCATACACCCTCCTCAGCCTATTACCCCCTGACCGAATATGGTATTCTGTTTTGGACCTGAAAGACGCCTTTTTCTGCATCCCTCTGGCCCCTGAGTCGCAATTGATCTTCGCATTCGAGTGGGCAGATGCGGAGGAAGGAGAATCAGGGCAACTAACCTGGACTAGGCTACCTCAGGGTTTTAAGAACTCACCCACCCTTTTTGATGAAGCCCTTAACAGGGATCTGCAGGGATTTCGACTTGATCACCCTTTCGTTTCCCTCCTTCAGTATGTAGACGACTTACTTATTGCGGCTGATACACAAGCCGCATGCCTGAGTGCCACCCGAGACTTACTCATGACTTTAGCGGAGCTGGGGTACCGGGTTTCAGGGAAGAAGGCCCAGCTCTGTCAAGAGGAAGTCACATACTTGGGGTTCAAGATCCATAAGGGATCACGGACCCTATCAAATAGCCGAACTCAGGCTATTCTTCAGATACCAGTACCGAAAACCAAAAGGCAGGTGCGCGAATTTTTAGGTACAATTGGGTACTGCAGGCTTTGGATCCCGGGGTTTGCCGAACTTGCCCAGCCCCTATATGCGGCAACGCGGGGGGGAAATGATCCTTTAGTGTGGGGCGAAAAAGAGGAAGAAGCGTTCCAGAGCTTGAAACTAGCCCTCACACAGCCACCAGCTTTGGCCCTGCCCTCCCTAGATAAGCCTTTCCAGCTCTTCGTAGAAGAAACAGGCGGGGCGGCCAAGGGAGTGCTCACACAGGCCCTCGGTCCATGGAAAAGACCCGTAGCCTACTTATCCAAAAGGCTGGACCCTGTGGCAGCTGGCTGGCCCCGGTGCCTCCGAGCCATTGCGGCAGCCGCTCTTCTCACAAGAGAAGCCTCTAAACTTACCTTCGGGCAGGACATAGAGATCACTTCGTCCCATAACTTGGAGAGTTTGCTGCGATCCCCTCCTGACAGGTGGCTGACCAATGCTCGCATCACGCAGTACCAGGTACTGCTCCTGGACCCTCCCCGAGTGCGCTTTAAGCAGACTGCGGCCCTCAATCCGGCTACCCTGTTACCCGAGACAGACGATACGCTGCCAATACACCATTGCCTGGACACTTTAGATTCTCTGACCTCCACCCGCCCCGACCTGACGGATCAGCCCCTGGCACAAGCGGAAGCCACCCTGTTCACTGACGGCAGCAGCTACATACGAGACGGAAAACGATACACCGGTGCAGCAGTGGTAACTCTGGACTCTGTTATTTGGGCAGAACCCCTCCCAATTGGAACATCAGCCCAGAAAGCAGAATTGATCGCACTAACAAAGGCCCTGGAATGGAGCAAGGACAAGAGCGTCAACATCTACACGGATAGCCGTTATGCATTCGCCACTCTACACGTCCATGGGATGATCTACAGAGAAAGGGGACTGTTGACAGCAGGGGGGAAGGCTATCAAAAACGCCCCCGAAATTCTAGCCTTGCTGACCGCGGTCTGGCTACCTAAACGGGTAGCTGTGATGCATTGCAAGGGACACCAGAAAGACGATGCACCCACATCAACTGGTAACCGACGGGCAGATGAGGTGGCTCGAGAAGTAGCTATACGTCCTTTGAGCACCCAGGCCACCATCTCCGATGCACCGGATATGCCAGATACCGAAACCCCTCAGTATTCGCATGTAGAGGAGGCTCTAGGACATCGACTAAGGGGGACCAAAGACCCTGCTGGGTGGTGGCACCTTCCTGACGGGCGCCTCTTGCTTCCCAGAGCAGTGGGGAGAAAGGTCCTAGAGCAAACTCACAGAGCCACACATTTGGGTGAATC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| 81,944
|
KU641115.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Wang,Y., Luan,H., Xu,S., Li,Y., Chang,S., Zhao,P., Cui,Z.
|
Shandong Agricultural University, College of Animal Science and Veterinary Medicine
|
China
|
2016-03-14
|
LN1201
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,438
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2012-01-01
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate LN1201, complete genome
|
AATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGAATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGGAATAGTGCTGGCTCGCTAACTGCTATATTAGCTTCTGTACACATGCTTGCTTGCCTTAGCCGCCATTGTACTTGATATGCCATTTCTCGGAATCGGCATCAAGTCTCGCTTCTCGGAATCGGCATCAAGTTTCGCTTCTCGAAATCGGCGTCATTTCTCGGCATCGAGAGCAAGCTCATAAACCATAAAAGGAAATGTGTATTGAAGGCAAGCATCAGACCACTTGCGCCATCCAATCTGCACCATCCAATCACGAACGAACACGAGATCGGACTATCATACTGAGCCAATGGTTGTAAAGGGCAGATGCTACTCTCCAATGAGGGAAAATGTCATGTAACACCCTGTAAGCTGTAAGCGGCTATATAAGCCGGGTACATCTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACACATTGTTGTTGTGACGTGCGGCCCAGATTCGAATCTGTAATAAAACTTTTTTTTCTGAATCCTCAGATTGGCAGTGAGAGGAGATTTTGTTCGTGGTGTTGGCTGGCCTACTGGGTGGGGTAGGGATCCGGACTGAATCCGTAGTATTTCGGTACAACATTTGGGGGCTCGTCCGGGATTCCTCCCCATCGGCAGAGGTGCCTACTGTTTCTTCGAACTCCGGCGCCGGTAAGTAAGTGCTTGATTTTGGTACCTCGCGAGGGTTTGGGAGGATCGGAGTGGCGGGACGCTGCCGGGAAGCTCCACCTCCGCTCAGCAGGGGACGCCCTGGTCTGAGCTCTGTGGTATCTGATTGTTGTTGAACCGTCTCTAAGACGGTGATACTATAAGTCGTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCTTGTGTTTGTTCGTCACTTGTCGACAGCGCCCTGCGAATTGGTGTACCCACACCGCGCGGCTTGCGAATAATACTTTGGAGAGTCTTTTGCCTCCAGTGTCTTCCGTTTGTACTCGTCCTCCTCTCCCTCTCCGGCCGGGATGGGACAGGCAGGATCGAAGGGGCTTTTAACCCCTCTAGAGTGCATTCTGAAGAACTTCTCTGACTTTAAGAAGAGGGCGGGAGACTATGGGGAGGATGTGGATTCGTTTACCCTTCGCAAGTTATGTGAGTTTGAATGGCCCACGTTTGGCGTGGGGTGGCCGAAGGAAGGGACTCTAGACTTTAGGGTGGTAGCCGCGGTCAGGAATATAGTTTTTGGGAATCCAGGGCATCCAGACCAGGTAATATATATAACCGTCTGGATAGATATAACCATAGAAAGGCCTAAATACTTGAAAGATTGCGGGTGTAAACCCACAGGACCCTCTAAAGTTCTGTTAGCTAGCCAAAAAGTTAATCCCAGGCGGCCCGTGCTCCCCTCAGCCCCAGAAAGCCCCCCTCGGATGAGGAGGGCTCAATTCCTGGATGAGAGACCTCTCTCTCCGGCCCCAGCCCCTCCACCTCCATATCCTGAGGTACCTGCCATTGCAGAGGAAGGTGAGGAGGGGCAACAACCAGACTCTACTGTAATGGCGAGCCCTCCCCACACCCGAAGTGGGTTAGAGTTCGGAGCACAAGGGCCGTCAGGGATGTACCCCCTTAGGGAAACTGGGGAACGGGATATGGGTGGTCGCCCCATGAGAACATATGTCCCATTCACCACCTCGGATCTGTATAATTGGAAAAACCAAAACCCATCATTCTCCCAGGCTCCAGATGAAGTAATTAGCCTATTAGAATCCGTTTTCTATACACACCAGCCTACCTGGGATGATTGCCAGCAACTCCTCCGTACCCTGTTTACGACGGAGGAGAGGGAGAGGGTGAGGACAGAAAGTAGGCGGGAGGTCAGGAATGATCAGGGAGTACAGGTCACTGACGAGCGAGAAATAGAAGCCCAGTTCCCAGCTACTCGGCCCGACTGGGATCCTAACACAGGGAGAGGAAACGACAATCTAGAACGATATCGCCAGATCTTGCTGAGGGGGCTCCGGGCAGCGGCACGGAAACCCACCAATCTTTCTAAAATAACTGAGGTTCGGCAGGGGGCGGACGAAAGTCCTACAGCTTACCTGGAGAGACTCTATCAGGCTTATCGGACCTGGTCCCCCATAGATCCAAGGGCACCCGAGAATCAGGCTGCCATAGTCATTCAATTTGTATCTCAATCCGCGCCCGATATTAGGAAGAAAATCCAAAAGATAGATGGGTTCCAGGGGAAATCTCTCTCCGAGTTAGTAGCTATTGCCCAGAAGGTTTTCGACCAACGGGAAGACCCAGCCAAGGCAACTCACGAACTCACTCAGAAGATGGCCAAGGTACTACTCGCCCAGGAGAGTAGAGCGGAGAGAGGAAGTAAGAAGACGCCTCCGGGTAAGGGACGCCCGCCTTTGGGGAAAAACCAATGCGCGTACTGTAAGGAGGAGGGACATTGGAAGAAGAACTGTCCAAAACTCGTAAGCGGGGCAACCCCAGTGTTGGTAGAAGAATTACAATAGGGCCGTCAGGGTTCTTCCGCCCTCCGTGAACCCAGGCTAAAAATTAAAGTAGGGGGGCAAATAATAGATTTTCTAGTAGATACGGGAGCGACCCATTCTGTAGTGCAGAAACCTGTGGGGCCTATGTCTAAAGAATCTGTAGCAATTATCGGGGCTACTGGGAACATACGGAATTACCCTAAGTCTGAAGGGCGTCTTGTGGACCTAGGGAGGGGACTAGTGACTCATTCATTTCTAGTGATTCCTGAGTGCCCAGACCCACTATTGGGGAGGGATCTATTACAGAAGCTAAGGGCTACCATCTCGTTCACCGGGGAAGGGCCCCCCGAAATACGGACAGAAGGGAAACTATTGGTAACGGCTCCCCTGGAAGAGGAATACCGTTTGTTTTTAGAGGCGCCGATACAAAATGTTACGCTGCTAGAGCAGTGGAAACGGGAAATCCCGAAAGTCTGGGCCGAGATAAATCCCCCGGGGTTGGCATCCACACAAGCCCCCATTCATGTCCAGCTATTAAGTACCGCCCTACCTGTGAGGGTAAGACAGTATCCTATTACCCTGGAGGCAAAACGAAGCCTGCGCGAAACTATTCGCAAATTCAGAGCAGCGGGCATCCTGAGACCCGTCCACTCCCCCTGGAACACTCCCCTCCTCCCTGTGCGAAAGTCCGGCACGTCCGAGTATCGGATGGTTCAAGATTTAAGGGAAGTAAACAAGAGAGTAGAGACTATTCACCCAACTGTCCCTAACCCATACACCCTCCTCAGCCTATTACCCCCTGACCGAATATGGTATTCTGTTTTGGACCTGAAAGACGCCTTTTTCTGCATCCCTCTGGCCCCTGAGTCGCAATTGATCTTCGCATTCGAGTGGGCAGATGCGGAGGAAGGAGAATCAGGGCAACTAACCTGGACTAGGCTACCTCAGGGTTTTAAGAACTCACCCACCCTTTTTGATGAAGCCCTTAACAGGGATCTGCAGGGATTTCGACTTGATCACCCTTTCGTTTCCCTCCTTCAGTATGTAGACGACTTACTTATTGCGGCTGATACACAAGCCGCATGCCTGAGTGCCACCCGAGACTTACTCATGACTTTAGCGGAGCTGGGGTACCGGGTTTCAGGGAAGAAGGCCCAGCTCTGTCAAGAGGAAGTCACATACTTGGGGTTCAAGATCCATAAGGGATCACGGACCCTATCAAATAGCCGAACTCAGGCTATTCTTCAGATACCAGTACCGAAAACCAAAAGGCAGGTGCGCGAATTTTTAGGTACAATTGGGTACTGCAGGCTTTGGATCCCGGGGTTTGCCGAACTTGCCCAGCCCCTATATGCGGCAACGCGGGGGGGAAATGATCCTTTAGTGTGGGGCGAAAAAGAGGAAGAAGCGTTCCAGAGCTTGAAACTAGCCCTCACACAGCCACCAGCTTTGGCCCTGCCCTCCCTAGATAAGCCTTTCCAGCTCTTCGTAGAAGAAACAGGCGGGGCGGCCAAGGGAGTGCTCACACAGGCCCTCGGTCCATGGAAAAGACCCGTAGCCTACTTATCCAAAAGGCTGGACCCTGTGGCAGCTGGCTGGCCCCGGTGCCTCCGAGCCATTGCGGCAGCCGCTCTTCTCACAAGAGAAGCCTCTAAACTTACCTTCGGGCAGGACATAGAGATCACTTCGTCCCATAACTTGGAGAGTTTGCTGCGATCCCCTCCTGACAGGTGGCTGACCAATGCTCGCATCACGCAGTACCAGGTACTGCTCCTGGACCCTCCCCGAGTGCGCTTTAAGCAGACTGCGGCCCTCAATCCGGCTACCCTGTTACCCGAGACAGACGATACGCTGCCAATACACCATTGCCTGGACACTTTAGATTCTCTGACCTCCACCCGCCCCGACCTGACGGATCAGCCCCTGGCACAAGCGGAAGCCACCCTGTTCACTGACGGCAGCAGCTACATACGAGACGGAAAACGATACACCGGTGCAGCAGTGGTAACTCTGGACTCTGTTATTTGGGCAGAACCCCTCCCAATTGGAACATCAGCCCAGAAAGCAGAATTGATCGCACTAACAAAGGCCCTGGAATGGAGCAAGGACAAGAGCGTCAACATCTACACGGATAGCCGTTATGCATTCGCCACTCTACACGTCCATGGGATGATCTACAGAGAAAGGGGACTGTTGACAGCAGGGGGGAAGGCTATCAAAAACGCCCCCGAAATTCTAGCCTTGCTGACCGCGGTCTGGCTACCTAAACGGGTAGCTGTGATGCATTGCAAGGGACACCAGAAAGACGATGCACCCACATCAACTGGTAACCGACGGGCAGATGAGGTGGCTCGAGAAGTAGCTATACGTCCTTTGAGCACCCAGGCCACCATCTCCGATGCACCGGATATGCCAGATACCGAAACCCCTCAGTATTCGCATGTAGAGGAGGCTCTAGGACATCGACTAAGGGGGACCAAAGACCCTGCTGGGTGGTGGCACCTTCCTGAC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| 83,256
|
KJ909530.1
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Bao,K.Y., Zhang,Y.P., Zheng,H.W., Lv,H.C., Gao,Y.L., Wang,J.F., Gao,H.L., Qi,X.L., Cui,H.Y., Wang,Y.Q., Ren,X.G., Wang,X.M., Liu,C.J., Bao,K., Zhang,Y., Zheng,H., Lv,H., Gao,Y., Qi,X., Gao,H., Liu,C., Wang,X.
|
Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Division of Avian Infectious Diseases, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology
|
China
|
2014-08-10
|
SY1209
|
Reticuloendotheliosis virus
|
Gammaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,284
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2012-09
| null | null |
Reticuloendotheliosis virus isolate SY1209, complete genome
|
AATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGAATGTGGGAGGGAGCTCCGGGGGGAATAGCGCTGGCTCGCTAACTGCCATATTAGCTTCTGTAATCATGCTTGCTTGCCTTAGCCGCCATTGTACTTGATATATTTCGCTGATATCATTTCTCGGAATCGGCATCAAGAGCAGGCTCATAAACCATAAAAGGAAATGTTTGTTGAAGGCAAGCATCAGACCACTTGCACCATCCAATCACGAACAAACACGAGATCGAACTATCATACTGAGCCAATGGTTGTAAAGGGCAGATGCTATCCTCCAATGAGGGAAAATGTCATGCAACATCCTGTAAGCGGCTATATAAGCCAGGTGCATCTCTTGCTCGGGGTCGCCGTCCTACACATTGTTGTGACGTGCGGCCCAGATTCGAATCTGTAATAAAAGCTTTTTCTTCTATATCCTCAGATTGGCAGTGAGAGGAGATTTTGTTCGTGGTGTTGGCTGGCCTACTGGGTGGGGTAGGGATCCGGACTGAATCCGTAGTATTTCGGTACAACATTTGGGGGCTCGTCCGGGATTCCTCCCCATCGGCAGAGGTGCCTACTGTTTCTTCGAACTCCGGCGCCGGTAAGTAAGTGCTTGATTTTGGTACCTCGCGAGGGTTTGGGAGGATCGGAGTGGCGGGACGCTGCCGGGAAGCTCCACCTCCGCTCAGCAGGGGACGCCCTGGTCTGAGCTCTGTGGTATCTGATTGTTGTTGAACCGTCTCTAAGACGGTGATACTATAAGTCGTGGTTTGTGTGTTTGTTTGTTACCTTGTGTTTGTTCGTCACTTGTCGACAGCGCCCTGCGAATTGGTGTACCCACACCGCGCGGCTTGCGAATAATACTTTGGAGAGTCTTTTACCTCCAGTGTCTTCCGTTTGTACTCGTCCTCCTCTCCCTCTCCGGCCGGGATGGGACAGGCAGGATCGAAGGGGCTTTTAACCCCTCTAGAGTGCATTCTGAAGAACTTCTCTGACTTTAAGAAGAGGGCGGGAGACTATGGGGAGGATGTGGATTCGTTTACCCTGCGCAAGTTATGTGAGTTTGAATGGCCCACGTTTGGCGTGGGGTGGCCGAAGGAAGGGACTCTAGACTTTAGGGTGGTAGCCGCGGTCAGGAATATAGTTTTTGGGAATCCAGGGCATCCAGACCAGGTAATATATATAACCGTCTGGATAGATATAACCATAGAAAGGCCTAAATACTTGAAAGATTGCGGGTGTAAACCCACAGGACCCTCTAAAGTTCTGTTAGCTAGCCAAAAAGTTAATCCCAGGCGGCCCGTGCTCCCCTCAGCCCCAGAAAGCCCCCCTCGGATGAGGAGGGCTCAATTCCTGGATGAGAGACCTCTCTCTCCGGCCCCAGCCCCTCCACCTCCATATCCTGAGGTACCTGCCATTGCAGAGGAAGGTGAGGAGGGGCAACAACCAGACTCTACTGTAATGGCGAGCCCTCCCCACACCCGAAGTGGGTTAGAGTTCGGAGCACAAGGGCCGTCAGGGATGTACCCCCTTAGGGAAACTGGGGAACGGGATATGGGTGGTCGCCCCATGAGAACATATGTCCCATTCACCACCTCGGATCTGTATAATTGGAAAAACCAAAACCCATCATTCTCCCAGGCTCCAGATGAAGTAATTAGCCTATTAGAATCCGTTTTCTATACACACCAGCCTACCTGGGATGATTGCCAGCAACTCCTCCGTACCCTGTTTACGACGGAGGAGAGGGAGAGGGTGAGGACAGAAAGTAGGCGGGAGGTCAGGAATGATCAGGGAGTACAGGTCACTGACGAGCGAGAAATAGAAGCCCAGTTCCCAGCTACTCGGCCCGACTGGGATCCTAACACAGGGAGAGGAAACGACAATCTAGAACGATATCGCCAGATCTTGCTGAGGGGGCTCCGGGCAGCGGCACGGAAACCCACCGATCTTTCTAAAATAACTGAGGTTCGGCAGGGGGCGGACGAAAGTCCTACAGCTTACCTGGAGAGACTCTATCAGGCTTATCGGACCTGGTCCCCCATAGATCCAAGGGCACCCGAGAATCAGGCTGCCATAGTCATTCAATTTGTATCTCAATCCGCGCCCGATATTAGGAAGAAAATCCAAAAGATAGATGGGTTCCAGGGGAAATCTCTCTCCGAGTTAGTAGTTATTGCCCAGAAGGTTTTCGACCAACGGGAAGACCCAGCCAAGGCAACTCACGAACTCACTCAGAAGATGGCCAAGGTACTACTCGCCCAGGAGAGTAGAGCGGAGAGAGGAAATAAGAAGACGCCTCCGGGTAAGGGACGCCCGCCTTTGGGGAAAAACCAATGCGCGTACTGTAAGGAGGAGGGACATTGGAAGAAGAACTGTCCAAAACTCGTAAGCGGGGCAACCCCAGTGTTGGTAGAAGAATTACAATAGGGCCGTCAGGGTTCTTCCGCCCTCCGTGAACCCAGGCTAAAAATTAAAGTAGGGGGGCAAATAATAGATTTTCTAGTAGATACGGGAGCGACCCATTCTGTAGTGCAGAAACCTGTGGGGCCTATGTCTAAAGAATCTGTAGCAATTATCGGGGCTACTGGGAACATACGGAATTACCCTAAGTCTGAAGGGCGTCTTGTGGACCTAGGGAGGGGACTAGTGACTCATTCATTTCTAGTGATTCCTGAGTGCCCAGACCCACTATTGGGGAGGGATCTATTACAGAAGCTAAGGGCTACCATCTCGTTCACCGGGGAAGGGCCCCCCGAAATACGGACAGAAGGGAAACTATTGGTAACGGCTCCCCTGGAAGAGGAATACCGTTTGTTTTTAGAGGCGCCGATACAAAATGTTACGCTGCTAGAGCAGTGGAAACGGGAAATCCCGAAAGTCTGGGCCGAGATAAATCCCCCGGGGTTGGCATCCACACAAGCCCCCATTCATGTCCAGCTATTAAGTACCGCCCTACCTGTGAGGGTAAGACAGTATCCTATTACCCTGGAGGCAAAACGAAGCCTGCGCGAAACTATTCGCAAATTCAGAGCAGCGGGCATCCTGAGACCCGTCCACTCCCCCTGGAACACTCCCCTCCTCCCTGTGCGAAAGTCCGGCACGTCCGAGTATCGGATGGTTCAAGATTTAAGGGAAGTAAACAAGAGAGTAGAGACTATTCACCCAACTGTCCCTAACCCATACACCCTCCTCAGCCTATTACCCCCTGACCGAATATGGTATTCTGTTTTGGACCTGAAAGACGCCTTTTTCTGCATCCCTCTGGCCCCTGAGTCGCAATTGATCTTCGCATTCGAGTGGGCAGATGCGGAGGAAGGAGAATCAGGGCAACTAACCTGGACTAGGCTACCTCAGGGTTTTAAGAACTCACCCACCCTTTTTGATGAAGCCCTTAACAGGGATCTGCAGGGATTTCGACTTGATCACCCTTTCGTTTCCCTCCTTCAGTATGTAGACGACTTACTTATTGCGGCTGATACACAAGCCGCATGCCTGAGTGCCACCCGAGACTTACTCATGACTTTAGCGGAGCTGGGGTACCGGGTTTCAGGGAAGAAGGCCCAGCTCTGTCAAGAGGAAGTCACATACTTGGGGTTCAAGATCCATAAGGGATCACGGACCCTATCAAATAGCCGAACTCAGGCTATTCTTCAGATACCAGTACCGAAAACCAAAAGGCAGGTGCGCGAATTTTTAGGTACAATTGGGTACTGCGGGCTTTGGATCCCGGGGTTTGCCGAACTTGCCCAGCCCCTATATGCGGCAACGCGGGGGGGAAATGATCCTTTAGTGTGGGGCGAAAAAGAGGAAGAAGCGTTCCAGAGCTTGAAACTAGCCCTCACACAGCCACCAGCTTTGGCCCTGCCCTCCCTAGATAAGCCTTTCCAGCTCTTCGTAGAAGAAACAGGCGGGGCGGCCAAGGGAGTGCTCACACAGGCCCTCGGTCCATGGAAAAGACCCGTAGCCTACTTATCCAAAAGGCTGGACCCTGTGGCAGCTGGCTGGCCCCGGTGCCTCCGAGCCATTGCGGCAGCCGCTCTTCTCACAAGAGAAGCCTCTAAACTTACCTTCGGGCAGGACATAGAGATCACTTCGTCCCATAACTTGGAGAGTTTGCTGCGATCCCCTCCTGACAGGTGGCTGACCAATGCTCGCATCACGCAGTACCAGGTACTGCTCCTGGACCCTCCCCGAGTGCGCTTTAAGCAGACTGCGGCCCTCAATCCGGCTACCCTGTTACCCGAGACAGACGATACGCTGCCAATACACCATTGCCTGGACACTTTAGATTCTCTGACCTCCACCCGCCCCGACCTGACGGATCAGCCCCTGGCACAAGCGGAAGCCACCCTGTTCACTGACGGCAGCAGCTACATACGAGACGGAAAACGATACACCGGTGCAGCAGTGGTAACTCTGGACTCTGTTATTTGGGCAGAACCCCTCCCAATTGGAACATCAGCCCAGAAAGCAGAATTGATCGCACTAACAAAGGCCCTGGAATGGAGCAAGGACAAGAGCGTCAACATCTACACGGATAGCCGTTATGCATTCGCCACTCTACACGTCCATGGGATGATCTACAGAGAAAGGGGACTGTTGACAGCAGGGGGGAAGGCTATCAAAAACGCCCCCGAAATTCTAGCCTTGCTGACCGCGGTCTGGCTACCTAAACGGGTAGCTGTGATGCATTGCAAGGGACACCAGAAAGACGATGCACCCACATCAACTGGTAACCGACGGGCAGATGAGGTGGCTCGAGAAGTAGCTATACGTCCTTTGAGCACCCAGGCCACCATCTCCGATGCACCGGATATGCCAGATACCGAAACCCCTCAGTATTCGCATGTAGAGGAGGCTCTAGGACATCGACTAAGGGGGACCAAAGACCCTGCTGGGTGGTGGCACCTTCCTGACGGGCGCCTCTTGCTTCCCAGAGCAGTGGGGAGAAAGGTCCTAGAGCAAACTCACAGAGCCACACATTTGGGTGAATC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| 89,252
|
NC_076186.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Xu,L., He,B., Tu,C.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
| null |
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,866
|
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus affinis
|
abdominal cavity
|
2011
| null |
PRJNA485481
|
Rhabdoviridae sp. strain IH17, complete genome
|
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| 425
|
NC_076504.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Xu,L., Guo,M., Hu,B., Zhou,H., Yang,W., Hui,L., Huang,R., Zhan,J., Shi,W., Wu,Y.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
| null |
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,728
|
RefSeq
| 1
|
China
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
| null |
PRJNA485481
|
Rhabdoviridae sp. strain RhV/SZWH3, complete genome
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ATTTCATAAAGGGCCTAAGTGGAGTACCTAAAAAAAACTAGCAAACCTACCCTTTGCAGGGGAAAAGAGTGTTCCGTTCTTCTTCAAAGGGAGGTGGTGTAGAGGCTCAGTTCGGTTTCTTCCTTCCTTTTCCCTTCTCCTTCCTAGCTACACTTCTCACGTCAGTGTCCTTTCTACCTCATAGAATCTCTAGTTAGCGCGGTCTTCGGGCCTCCCGATGACCTCCGATTCCCCCCCATTTTTCTTCGGGCGTGCCCGGCTTGGGGCCCCAACCGGACGCGGTCTCCGACCGCCAGGAGGGACGTTCCGACGTGATCCGGGGGTTCCCCCGCAGGAGGTGGACGATGAGCCGGAGACGCCTCAGCAGCGCATGGAGCGCATCGCGATTTGGGAGAGATCCCAGCTGGGGATAGCAGTCCGAGAAGGAGTCACTGATCCGCGCCCCAGACCGAACCTCCTCACAATTCATCGCAGCTCGGTCCACACTTACCGTAGGGCAGTGAGGGTGACGGAGCGGGACGAGGCAGTCGAGTACCCCTCCCTTTGGTTCATCAAGAACCCCGGAAAAAGGCCCAAAGTGGTGTACAAAAAGTGGCAAATCTCTGGTCCTGAGCTCAAAAAGACGGTCATCCAAGGCTTCTTCCAGGACAACCTGGACCTATCCGTTGTGGCTCAGTACTTGGTGTACATCCTTCCCAAGTACAAGTTCAAGCTCGAGGAAAACTGGATCAGCTATGGAGTGGAGATAGGTCATGCCGGGCAAGAAATAACCCCTTTATCGCTCCTGGAGATTGCAGAAGAAGTGCAACCTGGAACCACTGGAAGCATCGCACCACAAGACTTCTCTGACATAGCAGTCATCCTGCTCATCACGACTCAGTATCGGCTCTCCGTGATGCACAACCGAGGGGCCAGACCGGAGTACATCAACCAGGTGACTGAGCGCTTCAAGACACTGGCTCCCGAACTGGGACTCACAGAGGCCGGGCTGCTGGGGAAAGAGCTCAAGGACGTCAAGATTTGGGCTCTAGAGCCGAACATCCGGAAACTGATGGCCGCCATCAACATGTTCATCGAGAAGACCTGGCACGACGAGCTGTCAGTGGCACGGATCGGCACCCTGGTCTCCAAGGGCAGAGACAGCGCAGTCATTGGAGACCTCCTTCGTCTCCAAAAGATCTTGGGTCTCAACACTGAGGGCACAATCAAGTGGTTATTCTCGCCTCTACTTGAAGTAGAGATCGATGCAATGACCGTGACGACCGAAGAGTACTGGGACGAGCAGGGGTACTTCTTCTACATGGCCGACATGGGTTTGTCTAAGAAGAGCCCCTACTCCGGATCCGCCAACCCTCGGATGCATTTTATCTTAAATGCAATTGCATTCTTCCTGGATGGGCAGGCGGCTCCAACGACCCGGTGGATCGAGTGCCCCAAGGTGCACACTCTTCTACGGGCAGCCATTCTGGCAGGTTTTGCTTTGAAGAGCCCGGGAGGGATTGCTCCGGTGGCAAGCGAGACTCCAGACGAGGGCCAGATGGTTACCCTGATCCTTCGTCGAATGGAGCAAGATGATGGAGTAGCTCTGGACGGCGCCCCTCGCACCAATGATTGGGCCAACTGGGTGATGTACTACGAACAAACGGAGTGGGAGGTCACCACCCAGATGAAGGAGTGGGCTCTGCGGTTCCGAAGGCCAGTGGGTGCTGCCCGTCCGGGCTCGCTGGCAGAGAAAATGAACTCTCTTCTGGAGACTCTCTAAGCAGAAGAATGTACGCATGCTCTAATACCCATGAAAAAAATCAGCAACTCTCCACCATGTCAGGACCTAACCCAACCCCGAAGGGACCGAGTGGTGTCGGGGCGAGGACATCCGGGCTCCGGGGCCCCTCTGGAACCCGGGAGCTCGGAGTTTTAGACATCGGGGCGAAGGCAAAGGCCTTGGGCCAGATGACAACTTTCCTACAGGAGCAAATTGAGGCCGAGGGAGACGATTTGTCGGGGTTTGAAGATGAGGAGGTGCAAGAGACGGTGCCTCATTACACGTGCCCAGGACCTGAACTGGAGACTGTCTCTCTTCCCCCTCCTGAAGAGCCGAGCATCTCCATCGAGTTAGATCCTGCTAAGGGAGATGTCAACTACATGTTTGACAAACTCAAAGAGGTCGTGAACCAGCTCGAGGTGCAGGGGGTCCTTCTCCCCTCAGAGCCGGTGTTGGTAGATCGAACTGCCATCATCAAGTACACCTGCGTCCCCAGAGTCCTCTCCGTGTCCACGGCCGATGATCGGTCCTCTGTGAATTCCGAGCCCACTCAGCCTGTGCTCGCTGCTTCAAAGGAACCCCCTGCAACGGACCCCACTCTTCTTCAGGAGGTCGAGAGTGTCTTCACCCCCGTCTCACTTCGAAATCTGATGGGTCGTCCTGTCTTGATTTCCCTGAGGGAGCAGGAAGTGAGCCGGGAGGATGTCTTAAAGGCGTTGAAGAAAGGACGAGAGGACGGGACCGGGATTGATCCAAAGAGTTCCGTGGAGAAGAAGGTGTACCTCCTCCTAGACCTCTCGGAGAAGGGCAAGAGATCGAAGCGCATTCTGCAGGCTCCACCATCTTGAAGGAACCTCCTCCCCAAGCTTGCCCCAGCGATCCCCTTGCTCCTGAAAAAAATCAGCAACCCTACACCATGTTGAGCAAACTCGGGCTCAAGAAGAAGACGGGAAAGAGTGCTCCCGCGGGGGCAACTCTAGGAGGGAGCTCATCTGGCTCCAATATAGTCGGTCCCTGGGTGAGTCCCTTTGCGGACCTCCCGTCAGAGTGGGAGCCCACCACTACCCCCTCAGCTCCTCCTCCAGGCATTGCTCACGTAGTCTTCGATCTCTCCACCTCGCTCCTGATTCGAGCCCCGAAGGAGCTCTCCCCTCGACTCATTGCAGAGATGAGCCTGAATTTCCCTTCCTCTTACCGGGGTGACCACGTCTCCAGGATCCTCGCCTACACTTGGATGGCTCACCACGTAGTTTCGGTCCGACCCGTTCCCGCCGCGGGACCGGACATTCGTTACTTCTCTGAAGTAAGTGAGTGTGTTCTGTTTTCCGGGGCCGAACCGGACCTACCCGCTCGAGGACCTCACCGCATTATGGACACATTCCAGTGGAGATACAAGGGGGAGATTTATGAATGGGGATTTAAACTCGAGGCCCACCCCACAGTGATGTCCGGGATTCCTCTCCACAAAGTCCTGTCGCCCAAAAGTGCTCAGGTGATCAGGGCATTTGGAGTCACTGCCACTTTCCACAAGAGTCCTGAGTACCTCGAGATCACCAAGCCGATGGTGGGACAATAGCGGGCGTGATCCGTGGGACAGATCCAGTCCTAAGTCTTCTGACGGCCCATGAAAAAAATCAGCAATCCTCCTAGGATTAGTGAGAGGAACGTTAGGTTCCTGTCTTGTACTTAATTTTCCTCTGTCAATCATGTCTTTCGGTGTAGTGCTTCTTCTCCTCCTTTGTTCAGGTCCGACGACCCAGGATGAAGATCTTGTTTCTGCCCCCTATTACTTTCCAGAATCAGCTCCTGCCCAGTGGCACCCTGTTCCCCTCTCCAGTGTAACGTGTCCTCCTCATCACTTTCGTCCATCCGGAAACGCCCATAGAGTGAAGATCAAGTCTCCTTACCGGACCCACCTCAGCAACGCTACCATTGATGGTGCAGTTTGTTACACAGCGACATTTTCCGTGAAATGCTCCGTGAATTTTGTCGGCTGGAGAACACTCGAATATTACATTGAACCACGACAATCAGACCTCACCGAGTGTAAGTCTTGGGTTGGTAAGCTTTTGAATGGGGAAGACATCCCCCCCGCCACGTTCCCTGCTCCAAACTGTGTCTGGTGGAGTGAGAACTGGTCCACAGAGTCACATACTTATGTGTCTCGACACGCAGTTCTTCAAGACCCATACTCGGAAACCCTTGCAGATCCTCTGTTCCCAGGGGGGAAATGTTCTAGTCAAACCTGCCCTTTAATCCACAAGGGAGGGTTTTGGATCCAGACCAGCGGATTCTCCTCTCTTTGTTCAAATTGGGAGGAGATTACCGGATTCTTGGGAACCTTCGGCAATGTCACCGTCGTCTCCCCTGAAGTCGGACCGTCTCGGATTTTGACAGGAGGGTGCAGGATGAATTATTGTGGTCGAGAAGGGGTCCGGACGAGTCAGGGAGAGTTCTTGAGCATAGAGGAGAGTCCGGGCTACACTCTGATCCACACCGTGATGAAGGTATGTTCTCCCGGACAAATTGTGAAGACAGGTTCGAAGAGGCCTTTTGCAGCATGGCTTGAGTACTCCGTCGCCGAGGAAGAGGAGAGATTGGAATGTCTAGCCCACCTATCCCTCAGCCTTGCGACCAACAAGGTCAGTCCAGAACTTCTCGGTGCATTGGCCCCTTATCATTCCGGACCGGGACTATCTTACCGAGTGAATGACGGAATCCTAGAAGTAGCAAAAGTCACATACGTCCCGATCTACGAGGCATCCAAAGTAAATGATCGGTCCGTAGTCGGCTACAGTACCGGTGGACAACCTGTTCTCTGGACTGACTGGGTCAAATGGGGGAACCGAACCTCCGGGCCCGGGGGGACATACCACTCCCCGCGAGGTAGGGTCATTATTCCGCATTTCGAGAAACGACGATTAGAGTATGACAGAGAAATTCATGCTTTTTCAGAGCTGAAGGAGGTGCCCCATCCCCATGTCAAGATTTACTCAAACCTCTCTGACCTCCTTACCTCGGTCAGCCATCCCTCTGGGCATGCCGAAGATGGGTGGTCAAAAATCTCCGGGTGGTTCCAGTCAATGTGGGGATCGTTCACCTGGTCGCTTGTCGCCGCCATCCTCTGTTTGCTCCTGGGGGTGTGGGCCCTCAAGAAAGGGCTTCCTCTCATCTGTAAGAAACGTCGTCAACCTCGTACGTGGGGAGATATTGAGATGGTCTCATGGGAAACCAGTTA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| 519
|
NC_077058.1
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
RtRt-RhaV/Tb2018B
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,660
|
RefSeq
| null |
Thailand
|
Thailand
|
Rattus tanezumi
| null |
2018-09
| null |
PRJNA485481
|
Rhabdoviridae sp. isolate RtRt-RhaV/Tb2018B, partial genome
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AAGACAGCATTAGGGATACCCAGAAAGCGATCCTTTCAGGGCCTATCCCTGCGAACACTCCGCCATCCATCGGAGTCAACTATATCTGCCACATGCTAAGCCGCATGATCGGGGTATTGGATGAGGACTGGATATCATATGATATCAAAATAGGAAGCCCGGATGACGAAATCTGCCCCCTTGATCTCATCGACATGGTTCCCAAAGAGGTGGAGTTCACAGGGAAGGCAGGGCAATCCGCATCCACGATGTCCGATTGGGGTATCTTGGCTAAGTGCCTGATGGTCTATCGTGTTTCGCTAGCTCCTCAGGCGCAGACAGGATACAAGGGTGAGTTGGTTAAGAGGCTTCAGCAAATCTTCATGATGGATCCGTACTATATGGACAACACATCCGGGGTGTTGGGATTGCAGCACTGGGTATCAGATGCTTCCTTTTGTGCACTTGTTGCGGCTGTGGACATGTTCCTCCGAAAGTTCCCCAGGCATGACTTTGAGCGACTGCGGGCGTGCACTCTGGGGTCTCAATACCGTGATTGTGTTATAATTGGCTCCATTTCGCACACCGCAAAAGTTCTCGGTACAAGTCCGGGAGGTGTCTTCGGATATATCTTCAACAAAGATGTTGCTGAGGAGGCCGAACAAGTGTATGCAGGGGGGGATGATGAGAAGACGAAGAAAGACTCTTACTTCCAGTACATGAGGGACTTCGGGTTGGTGACGAAGACTGCTTACTCTGCGAGTGCAAACCCTAATTTATTTGTTTGGTGCCACATGATCGGAACGCTCGCAGGGAAGCGCCGATCGATGTATGCCAGATTCATCGACTGCTCAAACCCTGTAATTCTGCTAACTGAGGCAATGTACATTGTTTACCACCTGGGCGGGTCAGCAGACATTGACCTCAGATTCGTCTCAACAGAGGCTGAAAATGAGAGAATCCAAAGACATCGAGCTCAACTGGAGGCTGCCGGCATCATGACGACTGATAGGATTACTCCTGATCAAATCCTGCAACTCATGAGGGAGAACAACATGAGTATCACGGTCGATATGAAAGAGAAGTTCGCCCCAATCATCGGGACCATCGACGGATCCCGCGCTGGCACAATCGGGGAATTTGTTAAGACATATTTTGATAAACTGTTGTAATGTGGTTGAACTGTCATGGAAAAAATTAACATCAATCACCATGTCGACTAGCTCTCGATCATCATTCACCGTGAAGTCTCAAACGCCTCCGAAAGGGCCTACACGTGCGCAAATGAAGAATTGGGATACTGTCGCGGCTGTGCATGCTGCGTTGACAGAGGAGGCAATGATCCAAGGAGGATCATCAGATGTGATTGAGGACTTGGATGACTCTCTTCTCGTTGACCCCTCTGAATATGCTTCTCCACCACGCATTAGGGTCCCCCGTGATGTTATCGATCGTGGTAGTTACAGACCATCACACCCTCTACAGAGGGGAGCTGTGGACCCAGGTGTCGTGGAGTTCACTGTTCCAATCCAGGAAGAAATTCACCAGGATCTGTATGAGAAGATAGTCTTGGATACCATTCTTAGACTAGAAAGCTTGAACATGTTTAGAGTTGGAAATACAATTCAGACTCCACAAGGACTCAAGGTACAACTCAAGAAACATTCGATTATCCCGTCCTCCGGGACATCTTCATCAGAGGAGGGTCTAGAACTACAGGCCGCAGTGGACGTCGAAACTGCTGCACTGACATCCAAGCAGCAGACTCAATACTACCAAACCAGAGACCAAATTCGTGATCTTGCTTCCACAATTCCGTGTCCCATTAAAATGGTGACACATATGGGTGTATCCATGTTTGTTAATTGGAAGAAAATGATTTCTAATCCGGAGCAGGATTTTCTGCAGACTGCTCTGCACTTGGGGCCAGACAGATTTTTAAGTCTCAAAGATGATCAGAAGATTCACAAGGTGATAGCGCACGTCTATCCCAAGAATCCGGTTCTGAGAAACCTCTCCCTAGATTACCTTTCTATCTAGGGCCCTCTGGGTTGCGACCCTGTTGTTAACATGAGAAAAATTAACATCACTCACCCCATGGAAAAGGTGTGGCAAATTGTCATTGCATCCAAGAAAAGGATTCAAGGTCTAAATCAATCCTCCACCCGAATTGGCGAGGTGTCGGATCTTTTGACACCCATTAACACTACTCCAATCAGGAATGAGTCTTATTCATCGGAGAGGGGGAAATTCCACTACTCTATTGAAGTGGAATCTCAGCTAATCGTTCAAACATCCCAGATGGTGTCATTGAGGCAGCTGATTGGACACCTACATCAGCACTTAAAAGCGTACACTGGAGAACTGTTGTTGTTCAAAATTCATCACCTCATATTGTGTTTAAATGTGAGGCTCATTCAGCATGAGTCAGTCAATTCTTCAAGTATCTACATGCATCGTTACTCAGCACAGATGACAACGGTCTTGTCGTTATCCTCCTTTACATCACTTGACCGCTTATTTCGAGCTGGAACTATTCGTGCTCGTTCCTCCTGGGATAGTGCAGGTATTGGATACAAGACCAAGTGGCTGTTCACTTCAAGCATTAAACAAACCACTGTACCCGGGATTGTTGTATCAATTAAAATGCTTCCGGAACTTGAAGAGCTACTTAGGAATTCCAGCATCAGTAATGATTATACTACAGAGGGTGAAGTCATGGTATTTTATTGACCATGAGAAAAATCAACATAAATCACCGTTATTGAAGATATCAGTCTACAGTGAACCTGATGAAGGCCGAGTGGTTATGTATCCTGGCGGGGCTCGCCTTGGGGGACCTAATCCCAGTTTGCGGTCCTTTGACAAAATGGACACCAGCCACGATTCTTCCATCAATGTGTGATATCGAGGATAGCATCGGCCATGACGATGGTGTCCCTGTCCGTATTACTCAGCTATCAATGTCTACAACAGACCCTGAGGTCATGGGCTTCCTATGCACCAAACTAATCTTAACCACGCGATGCACCTATTATTGGTACTTCCACTCTACTGTGGAGAGACTGATAATTAAGGAACCTGTGTCGACTCAGGAGTGTCTGGATCAGCTAACTAAAATCAACCAAGCGGATGGGGATGAGCCAATTCCATATTTCCCGTCGGAGGAATGTGTCTGGCAGTTGGGGGTGAGTGTGATTGATAAAAAACACCCTATTATTTTAATAAAACCTCATTCTGTCATGCTGGATCTGCGAGAGAATAAGCTGGTGGACAATGTCTTTTTAAATAACCGTTGCAAAGAAGCCATTTGTGATACAATCCATGAAAATGTTAAGTGGATCAGAAAAGGCACGACTGATCTCTGCACCCAGAGCCAGGTAACAGAAGGCACTATATATACCACTAAACAAAATACAAAGTATCTTCAAGGCACCTTGTTACCCCCTATACCTATGAGCCAGATGTGTTGGGAAACAATTTGTGGGAGACCCACTCTTAGGACCCCTCAGGGGATTCCTATATGGATCAATGTTAATGAGTTAATCACTGGAGTCGCACGTTGCTCAGAGGGCATTAACTCAGTTACATTTCTTAAACCTCAAGCAGCTGAAATAGAGGAATTAGCTCTGCTCCAGAACACCATGGATTGGATCATATGCCAAATGGCTGTTAGGAACTTCAACTCCAACCAATCCGCCATTGATTTACCTCGTGTACTTAACCTGCTTCAACCACATCGGCCAGGGGTTCATCCGGTGTACCAAATGTTCAATCAAACACTCAAGACTGCATCATGCCCATATGTGAATGGGACATACCAAACGTCCAGAAGAGGAAATCAACTCGGGATTGGAAGCCATGGGAACCCAATCCCGTGGTATTTTTGGAATTCCATTTCTTCTGGTCCTAATGAGTTCTGTAAAGCATCTGGACCTAATGGGATTTCAAGGGATATTGATTGTCGAGTGATTAAACCATACAAGCGGGCTTCAGCGCTTCAGCATTATTTGAGTGATAAGGAATCTCTCACTATGATGTTCCCTGAGGTTGGCTTGACCCATGACCTCCCACAAGAGACTCTGGTGAAATTGCTGAATCCAAAGAAAACTGTGATCAGCTTCACAAGCATGTTGGAGTCACTAGATCATGCCTGGGTATACTTTAAGCTGTCCATACTCTACTGGATTGTGTCTGTCCTGTTAGTCATCGGAATTGTATGGATTCTTCCCTGGACCAAAGTCGGGATTGTGAGATGCTGTTGCCAGCTTCGAAGCTCTCAACTGGTGAACGACAGTGATCGGCGAGAGTTAGAGTTGATGCCAATATAACCTCATCATGGAAAAAATCAACATAAATCACAATGGATTTGTTTACCGACGATTGGGATTGCTCCTTGGATCAGTGTCCGGATTACCTGCTTGAGGTAGATCCGTTAGACGACTTAGATATAGGAATGGGAGGCGGGGTGGAGCTTCCAAACTTTGATTACAACTTGAATTCCCCTCTAATCCGAGACGAGGTAGATGAATTTGTCGCCAGTCTGCGACAGGGATTTACCTCTTCTCGTTATAAAGGGAAGTGGAACTTCGAAGAGGGATTGAAATGGTTTCGAAGTCTTGGGGTTATTTGGGGGACAACATTGGGATCTTGGGGGTTTCATGAATGGGTCTTCTCCCAAGTGATTCCGATGAAAATTCGATCACTCAGTTGCAAGGAAGAGATCAAATGGATCTGTGAATTTCTTGATGCACCTACTCAGGTGATGAATGATTATTTAAGTCATGTATTGCAATGTGAAGTAGATTTCCCATTGCGAATGGTGAGCAAGGAGCAGATCCTCCATCATGACCTAATGATTGACACAGTGAACCAGATCCAGCTATATAACATCTTCCACTGGGTGATTAACCTCCTAAATAGTAGTAACAAGGATGCACGTCAAGAGATCAGTAAGGTGTCTCCTTTTGTTTTCAAGTTGACCAAGGAGGCGCCCAAGAAGAACTCCTTCCTAGTGGCAA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| 770
|
NC_077114.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Zhu,W., Yang,J., Huang,Y., Lu,S., Xu,J.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
YSN900
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,485
|
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2019-07
|
SAMN18121159
|
PRJNA485481
|
Rhabdoviridae sp. isolate YSN900 genomic sequence
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GCTCAAAAGAAGCTTCGTTATAGAATTTGATAGATTAACCTGTTTTCTCATTTTTATTCCATCCCATTGATTATGTATTTCTCACCATCCTCTTTGTTGCTTTCCCCCGGGACACCCTGTCAATTGACTCTCCACTGATTACATAGTCCGACCTCAGATAGCTGATCCTAATAAAGATAGTAGCCCATTATACTCCTGAATAAACGTTTCTCCCCTCAGGGTCTCATCTTCCTATTTTTTATTTTTTTCATGATTGTTATGATGTATAATGAGGAATCATTGCACCGTGATCAGACTCCATATACGACGGCGTTGGGGGACCTGTATTATCGCAGATTCTACCAGAAAACATCGCACCGAGAACGCCCGTTATATCTTCGAAAAATTCTGCTGTCAATCCCTTATTGAAGCTTTTGAGATCTTCATTGATGACCTCGATACTCATAGCCTTCAAGTTCGGTCGAAAGTTTCGCCGTAATATTCTTATCAGCTGGCCTATCAGAGCCATTTTATGATCTAAGTGTAGATATTTCTTCACACGTAGCACTTGAGAGATGGACCAACAATGATAATACCGACCCCGATCTTTGATTACAGACCAAGAGAAAGGATAAGTTCCATCTATCACCTTGAGAGCGTTCCTGTATGTTTCTAGTTCTTCGCAAACGTACGCTATCCATAGTCCAATCCCGGAGAATAATACTCCCAGGGAAACTACGGAGGAGTCAGATGGAATCCTGGGCGATTGGGGGTATCCTCGAGTGATCGGAACGATAGAATTACTAGCAGCTATCAACGCGACAATTGCCTCACTCACCGAGGGGGAAGATTTTTTTGCATGGAGATAAGAGGAGATTTTGTAAGACACCCCGGTTTCCACCCCCAATGATCTAAATAGTTCTGTTAGATCCAATAATTCATCTGTCTGGTACTTAATTGGGACGCCTTTCATGAAATCGTATTGTTTGAGTCCTATGGCTCTTTCAAATTCTGATTCGTCTGATTGGAGAACTGGGAGGTTAGTTAAAAACGAATGTACTGCTGTCCAATCGGGATATAAGGGGAAGACCTGAGATGTTGTTAGATTTTGAAAAATTGCATATAACTCTGAGGTGGATGAAGATGAAACTTCTGTGATAGACAATTTTACAGTCTGGAAGAATCGACCAAGCGTAACCAGACATGATGTTTCAGGCGTCAGCAACAAGGCCCCGTAGGTCTTGAAGATCACTGTGCAATTGGTTTCTAATATGTCGTACATATGATTCCTTAAATTGACAAGAATTTTGTATATGGAAGGATCATCTTTGGCTTCCATGTCTAAGATTAATAGGTTGATGTGTAATCCAAATTCATGTTTCAGCTTTGTGAAATACAGCCACGTTTCTTCATCTGTTAAGTCATGCGGATTGAGCCATGCGTCTTTCAGATTGACACATCGGTGAGCCACTTCTTCAACCATTTTTATTGCGGAAGGAGGTGCAGGATTCGATCCTCTGAGATTAACTCCTGATAGGTCTAACAAGCTATTGAAAATCAATCGTGTTTTTTTAGAGTATCTTAAAACCATCGACCCTATCCCACCAGAACCATCTCCTCCACATAATGCATCGCGTACTGAAATGTTAAAACAGGTGAGGATTGATCTGACCTTATAGTGGGATCCAGTTGCGCATTGGAACAGACGGAGCCCAGAGATTAATGGGTTTTGCTTCCTAGGAATCAGTAAATTGGGGACTTCGGTTACATATCCGTTCAGATAAGGTATTTCATTATAGTAAGTGGAACAAGACAGTTCAGTTCCCCACTCCGTTTTTTCGGGGCATAATCTGATAGCGGGGGAATATGGTTCCATTCCTTTGGCTGCATGTCTGACTTCGCTATCGGTTGTTACTATTCCTGCTAAAACAACATTTAATTGATCTTGACTTAATTCTGCTTCTGATCTTAGCGCGACTATTAAATGGATTCTCTCTCTTATTTGATTTTTCGTGGACTCATTTAAATGGCTGGTGTATAGTATTTGAACTAATTGAGATGATAAACCTAGTAATCCGGCAGATCTTAGGTCTCCCATATCAGAGAATAACCACACTTCTGATCTTGTCTGGGTGGTTTTGATCCATGTGTTTGCAAGTCTTAATAGACGATGTTCAAGGTAATTTCGCCCTAGGCATCCCAAATCTCTCCCTTTAAGTGGATAGGAAGGGGGTGTCCGATGGGGGATGCTCATAAACAAGCTGAGGAACCTTTCTTCGCGCCACAGATTTTGTAAGGCCAAGTCTTCTGAAATTTTGGAAATTAAGAATAGAACTCCTCCTATCAGGGCAGCTTTGGGATTTTTTAGTTCATGGACGGAATGACGAAATATGACATTTAGAGATGATGCCCTCAAAAGACCGTCTAGAATTCCATCTATGTATAGAACGGGATTCACCTTTTTTGCTAGAGTCAAAGGGAACAGTGTACCTTCCACTGCTGTAGATCTTCCAGTTGTCAGCTTTTCACCAAATAGGAACCCTTCCGCGCGACCGATGTGAAAAGATTTTTCAGGAGATGGAACAGCGGTCCAATTTCCTTCTTCTAAGCTAGGTACCATTCTGGATGTAAACCACACGGTGTTTGCTGGTTTCCACTTGTTGAGAAGGCGGTGTATATCCCGATGTCTATAGGTGGACATTGTATTTAGTATCGGTTCATCTATCGGCCTCAGACAACCGCTGCATGAGAAATGAAAGTGATATCCACCATAGTTAGGTTGTCCATCATGAACCTCTCCGGCTGTCATCTGAGCGTATAATATACACGTTTGGAACATGAAATCAAAGTTCTGATCTCCCAAATCCTGTAGAGTGCTAGTTGTCGTCGAAATTCGAGTGAGCTTGACAGGACTTTGAGCTGTGTATCCTCCGGAACTCTGCCGCGAACATCTGAACCTATGTAGGGCTGACCCGGTTCTCTTGAAACTTGCTGAGACACGATCCCAATCTTCGCCTGTTAGAGCGTGCAAATTTTGATATATAGTTTCCGCAAGGTTTGATTCGGGTGTAATGAACCATCCTATAGCTTTTCTTAAGTTTGATGCACGCGTTAACATAGGTATATTAGTCTCTTTTTCCCACGGTCTCAATATACTTGTGGATTCATTTGTTGAGGATCCTAAATAAGCAGCGTACGGACCCCTTACGTTCCAATAGTCCTTCAGACCATCTGGTATGACTAAGCTGACATATAATGCTTCATTTTGGTTTTCTTCACATATTCTGCATCTCCCTGATTCAATTCGAGATGTTACAAGAAATTCAGCTGGATGTGGTACTGTTGCTCCCAGTATGTCGTGTCCCCATGAGGTCTTTCTTAACATGTCTGCATACGAAGCTGAGCAGTGCCAGATCGGTCTTGGAATTCGGATAGATCCGAATCTGAGGAGAATTGCATAAGATATTATTTCACTTTTGATCATCACACGGTCAAGTTCTTTAGACAGATGACGAGAGAAAACGTTGCGTATGGTTCTTGAGTTCTGAAACAGCCCTATGAGAGATTCCGTTATTCCCAGGAATGTAGCAGATTTGTATTCACTGAGGAAGCGGGGGAATACGGGGGAGATCGAGAAAAGGAATGTATAGATGTTGTCTTCTTCTCTTTTATGGTAGTCTAAGGCCCCTTGAATCAGCAAATTTTTTATGGTCTTCCTTTCGTCAAGAAGCTTCTCCTTGATTTTGTTTTTTATCATTGTCAGAATGTCCACTCCCCGTGGTATATTTAATGAAAGGGGATTTTCCACCAATTTTTTCTTGTCAACTAATTTCGATCGCGCAACTTGTATATCACCCATCTCCAAGATCAGTTTCCTCAGCCACGGTTTTTGAGTTCCCTTGTACACCATCTTTAGGAAAGTTAGACTCTCTGTTACTGGATCAGGAAATTGTCGAATCAAAAACCTAGTCAGAGAAGTCCCGCATACTCCGCCGAGAGATGGATCCAGGTATGATGTAACTACTTTGTGTGCTTTTGTCTCAAGTCGATCAGGGAAATTGAGCTTCTCTGCAACAGATGCTCTCATTGCTGGATTGTGTTCTTCAATAAGACGTCTTGAAAAATTCGACAAAAAATTTAGATGGAACATAGCGTTTATGGGACTTGCGGAAAAGTGAGACACAGTAAGGGCATTTGTGGAAACTGTGGACATAATGTTCGCTAAGGTGGGAATTTGATCATTGGTAACACACGTTACTCTCGACCACCTTTTAATCTCCAAATTCCTCATATTTCCACGGAAAATTGGTATCTTCCCATAATTAAGATAATCAGCACTCTGCATTGTTTCATCCTTGTTTATCAAAAGCCCAAGCCTCTTAGTTCCTTCTTCTATATGTTTGATTATAAATTGGTTATTAGAGATAATATTTTGAATATTTGTTTTTAACTCATCTTCTGTTCTATATCTCTGCAGTTTGTATTGAGTACATATAACTTGATTGTCTCCTTGAGCCAGGCATCTGATTCGCGTGTTTCGGTCTTGCCCTTCTCTCCTTATAACTAACAAGTTTAGGATACTCCATCCTTTCTGTCTCAACCCTTCCAGTCCGCCCTTCTGCCCTTGCCAACAAACCAAATGGGCCGGTGAGCGGTTGATAATATTATTCCCAACCACTTTCATTAGATCAGCTCTTCCTCCGTGATATATGAAACTTTTCTCAAAAAACTCGTGTGTTCTTGCTATCAAGTTCGGGTATCCCAAGAACTTTCCCATTACAGTGAAAACCGGCTCTGTTGACTTGTATCTCTGATGGTTGTTCCACTTCTCGTAATCTAGATGATTTGCAATTCCGATGTTTTCATAATCGTTGGACCCTTGACCGCTCGTGTTCTCCATCATTTTCTTGACGACGGTTGTCATATCGTCTGCCATAGTAAGACCATAGAAGAGGGGGACGAAATGAGTTTTGATGAGGTATTCTGTCACAACAAAATAATCTCTCAAGTCCCAGGACATT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CCGGGCAGCTGAAAGTCTTTGTCATTCACCTCACAGATTTGAGAATAGGTGATATTGTGGGTCTGGTTGTATACCGCGTGTAGGTGAATCGTCTGCTCTACATAAAATGGATCATTCAACCGTATCCATCCGTGATACTCGGTCGTCAATACATCATAAGACTCCTCTTGAGGGAGGTCATTTGAAGTGCATTGTATATCCAAAACAGATGCTTGCACGATAAGAAAACCGCCTAGGGCAGCAATTAAAGCAAAATGGATCTTCATGATTGATTTGGAGAGTATATGTGTTAGTTTTTTTCATGCATATATTAACTGCTATTATTCAGCATAATTATCGAACATCTTACCACTTAAACCCTTGTAGCGTCTGAGGCGTTTAATCAAATCAACAATGTCAGTGCAGTTAGACTCTGATGCGATTCTACGAGCTTCACATTCTGTCACCTCTAAAGCTTTCAATGAAACTATGAGATGTACGTAACCGATACACAACGGTCTCAATCGTATACCGTCGGAAAGTTTCTTAACCATTTCATCTATAATGTTTGATGATGGTGGCTCGACAGGGGCAGATTCTCTGACCCTCTTGGCTTCAGGGGAGTCCTTCTTTCCGCCTGCTCTCGAGGAGGTGGATGGTCTGACATCGGACTGGATACATTTTATTGCCTTAAGAAACTGTTCTGCAAATTCTATTACCTGTACAGAAGTCCAAGTGCGATCCAGAGGGACGCTATATTGGGGTTCGCCCTCAACGACAGTCACATTGAGAATTTCCTCGCAATCCATTTCGTCATCGGATGACGGGGTGAGGACTTTCAGTAAATGCTCCCCCGTTTCCAATACGTCGAGAGGTATGGTGTCTGGATCGGAAACAGAATTTGGATTGTCGCGAGAGGTACTAGGAATATCCGATTCCATGAAATGATCTTCATCTCTCTCTAGGGTCTTGCTCACATTGTTTATTAAATTTCCTCCTCTATTGTTTAACATATCCGCAACATCTTTGTTGCTGGCGCGCGTCTTGGTCGTCTTCCTCTTGGCCATATTTTTTGGAGTTTCCATTTTTTTCATGTTATTTGTGTTGAAGTTTATCTGTATAGATTGGTTTTGAGAAATTCGCCAATAGTATCAGCCCGCTGATTAATAAGGGTCGACATGACTGATTGAAATACTGTGATCATGTTCAGATTCGGTTTCCCATCTAAGCCGTCATAATAAGCAAACCACTCCACTGGGGATCTCCCCGCTGGCTCTATTCCGAGTTCATAATCCTCAGAAGCCGAAGCTCTGGTTGTCCTTGCTGCGATATTAGCAGTGGCAGCACTCTCTTCGACGAATTGGATAGATCTTCCCGTTTTGCTCATAAAAACATATCCGACCAACCTAGCGTTGTGAAGTACTCCGATGATATCTTTCTGAAGAGTCATCCTAGCGTTTTGACTACGTTTTTCTCCTTGCAAGACCCCTATCACATGACAAAAAAAGTAGATACACGGGTTTATCCTGGATGAGTATGGACTCCTCGGTGTCAATCCGAAGTCCATTTGATAAGGAAAATAAGAGTCATCCACATCAAATTCTTCGTCAGTTGAAAACATTTGCATTAACTCTGAACTTAATGTATCCGTGAACATCCACAAGGCTAACTCTCCTTGACGCTTCAAACCCATCACTCCGGATATCATACCGTATGATACTAAAGCCGCACAATCTCTAAATCTGGACCCAGTTGTACTGATCCTTAGAGAAGCCCAAGTACTTTTCTCGAACTTATAAAAGAACATGTCGACAGCTGCTACCAAGACTCGGAAGGACTGATCTATAGACCAACTAGCGTGTTTTGAGGAGACTTGCTCAAGACTAACAGTTTCAGAGTCGATACCGGTTAGAGCCATTTGTCTCTCAATGCTAGTGGCTATCTGTCTCCTGTACGTGGGGTCACTCGCCTTTTCTATACGATAAGTAGATAACAACCAGATCATCAACCACTTGTCTAAAGCCTCGTTCCCGTCAATTCCATTTCCTGAAGTTATATCAGGGTTGTTGTCAGGTCCCCATTTGACTTCTATTAGATTCAAGGGAGTGATCTCCGTTCCTTCGTCGGCGATTTTTACACCATATGATTTCCATTCAGTCGGACTTTTCATTTTGAGAGTGGCTAGTATTTGTAGCATATAGTTCATGGCGGCATCAAAGTTTACTTTCTCGTTTTCTTCAGCTTGTTTCTTTAAGTATTCACGCAAAATTCTTAAATCATTCTTTTCTAGTTTAGGGATTATACAAACGGGTTTACCTTGATTGGCTGCAAACCAAGAAGATGGATACACAGGTTTTTTCCCTTCAGTCATGGACTTGATGGTTATTTTGTTTCCATCAGAGACCCGAACCAATTTCAATGATGTAGACATGATGACGATACTTGTTCTGAGATCAGATTAGGATATCAAAGCAAAATAAGGTGTTGTTCATTTTCGATTGATAAG
| 795
|
ON812474.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,449
|
GenBank
| null |
China:Huanggang
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28618667
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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TATAAATTTGCTTGACACCTCAATCCCTAGTAACCCTTAACAGAACTCACCTTTTAAGGAATCTCAGTTTTGTAATCTCTGTAGTTCCTTTCAGATCTCAAGTTCTGTTCCACTAAAGTTCCTACAATCTCTAGTCAATGGCGGATCTTGCCGGAGCTAGACTCGGCCCGGACGGGTTGCCAATCGCGGAGGGGGGAGATGAAGACGAGCTGCATGAGAACGGCAATGAGAATGAAAATGGAAATAATGGTGCAGCTAATGGAGGGAACCAGGCAGCACTCCTAAATCCACAGGGGAGGGTCCCGCGTGGAGACGACGTTGTTGTGCCCAAAGGAATGCCTATACTCTTCTCACGAGATCAGATCAAGGTAATGCACTCAGAAGCCCCGACAGCCAAGCCTAAACCCGATTTCCCCTCAGTCTGGTTTGCAGAAAAGAAAACCAAGCCCCAGCTGATTGTCTACAAGTTCACCTTCAGCCCTGCTGTGCTGCGCAAAATCGTACACAAACACCTGCTGGCAGGCCAACTCCACCCGGACATCGCAGTCGCATTCCTAAAGGATGCTGCCTCGACCTTTGAGCATGTGCTCAGACAAAGAATTGCGAGCTTCGGTCAGGTCATCGGAGAGGATGGGGACAAGATCACTCCTCTTTCGATAGTTGAAGTCACAGAAAAGGACTGGGGTGGAGCGGTCCCCGAGAGCACCATCGCGACAGAGCCTCCCTCAGATGCCGTCTTGGTGGCATCAATTGCCATGGCATACAGATTGGCCGTCGCCAAGAGCAGGGGCGGAACCGACGCATACCTTGTTACCCTCCGAGACAGGTGCAAGACCATGCTTTCGAGTCCCCCGTACTCCGACCAGGGCCTACACGTTGACAACTGGCACACCAATAAAAACTGGGCCAACCACCGGGACTTGCGGGCGATGATGGCGGCTTACGACATGTTTTTCTACATAGCCTCCGACCACGAATTCAGTGGCATTCGCGCAGGCACTCTGGTTTGTCGCGGACGTGACTGTGCCGTCCTGGGAGACCTCCAGCGTGCAGCTCGAGCAATGGGTCAGGCCCCTTGTGATATTTTTTACTGGTGTTTTGCATTGATTTTGTATGCTGAACTCGACATTGTCGGCACCGAGGGTCAGGAACTCGGGGAAGAGTTCAGTTACTACCACTATGCCTCAGACTTGGGAGTGAGCAAGCGGTCACCATTCTCGGCATCCATGTGCCCCGGACTCCATCTCCTCTGCAACTCAGTCGCTGCCCTTCTAGGCATGGAGGATGCACAGAACACCAGGTTTGTCAACTGCGAAGGACCGAACTCTGTGCTGTCCAACGCTGCCTTCGTGGCCTACGCCTTCCGGGAGGGCACCGGATTCGGGCCCATGGTGGCACGAACCGTCGATGAGGCCAGACAGACCAGGGCTGACATGGACGAAGAGGCCAGAAAGGAGCAGGACAACCAGGCCATCGACGGAGAGGTCCCTCCTTTGTCCCAAGAGCCGGGAGTGTGGCATATGTACATGCGCACACGAGATTGGAGGCTGCCACATCAGATCACCAACTGGTGCCGACAACGTGTCGCCCTCTTCAAAACCGTCCGGGCAGGCTCAATTGCAGAGTTTCTGCGCAATCGCTTCTCAGTGGTCGAGTGATCCGTGAAAAAAAGTAACAGCCCTCCACTATGAATCCCAACCCCCTGGACACCTTTCCCCCAGAGATGCCCAACAGCAAGAAGCTCCCTAGAGGGCGAGGAGCTATGGCAATAAATCGTGCGGCAGCACTGCAGGACCAAAGCTTCGAGGAAGAAGCATTCCGGAAGGGTGCCCTGGCATGTAAGGACCCGGCTCTCCAGTTCGTTCCTGGCTACACAGCTCCACCTCAAGTGGAAACGGAAGGTCGCTCTAGGCCTCCCACTCCGACTCTTGATCCATCAAGCTATGTTGACTTCTCTTACGAAGCCAAAGACGAAGTTCAGGCAGAATTGTTCCTCAAACCCCTTAAGGCATTCATTGAATCCCTGGAAGAGTCAAAGTCTGTAATGGTGGAGGAAATTCGAGTGAACGGAAACAAAGTATTAGCTCGCTATCGCCCCTTCCGCGCCGCCACCCCATCGTGCAGTCGGTCAGGAAGCGAAGCTGGAGAAAAACCTGACTCAGAGCCCGACAAGGACGAGACGACCCCGAAGGCTTCCAGCTCCACAACCAAGACCAGCCCCGCCGACACTGTAACCACGTCAGCGGATCCCAAGAGCCAGACCCCCGATCCAGCCAAACCCGGTCCGTCATCTACCGAGCTACAGAGTATCTCCTTCTCCACCACATCGGCCAGTTTGGATGTGAATTCATTGTTCGGGTTCTGTGAGGATCGGGTTCCAATGAAAGGGTTTGGAGGAGCCAAGATCACCATAAACCTGGCCTCCACAGGATGCACTCCAGCAATCGCCAGTCAGCATGTGGCAGAGGGAAGATCCGAATCCTTCATGTGCGATCCCAGAGTCCCCCGGGACATGAAGGTCTACTGGCTTCTCAAGCGGCACAAGCCAGCCAACAGATTTTTGAAGGCAGTTTCTTCCTCTTATTACAAATCAGTTCCATGAAAAAAACGTAACAGCCCTCACCATGCGACGATTCATCGACCGAGTTCTCCGTTCCGGGGCTGACGAGGCCCGCGGCCGACGTTCTGCCCGCCAGGACCAGAATCCCCTGGACCGATGGGGAGGAGCCCTCGCGGCGGTTGAGGCGCCTGCACCGCCACGTCCCCAGCTCCAGTTGGTCTCCTACGATGTGACAGGGGAGTTGAAGGTGATCAGCCCCGTCTTCGTGGACCGGCAGGCCTTCTTCGGGCGAATGAGTGTCAATTTCCCTCACTTCTATCAAGGCGATGCTCTGATGAAGCCGTACCACACCACGGTCTTTGCCCTGCTGGTTGCGGGCCTTAGAACAGGCATCCAAACTGATCGCGGATGGATCTACCGCTCCACCGTCGCCGAATGTGTCACCATTCGTGGATTGGCCATGGAAATTCCACACCAAGAATCCAGAATATTCAGGGACTCATTCACCTGGAAGTACCGCGGAGATAGCTATGTCTGGTCCGTAACTATCTCCTGGACTAGGTCGTACATGGTGGGGGTTCCTCTTGATCGGTTTATTCCAGTGGAGCACCGCACCCTATTGTCAGCGCTAGGTGTGAAGACCATCTGGAATCGCGAAGGGAACTACCTTAGTCTTCGCAGTGAGTTTTGATCAATTTGCATCATGAAAAAAAGTAACAGCCCTCAACATGTATCCGTTTAGCCTTGTCGCCATTGCAGCCTCCACACTGGTCAGTTCCCTGGTGGTTAACGAGATGTACATGTTCCCCAAAGAAAGAAAATACATTTGGAAACCTATTAATCTTTCTGCATTGCATTGCCCCCTAAGCCCAATTGAGACCATAATACATAACCCTCAACCCGTCCAAGTTCGCCTATTGAGGCCTTCTGGTCACTTAGACTCCCACATCACCGGTTACATCTGTTCAAAATTAAAGCTGTCTATCCAGTGTTCGGTCAACTTCTTGGGGTGGAAAACACTGTCGCACCGGACGGAGGACATATCTCCTGGGCTGGGCGAGTGTACTGAGGCCCTGCACCGACAACAGCAGGGGGATATTTCCTCGATCCCAGCATTCCCTGCTCCCAATTGTGGCTGGATGAATGACCTCTGGGCGTCAGCAACCTTCCTGCTTATGACTCTACACCCCGTGACCGTGGACCCATACTCAGGAGACCTGGTGGATCGGATATTTCCAGGGGGGAGCTGCAAAGACAAACTTTGCAAAACAGTGCACCATGGAGCATATTGGGTGTCTAATAGTCGTGTTCCCGAAATGTGTACTCAATGGGAGGTGATCCCGGGGACAGTGGGAACTAGCAGGGATGGGGACCCCTGGGTTCTGCTCCCTTTGCTGGGCCATAAGAGTCTAGTAGATATTTGCAAAATCACCTTCTGCGGCCACACAGGCTGGAGACTTATTACAGGGGAATTTCTAATATTTGAATCAGGACTTAGTTCAAGCTTGCTTCGGGCTCCTCCTTGTCCTGCTGGGAGTGAGGTGGGAGAGCTGTCTGTGGAAGGTGAGTTAGGATTGGCTAACCTCCAATTGATGAGAGAAGAGTTGCGACTCCAATGCCTCTCAACACTGACGACGATTCTGGCAACAGGGAGAATCAGTGCATTTCAACTCGGGTACTTTACACCTTCTCAGATTGGCCCAGGAGAGGCCTATCGACTCAACGGACTTCGCTTAGAGGAAGCGAAGGTTGATTATATCGAGGTCTCGCGTTTTTCAACCACCAGGGCGCCGAACATTATTGGTTACATGGTCAATGGATCGGAAGTTACCTGGAGCGACTGGACCCCTCTGTCAAATTCCAATCGGACAACTGGCCCGAACGGCGTGGTGCGGCTCTCTTCTGGGGTTATCCTGATACCTCAATTAGAGTCCCGTCGGCTAATAAATGACATCGTGATGATGATCGGACAGGAGGTTCACCTAGCCCGGCATCCACATCGGAACATAGAAAGCAATTTCTCTGACCTAATTGTGACCCATGAACACGATGAGGGGAAATCCGGGGAGTGGTCGCTGCTATCTTGGCTATTCGGCAAATTCAGATGGGAAGGGACGCTGGTTGTCATCGGGACCCTATTGATCCTCATTGTAGGTGTCAAACTGGCCATCAAATCTACTCGCTGTACTTGTCTGTCAAGATCCAAACCCACCATTCACTCATGGGACCAAATTGAAACGTCTTCTGTGTAGGGCATGAAAAAAACTAACAGGCCTCACCATGGCCTCATACGAAGACGAGGACACTGAGCTCCTGTTTCACCCGGATGAGGATTGGTCCGACTTCCTCGAGTGGGAACCAGAGATCCGGGGTGCCTTTACAGGATTAGATCGTCTTACCACTCGAGGGATCCTCAATGCTACAGACTACAACCTCAACT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| 20,801
|
ON812475.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,337
|
GenBank
| null |
China:Yanbian
|
China
|
Ixodes persulcatus
| null |
2019
|
SAMN28697465
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
|
ATTTCCTGAAACTATGAATAGGACAGGATCATAAGCTGTCAACTCTACTCAGAGAGTAATTATTTTCCAGATTTGATCCAGATCCGACTCATCATGGCAGTCCCCAGGAAAACCTACTTCGTGAAAGAAGGAGAGCCCGGGGAACTAGTGAATTTCCCGAAGTTGCTTGGAACACAAGCTCGAGTGTTCCCGTCGGAATATTTTAATAAAAACGGGCATAAGAAGCCGAAAATCGTATTGCCGAAAGACACAATGACGATCGAACAACTGAGAGGGTCTCTCTCGTCGGGGATCACCCTCTCCCAAGCAAGTGTTGAACATGCTGTTCTGTACCTGCATAAATTCGGCTCTCGGATCACTGGCAAGCTCTCGGAACCTTGGGAGTCCTTTGGTGTGAAGCTGGGCGAGACGGGGAGTGAGCTCACTCCTTGGAGCCTGTTGGAGATTGTTTTCTCTGACGTCCCGCCACCTACAGCCCCGGACGGAACGGGCGTGATGATGTCTGAAGAGGGCCTGTTTGGATACATCTTGTTTATTTATCGTGTTTTGTCAGTCCGTGACAGAGGAACGGCCGCCTATCGTACAGAAATCCATGCGAAGTTGTCCCAACTGCTCTCGGCCGCTCCGTTCAAAACATCCAAAGCTGACTTTTCGGGAGCGGGGTCCTCCTATGTAAGTTGGCTTTCAGAGCCGGCTTATATGGCCATGGTGGCGGCGATCGACATGTTCTTGTGCAAGTTCCCCAACAACCTCTACTCAACCGTCAGGGTAGGAACGATGCCGTCGAGGTACAAGGACTGTTCGGTGTTCATGGCCCTCTGCCAAGCAGTTCACAACCTCGCAGTCCCCGTCGACGAGCTGTACCGATGGATGTTCGTACGAGAAGTGGCCAAAGAAGCTCACGAAATGATCAGCGGGACAGAAGAACTCGAGATGGAGGACTCGTACTCAGCATACTTGTCCGACTTGAGACTGGTAACAAAGTCCCCTTACTCCGCAGTGACAAACCCACGACTGCACTCTTGGCTACATTGCTTGGGAAGCCTCCTCCTTGAGACCCGATCGCTGAATGCACGGCATCTCAGTGACGCCAGCTTTCACCAGATCCTGGCGAACACAATCATCCTTGCATTTGTCCGAAAGAGGAGCACAGGGTTCACCATGTCGTACGTCGACACTGCACAGCAAGCTGAATCCGAGGGGAAGTTAATCGGGAAACAAGACCACTCAATCAACACCGAGAAGATGCCATCCAACATTGTCGCAGCCAGTTGGTTCGCGTGGCTTGCGGACGAGGGGTTCGTTGTTCCAGACTCAATGTACGAGTTCTTCAGCAAAGTGATGGAAGGAGCGCCTCCCCTCCGAGACGGATCGGTAGGAAAGAAGGTCAAGAGCTCACTCGAGGCCTGGAGGCCCACGTCCTAAAGAAGATGAAAGCCCTCTCGGACTAGCAAGGCCAGGTTTCGAGTCCACTAGGCCTCTAGGCTTTCTTTAACCAGTTTTTTTCTTCTTTTTTCTTTTTTGTCGTTTGCTTGTATTTTGTCTCTATTTTTGAGTCTTTATTTTTTCCCTTTATCTTTGCACATACTTTTGTTCTTTACAAGTTTCCGCTCTGGAGCATTTTTCTTTCACACACAGGAGCCCTCTAGCAGGACCGAGAGCTCCCAGATCTCATGAAAAAAACAAAAACCGCAACTAAAATCAAGCAAACCGCAAACATGAGTGAACTCGAAGGAGATGCCGACTTTGGAGCGTCGGAGCTCCCGGCGGATAAAGTTCGTATATTCGAGAAGGCAATGTCTTACTTTACCAAAGATGACGAGGAAAAGAGACGAGAAATGATAGTCGAGGACGATGCAGTCCCAGGGACCTCAGTGAGCGCTGAAATCGTTCCGATCGAGTACTCACATGTGACAACTCCTCCTTCACGAACCCTACGGACAGGAACCAAGTCAGTCCTCAAAACTCCACTTCCCGGGACAAAGAAGAGGGCGCCCGCGAAGAGGGGGAAAACAGCAAATCCCCCATCCCCTCTCAAGAAGGACAACAAGTCCAAGAAGGCCAAGACAGACGTGGAGGATGAGAAACCAATAAGTCTTACCAGCGACGGAACCAGCACACAGTACATTGATAAGGAGGGGGTCTGTTGGGATGGACCAATTTTTGTCCCAAGTCTAAACAAGATGAGTGACAAGCCGGGCGAGGATCCAGTCCACCTGACCACACTGCATCTTCTGAACCAGTTTCAGAACAGAGGAGTGTTGACTCGTTACCGTATTACAGAAGAACCGGAGGGCTGGAGAGTTGATTACCGATACCCCGTGGTAGGCAACACATCTATTGCCGTGGAGGTTGAAGACGAGATCGAGAAAATGGAAGACGACGTCGCCGAACCAGACCCCGTGCCGACTCCACATCCCCAAACACAGACTTACTCTTGGAGCTTTCTCAATGGAACTTTCAGATACCCGTCCCGCTACACAGCAGGAGAGCACTCTTTTCATCTTCCAGACTACAAGGTAACCCAGGAAGTTATTATCGAGGGGCTAGGGGATACACCATTGGAGGCATTCTTTGATCCTCGCATCTCTAACAAGGAAAGAGCTCTATTCGGGCTGGCCCAGGTGATCGGAGTAAGGAGACTCCAACACCAAATTGCACCAGCTGCCTTCGAGAATGTACCTCTCATCTAACCTGGTCAGCCTGACCAGATGCGATTGGTAGGCCCTCCTCCCCGACCGAGAGAGGAGGCCCCCATCGGTGTGCCGTGAAAAAAACTAGACTCAATCAAACCTCAACACACAATAATATTACTAATCGATATCTGTTTTTATTCCAGAGGCCGAGTTTTGAACGACTTCAGTGAAGTACGCTACTTCTCGGATACCCAAGATCCAAGATCAAGGGAGAGACAATGGCGCAGCGAAACATCAATGTTTTAAGCTCGATCAAGATCATCACCTCAATTCCAGCAACATCTCAAGAATCCCTGTATGCCGTAGGATTGAACATATTGGACGACTATTCTGGACCTCTTGAGTGGAAACAGTTCGTTTCTGCAGTATTTCTTGCCACCCTCTGCTCAATGAAGACTTTGGATGATGAGGAGTCTTTACTTTCTATGGAGGGAGAGTTTAACGAGGTCCTCCAGGTTAAAAGAGAATACTCTTTGCTTATACCAGAACACCGTCTCCTCTACAGAGACCGATTCGCTTGGCCATTCGAAGGCGTTCGGTATATTATAAATCTGAAGATGGAGCTGTCTAAGACAAGGGTGCCGGGCATTCCGCTAGCACCTCGCCTCCTTGGTGTACCGTCACACCTCAAGACCCAATATGTCACTAATTGGGATGTGTACGAAACAGTCGAATGATTGTGAAGTTATAGACCGCAAACTTCCTTCCTCCAGATATGCTGGACATTGAGGAAATGTTGCCATGAAAAAAACTAGTCCATACATGATTTCACAACCGACATGACAAGAAACCCCCAACAAGGATACCATCTTCAAGACCTTCCATCATGGACTGTCTATGGGAAGAAGAACCTCCGGACCTGCTCACCGAAGAAGAGGAAATATGCTCTGACCACTTCGACCCACTTTATCTCGAAGAAATCCAAGAGACGATCAAAAGAATCTCTGTGAAGCACACTGGTCCGCTCATCAATGTTGACTATAACCTTAACTCACCGTTACTCAGTGAACGCCCCGATGCTGTATTGAACACCCTCCGGGGAAGATCAGTTGAACAACGCCTGTCCTCAGTACCTGGAGTGAAATCCGCCTCAGAAGTGTTCAAGCACCTCGGCTTGAATTGGGACCGTGTAGAGGCCTCAGAAGGCTTTCATTCATGGGTTGCTTCGACTGTGTTTGAGGGGAGCCTTAAATCCCACCAATTCAGTAACAGACTCGGCTCTCTTCTTGACAAGAGCAAAGATGCAGTTGAAGTGCTGGAAACGTTCTGGACACATTTAACTGAGAACAAAGATCCACTCCCGATTGACCCTATGAAGATGGACTGGGTGAAGGGCAATGCAAATCATCCATCACAACCTCGCCTCTTACAGGATGGTGAATGGTTCTGGTTGTTCCATCGGATTGTCATGATGATGAATTCATCCACCAAGGAAGAAAGATCCAGCCTTGTTCGCTCAGAACTCGATCACCTGAAATGGATCGTCAAAGAGGAGAAAGAGGGATTCATCGCATCATCGAACACTCCCGAATACGGAATCATCCACGTGGTCCCGGGATATGTATTCTTTCAACTTCACAACCGCCTGCTTAACAGAGACATGACACTCATGGTCAAAGACACGTTGATTGCGAGATACGCATCTAAGATGAGTCTTCTTTGTCGCTCTGACGGCCAGGATGGACCAGATGCTTTGAAAAAGTTGACAGCATTCTATGCAGAGGGAGACTCGCTAATGTCATCTTTGGGAAACAGCGTTTATGATATACTCAAGCTAGTGGAACCTCACTGCAACTTTCAAATGAGTATAATTGCGCACCAGAACAGACCGCTTATTCCACTAGACACTTCATTTAGATACCACCTGTCGAGCTCTCTGGAGACCATCAAGGATGAGATGTCCGTTGATCCTGACCCTTTGTTTCGTATGATCAAAGAGGAGTACTCTCATCGGCAAGTCCTTCTCTATTACGGGGCGTTCCGACATTGGGGACACCCTTTCTTGGACTATGAAGAGGGCCTAAGACGGTTGCACGCTCAGGTGCAGCTTGAGAAGACCATCGACACAGAGTATGCAGAAGCTTTGGCAAGTGATCTGGCATATATGGTCCTCGAGAAAGAATTTTTCACACAGCGCCAATGGTTTGTTGATCTTGAGAAGCTGGATGTCCAGGATCCTCTGTACAACCATGTCCAAAACACGACTTGGCCAACCCCGTTGGAGATCAGGAATTACGGAGACAGATGGCACCTGCTCCCTTTGATTCCATGTTACACGGTTCCTCAGACGATTGACCCATCTGT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| 20,802
|
ON812476.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,564
|
GenBank
| null |
China:Guyuan
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
SAMN28618663
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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CTTCATAAAGGCCCTAAATTGCCGGTTGAGAAAACGTAGCAAATCTCACTTTTTTTGAGACCTCGAATCTCGTTTTGCTTCCAGCACAAAGCGATATAGGCATTCATAATCCTTGAGTCCGATCCCTTTCCTTTTTTCCCTTTTTCTTTTTTTATTCCCTCATTTCCTTATTGCTTTCACCCCGCACCTCTAGCCCGCCTGCCATGGAAGACGAGATAGACAACGAAACGTATGCCCGCATTGTCGCCGCAGACCCGAGAAAGAGGGAGGCCTCATTCAGGATTCATGACACGGCCGAGACCTTTACGGAGGTCCGTTTTGATCTCCCGGTCCAGAAAGAGGCCGTTGAGTATCCGAGCCTTTGGTTTGAAAATCACCCCAAAGGGAAGCCGGAGGTGTTTTACAAACCGACAGAGATTGAGGCCGCGGAGCTTGGTCGAGCGGTGATGAAGTCCATAAAGGACCAGACTTTTGATCAAGATCTGGCCATCCACTTCATCATCACTGCTCTGGAAAAGTACACCTTCAAACTTGATCAGCATTGGATCTCGTACGGGACTGTCATTGGCGTAAAGGACGCTCTGGTCACACCGCTCTCTCTGTTAAAACTGACCGCTTCACCGGATAAGTCAAATGCGGGCACCCGAGACACGACCCCGATCAAGGATGAAGCAGTCCTGCTTATTCTAGCCTGTTGGTACCGTCAGTCAGTTCTGGCCGCCCGCTCTGCCATGCCGGACTACATAAGCGCGGTGATGGGTCGGTGCAAGACCCTTGTCCAGTCCATGGGAGTGAGGGAGGTTGACTTCATGGACACTCCTCCGGAGGTGACCAAGACTTGGCACCAGGACGCCAACGTGAGAAAACTGATGGCGGCCATCGACATGTTCATCTGTCGCACCTGGCACCCCGACCTCAACCCGGTTCGAATGGGGACCCTGGTTTGCAAGGGCCGTGACTGTGCCGTGGTCGGGGACATGCTTCGTCTTCAGGAGAAGCTTGGCCTGAGCACCAAGAACACCGTGAAGTGGCTCCTCACTCCCGCCGTGGTCCCGGAGATCAAATCTCTGACAAAGGACTCCGAAGAGTTTTGGGATCCTTATAGTTATTTTTATTACATGTCTGACATGGGCCTCACCAAGAAGAGCCCATACTCTGGGTCGGCCTGCCCCAAACTCCATTTCCTGTTGAATGCTATCGCCTACCTCCTGGACGACTCGGCGGCCGCCGGGACAAAGTGGATTGAGTGCGGAGATGCACAGACCCTCCTGACGGCGGCAATTTTTGCTGCTTTTGCTCTTAAGCGACCTGGGGGGCTCGGACCCATCGCCTCGACCACAGAGCAGGAGTCGAAGGCCGTGGTGAAGATCCTCAAGAACAAGCTGCCCCAGGCATCCTCCAACATCCCGACCACCTCCGACTGGGCCTCCTGGATGACATACTACGAACAGGAGGGGTGGCAGATGACCATCCAGATCAAGGAGTGGGCGTGCCGAGTGGGCAAGAGTGTGCCTGGGGCACGGCCTGGAACCCTCGCAATGAAGGTGCCCTCCCTCGTCTCGGGGATCCCCTGAAGCACCGTCATAGTCCTCCGGACCATGAAAAAAACTAGCAAAAATCCTGAAGATTTTAGCCATGAGTCACAAGGGAAAGAAGGATAAGAAGGTGCCAAAGGCAGCTGGGGCCTTCGGACCAATTATAGACATGTTGAGCGAGCAGGACACCCTTGGGCTGGAACAGATGACCGCCAACATGAAGACCCTACAGGAGCAAGAAGCAGAGGCCCTCCAATCCGCTCCCGGCAGGTCTGAACCCGGGGAGGAGCAGCTGCCTGGGTTTCATCTGCCAATGCCGCCCATCAAGGAGGAAGAACCCGCCCCACCGGAAGGCGTGAAAGTGATGACCATCGAGCTGGATCCCAACAACGCAGGCTCAGACTACGCTCTATCGAAGATTAAGGAGGTGTTTGACCATCTGGCGACGGATGGAGTTCTGGCTCCGGCCACCCCGGTTCTTGTAGATGGAGTGGTACGGGTGGAGTACACCCCAATCCCTGTCTGGTCATCCCGCGGGTCTCCCAGTGAAGAAGATCGAACGGAGGAGCCGCCGTTGGAGGAAACTTCCTTCCTTTCACGTCTTCAGGAGCCGGTCACTCTTTACACCATCTTTGAGGTGCCGATGCCGATCTCGCTGTCCGAGCTGGGGATCTCGATGGAGCAGATCAAGAGGGAGATCACCAGCAAGAGAGACTTCTTTTTTAACTCCACGATTTCTCTGGAGAGAAAGGTCTACTCCCTGCTTGATCTGTCCGAACGCGGTATCAAGGTGAAGCGGGGCCTGGATGAGCCACTGTGAGATCCCTCAAGAGGAAGGACCATGAAAAAAATCAGCAACTTTCCATCATGTGGAAGAAGTTGTCATTTTCCTCGTTCAAAGAGTCTCTTGGCCTTGGTCAAGAATCGCTCACCGAACCGGAAGAGGACGGGTACGGGACAATCCCCCCAACGAAGAAGCCCTCGACCCTCAGGGCCCTCTTCAGGTCGAAGAAGCGATCCCAGGAAGGGGCGACGGGGGGGAGCTCAGGCACCCACCCTCTCTGGCAGAACCCCTTTGAGGACCTCCCAGAGTCGTGGGATGATGAAACAGTCCCGTCGGCCCCTGTTCCCTCGGTGGGGAAGGTTGTTCTGGACCTGGTGAGCAGATTGGAGATCTTGGCGCCGCGGCAGATGACTCCAAGATCTATTGCGGAGATGAGTCAGAACTTCCCGCCTGTCTACAGGGGTGACTACAAGAGTCGTCGACTGTGCTTTTTGATGATGGGACACCACGTCACCAACCTGACCCCTCTCCCTCAAGAGCTTCGGGGTTTTCGATACCTCTCCGAGGTGAAAGAGTGTATCCTCTTTGGAGGATCTCCTGGATCCCTGCCCCCGGAAGAGCCGCACCACTTCCGTGATGCGTACCAGTGGAGATTCAAGGGGGATATCTACGAATGGTCCTTTAGCATGGAGGCATATCCCACCGTCATGTCTGGAAAGCCGTTGCATGAAGTGATCTCAACCAAGAGCCTTCCAGTCTTGAAGGCTCTTGGACTGACAACTACATTCCGGAAGGATCTGGGGGTCCTGGAGGTCACTGGACCGTAGGTGGTCTCCTCTCTCTGCATGTCCGTCGCCTCAGAGGCCCTGAGGACTTGAAAAAAATCAGCAAATTCTCCATCTGAGAATATGCATCTCCTCAATATGAAGATTCTTTTTGTCCTTTTCTCTTTAATCAAACTTTCCCCTTCAGCCCCGCAGCCCCACTTCTCTGCCCCCTACTTTGCTCCCAAGAACCTTCAGTATCCCTGGCATCCTATCCCGGCCGTCTCCTTGAGATGTCCTCCACTTCATCCGGTCATTTCAGGAGAGGGGATTCCAGCCCATATAGAATCTCCTGTCAAGCATGACATTGAGGGGGCGACTATCGGTGGCTACTCTTGCTACGGCTCGACATTCAAGGTGAAATGCGTGGTCAACTTTGTGGGGTGGAGATCTTTCGAACATGTGATTGTGGACTTAAAGGTGACCTCTCAGATCTGTAGGGAGAAAATTGGAGTGGTCGAGTCAGGTGGGCTCCCGGATTCACCGATCTTCCCACCGCCTAGTTGTTCCTGGTGGAGCGAAAATTGGTCAACTCTAGATCACGTTTTTGTTCTTCGACACCCTGTAGCAATGGACCCGTACTCGAGTGTGTTGCTGGATCCCCTGTTCCCTGGCGGACGATGTGATAACAAAGAATGCCCGTTGATCCACCACGGAGGACTGTGGCTTCAAACTGAGGCCCTGTCCTCTTCTTGTGCCGATTGGAGCCGAATCCCGGTTACCATAGGGCTCGTGGGGGATCAGGTGATGATCGTTCCTCATGTCGGACCGCCAATGTCCCTTCAAGGAAGCTGCATGCTTCGATACTGTCAGCGATTGGGAATCCGATTGAGTGACGGGGAGTTCATCCGAATCGAGGACTTTAAAGGGAGATCCCGAATTCTTCCGAACCCACCTATTTGCTCAGACGGGGTGACGATCAAGGCCCTTTCAGAGACCGCAGATGAAGACAGACGGGAATTATCCAGTATGGAGGAAACAGACAGACTGAACTGCATTTCCCGTTTGTCTGTAGCCTTGGCAACCAACAAGATCAGTCCGGAGCTACTTGGCTCTTTGACCCCACGGCATGCAGGGGTCGACAAGGCCTATCGTTTAAGAGACGGGGTCTTGGAATACGCGAATGTGGAGTATGTTCCTCTCTCCCGGCCCTCCAATCTGACAGACCCTTTTTTGATTGGTTACTCTCCGAAAGGCTATAGACTTGAATGGAACGATTGGGTGGTCTCGTCGAATATCTCCTTTGGACCTAACGGAATTGTCCGTCCCCCCAATTCGACTGTTATCATTCCGAACTTTGAACGTCTGAAAGTGGAATACGATCAGGTCATACAATTTTATCATGATCTTCGCGAGGTCCCGCATCCCAAAATCAGATATTACTCAAACCACTCCGATCTTCAAGGCTTCCAATTTGGAAATGTCGCCTCGGAGGGGTCCAATTGGGAGGTTTTTTCTGGTTGGTGGAGTTCTATTTGGGGCTCATTTACCTGGACTGTAGGACTGGGTCTCGTCGGTCTGATAGTGATATGGTGTTTGATGCGGCGTTGCGGGCGGAATCCTGTGGCCACACAGACTGTGATCCGATCTCCTTCCAGATGGGAAGACATAGAGATGCAGTGACCCAGGACTGACCCTCCCCCAATGGAGCACGTAATCACCTGTTCATGAAAAAAACTAGCAAAAATCATAATGTTTGAAGACGAAGGTCTTTTCGGAGAGGAGGCCGACCTTGGTCCGGCTCCTTTTCATGATGCCACCGAGTTAGAGATGGATCCTCCGCTCCTTACTGAGGAGCAGCAAAGTAGAGTGTTCTCAGGAAGTGCCCTAAACAACTTTGACTACAACCTTAACTCA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| 20,803
|
ON812477.1
|
Rhabdoviridae sp.
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Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,728
|
GenBank
| null |
China:Qingyang
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
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SAMN28697449
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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CATAAAGGGCCTAAGTGGAGTACCTAAAAAAAACTAGCAAACCTACCCTTTTCAGGGGAAAAGAGTGTTCCGTTCTTCTTCAAAGGGGGTGGTGTAGAGGCTCAGTTCAGTTTCTTCTTTTCTTTTCTTTTCCCGTCTCCTTCCTAGCTGCGCTTCTCACGTCAGTGTTCTTTCTACCTCATAGAATCTCTAGTTAGCGCGGTCTTCGGGCCTCCCGATGACCTCCGATTCCCCCCCATTTTTCTTTGGGCGTGCCCGGCATGGGGCCCCAACCGGACGCGGTCTCCGACCGCCAGGAGGGACGTTCCGACGAGATCCGGGGGTTCCCCCGCAGGAGGTGGACGATGAACCGGAGACGCCCCAGCAGCGCATGGAGCGCATCACGATTTGGGAGAGATCCCAGCTGGGGATAGCAGTCCGAGAAGGAGTCACTGATCCGCGCCCCAGGCCGAACCTCCTCACCATTCATCGCAGCTCGGTCCACACTTACCGTAGGGCAGTGAGGGTGACGGAGCGGGAAGAGGCAGTTGAGTACCCCTCCCTTTGGTTCATCAAGAACCCCGGAAAAAGGCCCAAAGTGGTGTACAAAAAATGGCAAATCGCTGGTCCGGAGCTCAAGAAGACTGTCATCCAAGGCTTCTTTCAGGACAACCTGGACCTATCTGTTGTGGCTCAGTACTTGGTGTACATCCTTCCCAAGTACAAGTTCAAGCTCGAGGAAAACTGGATCAGCTATGGAGTGGAGATAGGTCATGCCGGGCAAGAAATAACCCCTTTATCGCTCTTGGAGATTGCAGAAGAAGTGCAACCTGGAACCACTGGAAGCATCGCACCACAAGACTTCTCTGACATAGCAGTCATCCTGCTCATCACGACTCAGTATCGGCTCTCCGTGATGCACAACCGGGGGGCCAGACCGGAGTACATCAACCAGGTGACTGAGCGCTTCAAGACACTGGCTCCCGAACTGGGACTCACAGAGGCCGGACTGCTGGGAAAGGAGCTCAAGGACGTCAAGATTTGGGCTCTAGAGCCGAACATCCGGAAACTGATGGCCGCCATCAACATGTTCATCGAGAAGACCTGGCACGACGAACTGTCAGTGGCAAGGATCGGCACCCTGGTCTCTAAGGGCAGAGACAGTGCCGTCATTGGAGACCTCCTTCGTCTCCAAAAGATCTTGGGTCTCAACACTGAAGGCACAATCAAGTGGTTATTCTCGCCTCTACTTGAAGTAGAGATCGATGCAATGACCGTGACGACTGAAGAGTACTGGGACGAGCAGGGGTACTTCTTCTACATGGCCGACATGGGTTTGTCCAAGAAGAGCCCCTACTCCGGATCCGCCAACCCTCGGATGCATTTTATCTTAAATGCAATTGCATTCTTCCTGGATGGGCAGGCGGCTCCAACGACCCGGTGGATCGAGTGCCCCAAGGTGCACACTCTTCTACGGGCAGCCATTCTGGCAGGTTTTGCATTGAAGAGCCCGGGAGGGGTTGCTCCGGTGGCAAGCGAGACTCCAGACGAAGGCCAGATGGTTACCCTGATCCTTCGTCGAATGGAGCAAGATGATGGAGTAGCTCTGGACGGCGCTCCTCGCACCAATGATTGGGCCAACTGGGTGATGTACTACGAACAAACGGAGTGGGAGGTCACCACCCAGATGAAGGAGTGGGCTCTGCGGTTCCGAAGGCCAGTGGGTGCTGCCCGTCCGGGCTCGCTGGCAGAGAAAATGAACTCCCTTCTGGAGACTCTCTAAGCGGAAGAATGTAAGCATGCTCTAATACCCATGAAAAAAATCAGCAACTCTCCACCATGTCAGGACTTGACCCAACCCCGAAGGGACCGAGTGGCATCGGAGCGAGGACATCCGGGCTCCGGGGTCCCTCCGGAACCCGGGAGCTCGGAGTTTTAGACATCGGGGCGAAGGCAAAGGCCTTGGGCCAGATGACAACTTTCCTACAGGAGCAAATCGAGGCTGAGGGAGACGATTTGGCGGGGTTCGAAGATGAGGAGGTACAAGAGACGGTGCCTCATTACACGTGTCCAGGACCTGAACTGGAGACTGTCTCTCTTCCCCCTCCAGAAGAGCCGAGCATCTCCATCGAGTTAGATCCTGCTAAGGGAGATGTCAACTACATGTTTGACAAACTCAAAGAGGTCGTGAACCAGCTCGAGGTGCAGGGGGTCCTTCTCCCCTCAGAGCCGGTGTTGGTAGATCGAACTGCCATCATCAAATACACCTGCGTCCCCAGAGTCCTCTCCGTGTCCACGGCCGATGATCGGTCCTCTGTGAATTCCGAGCCCACTCAGCCTGTGCTTGCTGCTTCAAAGGAACCCCCCGCAACGGACCCCACTCTTCTTCAAGAGGTCGAGAGTGTCTTCACCCCCGTCTCACTTCGAAATCTGATGGGTCGTCCTGTCTTGATTTCCCTGAGGGAGCAGGAAGTGAGCCGGGAGGATGTCTTAAGGGCGTTGAAGAAAGGAAGAGAGGACGGGACCGGGATTGATCCAAGGAGTTCCGTGGAGAAGAAGGTGTACCTCCTCTTAGACCTCTCGGAGAAGGGCAAGAGATCCAAGCGCATTCTGCAGGCTCCGCCATCTTGAAGGAACCTCCTCCCCAAGCTTGCCTCAGCGATCCCCTTGCTCCTGAAAAAAATCAGCAACCCTACACCATGTTGAGCAAACTCGGACTCAAGAAGAAAACGGGAAAGAGTGCTCCCGCGGGGGCAACTCTAGGAGGGAGCTCATCGGGCTCCAATATAGTCGGTCCCTGGGTGAGTCCCTTTGCGGACCTCCCGTCAGAGTGGGAGCCCACCACCACCCCCTCAGCTCCTCCTCCAGGCATTGCTCACGTGGTCTTCGACCTCTCCACCTCGCTCCTGATTCGAGCCCCGAAGGAGCTCTCCCCTCGACTCATTGCAGAGATGAGCCTGAATTTCCCTTCCTCTTATCGGGGTGACCACGTCTCCAGGATCCTCGCCTACACTTGGATGGCGCACCACGTAGTTTCGGTCCGGCCCGTTCCCGCCGCGGGACCGGACATTCGCTACTTCTCTGAAGTAAGCGAGTGTGTTCTGTTCTCTGGGGCCGAACAGGACCTGCCCGCTCGAGGACCTCACCGCATTATGGACACATTCCAGTGGAGATACAAGGGGGAGATTTACGAATGGGGATTTAAACTCGAGGCCCACCCCACAGTGATGTCCGGAATTCCTCTCCACAAAGTCCTGTCGCCCAAAAGTGCTCAGGTGATCAGGGCATTTGGAGTCACTGCCACCTTCCACAAGAGTCCTGAGTACCTCGAGATCACCAAGCCGATGGCGGGACAATAGCGGGCGGGACCCGTAGGACAGGTCCAGTCCCAGGTCTTCTGACGGACCATGAAAAAAATCAGCAATCCTCCTAGGATTAGTGAGAGGAACGTTAGGTTCCTGTCTTGTACTTAATTTTCCTCCGTCAATCATGTCTTTCGGTGTAGTGCTTCTTCTCCTCCTTTGTTCAAGTTCTACAACCCAGGATGAAGATCTTGTTTCTGCCCCCTATTACTTTCCAGAATCAGCTCCTGCCCAGTGGCACCCTGTTCCCCTCTCTAGTGTAACGTGTCCTCCTCATCACTTTCGTCCATCCGGAAACGCCCATCGAGTGAAGATCAAGTCTCCTTACCGGACCCACCTTAGCAACGCTACCATTGATGGTGCAGTTTGTTACACAGCAACATTTTCCGTGAAATGCTCCGTAAATTTTGTCGGCTGGAGAACACTCGAATATTACATTGAACCGCGACAATCAGACCTCACCGAGTGTAAGTCTTGGGTTGGTAAGCTTTTGAATGGGGAAGACATCCCCCCCGCCACGTTCCCCGCTCCAAATTGTGTCTGGTGGAGTGAGAACTGGTCCACAGAGTCACATACTTATGTGTCTCGACACGCAGTTCTTCAGGACCCATACTCGGAAACCCTTGCAGATCCTCTGTTCCCCGGGGGGAAATGTTCTAGTCAAACCTGCCCCTTGATCCACAAGGGAGGGTTTTGGATCCAGACCAGCGGATTCTCCTCTCTTTGTTCAAATTGGGAGGAGATTACCGGATTCTTGGGAACCTTCGGCAATGTCACCGTCGTCTCCCCTGAAGTCGGACCGTCTCGGATTTTGACCGGAGGGTGCAGGATGACTTATTGTGGTCGAGAAGGGGTCCGGACGAGTCAGGGAGAGTTCTTGACCATAGAGGAGAGTCCGGGCTACACTCTGATCCACACCGTGATGAAAGTATGTTCTCCCGGACAAATTGTGAAAACAGGTTCGAAAAGGCCTTTTGCAGCATGGCTTGAGTACTCCGTCGCTGAGGAAGAGGAGAGATTGGAATGCCTAGCCCACCTATCCCTCAGCCTAGCGACCAACAAGGTCAGTCCAGAACTTCTCGGTGCATTGGCCCCTTATCACTCCGGACCGGGATTATCTTACCGAGTGAATGACGGAATCCTAGAAGTAGCAAAGGTCACATATGTCCCGATCTATGAGGCATCCAAAGTCAATGATAGGTCCGTAGTCGGCTACAGTACCGGTGGACAACCCGCTCTCTGGACTGACTGGGTCAAATGGGGGAACCGGACCTCCGGGCCCGGGGGGACGTACCACTCCCCGCGGGGTAGGGTCATTATTCCGCATTTCGAGAAACGACGATTAGAATATGACAGAGAAATTCATGCTTTTTCAGAGCTGAAGGAGGTGCCCCATCCCCATGTCAAGATTTACTCAAACCTCTCTGACCTCCTTACCTCGGTCAGCCATCCCTCTGGGCATGCTGAAGATGGGTGGTCAAAAATCTCCGGGTGGTTCCAGTCAATGTGGGGATCTTTCACCTGGTCGCTTGTCGCTGCCATCCTCTGTTTGCTCCTGGGGGTATGGGCCCTCAAGAAAGGGCTTCCTCTCATCTGTAAGAAACGTCGTCAACCTCGTACGTGGGGGGACATTGAGATGGTCTCATGGGAAACCAGTTA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| 20,804
|
ON812479.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 9,418
|
GenBank
| null |
China:Mudanjiang
|
China
|
Ixodes persulcatus
| null |
2019
|
SAMN28697465
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
|
GATCTCTGATGCATCCTCTCAGGAGATTTAGAAAAAACAAGATCCTAGATCTCAAAATGGCTCGTCATCATCCTCTCCTGTTGATCCTCACCCTGCAGATCCTCTTATCTAATGGGTTGAAGGAAACCTGGGTCGGATACCTAACAGATCCCTTGACACCTGGGGAAATCAAATTGGAACATCCCCCTCTAGGAGCTCACCACAAGATCTCCACCTCCGACATGATCACTGAGGGACTAGTGAACTCAACTCACTTCTTGGTTCAGTTTCCATCAATCAGTCGATGGTTTTTTCTTCCCCGAGTTCTTGCTCCTCCACCTCTTCCATCTCACTTGACTGTGATCCACTCCCATGCGAGGATCAAGACCCACAAGGAAAATTTGACTCTGATGAGAGGAAATGGGTCGCTTTTCCTCCCTGTGACGAAATCCCTTCGATTCTTTTCCTTCCACCCCTCGCTCATGTCCACCCCACATCTGGTTCCTCCAATGTCTTGTCAGCTGGATGATTCATCCAGTCTACTGTCAGGCATTCTCAGAGTCTGGGGTCCACCCTCCCATGCCTCCTCTATGTCTGGATCCTTGGTGACATGTAAAACCAAATCTGAGAATTGCACGAAATACTTCTTCGGGTCAGAGCAAGTCGTTTTGAACTGGGACAAGCCGACTCACTGTAACTCTTTCCACCACTCGCTGATGCTGCACAACAAAAAGAAACTGGAGATCGAACCAGCTTTAACCCTTCCTGTTGTTCAAGCTCCCTGCCTTTGGACTGGGACTCAGCTTGTATCAGAGGATTACATTGAGTCCCTACGTGTTAATGTCATCTTGTCTGCAGACGGATACATTTCCTTCCCCCCGGGTTTCTCTTCTTGCAAAGCTTTTCAAAACTCCACTTGCGTCTCTGCCTCTCAAGTCCTATTTTTGGACAGAACCATTGAGGATCCATCTGATTGCAAAAATCTTGAGATAAAATTGATCAGCAAATCTTTTATACAAGCAGAGAAGTCTGAGAACAAAACTCTACATCTCATCGGCGTGAAAGATCCTCATCACCAGCTGGGGTTCTCCTTGGAGGACTCAAGAGCTGTCTGTCTGAAAGAGGGAACCCGATTTTCTCACAGACTCCTCTTAACAAAGAGCTCATACATCATTAGCATTTTTCTCATCCCAGATGGCTCGTCGCCTATGAACGTCTCCAGTCCTGACTCATTCTCCCGAGATCTACCAGATGACCTGGTATACTGGAAAGAAAAAGAAAGCCATGATCAACACAACTCTGACAGCCATTTTTCTGTAGCTGTTCATCAGTGGAAGCTACATCACAAACTTCCTATTAGAACCCAGTACTCTGAATCAGAAATGATATACGGCCTGTCAGACCTGATGGACAAAACCAATGTCGCCTTGAAAACTCTCTTCTTGGAGCTCTGCCGGGTATCCACTCAAATTTGGAAATTGGCCTTTCAGTCTTGGACACTCAACCCAACATTGATGGCCCAAGTTTTGACTGGAGATCCTACTGTAATCGGTGAGAACAGAGCAGGGAAGCTCCGAGTTCACCATTCCGTTCCCGCAGGCCCTCTCAAACTCTCAAAACCCATCCTGTGCAGAGGGGACTGGATGTCAGTTCACATGTTCAACATGACGGATCAAACGTATACTCCTGTCTGGATCCAGAAATTCTCCGGATTCATCGTCCCCATAGTTCCAAAAGTTCCTGTCAGTCCTATTCCACCCAATTTTTTTGTTCCTTTCAATAAGTCTCATTATCTCGATGTCCTCAATGGAATTTTCCTGATCAGTGCTCTCAATCCCAACATCAGTCTCAACAAAACATTTCCGTTTTTCTCATCTGATCTTACATTGGAGAGATCAGATATCAACTCTTTAGAGTATGTGTCCAAGATCTTGGATGAGATCACAATTCCTGTTCCAGATGATCATCAGTCAAAAAACAAAGAAAGAGACCGAGGAGTTGACATCTCTCATCACTGGAAGGATTTTGTAGATTGGATCACTAGTTTCTTCCTCTCCTGGAAGATAATTTTTGTTGTCGTGATCCTGTTGATAAGCCTATGTCTTATCAGAGTGTGTATGAAGACTTCAAAGTGTTTCAGAGACAAACAAGTCTCATCCCCACCAGAGTCCCCTCTCTCCAGCCCTTGGTTCTCATCAAGGGGTCAGGCTGGATTGATTTGAGTCAGAGGAGCCCGTCAGGAGCATCTCCAACAAGTTAAGTCCCACCAAAGTGCCTCAGCCATCAGGGTCAGGCAATGCCTCCATCTGTCTCCTCTCCCCTTTGGCGGGTGAATCCAGAGAAAAGGGACTCCCATTAAGATCTTCCACATCTTTGGCCTAAAGAACATGGCCCACTCCTCCATCATTCTCCACTATCTCATTTCTCAATGGTCGTTATTATCCAAGATCATTCTAGATAGATTTAGAAAAAACAAGATCCATGAATCTACTCGACCCAGAAGAAGGGCTTCCCAGAAGAACGAGACACATAGCGAACACTCATCTTGACGTGCCTCTAAGACCCGGTTTCTTAGAGGAAGGGGCCGAATACCTGCTAGGGCTTAGGCCCACATTCCCCAGGAAGAGAGAAAAATCATCCTTAGACTCTCTTCAACCCTACATCATCAAGAACAAACCCTTGATAACAGACTACTCGTACCTCTTTCCCATTCTCTGGAGAGAGGTCCAAAATCTTCAGCCAACCACCTCCTGCCAAAGACTATTCATGAAAGTCCTCAGTGTCGCCTGGGGTCTCCTCATCTCACAGATCCTCAGTCTAGCCTCTTTTGCCTCTAACCTGACCCCTCCAGAGAAGAAAGAACTAAAACATCATGGACACCTCTCCCGCCTCTATTATCTCAGATACGTCTTGGAAGGTGGAGTCCGATGGAGTGGAGAGCTGGATCACAACCCCTCTGCATTCTATTCGGAGGACTGGAAACAAACCAGTGAAGAAGTGGCCATCTGGAACAGTCAGAAGAGAGTTCACGTCTATGCATCTCGAGATTTCTTTCTCATTGCCACAGCCAGGGATCAGTTTCTGATCACCAGGGACATGTTCCTCTGTCTATCGGACACACTGTCCAGTCGATTTCTGTGTCTTCTAGCTGCCGATCTGACTGATTGCATTCCCAGTCCCAGCATCCCAGAGTACTCCCTCGTGTACAGAACATTTGACTGGGGAGATGATATCTTGGCAAGATTCGGAAATGAAGGATATCGTTTGATCGGCATGTGGGAACCTTTGTGCCTGGGGGTCATGCAAAAGATGACTCCTGATGATCTGACAGACAATTTTCAATTCTGGCTTGAGATGTCACATGACTTTCTCACGGCCTTACCAGGACAAGACATCACAAGACATTTGGCACAGGTCAGCTCTTTGCTAGAGGAAACCTTCCAGCAATCTCCTTCTCATCTGGCTCAACTCTATGGCTTGTATCGACTCTGGGGACATCCAGTTGTGAACTCACAAAAGGGGATATCTAAACTCAAAGTAGTGGCCTGTTCTCCCAAAGCAATCGATTTCAACCGTGCTATGCAGGTGGCATGCAAGGCGAAAGAGATCTTTGCTCTCAGATTTAGAAAGACTCACAGACACTGGCCCAAAATGGACATATCAGAACTGACCGAGGGTTCTCACTTAAAGAAATGCATTGACAATAACTGGCCTGTGACCATCAGACACCCTGATTACAGCCTCCTTGATTGGCATTATGTTCGATTCGAGCAGAGCTTTGAAATCTCTGAAAAAGTGGACCTGACCGCTTTCATCTCGGATAAGGCTCTGTCCCTGACTCGTCCTGAGCTGAAGGAGGCAGTTGAGTCTCTCAGATGTATCGGTTTTGCATGGAAACGATCCGTCCTTTATCAATGGCTTTCAACGGAATTTGAGGGCCCCAAGGAGTTTCTCGAGAGAATTGGAAAGAATGGATTCCCTGAAGGAGAGAATGTGGTGGGAGTATGTCCCAAAGAGAGGGAGCTAAAAATTGAACCAAGACTCTTCGGACTATTAACTCTGAGTAAGAGAATGTATGTAGTCCTAACTGAGGCCCTTCTGGCAGAACATCTTCTTCCTTATTATGAGGAAATCACCATGATGGATGATTACTTGACCCTTCTGAAGAAGATCCACAGACAGACCTCTGATCCCGAACACACAGCCAACAGGAAGAACCTGTTCACCGTCTTGGACTTTGAGAAGTGGAACTCAAACATGAGAAAAGAGGAAACAGAGGAGCTGTTTACCATGTTTGATCAGCTCTTCGGCCTGACCAATGTTTTCACCCGAAGTCATGAGATGTTTGAGACCTCTTATCTTTATCTGGCAGACGGATCCTACCTCCCTCATTTTTACTCATCATCAGAGCTCAGAGAAGATGCATCCTGTTGGACGGAACATCTTGGAGGGATTGAGGGGTTGAGACAAAAAGGGTGGACAATCTTCACTGTAGCATTGATTCGCCTCATTGCTGACCAACATGACATTGAAATCTCTCTAATGGGACAAGGAGACAATCAAGTCCTCAAGTGCAGTTTTCCCGCCACAATGACCAATGAGGAGATCAAAATGAAACATCAAAAGTTCCTGGATCATCTCTTCTCTGAGTTTGGTCTCGTAGGACCTCCTCTGAAGAAGAGTGAGACATGGACCACGTCAAATCTATTTATCTATGGTAAATTCCCCGTCTTAAAGGGAGTTCCACTTCCTATGTCCCTCAAGAGAGTTTGTCGCATGTTTCGACTCAGCAATGAAGGATTCCCAACTCTAGAATCCTCCCTCGCATCAATCTTCACGAACGTCATCGCGGCGACCTTAAGTGATCATCATGGAGCTATCCCTTATTTTTGTGGAGTTCTGGAGGCTGCGTCAGCCCTGATCCTTGGTAGCTCTCACTCTATGATTGGAGGAAACCCTCTCATCAATGAGGTTCAGACTTCTCACCTGAAAGTGGTCATCCCTGATGGAGAGGGAGGTCA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| 20,806
|
ON812480.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,338
|
GenBank
| null |
China:Yanbian
|
China
|
Haemaphysalis japonica
| null |
2019
|
SAMN28669417
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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AATTGTATGATATTTATGACTGCCCCAATGCCTGAGAACCCTTAACAGACCTCCAATCAAAGGGCTTCCAGTGGTTTCGTACCCTTAGAGCCAACGATTTTCCCACCTTAAGGACTCTTTGTGGAGTGAGAGAAGGAACTCAAAAGCGAACTCGCCAAATGGCGGATGACCAAGATAACCTCGTTAACGAAGACCCTCTTCGAGAGCTGGTGGACGAACCCGTCTTCAACGATGCGGGCGGGTTATACCAGCTGCACGGACCAGCCGAGGTGGCTCGAGTGGCCCCAGAGTTTCCGGCCACGTGGTTTGCAGCTCAGCGGAACAAGCCGCGACTCAATTGCCCCGTCTTCCAGGGGCTATCGCCAGAGGACCTCCGCAAGACGGTTCATGGTGGTCTTGCTGGGGGGAATTTACCCGCCGATTACGCTGTCTTGTTCCTGAAGGTGGCGGCAGTGAGCATCCAGACCACCCTGACTGCCGATCTGACGAGCTTCGGTCAAACCGTTGGCGCGGCAACTGATGTGATCAACCCGCTGAGTCTGCTGGACGTTCATGAAGAGCCATTTGCCGGAGAACGTCCTGCTTGCCCCATGAAGGACAACCCTCCCTCAGATGCGGCCATGGTGGCAGGCATTGCGGTGAACTATCGACTGTGTGTCGCTAAAGGTCGAGGCGGCACAGAGACATATCTGAACGCTATCAAGGACCGGTGTGTGGCCCTGCTGGCCAATCCGCCATTCCGGATGCCAGAGGGCTACCTGGACAACTGGACCACCTGCGCACCGTGGACCAGTCACAGAGAGATTCAGGTCATCCTGGCAGCCTACGACATGCTGCTGTACCTAGATGGAAACCATGCATATGGTGCCATCCGGGCGGGGACCCTCGTGTGCCGAGGAAGAGACTGCGCCATTCTGGGCGATCTCCAACGAGCGGGGAGAGCACTGGGGACCGCACCAACTGGAGTTTTCTACTGGTGCTTCTCGGAATCACTGGCACCTGAGCTCAAGTTGCTGACTACTCGGGGTCAGGAGCTTGGTGACGACAGAAGTTACTACCACTACCTGGCTCCGATGGCTTTGTCTCGGCGGTCTCCCTACTCAGCGTCCATCTGCCCTGGGATCCATCTCATGTGCAATGCTGTAGCAGCCCTCCTCGGAATTGAAGAGGCCCAGAACACCCGCTACGTGGCTTGCAGCAGCCCGCATGCGGTTCTCACAAACGCTGCCATGGTCGCCTACGCCAACAGAGAAGGGACCGGCTTTCGCCAGATGGTGACCAAGGGGACAGCAGCCGGACGGGTTGCACGAACTGAATGGTTGGCCAGCCTGGGACGCCTGGCAGAGGAAGAGGTTGTGGACGGGACTCAGCTCCCCAGCACAGCTAGCCCACTCATGTGGTGTCAGTTCATGCGCCTCCGAGGATGGATGCTTCCTGAGGAGATCAAGGACTGGGCCAGTGTGCGGGTCCAAACCTTCCACAGTGTTCGCACCGGGTCCGTGGCTGAGTTTGTACGCAACCGCTTTGCCCGGGAGGTCTGAATTCCCATGAAAAAAAGTAACAGACCTCCACTATGTCATCAGATAGCGAAGCAAGCGACTTTATCGACGACCCACACGCCTTTTTCGCTGGGCTAGATCCTGATGCCCTAGAAGAGCTAGATCGGGCTGCGGTGTTGCAGGGTCAGTCAGAGGCGGCCGAAAAGCTTCCGTCAGCCGGCCACACAGATGATCCAGCTCGAGAACGGGTTCCGGGATACAATGAGCTCCTGGTGGTGCCTCTAGATCAACCCCAGGCTGAACTGACCCAGGCCACTCTAGAAGAGCTGGGGTTGGAGCAGTTTGAGTGGGAGGGAGAGACGGAGGAGATGGCCCTGAGGGAGTCAATTGCCATCCGAAAGTTTGCGGAGGACTTGGTTGAGAAGAAGGCAATTCACCTGGAATCCGTTGACGTGGTCAAGAACAAAGTGGTGGCAAAATATCGGCCGTTTCGGGCAGCTCTCTCATCTGACAGCAGCTCAGGTGGGGAGCTTCGATCCAAGTCAGTCGCGAAGGCCAGTAAACCTGCCCCAGCCGCGGCCCCACCCAAGCTTCCACGCGTTCCACCCAAGCCAGTCCAGACGCCCTCAGCCCCATCGACCCCGTCCACCCTGACCCCAAGCTCAGATGACCAAACCGCCGCTCTCGGGTTCTGCAACACCAAAGTGCTGATGAAAGGGTACGGTGGAAGTCAGATAGCTGTCCAATTGAGCAACTACGACTGTTCACCGGCCCTCGCTGCTCAGTATACAGCTCACAGCGGAAGAGAATCCTGGATGTTAGACCCTGCTGTCCCGGTGGACAAGAAGGTCTACTGGCTCTTGACCCAACATCGCAAAGCGTCGAAAGTGCTGAACGCCCTTTCCCCTCTTGCCTATCCTTAGGTCACGTGAAAAAAACTAACAGTCCTCACCATGAAGCGACTGTTTAAGAGGAAGGGAGGGTCTAAGTCCTCCCGCACGTCTTCCAGCAAAGACGAGGAGGGAACGGACGGGGGAGCTCTCTCCGGGTGGGGTCAACCACTGGTTGGTCCAAGTGCTCCGCCGGCCAGGAGGGTCCTTGACTCCCTGTCAAGGACGTATGATGTTGTCGGGGAACTTACAGTGTCTAGTCCCCGTCAAATTGATCATCAATCCTTCTTTGGCCGCATGAGTATGAATTTCCCCCACAGTTACCAGGGGGATGTGGCCATGAAACCCTTCCACACGACCATCTTCGCTGCTCTTGTGTCGGGTCTGAAGGAGGGAAAGGTATCCCACAAGGGCTGGATTTACTCGCATCGCCTGGCAGAATGTGTCACCTTCCAGGGGCAAGCTTCCCAATTACCCCAAGGGACCTCTGTCCACTTCAAGGACACCTTTGTCTGGCAATACAGAGGAGACTCCTACACCTGGGTGATCAACATCACCTGGACCTTGTCTCACATGCCTGGGATCCCCCTGCATGCCTTTCTTCCTCCCCAGGTGAATCCCCTCCTAGAAGTGCTGGGGGTAACAACCGTGTGGAACAAGGAGCAGCGTTTCCTGACACTGATTGACTAGTGGGGTGAAGTGCCCGTGAAAAAAACTAACAGACCTCAACATGTTGCTCCTTATCACAATTGTGTGCTTTCCCATATTGACTGGCGGTGTATGGGAGCCCGAAGCCACCTTTGTGGTTCCCGAGGATCGTCAGTATGTCTGGAAAAGGATCAACGTCTCTTCTCTGGAGTGTCCGAACATCTACAGCGTTCCACGGCTCAGCCGGATTGCACAAGTTGCACTATTGAGACCCGAGTTCACCGGCAGTTTTGATGACGCAATACAGGGGTACATCTGCTCCAAGGTCAAAATGTCTGTCAAATGCTCTGTAAATTTCTTTGGCTGGCGTTCTTTCGAACATCTCGTTGAAGATGTTGTACCATCACGACAGGAGTGCCTGGAAGGGGTAAGGACTCTCCAGGTAGATGGAAAACTGTCGAGTCCGGCATTTCCTGCTCCCAACTGTGGATGGATGGATGATAGGTGGGCAGAAGATCTGTTTTTGATTCTGACCAGCCATCCAACCCATGGTGATCCATACACAGGGGACTTTATAGACAAGATTTTCCCGGCCGGTATATGCGGAACCGATGACTGTCCCACCATACACCACGGATCTAGGTGGGTAACTACTAACCGAACCCCATCTTCATGCACTCGGTTTCAGACATCCTGGGCAAACATCGGGAACCAAGAGGATCCCCCTCATACCAGAGTGGTATACTCTCCAGAATTTGGGGTTAGATCGCTCGAGGGGTCCTGCACTATCCGCTTCTGCGGGAAATCCGGTTGGAGATTGGAAACAGGCGAATTTTTTGTGCTGAGCAGCCCAGGAGGAACGTCCCTGGGGATCCCTCCTCTGTGTGAACGGGGCGTAAAAATTGGGGAACTCAGCCTTCAGGGACAATTGGACTACACACGTCTAGAATTACTGGATCAGGAAACCCGGCTCCAATGTTTAACCACCCTTGCCACTATTGTCGCCACCAACAAAGTCAGCCCATTTCAACTCGGGATGTTCAATCCAACACACCCAGGCAACGGAAGGGCATACCGAATCAGGCAGAAGTTCCTAGAAGAGGCCCTGGTGCGATATGTTGGGGTGACCAGACTTGACGACAAGCCGCGGAACAACAGATTAGGTGTCGACCATCAAGGGAAACCTGTGATGTGGTCTGACTGGGTGGAGGTGCCCGGCACCAATCGGACCTTTGGACCTAACGGGCTTCTCAAATTACCCACCGGTGAAATAGTGATCCCCAATAAAGAGATTCGGGCATTGAGGCACAACCTTCAAATGACCGTGGCTCAAGACATAGACCTTGTGGGACATCCGCATCGGGAGATCACACAGAACTTTTCTGACCAAATCGGTCTCAGTTCCCGCAACACAGCAACTGACGGCGGAATAGATCCCTTTGGATGGATCAAAAGCAAATGGGGGTCACTCGGAGGAGGACTCACCACTTTGATTGTTGCGGGACTAATCCTCTGGCTCCTTGGTCGCTGCATTTGCAAACGCTCCCCCTCCAACTCAGTCCCCACAATCAAACTCTCCACCAGGGATCGCAACTGGGAGAAGGTGGCTACCACCAGTGTGTAACCTTGAAAAAAACTAACAGACCTCCAACATGACCTCTTACGAGGACGACCTCGAGGACGAGGTCCCTGGTCCCGTAGATGACTGGGACGCTTTTACAGAAGTAGAAATTGATCTGTTGAACCCGCTGAATGACCATGAAAGGTCAAGGGTCAAGGGAGTTCTCAATTCGACTGATTATAACCTGAACTCACCACTGATCAGCGACCACTCAGATGCAGTACTCGCCAGTTTAGCTGGGAGAGGGCTTCCCGGTCGCTACCTTCGAAGCCAGGAAATCGAGCGACAACAACAAAGCCTGGCACACTTGTCCTGCGACTGGAACAAAATCCAAGCCAGCCG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| 20,807
|
ON812481.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_2
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,520
|
GenBank
| null |
China:Huanggang
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28688364
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_2, complete genome
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CCCTAGTAACCCTTAACAGAACTCACCTTTTAAGGAATCTCAGCTTTGTAATCTCTTTAGTTCCTCTCAGATCTCAAGTTCTGTTCTACTAAAGTTCCTACAATCTCTAGTCAATGGCGGATCTCGCGGGAGCTAGACTCGGGCCGGATGGACTGCCAATCGCGGAGGGGGGAGAAGAAGATGACCTGCACGGAAATGGCAATGAAAATGGAAATGAAAATGGAAATGGGAATGATGATCCTGCTGATGGAGGAGACCGGGCAGCACTCGGAAACGCACGGGGAAGAGTCCCGCGGGGAGACAACGCCGAGGTGCCCAGGGGAATGCCCATACTCTTCTCACGAGATCAAATCAAGGCAATGCACTCTGAAGCCCCGACAGCCAAGCCAAAACCTGATTTCCCCTCGGTCTGGTTCGCGGACAAGAAAACCAAGCCCCAACTGATCGTTTACAAGTTCACCTTCAGCCCTACAGTACTGCGCAAAGTAGTGCACAAACACTTGTTGGCAGGCCAGCTCCACCCAGACATCGCAGTCGCATTCCTAAAAACTGCTGCCCCGACCTTCGAACATGTGCTCAGACAAAGAATTGCAAGCTTCGGACAGGTCATCGGAGAGGATGGGGACACGATCACCCCTCTCTCGATAGTTGAGGTCACGGAGAAGGACTGGGGTGGAGCGGTTCCCGAGAGCAATATCGCAACAGAACCTCCCTCAGATGCCGTCTTAGTGGCATCTATTGCGATGGCATACAGATTGGCCGTCGCCAAGAGCAGAGGCGGAACCGACGCATACCTTGTGACCCTCCGAGACAGATGCAAGACCATGCTTGCGAGTCCCCCTTACTCCGACTCGGGCCTACACGTCGACAACTGGCACACCAATAAGAACTGGGCTAACCACAGGGATCTGCGGGCAATGATGGCAGCTTACGACATGTTTTTCTACATAGCTTCTGACCACGAATACAGTGGCATCCGTGCAGGCACTCTAGTTTGCCGTGGACGTGACTGTGCCGTCCTGGGAGACCTCCAGCGAGCAGCTCGAGCCATGGGGCAGGCTCCCTGTGATATTTTTTATTGGTGTTTTGCATTGATTTTGTATGCAGAGCTCGACATCGTCGGCACCGAGGGTCAAGAACTGGGCGAGGAGTTCAGTTACTACCACTACGCCTCAGACTTTGGAGTGAGCAAGCGCTCACCATTCTCGGCATCCATGTGCCCCGGACTCCACCTCCTCTGCAACTCAATCGCGGCTCTATTAGGCCTTGAGGATGCACAAAACACCAGGTTTGTTAACTGTGAAGGGCCGAACTCCGTGTTGTCCAATGCTGCCTTTGTGGCCTACGCCTTCCGGGAGGGCACCGGATTCGGACCCATGGTTGCACACACCGTCGAGGAAGCCAGACAGACCAGAGCAGACATGGACGAAGAGGCCAGAAGGGAGCAAGACAACCAGGCCATCGACGGGGAGGTCCCTCCTGTGTCCCAGCAGCCGGGAGTGTGGCACATGTACATGCGCACACGAGATTGGAGGCTGCCCCACCAGATCACCAACTGGTGCCGACAACGTGTCGCCCTCTTCAAAACTGTCCGGGCAGGCTCAATCGCAGAGTTTCTGCGCAATCGTTTCTCAGTGGTCGAGTGACCCGTGAAAAAAAGTAACAGCCCTCCACTATGAATCCCAACCCCTTGGACACCTTCCCCCCCGAGATGCCCAACAGCAAGAAACTTCCCACAGGACGAGGAGCTATGGCAATAAATCGCGCGGCTGCACTGCAAGACCGAAGCTTTGAGGAAGAAGCCTTCCGAAAGGGTGCCTTAGCATGTACAGACCCAGCCCTCCAGTTTGTCCCTGGCTACACAGCTCCACCTCAGGTAGAGACAGAAGGTCGCTCCCGGCCTCCCACTCCGACTCTCGATCCATCTAGCTATGTGGACTTCTCCTACGAGGCCAGGGACGAGACTCAAGCAGAACTATTTCTCAAACCCCTGAAAGCATTCATCGAGTCCTTGGAAGAATCAAAGTCTGTGATGGTGGAGGAAATTCGAGTGCATGGGAACAAGGTATTGGCTCGCTATCGCCCCTTCCGCGCTGCTACCCCATCATGCAGCCAGTCAGGAAGCGAAGCCGGAGAAAAACCTGACTTGGAACCCGAGAAGGACGAAACGACCCCAAAACCCACCAGCTCCACAACCAACACCAGCCCTGCCGACATCGCAGTCACGACAGTGGGTCCCAAGAACCAGACTCCCGATCCGGCCAAACCCGGTCCATCATCCACTGACACACAGAGCATCTCCTTCTCCACCACATCGGCTGGTCTAGATGTGAACTCACTGTTCAGGTTTTGTGAGGAACGAATCCTAATGAAGGGGTTTGGAGGAGCAAAGATCACCATAAACTTGGCCTCCACAGGATGCACTCCGGCGGTCGCCAGTCAGCATGTGGCAGAGGGGAGAGCCGAGTCTTTTATGTGTGACCCCAAAGTCCCCCAGGACATGAAGGTCTACTGGCTTCTCAAGCGGCATAAGCCTGCCAGCAAATTTCTGAAGGCAGTATCTTCCTCTTATTACAAATCTGTTCCATGAAAAAAACGTAACAGCCCTCACCATGCGACGATTCATTGACCGAGTTCTCCGTCCCGGGGCTGAAGAGGCCCGTGGCCGCCGCTCTGCCCGCCAAGACCAGAATCCCTTGGACCGATGGGGAGGAGCCCTCGCTGCAGTGGAGGCGCCCGCACCGCCGCGTCCTCAGCTTCAACTGGTCTCCTACGATGTAACGGGGGAGCTGAAGGTGATCAGTCCTGTTTTTGTGGACCGACAAGCCTTCTTCGGGCGAATGAGTGTTAATTTCCCTCATTTCTATCAAGGCGATGCTCTAATGAAACCGTACCACACCACGGTCTTCGCCCTACTGGTTGCGGGCCTCAGAACGGGCATCCAAACTGATCGCGGGTGGATCTACCGCTCCACTGTCGCCGAGTGTGTTACCATCCGTGGAATGGCCATGGAAATTCCACACCAGGAGTCCAGGACATTCAGGGACTCATTTACCTGGAGATACCGCGGGGACAGTTATGTCTGGTCAGTAACTATCTCGTGGACTAGGTCGTACATGGTGGGGGTCCCTCTTGATCGTTTTATTCCAGTTGAACACCGCACCCTCCTGTCCGCTCTAGGTGTGAAGACCATCTGGAATCGCGAAGGGAACTATCTTAGTCTTCGCAGTGAGTTTTGATCCATTTGCATCATGAAAAAAAGTAACAGCCCTCAACATGCATCCACTCATCCTTGTGGTCGTAGCAGCCTCCACACTGGTCAGCTCCCTGGTGGTAAACGAGATGTACATGTTCCCTAGAGAAAAGAATTACATTTGGAAACCTATTAATCTTTCCGCACTACATTGCCCCCTAAGCCCAACTGAAACCACCATTCATAACCCTCAATCTGTTCAAGTCCGCCTATTGAGGCCTTCTGGTCACTTGGACTCCCACATCACCGGTTACATCTGTTCGAAATTAAAGCTGTCCGTCCAGTGTTCTGTTAACTTCTTGGGGTGGAAAACGCTATCCCACCGAACGGAGGATGTGTCTCCTGGCCTGGGCGAGTGCACTGAAGCTCTACACCGACAACAGCAAGGTGATATCTCCTCGATCCCAGCATTCCCCGCTCCTAATTGTGGCTGGATGAATGACCTCTGGGCATCCGCAACCTTCTTGCTCATGACTCTCCACCCAGTTTCCGTGGATCCATACTCGGGGGACCTGGTGGATAGGATTTTCCCAGGGGGGAGCTGCAAAGACAAATTTTGCAAAACAGTGCACCATGGAGCACATTGGGTGTCGAACAGTCGAGTTCCCGAGATGTGTTCCCAATGGGAGGTGATTCCCGGGACAATGGGAACTAGCAGGGATGGAGACCCCTGGGTTCTGCTCCCTTTGCTCGGCCATAAGAGTCTAGTAGATGTTTGCAAAATAACCTTCTGCGGCCACACAGGTTGGAGACTTGTTACGGGAGAATTTCTAATATTTGAATCAGGACTTAGTTCGCATTTGCTCCGTGCCCCTCCTTGCCCAGCTGGGAGTGAGGTAGGAGAACTGTCTGTGGCAGGTGAGTTGGGATTGGCTAACCTCCAATTGATGAGGGAAGAGTTGCGACTCCAATGCCTCTCCACACTGACGACTATCCTGGCAACAGGGAGAGTCAGTGCGTTCCAGCTCGGGTTCTTTACACCCTCTCAAATAGGCCCAGGTGAGGCATATCGACTCAACGGACCTCGTTTGGAGGAAGCGAAGGTGGATTATATCGAGGTCTCACGGTTTCCAACCACTGGGGTGTCAGATATCATTGGCTACATGGTTAACGGATCAGAGGTCACGTGGAGCGACTGGACTCCTCTGTCAAATTCCAATAAAACCACAGGTCCGAACGGCGTGGTGAGACTCTCTTCAGGGGTTGTCCTGATACCCCAACTAGAGTCCCGTCGGCTGATAAGTGATCTCGTGATGATGATCGGACAAGAGGTTCACTTAGCTAGGCATCCGCACCGAGACATCGAAAGCAATTTCTCTGACCTAATTGTGACCAGTGAGCGCGATGAAGGGAAACCGGGAGAGTGGTCGCTGTTATCCTGGCTGTTCGGTAAGTTCAGATGGGAGGGTACATTAGTTATTGTCGGGACCATATTAATACTTATCATAGGGGTCAGATTGGTCATTAAAACCACTCGCTGCACCTGTCGATCAAGATCTAAACCCACCATTCACTCATGGGACCAGGTCGACTCGTCCTCCGTATAGGGCATGAAAAAAAACTAACAGGCCTCACCATGGCCTCATACGAAGACGAAGACACTGAATTCCTCTTTCACCCGGATGAGGATTGGTCCGATTTCCTCGAATGGGAACCAGAGATCCGGGGCACCTTCACGGGACTAGATCGTCTCACAACTCGAGGGATCCTCAATGCTACAGATTACAATCTCAATTCCCCTTTAATC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| 20,808
|
ON812482.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_2
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 9,816
|
GenBank
| null |
China:Yanbian
|
China
|
Ixodes persulcatus
| null |
2019
|
SAMN28669472
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_2, complete genome
|
CGCTTGCCGCCCGCTAAAGAGCAACTGGTCGCATTTTTAAAATCGGTATTAGTGGAGTATACAGCTTCACCTTGACGTTATATTTCGGCTGTAATCATATTTCGGAACACTAAAGCGATGCCAGACATTTATTTTGGTTTCGTTTTCGATTGGAGTTGTCTTTTATTCGAGTAAAAATATCTTCTAAAGCATAGTTCTAATACAGGAAAGATGATGACAGGGGGAGTGCCAAGGGAATGTCTACCCTCCTGGTTCAGCATTTTGAATGAGGAAAAACCTAGCTTCCAGAGGCAATTTCGGCACTTTATTACAACATTCAGGTGTAGCATTTAGTTGCGTTAAGTTCCATAAAATAATCTTGGAAGGAACAAACAGATACCAATGTCTGGGTATGTCACTCGAAAACTTCCATGGCGATGCAGTCAAAGGTACAGCAGCGCGTGCATGCGCACATCTTGAGCACCGAAAGAACACCGGCAGGTGCACTCCACTCTCTGGGAGCACCCCAGAAAGTCGCCCTTATAAAGTGGTAATTTATAAGGTAACAATCACATGTGAATTTCACAGATTTCATTACTTCAGAAGCATGCACCCCTTCTATTGGAAGCCTTTTGATGGTGAACTCCGATACAGAAGGCTTGCAAGATTATCACCAAGTGCCCCCTTTATTCAACAGGGTATTGCAGTGTTTGTGGCAAACCACCAGCAGAATGTTTTCTACTAAGCATATGCTATTTGGCTCATCCCAGAATTGCAAGACACTCGCAGAGTATGCAGACTTCCAAGCTTCTATCATAGAGTTCACATCAAAATGAATTGGCCACATGCCGCGACTTCTCGGCACAAATTTACATGCTGCTCAACATGTCCTGAATATTTAGAAAGCTGCATGTCAGTGAATGACAGCCAAGAGCAACATGTTTGCAACTGGAAACAGATTATATTCTGAACACAGTACAATAATTTATCATTCTGTAGATCACCACTTTTTCAAGGCCCTAATTTTTTTTAAATTTAAAAGTATCTGAAATTCTTTTCTTTCTTTTTTTCTTTTTTCTTTGCACATACTTTTGTTCTTTACAAGTTTCCGCTCTGGAGCATTTTTCTTTCACACACAGGAGCCCTCTAGCAGGACCGAGAGCTCCCAGATCTCATGAAAAAAACAAAAACCGCAACTAAAATCAAGCAAACCGCAAACATGAGTGGACTCGAAGGAGATGCCGACTTTGGAGCGTCGGAGCTCCCGGCGGATAAAGTTCGTATATTCGAGAAGGCAATGTCTTACTTTACCAAAGATGACGAGGAAAAGAGACGAGAAATGATAGTCGAGGACGATGCAGTCCCAGGGACCTCAGTGAGCGCTGAAATCGTTCCGATCGAGTACTCACATGTGACAACTCCTCCTTCACGCACCCTACGGACAGGAACCAAGTCGGTCCTCAAAACTCCACTTCCCGGGACAAAGAAGAGGGCGCCCGCGAAGAGGGGGAAAACAGCAAAACCCCTATCCCCTCTCAAGAAGGACAACAAGTCCAAGAAGGCCAAGACAGACGTGGAGGATGAGAAACCAATAAGTCTTACCAGCGACGGAACCAGCACACAGTACATTGATAAGGAGGGGGTCTGTTGGGATGGACCAATTTTTGTCCCAAGTCTAAACAAAATGAGTGACAAGCCGGGCGAGGACCCAGTCCACCTGACCACACTGCATCTTCTGAACCAGTTTCAGAACAGAGGAGTGTTGACTCGTTATCGTATTACAGAAGAACCGGAGGGCTGGAGAGTTGATTACCGATACCCCGTGGTAGGCAACACATCTATTGCCGTGGAGGTTGAGGACGAGATCGAGAAAATGGAGGACGACGTCGCCGAACCAGACCCCGTGCCGACTCCACATCCCCAAACACAGACTTACTCTTGGAGCTTTCTCAATGGAACTTTCAGATACCCGTCCCGCTACACAGCAGGAGAGCACTCTTTTCATCTTCCAGACTACAAGGTAACCCAGGAAGTTATTATCGAGGGGCTAGGGGAGACACCATTGGAGGCATTCTTTGATCCTCGCATCTCTAACAAGGAAAGAGCTCTATTCGGGCTGGCCCAGGTGATCGGAGTAAGGAGACTCCAACACCAAATTGCACCAGCTGCCTTCGAGAATGTACCTCTCATCTAACCTGGTCAGCCTGACCGGATGCGATTGGTAGGCCCTCCTCCCCGACCGAGAGAGGAGGCCCCCATCGGTGTGCCGTGAAAAAAACTAGACTCAATCAAGCCTCAACACACAATAATATTACTAATCGATATCTGTTTTTATTCCAGAGGCCGAGTTTTGAACGACTTCAGTGAAGTACGCTACTTCTCGAATACCCAAGATCCAAGATCAAAGGAGAGACAATGGCGCAGCGAAACATCAATGTTTTAAGCTCGATCAAGATCATCACCTCAATTCCAGCAACATCTCAAGAATCCCTGTATGCCGTAGGATTGAACATATTGGACGACTATTCCGGACCTCTTGAGTGGAAACAGTTCGTTTCTGCAGTATTTCTTGCCACCCTCTGCTCAATGAAGACCTTGGATGACGAGGAGTCTTTACTTTCTATGGAGGGAGAGTTTAACGAGGTCCTCCAGGTTAAAAGAGAATACTCTTTGCTTATACCAGAACACCGTCTCCTCTACAGAGACCGATTCGCTTGGCCATTCGAAGGCGTTCGGTATATTATAAATCTGAAGATGGAGCTGTCTAAGACAAGGGTGCCGGGCATTCCGCTAGCACCTCGCCTCCTTGGTGTACCGTCACACCTCAAGACCCAATATGTCACTAATTGGGATGTGTACGAAACAGTCGAATGATTGTGAAGTTATAGACCGCAAACTTCCTTTCCCCAGATCTGCTGGACATTGAGGAAATGTTGCCATGAAAAAAACTAGTCCATACATGATTTCAGAACCGACATGACAAGAAACCCCCAACAAGGATACCATCTTCAAGACCTTCCATCATGGACTGTCTATGGGAAGAAGAACCTCCGGACCTGCTCACCGAAGAAGAGGAAATATGCTCTGACCACTTCGACCCACTTTATCTCGAAGAAATCCAAGAGACGATCAAAAGAATCTCTGTGAAGCACACTGGTCCGCTCATCAATGTTGACTATAACCTTAACTCACCGTTACTCAGTGAACGCCCCGATGCTGTATTGAACACCCTCCGGGGAAGATCAGTTGAACAACGCTTGTCCTCAGTACCTGGAGTGAAATCCGCCTCAGAAGTGTTCAAGCACCTCGGCTTGAATTGGGACCGTGTAGAGGCCTCAGAAGGCTTTCATTCATGGGTTGCTTCGACTGTGTTTGAGGGGAGCCTTAAATCCCACCAATTCAGTAACAGACTCGGCTCTCTTCTTGAAAAGAGCAAAGATGCAGTTGAAGTGCTGGAAACGTTCTGGACACATTTGACTGAGAACAAAGATCCACTCCCAATTGACCCTATGAAGATGGATTGGGTGAAGGGCAATGCAAATCATCCATCGCAACCTCGCCTCTTACAGGATGGTGAATGGTTCTGGTTGTTCCATCGGATTGTCATGATGATGAATTCATCCACCAAGGAAGAAAGATCCAGCCTTGTTCGCTCAGAACTCGATCACCTGAAATGGATCGTCAAAGAGGAGAAAGAGGGATTCATCGCATCATCGAACACTCCCGAATACGGAATCATCCACGTGGTCCCGGGATACGTATTCTTTCAACTTCACAACCGTCTGCTCAACAGAGACATGACACTCATGGTCAAAGACACGTTGATTGCGAGATACGCATCTAAAATGAGTCTTCTTTGTCGCTCTGACGGCCAGGATGGACCAGATGCTTTGAAAAAGTTGACAGCATTCTATGCAGAGGGAGACTCGCTAATGTCATCTTTGGGAAACAGCGTTTATGATATACTCAAGCTAGTGGAACCTCACTGCAACTTTCAAATGAGTATAATTGCGCACCAGAACAGACCGCTTATTCCACTAGACACTTCATTTAGATACCACCTGTCGAGCTCTCTGGAGACCATCAAGGATGAGATGTCCGTTGATCCTGACCCTTTGTTTCGTATGATCAAAGAGGAGTACTCTCATCGGCAAGTCCTTCTCTATTACGGGGCGTTCCGACATTGGGGACACCCTTTCTTGGACTATGAAGAGGGCCTAAGACGGTTGCACGCCCAGGTGCAGCTTGAGAAGACCATCGACACAGAGTATGCAGAAGCTTTGGCAAGTGATCTGGCATATATGGTTCTCGAAAAAGAATTTTTCACACAGCGCCAATGGTTTGTTGATCTTGAGAAGCTGGATGTCCAGGATCCTCTGTACAACCATGTCCAAAACACGACTTGGCCAACCCCGTTGGAGATCAGGAATTACGGAGACAGATGGCACCTGCTCCCTTTGATTCCATGTTACACAGTTCCTCAGACGATTGACCCATCTGTGCTCTATGGAGATCGTAGCCACTCCATGAACAGATCAGAGGTTATTCGTCACGTTCAAGCCCATCCTGACCGTGAAATTCCCTCTCGAAAAGTTCTCCGGACGGCGCTTGAAACTCCGCAGACCAATGTGAAAGACTTCCTCCAAGATGTCAATGATAAGGGACTCCGGAGAGACGATCTCGTCATCGGATTAAAGGGGAAGGAACGGGAGATCAAGAGGGAAGGACGGTTCTTCTCCCTCATGTCTTGGAATTTGAGGCAGTACTTCGTTACAACGGAGCATCTGATCAAAGAGTTTTACGTACCACTTTTCTCCGGACTCACTATGGCGGATGATTTGACCAAGGTGACTAAAAAGCTTTTGGATAACTCAATCCACCAAGGTCGACATGATTATGCCTCCATCTCGGTGGCTAATCATGTCGACTACGAAAAATGGAACAACCACCAACGGGGCCCTGCAAATGATCCTGTCTTCCGCGTCATGGGACAATTCCTTGGTCTGCCAGAGGTATTCGTA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| 20,809
|
ON812484.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,666
|
GenBank
| null |
China:Zhangjiakou
|
China
|
Dermacentor silvarum
| null |
2018
|
SAMN28669566
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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TTCCGGAGTCGGACCCGGCAAAGAGTAACTCGGATCCAAGCGGGTTGAGAAGGTAGAGGATTCCCTGACACGCAAGGCCCTAGGATAGAACGCGTCTCGGACTGGTTGTCTGTAAGTGGCCGAAATGGCAAATTTGGCCGATTACGAACAGGTGGATGGTGGGGAAGTCTCTGTTTATCGAAACCCGATAACGGGAGTTGATGAGGACCACTGGATTCCCGACTGGAGGCGCCGAACCGGCTCAGACGAGATAGAAAAGTTTTATGCAGGAGGAGTAACAGAAAAACCAAGTGTGGCGCTATTGTTGAAGGGGACCCCGACCGCGCACAACGACCCTACACTTCCTGGCCGAGTGAAGAAGGCAATCTCCGCTGGGCTCATTGGAGGGGACATGGCCGCGGCTTTCCTGTACCGAATCTCAAAAGAGATCACCCAGACACTGACCGAGGACCTGGTGATCGATGGTCTCGTCATCCAGAAAAAGGGTGGCAAAGTAAGTCCACTGGATTTCATTACAGTCACAGAGACATTCTCAGACGAGTACCCGTATGATCCGAACGCTGTGGAGGACACTCTCTGCTCTGACCTGGCGGCTGCGTTCCTTTTATGCATGTGTCACCGGCTGCACATGTCGACAACCGTTCCCAACGACGAAAGGATTGAAAGGATGGTAGACAGAGGGATGATGATAGTGAAGTCTTCGCCGTTCAATGCTCACAGCGACGTCCTCAAGACTGCAATGGCAACAGCTCGCAACTTTGCGGCGGACCTGGTGGGGAACGCTGCTTTCACTGCCTTCCTTACAGCGATCGACATGTTTTTCTGTAATTTTCCCTCGCACAGGTATTCAAAGTTCCGTATCGCGACCCTGCATATGTTCTGCAAGGACTTTGCAGTCCTAAACGACATCATCTTTTTCAGAGAGCTGATGGGCATGCCACCGACAGAGTGGAGGAGTTGGGTCTGGGTCAACATCATCGGGGCAGAGCTGCACCGGATCGTCAACTTGAACAAGTTGGCCAAGTTCGACCGATCGTACTTTCCCTACATGAGAGGATTGGGGATCATTTCCAGGTCTCCACTATCAGTCTCTGCATCGCCGAACATCCACGCCTTCATCCATGCAGTAGGAACCTTAAAAGGCTCTGAAAGGTCACGAAATGCCAAGCTCATCGGACATGTCTCAGACGATGTCTTCATCAACGCCCGCATCGTGTCCCTGGCAACCACTGTGACCGATGCAAAGTTTCGAGCAGCATGGGTGCCAAAGCGAATCTCCGCAGAGATTTCCAGAGCTGAGCAGATGTTGAAGGTGTCCGCCAAGCCGGGAGGGCAATCAACAGCTGCGTTGCCCAGGACCAGGGACTTCATGGCCTGGTACCTTCACTGCATCCAATGTGGTGGAACTGAACCTGCCCGATCTATCTCGACTGCAAAGCAGACTCTCCACAACCTGGGACGTCTCAGGGATGCGTCCGTTGCGGTGGCCCTGAAGAGGTCTACCGAGGCTCGCTTCATTGCTATGCAGCTCCCACCTGTAGTGGAAGCCATCGAGACCAGTGAGGATGAGGCCGAAGAAGAGCCACCCGCCCAGAGACCACGAGTCGCCCCAGCCGACACAGCCCCCGCAAGCGACCAGCCCGGCTCCCGCAGGACCCCGGCTGCTCCCCTCTCAACTCCCCGTCACCCGAGGGGACTGGGTCTCCGACGAACCCGGGAGGCTGACTCCGATCAAGACTGAGCGGCTATGGCGCCCCCAGAATCCGAGCCAAGTACCTGAACGGGAGAAGCACCTCTCCTCCTTAGTCACAAGCTGTGATATTTTCTTTGTCTTGAAAAAAACTCTAACTACCCTCCAGAGCAGCCCCATAGACCAATCCGGCCCCAACATTCCCGACATGTCAGAGCGCGACAACCAAGAAGGAAAGGTGTATAAGGGAGCTGGAGTGTCCGGATTTCAAAGACCAGACCTGTTGACTACAGAGGAGCTTAGTGACCTGAAGACCCTCGACGAGTGGACCCTCAAAGCCGCCGAGTCTTTCCCGAGAGGCGAACCGATTGGCCCTGAAGAGGAAATCATTGGTGCCGGGCAGGCATCTGACCTCCTCTCTCCGACATCTCTAGGTCGTAGATCCGACGAAGCCTTGTCTCAACTAGTCACCGATATGAAACTCAACACGGCAGGCAGGAAGCGGCATAGGGCGGGAGACAAAGAAAAGCACGGCGGCCACCGCAAAACACCCCGCTCAAACCCCGGGACACCCCGCTCCCTCACCCCCGAGCCTTCTACTTCCAAAGCCGGCACCCAAGAACCTCCCGTCCAGGAGCCGGAAACGCCACCTGAGGCACCGCCAAGTCCCGCTCCCTCTACATCTAGCATCGCAAGCCCGGCCAAAAGCGGGTCCGGAAGCAATGTCGCCAGATTCCTCGCAAAACATCGCCAGCCCCTGTCTAGCCTCATCGACCCCTCAAATAAAAAGGATGTCGTCGTGACTGTTGGGGAAGGAGACTTTGATCCAGAATCAGACTTGCTTTGGCGCGTGAAGATCTCGGAAAACAAAGCGACAAAAACCTCCGACCTCAAGGGAATTGACATCCATAACCCCCTGGTTTTCCCGGTGTGCAACCCGCGGTCAAACGCAAAAGGCCTTGACTGGACCCTGGGCATCATTGATCGGGTGCTTAAAGTTTGCAATTTGGAGCCCATCCAAGTCCAGTATTCGCACTCCACACAAACGTTGACCCTCCTTCCGCGAGACCCCGAGCCGCCTCCAAAACCGGCAACCTCGGATGCGAGCATCCCCGTCCAAAGCCCCGGCCTAGCCCCTGCGACCGAACCCGGGCCCCGTCCAGGCCCCTCGAGTTCTCGAGATCCGGCTCCCGCTCGAGGTGGAGTCCAGGGTCTAGAACCCTTGAGAGAGTTGCTCCCCAAAACGCGGGTCCGCATGCAGGGTGGAAGAATGGGAGTGCTAGATCTATTGGCACTGCATAGCTCTGTTAATGTCCTCTCCACCTTGGAGACTTGGGACAAAAAGTGGGCAATCTTAGCAGAGGAGGATCCTTTGCGTCGACAGGTCATCGCTCATCTCGCAATGGGTCAGGTGGATATTCTCCTGAAGGTCGATGATCCTTGCGTGATGGAGATCGTCGGGCTATTGGCAGGCTAAGACCATGAAAAAAACTCTAACTACCATCCCATCATCGACCCCTCACCATGGCAGCTCCGATTGAGTCCCATGACGGTTCTGACTCATCTGACGGCTTTCCCCCTCAGTTGTACTTAGATGTTCTTACGACCCTGCACATCACAGGGCCCGAGAAGGTCACCACAATAGAAAGCCTAAAGCCTTTGTTGGTCAACCTTTCTCTTTTGGTGGGGGATGGAGAAGGACACCGTGGCAAGATCCTTCTGGGAGCTCTCGGTGCTTTTGAGTCCTTAAAAGGAGGGCTGGTGAACGCGGCCATGCGTCGAGACTGGGAAGGAGAATGCGGTCTGCGGTACCAAGGGGAACCTATCACCAGCGGCGGCATGGACATCCGCGTCCCCAAGACCTTTCAAAGAACACAGTCATGGAGCCTCATGGGAGGTCGATTCGACCTATCGGTGACTGCACGCTATTCGGAAACCTTTATCCCTCCTGACAACGCGACATCCGCATTGAGTCGTCGCTGGAGGGAAGTCCTGCAGGGATGGCGAACCGAGCAAGCATCCCTGGAGAGCCTCCTGGGAGTCGAGGAGACCTTCGGCGTCTGATTCACGATTGCGAGCCCCCCCAATCTCATGAAAAAAACTCTCAACTTCACTTCGTTACTCAACTCACCAAGTCAGAACTCACTGACGAGGATTGGGATGCAGCGGCGGCCGTGGGAGAAGATGGCTTCGAGTCATCTGACGAGATGTTCGAGGAGTACTTCGATCCAGAGGGGTATCTAGAGTCCTCCTCTTTGCAAGCCGCCATGAAAGAGTCCACAGAGCTTATTGCAAACGATTATAACTTGAACTCCCCTCTTATCACTGATGAAGTCGAGGGTTTGTTGCTAAGCCTCAAAACAGGGTGTTCTCTCCCGACACGATTCAAGTCTCGATTCTTCATTCGTGTGGCCCTGCAGAACCTCAAGGAAGCTGGGATAGACTGGTCTAAAGTCACATCAACCTCCACTTACCACCAATGGATCGGACGTCTCTTGACTGACAAGACCGAATATCCCAAGACTCTCTTGGGGATCCTGAAATCCTCCTCGGTCAACTGGGACGCTGCACTCGATGTTTTAACCACCTTTTTCTCCTCGTGGGGGAAGATTGGTCTCCCAAACAAGGTGGTTCTCAAAAAGCTAGATCTGCTCAAGGACCCCTCCCTCATTGGTGTGTCAGACAGGGTTTACAAGGACCTTGAACTTTTCTGGTTGTTCCATTGTCTTACCTTAATGATGAACAGTTCCAGCCAAAAAGAGCGGAAAAACCTCCAGACTCAGGAAGGAACCGGCTATTCTTGGTCTATAGAAGAGAAGGACAAAATGACCTTTCTGGCCAGAGGAGTCCTTCCAGGACTTGGACCAGTGATTGTCACCTCAGGGTTCGTCCTGTTTAGCTGCGTGGGAATACTGTTGGACAGAAACATGCTTCTCATGGCGAAAGACCTATTCGCTGCAAGAGCTTGCACGAAGCTTTCCTTGCTCGGCAGAATGGAGACCAACAAGTACCAGAGACAACTCATTAAGCTGGACAATTTTTACCTCAAAGGGGATCGACTGTTAGCCAAGCATGGCAATCAGTTTTACCCTGTTGTAAAACTACTGGAGCCGCACGCTAACGCCAGAATTATTGCCCTCGCTCAAGCGCAGAAGCCTAGAGTTCTGATTCCGCCAGACTTCGAAGAATTCTTGAAAGAGAGCCGGAAAGAGATCCGGGAAAAGTTGAAAATTGACTGCACGGAGTTTTTCCAGACCATCTCAGAAGAGCCAGATTTAGATGTGGTCTTGTTAATGTATGGCGCATTTCG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CCGAGGGATTCCAAGGACATGAGAGATGGTTCACCACATGGAGGTGGAATCATTCCTTGAACCAGAAGAAAACTTTCTACGGAGTAGATCAGCTCGGTTTAGCGAGCAGGCTGATAAGAGCTTTGTCAATGTGGAACCCCGCTGGAACAAGATACTCTGTGCCTGATTTTGAGTCTCTTTTTGAAGAGGCTTCAAGGGAAGCTCGTAATTGGGACAGGGGGTTGACCACTCGCCACTTGCGATCATCCCTTGACCTTTTTATGGGCCTTGACATTTTCTCCGACGCACCAGATCACCCTTCCAGCGAAGAGCACCAGTATGTCCAGGGCCCTGAGGCTCTTGAGTGGCAAGCCCAACCCGATGACGTCGCAGGGCTTCCTCTCGACCCTACAGGCCTAGACGAAGAGGGAGGCTGGCGTGGCGACGAACACTACGGAGTTTAAGGTTGACAAGACCCAACGGTCGCTTGAAAAAAACTCTCACGGCTAATAAAATCCACCACACCTCACTTCCGAGAGACTCTCCTTACCACCAAGGAATGGACCGGGACCTCCCCCGAATCACCCCGCCGCCCGGGGCCCCTCGGCTCGGCGAGCCCAGCCAACCTGGAACCGAGCGGATCCGAGGCCACCACGGCAAAGTCCGATATGTGGTCTTGTAACCTCG
| 20,811
|
ON812512.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,529
|
GenBank
| null |
China:Zhangjiakou
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669347
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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| 20,838
|
ON812513.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_3
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,717
|
GenBank
| null |
China:Huanggang
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669349
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_3, complete genome
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TTACCCTCCGAGACAGGTGCAAGACCATGCTTTCGAGTCCCCCGTACTCCGACCAGGGCCTACACGTCGACAACTGGCACACCAATAAAAACTGGGCCAACCACCGGGACTTGCGGGCGATGATGGCGGCTTACGACATGTTTTTCTACATAGCCTCCGACCACGAATTCAGTGGCATTCGCGCAGGCACTCTGGTTTGTCGCGGACGTGACTGTGCCGTCCTGGGAGACCTCCAGCGTGCAGCTCGGGCCATGGGCCAGGCCCCTTGTGATATTTTTTACTGGTGTTTTGCATTGATTTTGTATGCTGAACTCGACATTGTCGGCACCGAGGGTCAGGAACTCGGGGAAGAGTTCAGTTACTACCACTATGCCTCAGACTTGGGAGTGAGCAAGCGGTCACCATTCTCGGCATCCATGTGCCCCGGACTCCATCTCCTCTGCAACTCAGTCGCTGCCCTTCTAGGCATGGAGGATGCACAGAACACCAGGTTTGTCAACTGCGAAGGACCGAACTCTGTGCTGTCCAACGCTGCCTTCGTGGCCTACGCCTTCCGGGAGGGCACCGGATTCGGGCCCATGGTGGCACGAACCGTCGATGAGGCCAGACAGACCAGGGCTGACATGGACGAAGAGGCCAGAAAGGAGCAGGACAACCAGGCCATCGACGGAGAGGTCCCTCCTTTGTCCCAAGAGCCGGGAGTGTGGCATATGTACATGCGCACACGAGATTGGAGGCTGCCACATCAGATCACCAACTGGTGCCGACAACGTGTCGCCCTCTTCAAAACCGTCCGGACAGGCTCAATTGCAGAGTTTCTGCGCAATCGCTTCTCAGTGGTCGAGTGATCCGTGAAAAAAAGTAACAGCCCTCCACTATGAATCCCAACCCCCTGGACACCTTTCCTCCAGAGATGCCCAACAGCAAGAAGCTCCCTAGAGGGCGAGGAGCTATGGCAATAAATCGTGCGGCAGCACTGCAGGACCAAAGCTTCGAGGAAGAAGCATTCCGGAAGGGTGCCCTGGCATGTAAGGACCCGGCTCTCCAGTTCGTTCCTGGCTACACAGCCCCACCTCAAGTGGAAACGGAAGGTCGCTCTAGGCCTCCCACTCCGACTCTTGATCCATCAAGCTATGTTGACTTCTCTTACGAAGCCAAAGACGAAGTTCAGGCAGAATTGTTCCTCAAACCCCTTAAGGCATTCATTGAATCCCTGGAAGAGTCAAAGTCTGTAATGGTGGAGGAAATTCGAGTGAACGGAAACAAAGTATTAGCTCGCTATCGCCCCTTCCGCGCCGCCACCCCATCGTGCAGTCGGTCGGGAAGCGAAGCTGGAGAAAAACCTGACTCAGAGCCCGACAAGGACGAGACGACCCCGAAGGCTTCCAGCTCCACAACCAAGACCAGCCCCGCCGACACTGTAACCACGTCAGCGGATCCCAAGAGCCAGACCCCCGATCCAGCCAAACCCGGTCCGTCATCTACCGATCTACAGAGTATCTCCTTCTCCACCACATCGGCCAGTTTGGATGTGAATTCATTGTTCGGGTTCTGTGAGGATCGGGTTCCAATGAAAGGGTTTGGAGGAGCCAAGATCACCATAAACCTGGCCTCCACAGGATGCACTCCAGCAATCGCCAGTCAGCATGTGGCAGAGGGAAGATCCGAATCCTTCATGTGCGATCCCAAAGTCCCCCGGGACATGAAGGTCTACTGGCTTCTCAAGCGGCACAAGCCAGCCAACAGATTTTTGAAGGCAGTTTCTTCCTCTTATTACAAATCAGTTCCATGAAAAAAACGTAACAGCCCTCACCATGCGACGATTCATCGACCGAGTTCTCCGTTCCGGGGCTGACGAGGCCCGCGGCCGACGTTCTGCCCGCCAGGACCAGAATCCCCTGGACCGATGGGGAGGAGCCCTCGCGGCGGTTGAGGCGCCTGCACCGCCACGTCCCCAGCTCCAGTTGGTCTCCTACGATGTGACAGGGGAATTGAAGGTGATCAGCCCCGTCTTCGTGGACCGGCAGGCCTTCTTCGGGCGAATGAGTGTCAATTTCCCTCACTTCTATCAAGGCGATGCTCTGATGAAGCCGTACCACACCACGGTCTTTGCCCTGCTGGTTGCGGGCCTTAGAACAGGCATCCAAACTGATCGCGGATGGATCTACCGCTCCACCGTCGCCGAATGTGTCACCATTCGTGGATTGGCCATGGAAATTCCGCACCAAGAATCCAGAATATTCAGGGACTCATTCACCTGGAAGTACCGCGGAGATAGCTATGTCTGGTCCGTAACTATCTCCTGGACTAGGTCGTACATGGTGGGGGTTCCTCTTGATCGGTTTATTCCAGTGGAGCACCGCACCCTATTGTCAGCGCTAGGTGTGAAGACCATCTGGAATCGCGAAGGGAACTACCTTAGTCTTCGCAGTGAGTTTTGATCAATTTGCATCATGAAAAAAAGTAACAGCCCTCAACATGTATCCGTTTAGCCTTGTCGCCATTGCAGCCTCCACACTGGTCAGTTCCCTGGTGGTTAACGAGATGTACATGTTCCCCAAAGAAAGAAAATACATTTGGAAACCTATTAATCTTTCTGCATTGCATTGCCCCCTAAGCCCAATTGAGACCATAATACATAACCCTCAACCTGTCCAAGTTCGCCTATTGAGGCCTTCTGGTCACTTAGACTCCCACATCACCGGTTACATCTGTTCAAAATTAAAGCTGTCTATCCAGTGTTCGGTCAACTTCTTGGGGTGGAAAACACTGTCGCACCGGACGGAGGACATATCTCCTGGGCTGGGCGAGTGTACCGAGGCCCTGCACCGACAACAGCAGGGGGATATTTCCTCGATTCCAGCATTCCCTGCTCCCAATTGTGGCTGGATGAATGACCTCTGGGCGTCAGCAACCTTCCTGCTTATGACTCTACACCCCGTGACCGTGGACCCATACTCAGGAGACCTGGTGGATCGGATATTTCCAGGGGGGAGCTGCAAAGACAAACTTTGCAAAACAGTGCACCATGGAGCATATTGGGTGTCTAATAGTCGTGTTCCCGAAATGTGTACTCAATGGGAGGTGATCCCGGGGACAGTGGGAACTAGCAGGGATGGGGACCCCTGGGTTCTGCTCCCTTTGCTGGGCCATAAGAGCCTAGTAGATATTTGTAAAATCACCTTCTGCGGCCACACAGGCTGGAGACTTATTACAGGGGAATTTCTAATATTTGAATCAGGACTTAGTTCAAGCTTGCTTCGGGCTCCTCCTTGTCCTGCTGGGAGTGAGGTGGGAGAGCTGTCTGTGGAAGGTGAGTTAGGATTGGCTAACCTCCAATTGATGAGAGAAGAGTTGCGACTCCAATGCCTCTCAACACTGACGACGATTCTGGCAACAGGGAGAATCAGTGCATTTCAACTCGGGTACTTTACACCTTCTCAGATTGGCCCAGGAGAGGCCTATCGACTCAACGGACTTCGCTTAGAGGAAGCGAAGGTTGATTATATCGAGGTCTCGCGTTTTTCAACCACCAGGGCGCCGAACATTATTGGTTACATGGTCAATGGATCGGAAGTTACCTGGAGCGACTGGACCCCTCTGTCAAATTCCAATCGGACAACTGGCCCGAACGGCGTGGTGAGGCTCTCTTCTGGGGTTATCCTGATACCTCAATTAGAGTCCCGTCGGCTAATAAATGACATCGTGATGATGATCGGACAGGAGGTTCACCTAGCCCGGCATCCACATCGGAACATAGAAAGCAATTTCTCTGACCTAATTGTGACCCATGAACACGATGAGGGGAAATCCGGGGAGTGGTCGCTGCTATCTTGGCTATTCGGCAAATTCAGATGGGAAGGGACGCTGGTTGTCGTCGGGACCCTATTGATCCTCGTTGTAGGTGTCAAATTGGCCATCAAATCTACTCGCTGTACTTGTCTGTCAAGATCCAAACCCACCATTCACTCATGGGACCAAGTTGAAACGTCTTCTGTATAGGGCATGAAAAAAACTAACAGGCCTCACCATGGCCTCATACGAAGACGAGGACACTGAGCTCCTGTTTCACCCGGATGAGGATTGGTCCGACTTCCTCGAGTGGGAACCAGAGATCCGGGGTGCCTTTACAGGATTAGATCGTCTTACCACTCGAGGGATCCTCAATGCTACAGACTACAACCTCAACTCGCCCCTAATCGCAGACCACAGCGAGGCCATCCTCGCTCGCTTAAATAACAAAGGCCTCCCTGCCAGATACCTAAGATGTGAGGAAATTGAAACGCAAGTGACTAGCCTTCAACATCTGACACTTGATTGGGGTAAAACCAAAGCCAGTAACCAATTCCACTCCTGGGTCGCAAGCAAGGTGTATCAGAGGCCAATAAAGACCCGACATCTGATTCAGATCTGGAACGAGAACCAGGACGAAAGCACCTTGGCTATGTCTATTGTCCGAGAGTTTTGGCAACACTTGACGGAACATGAGCTCCCTAACGAGTCGGCTCTCTTGAGGGATCGCTGGTCCGAGCCGGCTGAAGACAAAGTATCACAACGACTAGTGGCCGACGGGGAAACCTACTGGTTCTTCCACGTGGTCACCCTGATGGCCAATTCAGCCAGTCCCGAAGAAAGAGAGGCGCTCGTAGACAGCACCAGATCAATGTTTGGAACCAGATTGAGGCAAGGAGACAAGGGTGCGTTTTGTTTCGAGGGGTGGCACCGAGATTACGGGCTATTCGCCGTTGGCCCAGGCGTATTGGTCCTCATAGAAGAAAACCGACTATTGGATAGGAATATGATATTGATGATAAAAGACACCATGGTGGCGCGTTTTTGTACAAAATTAACCCTGTTGACGCCAGATGTAACAATTATCACTACCAGTAAATTGTCTCGGTTGACAGACTTTTATTACAAAGGGGATCAATTAATGATTGAGTTTGACAACGACGTGTTTGATGTACTACAGCTGTTGGAGCCTTTCTGTAATGCAAGGT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| 20,839
|
ON812514.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_4
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,532
|
GenBank
| null |
China:Huanggang
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669350
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_4, complete genome
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TATAAATTTGCTTGACACCTCAATCCCTAGTAACCCTTAACAGAACTCACCTTTTAAGGAATCTCAGTTTTGTAATCTCTGTAGTTCCTCTCAGATCTCAAGTTCTGTTCCACTAAAGTTCCTACAATCTCTAGTCAATGGCGGATCTTGCCGGAGCTAGACTCGGCCCGGACGGGTTGCCAATCGCGGAGGGGGGAGATGAAGACGAGCTGCATGAGAACGGCAATGAGAATGAAAATGGAAATAATGGTGCAGCTAATGGAGGGAACCAGGCAGCACTCCTAAATCCACAGGGGAGGGTCCCGCGTGGAGACGACGTTGTTGTGCCCAAAGGAATGCCTATACTCTTCTCACGAGATCAGATCAAGGTAATGCACTCAGAAGCCCCGACAGCCAAGCCTAAACCCGATTTCCCCTCAGTCTGGTTTGCAGAAAAGAAAACCAAGCCCCAGCTGATTGTCTACAAGTTCACCTTCAGCCCTGCTGTGCTTCGCAAAATCGTACACAAACACCTGCTGGCAGGCCAACTCCACCCGGACATCGCAGTCGCATTCCTAAAGGATGCTGCCTCGACCTTTGAGCATGTGCTCAGACAAAGAATTGCGAGCTTCGGTCAGGTCATCGGAGAGGATGGGGACAAGATCACTCCTCTTTCGATAGTTGAAGTCACAGAAAAGGACTGGGGTGGAGCGGTCCCCGAGAGCACCATCGCGACAGAGCCTCCCTCAGATGCCGTCTTGGTGGCATCAATTGCCATGGCATACAGATTGGCCGTCGCCAAGAGCAGGGGCGGAACCGACGCATACCTTGTTACCCTCCGAGACAGGTGCAAGACCATGCTTTCGAGTCCCCCGTACTCTGACCAGGGCCTACACGTCGACAACTGGCACACCAATAAAAACTGGGCCAACCACCGGGACTTGCGGGCGATGATGGCGGCTTACGACATGTTTTTCTACATAGCCTCCGACCACGAATTCAGTGGCATTCGCGCAGGCACTCTGGTTTGTCGCGGACGTGACTGTGCCGTCCTGGGAGACCTCCAGCGTGCAGCTCGAGCAATGGGTCAGGCCCCTTGTGATATTTTTTACTGGTGTTTTGCATTGATTTTGTATGCTGAGCTCGACATTGTCGGCACCGAGGGTCAGGAACTCGGGGAAGAGTTCAGTTACTACCACTATGCCTCAGACTTGGGAGTGAGCAAGCGGTCACCATTCTCGGCATCCATGTGCCCCGGACTCCATCTCCTCTGCAACTCAGTCGCTGCCCTTCTAGGCATGGAGGATGCACAGAACACCAGGTTTGTCAACTGCGAAGGACCGAACTCTGTGCTGTCCAACGCTGCCTTCGTGGCCTACGCCTTCCGGGAGGGCACCGGATTCGGGCCCATGGTGGCACGAACCGTCGATGAGGCCAGACAGACCAGGGCTGACATGGACGAAGAGGCCAGAAAGGAGCAGGACAACCAGGCCATCGACGGAGAGGTCCCTCCTTTGTCCCAAGAGCCGGGAGTGTGGCATATGTACATGCGCACACGAGATTGGAGGCTGCCACATCAGATCACCAACTGGTGCCGACAACGTGTCGCCCTCTTCAAAACTGTCCGGGCAGGCTCAATTGCAGAGTTTCTGCGCAATCGCTTCTCAGTGGTCGAGTGATCCGTGAAAAAAAGTAACAGCCCTCCACTATGAATCCCAACCCCCTGGACACCTTTCCCCCAGAGATGCCCAACAGCAAGAAGCTCCCTAGAGGGCGAGGAGCTATGGCAATAAATCGTGCGGCAGCACTGCAGGACCAAAGCTTCGAGGAAGAAGCATTCCGGAAGGGTGCCCTGGCATGTAAGGACCCGGCTCTCCAGTTCGTTCCTGGCTACACAGCTCCACCTCAAGTGGAAACGGAAGGTCGCTCTAGGCCTCCCACTCCGACTCTTGATCCATCAAGCTATGTTGACTTTTCTTACGAAGCCAAAGACGAAGTTCAGGCAGAATTGTTCCTCAAACCCCTTAAGGCATTCATTGAATCCCTGGAAGAGTCAAAGTCTGTAATGGTGGAGGAAATTCGAGTGAACGGAAACAAAGTATTAGCTCGCTATCGCCCCTTCCGCGCCGCCACCCCATCGTGCAGTCGGTCGGGAAGCGAAGCTGGAGAAAAACCTGACTCAGAGCCCGACAAGGACGAGACGACCCCGAAGGCTTCCAGCTCCACAACCAAGACCAGCCCCGCCGACACTGTAACCACGTCAGCGGATCCCAAGAGCCAGACCCCCGATCCAGCCAAACCCGGTCCGTCATCTACCGAGCTACAGAGTATCTCCTTCTCCACCACATCGGCCAGTTTGGATGTGAATTCATTGTTCGGGTTCTGTGAGGATCGGGTTCCAATGAAAGGGTTTGGAGGAGCCAAGATCACCATAAATCTGGCCTCCACAGGATGCACTCCAGCAATCGCCAGTCAGCATGTGGCAGAGGGAAGATCCGAATCCTTCATGTGCGATCCCAGAGTCCCCCGGGACATGAAGGTCTACTGGCTTCTCAAGCGGCACAAGCCAGCCAACAGATTTTTGAAGGCAGTTTCTTCCTCTTATTACAAATCAGTTCCATGAAAAAAACGTAACAGCCCTCACCATGCGACGATTCATCGACCGAGTTCTCCGTTCCGGGGCTGACGAGGCCCGCGGCCGACGTTCTGCCCGCCAGGACCAGAATCCCCTGGACCGATGGGGAGGAGCCCTCGCGGCGGTTGAGGCGCCTGCACCGCCACGTCCCCAGCTCCAGTTGGTCTCCTACGATGTGACAGGGGAGTTGAAGGTGATCAGCCCCGTCTTCGTGGACCGGCAGGCCTTCTTCGGGCGAATGAGTGTCAATTTCCCTCACTTCTATCAAGGCGATGCTCTGATGAAGCCGTACCACACCACGGTCTTTGCCCTGCTGGTTGCGGGCCTTAGAACAGGCATCCAAACTGATCGCGGATGGATCTACCGCTCCACCGTCGCCGAATGTGTCACCATCCGTGGATTGGCCATGGAAATTCCGCACCAAGAATCCAGAATATTCAGGGACTCATTCACCTGGAAGTACCGCGGAGATAGCTATGTCTGGTCCGTAACTATCTCCTGGACTAGGTCGTACATGGTGGGGGTTCCTCTTGATCGGTTTATTCCAGTGGAGCACCGCACCCTATTGTCAGCGCTAGGTGTGAAGACCATCTGGAATCGCGAAGGGAACTACCTTAGTCTTCGCAGTGAGTTTTGATCAATTTGCATCATGAAAAAAAGTAACAGCCCTCAACATGTATCCGTTTAGCCTTGTCGCCATTGCAGCCTCCACACTGGTCAGTTCCCTGGTGGTTAACGAGATGTACATGTTCCCCAAAGAAAGAAAATACATTTGGAAACCTATTAATCTTTCTGCATTGCATTGCCCCCTAAGCCCAATTGAGACCATAATACATAACCCTCAACCTGTCCAAGTTCGCCTATTGAGGCCTTCTGGTCACTTAGACTCCCACATCACCGGTTACATCTGTTCAAAATTAAAGCTGTCTATCCAGTGTTCGGTCAACTTCTTGGGGTGGAAAACACTGTCGCACCGGACGGAGGACATATCTCCTGGGCTGGGCGAGTGTACCGAGGCCCTGCACCGACAACAGCAGGGGGATATTTCCTCGATCCCAGCATTCCCTGCTCCCAATTGTGGCTGGATGAATGACCTCTGGGCGTCAGCAACCTTCCTGCTTATGACTCTACACCCCGTGACCGTGGACCCATACTCAGGAGACCTGGTGGATCGGATATTTCCAGGGGGGAGCTGCAAAGACAAACTTTGCAAAACAGTGCACCATGGAGCATATTGGGTGTCTAATAGTCGTGTTCCCGAAATGTGTACTCAATGGGAGGTGATCCCGGGGACAGTGGGAACTAGCAGGGATGGGGACCCCTGGGTTCTGCTCCCTTTGCTGGGCCATAAGAGCCTAGTAGATATTTGTAAAATCACCTTCTGCGGCCACACAGGCTGGAGACTTATTACAGGGGAATTTCTAATATTTGAATCAGGACTTAGTTCAAGCTTGCTTCGGGCTCCTCCTTGTCCTGCTGGGAGTGAGGTGGGAGAGCTGTCTGTGGAAGGTGAGTTAGGATTGGCTAACCTCCAATTGATGAGAGAAGAGTTGCGACTCCAATGCCTCTCAACACTGACGACGATTCTGGCAACAGGGAGAATCAGTGCATTTCAACTCGGGTACTTTACACCTTCTCAGATTGGCCCAGGAGAGGCCTATCGACTCAACGGACTTCGCTTAGAGGAAGCGAAGGTTGATTATATCGAGGTCGCGCGTTTTTCAACCACCAGGGCGCCGAACATTATTGGTTACATGGTCAATGGATCGGAAGTTACCTGGAGCGACTGGACCCCTCTGTCAAATTCCAATCGGACAACTGGCCCGAACGGCGTGGTGAGGCTCTCTTCTGGGGTTATCCTGATACCTCAATTAGAGTCCCGTCGGCTAATAAATGACATCGTGATGATGATCGGACAGGAGGTTCACCTAGCCCGGCATCCACATCGGAACATAGAAAGCAATTTCTCTGACCTAATTGTGACCCATGAACACGATGAGGGGAAATCCGGGGAGTGGTCGCTGCTATCTTGGCTATTCGGCAAATTCAGATGGGAAGGGACGCTGGTTGTCATCGGGACCCTATTGATCCTCATTGTAGGTGTCAAACTGGCCATCAAATCTACTCGCTGTACTTGTCTGTCAAGATCCAAACCCACCATTCACTCATGGGACCAAATTGAAACGTCTTCTGTGTAGGGCATGAAAAAAACTAACAGGCCTCACCATGGCCTCATACGAAGACGAGGACACTGAGTTCCTGTTTCACCCGGATGAGGATTGGTCCGACTTCCTCGAGTGGGAACCAGAGATCCGGGGTGCCTTTACAGGATTAGATCGTCTTACCACTCGAGGGATCCTCAATGCTACAGACTACAACCTCAACT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| 20,840
|
ON812515.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_10
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,517
|
GenBank
| null |
China:Huanggang
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28669546
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_10, complete genome
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TCAATCCCTAGTAACCTTTAACAGAACTCACCTTTTAAGGAATCTCAGTTTTGTAATCTCTGTAGTTCCTCTCAGATCTCAAGTTCTGTTCTACTAAAGTTCCTACAATCTCTAGTCAATGGCGGATCTTGCCGGAGCTAGACTCGGCCCGGACGGGTTGCCAATCGCGGAGGGGGGAGATGAAGACGAGCTGCATGAGAACGGCAATGAGAATGAAAATGGAAATAATGGTGCAGCTAATGGAGGGAACCAGGCAGCACTCCTAAATCCACAGGGGAGGGTCCCGCGTGGAGACGACGTTGTTGTGCCCAAAGGAATGCCTATACTCTTCTCACGAGATAAGATCAAGGTAATGCACTCAGAAGCCCCGACAGCCAAGCCTAAACCCGATTTCCCCTCAGTCTGGTTTGCAGAAAAGAAAACCAAGCCCCAGCTGATTGTCTACAAGTTCACCTTCAGCCCTGCTGTGCTGCGCAAAATCGTACACAAACACCTGCTGGCAGGCCAACTCCACCCGGACATCGCAGTCGCATTCCTAAAGGATGCTGCCTCGACCTTTGAGCATGTGCTCAGACAAAGAATTGCGAGCTTCGGTCAGGTCATCGGAGAGGATGGGGACAAGATCACTCCTCTTTCGATAGTTGAGGTCACAGAAAAGGACTGGGGTGGAGCGGTCCCCGAGAGCACCATCGCGACAGAGCCTCCCTCAGATGCCGTCCTGGTGGCATCAATTGCCATGGCATACAGATTGGCCGTCGCCAAGAGCAGGGGCGGAACCGACGCATACCTTGTTACCCTCCGAGACAGATGCAAGACCATGCTTGCGAGTCCTCCGTACTCCGACCAGGGCCTACACGTCGACAACTGGCACACCAATAAAAACTGGGCCAACCACCGGGACTTGCGGGCGATGATGGCGGCTTACGACATGTTTTTCTACATAGCCTCCGACCACGAATTCAGTGGCATTCGCGCAGGCACTCTGGTTTGTCGCGGACGTGACTGTGCCGTCCTGGGAGACCTCCAGCGTGCAGCTCGAGCCATGGGTCAAGCCCCTTGTGATATTTTTTACTGGTGTTTTGCATTGATTTTGTATGCTGAGCTCGACATTGTCGGCACCGAGGGTCAGGAACTCGGGGAAGAGTTCAGTTACTACCACTATGCCTCAGACCTGGGAGTGAGCAAGCGGTCACCATTCTCGGCATCCATGTGCCCTGGACTCCATCTTCTCTGCAACTCAGTTGCTGCCCTTCTAGGCCAGGAGGATGCACAGAACACCAGGTTTGTCAACTGCGAAGGACCGAACTCTGTGCTGTCCAACGCTGCCTTCGTGGCCTACGCCTTCCGGGAGGGCACCGGATTCGGGCCCATGGTGGCACGAACTGTCGATGAGGCCAGACAGACCAGGGCTGACATGGACGAAGAGGCCAGAAAGGAGCAGGACAACCAGGCCATCGACGGAGAGGTCCCTCCTTTGTCCCAAGAGCCGGGAGTGTGGCATATGTACATGCGCACACGAGATTGGAGGCTGCCACATCAGATCACTAACTGGTGCCGACAACGTGTCGCCCTCTTCAAAGCCGTCCGGGCAGGCTCAATTGCAGAGTTTCTGCGCAATCGCTTCTCAGTGGTCGAGTGATCCGTGAAAAAAAGTAACAGCCCTCCACTATGAATCCCAACCCCCTGGACACCTTTCCCCCAGAGATGCCCAACAGCAAGAAGCTCCCTAGAGGGCGAGGAGCTATGGCAATAAATCGTGCGGCAGCACTGCAGGACCAAAGCTTCGAGGAAGAAGCATTCCGGAAGGGTGCCCTGGCATGTAAGGACCCGGCTCTCCAGTTCGTTCCTGGCTACACAGCTCCACCTCAAGTGGAAACGGAAGGTCGCTCTAGGCCTCCCACTCCGACTCTTGATCCATCAAGCTATGTTGACTTCTCTTACGAAGCCAAAGACGAAGTTCAGGCAGAATTGTTCCTCAAACCCCTTAAGGCATTCATTGAATCCCTGGAGGAGTCAAAGTCTGTAATGGTGGAGGAAATTCGAGTGAACGGAAACAAAGTATTAGCTCGCTATCGCCCCTTCCGCGCCGCCACCCCATCGTGCAGTCGGTCTGGAAGCGAAGCTGGAGAAAAACCTGACTCAGAGCCCGACAAGGACGAGACGACCCCGAAGGCTTCCAGCTCCACAACCAAGACCAGCCCCGCCGACACTGCAACCACGTCAGCGGATCCCAAAAGCCAGACCCCCGATCCAGCCAAACCCGGTCCGTCATCTACCGAGCTACAGAGTATCTCCTTCTCCACCACATCGGCCAGTTTGGATGTGAATTCATTGTTCGGGTTCTGTGAGGATCGGGTTCCAATGAAAGGGTTTGGAGGAGCCAAGATCACCATAAACCTGGCCTCCACAGGATGCACTCCAGCAATTGCCAGTCAGCATGTGGCAGAGGGAAGATCCGAATCCTTCATGTGCGATCCCAGAGTCCCCCGGGATATGAAGGTCTACTGGCTTCTCAAGCGGCACAAGCCAGCCAACAGATTTTTGAAGGCAGTTTCTTCCTCTTATTACAAATCAGTTCCATGAAAAAAACGTAACAGCCCTCACCATGCGACGATTCATCGACCGAGTTCTCCGTTCCGGGGCTGACGAGGCCCGCGGCCGACGTTCTGCCCGCCAGGACCAGAATCCCCTGGACCGATGGGGAGGAGCCCTCGCGGCGGTTGAGGCGCCTGCACCGCCACGTCCCCAGCTCCAGCTGGTCTCCTACGATGTGACAGGGGAGTTGAAGGTGATCAGCCCCGTCTTCGTGGACCGGCAGGCCTTCTTCGGGCGAATGAGTGTCAATTTCCCTCACTTCTATCAAGGCGATGCTCTGATGAAGCCGTACCACACCACGGTCTTTGCCCTGCTGGTTGCGGGCCTTAGAACAGGCATCCAAACTGATCGCGGATGGATCTACCGCTCCACCGTTGCTGAATGTGTTACCATTCGTGGATTGGCCATGGAAATTCCGCACCAGGAATCCAGAATATTCAGGGACTCATTCACCTGGAAGTACCGCGGAGATAGCTATGTCTGGTCCGTAACTATCTCCTGGACTAGGTCGTACATGGTGGGGGTTCCTCTTGATCGGTTTATTCCAGTGGAGCACCGCACCCTATTGTCAGCGCTAGGTGTGAAGACCATCTGGAATCGCGAAGGGAACTACCTTAGTCTTCGCAGTGAGTTTTGATCAATTTGCATCATGAAAAAAAGTAACAGCCCTCAACATGTATCCGTTTAGCCTTGTCGCCATTGCAGCCTCCACACTGGTCAGTTCGCTTGTGGTTAACGAGATGTACATGTTCCCCAAAGAAAGAAATTACATTTGGAAACCTATTAATCTTTCTGCATTGCATTGCCCCCTAAGCCCAATTGAGACCATAATACATAACCCTCAACCTGTCCAAGTTCGCCTATTGAGGCCTTCTGGTCACTTAGACTCCCACATCACCGGTTACATCTGTTCAAAATTAAAGCTGTCTATCCAGTGTTCGGTCAACTTCTTGGGGTGGAAAACACTGTCGCACCGGACGGAGGACATATCTCCTGGGCTGGGCGAGTGTACCGAGGCCCTGCACCGACAACAGCAGGGGGATATTTCCTCGATCCCAGCATTCCCTGCTCCCAATTGTGGCTGGATGAATGACCTCTGGGCGTCAGCAACCTTCCTGCTTATGACTCTACACCCCGTGACCGTGGACCCATACTCAGGAGACCTGGTGGATCGGATATTTCCAGGGGGGAGCTGCAAAGACAAACTTTGCAAAACAGTGCACCATGGAGCATATTGGGTGTCTAATAGTCGTGTTCCCGAAATGTGTACTCAATGGGAGGTGATCCCGGGGACAGTGGGAACTAGCAGGGATGGGGACCCCTGGGTTCTGCTCCCTTTGCTGGGCCATAAGAGCCTAGTAGATATTTGTAAAATCACCTTCTGCGGCCACACAGGCTGGAGACTTATTACAGGGGAATTTCTAATATTTGAATCAGGACTTAGTTCAAGCTTGCTTCGGGCTCCTCCTTGTCCTGCCGGGAGTGAGGTGGGAGAGCTGTCTGTGGAAGGTGAGTTAGGATTGGCTAACCTCCAGTTGATGAGGGAAGAGTTGCGACTCCAATGCCTCTCAACACTGACGACGATTCTGGCGACAGGGAGAATCAGTGCATTTCAACTCGGGTACTTTACACCTTCTCAGATTGGCCCAGGAGAGGCATATCGACTCAACGGACTTCGCTTAGAGGAAGCGAAGGTTGATTATATCGAGGTCTCGCGTTTTCCAACCACCAGGGCGCCGAACATTATTGGTTACATGGTCAATGGATCGGAAGTTACCTGGAGCGACTGGACCCCTCTGTCAAATTCCAATCGGACAACTGGCCCGAACGGCGTGGTGAGGCTCTCTTCTGGGGTTATCCTGATACCTCAATTAGAGTCCCGTCGGCTAATAAATGACATCGTGATGATGATCGGACAGGAGGTTCACCTAGCCCGGCATCCACATCGGAACATAGAAAGCAATTTCTCTGACCTAATTGTGACCCATGAACACGATGAGGGGAAATCCGGGGAGTGGTCGCTGCTATCTTGGCTATTCGGCAAATTCAGATGGGAAGGGACGCTGGTTGTCATCGGGACCCTATTGATCCTCATTGTAGGTGTCAAACTGGCCATCAAATCTACTCGCTGTACTTGTCTGTCAAGATCCAAACCCACCATTAACTCATGGGACCAGGTTGAAACGTCTTCTGTGTAGGGCATGAAAAAAACTAACAGGCCTCACCATGGCCTCATACGAAGACGAGGACACTGAGCTCCTATTTCACCCAGATGAGGATTGGTCCGATTTCCTCGAGTGGGAGCCAGAGATCCGGGGTGCCTTTACAGGATTAGATCGTCTTACCACTCGAGGGATCCTCAATGCTACAGACTACAACCTCAACTCGCCCTTGATCGCAGACCA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| 20,841
|
ON812516.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_11
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,544
|
GenBank
| null |
China:Huanggang
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28669547
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_11, complete genome
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AACAAACCGTATAAATTTGCTTGACACCTCAATCCCTAGTAACCCTTAACAGAACTCACCTTTTAAGGAATCTCAGTTTTGTAATCTCTGTAGTTCCTCTCAGATCTCAAGTTCTGTTCCACTAAAGTTCCTACAATCTCTAGTCAATGGCGGATCTTGCCGGAGCTAGACTCGGCCCGGACGGGTTGCCAATCGCGGAGGGGGGAGATGAAGACGAGCTGCATGAGAACGGCAATGAGAATGAAAATGGAAATAATGGTGCAGCTAATGGAGGGAACCAGGCAGCACTCCTAAATCCACAGGGGAGGGTCCCGCGTGGAGACGACGTTGTTGTGCCCAAAGGAATGCCTATACTCTTCTCACGAGATCAGATCAAGGTAATGCACTCAGAAGCCCCGACAGCCAAGCCTAAACCCGATTTCCCCTCAGTCTGGTTTGCAGAAAAGAAAACCAAGCCCCAGCTGATTGTCTACAAGTTCACCTTCAGCCCTGCTGTGCTGCGCAAAATTGTACACAAACACCTGCTGGCAGGCCAACTCCACCCGGACATCGCAGTCGCATTCCTAAAGGATGCTGCCTCGACCTTTGAGCATGTGCTCAGACAAAGAATTGCGAGCTTCGGTCAGGTCATCGGAGAGGATGGGGACAAGATCACTCCTCTTTCGATAGTTGAAGTCACAGAAAAGGACTGGGGTGGAGCGGTCCCCGAGAGCACCATCGCGACAGAGCCCCCCTCAGATGCCGTCTTGGTGGCATCAATTGCCATGGCATACAGATTGGCCGTCGCCAAGAGCAGGGGCGGAACCGACGCATACCTTGTTACCCTCCGAGACAGGTGCAAGACCATGCTTTCAAGTCCCCCGTACTCCGACCAGGGCCTACACGTCGACAACTGGCACACCAATAAAAACTGGGCCAACCACCGGGACTTGCGGGCGATGATGGCGGCTTACGACATGTTTTTCTACATAGCCTCCGACCACGAATTCAGTGGCATTCGCGCAGGCACTCTGGTTTGTCGCGGACGTGACTGTGCCGTCCTGGGAGACCTCCAGCGTGCAGCTCGAGCCATGGGTCAGGCCCCTTGTGATATTTTTTACTGGTGTTTTGCATTGATTTTGTATGCTGAGCTCGACATTGTCGGCACCGAGGGTCAGGAACTCGGGGAAGAGTTCAGTTACTACCACTATGCCTCAGACATGGGAGTGAGCAAGCGGTCACCATTCTCGGCATCCATGTGCCCCGGACTCCATCTCCTCTGCAACTCAGTGGCTGCCCTTCTAGGCCAGGAGGATGCACAGAACACCAGGTTTGTCAACTGCGAAGGACCGAACTCTGTGCTGTCCAACGCTGCCTTCGTGGCCTACGCCTTCCGGGAGGGCACCGGATTCGGGCCCATGGTGGCACGAACCGTTGATGAGGCCAGACAGACCAGGGCTGACATGGACGAAGAGGCCAGAAAGGAGCAGGACAACCAGGCCATCGACGGAGAGGTCCCTCCTGTGTCCCAAGAGCCGGGAGTGTGGCATATGTACATGCGCACACGAGATTGGAGGCTGCCACATCAGATCACTAACTGGTGCCGACAACGTGTCGCCCTCTTCAAAGCCGTCCGGGCAGGCTCAATTGCAGAGTTTCTGCGCAATCGCTTCTCAGTGGTCGAGTGATCCGTGAAAAAAAGTAACAGCCCTCCACTATGAATCCCAACCCCCTGGACACCTTTCCCCCAGAGATGCCCAACAGCAAGAAGCTCCCTAGAGGGCGAGGAGCTATGGCAATAAATCGTGCGGCAGCGCTGCAGGACCAAAGCTTCGAGGAAGAAGCATTCCGGAAGGGTGCCCTGGCATGTAAGGACCCGGCTCTCCAGTTCGTTCCTGGCTACACAGCTCCACCTCAAGTGGAAACGGAAGGTCGCTCTAGGCCTCCCACTCCGACTCTTGATCCATCAAGCTATGTTGACTTCTCTTACGAAGCCAAAGACGAAGTTCAGGCAGAATTGTTCCTCAAACCCCTTAAGGCATTCATTGAATCCCTGGAGGAGTCAAAGTCTGTAATGGTGGAGGAAATTCGAGTGAACGGAAACAAAGTATTAGCTCGCTATCGCCCCTTCCGCGCTGCCACCCCATCGTGCAGTCGGTCTGGAAGCGAAGCTGGAGAAAAACCTGACTCAGAGCCCGATAAGGACGAGACGACCCCGAAGGCTTCCAGCTCCACAACCAAGACCAGCCCCGCCGACACTGTACCCACGTCAGCGGATCCTAAGAGCCAGACCCCCGATCCAGCCAAACCCGGTCCGTCATCTACCGAGCTACAGAGTATCTCCTTCTCCACCACATCTGCCAGTTTGGATGTGAATTCATTGTTCGGGTTCTGTGAGGATCGGGTTCCAATGAAAGGGTTTGGAGGAGCCAAGATCACCATAAACCTGGCCTCCACAGGATGCACTCCAGCAATTGCCAGTCAGCATGTGGCAGAGGGAAGATCCGAATCCTTCATGTGCGATCCCAGAGTCCCCCGGGATATGAAGGTCTACTGGCTTCTCAAGCGGCACAAGCCAGCCAACAGATTTTTGAAGGCAGTTTCTTCCTCTTATTACAAATCAGTTCCATGAAAAAAACGTAACAGCCCTCACCATGCGACGATTCATCGACCGAGTTCTCCGTTCCGGGGCTGACGAGGCCCGCGGCCGACGTTCTGCCCGCCAGGACCAGAATCCCCTGGACCGATGGGGAGGAGCCCTCGCGGCGGTTGAGGCGCCTGCACCGCCACGTCCCCAGCTCCAGCTGGTCTCCTACGATGTGACAGGGGAGTTGAAGGTGATCAGCCCCGTCTTCGTGGACCGGCAGTCCTTCTTCGGGCGAATGAGTGTCAATTTCCCTCACTTCTATCAAGGCGATGCTCTGATGAAGCCGTACCACACCACGGTCTTTGCCCTGCTGGTTGCGGGCCTTAGAACAGGCATCCAAACTGATCGCGGATGGATCTACCGCTCCACCGTCGCCGAATGTGTCACCATTCGTGGATTGGCCATGGAAATTCCGCACCAAGAATCCAGAATATTCAGGGACTCATTCACCTGGAAGTACCGCGGAGATAGCTATGTCTGGTCCGTAACTATCTCCTGGACTAGGTCGTACATGGTGGGGGTTCCTCTTGATCGGTTTATTCCAGTGGAGCACCGCGCCCTATTGTCAGCGCTAGGTGTGAAGACCATCTGGAATCGCGAAGGGAACTACCTTAGTCTTCGCAGTGAGTTTTGATCAATTTGCATCATGAAAAAAAGTAACAGCCCTCAACATGTATCCGTTTAGCCTTGTCGCCATTGCAGCCTCCACACTGGTCAGTTCCCTGGTGGTCAACGAGATGTACATGTTCCCCAAAGAAAGAAAATACATTTGGAAACCTATTAATCTTTCTGCATTGCATTGCCCCCTAAGCCCAATTGAGACCATAATACATAACCCTCAACCTGTCCAAGTTCGCTTGTTGAGGCCTTCTGGTCACTTAGATTCCCACATCACCGGTTACATCTGTTCAAAATTAAAGCTGTCTATCCAGTGTTCGGTCAACTTCTTGGGGTGGAAAACACTGTCGCACCGGACGGAGGACATATCTCCTGGGCTGGGCGAGTGTACCGAGGCCCTGCACCGACAACAGCAGGGGGATATTTCCTCGATCCCAGCATTCCCTGCTCCCAATTGTGGCTGGATGAATGACCTCTGGGCGTCAGCAACCTTCCTGCTTATGACTCTACACCCCGTGACCGTGGACCCATACTCAGGAGACCTGGTGGATCGGATATTTCCAGGGGGGAGCTGCAAAGACAAACTTTGCAAAACAGTGCACCATGGAGCATATTGGGTGTCTAATAGTCGTGTTCCCGAAATGTGTACTCAATGGGAGGTGATCCCGGGGACAGTGGGAACTAGCCGGGATGGGGACCCCTGGGTTCTGCTCCCCTTGCTTGGCCATAAGAGCCTAGTAGATATTTGTAAAATCACCTTCTGCGGCCACACAGGCTGGAGACTGATTACGGGGGAATTTCTAATATTTGAATCAGGACTTAGTTCAAGCTTGCTTCGGGCTCCTCCTTGTCCTGCTGGGAGTGAAGTGGGAGAGCTGTCTGTGGAAGGTGAGTTAGGATTGGCTAACCTTCAGTTGATGAGGGAAGAGTTGCGACTCCAATGCCTCTCAACACTGACGACAATTCTGGCGACAGGGCGAATCAGTGCATTTCAACTCGGGTACTTTACACCTTCTCAGATTGGCCCAGGAGAGGCATATCGACTCAACGGACTTCGCTTAGAGGAAGCGAAGGTTGATTATATCGAGGTCTCGCGTTTTTCAACCACCAGGGCGCCGAACATTATTGGTTACATGGTCAATGGATCGGAAGTCACCTGGAGCGACTGGACCCCTCTGTCAAATTCCAATCGGACAACTGGCCCGAACGGCGTGGTGAGGCTCTCTTCTGGGGTTATCCTGATACCTCAATTAGAGTCCCGTCGGCTAATAAATGACATCGTGATGATGATCGGACAGGAGGTTCACCTAGCCCGGCATCCACATCGGGACATAGAAAGCAATTTCTCTGACCTAATTATGACCCATGAACACGATGAGGGGAAATCCGGGGAGTGGTCGCTGCTATCTTGGCTATTCGGCAAATTCAGATGGGAAGGGACGCTGGTTGTCATCGGGACCCTATTGATCCTCATTGTAGGTGTCAAACTGGCCATCAAATCTACTCGCTGTACTTGTCTGTCAAGATCCAAACCCACCATTCACTCATGGGACCAAGTTGAAACGTCTTCTGTGTAGGGCATGAAAAAAACTAACAGGCCTCACCATGGCCTCATACGAAGACGAGGACACTGAGCTCCTATTTCACCCAGATGAGGATTGGTCCGATTTCCTCGAGTGGGAGCCAGAGATCCGGGGTGCCTTTACAGGATTAGATCGTCTTACCACTCGAGGGATCCTCAATGCTACAGACTACA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| 20,842
|
ON812517.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_12
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,541
|
GenBank
| null |
China:Huanggang
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2018
|
SAMN28669548
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_12, complete genome
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AACCGTATAAATTTGCTTGACACCTCAATCCCTAGTAACCCTTAACAGAACTCACCTTTTAAGGAATCTCAGTTTTGTAATCTCTGTAGTTCCTCTCAGATCTCAAGTTCTGTTCCACTAAAGTTCCTACAATCTCTAGTCAATGGCGGATCTTGCCGGAGCTAGACTCGGCCCGGACGGGTTGCCAATCGCGGAGGGGGGAGATGAAGACGAGCTGCATGAGAACGGCAATGAGAATGAAAATGGAAATAATGGTGCAGCTAATGGAGGGAACCAGGCAGCACTCCTAAATCCACAGGGGAGGGTCCCGCGTGGAGACGACGTTGTTGTGCCCAAAGGAATGCCTATACTCTTCTCACGAGATAAGATCAAGGTAATGCACTCAGAAGCCCCGACAGCCAAGCCAAAACCCGATTTCCCCTCAGTCTGGTTTGCAGAAAAGCAAACCAAGCCCCAGCTGATTGTCTACAAGTTCACCTTCAGCCCTGCTGTGCTGCGCAAAATCGTACACAAACACCTGCTGGCAGGCCAACTCCACCCAGACATCGCAGTCGCATTCCTAAAGGATGCTGCCTCGACCTTTGAGCATGTGCTCAGACAAAGAATTGCGAGCTTCGGTCAGGTCATCGGAGAGGATGGGGACAAGATCACTCCTCTTTCGATAGTTGAGGTCACAGAAAAGGACTGGGGTGGAGCGGTCCCCGAGAGCACCATCGCGACAGAGCCTCCCTCAGATGCCGTCCTGGTGGCATCAATTGCCATGGCATACAGATTGGCCGTCGCCAAGAGCAGGGGCGGAACCGACGCATACCTTGTTACCCTCCGAGACAGGTGCAAGACCATGCTTGCGAGTCCCCCGTACTCCGACCAGGGCCTACACGTCGACAACTGGCACACCAATAAAAACTGGGCCAACCACCGGGACTTGCGGGCGATGATGGCGGCTTACGACATGTTTTTCTACATAGCCTCCGACCACGAATTCAGTGGCATTCGCGCAGGCACTCTGGTTTGTCGCGGACGTGACTGTGCCGTCCTGGGAGACCTCCAGCGTGCAGCTCGAGCCATGGGCCAGGCCCCTTGTGATATTTTTTACTGGTGTTTTGCATTGATTTTGTATGCTGAGCTCGACATTGTCGGCACCGAGGGTCAGGAACTCGGGGAAGAGTTCAGTTACTACCACTATGCCTCAGACATGGGAGTGAGCAAGCGGTCACCATTCTCGGCATCCATGTGCCCTGGACTCCATCTCCTCTGCAACTCAGTCGCTGCCCTTCTAGGCATGGAGGATGCACAGAACACCAGGTTTGTCAACTGCGAAGGACCGAACTCTGTGCTGTCCAACGCTGCCTTCGTGGCCTACGCCTTCCGGGAGGGCACCGGATTCGGGCCCATGGTGGCACGAACCGTTGATGAGGCCAGACAGACCAGGGCTGACATGGACGAAGAGGCCAGAAAGGAGCAGGACAACCAGGCCATCGACGGAGAGGTCCCTCCTTTGTCCCAAGAGCCGGGAGTGTGGCATATGTACATGCGCACACGAGATTGGAGGCTGCCACATCAGATCACTAACTGGTGCCGACAACGTGTCGCCCTCTTCAAAGCCGTCCGGGCAGGCTCAATTGCAGAGTTTCTGCGCAATCGCTTCTCAGTGGTCGAGTGATCCGTGAAAAAAAGTAACAGCCCTCCACTATGAATCCCAACCCCCTGGACACCTTTCCCCCAGAGATGCCCAACAGCAAAAAGCTCCCTAGAGGGCGAGGAGCTATGGCAATAAATCGTGCGGCAGCACTGCAGGACCAAAGCTTCGAGGAAGAAGCATTCCGGAAGGGTGCCCTGGCATGTAAGGACCCGGCTCTCCAGTTCGTTCCTGGCTACACAGCTCCACCTCAAGTGGAAACGGAAGGTCGCTCTAGGCCTCCCACTCCGACTCTTGATCCATCAAGCTATGTTGACTTCTCTTACGAAGCCAAAGACGAAGTTCAGGCAGAATTGTTCCTCAAACCCCTTAAGGCATTCATTGAATCCCTGGAGGAGTCAAAGTCTGTAATGGTGGAGGAAATTCGAGTGAACGGAAACAAAGTATTAGCTCGCTATCGCCCCTTCCGCGCTGCCACCCCATCGTGCAGTCGGTCTGGAAGCGAAGCTGGAGAAAAACCTGACTCAGAGCCCGACAAAGACGAGACGACCCCGAAGGCCCCCAGCTCCACAGCCAAGACCAGCCCCGCCGACACTGTACCCACGTCAGCGGATCCTAAAAGCCAGACCCCCGATCCAGCCAAACCCGGTCCGTCATCTACCGAGCTACAGAGTATCTCCTTCTCCACCACATCGGCCAGTTTGGATGTGAATTCATTGTTCGGGTTCTGTGAGGATCGGGTTCCAATGAAAGGGTTTGGAGGAGCCAAGATCACCATAAACCTGGCCTCCACAGGATGCACTCCAGCAATTGCCAGTCAGCATGTGGCAGAGGGAAGATCCGAATCCTTCATGTGCGATCCCAGAGTCCCCCGGGATATGAAGGTCTACTGGCTTCTCAAGCGGCACAAGCCAGCCAACAGATTTTTGAAGGCAGTTTCTTCCTCTTATTACAAATCAGTTCCATGAAAAAAACGTAACAGCCCTCACCATGCGACGATTCATCGACCGAGTTCTCCGTTCCGGGGCTGACGAGGCCCGCGGCCGACGTTCTGCCCGCCAGGACCAGAGTCCCCTGGACCGATGGGGAGGATCCCTCGCGGCGGTTGAGGCGCCTGCACCGCCACGTCCCCAGCTCCAGCTGGTCTCCTACGATGTGACAGGGGAGTTGAAGGTGATCAGCCCCGTCTTCGTGGACCGGCAGTCCTTCTTCGGGCGAATGAGTGTCAATTTCCCTCACTTCTATCAAGGCGATGCTCTGATGAAGCCGTACCACACCACGGTCTTTGCCCTGCTGGTTGCGGGCCTTAGAACAGGCATCCAAACTGATCGCGGATGGATCTACCGCTCCACCGTTGCTGAATGTGTCACCATTCGTGGATTGGCCATGGAAATTCCGCACCAGGAATCCAGAATATTCAGGGACTCATTCACCTGGAAGTACCGCGGAGATAGCTATGTCTGGTCCGTAACTATCTCCTGGACTAGGTCGTACATGGTGGGGGTTCCTCTTGATCGGTTTATTCCAGTGGAGCACCGCACCCTATTGTCAGCGCTAGGTGTGAAGACCATCTGGAATCGCGAAGGGAACTACCTTAGTCTTCGCAGTGAGTTTTGATCAATTTGCATCATGAAAAAAAGTAACAGCCCTCAACATGTATCCGCTTAGCCTTGTCGCCATTGCAGCCTCCACACTGGTCAGTTCGCTTGTGGTTAACGAGATGTACATGTTCCCCAAAGAAAGAAATTACATTTGGAAACCTATTAATCTTTCTGCATTGCATTGCCCCCTAAGCCCAATTGAGACCATAATACATAACCCTCAACCTGTCCAAGTTCGCTTGTTGAGGCCTTCTGGTCACTTAGATTCCCACATCACCGGTTACATCTGTTCAAAATTAAAGCTGTCTATCCAGTGTTCGGTCAACTTCTTGGGGTGGAAAACACTGTCGCATCGGACGGAGGACATATCTCCTGGGCTGGGCGAGTGTACCGAGGCCCTGCACCGACAACAGCAGGGGGATATTTCCTCGATCCCAGCATTCCCTGCTCCCAATTGTGGCTGGATGAATGACCTCTGGGCGTCAGCAACCTTCCTGCTTATGACTCTACACCCCGTGACCGTGGACCCATACACAGGAGACCTGGTAGATCGGATATTTCCAGGGGGGAGCTGCAAAGACAAACTTTGCAAAACAGTGCACCATGGAGCATATTGGGTGTCTAATAGTCGTGTTCCCGAAATGTGTACTCAATGGGAGGTGATCCCGGGGACAGTGGGAACTAGCCGGGATGGGGACCCCTGGGTTCTGCTCCCTTTGCTGGGCCATAAGAGCCTAGTAGATATTTGTAAAATCACCTTCTGCGGCCACACAGGCTGGAGACTTATTACAGGGGAATTTCTAATATTTGAATCAGGACTTAGTTCAAGCTTGCTTCGGGCTCCTCCTTGTCCTGCCGGGAGTGAGGTGGGAGAGCTGTCTGTGGAAGGTGAGTTAGGATTGGCTAACCTCCAGTTGATGAGGGAAGAGTTGCGACTCCAATGCCTCTCAACACTGACGACGATTCTGGCGACAGGGAGAATCAGTGCATTTCAACTCGGGTACTTTACACCTTCTCAGATTGGCCCAGGAGAGGCATATCGACTCAACGGACTTCGCTTAGAGGAAGCGAAGGTTGATTATATCGAGGTCTCGCGTTTTTCAACCACCAGGGCGCCGAACATTATTGGTTACATGGTCAATGGATCGGAAGTCACCTGGAGCGACTGGACCCCTCTGTCAAATTCCAATCGGACAACTGGCCCGAACGGCGTGGTGAGGCTCTCTTCTGGGGTTATCCTGATACCTCAATTAGAGTCCCGTCGGCTAATAAATGACATCGTGATGATGATCGGACAGGAGGTTCACCTAGCCCGGCATCCACATCGGGACATAGAAAGCAATTTCTCTGACCTAATTATGACCCATGAACACGATGAGGGGAAATCCGGGGAGTGGTCGCTGCTATCTTGGCTATTCGGCAAATTCAGATGGGAAGGGACGCTGGTTGTCATCGGGACCCTATTGATCCTCATTGTAGGTGTCAAACTGGCCATCAAATCTACTCGCTGTACTTGTCTGTCAAGATCCAAACCCACCATTCACTCATGGGACCAAGTTGAAACGTCTTCTGTGTAGGGCATGAAAAAAACTAACAGGCCTCACCATGGCCTCATACGAAGACGAGGACACTGAGCTCCTGTTTCACCCGGATGAGGACTGGTCCGACTTCCTCGAGTGGGAACCAGAGATCCGGGGTGCCTTTACAGGATTAGATCGTCTTACCACTCGAGGGATCCTCAATGCTACAGACTACAACCT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| 20,843
|
ON812518.1
|
Rhabdoviridae sp.
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_13
|
Rhabdoviridae sp.
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,540
|
GenBank
| null |
China:Huanggang
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2017
|
SAMN28669550
|
PRJNA841744
|
MAG: Rhabdoviridae sp. isolate TIGMIC_13, complete genome
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ACAAACCGTATAAATTTGCTTGACACCTCAATCCCTAGTAACCCTTAACAGAACTCACCTTTTAAGGAATCTCAGTTTTGTAACCTCTGTAGTTCCTCTCAGATCTCAAGTTCTGTTCCACTAAAGTTCCTACAATCTCTAGTCAATGGCGGATCTTGCCGGAGCTAGACTCGGCCCGGACGGGTTGCCAATCGCGGAGGGGGGAGATGAAGACGAGCTGCATGAGAACGGCAATGAGAATGAAAATGGAAGTAATGGTGCAGCTAATGGAGGGAACCAGGCAGCACTCCTAAATCCACAGGGGAGGGTCCCGCGTGGAGACGACGTTGTTGTGCCCAAAGGAATGCCTATACTCTTCTCACGAGATCAGATCAAGGTAATGCACTCAGAGGCCCCGACAGCCAAGCCTAAACCCGATTTCCCCTCAGTCTGGTTTGCAGAAAAGAAAACCAAGCCCCAGCTGATCGTCTACAAGTTCACCTTCAGCCCTGCTGTGCTGCGCAAAATCGTACACAAACACCTGCTGGCAGGCCAACTCCACCCGGACATCGCAGTCGCATTCCTAAAGGATGCTGCCTCGACCTTTGAGCATGTGCTCAGACAAAGAATTGCGAGCTTCGGTCAGGTCATCGGAGAGGATGGGGACAAGATCACTCCTCTTTCGATAGTTGAAGTCACAGAAAAGGACTGGGGTGGAGCGGTCCCCGAGAGCACCATCGCGACAGAGCCTCCCTCAGATGCCGTCTTGGTGGCATCAATTGCCATGGCATACAGATTGGCCGTTGCCAAGAGCAGGGGCGGAACCGACGCATACCTTGTTACCCTCCGAGACAGGTGCAAGACCATGCTTTCAAGTCCCCCGTACTCCGACCAGGGCCTACACGTCGACAACTGGCACACCAATAAAAACTGGGCCAACCACCGGGACTTGCGGGCGATGATGGCGGCTTACGACATGTTTTTCTACATAGCCTCCGACCACGAATTCAGTGGCATTCGCGCAGGCACTCTGGTTTGTCGCGGACGTGACTGTGCCGTCCTGGGAGACCTCCAGCGTGCAGCTCGAGCCATGGGTCAGGCCCCTTGTGATATTTTTTACTGGTGTTTTGCATTGATTTTGTATGCTGAGCTCGACATTGTCGGCACCGAGGGTCAGGAACTCGGGGAAGAGTTCAGTTACTACCACTATGCCTCAGACTTGGGAGTGAGCAAGCGGTCACCATTCTCGGCATCCATGTGCCCCGGACTCCATCTCCTCTGCAACTCAGTCGCTGCCCTTCTAGGCATGGAGGATGCACAGAACACCAGGTTTGTCAACTGCGAAGGACCGAACTCTGTGCTGTCCAACGCTGCCTTCGTGGCCTACGCCTTCCGGGAGGGCACCGGATTCGGGCCCATGGTGGCACGAACTGTCGATGAGGCCAGACAGACCAGGGCTGACATGGACGAAGAGGCCAGAAAGGAGCAGGACAACCAGGCCATCGACGGAGAGGTCCCTCCCTTGTCCCAAGAGCCGGGAGTGTGGCATATGTACATGCGCACACGAGATTGGAGGCTGCCACATCAGATCACCAACTGGTGCCGACAACGTGTCGCCCTCTTCAAAACCGTCCGGGCAGGCTCAATTGCAGAGTTTCTGCGCAATCGCTTCTCAGTGGTCGAGTGATCCGTGAAAAAAAGTAACAGCCCTCCACTATGAATCCCAACCCCCTGGACACCTTTCCCCCAGAGATGCCCAACAGCAAGAAGCTCCCTAGAGGGCGAGGAGCTATGGCAATAAATCGTGCGGCAGCACTGCAGGACCAAAGCTTCGAGGAAGAAGCATTCCGGAAGGGTGCCCTGGCATGTAAGGACCCGGCTCTCCAGTTCGTTCCTGGCTACACAGCTCCACCTCAAGTGGAAACGGAAGGTCGCTCTAGGCCTCCCACTCCGACTCTTGATCCATCAAGCTATGTTGACTTCTCTTACGAAGCCAAAGACGAAGTTCAGGCAGAATTGTTCCTCAAACCCCTTAAGGCATTCATTGAATCCCTGGAGGAGTCAAAGTCTGTAATGGTGGAGGAAATTCGAGTGAACGGAAACAAAGTATTAGCTCGCTATCGCCCCTTCCGCGCTGCCACCCCATCGTGCAGTCGGTCTGGAAGCGAAGCTGGAGAAAAACCTGACTCAGAGCCCGACAAGGACGAGACGACCCCGAAGGCTTCCAGCTCCACAACCAAGATCAGCCCCGCCGACACTGTACCCACGTCAGCGGATCCTAAGAGCCAGACCCCCGATCCAGCCAAACCCGGTCCGTCATCTACCGAGCTACAGAGTATCTCCTTCTCCACCACATCTGCCAGTTTGGATGTGAATTCATTGTTCGGGTTCTGTGAGGATCGGGTTCCAATGAAAGGGTTTGGAGGAGCCAAGATCACCATAAACCTGGCCTCCACAGGATGCACTCCAGCAATTGCCAGTCAGCATGTGGCAGAGGGAAGATCCGAATCCTTCATGTGCGATCCCAGAGTCCCCCGGGATATGAAGGTCTACTGGCTTCTCAAGCGGCACAAGCCAGCCAACAGGTTTTTGAAGGCAGTTTCTTCCTCTTATTACAAATCAGTTCCATGAAAAAAACGTAACAGCCCTCACCATGCGACGATTCATCGACCGAGTTCTCCGTTCCGGGGCTGACGAGGCCCGCGGCCGACGTTCTGCCCGCCAGGACCCGAATCCCCTGGACCGATGGGGAGGAGCCCTCGCGGCGGTTGAGGCGCCTGCACCGCCACGTCCCCAGCTCCAGTTGGTCTCCTACGATGTGACAGGGGAGTTGAAGGTGATCAGCCCCGTCTTCGTGGACCGGCAGGCCTTCTTCGGGCGAATGAGTGTCAATTTCCCTCACTTCTATCAAGGCGATGCTCTGATGAAGCCGTACCACACCACGGTCTTTGCCCTGCTGGTTGCGGGCCTTAGAACAGGCATCCAAACTGATCGCGGATGGATCTACCGCTCCACCGTCGCCGAATGTGTCACCATTCGTGGATTGGCCATGGAAATTCCGCACCAAGAATCCAGAATATTCAGGGACTCATTCACCTGGAAGTACCGCGGAGATAGCTATGTCTGGTCCGTAACTATCTCCTGGACTAGGTCGTACATGGTGGGGGTTCCTCTTGATCGGTTTATTCCAGTGGAGCACCGCGCCCTATTGTCAGCGCTAGGTGTGAAGACCATCTGGAATCGCGAAGGGAACTACCTTAGTCTTCGCAGTGAGTTTTGATCAATTTGCATCATGAAAAAAAGTAACAGCCCTCAACATGTATCCGTTTGGCCTTGTCGCCATTGCAGCCTCCACACTGGTCAGTTCCCTGGTGGTCAACGAGATGTACATGTTCCCCAAAGAAAGAAAATACATTTGGAAACCTATTAATCTTTCTGCACTGCATTGCCCCCTAAGCCCAATTGAGACCATAATACATAACCCTCAACCTGTCCAAGTTCGCCTATTGAGGCCTTCTGGTCACTTAGACTCCCACATCACCGGTTACATCTGTTCAAAATTAAAGCTGTCTATCCAGTGTTCGGTCAACTTCTTGGGGTGGAAAACACTGTCGCACCGGACGGAGGACATATCTCCTGGGCTGGGCGAGTGTACCGAGGCCCTGCTCCGACAACAGCAGGGGGATATTTCCTCGATCCCAGCATTCCCTGCTCCCAATTGTGGCTGGATGAATGACCTCTGGGCGTCAGCAACCTTCCTGCTTATGACTCTACACCCCGTGACCGTGGACCCATACTCAGGAGACCTGGTGGATCGGATATTTCCAGGGGGGAGCTGCAAAGACAAACTTTGCAAAACAGTGCACCATGGAGCATATTGGGTGTCTAATAGTCGTGTTCCCGAAATGTGTACTCAATGGGAGGTGATCCCGGGGACAGTGGGAACTAGCAGGGATGGGGACCCCTGGGTTCTGCTCCCTTTGCTGGGCCATAAGAGCCTAGTAGATATTTGTAAGATCACCTTCTGCGGCCACACAGGCTGGAGACTTATTACAGGGGAATTTCTAATATTTGAATCAGGACTTAGTTCAAGCTTGCTTCGGGCTCCTCCTTGTCCTGCCGGGAGTGAGGTGGGAGAGCTGTCTGTGGAAGGTGAGTTAGGATTGGCTAACCTCCAGTTGATGAGGGAAGAGTTGCGGCTCCAATGCCTCTCAACACTGACGACGATTCTGGCGACAGGGAGAATCAGTGCATTTCAACTCGGGTACTTTACACCTTCTCAGATTGGCCCAGGAGAGGCATATCGACTCAACGGACTTCGCTTAGAGGAAGCGAAGGTTGATTATATCGAGGTCTCGCGTTTTCCAACCACCAGAGCGCCGAACATTATTGGTTACATGGTCAATGGATCGGAAGTTACCTGGAGCGACTGGACCCCTCTGTCAAATTCCAATCGGACAACTGGCCCGAATGGCGTGGTGAGGCTCTCTTCTGGGGTTATCCTGATACCTCAATTAGAGTCCCGTCGGCTAATAAATGACATCGTGATGATGATCGGACAGGAGGTTCACCTAGCCCGGCATCCACATCGGAACATAGAAAGCAATTTCTCTGACCTAATTGTGACCCATGAACACGATGAGGGGAAATCCGGGGAGTTGTCGCTGCTATCTTGGCTATTCGGCAAATTCAGATGGGAAGGGACGCTAGTTGTCATCGGGACCCTATTGATCCTCATTGTAGGTGTCAAACTGGCCATCAAATCTACTCGCTGTACTTGTCTGTCAAGATCCAAACCCACCATTCACTCATGGGACCAAGTTGAAACGTCTTCTGTGTAGGGCATGAAAAAAACTAACAGGCCTCACCATGGCCTCATACGAAGACGAGGACACTGAGCTCCTGTTTCACCCGGATGAGGATTGGTCCGACTTCCTCGAGTGGGAACCAGAGATCCGGGGTGCCTTTACAGGATTAGATCGTCTTACCACTCGAGGGATCCTCAATGCTACAGACTACAA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National Center for Biotechnology Information, NIH
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Rhinolophus bat coronavirus HKU2
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RefSeq
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Rhinolophus bat coronavirus HKU2, complete genome
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| 7,909
|
MF370205.1
|
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
|
Pan,Y., Tian,X., Qin,P., Wang,B., Zhao,P., Yang,Y.-L., Wang,L., Wang,D., Song,Y., Zhang,X., Huang,Y.-W., Huang,Y.W.
|
Zhejiang University, Department of Veterinary Medicine, College of Animal Sciences
|
China
|
2017-10-24
|
Swine enteric alphacoronavirus CH/GD-01/2017/P2
|
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,155
|
GenBank
| null |
China: Guangdong
|
China
|
Sus scrofa
|
abdominal cavity
|
2017
| null | null |
Rhinolophus bat coronavirus HKU2 isolate Swine enteric alphacoronavirus CH/GD-01/2017/P2, complete genome
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| 74,271
|
EF203064.1
|
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Li,K.S., Huang,Y., Wang,M., Lam,C.S., Xu,H., Guo,R., Chan,K.H., Zheng,B.J., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Li,K.S.M., Lam,C.S.F.
|
The University of Hong Kong, Department of Microbiology
| null |
2007-10-09
| null |
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,165
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Bat coronavirus HKU2 strain HKU2/GD/430/2006, complete genome
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| 106,663
|
EF203065.1
|
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Li,K.S., Huang,Y., Wang,M., Lam,C.S., Xu,H., Guo,R., Chan,K.H., Zheng,B.J., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Li,K.S.M., Lam,C.S.F.
|
The University of Hong Kong, Department of Microbiology
| null |
2007-10-09
| null |
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,164
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Bat coronavirus HKU2 strain HKU2/HK/46/2006, complete genome
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| 106,664
|
EF203066.1
|
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Li,K.S., Huang,Y., Wang,M., Lam,C.S., Xu,H., Guo,R., Chan,K.H., Zheng,B.J., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Li,K.S.M., Lam,C.S.F.
|
The University of Hong Kong, Department of Microbiology
| null |
2007-10-09
| null |
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,164
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Bat coronavirus HKU2 strain HKU2/HK/298/2006, complete genome
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| 106,665
|
EF203067.1
|
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Li,K.S., Huang,Y., Wang,M., Lam,C.S., Xu,H., Guo,R., Chan,K.H., Zheng,B.J., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Li,K.S.M., Lam,C.S.F.
|
The University of Hong Kong, Department of Microbiology
| null |
2007-10-09
| null |
Rhinolophus bat coronavirus HKU2
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,164
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Bat coronavirus HKU2 strain HKU2/HK/33/2006, complete genome
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| 106,666
|
OR261262.1
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
|
Temmam,S., Tu,T.C., Regnault,B., Bonomi,M., Chretien,D., Vendramini,L., Duong,T.N., Phong,T.V., Yen,N.T., Anh,H.N., Son,T.H., Anh,P.T., Amara,F., Bigot,T., Munier,S., Thong,V.D., van der Werf,S., Nam,V.S., Eloit,M.
|
Institut Pasteur, Pathogen Discovery Laboratory
|
France
|
2023-10-04
|
RtVN21-29
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,476
|
GenBank
| 1
|
Viet Nam: Son La province, Sop cop district, Muong va commune, Khay lau hamlet
|
Viet Nam
|
Rhinolophus thomasi
| null |
2021-03
| null | null |
Rhinolophus thomasi bat coronavirus isolate RtVN21-29, complete genome
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OR261263.1
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
|
Temmam,S., Tu,T.C., Regnault,B., Bonomi,M., Chretien,D., Vendramini,L., Duong,T.N., Phong,T.V., Yen,N.T., Anh,H.N., Son,T.H., Anh,P.T., Amara,F., Bigot,T., Munier,S., Thong,V.D., van der Werf,S., Nam,V.S., Eloit,M.
|
Institut Pasteur, Pathogen Discovery Laboratory
|
France
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2023-10-04
|
RtVN21-192
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Rhinolophus thomasi bat coronavirus
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,677
|
GenBank
| 1
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Viet Nam: Son La province, Moc Chau district, Long Sap commune, Pha nhe hamlet - cave 1
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Viet Nam
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Rhinolophus thomasi
| null |
2021-07
| null | null |
Rhinolophus thomasi bat coronavirus isolate RtVN21-192, complete genome
|
GGAAAAGCCAATCAACCTTCGATCTCTTGTAGATCTGTTCTCTAAACGAACTTTAAAATCTGTGTAGCTGTCGCTCGGCTGCATGCCTAGTGCACCTACGCAGTATAAACAATAATAAACCTACTGTCGTTGACAAGAAACGAGTAACTCGTCCGTCTTCTGCAGACTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTTACAGTCGATCATCAGCATACATAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTTCTTGGACTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTACCTGTTCTTCAGGTTAGAGACGTGCTAGTACGTGGTTTCGGGGACTCTGTGGAAGAGGCCCTCTCGGAAGCGCGTGAACATTTAAAAAATGGCACTTGTGGATTAGTAGAGCTGGAAAAAGGCGTATTGCCTCAGCTTGAACAACCCTATGTGTTCATTAAACGATCTGACGCTCTAAGCACCAACCATGGCCACAAGGTCGTGGAGTTGGTTGCCGAATTAGATGGCGTTCAGTTCGGTCGTAGCGGTATGACTCTTGGAGTTCTCGTGCCACATGTGGGCGAAACCCCAATTGCATACCGCAAAGTTCTTCTTCGTAAGAACGGAAATAAGGGAGCCGGTGGCCATAGTTACGGCATCGATCTAAAGTCTTATGACTTAGGTGACGAGCTAGGCACTGATCCTATTGAAAATTATGAACAAAACTGGAACACTAAACATGGCAGTGGTGCACTCCGTGAACTCACTCGTGAGCTCAATGGAGGTGCAGTCACTCGCTATGTAGACAATAACTTTTGTGGCCCAGATGGCTATCCTCTTGATTGCATTAAAGACCTCCTCGCTCGCGCGGGCAAGTCAATGTGCACTCTTTCTGAACAACTTGATTATATCGATTTGAAGAGGGGTGTCTATTGCTGCCGTGACCATGAGCATGAAATTGCTTGGTACACAGAGCGCTCTGATAAGAGCTATGAGCATCAGACGCCTTTCGAAATTAAGAGTGCCAAGAAATTTGACACTTTTAAAGGGGAGTGCCCAAAGTTCGTATTTCCTCTTAACTCAAAAGTCAAAGTCATTCAACCACGTGTTGAAAAGAAAAAGACTGAGGGTTTCATGGGACGTATACGTTCCGTGTACTCTGTTGCATCCCCCGAGGATTGTAACAATATGCACTTGTCTACCTTGATGAAATGTAATCATTGTGGTGAAGTTTCATGGCAGACGTGTGATCTTCTTAACGCCACTTGTGAAATTTGTGGCACCGAAAACCCAATTACTGATGGACCTACTACATGTGGGTACTTACCTAATAATGCTGTAGTTAAAATGCCATGTCCAGCTTGTCAAGACCCAGATATTGGACCTGAGCATAGTGTTGCAGAATACCACAATCATTCGAACATTGAAACTCGACTCCGCAAGGGAGGTAGGACTAGATGTTTTGGTGGGTGTGTTTTTGCCTATGTGGGCTGCTATAACAAGCGTGCTTACTGGGTACCTCGTGCTAGTGCTGACATTGGTGCTAACCACACCGGCATCACTGGAGATAATGTGGAGACTCTTAATGAAGATCTCCTCGAAATACTGAACCGTGAACGTGTTAATATTAACATTGTTGGCGATTTTCAGTTAAATGAGGAAGTTGCTATTATTTTGGCGTCTTTCTCTGCTTCTACTAGTGCATTCATTGATACTATAAAAGGTCTTGACTTCAAGACTTTTAAAGCCATTGTTGAATCCTGCGGTAACTATAAAGTTACTAAGGGAAAGCCCGTTAATGGTGCTTGGAACATTGGACAACAGAGATCAGTTCTAACACCACTGTGTGGTTTTCCTTCACAGGCTGCTGGTGTTATCAGATCAATCTTTTCACGCACACTTGATGCAGCAAATCAATCAATTCCCGATCTTCAAAGAGCAGCTGTTACCATACTTGATGGTATTTCTGAGCAGTCATTGCGTCTTGTTGACGCTATGGTTTATACTTCAGACTTGATCACTAACAGTGTCATTATTTTGGCATATGTAGCTGGTGGTCTTGTACAGCAGACTTCGCAGTGGTTATCTAATTTGCTGGGTACTACTGTTGAAAAACTCAAGCCTGTCCTTGTATGGGTTGAGGCAAGACTCCATGCAGGAGTTGAATTTCTTAGAGATGCTTGGGAGATTCTTAAATTCTTGATTGCAGGTGTTTTTGACATCATTAAGGGTCAAATACAGGTTGTGTCAGACAACATCAAAGAATGTGTAAAAACCTTCATTGGTGTTGTCAACAAAGCACTTGAAATGTGCATTGATCAAGTTACCATTGCAGGCACAAAGTTGAGGTCTCTCAATTTAGGTGAGGTTTTTATTGCACAAAGCAAAGGACTCTATCGCCAGTGTCTACGTGGTAAAGAACAGCTGCAACTACTTATGCCTCTTAAGGCACCAAAAGAACTCACCTTCCTTGAAGGTGATTCACACGACACAGTGCTTACCTCCGAAGAGGTTGTTCTTAAAAATGGTGAACTCGAGGCACTTGAGACCCCCGTTGACAGCTTCATAAATGGAGCTGTTATTGGTACACCAGTTTGTGTGAATGGCCTCATGCTCTTAGAGATCAAAGACAAAGAACAATATTGTGCTTTGTCTCCTGGTTTACTGGCTACAAACAATGTCTTTCGTTTAAAAGGGGGCGCACCAATTAAAGGTGTGACCTTTGGAGAAAACACTGTTGTAGAGGTTCAAGGCTATAAGAATGTGAGAATCACATTTGAGCTTGATGAGCGTGTAGACAAAGTGCTTAATGAGAAGTGCTCTGTCTACACTGTTGAGTCCGGTACTGAAGTTACTGAATTTGCTTGTGTTGTGGCAGAGGCTGTTGTAAAAACTTTACAACCAGTTTCTGATCTCATAACTAATATGGGTATTGACCTTGATGAATGGGGCGTAGCAACGTTCTACTTATTTGATGATGCTGGTGAGGAAAAACTTTCTTCACGTATGTATTGTTCCTTCTATCCTCCAGATGAGGAAGATGATTGTGAAGAGCTTGAGGAAGAAGAAGAAATTCTTGAAGAAACCTGTGAACATGAATATGGCACAGAGGACGACTACCAGGGTCTTCCACTGGAGTTTGGAGCTTCGACTGAAACAGTTCATGTCGAAGAAGAAGATGAAGAGGACTGGCTTGATGACGCCACTGACTTACCAGTGGCTGAATCACAAACAGAACCAACATCTGAAGTACCAGTTAACCAGTTTACTGGTTATTTAAAACTTACTGACAACGTTGCCATTAAGTGTGCGGACATCGTTAAGGAGGCACAAAGTGCTAATCCTATAGTCATTGTAAATGCTGCAAACATACATCTTAAACATGGTGGTGGTGTAGCAGGTGCACTCAACAAGGCTACTAATGGTGCCATGCAAAAAGAGAGTGACGATTACATTAAGCAGAATGGTCCCCTTACAGTAGGAGGGTCGTGTTTGCTTTCTGGACACAATCTTGCTAAGAAGTGTCTGCATGTTGTAGGACCTAACCTAAAGGCAGGAGAAGACATTCAACTGCTTAAGTTAGCATATGAAAACTTCAATTCACAGGATATCTTACTAGCACCACTATTGTCAGCTGGCATATTTGGTGCTAAACCACTCCAATCCTTACAAGTGTGCGTGCAGACTGTTCGTACACAGGTTTATATTGCAGTCAACGACAAAGCCCTCTATGAGCAGGTTGTCATGGATTACCTTGATAGCCTGAAGCCTAGAGTGGAAGCACCTAAACAAAAAGAGCTACCAGAGGTTGAACTCAGAGTTGAGGAAAAACCCATTGTACAGAAGCCTGTTGATGTCAAGCCTAAAATTAAGGCTTGCATTGATGAGGTTACCACAACATTGGAAGAGACTAAGTTTCTTACCAATAATTTGCTTTTATTTGCTGACATTAATGGTAAGCTTTACCAGGATTCTCAGAATATGCTTAGAGGTGAAGATATCTCTTTTCTTGAAAGAGACGCACCTTACATGGTGGGAGATGTCATCAGTAGTGGTGACATTACCTGTGTTGTAATACCTGCTAAAAAGGCTGGTGGTACTACTGAAATGCTTACAAGAGCTTTGAAGAAAGTGCCAGCTGGTGAATATATAACCACATACCCTGGACAAGGCTGTGCGGGTTATACACTTGAGGAAGCGAAGACTGCTCTTAAGAAATGCAAATCAGCATTCTATGTGTTACCTTCAGAAACACCTAATGTTAAAGAAGAGATTCTAGGAACTGTATCCTGGAACCTAAAAGAAATGCTTGCTCATGCAGAAGAGACAAGAAAATTGATGCCTGTTTGCATGGATGTGAGAGCAATAATGGCTACCATCCAACGCAAGTATAAAGGAATTAAAGTTCAAGAAGGAATTGTTGACTATGGTATCCGATTCTTCTTTTACACTAGCAAAGAGCCTATAGCTTCTATTATTACTAAGCTAAACTCTCTAAATGAGCCACTTATCACGATGCCAATTGGTTATGTGACACATGGTTTGAATCTTGAAGAAGCTGCGCGTTGCATGCGCTCTCTTAAAGCTCCCGCCGTAGTGTCAGTATCATCACCTGATGCTGTTACTACATACAATGGATACCTCACTTCGTCCTCAAAAACACCTGAGGAACACTTTGTAGAAACAGTGTCTTTAGCTGGTTCTTACAGAGATTGGTCATATTCGGGACAGCGTACAGAATTAGGTGTTGAGTTTCTTAAGCGTGGTGAAAAAATTGTTTACCACACATTGGAGAGTCCTATTGAGTTTCATCTTGATGGTGAGGTTCAACCACTAGATAAATTAAAGAGTCTCTTATCTCTACGGGAGGTTAGAACTATTAAAGTATTCACTACTGTGGATAATACTAATCTCCACACACAAATTGTGGATATGTCTATGACATATGGGCAGCAGTTTGGTCCAACATATTTGGACGGTGCTGATGTCACTAAAATTAAACCT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| 12,308
|
OR261264.1
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
|
Temmam,S., Tu,T.C., Regnault,B., Bonomi,M., Chretien,D., Vendramini,L., Duong,T.N., Phong,T.V., Yen,N.T., Anh,H.N., Son,T.H., Anh,P.T., Amara,F., Bigot,T., Munier,S., Thong,V.D., van der Werf,S., Nam,V.S., Eloit,M.
|
Institut Pasteur, Pathogen Discovery Laboratory
|
France
|
2023-10-04
|
RtVN21-193
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,693
|
GenBank
| 1
|
Viet Nam: Son La province, Moc Chau district, Long Sap commune, Pha nhe hamlet - cave 2
|
Viet Nam
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Rhinolophus thomasi
| null |
2021-07
| null | null |
Rhinolophus thomasi bat coronavirus isolate RtVN21-193, complete genome
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| 12,309
|
OR261266.1
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
|
Temmam,S., Tu,T.C., Regnault,B., Bonomi,M., Chretien,D., Vendramini,L., Duong,T.N., Phong,T.V., Yen,N.T., Anh,H.N., Son,T.H., Anh,P.T., Amara,F., Bigot,T., Munier,S., Thong,V.D., van der Werf,S., Nam,V.S., Eloit,M.
|
Institut Pasteur, Pathogen Discovery Laboratory
|
France
|
2023-10-04
|
RtVN21-197
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,752
|
GenBank
| 1
|
Viet Nam: Son La province, Moc Chau district, Long Sap commune, Pha nhe hamlet - cave 2
|
Viet Nam
|
Rhinolophus thomasi
| null |
2021-07
| null | null |
Rhinolophus thomasi bat coronavirus isolate RtVN21-197, complete genome
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| 12,311
|
OR261267.1
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
|
Temmam,S., Tu,T.C., Regnault,B., Bonomi,M., Chretien,D., Vendramini,L., Duong,T.N., Phong,T.V., Yen,N.T., Anh,H.N., Son,T.H., Anh,P.T., Amara,F., Bigot,T., Munier,S., Thong,V.D., van der Werf,S., Nam,V.S., Eloit,M.
|
Institut Pasteur, Pathogen Discovery Laboratory
|
France
|
2023-10-04
|
RtVN21-200
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,680
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GenBank
| 1
|
Viet Nam: Son La province, Moc Chau district, Long Sap commune, Pha nhe hamlet - cave 2
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Viet Nam
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Rhinolophus thomasi
| null |
2021-07
| null | null |
Rhinolophus thomasi bat coronavirus isolate RtVN21-200, complete genome
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| 12,312
|
OR261268.1
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
|
Temmam,S., Tu,T.C., Regnault,B., Bonomi,M., Chretien,D., Vendramini,L., Duong,T.N., Phong,T.V., Yen,N.T., Anh,H.N., Son,T.H., Anh,P.T., Amara,F., Bigot,T., Munier,S., Thong,V.D., van der Werf,S., Nam,V.S., Eloit,M.
|
Institut Pasteur, Pathogen Discovery Laboratory
|
France
|
2023-10-04
|
RtVN21-201
|
Rhinolophus thomasi bat coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,741
|
GenBank
| 1
|
Viet Nam: Son La province, Moc Chau district, Long Sap commune, Pha nhe hamlet - cave 2
|
Viet Nam
|
Rhinolophus thomasi
| null |
2021-07
| null | null |
Rhinolophus thomasi bat coronavirus isolate RtVN21-201, complete genome
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| 12,313
|
NC_001617.1
|
Rhinovirus A
| null |
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-09-22
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,152
|
RefSeq
| null | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Human rhinovirus 89, complete genome
|
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| 8,943
|
LC789193.1
|
Rhinovirus A
|
Nguema,G., Ushijima,Y., Abe,H., Mahmoudou,S., Bikangui,R., Nkoma,A.M., Mbadinga,M.J., Ayong,M., Agbanrin,D.M., Pemba,M.C., Beh,M.R., Ayola,A.A., Lell,B., Yasuda,J.
|
Virology; Hopital Albert Schweitzer, Abongo, Lambarene, Moyen Ogooue 242
|
Gabon
|
2023-12-06
|
HRVA71-K271-Gabon
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,156
|
GenBank
| null |
Gabon
|
Gabon
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2020-04-02
| null | null |
Rhinovirus A HRVA71-K271-Gabon RNA, complete genome
|
AAACTGAGTGTGGGTTGTTCCCACCCACACTGTCTACGGACGTAGTGCTCTCATATTCCGGTATGTTTGCACGCCAGTTTGCCTTTCCTTTCCCATGTAACGTTAGAAGTTTGTACACTTAATCGACCAATAGGTGAGTGATAAACCATATCATTCTTTGGTCAAGCACTTCTGTTACCCCGGTACGCAAGGAATAGGCTCCTTCAGGGCTGAAGCCTTAACTATCGTTATCCGCACATTTACTACGCAAAGCCTATTAATACTCTGAAAGTTCATTGGTTGGTTGTTCCGCTAGACTAACCCGTCTAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGATAGACCCCACTGGCGACAGTGATCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCTGGAAACAGGTGTGAAGCCTATGAATAGACAGGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTAAATGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCTAACCCCACAGCTAATACACACAAACCAGTGTGGATTTAGTCGTAATGGGCAACTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATTCCTTTTATATTGCTTATGGTGACAAGTATATAGATATATATTTGTTACCATGGGTGCACAGGTTTCCAGACAGAATGTTGGTACTCATTCCACTCAGAATACAGTTGCAAACGGGTCAAGTCTTAATTATTTTAACATCAATTACTTTAAAGATGCGGCGTCTAATGGAGCTTCTCGATTGGATTTCTCACAAGACCCAAGTAAATTTACTGACCCTGTTAAAGATGTCTTGATAAAGGGAGTTCCCACTCTACAATCACCATCCGTGGAGGCCTGTGGATATTCAGACAGAATAATTCAAATAACTAGAGGAAATTCAACCATAACCTCCCAAGACATTGCAAACGCAGTGGTTGCATATGGGGTTTGGCCACAATACCTATCAGATGCAGATGCAAATGCCATAGACAAACCATCACACCCAGACACCTCTTCAAATAGATTCTACACTCTTGATAGTAAGCTTTGGGAAAACAGTTCAAAAGGTTGGTGGTGGAAACTCCCAGATGCTTTGAAGAACATGGGTATTTTTGGAGAGAATATGTTTTATCACTTTTTAGGAAGAGCTGGTTACACAGTTCATGTTCAGTGCAATGCTAGTAAATTTCATCAGGGAACTTTGGTAGTGGCTGCTATACCAGAACATCAATTAGCTTACATTGGATCAGGAAATGTAAGTGTAGGATATAGGCATACTCATCCAGGAGAACAGGGACGTGTGATAGGGACACGTGAAAACAGAAACACAAACCAACCTACAGATGAAAGTTGGCTTAACTGTGATGGCACATTGTTAGGAAACATAACCATATTCCCGCACCAGTTTATTAACCTTAGAAGCAACAATTCAGCTACACTAATTCTACCTTATGTTAATGCAGTGCCCATGGATTCTATGATAAGACACAACAATTGGAGTATTGTTATAATACCAATTTCCCCTTTGGAAGCAAATGTAACAGACCCAGTGCCTATAACAATTTCCATAAGTCCAATGTGTACTGAATTTTCAGGTGCTCGGAACCAGTCGGTCAAAATACAAGGGCTGCCAGTTATGTTGACCCCAGGATCAGCACAATTCCTAACTACTGATGATACACAATCACCCTCAGCTCTACCCTACTTTCACCCAACAAAAGAGATATTTATACCAGGGGAGGTTAAAAATTTATCAGAAATTTGTCAAGTAGATTCAATAATACCAATTAACAATGTTGAGGCTAGGAAGAACTCCATAAGCATGTACACAGTTGAGGTTGGTGTCAAAACAACTCTAGCAGAGGAAGTTTTCGCTATACCTGTGGATGTGGCATCACAGCCCTTGGCAACAACTCTGATTGGAGAAATATCCAGCTATTACACCCATTGGACAGGTTCCATCCGTTTCTCATTCATGTTTTGTGGAACTGCTAACACTAGCCTTAAACTACTGATTGCATACACACCACCAGGAGTTGGAAAACCACAAAATAGAACACAAGCCATGCTGGGAACACACATGATATGGGATGTAGGATTACAATCAACAGTTTCTATGGTGGTACCATGGATTTCAGCTAGTAATTACAGGTTCACTACCCCAGACACCTACTCCCAGGCTGGTTTTATAACTTGCTGGTATCAGACAAATTTTGTAGTTCCTCCTAACACTCCTAAAACAGCTAATATCATATGTTTTGTTTCAGGTTGTAAAGACTTCTGCTTGCGTATGGCTAGAGACACCAACTTACACTCACAAACTGTCAACATTGAACAGAATCCTGTGGAAAAATATACAGAAGCAATACTCAATGAAGTTTTAGTTGTACCAAACATACAACCTAGTAGTGGACACACCTCAAACTCAGCACCAGCTCTAGATGCAGCAGAAACTGGACACACAAACCAGGTGCAACCAGAAGATGTCATGGAAACCAGATACGTGATCACTGATCAAACCAGAGATGAAATGAGCATCGAAAGTTTTCTGGGTAGGTCTGCTTGCATAGCTACCATACACACCAAATTAGTGCATGGAGAGGAGGGTGTTTACAATATGAAAGGTAACAATCTCTCACAATGGAAAATTACACTCAAAGAAATGGCACAGATCAGGAGAAAGTGTGAACTTTTCACATATCTGCGCTTTGATTCAGAGATAACAATTGTAGCTACACTGGCAGGACAAGGGGATGACTTAGGACACATTGTACTCCAATACATGTATGTTCCCCCAGGTGGCCCAATACCAGAAACTAGAGATGCCGATGAATGGCAATCAGGAACTAATGCATCAGTTTTCTGGCAGCATGGCCAGCCATACCCAAGGTTTACAATTCCCTTCATAAGTATTGCATCTGCATACTATATGTTTTATGATGGGTATGAAGGTGATGCTCTCAGTTCCAAATATGGTTCAGTGGTTACTAATGCCATGGGCACCTTATGTGTTCGTGTGGTCACAGAACAACAAAGCAATACAGTTAACATAACAAGCAGAGTTTATCATAAAGCAAAACATGTCAAAGCATGGTGCCCTAGACCTCCCAGAGCAGTGGCTTATCAATCAACATACACCACAAACTTTGTTCCACAAGATGGTATTACTTCTATCAAAACCAAAATTAAAATCAGAAGAGACATTAAAGAGGTTAGTAATTATGGACCCTCTGACTTGTATGTGCACATGGGTGATCTAGTATACAGGAATTTACATCTGTGTGATCCAGAGAATTTGAATGATTCAGTATTAATATGTTATTCAAGTGATTTAGTCATATACCGAACAAATACAGAAGGTGATGACTTTATTCCAACATGTAATTGCACACAAGCCACATACTATTGTAAACATAAAAACAGGTATTTTCCCATAAATGTAAAGAAACATGAATGGTATGAGATCCAAGAATCAGAATATTACCCTAAACACATTCAGTATAACATTTTAATTGGTGAGGGACCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGAAAGTTGCTCTGTAGTCATGGAGTCATAGGGATTGTCACTGCTGGTGGTGAAGGTCATGTTGCCTTCATTGACTTACGAGACTTTCATGTTGCAGAAACACAGGGAATCACAGATTACATACACAATCTAGGTGAAGCTTTTGGTGCTGGATTTATTGATAATATTAAAGACCAAATTAATGTTATTAACCCAATCAACAAAATTACCAGTAAGATAGTTAAGTGGATCATCAGAATAATATCAGCCATGACAATCATTATTAGGAACAGTGCAGATCCCCATACAGTTATTGCCACTCTTGCTTTGATAGGCTGTTCAGGGTCTCCATGGAGGTTTATTAAAGACAAAGTCTGCAAGTGGTTACAGTTGACTTATGTACATAAAGAATCAGATGGATGGATCAAGAAATTTACAGAGATGTGTAATGCTGCTAGAGGTTTAGAGTGGTTAGGTAATAAAATATCAAAATTTATTGATTGGTTTAAATCTATGCTCCCACAAGCAAAATTAAAGGTTGAGTATATAAAGAATCTCAAACAACTGCCTCTATTAGAAAAACAAATTGATGGCTTGAGATTGGCCCCTCAGAAACAACAGCAGGAATATATAGATACTTTGAGGATCATGTTAGATTCATCAAATAAATTCTTACCTCTGTATGCATCAGAAAACAAAAGAATCAAAGAACTCCTCAAAAGGAGCGACATGATACTGCGCACATCAAAGAGAACAGAACCAGTTGGTGTGCTTTTCCATGGTGACCCAGGAACTGGAAAATCAATAGCCACTTCCATTTTAGCCAGAATGATAACCACAGAATCTGATATATACTCACTTCCACCATCCCCTAAGTATTTTGATGGCTATGATCAGCAAAGTGTGGTTATCATGGATGACATAATGCAAAACCCAAATGGTGAAGACATGTCTCTGTTTTGCCAAATGGTCTCCTCAGTACCATTTATCCCACCTATGGCAGATTTACCTGATAAGGGAAAACCTTTCTCTTCTGATTATGTGCTGGCGAGCACAAATCACAGTCTGCTACACCCACCAACTATAACATGCACTCCAGCTATGAATAGAAGGTTCTTCTTAGATCTAGACATTATAGTCAAGGATGATTATAAAATGAATCAGGGGAAACTAAATTTACAGTGTGCTCTTAAACCATGCAAAGAAGGAAAAGTGGGCAATGCTAAGTGTTGTCCCCTCATATGCGGGAAGGCTGTCCTCTTTAGGGATAGGAATACAGGAGAACACTTATCACTAGCAACCATATACAATAAAATTGTAGAAGAGAGTAAAAACAGAAAAGAATTGAATACATCGTTACAGGCAATATTTCAAGGTCCAATAGACGTGGTCAATAAGCCACCACCTCCAGCTATATTAGATTTATTAAAGTCTGTTAGAAACCCTGAAATTATTAGATATTGTGAAGAAAACAAATGGATTGTA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| 10,416
|
OR220809.1
|
Rhinovirus A
|
Guo,L., Liang,Y., Zhou,J., Gao,Y., Wang,M.
|
Yunnan Institute of Pediatrics, Kunming Children's Hospital
|
China
|
2023-09-13
|
HRVA298/China/Kunming/2023/LZG
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,063
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2023-02-24
| null | null |
Rhinovirus A isolate HRVA298/China/Kunming/2023/LZG, complete genome
|
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| 12,975
|
LC769225.1
|
Rhinovirus A
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
HRV_A81_Fukushima_O714_2019
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,088
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null | null |
Rhinovirus A HRV_A81_Fukushima_O714_2019 DNA, nearly complete genome
|
ATAAAACTGGATCTGGGTTGTTCCCACCCAGATCACCTACATGGTGTTGTACACTATTATTACGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATATCCCCTTCCCCAAATGTAACTTAGAAGCAACGCAAACTGATCAATAGGGGGCAATCATCCAGATTGCTAATGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAGGTTGATATGCTCCACAAGGGCAAAAACAGCCAAGATCGTTATCCGCAAGATGCCTACGCAAAGCTTAGTAATGCTTTTGAAGATGCCTGGTTGGTCGCTCAGCTGTGAACCTGACAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAGTACCCCTCTGGCGACAGAGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTTTGGGTGTGAAGCCAAGTATTGGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCATCTTGAATCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAAACCTGCAGCCAGTGCACACAAGCCAGTGTGTGGCTGGTCGTAACGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTACCTTTATATTGCTTATGGTGACAATATATATAGCACATATATATTGTTATCATGGGCGCTCAAGTATCTAGACAGAATGTTGGTACACACTCAACACAAAATTCAGTGTCAAATGGTTCTAGTCTCAATTATTTCAACATAAATTACTTTAAAGATGCTGCATCCAGTGGTGCTTCACGACTGGACTTTTCTCAAGACCCTAGCAAATTCACTGACCCGGTTAAGGATGTTTTGGAAAAAGGTATCCCCACTTTGCAATCTCCTTCTGTCGAAGCTTGTGGATACTCAGATAGGATAATTCAAATTACCAGAGGTGACTCAACTATAACTTCACAAGATGTTGCCAATGCAGTAGTTGGTTATGGGGTATGGCCACATTATCTAAATTCACGGGATGCTGTGGCCATAGATAAACCAACTCAACCAGATACATCATCAAATAGATTTTACACCTTAGACAGTAAAATGTGGGATAGTAACTCCAAAGGATGGTGGTGGAAACTACCTGATGCACTTAAGGACATGGGTATCTTTGGTGAGAACATGTTTTATCATTTCCTGGGAAGAAGTGGTTACACAGTACATGTGCAATGCAATGCCAGCAAATTTCACCAAGGCACTTTATTGGTGACTATGATACCAGAACATCAATTGGCTACGGTTAATAAAGCTAATGTTACTGCAGGTTACAAATACACACACCCTGGAGAGTCTGGTAGAGTGGTTGGTACACAGGCAGATGACACACGGCAACCCAGTGATGACAATTGGCTGAATTTTGATGGCACACTTTTAGGTAATTTGTTAATCTTCCCCCACCAATTTATTAATTTGAGGAGCAACAATTCAGCCACTATTATAGTACCATATGTCAATGCTGTACCAATGGATTCTATGGTTAGGCACAACAACTGGAGTTTAGTGATAATACCAATTTGTCAACTTCAAAGTAACAATACATCTAATATTGTCCCCATCACTGTTTCTATTAGTCCAATGTTTGCTGAGTTTTCGGGAGCACGTGCAAAAACAGTTGTGCAAGGCCTACCAGTCTATGTTACACCAGGCTCAGGTCAATTCATGACAACTGATGACATGCAGTCCCCTTGTGCACTACCCTGGTATCATCCAACAAAAGAGATTTTCATACCAGGCGAAGTCAAGAATCTAATTGAAATGTGTCAAGTGGATACTCTAATCCCAATAAACAGTACAAGAGCTAACATAGGCAATGTCAACATGTATACGGTCACCCTCCAACCTCAAACTGACATGGCTACTGAAGTTTTTGCAATCAAGGTGGATATTGCATCACATCCACTGGCCACAACCTTAATTGGAGAGATTGCCAGTTACTTTACCCACTGGACAGGAAGTTTGAGATTTAGTTTCATGTTTTGTGGAACAGCAAACACTACCTTGAAGCTCTTGCTAGCTTACACACCTCCAGGTATTAGTAAACCCAAAAATAGGAAAGAGGCAATGTTAGGAACACATGTTGTATGGGATGTGGGCTTGCAGTCAACAGTATCTTTAGTTGTGCCATGGGTTAGTGCTAGTCAGTATAGATTCACCACACCAGATACATACTCCTCAGCTGGATATATCACATGTTGGTACCAAACCAATTTTGTTGTCCCACCGAATACACCAAATACTGCTGAGATGTTGTGTTTTGTATCTGGTTGCAAGGATTTTTGTTTACGAATGGCAAGAGACACAGACTTACACAAGCAGAGTGGGCCTATAGAACAAAATCCAGTAGAACGATATGTAGATGAAGTTCTAAATGAGGTCTTAGTAGTCCCTAACATCAATGAAAGTCATCCTACAACATCCAATGCAGCTCCTGTTCTAGATGCAGCTGAAACCGGACACACTAGTAACATACAACCTGAAGATACAATTGAAACCAGATACGTACAATCCTCACAAACACTGGATGAGATGAGTGTAGAGAGTTTCTTAGGTAGGGCAGGCTGTATTCATGAATCTATACTGGATATCAAGGAGGATTATAACACTCAAAGTTTTACTAAGTGGAAAATCAATTTACAGGAGATGGCACAAATTAGAAGAAAATTTGAAATGTTTACATATACCAGGTTTGATTCTGAGATCACATTAGTACCAAGCATTGCAAACAAAGAAGGTCACATTGGTCACATAGTCATGCAATACATGTATGTACCACCAGGAGCACCTATTCCAACAACCAGAGAAGATTATGCTTGGCAATCTGGGACAAATGCATCTATATTCTGGCAGCATGGACAACCTTTTCCTCGCTTTTCACTCCCTTTTCTAAGTGTTGCATCAGCATATTATATGTTTTATGATGGGTATGATGGAGACACTTATCAATCTAGGTACGGGACTGTAGTTACCAATGATATGGGGACACTGTGTTCAAGGATAGTAACAAGTGAGCAAGTACATAAGGTTAAAGTAGTAACAAGAATATATCACAAGGCTAAACATACCAAAGCCTGGTGTCCAAGACCACCCAGAGCTGTTCAGTACACACACACTCATGTGACTAATTACAAACTAGAAACAGATGTTCACACTAGTGTAGCTATAAGACCTAGAACAAGTTTAACAAATGTTGGTCCCAGTGACATGTACGTGCATGTTGGAAATCTCATATATAGAAATTTGCATCTTTTCAATTCAGACATGCACGACTCCATCTTGGTCTCTTACTCATCAGATTTAGTCATATACCGAACAAACACACAAGGTGATGATTATATCCCCACATGTAACTGTACTGATGCTACATACTATTGTAAACATAAAAACAGATATTATCCAATTACAGTTACACCACATGATTGGTATGAAATTCAGGAGAGTGAGTACTACCCAAAACACATTCAGTATAATCTGTTGATAGGTGAGGGACCATGTGAGCCAGGTGATTGTGGTGGAAAATTACTGTGCAAACACGGTGTGATTGGCATTATCACAGCTGGTGGTGAGGGTCATGTGGCTTTCATAGATCTCAGACACTTTCATTGTGCTGAAGAGCAAGGGATAACTGATTACATACACATGCTTGGTGAAGCTTTTGGAAGTGGATTTGTAGATAGTGTTAAAGAGCAGATCAACTCAATCAATCCAATCAATAGTATTAGTAGTAAAATGGTTAAGTGGATGCTTAGGATAATATCAGCTATGGTCATAATAATTAGGAACTCTTCGGATCCACAAACTATAATTGCCACTCTTACACTAATTGGATGCAATGGCTCACCATGGAGGTTTCTTAAAGAGAAATTTTGTAAATGGACCCAGCTAACCTATGTACATAAAGAATCAGACTCATGGCTCAAAAAATTTACTGAAATGTGTAATGCAGCTAGGGGCTTGGAATGGATTGGCAACAAAATTTCTAAATTTATCGATTGGATGAAATCTATGTTACCTCAGGCACAACTTAAGGTTAAGTATTTGAATGAACTCAAAAAATTGAATCTCCTAGAAAAACAGATTGAAAATCTCAGAGCAGCTGACACAAGCACCCAAGAGAAGATTAAGTGTGAGATTGACACTCTGCATGATTTATCTTGTAAATTTCTACCCTTGTATGCTAGCGAGGCAAAAAGGATTAAAGTGTTATACCACAAATGCACTAATATTATTAAACAGAAAAAGAGAAGTGAGCCAGTGGCAGTTATGATACATGGGCCCCCTGGAACAGGCAAGTCTATCACTACTAGTTTTTTAGCTAGGATGATTACCAATGAGAGTGACATATACTCACTTCCACCAGACCCAAAATACTTTGATGGGTACGACAACCAGAGTGTGGTGATAATGGATGACATCATGCAAAATCCTGGTGGAGAGGACATGACATTGTTCTGCCAAATGGTGTCTAGTGTTACATTCATACCCCCTATGGCAGACTTGCCAGATAAAGGAAAACCTTTTGATTCCAGGTTTGTGCTATGTAGCACCAACCACTCTCTCCTAGCTCCTCCAACTATATCATCACTACCAGCAATGAATAGAAGGTTTTACTTAGACCTGGATATTACTGTGCATGACAACTTTAAAGATAATCAAGGTAAATTGGATGTGTCAAGGGCATTTCAACCATGTGATACTAACTTGAAAATTGGGAATGCAAAATGCTGTCCATTTGTGTGTGGTAAAGCAGTGATGTTCAAAGACCGCAACACTTGCAAAACTTACTCACTTTCACAAGTATATAGTCAAATTTTAGAGGAAGACAAGAGAAGAAGGCAAGTGATAGATGTCATGTCAGCAATTTTCCAAGGTCCTATATCAATGGACAAACCCCCACCACCGGCCATAACAGATCTATTACGGTCAGTGAGGACACCTGAAGTGATTAAGTACTGTCAGGATAATAAATGGATAGTGCCTGCAGATTGTCAAATTGAGAGAGATCTTAGTATAGCT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| 15,519
|
MZ667417.2
|
Rhinovirus A
|
Makhsous,N., Goya,S., Avendano,C., Kuypers,J., Jerome,K., Boeckh,M., Greninger,A., Waghmare,A.
|
University of Washington, Virology
|
USA
|
2021-09-04
|
HRV-A78/NW8/2008
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,134
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2008-01-10
| null | null |
Rhinovirus A strain NW8, complete genome
|
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|
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|
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|
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|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
|
2021-07-18
|
AZ6_15
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
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GenBank
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|
USA
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Homo sapiens
|
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|
2020-03-13
|
SAMN17914668
|
PRJNA701833
|
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|
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Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
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2021-07-18
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Rhinovirus A
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MAG: Rhinovirus A isolate AZ9_2, complete genome
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| 40,380
|
MN749155.1
|
Rhinovirus A
|
Addetia,A., Phung,Q., Greninger,A.L.
|
University of Washington, UW Virology
|
USA
|
2020-01-20
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,100
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2015
| null | null |
Rhinovirus A strain 12N2, complete genome
|
TTAAAACTGGGTCCAGGTTGTTCCCACCTGGATCTCCCAAAGGGAGTGGTACTCTGTTATTACGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTATCCTCCCCCTACCCCCTGTAACTTAGAAGTTTTTCACAAAGACCAATAGTTGGTAATCATCCAGATTACTTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAATGCTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACTGCGATCGTTATCCGCAAAGCGCCTACACAAAGCCTAGTAGCACCTTTGAAATTATTTGGTTGGTCATTCCGCCATTTCCCCTGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGAAGTACCCCACTGGCGACAGTGTTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTATGGGTGTGAAGCCAAATAATGGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCGCTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTGGAGCACACAAACCAGTGTGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTACTTATAATTGCTTATGGTGACAATATATATATAGTATATATTGGCACTATGGGCGCACAGGTATCCAGACAGAATGTTGGGACTCACTCTACACAGAACTCTGTATCCAATGGATCTAGTTTAAACTACTTCAACATCAACTACTTCAAAGATGCTGCTTCAAATGGTGCATCTAAATTAGAGTTCACCCAAGACCCCAGCAAATTTACAGACCCTGTTAAAGATGTATTAGAGAAAGGAATACCGACACTGCAATCACCTACAGTTGAAGCTTGTGGATATTCAGATAGAATCATACAGATTACCAGAGGAGATTCAACAATAACATCACAAGATGTGGCAAATGCTGTTGTTGCATATGGTGTTTGGCCACACTATCTATCCTCTAAAGATGCTTCTGCAATTGACAAGCCTTCCCGCCCAGACACATCTTCCAATAGGTTTTATACCTTAAAGAGTGTGACTTGGTCTTACTCTTCAAAAGGTTGGTGGTGGAAATTGCCAGATGCATTGAAGGAAATGGGCATCTTTGGTGAAAATATGTTTTACCACTACTTGGGCAGAAGTGGTTATACAATACATGTACAGTGTAATGCTAGTAAATTCCACCAAGGCACACTGATTGTTGCACTGATACCTGAGCACCAAATCGCAAGCGCACTCCATGGTGATGTAAATGTTGGTTATAAATACACTCACCCAGGAGAAGGAGGGAGAGAGGTTAAAAGTGACAGGAATATAAACCTAGCTGTGCAACCCACTGAAGAATATTGGCTGAATTTTGATGGAACACTACTTGGAAACATTACCATTTACCCCCATCAATTTATTAACCTGAGAAGTAACAACTCTGCTACAATAATTGCTCCATATGTTAATGCAGTTCCCATGGATTCAATGCGCAGTCACAACAACTGGAGCCTGGTTATAATCCCAATATGTCCTCTTGAAACATCAAGTACTGTCAATACAATACCTATTACAATATCAATAAGTCCCATGTGTGCAGAGTTTTCTGGAGCACGTGCCAAAAACCAGGGTCTACCAGTTCTCATCACACCAGGATCAGGTCAATTTCTGACAACAGATGATTTCCAATCCCCATGTGCACTCCCTTGGTATCACCCAACCAAAGAAATATCCATCCCAGGTGAGGTGAAAAATTTAGTTGAAATATGTCAAGTGGATAGCTTAGTACCAATAAACAATACTGAAAATAACATCACCAACGGGGACATGTATTCAGTCATATTGCAATCAACAATTGGAGAACCAGATAAAATCTTTTCAATCAAAACAGATGTAGCCTCTCAGCCACTGGCTACAACTCTAATTGGTGAAATATCCAGCTATTACACTCACTGGACAGGAAGCCTTCGCTTTAGTTTTATGTTCTGTGGTACAGCCAACACTACTGTTAAACTCCTACTAGCCTACACACCACCTGGTATTAGAGAGCCTACTACAAGAAGAGAAGCAATGTTGGGCACTCATGTAATATGGGATATTGGCCTTCAATCTACAATATCAATGGTAGTACCATGGATTAGTGCTAGCCATTACAGAAATACATCATCGGGTGCATCTTCAGCAGGATACATAACATGCTGGTATCAAACCAGATTAGTAATTCCACCTCAAACTCCACCCACAGCTAGGTTGTTGTGTTTTGTATCAGGCTGCAAGGATTTTTGTTTACGCATGGCTCGTGATACTAATTTACATCTACAGAGTGGGCCAATAGAGCAAAATCCTGTTGAGCACTATATAGATGAGGTCCTTAATGAGGTTTTAGTAGTTCCAAATATTAATAGTAGTCATCCCACAACATCAAATTCTGCCCCAGCACTAGATGCCGCAGAAACAGGACATACTAGTAATGTGCAGCCTGAAGATGTAATTGAAACCAGATATGTACAGACATCACAAACAAGAGATGAGATGAGTTTAGAGAGTTTTCTTGGTAGATCAGGGTGCATACATGAATCTAAACTGGAGGTCACGCTTACAAATTACAATAAAAACAATTTCAAAGTGTGGAATATCAATTTACAAGAGATGGCCCAGATTAGAAGGAAATTTGAGTTGTTCACTTATACTAGATTTGACTCTGAGATAACCCTAGTTCCATGTATTTCTGCACTTAGTGAGGACATTGGACATGTTACTATGCAATACATGTATGTACCACCAGGTGCACCTGTACCAGAGAGTAGGGATGATTATGCATGGCAGTCTGGCACTAATGCATCTATTTTCTGGCAACATGGGCAAGCATACCCAAGATTTTCTCTACCCTTTTTGAGTGTGGCTTCAGCTTACTACATGTTTTATGATGGATATAATGAAGAAGGGCAAAATTACGGCACAGTAAGCACAAATAACATGGGATCATTATGTTCTAGAATAGTGACAGAGAAACACATTCATAATATGCATATTATGACAAGAATCTATCATAAAGCCAAACATGTCAAAGCGTGGTGCCCGCGCCCACCCAGAGCACTTGAATATACTCGTGCTCACCGTACTAATTTCAAGATTCAAAATAAAGATATCAAAACAGGAATTAAATCTAGAGCAATTATTACAACAGCTGGTCCTAGTGATATGTATGTCCATGTTGGCAATCTTATTTACAGAAATTTACACCTCTTCAACTCTGAAATGCATGAATCTATACTGGTATCTTACTCATCAGATTTAATCATCTACCGAACAAACACCATAGGTGATGATTATATTCCCTCTTGTGATTGTACCCAGGCTACATACTATTGTAAACATAAAAATAGATATTTCCCAATAACAGTGACAAGTCATGACTGGTATGAAATACAGGAAAGTGAATACTATCCCAAACATATACAGTACAATTTGCTAATTGGTGAGGGTCCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGGAAATTATTATGTAAACATGGTGTTATTGGCATAGTAACAGCTGGTGGTGACAATCATGTGGCCTTCATCGATCTTAGACACTTTCATTGTGCTGAAGAGCAAGGAGTTTCAGATTACATACATATGCTGGGTGAGGCATTTGGAAATGGATTCGTAGATAGTGTAAAAGAACACATACATGCCATTAACCCAGTTGGAAATATTAGCAAAAAGATCATCAAATGGATGCTAAGGATAATATCTGCAATGGTCATAATAATAAGGAACTCCTCTGATCCACAAACTATATTAGCAACACTCACATTGATTGGATGTTCTGGTTCACCATGGAGATTTTTAAAAGAAAAATTTTGTAAATGGACACAACTTAATTATATACATAAAGAATCAGACTCATGGTTGAAAAAATTCACTGAAGCATGCAATGCGGCCAGAGGGCTTGAATGGATAGGAAATAAAATATCCAAATTCATTGAATGGATGAAGTCAATGCTCCCACAAGCACAACTCAAAGTGAAGTACTTAAATGAACTCAAAAAATTAAGCCTGTATGAAAAGCAAGTTGAAAGTCTTAGAATAGCAGATGTAAGAACACAAGAGAAGATCAAGATGGAAATTGACACTTTACATGATTTATCATGTAAATTTCTGCCACTGTATGCAAGTGAAGCAAAGAGAATAAAGACACTACACATCAAATGTGACAACATTATCAAGCAAAAGAAAAGGTGTGAGCCAGTGGCTATAGTCATCCATGGGCCACCTGGTGCTGGAAAATCAATAACAACAAATTTTTTAGCCAGGATGATAACTAATGATAGTGACATATACTCTTTACCCCCAGATCCAAAATATTTTGATGGTTACGATCAACAAAGCGTCGTAATAATGGATGATATTATGCAAAATCCAGCTGGGGATGATATGACCCTATTTTGTCAAATGGTTTCAAGTGTCACTTTTATACCACCAATGGCTGATTTACCAGACAAGGGCAAGGCTTTTGACTCTAGGTTTGTGCTATGCAGCACAAATCACTCACTTTTAGCACCACCTACAATAACATCACTACCTGCAATGAATAGAAGGTTCTTTTTAGATTTAGATATATTAGTGCATGATAATTTCAAGGACTCACAGGGCAAACTTAATGTAGCAGCAGCCTTCCAACCGTGCGATGTGGATAACAAGATCGGGAATGCCCGGTGTTGCCCATTTGTGTGTGGAAAGGCTGTCTCTTTCAAAGATCGCAATTCTTGCAGCAAATACACCTTAGCACAAGTATATAACATAATGCTTGAAGAAGACAAGCGCAGAAGACAAGTGGTTGATGTTATGTCAGCTATTTTCCAGGGACCAATTGACATGAAGAACCCACCGCCGCCCGCAATTACAGATCTACTCCAGTCAGTTAGGACTCCTGAAGTTATCAAGTATTGTGAAGACAATAGGTGGATAATACCAGCAGAATGTAAGATAGAAAAGGAGTTAAATTTAGCTAATACAATCATAACA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| 54,617
|
MN306020.1
|
Rhinovirus A
|
Lin,M.J., Tait,A., Greninger,A.L.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
|
USA
|
2019-08-25
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,953
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null |
PRJNA338014
|
Rhinovirus A strain SC0218, complete genome
|
AAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAATGTTGATATGCTTCAACAAGGCAAAAACANCATCGATCGTTATCCGCAAGATGCCTACACAAAGCCTAGTACCTCCTTCGATGGTATTTGTCTGGTCGCTCAGGTGTTTTCCCAACACTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAACTCCCCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTTCGGGTGTGAAGCCAAATACTGGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCATCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAAACCCGCAGCCATTACTCACAATCCAGTGAGCGGATGGTCGTAATGAGCAATTGTGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCATGTTTTACCTTATGATTTGCTTATGGTGACAATATATAGAGATATATATTGGCATCATGGGCGCTCAAGTATCTAGACAGAATGTTGGTACGCACTCAACTCAAAATATGGTTTCAAATGGATCTAGCTTAAATTATTTCAACATTAATTATTTTAAAGATGCTGCTTCTAATGGAGCATCCAAATTGGAATTCTCACAAGATCCCAGTAAATTTACAGACCCAGTCAAGGATGTTTTGGAAAAGGGAATCCCAACTTTGCAGTCACCAACAGTTGAAGCCTGTGGATATTCGGATAGAATTATTCAAATAACAAGAGGAGACTCCACAATTACATCACAGGATGTAGCAAATGCTGTTGTGGGGTATGGGATATGGCCACACTACTTATCCCCTGAGGATGCTACAGCTATAGATAAACCAACACGCCCTGATACGTCATCTAACAGGTTCTATACTTTAGAAAGCAAAATTTGGACGAGAGACTCAAAAGGTTGGTGGTGGAAATTGCCTGATGCACTCAAGGAAATGGGAGTTTTTGGACAAAACATGTATTACCATTTCCTGGGGAGAAGTGGCTATACAATTCATGTTCAATGCAATGCTAGCAAATTCCATCAGGGCACGTTGATAGTGGCTGCAATACCAGAACATCAATTGGCAAGTGCAGAGAAAGGAAATGTTAACACTGGCTATAATTACACACACCCTGGTGAAAGGGGTAGGGATGTTGGGCAGGAAAGAGAAAGTACCAGCTATCAGCCCAGTGATGATAATTGGCTTAATTTTGATGGCACTCTATTAGGTAATATAACCATTTTCCCACATCAATTTATCAATTTGAGAAGCAATAATTCTGCAACACTTATTCTTCCATATGTGAATGCTGTACCCATGGACTCAATGCTTAGACACAATAATTGGAGTTTGGTAATAATCCCAATTTGTCCTCTAGAAACTAATGGTGGAGATGTTACTGTACCTATAACAATATCTATTAGCCCAATGTTTGCTGAGTTCTCTGGAGCACGAGCCCGTAGCCAGGGATTGCCAGTATTAATGACCCCAGGATCTGGTCAGTTCATGACAACTGATGATTACCAATCACCTAGTGCATTACCATGGTTCCATTCAACAAAAGAAATATTCATCCCAGGTCAAGTACATAATTTAGCAGAACTGTGTCAAGTTGATACAATAATACCAATTAATTATACAACAGCAAACACGACTAGTGTTAATATGTACACTGTGGTGCTGCAAAAAGAAAACCCTGGAACAGAAGTTTTTGCTATGAGAGTTGATATAGCAACACAACCTTTAGCTACAACATTAATTGGTGAGATTGCTAGTTATTATACACATTGGACTGGTAGTTTGAGATTTAGCCTCATGTTTTGTGGAACAGCAGGCACCACACTTAAATTACTAGTTGCCTACACACCTCCTGGAATTGCCAAACCAGAAAACAGGAAAGATGCAATGCTTGGTACCCATGTTGTCTGGGATGTTGGCCTACAGTCAACCATATCAATGATTGTGCCCTGGGTCAGTGCTAGTCATTTTAGAAACACCACACCAGATAAATTCTCACAAGCAGGATACATAACATGTTGGTACCAAACCACTCTTGTCACACCCCCTAGCACGCCTTCCACGGCCAGAATGCTCTGTTTTGTATCAGGGTGCAAGGATTTCTGTCTACGCATGGCTAGAGACACTAACTTACATAAACAAGTTGGGCCCATTACACAGAATCCAGTTGAAAAATATGTTGACAGTGTTCTGAATGAGGTGTTAGTTGTTCCCAATATTAATGAAAGTCACCCTAGTACCTCAAACTCAGCTCCTGCACTGGATGCTGCAGAGACTGGGCACACAAGTACTGTGCAACCTGAAGACATGATTGAAACACGGTATGTCCAAACATCACAAACTAGAGATGAGATGAGTCTTGAGAGTTTCTTAGGAAGGTCTGGCTGTATACATATATCACATCTAAATGTCAAGTATACAGATTACAATGAGAAGAATAATTTCAGATCTTGGCCAATAAGCATAAAGGAGATGGCACAAATAAGAAGAAAGTTTGAACTTTTCACATATGTGAGATTTGATTCAGAAATCACCCTAGTGCCTTGCATAGCCTCTCAAAGTAATGACATTGGGCATGTAGTGATGCAATATATGTATGTCCCACCTGGTGCACCCAAACCAGAGAAGAGAGATGATTACACTTGGCAATCTGGAACCAATGCTTCAATTTTCTGGCAACACGGTCAACCTTACCCTCGTTTCTCACTTCCTTTCCTAAGCATAGCCTCGGCTTATTACATGTTTTATGATGGTTATGATGGTGATGTTCCCGGATCAAGATACGGGACCATAGTAACAAATGATATGGGCACACTGTGTTCTAGAATTGTAACTGAAGAGCACCAAACTCAAGTTAACATCACCACAAGGATATATCACAAAGCCAAACATGTGAAAGCGTGGTGCCCACGACCCCCAAGAGCTGTGGGTTACACACACACACATGTCACTAACTACAAACCATCAGAAGGAGAATACAGTATCAGTATTCCAACCAGAGACAGCCCTAGACATATTCTCAATGTGGGACCTAGTGACATGTATGTACATGTCGGCAATTTAATATATAGAAATTTACATCTTTTCAACTCTGATGTCCACGATTCCATCTTGGTCTCTTATTCATCTGATCTAGTCATTTACCGCACAAACACTACAGGTGATGACTATATTCCAACATGTGATTGCACAGATGCAACTTATTACTGTAGACATAAAAATAGATATTACCCAATAAAAGTTACTAGTCATGACTGGTATGAAATACAAGAAAGTGAGTATTATCCCAAACACATCCAATACAATCTCTTGATTGGTGAAGGCCCATGTGAACCAGGGGATTGTGGTGGGAAACTCCTTTGCAAACATGGTGTGATTGGAATTATTACAGCAGGTGGTGAGGGGCATGTGGCTTTCATAGATTTGAGACATTTCCATTGTGCAGAAGAGCAAGGTATCACAGATTACATACATATGTTAGGGGAAGCCTTTGGAAGTGGATTTGTGGACAGTGTTAAGGATCAAATCAATGCAATAAACCCTATAAATAATATTAGCAAGAAACTAGTTAAATGGATCCTTAGGATAATATCTGCTATGGTGATAATTATAAGGAATAGCTCAGATCCGCAAACAGTTGTAGCTACACTTACACTAATAGGTTGTTCAGGATCACCATGGCGGTTTCTAAAGGAAAAATTTTGTAAATGGACACAGCTTCATTATGTACACAAAGAGTCAGACTCATGGCTTAAGAAATTCACAGAAATGTGCAATGCAGCAAGAGGTCTTGAGTGGATTGGAAATAAAATATCTAAATTCATAGAATGGATGAAGTCTATGTTACCCCAGGCCCAATTGAAAGTTAAGTATCTCAATGAACTTAAAAAACTGAGTTTGTTGGAGAAGCAGATTGAAAACTTGCGCTGTGCAGACACAAAAACCCAGGAGAAAATAAAGGTAGAAGTTGATACTCTCCATGATTTATCATGTAAATTCCTTCCTTTATATGCTAGTGAAGCAAAAAGAATCAAAGTCTTGTACAATAAATGCAATAATATAATTAAGCAGAAAAAGAGGAGTGAGCCAGTTGCCGTGATGATACACGGTCCACCTGGAACTGGTAAGTCTATAACTACAAGCTTTCTTGCTAGGATGATAACAAATGAAAGTGACATTTATTCATTACCACCAGATCCCAAATACTTTGATGGATACGACCAACAGAGTGTAGTTATCATGGATGATATAATGCAGAATCCAGATGGAGAGGATATGTCCCTGTTTTGTCAGATGGTATCAAGTGTCACATTTATTCCACCAATGGCTGATTTGCCAGATAAGGGTAAACCATTTGATTCTCGCTTTGTTTTCTGTAGCACAAACCAATCTCTTTTAGCTCCACCAACTATTACTTCACTTTCTGCTATGAATAGAAGATTTTATTTAGATTTGGATATAATTGTGCATGAGAATTACAAAAACAGCCAAGGGAAATTAGATGTGTCCAGATCTTTTAAACCATGTGATGTAGATACAAAAATAGGCAATGCAAAATGCTGTCCATTCATATGTGGTAAGGCTGTGTCTTTCAAAGACCGAAACACGTGTGAGGTGTATTCTCTCTCTCAGATTTACAACATGATTATGCAAGAGGATAAGCACCGTAGAAGTGTTGTAGATGTGATGACAGCAATATTTCAAGGACCTATCACAATGAATGCCCCACCACCACCTGCAATAGCAGATTTATTACAATCAGTTAGAACTCCAGAAGTAATCAAATATTGTGAAGAGAATAAGTGGATAATTCCAGCAGATTGCAAAATTGAGAGGGATTTAAATTTAGCAAACAATATCATAACAATTATAGCAAATGTTATTAGTATAGCTGGTATTATTTTTGTTATTTACAAATTATTTTGCACACTCCAGGGCCCATACTCCGGAGAGCCTAAACCTAAACCCAAAATTCCAGAGAGAAGAGTTGTGGCTCAAGGGCCT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| 60,161
|
MH899591.1
|
Rhinovirus A
|
Tirosh,O., Conlan,S., Deming,C., Lee-Lin,S.-Q., Huang,X., Su,H.C., Freeman,A.F., Segre,J.A., Kong,H.H.
|
National Institutes of Health, National Human Genome Research Institute
|
USA
|
2018-10-01
|
HRV_A_SK001
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,018
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
|
skin
|
2015-01
| null |
PRJNA471898
|
MAG: Rhinovirus A isolate HRV_A_SK001, complete genome
|
AAAGTGACCAATAGGCGGCAATCACCCAGATTGTCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCGAAGCTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAGCTGAGATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGCAAAGCCTAGTAACATTTTCGAAGTTATATGGTTGGTCGCTCAGCCAAACCCCATGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAATACCCCACTGGTGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTCTGGGTGTGAAGCCATATAATAGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCATGCAATCCAGCATGTATCTAGTCGTAATGAGTAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTTATCCTTATTGATTGCTTATGGTGACAATATATAGTACTATATATTGACACCATGGGCGCCCAGGTATCAAGACAGAATGTTGGCACACACTCAACTCAAAATGTGGTTTCTAGTGGTTCTAGTTTAAATTATTTTAACATTAATTATTTTAAAGATGCAGCCTCAAGCGGTGCATCAAAATTGGAGTTTTCACAAGATCCAAGTAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTGTTAGAAAAAGGTATTCCTACCCTCCAATCTCCAACAGTTGAAGCATGTGGATACTCTGATAGAATCATTCAAATTACCAGAGGAGATTCTACCATAACATCACAAGATGTAGCCAATGCTGTTGTCGGTTATGGAGTATGGCCCCACTATCTCACAGCACAAGATGCCACCGCAATAGATAAACCATCACAACCTGATACATCATCTAATAGATTTTATACATTAGAGAGTAAACTGTGGACAAATGAATCAAAAGGTTGGTGGTGGAAACTGCCTGATGCTCTCAAAGAAATGGGTGTTTTTGGACAAAACATGTATTACCACTTTCTCGGAAGAAGTGGCTATACAGTGCACGTCCAATGTAATTCTAGCAAATTTCATCAAGGTACACTTATAGTGGCAATGATACCAGAGCATCAATTAGCGGCAGCAGAGAAGGGAAATGTAACTGCTGGTTATAATTTGACACATCCAGGTGAGAGAGGCAGAACAATTGGGATTCCTGATCGTCTGCATCCAAATAAACAACCTAGTGATGATAATTGGTTGAACTTTGATGGCACACTACTAGGGAACATAACCATTTTTCCACACCAATTCATTAATTTGAGGAGCAACAACTCAGCCACAATAATCGTGCCTTATGTGAATGCAGTACCTATGGATTCTATGCTCAGTCATAATAATTGGAGTTTGGTTATAATCCCCATTTGTCCTTTAGAGGTTAGTACCACTGGAACCAATGGTATACCCATAACTGTATCAATCAGCCCCATGTTTGCTGAGTTTTCTGGTGCACGTGCCAGAAGCCAAGGTCTGCCAACTATGTTAACACCCGGATCTGGACAATTTATGACCACAGATGATTTCCAATCACCTTGTGCGCTGCCGTGGTTCCATCCCACAAAGGAGATCTCAATACCTGGTGAAGTCAAGAATTTGATTGAGTTGTGCCAGGTTGACAGCATGATTCCAATAAATAATGTTGCAGGTAAAATAAGGAGTGTTGACATGTATACAGTAGTGCTGCAGAGACAAGATGAACTAATGCAGGAGGTTTTTGCTATAAGGGTTGACGTGGCATCGCAACCACTTGCAACAACATTAATTGGTGAAATCTCAAGCTATTACACCCAATGGACAGGAAGTCTCCGCTTCAGTTTCATGTTTTGTGGAACAGCTAATACAACACTTAAACTTTTAATAGCATATACACCTCCAGGTATAGCAAAACCCCAAAATAGGAAAGATGCAATGTTAGGAACTCATATTGTATGGGATGTGGGCCTGCAATCAACAATATCTATGATTGTACCTTGGGTTAGTGCTAGTCATTTTAGAAACACCACACCTGATACATACTCTCTAGCTGGGTTCATAACATGTTGGTATCAAACCAATCTTGTGTTTCCTCCAGACACCCCAAACACTGCTAGAATGCTTTGTTTTGTATCTGGCTGCAAGGATTTTTGTTTGCGCATGGCCAGAGACACAAATTTACACAAACAATCAGGAATTATAACGCAGAACCCAGTAGAAAACTATATAGATGGAATTTTAAATGAAGTCCTTGTAGTTCCAAACATTAAAGAGAGCCAACCCACTACTTCCAATTCTGCTCCAGCATTAGATGCTGCTGAAACTGGTCATACTAGCAATGTGCAACCTGAAGACATGATTGAAACACGCTATGTACAGATCACACAAACTAGAGATGAAATGAGTGTTGAAAGTTTCCTTGGTAGGTCTGGATGCATTCACATTTCCAAATTAGAGATTGATTATAACAATTATAATGAAAAGAACAAAAACTTCACAACTTGGCAAATCAACTTAAAGGAAATGGCACAAATTAGAAGAAAATTTGAATTATTTACATATGTAAGATTTGATTCAGAAGTGACTTTAGTCCCATGCATAGCAGCAAAAAGTGATGGCATAGGTCACGTTGTCATGCAGTACATGTATGTTCCTCCAGGAGCACCATTACCAACAAAAAGGGATGACTACACGTGGCAATCTGGCACAAATGCTTCTGTATTTTGGCAACATGGACAAACATATCCTAGATTCTCACTCCCATTTCTGAGCATTGCATCTGCTTACTACATGTTCTATGATGGTTATGACGGTCACACAACTGAATCGCATTACGGGACAGTCGTGACCAATGACATGGGAACATTATGCTCCAGAATAGTTACTGAGCATCACGGAACGCAGGTACATGTCACAACAAGGATATATCACAAAGCAAAACATGTCAAGGCTTGGTGCCCAAGACCTCCAAGAGCGGTTGAATATAGGCATACACATGTAAACAATTATAGACCAGATGAAGGAGAGGCATCCATAACAATCCCCACTAGAACTGACATACGAACAATAAAAACAGTTGGCCCCAGTGACATGTATGTACATGTAGGGAATTTAATATATAGAAATTTGCATTTATTCAATTCAGAGATTAGTGATTCTGTTTTAGTTTCTTACTCATCAGATTTAGTCATTTACCGAACAAACACTACAGGTGATGACTACATTCCCACTTGTGACTGTACAGATGCAACATATTATTGTAAACACAAGAATAGATACTACCCAATTAAAGTCACCAGCCATGATTGGTATGAAATACAAGAAAGTGAATATTACCCAAAACACATACAATACAACTTGTTAATTGGTGAAGGGCCTTGTGAACCTGGAGACTGTGGAGGGAAACTATTATGTAAACACGGCGTGATTGGCATCATCACAGCCGGTGGAGAAGGACATGTGGCGTTCATAGATTTACGTCACTTTCACTGTGCAGAAGAGCAGGGAATCACTGATTATATACACATGCTTGGTGAGGCATTTGGTAATGGCTTTGTGGATAGTGTGAAGGAACAAGTCAATGCCATAAATCCAATCAATAACATCAGCAAGAAATTGATTAAGTGGATGCTTAGAATAATTTCAGCAATGGTAATAATAATCAGGAATTCCTCAGACCCTCAAACAATTGTAGCCACACTTACATTGATAGGGTGCTCTGGATCACCATGGCGATTTCTTAAGGAGAAGTTTTGTAAATGGACACAGCTAACTTATATCCATAAGGAATCAGATTCGTGGCTCAAAAAATTCACAGAAATGTGCAATGCAGCTAGAGGCCTTGAATGGATTGGTAATAAGATATCCAAGTTTATTGATTGGATGAAATCCATGTTACCACAAGCACAATTAAAAGTCAAATATCTTAGTGAGTTAAAGAAATTAAATCTATTGGAGAAACAAATTGAGAATTTGCGTGGTGCTGATACCAATACGCAAGAGAAAATTAAACTAGAGATTGATACACTACATGATCTATCTTGTAAATTTCTCCCTCTGTATGCTAGTGAGGCTAAAAGGATTAAAGTACTATACAACAAATGTAACACAATTATTAAGCAAAAGAAGAGAAGTGAGCCAGTTGCTATCATGATACATGGTCCGCCAGGAACAGGCAAATCTATAACAACCAGCTTCCTTGCTAGGATGATAACCAATGAGAGTGATATTTACTCATTGCCTCCAGATCCAAAGTACTTTGATGGATATGATCAGCAAAGTGTTGTTATAATGGATGATATAATGCAAAACCCAGATGGAGAAGATATGTCACTATTTTGTCAAATGGTGTCAAGTGTAGCATTTATACCTCCAATGGCTGATCTTCCGGATAAAGGAAAACCATTTGATTCTAGATTTGTCTTTTGTAGTACAAACCAATCTTTATTAACTCCACCAACTATCACCTCCCTCTCTGCAATGAATAGGAGATTTTATTTAGATTTAGATATTACAGTCCATGACAATTACAAGGATAACCTAGGCAAGCTGGATGTACCAAAAGCATTTAAACCATGTGATGTTGACACGAAAATAGGTAATGCTAAATGTTGTCCATTTATTTGTGGTAAAGCTGTGTCATTCAAAGATCGCAATACTTGCCAGGTGTACTCACTTAGTCAAATTTACAACTCAATCATAGAAGAGGATAAACGCCGTAGGAATGTTGTTGATGTTATGTCAGCAATTTTCCAAGGTCCTATATCTATGAATGCCCCTCCACCACCAGCAATAGCAGATCTATTACAGTCAGTTAGAACCCCAGAAGTCATTAAATACTGTGAAGAAAATAAATGGATCATTCCAGCAGATTGTAAAATAGAACGTGATTTGAATTTAGCAAATAATATAATAACAATTATAGCAAATATTATTAGTATAGCAGGTATTATATTTGTAATTTATAAATTGTTTTGTTCACTCCAAGGTCCTTATTCCGGGGAGCCTAAACCCAAAACCAAAGTCCCAGAAAGGAGAGTGGTGGCACAGGGACCAGAAGAAGAATTTGGTCGGTCACTCATTAAACACAACTCATGTGTAGTAACCACTTCAAATGGTAAGTTTACAGGACTAGGAATTTATGACAGGACACTTATTATACCAACACATGCTGATCCAGGCAAGGAGGTACAGATAGATGGCATTACAACTGCTGTTCAGGATTCCTATGACCTATACAATAGGGATGGAGTGAAGCTAGAAATTACAGTTCTTAAACTCAAAAGAAATGAAAAATTCAAAGACATTAGAAAGTATATCCCTGAGAATGAAGATGACTACCCAGATTGCAATTTGGCTTTGTCTGCTAACCAACCAGAAACTACTATAATTAGTGTTGGGGATGTTGTATCATATGGTAATATCTTGCTCAGTGGTAATCAGACAGCAAGAACACTCAAACACAATTATCCTACAAAATCAGGGTACTGTGGTGGAATTTTATACAAAATTGGGCAAGTTTTGGGTATACATGTTGGTGGTAATGGAAGGGATGGATTTGCAGCTATGTTACTAAGATCTTATTTTACTGAGGCACAAGGTCAAATAACTACCACCAAGACTACTGCTGAGTGCAACCTGCCCAGTATTCATACCCCAAGTAAAACCAAATTGCAACCTAGTGTATTCTATGATGTCTTCCCAGGAAGTAAGGAACCAGCTGTACTTTCAGAAAATGACCCTAGATTAAAGACCAATTTCAAAGAGGCTTTATTCTCTAAGTATAAAGGGAACAATCAATGTGAGATCAATGACCATATTAGAGTGGCAATCTCTCATTATTCAGCACAATTGGCAACACTGGATATTGACCCAAGTCCAATTTCCTTAGAGGATAGTGTTTTTGGTATAGAGGGATTAGAGGCACTTGATCTCAACACTAGTGCTGGATTTCCTTATGTTTCTATGGGTATCAAGAAAAGGGATTTGATTAATAAACAAACAAAAGATATCACAAAACTCAAGATGGCAATGGATAAATATGGTGTTGACTTACCTATGGTTACTTTTCTTAAAGATGAACTCAGGAAACAAGAAAAGATTTCTGCTGGAAAAACTCGTGTCATAGAAGCTAGTAGTGTGAATGACACTGTATTGTTTAGAACAACATTTGGAAATCTCTTTTCAAAATTCCATTTAAACCCTGGGATTGTAACTGGTTCTGCTGTGGGCTGCGATCCAGAAGTGTTTTGGTCAAAAATACCAGCTATGCTGAATGGTGAATGTTTGATGGCATTTGATTACACAAATTATGATGGTAGCATCCATCCAGTGTGGTTTCAAGCACTAAAAGAAATATTATCCAATTTGGGTTTTCAATCTGATCTAATAGATATTATGCAAGTCAAACACATTTTTAAGAATATATATTATGAGGTTGAAGGTGGTGTACCATCAGGTTGCTCAGGGACCAGTATATTTAATACAATGATAAATAATGTTATAATCAGAACATTAGTTTTAGATGCATACAAAAACATTGATTTGGATAAACTTAAAATAATAGCATATGGTGATGATGTTATTTTCTCATATATATATCAGCTGGATATGGAAGCAATTGCTAAAGAAGGTGCAAAATATGGTCTTACAATAACACCTGCTGATAAATCAAGTGAGTTCAAACAATTGGATTACAACAATGTAACTTTCTTAAAAAGAGGATTTAGACAAGATGACAAATATCATTTTTTAATACATCCAACTTTTCCAATTGAGGAGATTCATGAGTCCATACGATGGACAAAGAAGCCATCTCAGACACAAGAACACATTCTTTCACTATGTCATTTAATGTGGCATAACGGCAAGGATGTGTATAAGCAGTTCGAGCATAAGATCCGCAGTGTGAGCGCTGGTCGCGCACTGTATATTCCTCCTTATGAGCTGCTTCAGCATGAGTGGTATGAGAAATTTTAAATTGTTTAGATATAGAAGTAATAAACAATTAGTTTTTTAGCTGTCTCTTA
| 68,196
|
MF043119.1
|
Rhinovirus A
|
Loeb,J.C., Lednicky,J.A.
|
University of Florida - Gainesville, Environmental and Global Health
|
USA
|
2018-03-12
| null |
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,159
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2014-01-14
| null | null |
Rhinovirus A strain RV-A21/environment/UF-1/2014, complete genome
|
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| 71,830
|
KF958307.1
|
Rhinovirus A
|
Nakagome,K., Bochkov,Y.A., Ashraf,S., Brockman-Schneider,R.A., Evans,M.D., Pasic,T.R., Gern,J.E.
|
University of Wisconsin-Madison, Pediatrics
|
USA
|
2014-03-04
|
2916
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,141
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
1999-04-17
| null | null |
Rhinovirus A isolate 2916, complete genome
|
TTAAAACTGGGAGTGGGTTGTTCCCACTCACTCCACCCATGCGGTGTTGTACACTGTTATTACGGTAACCTTGTACGCCAGTTTTGCCACCCTTCCCTAATATGTAACTTAGAAGTTTGAGCAATAAGACCAATAGGTGATAATTATCCAGATTATCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAACGAGGATATGCTTTACCCAAGGCAAAAACCTTAGAGATCGTTATCCCCACACTGCCTACACAGAGCCTAGTATCACTTTTGATGTAATTAGGTTGGTCGCTCCCTGCAAACCCAGCAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGACATTCCCCACTGGCGACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCTCACCCTATCGGGTGAGAAGCCTACTTATTGACAAGGTGTGAAGAGCCGCGTGTGCTCAGTGTGCTTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCCGCTGCCCATAATCCAATGGGTCTACGGTCGTAACGCGCAAGTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTATTTTTCCTTTATTTGCATTTTATGGTGACAATTTATGGTATATAGATTGTCATCATGGGTGCACAAGTATCTAGACAAAATGTTGGTACGCATTCTACACAAAATTCAGTGAGCAATGGATCAAGTCTGAACTATTTTAACATTAATTATTTTAAAGATGCAGCATCGAGTGGTGCTTCCAGATTAGATTTTTCCCAAGATCCTAGTAAATTTACTGACCCCGTCAAAGATGTACTAGAAAAGGGTATCCCAACACTCCAATCACCAACAGTTGAAGCTTGTGGTTATTCAGATAGGTTAATACAGATAACCCGTGGAGACTCTACTATAACATCCCAGGACATTGCAAATGCAGTTGTTGGTTATGGTGTATGGCCATCATACCTAACCCCAGATGATGCAACTGCTATTGATAAACCTACACAACCAGACACTTCATCCAACAGATTCTATACATTGGAGAGCCGTTCCTGGACGTCCTCTTCATCTGGCTGGTGGTGGAAGTTACCTGATGCTCTTAAGAACATGGGCATATTTGGTGAAAATATGTTTTATCACTTTCTAGGAAGATCTGGATACACAATACATGTACAATGTAATTCTAGTAAATTTCACCAGGGTTTACTGATAGTTGCTGCTATTCCAGAACATCAATTGGCATCTGCAACAAGTGGGAATGTATCAGTGGGGTATAACCACACCCATCCAGGTGAACAAGGTAGAGAAGTGGTACCATCACGAAATTCTGATGACAACAAAAGACCTAGTGATGATAGCTGGTTAAATTTTGATGGGACTTTACTTGGCAACCTACCTATTTACCCACATCAATATATTAACTTGAGAACCAACAACTCAGCCACTCTCATTTTACCTTATGTCAATGCTGTGCCAATGGACTCTATGCTTAGACATAATAATTGGAGTCTAGTCATTATTCCAATATGCCCTTTACAAGTTCAGGCTGGGGGGACAAATTCCATACCCATAACAGTGTCAATTAGCCCCATGTTTTCAGAATTTTCAGGACCAAGAAATAAAGTTACATTTGGTACTACTGAAGGTTTACCAGTCATGCTTACACCTGGATCTGGACAATTTTTAACAACTGATGACACACAATCTCCATCAGCATTTCCATACTTCCACCCAACCAAGGAAATATTCATACCTGGACAAGTCAGAAATTTGATTGAAATGTGCCAAGTTGATACACTCATTCCCGTTAACAATAAAGAGGAAAATGTAAAATCTGTAAATATGTACACTGTTGATTTACGCACTCAAACTGAGTTAGCAAAAGAAGTCTTTTCTATACCAGTGGATGTTGCCTCACAACCGCTGGCCACTACCCTCATAGGTGAACTTGCAAGTTACTACACACACTGGACTGGTAGTTTGCGTTTTAGTTTCATGTTCTGTGGCTCTGCCAGCTCCACTTTAAAGCTGTTGATTGCTTATACTCCTCCTGGTGTTGGAAAACCTAGATCAAGAAGAGAAGCCATGCTTGGTACACACTTAGTATGGGATGTAGGGTTACAGTCCACTGCCTCTCTAGTAGTACCATGGGTTAGTGCTAGTCATTTTAGATTCACCACACCTGATACATATTCTTCAGCTGGTTACATTACATGCTGGTATCAAACCAATTTTGTAGTTCCCGCCAGTACACCAGACAATGCTAAAATGGTGTGTATGGTTTCAGCTTGCAAAGATTTTTGTCTGAGATTAGCTAGGGATACCAATCTACACATGCAGGAAGGGGTACTTACACAAAACCCAGTTGAAAATTACATAGATAATGTGTTAAATGAAGTGCTTGTAGTGCCAAATATCCAACCTAGTTCATCTGTGTCAAGTCACTCAGCTCCTGCTCTAGATGCTGCAGAAACTGGACATACTAGCTCCGTCCAACCAGAGGATATGATTGAAACCAGATATGTTATAACTGATCAAACAAGAGATGAAACAAGTATTGAGAGCTTCTTAGGCAGGTCAGGATGTATAGCTATGATAGAATTCAGTACAAGTAGTGATAAAGATGAACATGACAAAATTGGTAAGGGATTCAAAACATGGAAGATTAGTCTTCAAGAAATGGCACAAATCAGAAGAAAATATGAATTGTTTACATACACAAGGTTTGATTCAGAAATCACAATAGTCACTGCAGCAGCAGTGCAAGGGGATGACAGTGGGCATGTAGTGTTGCAATTCATGTATGTGCCTCCGGGAGCACCCGTCCCTGTGAAACGTGATGACTACACATGGCAATCGGGAACAAATGCATCTGTGTTTTGGCAAGAAGGACAACCATATCCTAGATTTACAATTCCCTTTATGAGCATTGCATCAGCTTATTACATGTTTTATGATGGTTATGATGGTGATAATGCTGCATCAAAATATGGGTCTGTGGTTACTAATGATATGGGAACCATATGTGTCAGAATAGTTACATCTAACCAGAAACATGATTTAAATATTGTGTGCCGCATTTATCACAAGGCTAAACACATAAAGGCCTGGTGTCCACGCCCACCAAGAGCCGTTCCTTACCAACACACACATTCCACTAATTATATACCATCTAAAGGTGAGATCACAACCCAAATTAAGACCAGACCTAATGTTTTCACTGTTGGGCCCTCCAGCATGTTTGTACATGTAGGTAATTTAATTTATAGAAACCTTCATCTTTTTAACTCTACTCTTGATGATTCCATCCTTGTGTCATATTCCAGTGATCTAGTCATATACCGAACAAACACCGAAGGTGATGATGTGATCCCAAATTGTGATTGTACTGAATGTACATATTATTGTCATCACAAAGATAGATACTTTCCCATTAAGGTTACCCCACATGATTGGTACGAAATTCAAGAATCAGAGTATTACCCAAAGCATATCCAGTACAATCTCCTAATTGGAGAGGGACCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGAGGTAAATTACTGTGTAAACATGGGGTTATAGGCATGATTACAGCTGGTGGTGATGGTCATGTTGCTTTCATTAACCTTAGAAAATTCCAATGTGCTGAAGAACAAGGATTATCTGATTATGTGGAACATCTTGGTCAAGTCTTTGGTGTTGGTTTTGTAGATAGTATCAAACAACAAGTAAATTTTATTAACCCCACTAGCAAAATTGGCTCAAAAGTAATTAAATGGTTACTAAGGATAGTATCAGCTATGATAATAATGGTAAGAAACAGTTCTGACCCTCAAACCATAATTGCTACTCTTACCCTCTTAGGCTGTTCAGGTTCACCATGGAGATTCCTCAAAGAGAAGCTCTGTGCATGGCTTCAGCTCAGTTATGTACATAAACAATCTGATTCATGGCTTAAAAAATTTACTGAAGCGTGTAATGCAGCACGTGGATTGGAATGGATTGGACAGAAAATATCTAAATTCATAGATTGGATAAAGAGTATGTTACCACAAGCTCAATTAAAGGTTGATTATCTGACTAAATTAAAACAACTTAATCTCTTAGAGAAACAGATAGAGACAATCAGGCTTGCACCTGCTAATGACCAGGAAAAAATATTTACTGAAATAAATACTCTCCATGATCTATCCTTAAAATTTTTACCACTGTACGCATCTGAAGCGCGCAGGATCAAGAATCTATATATCAAGTGTAGTAACATCATTAAAGGAGGGAAAAGAAATGAACCAGTTGCAGTATTAATACATGGTTCTCCTGGCACTGGAAAATCTCTTGCTACTTCAGTTCTTGCTCGGATGCTGACTGTTGAGACTGACATATATTCTTTGCCCCCAGATCCCAAATATTTTGATGGGTATGATCAACAAAGTGTTGTTATTATGGATGATATTATGCAAAACCCTAGTGGTGAGGATATGACCCTATTCTGCCAAATGGTATCAAGTGTTCCTTTCATACCTCCTATGGCAGATCTTCCAGATAAGGGGAAACCATTTACATCTAAATTTGTGCTTGCAAGTACTAATCATACCATGTTGACACCACCAACAGTATCTTCACTACCAGCAATGTCAAGGAGGTTTTATTTTGATTTAGATATTCAGGTTAAGAAAGATTATCTCTTAGATGGTAAGTTAGATATAGCAAAAAGTTTCCGACCATGTGATGTAAACACCAAAATAGGTAATGCTAAGTGCTGCCCATTTATTTGTGGAAAAGCTGTGGAATTTAAAGATAGAAACTCATGCACCACCTTATCCTTGTCTCAATTATACAACCACATTAAGGAAGAGGACAAGAGAAGAAGTAGCGCGGCACAAGCAATGGAAGCTATATTTCAAGGTATAGATCTCCAGTCCCCCCCACCTCCAGCCATAGCTGATCTTCTCAGATCTGTGAAGACACCAGAAATTATTAAATATTGTCAAGATAATAATTGGATTGTCCCAGCAGAGTGTTCTA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| 91,544
|
GQ415052.1
|
Rhinovirus A
|
Rathe,J.A., Liu,X., Tallon,L.J., Gern,J.E., Liggett,S.B., Lee,W.-M., Liu,X.J.
|
University of Maryland School of Medicine
|
USA
|
2009-12-01
|
hrv-A101-v1
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,129
|
GenBank
| 1
|
USA: Maryland, Baltimore
|
USA
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2008-08
| null |
PRJNA32533
|
Human rhinovirus A isolate hrv-A101-v1, complete genome
|
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| 101,627
|
GQ223229.1
|
Rhinovirus A
|
Huang,T., Wang,W., Bessaud,M., Ren,P., Sheng,J., Yan,H.J., Zhang,J., Lin,X., Wang,Y.J., Delpeyroux,F., Deubel,V.
|
Institut Pasteur of Shanghai, Biology of Emerging Viruses
|
China
|
2009-08-08
|
N13
|
Rhinovirus A
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,136
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2007-07-19
| null | null |
Human rhinovirus A isolate N13, complete genome
|
TTGAAACTGAGTGTGGGTTGTTCCCACCCACACTTCCCATGTGGAGTAGTACACTGTTATTACGGTAACCTTGTACGCCAGTTTTATCATCCCTTTCCCTTTGTAACTTAGAAGTTTTAAACTTGAGACCAATAGGTGGTGATCAGCCAGATCACTAAAGGTCAAGCACTTCTGTCTCCCCGGTCAACGCTGATATGCTCCGCCAGGGCAAAAACAGCTGCGATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGCAAAGCCTAGTAATATCTTGAATGATATATGGTTGGTCGTTCAGCTAAACCCCATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGAAATACCCCACTGGTGACAGTGTTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCACTCTTGCGAGTGCGAAGCCATATATTTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCATACAATCCAGTGTGTGGCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTATAATTTGCTTATGGTGACAGTATATAGCTTATATATTGTTACCATGGGCGCACAAGTCTCCAGACAGAATGTTGGCACACACTCCACGCAAAACATGGTCTCAAATGGGTCTAGTTTAAATTATTTTAATATAAATTACTTTAAGGATGCAGCCTCCAGCGGCGCTTCAAAATTAGAATTTTCACATGACCCAAGCAAATTTACTGACCCAGTCAAAGATGTCCTTGAAAAAGGAATTCCAACACTGCAATCTCCTACAGTAGAGGCATGTGGTTATTCAGATAGAATAATGCAAATCACAAGAGGTGACTCTACAATAACATCACAGGATGTTGCAAATGCAGTGGTGGGTTATGGGGTGTGGCCACACTATTTAAGTGCAAAGGACGCCACTGCTATTGATAAGCCCACACAACCAGACACTTCATCAAACAGATTCTACACACTAGATAGCAAAATATGGAAACCAGGTTCTAAGGGCTGGTGGTGGAAGCTACCCGATGCATTGAAGGAAATGGGTATATTTGGAGAAAATATGCACTATCATTATCTTGGCAGAAGTGGTTATACTGTACATGTTCAATGCAATGCCAGTAAATTTCATCAAGGGACTTTACTAATTTTGATGATACCTGAGCACCAGTTGGCAAATGCAAATGCTACCAATGCAGACGCTGGATACAATTATACCCATCCTGGTGAACGAGGCAGAGAGGTTGGTAGCGATCGTGTTGCTCATGCTAACCTTCCAAGTGATGATAATTGGCTTAATTTTGATGGTACTTTATTGGGTAATGCTCTTATATTTCCCCACCAATTCATTAATTTGAGAAGCAACAACTCTGCAACACTGATAGTCCCTTATGTAAATGCTGTTCCAATGGATTCAATGCTTAGACATAATAATTGGAGTTTAGTGATAATTCCAATTTGTGAATTACTAGTAGATGCTAATGCCAGTGCTGTAGTTCCAATCACTATATCAATAAGCCCAATGTTTGCCGAATTCTCTGGGGCACGTGCAAAACCAGTGGCTGCTCCACAGGGTCTACCAATTTATATGACACCTGGCTCAGGCCAATTTATGACAACTGATGATTTCCAATCACCTTCAGCCTTACCATGGTATCACCCAACCAAAGAAATCTTAATTCCAGGGGAGGTCAAAAATTTAATAGAGATGTGTCAGGTGGATACTTCGATCCCTATCAATAACACAACACAAAACTTGAGAAAGATAAATATGTATACTATACAGTTAGAAAATCAAACAGAAATGGCCAAAGAGATTTTTGCTATTAAAGTAGATATTGCATCACAACCTTTAGCAAATACCATGATTGGAGAAATTGCAAGTTATTTTACACATTGGGCTGGTAGTTTGCGTTTTAGTTTTATGTTCTGTGGTACAGCAAATACCACTCTCAAACTACTTCTAGCTTACACACCACCAGGCATAGGCAAACCAAGAGACAGAAAGCAAGCTATGCTTGGGACACACATAGTTTGGGACGTTGGGTTGCAATCAACAGTGTCTTTAGTTGTTCCATGGGTTAGTGCCAGTCATTTCAGGTACACATCTAGGGATGAACATTCAGCAGCTGGATTCATAACATGTTGGTATCAGACAAATTTTGTTTTTCCCCCGAACACTCCCAATAGGGCTGACATGCTGTGTTTTGTATCAGCGTGCAAGGATTTCTGCTTGCGTATGGCCAGAGACACGGATATGCACAAACAAGATGATGCCATTGAACAAAACCCAGTTGAAAATTATGTGGGAGAGGCGCTTAATGAGGTCTTGGTTGTACCAAATATCAAAGAGAGTCATCCAAGCACGTCCAACTCTGCCCCAATTTTAGATGCTGCTGAAACTGGGCATACTAGTAATGTACAACCAGAGGATACAATTGAAACCCGATATGTACAAACAACACAAACAAGAGATGAAATGAGCATTGAGAGCTTCCTTGGTAGGTCAGGATGCGTGCATTCCTCAACAATAACACATGATGAACAACACACTAAGAAATTTAGAGTGTGGCGCATCAATTTACAAGAAATGGCCCAGATTAGGCGTAAATATGAAATGTTTACATATGTAAGATTTGATTCAGAGATGACTATGGTTCCAAGCATTGCAGGGTATGGTAATGATGTAGGTCATATAGTTATGCAATACATGTATGTACCGCCTGGAGCTCCAGAACCAACAAGTAGAGAACATTTTGCATGGCAATCAGGCACTAATGCATCTATCTTCTGGCAACAAGGACAACCCTTCCCAAGGTTTTCACTACCATTTTTGAGTGTTGCATCTGCTTATTACATGTTTTATGATGGTTATAATGGTGACACACCTGGATCCAAATATGGCACCACAGTAGTCAATCGCATGGGTGCACTGTGTATGAGGGTTGTGACAAACAAACAAATCAATAAAGTTGAAATCACAACTAATATATACCATAAAGTTAAGCATGTGAAAGCATGGTGTCCCAGACCACCCAGAGCTGTTCCATACAGGTATGTTGGATCAACAAATTATAAAAAACCTGATCAGGAAGATGTTACAATTTTCATTGAACGTAGACAAGACCCAAAATTCATTACAACAGGACCAAGTGATTTGTTCGTACATGTGGGTAATTTGATATACAGAAATTTACATCTATTTAATTCAGAAGTACATGACTCAGTATTAATATCGTATTCCTCAGATTTAGTCATCTACCGCACAAACTCTACAGGTAATGACTACATTCCCACATGTGACTGCACTCAAGCAACCTATTATTGTAGACATAAAGATAGGTATTACCCAATTAATGTTACCAGTCATGACTGGTATGAGATTCAAGAAAGTGAATACTACCCAAAACACATTCAATATAACCTTTTGATAGGTGAAGGTCCATGTGAACCAGGAGACTGTGGAGGAAAGCTATTGTGTAAACATGGAGTGATTGGAATAATAACAGCAGGTGGAGAGGGTCATGTGGCATTTATTGATCTCAGGCAATTTCATTGTGCAGATGAGCAAGGAATAACTGATTACATCCACATGCTGGGTGAAGCCTTTGGATCAGGATTTGTTGACAGTGTTAAAGGCCAAATAAACGCTATCAATCCAATTAACAACATTAGTAAAAAGATAGTCAAGTGGTTGCTTAGAATAATCTCTGCAATGGTTGTAATTATTAGAAATTCCTCTGATCCACAAACAATCATAGCCACATTAACACTAATTGGATGCTCAGGTTCCCCCTGGCGATTTCTTAAAGAAAAATTTTGCAAATGGACCCAATTAAATTACATACACAAGGAATCTGATTCATGGTTAAAGAAATTCACCGAAATGTGTAATGCAGCCAGAGGCTTAGAACGGATTGGCAATAAAATATCAAAATTCATTGAATGGATGAAATCTATGCTTCCTCAGGCTCAGCTTAAAATCAAATATTTGAGTGAGCTCAAGAAACTTAGTTTTTTAGAGAAGCAGATGGAGTACTTAAGAGTTGCTGACTCACAAACACAGGAAAAAATTAAATGTGAGATTGACACTTTACATGATCTTTCTTGTAAATTTTTACCACTCTATGCTAGTGACGCTAAAAGAATAAAGATATTATATAACAAATGTAACACAATTATTAAACAGAAGAAAAGGTGTGAACCAGTTGCAGTTGCCATACATGGTGAACCTGGTACTGGTAAGTCTATGACTACAAACTTTCTTGCTAGAATGATAACTAATGATAGTGACATATACTCCTTACCACCTGATCCCAAATACTTTGATGGATACGACCAGCAAAGTGTGGTTATTATGGATGACATTATGCAAAATCCAAGTGGGGAAGATATGACCTTATTCTGTCAAATGGTGTCTAGTGTCACATTCATACCACCGATGGCCGATTTGCCTGATAAGGGTAAACCTTTTGATTCCAGGTTTGTGTTGTGCGGTACTAATCATAATTTATTAGCACCTCCTACAATTACTTCATTGCCAGCTATGAACAGAAGATTCTTTCTAGATTTAGATATTGTGGCGTGTGATAAATACAAGGATCCACAGGGAAAGCTAAATGTGGCTGCTGCCTTTCAACCTTGTGATGTAAATACAAAAATTGGAAATGCTCGCTGCTGTCCCTTTATCTGTGGTAAAGCTGTCATTTTTAGAGATCGTAATAATTGTCAGACTTACACTCTGGCACAAGTGTATAATCAAATACTTACTGAGGACAAAAGACGTAGGCAAGTAGTAGATGTTATGGCAGCAATTTTTCAGGGACCCATTACTCTTGAAGGACCTCCACCTGCAGCAATAAATGATTTATTGAAATCAGTTAGAACTCCAGAAGTCATTAAGTACTGTGAGGACAATAAATGGATAGTTCCAGCTGAGTGTAAGGTTGAAAGAGATCT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| 102,434
|
PP125278.1
|
Rhinovirus B
|
Goya,S., Sereewit,J., Greninger,A.L.
|
University of Washington, Department Laboratory Medicine and Pathology
|
USA
|
2024-01-24
|
RV-B6/USA/JJ34R9/2021
|
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,183
|
GenBank
| null |
USA: WA
|
USA
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2021-05-13
| null |
PRJNA1066815
|
Rhinovirus B isolate RV-B6/USA/JJ34R9/2021, complete genome
|
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| 9,508
|
PP125279.1
|
Rhinovirus B
|
Goya,S., Sereewit,J., Greninger,A.L.
|
University of Washington, Department Laboratory Medicine and Pathology
|
USA
|
2024-01-24
|
RV-B6/USA/MS88DE/2021
|
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,156
|
GenBank
| null |
USA: WA
|
USA
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2021-06-07
| null |
PRJNA1066815
|
Rhinovirus B isolate RV-B6/USA/MS88DE/2021, complete genome
|
TACTCTGGTATTATGTACCTTTGTACGCCTGTTCTTCCCATTGTACCCTCCCTAAATTTCCAACCCAAGTAACGTTAGAAGTTTCACATAAAAGTACAATAGGAAGCACCACATCCAGTGGTGTTTTGTACAAGCACTTCTGTCTCCCCGGAGCGAGGTATAGGCTGTACCCACTGCCAAAAGCCTTTAACCGTTACCCGCCAACCAACTACGTAAAAGCTAGTAACATCTTGTTTGTAACTTGGCGTTCGATCAGGTGGATTCCCCCTCCACTAGTTTGGTCGATGAGGCTAGGAGTTCCCCACGGGCAACCGTGTCCTAGCCTGCGTGGCGGCCAACCCAGCACTTGCTGGGACGCCCTTTTATAGACATGGTGTGAAGACTCGCATGTGCTTGGTTGTGACTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCCGGAGCCTTGTGTTGCAAACCAGCAACATTAAGGTCGTAATGAGCAATTCTGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCAATTTTTCTTATTATTGTCTTATGGTCACAGCATATTTGATAAATATACTGTGATCATGGGCGCACAAGTTTCAACACAGAAGAGTGGTTCCCACGAGAATCAGAATATCTTGACTAACGGATCAAATCAAACCTTTACAGTCATAAATTACTATAAAGATGCAGCTAGCTCATCATCAGCAGGACAGTCTTTCTCAATGGACCCATCAAAATTCACAGAACCAGTCAAAGATCTAATGCTGAAAGGCGCTCCAGCATTGAATTCGCCAAATGTTGAAGCGTGTGGTTATAGTGACAGGGTCCAACAAATTACTTTAGGTAATTCCACTATAACAACCCAGGAAGCAGCTAACGCAGTTGTATGTTATGCTGAGTGGCCTGAGTACTTACCAGACAATGATGCTAGTGATGTGAATAAGACTTCCAAACCTGACACATCTGTATGTAGATTTTACACATTGGAAAGCAAAGTTTGGCAAAATAGCTCAAAAGGCTGGTGTTGGAAACTACCAGACGCTCTCAAAGACATGGGGGTGTTTGGGCAAAACATGTTCTTCCACTCACTTGGTAGATCTGGCTACACTATACATGTGCAGTGTAATGCAACCAAATTCCATAGTGGCTGTCTTCTTGTTGTTGTCATTCCAGAACATCAATTAGCATCTCATAAAGGGGGAAATGTATCAGTGAAGTATAAATACACACACCCAGGAGAAAGTGGCATAGATTTGAGCACACAGTTAGATGAGGATGGGCCAGTAAAAGACCCTGTCTATAGCATGAATGGTACTCTGTTAGGAAATTTGCTTATTTTCCCTCATCAATTCATTAATCTCAGAACAAACAATACAGCTACAATAGTTGTACCATACATTAATTCAGTACCAATAGACTCAATGACACGTCACAACAACGTGTCACTTCTAGTGGTTCCCATTGCACCTCTAGTGGCTCCAACTGGATCACCACAAACACTTCCAGTAACAGTGACCATAGCCCCCATGTGCACAGAATTTACAGGCATTAGATCAAAAACTATTGTTCCACAGGGATTACCGACTACAACCCTACCAGGTTCAGGGCAGTTTCTTACTACTGATGATAGGCAATCACCCAGTGCATTACCCAATTACGAACCAACTCCCAGAATCCACATCCCAGGAAAGGTTAGGAATTTACTAGAAATCATACAGGTGGACACACTAATTCCAATGAATAATGTGCACAATAGTGATGAGGTAAACAGTTATCTTATACCCCTGACAGCCAATAGACAGAATGATCAGATATTTGGGACAAGGTTGTTTATTGGTGATGGTGTGTTTAAAACAACTTTGCTTGGTGAAATTGCACAGTACTACACACACTGGTCTGGTTCCCTCAGGATCTCTCTAATGTACACTGGTCCAGCTCTGTCCAGTGCTAAACTCATTTTGGCATACACACCCCCTGGTGCACAAGGACCTACCAACAGAAAGGATGCAATGCTCGGAACACATGTTGTATGGGATATTGGGTTACAATCCACTATTATCATGACAATACCATGGACATCAGGAGTGCAATTCAGATACACTGATCCGGACACTTACACTAGTGCTGGTTATCTATCTTGTTGGTATCAGACATCACTTATACTACCACCCAATACCACTGGACAAGTTCACCTGTTATCCTTTATCAGTGCATGTCCAGATTTTAAATTAAGGTTGATGAAAGATACCCAGACCATTTCACAAACTGATGCCCTGACAGAAGGATTGGGTGATGAATTGGAAGAAGTTATTGTCGAGAAAACGAAACAGACATTAGCTTCAATATCATCAGGACCAAAACACACTCAGAGTGTCCCAACATTAACAGCCAATGAAACAGGTGCTACTATGCCAACCAACCCTTCAGATAATGTGGAAACCAGAACAACATACATGCATTTTAATGGATCTGAAACAGATGTTGAAAGTTTCTTAGGACGTGCTGCTTGTGTGCACATAGTTGAGATAGAAAACAAAAATCCAGCAGGTATTGAAAATCAGAAAGAACAAAAATTGTTTAACGACTGGAAGATCAATTTATCCAGTCTGGTTCAACTCAGAAAGAAACTAGAACTTTTCACATATGTTAGGTTTGATTCTGAATACACCATTTTGGCCACAGCCTCACAACCCACTGAATCTAGTTATGCAAGTAATTTGGTAGTTCAAGCAATGTATGTGCCTCCTGGAGCACCAAACCCAGAAAAATGGGATGATTTCACATGGCAAAGTGCCTCTAACCCAAGTGTGTTTTTCAAAGTGGGTGACACATCTAGGTTTAGTGTGCCTTTTGTAGGCATTGCTTCAGCATATAACTGTTTTTATGATGGTTACTCACATGATGACAAAGATACACCATATGGGATATCAGTTCTCAATCATATGGGTAGCATAGCCTTTAGAGTAGTTAATGAACATGATGCACACAAAACACTAGTAAAAATTAGGGTTTATCATAGAGCAAAGCACGTTGAAGCTTGGATACCCAGAGCCCCTAGAGCACTACCATATGAGACAATAGGACGCACAAACTACCCTAAAAAGAGTGAAATTGTTCCAGTGATTAAGAAGAGAGACACCATAACAACTTATGGACTTGGATCCAGGTATGGTGGTGTCTTTACAAGTAATGTCAAGATCATGAATTACCACTTAATGACCCCAGAAGACCACCTAAATTTGATTACACCTTATGTTAATAGAGATTTAGCAGTTGTGTTCACTGGAGCACACGGTGCAGAAACTATACCACATTGCAGCTGCACCTCAGGAGTGTACTACTCTAGATACTACAGAAAATTTTACCCAGTAATATGTGAAAAACCCACTACCATATGGATAGAAGGCAGCTCTTATTACCCAAGTAGATACCAAACAGGTGTCATGAAAGGTGTCGGACCTGCTGAACCAGGTGATTGTGGTGGTATCTTGAGGTGTGTGCATGGCCCAATAGGTTTGTTAACAGCAGGAGGGAGTGGGTATGTTTGTTTTGCAGATATTAGACAGTTGGATTGTATTGCAGAAGAACAGGGTCTAAATGACTATATCACCAGTTTAGGAAGGGCATTTGGGGTCGGTTTTACTGATCAGATATCAGCTAAAGTAACAGAACTGCAGGATGTGGCCAAAGATTTTCTAACTACAAAAGTGTTGTCCAAAGTAGTTAAGATGATTTCAGCTCTTGTAATTATTTGTAGAAACCATGATGATTTAGTTACTGTTACAGCAACACTAGCACTCTTGGGTTGTGATGGCTCTCCGTGGAGGTTTTTAAAGATGTACATATCTAAACACTTCCAGGTACCGTACATTGAAAGACAAGCCAACGATGGTTGGTTCAGGAAGTTCAATGATGCTTGCAATGCAGCGAAGGGCCTAGAATGGATTGCTAACAAAATCTCTAAATTAATTGAATGGATTAAGAACAAAATTCTGCCACAAGCAAAAGAGAAACTTGAGTATTGCAGCAAATTAAAACAATTGGATATTCTAGAAAGACAAATAACCACAATGCACGTATCAAACCCTTCCCAGGAAAAGAGGGAGCAGTTGTTTAACAATGTGCTGTGGTTGGAGCAAATGTCACAAAAGTTTGCCCCACTATACGCAGCTGAATCAAAAAGAATCAAAGACCTCAAGAACAAAATCATGAATTACATGCAATTTAAAAACAAGCAGAGGACTGAACCTGTTTGTGTGTTAATACACGGCACACCTGGCTCTGGAAAATCCCTAACAACCTCAATTGTAGGCCGTGCACTAGCAGAATATTTCAACTCATCAGTTTATTCTTTACCACCTGACCCCAAACACTTTGATGGTTACCAACAACAGGAGGTTGTCATAATGGACGACTTAAATCAGAACCCAGATGGTCAAGATATCAGCATGTTTTGTCAAATGGTTTCATCAGTTGATTTCATACCTCCAATGGCCAATCTAGATAATAAAGGAATGCTCTTCACCAGCAACTTTGTTTTGGCCTCAACAAACTCTAACACCTTGAGTCCCCCAACAATTCTTAACCCAGAGGCTCTAGCCAGAAGATTTGGATTTGACTTAGACATTTGTTTGCACAGTACTTATACTAAAAATGGAAAGCTTAACGCAACAATGTCAACAAGTTTGTGCAAAGATTGCCATCAACCAGCAAACTTCAAAAAGTGCTGCCCACTGGTTTGTGGTAAAGCAATCAGTTTAGTAGATAGAACCACTAACATTAGATACAGTGTGGACCAACTTGTCACAGCTATAATTAATGACTATAAAAACAAGATGAAAATAACAGATTCATTGGAGGTGTTGTTTCAGGGTCCAGTATACAAAGATCTAGAGATTGATATTTGTAACACACCTCCTCCAGAATGCATAAATGACCTACTGAAATCAGTTGATTCAGAAGAAGTCAGGGAGTATTGCAAGAAGAAGAAGTGGATTATA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| 9,509
|
LC769226.1
|
Rhinovirus B
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
HRV_B6_Fukushima_OR636_2022
|
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,268
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2022
| null | null |
Rhinovirus B HRV_B6_Fukushima_OR636_2022 DNA, nearly complete genome
|
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| 15,520
|
OQ533275.1
|
Rhinovirus B
|
Guo,L., Liang,Y., Liu,K., Wang,M., Gao,Y., Zhou,J., Xiao,Y.
|
Yunnan Institute of Pediatrics, Kunming Children's Hospital
|
China
|
2023-04-04
|
HRVB222/China/Kunming/2023/LLZX
|
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,178
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2023-02-22
| null | null |
Rhinovirus B isolate HRVB222/China/Kunming/2023/LLZX, complete genome
|
CGGATGGGTATCCCACCATCCGCCCCACAGGGTGTAGTGCTCTGGTATTTTGTACCTTTGCACGCCTGTTTTCCCATTGTACCCCTCCTTAAATTCCTCCCCAAGTAACGTTAGAAGTTTAAGGAAACCAATGTACAATAGGAAGCATCACATCCAGTGGTGTAATGTACAAGCACTTCTGTTTCCCCGGAGCGAGGTATAAGTGGTACCCACCGCTGAAAGCCTTTAACCGTTAACCGCCAATCAACTACGTAATGGCTAGTATCATCATGCTTGTAATCTGGCGTTCGATCAGGTGGTTCCCCCCACTAGTTTGGTCGATGAGGCTAGGAACTCCCCACGGGTGACCGTGTCCTAGCCTGCGTGGCGGCCAACCCAGCTCTTGCTGGGACGCCTTTTTATAGACATGGTGTGAAGACTTGCATGTGCTTGATTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCCGGAGCCTTGCAGCATAATCCAATGTTGTTGAGGTCGTAATGAGTAATTCTGGGACGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATTCTTTATATTGTCTTATGGTCACAGCATATATAGTATATATACTGTGATCATGGGCGCACAGGTGTCAACACAGAAGAGCGGTTCACACGAAAACCAAAATATCCTTACCAATGGATCAAATCAAACTTTCACAGTCATAAATTATTATAAAGATGCGGCCAGCTCGTCATCAGCTGGTCAATCACTCTCAATGGATCCATCAAAATTCACTGAACCGGTTAAGGACATAATGCTCAAGGGTGCACCAGCTCTAAATTCTCCAAACATTGAAGCATGTGGTTATAGTGACAGAGTTGAACAAATAACCATTGGCAATTCAACGATCACAACTCAAGAAGCAGCCAATGCAGTAGTGGCCTATGCTGAATGGCCTAGCTTTTTAAAAGATGATGATGCTAGTGATGTGAACAAGCCTACTAGACCAGACACATCTGCTTGCAGATTTTACACACTTGCTAGCAAGACATGGAGTCGTGATTCTAAAGGCTGGTGTTGGAAATTGCCAGATGCTCTCAAAGACATGGGAATATTTGGACAAAACATGTTTTATCATTCTCAAGGCAGAACTGGATATACTATCCATGTGCAATGCAACGCTACAAAATTTCACAGTGGAACTTTACTGGTTGTAACCATTCCAGAACATCAATTAGCATCAGCAGAGGGTGGAAATGTCTCAGTTTTCTATGATCAAACACACCCAGGAGAAAGGGGGATTGATCTGGGAACAGTTATTGAAAAGGGACCAATGACTGACCCAATATATAACATGGATGGAACACTACTTGGTAATGCTCTCATCTTTCCTCATCAGTTCATTAATCTGAGAACCAATAATACAGCTACAATAGTAGTCCCATACATAAACTCAGTCCCAATGGATTCTATGACCAGACACAATAATTTGTCACTTCTTGTAATACCAGTTGTACCAATTACTGCTAACACCGGGTCACCACCCAGTATACCTGTCACTGTAACAATAGCACCAATGAATCTTGAGTTGTCAGGAATTAGATCAAAAACAGTGGTGAAAGAACAAGGCCTTCCTGCAACACTAACGCCTGGTTCTGAACAGTTCTTGACCACAGATGACAGACAATCTCCTTCAGCTCTACCAAATTATGAACCAACTCCACTCATACACATCCCCGGTAGGGTTACCAATTTATTAGAGTTGATACAGGTTGACACAATGATTCCAATTAACAATGTGACAGATTTGGACACAATAGAAAAATACAGAATACCACTAATGCAGAACTTACAAGAACAGCAAGTTTTTGGTTTCTCCCTGTTTTTAGGAGGAGATGTTTTAAAGACAACATTACTAGGTGAAATAGCACAGTATTACACTCACTGGGCAGGTTCAATTAGAATATCATTCATGTACACGGGTCCAGCTTTGTCTAGTGCAAAACTGTTACTTGCATACACACCACCAGGAGCACCAGGGCCTACAAATAGGAAAGATGCAATGTTAGGTACCCATATAATTTGGGATATTGGTTTGCAGTCAACCATAGTGATGAACATACCCTGGACTGCCGGATCCCAGTTTAGATATACAGACCCAGACACCTATACACACCCAGGCTTTATATCATGTTGGTATCAAACCTCACTAGTGCTACCACCAGATACAAATCAGAAGGTGTTCATAATTGGTTTCATTAGTGCATGCCCAGATTTCAAACTTAGATTACTCAAGGACACATCATCAATTTCACAAACTGAAGCACTAACTGAGGGATTGGGAGAGGAGCTTGAAGAAGTGATAGTCGACAAAGCGAAACAGACTATTGCTTCCGCATCGAGTAATTCCAAACACACTCAGAAGGTCCCGACACTATCAGCAAGTGAGACGGGGGCAACTCTTCCTACAGTTCCATCTGACAATGTTGAGACCAGAACCACATACATGCACTATGATGGTACAGAAACAAGTTTAGAAAGCTTCTTAGGCAGGGCTGCATGTGTACATGTCACAACCATAGAAAACAAGCTTCCCACAACAGGCACAACTCATAAAGAACAGAAATTGTATAATGACTGGAAAATAAATTTATCAAGCCTAGTACAGTTAAGGAGAAAGTTGGACATGTTCACCTATGTCAGATTTGATTCAGAGTACACTATTATTGCCACATCCTCACAGCCTCAAGCAGCACAATTTTCAAACACATTAACAGTACAAGCAATGTTCATACCTCCAGGAGCACCAAACCCGATAGAATGGGATGATTACACCTGGCAGAGTGCTTCAAACCCCAGCGTCTTCTTTAATGTTGGTAAGTCAGCACGCTTCAGTGTCCCCTATTTAGGTATTGCTTCAGCCTATAACAACTTTTATGATGGTTATTCACATGATAGCAAGACCACTGTTTATGGTATAAATGTGTTAAATCATATGGGTAGTATAGCATTTAGAATAGTCAATGAAAATGATGTTCATCTCACCAAAGTCAGAATTAGAGTTTATCACCGTGCCAAACATGTCTTGGCATGGGTTCCCAGACCCCCCAGAGCAAAACCATACCTTTCAATAGGTAGAACCAATTATGACAAAACAGGAAACATAATCCCAAAAAGAAGTAACATCTCAACTTATGGACTTGGTCCAAGATTTGGTGGCATATGCACAGGGAATATAAAAATAATGAACTATCATCTAATGACTCATGAAGACACACTAAATTTGCAGACTTCACTCCCAGAGAGAGATTTAGCAGTAATTAATATAAATGCTCATGGCTCAGAAACCGTCCCTCAATGCAACTGCACAGTTGGTGTTTATTACTCCAGATATTATAACAAGCACTACCCAGTGGTCTGTGAGAAGCCAACATGTGTGTGGATTGAAGGTAATAACTATTACCCTAGTAGATACCAACAAGGAGTCATGAAAGGAGTGGGTCCAGCTGAACCAGGGGATTGTGGTGGTATACTTAGGTGTATACACGGACCAATTGGCATTCTAACAGCTGGTGGTGGTGGCTATGTTTGTTTTGCTGACATCAGGGGCTTGGACATGTTCCAAGCAGAATACCAGGGAATATCAGATTACATATTAAACCTAGGAAAGGCATTTGGTACTGGCTTTACAGATCACATCAGTGAGAAGGTTAGTGAACTCCAAAACATCACCATGGGATACTTAAATACAAAGGTTCTCTCTAAAGTAATCAAAATTGTCTCTGCTTTAGTGATTATATGTAGAAACCATGAGGACTTAGTTACAGTTACTGCAACCTTAGCATTGTTAGGGTGTGATGGTTCACCTTGGAGATTCCTTAAAATGTATATCAGTAAACACTTTCACCTGCCCTACATTGAAAGACAATCAAATGATTTATGGTTTAAGAAGTTCAATGATATGTGTAATGCAGCTAAGGGATTGGAATGGATAGCAAACAAAATATCAAAATTAATAGAGTGGATTAAAAATAAAATTCTACCACAAGCCAGAGACAAGTTGGACTTCTGTAAAAGACTCAAACAGTTAGACATTTTAGAGAGGCAGATTGACACCTTGCACATGAACCACACCAACGAAAATGATAGGGAAACATTATTCAATAATGTGTTGTGGTTGGAACAAATGTCTCAGAAGTTTGCACCGCTATACGCTCTAGAAGCTAAAAGAATTAAATCACTGAAAAATAAGATTACCAATTTCATACAGTTTCGTTCAAAACACAGGACGGAACCAGTGTGTGTGTTGATTCATGGTACACCAGGGTCAGGCAAATCTCTAGCTACCTCTTTGATTGGTAGATCTATTGCTGACATACATAAATCTTCAGTTTATTCCCTCCCACCTGATCCTAAACACTTTGATGGTTACCAACAACAAGCAGTAGTTATTTTGGATGATCTAAATCAGAATCCCAATGGTGAGGATATAAGTACTTTCTGTCAAATGGTGTCATCAGTTGATTTCATTCCACCAATGGCAAACTTAGATAATAAAGGTATGTTGTTCACAAGCAGCTTTGTACTAGCTTCCACAAATTCACAGACCCTTAACCCTCCAACTGTATTAAACCCAGAGGCATTGGCACGTAGGTTTGGGTTTGATTTGGACATGTGCTTACATTCATCATTTACAAAATCAGGCAAGTTAAATGCAGCTATGGCATGTGAATTGTGCAAAGATTGTCATAAACCAACAAATTTTAAAAAGTGCTGTCCGTTGATTTGTGGAAAAGCCCTCAGTTTAGTAGATAGACACACTAATGTTAGGTATAGTATTGACCAGCTAGTTACAGCTATACTACAAGAGCATAACAACAAGACAAAAATTACCAACTCTCTTGAAGTCCTCTTTCAAGGTCCAGTATACAAGGACATGACTATTGATGTCTATGATAAACCTCCACCTGATTGTATAGTGGACTTACTCAAATCAGTTGATAGTGAAGAAGTGAGA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| 16,939
|
MZ667416.2
|
Rhinovirus B
|
Makhsous,N., Goya,S., Avendano,C., Kuypers,J., Jerome,K., Boeckh,M., Greninger,A., Waghmare,A.
|
University of Washington, Virology
|
USA
|
2021-09-04
|
HRV-B06/NW4/2008
|
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,199
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2008-01-10
| null | null |
Rhinovirus B strain NW4, complete genome
|
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| 38,253
|
MN212904.1
|
Rhinovirus B
|
Chamings,A., Liew,K.C., Reid,E., Athan,E., Raditsis,A., Vuillermin,P., Yoga,Y., Caly,L., Druce,J., Alexandersen,S., Ried,E.
|
Deakin University, Geelong Centre for Emerging Infectious Diseases, School of Medicine
|
Australia
|
2019-10-12
| null |
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,221
|
GenBank
| 1
|
Australia
|
Australia
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2019-06-29
| null | null |
Rhinovirus B strain RVB_G001-19, complete genome
|
ATGGGTTTCCCACCATCCGACCCACTGGGTGTAGTGCTCTGGTATTTTGTACCCTTGCACGCCTGTTTCCCATTTGTACCCTTCCTTAATTTCCTACCCCTGTAACATTAGAAGTTTTGGAATTTTACGGTACAATAGGAAGCGCCACATCCAGTGGTGTTGTGTACAAGCACTTCTGTTTACCCGGAGCGAGGTATAGGTTGTACCCACGGCCAAAAACCTTCAACCGTTATCCGCCAACCAACTACGTAACGGCTAGTATCATCTTGTATTTGACTTGGCGTTCGATCAGGTGGTATCCCCCACTAGTCTGGTCGATGAGGCTAGGAATTCCCCACGGGCGACCGTGTCCTAGCCTGCGTGGCGGCCAGCCCAGCTTTAGCTGGGACGCCTTTTCAAAGACATGGTGTGAAGACCTGCATGTGCTTGGTTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCCGGAGCCCAGTGACATAATCCAATGTTATTTGGGTCGTAATGAGTAATTCCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATTCTTTATATTGTCTTATGGTCACAGCATATATAGTATATATACTGTGATCATGGGCGCACAAGTGTCAACACAAAAGAGTGGTTCACATGAGAATCAAAACATCCTTACTAATGGATCAAATCAAACTTTTACTGTTATAAACTATTATAAGGACGCAGCCAGCTCATCATCTGCAGGCCAATCCTTGTCAATGGACCCAAGCAAATTTACCGAACCAGTCAAAGATTTGATGCTAAAGGGTGCACCGGCTCTGAATTCACCCAATATAGAAGCCTGTGGTTATAGTGATAGGGTAGAACAAATCACCTTAGGAAACTCTACAATAACAACTCAAGAGGCAGCAAATTCAATTGTAGCATATGGGGAATGGCCATCATTTCTCGATGACTCAGATGCAAGTGATGTGAACAAAACCACAAAGCCTGATACTTCAGCATGTAGATTCTATACCTTGGATAGTAAAACTTGGACCAATCAGTCAAAAGGGTGGTGTTGGAAGCTTCCTGATGCTTTGAAAGATATGGGAATATTTGGACAAAACATGTTTTTCCATTCACAAGGCAGAACAGGTTACACCATACATGTACAGTGTAATGCAACAAAATTCCACAGTGGTTGTTTATTAGTTGTGGTGATACCAGAGCATCAATTGGCATCTATACAGGGAGGAAGTGTATCAGTGTATTATGAGAAAACCCATCCAGGAGAAAAGGGAATAGATCTTAGTGAAACAGATAGTGATGGTCCAATGCTAGATCCATTATACATGATGGATGGAACTCTGATTGGAAATAGCTTAATTTTTCCTCATCAATTTATAAACTTGAGAACAAACAACACTGCAACAATTGTTGTCCCTTACATCAATTCAGTACCCATGGATTCAATGACCAGACACAATAATCTGTCTCTTATGGTGATTCCAATTGTAAACATCACTGCAACAAGTGGTGCAGCTCCATCTATACCTATTACAGTGACAATTGCACCCATGTACTTAGAATTGTCTGGTATTAGATCAAGAACAGTAATACAAGGGCTTCCCACTGTTTTGACACCTGGTTCAGAACAATTTCTTACCACAGATGACAGACAATCCCCTAGTGCAATGCCCAATTATGAGCCAACCCCTCTGATCCATATTCCAGGAGAAGTAAAGAACCTGTTAGAAATTGCCCAAGTGGACACGCTGGTACCCATAAACAATGCTCAAGGGGTTATGGGATTGGAAACATATAGGATCCCTCTTTATCAAAGCAGACAAGGTCAACAAGTCTTTGGTTTCAGGCTCTACTTAGGAGATGGTGTTTTGAAGACAACAATGCTAGGAGAAATTTGTCAGTACTTCACCCATTGGGCTGGTTCATTACGTCTGTCATTCATGTACACAGGACCAGCACTTTCGAGTGCAAAGTTACTCATTGCCTACACACCACCTGGGACAGCTGGTCCCACTGACCGCAAAGCAGCTATGTTGGGCACACATGTAGTTTGGGACATTGGATTACAATCAACAGTAGTTCTCAACATCCCCTGGACTTCAGGAGTTCAATTCAGATACACAGACCCAGATACATACACCAGCGCAGGATTTGTTTCATGCTGGTATCAAACTTCATTGGTATTGCCCCCTCAAGTGGAACAAACAGTGTATATGCTTGGCTTTGTTAGCGCATGTCCAGATTTTAAATTAAGACTCATGAAAGATACACAATCTATACAACAAGAAACAGCATTGACAGAAGGACTAGGTGAAGATCTAATGGAAGTCATTGTCGATAAAACTCACCAGACATTGGCTTCTGTGAAGAGTGATTCAAAACACACTCAGAAAGTACCTGCACTCACAGCAAATGAGACTGGAGCCACACTACCAACAACACCCTCAGACAATGTGGAAACCAGAACAACCTTGATGCACTATAGAGGATCAGAGACAACTTTGGAAAACTTCCTGGGAAGGGCTGCATGCGTGCATGTGGTGGAAATTAAGAATAAACAGGCCACTGATGATACTAATCATAAAGACCAGTTATTGTTCAATGATTGGAAAATTAGTTTATCTAGTTTAGTTCAACTTAGAAGAAAATTAGAACTGTTCACTTATGTTAGATTTGATTCAGAGTATACTATAATAGCTACCAGTTCCCAACCAGATGATGCAAATTATTCAAGTAATCTTACTGTCCAAGCAATGTTTATACCACCAGGTGCACCGAACCCAACCAAATGGGATGATTATACATGGCAAAGTGCAACTAACCCCAGTGTGTTCTTTAATGTAGGAAAATCTGCCAGATTCAGTGTTCCCTATTTAGGAATTGCTTCAGCATACAATTGTTTTTATGATGGTTATTCTCATGATAACAAAACAACACCTTATGGAATCAATGTGTTGAATCACATGGGTTCCATAGCATTCAGAGTAGTTAATGAGCATGACAAGCACACAACACATGTTAAGATTCGGGTTTACCACAGAGCAAAACATATTAGAGCTTGGATACCCAGAGCACCTAGGGCTTTACAGTATTTGTATATTGGAAGAACAAATTACAGTCCAAACCCTAATAGTCCTATTAAACCCAGAGAAACAATTAATACCTATGGGTTAGGGCCCAGATTTGGGGGGATTCACACTGGGAGCATCAAAATAATGAATTATCACCTGATGACTCATGAGGATAGTTTGAGGCTTTTGACACCCATACCTGAGAGAGATCTAGCAATAGTTGATGCAAGAGCCCATGGTTCAGAAACGGTGCCACAATGCAACTGCACATCTGGTGTCTACTATTCCAGGTACTACAATAAATACTACCCAGTAGTATGTGAAAAACCAACCTGTGTATGGATAGAAGGAAACAACTATTATCCAAGTAGATATCAACAGGGAGTCATGAAGGGTGTTGGCCCAGCAGAGCCAGGTGATTGTGGCGGCATCTTGAGATGTGTTCATGGTCCCATAGGCCTCCTCACTGCAGGGGGTAGTGGGTTTGTGTGCTTTGCTGACATTAGAATGCTGGAATTATTCAAAGCTGAGTATCAGGGTATATCAGATTACATTGTTAATCTTGGCAAAGCCTTTGGAACAGGATTTACTGATCATATCAGTGAAAAAGTGGTTGAACTTCAGAATATCTCAATGGGCTACCTAAATACTAAAGTCTTGTCTAAAATAATTAAAATAGTTTCTGCTTTGGTCATCATTTGTAGGAATCATGATGATTTAATTACTGTCACAGCCACACTAGCATTACTTGGTTGTGACGGATCTCCATGGAGGTATCTCAAAATGTATATCAGTAAACACTTTTGCTTACCCTACATAGAAAGACAATCAAATGATTTGTGGTTCAAGAAATTCAATGACATGTGTAATGCTGCTAAAGGCCTTGAGTGGATTGCCAACAAAATATCCAAGTTGATTGATTGGGTCAAACAAAAAATTTTACCTCAGGCAAGAGACAAGCTAGATTTTTGTAAAAGACTAAAACAGTTGGATATTCTAGAAAGGCAGATTGATACCCTGCATGTGAATCAGGTCAATGATAATGACAGAGAAACATTATTTAACAATGTTTTGTGGCTAGAACAGATGTCACAAAAGTTTGCCCCATTGTATGCAGTTGAAGCAAAGAGGATAAAAAGTTTAAAGAACAAAATCACAAATTTTATACAATTCAGATCAAAACACCGTACAGAACCAGTATGTGTCCTCATACATGGAACACCAGGATCAGGAAAGTCATTAACTACTTCATTGATTGGCAGGGCTATTGCTGATAATTACAACTCATCTGTCTACTCATTGCCACCAGACCCTAAACATTTTGATGGATATCAGCAACAAGCAGTCGTCATACTTGATGACCTAAATCAAAACCCTAATGGTGAAGATATTAGCACATTCTGTCAAATGGTTTCATCAGTTGACTTCATCCCACCCATGGCAAACTTAGACAATAAAGGAATGCTATTCACAAGCAGTTTTGTTCTGGCTTCCACAAACTCCCAGACGTTAAACCCTCCAACTATTCTAAATCCAGAGGCATTGGCACGTAGATTTGGTTTTGATTTAGATATGTGTCTCCACACCACATTCACCAGATCTGGAAAATTGAATGCCGCATTAGCATCAGAATTGTGTAAGGACTGTCACAAGCCAGCTAATTTCAAAAAGTGTTGTCCCCTTATTTGTGGAAAAGCCCTGAGTTTAGTTGATAGACACACAAATGTTAGGTACAGTATAGATCAATTGGTTACAGCAATAATCAATGAACATGTGAATAAGACTAAAATATCAAATTCATTGGAGGTTCTTTTCCAAGGACCTACCTACAAAGACCTAAATATTAATGTCACAACAACACCGCCACCAGAATGCATTGTGGATTTACTCAAATCAGTAGATAATGAAGAGGTTAGGCAATAC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| 58,670
|
MN306037.1
|
Rhinovirus B
|
Lin,M.J., Tait,A., Greninger,A.L.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
|
USA
|
2019-08-25
| null |
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,189
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null |
PRJNA338014
|
Rhinovirus B strain SC0739, complete genome
|
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| 60,178
|
LC495296.1
|
Rhinovirus B
|
Takeuchi,S., Kawada,J., Horiba,K., Okuno,Y., Okumura,T., Suzuki,T., Torii,Y., Kawabe,S., Wada,S., Ikeyama,T., Ito,Y.
|
Pediatrics; 65 Tsurumai-cho, Showa-ku, Nagoya, Aichi 466-8550
|
Japan
|
2019-08-15
|
take1
|
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,259
|
GenBank
| 1
|
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2017-06-09
| null | null |
Rhinovirus B take1 genomic RNA, complete genome
|
TACTAATACAGAGTACTACACCCAGTGGGTCGGATGGGTATCCCACCATCCGACCCACTGGGTGTAGTACTCTGGTATTATGTACCTTTGTACGCCTGTTCTTCCCATTGTACCCTCCCTAAATTTCCAACCCAAGTAACGTTAGAAGTTCCACATAACAGTACAATAGGAAGCACCACATCCAGTGGTGTTTTGTACAAGCACTTCTGTCTCCCCGGAGCGAGGTATAGGCTGTACCCACTGCCAAAAGCCTTTAACCGTTATCCGCCAACCAACTACGTAAAAGCTAGTAACATCTTGTTTGTAACTTGGCGTTCGATCAGGTGGATTCCCCCTCCATTAGTTTGGTCGATGAGGCTAGGAATTCCCCACGGGCGACCGTGTCCTAGCCTGCGTGGCGGCCAACCCAGCATTTGCTGGGACGCCCTTTTATAGACATGGTGTGAAGACTCGCATGTGCTTGGTTGTGACTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCCGGAGCCTTGTGTTGCAAGCCAGCAACATTAAGGTCGTAATGAGTAATTCTGGGACGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCAATTTTTCTTATTATTGTCTTATGGTCACAGCATATTTGACAAATATACTGTGATCATGGGCGCACAAGTTTCAACACAGAAGAGTGGTTCCCACGAGAATCAGAATATCTTGACTAATGGATCAAATCAAACCTTTACAGTCATAAATTACTACAAAGATGCGGCCAGCTCATCATCAGCAGGACAGTCTTTCTCAATGGACCCATCAAAATTCACAGAACCAGTCAAAGATCTAATGCTGAAAGGCGCTCCAGCGTTGAACTCGCCAAATGTTGAAGCATGTGGTTATAGCGACAGAGTCCAACAAATTACTTTAGGTAATTCCACTATAACAACACAGGAAGCGGCTAACGCAGTTGTATGTTATGCTGAGTGGCCTGAGTATTTGCCAGATAGTGATGCTAGTGATGTGAACAAGACTTCCAAACCTGACACATCTGTATGTAGATTTTACACATTGGAAAGCAAAGTGTGGCAAAACAGCTCAAAAGGCTGGTGCTGGAAACTACCAGACGCTCTCAAAGACATGGGGGTGTTTGGGCAAAACATGTTCTTCCACTCACTTGGCAGATCTGGCTACACTATACATGTGCAGTGCAACGCAACCAAATTCCATAGTGGCTGTCTTCTTGTTGTTGTCATTCCAGAACATCAGTTAGCATCTCATAAAGGGGGAAATGTATCAGTGAAGTACAAATACACACACCCAGGAGAAAGTGGCATAGATTTGAGCACACAGTTAGATGAGGACGGACCAGTAAAAGACCCCGTCTATAGTATGAATGGTACTCTGCTAGGAAATTTGCTTATCTTCCCTCACCAATTCATTAATCTCAGAACAAACAATACAGCTACAATAGTTGTACCATATATCAACTCAGTACCAATAGATTCAATGACGCGTCACAACAACGTGTCACTTCTAGTGGTTCCCATTGCACCTCTAGTGGCTCCAACTGGATCACCACAAACACTTCCAGTAACAGTGACCATAGCTCCCATGTGCACAGAATTTACAGGCATTAGATCAAAAACTATTGTTCCACAGGGATTACCGACTACAACCCTACCAGGTTCAGGACAGTTCCTTACTACTGATGATAGGCAATCACCCAGTGCATTACCCAATTACGAGCCAACTCCCAGAATCCACATCCCGGGAAAGGTTAGGAACCTGCTAGAAATCATACAGGTGGACACACTAATTCCAATGAATAATGTGCACAATAGTGATGAGGTAAACAGTTATCTTATACCTCTAACAGCCAATAGACAGAATGATCAGATATTTGGGACAAGGTTGTTTATTGGTGATGGTGTATTTAAAACAACTTTGCTTGGTGAAATTGCACAGTACTACACACACTGGTCTGGTTCCCTCAGGATCTCTCTAATGTATACTGGTCCAGCTCTGTCCAGTGCTAAACTCATTTTGGCATACACACCCCCTGGCGCACAAGGGCCTACCAACAGAAAGGATGCAATGCTTGGAACACATGTTGTATGGGATATCGGGTTGCAATCCACTATTGTTATGACAATACCATGGACATCAGGAGTGCAATTCAGATACACTGATCCAGACACTTACACTAGTGCTGGTTACCTATCTTGTTGGTATCAGACATCACTCATACTACCACCCAATACCACTGGACAAGTTCACCTGTTGTCTTTTATCAGTGCATGTCCGGATTTTAAATTAAGGTTAATGAAAGATACCCAGACCATTTCACAAACTGATGCCCTAACAGAAGGATTGGACGATGAATTGGAAGAAGTTATTGTCGAGAAAACGAAACAGACATTAGCTTCAATATCATCAGGACCAAAACACACTCAGAGTGTCCCTACATTAACAGCCAATGAAACAGGTGCCACTATGCCAACCAACCCTTCAGATAATGTGGAAACCAGAACAACATACATGCATTTTAATGGATCTGAAACAGATGTTGAAAGTTTCTTGGGACGTGCTGCTTGTGTGCACATAGTTGAGATAGAGAACAAGAACCCAGCAGGTATTGAAAATCAGAAAGAACAAAAACTGTTTAATGACTGGAAAATCAATTTATCCAGTCTTGTTCAACTCAGGAAGAAACTAGAACTTTTCACATATGTTAGGTTTGATTCTGAATACACCATTTTGGCCACAGCCTCACAACCCACTGAATCCAGTTATGCAAGTAATTTGGTAGTTCAAGCAATGTATGTGCCTCCTGGAGCACCAAACCCAGAAAAATGGGATGATTTCACATGGCAAAGTGCCTCTAACCCAAGTGTGTTTTTCAAAGTGGGTGACACATCTAGGTTTAGTGTACCTTTTGTAGGCATTGCTTCAGCATACAACTGTTTTTATGATGGTTACTCACATGATGATAAAGACACACCATATGGGATATCAGTTCTCAATCATATGGGTAGCATAGCCTTTAGAGTAGTTAATGAACATGATGCACACAAAACACTAGTAAAAATTAGGGTTTATCATAGAGCAAAGCATGTTGAAGCTTGGATACCCAGAGCTCCCAGAGCACTACCATATGAGACAATAGGACGCACAAACTACCCTAAAAAGAGTGAAATTGTCCCAGTGATTAAGAAGAGAGACACCATAACAACTTATGGACTTGGATCCAGGTATGGCGGTGTCTTTACAAGTAATGTCAAGATCATGAATTACCACTTAATGACCCCAGAAGACCACTTAAATTTGATTACACCTTATGTTAATAGAGATTTAGCAGTTGTGTTCACTGGAGCACATGGTGCAGAAACAATACCACACTGCAGCTGCACCTCAGGAGTGTACTACTCTAGATACTACAGAAAATTTTACCCAGTAATATGTGAAAAACCCACCACCATATGGATAGAAGGTAGCTCTTATTATCCAAGTAGATACCAAACAGGTGTCATGAAAGGTGTCGGACCTGCTGAACCAGGTGATTGTGGTGGTATCTTGAGGTGTGTGCATGGCCCAATAGGTCTGTTAACAGCAGGAGGGAGTGGGTATGTTTGTTTTGCAGATATTAGACAACTAGATTGTATTGCAGAAGAACAGGGTCTAAATGACTATATCACCAACTTAGGAAGGGCATTTGGGGTTGGTTTTACTGATCAGATATCAGCCAAAGTAACAGAACTGCAGGATGTGGCCAAAGATTTTCTAACTACAAAAGTGTTGTCCAAAGTAGTTAAGATGATTTCAGCTCTTGTAATTATTTGTAGAAATCATGATGATTTAGTTACTGTTACAGCAACACTAGCACTCTTGGGTTGTGATGGCTCCCCGTGGAGGTTTTTAAAGATGTACATATCTAAACACTTCCAGGTACCGTACATTGAAAGACAAGCCAACGATGGTTGGTTTAGGAAGTTCAATGATGCTTGTAACGCAGCGAAGGGCCTAGAATGGATTGCTAACAAAATCTCTAAATTAATTGAATGGATTAAAAACAAAATTCTGCCACAAGCAAAAGAGAAACTTGAGTATTGCAGTAAATTAAAACAATTGGATATTCTAGAAAGACAAATAACCACAATGCACGTATCAAACCCTTCCCAGGAAAAGAGGGAGCAATTGTTTAACAATGTGCTGTGGTTGGAACAAATGTCACAAAAGTTCGCCCCATTATACGCAGCTGAATCAAAAAGAATCAAAGACCTCAAAAATAAAATCATGAATTACATGCAATTTAAAAATAAGCAGAGGACTGAACCTGTTTGTGTGTTAATACACGGCACACCTGGCTCCGGGAAATCCCTAACAACCTCAATTGTAGGTCGTGCACTAGCAGAATACTTTAACTCATCAGTCTATTCTTTACCACCTGACCCCAAACACTTTGATGGTTACCAACAACAGGAGGTTGTCATAATGGACGACTTAAACCAGAACCCAGATGGTCAAGATATCAGCATGTTTTGTCAAATGGTTTCATCAGTTGATTTCATACCTCCAATGGCCAATCTAGATAATAAAGGAATGCTCTTCACTAGCAACTTTGTTTTGGCCTCAACAAACTCCAACACTTTAAGTCCCCCAACAATTCTTAACCCAGAGGCTCTAGCCAGAAGATTTGGATTTGACTTAGATATTTGTTTGCATAGTACTTATACTAAAAATGGAAAGCTTAACGCAACAATGTCAACAAGTTTGTGCAAAGATTGCCATCAACCAGCAAACTTTAAAAAGTGCTGCCCACTGGTTTGTGGTAAAGCAATTAGTTTAGTAGATAGAACCACTAACATTAGATACAGTGTAGACCAACTTGTCACAGCTATAATTAATGACTATAAAAACAAGATGAAAATAACAGATTCATTGGAGGTGTTGTTTCAGGGTCCAGTGTACAAAGATCTAGAGATTGATATTTGTAACACACCACCTCCAGAATGCATAAA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| 60,271
|
KF958308.1
|
Rhinovirus B
|
Nakagome,K., Bochkov,Y.A., Ashraf,S., Brockman-Schneider,R.A., Evans,M.D., Pasic,T.R., Gern,J.E.
|
University of Wisconsin-Madison, Pediatrics
|
USA
|
2014-03-04
|
3039
|
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,216
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
1999-10-20
| null | null |
Rhinovirus B isolate 3039, complete genome
|
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| 91,545
|
KF958309.1
|
Rhinovirus B
|
Nakagome,K., Bochkov,Y.A., Ashraf,S., Brockman-Schneider,R.A., Evans,M.D., Pasic,T.R., Gern,J.E.
|
University of Wisconsin-Madison, Pediatrics
|
USA
|
2014-03-04
|
R93
|
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,217
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2007-09-29
| null | null |
Rhinovirus B isolate R93, complete genome
|
TTAAAACAGCGGATGGGTTCTCCCACCATCCGACCCACTGGGTGTAGTACTCTGGTATTATGTACCTTTGTACGCCTGTTTATTCCCAAACCCCCTCCCGTTACATTTCCAACCCCTGTAACGTTAGAAGTTTGGAACTTAACAGTACAATAGGAGGCACCATATCCAATGGTGTAATGTACGAGCACTTCTGTTTCCCCGGAGCGAGGTATAGGTGGTACCCACCGCTGAAAGCCTTTAACCGTTATCCGCCAATCAACTACGTAACAGCTAGTAGCATTTTGTTGTTGACTGGACGTTCGATCAGGTGGTTTACCCCCCCACTAGTTTGGTCGATGAGGCTGGAAATTCCCCACGGGTGACCGTGTTCCAGCCTGCGTGGCGGCCAACCCAGCTCATGCTGGGACGCCCTTTCAATGACATGGTGTGAAGACTCGCATGTGCTTGATTGTGAATCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCCTAACCCCGGAGCCTTGCATCACAATCCAGTGATGTTAGGGTCGTAATGAGTAATTCTGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTCATTTTTCTTTGAATTGTCTTATGGTCACAGCATATAGTAATATATACTGTGATCATGGGCGCTCAAGTCTCAACACAAAAGAGTGGATCCCACGAGAATCAAAATATCCTAACAAATGGGTCAAATCAAACTTTCACAGTCATAAACTACTACAAGGATGCTGCAAGTAGCTCATCAGCTGGTCAATCTCTATCAATGGACCCATCTAAGTTTACTGAACCAGTTAAGGACCTTATGTTAAAGGGTGCACCAGCACTAAATTCACCCAACGTTGAAGCGTGTGGGTATAGTGACAGGGTGCAACAAATCACTCTTGGTAACTCTACCATCACAACACAAGAAGCTGCAAACGCAGTGGTTTGTTATGCTGAGTGGCCTGAATATCTCCCAGATAAAGATGCAAGTGATGTAAACAAAACTTCAAAACCAGACACATCTGTTTGTAGATTTTACACACTGGATAGCAAAATGTGGCAGAAAAATTCAAAAGGGTGGTGTTGGAAACTACCAGATGCTTTGAAAGATATGGGTGTTTTTGGTCAAAACATGTTTTTCCACTCACTGGGTAGATCAGGATACACCATACATGTACAGTGCAATGCAACAAAGTTTCACAGTGGGTGTTTGCTTGTGGTTGTGATACCAGAACATCAGCTAGCATCACATGAAGGTGGCAATGTGTCGGTTAAATATAAACTCACACACCCGGGTGAAGGTGGTATTGATTTGTCAACAAATGTAGAGGCAGATGGACCTGTTAAGGACCCAGTTTATAACATGAATGGTACATTACTAGGTAATTTATTAATATTTCCCCATCAGTTTATTAATTTGAGGACCAATAACACTGCTACATTGGTAGTACCATACATTAATTCAGTGCCAATTGATTCGATGACAAGACACAACAATGTATCACTAATGATCATTCCAATTGCCCCACTTATTGTTCCCACTAACGCATCACCCACTTTACCTATTACAGTCACAATAGCTCCAATGTGTACTGAGTTCACGGGCATAAGGTCTAAAACTGTAGTTCCACAAGGGTTACCAACAACAACTCTACCGGGATCTGGTCAGTTTCTGACCACTGATGATAGACAATCACCCAGTGCATTACCAAATTATGAGCCAACACCAAGAATACACATACCAGGCCAAGTCAAAAACCTATTAGAAATTATTCAAGTAGATACTCTAATCCCAATGAACAATACCCACAATAGGGATGAAGTGAAAAGCTACCTTATACCCCTGCAGCCAAACAGACAAGGAGAGATGGTGTTTGGAACCAAATTGTTCATAGGAGATGGTGTTTTCAAAACCACCCTTCTTGGCGAAATAGTTCAGTACTACACCCATTGGGCAGGATCATTGAGATTTTCTTTAATGTATACAGGTCCCGCCTTGTCTAGTGCAAAGTTAATACTGTCTTACACTCCCCCAGGAGCTAATGGACCAACAACCAGAAAGGAGGCAATGCTTGGAACACATGTGGTGTGGGATATTGGATTACAGTCCACAATAGTTATGACAATACCCTGGACTTCAGGGGTGCAATTCAGGTACACAGATCCAGATACTTACACTAGTGCAGGATTTTTATCATGTTGGTATCAAACATCTCTAATACTTCCCCCAGACACACCCAATGAAGTGTACATGCTCTCCTTTATCAGCGCATGCCCAGACTTTAAACTTAGACTTATGAAAGATACCCAGACTATATCACAGACTGTAGCACTAACAGAAGGTTTAAATGATGAATTAGAAGAAGTCATCGTCGAGAAAACGAAACAGACGTTGGCTTCGGTTTCATCTGGGCCAAAACACACACAAAGTGTCCCCACTCTAACTGCAAATGAAACAGGTGCTACTATGCCAACTTTACCCTCTGATAATGTTGAAACCAGAACAACATACATGCACTTTAATGGGTCTGAGACAGACATTGAATGCTTCCTGGGTCGTGCTGCTTGTGTACATGTGACAGAGATAGAAAACAAAAACCCAACTGGGATAGAAAATCACAAAGTAGGAAAATTGTTCAATGATTGGAAAATTAGTCTCTCTAGTCTTGTGCAACTCAGGAAGAAGTTAGAACTCTTTACCTATGTCAGATTTGATTCAGAATACACAATATTAGCAACTGCTTCACAGCCCGATACAGCCAATTACTCGAGTAACCTAGTGGTCCAAGCTATGTATGTACCTCCTGGTGCACCCAACCCAGTAGAATGGGATGATTACACATGGCAGAGTGCATCCAACCCCAGTGTCTTCTTTAAAGTTGGTGACACTTCCAGATTTAGTGTGCCATATGTAGGCTTAGCATCAGCATATAATTGCTTCTATGATGGTTACTCACATGATGACGCAAATACTCCGTATGGAATATCTGTTCTGAATCATATGGGTAGCATGGCTTTTAGAATAGTTAATGAGCATGACACACATAGGACTTTAGTCAAGATCAGAGTCTACCATCGGGCAAAACACATTGAAGCGTGGATTCCACGTGCTCCCAGGGCCTTACCATACACATCAATTGGACGCACCAATTATCCTAAAAATCCACAACCAGTAATCAAGAAGAGAGAAGGGGACATAAAAACTTATGGACTGGGACCAAGGTTTGGAGGGGTGTATACATCCAATGTGAAGATAATGAATTTCCACTTGATGACACCAGAAGATCATTTGAACCTAGTAACCCCATACCCTAGCAGGGACCTAGCAGTTGTCTCAACAGGAGCACATGGTGCAGAAACTATACCACATTGTAACTGTACATCAGGTGTCTATTACTCTAGTTACTACAGGAAATTTTACCCAGTGATATGTGAAAAACCCACTACCATATGGATTGAAGGTGGGCCATACTACCCCAGTAGATTTCAAGCAGGAGTTATGAAAGGTGTTGGTCCCGCAGAACCAGGTGATTGTGGTGGCATACTCAGGTGCATTCATGGACCAATTGGGTTACTGACAGCAGGTGGCAGTGGTTATGTCTGTTTTGCTGACATAAGGCAATTAGAGTGCATTGCAGAAGAACAAGGAATAAGTGATTACATCACCAGCCTGGGGAGAGCTTTCGGTGTTGGGTTCACCGATCAAATTTCAGCCAAGGTAACAGAGTTGCAGGATGTTGCCAAAGATTTTCTGACAACAAAAGTTTTATCAAAAGTAGTGAAAATGGTGTCAGCATTAGTGATCATCTGCAGAAACTATGAAGATCTTGTCACAGTCACTGCCACTTTGGCTTTGTTAGGTTGTGATGGTTCTCCCTGGAGGTTTCTAAAAATGTATATTTCTAAGCATTTTCAAGTACCCTACATTGAAAGACAGGCAAACGATGGCTGGTTTAGAAAATTCAATGATGCATGTAATGCAGCAAAAGGTTTGGAGTGGATCGCAAACAAGATTTCAAAACTAATTGAATGGGTCAAAAACAAGGTACTTCCACAGGCCAAAGAGAAGTTAGAATTCTGCAGCAAACTGAAACAATTGGACTTGTTGGAAAGACAGATTAACACCATGCATGTTTCAAACCCCACGCAAGAGAAAAGAGAGCAACTGTTCAACAACGTATTATGGTTGGAACAAATGTCTCAAAAGTTTGCACCTCTTTATGCCACTGAAGCAAAAAGAATTAGAGAATTAAAAAACAAAATAGTGAATTACATGCAGTTTAGAAATAAACAAAGGACTGAACCAGTATGTGTGTTGATTCATGGTACCCCAGGTTCAGGAAAATCATTGACTACCTCGATAATCGGGAGAGCAATAGCAGAACAATTTAACTCAGCAGTCTACTCCCTTCCCCCAGATCCAAAACACTTTGATGGTTACCAACAGCAAGAGGTTGTTATCATGGATGACTTGAATCAAAATCCAGATGGACAAGATATAAGCATGTTCTGCCAAATGGTATCATCAGTGGACTTTCTGCCTCCAATGGCTAGTTTAGATAACAAAGGGATGTTGTTCACTAGCAACTTTGTTTTAGCTTCAACTAATTCCAACACATTAAGTCCTCCAACCATCTTAAACCCAGATGCCCTAGCTAGGAGATTTGGTTTTGACCTTGATATCTGTCTACACAGTACATACACTAAGAATGGTAAACTTAATGCTGCAATGGCAACCAGAGTGTGCAAGGATTGTCACCAACCAACAAATTTCAAAAAGTGCTGTCCACTCGTTTGTGGAAAAGCCATTAGTTTAGTGGATAGAGCTACTAATGTTAGGTACAGTATAGACCAATTAGTTACAGCTGTTGTTAATGATTACAAGAATAAAATGCAAATCACTGATTCCCTTGAGATACTATTCCAGGGCCCTGTATACAAAGACCTAGAAATAGATGTGAACAGCACACCACCACCTGAATGTATAAATGACTTGTTAAGATCTGTAG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| 91,546
|
GU568096.2
|
Rhinovirus B
|
Xiang,Z., Gonzalez,R., Xie,Z., Xiao,Y., Liu,J., Chen,L., Liu,C., Zhang,J., Ren,L., Vernet,G., Paranhos-Baccala,G., Shen,K., Jin,Q., Wang,J.
|
Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences, Dr. Christophe Merieux Laboratory, IPB, CAMS-Fondation Merieux
| null |
2010-10-13
|
BCH214
|
Rhinovirus B
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,224
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2007-10
| null | null |
Rhinovirus B isolate BCH214, complete genome
|
TTAAAACAGCGGGTGGGTATCCCACCACCCGACCCACTGGGTGTGGTACACTGGTACTTTGTACCTTTGTATGCCTGTTTGCATCCCTTTTCCCTTCACCTAACATCCTCCCCCAAAGTATATTTTGCGGTAACGTTAGAAGAAGTGAACTCAGTGCAACAGGAAGTATCACCACCAGTGATATAACGCACAAGCAATTCTTGTTCCCCGGAGCTGGATATAGACTGCTAACGTGGTCAAAAGTCCTTAACCGTTATCCGCCAGCTAACTGCGAGAAGACTAGTAACATCATGCACATTTCTAGACGTTCGATCAGGTGAATACCCCATTCACTAGTTTGGTCGATGAGGCTGAGAGTTCCCCACAGGTGACTGTGTCTCAGCCTGCGTGGCGGCCAACCCGACTTATGTCGGGACGCCTATTAATGGACATGGTGTGAAGATCCTATTGCGCTTAGCTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCCGGAGCCTTGTGGTGCAAACCAGCATTTGCAAGGTCGTAATGAGCAATTCTGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTATTCTTATTATTTGTGTTTCATGGTTACAAGCATAGTTTGTAATCATGGGCGCACAGGTATCAACACAAAAGAGTGGTTCACATGAAAATCAAAACATACTCACAAATGGATCAAACCAGACATTTACAGTTATAAATTATTACAAGGATGCAGCTAGTTCATCTTCTGCAGGGCAATCATTTTCAATGGACCCGAGCAAGTTTACTGAACCAGTAAAGGATATCATGTTGAAAGGAGCACCAGCATTAAATTCACCAAACATAGAAGCATGTGGATATAGTGACAGAGTTGAACAAATAACACTAGGGAATTCTACAATCACCACACAGGAGGCAGCAAACTCGATTGTGGCCTATGGAGAGTGGCCATCATTCTTGTCAGATGTTGATGCTAGTGATGTTAACAAAACCACCAAACCAGACACTTCAGCTTGTAGGTTTTACACTTTGGATAGCAAAACATGGAGTCAGAATTCAAAGGGTTGGTGTTGGAAGCTACCAGATGCGCTCAAGGATATGGGCATTTTTGGTCAAAACATGTTCTTTCACTCTCAAGGCAGAACTGGGTACACCATTCATGTTCAATGTAACGCAACCAAATTTCACAGTGGCTGCCTACTGGTCGTAGTGATACCTGAACACCAACTAGCATCAGTAGAAGGTGGTAATGTCTCAGTCTTGTATGATAAAACGCACCCTGGAGAGAAAGGCATAGACCTTAACAAAGAAGATTCAAAAGGTCCAATGAAAGATCCCCTTTACATGATGGATGGTACATTAATTGGAAACAGTCTCATTTTCCCACATCAGTTTATTAATCTGAGAACAAATAATACAGCAACAATTGTGGTTCCTTACATTAATTCAGTGCCCATGGACTCCATGACTAGACATAACAATCTTTCTTTATTGGTCATTCCCATTGTACAAATCACAGCAACAACTGGTACAGCCCCCTCCATACCAGTGACTGTGACTATTGCTCCAATGTTTTTAGAGTTGTCTGGCATACGATCAAAAGCTGTTATACAAGGATTGCCTACAGTTCTGACACCAGGCTCAGAGCAGTTTTTGACTACAGATGATAGACAATCTCCTAGTGCTATGCCCAATTATGAACCAACACCACTAATACACATTCCTGGAGAAGTCAAAAACCTATTAGAAATTGCACAGGTTGATACTTTGATTCCAATAAATAATGCAAAGAATGTCAATGGTCTGGACATGTACAGGGTCCCACTCACACAAAACAAACAGGGAGAACAAGTGTTTGGGTTCAGACTTTGCTTGGGTGATGGTGTTCTAAAAACAACACTAATAGGTGAGTTGTGTCAGTATTTTACACATTGGGCAGGTTCATTGCGCCTATCCTTTATGTATACTGGCCCAGCACTATCTAGTGCTAAATTACTAATTGCTTACACACCCCCAGGAGCCCAAGGTCCAACCAAACGTAAAGAAGCAATGTTAGGTACACATGTAATTTGGGATATTGGGCTACAATCAACGGTAGTGTTGAACATACCTTGGACCTCAGGAGTACAATTCAGGTACACAGATCCAGACACATACACTAGCGCAGGGTTTATTTCTTGCTGGTATCAAACATCCTTGGTGTTACCCCCACAAACACAACAAACAGTGTATATACTAGGTTTTATCAGTGCCTGCCCTGACTTCAAGCTTAGACTTATGAAAGACACACAGTCGATACATCAAGAAACAGCACTGACTGAGGGATTGGAGGATGAATTGATGGAAGTCATTGTTGACAAAACGCAGCAAACATTGGCTTCAGTTAAAAGTGGATCCAAACACACCCAAAAAGTGCCTTCACTCACCGCTAATGAAACCGGAGCAACACTGCCAACAACACCATCCGACAGTGTGGAAACCCGGACAACCATGATGCATTATACAGGGTCAGAAACAACATTGGAAAATTTCCTGGGTAGGGCAGCTTGTGTGCATGTGGTGGAGATCAGAAACAAGCGACCTGAAGAAAATCAGGAACACAAAATGCAGCTCCTGTTTAATGATTGGAAGATAAATCTGTCTAGCTTAGTACAACTTAGAAGAAAACTTGAAATGTTCACATATGTCAGATTTGATTCAGAGTACACTATAATAGCTACCAGTTCACAACCTAATGATGCTAAATTTTCCAGCAATCTTACTGTCCAAGCAATGTTTATCCCACCAGGCGCACCCAACCCCAGTAAATGGGATGATTATACATGGCAAAGTGCAACTAATCCCAGTGTATTCTTTAATGTAGGAAAATCAGCCAGATTTAGTGTACCTTATTTAGGAATAGCTTCTGCTTATAACTGTTTTTATGATGGTTATTCTCATGACAATCCAACCACGCCATATGGAATAAATGTGCTAAACCACATGGGCTCAATGGCTTTTAGAGTAGTTAATGAGCATGATAATCATACCACCCATGTTAAAATCAGAGTTTATCATAGAGCCAAACATATTAGAGCATGGATACCCAGAGCCCCTAGAGCTTTAGAGTACTTACATATTGGTAGAACAAATTACAAACAAAATCCAGAAAATCCCATTAAGACTAGAGAAACCATCAGCACATACGGGTTGGGACCCAGGTTTGGTGGAGTGTGTACTGGCAACATTAAAATAATGAACTACCATCTAATGTCTCATGAGGACACTCTCAACCTTGTCACACCTCTACCTGAAAGGGATCTTGCTATCGTGAGTACAGGTGCTCACGGTTCAGAAACTGTTCCGCAATGCAATTGTATGTCAGGAGTTTATTACTCAAGGTACTACAACAAATTTTACCCTGTAGTTTGTGAAAAACCAACATGTTTATGGATTGAAGGTAACAACTACTACCCAAGTAGATACCAACAGGGTGTAATGAGAGGTGTTGGTCCAGCTGAACCAGGTGATTGTGGAGGTATCTTGAGATGCATACATGGACCCATTGGACTTTTGACTGCAGGTGGAAGTGGCTATGTCTGTTTTGCTGACATCAGAGCATTAGATATGTTTAAAGCTGAATACCAAGGGATTTCAGATTACATCTTGAATCTAGGAAAAGCCTTCGGGACAGGGTTCACAGAACACATCAGTGAAAAGGTAACAGAACTGCAGAACATGTCACTAGGTTACTTAAATACTAAGGTTTTATCTAAAATAGTAAAAATAGTTTCAGCCCTAGTTATAATCTGTAGAAATCATGATGACTTGATTACTGTTACAGCCACATTAGCATTATTAGGATGTGATGGATCACCATGGAGGTATTTAAAGATGTATATAAGCAAGCACTTTTGCTTACCTTATATAGAAAGACAATCCAATGATTTATGGTTCAAGAAGTTTAATGACATGTGTAATGCAGCAAAAGGGCTAGAATGGATTGCAAACAAAATTTCCAAACTTATAGATTGGGTTAAACAAAAAATTTTGCCACAGGCAAGGGACAAACTAGATTTTTGTAGAAGACTTAAACAATTAGATATCTTGGAAAGGCAAATAGATACATTACACATGAACCAGGTTAATGATAATGACAGAGAGGTATTATTCAATAACATATTGTGGCTAGAACAAATGTCCCAGAAATTTGCACCATTGTACGCTGTTGAGGCAAAAAGAATCAAAACACTCAAGAATAAAATGACCAATTTTATACAGTTTAGATCAAAACATCGCACAGAACCAGTGTGTGTGCTAATACATGGTTCACCTGGCTCAGGTAAATCATTGACTACCTCCTTGATTGGCAGAGCTATTGCAGATAGTTGTGGCTCCTCTGTGTACTCACTACCCCCAGATCCAAAACACTTTGATGGCTATCAGCAGCAAGCCGTTGTCATACTTGATGATCTAAATCAAAACCCAAATGGTGAAGATATTAGTACTTTTTGTCAGATGGTTTCATCAGTTGATTTCATTCCCCCAATGGCAAACCTAGATAACAAAGGTATGTTATTCACTAGCAACTTTGTGTTGGCTTCCACAAATTCTCAAACTCTGAACCCACCAACGGTTCTCAATCCCGAAGCCCTAGCACGCAGATTTGGATTTGACTTAGATATGTGTTTGCACACCACATACACAAAATCAGGGAAATTGAATGCCGCATTAGCATCAGAATTGTGTAAAGACTGTCACAAACCAACAAATTTCAAGAGATGCTGTCCACTGATCTGTGGCAAAGCCTTAAGCTTGGTTGACAGACACACAAATGTTAGATACAGCATAGATCAGTTGGTTACTGCAATTATAAATGAGCATGCAAACAAGACCAAAATCTCCAGCTCATTGGAGGTGCTATTTCAAGGACCAACATACAAGGACTTGCACATAGATGTAACAACTACACCACCTCCAGAATGCATAGTGGACCTACTAAAATCTGTGGACAA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| 100,155
|
NC_009996.1
|
Rhinovirus C
|
Lau,S.K., Yip,C.C., Tsoi,H.W., Lee,R.A., So,L.Y., Lau,Y.L., Chan,K.H., Woo,P.C., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Yip,C.C.Y., Woo,P.C.Y.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2007-11-20
| null |
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,099
|
RefSeq
| 1
|
Hong Kong
|
Hong Kong
| null |
oronasopharynx
| null | null |
PRJNA485481
|
Human rhinovirus C, complete genome
|
TTAAAACTGGGCTCGGGTTGTACCCACCCGAGCTGCCCATGTGGCGTGGTGCTCTTGTATCCCGGTACACTTGCACGCCAGTTTGCCTCTCCTTACCCCGTAACATATCTAGAAGAATGTGCATAACGGACCAATAGGTGGTGGCAACCCATGCCACTGACGGTCAAGTACTTCTGTTTCCCCGGTGTGATGTGGAATAGACTCTCTCAGGGTTGAAGCCATAAGCATCGTTATCCGCTACGTGCCTACGCAAAACCTAGTAGCATTTTGAAGCTTACTTGGTTGGCCGCTCAGCCACTAACCCGTGGTAGGCCTGGCAGATGAGGCTGGGCGCACCCCACTGGCGACAGTGGCCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCCCCTCTTTGAGGGGAAGCCATTTAAGTGACAAGGTGTGAAGAGTCTCGTGTGCTCCACGTAGAATCCTTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGCAGCTATTGCACACAATCCAGTGTGTTGATAGTCGTAATGGGCAACTGTGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTCTTTAAATACTTGCTTATGGTGACAAATAGTGTATACTGTTTGACACCATGGGCGCACAGGTCAGCAAGCAAAATGTCGGCTCGCATGAAAACTCAGTCTCAGCCACAGGTGGATCCGTGATTAAGTATTTCAACATCAATTACTACAAGGATTCTGCTAGCTCTGGCTTGACTAAACAAGATTTTTCCCAAGACCCATCGAAATTCACACAACCTCTAGCAGAAGCACTTACAAATCCAGCTTTAATGTCACCAACTGTTGAAGCATGTGGGATGTCCGATAGGCTTAAACAAATTACTATCGGGAATTCCACTATAACAACACAAGATACACTAAACTCTATACTGGCATATGGGGAGTGGCCCAAATACTTGAGTGACCTGGACGCTTCCTCAGTGGATAAACCTACCCACCCAGAAACATCATCTGATAGATTTTACACATTAACTAGTGTAGATTGGACCACTACGTCTAAAGGTTGGTGGTGGAAGTTGCCTGATTGCCTTAAAGATATGGGCATCTTCGGGCAAAATCTGTACCATCATGCATTGGGTAGGTCAGGGTACATAATACACACCCAATGTAATGCCACAAAATTCAATAGTGGTTGTCTAATAGTGGCTGTTGTACCAGAACACCAGCTAGCTTACATAGGTGAAGCAAATGTCAATGTTGGTTATGATCACACACACCCTGGTGAGGGAGGACATGTAATTGGTTCAAATGTTAGGAGAGATAACAAGCAACCTGATGAAGACCCCTTCTTTAATTGTAATGGGACCCTGCTTGGTAACATCACTATATTCCCACACCAGCTCATAAACTTGAGGACAAACAATTCCAGCACAATTGTTGTACCATACATTAATTGTGTACCTATGGACAACATGCTCAGGCACAACAACCTATCTCTAGTTATTATTCCAATCGTTCCTCTCAGAGCCGCAAATGGTGTCACCAAGGTCCCCATTACAATCTCAATAGCACCAGATAAGTCAGAGTTCTCAGGGGCTAGACAGTCTGTAAAACAGGGGTTACCAACACGGCTGCCAAGTGGATCTCAACAATTTCTCACAACTGAGGACGAGCAGTCGGCTAATCTTCTACCAGACTTTAGTGTCACAAAGATCATCGACATTCCTGGTAGGATCACAAACATACTCCACATGGCTATGGTAGATTCATTCATGCCACTAAACAACATTGAGACCAATGTAGGACAAATCTCAATTTACAATGTACAAGTGACCAAGAAAACAGCAGACAAGCCCATAGTTGTGATACCCATGGACATTAGCAACACTCTCTTTTCTACCACTTTACTAGGTGAAGTTCTTAATTACTTTGCAAATTGGTCAGGTAGTATCTCTATAACTTTTATGTGTGTTTGTGATAGCTTTAGTACAGGTAAATTTTTGCTAGCATACACACCCCCAGGAGCCGCTTTGCCACCAGACAGGAAAACCGCAATGTTAGGTGTACATGTAATCTGGGATTTGGGACTCCAATCCTCGTGCACCATTGTAGTACCATGGATGAGCGGCACCTTCCATAGACGGACTAAAGCTGACAATTACACCCAGGCTGGATATGTGTCACTATGGTACCAGACTGATTTTGTGTCACCAAATGATGGGATTGGGACAATCGTTGCTACATGCTCCGGATGTCCTGATTTGTCTGTTAGAATGCTGCGTGACACACCAATGATGAAACAGGAAAAAGATTTGACTCAAAACCCAGTTGAGGACTACATAGACAAGGTGGTCGACACTGTACTACAGGTCCCAAACACCCAACCCAGTGGTCCACAACACAGTATTCAACCAAGTGCTTTGGGCGCTATGGAAATTGGGGCATCTTCAACCACCATACCAGGTGATCTCATAGAGACTAGGTATGTAATCAACTCAAATACTAACAGTGAAGCCCTAATTGAGAACTTCATGGGCCGCTCAGCTCTTTGGGCCAAGATCCAGGTGGCGAATGGTTTTGCAAAATGGGATATAAACTTCCAAGAGCATGCACAAGTCAGAAAGAAATTTGAAATGTTTACATATGCTAGATTTGACATGGAAGTTACTGTTGTCACCAACAACACAGGTTTGGTACAAATCATGTTTGTACCACCTGGTATAGATGCACCAGATAGTATTGACTCCCGTCTATGGGATTCTGCCTCCAACCCGAGTGTTTTCTATCAACCAAAATCAGGTTTTCCTAGGTTTACTATTCCATTCACTGGATTGGGTTCAGCTTATTATATGTTTTATGATGGTTATGATGTCCCCAGAAATAAAAGTAATGCTGTGTATGGTATCACATCTACAAATGATATGGGGACACTTTGCTTCAGAGCTATGGAAGACACCAATGAACACAGCATTAGAGTCTTTGTAAAGCCTAAACATACCATAGCATGGATTCCACGACCACCTCGTGCCACCCAATACACCCACAAATTCAGCACAAACTACCATGTTAAGAAACCAGATGACACTACTGGACTACTAATACAGAAACACTTTATTAACCACAGGACTGATATAAAAACTGCAGGCCCAAGTGATCTCTTTGTCCATACAGCCACTATGATTTACAGGAATGCGCACTTAACCAGCTTGAATGACAAAACCGTTCTACTGGCTCTCAGTGCAGATCTCCAGGTGGACGCAGCTGACCAGCCAGGCCCAGATACCATCCCACAATGTGACTGCTTGGAGGGCTGCTACTATAGCAAAAGTTTAGATAGATATATACCAGTTAAATTAGAAGCACACGACTGGTATCAGATAGAGGAAACCTGTTATTACCCACAGCACATCCAGTATAATATAATGATTGGTGAAGGACATTGTCAGCCTGGAGACTGCGGAGGGAAGTTACTGTGCACTCATGGTGTGATTGGCATCATCACAGCTGGTGGAGACAATCATGTAGCTTTCACAGATCTAAGACCCTATTCATGTTTAGACACTCACCAAGGTCCTATTCAGGACTATGTGACACAATTAGGGAGTGCCTTTGGTAGCGGTTTCACTGACACACTTAAAGACCAATTGACAGATGTGAGTGCCCATATTAAAGACAAAATTACTTCAAAGGTAGTTAAATGGCTAGTACGTATCATCAGTGCACTTACCATAATGATACGTAACAGTACTGACACACCCACTGTACTTGCAACCCTTGCTCTTTTAGGCTGTCACAAGTCACCATGGTCATTTCTCAAGGACCGGTTATGTCAGTGGTTAAACATCACTAGACCGCCAAGCCGACAAGGTGATGGCTGGTTGAAGAAATTCACTGAATGCTGCAACGCCGCTAAGGGCCTTGAGTGGATTGGCATTAAGATCAGTAAATTTATAGAATGGCTTAAAAATAGACTGCTTCCTACCTTACAACACAAAAAAGAAATCTTAGATGAATGCAAGAAAATAGATCTTTATCAAGAACAGGTTAAAGGATTTTCCAAAGTTGATGAACCAGCTCAGCAGGAACTACTAATTAAAGTTGAAAAACTGAAGAAAGGTTTAGACAGCCTAGCACCTCTGTATGCAGTTGAAAACAAAAGAGTTACAAACATCTATAAAGAACTCAAAGCATTGTCTGCATATAAAACAACACAGAGAACTGAACCAGTATGCATACTGATCAGAGGAGCTCCTGGGTGTGGGAAATCTTTGGTTACTTCAATAATAGCCAGAGGTTTAACCAAACCAGGTGACATTTACTCCCTTCCTCCAGACCCTAAACATTTTGATGGGTATGATCAACAAGAAGTGGTAATTATGGATGATCTGGGCCAAAACCCTGATGGTAAGGACCTTTCTATGTTCTGTCAGATGGTGTCAACCACTAATTTCATTCCCCCAATGGCAGCTCTGGAAGATAAGGGGAAGACCTTTACAAGTAAATATATATTAGCCAGCACAAATCTTTTAAATCTCCAACCACCCACAGTAACAGTCCCCGAAGCCATTGACAGGCGCTTCTACTTAGATTTAGATCTTAAGATCTTGCAAGGGTACCAAAATCAAGTAGGCTTGCTAGATACTGCCAAAGCACTTCAGCCCTGTGCGAACTGTAGTAAGCCACCACATTACAAACAATGTTGTCCTTTGCTATGTGGTAAAGCTGTAGTACTGGTGAACAGGAGAACTAAGGGCAGTTATGCTATCAACATGGTGGTTCAGCAACTTATAGAGGAGAGCAAATCCAGAAAGAGTGTTGGCAATAATTTAACAGCTATATTTCAGGGCTTGGGTGATAAGGAAACCCCAGGTTTCATAATAGATCTTCTATCATCATCTAAAGACCCTAAAGTCATTCAATACTGCCAAGACCAGGGCTACATCTCACCAGTCCATGGCTCAATTGAGCGAGATTTTGCTTATGTCACATATGCTCTAAATTGTCTAGGTAGTCTTGTGATTATTCTGGGTACCATATACGCATTATATCGCTTGATGTGTATTGCCCAAGGACCATACACAGGCATGCCTACTACACCCAAGAAGAAACCTGAGTTAAGAAGAGCAACCTTGCAAGGTCCTGAACATGAATTTTTGAATGCCCTTATTAGAAGAAACTGCCATATCATTACCACTGACAAAGGAGAATTTAACCTACTAGGTATATACTCTAACTGTGCTGTAGTACCAACACATGCTGAACCTGGTGACGTGGTAGATATTGATGGAAGGTTAGTTAGAGTGCTTAAACAACAAGTCCTCACTGATATGAATGATGTGGATACGGAAGTAACTGTGTTGTGGCTTGACCAGAATGAAAAGTTCAGAGACATAAGAAGATTTATACCTGAACATCAGCAAGATTGGCACAATATACATTTAGCTACCAATGTCACCAAATTCCCTATGCTCAATGTAGAAGTAGGACACACTGTACCCTATGGGGAAATCAATCTTAGTGGTAATGCTACATGCAGGTTGTACAAATATGACTATCCAACCCAACCAGGTCAATGTGGTGCAGTGCTGGCCAACACAGGTAATATCATAGGAATACATGTGGGTGGAAATGGTAGGGTTGGTTACGCAGCAGCACTACTTAGGAAATATTTTGCTGAGGAACAAGGTGCCATCATTTCTAAATGTAATGTTAAGGAAAAGAACTGGAAACCCGTCAATACACCCTCCCAGACCAAACTACACCCTAGTGTCTTCCACGATGTGTTTCCTGGTGTTAAGGAACCAGCAGCTTTACACCCCAAGGATCCACGATTGGAAGTAGACCTCACTACAGCTGTTATGTCAAAATATAAAGGTAATATTGATGTCCCTATGAATGAGTACATAGAAACAGCCGTTGACCACTACGCGGCACAACTTTACATGCTTGACATCAACCCAGAACCAATCACCATGGAACAAGCAATATATGGTTATGCTAACTTGGAACCATTGGACCTTACCACTAGCCCTGGTTTCCCTTATGTGTCTTTGGGCGTGAAAAAGAAAGACATCTTAAACAACGCTACTAAAGACACAAGGAAAATGCAACAGATGTTAGATCTGTATGGTATTGATCTACCCTACATAACTTTCCTAAAGGATGAACTCCGCGCCCCAGAGAAAATTAAGGCTGGTAAGACCAGGATTGTGGAGGCTGCTAGTGTCAATGATACAGTGTACTTTAGAACAACTTTTGGCAATCTATACAGTACTTTTCATGCAAACCCAGGTATCTTAACAGGCTCAGCTGTGGGGTGTAATCCAGATGTGTTTTGGTCACAAATGCATGCTATGTTAGATGGAGAACTCATTGCTTTTGATTACACCAATTATGATGGCAGCTTGGAACCAGTGTGGTTTAAAGCGCTTGGGAAAGTGTTAGATCAGCTTGGCTTCCCTGGACACCTTACACAAAGATTGTGTAATACAACCCACATCTTCAGAGACACAACCTACGATGTCAAAGGTGGCATGCCGTCAGGAATTTCAGGTACCTCCATATTTAACACTATGATGAACAATATCATAATAAGAACTCTGGTCTTGGAGACTTACAAAAACATCAATTTGGACAAACTACGCATTATTGCCTACGGTGATGATGTAGTAGCCTCATATCCAGATGAATTGGACCCAAAGGAGATTGCCATGACGGCCAAGCGTTATGGTCTCACTATCACTCCCCCAGATAAAACAGATCAATTTTCCAAGATGACCTGGGATAATGTGACCTTCCTTAAACGTAAATTTAAACCTGACTCCAAATACAAATTTCTGATACATCCTGTTTACTCAATGCAGGATGTTTATGAGTCAATCAGATGGACTAAGGATCCAAAGAACACGCAGGACCACGTCCATTCGTTGTGTTTGTTAGCCTGGCACAATGGAGAAGAGGTTTATGAGGATTTCTGCGCCAAAATTAGGACAACTAGTGTTGGCAAGAGTCTGTATTTACCACCATACAAATACTTGTACAGACAGTGGATTGACCTCTTCATTTGATTGGCCCACAATCTATATACTAAATTGTTTGATTAGAACTTAGTTAGTA
| 7,917
|
OR220808.1
|
Rhinovirus C
|
Guo,L., Liang,Y., Zhou,J., Gao,Y., Wang,M.
|
Yunnan Institute of Pediatrics, Kunming Children's Hospital
|
China
|
2023-09-13
|
HRVC318/China/Kunming/2023/LZG
|
Rhinovirus C
|
Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,069
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2023-02-23
| null | null |
Rhinovirus C isolate HRVC318/China/Kunming/2023/LZG, complete genome
|
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| 12,974
|
MZ667421.2
|
Rhinovirus C
|
Makhsous,N., Goya,S., Avendano,C., Kuypers,J., Jerome,K., Boeckh,M., Greninger,A., Waghmare,A.
|
University of Washington, Virology
|
USA
|
2021-09-04
|
HRV-C17/NW1/2009
|
Rhinovirus C
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Enterovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,051
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2009-08-24
| null | null |
Rhinovirus C strain NW1, complete genome
|
GTACACTTGTATTACGGTACATTTGTACGCCAGTTTGCCTCCCTTCCCTACCTTGTAACTTTAGAAGATATAACTACACGACAAATAGGAAGCCAACAAGCCATGTTGGTTAATGTCAAGCACTTCTGTTACCCCGGTACTAGGGTGTTAGACTTCCCCAGAGGTTGAAGCCCGATGTATCGTTATCCGCATGATTACTAAGCAGAGCCTAGTAACATCTTACTTTATATATGGGTTGGTCGCTCAGTCAGTTACCCCCTGATAGACCTGGCAGATGAGGCTGGAAACACCCCACTGGTAACAGTGTTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCCCCTCTTCTGAGGGGAAGCCCATATGTAGACAAGGTGAGAAGAGCCGCGTTTGCTGATCATGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTACTGCGCAGAAACCAATGCGTGGGTAGTCGTAATGAGCAATTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTACCTTACATTGCTTATGGTCGCAACATATATAAAATCGTATATGTTGTTCACCATGGGCGCACAGGTATCAAGACAAACTACTGGCTCACATGAGAGTGCTGTCAATGCCACGAATGGTGGTATCATAAAATATTTCAATATTAATTACTATAGGGACTCAGCTAGTTCTGGCTTAACTAAGCAAGATTTCTCTCAAGACCCCTCTAAATTCACCCAACCCCTTGTTGACACACTCACCAACCCAGCTTTAATGTCACCTTCAGTAGAAGCATGTGGATTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATGGGAAACTCCACTATAACTACACAAGATGCCCTACATACTGTTCTTGCCTATGGAGAATGGCCTCAATACTTGTCAGATCTTGATGCGACCTCTGTTGACAAACCCACACACCCTGAGACTTCCTCAGATAGATTTTACACCTTATCAAGTGTTCCATGGACCAACACGTCAAAGGGTTGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTTTAAAGGATATGGGAGTCTTTGGACAAAATCTCTATTATCATGCTATGGGGAGGGCTGGTTATATAATACACACACAATGTAATGCTACAAAATTTCACAGTGGTGCTTTATTGGTGGTCCTCATACCTGAGCATCAATTAGCTTACATAGGTGCAGAAAAAGTCAACATTGCCTATGATCTTACACACCCAGGGGAAACAGGTCATGTTCTGGGTAGGAACACATCCAGAGGCAATAATAATCCTGATGAAGACCCTTTCTTCAATTGTAATGGCACACTCTTTGGTAACCTCACCATCTTTCCCCATCAGATTATTAACCTACGTACCAACAACTCCAGTACCATTATAACACCCTACATCAATTGCCAACCGATGGACAACATGCTAAAGCATAACAATCTGACTCTCTTAATTGTTCCTCTTGTCAGACTTAGATTTGGCACGGAGGCCTCTCCTACAGTGTCAATAACTGTTACAATTGCACCCTATAAGTCTGAATTCTCTGGTGCCATGGAAACCCAAAAACACCAGGGATTACCAACACGCATGCCCAGTGGTGGTCAACAATTTATGACCACTGAAGATGAGCAATCAGCCAACTTATTGCCAGGCTTTCATCCCAGCAAGAAGATTCACATACCTGGTATGATTACCAATGTGTTGCACATGGCTAGGGTGGATTCATTTATGCCTATACACAATATATCAACAAATATTGGGAAGATTGATATATACAGCCTACAAATTACTAAGAAACCTGCTGGCAACAATGATTTGTTACTTACCATTCCATTAGATATTAGTAACACCCTATTCTCCACCACATTGTTGGGTGAAGTTCTTAACTACTTTGCAAATTGGTCTGGTAGCATATCCCTGACTTTTATGTGTGTGTGTGACTCTTTTTCAACTGGTAAGTTCCTATTAGCCTACACACCCCCAGGCGGTGAGCATCCCACTACAAGGAAACAGGCAATGCTTGGTGTGCATGTGATTTGGGATCTGGGATTACAATCCTCATGCACTATGGTGGTACCATGGATGTCATCAGGATTTTACCGTAGAACTAAATCTGATGATTATACACATGCAGGTTATGTCACCTTGTGGTATCAAACAGACTTCATAACCACCTCAAATAATGTGGGAGAAATACTAGTCACCTGTAGTGGTTGCCCAGATCTCTCTGTTAGAATGTTAAGAGACACTCCTATGATGCAACATGTCAATGACCTCCAGAACAATGACCCAGTGGACACATTTGTGCATGGTGTGCTTGAAGAGGTTGTTGTTGTCCCAGACACACATGCTTCCGGACCACAACACACCACACGACCCAGTGCTTTGGGAGCCATGGAAATAGGGGCATCCAGTAATGCTATACCCGAGTCCGTTATGGAAACTCGGTATGTGGTCAATGACAACACCAATGAAGAAGCTGAGATTGAGATGTTCCTAGGAAGGTCAGCCTTGTGGAGCAAATTCTCTCTCACTGAAAAACATGCCAAATGGGAGATTAACTTCCAGGAACAGGCACACATCAGGAAGAAGTTTGAAATGTTTACATACCTCCGTTTTGATATGGAGGTTACTATAGTTACAAACAACACAGGATTGATGCAAATTATGTATTTCCCACCTGGTCTCAAAGCTTCTGAAAATAAAGATGATCCTGTATGGAATTCAGCTTCTAATCCAAGTGTGTTCTTTCAGTCTAAGAATGGTTTCCCCCGCTTTACAATCCCTTTTACAGGCTTAGCATCAGCATACTACATGTTTTATGATGGGTACAGTAATAGAAAACGCCCCCAGGACAATGTGTATGGTATATCCCCCACTAATGACATGGGGACATTGTGTTTTAGAGCGCTGGATGATGCTGATGGTACCAATATCATGGTGTATATAAAGCCTAAACACATAACAGCATGGATACCTAGACCGCCCAGAGCCACGGAATATACACACAAATACAGCACAAATTATCACATTTCAGACTCTAATGAGACAGATGGATTAAAGGAGAAACACTTTATCAAACCAAGAGAACACATAAAGAATGTTGGACCCAGTGATCAGTGTGTTCATACCAAAGATGCCATCTACACTTGTGCTCACTTAACTGAACCTAACCCTAACACCATTCTCTTAGCCATCACAGCAGACTTGCAAGTTGATAGTACAGACATTCAAGGTCCAGATTTTATTCCAACTTGTGACTGTGTGCAGGCATGTTATTACGCAAAACATGCTCAGAGATACTACCCCATCACAGTTACGCCACATGACTGGTATGAGATCCAAGAATCACAGTACTACCCTAAACATATCCAGTACAACATACTAATTGGGGAAGGTCCTTGTGAACCAGGGGATTGTGGGGGCAAATTACTGTGTAGACATGGGGTGATAGGCATAATTACTGCTGGAGGCGAGGGGCACGTGGCATTCACCGACCTTCGCCCCTATGCCTGTTTGAGTGCACACCAGGGTTTGGTATCAGATTATGTTAATCAGCTTGGTGCAGCATTTGGTGACGGTTTTTCCAGTAACATTAAAGATCATCTAACAGGCTTATGCACAACAGTGTCTGACAAAATAACAGGTAAAGTCATCAAATGGTTAGTTAGAGTCATCAGTGCCCTCACTATTATGATTAGGAACTCAAGTGACACAGCAACTGTCTTAGCCACTCTCGCCTTACTGGGATGTCATGGGTCACCATGGTCATTTCTTAAAGAGAAAATATGTCAATGGTTGGGGATACCTAGACCTCCAACTCGACAGGGGGAATCCTGGCTCAAGAAATTCACTGAATGTTGTAATGCTGCTAAGGGACTAGAATGGGTTGCACAGAAGATTGGCAAATTCATTGATTGGCTAAAAGAGAAATTGATACCCACAGTGCAACGTAAGAAAGAGACTTTAGATCAGTGCAAAAAGATAGGACTTTATGAAGAACAAACAAAAGGCTTTTCTCATTCAGAGGCAGAAGCACAACAGAGTCTAATTTTAGAAGTTGCAAAATTGAAAAGAGGTTTAGATGATTTGGCTCCTCTTTATGCTAGTGAAAATAAAAGAGTGACAATTATTCAGAAAGAATTGCAACGTTTGTCTGCTTACCAGAAAACCCACAGACACGAACCAGTGTGTTGCTTGTTGAGAGGTCCTCCCGGGTGCGGTAAATCCTTAGTCACTTCCATCATAGCACATGGTTTAACCAATGAAGCAAATATCTACTCTCTGCCACCTGACCCCAAACACTTTGACGGGTACAATCAACAAACAGTGGTAATTATGGATGACGTGGGGCAAAACCCTGATGGTAAAGATCTGAGCATGTTTTGTCAGATGGTGTCCACCACAGAATTCATAGTCCCAATGGCTAGCATAGAAGATAAGGGTAGAGCTTTCACTAGTCAATATGTCTTGGCTAGCACGAACTTAGATTCACTTTCCCCCCCTACTGTGACAATACCAGAAGCAATTAGCAGAAGATTCTACTTGGATGCTGACCTACAAGTTACAAGTAAATTCAAAGCGCACAATGGTTTATTAGATGTAGCAAAGGCCTTACAACCTTGCGCTAAGTGTCCAAAGCCTAATCACTACAAACAGTGCTGTCCAATACTATGTGGGCAGGCTTTAGTCCTGAGAGATAGGAGGACATCAGCAAATTACCCATTACTGGCAGTAGTAGAACAACTTAGAATGGAGAACAACACTAGAGATAAGGTCAAAAGTAACCTCAGAGCCATCTTCCAGGGACTGGGTGATACAACACCTCCAGGTTTCATAGTGGACTTACTATCCAGTTCCAAGGATCCCAAGGTCATAGATTACTGTGTAGAGCAAGGTTGGGTGGGAAAAGCACAATCAACCATAGAGAGAGACTTTAATTATATACAATATGTTTTAAATTGTTTAGGTAGCTTAATAGTGATTTTAGGTACCATATATGCTCTTTAC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