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VRL Laboratories
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2010-08-23
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|
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VRL Laboratories
|
USA
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2010-08-23
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Betaretrovirus
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Retroviridae
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USA
|
USA
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Macaca fascicularis
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Simian retrovirus 4 strain SRV4/TEX/2009/V3, complete genome
|
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| 100,343
|
NC_031326.1
|
Simian retrovirus 8
|
Zao,C.L., Tomanek,L., Cooke,A., Berger,R., Yang,L., Xie,C., Chen,S., Shi,C., Rong,R., Zao,C.-L.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2016-10-05
| null |
Simian retrovirus 8
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,126
|
RefSeq
| 1
|
China: Suzhou
|
China
|
Macaca fascicularis
| null |
2012
| null |
PRJNA485481
|
Simian retrovirus 8 strain SRV8/SUZ/2012, complete genome
|
TGTCCGGAGCCGTGCTGCCCGGCTATGGATTCTTAAGTCTCAGCCTCCATGTTGTTGAGTTAAGATGGCGTACTTCCTGCTTCTTCTCCGTCTTGCTTTCCCCGCCGGCGCCAATTCTTCCCGCCTTTGCAGACGTGGCACTTCCTGCCTAAAGTGTTTGAGCATGCGCCCTACAATGTTTCCCCTCCTCCCTATCATTCGCCTATATAAGGCAGCGCTCTGCCGTCATTAAATGAGACTTGATCAGAACACTGTCTTGTCTCCATCTCTTGTGTCTCTTGTCCCTTCAATTCCCACTCCCTCCTCCAGGTTCCTAGTTGCTGTCCCGCGGGACGGGACATCTGGCGCCCAACGTGGGGCTTGGATACGAGGGAATTTTGTGAGGAAGACGACCCGCATAGCTGCCGGCGTTAAAAGTGAAAGTAGCCCGTTTCATCCGCCGCGGGAGCCTGCCGCGTCGGAATTCAAGTAAGTGGTTTGGTCGGATATGGGGCAAGAATTAAGCCAACATGAACGCTATGTTACTCAATTGAAAGAGGCTTTAAAGACACGGGGAGTAAAGGTTAAATATATTGATCTGTTAAAATTCTTTGACTTTGTAAAAGACACCTGTCCCTGGTTTCCTCAAGAAGGAACCATCGACATCAAGAGATGGCTTAGAGTAGGCGATTGTTTTCGAGATTATTATGATACTTTTGGCCCCGAAAAGGTACCAGTTACTGCCTTTTCTTATTGGAACTTAATAAAGGAGTTAATTGACAAAAAGGACAAGGATCCTCAGGTATTAGCTGCAGTGACCCATACCGAAGAAATTCTGAAGAGCAGTTCTCAGACAGACCTTAGAGAGTCCCCTCCTGATAAAGAGACGGATCTTATTTCTTTAGACAGTGATGAGGAAGAAACTAAGGCCCCATCTATAAAAAACCAAAAGGTGCCCGTTACTAAAAAATCCCAAGACAAGCCAAAAAGATTTCCTGTTCTCTTAACTCAAGAGAATAAAGCTGATAATGACCCTGACCCTTCAGAAGTGGACTGGGGTGAGTTAGAAGACGAGGCAGCACAATATCATAATCCTGACTGGCCTCCCTTCTTGACTCGTCCGCCCCCATATAACAAAGCCACCCCTTCTGCGCCCACTGTTATGGCAGTTGTTAACCCAAAGGAAGAACTTAAGGAAAAAATTGCCCAGTTAGAGGAACAAATTAAATTAGAAGAGTTGCATCAATCATTAATTGTCAGATTGCAAAAATTAAAAACAGGAAATGAAAGAGTAACCAACCCTGACAGCACAGGGGGCCCTCCCGTCATGCCTCGCTGGCCAGGACAACATGTCCCCAAAGGCAAATGCTGTGCTAGTCGAGACAAAGAGGAACAACCTATTAAGGATATTTTTCCAGTTACAGAAACTGTAGATGGGCAGGGCCAAGCCTGGAGACACCACAATGGTTTTGATTTTACTATCATCAAAGAATTGAAAACTGCTGCCTCTCAATACGGAGCTACCGCCCCGTATACATTAGCCATAGTCGAGTCTGTGGCGGACAATTGGCTTACCCCTGCAGACTGGAACACGCTAGTCAGAGCCGTCCTCTCGGGGGGAGACCACCTACTTTGGAAGTCTGAGTTTTTTGAAAACTGTAGAGATACAGCAAAACGAAACCAACAAGCCAACAATGGTTGGAATTTTGATATGTTAACAGGCTCTGGCAATTATGCCAGTACTGATGCACAGATGCAATATGATCCAGGACTATTTGCCCAAATTCAAGCTGCGGCCACAAAAGCTTGGAGAAAACTCCCTGTTAAGGGGGACCCTGGGGCTTCCCTCACTGGGGTCAAACAGGGGCCCGACGAGCCGTTCTCCGAGTTTGTACATCGACTTATGACTACAGCTGGGAGAATCTTCGGCAACGCCGAGGCTGGTGTAGATTATGTTAAACAACTAGCATATGAGAATGCCAACCCAGCTTGCCAAGCTGCTATTCGCCCTTACAGAAAGAAAACAGATTTAACTGGTTATATCCGCCTTTGTTCGGATATTGGACCCTCTTATCAGCAAGGCCTGGCCATGGCCGCCGCGTTCAGCGGACAAACTGTGAAAGATTTCCTAAACAACAAAAATAAGGATAAAGGAGGGTGTTTCAAATGTGGTAAGAGAGGACATTTTGCAAAAAATTGCCGTGATAGTACTATCAAAACATCTGAAGTTAAAGTTCCAGCACTCTGCCCCAGGTGTAAACGAGGAAAGCATTGGGCTAATGAATGTAAATCCAAAACTGATAATCAGGGAAATCCACTGCCACCCCATCAGGGAAACGGAATGAGGGGCCAGCCCCAGGCCCCGAAGCAAGCTTATGGGGCGGTCAGTTTTGTTCCAGCCAGCAACAACAATCCGTTTCAAAACTTATTAGAGCCACACCAGGAAGCGCAGGACTGGACCTCTGTTCCACCTCCCACACAGTACTAACACCTGAAATGGGCCCCCAAACTCTCAGTACTGGTATTTATGGGCCCCTACCTCCAAATACCTTCGGATTAATCTTAGGTAGAAGCAGTACTACCATGAGAGGTTTACAAGTTTTTCCAGGAGTCATTGACAATGATTATGAGGGAGAAATTAAGATAATGGCCAAAGCCATAGATAACATCGTCACTGTCCCTCAAGGGAATAGGATCGCACAACTAGTCCTCCTGCCTTTAATTAAAACAGCCCACACTATACAACATCCATATAGAGGAAAAGGCAGTTTTGGATCCTCAGACATATATTGGGTTCAGCCAATTACAAATCAAAAACCTTCCTTAACGTTATGGCTGGACGGTAAGTTGTTTACAGGATTAATAGATACAGGAGCTGATGTTACTATTATTAAACAAGAGGACTGGCCCCTTGATTGGCCTACTACAGATACCTTAACTAATTTAAGAGGAATTGGACAAAGTAATAATCCTAAACAAAGTTCAAAATACCTTACTTGGTCAGACAAGGAAGGTAATTCTGGCCTCATCAAACCTTTTGTTATTCCTAACTTACCTGTTAATCTCTGGGGTCGAGACTTACTCTCTCAGATGAAAATTATGATGTGCAGCCCTAACGAAGTTGTTACTGCCCAAATGCTAGCTCAAGGCTATGCCCCAGGAAAAGGATTAGGAAAAAAGGAAAACGGGATCTTACAGCCCATTCCAAACCGAGGGCAATGTGATAAAAAAGGATTTGGAAATTTTTAACTATGGCCATTGACATGCTTGCACCCCAACAGTACGCTGACCCCATTACTTGGAGGTCCGACGAACCCGTTTGGGTTGATCAGTGGCCATTAACCAGTGAAAAACTTACCGCCGCCCAACAGTTAGTGCAAGAACAATTAGCGGCGGGACACGTTATAGAAAGTAACTCCCCCTGGAATACACCCATATTTGTTATAAAAAAGAAATCTGGAAAGTGGAGACTTCTTCAGGACTTAAGAGCTGTTAATGCCACTATGATATTGATGGGAGCTCTACAACCTGGATTACCCTCGCCGGTAGCCATCCCTCACAATTTTCTCAAAATTATTATTGATCTCAAAGACTGTTTTTTCACCATTCCTCTTCATCCTAATGACCAAAAAAGATTTGCCTTTAGTTTACCATCCATAAATTTTAAAGAACCTATGAAACGCTATCAGTGGAAAGTTTTGCCCCAAGGTATGGCCAACAGCCCCACCTTGTGCCAAAAATATGTTGCTGCAGCAATCAGTAACGTTAGAAATGCATGGCCACAGATGTATATTGTGCATTATATGGATGATATTCTCATAGCAGGCTCAGAAGGACAACAAGTTTTGCAATGCTTTTCGCAACTCAAAGAACACCTAACTATGGCTGGATTACATATAGCTCCAGAAAAGATACAGTTACAAGATCCCTATACATATCTAGGTTTTCACATGAATGGACCTAAGATCACCAACCAAAAAGCAGTAATTCGTAAAGACAACTTACAAACTCTTAATGATTTCCAAAAACTCTTAGGAGATATCAATTGGCTTCGTCCATACTTAAAACTCACCACAGGAGACTTAAAACCTTTATTTGATATTCTCAAGGGAGACTCTAACCCCAATTCTCCTAGATCCTTGTCAAAAGAAGCTCAAATGGCACTTAATACAGTAGAAACAGCCATTGCTGAACAATTTGTTACTTACATAGACTATTCACAACCACTAATCTTTCTTATTTTTAACACAACTCTGACACCTACCGGCTTGTTTTGGCAAAATAATCCCATCATGTGGGTCCACCTGCCTGCCTCACCTAAAAAGGTGTTACTTCCATATTATGAAGCTGTAGCAGATTTAATCCTTCTAGGAAGAGATAACAGTAAAAAATATTTTGGAATTGAACCATTTACAATTATCCAACCATACTCTGCCTCCCAGATTAATTGGTTAATGCAAAATACAGAGACATGGCCAATTGCCTGCGCCTCATATGCGGGTAACCTAGACAACCATTATCCTCCCAATAAACTTATTCAATTTTGTAAATTGCACACCTTTATTTTTCCTCAGATTGTCAGCCAATCGCCCCTAAATGATGCTTTGTTGATCTTTACTGATGGCTCTTCCACCGGAATAGCCGCATATACTTTCTCAGGCACTACGGTCAAATTTCATACCACACTTACTTCGGCCCAATTAGTAGAATTACAAGCTCTTATTGCAGTCCTATCAGCCTTTCCTGACCAACCTCTTAATATCTATACCGATAGTGCATATCTGGCCCATTCAATACCTTTACTTGAAACCGTTACACAAATCACACATATATCTACAACTGCCCAATTATTCTTACAATGTCAACAATTAATACACGCCAGATCCATACCCTTCTACATTGGACATGTCAGAGCTCATTCTGGACTACCTGGACCTATAGCCGAAGGCAACAAGTTAGCTGATCTGGCAACCAAAACTATTGCTCTTAACCTACAAACAAATCTTAAATCAGCTCAAGCT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| 5,260
|
KU605777.1
|
Simian retrovirus 8
|
Zao,C.L., Tomanek,L., Cooke,A., Berger,R., Yang,L., Xie,C., Chen,S., Shi,C., Rong,R., Zao,C.-L.
|
VRL
|
USA
|
2016-10-01
| null |
Simian retrovirus 8
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,126
|
GenBank
| 1
|
China: Suzhou
|
China
|
Macaca fascicularis
| null |
2012
| null | null |
Simian retrovirus 8 strain SRV8/SUZ/2012, complete genome
|
TGTCCGGAGCCGTGCTGCCCGGCTATGGATTCTTAAGTCTCAGCCTCCATGTTGTTGAGTTAAGATGGCGTACTTCCTGCTTCTTCTCCGTCTTGCTTTCCCCGCCGGCGCCAATTCTTCCCGCCTTTGCAGACGTGGCACTTCCTGCCTAAAGTGTTTGAGCATGCGCCCTACAATGTTTCCCCTCCTCCCTATCATTCGCCTATATAAGGCAGCGCTCTGCCGTCATTAAATGAGACTTGATCAGAACACTGTCTTGTCTCCATCTCTTGTGTCTCTTGTCCCTTCAATTCCCACTCCCTCCTCCAGGTTCCTAGTTGCTGTCCCGCGGGACGGGACATCTGGCGCCCAACGTGGGGCTTGGATACGAGGGAATTTTGTGAGGAAGACGACCCGCATAGCTGCCGGCGTTAAAAGTGAAAGTAGCCCGTTTCATCCGCCGCGGGAGCCTGCCGCGTCGGAATTCAAGTAAGTGGTTTGGTCGGATATGGGGCAAGAATTAAGCCAACATGAACGCTATGTTACTCAATTGAAAGAGGCTTTAAAGACACGGGGAGTAAAGGTTAAATATATTGATCTGTTAAAATTCTTTGACTTTGTAAAAGACACCTGTCCCTGGTTTCCTCAAGAAGGAACCATCGACATCAAGAGATGGCTTAGAGTAGGCGATTGTTTTCGAGATTATTATGATACTTTTGGCCCCGAAAAGGTACCAGTTACTGCCTTTTCTTATTGGAACTTAATAAAGGAGTTAATTGACAAAAAGGACAAGGATCCTCAGGTATTAGCTGCAGTGACCCATACCGAAGAAATTCTGAAGAGCAGTTCTCAGACAGACCTTAGAGAGTCCCCTCCTGATAAAGAGACGGATCTTATTTCTTTAGACAGTGATGAGGAAGAAACTAAGGCCCCATCTATAAAAAACCAAAAGGTGCCCGTTACTAAAAAATCCCAAGACAAGCCAAAAAGATTTCCTGTTCTCTTAACTCAAGAGAATAAAGCTGATAATGACCCTGACCCTTCAGAAGTGGACTGGGGTGAGTTAGAAGACGAGGCAGCACAATATCATAATCCTGACTGGCCTCCCTTCTTGACTCGTCCGCCCCCATATAACAAAGCCACCCCTTCTGCGCCCACTGTTATGGCAGTTGTTAACCCAAAGGAAGAACTTAAGGAAAAAATTGCCCAGTTAGAGGAACAAATTAAATTAGAAGAGTTGCATCAATCATTAATTGTCAGATTGCAAAAATTAAAAACAGGAAATGAAAGAGTAACCAACCCTGACAGCACAGGGGGCCCTCCCGTCATGCCTCGCTGGCCAGGACAACATGTCCCCAAAGGCAAATGCTGTGCTAGTCGAGACAAAGAGGAACAACCTATTAAGGATATTTTTCCAGTTACAGAAACTGTAGATGGGCAGGGCCAAGCCTGGAGACACCACAATGGTTTTGATTTTACTATCATCAAAGAATTGAAAACTGCTGCCTCTCAATACGGAGCTACCGCCCCGTATACATTAGCCATAGTCGAGTCTGTGGCGGACAATTGGCTTACCCCTGCAGACTGGAACACGCTAGTCAGAGCCGTCCTCTCGGGGGGAGACCACCTACTTTGGAAGTCTGAGTTTTTTGAAAACTGTAGAGATACAGCAAAACGAAACCAACAAGCCAACAATGGTTGGAATTTTGATATGTTAACAGGCTCTGGCAATTATGCCAGTACTGATGCACAGATGCAATATGATCCAGGACTATTTGCCCAAATTCAAGCTGCGGCCACAAAAGCTTGGAGAAAACTCCCTGTTAAGGGGGACCCTGGGGCTTCCCTCACTGGGGTCAAACAGGGGCCCGACGAGCCGTTCTCCGAGTTTGTACATCGACTTATGACTACAGCTGGGAGAATCTTCGGCAACGCCGAGGCTGGTGTAGATTATGTTAAACAACTAGCATATGAGAATGCCAACCCAGCTTGCCAAGCTGCTATTCGCCCTTACAGAAAGAAAACAGATTTAACTGGTTATATCCGCCTTTGTTCGGATATTGGACCCTCTTATCAGCAAGGCCTGGCCATGGCCGCCGCGTTCAGCGGACAAACTGTGAAAGATTTCCTAAACAACAAAAATAAGGATAAAGGAGGGTGTTTCAAATGTGGTAAGAGAGGACATTTTGCAAAAAATTGCCGTGATAGTACTATCAAAACATCTGAAGTTAAAGTTCCAGCACTCTGCCCCAGGTGTAAACGAGGAAAGCATTGGGCTAATGAATGTAAATCCAAAACTGATAATCAGGGAAATCCACTGCCACCCCATCAGGGAAACGGAATGAGGGGCCAGCCCCAGGCCCCGAAGCAAGCTTATGGGGCGGTCAGTTTTGTTCCAGCCAGCAACAACAATCCGTTTCAAAACTTATTAGAGCCACACCAGGAAGCGCAGGACTGGACCTCTGTTCCACCTCCCACACAGTACTAACACCTGAAATGGGCCCCCAAACTCTCAGTACTGGTATTTATGGGCCCCTACCTCCAAATACCTTCGGATTAATCTTAGGTAGAAGCAGTACTACCATGAGAGGTTTACAAGTTTTTCCAGGAGTCATTGACAATGATTATGAGGGAGAAATTAAGATAATGGCCAAAGCCATAGATAACATCGTCACTGTCCCTCAAGGGAATAGGATCGCACAACTAGTCCTCCTGCCTTTAATTAAAACAGCCCACACTATACAACATCCATATAGAGGAAAAGGCAGTTTTGGATCCTCAGACATATATTGGGTTCAGCCAATTACAAATCAAAAACCTTCCTTAACGTTATGGCTGGACGGTAAGTTGTTTACAGGATTAATAGATACAGGAGCTGATGTTACTATTATTAAACAAGAGGACTGGCCCCTTGATTGGCCTACTACAGATACCTTAACTAATTTAAGAGGAATTGGACAAAGTAATAATCCTAAACAAAGTTCAAAATACCTTACTTGGTCAGACAAGGAAGGTAATTCTGGCCTCATCAAACCTTTTGTTATTCCTAACTTACCTGTTAATCTCTGGGGTCGAGACTTACTCTCTCAGATGAAAATTATGATGTGCAGCCCTAACGAAGTTGTTACTGCCCAAATGCTAGCTCAAGGCTATGCCCCAGGAAAAGGATTAGGAAAAAAGGAAAACGGGATCTTACAGCCCATTCCAAACCGAGGGCAATGTGATAAAAAAGGATTTGGAAATTTTTAACTATGGCCATTGACATGCTTGCACCCCAACAGTACGCTGACCCCATTACTTGGAGGTCCGACGAACCCGTTTGGGTTGATCAGTGGCCATTAACCAGTGAAAAACTTACCGCCGCCCAACAGTTAGTGCAAGAACAATTAGCGGCGGGACACGTTATAGAAAGTAACTCCCCCTGGAATACACCCATATTTGTTATAAAAAAGAAATCTGGAAAGTGGAGACTTCTTCAGGACTTAAGAGCTGTTAATGCCACTATGATATTGATGGGAGCTCTACAACCTGGATTACCCTCGCCGGTAGCCATCCCTCACAATTTTCTCAAAATTATTATTGATCTCAAAGACTGTTTTTTCACCATTCCTCTTCATCCTAATGACCAAAAAAGATTTGCCTTTAGTTTACCATCCATAAATTTTAAAGAACCTATGAAACGCTATCAGTGGAAAGTTTTGCCCCAAGGTATGGCCAACAGCCCCACCTTGTGCCAAAAATATGTTGCTGCAGCAATCAGTAACGTTAGAAATGCATGGCCACAGATGTATATTGTGCATTATATGGATGATATTCTCATAGCAGGCTCAGAAGGACAACAAGTTTTGCAATGCTTTTCGCAACTCAAAGAACACCTAACTATGGCTGGATTACATATAGCTCCAGAAAAGATACAGTTACAAGATCCCTATACATATCTAGGTTTTCACATGAATGGACCTAAGATCACCAACCAAAAAGCAGTAATTCGTAAAGACAACTTACAAACTCTTAATGATTTCCAAAAACTCTTAGGAGATATCAATTGGCTTCGTCCATACTTAAAACTCACCACAGGAGACTTAAAACCTTTATTTGATATTCTCAAGGGAGACTCTAACCCCAATTCTCCTAGATCCTTGTCAAAAGAAGCTCAAATGGCACTTAATACAGTAGAAACAGCCATTGCTGAACAATTTGTTACTTACATAGACTATTCACAACCACTAATCTTTCTTATTTTTAACACAACTCTGACACCTACCGGCTTGTTTTGGCAAAATAATCCCATCATGTGGGTCCACCTGCCTGCCTCACCTAAAAAGGTGTTACTTCCATATTATGAAGCTGTAGCAGATTTAATCCTTCTAGGAAGAGATAACAGTAAAAAATATTTTGGAATTGAACCATTTACAATTATCCAACCATACTCTGCCTCCCAGATTAATTGGTTAATGCAAAATACAGAGACATGGCCAATTGCCTGCGCCTCATATGCGGGTAACCTAGACAACCATTATCCTCCCAATAAACTTATTCAATTTTGTAAATTGCACACCTTTATTTTTCCTCAGATTGTCAGCCAATCGCCCCTAAATGATGCTTTGTTGATCTTTACTGATGGCTCTTCCACCGGAATAGCCGCATATACTTTCTCAGGCACTACGGTCAAATTTCATACCACACTTACTTCGGCCCAATTAGTAGAATTACAAGCTCTTATTGCAGTCCTATCAGCCTTTCCTGACCAACCTCTTAATATCTATACCGATAGTGCATATCTGGCCCATTCAATACCTTTACTTGAAACCGTTACACAAATCACACATATATCTACAACTGCCCAATTATTCTTACAATGTCAACAATTAATACACGCCAGATCCATACCCTTCTACATTGGACATGTCAGAGCTCATTCTGGACTACCTGGACCTATAGCCGAAGGCAACAAGTTAGCTGATCTGGCAACCAAAACTATTGCTCTTAACCTACAAACAAATCTTAAATCAGCTCAAGCT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| 79,782
|
KU605778.1
|
Simian retrovirus 8
|
Zao,C.L., Tomanek,L., Cooke,A., Berger,R., Yang,L., Xie,C., Chen,S., Shi,C., Rong,R., Zao,C.-L.
|
VRL
|
USA
|
2016-10-01
| null |
Simian retrovirus 8
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,138
|
GenBank
| 1
|
USA: San Antonio, TX
|
USA
|
Macaca fascicularis
| null |
2015
| null | null |
Simian retrovirus 8 strain SRV8/TEX/2015/V1, complete genome
|
TGTCCGGAGCCGTGCTGCCCGGCTATGGATTCTTAAGTCTCAGCCTCCATGTTGTTGAGTTAAGATGGCGTACTTCCTGCTTCTTCTCCGTCTTGCTTTCCCCGCCGGCGCCAATTCTTCCCGCCTTTGCAGACGTGGCACTTCCTGCCTAAAGTGTTTGAGCATGCGCCCTACAATGTTTCCCCTCCTCCCTATCATTCGCCTATATAAGGCAGCGCTCTGCCATCATTAAATGAGACTTGATCAGAACACTGTCTTGTCTCCATTTCTTGTGTCTCTTGTCCCTTCAATTCCCACTCCCTCCTCCAGGTTCCTAGTTGCTGTCCCGCGGGACGGGACATCTGGCGCCCAACGTGGGGCCTGGATACGAGGGAATTTTGTGAGGAAGACGACCCGCATAGCTGCCGGCGTTAAAAGTGAAAGTAACCCGTTTCATCCGCCGCGGGAGCCTGCCGCGTCGGAATTCAAGTAAGTGGTTTGGTCGGATATGGGACAAGAATTAAGCCAACATGAACGCTATGTTACTCAATTGAAAGAGGCTTTAAAGACACGGGGAGTAAAGGTTAAATATATTGATCTGTTAAAATTCTTTGACTTTGTAAAAGACACCTGTCCCTGGTTTCCTCAAGAAGGAACCATCGACATCAAGAGATGGCTTAGAGTAGGCGATTGTTTTCAAGATTATTATGATACTTTTGGCCCCGAAAAGGTACCAGTTACTGCCTTTTCTTATTGGAACTTAATAAAGGAGTTAATTGACAAAAAGGACAAGGATCCTCAGGTATTAGCTGCAGTGACCCATACCGAAGAAATTCTGAAGAGCAGTTCTCAGACAGACCTTAGAAAGTCCCCTCCTGATAAAGAGACGGATCTTATTTCTTTAGACAGTGATGAGGAAGAAACTAAGGCCCCATCTATAAAAAACCAAAAGGTGCCCGTTACTAAAAAATCCCACGACAAGCCAAAAAGATTTCCTGTTCTCTTAACTCAAGAGAATAAAGCTGATAATGACCCTGACCCTTCAGAAGTGGACTGGGGTGAGTTAGAAGACGAGGCAGCACAATATCACAATCCTGACTGGCCTCCCTTCTTGACTCGTCCGCCCCCATATAACAAAGCCACCCCTTCTGCGCCCACTGTTATGGCAGTTGTTAACCCAAAGGAAGAACTTAAGGAAAAAATTGCCCAGTTAGAGGAACAAATTAAATTAGAAGAGTTGCATCAATCATTAATTGTCAGATTGCAAAAATTAAAAACAGGAAATGAAAGAGTAACCAACCCAGACAGCACAGGGGGCCCTCCCGTCATGCCTCGCTGGCCAGGACAACATGTCCCCAAAGGCAAATGCTGTGCTAGTCGAGACAAAGAGGAACAACCTATTAAGGATATTTTTCCAGTTACAGAAACTGTAGATGGGCAGGGCCAAGCCTGGAGACACCACAATGGTTTTGATTTTACTATCATCAAAGAATTGAAAACTGCTGCCTCTCAATACGGAGCTACTGCCCCGTATACATTAGCCATAGTCGAGTCTGTGGCGGACAATTGGCTTACCCCTGCAGACTGGAACACGCTAGTCAGAGCCGTCCTCTCGGGGGGAGACCACCTACTTTGGAAGTCTGAGTTTTTTGAAAACTGTAGAGATACAGCAAAACGAAACCAACAAGCCAACAATGGTTGGGATTTTGATATGTTAACAGGCTCTGGCAATTATGCCAGTACTGATGCACAGATGCAATATGATCCAGGACTATTTGCCCAAATTCAAGCTGCGGCCACAAAAGCTTGGAGAAAACTCCCTGTTAAGGGGGACCCTGGGGCTTCCCTCACTGGGGTCAAACAGGGGCCCGACGAGCCGTTCTCCGAGTTTGTACATCGACTTATGACTACAGCTGGGAGAATCTTCGGCAACGCCGAGGCTGGTGTAGATTATGTTAAACAACTAGCATATGAGAATGCCAACCCAGCTTGCCAAGCTGCTATTCGCCCTTACAGAAAGAAAACAGATTTAACTGGTTATATCCGCCTTTGTTCGGATATTGGACCCTCTTATCAGCAAGGCCTGGCCATGGCCGCCGCGTTCAGCGGACAAACTGTGAAAGATTTCCTAAACAACAAAAATAAGGATAAAGGAGGGTGTTTTAAATGTGGTAAGAGAGGACATTTTGCAAAAAATTGCCGTGATAGTACTATCAAAACATCTGAAGTTAAAGTTCCAGCACTCTGCCCCAGGTGTAAACGAGGAAAGCATTGGGCTAATGAATGTAAATCCAAAACTGATAATCAGGGAAATCCACTGCCACCCCATCAGGGAAACGGAATGAGGGGCCAGCCCCAGGCCCCGAAGCAAGCTTATGGGGCGGTCAGTTTTGTTCCAGCCAGCAACAACAATCCGTTTCAAAACTTATTAGAGCCACACCAGGAAGCGCAGGACTGGACCTCTGTTCCACCTCCCACACAGTACTAACACCTGAAATGGGCCCCCAAACTCTCAGTACTGGTATTTATGGGCCCCTACCTCCCAATACCTTCGGATTAATCTTAGGTAGAAGCAGTACTACCATAAGAGGTTTACAGGTTTTTCCAGGAGTCATTGACAATGATTATGAGGGAGAAATTAAGATAATGGCCAAAGCCATAGATAACATCGTCACTGTCCCTCAAGGGAATAGGATCGCACAACTAGTCCTCCTGCCTTTAATAAAAACAGCCCACACTATACAACATCCATATAGAGGAAAAGGCAGTTTTGGATCCTCAGACATATATTGGGTTCAGCCAATTACAAATCAAAAACCTTCCTTAACGTTATGGCTGGACGGTAAGTTGTTTACGGGATTAATAGATACAGGAGCTGATGTTACTATTATTAAACAGGAGGACTGGCCCTTTGATTGGCCTACTACAGATACCTTAACTAATTTAAGAGGAATTGGACAAAGTAATAATCCTAAACAAAGTTCAAAATACCTTACTTGGTCAGACAAGGAAGGTAATTCTGGCCTCATCAAACCTTTTGTTATTCCTAACTTACCTGTTAATCTCTGGGGTCGAGACTTACTCTCTCAGATGAAAATTATGATGTGCAGCCCTAACGAAGTTGTTACTGCCCAAATGCTAGCTCAAGGCTATGCCCCAGGAAAAGGATTAGGAAAAAAGGAAAACGGGATCTTACAGCCCATTCCAAACCGAGGGCAATGTGATAAAAAAGGATTTGGAAATTTTTAACTGTGGCCATTGACATGCTTGCACCCCAACAGTGCGCTGACCCCATTACTTGGAGGTCCGACGAACCCGTTTGGGTTGATCAGTGGCCATTAACCAGTGAAAAACTTACCGCCGCCCAACAGTTAGTGCAAGAACAATTAGCGGCGGGACACGTTATAGAAAGTAACTCCCCCTGGAATACACCCATATTTGTTATAAAAAAGAAATCTGGAAAGTGGAGACTTCTTCAGGACTTAAGAGCTGTTAATGCCACTATGATATTGATGGGAGCTCTACAACCTGGATTACCCTCGCCGGTAGCCATCCCTCACAATTTTCTCAAAATTATTATTGATCTCAAAGACTGTTTTTTCACCATTCCTCTTCATCCTAATGACCAAAAAAGATTTGCCTTTAGTTTACCATCCATAAATTTTAAAGAACCTATGAAACGCTATCAGTGGAAAGTTTTGCCCCAAGGTATGGCCAACAGCCCCACCTTGTGCCAAAAATATGTTGCTGCAGCAATCAGTAACGTTAGAAATGCATGGCCACAGATGTATATTGTGCATTATATGGATGATATTCTCATAGCAGGCTCAGAAGGACAACAAGTTTTGCAATGCTTTTCGCAACTCAAAGAACACCTAACTATGGCTGGATTACACATAGCTCCAGAAAAGATACAGTTACAAGATCCCTATACATATCTAGGTTTTCACATGAATGGACCTAAGATCACCAACCAAAAAGCAGTAATTCGTAAAGACAACTTACAAACTCTTAATGATTTCCAAAAACTCTTAGGAGATATCAATTGGCTTCGTCCATACTTAAAACTCACCACAGGAGACTTAAAACCTTTATTTGATATTCTCAAGGGAGACTCTAACCCCAATTCTCCTAGATCCTTGTCAAAAGAAGCTCAAATGGCACTTAATACAGTAGAAACAGCCATTGCTGAACAATTTGTTACTTACATAGACTATTCACAACCACTAATCTTTCTTATTTTTAACACAACTCTGACACCTACCGGCTTGTTTTGGCAAAATAATCCCATCATGTGGGTCCACCTGCCTGCCTCACCTAAAAAGGTGTTACTTCCATATTATGAAGCCGTAGCAGACTTAATCCTTCTAGGAAGAGATAACAGTAAAAAATATTTTGGAATTGAACCATTTACAATTATCCAACCATACTCTGCCTCCCAGATTAATTGGCTAATGCAAAATACAGAGACATGGCCAATTGCCTGCGCCTCATATGCGGGTAACCTAGACAACCATTATCCTCCCAATAAACTTATTCAATTTTGTAAATTGCACACCTTTATTTTTCCTCAGATTGTCAGCCAATCGCCCCTAAATGATGCTTTGTTGATCTTTACTGATGGCTCTTCCACCGGAATAGCCGCATATACTTTCTCAGGCACTACGGTCAAATTTCATACCACGCTTACTTCGGCCCAATTAGTAGAATTACAAGCTCTTATTGCAGTCCTATCAGCCTTTCCTGACCAACCTCTTAATATCTATACCGATAGTGCATATCTGGCCCATTCAATACCTTTACTTGAAACCGTTACACAAATCACACATATATCTACAACTGCCCAATTATTCTTACAATGTCAACAATTAATACACGCCAGATCCATACCCTTCTACATTGGACATGTCAGAGCTCATTCTGGACTACCTGGACCTATAGCCGAAGGCAACAGGTTAGCTGATCTGGCAACCAAAACTATTGCTCTTAACCTACAAACAAATCTTAAATCAGCTCAAGCT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| 79,783
|
KU605779.1
|
Simian retrovirus 8
|
Zao,C.L., Tomanek,L., Cooke,A., Berger,R., Yang,L., Xie,C., Chen,S., Shi,C., Rong,R., Zao,C.-L.
|
VRL
|
USA
|
2016-10-01
| null |
Simian retrovirus 8
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,138
|
GenBank
| 1
|
USA: San Antonio, TX
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USA
|
Macaca fascicularis
| null |
2015
| null | null |
Simian retrovirus 8 strain SRV8/TEX/2015/V2, complete genome
|
TGTCCGGAGCCGTGCTGCCCGGCTATGGATTCTTAAGTCTCAGCCTCCATGTTGTTGAGTTAAGATGGCGTACTTCCTGCTTCTTCTCCGTCTTGCTTTCCCCGCCGGCGCCAATTCTTCCCGCCTTTGCAGACGTGGCACTTCCTGCCTAAAGTGTTTGAGCATGCGCCCTACAATGTTTCCCCTCCTCCCTATCATTCGCCTATATAAGGCAGCGCTCTGCCATCATTAAATGAGACTTGATCAGAACACTGTCTTGTCTCCATTTCTTGTGTCTCTTGTCCCTTCAATTCCCACTCCCTCCTCCAGGTTCCTAGTTGCTGTCCCGCGGGACGGGACATCTGGCGCCCAACGTGGGGCTTGGATACGAGGGAATTTTGTGAGGAAGACGACCCGCATAGCTGCCGGCGTTAAAAGTGAAAGTAACCCGTTTCATCCGCCGCGGGAGCCTGCCGCGTCGGAATTCAAGTAAGTGGTTTGGTCGGATATGGGACAAGAATTAAGCCAACATGAACGCTATGTTACTCAATTGAAAGAGGCTTTAAAGACACGGGGAGTAAAGGTTAAATATATTGATCTGTTAAAATTCTTTGACTTTGTAAAAGACACCTGTCCCTGGTTTCCTCAAGAAGGAACCATCGACATCAAGAGATGGCTTAGAGTAGGCGATTGTTTTCAAGATTATTATGATACTTTTGGCCCCGAAAAGGTACCAGTTACTGCCTTTTCTTATTGGAACTTAATAAAGGAGTTAATTGACAAAAAGGACAAGGATCCTCAGGTATTAGCTGCAGTGACCCATACCGAAGAAATTCTGAAGAGCAGTTCTCAGACAGACCTTAGAAAGTCCCTTCCTGATAAAGAGACGGATCTTATTTCTTTAGACAGTGATGAGGAAGAAACTAAGGCCCCATCTATAAAAAACCAAAAGGTGCCCGTTACTAAAAAATCCCACGACAAGCCAAAAAGATTTCCTGTTCTCTTAACTCAAGAGAATAAAGCTGATAATGACCCTGACCCTTCAGAAGTGGACTGGGGTGAGTTAGAAGACGAGGCAGCACAATATCATAATCCTGACTGGCCTCCCTTCTTGACTCGTCCGCCCCCATATAACAAAGCCACCCCTTCTGCGCCCACTGTTATGGCAGTTGTTAACCCAAAGGAAGAACTTAAGGAAAAAATTGCCCAGTTAGAGGAACAAATTAAATTAGAAGAGTTGCATCAATCATTAATTGTCAGATTGCAAAAATTAAAAACAGGAAATGAAAGAGTAACCAACCCAGACAGCACAGGGGGCCCTCCCGTCATGCCTCGCTGGCCAGGACAACATGTCCCCAAAGGCAAATGCTGTGCTAGTCGAGACAAAGAGGAACAACCTATTAAGGATATTTTTCCAGTTACAGAAACTGTAGATGGGCAGGGCCAAGCCTGGAGACACCACAATGGTTTTGATTTTACTATCATCAAAGAATTGAAAACTGCTGCCTCTCAATACGGAGCTACTGCCCCGTATACATTAGCCATAGTCGAGTCTGTGGCGGACAATTGGCTTACCCCTGCAGACTGGAACACGCTAGTCAGAGCCGTCCTCTCGGGGGGAGACCACCTACTTTGGAAGTCTGAGTTTTTTGAAAACTGTAGAGATACAGCAAAACGAAACCAACAAGCCAACAATGGTTGGGATTTTGATATGTTAACAGGCTCTGGCAATTATGCCAGTACTGATGCACAGATGCAATATGATCCAGGACTATTTGCCCAAATTCAAGCTGCGGCCACAAAAGCTTGGAGAAAACTCCCTGTTAAGGGGGACCCTGGGGCTTCCCTCACTGGGGTCAAACAGGGGCCCGACGAGCCGTTCTCCGAGTTTGTACATCGACTTATGACTACAGCTGGGAGAATCTTCGGCAACGCCGAGGCTGGTGTAGATTATGTTAAACAACTAGCATATGAGAATGCCAACCCAGCTTGCCAAGCTGCTATTCGCCCTTACAGAAAGAAAACAGATTTAACTGGTTATATCCGCCTTTGTTCGGATATTGGACCCTCTTATCAGCAAGGCCTGGCCATGGCCGCCGCGTTCAGCGGACAAACTGTGAAAGATTTCCTAAACAACAAAAATAAGGATAAAGGAGGGTGTTTTAAATGTGGTAAGAGAGGACATTTTGCAAAAAATTGCCGTGATAGTACTATCAAAACATCTGAAGTTAAAGTTCCAGCACTCTGCCCCAGGTGTAAACGAGGAAAGCATTGGGCTAATGAATGTAAATCCAAAACTGATAATCAGGGAAATCCACTGCCACCCCATCAGGGAAACGGAATGAGGGGCCAGCCCCAGGCCCCGAAGCAAGCTTATGGGGCGGTCAGTTTTGTTCCAGCCAGCAACAACAATCCGTTTCAAAACTTATTAGAGCCACACCAGGAAGCGCAGGACTGGACCTCTGTTCCACCTCCCACACAGTACTAACACCTGAAATGGGCCCCCAAACTCTCAGTACTGGTATTTATGGGCCCCTACCTCCCAATACCTTCGGATTAATCTTAGGTAGAAGCAGTACTACCATAAGAGGTTTACAGGTTTTTCCAGGAGTCATTGACAATGATTATGAGGGAGAAATTAAGATAATGGCCAAAGCCATAGATAACATCGTCACTGTCCCTCAAGGGAATAGGATCGCACAACTAGTCCTCCTGCCTTTAATAAAAACAGCCCACACTATACAACATCCATATAGAGGAAAAGGCAGTTTTGGATCCTCAGACATATATTGGGTTCAGCCAATTACAAATCAAAAACCTTCCTTAACGTTATGGCTGGACGGTAAGTTGTTTACGGGATTAATAGATACAGGAGCTGATGTTACTATTATTAAACAGGAGGACTGGCCCTTTGATTGGCCTACTACAGATACCTTAACTAATTTAAGAGGAATTGGACAAAGTAATAATCCTAAACAAAGTTCAAAATACCTTACTTGGTCAGACAAGGAAGGTAATTCTGGCCTCATCAAACCTTTTGTTATTCCTAACTTACCTGTTAATCTCTGGGGTCGAGACTTACTCTCTCAGATGAAAATTATGATGTGCAGCCCTAACGAAGTTGTTACTGCCCAAATGCTAGCTCAAGGCTATGCCCCAGGAAAAGGATTAGGAAAAAAGGAAAACGGGATCTTACAGCCCATTCCAAACCGAGGGCAATGTGATAAAAAAGGATTTGGAAATTTTTAACTGTGGCCATTGACATGCTTGCACCCCAACAGTGCGCTGACCCCATTACTTGGAGGTCCGACGAACCCGTTTGGGTTGATCAGTGGCCATTAACCAGTGAAAAACTTACCGCCGCCCAACAGTTAGTGCAAGAACAATTAGCGGCGGGACACGTTATAGAAAGTAACTCCCCCTGGAATACACCCATATTTGTTATAAAAAAGAAATCTGGAAAGTGGAGACTTCTTCAGGACTTAAGAGCTGTTAATGCCACTATGATATTGATGGGAGCTCTACAACCTGGATTACCCTCGCCGGTAGCCATCCCTCACAATTTTCTCAAAATTATTATTGATCTCAAAGACTGTTTTTTCACCATTCCTCTTCATCCTAATGACCAAAAAAGATTTGCCTTTAGTTTACCATCCATAAATTTTAAAGAACCTATGAAACGCTATCAGTGGAAAGTTTTGCCCCAAGGTATGGCCAACAGCCCCACCTTGTGCCAAAAATATGTTGCTGCAGCAATCAGTAACGTTAGAAATGCATGGCCACAGATGTATATTGTGCATTATATGGATGATATTCTCATAGCAGGCTCAGAAGGACAACAAGTTTTGCAATGCTTTTCGCAACTCAAAGAACACCTAACTATGGCTGGATTACACATAGCTCCAGAAAAGATACAGTTACAAGATCCCTATACATATCTAGGTTTTCACATGAATGGACCTAAGATCACCAACCAAAAAGCAGTAATTCGTAAAGACAACTTACAAACTCTTAATGATTTCCAAAAACTCTTAGGAGATATCAATTGGCTTCGTCCATACTTAAAACTCACCACAGGAGACTTAAAATCTTTATTTGATATTCTCAAGGGAGACTCTAACCCCAATTCTCCTAGATCCTTGTCAAAAGAAGCTCAAATGGCACTTAATACAGTAGAAACAGCCATTGCTGAACAATTTGTTACTTACATAGACTATTCACAACCACTAATCTTTCTTATTTTTAACACAACTCTGACACCTACCGGCTTGTTTTGGCAAAATAATCCCATCATGTGGGTCCACCTGCCTGCCTCACCTAAAAAGGTGTTACTTCCATATTATGAAGCCGTAGCAGACTTAATCCTTCTAGGAAGAGATAACAGTAAAAAATATTTTGGAATTGAACCATTTACAATTATCCAACCATACTCTGCCTCCCAGATTAATTGGCTAATGCAAAATACAGAGACATGGCCAATTGCCTGCGCCTCATATGCGGGTAACCTAGACAACCATTATCCTCCCAATAAACTTATTCAATTTTGTAAATTGCACACCTTTATTTTTCCTCAGATTGTCAGCCAATCGCCCCTAAATGATGCTTTGTTGATCTTTACTGATGGCTCTTCCACCGGAATAGCCGCATATACTTTCTCAGGCACTACGGTCAAATTTCATACCACGCTTACTTCGGCCCAATTAGTAGAATTACAAGCTCTTATTGCAGTCCTATCAGCCTTTCCTGACCAACCTCTTAATATCTATACCGATAGTGCATATCTGGCCCATTCAATACCTTTACTTGAAACCGTTACACAAATCACACATATATCTACAACTGCCCAATTATTCTTACAATGTCAACAATTAATACACGCCAGATCCATACCCTTCTACATTGGACATGTCAGAGCTCATTCTGGACTACCTGGACCTATAGCCGAAGGCAACAGGTTAGCTGATCTGGCAACCAAAACTATTGCTCTTAACCTACAAACAAATCTTAAATCAGCTCAAGCT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| 79,784
|
KU605780.1
|
Simian retrovirus 8
|
Zao,C.L., Tomanek,L., Cooke,A., Berger,R., Yang,L., Xie,C., Chen,S., Shi,C., Rong,R., Zao,C.-L.
|
VRL
|
USA
|
2016-10-01
| null |
Simian retrovirus 8
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,134
|
GenBank
| 1
|
USA: San Antonio, TX
|
USA
|
Macaca fascicularis
| null |
2015
| null | null |
Simian retrovirus 8 strain SRV8/TEX/2015/V3, complete genome
|
TGTCCGGAGCCGTGCTGCCCGGCTATGGATTCTTAAGTCTCAGCCTCCATGTTGTTGAGTTAAGATGGCGTACTTCCTGCTTCTTCTCCGTCTTGCTTTCCCCGCCGGCGCCAATTCTTCCCGCCTTTGCAGACGTGGCACTTCCTGCCTAAAGTGTTTGAGCATGCGCCCTACAATGTTTCCCCTCCTCCCTATCATTCGCCTATATAAGGCAGCGCTCTGCCATCATTAAATGAGACTTGATCAGAACACTGTCTTGTCTCCATTTCTTGTGTCTCTTGTCCCTTCAATTCCCACTCCCTCCTCCAGGTTCCTAGTTGCTGTCCCGCGGGACGGGACATCTGGCGCCCAACGTGGGGCTTGGATACGAGGGAATTTTGTGAGGAAGACGACCCGCATAGCTGCCGGCGTTAAAAGTGAAAGTAACCCGTTTCATCCGCCGCGGGAGCCTGCCGCGTCGGAATTCAAGTAAGTGGTTTGGTCGGATATGGGACAAGAATTAAGCCAACATGAACGCTATGTTACTCAATTGAAAGAGGCTTTAAAGACACGGGGAGTAAAGGTTAAATATATTGATCTGTTAAAATTCTTTGACTTTGTAAAAGACACCTGTCCCTGGTTTCCTCAAGAAGGAACCATCGACATCAAGAGATGGCTTAGAGTAGGCGATTGTTTTCAAGATTATTATGATACTTTTGGCCCCGAAAAGGTACCAGTTACTGCCTTTTCTTATTGGAACTTAATAAAGGAGTTAATTGACAAAAAGGACAAGGATCCTCAGGTATTAGCTGCAGTGACCCATACCGAAGAAATTCTGAAGAGCAGTTCTCAGACAGACCTTAGAAAGTCCCCTCCTGATAAAGAGACGGATCTTATTTCTTTAGACAGTGATGAGGAAGAAACTAAGGCCCCATCTATAAAAAACCAAAAGGTGCCCGTTACTAAAAAATCCCACGACAAGCCAAAAAGATTTCCTGTTCTCTTAACTCAAGAGAATAAAGCTGATAATGACCCTGACCCTTCAGAAGTGGACTGGGGTGAGTTAGAAGACGAGGCAGCACAATATCATAATCCTGACTGGCCTCCCTTCTTGACTCGTCCGCCCCCATATAACAAAGCCACCCCTTCTGCGCCCACTGTTATGGCAGTTGTTAACCCAAAGGAAGAACTTAAGGAAAAAATTGCCCAGTTAGAGGAACAAATTAAATTAGAAGAGTTGCATCAATCATTAATTGTCAGATTGCAAAAATTAAAAACAGGAAATGAAAGAGTAACCAACCCAGACAGCACAGGGGGCCCTCCCGTCATGCCTCGCTGGCCAGGACAACATGTCCCCAAAGGCAAATGCTGTGCTAGTCGAGACAAAGAGGAACAACCTATTAAGGATATTTTTCCAGTTACAGAAACTGTAGATGGGCAGGGCCAAGCCTGGAGACACCACAATGGTTTTGATTTTACTATCATCAAAGAATTGAAAACTGCTGCCTCTCAATACGGAGCTACTGCCCCGTATACATTAGCCATAGTCGAGTCTGTGGCGGACAATTGGCTTACCCCTGCAGACTGGAACACGCTAGTCAGAGCCGTCCTCTCGGGGGGAGACCACCTACTTTGGAAGTCTGAGTTTTTTGAAAACTGTAGAGATACAGCAAAACGAAACCAACAAGCCAACAATGGTTGGGATTTTGATATGTTAACAGGCTCTGGCAATTATGCCAGTACTGATGCACAGATGCAATATGATCCAGGACTATTTGCCCAAATTCAAGCTGCGGCCACAAAAGCTTGGAGAAAACTCCCTGTTAAGGGGGACCCTGGGGCTTCCCTCACTGGGGTCAAACAGGGGCCCGACGAGCCGTTCTCCGAGTTTGTACATCGACTTATGACTACAGCTGGGAGAATCTTCGGCAACGCCGAGGCTGGTGTAGATTATGTTAAACAACTAGCATATGAGAATGCCAACCCAGCTTGCCAAGCTGCTATTCGCCCTTACAGAAAGAAAACAGATTTAACTGGTTATATCCGCCTTTGTTCGGATATTGGACCCTCTTATCAGCAAGGCCTGGCCATGGCCGCCGCGTTCAGCGGACAAACTGTGAAAGATTTCCTAAACAACAAAAATAAGGATAAAGGAGGGTGTTTTAAATGTGGTAAGAGAGGACATTTTGCAAAAAATTGCCGTGATAGTACTATCAAAACATCTGAAGTTAAAGTTCCAGCACTCTGCCCCAGGTGTAAACGAGGAAAGCATTGGGCTAATGAATGTAAATCCAAAACTGATAATCAGGGAAATCCACTGCCACCCCATCAGGGAAACGGAATGAGGGGCCAGCCCCAGGCCCCGAAGCAAGCTTATGGGGCGGTCAGTTTTGTTCCAGCCAGCAACAACAATCCGTTTCAAAACTTATTAGAGCCACACCAGGAAGCGCAGGACTGGACCTCTGTTCCACCTCCCACACAGTACTAACACCTGAAATGGGCCCCCAAACTCTCAGTACTGGTATTTATGGGCCCCTACCTCCCAATACCTTCGGATTAATCTTAGGTAGAAGCAGTACTACCATAAGAGGTTTACAGGTTTTTCCAGGAGTCATTGACAATGATTATGAGGGAGAAATTAAGATAATGGCCAAAGCCATAGATAACATCGTCACTGTCCCTCAAGGGAATAGGATCGCACAACTAGTCCTCCTGCCTTTAATAAAAACAGCCCACACTATACAACATCCATATAGAGGAAAAGGCAGTTTTGGATCCTCAGACATATATTGGGTTCAGCCAATTACAAATCAAAAACCTTCCTTAACGTTATGGCTGGACGGTAAGTTGTTTACGGGATTAATAGATACAGGAGCTGATGTTACTATTATTAAACAGGAGGACTGGCCCCTTGATTGGCCTACTACAGATACCTTAACTAATTTAAGAGGAATTGGACAAAGTAATAATCCTAAACAAAGTTCAAAATACCTTACTTGGTCAGACAAGGAAGGTAATTCTGGCCTCATCAAACCTTTTGTTATTCCTAACTTACCTGTTAATCTCTGGGGTCGAGACTTACTCTCTCAGATGAAAATTATGATGTGCAGCCCTAACGAAGTTGTTACTGCCCAAATGCTAGCTCAAGGCTATGCCCCAGGAAAAGGATTAGGAAAAAAGGAAAACGGGATCTTACAGCCCATTCCAAACCGAGGGCAATGTGATAAAAAAGGATTTGGAAATTTTTAACTGTGGCCATTGACATGCTTGCACCCCAACAGTGCGCTGACCCCATTACTTGGAGGTCCGACGAACCCGTTTGGGTTGATCAGTGGCCATTAACCAGTGAAAAACTTACCGCCGCCCAACAGTTAGTGCAAGAACAATTAGCGGCGGGACACGTTATAGAAAGTAACTCCCCCTGGAATACACCCATATTTGTTATAAAAAAGAAATCTGGAAAGTGGAGACTTCTTCAGGACTTAAGAGCTGTTAATGCCACTATGATATTGATGGGAGCTCTACAACCTGGATTACCCTCGCCGGTAGCCATCCCTCACAATTTTCTCAAAATTATTATTGATCTCAAAGACTGTTTTTTCACCATTCCTCTTCATCCTAATGACCAAAAAAGATTTGCCTTTAGTTTACCATCCATAAATTTTAAAGAACCTATGAAACGCTATCAGTGGAAAGTTTTGCCCCAAGGTATGGCCAACAGCCCCACCTTGTGCCAAAAATATGTTGCTGCAGCAATCAGTAACGTTAGAAATGCATGGCCACAGATGTATATTGTGCATTATATGGATGATATTCTCATAGCAGGCTCAGAAGGACAACAAGTTTTGCAATGCTTTTCGCAACTCAAAGAACACCTAACTATGGCTGGATTACACATAGCTCCAGAAAAGATACAGTTACAAGATCCCTATACATATCTAGGTTTTCACATGAATGGACCTAAGATCACCAACCAAAAAGCAGTAATTCGTAAAGACAACTTACAAACTCTTAATGATTTCCAAAAACTCTTAGGAGATATCAATTGGCTTCGTCCATACTTAAAACTCACCACAGGAGACTTAAAACCTTTATTTGATATTCTCAAGGGAGACTCTAACCCCAATTCTCCTAGATCCTTGTCAAAAGAAGCTCAAATGGCACTTAATACAGTAGAAACAGCCATTGCTGAACAATTTGTTACTTACATAGACTATTCACAACCACTAATCTTTCTTATTTTTAACACAACTCTGACACCTACCGGCTTGTTTTGGCAAAATAATCCCATCATGTGGGTCCACCTGCCTGCCTCACCTAAAAAGGTGTTACTTCCATATTATGAAGCCGTAGCAGACTTAATCCTTCTAGGAAGAGATAACAGTAAAAAATATTTTGGAATTGAACCATTTACAATTATCCAACCATACTCTGCCTCCCAGATTAATTGGCTAATGCAAAATACAGAGACATGGCCAATTGCCTGCGCCTCATATGCGGGTAACCTAGACAACCATTATCCTCCCAATAAACTTATTCAATTTTGTAAATTGCACACCTTTATTTTTCCTCAGATTGTCAGCCAATCGCCCCTAAATGATGCTTTGTTGATCTTTACTGATGGCTCTTCCACCGGAATAGCCGCATATACTTTCTCAGGCACTACGGTCAAATTTCATACCACGCTTACTTCGGCCCAATTAGTAGAATTACAAGCTCTTATTGCAGTCCTATCAGCCTTTCCTGACCAACCTCTTAATATCTATACCGATAGTGCATATCTGGCCCATTCAATACCTTTACTTGAAACCGTTACACAAATCACACATATATCTACAACTGCCCAATTATTCTTACAATGTCAACAATTAATACACGCCAGATCCATACCCTTCTACATTGGACATGTCAGAGCTCATTCTGGACTACCTGGACCTATAGCCGAAGGCAACAGGTTAGCTGATCTGGCAACCAAAACTATTGCTCTTAACCTACAAACAAATCTTAAATCAGCTCAAGCTTCCCATGCTTTACATCATCTCAATGCTCAAACTTTAAAGCAGATGTTTAATATCCCTAGAGAACAAGCTAGGCACATTGTAAAAAATTGCCCAACATGTGTTACTTACCTACCTGTTCCACATCTAGGAGTCAATCCTAGGGGATTATTCCCTAATATGCTCTGGCAAATGGATGTCACTCATTATTCAGAATTTGGTAAACTAAAATATATCCATGTATCTATAGACACGTTTAGTGGCTTCATACTAGCCACCCTGCAAACTGGAGAGGCTGCAAAACAAGTCATAGCACACTTACTCCACTGCTTCTCTATAATTGGACCCCCCAAACACCTTAAAACAGACAATGGCCCTGGATACACCTCCAAAACTTTTCAAGACTTTTGTTCTACATTACAAATTAAACATACTACCGGTATTCCCTATAACCCTCAAGGTCAAGGCATTGTCGAAAGAGCACATTTATCTCTTAAGACTACCATTGAAAAAATAAAAAAGGGAGAATGGTATCCCACAAAGGGCACCCCCAGAAATATTCTCAATCATGCTCTCTTTATTTTAAATTTTTTGAATTTAGATGATCAAGGTAAATCAGCAGCCGATCGCTTTTGGCATAATGACCCTGCAAAACAAACCGCTATGGTCAAATGGAGGGACCCGCTAGACAATAAGTGGCATGGTCCTGACCCCGTGCTAATATGGGGTAGAGGCTCGGTCTGCATCTTTTCGCAAACCCATGATGCGGCCAGATGGCTGCCAGAGCGATTAGTAAGGCAAATAAATAATGACAACCAATCCAGGGAATAACTCTTCTCCCTGAGATTCTTTTCTATTTTCTCATTACAGAATGAAGCTTATTCACATCGCCATCTGGAGCTTAGTGATCTTTTTTCAAGTATCACTAAGCCGTGCTGGTTTTGGAGATCCGCGTGAGGCTCTAGCCCACATACAAAACAAGCATGGCAAGCCTTGTGACTGCGGAGGAGGTTATACTCAGACCCAACCGACCACCTATGTCACCTCCATCTCCTGCGGTTCTCATACAGCTTACTCCCAAGTAGGTTCCCTTAAGTGGTTATGTATAAAAGCCCCGTCCACACCCAGTGGACAACATGTCGGAAGTTGCCCCCAGCAATGTTATACCCAGTCTTATGAATCTATGCATTCTTCCTGCTATACGTCCTATCAACAATGCACTATAGGTAATAAAACTTATTTTACCGCTACTATAACTGGTAGCAGGACTCCCACTGTGGGACAATCTAATACCCCTTCAGTAACGGGAAACAGCCATAATCTCATATCAGCTGGCTGTCATGACACAGGAAAGCCAGCCTGCTGGAGCACCCATCCTCCCGTTCATGTATCTGACGGAGGAGGGCCTCAAGACAAAGTTCGTGAGATTATAGTGGAAAAGAAGTTAGAAGAAATACAAAAGTCATTGTTCCCTGAACTTTCCTACCACCCTCTGGCTTTACCCGAAACCCGTGGTAAAGAGATGATTGATCCTCAAACTTTTGAGATTCTAACTACTGTACATAGTCTGCTTAATGCAACCAAACCCGACCTTGCTCAAGATTGTTGGCTATGCCTACGATCAGGAACTCCTGTTCCTCTCGCCCTTCCCTATAACAATATATCTTTGCCGAACTTCAATTGTTCATCTAATTACTCCTACCTCGTTACTCCACCCTTTCTAGTACAGCCTTTTAACTTCTCAGAATCTGATTGCCTGTATGCTCCATATCAAAACAATTCATTTGATATTGATGTAGGCACAGCTCAGTTTACCAATTGTACTAACACTTATAACATATCTATCTCCACTCCTCTGTGCGCCTATAATGGCTCTGTCTTTGTATGTGGCAACAATAAGGCATACACCTATCTGCCCACAAACTGGACCGGACTGTGTGCAGTTGCCACCCTTATACCAGACATAGACATCATTCCAGGCGATGAACCTGTTCCTGTTCCAGCTATAGATTACTTTATAAGTAGACCAAAAAGAGCTGTCCAATTTATTCCTTTACTCGTAGGGTTAGGCATTACAACAGCAGTATCAACTGGCGCTGCTGGCCTAGGACATTCCATTACCCAATACTCAAAATTGTCTCACCAACTAATTTCTGATGTACAGGCCATCTCTAGCACCATACAAGACCTCCAAGACCAAGTAGACTCCTTAGCAGAGGTAGTGCTACAAAATAGAAGGGGATTAGATCTATTAACTGCAGAACAGGGAGGTATCTGCTTAGCCCTACAGGAGAAATGCTGCTTCTACACCAACAAGTCCGGAGTCGTCAGAGACAAAATTAAACGTCTACAAGATGACTTGGAGAAACGTCGGCAACAGTTAATCGAAAGCCCCTTCTGGACTGGCCTCAATGGACTTCTTCCCTATCTCCTACCCTTGTTAGGCCCCTTACTTTGCTTGTTGCTTGTATTAACTTTTGGACCTCTTATCCTCAACAAACTTATGGCATTTATTAGACAACAAATCGAATCCATTCAAGCGAAACCCATACAGGTCCATTATCATCGACTTGAGCAAGAAGACCGCTGTGGCTCATATTTACGCATAACATAGCCACATTCCCTGTGAGCTAAACTGGACAGCCAGTGACGGGTAAGAGAGTGATATTTCTCACTGACCTAAGACAGGAGGGCCGTCTTAGCTACTGCCTAATCCCATGACGGGTAACAGTGATAGAAATAGATCACTCCAACCTAAGACAGGCGCAGTTTCCGAGGGAATCTTTGCTCCTATTTTATAAACAAAAAAAGGGTGACCTGTCCGGAGCCGTGCTGCCCGGCTATGGATTCTTAAGTCTCAGCCTCCATGTTGTTGAGTTAAGATGGCGTACTTCCTGCTTCTTCTCCGTCTTGCTTTCCCCGCCGGCGCCAATTCTTCCCGCCTTTGCAGACGTGGCACTTCCTGCCTAAAGTGTTTGAGCATGCGCCCTACAATGTTTCCCCTCCTCCCTATCATTCGCCTATATAAGGCAGCGCTCTGCCATCATTAAATGAGACTTGATCAGAACACTGTCTTGTCTCCATTTCTTGTGTCTCTTGTCCCTTCAATTCCCACTCCCTCCTCCAGGTTCCTAGTTGCTGTCCCGCGGGACGGGACA
| 79,785
|
OR117733.1
|
Simian-Chimpanzee immunodeficiency virus
|
Musaharrafieh,R., Safonova,Y., Song,G., Roark,R.S., Lee,F.-H., Zhang,S., Hurtado,J., Yong,P., Wang,S., Russell,R.M., Ding,W., Li,Y., Rando,J., Murphy,A., Lindemuth,E., Zhao,C., Connell,A.J., Lee,W.-H., Wagh,K., Mishra,N., Avillion,G., He,W., Callaghan,S., Dueker,K., Joyce,C., Zhao,F., Anzanello,F., Liu,W., Bibollet-Ruche,F., Ramos,A., Li,H., Lewis,M.G., Ozorowski,G., Landais,E., Sok,D., Briney,B., Ward,A.B., Hahn,B.H., Burton,D.R., Shaw,G.M., Andrabi,R.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2023-08-08
|
MT145
|
Simian immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,409
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null | null | null | null |
Simian-Chimpanzee immunodeficiency virus isolate MT145, complete genome
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| 14,175
|
OR117734.1
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Simian-Chimpanzee immunodeficiency virus
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Musaharrafieh,R., Safonova,Y., Song,G., Roark,R.S., Lee,F.-H., Zhang,S., Hurtado,J., Yong,P., Wang,S., Russell,R.M., Ding,W., Li,Y., Rando,J., Murphy,A., Lindemuth,E., Zhao,C., Connell,A.J., Lee,W.-H., Wagh,K., Mishra,N., Avillion,G., He,W., Callaghan,S., Dueker,K., Joyce,C., Zhao,F., Anzanello,F., Liu,W., Bibollet-Ruche,F., Ramos,A., Li,H., Lewis,M.G., Ozorowski,G., Landais,E., Sok,D., Briney,B., Ward,A.B., Hahn,B.H., Burton,D.R., Shaw,G.M., Andrabi,R.
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University of Pennsylvania, Medicine
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USA
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2023-08-08
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MT145K
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Simian immunodeficiency virus
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Lentivirus
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Retroviridae
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ssRNA-RT
| 10,409
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GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null | null | null | null |
Simian-Chimpanzee immunodeficiency virus isolate MT145K, complete genome
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| 14,176
|
OR117735.1
|
Simian-Chimpanzee immunodeficiency virus
|
Musaharrafieh,R., Safonova,Y., Song,G., Roark,R.S., Lee,F.-H., Zhang,S., Hurtado,J., Yong,P., Wang,S., Russell,R.M., Ding,W., Li,Y., Rando,J., Murphy,A., Lindemuth,E., Zhao,C., Connell,A.J., Lee,W.-H., Wagh,K., Mishra,N., Avillion,G., He,W., Callaghan,S., Dueker,K., Joyce,C., Zhao,F., Anzanello,F., Liu,W., Bibollet-Ruche,F., Ramos,A., Li,H., Lewis,M.G., Ozorowski,G., Landais,E., Sok,D., Briney,B., Ward,A.B., Hahn,B.H., Burton,D.R., Shaw,G.M., Andrabi,R.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2023-08-08
|
MT145K.dV5
|
Simian immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,382
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null | null | null | null |
Simian-Chimpanzee immunodeficiency virus isolate MT145K.dV5, complete genome
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ACGCGTGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAA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TACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCA
| 14,177
|
OP373447.1
|
Simian-Chimpanzee immunodeficiency virus
|
Bibollet-Ruche,F., Russell,R.M., Ding,W., Liu,W., Li,Y., Wrapp,D., Habib,R., Skelly,A.N., Roark,R.S., Sherrill-Mix,S., Wang,S., Rando,J., Lindemuth,E., Cruickshank,K., Park,Y., Baum,R., Connell,J., Giorgi,E.E., Wagh,K., Song,G.S., Andrabi,R., Finzi,A., Ding,S., Newman,A., Cain,D.W., Mansouri,K., Wiehe,K., Alam,M., Saunders,K.O., Lewis,M.G., Montefiori,D.C., Kwong,P.D., Verkoczy,L., Burton,D.R., Korber,B.T., Haynes,B.F., Edwards,R.J., Shaw,G.M., Hahn,B.H.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2022-10-30
|
SCIV.CAM13.Q171K.375M
|
Simian immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,428
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Chimpanzee immunodeficiency virus isolate SCIV.CAM13.Q171K.375M, complete genome
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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| 22,489
|
OP373448.1
|
Simian-Chimpanzee immunodeficiency virus
|
Bibollet-Ruche,F., Russell,R.M., Ding,W., Liu,W., Li,Y., Wrapp,D., Habib,R., Skelly,A.N., Roark,R.S., Sherrill-Mix,S., Wang,S., Rando,J., Lindemuth,E., Cruickshank,K., Park,Y., Baum,R., Connell,J., Giorgi,E.E., Wagh,K., Song,G.S., Andrabi,R., Finzi,A., Ding,S., Newman,A., Cain,D.W., Mansouri,K., Wiehe,K., Alam,M., Saunders,K.O., Lewis,M.G., Montefiori,D.C., Kwong,P.D., Verkoczy,L., Burton,D.R., Korber,B.T., Haynes,B.F., Edwards,R.J., Shaw,G.M., Hahn,B.H.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2022-10-30
|
SCIV.CAM13.RRK.375W
|
Simian immunodeficiency virus
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Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,428
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Chimpanzee immunodeficiency virus isolate SCIV.CAM13.RRK.375W, complete genome
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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| 22,490
|
MW410732.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,532
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain 9032.08_A1, complete sequence
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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GGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCA
| 43,491
|
MW410733.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,508
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain Ce1176, complete sequence
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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| 43,492
|
MW410734.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,496
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain CH1012, complete sequence
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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| 43,493
|
MW410735.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,496
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain T250-4, complete sequence
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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| 43,494
|
MW410736.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,490
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain Q23.17, complete sequence
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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| 43,495
|
MW410737.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,499
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain WITO, complete sequence
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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| 43,496
|
MW410738.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,457
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain ZM233, complete sequence
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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| 43,497
|
MW410739.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,493
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain 1086, complete sequence
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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| 43,498
|
MW410740.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,523
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain 40100, complete sequence
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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TAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCA
| 43,499
|
MW410741.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,443
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain CH0694, complete sequence
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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TTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCA
| 43,500
|
MW410742.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,395
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus strain CH505, complete sequence
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CACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCA
| 43,501
|
MW476487.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
|
USA
|
2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,314
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus clone SHIV.V2.Backbone2, complete sequence
|
TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATGTACTTAGAAAAAGAAGAAGGCATCGTACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGAGGCATTATTTAATGCAGCCAGCTCAAACTTCCAAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTAGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAGATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGATAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCAGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAGCAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAGGCGGCTATGCAGATTATCAGAGACATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAGCTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGCTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAGGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGCTTAAGAGCAGAACAAACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGACCAGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAAGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGACGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATCTTCCCATAGCTAAGGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGTTGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGGATTACAGTACTGGATATAGGTGACGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGTTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTAAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTAAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTTAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAGGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCACTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGAACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAGGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAACCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGACTAGTGGCCAAACAGATAGTAGACACATGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAAGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCCTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCGTACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAA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| 43,502
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MW476488.1
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Simian-Human immunodeficiency virus
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Li,H., Wang,S., Lee,F.H., Roark,R.S., Murphy,A.I., Smith,J., Zhao,C., Rando,J., Chohan,N., Ding,Y., Kim,E., Lindemuth,E., Bar,K.J., Pandrea,I., Apetrei,C., Keele,B.F., Lifson,J.D., Lewis,M.G., Denny,T.N., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
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University of Pennsylvania, Medicine
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USA
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2021-03-13
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
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Lentivirus
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Retroviridae
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ssRNA-RT
| 8,151
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GenBank
| 1
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Simian-Human immunodeficiency virus clone SHIV.V2.Backbone1, complete sequence
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| 43,503
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MT509359.1
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Simian-Human immunodeficiency virus
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Roark,R.S., Li,H., Williams,W.B., Chug,H., Mason,R.D., Gorman,J., Wang,S., Lee,F.-H., Rando,J., Bonsignori,M., Hwang,K.-K., Saunders,K.O., Wiehe,K., Moody,M.A., Hraber,P.T., Wagh,K., Giorgi,E.E., Russell,R.M., Bibollet-Ruche,F., Liu,W., Connell,J., Smith,A.G., DeVoto,J., Murphy,A.I., Smith,J., Ding,W., Zhao,C., Chohan,N., Okumura,M., Rosario,C., Ding,Y., Lindemuth,E., Bauer,A.M., Bar,K.J., Ambrozak,D., Chao,C.W., Chuang,G.-Y., Geng,H., Lin,B.C., Louder,M.K., Nguyen,R., Zhang,B., Lewis,M.G., Raymond,D., Doria-Rose,N.A., Schramm,C.A., Douek,D.C., Roederer,M., Kepler,T.B., Kelsoe,G., Mascola,J.R., Kwong,P.D., Korber,B.T., Harrison,S.C., Haynes,B.F., Hahn,B.H., Shaw,G.M.
|
University of Pennsylvania, Medicine
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USA
|
2020-11-27
| null |
Simian-Human immunodeficiency virus
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Lentivirus
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Retroviridae
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ssRNA-RT
| 10,487
|
GenBank
| null |
USA
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USA
| null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus clone SHIV.CAP256SU.375S, complete genome
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GTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAGACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACACCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCGGTAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCA
| 45,533
|
MK686073.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Bender,A.M., Simonetti,F.R., Kumar,M.R., Fray,E.J., Bruner,K.M., Timmons,A.E., Tai,K.Y., Jenike,K.M., Antar,A.A.R., Liu,P.T., Ho,Y.C., Raugi,D.N., Seydi,M., Gottlieb,G.S., Okoye,A.A., Del Prete,G.Q., Picker,L.J., Mankowski,J.L., Lifson,J.D., Siliciano,J.D., Laird,G.M., Barouch,D.H., Clements,J.E., Siliciano,R.F., Bender,A., Siliciano,R.
|
Johns Hopkins University School of Medicine, Medicine
|
USA
|
2020-07-27
|
SHIV_SF162
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,633
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus isolate SHIV_SF162, complete genome
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TGGAAGGGATTTATTACAGTGCAAGAAGACATAGAATCTTAGACATATACTTAGAAAAGGAAGAAGGCATCATACCAGATTGGCAGGATTACACCTCAGGACCAGGAATTAGATACCCAAAGACATTTGGCTGGCTATGGAAATTAGTCCCTGTAAATGTATCAGATGAGGCACAGGAGGATGAGGAGCATTATTTAATGCATCCAGCTCAAACTTCCCAGTGGGATGACCCTTGGGGAGAGGTTCTAGCATGGAAGTTTGATCCAACTCTGGCCTACACTTATGAGGCATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAAACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACGCCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGACTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGCCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCAATAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCTGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAAATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGGTAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGTGAGATACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCAACGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCGGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGGAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAACAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAAGCGGCTATGCAGATTATCAGAGATATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAACTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGTTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAAGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGTTTAAGAGCAGAACAGACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGCGTAAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTAACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGGCCGGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTGAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAGGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGATGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGGAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATTTTCCCATAGCTAAAGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGATGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAAATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTAGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGAATTACAGTACTGGATATAGGTGATGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGCTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTCAAAGGAACTCTTGAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTGAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTGAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAAGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCGCTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGGACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAAGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAATCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGAATAGTGGCCAGACAGATAGTAGACACCTGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAGGCTATACATGGGCAGACAAATTCAGATCTAGGGRCTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAGGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCTTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCATACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACC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| 48,207
|
MN816822.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Shingai,M., Donau,O.K., Schmidt,S.D., Gautam,R., Plishka,R.J., Buckler-White,A., Sadjadpour,R., Lee,W.R., LaBranche,C.C., Montefiori,D.C., Mascola,J.R., Nishimura,Y., Martin,M.A.
|
National Institutes of Allergy and Infectious Diseases, Laboratory of Molecular Microbiology
|
USA
|
2020-01-21
|
AD8_EO
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,262
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus isolate AD8_EO, complete genome
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CATATGTTAGATACCCAGAAGAGTTTGGAAGCAAGTCAGGCCTGTCAGAGGAAGAGGTTAGAAGAAGGCTAACCGCAAGAGGCCTTCTTAACATGGCTGACAAGAAGGAAACTCGCTGAAACAGCAGGGACTTTCCACAAGGGGATGTTACGGGGAGGTACTGGGGAGGAGCCGGTCGGGAACGCCCACTTTCTTGATGTATAAATATCACTGCATTTCGCTCTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGACTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGCCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCAATAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCTGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAAATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGGTAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGTGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCAACGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCGGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAACAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAAGCGGCTATGCAGATTATCAGAGATATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAACTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGTTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAAGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGTTTAAGAGCAGAACAGACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTGACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGGCCGGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTGAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAGGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGATGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATTTTCCCATAGCTAAAGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGATGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGAATTACAGTACTGGATATAGGTGATGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGCTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTCAAAGGAACTCTTGAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTGAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTGAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAAGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCGCTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGGACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAAGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAATCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGAATAGTGGCCAGACAGATAGTAGACACCTGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAGGCTATACATGGGCAGGCAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAGGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCTTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCATACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAATAGATAGAATCAGGGAACAAGCAAATTCAGTAGAAACCATAGTATTAATGGCAGTTCATTGCATGAATTTTAAAAGAAGGGGAGGAATAGGGGATATGACTCCAGCAGAAAGATTAATTAACATGATCACTACAGAACAAGAGATACAATTTCAACAATCAAAAAACTCAAAATTTAAAAATTTTCGGGTCTATTACAGAGAAGGCAGAGATCAACTGTGGAAGGGACCCGGTGAGCTATTGTGGAAAGGGGAAGGAGCAGTCATCTTAAAGGTAG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| 54,593
|
MK573511.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Zhou,M., Humbert,M., Mukhtar,M.M., Scinto,H.B., Vyas,H.K., Lakhashe,S.K., Byrareddy,S.N., Maurer,G., Thorat,S., Owuor,J., Lai,Z., Chen,Y., Griffiths,A., Chenine,A.L., Gumber,S., Villinger,F., Montefiori,D., Ruprecht,R.M., Chenine,A.-L.
|
Texas Biomedical Research Institute
|
USA
|
2019-03-11
|
SHIV-KNH1144p1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,913
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus isolate SHIV-KNH1144p1, complete genome
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CAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGCTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGACTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGCCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCAATAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAAATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGGTAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGTGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCAACGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCGGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAACAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAAGCGGCTATGCAGATTATCAGAGATATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAACTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGTTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAAGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGTTTAAGAGCAGAACAGACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTGACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGGCCGGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTGAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAGGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGATGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATTTTCCCATAGCTAAAGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGATGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGAATTACAGTACTGGATATAGGTGATGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGCTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTCAAAGGAACTCTTGAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTGAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTGAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAAGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCGCTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGGACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAAGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAATCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGAATAGTGGCCAGACAGATAGTAGACACCTGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAGGCTATACATGGGCAGGCAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAGGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCTTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCATACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAATAGATAGAATCAGGGAACAAGCAAATTCAGTAGAAACCATAGTATTAATGGCAGTTCATTGCATGAATTTTAAAAGAAGGGGAGGAATAGGGGATATGACTCCAGCAGAAAGATTAATTAACATGATCACTACAGAACAAGAGATACAATTTCAACAATCAAAAAACTCAAAATTTAAAAATTTTCGGGTCTATTACAGAGAAGGCAGAGATCAACTGTGGAAGGGACCCGGTGAGCTATTGTGGAAAGGGGAAGGAGCAGTCATCTTAAAGGTAGGGACAGACATTAAGGTAGTACCCAGAAGAAAGGCTAAAATTATCAAAGATTATGGAGGAGGAAAAGAGGTGGATAGCAGTTCCCACATGGAGGATACCGGAGAGGCTAGAGAGGTGGCATAGCCTCATAAAATATCTGAAATATAAAACTAAAGATCTACAAAAGGTTTGCTATGTGCCCCATTTTAAGGTCGGATGGGCATGGTGGACCTGCAGCAGAGTAATCTTCC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| 64,788
|
MK573512.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Zhou,M., Humbert,M., Mukhtar,M.M., Scinto,H.B., Vyas,H.K., Lakhashe,S.K., Byrareddy,S.N., Maurer,G., Thorat,S., Owuor,J., Lai,Z., Chen,Y., Griffiths,A., Chenine,A.L., Gumber,S., Villinger,F., Montefiori,D., Ruprecht,R.M., Chenine,A.-L.
|
Texas Biomedical Research Institute
|
USA
|
2019-03-11
|
SHIV-KNH1144p2
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,907
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus isolate SHIV-KNH1144p2, complete genome
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CAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGCTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGACTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGCCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCAATAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAAATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGGTAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGTGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCAACGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCGGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAACAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAAGCGGCTATGCAGATTATCAGAGATATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAACTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGTTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAAGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGTTTAAGAGCAGAACAGACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTGACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGGCCGGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTGAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAGGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGATGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATTTTCCCATAGCTAAAGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGATGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGAATTACAGTACTGGATATAGGTGATGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGCTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTCAAAGGAACTCTTGAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTGAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTGAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAAGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCGCTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGGACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAAGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAATCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGAATAGTGGCCAGACAGATAGTAGACACCTGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAGGCTATACATGGGCAGGCAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAGGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCTTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCATACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAATAGATAGAATCAGGGAACAAGCAAATTCAGTAGAAACCATAGTATTAATGGCAGTTCATTGCATGAATTTTAAAAGAAGGGGAGGAATAGGGGATATGACTCCAGCAGAAAGATTAATTAACATGATCACTACAGAACAAGAGATACAATTTCAACAATCAAAAAACTCAAAATTTAAAAATTTTCGGGTCTATTACAGAGAAGGCAGAGATCAACTGTGGAAGGGACCCGGTGAGCTATTGTGGAAAGGGGAAGGAGCAGTCATCTTAAAGGTAGGGACAGACATTAAGGTAGTACCCAGAAGAAAGGCTAAAATTATCAAAGATTATGGAGGAGGAAAAGAGGTGGATAGCAGTTCCCACATGGAGGATACCGGAGAGGCTAGAGAGGTGGCATAGCCTCATAAAATATCTGAAATATAAAACTAAAGATCTACAAAAGGTTTGCTATGTGCCCCATTTTAAGGTCGGATGGGCATGGTGGACCTGCAGCAGAGTAATCTTCC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| 64,789
|
MK573513.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Zhou,M., Humbert,M., Mukhtar,M.M., Scinto,H.B., Vyas,H.K., Lakhashe,S.K., Byrareddy,S.N., Maurer,G., Thorat,S., Owuor,J., Lai,Z., Chen,Y., Griffiths,A., Chenine,A.L., Gumber,S., Villinger,F., Montefiori,D., Ruprecht,R.M., Chenine,A.-L.
|
Texas Biomedical Research Institute
|
USA
|
2019-03-11
|
SHIV-KNH1144p4
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,913
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus isolate SHIV-KNH1144p4, complete genome
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CAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGACTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGCCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCAATAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAAATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGGTAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGTGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAACAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCAACGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCGGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGTGGAAACAGGAACAACAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAAGCGGCTATGCAGATTATCAGAGATATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAACTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGTTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAAGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGTTTAAGAGCAGAACAGACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTGACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGGCCGGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTGAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAGGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGATGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATTTTCCCATAGCTAAAGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGATGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGAATTACAGTACTGGATATAGGTGATGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGCTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTTAAAGGAACTCTTGAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTGAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTGAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAAGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCGCTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGGACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAAGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAATCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGAATAGTGGCCAGACAGATAGTAGACACCTGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAGGCTATACATGGGCAGGTAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAGGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCTTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCATACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAATAGATAGAATCAGGGAACAAGCAAATTCAGTAGAAACCATAGTATTAATGGCAGTTCATTGCATGAATTTTAAAAGAAGGGGAGGAATAGGGGATATGACTCCAGCAGAAAGATTAATTAACATGATCACTACAGAACAAGAGATACAATTTCAACAATCAAAAAACTCAAAATTTAAAAATTTTCGGGTCTATTACAGAGAAGGCAGAGATCAACTGTGGAAGGGACCCGGTGAGCTATTGTGGAAAGGGGAAGGAGCAGTCATCTTAAAGGTAGGGACAGACATTAAGGTAGTACCCAGAAGAAAGGCTAAAATTATCAAAGATTATGGAGGAGGAAAAGAGGTGGATAGCAGTTCCCACATGGAGGATACCGGAGAGGCTAGAGAGGTGGCATAGCCTCATAAAATATCTGAAATATAAAACTAAAGATCTACAAAAGGTTTGCTATGTGCCCCATTTTAAGGTCGGATGGGCATGGTGGACCTGCAGCAGAGTAATCTTCC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| 64,790
|
MH169603.1
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Scinto,H.B., Gupta,S., Throat,S., Griffiths,A., Delgado,J., Plake,E., Vyas,H.K., Strickland,A., Byrareddy,S.N., Montefiori,D.C., LaBranche,C., Pal,R., Treece,J., Orndorff,S., Grazia Ferrari,M., Weiss,D., Chenine,A.-L., McLinden,R., Michael,N., Kim,J.H., Robb,M., Rerks-Ngarm,S., Pitisuttithum,P., Nitayaphan,S., Ruprecht,R.M.
|
Texas Biomedical Research Institute, Virology and Immunology
|
USA
|
2018-05-08
|
SHIV-E1p1d203
|
Simian-Human immunodeficiency virus
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,893
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Simian-Human immunodeficiency virus isolate SHIV-E1p1d203, complete genome
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CAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGAGTGACTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGCCCTCTTCAATAAAGCTGCCATTTTAGAAGTAAGCTAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGCCGCCGCCTGGTCAACTCGGTACTCAATAATAAGAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTTCTGCTTTGGGAAACCGAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGATTGGCGCCCGAACAGGGACCTGAAGGAGAGTGAGAGACTCCTGAGTACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACCAACCACGACGGAGTGCTCCTATAAAGGCGCGGGTCGGTACCAGACGGCGTGAGGAGCGGGAGAGGAAGAGGCCTCCGGTTGCAGGTAAGTGCAACACAAAAAAGAAATAGCTGTCTTTTATCCAGGAAGGGGTAATAAGATAGAGTGGGAGATGGGCGTGAGAAACTCCGTCTTGTCAGGGAAGAAAGCAGATGAATTAGAAAAAATTAGGCTACGACCCAACGGAAAGAAAAAGTACATGTTGAAGCATGTAGTATGGGCAGCAAATGAATTAGATAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAGAACAAAGAAGGATGTCAAAAAATACTTTCGGTCTTAGCTCCATTAGTGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTATAATACTGTCTGCGTCATCTGGTGCATTCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACTGAGGAAGCAAAACAGATAGTGCAGAGACACCTAGTGGGGGAAACAGGAACAACAGAAACTATGCCAAAAACAAGTAGACCAACAGCACCATCTAGCGGCAGAGGAGGAAATTACCCAGTACAACAAATAGGTGGTAACTATGTCCACCTGCCATTAAGCCCGAGAACATTAAATGCCTGGGTAAAATTGATAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTGTCAGAAGGTTGCACCCCCTATGACATTAATCAGATGTTAAATTGTGTGGGAGACCATCAAGCGGCTATGCAGATTATCAGAGATATTATAAACGAGGAGGCTGCAGATTGGGACTTGCAGCACCCACAACCAGCTCCACAACAAGGACAACTTAGGGAGCCGTCAGGATCAGATATTGCAGGAACAACTAGTTCAGTAGATGAACAAATCCAGTGGATGTACAGACAACAGAACCCCATACCAGTAGGCAACATTTACAGGAGATGGATCCAACTGGGGTTGCAAAAATGTGTCAGAATGTATAACCCAACAAACATTCTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAAGAGCCATTTCAGAGCTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGTTTAAGAGCAGAACAGACAGATGCAGCAGTAAAGAATTGGATGACTCAAACACTGCTGATTCAAAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTGCTGAAGGGGCTGGGTGTGAATCCCACCCTAGAAGAAATGCTGACGGCTTGTCAAGGAGTAGGGGGGCCGGGACAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTGAAAGAGGCCCTCGCACCAGTGCCAATCCCTTTTGCAGCAGCCCAACAGAGGGGACCAAGAAAGCCAATTAAGTGTTGGAATTGTGGGAAAGAGGGACACTCTGCAAGGCAATGCAGAGCCCCAAGAAGACAGGGATGCTGGAAATGTGGAAAAATGGACCATGTTATGGCCAAATGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGCCTTGGTCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCATGGCTCAAGTGCATCAGGGGCTGATGCCAACTGCTCCCCCAGAGGACCCAGCTGTGGATCTGCTAAAGAACTACATGCAGTTGGGCAAGCAGCAGAGAGAAAAGCAGAGAGAAAGCAGAGAGAAGCCTTACAAGGAGGTGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGGAGACCAGTAGTCACTGCTCATATTGAAGGACAGCCTGTAGAAGTATTACTGGATACAGGGGCTGATGATTCTATTGTAACAGGAATAGAGTTAGGTCCACATTATACCCCAAAAATAGTAGGAGGAATAGGAGGTTTTATTAATACTAAAGAATACAAAAATGTAGAAATAGAAGTTTTAGGCAAAAGGATTAAAGGGACAATCATGACAGGGGACACCCCGATTAACATTTTTGGTAGAAATTTGCTAACAGCTCTGGGGATGTCTCTAAATTTTCCCATAGCTAAAGTAGAGCCTGTAAAAGTCGCCTTAAAGCCAGGAAAGGATGGACCAAAATTGAAGCAGTGGCCATTATCAAAAGAAAAGATAGTTGCATTAAGAGAAATCTGTGAAAAGATGGAAAAGGATGGTCAGTTGGAGGAAGCTCCCCCGACCAATCCATACAACACCCCCACATTTGCTATAAAGAAAAAGGATAAGAACAAATGGAGAATGCTGATAGATTTTAGGGAACTAAATAGGGTCACTCAGGACTTTACGGAAGTCCAATTAGGAATACCACACCCTGCAGGACTAGCAAAAAGGAAAAGAATTACAGTACTGGATATAGGTGATGCATATTTCTCCATACCTCTAGATGAAGAATTTAGGCAGTACACTGCCTTTACTTTACCATCAGTAAATAATGCAGAGCCAGGAAAACGATACATTTATAAGGTTCTGCCTCAGGGATGGAAGGGGTCACCAGCCATCTTCCAATACACTATGAGACATGTGCTAGAACCCTTCAGGAAGGCAAATCCAGATGTGACCTTAGTCCAGTATATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTGGAACATGACAGGGTAGTTTTACAGTCAAAGGAACTCTTGAATAGCATAGGGTTTTCTACCCCAGAAGAGAAATTCCAAAAAGATCCCCCATTTCAATGGATGGGGTACGAATTGTGGCCAACAAAATGGAAGTTGCAAAAGATAGAGTTGCCACAAAGAGAGACCTGGACAGTGAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAGTATTAAATTGGGCAGCTCAAATTTATCCAGGTATAAAAACCAAACATCTCTGTAGGTTAATTAGAGGAAAAATGACTCTAACAGAGGAAGTTCAGTGGACTGAGATGGCAGAAGCAGAATATGAGGAAAATAAAATAATTCTCAGTCAGGAACAAGAAGGATGTTATTACCAAGAAGGCAAGCCATTAGAAGCCACGGTAATAAAGAGTCAGGACAATCAGTGGTCTTATAAAATTCACCAAGAAGACAAAATACTGAAAGTAGGAAAATTTGCAAAGATAAAGAATACACATACCAATGGAGTGAGACTATTAGCACATGTAATACAGAAAATAGGAAAGGAAGCAATAGTGATCTGGGGACAGGTCCCAAAATTCCACTTACCAGTTGAGAAGGATGTATGGGAACAGTGGTGGACAGACTATTGGCAGGTAACCTGGATACCGGAATGGGATTTTATCTCAACACCACCGCTAGTAAGATTAGTCTTCAATCTAGTGAAGGACCCTATAGAGGGAGAAGAAACCTATTATACAGATGGATCATGTAATAAACAGTCAAAAGAAGGGAAAGCAGGATATATCACAGATAGGGGCAAAGACAAAGTAAAAGTGTTAGAACAGACTACTAATCAACAAGCAGAATTGGAAGCATTTCTCATGGCATTGACAGACTCAGGGCCAAAGGCAAATATTATAGTAGATTCACAATATGTTATGGGAATAATAACAGGATGCCCTACAGAATCAGAGAGCAGGCTAGTTAATCAAATAATAGAAGAAATGATTAAAAAGTCAGAAATTTATGTAGCATGGGTACCAGCACACAAAGGTATAGGAGGAAACCAAGAAATAGACCACCTAGTTAGTCAAGGGATTAGACAAGTTCTCTTCTTGGAAAAGATAGAGCCAGCACAAGAAGAACATGATAAATACCATAGTAATGTAAAAGAATTGGTATTCAAATTTGGATTACCCAGAATAGTGGCCAGACAGATAGTAGACACCTGTGATAAATGTCATCAGAAAGGAGAGGCTATACATGGGCAGGCAAATTCAGATCTAGGGACTTGGCAAATGGATTGTACCCATCTAGAGGGAAAAATAATCATAGTTGCAGTACATGTAGCTAGTGGATTCATAGAAGCAGAGGTAATTCCACAAGAGACAGGAAGACAGACAGCACTATTTCTGTTAAAATTGGCAGGCAGATGGCCTATTACACATCTACACACAGATAATGGTGCTAACTTTGCTTCGCAAGAAGTAAAGATGGTTGCATGGTGGGCAGGGATAGAGCACACCTTTGGGGTACCATACAATCCACAGAGTCAGGGAGTAGTGGAAGCAATGAATCACCACCTGAAAAATCAAATAGATAGAATCAGGGAACAAGCAAATTCAGTAGAAACCATAGTATTAATGGCAGTTCATTGCATGAATTTTAAAAGAAGGGGAGGAATAGGGGATATGACTCCAGCAGAAAGATTAATTAACATGATCACTACAGAACAAGAGATACAATTTCAACAATCAAAAAACTCAAAATTTAAAAATTTTCGGGTCTATTACAGAGAAGGCAGAGATCAACTGTGGAAGGGACCCGGTGAGCTATTGTGGAAAGGGGAAGGAGCAGTCATCTTAAAGGTAGGGACAGACATTAAGGTAGTACCCAGAAGAAAGGCTAAAATTATCAAAGATTATGGAGGAGGAAAAGAGGTGGATAGCAGTTCCCACATGGAGGATACCGGAGAGGCTAGAGAGGTGGCATAGCCTCATAAAATATCTGAAATATAAAACTAAAGATCTACAAAAGGTTTGCTATGTGCCCCATTTTAAGGTCGGATGGGCATGGTGGACCTGCAGCAGAGTAATCTTCC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| 70,828
|
NC_001547.1
|
Sindbis virus
|
Strauss,E.G., Rice,C.M., Strauss,J.H., Ou,J.H., Dalgarno,L., Trent,D.W., Monroe,S.S., Schlesinger,S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-03
| null |
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,703
|
RefSeq
| 9
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Sindbis virus, complete genome
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CTGCTGCTCCTGCTGCCTGCCTTTTTTAGTGGTTGCCGGCGCCTACCTGGCGAAGGTAGACGCCTACGAACATGCGACCACTGTTCCAAATGTGCCACAGATACCGTATAAGGCACTTGTTGAAAGGGCAGGGTATGCCCCGCTCAATTTGGAGATCACTGTCATGTCCTCGGAGGTTTTGCCTTCCACCAACCAAGAGTACATTACCTGCAAATTCACCACTGTGGTCCCCTCCCCAAAAATCAAATGCTGCGGCTCCTTGGAATGTCAGCCGGCCGCTCATGCAGACTATACCTGCAAGGTCTTCGGAGGGGTCTACCCCTTTATGTGGGGAGGAGCGCAATGTTTTTGCGACAGTGAGAACAGCCAGATGAGTGAGGCGTACGTCGAATTGTCAGCAGATTGCGCGTCTGACCACGCGCAGGCGATTAAGGTGCACACTGCCGCGATGAAAGTAGGACTGCGTATTGTGTACGGGAACACTACCAGTTTCCTAGATGTGTACGTGAACGGAGTCACACCAGGAACGTCTAAAGACTTGAAAGTCATAGCTGGACCAATTTCAGCATCGTTTACGCCATTCGATCATAAGGTCGTTATCCATCGCGGCCTGGTGTACAACTATGACTTCCCGGAATATGGAGCGATGAAACCAGGAGCGTTTGGAGACATTCAAGCTACCTCCTTGACTAGCAAGGATCTCATCGCCAGCACAGACATTAGGCTACTCAAGCCTTCCGCCAAGAACGTGCATGTCCCGTACACGCAGGCCTCATCAGGATTTGAGATGTGGAAAAACAACTCAGGCCGCCCACTGCAGGAAACCGCACCTTTCGGGTGTAAGATTGCAGTAAATCCGCTCCGAGCGGTGGACTGTTCATACGGGAACATTCCCATTTCTATTGACATCCCGAACGCTGCCTTTATCAGGACATCAGATGCACCACTGGTCTCAACAGTCAAATGTGAAGTCAGTGAGTGCACTTATTCAGCAGACTTCGGCGGGATGGCCACCCTGCAGTATGTATCCGACCGCGAAGGTCAATGCCCCGTACATTCGCATTCGAGCACAGCAACTCTCCAAGAGTCGACAGTACATGTCCTGGAGAAAGGAGCGGTGACAGTACACTTTAGCACCGCGAGTCCACAGGCGAACTTTATCGTATCGCTGTGTGGGAAGAAGACAACATGCAATGCAGAATGTAAACCACCAGCTGACCATATCGTGAGCACCCCGCACAAAAATGACCAAGAATTTCAAGCCGCCATCTCAAAAACATCATGGAGTTGGCTGTTTGCCCTTTTCGGCGGCGCCTCGTCGCTATTAATTATAGGACTTATGATTTTTGCTTGCAGCATGATGCTGACTAGCACACGAAGATGACCGCTACGCCCCAATGATCCGACCAGCAAAACTCGATGTACTTCCGAGGAACTGATGTGCATAATGCATCAGGCTGGTACATTAGATCCCCGCTTACCGCGGGCAATATAGCAACACTAAAAACTCGATGTACTTCCGAGGAAGCGCAGTGCATAATGCTGCGCAGTGTTGCCACATAACCACTATATTAACCATTTATCTAGCGGACGCCAAAAACTCAATGTATTTCTGAGGAAGCGTGGTGCATAATGCCACGCAGCGTCTGCATAACTTTTATTATTTCTTTTATTAATCAACAAAATTTTGTTTTTAACATTTC
| 8,964
|
OR882082.1
|
Sindbis virus
|
Alcorn-Burckhardt,M.D., Sun,C., Klimstra,W.B.
|
University of Pittsburgh, Immunology and Center for Vaccine Research
|
USA
|
2023-12-12
| null |
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,703
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2001
| null | null |
Sindbis virus strain TR339, complete genome
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ATTGGCGGCGTAGTACACACTATTGAATCAAACAGCCGACCAATTGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTAAACGTAGACGTAGACCCCCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAAAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATCTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCATTGTGTCTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGTAAACTGGCGGAAAAAGCGTGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATTAAGGATCTCCGGACCGTACTTGATACGCCGGATGCTGAAACACCATCGCTCTGCTTTCACAACGATGTTACCTGCAACATGCGTGCCGAATATTCCGTCATGCAGGACGTGTATATCAACGCTCCCGGAACTATCTATCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCGTACAACACCAACTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTTTGCAGCACAAAGCTGAGTGAAGGTAGGACAGGAAAATTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCGCGGGTTTATTTCTCCGTAGGATCGACACTTTATCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAATGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGTTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGTCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACACACAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGAGAACGGGTATCGTTCCCTGTGTGCACGTACATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACTGGTATAATGGCCACGGATATATCACCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAGGACTAACAGGAACACCAACACCATGCAAAATTACCTTCTGCCGATCATAGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCTAAGGAGCGCAAGGATGATCTTGATAACGAGAAAATGCTGGGTACTAGAGAACGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGAAAGTACATTCGTTTTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCATCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTTCCCATGTCGTCCGTATGGACGACCTCTTTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAATTGAAACTGGCATTGCAACCAAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCTCGGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTTTGAGGATGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTTCCACCATTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCAGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGGCTCCAGGCGGACATCGGAGCAGCATTAGTTGAAACCCCGCGCGGTCACGTAAGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTTGTCTCGCCAAACTCTGTGCTGAAGAATGCCAAACTCGCACCAGCGCACCCGCTAGCAGATCAGGTTAAGATCATAACACACTCCGGTAGATCAGGAAGGTACGCGGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAGGTGCCGTACCATGGCCAGAATTCCTAGCACTGAGTGAGAGCGCCACGTTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAACCGCAAACTATACCACATTGCCATGCATGGCCCCGCCAAGAATACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTTGCAGAAACAGAGTACGTGTTTGACGTGGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGTCTGGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCTCCCTATCATGAGCTAGCTCTGGAGGGACTGAAGACCCGACCTGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCGGGGTCGGGCAAGTCAGCTATTATCAAGTCAACTGTCACGGCACGGGATCTTGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAATTGTCGCGAAATTGAGGCCGACGTGCTAAGACTGAGGGGTATGCAGATTACGTCGAAGACAGTAGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCACAAAGCCGTAGAAGTGCTGTACGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCACTACTTGCCTTGATTGCTATCGTCAGGCCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGCGGAGACCCCATGCAATGCGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAGGTACATTTCAATCACCCTGAAAAAGACATATGCACCAAGACATTCTACAAGTATATCTCCCGGCGTTGCACACAGCCAGTTACAGCTATTGTATCGACACTGCATTACGATGGAAAGATGAAAACCACGAACCCGTGCAAGAAGAACATTGAAATCGATATTACAGGGGCCACAAAGCCGAAGCCAGGGGATATCATCCTGACATGTTTCCGCGGGTGGGTTAAGCAATTGCAAATCGACTATCCCGGACATGAAGTAATGACAGCCGCGGCCTCACAAGGGCTAACCAGAAAAGGAGTGTATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCACTGTACGCGATCACATCAGAGCATGTGAACGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGGCTAGTGTGGAAAACCTTGCAGGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAACATACCTAAAGGAAACTTTCAGGCTACTATAGAGGACTGGGAAGCTGAACACAAGGGAATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCACTCCCCGTGCCAATCCGTTCAGCTGCAAGACCAACGTTTGCTGGGCGAAAGCATTGGAACCGATACTAGCCACGGCCGGTATCGTACTTACCGGTTGCCAGTGGAGCGAACTGTTCCCACAGTTTGCGGATGACAAACCACATTCGGCCATTTACGCCTTAGACGTAATTTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGACTTGACAAGCGGACTGTTTTCTAAACAGAGCATCCCACTAACGTACCATCCCGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCATTGCCGCCGAACTCTCCCGTAGATTTCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAGGGCACACAACTTGATTTGCAGACGGGGAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACCTGGTCCCGGTGAACCGCAATCTTCCTCACGCCTTAGTCCCCGAGTACAAGGAGAAGCAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCAGTACTTGTGGTATCAGAGGAAAAAATTGAAGCTCCCCGTAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATTGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTACAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTCATCAACATTGGAACTAAATACAGAAACCACCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTAAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAATTGCCTTAACCCAGGAGGCACCCTCGTGGTGAAGTCCTATGGCTACGCCGACCGCAACAGTGAGGACGTAGTCACCGCTCTTGCCAGAAAGTTTGTCAGGGTGTCCGCAGCGAGACCAGATTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAACTAGACAACAGCCGTACACGGCAATTCACCCCGCACCATCTGAATTGCGTGATTTCGTCCGTGTATGAGGGTACAAGAGATGGAGTTGGAGCCGCGCCGTCATACCGCACCAAAAGGGAGAATATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCAGTTGTCAACGCAGCCAATCCGCTGGGTAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGACCAGTTTTACCGATTCAGCCACGGAGACAGGCACCGCAAGAATGACTGTGTGCCTAGGAAAGAAAGTGATCCACGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAGCACCCAGAAGCAGAAGCCTTGAAATTGCTACAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTAGTAAATGAACATAACATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTAGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTATTGCCTGGATAAGAAGTGGAAGGAAAGAATCGACGCGGCACTCCAACTTAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGATGAGTTAGTATGGATCCATCCAGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTCAGTACTACAAAAGGAAAATTGTATTCGTACTTCGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCAGCAAAAGACATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCTAATGACCAGGAAAGTAATGAACAACTGTGTGCCTACATATTGGGTGAGACCATGGAAGCAATCCGCGAAAAGTGCCCGGTCGACCATAACCCGTCGTCTAGCCCGCCCAAAACGTTGCCGTGCCTTTGCATGTATGCCATGACGCCAGAAAGGGTCCACAGACTTAGAAGCAATAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCCCTTCCTAAGCACAAAATTAAGAAT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CTGCTGCTCCTGCTGCCTGCCTTTTTTAGTGGTTGCCGGCGCCTACCTGGCGAAGGTAGACGCCTACGAACATGCGACCACTGTTCCAAATGTGCCACAGATACCGTATAAGGCACTTGTTGAAAGGGCAGGGTATGCCCCGCTCAATTTGGAGATCACTGTCATGTCCTCGGAGGTTTTGCCTTCCACCAACCAAGAGTACATTACCTGCAAATTCACCACTGTGGTCCCCTCCCCAAAAATCAAATGCTGCGGCTCCTTGGAATGTCAGCCGGCCGCTCATGCAGACTATACCTGCAAGGTCTTCGGAGGGGTCTACCCCTTTATGTGGGGAGGAGCGCAATGTTTTTGCGACAGTGAGAACAGCCAGATGAGTGAGGCGTACGTCGAACTGTCAGCAGATTGCGCGTCTGACCACGCGCAGGCGATTAAGGTGCACACTGCCGCGATGAAAGTAGGACTGCGTATAGTGTACGGGAACACTACCAGTTTCCTAGATGTGTACGTGAACGGAGTCACACCAGGAACGTCTAAAGACTTGAAAGTCATAGCTGGACCAATTTCAGCATCGTTTACGCCATTCGATCATAAGGTCGTTATCCATCGCGGCCTGGTGTACAACTATGACTTCCCGGAATATGGAGCGATGAAACCAGGAGCGTTTGGAGACATTCAAGCTACCTCCTTGACTAGCAAGGATCTCATCGCCAGCACAGACATTAGGCTACTCAAGCCTTCCGCCAAGAACGTGCATGTCCCGTACACGCAGGCCGCATCAGGATTTGAGATGTGGAAAAACAACTCAGGCCGCCCACTGCAGGAAACCGCACCTTTCGGGTGTAAGATTGCAGTAAATCCGCTCCGAGCGGTGGACTGTTCATACGGGAACATTCCCATTTCTATTGACATCCCGAACGCTGCCTTTATCAGGACATCAGATGCACCACTGGTCTCAACAGTCAAATGTGAAGTCAGTGAGTGCACTTATTCAGCAGACTTCGGCGGGATGGCCACCCTGCAGTATGTATCCGACCGCGAAGGTCAATGCCCCGTACATTCGCATTCGAGCACAGCAACTCTCCAAGAGTCGACAGTACATGTCCTGGAGAAAGGAGCGGTGACAGTACACTTTAGCACCGCGAGTCCACAGGCGAACTTTATCGTATCGCTGTGTGGGAAGAAGACAACATGCAATGCAGAATGTAAACCACCAGCTGACCATATCGTGAGCACCCCGCACAAAAATGACCAAGAATTTCAAGCCGCCATCTCAAAAACATCATGGAGTTGGCTGTTTGCCCTTTTCGGCGGCGCCTCGTCGCTATTAATTATAGGACTTATGATTTTTGCTTGCAGCATGATGCTGACTAGCACACGAAGATGACCGCTACGCCCCAATGATCCGACCAGCAAAACTCGATGTACTTCCGAGGAACTGATGTGCATAATGCATCAGGCTGGTACATTAGATCCCCGCTTACCGCGGGCAATATAGCAACACTAAAAACTCGATGTACTTCCGAGGAAGCGCAGTGCATAATGCTGCGCAGTGTTGCCACATAACCACTATATTAACCATTTATCTAGCGGACGCCAAAAACTCAATGTATTTCTGAGGAAGCGTGGTGCATAATGCCACGCAGCGTCTGCATAACTTTTATTATTTCTTTTATTAATCAACAAAATTTTGTTTTTAACATTTC
| 10,344
|
OL943983.1
|
Sindbis virus
|
Meno,K.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2022-12-07
|
GAU14MP070/SA
|
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,367
|
GenBank
| null |
South Africa: Boschkop
|
South Africa
|
Culex univittatus
| null |
2014
| null | null |
Sindbis virus isolate GAU14MP070/SA, complete genome
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ATGGAGAAGCCAGTAGTAAACGTAGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCATTGTGTCTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCGTGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATTAAGGATCTCCGGACCGTACTTGATACGCCGGATGCAGAAACACCATCGCTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCAACACGCGTGCCGAGTATTCCGTCATGCAGGACGTGTATATCAACGCTCCCGGAACTATCTATCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCGTACAACACCAACTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTTTGCAGCACAAAGCTGAGCGAAGGTAGGACAGGAAAATTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCGCGGGTTTATTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAAAGGAAAGCAGTCGTATACTTGCCGTTGTGATACAGTGGTGAGTTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGCCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACACATAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGAGAGCGGGTGTCGTTCCCTGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGTATAATGGCCACGGATATATCGCCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAGGACTAACAGGAACACCAACACCATGCAGAATTACCTTCTGCCGATCATAGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCTAAGGAGCGCAAGGAAGATCTTGAAAACGAGAAAATGCTGGGTACTAGAGAACGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCATTTCGCACTAAGAAAGTACATTCATTTTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCAGCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTTCCAATGTCGTCCGTGTGGACGACCTCTTTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAATTGAAACTGGCATTGCAACCGAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCTCAGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTATGAGGACGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTTCCACCGTTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCAGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGACTCCAGGCGGATATCGGAGCGGCACTAGTTGAAACCCCGCGCGGTCACGTACGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTTGTCTCGCCGAACTCTGTGCTGAAGAATGCCAAACTCGCACCAGCGCATCCGCTAGCTGACCAGGTTAAGATCATAACACACTCCGGAAGGTCAGGAAGGTACGCGGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAGGTGCCGTACCATGGCCAGAATTTCTAGCACTGAGTGAGAGCGCCACACTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAACCGCAAACTATACCACATTGCCGTGCATGGCCCCGCCAAGAACACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTTGCAGAAACAGAGTACGTGTTTGACGTGGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGTCTTGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCTCCCTATCACGAGCTAGCACTGGAGGGACTGAAGACCCGACCTGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCGGGGTCGGGCAAGTCAGCTATTATCAAGTCAACTGTCACAGCACGAGATCTCGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAATTGTCGCGAGATTGAGGCCGACGTGCTAAGACTAAGGGGTATGCAGATTACGTCGAAGACAGTAGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCATAAAGCCGTAGAAGTGCTGTACGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCGCTACTTGCCTTGATTGCTATCGTCAGGCCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGCGGAGACCCTATGCAATGTGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAAGTACACTTCAATCACCCTGAAAAAGACATATGCACCAAGACATTCTACAAATACATTTCCCGGCGTTGCACACAGCCAGTTACAGCTATTGTATCGACACTGCATTACGGCGGAAAGATGAAGACCACGAACCCGTGCAAGAAGAACATTGAAATCGATATTACAGGGGCCACAAAGCCAAAGCCTGGGGATATCATCCTGACGTGTTTCCGCGGGTGGGTTAAGCAATTGCAAATTGACTATCCCGGACATGAAGTAATGACAGCCGCGGCCTCACAAGGGCTAACTAGAAAAGGAGTGTATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCACTGTACGCAATCACATCAGAGCATGTGAATGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGGCTGGTGTGGAAAACCTTGCAGGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAACGTACCTAAGGGAAACTTTCAGGCTACTATAGAGGACTGGGAAGCTGAACACAGGGGGATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCGCTCCCCGTACCAATCCGTTCAGCTGCAAGACCAACGTTTGCTGGGCAAAGGCATTGGAACCGATACTAGCCACAGCCGGTATCGTACTTACCGGTTGTCAGTGGAGCGAACTGTTCCCGCAGTTTGCGGATGATAAACCGCATTCGGCCATCTACGCCCTGGACGTAATTTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGATTTGACAAGCGGATTGTTCTCTAAACAGAGCATCCCATTAACGTACCATCCTGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCATTGCCGCTGAGCTCTCCCGTAGGTTCCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAGGGCACACAGCTTGATTTGCAGACGGGGAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACCTGGTCCCGGTGAACCGCAATCTTCCTCACGCCTTAGTCCCCGAGTACAAGGAGAAGCAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCAGTACTTGTGGTATCAGAGGAAAGAATTGAAGCTCCCCACAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATCGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTACAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTTATCAACATTGGAACTAAATACAGAAATCACCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTAAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAATTGCCTTAACCCAGGAGGCACCCTCGTGGTAAAGTCCTATGGTTACGCCGACCGCAATAGTGAGGACGTGGTCACTGCTCTTGCCAGGAAGTTTGTCAGGGTGTCTGCAGCGAGACCAGATTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAATTAGACAACAGCCGTACACGGCAATTCACCCCGCACCACCTGAATTGCGTGATCTCGTCCGTGTACGAGGGTACAAGAGATGGAGTTGGAGCCGCGCCGTCATACCGCACTAAAAGGGAGAATATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCGGTTGTCAACGCAGCCAATCCGCTGGGTAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGAACAGTTTTACCGATTCAGCCACAGAGACAGGCACTGCAAGACTGACTGTGTGCCAAGGAAAGAAAGTGATCCATGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAGCACCCAGAAGCAGAAGCCTTGAAATTGCTACAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTAGTAAACGAACATAACATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTAGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTACTGCCTGGACAAGAAGTGGAAGGAAAGAATCGACGCGGTACTCCAACTTAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGACGAGTTAGTATGGATCCATCCAGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTTAGTACTACAAAAGGCAAGTTGTATTCGTACTTTGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCGGCAAAGGACATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCTAATGACCAGGAAAGTAATGAACAACTGTGCGCCTACATATTGGGTGAGACTATGGAAGCAATCCGTGAAAAATGCCCGGTCGATCATAACCCGTCGTCTAGCCCGCCCAAAACATTACCATGCCTTTGCATGTATGCCATGACGCCGGAAAGGGTCCACAGACTTAGAAGCAATAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCCCTTCCTAAGTACAAGATCAAGAATGTTCAGAAGGTTCAGTGTACGAAAGTAGTCCTGTTTAACCCGCATACTCCCGCATTCGT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| 21,336
|
OL943984.1
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Sindbis virus
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Meno,K.
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University of Pretoria, Medical Virology
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South Africa
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2022-12-07
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KYA14MP133/SA
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Sindbis virus
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Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,367
|
GenBank
| null |
South Africa: Kyalami
|
South Africa
|
Culex pipiens sensu lato
| null |
2014
| null | null |
Sindbis virus isolate KYA14MP133/SA, complete genome
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ATGGAGAAGCCAGTAGTAAACGTAGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCATTGTGTCTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCGTGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATTAAGGATCTCCGGACCGTACTTGATACGCCGGATGCAGAAACACCATCGCTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCAACACGCGTGCCGAGTATTCCGTCATGCAGGACGTGTATATCAACGCTCCCGGAACTATCTATCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCGTACAACACCAACTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTTTGCAGCACAAAGCTGAGCGAAGGTAGGACAGGAAAATTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCGCGGGTTTATTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAAAGGAAAGCAGTCGTATACTTGCCGTTGTGATACAGTGGTGAGTTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGCCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACACATAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGAGAGCGGGTGTCGTTCCCTGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGTATAATGGCCACGGATATATCGCCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAGGACTAACAGGAACACCAACACCATGCAGAATTACCTTCTGCCGATCATAGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCTAAGGAGCGCAAGGAAGATCTTGAAAACGAGAAAATGCTGGGTACTAGAGAACGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCATTTCGCACTAAGAAAGTACATTCATTTTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCAGCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTTCCAATGTCGTCCGTGTGGACGACCTCTTTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAATTGAAACTGGCATTGCAACCGAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCTCAGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTATGAGGACGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTTCCACCGTTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCAGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGACTCCAGGCGGATATCGGAGCGGCACTAGTTGAAACCCCGCGCGGTCACGTACGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTTGTCTCGCCGAACTCTGTGCTGAAGAATGCCAAACTCGCACCAGCGCATCCGCTAGCTGACCAGGTTAAGATCATAACACACTCCGGAAGGTCAGGAAGGTACGCGGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAGGTGCCGTACCATGGCCAGAATTTCTAGCACTGAGTGAGAGCGCCACACTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAACCGCAAACTATACCACATTGCCGTGCATGGCCCCGCCAAGAACACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTTGCAGAAACAGAGTACGTGTTTGACGTGGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGTCTTGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCTCCCTATCACGAGCTAGCACTGGAGGGACTGAAGACCCGACCTGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCGGGGTCGGGCAAGTCAGCTATTATCAAGTCAACTGTCACAGCACGAGATCTCGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAATTGTCGCGAGATTGAGGCCGACGTGCTAAGACTAAGGGGTATGCAGATTACGTCGAAGACAGTAGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCATAAAGCCGTAGAAGTGCTGTACGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCGCTACTTGCCTTGATTGCTATCGTCAGGCCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGCGGAGACCCTATGCAATGTGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAAGTACACTTCAATCACCCTGAAAAAGACATATGCACCAAGACATTCTACAAATACATTTCCCGGCGTTGCACACAGCCAGTTACAGCTATTGTATCGACACTGCATTACGGCGGAAAGATGAAGACCACGAACCCGTGCAAGAAGAACATTGAAATCGATATTACAGGGGCCACAAAGCCAAAGCCTGGGGATATCATCCTGACGTGTTTCCGCGGGTGGGTTAAGCAATTGCAAATTGACTATCCCGGACATGAAGTAATGACAGCCGCGGCCTCACAAGGGCTAACTAGAAAAGGAGTGTATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCACTGTACGCAATCACATCAGAGCATGTGAATGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGGCTGGTGTGGAAAACCTTGCAGGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAACGTACCTAAGGGAAACTTTCAGGCTACTATAGAGGACTGGGAAGCTGAACACAGGGGGATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCGCTCCCCGTACCAATCCGTTCAGCTGCAAGACCAACGTTTGCTGGGCAAAGGCATTGGAACCGATACTAGCCACAGCCGGTATCGTACTTACCGGTTGTCAGTGGAGCGAACTGTTCCCGCAGTTTGCGGATGATAAACCGCATTCGGCCATTTACGCCCTGGACGTAATTTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGATTTGACAAGCGGATTGTTCTCTAAACAGAGCATCCCATTAACGTACCATCCTGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCATTGCCGCTGAGCTCTCCCGTAGGTTCCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAGGGCACACAGCTTGATTTGCAGACGGGGAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACCTGGTCCCGGTGAACCGCAATCTTCCTCACGCCTTAGTCCCCGAGTACAAGGAGAAGCAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCAGTACTTGTGGTATCAGAGGAAAGAATTGAAGCTCCCCACAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATCGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTACAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTTATCAACATTGGAACTAAATACAGAAATCACCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTAAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAATTGCCTTAACCCAGGAGGCACCCTCGTGGTAAAGTCCTATGGTTACGCCGACCGCAATAGTGAGGACGTGGTCACTGCTCTTGCCAGGAAGTTTGTCAGGGTGTCTGCAGCGAGACCAGATTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAATTAGACAACAGCCGTACACGGCAATTCACCCCGCACCACCTGAATTGCGTGATCTCGTCCGTGTACGAGGGTACAAGAGATGGAGTTGGAGCCGCGCCGTCATACCGCACTAAAAGGGAGAATATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCGGTTGTCAACGCAGCCAATCCGCTGGGTAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGAACAGTTTTACCGATTCAGCCACAGAGACAGGCACTGCAAGACTGACTGTGTGCCAAGGAAAGAAAGTGATCCATGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAGCACCCAGAAGCAGAAGCCTTGAAATTGCTACAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTAGTAAACGAACATAACATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTCAACTGCTTGACAACCGCGCTAGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTACTGCCTGGACAAGAAGTGGAAGGAAAGAATCGACGCGGTACTCCAACTTAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGACGAGTTAGTATGGATCCATCCAGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTTAGTACTACAAAAGGCAAGTTGTATTCGTACTTTGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCGGCAAAGGACATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCTAATGACCAGGAAAGTAATGAACAACTGTGCGCCTACATATTGGGTGAGACTATGGAAGCAATCCGTGAAAAATGCCCGGTCGATCATAACCCGTCGTCTAGCCCGCCCAAAACATTACCATGCCTTTGCATGTATGCCATGACGCCGGAAAGGGTCCACAGACTTAGAAGCAATAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCCCTTCCTAAGTACAAGATCAAGAATGTTCAGAAGGTTCAGTGTACGAAAGTAGTCCTGTTTAACCCGCATACTCCCGCATTCGT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| 21,337
|
OL943985.1
|
Sindbis virus
|
Meno,K.
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University of Pretoria, Medical Virology
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South Africa
|
2022-12-07
|
MAR14MP222/SA
|
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,367
|
GenBank
| null |
South Africa: Marakele
|
South Africa
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Culex univittatus
| null |
2014
| null | null |
Sindbis virus isolate MAR14MP222/SA, complete genome
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ATGGAGAAGCCAGTAGTAAACGTAGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCATTGTGTCTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCGTGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATTAAGGATCTCCGGACCGTACTTGATACGCCGGATGCAGAAACACCATCGCTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCAACACGCGTGCCGAGTATTCCGTCATGCAGGACGTGTATATCAACGCTCCCGGAACTATCTATCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCGTACAACACCAACTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTTTGCAGCACAAAGCTGAGCGAAGGTAGGACAGGAAAATTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCGCGGGTTTATTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAAAGGAAAGCAGTCGTATACTTGCCGTTGTGATACAGTGGTGAGTTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGCCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACACATAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGAGAGCGGGTGTCGTTCCCTGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGTATAATGGCCACGGATATATCGCCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAGGACTAACAGGAACACCAACACCATGCAGAATTACCTTCTGCCGATCATAGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCTAAGGAGCGCAAGGAAGATCTTGAAAACGAGAAAATGCTGGGTACTAGAGAACGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCATTTCGCACTAAGAAAGTACATTCATTTTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCTGCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTTCCAATGTCGTCCGTGTGGACGACCTCTTTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAATTGAAACTGGCATTGCAACCGAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCTCAGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTATGAGGACGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTTCCACCGTTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCAGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGACTCCAGGCGGATATCGGAGCGGCACTAGTTGAAACCCCGCGCGGTCACGTACGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTTGTCTCGCCGAACTCTGTGCTGAAGAATGCCAAACTCGCACCAGCGCATCCGCTAGCTGACCAGGTTAAGATCATAACACACTCCGGAAGGTCAGGAAGGTACGCGGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAGGTGCCGTACCATGGCCAGAATTTCTAGCACTGAGTGAGAGCGCCACACTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAACCGCAAACTATACCACATTGCCGTGCATGGCCCCGCCAAGAACACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTTGCAGAAACAGAGTACGTGTTTGACGTGGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGTCTTGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCTCCCTATCACGAGCTAGCACTGGAGGGACTGAAGACCCGACCTGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCGGGGTCGGGCAAGTCAGCTATTATCAAGTCAACTGTCACAGCACGAGATCTCGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAATTGTCGCGAGATTGAGGCCGACGTGCTAAGACTAAGGGGTATGCAGATTACGTCGAAGACAGTAGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCATAAAGCCGTAGAAGTGCTGTACGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCGCTACTTGCCTTGATTGCTATCGTCAGGCCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGCGGAGACCCTATGCAATGTGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAAGTACACTTCAATCACCCTGAAAAAGACATATGCACCAAGACATTCTACAAATACATTTCCCGGCGTTGCACACAGCCAGTTACAGCTATTGTATCGACACTGCATTACGGCGGAAAGATGAAGACCACGAACCCGTGCAAGAAGAACATTGAAATCGATATTACAGGGGCCACAAAGCCAAAGCCTGGGGATATCATCCTGACGTGTTTCCGCGGGTGGGTTAAGCAATTGCAAATTGACTATCCCGGACATGAAGTAATGACAGCCGCGGCCTCACAAGGGCTAACTAGAAAAGGAGTGTATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCACTGTACGCAATCACATCAGAGCATGTGAATGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGGCTGGTGTGGAAAACCTTGCAGGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAACGTACCTAAGGGAAACTTTCAGGCTACTATAGAGGACTGGGAAGCTGAACACAGGGGGATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCGCTCCCCGTACCAATCCGTTCAGCTGCAAGACCAACGTTTGCTGGGCAAAGGCATTGGAACCGATACTAGCCACAGCCGGTATCGTACTTACCGGTTGTCAGTGGAGCGAACTGTTCCCGCAGTTTGCGGATGATAAACCGCATTCGGCCATCTACGCCCTGGACGTAATTTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGATTTGACAAGCGGATTGTTCTCTAAACAGAGCATCCCATTAACGTACCATCCTGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCATTGCCGCTGAGCTCTCCCGTAGGTTCCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAGGGCACACAGCTTGATTTGCAGACGGGGAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACCTGGTCCCGGTGAACCGCAATCTTCCTCACGCCTTAGTCCCCGAGTACAAGGAGAAGCAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCAGTACTTGTGGTATCAGAGGAAAGAATTGAAGCTCCCCACAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATCGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTACAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTTATCAACATTGGAACTAAATACAGAAATCACCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTAAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAATTGCCTTAACCCAGGAGGCACCCTCGTGGTAAAGTCCTATGGTTACGCCGACCGCAATAGTGAGGACGTGGTCACTGCTCTTGCCAGGAAGTTTGTCAGGGTGTCTGCAGCGAGACCAGATTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAATTAGACAACAGCCGTACACGGCAATTCACCCCGCACCACCTGAATTGCGTGATCTCGTCCGTGTACGAGGGTACAAGAGATGGAGTTGGAGCCGCGCCGTCATACCGCACTAAAAGGGAGAATATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCGGTTGTCAACGCAGCCAATCCGCTGGGTAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGAACAGTTTTACCGATTCAGCCACAGAGACAGGCACTGCAAGACTGACTGTGTGCCAAGGAAAGAAAGTGATCCATGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAGCACCCAGAAGCAGAAGCCTTGAAATTGCTACAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTAGTAAACGAACATAACATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTAGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTACTGCCTGGACAAGAAGTGGAAGGAAAGAATCGACGCGGTACTCCAACTTAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGACGAGTTAGTATGGATCCATCCAGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTTAGTACTACAAAAGGCAAGTTGTATTCGTACTTTGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCGGCAAAGGACATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCTAATGACCAGGAAAGTAATGAACAACTGTGCGCCTACATATTGGGTGAGACTATGGAAGCAATCCGTGAAAAATGCCCGGTCGATCATAACCCGTCGTCTAGCCCGCCCAAAACATTACCATGCCTTTGCATGTATGCCATGACGCCGGAAAGGGTCCACAGACTTAGAAGCAATAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCCCTTCCTAAGTACAAGATCAAGAATGTTCAGAAGGTTCAGTGTACGAAAGTAGTCCTGTTTAACCCGCATACTCCCGCATTCGT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| 21,338
|
OL943986.1
|
Sindbis virus
|
Meno,K.
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University of Pretoria, Medical Virology
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South Africa
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2022-12-07
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KYA14MP134/SA
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Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,367
|
GenBank
| null |
South Africa: Kyalami
|
South Africa
|
Culex univittatus
| null |
2014
| null | null |
Sindbis virus isolate KYA14MP134/SA, complete genome
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ATGGAGAAGCCAGTAGTAAACGTAGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCATTGTGTCTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCGTGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATTAAGGATCTCCGGACCGTACTTGATACGCCGGATGCAGAAACACCATCGCTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCAACACGCGTGCCGAGTATTCCGTCATGCAGGACGTGTATATCAACGCTCCCGGAACTATCTATCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCGTACAACACCAACTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTTTGCAGCACAAAGCTGAGCGAAGGTAGGACAGGAAAATTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCGCGGGTTTATTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAAAGGAAAGCAGTCGTATACTTGCCGTTGTGATACAGTGGTGAGTTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGCCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACATATAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGAGAGCGGGTGTCGTTCCCTGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGTATAATGGCCACGGATATATCGCCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAGGACTAACAGGAACACCAACACCATGCAGAATTACCTTCTGCCGATCATAGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCTAAGGAGCGCAAGGAAGATCTTGAAAACGAGAAAATGCTGGGTACTAGAGAACGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCATTTCGCACTAAGAAAGTACATTCATTTTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCAGCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTTCCAATGTCGTCCGTGTGGACGACCTCTTTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAATTGAAACTGGCATTGCAACCGAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCTCAGAGGAATTAGTCACGGAGGCCAAGGCTGCTTATGAGGACGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTTCCACCGTTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCAGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGACTCCAGGCGGATATCGGAGCGGCACTAGTTGAAACCCCGCGCGGTCACGTACGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTTGTCTCGCCGAACTCTGTGCTGAAGAATGCCAAACTCGCACCAGCGCATCCGCTAGCTGACCAGGTTAAGATCATAACACACTCCGGAAGGTCAGGAAGGTACGCGGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAGGTGCCGTACCATGGCCAGAATTTCTAGCACTGAGTGAGAGCGCCACACTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAACCGCAAACTATACCACATTGCCGTGCATGGCCCCGCCAAGAACACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTTGCAGAAACAGAGTACGTGTTTGACGTGGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGTCTTGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCTCCCTATCACGAGCTAGCACTGGAGGGACTGAAGACCCGACCTGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCGGGGTCGGGCAAGTCAGCTATTATCAAGTCAACTGTCACAGCACGAGATCTCGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAATTGTCGCGAGATTGAGGCCGACGTGCTAAGACTAAGGGGTATGCAGATTACGTCGAAGACAGTAGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCATAAAGCCGTAGAAGTGCTGTACGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCGCTACTTGCCTTGATTGCTATCGTCAGGCCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGCGGAGACCCTATGCAATGTGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAAGTACACTTCAATCACCCTGAAAAAGACATATGCACCAAGACATTCTACAAATACATTTCCCGGCGTTGCACACAGCCAGTTACAGCTATTGTATCGACACTGCATTACGGCGGAAAGATGAAGACCACGAACCCGTGCAAGAAGAACATTGAAATCGATATTACAGGGGCCACAAAGCCAAAGCCTGGGGATATCATCCTGACGTGTTTCCGCGGGTGGGTTAAGCAATTGCAAATTGACTATCCCGGACATGAAGTAATGACAGCCGCGGCCTCACAAGGGCTAACTAGAAAAGGAGTGTATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCACTGTACGCAATCACATCAGAGCATGTGAATGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGGCTGGTGTGGAAAACCTTGCAGGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAACGTACCTAAGGGAAACTTTCAGGCTACTATAGAGGACTGGGAAGCTGAACACAGGGGGATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCGCTCCCCGTACCAATCCGTTCAGCTGCAAGACCAACGTTTGCTGGGCAAAGGCATTGGAACCGATACTAGCCACAGCCGGTATCGTACTTACCGGTTGTCAGTGGAGCGAACTGTTCCCGCAGTTTGCGGATGATAAACCGCATTCGGCCATTTACGCCCTGGACGTAATTTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGATTTGACAAGCGGATTGTTCTCTAAACAGAGCATCCCATTAACGTACCATCCTGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCATTGCCGCTGAGCTCTCCCGTAGGTTCCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAGGGCACACAGCTTGATTTGCAGACGGGGAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACCTGGTCCCGGTGAACCGCAATCTTCCTCACGCCTTAGTCCCCGAGTACAAGGAGAAGCAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCAGTACTTGTGGTATCAGAGGAAAGAATTGAAGCTCCCCACAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATCGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTACAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTTATCAACATTGGAACTAAATACAGAAATCACCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTAAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAATTGCCTTAACCCAGGAGGCACCCTCGTGGTAAAGTCCTATGGTTACGCCGACCGCAATAGTGAGGACGTGGTCACTGCTCTTGCCAGGAAGTTTGTCAGGGTGTCTGCAGCGAGACCAGATTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAATTAGACAACAGCCGTACACGGCAATTCACCCCGCACCACCTGAATTGCGTGATCTCGTCCGTGTACGAGGGTACAAGAGATGGAGTTGGAGCCGCGCCGTCATACCGCACTAAAAGGGAGAATATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCGGTTGTCAACGCAGCCAATCCGCTGGGTAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGAACAGTTTTACCGATTCAGCCACAGAGACAGGCACTGCAAGACTGACTGTGTGCCAAGGAAAGAAAGTGATCCATGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAGCACCCAGAAGCAGAAGCCTTGAAATTGCTACAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTAGTAAACGAACATAACATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTAGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTACTGCCTGGACAAGAAGTGGAAGGAAAGAATCGACGCGGTACTCCAACTTAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGACGAGTTAGTATGGATCCATCCAGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTTAGTACTACAAAAGGCAAGTTGTATTCGTACTTTGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCGGCAAAGGACATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCTAATGACCAGGAAAGTAATGAACAACTGTGCGCCTACATATTGGGTGAGACTATGGAAGCAATCCGTGAAAAATGCCCGGTCGATCATAACCCGTCGTCTAGCCCGCCCAAAACATTACCATGCCTTTGCATGTATGCCATGACGCCGGAAAGGGTCCACAGACTTAGAAGCAATAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCCCTTCCTAAGTACAAGATCAAGAATGTTCAGAAGGTTCAGTGTACGAAAGTAGTCCTGTTTAACCCGCATACTCCCGCATTCGT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| 21,339
|
OM179803.1
|
Sindbis virus
|
Johnson,B.K., Shockley,P., Chanas,A.C., Squires,E.J., Gardner,P., Wallace,C., Simpson,D.I., Bowen,E.T., Platt,G.S., Way,H., Chandler,J.A., Highton,R.B., Hill,M.N., Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-11-27
|
K512
|
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,523
|
GenBank
| 1
|
Kenya
|
Kenya
|
Mansonia uniformis
| null |
1971
| null | null |
Sindbis virus isolate K512, complete genome
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CACTATTGAATCAAACAGCCGACCAATTGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTAAACGTAGACGTAGACCCCCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAAAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATCTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCATTGTGTCTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGTAAACTGGCGGAAAAAGCGTGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATTAAGGATCTCCGGACCGTACTTGATACGCCGGATGCTGAAACACCATCGCTCTGCTTTCACAACGATGTTACCTGCAACATGCGTGCCGAATATTCCGTCATGCAGGACGTGTATATCAACGCTCCCGGAACTATCTATCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCGTACAACACCAACTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTTTGCAGCACAAAGCTGAGTGAAGGTAGGACAGGAAAATTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCGCGGGTTTATTTCTCCGTAGGATCGACACTTTATCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAATGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGTTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGTCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACACACAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGAGAACGGGTATCGTTCCCTGTGTGCACGTACATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACTGGTATAATGGCCACGGATATATCACCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAGGACTAACAGGAACACCAACACCATGCAAAATTACCTTCTGCCGATCATAGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCTAAGGAGCGCAAGGATGATCTTGATAACGAGAAAATGCTGGGTACTAGAGAACGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGAAAGTACATTCGTTTTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCATCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTTCCCATGTCGTCCGTATGGACGACCTCTTTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAATTGAAACTGGCATTGCAACCAAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCTCGGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTTTGAGGATGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTTCCACCATTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCAGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGGCTCCAGGCGGACATCGGAGCAGCATTAGTTGAAACCCCGCGCGGTCACGTAAGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTTGTCTCGCCAAACTCTGTGCTGAAGAATGCCAAACTCGCACCAGCGCACCCGCTAGCAGATCAGGTTAAGATCATAACACACTCCGGAAGATCAGGAAGGTACGCGGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAGGTGCCGTACCATGGCCAGAATTCCTAGCACTGAGTGAGAGCGCCACGTTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAACCGCAAACTATACCACATTGCCATGCATGGCCCCGCCAAGAATACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTTGCAGAAACAGAGTACGTGTTTGACGTGGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGTCTGGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCTCCCTATCATGAGCTAGCTCTGGAGGGACTGAAGACCCGACCTGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCGGGGTCGGGCAAGTCAGCTATTATCAAGTCAACTGTCACGGCACGAGATCTTGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAATTGTCGCGAAATTGAGGCCGACGTGCTAAGACTGAGGGGTATGCAGATTACGTCGAAGACAGTAGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCACAAAGCCGTAGAAGTGCTGTACGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCACTACTTGCCTTGATTGCTATCGTCAGGCCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGCGGAGACCCCATGCAATGCGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAGGTACATTTCAATCACCCTGAAAAAGACATATGCACCAAGACATTCTACAAGTATATCTCCCGGCGTTGCACACAGCCAGTTACAGCTATTGTATCGACACTGCATTACGATGGAAAGATGAAAACCACGAACCCGTGCAAGAAGAACATTGAAATCGATATTACAGGGGCCACAAAGCCGAAGCCAGGGGATATCATCCTGACATGTTTCCGCGGGTGGGTTAAGCAATTGCAAATCGACTATCCCGGACATGAAGTAATGACAGCCGCGGCCTCACAAGGGCTAACCAGAAAAGGAGTGTATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCACTGTACGCGATCACATCAGAGCATGTGAACGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGGCTAGTGTGGAAAACCTTGCAGGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAACATACCTAAAGGAAACTTTCAGGCTACTATAGAGGACTGGGAAGCTGAACACAAGGGAATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCACTCCCCGTGCCAATCCGTTCAGCTGCAAGACCAACGTTTGCTGGGCGAAAGCATTGGAACCGATACTAGCCACGGCCGGTATCGTACTTACCGGTTGCCAGTGGAGCGAACTGTTCCCACAGTTTGCGGATGACAAACCACATTCGGCCATTTACGCCTTAGACGTAATTTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGACTTGACAAGCGGACTGTTTTCTAAACAGAGCATCCCACTAACGTACCATCCCGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGTAAGTATGGGTACGATCACGCCATTGCCGCCGAACTCTCCCGTAGATTTCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAGGGCACACAACTTGATTTGCAGACGGGGAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACCTGGTCCCGGTGAACCGCAATCTTCCTCACGCCTTAGTCCCCGAGTACAAGGAGAAGCAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCAGTACTTGTGGTATCAGAGGAAAAAATTGAAGCTCCCCGTAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATTGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTACAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTCATCAACATTGGAACTAAATACAGAAACCACCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTAAAAAACCTTTCGCGTTCGGCCCTGAATTGCCTTAACCCAGGAGGCACCCTCGTGGTGAAGTCCTATGGCTACGCCGACCGCAACAGTGAGGACGTAGTCACCGCTCTTGCCAGAAAGTTTGTCAGGGTGTCTGCAGCGAGACCAGATTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAACTAGACAACAGCCGTACACGGCAATTCACCCCGCACCATCTGAATTGCGTGATTTCGTCCGTGTATGAGGGTACAAGAGATGGAGTTGGAGCCGCGCCGTCATACCGCACCAAAAGGGAGAATATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCAGTTGTCAACGCAGCCAATCCGCTGGGTAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGACCAGTTTTACCGATTCAGCCACGGAGACAGGCACCGCAAGAATGACTGTGTGCCTAGGAAAGAAAGTGATCCACGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAGCACCCAGAAGCAGAAGCCTTGAAATTGCTACAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTAGTAAATGAACATAACATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTAGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTATTGCCTGGATAAGAAGTGGAAGGAAAGAATCGACGCGGCACTCCAACTTAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGATGAGTTAGTATGGATCCATCCAGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTCAGTACTACAAAAGGAAAATTGTATTCGTACTTCGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCAGCAAAAGACATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCTAATGACCAGGAAAGTAATGAACAACTGTGTGCCTACATATTGGGTGAGACCATGGAAGCAATCCGCGAAAAGTGCCCGGTCGACCATAACCCGTCGTCTAGCCCGCCCAAAACGTTGCCGTGCCTTTGCATGTATGCCATGACGCCAGAAAGGGTCCACAGACTTAGAAGCAATAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCCCTTCCTAAGCACAAAATTAAGAATGTTCAGAAGGTTCAGTG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| 21,890
|
ON003414.1
|
Sindbis virus
|
Nagai,A., Pereira,L.P.M., Fontoura,M.A., Costa,G.H., Melo-Hanchuk,T.D., Marques,R.E.
|
CNPEM, Virologia
| null |
2022-06-08
|
LMP_B
|
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,690
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
| null | null |
2021-07-08
| null | null |
Sindbis virus isolate LMP_B, complete genome
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GCGTAGTACACACTATAAAGAACCAAGCCGACCAATTGCACTACCATCATCATGGAGAAACCTGTAGTTAACGTTGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTATTACGCAACTACAGAAGAGTTTCCCGCAGTTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGCCACACCGAATGACCATGCAAATGCCAGAGCTTTTTCGCATCTGGCCAGCAAACTGATCGAGCTGGAGGTCCCGACCACAGCGACGATCTTGGACATCGGCAGCGCACCTGCTCGTAGAATGTATTCCGAGCACCACTATCATTGCGCTTGCCCCATGCGTAGTCCCGAAGATCCGGACCGCATGATGAAGTACGCCAGAAAACTGGTGGAGAAGTCGTGCAAGATTACGGACAAGAACTTGCACGAAAAAATCAAGGACCTCCGGACAGTGCTAAGCACGCCGGATGCGGAGACACCATCGCTGTGTTTCCATAATGACGTTACCTGCAGCATGCAGGCTGAATACTCCGTTATGCAGGACGTCTATATCAACGCTCCTTCTACGATCTACCATCAAGCAATGAAAGGAGTCAGAACATTGTACTGGATCGGGTTCGATACCACGCAGTTCATGTTCTCGGCCATGGCAGGGTCATATCCTGCGTATAACACCAATTGGGCCGATGAGAAAGTCCTGGAAGCCCGTAATATAGGACTGTGCAGTACAAGGCTTAGTGAAGGCAGGACAGGAAAGTTGTCGATAATGCGGAAGAAGGCGCTGCGACCAGGAGCACGCGTCTATTTCTCCGTTGGTTCGACCTTATACCCTGAGAACAGAGAGAGCCTGCAGAGCTGGCACCTACCGTCGGTGTTCCACCTGAAAGGTAAGCAATCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTTAGTTGCGAAGGCTACGTGGTGAAGAAGATCGTCATCAGTCCCGGGATAACGGGCGAGACCGTGGGATACGCGGTTACGAACAACAGTGAGGGTTTCTTACTGTGCAAAGTTACTGACACAGTGAAAGGGGAGCGGGTCTCGTTCCCCGTGTGCACCTACATACCGGCGACCATCTGCGATCAGATGACAGGTATCATGGCGACGGATATCTCACCCGATGACGCACAGAAGTTACTGGTTGGGCTCAACCAGAGGATTGTCATCAACGGAAAAACGAATAGGAACACCAATACTATGCAAAATTACCTCTTACCAATTATCGCACAGGGCTTTAGCAAATGGGCGAAGGAGAGGAAAGAGGACCTAGACAACGAGAAAATGCTAGGCACCAGAGAAAGGAAACTGACGTTTGGGTGCCTGTGGGCGTTTCGCACAAAAAAAGTGCACTCATTCTATCGACCCCCGGGCACACAGACGATTGCTAAGGTTCCCTCAGTCTTTAGCGCGTTTCCGCTGTCCTCCGTTTGGACAACTACGTTGCCGATATCATTCCGGCAACAGATTAAACTTCTCCTCCAGCCAAAGAAGGAAGAAGAATTGGTCCAAATATCTGAACAGCAGGTCGAAGAAGCGTCGTCAGCGTATGCAGAGGCGAAAGAGGCGGAGCGCGCAGAGAAGCTAAGAGAGGCTTTACCACCGCTAGTTGCAGATAAAGAGGTAGATGCAGCCGCGGAAGTGATTTGCGAAGTTGAAGGGCTACAAGCTGATGTTGGTGCCGCGTTGGTAGAAACGCCTCGCGGGCACGTGAGGATAATTCCCCAGCCTGGGGACAGGCTGATCGGGCAGTACCTGGTCGTGTCACCGACCTCTGTACTGAAGAACTCCAAGCTGGCACCAGTTCATCCACTCGCAGAACAGGTCAAAATCATTACCCACTCAGGACGCACAGGTAGGTATGCAGTCGAGCCGTATGATGCAAAAGTCCTATTGCCGGCAGGAGGCGCGGTACCGTGGCCAGAGTTCCTAGCTCTTAGCGAGAGCGCCTCTTTGGTCTACAACGAATGTGAATTCGTAAACCGCAAACTTTATCATATAGCGGTCCACGGCCCGGCTAAGAACACCGAGGAGGAACAGTACAAGATTACCAAAGCCGCGCTGGCTGAGACGGAATTCGTATTCGACGTTGACAAGCGAAGGTGCGTCAAGAAAGAAGAGGCTTCAGGGCTGGTCTTGTCAGGGGAACTGACCAATCCACCTTATCATGAAATGGCATTAGAGAGTTTACAGACACGGCCCGCAGTTCCTTACAAAGTGGAAACAATCGGAGTCATCGGCACGCCGGGCTCGGGTAAATCAGCTATTATCAAGTCAACAGTCACAGCCAAAGACCTCGTCACCAGCGGGAAGAAGGAGAACTGTAAAGAAATTGAAACTGATGTCTTGAGGATGCGAGGAATGCAAATCACCTCACGAACGGTCGACTCAGTCATGCTCAATGGGTGCCACAAGGCGGTCGACGTCTTGTACGTCGACGAGGCCTTTGCTTGCCATGCTGGAGCATTGCTGGCACTTATTGCAATAGTCAGACCCCGAAAGAAAGTAGTGCTGTGCGGTGATCCGAAGCAGTGTGGGTTCTTCAACATGATGCAGCTCAAAGTGCATTTCAACAACCCAGAGAAAGACATCTGCACTAAGACGTTTTACAAGTACATCTCCCGCAGATGCACTCAGCCAGTCACGGCCATTGTTTCCACGCTGCACTACGACGGTAGGATGAAGACAACTAACCCTTGTAAAAAGAGCGTGGAAATTGACATTACCGGCTCGACCAAACCAAAACCGGGTGATATCGTGTTGACTTGCTTCCGCGGATGGGTCAAACAGCTGCAGATCGAATACCCCGGGCACGAAGTCATGACAGCAGCCGCGTCACAAGGGTTAACGCGGAAAGGCGTGTATGCCGTGCGCCAAAAAGTCAACGAAAATCCCTTGTACGCGATAACTTCCGAACACGTTAACGTATTGCTCACGCGTACTGAAGACCGGCTCGTTTGGAAGACCCTTCAGGGCGACCCATGGATCAAACAGCTCACTAACATCCCGAAGGGGAACTTCCAGGCTACTATCGAAGATTGGGAAGCAGAGCACAGGGGCATCATCGCAGCAATTAACAGCCCAGCACCTAGAGTCGACCCGTTCAGTTGCAAGACTAACGTTTGCTGGGCGAAGGCCCTAGAGCCTATACTAGCGACGGCAGGTATATCACTAACAGGGCGTCAGTGGAGTGAGTTGTTCCCACAATTCGCAGATGACAAGCCCCATTCGGCCGTGTACGCTTTGGACGTTTTGTGCATAAGATTCTTTGGAGTCGACTTGACCAGTGGAATATTCTCCAGGCAAAGCGTCCCGCTGACGTACCACCCTGCCGACGCTTCAAGGCAAGTAGCCCATTGGGACAACAGTCCCGGTTCACGTAAGTATGGGTATGATCAGGCGGTTGCCGCGGAGCTATCACGTCGCTTCCCGGTGTTCCAGATGGCAGGCAAAGGTACTCAACTTGACCTGCAAACTGGTAGAACAAGGGTAGTATCACCGCAGCACAACCTCGTTCCGGTCAACCGTAATCTACCACACTCGCTCGTCCCTGAACACAAGACACGTAACCCCGGTCCGGTGGAAAAGTTCCTGATGCAGTTTAAGCATCATACGATCTTGGTCGTTTCAGAGACCAAGGTCGACATGCCCCAGAGGAGAGTAGAGTGGATAGCGCCGCTCGGCACCGCCGGAGCTGACAAGACTTACAACCTCGCATTTGGATTCCCACCCCAATCGAGGTACGATTTGGTTTTTATTAACATTGGCACAAAGTTCAGGTATCACCACTTCCAGCAGTGCGAAGACCACGCAGCTACACTAAAAACCTTGTCTCGCTCGGCGTTGAATTGCCTTAATCCTGGTGGTACACTGGTGGTCAAAGCTTACGGCTACGCGGACAGAAATAGCGAGGACGTGGTCACCGCCTTAGCGCGAAAATTTGTTCGCGTTTCAGCGGCCCGCCCCGATTGCGTCACCAGCAATACCGAGATGTTCCTAATCTTCAGGCAACTGGATAACAGTAGGACCAGGCAGTTCACCCCGCACCATCTGAATTGTGTTGTCTCGTCTGTATATGAGGGCCTTCGTGACGGTGTGGGAGCTGCTCCGGCCTACCGCTCGAAACGTGAGAATATCGCCGAATGCCTTGAAGAGGCCGTAGTTAACGCCGCGAACCCACTCGGACGTCCGGGCGAAGGGGTGTGTAAAGCCATATATAAAAAATGGCCCAATAGTTTTGTCGATTCTGCGACAGAGACTGGAACAGCTAAGCTAGTGTGCTGTCAAGGAAAAAAGATTATCCATGCCGTCGGACCCGACTTCCGTAAACACCCCGAGGCAGAAGCACTGAAGATTCTCCAGAACACATACCACGCCATTGCAGATTTGGTTAACAAACATGGAATCAAGACCGTAGCGATTCCGCTCCTATCCACCGGGATTTACGCAGCGGGAAAAGACAGACTTGAGGTCTCCTTAAACTGCCTCACTACCGCCCTGGACAGAACAGACGCAGACGTCACAATCTACTGCCTTGACAAAAAATGGAAAGAACGGATTGATGCGGTTATACAGTTGAAGGAGTCGGTGACGGAACTGAAGGATGATGACATGGAGATCGACGACGAACTAGTATGGATCCACCCGGATAGTTGCCTCAAGGGCAGGAAAGGGTTTAGTACGACGAAGGGCAAACTCTACTCGTACTTTGAGGGGACTAAATTTCATCAAGCAGCAAAAGACATGGCTGAGATCAAGGTACTTTTTCCCGATGAGCAAGAGTGCAACGAGCAACTGTGTGCATACATTCTAGGCGAAACCATGGAAGCCATTAGGGAAAAATGCCCAGTGGACTTTAATCCGTCGTCCAGTCCGCCGAAGACGCTCCCCTGTTTGTGTATGTACGCCATGACGCCCGAGAGAGTGCACCGCTTGCGTAGCAATAACGTCAAATCCATCACAGTATGCTCGTCAACCCCACTTCCGAAGCACAAAATTAAGAACGTTCAGAA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CGAAGGTAGACGCCTTCGAACATGCGACCACTGTCCCAAATGTGCCGAGGATTCCGTATAAGGCTCTGGTCGAGAGAGCGGGATATGCGCCTTTGAACTTGGAGATTACAGTTATGTCCTCCGAATTGATCCCGTCGACGAACCTGGAGTACGTCACATGCAAGTACACGACTGTAGTTCCATCACCCAAAGTGAAGTGCTGTGGAACGCTAGAGTGCTCATCTGCCCGCCATGCCGACTACAACTGTAAGGTGTTCGGGGGAGTGTACCCATTCATGTGGGGCGGCGCACAGTGTTTCTGCGATAGCGAGAACAGCCAAATGAGTGAGGCATACGTGGAATTTTCTGCTGACTGCGCCGCAGATCACGCTCAGGCAGTGAAAGTGCACACAGCGGCACTGAAGGTAGGACTGCGCGTTGTGTATGGTAACACCACCAGCATGCTGGACGTGTACGTTAACGGAGTCACCCCTGGCACTTCGAAGGATCTTAAAGTGATCGCAGGCCCAATTTCAGCGGCCTATACACCATTCGATCACAAAGTCATCATTCATAAAGGGAAGGTGTACAACTACGACTTTCCAGAATATGGAGCGATGAAACCAGGAGCGTTCGGAGACATACAAGCAACATCCCTTACCAGTAGCGATCTGATAGCCAACACGGACATCAGGCTCCTGAAGCCATCAGCGAAGAACGTTCACGTGCCGTACACTCAAGCTGCATCTGGCTTTGAGATGTGGAAGAACAATTCCGGCAGACCTTTGCAGGAGACTGCCCCGTTTGGGTGCCAGATTGCCGTAAACCCGCTAAGGGCGATCGACTGCGCGTACGGCAACATCCCGATCTCGCTGGACATCCCTAACGCGGCATTTATTCGCGTCTCCGACGCGCCGCTTGTATCGACCTTGAAGTGCGAGGTCGGTGAATGCGTCTACTCGGCCGACTTCGGCGGAATAGCCACCCTGCAGTACTCATCAGACAGAGAAGGACAGTGTCCAGTGCACTCCCATTCCAGCACTGCAACTCTACAAGAGTCTACAGTGCATGTACTGCAAAAAGGCGGTGTCACGATCCACTTCAGCACCGCTAGCCCGCAGGCTAACTTCATAGTGTCACTATGCGGTAAAAAGACCACATGCAATGCCGAATGTAAACCACCGGCCGATCATATAGTGAACGTACCACACAAAAACGACCAGGAGTTCCAGGCAGCCGTCTCCCAAACATCATGGAGCTGGCTGTTTGCACTATTTGGGGGAGCTTCATCCCTGTTAGTTATAGGAGTAATGATTTTCGCTTGCAGCGCTTTGCTGACAAGCACCCGACGATGACCGCTACGCCCCAATGACCCGACCAGCAAAAACTCGATGTACTACCGAGGAACCGATGTGCATAACGCATCGGGCTGGTACATTAGATCCCCGTCATCAGACGGGCTCATAGCGACGCTAAAACTCGACGTATTCCCGAGGAAGTGCAGTGCATAATGCTGCACAGCGTCGTCATATATTCATTTATTATTCAATATATAATAGACACCAAAACTCAATGTATTTCTGAGGAAGCGTGGTGCATAATGCCACGCAGTGTCTAACTAATCAATTCATTATTTTCTTTTATTTTATTCACATAATTTTGTTTTTAATATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 30,281
|
ON003415.1
|
Sindbis virus
|
Nagai,A., Pereira,L.P.M., Fontoura,M.A., Costa,G.H., Melo-Hanchuk,T.D., Marques,R.E.
|
CNPEM, Virologia
| null |
2022-06-08
|
LMP_A
|
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,631
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
| null | null |
2021-07-08
| null | null |
Sindbis virus isolate LMP_A, complete genome
|
GCGTAGTACACACTATAAAGAACCAAGCCGACCAATTGCACTACCATCATCATGGAGAAACCTGTAGTTAACGTTGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTATTACGCAACTACAGAAGAGTTTCCCGCAGTTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGCCACACCGAATGACCATGCAAATGCCAGAGCTTTTTCGCATCTGGCCAGCAAACTGATCGAGCTGGAGGTCCCGACCACAGCGACGATCTTGGACATCGGCAGCGCACCTGCTCGTAGAATGTATTCCGAGCACCACTATCATTGCGCTTGCCCCATGCGTAGTCCCGAAGATCCGGACCGCATGATGAAGTACGCCAGAAAACTGGTGGAGAAGTCGTGCAAGATTACGGACAAGAACTTGCACGAAAAAATCAAGGACCTCCGGACAGTGCTAAGCACGCCGGATGCGGAGACACCATCGCTGTGTTTCCATAATGACGTTACCTGCAGCATGCAGGCTGAATACTCCGTTATGCAGGACGTCTATATCAACGCTCCTTCTACGATCTACCATCAAGCAATGAAAGGAGTCAGAACATTGTACTGGATCGGGTTCGATACCACGCAGTTCATGTTCTCGGCCATGGCAGGGTCATATCCTGCGTATAACACCAATTGGGCCGATGAGAAAGTCCTGGAAGCCCGTAATATAGGACTGTGCAGTACAAGGCTTAGTGAAGGCAGGACAGGAAAGTTGTCGATAATGCGGAAGAAGGCGCTGCGACCAGGAGCACGCGTCTATTTCTCCGTTGGTTCGACCTTATACCCTGAGAACAGAGAGAGCCTGCAGAGCTGGCACCTACCGTCGGTGTTCCACCTGAAAGGTAAGCAATCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTTAGTTGCGAAGGCTACGTGGTGAAGAAGATCGTCATCAGTCCCGGGATAACGGGCGAGACCGTGGGATACGCGGTTACGAACAACAGTGAGGGTTTCTTACTGTGCAAAGTTACTGACACAGTGAAAGGGGAGCGGGTCTCGTTCCCCGTGTGCACCTACATACCGGCGACCATCTGCGATCAGATGACAGGTATCATGGCGACGGATATCTCACCCGATGACGCACAGAAGTTACTGGTTGGGCTCAACCAGAGGATTGTCATCAACGGAAAAACGAATAGGAACACCAATACTATGCAAAATTACCTCTTACCAATTATCGCACAGGGCTTTAGCAAATGGGCGAAGGAGAGGAAAGAGGACCTAGACAACGAGAAAATGCTAGGCACCAGAGAAAGGAAACTGACGTTTGGGTGCCTGTGGGCGTTTCGCACAAAAAAAGTGCACTCATTCTATCGACCCCCGGGCACACAGACGATTGCTAAGGTTCCCTCAGTCTTTAGCGCGTTTCCGCTGTCCTCCGTTTGGACAACTACGTTGCCGATATCATTCCGGCAACAGATTAAACTTCTCCTCCAGCCAAAGAAGGAAGAAGAATTGGTCCAAATATCTGAACAGCAGGTCGAAGAAGCGTCGTCAGCGTATGCAGAGGCGAAAGAGGCGGAGCGCGCAGAGAAGCTAAGAGAGGCTTTACCACCGCTAGTTGCAGATAAAGAGGTAGATGCAGCCGCGGAAGTGATTTGCGAAGTTGAAGGGCTACAAGCTGATGTTGGTGCCGCGTTGGTAGAAACGCCTCGCGGGCACGTGAGGATAATTCCCCAGCCTGGGGACAGGCTGATCGGGCAGTACCTGGTCGTGTCACCGACCTCTGTACTGAAGAACTCCAAGCTGGCACCAGTTCATCCACTCGCAGAACAGGTCAAAATCATTACCCACTCAGGACGCACAGGTAGGTATGCAGTCGAGCCGTATGATGCAAAAGTCCTATTGCCGGCAGGAGGCGCGGTACCGTGGCCAGAGTTCCTAGCTCTTAGCGAGAGCGCCTCTTTGGTCTACAACGAATGTGAATTCGTAAACCGCAAACTTTATCATATAGCGGTCCACGGCCCGGCTAAGAACACCGAGGAGGAACAGTACAAGATTACCAAAGCCGCGCTGGCTGAGACGGAATTCGTATTCGACGTTGACAAGCGAAGGTGCGTCAAGAAAGAAGAGGCTTCAGGGCTGGTCTTGTCAGGGGAACTGACCAATCCACCTTATCATGAAATGGCATTAGAGAGTTTACAGACACGGCCCGCAGTTCCTTACAAAGTGGAAACAATCGGAGTCATCGGCACGCCGGGCTCGGGTAAATCAGCTATTATCAAGTCAACAGTCACAGCCAAAGACCTCGTCACCAGCGGGAAGAAGGAGAACTGTAAAGAAATTGAAACTGATGTCTTGAGGATGCGAGGAATGCAAATCACCTCACGAACGGTCGACTCAGTCATGCTCAATGGGTGCCACAAGGCGGTCGACGTCTTGTACGTCGACGAGGCCTTTGCTTGCCATGCTGGAGCATTGCTGGCACTTATTGCAATAGTCAGACCCCGAAAGAAAGTAGTGCTGTGCGGTGATCCGAAGCAGTGTGGGTTCTTCAACATGATGCAGCTCAAAGTGCATTTCAACAACCCAGAGAAAGACATCTGCACTAAGACGTTTTACAAGTACATCTCCCGCAGATGCACTCAGCCAGTCACGGCCATTGTTTCCACGCTGCACTACGACGGTAGGATGAAGACAACTAACCCTTGTAAAAAGAGCGTGGAAATTGACATTACCGGCTCGACCAAACCAAAACCGGGTGATATCGTGTTGACTTGCTTCCGCGGATGGGTCAAACAGCTGCAGATCGAATACCCCGGGCACGAAGTCATGACAGCAGCCGCGTCACAAGGGTTAACGCGGAAAGGCGTGTATGCCGTGCGCCAAAAAGTCAACGAAAATCCCTTGTACGCGATAACTTCCGAACACGTTAACGTATTGCTCACGCGTACTGAAGACCGGCTCGTTTGGAAGACCCTTCAGGGCGACCCATGGATCAAACAGCTCACTAACATCCCGAAGGGGAACTTCCAGGCTACTATCGAAGATTGGGAAGCAGAGCACAGGGGCATCATCGCAGCAATTAACAGCCCAGCACCTAGAGTCGACCCGTTCAGTTGCAAGACTAACGTCTGCTGGGCGAAGGCCCTAGAGCCTATACTAGCGACGGCAGGTATATCACTAACAGGGCGTCAGTGGAGTGAGTTGTTCCCACAATTCGCAGATGACAAGCCCCATTCGGCCGTGTACGCTTTGGACGTTTTGTGCATAAGATTCTTTGGAGTCGACTTGACCAGTGGAATATTCTCCAGGCAAAGCGTCCCGCTGACGTACCACCCTGCCGACGCTTCAAGGCAAGTAGCCCATTGGGACAACAGTCCCGGTTCACGTAAGTATGGGTATGATCAGGCGGTTGCCGCGGAGCTATCACGTCGCTTCCCGGTGTTCCAGATGGCAGGCAAAGGTACTCAACTTGACCTGCAAACTGGTAGAACAAGGGTAGTATCACCGCAGCACAACCTCGTTCCGGTCAACCGTAATCTACCACACTCGCTCGTCCCTGAACACAAGACACGTAACCCCGGTCCGGTGGAAAAGTTCCTGATGCAGTTTAAGCATCATACGATCTTGGTCGTTTCAGAGACCAAGGTCGACATGCCCCAGAGGAGAGTAGAGTGGATAGCGCCGCTCGGCACCGCCGGAGCTGACAAGACTTACAACCTCGCATTTGGATTCCCACCCCAATCGAGGTACGATTTGGTTTTTATTAACATTGGCACAAAGTTCAGGTATCACCACTTCCAGCAGTGCGAAGACCACGCAGCTACACTAAAAACCTTGTCTCGCTCGGCGTTGAATTGCCTTAATCCTGGTGGTACACTGGTGGTCAAAGCTTACGGCTACGCGGACAGAAATAGCGAGGACGTGGTCACCGCCTTAGCGCGAAAATTTGTTCGCGTTTCAGCGGCCCGCCCCGATTGCGTCACCAGCAATACCGAGATGTTCCTAATCTTCAGGCAACTGGATAACAGTAGGACCAGGCAGTTCACCCCGCACCATCTGAATTGTGTTGTCTCGTCTGTATATGAGGGCCTTCGTGACGGTGTGGGAGCTGCTCCGGCCTACCGCTCGAAACGTGAGAATATCGCCGAATGCCTTGAAGAGGCCGTAGTTAACGCCGCGAACCCACTCGGACGTCCGGGCGAAGGGGTGTGTAAAGCCATATATAAAAAATGGCCCAATAGTTTTGTCGATTCTGCGACAGAGACTGGAACAGCTAAGCTAGTGTGCTGTCAAGGAAAAAAGATTATCCATGCCGTCGGACCCGACTTCCGTAAACACCCCGAGGCAGAAGCACTGAAGATTCTCCAGAACACATACCACGCCATTGCAGATTTGGTTAACAAACATGGAATCAAGACCGTAGCGATTCCGCTCCTATCCACCGGGATTTACGCAGCGGGAAAAGACAGACTTGAGGTCTCCTTAAACTGCCTCACTACCGCCCTGGACAGAACAGACGCAGACGTCACAATCTACTGCCTTGACAAAAAATGGAAAGAACGGATTGATGCGGTTATACAGTTGAAGGAGTCGGTGACGGAACTGAAGGATGATGACATGGAGATCGACGACGAACTAGTATGGATCCACCCGGATAGTTGCCTCAAGGGCAGGAAAGGGTTTAGTACGACGAAGGGCAAACTCTACTCGTACTTTGAGGGGACTAAATTTCATCAAGCAGCAAAAGACATGGCTGAGATCAAGGTACTTTTTCCCGATGAGCAAGAGTGCAACGAGCAACTGTGTGCATACATTCTAGGCGAAACCATGGAAGCCATTAGGGAAAAATGCCCAGTGGACTTTAATCCGTCGTCCAGTCCGCCGAAGACGCTCCCCTGTTTGTGTATGTACGCCATGACGCCCGAGAGAGTGCACCGCTTGCGTAGCAATAACGTCAAATCCATCACAGTATGCTCGTCAACCCCACTTCCGAAGCACAAAATTAAGAACGTTCAGAA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CGAAGGTAGACGCCTTCGAACATGCGACCACTGTCCCAAATGTGCCGAGGATTCCGTATAAGGCTCTGGTCGAGAGAGCGGGATATGCGCCTTTGAACTTGGAGATTACAGTTATGTCCTCCGAATTGATCCCGTCGACGAACCTGGAGTACGTCACATGCAAGTACACGACTGTAGTTCCATCACCCAAAGTGAAGTGCTGTGGAACGCTAGAGTGCTCATCTGCCCGCCATGCCGACTACAACTGTAAGGTGTTCGGGGGAGTGTACCCATTCATGTGGGGCGGCGCACAGTGTTTCTGCGATAGCGAGAACAGCCAAATGAGTGAGGCATACGTGGAATTTTCTGCTGACTGCGCCGCAGATCACGCTCAGGCAGTGAAAGTGCACACAGCGGCACTGAAGGTAGGACTGCGCGTTGTGTATGGTAACACCACCAGCATGCTGGACGTGTACGTTAACGGAGTCACCCCTGGCACTTCGAAGGATCTTAAAGTGATCGCAGGCCCAATTTCAGCGGCCTATACACCATTCGATCACAAAGTCATCATTCATAAAGGGAAGGTGTACAACTACGACTTTCCAGAATATGGAGCGATGAAACCAGGAGCGTTCGGAGACATACAAGCAACATCCCTTACCAGTAGCGATCTGATAGCCAACACGGACATCAGGCTCCTGAAGCCATCAGCGAAGAACGTTCACGTGCCGTACACTCAAGCTGCATCTGGCTTTGAGATGTGGAAGAACAATTCCGGCAGACCTTTGCAGGAGACTGCCCCGTTTGGGTGCCAGATTGCCGTAAACCCGCTAAGGGCGATCGACTGCGCGTACGGCAACATCCCGATCTCGCTGGACATCCCTAACGCGGCATTTATTCGCGTCTCCGACGCGCCGCTTGTATCGACCTTGAAGTGCGAGGTCGGTGAATGCGTCTACTCGGCCGACTTCGGCGGAATAGCCACCCTGCAGTACTCATCAGACAGAGAAGGACAGTGTCCAGTGCACTCCCATTCCAGCACTGCAACTCTACAAGAGTCTACAGTGCATGTACTGCAAAAAGGCGGTGTCACGATCCACTTCAGCACCGCTAGCCCGCAGGCTAACTTCATAGTGTCACTATGCGGTAAAAAGACCACATGCAATGCCGAATGTAAACCACCGGCCGATCATATAGTGAACGTACCACACAAAAACGACCAGGAGTTCCAGGCAGCCGTCTCCCAAACATCATGGAGCTGGCTGTTTGCACTATTTGGGGGAGCTTCATCCCTGTTAGTTATAGGAGTAATGATTTTCGCTTGCAGCGCTTTGCTGACAAGCACCCGACGATGACCGCTACGCCCCAATGACCCGACCAGCAAAAACTCGATGTACTACCGAGGAACCGATGTGCATAACGCATCGGGCTGGTACATTAGATCCCCGTCATCAGACGGGCTCATAGCGACGCTAAAACTCGACGTATTCCCGAGGAAGTGCAGTGCATAATGCTGCACAGCGTCGTCATATATTCATTTATTATTCAATATATAATAGACACCAAAACTCAATGTATTTCTGAGGAAGCGTGGTGCATAATGCCACGCAGTGTCTAACTAATCAATTCATTATTTTCTTTTATTTTATTCA
| 30,282
|
OK644705.1
|
Sindbis virus
|
Ayhan,N., Hachid,A., Thirion,L., Benallal,K.E., Pezzi,L., Khardine,F.A., Benbetka,C., Benbetka,S., Harrat,Z., Charrel,R.
|
Aix-Marseille Univ - Ird_190, Emergence des Pathologies Virales
|
France
|
2022-05-10
|
P29 Algeria
|
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,522
|
GenBank
| null |
Algeria
|
Algeria
|
Culex perexiguus
| null |
2017-09
| null | null |
Sindbis virus isolate P29 Algeria, complete genome
|
TGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTAAACGTGGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCATTGTGTCTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATACGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCGTGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATTAAGGATCTCCGGACCGTACTTGATACGCCGGATGCTGAAACACCATCGCTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCAACACGCGTGCCGAGTATTCCGTCATGCAGGACGTGTATATCAACGCTCCCGGAACTATCTATCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCCATGGCAGGTTCGTACCCTGCGTACAACACCAACTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTTTGCAGCACACAGCTGAGCGAAGGTAGGACAGGAAAATTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCGCGGGTCTACTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAAAGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGTTGTGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGCCCCGGGATCACGGGGGAAACCGTGGGATACGCGGTTACACATAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGAGAGCGGGTGTCGTTCCCTGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGTATAATGGCCACGGATATATCGCCCGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATCGTCATTAACGGTAGGACTAACAGGAACACCAACACCATGCAGAATTACCTTCTGCCGATCATAGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCTAAGGAGCGCAAGGAAGATCTTGAAAACGAGAAAATGCTGGGTACTAGAGAACGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGAAAGTACATTCATTTTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCAGCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTTCCCATGTCGTCCGTGTGGACGACCTCTTTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAATTGAAACTGGCATTGCAACCGAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCTCAGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTATGAGGACGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTTCCACCATTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCTGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGACTCCAGGCGGACATCGGAGCGGCATTAGTTGAAACCCCGCGCGGTCACGTGCGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTTGTCTCGCCGAACTCTGTGCTGAAGAATGCCAAACTCGCACCAGCGCATCCGCTAGCCGATCAGGTTAAGATCATAACACACTCCGGAAGATCAGGAAGGTACGCAGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAGGTGCCGTACCATGGCCAGAATTCCTAGCACTGAGTGAGAGCGCCACACTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTGAACCGCAAACTATACCACATTGCTGTGCACGGTCCCGCCAAGAACACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTTGCAGAAACAGAGTACGTGTTTGATGTAGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGTCTTGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCTCCCTATCACGAGCTAGCACTGGAGGGACTGAAGACCCGACCTGCGGTCCCGTATAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCGGGGTCGGGCAAGTCAGCTATTATCAAGTCAACTGTTACAGCACGAGATCTCGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAACTGTCGCGAGATTGAGGCCGATGTGCTACGACTAAGGGGTATGCAGATTACGTCGAAGACAGTAGATTCGGTTATGCTCAACGGATGTCACAAAGCCGTAGAAGTGCTGTACGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCGCTGCTTGCCTTGATTGCTATCGTCAGGCCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGCGGAGACCCCATGCAATGCGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAAGTACACTTCAATCACCCTGAAAAAGACATATGCACCAAGACATTCTACAAGTACATTTCCCGGCGTTGCACACAGCCAGTTACAGCTATTGTATCGACACTGCATTACGGTGGAAAGATGAAAACCACGAACCCGTGCAAGAAGAACATTGAAATCGATATTACAGGGGCCACAAAGCCAAAGCCTGGGGATATCATCCTGACGTGTTTCCGCGGGTGGGTTAAGCAATTGCAAATCGACTATCCCGGACATGAAGTAATGACAGCCGCGGCCTCACAAGGGCTAACTAGAAAAGGAGTGTATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCACTGTACGCGATCACATCAGAGCATGTGAATGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGGCTGGTGTGGAAAACCTTGCAGGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAACGTACCTAAAGGTAACTTTCAGGCTACTATAGAGGACTGGGAAGCTGAACACAGGGGGATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCGCTCCCCGTACCAATCCGTTCAGCTGCAAGACCAACGTTTGCTGGGCAAAGGCATTGGAGCCGATACTAGCCACAGCCGGTATCGTACTTACCGGTTGTCAGTGGAGCGAACTGTTCCCGCAGTTTGCGGATGATAAACCGCATTCGGCCATTTACGCCCTGGACGTAATTTGTATTAAGTTTTTCGGCATGGATTTGACAAGCGGATTGTTCTCTAAACAGAGCATCCCACTAACGTACCATCCCGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCATTGCCGCTGAGCTCTCCCGTAGGTTCCCGGTTTTCCAGCTAGCTGGGAAGGGCACACAGCTTGATTTGCAGACGGGGAGAACCAGAGTTGTCTCTGCACAGCATAACCTGGTCCCGGTGAATCGCAATCTTCCTCACGCCTTAGTCCCCGAGTACAAGGAGAAGCAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCAGTACTTGTGGTATCAGAGGAAAGAATTGAAGCTCCCCACAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATTGACATAGCCGGTGCAGATAAGAACTATAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTCATCAACATTGGAACTAAATACAGAAATCACCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCACGCGGCGACCTTAAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAATTGCCTTAATCCAGGAGGCACCCTCGTGGTGAAATCCTATGGTTACGCCGACCGCAACAGTGAGGACGTGGTCACTGCTCTTGCCAGAAAGTTTGTCAGGGTGTCTGCAGCGAGACCAGATTGCGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACTTGATTTTCCGACAATTAGACAACAGCCGTACACGGCAATTCACCCCGCACCACCTGAATTGCGTGATCTCGTCCGTGTATGAGGGTACAAGAGATGGAGTTGGAGCCGCGCCGTCATACCGCACAAAAAGGGAGAATATCGCTGACTGTCAAGAGGAAGCGGTTGTCAACGCAGCCAATCCGCTAGGTAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAGCGTTGGCCGAACAGCTTTACCGATTCAGCCACAGAGACAGGCACTGCAAGATTGACTGTGTGCCAAGGAAAGAAAGTGATCCACGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAGCACCCAGAAGCAGAAGCTTTGAAATTGCTACAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTAGTAAATGAACATAACATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTAGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTACTGCCTGGACAAGAAGTGGAAGGAAAGAATCGACGCGGTACTCCAACTTAAGGAGTCTGTAACAGAGTTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGACGAGTTAGTATGGATCCATCCAGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTTAGTACTACAAAAGGCAAGTTGTATTCGTACTTCGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCGGCAAAGGACATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCTAATGACCAGGAAAGTAATGAACAACTGTGCGCCTACATATTGGGTGAGACCATGGAAGCGATCCGTGAAAAATGCCCGGTCGACCATAACCCGTCGTCTAGCCCGCCCAAAACATTGCCATGCCTTTGCATGTATGCCATGACGCCGGAAAGGGTCCACAGACTTAGAAGCAATAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCCCTTCCTAAGTACAAGATTAAGAATGTTCAGAAGGTTCAGTGTACAAAAGTAGTCCTGTTTAACCCGCA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GCGCCTACCTGGCGAAGGTAGACGCCTACGAACATGCGACCACTGTTCCAAATGTGCCACAGATACCGTATAAGGCACTTGTTGAAAGGGCAGGGTATGCCCCGCTCAATTTGGAGATCACTGTCATGTCCTCGGAGGTTTTGCCTTCCACCAACCAAGAGTACATTACCTGCAAATTCACCACTGTGGTCCCCTCCCCAAAAATCAAATGTTGCGGCTCCCTGGAATGTCAACCAGCCGCTCATGCAGACTACACCTGTAAGGTCTTTGGAGGGGTCTATCCCTTTATGTGGGGAGGAGCGCAATGTTTTTGCGACAGTGAGAACAGCCAGATGAGTGAGGCATACGTCGAATTGTCAGCAGATTGTGCTTCTGATCACGCGCAGGCGGTCAAGGTGCACACTGCCGCAATGAAAGTAGGACTGCGTATAGTGTACGGGAACACTACCAGTTTCCTAGATGTGTACGTGAACGGAGTCACACCAGGAACGTCTAAAGACTTGAAAGTCATAGCTGGACCGATTTCAGCATCGTTTACGCCATTCGATCATAAGGTCGTTATCCATCGCGGCCTGGTATACAACTATGACTTCCCGGAATATGGAGCGATGAAACCAGGAGCGTTTGGAGACATTCAAGCTACCTCCTTGACTAGCAATGATCTCATCGCCAGCACAGACATTAGGCTTCTTAAGCCTTCCGCCAAGAACGTGCACGTCCCGTACACGCAGGCTGCGTCAGGATTTGAGATGTGGAAAAATAACTCAGGTCGTCCACTGCAGGAAACCGCACCTTTTGGGTGTAAGATCGCAGTAAATCCGCTCAGAGCGGTGGACTGTTCATACGGGAATATTCCCGTTTCTATTGACATCCCGAACGCTGCCTTTATTAGGACATCAGATGCACCACTGGTCTCAACAGTCAAATGCGAAGTCAGTGAGTGCACTTATTCAGCAGACTTCGGCGGGATGGCCACCCTGCAGTACGTATCCGACCGCGAAGGTCAATGCCCCGTACATTCGCATTCGAGCACAGCAACTCTCCAGGAGTCGACAGTACATGTCCTGGAGAAAGGAGCGGTGACAGTACATTTTAGCACCGCGAGTCCACAGGCAAACTTTATTGTATCGCTGTGCGGGAAGAAGACAACATGCAACGCAGAATGTAAACCACCAGCTGATCACATCGTGAGCACTCCGCACAAAAATGACCAAGAATTTCAAGCAGCCATCTCAAAAACATCGTGGAGTTGGCTGTTTGCCCTTTTCGGCGGCGCCTCGTCGCTATTAATTATAGGACTTATGATTTTTGCTTGCAGCATGATGCTGACTAGCACACGAAGATGACCGCTACGCCCCAATGACCCGACCAGCAAAACTCGATGTACTTCCGAGGAACTGATGTGCATAATGCATCAGGCTGGTACATTAGATCCCCGCTTACCGCGGGCAATATAGCAACACTAAAACTCGACGTACTTCCGAGGAAGCGCAGTGCATAATGCTGCGCAGTGTTGCCACAT
| 30,841
|
MT270144.1
|
Sindbis virus
|
Korhonen,E.M., Suvanto,M.T., Uusitalo,R., Faolotto,G., Smura,T., Sane,J., Vapalahti,O., Huhtamo,E.
|
University of Helsinki, Department of Virology, Haartman Institute
|
Finland
|
2020-09-22
|
FIN_2018_H_25
|
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,711
|
GenBank
| 1
|
Finland
|
Finland
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null | null |
Sindbis virus isolate FIN_2018_H_25, complete genome
|
CGGCGTAGTACACACTATTGAATCAAACAGCCGACCAATTGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTTAACGTAGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGCCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCACTGCGTTTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCATGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATCAAGGACCTCCGGACCGTACTCGATACACCGGATGCTGAAACGCCATCACTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCAACACGCGTGCCGAGTATTCCGTCATGCAGGACGTGTACATCAACGCTCCCGGAACTATCTACCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACTCTGTACTGGATTGGCTTTGACACCACCCAGTTCATGTTTTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCCGCGTACAACACCAATTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTCTGCAGCACAAAGCTGAGTGAAGGCAGGACGGGAAAGTTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCACGGGTTTATTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCATTTGAAAGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGCTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACTATCAGTCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACAAACAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACCGACACAGTAAAAGGAGAGCGGGTATCGTTCCCTGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGCATAATGGCCACGGATATCTCACCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAAGACTAACAGGAACACCAATACCATGCAAAATTACCTTCTGCCAATCATTGCACAAGGGTTCAGTAAATGGGCCAAGGAGCGCAAAGAAGATCTTGACAACGAGAAAATGCTGGGCACCAGAGAGCGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGAAAGTGCACTCGTTCTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCAGCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTCCCCATGTCATCCGTATGGACGACCTCATTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAGATGAAATTGGCATTACAACCAAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCGCGGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTTCGAGGATGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTCCCACCATTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCGGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGGCTCCAGGCGGACATTGGAGCAGCACTCGTCGAAACCCCGCGCGGCCATGTAAGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTCGTTTCACCAACCTCTGTGCTGAAGAACGCCAAACTCGCACCAGCACACCCGCTAGCAGACCAGGTTAAGATCATAACGCACTCCGGAAGAGCAGGAAGGTATGCAGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAAGTGCCGTACCATGGCCAGAATTCTTAGCACTGAGTGAGAGTGCCACGCTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAATCGCAAGCTATACCATATTGCCATGCACGGCCCCGCTAAGAATACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTCGCAGAAACAGAGTACGTGTTCGACGTGGACAAGAAGCGATGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGACTCGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCGCCCTATCACGAGCTAGCTCTTGAGGGACTGAAGACTCGACCCGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCAGGATCGGGCAAGTCAGCTATCATCAAGTCAACTGTCACGGCACGTGACCTTGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCGCGAAATTGAGGCCGACGTGCTAAGGCTGAGGGGCATGCAGATCACGTCGAAGACAGTGGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCACAAAGCCGTAGAAGTGCTGTATGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCGCTGCTTGCCTTGATTGCAATCGTCAGACCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGTGGGGACCCTAAGCAATGCGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAGGTACATTTCAACCATCCTGAAAAAGATATATGTACCAAGACATTCTACAAGTTCATCTCCCGACGTTGCACACAGCCAGTCACGGCAATTGTATCGACACTGCATTACGATGGAAAGATGAAAACCACGAACCCGTGCAAGAAGAATATCGAAATTGACATTACAGGGGCCACGAAGCCGAAGCCAGGGGATATCATCCTGACATGTTTTCGCGGGTGGGTTAAGCAACTGCAAATCGACTATCCCGGACATGAGGTAATGACAGCCGCGGCCTCCCAAGGGCTAACTAGAAAAGGAGTATATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCGCTGTACGCGATCACATCAGAGCACGTAAACGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGACTAGTATGGAAAACCTTGCAAGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAATGTACCTAAAGGAAATTTCCAAGCCACCATCGAGGACTGGGAAGCTGAACACAAGGGAATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCGCTCCCCGTACCAATCCGTTCAGCTGCAAGACTAACGTTTGCTGGGCGAAAGCACTGGAGCCGATACTGGCCACGGCCGGCATCGTACTTACCGGTTGCCAGTGGAGCGAGCTGTTCCCGCAGTTTGCAGATGACAAACCGCACTCGGCCATTTACGCCTTAGACGTAATCTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGATTTGACAAGCGGACTGTTTTCCAAACAGAGCATCCCGCTAACGTATCATCCTGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCGTTGCCGCAGAACTCTCCCGCAGATTTCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAAGGCACACAGCTTGACTTGCAGACGGGCAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACTTGGTCCCAGTGAACCGCAATCTCCCTCACGCCTTAGTCCCTGAGCACAAGGAGAAACAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCCGTACTTGTGGTCTCAGAAGAAAAAATTGAAGCTCCCCACAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATTGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTATAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTCATCAATATTGGAACTAAATACAGAAACCATCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTGAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAACTGCCTTAACCCCGGAGGCACCCTTGTGGTGAAGTCCTACGGTTACGCCGACCGCAACAGTGAGGACGTAGTCACCGCTCTTGCCAGAAAATTTGTCAGAGTGTCTGCAGCGAGGCCAGAGTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAACTAGACAACAGCCGCACACGACAATTCACCCCGCATCATCTGAATTGCGTGATTTCGTCAGTGTACGAGGGTACAAGAGACGGAGTTGGAGCCGCACCGTCATACCGCACTAAAAGGGAGAACATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCAGTTGTCAACGCAGCCAATCCGCTGGGCAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGAACAGTTTTACCGATTCAGCCACAGAGACAGGCACCGCAAAACTGACTGTGTGCCATGGAAAGAAAGTGATACACGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAACATCCAGAGGCAGAAGCCCTGAAATTGCTGCAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTGGTAAATGAACACAATATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTGGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTACTGCCTGGATAAGAAGTGGAAGGAACGAATCGACGCGGTGCTCCAACTCAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGACGAGTTAGTATGGATCCATCCGGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTCAGTACTACTAAAGGAAAGTTGTATTCGTACTTCGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCAGCAAAGGATATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCAAATGACCAGGAAAGCAACGAACAACTGTGTGCCTACATATTGGGAGAGACCATGGAAGCAATCCGCGAAAAATGCCCGGTTGACCACAACCCGTCGTCTAGCCCGCCAAAAACGCTGCCGTGTCTTTGCATGTATGCCATGACGCCGGAAAGGGTCCACAGACTCAGAAGCAACAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCTCTTCCAAAGTATAAAATCAAGAATGTTCA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| 46,969
|
MT270145.1
|
Sindbis virus
|
Korhonen,E.M., Suvanto,M.T., Uusitalo,R., Faolotto,G., Smura,T., Sane,J., Vapalahti,O., Huhtamo,E.
|
University of Helsinki, Department of Virology, Haartman Institute
|
Finland
|
2020-09-22
|
FIN_2018_H_05
|
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,709
|
GenBank
| 1
|
Finland
|
Finland
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null | null |
Sindbis virus isolate FIN_2018_H_05, complete genome
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CGGCGTAGTACACACTATTGAATCAAACAGCCGACCAATTGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTTAACGTAGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGCCACCCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCACTGCGTTTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCATGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATCAAGGACCTCCGGACCGTACTCGATACACCGGATGCTGAAACGCCATCACTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCACCACGCGTGCCGAGTATTCCGTCATGCAGGACGTGTACATCAACGCTCCCGGAACTATCTACCACCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACTCTGTACTGGATTGGCTTTGACACCACCCAGTTCATGTTTTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCCGCGTACAACACCAATTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTCTGCAGCACAAAGCTGAGTGAAGGCAGGACAGGAAAGTTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCACGGGTTTATTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCATTTGAAAGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGCTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACTATCAGTCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACAAACAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACCGACACAGTAAAAGGAGAGCGGGTATCGTTCCCTGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGCATAATGGCCACGGATATCTCACCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTTATTAACGGTAAGACTAACAGGAACACCAATACCATGCAAAATTACCTTCTGCCAATCATTGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCCAAGGAGCGCAAAGAAGATCTTGACAACGAGAAAATGCTGGGCACCAGAGAGCGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGAAAGTGCACTCGTTCTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCAGCGTAAAAGTCCCGGCCTCTTTTAGCGCTTTCCCCATGTCATCCGTATGGACGACCTCATTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAGATGAAATTGGCATTACAACCAAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCCCGGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCCGCTTTCGAGGATGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTCCCACCATTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCGGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGGCTCCAGGCGGACATTGGAGCAGCACTCGTCGAAACCCCGCGCGGTCATGTAAGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTCGTTTCACCAACCTCTGTGCTGAAGAACGCCAAACTCGCACCAGCACACCCGCTAGCAGACCAGGTTAAGATCATAACGCACTCCGGAAGAGCAGGAAGGTATGCAGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAAGTGCCGTACCATGGCCAGAATTCTTAGCACTGAGTGAGAGTGCCACGCTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAATCGCAAGCTGTACCATATTGCCATGCACGGCCCCGCTAAGAATACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTCGCAGAAACAGAGTACGTGTTCGACGTGGACAAGAAGCGATGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGACTCGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCGCCCTATCACGAGCTAGCTCTTGAGGGACTGAAGACTCGACCCGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCAGGATCGGGCAAGTCAGCTATCATCAAGTCAACTGTCACGGCACGTGACCTTGTCACCAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCGCGAAATTGAGGCCGACGTGCTAAGGCTGAGGGGCATGCAGATCACGTCGAAGACAGTGGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCACAAAGCCGTAGAAGTGCTGTATGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCGCTGCTTGCCTTGATTGCAATCGTCAGACCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGTGGGGACCCTAAGCAATGCGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAGGTACATTTCAACCATCCTGAAAAAGATATATGTACCAAGACATTCTACAAGTTCATCTCCCGACGTTGCACACAGCCAGTCACGGCAATTGTATCGACACTGCATTACGATGGAAAGATGAAAACCACGAACCCATGCAAGAAGAATATCGAAATTGACATTACAGGGGCCACGAAGCCGAAGCCAGGGGATATCATCCTGACATGTTTTCGCGGGTGGGTTAAGCAACTGCAAATCGACTATCCCGGACATGAGGTAATGACAGCCGCGGCCTCCCAAGGGCTAACTAGAAAAGGAGTATATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCGCTGTACGCGATCACATCAGAGCACGTAAACGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGACTAGTATGGAAAACCTTGCAAGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAATGTACCTAAAGGAAATTTCCAAGCCACCATCGAGGACTGGGAAGCTGAACACAAGGGAATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCGCTCCCCGTACCAATCCGTTCAGCTGCAAGACTAACGTTTGCTGGGCGAAAGCACTGGAACCGATACTGGCCACGGCCGGCATCGTACTTACCGGTTGCCAGTGGAGCGAGCTGTTCCCGCAGTTTGCGGATGACAAACCGCACTCGGCCATTTACGCCTTAGACGTAATCTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGATTTGACAAGCGGACTGTTTTCCAAACAGAGCATCCCGCTAACGTATCATCCTGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCGTTGCTGCAGAACTCTCCCGCAGATTTCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAAGGCACACAGCTAGACTTGCAGACGGGCAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACTTGGTCCCAGTGAACCGCAATCTCCCTCACGCCTTAGTCCCTGAGCACAAGGAGAAACAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCCGTACTTGTGGTCTCAGAAGAAAAAATTGAAGCTCCCCACAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATTGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTATAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTCATCAATATTGGAACTAAATACAGAAACCATCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTGAAAACTCTTTCGCGTTCGGCCCTGAACTGCCTTAACCCCGGAGGCACCCTCGTGGTGAAGTCCTACGGTTACGCCGACCGCAACAGTGAGGACGTAGTCACCGCTCTTGCCAGAAAATTTGTCAGAGTGTCTGCAGCGAGGCCAGAGTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAACTAGACAACAGCCGCACACGACAATTCACCCCGCATCATCTGAATTGCGTGATTTCGTCAGTGTACGAGGGTACAAGAGACGGAGTTGGAGCCGCACCGTCATACCGCACTAAAAGGGAGAACATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCAGTTGTCAATGCAGCCAATCCGCTGGGCAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGAACAGTTTTACCGATTCAGCCACAGAGACAGGCACCGCAAAACTGACTGTGTGCCATGGAAAGAAAGTGATACACGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAACATCCAGAGGCAGAAGCCCTGAAATTGCTGCAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTGGTAAATGAACACAATATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTGGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTACTGCCTGGATAAGAAGTGGAAGGAACGAATCGACGCGGTGCTCCAACTCAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGACGAGTTAGTATGGATCCATCCGGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTCAGTACTACTAAAGGAAAGTTGTATTCGTACTTCGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCAGCAAAGGATATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCAAATGACCAGGAAAGCAACGAACAACTGTGTGCCTACATATTGGGAGAGACCATGGAAGCAATCCGCGAAAAATGCCCGGTTGACCACAACCCGTCGTCTAGCCCGCCAAAAACGCTGCCGTGTCTTTGCATGTATGCCATGACGCCGGAAAGGGTCCACAGACTCAGAAGCAACAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCTCTTCCAAAGTATAAAATCAAGAATGTTCA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| 46,970
|
MF543016.1
|
Sindbis virus
|
Keller,M., Hoeper,D., Wylezich,C., Ziegler,U.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2019-02-28
|
Giessen_2016-A
|
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,710
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Columba palumbus
| null |
2016
| null | null |
Sindbis virus isolate Giessen_2016-A, complete genome
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CGTAGTACACACTATTGAATCAAACAGCCGACCAATTGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTTAACGTAGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGCCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCACTGCGTTTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCATGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATCAAGGACCTCCGAACCGTACTTGATACACCGGATGCTGAAACGCCATCACTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCAACACGCGTGCCGAGTATTCCGTCATGCAGGACGTGTACATCAACGCTCCCGGAACTATCTACCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACTCTGTACTGGATTGGCTTTGACACCACCCAGTTCATGTTTTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCGTACAACACCAATTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTCTGCAGCACAAAGCTGAGTGAAGGCAGGACAGGAAAGTTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCACGGGTTTATTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCATTTGCAAGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGCTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAGATCACTATCAGTCCCGGGATAACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACAAACAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACCGACACAGTAAAAGGAGAGCGGGTATCGTTCCCTGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGCATAATGGCCACGGATATCTCACCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAAGACTAACAGGAACACCAATACCATGCAAAATTACCTTCTGCCAATCATTGCACAAGGGTTCAGTAAATGGGCCAAGGAGCGCAAAGAAGATCTTGACAACGAGAAAATGCTGGGCACCAGAGAGCGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGAAAGTGCACTCGTTCTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCAGCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTCCCCATGTCATCCGTATGGACGACCTCATTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAGATGAAATTGGCATTACAACCAAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCCCGGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTTCGAGGATGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTCCCACCATTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCGGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGGCTCCAGGCGGACATTGGAGCAGCACTCGTCGAAACCCCGCGCGGTCATGTAAGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTCGTTTCACCAACCTCTGTGCTGAAGAACGCCAAACTCGCGCCAGCACACCCGCTAGCAGACCAGGTTAAGATCATAACGCACTCCGGAAGAGCAGGAAGGTATGCAGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAAGTGCCGTACCATGGCCAGAATTCTTAGCACTGAGTGAGAGTGCCACGCTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAATCGCAAGCTATACCATATTGCCATGCACGGCCCCGCTAAGAATACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTCGCAGAAACAGAGTACGTGTTCGACGTGGACAAGAAGCGATGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGACTCGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCGCCCTATCACGAGCTAGCTCTTGAGGGACTGAAGACTCGACCCGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCAGGATCGGGCAAGTCAGCTATCATCAAGTCAACTGTCACGGCACGTGACCTTGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCGCGAAATTGAGGCCGACGTGCTAAGGCTGAGGGGCATGCAGATCACGTCGAAGACAGTGGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCACAAAGCCGTAGAAGTGCTGTATGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCGCTGCTTGCTTTGATTGCAATCGTCAGACCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGTGGGGACCCTAAGCAATGCGGATTCTTCAACATGATGCAACTAAAGGTACATTTCAACCATCCTGAAAAAGATATATGTACCAAGACATTCTACAAGTTCATCTCCCGACGTTGCACACAGCCAGTCACGGCAATTGTATCGACACTGCATTACGATGGAAAGATGAAAACCACGAACCCGTGCAAGAAGAATATAGAAATTGACATTACAGGGGCCACGAAGCCGAAGCCAGGGGATATCATCCTGACATGTTTTCGCGGGTGGGTTAAGCAACTGCAAATCGACTATCCCGGACATGAGGTAATGACAGCCGCGGCCTCCCAAGGGCTAACTAGAAAAGGAGTATATGCTGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCGCTGTACGCGATCACATCAGAGCACGTAAACGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGACTAGTATGGAAAACCTTGCAAGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTTACTAATGTACCTAAAGGAAATTTCCAAGCCACCATCGAGGACTGGGAAGCTGAACACAAGGGAATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCGCTCCCCGTACCAATCCGTTCAGCTGCAAGACTAACGTTTGCTGGGCGAAAGCACTGGAGCCGATACTGGCCACGGCCGGCATCGTACTTACCGGCTGCCAGTGGAGCGAGCTGTTCCCGCAGTTTGCGGATGACAAACCGCACTCGGCCATTTACGCCTTAGACGTAATCTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGATTTGACAAGCGGACTGTTTTCCAAACAGAGCATCCCGCTAACGTATCATCCTGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCGTTGCTGCAGAACTCTCCCGCAGATTTCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAAGGCACACAGCTTGACTTGCAGACGGGCAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACTTGGTCCCAGTGAACCGCAATCTCCCTCACGCCTTAGTCCCTGAGCACAAGGAGAAACAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCCGTACTTGTGGTCTCAGAAGAAAAAATTGAAGCTCCCCACAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATTGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTATAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTCATCAATATTGGAACTAAATACAGAAACCATCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTGAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAACTGCCTTAACCCCGGAGGCACCCTTGTGGTGAAGTCCTACGGTTACGCCGACCGCAACAGTGAGGACGTAGTCACCGCTCTTGCCAGAAAATTTGTCAGAGTGTCTGCAGCGAGGCCAGAGTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAACTAGACAACAGCCGCACACGACAATTCACCCCGCATCATCTGAATTGCGTGATTTCGTCAGTGTACGAGGGTACAAGAGACGGAGTCGGAGCCGCACCGTCATACCGCACTAAAAGGGAGAACATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCAGTTGTCAATGCAGCCAATCCGCTGGGCAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGAACAGTTTTACCGATTCAGCCACAGAGACAGGCACCGCAAAACTGACTGTGTGCCATGGAAAGAAAGTGATACACGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAGACATCCAGAGGCAGAAGCCCTGAAATTGCTGCAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTGGTAAATGAACACAATATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTGGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTACTGCCTGGATAAGAAGTGGAAGGAACGAATCGACGCGGTGCTCCAACTCAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGACGAGTTAGTATGGATCCATCCGGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTCAGTACTACTAAAGGAAAGTTGTATTCGTACTTCGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCAGCAAAGGATATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCAAATGACCAGGAAAGCAACGAACAACTGTGTGCCTACATATTGGGAGAGACCATGGAAGCAATCCGCGAAAAATGCCCGGTTGACCACAACCCGTCGTCTAGCCCGCCAAAAACGTTGCCGTGTCTTTGCATGTATGCCATGACGCCGGAAAGGGTCCACAGACTCAGAAGCAACAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCTCTTCCAAAGTATAAAATCAAGAATGTTCAGAA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TAATGCGCTGTTGCTCCTGCTGCCTGCCTTTTTTAGTGGTTGCCGGCGCCTACCTGGCGAAGGTAGACGCCTACGAACATGCGACCACTGTTCCAAATGTGCCACAGATACCGTATAAGGCACTTGTTGAAAGGGCAGGGTACGCCCCGCTCAATCTGGAGATTACTGTCATGTCCTCGGAGGTTTTACCTTCCACCAACCAAGAGTACATCACTTGTAAATTCACTACCGTGGTCCCCTCCCCTAAAGTCAAATGCTGCGGCTCCTTGGAATGTCAGCCCGCCGCTCACGCAGACTATACCTGCAAGGTCTTTGGAGGGGTGTACCCCTTCATGTGGGGAGGAGCACAATGTTTTTGCGACAGTGAGAACAGCCAGATGAGTGAGGCGTACGTCGAATTGTCAGCAGATTGCGCGACTGACCACGCGCAGGCGATTAAGGTACATACTGCCGCGATGAAAGTAGGACTGCGTATAGTGTACGGGAACACTACCAGTTTCCTAGATGTGTACGTGAACGGAGTTACACCAGGAACGTCTAAAGACCTGAAAGTCATAGCTGGACCGATTTCAGCATCGTTTACACCATTCGATCACAAGGTCGTTATCCATCGCGGCCTGGTGTACAACTATGACTTCCCGGAATACGGAGCGATGAAACCAGGAGCGTTTGGAGACATTCAAGCTACCTCCTTGACCAGCAAAGACCTCATCGCCAGCACAGACATTAGGCTACTTAAGCCTTCCGCCAAGAACGTGCATGTCCCGTACACGCAGGCCGCATCAGGATTCGAGATGTGGAAAAACAACTCAGGCCGCCCACTGCAGGAAACCGCCCCTTTCGGGTGTAAGATCGCAGTCAATCCGCTTCGAGCGGTGGACTGCTCATACGGGAACATTCCCATTTCTATTGACATCCCGAACGCTGCCTTTATCAGGACATCAGATGCACCACTGGTCTCAACAGTCAAATGTGATGTCAGTGAGTGCACTTATTCAGCAGACTTCGGCGGGATGGCCACCCTGCAGTATGTATCCGACCGCGAAGGACAATGCCCTGTACATTCGCATTCAAGCACAGCAACCCTCCAAGAGTCGACAGTTCATGTCCTGGAGAAAGGAGCGGTGACAGTACACTTCAGCACCGCGAGTCCACAGGCGAACTTCATTGTATCGCTGTGCGGTAAGAAGACAACATGCAATGCAGAATGTAAACCACCAGCTGACCATATCGTGAGCACCCCGCACAAAAATGACCAAGAATTCCAAGCCGCCATCTCAAAAACATCATGGAGTTGGCTGTTTGCCCTTTTCGGCGGCGCCTCGTCGCTATTAATTATAGGACTTACGATTTTTGCTTGCAGCATGATGCTGACTAGCACACGAAGATGACCGCTACGCCCCAATGACCCGACCAGCAAAACTCGATGTATTTCCGAGGAACTGATGTGCATAATGCATCAGGCTGGTATATTAGAACCCCGCTTACTGCGGGCAATATAGCAACACCAAAACTCGACGTACTTCCGAGGAAGCGCAGTGCATAATGCTGCGCAGTGTTGCCACATTATCACTATATTAACCATTTATTTAGCGGACGCCGAAACTCAATGTATTTCTGAGGAAGCATGGTGCATAATGCCATGCAGCGTCTGCATAACTTTTTATTATTTCTTTTATTAATCAACAAAATTTTGTTTTTAACNATTTC
| 64,972
|
MG495620.1
|
Sindbis virus
|
Jaworski,L., Luehken,R., Schmidt-Chanasit,J., Cadar,D.
|
Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine, Virology
|
Germany
|
2018-12-12
| null |
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,640
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Culex pipiens pipiens
| null |
2016
| null | null |
Sindbis virus strain BNI-CuliMo543, complete genome
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TATTGAATCAAACAGCCGACCAATTGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTTAACGTAGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGCCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCACTGCGTTTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGCAAACTGGCGGAAAAAGCATGCAAGATTACTAACAAGAACTTGCATGAGAAGATCAAGGACCTCCGGACCGTACTCGATACACCGGATGCTGAAACGCCATCACTCTGCTTCCACAACGATGTTACCTGCAACACGCGTGCCGAGTATTCCGTCATGCAGGACGTGTACATCAACGCTCCCGGAACTATCTACCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACTCTGTACTGGATTGGCTTTGACACCACCCAGTTCATGTTTTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCCGCGTACAACACCAATTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTCTGCAGCACAAAGCTGAGTGAAGGCAGGACAGGAAAGTTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCACGGGTTTATTTCTCCGTTGGATCGACACTTTACCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAAAGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGCTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACTATCAGTCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACAAACAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACCGACACAGTAAAAGGAGAGCGGGTATCGTTCCCTGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACCGGCATAATGGCCACGGATATCTCACCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAAGACTAACAGGAACACCAATACCATGCAAAATTACCTTCTGCCAATCATTGCACAAGGGTTCAGTAAATGGGCCAAGGAGCGCAAAGAAGATCTTGACAACGAGAAAATGCTGGGCACCAGAGAGCGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGAAAGTGCACTCGTTCTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCAGCGTAAAAGTCCCGGCCTCTTTTAGCGCTTTCCCCATGTCATCCGTATGGACGACCTCATTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAGATGAAATTGGCACTACAACCAAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCCCGGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTTCGAGGATGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTCCCACCATTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCGGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGGCTCCAGGCGGACATTGGAGCAGCACTCGTCGAAACCCCGCGCGGTCATGTAAGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTCGTTTCACCAACCTCTGTGCTGAAGAACGCCAAACTCGCACCAGCACACCCGCTAGCAGACCAGGTTAAGATCATAACGCACTCCGGAAGAGCAGGAAGGTATGCAGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAAGTGCCGTACCATGGCCAGAATTCTTAGCACTGAGTGAGAGTGCCACGCTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAATCGCAAGCTATACCATATTGCCATGCACGGCCCCGCTAAGAATACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTCGCAGAAACAGAGTACGTGTTCGACGTGGATAAGAAGCGATGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGACTCGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCGCCCTATCACGAGCTAGCTCTTGAGGGACTGAAGACTCGACCCGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCAGGATCGGGCAAGTCAGCTATCATCAAGTCAACTGTCACGGCACGTGACCTTGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCGCGAAATTGAGGCCGACGTGCTAAGGCTGAGGGGCATGCAGATCACGTCGAAGACAGTGGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCACAAAGCCGTAGAAGTGCTGTATGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGTGCGCTGCTTGCCTTGATTGCTATCGTCAGACCTCGCAAGAAGGTAGTACTATGTGGGGACCCTAAGCAATGCGGATTTTTTAACATGATGCAACTAAAGGTACATTTCAACCATCCTGAAAAAGATATATGCACCAAGACATTCTACAAGTTCATCTCCCGACGTTGCACACAGCCAGTCACGGCAATTGTATCGACACTGCATTACGATGGAAAGATGAAAACCACGAACCCGTGCAAGAAGAACATCGAAATTGACATTACAGGGGCCACGAAGCCGAAGCCAGGCGATATCATCCTGACATGTTTTCGCGGGTGGGTTAAGCAACTGCAAATCGACTATCCCGGACATGAGGTAATGACAGCCGCGGCCTCCCAAGGGCTAACTAGAAAAGGAGTATATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCGCTGTACGCGATCACATCAGAGCACGTAAACGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGACTAGTATGGAAAACCTTGCAAGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAATGTACCTAAAGGAAATTTCCAAGCCACCATCGAGGACTGGGAAGCTGAACACAAGGGAATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCGCTCCCCGTACCAATCCGTTCAGCTGCAAGACTAACGTTTGCTGGGCGAAAGCACTGGAGCCGATACTGGCCACGGCCGGCATCGTACTTACCGGTTGCCAGTGGAGCGAGCTGTTCCCGCAGTTTGCGGATGACAAACCGCACTCGGCCATTTACGCCTTAGACGTAATCTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGATTTGACAAGCGGACTGTTTTCCAAACAGAGCATCCCGCTAACGTATCATCCTGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCGTTGCTGCAGAACTCTCCCGCAGATTTCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAAGGCACACAGCTTGACTTGCAGACGGGCAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACTTGGTCCCAGTGAACCGCAATCTCCCTCACGCCTTAGTCCCTGAGCACAAGGAGAAACAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCCGTACTTGTGGTCTCAGAAGAAAAAATTGAAGCTCCCCACAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATTGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTATAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTCATCAATATTGGAACTAAATACAGAAACCATCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTGAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAACTGCCTTAACCCCGGAGGCACCCTTGTGGTGAAGTCCTACGGTTACGCCGACCGCAACAGTGAGGACGTAGTCACCGCTCTTGCCAGAAAATTTGTCAGAGTGTCTGCAGCGAGGCCAGAGTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAACTAGACAACAGCCGCACACGACAATTCACCCCGCATCATCTGAATTGCGTGATTTCGTCAGTGTACGAGGGTACAAGAGACGGAGTTGGAGCCGCACCGTCATACCGCACTAAAAGGGAGAACATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCAGTTGTCAATGCAGCCAATCCGCTGGGCAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGAACAGTTTTACCGATTCAGCCACAGAGACAGGCACCGCAAAACTGACTGTGTGCCATGGAAAGAAAGTGATACACGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAACATCCAGAGGCAGAAGCCCTGAAATTGCTGCAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTGGTAAATGAACACAATATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTGGACAGAACTGATGCGGACGTAACCATCTACTGCCTGGATAAGAAGTGGAAGGAACGAATCGACGCGGTGCTCCAACTCAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGACGAGTTAGTATGGATCCATCCGGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTCAGTACTACTAAAGGAAAGTTGTATTCGTACTTCGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCAGCAAAGGATATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCAAATGACCAGGAAAGCAACGAACAACTGTGTGCCTACATATTGGGAGAGACCATGGAAGCAATCCGCGAAAAATGCCCGGTTGACCACAACCCGTCGTCTAGCCCGCCAAAAACGCTGCCGTGTCTTTGCATGTATGCCATGACGCCGGAAAGGGTCCACAGACTCAGAAGCAACAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCTCTTCCAAAGTATAAAATCAAGAATGTTCAGAAGGTTCAGTGCAC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| 66,172
|
MH229928.1
|
Sindbis virus
|
Wang,M.
|
Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Animal Virus Structure and Informatics Research Team
|
China
|
2018-10-23
| null |
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,667
|
GenBank
| null |
China: Yunnan Province
|
China
|
Chironomus thummi
| null |
2013
| null | null |
Sindbis virus strain YN_222, complete genome
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CTACGTCAACGTTAACTACAGGTTTCTCCATGGTGATGGTAGTGCAATTGGTCGGCTTGATTCTTTATAGTGTGTACTACGCCGCCAATTGCACTACCATCACCATGGAGAAACCTGTAGTTAACGTTGACGTAGACCCTCAGAGTCCGTTCATTACGCAACTGCAAAAGAGTTTCCCGCAGTTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGCCACACCAAATGACCATGCTAACGCCAGAGCTTTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTGATCGAGCTGGAGGTCCCGACCACAGCGACGATCTTGGACATTGGCAGCGCACCTGCTCGTAGAATGTATTCCGAGCACCACTATCATTGCGTTTGCCCCATGCGTAGCCCCGAAGACCCGGACCGCATGATGAAGTACGCCAGTAAACTGGTGGAGAAATCGTGCAAGATTACGGACAAAAACTTGCACGAAAAGATCAAGGACCTCCGGACAGTGCTAAGCACGCCGGATGCGGAGACACCGTCGCTGTGTTTCCACAACGACGTCACCTGCAGTATGCGGGCTGAATATTCTGTCATGCAGGACGTCTACATTAACGCTCCTTCTACGATTTACCATCAAGCAATGAAAGGAGTCAGAACACTGTACTGGATCGGGTTCGATACCACGCAGTTCATGTTCTCGGCCATGGCAGGGTCATACCCTGCTTATAACACCAACTGGGCCGATGAGAAAGTCTTGGAAGCCCGCAACATAGGACTGTGTAGTACAAGGCTTAGCGAAAGCAGGACAGGGAAGTTGTCGATAATGCGGAAGAAGGCGCTGCGACCAGGAGCTCGCGTCTACTTCTCCGTTGGCTCGACGTTATACCCTGAGAATAGAGAGAGCCTGCAGAGCTGGCATCTACCATCGGTGTTCCACCTGAAAGGTAAGCAATCGTATACTTGCCGCTGTGACACAGTGGTCAGCTGCGAAGGCTATGTGGTGAAGAAGATCGTCATCAGTCCCGGGATAACGGGCGAGACCGTGGGATACGCGGTCACGAACAACAGTGAGGGTTTCTTACTGTGCAAAGTCACCGACACGGTGAAAGGGGAACGGGTCTCGTTCCCCGTATGCACCTACATACCGGCAACCATCTGTGACCAGATGACAGGTATCATGGCGACGGACATCTCACCTGATGATGCACAGAAGCTACTGGTTGGGCTCAACCAGAGGATTGTCATCAACGGTAAAACGAACAGGAACACCAATACCATGCAGAACTACCTCTTACCAATCATTGCACAGGGCTTCAGCAAATGGGCGAAAGAGAGGAAGGAAGACCTAGACAATGAGAAAATGCTAGGCACCAGAGAAAGGAAACTGACGTTTGGGTGCCTGTGGGCATTCCGCACTAAAAAGGTACACTCGTTCTACCGGCCTCCGGGTACACAGACATGCGTCAAGGTCCCCTCCGTCTTTAGTGCATTTCCGCTGTCCTCCGTCTGGACAACAACGCTGCCGATATCATTCCGGCAACAGATTAAACTTCTCCTCCAACCAAAGAAGGAGGAGGAGTTGGTCCAGATATCTGAACAGCAGGTTGAAGAAGCGAAATCAGCTTACACAGAGGCGAAAGAGGCGGAGCGCGCTGAGAAGCTAAGAGAGGCATTACCACCGCTCGTTGCGGATAAAGAGGTAGATGCAGCTGCGGAAGTGATCTGCGAAGTTGAAGGGCTGCAAGCTGATGTTGGTGCCGCGTTGGTAGAAACACCTCGCGGGCACGTGAGGATAATTCCTCAGCCTGGGGACAGGCTGATTGGGCAGTACCTGGTCGTGTCACCGACCTCTGTGCTGAAGAATTCCAAGCTGGCACCAGTTCACCCACTCGCAGAACAGATCAAGATCATAACCCACTCAGGACGAACAGGTAGGTACGCAGTCGAACCATATGACGCAAAGGTCCTATTACCGGCGGGAGGCGCGGTACCGTGGCCGGAGTTCCTAGCTCTTAGCGAGAGCGCCTCTTTGGTCTACAACGAACGTGAGTTCGTGAACCGCAAACTTTATCACATAGCGGTCCATGGCCCGGCTAAGAACACCGAGGAGGAACAGTACAAGATCACTAAAGCCGCACTGGCTGAGACGGAATTCGTATTTGATGTGGACAAGCGAAGGTGCGTCAAGAAAGAGGAGGCCTCGGGACTGGTCTTGTCAGGGGAACTAACAAACCCACCTTACCACGAAATGGCGTTGGAGAGTTTACAGACACGACCCGCAGTTCCTTACAAAGTGGAAACAATTGGAGTTATTGGCACACCGGGCTCAGGTAAATCGGCCATTATCAAGTCAACAGTTACAGCCAAAGACCTCGTCACCAGTGGAAAGAAGGAGAACTGCAAAGAAATTGAAACCGATGTCTTGAGGATGCGTGGGATGCAAATCACCTCACGAACGGTCGACTCAGTCATGCTCAATGGATGCCATAAGGCGGTCGACGTTTTGTACGTCGACGAGGCCTTTGCTTGTCATGCTGGAGCACTGCTGGCACTTATCGCAATAGTCAGGCCCCGAAAGAAGGTCGTGCTGTGTGGTGATCCGAAGCAATGCGGGTTCTTCAACATGATGCAGCTTAAGGTGCATTTCAACAACCCGGAGAAAGACATATGCACCAAGACATTTTACAAGTACATTTCCCGCAGATGCACGCAACCTGTCACGGCCATTGTTTCCACGTTACATTATGACGGAAGAATGAAGACGACTAACCCTTGCAGAAAGGGCGTGGAAATTGACATCACCGGCTCGACCAAACCAAAACCCGGTGATATCGTGCTGACTTGCTTCCGCGGATGGGTCAAACAGCTGCAGATTGAGTATCCTGGATATGAGGTCATGACAGCAGCCGCGTCACAAGGACTAACGCGAAAAGGCGTGTATGCCGTCCGCCAGAAGGTCAATGAAAACCCTCTGTACGCGATAACTTCCGAACATGTTAATGTACTACTTACGCGTACTGAAGACCGGCTTGTTTGGAAGACTTTACAGGGCGACCCTTGGATCAAACAGCTCACCAACATCCCGAAGGGGAACTTCCAAGCCACTATTGAAGATTGGGAAGCAGAGCACAGAGGCATCATTGCAGCAATTAACAGTCCAGCACCGAGAGCCGACCCGTTCAGTTGCAAGACGAACGTTTGCTGGGCGAAGGCCCTGGAACCTATACTAGCTACGGCAGGTATATCATTGACGGGGTGCCAGTGGAGCGAGTTGTTTCCACAATTCGCAGACGACAAACCCCATTCGGCCGTGTACGCTCTGGACGTCTTATGTATAAAATTCTTCGGAGTTGACTTGACCAGCGGAATATTCTCCAAGCAAAGCGTCCCGCTGACGTACCACCCCGCCGATGCTTCAAGGCAAGTAGCTCACTGGGACAATAGCCCTGGCTCACGCAAGTACGGATATGACCAGGCGGTTGCCGCGGAGCTATCACGCCGCTTCCCGGTGTTCCAGATGGCAGGCAAAGGTACGCAGCTTGACCTGCAGACAGGTAGAACAAGGGTGGTATCGCCGCAGCACAACCTCGTTCCAGTTAACCGCAACCTGCCACACTCGCTTGTCCCTGAATACAAAACACGTAACCCCGGCCCGGTGGAAAAGTTCCTGATGCAGTTTAAGCACCATACCATCTTGGTCGTCTCAGAGACCAAGGTCGACATGCCCCAGAGGAGAGTAGAGTGGATAGCGCCGCTTGGCACTGCCGGAGCTGACAGGACCTGCAACCTCGCATTCGGATTCCCACCCCAATCGAGGTACGATTTGGTTTTTATCAATATTGGCACGAAATTCAGGTACCACCACTTCCAGCAGTGCGAAGATCATGCAGCTACATTGAAAACCTTGTCTCGCTCTGCATTGAATTGTCTCAATCCAGGAGGTACATTGGTGGTCAAAGCTTATGGTTACGCAGATAGAAACAGTGAGGACGTAGTCACCGCCTTGTCGCGGAAATTCGTTCGCGTTTCGGCAGCTCGCCCAGACTGCGTCTCCAGCAACACCGAAATGTTCCTAATTTTCAGGCAACTGGATAACAGCAGGACTAGACAATTCACCCCGCACCACCTAAATTGTGTCGTTTCGTCTGTGTACGAAGGTCTTCGCGATGGTGTGGGAGCTGCTCCGGCCTATCGCTCGAAACGTGAGAACATCGCCGAGTGCCTTGAAGAGGCCGTAGTTAATGCTGCGAACGCGCTCGGACGGCCGGGCGAAGGGGTATGCAAAGCCATATACAAAAAATGGCCTAACAGTTTCGTCGATTCCGCGACAGAGACGGGAACGGCTAAGCTGGTGTGCTGTCAAGGAAAGAAAATTATCCACGCCGTCGGACCCGACTTCCGCAAACACTCCGAGGCAGAAGCGCTGAAGATTCTCCAGAACACATACCACGCCATAGCAGATTTGGTTAACAAACATGGAATCAAGACTGTAGCGATCCCGCTACTATCCACCGGGATCTACGCAGCGGGAAAAGACAGACTCGAGGTCTCCTTAAACTGTCTTACCACCGCCCTGGACAGAACAGATGCAGACGTCACAATTTACTGTCTAGACAAAAAATGGAAAGAAAGGATCGATGCGGTTATACAATTGAAGGAGTCGGTGACGGAACTGAAGGATGAGGATATGGAGATCGACGATGAGTTAGTATGGATCCACCCGGATAGTTGTCTCAAGGGCAGGAAAGGTTACAGCACGACAAAAGGTAAACTTTATTCGTACTTTGAGGGGACTAAATTTCATCAGGCAGCAAAAGACATGGCGGAGATTAAAGTACTTTTTCCCGATGAGCAAGAGTGCAACGAGCAGTTGTGTGCATACATCCTTGGTGAAACCATGGAAGCCATCAGGGAAAAATGTCCAGTGGACTTTAATCCGTCGTCCAGTCCGCCGAAGACACTCCCCTGTTTGTGCATGTATGCCATGACGCCTGAGAGAGTGCACCGTCTGCGTAGCAACAATGTCAAGTCCATC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| 67,793
|
MG679373.1
|
Sindbis virus
|
Belyaev,A.M., Uryvaev,L.V., Ionova,K.S., Parasjuk,N.A., Lvov,D.K., Gromashevsky,V.L.
|
The D.I. Ivanovsky Institute of Virology, Lab. of Enzymology
|
Russia
|
2018-10-17
| null |
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,616
|
GenBank
| null |
Russia: Altay krai
|
Russia
| null | null | null | null | null |
Sindbis virus strain Altay, complete genome
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ATTGACGGCGTAGTACACACTATTGAATCAAACAGCCGACCAATTGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTAAACGTAGACGTAGACCCCCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAAAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATCTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCATTGTGTCTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGTAAACTGGCGGAAAAAGCGTGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATTAAGGATCTCCGGACCGTACTTGATACGCCGGATGCTGAAACACCATCGCTCTGCTTTCACAACGATGTTACCTGCAACATGCGTGCCGAATATTCCGTCATGCAGGACGTGTATATCAACGCTCCCGGAACTATCTATCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCGTACAACACCAACTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTTTGCAGCACAAAGCTGAGTGAAGGTAGGACAGGAAAATTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCGCGGGTTTATTTCTCCGTAGGATCGACACTTTATCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAATGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGTTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGTCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACACACAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGAGAACGGGTATCGTTCCCTGTGTGCACGTACATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACTGGTATAATGGCCACGGATATATCACCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAGGACTAACAGGAACACCAACACCATGCAAAATTACCTTCTGCCGATCATAGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCTAAGGAGCGCAAGGATGATCTTGATAACGAGAAAATGCTGGGTACTAGAGAACGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGAAAGTACATTCGTTTTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCATCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTTCCCATGTCGTCCGTATGGACGACCTCTTTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAATTGAAACTGGCATTGCAACCAAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCTCGGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTTTGAGGATGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTTCCACCATTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCAGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGGCTCCAGACGGACATCGGAGCAGCATTAGTTGAAACCCCGCGCGGTCACGTAAGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTTGTCTCGCCAAACTCTGTGCTGAAGAATGCCAAACTCGCACCAGCGCACCCGCTAGCAGATCAGGTTAAGATCATAACACACTCCGGAAGATCAGGAAGGTACGCGGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAGGTGCCGTACCATGGCCAGAATTCCTAGCACTGAGTGAGAGCGCCACGTTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAACCGCAAACTATACCACATTGCCATGCATGGCCCCGCCAAGAATACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTTGCAGAAACAGAGTACGTGTTTGACGTGGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGTCTGGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCTCCCTATCATGAGCTAGCTCTGGAGGGACTGAAGACCCGACCTGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCGGGGTCGGGCAAGTCAGCTATTATCAAGTCAACTGTCACGGCACGAGATCTTGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAATTGTCGCGAAATTGAGGCCGACGTGCTAAGACTGAGGGGTATGCAGATTACGTCGAAGACAGTAGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCACAAAGCCGTAGAAGTGCTGTACGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCACTACTTGCCTTGATTGCTATCGTCAGGCCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGCGGAGACCCCATGCAATGCGGATTCTTCAACACGATGCAACTAAAGGTACATTTCAATCACCCTGAAAAAGACATATGCACCAAGACATTCTACAAGTATATCTCCCGGCGTTGCACACAGCCAGTTACAGCTATTGTATCGACACTGCATTACGATGGAAAGATGAAAACCACGAACCCGTGCAAGAAGAACATTGAAATCGATATTACAGGGGCCACAAAGCCGAAGCCAGGGGATATCATCCTGACATGTTTCCGCGGGTGGGTTAAGCAATTGCAAATCGACTATCCCGGACATGAAGTAATGACAGCCGCGGCCTCACAAGGGCTAACCAGAAAAGGAGTGTATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCACTGTACGCGATCACATCAGAGCATGTGAACGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGGCTAGTGTGGAAAACCTTGCAGGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAACATACCTAAAGGAAACTTTCAGGCTACTATAGAGGACTGGGAAGCTGAACACAAGGGAATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCACTCCCCGTGCCAATCCGTTCAGCTGCAAGACCAACGTTTGCTGGGCGAAAGCATTGGAACCGATACTAGCCACGGCCGGTATCGTACTTACCGGTTGCCAGTGGAGCGAACTGTTCCCACAGTTTGCGGATGACAAACCACATTCGGCCATTTACGCCTTAGACGTAATTTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGACTTGACAAGCGGACTGTTTTCTAAACAGAGCATCCCACTAACGTACCATCCCGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCATTGCCGCCGAACTCTCCCGTAGATTTCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAGGGCACACAACTTGATTTGCAGACGGGGAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACCTGGTCCCGGTGAACCGCAATCTTCCTCACGCCTTAGTCCCCGAGTACAAGGAGAAGCAACCCGGCCCGGTCGAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCAGTACTTGTGGTATCAGAGGAAAAAATTGAAGCTCCCCGTAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATTGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTACAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTCATCAACATTGGAACTAAATACAGAAACCACCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTAAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAATTGCCTTAACCCAGGAGGCACCCTCGTGGTGAAGTCCTATGGCTACGCCGACCGCAACAGTGAGGACGTAGTCACCGCTCTTGCCAGAAAGTTTGTCAGGGTGTCTGCAGCGAGACCAGATTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAACTAGACAACAGCCGTACACGGCAATTCACCCCGCACCATCTGAATTGCGTGATTTCGTCCGTGTATGAGGGTACAAGAGATGGAGTTGGAGCCGCGCCGTCATACCGCACCAAAAGGGAGAATATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCAGTTGTCAACGCAGCCAATCCGCTGGGTAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGACCAGTTTTACCGATTCAGCCACGGAGACAGGCACCGCAAGAATGACTGTGTGCCTAGGAAAGAAAGTGATCCACGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAGCACCCAGAAGCAGAAGCCTTGAAATTGCTACAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTAGTAAATGAACATAACATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTAGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTATTGCCTGGATAAGAAGTGGAAGGAAAGAATCGACGCGGCACTCCAACTTAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGATGAGTTAGTATGGATCCATCCAGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTCAGTACTACAAAAGGAAAATTGTATTCGTACTTCGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCAGCAAAAGACATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCTAATGACCAGGAAAGTAATGAACAACTGTGTGCCTACATATTGGGTGAGACCATGGAAGCAATCCGCGAAAAGTGCCCGGTCGACCATAACCCGTCGTCTAGCCCGCCCAAAACGTTGCCGTGCCTTTGCATGTATGCCATGACGCCAGAAAGGGTCCACAGACTTAGAAGCAATAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCCCTTCCTAAGCACAAAATTAAGAAT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CTGCTGCTCCTGCTGCCTGCCTTTTTTAGTGGCTGCCGGCGCCTACCTGGCGAAGGTAGACGCCTACGAACATGCGACCACTGTTCCAAATGTGCCACAGATACCGTATAAGGCACTTGTTGAAAGGGCAGGGTATGCCCCGCTCAATTTGGAGATCACTGTCATGTCCTCGGAGGTTTTGCCTTCCACCAACCAAGAGTACATTACCTGCAAATTCACCACTGTGGTCCCCTCCCCAAAAATCAAATGCTGCGGCTCCTTGGAATGTCAGCCGGCCGTTCATGCAGACTATACCTGCAAGGTCTTCGGAGGGGTCTACCCCTTTATGTGGGGAGGAGCGCAATGTTTTTGCGACAGTGAGAACAGCCAGATGAGTGAGGCGTACGTCGAACTGTCAGCAGATTGCGCGTCTGACCACGCGCAGGCGATTAAGGTGCACACTGCCGCGATGAAAGTAGGACTGCGTATAGTGTACGGGAACACTACCAGTTTCCTAGATGTGTACGTGAACGGAGTCACACCAGGAACGTCTAAAGACTTGAAAGTCATAGCTGGACCAATTTCAGCATCGTTTACGCCATTCGATCATAAGGTCGTTATCCATCGCGGCCTGGTGTACAACTATGACTTCCCGGAATATGGAGCGATGAAACCAGGAGCGTTTGGAGACATTCAAGCTACCTCCTTGACTAGCAAGGATCTCATCGCCAGCACAGACATTAGGCTACTCAAGCCTTCCGCCAAGAACGTGCATGTCCCGTACACGCAGGCCGCATCAGGATTTGAGATGTGGAAAAACAACTCAGGCCGCCCACTGCAGGAAACCGCACCTTTCGGGTGTAAGATTGCAGTAAATCCGCTCCGAGCGGTGGACTGTTCATACGGGAACATTCCCATTTCTATTGACATCCCGAACGCTGCCTTTATCAGGACATCAGATGCACCACTGGTCTCAACAGTCAAATGTGAAGTCAGTGAGTGCACTTATTCAGCAGACTTCGGCGGGATGGCCACCCTGCAGTATGTATCCGACCGCGAAGGTCAATGCCCCGTACATTCGCATTCGAGCACAGCAACTCTCCAAGAGTCGACAGTACATGTCCTGGAGAAAGGAGCGGTGACAGTACACTTTAGCACCGCGAGTCCACAGGCGAACTTTATCGTATCGCTGTGTGGGAAGAAGACAACATGCAATGCAGAATGTAAACCACCAGCTGACCATATCGTGAGCACCCCGCACAAAAATGACCAAGAATTTCAAGCCGCCATCTCAAAAACATCATGGAGTTGGCTGTTTGCCCTTTTCGGCGGCGCCTCGTCGCTATTAATTATAGGACTTATGATTTTTGCTTGCAGCATGATGCTGACTAGCACACGAAGATGACCGCTACGCCCCAATGATCCGACCAGCAAAACTCGATGTACTTCCGAGGAACTGATGTGCATAATGCATCAGGCTGGTACATTAGATCCCCGCTTACCGCGGGCAATATAGCAACACTAAAAACTCGATGTACTTCCGAGGAAGCGCAGTGCATAATGCTGCGCAGTGTTGCCACATAACCACTATATTAACCATTTATCTAGCGGACGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 67,851
|
MG679374.1
|
Sindbis virus
|
Belyaev,A.M., Uryvaev,L.V., Ionova,K.S., Parasjuk,N.A., Lvov,D.K., Gromashevsky,V.L.
|
The D.I. Ivanovsky Institute of Virology, Lab. of Enzymology
|
Russia
|
2018-10-17
| null |
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,656
|
GenBank
| null |
Azerbaijan
|
Azerbaijan
| null | null |
1963
| null | null |
Sindbis virus strain Kyzylagach LEIV-65A, complete genome
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ATATAGTGGTGAGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAGACCGGGGTTCGGTTCCCCGACGGGGAGCCAAACAGCCGACCAACAGCACTACCATCATAATGGAGAAGCCTGTAGTTAACGTAGACGTAGACCCCCAGAGTCCGTTTGTCGCTCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTCGAGGTAGTAGCACAGCAGGCCACACCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCTAGTAAATTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCACTATCACTGCGTCTGCCCTATGCGGAGCCCTGAAGATCCCGACCGTATGATGAAATACGCCAATAAGTTGGCGGAGAAGGCAAATAAGATTACTAATAAAAATTTGCATGAGAAGATTAAAGACCTCCGGATCGTACTTGATACTCCGGATGCTGAGACACCGTCGCTCTGCTTCCATAATGACGTTACCTGCAGTACGCGTGCAGAGTACTCCGTTATGCAAGATGTGTATATTAACGCACCTGGAACTATTTACCATCAAGCTATGAAAGGCGTGCGGACACTTTACTGGATTGGGTTTGACACCACTCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGATCATATCCTGCCTATAATACTAACTGGGCCGACGAAAAAGTCCTTGAAGCACGCAATATTGGACTCTGTAGTACCAAGTTGAGCGAAGGCCGTATAGGAAAGTTGTCAATAATGAGGAAAAAGGAGTTTAAGCCCGGGTCACGGGTTTACTTCTCAGTGGGATCAACACTCTACCCAGAATATAGGGACAGCTTACAGAGCTGGCACCTCCCATCAGTGTTCCATCTGAAAGGAAAGCAATCGTATACATGCCGCTGTGATACAGTGGTAAGTTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAGATCACTATTAGTCCCGGGATTACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACAAACAATAGCGAGGGTTTCTTGCTATGTAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGGGAACGGGTCTCGTTCCCCGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGACCAGATGACAGGCATAATGGCCACGGATATTTCACCTGACGATGCACAGAAGCTTCTGGTTGGGCTCAACCAGAGGATTGTCATTAACGGTAAAACCAACAGGAACACTAACACTATGCAAAACTACCTTCTGCCGATTATAGCACAAGGCTTCAGCAAGTGGGCTAAAGAGCGCAAAGAAGATCTTGATAATGAAAAGAAGCTGGGCACTAGGGAGCGTAAGCTTATTTACGGGTGTCTATGGGCGTTTCGTACTAAGAAAGTGCACTCGTTTTACCGCCCGCCCGGAACGCAGACCAGCGTGAAAGTCCCGGCATCTTTTAGCGCTTTTCCAATGTCATCTGTATGGACAACCTCACTACCCATGTCGCTGAGGCAGAAGATAAAATTGGTACTACAACCGAAAAAAGAGGAGAAATTACTGCAGGTCTCAGAAGAGTTAGTTGCGGAGGCTAAAGCGGCCTTTGAAGATGCACAGGAGGAGATCAGAGCGGAGCAACTCCGTGAAGCACTTCCACCACTGGTAGCAGACAAAGGTATTGAAGCCGCTGCAGAAGTCGTCTGCGAAGTGGAAGGGCTTCAAGCTGATATAGGAGCAGCTCTTGTTGAGACGCCACGAGGGCATGTAAGGATTATACCTCAAGTAACAGACCGCATGATTGGGCAGTACATCGTGGTCTCACCAACCTCCGTGCTTAAGAACGCCAAATTAACACCTGTACACCCTTTGGCTGACCAAGTCAAAATTATAACACATTCAGGGAGGACAGGAAGATTCGCGGTGGAACCGTATGACGCTAAAGTGCTGATGCCAGCAGGTAGTGCCGTTCCATGGCCTGAGTTCCTGGCGTTGAGTGAAAGCGCCACGCTAGTGTATAACGAAAGAGAATTTGTCAACCGTAAACTTTACCATATCGCCATACATGGTCCCGCGAAGAATACTGAAGAGGAGCAGTATAAGGTCACTAAAGCCGAACTCGCAGAAACAGAGTATGTATTTGATGTCGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAGGCCTCGGGGCTGGTTCTCTCGGGAGAACTAACTAACCCACCGTATCATGAAATGGCGCTTGAGGGGCTGAAGACTCGACCCGCTGTTCCGTATAAGGTCGAAACAATAGGAGTAATAGGCACACCAGGATCAGGCAAGTCTGCGATTATTAAATCGACCGTTACCGTACGAGATCTTGTTACCAGCGGAAAGAAGGAAAACTGCCGTGAAATTGAAACTGACGTGTTGAGGTTGAGAGGTATGCAGATCACGTCAAGGACGGTAGACTCAGTCATGCTTAACGGATGCCATAAAGCCGTAGAGATGCTATACGTTGATGAAGCATTTGCGTGCCATGCTGGTACGTTGCTTGCCTTGATCGCTATTGTTAGACCCCGAAAGAAGGTAGTACTTCGCGGGGATCCTAAGCAGTGTGGTTTTTTCAATATGATGCAACTCAAAGTACATTTTAATCACCCTGAAAAAGATATATGTACCAAGACGTTTTACAAATTCATCTCTCGACGCTGCACGCAACCAGTAACGGCGATTGTTTCAACACTTCATTACGACGGAAAGATGAAGACTACAAACCCTTGCAAGAAGAGCATTGAGATAGATATTACAGGTACTACGAAGCCGAAGCCCGGGGACCTCGTTTTGACGTGCTTCCGCGGATGGGTCAAGCAGCTACAGATCGATTACGCGGGAAATGAAGTGATGACGGCTGCTGCCTCGCAGGGACTGACTAGAAAGGGTGTTTACGCCGTTCGGCAAAAAGTTAATGAGAATCCACTGTACGCGATTACGTCGGAGCACGTGAATGTGTTACTCACCCGTACTGAGGATAGATTAGTGTGGAAGACCTTACAGGGCGATCCATGGATCAAACAACTTACTAACATTCCGAAAGGAAACTTCCAAGCTACTATTGAGGACTGGGAAGCTGAACATAAGGGGATTATCGCTGCAATAAACAGCCCAACCCCTCGTATAAACCCGTTCAGCTGTAAGACTAATGTGTGCTGGGCGAAGGCACTGGAACCGATACTGGCCACAGCCGGTATTGTCCTTACCGGTTGCCAGTGGAGTGAGCTGTTTCCACAGTTCGCAGATGACAAACCCCACTCAGCTATCTACGCCCTAGATGTGATTTGTATTAAGTTCTTTGGTATGGATCTGACAAGCGGTCTATTCTCAAAGCAGAGCATCCCTCTGACGTACCACCCTGCGGACTCTGCAAGGCCAGTGGCGCATTGGGACAACAGTCCAGGAACCCGAAGGTATGGATACGACCATGCGGTTGCTGCCGAATTGTCTCGTAGATTCCCGGTGTTCCAACTTGCTGGAAAAGGCACACAGCTTGACTTGCAGACTGGTAGAACCAGAGTCGTTTCCGCGCAGTGTAACTTGGTCCCAGTGAACCGTAACCTCCCGCACGCTCTTGTCCCCGAGTATAAAGAGAAACAACCCGGCCCGATTAAAAATTTTTTAAATCAGTTTAAGCATCACTCCATACTTGTAGTATCAGAAACGAAAATCGAAGTTCCCAATAAGCGCATCGAATGGATTGCACCGCTTGGCATAGCTGGTGCAGATAAGAGCTACAACCTGGCCTTCGGATTTCCACCGCAGGCACGGTACGATATGGTGTTTATCAATATAGGAACAAAATATAGAAACCACCATTTTCAACAGTGTGAAGACCATGCGGCGACTTTGAAGACTCTTTCCCGCTCGGCTCTGAATTGCCTCAACCCTGGAGGCACCTTAGTGGTGAAATCCTATGGATATGCTGATCGCAATAGCGAGGACGTAGTCACCGCACTTGCCAGGAAGTTTGTTAGAGTGTCTGCGGCCAGGCCAGAGTGCGTCTCAAGTAACACAGAAATGTACCTAATCTTTCGGCAATTAGATAATAGCCGTACACGGCAGTTCACTCCACATCATTTGAACTGTGTAATCTCGTCGGTGTATGAAGGCACGAGAGAAGGAGTCGGAGCTGCGCCATCCTACCGTGTGAAACGGGAAAATATTGCAGACTGCCATGAGGAAGCAATCGTCAACGCCGCTAACTCGCTGGGTAAACCAGGTGAAGGAGTTTGCCGCGCCGTCTACAAGCGTTGGCCGAGCAGCTTTATGGATTCCGCCACAGAAACGGGTACGGCTAAATTAACTGTAAGCCAAGGAATGAAAGTGATACACGCGGTCGGCCCTGACTTCCGTAAGTATCCTGAGGCGGAAGCTTTGAAGCTGCTGCAAAACGCTTACCATGCAGTGGCGGACTTGGTTAACAAACACAACATTAAGTCCATTGCTATCCCGCTACTATCAACAGGTATATATGCAGCTGGTAAGGATCGCTTGGAAGTTTCGCTTAATTGCCTGACCACCGCACTAGACAGGACCGATGCAGACGTAACTATTTATTGTTTGGATAAGAAATGGAAAGAGAGAATTGACGCGGTGTTGCAACTTAAGGAGTCAGTGACAGAACTGAAGGACGAGGACATGGAAATCGATGACGAATTGGTATGGATTCACCCGGATAGTTGTCTAAAAGGGAGAAAGGGATACAGTACTACAAAAGGAAAGCTATATTCGTACTTTGAGGGTACTAAATTTCACCAAGCAGCCAAAGACATGGCTGAAATAAAAGTGCTGTTTCCGGACGACCAGGAAAGCAACGAACAGTTATGCGCTTACATACTGGGCGAAACTATGGAAGCAATTCGTGAAAAATGCCCAGTTGACCGTAACCCGTCATCCAGTCCTCCGAAGACGCTGCCTTGCCTTTGCATGTATGCAATGACTCCGGAAAGAGTTCATAGGCTCAGAAGTAACAATGTTAAAGAAATTACTGTGTGC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| 67,852
|
MG679375.1
|
Sindbis virus
|
Belyaev,A.M., Uryvaev,L.V., Ionova,K.S., Parasjuk,N.A., Lvov,D.K., Gromashevsky,V.L.
|
The D.I. Ivanovsky Institute of Virology, Lab. of Enzymology
|
Russia
|
2018-10-17
| null |
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,535
|
GenBank
| null |
Russia: Stavropol
|
Russia
| null | null | null | null | null |
Sindbis virus strain Stavropol, complete genome
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ATATAGTGGTGAGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAGACCGGGGTTCGGTTCCCCGACGGGGAGCCAAACAGCCGACCAACAGCACTACCATCATAATGGAGAAGCCTGTAGTTAACGTAGACGTAGACCCCCAGAGTCCGTTTGTCGCTCAACTGCAAAAGAGCTTCCCGCAATTCGAGGTAGTAGCACAGCAGGCCACACCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCTAGTAAATTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATTTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCACTATCACTGCGTCTGCCCTATGCGGAGCCCTGAAGATCCCGACCGTATGATGAAATACGCCAATAAGTTGGCGGAGAAGGCAAATAAGATTACTAATAAAAATTTGCATGAGAAGATTAAAGACCTCCGGATCGTACTTGATACTCCGGATGCTGAGACACCGTCGCTCTGCTTCCATAATGACGTTACCTGCAGTACGCGTGCAGAGTACTCCGTTATGCAAGATGTGTATATTAATGCACCCGGAAATATTTACCATCAAGCTATGAAAGGCGCGCGGACCCTTTATTGGATTGGGTTTGACACCACTCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGATCATATCCTGCCTATAATACTAACTGGGCCGATGAAAAAGTCCTTGAAGCACGCAATATTGGACTCTGTAGTACCAAGTTGAGCGAAGGCCGTATAGGAAAGTTGTCAATAATGAGGAAAAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCACGGGTCTACTTCTCAGTGGGATCAACACTCTACCCAGAATATAGGGACAGCTTACAGAGCTGGCACCTCCCATCAGTGTTCCATCTGAAAGGAAGGCAATCGTATACATGCCGCTGTGATACAGTGGTAAGTTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAGATCACTATTAGTCCCGGGATTACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACATACAATAGCGAGGGTTTCTTGCTATGTAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGGGAACGGGTCTCGTTCCCCGTGTGCACGTATATCCCGGCCACCATATGCGACCAGATGACAGGTATAATGGCCACGGATATTTCACCTGACGATGCACAGAAGCTTCTGGTTGGGCTCAACCAGAGGATTGTCATTAACGGTAAAACCAACAGGAACACTAACACCATGCAAAACTACCTTCTGCCGATTATAGCACAAGGCTTCAGCAAGTGGGCTAAAGAGCGCAAAGAAGATCTTGATAATGAAAAGAAGCTGGGCACTAGGGAGCGTAAGCTTATTTACGGGTGTCTATGGGCGTTTCGTACTAAGAAAGTGCACTCGTTTTACCGCCCGCCCGGAACGCAGACCAGCGTGAAAGTCCCGGCATCTTTTAGCGCTTTTCCAATGTCATCTGTATGGACAACCTCACTACCCATGTCGCTGAGGCAGAAGATAAAATTGGTACTACAACCGAAAAAGGAGGAGAAATTACTGCAGGTCTCAGAAGAGTTAGTTGCGGAGGCTAAAGCGGCCTTTGAAGATGCACAGGAGGAGATCAGAGCGGAGCAACTCCGTGAAGCACTTCCACCACTGGTAGCAGACAAAGGTATTGAAGCCGCTGCAGAAGTCGTCTGTGAAGTGGAAGGGCTTCAAGCTGATATAGGAGCAGCTCTTGTTGAGACGCCACGAGGGCATGTAAGGATTATACCTCAAGTAACAGACCGCATGATTGGGCAGTACATCGTGGTCTCACCAACCTCCGTGCTTAAGAACGCCAAATTAACACCTGTTCACCCTTTGGCTGACCAAGTCAAAATTATAACACATTCAGGGAGGACAGGAAGATTCGCGGTGGAACCGTATGATGCTAAAGTGTTGATGCCAGCAGGTAGCGCCGTTCCATGGCCTGAGTTCCTGGCGTTAAGTGAAAGCGCCACGCTAGTGTATAACGAAAGAGAATTTGTCAACCGCAAACTTTACCATATCGCCATACATGGTCCCGCGAAGAATACTGAAGAGGAGCAGTATAAAGTTACTAAAGCCGAACTCGCAGAAACAGAGTATGTATTTGATGTCGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAGGCCTCGGGGCTGGTTCTCTCGGGAGAACTAACTAACCCACCGTATCATGAAATGGCGCTTGAGGGGCTGAAGACTCGACCCGCTGTTCCGTATAAGGTCGAAACAATAGGAGTAATAGGCACACCAGGATCAGGCAAGTCTGCGATTATTAAATCGACCGTTACCGTACGAGATCTTGTTACCAGCGGAAAGAAGGAAAACTGCCGTGAAATTGAAACTGACGTGTTGAGGTTGAGAGGTATGCAGATCACGTCAAGGACGGTAGACTCAGTCATGCTTAACGGATGCCATAAAGCCGTAGAGATGCTATACGTTGATGAAGCATTTGCGTGCCATGCTGGTACGTTGCTTGCCTTGATCGCTATTGTTAGACCCCGAAAGAAGGTAGTACTTCGCGGAGATCCTAAGCAGTGTGGTTTTTTCAATATGATGCAGCTCAAAGTACATTTTAATCACCCTGAAAAAGATATATGTACTAAGACGTTTTACAAATTCATCTCTTGCCGCTGCACGCAACCAGTAACGGCGATTGTTTCAACACTCCATTACGACGGAAAGATGAAGACTACAAACCCCTGCAAGAAGAGCATTGAGATAGATATTACAGGTACTACGAAGCCGAAGCCCGGGGACCTCGTTTTGACGTGCTTCCGCGGATGGGTCAAGCAGCTACAGATCGATTACGCGGGAAATGAAGTGATGACGGCTGCTGCCTCGCAGGGACTGACTAGAAAGGGTGTTTACGCCGTTCGGCAAAAAGTTAATGAGAATCCACTGTACGCGATTACGTCGGAGCACGTGAATGTGTTACTCACCCGTACTGAGGATAGATTAGTGTGGAAGACCTTACAGGGCGATCCATGGATCAAACAACTTACTAACATTCCGAAAGGAAACTTCCAAGCTACTATTGAGGACTGGGAAGCTGAACATAAGGGGATCATCGCTGCAATAAACAGCCCAACCCCTCCTATAAACCCGTTCAGCTGTAAGACTAATGTGTGCTGGGCGAAGGCACTGGAACCGATACTGGCCACAGCCGGTATTGTCCTCACCGGTTGCCAGTGGAGTGAGCTGTTTCCACAGTTCGTAGATGATAAACCCCACTCAGCTATCTACGCCCTAGATGTGATTTGTATTAAGTTCTTTGGTATGGATCTGACAAGCGGTCTATTTTCAAAGCAGAGCATCCCTCTGACGTACCACCCTGCGGACTCTGCAAGGCCAGTGGCGCATTGGGACAACAGTCCAGGAACCCGAAAGTATGGATACGATCATGCGGTTGCTGCCGAATTGTCTCGTAGATTCCCGGTGTTCCAACTTGCTGGAAAAGGCACACAGCTTGACTTGCAGACTGGTAGAACCAGAGTCGTTTCCGCGCAGTGTAACTTGGTCCCAGTGAACCGTAACCTCCCGCACGCTCTTGTCCCCGAGTATAAAGAGAAACAACCCGGCCCGATTAAAAATTTTTTAAATCAGTTTAAGCATCACTCCATACTTGTAGTATCAGAAACGAAAATCGAAGTTCCCAATAAGCGCATCGAATGGATTGCACCGCTTGGCATAGCTGGTGCAGATAAGAGCTACAACCTGGCCTTCGGATTTCCACCGCAGGCACGGTATGATATGGTGTTTATCAATATAGGAACAAAATATAGAAACCACCATTTTCAACAGTGTGAAGACCATGCGGCGACTTTGAAGACTCTTTCCCGCTCGGCTCTGAATTGCCTCAACCCTGGAGGCACCTTAGTGGTGAAATCCTATGGATATGCTGATCGTAATAGCGAGGACGTAGTCACCGCACTTGCCAGGAAGTTTGTTAGAGTGTCTGCGGCCAGGCCAGAGTGCGTCTCAAGTAACACAGAAATGTACCTAATCTTTCGGCAATTAGATAATAGCCGTACACGGCAGTTCACTCCACATCATTTGAACTGTGTAATCTCGTCGGTGTATGAAGGCACGAGAGAAGGAGTCGGAGCTGCGCCATCCTACCGTGTGAAACGGGAAAATATTGCAGACTGCCATGAGGAAGCAATCGTCAACGCCGCTAACTCGCTGGGTAAACCAGGTGAAGGAGTTTGCCGCGCCGTCTACAAGCGTTGGCCGAGCAGCTTTATTGATTCCGCCACAGAAACGGGTACGGCTAAATTAACTGTAAGCCAAGGAATGAAAGTGATACACGCGGTCGGCCCCGACTTCCGTAAGTATCCTGAGGCGGAAGCTTTGAAGCTGCTGCAAAACGCTTACCATGCAGTGGCGGACTTGGTTAACAAACACAACATTAAGTCCATTGCTATCCCGCTACTATCAACAGGTATATATGCAGCTGGTAAGGATCGCTTGGAAGTTTCGCTCAATTGCCTGACCACCGCACTAGACAGGACCGATGCAGATGTAACTATTTATTGTTTGGATAAGAAATGGAAAGAGAGAATTGACGCGGTGTTGCAACTTAAGGAGTCAGTGACAGAACTGAAGGACGAGGACATGGAAATCGATGACGAATTGGTATGGATTCATCCGGATAGTTGTCTAAAAGGGAGAAAGGGATACAGTACTACAAAAGGAAAGCTATATTCGTACTTTGAGGGTACTAAATTTCACCAAGCAGCCAAAGATATGGCTGAAATAAAAGTGCTGTTTCCGGACGACCAGGAAAGCAACGAACAGTTATGCGCTTACATACTGGGCGAAACTATGGAAGCAATTCGTGAAAAATGCCCAGTTGATCGTAACCCGTCATCCAGTCCTCCGAAGACGCTGCCTTGCCTTTGCATGTATGCAATGACTCCGGAAAGAGTTCATAGGCTCAGAAGTAACAATGTTAAAGAAATTACTGTGTGC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GGGGAAGGTAGACGCCTACGAACATGCGACCACCATTCCAAATGTGCCGAAGATTCCGTATAAAGCACTTGTAGAACGGTCTGGCTACGCCCCGCTTAACTTAGAGATCACCGTCGTGTCGTCGCAGGTTTTACCATCTACTAATCAAGAGTATATCACCTGCAAGTTTACTACTGTAGTCCCCTCCCCGAAAGTCAAATGTTGCGGCTCCTTGGAATGTCAGCCCGCCGCTCACGCCGACTATAACTGCAAAGTTTTTGGAGGGGTTTACCCATTCATGTGGGGAGGAGCACAGTGTTTTTGCGACAGCGAGAACACCCAGATGAGCGAGGCGTACGTCGAACTGTCAGCGGACTGCGTAACGGATTACGCACAGGCAGTTAATGTGCATACTGCTGCAATGAAGGTAGGACTACGTATAGTGTATGGGAATACCACCAGCTATTTAGATGTGTACGTGAATGGAGTCACGCCGGGGACATCCAAAGATCTAAAAGTCATAGCTGGGCCAGTTTCGTCCTCCTTTACGCCGTTTAATCATAAGGTTGTCATCTACCGTGGTTTAGTCTATAATTATGACTTCCCTGAATACGGCGCAATGAAACCTGGAGTGTTCGGAGACATCCAAGCTACCTCCTTGACCAGTAGAGACCTTATTGCAAGCACGGACATTAGACTGCTTAAGCCTTCCGTTAAAAACGTGCACGTCCCGTACACGCAAGCTGCTTCAGGATTCGAGATGTGGAAGAACAACTCAGGCCGCCCACTGCAGGAAACCGCTCCTTTTGGGTGTAAGATTGCAGTCAACCCGCTACGAGCGGTGGACTGTTCGTACGGTAATATTCCCATCTCCATCGATATCCCAAATGCCGCCTTCATTAGGATATCGGATGCGCCGCTAGTTTCGACGGTTAAATGTGAGGTCAGCGAATGTACTTATTCAGCTGATTTGGGTGGTATGGCAACCCTGCAGTATGTGTCGGACCGCGAAGGACAATGCCCCGTGCACTCTCACTCAAGCACAGCAACACTTCAGGAATCGACAGTGCATGTCCTGGAGAAAGGGGCGGTGACCGTGCACTTTAGTACCGCCAGCCCACAGGCTAATTTCATTATATCGCTGTGTGGCAAGAAAACAACATGCAACGCGGAATGTAAGCCACCTGCGGACCACATTGTGAGTACACCGCACAAAATCGATCAGGAGTTCCAAACCGCTATTTCAAAAACATCATGGAGCTGGTTACTGGCACTCTTTGGCGGCGCCTCGTCGCTATTAATTATAGGACTCATGATTTTTACTTGCAGCATGTTGCTGACAAGCACCCGGAGATGACCGCTACGCCCCAATGACCCGACCAGCAAAACTCGACGTATTTCCGAGGAACTGATGTGCATAATGCATCAGGCTGGTACTGTAGAACCCCGCTCATCGCGGGCACTATAGCATCAATGAAACTCGATGTATTTCCGGTGAAGCGCGGTCCCTCTTGCTCCTGCGTGTAGACACATAATCACTTTATTCATTTGACTAC
| 67,853
|
MG679376.1
|
Sindbis virus
|
Belyaev,A.M., Uryvaev,L.V., Ionova,K.S., Parasjuk,N.A., Lvov,D.K., Gromashevsky,V.L.
|
The D.I. Ivanovsky Institute of Virology, Lab. of Enzymology
|
Russia
|
2018-10-17
| null |
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,582
|
GenBank
| null |
Armenia
|
Armenia
|
Bubulcus ibis
| null |
1990
| null | null |
Sindbis virus strain F-720, complete genome
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ATTGACGGCGTAGTATACACTATTGAATCAAACAGCCGACCAATTGCACTACCATCACAATGGAGAAGCCAGTAGTAAACGTAGACGTAGACCCCCAGAGTCCGTTTGTCGTGCAACTGCAAAAAAGCTTCCCGCAATTTGAGGTAGTAGCACAGCAGGTCACTCCAAATGACCATGCTAATGCCAGAGCATTTTCGCATCTGGCCAGTAAACTAATCGAGCTGGAGGTTCCTACCACAGCGACGATCTTGGACATAGGCAGCGCACCGGCTCGTAGAATGTTTTCCGAGCACCAGTATCATTGTGTCTGCCCCATGCGTAGTCCAGAAGACCCGGACCGCATGATGAAATATGCCAGTAAACTGGCGGAAAAAGCGTGCAAGATTACAAACAAGAACTTGCATGAGAAGATTAAGGATCTCCGGACCGTACTTGATGCGCCGGATGCTGAAACACCATCGCTCTGCTTTCACAACGATGTTACCTGCAACATGCGTGCCGAATATTCCGTCATGCAGGACGTGTATATCAACGCTCCCGGAACTATCTATCATCAGGCTATGAAAGGCGTGCGGACCCTGTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCAGTTCATGTTCTCGGCTATGGCAGGTTCGTACCCTGCGTACAACACCAACTGGGCCGACGAGAAAGTCCTTGAAGCGCGTAACATCGGACTTTGCAGCACAAAGCTGAGTGAAGGTAGGACAGGAAAATTGTCGATAATGAGGAAGAAGGAGTTGAAGCCCGGGTCGCGGGTTTATTTCTCCGTAGGATCGACACTTTATCCAGAACACAGAGCCAGCTTGCAGAGCTGGCATCTTCCATCGGTGTTCCACTTGAATGGAAAGCAGTCGTACACTTGCCGCTGTGATACAGTGGTGAGTTGCGAAGGCTACGTAGTGAAGAAAATCACCATCAGTCCCGGGATCACGGGAGAAACCGTGGGATACGCGGTTACACACAATAGCGAGGGCTTCTTGCTATGCAAAGTTACTGACACAGTAAAAGGAGAACGGGTATCGTTCCCTGTGTGCACGTACATCCCGGCCACCATATGCGATCAGATGACTGGTATAATGGCCACGGATATATCACCTGACGATGCACAAAAACTTCTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATTGTCATTAACGGTAGGACTAACAGGAACACCAACACCATGCAAAATTACCTTCTGCCGATCATAGCACAAGGGTTCAGCAAATGGGCTAAGGAGCGCAAGGATGATCTTGATAACGAGAAAATGCTGGGTACTAGAGAACGCAAGCTTACGTATGGCTGCTTGTGGGCGTTTCGCACTAAGAAAGTACATTCGTTTTATCGCCCACCTGGAACGCAGACCATCGTAAAAGTCCCAGCCTCTTTTAGCGCTTTTCCCATGTCGTCCGTATGGACGACCTCTTTGCCCATGTCGCTGAGGCAGAAATTGAAACTGGCATTGCAACCAAAGAAGGAGGAAAAACTGCTGCAGGTCTCGGAGGAATTAGTCATGGAGGCCAAGGCTGCTTTTGAGGATGCTCAGGAGGAAGCCAGAGCGGAGAAGCTCCGAGAAGCACTTCCACCATTAGTGGCAGACAAAGGCATCGAGGCAGCCGCAGAAGTTGTCTGCGAAGTGGAGGGGCTCCAGGCGGACATCGGAGCAGCATTAGTTGAAACCCCGCGCGGTCACGTAAGGATAATACCTCAAGCAAATGACCGTATGATCGGACAGTATATCGTTGTCTCGCCAAACTCTGTGCTGAAGAATGCCAAACTCGCACCAGCGCACCCGCTAGCAGATCAGGTTAAGATCATAACACACTCCGGAAGATCAGGAAGGTACGCGGTCGAACCATACGACGCTAAAGTACTGATGCCAGCAGGAGGTGCCGTACCATGGCCAGAATTCCTAGCACTGAGTGAGAGCGCCACGTTAGTGTACAACGAAAGAGAGTTTGTGAACCGCAAACTATACCACATTGCCATGCATGGCCCCGCCAAGAATACAGAAGAGGAGCAGTACAAGGTTACAAAGGCAGAGCTTGCAGAAACAGAGTACGTGTTTGACGTGGACAAGAAGCGTTGCGTTAAGAAGGAAGAAGCCTCAGGTCTGGTCCTCTCGGGAGAACTGACCAACCCTCCCTATCATGAGCTAGCTCTGGAGGGACTGAAGACCCGACCTGCGGTCCCGTACAAGGTCGAAACAATAGGAGTGATAGGCACACCGGGGTCGGGCAAGTCAGCTATCATCAAGTCAACTGTCACGGCACGAGATCTTGTTACCAGCGGAAAGAAAGAAAATTGTCGCGAAATTGAGGCCGACGTGCTAAGACTGAGGGGTATGCAGATTACGTCGAAGACAGTAGATTCGGTTATGCTCAACGGATGCCACAAAGCCGTAGAAGTGCTGTACGTTGACGAAGCGTTCGCGTGCCACGCAGGAGCACTACTTGCCTTGATTGCTATCGTCAGGCCCCGCAAGAAGGTAGTACTATGCGGAGACCCCATGCAATGCGGATTCTTCAACACGATGCAACTAAAGGTACATTTCAATCACCCTGAAAAAGACATATGCACCAAGACATTCTACAAGTATATCTCCCGGCGTTGCACACAGCCAGTTACAGCTATTGTATCGACACTGCATTACGATGGAAAGATGAAAACCACGAACCCGTGCAAGAAGAACATTGAAATCGATATTACAGGGGCCACAAAGCCGAAGCCAGGGGATATCATCCTGACATGTTTCCGCGGGTGGGTTAAGCAATTGCAAATCGACTATCCCGGACATGAAGTAATGACAGCCGCGGCCTCACAAGGGCTAACCAGAAAAGGAGTGTATGCCGTCCGGCAAAAAGTCAATGAAAACCCACTGTACGCGATCACATCAGAGCATGTGAACGTGTTGCTCACCCGCACTGAGGACAGGCTAGTGTGGAAAACCTTGCAGGGCGACCCATGGATTAAGCAGCTCACTAACATACCTAAAGGAAACTTTCAGGCTACTATAGAGGACTGGGAAGCTGAACACAAGGGAATAATTGCTGCAATAAACAGCCCCACTCCCCGTGCCAATCCGTTCAGCTGCAAGACCAACGTTTGCTGGGCGAAAGCATTGGAACCGATACTAGCCACGGCCGGTATCGTACTTACCGGTTGCCAGTGGAGCGAACTGTTCCCACAGTTTGCGGATGACAAACCACATTCGGCCATTTACGCCTTAGACGTAATTTGCATTAAGTTTTTCGGCATGGACTTGACAAGCGGACTGTTTTCTAAACAGAGCATCCCACTAACGTACCATCCCGCCGATTCAGCGAGGCCGGTAGCTCATTGGGACAACAGCCCAGGAACCCGCAAGTATGGGTACGATCACGCCATTGCCGCCGAACTCTCCCGTAGATTTCCGGTGTTCCAGCTAGCTGGGAAGGGCACACAACTTGATTTGCAGACGGGGAGAACCAGAGTTATCTCTGCACAGCATAACCTGGTCCCGGTGAACCGCAATCTTCCTCACGCCTTAGTCCCCGAGTACAAGGAGAAGCAACCCGGCCCGGTCAAAAAATTCTTGAACCAGTTCAAACACCACTCAGTACTTGTGGTATCAGAGGAAAAAATTGAAGCTCCCCGTAAGAGAATCGAATGGATCGCCCCGATTGGCATAGCCGGTGCAGATAAGAACTACAACCTGGCTTTCGGGTTTCCGCCGCAGGCACGGTACGACCTGGTGTTCATCAACATTGGAACTAAATACAGAAACCACCACTTTCAGCAGTGCGAAGACCATGCGGCGACCTTAAAAACCCTTTCGCGTTCGGCCCTGAATTGCCTTAACCCAGGAGGCACCCTCGTGGTGAAGTCCTATGGCTACGCCGACCGCAACAGTGAGGACGTAGTCACCGCTCTTGCCAGAAAGTTTGTCAGGGTGTCTGCAGCGAGACCAGATTGTGTCTCAAGCAATACAGAAATGTACCTGATTTTCCGACAACTAGACAACAGCCGTACACGGCAATTCACCCCGCACCATCTGAATTGCGTGATTTCGTCCGTGTATGAGGGTACAAGAGATGGAGTTGGAGCCGCGCCGTCATACCGCACCAAAAGGGAGAATATTGCTGACTGTCAAGAGGAAGCAGTTGTCAACGCAGCCAATCCGCTGGGTAGACCAGGCGAAGGAGTCTGCCGTGCCATCTATAAACGTTGGCCGACCAGTTTTACCGATTCAGCCACGGAGACAGGCACCGCAAGAATGACTGTGTGCCTAGGAAAGAAAGTGATCCACGCGGTCGGCCCTGATTTCCGGAAGCACCCAGAAGCAGAAGCCTTGAAATTGCTACAAAACGCCTACCATGCAGTGGCAGACTTAGTAAATGAACATAACATCAAGTCTGTCGCCATTCCACTGCTATCTACAGGCATTTACGCAGCCGGAAAAGACCGCCTTGAAGTATCACTTAACTGCTTGACAACCGCGCTAGACAGAACTGACGCGGACGTAACCATCTATTGCCTGGATAAGAAGTGGAAGGAAAGAATCGACGCGGCACTCCAACTTAAGGAGTCTGTAACAGAGCTGAAGGATGAAGATATGGAGATCGACGATGAGTTAGTATGGATCCATCCAGACAGTTGCTTGAAGGGAAGAAAGGGATTCAGTACTACAAAAGGAAAATTGTATTCGTACTTCGAAGGCACCAAATTCCATCAAGCAGCAAAAGACATGGCGGAGATAAAGGTCCTGTTCCCTAATGACCAGGAAAGTAATGAACAACTGTGTGCCTACATATTGGGTGAGACCATGGAAGCAATCCGCGAAAAGTGCCCGGTCGACCATAACCCGTCGTCTAGCCCGCCCAAAACGTTGCCGTGCCTTTGCATGTATGCCATGACGCCAGAAAGGGTCCACAGACTTAGAAGCAATAACGTCAAAGAAGTTACAGTATGCTCCTCCACCCCCCTTCCTAAGCACAAAATTAAGAAT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CTGCTGCTCCTGCTGCCTGCCTTTTTTAGTGGCTGCCGGCGCCTACCTGGCGAAGGTAGACGCCTACGAACATGCGACCACTGTTCCAAATGTGCCACAGATACCGTATAAGGCACTTGTTGAAAGGGCAGGGTATGCCCCGCTCAATTTGGAGATCACTGTCATGTCCTCGGAGGTTTTGCCTTCCACCAACCAAGAGTACATTACCTGCAAATTCACCACTGTGGTCCCCTCCCCAAAAATCAAATGCTGCGGCTCCTTGGAATGTCAGCCGGCCGTTCATGCAGACTATACCTGCAAGGTCTTCGGAGGGGTCTACCCCTTTATGTGGGGAGGAGCGCAATGTTTTTGCGACAGTGAGAACAGCCAGATGAGTGAGGCGTACGTCGAACTGTCAGCAGATTGCGCGTCTGACCACGCGCAGGCGATTAAGGTGCACACTGCCGCGATGAAAGTAGGACTGCGTATAGTGTACGGGAACACTACCAGTTTCCTAGATGTGTACGTGAACGGAGTCACACCAGGAACGTCTAAAGACTTGAAAGTCATAGCTGGACCAATTTCAGCATCGTTTACGCCATTCGATCATAAGGTCGTTATCCATCGCGGCCTGGTGTACAACTATGACTTCCCGGAATATGGAGCGATGAAACCAGGAGCGTTTGGAGACATTCAAGCTACCTCCTTGACTAGCAAGGATCTCATCGCCAGCACAGACATTAGGCTACTCAAGCCTTCCGCCAAGAACGTGCATGTCCCGTACACGCAGGCCGCATCAGGATTTGAGATGTGGAAAAACAACTCAGGCCGCCCACTGCAGGAAACCGCACCTTTCGGGTGTAAGATTGCAGTAAATCCGCTCCGAGCGGTGGACTGTTCATACGGGAACATTCCCATTTCTATTGACATCCCGAACGCTGCCTTTATCAGGACATCAGATGCACCACTGGTCTCAACAGTCAAATGTGAAGTCAGTGAGTGCACTTATTCAGCAGACTTCGGCGGGATGGCCACCCTGCAGTATGTATCCGACCGCGAAGGTCAATGCCCCGTACATTCGCATTCGAGCACAGCAACTCTCCAAGAGTCGACAGTACATGTCCTGGAGAAAGGAGCGGTGACAGTACACTTTAGCACCGCGAGTCCACAGGCGAACTTTATCGTATCGCTGTGTGGGAAGAAGACAACATGCAATGCAGAATGTAAACCACCAGCTGACCATATCGTGAGCACCCCGCACAAAAATGACCAAGAATTTCAAGCCGCCATCTCAAAAACATCATGGAGTTGGCTGTTTGCCCTTTTCGGCGGCGCCTCGTCGCTATTAATTATAGGACTTATGATTTTTGCTTGCAGCATGATGCTGACTAGCACACGAAGATGACCGCTACGCCCCAATGATCCGACCAGCAAAACTCGATGTACTTCCGAGGAACTGATGTGCATAATGCATCAGGCTGGTACATTAGATCCCCGCTTACCGCGGGCAATATAGCAACACTAAAAAATCGATGTACTTCCGAGGAAGCGCAGTGCATAATGCTGCGCAGTGTTGCCACATAACCACTATATTAACCATTTA
| 67,854
|
MG679377.1
|
Sindbis virus
|
Belyaev,A.M., Uryvaev,L.V., Ionova,K.S., Parasjuk,N.A., Lvov,D.K., Gromashevsky,V.L.
|
The D.I. Ivanovsky Institute of Virology, Lab. of Enzymology
|
Russia
|
2018-10-17
| null |
Sindbis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,557
|
GenBank
| null |
Russia: Astrakhan
|
Russia
| null | null |
2003
| null | null |
Sindbis virus strain LEIV-Ast03-1-839, complete genome
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| 67,855
|
LC786485.1
|
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|
Harakawa,S., Mekata,T.
|
Laboratory of Fish Diseases Faculty of Veterinary Medicine; 1-3 Ikoinooka, Imabari, Ehime 794-0085
|
Japan
|
2023-11-15
|
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|
Sinsheimervirus phiX174
|
Sinsheimervirus
|
Microviridae
|
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|
GenBank
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Japan:Ehime
|
Japan
|
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| null |
2015-09-21
|
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|
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|
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| 10,980
|
MN385565.1
|
Sinsheimervirus phiX174
|
Jaschke,P.R., Dotson,G.A., Hung,K., Liu,D., Endy,D.
|
Macquarie University, Molecular Sciences
|
Australia
|
2019-09-18
| null |
Sinsheimervirus phiX174
|
Sinsheimervirus
|
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 5,386
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Sinsheimervirus phiX174, complete genome
|
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|
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|
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|
Kula,A., Saelens,J., Cox,J., Schubert,A.M., Travisano,M., Putonti,C.
|
Loyola University Chicago, Bioinformatics, Biology & Computer Science
|
USA
|
2018-07-21
| null |
Sinsheimervirus phiX174
|
Sinsheimervirus
|
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 5,386
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Sinsheimervirus phiX174 strain evolved J3 line, complete genome
|
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|
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|
Sinsheimervirus phiX174
|
Kula,A., Saelens,J., Cox,J., Schubert,A.M., Travisano,M., Putonti,C.
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Loyola University Chicago, Bioinformatics, Biology & Computer Science
|
USA
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2018-07-21
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Sinsheimervirus phiX174
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Sinsheimervirus
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Microviridae
|
ssDNA(+)
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|
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| 1
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|
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MH378443.1
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Sinsheimervirus phiX174
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Kula,A., Saelens,J., Cox,J., Schubert,A.M., Travisano,M., Putonti,C.
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Loyola University Chicago, Bioinformatics, Biology & Computer Science
|
USA
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2018-07-21
| null |
Sinsheimervirus phiX174
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Sinsheimervirus
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Microviridae
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ssDNA(+)
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GenBank
| 1
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Sinsheimervirus phiX174 strain evolved J1, complete genome
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| 69,864
|
LC629500.1
|
Siphoviridae sp.
|
Hiraoka,S., Sumida,T., Hirai,M., Toyoda,A., Kawagucci,S., Yokokawa,T., Nunoura,T., Takaki,Y.
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Deep-Sea Bioresource Research Group, Research Center for Bioscience and Nanoscience ; Natsushima-cho 2-15, Yokosuka, Kanagawa 237-0061
|
Japan
|
2021-05-08
|
CM1_5m.V46
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 48,474
|
GenBank
| 1
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Pacific Ocean
|
Pacific Ocean
| null | null |
2019-09-02
|
SAMD00291119
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PRJDB11069
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MAG: Siphoviridae sp. CM1_5m.V46 DNA, nearly complete genome
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| 42,258
|
LC629519.1
|
Siphoviridae sp.
|
Hiraoka,S., Sumida,T., Hirai,M., Toyoda,A., Kawagucci,S., Yokokawa,T., Nunoura,T., Takaki,Y.
|
Deep-Sea Bioresource Research Group, Research Center for Bioscience and Nanoscience ; Natsushima-cho 2-15, Yokosuka, Kanagawa 237-0061
|
Japan
|
2021-05-08
|
CM1_5m.V65
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 43,430
|
GenBank
| 1
|
Pacific Ocean
|
Pacific Ocean
| null | null |
2019-09-02
|
SAMD00291138
|
PRJDB11069
|
MAG: Siphoviridae sp. CM1_5m.V65 DNA, nearly complete genome
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| 42,260
|
LC629524.1
|
Siphoviridae sp.
|
Hiraoka,S., Sumida,T., Hirai,M., Toyoda,A., Kawagucci,S., Yokokawa,T., Nunoura,T., Takaki,Y.
|
Deep-Sea Bioresource Research Group, Research Center for Bioscience and Nanoscience ; Natsushima-cho 2-15, Yokosuka, Kanagawa 237-0061
|
Japan
|
2021-05-08
|
CM1_5m.V70
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 39,982
|
GenBank
| 1
|
Pacific Ocean
|
Pacific Ocean
| null | null |
2019-09-02
|
SAMD00291143
|
PRJDB11069
|
MAG: Siphoviridae sp. CM1_5m.V70 DNA, nearly complete genome
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| 42,262
|
MN855585.1
|
Siphoviridae sp.
|
Deboutte,W.
|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
306
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 40,087
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Apis mellifera
| null |
2012
|
SAMN13135889
|
PRJNA579886
|
MAG: Siphoviridae sp. isolate 306, complete genome
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AAACAGGTGTGAAGGCTCGCCGGATTATCCAGATTGCAGAGCTGAAAACGGAAAGCCGCATCCGGTGACAGGTTCTAATGAGCTGTA
| 52,443
|
MN855587.1
|
Siphoviridae sp.
|
Deboutte,W.
|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
137
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 15,037
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Apis mellifera
| null |
2012
|
SAMN13135889
|
PRJNA579886
|
MAG: Siphoviridae sp. isolate 137, complete genome
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| 52,445
|
MN855590.1
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Siphoviridae sp.
|
Deboutte,W.
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KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
185
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Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 12,499
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
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Apis mellifera
| null |
2012
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SAMN13135889
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PRJNA579886
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MAG: Siphoviridae sp. isolate 185, complete genome
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| 52,448
|
MN855593.1
|
Siphoviridae sp.
|
Deboutte,W.
|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
195
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 11,265
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Apis mellifera
| null |
2012
|
SAMN13135889
|
PRJNA579886
|
MAG: Siphoviridae sp. isolate 195, complete genome
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| 52,451
|
MN855594.1
|
Siphoviridae sp.
|
Deboutte,W.
|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
197
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 10,999
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Apis mellifera
| null |
2012
|
SAMN13135889
|
PRJNA579886
|
MAG: Siphoviridae sp. isolate 197, complete genome
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AACGATTTTTAAAGATAAAGAGCATTCTTTAGCAGCGGTTATAAAGAGTAAGAGTTTTTAAAGGTTTGTATTTCTTGAGAATTAATAACTCTTTAGTAGGTATTGAAAAATAATTTTGTAAAATTAATAATTCTTAGGCAGCACTTTATATAGTAGTACCTAAATTTTTGAAGTAAATAATTTAAGGGGGTGGGGGTACCTCCTTTTTTATTTAAGTTACTCCAGCGTTTACGTTTTAAAGACTTTTAAGAGAAAAGAATTATTAACCCTAGGTTAGAATAGTATGCAGTACCTAGGGGTAGCCACTGGGAAAATTAAGGGGGCAGGGGGTGCATCAAAGATTGTCAGAATAAGGCTTTAGGTAAAAATTAATTGCCGTAAGTATCTTTTTTTAATTAGGGGATCACGCCCAAAGAAAAAAGTTGCTCAAGTAAAAAAATTGTGTTATAATAAAATAATTATGAAGTTATAGGCTATTTATTTTTTTGACGTACGCATTTATTATCATAATTATATGTTAATGATAGCGTCATGTATACTTTATAGAAATAAGTTCTATAAAGTATGCAACATACCAGTTGACTCCCTATAGTTTCATAAAGGTTTGAGAAAGTCCTAACTTAATTGTTGGGGCTTTTTTGTTGTCTTAATAAAGAAAGGCTTGACAAGTAACTACAGTGTGTTATGATGAAGTAGTAATAAAGGTTAGGTAATACTTTATTACATGATACTTACGAAGCTATATAATATTACCTTATGCGATCTGGCAATTTAAATTAATAAATGTACAACCAAAAGTAAGAATTCAAAATAATAAAGTATTTACTTTTATTTACTCCTTTTATTTTTTATCTTCGTAAGTATTAAAAGCCCTAGCTTGACCCTAGGACTTTTTTTATTGCCTTAAAAAGTATTGCTTAAGTAACGACAGTGTGTTATAGTAAGAATGTAATAAAGCTTTGGGTAATTGCTTTATTACTTTGCCTTTTGACTGTGAATGGATTTTGTTGTGTTTACACACTTACACTAGGGGTCATCTCCTTGAGAAAGATCAGAGAAAGTCTTAGTAATTAGTCTAGGGCTTTCTTTTTTTATGCAGCAAGTGGTCATCAAAAAGATCTAGAAAGTACTTGACAATAACCCGTAATATGATATACTGAGAATGTAATAAAGTTAGCCCTTAATAATAACTTTATTAACATCAAAATCATCACTATTTTTGCCTAGTTAAGTTAAGGGACAATTAGCTAGTGACCATTAATGGCTGTTATTTCTTTATTACAGCGGTAATTGTTATAATTTTTTTCTTTTTCGTTTAGTTTCATTTTAATTACCTCGGCAATTACCGCGAACCCCAATATTAATTTATTGGGGTTCTTTTTTGCTTAAAAACAGATTAGAAAAATGAATAAAAAATGTAATTAAAGCTTGACTTTTCAGGCAATTATGTTAAGATAAAGATGTACCTAAATATAGGTACATTGGGTTATTTTTGGTTAATTGGGTTTGGCTAGAGTCCGTTAACTTAGGGGGAGATACTATAGATAAATACGATAATTATTGAATATATAAAGAGATAGCCTAGGAAAAAGCTTTCAACAGCCCGAAAGCTTTTTTTGTGCCTAGATGTTTAATTATACATATTACTGGCAAGAATACAATTAATAAGCTTAGAAAAAAGCTTGCAACCATCAATAACTGTGTTATAATAGAGTTGTTATTGAGGAGGTTCAATAACAAAATTATTACTAAAAGAACAGTAATAATTGAAGACTTATAATAACTAGTTTTATTTCAGTTGTTCCGTTTATTATTTTTAACCAAAAAAGACAAGTATTAAGAAAAGCGGTGATCTGAGAAGTAAAAACTATTTAGTGTGTACTAATTTAATTGCGGCAAACTCTTTTATATTATTTTGGGCAAAAATGTAATGGTGTTTTTTATTTGTTGCGTATATTAATTACTAATCCCTATGGTGTCTATTATTTAACCAACAAGTAAAGGTGGCAATAATGCAACCGACAATTGCTAATACTTGCCGCAATTAATTAAAAGGACTTTACTACTAGTAAGGTAAAGCCTTTTTTATTTATAACGATCTTGTAACTACTAGTAACTAGTTATATAATAAGCATGTAGGCAAAGATTTTGCTTATATGAGGAACAATTAATATCGCCTGAAGACTTTATCATTGGGGGTAAAGTCTTTTTATTTACTTAAAATAACCTTGTAATTACTGGTAATTGATTGTATAATAAAAATGTAAACAAACTTATTGTTTACTTTGAGAAAAGACAGCAACATGTTTTATACTTCCGTGGGTGGCTAACAAGTAAAGGACTTAACCAATAATAAAGTTAAGTCCTTTTTGCTTAAAACCTTGTAATTATTGGGAACTAGTTGTATAATAAGAATGTAAGCAAAATTATTGCTTACCGATAAGGTTTGAAAGGATCTTTAGAAATATTTTCATGTAGTTATTGTAGAATATATTAATGTCTGTTATTTAACCACCAAGTAAATAAAGCAATTATACATTCTACAATTAAATTTGTTAATATGGTTAGCAACATTTAGGACTTTACTAATAACAAGATAAAGTCCTTTTTGTTTATAATGATCTTGTAATTACCTTTATTTAGCTGTATAATAAAACTGTAGGCAGTAGCTTTGCTTACGTTGGTAACTGATAACTGGTAAATATATATTATTATGCAATGAAGCAGTAGAAACTCCGTAATTTAGTTACGGGGCTTTTTACTAATCAGAAACAATAATAACTAATTATTTCCTGTGTACGCTAAATAATTCACGACTACAGAGTTTTAATTCTAATTTAGGGTAATTAGCTTAAGCAAGAACAAAAGCCCTCAGATCGTTAAAATTTACGTTTTAAGGAGGTGGGTAAATTGTGGCTGGTAAGAATAAGTCAAGATCTGCATAATTTAATTATGAAGGTAATTAATAAAGTCTTTCATAAGACTAGTAACAACCCAGTAACTGATAGGCAACCAGCATTTACTCAAGACTGGCTACATGTAGGCAGCGACCTAAAGAATAGTATTCTTACTTACGATAAAAAAGATAAGAAATAGCTTGACCCCTTAATAACTAGGTGTTATTATAATGATGTACCAATTAATAAATATCTTTTGGATTTCTTTTATTTATTGTGGTACTCCTTTTTTAATATGTAAAAATAAGGTGCTTCTGACTGATCATCACACCTTATTTTTTTGTATTAGTTACTTGACTTACTGAGTAATTTTTGTTATTATAATAATGTACTTAATAGATAGTTGCCAGACTTATTTATTAAGTACCTGGATTTTACCTATTAACTTTTTTTATCATAGAGTTCTCTTTACTAAAATAAGGTGCAATAACACACCTTATTTTTTTGTCTTAAGAATAGCTTTATTTATTGATGTTCTTTAGACGGCTTATTTTAACGTTTCTGGGGCTTTTAAACTTAACGGGTGTAATTACCCTAGAAACTAATTAAAAACCCGCCAGCGTTAAATTAGGTGGGTAATTATTGAGGATAATAAAAAAGCTACCATAACTGGCAGCCAACTAATAATTTACTTGTAAGGTGTAAACTTATAAACTGATCTAACTTCCATGGCGGTAATGATATCAAAGAACCAGTTATATTTACTTAACTTATCTTTGTTAGACGCTTTAGCTAGTTCTTTTAAGCAGACAATACAAGTAAGAATAGCTTTTTGAAATGTACCGCTTACCTGATTAAAAATAACTTGTTCTAACTCTGGATCGCCTTCATTCTTCCAAAAATACGGTAACATGATGTGGGGGCAATCTTCGGTTAAGTTAATAACTAAAGCTTCCAATACTTCAATTTTAACTCTAAAATAGGGTTTAAATAACTCTAGCAACTCTTGTTCTTGATAACTGAGTAATTCACTTGCTAAAGCTTGCGTCTTTTGTTGTAAATTCTTCTTACTAGTAATTTTAATATAATCTTGTAGTGCTTGTTGTACTTCAGTATTCATTCTTAATTACCTCTTTTTCTTGATTACAATTACAGTATAATCCATTACATGGTTATTGTCAATAGTAATTTAAAGCTTATTAGAATAACTTTTTAGGGAAGTAATTAAGGCTTTTCTGTTGACAATAATTTATTTTGTGCTATAATTAAGATAATAAAAGAAGAACTTAGCAAGGCCAAGGGGGTAATCCGTGGTCTTTTTTAAGAAGACAGATTCCCTCAGAGTTTAGCTGTTTAGACTCCCCGTTGATGTGAGACTCCGCGTTTGTGATATGTGGCGCTGGTGCTAGTGGTTCGTTGCTGCTTACTGCTTAAATTGTCAATGTACCTGTAGCCTTATCCTTGCTACAATTATAGTATAATCCATTAAATAGGTATTGTCAACAGTTATTTACTACTTTTTTAAAGTTTTTTGTAATTGGTATAGGTGAATTTTTGAGGTTTCGCCCCCTGTGAAATATTTACTCCCAGTTCTTTAAAAGCCTATGATTACAAGGAGTAATTTTTCCCGCTTTTTTACCCAGTTCCTAGAATAAAAAATTGGTATAGTTATATTTCCCTAATAACTATACCTTTTTATAATACATAGTAATAAACATCAATAACTGTCTTACCGTCGGGGGCGTATTTAGTAACCTCAAATAACCGTTGGGTAATCATCACTATTGATCGTGTCTTGATGGTAAACAAAGAACCATCTGTTAATAACCCCGTAAAGGCTTCTTTATTAGCATAATTAGGGTTGTTGATGTTCTGGTTTAATTCTTGATTATAAGTGGCAACTGCTTCAGTAATTGAAGGATAGATCGTTATCTGGGGCGTTAAACGCTTATTATAACTATTAAGTAGTTCTTTAATTAACTTCTTCATTCTTGCGCCCCTTTCTGATTGATGAATAGTAATTACTTAATAACCAGTCATTAACTGGCTGCTAACTTCCCTAGTAATCGCCTAATTACTAATTAGTTACTAGGTAATTACTAG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| 52,452
|
MN855596.1
|
Siphoviridae sp.
|
Deboutte,W.
|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
223
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 9,985
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Apis mellifera
| null |
2012
|
SAMN13135889
|
PRJNA579886
|
MAG: Siphoviridae sp. isolate 223, complete genome
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|
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|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
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27
|
Caudoviricetes sp.
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|
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Belgium
|
Belgium
|
Apis mellifera
| null |
2012
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|
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|
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| 52,457
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MN855601.1
|
Siphoviridae sp.
|
Deboutte,W.
|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
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2020-04-09
|
315
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 7,743
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GenBank
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Belgium
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Belgium
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Apis mellifera
| null |
2012
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SAMN13135889
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PRJNA579886
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MAG: Siphoviridae sp. isolate 315, complete genome
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MN855602.1
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Deboutte,W.
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KULeuven, Microbiology and Immunology
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Belgium
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2020-04-09
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316
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dsDNA
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GenBank
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Belgium
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Belgium
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Apis mellifera
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2012
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SAMN13135889
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KULeuven, Microbiology and Immunology
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Belgium
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2020-04-09
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Belgium
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KULeuven, Microbiology and Immunology
|
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|
2020-04-09
|
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|
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|
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Belgium
|
Belgium
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|
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|
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|
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|
KULeuven, Microbiology and Immunology
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|
2020-04-09
|
42
|
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Belgium
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|
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|
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|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
432
|
Caudoviricetes sp.
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| 6,020
|
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Belgium
|
Belgium
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|
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|
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|
MN855609.1
|
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|
Deboutte,W.
|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
454
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 5,857
|
GenBank
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Belgium
|
Belgium
|
Apis mellifera
| null |
2012
|
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|
PRJNA579886
|
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|
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|
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|
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|
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|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
60
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 5,021
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Apis mellifera
| null |
2012
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SAMN13135889
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PRJNA579886
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MAG: Siphoviridae sp. isolate 60, complete genome
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|
MN855614.1
|
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|
Deboutte,W.
|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
217
|
Caudoviricetes sp.
| null | null |
dsDNA
| 10,582
|
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Apis mellifera
| null |
2012
|
SAMN13135889
|
PRJNA579886
|
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|
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|
MN855615.1
|
Siphoviridae sp.
|
Deboutte,W.
|
KULeuven, Microbiology and Immunology
|
Belgium
|
2020-04-09
|
320
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Caudoviricetes sp.
| null | null |
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GenBank
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Belgium
|
Belgium
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| null |
2012
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MAG: Siphoviridae sp. isolate 320, complete genome
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| 52,473
|
BR001669.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern1_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 44,163
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern1_CT89 DNA, nearly complete genome
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TTTTCCCCGGAGGTAGGTTTGGGCACACCGAATCCGGGTTTCGGATAAGACAGGACGACCTGTGTCGTTGGGGTCTTCTTGCGTTCGTTCCTTTCTACCCAACGAGGGGTACGCAAGTCGTCCTGTCCTACCTGAAACCCGGATTCGGAAACAGCAAAGGAACCCGGAATAGGAGAGAACTCCGTGGCAAGGGCCAAGAAGTCACCCAGAGGACGGGCCGCCACTCCGGAGCAGCAGGAGAATCAACTCATTTCGCTCGCAGTCCAGCGAGCCGAGGAGATGCTACTGGACGGCACGGCTCCTCCTTCCATCATCACGCACTACCTCAAGCTCGCCACGAGCCGAGAGCGGTTGGAGCAGGAGCGAATCAAGGCCGAGAACGACATGCTCAAGGCCAAAGCCGACGCTCTGGCGGCCTCAGCACGAGGGGAGGAGGCCTACAAGGAGGTTCTCGAGGCATTCAAGTCCTACGCCGGAGGAGGTGTGGGTCTTGAGTCGGATTCGGACCTACCATGAACTCTCTCGCATCGAATCCTTCGAGGAACGGTACGAGTACCTACGTCTCAATCAGGATCCAGGGGATCAGACCTTCGGTTTCGAACGGTATCTGAACCAATCCTTCTATCACTCGACCGAATGGCGTCAAGCAAGGCAGAAGGTCATCCTAAGAGACGACGCATGCGACCTCGGGGTCCCGGGTCACGACATCTACGGTAAGATTCTTGTTCATCACATGAACCCGATTCGGCCCGAGGACCTCGAGGGAGAGTTTAATCCCGACATCCTCGACCCCGAATACCTGGTCTGCGTGCGACACGACACACATAACGCGATTCACTTCGGCGACGCGAGCCTGTTACCCAAGCCTCTAGTCGAGAGAACGCCGAACGACACGATACCCTGGAGGTGACCGTGGCTGATTCGATATTGAATGACATCAAGAAGGCTCTCGGCATCACCGAGGACTATACGGCTTTCGACCAGGAGATTATTCTCCACACAAACACGGCGCTCATGTTCGCAGAGGAGATCGGTCTCCCCTCGTTCAAGATCGCCGGAAAGACAGAGACCTGGGACCAGTACCTTAGTGGCGTCACGAAGAACGTTGAGGCCGTCAAGACGTACCTGTACCTGCAAGTGCGGCTCGTATTCGACCCGCCCGCTAACTCTTTCGTCGTAACGGCGATCGAGAAGCAGCTTCAGGAATACGCCTGGCGTATCAACCTGCAGAAGGAGACTCCATGAGCGACCAACTCATGCACTACGGGGTCAAGGGGATGCGTAAGGGCGCTCGAAAGAGCCGTGAGCAGCGGAATGCTGAGCGCCGCGCCAAGTATGAGGCCAAGCTCAAAGCCAAGTATGGCGACCACGACATCGCTACGATTGAGGCCTTCATCAAGAAGCGCAAGGCGCAAGCAAAGGCAGCCAGGGACTGGCGTCTCGGCAACCAGCGCAACCGTCAACTCACCGCTACCGAGCGTCGAGAGAAATATTACAACGAACTCGACACCGGCCAGCTGGGTAAGACCTACGCAACCGATGCAACTCTCGCTGAAGCCGCTCGTAGATACTACAAGAAGGGGCATAACAAGCGAATGGGTCATTCGGAGCTGATGCATTACGGCGTCAAAGGCATGAAGTGGGGCGTTCGCCGCCGTGCTCGTCGTGACGCCAAGGAATTCACCCAGGCCAAGATGTATTACGGCGAGGGAGCGGGTAATCGGCGGAAGCTGATCAAGGCAACAGTCAAGGCCCGCTCGAAGGATCCGTTCTACAAGAGCGAATTCGACAAGGCCGTCGCCAATACCGACATGTCCAAGCGGGCTTCCCAGGCTCGAAGGCAGCGCGGTCGTAAGAACGCCCGAAATTCCGCAGGCAAGACTGTTCGCGGAGTTGGTAACATCGCTTCGGGAAATGCCGGTCGGGCTGGAGGCGCCCTGTTTCTCGGTTATCTGGGGTATCAGGGGGCTAAGGCCGCTGGGATCGCTCCCACCGAGAAAGAGTTGCTCACCAAAGCCGTTAAGGGGGCGAAGAAGATCAAACGAGTTGTCCAACACGACGATGTTCTCGCTCACTACGGCGTCAGGGGAATGCGCTGGGGAATCCGCAAGTCCCGCATCAAGGGTGCGAAGAGGTGGACTTCCAAAAAGCAGGCCAAAATAGATGGCATGTCCGATGATCAGCTCAGACGGGTCAACAACCGCCTTCGGTTAGAGAAGGAGTACCGTCAGCTGACCCAGACTCGGATGGAGCGCTACCGCGCCAAGGCGGGGAAGGTGGTCGAAGAGGCCGCAGCCAACACTCTGCAGAACGCACTTCAGAAGAATCTTAAGAAGGCTGCCAGCCTGGGCGGATCGGCCGCCATCAAGGGCGCCAAACGGTTCAAGAAATAGGATTAGGACATGACTGACAACCTGTTCTTCATCGACGAGGACGAGGTCCTCGCACACCACGGCGTCAAAGGCATGAAGTGGGGCGTTCGCAAGCAGCGAGCCGCTTCCGGAGGCGCCGGATCAACCAAGAAGCGCAAGGGACTCTCTCGCAAGCAGAAAGCGGCCATCGCCGGCGTTCTCGGTACGGCTGCTGCAGCTGGCGCTGGGTACTACCTGCACAAGTCCGGCAAGGGCAAGCAGCTCGCAGGCCTGGCTAAGAAGGGCGGGGCTTCTGCCAAGAAGTACGCCCAGGGTAAAGGTCGTAACCTAGGCGCTCAGGCTCGAGTCAAGACAGCGCAGGCCAAGCGACAGGCACGGGCCTTCGGTAAGGACGCTAAGAACTTCGCCGGAGCTCAGGCGGCGCTTGGCAAGTTGATGGTGGCCGATACTAAGCGGCGCGCCAAGGCAGCTGCTTCGAAGCTGAAGTATTCCAAAGCCGGCAAGTACGCCGAGGCTACTCGTCTCGCCGCCAATGCAGCCGCATTTAAGACGGGTAACGCGGCTCGTTCCGCTGGCTTCAGGGCCAAGCAAGGGGCGTGGAAGGTCGGCAATAAGGCCCGCAGGGCAGCTACAGGCGGCGTCAGGGCCGCAGCGGGTTCCGCTAAGTCCAAAGTTGGGGCAGCGGCAGGGGGCGCGGCTAAGTCTACAGCCAGCGCAAAGACTCCGGGTAAGGCTCTTCAGGTTAGCTCCCGCGCGGTTGGATACAGGAAGCTCCACACTAGTGGAACCAAGGTCGTTAGGCCCAAGGGCGCTGCTGCCGACAAGCTCGTCAAGGCCTCTGTCGCCGGACTTGCTACCGGCGTGGGAGGGGGCGCGCTCCAGTATGCCGCCCTGAAGGCCATGAGCGGCGGTAAGAAGAAGCGCGGACGCTCCAGGAAGCGTCGTCGCTGACCATGTTCTCCAATACCGCTACCCCGCGATATTACGCCGAGTTCAGAGAAGATGTCCTTGCGGGCAAGATTCCGATCTGCAAGGAGATCGAGATGGAGATGAATAGGATCGATGATCGGATTCGCAATCCCGGTTTTTATTACGATAGCGACGCTGTGGAGGGGTTCATCCGCTTCGCGGAAGCGGAGATGACTCTAACCGACGGATCCGATCTTCGACTCCTACCGAGCTTCAAGCTCTGGGCCGAACAGATCTTCGGATGGTGGTTCTTCACCGAGCGATCGGTCTACGTCCCGAACGAGACGAAGGCCGGCGGCCACTTCGAGAAACGCCGGGTGAAGCAGCGCCTCATCAACAAGCAGTACATCATCGTCGCCCGAGGCGGGGCGAAGTCTTTGTATGAAACCCTCCTTCAAGCCTACTTCCTCACAATCGACACGTCGACCACCCACCAGGTGACGACCGCGCCGACGATGAAGCAGGCTGAGGAGGTCATGCAGCCCTTCCGCACTGCCATCACAAGGGCCAAGGGACCCCTGTTCGATTTCATGACTCAAGGGTCTCTCCAGAACACGACCGGCAGTCGCGCGCTCAGGCAGAAGCTCGTCCCCACCAAGAAGGGGATCGAGAACTTCATGACTAACAGCCTGCTTGAGGTTCGACCCATGTCGATCGATAAGCTCCAGGGCCTTCGCACCAAGATGAACACAGTGGACGAGTGGCTCTCGGGCGATATTCGTGAAGACGTGGTCGGCGCCATCGAGCAAGGTGCGTCCAAGGTCGACGACTGGCTTATTCTGGCAGTGTCCTCGGAGGGCACCGTCAGGAACTCAGCCGGCGACAACATGAAGATGGAGCTCCTCAACATTCTTCGAGGAGAGTACTCGGATCCCCACACTTCCATCTTCTACTACAGGCTCGATGACCTCAAGGAGGTAGGGGATCCGTCGACCTGGCTGAAGGCCCAGCCAAATCTCGGGGCCACTGTCTCCTACGAGACATATCAGCGAGACGTCGAAAGGGCAGAGCACGTGCCGGCGGCTAGGAACGACATCCTGGCCAAGAGGTTCGGCATTCCCATGGAGGGGTATACATACTTCTTCACCTACGAGGAGACCCTGCGACACAACCGTCAGGACTTCTGGGGTATGCCTTGCTCCATCGGCGTCGACCTGTCGCAGGGCGACGACTTCACCGCCTTCACATTCTTGTTCCCCCTCAGCCGGGGCAGGTTTGGTGTCAAGACGCGCTGCTACATTTCCGAGCGAACCATGCTGCGCCTCCCGGGAGCCACTCGTCAGAAGTACGAGGAGTTCCTGCAGGAGGGCTCGCTCATGGTGCTCGAGGGTACGGTTCTCGACATGATGAACGTCTACGAAGACCTCGAGGCGTTCATCGCCGACTGCGAGTACGACGTGCGCTGCCTGGGCTTCGACCCGTACAACGCCAAGGAGTTCGTGACTCGCTGGGAGAACGAGAACGGGCCGTTCGGCATCGAGAAGGTGATCCAGGGAGCCCGGACCGAGTCCGTGCCCCTCGGCGAGATCAAGGACATGGCGGAGGATCGCAAGCTCCTCTTCGACCAATCCATGATGACCTTCACGATGGGGAACGCCATCACCCTGGAGGACACCAACGGGAACCGCAAGCTCCTGAAGGCCCGACGGGAGAACAAGA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Japan
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2020-10-06
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Modern2_CT89
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Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 44,100
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern2_CT89 DNA, nearly complete genome
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|
BR001671.1
|
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|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern3_CT89
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Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
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GenBank
| 1
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MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern3_CT89 DNA, nearly complete genome
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Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
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Japan
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2020-10-06
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Modern4_CT89
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Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,988
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern4_CT89 DNA, nearly complete genome
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Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
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Japan
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GenBank
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MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern5_CT89 DNA, nearly complete genome
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| 46,495
|
BR001674.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern6_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,341
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern6_CT89 DNA, nearly complete genome
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| 46,496
|
BR001675.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern7_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 44,204
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern7_CT89 DNA, nearly complete genome
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BR001676.1
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Siphovirus LN-2020-1
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Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
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Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
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Japan
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2020-10-06
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Modern8_CT89
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Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,686
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern8_CT89 DNA, nearly complete genome
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AAATGGCCCACCCCCCGTCATCGGCCCGCACCTCGCATTTTCCCCGGAGGTAGGTTTGGGCACACCGAATCCGGGTTTCGGATAAGACAGGACGACCTGTGTCGTTGGGGTCTTCTTGCGTTCGTTCCTTTCTACCCAACGAGGGGTACGCAAGTCGTCCTGTCCTACCTGAAACCCGGATTCGGAAACAGCAAAGGAACCCGGAATAGGAGAGAACTCCGTGGCAAGGGCCAAGAAGTCACCCAGAGGACGGGCCGCCACTCCGGAGCAGCAGGAGAATCAACTCATTTCGCTCGCAGTCCAGCGAGCCGAGGAGATGCTACTGGACGGCACGGCTCCTCCTTCCATCATCACGCACTACCTCAAGCTCGCCACGAGCCGTGAGCGGTTGGAGCAGGAGCGAATCAAGGCCGAGAACGACATGCTCAAGGCCAAAGCCGACGCTCTGGCGGCCTCAGCACGAGGGGAGGAGGCCTACAAGGAGGTTCTCGAGGCATTCAAGTCCTACGCCGGAGGAGGTGTGGGTCTTGAGTCGGATTCGGACCTACCATGAACTCTCTCGCATCGAATCCTTCGAGGAACGGTACGAGTACCTACGTCTCAATCAGGATCCAGGAGATCAGACCTTCGGTTTCGAACGGTATCTGAATCAATCCTTCTACCACTCGACCGAATGGCGTCAAGCAAGACAGAAGGTTATCCTCAGAGACGACGCATGCGACCTCGGGGTCCCGGGTCACGACATCTACGGTAAGATTCTTGTTCATCACATGAACCCGATTCGGCCCGAGGACCTCGAGGGAGAGTTCAATCCCGACATCCTCGATCCCGAATACCTAGTCTGCGTGCGACACGATACACATAACGCGATTCACTTCGGCGACGCGAGCCTGTTACCCAAGCCTCTAGTCGAGAGAACGCCGAACGACACGATACCCTGGAGGTGACCGTGGCTGATTCGATATTGAATGACATCAAGAAGGCCCTCGGCATCACCGAGGACTATACGGCTTTCGATCAGGAGATTATTCTCCACACAAACACGGCGCTCATGTTCGCAGAGGAGATCGGTCTCCCCTCGTTCAAGATCGCCGGAAAGACAGAGACCTGGGACCAGTACCTTAGCGGCGTCACGAAGAACGTCGAGGCTGTCAAGACGTATCTGTATCTGCAAGTGCGGCTCGTATTCGACCCGCCTGCGAATTCCTTCGTCGTGACGGCGATCGAGAAGCAGCTTCAGGAGTACGCCTGGCGTATTAACCTGCAGAAGGAGACTCCATGAGTGACCAACTCATGCACTACGGGGTCAAGGGGATGCGTAAGGGTGCTCGGAAGAGCCGTGAGCAGCGGAATGCCGAGCGCCGCGCCAAGTACGAAGCCAAACTTAAGGCTAAGTATGGCGATCATGACATCGCTACGATTGAGGCCCACATCAAGAAGCGCAAGGCGCAAGCAAAAGCGGCCCGGGACTGGCGTCTCGGTAACCAGCGCAACCGTCAGCTCACCGCTACCGAGCGTCGAGAGAAGTATTACAACGAACTTGACACCGGTCAACTGGGCAAGACCTATGCAACCGATGCAACTCTCGCCGAAGCCGCTCGTAGGTACTACAAGAAGGGGCATAACAAGCGAATGGGCCATTCGGAGCTGATGCATTACGGCGTCAAAGGCATGAAGTGGGGCGTTCGCCGCCGTGCTCGTCGTGACGCCAAGGAATTCACCCAGGCCAAGATGTACTATGGCGAGGGTGCCGGCAATCGGCGAAAGCTGATCAAGGCAACCGTCAAGGCCCGCTCAAAGGATCCGTTCTACAAGAGCGAATTCGACAAGGCCGTCGCTAATACCGACATGTCCAAGCGGGCTTCTCAGGCTCGAAGGCAGCGCGGTCGTAAGAACGCCCGCAATTCCGCAGGCAAGACCGTTCGCGGCGTTGGCAACATCGCCACTGGGAACGTCAGTCGGGCCGGAGGCGCACTGGCTCTCGGTTATCTGGGGTATCAGGGGGCTAAGGCTGCCGGTATCGCTCCCACCGAGAAAGAGCTACTTACCAAAGCCGTTAAGGGTGCAAGGAAGATCAAGCGTGTCGTTCAGCACGATGATGTTCTTGCCCATTACGGCGTCAGGGGTATGCGCTGGGGGATCCGCAAGTCTCGTATCAAGGGTGCGAAGAGGTGGACTTCCAAAAAGCAGGCCAAAATAGATGGTATGTCCGATGATCAGCTCAGACGGGTCAACAACCGCCTTCGGTTAGAGAAGGAGTACCGTCAGCTGACCCAGACTCGGATGGAGCGCTACCGCGCCAAGGCGGGGAAGGTGGTCGAGGAGGCCGCAGCCAACACCCTGCAGAACGCAATCCAGAAAGGGCTGAAGAAGGCGGCTAGCCAGGGCGGATCCGCTGCTATCAAGGGCGCCAAACGGTTCAAACGGTAGGACTATGACATGACAGACACACTGTTCTTCATTGACGAGGACGAGGTCCTCGCTCACCACGGCGTCAAAGGCATGAAGTGGGGCGTTCGCAAGCAGCGAGCCGCTTCCGGAGGCGCCGGATCAACCAAGAAGCGTAAGGGGTTCTCTCGTAAGCAGAAAGCCGCTATCGCCGGCGTTCTCGGTACGGCCGCTGCCGCTGGCGCTGGATACTACCTGCACAAGTCCGGCAAGGGCAAGCAGCTTGCAGGCCTGGCCAAGAAAGGCGGAGCCTCGGCTAAGAAGTATGCCCAGGGTAAAGGTCGTAACCTAGGCGCTCAGGCTCGAGTCAAGACGGCGCAGGCCTTCGGTAAAGACGCCAAGAACTTCGCCGGAGCTCAGGCGGCGCTTGGCAAGTTGATGGTGGGCGACACTAAGCGGCGCGCTAAGACAGCGGCTTCGAAGTTGAAGTATTCCAAGGCCGGCAAGTACGCCGAGGCCACTCGTCTCGCCGCCAACGCTGCTGCATTCAAGACTGGTCACACAGCTCGCTCCGCCGGTTTCAGGGCCAAGCAAGGTGCATGGAAGGTCGGTAATAAGGCCCGCAGGGCAGCTACAGGCGGCGTCAGTGGAGCGAAGTCTGCAGCTGGTATGGCCGCGCGTTCAGCCAAGTCCAAGGCAGGCGCAGCAGCAAGCGCCGCCAGGGCCGCAGCGGGTTCCGCTAAGTCCAAAGTTGGGGCAGCGGCTAAATCCACAGCCAGCGTGAAGACTCCCGGCAAGGCCCTTCAGGTCGCCCCTCGTGGCGTTGGTTATAGGAAGCTCTACACCACCGGAACCAAGGTTAAGGCTGGAAAGGGCGTCGGTGCTGATAAGCTCGCCAAACGTGCTGCCCTCGGACTAGGCGTCGGAATAGGCGCTAATGCGGCCGCAGCAGCAGCGGGCGCGGCTATCAACCGAAAGGCCGCCGGCGGTAAGAAGGGTGGCCGCTCTAGGAAGCGCCGCCGCTGACCATGCTGTCCAATACCGCTACCCCGCGATATTACGCTGAGTTCAGAGACGATGTCCTAGCCGGTCGGATTCCGATCTGCAAGGAGATCGAGATGGAGATGAATAGGATCGATGATCGGATTCGCAATCCCGGTTTTTATTACGATAGCGACGCTGTGGAGGGGTTCATCCGCTTCGCGGAAGCGGAGATGACTCTTACCGACGGATCCGATCTCCGGCTCCTCCCGAGCTTCAAGCTCTGGGCTGAACAGATCTTCGGATGGTGGATCTTCACCGAGCGATCAGTCTACGTCCCGAACAAGACGACGGCTGGCGGGCATTTCGAGAAACGCCGGGTGAAGCAGCGCCTCATCAACAAGCAGTACATCATCGTCGCTCGAGGTGGGGCGAAGTCTCTGTACGAAACTCTCCTCCAAGCCTACTTCCTCACTATCGACACGTCGACCACCCACCAGGTGACGACCGCGCCGACGATGAAGCAGGCCGAAGAGGTCATGCAGCCCTTCCGCACCGCCATCACGAGGGCCAAAGGTCCCCTGTTCGATTTCATGACTCAGGGGTCTCTCCAGAACACGACTGGCAGCCGCGCTCTCCGGCAGAAGCTCGTCCCCACCAAGAAGGGGATCGAGAACTTCATGACCAACAGCCTGCTCGAGGTTCGGCCCATGTCGATCGATAAGCTCCAGGGCCTCCGCACCAAGATGAACACGGTGGACGAGTGGCTCTCGGGCGATATTCGTGAAGATGTGGTCGGCGCCATCGAGCAGGGCGCGTCCAAGGTTGACGACTGGCTTATCCTGGCGGTGTCCTCGGAGGGTACTGTCAGGAACTCGGCCGGCGACAACATGAAGATGGAGCTCCTCAACATTCTTCGAGGGGAGTACTCGGATCCCCACACTTCCATCTTCTACTACAGGCTCGATGACCTCAAGGAGGTAGGGGATCCGTCGACCTGGCTGAAGGCCCAACCCAATCTCGGGGCCACCGTCTCCTACGAGACATATCAGCGCGACGTCGAACGGGCGGAGCATGTACCTGCGGCTAGGAACGACATCCTGGCTAAGAGGTTCGGCATTCCCATGGAGGGGTATACATACTTCTTTACCTACGAGGAGACCCTGCGGCACAACCGTCAGGACTTCTGGGGTATGCCTTGCTCCATCGGCGTCGACCTGTCGCAGGGCGATGACTTCACCGCCTTCACATTCTTGTTCCCCCTCAGCCGGGGCAGGTTTGGCGTCAAGACGCGCTGCTACATTTCCGAGCGCACCATGCTGCGCCTCCCGGGAGCGACTCGTCAGAAGTACGAGGAGTTCCTGCAGGAGGGCTCGCTCATGGTGCTCGAGGGTACGGTTCTTGACATGATGAACGTCTACGAAGACCTCGAGGCGTTCATCGCAGACTGCGAGTACGACGTGCGCTGCCTGGGCTTCGACCCATACAACGCCAAAGAGTTCGTGACCCGCTGGGAGAACGAGAACGGACCGTTCGGCATCGAGAAGGTGATCCAGGGAGCCCGGACCGAGTCTGTGCCCCTTGGTGAGATCAAGGACATGGCAGAGGATCGCAAGCTCCTTTTCGACCAG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| 46,498
|
BR001677.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern9_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,966
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern9_CT89 DNA, nearly complete genome
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Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
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Modern10_CT89
|
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GenBank
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MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern10_CT89 DNA, nearly complete genome
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Japan
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2020-10-06
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Modern11_CT89
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Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,918
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern11_CT89 DNA, nearly complete genome
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Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
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2020-10-06
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Modern12_CT89
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Siphovirus LN-2020-1
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GenBank
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MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern12_CT89 DNA, nearly complete genome
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TACGGCGTTAGGGGCATGCGCTGGGGAATCCGCAAGTCTCGCATCAAGGGTGCGAAGCGGTGGACTTCCAAAAAGCAGGCCAAAATAGACGGTATGTCTGATGATCAGCTCAGACGGGTCAACAACCGCCTCCGGTTAGAGAAGGAGTACCGTCAGCTGACCCAGACTCGGATGGAGCGCTACCGCGCCAAGGCGGGGAAGGTGGTCGAAGAGGCCGCAGCCAACACCTTGCAGAACGCGATTCAGAAGAGCCTGAAGAAGGCTGCTAGCAAGGGCGGATCCGCCGCCATCAAGGGCGCCAAACGGTTCAAGCAATAGGACTATGACATGACAGACACGTTGTTCTTCATCGACGAGGACGAGGTCCTCGCACACCACGGCGTCAAAGGTATGAAGTGGGGCGTTCGCAAGCAGCGTGCGGCTTCCGGAGGCGCCGGATCAACCAAGAAGCGCAAGGGGCTCTCCCGCAAGCAGAAAGCAGCCATTGCTGGCGTTCTCGGCACTGCGGCAGCCGCTGGTGCTGGCTACTACCTGCACAAGTCGGGCAAGGGTAAGAAGATCGCGGCTCTGGCCAAGAAGCATGGAGCCTCCGCTAAGGACTTTGCCAAGGGCAAGGGTCGTAATCTCGGTGCTCAGGCTCGAGTCAAGCAGGCCCAGGCCAAGCGGTTCGCTAAGGCTCAGTCTGCCAACGCCAAGGGCGCAGCTGAGAAACTGAAGACCACCAAGGCCGGCAAGTACGCTGAGGCCACTCGTCTCGCCGCAAACGCAGCCGCCTTCAAGACTGGTAACGCAGTCAAGGGAGCCGGCTACAAGGCCAAGAACCAGGCTTGGAAGGCTGGTAATAAGGCACGCAAGGCAGCTGAGGGCGGCGTCGGCGGTGTGAAGTCTTCGGCCGGCATGGCAGCCCGTTCGGCCAAGGCTGCGGCTGGTAAGGCGGCAGGGGCGGCTAAGTCTAAGTTTGGCAAACAGGCCGCTAAGGCTCCCGGTAAGGCGCTTTCGACTCATGTTGTTCAGCCCGGTAAGGGCGTCGGCTACAGGAAGCTCGCTACCACCGGAACCAAGGTCGTGAGGCCCAAGGGCGCCGCTGCTGACAAGCTCGCCAAACGTGCCGCCCTCGGACTAGGCGTCGGAATTGGCGCCAACGCGGCAGCAGCGGCAGCAGGCGCGGCTATCAACCGAAAGGCCAATGGTGGCGGTAAGAAGGGCGGACACTCTAGGAAGCGTCGCCGCTGACCATGCTCTCCAATACCGCTACCCCGCGATATTACGCTGAGTTCAGAGAAGATGTTCTTGCAGGCAAGATTCCGATCTGCAAGGAGATCGAGATGGAGATGAACAGGATCGATGATCGGATTCGCAATCCCGGTTTTTATTACGATAGCGACGCTGTGGAGGGGTTCATCCGCTTCGCGGAAGCGGAGATGACTCTAACCGACGGATCCGATCTTCGACTCCTGCCGAGCTTCAAACTCTGGGCTGAACAGATCTTCGGATGGTGGATCTTCACCGAGCGATCAGTCTACGTCCCTAACAAGACGACGGCTGGCGGCCACTTCGAGAAGCGCCGGGTGAAGCAACGCCTCATCAACAAGCAGTACATCATCGTCGCTCGAGGCGGGGCGAAGTCTCTGTACGAAACCCTCCTTCAAGCCTACTTCCTCACGATCGACACGTCGACCACTCATCAGGTGACGAGCGCGCCGACGATGAAGCAGGCCGAGGAGGTCATGCAGCCCTTCCGAACCGCCATCACAAGGGCTAAGGGTCCCTTGTTCGATTTCATGACTCAGGGGTCTCTCCAGAACACGACCGGTAGTCGCGCTCTCAGGCAGAAGCTCGTTCCCACCAAGAAGGGGATCGAGAACTTCATGACCAACAGCCTGCTCGAGGTTCGCCCCATGTCGATCGATAAGCTCCAGGGCCTCCGCACCAAGATGAACACGGTGGACGAGTGGCTCTCGGGCGATATTCGCGAAGACGTGGTCGGCGCCATCGAGCAGGGGGCGTCCAAGGTTGACGACTGGCTTATTCTGGCAGTGTCCTCCGAAGGTACCGTTAGGAACTCGGCTGGCGACAACATGAAGATGGAGCTCCTCAACATTCTTCGAGGGGAGTACTCGGATCCCCACACGTCCATCTTCTACTACAGACTCGATGACCTCAAGGAGGTCGGGGATCCGTCGACCTGGCTGAAGGCCCAACCCAATCTCGGGGCCACCGTCTCCTACGAGACATATCAGCGAGACGTCGAACGGGCGGAGCACGTGCCGGCGGCTAGGAACGACATCCTGGCCAAGAGGTTCGGCATTCCCATGGAGGGGTACACATACTTCTTCACCTACGAGGAGACCCTACGGCATAACCGTCAGGACTTCTGGGGTATGCCATGCTCCATCGGCGTCGACCTGTCGCAGGGCGATGACTTCACTGCCTTCACATTCTTGTTTCCTCTCAGCAGGGGCAGGTTTGGTGTCAAGACGCGCTGCTACATTTCCGAGCGCACCATGCTGCGCCTTCCGGGAGCCACTCGCCAGAAGTACGAGGAATTCCTACAGGAGGGCTCGCTCATGGTGCTCGAGGGTACGGTTCTTGACATGATGAACGTCTACGAAGACCTCGAGGCGTTCATCGCAGACTGCGAGTACGACGTGCGCTGCCTGGGCTTCGACCCGTACAACGCCAAAGAGTTCGTGACCCGCTGGGAGAACGAGAACGGACCGTTCGGCATCGAAAAGGTGATCCAGGGAGCCCGGACCGAGTCGGTGCCCCTTGGTGAGATCAAGGACATGGCAGAGGATCGCAAGCTCCTCTTCGACCAATCCATGATGACCTTCACGATGGGGAACGCCATAACCCTGGAGGACACCAACGGGAACCGCAAGCTCCTGAAGGCCCGACGGGAGAACAAGATCGACTCAGTCGCCGCCCTGATGGACGCCTGGGTCGCTTACAAACTCAACAAGGACATGTTCGACTAGGAGGTGAAGGACATAGGACTGCGAGATAGACTACAGCACGCCTACAACGCCTTCACTGGCAGGGACGTCGACCGATCGAACCTCGGTCCTTCCTACAGTGTACGGGCCGACCGGCTCGCGCTCGGATGGACGGCCGATAAGTCGATCATCTCGTCGCTGTTCAACATGATCGCCATCGACGTGTCCGCCACGCCGATCCGACATGTCGACACAGCTCAAAATGGAACGTTTGTTGGCGTTCGGCGGTCAGCCCTGAACGATTGCCTGATGTTGGAGCCCAACATCGATCAGAGCGGCCGAGCATTCATCCAAGATGCCGTGCTGTCCCTGTTCGACGAGGGGGTCATCGCAATCGTTCCGGTCGAGTCAGATCTGGACCCGAGGACCAACAACAGCTTCGACATCAAACAACTGCGAGTCGGGCGGATCACTCAGTGGTTTCCCGAACAGGTCGAGGTTGAGGTCTACAACCAGGCTCGCTCAACCAAGGAGCGGGTGATCCTGCCAAAGCGCACCGTCGCCATCATCGAGAACCCTCTCTATGAGGTGATGAACAAGCCGAACTCGACCCTCAAGCGACTGAGCCGCAAGCTCTCCATGCTGGACCTGGCCGACGAGAAGACGTACACCGGAAAGCTGGACATCATCATTCAGCTCCCCTACGTCGTCAAGACCGAGGCCATGCGCCAGCGGGCGGAGAACCGCATTCAGTCTATCGAGGACCAGCTCGGCAAGGGCGGACATGGGATCGCCTACACTGACGGTTCCGAGAAGATTACTCAGCTGAACCGCCCGGCGGAGAACAACCTGCTTGACCAGATCAAGTTCCTCACCGCCGAGCTCATGAGTCGACTGGGTATCTCGGAGGACGTCTTCAAGGGTACTGCGACGGAGATCGTCTGGACGCACTACTGGAACCGGGCTGTGGAGCCTGTGCTCTCGGCACTCGCCGATGGGATGAGTAAGGCCTTCCTCACGAAGACCGCGCGCACCCAGGGGCAGGCCGTGCAGTACATCCGTGATCCGTTCAAGAACGTTCCTCCGAGCCAGATCGTCACGTCTCTGGACACCATGCTCAGGGACCAGGTCATCACGCCGAACGAGGCCCGTACGAGGATTGGTCTTCCGCCGTCCCCGAACGAGCAGGCGGATCAGTTGCAGAACCCGAACATCAACCCTCAGATGGGTGATACCTCCCTGGACGGCGAGGGGGATATTCCGGGCCCCAGCGGTCCTGATGTTCAGTCAGTGCTCAGCATGCCGATGAGCCAAGTCAGAGGAGAAGGATGAAGTTCGACTTCAGTGGCTGGGCCACTAAGAACGACCTGACCTGCTCCGACGGACGCACTATCAAGCATAATGCGTTCAAGGAGAATGACGGCCAGCGCGTGCCGCTTGTATGGCAGCATGGGCACAACGCCGTCGACAACGTTCTCGGGCACGCACTGCTCGAGAATCGGGATGAGGGTGTTTACGCCTACTGCGCGTTCAATGACACTCCCGGCGCCGAGAACGCCAAGGAGCTCGTGAAGCACGGTGACGTCAAGGCTCTCTCGATCTACGCCAACCGCCTCGACCAGCGAGGGGCTGACGTTATTCACGGCAACATCGTCGAGGTTTCCATGGTCCTGTCCGGGGCCAACCCGGGCGCCTTGATCGACAACGTTGCTCTGGAGCACTCGGATGGTTCATGGACCGAGTCCGAGGACGAGGCCGTCATTTATTCCGGTCTCACGCTCTCGCACGATTCCGGAGAAACAACGGAGGACACAGAATCCATGGACGAAGACGAGGTTTACGACGAGGACGACCTCACGGTCGCCGATGTCCTCGAGACCCTCGACGATGACCAGCGTCTGGCTGTTGCGGCCCTTATCGAGGAGATCAGCGGCGACGTTGATGCCGAGGATGAGGACTTCGACGAGGACGAAGAGTTCGATGAGGACTATGACGAAGACTACGATGAGGACGCCGAGCACGGCGACTCCGGGGGTGATACTCTGATGCATTCCAACATCTTCG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| 46,502
|
BR001681.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern13_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 40,896
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern13_CT89 DNA, nearly complete genome
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CGGATTCCACGAGGAGCGGGTCGTGGCCCTCGATCCAGGTCAGCACTATAGCCTGGCTGCGCTCATGGGCTGTACCCCTATCTCACTATCGGGGTTGAAGCAGATCTATAGGACTTACCACGAAGTAGCTTGTCGGAACTTTCCTAAGCGGCCTTATGCCTGAAAGGTCAAAATGACTGTATCTCAATACGCAGCATCCTGCGCCAGGTACTACGCCGACGTCGCTGATGTCGGCTACTCCCAGCCAGATCGCTGGACTTTCTATGATCGGTCCGACTGGGACGGCTGGCTGATCAATCCGCCCGCCAATGCCGACTGTTCGGCCCTCGTCGCTGGCTGTTACAACCTTGCGGCGCACCACGAGTGGGGCGAGCCCTTCACTGCCGGCTACTTCCCACGGTCGACCTGGACCGGTTCGCTTCGGGAGGAGTGTCTTCAGCGCAACTTTGCAGACATATCGAATTCCTGGACCGGTAACGAGCCGGACGGGGGGTTCGAGATCGGCGACATCGTCTTGTCCGAGGCCGCTTCGGGAGGTCGAGGTCATGTCGCAATGGTGACTGGTCTCAACCCCACGATTCTGTCCGAGGCATGGATCGCTGAGGATGGTTCCGACGACGGTTGGATGGGCGACCAGACCGAGCAAGAGGTCCGCACCAAGGAGTACAACGAGCACCCGTACACCCAACAAGCGGCCTGGACGCACTGTCTGCGTCGACGGGACAACCGCGGCGCTTCGGCTCCCTCACACGCCGAGTCATCCTCGGGAACTTCCATTCAGGAAGCCGTTCTTCGCGCCGCGGACGCTACTGGGTGCCCCTGGTGGGCTGCTCTCGGCTGCCTCAAGGTGGAGACCGGTGAGGAGGGCGCCAACATCTACGGCCATGACGCCGGAG
| 46,503
|
BR001682.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern14_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,638
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern14_CT89 DNA, nearly complete genome
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| 46,504
|
BR001683.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern15_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 44,292
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern15_CT89 DNA, nearly complete genome
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Siphovirus LN-2020-1
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Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
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Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
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Japan
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2020-10-06
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Modern16_CT89
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Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,725
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern16_CT89 DNA, nearly complete genome
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GGAGGTAGGTTTGGGCATCCCGAATCCGGGTTTCGGATAAGACAGGACGACCTGTGTCGTTGGGGTCTTCTTGCGTTCGTTCCTTTCTACCCAACGAGGGGTACGCAAGTCGTCCTGTCCTACCTGAAACCCGGATTCGAAAACAGCAAAGGAACCCGGAATAGGAGAGAACTCCGTGGCAAGGGCCAAGAAGTCACCCAGAGGACGGGCCGCCACTCCGGAGCAGCAGGAGAATCAGCTCATTTCGCTCGCAGTCCAGCGAGCCGAGGAGATGCTACTGGACGGCACGGCTCCTCCTTCCATCATCACGCACTACCTCAAGCTCGCCACGAGTCGAGAGCGGTTGGAGCAGGAGCGAATCAAGGCCGAGAACGACATGCTCAAGGCCAAAGCCGACGCTCTGGCGGCCTCAGCACGAGGGGAGGAGGCCTACAAGGAGGTTCTCGAGGCGTTCAAGTCCTATGCCGGAGGAGGTGTGGGCCTTGAGTCGGATTCGGACCTTCAGTGAACTCTCTCGCATCGAATCCTTCGAGGAACGGTACGAGTACCTACGTCTCAATCAGGATCCAGGGGATCAGACCTTCGGTTTCGAACGGTACCTGAACCAATCCTTCTACCACTCGACCGAATGGCGTCAAGCAAGGCAGAAGGTTATCCTTAGAGACGACGCATGCGACCTCGGGGTCCCGGGTCACGACATCTACGGTAAGATTCTTGTTCATCACATGAACCCGATTCGGCCCGAGGACCTCGAGGGAGAGTTCAATCCCGACATCCTCGACCCCGAATACCTAGTCTGCGTGCGACACGACACACATAACGCGATTCACTTCGGCGACGCGAGCCTGTTACCCAAGCCTCTAGTCGAGAGAACGCCGAACGACACGATACCCTGGAGGTGACCGTGGCTGATTCGATATTGAATGACATCAAGAAGGCTCTCGGCATCACTGAGGACTATACGGCTTTCGATCAGGAGATTATTCTCCACACAAACACGGCGCTCATGTTCGCAGAGGAGATCGGTCTCCCCTCGTTCAAGATCACCGGAAAGACAGAGACCTGGGATCAGTACCTCACTGGTGTCACGAAGAACATAGAGGCCGTCAAGACGTACCTGTACCTACAAGTGCGGCTCGTATTCGACCCGCCTGCTAACTCTTTCGTCGTAACGGCGATCGAGAAGCAACTTCAAGAGTACGCCTGGCGTATCAACCTGCAGAAGGAGACTCCATGAGCGACCAACTCATGCATTACGGGGTCAAGGGGATGCGCAAGGGCGCTAGGAAGAGCCGTGAGCAGCGGAATGCTGAGCGCCGCGCCAAGTACGAGGCCAAACTCAAGGCTAAGTATGGCGATCATGACATCGCTACGATTGAGGCCTTCATCAAGAAGCGTAAGGCACAAGCAAAAGCGGCCCGGGACTGGCGTCTTGGCAACCAGCGCAACCGTCAGCTCACCGCTACCGAGCGTCGAGAGAAGTATTACAACGAACTCGACACCGGCCAGCTGGGCAAGACCTACGCAACTGATGCAACTCTCGCTGAAGCCGCTCGTAGGTACTACAAGAAGGGGCATAACAAGCGAATGGGTCATTCGGAGCTGATGCATTATGGCGTCAAGGGCATGAAGTGGGGCGTTCGCCGCCGTGCTCGTCGTGACGCCAAGGAATTCACCCAGGCCAAGATGTATTACGGCGAGGGGGCCGGCAATCGGCGGAAGCTGATCAAGGCAACCGTCAAGGCCCGCTCGAAGGATCCGTTCTACAAGAGCGAATTCGACAAGGCGGTCGCCAATACCGACATGTCTAAGCGGGCTTCCCAGGCTCGAAGGCAGCGCGGCCGGAAGAATGCACGCAATTCCGCAGGCAAGACTGTTCGCGGAGTTGGCAACATCGCTTCGGGAAACGCTGGTCGGGCCGGAGGCGCCCTGTTTCTCGGTTATCTAGGGTACCAGGGGGCTAAGGCTGCCGGGATCGCCCCTACCGAGAAAGAGCTACTCACCAAAGCCGTTAAGGGGGCGAGGAAGATCAAACGAGTTGTCCAACACGATGATGTTCTTGCCCATTACGGCGTCAGGGGAATGCGCTGGGGAATCCGCAAGTCCCGCATCAAGGGCGCGAAGAAGTGGACTTCTGCCAAGCAGGCCAAAATAGACGGTATGTCTGATGATCAGCTCAGACGGGTCAACAACCGCCTCCGGTTAGAGAAGGAGTACCGTCAGCTGACCCAGACTCGGATGGAGCGCTACCGCGCCAAGGCGGGGAAGGTGGTCGAAGAGGCCGCAGCCAACACTCTGCAGAACGCACTTCAGAAGAATCTTAAGAAGGCTGCCAGCCTGGGGGGATCGGCTGCCATCAAGGGCGCCAAACGGTTCAAGAAATAGGATTAGGACATGACTGACAACCTGTTCTTCATCGACGAGGACGAGGTCCTCGCTCACCATGGCGTCAAAGGTATGAAGTGGGGCGTTCGCAAGCAGCGAGCCGCTTCCGGAGGCGCCGGATCAACCAAGAAGCGCAAGGGACTCTCTCGCAAGCAGAAAGCGGCCATCGCCGGCGTTCTCGGTACGGCTGCTGCAGCTGGTGCTGGGTACTACCTGCACAAGTCCGGCAAGGGCAAGCAGCTCGCAGGCCTGGCTAAGAAGGGCGGGGCTTCTGCCAAGAAGTACGCCCAGGGTAAAGGTCGTAACCTAGGTGCTCAGGCTCGAGCCAAGACAGCGGCTTCGAAGCTGAAGTATTCCAAGGCCGGCAAGTACGCCGAGGCCACCCGACTCGCTGCCAACGCTGCCGCGTTCAAGACGGGTCACGCAGCTCGCTCCGCCGGTTTCAGGGCCAAGCAAGGGGCGTGGAAGGTCGGCAATAAGGCACGCAGGGCAGCTACGGGCGGCGTCAGTGGCGCGAAGTCTGCGGCTGGTATGGCCGCGCGTTCGGCCAAATCCAAAGCGGGCGCAGCAGCAAGCGCTGCCAGGTCCGCGGCAGGTGCGGCTAAGTCCAAGTTCGGTAAGGCCTCCACTAGAGCCGCTAAGGCCCCGGGTAAGGCCGTTGGATACCGGAGGCTCGCCACCACCGGAACCAGGGTCGTGAGGCCCAAGGGCGCCGCTGCCGAAAAGCTCGTCAAGGCTTCTGTCGTCGGACTCGCTACCGGCACGGCAGCGGGCGCGGTCCCGTATGCCGCCCGGAAGGCCATGAGTGGTCGGAAGGGTGGCCGCTCTAGGAAGCGCCGCCGCTGACCATGCTGTCCAATACCGCTACCCCGCGATATTACGCTCAGTTCAGAGACGATGTCCTCGCAGGTAAGATTCCGATCTGCAAGGAGATCGAGATGGAGATGAATAGGATCGATGATCGGATTCGCAATCCCGGTTTTTATTACGATAGCGACGCTGTGGAGGGGTTCGTCCGCTTCGCGGAAGCGGAGATGACTCTAACCGACGGATCCGATCTTCGACTTCTACCGAGCTTCAAGCTCTGGGCCGAACAGATCTTCGGATGGTGGATCTTCACCGAGCGATCAGTCTACGTCCCTAACAAGACGACGGCTGGCGGCCACTTCGAGAAGCGCCGGGTGAAGCAACGCCTCATCAACAAGCAGTACATCATTGTCGCTCGAGGTGGGGCGAAGTCTCTGTACGAAACCCTCCTTCAAGCCTACTTCCTCACGATCGACACGTCGACCACCCATCAGGTGACGACCGCGCCGACGATGAAGCAGGCCGAGGAGGTCATGCAGCCCTTCCGCACCGCCATCACAAGGGCCAAGGGACCCCTGTTCGATTTCATGACTCAGGGGTCTCTCCAGAACACGACCGGCAACCGCGCGCTCAGGCAGAAGCTCGTCCCCACCAAGAAGGGGATCGAGAACTTCATGACCAACAGTTTACTCGAGGTTCGCCCCATGTCGATCGATAAGCTCCAGGGCCTCCGAACCAAGATGAATACGGTGGACGAGTGGCTCTCGGGTGATATTCGCGAAGACGTGGTCGGCGCCATCGAGCAGGGCGCGTCCAAGGTTGACGACTGGCTTATTCTGGCGGTGTCCTCGGAGGGTACCGTCAGGAACTCAGCTGGCGACAACATGAAGATGGAGCTCCTCAACATTCTTCGAGGGGAGTACTCGGATCCCCACACATCCATCTTCTATTACAGGCTCGATGACCTCAAGGAGGTCGGGGATCCGTCGACCTGGCTGAAGGCCCAACCCAATCTCGGGGCCACCGTCTCCTACGAGACATATCAGCGAGACGTCGAAAGGGCGGAGCACGTACCTGCGGCTAGGAACGACATCCTGGCCAAGAGGTTTGGCATTCCCATGGAGGGGTATACATACTTCTTCACCTACGAGGAGACCCTGCGGCACAACCGTCAGGACTTCTGGGGTATGCCTTGCTCCATCGGCGTCGACCTGTCGCAGGGCGATGACTTCACCGCCTTCACATTCTTGTTCCCCCTCAGCCGGGGCAGGTTTGGCGTCAAGACGCGCTGCTACATTTCCGAGCGCACCATGCTGCGCCTCCCGGGAGCGACTCGTCAGAAGTACGAGGAGTTCCTACAGGAGGGCTCGCTCATGGTGCTCGAGGGCACGGTTCTTGACATGATGAACGTCTACGAAGACCTCGAGGCGTTCATCGCAGACTGCGAGTACGACGTGCGCTGCCTGGGCTTCGACCCATACAACGCCAAAGAGTTCGTGACCCGCTGGGAGAACGAGAATGGACCGTTCGGCATCGAGAAGGTGATCCAGGGAGCCCGGACCGAGTCTGTGCCCCTTGGTGAGATCAAGGACATGGCAGAGGATCGCAAGCTCCTCTTCGACCAATCCATGATGACCTTCACGATGGGGAATGCCATCACCCTGGAGGACACCAACGGGAACCGCAAGCTCCTGAAGGCCCGACGGGAGAACAAGATCGACTCGGTCGCTGCCCTGATGGACGCCTGGGTCGCTTACAAACTCAACAAGGACATGTTCGACTAGGAGGTGAAGGACATAGGACTGCGA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| 46,506
|
BR001685.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern17_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,818
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern17_CT89 DNA, nearly complete genome
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| 46,507
|
BR001686.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern18_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,845
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern18_CT89 DNA, nearly complete genome
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| 46,508
|
BR001687.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern19_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,287
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern19_CT89 DNA, nearly complete genome
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| 46,509
|
BR001688.1
|
Siphovirus LN-2020-1
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern20_CT89
|
Siphovirus LN-2020-1
| null | null |
dsDNA
| 43,465
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-1 Modern20_CT89 DNA, nearly complete genome
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| 46,510
|
BR001697.1
|
Siphovirus LN-2020-2
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern29_CT89
|
Siphovirus LN-2020-2
| null | null |
dsDNA
| 43,609
|
GenBank
| 1
| null | null | null |
saliva, oronasopharynx
| null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-2 Modern29_CT89 DNA, nearly complete genome
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| 46,519
|
BR001698.1
|
Siphovirus LN-2020-2
|
Nishimura,L., Sugimoto,R., Inoue,J., Nakaoka,H., Kanzawa-Kiriyama,H., Shinoda,K.I., Inoue,I., Shinoda,K.
|
Human Genetics Laboratory; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540
|
Japan
|
2020-10-06
|
Modern30_CT89
|
Siphovirus LN-2020-2
| null | null |
dsDNA
| 43,994
|
GenBank
| 1
| null | null | null |
saliva, oronasopharynx
| null | null | null |
MAG TPA_asm: Siphovirus LN-2020-2 Modern30_CT89 DNA, nearly complete genome
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