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KP271965.1
|
Semliki Forest virus
|
Ferguson,M.C., Saul,S., Fragkoudis,R., Weisheit,S., Cox,J., Patabendige,A., Sherwood,K., Watson,M., Merits,A., Fazakerley,J.K.
|
The Pirbright Institute, Pirbright Laboratory
| null |
2015-05-25
|
L10
|
Semliki Forest virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,445
|
GenBank
| 1
|
Uganda
|
Uganda
|
Aedes africanus
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Semliki Forest virus isolate L10, complete genome
|
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AATACATAACCTGTGAGTACAAGACGGTCGTCCCGTCGCCGTACGTGAAGTGCTGCGGCGCCTCAGAGTGCTCCACTAAAGAGAAGCCTGACTACCAATGCAAGGTTTACACAGGCGTGTACCCGTTCATGTGGGGAGGGGCATATTGCTTCTGCGACTCAGAAAACACGCAACTCAGCGAGGCGTACGTCGATCGATCGGACGTATGCAGGCATGATCACGCATCTGCTTACAAAGCCCATACAGCATCGCTGAAGGCCAAAGTGAGGGTTATGTACGGCAACGTAAACCAGACTGTGGATGTTTACGTGAACGGAGACCATGCCGTCACGATAGGGGGTACTCAGTTCATATTCGGGCCGCTGTCATCGGCCTGGACCCCGTTCGACAACAAGATAGTCGTGTACAAAGACGAAGTGTTCAATCAGGACTTCCCGCCGTACGGATCTGGGCAACCAGGGCGCTTCGGCGACATCCAAAGCAGAACAGTGGAGAGTAACGACCTGTACGCGAACACGGCACTGAAGCTGGCACGCCCTTCACCCGGCATGGTCCATGTACCGTACACACAGACACCTTCAGGGTTCAAATATTGGCTAAAGGAAAAAGGGACAGCCCTAAATACGAAGGCTCCTTTTGGCTGCCAAATCAAAACGAACCCTGTCAGGGCCATGAACTGCGCCGTGGGAAACATCCCTGTCTCCATGAATTTGCCTGACAGCGCCTTTACCCGCATTGTCGAGGCGCCGACCATCATTGACCTGACTTGCACAGTGGCTACCTGTACGCACTCCTCGGATTTCGGCGGCGTCTTGACACTGACGTACAAGACCGACAAGAACGGGGACTGCTCTGTACACTCGCACTCTAACGTAGCTACTCTACAGGAGGCCACAGCAAAAGTGAAGACAGCAGGTAAGGTTACCTTACACTTCTCCACGGCAAGCGCATCACCTTCTTTTGTGGTGTCGCTATGCAGTGCTAGGGCCACCTGTTCAGCGTCGTGTGAGCCCCCGAAAGACCACATAGTCCCATATGCGGCTAGCCACAGTAACGTAGTGTTTCCAGACATGTCGGGCACCGCACTATCATGGGTGCAGAAAATCTCGGGTGGTCTGGGGGCCTTCGCAATCGGCGCTATCCTGGTGCTGGTTGTGGTCACTTGCATTGGGCTCCGCAGATAAGTTAGGGTAGGCAATGGCATTGATATAGCAAGAAAATTGAAAACAGAAAAAGTTAGGGTAAGCAATGGCATATAACCATAACTGTATAACTTGTAACAAAGCGCAACAAGACCTGCGCAATTGGCCCCGTGGTCCGCCTCACGGAAACACGGGGCAACTCATATTGACACATTAATTGGCAATAATTGGAAGCTTACATAAGCTTAATTCGACGAATAATTGGATTTTTATTTTATTTTGCAATTGGTTTTTAATATTTCC
| 87,002
|
EU350586.1
|
Semliki Forest virus
|
Tan le,V., Ha do,Q., Hien,V.M., van der Hoek,L., Farrar,J., de Jong,M.D., Le,T.V., Do,H.Q., Vo,H.M.
|
Oxford University Clinical Research Unit, Virology
| null |
2008-07-01
| null |
Semliki Forest virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,820
|
GenBank
| 1
|
Viet Nam
|
Viet Nam
| null | null | null | null | null |
Semliki forest virus from Viet Nam, complete genome
|
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GACAGTAATGCCGAACGTGGTGGGGTTCCCGTATAAGGCTCACATTGAAAGGCCAGGATATAGCCCCCTCACTTTGCAGATGCAGGTTGTTGAAACCAGCCTCGAACCAACCCTTAATTTGGAATACATAACCTGTGAGTACAAGACGGTCGTCCCGTCGCCGTACGTGAAGTGCTGCGGCGCCTCAGAGTGCTCCACTAAAGAGAAGCCTGACTACCAATGCAAGGTTTACACAGGCGTGTACCCGTTCATGTGGGGAGGGGCATATTGCTTCTGCGACTCAGAAAACACGCAACTCAGCGAGGCGTACGTCGATCGATCGGACGTATGCAGGCATGATCACGCATCTGCTTACAAAGCCCATACAGCATCGCTGAAGGCCAAAGTGAGGGTTATGTACGGCAACGTAAACCAGACTGTGGATGTTTACGTGAACGGAGACCATGCCGTCACGATAGGGGGTACTCAGTTCATATTCGGGCCGCTGTCATCGGCCTGGACCCCGTTCGACAACAAGATAGTCGTGTACAAAGACGAAGTGTTCAATCAGGACTTCCCGCCGTACGGATCTGGGCAACCAGGGCGCTTCGGCGACATCCAAAGCAGAACAGTGGAGAGTAACGACCTGTACGCGAACACGGCACTGAAGCTGGCACGCCCTTCACCCGGCACGGTCCATGTACCGTACACACAGACACCTTCAGGGTTCAAATATTGGCTAAAGGAAAAAGGGACAGCCCTAAATACGAAGGCTCCTTTTGGCTGCCAAATCAAAACGAACCCTGTCAGGGCCATGAACTGCGCCGTGGGAAACATCCCTGTCTCCATGAATTTGCCTGACAGCGCCTTTACCCGCATTGTCGAGGCGCCGACCATCACTGACCTGACTTGCACAGTGGCTACCTGTACGCACTCCTCGGATTTCGGCGGCGTCTTGACACTGACGTACAAGACCGACAAGAACGGGGACTGCTCTGTACACTCGCACTCTAACGTAGCTACTCTACAGGAGGCCACAGCAAAAGTGAAGACAGCACGTAAGGTGACCTTACACTTCTCCACGGCAAGCGCATCACCTTCTTTTGTGGTGTCGCTATGCAGTGCTAAGGCCACCTGTTCAGCGTCGTGTGAGCCCCCGAAAGACCACATAGTCCCATATGCGGCTAGCCACAGTAACGTAGTGTTTCCAGACATGTCGGGCACCGCACTATCATGGGTGCAGAAAATCTCGGGTGGTCTGGGGGCCTTCGCAATCGGCGCTATCCTGGTGCTAGTTGTGGTCACTTGCATTGGGCTCCGCAGATAATGAGTACCTCACCTTAGCATACAGGGTACTAAACTCATAGCTTAATTGACAGTATACCTCCATCATAATTAGCCAAGGGTACTGTAATTTTATCATAACTACTTGAACAGAAAACTGGAAAACAGAAAAAGTTAGGGTAGGCAATGTTAGTATATTATACCTCTATTATAATCACTTGAACGAAAACTGAAAAACAGAAAAAGTTAGGGTAAGCAATGGCATTAATATAGCAAGAAAACCGAAAATAGAAAAAGTTAGGGTAGGCAATGGCATTGATATAGCAAGAAAATTGAAAACAGAAAAAGTTAGGGTAAGCAATGGCATATAACCATAACTGTATAACTTATAACAAAGCGCAACAAGACCTGCGCAATTGGCCCCGTGGTCCGCCTCACGGAAACTCGGGGCAACTCATATTGACACATTAATTGGCAATAATTGGAAGCTTACATAAGCTTAATTCGACGAATAATTGGATTTTTATTTTATTTTGCAATTGGTTTTTAATATTTCC
| 105,090
|
AY112987.1
|
Semliki Forest virus
|
Logue,C., Mooney,D., Shanley,R., Atkins,G.J.
|
Trinity College Dublin, Microbiology
|
Ireland
|
2002-07-01
| null |
Semliki Forest virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,406
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Semliki forest virus strain L10, complete genome
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| 110,753
|
NC_011349.1
|
Senecavirus A
|
Hales,L.M., Knowles,N.J., Reddy,P.S., Xu,L., Hay,C., Hallenbeck,P.L.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2008-10-09
|
SVV-001
|
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,310
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
| null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Seneca valley virus, complete genome
|
TTTGAAATGGGGGGCTGGGCCCTGATGCCCAGTCCTTCCTTTCCCCTTCCGGGGGGTTAACCGGCTGTGTTTGCTAGAGGCACAGAGGGGCAACATCCAACCTGCTTTTGCGGGGAACGGTGCGGCTCCGATTCCTGCGTCGCCAAAGGTGTTAGCGCACCCAAACGGCGCACCTACCAATGTTATTGGTGTGGTCTGCGAGTTCTAGCCTACTCGTTTCTCCCCCGACCATTCACTCACCCACGAAAAGTGTGTTGTAACCATAAGATTTAACCCCCGCACGGGATGTGCGATAACCGTAAGACTGGCTCAAGCGCGGAAAGCGCTGTAACCACATGCTGTTAGTCCCTTTATGGCTGCAAGATGGCTACCCACCTCGGATCACTGAACTGGAGCTCGACCCTCCTTAGTAAGGGAACCGAGAGGCCTTCGTGCAACAAGCTCCGACACAGAGTCCACGTGACTGCTACCACCATGAGTACATGGTTCTCCCCTCTCGACCCAGGACTTCTTTTTGAATATCCACGGCTCGATCCAGAGGGTGGGGCATGACCCCTAGCATAGCGAGCTACAGCGGGAACTGTAGCTAGGCCTTAGCGTGCCTTGGATACTGCCTGATAGGGCGACGGCCTAGTCGTGTCGGTTCTATAGGTAGCACATACAAATATGCAGAACTCTCATTTTTCTTTCGATACAGCCTCTGGCACCTTTGAAGATGTAACCGGAACAAAAGTCAAGATCGTTGAATACCCCAGATCGGTGAACAATGGTGTTTACGATTCGTCTACTCATTTGGAGATACTGAACCTACAGGGTGAAATTGAAATTTTAAGGTCTTTCAATGAATACCAAATTCGCGCCGCCAAACAACAACTCGGACTGGACATCGTGTACGAACTACAGGGTAATGTTCAGACAACGTCAAAGAATGATTTTGATTCCCGTGGCAATAATGGTAACATGACCTTCAATTACTACGCAAACACTTATCAGAATTCAGTAGACTTCTCGACCTCCTCGTCGGCGTCAGGCGCCGGACCCGGGAACTCCCGGGGCGGATTAGCGGGTCTCCTCACAAATTTCAGTGGAATCTTGAACCCTCTTGGCTACCTCAAAGATCACAACACCGAAGAAATGGAAAACTCTGCTGATCGAGTCACAACGCAAACGGCGGGCAACACTGCCATAAACACGCAATCATCATTGGGTGTGTTGTGTGCCTACGTTGAAGACCCGACCAAATCTGATCCTCCGTCCAGCAGCACAGATCAACCCACCACCACTTTCACTGCCATCGACAGGTGGTACACTGGACGTCTCAATTCTTGGACAAAAGCTGTAAAAACCTTCTCTTTTCAGGCCGTCCCGCTTCCCGGGGCCTTTCTGTCTAGGCAGGGAGGCCTCAACGGAGGGGCCTTCACAGCTACCCTACATAGACACTTTTTGATGAAGTGCGGGTGGCAGGTGCAGGTCCAATGTAATTTGACACAATTCCACCAAGGCGCTCTTCTTGTTGCCATGGTTCCTGAAACCACCCTTGATGTCAAGCCCGACGGTAAGGCAAAGAGCTTACAGGAGCTGAATGAAGAACAGTGGGTGGAAATGTCTGACGATTACCGGACCGGGAAAAACATGCCTTTTCAGTCTCTTGGCACATACTATCGGCCCCCTAACTGGACTTGGGGTCCCAATTTCATCAACCCCTATCAAGTAACGGTTTTCCCACACCAAATTCTGAACGCGAGAACCTCTACCTCGGTAGACATAAACGTCCCATACATCGGGGAGACCCCCACGCAATCCTCAGAGACACAGAACTCCTGGACCCTCCTCGTTATGGTGCTCGTTCCCCTAGACTATAAGGAAGGAGCCACAACTGACCCAGAAATTACATTTTCTGTAAGGCCTACAAGTCCCTACTTCAATGGGCTTCGCAACCGCTACACGGCCGGGACGGACGAAGAACAGGGGCCCATTCCTACGGCACCCAGAGAAAATTCGCTTATGTTTCTCTCAACCCTCCCTGACGACACTGTCCCTGCTTACGGGAATGTGCGTACCCCTCCTGTCAATTACCTCCCTGGTGAAATAACCGACCTTTTGCAACTGGCCCGCATACCCACTCTCATGGCATTTGAGCGGGTGCCTGAACCCGTGCCTGCCTCAGACACATATGTGCCCTACGTTGCCGTTCCCACCCAGTTCGATGACAGGCCTCTCATCTCCTTCCCGATCACCCTTTCAGATCCCGTCTATCAGAACACCCTGGTTGGCGCCATCAGTTCAAATTTCGCCAATTACCGTGGGTGTATCCAAATCACTCTGACATTTTGTGGACCCATGATGGCGAGAGGGAAATTCCTGCTCTCGTATTCTCCCCCAAATGGAACGCAACCACAGACTCTTTCCGAAGCTATGCAGTGCACATACTCTATTTGGGACATAGGCTTGAACTCTAGTTGGACCTTCGTCGTCCCCTACATCTCGCCCAGTGACTACCGTGAAACTCGAGCCATTACCAACTCGGTTTACTCCGCTGATGGTTGGTTTAGCCTGCACAAGTTGACCAAAATTACTCTACCACCTGACTGTCCGCAAAGTCCCTGCATTCTCTTTTTCGCTTCTGCTGGTGAGGATTACACTCTCCGTCTCCCCGTTGATTGTAATCCTTCCTATGTGTTCCACTCCACCGACAACGCCGAGACCGGGGTTATTGAGGCGGGTAACACTGACACCGATTTCTCTGGTGAACTGGCGGCTCCTGGCTCTAACCACACTAATGTCAAGTTCCTGTTTGATCGATCTCGATTATTGAATGTAATCAAGGTACTGGAGAAGGACGCCGTTTTCCCCCGCCCTTTCCCTACACAAGAAGGTGCGCAGCAGGATGATGGTTACTTTTGTCTTCTGACCCCCCGCCCAACAGTCGCTTCCCGACCCGCCACTCGTTTCGGCCTGTACGCCAATCCGTCCGGCAGTGGTGTTCTTGCTAACACTTCACTGGACTTCAATTTTTATAGCTTGGCCTGTTTCACTTACTTTAGATCGGACCTTGAGGTTACGGTGGTCTCACTAGAGCCGGATCTGGAATTTGCTGTAGGGTGGTTTCCTTCTGGCAGTGAATACCAGGCTTCCAGCTTTGTCTACGACCAGCTGCATGTGCCCTTCCACTTTACTGGGCGCACTCCCCGCGCTTTCGCTAGCAAGGGTGGGAAGGTATCTTTCGTGCTCCCTTGGAACTCTGTCTCGTCTGTGCTCCCCGTGCGCTGGGGGGGGGCTTCCAAGCTCTCTTCTGCTACGCGGGGTCTACCGGCGCATGCTGATTGGGGGACTATTTACGCCTTTGTCCCCCGTCCTAATGAGAAGAAAAGCACCGCTGTAAAACACGTGGCCGTGTACATTCGGTACAAGAACGCACGTGCCTGGTGCCCCAGCATGCTTCCCTTTCGCAGCTACAAGCAGAAGATGCTGATGCAATCTGGCGATATCGAGACCAATCCTGGTCCTGCTTCTGACAACCCAATTTTGGAGTTTCTTGAAGCAGAAAATGATCTAGTCACTCTGGCCTCTCTCTGGAAGATGGTGCACTCTGTTCAACAGACCTGGAGAAAGTATGTGAAGAACGATGATTTTTGGCCCAATTTACTCAGCGAGCTAGTGGGGGAAGGCTCTGTCGCCTTGGCCGCCACGCTATCCAACCAAGCTTCAGTAAAGGCTCTTTTGGGCCTGCACTTTCTCTCTCGGGGGCTCAATTACACTGACTTTTACTCTTTACTGATAGAGAAATGCTCTAGTTTCTTTACCGTAGAACCACCTCCTCCACCAGCTGAAAACCTGATGACCAAGCCCTCAGTGAAGTCGAAATTCCGAAAACTGTTTAAGATGCAAGGACCCATGGACAAAGTCAAAGACTGGAACCAAATAGCTGCCGGCTTGAAGAATTTTCAATTTGTTCGTGACCTAGTCAAAGAGGTGGTCGATTGGCTGCAGGCCTGGATCAACAAAGAGAAAGCCAGCCCTGTCCTCCAGTACCAGTTGGAGATGAAGAAGCTCGGGCCTGTGGCCTTGGCTCATGACGCTTTCATGGCTGGTTCCGGGCCCCCTCTTAGCGACGACCAGATTGAATACCTCCAGAACCTCAAATCTCTTGCCCTAACACTGGGGAAGACTAATTTGGCCCAAAGTCTCACCACTATGATCAATGCCAAACAAAGTTCAGCCCAACGAGTTGAACCCGTTGTGGTGGTCCTTAGAGGCAAGCCGGGATGCGGCAAGAGCTTGGCCTCTACGTTGATTGCCCAGGCTGTGTCCAAGCGCCTCTATGGCTCCCAAAGTGTATATTCTCTTCCCCCAGATCCAGATTTCTTCGATGGATACAAAGGACAGTTCGTGACCTTGATGGATGATTTGGGACAAAACCCGGATGGACAAGATTTCTCCACCTTTTGTCAGATGGTGTCGACCGCCCAATTTCTCCCCAACATGGCGGACCTTGCAGAGAAAGGGCGTCCCTTTACCTCCAATCTCATCATTGCAACTACAAATCTCCCCCACTTCAGTCCTGTCACCATTGCTGATCCTTCTGCAGTCTCTCGCCGTATCAACTACGATCTGACTCTAGAAGTATCTGAGGCCTACAAGAAACACACACGGCTGAATTTTGACTTGGCTTTCAGGCGCACAGACGCCCCCCCCATTTATCCTTTTGCTGCCCATGTGCCCTTTGTGGACGTAGCTGTGCGCTTCAAAAATGGTCACCAGAATTTTAATCTCCTAGAGTTGGTCGATTCCATTTGTACAGACATTCGAGCCAAGCAACAAGGTGCCCGAAACATGCAGACTCTGGTTCTACAGAGCCCCAACGAGAATGATGACACCCCCGTCGACGAGGCGTTGGGTAGAGTTCTCTCCCCCGCTGCGGTCGATGAGGCGCTTGTCGACCTCACTCCAGAGGCCGACCCGGTTGGCCGTTTGGCTATTCTTGCCAAGCTAGGTCTTGC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| 7,772
|
OR759780.1
|
Senecavirus A
|
Wen,J., Bai,J., Jiang,P.
|
Nanjing Agricultural University, Infectious Disease Research Group
|
China
|
2023-11-13
|
SVA/SD/2023
|
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,286
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null |
2023
| null | null |
Senecavirus A isolate SVA/SD/2023, complete genome
|
TTTGAAATGGGGGGCTGGGCCCTCATGCCCAGTCCTTCCTTTCCCCTTCCGGGGGGTAAACCGGCTGTGTTTGCTAGAGGCACAGAGGAGCAACATCCAACCTGCTTTTGTGGGGAACGGTGCGGCTCCAATTCCTGCGTCGCCAAAGGTGTTAGCGCACCCAAACGGCGCATCTACCAATGCTATTGGTGTGGTCTGCGAGTTCTAGCCTACTCGTTTCTCCCCTACTCACTCATTCACACACAAGAACTGTGTTGTGACTACAAGATTTGGCCCTCGCACGGGATGTGCGATAACCGCAAGATTGACTCAAGTGCGGAAAGCGCTGTAACCACATGCTGTTAGTCCCTTTATGGCTGCGAGATGGCTATCCACCTCGGGTCACTGAACTGGAGCTCGACCCTCCTTAGTAAGGGAACCGAGAGGCCTTCCTGCAACAAGCTCCGACACAGAGTCCACGTGATTGCTACCACCATGAGTACATGGTTCTCCCCTCTCGACCCAGGACTTCTTTTTGAATATCCACGGCTCGATCCAGAGGGTGGGGCATGATCCCCCTAGCATAGCGAGCTACAGCGGGAACTGTAGCTAGGCCTTAGCGTGCCTTGGATACTGCCTGATAGGGCGACGGCCTAGTCGTGTCGGTTCTATAGGTAGCACATACAAATATGCAGAACTCTAATTTTTCTTTCGATACAGCCTCTGGCACCTTTGAAGACGTAACCGGAACAAAAGTCAAGATCGTTGAATACCCCAGATCGGTGAACAATGGTGTTTACGATTCGTCCACTCATTTAGAGATACTGAATCTACAGGGTGAAATTGAAATTTTAAAGTCTTTCAACGAATACCAAATTCGCGCCGCCAAACAACAACTTGGACTGGACATCGTATACGAACTACAGGGTAATGTTCAGACAACCTCAAAGAACGATTTTGATTCGCGCGGCAATAATGGTAACATGACCTTTAATTACTACGCAAACACTTACCAGAATTCAGTAGACTTCTCGACCTCCTCGTCGGCGTCAGGCGCCGGACCCGGGAACTCCCGGGGCGGATTAGCGGGTCTCCTCACAAATTTCAGTGGAATCTTGAACCCTCTTGGCTACCTCAAAGATCACAATACCGAAGAAATGGAAAACTCTGCTGATCGAGTCATAACGCAAACGGCGGGCAACACTGCCATAAACACGCAATCATCACTGGGTGTGTTGTGTGCCTACGTTGAAGACCCGACCAAATCTGACCCTCCGTCCAGCAGCACAGATCAACCCACCACCACTTTTACTGCCATCGACAGGTGGTACACTGGACGCCTCAATTCTTGGACAAAAGCTGTGAAAACCTTCTCCTTTCAGGCCGTCCCGCTCCCTGGAGCCTTCCTGTCTAGACAGGGAGGCCTCAACGGAGGGGCCTTCACGGCCACCCTACATAGACATTTCTTAATGAAGTGCGGGTGGCAGGTGCAGGTCCAATGCAACCTGACGCAATTCCACCAGGGTGCTCTTCTTGTTGCCATGGTCCCCGAAACCACCCTTGATGTCAAACCTGACGGCAAGGCAAAGAGCTTACAGGAGCTGAATGAAGAGCAGTGGGTGGAAATGTCTGACGACTACCGGACCGGGAAAAACATGCCTTTTCAGTCTCTTGGTACGTACTATCGGCCCCCTAACTGGACTTGGGGCCCCAATTTCATCAACCCCTATCAAGTAACAGTTTTCCCACATCAAATTCTGAACGCGAGAACCTCCACCTCGGTAGACATAAGTGTCCCATATATCGGGGAAACTCCTACACAATCCTCAGAAACACAGAACTCCTGGACCCTCCTTGTTATGGTGCTTGTCCCCCTGGACTACAAGGAGGGAGCCACAACTGACCCAGAAATTACATTTTCTGTAAGGCCTACAAGTCCCTACTTCAATGGGCTTCGTAACCGTTTCACGACCGGGACGGACGAGGAACAGGGGCCCATTCCCACAGCACCCAGAGAAAATTCGCTTATGTTTCTCTCAACCATCCCTGACGACACTGTCCCTGCTTACGGGAATGTGCGTACCCCTCCCGTCAATTACCTCCCCGGTGAAATAACCGACCTCTTACAACTGGCCCGTATACCCACTCTCATGGCGTTTGGGCGGGTGTCTGAACCCGAGCCTGCCTCAGACGCATATGTGCCCTACGTAGCCGTTCCTGCCCAGTTCGACGACAAGCCTCTCATCTCCTTCCCGATCACCCTTTCAAATCCTGTTTACCAGAACACCCTGGTAGGCGCCATCAGTTCGAACTTCGCCAACTACCGGGGGTGTATCCAAATCACTCTGACATTTTGTGGACCCATGATGGCAAGAGGGAAATTCCTGCTCTCGTATTCTCCCCCAAATGGAGCACAACCACAGACCCTTTCTGAAGCTATGCAGTGCACATACTCTATTTGGGATATAGGCTTGAACTCTAGTTGGACCTTTGTCATCCCCTACATATCGCCCAGTGATTACCGTGAAACTCGGGCTATTACCAACTCAGTTTATTCTGCTGATGGTTGGTTTAGCTTGCACAAGCTGACCAAAATTACTTTACCACCTGACTGCCCACAGAGTCCCTGCATTCTCTTTTTCGCCTCTGCTGGTGAGGATTACACCCTCCGTCTCCCTGTTGATTGTAATCCTTCCTACGTGTTCCACTCCACCGACAACGCCGAGACTGGGGTTATTGAGGCAGGTAACACTGACACCGACTTCTCTGGTGAACTGGCGGCTCCTGGCTCCAACCATACTAATGTCAAATTCCTGTTTGACCGATCTCGACTACTGAATGTAATTAAAGTACTGGAGAAGGACGCCGTCTTCCCCCGTCCTTTCCCCACAGCAACAGGTGCACAGCAGGATGATGGTTACTTTTGTCTTCTAACACCCCGCCCAACAGTCGCGTCCCGACCCGCCACTCGTTTCGGCCTGTACGTCAACCCGTCTGACAGTGGCGTTCTCGCTAACACTTCACTGGATTTCAATTTTTACAGCTTGGCTTGTTTCACTTACTTTAGATCAGACCTTGAAGTCACGGTGGTCTCACTGGAGCCAGATTTGGAATTCGCTGTGGGGTGGTTCCCCTCTGGCAGTGAGTACCAGGCTTCTAGCTTTGTCTATGACCAACTGCATGTACCCTACCACTTTACTGGGCGCACTCCCCGCGCTTTCACCAGCAAGGGTGGAAAGGTATCTTTCGTGCTCCCTTGGAACTCTGTCTCTTCCGTGCTTCCCGTGCGCTGGGGGGGCGCTTCCAAGCTTTCTTCTGCCACGCGTGGTCTGCCGGCTCATGCTGACTGGGGGACCATTTACGCCTTTATCCCCCGTCCTAACGAGAAGAAAAGCACCGCTGTAAAGCACGTGGCGGTGTACGTTCGGTACAAGAACGCGCGTGCTTGGTGCCCCAGCATGCTTCCCTTTCGCAGCTATAAGCAGAAGATGCTGATGCAATCAGGCGACATCGAGACCAACCCTGGCCCTGCTTCTGACAACCCAATCTTGGAGTTTCTTGAAGCGGAAAACGACCTAGTCACTCTGGCCTCTCTCTGGAAGATGGTACACTCTGTTCAGCAGACCTGGAGAAAGTATGTGAAGAACGACAATTTTTGGCCCAACTTGCTCAGTGAGCTAGTGGGGGAAGGCTCCATCGCCTTGGCCGCCACGCTATCTAACCAAGCTTCAGTGAAAGCTCTCTTGGGCCTGCATTTTCTCTCTCGGGGGCTCAATTACACAGATTTTTACTCTTTACTGATAGAGAAATGCTCTAGTTTCTTTACTGTAGAACCGCCTCCTCCACCAGCTGAAAATCTGATGACCAAGCCCTCCGTGAAGTCGAAATTCCGAAAGCTGTTTAAGATGCAAGGACCCATGGATACAGTCAAAGACTGGAACCAAATAGCCGCCGGCTTGAAGAATTTCCAATTTGTTCGTGACCTAGTTAAAGAGGTGGTCGACTGGCTCCAGGCCTGGATCAATAAAGAGAAAGCCAGCCCTGTCCTCCAGTACCAGCTGGAGATGAAGAAACTCGGGCCCGTGGCTTTGGCTCATGATGCCTTCATGGCCGGTTCTGGGCCCCCTCTTGGTGACGACCAGATTGAATACCTCCAGAACCTCAAATCTCTTGCCCTAACACTGGGGAAGACTAATTTGGCCCAAAGTCTCACCACTATGATCAATGCCAAGCAGAGCTCCGCCCAACGAGTCGAACCCGTTGTGGTGGTCCTCAGAGGCAAGCCGGGATGCGGCAAAAGCTTGGCCTCCACGTTGATTGCCCAGGCCGTGTCCAAGCGTCTCTATGGCTCACAAAGTGTGTATTCCCTTCCTCCGGACCCAGACTTCTTCGACGGATACAAAGGACAGTTTGTAACCTTGATGGACGATCTGGGACAAAACCCGGATGGACAAGATTTCTCCACCTTTTGTCAGATGGTGTCGACCGCCCAATTTCTTCCCAACATGGCGGACCTTGCAGAGAAGGGGCGTCCCTTTACCTCCAATCTTATCATTGCAACCACAAACCTCCCTCACTTTAGCCCTGTCACTATTGCTGATCCTTCTGCAGTCTCTCGGCGTATCAACTACGACCTGACTCTAGAAGTATCCGAGGCCTATAAGAAGCACACACGGCTGAATTTTGACCTGGCTTTCAGACGCACAGACGCCCCTCCCATTTACCCTTTTGCTGCCCATGTGCCCTTCGTGGACGTGGCTGTGCGTTTCAAAAATGGTCATCAAAGTTTCAATCTCCTAGAGTTGGTCGACTCTATTTGTGCAGACATTCGGGCCAAGCAGCAAGGTGCCCGAAATATGCAGACTCTGGTTCTACAGAGCCCTAACGAGAACGACGACACTCCTGTCGACGAGGCGTTGGGAAGAGTTCTCACCCCCGCTGCGGTCGACGAGGCGCTTGTCGACCTCGCTCCAGATGCCGACCCGGTTGGCCGCTTGGCTATTCTCGCCAAGCTAGGTCTT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| 11,079
|
OR703632.1
|
Senecavirus A
|
Lin,Y.T., Wang,Y., Niu,S., Zhao,Y.J., Tian,W.X., Ren,J.L.
|
Shanxi Agricultural University, Preventive Veterinary Medicine
|
China
|
2023-11-08
|
SX2020
|
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,280
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
tissue
|
2020
| null | null |
Senecavirus A isolate SX2020, complete genome
|
TTGAATGGGGGGCTGGGCCCTCATGCCCAGTCCTTCCTTTCCCCTTCCGGGGGGTAAACCGGCTGTGTTTGCTAGAGGCACAGAGGAGCAACATCCAACCTGCTTTTGTGGGGAACGGTGCGGCTCCAATTCCTGCGTCGCCAAAGGTGTTAGCGCACCCAAACGGCGCATCTACCAATGCCATTGGTGTGGTCTGCGAGTTCTAGCCTACTCGTTTTTCCCCTACTCACTCATTCACGCACAAAAAGTGTGTTGTAACTACAAGATTTAGCCCTCGCACGGGATGTGCGGTAACCACAAGATTGACTCAAGCGCGGAAAGCGCTGTAACCACATGCTGTTAGTCCCTTTATGGCTGCGAGATGGCTATCCACCTCGGATCACTGAACTGGAGCTCGACCCTCCTTAGTAAGGGAACCGAGAGGCCTTCTTGCAACAAGCTCCGACACAGAGTCCACGTGATTGCTACCACCATGAGTACATGGTTCTCCCCTCTCGACCCAGGACTTCTTTTTGAATATCCACGGCTCGATCCAGAGGGTGGGGCATGATCCCCCTAGCATAGCGAGCTACAGCGGGAACTGTAGCTAGGCCTTAGCGTGCCTTGGATACTGCCTGATAGGGCGACGGCCTAGTCGTGTCGGTTCTATAGGTAGCACATACAAATATGCAGAACTCTCATTTTTCTTTCGATACAGCCTCTGGCACCTTTGAAGACGTAACCGGAACAAAAGTCAAGATCGTTGAATACCCCAGATCGGTGAACAATGGTGTTTACGATTCGTCCACTCATTTAGAGATACTGAACCTACAGGGTGAAATTGAAATTTTAAAGTCTTTCAACGAATACCAAATTCGCGCCGCCAAACAACAACTTGGACTGGACATCGTATACGAGCTGCAGGGTAATGTTCAGACAACCTCAAAGAATGACTTTGATTCCCGCGGCAATAATGGTAACATGACCTTCAATTACTACGCAAACACTTACCAGAATTCAGTAGACTTCTCGACCTCCTCGTCGGCGTCAGGCGCCGGACCCGGGAACTCCCGGGGCGGACTAGCGGGTCTCCTCACAAATTTCAGTGGAATCTTGAACCCTCTTGGCTACCTCAAAGATCACAATACCGAAGAAATGGAAAACTCTGCTGATCGAGTCATAACGCAAACGGCGGGCAACACTGCCATAAACACGCAATCATCACTGGGTGTGTTGTGTGCCTACGTTGAAGACCCGACCAAGTCTGACCCTCCGTCCAGCAGCACAGATCAGCCCACCACCACTTTTACTGCCATCGACAGGTGGTATACTGGACGCCTCAATTCTTGGACAAAAGCTGTAAAAACCTTCTCTTTTCAGGCCGTCCCGCTCCCTGGAGCCTTCCTGTCTAGACAGGGAGGCCTCAACGGAGGGGCCTTCACGGCTACCCTACATAGACACTTCTTAATGAAGTGCGGGTGGCAGGTGCAGGTCCAATGCAATTTGACGCAATTCCACCAAGGTGCTCTTCTTGTTGCCATGGTCCCTGAGACCACCCTTGATGTCAAACCTGACGGCAAGGCAAAGAGCTTACAGGAGCTGAATGAAGAACAGTGGGTAGAAATGTCTGATGATTACCGGACCGGGAAAAACATGCCTTTTCAGTCTCTTGGCACATACTATCGGCCCCCTAACTGGACTTGGGGTCCCAATTTTATCAACCCCTATCAAGTAACAGTTTTCCCACACCAAATTCTGAACGCGAGAACCTCTACCTCGGTAGACATAAGTGTCCCATACATCGGGGAGACTCCTACACAATCCTCAGAGACACAGAACTCCTGGACCCTCCTCGTTATGGTGCTTGTCCCCTTAGACTACAAGGAGGGAGCCACAACTGACCCAGAAATTACATTCTCTGTAAGGCCTACAAGTCCTTACTTCAATGGGCTTCGTAACCGTTTCACGACCGGGACGGACGAGGAACAGGGGCCCATTCCCACAGCACCCAGAGAAAACTCGCTTATGTTTCTCTCAACCATCCCCGACGACACTGTCCCTGCTTACGGGAATGTGCGTACCCCTCCCGTCAATTACCTCCCCGGTGAAATAACCGACCTCTTACAACTGGCCCGTATACCCACTCTTATGGCGTTTGGGCGGGTGTCTGAACCCGAGCCTGCCTCAGACGCTTATGTGCCCTACGTTGCTGTTCCTGCTCAGTTCGACGACAAGCCTCTCATCTCCTTCCCGATCACCCTCTCAGATCCTGTCTACCAGAACACCCTGGTAGGCGCCATCAGTTCGAACTTCGCTAACTACCGGGGGTGTATCCAAATCACTTTGACATTTTGTGGACCCATGATGGCAAGAGGGAAATTCCTGCTCTCGTATTCTCCCCCAAATGGAGCACAACCACAGACCCTTTCTGAAGCTATGCAGTGCACATACTCTATTTGGGACATAGGCTTGAACTCTAGTTGGACCTTTGTCATCCCCTACATCTCGCCCAGTGATTACCGTGAAACTCGGGCTATTACCAACTCAGTTTATTCTGCTGATGGTTGGTTTAGCTTACACAAGCTGACCAAAATCACTCTACCACCTGACTGCCCACAGAGTCCCTGTATTCTCTTTTTCGCCTCTGCTGGTGAGGATTACACCCTCCGTCTCCCTGTTGATTGTAATCCTTCCTACGTGTTCCACTCCACCGACAACGCCGAGACTGGTGTTATTGAGGCAGGTAACACTGACACCGATTTCTCTGGTGAACTGGCGGCTCCTGGCTCTAACCATACTAATGTCAAATTTCTTTTTGATCGATCTCGACTACTGAATGTAATTAAGGTACTGGAGAAGGACGCTGTCTTCCCCCGTCCTTTCCCCACAGCAACAGGTGCACAGCAGGACGATGGTTACTTTTGTCTTCTGACACCCCGCCCAACAGTCGCTTCCCGACCCGCCACCCGTTTCGGCCTGTACGTCAACCCGTCTGACAGTGGCGTTCTCGCTAACACTTCACTGGATTTCAATTTTTACAGTTTGGCCTGTTTCACTTACTTTAGATCAGACCTTGAAGTCACGGTGGTCTCACTGGAGCCAGATCTGGAATTCGCCGTGGGGTGGTTCCCCTCTGGCAGTGAGTACCAGGCTTCTAGCTTTGTCTACGACCAACTGCATGTACCCTACCACTTTACTGGGCGCACTCCCCGCGCTTTCACCAGCAAGGGTGGAAAGGTGTCTTTCGTGCTCCCTTGGAACTCTGTCTCTTCCGTGCTTCCCGTGCGCTGGGGGGGCGCTTCCAAGCTTTCTTCTGCCACGCGGGGTCTGCCGGCTCATGCTGACTGGGGGACCATTTACGCCTTCATCCCCCGTCCTAACGAGAAGAAAAGCACCGCTGTAAAGCACGTGGCGGTGTACGTTCGGTACAAGAACGCGCGTGCTTGGTGCCCCAGCATGCTTCCCTTTCGCAGCTACAAGCAAAAGATGCTGATGCAATCAGGCGACATCGAGACCAACCCTGGCCCTGCTTCTGACAACCCAATCTTGGAGTTTCTTGAAGCGGAAAACGATCTAGTCACTCTGGCCTCTCTCTGGAAGATGGTACACTCTGTTCAACAGACCTGGAGGAAGTATGTGAAGAACGACAATTTTTGGCCCAACTTGCTCAGTGAGCTAGTGGGGGAAGGCTCCATCGCTTTGGCCGCCACGCTATCTAACCAAGCTTCAGTGAAAGCTCTCTTGGGCCTGCATTTTCTCTCTCGAGGGCTCAATTACACATATTTTTACTCTTTACTGATAGATAAATGCTCTAGTTTCTTTACTGTAGAACCGCCTCCTCCACCAGCTGAAAATCTGATGACCAAGCCCTCCGTGAAGTCGAAATTCCGAAAGCTGTTCAAGATGCAAGGACCCATGGATACAGTCAAAGACTGGAACCAAATAGCCGCCGGCTTGAATAATTTCCAATTTGTTCGTGACCTAGTCAAAGAGGTGGTCGACTGGCTCCAGGCCTGGATCAATAAAGAGAAAGCCAGCCCTGTCCTCCAGTACCAGCTGGAGATGAAGAAGCTCGGGCCCGTGGCTTTAGCTCATGATGCCTTCATGGCCGGTTCTGGGCCCCCCCTTGGTGACGACCAGATTGAATACCTCCAGAACCTCAAATCTCTTGCCCTGACACTGGGAAAGACTAATTTGGCCCAAAGTCTCACCACTATGATCAATGCCAAGCAGAGCTCCGCCCAACGAGTCGAACCCGTTGTGGTGGTCCTCAGAGGCAAGCCGGGATGCGGCAAAAGCCTGGCCTCCACGTTGATTGCCCAGGCTGTGTGTAAGCGTCTGTATGGCTCACAAAGTGAGTATTCTCTTCCTCCGGACCCAGAATTCTTCGACGGATACAAAGGACAGTTTGTAACCTTGATGGACGATCTGGGACAAAACCCGGATGGGCAAGATTTCTCCACCTTTTGTCAGATGGTATCGACCGCCCAATTTCTTCCCAACATGGCGGCCCTTGCAGAGAAGGGGCGTCCCTTCACCTCCAATCTTATCATTGCAACTACAAACCTCCCTCACTTTAGCCCTGTCACCATTGCTGATCCTTCTGCAGTCTCTCGGCGTATTAACTACGACCTGACTCTGGAAGTATCTGAGGCCTACAAGAAGCACACACGGCTGAATTTTGACCTGGCTTTCAGACGCACTGACGCCCCCCCCATTTACCCTTTTGCTGCCCATGTGCCCTTCGTGGACGTGGCTGTGCGCTTCAAAAATGGTCATCAAAGCTTCAATCTCCTAGAGTTGGTCGACTCTATTTGTGCAGACATTCGGGCCAAGCAACAAGGTGCTCGAAATATGCAGACTCTGGTTCTACAGAGCCCTAACGAGAACGACGACACCCCCGTCGACGAGGCGTTGGGTAGAGTTCTCACCCCCGCTGCGGTCGACGAAGCGCTTGTTGACCTCGCTCCGGATGCCGACCCGGTTGGCCGCTTGGCTATTCTCGCCAAGCTAGGTCTCGCCCTAGCTGCGGTCACCCCTGGTTTGATAATCTTGGCAGTGGGACTCTACAAATACTTCTCTGGCTCTGATACAGACCAAGAAGAGACAGAAAGTGAGGAGCCTGCTAAAGCGCCTAGGAGCGAGAATGCTTATGACGGACCGAAGAAAAACTCTAAGCCCCCTGGAGCGCTCTCTCTTATGGAAATGCAACAGCCCAACGTGGACATGGGCTTTGAGGCTGCGGTCGCTAAGAAAGTGGTCGTCCCCATTACCTTCATGGTTCCCAACAGACCTTCTGGACTTACACAGTCCGCTCTTCTTGTAGCCGGCCGGACCTTCCTAATCAATGAGCATACATGGTCCAACCCCTCTTGGACCAGCTTCACAATCCGTGGTGAGGTGCACACTCGTGATGAGCCTTTCCAAACGGTTCATTTTACCCACCATGGTCTTCCCACAGATCTGATGATGGTACGTCTCGGACCGGGCAACTCTTTCCCTAACAATCTAGACAAGTTTGGACTTGACCAGATGCCGGCACGTAACTCCCGTGTGGTTGGCGTTTCGGCTAGTTACGGTAACTTCTTTTTCTCTGGGAACTTCCTCGGGTTTGTTGACTCCATCACCTCTGATCAAGGAACCTATGCGAGACTTTTCAGGTACAGGGTGACGACTTACAAGGGATGGTGCGGTTCGGCCCTGGTCTGTGAGGCCGGTGGTGTCCGACGCATCATTGGCATGCATTCTGCTGGTGCCGCTGGTATCGGCGCCGGGACTTACATCTCAAAATTAGGACTGATCAAAGCCCTTAAACACCTCGGTGAGCCTCTGGCTACAATGCAAGGACTAATGACTGAGCTAGAGCCTGGAGTCACCGTACATGTACCCCGAAAATCTAAATTGAGAAAGACGACCGCACACGCGGTGTACAAACCGGAGTTTGAACCTGCTGTGTTGTCAAAATTTGATCCCAGACTGAACAAGGATGTTGACCTAGATGAGGTAATTTGGTCTAAACACACCGCCAACGTCCCTTATCAACCTCCTTTGTTCTACACATACATGTCAGAGTACGCTCATCGGGTTTTCTCCTTTTTGGGAAAAGACAATGACATTCTGACCGTCAAAGAAGCAATCCTGGGCATCCCTGGACTAGACCCTATGGATCCCCACACAGCTCCGGGTTTGCCCTACGCCATTAACGGCCTTCGACGTACTGATCTCGTCGATTTTGCGAACGGCACGGTAGACCCGGCACTGGCCATGCAGATCCAGAGATTCTTAGACGGTGACTACTCTGATCATGTCTTCCAAACTTTTCTGAAAGATGAAATCAGACCCTCAGAGAAGGTCCGGGCGGGAAAAACCCGCATTGTCGATGTGCCCTCCCTGGCGCACTGCATTGTGGGCAGAATGTTGCTTGGGCGCTTTGCCGCCAAGTTTCAATCCCATCCTGGCTTTCTCCTTGGCTCCGCTATCGGGTCTGACCCCGACGTCTTCTGGACCGTCATAGGGGCTCAGCTCGAGGGAAGAAAGAACACGTATGACGTGGACTACAGTGCCTTTGACTCTTCACACGGCACTGGCTCCTTCGAGGCTCTCATCTCTCACTTTTTCACCGTGGACAATGGTTTCAGCCCTGCGCTGGGACCGTATCTCAGATCCCTGGCTGTCTCGGTGCACGCTTACGGCGAGCGTCGCATCAAGATTACCGGAGGCCTCCCCTCTGGTTGTGCCGCGACCAGCCTGCTGAACACAGTGCTCAACAATGTGATCATCAGGACTGCTCTGGCATTGACCTACAAGGAATTTGAATATGACATGGTTGATATCATCGCCTACGGTGACGACCTTCTGGTTGGTACGGATTACGATCTGGACTTCAATGAGGTGGCGCGGCGCGCTGCCAAACTGGGGTATAAGATGACTCCTGCCAACAAGGGTTCTGTCTTCCCTCCGACTTCCTCTCTCTCTGATGCTGTTTTTCTAAAACGCAAATTCGTCCAAAACAATGACGGCTTATATAGACCAGTTATGGATGTAAAGAATTTGGAAGCCATGCTCTCCTACTTCAAACCAGGAACACTACTCGAGAAGCTGCAATCTGTTTCTATGTTGGCTCAACATTCTGGAAAAGAAGAATATGATAGATTGATGCACCCCTTCGCTGACTACGGTGCCGTACCGAGTCACGAGTACCTGCAGGCAAGATGGAGGGCCTTGTTCGACTGACCTGGATAGCCCAACGCGCTTCGGTGCTGCCGGCGATTCTGGGAGAACCCAGTCGGAACAGAAAAGGG
| 11,161
|
OQ162219.1
|
Senecavirus A
|
Zeng,W., Yan,Q.
|
South China Agricultural University, School of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-06-14
|
CH-GD-2018
|
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,264
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Senecavirus A isolate CH-GD-2018, complete genome
|
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| 15,146
|
OP714192.1
|
Senecavirus A
|
Ma,Y.Y., Li,J., Li,C., Huang,M.M., Mei,L.L., Shi,J.J., Liu,C.
|
Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Division of Swine Diseases, Shandong Provincial Key Laboratory of Animal Disease Control & Breeding
| null |
2023-05-08
|
SVA-CH-SDFX-2022
|
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,282
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2022-07-04
| null | null |
Senecavirus A isolate SVA-CH-SDFX-2022, complete genome
|
TTGAAAGGGGGGGCTGGGCCCTCATGCCCAGTCCTTCCTTTCCCCTTCCGGGGGGTAAACCGGCTGTGTTTGCTAGAGGCACAGAGGAGCAACATCCAACCTGCTTTTGTGGGGAACGGTGCGGCTCCAATCCCTGCGTCGCCAAAGGTGTTAGCGCACCCAAACGGCGCATCTACCAATGCTATTGGTGTGGTCTGCGAGTTCTAGCCTACTCGTTTCCCCCCTACTCACTCATTCACGCACAAAAAGTGTGTTGTAACTACAAGATTTAGCCCTCGCACGGGATGTGCGATAACCGCAAGATTGACTCAAGCGCGGAAAGCGCTGTAACCACATGCTGTTAGTCCCTTTTAAGGCTGCGAGATGGCTATCCACCTCGGATCACTGAACTGGAGCTCGACCCTCCTTAGTAAGGGAACCGAGAGGCCTTCTTGCAACAAGCTCCGACACAGAGTCCACGTGATTGCTACCACCATGAGTACATGGTTCTCCCCTCTCGACCCAGGACTTCTTTTTGAATATCCACGGCTCGATCCAGAGGGTGGGGCATGATCCCCCTAGCATAGCGAGCTACAGCGGGAACTGTAGCTAGGCCTTAGCGTGCCTTGGATACTGCCTGATAGGGCGACGGCCTAGTCGTGTCGGTTCTATAGGTAGCACATACAAATATGCAGAACTCTCATTTTTCTTTCGATACAGCCTCTGGCACCTTTGAAGACGTAACCGGAACAAAAGTCAAGATCGTTGAATACCCCAGATCGGTGAACAATGGTGTTTACGATTCGTCCACTCATTTAGAGATACTGAACCTACAGGGTGAAATTGAAATCTTAAAGTCTTTCAACGAATACCAAATTCGCGCCGCCAAACAACAACTTGGACTGGACATCGTATACGAACTACAGGGTAATGTTCAGACAACCTCAAAGAATGATTTTGATTCCCGCGGCCATAATGGTAACATGACCTTCAATTACTACGCAAACACTTACCAGAACTCAGTAGACTTCTCGACCTCCTCGTCGGCGTCAGGCGCCGGACCCGGGAACTCCCGGGGCGGATTAGCGGGTCTCCTCACAAATTTCAGTGGAATCTTGAACCCTCTTGGCTACCTCAAAGATCACAATACCGAAGAAATGGAAAACTCTGCTGATCGGGTCATAACGCAAACAGCGGGCAACACTGCCATAAACACGCAATCATCACTGGGTGTGTTGTGTGCCTACGTTGAAGACCCGACCAAATCTGACCCTCCGTCCAGCAGCACAGACCAACCCACCACCACTTTTACTGCCATCGACAGGTGGTACACTGGACGCCTTAATTCTTGGACAAAAGCTGTAAAAACCTTCTCTTTTCAGGCCGTCCCGATCCCGGGAGACTTCCTGTCTAGGCAGGGAGGCCTCAACGGAGGGGCCGTCACGGCTACCCTACATAGACATTTCTTGATGAAGTGCGGGTGGCAGGGGCAGGTCCAATGCAATTTGACGCAATTCCACCAAGGTGCTCTTCTTGTTGCTATGGTCCCCGAGACCACCCTTGATGTCAGACCTGACGGCAAGGCAAAGAGCTTAGAAGAGCTGAATGAAGAGCAGTGGGTAGAAATGTCTGACGATTACCGGACCGGGAAAAACATGCCTTTTCAGTCTCTTGGCACATACTATCGGCCCCCTAACTGGACTTGGGGCCCCAATTTTATCAACCCCTATCAAGTAACAGTTTTCCCACACCAAATTCTGAACGCGAGAACCTCTACCTCGGTAGACATAAGTGTCCCATACATCGGGGAGACTCCTACACAATCCTCAGAGACACAGAACTCCTGGACCCTCCTCGTTATGGTGCTTGTCCCCTTAGACTACAAGGAGGGAGCCACAACTGACCCAGAAATTACATTCTCTGTAAGGCCTACAAGTCCTTACTTCAATGGGCTTCGTAACCGTTTCACGACCGGGACGGACGAGGAACAGGGGCCCATTCCCACAGCACCCAGAGAAAATTCGCTTATGTTTCTCTCAACCATCCCTGACGACACTGTCCCTGCTTACGGGAATGTGCGTACCCCTCCCGTCAATTACCTCCCTGGTGAAATAACCGACCTCTTACAACTGGCCCGTATACCCACTCTCATGGCGTTTGGGCGGGTGTCTGAACCCGAGCCTGCCTCAGACGCATATGTGCCCTACGTTGCCGTTCCTGCCCAGTTCGACGACAAGCCTCTCATCTCCTTCCCGATCACCCTTTCAGATCCTGTCTACCAGAACACCCTGGTAGGCGCCATCAGTTCGAACTTCGCCAACTACCGGGGGTGTATCCAAATCACTCTGACATTTTGTGGACCCATGATGGCAAGAGGGAAATTCCTGCTCTCGTATTCTCCCCCGAATGGAGCACAACCACAGACCCTTTCTAAAGCTATGCAGTGCACATACTCTATTTGGGATATAGGCTTGAACTCTAGTTGGACCTTTGTCATCCCCTACATCTCGCCCAGTGATTACCGTGAAACTCGGGCTATTACCAATTCAGTTTATTCTGCCGATGGTTGGTTTAGCTTGCACAAGCTGACCAAAATTACTCTACCACCTGACTGCCCACAGAGTCCCTGTATTCTCTTTTTCGCCTCTGCTGGTGAGGATTACACCCTCCGTCTCCCTGTTGATTGTAATCCTTCCTACGTGTTCCACTCCACCGACAACGCCGAGACTGGGGTTATTGAGGCAGGTAACACTGACACCGATTTCTCTGGTGAACTGGCGGCTCCTGGCTCCAACCATACTAATGTCAAATTCCTGTTTGACCGATCTCGACTACTGAATGTAATTAAGGTACTGGAGAAGGACGCCGTCTTCCCCCGTCCTTTCCCCACAGCAACAGGTGCACAGCAGGATGATGGTTACTTTTGTCTTCTAACACCCCGCCCGACAGTCGCTTCCCGACCCGCCACTCGTTTCGGCCTATACGTCAACCCGTCCGACAGTGGCGTTCTCGCTAACACTTCACTGGATTTCAATTTTTACAGTTTGGCCTGTTTCACCTACTTTAGATCAGACCTTGAAGTCACGGTGGTCTCACTGGAGCCAGATTTGGAATTCGCCGTGGGGTGGTTCCCCTCTGGCAGTGAGTACCAGGCTTCTAGCTTTGTCTACGACCAACTGCATGTACCCTACCACTTTACTGGGCGCACTCCCCGTGCTTTCACCAGCAAGGGTGGAAAGGTATCTTTCGTGCTCCCTTGGAACTCTGTCTCTTCCGTGCTTCCCGTGCGCTGGGGGGGCGCCTCCAAGCTTTCTTCTGCCACGCGTGGTCTGCCGGCTCATGCTGACTGGGGGACCATTTACGCCTTTATCCCCCGTCCTAACGAGAAGAAAAGCACCGCTGTAAAGCACGTGGCGGTGTACGTTCGGTACAAGAACGCACGCGCCTGGTGCCCCAGCATGCTTCCCTTTCGCAGCTACAAGCAGAAGATGCTGATGCAATCAGGAGACGTTGAGTCCAACCCTGGACCTGCTTCTGACAACCCGATCTTGGAGTTTCTTGAAGCGGAAAACGATCTAGTCACTCTGGCCTCTCTCTGGAAGATGGTACACTCTGTTCAACAGACCTGGAGAAAGTATGTGAAGAACGACAATTTTTGGCCCAACTTGCTCAGTGAGCTAGTGGGGGAAGGCTCCATCGCCTTGGCCGCCACGCTATCTAACCAAGCTTCAGTGAAAGCTCTCTTGGGCCTGCATTTTCTCTCTCGAGGGCTCAATTACACAGATTTTTATTCTTTACTGATAGAGAAATGCTCTAGTTTCTTTACTGTAGAACCGCCTCCTCCACCAGCTGAAAATCTGATGACCAAGCCCTCCGTGAAGTCGAAATTCCGAAAGCTGTTTAAGATGCAAGGACCCATGGACACAGTCAAAGACTGGAACCAAATAGCCGCCGGTTTGAAGAATTTCCAATTTGTTCGTGACCTAGTCAAAGAGGTGGTCGACTGGCTCCAGGCCTGGATCAATAAAGAGAAAGCCAGCCCTGTCCTCCAGTACCAGCTGGAGATGAAGAAGCTCGGGCCCGTGGCTTTGGCTCATGATGCCTTCATGGCCGGTTCCGGGCCCCCTCTCGGTGACGACCAGATTGAATACCTCCGGAACCTCAAATCTCTTGCCCTAACACTGGGGAAGACTAATTTGGCCCAAAGTCTCACCACTATGATCAATGCCAAGCAGAGCTCCGCCCAACGAGTCGAACCCGTTGTGGTGGTCCTCAGAGGCAAGCCGGGATGCGGCAAAAGCTTGGCCTCCACGTTGATTGCCCAGGCTGTGTCCAAGCGTCTCTACGGCTCACAAAGTGTATATTCTCTTCCTCCGGACCCAGACTTCTTTGACGGATATAAAGGGCAGTTTGTAACCTTGATGGACGATCTGGGACAAAACCCGGATGGGCAAGATTTCTCCACCTTTTGTCAGATGGTGTCGACCGCCCAATTTTTCCCCAACATGGCGGACCTTGCAGAGAAGGGGCGTCCCTTCACCTCCAATCTTATCATTGCAACTACAAACCTCCCTCACTTTAGCCCTGTCACCATTGCTGATCCTTCTGCAGTCTCTCGGCGTATCAATTACGACCTGACTCTAGAAGTATCTGAGGCCTACAAGAAGCACACACGGCTGAATTTCGACCTGGCTTTCAGACGCACTGACGCCCCCCCCATTTATCCTTTTGCTGCCCATGGGCCCTTCGTGGACGTGGCTGTGCGCTTCAAAAATGGTCATCAAAGCTTCAATCTCCTAGAGTTGGTCGACTCTATTTGTGCAGACATTCGAGCCAAGCAACAAGGTGCCCGAAATATGCAGACTCTGGTTCTACAGAGCCCTAACGAGAACGACGGCACCCCTGTCGACGAGGCGTTGGGTAGAGTTCTCACCCCCGCTGCGGTCGACGAGGCGCTTGTCGACCTCGCTCCAGATGCCGACCCGGTTGGCCGCTTGGCTATTCTCGCCAAGCTAGGTCTT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| 16,138
|
OP562896.1
|
Senecavirus A
|
Lan,Y.G., Wang,B.L., Chen,Y.Z., Wang,Z.Z., He,W.Q., Song,D.G., Gao,F.
|
Jilin University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-03-25
|
CH/JL/2022
|
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,278
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
tissue
|
2022-02-15
| null | null |
Senecavirus A isolate CH/JL/2022, complete genome
|
GGTTTCCTTTCCCCTTCCGGGGGGTAAACCGGCTGTGTTTGCTAGAGGCACAGAGGAGCAACATCCAACCTGCTCTTGTGGGGAACGGTGCGGCTCCAATTCCTGCGTCGCCAAAGGTGTTAGCGCACCCAAACGGCGCATCTACCAATGCTATTGGTGTGGTCTGCGAGTTCTAGCCTACTCGTTTCTCCCCTACTCACTCACTCACGAAAAAAAAACTGTGTTGTAACTACAAGATTTAGCCCTCGCACGGGATGTGCGATAACCGCAAGATTGACTCAAGCGCGGAAAGTGCTGCAACCACATGCTGTTAGTCCCTTTATGGCTGCGAGATGGCTATCCACCTCGGATCACTGAACTGGAGCTCGACCCTCCTTAGTAAGGGAACCGAGAGGCCTTCTTACAACAAGCTCCGACACAGAGTCCACGTGATTGCTACCACCATGAGTACATGGTTCTCCCCTCTCGACCCAGGACTTCTTTTTGAATATCCACGGCTCGATCCAGAGGGTGGGGCATGATCCCCCTAGCATAGCGAGCTACAGCGGGAACTGTAGCTAGGCCTTAGCGTGCCTTGGATACTGCCTGATAGGGCGACGGCCTAGTCGTGTCGGTTCTATAGGTAGCACATACAAATATGCAGAACTCTCATTTTTCTTTCGATACAGCCTCTGGCACCTTTGAAGACGTAACCGGAACAAAAGTCAAGATCGTTGAATACCCCAGATCGGTGAACAATGGTGTTTACGATTCGTCCACTCATTTAGAGATACTGAACCTACAGGGTGAAATTGAAATTCTAAAGTCTTTCAACGAATACCAAATTCGCGCCGCCAAACAACAACTTGGACTGGACATCGTATACGAACTACAGGGTAATGTTCAGACAACCTCAAAGAATGATTTTGATTCCCGCGGCAATAATGGTAACATGACTTTCAATTACTACGCAAACACTTACCAGAATTCAGTAGACTTCTCGACCTCCTCGTCGGCGTCAGGCGCCGGACCCGGGAACTCCCGGGGCGGATTAGCGGGTCTCCTCACAAATTTCAGTGGAATCTTGAACCCTCTTGGCTACCTCAAAGATCACAATACCGAAGAAATGGAAAACTCTGCTGATCGAGTCATAACGCAAACGGCGGGCAACACTGCCATAAACACGCAATCATCACTGGGTGTGTTGTGTGCCTACGTTGAAGACCCGACCAAGTCTGACCCTCCGTCCAGCAGCACAGATCAACCCACCACCACTTTTACTGCCATCGACAGGTGGTACACTGGACGCCTCAATTCTTGGACAAAAGCTGTAAAAACCTTCTCTTTTCAGGCTGTTCCGCTTCCTGGAGCCTTCCTGTCTAGACAGGGAGGCCTCAACGGAGGGGCCTTCACGGCCACCCTACACAGACACTTCTTAATGAAGTGCGGGTGGCAGGTGCAAGTCCAATGCAATTTGACACAATTCCACCAAGGTGCTCTTCTTGTTGCCATGGTCCCCGAAACCACCCTTGATGTCAAACCTGACGGCAAGGCAAAGAGCTTACAGGAGCTGAATGAAGAGCAGTGGGTGGAAATGTCTGACGACTACCGGACCGGGAAAAACATGCCTTTTCAGTCTCTTGGTACATACTACCGGCCCCCTAACTGGACCTGGGGCCCCAATTTCATCAACCCCTATCAAGTAACAGTTTTCCCACATCAAATTCTGAACGCGAGAACCTCTACCTCGGTAGACATAAGTGTCCCATATATCGGGGAAACTCCTACACAATCCTCAGAGACACAGAACTCCTGGACCCTCCTTGTTATGGTGCTTGTCCCCCTAGACTACAAAGAGGGAGCCACGACTGACCCAGAAATCACATTTTCTGTAAGGCCTACAAGTCCCTACTTCAATGGGCTTCGTAACCGTTTCACGACCGGGACGGACGAGGAACAGGGGCCCATTCCCACAGCATCCAGAGAAAATTCGCTTATGTTTCTCTCAACCATCCCTGACGACACCGTCCCTGCTTATGGGAATGTGCGTACCCCTCCCGTCAATTACCTCCCCGGTGAAATAACCGACCTCTTACAACTGGCCCGTATACCCACTCTCATGGCGTTTGGGCAGATGTCTGAACCCGAGCCTGCCTCAGACGCATATGTGCCCTACGTCGCCGTTCCTGCCCAGTTCGACGACAAGCCTCTCATCTCTTTCCCGATCACCCTTTCAGATCCTGTCTACCAGAACACCCTAGTGGGCGCCATCAGTTCGAACTTCGCCAACTACCGGGGGTGTATCCAAATCACTCTGACATTTTGTGGACCCATGATGGCAAGAGGGAAATTCCTGCTCTCGTATTCTCCCCCAAATGGAGCACAACCACAGACCCTTTCTAAAGCTATGCAGTGCACATACTCTATTTGGGATATAGGCTTGAACTCTAGTTGGACCTTTGTCATCCCCTACATCTCGCCCAGTGATTACCGTGAAACTCGGGCCATTACCAACTCAGTTTATTCTGCTGATGGTTGGTTTAGCTTGCACAAGCTGACCAAAATTACTTTACCACCTGACTGCCCACAGAGTCCCTGCATTCTCTTTTTCGCCTCTGCTGGTGAGGACTACACCCTCCGTCTCCCTGTTGATTGTAATCCTTCCTACGTGTTCCACTCCACCGACAACGCCGAGACTGGGGTTATTGAGGCAGGTAACACCGACACCGATTTCTCTGGCGAACTGGCGGCTCCTGGCTCTAACCATACTAATGTCAAATTCCTGTTTGACCGATCTCGACTACTGAATGTAATTAAGGTACTGGAGAAGGACGCCGTCTTCCCCCGTCCTTTCCCCACAGCAACAGGTGCACAGCAGGACGATGGTTACTTTTGTCTTCTAACACCCCGCCCAACAGTCGCTTCCCGACCCGCCACTCGTTTCGGCCTGTACGTCAACCCGTCTGACAGTGGCGTTCTCGCTAACACTTCACTGGATTTTAATTTTTACAGTTTGGCCTGTTTCACTTACTTTAGATCAGACCTTGAAGTCACGGTGGTCTCACTGGAGCCAGATTTGGAATTCGCCGTGGGGTGGTTCCCTTCTGGCAGTGAGTATCAGGCTTCTAGCTTTGTCTATGACCAACTGCATGTACCCTACCACTTTACTGGGCGCACTCCCCGCGCTTTCACCAGCAAGGGTGGAAAGGTATCTTTCGTGCTCCCTTGGAACTCTGTCTCTTCCGTGCTTCCCGTGCGCTGGGGGGGCGCTTCCAAGCTTTCTTCTGCCACGCGGGGTCTGCCGGCTCATGCTGACTGGGGGACCATTTACGCCTTTATCCCCCGTCCTAACGAGAAGAAAAGCACCGCTGTAAAACACGTGGCGGTGTACGTTCGGTACAAGAACGCGCGTGCTTGGTGCCCCAGCATGCTCCCCTTTCGCAGCTACAAGCAGAAGATGCTGATGCAATCAGGCGACATCGAGACCAACCCTGGCCCCGCTTCTGACAACCCAATCTTGGAGTTTCTTGAGGCGGAAAACGATCTAGTCACTCTGGCCTCTCTCTGGAAGATGGTACACTCGGTTCAACAGACCTGGAGAAAGTATGTGAAGAACGATAATTTTTGGCCCAACTTGCTCAGTGAGCTAGTGGGGGAAGGCTCCATCGCCTTGGCCGCCACGCTATCTAACCAAGCTTCAGTGAAAGCTCTCTTGGGCCTGCATTTTCTCTCCCGCGGGCTCAATTACACAGATTTTTACTCTTTGCTGATAGAGAAATGCTCTAGTTTCTTTACTGTAGAACCGCCTCCTCCACCAGCTGAAAATCTGATGACCAAGCCCTCTGTGAAGTCGAAGTTCCGAAAGCTGTTTAAGATGCAAGGACCCATGGATACAGTCAAAGACTGGAACCAAATAGCCGCCGGCTTGAAGAATTTCCAATTTGTTCGCGACCTAGTCAAAGAAGTGGTCGACTGGCTCCAGGCCTGGATCAACAAAGAGAAAGCCAGCCCTGTCCTCCAGTACCAGCTGGAGATGAAGAAGCTCGGGCCCGTGGCTTTGGCTCATGATGCCTTCATGGCCGGTTCTGGGCCCCCTCTTGGTGACGACCAGATTGAATACCTCCAGAACCTCAAATCTCTTGCCCTAACACTGGGGAAGACTAATTTGGCCCACAGTCTCACCACTATGATCAATGCCAAGCAGAGCTCCGCCCAACGAGTCGAACCCGTTGTGGTGGTCCTCAGAGGCAAGCCGGGATGCGGCAAAAGCTTGGCTTCCACGTTGATTGCCCAGGCTGTGTCCAAGCGTCTCTATGGCTCACAAAGTGTGTATTCTCTTCCTCCGGACCCAGACTTCTTCGACGGATACAAAGGACAGTTTGTAACCTTGATGGATGATCTGGGACAAAACCCGGATGGGCAAGATTTCTCCACCTTTTGTCAGATGGTGTCGACCGCCCAATTTCTTCCCAACATGGCGGACCTTGCAGAGAAGGGGCGTCCCTTCACCTCAAATCTTATCATTGCAACTACAAACCTCCCTCACTTTAGCCCTGTCACCATTGCTGATCCTTCTGCAGTCTCTCGGCGTATTAACTACGACCTGACTCTAGAAGTATCTGAGGCCTACAAGAAGCACACACGGCTGAATTTCGACCTGGCTTTCAGACGCACTGACGCCCCCCCCATTTATCCTTTTGCTGCCCACGTGCCCTTCGTGGACGTGGCTGTGCGCTTCAAAAATGGCCATCAAAGCTTCAATCTCCTAGAGTTAGTCGACTCTATTTGTGCAGACATTCGGGCCAAGCAACAAGGTGCCCGAAATATGCAGACTCTGGTTCTACAGAGCCCTAACGAGAACGACGACACCCCCGTCGATGAGGCGTTGGGTAGAGTTCTCACCCCCGCCGCAGTCGACGAGGCGCTTGTCGACCTCGCTCCAGATGCCGACCCGGTTGGCCGCTTGGCTATTCTCGCCAAGCTAGGTCTTGCCCTAGCTGCGGTCACCCCTGGTTTGATAA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| 17,245
|
ON024061.1
|
Senecavirus A
|
Dong,J.
|
Xinyang Agriculture and Forestry University, School of Animal Husbandry and Medical Engineering
|
China
|
2023-01-17
| null |
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,280
|
GenBank
| null |
China: Guangxi Province
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-06
| null | null |
Senecavirus A strain CHgx, complete genome
|
TTGAATGGGGGGCTGGGCCCTCATGCCCAGTCCTTCCTTTCCCCTTCCGGGGGGTAAACCGGCTGTGTTTGCTAGAGGCACAGAGGAGCAACATCCAACCTGCTTTTGTGGGGAACGGTGCGGCTCCAATTCCTGCGTCGCCAAAGGTGTTAGCGCACCCAAACGGCGCATCTACCAATGCCATTGGTGTGGTCTGCGAGTTCTAGCCTACTCGTTTTTCCCCTACTCACTCATTCACGCACAAAAAGTGTGTTGTAACTACAAGATTTAGCCCTCGCACGGGATGTGCGGTAACCACAAGATTGACTCAAGCGCGGAAAGCGCTGTAACCACATGCTGTTAGTCCCTTTATGGCTGCGAGATGGCTATCCACCTCGGATCACTGAACTGGAGCTCGACCCTCCTTAGTAAGGGAACCGAGAGGCCTTCTTGCAACAAGCTCCGACACAGAGTCCACGTGATTGCTACCACCATGAGTACATGGTTCTCCCCTCTCGACCCAGGACTTCTTTTTGAATATCCACGGCTCGATCCAGAGGGTGGGGCATGATCCCCCTAGCATAGCGAGCTACAGCGGGAACTGTAGCTAGGCCTTAGCGTGCCTTGGATACTGCCTGATAGGGCGACGGCCTAGTCGTGTCGGTTCTATAGGTAGCACATACAAATATGCAGAACTCTCATTTTTCTTTCGATACAGCCTCTGGCACCTTTGAAGACGTAACCGGAACAAAAGTCAAGATCGTTGAATACCCCAGATCGGTGAACAATGGTGTTTACGATTCGTCCACTCATTTAGAGATACTGAACCTACAGGGTGAAATTGAAATTTTAAAGTCTTTCAACGAATACCAAATTCGCGCCGCCAAACAACAACTTGGACTGGACATCGTATACGAGCTGCAGGGTAATGTTCAGACAACCTCAAAGAATGACTTTGATTCCCGCGGCAATAATGGTAACATGACCTTCAATTACTACGCAAACACTTACCAGAATTCAGTAGACTTCTCGACCTCCTCGTCGGCGTCAGGCGCCGGACCCGGGAACTCCCGGGGCGGACTAGCGGGTCTCCTCACAAATTTCAGTGGAATCTTGAACCCTCTTGGCTACCTCAAAGATCACAATACCGAAGAAATGGAAAACTCTGCTGATCGAGTCATAACGCAAACGGCGGGCAACACTGCCATAAACACGCAATCATCACTGGGTGTGTTGTGTGCCTACGTTGAAGACCCGACCAAGTCTGACCCTCCGTCCAGCAGCACAGATCAGCCCACCACCACTTTTACTGCCATCGACAGGTGGTATACTGGACGCCTCAATTCTTGGACAAAAGCTGTAAAAACCTTCTCTTTTCAGGCCGTCCCGCTCCCTGGAGCCTTCCTGTCTAGACAGGGAGGCCTCAACGGAGGGGCCTTCACGGCTACCCTACATAGACACTTCTTAATGAAGTGCGGGTGGCAGGTGCAGGTCCAATGCAATTTGACGCAATTCCACCAAGGTGCTCTTCTTGTTGCCATGGTCCCTGAGACCACCCTTGATGTCAAACCTGACGGCAAGGCAAAGAGCTTACAGGAGCTGAATGAAGAACAGTGGGTAGAAATGTCTGACGATTACCGGACCGGGAAAAACATGCCTTTTCAGTCTCTTGGCACATACTATCGGCCCCCTAACTGGACTTGGGGTCCCAATTTTATCAACCCCTATCAAGTAACAGTTTTCCCACACCAAATTCTGAACGCGAGAACCTCTACCTCGGTAGACATAAGTGTCCCATACATCGGGGAGACTCCTACACAATCCTCAGAGACACAGAACTCCTGGACCCTCCTCGTTATGGTGCTTGTCCCCTTAGACTACAAGGAGGGAGCCACAACTGACCCAGAAATTACATTCTCTGTAAGGCCTACAAGTCCTTACTTCAATGGGCTTCGTAACCGTTTCACGACCGGGACGGACGAGGAACAGGGGCCCATTCCCACAGCACCCAGAGAAAACTCGCTTATGTTTCTCTCAACCATCCCCGACGACACTGTCCCTGCTTACGGGAATGTGCGTACCCCTCCCGTCAATTACCTCCCCGGTGAAATAACCGACCTCTTACAACTGGCCCGTATACCCACTCTTATGGCGTTTGGGCGGGTGTCTGAACCCGAGCCTGCCTCAGACGCTTATGTGCCCTACGTTGCTGTTCCTGCTCAGTTCGACGACAAGCCTCTCATCTCCTTCCCGATCACCCTCTCAGATCCTGTCTACCAGAACACCCTGGTAGGCGCCATCAGTTCGAACTTCGCTAACTACCGGGGGTGTATCCAAATCACTTTGACATTTTGTGGACCCATGATGGCAAGAGGGAAATTCCTGCTCTCGTATTCTCCCCCAAATGGAGCACAACCACAGACCCTTTCTGAAGCTATGCAGTGCACATACTCTATTTGGGACATAGGCTTGAACTCTAGTTGGACCTTTGTCATCCCCTACATCTCGCCCAGTGATTACCGTGAAACTCGGGCTATTACCAACTCAGTTTATTCTGCTGATGGTTGGTTTAGCTTACACAAGCTGACCAAAATCACTCTACCACCTGACTGCCCACAGAGTCCCTGTATTCTCTTTTTCGCCTCTGCTGGTGAGGATTACACCCTCCGTCTCCCTGTTGATTGTAATCCTTCCTACGTGTTCCACTCCACCGACAACGCCGAGACTGGTGTTATTGAGGCAGGTAACACTGACACCGATTTCTCTGGTGAACTGGCGGCTCCTGGCTCTAACCATACTAATGTCAAATTTCTTTTTGATCGATCTCGACTACTGAATGTAATTAAGGTACTGGAGAAGGACGCTGTCTTCCCCCGTCCTTTCCCCACAGCAACAGGTGCACAGCAGGACGATGGTTACTTTTGTCTTCTGACACCCCGCCCAACAGTCGCTTCCCGACCCGCCACCCGTTTCGGCCTGTACGTCAACCCGTCTGACAGTGGCGTTCTCGCTAACACTTCACTGGATTTCAATTTTTACAGTTTGGCCTGTTTCACTTACTTTAGATCAGACCTTGAAGTCACGGTGGTCTCACTGGAGCCAGATCTGGAATTCGCCGTGGGGTGGTTCCCCTCTGGCAGTGAGTACCAGGCTTCTAGCTTTGTCTACGACCAACTGCATGTACCCTACCACTTTACTGGGCGCACTCCCCGCGCTTTCACCAGCAAGGGTGGAAAGGTGTCTTTCGTGCTCCCTTGGAACTCTGTCTCTTCCGTGCTTCCCGTGCGCTGGGGGGGCGCTTCCAAGCTTTCTTCTGCCACGCGGGGTCTGCCGGCTCATGCTGACTGGGGGACCATTTACGCCTTCATCCCCCGTCCTAACGAGAAGAAAAGCACCGCTGTAAAGCACGTGGCGGTGTACGTTCGGTACAAGAACGCGCGTGCTTGGTGCCCCAGCATGCTTCCCTTTCGCAGCTACAAGCAAAAGATGCTGATGCAATCAGGCGACATCGAGACCAACCCTGGCCCTGCTTCTGACAACCCAATCTTGGAGTTTCTTGAAGCGGAAAACGATCTAGTCACTCTGGCCTCTCTCTGGAAGATGGTACACTCTGTTCAACAGACCTGGAGGAAGTATGTGAAGAACGACAATTTTTGGCCCAACTTGCTCAGTGAGCTAGTGGGGGAAGGCTCCATCGCTTTGGCCGCCACGCTATCTAACCAAGCTTCAGTGAAAGCTCTCTTGGGCCTGCATTTTCTCTCTCGAGGGCTCAATTACACATATTTTTACTCTTTACTGATAGATAAATGCTCTAGTTTCTTTACTGTAGAACCGCCTCCTCCACCAGCTGAAAATCTGATGACCAAGCCCTCCGTGAAGTCGAAATTCCGAAAGCTGTTCAAGATGCAAGGACCCATGGATACAGTCAAAGACTGGAACCAAATAGCCGCCGGCTTGAATAATTTCCAATTTGTTCGTGACCTAGTCAAAGAGGTGGTCGACTGGCTCCAGGCCTGGATCAATAAAGAGAAAGCCAGCCCTGTCCTCCAGTACCAGCTGGAGATGAAGAAGCTCGGGCCCGTGGCTTTAGCTCATGATGCCTTCATGGCCGGTTCTGGGCCCCCCCTTGGTGACGACCAGATTGAATACCTCCAGAACCTCAAATCTCTTGCCCTGACACTGGGAAAGACTAATTTGGCCCAAAGTCTCACCACTATGATCAATGCCAAGCAGAGCTCCGCCCAACGAGTCGAACCCGTTGTGGTGGTCCTCAGAGGCAAGCCGGGATGCGGCAAAAGCCTGGCCTCCACGTTGATTGCCCAGGCTGTGTGTAAGCGTCTGTATGGCTCACAAAGTGAGTATTCTCTTCCTCCGGACCCAGAATTCTTCGACGGATACAAAGGACAGTTTGTAACCTTGATGGACGATCTGGGACAAAACCCGGATGGGCAAGATTTCTCCACCTTTTGTCAGATGGTATCGACCGCCCAATTTCTTCCCAACATGGCGGCCCTTGCAGAGAAGGGGCGTCCCTTCACCTCCAATCTTATCATTGCAACTACAAACCTCCCTCACTTTAGCCCTGTCACCATTGCTGATCCTTCTGCAGTCTCTCGGCGTATTAACTACGACCTGACTCTGGAAGTATCTGAGGCCTACAAGAAGCACACACGGCTGAATTTTGACCTGGCTTTCAGACGCACTGACGCCCCCCCCATTTACCCTTTTGCTGCCCATGTGCCCTTCGTGGACGTGGCTGTGCGCTTCAAAAATGGTCATCAAAGCTTCAATCTCCTAGAGTTGGTCGACTCTATTTGTGCAGACATTCGGGCCAAGCAACAAGGTGCTCGAAATATGCAGACTCTGGTTCTACAGAGCCCTAACGAGAACGACGACACCCCCGTCGACGAGGCGTTGGGTAGAGTTCTCACCCCCGCTGCGGTCGACGAAGCGCTTGTTGACCTCGCTCCGGATGCCGACCCGGTTGGCCGCTTGGCTATTCTCGCCAAGCTAGGTCTCGC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| 19,351
|
ON868368.1
|
Senecavirus A
|
Gao,H., Chen,Y., Xu,X., Xu,Z., Xu,S., Xing,J., Liu,J., Zha,Y., Sun,Y., Zhang,G.
|
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-28
| null |
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,546
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2020-03-01
| null | null |
Senecavirus A strain SVA/China/GD-HZ1/26/3/2020, complete genome
|
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| 26,570
|
ON868369.1
|
Senecavirus A
|
Gao,H., Chen,Y., Xu,X., Xu,Z., Xu,S., Xing,J., Liu,J., Zha,Y., Sun,Y., Zhang,G.
|
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-28
| null |
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,546
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2020-03-01
| null | null |
Senecavirus A strain SVA/China/GD-HZ2/26/3/2020, complete genome
|
ATGCAGAACTCTCATTTTTCTTTCGATACAGCCTCTGGCACCTTTGAAGACGTAACCGGAACAAAAGTCAAGATCGTTGAATACCCCAGATCGGTGAACAATGGTGTTTACGATTCGTCCACTCATTTAGAGATACTGAACCTACAGGGTGAAATTGAAATTTTGAAGTCTTTCAACGAATACCAAATTCGCGCCGCCAAACAACAACTTGGACTGGACATCGTATACGAACTACAGGGTAATGTTCAGACAACCTCAAAGAATGATTTTGATTCCCGCGGCAATAATGGTAACATGACCTTCAATTACTACGCAAACACTTACCAGAATTCAGTAGACTTCTCGACCTCCTCGTCGGCGTCAGGCGCCGGACCCGGGAACTCTCGGGGCGGATTAGCGGGTCTCCTCACAAATTTCAGTGGAATCTTGAACCCTCTTGGCTACCTCAAAGATCACAATACCGAAGAAATGGAAAACTCTGCTGATCGAGTCATAACGCAAACGGCGGGCAACACTGCCATAAACACACAATCATCACTGGGTGTGTTGTGTGCCTACGTTGAAGACCCGACCAAATCTGACCCTCCGTCCAGCAGTACAGATCAACCCACCACCACTTTTACTGCCATCGACAGGTGGTACACTGGACGCCTCAATTCTTGGACAAAAGCTGTAAAAACCTTCTCTTTTCAGGCCGTCCCGCTCCCTGGAGCCTTCCTGTCTAGACAGGGAGGCCTCAACGGAGGGGCCTTCACGGCCACCCTACACAGACATTTCTTAATGAAGTGCGGGTGGCAGGTGCAGGTCCAATGTAATTTGACGCAATTCCACCAAGGTGCTCTTCTTGTTGCCATGGTCCCCGAAACCACCCTTGATGTCAAACCTGACGGCAAGGCAAAGAGCTTACAGGAGCTGAATGAAGAGCAGTGGGTGGAAATGTCTGACGACTACCGGACCGGGAAAAACATGCCTTTTCAGTCTCTTGGTACATACTATCGGCCCCCTAATTGGACTTGGGGCCCTAATTTCATCAACCCCTATCAAGTAACAGTTTTCCCACATCAAATTCTGAACGCGAGAACCTCTACCTCGGTGGACATAAGTGTCCCATACATCGGGGAAACTCCTACACAATCCTCAGAGACACAGAACTCCTGGACCCTCCTTGTTATGGTGCTTGTCCCCCTGGACTACAAGGAGGGAGCCACAACTGACCCAGAAATTACATTTTCTGTAAGGCCTACAAGTCCCTACTTCAATGGGCTTCGTAACCGCTTCACGACCGGGACGGACAAGGAACAGGGGCCCATTCCCACAGCACCCAGAGAAAATTCGCTTATGTTTCTCTCAACTATCCCTGACGACACTGTCCCTGCTTACGGGAATGTGCGTACCCCTCCCGTCAATTACCTCCCCGGTGAAATAACCGACCTCTTACAACTGGCCCGTATACCCACTCTCATGGCGTTTGGGCGGGTGTCTGAACCCGAGCCTGCCTCAGACGCATATGTGCCCTACGTTGCCGTTCCTGCCCAGTTCGACGACAAGCCTCTCATCTCCTTCCCGATCACCCTTTCAGATCCTGTCTACCAGAACACCCTGGTAGGCGCCATCAGTTCGAACTTCGCCAACTACCGGGGGTGTATCCAAATCACTCTGACATTTTGTGGGCCCATGATGGCAAGAGGGAAATTCCTGCTCTCGTATTCTCCCCCAAATGGAGCACAACCACAGACCCTTTCTGAAGCTATGCAGTGCACATACTCTATTTGGGATATAGGCTTGAACTCTAGTTGGACCTTTGTCATCCCCTACATCTCGCCCAGTGATTACCGTGAAACTCGGGCTATTACCAACTCAGTTTATTCTGCTGATGGTTGGTTTAGCTTGCACAAGCTGACCAAAATTACTCTACCACCTGACTGCCCACAGAGTCCCTGTATTCTCTTTTTCGCCTCTGCTGGTGAGGATTACACCCTCCGTCTCCCTGTTGATTGTAATCCTTCCTACGTGTTCCACTCCACCGACAACGCCGAGACTGGGGTTATTGAGGCAGGTAACACTGACACCGATTTCTCTGGTGAATTGGCGGCTCCTGGCTCTAACCATACTAATGTCAAATTCCTGTTTGACCGATCTCGACTACTGAATGTAATTAAGGTACTGGAGAAGGACGCCGTCTTCCCCCGTCCTTTCCCCACAGCAACGGGTGCACAGCAGGACGATGGTTACTTTTGTCTTCTAACACCCCGCCCAACAGTCGCTTCCCGACCCGCCACTCGCTTCGGCCTGTACGTCAACCCGTCTGACAGTGGCGTTCTCGCTAATACTTCACTGGATTTCAATTTTTACAGTTTGGCCTGTTTCACTTACTTTAGATCAGACCTTGAAGTCACGGTGGTCTCACTGGAGCCAGATTTGGAATTCGCCGTGGGGTGGTTCCCCTCTGGCAGTGAGTACCAGGCTTCTAGCTTTGTCTATGACCAACTGCATGTACCCTACCACTTTACTGGGCGCACTCCCCGCGCTTTCACCAGCAAGGGTGGAAAGGTATCTTTCGTGCTCCCTTGGAACTCTGTCTCTTCCGTGCTTCCCGTGCGCTGGGGGGGCGCTTCCAAGCTTTCTTCTGCCACGCGGGGTCTGCCGGCTCATGCTGACTGGGGGACCATTTACGCTTTTATCCCCCGTCCTAACGAGAAGAAAAGCACCGCTGTAAAGCACGTGGCGGTGTACGTTCGGTACAAGAACGCGCGTGCTTGGTGCCCCAGCATGCTTCCCTTTCGTAGCTATAAGCAGAAGATGCTGATGCAATCAGGCGACATCGAAACCAACCCTGGCCCTGCTTCTGACAACCCAATCTTGGAGTTTCTTGAGGCGGAAAACGATCTAGTCACTCTGGCCTCTCTCTGGAAGATGGTGCACTCTGTTCAACAGACCTGGAGAAAGTATGTGAAGAACGACAATTTTTGGCCCAACTTGCTCAGTGAGCTAGTGGGGGAAGGCTCCATCGCCTTGGCCGCCACGCTATCTAACCAAGCTTCAGTGAAAGCTCTCTTGGGCCTGCATTTTCTCTCTCGGGGACTCAACTACACAGATTTTTACTCTTTACTGATAGAGAAATGCTCTAGTTTCTTTACTGTAGAACCGCCTCCTCCACCAGCTGAAAATCTGATGACCAAGCCCTCCGTGAAGTCGAAATTCCGAAAGCTGTTTAAGATGCAAGGACCCATGGACACAGTCAAAGACTGGAACCAAATAGCCGCCGGCTTGAAGAATTTCCAATTTGTTCGTGACCTAGTCAAGGAGGTGGTCGACTGGCTCCAGGCTTGGATCAATAAAGAGAAAGCCAGCCCTGTCCTCCAGTACCAGCTGGAGATGAAGAAGCTCGGGCCCGTGGCTTTGGCTCATGATGCCTTCATGGCCGGTTCTGGGCCCCCTCTTGGTGACGACCAGATTGAATATCTCCAGAACCTCAAATCTCTTGCCCTAACACTGGGGAAGACCAATTTGGCCCAAAGTCTCACCACTATGATCAATGCAAAGCAGAGCTCCGCCCAACGAGTCGAACCCGTTGTGGTGGTCCTCAGAGGCAAGCCGGGATGCGGAAAAAGCTTGGCCTCCACGTTGATTGCCCAGGCTGTGTCCAAGCGTCTCTATGGCTCACAAAGTGTGTATTCTCTTCCTCCGGACCCAGACTTCTTCGACGGATACAAAGGACAGTTTGTAACCTTAATGGACGATCTGGGACAAAACCCGGATGGGCAAGACTTCTCCACCTTTTGTCAGATGGTGTCGACCGCCCAATTTCTTCCCAACATGGCGGACCTTGCAGAGAAGGGGCGTCCCTTCACCTCCAATCTTATCATTGCAACTACCAACCTCCCTCACTTTAGCCCTGTCACCATTGCTGATCCTTCTGCAGTCTCTCGGCGTATCAACTACGACCTGACTCTGGAAGTATCTGAGGCCTACAAGAAGCACACACGGCTAAATTTTGACTTGGCTTTCAGACGCACTGACGCCCCCCCCATTTATCCTTTTGCTGCCCATGTGCCCTTCGTGGACGTGGCTGTGCGCTTCAAAAATGGTCATCAAAGCTTCAATCTCCTAGAGTTGGTCGACTCTATTTGTGCAGACATTCGGGCCAAGCAACAAGGCGCCCGAAATATGCAGACTCTGGTTCTACAGAGCCCTAACGAGAACGACGACACCCCCGTCGACGAGGCGTTGGGTAGGGTTCTCACCCCCGCTGCGGTCGACGAGGCGCTTGTCGACCTCGCTCCAGATGCCGACCCGGTTGGCCGCTTGGCTATTCTCGCCAAGCTAGGTCTCGCCCTAGCTGCGGTCACCCCTGGTTTGATAATCCTGGCAGTGGGACTCTACAAGTATTTCTCTGGCTCTGATACAGACCAAGAAGAAACAGAAAGTGAGGAACCTGCTAAAGCGCCTAGGAGCGAGAATGCTTATGACGGCCCAAAGAAAAACTCTAAGCCCCCTGGAGCGCTCTCTCTTATGGAAATGCAACAGCCCAACGTGGACATGGGCTTTGAGGCTGCGGTCGCTAAGAAAGTGGTCGTCCCCATTACCTTCATGGTTCCCAACAGACCTTCTGGACTTACACAGTCCGCTCTTCTTGTGGCCGGCCGGACCTTCTTAATCAATGAGCACACATGGTCCAACCCCTCCTGGACCAGCTTCACAATCCGTGGTGAGGTGCACACTCGTGATGAGCCTTTCCAAACGGTTCATTTTACCCACCATGGTCTTCCCACAGATCTGATGATGGTACGTCTCGGACCGGGCAACTCTTTCCCTAACAATCTAGACAAATTTGGACTTGACCAGATGCCGGCACGTAACTCCCGTGTGGTTGGCGTTTCGGCTAGTTACGGTAACTTCTTTTTCTCTGGGAACTTCCTCGGGTTTGTTGACTCCATCACCTCTGATCAAGGAACCTATGCGAGACTTTTCAGGTACAGGGTGACGACTTACAAGGGATG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|
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|
Senecavirus A
|
Gao,H., Chen,Y., Xu,X., Xu,Z., Xu,S., Xing,J., Liu,J., Zha,Y., Sun,Y., Zhang,G.
|
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-28
| null |
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,546
|
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China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
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Senecavirus A strain SVA/China/GD-SG3/2/9/2020, complete genome
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|
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|
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|
Gao,H., Chen,Y., Xu,X., Xu,Z., Xu,S., Xing,J., Liu,J., Zha,Y., Sun,Y., Zhang,G.
|
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-28
| null |
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,546
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
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|
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|
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|
Senecavirus A
|
Gao,H., Chen,Y., Xu,X., Xu,Z., Xu,S., Xing,J., Liu,J., Zha,Y., Sun,Y., Zhang,G.
|
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-28
| null |
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
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|
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| null |
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|
China
|
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2020-04-01
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|
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|
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
|
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|
2022-08-28
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|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
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|
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China
|
China
|
Sus scrofa
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|
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|
Senecavirus A
|
Gao,H., Chen,Y., Xu,X., Xu,Z., Xu,S., Xing,J., Liu,J., Zha,Y., Sun,Y., Zhang,G.
|
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-28
| null |
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|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
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| null |
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|
China
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|
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|
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|
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|
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-28
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|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,546
|
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China
|
China
|
Sus scrofa
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|
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|
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|
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
|
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|
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|
Picornaviridae
|
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|
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| 26,578
|
ON868377.1
|
Senecavirus A
|
Gao,H., Chen,Y., Xu,X., Xu,Z., Xu,S., Xing,J., Liu,J., Zha,Y., Sun,Y., Zhang,G.
|
South China Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2022-08-28
| null |
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 6,546
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021-12-01
| null | null |
Senecavirus A strain SVA/China/GD-GZ/09/12/21, complete genome
|
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| 26,579
|
MW713116.1
|
Senecavirus A
|
Jiang,J., Zha,Y., Xing,C., Liu,J., Mi,S., Yu,J., Sun,Y., Tu,C., Gong,W., Lu,Z.
|
Foshan University, College of Life Sciences and Engineering
|
China
|
2022-07-23
| null |
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,318
|
GenBank
| null |
China: Guangdong
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2019
| null | null |
Senecavirus A strain SVA-GDLD2-2019, complete genome
|
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| 27,728
|
MW713117.1
|
Senecavirus A
|
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|
Foshan University, College of Life Sciences and Engineering
|
China
|
2022-07-23
| null |
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,318
|
GenBank
| null |
China: Guangdong
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2019
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|
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| 27,729
|
MW713118.1
|
Senecavirus A
|
Jiang,J., Zha,Y., Xing,C., Liu,J., Mi,S., Yu,J., Sun,Y., Tu,C., Gong,W., Lu,Z.
|
Foshan University, College of Life Sciences and Engineering
|
China
|
2022-07-23
| null |
Senecavirus A
|
Senecavirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
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|
GenBank
| null |
China: Guangdong
|
China
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Sus scrofa
| null |
2018
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Senecavirus A strain SVA-GD5-2018, complete genome
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| 27,730
|
KY986579.1
|
Serinus canaria polyomavirus
|
Rinder,M., Schmitz,A., Peschel,A., Moser,K., Korbel,R.
|
Clinic for Birds, Small Mammals, Reptiles and Ornamental Fish, Center for Clinical Veterinary Medicine, LMU Munich
|
Germany
|
2018-01-15
| null |
Gammapolyomavirus secanaria
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Gammapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,403
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Taeniopygia guttata
|
animal tissues
|
2014
| null | null |
Serinus canaria polyomavirus strain 32469, complete genome
|
TTCTGACCGCGTGGCAGTGGGGTCACTTTGGCGCCAACTTTTTTCTCTTTGCTATAGCATATCTTGCCAGAGCACACAGACAAAAAGTAGTTTGAGCCCTACGTCATCTACCATGTTTGGTCAGTAGGGGCGGTGCAGGGTTAGATGTGTTTGTGATTGGTTCACGTCAAACGCGTCACGCAGCCCATAAAAGGCAGTGCCTCTTAATTCTAACACAGACAGTCCTGTAGCGGGAATAAGTGTTTAAACCTCTGTCCTCCAATCAAGGTAAGCGGGAATGGCCAGCCGACCTGACGACACTTCCTCTGTAAGTGCTTACCCCTCTTACGTATATCCTCAGGATGCCGCCATTGGGGTTCTTTAACTGGGACCTTTACGCGGAGCTCGCTTTTATCCTTTTTGTTTGCTATTTCTGCTATATAGTTTTGCTCCGCTGCCTCATGGATTTCTTGGGGGTACCACCGCCGGGCTTCTTTAATGTTACACCGTTTTTCTGGCAAGGACCTCGCCCGCCGGAGCCCCCACCTTCTCTGAACTAATGCGCTGCTTTGCATATATGGCTCATATCCCCTTCCCCACCACCCCCGTTCCTCACAACGTGATCTGTATGTAGGGCCCATATCCCCTTCCCTCCACCCCCGGCCCTGACAACGCCGATGGGGCAGCTGACGATGATGGCTCGTCTACTGGTGAAGAGATGGAGTGCTCCTTTGTTGTAGTAAGTACTGGCCGTTGGCCGCTATCCCTCTTCCCGCCTTGGCTGTCAGCCATATGGCTGTCCAGTAGAACTTATTTAGAATTGTTTTCAGAACCTTAAGCCGAAGAAGGAGAGGCCCAGGCCTTATGCGAGACCTGTTCGTCGCAATCTTGAGAAGGAATTTGCGGAGCTGGAGAAGAAAATAAAAGAACTCGAGGACAAAATCAAGGAAGAGGAGAAGGAAAACATTCCGCCGTCTGCTCCGGAACCTGCTGTCGTCATTGCCTCGCCGCCAGTCCAACCACAACCGACCCCAACCCCCCCTGCCGACACATCAGCCTAGGTTGGTGTTAGGTTGGATATGTTTTCCCATGGGTGCTATTGTTAGCATCTTTGTTGCTATTGGTGAAGCTGTAGCAGCCACAGGGCTTGCTGCTGAGACTATCATATCTGGGGAGGCGGCAGCTATATTAGGGGCACAGATATCATCTTTGGTGGCTGAGGGGTTTACAACCGCGGAGGCCCTAAGTACCTTAGGTCTCACACCTGAATTATTTGCATTCACCACATCTCTTGCAAGTGCTGCAGAGTCAGGAGGGGCTTTGTGGACAGGACTTGCTTCAGGATTGTATAGCCTAGGTGGGGCAGGGGTTTCGGGTATTGCAGGTGGCTTTCAGGGAGGCATTGCCACAGCAGCTGCTGGTCTCGTACGTTTCCCTAATATTTCAAAACACAGACACGAGATGGCCTTGCAGATTTGGCAACCCCTGGACTGGCTTTACCCAGAGGCGGAGTGGTTGTATAATGCTTACCATTACTTCGACCCATATTCCTGGCTGCCCTCCCTGATGGACCAATTGGGATCCTACTTCTGGCAGTATGTAGAGCGTACAGGTCATAGGCAACTTACGTCACAGGCCACTGCTGTAGCCGTCCGTGCTACTAATAGGGCTTGGTACACACTTATGGAGCAGATAAATAATGCTGGGTGGTTTATTAGGAATAGTTATTATGCTCTGGAGCATTATTATCGAGTGCTCCCTCCCAGATTTGGTCCTCCCAGATTGGGGCCATATTTGGAAGCTAATAGGGACAATGTTTTCATAGATCCTCCTGATATGGGAAGTGAGACCTCAGACAACAGGTTTGAGGGAGACTTTTTAAAAAGGCTTAAGAAGATGTTTAACAGAGAGCAGGAGAGTGGAGAACGTGTCTATAGGTCACGTCCTCCTGGTGGTGCTGAGCAAATGGTGACACCTGACTGGCTTCTCCCTCTAATTTTAGGTCTGTTTGGCGATCTGACTCCTACGTTTGCTGCTGATATCAGGAGGTATGGCTCCGAGAACAGGAAAAGGAAGGCAACCAACACCAGTACCCCGCCTGTTAATAAAAGGAGGAATCGAGGTACTAGGCCTAAAGACCGGAGAAGACTCAATAACCACAGTCGAGGCCTATCTAAATCCTAGAATGGGAACCGGTAATGGAGCATATTCAGCAGCATTAACAGTAGGGTCAGCTACGTCTGACAAACCTAAAAAATCAGAATTGCCTTGTTATAGCTGTGCTAAGATATCTTTACCTACTCTAAACGAAGACCTTACAGGTAGTACTATGCTTATGTGGGAGGCAGTGTCTGTGAAAACCGAGGTGGTGGGTGTGTCTTCCCTAACAAACGTGCATTCGGGGGGTCTCAATAACAGACAGGTTGGAGGTTATGGTGCAGGTCTTCCTGTCAGTGGCCTAAATTTCCATTTCTTTGCTGTTGGAGGAGAGCCATTAGACATGCAAGGGTATGTGCAAAGCGTAGTTACAGAGTATCCTGAAGGGACTACAGGGCCGAAGGAAGGGCACACTAGCAATACTGACAGTGATGTCCTGAACCCTATCTATAAGGCTAGGCTGACTGCTGATGGTACCTTCCCTGTGGAGAGTTGGTGCCCTGACCCATCGAGGAATGAGAACACCAGATACTTTGGTCACCTTACAGGGGGGATAGGAGCACCACCTGTATTACAGTTCACTAACACCGTGACCACTGTACTCCTGGATGAAAACGGGGTGGGTCCCCTCTGTAAGGGAGACGGCCTGTACCTGACCTCTGCAGATATATGTGGCCTCCTCACCGATCAGGACAGCAAGCAGTATTTTAGGGGCCTAGCTAGATATTTCAATGTGACCCTCAGGAAAAGAGTTGTGAAAAACCCCTACCCTGTGTCTAGCCTGCTTAACACACTCTTCTCCTCCATGATGCCCACTGTGACAGGCCAGCCTATGACAGGTAGTGGTGCTCAGGTTGAAGAAGTCCGGATTTATGAAGGTACAGAGGGCCTCCCAGGTGATCCTGATATTCAGAGAACTAGGGATCAGCTGGGCCGCACGATCACTGAACTTCCCCATAACTGAAAAGTCTTAACCCCCCCAATATCTAGACCCCCCTGGGTTCTGACCTATGGGTCTGAGCATTAACCCTGGAAAATTTGGGACTTCTCTCCCTCACCGTTCGGGAGGGAGGGGCTGGCAAATTCATGCATTCTGAGCCTATATATGTAGCGCGCGCTTTTCGCCGGAAGTGAAGAACACTATTGTAACAAGCCTTTTATTGGAATAAAAGTTCTCGCTGCTACCAAGTTGTAGAGTCTTCTTCGTCAGGTGCAAAATACGCTTTTCCCTCACGCAGGTTATAGGAGTACTTCATGCATCGTCGGTCGAACTCCAACTTTAGTGCTTCAACAGTCAGCTTATGCTCCAGGATTAATGTCTTCTTAACTCTACCTTCAGTCTCTGGAGTTACAAGTAGCAGGCCTAAGACAGTCTCTGCCTTTGTTAGATATCGTCCCTCGGTGATATCTAGGTTTGCATCCAAGGCTCGTGCATATTCGGGGTTTGGGGCAAAATCAACTACCTGCCTGCATCTCACTCTCACAGTGTGGGGTATCACATACTGATTGCAAGTAATGATACCTGGTGGGAAAATCTGTGAGACCTTGTTCTGATGCTTTCTCTCAAGATTCACAGGTACATAGCCATCCAAGTGATCTCTAAGATTGTCTAAATTTAGCATGCCCATGCCTGACGGGAGTGATTTATCCCCCTCAGGCTGTCCCTTTACATCCTCAAAAAGCACAGCAAAGCAGTCTATAGCACACCCTAGCTCGAAGGGCAACCTCTCAGGATTGCCATTAACATTAAGTGTAGAACCCCCCAGGAGGTTTAGCAGTCCAGCTGCTAGGGTGGTCTTCCCTGTATTCACAGGCCCCTTGAATACAAAGTACCTCTGTTTAGGGGGGTTCCTCACCATGGTCTCAATAATATCTGCAAGAAGCTCTACATTACCCTTAATTAGCATGTTAAGCAATAGCATAGCACAAACAAGGTTATCTGTTTCCTCTGTGTCCGCAAGCATACGTGCTAACCCCTTAAGAACAACCCCCACCCTCTCAGCAAACATCTCATTACGTGTCATAGTGTATGCTTTGTATCGTCTTTCTGCAAGGACACAGTCTACAGCACACTGACATATCCTCTTTTGATCCTTTAAGGTAGTGAATATTTTTGCATTCTTATGGTGGTCGTCATGTAGAGTGGGATGGCTGTTCCTGGGGTTGCCTTTAGGCTTTCTAGAGCCTTTGCATTCTAGGCATTCCTTGATAGGTGTTGCAAACCTTTTGTACACAGCTAGGAGCAACAGTGCATCCGTCAACTCCTTCGTAATTGCAAACTCATTAAGTAGGGCATAATTAAATTGTTTTTCCTCGGGCCCTTCCTCTGCAAGGTTGCTCTCAACAATACTTATGCTATCGAGGTCTTTGAATGCTGCACAGAGCTTGGAGAAGCAGTTTTTCTTCACTCCTCTCGAATTGAAATAGGAAATGGTGCAATGCTTTTTTAGGAAGTTCTGAATTGTGGAGACTCTTGTTGTATTTTGCAGGTGTAGGAGGAGGAAAGCCAAATCCTCCCCCCAATTAGCCCGTAGGTAGCCCTTTGTAGTAAAGTGCTGCAAAATCCGGACCCTTAGAGATTCCATTTTTTGCTGGGTTGTGCAAACGAGGTGTACATCTGGGCAGCTCTGCACAGATTTCTCATTTAATAGACAGGCTTCAATGACTTCAGGGAGTACGACAGTACGGCCAAATTTGGGTGGGGTCCCCCAGGAGTCTCCTGAGTTTGGGGGGGTCCGGTCAGGGTCCTACGGGCAAAACAGAGCCTTAAAGATCTGTCTCTTTGAACAGTCTCCCGAAAACCCCCCATGGAATTTCATTGTAGTTTGCAGCCATCCTGCCAAATTCAGGGCTCAGGCATTGCT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|
KY986580.1
|
Serinus canaria polyomavirus
|
Rinder,M., Schmitz,A., Peschel,A., Moser,K., Korbel,R.
|
Clinic for Birds, Small Mammals, Reptiles and Ornamental Fish, Center for Clinical Veterinary Medicine, LMU Munich
|
Germany
|
2018-01-15
| null |
Gammapolyomavirus secanaria
|
Gammapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,400
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Carduelis carduelis
|
animal tissues
|
2015
| null | null |
Serinus canaria polyomavirus strain 34639, complete genome
|
TTCTGACCGCGTGGCAGTGGGGTCACTTTGGCGCCAACTTTTTTCTCTTTGCTATAGCATATCTTGCCAGAGCACACAGACAAAAAGTAGTTTGAGCCCTACGTCATCTACCATGTTTGGTCAGTAGGGGCGGTGCAGGGTTAGATGTGTTTGTGATTGGTTCACGTCAAACGCGTCACGCAGCCCATAAAAGGCAGTGCCTCTTAATTCTAACACAGACAGTCCTGTAGCGGGAATAAGTGTTTAAACCTCTGTCCTCCAATCAAGGTAAGCGGGAATGGCCAGCCGACCTGACGACACTTCCTCTGTAAGTGCTTACCCCTCTTACGTATATCCTCAGGATGCCGCCATTGGGGTTCTTTAACTGGGACCTTTACGCGGAGCTCGCTTTTATCCTTTTTGTTTGCTATTTCTGCTATATAGTTTTGCTCCGCTGCCTCATGGATTTCTTGGGGGTACCACCGCCGGGCTTCTTTAATGTTACACCGTTTTTCTGGCAAGGACCTCGCCCGCCGGAGCCACCTTCTCTGAACTAATGCGCTGCTTTGCATATATGGCTCATATCCCCTTCCCCACCACCCCCGTTCCTCACAACGTGATCTGTATGTAGGGCCCATATCCCCTTCCCTCCACCCCCGGCCCTGACAACGCCGATGGGGCAGCTGACGATGATGGCTCGTCTACTGGTGAAGAGATGGAGTGCTCCTTTGTTGTAGTAAGTACTGGCCGTTGGCCGCTATCCCTCTTCCCGCCTTGGCTGTCAGCCATATGGCTGTCCAGTAGAACTTATTTAGAATTGTTTTCAGAACCTTAAGCCGAAGAAGGAGAGGCCCAGGCCTTATGCGAGACCTGTTCGTCGCAATCTTGAGAAGGAATTTGCGGAGCTGGAGAAGAAAATAAAAGAACTCGAGGACAAAATCAAGGAAGAGGAGAAGGAAAACATTCCGCCGTCTGCTCCGGAACCTGCTGTCGTCATTGCCTCGCCGCCAGTCCAACCACAACCGACCCCAACCCCCCCTGCCGACACATCAGCCTAGGTTGGTGTTAGGTTGGATATGTTTTCCCATGGGTGCTATTGTTAGCATCTTTGTTGCTATTGGTGAAGCTGTAGCAGCCACAGGGCTTGCTGCTGAGACTATCATATCTGGGGAGGCGGCAGCTATATTAGGGGCACAGATATCATCTTTGGTGGCTGAGGGGTTTACAACCGCGGAGGCCCTAAGTACCTTAGGTCTCACACCTGAATTATTTGCATTCACCACATCTCTTGCAAGTGCTGCAGAGTCAGGAGGGGCTTTGTGGACAGGACTTGCTTCAGGATTGTATAGCCTAGGTGGGGCAGGGGTTTCGGGTATTGCAGGTGGCTTTCAGGGAGGCATTGCCACAGCAGCTGCTGGTCTCGTACGTTTCCCTAATATTTCAAAACACAGACACGAGATGGCCTTGCAGATTTGGCAACCCCTGGACTGGCTTTACCCAGAGGCGGAGTGGTTGTATAATGCTTACCATTACTTCGACCCATATTCCTGGCTGCCCTCCCTGATGGACCAATTGGGATCCTACTTCTGGCAGTATGTAGAGCGTACAGGTCATAGGCAACTTACGTCACAGGCCACTGCTGTAGCCGTCCGTGCTACTAATAGGGCTTGGTACACACTTATGGAGCAGATAAATAATGCTGGGTGGTTTATTAGGAATAGTTATTATGCTCTGGAGCATTATTATCGAGTGCTCCCTCCCAGATTTGGTCCTCCCAGATTGGGGCCATATTTGGAAGCTAATAGGGACAATGTTTTCATAGATCCTCCTGATATGGGAAGTGAGACCTCAGACAACAGGTTTGAGGGAGACTTTTTAAAAAGGCTTAAGAAGATGTTTAACAGAGAGCAGGAGAGTGGAGAACGTGTCTATAGGTCACGTCCTCCTGGTGGTGCTGAGCAAATGGTGACACCTGACTGGCTTCTCCCTCTAATTTTAGGTCTGTTTGGCGATCTGACTCCTACGTTTGCTGCTGATATCAGGAGGTATGGCTCCGAGAACAGGAAAAGGAAGGCAACCAACACCAGTACCCCGCCTGTTAATAAAAGGAGGAATCGAGGTACTAGGCCTAAAGACCGGAGAAGACTCAATAACCACAGTCGAGGCCTATCTAAATCCTAGAATGGGAACCGGTAATGGAGCATATTCAGCAGCATTAACAGTAGGGTCAGCTACGTCTGACAAACCTAAAAAATCAGAATTGCCTTGTTATAGCTGTGCTAAGATATCTTTACCTACTCTAAACGAAGACCTTACAGGTAGTACTATGCTTATGTGGGAGGCAGTGTCTGTGAAAACCGAGGTGGTGGGTGTGTCTTCCCTAACAAACGTGCATTCGGGGGGTCTCAATAACAGACAGGTTGGAGGTTATGGTGCAGGTCTTCCTGTCAGTGGCCTAAATTTCCATTTCTTTGCTGTTGGAGGAGAGCCATTAGACATGCAAGGGTATGTGCAAAGCGTAGTTACAGAGTATCCTGAAGGGACTACAGGGCCGAAGGAAGGGCACACTAGCAATACTGACAGTGATGTCCTGAACCCTATCTATAAGGCTAGGCTGACTGCTGATGGTACCTTCCCTGTGGAGAGTTGGTGCCCTGACCCATCGAGGAATGAGAACACCAGATACTTTGGTCACCTTACAGGGGGGATAGGAGCACCACCTGTATTACAGTTCACTAACACCGTGACCACTGTACTCCTGGATGAAAACGGGGTGGGTCCCCTCTGTAAGGGAGACGGCCTGTACCTGACCTCTGCAGATATATGTGGCCTCCTCACCGATCAGGACAGCAAGCAGTATTTTAGGGGCCTAGCTAGATATTTCAATGTGACCCTCAGGAAAAGAGTTGTGAAAAACCCCTACCCTGTGTCTAGCCTGCTTAACACACTCTTCTCCTCCATGATGCCCACTGTGACAGGCCAGCCTATGACAGGTAGTGGTGCTCAGGTTGAAGAAGTCCGGATTTATGAAGGTACAGAGGGCCTCCCAGGTGATCCTGATATTCAGAGAACTAGGGATCAGCTGGGCCGCACGATCACTGAACTTCCCCATAACTGAAAAGTCTTAACCCCCCCAATATCTAGACCCCCCTGGGTTCTGACCTATGGGTCTGAGCATTAACCCTGGAAAATTTGGGACTTCTCTCCCTCACCGTTCGGGAGGGAGGGGCTGGCAAATTCATGCATTCTGAGCCTATATATGTAGCGCGCGCTTTTCGCCGGAAGTGAAGAACACTATTGTAACAAGCCTTTTATTGGAATAAAAGTTCTCGCTGCTACCAAGTTGTAGAGTCTTCTTCGTCAGGTGCAAAATACGCTTTTCCCTCACGCAGGTTATAGGAGTACTTCATGCATCGTCGGTCGAACTCCAACTTTAGTGCTTCAACAGTCAGCTTATGCTCCAGGATTAATGTCTTCTTAACTCTACCTTCAGTCTCTGGAGTTACAAGTAGCAGGCCTAAGACAGTCTCTGCCTTTGTTAGATATCGTCCCTCGGTGATATCTAGGTTTGCATCCAAGGCTCGTGCATATTCGGGGTTTGGGGCAAAATCAACTACCTGCCTGCATCTCACTCTCACAGTGTGGGGTATCACATACTGATTGCAAGTAATGATACCTGGTGGGAAAATCTGTGAGACCTTGTTCTGATGCTTTCTCTCAAGATTCACAGGTACATAGCCATCCAAGTGATCTCTAAGATTGTCTAAATTTAGCATGCCCATGCCTGACGGGAGTGATTTATCCCCCTCAGGCTGTCCCTTTACATCCTCAAAAAGCACAGCAAAGCAGTCTATAGCACACCCTAGCTCGAAGGGCAACCTCTCAGGATTGCCATTAACATTAAGTGTAGAACCCCCCAGGAGGTTTAGCAGTCCAGCTGCTAGGGTGGTCTTCCCTGTATTCACAGGCCCCTTGAATACAAAGTACCTCTGTTTAGGGGGGTTCCTCACCATGGTCTCAATAATATCTGCAAGAAGCTCTACATTACCCTTAATTAGCATGTTAAGCAATAGCATAGCACAAACAAGGTTATCTGTTTCCTCTGTGTCCGCAAGCATACGTGCTAACCCCTTAAGAACAACCCCCACCCTCTCAGCAAACATCTCATTACGTGTCATAGTGTATGCTTTGTATCGTCTTTCTGCAAGGACACAGTCTACAGCACACTGACATATCCTCTTTTGATCCTTTAAGGTAGTGAATATTTTTGCATTCTTATGGTGGTCGTCATGTAGAGTGGGATGGCTGTTCCTGGGGTTGCCTTTAGGCTTTCTAGAGCCTTTGCATTCTAGGCATTCCTTGATAGGTGTTGCAAACCTTTTGTACACAGCTAGGAGCAACAGTGCATCCGTCAACTCCTTCGTAATTGCAAACTCATTAAGTAGGGCATAATTAAATTGTTTTTCCTCGGGCCCTTCCTCTGCAAGGTTGCTCTCAACAATACTTATGCTATCGAGGTCTTTGAATGCTGCACAGAGCTTGGAGAAGCAGTTTTTCTTCACTCCTCTCGAATTGAAATAGGAAATGGTGCAATGCTTTTTTAGGAAGTTCTGAATTGTGGAGACTCTTGTTGTATTTTGCAGGTGTAGGAGGAGGAAAGCCAAATCCTCCCCCCAATTAGCCCGTAGGTAGCCCTTTGTAGTAAAGTGCTGCAAAATCCGGACCCTTAGAGATTCCATTTTTTGCTGGGTTGTGCAAACGAGGTGTACATCTGGGCAGCTCTGCACAGATTTCTCATTTAATAGACAGGCTTCAATGACTTCAGGGAGTACGACAGTACGGCCAAATTTGGGTGGGGTCCCCCAGGAGTCTCCTGAGTTTGGGGGGGTCCGGTCAGGGTCCTACGGGCAAAACAGAGCCTTAAAGATCTGTCTCTTTGAACAGTCTCCCGAAAACCCCCCATGGAATTTCATTGTAGTTTGCAGCCATCCTGCCAAATTCAGGGCTCAGGCATTGCTTCC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Serinus canaria polyomavirus
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Rinder,M., Schmitz,A., Peschel,A., Moser,K., Korbel,R.
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Clinic for Birds, Small Mammals, Reptiles and Ornamental Fish, Center for Clinical Veterinary Medicine, LMU Munich
|
Germany
|
2018-01-15
| null |
Gammapolyomavirus secanaria
|
Gammapolyomavirus
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Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,422
|
GenBank
| 1
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Germany
|
Germany
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Serinus canaria
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animal tissues
|
2015
| null | null |
Serinus canaria polyomavirus strain 37273, complete genome
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TTTTTGACCGCGTGGCAGTGGGGTCAGATTGGCGCCAACTTTTTTTCCTTTGCTATAGCATATCTTGCCAGAGCACACAGACAAAAAGTAGTTTGAGCCCTACGTCACCTACCATGTTTGGTCAGTAGGGGCGGTGCAGGGTTGCATGTGTGTGTGATTGGTCCACGTCAAACGCGTCACACAGCCCATAAAAGGCAGTGCCTCTTAATTCTAGCACAGACAGTTTTGTAGCGGGAATAAGTGTTTAAATCTCTGTCCTCCAATCAAGGGCCAGGTAAGCGGGAATGGCCAGCCGACCTGACGACACTTCCTCTGTAAGTGCTTACCCCTTCTTACGTGCTTCCTCAGGATGCCGCCAGTGGGGTTCTTTAACTGGGACCTTTACGCGGAACTCGCTTTTATCCTTTTTGTTTGTTATTTCTGTTACTCTGTTTTGCTCCGCTGCCTAATGGATTTCCTGGGGGTCCCGACGCCGGGCTTCTTTAATGTAACACCATGGTTCTGGCAAGGACCTCGCCCGCCCGAGCCCCCGCCTTCTCTGAACTAATACGCTGTTTTGCATGTATGGCTCAGATCCCCTTCCCCACCACCCCCGTTCCTGACAACGTGATCTGTATGTAGGGCCCATATCCCCTTCCCTCTGCCACCCCCGGCCCTGACAGCGCCGACGGGGCGGCTGAAGATGGCTCCTCGACAAGTGGTGAAGAAGTGGAGTGTTCTTTTGTCGTAGTAAGTACTGGCCGCTGGCTGCTATCCCTTTTCCCGCCTTGGCTGTCAGCCATATGGCTGTCCAGCTGGACTCAATTAGAATTGTTTTCAGAACCTTAAGCCGAAGAAGGAGAGGCCCAGGCCTTATAAGAGACCTGTTCGTCGAAACCTTGAGAAGGAATTTGAGGAGCTGGAGAAGAAAATAAAAGAACTCGAGGAGAAAATAAAGGAAGAAGAGGAGAAGGAAAACATTCCGCCGTCTGCTCCGGAACCTGCTGTCGTCACCGCCTCGCCGCCAGCCCAACCACAGCCGACCCCAACCCCCCCCGCCGACACATCAGCCTAGGTTGGTGTTAGGTTGGATATGTTTTCCCATGGGTGCTATTGTTAGCATCTTCGTTGCTATTGGTGAAGCTGTAGCAGCCACAGGACTTGCTGCTGAAACCATTATATCTGGGGAGGCGGCAGCAATATTAGGGGCACAGATATCATCTCTGGCGGCTGAGGGGTTTACAACCGCGGAGGCCTTAAGTACTTTAGGTCTCACACCTGAATTATTTGCATTCACCACATCCCTTGCAAGTGCTGCAGAGTCAGGAGGGGCTTTGTGGACAGGAATAGCTTCGGGATTGTATAGCCTAGGTGGGGCAGGGGTTTCGGGTATTGCAGGTGGCTTGCAGGGAGGCATTGCCACAGCAGCTGCTGGTCTGGTACGTTTCCCTAACATTTCCAAACAGAGACACGAGATGGCCTTACAGATTTGGCAACCTCTGGACTGGCTTTACCCAGAGGCGGAGTGGTTGTACAATGCCTACCATTACTTCGACCCATATTCCTGGCTCCCCTCTCTGATTGACCAATTGGGATACTACTTCTGGGAGTATGTAGAACGTACAGGTCAGAGGCAACTTGCGTCACAGGCCACCGCCGTAGCCGTCCGTGCTACTAATAGGGCTTGGTACACACTGACGGAGCAGATAAGTAATGCTGGGTGGTTCATTAGGAATGGGTATTATGCTCTGGAGCACTATTATCGAGTGCTCCCTCCCAGATTTGGTCCTCCTAGGTTGAGGTCATATTTAGAAGCTAATAGGGAAAATGTCTTCATAGATCCTCCTGATATGGGAAGTGAGACCTCAGACAACAGATTTGAGGGAGACTTTTTAAAGAGACTCAAGAAGATATTTAGTAGAGAGCAGGAGAGTGGAGAACGTGTCTACAAGTCACGTCCTCCTGGTGGTGCTGAGCAAATGGTGACACCTGACTGGCTTCTCCCTCTAATTTTAGGTCTGTTGGGCGACCTGACTCCTACGTTTGCTGCTGATATCAGGAGGTATGGCTCCGAGAACAGGAAAAGGAAGGCTACCAGCACCAGTACCCCGCCTGTTAATAAAAGGAGGAATCGAGGTACTAGGCCTAAAGACCGGAGAAGACTCAATAACAACAGTCGAGGCCTATCTAAATCCCAGAATGGGAACCGGTAATGGAGCATATTCAGCAGCATTAACAGTAGGGTCAGCTACGTCTGACAAACCTAAAAAATCAGAATTGCCATGTTATAGCTGTGCTAAGATAACTTTACCAACTCTGAACGATGACCTTACAGGTAGTACTATGCTTATGTGGGAGGCAGTGTCTGTGAAAACCGAGGTGGTGGGTGTCTCTTCCCTGACAAATGTGCATTCGGGGGGTCTGAATAACAGACAGGTTGGAGGTTATGGTGCAGGTCTTCCTGTCAGTGGCCTAAATTTCCATTTCTTTGCTGTTGGAGGAGAGCCATTAGATATGCAAGGGTATGTGCAAAGCGTAAATACAGAATATCCTGCAGGGACTACAGGGCCGAAGGAAGGGCACACTAGTAATGCTGACAGTGATGTCCTCAACCCTATCTATAAGGCCAAGCTAACTGCTGATGGTGTGTTCCCTGTGGAGAGTTGGTGCCCTGACCCATCGAGGAATGAAAACACCAGATACTTTGGTCACCTTACAGGGGGAGTGGGAGCACCACCTGTAATACAGTTCACTAACACTGTGACCACTATTCTGCTGGATGAGAACGGGGTGGGTCCCCTCTGTAAGGGAGACGGGTTGTACCTTACATCTGCAGATATATGTGGCCTCCTCACTGATCAGGACAGCAAGCAGTATTTCAGGGGCCTGGCCAGATACTTCAATGTGACCCTTAGGAAACGAGTTGTGAAAAACCCCTATCCTGTGTCTTCTTTGCTGAACACACTCTTCTCCTCAATGATGCCCACTGTGACAGGCCAGCCTATGTCTGGCACCGATGCTCAGGTTGAAGAAGTCCGGATTTATGAAGGTACAGAGGGCCTACCAGGTGATCCTGATGTTCAGAGAACTAGGGATCAACTGGGCCGCGTGGTCAGTGAACTTCCTCATAACTGAAAATTCTTACCCCCCCCAATATCTAGACCCCCCTGGGTTCTGACCTATGGGTCTGAGCATTAACCCCGCAAAATGTGGAATTTCTCCTCCTTACCGTTTGGGAGGGAGGGGCTGGCAAATTCATGCATTTCTGGGCCTATACATGTAGCGCGCGCTTTTAGCCGGAAGTGAAGAACACTAATTGTAACAAGCCTTTTATTGGAATAAAGGTTCTCGCTGCTATCAGGGTGTAGAGTATTCTTCATCGGGTGCAAAATACGCTTTTCCCTCACGTAGGTTATAGGAGTACTTCATGCACCGGCGGTCGAACTCGATCTTCAGTGCTTCAACAGTCAGCTTATGCTCCAGGAGTAATGTCTTCTTAACTCTACCTTCAGTCTCTGGAGTTACAAGTAGCAAACCTAATACAGTCTCTGCCTTCGTTAGATATCGTCCCTCGGTAATATCTAAATTTGCATCCAAGGCTTGTGCATATTCTGGGTTGGGGGTAAAATCAACGACCTGCCTACATCTCACTCTCACAGTGTGGGGTATTACATACTGATTGCAGGTAATGATACCTGGTGGGAAGATCTGTGAGACCTTGTTCTGATGCTTCCTCTCAAGATTCACAGGTACATAGCCATCCAGGTGATCTCTAAGATTGTCTAAATTCAGCATGCCCATGCCTGACGGGAGTGATTTATCCCCCTCAGGCTGTCCCTTTACATCCTCGAAAAGCACAGCAAAGCAGTCTATAGCACACCCTAGCTCGAAGGGCAACCTCTCAGGATTGCCATTAACATTCAGTGTAGAACCCCCCAGAAGGTTTAGCAGGCCAGCTGCTAGGGTGGTCTTCCCTGTATTCACAGGCCCCTTGAACACATAGTACCGCTGTTTAGGGGGGTTCCTCACCATGGTCTCAATGATCTCTGCAAGAAGCTCTACATTACCCCTAATTAGCATGTTCAGCAATAGCATAGCACAAACAAGGTTATCAGTTTCCTCTGTGTCCGCAAGCATACGTGCTAACCCCTTAAGTACAGCCCCCACCCTCTCAGCAAACATTTCATTACGTGTCATAGTGTATGCTTTGTATCGTCTTTCTGCAAGGACACAGTCTACAGCACACTGACATATCCTCTTCTGATCCTTCAAGGTACAGAATATCTTTGCATTCTTATGGTGGTCGTCATGTAGAGTGGGGTGGCTGTTCCTGGGGTTGTCTTTAGGCCTTCTAGAGGCTTTGCACTCTAGGCACTCCTTGATAGGTGTTGCAAACCTCTTGTACACAGCTAGGAGCAAAAGTGCATCCGTCAACTCCTTTGTAATTGCAAACTCATTAAGCAGGGCATAATTAAATTGTTTTTCCTCGGGCCCTTCCTCTGCAAGGTGGTTCTCAACAATGTCTATGTCATGGAGGTCTTTGAATGCTGCACAGAGCTTGGAGAAGCAGTTCTTCTTCACTCCTCTCGAATTGCAATAGGAGATGGTACAATGTTTTTTTAGGAAGTTCTGTATTGTGGAGACCCTTGTTGTATTTTGCAGGTGTAGGAGAAGGAAAGCCAGGTCCTCCCTCCAGTTAGCCCGTAGGTAGCCCTTGGTAGTAAAATGCTGCAATATCCGGACCCTGAGAGATTCCATTTTTTGCTGGGTTGTGCAAACGAGGTGTACATCTGGGCAGCTCTGCACAGATTTCTCATTTAATAGACAGGCTTCAATGATTTCAGGGAGCACAACAGTACGGCCAAATTTGGGTGGGGTCCCCCAGGAGTCTCCTGAGTTAGGGGGGGTCCGGTCAGGGTCCTACGGGCAAAACACATCCTTAAAGATCCGTCTCTTTGAACAGTCTCCCGAACACCCCCCATGGAATTGCATAGTAGTTTTCAGCCATCCTGCCAAATTCA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|
Serinus canaria polyomavirus
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Rinder,M., Schmitz,A., Peschel,A., Moser,K., Korbel,R.
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Clinic for Birds, Small Mammals, Reptiles and Ornamental Fish, Center for Clinical Veterinary Medicine, LMU Munich
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Germany
|
2018-01-15
| null |
Gammapolyomavirus secanaria
|
Gammapolyomavirus
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Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,422
|
GenBank
| 1
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Germany
|
Germany
|
Carduelis carduelis
|
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|
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|
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| 72,629
|
KY986583.1
|
Serinus canaria polyomavirus
|
Rinder,M., Schmitz,A., Peschel,A., Moser,K., Korbel,R.
|
Clinic for Birds, Small Mammals, Reptiles and Ornamental Fish, Center for Clinical Veterinary Medicine, LMU Munich
|
Germany
|
2018-01-15
| null |
Gammapolyomavirus secanaria
|
Gammapolyomavirus
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Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,403
|
GenBank
| 1
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Germany
|
Germany
|
Taeniopygia guttata
|
animal tissues
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2016
| null | null |
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| 72,630
|
AY545914.1
|
Severe acute respiratory syndrome coronavirus
|
Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Department of Microbiology
| null |
2005-03-01
|
HC/SZ/79/03
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,723
|
GenBank
| null |
China: Shenzhen
|
China
| null | null | null | null | null |
SARS coronavirus isolate HC/SZ/79/03, complete genome
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| 109,149
|
AY545915.1
|
Severe acute respiratory syndrome coronavirus
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Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Department of Microbiology
| null |
2005-03-01
|
HC/SZ/DM1/03
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
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|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null | null | null | null |
SARS coronavirus isolate HC/SZ/DM1/03, complete genome
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus
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Guan,Y.
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The University of Hong Kong, Department of Microbiology
| null |
2005-03-01
|
HC/SZ/266/03
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
| null |
China
|
China
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SARS coronavirus isolate HC/SZ/266/03, complete genome
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus
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Guan,Y.
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The University of Hong Kong, Department of Microbiology
| null |
2005-03-01
|
HC/GZ/81/03
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
| null |
China
|
China
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SARS coronavirus isolate HC/GZ/81/03, complete genome
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus
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Guan,Y.
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The University of Hong Kong, Department of Microbiology
| null |
2005-03-01
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HC/GZ/32/03
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
| null |
China
|
China
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SARS coronavirus isolate HC/GZ/32/03, complete genome
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Severe acute respiratory syndrome coronavirus
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Guan,Y.
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The University of Hong Kong, Department of Microbiology
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2005-03-01
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CFB/SZ/94/03
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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China
|
China
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SARS coronavirus isolate CFB/SZ/94/03, complete genome
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| 109,154
|
OQ503495.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
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2023-06-22
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141341
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,657
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
| null |
2014-09-02
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate 141341, complete genome
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| 15,029
|
OQ503496.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
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2023-06-22
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141376
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
| null |
2014-09-02
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate 141376, complete genome
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| 15,030
|
OQ503497.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
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2023-06-22
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151491
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,648
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GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
| null |
2015-08-29
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate 151491, complete genome
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| 15,031
|
OQ503498.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
|
2023-06-22
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BDA190366
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
| null |
2019-04-19
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate BDA190366, complete genome
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| 15,032
|
OQ503499.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
|
2023-06-22
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RsHB190371
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
| null |
2019-04-19
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate RsHB190371, complete genome
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| 15,033
|
OQ503500.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
|
2023-06-22
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4105
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,385
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
| null |
2012-09-18
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate 4105, complete genome
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| 15,034
|
OQ503501.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
|
2023-06-22
|
4230
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,689
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
| null |
2013-04-17
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate 4230, complete genome
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| 15,035
|
OQ503502.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
|
2023-06-22
|
6301
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,674
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
| null |
2014-05-07
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate 6301, complete genome
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| 15,036
|
OQ503503.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
|
2023-06-22
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162171
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,141
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
| null |
2016-08-13
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate 162171, complete genome
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| 15,037
|
OQ503504.1
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
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2023-06-22
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162173
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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China
|
China
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Rhinolophus sinicus
| null |
2016-08-13
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate 162173, complete genome
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| 15,038
|
OQ503505.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
|
2023-06-22
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162181
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,448
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GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
| null |
2016-08-13
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate 162181, complete genome
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| 15,039
|
OQ503506.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Li,A., Dong,T.-Y., Si,H.-R., Hu,B., Li,B., Zhu,Y., Shi,Z.-L., Letko,M., Dong,T., Si,H., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
|
2023-06-22
|
B228
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,751
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus thomasi
| null |
2018-07-03
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate B228, complete genome
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| 15,040
|
ON378802.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Lo,V.T., Kim,H.K.
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Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, Bionanotechnology Research Center
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South Korea
|
2022-05-23
|
BatCoV_B20-50
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,612
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Rhinolophus ferrumequinum
|
feces
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2020-03-20
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SAMN27963144
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PRJNA833201
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MAG: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate BatCoV_B20-50, complete genome
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| 30,654
|
MW681002.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Li,L., Zhou,J., Liu,P., Chen,J.
|
Institute of Zoology, Guangdong Academy of Sciences, Animals Endemic Disease
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China
|
2022-03-15
|
Rs56
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,146
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
|
feces
|
2020-04-29
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate Rs56, complete genome
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GCAGCCAGGCCACCACCAGGCCATTCACGAATCCTTTTAGAATTGACACAAATTTGTAGAAGTAGAAAAAATGTCCCTATGCACCTTCAAATTTTTGCGTACAGTTTTATGAGGTTCACAGGCTTCCTGCAGCCAGGCCACCACCA
| 32,473
|
OL674074.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Hu,B., Si,H.R., Zhu,Y., Zhang,W., Li,B., Li,A., Geng,R., Lin,H.F., Yang,X.L., Zhou,P., Shi,Z.L., Si,H., Ben,H., Hua,G., Wei,Z., Li,Y., Shi,Z.
|
Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety and Center for Emerging Infectious Diseases
|
China
|
2021-12-05
|
Rs7896
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,385
|
GenBank
| 1
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China: Yunnan, Puer
|
China
|
Rhinolophus stheno
|
feces
|
2015-05-29
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate Rs7896, complete genome
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OL674075.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Hu,B., Si,H.R., Zhu,Y., Zhang,W., Li,B., Li,A., Geng,R., Lin,H.F., Yang,X.L., Zhou,P., Shi,Z.L., Si,H., Ben,H., Hua,G., Wei,Z., Li,Y., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety and Center for Emerging Infectious Diseases
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China
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2021-12-05
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Rs7905
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,676
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GenBank
| 1
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China: Yunnan, Puer
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China
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Rhinolophus stheno
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feces
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2015-05-29
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate Rs7905, complete genome
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ACCTTCCCAGGTAACAAAACCAACCAACCTCGATCTCTTGTAGATCTGTTCTCTAAACGAACTTAAAATCTGTGTTTCTGTCACTGGGCTGTATGTCTAGTGCACCTACGCAGTATAATTAAAAATCTTTACTGTCGTTGACAGGACACGAGTAACTCGTCCCTCTTCTGCAGATCACTTACGGTTTCGTCCGTGTTGTGGTCGATCATCAGCATACCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTCCCTGGTTTCAACGAGAAAACGCACGTCCAACTCAGTTTACCTGTTTTACAGGTTCGTGACGTGCTAGTACGTGGCTTTGGAGACTCCGTAGAAGGGGCTCTTGCTGAGGCACGTCAACATCTTATTGACGGCACTTGCGGCATAATAGAAGTAGAGAAAGGCGTTTTGCCTCAACTCGAACAGCCGTTTGTGTTTGTTAAGCGTTCTGATGCCCGAGCTGCACCACATGGCCACGTTGTTGTGGAGTTGGTTGCAGAACTCGATGGCGTTCAGTACGGTCGTAGTGGTGAGACACTTGGAGTACTTGTACCCCATGTTGGTGAAGTACCAGTTGCTTACCGCAAGATTCTTCTCCGCAAGAATGGTAATAAGGGTGCTGGTGGCCATAGTTTTGGTGCCGATCTAAAGTCGTATGACTTAGGTACTGACTTGGTCACCGACCCTTTTGAAGACTTTGAGTTTAATTGTAACACTAAATATAGTGGTGGTGTCACCCGTAACCTCATGCGTGAGCTAAACGGGGGTTCATACACGCGCTATATAGACAACAACTTTTGTGGCCCAGATGGCTATCCCTTAGAGTGTGTTAAGGATTTACTGGCGCGTGCTGGTAAAGCTTCTTGCACCCTTGCTGAGCAACTCGACTATTTAGAGACTAAGAGGGGTGTCTATTGTTGTCGCGACCATGACCACGAGATTGCTTGGTTTACAGAGCGCTCTGACGTTAGTTATGCCCAGCAGACACCCTTTGAAATAAAAATAGCTAAAAAGTTTGACAGCTTTACAGGTGAATGCCCTAAGTTTGTCTTTCCACTAAATTCCACTGTTCATGTTCTTCAGCCTCGTGTTGACAAAAAGAAGATGGATGGTTTCATGGGTAGGATCCGTTCTGTGTACCCAGTTAGCTCACCTTGTGAGTGTAACACTATGCACCTATCGATTCTCATGAAGTGTAGTCATTGTGACGAAACTTCATGGCAATCCGGTGATTTTGTCAATGCTACATGTGAGTACTGTGGCACTAAGAATGCGGTCGATGATGGACCCTCCACCTGTGGCTACTTACCACAGAACCCAGTTGTTAAAATCAGTTGTCCCGCTTGTCATAATCCAGATATGGGACCTGAACACAGTGTTGCAGAATACCATAATGAATCTGGTTTAAAGACCATCTTACGTAAGGGTGGCCGTACCATACAATTTGGTGGTTGTGTGTTCTCTTACGTAGGTTGCTATAATAAGTGTGCGTTCTGGGTACCACGTGCCAGTGCTAACATAGGTAACCGACATACTGGCATCGTAGGTGCGGAGACAGAGGCTCTAAATGATAGTTTACGTGAAGTACTCCACAAGGACAAAATTGTCATCAATGTAGTGGGTGACTTCAAATTAACGGAGGAGGTCGCTATTATTTTAGCATCCTTCTCTGCCTCCACAAGTGCCTTTATAGACACTATTAAGGGTTTGGACTTTAAGAAGTTCAAGCAGATTGTAGAATCCTGTGGCAATTTTAAGGTTGCACGAGGTAAATACAAGAAGGGTGCGTGGAACATAGGTGAAAGTACGTCAATTCTCACACCACTACACGCATTTTCGACACAGGCGACTAGTGTCGTCCGCTCTATATTTTCTAGAACTATGAAGACGGCTGATTGCTCAGTTCAAGTGCTACAATCTAGGGCTGTCGACATACTAAGTAGTATTTCCGAATACTCTCTTAGACTTATAGATGCTATGTCTTTCACATGTGAACTTGCCACTGACAATTTAATAGTCATGGCCTACGTCACAGGGAGCCTAGTGCAGATGACCAACCAGTGGTTTGTTAATATCTTTGGTATGGTGCATGATCAGTTAAAACCTGTACTTAATTGGCTAGAGGATAGTCTCAAGTCCGGTGTGGAATTTCTTAAGGACGGCTGGGAAATATTTAAGGTTATTTCCCAGTGCGCTTGTGATATAGTTAGTGGGCAACTTGTTGCGCTTACTACCGAAGTAAAAGATTGTGTCAAGGCTTTCTTTGCTCTTGTCAACAAATTCCTTGCCCTTTGTGCTGACACTATTATTATTGGTGGTGCCAGACTAAGGGCCTTGAATTTAGGTGAAACCTTTATTGCTCACTCCAAAGGTCTTTATAAGAAATGTGTTAGACCTAAAGGTGATGCTGGTCTTCTCATGCCATTAAAGGCCCCTAAGGAAGTTGTCTTCTTGGAGGGTGCCACATTACCTACTGAGGTTATCGCGGAGGAGGTGGTACTAAAAACTGGTGAATTGCAACCTTTAGATGAACCAGCTTCCGCCGATGCTAAAAATCCTTTAGTTGGTACTCCCGTTTGTATAAATGGTCTTATGCTGTTAGAGATAAAGGACACTACAAAGTATTGTGCTCTGTCACCTAATATGTTGGCAACCAACAACCTCTTTACGCTTAAAGGCGGTGCGCCTACCAAAGTTACTTTTGGTGATGATACTGTGATAGAAATTCAGGGTTACAAGACTATTAAAGTCACCTTTGAACTAGACGAAAGAGTCGATAAGGCTCTCAACGAGAAGTGCTCAGATTATACAGTTGAATTGGGTACTGACGTCAAAGAGTTAGCTTGTGTTGTGGCAGACAATGTTGTCAAAACCCTGACACCTCTTACAGATTTATTAACTCCCCTAGGTATTGACTTGGATGAGTGGAGTGTGGCTACTTTCTACTTGTTTGACGAAGCCGGGGACTATAAATTAGCTTCGAGCATGTATTGTTCCTTCTACCCTCCTTCAGAGGATTATGAAGACAATGCATCGGAGTTTGACCAACAAGAGTCCACTGAATATGGTACCGAAGCAGATTATGAAGGGCGTACCATGGAATTTGAAGCCACCCAACAGGAATTCGTTGAAGAAGAGGATTGGCTAGCTGATCTTGAAGAGTCTACATTAGAAACAGAGGTAGACCCTGTGTCTGTAGCCATTGATCATGAAGATCTAACCGTGGAGTCGGCTGTTGAAGAGATACAACTTCAGCCTACAACTAATAATGCCAATGGCTATCTAAAACTTACTGACAATGTTTTTATAAAGAACGTTGATATAGTTGAGGAGGCTCTTAATATGCAACCTCAAGTTATAGTAAATGCTGCCAACGTCTATTTAAAGCACGGTGGTGGTGTTGCTGGTGCTTTAAACAAGGCCACGAAAGGCGCTATGCAACTTGAGTCAGATAAGTATATAGCTGACCACGGACCTTTACAGGTGGGTGGTAGTTGTGTACTTAGTGGACATAATTTGGCAACTAATTGTCTACATGTGGTAGGTCCAAATCTGACTAGGGGTGAGGATATAAGCCTACTAGCTCAAGCCTACAAAAACTTTAATCAATTTAATTGTCTCTTAGCCCCTCTATTATCAGCTGGCATCTTTGGAGCTGACCCCTTAGTTTCATTAGAAGCTTGTATTCAGAATGTCAACTCGACAGTTTTCCTAGTAGTCTTTGATAAGGCCATGTATGACAAACTGATATCTGACTTCTTATCTAAGAAGTCTGATGCAGTACAGACTAAACAGTCTGCTATAGTACAGGATACACTTCAGTCTGAGGTTAGCCAATTAGAGGTACCACAGGCTGAACAGACTAAGCAGAATGTAGTGCCTTGTGTTGATGAGGTCACTACCACATTAGAGGAGACTAAGTTCCTAACGAAGAACTTATTAGTGTACATTGACATTAATGGTAAACCATATCACGACTCTTTGAGTCTCTTAGGTGATATGGATTTAACATTCCTTACTAAAGACGCACCACACATAGTTGGTGACATTATTATTAGTGACTTCATTACAGCAGTTGTGATACCCACAAAAAAAGCTGGTGGCACAATGTCAATGCTGTGTAAAGCGCTTAAAAATATTCCAACAAACCAATACATAACTACCTACCCTGGACAGGGTTGTGCTGGTTATACTATTGAGGAGGCTAAGGCAGCTTTAAAGAAGGCTAAAAGTGCCTTCTATATACTACCTTCAAACCAGCCTAATAAGAAGGAAGAAATTCTTGGTACCGTAGCTTGGAACTTACGGGAGATGTTAACACATGCGGAAGAAACTAGAAAACTCATGCCTGTTTGCATGGATACCAGAGCTATAATATCAACTATCCAAAGGCGTTTTAAAGGTATAAAGGTTCAGGAGGGCGTCATCGATTATGGCGTGCGTTTCTACTTTTATACTAGTAAAACTCCCATTGCAAACGTTATAGCAGCTATTAATAATCTAAATGAGACTATTATTACCATGCCTTTAGGCTATGTAACACATGGCTTAAACTTAGAAGAAGCAGCTCGTTATATGCGTTCGCTTAAAGTGCCAGCCACAGTGTCTGTTTCTTCACCTGAGGCTGTGACTGCATATAACGGATATCTTACTTCTTCTTCCAAGACGGCAGAGGAGCATTTTATAGAGACTGTATCATTGGCAGGTTCATATAAGGACTGGTCCTATATCGGCCAATCTACTACATTAGGTATAGCCTTCTTGAAGCGTGGTGATGTTGTTATCTATCACACTACAAACAAGCCTATACTATTTCATAAGGAGGGTGAGACTATTGGTCTTGAGGACCTCAAGAAATACCTTGCCTTGCGTGAATTAAGGACTATTAAGGTTTTTACAACTGTTGACAATATAAATTTACATACTCAAATTGTTGACATGTCCATGACCTATGGCCAACAATTTGGTCCTATTTACT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| 35,524
|
OL674076.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Hu,B., Si,H.R., Zhu,Y., Zhang,W., Li,B., Li,A., Geng,R., Lin,H.F., Yang,X.L., Zhou,P., Shi,Z.L., Si,H., Ben,H., Hua,G., Wei,Z., Li,Y., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety and Center for Emerging Infectious Diseases
|
China
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2021-12-05
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Rs7907
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,780
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GenBank
| 1
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China: Yunnan, Puer
|
China
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Rhinolophus stheno
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feces
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2015-05-29
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate Rs7907, complete genome
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| 35,525
|
OL674077.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Hu,B., Si,H.R., Zhu,Y., Zhang,W., Li,B., Li,A., Geng,R., Lin,H.F., Yang,X.L., Zhou,P., Shi,Z.L., Si,H., Ben,H., Hua,G., Wei,Z., Li,Y., Shi,Z.
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Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety and Center for Emerging Infectious Diseases
|
China
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2021-12-05
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Ra7909
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,803
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GenBank
| 1
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China: Yunnan, Puer
|
China
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Rhinolophus affinis
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feces
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2015-05-29
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate Ra7909, complete genome
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| 35,526
|
OL674078.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Hu,B., Si,H.R., Zhu,Y., Zhang,W., Li,B., Li,A., Geng,R., Lin,H.F., Yang,X.L., Zhou,P., Shi,Z.L., Si,H., Ben,H., Hua,G., Wei,Z., Li,Y., Shi,Z.
|
Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety and Center for Emerging Infectious Diseases
|
China
|
2021-12-05
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Rs7921
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,816
|
GenBank
| 1
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China: Yunnan, Puer
|
China
|
Rhinolophus stheno
|
feces
|
2015-05-29
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate Rs7921, complete genome
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| 35,527
|
OL674079.1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Guo,H., Hu,B., Si,H.R., Zhu,Y., Zhang,W., Li,B., Li,A., Geng,R., Lin,H.F., Yang,X.L., Zhou,P., Shi,Z.L., Si,H., Ben,H., Hua,G., Wei,Z., Li,Y., Shi,Z.
|
Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety and Center for Emerging Infectious Diseases
|
China
|
2021-12-05
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Rs7924
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,645
|
GenBank
| 1
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China: Yunnan, Puer
|
China
|
Rhinolophus stheno
|
feces
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2015-05-29
| null | null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus isolate Rs7924, complete genome
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| 35,528
|
NC_043450.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
| null |
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-06-28
| null |
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,255
|
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-10-11
| null |
PRJNA485481
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus strain HNXH segment L, complete sequence
|
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| 3,403
|
OR915873.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Hu,H.
|
Nanchang Center for Disease Control and Prevention, Quality Management Section
|
China
|
2023-12-24
|
JX23XSH
|
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,368
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2023-05-21
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolate JX23XSH segment L, complete sequence
|
ACACAGAGACGCCCAGATGAACTTGGAAGTGCTTTGTGGTAGGATAAACGTGGAGAATGGGCTGTCTCTTGGAGAACCAGGCCTGTACGACCAAATCTACGACAGGCCTGGGCTACCAGACCTAGATGTGACTGTCGATGCCACAGGTGTAACAGTGGACATAGGAGCTGTGCCAGACTCAGCATCACAACTGGGTTCATCAATCAATGCTGGGTTGATCACAATCCAGCTCTCTGAAGCATATAAGATCAATCATGACTTCACGTTCTCTGGCCTGTCAAAGACGACAGATCGACGCCTCTCAGAGGTGTTCCCCATTACCCATGATGGTTCTGATGGGATGACCCCTGATGTGATTCACACCAGATTGGATGGGACCATTGTGGTGGTTGAATTTTCAACCACTAGGAGCCATAACATTGGGGGCCTGGAGGCAGCATATAGGACAAAGATAGAAAAATATAGGGACCCAATCTCAAGGCGTGTTGATATCATGGAGAACCCGAGGGTCTTCTTTGGCGTTATTGTAGTCTCGTCAGGAGGGGTTCTGTCCAACATGCCCCTGACTCAGGATGAGGCAGAGGAGCTCATGTACAGGTTTTGCATTGCCAATGAGATCTACACCAAGGCTAGATCTATGGATGCAGACATTGAGCTACAGAAGAGTGAGGAAGAGCTTGAGGCTATTAGCAGGGCACTATCATTCTTCAGTTTGTTTGAGCCTAACATTGAAAGAGTAGAAGGAACATTCCCTAATTCAGAAATCGAGATGCTGGAACAGTTTCTCTCAACTCCAGCTGATGTTGACTTCATCACCAAGACCCTCAAAGCAAAAGAGGTAGAGGCCTATGCTGATCTTTGTGACAGCCACTACCTAAAGCCTGAAAAAACCATTCAGGAGCGGCTAGAGATCAATAGATGTGAGGCTATTGACAAAACTCAGGACCTCCTAGCTGGTCTACATGCAAGGAGCAACAAGCAAACATCATTGAATCGAGGGACAGTCAAACTCCCGCCCTGGCTACCAAAGCCGTCAAGTGAGTCAATAGACATCAAGACCGACTCAGGCTTTGGTTCCTTAATGGATCATGGCGCATATGGTGAGCTGTGGGCAAAGTGCCTTCTAGATGTCTCGCTGGGCAATGTGGAGGGGGTAGTCAGCGACCCTGCAAAAGAACTTGACATTGCCATCTCTGATGATCCTGAAAAAGATACCCCCAAAGAGGCAAAGATAACCTATAGGCGATTCAAGCCAGCCTTAAGTTCAAGTGCCCGTCAAGAATTTTCTCTCCAAGGAGTGGAGGGGAAGAAGTGGAAGAGAATGGCAGCAAACCAGAAGAAAGAGAAGGAGTCCCATGAGGCATTGAGCCCTTTCTTGGATGTTGAAGACATTGGGGATTTCCTAACATTCAACAATCTTCTTGCAGATTCGAGGTATGGAGATGAGTCCGTCCAGAGGGCAGTGTCAATCTTGTTGGAAAAGGCATCTGCCATGCAAGACACAGAGCTCACTCATGCCCTCAACGATTCATTCAAGAGGAACCTAAGCAGTAATGTGGTTCAGTGGTCCCTTTGGGTCTCTTGTTTAGCACAGGAGCTAGCTAGTGCTCTGAAGCAGCACTGCAGGGCTGGTGAGTTCATCATCAAGAAGCTGAAATTCTGGCCTATCTATGTCATTATCAAGCCGACCAAATCATCATCCCATATCTTCTACAGCTTAGGGATTCGCAAGGCTGACGTGACAAGGAGGCTCACTGGCAGAGTCTTCTCTGATACCATTGATGCTGGGGAATGGGAGCTAACAGAGTTCAAAAGCCTGAAGACATGCAAGCTTACAAACCTTGTCAACTTGCCATGCACCATGCTGAACTCAATAGCTTTCTGGAGAGAGAAGCTGGGCGTGGCTCCATGGTTGGTTCGAAAACCTTGTTCAGAGCTCAGGGAGCAGGTGGGCCTGACCTTCCTGATCAGTCTGGAGGACAAGTCTAAGACTGAGGAGATCATCACCTTGACAAGGTACACCCAGATGGAGGGCTTTGTCTCTCCCCCCATGCTGCCTAAGCCCCAAAAAATGCTAGGGAAACTGGATGGACCTCTGAGAACTAAGCTACAGGTGTACCTCCTCAGGAAGCATCTAGATTGCATGGTGCGAATTGCTTCTCAGCCATTCAGCCTAATCCCTAGAGAGGGGAGGGTAGAATGGGGAGGAACATTCCATGCCATCTCAGGCCGGTCCACAAACCTTGAGAATATGGTGAACAGCTGGTACATTGGGTACTACAAGAACAAAGAGGAGTCAACAGAGCTAAATGCCCTTGGAGAAATGTATAAGAAGATCGTGGAGATGGAAGAGGACAAGCCCAGCAGCCCTGAGTTTCTAGGGTGGGGGGACACTGATTCCCCTAAGAAGCATGAATTCTCACGGAGCTTCCTCAGAGCTGCTTGCTCATCTCTGGAGAGAGAAATTGCTCAGCGACATGGAAGACAATGGAAGCAGAACCTTGAGGAGCGTGTCCTGAGAGAGATTGGGACCAAGAACATTCTGGACCTTGCATCCATGAAGGCCACAAGCAACTTTTCCAAAGACTGGGAGCTCTACTCAGAAGTCCAGACCAAAGAGTACCATAGGTCCAAACTGTTGGAGAAGATGGCCACATTGATTGAGAAAGGGGTCATGTGGTACATTGATGCTGTAGGTCAGGCATGGAAGGCAGTCCTAGATGATGGGTGCATGCGAATCTGTCTCTTCAAGAAGAATCAGCATGGTGGCCTCAGAGAGATCTACGTTATGGATGCGAATGCCCGACTTGTGCAGTTTGGGGTCGAGACAATGGCTAGGTGTGTCTGTGAACTGAGCCCACATGAGACTGTTGCCAACCCTAGGCTCAAGAATTCCATCATAGAGAACCATGGGCTGAAGTCAGCCCGTAGTCTTGGCCCTGGCTCCATAAACATAAACTCATCCAATGACGCCAAGAAGTGGAATCAGGGGCACTACACAACAAAGCTAGCTCTAGTTCTTTGTTGGTTCATGCCAGCCAAATTCCACAGATTCATTTGGGCTGCCATTTCCATGTTTCGGAGAAAAAAGATGATGGTGGACCTAAGGTTTCTAGCTCACCTCAGTTCTAAATCTGAGTCTAGGTCATCTGATCCGTTTAGGGAAGCAATGACAGATGCCTTCCATGGTAATAGGGAAGTCTCATGGATGGACAAAGGGCGAACTTACATAAAGACAGAGACAGGGATGATGCAGGGCATACTGCACTTTACATCCAGTCTCCTCCACTCTTGTGTTCAGAGCTTTTACAAGTCTTATTTCGTCTCGAAGCTCAAAGAGGGCTACATGGGGGAAAGCATCAGTGGGGTGGTGGACGTCATAGAAGGTTCTGACGACTCTGCGATCATGATCAGCATACGCCCTAAGTCAGACATGGATGAAGTCCGATCAAGGTTCTTTGTTGCTAACTTGCTCCACTCTGTCAAGTTCTTAAACCCTTTGTTTGGGATTTATTCATCAGAGAAATCAACAGTGAACACAGTGTATTGTGTCGAGTATAACTCTGAATTCCATTTCCACAGGCACTTGGTTAGACCCACACTGAGATGGATAGCAGCGTCTCACCAAATCTCAGAGACTGAAGCCCTTGCAAGCAGGCAAGAGGATTACTCTAACCTTCTGACCCAGTGCTTGGAAGGGGGGGCCTCATTCTCTCTTACCTACCTCATACAGTGCGCTCAGCTCCTACACCACTACATGCTTCTAGGACTATGCTTACATCCCTTGTTTGGAACCTTCATGGGGATGCTGATATCAGACCCAGATCCAGCCCTAGGGTTCTTTCTCATGGACAACCCTGCATTCGCAGGGGGAGCAGGATTTAGATTCAATCTGTGGAGAGCCTGCAAGACAACAGACCTAGGGCGGAAGTATGCATATTATTTCAATGAGATACAGGGTAAAACAAAGGGAGATGAGGACTACAGGGCTCTGGACGCCACATCGGGAGGAACTCTCAGCCACTCTGTTATGGTGTACTGGGGGGACAGGAAGAAGTATCAGGCCCTATTGAGCAGGATGGGCCTTCCTGAAGACTGGGTGGAGCAGATAGATGAGAATCCTGGAGTCCTTTACAGGAGAGCAGCCAACAAGAAGGAACTACTCTTAAAGCTGGCAGAGAAGGTTCATTCACCTGGTGTGACTAGCAGCCTGAGTAAAGGGCATGTGGTGCCTCGGGTGGTGGCAGCAGGAGTATACCTCCTCTCACGCCACTGCTTTCGCTTTAGCTCAAGCATCCATGGCAGGGGCTCAACTCAGAAGGCTAGCCTTATAAAACTGTTGATGATGTCTTCTATTTCTGCCATGAAGCACGGGGGCTCACTAAACCCTAATCAGGAGCGAATGCTCTTCCCTCAGGCTCAGGAGTATGACAGGGTGTGCACATTGCTTGAGGAAGTTGAACACCTAACAGGGAAATTTGTTGTTAGGGAGAGGAACATTGTCAGGAGCCGCATAGACCTGTTCCAAGAGCCAGTTGACTTGCGGTGCAAGGCAGAAGACCTGGTGTCTGAGGTGTGGTTTGGCCTGAAAAGGACTAAGCTTGGGCCCCGTCTCCTCAAGGAAGAGTGGGACAAACTTAGGGCCTCATTTGCATGGTTGAGCACAGACCCATCTGAAACATTGAGGGATGGTCCTTTTCTTAGCCATGTGCAGTTTAGAAACTTCATAGCCCACGTTGATGCCAAATCAAGATCAGTCAGGCTCCTAGGTGCCCCCGTGAAGAAATCAGGCGGGGTCACCACTATAAGCCAAGTAGTCAGGATGAACTTCTTCCCTGGTTTTAGCCTAGAAGCTGAGAAGAGCTTAGACAATCAGGAAAGGCTTGAGAGCATCTCCATCCTCAAGCATGTCTTGTTCATGGTCTTGAATGGCCCATACACTGAGGAGTACAAGCTGGAAATGATCATAGAGGCCTTTTCTACTCTTGTGATACCACAGC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| 10,016
|
OP651048.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Hu,L., Li,J.
|
The First Affiliated Hospital of Anhu Medical University, The Infection Department
|
China
|
2023-12-19
|
AHZ-2019-LCL
|
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,352
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
blood
|
2019-04-28
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolate AHZ-2019-LCL segment L, complete sequence
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The First Affiliated Hospital of Anhu Medical University, The Infection Department
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China
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Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
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The First Affiliated Hospital of Anhu Medical University, The Infection Department
|
China
|
2023-12-19
|
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Bandavirus dabieense
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Bandavirus
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Phenuiviridae
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China
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2019
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Bandavirus
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China
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The First Affiliated Hospital of Anhu Medical University, The Infection Department
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China
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2023-12-19
|
AHZ-2019-WGL
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Bandavirus dabieense
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Bandavirus
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Phenuiviridae
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|
China
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The First Affiliated Hospital of Anhu Medical University, The Infection Department
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China
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2023-12-19
|
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Bandavirus dabieense
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Bandavirus
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Phenuiviridae
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| 10,161
|
OP729250.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Hu,L., Li,J., Chen,Q.
|
The First Affiliated Hospital of Anhu Medical University, The Infection Department
|
China
|
2023-12-19
|
AHZ-2019-22
|
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,368
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
blood
|
2019
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolate AHZ-2019-22 segment L, complete sequence
|
ACACAGAGACGCCCAGATGAACTTGGAAGTGCTTTGTGGTAGGGTAAACGTGGAGAATGGGCTGTCTCTTGGAGAACCAGGCCTGTACGACCAAATCTACGACAGGCCAGGGCTCCCAGACCTAGATGTAACTGTCGATGCCACAGGTGTGACAGTGGACATAGGGGCTGTGCCAGACTCAGCATCACAACTGGGTTCATCAATCAATGCTGGGTTGATCACAATCCAGCTCTCTGAAGCATATAAGATCAATCATGACTTCACGTTTTCTGGTCTGTCAAAGACAACAGACCGACGCCTCTCAGAGGTATTCCCCATTACCCATGATGGTTCTGATGGGATGACCCCTGATGTGATTCACACCAGATTGGATGGAACCATTGTGGTGGTTGAATTTTCAACCACTAGGAGCCATAACATTGGGGGCCTGGAGGCAGCATATAGGACAAAGATAGAAAAATATAGGGACCCAATCTCAAGGCGTGTTGATATCATGGAGAACCCGAGGGTCTTCTTTGGCGTAATTGTGGTCTCGTCAGGAGGGGTTCTGTCCAACATGCCCTTGACCCAGGATGAGGCAGAGGAGCTCATGTACAGGTTCTGCATAGCCAATGAGATTTACACTAAGGCTAGATCTATGGATGCAGACATTGAGCTACAGAAAAGTGAAGAAGAGCTTGAGGCTATTAGCAGGGCACTATCATTCTTCAGCTTGTTTGAGCCTAACATTGAAAGAGTGGAAGGAACATTCCCTAATTCAGAAATCAAGATGCTGGAACAGTTTCTCTCAACACCAGCTGATGTTGACTTCATCACCAAGACCCTCAAAGCAAAAGAAGTGGAAGCCTATGCTGATCTTTGTGACAGCCACTACCTTAAGCCTGAGAAAACCATACAGGAGCGGCTAGAGATCAATAGATGTGAGGCTATTGACAAAACTCAGGACCTCCTAGCTGGCCTGCATGCAAGGAGCAACAAGCAAACATCATTGAATCGAGGGACAGTCAAACTCCCGCCCTGGCTACCAAAGCCATCAAGTGAGTCAATAGACATCAAGACCGACTCAGGCTTTGGTTCCTTAATGGATCATGGCGCATATGGTGAGCTGTGGGCAAAGTGCCTTCTAGATGTCTCGCTAGGCAATGTGGAGGGGGTAGTCAGTGACCCTGCAAAAGAACTTGACATTGCCATCTCTGATGATCCAGAAAAAGACACCCCCAAAGAGGCAAAGATAACCTACAGGCGATTCAAGCCTGCCTTAAGTTCAAGTGCCCGTCAGGAATTTTCTCTCCAAGGAGTGGAGGGGAAGAAGTGGAAGAGAATGGCAGCAAATCAGAAGAAAGAGAAGGAGTCCCATGAGACATTGAGCCCGTTCTTGGATGTTGAAGACATAGGAGATTTCCTAACTTTCAACAATCTTCTTACAGATTCGAGGTATGGAGACGAGTCCATCCAGAGAGCTGTGTCAATATTGTTGGAAAAGGCATCTGCCATGCAAGACACAGAGCTCACTCATGCCCTCAACGACTCATTTAAGAGGAATCTAAGCAGCAATGTGGTTCAGTGGTCTCTTTGGGTCTCCTGTTTAGCACAGGAGCTAGCTAGTGCCCTGAAGCAGCACTGCAGGGCTGGTGAGTTCATCATCAAGAAGCTGAAGTTCTGGCCTATCTATGTCATTATCAAGCCGACCAAATCATCATCCCATATCTTCTACAGCTTAGGGATCCGCAGGGCTGACGTGACAAGGAGGCTAACTGGCAGAGTCTTCTCTGACACCATTGATGCTGGGGAATGGGAACTAACAGAGTTCAAAAGCCTGAAGACATGCAAGCTCACGAATCTTGTCAACTTGCCATGCACCATGCTGAACTCAATAGCTTTCTGGAGAGAGAAGCTGGGCGTGGCTCCATGGCTGGTTCGAAAGCCCTGTTCAGAGCTCAGGGAGCAGGTGGGCCTGACCTTCCTGATCAGTCTGGAGGACAAGTCTAAGACTGAGGAGATCATCACCTTGACAAGGTACACCCAGATGGAGGGCTTTGTCTCTCCTCCCATGCTGCCTAAGCCCCAAAAGATGCTAGGGAAACTGGATGGGCCTTTGAGAACTAAGCTACAGGTATACCTCCTCAGGAAGCATCTGGATTGCATGGTGCGAATTGCGTCTCAGCCATTCAGCCTAATCCCTAGAGAGGGGAGGGTAGAGTGGGGAGGAACATTCCATGCCATCTCAGGCCGGTCCACAAACCTTGAGAACATGGTGAACAGCTGGTACATTGGGTATTACAAGAACAAAGAGGAGTCAACAGAGCTAAATGCCCTCGGAGAAATGTATAAGAAGATTGTGGAGATGGAAGAGGACAAGCCCAGCAGCCCTGAGTTTCTAGGGTGGGGGGACACAGATTCCCCTAAGAAGCATGAATTCTCACGGAGCTTCCTCAGAGCTGCTTGCTCATCTCTAGAGAGAGAAATTGCTCAGCGACATGGAAGACAATGGAAGCAGAACCTTGAGGAGCGTGTCCTGAGAGAGATTGGGACCAAGAACATACTGGACCTTGCATCCATGAAGGCTACAAGCAACTTTTCCAAAGACTGGGAGCTCTACTCAGAAGTCCAGACCAAAGAGTACCATAGGTCCAAACTGCTGGAGAAGATGGCCACATTGATTGAGAAGGGGGTTATGTGGTACATTGATGCTGTGGGCCAGGCATGGAAGGCAGTCCTAGATGACGGGTGCATGCGAATCTGTCTCTTCAAAAAGAATCAACATGGTGGCCTCAGAGAGATCTACGTTATGGATGCGAATGCCCGGCTCGTGCAGTTTGGGGTTGAGACCATGGCTAGGTGTGTTTGTGAGCTGAGCCCACATGAGACTGTTGCTAACCCTCGGCTCAAGAATTCCATCATAGAGAACCATGGGCTGAAGTCAGCCCGTAGCCTTGGCCCTGGCTCTATAAACATAAACTCATCCAATGATGCCAAGAAGTGGAATCAAGGGCACTACACAACAAAGCTAGCTCTAGTTCTTTGTTGGTTCATGCCAGCCAAATTCCACAGATTCATTTGGGCTGCCATTTCCATGTTCCGGAGAAAAAAGATGATGGTGGACCTAAGGTTTTTAGCTCACCTCAGTTCTAAATCTGAGTCTAGGTCATCTGATCCGTTTAGGGAAGCAATGACAGATGCCTTCCATGGCAATAGGGATGTCTCATGGATGGACAAAGGACGAACTTACATTAAGACAGAGACAGGAATGATGCAGGGCATACTGCACTTCACATCCAGTCTCCTCCACTCTTGTGTTCAGAGCTTCTACAAGTCTTATTTCGTCTCGAAGCTCAAGGAGGGCTACATGGGGGAAAGCATTAGTGGGGTGGTGGATGTCATAGAAGGCTCTGACGACTCAGCGATCATGATTAGCATACGCCCTAAGTCAGACATGGATGAAGTTCGATCCAGGTTCTTTGTTGCCAACTTGCTCCACTCTGTCAAGTTCTTGAACCCATTGTTTGGGATTTATTCATCAGAGAAATCAACAGTGAACACAGTGTATTGTGTCGAGTATAACTCTGAATTCCATTTCCACAGGCACTTGGTTAGACCCACACTGAGATGGATAGCAGCGTCTCATCAAATCTCAGAGACTGAAGCCCTTGCAAGCAGGCAAGAGGATTACTCCAACCTCCTAACCCAGTGCTTGGAAGGAGGGGCCTCATTCTCTCTTACCTACCTCATACAGTGCGCTCAGCTCCTGCACCACTACATGCTTCTAGGACTATGCTTACATCCCTTGTTTGGAACCTTCATGGGGATGCTGATATCAGACCCAGATCCAGCCCTAGGGTTCTTCCTCATGGACAACCCTGCATTCGCAGGAGGAGCAGGATTTAGATTCAATCTGTGGAGAGCCTGCAAGACTACAGACCTTGGGCGGAAGTATGCATATTATTTTAATGAGATACAGGGTAAAACAAAGGGAGATGAGGACTACAGAGCTCTGGACGCCACATCGGGAGGAACTCTCAGCCACTCTGTTATGGTGTACTGGGGGGACAGGAAGAAGTATCAGGCCTTATTGAACAGGATGGGTCTTCCTGAGGACTGGGTGGAGCAGATAGATGAGAATCCTGGAGTCCTTTACAGGAGAGCTGCCAACAAGAAGGAACTGCTCTTAAAGCTGGCAGAGAAGGTTCATTCACCTGGTGTGACTAGCAGCCTGAGTAAAGGGCATGTAGTGCCTCGGGTGGTGGCAGCAGGAGTGTACCTCCTCTCACGTCATTGCTTTCGCTTTAGTTCAAGTATCCATGGCAGGGGCTCGACGCAGAAGGCTAGCCTTATAAAATTGCTGATGATGTCTTCTATTTCTGCCATGAAGCATGGGGGCTCACTGAACCCTAACCAGGAGCGAATGCTCTTCCCTCAGGCTCAAGAGTATGACAGAGTATGCACATTGCTAGAGGAAGTTGAACACCTAACAGGGAAATTTGTTGTTAGGGAGAGAAACATTGTCAGGAGCCGCATAGACTTGTTCCAAGAGCCAGTGGACTTGCGGTGCAAGGCAGAAGATCTGGTGTCAGAGGTGTGGTTTGGCCTGAAAAGGACTAAGCTTGGACCCCGTCTCCTCAAGGAAGAGTGGGACAAACTTAGGGCCTCATTTGCATGGCTGAGCACAGACCCATCTGAAACATTGAGGGATGGTCCTTTTCTTAGCCATGTGCAGTTTAGGAACTTCATAGCCCACGTTGATGCCAAATCAAGATCAGTCAGGCTCCTAGGTGCCCCCGTGAAGAAGTCAGGTGGGGTCACCACCATAAGCCAAGTGGTCAGAATGAACTTCTTCCCTGGTTTTAGCCTAGAAGCTGAGAAGAGCTTAGACAATCAGGAAAGACTTGAGAGCATCTCCATCCTCAAGCATGTCTTGTTCATGGTCTTGAATGGCCCATACACTGAGGAGTACAAGCTGGAAATGATCATAGAGGCCTTCTCTACTCTTGTGATACCACAGC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| 10,162
|
OR797605.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Roh,I.-S., Park,H.-J.
|
Gyeongsang National University, 3 Laboratory Animal Research Center, Central Scientific Instrumentation Facility
|
South Korea
|
2023-11-26
|
JJCB01/2022
|
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,368
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Canis lupus familiaris
|
blood
|
2022-08-13
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolate JJCB01/2022 segment L, complete sequence
|
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| 10,588
|
OR797610.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Kim,H.-J., Roh,I.-S., Park,H.-J.
|
Gyeongsang National University, 3 Laboratory Animal Research Center, Central Scientific Instrumentation Facility
|
South Korea
|
2023-11-26
|
JJCB01/2021
|
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,368
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Canis lupus familiaris
|
blood
|
2021-10-31
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolate JJCB01/2021 segment L, complete sequence
|
ACACAGAGACGCCCAGATGAACTTGGAAGTGCTTTGTGGTAGGATAAACGTGGAGAATGGGCTGTCTCTTGGAGAACCAGGCCTGTACGACCAAATCTACGACAGGCCAGGGCTGCCAGACCTAGATGTGACTGTCGATGCCACAGGTGTGACAGTGGACATAGGGGCTGTGCCAGACTCAGCATCACAATTGGGTTCATCAATCAATGCTGGGTTGATCACAATCCAGCTCTCTGAAGCATATAAGATCAATCATGATTTCACGTTTTCTGGCCTGTCAAAGACAACAGACCGACGCCTCTCAGAGGTATTCCCCATTACCCATGATGGCTCTGATGGGATGACCCCTGATGTGATTCACACCAGATTGGATGGAACCATTGTGGTGGTTGAATTTTCAACCACTAGGAGCCATAACATTGGGGGTCTGGAGGCAGCATACAGGACAAAGATAGAAAAATATAGGGACCCAATCTCAAGGCGTGTTGATATCATGGAGAACCCGAGGGTCTTCTTTGGCGTTATTGTAGTCTCGTCTGGGGGAGTTCTGTCCAACATGCCCCTGACTCAGGATGAGGCAGAGGAGCTCATGTACAGGTTCTGCATAGCCAATGAGATCTACACTAAGGCTAGGTCTATGGATGCAGACATTGAGCTACAGAAGAGCGAAGAAGAGCTTGAGGCTATTAGCAGAGCACTATCATTCTTCAGTTTGTTTGAGCCTAACATTGAGAGAGTGGAAGGAACATTCCCTAATTCAGAAATCGAGATGCTGGAACAGTTTCTCTCAACTCCAGCTGATGTTGACTTCATCACCAAGACCCTCAAGGCAAAAGAGGTGGAGGCCTATGCTGATCTTTGTGACAGCCACTACCTAAAGCCTGAAAAAACCATTCAGGAGAGGCTAGAGATCAATAGATGTGAGGCTATTGACAAGACCCAGGACCTCCTAGCTAGCCTACATGCAAGGAGTAACAAGCAAACATCATTGAATCGAGGGACAGTCAAACTCCCGCCCTGGCTACCAAAGCCATCAAGTGAGTCAATAGACATCAAGACCGACTCAGGCTTTGGTTCCTTAATGGATCATGGCGCATATGGTGAGCTGTGGGCAAAGTGCCTTCTAGATGTCTCGCTGGGCAATGTGGAGGGGGTAGTCAGTGACCCTGCAAAAGAACTTGACATTGCTATCTCTGATGATCCAGAAAAAGATACCCCCAAGGAGGCAAAGATAACCTATAGGCGATTTAAGCCTGCCTTGAGCTCAAGTGCCCGTCAAGAATTTTCTCTCCAAGGAGTGGAGGGGAAGAAGTGGAAGAGAATGGCAGCAAACCAGAAGAAAGAGAAGGAGTCCCATGAGACATTGAGTCCTTTCTTGGATGTTGAAGACATTGGGGATTTCCTAACATTCAACAATCTTCTAGCAGATTCGAGGTATGGAGATGAGTCCGTCCAGAGAGCTGTGTCAATCTTGTTGGAAAAGGCATCTGCCATGCAAGACACAGAGCTTACTCATGCCCTCAATGACTCATTCAAGAGGAACCTAAGCAGCAATGTTGTTCAGTGGTCCCTTTGGGTCTCCTGTTTAGCACAAGAGCTAGCTAGTGCTCTGAAGCAGCACTGCAGGGCTGGTGAGTTCATCATCAAGAAGCTGAAGTTCTGGCCTATCTATGTCATTATCAAGCCAACCAAATCGTCATCCCATATCTTCTACAGCTTAGGGATCCGTAAGGCTGACGTGACAAGGAGGCTCTCTGGCAGAGTCTTCTCTGACACCATTGATGCTGGGGAATGGGAGCTAACAGAGTTCAAAAGCCTGAAGACATGCAAGCTCACGAACCTTGTCAACTTGCCATGCACCATGCTGAACTCAATAGCTTTCTGGAGAGAGAAGCTGGGCGTGGCTCCATGGCTGGTTCGGAAGCCTTGTTCAGAACTCAGAGAGCAGGTGGGCCTGACCTTCCTGATCAGCCTGGAGGACAAGTCTAAGACTGAGGAGATCATCACCTTAACAAGGTACACCCAGATGGAGGGCTTTGTCTCTCCTCCTATGCTGCCAAAGCCCCAAAAGATGCTAGGGAAACTGGATGGACCGCTGAGAACTAAGCTACAGGTTTACCTCCTCAGGAAGCATCTGGATTGTATGGTGCGAATTGCTTCTCAGCCATTCAGCCTAATCCCTAGAGAGGGGAGGGTAGAATGGGGAGGGACATTCCATGCCATCTCAGGCCGGTCCACAAACCTTGAGAATATGGTGAACAGCTGGTACATTGGGTACTACAAGAACAAAGAGGAGTCAACGGAGCTAAATGCTCTTGGGGAAATGTATAAGAAGATTGTGGAGATGGAGGAGGACAAGCCCAGCAGCCCTGAGTTTCTAGGGTGGGGGGACACTGATTCCCCTAAGAAGCATGAATTCTCACGGAGCTTCCTCAGAGCTGCCTGCTCATCTCTGGAGAGAGAGATTGCTCAACGACATGGAAGACAATGGAAGCAGAACCTTGAGGAGCGTGTCCTGAGAGAGATTGGGACCAAGAACATCCTAGACCTTGCATCCATGAAGGCTACAAGCAACTTTTCCAAAGACTGGGAACTCTACTCAGAAGTCCAGACCAAAGAGTACCATAGGTCCAAACTGCTGGAGAAGATGGCCACATTGATTGAGAAGGGGGTCATGTGGTACATTGATGCTGTGGGCCAGGCATGGAAGGCAGTTCTAGATGACGGGTGCATGCGAATCTGTCTCTTCAAAAAGAATCAGCATGGTGGCCTCAGAGAGATCTACGTCATGGATGCAAATGCCCGGCTTGTGCAGTTTGGTGTTGAGACCATGGCTAGGTGTGTCTGTGAGCTGAGCCCACATGAGACTGTTGCCAACCCTAGGCTCAAGAATTCCATCATAGAGAACCATGGACTGAAGTCAGCCCGTAGTCTTGGTCCTGGCTCTATAAACATAAACTCATCCAATGATGCCAAGAAGTGGAATCAGGGGCACTACACAACAAAGCTAGCTCTAGTTCTTTGTTGGTTCATGCCAGCCAAATTCCACAGATTCATTTGGGCTGCCATTTCCATGTTTCGGAGAAAAAAGATGATGGTGGACCTGAGGTTTTTAGCTCACCTCAGTTCTAAATCTGAGTCTAGGTCATCTGATCCGTTTAGGGAAGCAATGACAGACGCCTTCCATGGTAATAGGGAAGTCTCATGGATGGACAAAGGGCGAACTTACATAAAGACAGAGACAGGGATGATGCAGGGCATACTGCACTTTACATCCAGCCTCCTCCACTCTTGTGTTCAGAGTTTTTACAAGTCTTATTTCGTCTCGAAGCTCAAGGAGGGCTACATGGGGGAAAGCATCAGTGGGGTGGTGGATGTCATAGAAGGCTCTGACGACTCAGCAATCATGATCAGCATACGCCCTAAGTCAGACATGGATGAAGTCCGATCAAGGTTCTTTGTTGCTAACTTGCTCCACTCTGTCAAGTTCTTGAACCCTTTGTTTGGGATTTACTCATCAGAGAAATCAACAGTGAACACAGTCTATTGTGTCGAGTATAACTCTGAATTCCACTTCCACAGGCACTTGGTTAGACCCACACTGAGATGGATTGCAGCGTCTCACCAAATCTCAGAGACTGAAGCCCTTGCAAGCAGGCAAGAGGATTACTCCAACCTTCTAACCCAGTGCTTGGAAGGAGGGGCCTCATTCTCTCTTACCTACCTCATACAGTGCGCTCAGCTCTTGCACCACTACATGCTTCTAGGACTATGCTTACATCCCCTGTTTGGAACCTTCATGGGGATGCTGATATCAGACCCAGATCCTGCCCTAGGATTCTTCCTCATGGACAACCCTGCATTCGCAGGAGGAGCAGGATTTAGATTCAATCTGTGGAGAGCCTGCAAGACTACAGACCTTGGGCGGAAGTATGCATATTATTTTAATGAGATACAAGGTAAAACAAAGGGAGATGAGGACTACAGAGCTCTGGACGCCACATCGGGAGGAACTCTCAGCCACTCTGTTATGGTGTACTGGGGGGACAGGAAGAAGTACCAGGCCTTATTGAACAGGATGGGCCTTCCTGAAGACTGGGTGGAGCAGATAGATGAGAATCCAGGAATCCTTTACAGGAGAGCTGCCAACAAGAAGGAACTACTCTTAAAACTGGCAGAGAAGGTTCATTCACCTGGTGTAACTAGCAGCTTGAGTAAAGGGCATGTAGTGCCTCGGGTGGTGGCAGCAGGAGTATACCTTCTCTCACGCCACTGCTTTCGCTTTAGCTCAAGCATCCATGGAAGGGGCTCAGCTCAGAAGGCTAGTCTCATAAAACTGCTGATGATGTCTTCTATTTCTGCCATGAAACACGGGGGCTCACTAAACCCTAATCAGGAGCGAATGCTCTTCCCTCAGGCTCAAGAGTATGACAGGGTATGCACATTACTTGAGGAAGTTGAACACCTAACAGGGAAATTTGTTGTCAGGGAGAGAAACATTGTCAGGAGCCGCATAGACTTGTTCCAAGAGCCAGTGGACTTGCGGTGCAAGGCAGAAGATCTGGTGTCAGAGGTGTGGTTTGGCCTGAAAAGGACTAAGCTTGGGCCCCGTCTCCTCAAGGAAGAGTGGGACAAACTTAGGGCCTCATTTGCATGGCTGAGCACAGACCCATCTGAAACATTGAGGGATGGTCCTTTTCTTAGCCATGTGCAGTTTAGGAACTTCATAGCCCACGTTGATGCCAAATCAAGGTCAGTCAGGCTCCTAGGTGCCCCCGTGAAGAAGTCAGGTGGGGTCACCACCATAAGCCAAGTAGTCAGAATGAACTTCTTCCCTGGTTTTAGCCTAGAAGCTGAGAAGAGCTTAGACAATCAGGAGAGACTTGAGAGCATCTCCATCCTCAAGCATGTCTTGTTCATGGTCCTGAATGGCCCATACACTGAGGAGTACAAGCTGGAAATGATCATAGAGGCCTTCTCTACTCTTGTGATACCTCAGC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| 10,589
|
OR574965.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Hu,H.
|
Nanchang Center for Disease Control and Prevention, Quality Management Section
|
China
|
2023-10-23
|
JX23WN
|
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,368
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023-05-16
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolate JX23WN segment L, complete sequence
|
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| 11,784
|
OQ832099.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Sun,Y., Dou,X., Wang,Z., Song,L., Li,R., Zhang,D.
|
Institute for Infectious Disease and Endemic Disease Prevention and Control, Beijing Center for Disease Prevention and Control
|
China
|
2023-10-21
|
BJ001-2021
|
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,368
|
GenBank
| null |
China:Beijing
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2021-10-30
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolate BJ001-2021 segment L, complete sequence
|
ACACAGAGACGCCCAGATGAACTTGGAAGTGCTTTGTGGTAGGATAAACGTGGAGAATGGGCTGTCTCTTGGAGAACCAGGCCTGTACGACCAAATCTACGATAGGCCAGGGCTTCCAGACCTAGATGTGACCGTCGATGCCACCGGTGTAACAGTGGACATAGGGGCTGTGCCAGACTCAGCATCACAATTAGGCTCATCAATCAACGCTGGGTTGATCACAATCCAGCTCTCTGAGGCATATAAGATCAATCATGACTTCACGTTTTCTGGCCTGTCAAAGACAACAGACCGACGCCTCTCAGAGGTATTCCCCATTACCCATGATGGTTCTGATGGGATGACCCCTGATGTGATTCACACCAGATTGGATGGAACCATTGTGGTGGTGGAATTTTCAACCACTAGGAGCCATAACATTGGGGGCCTGGAGGCAGCATACAGGACAAAAATAGAAAAATATAGGGACCCAATCTCAAGGCGTGTTGATATCATGGAGAACCCGAGGGTCTTCTTTGGCGTTATTGTAGTCTCGTCAGGAGGGGTTCTGTCCAACATGCCCCTGACTCAGGATGAGGCAGAGGAGCTCATGTACAGATTCTGCATAGCCAATGAGATCTACACTAAGGCTAGATCTATGGATGCAGACATTGAGCTACAGAAGAGTGAAGAAGAGCTTGAGGCTATTAGTAGGGCACTATCATTCTTCAGTCTGTTTGAGCCTAATATTGAAAGAGTGGAGGGAACATTCCCCAATTCAGAAATCGAGATGCTGGAACAGTTTCTCTCAACACCAGCTGATGTTGACTTCATCACCAAGACCCTCAAAGCAAAAGAGGTGGAGGCCTATGCTGATCTTTGCGACAGTCACTACCTAAAGCCTGAGAAAACTATTCAGGAGCGGCTAGAGATCAATAGATGTGAGGCTATAGACAAAACTCAGGACCTACTAGCTGGCCTGCATGCGAGGAGCAACAAGCAAACATCATTGAATCGAGGGACAGTCAAACTCCCACCCTGGCTACCAAAGCCATCAAGTGAGTCAATAGACATCAAGACCGACTCAGGCTTTGGTTCCTTGATGGATCATGGCGCATATGGTGAGCTGTGGGCAAAGTGCCTTCTAGATGTCTCGCTGGGCAATGTGGAGGGGGTAGTCAGTGACCCTGCAAAAGAGCTTGATATTGCTATCTCTGATGATCCAGAAAAGGATACCCCCAAAGAGGCAAAGATAACCTATAGGCGATTCAAGCCTGCCTTAAGTTCAAGTGCCCGTCAAGAATTTTCTCTCCAAGGAGTGGAGGGGAAGAAATGGAAGAGAATGGCAGCAAACCAGAAGAAAGAGAAGGAGTCCCATGAGACATTGAGCCCTTTCTTGGATGTTGAAGACATTGGAGATTTCCTAACATTCAACAATCTTCTTGCTGATTCGAGGTATGGAGATGAGTCCATCCAGAGAGCTGTGTCAATCTTGCTGGAAAAGGCATCTGCCATGCAAGATACAGAGCTCACTCATGCCCTCAATGACTCATTTAAGAGGAACCTAAGCAGTAATGTGGTCCAGTGGTCTCTTTGGGTCTCCTGCTTAGCACAGGAGCTAGCTAGTGCCCTGAAGCAGCACTGCAGGGCTGGTGAGTTCATCATCAAGAAGCTGAAGTTCTGGCCTATCTATGTCATTATCAAGCCGACCAAATCATCATCCCATATCTTCTTCAGCTTAGGGATCCGTAGGGCTGACGTGACAAGGAGGCTAACTGGCAGGGTCTTCTCTGACACCATTGATGCTGGGGAATGGGAGCTAACAGAGTTCAAAAGCCTGAAGACATGCAAGCTCACAAATCTTGTCAACCTGCCATGCACCATGCTGAACTCAATAGCTTTCTGGAGAGAGAAGTTGGGCGTGGCTCCATGGCTGGTTCGAAAGCCTTGTTCAGAGCTCAGAGAGCAGGTGGGCCTGACCTTCCTGATCAGTCTTGAGGACAAGTCCAAGACTGAGGAGATCATCACCTTGACAAGGTACACCCAGATGGAGGGCTTCGTCTCCCCCCCTATGCTGCCTAAGCCCCAAAAGATGCTAGGGAAACTGGATGGACCTTTGAGGACTAAGCTACAGGTATACCTCCTCAGGAAGCATCTGGATTGCATGGTGCGAATTGCTTCCCAGCCATTCAACTTAATCCCTAGGGAGGGGAGGGTAGAGTGGGGAGGAACATTCCATGCCATCTCAGGCCGGTCCACAAACCTTGAGAATATGGTGAACAGCTGGTACATTGGGTACTACAAGAACAAAGAGGAGTCAACAGAGCTAAATGCCCTCGGAGAAATGTATAAGAAGATTGTGGAGATGGAAGAGGACAAGCCCAGCAGCCCTGAGTTTCTAGGGTGGGGGGACACAGATTCCCCTAAGAAGCATGAATTCTCACGGAGCTTCCTCAGAGCTGCTTGCTCATCTCTGGAGAGAGAAATTGCTCAGCGGCATGGAAGGCAATGGAAGCAGAACCTTGAGGAGCGTGTCCTGAGAGAGATTGGGACCAAGAACATCCTGGACCTTGCATCCATGAAAGCTACAAGCAACTTTTCCAAAGATTGGGAGCTCTACTCAGAAGTCCAGACCAAAGAGTACCATAGGTCCAAACTGCTGGAGAAGATGGCCACATTGATTGAGAAGGGGGTCATGTGGTACATTGATGCTGTGGGCCAGGCATGGAAGGCAGTTCTGGATGACGGGTGCATGCGAATCTGTCTCTTCAAAAAGAATCAGCATGGTGGCCTCAGAGAGATCTACGTTATGGATGCTAATGCCCGGCTTGTGCAGTTTGGGGTTGAGACCATGGCCAGGTGTGTTTGTGAGCTAAGCCCACATGAGACTGTTGCCAACCCTAGGCTCAAGAATTCCATCATAGAGAACCATGGGCTGAAGTCAGCCCGCAGTCTTGGCCCTGGCTCCATTAACATAAACTCATCCAATGATGCCAAGAAGTGGAATCAGGGGCACTACACAACAAAGCTAGCTCTAGTTCTTTGTTGGTTCATGCCAGCCAAATTCCACAGATTCATTTGGGCTGCCATTTCTATGTTTCGGAGAAAAAAGATGATGGTGGACCTAAGGTTTTTGGCTCACCTCAGTTCTAAATCTGAGTCTAGGTCATCTGATCCGTTCAGGGAAGCAATGACAGACGCCTTCCATGGTAATAGGGAAGTTTCATGGATGGACAAAGGGCGAACTTACATAAAGACAGAGACAGGAATGATGCAGGGCATACTGCACTTTACATCTAGTCTCCTCCACTCTTGTGTTCAGAGCTTTTACAAGTCCTATTTCGTCTCGAAGCTCAAGGAGGGCTACATGGGGGAAAGCATCAGTGGGGTGGTGGATGTCATAGAAGGCTCTGACGACTCAGCGATCATGATCAGCATACGCCCTAAGTCAGACATGGATGAAGTCCGATCAAGGTTCTTTGTTGCTAACTTGCTCCACTCTGTCAAGTTCTTGAACCCTTTGTTTGGGATTTATTCATCAGAGAAATCAACAGTGAACACAGTGTATTGTGTCGAGTATAACTCTGAATTCCATTTCCACAGGCACTTGGTTAGACCCACACTGAGATGGATAGCAGCGTCTCACCAAATCTCAGAGACAGAAGCTCTTGCAAGCAGGCAAGAAGATTACTCCAACCTTCTAACGCAGTGCTTGGAAGGAGGGGCCTCATTCTCTCTTACCTACCTCATACAGTGCGCTCAACTCCTGCACCACTACATGCTTCTAGGACTATGCTTACATCCCTTATTTGGGACCTTCATGGGGATGTTGATATCAGACCCAGATCCAGCCCTAGGGTTCTTCCTCATGGACAACCCTGCATTCGCAGGGGGAGCAGGGTTTAGATTCAATCTGTGGAGAGCCTGCAAGACTACAGACCTTGGGCGGAAGTATGCTTATTATTTTAATGAGATACAGGGCAAAACAAAGGGAGATGAGGACTATAGAGCTCTGGATGCCACATCGGGAGGAACTCTCAGCCACTCTGTTATGGTGTACTGGGGGGACAGGAAGAAGTATCAGGCCTTGTTGACCAGGATGGGCCTTCCTGAAGACTGGGTGGAGCAGATAGATGAGAATCCTGGAGTCCTTTACAGGAGAGCTGCCAACAAGAAGGAACTACTCTTAAAACTGGCAGAGAAGGTTCATTCTCCTGGTGTTACTAGCAGCCTGAGTAAAGGGCATGTGGTGCCTCGGGTGGTGGCAGCAGGAGTATACCTTCTCTCACGCCACTGCTTTCGCTTTAGCTCAAGCATTCATGGCAGGGGCTCAACACAGAAGGCTAGCCTTATAAAACTGCTGATGATGTCTTCTGTTTCTGCCATGAAGCACGGGGGCTCACTAAACCCTAATCAGGAGCGAATGCTCTTCCCTCAGGCTCAAGAGTATGACAGAGTATGCACATTGCTTGAGGAAGTTGAACACCTAACAGGGAAATTTGTTGTTAGGGAGAGAAACATTGTCAGGAGCCGCATAGACTTGTTCCAAGAGCCAGTGGACTTGCGGTGCAAGGCAGAGGATCTGGTGTCAGAGGTGTGGTTTGGCCTGAAAAGGACCAAGCTTGGACCCCGTCTCCTCAAGGAAGAGTGGGACAAACTTAGGGCTTCATTTGCATGGCTGAGCACAGACCCATCTGAAACACTGAGGGATGGTCCTTTTCTTAGCCATGTGCAGTTTAGGAACTTCATAGCCCACGTTGATGCCAAATCAAGATCAGTCAGGCTCCTGGGTGCCCCCGTGAAGAAGTCAGGTGGGGTCACCACCATAAGCCAAGTAGTCAGAATGAACTTCTTCCCTGGTTTTAGCCTAGAAGCTGAGAAGAGCTTAGATAATCAGGAAAGACTTGAGAGCATCTCCATCCTCAAGCATGTCTTGTTCATGGTCTTGAATGGCCCATACACTGAGGAGTACAAGCTGGAAATGATCATAGAGGCCTTCTCTACTCTTGTGATACCACAGCCATCAGAGGTCATCAGGAAATCTAGGACCATGACCTTATGCCTCTTATCGAATTACTTGTCCAGTAAGGGTGGGTCCATTCTAGACCAGATTGAGAGGGCACAGTCAGGAACTCTAGGAGGCTTTAGCAAGCCCCAGAAGACATTCATTAGGCCAGGAGGTGGTGTTGGCTATAAGGGGAAAGGTGTGTGGACTGGGGTGATGGAGGACACCCATGTTCAAATTCTGATAGATGGAGACGGGACTAGTAACTGGCTTGAGGAGATCAGGCTCAGTAGTGATGCCAGGCTTTATGATGTCATTGAATCCATCCGAAGGTTATGTGATGACCTTGGGATCAACAACAGGGTAGCATCTGCATATAGAGGTCATTGCATGGTTAGGCTGAGTGGATTCAAGATCAAGCCTGCATCAAGGACTGATGGGTGTCCAGTCAGGATCATGGAAAGGGGCTTCAGAATTAGGGAACTTCAAAACCCGGATGAGGTCAAGATGAGAGTGAGGGGCGACATCCTCAACCTCTCTGTCACAATACAAGAAGGAAGGGTCATGAACATTCTGAGCTACAGGCCAAGAGACACTGATATATCAGAGTCAGCTGCAGCATACCTCTGGAGTAATCGAGACCTCTTCTCCTTTGGGAAGAAGGAACCATCCTGCAGCTGGATCTGCTTAAAAACTCTTGACAATTGGGCCTGGTCACATGCCTCAGTTCTCCTGGCAAATGACAGAAAGACCCAAGGCATTGATAATAGAGCTATGGGGAACATTTTCAGGGACTGTCTAGAAGGTTCTCTTAGAAAGCAAGGGCTGATGAGGTCAAAGCTCACAGAGATGGTGGAGAAGAATGTAGTTCCTTTAACAACTCAAGAGCTCGTCGACATTCTGGAGGAGGACATTGACTTTTCAGATGTCATAGCTGTGGAGCTCTCTGAGGGGTCGCTTGACATTGAATCCATCTTTGATGGGGCACCTATCTTGTGGTCTACTGAGGTGGAAGAGTTTGGAGAGGGAGTGGTGGCTGTGAGCTATTCCAGTAAGTACTATCATCTAACTCTGATGGATCAAGCTGCCATCACAATGTGTGCGATCATGGGTAAGGAAGGCTGTAGAGGGCTCCTTACCGAGAAGAGATGCATGGCAGCCATACGAGAGCAGGTACGGCCATTCCTCATATTCCTGCAAATTCCTGAGGACAGCATTTCTTGGGTGTCTGATCAGTTCTGCGACTCCAGGGGCCTTGATGAAGAGAGCACCATTATGTGGGGTTAACTTTAAAACACGGTTGGAACGCAGTTGATGTGTCTGTGGGTGGCTAGGGAATGTTGGTTTTAGAAGGATTTCCTTAAGATCTGGGCGGTCTTTGTGT
| 11,793
|
OR260285.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Marano,J.M., Bowen,R.A., Bosco-Lauth,A.M.
|
Colorado State University, Biomedical Sciences
|
USA
|
2023-07-18
| null |
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,368
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2011
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus strain YL-1 segment L, complete sequence
|
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| 14,665
|
OP899816.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Zhu,C., Tan,W.
|
Nanjing Bioengineering (Gene) Technology Center for Medicines, Department of Epidemiology
|
China
|
2023-06-10
|
CWP10
|
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,347
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Erinaceus amurensis
| null |
2018-03
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolate CWP10 segment L, complete sequence
|
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| 15,275
|
OQ388741.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Ren,Y., Xu,J., Chen,J., Chen,L., Hou,W.
|
School of Basic Medical Sciences, Wuhan University, State Key Laboratory of Virology/Institute of Medical Virology/Department of Infectious Diseases
|
China
|
2023-05-16
|
HBHG2019-09/Huanggang_Qichun/2019
|
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,368
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
blood
|
2019
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolate HBHG2019-09/Huanggang_Qichun/2019 segment L, complete sequence
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| 15,722
|
OQ388744.1
|
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
|
Ren,Y., Xu,J., Chen,J., Chen,L., Hou,W.
|
School of Basic Medical Sciences, Wuhan University, State Key Laboratory of Virology/Institute of Medical Virology/Department of Infectious Diseases
|
China
|
2023-05-16
|
HBHG2020-08/Huanggang_Yingshan/2020
|
Bandavirus dabieense
|
Bandavirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,368
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
blood
|
2020
| null | null |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolate HBHG2020-08/Huanggang_Yingshan/2020 segment L, complete sequence
|
ACACAGAAACGCCCAGATGGACTTGGAAGTGCTTTGTGGTAGGATAAGCGTGGAGAATGGGCTGTCTCTTGGAGAACCAGGCCTGTACGACCAAATCTACGACAGGCCAGGGCTGCCAGACCTAGATGTGACTGTCGATGCCACAGGTGTGACAGTAGACATAGGGGCTGTGCCAGACTCAGCGTCACAACTGGGTTCATCAATCAATGCTGGGTTGATCACAATCCAGCTCTCCGAAGCATATAAGATCAATCACGACTTCACGTTTTCTGGCCTGTCAAAGACAACAGACCGACGTCTCTCAGAGGTATTCCCCATTACCCATGATGGATCTGATGGGATGACCCCTGATGTGATTCACACCAGATTAGATGGAACCATTGTGGTGGTTGAATTTTCAACCACTAGGAGCCATAACATTGGGGGTCTGGAGGCAGCATACAGGACAAAGATAGAAAAGTATAGAGACCCAATCTCAAGGCGTGTTGATATCATGGAGAACCCGAGGGTCTTCTTTGGCGTTATTGTAGTCTCGTCAGGGGGAGTTCTCTCCAACATGCCCCTGACTCAGGATGAGGCTGAGGAGCTCATGTACAGGTTCTGCATAGCCAATGAGATCTACACTAAGGCTAGGTCTATGGATGCAGACATTGAGCTACAGAAGAGCGAAGAAGAGCTTGAGGCTATTAGCAGGGCACTATCATTCTTCAGTTTGTTTGAGCCTAACATAGAAAGAGTGGAAGGAACATTCCCTAATTCAGAAATTGAGATGCTGGGACAGTTTCTCTCAACTCCAGCTGATATTGACTTCATCACCAAGACCCTCAAAGCAAAAGAGGTGGAGGCCTATGCTGATCTTTGTGACAGTCACTATCTAAAGCCTGAAAAAACCATTCAGGAGCGGCTAGAGATCAATAGATGTGAGGCTATTGACAAGACTCAGGACCTCCTAGCTAGCCTACATGCAAGGAGCAACAAGCAAACATCATTGAATCGAGGGACAGTCAAGCTCCCGCCCTGGCTACCAAAGCCATCAAGTGAGTCAATAGACATTAAGACCGACTCGGGCTTTGGTTCCTTAATGGATCATGGCGCATATGGTGAGCTGTGGGCAAAGTGCCTTCTAGATGTCTCGCTGGGCAATGTGGAGGGGGTAGTCAGTGACCCTGCAAAAGAACTTGACATTGCCATCTCTGATGACCCAGAAAAAGATACCCCCAAAGAGGCAAAGATAACCTATAGGCGATTCAAGCCTGCCTTAAGCTCAAGTGCCCGTCAGGAATTCTCTCTCCAAGGAGTAGAGGGGAAGAAGTGGAAGAGAATGGCAGCAAACCAGAAGAAAGAGAAGGAGTCCCATGAGACATTGAGCCCTTTCTTGGATGTTGAAGACATTGGGGATTTCCTAACATTCAACAATCTTCTCGCAGATTCGAGGTATGGAGATGAGTCCGTCCAGAGAGCTGTGTCAATCTTGTTGGAAAAGGCATCTGCCATGCAAGACACAGAGCTTACTCATGCCCTCAACGACTCATTCAAGAGGAACCTAAGCAGCAATGTGGTTCAGTGGTCCCTTTGGGTCTCCTGTTTAGCACAAGAGCTAGCTAGTGCTCTGAAGCAGCACTGCAGGGCTGGCGAGTTCATCATCAAGAAGCTGAAGTTCTGGCCTATCTATGTCATTATCAAGCCGACCAAATCGTCATCCCATATCTTCTACAGCTTAGGGATCCGCAAGGCTGACGTGACAAGAAGGCTCACTGGTAGAGTCTTCTCTGACACCATTGATGCTGGGGAATGGGAGCTAACAGAGTTCAAAAGCCTGAAGACATGCAAGCTCACTAACCTTGTCAACTTACCATGCACCATGCTGAACTCAATAGCTTTCTGGAGAGAGAAGCTGGGCGTGGCTCCATGGCTGGTTCGGAAGCCTTGTTCAGAGCTCAGAGAGCAGGTGGGCCTGACCTTCCTGATCAGTCTGGAGGACAAGTCTAAGACTGAGGAGATCATCACCTTGACAAGGTACACCCAGATGGAGGGCTTTGTCTCTCCTCCCATGCTACCTAAGCCCCAAAAGATGCTAGGGAAACTGGATGGACCTTTGAGAACTAAGCTGCAGGTGTACCTCCTCAGGAAGCATCTGGATTGTATGGTGCGAATTGCTTCTCAGCCATTCAGCCTAATCCCTAGAGAGGGGAAGGTAGAATGGGGAGGGACATTCCATGCCATCTCAGGCCGGTCCACAAACCTTGAGAATATGGTGAATAGCTGGTACATTGGGTACTACAAGAACAAAGAGGAGTCAACAGAGCTAAATGCTCTTGGAGAAATGTATAAGAAGATTGTGGAGATGGAAGAGGACAAGCCCAGCAGCCCTGAGTTTCTAGGGTGGGGGGACACTGATTCCCCTAAGAAGCATGAATTCTCACGGAGCTTCCTCAGAGCTGCTTGCTCATCTCTGGAGAGAGAGATTGCTCAGCGACATGGAAGACAATGGAAGCAGAACCTTGAGGAGCGTGTCCTGAGAGAGATTGGGACTAAGAACATCCTAGACCTTGCATCCATGAAGGCTACAAGCAACTTTTCCAAAGACTGGGAGCTCTACTCAGAAGTCCAGACCAAAGAGTACCATAGGTCCAAACTGCTAGAGAAGATGGCCACATTGATTGAGAAGGGGGTTATGTGGTACATTGATGCAGTGGGCCAGGCATGGAAGGCAGTTCTAGATGACGGGTGCATGCGAATCTGTCTCTTCAAAAAGAATCAGCATGGTGGCCTCAGAGAGATCTACGTTATGGATGCAAATGCCCGACTCGTGCAGTTTGGGGTTGAGACCATGGCTAGGTGTGTCTGTGAGCTGAGCCCACATGAGACTGTTGCCAACCCTAGGCTTAAGAATTCCATCATAGAGAACCATGGGCTGAAGTCAGCCCGTAGTCTTGGCCCTGGCTCTATAAACATAAACTCATCCAATGATGCCAAGAAGTGGAATCAGGGGCACTACACAACAAAGCTAGCTCTAGTTCTTTGTTGGTTCATGCCAGCCAAATTCCACAGATTCATTTGGGCTGCCATTTCCATGTTTCGGAGAAAAAAGATGATGGTGGACCTTAGGTTTTTAGCTCACCTCAGTTCTAAATCTGAGTCTAGGTCATCTGATCCGTTTAGGGAAGCAATGACAGACGCCTTCCATGGTAATAGAGAAGTCTCATGGATGGACAAAGGGCGAACTTACATAAAGACAGAGACAGGGATGATGCAGGGAATACTGCACTTTACATCCAGCCTCCTCCACTCCTGTGTTCAGAGTTTTTACAAGTCTTATTTCGTCTCGAAGCTCAAGGAGGGCTACATGGGGGAAAGCATCAGTGGGGTGGTGGATGTCATAGAAGGCTCTGACGACTCAGCAATCATGATCAGCATACGCCCTAAGTCAGACATGGATGAAGTCCGATCAAGGTTCTTTGTTGCTAACTTGCTCCACTCTGTCAAATTCTTGAACCCTTTGTTTGGGATTTACTCATCAGAGAAATCAACAGTGAACACAGTGTATTGTGTTGAGTATAACTCTGAATTCCATTTCCACAGGCACTTGGTTAGACCCACACTGAGATGGGTAGCAGCGTCTCACCAAATCTCAGAGACTGAAGCCCTTGCAAGCAGGCAAGAGGATTACTCCAACCTCCTAACTCAGTGCTTGGAAGGAGGGGCCTCATTCTCTCTTACCTACCTCATACAGTGCGCTCAGCTCCTGCACCACTACATGCTTCTAGGTCTATGCTTACATCCCTTGTTTGGAACCTTCATGGGGATGCTGATATCAGACCCAGATCCTGCCCTAGGATTCTTCCTCATGGACAACCCTGCATTCGCAGGAGGGGCAGGGTTTAGATTCAATCTGTGGAGAGCCTGCAAGACTACAGACCTTGGGCGGAAGTATGCATATTACTTTAATGAGATACAGGGTAAAACAAAGGGAGATGAGGACTACAGAGCTCTGGACGCCACATCGGGAGGAACTCTCAGCCACTCTGTTATGGTGTACTGGGGGGACAGGAAGAAGTATCAGGCCTTATTGAACAGGATGGGCCTTCCTGAAGACTGGGTGGAGCAGATAGATGAGAATCCTGGAGTCCTTTACAGGAGAGCTGCCAACAAGAAAGAACTACTCTTAAAACTGGCAGAGAAGGTTCATTCACCTGGTGTGACTAGCAGCCTGAGTAAAGGGCATGTAGTGCCTCGGGTGGTGGCAGCAGGAGTATACCTTCTCTCACGCCACTGCTTCCGCTTTAGCTCAAGCATCCATGGAAGGGGCTCAGCACAGAAGGCTAGTCTCATAAAACTGCTGATGATGTCTTCTATTTCTGCCATGAAACACGGGGGCTCACTAAACCCTAATCAGGAGAGAATGCTTTTCCCTCAGGCTCAAGAGTATGACAGAGTATGCACATTGCTTGAGGAAGTTGAACACCTAACAGGGAAATTTGTTGTTAGGGAGAGAAACATTGTCAGGAGCCGCATAGACTTGTTCCAAGAGCCAGTTGACTTGCGGTGCAAGGCAGAAGATCTGGTGTCAGAGGTGTGGTTTGGCCTGAAAAGGACTAAGCTTGGACCCCGTCTCCTCAAGGAAGAGTGGGACAAACTCAGGGCCTCATTTGCATGGCTGAGCACAGACCCATCTGAAACATTGAGGGATGGCCCTTTTCTTAGCCATGTGCAGTTTAGGAACTTCATAGCCCATGTTGATGCCAAATCAAGATCAGTCAGGCTCCTAGGTGCCCCCGTAAAGAAGTCAGGAGGGGTCACCACCATAAGCCAAGTAGTCAGGATGAACTTCTTCCCTGGTTTTAGCCTAGAAGCTGAGAAGAGCTTGGACAATCAGGAGAGACTTGAGAGCATCTCCATCCTCAAGCATGTCTTGTTCATGGTCTTAAATGGCCCATACACTGAGGAGTACAAGCTGGAAATGATCATAGAGGCCTTCTCTACTCTTGTGATACCTCAGC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| 15,723
|
OQ446800.1
|
Shallot latent virus
|
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
|
Leibniz Institute Dsmz - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
Germany
|
2023-06-21
|
DSMZ PV-0512
|
Shallot latent virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,353
|
GenBank
| null |
Taiwan
|
Taiwan
|
Allium fistulosum
| null | null | null | null |
Shallot latent virus isolate DSMZ PV-0512, complete genome
|
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| 15,053
|
ON624129.1
|
Shallot latent virus
|
Singh,J., Majumder,S.
|
Sharda University, Biotechnology
|
India
|
2023-02-20
|
KER-2
|
Shallot latent virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,335
|
GenBank
| null |
India
|
India
|
Allium cepa var. aggregatum
| null |
2019-11
| null | null |
Shallot latent virus isolate KER-2, complete genome
|
CTAAACGAACAGCAACGTCTCGTAATGGCTCTAACTTATAGAAGTCCAGTTGAGGAAGTGCTGACAAGCTTCACCACAAGCGAGCAGAGTGAGATTGCACGAGGAGCAGTCCAGGGGATGTTAAAATTAGAGGAGTTCAACCATAACCTATTTAACTTCGCCCTCAGCCCAATAGCGAAACAAAGGTTATGCGGTAGCGGAATCTATTTAAGCCCGTTCTCTTATGTGCCTCACTCTCACCCCGCTTGTAAGACGCTTGAAAATTACAACCTTTATCAAGTCGTATGTCCACTTATAGATCATAGGTTTTATTTAGTAGGTATTAAACAGAATAAATTATGCTTTTTGAAAAGTCGAAATAAGAAAATAGGTATTGCAGAATGTTTGAATCGAATGGTGACCAGTCGCGATAAAATTCGCTATGGTAGTGATTTTGTGATTCAGTCTGGTACGCCTGGTACTGTCAAGAAGAACAGCAACACCACTACTTTCTACCCCGAGTTAGCTAGCCTGATCCCGCATGAGGTCAAATTTAGGTCTAGAGCCCTATTTCTGCATGATGAGCTGCACTATTGGAGCAAAGAAAGTTTGGCCATCTTTCTAGATCAATGTTCCCCAGAACTAATGCTAGCAACTGTGGTTGTGCCACCAGAGCTATTACTGAACGCCAAAGAAAGTATGAACAAGTGGTGTTATGAATTCGAGGTGAAGGGTCCTGATCTTTACTTCTACCCCGACGGCGTGCGGTCGGAAGGTTACATTCAGCCAGTGAGCTGCATTTACTTGCTACGGACCAACAAGATCATAACTCCCGGGGGCCTAGTTTATTGTGTGGATATCATCAGTTCCAAATTTGCACACCACGTGATCGCAATAACTCGCGGCGAGGCCTTGGTCAAAAAAGAAAATTCCTTTTCAAATTTTGAAGCTATCGGTTCTAGTTTTGCTAGCAAGTTACTGCATGATGATTATCCTTGCTTCCCGATCAGCTACGAAGTGGTCATGAAACTGTACACATACTTATCGTCATTGAATTCGCCCGATGTGAAGTCTGCGGTGGCTAAATTGAGGCAACTGGTGGAGCACCCGACCGCTTTCGAAGTCCAATTCACAATAGAATTCGCTAACCTTTACATTCGCTGCGGGGTGAATTTGGATATCTTTACTCCTAGCACTAAAACCTTATTGCTGAAAAGTATCTCAGTTCTGATGCCCGCCCTGCTCACTAAGTACTCAAAAAAATTGATGAGGGTCAGTTTCACAAGTTTTGTGAGCCATTTGAAACCTTTGAGCTTCAACGTTCGCTGTGAAACCATCGATCTCCAGCTCAAGAAAACGCAACATCTCGACTTAATGCCTATCCTGGAGGAAAAGTTTCTGAAACCTTGCATGAATTTAATGGGGGAGCCGAAAGAAAGGTTTTTATGTGACAGAACCTCAGCACCCTATAGTTCAATAGAGGGTGAGGCATTACAACTGCACGTGGAGCCCGAGGTGTTGCTGCGGGATAATTTGAAGTACCTCGGTGATCTCAATGATTTCATGTACTCCAGCACGGAACAAGTGATGCTCGGAGCCTCCGTGCTGTTTAGGCCGTTGTATTGGTACTTATTCAGCCTGCTAGGTGAAGATTGTTTCGATCGCTGCCTCATGGAAGCTACGCGGATGCAAGTAATGCGTCAGAATTTGGAGAAAGTGCAGCATGAAAACTCAAAGTTGGCACTCCCGTGGAGGGAAGCGCAAGAAGAAGAAGGGAATGCAACTTACCCAGCACCAACCTTTAACTGCTTGGAACATGAAGATGAAACTTGGGGTGCTGCGGAAGCCTTGAGTGATGTTGAACCAATGCTACTCAATCTGTTCAACTGCGTGTGCGGTACGGGCATACAGTGGACCATTGCTTTTCATGTTGAATTGTTAGAAGTCCCTATGGTCGACAATTTACACAATCGCAGGGCTGCCTTTTACAGCAAGGGTGGTTTTAATTACAGTTACAACGGTGGGTATCATCTCGGGCATGAATGGTTAAGCGAATTTGATTCATTCCTCGCAATCAATGGGCATGACTTGGATTATTTTAACTGCGTTCTATTTCAACAATATGATGGGGGTCATGGTATAGGTTTCCACAGTGATGATGAGGACTTGTTCGAGCAAGGGAGTAGAATACTGACCGTTTGCATTCAGGGTGATTGTGAATTTAGATTCCGCTGCGCTGCTGGGGAGACCGGATTCTATATGGCAGCACCAAAGCAATTCATGATGCCAGACGGCTTTCAGGGTACCCACAAGCATGCAGTGCGTAATTGCTCCCCTGGCCGCCTGAGTGCAACTTTCCGTCGCGCTAAAAACGTCTTGCAATTCCAAGAAGAGGTCGGGAAGTCGGACGTCGAAGATGTAGAGCTTAGCTCTGACGGGAACGAGCAAATGGAATGCATTAGTTACATAGATGGTCTGGGGGTGTCCCACACAATCCAGAGAAATGTATGCATCGATCCTTTCGTCGTTCGTCAAGTAAGTGGGGAGAACAACATGTGCTTCTGGAATTGCTTATCCTTCTTGCTCAATTTGGACGCTCAGTTACTCAAGGAAAGTCTCGTCAAAGGCTTAGAGAAACTTAGGGGAACGGGGTTGCACACTACTCTTGCTAAACAGCTTGCTCCCGGTGCGATGGCTGAGGATGATGTGATTTCACTTAGCTGCCAGATTTTCTCTTTAGAAATAGTCGTGCATAGTGTTAGTCAGCGCTGCACAACTATATTCGCAGCAGAAGACTTTGAGAAGCGTATTGATATTATGCATGACAATGAACACTTTTCCCTACTTTTCTATAAAAATGACTGTTTTGTGTCTGCTGTCGCGCAGACCTTTTCACGGAGTGTCGATGAAATGTATCGGGTCCTGGCCGACAAACGCTTTGGAGAACTGACTGACCTACTACGACTCGGCTGTGGATTAACCATTGCAGATTTGGAAGTCGGCTTCAAACTTCTGAACATTAAAGCGCATGTGCTTAATGATGGTGAGTACTTACTCATTAATGAAGTTGGGGAGATCAATGGCTTTTACTCTCTCACAGAAGACCACCTCGTGGCGGTTCCGCCTTTTAGTAAAAACCTATACGCGACGAAAGTGACTCTCAACGCGAACGAGCACTTGGCTGTGACCGCACTCAAAATGCTGCGAGAAGCCGGTACAGAACTTACGTACGACGCATCTCTTGATAGGGCCTCCAATTTCGAGAAAAGTTTGCTCAAGGGATGCACTGGTATAAGATCTTCCACGCTTTTCGCGGGGTTTTCCAGCAGACTCCAAGAACGACATGCGGATCATACCCGAGCCGTGACTACCATTCTAGGAACTTTCGGTGCCGGAAAAACCAGCTTAATCAAAAGGGCGGTGGTGAATTTCCGGAAGAGTGGTCGTGTGGTGCACTTTGTTTCGCCTCGGAGATCTCTAGCCGACGCTCTAATCAACTCCTTAGGGATCTCAAGGGAAGGAACCCATAAGAAAAATGGGATGGATGCTAAAAGTAAGAGAAGTCGGAACAAATCACAAAGTACATTCGTTAGAACCTTTGAGACCTTTTTGATACAGCACACCCGAGTGGGGGGCAATGATTTAGTTTTTTTTGATGAAATTCAACTTTTTCCACCCGGGTATTTGGATTATGCGTCCATGTTACTCCCTACAACTGCTGATTTTTTTGTGCTTGGGGATCCACTGCAGAGTGATTATGATAGCATGAACGATAGGCATGTCTACCTGGGTTACGATAGTGATGTCTCAAATCTATTAAAGGGTAAAGAATACAAGTATAATATCTTAAGCCGTCGCTTTGCTAATAGGATGTTTGCGTCTCGCTTGCCATGCGTGTTCGTCGAGGAGAGCTTTACCATGGAAGAACCCTATGTCATGTTACAAGGCTTGGGGGCGCATCTGGACGAAATCAAGAACTTTTCGGAAGTTTATCTGGTCGCGAGTTTCGTCGAGAAAAATTTTGTCAAGGCACACTTGGGGGAAAATGTGAAAGTGCTTACTTTTGGTGAGAGTACCGGTTTAACGTTTGAGCGGGGGGCGATTTTTATAACAGAAAGTGCGTTGAAAACCTCTGAGTGCCGGTGGGTCACCGCGTTGAGTCGTTTCTCAAGGAATCTGATTCTGGTCAATATGCTCGAGTGTACTTTCGAATCGTTAGCGAACCAGAGATCAGGCACGGTCCTCGGGCGTTTCCTAAAGGGCACAGCAGAACCTTCGCAAACGTTGGAGAAACTTCCAGGAAGTCCCATTGAACAACGCGGGTTCACCCATTGTGTGGGTCGTAATCTAGGGGTTCGTGAAGAGAAATTGCGTGGTGACCCTTGGCTAAAGAGTGAGCTGTTCTTGGGACAGGAAGAGGAAATGCTGGAGGTAGAAGACGTGGAGGCCATAATGAAGGAGGAGGTATTTAAGACCCACCTACCTCGGTGCGATCTGGAAGGGTTGAGGGCCCAATGGAATGATAAAATCGCCCTTAAGGAAGCCAGGGAATTCAAATTTCGCAATCTCGTGACCGACCAGTTCACCGACTGCCACTCTAAACAACGTGGGAAAATCTTGACCAATCAGGCAGAGCGCTTCGAAACCATCTACCCCAGACATAGGGCCAATGATACTTTGACCTTCCTCATGGCCGTGAAGAAGAGATTGAGATTCTCAAAACCACACTTGGAATGCGCCAAGTTGAAAGAAGCTGAGCCCTATGGCAAATTCTTGCTGGATGAATTCCTCAAACGTATACCTCTTAAACCGCACCACCGACATGATCTCATGGCAGAAGCTTTAAATGACTTCGAGGAAAAGAAGGTTAGTAAATCCGCCGCAATCATCGAAAATCACGCGAACCGCTCATGTTCGGATTGGTTGGCTGATGTTGGTCTTGTGTTCTCGAAAAGCCAGATTTGCACTAAATGGGACAATCGCTTCCGAGCCGCCAAAGCTGCCCAAACCATTGTCTGTTT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| 18,175
|
MH389247.1
|
Shallot latent virus
|
Marais,A., Faure,C., Theil,S., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2020-06-07
|
13-02
|
Shallot latent virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,362
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Allium cepa var. aggregatum
| null |
2013
| null | null |
Shallot latent virus isolate 13-02, complete genome
|
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| 49,812
|
MH389248.1
|
Shallot latent virus
|
Marais,A., Faure,C., Theil,S., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2020-06-07
|
13-06
|
Shallot latent virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,362
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Allium cepa var. aggregatum
| null |
2013
| null | null |
Shallot latent virus isolate 13-06, complete genome
|
GGATAAACAACACTACTCAAAACAAGACGCCGCTATTCTAACAAAACAGAGACGTCTCGTAATGGCCCTAACATACAGGAGTCCAGTTGAGGAAGTGCTAACAAGCTTCACCACAAGCGAACAGAGTGAGATCGCACGAGGAGCAGTCCAGGGTTTGCTAAAGTTAGAAGAATCTAATCACAATCTTTTTAATTTCGCGTTAAGTCCCATGGCGAAACAAAGATTGAGTAATAGTGGAATCTACTTGAGCCCTTTCTCTTACGTGCCTCATTCTCATCCCGCTTGTAAGACGCTTGAGAATTACAATCTTTACCAAGTTGTGTGTCCTCTTATAGATCATAGATTTTACCTCGTAGGCATTAAGCAATCTAAATTGTGTTTTCTTAAAAATAGGAATAGGAAATTAAGCATAGTTGAATGTTTGAATCGTATGGTAACTAGCCGTGATAAATTACGTTACAGTAGTGATTTTGTTATTCAATCTGGTCAACCCGGGACTGTCAAGAAAAATAGCAATACGGTAACTTTTTACCCGGAACTTGCAAGTTTAGTCCCACATGAAATTAAATTCAGATCAAGGGCTCTCTTCTTACACGATGAACTACACTATTGGAGCAAAGAGAGTCTGGTCATTTTCTTAGATCAATGTGCACCTGAATTGATGATAGCTACGATTGTAATACCGCCTGAGTTATTACTGAATGCAAAAGAAAGCATGAATAAATGGTGTTACGAGTTCGAGATCAAAGGTACAGATCTCTATTTTTACCCTGATGGTGTACGTTCTGAAGGTTATATACAACCCGCGAGTTGCATTTACCTGCTCAAGACCAATAAAATCATTACTCCAAATGGCCAGGTATACTGCATAGATATTATCAGTTCAAAATTTGCGCACCATGTGATAGCAATAACGCGCGGCGAAGTTCTAGTTAAAAAAGAGAATTCTTTTTCGAATTTCGAGGCTATAGGCTCCGCTTTCGCTAGCAAGTTATTGCATGATGATTATCCATGTTTCCCAATTAGCTATGAAGTGGTGATGAAATTGTACACTTATCTATCTTCACTAAATTCGCCTGACGTGAAATCAGCTGTGGCGAAACTGAGGCAATTAGTGGAGCATCCAACTGCTTTCGAGGTGCAATTTACTATAGAATTCGCAAATTTGTACATTCGCTGCGGGGTTAATTTGGATATTTTTACTCCTAGCACAAAAACACTGCTCTTGAAGAGTATAGCTGTGCTAATGCCCTCACTACTCACTAAATATTCAAAAAAATTGATGAGGGTTAGTTTCACCAGTTTCGTAAGTCACTTGAAGCCGCTAAGTTTTAATGTGACTTGCGAGACTTTAGATTTTGGAAAACGAATTAAACCTAACTATAATCTGGTGCCTTTCCTTGATGATAAGATACTGGCACCCTGCACTGAGATCTATGAAGGTCTATTCGAAAAGAGGAAATTTGATAGAGAGCCAGCGCCATACAATTTAACTCCTTGCGAAATGTTGCATCTGCATGAGGCACCTGAACAATTGCTGAAAGATAATATGATGTACTTAGGTGAATTGGAAAGTTTCGCTTTTTCAAGCATTGAGCAAGTTATGATAGGAGCTGCAGCAATTTATAGACCATTGTATTGGTTCTTATTCAGCATCTTGGGCGAACATTGTTTCGATCACTGCTTAATGGAAGCAACTAGAAGGCAGGGGATTGAGAAGAAAAGGAAAGGAGTTAAACAAGTTCTCTCGCTCCCTTGGTTTTCCGCGGAGAAAGAAGAAAAAGTTGCGATGTACCCCGCACCCCTTTTCAACTGCCTGGAACACGAAGAAGAAAATTGGGGCGCTGAGCTCGGGACCGATGATGCAGAACCTATGCTTTTGAATCTTTTTAACTGTGTCTGTGGTGTCGGTATACAATGGACCATTGCTTTCCACATCGAACTGCTCAGTGTACCAATGGAAGAACGTCTGGTTAACCGTTATGCTTCTTTCTACAGTAAAGGGGCTTTCGGTTATAGTTATAATGGAGGGTGCCATATTGGGCATGAATGGTTAGGGGAATTTGATTCATTCTTGGCGATAAATGGGCACGATTTAGAATATTTCAACTGTGTGCTATTTCAACGGTATGACGGAGGGCATGGCATAGGTTTCCACAGCGATGATGAGGAAATCTTTGAGGAAGGGAGCAAAATCTTAACTGTCTGCATGCAAGGTGATTGCGAGTTCCGGTTCCGTTGCTCTGCTGGAGAAACAGGTTTTTATATGGAAGCTCCAAAACAGTTTATGATGCCCGAAGGTTTCCAGCAGAATCACAAACATTCCGTTAGAAGTTGCACACCTGGACGTGTAAGCGCCACGTTTCGCCGAGCAAAGGTCAGGTTGCCCAAAGAGATTGAAGAAGTGCTCAGCGGGAGTGGGGGTGCAGATTTGAGTTCAGATGAAGGGAGTGCCGCTGATGATCTTAGTTATGTTGACAATTTGGGTGTCACGCACACAATCCAGAATAGCGTGAATATAGGTCCTTTTGTGATGCGTGAAGTGAGCGGCGAGAACAATATGTGCTTCTGGAATTGTCTTTCTTTTCTGCTCAATCTCGACGCACAACTGCTTAAGGATAATTTAACCAGAGGGTTGGGGAAACTCCGGGACATGAGTGTGCACGCTGCTTTGTCTAGACAATTGGCTCCTGGAGCTATGGCTGAGGATGACGTCATCTCATTAAGCTGCCAGATCTTTTCTTTAGAAATTGTGGTGCACAGTTTGAGTCAGAATTGTACTACTATCTTTTCAGCTGAAGATGCCGACAAAAGAATGGATATATTGCATAGGGATGAACATTTCTCGTTGTTGTTTTATAAGAATGACTGTTTTGTGTCAGCTGTTGCACAAACTTTTTCACGAGATACGAATGAAATGTACAGAGTCTTAGCTGATAAAAAATTTGATGAGCTGACCGATTTGTTGCGCCTAGGATGCGGCCTTACACTGGAAGATTTGGAAGTTGGATTTCGGCTCCTAAACATCAAAGCACACATTAAAAAAGATGGGGAGTACATGCTTGTAAACGAGAATGGGGAGATCAACGGTTTCTACGTACTGTCTGAAGAGCACCTTGTGGCCTGTCCACCCTTCAGTAAGAATCTATTCGCTACGAAAACGACGCTCAATTCAAATGAGCATTTAGCTACCACAGCTATCAAAATGTTGCGCGAAGCTGGTACGGAATTAACTTATAATGCGTCGTTAGATAGGGCCGCCAATTTCGAGAGGAGTCTGCTGAAGGGGTGCACAGGTATTAGATCTTCAACGCTTTTTTCTGGTCTCTCCAGTAGGCTCAAAGATATCCATGCGGACCATGAAAGGCCGTTGACCACCGTTTTGGGAACGTTTGGAGCTGGTAAAACAAGTCTGATCAAGAGAGCCGTTGTCAATTTCAAGAAAAGTGGTCGCATAGTCCATTTTGTGTCGCCCCGTCGTTCTTTAGCAGATGCGCTCATTCAGTCCTTGGGTTTAACTGACCGACGAAGTTCAGCTGCGGGTGAGAAGGGTACAACAAAGAAAAAACATCGCAAAATTTCGCAAAATACTTTTGTGCGGACCTTTGAAACCTTCTTGATTCAGCATACCCGGGTCGGTGGCAATGATCTAGTATTTTTTGATGAAATCCAGTTGTTCCCTCCCGGGTATTTAGATTATGCTTCCATGCTACTTCCAGACTCAACACAATTCTTTGTTTTAGGAGATCCATTGCAGAGCGATTATGATAGCATGAATGATAGGCATGTTTTCCTTGGTTATGAAGGGGATATCTTCCACCTGCTGAACGGGAAGGATTATAAGTACAACATTTTGAGTCGTCGGTTTTCAAATAGGATGTTTGCCACTCGTTTGCCTTGTGAATTTGCCACAGAGGGTTTTACTTCGGAAGAACCTTACATGATGTTGCAGGGCCTGGGGGCTAACCTGGAGGATATAAGAGCCTTTTCTGAAGTTTATCTAGTGGCCAGTTTCATTGAGAAAAATTTTGTAAAGGCTCACCTAGGAGAAAACGTTAAAGTCTTGACTTTCGGGGAGAGTACTGGTTTGACTTTTGATCGTGGGGCAGTGTTCATAACTGAAAGTGCTTTGAAAACTTCCGAGTGCAGATGGGTAACCGCACTAAGCAGGTTCTCTAAAAACCTTATCTTGATAAACATGCTTGAAGTCACCTTTGAGATGCTAGCTAGCCAAAGAGCTTCCACTGTGCTCGGACGGTTCCTCAAGGGCACTGCTGAACCCACGAATACTTTGGAGAAATTGCCAGGAAGGCCTACAGCGCAACATGGTTTTACTCACTGCGTAGGGAGGAATCTTGGAGTGCGTGAGGAAAAATTGCGAGGAGATCCTTGGCTCAAAAGTGAGATTTTCCTAGGGCAGGAGGTGGAAATGCAGGAAATTGAGGAAGTGGCTGAGATAGTTCAGAAAGAAGTCTTTAAGACTCATTTGCCCAGATGCGACTTGGAGGGTTTGCGCGCTCAATGGAATGACAAGATCTTGTTAAAAGAAGCGCGTGAATTCAAGTTCCGCAATCTCGTCACAGAGCAGTTCACTGATTGCCATTCCAAACAAAAAGGAAAAATTTTAACAAATCAGGCTGAACGTTTTGAGACTATTTACCCGCGACATAGGGCAAGTGATACTTTGACTTTCCTCATGGCCGTCAAGAAAAGGCTCAGATTTTCGAAACCACACCTTGAATGTGCCAAGCTGAAGGAAGCAGAACCTTATGGCAAATTCTTGCTTGATGAGTTTTTAAAGCGGGTACCGCTAAAGCCGCACCACAGGCATGATCTCATGAACGAAGCCCTACACGAATTCGAGGACAAGAAAGTTAGCAAATCCGCCGCGATTATAGAGAATCATGCTAACAGGTCCTGTTCAGATTGGTTGGCAGATGTAGGTCTGGTTTTTTCTAAGAGTCAAATCTGCACCAAGTGGGACAATAGATTTAGATCTG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| 49,813
|
MG657357.1
|
Shallot latent virus
|
Karavina,C., Ibaba,J.D., Gubba,A.
|
University of Kwazulu-Natal, Plant Pathology Department
|
South Africa
|
2018-09-10
|
q23-Manresa
|
Shallot latent virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,423
|
GenBank
| null |
Zimbabwe
|
Zimbabwe
|
Allium sativum
| null |
2015-10-24
| null | null |
Shallot latent virus isolate q23-Manresa, complete genome
|
CTACTCAAAACAAGACGCCACTATTCTAACAAAACAGAGACGTCTCGTAATGGCCCTAACATACAGGAGTCCTATTGAGGAAGTGATCACAAGCTTTACAACAAGTGAGCAGAGTGAGATCGCACGGGGAGCAGTCCAGGGTTTACTAAAGTTAGAGGAAATTAATCATAATCTTTTTAACTTTGCTTTGAGTCCAATCGCAAAACAAAGATTGTGCAATAGTGGAATCTACTTGAGCCCCTACTCCTACGTACCTCATTCACATCCCGCTTGTAAAACGCTTGAGAATTATAATCTTTACCAAGTTGTATGCCCACTCGTAGATCATAAATTTTACTTAGTAGGTATAAAACAATCTAAAATTTGTTTTTTGAAAAGTAGGAATAGGAAGATAGATATGGTAGAATGTATTAACCGTGTAGTGACTAGTAGGGATAAGTTGCGTTATAGCAATGATTTCGTTGTCCACGCAGGACAACCTGGAACTGTAAAGAAAAGCAGTAATACAGTCAGTTTCTACCCTGAGATAGCAAGCTTGATCCCACAAGATGTGAAATTCCGATCACGCTCTCTCTTTTTGCACGATGAGTTGCACTACTGGAGTGCGGAGAGCCTGGCCATTTTTTTGGATCAATGCTCACCAGAGTTGTTGCTTGCGACGGTCGTCATACCACCGGAGTTATTGCTAAATGCCAAAGAGAGTATGAACAAGTGGTGTTATGAATTTGAACTTAAGGGACCCGACCTCTATTTTTATCCTGATGGAGTCCGATCGGAGGGTTATATACAACCTGCCAAATGTATTTACTTGCTCAAAACCAATAGAATTATAACACCTGGAGGGCAGGTGTACTGCGTAGACATAATTAGTTCCAAATTCGCTCATCATGTTATCGCGATAACTCGGGGGGAAGCGCTCGTTAAAAAAGAAAATTCTTTCTCAAATTTTGAAGCTATAGGCTCCTCATTTGCGAGCAAATTGTTGCATGATGATTACCCCTGCTTCCCAATCAGTTATGAGGTGGTGATGAAACTGTATACGTATTTGTCCTCATTAAATTCACCTGATGTAAAGTCTGCAGTAGCCAAATTGCGTCAGCTGGTTGAGCATCCTACAGCCTTTGAAGTGCAATTCACCATAGAATTCGCGAACTTATATATCCGTTGCGGAGTTAATTTGGATATTTTTACCCCTAGCACTAAGACGCTGCTGCTGAAAAGCTTGGCCGTTCTGATGCCCGCCCTTTTGACGAAATATTCTAAGAAGCTGATGAGAGTGAGCTTCACCGGTTTTGTGAGTCACTTAAAACCTCTGAGTTTTAATGTCACTTGCGAGACAATTAATTTTAAAAACAAGAACAAAATCGACTACGGATTGGTCAGGTTTTTGGATAAGAATATTTTGGAACCTTGCTTAGAGTTTGGTGAGCGAGCACTAGGTTGTGCAGGCCTTGATAGAGATCCGCAGTCGTACGCTTCATTGTCAGGGGAGGTAACACACTTGCATGCCGATCCTGAGAAATTGCTAAAAGAAAATCTTAAGTTTCTCGGGGATCTCGAAAGTTACGCTTTCTCTAGTTATGAGCAGGTTATTATCGGTGCGGAGAGCGTATTCCGACCACTGTATTGGTTCCTATTCAATAGTTTGGGGGAGTCTTGTTTCGATCACTGTTTTCTGGAGGCCATCAGATTACAGAAAATGGAAAGCGCAATTCAATGTAATCAGGGATTGTTGTACCTACCTTGGTATCCCAACGGGAAAGTCAATGGGGAAGGAAAATATCCAGTGCCATCATTCAACTGTTTAGAACATGAGGATGAAAACTGGGGGGCGGATGCAGCGACTGATGGCATTGAGCCCATGTTGCTTAATCTTTTCAATTGCGTCTGTGGGACAGGCATACAGTGGACGATAGCATTTCACGTTGAACTCCTTGAAGTTCAAATGGAGGAACGTCTACATAATCGGGCTGCTACTTTCTACAGCAAAGGTGGTTTTGGTTATAGCTATAACGGTGGTAGCCACGCAGGCCATGAATGGTTAGAAGAATTCGACTCCTTTTTGGCTATTAATGGACATGATCTCGATTATTTCAACTGTGTCTTGTTTCAGCGATACGATGGCGGCCACGGGATCGGTTTCCATAGCGATGATGAAGAACTTTTTGAAAAGGGTAGCAGGATTCTAACTGTCTGCATACAGGGTGATTGCGAATTTCGTTTTCGTTGTGCTGCAGGCGAGACGGGGTTCCTTATGGAGGCCCCAAAACAGTTTATGATGCCTGAGGGTTTCCAACAAAATCACAAACATGCTGTAAGAGAATGTACCCCTGGGCGCATCAGTGCCACTTTTCGCAGAGCTAAAAGGCCAACTGGTGAACAAGAACATACACCCCCATGCGTGGTTGGTGAGATCGATGAAAGTGCGGAAAGTGAAAATGATTCTGAGTGCTTAAGTTTTGTGGATAACCTGGGAGTTGTGCATACCATCCAGAAAACAGTGAATGTCGAGCCTTTCGTGGTCGGTGAAGTCAGTGGGGAAAATAACATGTGTTTTTGGAACTGCCTATCTTTCTTATTAAATCTCGATGCCCACGTACTGAAAGATAATTTATACAAGGGGATTGAAAAATTAAAAGGCACAGGAGTACATTCTTCATTGTCAAGGCAGTTATTACCAGGTGCTATGGCCGAGGAAGATGCAATCTCCCTGAGTTGCCAGATCTTTTCTTTAGAGATAGTCGTGCATAGTCTGAGTCATAATTGTACAACGACCTTTTCTGCATCTGATTCTGAAAGGAAGATCGATATTCTGCACGATAAAGAACACTTCTCCCTGCTATTTTACAAGAATGATTGTTTTGTGTCTGCAGTTGCTCAAACCTTTTCTAGAAGCACTAAAGAAATGTATCGAGTTCTGGCTGATAAGAAATTTGATGAGCTGACTGATCTCCTTCGGTTGGGTTGTGGTTTAACTCTGGCAGATTTAGAAGTTGGTTTTAAACTCTTGAACATTAAGGCGCATATCAAAAGAGAAGGTGACTGTATCCTTATCAATGAAAAGGGTGAGATAAATGGTTTTTATGCGTTAACGGATGATCACCTAGTTGCATGCGCCCCTTTTAGCGAGAGTCTCTTTGCAACCAAAACCACGCTCAATAGAAATGACCATTTGGCAGTGACCGCCATTAAAATGTTGCAGGAAGCGGGGACTGATTTGGTATACGATGCAACATTAGATAGGGCGTCAAATTTTGAAAGGAGCTTGTTAAAGGGTTGTACGGGCATTAGATCTTCTACGCTTTTTGCTGGTTACTCTAGCCGACTCAAATCAGAGCATGTGGATCATGGGAGGCAACTCACTGCTGTACTAGGTACTTTTGGTGCTGGAAAAACTAGTTTGATCAAGAGGGCCGTCGTTAATTTCAAAAAAAGTGGTAGAGTGGTGCATTTTGTATCGCCGCGACGATCCTTGGCCGATGCACTAATTCATTCACTAGGTCTCTCTGATAATCAGAACTCAAGCCCCAATGGTGGAGCAATTAAAAAAAAGCATGGTAAGAAAAATTCGCAAAATACCTACGTGCGAACTTTTGAGACCTTCTTGATACAAATCACTAGAATTGGGGGCAACGATCTTGTATTCTTTGACGAAATTCAATTGTTTCCGCCCGGTTATCTAGATTATGCATCCATGTTGTTGCCATCATCGGTCCATTTCTTCGTACTGGGGGATCCCCTACAAAGCGATTATGATAGTATGAATGATAGGCACGTCTTCATAGGTTATGAGCGTGATGTTATGCGATTACTCAAAGGGAAGGAGTACCAGTATAACATACTGAGCCGCCGTTTCTCAAATAAAATGTTTGAAACTAGATTACCTTGTGAGTTCACCAAAGAAAGTTTCACACTTGAAGAACCATACATCATGTTGCAAGGTTTGAATTCTGATTTGGCCGATGTCAAAAATTTTTCAGAGGTTTACCTAGTGGCCAGTTTCGTCGAGAAGAATTTCGTCAAAGCACACCTCGGGGAGAACGTGAAGGTATTGACTTTTGGTGAAAGCACTGGTCTAACATTCGAAAGAGGTACTATTTTCATCACAGAGAGTGCACTAAAAACCTCTGAATGTCGCTGGGTGACCGCTTTAAGTCGGTTCTCTAAAAATTTGATCTTGATTAATATGCTTGATATCACCTTCGAAATTTTAGCCAATCAAAAGTCGAACACAATACTCGGTCGTTTCCTGAAGGGTACAGCTGACCCCGCCCAGACTCTGGAAAATTTGCCGGGAAAACCCAAAGCACAATACGGTTTTGCGCAATGTGTCGGGAAAAATTTTGGGGTACGGGAATCGAAATTGGGTGGTGACCCCTGGTTGAAAAGCGAAATTTTCCTCGGTCAAATTGAAGAGATGCAGGAGATCGAAGAGGTTGAGGCCGTGATGCAGCAGGAAATTTTTAAAACGCACTTGCCAAGATGCGACCTTGAAGGGTTGCGGGCTCAGTGGAATGATAGGATCTTGCTGAAAGAGGCTCGTGAATTTAAATTTCGCAATTTAGTGACGGAGCAATTCACCGATAGTCATTCTAAACAGAAAGGAAAAATATTAACAAATCAGGCTGAACGTTTTGAGACGATCTACCCTCGGCACCGTGCAAATGATACTCTGACTTTTCTCATGGCAGTTAAAAAACGGCTTAGGTTTTCCAAACCCCATTTGGAATGTGCCAAGTTAAAGGAGGCAGAACCTTATGGAAAGTTCCTTCTTGATGTTTTCCTCAAGAAAGTGCCGCTCAAGCCTCATCTTCGGCACGACCTAATGGCTCAAGCTCTACATGAATTTGAGGAAAAGAAAGTGAGTAAATCCGCGGCCATAATAGAGAATCACGCGAACAGATCTTGCTCTGATTGGCTTGCAGATATGGGTTTGGTATTTTCCAAGAGTCAAATTTGTACAAAGTGGGATAATCGTTTCAGAGCGGCTAAAGCTGCCC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| 68,726
|
LC279526.1
|
Shallot latent virus
|
Ohshima,K., Okamura,K., Yasaka,R., Fukuda,S., Ishimaru,K., Tomitaka,Y., Yamashita,K.
|
Faculty of Agriculture; 1-banchi, Honjo-machi, Saga, Saga 840-8502
|
Japan
|
2017-07-04
|
SLV-WOST87
|
Shallot latent virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,338
|
GenBank
| null |
Japan:Saitama Prefecture
|
Japan
|
Allium macrostemon
| null |
2013
| null | null |
Shallot latent virus DNA, nearly complete genome, isolate: SLV-WOST87
|
AAGACGCCACTATTCTAACCAAACAGAGACGTCTCGTAATGGCCCTAACTTACAGGAGTCCAGTTGAGGAAGTGCTCACAAGCTTTACTACAAGCGAGCAGAGTGAGATTGCACGTGGAGCGGTCCAGGGTTTGCTAAAGTTAGAAGAATTTAATCACAACCTTTTCAATTTTGCTTTAAGTCCAATTGCAAAACAAAGATTGTGCAGTAGTGGAATCTACTTGAGCCCCTTCTCTTACGTGCCTCATTCCCATCCAGCTTGTAAAACGCTTGAGAATTATAATCTTTACCAGGTCGTGTGTCCACTTGTGGATCATAGATTCTATTTGGTAGGTATTAAGCAGTCTAAATTATGTTTTTTAAAAAGTAGGAATAGGAAGATAGATATTGTAGAATGCTTAAATCGCATGGTCACAAGCCGTGATAAATTACGTTACAGTAGTGATTTTGTCGTTCAAGCTGGTCAACCCGGCACAGTGAAGAAATGCAGTAACACAGTAACCTTTTATCCTGAGATTGCCAGCTTAATCCCTCACGAAGTTAAATTCAGATCAAGGGCTCTTTTCTTGCACGATGAACTGCACTATTGGAGCAAAGAAAGTTTGGCGATCTTTTTGGATCAATGCTCGCCCGAATTGATGATTGCAACTGTTGTTATCCCACCTGAGTTGCTGTTAAAAGCCAAAGAAAGCATGAACAAGTGGTGCTATGAATTTGAGGTCAAAGGCCCTGATCTTTATTTCTATCCTGATGGTGTGAGATCAGAGGGTTATATACAGCCTGTGAAGTGTATCTATCTGCTGAACACGAACAAAATCATTACGCCTGGAGGACAGGTCTATTGTGTCGATATCATAAGCTCTAAATTCGCGCACCATGTGATAGCTATTTCACGAGGCGAGGCTTTAGTTAAGAAAGAAAATTCTTTTTCGAATTTCGAAGCCATAGGATCCTCCTTTGCTAGTAAGCTGTTGCATGATGATTACCCATGCTTCCCCATTAGTTACGAGGTGGTTATGAAATTGTATACTTATTTGTCCTCTTTAAATTCCCCCGATGTGAAGTCAGCCGTCGCTAAATTACGGCAGTTGGTTGAACATCCCACCGCATTTGAGGTGCAATTCACGATAGAATTTGCGAATCTTTACATCCGATGCGGTGTCAATTTGGACATTTTTACGCCCAGCACTAAAGTGTTACTCCTCAAGAGTTTGTCTGTGTTAATGCCAGCTCTGCTGACCAAATATTCGAAGAAATTAATGAGGGTCAGTTTCACTAGTTTCGTGAGTCATTTAAAACCCTTGAGCTTTAACGTGTGTTGTGAAACTTTGGATATGAGAACTAGGGCAAAACCTTGCTACAATCTTGTGCCCTTTCTCGATGAAAAGTTGCTTGCGCCATGTTTGGATATGGGCGAGAAGCTGTTCTGGTCAGAGAGTTTCGATAGGGAGCCTGCCCCCTACGGGATGGTTATGAGAGAAGAAGTTCATCTCCATGGAGACCCGGAACAATTACTCAAGGATTACCTGATATACCTCGGTGATTTGGAAGGTTTCACTTTTTCTAGTGTTGATCAGATACTGGTGGGTGCCATGACTATCTATAGACCGCTGTATTGGTTTTTATTTAGCACTTTGGGTGATCATTGTTTCGACCATTGTTTGATGGTAGCCACCCGAAATCAAAGAATTGGAAAACAGCACGACGTTGGAGGAAAAACTCTTTCCCTCCCGTGGTACCCCGAGGGCAAAACAGGAAAAAATGGGGCATACTCCGCACCAGTTTTTAATTGCTTGGAACATGAGGAAGAAAATTGGGGAGCGAGGGATGTAATAGACGACATTGAACCCATGTTGCTTAATCTTTTCACTTGTGTGTGTGGGGTTGGAATACAATGGACGATCGCCTTTCATGTAGAACTGCTTGACGTCCCCATGCATGAACGTTTGCGTAATCGCAGCACTGCTTTTTATAGTAAGGGGAGTTTTTGTTACAATTATAACGGTGGGAGCCACATTGGGCTTGAATGGCGGGAAGAATTTGATTCCTTTTTGTCAATCAATGGGCATGATCTTGAGTACTTCAACTGCGTGCTATTCCAAAAATATGATGGTGGACATGGCATTGGTTTCCACAGTGATGATGAGGAACTTTTCGAAAGGGGTAGTAAGATTTTGACCGTATGCATCGAAGGGGATTGTGAATTCAGGTTCCGTTGTGCTACCGGAGAAACCGGCTTTTATATGGAAGCGCCAAAGCAATTTATGATGCCTGAAGGTTTTCAAGAGAGTCACGTGCACGCTGTGGGAGAATGCACACCAGGACGCATAAGCGCGACCTTCCGCAGGGCCAAAAGTGTGTATGATAAGGAAGAAACCTCTTTAGAAAACTGCAGTGAAGGCGTAGAAAACTGTGCTGATGAGTGTAGCGAAACTGAATGCATTAGCTACATAGATAATCTGGGCGTATCACACACTATCCAGAGGGCTGTCTGCATTTCTCCCTTCGTCATTCGTGAGGTAAGTGGAGAGAACAACATGTGTTTTTGGAATTGCTTATCTTTCCTACTCAATTTGGACGCGCAGTTACTCAAAGTAAGTCTTTCTAAGGGCCTTGAGAAACTCAAGGGTGCTAGCATGCACGCCTCTCTGGCTCGACAGTTGGCCCCCGGCGCTATGGCAGAGGATGATGTTATTTCTTTGAGCTGTCAGATCTTCTCCCTAGAGGTCGTGGTGCATAGCTTGAGTCAGAATTGCACTACAACTTTCTCAGCATCGGATGCAGAAAAACGGATAGATATTTTGCATGAAAATGATCATTTTTCCTTGCTGTTTTACAAAAACGATTGCTTTGTGTCAGCTGTCGCACAAACTTTCTCACGTGACACTAACGAGATGTACAGGGTCTTGGCTGACAAGAAATTTGATGAGTTAACGGAGCTGTTACGTCTTGGTTGCGGGCTAACTTTAGAAGATTTGGAGGTTGGTTTCAGACTGTTGAACATTAAAGCGCACATTCAAAAAGACGGAGAATACCTGCAGATCAATGAGGCTGGAGAAATCAATGGGTTCTACGTTTTAACTGAAGATCACCTCGTGGCTTGCCCACCATTCAGCAAGAGTTTGTTCTCAACGAAAACCACACTGAACACAAATGAGCACCTAGCAGTTACAGCTATTAAGATGTTACAGGAAGTCGGCACGGAACTGACTTATCAGGCTTCTTTGGATAGGGCTTCTAACTTTGAAAGGAGTCTACTCAAGGGTTGCACTGGAATTCGATCCTCAACGCTTTTTGCTGGTTTTTCTAGCAGACTCAAAAATGAGCATGCAAGCCATGAAAGACAACTGACGACTGTTTTAGGGACTTTTGGGGCGGGCAAAACTAGTCTGATTCGGAGGGCTGTAATCAACTTCAAGAAAAGTGGTAGAGTGGTGCACTTTGTCTCGCCACGAAGATCACTGGCTGATGCGCTTATCCAGTCTCTGGGTCTCACTGAAAATAGGGGTCCCGGCTTTGACGGAAAGGGAGGCAAGAAACGCAAAGGAAAAAATTCACAGAATACTTTTGTACGGACTTTTGAGACCTTCCTAATCCAATGCGCTCGGGTAGGAGGCAATGATCTGGTGTTTTTCGATGAAATCCAACTATTTCCACCAGGCTATTTGGACTACGCTTCAATGTTGCTCCCAACGACCACGCAATTTTTTGTCCTGGGGGATCCCATGCAAAGTGACTACGACAGTATGAATGATAGGCATGTTTTCCTTGGTTATGAGGGTGACATTTTCCATTTGTTGCAGGATAAAGAATACAAATACAATATTTTGAGCCGTCGTTTTTCGAACAAAATGTTCGCGTCTCGCTTACCTTGTGCATTCACCGTCGAAAGTTTCACTTCCGAGGAACCTTACATCATGTTACAGGGTTTGGGTGCGAATTTGGATGAGATCAAAGCCTTCTCGGAGGTATATCTGGTTGCAAGTTTCGTTGAGAAAAATTTTGTTAAGGCGCACCTGGGTGAAAATGTGAGGGTTCTGACTTTTGGGGAAAGCACCGGTCTTACTTTTGATAAGGGGGCAGTGTTCATCACTGAAAGTGCAATGAAGACCTCAGAGTGCAGATGGGTAACCGCCCTAAGTCGGTTTTCGAAAAATCTGATTTTAATTAATATGCTTGAGGTCACTTTTGAAGCGCTTGCGAGTCAAAGATCCACAACTGTTTTGGGGCGTTTCCTTAAAGGCACAGCTGAGCCTTCACACACGCTGGAGAAATTGCCAGGTAAACCCACGGCGCAATATGGTTTTACCCACTGTGTTGGTAAAAACTTGGGGGTGCGTGAAACGAAACTGCAAGGAGACCCTTGGCTCAAGAGCGAGATCTTTCTCGGTCAAGAAGAAGAAATGCAGGAAATTGAAGAAATGGAAGTGATGATGCAAAAGGAGATCTTTAAGACTCATTTGCCAAGGTGCGACTTGGAAGGTTTACGTTCTCAATGGAATGACAAAATTTTACTGAAAGAGGCGCGCGAATTCAAGTTCCGCAACCTTGTGACTGACCAGTTTACTGATTGTCATTCCAAACAAAGAGGGAAAATATTGACAAATCAGGCTGAACGTTTCGAGACCATTTACCCCAGACATCGAGCTAGCGATACCTTAACTTTCCTCATGGCTGTGAAGAAACGTTTAAGATTTTCCAAACCTCATTTAGAATGTGCGAAATTGAAAGAAGCCGAACCTTACGGTAAGTTCTTGCTTGACGAGTTCTTAAAAAAAGTACCTCTCAAGCCACATCATAGGCATGATCTCATGACTGAAGCTCTCCATGAATTCGAGGAGAAAAAAGTAAGTAAATCGGCGGCCATCATTGAGAATCATGCTAACCGTTCCTGCTCTGACTGGCTGGCTGATGTAGGTCTGGTTTTCTCGAAAAGTCAGATCTGCACGAAATGGGACAATCGTTTCCGAAGTGCCAAGGCTGCTCAAACTATCGTCTGTTTTCAACATTCTGTATTAGTAAGATTCGCCCCTTACATGCGTTACATTGAGAAGAAAGTGCTTGAAGTCTTGCCTAAGCAATACTATATTCATTCTGGCAAAGGGCTAGATGAATTGAATCAATGGGTGTGTGACAATAAGTTCCATGGCTTTTGTACTGAGTCTGACTATGAGGCATTTGATGCATCACAGGACCAGTACATCATGTCTTTTGAAATCGCCCTGATGGAATTCCTTGGTTTGCCAAAGACACTCATAAACGACTATAAGTACATTAAAACCCATTTGGGTTGCAAAATGGGGGCTCTTGCGATCATGAGGTTTTCTGGTGAAGCCAGCACTTTCCTATTCAACACTTTGGCTAATATGCTTTTCACCTTTTTGCGATATGATCTAAATGGGAAAGAAAGCATCTGTTTCGCTGGGGATGATATGTGCGCTAATCGCAGGTTACGAGTTAGTCTTAAGCATGAAGATTTCTTGGGTAAACTCAAATTGAAGGCGAAAGTTGCCTTCACCAAAAGGCCCACCTTTTGTGGTTGGAATTTGACTTTTTTCGGCATTTATAAAAAACCCCAATTGGTTTTCGAAAGGATGTGCATAGCCAAAGAGACGAATAATTTGCATAATTGCATCGATAACTATGCCATCGAGATAAGTTTTGCTTATGTGAAAGGCGAAATGGCTGTTTGCCATATGGATAAAGACGAACTAGATGCCTTTTACAATTGCGTCCGTGTAGTTGTGAAGAGTATGCACCTCCTGAAATCAAACGTTCGTGAACTTTTCAAAAATGAGGTCGAAACTTGAGCTTAGGTATTAGCTATATTATTGATATATATGGATGTGTTTTGTAAAGTATTAATTGAGTGTGGTTTTAGTAGAATAGACGGTTCTGGTAATAAGTGCAAAATAGTTCTAGGTGTGCCTGGTTGTGGTAAAAGTAGTTGCATCCGCAAATTGCTAAATTTAGATTCTCGTTTCATCGCCGCCACTTTCGGAACGCCCGATCCGCTCAACGTGACCGGACGACGGATTCGCGCCATAACTGAACTTGCCACTTTAGATTGTACAGGGAAATTCCTATTAATTGACGAGTTCCAACAGGGCGATTTCGAAGAGCTTAAACCTTTTGCTCTTTTTGGTGACGTGTGCCAGTTCTTTGATTCCACCAAGCCCTATCCTATTGCTGACTGGTACAAGACGGTGAGTCACCGCGTAAACAAACTCACTTGCGACTTCTTGCGGAATTTTGGTTTTGAAATCAACTCTAGTGTGCAAGGAAATTTAACTTTTCGTGGGCTATACGAAGAAGAGCTGAAGGGCGTTGTTATAACTTACTGTACGCAGGTCTCCGCTCTGTTGAAGGCTCATCAGGTCGAGCATCATACGCTTGCTAGTTGTCGCGGTTCTGAATTTCCAAACGTGAGCCTCTGTTTGAGCGATTCCGTGGTGCACCGAGAAGATCTAGCAAAATTTTACGTCTGCGCCACTCGGAGTACTGGGGATTTGCTTATCCTAACTCCGGATGCCTCTAAGCCCTCCACCTGATCACACCAAGACTCTCTTTGCCGGTGCTATTGGCGTTTGCATAGCTCTTTGCTTATATACTTTAACTCGCTCGACTCTGCCGCACGTTGGTGATAACATACATAGTTTACCGCACGGAGGTTGCTACCAAGACGGCACTAAAAAGATAGTTTATAACAGCCCGGCTAGGAATTTCCCTAGCAGTAATCTGCTTTCAAAATCCACTTCTCCCATTTGCTTAATCGCCCTAATTATTGGTCTGATCTTTTTGAGCGAAAGGATTAAAACAAGTTCAAGCACGCGCGTTACATGCCGTTGCAACCACTCATAGCCCTGACCATCGGCCTCCTCGTGACGTTGCTGATTTGTTACGTTTTTGAGAATTTCAAAACTGAAAGGTGTACAGTCGTAATTACTGGTGAATCAGTCAAAATACTTGGTTGTGAATTTACAAGGGAATTTGTCGATTTCGCCAAACAGGCGAAACCTTTTGGTTCACTTTAGGTATACAGCGCTCTTAATTGATATCATGGCTAACGAGAAAGAAGAACTCAATAACGTGCAGAATTTGCCGACGCGCGACCCTGAGACGATCCCAGAACGTGAGCGCAGTAAAACAGTGAATGATGTAGGCGTTATGGAGCGCGAAGGTTTTGAGACAGTGCTGCGAAGGAGCGAGGAAAGGTTCAACAAACTTAAGGAAAAGTGCTTGTCCGAGTTGTCCAGTGTGAATGTCACAAATTGCGGGTGGGAATCAGGACGACCCAAAGCACAACTTGCTGATAGTCTCAAAGGGGATGCTTCCAACATTTTCACTCGCCCCTCAATGGACGCACTCCTCGTGCGAAATTATGCACCTGAAAGTAATAACATGGCTACAGCTGAAGAGTTAGCTAAAATCTCAGCCAAAGTACAGGCCCTTGGCGCCCCTGAGGAATGCCTGGCCGAAGTTTTTTGGGACATATGCATGTATTGCACTACTGCTGGCAGTTCCCCAAATGTAAATCCTAAAGGAACTATATCTGTAGGTGGCAAGGTTGTGACCAGAGACATGGTTGTGGCCGTAATCAAAGAATATTCTACTTTGCGCCAGGTTTGTCGCTGTTATGCGCCTGTGGTATGGAATTACATGCTGTTGAATGAACAACCACCTGCTAATTGGGACGCAAAGGGCTTCACTGAGAACACTAAATATGCCGCTTTCGACACCTTTGATGCAGTAACAAATAAGGCCGCAATCCAACCTCTTGAGGGTCTGATTAGGGCTCCTACTGATGCTGAACGGATCGCTTTTGCGACGCACAAAAAGTTGGCCCTGGCTAAAAATGCTCAGAACTCTCGCTATGCCAACACTTCTGCCGAAGTCACTGGAGGCTTCTTTGGATGTTTTCCTAAAAACAATTTCAGAGAGAATCGATGTTGATCAAACAGAGAACTTACCGTAGACTATTGCGTGCTATATTTAAATTACATACTAATAGAAATTGTGTGGATGTGATTAATATTATCGTGAGTAAAATAGTGTGTGAGAGTGTTGGGGCCTCAACCTATGCTCGAGCTCGTAGAGCTAAAAGCATTGGTAGATGCCCTCGATGCTTCCGGTGTTCACCTGGTTTTTATTTCACTAAAAACTGTGACACCAAAACTTGTTCCCCAGGTATTAGCTATAATGCAAAAGTCAAGGACTTTATAGTTGATGGTGTAACAATGTGAAACCCTACTACAAGACCTTGGCTAGTTGCCCATAAAACCTAAGTAATGAATAAGTGGGAACTTATAAAAAAAATTTGTTTTTAAAATATTTTCGC
| 75,934
|
JQ899443.1
|
Shallot latent virus
|
Wylie,S.J., Li,H., Jones,M.G.K.
|
Murdoch University, Plant Virology, WA State Agricultural Biotechnology Centre
|
Australia
|
2013-05-01
|
SW3
|
Shallot latent virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,400
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Allium sativum
| null |
2011-09-01
| null | null |
Shallot latent virus isolate SW3, complete genome
|
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| 94,211
|
JF320811.1
|
Shallot latent virus
|
Wylie,S.J., Luo,H., Li,H., Jones,M.G.
|
Murdoch University, Plant Virus Group, WA State Agricultural Biotechnology Centre
|
Australia
|
2011-12-12
|
WA-1
|
Shallot latent virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,371
|
GenBank
| 1
|
Australia
|
Australia
|
Allium sativum
| null |
2010-09-28
| null | null |
Shallot latent virus isolate WA-1, complete genome
|
CGGGGATAAACAACACTACTCAAAACAAGACGCCACTATTCTAACCAAACAGAGACGTCTCGTAATGGCCCTAACTTACAGGAGTCCAGTTGAGGAAGTGCTTACAAGCTTTACCACAAGTGAACAGAGTGAGATCGCGCGCGGAGCAGTCCAGGGTTTGCTAAAGTTAGAGGAGTTCAACCACAATCTATTTAATTTCGCATTGAGTCCCATCGCGAAGCAAAGGTTGTGCAGTAGCGGAATCTACTTAAGCCCCTTCTCTTACGTGCCTCACTCCCATCCCGCTTGTAAAACGCTTGAAAATTACAACCTTTATCAAGTCGTATGCCCGTTAATAGATCATAGGTTTTACTTAGTTGGTATTAAGCAGTCTAAATTATGTTTTTTAAAAAGTAGGAATAGGAAAATGGATATGGTAGAATGCATCAATCGCATGGTTACGAGCCGCGACAAGTTGCGCTACGGGAATGATTTCGTGGTCCAAGCTGGTCAATCCGGGACTGTTAAGAAGAACAGCAGAACTGTAACCTTTTATCCAGAGTTAGCTAGTCTTGTTCCACACGAAATTAAATTTAAGTCTAGAGCTCTCTTCTTGCACGACGAATTGCACTATTGGAGTAAAGAAAGCTTGGCTATCTTTTTGGATCAATGCTCACCTGAGTTAGTGCTTGCTACTGTAGTTATACCACCTGAACTGTTGCTCAAGGCCAAGGAGAGCATGAACAAATGGTGTTATGAGTTCGAGGTCAAAGGTCCTGATCTCTATTTCTACCCAGATGGAGTCAGAGCTGAGGGCTATATACAACCCGCCAGTTGCACTTACCTTTTGAATACGAACAAGATGATTACCCCGAGCGGGCAGGTTTATTGTTTCGACATCATCAGTTCAAAATTCGCGCACCATGTGATAGCAATAACCCGCGGCGAAGCTCTAGTTAAAAAAGAGAATTCTTTCTCCAATTTCGAAGCTATCGGCTCATCCTTTGCGAGCAAGTTGCTACACGATGACTATCCCTGCTTCCCGATTAGTTACGAAGTGGTCATGAAACTGTACACTTACCTCTCTTCTTTAAATTCGCCTGATGTGAAGTCTGCCGTTGCTAAGTTGCGCCAGTTGGTTGAACATCCGACGGCTTTTGAAGTTCAATTTACTATTGAATTCGCTAACTTGTACATTCGCTGTGGCGTCAATCTGGATATCTTTACGCCAAGCACTAAAACACTTTTGCTCAAAAGCCTAGCTGTGCTAATGCCTGCCCTGCTAACTAAATATTCGAAGAAGTTAATGAGGGTTAGTTTCACTAGTTTCGTTAGCCATCTAAAACCTTTGAGTTTTAATGTGAAATGTGAAACGATTGATCTCAAAGTGCAGGCGAAGCCTAACTATGAGAGGCTCATTCCTTCTGGAATTGATTCGCTCCTGAATCACTTGGAATGTGGAAATTTTGGTTTTGGGAGGGAAAGCCTGTCTAGAGAGCCTGCCCCTTACAGTTTTACCCCCAATGAGACATGCCACCTACATAGTGCTCCTGAGGAGTTACTTACGGCAAATATGAAATTTCTTGGTGATCTGGAAAGTCTCACCTTCTCCAGCACTGATCAAGTGCTCGCTGGGGCTGCTGCTGTATTTCGACCATTGTATCGGTTCCTTTTCAGCACTCTGGGAGAATATTGTGTGGATTATTGTCTGATGCAAGCGACCCGCAAACAACGTGTGGAAAAGAATGAGGGCGCTGCATCAAAGCAGCTCGCACTACCATGGTTCACTAGCAAGGCTCATGAAGAGGAGAGGATGTACCCGACACCTGCGTTCAATTGTTTGGAGCACGAAGATGAAAACTGGGGTGCTGCTGAGGTGGTCGATGATATGGAACCCATGTTGTTAAATCTTTTTAATTGTGTCTGTGGGGCAGGTATTCAGTGGACTGTTGCATTTCACACGGAGTTGCTTGATGTCTGCATGGCTGATCGTCTGGTTAACCGCAGTGCAGCTTTCTATAGTAAAGGGAGTTTCGGTTACAGCTACAATGGTGGAAATCACATAGGCCATGAGTGGTTAGATAACTTCGATTCATTTTTGGCGCTCAATGGTCATGATCTTAACTACTTCAATTGTGTGCTTTTCCAGAAGTATGATGGTGGTCACGGTATAGGTTTTCACAGCGATGATGAAGAACTTTTTGAAAGAAACAGTAAAATACTCACCGTTTGTATTCAAGGTGATTGTGAGTTTAGGTTCCGTTGTGCCACTGGTGAGACAGGTTTCTTCCTTGAAGCCCCAAAACAATTCATGATGCCTGAAGGATTCCAGGAGAGCCACAAACATGCTGTGAGGGGTTGTTCACCCGGTAGAATCAGTGCCACTTTCCGTAGGGCTAAGATTTTGCCTGTTGAGGAATATCTAACTACTGAGAACGGAAATGCGGATTCCGACAACAGTGTAGATGATAGCAATGGGTCGGAATGCTTAAACTTCATTGATAATTTGGGTGTTTCACACACTGTTCAGATGAATGTCGACATCTCACCTTTTGTTGTTCGAGGAGTTAGTGGAGAGAATAACATGTGCTTCTGGAATTGCCTTTCCTTCCTACTCAATTTGGATGCACACTTGCTTAAAGATAATCTATCCAAGGGTTTAGCAAAACTCAAAGGAGCAAGTGTGCATGCTACTTTGGCAAGACAGTTGGCCCCTGGTGCAATGGCTGAGGATGATGTTATCTCACTCAGTTGTCAAATTTTTTCTTTGGAAATCGTGGTACACAGCTTGAGTTCGGGATGCACCACTACCTTCTCCACTGAAGACGCAGAGAAGAGGATTGACATCTTGCACGAAAATGAACATTTTTCACTGCTCTTTTATAAGAATGATTGTTTCATTTCCGCTGTGGCTCAAACATTTTCACGTGATACTAATGAGATGTACAAAGTATTGGCTGATAAAAAATTTGATGAACTCACGGAATTGCTACGTTTGGGGTGCGGCTTGACTCTTGAGGATCTGGAGGTGGGCTTTAAACTTCTGAACATCAAAGCTCATATTAATAAAGATGGGGAGTATCTACAAATCAATGATTCGGGAGAGATAAATGGTTTCTATTCTTTAACAGATGAACATCTTGTGGCCTGTCCACCCTTTAGTAAGAACTTGTTTGCCACCAAAACCATCCTCAATTCTAATGAACATTTGGCCGTGACTGCTATCAAAATGCTACGTGAAGTGGGTTCTGAGTTGATTTATCGTGCTTCCCTTGATAGAGCTTCCAATTTTGAACGGAGCCTTCTCAAGGGTTGTACTGGAATTAGATCATCCACTCTCTTCGCTGGGCTTACTAGTAGACTCAAGGATGGACATGAAGATCATGAACGCCCACTGACTACTGTCCTGGGGACTTTTGGTGCTGGTAAGACAAGCTTAATCAAAAGAGCCGTGGTGAATTTTAAAAAAAGCGGTCGCGTAGTGCATTTTGTGTCACCGCGGCGCTCATTGGCCGATGCTCTTATTCAATCATTGGGCCTTACTGACAGATCAAGTGCCTGTGTTGATGGCAATAGGGGGGGCAAACGAAAAGGTAAGAAAAACTCGCAGAACACCTTCGTTAGGACCTTTGAGACCTTTTTGATCCAAAATGCACGTGTCGGGGGTAATGACCTAGTATTCTTTGACGAAATTCAGCTTTTCCCACCTGGTTATCTAGATTACGCTTCCATGTTGCTCCCAAGTACTGTTCAGTTTTTTGTACTCGGGGATCCACTTCAAAGTGACTACGATAGTATGAATGATAGGCATGTTTTCCTCGGCTATGAATCGGATATTTGCAATCTGCTAAAGGGGAAAGAATACCAGTACAATATTTTGAGTCGCCGATTCGCCAACAAGATGTTCACTTCTCGTTTGCCTTGTTCTTTCAAATCTGATTGCTTCACCATTGATGAACCCTACATCATGTTACAGGGCTTAGGGGCCAATCTGGTTGAAATTAAAAACTTTTCTGAGGTTTATCTTGTAGCAAGCTTTGTAGAGAAAAATTTTGTGAAGGCTCACTTGGGAGAAAATGTGAAGGTTCTAACCTTTGGTGAGAGTACCGGCTTGACATTCGAAAGAGGATCTGTTTTTATTACTGAAAGTGCCTTGAAGACTTCAGAGTGCAGGTGGGTGACCGCTTTGAGTAGGTTCTCGAGAAATTTGATCCTGATCAACATGCTCGAAATCTCTTTCGAATCTTTAGCTAACCAGAGGTCAAATACTGTGTTAGGACGTTTTCTGAAAGGCACGGCAGATCCTTCTCATACTCTTGAAAATTTGCCCGGCAAGCCAATCGCGCAATATGGGTTCACACACTGCGTTGGCAGGAACTTTGGGGTCCGTGAAGCCAAATTACAGGGGGATCCTTGGCTAAAAAGCGAGATCTTTCTTGGACAAGAGGATGACATGCAAGAAATTGATGAAGTCGCTGAAATTGTACAAAAAGAGATTTTCAAGACTCATTTACCCCGCTGCGATTTGGAGGGTTTACGAGCGCAATGGAACGAAAAAATCCTTTCAAAAGAAGTGCGTGAGTTCAAATTTCGCAATCTTGTCACCGATCAATTCACAGATTGTCACTCTAAGCAGAAAGGAAAAATCCTAACAAATCAGGCGGAACGTTTTGAAACTATTTATCCTAGGCACCGTGCTAGCGACACTCTTACTTTCCTCATGGCTGTCAAGAAGAGATTGAGATTTTCAAAACCACACTTAGAATGTGCCAAGCTGAAAGAAGCTGAACCTTACGGCAAGTTTCTGCTCGATGAATTTTTGAAGCGAATTCCCTTAAAGCCGCACCACAGGCATGATCTAATGTCCGAAGCTCTCCACGATTTTGAAGAGAAAAAGGTGAGCAAGTCAGCTGCCATCATTGAGAACCATGCTAATCGTTCTTGTTCCGATTGGTTGGCCGATGTCGGTCTAGTGTTCTCCAAAAGCCAAATTTGTACTAAATGGGACAATCGTTTTCGATCTGCGAAAGCAGCACAAACAATCGTTTGCTTCCAACATTCGGTGTTGATAAGATTCGCGCCCTACATGCGTTACATTGAGAAAAAGGTACTTGAAGTGTTACCTAAAAAGTACTACATTCACTCTGGCAAGGGCCTTGATGAGCTGAATCAGTGGGTGTGCGACAATAAATTCCATGGCGTCTGCACTGAGTCTGACTATGAAGCTTTTGATGCTTCCCAAGACCAATACATCATGGCCTTTGAAATTGCATTGATGGAATACCTTGGTCTGCCCAGATCACTAATAAATGATTACAAATACATCAAGACCCACCTGGGTTGTAAGATGGGTGCACTGGCGATCATGAGGTTTTCCGGCGAAGCCAGCACCTTTCTGTTCAATACTCTGGCGAACATGCTATTCACGTTTTTGCGGTATGATTTAAACGGGCAGGAGAGCATTTGCTTCGCGGGAGATGATATGTGCGCTAATCGTCGATTACGTATCAATCTCAAGCACGAGGATTTTATGAGCAAGCTCAAACTAAAAGCAAAGGTGGCTTTCACCAAGAGACCAACTTTTTGCGGATGGAATTTAACTCACTTTGGCATCTACAAAAAACCGCAATTGGTCTTCGAGAGGATGTGCATAGCAAAAGAGACTAACAATCTGCACAATTGCATTGACAATTACGCCATCGAGATTAGCTTCGCCTATGTGAAAGGTGAACTTGCTGTTTGCCACATGGATAATGAAGAACTCGATGCCTTCTACAACTGTGTGCGTGTGGTAGTCAAGAGTAAACACCTTCTGAAGTCTAACGTGCGAGAGCTATTTAAGAATGAGGTTGAAACTTGAGCTTAGGTATTAGCTATATTATTGATATATATGGATGTGTTCTGTAAAGTGTTAATTGAGTGTGGTTTTAGTAGATTAGACGGATCCAGTAATAAGTGTAAGGTAGTATTAGGAGTGCCTGGTTGCGGTAAGAGTAGTTGTATCCGCAAATTGATTAATCTTGATTCTCGTTTCATTGCTGCTACTTTCGGCGCCCCGGACCCGCTCAACGTCACCGGGAGACGTATTCGGGCTGTCACTGAAATCACCGCGACTGAGCTCGACGGGAAATTACTTCTGCTTGACGAATTCCAGCAGGGAGATTACGAAGACCTTAAACCTTTTGCGCTTTTTGGAGACGTGTGCCAATTTTTCGACTCAACCAAACCATACCCAGTCGCTGACTGGTGCAAAACTGTTAGTCATCGCGTAAATAAACCCACGTGTGACTTCTTGCGGACTTTTGGTTTTGAGATCACTTCTGGCGTTTCTGGAGACTTAGTATTTGGAGGTCTGTACGAGAAAGAATTACAGGGGGCAGTCATCACTTATTGCACCCAGGTCTCGGCTCTATTGAAAGCTCACAGGGTTGAACACTATACTGTTGCCAATTGTCGTGGGTCTGAATTTGCTGAAGTTACTCTCTGCTTAAGTGACCACATAGTGCCTAAGGTAGATCTCGCTAAGTTCTACGTTTGTGCCACTCGAAGCCGCGGGAATTTACTGATTTTAACGCCTGATGCCTCTGAGCCCTCCACCTGATCACACCAAAACTTATTTTGCTGGTGCTATAGGGGTCTGTGTCGCTCTTTGTTTGTACACTCTAACTCGCTCAACGTTGCCACACGTAGGAGATAATATACATAGTCTACCTCACGGCGGCTGCTATCAAGACGGTACTAAGAGAATTATTTACAATCGTCCAGCTAAGAACTTTCCAAGTAGTAACTTGCCACTGAACTTCACTTCGCCTGTCCTGTTACTAGGAATTCTAATCGGTCTAATTTGCTTGAGCGAAAAGTTAAGGCCCAGCTCGCGAACGCGCATCACATGCAGTTGCAACCACTCATAGCTCTAATAATTGGTCTTTCTGTAACACTGATTATTTGCTTTACTTTCGATAGCGTCAGAACTGAGCGGTGTACCGTTATCATTACTGGAGAATCGGTCAAATTTTTAGGGTGTGAATTCACTAGGGACTTCATAGATTTTGCCATACAAGCTAAACCTTTTGGTTCACTTTAGGTTTACAGCGCTATAAATTGATATTATGGCAAACGAAGAAGAAGAACTCAACAGAGTAAAGAATTTGCCCACACGCGACCCGGCGACGGTGCCCGAAGGGGAACGCCGTAAGGCCGTTAATGACGTTGGCGTTATGGAACGTGAAGGCTTTGAGGCCGTTCTTCGTAGGAGTGAAAGTAGATTCAACAAGCTCAAAGAGAAGTGCATAGCTGAATTATCTAGCATAAATGTGACGAATTGTGGCTGGGAATCCGGACGCCCCAAAGCTCAGCTTGCCGATAGTCTTAAAGGGGATGCATCAAATATTTTCACCCGTCCTTCCATGGATGCACTTTTGGTACGGAACTACGCACCTGAAAGTAATAATTTGGCGACTGCCGAAGAATTGGCAAAAATATCCGCCAAGGTGCAGGCTCTAGGTGCACCAGAAGAGTGTCTAGCTGAAGTGTTCTGGGACATTTGCATGTATTGCACTACAGCAGGAAGCTCGCCAAATGTGAACCCTAAAGGGACCATCTCTGTCGGCGGTAAGGTTGTAACTAGGGACATGGTGGTCGCCGTCATTAAGGAATACTCAACGCTACGACAGGTTTGCCGTTGTTACGCGCCCGTTGTTTGGAATTACATGTTGTTGAATGAGCAGCCGCCCGCTAATTGGGACGCAAAGGGATTCACTGAAAACACTAAATATGCTGCTTTTGATACTTTCGATGCGGTGACGAATAAGGCTGCAATCCAACCGCTGGAAGGCCTGATAAGGGCCCCGACTGATGCTGAACGCGTTGCTTTCGCAACACACAAGAAGTTAGCCCTTGCGAAGAATTCGCAAAATTCCCGATACGCCAACACCTCCGCTGAGGTTACTGGAGGATTCTTCGGATGCTTTCCTAAAAACAATTTTAGAGAGAATCGATGTTGATCAAGCAAAGAACTTACCGTAGGTTACTGCGTGCTATATTTAAATTACATACTAATAAGAATTGTGTGGATTTGATCGATATTATCGTAAGTAAAATAGTGTGTGAGAGTGCTGGGTCTTCGCGCTATGCTCGAGCTCGTAGAGCTAAGAGTATAGGTAGGTGCCCTCGTTGTTTCAGGTGCTCACCTGGTTTTTATTTCACTAAAAACTGTGACGCTAAAACTTGCACCCCTGGCGCAAGCTATAATACTAAAGTCAAGGATTTTATAGTTAATGGTGTAACAATGTGAAACCTTACTATAAACCTTGAATAGTTGCCCATAAAACCTAAATAATGTATAAGTGGGAACGAACTAAAATAAATTTGTTTTTAAAATATTTTCGCAAAA
| 97,777
|
HQ258896.2
|
Shallot latent virus
|
Saqib,M., Wylie,S.J., Jones,M.G.K.
|
Murdoch University, School of Biological Sciences and Biotechnology, West Australian State Agricultural Biotechnology Centre
|
Australia
|
2011-06-01
|
MS/SW/Aus2
|
Shallot latent virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,400
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Allium sativum
| null |
2010-01-24
| null | null |
Shallot latent virus isolate MS/SW/Aus2, complete genome
|
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| 98,930
|
NC_003795.1
|
Shallot virus X
|
Kanyuka,K.V., Vishnichenko,V.K., Levay,K.E., Kondrikov,D.Yu., Ryabov,E.V., Zavriev,S.K.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-06-12
| null |
Shallot virus X
|
Allexivirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,832
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Shallot virus X, complete genome
|
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| 9,020
|
OK104171.1
|
Shallot virus X
|
Singh,J., Majumder,S.
|
Sharda University, Biotechnology
|
India
|
2022-07-26
|
KER-1
|
Shallot virus X
|
Allexivirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,911
|
GenBank
| null |
India
|
India
|
Allium cepa var. aggregatum
| null |
2019-10
| null | null |
Shallot virus X isolate KER-1, complete genome
|
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France
|
France
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Shallot virus X isolate 13-05, complete genome
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|
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|
Shallot virus X
|
Marais,A., Faure,C., Theil,S., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2020-06-07
|
13-06
|
Shallot virus X
|
Allexivirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,898
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Allium cepa var. aggregatum
| null |
2013
| null | null |
Shallot virus X isolate 13-06, complete genome
|
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| 49,816
|
JX310755.1
|
Shallot virus X
|
Arkhipov,A., Gushchin,V., Vishnichenko,V., Solovyev,A.
|
Moscow State University, Belozersky Institute
|
Russia
|
2013-01-22
| null |
Shallot virus X
|
Allexivirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,898
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Shallot virus X strain Russian, complete genome
|
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| 95,321
|
ON811833.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_1
|
Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 12,079
|
GenBank
| null |
China:Gansu
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
SAMN28688347
|
PRJNA841744
|
MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_1, complete genome
|
TATATCCTGCCCCCCCATGTGTACATAACATCTCATCATAAAGCCAGAATGGCATCACTGGATGATGTTGTAAATAAGACGGAAATCGCTGAAGGCCTGTTTAGTTCCAGCACTGATTTAATAGAGGCAAGGTCAACATTGATCAAGATTAACCTAAAAGAAGTTTTTGACCTACATCACATACCTTCTGACAATGACTGTTTTTTCCATTGTGTTTCACAGCATCTGTCAGAAGGAGCCTTGCCAGTGAGCCAGGTGAAAGGCATCATATTTAGTTTTGCTTCCAGAAACTGGGACAAACTTTATGAAGCGAAGACATTCTACGGTAGCTCTGATGAGTATGGCAAAGAACTCATGAGCAAAGGCTACTGGGGAGGGTCCTGTGAAGCAGAAATTCTCAACAAAGCATATGGAATGCCAATCCTGTTCTGGATGACAGATGACTTTCAAGTGACAACTGCTGTAAAATTCTGGTCGAGAAGGTACGCTGGGTTTTCTGAGTTGAACGTGGTATGCAATGAAAGGCATTTTCAGTATTTAACCCTGAAAGACTCACCAAAGCCTGAGCCCAAAGAGCTTGTCGTGGAAGAGAGTGGGTTTGAGGTGGTGAGTGACTCAGAAGAGGAGGAACCTGACAACCTGGAAGACATCTTCCTACCAGAGCATGAAAAGAGCCGCCTGGAGCTGTTTAGCAAGCCTACACCGTCCCTAGTGAAGCAAGACAGTAAGGTAAGCAAGCAGCTTAGCAAGCTGCTGGACCAGGAGAAGACATTACCCCTAAGAATAGGAAGGATTCTGTCAAAGATTTTCCCTTGTAATGTCAAGGCGCAGCGGTTGGACAGTGGAACCTACGTGTTGCTGCCAGAGCATTCCAGTGCCAGAGGGCTAATCAGCCTGTCAGACCTAGGCTGGAACTGGATGAAGCTTAGAAGGAAGAAACAACTCACTGTGAAGCACAATGTTGCAGTGTCGGAGGAGCTCCTTGCATTTGCTGACAGTCAGTTTGTGCTCACGAACCTGGTAGGAGCTAGCCTGCTTGCGGCGAATGCTGCAATACTTCCAACCGAACTCGTGAACAAGATCGCGACTGCAGCATCCATAGTGCTTCTATCTAGTTTCCTTTACAAGTCATCGATGAAAGCAAAGAGGGATTTCATCTCTGAAAACCTTGAGCTGAATGACATCAGTGCCAAAAAGGCCCAAAGGTATATATGGTCTCTCCGGCCTTTCTCGGTTTACCAGAGACCATTGGAGACTGCACAGACAGTCATCTTCCTTTGCCTGGGTGACCTTTGCCAAGAGCTTTCTCTGAGGATCTCTAGGTTGCCTGCTTCTTCTTACTTGCTGCTTAACTGTATTGACGTCGCTGACAGAAATATCAACGAATTCTTGTCACTACTAGACTCCATTGGCCAAGACGACACAGACGAGATGGCAATCAGTTCCTCAGAAGTCCAAGACATTAGCATCACATGCAACAGACTTCAGGAGCTTTTCAACTTAAAGTCCACCGGAGCGACCAAACTTCAGTACCGAGACTATCTGGCAACACAGGGACTTAACCCTGACAAGTTCATACATGGCACAACCAACCTTTACTACAAAGCCAAGGAAGCAGTGCTAAAGACCTTTTTTGAATCACGGCACATTATGAAGATGATATCTAAGCATGGGAAGGCGTATGCTGGGTCTTCTATAAGCTCTCTCATGGCTTACATCTCAAACCTCCTGATTATCAGGGAAAAGCTGGGCCTAACCCTGGAAGACACTGCAAGACTTGAGACCATTGAGCGCAGACTTATGTCCATACAGTCTAGGGATAAGAGAGTCCCAATCCCCATTCTATGTTCCCTAGTTGAACCTTGCATGAAAGAGCTCTATGATAACTTGCCATCCGACTGTGCCCAAGAGTGTGAGATGCTTTTCACACGGATAAGAAATTCAGATACTCATTCGACAGCCTGGTCAGCTGCTTTAAGATTGAAAGGGGTGGCGTATGAAGGCCTGTTTTCCAAGGCACATTCCATAAAGTATGTGCCTGAGGATCAGAAGCCCACATTGTCAATGGCTATTCAAACCTACTTCCCCGATCGGTTTGAAAAGTTCCTTCAGAGGACTCAGCTACACCCTGAGGTCAGAGAGTTTAGACCTGACTTTCTACTTGCCAAGAAGCTCCTAATGCCAAGCACCAAAATACCAGAAGGAATTTCTAAAATTGTCCAAGTTATGAGTGATCCCCAGCTAGACGAGGGATTTCGCTATAGCAGAAGGGAAGGCAGGGCTTTCCCCCTGCCAGAAGTACCGATTAGTGAAGTCCACTCTTTCAGAGATGTAGCCCCGAACCTAGAGGAAATTAGCAAGCTAAGGTTCCAAAAGTATAAGGAGATAACTGGGCAAGTCATGACAACTGAGCAACCAAAGCAGCTGAAGGTCCTGGCAAAGGAAGCAGTGGCAGTGTTGAAAGAAAATGGAATCTCAGGGTACTATGAAGCCCTTAGAAGGCCGAGGCAACAGCTTGAAGAAGAGACAGAGTTTCTCATCATAGAGGTAGGCTACCAGACAGATACAGAGGTTAAAGTGCAAATGGACATTGACAAGTGGAGGGTTGCAGTTAGCCTTTTAAAAGACCTTGGAATAAGATCAACTGTTGTTGCCTGCTCAGACAATACTGCAACAAAGTCTTCTGATTGGTACATACCTGAAAGGCTTGTGAAGGTCATAAAGAACTCAGTTAGTAACCTTTTTTCAAAATTGTCTCAGAACTCACCTCAAGAGGTCACCGACATGATGGTAGGAGCCATTAGCACTCAAAAGATCAGATCTGTCTTAAAGTCTGGCAGCGCCATCAAGACCCCAGTCACAATTCAAGACATTCTGACGACTTGGGATGACAACAAGAGATACATCATCAACAGACCCACAGGTGCTCAACTACCATCCAGGTTAGAGAAGATCATCTCCACAGCATTGTGTGAAGGTGCCGTGATTTCAAAAGACAGTTCAAGGAAAGTTGTGGATGCCGTCATCAAAGAAAAAGGCCAGATAGCAGACTGGGTGGAGCAGACCAAGTACGCAGTGGAGGTAGTTGAACCTGTAGTAACGGCGGAGAAACTCCTAACAGGTTGGCTGCTAGATGACCTGGAAAGCTGCAGATGTAGCAAATGTGTAGATCAGGTTAAGAAGACCCTCAGAGAAACGAGTTCAATGTCAGAGGGCCTTACATACCTTGCTTCACAGATTCAATTAGAGTCGCATGAGCCCTGTTGTCACTCTATTGAAGTTCACCCTAAATCAGCCGACATGCTTAGACGTAGGACAGTACAGCTTGAATTTGTTAGCCATATGAGCACTGAAATTGCCGACCTTGACGACAAATCTACTGCCCTAGATCGGCTATGCAGGCTAACACTTCCTGGCAAAACGGAGAAAGAGCGCAGCATCAAGCGTGGTGTCGAGTCCCTGCTTAGACAAACAATGAAAGACTCCGGTATACCCTGCATCAAACTGCCAACCGGGCAAATAGTGGTTAACACAGACCTATTTAACACAAGCAAGTCAATGGAGGGAGGTATTCGAACTAAGTCTAAAAAAGAGAACCTAGACCAAGAGACAAGACTGGATAGGCTAAAAAAAACATTGTCCCCTGATCGTTTGAAGGGTTACTCAGAATTTGTCAAATCTACAATCTCTTCGGTGCTAGCAAATACGACAAACCAGCAAGAGAGCCTGTGTGCAATGAAGCCTGAATGGGTTCGTAAGGTCTTGGCAGATCTGGAAGCTGACATGACAGAGGAAGACTTGTTAACAAAGATAGAAGAGACCCGTTCACTAAGGCAGAACTTTGTGATCAACAATGACAAGCTCGTGCCCCTGTCTAACAGTGAAGTAAGTACGTACATACAGGACAAAAGTTCAGCATTGCTGAATTCAAAAGACCTAAAGAAGCCATTTAAACTCGACTGCATGCTTCACAAAGAAATATACCTTGAATGCATCCGACGCTACCAAAGTACACCATACTTTGACTGTATGACGATAGTGGCTAAATTGGTAAAACTGTTCCTCAAGTTTGACTGGTTTCAGGAGATTGTTCTTTATTCTAAAGTTTGCGAAACATTTCTACAATGCTGCACAGAGTTCAACAGGTCTGGCATCAAGATAAGAAGGGTAAGACATTGTAACCTGAACCTAGCCATAGCACTACCATCAAACAAAAAAGAAAACATGAGATGTGCTCTGTATGACAATAATTTCTGCCAGCTCAGTGCAAGGTATTTCCTTCTCTCGAGGAGGGTTGCAGTTTTGGGTGCTGCCATGCCTTATATAGTACTCATATGTGCACTGCAGTGCCTTCAACATGCAAGATGCGTGGATGCAGTCCATGATGCTGATCCTGTTGTTGTCCAAGAAATATTGGAGCGGAATGCAGTTAACTTGGACTGCATCACTTCTAGCCTCAAAAAAACAAACTCAGGCAACTTTGAGGAGGCTTCAAGAGAATACATCGAGCACTGTAAGAGAAGCGGCAACTATCTTACGAGGTCTAGCAAAGATGTGTTTGTTACAACCATCTCAGGGCTCAGCATGACCTTTGGGCTGTTATTGGGTCCAGCTATGCTCTTAAACTCCCAGCCCTTCAACAAGCAGATTCAAAACATGAGATTCGGGATGCTGTATGGCCTGTCAAGGATTGCATCACCAAAAGAGCTTGGAAAGAAACTAAGCAGTTCCTGCAGAAATGTTGAAACATACGTGGCCAGGCTACTGCTGCAACTAGTTGTTTTCTCTTCAGGACTTGACACAGACAAAAACATCGAGGCCTGGAGAAAGCATGACCTCTGCCCAGAAGTTACAATCCCTAGCTTGACTTTGACGGGTACAATAGTTAGTGGAGACAGGCAGCTCATTTTTGACATCTACCTAGTCCACATTTACAACAAGGAAATGGACAACTTTGACGAAGGTTGCATCAAAGTCCTACAGGAGACATTGGAGAGACA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| 20,432
|
ON811842.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_2
|
Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 12,086
|
GenBank
| null |
China:Liaoning
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2018
|
SAMN28697478
|
PRJNA841744
|
MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_2, complete genome
|
AAAGATATATATCCTGCCCCCCCATGTGTACATAACATCTCATCATAAAGCCAGAATGGCATCACTGGATGATGTTGTAAATAAGACGGAAATCGCTGAAGGCCTTTTTAGCTCCAGCACTGATTTAATAGAGGCAAGGTCAACCTTGATCAAGATTAACCTAAAAGAAGTTTTTGACCTACACCACATACCTTCTGACAATGACTGCTTTTTCCATTGTGTTTCACAGCATCTGTCAGAAGGAGCCTTGCCAGTGAGCCAGGTGAAAGGTATCATATTTAGCTTTGCTTCCAGAAACTGGGACAAGCTTTATGAAGCGAAGACATTCTACGGCAGCTCTGATGAGTATGGCAAGGAACTCATGAGCAAGGGCTACTGGGGAGGGTCTTGTGAAGCAGAAATTCTCAACAAAGCATATGGAATGCCAATCCTGTTCTGGATGACAGAGAACTTCCAGGTGACAACTGCTGTAAAATTCTGGTCAAGGAGGTACGCCGGGTTTTCAGAGTTGAACATGGTATGCAATGAAAGGCATTTTCAGTATTTGACCTTGAAAGACTCACCAAAGCCTGAGCCCAAAGAGCTTGTCGTAGAAGAGAGTGGATTCGAGGTGGTAAGTGACTCAGAAGAGGAGGAACCTGACAACCTGGAAGACATCTTCCTACCAGAGCATGAAAAGAGCCGCCTAGAGCTGTTTAGCAAGCCCACACCGTCCCTAGCTAAGCAGGACAGTAAAGTAAGCAAGCAGCTTAACAAGCTGCTTGACCAGGAGAAGACATTACCCCTAAGAGTAGGAAGGATCTTGTCAAAGATCTTCCCCTGCAATGTCAAGGCACAACGGTTGGACAGTGGAACCTACGTGTTGCTGCCAGAGCACTCCAGTGCCAGAGGGTTAATCAGCCTATCAGACCTAGGTTGGAACTGGATGAAGCTTAGAAAGAAGAAGCAGCTCACTGTGAAACACAATGTTGCAGTGTCGGAGGAGCTCCTTGCATTTGCTGACAGTCAATTTGTGCTCACCAACCTGGTGGGAGCTAGCCTGCTTGCGGCGAATGCTGCAATACTACCAACCGAACTTGTGAACAAGATCGCAACTGCAGCATCCATAGTGCTTCTATCTAGCTTCCTTTACAAATCATCGATGAAAGCAAAGAGGGATTTCATCTCTGAAAATCTAGAGCTGAATGACATCAGTGCCAAAAAGGCTCAAAGGTACATATGGTCTCTCCGGCCTTTTTCGGTCTACCAGAGACCATTGGAGACTGCACAGACGATCATCTTCCTGTGCCTAGGTGACCTTTGCCAGGAGCTTTCTCTGAGGATCTCTAGGTTGCCTGCTTCTTCTTACCTGCTGCTTAACTGTATTGACGTCGCTGACAGAAACATCAACGAATTCTTGTCACTACTAGACTCCATTGGCCAAGACGACACAGACGAGATGGCAATCAGTTCCTCAGAAGTCCAAGATATTAGCATCACATGCAACAGACTTCAGGAGCTTTTTAACTTAAAGTCCACCGGTGCGACCAAACTTCAGTACCGAGACTATCTGGCAACACAGGGACTTAACCCTGACAAGTTCATACATGGCACAACCAACCTTTACTACAAAGCCAAGGAAGCAGTGCTAAAGACCTTTTTTGAATCACGGCACATTATGAAGATGATATCTAAGCATGGTAAGGCGTATGCTGGGTCTTCTATAAGCTCTCTCATGGCTTACATCTCAAACCTCCTGATTATCAGGGAAAAACTAGGCCTAACACTGGAAGACACCGCAAGGCTTGAGACCATTGAGCGCAGACTTATGTCCATACAGTCTAGGGATAAGAGAGTCCCAATTCCTATCCTATGTTCCCTAGTTGAACCATGCATGAAAGAGCTCTATGACAACCTGCCATCCGACTGTGCCCAAGAGTGTGAAATGCTTTTCACACGGATAAGAAATTCAGACACTCATTCAACAGCCTGGTCAGCTGCTTTAAGATTGAAAGGGGTGGCGTATGAAGGCCTGTTTTCCAAGGCACATTCTATAAAGTATGTGCCTGAGGATCAGAAGCCCACATTGTCAATGGCTATTCAAACCTACTTCCCCGATCGGTTTGAAAAGTTCCTTCAGAGGACTCAGCTACACCCTGAGGTCAGAGAGTTTAGACCTGACTTTTTACTTGCCAAGAAGCTCCTGATGCCAAGCACCAAGATTCCTGAAGGAATCTCTAAAATTGTCCAAGTAATGAGTGATCCCCAGCTAGACGAGGGATTTCGCTATAGCAGAAGGGAAGGCAGGGCTTTCCCCTTGCCAGAAGTACCGATTAGTGAAGTCCACTCTTTCAGAGATGTTGCCCCGAATCTAGAGGAAATTAGTAAGCTAAGGTTCCAAAAGTATAAGGAGATAACTGGGCAAGTCATGACAACTGAACAACCTAAACAGCTAAAGGTCCTAGCAAAGGAAGCAGTAGCAGTGTTAAAAGAAAATGGTATCTCTGGGTACTATGAAGCCCTTAGGAGACCGAGGCAACAGCTTGAGGAAGAGACAGAGTTTCTCATCATAGAGGTAGGCTACCAGACCGATACAGAAGTTAAAGTACAGATGGACATTGACAAGTGGAGGGTTGCAGTTAGCCTCTTAAAAGACCTTGGAATCAGATCAACTGTTGTTGCCTGCTCAGACAATACTGCAACAAAGTCTTCTGATTGGTACATACCTGAAAGGCTTGTGAAGGTCATAAAGAACTCAGTTAGCAACCTTTTTTCAAAATTGTCTCAGAACTCACCTCAAGAGGTCACCGATATGATGGTAGGAGCCATTAGCACTCAAAAGATCAGATCTGTCTTAAAGTCTGGCAGCGCCATCAAAACCCCAGTTACAATTCAAGACATTCTGACGACTTGGGATGACAACAAGAGATACATCATCAACAGACCCACAGGTGCTCAACTACCATCCAGGTTAGAGAAGATCATATCTACAGCATTGTGTGAAGGTGCCGTGATCTCAAAAGATAGTTCAAGGAAAGTTGTGGATGCCGTTATCAAAGAAAAAGGCCAGATAGCAGACTGGGTGGAACAGACCAAGTACGCAGTGGAGGTTGTTGAACCTGTAGTAACGGCGGAGAAACTCCTAACAGGTTGGCTGCTGGATGACCTGGAAAGCTGTAGGTGTAGCAAATGTGTAGATCAGGTTAAGAAGACCCTTAGAGAAACGAGTTCAATGTCAGAGGGTCTCACCTACCTTGCTTCACAGATCCAATCAGAGTCGCATGAGCCCTGTTGTCACTCTATTGAAGTTCACCCGAAATCAGCTGACATGCTTAGACGTAGGACAGTACAGCTTGAATTTGTTAGCCATATGAGCACTGAAATTGCCGACCTTGACGACAAATCTACTGCCCTAGATCGGCTCTGCAGGCTAACACTTCCTGGCAAAACGGAGAAAGAGCGTAGTATCAAGCGAGGTGTCGAGTCCCTGCTTAGACAAACAATGAAAGACTCCGGCATACCCTGCATCAAACTGCCGACCGGACAAATAGTGGTTAACACAGAACTATTTAATACAAGCAAAGCAATGGAGGGAGGTGTTCGAACTAAGGCAAAAAAAGAGTCCCTAGACCAAGAGACAAGACTGGATAGGCTAAAAAAAACATTGTCCCCTGATCGGTTGAAAGGTTACTCAGAATTTGTCAAGTCTACAATCTCTTCGGTGCTAGCGAATACGACAAACCAACAAGAAAGCCTGTGTGCAATGAAGCCTGAATGGGTTCGTAAGGTCTTGGCAGATCTGGAAGCTGACATGACAGAAGAGGACTTGTTGACAAAGATAGAAGAAACCCGTTCACTAAGGCAGAACTTTGTAATCAACAATGACAAGCTTGTGCCCCTGTCTAACAGTGAAGTAAGTACGTACATACAGGATAAGAGCTCAACACTACTGAATTCAAAAGACCTAAAAAAGCCATTTAAACTCGACTGTATGCTTCACAAAGAAATTTACCTTGAGTGCATCCGACGCTACCAGAGCACACCATACTTTGACTGTATGACGATAGTGGCTAAATTGGTAAAACTATTCCTCAAGTTTGACTGGTTTCAGGAGATTGTTCTTTATTCTAAGGTTTGTGAAACTTTCCTACAATGCTGCACAGAGTTCAACAGATCTGGCATCAAGGTAAGGAGGGTAAGACATTGTAACTTGAACCTAGCCATAGCACTACCATCAAACAAAAAAGAAAACATGAGATGTGCTCTATATGATAATAATTTCTGCCAGCTCAGTGCAAGATATTTCCTTCTCTCGAGGAGGGTTGCAGTTTTAGGTGCTGCCATGCCTTACATAGTACTCATATGTGCATTGCAGTGCCTTCAACATGCAAGATGCGTGGATGCAGTCCATGATGCAGATCCTGTTGTTGTCCAAGAGATATTGGAGCGGAATGCAGTTAACTTGGACTGCATCACTTCTTGTCTTAAGAAAACAAACTCAGGCAACTTTGAGGAGGCATCAAGAGAATACATCGAGCACTGTAAGAGAAGCGGCAACTATCTTACGAGATCTAGCAAAGATGTGTTTGTCACCACCATCTCAGGGCTTAGCATGACCTTCGGGCTGTTACTAGGGCCAGCTATGCTCTTAAACTCCCAGCCCTTCAACAAACAGATTCAAAACATGAGATTCGGAATGCTGTATGGTCTGTCAAGGATTGCATCACCAAAAGAGCTTGGAAAGAAACTGAGCAGTTCCTGCAGAAACGTTGAAACATATGTGGCCAGGTTGCTGTTGCAACTAGTTGTTTTCTCCTCAGGACTTGACACAGACAAGAACATTGAGGCCTGGAGGAAGCATGACCTTTGCCCAGAAGTTACAATCCCTAGCTTGACTTTGACAGGTACAATAGTTAGTGGAGACAGGCAGCTCATTTTTGACATCTACCTGGTCCACATTTACAACAAGGAAATGGACAACTTTGACGAAGGCTGCATCAAGGTACTTCAGGAGACATTGG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| 20,440
|
ON811851.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_4
|
Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 12,079
|
GenBank
| null |
China:Anhui
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
SAMN28704335
|
PRJNA841744
|
MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_4, complete genome
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ATCCTGCCCCCCCCATGTGTACATAACATCTCATCATAAAGCCAGAATGGCATCACTGGATGATGTTGTAAATAAGACGGAAATCGCTGAAGGCCTGTTTAGCTCCAGCACTGATTTAATAGAGGCAAGGTCAACCTTGATCAAGATTAACCTAAGAGAGGTTTTTGATCTGCACCACATACCCTCTGACAATGACTGCTTTTTCCATTGTGTTTCACAGCACCTGTCAGAAGGAGCCTTGCCAGTGAGCCAGGTGAAGGGCATCATATTTAGCTTTGCTTCCAGAAACTGGGACAAACTTTATGAAGCGAAGACATTCTACGGCAGCTCTGATGAGTATGGCAAGGAACTCATGAGCAGGGGCTACTGGGGAGGGTCTTGTGAGGCAGAAATTCTCAACAAAGCATATGGAATGCCAATCCTGTTCTGGATGACAGAAGACTTCCAAGTTACAACTGCTGTAAAATTCTGGTCAAGAAGGTACGCCGGGTTTTCAGAGTTGAACATGGTATGCAATGAAAGGCACTTTCAGTATTTGACCCTGAAAGACTCACCAAAACCTGAGCCCAAAGAGCTTGTTGTAGAAGAGAGTGGGTTCGAGGTGGTAAGTGACTCAGAAGAGGAGGAACCTGACAACCTGGAAGACATCTTCCTACCGGAGCATGAAAAGAGCCGCCTAGAGCTGTTTAGCAAGCCCACACCATCCCTAGCTAAGCAAGACAGCAAGGTAAGCAAGCAGCTCAACAGGCTGCTGGACCAGGAGAAGACGTTGCCCCTAAGAGTAGGACGGATCTTGTCAAAGATTTTCCCCTGCAATGTCAAGGCACAGCGGTTGGACAGTGGAACCTACGTGTTGTTGCCAGAGCACTCCAGTGCTAGAGGGCTAATCAGCCTGTCAGACCTAGGTTGGAACTGGATGAAGCTTAGAAGGAAGAAGCAGCTCACTGTGAAACACAGTGTTGCAGTGTCGGAAGAGCTCCTTGCTTTTGCTGACAGTCAGTTTGTGCTCACCAACCTGGTGGGAGCTAGCCTACTTGCGGCGAATGCTGCGATACTACCAACCGAACTTGTGAACAAGATCGCGACTGCAGCATCCATAGTGCTTCTATCTAGCTTCCTTTACAAATCATCGATGAAAGCAAAGAGGGACTTCATCTCTGAAAACCTTGAGCTGAATGACATCAGTGCCAAAAAAGCTCAAAGGTACATATGGTCTCTCCGGCCTTTTTCGGTTTACCAGAGACCATTGGAGACTGCACAGACGGTCATCTTCCTGTGCCTGGGTGACCTTTGCCAGGAGCTTTCTCTGAGGATCTCTAGGTTGCCTGCTTCTTCTTACTTGCTGCTCAACTGTATTGACGTCGCTGACAGAAATATCAACGAATTCTTATCACTACTAGACTCCATTGGCCAAGACGACACAGACGAGATGGCAATCAGTTCCTCAGAAGTCCAAGATATCAGCATCACATGCAACAGACTTCAGGAGCTTTTCAACTTAAAGTCCACCGGTGCGACCAAACTTCAGTACCGAGACTATCTGGCAACACAAGGACTTAACCCTGACAAGTTCATACACGGCACAACCAACCTTTACTACAAAGCCAAGGAAGCAGTGCTAAAGACTTTTTTTGAGTCACGGCACATTATGAAGATGATATCTAAGCATGGTAAGGCGTATGCTGGGTCTTCTATAAGCTCCCTCATGGCATACATCTCAAACCTCCTGATCATCAGGGAAAAACTAGGCCTAACCCTGGAAGACACCGCAAGGCTTGAGACCATTGAGCGCAGACTTATGTCCATACAGTCTAGGGATAAGAGAGTCCCAATCCCCATTCTGTGTTCCCTAGTTGAACCATGCATGAAAGAGCTTTATGACAACCTGCCATCCGACTGTGCCCAAGAGTGTGAAATGCTTTTCACACGAATAAGAAATTCAGACACTCATTCAACAGCCTGGTCAGCTGCCTTAAGATTGAAAGGGGTGGCGTATGAAGGCCTATTTTCCAAGGCACATTCTATAAAGTATGTGCCTGAGGATCAGAAGCCCACATTGTCGATGGCTATTCAAACCTACTTCCCTGATCGGTTTGAAAAGTTCCTTCAGAGGACCCAGCTGCACCCTGAGGTCAGAGAGTTTAGACCTGACTTTCTACTTGCCAAGAAGCTCTTGATGCCAAGCACCAAGATTCCTGAAGGAATCTCTAAAATTGTCCAAGTCATGAGTGATCCCCAGCTAGACGAGGGATTCCGTTATAGCAGAAGGGAAGGCAGGGCTTTCCCCTTGCCAGAAGTGCCGATTAGTGAGGTCCACTCTTTCAGAGATGTCGCCCCGAACCTAGAGGAAATTAGCAAGCTAAGGTTCCAAAAGTATAAGGAGATAACTGGGCAAGTCATGACAACTGAACAACCTAAACAACTAAAGGTCCTAGCAAAGGAAGCAGTGGCAGTGCTAAAAGAAAATGGAATTTCTGGATACTATGAAGCCCTTAGGAGGCCGAGGCAACAGCCTGAAGAAGAGACAGAGTTTCTCATCATAGAGGTAGGCTACCAGACAGATACAGAAGTTAAAGTACAGATGGACATTGACAAGTGGAGGGTTGCAGTTAGCCTTTTAAAGGACCTTGGAATCAGATCAACTGTTGTTGCCTGCTCAGACAACACTGCAACAAAGTCTTCTGATTGGTACATACCTGAAAGGCTTGTGAAGGTCATAAAGAACTCAGTTAGTAACCTTTTTTCAAAATTGTCTCAGAACTCACCTCAAGAAGTCACCGACATGATGGTAGGAGCCATTAGCACTCAAAAGATCAGATCTGTCTTAAAGTCTGGCAGCGCCATCAAAACCCCAGTCACAATTCAAGACATTCTGACGACTTGGGATGACAACAAGAGGTACATCATCAACAGACCCACAGGTGCTCAACTACCATCCAGGTTGGAGAAGATCATATCCACAGCATTGTGTGAAGGTGCCGTGATCTCGAAGGATAGTTCAAGGAAAGTTGTAGATGCCGTCATCAAAGAAAAAGGCCAGATAGCAGACTGGGTAGAACAGACCAAGTACGCAGTGGAGGTAGTTGAACCTGTAGTAACGGCGGAGAAACTCCTAACAGGTTGGCTGCTGGATGACCTGGAAAGCTGCAGGTGTAGCAGATGTGTAGACCAAGTTAAGAAGACACTCAGAGAAACGAGTTCAATGTCAGAGGGCCTCACCTACCTTGCTTCACAGATCCAATTAGAGTCGCATGAGCCCTGTTGTCACTCTGTTGAAGTTCACCCTAAATCAGCTGACATGCTTAGACGTAGAACAGTACAGCTTGAATTTGTTAGCCATATGAGCACTGAGATTGCCGACCTTGACGACAAATCTACTGCTCTAGATCGGCTCTGCAGGCTAACACTTCCTGGCAAAACGGAGAAAGAGCGTAGCATCAAGCGAGGTGTTGAGTCCCTGCTTAGACAAACAATGAAAGACTCCGGCATACCCTGCATCAAACTGCCAACTGGACAAATTGTGGTTAACACAGAACTATTTAATACAAGCAAATCAATGGAGGGAGGTATTCGAACTAAGGCAAAAAAAGAGTTCCTAGACCAAGAGACAAGACTGGATAGGCTAAAAAAAACATTGTCCCCTGATCGGTTGAAAGGTTACTCAGAATTTGTCAAGTCTACAATCTCTTCGGTGCTAGCAAATACGACAAACCAACAAGAAAGCCTGTGTGCAATGAAGCCTGAATGGGTTCGTAAGGTCTTGGCAGATCTGGAAGCCGACATGACAGAAGAGGACTTGTTAACAAAGATAGAAGAAACCCGTTCACTAAGGCAGAACTTTGTAATCAACAATGACAAGCTAGTGCCCCTGTCTAACAGTGAAGTAAGTACATACATACAGGATAAGAGCTCAACGCTGTTGAATTCAAAAGACCTAAAGAAGCCATTTAAACTCGACTGTATGCTTCACAAAGAAATATACCTTGAGTGCATCCGGCGCTACCAGAGCACACCATACTTTGACTGTATGACGATAGTGGCTAAATTAGTAAAACTATTCCTCAAGTTTGACTGGTTTCAAGAGATTGTTCTTTATTCTAAAGTTTGTGAAACATTTCTACAATGCTGCACAGAGTTCAACAGATCTGGCATCAAGGTTAGAAGAGTGAGACATTGTAACTTGAACCTAGCCATAGCACTACCATCAAACAAAAAGGAAAACATGAGATGTGCTCTGTATGATAACAATTTCTGCCAGCTCAGTGCAAGATATTTCCTTCTCTCGAGGAGGATTGCAGTTTTAGGTGCTGCCATGCCTTACATAGTGCTCATATGTGCACTGCAGTGCCTTCAACATGCAAGATGCGTGGATGCAGTCCATGATGCAGATCCCGTCGTTGTCCAAGAGATATTGGAGCGGAATGCAGTTAACTTGGACTGCATCACTTCTTGCCTTAAGAAAACAAACTCAGGCAACTTTGAGGAGGCATCAAGAGAATATATCGAGCACTGTAAGAGAAGCGGTAACTATCTTACGAGGTCTAGCAAGGATGTGTTTGTCACCACCATCTCAGGGCTTAGCATGACCTTTGGGCTGTTATTAGGGCCAGCTATGCTCTTAAACTCCCAGCCCTTCAACAAACAGATTCAAAACATGAGATTCGGGATGCTATATGGTCTGTCAAGGATTGCATCACCAAAAGAGCTTGGAAAGAAACTAAGCAGTTCCTGCAGAAATGTTGAAACATATGTGGCTAGGTTGCTGCTGCAACTAGTTGTTTTCTCCTCAGGACTTGACACAGACAAGAACATCGAGGCCTGGAGGAAGCATGACCTTTGCCCAGAAGTAACAATTCCTAGCTTGACCCTGACGGGTACAATAGTTAGTGGAGACAGGCAGCTCATTTTTGACATCTACCTAGTCCACATTTATAACAAGGAAATGGACAACTTTGACGAAGGTTGTATCAAGGTTCTACAGGAGACATTAGAAAGACACG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| 20,445
|
ON811853.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_5
|
Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 12,077
|
GenBank
| null |
China:Peking
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
SAMN28688333
|
PRJNA841744
|
MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_5, complete genome
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TTCCTGCCCCCCCATGTGTACATAACATCTCATCATAAAGCCAGAATGGCATCACTGGATGATGTTGTAAATAAGACGGAAATCGCTGAAGGCCTGTTTAGCTCCAGCACTGATTTAATAGAGGCAAGGTCAACCTTGATCAAGATTAACCTAAAAGAAGTTTTTGACCTACATCACATACCTTCTGACAATGACTGTTTTTTTCATTGTGTTTCACAGCATCTGTCAGAAGGAGCCTTGCCAGTGAGCCAGGTGAAAGGCATCATATTCAGTTTTGCTTCCAGAAACTGGGACAAACTCTATGAAGCGAAGACATTCTACGGTAGCTCTGATGAGTATGGCAAAGAACTCATGAGCAAAGGCTACTGGGGAGGGTCCTGTGAAGCAGAAATTCTCAACAAAGCATATGGGATGCCAATCCTTTTTTGGATGACAGAGGACTTTCAAGTGACAACTGCTGTAAAGTTCTGGTCGAGAAGGTACGCCGGGTTTTCTGAGTTGAACGTGGTATGCAATGAAAGGCATTTTCAGTATTTAACCCTGAAAGACTCACCAAAGCCTGAGCCCAAAGAGCTTGTCGTAGAAGAGAGTGGGTTTGAGGTGGTGAGTGACTCAGAAGAGGAGGAACCTGACAACCTGGAAGACATCTTCCTACCAGAGCATGAAAAGAGCCGCCTGGAGCTGTTTAGCAAGCCTACACCGTCCCTGGCGAGGCAAGACAGTAAGGTAAGCAAGCAGCTTAACAAGCTGCTGGACCAGGAGAAGACATTACCCCTAAGAATAGGAAGGATTTTGTCAAAGATTTTCCCTTGTAATGTCAAGGCGCAGCGGTTGGACAGTGGAACCTATGTGTTGCTGCCAGAGCATTCCAGTGCCAGAGGGCTAATCAGCCTGTCAGACCTAGGTTGGAACTGGATGAAGCTTAGAAGGAAGAAGCAGCTCACTGTGAAGCACAATGTTGCAGTGTCGGAGGAGCTTCTTGCGTTTGCTGACAGTCAGTTTGTGCTCACGAACCTGGTGGGGGCTAGCCTGCTTGCGGCGAATGCTGCAATACTTCCAACCGAACTCGTGAACAAGATCGCGACTGCAGCATCCATAGTGCTTCTGTCTAGTTTCCTTTACAAGTCGTCGATGAAAGCAAAGAGGGATTTCATCTCTGAAAACCTTGAGCTGAATGACATCAGTGCCAAAAAGGCTCAAAGGTATATATGGTCTCTCCGGCCTTTTTCGGTTTACCAGGGACCATTGGAGACTGCACAGACGGTCATCTTCCTGTGCCTGGGTGACCTTTGCCAGGATCTTTCTCTGAGGATCTCTAGGTTGCCTGCTTCTTCTTACCTGCTGCTTAACTGTATTGACGTCGCTGACAGAAATATCAACGAATTCTTGTCACTACTAGACTCCATTGGCCAAGATGACACAGACGAGATGGCAATCAGTTCCTCAGAAGTCCAAGACATTAGCATCACATGCAACAGACTTCAAGAGCTTTTCAACTTGAAGTCCACTGGTGCAACCAAACTTCAGTACCGAGACTATCTGGCAACACAGGGACTTAACCCTGACAAGTTTATACATGGAACAACTAACCTTTACTACAAAGCCAAGGAAACAGTGCTGAAGACTTTTTTTGAATCACGGCATATCATGAAGATGATATCTAAGCATGGGAAGGCGTATGCTGGATCTTCTATAAGCTCTCTCATGGCTTACATCTCAAACCTCCTGATTATCAGGGAAAAACTGGGCCTAACCCTGGAAGACACTGCAAGACTTGAGACCATTGAGCGCAGACTTATGTCCATACAGTCTAGGGATAAGAGAGTCCCAATCCCCATTCTATGTTCCCTAGTTGAACCTTGCATGAAAGAGCTCTATGATAACTTGCCATCCGACTGTGCCCAAGAGTGTGAGATGCTTTTCACACGGATAAGAAATTCAGACACTCATTCGACAGCCTGGTCAGCTGCTTTAAGATTGAAAGGGGTGGCGTATGAAGGCCTGTTTTCCAAGGCACATTCCATAAAGTATGTGCCTGAGGATCAGAAGCCCACATTGTCAATGGCTATTCAAACCTACTTCCCCGATCGGTTTGAAAAGTTCCTTCAGAGGACTCAGCTACACCCTGAGGTCAGAGAGTTTAGACCTGACTTTCTACTTGCCAAGAAGCTCCTAATGCCAGGCACCAAAATACCTGAAGGAATCTCTAAAATTGTCCAAGTTATGAGTGATCCCCAGCTAGATGAGGGATTTCGCTATATCAAAAGGGAAGGCAGGGCTTTCCCCCTGCCAGAAGTACCGATTAGTGAGGTCCACTCTTTCAGAGATGTAGCCCCGAACCTAGAGGAAATTAGCAAGCTAAGGTTCCAAAAGTATAAGGAGATAACTGGGCAAGTCATGACAACTGAGCAACCCAAGCAGCTGAAGGTCCTGGCAAAGGAAGCAGTGGCAGTGTTAAAAGAAAATGGAATCTCTGGATACTATGAAGCCCTTAAAAGGCCGAGGCAACAGCTTGAAGAAGAGACAGAGTTTCTCATCATAGAGGTAGGCTACCAGACAGATACAGAAGTTAAAGTGCAGATGGACATTGACAAGTGGAGGGTTGCAGTTAGCCTTTTAAAAGACCTTGGAATAAGATCAACTGTTGTTGCCTGCTCAGACAATACTGCAACAAAGTCCTCTGATTGGTACATACCTGAAAGGCTTGTTAAGGTAATAAAGAACTCAGTTAGTAACCTTTTTTCAAAATTGTCTCAGAACTCACCCCAAGAGGTCACCGACATGATGGTAGGAGCCATTAGCACTCAAAAGATCAGATCTGTCTTAAAGTCTGGCAGCGCCATCAAAACTCCGGTCACTATTCAAGACATTCTGACAACTTGGGACGACAACAAGAGATACATCGTCAACAGGCCTACAGGTGCTCAACTACCACCCAGGTTAGAGAAGATCATCTCCACAGCATTGTGTGAAGGTGCCGTGATTTCAAAAGACAGTTCAAGGAAAGTTGTGGATGCCGTCATCAAAGAAAAAGGCCAGATAGCAGACTGGGTGGAACAGACCAAGTACGCAGTGGAGGTAGTTGAACCTGTAGTAACGGCGGAGAAACTCCTAACAGGTTGGCTGCTGGATGACCTGGAAAGCTGCAGATGTAGCAAATGTGTAGATCAGGTTAAGAAGACCCTCAGAGAAACGAGTTCAATGTCAGAGGGTCTCACTTACCTTGCTTCACAGATTCAATTAGAGTCGCATGAGTCCTGTTGTCACTCTATTGAAGTTCACCCTAAATCTGCTGACATGCTTAGACGTAGGACAGTGCAGCTTGGATTTGTTAGCCATATGAGCACTGAGATTGCCGACCTTGACGACAAATCTACTGCCCTAGATCGGCTCTGCAGGCTAACACTTCCTGGCAAAACAGAGAAAGAGCGTAGCATCAAGCGTGGTGTCGAGTCCCTGCTTAGACAAACAATGAAAGACTCCGGCATACCCTGCATCAAACTACCAACCGGGCAAATAGTGGTTAACACAGAACTATTTAACACAAGCAAGTCAATGGAGGGAGGTATTCGAACTAAGTCTAAAAAAGAGAACCTAGATCAAGAGACAAGACTGGATAGACTAAAAAAGACATTGTCCCCTGATCGTTTGAAGGGTTACTCAGAATTTGTCAAGTCTACAATCTCTTCGGTGCTAGCGAATACGACAAACCAGCAAGAGAGCCTGTGTGCAATGAAGCCTGAATGGGTTCGTAAGGTCTTGGCAGATCTGGAAGCTGACATGACAGAGGAGGACTTGTTAACAAAGATAGAAGAAACCCGTTCACTAAGGCAGAGCTTTGTGATCAACAATGACAAGCTCGTCCCCCTGTCTAACAGTGAAGTAAGTACGTACATACAGGACAAAAGTTCAACATTGCTAAATTCAAAAGACCTAAAGAAGCCATTTAAACTCGACTGTATGCTTCACAAAGAAATATACCTTGAGTGCATCCGACGCTACCAAAGTACACCATACTTTGACTGTATGACGATAGTGGCTAAATTGGTAAAGCTATTCCTCAAGTTTGACTGGTTTCAGGAGATTGTTCTTTATTCTAAAGTTTGCGAAACATTTCTACAATGCTGCACAGAGTTCAACAGGTCTGGCATCAAGATAAGAAGGGTAAGACATTGTAACTTGAACCTAGCCATAGCACTACCATCAAACAAGAAAGAAAACATGAGATGTGCTCTGTATGACAACAATTTCTGCCAGCTCAGTGCAAGGTATTTCCTTCTCTCGAGGAGGGTTGCAGTTCTAGGTGCTGCCATGCCTTACATAGTACTCATATGTGCACTGCAGTGCCTTCAACATGCAAGATGCGTGGATGCGGTCCATGATGCTGACCCTGTTGTTGTCCAAGAAATATTGGAGCGGAATGCAGTTAACTTGGACTGCATCACTTCTTGCCTTAAAAAAACAAACTCAGGCAACTTTGAGGAGGCTTCAAGAGAATACATCGAGCACTGTAAGAGAAGCGGCAACTATCTTACGAGGTCTAGCAAAGATGTGTTTGTCACAACCATCTCAGGGCTCAGCATGACCTTTGGGCTGTTATTGGGCCCAGCTATGCTCTTAAACTCCCAGCCCTTCAACAAGCAGATTCAAAACATGAGATTCGGAATGCTGTACGGTCTGTCAAGGATTGCATCACCAAAAGAGCTTGGAAAGAAACTAAGCAGTTCCTGTAGAAATGTTGAAACATACGTGGCCAGGCTACTGCTGCAACTAGTTGTTTTCTCTTCAGGACTTGACACAGATAAAAACATCGAGGCCTGGAGAAAGCATGACCTTTGCCCAGAAGTTACAATCCCTAGCTTGACTTTGACGGGTACAATAGTTAGTGGAGACAGGCAACTCATTTTTGACATCTACCTAGTCCATATTTACAACAAGGAAATGGACAACTTTGACGAAGGTTGCATCAAGGTCCTACAGGAGACATTGGAAAGACATGT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AAGACTCAGTTCTCGAACAGTTCAAGGACAGGTCAATTGTCAGCAACCTCTTCGAAGAACTACCTAACATCAAGCGCGAGTCAGAGCGAAGGCAAATAGAAAACCTAGTTGACTACGTCAAAGACCCCATGGTACTAGTAGCTAAAAAGCCCTTCTTTGGGAAGACAGTGGACTTCAACACCAGAGGCTCAGAGGGAGCTAGAACAGGCTCCTTTACTATGAGTAGCAGTGCAGGCGAAGCAGTCGGTGTTTTTGTTTCAGGGCATTTGCACATATACCTTTCTAAAGAGTCGGACATACTTCTGACAGAGGTGGAAGGGCATGTTCTTGCTTGGCAAAACCGCATGAGGACAGACATTGTGACAAAGGAGCAGCACGACTATTTCATTGAGATGCTACCAACATATGCAATGCTCCCTAGGCGTTTAGCAGAAGGTACTTTAAAGGCTGTTGACATTGACAGGACCAACCCAAGAATGCTAAGACTAGTCAATTGTAGAGGGCCCTGTAGGGTTGTGCGCATCAGGCCCCACATTCTTACAGTCAGAAAAACTTCAGTAGAAGCAAGGTTGAATGAGCCTAGACTTGTGTGGGGTAGGTCGTCTCTGTCAATTGTATACGATGAGGTTTCTACAGAGTCAATTTACCATGAGTCAATCTTAAGCCTTAGGAGAAAGTTAGACGTGGCCACAGGAGTACAAGAGCCTAAGATTCCTGGACAGTTCTTTTCTGACATGAAGATAGTGCTAGGCAAAGTGCACTTCAAACAGGAGGCCACTAACACATCTTTAGCCCTTTTGCACTACTACTTGGTACACTCTGCTGAGAATGTCCATATTGAGTTCCACACAAAGTCTGCCCTACTCCAAAGACTGCTAGGGACAGAGCAACAGGAGCTGAACATACTCAGGAAGCTCAGGGAAGGAGGCTGTAAAGACCGAAGACCAATGATTGACAGGACAGAACAACTGCTCTCAATTGCAAGCAGTTTGGAAGATACACTCAACAGGGACACTGTTCCTCTGCACTGCCTGTCTGAAGTGCAGCAATACTTAGACGAAACAGGTAACTCAGCAATCAAAGTAGAGGTGGCTTCTAAGGGTTTACAGACAGCATACCAATGGAAGTGCTCAGTTGAGACGTTGAGTTCTAACCATCCAAGCAACTGTCTCAGAACAATCATCAACACAATAGGAATGGAATCACTTCCCCTGCAACTCTCACAGTTCATTGCCTGTGCGGAGAGTTGGGACACATTACAACAGCTGGGAAAGCGTGCACAAGGGGAGGTCGTGGCTTGCCTATTTGAGGACAATGTGTTAGAATGTTTGTTTTGTTGCACCATATTCTGCCAGCAGGAGAAGAACTTGACTAGGGATAGCTTTTATTTCCCACCAAGCGCACTCCTTGGCCTAGTTGCATCAAGAGAATTCAAGCTTCAGTCTGTCGGAACCGTTAAATTTGAGCCAAATGAGGAAGGTAAAGTTGATATGGAACTGGTGGTCAGGACAGGTCTGGTGAAAGCTAGTGACAGAGATGCGGCAAAACGTCTGGCACAGCTAGGAGCAAATGCCAATAACCTTCTTATGGACAGAGTAAGAACTTTCAATGAAGTACGGAGAGATTTGAGAATTTCTTTGGAGCACACTACAAGCAGCACTGTCCTTAGGGTCTACTATGGGAATGAGGCTTCTTGGGAGACAACAATTGACAAACTCTTTTACTCCCTAACAGCAATGAAAGAAGACTCTATAGGCAAGATCAAGCATGTATCCAACTTATGCTGCTTCCTCATGGCAAGGCCATATGCATTCTATTCTGAAGAACCAGAGCAACAACCCATCCTGGAAGGAGGTGAAGCACTGGCCACACTTGATGATCTTCTAGAATCCACCAGCAGCACAGGAGACAGTATGGAGGCTCAGAACATTGAGTATGAGTTCAATTTCGACTAGTTGGTCAACTACAGTCACACTAAACTTCACCATCTTGTGACCGCTGGCTTGGGTCTGCACATGTATCGTTGCACTAGCACGGATCTGGCACGAGGGGTAAGGCTTATGGGGGTGCAGGAACA
| 20,447
|
ON811855.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_6
|
Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 12,079
|
GenBank
| null |
China:Gansu
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
SAMN28688349
|
PRJNA841744
|
MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_6, complete genome
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ATATCCTGCCCCCCCCATGTGTACATAACATCTCATCATAAAGCCAGAATGGCATCACTGGATGATGTTGTAAATAAGGCAGAGATTGCTGAAGGCTTATACAGTTCCAGTACTGATTTAATAGAAGCAAGGTCAACTTTGATCAAGATCAACCTAAAAGAAGTTTTTGACATACATCACATACCTTCTGACAATGACTGTTTTTTCCACTGTGTTTCGCAGCATCTGTCAGAAGGTGCCCTGCCAGTGAGCCAGGTGAAGGGCATCATATTTAGCTTTGCTTCTAGGAACTGGGACAAACTCTATGAAGCGAAGACATTCTATGGCAGCCCTGATGAGTATGGTAAGGAGCTTATGAGCAAGGGCTACTGGGGAGGGTCCTGTGAGGCAGAAATCCTCAACAAAGCATATGGAATGCCGATCTTGTTCTGGATGACAGAAGACTTCCAAGTGACAAGCGCTGTAAAATTCTGGTCAAGAAGGTACGCCGGGTTTTCTGAGCTGAACGTGGTGTGCAATGAAAGGCACTTCCAGTATTTGACCCTGAAAGACTCACCGAAGCCCGAGCCGAAAGAGCTTGTTGTAGAGGAGAGTGGGTTCGAGGTGGTCAGTGACTCGGAAGAGGAAGAACCTGACAACCTGGAAGACATCTTCCTACCAGAGCATGAAAAGAGCCGCCTAGAGCTATTTAGCAAACCTACTCCGTCCCTAGCAAGGCAGGATAGTAGGGTGAGCAAGCAGCTGAATAAGCTACTGGACCAGGAGAAGACATTACCCCTAAGAGTAGGAAGAATCTTGTCAAAGATCTTCCCTTGTAATGTCAAAGCACAGCGGTTGGACAGTGGAACCTATGTATTGCTGCCAGAGCACTCCAGCGCCAGAGGACTAATCAGCCTATCAGACTTAGGTTGGAATTGGATGAAGCTCAGAAAGAAGAAGCAGCTCACTGTAAAACATAATGTTGCAGTATCGGAAGAACTCCTTGCATTTGCTGATAGCCAGTTTGTGCTGACTAACCTAGTAGGAGCTAGCCTACTTGCAGCGAATGCTGCAATACTTCCAACTGAACTTGTGAACAAGATTGCAACCACAGCAGCAATAGTGCTTCTGTCTAGCTTCCTCTACAAATCATCGATGAAAGCAAAGAGGGACTTCATTTCTGAAAACCTTGAGCTAAATGACATCAGTTCAAAAAAAGCTCAAAGGTACATATGGTCCCTCCGGCCTTTTTCGGTTTACCAGAGACCATTGGAGACAGCACAGACAATCATCTTTCTATGCCTGGGTGACCTTTGCCAGGAACTCTCTCTAAGGATCTCTAGGTTGCCTGCATCCTCTTACTTACTGCTTAACTGCATTGACGTCGCTGACAGGAATATCAACGAATTCCTGTCATTGTTGGACTCCATAGGCCAAGACGACACGGATGAGATGGCAATCAGCTCCTCAGAGGTCCAAGACATTAGCATCACTTGCAACAGACTTCAGGAGCTTTTCAACTTGAAGTCCACCGGTGCGACCAAGCTTCAGTACCGAGACTATCTGGCGACACAAGGACTCAACCCTGATAAGTTCATACACGGCACAACCAACCTTTACTACAAAGCCAAGGAAGCGGTGCTAAAGACTTTCTTTGAATCAAGGCACATCATGAAGATGATATCGAAGCATGGAAAGGCATATGCCGGGTCTTCTATAAGCTCTCTTATGGCTTACATTTCGAACCTCCTGATCATTAGAGAAAAACTAGGCCTGACCCTCGAAGACACTGCAAGGCTGGAGACCATTGAACGCAGGCTCATGTCCATACAGTCCAGGGACAAGAGAGTACCAATCCCCATTCTGTGCTCTTTGGTTGAACCGTGCATGAAAGAGCTCTACGACAACCTACCACCCGACTGTGCACAGGAGTGTGAAATGCTCTTCACACGAATAAGAAACTCGGACACCCATTCAACAGCCTGGTCAGCTGCATTGAGACTGAAAGGAGTGGCGTATGAAGGTTTGTTTTCTAAGGCGCATTCTATAAAGTATGTGCCTGAAGATCAAAAGCCCACGCTGTCGATGGCCATTCAAACCTATTTCCCTGATCGGTTTGAAAAGTTCCTTCAAAGAACTCAGCTACATCCTGAGGTCAGAGAGTTTAGACCTGATTTTCTACTTGCCAAGAAGCTCCTAATGCCGAGTACTAAGATCCCTGAAGGAATCTCTAAAATTGTCCAGGTTATGAGTGATCCTCAACTGGACGAGGGGTTCCGCTACAGCAAAAGGGAGGGTAGAGCTTTTCCCTTGCCAGAGGTTCCGATTAGTGAAGTCCATTCCTTCAGAGATGTTGCCCCGAACCTAGAGGAAATTAGCAAACTGAGGTTCCAAAAATATAAGGAGGTGACTGGGCAAGTCATGACAACTGAGCAACCCAAGCAACTGAAGGTCCTGGCAAAGGAAGCAGTGGCAGTGCTAAAAGAAAATGGCATCTCTGGGTACTATGAAGCCCTCAAAAGGCCGAAGCGGCAGCCTGAGGAGGAGACAGAGTTTCTCATCATAGAGGTTGGCTACCAGACAGACACAGAAGTTAAAGTTCAGATGGACATTGACAAATGGAGAGTTGCAGTCAGCCTTTTGAAAGACCTTGGGATAAAATCAACTGTTGTAGCCTGCTCGGATAACACTGCAACGAAGTCTTCTGATTGGTACATACCCGAAAGACTTGTGAAGGTCATCAAGAACTCAGTTAGTAACCTTTTCTCAAAATTGTCTCAAAACTCACCTCAGGAGGTTACTGACATGATGGTGGGAGCCATTAGCACCCAAAAGATTAGGTCTGTCTTGAAATCTGGTAGTGCCATCAAAACCCCAGTCACAATTCAAGATATTCTAACAACTTGGGACGACAACAAAAGATATATCATCAATAGGCCCACAGGTGCTCAACTTCCAACCAGGTTAGAAAAGATCATTTCCACAGCATTGTGCGAAGGTGCCGTGATCTCAAAAGATAGTTCAAGGAAAGTTGTAGATGCCATTATCAAAGAAAAAGGCCAGATAGCAGACTGGGTAGAACAAACTAAGTACGCAGTAGAGGTAGTAGAACCTGTAGTGACAGCGGAGAAACTCCTAACAGGTTGGCTGCTAGATGACCTAGAAAGCTGCAGGTGTAGCAAGTGTGTAGAACAGGTTAAGAAAACCCTCCGAGAAACAAGTTCAATGTCAGAAGGCCTCACTTACCTTGCTTCACAGATCCAACTGGAGTCACATGAGCCCTGTTGTCACTCTATTGAAGTCCATCCCAAATCAGCTGACATGCTTAGACGTAGGACAGTACAGTTAGAATTTGTTAGCCATATGAGCACTGAAATTTCCGATCTTGACGACAAATCCACTGCCCTAGACCGGCTTTGCAGGCTAACACTACCCGGTAAAACAGAAAAGGAGCGTAGCATTAAGCGAGGCGTCGAATCCCTACTAAGGCAAACGATGAAAGACTCTGGCATACCCTGCATTAAGCTGCCGACTGGACAAATAGTGGTCAATACAGAACTATTCAATACAAGCAAAGCAATGGAGGGAAGTATTCGAACTAAGGCCAAAAAAGAGTGTCTAGACCAAGAGACAAGACTGGATAGGCTGAAGAAGACATTGTCCCCTGATCGGTTGAAGGGCTACTCAGAGTTTGTTAAGTCTACAATCTCTTCGGTGCTAGCAAACACGACAAACCAACAAGAGAGCCTGTGTGCAATGAAGCCTGAATGGGTTCGTAAGGTCTTGGCAGATCTAGAGGCTGACATGACAGAAGAGGACTTGCTGACAAAGATAGAAGAAACCCGTTCACTAAGGCAGAACTTTGTCATTAACAATGACAAGCTAGTACCCCTGTCTAATAGTGAAGTGAGTACATACATACAGGATAAAAGCTCAACATTGCTGAATTCAAGAGACCTGAAGAAGCCATTTAAACTCGACTGTATGCTTCACAAGGAAATTTACCTTGAGTGCATCCGACGATACCAGAGCACACCATACTTTGACTGCATGACGATAGTGGCCAAGTTGGTAAAACTTTTTCTCAAGTTTGACTGGTTTCAGGAGATTGTTCTTTATTCTAAAGTTTGTGAAACATTTCTACAATGCTGCACAGAGTTCAACAGGTCAGGCATCAAGATAAGAAGGGTGAGACACTGCAACTTGAACCTGGCCATAGCACTGCCCTCAAACAAAAAGGAAAACATGAGATGTGCTCTGTATGACAACAACTTCTGCCAGCTCAGTGCAAGATATTTCCTTCTCTCAAGGAGGATTGCAGTTCTGGGTGCTGCCATGCCTTACATAGTACTCATATGTGCACTACAGTGTCTTCAGCATGCGAGATGCGTGGATGCAGTCCATGATGCAGATCCTGTTGTCATCCAAGAGATATTAGAGCGGAATGCAGTTAACCTGGACTGCATAACTTCATGCCTTAAGAAAACAAACTCGGGCAACTTTGAGGAGGCATCAAGAGAATACGTCGAGCACTGTAAGAGAAGCGGTAACTATCTTACGAGATCTAGTAAAGATGTGTTTGTCACCACCATCTCAGGGCTCAGCATGACCTTTGGGCTGCTGCTAGGGCCAGCTATGCTCTTAAACTCCCAGCCTTTCAATAAACAGATTCAGAACATGAGATTCGGGATGCTGTATGGCCTGTCAAGGATTGCATCACCAAAGGAGCTTGGAAAGAAACTAAGCAGTTCCTGCAGAAATGTTGAAACATATGTGGCTAGGTTACTGCTGCAGCTGGTTGTCTTCTCATCAGGACTTGAAACAGACAAGAACATTGAGGCCTGGAGAAAGCATGACCTCTGCCCAGAGGTCACAATTCCTAGCTTGACTTTGACAGGTACAATAGTTAGTGGAGATAGACAGCTCATCTTTGACATCTACCTCGTCCACATTTACAACAAAGAAATGGATAACTTTGATGAAGGCTGTATCAAGGTCCTACAGGAAACATTGGAAAGACA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| 20,449
|
ON811856.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_7
|
Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 12,079
|
GenBank
| null |
China:Gansu
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
SAMN28697451
|
PRJNA841744
|
MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_7, complete genome
|
ATATCCTGCCCCCCCATGTGTACATAACATCTCATCATAAAGCCAGAATGGCATCACTGGATGATGTTGTAAATAAGACGGAAATCGCTGAAGGCCTGTTTAGCTCCAGCACTGATTTAATAGAGGCAAGGTCAACCTTGATCAAGATTAACCTAAAAGAAGTTTTTGACCTACATCACATACCTTCTGACAATGACTGTTTTTTCCATTGTGTTTCACAGCATCTGTCAGAAGGAGCCTTGCCAGTGAGCCAGGTGAAAGGCATCATATTCAGTTTTGCTTCCAGAAACTGGGACAAACTCTATGAAGCGAAGACATTCTACGGTAGCTCTGATGAGTATGGCAAAGAACTCATGAGCAAAGGCTACTGGGGAGGGTCCTGTGAAGCAGAAATTCTCAACAAAGCATATGGGATGCCAATCCTTTTTTGGATGACAGAGGACTTTCAAGTGACAACTGCTGTAAAGTTCTGGTCGAGAAGGTACGCCGGGTTTTCTGAGTTGAACGTGGTATGCAATGAAAGGCATTTTCAGTATTTAACCCTGAAAGACTCACCAAAGCCTGAGCCCAAAGAGCTTGTCGTAGAAGAGAGTGGGTTTGAGGTGGTGAGTGACTCAGAAGAGGAGGAACCTGACAACCTGGAAGACATCTTCCTACCAGAGCATGAAAAGAGCCGCCTGGAGCTGTTTAGCAAGCCTACACCGTCCCTGGCGAGGCAAGACAGTAAGGTAAGCAAGCAGCTTAACAAGCTGCTGGACCAGGAGAAGACATTACCCCTAAGAATAGGAAGGATTTTGTCAAAGATTTTCCCTTGTAATGTCAAGGCGCAGCGGTTGGACAGTGGAACCTATGTGTTGCTGCCAGAGCATTCCAGTGCCAGAGGGCTAATCAGCCTGTCAGACCTAGGTTGGAACTGGATGAAGCTTAGAAGGAAGAAGCAGCTCACTGTGAAGCACAATGTTGCAGTGTCGGAGGAGCTTCTTGCGTTTGCTGACAGTCAGTTTGTGCTCACGAACCTGGTGGGGGCTAGCCTGCTTGCGGCGAATGCTGCAATACTTCCAACCGAACTCGTGAACAAGATCGCGACTGCAGCATCCATAGTGCTTCTGTCTAGTTTCCTTTACAAGTCGTCGATGAAAGCAAAGAGGGATTTCATCTCTGAAAACCTTGAGCTGAATGACATCAGTGCCAAAAAGGCTCAAAGGTATATATGGTCTCTCCGGCCTTTTTCGGTTTACCAGAGACCATTGGAGACTGCACAGACGGTCATCTTCCTGTGCCTGGGTGACCTTTGCCAGGAGCTTTCTCTGAGGATCTCTAGGTTGCCTGCTTCTTCTTACTTGCTGCTTAACTGTATTGACGTCGCTGACAGAAATGTCAACGAATTCTTGTCACTACTAGACTCCATTGGCCAAGACGACACAGACGAGATGGCAATCAGTTCCTCAGAAGTCCAAGACATTAGCATCACATGCAACAGACTTCAGGAGCTTTTCAACTTGAAGTCCACTGGTGCAACCAAACTTCAGTACCGAGACTATCTGGCAACACAGGGACTTAACCCTGACAAGTTTATACATGGAACAACTAACCTTTACTACAAAGCCAAGGAAGCAGTGCTGAAGACTTTTTTTGAATCACGGCATATTATGAAGATGATATCTAAGCATGGGAAGGCGTATGCTGGATCTTCTATAAGCTCTCTCATGGCTTACATCTCAAACCTCCTGATTATCAGGGAAAAACTGGGCCTAACCCTGGAAGACACTGCAAGACTTGAGACCATTGAGCGCAGACTTATGTCCATACAGTCTAGGGATAAGAGAGTCCCAATCCCCATTCTATGTTCCCTAGTTGAACCTTGCATGAAAGAGCTCTATGATAACTTGCCATCCGACTGTGCCCAAGAGTGTGAGATGCTTTTCACACGGATAAGAAATTCAGACACTCATTCGACAGCCTGGTCAGCTGCTTTAAGATTGAAAGGGGTGGCGTATGAAGGCCTGTTTTCCAAGGCACATTCCATAAAGTATGTGCCTGAGGATCAGAAGCCCACATTGTCAATGGCTATTCAAACCTACTTCCCCGATCGGTTTGAAAAGTTCCTTCAGAGGACTCAGCTACACCCTGAGGTCAGAGAGTTTAGACCTGACTTTCTACTTGCCAAGAAGCTCCTAATGCCAGGCACCAAAATACCTGAAGGAATCTCTAAAATTGTCCAAGTTATGAGTGATCCCCAGCTAGATGAGGGATTTCGCTATATCAAAAGGGAGGGCAGGGCTTTCCCCCTGCCAGAAGTACCGATTAGTGAGGTCCACTCTTTCAGAGATGTAGCCCCGAACCTAGAGGAAATTAGCAAGCTAAGGTTCCAAAAGTATAAGGAGATAACTGGGCAAGTCATGACAACTGAGCAACCCAAGCAGCTGAAGGTCCTGGCAAAGGAAGCAGTGGCAGTGTTAAAAGAAAATGGAATCTCTGGATACTATGAAGCCCTTAGAAGGCCGAGGCAACAGCTTGAAGAAGAGACAGAGTTTCTCATCATAGAGGTAGGCTACCAGACAGATACAGAAGTTAAAGTGCAGATGGACATTGACAAGTGGAGGGTTGCAGTTAGCCTTTTAAAAGACCTTGGAATAAGATCAACTGTTGTTGCCTGCTCAGACAATACTGCAACAAAGTCCTCTGATTGGTACATACCTGAAAGGCTTGTTAAGGTAATAAAGAACTCAGTTAGTAACCTTTTTTCAAAATTGTCTCAGAACTCACCCCAAGAGGTCACCGACATGATGGTAGGAGCCATCAGCACTCAAAAGATCAGATCTGTCTTAAAGTCTGGCAGCGCCATCAAAACCCCGGTCACTATTCAAGACATTCTGACAACTTGGGTCGACAACAAGAGATACATCGTCAACAGGCCTACAGGTGCTCAACTACCACCCAGGTTAGAGAAGATCATCTCCACAGCATTGTGTGAAGGTGCCGTGATTTCAAAAGACAGTTCAAGGAAAGTTGTGGATGCCGTCATCAAAGAAAAAGGCCAGATAGCAGACTGGGTGGAACAGACCAAGTACGCAGTGGAGGTAGTTGAACCTGTAGTAACGGCGGAGAAACTCCTAACAGGTTGGATGCTGGATGACCTGGAAAGCTGCAGATGTAGCAAATGTGTAGATCAGGTTAAGAAGACCCTCAGAGAAACGAGTTCAATGTCAGAGGGTCTCACTTACCTTGCTTCACAGATTCAATTAGAGTCGCATGAGTCCTGTTGTCACTCTATTGAAGTTCACCCTAAATCAGCTGACATGCTTAGACGTAGGACAGTGCAGCTTGAATTTGTTAGCCATATGAGCACTGAAATTGCCGACCTTGACGACAAATCTACTGCCCTAGATCGGCTCTGCAGGCTAACACTTCCTGGCAAAACAGAGAAAGAGCGCAGCATCAAGCGTGGTGTCGAGTCCCTGCTTAGACAAACAATGAAAGACTCCGGCATACCCTGCATCAAACTACCAACCGGGCAAATAGTGGTTAACACAGAACTATTTAACACAAGCAAGTCAATGGAGGGAGGTACTCGAACTAAGTCTAAAAAAGAGAACCTAGATCAAGAGACAAGACTGGATAGACTAAAAAAAACATTGTCCCCTGATCGTTTAAAGGGTTACTCAGAATTTGTCAAGTCTACAATCTCTTCGGTGCTAGCGAATACGACAAACCAGCAAGAGAGCCTGTGTGCAATGAAGCCTGAATGGGTTCGTAAGGTCTTGGCAGATCTGGAAGCTGACATGACAGAGGAGGACTTGTTAACAAAGATAGAAGAAACCCGTTCACTAAGGCAGAACTTTGTGATCAACAATGACAAGCTCGTGCCCCTGTCTAACAGTGAAGTAAGTACATACATACAGGACAAAAGTTCAACATTGCTAAATTCAAAAGACCTAAAGAAGCCATTTAAACTCGACTGTATGCTTCACAAAGAAATATACCTTGAGTGCATCCGACGCTACCAAAGTACACCATACTTTGACTGTATGACGATAGTGGCTAAATTGGTAAAGCTATTCCTCAAGTTTGACTGGTTTCAGGAGATTGTTCTTTATTCTAAAGTTTGCGAAACATTTCTACAATGCTGCACAGAGTTCAACAGGTCTGGCATCAAGATAAGAAGGGTAAGACATTGTAACTTGAACCTAGCCATAGCACTACCATCAAACAAAAAAGAAAACATGAGATGTGCTCTGTATGACAACAATTTCTGCCAGCTCAGTGCAAGGTATTTCCTTCTCTCGAGGAGGGTTGCAGTTCTAGGTGCTGCCATGCCTTACATAGTACTCATATGTGCACTGCAGTGCCTTCAACATGCAAGATGCGTGGATGCGGTCCATGATGCTGACCCTGTTGTTGTCCAAGAAATATTGGAGCGGAATGCAGTTAACTTGGACTGCATCACTTCTTGCCTTAAAAAAACAAACTCAGGCAACTTTGAGGAGGCTTCAAGAGAATACATCGAGCACTGTAAGAGAAGCGGCAACTATCTTACGAGGTCTAGCAAAGATGTGTTTGTCACAACCATCTCAGGGCTCAGCATGACCTTTGGGCTGTTATTGGGCCCAGCTATGCTCTTAAACTCCCAGCCCTTCAACAAGCAGATTCAAAACATGAGATTCGGAATGCTGTACGGTCTGTCAAGGATTGCATCACCAAAAGAGCTTGGAAAGAAACTAAGCAGTTCCTGCAGAAATGTTGAAACATACGTGGCCAGGCTACTGCTGCAACTAGTTGTTTTCTCTTCAGGACTTGACACAGACAAAAACATCGAGGCCTGGAGAAAGCATGACCTTTGCCCAGAAGTTACAATCCCTAGCTTGACTTTGACAGGTACAATAGTTAGTGGAGACAGGCAACTCATTTTTGACATCTACCTAGTCCATATTTACAACAAGGAAATGGACAACTTTGACGAAGGTTGCATCAAGGTCCTACAGGAGACATTGGAAAGACAT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| 20,450
|
ON811860.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_9
|
Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 12,088
|
GenBank
| null |
China:Gansu
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
SAMN28669377
|
PRJNA841744
|
MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_9, complete genome
|
CCTGCCCCCCCATGTGTACATAACTTCTCATCATAAAGCCAGAATGGCATCACTGGATGATGTTGTAAATAAGACGGAAATCGCTGAAGGCCTGTTTAGCTCCAGCACTGATTTAATAGAGGCAAGGTCAACCTTGATCAAGATTAACCTAAAAGAAGTTTTTGACCTACATCACATACCTTCTGACAATGACTGTTTTTTCCATTGTGTTTCACAGCATCTGTCAGAAGGAGCCTTGCCAGTGAGCCAGGTGAAAGGCATCATATTCAGTTTTGCTTCCAGAAACTGGGACAAACTCTATGAAGCGAAGACATTCTACGGTAGCTCTGATGAGTATGGCAAAGAACTCATGAGCAAAGGCTACTGGGGAGGGTCCTGTGAAGCAGAAATTCTCAACAAAGCATATGGGATGCCAATCCTTTTTTGGATGACAGAGGACTTTCAAGTGACAACTGCTGTAAAGTTCTGGTCGAGAAGGTACGCCGGGTTTTCTGAGTTGAACGTGGTATGCAATGAAAGGCATTTTCAGTATTTAACCCTGAAAGACTCACCAAAGCCTGAGCCCAAAGAGCTTGTCGTAGAAGAGAGTGGGTTTGAGGTGGTGAGTGACTCAGAAGAGGAGGAACCTGACAACCTGGAAGACATCTTCCTACCAGAGCATGAAAAGAGCCGCCTGGAGCTGTTTAGCAAGCCTACACCGTCCCTGGCGAGGCAAGACAGTAAGGTAAGCAAGCAGCTTAACAAGCTGCTGGACCAGGAGAAGACATTACCCCTAAGAATAGGAAGGATTTTGTCAAAGATTTTCCCTTGTAATGTCAAGGCGCAGCGGTTGGACAGTGGAACCTATGTGTTGCTGCCGGAGCATTCCAGTGCCAGAGGGCTAATCAGCCTGTCAGACCTAGGTTGGAACTGGATGAAGCTTAGAAGGAAGAAGCAGCTCACTGTTAAGCACAATGTTGCAGTGTCGGAGGAGCTTCTTGCGTTTGCTGACAGTCAGTTTGTGCTCACGAACCTGGTGGGGGCTAGCCTGCTTGCGGCGAATGCTGCAATACTTCCAACCGAACTCGTGAACAAGATCGCGACTGCAGCATCCATAGTGCTTCTGTCTAGTTTCCTTTACAAGTCGTCGATGAAAGCAAAGAGGGATTTCATCTCTGAAAACCTTGAGCTGAATGACATCAGTGCCAAAAAGGCTCAAAGGTATATATGGTCTCTCCGGCCTTTTTCAGTTTACCAGAGACCATTGGAGACTGCACAGACGGTCATCTTCCTGTGCCTGGGTGACCTTTGCCAGGAGCTTTCTCTGAGGATCTCTAGGTTGCCTGCTTCTTCTTACTTGCTGCTTAACTGTATTGACGTCGCTGACAGAAATATCAACGAATTCTTGTCACTACTAGACTCCATTGGCCAAGACGACACAGACGAGATGGCAATCAGTTCCTCAGAAGTCCAAGACATTAGCATCACATGCAACAGACTTCAGGAGCTTTTCAACTTGAAGTCCACTGGTGCAACCAAACTTCAGTACCGAGACTATCTGGCAACACAGGGACTTAACCCTGACAAGTTTATACATGGAACAACTAACCTTTACTACAAAGCCAAGGAAGCAGTGCTGAAGACTTTTTTTGAATCACGGCATATTATGAAGATGATATCTAAGCATGGGAAGGCGTATGCTGGATCTTCTATAAGCTCTCTCATGGCTTACATCTCAAACCTCCTGATTATCAGGGAAAAACTGGGCCTAACCCTGGAAGACACTGCAAGACTTGAGACCATTGAGCGCAGACTTATGTCCATACAGTCTAGGGATAAGAGAGTCCCAATCCCCATTCTATGTTCCCTAGTTGAACCTTGCATGAAAGAGCTCTATGATAACTTGCCATCCGACTGTGCCCAAGAGTGTGAGATGCTTTTCACACGGATAAGAAATTCAGACACTCATTCGACAGCCTGGTCAGCTGCTTTAAGATTGAAAGGGGTGGCGTATGAAGGCCTGTTTTCCAAGGCACATTCCATAAAGTATGTGCCTGAAGATCAGAAGCCCACATTGTCAATGGCTATTCAAACCTACTTCCCCAATCGGTTTGAAAAGTTCCTTCAGAGGACTCAGCTACACCCTGAGGTCAGAGAGTTTAGACCTGACTTTCTACTTGCCAAGAAGCTCCTAATGCCAGGCACCAAAATACCTGAAGGAATCTCTAAAATTGTCCAAGTTATGAGTGATCCCCAGCTAGATGAGGGATTTCGCTATATCAAAAGGGAGGGGAGGGCTTTCCCCCTGCCAGAAGTACCGATTAGTGAGGTCCACTCTTTCAGAGATGTAGCTCCGAACCTAGAGGAAATTAGCAAGCTAAGGTTCCAAAAGTATAAGGAGATAACTGGGCAAGTCATGACAACTGAGCAACCCAAGCAGCTGAAGGTCCTGGCAAAGGAAGCAGTGGCAGTGTTAAAAGAAAATGGAATCTCTGGATACTATGAAGCCCTTAGAAGGCCGAGGCAACAGCTTGAAGAAGAGACAGAGTTTCTCATCATAGAGGTAGGCTACCAGACAGATACAGAAGTTAAAGTGCAGATGGACATTGACAAGTGGAGGGTTGCAGTTAGCCTTTTAAAAGACCTTGGAATAAGATCAACTGTTGTTGCCTGCTCAGACAATACTGCAACAAAGTCCTCTGATTGGTACATACCTGAAAGGCTTGTTAAGGTAATAAAGAACTCAGTTAGTAACCTTTTTTCAAAATTGTCTCAGAACTCACCCCAAGAGGTCACCGACATGATGGTAGGAGCCATTAGCACTCAAAAGATCAGATCTGTCTTAAAGTCTGGCAGCGCCATCAAAACCCCGGTCACTATTCAAGACATTCTGACAACTTGGGACGACAACAAGAGATACATCGTCAACAGGCCTACAGGTGCTCAACTACCACCCAGGTTAGAGAAGATCATCTCCACAGCATTGTGTGAAGGTGCCGTGATTTCAAAAGACAGTTCAAGGAAAGTTGTGGATGCCGTCATCAAAGAAAAAGGCCAGATAGCAGACTGGGTGGAACAGACCAAGTACGCAGTGGAGGTAGTTGAACCTGTAGTAACGGCGGAGAAACTCCTAACAGGTTGGCTGCTAGATGACCTGGAAAGCTGCAGATGTAGCAAATGTGTAGATCAGGTTAAGAAGACCCTCAGAGAAACGAGTTCAATGTCAGAGGGTCTCACTTACCTTGCTTCACAGATTCAATTAGAGTCGCATGAGTCCTGTTGTCACTCTATTGAAGTTCACCCTAAATCAGCTGACATGCTTAGACGTAGGACAGTGCAGCTTGAATTTGTTAGCCATATGAGCACTGAAATTGCCGACCTTGACGACAAATCTACTGCCCTAGATCGGCTCTGCAGGCTAACACTTCCTGGCAAAACAGAGAAAGAGCGTAGCATCAAGCGTGGTGTCGAGTCCCTGCTTAGACAAACAATGAAAGACTCCGGCATACCCTGCATCAAACTACCAACCGGGCAAATAGTGGTTAACACAGAACTATTTAACACAAGCAAGTCAATGGAGGGAGGTATTCGAACTAAGTCTAAAAAAGAGAACCTAGACCAAGAGACAAGACTGGATAGACTAAAAAAAACATTGTCCCCTGATCGTTTGAAGGGTTACTCAGAATTTGTCAAGTCTACAATCTCTTCGGTGCTAGCGAATACGACAAACCAGCAAGAGAGCCTGTGTGCAATGAAGCCTGAATGGGTTCGTAAGGTCTTGGCAGATCTGGAAGCTGACATGACAGAGGAGGACTTGTTAACAAAGATAGAAGAAACCCGTTCACTAAGGCAGAACTTTGTGATCAACAATGACAAGCTCGTGCCCCTGTCTAACAGTGAAGTAAGTACGTACATACAGGACAAAAGTTCAACATTGCTAAATTCAAAAGACCTGAAGAAGCCATTTAAACTCGACTGTATGCTTCACAAAGAAATATACCTTGAGTGCATCCGACGCTACCAAAGTACACCATACTTTGACTGTATGACGATAGTGGCTAAATTGGTAAAGCTATTCCTCAAGTTTGACTGGTTTCAGGAGATTGTTCTTTATTCTAAAGTTTGCGAAACATTTCTACAATGCTGCACAGAGTTCAACAGGTCTGGCATCAAGGTAAGAAGGGTAAGACATTGTAACTTGAACCTAGCCATAGCACTACCATCAAACAAAAAAGAAAACATGAGATGTGCTCTGTATGACAACAATTTCTGCCAGCTCAGTGCAAGGTATTTCCTTCTCTCGAGGAGGGTTGCAGTTCTAGGTGCTGCCATGCCTTACATAGTACTCATATGTGCACTGCAGTGCCTTCAACATGCAAGATGCGTGGATGCGGTCCATGATGCTGACCCTGTTGTTGTCCAAGAAATATTGGAGCGGAATGCAGTTAACTTGGACTGCATCACTTCTTGCCTTAAAAAAACAAACTCAGGCAACTTTGAGGAGGCTTCAAGAGAATACATCGAGCACTGTAAGAGAAGCGGCAACTATCTTACGAGGTCTAGCAAAGATGTGTTTGTCACAACCATCTCAGGGCTCAGCATGACCTTTGGGCTGCTGCTAGGGCCAGCTATGCTCTTAAACTCCCAGCCTTTCAATAAACAGATTCAGAACATGAGATTCGGGATGCTGTATGGCCTGTCAAGGATTGCATCACCAAAGGAGCTTGGAAAGAAACTAAGCAGTTCCTGCAGAAATGTTGAAACATATGTGGCTAGGTTACTGCTGCAGCTGGTTGTCTTCTCATCAGGACTTGAAACAGACAAGAACATTGAGGCCTGGAGAAAGCATGACCTCTGCCCAGAGGTCACAATTCCTAGCTTGACTTTGACAGGTACAATAGTTAGTGGAGATAGACAGCTCATCTTTGACATCTACCTCGTCCACATTTACAACAAAGAAATGGATAACTTTGATGAAGGCTGTATCAAGGTCCTACAGGAAACATTGGAAAGACACGTTT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| 20,452
|
ON811862.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_11
|
Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 7,776
|
GenBank
| null |
China:Gansu
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
SAMN28688354
|
PRJNA841744
|
MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_11, complete genome
|
GGGTGCTGCCATGCCTTACATAGTACTCATATGTGCACTACAGTGCCTTCAGCATGCGAGATGCGTGGATGCAGTCCATGATGCAGATCCTGTTGTCATCCAAGAGATATTAGAGCGGAATGCAGTTAACCTGGACTGCATAACTTCATGCCTTAAGAAAACAAACTCGGGCAACTTTGAGGAGGCATCAAGAGAATACGTCGAGCACTGTAAGAGAAGCGGTAACTATCTTACGAGATCTAGTAAAGATGTGTTTGTCACCACCATCTCAGGGCTCAGCATGACCTTTGGGCTGCTGCTAGGGCCAGCTATGCTCTTAAACTCCCAGCCCTTCAACAAGCAGATTCAAAACATGAGATTCGGAATGCTGTATGGTCTGTCAAGGATTGCATCACCAAAAGAGCTTGGAAAGAAACTAAGCAGTTCCTGCAGAAATGTTGAAACATACGTGGCCAGGCTACTGCTGCAACTAGTTGTTTTCTCTTCAGGACTTGACACAGACAAAAACATCGAGGCCTGGAGAAAGCATGACCTTTGCCCAGAAGTTACAATCCCTAGCTTGACTTTGACGGGTACAATAGTTAGTGGAGACAGGCAACTCATTTTTGACATCTACCTAGTCCATATTTACAACAAGGAAATGGACAACTTTGACGAAGGTTGCATCAAGGTCCTACAGGAGACATTGGAAAGACATGTTTCTTGGGAGATGCAGGTACTTGACTCCTGTAATAGGTTTAGAGATGGGAAACTAACAGACAAGCTTAAGGAATTGAGAACTTTAAGACTCCTGCTGGGCCTCCCCAACCTCAAAAGTGGTAGAAGCGATGATGATGAGTCTCCTAAGTCCTCAAGCTGCAGCTCTGCTTCATCAATGTCCTCTGCACATAGCATCGGGAAGACAAGATCATTTAGCTCAGGTAAGAGAGTCAAGAGTATGTATGGTAGGCTCAGGTCAACAATGAAGCCCATCATAACACATGTTGGGCTTGAGGCAGTCCCCGATGAGCTGACAGACTTTCAGTTCTCAGCGCAAGATATGGGTCTTGGAGTCAAGTATGATGCCAAGCCTGAGTCTGTCTTGAAAGACTTAAAACAGGTCATAAAGGACAACCCAAGTCACACCTATGGCAGCTTCGAGTTAGTGCAGGCAATGACCGAAACAGCCAGGTCAAAATTCCCTCCTGAATCAGTAGGAAAAGCACAAAGAGACAGCACAAATTGGCAAGGTGTGTCTGCTTACACAGAGACAACAAGCTCAGTTTCAGAGCCCAAAACAAGGATAGTTGTCAAGGATGCCATCAAGGTCCTTAGCACAGGAGAGGTGAAGAAAACAGTAAAATTGGTTAGAAACCGACTCAAGAAACTGGATGGTGGAGCAAACCCAAAACCGGAAAGACTGAGTGAGCTAGCGTCAATGCTTTGCACAGTTGATACCTTCACTGAAAAACAAAGGGAAGAAATCAAGAGGGGGATTAGTGAGCCAAGTAAGCTGACATTTTTCCCCTGGCGTGAAGTGGTTAATCGTTCCATTCGGGACGTGCTGATAACAAACGACGCCAACATGCTATATTGCTGGCTGAAGTCTCTTGCCTCAGGGATAAAGAAATCCTTGCGGCCTTATATGCCTGGTTTAAGGTACTGCAAGGAATCTAGCCCCAGTGACCACCCTAAGCTAGCAAAACTCCTAAGCAAAGAAGAACTCTGCGCCTTAACCGGTCTAACCAAGCTGTTCAGCAACCTCATAAAGGGCAACAGGGAAGCAGACACACCTCTTCCATTGGAAGATGACTTATACTGCTGTTGGCTAACATTTGTTGATGCTGTTCCACTTATAAAAGATGTGCTAGAGGTAGGATACCTCTCAATCAGAAACAGTTTAGTCCACTTTAACGAACTGTGTGTAGCCTATGAAAAACTTAGGGCTATCAAGAAAGAGTACCCAGAACTAAGCTTCATCAGAGAAGAGATTGAAGTAAAGAGCTTGGAGAGTAACTTCCTCAGGGAACATGATGGAGACATTATGAAGATGGTAAACCTAATCTTTTCGCTCTCCCTATGCTGCCCTTGGTCTATCCATTACAAGTCCTTTGAACTACTCCTCTCTCAAGAAGGGTCACCTCTTGCAGATGACGGAGTGCAAGAAGGCTACATGGAGCTGCTGAAATCGCTAGGCCCATGTAACTTCATACTTAGCAAAAGCAAAGAACTGTTTGGCGGTGAATCATTCAGTGAGACTGAGTGTAAAACTGTAGAGATGCTTTACAGGTACTGCTGCTCAATGTTTTCCTCCAATGATGAGCCAATTCGAGCCATATTGGATCTAAGGGAGGTTACAATTACAAGCCACATGGAGGAGAGTGCCCTCAGCACCACTAGATCTCTACTAGCCAAATATGGGATGGATAGAACTGACCTTGATTTCAAGTGGACACTGAATCTGATCGCCAATAGTAACTTTGAAGTTACCAAGAGATTAACAGGAAGGACAGAGGGAGAGAGGTTGCCAAGAAGTGTTAGAAGCAAGGTCATCTACGAGATGATCAAGTTGGTCAAAAGCACCGGGATGGCAATCTTGCAACAGCATGCTTTTAGCTACATACTCAACTCCGGACACAGACTCTTTGCAGTGCTCGCCCCAAAAGCACAGCTGGGTGGACACAGAGATTTGCTGGTTCAGGAGATCATGACAAAGATTATCCACGCAGCCTCAGAAACTTTCTCTCGTGCTCTGCTTGCAACAACAAACGATGATGGCCTGACTAACCAACATCTCAAAGAAAGCATACTGCAGTCGGCACATGATAGTCTCCAGCTGTCATCGTTCTCCCATGGCAAAGTTGTATCGGATTCTGGTGGTGGAACCAAATACTTTTCCAAAACTTTCTGCATCTCTGGCGACAGAACAAAGTGGGGTCCCATACACTGCACGTCCTTCTTCTCAGGGATGATGCAGCAGCTACTGCAGGATGCCCCTGACTGGAGTGCTTTTTTCAAGCTGGTGATGCTAAAAAATCTCTACAGACAAGTAGAAATACCGTCTGGAGCAATCAAAAAACTTCTTAACTCTTTCCGCTACAGGGTCAAAACCAGCATGCCTATAGAGTCGTTGTCTGAAGAGCAACTGAGGCACTTACTCTCAGAAAACCTAGACATATGGTCTGATAACCATATGATGCAGTTCCTGGTTCAGGTTTATATCTCAAAGGGTAAGATGGCTCTCGAGTGCTACAACCATATGGGCCAAGGGATACACCATGCCACTTCATCGGTGATGACATCATGCATGGCCGTGCTCACAGAAGAGCTTATAGTAGCTTACTTCCAGGAACACATGCCAGAACTAAACACATCTGTAAAACACGCAGGAAGCTCAGATGACTATGCAAAGGTCATAACCGTCTCTGGCAACCTACCGGCATCCCGTTTTGAGGCCTACGAGGAGAGTTTTTGGCGCCATGTCTGCCGGCTTCAAAACTCCATGGTAGGCCTAGCCAGAGGCTGCCAAATGAAAGACTCTGCGAAGACACTTATAGGTGATGTCATGTGTGAGTTCTATAGTGAATTCATGTTGTTCCACCGTGTCACCCCTGCAGTCATAAAGTTTATTCTGACAGGCCTCATTAACAGTTCTGTTACCTCACCACAGAGTATGGTGCAGGCCTGCCAGGTGTCAGCACAACAAGCAATGTACAACAGTGTTCCACTACTGACAAACATCTGCTTTACAGTCTTCCGTCAGCAGATGTTCGCCAACCATACGGAGTTGTTCCAGCGGAAGTACGGTCCCATTGTACATGGTTTGCCGTCTTCATTTGGAAGGCTTTACTTGCCTATGTACTCAAACCTAACCTCATCGACCATTGCAGTAGAAGATGCTGAGAGTATAGCCCAGGACCTAGAAAGCCTAGTTGACCTGAGCACACACCTTACAGCCCCGGAACCAACAGAGTATGCTGTCAGCCTTCCCGGACCAAAAGACGACGACAAGTCGACAGGATCCTCCATAAGTGGAGACGGCATTGGGAGTGAGGATACTGGGTCTGTTTCATCTAAGTCAACTTCCAGCTTTAGATTCAGCGAGGTGAAGCGCTTGACAACCACTGAGATTGAGTACCTCAAGGCTAGTTCTCTGGCTGACACTACTGAGATAGAGACTGACATACTTGAGAGGGTGGAGTACATGTACCAAGGGGAGGCTGATTACGATAACTGGCCATGTCTTGAAAAGATCGCTAAGTCAAAAATAGTGACAGACTGTAAGGAACTGAAAGAACTCTCCAAGAGAAACCCCGTGAGGTTGTTTAGGTACATTCGATCTGTAGTAAGCTCCTTGATCATTGGGCACTATAGAAGTTTTGCAAGTGAAGGAACAGAGAAAACAATGAAAGCCAATCTGAACAGGGATGAAAATAGGATTGTTGAGGACCCAATGATTCAACTAGTACCAGAAAAACTGAGGAGAGAGCTATCTAGGCTTGGCTTGGCTAGAGAGGATTACGAAGGCTACCAAGTCAAGCAAATGGCAAGCAAGCCCCTCGTAGAGCAAGTTGCACGTAGAGTCATCACTATGAACTGCCTCACAGAGGATTTTCAAGCTGAAGCAGATAGGCTAAAGCAAACACTAAGCTCAAGGAACATAATACATGGATTGGCAGGAGGGATCAAAGAGCTTTCCCTCCCTCTTTATACCATCTTCTTGAAATCGTACTTCTTTGTGGACAGAGTCTTCCTGGACCATATCGACAGGTGGAATAGCAAGCACAGCAAAAACTACAGGGATAGCTCAGGAAGGCCATTGGATGGTAAGGTAGTAACAAAGTACATGATATGGCTTGATGCAGTCTTGAGCTCTAGCATCCGTAGAAGCCTTGAGAGCACAGTTGAGCCTCAGAGCTTGTTCAATCAGTCGATCAAGTGCCTAGAACTCTTAACGTACGTCGATGGGTCAAGGTGTTTGATCGTAAAGGTGGATGACCTTAGGCTATTCAAGGAAGAGC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| 20,453
|
ON811863.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_13
|
Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 7,776
|
GenBank
| null |
China:Gansu
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2019
|
SAMN28688354
|
PRJNA841744
|
MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_13, complete genome
|
GGGTGCTGCCATGCCTTACATAGTACTCATATGTGCACTACAGTGCCTTCAGCATGCGAGATGCGTGGATGCAGTCCATGATGCAGATCCTGTTGTCATCCAAGAGATATTAGAGCGGAATGCAGTTAACCTGGACTGCATAACTTCATGCCTTAAGAAAACAAACTCGGGCAACTTTGAGGAGGCATCAAGAGAATACGTCGAGCACTGTAAGAGAAGCGGTAACTATCTTACGAGATCTAGTAAAGATGTGTTTGTCACCACCATCTCAGGGCTCAGCATGACCTTTGGGCTGCTGCTAGGGCCAGCTATGCTCTTAAACTCCCAGCCTTTCAATAAACAGATTCAGAACATGAGATTCGGGATGCTGTATGGCCTGTCAAGGATTGCATCACCAAAGGAGCTTGGAAAGAAACTAAGCAGTTCCTGCAGAAATGTTGAAACATATGTGGCTAGGTTACTGCTGCAGCTGGTTGTCTTCTCATCAGGACTTGAAACAGACAAGAACATTGAGGCCTGGAGAAAGCATGACCTCTGCCCAGAGGTCACAATTCCTAGCTTGACTTTGACAGGTACAATAGTTAGTGGAGATAGACAGCTCATCTTTGACATCTACCTCGTCCACATTTACAACAAAGAAATGGATAACTTTGATGAAGGCTGTATCAAGGTCCTACAGGAAACATTGGAAAGACACGTTTCATGGGAAATGCAGGTGCTTGACTCTTGCAATAGGTTTAGGGACGGAAAACTTACAGATAAGCTTAAAGAACTAAGAACTCTAAGACTCCTGCTAGGCCTACCAAACCTCAAAAGTGGTAGAAGCGATGATGACGAGTCCCCTAAATCTTCAAGCTGCAGCTCTGCTTCATCGATATCTTCTGCACACAGCATTGGGAAAACAAGGTCGTTTAGCTCAGGTAAGAGAGTCAAAAGCATGTATGGTAGGCTCAGGTCAACAATGAAGCCTATCATAACACATGTTGGTCTTGAGGCAGTCCCCGATGAGCTAACAGACTTTCAGTTCTCAGCACAAGATATGGGCCTTGGAGTCAAATATGATGCTAAGCCTGAGTCTGTCTTGAAGGACTTGAAGCAGGTCATAAAGGACAACCCAAGCCACACCTATGGCAGCTTTGAGTTGGTGCAAGCAATGACCGAAACAGCCAGGTCAAAATTCCCTCCTGAATCAGTAGGAAAAGCACAGAGAGATAGCACAAATTGGCAAGGTGTATCTGCTTACACAGAGACAACAAGCTCAGTTTCAGAGCCCAAAACAAGAATAGTTGTCAAAGATGCCATCAAGGTCCTAAGCACAGGAGAAGTAAAAAAAACAGTAAAGTTGGTCAGAAATCGGCTCAAGAAGCTAGATGGTGGAGCAAACCCAAAACCAGAGAGGCTAAGTGAGCTGGCTTCAATGCTTTGCACAGTTGACACCTTCACTGAAAAGCAAAAAGAAGAGATCAAGAGAGGAATTAGTGAGCCAAGCAAGCTGACATTTTTCCCTTGGCGTGAAGTGGTCAACCGTTCTATTCGGGATGTGCTGATAACAAACGATGCCAACATGCTATACTGTTGGTTGAAATCCCTTGCCTCTGGAATAAAGAAATCCCTGCGGCCCTATATGCCTGGTTTAAGATATTGCAAAGAATCAAGCCCCAGTGACCACCCTAAGCTAGCAAAACTTCTGAGCAGAGAAGAGCTCTGCGCCCTGACCAGTCTAACCAAGCTGTTCAGCAATCTCATTAAAGGTAATAGGGAGGCAGACACACCTCTACCTTTGGAAGATGACTTATACTGCTGTTGGCTAACATTTGTTGATGCTGTTCCACTCTTAAAAGATGTGCTGGAGGCAGGGTACCTCTCGATCAGAAATAGCTTGGTCCACTTTAACGAACTGTGTGTCGCCTATGAAAAACTTAGGGCCATCAAGAAAGAGTACCCAGAGCTAAGCTTCATAAGGGAAGAGATTGAGGTAAAAAGCTTGGAGAGCAACTTCCTTAGGGAACATGACGGAGACATTATGAAGACAGTAAACCTGATCTTTTCGCTCTCCCTATGTTGCCCTTGGTCTATCCATTACAAGTCCTTTGAACTACTCCTCTCCCAAGAAGGGTCACCGCTTGCAGATGACGGAGTTCAAGAAGGCTATATGGAGCTGCTGAAGTCGCTTGGCCCTTGTAACTTCATACTTAGCAAAAGTAAAGAACTTTTTGGAGGTGAGTCATTCAGTGAGAATGAGTGTAAAACTGTAGAGATGCTTTACAGGTACTGCTGCTCAATGTTTTCCTCCAATGATGAGCCAATTCGAGCCATACTGGATCTGAGGGAAGTCACAATTACAAGCCACATGGAAGAGAGTGCCCTAAGTACCACTAGATCCCTACTGGCCAAGTATGGGATGGATAGAACTGACCTTGATTTTAAGTGGACACTAAATTTGATTGCTAATAGCAATTTTGAAGTGACCAAAAGACTAACAGGAAGAACAGAAGGAGAGAGGTTGCCAAGAAGTGTTAGAAGCAAGGTCATCTACGAGATGATCAAGTTGGTCAAAAGCACTGGAATGGCAATCCTACAACAGCATGCTTTCAGCTACATACTCAACTCCGGACACAGACTTTTTGCAGTGCTTGCCCCAAAAGCACAGCTAGGTGGACACAGAGACTTGTTGGTTCAGGAAATCATGACAAAGATCATTCACGCAGCCTCAGAAACCTTCTCTCGTGCTTTGCTTGCAACAACAAACGATGATGGCCTGACCAACCAACATCTAAAAGAAAGCATTTTGCAATCTGCACATGACAGTCTTCAGCTGTCATCGTTCTCCCATGGTAAAGTTGTATCGGATTCCGGTGGTGGAACCAGGTACTTTTCCAAGACTTTCTGTATTTCTGGCGACAGGACAAAGTGGGGTCCCATACACTGCACGTCCTTCTTCTCAGGGATGATGCAGCAGCTGCTGCAAGATGCCCCTGATTGGAGTGCCTTTTTCAAACTGGTGATGCTCAAAAACCTCTACAGACAAGTAGAAATACCGTCAGGGGCAATCAAAAAACTTCTCAACTCTTTCCGCTACAGGGTTAAAACCAGCATGCCTATAGAGTCATTATCTGAAGAGCAATTGAGGCACTTGCTCTCAGAAAACCTAGACATATGGTCTGACAACCATATGATGCAGTTTCTGGTTCAGGTCTACATCTCAAAAGGAAAGATGGCTCTTGAATGCTACAACCATATGGGCCAAGGGATACACCATGCAACTTCATCAGTGATGACATCATGCATGGCCGTACTCACAGAAGAGCTTATAATAGCTTACTTTCAGGAACACATGCCAGAGCTAAACACATCTGTGAAGCACGCAGGAAGCTCAGATGACTATGCAAAGGTCATAACAGTCTCTGGCAACCTACCAGCATCCCGTTTTGAAGCCTACGAGGAGAGCTTCTGGCGCCATGTCTGCCGGCTTCAAAACTCCATGGTAGGTCTTGCCAGAGGTTGCCAGATGAAAGACTCTGCGAAGACACTCATAGGTGATGTTATGTGTGAGTTCTACAGTGAGTTTATGTTGTTCCACCGTGTCACCCCTGCTGTCATAAAGTTTATACTAACAGGTCTCATTAACAGTTCTGTCACCTCACCACAGAGTATGGTACAGGCGTGCCAAGTGTCAGCACAACAGGCAATGTACAACAGTGTGCCACTGCTGACAAACATCTGTTTTACAGTCTTCCGTCAGCAGATGTTTGCAAACCACACTGAGCTGTTCCAACGGAAGTATGGTCCTATTGTGCATGGTTTACCATCTTCATTTGGAAGGCTTTACTTGCCTATGTATTCCAACCTGACTTCATCAACCATTGCAGTCGAAGATGCTGAGAGTATTGCCCAGGACTTGGAAAGCCTAGTTGATCTAAGTACACACCTCACGGCCCCAGAGCCAACAGAGTATGCTGTCAGCCTTCCTGGGCCAAAAGATGATGACAAGTCGACAGGATCCTCCATAAGCGGAGACGGCATCGGAAGTGAAGATACTGGGTCTGTTTCATCTAAGTCAACTTCTAGCTTTAGATTTAGCGAGGTAAAGCGCTTGACAACCACTGAGATTGAATACCTTAAGGCCAGTTCTCTGGCTGATACCACTGAGATAGAGACTGATATCCTTGAGAGGGTGGAGTACATGTACCAGGGGCAAGCTGATTACGACAACTGGCCCTGTCTTGAAAAGATTGCTAAATCAAAGCTAGTAACAGACTGTAAGGAACTGAAAGAACTTTCTAAGAGAAACCCTGTGAGACTGTTTAGGTACATCAGATCTGTAGTAAGCTCCTTGATCATTGGGCACTATAGAAGTTTTGCAAGTGAAGGGACAGAGAAAACAATGAAAGCCAACCTAAACAGAGACGAAAATAGGATTGTCGAGGATCCAATGATTCAACTGGTACCAGAGAAGCTGAGAAGAGAGCTGTCTAGGCTTGGCTTGGCCAGAGAAGACTACGAAGGCTACCAAGTCAAGCAGATGGCAAGTAAGCCTTTGGTAGAACAAGTTGCCCGTAGGGTTATTACTATGAACTGCCTCACGGAGGACTTTCAAGCTGAAGCAGATAGGCTAAAGCAAACACTAAGCTCAAGGAACATAATACATGGATTGGCAGGAGGGATTAAAGAGCTTTCTCTCCCTCTTTATACCATCTTCCTGAAATCGTACTTCTTTGTAGACAGAGTTTTCCTGGATCATATCGACAGGTGGAACAGCAAACACAGCAAAAACTACAGAGACAGTTCAGGGAGACCACTGGATGGCAAAGTGGTAACAAAGTACATGATATGGCTTGATGCAGTCTTGAGCTCTAGCATCCGCAGGAGCCTAGAGAGCACAGTTGAGCCTCAGAGCCTGTTCAACCAGTCGATTAAATGCCTAGAGCTCTTAACTTATGTGGATGGGTCGAGGTGTTTAATTGTGAAGGTGGATGACCTTAGGCTATTTAAGGAAGAAC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| 20,454
|
ON811879.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_15
|
Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 12,106
|
GenBank
| null |
China:Ningxia
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2017
|
SAMN28669524
|
PRJNA841744
|
MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_15, complete genome
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| 20,468
|
ON811888.1
|
Shanxi tick virus 2
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
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TIGMIC_16
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Shanxi tick virus 2
| null | null |
unknown
| 12,077
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Haemaphysalis longicornis
| null |
2018
|
SAMN28613792
|
PRJNA841744
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MAG: Shanxi tick virus 2 isolate TIGMIC_16, complete genome
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