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MH587229.1
Tomato torrado virus
Moodley,V., Gubba,A., Mafongoya,P.L.
University of KwaZulu Natal, Plant Virology
South Africa
2019-03-13
ToT-186
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
Secoviridae
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South Africa
South Africa
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2015-02-05
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MH587230.1
Tomato torrado virus
Moodley,V., Gubba,A., Mafongoya,P.L.
University of KwaZulu Natal, Plant Virology
South Africa
2019-03-13
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South Africa
South Africa
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Tomato torrado virus
Nerva,L., Ciuffo,M., Turina,M.
CNR Torino, Italy, Istituto per la Protezione Sostenibile Delle Piante
Italy
2016-12-24
T795
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
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Italy
Italy
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2001-09-06
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Tomato torrado virus isolate T795 segment RNA1, complete sequence
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78,976
KX132809.1
Tomato torrado virus
Nerva,L., Ciuffo,M., Turina,M.
CNR Torino, Italy, Istituto per la Protezione Sostenibile Delle Piante
Italy
2016-12-24
T795
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
Secoviridae
ssRNA(+)
5,403
GenBank
null
Italy
Italy
null
null
2001-09-06
null
null
Tomato torrado virus isolate T795 segment RNA2, complete sequence
TTTAAAAGAATAATTTTATACAATATTTATGTGATCCAAGCCATCACGGAACCTACGTCGTTCCTAAGATATTGTATCAATTATCTTTGCTGTTACCATTTTGAGTGCACCGTCAACTGAAGGAACCTACGCCGTTCCCAAGGACAGTGTATCTTTTGTTATTTATTTTGGTTATATCTCTATGTCATTTATTTCTCGTTTGAATACATCTCTTGAAGAGGAGGCATTTCACAAGCAAGTTGCAGACTCTCAGTGGGTGTGTTCGGTTGATACAGGCTCTGGCATAATAAACAGTGATCCAACTCTAGACTTCAAGATTTGTCCCAAGACAGGTGGAGCAATTTCTGTTCTATCTGTTTCGTGGCGAAACAATAGCCCTCAACTGGTTCCTGGTCATTATCTACTGCGAAGTGGAACTTGGCCAATTACTGGTGTTAAGCTATCTGGCTTACTAGTTCATAGATCAATTCGTTTGGAAACCACCAGGAAACTTCTAGAAGCTCAGAGGATTTCTGTATCCCAGCAAGCATCTTCTTCCTCCGCTGCTGGTGCTGCAGGAAAACAACCACAAGTAACGCTTACACAGTTACAAGAGGAGCTTGACGAGGCCAAAACTCGCTTAGCTCTCAAAGAGAAAGAGTTACTTGAAGCTCTATCCGAAATATCCAAATTAAGATTGCAATTGTCCAACCAACCAAGTAATGATGATGTCTTCAGTGGCTGGACAGAGGAGGGGCCCAAGTGATAAAAGTGCAGCTGTATCTGAGCAATTAATTGCTCAGATTACAGCTGCAGTCGAAGCAGGCAACAAAAACCTGCTTCGCAAACTGGGCATGGGTTCATTTGGGATTCTCTATGGTGCCCAAGAGAAGAAAGCCATGGAACTGTTTGACCCTGAGGATGTACATAATATAACCTCATTGTGGTCTTCATTTAAGAAAACTTTCACTTCCTCGAGGGATCATGGAAATCTATTCTTCCATTTGTATGGAGTTATGTTTTTCATGGTTCCTCATGTACATGGTGGGGAAGGTAGTGTAAAAATTAGTTTATGTTCCAGTAATGATCCAACCAATCCTGTTCTGCAGGAGAAGGTTTTGTATTTTTCCGGGGGGGCACAGGCAGTGTTAATGAGTCCGACCATTACACTACCTTTTGTTAAAAGAGGCCCCATGTTCTACTACACAATGGAGTGCCTTGGCACTCGGGCTCAAATTCCTTGCTCAGTAGTGGCCATTTGGAAACAAAAGATTGATATCCGTAGTGCCATTTACTCAAAGCAGGAAACAATGTCTTGGGCTATTGAGGCTCTTCACCGACCTCAATTTTTCCAGGACAGACAGGAGGCAGCACAGTACATATCATCAGTATATTCTAATGCTACCTCCTCAGCAACTGATTCAGTGCTTCCGTTTGTGGGAGCACAGCTTGGCGACACAAAGATGAATGTGCCAAGCGAAGCAAGAATGATCCGGTCCTCCTCGCTCCGGGTGCCCATGCTCAAGGTGCAGAGTAAGCGGTTTTCCTCAATGGAAATACCATCTACCTCAACTGCACACCTCCTTGGCACAACGCGTGATGAAACTGTAATACAGGAGGAAAGTAGGCACGAAGAGGAGGGTGATGATGGGGTTTTGTTCCCCGTTAAAAGGGCTCAAGGTCTGAACTATTCCCATGTGTGGGATAATCTTGGTATTGAGTCCTTTGTAGATGTTGAGCTGCCCGAAAACTGGGATGAGCTGTCGGTGAGACAGCAAGTTGCTGCAGCAATGATAGCATTTGCAAACAAGGGTGTTTGCTTGGTCCCAAAACATATAATCAACCGGGACAAGCACAATATCCACTTGGAGAATATCACCGAGCATAACTACTTGGTGATACTGGAAAGGTACGGCATCGTAAATGCCGGCTCTCTGGCCAGAACTGAAAACTGGTACAATCTTACCTTGGCACAGAGAGTGGAAGAACTGATTTATCAAAGGGACGATGCATACTTCATGTTTGGTGATAACACCAACCCATACCCTCCCTTTGATTGTTATGATGGCTTAACGCTCAAAGTTCGCAGTGAGCTAGAGCGTGTGGCAAAGGAGCAGGCGCGCCAAAGATTTTACAAGGAGGCGGCCAAGGCTCAGGTGAAAAACAAGGTGGCCCAAACTAGTGTGGAAGAAATACCATCCACCTCATTCGCCACAAAGGTTGCCATGGAGAGTGGCAGTGTGGATAGCATGAAAATTGCTATTCAAGCTGAAGCTGCCAATGAAGCTGTAAAGCCCAATGAAGTTATGTTTGAATTTGGGCAAGAAATGAATAATGAAGGTGCGACAGAGCTGGAATTACAACAACCAGCCTGCGTGGCCAGTAACTCCTTCTTCAACGTTGGAGTTTTTGAGTTTGCATGGAAGAAAAGCAGTTCTGTTGCTGCTGAGGTGCTATCACTGGCGCTCCCTGCGGCTCTCTTTGGTAAATCCAAGGAGATGTCAATGGGATCGCAAATGCTAAAGTATTATGATGCCGCATTAATTATGTACAAGGTCATCTTGTATATTTCCGGCATGGGTGCAATTTCGGGCCAGCTGGCCCTGGTTTGGGATGAGTGCAATGTGCTCAACAGAAAGAAGGAGTTCATCAACATTGCCTCTCTGTATGCCAGCAAACATAGGCTGGTTTCAGCATCTGAACAGAGTAGTGGGGAATTTTGTTTTACACCTACGGGTATTGGCAAATTCGTTCCACTTGATCCAGCCTCGGGGGCTTATGATCTGGGTAGCATACGGGTGTTTGTGACGCACCCCTTGGCTAGTGCTACTGAATTGGAGAGCATACCTTGTCACATCCATCTGCAGTGTAAAGTGTTGTCGACCAACATCATGCAGCCTCCTCGTTTGCGAGCACAGGCACAATTTGGTATGAAACCAGACCAGACACACTTTCCACGATTTCCAACAAATCAGGTACTGTTACACTACAATTGGGGAGTGGCTGCTAGCATGGGTACTACCCTAGTTAGCATCTTCTCTCCGTCAGGCATATATGAAAGTGACGGTACGCTGCAACCATCCTTGCTTGGAAACATAGCACGCAATTGCAAATGGTGGACTGGCACTTGCGTGTTTGAGATTTGTATTGAAAAGACTCAGTTCCATTCTGGTAGTTTGGCCATTGGACTGGGTACACTGAACACAAGCATGTCCACCCCTCATGACATTTTAAATATGCCGCATGTTATTTGTAACCTTGAGATGGGACGAAAGTTCTATTTCAGGTGTACGATAACCAATTGGAATGGGAAAAATCTTTTGACCACTGGTCGGAAGAGTTCTCTACCGCGGCCCAAGCATATGTCTCACATGAGGTTGTTTGCTACAGTCTTGAAACCCCTGGTATCAACTTCAATACATCTAGATACGGTCGGGGTAACAGTGCAGCTTAAATGCATAGAAGATTTGGTCCTTGGGGGCACTGTGTCTGTTAAACCCATTTACGGACACTGGACTAAAGGAAAGAATGCTGTGGACTTCCTATTCTCTGAGATGGACTTGTCTCAGCGTAAAGAAATTGAGAAATTACGCAAGGAAAACGTTGAGACATTTGATGAGAAAGGAAAGAAGCAGCCACAGGTGCAAGTGCCGCTCAGGGACAAGTTTTCATATGGGGCTGTACAATATTTTGTGATGAATTGGAAGGACGAAGAGCGACTGTTGGTTTTACCATGCGCACCTTGGTCCGTAAGATTCCCTCAGGGGGCACTGGTACAGGAGGCCATCACATGCCCATTCATTGATTGGTGCTCTTCCTTTTGTTATTGGTCTGGAAGTCTTGAATACACCATTATTGTACATAGAGTGCAGACTTCCAATAACATAGGAGGAGTGCTGAACATCACCTTAGATTCATCAGGGTATCCTTTTCCTCTTGGAATCTCAAAGGGCGCCTATGTTGTCTCTGCTGGTGGAGGAGCAAAATGGGCTTTCACTTATGGTATGAGCGACAACATCTTTTCTTTTGTGGTGCATGATGATGAGTTTTTCCCTAGACGCCATACCAAAGCCAGAGCAATAGATCCAAATGCTTCAAGAATAATGACTCTGCAAGATCGTCTAGGAAATCTCATAATAAATTTACCAGCCAAAGATGTGATAAGCTCTCTGGAAATCTTGGTCAAGCCAGGACCTGATTTCAAATTGCAACTGGCTCAAGCTCCTTCAGCAAATCATGAGAAGCATTTGGGTGATATGCAAACGCATACCTACCTTTATACTTCTGATTTTTCAGAACTAAGGAGTTTTGAAAATTAACTATCCTGTACGTGATATAGGAGCCGTGAGTCCGGCAAGTGACTCATCATGTGCAGTTAACATGTGTACTGTGAATAATGTTAACTGTAAGGATAGTTAATTTTAACGGAGAGTACTGACTTTAACTAGTTGGGAGTCCGGCTCCATTTGGAGTACCAATGAATCTACATTGGTTAAAGAGATTTGCACGCCTCTCTTTAAATATGGATCGTGTACCCTGCTTGGTTAGAAAGTACCTTTACTTAGGTTTACAAAGTACGGGGAGCACTCCCTGGTTAACATAGTGCAGGTGCTATCCCATGATAGTCCTTTAACTCAAGGGTTGAGTTCGGTTTGCATCTTTTGCCGTGATGAAAGATGAGGTAGCTTCCCCCTTATTGGGAGGCTGAAACTACACATATGTAGTGGGTTTGACTGAGTCCTATAATCAGTCCGTTTGAAATTCGATAATTTTCCGTAGCTTGCGTCAAGCTGCTCACGTTAGGGGCGTGAGTGAAGATGCGCCGTACCACGTCTTCCCCGGCAATGCCAGTGGTTCAGAGCGGGCCCTCAGAATAGAGGTTAAAACTAGTGTGATGGTGTATATCACGATAAAAAGTGACACCCGGGTTGTGCTGCGCCTAGTTAACACGAGCACAGGTCCCACCCTATAGTGGAAGAAACTTGGTTGAGTTTTAAAGAACAACCCGTTTGAGCGACGAC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78,977
KM114266.1
Tomato torrado virus
Budziszewska,M., Pospieszny,H., Obrepalska-Steplowska,A.
Plant Protection Institute - National Research Institute, Interdepartmental Laboratory of Molecular Biology
Poland
2015-08-03
Ros
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
Secoviridae
ssRNA(+)
5,404
GenBank
null
Poland
Poland
Solanum lycopersicum
null
null
null
null
Tomato torrado virus isolate Ros segment RNA2, complete sequence
TTTAAAAGAATAATTTTATACAATATTTATGTGATCCAAGCCATCACGGAACCTACGTCGTTCCTAAGATATTGTATCAATTATCTTTGCTGTTACCATTTTGAGTGCACCGTCAACTGAAGGAACCTACGCCGTTCCCAAGGACAGTGTATCTTTTGTTATTTATTTTGGTTACATCTCTATGTCATTTATTTCTCGTTTGAATACATCTCTTGAAGAGGAAGCATTTCACAAGCAAGTTGCAGACTCTCAGTGGGTGTGTTCGGTTGATACAGGCTCTGGCATAATAAACAGTGATCCAACTCTAGACTTCAAAATTTGTCCCAAGACAGGTGGAGCAATTTCTGTTCTATCTGTTTCGTGGCAAAACAATAGCCCTCAACTGGTTCCTGGTCATTATCTACTGCGAAGTGGAACTTGGCCAATTACTGGTGTTAAGCTATCTGGCTTGCTAGTTCATAGATCAATTCGTTTGGAAACCACCAGGAAACTTCTAGAAGCTCAGAGGATTTCTGTATCCCAGCAAGCATCTTCTTCCTCCGCTGCTGGTGCTGCAGGAAAACAACCACAAGTAACGCTTACACAGTTACAAGAGGAGCTTGACGAGGCCAAAACTCGCTTAGCTCTCAAAGAGAAAGAGTTACTTGAAGCTCTATCCGAAATATCCAAATTAAGATCGCAATTGTCCAACCAACCAAGTAATGATGATGTCTTCAGTGGCTGGACAGAGGAGGGGCCCAAGTGATAAAAGTGCAGCTGTATCTGAGCAATTAATTGCTCAGATTACAGCTGCAGTCGAAGCAGGCAACAAAAACCTGCTTCGCAAACTGGGCATGGGTTCATTTGGGATTCTCTATGGCGCCCAAGAGAAGAAAGCCATGGAACTGTTTGACCCTGAGGATGTACATAATATAACCTCATTGTGGTCTTCATTTAAGAAAACTTTCACTTCCTCGAGGGATCATGGAAATCTATTCTTCCATTTGTATGGAGTTATGTTTTTCATGGTTCCTCATGTACATGGTGGGGAAGGTAGTGTAAAAATTAGTTTATGTTCAAGTAATGATCCAACCAATCCTGTTCTACAGGAGAAGGTTTTGTATTTTTCCGGGGGGGCACAGGCAGTGTTAATGAGTCCGACCATTACACTACCTTTTGTTAAAAGAGGCCCCATGTTCTACTACACAATGGAGTGCCTTGGCACTCGGGCTCAAATTCCTTGCTCAGTAGTGGCCATTTGGAAACAAAAGATTGATATCCGTAGTGCCATTTACTCAAAGCAGGAAACAATGTCTTGGGCTATTGAGGCTCTTCACCGACCTCAATTTTTCCAGGACAGACAGGAGGCAGCACAGTACATATCATCAGTATATTCTAATGCTACCTCCTCAGCAACTGATTCAGTGCTTCCGTTTGTGGGAGCACAGCTTGGCGACACAAAGATGAATGTGCCAAGCGAAGCAAGAATGATCCGGTCCTCCTCGCTCCGGGTGCCCATGCTTAAGGTGCAGAGTAAGCGGTTTTCCTCAATGGAAATACCATCTACCTCAACTGCACACCTCCTTGGCACAACGCGTGATGAAACTGTAATACAGGAGGAAAGTAGGCACGAAGAGGAGGGTGATGATGGGGTTTTGTTCCCCGTTAAAAAGGCTCAAGGTCTGAACTATTCCCATGTGTGGGATAATCTTGGTATTGAGTCCTTTGTAGATGTTGAGCTGCCCGAAAACTGGGATGAGCTGTCGGTGAGACAGCAAGTTGCTGCAGCAATGATAGCATTTGCAAACAAGGGTGTTTGCTTGGTCCCAAAACATATAATCAACCGGGACAAGCACAATATCCACTTGGAGAATATCACCGAGCACAACTACTTGGTGATACTGGAAAGGTACGGCATTGTGAATGCCGGCTCTCTGGCCAGAACTGAAAACTGGTACAATCTTACCTTGGCACAGAGAGTGGAAGAACTGATTTATCAAAGGGACGATGCATACTTCATGTTTGGTGATAACACCAACCCATATCCTCCCTTTGATTGTTATGATGGCTTAACGCTCAAAGTTCGCAGTGAGCTAGAGCGTGTGGCAAAGGAGCAGGCGCGCCAAAGATTCTACAAGGAGGCGGCCAAGGCTCAGGTGAAAAACAAGGTGGCCCAAACTAGTGTGGAAGAAATACCATCCACCTCATTCGCCACAAAGGTTGCCATGGAGAGTGGCAGTGTGGATAGCATGAAAATTGCTATTCAAGCTGAAGCTGCCAATGAAGCTGTAAGGCCCAATGAAGTTATGTTTGAATTTGGGCAAGAAATGAATAATGAAGGTGTGACAGAGCTGGAATTACAACAACCAGCCTGCGTGGCCAGTAACTCCTTCTTCAATGTTGGAGTTTTTGAGTTTGCATGGAAGAAAAGCAGTTCTGTTGCTGCTGAGGYGCTATCACTGGCGCTCCCTGCGGCTCTCTTTGGTAAATCCAAGGAGATGTCAATGGGATCGCAAATGCTAAAGTATTATGATGCCGCATTAATTATGTACAAGGTCATCTTGTATATTTCCGGCATGGGTGCAATTTCGGGTCAGCTGGCCCTGGTTTGGGATGAGTGCAATGTGCTCAACAGGAAGAAGGAGTTCATCAACATTGCCTCTCTGTATGCCAGCAAACATAGGCTGGTTTCAGCATCTGAACAGAGTAGTGGGGAATTTTGTTTTACACCTACGGGTATCGGCAAATTCGTTCCACTTGATCCAGCCTCGGGGGCTTATGATCTGGGTAGCATACGGGTGTTTGTGACGCACCCCTTGGCTAGTGCTACTGAATTGGAGAGCATACCTTGTCACATCCATCTGCAGTGTAAAGTGTTGTCGACCAACATCATGCAGCCTCCTCGTTTGCGAGCACAGGCACAATTTGGTATGAAACCAGACCAGACACACTTTCCACGATTTCCAACAAATCAGGTACTGCTACACTACAATTGGGGAGTGGCTGCTAGCATGGGTACTACCCTAGTTAGCATCTTCTCTCCGTCAGGCATATATGAAAGTGACGGTACGCTGCAACCATCCTTGCTTGGAAACATAGCACGCAATTGCAAATGGTGGACTGGCACTTGCGTGTTTGAGATTTGTATTGAAAAGACTCAGTTCCATTCTGGTAGTTTGGCCATTGGACTGGGTACACTGAACACAAGCATGTCCACCCCTCATGACATTTTAAATATGCCGCATGTTATTTGTAACCTTGAGATGGGACGAAAGTTCTATTTCAGGTGTACGATAACCAATTGGAATGGGAAAAATCTTTTGACCACTGGTCGGAAGAGTTCTCTACCGCGGCCCAAGCATATGTCTCACATGAGGTTGTTTGCTACAGTCTTGAAACCCCTGGTATCAACTTCAATACATCTAGATACGGTCGGGGTAACAGTGCAGCTTAAATGCATAGAAGATTTGGTCCTTGGGGGCACTGTGTCTGTTAAACCCATTTACGGACACTGGACTAAAGGAAAGAATGCTGTGGACTTCCTGTTCTCTGAGATGGACTTGTCTCTGCGTAAAGAAATTGAGAAATTACGCAAGGAAAACGTTGAGACATTTGATGAGAAAGGAAAGAAGCAGCCACAGGTACAAGTGCCGCTCAGGGACAAGTTTTCATATGGGGCTGTACAATATTTTGTGATGAATTGGAAGGACGAAGAGCGACTGTTGGTTTTACCATGCGCACCTTGGTCCGTAAGATTCCCTCAGGGGGCACTGGTACAGGAGGCCATCACATGCCCATTCATTGATTGGTGCTCTTCCTTTTGTTATTGGTCTGGAAGTCTTGAATACACCATTATTGTACATAGAGTGCAGACTTCCAATAACATAGGAGGAGTGCTGAACATCACCTTAGATTCATCAGGGTACCCTTTTCCTCTTGGAATCTCAAAGGGCGCCTATGTTGTCTCTGCTGGTGGAGGAGCAAAATGGGCTTTCACTTATGGTGTGAGCGACAACATCTTTTCTTTTGTGGTGCATGATGATGAGTTTTTCCCTAGGCGCCATACCAAAGCCAGAGCAGTAGATCCAAATGCTTCAAGAATAATGACTCTGCAAGATCGTCTAGGAAATCTCATAATAAATTTACCAGCCAAAGATGTGATAAGCTCTCTGGAAATCTTGGTCAAGCCAGGACCTGATTTCAAATTGCAACTGGCTCAAGCTCCTTCAGCAAATCATGAGAAGCATTTGGGTGATATGCAAACGCATACCTACCTTTATACTCCTGATTTTTCAGAACTAAGGAGTTTTGAAAATTAACTATCCTGTACGTGATATAGGAACCGTGAGTCCGGCAAGTGACTCATCATGTGCAGTTAACATGTGTACTGTGAATAATGTTAACTGTAAGGATAGTTAATTTTAACGGAGAGTACTGACTTTAACTAGTTGGGAGTCCGGCTCCATTTGGAGTACCAATGAATCTACATTGGTTAAAGAGATTTGCACGCCTCTCTTTAAATATGGATCGTGTACCCTGCTTGGTTAGAAAGTACCTTTACTTAGGTTTACAAAGTACGGGGAGCACTCCCTGGTTAACATAGTGCAGGTGCTATCCCATGATAGTCCTTTAACTCAAGGGTTGAGTTCGGTTTGCATCTTTTGCCGTGATGAAAGATGAGGTAGCTTCCCCCTTATTGGGAGGCTGAAACTACACATATGTAGTGGGTTTGACTGAGTCCTATAATCAGTCCGTTTGAAATTCGATAATTTTCCGTAGCTTGCGTCAAGCTGCTCACGTTAGGGGCGTGAGTGAAGATGCGCCGTACCACGTCTTCCCCGGCAATGCCAGTGGTTCAGAGCGGGCCCTCAGAATAGAGGTTAAAACTAGTGTGATGGTGTATATCACGATAAAAAGTGACACCCGGGTTGTGCTGCGCCTAGTTAACACGAGCACAGGTCCCACCCTATAGTGGAAGAAACTTGGTTGAGTTTTAAAAGAACAACCCGTTTGAGCGACGA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86,519
KM091449.1
Tomato torrado virus
Budziszewska,M., Pospieszny,H., Obrepalska-Steplowska,A.
Plant Protection Institute - National Research Institute, Interdepartmental Laboratory of Molecular Biology
Poland
2015-07-31
Ros
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
Secoviridae
ssRNA(+)
7,661
GenBank
null
Poland
Poland
Solanum lycopersicum
null
null
null
null
Tomato torrado virus isolate Ros segment RNA1, complete sequence
TTAAAAGAGTTATTTTGAGAATATAACCTACGTCGTTATTCACAGACCAAGTCTCTGTTAATCAAAATCTCCCTTTTAAAACTCATTTTACTTTTACATTTGGCAACATGTCTTTTTCCAAGATGTTCTCCGGTTCCAACTCAGTTACTGAAAAGTGCGCTACCAGCTCCTCTGGTTCTTTCTTTTCAGAGCTTACTGCTAGTATTAGTAATTTCTCCCGCACTCTGTCCAATGTTACCAAGGTTTCATCTCAAATTTCTTCTCACATTGAAGATTTGAAGCCTTCRGTTACAGATGCTGCTTCTTCCTTTACCAGCACCTGTAACTCTGTTACTAAACTGTTAGATAAGATAATGACTTTAATTGAACCCTTCATCAAGGCTTACTCTTTTGTCGCATCCATGTACAAATCAATTTGTGATATGGTTGCAAAGATTGTTGCAAGCATCAAAGATAAGTTCACACTTGGTTTTAACTGGGTGTTGGACAAATCTGAGGATGTGGATGTTTTAGTTATAGCTTTTCTTATTTTTGCGATTTCTATGTTAATAATTGTTTTCATTTGTCCAAGTAGTGTACTAGATGGAGTTGTACAGATGACTCACATAGTTTTTAATACAGTAGGTAACTTCTTTTCAGCTTTGTACAAATTAGATTGGTTACCGACATGGTCCCAAAAGTTTTCAATGATGGCACAAGCCAATGTTCTACCAGGGGAATCCATGTCACACTCACCACTTTCACAAGTGGTAGCATCCCTCATAGCCTCTGGGATTTCTACCCTCGTGTTCGTGGCTGTACCTGGTAGACCCAATGGTCTATCCAACCCGCTATCAAAAATTCTGTACTCAGCGGGAAGTGGTGCTCAACAGTGCAATCAATTGTTTACCCTGTTCAGGAATATGAAAGATTGTACTTCCCAGGCCTTTTCCTGGGTTCTGGAAATAATAGTAGACATTTTTGGTTTTAAGAATCCAGTTTTGTCTGCTATTAGTGCCACATTGTCCACGGACTTATTCACGTGGATGGAAGAAGTGGATGCAGTGTGTGATCCAGCACATCGCTTGGAAAATTTTGCAAACCCTGCATTCACTATCAAGCTCCAACATCTAAGGGAGCAGGCTCTTAAAATCTCTGCTTACATTGCTACACATCCTGTAGCAGCCTTCATGAGCCACAGGGTAACGGCAGCAATAGCCCATCTTGACAAGATATATGGGGAGAACTGCCAGCACACTGGCGTGGGCCAATACAGGGCAGAACCTTTTATGGTTCAATGGTATGGTGCCAGTGGTTGTGGGAAATCCACCAGCATGCGGCTGTTCATCAATGATGTTTTGGACCGCATGGAAGAGCCAAAGTTGAACAGGCTCTATGCTGTGAGTAAGCGAGATGCTTACTGGTCAAATTATGCCCATCAAACTGCTATTCTGATGGATGACATGGGCGCTCTGAGAGATGGGGCAGGGCAATGCCAGGACATTAAGGATTTGATAGATATCAAGTCCACTCAACCAGCCCCCTTGCCCATGGCAGCAGTGGAGGATAAAGGCCGCCACTTTACCTCCCGATACATATTTGCCACATCCAACCTTATCTCAGCTCCTGCTCAGTGTGGTCTAACCTACCCCGATGCTTTTGAGAGAAGACGGGATGTTCTTGTGGAGTGCAGGAAGGTGGGTGAGTTTAACACTGATGCTCCCACTTCTCACCTTGAATTTGATGTGGTTGAGAGCAAAAGACCCCATGCAATAACACACAGGGGTTTGAGCTATGATGATTTGCTGGAATATGTGGTTGCCAAGTGCAAGGTTCATGCAGAAATCTCAGGAAAACTGTATGGCGCCACATCAGGCAAGGTGGCACAGGTTGATGTGTCACCTGAGGAAATAATAGCATCCATGGATATGTTGAATATCCAAGATACCAAGCAGGATGCYAAGCTTCCCGTGGTTGTTGTAAGTGAAGAGGATAGGGTGGCCTACTCTCAGGAGTTGACAGTGGAAGCTTTGAAATATGCTTATCAGGGTAGTCTGAATCCCGCAGCATATTTCCCTCATGACATGCACAAACAGGCCATATTTGATGTGCTAAGTGAATCCGCCAAAGAAACATTCACCAGGTGGGTTAATGACATGCTGTATCAAGGTTGCTGCAATGAGAACTATCGCTGGCTGATAAAGAATATCCCAGCTGATTATATCATGCACTTTAAGAGCTTCATCTACGCTTCCACAATCAATGAGCGTAGCTTTGACGTTCAGAAGCAGCTGCCTGATGGAATGGCGCACCGTGCCATAGATGCTGATGTGGACACACTGATATGCGTGGAGCAGATGCCTGCCCACGTACAATTCTTGTACACAGCATTTGTGAGGTATTGGTGCCGCAGAAAGATGGAACAGCCTAGGCAATCCTGGGTGGTAGTTTGCTACCACAGTATTGTGGATTATATCAAGAATGCTTGGTATGATTTACCGTACATCTTGAGAGTTCTGATTAAGGCTGGCCTTATTTTAATTGCACTCAATGGTGCATTTGGGGCTGTCACAGCATTCTGCGCTTGTTGGCAATCCAACACTTTCCCTTCAGCAGAAGGAAGAGGAGGGATTACCAACGAGTCAAATAGCATCTCCAGCCGGAAGAACAAGGGAAAGAGCATCTTTGCTCGATCTTTGCTGGCACAAGCCAAGGGTGATATGCTGGAGAAATGGGCAAGTGATGATGGCTTCATCAATGAAGGATTGAAGAAAAACCTAGTCGTCTTGAGACTAGGTGAAGGTGTCTACTTCAGAGGCACCTATGTCTGCTCGGGCTGGGTGATGACGGTGGCTCATGCTTTTTCAAGCCTCCGTGATGGCACAACTTTCTCAATAATACATGCCCAGTCAATTTCCAAGGTGCAATACAATGCCAAAACTGCACGGTTCTTGAAGGAGCAAGATATTGTCCTGCYCAATGTTGGAAACCCCGATGGTCCCAAGCCTGATATTCGCAAACACTTTCCTGTACGGGATGGTGTTTGTTTTTCTAAGGGCACTCAAGGGGTATGTGTGAGAGCAGTAGCATCAAAGGATGCTTCGCAAGGAAATCTTGAGTACTTGCGTTTTAATGTGATGATGTCCAAGGGTTACCTTGAAAAGGTAACGTACCAGATGGACTCCAGTTCCTTTAAACTGGAGTCTCAAGCATCTTATGAGTATCACATGAATGGTGAAAATGGTGATTGTGGTACTCTTCTTCTTTTGCCCAACGTGCAAGACAAGCAACCATGCATTGTGGGTATTCATTGTGCTTCTTATGATGAAGAAGCTGCGCACAAAGGGTTCGTAGCATCCAATGCTACAGCTATTTTCCGAGATCAGTTGGAAGATCTTCCGACTGGTCCGGTTAAAGTAGCAATGGTAAGGTGCCAGCTTCTTAAGGATCTACGAGCCAGGGATGCGGCTCTTTTTGAAGAAAAACAGGTGGCTTTTGTTGGCACATTGCCAGCTGAACAAGCAGCCACGGTTCCCCACAAAACAACGCTGCGAAGGAGTGGCTTGTTTGAAGCTTTTGGGCCTGCAGAAACTGCTCCATCTATCATTTCAGCTTCAGACAAACGTGGGGAAGGTTTTGATCCGTATGTGGCTGGCATACAAAAATACAATGAAACAGCACAAAATTTTGATGAGGACATTGCGAGGCTAGCCTATGAAGGGCTACGCCAAGCAATTTTGCCTGTGCTGCACTCCCAGCGAGTTCCTTTTGGAAAGCCCGTCACACAGAATGAAGATGTGGTGCTCAATGGTGTTGATGGGYTTGACTATTTTGATGGGATGGAGTTGAGTACCTCTTGCGGGTATCCGTACAACAAGTTGGGTATGGGCACTAGCAAGAGAGAGTTTGTGGAGCCAAGTGGAGATGGAGATCGAGTCCAACTCAAAAGGACCACTCCAATTTTTGATGATTGGGAGGCTTTGGATGTGGAAATTCGCAAAGGAAACTTTGTGGAACTGGTCACCACCCAATGTGCCAAAGATGAGCGCTTGCCGCTGGAAAAAGTTTTTGGGAAGCGGAAAACCCGTTTGTTTGAAATTCTTCCTTTCCATTACAATATGTTGGTTAGGAAGTATTTCCTGGATTTTTCCGCCAGTCTGATGGCATCCCACAATGCTCTGCCATGCAAGGTGGGCATTAATCCTGGAGGTATTGAATGGACTCTGTTGGCCAATGGCTTCAGAGCAGTCTCTGATACAGGATTTTCTGCTGACTATTCCAGTTTTGATGGGAGAGCTCCCATCTTTGCCTTTCAATGGTTTTGTGATCTTGTGGATGACTACTATGGATCACCTCCTGGTTCTCCAGACTCCAATGCCAGACATGTGCTTCTTATGATGGCTTCATGCCATTATACTATTTGTGAGAACAAGGTTTTTAGGTTGGTGGGAGGTATGCCTTCAGGATTTGCACTCACCGTTATCTTCAACTCTCTTCTCAATGAGTTTTATATGCGCTATGCATTTATTTCTCTATTGAGAAGACCACATATAGCAGCTCAAGCTATAGGGTGCAAACCCTCTGATTTCAACAAGCTATTTGTGGCAGTCTATGGTGATGACAATCTAGTTGCAGTTCCCATGGAATTGCATTGGTATACTCTGCCAGCTATTGCCCAAGAATTGGAGATGGTGAATGTTATTATAAAGAATGGCATCGACAAGAACATGGATGTTAGCAGTTCCAAAATGCTAGACTTGTCTGAGCTAACATTTCTAAGCAGAGGTTTTAAGAGGCACCGTCTAGGATACGTTCAAGCTCCTCTGAAATGGGTATCTATCATAGAACCAATGTACTGGATAAGGCCTTCTGTTGATTGTCCCGATGCTCTCGCTATGTTGGAAAACATAGACACGGGAGTTAGAGAGGCATTTCACCATGGGCCTCAGGTTTTTGAAAAGTTGGTGACAGATGTTCAAAACGCTCTCAAGGAGCGGTGTTTCCCAGCCACCACATTTCCT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KJ940974.1
Tomato torrado virus
Wieczorek,P., Budziszewska,M., Obrepalska-Steplowska,A.
Plant Protection Institute- National Research Institute, Interdepartmental Laboratory of Molecular Biology
Poland
2014-12-03
Kra
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
Secoviridae
ssRNA(+)
5,404
GenBank
1
Poland
Poland
Solanum lycopersicum
null
null
null
null
Tomato torrado virus isolate Kra segment RNA2, complete sequence
TTTAAAAGAATAATTTTATACAATATTTATGTGATCCAAGCCATCACGGAACCTACGTCGTTCCTAAGATATTGTATCAATTATCTTTGCTGTTACCATTTTGAGTGCACCGTCAACTGAAGGAACCTACGCCGTTCCCGAGGACAGTGTATCTTTTGTTATTTATTTTGGTTACATCTCTATGTCATTTATTTCTCGTTTGAATACATCTCTTGAAGAGGAGGCATTTCACAAGCAAGTTGCAGACTCTCAGTGGGTGTGTTCGGTTGATACAGGCTCTGGCATAATAAACAGTGATCCAACTCTAGACTTCAAAATTTGTCCCAAGACAGGTGGAGCAATTTCTGTTCTATCTGTTTCGTGGCAAAACAATAGCCCTCAACTGGTTCCTGGTCATTATCTACTGCGAAGTGGAACTTGGCCAATTACTGGTGTTAAGCTATCTGGCTTACTAGTTCATAGATCAATTCGTTTGGAAACCACCAGGAAACTTCTAGAAGCTCAGAGGATTTCTGTATCCCAGCAAGCATCTTCTTCCTCCGCTGCTGGTGCTGCAGGAAAACAACCACAAGTAACGCTTACACAGTTACAAGAGGAGCTTGACGAGGCCAAAACTCGCTTAGCTCTCAAAGAGAAAGAGTTACTTGAAGCTCTATCCGAAATATCCAAATTAAGATTGCAATTGTCCAACCAACCAAGTAATGATGATGTCTTCAGTGGCTGGACAGAGGAGGGGCCCAAGTGATAAAAGTGCAGCTGTATCTGAGCAATTAATTGCTCAGATTACAGCTGCAGTCGAAGCAGGCAACAAAAACCTGCTTCGCAAACTGGGCGTGGGTTCATTTGGGATTCTCTATGGCGCCCAAGAGAAGAAAGCCATGGAACTGTTTGACCCTGAGGATGTACATAATATAACCCCATTGTGGTCTTCATTTAAGAAAACTTTCACTTCCTCGAGGGATCATGGAAATCTATTCTTCCATTTGTATGGAGTTATGTTTTTCATGGTTCCTCATGTACATGGTGGGGAAGGTAGTGTAAAAATTAGTTTATGTTCAAGTAATGATCCAACCAATCCTGTTCTACAGGAGAAGGTTTTGTATTTTTCCGGGGGGGCACAGGCAGTGTTAATGAGTCCGACCATTACACTACCTTTTGTTAAAAGAGGCCCCATGTTCTACTACACAATGGAGTGCCTTGGCACTCGGGCTCAAATTCCTTGCTCAGTAGTGGCCATTTGGAAACAAAAGATTGATATCCGTAGTGCCATTTACTCAAAGCAGGAAACAATGTCTTGGGCTATTGAGGCTCTTCACCGACCTCAATTTTTCCAGGACAGACAGGAGGCAGCACAGTACATATCATCAGTATATTCTAATGCTACCTCCTCAGCAACTGATTCAGTGCTTCCGTTTGTGGGAGCACAGCTTGGCGACACAAAGATGAATGTGCCAAGCGAAGCAAGAATGATCCGGTCCTCCTCGCTCCGGGTGCCCATGCTCAAGGTGCAGAGTAAGCGGTTTTCCTCAATGGAAATACCATCTACCTCAACTGCACACCTCCTTGGCACAACGCGTGATGAAACTGTAATACAGGAGGAAAGTAGGCACGAAGAGGAGGGTGATGATGGGGTTTTGTTCCCCGTTAAAAAGGCTCAAGGTCTGAACTATTCCCATGTGTGGGATAATCTTGATATTGAGTCCTTTGTAGATGTTGAGCTGCCCGAAAACTGGGATGAGCTGTCGGTGAGACAGCAAGTTGCTGCAGCAATGATAGCATTTGCAAACAAGGGTGTTTGCTTGGTCCCAAAACATATAATCAACCGGGACAAGCACAATATCCACTTGGAGAATATCACCGAGCACAACTACTTGGTGATACTGGAAAGGTACGGCATTGTGAATGCCGGCTCTCTGGCCAGAACTGAAAACTGGTACAATCTTACCTTGGCACAGAGAGTGGAAGAACTGATTTATCAAAGGGACGATGCATACTTCATGTTTGGTGATAACACCAACCCGTATCCTCCCTTTGATTGTTATGATGGCTTAACGCTCAAAGTTCGCAGTGAGCTAGAGCGTGTGGCAAAGGAGCAGGCGCGCCAAAGATTCTACAAGGAGGCGGCCAAGGCTCAGGTGAAAAACAAGGTGGCCCAAACTAGTGTGGAAGAAATACCATCCACCTCATTTGCCACAAAGGTTGCCATGGAGAGTGGCAGTGTGGATAGCATGAAAATTGCTATTCAAGCTGAAGCTGCCAATGAAGCTGTAAGGCCCAATGAAGTTATGTTTGAATTTGGGCAAGAAATGAATAATGAAGGTGTGACAGAACTGGAATTACAACAACCAGCCTGCGTGGCCAGTAACTCCTTCTTCAATGTTGGAGTTTTTGAATTTGCATGGAAGAAAAGCAGTTCTGTTGCTGCTGAGGTGCTATCACTGGCGCTCCCTGCGGCTCTCTTTGGTAAATCCAAGGAGATGTCAATGGGATCGCAAATGCTAAAGTATTATGATGCCGCATTAATTATGTACAAGGTCATCTTGTATATTTCCGGCATGGGTGCAATTTCGGGTCAGCTGGCCCTGGTTTGGGATGAGTGCAATGTGCTCAACAGAAAGAAGGAGTTCATCAACATTGCCTCTCTGTATGCCAGCAAACATAGGCTGGTTTCAGCATCTGAACAGAGTAGTGGGGAATTTTGTTTTACACCTACGGGTATCGGCAAATTCGTTCCACTTGATCCAGCCTCGGGGGCTTATGATCTGGGTAGCATACGGGTGTTTGTGACGCACCCCTTGGCTAGTGCTACTGAATTGGAGAGCATACCTTGTCACATCCATCTGCAGTGTAAAGTGTTGTCGACCAACATCATGCAGCCTCCTCGTTTGCGAGCACAAGCACAATTTGGTATGAAACCAGACCAGACACACTTTCCACGATTTCCAACAAATCAGGTACTGTTACACTACAATTGGGGGGTGGCTGCTAGCATGGGTACTACCCTAGTTAGCATCTTCTCTCCGTCAGGCATATATGAAAGTGACGGTACGCTGCAACCATCCTTGCTTGGAAACATAGCACGCAATTGCAAATGGTGGACTGGCACTTGCGTGTTTGAGATTTGTATTGAAAAGACTCAGTTCCATTCTGGTAGTTTGGCCATTGGACTGGGTACACTGAACACAAGCATGTCCACCCCTCATGACATTTTAAATATGCCGCATGTTATTTGTAACCTTGAGATGGGACGAAAGTTCTATTTCAGGTGTACGATAACCAATTGGAATGGGAAAAATCTTTTGACCACTGGTCGGAAGAGTTCTCTACCGCGGCCCAAGCATATGTCTCACATGAGGTTGTTTGCTACAGTCTTGAAACCCCTGGTATCAACTTCAATACATCTAGATACGGTCGGGGTAACAGTGCAGCTTAAATGCATAGAAGATTTGGTCCTTGGGGGCACTGTGTCTGTTAAACCCATTTACGGACACTGGACTAAAGGAAAGAATGCTGTGGACTTCCTGTTCTCTGAGATGGACTTGTCTCAGCGTAAAGAAATTGAGAAATTACGCAAGGAAAACGTTGAGACATTTGATGAGAAAGGAAAGAAGCAGCCACAGGTACAAGTGCCGCTCAGGGACAAGTTTTCATATGGGGCTGTACAATATTTTGTGATGAATTGGAAGGACGAAGAGCGACTGTTGGTTTTACCATGCGCACCTTGGTCCGTAAGATTCCCTCAGGGGGCACTGGTACAGGAGGCCATCACATGCCCATTCATTGATTGGTGCTCTTCCTTTTGTTATTGGTCTGGAAGTCTTGAATACACCATTATTGTACATAGAGTGCAGACTTCCAATAACATAGGAGGAGTGCTGAACATCACCTTAGATTCATCAGGGTACCCTTTTCCTCTTGGAATCTCAAAGGGCGCCTATGTTGTCTCTGCTGGTGGAGGAGCAAAATGGGCTTTCACTTATGGTGTGAGCGACAACATCTTTTCTTTTGTGGTGCATGATGATGAGTTTTTCCCTAGGCGCCATACCAAAGCCAGAGCAGTAGATCCAAATGCTTCAAGAATAATGACTCTGCAAGATCGTCTAGGAAATCTCATAATAAATTTACCAGCCAAAGATGTGATAAGCTCTCTGGAAATCTTGGTCAAGCCAGGACCTGATTTCAAATTGCAACTGGCTCAAGCTCCTTCAGCAAATCATGAGAAGCATTTGGGTGATATGCAAACGCATACCTACCTTTATACTCCTGATTTTTCAGAACTAAGGAGTTTTGAAAATTAACTATCCTGTACGTGATATAGGAGCCGTGAGTCCGGCAAGTGACTCATCATGTGCAGTTAACATGTGTACTGTGAATAATGTTAACTGTAAGGATAGTTAATTTTAACGGAGAGTACTGACTTTAACTAGTTGGGAGTCCGGCTCCATTTGGAGTACCAATGAATCTACATTGGTTAAAGAGATTTGCACGCCTCTCTTTAAATATGGATCGTGTACCCTGCTTGGTTAGAAAGTACCTTTACTTAGGTTTACAAAGTACGGGGAGCACTCCCTGGTTAACATAGTGCAGGTGCTATCCCATGATAGTCCTTTAACTCAAGGGTTGAGTTCGGTTTGCATCTTTTGCCGTGATGAAAGATGAGGTAGCTTCCCCCTTATTGGGAGGCTGAAACTACACATATGTAGTGGGTTTGACTGAGTCCTATAATCAGTCCGTTTGAAATTCGATAATTTTCCGTAGCTTGCGTCAAGCTGCTCACGTTAGGGGCGTGAGTGAAGATGCGCCGTACCACGTCTTCCCCGGCAATGCCAGTGGTTCAGAGCGGGCCCTCAGAATAGAGGTTAAAACTAGTGTGATGGTGTATATCACGATAAAAAGTGACACCCGGGTTGTGCTGCGCCTAGTTAACACGAGCACAGGTCCCACCCTATAGTGGAAGAAACTTGGTTGAGTTTTAAAAGAACAACCCGTTTGAGCGACGA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KJ940975.1
Tomato torrado virus
Wieczorek,P., Budziszewska,M., Obrepalska-Steplowska,A.
Plant Protection Institute- National Research Institute, Interdepartmental Laboratory of Molecular Biology
Poland
2014-12-03
Kra
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
Secoviridae
ssRNA(+)
7,817
GenBank
1
Poland
Poland
Solanum lycopersicum
null
null
null
null
Tomato torrado virus isolate Kra segment RNA1, complete sequence
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88,615
EU563947.1
Tomato torrado virus
Budziszewska,M., Obrepalska-Steplowska,A., Wieczorek,P., Pospieszny,H.
Institiute of Plant Protection, Interdepartmental Laboratory of Molecular Biology
Poland
2008-10-11
Wal'03
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
Secoviridae
ssRNA(+)
5,404
GenBank
1
Poland
Poland
Solanum lycopersicum
null
null
null
null
Tomato torrado virus isolate Wal'03 segment RNA2, complete sequence
TTTAAAAGAATAATTTTATACAATATTTATGTGATCCAAGCCATCACGGAACCTACGTCGTTCCTAAGATATTGTATCAATTATCTTTGCTGTTACCATTTTGAGTGCACCGTCAACTGAAGGAACCTACGCCGTTCCCAAGGACAGTGTATCTTTTGTTATTTATTTTGGTTACATCTCTATGTCATTTATTTCTCGTTTGAATACATCTCTTGAAGAGGAGGCATTTCACAAGCAAGTTGCAGACTCTCAGTGGGTGTGTTCGGTTGATACAGGCTCTGGCATAATAAACAGTGATCCAACTCTAGACTTCAAGATTTGTCCCAAGACAGGTGGAGCAATTTCTGTTCTATCTGTTTCGTGGCAAAACAATAGCCCTCAACTGGTTCCTGGCCATTATCTACTGCGAAGTGGAACTTGGCCAATTACTGGTGTTAAGCTATCTGGCTTACTAGTTCATAGATCAATTCGTTTGGAAACCACCAGGAAACTTTTAGAAGCTCAGAGGATTTCTGTATCCCAGCAAGCATCTTCTTCCTCCGCTGCTGGTGCTGCAGGAAAACAACCACAAGTAACGCTTACACAGTTACAAGAGGAGCTTGACGAGGCCAAAACTCGCTTAGCTCTCAAAGAGAAAGAGTTACTTGAAGCTCTATCCGAAATATCCAAATTAAGATTGCAATTGTCCAACCAACCAAGTAATGATGATGTCTTCAGTGGCTGGACAGAGGAGGGGCCCAAGTGATAAAAGTGCAGCTGTATCTGAGCAATTAATTGCTCAGATTACAGCTGCAGTCGAAGCAGGCAACAAAAACCTGCTTCGCAAACTGGGCATGGGTTCATTTGGGATTCTCTATGGCGCCCAAGAGAAGAAAGCCATGGAGCTGTTTGACCCTGAGGATGTACATAATATAACCTCATTGTGGTCTTCGTTTAAGAAAACTTTCACTTCCTCGAGGGATCATGGAAATCTATTCTTCCATTTGTATGGAGTTATGTTTTTCATGGTTCCTCATGTACATGGTGGGGAAGGTAGTGTAAAAATTAGTTTATGTTCCAGTAATGATCCAACCAATCCTGTTCTGCAGGAGAAGGTTTTGTATTTTTCCGGGGGGGCACAGGCAGTGTTAATGAGTCCGACCATTACACTACCTTTTATTAAAAGAGGCCCCATGTTCTACTACACAATGGAGTGCCTTGGCACTCGGGCTCAAATTCCTTGCTCAGTAGTGGCCATTTGGAAACAAAAGATTGATATCCGTAGTGCCATTTACTCAAAGCAAGAAACAATGTCTTGGGCTATTGAGGCTCTTCACCGACCTCAATTTTTCCAAGACAGACAGGAGGCAGCACAGTACATATCATCAGTATATTCTAATGCTACCTCCTCAGCAACTGATTCAGTGCTTCCGTTTGTGGGAGCACAGCTTGGCGACACAAAGATGAATGTGCCAAGCGAAGCAAGAATGATCCGGTCCTCCTCGCTCCGGGTGCCCATGCTCAAGGTGCAGAGTAAGCGGTTTTCCTCAATGGAAATACCATCTACCTCAACTGCACACCTCCTTGGCACAACGCGTGATGAAACTGTAATACAGGAGGAAAGTAGGCACGAAGAGGAGGGTGATGATGGGGTTTTGTTCCCCGTTAAAAAGGCTCAAGGTCTGAACTATTCCCATGTGTGGGATAATCTTGGTATTGAGTCCTTTGTAGATGTTGAGCTGCCCGAAAACTGGGATGAGCTGTCGGTGAGACAGCAAGTTGCTGCAGCAATGATAGCATTTGCAAACAAGGGTGTTTGCTTGGTCCCAAAACATATAATCAACCGGGACAAGCACAATATCCACTTGGAGAATATCACCGAGAATCACTACTTGGTGATACTGGAAAGGTACGGCATTGTGAATGCCGGCTCTCTGGCCAGAACTGAAAACTGGTACAATCTTACCTTGGCACAGAGAGTGGAAGAACTGATTTATCAAAGGGACGATGCATACTTCATGCTTGGTGATAATACCAACCCATATCCTCCCTTTGATTGTTATGATGGCTTAACGCTCAAAGTTCGCAGTGAGCTAGAGCGTGTGGCAAAGGAGCAGGCGCGCCAAAGATTTTACAAGGAGGCGGCCAAGGCTCAGGTGAAAAACAAGGTGGCCCAAACTAGTGTGGAAGAAATACCATCCACCTCATTCGCCACAAAGGTTGCCATGGAGAGTGGCAGTGTGGATAGCATGAAAATTGCTATTCAAGCTGAAGCTGCCAATGAAGCTGTAAGGCCCAATGAAGTTATGTTTGAATTTGGGCAAGAAATGAATAATGAAGGTGCGACGGAGCTGGAATTACAACAACCAGCCTGCGTGGCCAGTAACTCCTTCTTCAATGTTGGAGTTTTTGAGTTTGCATGGAAGAAAAGCAGTTCTGTTGCTGCTGAGGTGCTATCACTGGCGCTCCCTGCGGCTCTCTTTGGTAAATCCAAGGAGATGTCAATGGGATCGCAAATGTTAAAGTATTATGATGCCGCATTAATTATGTACAAGGTCATCTTGTATATTTCCGGCATGGGTGCAATTTCGGGTCAGCTGGCCCTGGTTTGGGATGAGTGCAATGTGCTCAACAGAAAGAAGGAGTTCATCAACATTGCCTCTCTGTATGCCAGCAAACATAGGCTGGTTTCAGCATCTGAACAGAGTAGTGGGGAATTTTGTTTTACACCTACGGGTATCGGCAAATTCGTTCCACTTGATCCAGCCTCGGGGGCTTATGATCTGGGTAGCATACGGGTGTTTGTGACGCACCCCTTGGCTAGTGCTACTGAATTGGAGAGCATACCTTGTCACATCCATCTGCAGTGTAAAGTGTTGTCGACCAACATCATGCAGCCTCCTCGTTTGCGAGCACAGGCACAATTTGGTATGAAACCAGACCAGACACACTTTCCACGATTTCCAACAAATCAGGTACTGTTACACTACAATTGGGGAGTGGCTGCTAGCATGGGTACTACCCTAGTTAGCATCTTCTCTCCGTCAGGCATATATGAAAGTGACGGTACGCTGCAACCATCCTTGCTTGGAAACATAGCACGCAATTGCAAATGGTGGACTGGCACTTGCGTGTTTGAGATTTGCATTGAAAAGACTCAGTTCCATTCTGGTAGTTTGGCCATTGGACTGGGTACACTGAACACAAGCATGTCCACCCCTCATGACATTTTAAATATGCCGCATGTTATTTGTAACCTTGAGATGGGACGAAAGTTCTATTTCAGGTGTACGATAACCAATTGGAATGGGAAAAATCTTTTGACCACTGGTCGGAAGAGTTCTCTACCGCGGCCCAAGCATATGTCTCACATGAGGTTGTTTGCTACAGTCTTGAAACCCCTGGTATCAACTTCAATACATCTAGATACGGTCGGGGTAACAGTGCAGCTTAAATGCATAGAAGATTTGGTCCTTGGGGGCACTGTGTCTGTTAAACCCATTTACGGACACTGGACTAAAGGAAAGAATGCTGTGGACTTCCTATTCTCTGAGATGGACTTGTCTCAGCGTAAAGAAATTGAGAAATTACGCAAGGAAAACGTTGAGACATTTGATGAGAAAGGAAAGAAGCAGCCACAGGTACAAGTGCCGCTCAGGGACAAGTTTTCATATGGGGCTGTACAATATTTTGTGATGAATTGGAAGGACGAAGAGCGACTGTTGGTATTACCATGCGCACCTTGGTCCGTAAGATTCCCTCAGGGGGCACTGGTACAGGAGGCCATCACATGCCCATTCATTGATTGGTGCTCTTCCTTTTGTTATTGGTCAGGAAGTCTTGAATACACCATTATTGTACATAGAGTGCAGACTTCCAATAACATAGGAGGAGTGCTGAACATCACCTTAGATTCATCAGGGTACCCTTTTCCTCTTGGAATCTCAAAGGGCGCCTATGTTGTCTCTGCTGGTGGAGGAGCAAAATGGGCTTTCACTTATGGTATGAGCGACAACATCTTTTCTTTTGTGGTGCATGATGATGAGTTTTTCCCCAGACGCCATACCAAAGCCAGAGCAGTAGATCCAAATGCTTCAAGAATAATGACTCTGCAAGATCGTCTAGGAAATCTCATAATAAATTTACCAGCCAAAGATGTGATAAGCTCTCTGGAGATCTTGGTCAAGCCAGGGCCTGATTTCAAATTGCAACTGGCTCAAGCTCCTTCAGCAAATCATGAGAAGCATTTGGGTGATATGCAAACGCATACCTACCTTTATACTCCTGATTTTTCAGAACTAAGGAGTTTTGAAAATTAACTATCCTGTACGTGATATAGGAGCCGTGAGTCCGGCATGTGACTCATCATGTGCAGTTAACATGTGTACTGTGAATAATGTTAACTGTAAGGATAGTTAATTTTAACGGAGAGTACTGACTTTAACTAGTTGGGAGTCCGGCTCCATTTGGAGTACCAATGAATCTACATTGGTTAAAGAGATTTGCACGCCTCTCTTTAAATATGGATCGTGTACCCTGCTTGGTTAGAAAGTACCTTTACTTAGGTTTACAAAGTACGGGGAGCACTCCCTGGTTAACATAGTGCAGGTGCTATCCCATGATAGTCCTTTAACTCAAGGGTTGAGTTCGGTTTGCATCTTTTGCCGTGATGAAAGATGAGGTAGCTTCCCCCTTATTGGGAGGCTGAAACTACACATATGTAGTGGGTTTGACTGAGTCCTATAATCAGTCCGTTTGAAATTCGATAATTTTCCGTAGCTTGCGTCAAGCTGCTCACGTTAGGGGCGTGAGTGAAGATGCGCCGTACCACGTCTTCCCCGGCAATGCCAGTGGTTCAGAGCGGGCCCTCAGAATAGAGGTTAAAACTAGTGTGATGGTGTATATCACGATAAAAAGTGACACCCGGGTTGTGCTGCGCCTAGTTAACACGAGCACAGGTCCCACCCTATAGTGGAAGAAACTTGGTTGAGTTTTAAAAGAACAACCCGTTTGAGCGACGA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104,617
EU563948.1
Tomato torrado virus
Budziszewska,M., Obrepalska-Steplowska,A., Wieczorek,P., Pospieszny,H.
Institiute of Plant Protection, Interdepartmental Laboratory of Molecular Biology
Poland
2008-10-11
Wal'03
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
Secoviridae
ssRNA(+)
7,829
GenBank
1
Poland
Poland
Solanum lycopersicum
null
null
null
null
Tomato torrado virus isolate Wal'03 segment RNA1, complete sequence
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104,618
DQ388879.1
Tomato torrado virus
Van den Heuvel,J.F.J.M., Maris,P.C., Verbeek,M., Dullemans,A.M., Van der Vlugt,R.A.A., van den Heuvel,J.F., van der Vlugt,R.A.
Plant Research International, Biointeractions and Plant Health
Netherlands
2006-12-31
PRI-ToTV0301
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
Secoviridae
ssRNA(+)
7,808
GenBank
1
Spain
Spain
null
null
2003
null
null
Tomato torrado virus segment RNA1, complete sequence
TTAAAAGAGTTATTTTGAGAATATAACCTACGTCGTTATTCACAGACCAAGTCTCTGTTAATCAAAATCTCCCTTTAAAACTCATTCTACTTTTACATTTGGCAACATGTCTTTTTCCAAGATGTTCCCCGGTTTCAACTCAGTTACTGAAAAGTGCGCTACCAGCTCCTCTGGTTCTTTCTTTTCAGAGCTTACTGCTAGTATTAGTAATTTCTCCCGCACTCTGTCCAATGTTACCAAGGTTTCATCTCAAATTTCTTCTCACATTGAAGATTTGAAGCCTTCAGTTACAGATGCTGCTTCTTCCTTTACCAGCACCTGTAACTCTGTTACTAAATTGTTAGATAAGATAATGACTTTAATTGAACCCTTCATCAAGGCTTACTCTTTTGTCGCATCCATGTACAAATCAATTTGTGATATGGTTGCAAAGATTGTTGCAAGCATCAAAGATAAGTTCACACTTGGTTTTAACTGGGTGTTGGACAAATCTGAGGATGTGGATGTTTTAGTTATAGCTTTTCTTATTTTTGCAATTTCTATGTTAATAATTGTTTTCATTTGTCCAAGTAGTGTACTAGATGGAGTTGTACAGATGACTCACATAGTTTTTAATACAGTAGGTAACTTCTTTTCAGCTTTGTACAAATTAGACTGGTTACCGACATGGTCCCAAAAGTTTTCAATGATGGCACAAGCCAATGTTCTACCAGGGGAATCCATGTCACACTCACCACTTTCACAAGTGGTAGCATCCCTCATAGCCTTTGGGATTTCTACCCTTGTGTTCGTGGCTGTACCTGGTAGACCCAATGGTCTATCCAACCCGCTATCAAAAATTCTGTACTCAGCGGGAAGTGGTGCTCAACAGTGCAATCAATTGTTTACCCTGTTCAGGAATATGAAAGATTGTACTTCCCAGGCCTTTTCCTGGGTTCTGGAAATAATAGTAGACATTTTTGGTTTTAAGAATCCAGTTTTGTCTGCTATTAGTGCCACATTGTCTACGGACTTATTCACGTGGATGGAAGAGGTGGATGCAGTGTGTGATCCAGCACATCGCTTGGAAAATTTTGCAAACCCTGCATTCACTATCAAGCTCCAACATCTAAGGGAGCAGGCTCTTAAAATCTCTGCTTACATTGCTACACATCCTGTAGCAGCCTTTATGAGCCACAGGGTAACGGCAGCAATARCCCATCTTGATAAGATATATGGGGAGAACTGCCAGCACACTGGCGTGGGCCAATACAGGGCAGAACCTTTTATGGTTCAATGGTATGGTGCCAGTGGTTGTGGGAAATCCACCAGCATGCGGCTGTTCATCAATGATGTTTTGGACCGCATGGAAGAGCCAAAGTTGAACAGGCTCTATGCTGTGAGTAAGCGAGATGCTTACTGGTCAAATTATGCCCATCAAACTGCTATCCTGATGGATGACATGGGCGCTCTGAGAGATGGGGCAGGGCAATGCCAGGACATTAAGGATTTGATAGATATCAAGTCCACTCAACCAGCCCCCTTGCCCATGGCAGCAGTGGAGGATAAAGGCCGCCACTTTACCTCCCGATATATATTTGCCACATCCAACCTTATCTCAGCTCCTGCTCAGTGTGGTCTAACCTACCCCGATGCTTTTGAGAGAAGACGGGATGTTCTTGTGGAGTGCAGGAAGGTGGGTGAGTTTAACACTGATGCTCCCACTTCTCACCTTGAATTTGATGTGGTTGAGAGCAAAAGACCCCATGCAATAACACACAGGGGTTTGAGCTATGATGATTTGCTGGAATATGTGGTTGCCAAGTGCAAGGTTCATGCAGAAATCTCAGGAAAACTGTATGGCGCCACATCAGGCAAGGTGGCACAGGTTGATGTGTCACCTGAGGAAATAATAGCATCCATGGATATGTTGAATATCCAAGATACCAAGCAGGATGCTAAGCTTCCCGTGGTTGTTGTAAGTGAAGAGGATAGGGTGGCCTACTCYCAGGAGTTGACAGTGGAAGCTTTGAAATATGCTTATCAGGGTAGTCTGAATCCCGCAGCATATTTCCCTCATGACATGCACAAACAGGCCATATTTGATGTGCTAAGTGAATCCGCCAAAGAAACATTCACCAGGTGGGTTAATGACATGCTGTATCAAGGTTGCTGTAATGAGAACTATCGCTGGCTGATAAAGAATATCCCAGCTGATTATATCATGCACTTTAAGAGCTTCATCTACGCTTCCACAATCAATGAGCGTAGCTTTGACGTTCAGAAGCAGCTGCCTGATGGAATGGCGCACCGTGCCATAGATGCTGATGTGGACACACTGATATGCGTGGAGCAGATGCCTGCCCACGTACAATTCTTGTACACAGCATTTGTGAGGTATTGGTGCCGCAGAAAGATGGAACAGCCTAGGCAATCCTGGGTGGTAGTTTGCTACCACAGTATTGTGGATTATATCAAGAATGCTTGGTATGATTTACCGTACATCTTGAGAGTTCTGATTAAGGCTGGCCTTATTTTAATTGCACTCAATGGTGCATTTGGGGCTGTCACAGCATTCTGTGCTTGTTGGCAATCCAACACTTTCCCTTCAGCAGAAGGAAGAGGAGGGATTACCAACGAGTCAAATAGCATCTCCAGCCGGAAGAACAAGGGAAAGAGCATCTTTGCTCGATCTTTGCTGGCACAAGCCAAGGGTGATATGCTGGAGAAATGGGCAAGTGATGATGGCTTCATCAATGAAGGATTGAAGAAAAACCTAGTCGTCTTGAGACTAGGTGAAGGTGTCTACTTCAGAGGCACCTATGTCTGCTCGGGCTGGGTGATGACAGTGGCTCATGCTTTTTCAAGCCTCCGTGATGGCACAACTTTCTCAATAATACATGCCCAGTCAATTTCCAAGGTGCAATACAATGCCAAAACTGCACGGTTCTTGAAGGAGCAAGATATTGTCCTGCTCAATGTTGGAAACCCCGATGGTCCCAAGCCTGATATTCGCAAACACTTTCCTGTACGGGATGGTGTTTGTTTTTCTAAGGGCACTCAAGGGGTATGTGTGAGAGCAGTAGCATCAAAGGATGCTTCGCAAGGAAATCTTGAGTACTTGCGTTTTAATGTGATGATGTCCAAGGGTTACCTTGAAAAGGTAACGTACCAGATGGACTCTAGTTCCTTTAAACTGGAGTCTCAAGCATCTTATGAGTATCACATGAATGGTGAAAATGGTGATTGTGGTACTCTTCTTCTTTTGCCCAACGTGCAAGACAAACAACCATGCATTGTGGGTATTCATTGTGCTTCTTATGATGAAGAAGCTGCGCACAAAGGGTTTGTAGCATCCAATGCTACAGCTATTTTCCGAGATCAGTTGGAAGATCTTCCGACTGGTCCGGTTAAAGTAGCAATGGTAAGGTGCCAGCTCCTTAAGGATCTACGAGCCAGGGATGCGGCTCTTTTTGAAGAAAAACAGGTGGCTTTTGTTGGCACATTGCCAGCTGAACAAGCAGCCACGGTTCCCCACAAAACAACGCTGCGAAGGAGTGGCTTGTTTGAAGCTTTTGGGCCTGCAGAAACTGCTCCATCTATCATTTCAGCTTCAGACAAACGTGGGGAAGGTTTTGATCCGTACGTGGCTGGCATACAAAAATACAATGAAACAGCACAAAATTTTGATGAGGACATTGCGAGGCTAGCCTATGAAGGGCTACGTCAAGCAATTTTGCCTGTGCTGCACTCCCAGCGAGTTCCTTTTGGAAAGCCCGTCACACAGAATGAAGATGTGGTGCTCAATGGTGTTGATGGGTTTGACTATTTTGACGGGATGGAGTTGAGTACCTCTTGCGGGTATCCGTACAACAAGTTGGGTATGGGCACTAGCAAGAGAGAGTTTGTGGAGCCAAGTGGAGATGGAGATCGAGTCCAACTCAAAAGGACCACTCCAATTTTTGATGACTGGGAGGCTTTGGATGTGGAAATTCGCAAAGGAAACTTTGTGGAACTGGTCACCACCCAATGTGCCAAAGATGAGCGCTTGCCGTTGGAAAAGGTTTTTGGGAAGCGGAAAACCCGTTTGTTTGAAATTCTTCCCTTCCATTACAATATGTTGGTTAGGAAGTATTTCCTGGATTTTTCCGCCAGTCTGATGGCATCCCACAATGCTCTGCCATGCAAAGTGGGCATTAATCCTGGAGGTATTGAATGGACTCTGTTGGCTAATGGCTTCAGAGCAGTCTCTGATACAGGATTTTCTGCTGACTATTCCAGTTTTGATGGGAGAGCTCCCATCTTTGCCTTTCAATGGTTTTGTGATCTTGTGGATGACTACTATGGATCACCTCCTGGTTCTCCAGACTCCAATGCCAGACATGTGCTTCTTATGATGGCTTCATGCCATTATACTATTTGTGAGAACAAGGTTTTTAGGTTGGTGGGAGGTATGCCTTCAGGATTTGCACTCACCGTTATCTTCAACTCTCTTCTCAATGAGTTTTATATGCGTTATGCATTTATTTCTCTATTGAGAAGACCACATATAGCAGCTCAAGCTATAGGGTGCAAACCCTCTGATTTCAACAAGCTATTTGTGGCAGTCTATGGTGATGACAATCTAGTTGCAGTTCCCATGGAATTGCATTGGTATACTCTGCCAGCTATTGCCCAAGAATTGGAGATGGTGAATGTTATTATAAAGAATGGCATCGACAAGAACATGGATGTTAGCAGTTCCAAAATGCTAGACTTGTCTGAGCTAACATTTCTAAGCAGAGGTTTTAAGAGGCACCGTCTAGGATACGTTCAAGCTCCTCTGAAATGGGTATCTATCATAGAACCAATGTACTGGATAAGGCCTTCTGTTGGTTGTCCCGATGCTCTCGCTATGTTGGAAAACATAGACACGGGAGTTAGAGAGGCATTTCACCATGGGCCTCAGGTTTTTGAAAAGTTGGTGACAGATGTTCAAAACGCTCTCAAGGAGCGGTGTTTCCCAGCCACCACATTTCCTA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107,518
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Tomato torrado virus
Van den Heuvel,J.F.J.M., Maris,P.C., Verbeek,M., Dullemans,A.M., Van der Vlugt,R.A.A., van den Heuvel,J.F., van der Vlugt,R.A.
Plant Research International, Biointeractions and Plant Health
Netherlands
2006-12-31
PRI-ToTV0301
Torradovirus lycopersici
Torradovirus
Secoviridae
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GenBank
1
Spain
Spain
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2003
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null
Tomato torrado virus segment RNA2, complete sequence
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107,519
NC_034240.1
Tomato yellow mottle-associated virus
Xu,C., Sun,X., Taylor,A., Jiao,C., Xu,Y., Cai,X., Wang,X., Ge,C., Pan,G., Wang,Q., Fei,Z.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2017-04-05
null
Cytorhabdovirus lycopersici
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,389
RefSeq
1
China: Chongqing
China
Solanum lycopersicum
null
2013-06-26
null
PRJNA485481
Tomato yellow mottle-associated virus, complete genome
TTACGGATCATAAAATCCGTAGATGGCAAATTATGTATCAATGTACCAATATATCTAAAACCGAATCAGGCAATAATAATATCTATTTCAGTGGTTCCGTCATTATGTAGTATCAATGTTTCCGTTCCTCTCTACTACTTGTCTTCCCATCTTCTCATGTTAGTGTTTTCATAAATCACGGCTTCACAAGTCTTTATTTATGCATGTTACCTGTTATGCGTAAGTCAGTTCGCCTCATGTTATCATGTTGTTATAGTTTTATTAAATCGCACACGGACTATCGGATCGTCTTTAGCCCTCGAACGACACTTATGTTGTTATCTTATCAGTTCTCCTCTTGCGAGGTGCCTCTCGCCTTAATCTTTCAGACAGAGAAGTTATCGGAAAGCATAATTCCTCTCTGGATCTGGTGCATCTGAACTCTACCTTATTGGAGCAATTCTTGAACAAGAGGCCGTGTTCCTTCATCATTAAATTTAAAGCAGGAACGTACTTTATGACGTCACACGGCGGCTCGTTGATCTCTTCCTTCTCCTCCAGAGACACATCCCACTTGTCCGAATACTTTTTCCAAATCAGTGACCAGTGATGTGACCTGTTAATCATGCTCAGCCTGTCATTTACGTCTGCCATCATAGAGACAGCTATAGCAAATAACTTTCCTCTTAACTCCAGGTAGTCAGACTTATAAAGCTTGTGCGAAGAACTTTCACTTGCTTTAATTGAGAATGGGCGCTTCGTTTTCAATATGTAATAGTAAAGAGAAGTGTATGACCCATTTTTCGGAAGGAGGCTTCCTATTAGATCAAACACTGCCCAAGCTCTAACTCGAGATATCATCTTATAGAGCATCTGTCGATCATGCAGCGAGCTGATCAATGCGTTGTCTTCACCCGAGATGCTATACTCATGACTCTTCAACGCTCTTTCGATGCCGATCCACAAACACTGCACCTTATTGGGTATAGGATACAATATTGTATCAGAAGTCGGCGATACGGCATCATGTAACACCCACCATACTTCCGGATAGTTGTGTGACCTAAATCGAGTTGTTATCAATTCCCATCTCCTCGCCCTGCTAGCCCACATTATCCCGATTTTGTTCGACAATTCTTCGGCACTCCAGATATAATCCTTGATAACAGTTACTGGTCTCCTCCCGCTCAGTGCTATCTTCTTAACAAGCTCGAATCGTGACTCATGATCATCGGGGTTCACCACCTCAGCATCACTGTACAGCACGTCACACGATCTCAACTCCTCTGCCCAATCGGAACTCCATGCTTGATTCCTCACGTCGTTATGTCTGTTCGCAGCTTTTGTTGCATCGATGTTTCCGATCCCGTAAAATTGAGGTACTGGTAAGACATTGTGGGAATACGCATGAGGTATGGCTTCGTCTGGCTCCAACATCGTCGAACTTGTCACTGATTCGGCTCCTAAAGCTGAAAGCACCGTGCTGGATGTGCCTAGTCCGTCTCCTATGCACAAGCATTTTCTTCCTAAGATCTGTATCCCGCACCCTCCAATTATATCTTGCATTTTGTAGGACGTGGATGTAGGCATCGACATTACAGTAGCCAGGTGATACACAGTGAATCCTGATCGCACATCACTCACTATCTCAGGAGGTATCGCTTTATCATTAGACTCAGGCCTAATCCTCAAAGTATCAGAAGACAACAGAGTGATGTTGAAATTGAATTTCTTAGTACTAGAGTTCAGTCGAATTCGATCTGCAGCCCTCTCATTGGATATGTTATCACAGTCTTTTCTTAATCTCTCCACTGTCACATATGACTTTATCCATGGACTTTTCTTCATCCAGTCGGACATCTTATGTCCGTAATGACAGCTGTAGAATGACAATGTTCTCCACACATCACTCAACTCCGATCTTTCGATCATAGATATGCATGCTTTACATCGAGTGGCCTTCTCTAGATCATCAAGAATCAAGAACTTATAGATCAATTTTTCATTCTGTTCATCATGTAATATTATCTCTGATCTCTTCAGCCCAGTGACAATTCGTTTGCTCACTAGAGATATCATACTCGTTCTGACTGACTCGCAGGCAGAGAACACTGATATCGGATTCGTGGCAGGAGGGACCACTTCTGGATATATCCTACTGTAAGCCAAGGACGTCTCTTCCCAACAGAAGAACATAGCTAAGCCTAGAAAACCATGGGTGTCAGCCGAATTCAAGATATCTATCATGACTCTCTCGATCTCATTGTCGCTGGCATCTGTTCTTTCTGGGTGACTCCGCAACACAGTCCACTTCGACACTCTCCTCAACTCCATCATTACTGTATCGACCATGATCCGCGGATCCAATTTAAAATACATAGTACGCTCGTAGGCCTTTACACTTGTCAGCCCGACCGATACATGTGTCTCAGATTTTTGGCCAGTTACTATGTCCTTGATGATCCGGTCGCAGATCGATCGATGCAGAAGGACAGCCTTTCTTCTCCCTGATATATTATCGTAATCCTCGTGGCTCAACTCTCTATCCGATAATTCGTATAAAGGAGAAATCCGCTCCAGGACTCTAATTCTAGATGAGGGAGTGTATAGATACGGGTTGTCCTTGAACGAAGGGATAACACTCAATGCTTTCTCACTAGATAAGTCCACAAAATCTTCTTCAATCGGATGAATACACTCATAGCAACATTGTCTGAAATGCTTGAATCGAGCCACCACCTCTTCACCCCTTATCTTGTTGGACAGATACATATTCGACAGCTCGAGAATGACGCAGAAGGTTGCTTGATAATGAAAGTCGGTGTTTTCTGCTCCCTTAGAATACCTTACCAAACTATCCGTGGAGATATGACACCTAGTAGAGTAAAGATAATTAGAGCTAGACAGCGCCCCTCTGAAAGTGCTCGAGTCTTGATATCTGTGAGCCTCAGATCCGGCAGTCCCTTCCTCCATCCCTTTGAACTTGGACGTCTCCATATCGGTCACCGAGGAGACGCATGCTTCTATGATCTTCGCCATGGAACTATGCTGCGGTACAAACCAATTGATCGTCCGCAGCAGCCTGATCGGCCTCCGAATTAGCGGTTCGGCAGAATAAATCTTTCCTCCTGTTCCAACCACTACTTTTTCCTTAGTCATGCTTCCTAGGTACGGGGGGTTCCCTCCTATGTCACTACACCATGATTCATTAGGCATCTGTTTGTCCGGATAATGCACGGAGATAAAGCCGTCTGCGCAATCACACCCTGTTGCAGTGCTGCAGTTTGTCTCCTGCATATATGATAAAGGAAAGGGGGTGGTCACACCGCGTATGATCTTCTTCCAGCCCTGTTCTCTCATTAGTTTGCACTGAGTTGTCGCACAACGAGTTTCGAACGGAGTTCCTGACTGAAAGCATCTCCATACGAAGAAGGCAAAATAATTGCGCTCATCTTTCATTATTGTGTCAAACACCTTCACTGAATCGGATTGGATTGCTAGTTTCTGGATTGTTGTGGTCTTGGTGACTTTTGACAGGATGCTGTCTACATATCCGTATATTGTAGCATCATACACATCATGGAGCAGTCGGATATGCAGCTCTCTACCTTCGCACAAGCATTCTGCGAGATATCTGCAATCTTGGTCATTTTTCGCTCTTACTAGTTGCATAAACTCAGGATTCTCAATCTTCATTCCAGAATTCAAATATCTCTGTACCACCTGCCTCACTCCAGACAATGGCGATCGAGGCGACAATAAGTTGACAGCATAAACATCCTCCAGGAGCATTGAGTAATTGCATTCTGGCATATACAGGGGATTGATCCAGTTGTTGATAAGCGTAGCTGTCTCTCCCGAAGTGTTCCCGCCATTAACGATATTATTCAGATAACTCAGGTCTCTAGACAAGCGATCAGAGAAGCCTCTCACCATCATCTCATATATGTTAGCTCCGCAATATCCAGAGAGGCTCTTCGGTATTATAGAGATGGCTCTTCTCAAAGAGTGACGAGTCATAGTCCATGACTCCTTAGGCAGTTGATACCTTATCGCCGAGAACCGATGAGATCTCAGAACCCAATGCTTGTCCTTGTCCAGTGTTTTGTACAGAGAGTCCCCTAAAATAGGATGATAGTCCAGGAAATCATCGATGCATAACGATGTCATCAAAACATATATGCAGTAAGCTGTCCAAATGCAGGGACTGGCTTGAGTGGCTGCCATTGCGTTAGATGAGACTGTGGACAGAGCATTCTCTAATGTCATTACCCCCTCGTTACTCATAGGAAATGTCCGCATCAGCTTTTTAAGGTCCATAGTCAGAGGCACTCCTTTCCATATCGGGACTTTTCCATACAAATACAGATCCTCCGACATCCATGTCTCTAATGGCTTAAGGGGAAGTCCTGACTCTGTAAATGATCTGACCAAATCTTTGAAGATATCATCCAATATGCCCGACATCTGAAGCAAACCTTCTGCTGTGGCTTTCCCGCTCTCATCTACGATGTTAGAGTACACCGTGATTTGCAAGACCTGATTATCACCCATTCCCATTATTCTGTACTCGCAATCATATTTAGAGAGAATCACTTCCAAACCGCAGACAGTATACAACGTCCATCCTTTTTGCCTTAGTCCCTCCATTCCTCCTTGGTGGTTGATGAAGGACTTAGGCTCATCTACCACGAGATTTCCGTCATCGTCTATACTCGGCACATAGCTTCCATCTGCAAGGTAATAATAACTCTCGGAGAAGAGATCATATGTGACATTGAATAATTCTGAGAGCCCGAATAAGTCTCCGATAGCAGTGAATACGCCAGATGTCATTGATTTTCTCATATGTCCATTCCACTTCTCGAAATCAAGAGATATGCACACAGTTTTAGACGCCCATCCCTTTTCTTTATTATGCCTTTTCTTCAGGGACGACTGATTTCTCACGGTGTTATACATTTTCCTCGTCAGGTCTAGCAAAGAGTCAGTCATTGTTATCTGAGGAAACATTTCTAGGA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4,464
OR453866.1
Tomato yellow mottle-associated virus
Huang,S., Zhang,S., Wang,Z., An,M., Xia,Z., Wu,Y.
Shenyang Agricultural University, College of Plant Protection
China
2023-10-07
Guizhou
Cytorhabdovirus lycopersici
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,408
GenBank
null
China
China
Nicotiana tabacum
null
2023
null
null
Tomato yellow mottle-associated virus isolate Guizhou, complete genome
TTCCTCTACTATTTATCTTCATCCGATTTTACGGATCATAAAATCCGTAGATGGCAAATTATGTATCAATGTACCAATATATCTAAAACCGAATCAGGCAATATTAATATTTATTTCAGTGGTTCCGTCATCCTTTAGTATCAGAGTTTCCATTTTTCCCACACTTTATCTTCCCATCTCCGTATTTTAGTGTCTTCTTGAAATGCAGCTCCGCAAATCCCCATGAATACAAGTCACTAGTTATCCGTAAGCCGTTTCATCTGGATTTATCATTCCATTATAGTTTTATTAAATCACATACAGTTATTCGGATTGTCTCTAATCTGTGAGCTTGTGGATAGTGTCTATTTGATTACTTTATTAGCTCTCCTCTTGTGAGGTGCTGCCCGTCTCAATTTTTCAGAGAGAGAGGTTATGGGGAAACATAATTCCTCTCTAGAATTGGTGTGTCTAAATTCTACTCTATTAGGACAGTTCTTAAACAAAAGACCGTGATCCTTCATCATCAGATTCAGAGTAGGCACGTACTTTATGACATCACACGGTGGCTCATTGGTCTCTTCTCGTTCTTCCAGAGATACATCCCACTTGTCAGAGTACTTTCTCCAGATCAGCGACCAGTGAGGAGATCTATTAATCATATTCAGCCTGTCATTCACATCAGCCATCATAGATACTGCTATAGCAAATAACTTCCCTCTTAACTCTAGGTAATCGGACTTATAGAGTTTGTGTGAGGAACTCTCACTTGTCTTAATTGAAAATGGGCGCTTTGTCTTTAGGATGTAGTAGTAAAGAGAGGTGTATGACCCGTTCTGTGGAAGGAGGCTTCCTATTAGATCAAACACTGCCCAAGCTCTAACCCGAGATATCATCTTAGAGAGCATTTGTCGATCATGCAATGAGCTAATCAATGCATTGTCTCCATCTGAGATGCTATACTCATGACTCTTCAATGCTCGCTCTATTCCGATCCATAACAATTGGACTTTATTGGGGATGGGATACAATATGGTATCAGAAGTCATCGGTATGGTATCGTGCAATACCCACCATACTTCAGGATAATTATGCGATCTAAATCGAGTCGTTATCAAATCCCATCTTCTAGCCCTGCTAGCCCACATTATCCCTATTTTGTTCGACAGTTCCTCAGCACTCCAGATATAGTCCTTGATGATGGTAACAGGTCTTCTCCCGCTCAATGCAATCTTCTTGACCAGTTCGAATCGTGATTCATGGTCATCCGGGTTCACCACCTCAGCGTCACTATACAACACATCGCATGATCTCAACTCCTCAGCCCAATCGGAACTCCATGCTCGATTTCTCACATCGTTATGCCTATTCGCGGCCTTTGTTGCATCGATGTTTTCGATACCATAGAATTGAGGGACGGGTAAGACGTTATGGGAATATGCATGAGGTATAGCCTCGTCTGGCTCTAGCATCGTTGAACTTATCACCGACTCAGCTCCTAATGCAGAAAGTACTGTGCTAGACGTACCTAGTCCGTCTCCTATGCATAAGCATCTTCTTCCTAACACTTGTACCCCGCTGCCTCCAATTATATCTTGCATCTTGTATGAAGTGGATGTTGGCATCGACATTACAGTGGCCAGGTGATACACAGTGAACCCAGATCGTACATCATTCACTATCTCAGAAGGTATCGCTTTATCATTAGACTCGGGCCTAATCCTCAGAGTATCAGAAGACAATAAAATGATATTGAAATTGAACTTTTTAGTGCTAGAATTCATTTTGATTCGTTCGACGGTCCTCTCATTAGATATATTCTCACAGTCTTTTCTCAATCTCTCTACCGTCACGTATGACTTCACCCATGGACTCTTCTTCATCCAGTCAGACAACTTATGCCCGTAGTAACAGCTAGAGAATGTTAGTGTTCTCCACACATCGCTCAGCTCCGATCTCTCTATCATAGATATGCATGCTTTACATCGAGTGGCCTTCTCCAAACCATCCAGTATCAAGAACTTGTAGATCAATCTCTCATTTTGCTCATCATGCAATATTATTTCTGATCTCTTCAATCCAGTTACTATTCGTTTGCCCGCCAAGGATAACATACTCGTTCTGACGGATTCGCAGGCAGAGAACACCGATATCGGATTTGTAGCTGGAGGAACCACTTCTGGATATATCCTACTGTACGCTAAGGACGTCTCCTCCCAACAAAAGAACATAGCTAATCCCAGAAAACCATGGGTGTCCGCTGAATTCAAGATGTCTATCATGACTCGTTCGATCTCATTGTCGCTGGCATCTGTTCTTTCAGGATGACTCCGTAGCACAGTCCACCTCGACACTCTCCTCAATTCCATCATTATTGTGTCCACCATAACACGTGGATCTAACTTGAAATACATCGTACGCTCGTAGGCTTTTACACTTGTTAGTCCAACTGATACATGTGTCTCGGATTTCTGGCCCGTCACTATGTCTTTTATTATCCGGTCACAGATCGATCGATGCAGGAGGACAGCCTTTCTTCTCCCTGAGATATTATCATACTCCTCATGGCTCAACTCCCTCTCCGATAACTCATATAGAGGAGAAATTCGTTCTAGGACCCTAATCCGGGATGATGGAGTGTATAGATACGGATTGTCCTTGAAGGAAGGGATAACACCTAATGCTTTCTCACTTGACAGGTCCACAAAATCTTCTTCGATCGGGTGAATACACTCATAACAACATTGCTTGAAATGCTTGAACCGAGCCACTACCTCTTCGTTCCTTATCTTGTTGGACAGATACATATTAGACAACTCTAGAATGACGCAGAATGTCGCTTGATAATGAAAGTCAGTATTCTCTGCTCCCTTGGAGTACCTTATAAGACTATCTGTAGAGATGTGACACCTTGTAGAATAAAGATAATTAGAGCTGGATAGCGCCCCTCTGAAAGTGCTCGAGTCTTGATATCTGTGAGCTTCTGATCCGGCGGTTCCTTCCTCCATCCCTTTGAACTTGGACGTCTCCATATCAGTAACTGAGGAGACACAAGCTTCTATGATCTTCGCCATGGAACTATGTTGCGGTACAAACCAATTGATCGTCCGCAGCAGCCTGATCGGCCGCCGGATCAGTGGCTCGGCGGAATAAATCTTTCCTCCTGTCCCGACCACCACTTTCTCCTTCGTCATGCTTCCCAGATACGGAGGGTTCCCCCCTATGTCACTACACCAAGACTCATTGGGCATTTGTTTGTCCGGGTAATGCACGGAGATGAAGCCGTCTTCACAGTTACATCCTGTTTCAGTACTGCAGTTTGTTTCTTGCATATAGGACAAGGGAAAAGGAGTAGTGACGCCGCGGATTATCTTCTTCCAACCTTGTTCTCTCATCAGTTTGCACTGGGTTGTGGCGCAGCGAGTCTCAAACGAATCCCCTGATTGAAAGCATCTCCACACAAAAAAGGCGAAGTAATTACGCTCATCTTTCATTATAGTGTCGAACACCTTTACAGAATCAGATTGAATTGCCAGTTCCTGGATCGTAGTAGTCTTGGTGACTTTCGATAATATGCTGTCCACATATCCGTAGATTGTAGCATCATACACATCGTGGAGCGGTCGGATATGGAGCTCTTTACCCTCACATAAGCATTCTGCGAGATACCTGCAATCTTGATCATTTTTAGCTCTAACTAGCTGCATAAACTCAGGATTCTCAATCTTCATTCCAGAATTCAAATATCTCTGCACCACTTGCCTCACACCGGACAGGGGCGATCGAGGTGACAGCAAGTTGACAGCGTAGACATCTTCCAGGAGCATTGAGTAATTGCATTCCGGCATGTAGAGGGGATTGATCCAGTTATTGATAAGCGAAGCTGTTTCACTCGGAGTATTCCCGCCGTTGATGATGTTATTTAGGTAACTCATGTCTCTAGACAGGCGATCAGAAAAGCCCCTCACCATCATTTCATATATGTTCGCCCCACAGTACCCAGAAAGACTCTTCGGTATTATAGAGATGGCTCTTCTTAGAGAATGACGAGACATGGTCCATGACTCCTTTGGCAGTTGATACCTTATTGCTGAGAATCGACTGGATCTCAGAACCCAATACTTGTCCTTATCCAATGCTTTGTACAGGGGTTCTCCTAAAATAGGGTGATAGTCCAAGAAATCATCAATGCATAATGATGTCATCAAGACGTATATGCAATAAGCTGTCCAGATGCAGGGACTGGCTTGAGTGGCCGCCATTGCATTGGATGAGACAGTAGACAGAGCGTTCTCCAATGTCATCACCCCCTCATTGCTCATAGGGAATGTTCGCATCAGCTTTTTGAGGTCCATAGTTAGAGGCACACCTTTCCATATTGGGACTTTTCCATACAAGTACAGGTCCTCTGACATCCATGTCTCTAGTGGCTTGAGGGGAAGTCCAGATTCTGTGAAAGATCTAACTAAATCTTTGAAGATATCATCCAGGATTCCCGACATCTGAAGCAAACCTTCTGCCGTGGCTTTTCCGCTTTCATCTACGATGTTCGAATACACCGTAATTTGTAAAACCTGATTATCACCCATTCCCATTATTCTGTACTCACAATCATATTTAGAGAGAATCACCTCCAAACCACAGACAGTATATAGCGTCCATCCCTTTTGCCTTAGGCCTTCCATTCCCCCTTGATGGTTGATAAATGATTTGGGCTCATCTACCACAAGATTTCCGTCCTCGTCTATTCGCGGTACATAGCTTCCATCTGCGAGATAATAGTAACTTTCGGAGAAGAGATCGTATGTGACATTGAACAATTCTGAGAGTCCGAATAAGTCGCCGATGGCAGTGAACACTCCAGAGGTCATGGATTTCCTCATATGGCCATTCCACTTCTCAAAATCAAGAGATATGCATACAGTCTTAGATGCCCACCCTTTTTCTTTGTTGTGCCTTTTCTTCAGAGATGATTGATTTCTCACAGTGTTGTACATTTTTCTCGTCAAATCTAGAAGAGA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12,207
ON314142.1
Tomato yellow mottle-associated virus
Chen,S.
Yunnan University, School of Life Sciences
China
2023-02-19
NT
Cytorhabdovirus lycopersici
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,387
GenBank
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China: Honghe, Yunnan Province
China
Nicotiana tabacum
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Tomato yellow mottle-associated virus isolate NT, complete genome
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18,216
OP296980.1
Tomato yellow mottle-associated virus
Li,C., Liu,Y., Yin,C., Sun,K., Liu,G., Zhang,P.
College of Life Science, China Jiliang University
China
2022-11-09
Zhejiang
Cytorhabdovirus lycopersici
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,403
GenBank
1
China
China
Piperaceae
null
2021-07
null
null
Tomato yellow mottle-associated virus isolate Zhejiang, complete genome
TTACGGATCATAAAATCCGTAGATGGCAAATTATGTATCAATGTACCAATAAGTCTAAAACCGAATCAGGCAATAATAATATTTATTTCAGTGGTTCCGTCATTCTGTAGTATCAATGTTTCCGTTTTCCCCTACTCTTTATCTTCTTATCCTCTCATTTTAGTTTTTCGTAACTCGCGGCTCCGCAAGTCCTTATTTACGCATGTCACCTATTATTTGTAATTCAGTTCGTTTCGTATTATTATATTATTATAGTTTTATTAAATCACACACGGACAATTAGATTGTCTCTATCTCTTGAACACCATCTATTTGATCACCTTATCGGTTCTCTTCTTGTGAGGTGCTGCTCGTCTTAATCGTTCAGACAGAGAAGTTATTGGAAAGCATAATTCATCTCTGGATTTGGTGTATCTAAACTCTATCTTATTGGAACAATTCTTGAATAAGAGGCCGTGTTCCTTCATCATCAAATTTAAAGTAGGAACGTACTTTATGATGTCACACTGTGGCTCGTTTATCTCTGCCTTCTCCTCCAGATACACATCCCATTTGTCCGAGTACTTTCTCCAAATCAGTGACCAGTGATGTGATCTGTTAATCATGCTCAGCCTGTCATTCACGTCAGCCATCATAGAGACAGCTATAGCAAATAACTTTCCTCTTAACTCCAGGTAGTCAGACTTATAAAGCTTGTGCGAAGAACTTTCACTCGCCTTAATTGAGAATGGGCGCCTTGTTTTCAATATATAATAGTAAAGAGAAGTATATGACCCATTCTTCGGGAGGAGGCTCCCTATTAGATCAAACACTGCCCAAGCTCTAACCCGGGATATCATCTTATAGAGCATTTGTCGATCATGCAGTGAGCTAATCAATGCGTTGTCTTCATTTGAGATGCTATACTCGTGACTCTTCAGCGCTCGCTCTATACCGATCCACAAGAACTGCACTTTATTAGGTATAGGATACAATATTGTATCAGAAGCCGGCGATACAGCATCATGTAGCACCCACCATACCTCAGGATAGTTGTGTGATCTAAATCGAGTTGTTATCAATTCCCATCTCTTTGCCCTGCTAGCCCACATTATCCCGACTTTGTTCGACAATTCTTCGGCACTCCAGATATAATCCTTAATAACAGTCACTGGTCTCCTCCCGCTCAATGCTATCTTCTTGACCAATTCGAATCGTGACTCATGGTCATCAGGGTTCACCACCTCAGCGTCACTATACAGCACGTCACATGATCTCAACTCCTCTGCCCAATCAGAACTCCATGCTTGATTCCTCACATCGTTATGCCTATTCGCGGCTTTTGTTGCATCGATGTTTTCAATCCCATAAAACTGAGGTACCGGTAGGACATTGTGAGAATATGCATGAGGTATGGCCTCATCTGGCTCCAGCATCGTCGAACTTATCACTGATTCAGCTCCTAAAGCGGAAAGCACCGTGCTGGATGTACCTAGTCCGTCTCCTATGCACAAGCATTTTCTTCCTAAGACTTGTATCCCGCACCCTCCAATTATATCTTGCATTTTGTAGGATGTAGATGTAGGCATCGACATTACAGTAGCCAGGTGATATACGGTGAATCCGGATCGCACATCATTCACTATCTCAGGAGGTATCGCTTTATCATTAGACTCTGGCCTGATCCTCAAAGTATCGGAAGACAACAAGGTGATGTTGAAATTGAATTTCTTAGTGCTGGAGTTTAGTCTAATCCGATCTACAGCCCTCTCATTGAATATATTATCACAGTCTTTTCTTAATCTCTCCACTGTCACATATGACTTTATCCATGGACTTTTCTTCATCCAGTCGGACATTTTATGTCCGTAATGACAGCTATAGAATGACAGCGTTCTCCACACATCGCTCAACTCCGATCTCTCAATCATGGATATGCATGCTTTACATCGAGTGGCCTTCTCTAGATCATCAAGAATCAAGAACTTATAGATCAATTTTTCATTCTGTTCGTCATGCAATATTATCTCTGATCTCTTCAGCCCGGTGATGATTCGTTTGCTCACTAGAGATATCATACTTGTTCTGACAGATTCGCAGGCGGAGACCACTGATATCGGATTCGTGGCAGGAGGGACCACTTCTGGATATATCCTACTATAAGCTAAGGATGTCTCTTCCCAACAGAAGAACATAGCTAAGCCAAGAAAACCGTGGGTGTCGGCCGAATTCAAGATATCTATCATGACTCTTTCGATCTCATTGTCGCTGGCATCTGTTCTTTCTGGGTGACTCCGCAACACAGTCCACTTCGACACTCTCCTCAACTCCATCATCACCGTGTCAACCATGATTCGCGGATCCAACTTGAAATACATAGTACGCTCGTAGGCCTTTACACTCGTTAGTCCGACTGACACGTGTGTCTCAGATTTTTGGCCAGTTACTATGTCCTTGATGATCCGGTCGCAGATCGATCGATGCAGGAGGACAGCCTTTCTTCTCCCTGAGATATTATCATAATCCTCGTGGCTCAACTCCCTATCCGATAATTCATATAGAGGGGAAATCCGCTCCAAGACTCTAATTCTAGATGAGGGAGTGTACAGATACGGATTGTCTTTGAACGAAGGGATAACACTCAATGCTTTCTCACTAGATAAGTCCACAAAATCTTCTTCGATCGGATGAATACATTCATAGCAACATTGTCTGAAATGCTTGAACCGAGCCACTACCTCCTCACCCCTTATCTTGTTGGACAGATACATATTTGACAACTCGAGAATGACGCAGAAGGTTGCTTGATAATGGAAGTCCGTGTTTTCTGCTCCCTTAGAGTACCTTACCAAACTATCCGTGGAGATATGACACCTAGTAGAGTAAAGATAATTAGAGCTAGACAGTGCTCCTCTGAAAGTGCTCGAGTCCTGATATCTGTGAGCTTCAGATCCGGCAGTCCCTTCCTCCATACCTTTGAACTTGGACATCTCCATATCGGTCACCGAGGAGACGCATGCTTCTATGATCTTCGCCATGGAACTATGTTGCGGTACAAACCAATTGATCGTTCGCAGCAGCCTGATCGGCCTCCGAATTAGCGGTTCAGCAGAATAAATCTTTCCTCCTGTTCCGACTACCACTTTTTCCTTAGTCATGCTTCCTAGATACGGGGGGTTCCCTCCTATGTCACTACACCAAGATTCATTAGGCATCTGTTTGTCCGGGTAATGCACGGAGATGAAACCGTCTTCGCAATCACATCCTGTTGCAGTACTGCAGTTTGTCTCCTGCATATATGATAAAGGAAAGGGAGTGGTCACACCGCGTATGATCTTTTTCCAGCCCTGTTCTCTCATTAGTTTGCACTGAGTTGTAGCACAACGAGTTTCGAACGGAGCTCCTGATTGAAAGCATCTCCATACGAAGAAGGCAAAATAATTGCGCTCATCCTTCATTATTGTGTCAAACACCTTCACTGAATCAGATTGGATTGCTAATTTCTGAATTGTTGTGGTCTTAGTGACTTTTGACAGGATGCTGTCTACATATCCATATATTGTGGCATCATATACATCATGGAGCAGTCGGATGTGCAGCTCTCTTCCCTCACACAAGCATTCTGCAAGGTATCTGCAATCTTGATCATTTTTCGCTCTAACTAGCTGCATAAACTCAGGATTCTCAATTTTCATTCCAGAATTCAAATATCTCTGCACCACCTGCCTCACTCCGGACAATGGCGATCGAGGCGACAGTAAGTTGACAGCATAAACATCCTCTAGAAGCATTGAGTAATTGCATTCTGGCATATACAGAGGATTGATCCAGTTGTTGATAAGCGTAGCTGTCTCACTCGAGGTATTACCGCCGTTGATGATGTTATTCAAATAACTCAGGTCTCTGGACAAGCGATCAGAGAAGCCTCTCACCATCATCTCATATATGTTAGCTCCGCAATACCCAGAGAGACTCTTCGGTATTATCGAGATAGCTCTTCTCAAAGAGTGACGAGTCATAGTCCATGACTCCTTCGGCAGCTGATACCTTATTGCCGAGAACCTGTGAGATCTCAGAACCCAATGCTTGTCCTTGTCCAATGTTTTATACAGAGAGTCCCCTAAAATAGGATGATAGTCCAAGAAATCATCAATGCACAAAGATGTCATCAGGACGTATATGCAGTAAGCTGTCCAAATGCAAGGACTAGCCTGAGTGGCCGCCATTGCATTAGATGAGACTGTGGACAGAGCATTTTCCAATGTCATTACCCCCTCATTGCTCATAGGAAATGTCCGCATCAGTTTTTTGAGGTCCATAGTTAGAGGCACTCCTTTCCATATCGGGACTTTTCCATACAAATATAGATCCTCTGACATCCATGTCTCTAAAGGCTTAAGGGGAAGTCCAGACTCTGTAAATGATCTGACCAAATCTTTGAAGATATCATCCAAGATGCCTGACATCTGAAGCAAACCTTCTGCCGTGGCTTTTCCGCTCTCATCTACGATGTTCGAGTACACCGTGATTTGCAAAACCTGATTATCTCCCATTCCCATTATTCGATATTCGCAATCATATTTTGAGAGAATCACCTCCAAACCACAGACAGTATACAACGTCCATCCTTTTTGCCTTAGTCCTTCCATTCCTCCTTGATGGTTGATGAAGGACTTAGGCTCATCCACCACGAGATTTCCATCATCGTCTATACTCGGCACGTAGCTTCCATCCGCGAGGTAATAATAACTCTCAGAGAAGAGATCATATGTGACATTGAATAATTCCGAGAGTCCGAACAAGTCTCCGATAGCAGTGAATACGCCAGATGTCATTGATTTCCTCATATGCCCATTCCACTTCTCGAAATCAAGAGATATGCACACAGTTTTGGACGCCCATCCCTTTTCCTTATTATGCCTTTTCTTCAGGGACGACTGATTTCTTACGGTGTTGTACATTTTCCTCGTTAGGTCTAGCAGAGAGTCCGTCATTGTTATCTGAGGAAACATTTCTAGTAT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22,322
OM827245.1
Tomato yellow mottle-associated virus
Chen,K.
Sichuan Academy of Agricultural Sciences, Institute of Biotechnology and Nuclear Technology
China
2022-03-18
null
Cytorhabdovirus lycopersici
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,417
GenBank
null
China: Chengdu, Sichuan
China
Solanum lycopersicum
null
2020-05-27
null
null
Tomato yellow mottle-associated virus, complete genome
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32,378
OM827246.1
Tomato yellow mottle-associated virus
Chen,K.
Sichuan Academy of Agricultural Sciences, Institute of Biotechnology and Nuclear Technology
China
2022-03-18
SL-A
Cytorhabdovirus lycopersici
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,423
GenBank
null
China: Chengdu, Sichuan
China
Solanum lycopersicum
null
2020-05-27
null
null
Tomato yellow mottle-associated virus isolate SL-A, complete genome
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32,379
OM827247.1
Tomato yellow mottle-associated virus
Chen,K.
Sichuan Academy of Agricultural Sciences, Institute of Biotechnology and Nuclear Technology
China
2022-03-18
SL-B
Cytorhabdovirus lycopersici
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,424
GenBank
null
China: Chengdu, Sichuan
China
Solanum lycopersicum
null
2020-05-27
null
null
Tomato yellow mottle-associated virus isolate SL-B, complete genome
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32,380
MW527091.1
Tomato yellow mottle-associated virus
Li,Z., Tang,Y., He,Z.
Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Plant Protection Research Institute
China
2021-09-07
null
Cytorhabdovirus lycopersici
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,401
GenBank
null
China:Shantou, Guangdong province
China
Solanum nigrum
null
2020-05
null
null
Tomato yellow mottle-associated virus strain ST, complete genome
TTACGGATCATAAAATCCGTAGATGGCAAATTATGCATCAATGTACCAATAAGTCTAAAACCGAATCAGGCAATAATACTATTTATTGCAGTGGTTCCGCTATACTGTAGTATCATAGTTTCCATTTTCCCCTACCCTTTATCCTCTTGTCTCCATATTTTATCTTTTTCGTAAACCACAGCTTCGCAGATTCCCATGAATGTATATCACTGGTCACTTGTACGCCATTTTGTCTAGGCCTATCATACCATTATAGTTTTATTAAATCATATACTGTCATTCAGATTGTCTCTCGTCTATGAACTTCCGGATGGTGTCTGACTGAGTACTTTGTTAGTTCTTCTCTTGCGAGGTGCTGCTCGTCTTAATTTTTCAGAAAGAGAGGTTATTGGAAAGCATAATTCCTCTCTAGAATTAGTGTGTCTAAATTCTATTCTGTTGGAACAGTTCTTGAACAAGAGACCATGACTCTTCATCATCACATTCAAAGTGGGCACATACTTTATGACATCACAAGGTGGCTCATCGGTCTCATCTCTCTCCTCTAGCGATATGTCCCATTTGTCTGCATACTTCTTCCAGACCAGTGACCAGTGAGGCGATCTGTTTATCATACTCAGCCTATCATTCACATCCGCCATCATAGAAACAGCTATAGCAAACAACTTTCCTCTCAATTCAAGATAATCCGACTTATAGAGTTTGTGTGAAGAACCTTCACTCGTCTTGATTGAAAACGGGCGCTTTGTTTTCAGGATGTAATAGTAAAGAGAAGTGTACGACCCGTTCTTCGGGAGGAGACTTCCTATCAAATCAAACACTGCCCAAGCTCTGACCCGAGATATCATTTTAGAGAACATTTGTCGGTCGTGCAGTGTGCTAATCAATGCGTTGTCTCCATCAGAGATGCTGTATTCGTGGTTCCTTAGAGCTCGTTCTATTCCGATCCACAACAGTTGGACTTTGTTGGGAATGGGATACAGTATGATATCGGAAGTCGGCGGTACGGCGTCATGTAATATCCACCATACTTCAGGATAATTGTGCGATCTAAATCTTGTTGTTATCAACTCCCATCTTCTTGCCCTGCTAGCCCACATTATTCCGATTTTGTTTGACAGTTCCTCAGCACTCCATATATAGTCCTTGATAATGGTCACCGGTCTTCTCCCACTCAATGCAATCTTCTTGACAAGTTCGAATCGTGATTCATGATCATCAGGGTTCACCACTTCAGCATCACTGTACAGCACATCGCATGATTTCAGCTCTTCTGCCCAGTCAGAGTCCCATTCTTGATTTCTCACATCATTATGCCTATTCGCGGCTTTTGTTGCATCGACATTTTCAATCCCATAGAATTGAGGGACAGGTAAGACATTGTGGGAGTACGCATGAGGTATGGCCTCGTCTGGCTCCAGCATTGTCGAACTTATCACCGATTCAGCTCCTAATGCGGAAAGCACTGTGCTGGATGTACCTAGTCCGTCTCCTATGCATAAGCACTTTCTTCCTAATACTTGTATTCCACTACCTCCGATTATATCTTGCATTTTGTAGGATGTAGAAGTAGGCATCGACATTACTGTAGCCAGATGATACACAGTGAATCCGGACCGCACGTCGTTCACTATCTCAGATGGAATCGCTTTGTCATTAGACTCAGGCCTAATCCTCAAAGTATCAGAAGACAACAACATGATATTGAAATTGAATTTTTTTGTACTAGAATTCAGTTTGATTCTTTCGACGGCCCTTTCATTCGATATATTATCACAGTCCTTTCTCAGTCTCTCCACCGTCACGTATGACTTCATCCATGGACTTCTCTTCATCCAGTCGGACATTTTATGCCCATAATAACAGCTGGAGAATGTCAATGTTCTCCACACATCACTCAGCTCTGATCTCTCTATCATAGATATACAAGCTTTGCATCGAGTGGCCTTCTCTAGATCATCCAGGATTAAGAACTTGTAGATCAATTTCTCATTCTGCTCATCATGTAATATTATTTCTGATCTTTTCAGCCCTGTTACTATTCGCTTGCTCACCAGAGATACCATACTCGCTCTTACAGATTCGCAGGCAGAGAACACTGATATCGGATTTGTAGCCGGGGGAACTACTTCTGGATATATCCTACTGTAAGCTAAGGATGTCTCTTCCCAACAAAAGAACATAGCCACGCCTAAGAAACCATGGGTGTCAGCTGAATTCAAGATATCTATCATGACTCTTTCGATCTCATTGTCGCTAGCATCTGTTCTTTCAGGATGACTTCGCAAAACAGTCCATTTCGACACTCTTCTCAACTCCATCATTATTGTGTCAACCATAACACGCGGATCTAACTTGAAATACATGGTGCGCTCGTAGGCTTTTACACTTGTTAGTCCGACTGATACATGTGTCTCGGATTTCTGTCCAGTTACTATATCCTTGATTATCCTGTCACAAATCGAACGATGCAGGAGGACAGCTTTTCTTCTTCCTGAGATTTTGTCATACTCCTCATGGCTCAACTCCCTCTCCGATAACTCATATAGCGGGGAAATTCTCTCTAAGATCCTAATCCGAGATGATGGAGTATATAGATATGGATTGTTCTTGAAGGAAGGGATAACGCCTAATGCTTTCTCACTTGACAGGTCCACAAAATCTTCTTCTATCGGATGAATACACTCATAGCAACATTGCTTGAAATGCTTGAATCGAGCCACTATCTCTCCACTCCTGATCTTGTTAGACAGATACATGTTCGACAGCTCTAAAATGACGCAGAAGGTTGCTTGATAATGAAAATCAGTGTTCTCCGCTCCCTTGGAATACCTTATCAGACTATCTGTGGAGATGTGACACCTTGTGGAATAAAGATAATTAGAACTGGATAACGCTCCTCTGAAAGTGCTCGAGTCTTGATACCTGTGAGCTTCTGACCCGGCGGTTCCTTCTTCCATCCCTTTGAACTTGGACGTCTCCATATCAGTCACTGAGGAGACACATGCTTCTATGATCCTCGCCATGGAACTCTGTTGCGGCACAAACCAATTGATCGTTCTCAGTAATCTGATCGGTCTCCGGATTAGTGGCTCGGCGGAATAAATCTTTCCTCCTGTCCCGACCACTACTTTCTCTTTAGTCATGCTCCCAAGATATGGAGGGTTCCCTCCTATATCACTGCACCATGACTCATTAGGCATTTGTTTGTCCGGGTAATGCACGGAGATGAAGCCGTCTGCACAATTACACCCTGTTGCGGTGCTGCAATTTGTTTCCTGCATATATGACAAAGGAAAGGGAGTGGTCACACCGCGGATTATCTTCTTCCAGCCCTGTTCTCTCATCAGTTTGCACTGAGTTGTGGCGCAGCGGGTCTCGAACGGATCCCCTGATTGAAAACATCTCCACACAAAGAACGCAAAATAATTACGCTCATCTTTCATTATTGTATCAAACACCTTTACAGAATCAGATTGGATTGCCAGTCTCTGAATTGTCGTGGTCTTAGTAACTTTTGATAATATGCTGTCCACGTATCCGTATATTGTAGCATCATAAACATCATGGAGCAGTCGGATATGAAGCTCTTTACCCTCGCACAAGCATTCCGCGAGATATCTGCAATCTTGATCATTTTTCGCTCTCACTAGCTGCATAAACTCAGGATTCTCAATTTTCATTCCAGAATTCAAATATCTCTGCACCACTTGTCTCACCCCAGATAAGGGAGATCGAGGCGACAGTAAGTTGACAGCATAGACGTCCTCCAATAGCATTGAGTAATTGCATTCTGGCATGTATAGGGGATTGATCCAGTTATTGATGAGCGAAGCTGTCTCGTTTGGAGTGTTCCCACCGTTGATGATGTTGTTTAGGTAACTCAGGTCTCTAGACAGGCGATCAGAGAAGCCCCTCACCATCATTTCATATATGTTTGCTCCACAATACCCAGAGAGACTCTTCGGTATTATAGAGATGGCTCTTCTCAGAGAATAACGAGACATAGTCCATGATTCCTTCGGCAGCTGATACCTTATCGCTGAGAACCGGCGAGATCTCAGAATCCAGTGCTTGTCCTTGTCCAATGTTTTATACAGGGAGTCTCCTAGAATAGGATGATAGTCCAAGAAATCATCAATGCATAGTGATGTCATCAAGACGTATATGCAATAAGCTGTCCAGATGCAAGGACTGGCTTGAGTGGCCGCCATAGCATTGGATGAGACAGTGGACAGAGCATTCTCCAGCGTCATTACTCCCTCATTGCTCATAGGAAATGTCCGCATCAGTTTTTTAAGGTCCATAGTCAGAGGCACTCCTTTCCATATTGGGACTTTTCCATACAAGTATAGGTCCTCCGACATCCATGTCTCTAGCGGTTTAAGGGGAAGTCCGGAATCTGTGAACGATCTGACTAAATCTTTGAAGATATCATCCAGGACGCCTGACATTTGGAGCAAACCTTCTGCCGTGGCTTTTCCGCTTTCATCTACGATATTCGAGTACACAGTGATTTGTAAAACCTGATTATCACCCATTCCCATTATTCTGTACTCACAATCATATTTAGAGAGAATCACCTCCAGACCGCAGACAGTATACAATGTCCATCCCTTTTGCCTCAGGCCCTCCATTCCCCCCTGATGATTGATGAACGACTTGGGCTCGTCCACAACTAGATCTCCATCCTCTCCTATTCGCGGCACATAGCTCCCATCTGCAAGGTAATAATAACTCTCGGAGAAGAGATCGTATGTGACATTGAACAATTCTGAAAGTCCGAATAAGTCACCGATAGCAGTGAACACACCAGAAGTCATTGATTTCCTCATATGGCCGTTCCACTTCTCGAAATCAAGAGATATGCACACGGTCTTGGATGCCCATCCTTTATCTTTATTATGCCTTTTCTTCAGAGATGATTGATTTCTCACAGTATTGTACATTTTCCTCGTCAGATCTAGCAGAGAATCCGTCATTGTTATCTGAGGGAACAT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38,102
KY075646.1
Tomato yellow mottle-associated virus
Xu,C., Sun,X., Taylor,A., Jiao,C., Xu,Y., Cai,X., Wang,X., Ge,C., Pan,G., Wang,Q., Fei,Z.
Boyce Thompson Institute, Cornell University
USA
2017-03-18
null
Cytorhabdovirus lycopersici
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,389
GenBank
1
China: Chongqing
China
Solanum lycopersicum
null
2013-06-26
null
null
Tomato yellow mottle-associated virus, complete genome
TTACGGATCATAAAATCCGTAGATGGCAAATTATGTATCAATGTACCAATATATCTAAAACCGAATCAGGCAATAATAATATCTATTTCAGTGGTTCCGTCATTATGTAGTATCAATGTTTCCGTTCCTCTCTACTACTTGTCTTCCCATCTTCTCATGTTAGTGTTTTCATAAATCACGGCTTCACAAGTCTTTATTTATGCATGTTACCTGTTATGCGTAAGTCAGTTCGCCTCATGTTATCATGTTGTTATAGTTTTATTAAATCGCACACGGACTATCGGATCGTCTTTAGCCCTCGAACGACACTTATGTTGTTATCTTATCAGTTCTCCTCTTGCGAGGTGCCTCTCGCCTTAATCTTTCAGACAGAGAAGTTATCGGAAAGCATAATTCCTCTCTGGATCTGGTGCATCTGAACTCTACCTTATTGGAGCAATTCTTGAACAAGAGGCCGTGTTCCTTCATCATTAAATTTAAAGCAGGAACGTACTTTATGACGTCACACGGCGGCTCGTTGATCTCTTCCTTCTCCTCCAGAGACACATCCCACTTGTCCGAATACTTTTTCCAAATCAGTGACCAGTGATGTGACCTGTTAATCATGCTCAGCCTGTCATTTACGTCTGCCATCATAGAGACAGCTATAGCAAATAACTTTCCTCTTAACTCCAGGTAGTCAGACTTATAAAGCTTGTGCGAAGAACTTTCACTTGCTTTAATTGAGAATGGGCGCTTCGTTTTCAATATGTAATAGTAAAGAGAAGTGTATGACCCATTTTTCGGAAGGAGGCTTCCTATTAGATCAAACACTGCCCAAGCTCTAACTCGAGATATCATCTTATAGAGCATCTGTCGATCATGCAGCGAGCTGATCAATGCGTTGTCTTCACCCGAGATGCTATACTCATGACTCTTCAACGCTCTTTCGATGCCGATCCACAAACACTGCACCTTATTGGGTATAGGATACAATATTGTATCAGAAGTCGGCGATACGGCATCATGTAACACCCACCATACTTCCGGATAGTTGTGTGACCTAAATCGAGTTGTTATCAATTCCCATCTCCTCGCCCTGCTAGCCCACATTATCCCGATTTTGTTCGACAATTCTTCGGCACTCCAGATATAATCCTTGATAACAGTTACTGGTCTCCTCCCGCTCAGTGCTATCTTCTTAACAAGCTCGAATCGTGACTCATGATCATCGGGGTTCACCACCTCAGCATCACTGTACAGCACGTCACACGATCTCAACTCCTCTGCCCAATCGGAACTCCATGCTTGATTCCTCACGTCGTTATGTCTGTTCGCAGCTTTTGTTGCATCGATGTTTCCGATCCCGTAAAATTGAGGTACTGGTAAGACATTGTGGGAATACGCATGAGGTATGGCTTCGTCTGGCTCCAACATCGTCGAACTTGTCACTGATTCGGCTCCTAAAGCTGAAAGCACCGTGCTGGATGTGCCTAGTCCGTCTCCTATGCACAAGCATTTTCTTCCTAAGATCTGTATCCCGCACCCTCCAATTATATCTTGCATTTTGTAGGACGTGGATGTAGGCATCGACATTACAGTAGCCAGGTGATACACAGTGAATCCTGATCGCACATCACTCACTATCTCAGGAGGTATCGCTTTATCATTAGACTCAGGCCTAATCCTCAAAGTATCAGAAGACAACAGAGTGATGTTGAAATTGAATTTCTTAGTACTAGAGTTCAGTCGAATTCGATCTGCAGCCCTCTCATTGGATATGTTATCACAGTCTTTTCTTAATCTCTCCACTGTCACATATGACTTTATCCATGGACTTTTCTTCATCCAGTCGGACATCTTATGTCCGTAATGACAGCTGTAGAATGACAATGTTCTCCACACATCACTCAACTCCGATCTTTCGATCATAGATATGCATGCTTTACATCGAGTGGCCTTCTCTAGATCATCAAGAATCAAGAACTTATAGATCAATTTTTCATTCTGTTCATCATGTAATATTATCTCTGATCTCTTCAGCCCAGTGACAATTCGTTTGCTCACTAGAGATATCATACTCGTTCTGACTGACTCGCAGGCAGAGAACACTGATATCGGATTCGTGGCAGGAGGGACCACTTCTGGATATATCCTACTGTAAGCCAAGGACGTCTCTTCCCAACAGAAGAACATAGCTAAGCCTAGAAAACCATGGGTGTCAGCCGAATTCAAGATATCTATCATGACTCTCTCGATCTCATTGTCGCTGGCATCTGTTCTTTCTGGGTGACTCCGCAACACAGTCCACTTCGACACTCTCCTCAACTCCATCATTACTGTATCGACCATGATCCGCGGATCCAATTTAAAATACATAGTACGCTCGTAGGCCTTTACACTTGTCAGCCCGACCGATACATGTGTCTCAGATTTTTGGCCAGTTACTATGTCCTTGATGATCCGGTCGCAGATCGATCGATGCAGAAGGACAGCCTTTCTTCTCCCTGATATATTATCGTAATCCTCGTGGCTCAACTCTCTATCCGATAATTCGTATAAAGGAGAAATCCGCTCCAGGACTCTAATTCTAGATGAGGGAGTGTATAGATACGGGTTGTCCTTGAACGAAGGGATAACACTCAATGCTTTCTCACTAGATAAGTCCACAAAATCTTCTTCAATCGGATGAATACACTCATAGCAACATTGTCTGAAATGCTTGAATCGAGCCACCACCTCTTCACCCCTTATCTTGTTGGACAGATACATATTCGACAGCTCGAGAATGACGCAGAAGGTTGCTTGATAATGAAAGTCGGTGTTTTCTGCTCCCTTAGAATACCTTACCAAACTATCCGTGGAGATATGACACCTAGTAGAGTAAAGATAATTAGAGCTAGACAGCGCCCCTCTGAAAGTGCTCGAGTCTTGATATCTGTGAGCCTCAGATCCGGCAGTCCCTTCCTCCATCCCTTTGAACTTGGACGTCTCCATATCGGTCACCGAGGAGACGCATGCTTCTATGATCTTCGCCATGGAACTATGCTGCGGTACAAACCAATTGATCGTCCGCAGCAGCCTGATCGGCCTCCGAATTAGCGGTTCGGCAGAATAAATCTTTCCTCCTGTTCCAACCACTACTTTTTCCTTAGTCATGCTTCCTAGGTACGGGGGGTTCCCTCCTATGTCACTACACCATGATTCATTAGGCATCTGTTTGTCCGGATAATGCACGGAGATAAAGCCGTCTGCGCAATCACACCCTGTTGCAGTGCTGCAGTTTGTCTCCTGCATATATGATAAAGGAAAGGGGGTGGTCACACCGCGTATGATCTTCTTCCAGCCCTGTTCTCTCATTAGTTTGCACTGAGTTGTCGCACAACGAGTTTCGAACGGAGTTCCTGACTGAAAGCATCTCCATACGAAGAAGGCAAAATAATTGCGCTCATCTTTCATTATTGTGTCAAACACCTTCACTGAATCGGATTGGATTGCTAGTTTCTGGATTGTTGTGGTCTTGGTGACTTTTGACAGGATGCTGTCTACATATCCGTATATTGTAGCATCATACACATCATGGAGCAGTCGGATATGCAGCTCTCTACCTTCGCACAAGCATTCTGCGAGATATCTGCAATCTTGGTCATTTTTCGCTCTTACTAGTTGCATAAACTCAGGATTCTCAATCTTCATTCCAGAATTCAAATATCTCTGTACCACCTGCCTCACTCCAGACAATGGCGATCGAGGCGACAATAAGTTGACAGCATAAACATCCTCCAGGAGCATTGAGTAATTGCATTCTGGCATATACAGGGGATTGATCCAGTTGTTGATAAGCGTAGCTGTCTCTCCCGAAGTGTTCCCGCCATTAACGATATTATTCAGATAACTCAGGTCTCTAGACAAGCGATCAGAGAAGCCTCTCACCATCATCTCATATATGTTAGCTCCGCAATATCCAGAGAGGCTCTTCGGTATTATAGAGATGGCTCTTCTCAAAGAGTGACGAGTCATAGTCCATGACTCCTTAGGCAGTTGATACCTTATCGCCGAGAACCGATGAGATCTCAGAACCCAATGCTTGTCCTTGTCCAGTGTTTTGTACAGAGAGTCCCCTAAAATAGGATGATAGTCCAGGAAATCATCGATGCATAACGATGTCATCAAAACATATATGCAGTAAGCTGTCCAAATGCAGGGACTGGCTTGAGTGGCTGCCATTGCGTTAGATGAGACTGTGGACAGAGCATTCTCTAATGTCATTACCCCCTCGTTACTCATAGGAAATGTCCGCATCAGCTTTTTAAGGTCCATAGTCAGAGGCACTCCTTTCCATATCGGGACTTTTCCATACAAATACAGATCCTCCGACATCCATGTCTCTAATGGCTTAAGGGGAAGTCCTGACTCTGTAAATGATCTGACCAAATCTTTGAAGATATCATCCAATATGCCCGACATCTGAAGCAAACCTTCTGCTGTGGCTTTCCCGCTCTCATCTACGATGTTAGAGTACACCGTGATTTGCAAGACCTGATTATCACCCATTCCCATTATTCTGTACTCGCAATCATATTTAGAGAGAATCACTTCCAAACCGCAGACAGTATACAACGTCCATCCTTTTTGCCTTAGTCCCTCCATTCCTCCTTGGTGGTTGATGAAGGACTTAGGCTCATCTACCACGAGATTTCCGTCATCGTCTATACTCGGCACATAGCTTCCATCTGCAAGGTAATAATAACTCTCGGAGAAGAGATCATATGTGACATTGAATAATTCTGAGAGCCCGAATAAGTCTCCGATAGCAGTGAATACGCCAGATGTCATTGATTTTCTCATATGTCCATTCCACTTCTCGAAATCAAGAGATATGCACACAGTTTTAGACGCCCATCCCTTTTCTTTATTATGCCTTTTCTTCAGGGACGACTGATTTCTCACGGTGTTATACATTTTCCTCGTCAGGTCTAGCAAAGAGTCAGTCATTGTTATCTGAGGAAACATTTCTAGGA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77,679
ON165937.1
Toscana virus
Ayhan,N., Hachid,A., Charrel,R., Benbetka,C., Bourdjoul,N., Khardine,F., Khaldi,A.
Aix-Marseille Univ - Ird_190, Emergent Viruses
France
2023-01-31
null
Phlebovirus toscanaense
Phlebovirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,372
GenBank
null
Algeria
Algeria
Homo sapiens
cerebrospinal fluid
2018-06
null
null
Toscana virus strain W55/18 segment L, complete sequence
ATGGAAAGAATCCTTAAAAAACAACCAGCTCCTGTAAGAGCATTAACCATTCATCCACTGAGGAGGTATGAATCATCAATCTATGACACACCAATACCAGCCTATGTGATCAAGCATAGCTCAGATGGTGTCACCATAGATATTGCAACCTCCGAGCTTGCTGATGGACAATCTGGGTCCACTATCCAGCCTTTTGAGAGTGTCCCTGCTCAGAATTTAACTCTGTTCAAACATGACTTCACTTTTGGTCATCTAGCAGACACAACTGATAAGAAGTTTGTTGAAGTATTTGGGGTCTTAGAGAACAGAGCTGATGATTCTGACTTTCAATCTCCTGACATGATCATAGAGACAGAGACTGGCCATGTTTATGTGGTTGAATTCACAACAACCATGGGTGATGCAAACTCAGCAGATCTGGCTGCCAGAAACAAGATCGCAAAATATGAGATAGCTTGCCTCAACAGGTCTGCCATAAAGCCTATCTCTCTATACATAATTGCTGTGCATTTTAATGGAGTGGTTTCAAACCTCGATCTGTCAGACGAGGAGGTCAATGAAATTGTATTCAGGTTCAGACTGGCAAGGGACATCTTTGAGGAACTAAGAGAAATTAATCCAGCTCTATTTGACTCAGATGAGACTGTTAGCAGACTAGAGAGGGAGGTTAACAGTGTCATGTCAGCCATACAGATTGATTGGGAAACTACCGAGAAGAAATTTCCGAGCTTTAGGAAGGAGCTTTTTGAGAACTTCAGGAGTAGAGAAGTTGATGAAGAGTATATCTCCAAGATCATCAAAAGATGCACTGATGAAGCCCTGAGAGGGATTGAGAGAGATAGTCTCTACACTGAAGATATCACCAATAAAGAGAGATTTGAGCTGAACTCAAAGAGGGCAGCTTCAGACATAAAGAACAAGATGGCAGAGATGATGAGTTATGAGTTCTTAAGAGACACAGAGGACCATAAGTCAACAGTGCAGTTCCCTCCCTGGGTGACAAAGACAGGTCCGGCTGGTAAAGACTTAGAGCCTCTTAAGTCTGTAAATGTGGAAGGGTCTCATCCCATGTGTAAGATTTGGAATAAGGTATGCACAAATGCATCAATAGAGAAGATAGAGAGAATGCATGATGATCCAGTTTTGGAACTTGAATATGCAATGTCAGGGTCAACAGAGCGGTCAGTTGAGAGGAATAAGTACCACCGTACCGTGCTCACCTTGTCTCCAGAGGAGAGAGAGTATGCTGCAGTCCTGGGAGTTTGTGGAAAGAGAAATGCAAACCTGGGAGCTGTTAAAGAGGCCAGAGTGAGAAGCAAGAAGGGTTTTTCCATTGGCCACAACACTGAAAGAGTAGAAGAGTTCTTGTCTGATAGCTGTGTGGAGGATCTCATCCCAACTGAGGGCCTGTACAATCCGCTTTCTGAGGATAAATCCCTAAGACTGCTGGCAATGGGCTTGCACCAGCCTACTCTGATCCATATGGATGATGAGACTCCGGAGACTTTAGACTGCCATTTGAAATTCTTGAGTTCACCACTAGGAAGCTGGCTGCAAATGGTTTCCATAATTGGTGCAGAGTTGTCTGCTTCAGTGAAGCAGCACGTCAAGCCCAATCAGTTCATTGTGAAGAGGTTGCTGGACTCTGCTGTATTCTTGCTGATTAAGCCAACAACATCTAAGGGTCACATATTTGTCTCTCTTGCTGTCAACAAGAAGTTCTTACATGGTGAGCTAAGCAAGTCTAGTGTCTTCAAGCAATCTATTGATGCTGGTGACCTCCTGGTCACAGACTTTGTCTCGTTTAAGCTCAGTAAGATCACTAACCTTTGCAAGGCTCTGTGTGTGCTAGAGGCAGCTTCTTGTTTCTGGGCTGAAACATATGGTTTTGAACCATGGAAATTTGTGGACCAGGCCAGTGCTGTGAAGTTTTCTGATGCATGGTTCATGATAAAGCTATCTCTCCTGACTATGTTAGAGGACAAGGCAACAACAGAAGAGCTTCAGACCATGCAAAGATATGTGATAATGGAAGGGTTTGTGTCACTCCCTGAAATCCCTAAGCCACACAAGATGTTGTCAAAAATACCAAAAGTGCTTAGGTCTGAGCTGCAAGTATTCCTTACCCACAGGCTATTCAGCACAATGCAGCGAATATCAGCCACCCCTTTCCAGCTCCACAAGATAGGAGGGAACATCCGCTGGAAGGGACTTTTCAATCCTTACTCTGGAAACAGTATCGATGAGCTGCAAACATTAATTAGCTGCTGCTATAATGGTTATTTCAAAAACAAAGAGGAAGACACCGAGCCATCAGCATTATCAGCCATGTACAAGAAGATCATAGAGCTGGAACATCTTCGTCCTCCGACAGACACATACTTAGGGTATGAAGACCCCATTGATCCTAAGATGCACGAGTTTAGCAGGAGCTATCTAAAACTACTGTGCAACCATGCAAAAACCAAACTAAGGAAGCAATACGGCAGAGGAGTGATGAATCAGATTGAGAATAGCATAGTGAGAGAGGTCCAGTCAATCACTTTAGAACGGCTAGCAACTCTTAAAGCCACTAGCAACTTCGACAGTTCATGGTACACTTTCAAGGACGTGAAAGACAAGAATTACACAAGAGATAAACTTCTGGTCAAGATGACTCAGTTTGCCCATAGGGGAAAGACCCTGGCTATCGAGGTGTTTGAAGAATGCATGTCAAGGATTGAAGAGAAAGGCTGCATGGAGATCTGCCTATTCAAGAAACAGCAGCATGGTGGTCTCAGAGAGATTTATGTCATGGGTGCTGATGAGAGAATAGTTCAATCAGTGATCGAGGCCATAGCGCGGGCAATTGGAAGGTTCTTTGACTCAGACACCCTATGCAACCCTTCCAACAAAATAAGGATTCCAGAAACACACGGGCAGAGAGCCAAGAGAAGGTGTGGTCGATCTGTCTGGACTTGTGCCACCTCAGATGATGCTAGAAAGTGGAATCAAGGACATTATGTGACAAAATTTGCCCTGATGCTATGTGAATTCACTCCTCAAGAGTGGTGGCCTTTAATCATTAGGGGTTGCTCGATGTTCACAAACAAGTTCATGATGATGAATCTTGATTTCCTGAGAATAATTGATAGTCACAAGGAACTACAGATCGAGGATGAGTTTGTGAGTAAGTTGTTCAGGGCATACCATGGTGAGAGTGTGGAGCCATGGATATCTCAAGGGTGCACATACCTCAAGACAAGCACAGGGATGATGCAAGGGATCTTGCACTTCACCTCCTCCTTGCTGCACTCTTTACATCAGGAATTTGTAAAGACTACAGCCATCCAACTGTTCACTCTGAAGCTAGGCTCTGATGCATCTTCAAAAGTGGTGTGCGACATGATGCAGGGTTCGGATGACAGCAGTATGATCATCAGCTTTCCTGCTGATAATGAGAAGATTAAAATGAGGTACAAACTGGTTGCTGCTATGTGTTTCAGGATCAAGAAGAGCCTTGGCATTTACATTGGCATCTACCCGTCCGAGAAATCCACTCCCAACACAGATTTTGTGATGGAATACAACTCAGAGTTCTTCTTCCATTCTCAGCATGTGAGGCCTACCATCAGGTGGATAGCTGCTTCTTGCTCTCTCCCTGAGGTAGAGACACTAGTTGCAAGACAAGAAGAGGCTGCTAATCTTCTCACTGCTATAACTGAAGGAGGAGGGTCATTCTCCCTGGCAGCTATGATACAGCACTGCCAGTGCTCAATTCATTATATGCTCATGGGATTGGGTGTAAGTGCTCTGTTCTCGGAATTCTCAAAGGCCATTTCCAAGTGGCTCGACCCTGGGCTTGGTTTCTTCTTGTTTGACAACCCATACTCTGCGGGTCTGTCGGGATTTAAGTATAATCTGTACAGAGCCATAATGAATTCAAGCCTGAAATCAATTTACTCATTTTTCATGAAGAGGGTGAAGGGGGGATCTCAAAGAACGGATGGCATTATAAGTGAATCCTGCAGTGTCAGTCCTGGAGGAGCTATAGTAATGAGCTCCACTCTGAGGTGGGGATCAGTAGAGAAGTTTAAGAGGCTAAGGAATAGACTAAACATTCCTGAAACTTGGAAAGAGATGATCAATGAGAGTCCTGAGATCTTGTACAGGGCGCCGCAGACTGGGACTGAGATAATGCTAAGAATAGCTGAAAAGGTGCATAGTCCTGGAGTGGTTTCGTCATTAAGCACCGGGAATGCTGTCTGTAAAGTCATGGCATCTTCCGTGTACTTTCTCTCAGCCTGCATCTTCGAAGATGCAGGATCACAAGAGTACAAGGTTGTCAATAATGACAAGTACAGTCTAATGCAAAAGATCATAGCTTTTGACCAGATCGGCTGCAACGATGAAATCAGCCAAGAGGACTTGTTGTTTTTGTTCCCTAACCTGGCGGAATTTGAGGCTTTCGATTCAATCATCTATGATAAGGGGAGATTCAATGTTATTCCAAGAGCAAGCCAGAGGGAAGCAACCCAGACTCGGATTGTTGTTTTTGAACACCACTCTTCAGCCAGAGTTGCCCCAGAGAAACTTGTGAGTGACAAGTGGTTTGGCACTAGAAAGAGCAAGATAGGATCCCCTGGGTTCAGGCAAGAGTGGGATAGACTCAAGGCCATCGTTCGCTGGCTCAGAGACACTCCAGAAGAAACTCTTGACTCATCACCATTCTCTAACCACATCCAGATTCGTAACTTCTTTGCTAGAATGGAGGGTAGGCCGAGGGTCATCAAAGTCACTGGCGCACCTGTAAAAAAGAGATCTGGCATGAGCAAGATTGCAATGGCTATAAGGGACAATTTCTGTAAGACTGGGTTCTTACAAGGGCTGGAAGATGAAGTTGGTCACAGCAGAGCTATGCAAGTAGAAAAAATAAAACATTATCTGTTTTCAGTGCTCATGGGCCCATATTCTGAAGAGGCCAAGCTAGAATATGTGGTCAAGATTCTGAAAGAGGAGCC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18,843
MT032308.1
Toscana virus
Alexander,A.J.T., Confort,M.-P., Desloire,S., Dunlop,J.I., Kuchi,S., Vattipally,S.B., Mair,D., Wilkie,G.S., Filipe,A.D.S., Brennan,B., Ratinier,M., Arnaud,F., Kohl,A.
Centre for Virus Research, Institute of Infection, Immunity & Inflammation
United Kingdom
2020-03-30
1500590
Phlebovirus toscanaense
Phlebovirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,404
GenBank
null
null
null
Homo sapiens
null
2019-03-11
null
null
Toscana virus isolate 1500590 segment L, complete sequence
ACACAAAGAGGCCCAAATATGGAAAGAATCCTTAAAAAACAACCAGCTCCTGTAAGAGCATTAACCATTCATCCACTGAGGAGGTATGAATCATCAATCTATGACACACCAATACCAGCCTATGTGATCAAGCATAGCTCAGATGGTGTCACCATAGATATTGCAACCTCCGAGCTTGCTGATGGACAATCTGGGTCTACTATTCAGCCTTTTGAAAGTGTCCCTGCTCAAAATTTAACTCTGTTTAAACATGACTTCACTTTTGGTCATCTAGCAGACACAACTGATAAAAAGTTTGTTGAGGTGTTTGGGGTTTTAGAGAACAGGGCTGATGATTCTGATTTTCAGTCCCCTGACATGATCATAGAGACAGAGACTGGCCATGTTTATGTGGTTGAATTTACAACAACCATGGGGGATGCAAACTCAGCAGATCTGGCTGCCAGAAACAAGATCGCGAAATATGAGATAGCTTGCCTCAACAGGTCTGCTATAAAGCCTATCTCTCTATACATAATTGCTGTGCATTTTAATGGAGTGATCTCAAACCTCGACCTGTCAGACGAAGAAGTCAACGAAATAGTATTCAGATTCAGACTGGCAAGGGACATCTTTGAGGAATTGAGAGAAATTAATCCAGCTCTATTTGACTCAGATGAGACTATTAGTAGACTAGAAAGAGAGGTTAACAGTGTCATGTCTGCCATACAGATTGATTGGGACACCACCGAGAAGAAATTCCCGAGCTTTAGGAGGGAGCTCTTTGAGAACTTCAGGAGTAAGGAAGTTGATGATGAGTATATCTCCAAGATCATCAAAAGATGTACTGATGAAGCCCTGAGGGGGATTGAGAGAGATAGTCTCTACACTGAGGACATCACCAATAAAGAGAGATTTGAGCTAAACTCAAAGAGAGCTGCTTCTGATATAAAGAACAAGATGGCAGAGATGATGAGTTATGAGTTCTTAAGGGACACAGAGGATCACAAGTCGACTGTACAGTTTCCTCCCTGGGTGACAAGGACAGGCCCAGCTGGTAAAGACCTGGAGCCTCTTAAGTCTGTGAGTGTGGAGGGTTCTCATCCCATGTGTAAGATTTGGAATAAGGTGTGCACAAATGCTTCAATAGAGAAAATAGAGAGAATGCATGATGACCCAGTTTTGGAGCTTGAATATGCAATGTCAGGGTCAACAGAGCGGTCAGTTGAGAGGAACAAGTACCACCGCACCGTGCTCACTTTGTCCCCAGAGGAGAGAGAGTATGCTGCAGTCCTAGGAGTTTGTGGGAAGAGAAATGCAAATCTGGGAGCTGTCAAAGAAGCCAGGGTGAGGAGCAAGAAGGGCTTCTCCATTGGCCACAACACTGAGAGAGTGGAAGAGTTCTTGTCTGATAGCTGTGTAGAGGATCTCATCCCAACAGAAGGTCTGTACAACCCGCTCTCTGAGGACAAATCCCTGAGACTACTGGCAATGGGCCTGCATCAGCCTACTCTGATCCACATGGATGATGAGACCCCAGAGACTCTGGATTGCCATTTAAAATTCTTGAGTTCACCGATAGGAAGCTGGCTGCAAATGGTCTCCATAGTTGGTGCAGAGTTGTCTGCCTCAGTAAAGCAGCACGTCAAGCCTAATCAGTTCATTGTGAAGAGGTTGCTGGACTCTGCTATATTCTTACTGATTAAGCCAACAACTTCTAAGGGTCACATATTTGTCTCTCTTGCTGTCAACAAGAAGTTCTTACATGGTGAGTTAAGCAAATCTAGTGTCTTCAAGCAATCTATAGATGCTGGTGATCTCCTGGTCACAGACTTTGTTTCATTTAAGCTAAGTAAGATCACTAACCTTTGTAAGGCTCTATGTGTATTAGAGGCAGCTTCTTGCTTCTGGGCTGAGACATATGGTTTTGAACCTTGGAAATTCGTGGACCAGGCCAGTGCTGTGAAGTTTTTAGATGCATGGTTTATGATAAAACTATCTCTCCTGACTATGTTAGAGGACAAGGCAACAACAGAAGAGCTTCAGACTATGCAAAGGTATGTGATAATGGAGGGGTTTGTGTCACTCCCTGAAATTCCCAAGCCACACAAGATGTTGTCAAAAATCCCAAAAGTGCTCAGGTCTGAGCTACAAGTATTTCTAACCCACAGGCTATTCAGCACAATGCAGCGAATATCAGCCACCCCTTTCCAGCTCCACAAGGTAGGAGGGAACATCCGCTGGAAGGGACTTTTCAATCCTTACTCTGGTAACAGTATTGATGAGCTGCAGACTTTAATTAGCTGCTGCTATAATGGTTATTTCAAGAACAAAGAGGAAGACACTGAGCCATCAGCATTATCAGCCATGTACAAGAAGATTATAGAGCTAGAACATCTCCGACCCCCAACAGACACATACTTAGGATATGAAGACCCCATTGACCCTAAGATGCACGAGTTCAGCAGGAGCTATCTGAAGCTGCTGTGCAACCATGCAAAGACCAAACTAAGAAAGCAATATGGCAGAGGAGTAATGAATCAGATTGAGAACAGCATAGTGAGAGAGGTCCAGTCAATAACTTTGGAACGGCTAGCTACTCTTAAAGCTACTAGCAACTTCGATAGTTCATGGTACACTTTCAAGGACGTGAAAGACAAGAATTACACTAGAGATAAACTTCTAGTCAAGATGACCCAGTTTGCTCATAGAGGAAAGACTTTGGCTATAGAGGTGTTTGAAGAATGCATGTCAAGGATTGAAGAGAAAGGTTGCATGGAGATCTGCTTATTCAAGAAACAACAGCATGGTGGTCTCAGAGAGATTTATGTCATGGGTGCAGATGAAAGAATAGTTCAATCAGTGATAGAGGCCATAGCGCGGGCAATTGGAAGGTTTTTCGACTCAGACACCCTATGTAATCCATCCAACAAAATAAGGATTCCAGAAACACACGGGCAGAGAGCCAAAAGAAGGTGTGGTCGATCTGTCTGGACTTGTGCCACCTCAGATGATGCTAGAAAGTGGAATCAAGGACATTATGTCACAAAATTTGCCCTGATGCTATGTGAATTCACTCCTCAAGAGTGGTGGCCTTTAATCATCAGAGGTTGCTCGATGTTCACAAACAAGTTTATGATGATGAATCTTGATTTCTTGAGGATAATTGATAGTCACAAGGAGCTACAGATTGAGGATGAGTTTGTGAGTAAGCTGTTCAAGGCATACCACGGTGAGAGTGTGGAGCCATGGATATCTCAGGGGTGCACATACCTCAAGACAAGCACTGGGATGATGCAGGGGATTCTGCACTTCACTTCCTCCTTGCTTCATTCCCTGCATCAGGAGTTTGTAAAGACTACAGCCATCCAACTGTTCACTCTAAAGCTAGGCTCTGATGCGTCTTCAAAAGTAGTGTGCGATATGATGCAGGGCTCAGATGACAGTAGTATGATCATTAGCTTTCCTGCTGATAATGAGAAGATTAAAATGAGATACAAGCTGGTTGCTGCTATGTGTTTTAGGATTAAGAAGAGCCTTGGCATTTATATTGGCATTTACCCGTCCGAAAAATCCACTCCCAACACAGACTTCGTGATGGAGTACAACTCTGAGTTCTTCTTCCATTCTCAGCATGTGAGGCCTACCATCAGGTGGATAGCTGCTTCTTGCTCTCTCCCTGAGGTTGAGACATTGGTCGCAAGACAAGAAGAGGCTGCTAATCTGCTCACTGCCATAACAGAAGGAGGAGGATCATTCTCCCTGGCAGCCATGATACAGCACTGCCAGTGCTCAATTCATTACATGCTCATGGGGTTGGGTGTAAGTGCTCTATTCTCAGAATTCTCAAAGGCCATTTCCAAGTGGCTCGACCCTGGGCTTGGTTTCTTCTTGTTTGATAACCCGTACTCTGCTGGTCTGTCGGGATTCAAGTATAATCTGTACAGAGCCATAATGAATTCAAGCCTGAAGTCCATCTACTCATTTTTCATGAAGAGGGTAAAAGGGGGATCTCAAAGAACAGATGGCATTATAAGTGAATCCTGCAGTGTCAGTCCTGGTGGAGCTATAGTCATGAGCTCCACTCTGAGGTGGGGATCAGTAGAGAAGTTTAAGAGGCTAAGAAATAGACTAAACATACCTGAAACCTGGAAAGAGATGATCAATGAGAGTCCTGAGGTCTTGTACAGAGCCCCGCAGACTGGGACTGAAATAATGCTAAGAATAGCTGAAAAGGTGCATAGTCCTGGAGTGGTTTCGTCATTAAGCACCGGGAATGCTGTCTGTAAAGTCATGGCATCTTCAGTGTACTTTCTTTCAGCTTGCATTTTCGAAGATGCAGGATCACAAGAGTACAAGGTTGTCAATAATGACAAATACAGTCTGATGCAAAAGATCATAGCTTTTGATCAGATCGGCTGCAACGATGAAATTAGCCAAGAGGACTTGTTGTTTTTGTTCCCTAATCTGGCAGAATTTGAGGCTTTCGATTCAATCATCTATGATAAGGGGAGGTTTAATGTTATCCCAAGAGCAAGCCAGAGGGAAGCAACCCAGACTCGGATTGTTGTTTTTGAACACCACTCTTCAGCCAGAGTTGCTCCAGAGAAACTAGTGAGTGACAAGTGGTTTGGCACTAGAAAGAGCAAAATAGGATCTCCTGGGTTCAGGCAAGAGTGGGATAGACTCAAGGCCATCGTCCGCTGGCTTAGAGATACTCCAGAAGAAACTCTTGATTCATCACCATTCTCTAACCACATCCAAATTCGCAACTTCTTTGCCAGGATGGAGGGTAGGCCAAGGGTCATCAAAGTCACTGGCGCACCTGTAAAAAAGAGATCTGGCATGAGCAAGATTGCCATGGCTATAAGGGATAATTTCTGTAAGACTGGATTCTTACAAGGGCTGGAAGACGAAGTTGGCCACAGCAGGGCCATGCAAGTAGAGAAAATAAAGCATTACCTGTTTTCAGTACTTATGGGCCCATACTCCGAAGAGGCCAAGCTAGAATATGTGGTCAA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53,109
KU573064.1
Toscana virus
Calzolari,M., Chiapponi,C., Bellini,R., Bonilauri,P., Lelli,D., Moreno,A., Barbieri,I., Pongolini,S., Lavazza,A., Dottori,M., Baioni,L.
stituto Zooprofilattico Sperimentale della Lombardia e dell'Emilia Romagna
Italy
2018-09-06
181135-14
Phlebovirus toscanaense
Phlebovirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,427
GenBank
1
Italy
Italy
Diptera
null
2013
null
null
Toscana virus isolate 181135-14 segment L, complete sequence
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68,781
KU904265.1
Toscana virus
Baklouti,A., Leparc-Goffart,I., Piorkowski,G., Coutard,B., Papageorgiou,N., De Lamballerie,X., Charrel,R.N., Leparc Goffard,I.
Faculte de medecine, Unite des virus emergents UMR190 Emergence des pathologies virales
France
2016-04-13
null
Phlebovirus toscanaense
Phlebovirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,405
GenBank
1
France
France
Homo sapiens
null
2007
null
null
Toscana virus strain 9028 segment L, complete sequence
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KU922127.1
Toscana virus
Baklouti,A., Leparc-Goffart,I., Piorkowski,G., Coutard,B., Papageorgiou,N., De Lamballerie,X., Charrel,R.N., Leparc Goffard,I.
Faculte de medecine, Unite des virus emergents UMR190 Emergence des pathologies virales
France
2016-04-13
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Phlebovirus toscanaense
Phlebovirus
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6,404
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2004
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82,603
KX010934.1
Toscana virus
Baklouti,A., Leparc-Goffart,I., Piorkowski,G., Coutard,B., Papageorgiou,N., De Lamballerie,X., Charrel,R.N., Leparc Goffard,I.
Faculte de medecine, Unite des virus emergents UMR190 Emergence des pathologies virales
France
2016-04-13
null
Phlebovirus toscanaense
Phlebovirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,405
GenBank
1
France
France
Homo sapiens
null
2015
null
null
Toscana virus strain TOSV-54441132704 segment L, complete sequence
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82,604
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Toscana virus
Baklouti,A., Leparc Goffard,I., Piorkowski,G., Coutard,B., Papageorgiou,N., De Lamballerie,X., Charrel,R.N.
Faculte de Medecine, Unite des Virus Emergents UMR190 'Emergence des Pathologies Virales'
France
2015-12-15
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Phlebovirus toscanaense
Phlebovirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
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GenBank
1
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France
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2009
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Toscana virus strain P233 segment L, complete sequence
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84,574
KU204980.1
Toscana virus
Baklouti,A., Leparc Goffard,I., Piorkowski,G., Coutard,B., Papageorgiou,N., De Lamballerie,X., Charrel,R.N.
Faculte de Medecine, Unite des Virus Emergents UMR190 'Emergence des Pathologies Virales'
France
2015-12-15
null
Phlebovirus toscanaense
Phlebovirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,404
GenBank
1
France: Roquevaire
France
Phlebotomus
null
2009
null
null
Toscana virus strain TOSV/P51 segment L, complete sequence
ACACAAAGAGGCCCAAATATGGAAAGAATCCTTAAAAAACAACCAGCTCCTGTAAGAGCATTAACCATTCATCCCCTGAGGAGGTATGAATCATCAATTTATGACACCCCGATACCAGCCTATGTGATCAAGTATAGCTCAGATGGTGTTACCATAGACATAGCAACTTCTGAGCTTGCTGATGGGCAATCTGGATCAACGATCCAACCTTTTGAGAGTGTTCCTGCACAGAATCTGACCCTGTTCAAACATGACTTCACTTTTGGACATCTGGCAGACACTACTGACAAGAAATTTGTTGAAGTCTTTGGAGTTCTGGAGAACAGGGCTGATGACTCAGATTTTCAGTCTCCTGACATGATCATTGAGACTGAGACTGGCCATGTCTATGTTGTTGAATTCACCACAACAATGGGTGATGCCAATTCAGCTGACCTAGCTGCGAGGAACAAGATTGCCAAGTATGAGATAGCTTGCCTCAACAGGTCCGCCATAAAGCCGATCTCTCTGTACATAATTGCTGTGCATTTTAATGGGGTGGTATCAAATCTTGATCTATCAGATGAGGAGGTCAATGAGATTGTATTTAGATTCAGGCTGGCAAGGGATATCTTTGAGGAACTGAGAGAGATCAACCCAGCACTATTTGACTCAGATGAGACTGTCAGCAGACTGGAGAGGGAGGTGAATAGTGTCATGTCTGCCATACAAATAGATTGGAAGACCACAGAGAAGAAATTTCCAAGCTTCAGAAAGGAGCTATTTGACAACTTCAGAAGTAAAGAGGTTGATGAAGAATACATATCCAAGATCATTAAGGAGTGCACTGATGAAGCCTTAAAGGGGATTGAGAGAGACAGTCTCTACACTGAGAATATAACCAACAAAGAGAGGTTTGAAATGAACTCAAAGAGGGCAATTTCTGACATAAAGAACAAGATGGCAGAGATGATGAGTTATGAGTTCTTAAGAGATACAGAAGATCATAAGTCTACTGTGCAGTTCCCACCCTGGGTGACAAGAACTGGCCCCTCAGGGAAGGACCTAGAGCCCCTTAAATCTGTGAATGTTGAAGGTTCTCATCCCATGTGTAAGATCTGGAATAAGGTATGCACGAATGCATCAATCGAGAAGATAGAGAGAATGCATGATGATCCAGTGCTAGAACTTGAATATGCTATGTCAGGGTCTACAGAGCGGTCAGTTGAAAGAAATAAGTACCACCGCACAGTGCTCACTCTATCCCCAGAGGAAAGAGAATATGCTGCAGTCTTAGGGGTTTGTGGCAAGAAAAACGCAAACCTGGGAGCTGTCAAAGAGGCCAGGGTGAGGAGTAAGAAAGGCTTCTCTATTGAGCACAACACTGAAAGAGTGGAAGAATTTTTGTCTGACAGCTGTGTTGACGACCTCACCCCTACTGAAGGCCTTTACAACCCACTCTCAGAGGACAAATCATTGAGACTACTGGCTATGGGCTTGCATCAACCTACTCTAATCCACATGGATGAGGAAAATCCAGAGACCCTAGACTGTCATCTAAAATTTCTGAGTTCACCAATTGGGAGCTGGCTGCAAATGGTTTCCATCATTGGCGCTGAGTTGTCTGCCTCAGTGAAGCAGCATGTGAAGCCCAACCAGTTCATTGTGAAGAGGCTGCTGGACTCGGCTGTGTTCCTGCTGATTAAGCCCACAACATCTAAGGGCCACATATTTGTCTCTCTTGCTGTTAACAAGAAGTCACTGTACGGAGAGCTGAGCAAGTCTAGTGTATTCAAGCAGTCTATTGATGCTGGTGACCTCCTGGTGACCGACTTTGTTTCTTTCAAGCTCAGTAAGATCACTAATCTATGCAAAGCCCTATGTGTACTAGAGGCTGCATCTTGCTTCTGGGCTGAGACATACGGCTTTGAACCCTGGAAGTTTGTGGATCAGGCAAGTGCAGCAAAGTTCTCAGATGCTTGGTTCATGATCAAGTTGTCTCTCTTGACCATGCTGGAAGATAAAGCAACAACAGAAGAGCTCCAGACTATGCAAAGATATGTGATAATGGAAGGGTTTGTATCGCTCCCAGAAATCCCCAAGCCCCACAAGATGTTGTCAAAGATCCCAAAAGTGCTCAGATCTGAGTTGCAAGTATTTCTTACTCATAGATTGTTCAACACAATGCAGAGGATTTCAGCCACTCCATTCCAGCTTCATAAAGTTGGTGGAAATATCCGTTGGAAGGGGCTTTTCAACCCGTACTCTGGAAATAGCATTGATGAGCTACAAACTTTGATCAGCTGCTGCTACAATGGCTACTTCAAGAACAAGGAGGAAGATACTGAGCCATCGGCACTATCAGCCATGTACAAGAAGATTATAGAGCTAGAACATCTCCGCCCTCCTACTGACAAGTACCTAGGGTATGAAGACCCGACTGATCCTAAGATGCATGAGTTTAGCAGGAGCTATCTAAAGCTGCTATGCAATCATGCTAAGACCAAACTGAGGAAGCAGTATGGAAGAGGAGTGATGAGCCAAATTGAGAGCAGTATCGTGAGAGAGGTTCAATCAATAACCTTGGAGCGGCTGGCCACTCTCAAGGCCACCAGCAACTTTGATAGCTCATGGTACACCTTTAAAGAGGTGAAGGACAAGAACTACACAAGGGATAAGCTTCTGGTTAAGATGACTAAGTTTGCTCATAGAGGGAAGACCCTGGCCATAGAAGTGTTTGAGGAGTGTATGTCAAGAATTGAGGAGAAAGGTTGCATGGAAATATGCTTGTTCAAAAAGCAGCAGCATGGTGGTCTCAGAGAGATCTATGTCATGGGAGCTGATGAGAGGATAGTTCAATCTGTAATAGAAGCCATAGCACGGGCAATTGGGAGATTTTTTGACTCTGATACTTTGTGCAACCCTACTAACAAAATCAGGATTCCAGAAACACATGGGCAGAGAGCTAAAAGAAGATGTGGTCGGTCTGTATGGACATGCGCCACCTCAGATGATGCAAGAAAGTGGAATCAGGGACACTATGTGACGAAATTCGCACTGATGCTCTGCGAGTTCACACCCCAGGAGTGGTGGCCTTTAATTATTAGAGGCTGCTCAATGTTCACCAATAAATATATGATGATGAATCTTGACTTCTTGAGGATAATTGATAGCCACAAAGAACTACAGATAGAAGATGAATTTGTGAGCAAGCTGTTCAAAGCCTACCATGGAGAAAGTGTTGAGCCATGGATATCCCAAGGGTGCACATACCTCAAAACAAGCACTGGGATGATGCAAGGGATTCTACACTTCACCTCCTCCTTGTTACACTCTCTACATCAGGAGTTTGTAAAGACCACGGCTATTCAGCTGTTCACTCTGAAGCTAGGCTCTGATGCCTCCTCAAAAGTGGTGTGTGATATGATGCAGGGCTCAGATGATAGCAGCATGATCATTAGCTTCCCTGCTGATAATGAGAAAGTTAAGATGAGGTACAAGTTAGTTGCTGCTATGTGTTTCAGGATTAAGAAGAGTCTTGGCATTTACATTGGCATCTATCCATCAGAAAAGTCCACTCCTAACACCGACTTTGTGATGGAGTACAACTCAGAATTCTTCTTCCATTCCCAGCACGTGAGACCTACCATCAGGTGGATAGCTGCCTCCTGCTCACTTCCTGAGGTGGAAACCTTAGTCGCAAGACAGGAGGAGGCTGCAAATCTACTCACTGCTATAACTGAGGGAGGGGGATCGTTCTCACTGGCAGCCATGATACAACATTGTCAGTGCTCAATACATTACATGCTTATGGGATTGGGAGTGAGTGCCCTGTTCTCAGAGTTTTCGAAGGCCATCTCCAAGTGGCTTGATCCAGGACTTGGTTTCTTCTTATTTGATAATCCATACTCTGCTGGTCTATCAGGGTTCAAGTACAACCTTTACAGAGCTATAATGAACTCAAGTCTAAAGTCAATTTACTCGTTCTTCATGAAAAGGGTAAAAGGAGGGTCACAGAAAACAGATGGTATCATAAGTGAATCATGCAGTGTTAGCCCTGGAGGAGCTATAGTCATGAGCTCCACCCTAAGGTGGGGGTCGGTGGAGAAATTCAAGAGGTTAAGGAGCAGATTAAACATACCCGAGACCTGGAAGGAGATGATCAATGAAAGTCCTGAAGTCCTGTATAGGGCACCGCAGACTGGAACCGAGATCATGTTAAGAATAGCAGAGAAGGTGCATAGCCCTGGGGTGGTCTCCTCATTGAGCACTGGCAATGCAGTATGCAAGGTCATGGCATCATCAGTGTACTTTCTGTCAGCCTGTATCTTTGAAGATGCAGGATCACAAGAGTATAAGGTTGTCAATAATGACAAGTACAGTCTAATGCAGAAGATAATAGCCTTTGATCAAATAGGCTATAGTGATGAGATTAGCCAAGAGGACCTGCTATTTCTGTTTCCTAATCTAGCTGAGTTCGAGGCATTCGACTCAATCATCTATGACAAAGGGAGGTTTAATGTTATTCCCAGGGCAAGTCAGAGGGAAGCAACTCAAACTCGGATTGTCGTTTTTGAGCACCACTCCTCTGCCAGAGTTGCCCCAGAAAAGCTAGTGAGTGACAAGTGGTTTGGCACCAGAAAGAGTAAGATAGGATCTCCTGGATTTAGACAAGAGTGGGACAGGCTCAAGGCAATCGTCCGTTGGCTAAGAGACACACCAGAGGAGACTCTTGAAGCATCACCTTTCTCCAACCACATCCAGATTCGCAACTTCTTTGCTAGGATGGAAGGTAGGCCGAGGGTCATTAAGGTCACTGGTGCACCCGTCAAAAAGAGGTCTGGGATGAGCAAAATTGCCATGGCTATAAGAGATAATTTCTGCAAATCAGGATTCTTGCAAGGGTTGGAGGACGAAGTTGGTCATAGCAGAGCTATGCAGGTGGAAAAGATAAAGCATTATCTATTCTCAGTACTTATGGGCCCGTACTCTGAAGAAGCCAAGCTAGAGTACGTGGTAAA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84,575
KP694240.1
Toscana virus
Alkan,C., Allal-Ikhlef,A.B., Alwassouf,S., Baklouti,A., Piorkowski,G., de Lamballerie,X., Izri,A., Charrel,R.N., Allal,A., De Lamballerie,X.
UMR_D 190 'Emergence des Pathologies Virales', Aix Marseille Univ, IRD French Institute of Research for Development, EHESP French School of Public Health
France
2015-12-11
A189
Phlebovirus toscanaense
Phlebovirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,404
GenBank
1
Algeria
Algeria
Diptera
null
null
null
null
Toscana virus isolate A189 segment L, complete sequence
ACACAAAGAGGCCCAAATATGGAAAGAATCCTTAAAAAACAACCAGCTCCTGTAAGAGCATTAACCATTCATCCACTAAGGAGGTATGAATCATCAATCTATGACACACCAATACCAGCCTATGTGATCAAGCATAGCTCAGATGGTGTCACCATAGATATTGCAACCTCTGAGCTTGCTGATGGACAATCTGGGTCCACTATCCAGCCTTTTGAGAGTGTCCCTGCTCAGAATTTGACACTGTTCAAACATGACTTCACTTTTGGTCATCTAGCAGACACAACTGATAAAAAGTTTGTTGAAGTATTTGGGGTCTTAGAGAACAGAGCTGATGATTCTGACTTTCAATCTCCTGACATGATCATAGAGACAGAGACTGGCCATGTCTATGTGGTTGAATTCACAACAACCATGGTGGATGCAAACTCAGCAGATCTGGCTGCTAGAAACAAGATCGCAAAATATGAGATAGCTTGCCTCAACAGGTCTGCCATAAAGCCTATCTCTCTATACATAATTGCTGTGCATTTTAATGGAGTGGTTTCAAACCTCGATCTGTCAGACGAGGAGGTCAATGAAATTGTATTTAGGTTCAGACTGGCAAGGGATATCTTTGAGGAACTAAGAGAAATTAATCCAGCTCTATTTGACTCAGATGAGACTGTTAGCAGACTAGAGAGGGAGGTTAACAGTGTCATGTCTGCCATACAGATTGATTGGGAAACTACCGAGAAGAAATTCCCGAGCTTTAGGAAGGAGCTTTTTGAGAACTTCAGGAGTAGGGAAGTTGATGAAGAGTATATCTCCAAGATCATCAAAAGATGCACTGATGAAGCCCTGAGAGGGATTGAGAGAGATAGTCTCTACACTGAAGACATCACCAATAAAGAGAGATTTGAGCTGAACTCAAAGAGGGCAGCTTCAGACATAAAGAACAAGATGGCAGAGATGATGAGTTATGAGTTCTTAAGAGACACAGAGGACCATAAGTCAACTGTGCAGTTTCCTCCCTGGGTGACAAAGACAGGCCCGGCTGGTAAAGACTTAGAGCCTCTTAAGTCTATAAATGTGGAAGGGTCTCATCCCATGTGTAAGATTTGGAATAAGGTATGCACAAATGCATCAATAGAGAAGATAGAGAGAATGCATGATGACCCAGTTTTGGAACTTGAATATGCAATGTCAGGGTCAACAGAGCGGTCAGTTGAGAGGAATAAGTACCACCGCACCGTGCTCACCTTGTCTCCAGAGGAGAGAGAGTATGCTGCAGTCCTGGGAGTTTGTGGAAAGAGAAATGCAAACCTGGGGGCTGTTAAAGAGGCCAGAGTGAGAAGCAAGAAGGGCTTTTCTATTGGCCACAACACTGAAAGAGTAGAAGAATTCTTGTCTGACAGCTGTGTGGAGGATCTCATCCCAACTGAGGGCCTGTACAATCCGCTTTCTGAGGATAAATCCCTAAGACTGCTGGCAATGGGCTTGCACCAGCCTACTCTGATCCACATGGATGATGAGACCCCGGAGACTTTAGACTGCCATCTGAAATTCTTGAGTTCACCACTAGGAAGCTGGCTGCAAATGGTTTCCATAATTGGTGCAGAGTTGTCTGCTTCAGTGAAGCAGCACGTCAAGCCCAATCAGTTCATTGTGAAGAGGTTGCTGGACTCTGCTGTATTCTTGCTGATTAAGCCAACAACATCTAAGGGTCACATATTTGTCTCTCTTGCTGTCAACAAGAAGTTCTTACATGGTGAGCTGAGCAAGTCTAGTGTCTTCAAGCAATCTATTGATGCTGGTGACCTCCTGGTCACAGACTTTGTCTCGTTTAAACTTAGTAAGATCACTAACCTTTGCAAGGCTCTGTGTGTGCTAGAGGCAGCTTCTTGTTTCTGGGCTGAAACATATGGTTTTGAACCATGGAAATTCGTGGACCAGGCCAGTGCTGTGAAGTTTTCTGATGCATGGTTCATGATAAAGCTATCTCTCCTGACTATGTTAGAGGACAAGGCAACAACAGAAGAGCTTCAGACCATGCAAAGATATGTGATAATGGAAGGGTTTGTGTCACTCCCTGAAATCCCCAAGCCACACAAGATGTTGTCAAAAATACCAAAAGTGCTTAGGTCTGAGCTGCAAGTATTCCTTACCCACAGGCTATTCAGCACAATGCAGCGAATATCAGCCACCCCTTTCCAGCTCCATAAGGTAGGAGGGAACATCCGCTGGAAGGGACTTTTCAATCCTTACTCTGGAAACAGTATTGATGAGCTGCAAACATTAATTAGCTGCTGCTATAATGGTTATTTTAAAAACAAAGAGGAAGACACCGAGCCATCAGCATTATCAGCCATGTACAAGAAGATCATAGAGCTGGAACATCTTCGTCCTCTGACAGACACATATTTAGGGTATGAAGACCCCATTGATCCTAAGATGCACGAGTTCAGCAGGAGTTATCTAAAACTACTGTGCAACCATGCAAAAACCAAACTAAGGAAGCAATATGGCAGAGGAGTGATGAATCAGATTGAGAATAGCATAGTGAGAGAGGTCCAGTCAATCACTTTAGAGCGGCTAGCAACTCTTAAAGCCACTAGCAACTTTGACAGTTCATGGTACACTTTCAAGGACGTGAAAGACAAGAATTACACAAGAGACAAACTTCTGGTCAAGATGACTCAGTTTGCTCATAGGGGAAAGACCCTGGCTATCGAGGTGTTTGAAGAATGCATGTCAAGGATTGAAGAGAAAGGCTGCATGGAGATCTGCCTATTCAAGAAACAGCAGCATGGTGGTCTCAGAGAGATTTATGTCATGGGTGCTGATGAGAGAATAGTTCAGTCAGTGATCGAGGCCATAGCGCGGGCAATTGGAAGGTTCTTTGACTCAGACACCCTATGCAACCCTTCCAACAAAATAAGGATTCCAGAAACACACGGGCAGAGAGCCAAGAGAAGGTGTGGTCGATCTGTCTGGACTTGTGCCACCTCAGATGATGCTAGAAAGTGGAATCAAGGACATTATGTGACAAAATTTGCCCTGATGCTATGTGAATTCACTCCTCAGGAGTGGTGGCCTTTAATCATCAGAGGTTGCTCGATGTTCACAAACAAGCACATGATGATGAATCTTGATTTTCTGAGAATCCTCGACTCACATAGGGAACTACACGTGGAAGATGAATTTGTCCAAACTTTATTCGAAGCATACCATGGGAACCAAGTTGTCCCGTGGCTTCTACCAGGCTGCACTTTCTTGAAGACAAGCACAGGGATGATGCAAGGGATCTTGCACTTCACCTCCTCCTTGCTCCACTCTCTACATCAGGAATTTGTAAAGACTACAGCCATCCAACTGTTCACTCTGAAGCTAGGCTCTGATGCGTCTTCAAAAGTGGTGTGCGACATGATGCAGGGTTCGGATGACAGCAGTATGATCATCAGCTTTCCTGCTGATAATGAGAAGATTAAAATGAGGTACAAACTGGTTGCTGCTATGTGTTTCAGGATCAAGAAGAGCCTTGGCATTTACATTGGCATCTACCCGTCCGAGAAATCCACTCCCAACACAGATTTTGTGATGGAATACAACTCAGAGTTCTTCTTCCATTCTCAGCATGTGAGGCCTACAATTCGGTGGATAGCCGCGTCATGTAGTCTCCCAGAAGTTGAGACACTTGTTGCTCGCCAGGAGGAAGCTGCAAATTTGATGACAGCAGTCTCTGAGGGGGGTGGGTCGTTCTCCTTGGCAGCTTGTGTGCAACAAAGTCAATGCACTTTACACTACATGCTAATGGGCATGGGGACATCAATGCTATTTTCAGAATACAAAAAGGCCATTTCCAAGTGGCTCGACCCTGGGCTTGGTTTCTTCTTGTTTGACAACCCATACTCTGCTGGTCTGTCGGGATTTAAGTATAATCTGTACAGAGCCATAATGAATTCAAGCCTAAAATCAATTTACTCATTTTTCATGAAGAGGGTGAAGGGGGGATCTCAAAGAACGGATGGCATTATAAGTGAATCCTGCAGTGTCAGCCCTGGAGGAGCTATAGTAATGAGCTCCACTCTGAGGTGGGGATCAGTAGAGAAGTTTAAGAGGCTAAGGAATAGACTAAACATTCCTGAAACTTGGAAAGAGATGATCAATGAGAGTCCTGAGATCTTGTACAGGGCGCCGCAGACTGGGACTGAGATAATGCTAAGAATAGCTGAAAAGGTGCATAGTCCTGGAGTGGTTTCGTCTTTAAGCACCGGGAATGCTGTCTGTAAAGTCATGGCATCTTCCGTGTACTTTCTCTCAGCCTGCATCTTCGAAGATGCAGGATCACAAGAGTACAAGGTTGTCAATAATGACAAGTACAGTCTAATGCAAAAGATCATAGCTTTTGACCAGATCGGCTGCAACGATGAGATCAGCCAAGAGGACTTGCTGTTTTTGTTCCCTAATCTGGCGGAATTTGAGGCTTTCGATTCAATCATCTATGATAAGGGGAGATTCAATGTTATCCCAAGAGCAAGCCAGAGGGAAGCAACCCAGACTCGGATTGTTGTTTTTGAACACCACTCTTCAGCCAGAGTTGCTCCAGAGAAACTTGTGAGTGACAAGTGGTTTGGCACTAGAAAGAGCAAGATAGGATCCCCTGGGTTCAGGCAAGAGTGGGATAGACTCAAGGCCATCGTTCGCTGGCTCAGAGACACTCCAGAAGAAACTCTTGACTCATCACCATTCTCTAACCACATCCAGATTCGTAACTTCTTTGCTAGAATGGAGGGTAGGCCGAGGGTCATCAAAGTCACTGGCGCACCTGTAAAAAAGAGATCTGGCATGAGCAAGATTGCAATGGCTATAAGGGACAATTTCTGTAAGACTGGGTTCTTACAAGGGCTGGAAGATGAAGTTGGTCACAGCAGAGCCATGCAAGTAGAAAAAATAAAACATTATCTGTTTTCAGTGCTCATGGGCCCATATTCTGAAGAGGCCAAGCTAGAGTATGTGGTCAA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84,590
JX867534.2
Toscana virus
Bichaud,L., Dachraoui,K., Piorkowski,G., Chelbi,I., Moureau,G., Cherni,S., De Lamballerie,X., Sakhria,S., Charrel,R.N., Zhioua,E.
Aix Marseille Univ, UMR 190 Emergence des Pathologies Virales
France
2013-03-27
null
Phlebovirus toscanaense
Phlebovirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,404
GenBank
1
Tunisia
Tunisia
Phlebotomus
null
2010-09-21
null
null
Toscana virus strain T152 segment L, complete sequence
ACACAGAGAGGCCCAAATATGGAAAGAATCCTTAGAAAACAACCAGCTCCTGTAAGAGCATTAACCATTCATCCACTGAGGAGGTATGAATCATCAATCTATGACACACCAATACCAGCCTATGTGATCAAGCATAGCTCAGATGGTGTCACCATAGATATAGCAACCTCCGAGCTTGCTGATGGACAATCTGGGTCTACTATTCAGCCTTTTGAAAGTGTCCCTGCTCAGAATCTAACTCTGTTCAAACATGACTTCACTTTTGGTCATCTAGCAGACACAACTGATAAAAAGTTTGTTGAGGTATTCGGGGTTCTGGAGAACAGGGCTGATGATTCTGACTTTCAATCTCCTGACATGATCATAGAGACAGAGACTGGCCATGTTTATGTAGTTGAATTTACAACAACCATGGGAGATGCAAACTCAGCAGATCTGGCTGCCAGAAACAAGATCGCGAAGTATGAGATAGCTTGCCTCAACAGGTCTGCTATAAAGCCTATCTCTCTATACATAATTGCTGTGCATTTTAATGGAGTGATTTCAAACCTCGACCTGTCAGACGAGGAAGTCAACGAGATAGTATTCAGGTTCAGACTGGCAAGGGACATCTTTGAGGAATTAAGAGAAATTAATCCAGCTCTATTTGACTCAGATGAGACTATTAGTAGACTAGAAAGGGAGGTCAACAGTGTCATGTCTGCCATACAGATTAATTGGGACACCACCGAGAAGAAATTCCCGAGCTTCAGGAGGGAGCTTTTTGAGAACTTCAGGAGTAAGGAAGTTGATGAAGAGTATATCTCTAAGATCATCAAAAGATGCACTGATGAAGCCCTGAGAGGGATTGAGAGAGATAGTCTCTACACTGAAGACATCACCAATAAAGAGAGATTTGAGCTGAACTCAAAGAGAGCTGCTTCTGACATAAAGAACAAGATGGCAGAGATGATGAGTTATGAGTTCTTAAGAGACACAGAGGACCACAAGTCGACTGTGCAGTTTCCTCCCTGGGTGACAAGGACAGGCCCGGCTGGTAAAGACCTAGAGCCTCTTAAGTCTGTGAATGTGGAGGGTTCTCATCCCATGTGTAAGATTTGGAATAAGGTATGCACAAATGCTTCAATAGAGAAAATAGAGAGAATGCATGATGATCCAGTTTTGGAGCTTGAATATGCAATGTCTGGGTCAACAGAGCGGTCAGTTGAGAGGAACAAGTACCACCGCACCGTGCTCACCTTGTCCCCAGAGGAGAGAGAGTATGCTGCAGTCCTAGGAGTTTGTGGGAAGAGAAATGCAAATCTGGGAGCTGTTAAAGAGGCCAGAGTGAGAAGTAAGAAGGGCTTTTCCATTGGCCACAACACTGAAAGAGTGGAAGAGTTCTTGTCTGATAGCTGTGTAGAGGATCTCATCCCAACAGAGGGTCTGTACAACCCGCTCTCTGAGGACAAACCCTTAAGACTGCTGGCAATGGGCCTGCATCAGCCTACTCTGATCCACATGGATGATGAGACCCCGGAGACTCTGGACTGCCATTTAAAATTCTTGAGTTCACCGATAGGAAGCTGGCTGCAAATGGTATCCATAATCGGTGCAGAGCTGTCTGCTTCAGTAAAGCAGCACGTCAAGCCTAATCAATTCATTGTGAAGAGGTTGCTGGACTCTGCTGTATTCTTACTGATTAAGCCAACAACGTCTAAGGGTCACATATTTGTCTCTCTTGCTGTCAACAAGAAGTTCTTACATGGTGAGCTAAGCAAATCTAGTGTCTTCAAGCAGTCTATAGATGCAGGTGATCTCCTGGTCACAGACTTTGTTTCATTTAAGCTTAGCAAGATCACTAATCTTTGCAAGGCTCTATGTGTATTAGAGGCAGCTTCTTGCTTCTGGGCTGAAACATATGGTTTTGAACCATGGAAATTCGTGGACCAGGCCGGTGCTGTGAAGTTTTCAGATGCATGGTTTATGATAAAACTATCTCTCCTGACTATGTTAGAGGACAAGGCAACAACAGAAGAGCTCCAGACTATGCAAAGATATGTGATAATGGAGGGGTTTGTGTCACTCCCTGAAATTCCCAAACCTCACAAGATGTTGTCAAAAATCCCAAAAGTGCTTAGGTCTGAGCTACAAGTATTCCTAGCTCACAGGCTGTTCAGCACAATGCAGCGAATATCAGCCACCCCTTTCCAGCTCCACAAGGTAGGAGGGAACATCCGTTGGAAGGGACTTTTCAATCCTTACTCTGGAAACAGTATTGATGAGCTGCAAACATTAATTAGCTGCTGCTATAACGGTTATTTTAAAAACAAGGAGGAAGACACCGAGCCTTCAGCATTATCAGCCATGTACAAGAAGATTATAGAGCTGGAACATCTCCGACCTCCGACAGACACATACTTAGGATATGAAGACCCTATTGATCCTAAGATGCACGAGTTCAGCAGGAGTTATCTGAAACTGCTATGCAACCATGCTAAGACCAAACTAAGAAAGCAATATGGCAGGGGAGTGATGAATCAGATTGAGAATAGCATAGTGAGAGAGGTCCAGTCAATAACTTTAGAACGGTTAGCCACTCTCAAAGCTACTAGCAACTTCGACAGTTCATGGTACACTTTCAAGGAAGTGAAAGACAAGAATTACACTAGAGATAAACTTCTGGTTAAGATGACTCAGTTTGCTCATAGAGGAAAGACTCTGGCTATAGAGGTGTTTGAAGAATGCATGTCAAGGATTGAAGAGAAAGGCTGCATGGAGATCTGCCTATTCAAGAAACAACAGCATGGTGGTCTCAGAGAGATTTATGTCATGGGTGCTGATGAAAGAATAGTTCAATCAGTGATAGAGGCCATAGCGCGGGCTATTGGAAGATTTTTCGACTCAGACACCCTGTGCAATCCCTCCAACAAAATAAGGATTCCAGAGACACACGGGCAGAGAGCCAAAAAAAGGTGTGGTCGATCTGTCTGGACTTGTGCCACCTCAGATGATGCTAGAAAGTGGAATCAAGGGCATTATGTGACAAAATTTGCCCTGATGCTATGTGAATTCACCCCTCAAGAGTGGTGGCCCTTAATCATTAGAGGTTGCTCGATGTTCACAAACAAGTTTATGATGATGAATCTTGATTTCCTAAGGATAATTGATAGTCACAAGGAGCTACAGATTGAGGATGAGTTTGTGAGTAAGTTGTTCAGGGCATACCATGGTGAGAGTGTGGAGCCATGGATATCTCAGGGGTGCACATACCTCAAGACAAGCACTGGGATGATGCAGGGGATTCTGCACTTCACCTCCTCCTTGCTTCACTCCCTGCATCAGGAGTTTGTAAAGACTACAGCTATCCAACTGTTCACTCTAAAGCTAGGCTCTGATGCGTCTTCAAAAGTGGTGTGCGATATGATGCAGGGCTCAGATGACAGTAGTATGATCATTAGCTTTCCTGCTGATAATGAGAAGATTAAAATGAGGTACAAGCTGGTTGCTGCTATGTGTTTCAGGATCAAAAAGAGCCTTGGCATTTACATAGGCATCTACCCGTCCGAGAAGTCCACTCCCAACACAGACTTCGTGATGGAGTACAACTCGGAGTTCTTCTTCCATTCTCAGCATGTGAGGCCTACCATCAGGTGGATAGCTGCTTCTTGCTCTCTCCCTGAGGTTGAGACATTGGTTGCAAGACAAGAAGAGGCTGCTAATCTGCTCACTGCTATAACAGAAGGAGGAGGATCATTCTCCCTGGCAGCCATGATACAGCACTGCCAGTGCTCAATTCATTACATGCTCATGGGATTGGGTGTGAGTGCTCTGTTCTCAGAATTTTCAAAGGCTATTTCCAAGTGGCTCGACCCTGGGCTTGGCTTCTTCTTGTTTGATAACCCGTACTCTGCTGGTCTGTCGGGATTCAAGTATAATCTATACAGAGCCATAATGAATTCAAGCCTGAAATCCATCTACTCGTTTTTCATGAAGAGGGTGAAAGGGGGGTCTCAAAGAACAGATGGCATTATAAGTGAATCCTGCAGTGTCAGTCCTGGTGGAGCTATAGTCATGAGCTCCACTCTGAGGTGGGGATCAGTAGAGAAGTTTAAGAGGCTAAGAAATAGACTAAACATACCTGAAACCTGGAAAGAAATGATCAATGAGAGTCCTGAGATCTTGTACAGGGCGCCGCAGACTGGGACTGAAATAATGCTAAGAATAGCTGAAAAGGTGCATAGTCCTGGAGTGGTATCATCATTAAGCACCGGAAATGCTGTCTGTAAAGTCATGGCATCTTCAGTATACTTTCTCTCAGCTTGCATTTTTGAGGATGCAGGATCACAAGAGTACAAGGTTGTCAATAATGACAAATACAGTCTGATGCAAAAGATCATAGCTTTTGACCAGATCGGCTGCAACGATGAAATCAGCCAAGAGGACTTGTTGTTTCTGTTCCCTAATCTGGCAGAATTTGAGGCTTTCGATTCAATCATCTATGATAAGGGGAGGTTCAATGTTATCCCAAGAGCAAGCCAGAGGGAAGCAACCCAGACTCGGATTGTTGTCTTTGAACACCACTCTTCAGCCAGAGTTGCTCCAGAAAAACTTGTGAGTGATAAGTGGTTTGGCACTAGAAAGAGCAAGATAGGATCTCCTGGGTTCAGGCAAGAGTGGGACAGACTCAAGGCCATCGTCCGCTGGCTTAGAGATACTCCAGAAGAAACTCTTGATTCATCACCATTCTCTAACCACATCCAGATTCGCAACTTCTTTGCTAGAATGGAGGGTAGGCCAAGGGTCATCAAAGTCACTGGCGCACCTGTAAAAAAGAGATCTGGCATGAGCAAGATTGCCATGGCTATAAGGGACAATTTCTGCAAGGCTGGATTCTTACAGGGGCTGGAAGACGAAGTTGGTCACAGCAGGGCTATGCAAGTAGAGAAAATAAAGCATTACCTGTTTTCAGTACTCATGGGCCCATACTCAGAAGAAGCCAAGCTAGAATATGTGGTCAA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94,398
ON812581.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_1
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
8,798
GenBank
null
China:Kashgar
China
Rhipicephalus sanguineus
null
2019
SAMN28669352
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
ATAGAACATTTCTTCCTGCACTCTCTGGGAAATTTGGAGGGGCCGCGCAGGAGCCCCCTCCCGCGATTTTGCATTGACATGCCCCAAGAGTTGCATCGTCGTTAGGTTCTCAGGTGTGCTACCTACCTGCGTAGCAGCACATCAGTCCCGTCGACTTCAAGACGAGGCCCGGTATGGCGTCCCGGCAACCATATCGGCGCTATGATGATGGCGAACAGCCGGCCCCGATGCCGACAGTACCCCCAGAGTCGCCCCCAGTGATGGATGACTCTGTCCCCTACATGACCAACGTTCACATCCGTGGGCGTCCTCCCGGGCTCGAGGGTTATGGAGGTACGACTGACCCCGAAATCCCAGCACGGATAGGGCCCCCGGAATCTGAGCGTGTTCCACCGGACTTGACTCTTCACGGACTGAGACATGTGTGTTCTTGTGCGCGTGAGAAAGAACAGCGTGCCTACTACCTGCGGCCAGGGCGGATGACGATCCTACCCCCTGAGTGGAAAAGCGACTATCCCTGGCTACCTGTGGCCCTCGCTCATCTTGAGGCGTCCACCCCCGACATCACTCCCCCGTACCGCAGCACCTACATCGGCGCGGTCAGTAGCCAGCTTTTCCGTGCCCTGGACCGACTGCGGCAACGTGAGGTCATTCCATCTGGACCGTACGATTCAGTGCTGCGCGAAGAAGTTGGTCGGACGATTGAGTATACCCCCGTACCATTCCCAGACTTGGGCATGCCAGTCTCGACTAACGCCCACCGCTTTTGGAATCACCAACAATCCATGGCGAAGCACCTTTTCCACGAACTAAGACTTGAGAATATAGACGCACAGGAGTGGAGTCCACCTCCTCCCTCCGACCCTGAAGACGAAGTAGAAGAACCTCAAGAGACAGAAGATCCCGCTCCCGAGCCCGTTGACGAAACTGAAGAACCCAGCGAAGAGTCAACTCAACCCGACTCGCCTGGTGATGATACCTTATACCAAAGTTTTGAGGCTGGAGAAGGATGGGGAGGAGAGCCAGCAGAAAAGAAGGAGCGCGTAGATCGTGGGTCTTCGCCTATCGTCGTGGTTGAGGTGTTGAAAAATCCATCTCAAGTGACACCTGGAACTCCACCTCGAGCCACAGCGTCAACGTCGACGTATGCCGAAGTCACCCGTGCAACTCAGACCCCGACCAAGGCAGTTAAGATCATCGCCGCTCAAGCCAAACGGGATGCAGAACGACGCGAGACCAGCCGCACCATCCGTGAGCGTGTGACGCAGTTGGCTGCTCCAGCAGCACCGCTGCGACTACCTCACTACCGGCCCCGGTATGAAGAAGAAATGACTGAGCCAGCCCGTGAGTTGTTTTTCGAAGATGGGCCCACATCTGAAACCGACTTCGAAGCCATCGCCTACGCCAGGATTGGGAACCGCGGGCCAGAACCCAAATGTCTCCACTGGCTATACGAAGACGCTCGGTCAAGGCACAATTTAGATCGTGCTGACGAATTCTGCAAGCATGTTAAGCTTGCGGTGGCAGTTGACATCACCCGCCACCCGGATGAGTGGGGCATCGGCCCGGGCAACATCCAACTGCTGGGCGCCCTGGTTGATATGGATGTAATCAAGGATGAGTGGCTAGTGCTTGAAGAAAAGGCCACCGGTGTGAAACCTGACAGCGCCCCTCCCACTGTCAACCTTCAGGAGCGGTACACCGTGGAGGTGTATAATCGGTTCGATCCATTGTTCGAAGATGACATCAATACTCTGGAACTGACGGTTGACGATTATGCTGACATGGTAGCTACACAAGTGAAAGAAGCATTGGCCAAGAGCAAAAGGCCACCCACCGCAGCCGGCAAGAGATCTGCGCAAGCTAAGCGTCAACGAGAGGCTGACGAAGAGGAGAAGGAGCGTCGCAAGCCACTCCAGGATAAGACGAAGACGCGCGCACAGCGGAAACAGGATGGCTTAGCCGCCTTGCGGCGTATAGCGAAGAAAATAAACAACCCGGATTTGGATAAAGAGCAGCTGGCCCGCACCATACTGCGTGGTGGCTTGTCGTGTGCCGTGCGAAACATCTTGGCTGAGTACCACCACTGGCTTCGCTACCCAGCCCAGGCCCGTGCGAATGGCCAATGGTGCTGGTTGGCCGCATGCTCTCTGAACAGTGTTGCCAAACATGTGACTTTAGCTGGGTCTTTGTCAATGATGGCCCAATTTACCAACCTGTGTCATGCTACCGGAACCAGTGGATGGATCCGTGACCTGTCTGCGGACGGTGATGTCGAAAAGAACCCAGGCCCTGGACCAACAACATTCCCCATTGACCGAGCGCAGCAGGGCAACACGAGAATTGCCGATTGGGCAACCAACAAAGAAGGACTAGCGGACAATATGGCGGTACCGGCAACGATGTTTGTGCGCAACATCACGAAGAGGGTGGGGTCCAACTTGCCCGATGTGAACTATGCTGTGATCGCGGAGGGCAACTGGACGCCTGCGTCAGAAGGAGCCGCCATCCCAGTCCCCTTAGGGACATGGACTGCCATATTGTACCCAAGCACCATCAGCGATGAGTTTGTCACCTACACTCTGAGCCAGATGATGATGATGGACAGGACTAACAACATCAAGTCCGTCCCCACGTCGGCGCAGCCAACACCAGCGCCCCTTTCACCGCCCTATCGAGTGTCGCTGTCCCAAACGGGCAGTGTAGGCACCCCAACCCAAGATGAAGTCGTTTCGACCCCCGCCCGGCCTCGCACCCGTTCCCAGACTCGGGCCCGAGCGGCGGCCGAGGCAGCAGCGGCCAGCCAACCATCGACATCGGGCGGCCAAGCCACAGACCAGACCTCCAACACCAGTGACGAGCCCGAGCCAGAGCAGCCAGAAGATCCAGGGTATCCATCAGACCCAAATGTCATCGTAGCAGGCTTAACCCGCGAGGGTCTCCCGGTGCGAGTGGCCCGCGCGCGAGGCGACGGAGTTGCACTTCCTCTCCATCTCCGCGGAACCATCTCATCCCTCCACGCCCCCGGTCATCGTGTAAACGTCGTTGTCATGGAGGAAGAGGGACTGCATCAGCAACGGCCCATATGTTATGCCCGGCGTGTACCCATCACTATGGTACAACGCGGCCCGAGTCATCCAGCCGAAATTTACATTGGGTCGTATGGTGTAGCACCAGAAGATACGCCTGCCCTTGCGGCTTTAAAGACCGACACGTCGCCTAGTATTAACAAGGGCCAGGGCGTCGTCGTCTATCTCATCGGAGAATGGTATCCCGGAGTGGGGAACACAGTACCAGCCACTCAGCGGTTCCGGGGCTGGGGTCCACCCATGGTCGTGTACGGAGCACGCACAGGCATGGGCGATGGGACGTCCGTAACATCGACGATCCTAGGACAGAACCAGACTGCGAAAGCTACACCAGAACAAGTCACCACGCCGCGCTTCGACGTGACGGAAACCGGACTAGACGCAACATCTGCAGACAGGCTTGCCCGTTTGCCTCCACCGACACCGACAACCTGTGAGGCCAATGCGCTGAAGCTGGGCTTGATGTGGCAGTGGGCATCATATGGTTCGCCCCAGGCAACAACCGCCAACATCTTCACTGGGCAGCTCCAGGTGCATGAGCCTAACCGCCACATTGTGAAGGGCTCAGCTATCAAGAGGCACTTCAACAGCTCCGGCTGCGAGCGAGAAGACTGTGGTGGACTGATCACCCCCACCTTCCCCTTCCTCTGCGGATTCGAGCGGGGCGCAGTCCGGTTCTACGCAACGGCACAAGCGGTTCCGGACGGTGCCCGTTTTTTGCTTCTCCCGTTCTGCTTTGAAAAGCAGGGGTCATTTGCGGAGGCTGCAATTTACATCCTGTCTTTCCTCCGCTGGCCCTGGGGTAACATGAGCTTGTCAGCTGATACTGCCGATGACGCAGGGCAGGGGAATGTGCGACGGTTGTTCACGTGGTATGGGGCGACAACGGTGGTGCCCGGCGAGACAGTCCTGAATGTGGTTCTTCACGTTACGAACTACAGCGAGGCAGCCAACCTGCAAAAAGGGGAGCCCCGACTGGGCGTAGTCCCTACAATGGGCGGAACAGCCGTGGAGTTCTGGCAGCCGTGGGAGCCGATACCAGTGAACTACAAGGCTGATCAGCACTACTACGTCCCGGCCGCATCCTTCGCTGCCTCATGGGCGATGTCATTCGAGCCCAACCTGGTGGCCAATGTGCTGGCCAAAATCAACAACTACGGGTTGTTTGACAACGTGGAGCGTTGGGTTTTCGAGGGGCCGGCGATGCACATGGGCCACTCAGGAATAATGGCGGTCGCAGAGGCCCACATGCGTGCCACACGCTGCGCAGAAGGTGAAGGGCAGAATCTCAGTCTCCAGATTGCTGGCTCTCTGAGTGTGAATGACAACGTAGAAGTACCCCTGATGTACAGATGTTGGGCTGCGGCGGGAAATCGCATCGCTCAGGTCGAGTCCCATGCTGTTTGGACGGACGTTGAATTTTGGCCAGACACCGAGGTGTGTGTACCTGACATCATCACCATCTCTCAGATCAACTCTGGCTTCTATGCTTTTGACAAGCGGTTCGGAGTAACATCTATCCGGACAGATGCCACGTTGCTGACGGCCTACCAGTACCTGATATGCGAGAAGATGTTCGTGGGCTGGCATTTATTCCACGCGACCATGGGCCTCGGCTACTCGACACTCAGCCAGGCGCAGAGGGCGGGAATGCCTGGGCAAGGTGAGACTGTGTATTTTGCACAGCTCTTCGACAATCTGGTGTTGGAGCCCACCGACATGCAAGTCGCCTTGGAAAACATCCTGGAACGTGTGATCGGCGGCAAACTTCTGACCTCGGCGGCAGGAGCAAGTTTAACACCCCGCCTAGTCCCGCCTCGCAGATGGGAGTCACCTGTCTACGACCTTGAAGAGGTGGCCCCCCTAGAGGCCGTCACCCCTACACCCTTGGTGGACGCCTTTGTGTTCAAG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20,897
ON812582.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_1
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
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9,027
GenBank
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China:Zhangjiakou
China
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null
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PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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20,898
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Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_1
Totiviridae sp.
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2019
SAMN28697473
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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20,899
ON812584.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_1
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
7,191
GenBank
null
China:Yanbian
China
Haemaphysalis longicornis
null
2018
SAMN28669503
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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20,900
ON812586.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_1
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
6,706
GenBank
null
China:Xiangxi
China
Haemaphysalis longicornis
null
2019
SAMN28669438
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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20,901
ON812587.1
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Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_3
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
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9,143
GenBank
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China:Zhangzhou
China
Rhipicephalus microplus
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PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_4, complete genome
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20,903
ON812589.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_5
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
8,927
GenBank
null
China:Zhangzhou
China
Rhipicephalus microplus
null
2019
SAMN28669363
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_5, complete genome
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20,904
ON812590.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_4
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
6,081
GenBank
null
China:Nanning
China
Amblyomma varanense
null
2019
SAMN28669375
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_4, complete genome
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20,905
ON812591.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_3
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
8,850
GenBank
null
China:Kashgar
China
Rhipicephalus sanguineus
null
2019
SAMN28669378
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_3, complete genome
CATTTCTTCCTGCACTCTCTGGGAAATTTGGAGGGGCCGCGCAGGAGCCCCCTCCTGCGATTTTGCATTGACATGCCCCAAGAGTTGCATCGTCGTTAGGTTCTCAGGTGTGCTACCTACCTGCGTAGCAGCACATCAGTCCCGTCGACTTCAAGACGAGGCCCGGTATGGCGTCCCGGCAACCATATCGGCGCTATGATGATGGCGAACAGCCGGCCCCGATGCCGACAGTACCCCCAGAGTCGCCCCCAGTGATGGATGACTCTGTCCCCTACATGACCAACGTTCACATCCGTGGGCGTCCTCCCGGGCTCGAGGGTTATGGAGGTACGACTGACCCCGAAATCCCAGCACGGATAGGGCCCCCGGAATCTGAGCGTGTTCCACCGGACTTGACTCTTCACGGACTGAGACATGTGTGTTCTTGTGCGCGTGAGAAAGAACAGCGTGCCTACTACCTGCGGCCAGGGCGGATGACGATCCTACCCCCTGAGTGGAAAAGCGACTATCCCTGGCTACCTGTGGCCCTCGCTCATCTTGAGGCGTCCACCCCCGACATCACTCCCCCGTACCGCAGCACCTACATCGGCGCGGTCAGTAGCCAGCTTTTCCGTGCCTTGGACCGACTGCGGCAACGTGAGGTCATTCCATCTGGACCGTACGATTCAGTGCTGCGCGAAGAAGTTGGTCGGACGATTGAGTATACCCCCGTACCATTCCCAGACTTGGGCATGCCAGTCTCGACTAACGCCCACCGCTTTTGGAATCACCAACAATCCATGGCGAAGCACCTTTTCCACGAACTAAGACTCGAGAATATAGACGCACAGGAGTGGAGTCCACCTCCTCCCTCCGACCCTGAAGACGAAGTAGAAGAACCTCAAGAGACAGAAGATCCCGCTCCCGAGCCCGTTGACGAAACTGAAGAACCCAGCGAAGAGTCAACTCAACCCGACTCGCCTGGTGATGATACCTTATACCAAAGTTTTGAGGCTGGAGAAGGATGGGGAGGAGAGCCAGCAGAAAAGAAGGAGCGCGTAGATCGTGGGTCTTCGCCTATCGTCGTGGTTGAGGTGTTGAAAAATCCATCTCAAGCGACACCTGGAACTCCACCTCGAGCCACAGCGTCAACGTCGACGTATGCCGAAGTCACCCGTGCAACTCAGACCCCGACCAAGGCAGTTAAGATCATCGCCGCTCAAGCCAAACGGGATGCAGAACGACGCGAGACCAGCCGCACCATCCGTGAGCGTGTGACGCAGTTGGCTGCTCCAGCAGCACCGCTGCGACTACCTCACTACCGGCCCCGGTATGAAGAAGAAATGACTGAGCCAGCTCGTGAGTTGTTTTTCGAAGATGGGCCCACATCTGAAACCGACTTCGAAGCCATCGCCTACGCCAGGATTGGGAACCGCGGGCCAGAACCCAAATGTCTCCACTGGCTATACGAAGACGCTCGGTCAAGGCACAATTTAGATCGTGCTGACGAATTCTGCAAGCATGTTAAGCTTGCGGTGGCAGTTGACATCACCCGCCACCCGGATGAGTGGGGCATCGGCCCGGGCAACATCCAACTGCTGGGCGCCCTGGTTGACATGGATGTAATCAAGGATGAGTGGCTAGTGCTTGAAGAAAAGGCCACCGGTGTGAAACCTGACAGCGCCCCTCCCACTGTCAACCTTCAGGAGCGGTACACCGTGGAGGTGTATAATCGGTTCGATCCATTGTTCGAAGATGACATCAATACTCTAGAACTGACGGTTGACGATTATGCTGACATGGTAGCTACACAAGTGAAAGAAGCATTGGCCAAGAGCAAAAGGCCACCCACCGCAGCCGGCAAGAAATCTGCGCAAGCTAAGCGTCAACGAGAGGCTGACGAAGAAGAGAAGGAGCGTCGCAAGCCACTCCAGGATAAGACGAAGACGCGCGCACAGCGAAAACAGGATGGCTTAGCCGCCTTGCGGCGTATAGCGAAGAAAATAAACAACCCGGATTTGGATAAAGAGCAGCTGGCCCGCACCATACTGCGTGGTGGCTTGTCGTGTGCCGTGCGAAACATCTTGGCTGAGTACCACCACTGGCTTCGCTACCCAGCCCAGGCCCGTGCGAATGGCCAATGGTGCTGGTTGGCCGCATGCTCTCTGAACAGTGTCGCCAAACATGTGACTTTAGCTGGGTCTTTGTCAATGATGGCCCAATTTACCAACCTGTGTCATGCTACCGGAACCAGTGGATGGATCCGTGACCTGTCTGCGGACGGTGATGTCGAAAAGAACCCAGGCCCTGGACCAACAACATTCCCCATTGACCGAGCGCAGCAGGGCAACACGAGAATTGCCGACTGGGCAACCAACAAAGAAGGACTAGCGGACAATATGGCGGTACCGGCAACGATGTTTGTGCGCAACATCACGAAAAGGGTGGGGTCCAACTTGCCCGATGTGAACTATGCTGTGATCGCGGAGGGCAACTGGACGCCTGCGTCAGAAGGAGCCGCCATCCCAGTCCCCTTAGGGACATGGACTGCCATATTGTACCCAAGCACCATCAGCGATGAGTTTGTCACCTACACTCTGAGCCAGATGATGATGATAGACAGGACTAACAACATCAAGTCCGTCCCCACGTCGGCGCAGCCAACACCAGCGCCCCTTTCACCGCCCTATCGAGTGTCGCTGTCCCAAACGGGCAGTGTAGGCACCCCAACCCAAGATGAAGTCGTTTCGACCCCCGCCCGGCCTCGCACCCGTTCCCAGACTCGGGCCCGAGCGGCGGCCGAGGCAGCAGCGGCCAGCCAACCATCGACATCGGGCGGCCAAGCCACAGACCAGACCTCCAACACCAGTGACGAACCCGAGCCAGAGCAGCCAGAAGATCCAGGGTATCCATCAGACCCAAATGTCATCGTAGCAGGCTTAACCCGCGAGGGTCTCCCGGTGCGAGTGGCCCGCGCGCGAGGCGACGGAGTTGCACTTCCTCTCCATCTCCGCGGAACCATCTCATCCCTCCACGCCCCCGGTCATCGTGTAAACGTCGTTGTCATGGAGGAAGAGGGACTGCATCAGCAACGGCCCATATGTTATGCCCGGCGTGTACCCATCACTATGGTACAACGCGGCCCGAGTCATCCAGCCGAAATTTACATTGGGTCGTATGGTGTAGCACCAGAAGATACGCCTGCCCTTGCGGCTTTAAAGACCGACACGTCGCCTAGTATTAACAAGGGCCAGGGCGTCGTCGTCTATCTCATCGGAGAATGGTATCCCGGAGTGGGGAACACAGTACCAGCCACTCAGCGGTTCCGGGGCTGGGGTCCACCCATGGTCGTGTACGGAGCACGCACAGGCATGGGCGATGGGACGTCCGTAACATCGACGATCCTAGGACAGAACCAGACTGCGAAAGCTACACCAGAACAGGTCACCACGCCGCGCTTCGACGTGACGGAAACCGGACTAGACGCAACATCTGCAGACAGGCTTGCCCGTTTGCCTCCACCGACACCGACAACCTGTGAGGCCAATGCGCTGAAGCTGGGCTTGATGTGGCAGTGGGCATCATATGGTTCGCCCCAGGCAACAACCGCCAACATCTTCACTGGGCAGCTCCAGGTGCATGAGCCTAACCGCCACATTGTGAAGGGCTCAGCTATCAAGAGGCACTTCAACAGCTCCGGCTGCGAGCGAGAAGACTGTGGTGGACTGATCACCCCCACCTTCCCCTTCCTCTGCGGATTCGAGCGGGGCGCAGTCCGGTTCTACGCAACGGCACAAGCGGTTCCGGACGGTGCCCGTTTTTTGCTTCTCCCGTTCTGCTTTGAAAAGCAGGGGTCATTTGCGGAGGCTGCAATTTACATCCTGTCTTTCCTCCGCTGGCCCTGGGGTAACATGAGCTTGTCAGCTGATACTGCCGATGACGCAGGGCAGGGGAATGTGCGGCGGTTGTTCACGTGGTATGGGGCGACAACGGTGGTGCCCGGCGAGACAGTCCTGAATGTGGTTCTTCACGTTACGAACTACAGCGAGGCAGCCAACCTGCAAAAAGGGGAGCCCCGACTGGGCGTAGTCCCTACAATGGGCGGAACAGCCGTGGAGTTCTGGCAGCCGTGGGAGCCGATACCAGTGAACTACAAGGCTGATCAGCACTACTACGTCCCGGCCGCATCCTTCGCTGCCTCATGGGCGATGTCATTCGAGCCCAACCTGGTGGCCAATGTGCTGGCCAAAATCAACAACTACGGGTTGTTTGACAACGTGGAGCGTTGGGTTTTCGAGGGGCCGGCGATGCACATGGGCCACTCAGGAATAATGGCGGTCGCAGAGGCCCACATGCGTGCCACACGCTGCGCAGAAGGTGAAGGGCAGAATCTCAGTCTCCAGATTGCTGGCTCTCTGAGTGTGAATGACAGCGTAGAAGTACCCCTGATGTACAGATGTTGGGCTGCGGCGGGAAATCGCATCGCTCAGGTCGAGTCCCATGCTGTTTGGACGGACGTTGAATTTTGGCCAGACACCGAGGTGTGTGTACCTGACATCATCACCATCTCTCAGATCAACTCTGGCTTCTATGCTTTTGACAAGCGGTTCGGAGTAACATCTATCCGGACAGATGCCACGTTGCTGACGGCCTACCAGTACCTGATATGCGAGAAGATGTTCGTGGGCTGGCATTTATTCCACGCGACCATGGGCCTCGGCTACTCGACACTCAGCCAGGCGCAGAGGGCGGGAATGCCTGGGCAAGGTGAGACTGTGTATTTTGCACAGCTCTTCGACAATCTGGTGTTGGAGCCCACCGACATGCAAGTCGCCTTGGAAAACATCCTGGAACGTGTGATCGGCGGCAAACTTCTGACCTCGGCGGCAGGAGCAAGTTTAACACCCCGCCTAGTCCCGCCTCGCAGATGGGAGTCACCTGTCTACGACCTTGAAGAGGTGGCCCCCCTAGAGGCCGTCACCCCTACACCCCTGGTGGACGCCTTTGTGTTCAAGTATGCC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20,906
ON812593.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_1
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
5,835
GenBank
null
China:Hulunbuir
China
Haemaphysalis hystricis
null
2019
SAMN28669379
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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20,908
ON812594.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_4
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
5,643
GenBank
null
China:Yanbian
China
Haemaphysalis hystricis
null
2019
SAMN28688356
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_4, complete genome
TGGAGTCGAACAGCCGAAAGAGTACTTCAAGTTCAAGAAAGGGGTGGTGCCAGCAAAGTTGACTGGCAAGGGACTGCTGGCGGCCCAGGACCTCAAGAGTGTGATGATCGGATACCACACGCCCGTGAGAGGAAACGGGTGCCGGGCCGCACTCAAGTTCCGGACGTGGGGCCCCCCGGTGATAGGGGTGGCTCCGGTAGGAGACATTGGAACAGAGGTGAAGAAGACACTGTACATCGAGACGCTCATGGCAGACCAGAAGCCGAATCCCGAGAAGGCGATCGGATCGCGGCCGGACGTACTGGAATCGGGATACCTCCAGTCGTACCTGCTCCAGGTGGCCCTGTCGGCCCCGCCGCCCAAGACGACAATGGCTATGCCTTTGCTGAAGCTGTGCCTCTACCATCGGTGGGGGTCCTTCGCAAGTCGGGAGCCGGAGAAGACCATAGTCATGAGTGGACAAGCGCAGGTCCACGAACCGGACACGACAATGGAACCCGGCACGCCGTTCATCAGACTTCTCAACGCCTCGGGCATGGCTCTGGAGGACTGCGGGGGGACAGCCCGCCCTTCGTTTCCCTTCATGTATGGGCACCAAAGAGGAACGATCTCCTTCTACGCAGATCCTCAGATCCCGGTGGCCAACAATGAGACGCCCCTGGTGATACCGTGGGCCGTTTGGTCGACTCAGCAGATGGCCATTGTGGCCGCGTTCATCATGATGTTCGCCCCGTGGCCATGTGCCAACTTGTCACTTGGCATTAAGACGAAGGGAGCGGCGGTGGCGCACTCCTGCATGCAGACGTTTTCCTGGTTTGGGACCACGCTGGCCCTGCCAGGGGAACTGCACCTGTCAGTCGTCATACCTCGCCCGACTGCGGCCAACCTGGCGGCCCCGAAGTGGACTCTGCCCTTCTACCCGACGTTCGGGCCTACTGCCGTGCATCACTATGCACCGTTCGCGCCGATACCGGTCGTGTTCCAGGAAAGCCCGGGCAGGCGCCGCATCTACCTGTCGGACTTCTGTGTGTCATGGGTGTCTGGCATCCGGCCCTTCCACGTGGAGACGCTGCTCGGCATCCTGGAGAAGAGTGGGTTCATCGACATGAGCGAGCGGTGGGCCATCGACGCGATCACGCTCTTCTCGAACCACGTTGGCGTCATGGCCACAGGGCCTTGCGACCCCGGAGCAGGGCAGCCGCCGACACCAGACCTCCCCGACACGGTTGTTGACAAGACGGATGACCCCGTCCCCATCACGATGCGCTGCTGGCGTGACGTGGGCGACAGAATGGCACACGTGCCGCCAGAGGCAAACTGGACCGACTGGCAGCCCTCTGCCGACTGGAGCATGCCGCTTCCTGACTTGCGCACCATCAGTGGCATCGGCCTGGGAGTGTACGAGTTTGTTGACCGCACCCTCAAGATGCAGGCTCACGCTCTCCTCGCAATGCCCTACGTGGCTGCCGCCATCCAGGTTGCTGCTGAGAGGCGGTTTGTGGGGTGGAAGCAGGTCCACGCCGCAGTGGGGGCCAGCTACGAGACGTACCAGCTGGCCCATCTTGCCACAGTGGCCAGCAGCGGTGAGAGAACGGTCTTCGACGACATCTTCTCACCGGACGTGTACACGCTGCCGCGACTTCACAAGTTGGTCAGCGGCGCACAAAAGGCCGTGTCGGGAGCGCCTCCCCTGGAAGTGGTCCGCGGCCATCCGGCCTTGAACTTGCTCGCGCGTCCGGCGAGGTGGGACTCGGTAGTGTGGGATCTGAACACAGTCCGGGAGCTGCCCAAGGTGCTGGTGGGATGCCTGCCCGACCTGGTGATGTACAACTGGTGCGACTCAGTCCCCCAGGAAGACATGCCTTTTGTCATCACCACGTGCATCGAAGGCGGAACCCGGCCGCTGGAAGAGACGGGTGGCAAGGCCACCTACCCCCCCGATGGATTCAACGGCCCTCTGCTCACCATGCCGCACTATCAAGCGGAGCTGGGGCTGAACGACATGGCGGACCCGACGGTGGCTGACATCTGGATGAACAGGCTGGTGCTGTTCCTGCCGGACTACTACCTCGCGGAGTTTGTGAATGGAGACGCAGCAGCAGGGGCTCCCAGGCCCGGCCAGGTGCCGGTCCCGCTCTCCAGAAGAGAAGACGCATGGCGGAGGCTGCCCAACGTGGACCAGCTCGAGTTCCAGCAGGTGTACCCGAACCTGTCTACCACGTGGATGCCCTGGACAGACAGTCAAAAGCACAGAGTGACTGCTCTACTTTTCCAGGGCCACAGCGCCGCGTGGCGCGACCTGTTGAGGACCGGGCAGGGAGGACAGGCCTCGGGGGTGACATGGGACGACACGGGACCGCCTCTCAGCTGGTACCGCGTGTTGGGCAGTGTCGGCCCCAACCTGAAGAGCATTCAGGACAGATGGTCGGGAAATGGAGAAGGAGGAGATACGAAGCAGCCAACGGCGGCAGACTCGCCGACTGTCTCCTCCGATCCGCCGACGACCACATCTCAAGCCGATGCCGCCACGGACTGAATCCGCCACAGGAGTGGCTGGCCATGTTGCGGGACCCGTCGAAGCAAGACGTGGACAGGCTGACTCGCGTCAAGTTGAGCGAGGACGCCCGACAAGCCGTTAGATGTGCTGCCGACTTCGTTGTGGGTGCGGGAAGAACTGACTTGTTTGTTAATGTGTGTCTAACTCTAGCCGCCCGCGGGTACAACTACGACCCAGCCTTTGTGTTGTGTGCATACGTAGGAGACGTGGTGTTCGGGCAGGAGCCCCCCGAGTGTTTGGAGGCCCTGTACCGCGCTAACACCACCCTACTCCCAGAGTGTTGGATGGACCGAGTCACGGTCGAAGAGTTGGCGGACCGAGTGCGGCAAAAGGTGGTGCCGGACAAGAGTCAGCTGCCCGAGAGAGGCCCTGACTGGGACGCCCTGCTCGAAGAGGCTCTGGTCGAGCCCAACGACGACAGACTCATCCTGGCAGCTTTTCCGGCTCGTTCTCCTCAAGATTTGGGCATAAGATATGTCCGGGCCCCAGACTTGTGGGTCTTTTTCATGGAGAACAGAAGTTACGAGGAGCTGCGCCAAGTGCTTCGGCAGCTGAAGTTCTTTGACTATATTTGTATGGTTAACCTTCTGCTTGCGAAGATTGTGTTCACAAACCCCCAGTGGTGGGACACGCTTGCACGCGCCGGGTGCTTCGATGGGGGCTCCGAGCATTTCCGGCTCGCGTGCAAACAACTGTCAGACTGGGTCAAAAAAGAGAACGTCCAACTCCCGGCGGCCGAGAGAGTATGCTATTACGAATGCGCTTCGCTCTACGGGGCCATGTGCCCGCCGGTGCCGGGGTGGGACCCCATCTTAGAGACGAGAGAGCTGGCCCAGGGAGGTCAGGACGAGCACGGCCTGCTCCTCTCTTCCCGGGACGGCTACGCGCCCGAAGACTTCTGTGCGGCCATCGAGGACCTGGCTTCACTCCCCCCCCGCGACTCTCCCGATGTAAGGACATTCCGCGAGTTTCTGGAGTCGGAGGAGTGGGCCAGGGCCGGTGCGTCGTCAATCGGAACAGTGGAGTTCACGCTCGAGGCAGAGGGGACGAGGAAAATTGGACGTTTCAAGGCTCGAAAAAATTTCCTCCTCGATGTCGTCGAGTTGGACGACCTGGAACGCCGCGTCCGGGAATGTAAAGAGCAAAAGAACGTTGCTCTAATCAAGACGGAATTGTCAAAGATCAGGCTGGCGGTGTCAAGTCCGGTTGAAGTCTACTTGCCCCAGACCTGGCTGTTTCTGTTGTCCGGGAATGCATATTCCAGCTGGCCGTCCAACACGTTGGAAGAACCACTGTGGAAGGAACAGGCGCGGCACGAGACAACGTGGGAACGGCTTCAGGCGGGCGAGTATTCACTCCCCTACGACTTCGCCCGCTTTGATCATCAACCTACGACGGCGGAGATTCAGGCATTCCAGCGCGCCACCAATGAATGCGCCCGCCAGATGGTGCAGGATCACCAGCGACGCGACTTTGAAGAATTGACAGCCAACGTGCTTCAGGGGTTCAGCAATGCCACGCTGACATCGCCGCCCGGCTTGGGAGACCAGCTCACCTTCAAGGTGACAGGCGGCTTGATGTCAGGGCTGCGTTCCACGTCATGCGTCGGAAGCGGGTGGAACGCGATATTCGGACAATTCGCTACTCGCCTGATTTACGACGTACGCGGCGGACAGGCTGCCCCCAACGTATGGCAACTAGTACGGGGAGACGACACACAGGTTGTTGGCCGAAGCTACCACGACGTCCTTGGCGTTAAGCTAGGATATGACGCGCTCGGCGCAATAGCCAACGAGTCTAAGTTCACCCTCCGACGCGGCCGGACAGAGTTCCTGCGGGTTGAGACCGAAGACAGGCTCCGCGGGTATCCCTGTCGCACGATTCCTCTCATTGTGCAACGGCGGCCATGGAACGCACGACCGGTGCGGACGGAGGCAGGACTGGACCACGTCGCGAAAGCGGCATCTACTGTGAGGAGACGCATCCCTGACCCCACCGGCCTGGACGCCTTTGTGGGCTTCTTCATGACCAGGACGTGTGGAATGTTAGGCTTGGACGAACGACTGCTGAGTATCCCAGCCGCGGTTGGGGGACTAGGACTACGGCCCTGGCGTGGGGAGTGGGCTGTGCAGTGCTGGTCGTCAGTGCGTGCACCACCAGTAACCATCACCAACAGGACAAGCTACCGAGAGACGCGGGTTCGCCAAGACTTCGACAAGATCGGAGTGCCCGTGTTCCACGAAGAAGTGGCCCGGATGGCGGAGGAACGCATACGCTCCAAGATCGCCAGCGACGATATACCCGAGTTTGCCGGCATTGTCAGGCGGGCTGGCCGCAATGAGATTTTGCGGAGACGGATCCAGGCCACTAAGGTGCGCAAGGAACGCATAGACATGACGCTGATGCACATGGCCGGGTACGCCGCCACCTTGGCAGCGGTGCC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20,909
ON812595.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_5
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
8,698
GenBank
null
China:Yanbian
China
Haemaphysalis japonica
null
2019
SAMN28669411
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_5, complete genome
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20,910
ON812596.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_6
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
6,364
GenBank
null
China:Yanbian
China
Haemaphysalis japonica
null
2019
SAMN28669411
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_6, complete genome
GTGCTTGGACTCCTCAAGTGCTATGAAGTGACTGCGCGGTACGTGTTTGCCGCCCCGGACTCCTCGTGGGTCCGTGACCTGACGTGTGATGGCGACGTGGAGGCCAACCCAGGCCCCATTTCGGCGCCTCGTTCCATGGAAGAAGTCAAAGCCGCTCTCCCGCGGGTGAAGTGGTTCAAGTCCGCGACTGCCGCGTGTTGGTCTGACGTCGAGTCGGCTCGCGTGTACCTCGAGGACTACAACACGTGCACCACTCGCAACCAGGTGGGCACGAACGACGTGCTGTGTATGGACTACGGTTGGTACCCGTCTGGTTCGGGCGACAGGACGAACTACCGTACGGCCCCCTTCACGACACAGTACTACCCGACGCAGATCAACGAGGAAGTCGAGCGGCACGAGTGCCCAGGTATCTCTCAGCTCATCGAGACAACGGGCGATCGCCTTCCCCTCTGCGTGTCGACGGGCAGCCACTTCCCCCTGGCGAACGAAAAGGACCTGTACTACTACGTGGAGTACACTGGCGCGCAGCCAGGCCGTGTTGTTACCACCTCGCGCGGCGGACTTTTCTGGGCAAAGCATCGTGGTGAACGGAGTCGCTCTCCACTGGACACACCCGGTGTCACGAGCACAAGGATCTTCACCCGAGAGTCAGTGGCCGCCGGCACGGGTACGGTCGCGACGCTGCTCCCGTTCTGTGCCGTCCTGTTGCCTGACAATACCATCACAGGCTGGATGGTTAACGGAGTGCTGAAGCGCAAGGACTGGTACACGCCGATGGAGGGCGCCATCTCATGCAAGCTGGTGGGCAAGGCAGGTGTGCCGGGAACTGGACTGAGGTCCGTGATGGTGGGCTACTTTGCCGGGATCGAGGGCAACGGTGCGGAGGCTTCGCTGCGTCACCGCACCTGGGGACCTCCGATCATGGCAGTGGCGGCCGTCGAGCGTGTCGGGACACCGTTGCGCCTGTCGGACTTCTTCCAAGCGTTCCTGGATGCCAAGGACCGGCTGCGAGAGTCGGCCATCGGATCGAGGCCCGACGTCATGGAATCGGGCTACCTGAAGAGCTACCTGTCACAAGTGGCTCACGGCTCTGAAGCCCAGCCGACGACGATGGCCATGGCCTTCCTGAAGCTGGGCCTGATGCACCGTTGGGCATCGTTCGCCAGCGCTGAGCCTGCCAGGAACATCGTGCTGGCGGGCCAGGCTCAGGTTCATGAGCCAAACACGACGATCGAGAAGAACACGGTCGTCAAGCGGCTGTTGAACGCATCCGGCATGTGCCGTGAGGACTGCGGTGGAACAGGCCGCCCAGCATTCCCGTTCATGACCGGCCACAAGCAGGGCCGGATCGTGTTCTACGCAGACCCGCAAGAAGCAGTGAGGCGGAGGGAGTCGCCGTTGCACGTGCCCTGGGACATCTGGTGCACAGGCAACATGGCCCTGGTGGCGGGCTACATCATGCTCTTCACACCGTGGCCCTGCGGCAACCTCTCTCTCCTCATCAAGACACATGCGTCGCCAGAAGACCCCGCGCGCGCCCAGACCTTCTCGTGGTACGGCACGACGTTGTCGCTCCCCGGGGAGCTCCAGATCAGCGTGGTCTTCCCGCGTGACACGACCGCCGACCTGCAGGCTGCAGGCACCACACGGTGGTCGATCCCGATTCCACCAACGATGGGCCCAACCCCCGTCCGACACTTCGCCGCGTACGCGCCGATCCCAGTGGTCTACAGGCCGTCTGATCACATCCCGAAGATCAGGCTTGTGGACTTTTGCGTCTCATGGATCAACGGCTTGGCAGCAGGAGACCTTGCCAACCTGGCCTCCATCCTCACCAAGGCAGGCCTGTGCGACGGCGTCGACCGGTGGGCCGTGGACGGGCTCACGCTCTACTCGAACCACACGGGCCTGATGGCTGTGGGCCCGGTGGATCCGGGGGTGAAGGAGCCCGAGCCGATCGACGAGCCGGAGTGTCTGGAAGACCCGACGGACGACGAGGTGCCGTTGCTGATGCGGTGTTGGCGAGACGTCGGGGACAGGATGGCCCACGTCCCGTCCACTGCAGACTGGACCAATTGGGCACCCGAGGCTGATTGGACGCTCCCCCTCCCGGACATCCGTTCGGTGGGGCTGGTAGTGCTCGGCCTCTACCAATTTGACACGGCCACGAAGGCCACCACCGTGAACGTTCTGCTGTCGTCGCCCTACGTGGGGTCTGCGCTCTTCGTGGCGGCTGAAAGGAGGTTCATAGCTTGGAAGCAGGTCTACTCCGAGGCCCGCGTCAGCTACGAGAACCTGCAGCGTGCCGTCAACCCGGCCAGCGCAACCAGTGGGGAGCGCCGCACATACGACAGCATCTTTGGACTGACGGTGTACCAGGCAGGCCGGTACCTGGGCCTCATCTCCAAGATCATGACCGCAGTTCACGGCGCCAAGGCGCTACGGGTGACAGCCGACCTCGAGGCGACGAGGTTCCTCCGCCGGCCGACGCGGTGGGAGCCCAACACGTGGGATCTCACCAATGCCACCCCGATGAACAAGGTCGTGCCGGGTACGATGCCCGACAGCGTCATGTACACGTGGTGCCGCAGTGTGCCCCAGGAAGACATGCCGTTCGTGATCACCACCAAGATCGACGGCGCGTCATGTGCGCTGGTGGATGCCATCGACTCCACGCACCCGCCACCTCGGGACTACGACGGCGCATTTCTCGAGATGCGACGTTACCAGAACTTCCTGAGGCTGAACGACATGGCCGACCCGACGAGTAGTGACATCTGGGAGAACCGGCTGATGCACTTCATGCGCGGTTACTTCCTTGGCGAGTTCCACACGGCACAGCCGGCGCGCGGGGCCCCGCCTGCAGGCTACGCCCCGGTGCCGCTCACCAGGCGGCCTGACGGTTGGCAGAGGCAGCCCGGCGTTGACATGACCGAGATCAGCGCGACCTACCCGAACGTGTGCACGACGTGGACGCCGTGGACCGACTCGGTCGAGCACCAGGTGGTTGCACTGCTGGCCCCACACAACGGGTCATCGTGGATGAACCTGCGCAGGTTCGGAGAGGGAGGCCGCAGTGCCGGCATTGTGTTTGAGGACACGTCCCCGTACCAGGCGTGGTACTCAGAGCTGGGCGAGGTCGGACCCAGTCTCCGGGACATCGAGGCTCGGTGTTCGGGAAATGGCGACGAGGATGCTGCGGAGCCGAAGGGGCGGACGGACTTGCAGCAAGCATCCTCCAACACGCCAACGCAAACGCCCCCAGGCATTCCGCCACCGGACGTCAGCCACCCGTCGGCTGGTTCAGGCGGCTCGCTCGGACAGGAGGAGACCCACTGAGCCGTCTCACTGACGTGGCGCTGTGTGACGAGGGCAGACAGGCCGTGTTTGCGGCAGCGGAGAGGATCATGCTGCGCAGAAAAGACAAGCTGATGGCTAACATCTGCTACAGCTTGGCAGCACGCGGATACGACTACGACCCGGCATTTCTTGCCTGTGTCTACATGGGAGACTCGATGTTTGGTCGTACCCCACCCGCCTGTCTGGAGCCCCTGTACCGCGCCAACACCACGCTGCTGCCAGAAGACTGGATGACTCCGATTCCGGTCGAAAAGATCGCAGACCGCGTGGCTGCAGAAGTCAGGCCCAGTTGTCAAGACCTCCCGGACAGACCAGAAGACTGGGGCACGTTACTGGAGGATGCCCTGGTCAACCTCGAAGATGACAGGTACGCCCTGGCTGCCTTTCCTGCTCGCACGAACCAGGATCTGGGCATTCGCTACGCCAGAGCGGCCGATATCTGGTCCTTCTACATCGAGACCGGACGAAGCCAGGAGTTGAGGGACACGCTCCGGCTCCTCAAGTACTTCGACTACATCACCATGGTCAATGTGCTGATCGCGAAGATCGTCTTCACGCGCGCGGTCTGGTGGGACACTCTGGTGCGGGCTGGATGTTTCGTTGCTGGGGCGGAGCATTTCCGGCTTGCCGCTAGGGCCCTTTCGGACTACGTGAAGAAGGAGAATGTGGCACTGGACCCGGACGACAGAGTGTCGTTCTACGAGTGTGCGTCGCTGTACGGGGCAATGTGTCCTCCGGTCCCGGGATGGGATCCGGTGGAGGAGACGCAGGCGTTGGCCGAGGGAGGGAGCGATGAACACGGCCTGCTACTCGATTGTAGTCCGGGCTACAGCTCAGAAGACTTTCTCGATGCCGTGCGGGCGCTGGCTTTCGTTAAGCCGCGCGACGATCCTGATCCGCGGCCGTTCCACGAGTGGCTCTGGCAGGAAGAGTGGGCCCGGTCAGGTGCATCGTCGATCGGCCAGGTACGCTACACGCTCACACTTGGCGAGGAACGGATGAGCGGGAAGTTCAAGGCGAGGAAGAACCTGGTTTTGGATGTCGTGCCGCTCGAGGAGTTGGAGGAGCGGGCCCGAACCTACACCCGACAGGACAACGTGGCACTGGTCAAGACCGAATTGGCAAAGATCCGTCTGGCCGTGTCATGCCCGATTGAGACATATTTGGCACAGGCATGGATTTACCTGGTCACAGGCAACTCCTACTCCAACTGGCCGGCCAACACATTGGAAGAGCCGCTCCATGTTGAGGTGGCTAGGCACGAGGAGACGTGGGAGAAGCTGCAAGACGGGCAGTACTCTCTTCCCTACGATTTCGCGCGGTTCGATCACCAGCCGACCACCGCGGAAGTGACTGCCTTCCAGCATGCTACCAACTTGTGCGGCCTCCGCTACGCACGTCCCGAGCAGATGGATGACTATCTCCAGCTGTCGTCATGTGTCATCGAAGGATACAGCAATGCCACACTGACATCACCGCCGGGCCTGGGGAAACAGCAGACGTTCCGTGTCTCGGGCGGATTGATGTCCGGCCTCCGGTCGACCAGCTGCGTCGGTTCGGGCTGGAACGCGATCTTCGGCGAGTTCGCGAAACGGATGATCGGGGAGATGCGGGACCCTGACGACCCTGCGAGTGTG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20,911
ON812597.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_2
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
8,302
GenBank
null
China:Zhangjiakou
China
Dermacentor nuttalli
null
2019
SAMN28704271
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_2, complete genome
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20,912
ON812598.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_7
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
8,973
GenBank
null
China:Zhangzhou
China
Rhipicephalus haemaphysaloides
null
2019
SAMN28669444
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_7, complete genome
CGAATTCGAGCTTTCCCTTTTCTCGCTCTTGTACGGCGTCTTGATGAGACGTTAGAGAGCGGCCCATCTCTTTTTAGTTAGCTTTTCCCGGGAACGGCTCAGCCTTAGCGACTTGTTAGGTGTGTAGGTTTCGTAGTTGTATATGTAACGACAATTCCATCGCCGAGCGGAACGCTACCCGTCTCAGCATGGCCGCCTCCAGTGGAGGCGGTCCACCCGCCAGCGATCTTCGTAGTGCGGTGTTTTCGACATCAGGACTTGTCAGCGGCAACATATATTACCGCAACACTCTGCAAGACAGCGATAGTGAGGACGACCACACGTCTGTTGTCAGCTGGGCATCTGAGACCGCTCCCGTAGGAGCACGTGTCACCACGACAGACACCACCGGGTTGCGCCGCGTGTGCTGCTGTCTAGACGAGACTACGGTTCGTGCCCTGTACCTGCGGCGTGCTGTCAGACCCCGACCACTGCAACGATGGCGGCACCAGTACCCCTGGGTGGCCCGAATCTTTGCCGCGGTGATCTCAGGCTCAGAACCTGAGCCCCGCGGCAGCCACGAGACCTTCCGCGCCCTCTGGGCCTATACCCTCGCCCGCGCCTTTCAACGAGCAGAGGCAACTGGTGTAGTGTTCACTGGGCCCACAGACCCTGCATTCCGTGTGCTGCTGGGGGAGACCCTGGAGTATACGCCTGTGCAAATCCCCTTCCCTATACCGTCGGACTTGCGGTCATGTGCCTATGACTTCTACGGTCATCAGCGTGCACTGATGTCTCACATGGCTAGGGTGGACCGAGCTGGCTACCTGACGCCATGCGAGTCGATTCCATCGCATCTGACCCGCCCTCCATCACCCTGCCTCCAGGTGATGGCCAGCCCCGTGGCGCCTGCTGGTGCCGATCCGGTAGAAGAACCCACAGCCCCTTCACTCGATCCAGCCGTTGCGATGGGACCAATGGCGTCTGGCGGCTGCCTCGACGTCGAAGATTCCCCTCCATCCTCTGAGGGGTTTGTTGTCCCTGGCGGTGACCGTGATGATGTAGCGAGCAATCACAGCGCTGCATCAAACCTGTCCGTAGCCGCACCAGTCTTTTCGCCTCAGCGGCCCCCCCCTGGGTTTGAGCGCGATGAGACGTCCCTGGCGGGCGTACGACCACTGGACCCGGCCCGTCCAAGACCACGAAGTGCGCCGCCTTCCATTTCCGACGAAAAGGGCGTCCAGCAGACAACAACGCCGAGCTGCGTTCCCAACCAGCCTGAGCCCGCCGAACCCTCACCCCCACCCCCCGAATCCGTGCGACCCGATGGCGTCGCCCAGTGGGTTGCTGAGGCACAGGCTACCACATCCGCCCCCACCCTGCTCCCGTCCATGGGCCCTCGTCGTCCCTTTGGTGTGCAGCCACCGACACGGAACTTTGCCGCGCAGACTCCCAAAAAGCTTGAGCGACGGCCCGAACGTGAAGGTCGGCGAGTGCGCCGTGCCCGACGTTCGATGCGGTTTGGAGCCCCGCCCTCCCAAGGGGACTCAGACTGTGAACTGAAGGACCCGCCCCGCACAGTGAGTCCTGAGTACAGGCCTCAATTCTATGAGGAAGAGGGACCTGTCTGCGAGGAGATCTTCCGACGTGTGGCCGGTGCCGTGGGGGAGTGTGATCCTGACCAGATCCCATGCAACCACCTCCTCTTTCAAGAAGCGGTGAGCCGGAAGAAGATTAGTGACCCACGTCGCTACTGTCGTCATGTGCGGCGTGGTCTTGCTGTGGTCATGATGCGTCATCCCAGTGATTGGGGCATAGGCCAGGACACTTGCCAAGTGCTTGGTGCCTTTGTGGACCGAGAGATCCTCCCCCAATCCATTGCGACGAAGGGCGAACTGCGGCTGGACTACCTCGACTACACAGACCCCGCCCCCATCCAGACACTCCAGGAGTGCTACACCGTAGAAGTCCAAAATCGGTTTGCACCCTTGTTTGTCGACGAACTCGAGACCATTGAGAACGACCTCTCTGACTGTGATGACTTGACGGCATCTGCGGCAAAGGCCGCTCAGCGCCGTGGCAAGGGAGCTCATCCCAGTGGTGGCCCAGCCTCAGCTGAAGGCCAACGTCGCAAAAAGCGTGACCAAGAAGAACGGATGTCTCGTGAACAGCTGCAAGACATCAGGAAGACCCGTGACCAGAGAAAGCGTGACGGAAAGGCGGCGCTTCGACGCATCACCGCCAAAATAGCCGGCATTGATGTGCGCGACATTGATGTGGCAAAGACTGTAGTTGTAGGACACTTTTCCCCCGCCGTTCGGAAGCTGGTTGAAGAACACCACCACTGGCTTCGTGAACCAGAAGAGGCATACCGGCGAGGCAAGTGGTATTGGGCTGCCGCTTGCATCAATAACAACGTAGAGCCCTTCATCGCTGCCACTGGTCTTTTCCTGTTGGTACGCGGCCTTGGCGAGCTATGCCGGGCGACCGGATCCACAAGCTGGGTCCGTGACTTGTGCGCTGATGGCGACGTGGAGTCCAACCCTGGGCCAGCAGGCGTTGTTAACGCTCCAACCGACAGCATTGACGTTCACGCGGGCGCACTGTACTGGCGTTGGATTGAAGACAGGGCTGGCTTGAGTGCATCGCCAACCGACGTGTCGGTAGATTACCTGTCCCGCGTCACCAGCAGACCTAGCGGTTACGCTGAAGACGTCAACGACGCTGTCCTAGTTGAGGGCCGCTGGTTGCGTGCTGTCCCTTCGCGAGGCATATCCTTCAAGGCGGACACGTGGGCCACTACCCTGTACCCCACATCCATTGGCGACCGTGCCGTCAGACTGGCGAACCAGAACACCTTTCTGGCGAAGGATGCGGACGCGGCGTGCCACCTGGACAGTGTCCCTCACACAGCAGTCCCAAGACCACCGGCCCCTACGCCCTCTCCGAGCTATGTGCTCCAGACACCCCCCGGACTGCGCACCCCATTGCGGGATGAGGCATCCACATCATCGTCAAGCCCATCCACCGCCCCGCCGCCTGGCCCGACCGATGAAGAGTTGCGCCAGCAACACATCCACCCCGACCCCCCCGACGTGATTCTGGCGGCACTGGACAGCCACGGCAGCGTGTTGCGTGTGACCTCGTCCCGCGGCAACGGTATTGCTCTTCCTCTTCAGGGAGCAGGCGTTCTTCCCCGACTGGCGCACAATGACGCCCGCATCATGCTCATAGGGCGTATGAGAGAGGGAGTGGGTGTGGGAGGTCTCCACTATGCGACAAGGCACCCGATCACCATGCTCATTGAGGGAGATGGGCCACCCGTAGTCCGGATAGACGGCCAGCCCATCAGTCAGGAGGACTCTGTCTTCTTGCGTGTGTTAAAGACTCCAGAGTCTCCAAGCATCATGACCCCCACCGGTGGTGAGCTTTTCTTGATCGGCGAGTGGTACCCGGCTGAGGGGAATGGTGCGTCAGGCGAGCTTCACCACCGCAGTTGGAGTCCGCCCAAGTTTGCATTCACGGCCCAGACGGGTGTAGTGGTGGGTACTTCTTTGTCACCGACTGCTACAGGAACGGAAGAACGCCGTGACGTCGTCACTCGACCCGTGCTAGTGCCGCGAACTGAGATCACGGCTTTGGGGATAGACAAGACAACCGCTGAACGCTTGTCTATGATGCCCATAGCGTGGTCAACCACCTGTGAAGCCAATGCTCTCAAGTTGGGTCTCATGTTGGACTGGGCCCGTTACGGCGAAGAGGAGGCGTCTCACATGAATGTGTTCACAGGCCAGGCTCAGGTCCATGAGCCCCGCGTGCACGTGGCCCGGGACACCACTGTGACGCGGCTTTTCAATGCATCCGGGTTCCCACGCGAGGACTGCGGAGGTATGGTGATGCCATGTTTTCCCTTCCACGAGCGGTGGCGGCGCGGCAAGCTCAAGTTCTTTGCTACCGCCCAGCTGGTGCCGCGTGGACAGCCGTACCTCGTCTTACCCGCATGTTTTGACAGTGATGCAAGTTTCGCTGAGGCAGCGATCTTCCTGTTGACTTTCCTGCCGTGGCCCTGGGGCAACATGAGCATTGCAGTTCAGACTGTGCTCGAGGGCACCGCCCAAAAGCGTGAGCAAATCTACGCCTGGCACGGGACCACCACTGCCGTTCCGGGGTCAATGCACCTGAATATCGTGCTTCATCAGCTGAACGTGGGAGAGTTTGTCAGTGGCAGGTCAACTGACTTGGAGCTGGGCTCTGTCCCCCGCATGGGACCCGCTCCCGTTGAGTTTTGGCCGGGCGATGTTCCCATACCGGTCATCTGCAAACCGGGTCAACATTTCTACGTCCCCGCGGCGGCTTTCGCAGCGTCATGGGCCTGTGGTTTCGGCGTACGTGACATCAAGGCAGTCATTACCAAGATATGCACCTACGGCCTCTTCGATCGCGTTGAGCGGTGGATTTTGGAAGGCCCGTGCATAGCGCGTACACATGCGGGCATCATGACGGTGAGACGTGCGAAGATGGATGCGGAGGCCGTGATTGAGCCCAGCCCCGACAAGATCCCGCCCATCATGTTTGACATTGTCAATTCACCAGTTGACGAACTGATCCCCTTGATGTACCGGTGTTGGGCAGCGTCGGGCAACCAGATGGAACACATACCACACGGAGCGTCCTGGTCCGATGTCCGCCTGGTTGCAGATGCCCAGATCACATTGCCCGACATCATGTCTCTCACTATGGTGTATTCGGGTTTCTGGAAGTTTGACACCCACATGCACATCCCTCGACCAGAGGTCGATTGGCGTCTGCTGAGCGGCGCCCAGTTTTTGAACTGTGAACGGCTTTTTGTCGCGTGGCACATGTGGCACAGCATGATCGGCCTGGACGTGGGGACTTTGTGCCGGGCGGCGCGTTCTGAGCTCCCGGGCCGAGGTGAATCCGAGTACTACGACTGTGTGTTCGGCTTCGGGGCGTCTGAACACGTTCCTGCACTGGGGAACCTGCTGCGTCTGGGCCTGGAA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20,913
ON812602.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_10
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
8,044
GenBank
null
China:Yanbian
China
Dermacentor silvarum
null
2017
SAMN28669518
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_10, complete genome
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20,914
ON812607.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_8
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
8,992
GenBank
null
China:Zhangzhou
China
Rhipicephalus pumilio
null
2018
SAMN28669581
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_8, complete genome
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20,915
ON812610.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_9
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
5,000
GenBank
null
China:Kashgar
China
Rhipicephalus sanguineus
null
2019
SAMN28669353
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_9, complete genome
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
20,917
ON812611.1
Totiviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_10
Totiviridae sp.
null
Totiviridae
dsRNA
8,861
GenBank
null
China:Kashgar
China
Rhipicephalus sanguineus
null
2019
SAMN28669354
PRJNA841744
MAG: Totiviridae sp. isolate TIGMIC_10, complete genome
CGAATAGAACATTTCTTCCTGCACTCTCTGGGAAATTTGGAGGGGCCGCGCAGGAGCCCCCTCCCGCGATTTTGCATTGACATGCCCCAAGAGTTGCATCGTCGTTAGGTTCTCAGGTGTGCTACCTACCTGCGTAGCAGCACATCAGTCCCGTCGACTTCAAGACGAGGCCCGGTATGGCGTCCCGGCAACCATATCGGCGCTATGATGATGGCGAACAGCCGGCCCCGATGCCGACAGTACCCCCAGAGTCGCCCCCAGTGATGGATGACTCTGTCCCCTACATGACCAACGTTCACATCCGTGGGCGTCCTCCCGGGCTCGAGGGTTATGGAGGTACGACTGACCCCGAAATCCCAGCACGGATAGGGCCCCCGGAATCTGAGCGTGTTCTACCGGACTTGACTCTTCACGGACTGAGACATGTGTGTTCTTGTGCGCGTGAGAAAGAACAGCGTGCCTACTACCTGCGGCCAGGGCGGATGACGATCCTACCCCCTGAGTGGAAAAGCGACTATCCCTGGCTACCTGTGGCCCTCGCTCATCTTGAGGCGTCCACCCCCGACATCACTCCCCCGTACCGCAGCACCTACATCGGCGCGGTCAGTAGCCAGCTTTTCCGTGCCCTGGACCGACTGCGGCAACGTGAGGTCATTCCATCTGGACCGTACGATTCAGTGCTGCGCGAAGAAGTTGGTCGGACGATTGAGTATACCCCCGTACCATTCCCAGACTTGGGCATGCCAGTCTCGACCAACGCCCACCGCTTTTGGAATCACCAACAATCCATGGCGAAGCACCTTTTCCACGAACTAAGACTTGAGAATATAGACGCACAGGAGTGGAGTCCACCTCCTCCCTCCGACCCTGAAGACGAAGTAGAAGAACCTCAAGAGACAGAAGATCCCGCTCCCGAGCCCGTTGACGAAACTGAAGAACCCAGCGAAGAGTCAACTCAACCCGACTCGCCTGGTGATGATACCTTATACCAAAGTTTTGAGGCTGGAGAAGGATGGGGAGGAGAGCCAGCAGAAAAGAAGGAGCGCGTAGATCGTGGGTCTTCGCCTATCGTCGTGGTTGAGGTGTTGAAAAATCCATCTCAAGTGACACCTGGAACTCCACCTCGAGCCACAGCGTCAACGTCGACGTATGCCGAAGTCACCCGTGCAACTCAGACCCCGACCAAGGCAGTTAAGATCATCGCCGCTCAGGCCAAACGGGATGCAGAACGACGCGAGACCAGCCGCACCATCCGTGAGCGTGTGACGCAGTTGGCTGCTCCAGCAGCACCGCTGCGACTACCTCACTACCGGCCCCGGTATGAAGAAGAAATGACTGAGCCAGCCCGTGAGTTGTTTTTCGAAGATGGGCCCACATCTGAAACCGACTTCGAAGCCATCGCCTACGCCAGGATTGGGAACCGCGGGCCAGAACCCAAATGTCTCCACTGGCTATACGAAGACGCTCGGTCAAGGCACAATTTAGATCGTGCTGACGAATTCTGCAAGCATGTTAAGCTTGCGGTGGCAGTTGACATCACCCGCCACCCGGATGAGTGGGGCATCGGCCCGGGCAACATCCAACTGCTGGGCGCCCTGGTTGATATGGATGTAATCAAGGATGAGTGGCTAGTGCTTGAAGAAAAGGCCACCGGTGTGAAACCTGACAGCGCCCCTCCCACTGTCAACCTTCAGGAGCGGTACACCGTGGAGGTGTATAATCGGTTCGATCCATTGTTCGAAGATGACATCAATACTCTGGAACTGACGGTTGACGATTATGCTGACATGGTAGCTACACAAGTGAAAGAAGCATTGGCCAAGAGCAAAAGGCCACCCACCGCAGCCGGCAAGAGATCTGCGCAAGCTAAGCGTCAACGAGAGGCTGACGAAGAGGAGAAGGAGCGTCGCAAGCCACTCCAGGATAAGACGAAGACGCGCGCACAGCGGAAACAGGATGGCTTAGCCGCCTTGCGGCGTATAGCGAAGAAAATAAACAACCCGGATTTGGATAAAGAGCAGCTGGCCCGCACCATACTGCGTGGTGGCTTGTCGTGTGCCGTGCGAAACATCTTGGCTGAGTACCACCACTGGCTTCGCTACCCAGCCCAGGCCCGTGCGAATGGCCAATGGTGCTGGTTGGCCGCATGCTCTCTGAACAGTGTTGCCAAACATGTGACTTTAGCTGGGTCTTTGTCAATGATGGCCCAATTTACCAACCTGTGTCATGCTACCGGAACCAGTGGATGGATCCGTGACCTGTCTGCGGACGGTGATGTCGAAAAGAACCCAGGCCCTGGACCAACAACATTCCCCATTGACCGAGCGCAGCAGGGCAACACGAGAATTGCCGATTGGGCAACCAACAAAGAAGGACTAGCGGACAATATGGCGGTACCGGCAACGATGTTTGTGCGCAACATCACGAAGAGGGTGGGGTCCAACTTGCCCGATGTGAACTATGCTGTGATCGCGGAGGGCAACTGGACGCCTGCGTCAGAAGGAGCCGCCATCCCAGTCCCCTTAGGGACATGGACTGCCATATTGTACCCAAGCACCATCAGCGATGAGTTTGTCACCTACACTCTGAGCCAGATGATGATGATAGACAGGACTAACAACATCAAGTCCGTCCCCACGTCGGCGCAGCCAACACCAGCGCCCCTTTCACCGCCCTATCGAGTGTCGCTGTCCCAAACGGGCAGTGTAGGCACCCCAACCCAAGATGAAGTCGTTTCGACCCCCGCCCGGCCTCGCACCCGTTCCCAGACTCGGGCCCGAGCGGCGGCCGAGGCAGCAGCGGCCAGCCAACCATCGACATCGGGCGGCCAAGCCACAGACCAGACCTCCAACACCAGTGACGAGCCCGAGCCAGAGCAGCCAGAAGATCCAGGGTATCCATCAGACCCAAATGTCATCGTAGCAGGCTTAACCCGCGAGGGTCTCCCGGTGCGAGTGGCCCGCGCGCGAGGCGACGGAGTTGCACTTCCTCTCCATCTCCGCGGAACCATCTCATCCCTCCACGCCCCCGGTCATCGTGTAAACGTCGTTGTCATGGAGGAAGAGGGACTGCATCAGCAACGGCCCATATGTTATGCCCGGCGTGTACCCATCACTATGGTACAACGCGGCCCGAGTCATCCAGCCGAAATTTACATTGGGTCGTATGGTGTAGCACCAGAAGATACGCCTGCCCTTGCGGCTTTAAAGACCGACACGTCGCCTAGTATTAACAAGGGCCAGGGCGTCGTCGTCTATCTCATCGGAGAATGGTATCCCGGAGTGGGGAACACAGTACCAGCCACTCAGCGGTTCCGGGGCTGGGGTCCACCCATGGTCGTGTACGGAGCACGCACAGGCATGGGCGATGGGACGTCCGTAACATCGACGATCCTAGGACAGAACCAGACTGCGAAAGCTACACCAGAACAAGTCACCACGCCGCGCTTCGACGTGACGGAAACCGGACTAGACGCAACATCTGCAGACAGGCTTGCCCGTTTGCCTCCACCGACACCGACAACCTGTGAGGCCAATGCGCTGAAGCTGGGCTTGATGTGGCAGTGGGCATCATATGGTTCGCCCCAGGCAACAACCGCCAACATCTTCACTGGGCAGCTCCAGGTGCATGAGCCTAACCGCCACATTGTGAAGGGCTCAGCTATCAAGAGGCACTTCAACAGCTCCGGCTGCGAGCGAGAAGACTGTGGTGGACTGATCACCCCCACCTTCCCCTTCCTCTGCGGATTCGAGCGGGGCGCAGTCCGGTTCTACGCAACGGCACAAGCGGTTCCGGACGGTGCCCGTTTTTTGCTTCTCCCGTTCTGCTTTGAAAAGCAGGGGTCATTTGCGGAGGCTGCAATTTACATCCTGTCTTTCCTCCGCTGGCCCTGGGGTAACATGAGCTTGTCAGCTGATACTGCCGATGACGCAGGGCAGGGGAATGTGCGACGGTTGTTCACGTGGTATGGGGCGACAACGGTGGTGCCCGGCGAGACAGTCCTGAATGTGGTTCTTCACGTTACGAACTACAGCGAGGCAGCCAACCTGCAAAAAGGGGAGCCCCGACTGGGCGTAGTCCCTACAATGGGCGGAACAGCCGTGGAGTTCTGGCAGCCGTGGGAGCCGATACCAGTGAACTACAAGGCTGATCAGCACTACTACGTCCCGGCCGCATCCTTCGCTGCCTCATGGGCGATGTCATTCGAGCCCAACCTGGTGGCCAATGTGCTGGCCAAAATCAACAACTACGGGTTGTTTGACAACGTGGAGCGTTGGGTTTTCGAGGGGCCGGCGATGCACATGGGCCACTCAGGAATAATGGCGGTCGCAGAGGCCCACATGCGTGCCACACGCTGCGCAGAAGGTGAAGGGCAGAATCTCAGTCTCCAGATTGCTGGCTCTCTGAGTGTGAATGACAACGTAGAAGTACCCCTGATGTACAGATGTTGGGCTGCGGCGGGAAATCGCATCGCTCAGGTCGAGTCCCATGCTGTTTGGACGGACGTTGAATTTTGGCCAGACACCGAGGTGTGTGTACCTGACATCATCACCATCTCTCAGATCAACTCTGGCTTCTATGCTTTTGACAAGCGGTTCGGAGTAACATCTATCCGGACAGATGCCACGTTGCTGACGGCCTACCAGTACCTGATATGCGAGAAGATGTTCGTGGGCTGGCATTTATTCCACGCGACCATGGGCCTCGGCTACTCGACACTCAGCCAGGCGCAGAGGGCGGGAATGCCTGGGCAAGGTGAGACTGTGTATTTTGCACAGCTCTTCGACAATCTGGTGTTGGAGCCCACCGACATGCAAGTCGCCTTGGAAAACATCCTGGAACGTGTGATCGGCGGCAAACTTCTGACCTCGGCGGCAGGAGCAAGTTTAACACCCCGCCTAGTCCCGCCTCGCAGATGGGAGTCACCTGTCTACGACCTTGAAGAGGTGGCCCCCCTAGAGGCCGTCACCCCTACACCCTTGGTGGACGCCTTTGTGTTC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20,918
AB291142.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
5,592
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment C2, complete sequence
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107,471
AB291143.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
5,609
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment C3, complete sequence
CTCGAGCGTTCTGTTGTTTAAGGTTACACTGCAAGAGGCTACAGAACTTTTAAAAAAGTATCCTCGATTGTCGGAAACATACGGAAAGCTGGTCTCAAAAATATCTATAATATTTGCGGCGATATGGAACGTGTCAGCTGCCCAAGATATGTGACCGATTGCTGCGAGGTACGTTACACTTTTCCCACAGAACTGTTGCAAAATCTGGTGATAAAGTTTACGCAGCTATGCTCCGCAGAGCGTATGGCGTCCCAGAGCGTATAAATACTGCAAAAAAATCATGACAGCCGAACACAGACGTCGTTTCCATATGGCGAACGTAAGGAAGGTTTTGACGATGATGCCTGCTGCCGATTGATTCTTTTCGTTCGAGTCCATCAGTACCTTCATGAACCCAGGCAAACATAAAACGTACTTGACGCGTACATGAATCCGAAAACGTCCACGTCACGACCATTGGAAACTGGTAGCAATTATAAACTAATTGTTTGCAGATCAACATCCTACAATACATATTGCATTTTAATTTGGCACGAATATACGTTTGGTTCGTTGGCAAGATGTTTTTTCAGGCAGATAAGTCGCGGTTTTACGATCGCACTTGTCAACACCGCCTAGTAAAAATTCAGTCCTGGTGGCAGACAAGCTCCCTCCATTCCAGGGGTATTCCCTTGTTCGTTTAGCATTTTATTATCCACGATGAACCTGAAAAAGCTATAAACTTATGAATTATTACCAAGATCATCCAGGTTTTGAGTATAAAAGTGAATGCTGGAATATAATGCCACGCAGTTCACTTCGAATGTCGTAAAGTTCGGTTCTTCGAGCGGTTACAAGGGAAGATTGCAGAAAATAATAGTCGCGGGTTTTCCAACAGTTACAATGAATCCCGAAAATAATGAAGCATCGCAAGCTCTCTCGTCACAGCTAGTGCGTTTACCGGACGACGTTCTTCTTTACTTCAGCAAATTCGTAAATTTCCAAGACTTTCGTAGTTTCATCCGATTCCTTTGGCCCAACGGCGACGAAAGTGACGTCATTCAAGAACAGTTGGTGCGGAAGTCGACTCACACCTTCGAAGCTACGTTTTTTAACGAGAAAAAATTGAAGATAGTATATAACTTTGATCCGGAAAGAGACGACGAAGAGCGCATTCTTTTAGGCTTAGACAGCCTAAAACCCATATTCGGAGGGATCTCCTATCCGAAGATACACGAATTCTCGGGCATATGGGACCTATACGATTTCGTCTTTGTGCATATCCATCTGAATAGGTGTTCGCACTATCAGAACGCCTCCTGCTCCTGTGAACATGCGCCGAGCATGGAAGAGTTACCGCGACCGATCGAAAACAATTGCGAACATGACCACTTTCACCATTATTGTTGGGAGCACGTTTGGTTGTGGATATCGGGTTATCTGTATGGTTCGATTCTCTTGCAAGATCCAAACAATTTTTCAATGACCTCATGGCCGAACAATGGCGCTTATACCCTGAATTCATTGAGTATTTTCAAACAGGCAGCCGCGCCACGCCAGAATTTTTACTCCATGTGGCTTTAGAGAAATGTGGTTATTTTCCGGATGAGTTGCTTTGAATGTGTAGTTTTTTTTTCTTTTCGCCTTCCTAACCGGTAGAAAATTAACATCAGTTATACTCTAAAGTATGTAGCTCCCTTGTGTGTAATAATAAAATTATGTCAAATATGTGTACCCTTTCTTTCCTGCAACACTGTCACGAGAATTTTGTCATTCCACAGAGCACGACGGACGTCGTAGTCATGCTACCGAGCATATCATCACCGGGTATGTGTGTCTGTTTGACACTGCGTTGAGCTCGTCGTCGCATTGTGGAACGCGATGCCTCGAGCTACCTGTCGAACAAAGAACCATATATTCCATCAAAGTGTATCCGCGTTTGCTTCGGCTCATGAGGTAGCTTATCATGGCGCACACGAGTATGCAGCACCATCCAGCGTTGAGCACTTTCGCGACTGTGCAGTCGCATCGAAATCTCATAATGAAATACGACGGACGTTGTCGTTCGAGACCGACGAGTTTTACACTGGCTACTTGCATCGCTAAACCGAGTACGAAGCTCAATATACATACCAAGTCTGAAACAATGGTAATGAGCTTATGATGCATACAATATGGATTAACGTTCGCTGAGTTCGAGTAAACAAATAATTCTACAAATTTCTCGCTTGAGTCTGATGCAATTGCAAATCGATGTTCCTACTATTGACGTCGTCTATCAACATGCACTTGACGCTATACGCGACAATCACTCTAGAACCTGATGTGATCGGCTGCACAACTCGTCTATCATGTTGTTGTCCAAGTCTCGCTGTCACTCACGGATTCATTCGTTTCTGGCCGAATGATATCCACCCTGAGCCTTCTTTCCTGCACTTACTGTTTGTGACTGGGAAATTGTGAAAATCGGAAGCTAAGAGGAAGAGTAGTAGTTTTACCATCCCGTGACCACTCGCTTAGGTACACTTTTTCAATGACAGATTATTGGAATAGTCAGGTATCACTAATGGCTCACGAATTCATACATCAATTACATCCACACTGTGCCGAAGCGTGAAATAGTAGTTACTAGAAGCTGAAGTTCTGCGGTCTCGTAATTGCACTCTCGAGGAGTACTCTTTGATCTACAGTTACCAAGCCACATCATGACCACGGCATCGTAGGGTCAACCCACACAGTGTTCCTGTTCTTTGTACACGAACTCGAAACATTTGAACGAGTTCTTACCCCCTCGACCCGTTGATGCAGTGGTGAGCAACAGTATAATCCGAAGAAGATAAATTTCACCCGACAACATTTGACAGATGCTAAATGGAAAACACGTGTCGATCATATACGTTATTATGCTGGCCGCCGAATGAATACAGTCATAAATATGAAATGAGCTATGAAATTTATTACAGAGGTTCCCAAAGTGGATTGTATTTCCACACTTTGGTCCGTCAGCATGTGAAGATGTTGGAAATAATCTGGTTCGAACTCGAGACCAACCGCACTATCAGATACCCAGATATGACATTGTACAAATCACGTTCCAACCTCGAACCGTCCTCACCACCTTCCACCCGTTGAAAGAAACGGGCTCTGTAAGTTTGAGAATCTGAAATCATTCAGGATTCATGAATCAATTGACGAATGCAAACACCCGTATTTCATGTGAATTCAAGTTATTCAATGTAGTCCATGATTAGCATTTGGGTATTTATAGCGAAATTGAGCGAACAAAGTCGCAGTTCATCTCATCACAATTCAACGCGGCGTGTGGTTTAAAGATTCAACTATTGAAGTGCTCACTATAACCCAAAGTGAGTGTGTTCTTGTGCAATAACGATGCATTCTCGAAAACGTGGAAAATGGAGGGCTCCACCACCGCCGTTCTTCACGTCAGAACGTATTTCTTTACCGCTGAAGACAATTGTCTGCATGTCCAAATTTTTGTGTTTCGTCGATTACCAGAATTTCATCCGATCACTCTGGCCCACTGGAAACTACAGTGACATTATTGAAGCAACATTATGGCAAAAATCTACTTACAAGTACACAACCAAGTTCATTAATGGGAAAAGGATGGAGATCACGTACAATTTCAATCCCTCAAGATCTGAAAAAGATCGGATTCGCATAAACTTGGACTCTTTGCGGCCTGTGTTCGGTGGGTTGGTCCCTCCAGCAATGCACAAATTCACAAACGTATCAAAGCTGGAGAATTTCATCACGGTGCACGTTCATTTGAACATGTGTTCGAACCGTCGATTTGCTTCCTGCCCTTGTCATCTGATAAACGCCAATAATGAGGTTTGTGAAGAATTTGTGAAGCCTGCTATAGACGCGTGTAGCCATGGACACTTTCATCATTATTGCTCGGACCACGTTGAAACTTGGTTGAAAATTCTGGAGAATACTTTGATCTGCCGTCAGGAACTGGGAGAGCTTTTTAGCGAGGACATCGCCGAAATGTCGTTATTGTCTGTAGATGATATCGTTTATTTGCAAGGGGAACCGATGCGACGTTGCGGTGGATTACTCTTCAAATTGGTCTAGAAATGAATTTAGCTGCGGTGTTGGATGCGCGTATACAAGAGTGGTACAAGTGCATCTCGACGATATATAGCGTGTCTGGGTGACACATGTGATTAAATGTTAACGCAATTTAATGCATGCTGCCCACTGGTATATTCGAATAAATCTATGTATTAAACACGTTTGGTTTTATTCTTGCCTATAACCCTACATTGAGGTAAGTTTGAGCCACATTGTAGGAAAGAGCCATAAGACTACAAGAATAGTGTTACTGACGATCAGGAACTTGGTCATGTGAGCATAGTCAGTGAGTGTGCTGTGCTGGCGGGACTCATGAGCGCCCCTTCCAAGGAAAGCACGACAGCTCAAAATATGTATTTTCCTCGTTTTGCTGGATAATGCCTTAGGTGGCTCATAATGAATTTTGTAAAAATGATCCGACGATAAGAATATCTTGTGACTATACTGTTCTGTTATTGGTACCAGGCCCCCTCGCAATAGTTTTACCAGTTTTCAAGGCATATTAATGTCTACACTCGGGCGACAATCAGTCTTAACGACAATGCTACATTTTTGCGATGTCAGTAATTTTCTGCATTATCTTCATCACATAGATGCAGTTATCATGAAAGATCCAAATTTACTACATAAAGGTGACATCTTCAAGCAGTGTAGTTTAAACGTAATAACGGTTTGTATCATCTCCATCTTATTTATGTTGATAAAGGAAAATGTACGGCTCTGTGACAACACTGTTATATGGCATCAGTTGAGATTTAGGTTACGTAAGAATTTTGAAAATAACCTCTACTGCGTTTGCTGAGTCGGTATATCCCATCGACCGTCTATGCTGGGTTATGAGCATACGAAACGGTTTGCACTCTTACAACGGCTCGTTGAAACGACTAGCCACGACGGATCGTTAGTTCGACTATCAGCAG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107,472
AB291144.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
5,740
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment C4, complete sequence
GCAAAGAGTCATCATTACGGTTCACCATCGTCTGTTGTTAATGTCAAGCCATGGCTTTACGAGACGCTGAGCTGAATACTACACACCCTGTTCGCCGACCAAAGTAATGTGCTGTCAAGAATGAACTGGTGAAAATTTCCAACTGGGGCGTGACTTCTCGAAACCACGACAATTAACTCTTTACCGGCAAGCATGCTCTACGAACAGTCTGAGATCTTGAACTGCAGAAAACGTCCAGTGATCTCGTATGATCCATGGCAGCAGGTAAATCGTTTCATTGCCGCTAGGTTGTGGCGAAAACATGCTTAATAAGGCTGTGCTTCTAGAAGTATAGCGACAAGCGTGACTCTCGGAGATTGTAGTAGAAACATTGTTCCTGACGCAGGTAGACGCTGGGATGCCTTAGTAACATAGCTTCGTAGTGACCAATCCTCCGCAATGCTGCCGAATATCGAAGCAGTTGCGTACGCGCTACGAATTTTATAAACTGCTTCTTGAAACAGATGTAACCGGAGAAACTGGCTGCTCGGAAGACTTATACGATGAAGCCAAACACCGTCATCTATAATTATATGTCTTCAATTGCTCCAACATAACGATTTTCGCAAGTTTACCGACAAAATACCATATAATCCAGCCGTAGTGGCCGTAGATGTTATATGTGTGCTTCGCTACAAGCCGTCATAATGTTATTAGTATGCACAAGTGAAACACGTGCGATGTACACGTATGTTCTGCATTACTGTTGGTCTGGAATGAACAAGATCGGCAAGAAGTACGTTCGTTGAAAGCTGATCCCACTTTCGTTTTGTTATAACGATGTTCTGCTTTTGATGATCGTTCGTCCCGAGTTTAACTGTCTGACCTACTCAGATCTACTGACGTTGAAAAATGTGGTAAAACGACTACCATTATCCTTATCTCTTAGTTATTGCAACTATTTTCCTCTTAGGCCGCGGTGCGAGTTGTGCGAATAGAGCACACAGAAAAATCTATTTACAGTACTAACCAGTCTGACCGCTCGTGAGCGCGCTTAATCTTCCTACAATATGCGCATTACGTCAGCAGCTAACATAACCTGTTGATTTCGATAGTTATTTTTGAAGGAGGACATGGTTGATGTTTTTCGAAATGTATCTTGCGACAACGAGTGAAAAAATAAAAATTAGCATTTTGTACTAAATAAGAATAGCTGACCAACGTGAGAGGATAATTGCAGTCTAAGCATATGATAGTTTCATTATATGTCGTACCCAGGAATTTTTACGTTTAAACGATTAAAAATAAAACCACACTTTTGACACAATAGTGGGTGGCGGTTAATATTTTACAAATATTCGAAATGACGGTACTAGTGGCTATGACGTCACATCATCTTTAGTGCTAACTCTGATCGCTGAGAGCCCGAATCGGACCGGGCGTTGGTACGTCGTGAACGCTGTAAGCACAATTCGGACCGCGGTCTTATAAACAATAAGTTCAGAAAAGAGGGCAAACTGGTTTAGTTTCTTACACTATACTTTTGACGAAGGAGGAATTAAGTTTGAACTTCGATTACCGTTGAAAAGAATGACTTTTGGAGCCGTTCTCCCCAACGTTAATCGGAATTCAAACTAAGTGTATCATTTGTCACAATGATATTCAAAGAAATTGGACCGAATTTGAACCGGGTCGGAAAGAACAGCCATTACACTTATCCTGATGCACGTTTTCTGACATTCCACAGTAATGGATTCATAGGAAAAAATAAAAATGCACATATTTGAAAAGTATGTTTATTACAATAATTAAGCGAGCGACATTCCATTGAGCTACTTCTGCCTAGAATTTTGTACCGGGATGCGTACTTGCACTGTCGAAAACTTATTCACTGTTGCTGTCGTGAACCGTACCATCCATTCCTGAAGATCTTCCCGGAGAAGTGACGGTGGAGAAGTGATGACGGAGAAGTGGTAAGAAATTTTTGGCGCCTTCTTCGTTGACAAACACCCTCGTTTCTCTGAGCAGTATCGAGGCAGCCAGGGCAAGGTCCAACCAGTCTATAAGATGTTGAGAGCAGTAATGATGGGAGTGTCGGTTACCGCATGTGTCCACGTTAGATGAAGGCTGCAGAAATGTTTCGCCACGTTGCCCGTCTTTGTTTAGCAGGTGACACGCGCAGGAGGCGTATTGGTAGTCCGAACACGTATTCAGATTAACGTGTATTTTCACAAAATTGCGTAGATTCGATACGGTCATAAAACCGTCCACTAATGGAAGGACGATCCCACCGAATATAGGTAACAAAGAGTTAACGCTGATGAGGATGCAATCTTCTTTTCGTCTCCAGAGATTGAAGTTATATCTGATATTCAATTGTTGTCCGTTAAGAAAAGTGGTTCTGGCATCATAGGTAGATAATCGCCACAATATTTCTCGATAATCTTCTTCGTCATTGGGATAAAGTGCCCGGATAAAACTGCGACAGTCTGCGGAAGACAGAACCTCGGTCATGTATAGAATGATATCTACCGCTACAACAATTTTGTTTGACGTCGATACTGGCGGCAATGGTGGCGCCGGCGATATTTTTCGTTCTCCAGAATTCATAGTAGTCGCACGAAAACACACGTTTTTTATGTTTATGTTTCTTGTAACCGCGCACAGGACCGAACACGTCCTAAACGTTAAGTTGTTCGAAGGAGACAGAGCTGCATTCGTTATCAGTTTCATTTCCATTTATTAAATTGTTGCATCACGTGCGGTGCAACAAAAGTTATCAGCAAGGTGTTTTCAGATACTTGATTAATGGGTCAAATGTTATCAACCTTAAAAGTAAATCCATTATCCACGTTCTGACGACTCGAATTCTTGATGTATATTCTGATGACAACTTATTTATTTAACGCTCGACGGCAAAACTGTGGTGCAAACGACTCTGAATATTATAGTATGGGGAAGGTGCAAGTAGACGGGTAGAAAGGTCGCTTGATTGAATTACATGTCAACGTATATTTTGCAAACATGGGGAATTGTCTTCGGAAAATTACTCGCACCTTCCATATAGTAATGTCGGACTCCATCACCCATTTTGGAAATCTTTGCGGTACCCTACCTTGACCAGCTCATTGTATCTTAATCACTGTTTGTCGATACTGATAAAACCGAAGGAATCATCTGTTCGGAATACTCATAGGACAACGCCAAGCACGGTTGTCGATAACTGCATGTCTACAATTGCTACAACAAAAGCGATTCTCGCAAGTTTACCGACAAAATGCCATATAGTCTAGGCATAGTGGTCGTAGATGTTACCCTATGTGTGCTTTGCTACAAGCCGTCATGATCTTATTAATATGCCCAAGTGGTAACGTCAAGTACGTGCTATGTACGCCTGTGTTCTGTATTAATGTTGGTCATGCATGACCAAGCCAGGCCTCCAAGGAGTATGTTTGTTCATGGCTGATCTCGCTTCCGTTACGTTAAGACTATGTTCGGCTCTGGGCAATCTTTCATTCCGTTCAACTTTCTCAGCTTCTTACATCTGCTGACGTAAAAAAATGTAGCAGAACGACAACCGGTATCCCTACCTCTTAGATGCAACTTTTGGACGTTTACAAACTATAAGTTCCGAAAAAACGGAAATTGGTTCAATTTCTCTTACTATACGTTTGACATAGAAGGAATTGAGTTTGAACTTCGATTGAGGTTTAAGGGAATAGCTCTGAAGGCCGTTTACTCCAACGTCAATCGAAGATTCAACCGATCATCCTATGTCGAAAATATATTTAAAAAATTGAACTGAGTTTAAACAGCATTGGAGAAAACGGCCATCATACTTATTCTACATATTTTCTGATGTACTACAATAATGTGTTGGTAAGGAAAAATAAGAATATAAGTATTTGAAACATCTATTTATTGGAGTACTTAAGTAAACAACATTTCAATGAGCTACTTCTGTCACCAATTGTATGCTGTTGCTGTCGTATACCGCATCATCCATTCCTGGAGCTCTTTCCAGGGAAGTGTCGTCATAGCTGCACGCTCATGTTGCGAAAATGAATTGTTTTTGAGAAACATCAAGAAATTTTCGACGGCTTTTTCATCGATCAACATTTTCGTTTCTTTGTGCCAAATCGAAGTACACAGGGAAAAATCTATCCAGTATATAACGTGTAGATAGCAATAATGATGGAAGTGTCCGTAATTGCATGCCTCTACGAGAGGCCTTACAAATCTTCCACCACATTGCCCGCCGTTGTTTACCAGGTGACACGGGCAGGAGGCGTGTTGATAGTCCGAACACATACTCAGATGGACGTGTGTTTTCACAAAATTGCGCAGCTTCGATACGCTCGTGAAATCTTCCATTGTTGGAAGGAGGATCCCACCGAATAGAGGTAACAAAGAACCAACATTGATGTAGATGCGATCTTCTTCTGGTCTTGACGGATCGAAGTTATATACGATCTCCAATTTTTCCCCGTTAAGAAAAGTAGTCGTGATATTGTGAGCGAACAGAGATCTTTTGTATTCGCTTGGATCCATTGTGACCGCACGGAAACACTGGTACTTCGTATCACAGTATACACTTCAGATTGTTTAGTCTCCGAACCACAAATAGATACTGCGACATTATATCCGAGAATCGTCTTTTATTATCCTCAAGTCGTAAAGCAATGCCGTCATACAACCGCCATATTGCGAAATATATCATTTTAAATGTGTGACTCAGTTTGATGTTAAATTATTCTTTCGTTAGAGAATTCAGAGAATCGCCAAAATATTTTACAATATGCACAGTGACTATGACATCGTGGGGATTTCCTTGATTAGTCATTTGTGACATAAATCCAGATCCAGAAAATCAGAGGAGATGCGGACGGATGATGGGTGCTGTCTATCCTCTCGGATTGGGAATATCCCATTCCGAGTGAACAAAAAAAAATGCCAACATTGTGACAATGTCCACTGCGCTTTCGGTTTTCAGCGCTTGAAAATTCGAAGTATGCTGAGGA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107,473
AB291145.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
5,865
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment C5, complete sequence
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107,474
AB291146.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
5,950
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment C6, complete sequence
ACATAAACACTTGACATAAACACGAACATACACCTGATATATCAAGTTTTTATGTCCACTGCAACGGAGTTATTCCAATACGTTATTCCATTGGTGCGGCTGCACCAAAGAATCGTTATCACCAGCAGACAGGGCGCAGATCTCTGCACTCTACAGCTACTAACCTAGTTCCGTATTAAGCTAGTTTGTAAGTGTGAAATGGTGGAGACTAAGAGCGAAGAAGGCGAGTAGTCGTTCTATATCGTCGCGTAATCAGACTCTCGTAATCAGAGGATAATTTTTCAACAGCCGATAATCTGAATGTGCAAGATATATGAGCTTGGGCCGAATGGTCAGCAAGCTACAGTGTCACGTTCTCGAAGAATGCAAGTAAGGACAGTTAAGCGAACATACTTCTTGTCGATCTGCTTTCTGCGTTCAAATCCAGCAGTCACACATGTGTTTCGTAAGGAAGAGGTGCTCTGGCGAACGAGGAGCAGAAAGCTGCCCACTTTGCTCACAGCGCAAAGCGTCTTTATCTTAACACTCTGTAGTGTGCCGGGGTTACTACCTCGGGACTGTGTCAACCGTGTCCGGAGCAAACGTGTATCGTATCGACTATGCCGCGTTACCAGCCTTCCTAGCAAGTCTGACCTGTGCCAAGCCGTCCTCCGTGTCAACTGTACCCTGTGCTAAATGCTAACCCGTCGCTATGTCTGTATGTTTCGTTACAGCATCGCAGTGTGTACCAATGTCAAGAAGGTAGTTTTCCAAACGAACTTTTCGGTATGCTTAATAGATGGTTTTCTCTCTAGTACGTAACTCTGGCTTAATCGATTGAGGGCTCGTTCGACTTGGACGTTCAAAGCGTTGATAGCGTTGAAACTTTTTTTTTTAAACCAAACGTCTTCGACTCGAGTGAACGGTCGCGCTCGTGTCCTCGTGTGACGTTCGACTTGATGTAGTTGACAAGTACAACGATTCTCCCTACAGATGCGTTCAACAACGTGAACGTCGGAGCGTTTAGGATGACGTAGATCTGAAACGGTTTGGGCATCCAAGTCGAACGTGTACCCTAAGTATGCTCAACACATGCGGCACTCAAGCTACTGTGCTTCAAAGAAAAACTATCTGTAAAATATCTACCTGACTTCTGCCGGGAAAATTTGAACCATCAAGGAAGCTCTACTACAGTAGGTTAACATAGATGGTTTTTCCTAGTATAGCCCCAAATGAGTAGCACCAAGTATAAAAACTGGTGTTTCCTAATGTTTTAGAAGAGTACACGTAAGCTCAACATTCGTATCTGAGCTTACATGTTCTTTTAAATGAGACGATTATTAATAGAGGAACATGTTTATTAATCTTAATAGGAATTCACTATCACAACAAAATATACAAAAATACAGATCGATGTAAGAGCTGCAGGTATATAAAAGACTGCATCACGTAAGCCAATACGTCTGAACCAGCCTCTCTGTTGTCGACGCTCCCGTTCTTGTCGTAGCGTCTCTGCTGGTTTGTACATTGATATAAGCGTATTCCTACGCATCTTTCCTCCTACCCGACGCCAATGTTCGCACTTCACTTCTTGTTGGTTACGCTTTTTTCCACCAAGTTCTTCTTCTTGCTTGCGCTCTTCTTCACCCTTCTCTTCTTGTTTTTTAAGCTCTTTCTCACGCTTCTCTGCTTGGCTGCTGCCGCTGGTATCACTGTACCGATCACGATATTGCTGCTTTTTAATTTCTAATCCTTACCCATCTTAAAAGGTCTCTTCAGAACGAACGAAATGAGCATATTCAAAACTTAAAAAAACTATGAATTTGTTTGGATTTGTACCCACAGGTATCCTCCTACACAGTGCTCAAGCGTGAATGTGGCGCAGGTGAACCGCTTTCATCTATATATAACAACCATAATGGGCAGTTTAAGTTGCCTAGAGTATAACGCGAAGTGTCATTAACATATAATTTGCTAATGGACGACCGACCTTAGAGCTGGGAGTGGCCTAACGAAGTTGTACCCACAGGTATACCCCTAGACAGTGCTCAATCGTAATTGTGACGTAGGCCAACCGTTGTCATCCATATATCAGCCATAATGGCCAGTTTAAGCGTTCTAGAGGATCACGCGAAAGTAACGTAAACAAATAATTTAGTAATGTAAACCCGACGTCAGAGCTGGGAGTGGCGTCACAAATTTCAGAGCCCACACCCAACATTCCGGTAATAATATGTTTATTGCTGAATGAATGTTTCGCAAGGGCTATAAAAGTTATTATTCATTAAAAAATAACACGCAAGCCATAGCTTACTTTCAACAGCGAAACGTTTTAAAAGTAGATGCACACTCCACAGGTAGAGTACATTCGTCGGTCGAGCATGCACAAAGAATCTTTGGTGTAGGTTCGCAAAGGCAATCAGAAAAGATGAGAGTTCAGTTAGCACAGGGTAGTCGACACTACCCTTTCAATAGTGGATGGTCTCGTTTACGTCGGCCGTCTACTCGCGCATGAAGTAGTGGCCGGTCTCGGAGATCGACGGCAGCACCTCTTTGATGACCTAGCGACGAATGTCACGAGCCGGTAACGGCTTACACAAATTGTAAGGTGGCTTACATCCGACAAACTACTTTCGAAACCGCAATCCCTGTCGACAACGCTCCTCTTCTTGCCAATGCCACTCTATCAACGCTTCAGTACGATCGCATTGATGCGCATCTGTTCTTGTATCCTACGGCCATGTTCACTTTTCTCTCATTGTTGCTCACGCTCTTTTTCACGCTTCTCTTTCTGCCACCGATGCTCCTTTAATTGGCGGCAACTGCTGGAACCACTGCCACCACCGCCATTCTACTTGCAAGGTGTTTGCTTTTCACAAAACGAGAGAGGTTGGAACTTAACAAAACTCTAGGTTTGTCAAGGTGTGTGCGCACACTGTACCGCTTGAAAGCACTCGAGCGTAAATGAAAATTCTCCTTGCTATATTGCTCTCTTTAGATTGAGAATCCCCCAACGTTCTTCCCGACAAAATTTTGAGCATTGCTCTCATGGCGCTTATTATAGAGACACTGTAAATATGTATGAGACTACTGTCCCTCAACATACCCGTGGACCTTGTATTGGGATCTGACGAAATGCGTGAGACATCTGGTGTTAAATTTTGAACTATCAGTAAGTTGCACACCAACATTCAATACACGCGTATATCAGGCGTACATGTCACACACGCACACACACATACATGTCCAAATGCACCCCCGTTTCCGCCATCTTGCCTTAGCGACGCCTCCGTGTCAGATCCCAATATATATATTTATGTATATATATATTTAAAATCACTTTGCTTCACAATATATTTAATTTTGCTCCACAGATATATTCACAAATATATACATATATATATTCATTTATTTGAGCATAATTCCTGATGTGTTGACATGGATAATAGATTATTGTTATCTTGATTACGCCATACTATTTCAAGGCGTGTTCTTCTAATGGTATGTTGACATGCGACGGTTTTTATGACTGGCGTGCCAACGAATAATACGACTTTCGTGTAGCAATCAATATCGGCCTGGTATGGAATTGGAAGCCCGTCCCCAACTAGCCTCAGTTGACTTCGAAGTATTGACGATGGCGAGCGAGCTGTCTGGCTTGCGCGTTCTCCTGAAAGTTCATTCGATTTCCATCGACAATGATTTCTTCCGTCTGCATTACAAATTAACAGTAATTATGCTTCTTGTTACATCGTTGGTGATCATGGCGAGGCAGTTCTTGAAAAATCCCATGGACTGCTATTTTCCAGACTTGCCGGGAACCTCCTACAACACCTACTGTTATATTCACTTAAAATTTTTAGTGGAACGATCTGACACTCGTGAGGTGGGTGAAAAATTGCTCGATTCTGGAGTTTCTGGAATCACAACAGAAGATGAGTCGAAAATCTGCAGTTACGACCAATGGGTATTGATCGCATTATTCGTACAGGCGATTTTATTCTACATACCGCATTACCTTTGGAAGACATGGGAAGGAGGAAGAATGAAAATATTGGCCATTGAGCCCGTGATTCGAGTTCAGAAGAAAAATCGCGTAAAAGAATACTCAGGACCGTTGGTCGAATATTTCTGTTCGCAACTCCATTCACACAACAATTATGCCTACAAATATTTCACTTGTGAACTGTTGAATTTGATAAACGTCGTGGGACAAATATATCTCATGAATGCCTTCATCGCCAAAGATTTTCTATACGACGAAATTTATAAGATGATTTTTAACCAACGGCTGAACGAAACTATGACAAATCCTATGGAGCAGGTGTTCCCAACGATCGCCAAGTGTACGTATAGAGAATACGGCTCTTCCGGGACACTGGAGGAGTATACGAATGGAATTTGCGTCCTGACACAGAATTCAATGAATCAGAAAATATTTGTGTTATTGTGGTTCTGGTGCCACGTTTTGGCTGCCATCAGTGCACTCATTGTTATATTTCGCATAGTTACATTGCTTTTCCCCTCTATTAGATTTTATGGGTTTCGGTCAAACAATATGAATACTGCTAGATACAGTCAAGTAATTTTTCACAAGCTACAGATCGGTGATTGGTTCTTATTAAAAATGCTGCAACAAAATATAAGCTCGGTAGCTTACGACGAGCTTATATGTGGCATGGCACAGCGCTTTAACCCTGATTTGAGTGAGTAAATTTAGAATCCCGTTCCATGTCTCTGGTCGACGAGTCTCAATTTTGACTCGTAATAGTTGGACTTGCTGCGATTGGAGACTTGCTACGAGGGCTGGTTGTGCGATTCAGTGGACACGATGTATACTTGCTGCCAACACAGTTGACATCTTGCCTACCAAGCCATCAGCTTACAAAGAGCTGATACTTTACATTGCACGACGTCATGACTCTAATCTTTGGTATGTTTAAAAACATTTGTCATGTCTTGCGTGCACCGTTAACGTGTCTAATTTCTTGACAAATGTTCATGTGAATAACTTTCCTTCG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107,475
AB291149.2
Tranosema rostrale ichnovirus
Beliveau,C., Laforge,M., Cusson,M., Bellemare,G., Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Webb,B.A., Djoumad,A., Dallaire,F., Lucarotti,C.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
7,405
GenBank
2
Canada
Canada
Tranosema rostrale
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2011
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment D1, complete sequence
GTATGTACCCTAAACAATAGTATATACTCTCTAAATAATAAGGCGTAATATTTAGTTACATATAATTACAGATAATTTCAAGCATATTTTCCTCATCATTGAAAATAAGCTATTTGATTTCATCAGTCAGTAAAATCAGCTAAATTCTTACTGATGACTGCTCTAATAACTGAGTGGTTAGGTGCGATGTCAACACCGAAGGCAAATAGCCGTACTACCATACATGGTAGTGCTGGACGATAATGAATGTACGACTGTGCGCTGTAGCTGCACCATCGAGCCATCGACATCACCAACCCGTACGTGAATATTCGATGTTGCATCGCGCTCATGGTCTCACAATAGCATGAAGTGCAACGAGGCTGCTGTCGTTGGGGATAAACCATATATTCCACTCAAGCGTATTAACGTTGGCATCGGAGAGCCCATCACGACGTACATGACTATTGAGCAGCATCAACTGTCCGCGTCCGTCCGTGACTATGTCGCAGTATCCACATCGTACAATGAGGCGTAACGGGTGTCTACGTTGAAGAACAGCCAGTTTCACATTCGCGACTTGACTGCTCGGTTTTGCAGTGCAGCTATTTAAAAAATTGTTCAGCTATTCACGTTAGCGATTTAACAGTGCCACCGTCTAGAGCATCGCTTGTCTTTGCGACGTCTACGTTATAATCTGAAATCGTATTCGAATCCAACTCGCGTACTCGCGTTCTGTGTTCCGGTAAAACACTGTTACTTTGGGAAATAGACGACGACCCGGTAGCGTGCGGATCACACAGCCGCCGTAGTGTTATCACTATAATCTCCCTGAACTATGGATGATGATAATGTTTGTAATCTTTCAATATAGAAAGGAGCATACAGAATAAGCGGTAAGTGCCTCGTAAATACTACAAAGTGCAGCCGCAGAACTAGACAACTCGCCACTGACTGGTGCTCGTTGGATTGGAATACGACCTCATACGACATACGAATACGACTTGCATACGACCCCAACATCGAATGCAAACTATTAGTTTAAGTGTAAGTAAATATAATACCATTCGGATGATTTAGAAAATACTGTGCATTATGTTATATTTTATGCCGATAAATACTACAGATATCATATTATTATTTTTATTCTCCAAAAAAATGTTTAACATGTGTATGTATTTGGATCAGGTCCGTCATCGTCAAAGCCCATCTTGGTACCCATTACCGGCAGGCTGCTGGCGTCCACTGGACCATTGCCGGGTTGTTCCATAGGGTAACACGGCTTGGTGGAATCAGTGTTCTGAAAATATACAAATTAACATTAGTTTAGTCAAGTTTACAAGATGGGCTAAAGACACAGAATATAAAAAGGTGGTTGAGATCTACTCCTCCGTGAGATAACACTGAAGATTTGCGCCTTCGGGGTATGACAGGCCACGGCCTATTTGTATGTATAACAATTGACATCCCCACCATCATAGGGGTCTACCATGGGGACACAAGACAAACTCCTTGCTCAGCAATTCCATCGGTAGTATGCTTCAACGGATGGTTGAAATTAGTAGTAACACTGATGTACTCACATCCAAAACATCGCCGTTGTTCTTTATGATCGTCTTCGGCCATGCCTCCGCCAACACGGCCGCGACAATTAGAATACTAAGCATTTTCATTCTCATTTTGATCGGCTGAATAACTGCAAACGAAACATAATAAAACACATGTCAGTAATAAAACAGGTCATTGCAGGTCTTGTAGGAATGCGTATGATAATAAGTTCAAAGCTAGAATCTAGAAGGAAATCGATTCTAGTGCTGGATACTTACATTGAAAGAGTTGGAGGTGTTCGCGTCGTCGTTTCTGAGGACCTTCTGACATTCATGCTGAAACTTGGGACTTTATATACCGAGTTGCTGATAACATAGGAGGGGCAACATGGAGATAAAATGGGTTGACGCAATATGTTTTTTCCCCTTATCATAATATGGAATTATTGCGTCAATGACGATGTAATTTTGACCGCAACATTGAATATCACAATATATTTTAACCGTTATCCTTTTATTTTTCAATATAATTTCGAGCACATTTTCCTTATAATTGAAAATAACCTATTTGATTTTATCAGTGACGTAATGTACGTACTTAGTGCAGCTGATACTCGAAACAATAAAATAGTGTAACTTGCAACAGAATCAGGTAGATTCTGATAAAGCCAGAATATGATGAGAGAGTGTGTGTGTGGCGAAGAGAAGGAATGAAGGATAGAGAGAGAGTGAGGAAGAGCGTGTGATCACGTGGTGATGGGCGAGCGCCGCCATCTTGAGTATAGAAAGAATTAGAGAAAAGCAGTTGGAAAGGAAAATTGAGAGAGATCGGTCGTCCGAGCGAACGAGACCGTGGAAGTAGAAATATATTTCGCGTTAAAAGTGAAAGAGAAGAGAGAGACTGAGTCTCTCAAGAGCTATTTCGTCAAGTGTGTTATCTTTGTATAATTTTGTAAAATTTATGTACTTTTGTAATAATTATTTATTATGTTTTCATTTGCTGCGATTTAATAAAGATCGTTCTAGAACACGGTAAGGTACGCGTTCGTATGCTTATTATCGACTTGCTGGACAAAAAAAAAAACTCTATTAAAAATTCTTACTGATGACTGCTCTAATAAAAACAAGTGATTCTGTTGCGATGTCAAAACCGAAGGAAAATAGCCGTACTACCATACTGGTAGTGCTGGATGATAATGAATGTACGACTTCGTTTTGTAGCCGCACCATCGAGCAATTGATATCATGAACCCGTACGTGACTGTTCGATGTTGCATCGCGCTGGTGATCTCACAATGGCATGGAGTGCAACAAGTGTGCTGTCGTTGAAGATGAACCATATATTCCACTCAAGAGTATTAACGTCGGCCTAGGAGAGCACATCACGACGTACATGATTATTTTGCAGCATCGACTGTCAAGTACGTCCGTGACTATGTAGCAGTATCAACATCGTACAATGAGGCGCAACGGACGCTACGTTGAAGAACAGCCAGTTTCACATTCGCGACTTGACCGCTCGGTTCAGCAGTGCAACTATTTCAAAAATTTTCCAGCTATTGACGTTAGCGATTTAACAGTGCCACCGTCTAGAAAATCGCTTGTCTTTGCGACGTCTACGTTATAATCTGAGATCGTATTCGATTCCAACGACTCGCATCCTGCGCTCTAAGAAAACACTGTTACCTAAATAATATATTTAGGAAACAGACGACGATCCGGTACCGTGCGCATCACAAAGCCGCCCTAGTGTTATCACTATAGTCTCCCTGAACTATGGACGATGATCATGTTTTTAATCTTTCAATGTAGCACGAGATAGCTGTGACCGTCTCATGCAGAGGATTTTCCTTTTCACGTAACGCTAGGAGAGGGTGAAGATTCCAGACAAGTGATTGCCGTGCACGCTACTTAGTCGTCGGTAGTCACGTACATATACACAAACACTACGTTCTTTTTGTGTGACTGGCTAATCTTGCTGACCTCCCGAGAGCTTCGTTGCATAGCACGATGTACAGACGCAAACCTGAACAACTTCCCACTGACTGGTGCTCATTGTATTAAAATACGACGACCTCATCCGATGTGCATACGACCCCAACATCGAATGCAAACGATGAGTTTACTCGTAAGTTTATTTTCAATTAATAATTGCATGCAAACTGGACGGGATTTCCACATTCTTAATATCATTGCCGTCTATAAAGTAATATTCTGTGAGTAACGATTCCTTATTGTTTTCCCCATTCCATTGGTATATTATTTCATACACCTACATCCAGTACACAGTGTATCACTATGGACTTTGGTCGATTATTTGAAACGCGTCATACTATGAAACTTCCTATAACGCATGCTAAACTCTATCACGTAAGCCAATTTGTTTATCATATTCTGCAGTCCTAAGATTCGCGACATATAGGAAACAAAAGCATCCAACGTGGGCGCAAACGACTGACATGTCGCTGCGGTGTTTTATCAGGCGTATGCTCAATGGTTGGCTAATACGAGTAGTAGCAATGATACTTACTTACGACGAATTTCAAATGTACACTGGCTCGGATTCTGGCTTCACCTTTACCACAACCGCTGCAACGATCAAAACCTAACAAATGTCCATTGTCTGGGACTTTTCATGATTTGCTATTTGTGGTTGAAAACAAATGAAACGTCAAATTCAGAGACTCATCTGGATTTTCTGAGTGTTGTACATATATGAATACATCCCATCACTAACACCAGTACTACCACTACGGGAACTTTCCGGTTTAGCACCGATCGACTTNTNGAACGTAAGTAGAAAAAGAAATTGATTCCCTAGTATAAAATGTAACCGTCGATTTTTTTTACTTTGTCTCCGATGGTNGTTNTCTGTCGTTTTAGAGGAAGATTGCCAGTTCAGCAATGGGCCGCAAATNTGCAGTGTGTCAATTCGCCAGGGTAACTGGCTACTTAGCAAGTGAGCAAAGTGTAGCAAGTCTACNTGGTGCCAAGTNTCCACCGTGGCAACCGTGCATTGTGTCATCTNTCATTCGTAACGGCTCTACAATTTCCCCGACGCTCGCGTATTCCCACTCCTCACAGCTTCTGTGCGATCGACACTGGCAGGTCCCGACTTCCGAGTCCGAAGCGATGAAGTAGGGATACGCGATCGTCAGAGAAATTGTAGAGCTGCCTACGAGTGAGAGATGACAGTGTACGATTCTTGCAGTGGAGACTCGGTACCCTGTAGACTTGCTACACTTGCTGAACTGCTACGACGGCGAGTTACCCTGGGGAATTGACACAGTTCAGATTTTCCCATTGCTGAACTGACAACCGTTCGTTTTAGAACCTACCTTGAAACGACGATCGATAATGTCAGTTGATCCATTACATTATGTACATAACCATCGGAAAACTATAATCTTCCGGTTGAATCATGGTTGCTGAACCGTTCACGAATCGTTGACGAACAATTTAATTGTTTGCGAT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107,476
AB291150.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
6,839
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment D2, complete sequence
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107,477
AB291153.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
7,012
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment D5, complete sequence
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107,478
AB291154.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
7,049
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment D6, complete sequence
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107,479
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Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
7,055
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment D7, complete sequence
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107,480
AB291156.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
7,408
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment E1, complete sequence
GCAATCGTACTTCTACAAACCGCGTTGAAGAACACTTTTCACACAATGGTTCTTCCAGCAGTATCTGAAGCACACAGGAGGATGGAGGAACGCCGTCAAGAGGAGCGTCGTAAACGCGAAGACCAACAAAAACGAGAAGCCGCCGAGGCTCGGAAGCGCGAAGCAGAACAGCGTAAACGCGAAGAAGAACGTAAACGCGAGGACGAACGTAAGCGCGCACAACAGCGTAAGCAAGAAGAAGACCGTAGGCGAGAAAAGGAGCGAGAGCGCGCACTTGCGGCTGTTACCTTGGCTGCACAACTTCGCCTGACTCTCAAAGTGGTTCGAAAGTGAGTCGCTGAATACTTCGCATAGCAAAAATGTGAAATAAGTGTATCTCAATAAGTGTATAATAGTGTTTCTCAGTAATCCGAAAGCAAACAGGTTTTCTTTTGCACCAATGTCTCCAACGACATTTATGGAAAAAATGCTATGTTTATAGGTCTTATATATTAATAAATAAACATATGAACCGGTAAGTTTTCTTGATTTTTCTTAATACCCTTATCCATCGACTCGGACTCGTAGCAGCTAGACTAGCTACGGTTGGATACATACTACGAGATTGATTACGCTGTACAGTCTACGCGATGTACGCTTGCTGTGAACGCAGTTGACACTTTGGTGCCAGCGCGAGATCTTTTCGTGGCACTTTGGAGTATATGCTAGATTAATGTATCTGTGAAGTGTCAACTGTGCCCGGGGCAAACAAGTATGTGTGAATCGTGCCGCGTAATCATGCAGACGAAAGTGAGAATGGCTTTGACGGAGTACTCGAAGATACCATCTTTTTCGGTCAAGTTCAACGGCAACACATGTATTTCGTAGAGCGAACGCCACTTTGTCAATTGAGCATACTGCAAGCTTTATCATCGATTGTAACACAGCATACATAGGGTACGTTCGACTTGTACGCTCAAAGCGTTGAAAGCGTTACTTACCGTTCGACTTGGCACTGGAAATGATTACGAGCATTACGATGGATGTGTTCAGATTTTTACGTCCCAAACGCCCACGAATTTCACGTTATTAAACGCATCTGCATTGTATTTGGCTGTTCTCAGCTCAAGTCTCTACCAGCCTCGAAACTGTCGGAGCCCCGTTCTTGGACTCGTAGATGGTTTTCAGAGAAAGTGATGTCACATGCAACCCATGAGTTTTTTATAATTAAAAAAAAATGTAAGACACAACCTGGTCGGAATTTATTTAATTCCAACAACGTCATTGCGGTCGACAGAATATACCGAAATAGACTTTTCCCCGTTGGTTTTGATCATAATATATGATCTCATTACCTATAACCACCTTACAGGTAATCATACAGTGTTAGGTATGTCAACCGCACGCTGGTGCAAAGGTCAGGCAACGTCACTTTATTAATTAGGTATTAATGAGGGTAAAGGATATGAAACAATGGTGCTGTGTTGCGTTATCCGTTTAAGCTGGCTGGGTATTTCCATTATCGATATATTGCGATAAACCCAAACCATAGGAATAGGTATGGTTATTCCACAGGAATAAGTATGGTTATTCCATCGTATTAATTAAAAAAAAAAATTAACTTTAATTAACTTTAAATTTCCTGTTGCCGAAGCGATAATATCGTTATCGCTCTCACGTGTCCGTCGAATAGCCAATGTTCGCGTATTCACCCGCGCTAAAAATGCTGACCGAGTCGGGCACCGCGGTGCATCACACTATGGGCATCAGATTGTTTAGCGATCAGCCTCGTGAGTCTTTAAGTTATGTTTTGAAAGATTTTGTTGAAATTCCCAGAAGCGTTCAGATTTTTACGTCCCAAACGCTCATGACTTTCACGTTGTTAAATGCAACCGCATTGTATTTTGGTTGTACTATACCCAAGTCAAACGGGACTGATCTTAATAAACCTCCAACGCTTTGAGCGTCCAAGTCGAACGTACCCATAGCAGAGCTTCACAGCGGCCAGTACAACTGGAGTAAAGGTATGGAATAGAGACATACCTGTGTGTCTATTCCACTCACACAAAGCCACACAAAGAATAGCCTGTGTGGCTATTAATATACACATAAGCAATAATAACATTCAGGATAACTGTAGGTCACCGCGGATTATTTATAAAACACGGATAAAAGGGCTCTTAGTCATTCCTGTGACATGCCTAAACCACTGGCTATAAAACAGGAAACCCACGGCGAAAAAGAATAGTTTACATAGAACTACTCACGATGTTGCACGTTTTGAGTTCTTTGCAAGGATTGCTGAAAGTTCAGACGACCTTTATCGACAGTAAGATCTTCCGTCTGCATTACAAATTAACAGTCATCATACTTCTTGCTTTTTCGTTGCTGATTACGTCGGGGCAATTCTTCGGGGACCCCATAGATTGTGACTTTCCAGACTGGACAGGAAGCTCTCCCAACGCCTACTGTTACAGTCACTCAACATTTCTAGTGGAACGATCTCTGAGTTCTAAGCCGGGAACAAGATGGCCATATCCTGGAGTTTCTGAACACACAGAGGAAGACAAGTTGAAGTACTACAGTTACTACCAATGGGTGTTTATCGCACTATTCATACAGGCGATATCGTTCTACATACCTCATTACATTTGGAAATCATGGGAAGGAGGTAGAATGAAAATGTTGACCGTCGCGCTCGATTCTCCGGTTCTCAGCGAAAAGTCCATAGACGAAAACATGGAACCATTGGTTGAATATTTCTGCACGCAACTGCATTCACAGAACAGTTATGTCTACAAATATTACACTTGTGAACTGTTAAGTTTTATAAACATCGTCGGACAAATATATTTTATGAATGCGTTCATCGGCGAAGATTTTCAATACTACGGAATTTATCTGATAATTTTCCAGCAACACCTCAACGGAAGGATGACGAATCCTATGGAAAAGGTGTTTCCAACGATGACCAAGTGTTCTTATGAAAAATTCGGCCCTTCCGGGACCGTCGAGAAGAGAGATGGACTTTGCGTTCTGACACAGAACACGGTCAATGCAAAGATCTACGTTTTTTTATGGTTCTGGTTTCACATTTTAGCTATCATTAGTGCACTCATGATTATATGGCGCATAATGACATTGATTTTCCCCTCAATCAGATTCTACAGTTTTCGATCATCGTGCAGTATGAATCGTGATAAAGACATTGATGCAGTTTTCCACAAGCTTCGCATCGGAGATTGGTTTATGTTGCGGATGCTGCAACGAAATTTAAACTTGCTAGCTTACAAGCAGCTGATATTTCGTATCGCTCAGCGTTTCAACAGTGGTGTTTTTAATGTTTAAAATCATTTTCTACTATTCATTAGTACACGGTTTTCACTTGTGTAATTTCTCGATGAGTGTATTAATGAATAACTCTTTTTCGTGTTTGCAGATGCTCTTATCGTCGGTTTTTCTTATATCTTAACCAATATTCATGCAAGAGATGTAAAAGAGGTGTATGTAAACTTGTCTAATATTTCAATAAATCTGTAAACAAATAGCTGTGCTTTATTTTTACGAACACTACTCTGACCCGTAGCGGCCGCACTCCCTAAGGCTGAAGACTTGTTATGAGGACTGATTGCGCTAGTTACACAGTCGACACCTTGTTGCCTGCATAAAGCGTCTTTTCGCAACACCTCGTAGTGTGCTAGTGCTTATGCTCTGGCAAGATATTAACTGTATCCTGGACAAGCGTGTATCGTGTTAACTGTACCGCTTGACTAGCCCCTGTAGCAAGTCTCAAGTTTAACTCGTAGCACTTGGACTTGCTACAGTTGGAACCTCGCTAGGCGGGCTGGCTGTCGGATTCGTTCACACGATACGCACTTGCTCCGAGCACAGTTGACATCTTGCTTACCAGGCTCTCAGCTTACAAAAAGCTGATACTTTATATTGCACAGTGTTGTGAATCTAGTGTTTGGTATGTTCTAAAACGTTTTTCATGTCTTGCATGCGTTGAAAACGTGTCTAGTTTCTCGGTAACAGTAATAATAATAACAGTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAGATACATTGTCGATAATCAGATCGATATATAAACAGATTAGAATTCCTTCTTTGTAGTAATGTTTTTGTGGTTACTCATGTAACTGCGATAGATATACCCCGAAGTTTTCAACATATGCGACCATGAAATCATTTAGTACAGTCAGCGACGGTTATGCAGTACTCAAACGAAAATGTGAATCCTGGTTAAAGATGCTCCGTTATTATACAGGAATGGAAGGTGAATTTTCCACCACAGTATATAACTACAACGGAGCGTACGTGATTCCCGGACCACAAAAACCGCAGTCAACAGAGCGTACGTGACACAGTCATTTATGTGTGAACTGGTCATAATATCCAGTTTAGGTAATTTAGGTAATGATGATCAATTATAGAAAAATTACATATAAGCCCATTACTCACACTCAACAGTGACATCTTCCAAGAGTCGATGCAGTCTACAGGTGCAGTGCATTTGTTGGTTGAGCACAAACAATTCTTGGTGGAGGTCTTTAAAGATAAGCAAAAAGTGCCTCCACACGTTTCCGATAGCAAAAGCGATAGTTTCGTTACTGCTCTCAGGTGTACGTCGAATAGCCTACTTTGGCGTTGTCACTTAATCTAAGAGTAATCAAAAAGATTTGCCTGCCGCTGTAAGCCATAAGCAACTACTAGATATTCATCGCCGTTCACGATCCCGTACTATTCGAAAAGCAAGCCCGTGGCTTGACAGCAGAGAGTTTTCGTGTAGAAAAGGCCCGAAGAAAATGCATTTGCACTGACTGACCGCTAGACAACCTTATATCTTATGAGATGCACCCCAGCGCGATGCATCTGGTGCATCACATTAGGACTAATGTATTAAAATGCATTCACGCAGTACTGAATCCTGAAAAACACTTTTTCACGAGCAGGATAAGGATCAAGTTTCCCTAGTTAGGTCGTGTATGC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107,481
AB291158.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
8,551
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment F3, complete sequence
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107,482
AB291163.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A., Stoltz,D.B., Djoumad,A.
Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre; 1055 du P.E.P.S., Quebec, Quebec G1V 4C7
Canada
2007-01-30
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
10,139
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus DNA, segment G5, complete sequence
CTTTCGTTTAAATTTGTACAAAACGTGCTTGACAATCGTCGCTGCTACGTGAATTATCACGTAAGGATGAACATGACTCCATCACGATCTGTTTCTTCACAGGCCGGAGCTAAAGTACATACGCTTTAGTGAGATAGCCAGCTCTATGCACCGTCCGCACTCGTACTCGAACAGTACGGGGGACGGAACGTGGGGAAACGTGAATTTCAGTACGAGTAAGCACAAGTTTAGCGATGAGTACACGACGCTTGTTTCGCTGCTGGATTGCTTGCTTGATGTGCTTTTCTATACCTATATATATATAGACATACAAAAGTATATCACGCGAGCAATCTAGCAGCAAAACAAGCATCGTGTGCAGCGGGCTCTAATGGGCACGGTGTCAGGCCTTACCGAATGACGACTTGTTGGAACATTTGGCACTACGTGCTCGGAGATAAACACACAGGTTACGCGGTACGACTTGCGGCTCTATCAAATGAAACTGCTTGAAATAGACTGTTTTTCGAATATCAATGAATAAGAGAGCAGTGCATCAGGTAAACTGCTGTGGTCCTTGAAGCGGTCGGTAGCGCTACCATATTTGGAAAACCCAGCAATACTGATTTATAATGCATGTTCACTTGGATACGTGTTCAGGTCGACATATCTCCTGCCCGGGTCGACTGATGAACTACGATCACTGGAATTATGAAGTAGGCATTTGTGGCGTAGCAGAGACTTCCCACGCCATAAAAAATGGTATTTCCAGAGAATTTCAGACAGTCACTGTTATTGTTGTAATTTTAGAGACATGCCGTTGTTTGGCAAGATGTTTGGCTCGACCGGTCAAGAATGCTTGATATAGAACTTTCATTGTAACGTGATCAATCCAACTTTCTTGGAACACGATGGCACAAGTAACGATTAGATATAAACTATGGTTTGTAACAAGTATAAAACCCGTCGTAATGTTTAATCCATAGACTCACATAACAAGTTCAACAAACCCAAACAAACCCAGGTAGGAGTGGGATACCAGTTGAATGGAACTATTGACAGCGTTTTTCAAACAACCTGTGACAAGTTCAAGTTAGACGTTGTTCAGTGCATGTCGACGTATGACTGTAGAATATATGAAAGCGTACAGAACAAGTATATGCATAGCCCAGTGTACACCGTGAACGAGCTGAGCTGTAGCATAAGCAATGTATACGCTCTATGCTATGCTTTGCCTACGTTGTTTGACCATAACACACGTGACAACCTCTTGCGTCATCGTCTAGTGAAAAACTAGACGTCTGTTATTACTAGCAACCTCCAGCGCACAACTGGATGTACCGCAAACGATAACAACTGCGTTACAGCTCATGAAAACCTCGCATCGACAAAGAACTCGGACGGCGAATGCGCCATGTTTTAGGAGACCCGAGCGAGTTGCTGTCTCCCAACCACCGAGAGTGCTATCGGCATTTAGTGCCGCAAGCACGCACACATGCACGGCAAAACAGAATCTATCTTCCATAGACGACTGAGTTCTTTGGCATCGTTGGCTTTTGCAGGTTGAGTTTCATCTACCTATTCACGTTTTAATTCTTCCGAAGATTAAATTCGGTTCTCGTCATGCCGATGCTGCTACATGGTCACGTTGGTGTAATATACTCTCGCACTATGGAAGCCAATGTCGATACGCTCCAGTGAATATATAAATTCTTGTTCCCTTGTCAGACGACGAGCTTGTGGAGCGGTGAACAGTCACGTACGGAGTTTGATGATTTTCTCAATAGTCTGACTACGACGAAAAGTCGCGCTGTCGTGGTGGCGTAATACGACAAGATTTTGGTAGTAGTATTGCAGGAAAAAATAAAATTTGTCGAAGCTCTACGCATTTCGACAAGGCAGTAGGACGCGATGGTCAATCCTCCCCAAAAGAGTAACAGTCATATTACGACATATTGAAATGACTAATGTTCTTCATAGCTCTTTTTTTTCTTAATTCCACACTGACGAACTATATACTGCCGAGAAAAACGGTGAAAAGTCGATATTGTTTTTGTAGCGATAAATCAATCCGTGGGTGAGCTCGGATGTCGGCAGGAATTGGACAAACGGCAGCACGACCAGCAAGTCTGCGTGACCGATCAACGACGCCAGAGCGTTTGTCATGCATTGAATGATGTATATATTGACGGGCGCCATTAGCAGTAGAAAAATTGATGTCAGCATGTTGAAAAGTTCGTTACGAACTGACCTAAACAAATGAATTTTTTGTATCTCGAGTGTATGACTTCTTCAAGGTTTCAAGTATTGATCACGGCTAAATAGGAAGTCTCTTTTAATCAAAATATCTAGAAGTCTGTTAATTATGGAAGAAACATGCCCAGCCTTTTTGTAAGATTAGAACATTTCGTACACTTCGATAATCCAAACACGCAACCCAAACATAAAGTGCCAGTAATAAAACGTCCGACCCGCAAGCAATTACCGCCGTATTTATGACCACACAACGCCGAGCCTCGACGAACTCAGGTCATTCCATGGTCGGCGGGTATGTAAGCTGACGTGTTTCCGCATTGATCTCAGAATCTTTTGAGGAACAACCGCGTAAACATCGGTCGACTCTTTCAACGTGAGTATTGAAACATAAATTGATTTTTTCCCCGATCTTAACTTTAGACTAGTTTTGTTATGCATTTATTCGAGGAAGGAGGGAGCTGTTTCATCCGTGAAATTAATGTTCTATTTGTTTTTATTTACAGACAATAGACTCGAAAATATTATGAAAAATGAATCTTTTTTGGGTTGCATTGTGTGCCCAATTGGTTTCCGGATCCCCATTTTTGCCAGAAAAGGAACAAAAATCCAGCAGAGAGGAGGAGTCTCAAATAATCAATCAGCGACCTCGCCGGTCGCTGATCGATCCATTGAAGCTGCTTCCAAGTTGGAATCCGTTTCGAAGGTACCAACACTGCTATAAATCAAAGCAAGCCAGATGCAATGCCAACTGCAAAGTGACATGCAAAGCTACCCGTTTAGCTAGATGTAATGCCCTCTGTCGAGCAAATTGCTATGCCGACGCTAGAAAAAGATGCTCCAGGTGGAACAGTCTCAAAGAGGAGGAGTCTCAAATAATTAATCACCCGTCACCTCTTCTACGGCCGATGTTTGACAATGTTGGTTTGCCTATGATCTACAACGCATGCGTTGATAACAAGAAAGGCAAATGCTATGGCGGCTGCAAAGCGATATGCAAAGGTACCTTTCAATTCGGATGTATGGCCACCTGTCGCGCAAATTGCGATGCCGACGTTGGAAATGGATGCAAATAAGTGGTCAATATTAGTCAAGTTAATATTGGGAGCTTTCCAACAACACAGACGACGCAGTGTAACACAGTGTTTAGTGTTCGGTGTTCCAACTACGACATGCTGCAACACACTGCGAGTGACGTGAATGTCTCAGTGCTGCCAATATGTTCAGTGGTTGCATATTTTTATGTTCAAAGTGTGGTGCGGGATTTTGAAGTTTTTATTTTCAGTCAACCGGATATAAACTGTCGAACGTTACCACGCCACTTATGAGGCTAGAAAAAGTGTTATGGTTATCCCCTCTGTGTCATCTCTATAAAACTCTCAAGTGTTTCAACAAGCACCCACTCTCTGTGTTTCTCTGTGTTCTGCTGTGTTGCACTTTTTCCTATTGTTGGAACAGTCCCATACTATGTTCGTTAAAAATGATGAATGTCATGCTTACCTTATACGTATTCTTACACAGTGTTGCACTTTTTGCTCTCGTTGAGAAGGTCCCATACTATGGTTGTTTGTTAGAAATACAGAATGTAATGTGTTAGGCTTACCTTATATTTATTCTTACACAGTGTTGCACTTTTTGCTCTCGTTGGGAAGGTCCCATTCTATGGTTGTTTGTTAAAAATACAGAATGTAATGTGTTAGGCTTACCTTATACTTATTCTTACACAGAGTTGCACTTTTTGCTCTTATTGGGAAGGTCCCATACTATAGTTGTTTGTTAAAAATAAAGAATGTAATGTGTTAGGCTTAACTTATGCTTATTCTTACACGGTGTTGTACTCATATTCAGAGAGCCCCACGCTACATTTGTTTGTTAAAAATAAAGAATGTAATGTGTTATACTTACCTTATTCAAATAAAAATAAAAATACCATATCTTTCGCTTTTATTTGTCCAGACTATTGGTGCTGCCAGAACTCACCGCCGACGTGCTCGACGGTCGTCGCTGCTACGTGATCATTTCCGTTACGATCTGTTCTTTCCAGGCCGGAGCCAGCCCCCTGACGCAGCCGCCTCGACACAGTTCGCGGATAGTCGGCCTGTTTTACTCAATTCAAGCGCAGACAAACAGATAAAATAATTCCATTGGTGTCGGCGGGAATCAAACCCGAATTCTTCGATCGTGAATCGAGCGCACCACCACTGTACCACAACATCAGTGGATGTCAGTAGCTAGCTTATAAATAAGTTTAAATTAAAGCAATTCATAGGTAGTTTAAAATATACAGAAACATAAAATACATGATACATTGATTTATTTTGCTGAAGAAACGGTATCAAACATTATGATTCGCAAACTTGCACACTCAGTAACTGTGGTTTTTTCGTGCTCCATCTCCTTTTTTGAGAGGATGAGGGACAATGAATTCGTAGCTCCCTGGCAACGTACGCTAAGACGAAGAACTGCTGTGGGGACTACTAGCATCATTGAGGGACAATTGCAACCGAACCGTTTTTCAACTCAAGCAGCTTGACTGGCTGCATTTGGGTCTCGCTATGTGAACCGGTTACGCGGTACAGTTGACACGATACGCGTTTGCTCTGGACACAGTTGCCGCCTCGCTTACAGCACGAAGCGTCTTTCCGCGGTACTCGATAGTATACTAGAGACACCATCAGCGGAAGCAAAAACGCCTCTGACGAGAACACTTTTTGCCGGCCATCACTGCATCATATTAAAAAAAAGCTTCAATGTCATTGCACTATATA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107,483
AY940454.1
Tranosema rostrale ichnovirus
Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Cusson,M., Webb,B.A.
Laurentian Forestry Centre
Canada
2005-03-16
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
5,590
GenBank
1
Canada
Canada
Tranosema rostrale
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null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus segment C1, complete sequence
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109,127
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Tranosema rostrale ichnovirus
Beliveau,C., Levasseur,A., Stoltz,D., Cusson,M., Djoumad,A., Dallaire,F., Lucarotti,C.
Laurentian Forestry Centre, Natural Resources Canada
Canada
2003-02-01
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
5,410
GenBank
1
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Tranosema rostrale
null
null
null
null
Tranosema rostrale ichnovirus segment B4, complete sequence
AATAAGGGAAACAAACAATGGGCAGTAAATACCGCGTGCAATGTATAAACGAGGTAAAATAGTGTTACCAATACCCATGTGTGTTGATGACTGCTGGTACTTTTTTTTCATTCGTTTACTATTCACAAAACATTCTATTTTACGTATACTTAGTTGATGAGGCCAATGGCAGTACTTGATAACATATCCGTTATTGAAAGTAGTTTTCCTGCACAAATAGTTTCTGTAAAATGATCCACCAAACCATTATTTTATAACGCCTGACATCGTATTGGATAACCTCTGTTTTTACTCGGGCTTATCCATATTCTTACTAACTGATGAATTGGACGGAATTTTTTCGGGATGTTTCACGTTCTCATACCTGCACACAAGAACGTTACGCGGATAGATGGTTTGATGCCGTAGTGAAATAGTAGCTGCAGTGCCTACCTGCCATGTGTTGTATGCTACAATTCGTCACAATGCCTGCTGCATGATTTTATGGTAACTTTGCGTACGCAGTACAAAGCGAATTGCTGCCATGGTTGAACTTTAATGGAGAATACGTTATGTTGGGATAGAAGTACTTTCTCCGAAGTCGTTTTGACTTCTGTTACGTCAGAACGAGATGTGCACTGCTGTACCATATGCTCCTCATAGCGGTTCAAGCTACTTGACACGAACTCTTCCATTATTTAGGTATTACACTGTTGGANCTTGGGATCGATGGCAAATCTCCATGCAACTCAGAACATGAACGTCTAACTTCCATAGAGGATCCATCATTGAAAAAATGTCCTGACGACTGTGTCTCACATTCCATTTGTTTTTAAATTAATAATACTGTTTCGATAATTATTGAAACCATCGTTTCCCACGGATTTGCCATTCTCAACTGCTAAGATATCTTCGCGTCTGTATAATACGTAGTATTCTACACCTAGCTTTGAACGATGCTTATTTCAATATACCCATAGATGCGATGGCGCATTGACTGCAAGTGTTAAAAGTTAATGCTTATTAAACGGAGAAGGCAAGTCTCGCCGCGTAACGGTATAGTCAAGATTTGGTTCTTTTCTGTTGCGCTCAGACTTCGACTTGACTCTAGTCAAGAACGCACCAATTCGATGAGTGTTTCATGCTATTTAACGATTTACATCTCCATCATCCAAAGCATCCAACGTGGGCACAAACCATCGGCTCGTTGCTGCAGAGTTTCATCAGTCGCATGCTCAATGGTTGGCTAATACGAGTAATAGCGATGATACTTACTGACGACCAATTTTAGATGTACTGTGGCTCGGCTTCTGGCTTCNCTTCCACCTCAATCGCTGCAACGATTAAAACCTACAAAATGTTCATTGTCGTCCGAATGTTTTATACTTTTTGCTACTTACGGTGGAGACGAATAAAATGTTCATTTCAGTAACAAAACAGTCGATAACTAATCTAGATGTTCCGAGTTTTGCTGCAAAACAACGAAGAAGGTCAAATGGGTTATCTATACAAAGAAACGCTGGAATTTTATTGCGTCAACAACGTATGTGGGTAAATGACGTTATATTAAGACTATGCTGCTGAATTATTAGGTATGTATTTCGATCATGGAAGGAGTGGAATGTTCTAATTCTACTACAATTTGCCGCATATTTTTTCCATCATCAATAAGCTATTAGGTTTGTCTTTTGAAGTACCGTTTGTATATGGTGTGATTTACTCTGAGAATCTAAAATAAAGCCTAATTACTCAATAGTTAAAGCTATCTAGTAAAATGCTTTCGAACGCGCTGACTTTTCCAAACTTAGTACAATATTTTAGGCCCGCTAGAGACTGCTCTAGCAAACGATGTGGTTACTTTGGTCATCAACACAGTCACGGCGGACTATAATGAACGACATGGCTACAGCATCGAGGATCGAAATTCGATGTCAGCTTCTGACATGGAGGCGTGGCTAAGGCAAGATGGCCGACACGGGGGTGCATTTGGATATGTGTGATACATATACACGTGACATACGCGTGTGTTAAATGTTCGTGTGCACCTTACTAATAGTTCAAAATTTAGCACCAGATGTCTCACGGATTCTGTCAATAAGAGTGATTCAATGCATGTCAGCTTCCCGCAGTATAAGTATAGAGACAGTTTCTTTTTCAAAACGTTGATCTAACTCTGAATTCAGTTCATTCTATGCTGATGCTACATGCATGGTCACGTACGTTGTGGTGTGCTCCGTCACGGGCTGCAGATGATGTCGATACGCTCCAGTTCAATCTGTGGACTTCTCTTCAACCNGAGCATTCTCGTTGCGTCTCCTTCCATTATCCGAAGACTGGCTTATTTCCACGTCAAACAGTCACGTACGAGGTGATGATTTCTCAATGGTGCGACTACAACAGGAAAACGCGCGGACGATCCACTGCAATATGACAGGATTTCGGCTATAGTATTGCTTTTCAAGTCTTCAGATAATGTCACAGCGCCGAAGCAACGTGTTCCCAACAGTATCACAACAAAAGTGTCCATATTCGAACTCATCCACGGCAGTTGGTGCCAGTTTCTTGAAGTACAGCGCATTTCGACCAGACAGTGTACGACGGGATCATTATCGGTTTTTAAAAGAGTGACAGTCCGATCGCGAGATATTGGAACGACGGAGATATTGTTCTTCCAAGCTTTTCATAATATCACACTTATCAAACATGAGAGCGGAAATGAAGGTACGAAGTGGATATTGTTTGTTGCATCGGCGAATAAATCCGCGGGTGAGCTTCGATGACTGCAAAAATTGTTTACGTAACCGACTACAGACGCCAGAAAGATCATCGTGCATGGAATGAGGTAGGTACTAACGGACGCCGTTGACAGTAAAACAGATCAACTGGCATTTCCATATTGATCAAGTGTGAAGTTGTTGAGCCATACGGTACTAGAATGCATACGGCACGAATGAGTATCTTCCACGATATATTCCTCACAAGCGCCACCATCACCACTATTATCAAGAACATCTTCGCTGCCATTAGCCGTGTGCGAATTCATGAAAGTCACCCAATAAACCATTAGTAACCTGAGCTTGTCATGAAAAAGTGTACATGAAGAGTATCACCCTATCCAATATATTGGAAGCTCTACCGCCATCCTATCGTAAGTCAAAATGCAATTGCTGTGCCGCCAAACCTATCGTAGGTCAAAATGCAATTGCTGTGCTCTTGTGACTAACCACTGGCGCTCTGAAAATTGTTGGCAATGAAGGCAGCATCACGTTCTGTTCTAAGACACATTCGAAGAGATTATCATTGCTTTCTGATCGAATAATGCCAACAAACCACCACTTACATGGCATAAAGCTTTCTATTTGTTCGTGATACAGAGCAGCCCGTCCGCGGGATAGACCGTGTTGTCGTCTTCCTATGCTCTGAGCAGTCTCCTTGTGCGGCGTGAGCTTCATGGCCATGCTCGCATAACCCTGTTCTACCTAGTCAGTAGTTACACCACTACGGGAACCAATTTCGGCTTTACCTTCAAAAGCCGAGTGAACTCTCTTGTACTGCGGGCTCCATGCTAAATACGAACACGCTCATGAATTAAAAAATCCAATTGTTTCTCCGATCACATACTTATTAAATTGGCAGGAGTCACAATTTACATTTGTTTACCGAAATCCACCGCAGAAACGCAATGGAATTTACCGACCGCGTCATAAATAGATAACGTCCACTGTTTTGCACGCGACACTCGNGTGACTCATACCAATCATCGGAGCGCAGCAAGTATATATACAGTCCCGAGTTCCCGCATGTCAGAACGTTGTCGGGCTAGAGGGCGTGAGCATCGATCTACTTTTTCAACGTGAGTAGCAAAAATAATTGATTTCCTTGTAAATATTGGCTTCAGACTAGTTCTTCTATGTATTTTTTCAAGGAATAAAGAAGCTGTTTTATCACTGAAATGAATTCTTTCATTCGCAGATAACAAATCGCAAAATGAACATGACGTGGGTCATTATTGTCGCAGCTGTGGTGAATGCACACCCTACGGCTAGAAATGAAAACAAACCAGGAGTCAGAGTAACTATCGAGTCAGGAGTCGCGGCACCATACGAATCGGGAAAAACGGCAACATTCGAGACAAAAAACAAGGACGACTGGGTGACAGACCCACCGAACAAGGGGCTGTCAGACGCGTCGGGCACGTCGGTGACAGACGCAGGGAACGACTGGGTGACAGACCCACCGGACAACTCGCTGTCAGACGCGTCGGCCACGTCGGTAACAGACGCATCGGACGAGTCGGTGGCAGACGCATCGGACGAGTCGGTGGCAGACGCATCGGATGAATGGGTGACAGACCCACTGTACAAGTTGGTGACAGACACAAGGGCAAAAGGACACGTGAAAATTGCATTCAAAATTTAGGTATGTAGGTGCGTGGTTATTACCACTCATATACCGTTCAAGCATACAATTAATGAAACTGCTCAGCCAGTTGCGTGCCGTATGTCCCCATGTGGATGCTCTAGGTGATTGTAATTGCATGCGTTAAGTGACACGAGACTGCCAATAAATCAACGCCTCTTTTGATGGCGTCGGGTTGAAGTCTGAGCGTATAACGTTGAAAGGGCCATCGTGACTTGTCACATATGTGAGAGACGCAAGTCTTTCAGANCCACTTTAGTAAATAAATCCTAACTACCTTTATAAATTCTGTTTATTTATCCCATCTTGTTTGAAGTATTTTCAGTGTCCGGGCTGCAACTGGACGAGTCTCCGGCAGAGAAACCTGGAAACCCATCGAGTCATATCCAACAATTGAACTGTCTTCTATTTGGGAAAGATTTCTGTACACGTATTCATAAGTTCGCTACCTGTACAGAAAACGCGTTCAGGAATATAATATCTTAACCATTTTCGTGATTTCTTATTAAAATTATTTTCCATTATATGTATTTAATAAACTATTTTGGTTTGATAAAAATGTAGAATGTAACTTTTTATGATGTTTTATACTTTTTCCAAAT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110,505
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Tranosema rostrale ichnovirus
Volkoff,A.N., Beliveau,C., Rocher,J., Hilgarth,R., Levasseur,A., Duonor-Cerutti,M., Cusson,M., Webb,B.A., Tanaka,K., Lapointe,R., Barney,W.E., Makkay,A.M., Stoltz,D., Saint-Amour,M.-E.
Laurentian Forestry Centre, Natural Resources Canada
Canada
2002-10-02
null
Tranosema rostrale ichnovirus
Ichnoviriform
Polydnaviriformidae
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7,990
GenBank
2
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null
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Tranosema rostrale ichnovirus segment F1, complete sequence
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110,616
NC_038861.1
Transmissible gastroenteritis virus
Almazan,F., Gonzalez,J.M., Penzes,Z., Izeta,A., Calvo,E., Plana-Duran,J., Enjuanes,L.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2018-08-24
PUR46-MAD
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,586
RefSeq
1
USA:Indiana
USA
Sus scrofa
null
null
null
PRJNA485481
Transmissible gastroenteritis virus complete genome, genomic RNA
ACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATATCTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTTTCTATGAAATCATAGAGGACAAGCGTTGATTATTTCCATTCAGTTTGGCAATCACTCCTTGGAACGGGGTTGAGCGAACGGTGCAGTAGGGTTCCGTCCCTATTTCGTAAGTCGCCTAGTAGTAGCGAGTGCGGTTCCGCCCGTACAACGTTGGGTAGACCGGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTCAAGATCCTTGTTAATGAGGACTATCAAGTCAACGTGCCTAGTCTTCCTATTCGTGACGTGTTACAGGAAATTAAGTACTGCTACCGTAATGGATTTGAGGGCTATGTTTTCGTACCAGAATACTGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTTGGTAACGGAGTAAGTGATCTTAAACCTGTTCTTCTTACCGAACCCTCCGTCATGTTGCAAGGCTTTATTGTTAGAGCTAACTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCTCGCACTGGCAGAGGTGCCATATATGTTGATCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTCATTGAAGGCGATTTTAAGGACTACTTCGGTGATGAAGACATCATTGAATTTGAAGGAGAGGAGTACCATTGCGCTTGGACAACTGTGCGCGATGAGAAACCGCTGAATCAGCAAACTCTCTTTACCATTCAGGAAATCCAATACAATCTGGACATTCCTCATAAATTGCCAAACTGTGCTACTAGACATGTAGCACCACCAGTCAAAAAGAACTCTAAAATAGTTCTGTCTGAAGATTACAAGAAGCTTTATGATATCTTCGGATCACCCTTTATGGGAAATGGTGACTGTCTTAGCAAATGCTTTGACACTCTTCATTTTATCGCTGCTACTCTTAGATGCCCGTGTGGTTCTGAAAGTAGCGGCGTTGGAGATTGGACTGGTTTTAAGACTGCCTGTTGTGGTCTTTCTGGCAAAGTTAAGGGTGTCACTTTGGGTGATATTAAGCCTGGTGATGCTGTTGTCACTAGTATGAGCGCAGGTAAGGGAGTTAAGTTCTTTGCCAATTGTGTTCTTCAATATGCTGGTGATGTTGAAGGTGTCTCCATCTGGAAAGTTATTAAAACTTTTACAGTTGATGAGACTGTATGCACCCCTGGTTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCTGAGAGCAAATCACTAGTTGCATGCAGCGTTAAAAGAGCATTCATTACTGGTGATATTGATGATGCTGTACATGATTGTATCATTACAGGAAAATTGGATCTTAGTACCAACCTTTTTGGTAATGTTGGTCTATTATTCAAGAAGACTCCATGGTTTGTACAAAAGTGTGGTGCACTTTTTGTAGACGCTTGGAAAGTAGTAGAGGAGCTTTGTGGTTCACTCACACTTACATACAAGCAAATTTATGAAGTTGTAGCATCACTTTGCACTTCTGCTTTTACGATTGTAAACTACAAGCCAACATTTGTGGTTCCAGACAATCGTGTTAAAGATCTTGTAGACAAGTGTGTGAAAGTTCTTGTAAAAGCATTTGATGTTTTTACGCAGATTATCACAATAGCTGGTATTGAGGCCAAATGCTTTGTGCTTGGTGCTAAATACCTGTTGTTCAATAATGCACTTGTCAAACTTGTCAGTGTTAAAATCCTTGGCAAGAAGCAAAAGGGTCTTGAATGTGCATTCTTTGCTACTAGCTTGGTTGGTGCAACTGTTAATGTGACACCTAAAAGAACAGAGACTGCCACTATCAGCTTGAACAAGGTTGATGATGTTGTAGCACCAGGAGAGGGTTATATCGTCATTGTTGGTGATATGGCTTTCTACAAGAGTGGTGAATATTATTTCATGATGTCTAGTCCTAATTTTGTTCTTACTAACAATGTTTTTAAAGCAGTTAAAGTTCCATCTTATGACATCGTTTATGATGTTGATAATGATACCAAAAGCAAAATGATTGCAAAACTTGGTTCATCATTTGAATATGATGGTGATATTGATGCTGCTATTGTAAAAGTCAATGAACTACTCATTGAATTTAGGCAGCAAAGCTTGTGCTTCAGAGCTTTTAAGGACGACAAAAGCATTTTTGTTGAAGCCTATTTTAAAAAGTATAAAATGCCAGCATGCCTTGCAAAACATATTGGTTTGTGGAACATCATAAAGAAAGATTCATGTAAGAGGGGTTTTCTTAATCTCTTCAATCACTTGAATGAATTGGAAGATATCAAAGAAACTAATATTCAGGCTATTAAAAACATTCTTTGCCCTGATCCTCTTCTTGATCTGGATTATGGTGCCATTTGGTACAATTGCATGCCAGGTTGCTCTGATCCTTCAGTTTTGGGGAGTGTTCAACTTTTGATCGGTAATGGTGTGAAAGTAGTTTGTGATGGCTGCAAAGGTTTTGCTAACCAACTTTCAAAAGGTTACAACAAGCTCTGTAATGCGGCTCGCAATGATATTGAGATCGGTGGTATACCATTTTCCACTTTTAAAACACCTACAAATACTTTTATTGAAATGACAGATGCTATCTATTCAGTTATTGAACAAGGTAAGGCATTATCCTTTAGAGATGCTGATGTGCCAGTTGTAGACAATGGTACCATTTCTACTGCTGATTGGTCTGAACCCATTCTGCTTGAACCTGCTGAATATGTAAAACCAAAGAACAATGGTAATGTCATTGTTATTGCAGGTTATACATTTTATAAAGATGAGGATGAACATTTTTATCCTTATGGTTTTGGTAAAATTGTGCAGAGAATGTATAATAAAATGGGTGGTGGTGACAAAACTGTCTCATTTTCAGAAGAAGTAGATGTTCAAGAAATTGCACCTGTTACACGTGTTAAACTTGAATTCGAATTTGACAATGAAATTGTAACTGGTGTTCTTGAACGGGCTATTGGTACTAGATACAAATTTACTGGTACAACTTGGGAAGAATTTGAAGAGTCTATTTCTGAAGAACTCGATGCAATCTTTGATACTCTAGCAAACCAAGGTGTCGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACTTGTGGTGGCTTTGATATAAAAAATCCAGATGGTATTATGATCTCTCAGTATGATATCAATATTACTGCTGATGAAAAATCAGAAGTTAGTGCATCAAGTGAAGAAGAAGAAGTTGAATCTGTTGAAGAAGATCCTGAGAATGAAATTGTAGAAGCATCTGAAGGTGCTGAAGGGACTTCTTCTCAAGAAGAGGTTGAAACAGTAGAAGTTGCAGATATTACTTCTACAGAAGAAGATGTTGACATTGTTGAAGTATCTGCTAAAGATGACCCTTGGGCTGCAGCTGTTGATGTACAAGAAGCTGAACAATTTAATCCTTCTCTACCACCTTTCAAGACAACGAATCTCAACGGAAAAATTATCCTTAAGCAAGGGGATAATAATTGTTGGATAAATGCTTGTTGCTATCAGCTTCAGGCCTTTGATTTTTTCAACAATGAAGCTTGGGAGAAATTTAAGAAAGGTGATGTCATGGACTTTGTAAACCTTTGTTATGCAGCAACAACACTAGCAAGAGGTCATTCTGGTGATGCAGAGTATCTTCTTGAACTTATGCTCAATGATTATAGCACAGCCAAGATAGTACTTGCAGCTAAGTGTGGTTGTGGTGAAAAAGAAATTGTTTTGGAAAGAGCTGTTTTTAAACTCACCCCACTTAAGGAGAGTTTTAATTATGGTGTTTGTGGTGACTGCATGCAAGTTAACACCTGTAGATTTTTAAGTGTTGAAGGCTCTGGTGTTTTTGTTCATGACATATTAAGCAAGCAAACGCCAGAAGCTATGTTTGTTGTCAAACCTGTTATGCATGCAGTTTACACTGGCACAACTCAAAATGGCCATTACATGGTTGATGATATTGAACACGGTTATTGTGTAGATGGTATGGGTATTAAACCACTTAAGAAACGGTGTTATACATCCACATTGTTCATTAATGCCAATGTAATGACTAGAGCTGAAAAACCAAAACAAGAGTTTAAAGTTGAAAAAGTAGAACAGCAACCGATAGTGGAGGAAAACAAATCCTCTATTGAAAAAGAGGAAATTCAAAGTCCTAAAAACGATGACCTTATACTTCCATTTTACAAAGCTGGTAAACTTTCCTTTTATCAGGGTGCTTTGGATGTTTTGATCAATTTCTTGGAACCTGATGTTATTGTTAATGCTGCTAATGGTGATCTTAAACACATGGGTGGTGTCGCAAGAGCCATCGATGTTTTCACTGGTGGCAAATTAACAGAACGTTCTAAGGATTATCTTAAAAAGAACAAATCTATTGCTCCTGGTAATGCTGTTTTCTTTGAAAATGTCATTGAGCATCTTAGTGTTTTGAATGCAGTTGGACCACGTAATGGTGACAGCCGAGTTGAAGCCAAACTTTGTAATGTTTACAAAGCAATTGCAAAGTGTGAAGGAAAAATATTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATCTTTAATGTTAGACTTGAAACATCATTGCAGTGCTTACTTAAGACTGTGAATGACAGGGGATTGAATGTCTTCGTATACACTGACCAGGAGAGGCAAACTATTGAGAATTTCTTCTCTTGTTCTATCCCTGTCAATGTTACTGAGGATAATGTTAACCATGAACGTGTGTCTGTTTCTTTTGACAAAACATACGGTGAACAGCTTAAGGGCACCGTTGTCATCAAAGACAAAGATGTTACAAACCAGTTGCCTAGCGCTTTTGATGTTGGTCAAAAAGTTATTAAGGCTATTGATATAGATTGGCAAGCTCATTATGGTTTCCGTGATGCTGCTGCTTTTAGCGCT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4,137
OP805351.1
Transmissible gastroenteritis virus
Li,j.
Division of Swine Diseases, Shandong Provincial Key Laboratory of Animal, Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Shandong Academy of Agricultural Sciences
null
2023-05-13
TGEV-DS01-2022
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,591
GenBank
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China
China
Sus scrofa
null
null
null
null
Transmissible gastroenteritis virus isolate TGEV-DS01-2022, complete genome
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15,915
ON858825.1
Transmissible gastroenteritis virus
Xu,L., Zhou,Y.
School of Animal Medicine, Sichuan Agriculture University
China
2023-03-06
null
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,561
GenBank
null
China
China
Sus scrofa
null
2021-06-21
null
null
Transmissible gastroenteritis virus strain SC2021, complete genome
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17,656
ON016092.1
Transmissible gastroenteritis virus
Huang,X.
Sichuan Agricultural University, Research Center for Swine Diseases, College of Veterinary Medicine
China
2023-01-23
CHN-SC-H
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,503
GenBank
null
China
China
Sus scrofa
null
null
null
null
Transmissible gastroenteritis virus isolate CHN-SC-H, complete genome
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19,215
MZ322950.1
Transmissible gastroenteritis virus
Lu,B.X., Zhao,W., Qin,Y.B., Zhao,S., He,Y., Chen,Z.W., Duan,Q.P., Zhou,Y.N., Xu,X.T., Quan,C.Y., Chen,T.T., Li,B., Liang,J.X., Jiang,D.F., Lu,J.Z.
Guangxi Veterinary research institute, Department of Preventive Veterinary
China
2022-09-25
null
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,458
GenBank
null
China: Guangxi
China
Sus scrofa
feces, abdominal cavity
2019-04-21
null
null
Transmissible gastroenteritis virus strain CH/GX/TGEV/2662/2019, complete genome
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24,277
ON859974.1
Transmissible gastroenteritis virus
Yan,Q., Sun,Y.
South China Agricultural University, College of Veterinary
China
2022-09-06
HNSQ-2021
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,597
GenBank
null
China
China
Sus scrofa
null
2021-02-10
null
null
Transmissible gastroenteritis virus isolate HNSQ-2021, complete genome
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25,341
MW804449.1
Transmissible gastroenteritis virus
Jia,A.Q., Zhu,L., Li,F., Wang,G.
Guangdong Haid Institute of Animal Husbandry & Veterinary, Institute of Animal Medicine
China
2022-08-31
CH8438
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,488
GenBank
null
China
China
Sus scrofa
feces
2017-11
null
null
Transmissible gastroenteritis virus isolate CH8438, complete genome
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26,033
OM802899.1
Transmissible gastroenteritis virus
Song,L.
Jilin University, College of Veterinary Medicine
China
2022-04-23
null
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,020
GenBank
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China
China
Sus scrofa
null
2019-07-04
null
null
Transmissible gastroenteritis virus strain SZ19, complete genome
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31,163
MZ368889.1
Transmissible gastroenteritis virus
Zheng,B., Yan,S., Rui,P., Ma,Z., Song,T.
Hebei Normal University of Scicine and Technology, Hebei Key Laboratory of Perventive Veterinary Medicine
China
2022-03-07
null
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,590
GenBank
null
China: Hebei
China
Sus scrofa
null
2020-06-24
null
null
Transmissible gastroenteritis virus strain HB-1, complete genome
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32,685
MT576083.1
Transmissible gastroenteritis virus
Yuan,D.
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Clinical Veterinary Medicine
China
2021-02-02
HQ2016
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,571
GenBank
null
China
China
Sus scrofa
null
2016-03
null
null
Transmissible gastroenteritis virus isolate HQ2016, complete genome
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Transmissible gastroenteritis virus
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University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
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GenBank
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USA
USA
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2006-12-08
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null
Transmissible gastroenteritis virus strain TGEV/USA/Z/1986, complete genome
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68,140
KX900394.1
Transmissible gastroenteritis virus
Marthaler,D., Chen,F., Knutson,T.
University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
2018-10-01
null
Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,582
GenBank
null
USA
USA
null
feces, abdominal cavity
1988
null
null
Transmissible gastroenteritis virus strain TGEV/USA/HB/1988, complete genome
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Transmissible gastroenteritis virus
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University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
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Alphacoronavirus
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GenBank
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USA: Minnesota
USA
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null
Transmissible gastroenteritis virus strain TGEV/USA/Minnesota138/2006, complete genome
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Transmissible gastroenteritis virus
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University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
2018-10-01
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Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
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ssRNA(+)
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GenBank
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USA: Illinois
USA
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2006-11-17
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null
Transmissible gastroenteritis virus strain TGEV/USA/Illinois139/2006, complete genome
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Transmissible gastroenteritis virus
Marthaler,D., Chen,F., Knutson,T.
University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
2018-10-01
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Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,521
GenBank
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USA: North Carolina
USA
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feces, abdominal cavity
2007-02-08
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null
Transmissible gastroenteritis virus strain TGEV/USA/NorthCarolina140/2007, complete genome
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Transmissible gastroenteritis virus
Marthaler,D., Chen,F., Knutson,T.
University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
2018-10-01
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Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
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GenBank
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USA: Minnesota
USA
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2007-02-08
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null
Transmissible gastroenteritis virus strain TGEV/USA/Minnesota141/2007, complete genome
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Transmissible gastroenteritis virus
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University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
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Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
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GenBank
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USA: North Carolina
USA
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feces, abdominal cavity
2007-02-16
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null
Transmissible gastroenteritis virus strain TGEV/USA/NorthCarolina142/2007, complete genome
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Transmissible gastroenteritis virus
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University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
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Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
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GenBank
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USA: Iowa
USA
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feces, abdominal cavity
2008-03-06
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null
Transmissible gastroenteritis virus strain TGEV/USA/Iowa143/2008, complete genome
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Transmissible gastroenteritis virus
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University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
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GenBank
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USA
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null
Transmissible gastroenteritis virus strain TGEV/USA/Tennessee144/2008, complete genome
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Transmissible gastroenteritis virus
Marthaler,D., Chen,F., Knutson,T.
University of Minnesota, Veterinary Population Medicine
USA
2018-10-01
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Alphacoronavirus 1
Alphacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
28,582
GenBank
null
Mexico
Mexico
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feces
2008-04-17
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null
Transmissible gastroenteritis virus strain TGEV/Mex/145/2008, complete genome
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Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
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National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
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null
Alphapolyomavirus octihominis
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RefSeq
1
Netherlands
Netherlands
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skin
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PRJNA485481
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus, complete genome
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7,570
LC480521.1
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
Nako,T., Fukumoto,H., Hasegawa,H., Saeki,H., Katano,H.
Department of Pathology; 1-23-1 Toyama, Shinjuku, Tokyo 162-8640
Japan
2019-12-03
null
Alphapolyomavirus octihominis
Alphapolyomavirus
Polyomaviridae
dsDNA
5,232
GenBank
null
Japan
Japan
Homo sapiens
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2018-04
null
null
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus TSPyV-Syn DNA, complete genome
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57,771
MH351677.1
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
Bagasi,A.A., Khandaker,T., Clark,G., Akagha,T., Ball,J.K., Irving,W.L., McClure,C.P.
University of Nottingham, School of Life Sciences
United Kingdom
2018-08-20
null
Alphapolyomavirus octihominis
Alphapolyomavirus
Polyomaviridae
dsDNA
5,232
GenBank
null
United Kingdom
United Kingdom
Homo sapiens
oronasopharynx
2015-03
null
null
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus strain TSPyV Nottingham, complete genome
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69,027
MF094821.1
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
Loeb,J.C., Lednicky,J.A.
University of Florida - Gainesville, Environmental and Global Health
USA
2018-03-12
null
Alphapolyomavirus octihominis
Alphapolyomavirus
Polyomaviridae
dsDNA
5,235
GenBank
null
USA
USA
null
null
2016-11-11
null
null
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus strain TSPyV/UF-1, complete genome
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71,831
KU221329.1
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
van der Meijden,E., Horvath,B., Nijland,M., de Vries,K., Racz,E., Diercks,G.F., de Weerd,A.E., Clahsen-van Groningen,M.C., van der Blij-de Brouwer,C.S., van der Zon,A.J., Kroes,A.C., Hedman,K., van Kampen,J.J., Riezebos-Brilman,A., Feltkamp,M.C., Feltkamp,M.C.W.
Leiden University Medical Center, Medical Microbiology
Netherlands
2016-12-12
TSPyV 1614
Alphapolyomavirus octihominis
Alphapolyomavirus
Polyomaviridae
dsDNA
5,232
GenBank
1
Netherlands
Netherlands
Homo sapiens
skin
2014-09-15
null
null
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus isolate TSPyV 1614, complete genome
GCCTCAGCCTCCTGGTAATACTGAGAAAAAACAAGATTTCCATAGTAACCCCCTATTAGGAATTTGAGGAACTATACTTAGAGTGTTGACATAAATAGGTCATTGTTTGCTTAAGACCGTTATCCTGAGGAAGCTCGTGCGCCACCTATCATTTGTTGTGGAAAATGCTGTGTCAGTTAGTCTCAAGGGGATGTTTGTCATACTGCCACAAACACAGGAAGGCAGCCAAGAGACAAGAGGAAGCCAGCCAAATCCCGTGATTGTTTTTGTATATTCTTAAGATAGCACTTGTCTAACTGCTCTCATCCTGTCCGTCCGGTCTCCATAACAACACATCCTCCCGCTCTGTGTTCTCACGCGGCAAATTCAAATTCTAATGGTAAGTTTTTCTTATTTTTCAGGTAAAATGGGAGGAGTAATCAGCTTATTCTTTGATATTATTGAAATATCAACAGAATTAAGTGCTGCTACAGGATTTGCTGTGGATGCTGTGTTAGCAGGAGAAGCAGCAGCTGCTGTTGAAGTTGAAGTAATGGGCCTAATGACAGTTGAAGGCCTATCTGCCTCTGAAGCCTTAGGGACATTGGGGTTAACTATGGAAAATTTTAGCCTAATGCATGCTTTACCTGGGATGCTGTCAGAAGCAGTAGGCATTGGTACCCTTTTTCAAACTATTTCAGGTGCAAGTGGACTGGTAGCAGCTGGGATTCGCTACGGATATGCCAGAGAAGTGTCAATAGTAAACAGAAATATCTCCCAAATGGCTTTGCAAGTTTGGAGACCTTGGGACTATTATGATATTCTTTTTCCAGGGGTACAAACATTTGCCCACTACTTAAATGTTCTTGATCATTGGGCAAGCAGCCTGATCCATACTGTGAGCAGATATGTATGGGATGCTATTTTGCATGAAGGGAGACATCAAATTGGCCATGCCAGTAGAGAATTGATGATTAGGGGGACTAATCATTTCCAAGATCTCATGGCTAGATTGATAGAAAATAGCAGATGGGTGCTGACTACAGGCCCTAGCAATATCTATTCACATCTTGAATCATATTACAGAGATTTGCCAGGGATTAGTCCTCCACAAGCCAGAGATCTGTACAGAAGACTTCAGGAAAAAATACCTGACAGATATCAACTTGAGGCTGCCACAGATGAATCTGCTGAGGTAATTGAAACCTACTCAGCTCCAGGAGGAGCACATCAAAGAGTCTGCCCTGACTGGATGTTGCCTCTGGTACTGGGATTGTATGGTGATATAACCCCCACTTTTGGTTACTATTTGAGAGAAGAGGAAAGAGAAGATGGCCCCCAAAAGAAAAGGAGAAGGATGCGCTAGAAAGTGCCCCACAAAAACATGTCCTACACCCAAGCCTGTTCCAAAACTTATTATGAAGGGCAATATAGAGGTTCTAAACCTTGTTACAGGCCCTGACAGTATAACAACAATTGAACTCTATCTTAACACCAGGATGGGACAAAATGATGAGTCTAAGGACAACTATGGTTACAGTGAAAAAGTAACTGTTGCTAACAGCAGTGACCAGGACAAGCCTACTTCTGGAGAGATACCAACCTACAGTACAGCTAGAATTAATCTACCCATGTTGAATGAGGACCTAACCTGTAATACTCTAACTATGTGGGAAGCTGTCTCTGTAAAAACTGAAGTGGTTGGGGTTAGCTCTCTGGTAAATGTTCATATGGCTACTAAAAGAATGTATGATGACAAAGGTATTGGTTTCCCAGTTGAGGGAATGAATTTCCATATGTTTGCAGTGGGTGGGGAACCCCTAGAACTCCAGTTTCTAACTGGAAACTACAGAACTGATTACAGTGCTAATGATAAATTGGTTGTTCCCCCAATAAAACACCAGAGCACACAAGGCCTCAATCCTCACTACAAACAAAAGCTAACAAAAGATGGGGCCTTTCCTGTAGAGTGCTGGTGCCCAGACCCTTCAAAAAATGAAAATACAAGATATTATGGCAGCTATACTGGTGGTCAGAGTACACCTCCAGTTTTGCAATTTACAAACACTGTGACTACTGTGCTACTAGATGAGAATGGTGTTGGCCCACTTTGTAAAGGTGATGGCCTGTATGTGTCATGCTGTGACATAGTAGGCTTTCTGGTTGGGAAAGATGGAGACATGCAATACAGAGGCCTACCTAGGTACTTTAATATTCTATTGAGAAAGAGAACTGTAAGAAATCCTTACCCAGTTTCTTCCTTGTTGAATAATCTTTTCACTGGTCTTATGCCAGCTGTTCAGGGCCAGCCTATGGACAATGGACTAAGTACACAGGTTGAAGAAGTCAGAGTTTATGATGGAACTGAAGGCCTTCCTGGAGATCCAGACATGGTCAGATATATTGACAAGTTTGGACAAGACAAAACCCGCCCCCCCTTCCCCGCCCGGCTTTATTGAGTCACAAACAAAGTATTTGCAAAAAAGCTTTATTAAATGGCTTGCTTTCCATGCTGCAGGTTTTGCTGTTATATAAAACTAATAAAGGTTTATTGTGTTTGGAAACCAGAATCATTTGTTTCAGAGAATTCTTCTTCCTCCTCATCCTCCACCTCAATTACAACAGAATCAAGAGGATCTTTACCCTCCTCCACATTTAATAGCAAGGTAGCAAAATTAGTATGACCCATGTATTTACATAGAATATCTTTCCAATACTTAACATCCTCCTTTATTGACTCTGAAAACATGGTAATTGGACAGTACCAAACCAACAACAAAGCAATAGTGACTCCATCCTGTAGTATTCTTTCTGTTAATAAGTAGTCACTAACCTGAAGGCAAGATCTAAGATTATGCTTTGGAGTAAAATTCAAAACATAAGCAAACCTTGTAAAAATGGTTTCAGGCAAGAGGTACTCATTCATAGTCACAAGACAGGGTGGGAAGATCTGGCTTCTTTTGTTCACATGCTTCCTTTCTAAATTTACTTTAACACTGCCATCCAGATGGTCTCTTAAATTATCTAAATTAGATACTCCCTGTCCAGGCTGCAGCTTTTTATTAAGTGCTATTTGACCCTTGACATCTTCAAAAATAACTACAAACTGGTCTATTGCACAGCCAAGTTCAAAGGGCAATTTATCTGCAGGACAATTGACATTTAATGTTTTTCCTCCCAGGAAATTCATCAGAGCAGCTGCAAAAGTAGTTTTCCCACTATTGATTGGTCCTCTAAAAAGGCAATTTCTTTTTTTAGGGACATTTTCTACAATTAACTTTAAGATTTTGGTGACTACTTCATCTATATTTTCAAATAAGCAAGAATACCAAGCAACTCCCGCCATATACTGAAGAATTTTAATTTGACCAAACTCATCAGTAAGTTTCTCAAACATTAATTTAAATCTTTCCTCCAGTAATTCTTTTCTAGTACTTTCAATTAACTTTAATCTCTGTTTTGCCATCACCACATCTGCTGCTTGTTGGCAGGCAGTTTTTTGAGTTTTGCACTCCTTAAACAGCTTTGCATTTTTATGATGTAAGCTATGGTAATTATAGTGAGCTTTTAGAGCTTTTTTAGTGCATTTAGAGCATATGCTTGGCTCTTCTGCAAAGTCTAAGTAATGAGCCATAATTAACAGGGGATCATCTAGCCTGTTGGTAACTGCAAAATCAGTGAGAAGGTTCCAATTAACCACAGGCTTCCCATTTTCTTCATTAAACTCATATTCAAATATTCCTGGCTTGCTTTCCTCCAGTAGCTTAAATGGTTCACTGCACATACATCTGTAACATTCTACTTGTTTAATTACTGCTTTGCATAACAAGAAACTAACAGTGCAGTGTGTTACACATAAATTCTTAATTGCTGAAACTCTATGCTTGCCAGGAGTCATTAGGAATACCATGCTCCCTTCCTGAAAAGAGTGCCTACTTTTAAATTCAGGATTAAATTTATCAAGCTTTTTATACAAATATTCAGCTTTTTCATTAGTTGTATATATCAGAAAAGATGATAAAGTTTTATTACTATAGACAGCATTAGAAAGAAAAGGCCGCAACATATCAGGAAAATCATTAGGGACAGAGTCATACTTAGATTTTTTTGGCTTTGGGGGGGTGGCAGAGAAGGAGCTCTGGGTGCAGCCGGGGGAGTCCTCTGGTGGGGCAGCTCTTCTTCTTCTTGAATTCTCCTCGCTAAATTGAGTAGAGGGTCCCGGAGTGGGGCTTGGAGATCTAGATTCATCAGAGGGAATGGTGGATTCATGGCAGAAGAGATCTGGGTCCTGCATGGTGTCAAACAAGTTGTCCCATTCTTGATTGAAGCTTTCCCACCAGCTGGCCCAGGAGGGGTGCCCATAGGGAGGTATATCTCTTCCATCCTGGGTTGGAACATCATGCTAAAAGGAAAAACTAAATTAATATAGGTACATAACACCTGCAGTTTCCCCACCTTTTACTTACCCCAGTTAAAGCCTTGATTAACTCTCAGATAGAGATTCACCAGGTGAAAGTCAACTTCTCCTACTATGCAACTCCAAGCCCAAAGGGAATCCAAGCAATATAAGTCTTCTCCAAACCATGCACAGTAGCATTTGTAACAAAAGCATTCTCCCCAAACTACACACTTCTTCTGGTGCATTTGCTTATAAACATGATGTTGAAGGCCTATTTTGCAGGTTAAGCATTTACACTCTTTTAAAGCTTTTTCTGCACACTGAGGCCAATGTTTAATTACATTCTCATCATATTTTTTTTTCCCAAAATATTCCTTCAAAGATATTAAATTTGCCTCCCAATACCATGAGCCTACCTGGCTACTGAAGCTAGTTGGAAACTCTTGTCTTGCATTATAAATTCCTTCTTGCAGTTTTTGCCATAATTGATTTAATCTTGACATTTTTTCTGGATCTCCTCCTTTATCTGGATGGTATTTCAAGCTCATTTTTTTATGATTAATTTTCATTAGTGCAAAATTCCCATAGCAATGCCTTGGGATTTGCAATAAATCCATAAGTT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79,120
KX249740.1
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
Urbano,P.R. Sr., Oliveira,A.C.S., Romano,C.M.
Sao Paulo Institute of Tropical Medicine, Virology Laboratory
Brazil
2016-08-17
A
Alphapolyomavirus octihominis
Alphapolyomavirus
Polyomaviridae
dsDNA
5,235
GenBank
null
Brazil
Brazil
Homo sapiens
animal tissues
2014-04
null
null
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus isolate A, complete genome
GCCTCAGCCTCCTGGTAATACTGAGAAAAAACAAGATTTCCATAGTAACCCCCTATTAGGAATTTGAGGAACTATACTTAGAGTGTTGACATAAATAGGTCATTGTTTGCTTAAGACCGTTATCCTGAGGAAGCTCGTGCGCCACCTATCATTTGTTGTTGAAAAATGCTGTGTCAGTTAGTCTCAAGGGGATGTTTGTCATACTGCCACAAACACAGGAAGGCAGCCAACAGACAAGAGGAAGCCAGCCAAATCCCGTGATTGTTTTTGTATATTCTTAAGATAGCACTTGTCTAACTGCTCTCATCCTGTCCGTGCTGTCTCCATAACAACACATCCTCCCGCTCCTCTGTTCCCAGGCGGCAAATTCAAATTCTAATGGTAAGTTTTTCTTATTTTTCAGGTAAAATGGGAGGAGTAATCAGCTTATTCTTTGATATTATTGAAATATCAACAGAATTAAGTGCTGCTACAGGATTTGCTGTGGATGCTGTGTTAGCAGGAGAAGCAGCAGCTGCTGTTGAAGTTGAAGTAATGGGCCTAATGACAGTTGAAGGCCTATCTGCCTCTGAAGCCTTAGGGACATTGGGGTTAACTATGGAAAATTTTAGCCTAATGCATGCTTTACCTGGGATGCTGTCAGAAGCAGTAGGCATTGGTACCCTTTTTCAAACTATTTCAGGTGCAAGTGGACTGGTAGCAGCTGGGATTCGCTACGGATATGCCAGAGAAGTGTCAATAGTAAACAGAAATATCTCCCAAATGGCTTTGCAAGTTTGGAGACCTTGGGACTATTATGATATTCTTTTTCCAGGGGTACAAACATTTGCCCACTACTTAAATGTCCTTGATCACTGGGCAAGCAGCCTGATCCATACTGTGAGCAGATATGTATGGGATGCTATTTTGCATGAAGGGAGACATCAAATTGGCCATGCCAGTAGAGAATTGATGATTAGGGGGACTAATCATTTCCAAGATCTCATGGCTAGATTGATAGAAAATAGCAGATGGGTGCTGACTACAGGCCCTAGCAATATCTATTCACATCTTGAATCATATTACAGAGATTTGCCAGGGATTAGTCCTCCACAAGCCAGAGATCTGTACAGAAGACTTCAGGAAAAAATACCTGACAGATATCAACTTGAGGCTGCCACAGATGAATCTGCTGAGGTAATTGAAACCTACTCAGCTCCAGGAGGAGCACATCAAAGAGTCTGCCCTGACTGGATGTTACCTCTGGTACTGGGATTGTATGGTGATATAACCCCCACTTTTGGTTACTATTTGAGAGAAGAGGAAAGAGAAGATGGCCCCCAAAAGAAAAGGAGAAGGATGCGCTAGAAAGTGCCCCACAAAAACATGTCCTACACCCAAGCCTGTTCCAAAACTTATTATGAAGGGCAATATAGAGGTTCTAAACCTTGTTACAGGCCCTGACAGTATAACAACAATTGAACTGTATCTTAACACCAGGATGGGACAAAATGATGAGTCTAAGGAGAACTATGGTTACAGTGAAAAAGTAACTGTTGCTAACAGCAGTGACCAGGACAAGCCTACTTCTGGAGAGATACCAACCTACAGTACAGCTAGAATTAATCTACCCATGTTGAATGAGGACCTAACCTGTAATACTCTAACTATGTGGGAAGCTGTCTCTGTAAAAACTGAAGTGGTTGGGGTTAGCTCTCTGGTAAATGTTCATATGGCTACTAAAAGAATGTATGATGACAAAGGTATTGGTTTCCCAGTTGAGGGAATGAATTTCCATATGTTTGCAGTGGGTGGGGAACCCCTAGAACTCCAGTTTCTAACTGGAAACTACAGAACTGATTACAGTGCTAATGACAAATTGGTTGTCCCCCCAATAAAACACCAGAGCACACAAGGCCTCAATCCTCACTACAAACAAAAGCTAACAAAAGATGGGGCCTTTCCTGTAGAGTGCTGGTGTCCAGACCCCTCAAAAAATGAAAATACAAGATATTATGGCAGCTATACTGGTGGACAGAGTACACCTCCAGTTTTGCAATTTACAAACACTGTGACTACTGTGCTACTAGATGAGAATGGTGTTGGCCCACTTTGTAAAGGTGATGGCCTGTATGTGTCATGCTGTGACATAGTAGGCTTTCTGGTTGGGAAAGATGGAGACATGCAATACAGAGGCCTACCTAGGTACTTTAATATTCTATTGAGAAAGAGAACTGTAAGAAATCCTTACCCAGTTTCTTCCTTGTTGAATAATCTTTTCACTGGTCTTATGCCAGCTGTTCAGGGCCAGCCTATGGACAATGGACTAAGTACACAGGTTGAAGAAGTCAGAGTTTATGATGGAACTGAAGGCCTTCCTGGAGATCCAGACATGGTCAGATATATTGACAAGTTTGGACAAGACAAAACCCGCCCCCCCTTCCCCGCCCGGCTTTATTGAGTCACAAACAAAGTATTTGCAAAAAAGCTTTATTAAATGGCTTGTTTTCCATGCTGCAGGTTTTGCTGTTATATAAAACTAATAAAGGTTTATTGTGTTTGGAAACCAGAATCATTTGTTTCAGAGAATTCTTCTTCCTCCTCATCCTCCACTTCAATTACAACAGAATCAAGAGGATCTTTACCCTCCTCCACATTTAATAGCAAGGTAGCAAAATTAGTATGGCCCATGTATTTACATAGAATATCTTTCCAATACTTAACATCCTCCTTTATTGACTCTGAAAACATGGTAATTGGACAGTACCAAACCAACAACAAAGCAATAGTGACTCCATCCTGTAGTATTCTTTCTGTTAATAAGTAGTCACTAACCTGAAGGCAAGATCTAAGATTATGCTTTGGAGTAAAATTCAAAACATAAGCAAACCTTGTAAAAATGGTTTCAGGCAAGAGGTACTCATTCATAGTCACAAGACAGGGTGGGAAGATCTGGCTTCTTTTGTTCACATGCTTCCTTTCTAAATTTACTTTGACACTCCCATCCAGATGGTCTCTTAAATTGTCTAAATTGGCTACTCCCTGTCCAGGCTGCAGTTTTTTATTAAGTGCTATTTGACCCTTGACATCTTCAAAAATAACTACAAACTGGTCTATTGCACAGCCAAGTTCAAAGGGCAATTTATCTGCAGGACAATTGACATTTAATGTTTTTCCTCCCAGGAAATTCATCAGAGCAGCTGCAAAAGTAGTTTTCCCACTATTGATTGGTCCTCTAAAAAGGCAATTTCTTTTTTTAGGGACATTTTCTACAATTAACTTTAAGATTTTGGTGACTACTTCATCTATATTTTCAAATAAGCAAGAATACCAAGCAACTCCCGCCATATACTGAAGAATTTTAATTTGACCAAACTCATCAGTAAGTTTCTCAAACATTAATTTAAATCTTTCCTCCAGTAATTCTTTTCTAGTACTTTCAATTAACTTTAATCTCTGTTTTGCCATCACCACATCTGCTGCTTGTTGGCAGGCAGTTTTTTGAGTTTTGCACTCCTTAAACAGCTTTGCATTTTTATGATGTAAGCTATGGTAATTATAGTGAGCTTTTAGAGCTTTTTTAGTGCATTTAGAGCATGTGCTTGGCTCTTCTGCAAAGTCTAAGTAATGAGCCATAATTAACAGGGGATCATCTAGCCTGTTGGTAACTGCAAAATCAGTGAGAAGGTTCCAATTAACCACAGGCTTCCCATTTTCTTCATTAAACTCATATTCAAATATTCCTGGCTTGCTTTCCTCCAGTAGCTTAAATGGTTCACTGCACATACATCTGTAACATTCTACTTGTTTAATTACAGCTTTGCATAACAAGAAACTAACAGTGCAGTGTGTTACACATAAATTCTTAATTGCTGAAACTCTATGCTTGCCAGGAGTCATTAAGAATACCATGCTCCCTTCCTGAAAAGAGTGTCTACTTTTAAATTCAGGATTAAATTTATCAAGCTTTTTATACAAATATTCAGCTTTTTCATTAGTTGTATATATCAGAAAAGATGATAAAGTTTTATTACTATAGACAGCATTAGAAAGAAAAGGCCGCAACATATCAGGAAAATCATTAGGGACAGAGTCATACTTAGATTTTTTTGGCTTTGGGGGGGTGGCAGAGAAGGAGCTCTGGGTGCAGCCGGGGGAGTCCTCTGGCGGGGGAGCTCTTCTTCTTCTTGGATTCTCCTCGCTAAATTGAGTAGAGGGTCCCGGAGTGGGGCTTGGAGATCTAGATTCATCAGAGGGAATGGTGGATTCATGGCAGAAGAGGTCTGGGTCCTGCATGGTGTCAAACAAGTTGTCCCATTCTTGATTGAAGCTTTCCCACCAGCTGGCCCAGGAGGGGTGCCCATAGGGAGGTATATCTCTTCCATCCTGGGTTGGAACATCATGCTAAAAGGAAAAACTAAATTAATATAGGTACATAACACCTGCAGTTTCCCCACCTGTTACTTACCCCAGTTAAAGCCTTGATTAACTCTCAGATAGAGATTCACCAGGTGAAAGTCAACTTCTCCTACTATGCAACTCCAAGCCCAAAGGGAATCCAAGCAATATAAGTCTTCTCCAAACCATGCACAGTAGCATTTGTAACAAAAGCATTCTCCCCAAACTACACACTTCTTCTGGTGCATTTGCTTATAAACAAAATGTTGAAGGCCTATTTTGCAGGTTAAGCATTTACACTCTTTTAAAGCTTTTTCTGCACACTGAGGCCAGTGTTTAATTACATTCTCATCATATTTTTTTTTCCCAAAATATTCCTTCAAAGATATTAAATTTGCCTCCCAATACCATGAGCCTACCTGGCTACTGAAGCTAGTTGGAAACTCTTGTCTTGCATTATAAATTCCTTCTTGCAGTTTTTGCCATAATTGATTTAATCTTGACATTTTTTCTGGATCTCCTCCTTTATCTGGATGGTATTTCAAGCTCATTTTTTTATGATTAATTTTCATTAGTGCAAAATTCCCATAGCAATGCCTTGGGATTTGCAATAAATCCATAAG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80,105
KX249741.1
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
Urbano,P.R. Sr., Oliveira,A.C.S., Romano,C.M.
Sao Paulo Institute of Tropical Medicine, Virology Laboratory
Brazil
2016-08-17
B
Alphapolyomavirus octihominis
Alphapolyomavirus
Polyomaviridae
dsDNA
5,235
GenBank
null
Brazil
Brazil
Homo sapiens
blood
2014-02
null
null
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus isolate B, complete genome
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80,106
KX249742.1
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
Urbano,P.R. Sr., Oliveira,A.C.S., Romano,C.M.
Sao Paulo Institute of Tropical Medicine, Virology Laboratory
Brazil
2016-08-17
C
Alphapolyomavirus octihominis
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Polyomaviridae
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Brazil
Brazil
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2014-04
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null
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus isolate C, complete genome
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Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
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Sao Paulo Institute of Tropical Medicine, Virology Laboratory
Brazil
2016-08-17
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80,108
KM655816.1
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
Rockett,R., Barraclough,K.A., Isbel,N.M., Dudley,K.J., Nissen,M.D., Sloots,T.P., Bialasiewicz,S., Dudley,K.
The University of Queensland, Queensland Children's Medical Research Institute
Australia
2015-04-28
QLD-127M1b
Alphapolyomavirus octihominis
Alphapolyomavirus
Polyomaviridae
dsDNA
5,232
GenBank
1
Australia
Australia
Homo sapiens
blood
2010-10-15
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Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus isolate QLD-127M1b, complete genome
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87,115
KF444091.1
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Kazem,S., Lauber,C., van der Meijden,E., Kooijman,S., Kravchenko,A.A., Feltkamp,M.C., Gorbalenya,A.E., Feltkamp,M.C.W.
Leiden University Medical Center (LUMC), Medical Microbiology
Netherlands
2015-01-13
0203
Alphapolyomavirus octihominis
Alphapolyomavirus
Polyomaviridae
dsDNA
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GenBank
1
Netherlands
Netherlands
Homo sapiens
skin
2003
null
null
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Kazem,S., Lauber,C., van der Meijden,E., Kooijman,S., Kravchenko,A.A., Feltkamp,M.C., Gorbalenya,A.E., Feltkamp,M.C.W.
Leiden University Medical Center (LUMC), Medical Microbiology
Netherlands
2015-01-13
0304
Alphapolyomavirus octihominis
Alphapolyomavirus
Polyomaviridae
dsDNA
5,232
GenBank
1
Australia
Australia
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2004
null
null
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88,272
KF444093.1
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus
Kazem,S., Lauber,C., van der Meijden,E., Kooijman,S., Kravchenko,A.A., Feltkamp,M.C., Gorbalenya,A.E., Feltkamp,M.C.W.
Leiden University Medical Center (LUMC), Medical Microbiology
Netherlands
2015-01-13
0409
Alphapolyomavirus octihominis
Alphapolyomavirus
Polyomaviridae
dsDNA
5,232
GenBank
1
USA
USA
Homo sapiens
skin
2009
null
null
Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus isolate 0409, complete genome
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