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|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MH086246.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Padilla,S.L., Prieto,K., Haddow,A.D., Watts,D.M., Klein,T.A., Turell,M.J., Lowen,R.G., Palacios,G.F., Pitt,M.L., Wiley,M.R., Nasar,F.
|
United States Army Medical Institute of Infectious Diseases, Center for Genome Scienes
|
USA
|
2019-04-16
|
PE4-800
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,360
|
GenBank
| null |
Peru
|
Peru
|
Culex gnomatos
| null |
1997
|
SAMN08723479
|
PRJNA438670
|
Venezuelan equine encephalitis virus isolate PE4-800, complete genome
|
TATGNCCGGGTCTTCTGCGCACTATGGGCGGCGCATGAGATTAGCCCAATACAATCACTACCCATTATGGAGAAAGTTCACGTTGATATCGAGGAGGATAGCCCCTTCCTCAGAGCTTTGCAACGGAGCTTCCCCCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACCGACAATGACCATGCTAACGCTAGAGCGTTTTCGCATCTAGCTTCTAAATTGATCGAAACGGAGGTAGAACCATCCGATACGATCTTAGACATTGGAAGTGCGCCCGCTCGCAGAATGTACTCTAAACATAAGTACCACTGCATATGTCCCATGAAGTGCGCAGAAGACCCGGACAGACTATTCAAATATGCAGCCAAGTTAAAGAAAAACTGCAAGGACATCACAGACAAGGAGTTGGATAAGAAGATGGCAGAGCTCGCAGCCGTCATGGAGGACCCTGACCAGGAACAAGACACTATCTGCTTGCATGACGACGAATCTTGTCGCCATGAGGGGCAAGTGGCTGTCTACCAGGATGTCTATGCCGTGGACGGCCCCACCAGCCTCTATCACCAAGCAAATAAGGGAGTGAGAGTCGCCTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCCTTTTATGTTTAAGAACCTGGCCGGAGCGTACCCATCCTACTCCACAAATTGGGCAGATGAGACGGTGCTAACGGCCCGCAACATTGGTCTATGCAGTTCAGACGTTATGGAGCAGTCTCGCAGAGGACTGTCTATACTAAGGAAAAAGTATCTAAAACCATCGAATAACGTCATATTTTCCGTGGGTTCCACCCTTTACCACGAAAAACGGGACCTACTAAAAAGCTGGCACTTACCATCAGTGTTTCACCTACGTGGCAGGCAAAATTACACATGTCGGTGTGAGACGATAGTGAGTTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGAATCGCTATCAGTCCCGGCCTGTACGGGAAACCGTCAGGCTACGCTGCCACTATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGTTGCAAGGTAACGGACACGCTTAACGGGGAGAGGGTCTCTTTTCCTGTTTGCACATATGTGCCGGCGACACTATGCGACCAAATGACTGGCATCTTGGCTACAGACGTCAGTGCAGACGACGCACAAAAACTGCTGGTTGGGCTCAACCAGCGCATTGTCGTGAACGGCCGCACTCAGAGGAATACTAACACTATGAAAAACTACCTACTACCAGTAGTGGCCCAGGCGTTTGCACGGTGGGCCAAAGAGTACAAAGAAGATCAAGACGATGAAAGACCATTGGGATTGAGGGACAGACAGTTAGTAATGGGCTGTTGCTGGGCGTTTAAGAAACACAAAATCACATCTGTGTACAAACGCCCTGACACGCAGACCGTTATAAAAGTCCCCAGCGACTTCCATTCCTTTGTACTGCCTAGGCTTGGCAGTTGCTCATTGGAAATTGGGCTGAGGAGCAGAATAAAGAAGCTGCTCGCAGATAAGAAAGAACCACCGCCCCTGGTCACTCAGGAGGATGTCTCAGCGGCGAAAGAAGCGGCTGCAGAAGCCAAGGAGATCAAAGAGGCCGAGGAACTGCGCATCGCATTGCCCCCTATCGTTCCTGACGTGGAGGAACCGACACTAGAGGCTGATGTCGACCTAATGCTGCAGGAGGCCGGCGCGGGTTCCGTAGAGACTCCTCGTGGGCTTATAAAGGTAACCAGCTACTCCGGCGAAGACAAAATAGGCTCGTATGCTGTGCTATCACCCCAAGCCGTTCTTCGGAGCGAGAAGCTCTCCTGCATACACCCATTGGCTGAAGAAGCCATAGTCATCACCCATGCGGGTCGAAAAGGGCGTTACGCAGTCGAGCCATACCATGGCAAAGTGGTGGTTCCTGAGGGGCATGCGATTCCAGTTGCGGATTTCCAGGCACTTAGCGAGAGTGCTACCATCGTGTACAACGAAAGGGAATTCGTGAACAGGTATCTACATCATATCGCTGTTAACGGCGGAGCCTTAAACACTGATGAAGAGTACTACAAAGTAGTCAAGCCCAGCGAATATGAGGGAGAGTACCTGTACGACATTGACAAGAGGCAATGCGTCAAAAAGGATCAAGTGTCTGGTCTAGGCTTAACGGGCGAATTAGTGGAACCTCCGTTTCACGAGTTCGCGTATGAGAGCTTGAAAACCAGACCGGCAGCACCCTACCAGGTACCGACCATAGGCGTTTACGGCGTACCAGGGTCGGGTAAGTCAGGCATCATCAAGAGCGCTGTCACGAAACGAGACTTGGTGGTCAGCGCAAAGAAGGAGAACTGCGCTGAGATCATGCGTGATGTGAAGAGAATGCGAGGCTTGGACATAGTAGCGCGCACCGTTGACTCAGTGTTGTTAAACGGGTGTAAACACCCTGTTGACACGCTATACATCGACGAAGCGTTCGCATGTCACGCCGGGACTCTTCGCGCGCTGATCGCAATCATCAAACCTAAGAAAGCAGTGCTGTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTTTTCAATATGATGTGTCTTAAAGTGCACTTTAACCATGAAATTTGCACGCGGGTGTTCCACAAAAGCATCTCTCGTAGGTGCACCAAATCAGTCACGTCAGTCGTATCCACACTGTTTTACGACAAGAAAATGCGCACCACCAATCCAAAAGAGACGCAGATAGAAATCGACACCACTGGCAGTACGAAGCCTAAGAAAGACGACCTTATACTGACTTGCTTCAGAGGATGGGTAAAGCAGTTGCAAATAGATTACAAGGGTAACGAGATCATGACGGCAGCAGCATCCCAAGGCTTGACCCGAAAGGGGATCTACGCCGTCAGGTACAAAGTCAATGAGAACCCATTGTATGCACCCAACTCAGAACACGTCAATGTCCTGCTCACACGTACTGAGGACAGAATCGTATGGAAAACGTTGGCTGGAGATCCGTGGATCAAGACCCTCACGGCCAGATACCCAGGAGACTTTACTGCCACCCTTGAGGAGTGGCAACAGGAGCATGATGCTATTATGAGGCACATCCTGGAAAAACCAGACCCGGCAGATGTGTTCCAAAATAAAGCAAACGTGTGCTGGGCCAAGGCCTTAGTACCCGTATTGAGGACTGCCGGAATCGACATGACGGCGGACCATTGGAACACAGTCGCCCACTTTAAGGATGACAAGGCGCACTCGGCAGAAATCGTACTTAACCAACTGTGCGTCCGGTTCTTCGGGTTGGATTTAGATTCAGGGTTGTTTTCTGCGCCCACTGTCCCGTTATCGATCAAGAGCAATCACTGGGACAATTCACCATCACCGAATATGTACGGACTGAACAATGAGGTGGTCCGTCAGCTTTCCCGGCGTTACCCGCAACTGCCTCGAGCAGTGGCGACCGGTAGAGTCCTTGACATGAATACAGGAACGCTGCGCAGTTACGACCCGAGCATCAACCTCGTACCGGTTAACCGCAGACTACCTCATGCTTTAGTCACACACAGGCTAGAATACCCGCGGAGCGACTTTTCAACGTTCGCTAGTAAACTGAAAGGACGGACCGTTCTGGTAGTTGGCGACAAGATGAACATCACCGGGAAGACCGTCGACTGGTTATCCGAGAACCCGGAAGCCACTTACAAATCTCGACTGGATCTCGGTATTCCGAGCGAGCTGCCCAAATACGACATCGTGTTTGTGAATGTTCGAACGCCTTATAAGTATCATCACTATCAGCAGTGTGAGGATCACGCGATCAAGCTCAACATGCTGGCAAAGAAAGCATGCCTACACCTTAATCCTGGCGGGACTTGCGTCAGTATAGGTTACGGTTACGCAGATAGAGCCAGCGAAAGTATTATAGGAGCGATCGCACGACAGTTCAAGTTCTCTAGGGTGTGCAAGCCTAAAGCGTCACTGGAGGAGACAGAGGTCCTGTTCGTCTTCATAGGGTACGACCGGAGAACTCGCACGCACAATCCCTATAAGCTGTCTTCTACATTAACTAATATCTACACTGGGTCACATCTGCACGAAGCCGGATGTGCTCCTTCCTACCACGTGGTCCGGGGCGACATAGCTAACGCGGAGGAAGGGGTCATTGTCAACGCAGCAAACAGCAGAGGGCAGCCGGGCGGTGGGGTTTGTGGCGCCCTTTACAAGAAATTTCCCGAGAACTTTGACCTACAGCCAATCGACGTGGGAAAGTCTCGGCTTGTTAAGGGGGCGGCAAAGCACATCATACATGCTGTGGGACCCAATTTCAACAAAGTATCAGAAGTAGAGGGTGATAAGCAACTGGCAGATGCGTATGAGTCGGTCGCTAAAATAATCAATGACAACCACTACCGATCGGTGGCTATCCCACTCTTGTCAACAGGCATCTTTGCCGGTAACAAAGACAGACTTATGCAGTCGCTGAACCATCTGCTTACAGCGTTGGACACCACGGACGCAGATGTGGCTATCTACTGCAGGGACAAGAAATGGGAGACGACCCTAAAGGAAGTCATAGCTAGGAGAGAGGCGGTCGAAGAGATATGTATCTCCGAAGACGCGTCCCAAGCAGAACCCGACGTTGAACTGGTCAGGGTGCACCCAAAGAGCTCACTAGTGGGACGTAAAGGGTTTAGCACGACGGATGGAAAGACGTTTTCGTATCTCGAAGGGACAAAGTTTCACCAGGCAGCAAAGGACGTGGCCGAGATAAACGCAATGTGGCCGACCGCGACTGAAGCCAACGAACAGATATGCTTGTACATTCTGGGAGAAAGTATGAGTAGCATCCGGTCTAAGTGCCCTGTTGAGGAATCCGAAGCCTCTACACCACCTAGCACCCTGCCGTGCTTGTGTATACACTCAATGACACCTGAGCGAGTACACAGGCTTAAAGCAGCACGTCCGGAGCAAATAACAGTGTGCTCGTCGTTTCCTCTGCCTAAGTACAGGATCACAGGGGTGCAGAAGATTCAGTGTGCGCACCCCATTCTCTT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|
MH086247.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Padilla,S.L., Prieto,K., Haddow,A.D., Watts,D.M., Klein,T.A., Turell,M.J., Lowen,R.G., Palacios,G.F., Pitt,M.L., Wiley,M.R., Nasar,F.
|
United States Army Medical Institute of Infectious Diseases, Center for Genome Scienes
|
USA
|
2019-04-16
|
PE12-0123
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,318
|
GenBank
| null |
Peru
|
Peru
|
Culex gnomatos
| null |
1998
|
SAMN08723480
|
PRJNA438670
|
Venezuelan equine encephalitis virus isolate PE12-0123, complete genome
|
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| 63,295
|
MH086248.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Padilla,S.L., Prieto,K., Haddow,A.D., Watts,D.M., Klein,T.A., Turell,M.J., Lowen,R.G., Palacios,G.F., Pitt,M.L., Wiley,M.R., Nasar,F.
|
United States Army Medical Institute of Infectious Diseases, Center for Genome Scienes
|
USA
|
2019-04-16
|
PE20-0043
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,320
|
GenBank
| null |
Peru
|
Peru
|
Culex gnomatos
| null |
1999
|
SAMN08723481
|
PRJNA438670
|
Venezuelan equine encephalitis virus isolate PE20-0043, complete genome
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| 63,296
|
MH086249.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Padilla,S.L., Prieto,K., Haddow,A.D., Watts,D.M., Klein,T.A., Turell,M.J., Lowen,R.G., Palacios,G.F., Pitt,M.L., Wiley,M.R., Nasar,F.
|
United States Army Medical Institute of Infectious Diseases, Center for Genome Scienes
|
USA
|
2019-04-16
|
PE21-0029
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,306
|
GenBank
| null |
Peru
|
Peru
|
Culex gnomatos
| null |
1999
|
SAMN08723482
|
PRJNA438670
|
Venezuelan equine encephalitis virus isolate PE21-0029, complete genome
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| 63,297
|
MF590066.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Juarez,D., Guevara,C., Wiley,M., Torre,A., Palacios,G., Halsey,E.S., Ampuero,S., Leguia,M.
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U.S. Naval Medical Research Unit No. 6, Virology and Emerging Infections Department
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Peru
|
2018-03-06
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
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Alphavirus
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Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,412
|
GenBank
| null |
Peru
|
Peru
|
Homo sapiens
| null |
2013-06-25
| null | null |
Venezuelan equine encephalitis virus strain VEEV/Homo_sapiens/PER/CFI2256/2013, complete genome
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| 71,919
|
MF459684.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Kutchko,K.M., Madden,E.A., Morrison,C., Plante,K.S., Sanders,W., Vincent,H.A., Long,K.M., Moorman,N.J., Heise,M.T., Laederach,A.
|
University of North Carolina at Chapel Hill, Biology
|
USA
|
2018-02-04
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,421
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Venezuelan equine encephalitis virus strain ZPC738, complete genome
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| 72,248
|
KR260736.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Forrester,N.L., Auguste,A.J., Guerbois,M., Rossi,S.L., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2015-09-19
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
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ssRNA(+)
| 11,495
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Equus ferus
| null |
1967
|
SAMN03381384
|
PRJNA257008
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Venezuelan equine encephalitis virus strain COAN5506, complete genome
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| 85,660
|
KR260737.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Forrester,N.L., Auguste,A.J., Guerbois,M., Rossi,S.L., Lin,D., Hari,K., Weaver,S.C.
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University of Texas Medical Branch, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2015-09-19
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
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ssRNA(+)
| 11,370
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Culicidae
| null |
2013-07-02
|
SAMN03381385
|
PRJNA257008
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Venezuelan equine encephalitis virus strain EVG3-95, complete genome
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| 85,661
|
KP282671.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Yu,G.Y., Wiley,M.R., Kugelman,J.R., Ladner,J.T., Beitzel,B.F., Eccleston,L.T., Morazzani,E.M., Glass,P.J., Palacios,G.F., Yu,G.-Y., Rossi,C.A., Minogue,T.D.
|
U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, Center for Genome Sciences
|
USA
|
2015-03-01
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,417
|
GenBank
| 1
|
Venezuela
|
Venezuela
|
Homo sapiens
| null |
1995
| null | null |
Venezuelan equine encephalitis virus strain VEEV/H.sapiens/VEN/INH-9813/1995/IC, complete genome
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ATGGGCGGCGCAAGAGAGAAGCCCAAACCAATTACCTACCCAAAATGGAGAAAGTTCACGTTGACATCGAGGAAGACAGCCCATTCCTCAGAGCTTTACAACGGAGCTTCCCGCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACTGATAATGACCATGCTAATGCCAGAGCGTTTTCGCATCTGGCTTCAAAACTGATCGAAACGGAGGTGGACCCATCCGACACGATCCTTGACATTGGAAGTGCGCCCGCCCGCAGAATGTATTCTAAGCATAAGTATCATTGCATCTGTCCGATGAGATGTGCGGAAGATCCGGACAGATTGTACAAGTATGCAACTAAGCTGAAGAAAAATTGCAAGGAAATAACTGACAAGGAATTGGACAAGAAAATGAAGGAGCTCGCCGCCGTCATGAGCGACCCAGACCTGGAAACTGAGACTATGTGCCTCCACGACGATGAGTCATGTCGCTACGAGGGGCAAGTCGCTGTTTACCAGGATGTATACGCAGTTGACGGACCGACAAGTCTCTATCACCAAGCCAACAAGGGAGTTAGAGTCGCCTACTGGATAGGCTTTGACACCACCCCTTTTATGTTTAAGAACTTGGCTGGAGCATATCCATCATACTCTACCAACTGGGCCGACGAAACCGTGTTAACGGCTCGTAACATAGGCCTATGCAGCTCCGACGTCATGGAGCGGTCACGTAGAGGGATGTCCATTCTTAGGAAGAAGTATTTGAAACCATCCAATAATGTCCTATTCTCTGTTGGCTCGACCATCTACCACGAGAAGAGGGACTTACTGAGGAGCTGGCACCTGCCGTCTGTATTTCACTTACGTGGCAAGCAAAATTACACATGTCGGTGTGAGACTATAGTTAGTTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGAATAGCTATCAGTCCAGGCCTGTATGGGAAGCCTTCAGGCTATGCTGCTACGATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGCTGCAAAGTGACAGACACATTGAACGGGGAGAGGGTCTCTTTTCCCGTGTGCACGTATGTGCCAGCTACATTGTGTGACCAAATGACTGGCATACTGGCAACAGATGTCAGTGCGGACGACGCGCAAAAACTGCTGGTTGGGCTCAACCAGCGCATAGTCGTCAACGGTCGCACCCAAAGAAACACCAATACCATGAAGAATTATCTTTTGCCCGTAGTGGCCCAGGCATTTGCTAGGTGGGCAAAGGAATATAAGGAAGATCAAGAAGATGAGAGGCCACTAGGACTACGAGATAGACAGTTAGTCATGGGGTGCTGCTGGGCTTTTAGAAGGCACAAGATAACATCTATTTATAAGCGCCCAGATACCCAAACCATCATCAAAGTGAACAGCGAATTCCACTCATTCGTGCTGCCCAGGATAGGCAGTAACACACTGGAGATCGGGCTGAGAACGAGAATCAGGAAAATGCTAGAAGAGCACAAGGAGCCGTCACCTCTCATTACTGCCGAGGACATACAAGAGGCTAAGTGCGCAGCCGATGAGGCTAAGGAAGTGCGTGAAGCCGAGGAGCTGCGCGCTGCACTACCACCTTTGGCAGCTGATTTTGAGGAGCCCACTCTGGAAGCCGATGTCGACTTGATGTTACAAGAGGCTGGGGCCGGCTCAGTGGAGACACCTCGTGGCTTGATAAGGGTTACCAGCTATGCCGGCGAGGACAAGATCGGCTCTTACGCAGTGCTTTCTCCACAGGCTGTACTCAAGAGTGAGAAACTATCTTGCATTCACCCTCTCGCTGAACAAGTCATAGTGATAACACACTCTGGCCGAAAAGGGCGTTATGCCGTGGAACCCTACCATGGAAAAGTAGTGGTGCCAGAGGGACATGCAATACCCGTCCAGGACTTTCAAGCTCTGAGTGAAAGTGCCACCATTGTGTACAACGAACGAGAGTTCGTAAACAGGTACCTGCACCATATTGCCACACATGGAGGAGCGCTGAACACAGATGAAGAATATTACAAAACTGTCAAGCCCAGCGAGCACGACGGCGAATACCTGTATGACATCGACAGGAAACAATGCGTCAAGAAAGAATTAGTCACTGGGCTAGGGCTTACAGGCGAGCTGGTGGATCCTCCCTTCCATGAATTTGCCTACGAGAGTCTGAGAACACGTCCGGCCGCTCCTTACCAAGTACCAACCATAGGGGTGTATGGCGTGCCGGGGTCAGGCAAGTCTGGCATCATTAAAAGCGCAGTCACCAAAAAAGATCTGGTGGTGAGCGCCAAGAAAGAAAACTGCGCAGAAATAATAAGGGACGTCAAGAAAATGAAAGGGCTGGACGTCAATGCCAGAACTGTGGACTCAGTGCTCTTGAATGGATGCAAACACCCCGTAGAGACCCTGTATATTGACGAAGCTTTTGCTTGTCATGCAGGCACTCTCAGAGCGCTCATAGCCATCATAAGACCTAAAAAGGCAGTGCTCTGCGGGGATCCAAAACAGTGTGGCTTTTTCAATATGATGTGCCTGAAAGTGCATTTTAACCACGAGATTTGCACGCAGGTCTTCCACAAAAGCATCTCTCGTCGTTGCACTAAATCCGTGACTTCGGTCGTCTCAACCTTGTTTTATGACAAAAGGATGAGAACGACGAACCCGAAAGAGACTAAGATTGAGATTGACACTACTGGCAGTACCAAACCGAAGCAGGACGATCTCATTCTCACTTGTTTCAGAGGGTGGGTGAAGCAGTTGCAAATAGATTACAAAGGCAACGAAATAATGACGGCAGCTGCCTCTCAAGGGCTGACCCGTAAAGGCGTGTATGCCGTTCGGTACAAGGTGAATGAAAATCCCCTGTACGCACCCACCTCAGAACATGTGAACGTCCTACTGACCCGCACGGAGGACCGTATCGTGTGGAAAACACTAGCCGGTGATCCATGGATAAAAACACTGACGGCCAAGTATCCTGGGAACTTCACTGCCACGATAGAGGAATGGCAAGCAGAGCATGATGCCATCATGAGGCACATCTTGGAGAGACCGGACCCTACCGACGTTTTCCAAAATAAGGCGAACGTGTGTTGGGCCAAGGCTTTGGTGCCGGTACTGAAGACTGCAGGCATAGACATGACCACTGAACAATGGAACACTGTGGATTACTTCGAAACGGACAAAGCTCACTCAGCAGAGATAGTATTGAACCAACTATGCGTGAGGTTCTTTGGACTCGACCTGGACTCCGGTCTATTTTCTGCACCCACTGTTCCGTTATCCATTAGGAATAATCACTGGGATAATTCCCCGTCGCCTAACATGTACGGGTTGAATAAAGAAGTGGTCCGCCAGCTCTCCCGCAGGTACCCACAACTGCCTCGAGCAGTTGCCACCGGAAGAGTCTATGACATGAATACTGGCACGCTGCGCAATTATGATCCGCGCATAAATCTAGTACCTGTGAACAGAAGACTGCCTCATGCTTTAGTCCTCCACCATAATGAACACCCACAGAGTGACTTTTCTTCATTCGTCAGCAAACTGAAGGGCAGAACTGTCTTGGTGGTCGGGGAGAAGTTGTCCGTCCCAGGCAAAAAGGTCGACTGGTTGTCAGACCAGCCTGAGGCTACCTTTAGAGCTCGGCTGGATTTAGGTATCCCAGGTGACGTGCCCAAATACGACATTGTATTTATTAACGTGAGGACTCCATATAAATACCATCATTATCAGCAGTGTGAAGACCACGCCATTAAGCTTAGTATGTTGACCAAGAAAGCTTGTCTGCATTTGAATCCCGGCGGAACCTGCGTCAGCATAGGTTATGGTTACGCTGACAGGGCCAGCGAGAGCATCATTGGTGCTATAGCGCGGCAGTTCAAGTTCTCCCGGGTATGCAAACCGAAATCCTCACATGAAGAGACAGAAGTACTGTTTGTATTCATTGGGTACGATCGCAAGGCCCGTACGCACAATCCTTACAAGCTTTCATCTACCTTGACCAACATCTATACAGGTTCCAGACTCCACGAAGCCGGATGCGCACCCTCATATCATGTGGTGCGAGGGGATATTGCCACGGCCACCGAAGGAGTGATCATAAATGCTGCCAACAGCAAAGGACAACCTGGCGGAGGGGTGTGCGGAGCGCTGTATAAGAAATTCCCGGAAAGCTTCGATTTACAGCCGATCGAAGTGGGAAAAGCGCGACTGGTCAAAGGTGTAACTAAACATATTATTCATGCCGTAGGGCCCAACTTCAACAAAGTTTCGGAAGTTGAAGGGGACAAACAGTTGGCAGAGGCTTATGAGTCCATCGCTAAAATTGTCAACGATAACAATTACAAGTCAGTAGCGATTCCACTGTTGTCCACCGGCATCTTTTCCGGGAACAAAGATCGACTAACCCAATCATTGAACCATTTGCTGACAGCTTTAGACACCACTGATGCAGATGTAGCCATATACTGCAGGGACAAGAAATGGGAAATGACTCTCAAGGAAGCAGTGGCTAGGAGAGAAGCAGTGGAGGAGATATGCATATCAGACGACTCTTCGGTGACAGAACCGGATGCAGAGCTGGTGAGGGTACATCCGAAGAGTTCTTTGGCTGGAAGGAAGGGCTACAGCACAAGTGATGGCAAGACTTTCTCATATTTGGAAGGGACCAAATTTCACCAGGCGGCCAAGGATATAGCAGAAATTAATGCCATGTGGCCAGTTGCAACGGAGGCCAATGAGCAAGTATGCATGTATATCCTCGGTGAAAGCATGAGCAGCATTAGGTCGAAATGCCCCGTCGAGGAGTCGGAAGCCTCCACACCACCTAGCACGCTGCCTTGCTTGTGCATCCATGCTATGACTCCAGAAAGAGTACAACGCCTAAAAGCCTCACGTCCAGAACAAATTACTGTGTGCTCATCCTTTCCATTGCCGAAGTATAGAATCACTGGTGTGCAGAAGATCCAGTGCTCCCAGCCTATACTGTTCTCACCGAAGGTGCCTGCGTAC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TACGAGCACGCGACCACGATGCCGAGCCAAGCGGGAATCTCGTATAACACCATAGTCAACAGAGCAGGCTACGCGCCACTCCCTATCAGCATAACACCAACAAAGATCAAGCTGATACCCACAGTGAACTTGGAGTACGTCACCTGCCACTACAAAACAGGAATGGATTCACCAGCCATCAAATGCTGCGGATCTCAGGAATGTACTCCAACTAACAGGCCTGATGAACAGTGCAAAGTCTTCACAGGGGTTTACCCGTTCATGTGGGGAGGTGCATATTGCTTTTGCGACACTGAGAATACTCAGGTCAGCAAGGCCTACGTAATGAAATCTGACGACTGCCTTGCGGATCATGCTGAAGCATACAAAGCGCACACAGCCTCAGTGCAGGCGTTCCTCAACATCACAGTGGGGGAACACTCTATTGTGACCACCGTGTATGTGAATGGAGAAACTCCTGTGAACTTCAATGGGGTCAAACTAACTGCAGGTCCACTTTCCACAGCTTGGACACCCTTTGACAGAAAAATCGTGCAGTATGCCGGGGAGATCTATAATTACGATTTTCCTGAGTATGGGGCAGGACAACCAGGAGCATTTGGAGACATACAATCCAGAACAGTCTCAAGCTCAGATCTGTATGCCAATACCAACCTAGTGCTGCAGAGACCCAAAGCAGGAGCGATCCATGTGCCATACACTCAGGCACCATCGGGTTTTGAGCAATGGAAGAAAGATAAAGCTCCGTCATTGAAATTCACCGCCCCTTTCGGATGCGAAATATATACAAACCCCATTCGCGCCGAAAATTGTGCTGTAGGGTCAATTCCATTAGCCTTTGACATTCCCGACGCCTTGTTCACCAGGGTGTCAGAAACACCGACACTTTCAGCGGCCGAATGCACTCTTAACGAGTGCGTGTATTCATCCGACTTTGGCGGGATCGCCACGGTCAAGTATTCGGCCAGCAAGTCAGGCAAGTGCGCAGTCCATGTGCCATCAGGGACTGCTACCCTAAAAGAAGCAGCAGTCGAGCTAACCGAGCAAGGGTCGGCGACCATTCATTTCTCGACCGCAAATATCCACCCGGAGTTCAGGCTCCAAATATGCACATCATATGTCACGTGCAAAGGTGATTGTCACCCCCCGAAAGACCACATTGTGACACACCCCCAGTATCACGCCCAAACATTTACAGCCGCGGTGTCAAAAACCGCGTGGACGTGGTTAACATCCCTGCTGGGAGGATCGGCCGTAATTATTATAATTGGCTTAGTGCTGGCTACTATTGTGGCCATGTACGTGCTGACCAACCAGAAACATAATTGAACATAGCAGCAATTGGCAAGCTGCTTATATAGAACTTGCGGCGATTGGCATGCCGCTTTAAAATTTTATTTTATTTTCTTTTCTTTTC
| 87,638
|
KF985959.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Das,S., Halpin,R.A., Ransier,A., Mohan,M., Fedorova,N., Tsitrin,T., Puri,V., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Auguste,A.J., Wentworth,D.E., Weaver,S.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-12-25
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,444
|
GenBank
| null |
Venezuela
|
Venezuela
|
Anopheles
| null |
1995
| null |
PRJNA157941
|
Venezuelan equine encephalitis virus strain VEEV/Anopheles/VEN/12-1/1995/IC, complete genome
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ATGGGCGGCGCAAGAGAGAAGCCCAAACCAATTACCTACCCAAAATGGAGAAAGTTCACGTTGACATCGAGGAAGACAGCCCATTCCTCAGAGCTTTACAACGGAGCTTCCCGCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACTGATAATGACCATGCTAATGCCAGAGCGTTTTCGCATCTGGCTTCAAAACTGATCGAAACGGAGGTGGACCCATCCGACACGATCCTTGACATTGGAAGTGCGCCCGCCCGCAGAATGTATTCTAAGCATAAGTATCATTGCATCTGTCCGATGAGATGTGCGGAAGATCCGGACAGATTGTACAAGTATGCAACTAAGCTGAAGAAAAATTGCAAGGAAATAACTGACAAGGAATTGGACAAGAAAATGAAGGAGCTCGCCGCCGTCATGAGCGACCCAGACCTGGAAACTGAGACTATGTGCCTCCACGACGATGAGTCATGTCGCTACGAGGGGCAAGTCGCTGTTTACCAGGATGTATACGCAGTTGACGGACCGACAAGTCTCTATCACCAAGCCAACAAGGGAGTTAGAGTCGCCTACTGGATAGGCTTTGACACCACCCCTTTTATGTTTAAGAACTTGGCTGGAGCATATCCATCATACTCTACCAACTGGGCCGACGAAACCGTGTTAACGGCTCGTAACATAGGCCTATGCAGCTCCGACGTCATGGAGCGGTCACGTAGAGGGATGTCCATTCTTAGGAAGAAGTACTTGAAACCATCCAATAATGTCCTATTCTCTGTTGGCTCGACCATCTACCACGAGAAGAGGGACTTACTGAGGAGCTGGCACCTGCCGTCTGTATTTCACTTACGTGGCAAGCAAAATTACACATGTCGGTGTGAGACTATAGTTAGTTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGAATAGCTATCAGTCCAGGCCTGTATGGGAAGCCTTCAGGCTATGCTGCTACGATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGCTGCAAAGTGACAGACACATTGAACGGGGAGAGGGTCTCTTTTCCCGTGTGCACGTATGTGCCAGCTACATTGTGTGACCAAATGACTGGCATACTGGCAACAGATGTCAGTGCGGACGACGCGCAAAAACTGCTGGTTGGGCTCAACCAGCGCATAGTCGTCAACGGTCGCACCCAAAGAAACACCAATACCATGAAGAATTATCTTTTGCCCGTAGTGGCCCAGGCATTTGCTAGGTGGGCAAAGGAATATAAGGAAGATCAAGAAGATGAGAGGCCACTAGGACTACGAGATAGACAGTTAGTCATGGGGTGCTGCTGGGCTTTTAGAAGGCACAAGATAACATCTATTTATAAGCGCCCAGATACCCAAACCATCATCAAAGTGAACAGCGATTTCCACTCATTCGTGCTGCCCAGGATAGGCAGTAACACACTGGAGATCGGGCTGAGAACAAGAATCAGGAAAATGCTAGAAGAGCACAAGGAGCCGTCACCTCTCATTACTGCCGAGGACATACAAGAGGCTAAGTGCGCAGCCGATGAGGCTAAGGAAGTGCGTGAAGCCGAGGAGCTGCGCGCTGCACTACCACCTTTGGCAGCTGATTTTGAGGAGCCCACTCTGGAAGCCGATGTCGACTTGATGTTACAAGAGGCTGGGGCCGGCTCAGTGGAGACACCTCGTGGCTTGATAAAGGTTACCAGCTATGCCGGCGAGGACAAGATCGGCTCTTACGCAGTGCTTTCTCCACAGGCTGTACTCAAGAGTGAGAAACTATCTTGCATTCACCCTCTCGCTGAACAAGTCATAGTGATAACACACTCTGGCCGAAAAGGGCGTTATGCCGTGGAACCCTACCATGGAAAAGTAGTGGTGCCAGAGGGACATGCAATACCCGTCCAGGACTTTCAAGCTCTGAGTGAAAGTGCCACCATCGTGTACAACGAACGAGAGTTCGTAAACAGGTACCTGCACCATATTGCCACACATGGAGGAGCGCTGAACACAGATGAAGAATATTACAAAACTGTCAAGCCCAGCGAGCACGACGGCGAATACCTGTATGACATCGACAGGAAACAATGCGTCAAGAAAGAATTAGTCACTGGGCTAGGGCTTACAGGCGAGCTGGTGGATCCTCCCTTCCATGAATTTGCCTACGAGAGTCTGAGAACACGTCCGGCCGCTCCTTACCAAGTACCAACCATAGGGGTGTATGGCGTGCCGGGGTCAGGCAAGTCTGGCATCATTAAAAGCGCAGTCACCAAAAAAGATCTGGTGGTGAGCGCCAAGAAAGAAAACTGCGCAGAAATAATAAGGGACGTCAAGAAAATGAAAGGGCTGGACGTCAATGCCAGAACTGTGGACTCAGTGCTCTTGAATGGATGCAAACACCCCGTAGAGACCCTGTATATTGACGAAGCTTTTGCTTGTCATGCAGGCACTCTCAGAGCGCTCATAGCCATCATAAGACCTAAAAAGGCAGTGCTCTGCGGGGATCCAAAACAGTGTGGCTTTTTCAATATGATGTGCCTGAAAGTGCATTTTAACCACGAGATTTGCACGCAGGTCTTCCACAAAAGCATCTCTCGTCGTTGCACTAAATCCGTGACTTCGGTCGTCTCAACCTTGTTTTACGACAAAAGGATGAGAACGACGAACCCGAAAGAGACTAAGATTGAGATTGACACTACTGGCAGTACCAAACCGAAGCAGGACGATCTCATTCTTACTTGTTTCAGAGGGTGGGTGAAGCAGTTGCAAATAGATTACAAAGGCAACGAAATAATGACGGCAGCTGCCTCTCAAGGGCTGACCCGTAAAGGCGTGTATGCCGTTCGGTACAAGGTGAATGAAAATCCCCTGTACGCACCCACCTCAGAACATGTGAACGTCCTACTGACCCGCACGGAGGACCGTATCGTGTGGAAAACACTAGCCGGTGATCCATGGATAAAAACACTGACGGCCAAGTATCCTGGGAACTTCACTGCCACGATAGAGGAATGGCAAGCAGAGCATGATGCCATCATGAGGCACATCTTGGAGAGACCGGACCCTACCGACGTTTTCCAAAATAAGGCGAACGTGTGTTGGGCCAAGGCTTTGGTGCCGGTACTGAAGACTGCAGGCATAGACATGACCACTGAACAATGGAACACTGTGGATTACTTCGAAACGGACAAAGCTCACTCAGCAGAGATAGTATTGAACCAACTATGCGTGAGGTTCTTTGGACTCGACCTGGACTCCGGTCTATTTTCTGCACCCACTGTTCCGTTATCCATTAGGAATAATCACTGGGATAATTCCCCGTCGCCTAACATGTACGGGTTGAATAAAGAAGTGGTCCGCCAGCTCTCCCGCAGGTACCCACAACTGCCTCGAGCAGTTGCCACCGGAAGAGTCTATGACATGAATACTGGCACGCTGCGCAATTATGATCCGCGCATAAATCTAGTACCTGTGAACAGAAGACTGCCTCATGCTTTAGTCCTCCACCATAATGAACACCCACAGAGTGACTTTTCTTCATTCGTCAGCAAACTGAAGGGCAGAACTGTCTTGGTGGTCGGGGAGAAGTTGTCCGTCCCAGGCAAAAAGGTCGACTGGTTGTCAGACCAGCCTGAGGCTACCTTTAGAGCTCGGCTGGATTTAGGTATCCCAGGTGACGTGCCCAAATACGACATTGTATTTATTAACGTGAGGACTCCATATAAATACCATCATTATCAGCAGTGTGAAGACCACGCCATTAAGCTTAGTATGTTGACCAAGAAAGCTTGTCTGCATTTGAATCCCGGCGGAACCTGCGTCAGCATAGGTTATGGTTACGCTGACAGGGCCAGCGAGAGCATCATTGGTGCTATAGCGCGGCAGTTCAAGTTCTCCCGGGTATGCAAACCGAAATCCTCACATGAAGAGACAGAAGTACTGTTTGTATTCATTGGGTACGATCGCAAGGCCCGTACGCACAATCCTTACAAGCTTTCATCTACCTTGACCAACATCTATACAGGTTCCAGACTCCACGAAGCCGGATGCGCACCCTCATATCATGTGGTGCGAGGGGATATTGCCACGGCCACCGAAGGAGTGATCATAAATGCTGCCAACAGCAAAGGACAACCTGGCGGAGGGGTGTGCGGAGCGCTGTATAAGAAATTCCCGGAAAGCTTCGATTTACAGCCGATCGAAGTGGGAAAAGCGCGACTGGTCAAAGGTGTAACTAAACATATTATTCATGCCGTAGGGCCCAACTTCAACAAAGTTTCGGAAGTTGAAGGGGACAAACAGTTGGCAGAGGCTTATGAGTCCATCGCTAAAATTGTCAACGATAACAATTACAAGTCAGTAGCGATTCCACTGTTGTCCACCGGCATCTTTTCCGGGAACAAAGATCGACTAACCCAATCATTGAACCATTTGCTGACAGCTTTAGACACCACTGATGCAGATGTAGCCATATACTGCAGGGACAAGAAATGGGAAATGACTCTCAAGGAAGCAGTGGCTAGGAGAGAAGCAGTGGAGGAGATATGCATATCAGACGACTCTTCGGTGACAGAACCGGATGCAGAGCTGGTGAGGGTACATCCGAAGAGTTCTTTGGCTGGAAGGAAGGGCTACAGCACAAGTGATGGCAAGACTTTCTCATATTTGGAAGGGACCAAATTTCACCAGGCGGCCAAGGATATAGCAGAAATTAATGCCATGTGGCCAGTTGCAACGGAGGCCAATGAGCAAGTATGCATGTATATCCTCGGTGAAAGCATGAGCAGCATTAGGTCGAAATGCCCCGTCGAGGAGTCGGAAGCCTCCACACCACCTAGCACGCTGCCTTGCTTGTGCATCCATGCTATGACTCCAGAAAGAGTACAACGCCTAAAAGCCTCACGTCCAGAACAAATTACTGTGTGCTCATCCTTTCCATTGCCGAAGTATAGAATCACTGGTGTGCAGAAGATCCAGTGCTCCCAGCCTATATTGTTCTCACCGAAGGTGCCTGCGTAC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| 92,204
|
KC344429.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Dugan,V.G., Halpin,R., Ghedin,E., Wester,E., Bera,J., Fedorova,N., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Forrester,N., Adams,A.P., Chen,R., Aguilar,P., Moncayo,A.C., Medina,G.M., Kalvatchev,Z., Brault,A.C., Barrera,R., Boshell,J., Ferro,C., Freier,J.E., Navarro,J.C., Salas,R., De Siger,J., Vasquez,C., Walder,R., Wentworth,D.E., Weaver,S.C.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-02-17
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,444
|
GenBank
| null |
Colombia
|
Colombia
|
Mesocricetus auratus
| null |
2001
| null |
PRJNA157941
|
Venezuelan equine encephalitis virus strain VEEV/Mesocricetus auratus/COL/CO97-0054/2001/ID, complete genome
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TACGAGCACGCGACCACGATGCCGAGCCAAGCGGGAATCTCGTATAACACCATAGTCAACAGAGCAGGCTACGCACCACTCCCTATCAGCATAACACCAACAAAGATCAAGCTGATACCCACAGTGAACTTGGAGTACGTCACCTGCCACTACAAAACAGGAATGGATTCACCAGCCATCAAATGCTGCGGATCTCAGGAATGTACTCCAACTTACAGGCCTGATGAACAGTGCAAAGTCTTCACAGGGGTTTACCCGTTCATGTGGGGAGGCGCATATTGCTTTTGCGACACTGAGAACACCCAAGTCAGCAAGGCCTACGTAATGAAATCTGACGACTGCCTTGCTGATCACGCTGAAGCATACAAAGCGCACACAGCCTCAGTGCAGGCGTTCCTCAACATCACAGTGGGAGAACACTCTATTGTGACCACCGTGTATGTGAATGGAGAAACTCCTGTGAACTTCAATGGGGTCAAATTAACTGCAGGCCCACTTTCCACAGCTTGGACACCCTTTGACCGCAAAATCGTGCAGTATGCCGGGGAGATCTATAATTACGATTTTCCTGAGTATGGGGCAGGACAACCAGGAGCATTTGGAGACATACAATCCAGAACAGTCTCAAGCTCAGATCTGTATGCCAATACCAATCTAGTGCTGCAGAGACCCAAAGCAGGAGCGATCCATGTGCCATACACTCAAGCACCATCGGGTTTTGAGCAATGGAAGAAAGATAAAGCTCCGTCATTGAAATTCACCGCCCCTTTCGGATGCGAAATATATACAAACCCCATTCGCGCCGAAAATTGTGCTGTAGGGTCAATTCCATTAGCCTTTGACATCCCCGACGCCTTGTTCACCAGGGTGTCAGAAACACCGACACTTTCAGCGGCCGAATGCACTCTTAACGAGTGCGTGTATTCATCCGACTTTGGCGGGATCGCCACGGTCAAGTATTCGGCCAGCAAGTCAGGCAAGTGCGCAGTCCATGTGCCATCAGGGACTGCTACCCTAAAAGAAGCAGCAGTCGAGCTAACCGAGCAAGGGTCGGCGACCATTCATTTCTCGACCGCAAATATCCACCCGGAGTTCAGGCTCCAAATATGCACATCATATGTCACGTGCAAAGGTGATTGTCACCCCCCAAAAGACCACATTGTGACACACCCTCAGTATCACGCCCAAACATTTACAGCCGCGGTGTCAAAAACCGCGTGGACGTGGTTAACATCCCTGCTGGGAGGATCGGCCGTAATTATTATAATTGGCTTAGTGCTGGCTACTATTGTGGCCATGTACGTGCTGACCAACCAGAAACATAATTGAACATAGCAGCAATTGGCAAGCTGCTTATATAGAACTCGCGGCGATTGGCATGCCGCTTTAAAATTTTATTTTATTTTCTTTTCTTTTCCGAATCGGATTTTGTTTTTAATATTTC
| 95,055
|
KC344430.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Dugan,V.G., Halpin,R., Ghedin,E., Wester,E., Bera,J., Fedorova,N., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Forrester,N., Adams,A.P., Chen,R., Aguilar,P., Pfeffer,M., Marriott,K., Kang,W., Kinney,R.M., Wentworth,D.E., Weaver,S.C.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-02-17
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
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Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,399
|
GenBank
| null |
Peru
|
Peru
|
Equus caballus
| null |
1971-01-06
| null |
PRJNA157941
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Venezuelan equine encephalitis virus strain VEEV/Equus caballus/PER/Hoja Redonda/1971/IAB, complete genome
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GCACGCGACCACGATGCCGAGCCAAGCGGGAATCTCGTATAACACTATAGTCAACAGAGCAGGCTACGCACCACTCCCTATCAGCATAACACCAACAAAGATCAAGCTGATACCTACAGTGAACTTGGAGTACGTCACCTGCCACTACAAAACAGGAATGGATTCACCAGCCATCAAATGCTGCGGATCTCAGGAATGCACTCCAACTTACAGGCCTGATGAACAGTGCAAAGTCTTCACAGGGGTTTACCCGTTCATGTGGGGTGGTGCATATTGCTTTTGCGACACTGAGAACACCCAAGTCAGCAAGGCCTACGTAATGAAATCTGACGACTGCCTTGCGGATCATGCTGAAGCATATAAAGCGCACACAGCCTCAGTGCAGGCGTTCCTCAACATCACAGTGGGAGAACACTCTATTGTGACTACCGTGTATGTGAATGGAGAAACTCCTGTGAATTTCAATGGGGTCAAATTAACTGCAGGTCCGCTTTCCACAGCTTGGACACCCTTTGATCGCAAAATCGTGCAGTATGCCGGGGAGATCTATAATTATGATTTTCCTGAGTATGGGGCAGGACAACCAGGAGCATTTGGAGACATACAATCCAGAACAGTCTCAAGCTCAGATCTGTATGCCAATACCAACCTAGTGCTGCAGAGACCCAAAGCAGGAGCGATCCACGTGCCATACACTCAGGCACCATCGGGTTTTGAGCAATGGAAGAAAGATAAAGCTCCATCATTGAAATTTACCGCCCCTTTCGGATGCGAAATATATACAAACCCCATTCGCGCCGAAAACTGTGCTGTAGGGTCAATTCCATTAGCCTTTGACATCCCCGACGCCTTGTTCACCAGGGTGTCAGAAACACCGACACTTTCAGCGGCCGAATGCACTCTTAACGAGTGCGTGTATTCTTCCGACTTTGGCGGGATCGCCACGGTCAAGTACTCGGCCAGCAAGCCAGGCAAGTGCGCAGTCCATGTGCCATCAGGGACTGCTACCCTAAAAGAAGCAGCAGTCGAGCTAACCGAGCAAGGGTCGGCGACTATCCATTTCTCGACCGCAAATATTCACCCGGAGTTCAGGCTCCAAATATGCACATCATATGTTACGTGCAAAGGTGATTGTCACCCCCCGAAAGACCATATTGTGACACACCCTCAGTATCACGCCCAAACATTTACAGCCGCGGTGTCAAAAACCGCGTGGACGTGGTTAACATCCCTGCTGGGAGGATCAGCCGTAATTATTATAATTGGCTTGGTGCTGGCTACTATTGTGGCCATGTACGTGCTGACCAACCAGAAACATAATTGAATACAGCAGCAATTGGCAAGCTGCTTACATAGAACTCGCGGCGATTGGCATGCCGCTTTAAAATTTTTATTTTAT
| 95,056
|
NC_038236.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Rodriguez,L.L., Pauszek,S.J., Bunch,T.A., Schumann,K.R.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2018-08-24
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,162
|
RefSeq
| 1
|
USA: Colorado
|
USA
|
Equus caballus
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Vesicular stomatitis Indiana virus strain 98COE, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCAGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCGGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTTTACATCAATACTACAAAAAGTTTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCAAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCCTGAAAGCCCTGGATGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACTAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTCTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTGAGCTCAAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAGCATCGAGAGAAGGGGTCATTATGGAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCAGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAAGAGGCCATCCTGCTTGGTCTGAGGTACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCAATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAGTCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGGCCCTTCTACAAAATCTTGGCATTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGCGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTCAATATAGGTCTTTACAAGGGGACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATTTCCTAATTCCAGCCTTTCAAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATCCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAAAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCTTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCTGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAGGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGATTCCCTCCTCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTAAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCATGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCCCTAGGAAAGGAGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTTGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAAGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTCTGGTTCGAGATGGCTGATCAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCGGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATCAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTATTTTTTGGTGACACTGGATTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAAGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCGAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAATATTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAACGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATTAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATCCCATCCCAACATCT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| 3,974
|
NC_001560.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Wilusz,J., Youngner,J.S., Keene,J.D., Schubert,M., Harmison,G.G., Meier,E., Yang,F., Lazzarini,R.A., Piwnica-Worms,H., De,B.K., Perrault,J., Isaac,C.L., Gallione,C.J., Greene,J.R., Iverson,L.E., Rose,J.K., Welch,W.J., Sefton,B.M., Esch,F.S., Ling,N.C., Herman,R.C., Rowlands,K., Grabau,E., Spindler,K., Jones,C., Semler,B., Holland,J., Iverson,L., Rowlands,D.J., McGeoch,D.J., Dolan,A., Turnbull,N.T., Colonno,R.J., Banerjee,A.K.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-03
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,161
|
RefSeq
| 20
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Vesicular stomatitis Indiana virus, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTATCATTAAAAGGCTCAGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTTTACATCAATACTACAAAAAGTTTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGATAAAGATTGGTCAAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAAGCAGGGGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGTTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGAATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAAATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCCACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAGCCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTCGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCGAAAAGAGCAGTCATGTCACTGCAAGGCCTAAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATATTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTATTCTCGTCTGGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGCTGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGATGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGTTTGTATGCACAGGATCCAGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAGGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCGGACTGGAAACCACCTGAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATCGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTGCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTGGCAGAGTGCACATTTGAAGCATCGGGAGAAGGGGTCATTATGAAGGAGCGCCAGATAACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCAGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCAAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCAGCCTCTCACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAGTTCATCTCTGTCGGAGGTGACGGACGAATGTCTCATAAAGAGGCCATCCTGCTCGGCCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACGATCTAAGTGTTATCCCAATCCATTCATCATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGTCTGAAGGGGAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACCTATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAAATGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCTTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACACTCACTGCGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGGATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTCAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTCACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCGTGGGTCCTGGATTCTATCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAACTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTCTCTCCTAATTCCAGCCTCTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTCTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACTATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCCTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAAAAAGGAAACTGGAAAAATGTTCCTTCTAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCATACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACAGTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCTCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCCGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTGGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATTACATATGCCCCACTGTCCATAACTCTACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCATGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCCCTGGGAAAGGAGGGCACAGGGTTCAGAAGTAACTACTTTGCTTATGAAACTGGAGGCAAGGCCTGCAAAATGCAATACTGCAAGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTCTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTAATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGAGCGGGTCTTCCAATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGTCCTGCTTTCACCATAATCAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGAGTCGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATACATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAAGACGCTGCTTCGCAACTTCCTGATGATGAGAGTTTATTTTTTGGTGATACTGGGCTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAAGGTTGGTTCAGTAGTTGGAAAAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATCCATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGACATAGAGATGAACCGACTTGGAAAGTAACTCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGGACCAAATCAACTTGTGATACCATGCTCAAAGAGGCCTCAATTATATTTGAGTTTTTAATTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCACGATTTTGAGACCGACGAGTTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCCGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAATTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCGATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACATCATGTCAAGCCAATCCCATCTCAACATCTC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| 8,968
|
MW760857.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Texas
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2019-06-17
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Texas/18188/2019, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCAGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAATTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAACAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTTGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCYCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGATGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,832
|
MW760858.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Colorado
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2019-07-02
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Colorado/19559/2019, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAATTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACTAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTTGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGATGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,833
|
MW760859.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Wyoming
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2019-07-22
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Wyoming/21938/2019, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAATTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACTAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCWCCMCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTYCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTTGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGATGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,834
|
MW760860.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Utah
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2019-08-15
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Utah/24917/2019, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCTTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTGAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAGCATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTTGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTATTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAAGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,835
|
MW760861.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: New Mexico
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-04-10
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain New Mexico/10818/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCAGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAAACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,836
|
MW760862.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Arizona
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-05-27
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Arizona/14629/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTAGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCATATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,837
|
MW760863.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Kansas
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-06-15
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Kansas/16784/2020, complete genome
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ACGAAGACARACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,838
|
MW760864.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Kansas
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-06-29
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Kansas/18405/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACCGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,839
|
MW760865.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Kansas
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-01
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Kansas/18458/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGGTTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,840
|
MW760866.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Nebraska
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-01
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Nebraska/18479/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAACAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCCCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTGATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCATTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,841
|
MW760867.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Kansas
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-02
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Kansas/18624/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,842
|
MW760868.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,178
|
GenBank
| null |
USA: Kansas
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-13
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Kansas/19791/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCGTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGATGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAA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| 37,843
|
MW760869.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,177
|
GenBank
| null |
USA: Missouri
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-08-28
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain Missouri/25976/2020, complete genome
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ACGAAGACARACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTTGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAAGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAAT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| 37,844
|
MT437283.2
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
O'Donnell,V., Barrette,R.W., Pauszek,S., Xu,L., Vierra,D.A., Boston,T., Moran,K.E., Faburay,B., Dodd,K.
|
Scientific Liaison Service Section, Foreign Animal Disease Diagnostic Laboratory, National Veterinary Services Laboratories, APHIS/USDA, Plum Island Animal Disease Center
|
USA
|
2020-07-20
|
IN0919WYB2
|
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: Garland, Wyoming
|
USA
|
Bos taurus
| null |
2019-09-09
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus isolate IN0919WYB2, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAATTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACTAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTTGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGATGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATTGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 48,284
|
MT437284.2
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
O'Donnell,V., Barrette,R.W., Pauszek,S., Xu,L., Vierra,D.A., Boston,T., Moran,K.E., Faburay,B., Dodd,K.
|
Scientific Liaison Service Section, Foreign Animal Disease Diagnostic Laboratory, National Veterinary Services Laboratories, APHIS/USDA, Plum Island Animal Disease Center
|
USA
|
2020-07-20
|
IN0919WYB1
|
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: Wheatland, Wyoming
|
USA
|
Bos taurus
| null |
2019-09-05
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus isolate IN0919WYB1, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAATTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACTAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTTGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGATGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 48,285
|
MT437285.2
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
O'Donnell,V., Barrette,R.W., Pauszek,S., Xu,L., Vierra,D.A., Boston,T., Moran,K.E., Faburay,B., Dodd,K.
|
Scientific Liaison Service Section, Foreign Animal Disease Diagnostic Laboratory, National Veterinary Services Laboratories, APHIS/USDA, Plum Island Animal Disease Center
|
USA
|
2020-07-20
|
IN0919COB
|
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: Lyons, Colorado
|
USA
|
Bos taurus
| null |
2019-09-18
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus isolate IN0919COB, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAATTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACTAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTTTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTTGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGATGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 48,286
|
MH919396.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Ferran,M.C., Russell,T.M., Santo,E.E., Golebiewski,L., Haseley,N.S.
|
Rochester Institute of Technology, Life Sciences
|
USA
|
2018-10-21
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,143
|
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Bos taurus
| null |
1987
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain 22-20, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCAGGAGAAACCTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATATCCAGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGAATATTCCTCTTTACATCAATACAACGAAGAGTTTGTCGGATTTGAGAGGATATGTCTACCAAGGTCTGAAGTCCGGAAATGTTTCAATCATCCATGTCAACAGCTACTTGTATGCAGCATTAAAAGACATCCGGGGGAAGCTTGACAAAGATTGGTCAAGCTTCGGAATAAACATTGGGAAGGCAGGGGATACGATTGGAATATTCGACCTCGTATCCTTGAAAGCCCTAGATGGCGTATTACCAGACGGAGTATCCGATGCTTCCAGGACCAGCTCAGATGACAAATGGCTACCGTTATATCTGCTCGGTTTATACAGGGTGGGAAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGCCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAGCAATTCGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGAGACATTTTTGATGTGTGGGGAAACGACAGCAACTACACAAAAATCGTTGCCGCAGTGGACATGTTTTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCTTCATTCAGATATGGAACCATTGTGTCCAGATTTAAAGATTGTGCTGCCTTAGCAACATTCGGACACCTCTGTAAAATAACTGGGATGTCAACAGAAGATGTAACGACCTGGATATTAAATCGAGAAGTTGCAGATGAAATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAGATTGATAAGGCTGACTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGACTGTCTTCAAAATCGCCGTACTCTTCTGTCAAGAACCCTGCTTTTCACTTCTGGGGGCAGTTGACAGCACTTCTGCTTAGATCCACTAGAGCAAGAAATGCAAGACAGCCCGACGACATTGAGTATACATCTCTTACCACAGCAGGTTTGTTATATGCGTATGCAGTTGGATCTTCTGCAGATTTGGCGCAACAGTTTTGTGTCGGAGATAATAAGTACACTCCGGATGAGAGCAACGGGGGATTGACAACCAATGCTCCACCTCAAGGCAGAGATGTGGTTGAATGGCTTGGGTGGTTTGAGGACCAAAATCGAAAACCAACCCCTGACATGATGCAATATGCGAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAAAAAACAATTGGCAAGTATGCCAAGTCAGAATTCGACAAATGACCCTATAATTCTCAGCTCATATATTATATATTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGACTTATTCTCGTCTGGATCAGGCAATAGGAGAAATAGACGAGATCGAGGCACAAAGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTATTCCAAGAAGATGGAGTCGAAGAGCATGCCAAGCCTTCTTATTTTCAGGCAGCGGATGATTCTGACACGGATTCTGAACCTGAAGCTGAAGATAATCAGAACTCTTATGTACCAGATCCTGAGGCTGAGCAAGTTGAAGGTTATATACAAGGTCCACTGGATGATTATGCCGATGAGGAAGTGGATGTGGTTTTCACCTCAGATTGGAAGCAACCTGAGCTTGAATCGGACGAACATGGAAAGACCTTGCGGTTGACACTGCCTGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAAAAGTCTCAATGGCTTTCTACTATCAAAGCTGTTGTCCAAAGTGCTAAGTACTGGAACTTGACAGAATGCACTTTTGAGGCATCAGGAGAGGGGGTAATTATGAAGGAGCGCCAGATGACTCCAGATGTATATAAGGTCACCCCCGTGATGAACACCCATCCATCCCAATCTGAGGCCGTATCAGATGTTTGGTCCCTCTCGAAGACTTCCATGACTTTCCAACCCAAGAAGGCGAATCTTCAACCTCTCATCACATCATTGGATGAGTTGTTTTCATCTAGAGGAGAATTCATTTCCGTCGGAGGCAATGGACGAATGTCCCACAAAGAAGCTATCTTGCTTGGTCTGAGGTACAAGAAGTTGTACAACCAAGCGAGAGTCAAATATTCTTTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTCAGTGTTATCCTAATCTTTTCATCATGAGTTCTCTAAAGAAGATCCTTGGTTTAAAGAGTAAAGGGAAGAAATCTAAGAAATTGGGAATGGCGCCACCCCCTTATGAAGAGGACAACAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCCATTGACAAGTCCTATTTTGGAGTCGAGGATATGGGCACTCATGATCCCAATCAATTGAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAGATGACAGTTAGATCTAATCGTCCGTTTAGAACATACTCAGATGTGGCAGCAGCTGTGTCCCATTGGGATCACATGTACATTGGGATGGCAGGAAAACGTCCCTTTTACAAGATCCTTGCATTTTTGGGTTCTTCCAATCTTAAAGCCACTCCAGCAATATTGGCAGATCAAGGTCAACCGGAGTATCATGCTCATTGCGAAGGCAGGGCCTACTTGCCTCATCGGCTGGGGAAGACTCCTCCAATGCTCAACGTGCCTGAGCACTTCAGAAGACCTTTTAATATAGGTCTTTACAAAGGAACAATCGAGCTCACAATGACCATCTACGATGACGAGTCATTGGAAGCAGCACCTATGATCTGGGATCACTTCAACTCTTCTAAATTTTCCGATTTCCGCGAGAAGGCCTTGATGTTTGGTCTGATAGTCGAGAAAAAAGCGTCTGGTGCTTGGGTCTTAGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCCGATTTGGTTTTAGACATCTGAACAATCCTCGGTTTGCTTAGTCTCTCTCACTTCCAATCTTTCGAACAACTAACCTCCTGTCATTTCTGTCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCAATCTGTTTCACTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTCTTTTATTCATAGGAGTGAACTGTAAATTCACCATAGTATTCCCACACAATCAGAAAGGGAATTGGAAAAATGTTCCTTCCGGTTACCATTACTGCCCGTCCAGCTCAGATTTAAATTGGCACAACGGCTTGATAGGCACAGCTTTACAAGTCAAGATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGCCATGCTTCTAAATGGGTTACTACTTGCGATTTCCGCTGGTACGGACCGAAATATATAACACATTCCATCAGATCCTTCACACCATCAGTGGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAGACAAAACAAGGAACATGGCTGAATCCAGGTTTTCCTCCTCAGAGTTGCGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCCGTGATTGTCCAAGTGACTCCTCATCATGTACTGGTTGATGAGTACACAGGAGAGTGGGTCGATTCCCAGTTCATCAATGGAAAATGCAGCAACGACATATGCCCCACTGTACATAATTCCACAACCTGGCATTCAGATTACAAAGTGAAAGGGTTGTGTGATGCCAACCTCATCTCCATGGACATCACTTTTTTCTCAGAGGATGGGGAACTTTCATCCCTAGGGAAAGAAGGCACGGGATTCAGAAGCAATTATTTTGCTTACGAGACTGGAGACAAAGCCTGTAGAATGCAGTATTGCAAGCATTGGGGAATCAGACTCCCGTCAGGTGTTTGGTTTGAAATGGCTGATAACGATCTGTTTGCTGCAGCAAAATTCCCAGAATGTCCCGAAGGATCGAGTATCTCCGCCCCATCTCAGACATCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGATGTTGAGAGAATCCTGGATTACTCTCTTTGCCAAGAAACCTGGAGCAAGATTAGAACAGGTATTCCCATTTCCCCAGTGGATCTAAGCTATCTCGCTCCTAAAAACCCAGGGACAGGCCCAGCCTTTACGATAATCAACGGTACTCTGAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGAGTCGATATTGCTGCTCCAATTCTTCCAAGAATGGTCGGGACCATCAGTGGAACCACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATACGAGGACGTGGAAATTGGTCCAAACGGAGTTTTGAAAACCAGCTCAGGATATAAATTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTCCGCATCAGTTCAAAGGCCCAAGTGTTCGAACACCCTCACATTCAGGACGCTGCATCACAGCTTCCTGATGATGAGACTTTATTTTTTGGTGATACCGGGTTATCCAAAAACCCAATTGAGCTCGTAGAAGGTTGGTTTAGTGGTTGGAAGAGCTCCATTGCTTCTTTTTTCTTTATCGTAGGGTTGATAATTGGATTATTCTTGGTGCTCCGAGTTGGTATCTATCTCTGCATCAACTTAAGGCACACCAAAAAAAGAAAAATTTACACAGACATTGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCACAATACTGCACAACAGAATAATCATATTTAGACCAAATCGACTTGTGATATCATGCTTTAAGAGGCTTTAACGATGTTTTGATTGTATGAAAAAAACTAACAGTAATCATGGAAGTCCATGATTTCGAGGTCGAGGAATCCAATGATTTTAATGAAGATGACTATATCACAAGGGAATTCTTGAATCCTGACGAACGCATGACATACTTAAATCATGCTGACTACAACCTGAATTCTCCTTTGATTAGTGATGATATTGATAACTTGATTAGGAAGTACAATTCCCTTCCAATTCCCTCAATGTGGGATAGTAAAAAATGGGACGGAGTGCTTGAGATGTTAACTGCATGTCAAGCTAATCCTATTCCAACATCTCAAATGCAC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| 67,823
|
MH919397.1
|
Vesicular stomatitis Indiana virus
|
Ferran,M.C., Russell,T.M., Santo,E.E., Golebiewski,L., Haseley,N.S.
|
Rochester Institute of Technology, Life Sciences
|
USA
|
2018-10-21
| null |
Vesiculovirus indiana
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,143
|
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Bos taurus
| null |
1987
| null | null |
Vesicular stomatitis Indiana virus strain 22-25, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCAGGAGAAACCTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATATCCAGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGAATATTCCTCTTTACATCAATACAACGAAGAGTTTGTCGGATTTGAGAGGATATGTCTACCAAGGTCTGAAGTCCGGAAATGTTTCAATCATCCATGTCAACAGCTACTTGTATGCAGCATTAAAAGACATCCGGGGGAAGCTTGACAAAGATTGGTCAAGCTTCGGAATAAACATTGGGAAGGCAGGGGATACGATTGGAATATTCGACCTCGTATCCTTGAAAGCCCTAGATGGCGTATTACCAGACGGAGTATCCGATGCTTCCAGGACCAGCTCAGATGACAAATGGCTACCGTTATATCTGCTCGGTTTATACAGGGTGGGAAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGCCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAGCAATTCGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGAGACATTTTTGATGTGTGGGGAAACGACAGCAACTACACAAAAATCGTTGCCGCAGTGGACATGTTTTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCTTCATTCAGATATGGAACCATTGTGTCCAGATTTAAAGATTGTGCTGCCTTAGCAACATTCGGACACCTCTGTAAAATAACTGGGATGTCAACAGAAGATGTAACGACCTGGATATTAAATCGAGAAGTTGCAGATGAAATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAGATTGATAAGGCTGACTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGACTGTCTTCAAAATCGCCGTACTCTTCTGTCAAGAACCCTGCTTTTCACTTCTGGGGGCAGTTGACAGCACTTCTGCTTAGATCCACTAGAGCAAGAAATGCAAGACAGCCCGACGACATTGAGTATACATCTCTTACCACAGCAGGTTTGTTATATGCGTATGCAGTTGGATCTTCTGCAGATTTGGCGCAACAGTTTTGTGTCGGAGATAATAAGTACACTCCGGATGAGAGCAACGGGGGATTGACAACCAATGCTCCACCTCAAGACAGAGATGTGGTTGAATGGCTTGGGTGGTTTGAGGACCAAAATCGAAAACCAACCCCTGACATGATGCAATATGCGAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAAAAAACAATTGGCAAGTATGCCAAGTCAGAATTCGACAAATGACCCTATAATTCTCAGCTCATATATTATATATTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGACTTATTCTCGTCTGGATCAGGCAATAGGAGAAATAGACGAGATCGAGGCACAAAGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTATTCCAAGAAGATGGAGTCGAAGAGCATGCCAAGCCTTCTTATTTTCAGGCAGCGGATGATTCTGACACGGATTCTGAACCTGAAGCTGAAGATAATCAGAACTCTTATGTACCAGATCCTGAGGCTGAGCAAGTTGAAGGTTATATACAAGGTCCACTGGATGATTATGCCGATGAGGAAGTGGATGTGGTTTTCACCTCAGATTGGAAGCAACCTGAGCTTGAATCGGACGAACATGGAAAGACCTTGCGGTTGACACTGCCTGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAAAAGTCTCAATGGCTTTCTACTATCAAAGCTGTTGTCCAAAGTGCTAAGTACTGGAACTTGACAGAATGCACTTTTGAGGCATCAGGAGAGGGGGTAATTATGAAGGAGCGCCAGATGACTCCAGATGTATATAAGGTCACCCCCGTGATGAACACCCATCCATCCCAATCTGAGGCCGTATCAGATGTTTGGTCCCTCTCGAAGACTTCCATGACTTTCCAACCCAAGAAGGCGAATCTTCAACCTCTCATCACATCATTGGATGAGTTGTTTTCATCTAGAGGAGAATTCATTTCCGTCGGAGGCAATGGACGAATGTCCCACAAAGAAGCTATCTTGCTTGGTCTGAGGTACAAGAAGTTGTACAACCAAGCGAGAGTCAAATATTCTTTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTCAGTGTTATCCTAATCTTTTCATCATGAGTTCTCTAAAGAAGATCCTTGGTTTAAAGAGTAAAGGGAAGAAATCTAAGAAATTGGGAATGGCGCCACCCCCTTATGAAGAGGACAACAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCCATTGACAAGTCCTATTTTGGAGTCGAGGATATGGACACTCATGATCCCAATCAATTGAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAGATGACAGTTAGATCTAATCGTCCGTTTAGAACATACTCAGATGTGGCAGCAGCTGTGTCCCATTGGGATCACATGTACATTGGGATGGCAGGAAAACGTCCCTTTTACAAGATCCTTGCATTTTTGGGTTCTTCCAATCTTAAAGCCACTCCAGCAATATTGGCAGATCAAGGTCAACCGGAGTATCATGCTCATTGCGAAGGCAGGGCCTACTTGCCTCATCGGCTGGGGAAGACTCCTCCAATGCTCAACGTGCCTGAGCACTTCAGAAGACCTTTTAATATAGGTCTTTACAAAGGAACAATCGAGCTCACAATGACCATCTACGATGACGAGTCATTGGAAGCAGCACCTATGATCTGGGATCACTTCAACTCTTCTAAATTTTCCGATTTCCGCGAGAAGGCCTTGATGTTTGGTCTGATAGTCGAGAAAAAAGCGTCTGGTGCTTGGGTCTTAGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCCGATTTGGTTTTAGACATCTGAACAATCCTCGGTTTGCTTAGTCTCTCTCACTTCCAATCTTTCGAATAACTAACCTCCTGTCATTTCTGTCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCAATCTGTTTCACTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTCTTTTATTCATAGGAGTGAACTGTAAATTCACCATAGTATTCCCACACAATCAGAAAGGGAATTGGAAAAATGTTCCTTCCGGTTACCATTACTGCCCGTCCAGCTCAGATTTAAATTGGCACAACGGCTTGATAGGCACAGCTTTACAAGTCAAGATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGCCATGCTTCTAAATGGGTTACTACTTGCGATTTCCGCTGGTACGGACCGAAATATATAACACATTCCATCAGATCCTTCACACCATCAGTGGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAGACAAAACAAGGAACATGGCTGAATCCAGGTTTTCCTCCTCAGAGTTGCGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCCGTGATTGTCCAAGTGACTCCTCATCATGTACTGGTTGATGAGTACACAGGAGAGTGGGTCGATTCCCAGTTCATCAATGGAAAATGCAGCAACGACATATGCCCCACTGTACATAATTCCACAACCTGGCATTCAGATTACAAAGTGAAAGGGTTGTGTGATGCCAACCTCATCTCCATGGACATCACTTTTTTCTCAGAGGATGGGGAACTTTCATCCCTAGGGAAAGAAGGCACGGGATTCAGAAGCAATTATTTTGCTTACGAGACTGGAGACAAAGCCTGTAGAATGCAGTATTGCAAGCATTGGGGAATCAGACTCCCGTCAGGTGTTTGGTTTGAAATGGCTGATAACGATCTGTTTGCTGCAGCAAAATTCCCAGAATGTCCCGAAGGATCGAGTATCTCCGCCCCATCTCAGACATCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGATGTTGAGAGAATCCTGGATTACTCTCTTTGCCAAGAAACCTGGAGCAAGATTAGAACAGGTATTCCCATTTCCCCAGTGGATCTAAGCTATCTCGCTCCTAAAAACCCAGGGACAGGCCCAGCCTTTACGATAATCAACGGTACTCTGAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGAGTCGATATTGCTGCTCCAATTCTTCCAAGAATGGTCGGGACCATCAGTGGAACCACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATACGAGGACGTGGAAATTGGTCCAAACGGAGTTTTGAAAACCAGCTCAGGATATAAATTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTCCGCATCAGTTCAAAGGCCCAAGTGTTCGAACACCCTCACATTCAGGACGCTGCATCACAGCTTCCTGATGATGAGACTTTATTTTTTGGTGATACCGGGTTATCCAAAAACCCAATTGAGCTCGTAGAAGGTTGGTTTAGTGGTTGGAAGAGCTCCATTGCTTCTTTTTTCTTTATCGTAGGGTTGATAATTGGATTATTCTTGGTGCTCCGAGTTGGTATCTATCTCTGCATCAACTTAAGGCACACCAAAAAAAGAAAAATTTACACAGACATTGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCACAATACTGCACAACAGAATAATCATATTTAGACCAAATCGACTTGTGATATCATGCTTTAAGAGGCTTTAACGATGTTTTGATTGTATGAAAAAAACTAACAGTAATCATGGAAGTCCATGATTTCGAGGTCGAGGAATCCAATGATTTTAATGAAGATGACTATATCACAAGGGAATTCTTGAATCCTGACGAACGCATGACATACTTAAATCATGCTGACTACAACCTGAATTCTCCTTTGATTAGTGATGATATTGATAACTTGATTAGGAAGTACAATTCCCTTCCAATTCCCTCAATGTGGGATAGTAAAAAATGGGACGGAGTGCTTGAGATGTTAACTGCATGTCAAGCTAATCCTATTCCAACATCTCAAATGCAC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| 67,824
|
NC_024473.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-07-14
|
NJ1184HDB
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
RefSeq
| 1
|
Honduras
|
Honduras
|
Bos taurus
| null |
1984
| null |
PRJNA485481
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate NJ1184HDB, complete genome
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| 6,456
|
MW760870.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
GenBank
| null |
USA: Utah
|
USA
|
Equus caballus
|
tissue
|
2015-04-28
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus strain Utah/13873/2015, complete genome
|
ACGAAGACAAAAAAACCATTCTTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCCATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAATGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATCTTCGACCTAGTGAAAGTTGAAGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTCACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATAAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGATGAGCTGTGCCAGATGATGTATCCGGGCCAGGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTGTCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACCCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCAACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAAAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAATTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCAGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCCGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGGAAACGGAGGAGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAGAGTTCAGACGGACCAATGGATGAAGACAATTGAGGCAGTCTGCGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCGAATTATGAACTCAGGTAATTGTCTTATCCTCAAAGGCAGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAAAAATCCATGCAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCGCCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCTAAGAGGGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTCTTTAGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCAATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAGAAGTCACAAGAAACCAAAGAAATTAGGATTGCCACCTCCCTATGATGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGACAAGGACTCCTTGAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAGCCCTTCAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGGAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCGTTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTTGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCACATTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCCCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTTTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTCGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCACTCTATACATAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAACGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAGTGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGGAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATGAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCGTTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGATCCAGATTTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCGTCATAAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAGAGTTGCAGGAACTAAAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCCAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGACAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCACATTGAAGCCGCTCAGACATTTTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTTGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCCAGTCTTTTTAGACAAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGACCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGCTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCGGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGGGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCAACCCATATCCCATCAGGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAAT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| 37,845
|
MW760871.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
GenBank
| null |
USA: Texas
|
USA
|
Equus caballus
|
tissue
|
2015-05-15
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus strain Texas/16360/2015, complete genome
|
ACGAAGACAAAAAAACCATTCTTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCCATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAATGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATCTTCGACCTAGTGAAAGTTGAAGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTCACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATAAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGATGAGCTGTGCCAGATGATGTATCCGGGCCAGGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTGTCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACCCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCAACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAAAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAATTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCAGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCCGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGGAAACGGAGGAGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAGAGTTCAGACGGACCAATGGATGAAGACAATTGAGGCAGTCTGCGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCGAATTATGAACTCAGGTAATTGTCTTATCCTCAAAGGCAGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAAAAATCCATGCAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCGCCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCTAAGAGAGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTCTTTAGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCAATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAGAAGTCACAAGAAATCAAAGAAATTAGGATTGCCACCTCCCTATGATGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGACAAGGACTCCTTGAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAGCCCTTCAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGGAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCGTTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTTGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCACATTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCCCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTTTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTCGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCACTCTATACATAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAACGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAGTGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGGAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATGAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCGTTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGATCCAGATTTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCGTCATAAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAGAGTTGCAGGAACTAAAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCCAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGACAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCACATTGAAGCCGCTCAGACATTTTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTTGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCCAGTCTTTTTAGACAAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGACCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGCTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCGGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAAGTTCCCCCCATTTGGGGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCAACCCATATCCCATCAGGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAAT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| 37,846
|
MW760872.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-09-22
| null |
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
GenBank
| null |
USA: Nebraska
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2015-09-08
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus strain Nebraska/28589/2015, complete genome
|
ACGAAGACAAAAAAACCATTCTTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCCATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAATGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATCTTCGACCTAGTGAAAGTTGAAGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTCACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATAAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGATGAGCTGTGCCAGATGATGTATCCGGGCCAGGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTGTCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACCCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCAACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAAAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAATTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCAGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCCGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGGAAACGGAGGAGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAGAGTTCAGACGGACCAATGGATGAAGACAATTGAGGCAGTCTGCGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCGAATTATGAACTCAGGTAATTGTCTTATCCTCAAAGGCAGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAAAAATCCATGCAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCGCCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCTAAGAGAGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTCTTTAGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCAATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAGAAGTCACAAGAAATCAAAGAAATTAGGATTGCCACCTCCCTATGATGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGACAAGGACTCCTTGAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAGCCCTTCAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGGAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCGTTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTTGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCACATTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCCCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTTTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTTGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCACTCTATACATAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAACGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAGTGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGGAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATGAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCGTTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGATCCAGATTTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCGTCATAAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAGAGTTGCAGGAACTAAAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCCAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGACAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCACATTGAAGCCGCTCAGACATTTTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTTGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGGCTGATTGGAGTCCTATCCAGTCTTTTTAGACAAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGACCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGCTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCGGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGGGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCAACCCATATCCCATCAGGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAAT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| 37,847
|
MK613994.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Velazquez-Salinas,L., Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L.
|
Plum Island Animal Disease Center, Agriculture Research Services
|
USA
|
2019-04-29
|
NJ03CPB
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Bos taurus
| null |
2003
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate NJ03CPB, complete genome
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ACGAAGACAAAAAAACCATTCTTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCAATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAACGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTATGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATCGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATCTTCGATCTAGTGAAAGTTGAAGAGCTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTTACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATAAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGACGAGCTATGCCAGATGATGTATCCGGGTCAAGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTATCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACTCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCCACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAGAAGAGCAGTCAACTCTTTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATACGCCAAGGCAGAGTTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCCGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCTGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGAAAACGGAGGGGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAGAGTTCAGACGGACCAATGGAGGAAGACAATTGAGGCAGTCTGTGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCAAATTATGAACTCAGATAATTGTCTTATCCTCAAAGGCCGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAAAACTCCATACAGAGTTCCGAATCTTTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCACCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCGAAGAGGGCCGGAGTGAAAGACATGATAGTGAAATTGACAGACTTTTTTGGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAAGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCGATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAAAAGTCACAAGAAATCAAAGAAACTAGGCTTGCCACCTCCCTATGATGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGATAAGGACTCCTTGAGATACGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAGCCCTTCAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCATTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTCGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCATGTTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCTCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTTTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTTGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACGAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCATTCTATACATAATGAGAAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAAAGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTTACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAATGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGAAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGATTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATAAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGACCCAGATCTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGTAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCATCATCAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGAAGAGTTGCAGGAACTAGAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCTAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGACAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCATATTGAAGCCGCTCAGACATATTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTCGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCCAGTCTTTTTAGACCAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGGCCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGTTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCTGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGAGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCAACCCATATCCCATCAAGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACATGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAAT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| 63,028
|
MG552608.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Velazquez-Salinas,L., Pauszek,S.J., Stenfeldt,C., O'Hearn,E.S., Pacheco,J.M., Borca,M.V., Verdugo-Rodriguez,A., Arzt,J., Rodriguez,L.L.
|
Plum Island Animal Disease Center, Agriculture Research Services
|
USA
|
2018-01-07
|
NJ0806VCB
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
GenBank
| 1
|
Mexico
|
Mexico
|
Bos taurus
| null |
2006-08
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate NJ0806VCB, complete genome
|
ACGAAGACAAAAAAACCATTATTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCCATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAATGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAAGAGAATGTGAAAATCTTCGATCTAGTGAAAGTTGAAGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTCACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATCAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGATGAGCTGTGCCAGATGATGTATCCGGGTCAAGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTATCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACTCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCCACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAGAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAATTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATACTGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCCGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCTGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGAAAACGGAGGAGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCAGTTGGATTAACAAAAGTTCAGACGGACCAATGGATGAAGACAATTGAGGCAGTCTGCGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCAAATTATGAACTCAGATAATTGTCTTATCCTCAAAGGCAGAGTTATGACTTCTGACTGCAATTCATCAATCAAATCTCAAAAATCCATACAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCGCCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCGAAGAGGGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTTTTTAGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAAGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCAATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAAAAGTCACAAGAAATCAAAGAAATTAGGCTTGCCACCTCCCTATGATGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCACCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGATAAGGACTCCTTGAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAGCCCTTCAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCATTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTCGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAATCTAATGAAAAAGTCCCTCACATTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCTCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTGTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTCGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCACTCTATACATAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAAAGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTGTAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAATGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGAAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATGAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGATCCAGATCTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAAAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCGTCATAAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAGAGTTGCAGGAACTAGAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCTAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGACAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCACATTGAAGCCGCTCAGACATATTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTTGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCCAGTCTTTTTAGACCAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGGCCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGTTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCGGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGGGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCAACCCATATCCCATCAGGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAAT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| 72,760
|
MG552609.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Velazquez-Salinas,L., Pauszek,S.J., Stenfeldt,C., O'Hearn,E.S., Pacheco,J.M., Borca,M.V., Verdugo-Rodriguez,A., Arzt,J., Rodriguez,L.L., Barrera,J., Clark,B.A.
|
Plum Island Animal Disease Center, Agriculture Research Services
|
USA
|
2018-01-07
|
NJ0612NME6
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
GenBank
| 2
|
USA
|
USA
|
Equus caballus
| null |
2012-06
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate NJ0612NME6, complete genome
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ACGAAGACAAAAAAACCATTATTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCCATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAATGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATCTTCGACCTAGTGAAAGTTGAAGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTCACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATAAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGATGAGCTGTGCCAGATGATGTATCCGGGCCAGGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTGTCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACCCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCAACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAAAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAATTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAACGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCAGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCCGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGAAAACGGAGGAGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAGAGTTCAGACGGACCAATGGATGAAGACAATTGAGGCAGTCTGCGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCAAATTATGAACTCAGGTAATTGTCTTATCCTCAAAGGCAGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAAAAATCCATGCAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCGCCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCTAAGAGGGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTCTTTAGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCAATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAAAAGTCACAAGAAATCAAAGAAATTAGGATTGCCACCTCCCTATGACGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGACAAGGACTCCTTGAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAGCCCTTCAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGGAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCGTTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTTGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCACATTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCTCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTTTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTCGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCACTCTATACATAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAAAGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAGTGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGAAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATGAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCGTTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGATCCAGATTTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCGTCATAAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAGAGTTGCAGGAACTAGAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCCAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGATAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCACATTGAAGCCGCTCAGACATTTTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTTGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCCAGTCTTTTTAGACAAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGGCCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGCTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCGGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGGGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCGACCCATATCCCATCAGGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAAT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| 72,761
|
MF196237.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Velazquez-Salinas,L., Isa,P., Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L., Stenfeldt,C., O'Hearn,E.S., Pacheco,J.M., Borca,M.V., Verdugo-Rodriguez,A., Arzt,J.
|
Plum Island Animal Disease Center, Agriculture Research Services
|
USA
|
2017-08-09
|
NJ1008JAB
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,107
|
GenBank
| 2
|
Mexico
|
Mexico
|
Bos taurus
|
epithelium
|
2008-10
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate NJ1008JAB, complete genome
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AAAAAACCATTCTTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCCATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAATGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGACTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATCTTCGATCTAGTGAAAGTTGAAGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTCACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATAAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGATGAGCTGTGCCAGATGATGTATCCGGGTCAAGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTATCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCCCTCTTGCTAAGATCAACTCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCAACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAGAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAATTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCAGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCCGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGAAAACGGAGGAGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAAAGTTCAGACGGACCAATGGATGAAGACAATTGAGGCAGTCTGCGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCAAATTATGAACTCAGGTAATTGTCTTATCCTCAAAGGCAGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAGAACTCCATGCAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCGCCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCTAAGAGGGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTCTTTAGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAAGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCAATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAAAAGTCACAAGAAATCAAAGAAATTAGGCTTGCCACCTCCCTATGATGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGATAAGGACTCCTTGAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAGCCCTTCAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCATTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTTGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCACATTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCTCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTTTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTCGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCACTCTATACATAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAAAGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAATGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGAAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATGAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGATCCAGATTTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCGTCATAAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAGAGTTGCAGGAACTAGAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCCAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGACAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCACATTGAAGCCGCTCAGACATTTTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTTGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCCAGTCTTTTTAGACAAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGGCCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGCTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCGGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGGGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCAACCCATATCCCATCAGGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAATGACCTATGA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| 75,243
|
MF196238.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Velazquez-Salinas,L., Isa,P., Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L., Stenfeldt,C., O'Hearn,E.S., Pacheco,J.M., Borca,M.V., Verdugo-Rodriguez,A., Arzt,J.
|
Plum Island Animal Disease Center, Agriculture Research Services
|
USA
|
2017-08-09
|
NJ1007CPB
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,107
|
GenBank
| 2
|
Mexico
|
Mexico
|
Bos taurus
|
epithelium
|
2007-10
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate NJ1007CPB, complete genome
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AAAAAACCATTATTACAATTATTTGGCCTGGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCAATTATTCAGCCGAAATTACCGGCCAACGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTGTATGTGAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGGATCAAGTCCGGTAATCCATCCATCCTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCTGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGTTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATTTTCGATCTAGTAAAAGTTGAGGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGATCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCCTCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTTACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCACGAACGCGCTCCAATCAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTTGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTAAATAGGGAAGTTGCAGACGAGCTATGCCAGATGATGTATCCGGGTCAAGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTACATGATTGACTTTGGGTTATCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACTCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTATTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAGTTCTATATTGGAGAAGATAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCCACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAGAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAGTTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTATTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAGGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCCGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCTGACTGGACACAACCTGTAATGAAGGAAAACGGAGGTGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAAAGTTCAGACGGACCAATGGAGGAAGACAATTGAGGCAGTCTGTGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTATCAGAATGCCAGATTATGAACTCAGATGATTGTCTTATCCTAAAAGGCCGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAGAACTCCATACAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCACCAAAAGTCAAGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAGATCAACAGAAGTACAATTGATCTCGAAGAGGGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTTTTTGGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAGAAACTCTTTAATCAAGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCGATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAAAAGTCACAAGAAATCAAAGAAACTAGGCTTGCCACCTCCCTATGATGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGACTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGATAAGGACTCTTTAAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAGCCCTTTAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCGCAGTGGGATAACTCATACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCCTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTATGCCACATTAACAGGTCGTTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCATTTAATATCGGAATATACAAGGGGACACTAGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCATGTTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCTCAGATACAAAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTAATTTTAAGCAAGAAAGCAACAGGAACCTGGGTGTTAGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCCTTAATAATTGGAATGTCTAATACTCTTTCTGGTTGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTGTTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGGATTCCTATTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCATTCTATACACAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAAAGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTATACTGGAGAATGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGAAGATGCAAGGGCAAGATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATAAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACAGACCCAGACCTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAGCATGCAACAGACATATCCCTGATATCCGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACCCCCGTAGATCTCAGCTACCTGGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTCACCATCATCAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGAAGAGTTGCAGGAACTAGAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCTAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGACAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCATATTGAAGCCGCTCAGACATTCTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTCGAGGGTTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGTTGGCTGTGATTATCGGATTTGTGCTTTTGATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCCAGTCTTTTTAGACCAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTGGAGATGGCCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGTTCGACTTAATTGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCGGACTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCTCAAGAGGACCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCAGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATTTAATCAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGAGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGATATGCTTAAAGGTTGCCAAGCTCAACCCATATCCCATCAAGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGGTTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAATGACCTATGA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| 75,244
|
KU296051.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Fowler,V.L., King,D.J., Howson,E.L., Madi,M., Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L., Knowles,N.J., Mioulet,V., King,D.P.
|
The Pirbright Institute
|
United Kingdom
|
2016-02-23
|
Ecuador/85
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,118
|
GenBank
| 1
|
Ecuador
|
Ecuador
| null | null |
1985
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate Ecuador/85, complete genome
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AAGACAAACAAACCATTATTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGACATCAAAATGGCTCCCACAGTTAANAGAATCGTCAATGACTCTATTATTCATCCTAAATTGCCAGCCCATGAAGATCCGGTGGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAACAACACAAATATAGTGTTATACGTTAGCACTAAAGTGGCACTAAACGATTTAAGGGCTTATGTCTACCAAGGGATCAAATCTGGAAATCCGTCTATACTCCACATAAATGCTTACCTTTACGCAGCATTGAAGGGAGTAGAGGGGACCTTAGACAGAGATTGGGTCAGCTTCGGACGCACGATTGGAAAAAGAGAAGAGAGTGTGAAAATCTTTGACCTTGTTAAAGTAGAAGAATTAAAGACAGCACTTCCTGATGGAAAATCAGATCCCGACCGTTCAGCTGAGGATGACAAATGGCTTCCTCTTTATATCCTGGGTCTCTACAGAGTAGGTAGATCAAAAGTTACTGATTACCGGAAAAAATTGCTGGATGGCTTAGAGAATCAGTGCAAAGTAGCATCAACTAGATTCGAAAGCCTGGTTGAAGATGGACTGGATTTCTTTGACATATGGGAAAACGATCCGAACTTCACCAAGATAGTTGCAGCGGTGGATATGTTCTTTCATATGTTCAAAAAACACGAGCGTGCACCAATCAGATACGGAACCATAGTCTCACGTTTCAAAGACTGTGCAGCATTAGCTACATTTGGGCATCTCAGCAAGGTCAGTGGACTTTCTATTGAAGATCTCACAACATGGGTCCTCAATAGGGAGGTCGCAGACGAGCTATGCCAGATGATGTATCCGGGGCAAGAAATTGATAAGGCAGATTCTTACATGCCTTATATGATAGATTTTGGATTGTCACAGAAATCACCATACTCATCAGTTAAAAATCCAGCTTTTCACTTCTGGGGTCAACTTGCAGCACTCCTATTGAGATCTACTCGTGCAAAAAATGCCAGACAGCCAGATGACATTGAATATACATCATTAACTTGTGCAAGTCTACTGCTGTCATTTGCAGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAGCAGCAGTTCTATATTGGAGAAGATAAATACACAACAGATAAGGATGATGGTCTAAGGAAATCAGATGTACCACCCAAAGGGAGGAATGTCGTAGACTGGCTCGGCTGGTATGATGATAACGGGGGAAAACCTACACCGGACATGCTGAACTTCGCAAGAAGAGCAGTCAGCTCCCTCCAGGCACTTCGTGAGAAAACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAGTTTGATAAATGACCAAACTCTACACACTACTATCAATATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGACAGTGTTGATCGGCTCAAGACTTATTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCCAATGAATCTGAAGAGAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAGGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAATCAACTCCGTCGTATTATCAAGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCAGATGAGAGAGTAGACAAGTGGGAAGAAGACTTGCCTGAATTAGAGAAGATTGATGATGACATACCGGTTACCTTTCCTAATTGGACTCAACCTGTCATGAAAGAGAATGGTGGGGAGAAATCATTATCTCTATTTCCTCCCGTTGGATTGACCAAGTTTCAAACCGAACAATGGAGGAAGACGATTGAAGCGGTCTGTGAAAGCTCAAAATATTGGAATTTATCGGAATGCCAGATGGTAACTTCAGATGATTGTCTGATTCTCAGAGGACGAGTTATGACTCCTGATTGCAGTTCGTCAGTCAAATCTCATAATTCTGTACGGAGTTCAGAATCTCTCTATTCATCCCACTCACCAGGACCTGCACCTGGGGCATCCGGGTCAATGAATTTATGGGACTTGAAGTCAACAGAAGTCCAACTGACCTCAAAGAGAGCAGGAGTCAAGGACATGACAGTCAAGTTAACAGACTTCTTTGGAAGTGAGGAAGAGTATTATTCAGTATGCCCAGAAGGAGCATCAGATTTGATGGGTGCAATTATTATGGGACTGAAGCATAAGAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAATATCGACTTTAACCCTTTACTACAGTCAATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAGATGAGTTCATTCAAAAAGATTTTAGGACTTTCATCAAAAAGTCATAAAAAGTCAAAGAAGATGGGACTACCGCCTCCGTATGATGAATCCTGTCCGATGGAGATTCAACCTTCTGCTCCAATATCAAATGATTTCTTTGGGATGGAAGACATGGATCTCTATGATAAGGATTCTTTAAGATATGAGAAGTTCCGATTCATGTTAAAGATGACTGTCAGGTCCAATAAACCTTTTAGAGCATATGATGATGTTACTGCTGCCGTAGCACAGTGGGACAATTCCTACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCCTTTTATAAAATCATTGCTCTAATTGGATCAAGTCATTTGCAGGCTACCCCGGCTGTGTTGGCAGATTTGAATCAACCGGAGTACTATGCCACATTGACAGGTCGTTGCTTTCTGCCTCATCGACTGGGATTAATCCCACCTATGTTCAATGTGCCCGAGACATTCAGAAAACCGTTTGACATTGGACTATATAAAGGGACCCTTGACTTCACCTTCACAGTGTCAGATGATGAATCTAATGAAAAAGTCCCTCATGTTTGGGATTACATGAATCCAAAGTATCAATCTCAGATACAACAAGAGGGGCTCAAATTCGGGTTAATCCTGAGTAAAAAAGCAACCGGAACCTGGGTTTTAGACCAATTGAGTCCATTCAAATAAATTATGTCTCAACATTAATCAGACCATATAATACTCGTTTTGGTTGTGGGTTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTACCTCATCCTTGCACTTACCATCTCGCCCATACTGGGCAAAATTGAAATTGTCTTTCCCCAACATACCACAGGGGATTGGAAAAGAGTGCCACATGAGTACAATTATTGCCCTACCAGTGCGGACAAAAACTCCCACGGAACTCAAACAGGGATTCCTATTGAGTTGACAATGCCTAAAGGACTAACAACCCATCAAGTAGAGGGATTTATGTGTCATGCAGCTTTATGGGTGACCACTTGTGATTTTAGATGGTATGGACCAAAATATATAACTCATTCCATACATAATGAGGAACCGACAGACTATCAGTGCCTGGAGGCCATTAAAGCATATAAAGATGGAGCTAGCTTCAATCCTGGGTTTCCTCCTCAAAGCTGTGGATATGGTTCAGTGACGGATGCAGAGGCACACATAATCACAATTACTCCTCATTCTGTTAAAGTGGATGAGTATACTGGAGAATGGATTGACCCTCATTTTATAGGAGGAAGGTGCAAAGGGAAAACCTGTGAAACAGTTCATAATTCAACCAAGTGGTTTACATCTTCAGATGGGGAAAGTGTATGCAGCCAATTATTCACCTTGGTTAGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAGATTACCTCAATAGGATTACCAGAAACCGGAATCAGGAGCAATTACTTCCCCTATGTGTCTACAGAAGGAATTTGCAAAATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTATAAGCTTAAGAATGACCTCTGGTTCCAAATTGCAGACCCAGACTTGGATCAAAAAGTGAAGGATCTACCACACATAAAAGACTGTGACCTTTCTTCCTCTATCATCACCCCAGGGGAACATGCAACAGACATATCTCTAATATCAGATGTGGAACGGATACTTGATTATGCTCTTTGTCAAAATACCTGGAGCAAGATTGAAGCAGGAGAACCAATTACTCCTGTAGACATCAGCTATCTAGGACCTAAAAACCCTGGCGTTGGGCCGGTTTTCACAATCATCAACGGCTCACTACATTACTTTACCTCCAAGTATCTACGAGTTGAGTTAGAAAATCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAAAGTTGCGGGGACCCGAATTGTTCGTCAACTGTGGGACCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCAGAGATTGGACCTAATGGTGTTCTGAAAACCAAGCAAGGATATAAATTCCCATTGCACATCGTTGGGACTGGGGAAGTCGACAATGACATCAAAATGGAAAGGATTGTAAAGCATTGGGAGCACCCACACATAGAAGCTGCTCAGACGTTCTTAAAAAAAGATGACACAGAGGAGGTAATCTATTATGGGGACACTGGAGTATCCAAAAATCCCGTTGAATTAGTAGAGGGATGGTTCAGCGGTTGGAGAAGCTCAATCATGGGAGTGTTGGCTGTGATCATAGGTTTTGTAATCTTAATATTTTTAATTAGATTGATTGGACTGATGTCCAATTTCTGTAAACCAAGAAGAGGGCCAATCTACAAATCCGACGTAGAAATGGCTCACTTCCGGTAATCTATGAAAAAAACTGGGTTACACAAATAAATACAACAGGAATCAAAATGGATTTCGATCTAATTGAAGATTCTACTAACTGGGGAGAGGATGAATCGGACTTTCTTCTGCGAGATATTTTGTCACAGGAGGATCAGATGTCTTACTTGAACTCTGCTGATTATAATCTGAATTCCCCACTCATATCGGATGACATGGTTTATTTAGTCAAGCGGATGAACCATGAAGAAGTACCTCCCATCTGGAGATCAAAGGAATGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTCGGGGTTGTCAGGCTCAGCCCATATCTCATCAAGACATGCATAACTGGTTTGGAACATGGATTCAAAACATCCAACATGATTCTGCTCAAGGGTTTACATTTTTAAAAGAAGTTGACAAAGAAGCAGAAATGAC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| 83,705
|
KU296052.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Fowler,V.L., King,D.J., Howson,E.L., Madi,M., Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L., Knowles,N.J., Mioulet,V., King,D.P.
|
The Pirbright Institute
|
United Kingdom
|
2016-02-23
|
COL/1/93
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,957
|
GenBank
| 1
|
Colombia
|
Colombia
| null | null |
1993
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate COL/1/93, complete genome
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CATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCGTCAATGACTCTATTATTCATCCTAAATTGCCAGCCCATGAAGATCCAGTGGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAACAACACAAATATAGTGTTATACGTTAGCACTAAAGTGGCACTAAATGATTTAAGGGCTTATGTCTACCAAGGGATCANANCTGGCAANCNGTCTATACTCCACATAAATGCTTACCTTTACGCAGCATTGAAGGGAGTAGAAGGGACCTTAGACAGAGATTGGGTCAGCTTCGGACGCACGATTGGAAAAAGAGAAGAGAGTGTGAAAATCTTTGACCTTGTCAAAGTAGAGGAATTAAAGACAGCACTTCCAGATGGAAAATCAGATCCCGACCGTTCAGCTGAGGATGACAAATGGCTTCCCACTTATATCCTGGGTCTCTACAGAGTAGGTAGATCAAAAGTTACTGATTACCGGAAAAAATTGTTGGACGGCTTAGAGAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACTAGATTCGAAAGCCTAGTTGAAGATGGATTGGATTTCTTTGACATATGGGAAAACGATCCGAACTTCACCAAGATAGTTGCAGCGGTGGATATGTTCTTTCATATGTTCAAAAAACATGAGCGTGCACCAATCAGATACGGAACCATAGTCTCACGGTTCAAAGACTGTGCAGCATTAGCTACATTTGGGCATCTCAGCAAGGTCAGTGGACTTTCTATTGAAGATCTCACAACATGGGTCCTTAATAGGGAAGTCGCGGACGAGTTATGCCAGATGATGTATCCGGGGCAAGAAATTGATAAGGCAGATTCTTACATGCCTTATATGATTGATTTTGGATTGTCGCAGAAATCACCATACTCATCAGTTAAAAACCCAGCTTTCCACTTCTGGGGTCAACTTGCAGCGCTCCTATTGAGATCTACTCGCGCAAAAAATGCCAGACAGCCAGATGACATTGAATATACATCATTAACTTGTGCAAGTCTACTGCTGTCATTTGCAGTTGGGTCCTCAGCCGACATTGAGCAGCAGTTCTATATTGGAGAAGATAAATACACAACAGATAAGGATGATGGTCTAAAGAAATCAGATGTACCACCCAAAGGGAGGAATGTCGTAGACTGGCTCGGCTGGTATGACGATAATGGGGGAAAACCTACACCGGACATGCTGAACTTCGCAAGACGAGCAGTCAGCTCCCTACAGGCACTTCGTGAGAAAACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAGTTTGATAAATGACCAAACTCTACACACTACTATCAATATTATATTCTATGTTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGACAGTGTTGATCGGCTCAAGACTTATTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCCAATGAATCTGAAGAGAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAGGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAATCAACTCCGTCGTATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCAGATGAGAGAGTAGACAAGTGGGAAGAAGACTTGCCTGAATTAGAGAAGATTGATGATGACATACCGGTTACCTTTCCTAATTGGACTCAACCTGTTATGAAAGAGAATGGTGGGGAGAAATCATTATCTTTGTTTCCTCCCGTTGGATTGACCAAGGTTCAGACCGAACAATGGAGGAAGACGATTGAAGCGGTCTGTGAAAGCTCAAAATATTGGAATTTATCAGAATGCCGGATGGTAACTTCAGATGATTGTCTTATTCTCAGAGGACGAGTTATGACTCCTGATTGCAGTTCATCAGTTAAATCTCAGAATTCTGTACGGAGTTCAGAATCTCTCTATTCCTCCCAATCACCAGGACCTGCACCTGGGGCATCAGAGTCAATGAATTTATGGGACTTGAAGTCAACAGAAGTCCAACTGACCTCAAAGAGAGCAGGAGTCAAAGACATGACAGTCAAGTTAACAGACTTCTTTGGAAGTGAGGAAGAGTATTATTCCGTATGCCCAGAAGGAGCATCAGATTTGATGGGAGCAATTATTATGGGACTGAAGCATAAGAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAATATCGACTTTAACTCCCTACTACAGTCAATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAGATGAGTTCATTCAAAAAGATTTTAGGACTTTCGTCAAAAAGTCATAAAAAGTCAAAGAAGATGGGACTACCGCCTCCTTATGATGAATCCTGTCCGATGGAGATTCAACCTTCTGCTCCAATATCAAATGATTTCTTTGGGATGGAGGACATGGATCTCTATGATAAGGATTCTTTAAGATATGAGAAGTTCCGATTCATGTTAAAGATGACCGTCAGGTCCAATAAACCTTTCCGAGCATATGATGATGTTACTGCTGCTGTAGCACAGTGGGACAATTCCTACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCCTTCTATAAAATCATTGCTCTAATTGGATCGAGTCATCTGCAGGCTACCCCGGCTGTGTTGGCAGATTTGAATCAACCAGAGTACTATGCCACATTGACAGGTCGTTGCTTTCTACCTCATCGACTGGGATTAATCCCGCCTATGTTCAATGTGCCTGAAACATTCAGAAAACCGTTTGACATTGGACTATATAAAGGGACCCTTGACTTCACCTTCACAGTGTCAGATGATGAATCTAATGAAAAAGTCCCTCATGTTTGGGATTATATGAATCCGAAGTATCAATCTCAGATACAACAGGAGGGGCTCAAATTCGGGTTAATCCTGAGTAAAAAAGCAACCGGAACCTGGGTTTTAGACCAATTGAGTCCATTCAAATAAATGATGTCTCAACAATAATCAGATCATATAATACTCGTTTTGGTTGTGGGTTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTACCTCATCTTTGTACTTGCCGTCTCGCCCATACTGGGCAAAATTGAAATTGTCTTTCCCCAACATACTACAGGGGATTGGAAAAGAGTGCCACATGAGTACAATTATTGCCCTACCAGTGCGGACAAAAACTCTCACGGAACTCAAACAGGGATTCCTATTGAGTTGACAATGCCTAAAGGACTAACAACTCATCAGGTAGAGGGATTTATGTGTCATGCAGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTTAGATGGTATGGACCAAAATATATAACTCATTCCATACATAATGAGGAACCGACAGACTATCAGTGCCTGGAGGCAATTAAAGCATATAAGGATGGAGCTAGCTTCAATCCTGGGTTTCCTCCTCAAAGCTGTGGATACGGTTCAGTAACTGATGCAGAGGCACACATAATTACAGTTACCCCCCACTCTGTTAAAGTGGATGAGTATACTGGAGAATGGATTGACCCTCATTTTATAGGAGGAAGATGCAAAGGGAAAATCTGTGAAACAGTTCATAATTCAACCAAGTGGTTTACATCTTCAGATGGGGAAAGTGTATGCAGCCAATTATTCACCTTGGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGATTCAGAGGAGATTACCTCAATGGGATTACCAGAAACCGGAATCAGGAGCAATTACTTCCCCTATGTGTCTACAGAAGGAATTTGCAAAATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTATAAGCTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAAATTACAGACCCGGACTTGGATCAAACAGTGAAGGATCTACCACACATAAAAGACTGTGACCTTTCTTCCTCCATCATCACCCCAGGGGAACATGCAACAGACATATCTCTAATATCAGATGTGGAACGGATACTTGATTATGCTCTTTGTCAAAATACCTGGAGCAAGATTGAAGCAGGAGAACCAATTACTCCTGTAGATATCAGCTATCTAGGACCAAAAAACCCTGGTGTTGGGCCAGTTTTCACAATCATCAACGGCTCACTACATTACTTTACCTCCAAGTATCTACGGGTTGAGTTAGAAAGTCCTGTTATACCTAGAATGGAAGGAAAAGTTGCGGGGACCCGAATTGTTCGTCAACTATGGGACCAATGGTTTCCTTTTGGAGAGGCAGAGATTGGACCTAATGGTGTTCTGAAAACCAAGCAAGGATATAAATTCCCATTGCACATCATTGGGACTGGGGAAGTCGACAATGACATCAAAATGGAAAGGATTGTAAAACATTGGGAGCACCCACACATAGAAGCTGCTCAGACGTTTTTAAAAAAAGATGACACAGAAGAGGTAATCTATTATGGGGACACTGGAGTATCCAAAAATCCAGTTGAGTTAGTAGAGGGATGGTTCAGTGGTTGGAGAAGCTCAATCATGGGAGTGTTGGCTGTGATCATAGGTTTTGTGATCTTAATATTTTTAATTAGATTGATTGGACTGATGTCCAGTTTCTGTAAACCAAGAAGGAGGCCAATCTACAAATCTGACGTAGAAATGGCTCATTTCCGGTGATCTATGAAAAAAACTGGGTTATACAAATAAATACAACAGGAATCAAAATGGATTTCGATCTAATCGAAGATTCTACTAACTGGGGAGAGGATGAATCTGACTTTCTTCTGCGAGATATTTTGTCACAGGAGGATCAGATGTCTTACTTGAACTCTGCTGATTATAATCTGAATTCTCCACTCATATCAGATGACATGGTTTATTTAGTCAAGCGGATGAACCATGAAGAGGTACCTCCCATCTGGAGATCAAAGGAATGGGATTCTCCTCTCGACATGCTTCGGGGTTGTCAGGCTCAGCCCGTATCTCATCAAAACATGCATAACTGGTTTGGAACATGGATTCAAAACATCCAACATGATTCTGCTCAAGGGTTCACATTTTTAAAAGAAGTTGACAAAGAAGCAGAAATGACTTATGACTTAGTCTCAACTTTCTTGAAAGGATGGGTCGGAAAAGACTACCCATT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CATTGACCCTTATAGGATCACTATTTCACTCAGTTCAGCTCATCCAAACTGATTTAAGCTCTAGTAATACATCTGAATTATATTTAGTTTGTCGAAGACTCAAGAGTTATATAGATACTCCTTTTGTGGATTGGATAGAATTGTATGATCACTGGGAGAAACAATATGCCTTTAGAGATATAAAGGACGAATTCCATAGAGCCCGATTACTCAATCCTGACAAAACGCTTACAGGCATACCTTCTCAATTTATACCTGACCCAGGAGTAAATCTGGAGACACTGCTTCAAATTGCTGGGGTTCCCACTGGAGTAGCACATGGGATCACTCATCACATAATGCAGTCTAAAGACAAATTAATATCCAGTGCAATAGGAAGTATGTGTGTCATTTCTCACTTTGTGATCAACACCATACGGACCACAGATATCATGCCTGGGCCTCCATCAGATGGGGACGTCAACAAAATGTGTGCAGCATTGATCGGGACCTGTCTCTGGCTGAGCTGGATCGAATCAGATCTCAATCTATACAAGACATGTTTAAGATCAATAGTGAAGTCAATGCCTGTGAGATGGTTCAGGATCTTGAAAAATGAGAAATGGTCACAGAAGTGGGACTGTAAAGGAGATGCGATCCCAAAAGATTCCAGACTGGGAGACAGTATGGCTAATATAGGAAACTGGATAAGGGCTTGGGAATTGATTAGAGACGGTAAAAACTCAGAACCTTTTGATTCAAGGGCAGCAGAAGTCCTGACTAAGTCTGTTGACATGTCATTGAGTTGGAAGAAAATCCTGAAGTCAACTGGAATCCCAAGACTATTGAACAGTGATGTTGATGTCATAGATCAATCGATATTGAATGTGCAGATTGACATAGTGGAGAACCAGGCTTGGCAAAGCTGAATCAGTACTGATAAAAACATTAATAAAGAAAGCAGTACGATATTATGAA
| 83,706
|
KU296053.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Fowler,V.L., King,D.J., Howson,E.L., Madi,M., Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L., Knowles,N.J., Mioulet,V., King,D.P.
|
The Pirbright Institute
|
United Kingdom
|
2016-02-23
|
27946/COL/1998
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,076
|
GenBank
| 1
|
Colombia
|
Colombia
|
Bos taurus
| null |
1998
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate 27946/COL/1998, complete genome
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ACTTTTAACAGACATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCGTCAATGACTCTATTATTCATCCTAAATTGCCAGCCCATGAAGATCCGGTGGAGTACCCGGCTGATTACTTCAAAAACAACACAAATATAGTGTTATACGTTAGCACTAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGGGCTTATGTCTACCAAGGGATCAAATCTGGCAATCCGTCTATACTCCACATAAATGCTTACCTTTACGCAGCATTGAAGGGAGTAGAAGGGACCTTAGACAGAGATTGGGTCAGCTTCGGACGCACGATTGGAAAGAGAGAAGAGAGTGTGAAAATCTTTGACCTTGTTAAAGTAGAAGAATTAAAGACAGCACTTCCTGATGGAAAATCAGATCCCGACCGTTCAGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATTTATATCCTGGGTCTCTACAGAGTAGGTAGATCAAAAGTTACTGATTACCGGAAAAAATTGCTGGATGGCTTAGAGAATCAGTGCAAAGTGGCATCAACTAGATTCGAAAGCCTAGTTGAAGATGGATTGGATTTCTTTGACATATGGGAAAACGATCCGAACTTCACCAAGATAGTTGCAGCGGTGGATATGTTCTTTCATATGTTCAAAAAACATGAGCGTGCACCAATCAGATACGGAACCATAGTCTCACGGTTCAAAGACTGTGCAGCATTAGCTACATTTGGGCATCTCAGCAAGGTCAGTGGACTTTCTATTGAAGATCTCACAACATGGGTCCTTAATAGGGAAGTCGCAGACGAGCTATGCCAGATGATGTATCCGGGGCAAGAAATTGATAAGGCAGATTCTTACATGCCTTATATGATTGATTTTGGATTGTCGCAGAAATCACCATACTCATCAGTCAAAAACCCAGCTTTCCACTTCTGGGGTCAACTTGCAGCGCTCCTATTGAGATCTACTCGCGCAAAAAATGCCAGACAGCCAGATGACATTGAATATACATCATTAACTTGTGCAAGTCTACTGCTGTCATTTGCAGTTGGGTCCTCAGCAGATATTGAGCAGCAGTTCTATATTGGAGAAGATAAATACACAACAGATAAGGATGATGGTCTAAAGAAATCAGATGTACCACCCAAAGGGAGGAATGTCGTAGACTGGCTCGGCTGGTATGACGATAATGGGGGAAAACCTACACCGGACATGCTGAACTTCGCAAGAAGAGCAGTCAGCTCCCTACAGGCACTTCGTGAGAAAACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAGTTTGATAAATGACCAAACTCTACACACTACTATCAATATTATATTCTATGTTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGACAGTGTTGATCGGCTCAAGACTTATTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCCAATGAATCTGAAGAGAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAGGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAATCAACTCCGTCGTATTATCAGGAGGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCAGATGAGAGAGTAGACAAGTGGGAAGAAGACTTGCCTGAATTAGAGAAGATTGATGATGACATACCGGTTGCTTTTCCTAATTGGACTCAACCTGTAATGAAAGAGAATGGTGGGGAGAAATCATTATCTTTGTTTCCTCCCGTTGGATTGACCAAGATTCAGACCGAACAATGGAGGAAGACGATTGAAGCGGTCTGTGAAAGCTCAAAATATTGGAATTTATCAGAGTGCCGGATGGTGACTTCAGATGATTGTCTTATTCTCAGAGGACGAGTTATGACTCCTGATTGCAGTTCATCAGTTAAATCTCAGAATTCTGTGCGGAGTTCGGAATCTCTCTATTCCTCCCACTCACCAGGACCTGCACCTGGGGTATCAGAGTCAATGAACTTATGGAACTTGAAGTCAACAGAAGTCCAACTGACCTCAAAGAGAGCAGGAGTCAAAGACATGACAGTCAAGTTAACAGACTTCTTTGGAAGTGAGGAAGAGTATTATTCAGTATGCCCAGAAGGAGCATCAGATTTGATGGGAGCAATTATTATGGGACTGAAGCATAAGAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAATATCGACTTTAACTCCTTACTACAGTCAATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAGATGAGTTCATTCAAAAAGATTTTAGGACTTTCATCAAAAAGTCATAAAAAGTCAAAGAAGATGGGACTACCGCCTCCTTATGATGAATCCTGTCCGATGGAGATTCAACCTTCTGCTCCAATATCAAATGATTTCTTTGGGATGGAGGACATGGATCTCTATGATAAGGATTCTTTAAGATATGAGAAGTTCCGATTCATGTTAAAGATGACCGTCAGGTCCAATAAACCTTTCCGAGCATATGATGATGTTACTGCTGCTGTAGCACAGTGGGACAATTCATACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCCTTTTATAAAATCATTGCTCTAATTGGATCGAGTCATTTGCAGGCTACCCCAGCTGTGTTGGCAGATTTGAATCAACCGGAGTACTATGCCACATTGACAGGTCGTTGCTTTCTACCTCATCGACTGGGATTAGTCCCACCTATGTTCAATGTGCCTGAAACATTCAGAAAACCGTTTAACATTGGACTGTATAAAGGGACCCTTGACTTCACCTTCACAGTGTCAGATGATGAATCTAATGAAAAAGTCCCTCATGTTTGGGATTATATGAATCCGAAGTATCAATCTCAGATACAACAGGAGGGGCTCAAATTCGGGTTAATCCTGAGTAAAAAAGCAACCGGAACCTGGGTTTTAGACCAATTGAGTCCATTCAAGTAAATGATGTCTCAACAATAATCAGATCATATAATACTCGTTTTGGTTGTGGGTTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTACCTCATCCTTGCACTTGCCGTCTCGCCCATACTGGGCAAAATTGAAATTGTCTTTCCCCAACATACTACAGGGGATTGGAAAAGAGTGCCACATGAGTACAATTATTGCCCTACCAGTGCGGACAAAAACTCCCACGGAACTCAAACAGGGATTCCTATTGAGTTGACAATGCCTAAAGGACTGACAACTCATCAGGTAGAGGGATTTATGTGTCATGCAGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTTAGATGGTATGGACCAAAATATATAACTCATTCCATACATAATGAGGAACCGACAGACTATCAGTGCCTGGAGGCCATTAAAGCATATAAGGATGGAGTTAGCTTCAATCCTGGGTTTCCTCCTCAAAGTTGTGGATACGGTTCAGTAACAGATGCAGAGGCACACATAATCACAGTTACCCCCCACTCTGTTAAAGTGGATGAGTATACTGGAGAATGGATTGACCCTCATTTTATAGGAGGAAGATGCAAAGGGAAAATCTGTGAAACAGTTCATAATTCAACCAAGTGGTTTACATCTTCAGATGGGGAAAGTGTATGCAGCCAATTATTCACCCTGATTGGAGGAACTTTTTTCTCTGATTCAGAGGAGATTACCTCAATGGGATTACCAGAAACCGGAATCAGGAGCAATTACTTCCCCTATGTGTCTACAGAAGGAATTTGCAAAATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTATAAGCTTAAGAATGACCTCTGGTTCCAAATTACAGACCCGGACTTGGATCAAACAGTGAAGGACCTACCACACATAAAAGACTGTGACCTTTCTTCCTCCATCATCACCCCAGGGGAACATGCAACAGACATATCTCTAATATCCGATGTGGAACGGATACTTGATTATGCTCTTTGTCAAAATACCTGGAGCAAGATTGAAGCAGGAGAACCAATTACTCCTGTAGATATCAGCTATTTAGGACCTAAAAACCCTGGCGTTGGGCCAGTTTTCACAATCATCAACGGCTCACTACATTACTTTACCTCCAAGTATCTACGGGTTGAGTTAGAAAGTCCCATTATACCCAGAATGGAAGGAAAAGTTGCGGGGACCCGAATTGTTCGTCAACTGTGGGACCAATGGTTTCCTTTCGGAGAGGCAGAGATTGGACCTAATGGTGTTCTGAAAACCAAGCAAGGATATAAATTCCCATTGCACATCATTGGGACGGGGGAAGTCGACAATGACATCAAAATGGAAAGGATTGTAAAACATTGGGAGCACCCACACATAGAAGCTGCTCAGACGTTTTTAAAAAAAGATGACACAGAAGAGGTAATCTATTATGGGGACACTGGAGTATCCAAAAATCCAGTTGAGTTAGTAGAGGGATGGTTCAGCGGTTGGAGAAGCTCAATCATGGGAGTGTTGGCTGTGATCATAGGTTTTGTGATCTTAATATTTTTAATTAGATTGATTGGACTGATGTCCAGTTTCTGTAAACCAAGAAGGAGGCCAATCTACAAATCTGACGTAGAAATGGCTCATTTCCGGTAATCTATGAAAAAAACTGGGTTACACAAATAAATACAACAGGAATCAAAATGGATTTCGATCTAATTGAAGATTCTACTAACTGGGGAGAGGATGAATCGGACTTTCTTCTGCGAGATATTTTGTCACAGGAGGATCAGATGTCTTACTTGAACTCTGCTGATTATAATCTGAATTCTCCACTCATATCAGATGACATGGTTTATTTAGTCAAGCGGATGAACCATGAAGAGGTACCTCCCATCTGGAGATCAAAGGATTGGGATTCCCCTCTTGACATGCTTCGGGGTTGTCAGGCTCAGCCCATATCTCATCAAAACATGCATCACTGGTTTGGAACATGGATTCAAAACATCCAACATGATTCTGCTCAAGGGTTTACATTTTTAAAAGAAGTTGACAAAGAAGCAGAAATGACTTATGACTTAGTCTCAACTTTCCTGAAAGGATGGGTCGGAAA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| 83,707
|
KU296054.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Fowler,V.L., King,D.J., Howson,E.L., Madi,M., Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L., Knowles,N.J., Mioulet,V., King,D.P.
|
The Pirbright Institute
|
United Kingdom
|
2016-02-23
|
27775/COL/1998
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,108
|
GenBank
| 1
|
Colombia
|
Colombia
|
Bos taurus
| null |
1998
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate 27775/COL/1998, complete genome
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AAGACAAAAAAACCATTATTACAATTATTTGGCCTGGAGGGAACTTTTAACAGACATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCGTCAATGACTCTATTATTCATCCTAAATTGCCAGCCCATGAAGATCCGGTGGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAACAACACAAATATAGTGTTATACGTTAGCACTAAAGTGGCACTAAATGATTTAAGGGCTTATGTCTACCAAGGGATCAAATCTGGCAATCCGTCTATACTCCACATAAATGCTTACCTTTACGCAGCATTGAAGGGAGTAGAAGGGACCTTAGACAGAGATTGGGTCAGCTTCGGACGCACGATTGGAAAAAGAGAAGAGAGTGTGAAAATCTTTGACCTTGTTAAAGTAGAAGAATTAAAGACAGCACTTCCTGATGGAAAATCAGATCCCGACCGTTCAGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATTTATATCCTGGGTCTCTACAGAGTAGGTAGATCAAAAGTTACTGATTACCGGAAAAAATTGCTGGATGGCTTAGAGAATCAGTGCAAAGTGGCATCAACTAGATTCGAAAGCCTGGTTGAAGATGGATTGGATTTCTTTGACATATGGGAAAACGATCCGAACTTCACCAAGATAGTTGCAGCGGTGGATATGTTCTTTCATATGTTCAAAAAACATGAGCGTGCACCAATCAGATACGGAACCATAGTCTCACGGTTCAAAGACTGTGCAGCATTAGCTACATTTGGGCATCTCAGCAAGGTCAGTGGACTTTCTATTGAAGATCTCACAACATGGGTCCTTAATAGGGAAGTCGCAGACGAGCTATGCCAGATGATGTATCCGGGGCAAGAAATCGATAAGGCAGATTCTTACATGCCTTATATGATTGATTTTGGATTGTCGCAGAAATCACCATACTCATCAGTTAAAAACCCAGCTTTCCACTTCTGGGGTCAACTTGCAGCGCTCCTATTGAGATCTACTCGCGCAAAAAATGCCAGACAGCCAGATGACATTGAATATACATCATTAACTTGTGCAAGTCTACTGCTGTCATTTGCAGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAGCAGCAGTTCTATATTGGAGAAGATAAATACACAACAGATAAGGAGGATGGTCTAAAGAAATCAGATGTACCACCCAAAGGGAGGAATGTCGTAGACTGGCTCGGCTGGTATGACGATAATGGGGGAAAACCTACACCGGACATGCTGAACTTCGCAAGAAGAGCAGTCAGCTCCCTACAGGCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAGTTTGATAAATGAGCAGACTCTACACACTACTATCAATATTATATTCTATGTTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGACAGTGTTGATCGGCTCAAGACTTATTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCCAATGAATCTGAAGAGAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAGGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAATCAACTCCGTCGTATTATCAGGAGGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCAGATGAGAGAGTAGACAAGTGGGAAGAAGACTTGCCTGAATTAGAGAAGATTGATGATGACATACCGGTTACCTTTCCTGATTGGACTCAACCTGTAATGAAAGAGAATGGTGGGGAGAAATCATTATCTTTGTTTCCTCCCGTTGGATTGACCAAGGTTCAGACCGAACAATGGAGGAAGACGATTGAAGCGGTCTGTGAAAGCTCAAAATATTGGAATTTATCAGAATGCCGGATGGTGACTTCAGATGATTGTCTTATTCTCAGAGGACGAGTTATGACTCCTGATTGCAGTTCATCAGTTAAATCTCAGAATTCTGTACGGAGTTCAGAATCTCTCTATTCCTCCCACTCACCAGGGCCTGCACCTGGGGCATCAGAGTCAATGAATTTATGGGACTTGAGGTCAACAGAAGTCCAACTGACCTCAAAGAGAGCAGGAGTCAAAGACATGACAGTCAAGTTAACAGACTTCTTTGGAAGTGAGGAAGAGTATTATTCAGTATGCCCAGAAGGAGCATCAGATTTGATGGGAGCAATTATTATGGGACTGAAACATAAGAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAATATCGACTTTAACTCCTTACTACAGTCAATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAGATGAGTTCATTCAAAAAGATTTTAGGACTTTCATCAAAAAGTCATAAAAAGTCAAAGAAGATGGGACTACCGCCTCCTTATGATGAATCCTGTCCGATGGAGATTCAACCTTCTGCTCCAATATCAAATGATTTCTTTGGGATGGAGGACATGGATCTCTATGATAAGGATTCTTTAAGATATGAGAAGTTCCGATTCATGTTAAAGATGACCGTCAGGTCCAATAAACCTTTCAGAGCATATGATGATGTTACTGCTGCTGTAGCACAGTGGGACAATTCCTACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCCTTTTATAAAATCATTGCTCTAATTGGATCGAGTCATTTGCAGGCTACCCCAGCTGTGTTGGCAGATTTGAATCAACCGGAGTACTATGCCACATTGACAGGTCGTTGCTTTCTACCTCATCGACTGGGATTAATCCCACCTATGTTCAATGTGCCTGAAACATTCAGAAAACCGTTTGACATTGGACTATATAAAGGGACCCTTGACTTCACCTTCACAGTGTCAGATGATGAATCCAATGAAAAAGTCCCTCATGTTTGGGATTATATGAATCCGAAGTATCAATCTCAGATACAACAGGAGGGGCTCAAATTCGGGTTAATCCTGAGTAAAAAAGCAACCGGAACCTGGGTTTTAGACCAATTGAGTCCATTCAAATAAATGATGTCTCAACAATAATCAGATCATATAATACTCGTTTTGGTTGTGGGTTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTACCTTATCTTTGCACTTGCCGTCTCGCCCATACTGGGCAAAATTGAAATTGTCTTTCCCCAACATACTACAGGGGATTGGAAAAGAGTGCCACATGAGTACAATTATTGCCCTACCAGTGCGGACAAAAACTCCCACGGAACTCAAACAGGGATTCCTATTGAGTTGACAATGCCTAAAGGACTAACAACTCATCAGGTAGAGGGATTTATGTGTCATGCAGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTTAGATGGTATGGACCAAAATATATAACTCATTCCATACATAATGAGGAACCGACAGACTATCAGTGCCTGGAGGCTATTAAAGCATATAAGGATGGAGTTAGCTTCAATCCTGGGTTTCCTCCTCAAAGCTGTGGATACGGTTCAGTAACGGATRCAGAGGCACACATAATCACAGTTACTCCCCACTCTGTTAAAGTGGATGAGTATACTGGAGAATGGATTGACCCTCATTTTATAGGAGGAAGATGCAAAGGGAAAATCTGTGAAACAGTTCATAATTCAACCAAGTGGTTTACATCTTCAGATGGGGAAAGTGTGTGCAGCCAATTATTCACCTTGGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGATTCAGAGGAGATTACCTCAATGGGATTACCAGAAACCGGAATCAGGAGCAATTACTTCCCCTATGTGTCTACAGAAGGAATTTGCAAAATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTATAAGCTTAAGAATGACCTCTGGTTCCAAATTACAGACCCGGACTTGGATCAAACAGTGAAGGATCTACCACACATAAAAGACTGTGACCTTTCTTCCTCCATCATCACCCCAGGGGAACATGCAACAGACATATCTCTAATATCCGATGTGGAACGGATACTTGATTATGCTCTTTGTCAAAATACCTGGAGCAAGATTGAAGCAGGAGAACCAATTACTCCTGTAGATATCAGCTATCTAGGACCTAAAAACCCTGGCGTTGGGCCAGTTTTCACAATCATCAACGGCTCACTACATTACTTTACCTCCAAATATCTACGGGTTGAGTTAGAAAGTCCTATTATACCCAGAATGGAAGGGAAAGTTGCGGGGACCCGAATTGTTCGTCAACTGTGGGACCAATGGTTTCCCTTTGGAGAGGCAGAGATTGGACCTAATGGTGTTCTGAAAACCAAGCAAGGATATAAATTCCCATTGCACATCATTGGGACTGGGGAAGTCGACAATGACATCAAAATGGAAAGGATTGTAAAACATTGGGAGCACCCACACATAGAAGCTGCTCAGACGGTTTTAAAAAAAGATGACACAGAAGAGGTAATCTATTATGGGGACACTGGAGTATCCAAAAATCCAGTTGAGCTAGTAGAGGGATGGTTCAGCGGTTGGAGAAGCTCAATCATGGGAGTGTTGGCTGTGATCATAGGTTTTGTGATCTTAATATTTTTAATTAGATTGATTGGACTGATGTCCAGTTTCTGTAAACCAAGACGGAGGCCAATCTACAAATCTGATGTAGAAATGGCTCATTTCCGGTAATCTATGAAAAAAACTGGGTTACACAAATAAATACAACAGGAATCAAAATGGATTTCGATCTAATTGAAGATTCTACTAACTGGAGAGAGGATGAATCGGACTTTCTTCTGCGAGATATTTTGTCACAGGAGGATCAGATGTCTTACTTGAACTCTGCTGATTATAATCTGAATTCTCCACTCATATCAGATGACATGGTTTATTTAGTCAAGCGGATGAACCATGAAGAGGTGCCTCCCATCTGGAGATCAAAGGAATGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTCGGGGTTGTCAGGCTCAGCCCATATCTCATCAAAACATGCATAACTGGTTTGGAACATGGATTCAAAACATCCAACATGATTCTGCTCAAGGGTTTACATTTTTAAAAGAAGTTGACAAAGAAGCAGAAATGAC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| 83,708
|
KU296055.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Fowler,V.L., King,D.J., Howson,E.L., Madi,M., Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L., Knowles,N.J., Mioulet,V., King,D.P.
|
The Pirbright Institute
|
United Kingdom
|
2016-02-23
|
27405/COL/1998
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,108
|
GenBank
| 1
|
Colombia
|
Colombia
|
Bos taurus
| null |
1998
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate 27405/COL/1998, complete genome
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AGACAAAAAAACCATTATTACAATTATTTGGCNNNGAGGGAACTTTTAACAGACATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCGTCAATGACTCTATTATTCATCCTAAATTGCCAGCCCATGAAGATCCGGTGGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAACAACACAAATATAGTGTTATACGTTAGCACTAAAGTGGCACTAAATGATTTAAGGGCTTATGTCTACCAAGGGATCAAATCTGGCAATCCGTCTATACTCCACATAAATGCTTACCTTTACGCAGCATTGAAGGGAGTAGAAGGGACCTTAGACAGAGATTGGGTCAGCTTCGGACGCACGATTGGAAAAAGAGAAGAGAGTGTGAAAATCTTTGACCTTGTTAAAGTAGAAGAATTAAAGACAGCACTTCCTGATGGAAAATCAGATCCCGACCGTTCAGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATTTATATCCTGGGTCTCTACAGAGTAGGTAGATCAAAAGTTACTGATTACCGGAAAAAATTGCTGGATGGCTTAGAGAATCAGTGCAAAGTGGCATCAACTAGATTCGAAAGCCTGGTTGAAGATGGATTGGATTTCTTTGACATATGGGAAAACGATCCGAACTTCACCAAGATAGTTGCAGCGGTGGATATGTTCTTTCATATGTTCAAAAAACATGAGCGTGCACCAATCAGATACGGAACCATAGTCTCACGGTTCAAAGACTGTGCAGCATTAGCTACATTTGGGCATCTCAGCAAGGTCAGTGGACTTTCTATTGAAGATCTCACAACATGGGTCCTTAATAGGGAAGTCGCAGACGAGCTATGCCAGATGATGTATCCGGGGCAAGAAATCGATAAGGCAGATTCTTACATGCCTTATATGATTGATTTTGGATTGTCGCAGAAATCACCATACTCATCAGTTAAAAACCCAGCTTTCCACTTCTGGGGTCAACTTGCAGCGCTCCTATTGAGATCTACTCGCGCAAAAAATGCCAGACAGCCAGATGACATTGAATATACATCATTAACTTGTGCAAGTCWACTGCTGTCATTTGCAGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAGCAGCAGTTCTATATTGGAGAAGATAAATACACAACAGATAAGGAGGATGGTCTAAAGAAATCAGATGTACCACCCAAAGGGAGGAATGTCGTAGACTGGCTCGGCTGGTATGACGATAATGGGGGAAAACCTACACCGGACATGCTGAACTTCGCAAGAAGAGCAGTCAGCTCCCTACAGGCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAGTTTGATAAATGAGCAGACTCTACACACTACTATCAATATTATATTCTATGTTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGACAGTGTTGATCGGCTCAAGACTTATTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCCAATGAATCTGAAGAGAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAGGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAATCAACTCCGTCGTATTATCAGGAGGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCAGATGAGAGAGTAGACAAGTGGGAAGAAGACTTGCCTGAATTAGAGAAGATTGATGATGACATACCGGTTACCTTTCCTGATTGGACTCAACCTGTAATGAAAGAGAATGGTGGGGAGAAATCATTATCTTTGTTTCCTCCCGTTGGATTGACCAAGGTTCAGACCGAACAATGGAGGAAGACGATTGAAGCGGTCTGTGAAAGCTCAAAATATTGGAATTTATCAGAATGCCGGATGGTGACTTCAGATGATTGTCTTATTCTCAGAGGACGAGTTATGACTCCTGATTGCAGTTCATCAGTTAAATCTCAGAATTCTGTACGGAGTTCAGAATCTCTCTATTCCTCCCACTCACCAGGGCCTGCACCTGGGGCATCAGAGTCAATGAATTTATGGGACTTGAGGTCAACAGAAGTCCAACTGACCTCAAAGAGAGCAGGAGTCAAAGACATGACAGTCAAGTTAACAGACTTCTTTGGAAGTGAGGAAGAGTATTATTCAGTATGCCCAGAAGGAGCATCAGATTTGATGGGAGCAATTATTATGGGACTGAAACATAAGAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAATATCGACTTTAACTCCTTACTACAGTCAATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAGATGAGTTCATTCAAAAAGATTTTAGGACTTTCATCAAAAAGTCATAAAAAGTCAAAGAAGATGGGACTACCGCCTCCTTATGATGAATCCTGTCCGATGGAGNTTCAACCTTCTGCTCCAATATCAAATGATTTCTTTGGGATGGAGGACATGGATCTCTATGATAAGGATTCTTTAAGATATGAGAAGTTCCGATTCATGTTAAAGATGACCGTCAGGTCCAATAAACCTTTCAGAGCATATGATGATGTTACTGCTGCTGTAGCACAGTGGGACAATTCCTACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCCTTTTATAAAATCATTGCTCTAATTGGATCGAGTCATTTGCAGGCTACCCCAGCTGTGTTGGCAGATTTGAATCAACCGGAGTACTATGCCACATTGACAGGTCGTTGCTTTCTACCTCATCGACTGGGATTAATCCCACCTATGTTCAATGTGCCTGAAACATTCAGAAAACCGTTTGACATTGGACTATATAAAGGGACCYTTGACTTCACCTTCACAGTGTCAGATGATGAATCCAATGAAAAAGTCCCTCATGTTTSGGATTATATGAATCCGAAGTATCAATCTCAGATACAACAGGAGGGGCTCAAATTCGGGTTAATCCTGAGTAAAAAAGCAACCGGAACCTGGGTTTTAGACCAATTGAGTCCATTCAAATAAATGATGTCTCAACAATAATCAGATCATATAATACTCGTTTTGGTTGTGGGTTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTACCTTATCTTTGCACTTGCCGTCTCGCCCATACTGGGCAAAATTGAAATTGTCTTTCCCCAACATACTACAGGGGATTGGAAAAGAGTGCCACATGAGTACAATTATTGCCCTACCAGTGCGGACAAAAACTCCCACGGAACTCAAACAGGGATTCCTATTGAGTTGACAATGCCTAAAGGACTAACAACTCATCAGGTAGAGGGATTTATGTGTCATGCAGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTTAGATGGTATGGACCAAAATATATAACTCATTCCATACATAATGAGGAACCGACAGACTATCAGTGCCTGGAGGCTATTAAAGCATATAAGGATGGAGTTAGCTTCAATCCTGGGTTTCCTCCTCAAAGCTGTGGATACGGTTCAGTAACGGATRCAGAGGCACACATAATCACAGTTACTCCCCACTCTGTTAAAGTGGATGAGTATACTGGAGAATGGATTGACCCTCATTTTATAGGAGGAAGATGCAAAGGGAAAATCTGTGAAACAGTTCATAATTCAACCAAGTGGTTTACATCTTCAGATGGGGAAAGTGTGTGCAGCCAATTATTCACCTTGGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGATTCAGAGGAGATTACCTCAATGGGATTACCAGAAACCGGAATCAGGAGCAATTACTTCCCCTATGTGTCTRCAGAAGGAATTTGCAAAATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTATAAGCTTAAGAATGACCTCTGGTTCCAAATTACAGACCCGGACTTGGATCAAACAGTGAAGGATCTACCACACATAAAAGACTGTGACCTTTCTTCCTCCATCATCACCCCAGGGGAACATGCAACAGACATATCTCTAATATCCGATGTGGAACGGATACTTGATTATGCTCTTTGTCAAAATACCTGGAGCAAGATTGAAGCAGGAGAACCAATTACTCCTGTAGATATCAGCTATCTAGGACCTAAAAACCCTGGCGTTGGGCCAGTTTTYACAATCATCAACGGCTCACTACATTACTTTACCTCCAAATATCTACGGGTTGAGTTAGAAAGTCCTATTATACCCAGAATGGAAGGGAAAGTTGCGGGGACCCGAATTGTTCGTCAACTGTGGGACCAATGGTTTCCCTTTGGAGAGGCAGAGATTGGACCTAATGGTGTTCTGAAAACCAAGCAAGGATATAAATTCCCATTGCACATCATTGGGACTGGGGAAGTCGACAATGACATCAAAATGGAAAGGATTGTAAAACATTGGGAGCACCCACACATAGAAGCTGCTCAGACGGTTTTAAAAAAAGATGACACAGAAGAGGTAATCTATTATGGGGACACTGGAGTATCCAAAAATCCAGTTGAGCTAGTAGAGGGATGGTTCAGCGGTTGGAGAAGCTCAATCATGGGAGTGTTGGCTGTGATCATAGGTTTTGTGATCTTAATATTTTTAATTAGATTGATTGGACTGATGTCCAGTTTCTGTAAACCAAGACGGAGGCCAATCTACAAATCTGATGTAGAAATGGCTCATTTCCGGTAATCTATGAAAAAAACTGGGTTACACAAATAAATACAACAGGAATCAAAATGGATTTCGATCTAATTGAAGATTCTACTAACTGGAGAGAGGATGAATCGGACTTTCTTCTGCGAGATATTTTGTCACAGGAGGATCAGATGTCTTACTTGAACTCTGCTGATTATAATCTGAATTCTCCACTCATATCAGATGACATGGTTTATTTAGTCAAGCGGATGAACCATGAAGAGGTGCCTCCCATCTGGAGATCAAAGGAATGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTCGGGGTTGTCAGGCTCAGCCCATATCTCATCAAAACATGCATAACTGGTTTGGAACATGGATTCAAAACATCCAACATGATTCTGCTCAAGGGTTTACATTTTTAAAAGAAGTTGACAAAGAAGCAGAAATGACT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| 83,709
|
KU296056.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Fowler,V.L., King,D.J., Howson,E.L., Madi,M., Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L., Knowles,N.J., Mioulet,V., King,D.P.
|
The Pirbright Institute
|
United Kingdom
|
2016-02-23
|
29453/COL/2000
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,085
|
GenBank
| 1
|
Colombia
|
Colombia
|
Bos taurus
| null |
2000
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate 29453/COL/2000, complete genome
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GCCTAGAGGGAACTTTTAACAGACATCAAAATGGCTCCCACAGTTAAGAGAATCGTCAATGACTCTATTATTCNNNNNNNNNNNNNNGCCCATGAAGATCCGGTGGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAACAACACAAATATAGTGTTATACGTTAGCACTAAAGTGGCACTAAACGATTTAAGGGCTTATGTCTACCAAGGGATCAAATCTGGAAATCCGTCTATACTCCACATAAATGCTTACCTTTACGCAGCATTGAAGGGAGTAGAGGGGACCTTAGACAGAGATTGGGTCAGCTTCGGACGCACGATTGGAAAAAGAGAAGAGAGTGTGAAAATCTTTGACCTTGTTAAAGTAGAAGAATTAAAGACAGCACTTCCTGATGGAAAATCAGATCCCGACCGTTCAGCTGAGGATGACAAATGGCTTCCTCTTTATATCCTGGGTCTCTACAGAGTAGGTAGATCAAAAGTTACTGATTACCGGAAAAAATTGCTGGATGGCTTAGAGAATCAGTGCAAAGTAGCATCAACTAGATTCGAAAGCCTGGTTGAAGATGGACTGGATTTCTTTGACATATGGGAAAACGATCCGAACTTCACCAAGATAGTTGCAGCGGTGGATATGTTCTTTCATATGTTCAAAAAACACGAGCGTGCACCAATCAGATACGGAACCATAGTCTCACGTTTCAAAGACTGTGCAGCATTAGCTACATTTGGGCATCTCAGCAAGGTCAGTGGACTTTCTATTGAAGATCTCACAACATGGGTCCTCAATAGGGAGGTCGCAGACGAGCTATGCCAGATGATGTATCCGGGGCAAGAAATTGATAAGGCAGATTCTTACATGCCTTATATGATAGATTTTGGATTGTCACAGAAATCACCATACTCATCAGTTAAAAATCCAGCTTTTCACTTCTGGGGTCAACTTGCAGCACTCCTATTGAGATCTACTCGTGCAAAAAATGCCAGACAGCCAGATGACATTGAATATACATCATTAACTTGTGCAAGTCTACTGCTGTCATTTGCAGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAGCAGCAGTTCTATATTGGAGAAGATAAATACACAACAGATAAGGATGATGGTCTAAGGAAATCAGATGTACCACCCAAAGGGAGGAATGTCGTAGACTGGCTCGGCTGGTATGATGATAACGGGGGAAAACCTACACCGGACATGCTGAACTTCGCAAGAAGAGCAGTCAGCTCCCTCCAGGCACTTCGTGAGAAAACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAGTTTGATAAATGACCAAACTCTACACACTACTATCAATATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGACAGTGTTGATCGGCTCAAGACTTATTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCCAATGAATCTGAAGAGAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAGGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAATCAACTCCGTCGTATTATCAAGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCAGATGAGAGAGTAGACAAGTGGGAAGAAGACTTGCCTGAATTAGAGAAGATTGATGATGACATACCGGTTACCTTTCCTAATTGGACTCAACCTGTCATGAAAGAGAATGGTGGGGAGAAATCATTATCTCTATTTCCTCCCGTTGGATTGACCAAGTTTCAAACCGAACAATGGAGGAAGACGATTGAAGCGGTCTGTGAAAGCTCAAAATATTGGAATTTATCGGAATGCCAGATGGTAACTTCAGATGATTGTCTGATTCTCAGAGGACGAGTTATGACTCCTGATTGCAGTTCGTCAGTCAAATCTCATAATTCTGTACGGAGTTCAGAATCTCTCTATTCATCCCACTCACCAGGACCTGCACCTGGGGCATCCGGGTCAATGAATTTATGGGACTTGAAGTCAACAGAAGTCCAACTGACCTCAAAGAGAGCAGGAGTCAAGGACATGACAGTCAAGTTAACAGACTTCTTTGGAAGTGAGGAAGAGTATTATTCAGTATGCCCAGAAGGAGCATCAGATTTGATGGGTGCAATTATTATGGGACTGAAGCATAAGAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAATATCGACTTTAACCCTTTACTACAGTCAATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAGATGAGTTCATTCAAAAAGATTTTAGGACTTTCATCAAAAAGTCATAAAAAGTCAAAGAAGATGGGACTACCGCCTCCGTATGATGAATCCTGTCCGATGGAGATTCAACCTTCTGCTCCAATATCAAATGATTTCTTTGGGATGGAAGACATGGATCTCTATGATAAGGATTCTTTAAGATATGAGAAGTTCCGATTCATGTTAAAGATGACTGTCAGGTCCAATAAACCTTTTAGAGCATATGATGATGTTACTGCTGCCGTAGCACAGTGGGACAATTCCTACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCCTTTTATAAAATCATTGCTCTAATTGGATCAAGTCATTTGCAGGCTACCCCGGCTGTGTTGGCAGATTTGAATCAACCGGAGTACTATGCCACATTGACAGGTCGTTGCTTTCTGCCTCATCGACTGGGATTAATCCCACCTATGTTCAATGTGCCCGAGACATTCAGAAAACCGTTTGACATTGGACTATATAAAGGGACCCTTGACTTCACCTTCACAGTGTCAGATGATGAATCTAATGAAAAAGTCCCTCATGTTTGGGATTACATGAATCCAAAGTATCAATCTCAGATACAACAAGAGGGGCTCAAATTCGGGTTAATCCTGAGTAAAAAAGCAACCGGAACCTGGGTTTTAGACCAATTGAGTCCATTCAAATAAATTATGTCTCAACATTAATCAGACCATATAATACTCGTTTCGGTTGTGGGTTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTACCTCATCCTTGCACTTACCATCTCGCCCATACTGGGCAAAATTGAAATTGTCTTTCCCCAACATACCACAGGGGATTGGAAAAGAGTGCCACATGAGTACAATTATTGCCCTACCAGTGCGGACAAAAACTCCCACGGAACTCAAACAGGGATTCCTATTGAGTTGACAATGCCTAAAGGACTAACAACCCATCAAGTAGAGGGATTTATGTGTCATGCAGCTTTATGGGTGACCACTTGTGATTTTAGATGGTATGGACCAAAATATATAACTCATTCCATACATAATGAGGAACCGACAGACTATCAGTGCCTGGAGGCCATTAAAGCATATAAAGATGGAGCTAGCTTCAATCCTGGGTTTCCTCCTCAAAGCTGTGGATATGGTTCAGTGACGGATGCAGAGGCACACATAATCACAATTACTCCTCATTCTGTTAAAGTGGATGAGTATACTGGAGAATGGATTGACCCTCATTTTATAGGAGGAAGGTGCAAAGGGAAAACCTGTGAAACAGTTCATAATTCAACCAAGTGGTTTACATCTTCAGATGGGGAAAGTGTATGCAGCCAATTATTCACCTTGGTTAGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAGATTACCTCAATAGGATTACCAGAAACCGGAATCAGGAGCAATTACTTCCCCTATGTGTCTACAGAAGGAATTTGCAAAATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTATAAGCTTAAGAATGACCTCTGGTTCCAAATTGCAGACCCAGACTTGGATCAAAAAGTGAAGGATCTACCACACATAAAAGACTGTGACCTTTCTTCCTCTATCATCACCCCAGGGGAACATGCAACAGACATATCTCTAATATCAGATGTGGAACGGATACTTGATTATGCTCTTTGTCAAAATACCTGGAGCAAGATTGAAGCAGGAGAACCAATTACTCCTGTAGACATCAGCTATCTAGGACCTAAAAACCCTGGCGTTGGGCCGGTTTTCACAATCATCAACGGCTCACTACATTACTTTACCTCCAAGTATCTACGAGTTGAGTTAGAAAATCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAAAGTTGCGGGGACCCGAATTGTTCGTCAACTGTGGGACCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCAGAGATTGGACCTAATGGTGTTCTGAAAACCAAGCAAGGATATAAATTCCCATTGCACATCGTTGGGACTGGGGAAGTCGACAATGACATCAAAATGGAAAGGATTGTAAAGCATTGGGAGCACCCACACATAGAAGCTGCTCAGACGTTCTTAAAAAAAGATGACACAGAGGAGGTAATCTATTATGGGGACACTGGAGTATCCAAAAATCCCGTTGAATTAGTAGAGGGATGGTTCAGCGGTTGGAGAAGCTCAATCATGGGAGTGTTGGCTGTGATCATAGGTTTTGTAATCTTAATATTTTTAATTAGATTGATTGGACTGATGTCCAATTTCTGTAAACCAAGAAGAGGGCCAATCTACAAATCCGACGTAGAAATGGCTCACTTCCGGTAATCTATGAAAAAAACTGGGTTACACAAATAAATACAACAGGAATCAAAATGGATTTCGATCTAATTGAAGATTCTACTAACTGGGGAGAGGATGAATCGGACTTTCTTCTGCGAGATATTTTGTCACAGGAGGATCAGATGTCTTACTTGAACTCTGCTGATTATAATCTGAATTCCCCACTCATATCGGATGACATGGTTTATTTAGTCAAGCGGATGAACCATGAAGAAGTACCTCCCATCTGGAGATCAAAGGAATGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTCGGGGTTGTCAGGCTCAGCCCATATCTCATCAAGACATGCATAACTGGTTTGGAACATGGATTCAAAACATCCAACATGATTCTGCTCAAGGGTTTACATTTTTAAAAGAAGTTGACAAAGAAGCAGAAATGACCTATGACTTAGTCTCAACTTTCCTGAAAGGA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| 83,710
|
KU296057.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Fowler,V.L., King,D.J., Howson,E.L., Madi,M., Pauszek,S.J., Rodriguez,L.L., Knowles,N.J., Mioulet,V., King,D.P.
|
The Pirbright Institute
|
United Kingdom
|
2016-02-23
|
27879/COL/1998
|
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,091
|
GenBank
| 1
|
Colombia
|
Colombia
|
Bos taurus
| null |
1998
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus isolate 27879/COL/1998, complete genome
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TTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGACATCAAAATGGCTCCCACAGTTAAGAGAATCGTCAATGACTCTATTATTCATCCTAAATTGCCAGCCCATGAAGATCCGGTGGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAACAACACAAATATAGTGTTATACGTTAGCACTAAAGTGGCACTAAACGATTTAAGGGCTTATGTCTACCAAGGGATCAAATCTGGAAATCCGTCTATACTCCACATAAATGCTTACCTTTACGCAGCATTGAAGGGAGTAGAGGGGACCTTAGACAGAGATTGGGTCAGCTTCGGACGCACGATTGGAAAAAGAGAAGAGAGTGTGAAAATCTTTGACCTTGTTAAAGTAGAAGAATTAAAGACAGCACTTCCTGATGGAAAATCAGATCCCGACCGTTCAGCTGAGGATGACAAATGGCTTCCTCTTTATATCCTGGGTCTCTACAGAGTAGGTAGATCAAAAGTTACTGATTACCGGAAAAAATTGCTGGATGGCTTAGAGAATCAGTGCAAAGTAGCATCAACTAGATTCGAAAGCCTGGTTGAAGATGGACTGGATTTCTTTGACATATGGGAAAACGATCCGAACTTCACCAAGATAGTTGCAGCGGTGGATATGTTCTTTCATATGTTCAAAAAACACGAGCGTGCACCAATCAGATACGGAACCATAGTCTCACGTTTCAAAGACTGTGCAGCATTAGCTACATTTGGGCATCTCAGCAAGGTCAGTGGACTTTCTATTGAAGATCTCACAACATGGGTCCTCAATAGGGAGGTCGCAGACGAGCTATGCCAGATGATGTATCCGGGGCAAGAAATTGATAAGGCAGATTCTTACATGCCTTATATGATAGATTTTGGATTGTCACAGAAATCACCATACTCATCAGTTAAAAATCCAGCTTTTCACTTCTGGGGTCAACTTGCAGCACTCCTATTGAGATCTACTCGTGCAAAAAATGCCAGACAGCCAGATGACATTGAATATACATCATTAACTTGTGCAAGTCTACTGCTGTCATTTGCAGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAGCAGCAGTTCTATATTGGAGAAGATAAATACACAACAGATAAGGATGATGGTCTAAGGAAATCAGATGTACCACCCAAAGGGAGGAATGTCGTAGACTGGCTCGGCTGGTATGATGATAACGGGGGAAAACCTACACCGGACATGCTGAACTTCGCAAGAAGAGCAGTCAGCTCCCTCCAGGCACTTCGTGAGAAAACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAGTTTGATAAATGACCAAACTCTACACACTACTATCAATATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGACAGTGTTGATCGGCTCAAGACTTATTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCCAATGAATCTGAAGAGAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAGGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAATCAACTCCGTCGTATTATCAAGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCAGATGAGAGAGTAGACAAGTGGGAAGAAGACTTGCCTGAATTAGAGAAGATTGATGATGACATACCGGTTACCTTTCCTAATTGGACTCAACCTGTCATGAAAGAGAATGGTGGGGAGAAATCATTATCTCTATTTCCTCCCGTTGGATTGACCAAGTTTCAAACCGAACAATGGAGGAAGACGATTGAAGCGGTCTGTGAAAGCTCAAAATATTGGAATTTATCGGAATGCCAGATGGTAACTTCAGATGATTGTCTGATTCTCAGAGGACGAGTTATGACTCCTGATTGCAGTTCGTCAGTCAAATCTCATAATTCTGTACGGAGTTCAGAATCTCTCTATTCATCCCACTCACCAGGACCTGCACCTGGGGCATCCGGGTCAATGAATTTATGGGACTTGAAGTCAACAGAAGTCCAACTGACCTCAAAGAGAGCAGGAGTCAAGGACATGACAGTCAAGTTAACAGACTTCTTTGGAAGTGAGGAAGAGTATTATTCAGTATGCCCAGAAGGAGCATCAGATTTGATGGGTGCAATTATTATGGGACTGAAGCATAAGAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAATATCGACTTTAACCCTTTACTACAGTCAATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAGATGAGTTCATTCAAAAAGATTTTAGGACTTTCATCAAAAAGTCATAAAAAGTCAAAGAAGATGGGACTACCGCCTCCGTATGATGAATCCTGTCCGATGGAGATTCAACCTTCTGCTCCAATATCAAATGATTTCTTTGGGATGGAAGACATGGATCTCTATGATAAGGATTCTTTAAGATATGAGAAGTTCCGATTCATGTTAAAGATGACTGTCAGGTCCAATAAACCTTTTAGAGCATATGATGATGTTACTGCTGCCGTAGCACAGTGGGACAATTCCTACATTGGAATGGTTGGAAAGCGTCCCTTTTATAAAATCATTGCTCTAATTGGATCAAGTCATTTGCAGGCTACCCCGGCTGTGTTGGCAGATTTGAATCAACCGGAGTACTATGCCACATTGACAGGTCGTTGCTTTCTGCCTCATCGACTGGGATTAATCCCACCTATGTTCAATGTGCCCGAGACATTCAGAAAACCGTTTGACATTGGACTATATAAAGGGACCCTTGACTTCACCTTCACAGTGTCAGATGATGAATCTAATGAAAAAGTCCCTCATGTTTGGGATTACATGAATCCAAAGTATCAATCTCAGATACAACAAGAGGGGCTCAAATTCGGGTTAATCCTGAGTAAAAAAGCAACCGGAACCTGGGTTTTAGACCAATTGAGTCCATTCAAATAAATTATGTCTCAACATTAATCAGACCATATAATACTCGTTTTGGTTGTGGGTTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTACCTCATCCTTGCACTTACCATCTCGCCCATACTGGGCAAAATTGAAATTGTCTTTCCCCAACATACCACAGGGGATTGGAAAAGAGTGCCACATGAGTACAATTATTGCCCTACCAGTGCGGACAAAAACTCCCACGGAACTCAAACAGGGATTCCTATTGAGTTGACAATGCCTAAAGGACTAACAACCCATCAAGTAGAGGGATTTATGTGTCATGCAGCTTTATGGGTGACCACTTGTGATTTTAGATGGTATGGACCAAAATATATAACTCATTCCATACATAATGAGGAACCGACAGACTATCAGTGCCTGGAGGCCATTAAAGCATATAAAGATGGAGCTAGCTTCAATCCTGGGTTTCCTCCTCAAAGCTGTGGATATGGTTCAGTGACGGATGCAGAGGCACACATAATCACAATTACTCCTCATTCTGTTAAAGTGGATGAGTATACTGGAGAATGGATTGACCCTCATTTTATAGGAGGAAGGTGCAAAGGGAAAACCTGTGAAACAGTTCATAATTCAACCAAGTGGTTTACATCTTCAGATGGGGAAAGTGTATGCAGCCAATTATTCACCTTGGTTAGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAGATTACCTCAATAGGATTACCAGAAACCGGAATCAGGAGCAATTACTTCCCCTATGTGTCTACAGAAGGAATTTGCAAAATGCCATTCTGCAGAAAGCCAGGGTATAAGCTTAAGAATGACCTCTGGTTCCAAATTGCAGACCCAGACTTGGATCAAAAAGTGAAGGATCTACCACACATAAAAGACTGTGACCTTTCTTCCTCTATCATCACCCCAGGGGAACATGCAACAGACATATCTCTAATATCAGATGTGGAACGGATACTTGATTATGCTCTTTGTCAAAATACCTGGAGCAAGATTGAAGCAGGAGAACCAATTACTCCTGTAGACATCAGCTATCTAGGACCTAAAAACCCTGGCGTTGGGCCGGTTTTCACAATCATCAACGGCTCACTACATTACTTTACCTCCAAGTATCTACGAGTTGAGTTAGAAAATCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAAAGTTGCGGGGACCCGAATTGTTCGTCAACTGTGGGACCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCAGAGATTGGACCTAATGGTGTTCTGAAAACCAAGCAAGGATATAAATTCCCATTGCACATCGTTGGGACTGGGGAAGTCGACAATGACATCAAAATGGAAAGGATTGTAAAGCATTGGGAGCACCCACACATAGAAGCTGCTCAGACGTTCTTAAAAAAAGATGACACAGAGGAGGTAATCTATTATGGGGACACTGGAGTATCCAAAAATCCCGTTGAATTAGTAGAGGGATGGTTCAGCGGTTGGAGAAGCTCAATCATGGGAGTGTTGGCTGTGATCATAGGTTTTGTAATCTTAATATTTTTAATTAGATTGATTGGACTGATGTCCAATTTCTGTAAACCAAGAAGAGGGCCAATCTACAAATCCGACGTAGAAATGGCTCACTTCCGGTAATCTATGAAAAAAACTGGGTTACACAAATAAATACAACAGGAATCAAAATGGATTTCGATCTAATTGAAGATTCTACTAACTGGGGAGAGGATGAATCGGACTTTCTTCTGCGAGATATTTTGTCACAGGAGGATCAGATGTCTTACTTGAACTCTGCTGATTATAATCTGAATTCCCCACTCATATCGGATGACATGGTTTATTTAGTCAAGCGGATGAACCATGAAGAAGTACCTCCCATCTGGAGATCAAAGGAATGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTCGGGGTTGTCAGGCTCAGCCCATATCTCATCAAGACATGCATAACTGGTTTGGAACATGGATTCAAAACATCCAACATGATTCTGCTCAAGGGTTTACATTTTTAAAAGAAGTTGACAAAGAAGCAGAAATGACCTATGACTTAGTCTCAACTTTCCTGAA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| 83,711
|
KP688353.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L.
|
National Veterinary Services Laboratories, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2015-07-06
| null |
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
GenBank
| null |
USA: TX
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2014-06-11
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus strain Texas/NJ18826/2014, complete genome
|
ACGAAGACAAAAAAACCATTCTTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCCATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAATGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATCTTCGACCTAGTGAAAGTTGAAGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTCACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATAAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGATGAGCTGTGCCAGATGATGTATCCGGGCCAGGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTGTCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACCCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCAACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAAAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAATTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCAGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCCGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGAAAACGGAGGAGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAGAGTTCAGACGGACCAATGGATGAAGACAATTGAGGCAGTCTGCGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCAAATTATGAACTCAGGTAATTGTCTTATCCTCAAAGGCAGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAAAAATCCATGCAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCGCCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCTAAGAGGGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTCTTTAGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCAATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAAAAGTCACAAGAAATCAAAGAAATTAGGATTGCCACCTCCCTATGATGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGACAAGGACTCCTTGAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAACCCTTCAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGGAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTCAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCGTTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTCGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCACATTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCTCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTTTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTCGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCACTCTATACATAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAAAGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAGTGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGGAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATGAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCGTTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGATCCAGATTTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCGTCATAAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAGAGTTGCAGGAACTAGAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCCAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGACAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCACATTGAAGCCGCTCAGACTTTTTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTTGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCTAGTCTTTTTAGACAAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGGCCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGCTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCGGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGGGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCAACCCATATCCCATCAGGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAAT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| 86,734
|
KP202364.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Killian,M.L., Koster,L.G., Jenkins-Moore,M.M., Swenson,S.L.
|
National Veterinary Services Laboratories (NVSL), USDA, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2015-04-07
| null |
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
GenBank
| null |
USA: Colorado
|
USA
|
Equus caballus
| null |
2014-07-09
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus strain Colorado/21793/2014, complete genome
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ACGAAGACAAAAAAACCATTCTTGCAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCCATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAATGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATCTTCGACCTAGTGAAAGTTGAAGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTCACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATAAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGATGAGCTGTGCCAGATGATGTATCCGGGCCAGGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTGTCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACCCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCAACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAAAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAATTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCAGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCCGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGAAAACGGAGGAGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAGAGTTCAGACGGACCAATGGATGAAGACAATTGAGGCAGTCTGCGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCAAATTATGAACTCAGGTAATTGTCTTATCCTCAAAGGCAGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAAAAATCCATGCAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCGCCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCTAAGAGGGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTCTTTAGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCAATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAAAAGTCACAAGAAATCAAAGAAATTAGGATTGCCACCTCCCTATGATGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGACAAGGACTCCTTGAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAACCCTTCAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGGAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCGTTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTCGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCACATTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCTCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTTTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTCGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCACTCTATACATAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAAAGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAGTGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGGAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGGGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATGAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCGTTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGATCCAGATTTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCGTCATAAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAGAGTTGCAGGAACTAGAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCCAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGACAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCACATTGAAGCCGCTCAGACATTTTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTTGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCTAGTCTTTTTAGACAAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGGCCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGCTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCGGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGGGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCAACCCATATCCCATCAGGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAAT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| 87,264
|
KM012169.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Killian,M.L., Koster,L.G., Jenkins-Moore,M., Swenson,S.L.
|
National Veterinary Services Laboratories, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2014-09-24
| null |
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
GenBank
| null |
USA: Texas
|
USA
|
Equus caballus
| null |
2014-05-20
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus strain Texas/16313/2014, complete genome
|
ACGAAGACAAAAAAACCATTCTTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCCATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAATGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATCTTCGACCTAGTGAAAGTTGAAGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTCACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATAAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGATGAGCTGTGCCAGATGATGTATCCGGGCCAGGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTGTCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACCCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCAACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAAAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAATTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCAGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCCGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGAAAACGGAGGAGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAGAGTTCAGACGGACCAATGGATGAAGACAATTGAGGCAGTCTGCGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCAAATTATGAACTCAGGTAATTGTCTTATCCTCAAAGGCAGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAAAAATCCATGCAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCGCCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCTAAGAGGGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTCTTTAGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCAATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAAAAGTCACAAGAAATCAAAGAAATTAGGATTGCCACCTCCCTATGATGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGACAAGGACTCCTTGAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAACCCTTCAGATCGTATGATGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGGAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCGTTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTCGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCACATTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCTCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTTTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTCGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCACTCTATACATAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAAAGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAGTGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGGAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATGAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCGTTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGATCCAGATTTGGATAAAACAGTTAGAGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCGTCATAAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAGAGTTGCAGGAACTAGAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAAAGGCTGAGATTGGACCCAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGACAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCACATTGAAGCCGCTCAGACATTTTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTTGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCTAGTCTTTTTAGACAAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGGCCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGCTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCGGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGGGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCAACCCATATCCCATCAGGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAAT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| 88,934
|
KC905171.1
|
Vesicular stomatitis New Jersey virus
|
Koster,L.
|
National Veterinary Services Laboratories, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2013-08-07
| null |
Vesiculovirus newjersey
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,123
|
GenBank
| null |
USA: NM
|
USA
|
Equus caballus
|
swab
|
2012-05-24
| null | null |
Vesicular stomatitis New Jersey virus strain NJ2075212NM, complete genome
|
ACGAAGACAAACAAACCATTCTTACAATTATTTGGCCTAGAGGGAACTTTTAACAGATATCAAAATGGCTCCTACAGTTAAGAGAATCATTAACGACTCCATTATTCAGCCTAAGTTACCGGCTAATGAGGATCCGGTTGAATACCCGGCTGATTACTTCAAAAATAATACCAATATAGTATTATATGTAAGCACCAAAGTGGCACTAAATGATTTGAGAGCATACGTATACCAGGGAATCAAGTCCGGTAATCCATCCATACTCCACATAAATGCTTATCTCTACGCAGCATTAAAGGGAGTGGAAGGAACTTTAGACAGAGACTGGGTTAGCTTTGGAAGAACAATTGGAAAGAGAGAGGAGAATGTGAAAATCTTCGACCTAGTGAAAGTTGAAGAACTGAAGACAGCACTTCCTGATGGGAAATCAGACCCTGACCGTTCTGCTGAGGATGATAAATGGCTTCCCATCTACATCCTAGGTCTTTACAGAGTGGGCAGATCTAAAGTCACGGATTACAGAAAGAAACTACTGGACGGGCTTGAAAATCAGTGCAAAGTGGCGTCAACCAGATTTGAGAGTCTAGTCGAGGATGGTCTCGACTTCTTTGACATATGGGAGAATGATCCAAATTTCACCAAGATAGTTGCTGCAGTGGATATGTTCTTCCACATGTTTAAAAAGCATGAACGTGCTCCAATAAGATACGGAACCATAGTCTCAAGATTCAAGGACTGTGCAGCACTTGCGACATTCGGACATCTCAGCAAAGTCAGTGGACTCTCAATTGAGGAACTCACAACATGGGTCCTGAATAGGGAAGTTGCAGATGAGCTGTGCCAGATGATGTATCCGGGCCAGGAAATTGACAAAGCAGATTCATACATGCCGTATATGATTGACTTTGGGTTGTCTCAGAAATCCCCATATTCATCAGTGAAGAATCCAGCTTTTCATTTCTGGGGACAACTTGCTGCACTCTTGCTAAGATCAACCCGGGCAAAAAATGCTAGACAGCCTGACGACATCGAATACACTTCACTAACTTGTGCAAGTTTACTGCTGTCATTTGCTGTTGGGTCCTCAGCAGACATTGAACAGCAATTCTATATTGGAGAAGACAAATACACAACAGAAAAAGATGATGGTCTTAAGAAATCAGATGTCCCACCAAAAGGAAGAAATGTCGTGGACTGGCTTGGCTGGTATGATGACAATGGGGGAAAACCAACACCAGATATGCTCAACTTCGCAAAAAGAGCAGTCAACTCTCTGCAGTCACTTCGTGAGAAGACAATTGGCAAATATGCCAAGGCAGAATTTGACAAGTGACAAAATTTAAGATACCACTATCACTATTATATTCTATGTTATATATGAAAAAAACTAACAGAGATCATGGACAGTATTGATCGGCTCAAAACTTACTTGGCTACTTATGATAATTTGGATTCTGCCTTGCAGGATGCAAATGAATCTGAAGAAAGAAGAGAGGATAAATATCTCCAAGACCTCTTCATCGAAGATCAAGGAGATAAACCAACTCCGTCATATTATCAGGAAGAAGAATCGTCAGATTCAGATACTGACTATAATGCTGAACATCTTACGATGTTGTCGCCGGATGAAAGAATAGACAAATGGGAAGAGGATTTGCCAGAATTGGAAAAGATTGATGATGATATACCAGTCACTTTTTCCGATTGGACACAACCTGTAATGAAGGAAAACGGAGGAGAGAAATCACTATCTCTGTTTCCTCCGGTTGGATTAACAAGAGTTCAGACGGACCAATGGATGAAGACAATTGAGGCAGTCTGCGAGAGCTCTAAATATTGGAATTTGTCAGAATGCCAAATTATGAACTCAGGTAATTGTCTTATCCTCAAAGGCAGAGTTATGACTCCTGACTGCAGTTCATCAATCAAATCTCAAAAATCCATGCAGAGTTCCGAATCTCTCTCCTCCTCGCATTCACCCGGTCCAGCGCCAAAAGTCACGGAGTCAACTAGTCTATGGGACTTAAAATCAACAGAAGTACAACTGATCTCTAAGAGGGCCGGAGTGAAAGACATGATGGTGAAATTGACAGACTTCTTTAGAAGTGAAGATGAATATTATTCAGTATGCCCAGAAGGGGCACCAGACTTGATGGGAGCAATCATCATGGGACTAAAACATAAAAAACTCTTTAATCAGGCAAGAATGAAGTATCGTCTCTAATTAATTCCAATGATCGATATGAAAAAAACTAACAGAATTCAAAATGAGTTCCTTCAAAAAGATTCTGGGACTTTCTTCGAAAAGTCACAAGAAATCAAAGAAATTAGGATTGCCACCTCCCTATGACGAATCAAGTCCGATGGAGATTCAACCATCTGCCCCATTATCCAATGATTTCTTCGGAATGGAGGATATGGACTTATATGACAAGGACTCCTTGAGATATGAGAAGTTCCGTTTTATGTTGAAGATGACTGTTAGATCTAACAAGCCCTTCAGATCGTATGACGATGTCACTGCAGCTGTATCACAGTGGGATAATTCATACATTGGAATGGTTGGGAAGCGTCCTTTCTACAAGATCATTGCTCTGATTGGCTCCAGTCATCTACAAGCAACTCCAGCTGTGTTGGCAGACTTGAATCAACCAGAATATTACGCCACACTAACAGGTCGGTGTTTTCTTCCTCACCGACTAGGATTGATCCCACCGATGTTTAATGTGTCCGAAACTTTCAGAAAACCGTTCAATATCGGAATATACAAAGGGACACTTGACTTCACCTTTACGGTTTCAGATGATGAGTCTAATGAAAAAGTCCCTCACATTTGGGAATACATGAACCCAAAATATCAATCTCAGATACAGAAAGAAGGGCTTAAATTCGGATTGATTTTAAGCAAGAAAGCAACGGGAACCTGGGTTTTGGACCAATTGAGTCCGTTTAAATAATCAATCCACCTTTAATAATTGGAATATCTAATACTCTTTCTGGTCGTGGACTATGAAAAAAACTAACAGACATCAATATGTTGTCTTATCTAATTCTTGCAATTATTGTTTCGCCTATTTTAGGCAAAATTGAAATCGTCTTCCCTCAGCATACTACTGGAGATTGGAAGAGGGTTCCTCATGAATACAATTACTGTCCCACTAGTGCAGATAAAAACTCACATGGGACTCAGACAGGAATTCCTGTTGAGCTAACAATGCCCAAGGGACTAACAACACATCAGGTTGATGGGTTTATGTGTCACTCTGCTTTATGGATGACCACTTGTGATTTCAGATGGTATGGACCTAAATACATAACCCACTCTATACATAATGAGGAGCCTACAGATTACCAATGTTTGGAAGCCATCAAGGCATATAAAGATGGTGTTAGCTTTAATCCAGGGTTCCCTCCTCAGAGCTGTGGGTATGGTACGGTCACGGACGCTGAAGCCCATATTATAACAGTCACTCCTCACTCTGTTAAAGTAGATGAGTACACTGGAGAGTGGATTGACCCACATTTCATCGGGGGAAGATGCAAGGGCAAAATTTGTGAAACAGTCCACAACTCCACAAAATGGTTTACATCTTCAGATGGAGAAAGTGTCTGTAGTCAATTATTCACTCTAGTTGGAGGAACTTTTTTCTCTGACTCAGAGGAAATTACTTCAATGGGACTACCAGAAACAGGGATGAGGAGTAATTATTTTCCTTACATATCCACAGAGGGAATATGCAAGATGCCGTTCTGCAGAAAGCCAGGGTACAAACTTAAGAATGACCTCTGGTTTCAGATCACGGATCCAGATTTGGATAAAACAGTTAGGGATCTTCCGCACATCAAAGATTGTGATCTCTCCTCATCCATTATAACACCAGGGGAACATGCAACAGACATATCCCTGATATCAGATGTGGAAAGAATCCTGGATTATGCTCTTTGTCAAAACACATGGAGCAAAATTGAAGCCGGAGAACCAATCACTCCTGTAGATCTCAGCTACCTTGGACCAAAGAATCCCGGAGTAGGCCCGGTTTTTACCGTCATAAATGGTTCTTTGCATTACTTCACATCAAAATATCTGCGTGTGGAACTGGAAAGTCCTGTTATACCCAGAATGGAAGGGAGAGTTGCAGGAACTAGAATTGTGCGGCAATTGTGGGATCAATGGTTCCCTTTTGGAGAGGCTGAGATTGGACCCAATGGTGTGTTGAAGACCAAGCAAGGATACAAATTCCCATTACACATCATTGGAACAGGAGAGGTAGATAGTGACATCAAAATGGAGAGGATTGTTAAACACTGGGAACACCCCCACATTGAAGCCGCTCAGACATTTTTAAAAAAAGATGATACAGAAGAAGTCATCTATTATGGCGACACAGGGGTATCAAAAAACCCAGTTGAGTTAGTTGAGGGCTGGTTTAGTGGATGGAGGAGCTCTATCATGGGAGTGGTGGCTGTGATTATCGGATTCGTGATTTTAATATTTTTAATTAGACTGATTGGAGTCCTATCCAGTCTTTTTAGACAAAAAAGAAGGCCAATTTATAAATCGGATGTAGAGATGGCCCACTTCCGTTAAAATATGAAAAAAACTAAATTAAACACACAGCCTCAACAGGAATCAAAATGGAGCTCGACTTAATCGAAGATTCTACCCACTGGGAGGAAGAGGAGTCAGATTTTCTCCTGCGTGACATCTTATCGCAAGAGGATCAGATGTCTTATTTGAACTCTGCGGATTATAATTTGAACTCTCCGCTCATATCAGATGACATGGTTTATCTAATTAAAAGGATGAATCATGAAGAGGTTCCCCCCATTTGGGGATCCAAAGAGTGGGATTCTCCTCTTGACATGCTTAAAGGTTGTCAAGCTCGACCCATATCCCATCAGGATATGCACAATTGGTTTGGAACTTGGATTCAAAATATTCAACACGATTCAGCTCAAGGTTTCACATTCTTAAAAGAGGTGGACAAAGAGGCAGAAAT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| 93,536
|
OR995580.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Alkayyal,A.A., Darwish,M., Ajina,R., Alabbas,S.Y., Alotaibi,M.A., Alsofyani,A., Bokhamseen,M., Hakami,M., Albaradie,O.A., Moglan,A.M., Hala,S., Alsahafi,A.F., Zakri,S., Almuzaini,A., Alsharari,K., Kaboha,F., Taher,M.Y., Zein,H.S., Alroqi,F., Mahmoud,A.B., Mahmud,A.B.
|
University of Tabuk, Medical Laboratory Technology
|
Saudi Arabia
|
2024-01-22
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,751
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Mutant Vesicular stomatitis virus clone recombinant VSVdM51-RBD, complete genome
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ATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCGTAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTTTACATCAATACTACAAAAAGTTTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGATAAAGATTGGTCAAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAAGCAGGGGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGTTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGAATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAAATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCCACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAGCCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTCGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCGAAAAGAGCAGTCATGTCACTGCAAGGCCTAAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATATTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTATTCTCGTCTGGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGCTGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGATGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGCACCAGATCCAGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAGGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCGGACTGGAAACAGCCTGAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATCGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTGCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTGGCAGAGTGCACATTTGAAGCATCGGGAGAAGGGGTCATTATGAAGGAGCGCCAGATAACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCAGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCAAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCAGCCTCTCACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAGTTCATCTCTGTCGGAGGTGACGGACGAATGTCTCATAAAGAGGCCATCCTGCTCGGCCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCGGCGCGCCTCGAGCCCGGGCGGCCGCATGCCTAGGCTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACGATCTAAGTGTTATCCCAATCCATTCATCATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGTCTGAAGGGGAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGGACACCTATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAAATGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCTTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGCGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGGATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTCAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTCACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCGTGGGTCCTGGACTCTATCGGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAACTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTCTCCCCTAATTCCAGCCTCTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTCTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTACGCGTATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCCTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAAAAAGGAAACTGGAAAAATGTTCCTTCTAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCTCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCCGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTGGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATTACATATGCCCCACTGTCCATAACTCTACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCATGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCCCTGGGAAAGGAGGGCACAGGGTTCAGAAGTAACTACTTTGCTTATGAAACTGGAGGCAAGGCCTGCAAAATGCAATACTGCAAGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTCTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTAATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGAGCGGGTCTTCCAATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGTCCTGCTTTCACCATAATCAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGAGTCGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATACATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAAGACGCTGCTTCGCAACTTCCTGATGATGAGAGTTTATTTTTTGGTGATACTGGGCTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAAGGTTGGTTCAGTAGTTGGAAAAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATCCATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGACATAGAGATGAACCGACTTGGAAAGTAAGCTAGCTGTATGAAAAAAACTCATCAACAGCCATCATGAGGGTCCAACCAACAGAGAGCATTGTGAGGTTTCCAAACATCACCAACCTGTGTCCATTTGGAGAGGTGTTCAATGCCACCAGGTTTGCCTCTGTCTATGCCTGGAACAGGAAGAGGATTAGCAACTGTGTGGCTGACTACTCTGTGCTCTACAACTCTGCCTCCTTCAGCACCTTCAAGTGTTATGGAGTGAGCCCAACCAAACTGAATGACCTGTGTTTCACCAATGTCTATGCTGACTCCTTTGTGATTAGGGGAGATGAGGTGAGACAGATTGCCCCTGGACAAACAGGCAAGATTGCTGACTACAACTACAAACTGCCTGATGACTTCACAGGCTGTGTGATTGCCTGGAACAGC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CCCTCTTGCAAATCCTATACAAGCCATTTTTATCTGGGAAAGATAAGAATGAGTTGAGAGAGCTGGCAAATCTTTCTTCATTGCTAAGATCAGGAGAGGGGTGGGAAGACATACATGTGAAATTCTTCACCAAGGACATATTATTGTGTCCAGAGGAAATCAGACATGCTTGCAAGTTCGGGATTGCTAAGGATAATAATAAAGACATGAGCTATCCCCCTTGGGGAAGGGAATCCAGAGGGACAATTACAACAATCCCTGTTTATTATACGACCACCCCTTACCCAAAGATGCTAGAGATGCCTCCAAGAATCCAAAATCCCCTGCTGTCCGGAATCAGGTTGGGCCAATTACCAACTGGCGCTCATTATAAAATTCGGAGTATATTACATGGAATGGGAATCCATTACAGGGACTTCTTGAGTTGTGGAGACGGCTCCGGAGGGATGACTGCTGCATTACTACGAGAAAATGTGCATAGCAGAGGAATATTCAATAGTCTGTTAGAATTATCAGGGTCAGTCATGCGAGGCGCCTCTCCTGAGCCCCCCAGTGCCCTAGAAACTTTAGGAGGAGATAAATCGAGATGTGTAAATGGTGAAACATGTTGGGAATATCCATCTGACTTATGTGACCCAAGGACTTGGGACTATTTCCTCCGACTCAAAGCAGGCTTGGGGCTTCAAATTGATTTAATTGTAATGGATATGGAAGTTCGGGATTCTTCTACTAGCCTGAAAATTGAGACGAATGTTAGAAATTATGTGCACCGGATTTTGGATGAGCAAGGAGTTTTAATCTACAAGACTTATGGAACATATATTTGTGAGAGCGAAAAGAATGCAGTAACAATCCTTGGTCCCATGTTCAAGACGGTCGACTTAGTTCAAACAGAATTTAGTAGTTCTCAAACGTCTGAAGTATATATGGTATGTAAAGGTTTGAAGAAATTAATCGATGAACCCAATCCCGATTGGTCTTCCATCAATGAATCCTGGAAAAACCTGTACGCATTCCAGTCATCAGAACAGGAATTTGCCAGAGCAAAGAAGGTTAGTACATACTTTACCTTGACAGGTATTCCCTCCCAATTCATTCCTGATCCTTTTGTAAACATTGAGACTATGCTACAAATATTCGGAGTACCCACGGGTGTGTCTCATGCGGCTGCCTTAAAATCATCTGATAGACCTGCAGATTTATTGACCATTAGCCTTTTTTATATGGCGATTATATCGTATTATAACATCAATCATATCAGAGTAGGACCGATACCTCCGAACCCCCCATCAGATGGAATTGCACAAAATGTGGGGATCGCTATAACTGGTATAAGCTTTTGGCTGAGTTTGATGGAGAAAGACATTCCACTATATCAACAGTGTTTAGCAGTTATCCAGCAATCATTCCCGATTAGGTGGGAGGCTGTTTCAGTAAAAGGAGGATACAAGCAGAAGTGGAGTACTAGAGGTGATGGGCTCCCAAAAGATACCCGAATTTCAGACTCCTTGGCCCCAATCGGGAACTGGATCAGATCTCTGGAATTGGTCCGAAACCAAGTTCGTCTAAATCCATTCAATGAGATCTTGTTCAATCAGCTATGTCGTACAGTGGATAATCATTTGAAATGGTCAAATTTGCGAAGAAACACAGGAATGATTGAATGGATCAATAGACGAATTTCAAAAGAAGACCGGTCTATACTGATGTTGAAGAGTGACCTACACGAGGAAAACTCTTGGAGAGATTAA
| 9,559
|
OR995581.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Alkayyal,A.A., Darwish,M., Ajina,R., Alabbas,S.Y., Alotaibi,M.A., Alsofyani,A., Bokhamseen,M., Hakami,M., Albaradie,O.A., Moglan,A.M., Hala,S., Alsahafi,A.F., Zakri,S., Almuzaini,A., Alsharari,K., Kaboha,F., Taher,M.Y., Zein,H.S., Alroqi,F., Mahmoud,A.B., Mahmud,A.B.
|
Taibah University, Medical Laboratory Technology
|
Saudi Arabia
|
2024-01-22
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,041
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Mutant Vesicular stomatitis virus clone recombinant VSVdM51, complete genome
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ATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCGTAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTTTACATCAATACTACAAAAAGTTTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGATAAAGATTGGTCAAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAAGCAGGGGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGTTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGAATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAAATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCCACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAGCCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTCGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCGAAAAGAGCAGTCATGTCACTGCAAGGCCTAAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATATTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTATTCTCGTCTGGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGCTGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGATGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGCACCAGATCCAGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAGGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCGGACTGGAAACAGCCTGAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATCGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTGCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTGGCAGAGTGCACATTTGAAGCATCGGGAGAAGGGGTCATTATGAAGGAGCGCCAGATAACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCAGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCAAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCAGCCTCTCACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAGTTCATCTCTGTCGGAGGTGACGGACGAATGTCTCATAAAGAGGCCATCCTGCTCGGCCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCGGCGCGCCTCGAGCCCGGGCGGCCGCATGCCTAGGCTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACGATCTAAGTGTTATCCCAATCCATTCATCATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGTCTGAAGGGGAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGGACACCTATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAAATGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCTTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGCGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGGATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTCAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTCACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCGTGGGTCCTGGACTCTATCGGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAACTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTCTCCCCTAATTCCAGCCTCTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTCTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTACGCGTATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCCTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAAAAAGGAAACTGGAAAAATGTTCCTTCTAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCTCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCCGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTGGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATTACATATGCCCCACTGTCCATAACTCTACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCATGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCCCTGGGAAAGGAGGGCACAGGGTTCAGAAGTAACTACTTTGCTTATGAAACTGGAGGCAAGGCCTGCAAAATGCAATACTGCAAGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTCTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTAATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGAGCGGGTCTTCCAATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGTCCTGCTTTCACCATAATCAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGAGTCGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATACATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAAGACGCTGCTTCGCAACTTCCTGATGATGAGAGTTTATTTTTTGGTGATACTGGGCTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAAGGTTGGTTCAGTAGTTGGAAAAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATCCATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGACATAGAGATGAACCGACTTGGAAAGTAAGCTAGCCAGATTCTTCATGTTTGGACCAAATCAACTTGTGATACCATGCTCAAAGAGGCCTCAATTATATTTGAGTTTTTAATTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCACGATTTTGAGACCGACGAGTTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCCGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACCTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTAATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACATCATGTCAAGCCAATCCCATCTCAACATCTCAGATGCATAAATGGATGGGAA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| 9,560
|
OR921183.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Pauszek,S.J., O'Donnell,V., Faburay,B.
|
USDA, APHIS
|
USA
|
2023-12-20
|
IN88MRB
|
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,161
|
GenBank
| null |
Mexico
|
Mexico
|
Bos taurus
| null |
1988
| null | null |
Vesicular stomatitis virus isolate IN88MRB, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCAGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAACGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTTTACATCAATACTACAAAAAGTTTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGATAAAGATTGGTCAAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGGGACACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGATGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAGATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGAATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCTGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCGTATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCCACCAGAGCTAGGAATGCCCGACAGCCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTAACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTCGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCGAAAAGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAAGTCTCAGATCACCTATTATATATTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTATTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATCGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGACTCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAGAGGCCTTTAGACGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACCTCAGACTGGAAACAGCCTGAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTTGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTGGCAGAGTGCACATTTGAAGCATCGGGAGAAGGGGTCATTGTGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCTCAATCAGAATCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCAGCCTCTCACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCGTCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAAGAGGCCATCCTGCTTGGTCTGAGGTACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTTTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCAATCCATTCATCATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGTCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGATACTAGTATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAAATGACAGTTAGGTCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCTTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGCGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCATTTCAGAAGACCATTCAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTCACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCCTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTGATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGGTCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTCTCTCATAATTACAGCCTTTCGAACAACTAATATCTTGTCTTTTCTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCCGTTTCCTTGACACTATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCCTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAAAAAGGAAACTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTGCAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCAAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGGACTTGGCTGAACCCAGGTTTCCCTCCTCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCGACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCCACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTTATTTCCATGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCGTCCCTAGGAAAGGAGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACTACTTTGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATACAGTACTGCAAGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTCTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTGAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGAGCGGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCTTTCACCATAATCAATGGGACCCTAAAATACTTTGAAACCAGATACATCAGGGTCGAGATTGCTGCTCCGATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTAACACCGAGAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTATTCGAACATCCTCACATTCAAGACGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTATTTTTTGGTGATACTGGGCTATCCAAAAATCCAATCGAACTTGTAGAAGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTGATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTAGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAACACACTAAGAAAAGACAGATTTATACAGACATAGAGATGAACCGACTTGGAAAGTAACTCAAATCTTGCACAACAGATTCTTCATGCTTGAACCAGATCGACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAATTTTTAGTTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCCATTCTCTTCCAATCCCCTTGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACATCATGTCAAGCCAATCCCATCCCAACATCTC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| 10,154
|
OR712768.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Forcic,D., Mrsic,K., Peric-Balja,M., Kurtovic,T., Ramic,S., Silovski,T., Pedisic,I., Milas,I., Halassy,B., Ivancic-Jelecki,J., Savic-Mlakar,A.
|
University of Zagreb, Centre for Research and Knowledge Transfer in Biotechnology
|
Croatia
|
2023-11-06
|
CIPZB1-VSV-Indiana
|
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,161
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Vesicular stomatitis virus isolate CIPZB1-VSV-Indiana, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTATCATTAAAAGGCTCAGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTTTACATCAATACTACAAAAAGTTTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTGAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGATAAAGATTGGTCAAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGGGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGTGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGTTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAGGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGAATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCCACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAGCCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCTGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAGCAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTCGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCGAAACGAGCAGTCATGTCACTGCAAGGCCTAAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATATTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTATTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGCTGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAGGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAGGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGACGTGGATGTTGTATTCACTTCGGACTGGAAACAGCCTGAGCTTGAATCCGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTTGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAACACTGGAATCTGGCAGAGTGCACATTTGAAGCATCGGGAGAAGGGGTCATCATAAAAAAGCGCCAGATAACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCAAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCAGCCTCTCACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAAGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGGTACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCAATCCATTCATCATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGTCTGAAGGGGAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAACATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTTGACGAGATGGACACTCATGATCCGCATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAAATGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAGATCTTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACACAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTCAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGGTTGAGCTCACAATGACCATCTATGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGGTCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCCAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTCTCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTCTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATCGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAAAAAGGAAACTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTACGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCTCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGCGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCCACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCCGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCATGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGCTATCATCCCTAGGAAAGGAGGGCACAGGGTTCAGAAGTAACTACTTTGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAAGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTCTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGAGCGGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGTCCTGTCTTTACCATAATCAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGAGTCGATATTGCTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCTCCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTTGAACATCCTCACATTCAAGACGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTATTTTTTGGTGATACTGGGCTATCCAAAAATCCAATCGAGTTTGTAGAAGGTTGGTTCAGTAGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGACATAGAGATGAACCGACTTGGAAAGTAACTCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAATTTTTAATTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCACGATTTTGAGACCGACGAGTTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCCGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAATTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCGATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACATCATGTCAAGCCAATCCCATCTCAACATCTC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| 11,227
|
OK167013.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: AZ
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-04-23
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Arizona/11834/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTAGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,496
|
OK167014.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: AZ
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-05-21
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Arizona/14359/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTATAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTAGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCGTATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,497
|
OK167015.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: AZ
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-06-05
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Arizona/15902/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTAGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGACGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,498
|
OK167016.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: KS
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-06-17
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Kansas/16924/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCATGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,499
|
OK167017.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: KS
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-06-19
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Kansas/17164/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTCTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACTCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,500
|
OK167018.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: KS
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-06-26
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Kansas/17887/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTTGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,501
|
OK167019.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: OK
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-06
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Oklahoma/18783/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,502
|
OK167020.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: KS
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-06
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Kansas/18790-3/2020, complete genome
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ACGWAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCAGTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,503
|
OK167021.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: KS
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-06
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Kansas/18790-5/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCTCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTACCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,504
|
OK167022.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: KS
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-06
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Kansas/18790-9/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGCACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,505
|
OK167023.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: OK
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-04
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Oklahoma/18942/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACTCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGACCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,506
|
OK167024.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: KS
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-06
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Kansas/19017/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,507
|
OK167025.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: MO
|
USA
|
Equus caballus
|
tissue
|
2020-07-09
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Missouri/19331-1/2020, complete genome
|
ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCAGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAAAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTTTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCCACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,508
|
OK167026.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: MO
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-09
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Missouri/19331-3/2020, complete genome
|
ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCAGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAAAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGMTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTYGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,509
|
OK167027.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: KS
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-10
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Kansas/19593/2020, complete genome
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ACGWAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCAGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCAGGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATATAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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| 22,510
|
OK167028.1
|
Vesicular stomatitis virus
|
Koster,L.G., Killian,M.L., Franzen,K.M.
|
United States Department of Agriculture, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2022-10-29
| null |
Vesicular stomatitis virus
|
Vesiculovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,176
|
GenBank
| null |
USA: KS
|
USA
|
Equus caballus
|
oronasopharynx
|
2020-07-14
| null | null |
Vesicular stomatitis virus strain Kansas/19768/2020, complete genome
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ACGAAGACAAACAAACCATTATTACCATTAAAAGGCTCGGGAGAAACTTTAACAGTAATCAAAATGTCTGTTACAGTCAAGAGAATCATTGACAACACAGTCATAGTTCCAAAACTTCCTGCAAATGAGGATCCAGTGGAATACCCGGCAGATTACTTCAGAAAATCAAAGGAGATTCCTCTATACATCAATACTACAAAAAGTCTGTCAGATCTAAGAGGATATGTCTACCAAGGCCTCAAATCCGGAAATGTATCAATCATACATGTCAACAGCTACTTGTATGGAGCATTAAAGGACATCCGGGGTAAGTTGGACAAAGATTGGTCTAGTTTCGGAATAAACATCGGGAAGGCAGGAGATACAATCGGAATATTTGACCTTGTATCCTTGAAAGCCCTGGACGGCGTACTTCCAGATGGAGTATCGGATGCTTCCAGAACCAGCGCAGATGACAAATGGCTGCCTTTGTATCTACTTGGCTTATACAGAGTGGGCAGAACACAAATGCCTGAATACAGAAAAAAGCTCATGGATGGGCTGACAAATCAATGCAAAATGATCAATGAACAGTTTGAACCTCTTGTGCCAGAAGGTCGTGACATTTTTGATGTGTGGGGAAATGACAGTAATTACACAAAAATTGTCGCTGCAGTGGACATGTTCTTCCACATGTTCAAAAAACATGAATGTGCCTCGTTCAGATACGGAACTATTGTTTCCAGATTCAAAGATTGTGCTGCATTGGCAACATTTGGACACCTCTGCAAAATAACCGGGATGTCTACAGAAGATGTAACGACCTGGATCTTGAACCGAGAAGTTGCAGATGAGATGGTCCAAATGATGCTTCCAGGCCAAGAAATTGACAAGGCCGATTCATACATGCCTTATTTGATCGACTTTGGATTGTCTTCTAAGTCTCCATATTCTTCCGTCAAAAACCCTGCCTTCCACTTCTGGGGGCAATTGACAGCTCTTCTGCTCAGATCTACCAGAGCAAGGAATGCCCGACAACCTGATGACATTGAGTATACATCTCTTACTACAGCAGGTTTGTTGTACGCTTATGCAGTAGGATCCTCTGCCGACTTGGCACAACAGTTTTGTGTTGGAGATAACAAATACACTCCAGATGATAGTACCGGAGGATTGACGACTAATGCACCGCCACAAGGCAGAGATGTGGTCGAATGGCTAGGATGGTTTGAAGATCAAAACAGAAAACCGACTCCTGATATGATGCAGTATGCAAAACGAGCAGTCATGTCATTGCAAGGCCTGAGAGAGAAGACAATTGGCAAGTATGCTAAGTCAGAATTTGACAAATGACCCTATAATTCTCAGATCACCTATTATATACTATGCTACATATGAAAAAAACTAACAGATATCATGGATAATCTCACAAAAGTTCGTGAGTATCTCAAGTCCTACTCTCGTCTAGATCAGGCGGTAGGAGAGATAGATGAGATCGAAGCACAACGAGATGAAAAGTCCAATTATGAGTTGTTCCAAGAGGACGGAGTGGAAGAGCATACTAAGCCCTCTTATTTTCAGGCAGCAGATGATTCTGACACAGAATCTGAACCAGAAATTGAAGACAATCAAGGCTTGTATGTACCAGATCCGGAAGCTGAGCAAGTTGAAGGCTTTATACAAGGGCCTTTAGATGACTATGCAGATGAGGAAGTGGATGTTGTATTTACTTCAGACTGGAAACAGCCTAAGCTTGAATCTGACGAGCATGGAAAGACCTTACGGTTGACATTGCCAGAGGGTTTAAGTGGAGAGCAGAAATCCCAGTGGCTTTCGACGATTAAAGCAGTCGTTCAAAGTGCCAAATACTGGAATCTAGCAGAGTGCACATTTGAAACATCGAGAGAAGGGGTCATTATGAAAGAGCGCCAGATGACTCCGGATGTATATAAGGTCACTCCAGTGATGAACACACATCCGTCCCAATCAGAAGCCGTATCAGATGTTTGGTCTCTCTCGAAGACATCCATGACTTTCCAACCCAAGAAAGCAAGTCTTCCGCCTCTTACCATATCCTTGGATGAATTGTTCTCATCTAGAGGAGAATTCATCTCTGTCGGAGGTAACGGACGAATGTCTCATAAGGAGGCCATCCTGCTCGGTCTGAGATACAAAAAGTTGTACAATCAGGCGAGAGTCAAATATTCTCTGTAGACTATGAAAAAAAGTAACAGATATCACAATCTAAGTGTTATCCCTATCCATTCATAATGAGTTCCTTAAAGAAGATTCTCGGCCTGAAGGGAAAAGGTAAGAAATCTAAGAAATTAGGGATCGCACCACCCCCTTATGAAGAGGACACTAGCATGGAGTATGCTCCGAGCGCTCCAATTGACAAATCCTATTTTGGAGTGGACGAGATGGACACTCATGATCCGAATCAATTAAGATATGAGAAATTCTTCTTTACAGTGAAACTGACGGTTAGATCTAATCGTCCGTTCAGAACATACTCAGATGTGGCAGCCGCTGTATCCCATTGGGATCACATGTACATCGGAATGGCAGGGAAACGTCCCTTCTACAAAATCCTGGCTTTTTTGGGTTCTTCTAATCTAAAGGCCACTCCAGCGGTATTGGCAGATCAAGGTCAACCAGAGTATCACGCTCACTGTGAAGGCAGGGCTTATTTGCCACATAGAATGGGGAAGACCCCTCCCATGCTCAATGTACCAGAGCACTTCAGAAGACCATTTAATATAGGTCTTTACAAGGGAACGATTGAGCTTACAATGACCATCTACGATGATGAGTCACTGGAAGCAGCTCCTATGATCTGGGATCATTTCAATTCTTCCAAATTTTCTGATTTCAGAGAGAAGGCCTTAATGTTTGGCCTGATTGTCGAGAAAAAGGCATCTGGAGCTTGGATCCTGGATTCTGTCAGCCACTTCAAATGAGCTAGTCTAGCTTCTAGCTTCTGAACAATCCCCGGTTTACTCAGTATCTCCTAATTCCAGCCTTTCGAACAACTAATATCCTGTCTTTTTTATCCCTATGAAAAAAACTAACAGAGATCGATCTGTTTCCTTGACACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAGCTTTTTTATTCATTGGGGTGAATTGCAAGTTCACCATAGTTTTTCCACACAACCAGAAAGGAACCTGGAAAAATGTTCCTTCCAATTACCATTATTGCCCGTCAAGCTCAGATTTAAATTGGCATAATGACTTAATAGGCACAGCCTTACAAGTCAAAATGCCCAAGAGTCACAAGGCTATTCAAGCAGACGGTTGGATGTGTCATGCTTCCAAATGGGTCACTACTTGTGATTTCCGCTGGTATGGACCGAAGTATATAACACATTCCATCCGATCCTTCACTCCATCTGTAGAACAATGCAAGGAAAGCATTGAACAAACGAAACAAGGAACTTGGCTGAATCCARGCTTCCCTCCCCAAAGTTGTGGATATGCAACTGTGACGGATGCTGAAGCAGTGATTGTCCAGGTGACTCCTCACCATGTGCTTGTTGATGAATACACAGGAGAATGGGTTGATTCACAGTTCATCAACGGAAAATGCAGCAATGACATATGCCCAACTGTCCATAACTCCACAACCTGGCATTCTGACTATAAGGTCAAAGGGCTATGTGATTCTAACCTCATTTCCACGGACATCACCTTCTTCTCAGAGGACGGAGAGTTATCATCTCTAGGAAAGGGGGGTACAGGGTTCAGAAGTAACCACTTCGCTTATGAAACTGGAGACAAGGCCTGCAAAATGCAGTACTGCAGGCATTGGGGAGTCAGACTCCCATCAGGTGTTTGGTTCGAGATGGCTGATAAGGATCTCTTTGCTGCAGCCAGATTCCCTGAATGCCCAGAAGGGTCAAGTATCTCTGCTCCATCTCAGACCTCAGTGGATGTAAGTCTCATTCAGGACGTTGAGAGGATCTTGGATTATTCCCTCTGCCAAGAAACCTGGAGCAAAATCAGGGCAGGTCTTCCCATCTCTCCAGTGGATCTCAGCTATCTTGCTCCTAAAAACCCAGGAACCGGCCCTGCCTTCACTATAATTAATGGTACCCTAAAATACTTTGAGACCAGATACATCAGGGTTGATATTGTTGCTCCAATCCTCTCAAGAATGGTCGGAATGATCAGTGGAACTACCACAGAAAGGGAACTGTGGGATGACTGGGCACCATATGAAGACGTGGAAATTGGACCCAATGGAGTTCTGAGGACCAGTTCAGGATATAAGTTTCCTTTATATATGATTGGACATGGTATGTTGGACTCCGATCTTCATCTTAGCTCAAAGGCTCAGGTGTTCGAACATCCTCACATTCAGGATGCTGCTTCGCAGCTTCCTGATGATGAGACTTTGTTTTTTGGTGACACTGGGTTATCCAAAAATCCAATCGAGCTTGTAGAGGGTTGGTTCAGTGGTTGGAAGAGCTCTATTGCCTCTTTTTTCTTTATCATAGGGTTAATCATTGGACTATTCTTGGTTCTCCGAGTTGGTATTTATCTTTGCATTAAATTAAAGCACACCAAGAAAAGACAGATTTATACAGATGTAGAGATGAATCGACTTGGAAAGTAATCCAAATCCTGCACAACAGATTCTTCATGTTTGAACCAAATCAACTTGTGATATCATGCTCAAAGAGGCCTTAATTATATTTTAACTTTTAATTTTTTAATTTTTAAGTTTTATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGGAAGTCCATGATTTTGAGACCGACGAATTCAATGATTTCAATGAAGATGACTATGCCACAAGAGAATTCCTGAATCCTGATGAGCGCATGACGTACTTGAATCATGCTGATTACAACTTGAATTCTCCTCTAATTAGTGATGATATTGACAATTTGATCAGGAAATTCAATTCTCTTCCAATTCCCTCGATGTGGGATAGTAAGAACTGGGATGGAGTTCTTGAGATGTTAACGTCATGTCAAGCCAATC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Vibrio cholerae
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Vibrio phage pre-CTX, complete genome
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CCTTAGTGCGTATTAGGTGGGGCGGCATTATGTTGAGGGGCAGTCGTCAGTACCATTGCGTTAGCACTGACGGCCTCACTTGCAGCAGAACGTGGGCAGCTTGCTGAATCGTTCTGCCAAAGTGAGCCCGTAACATAATGCCCCTAATACGCATTAAGGCGGTATGTCAAAAATGACATACTCAGCCCCGCAGGGACTAGACCTAACGTTAGGTTCGTCGCTCACCGTTCTGATGCTACTGCATATCCAAGGCTGCTTTAGCACTCGCAGAAGTTCGCTTGATTGCTCAAGCGTTCCCTTCAGTGAAATGATCCTCTTTCCGATAGCGCCCGAAAAAACTCCCTTCGTCCTGCCAAGCCCATTTGGAAGTCTCAGCACACGCAGAGGGTAACAGCATTTGTCATGGATACGTTCAGCGCCCAAGGCGCGGCGAGAGTCGAGCAAGCCTCTTATACTGCGACAGCGGCAGGTGAGAACATAAGCGACGTAGCGTGCGGAGTCGCGTTGTTAGAGCCTGTCCGCTGTGGTAGACCCCCGTCTAGTATTACGGGGGTAAACTCTTAATTTATGCTTAATTCATTTCTAGCTTTATTGCTTTGGTGTCTTAGGTATAGGCCTTCGATTGTGATCATCAATGACGTGAGTTCCTCTGGTGTAAGATCATCAATAGCATGTCTTATTTTTTCTATTATTTCATTTCGCTTTGTCTCTTTTTCTCCAAGTATTTCATTTATTGATACTCCGAGTTTTTTTGATAATGCAAGTAATTCAGACGCTTTTGGTTCTGTTTTTCCTGATTCCCAGTTCATCACTGTTTTTGCTGTTGCTTTAGCTGCTGCTGCAACGTCACTTTGAGTTAGCCCTCTTTCCTCTCTAAGTCTTTTTAAGTTCGCATTAATCATTTTATCCCCCATGTTTGGTTTAATTATTTTCCCATTATAGGGAATGTTTTTTTATACAGTTACTTGACTAGTGCAAAGTTTTTACCTAGATTATGAAAAATATTTCCTCTTGACAGGTTTTTGGTGCATGGCGTTTGAACGGGTTTTGGATTTAAAAACAGGTAGAGAATCGTGGGTTGATTTTCTTCCTGCATCAACTTGGATTTCATCCGAGGACGCGCATTGGAAAAACTGGACGGGTCGCCGCCCCAATAACGCAACTTTAAGTGATTTAGGCTCTGATAAATCATACCGCCCTGAGGTTGTTGCCCGTAACCGCCATCTGTCATTCGTTTCTAATTCTTTAGAGACTTTAATTCCAACCAAGGTTGGTAAAAAAACTCGTTTTGTTAAGCACAGTCTGAGAATTAACATTCAGGACAGAACTGAATCTCATGCTGTTGCACCGTCTCCGGCTCTTTGCGTTCAGGTATCGCGCATACTAGGCCGTCATTATGATTTTGCTCGCCATATGCAGCGCGCTTTCACTGATTGCCTTTCTACTCGTACTGCGGTTGAGTCTTTTCGGGCGATTGAAGAGGCTCATGTGCGCCTTACTCAAAATGGTTATAGCTATGCCATGCCAGACGATGATTTGTGCGCTATGGCTAAAGATAAGGCGCATTATCACACTTTAGAATTGGCGAAGTACGACAGTGATATCGAGGGCAAATTTGCCAAGGTGTGTACTTTACTCTCTTTCTTGGGGCTTTCTTTTTCTGCTCCGATTATCAAGGCTAAACGCGAAAGTAACGAGCTTCACAGTTTGATTGCTCGCGCTTGCGATGAAACATGGCTACGCCGTCAGCTACGCAAAAAATGCGCTATTGAAGTTGAGCGAATCGCTCGTGATTTGGAATTGGTACAGCGCTCAAAACAGGCGTATTGCTCTGATTTCTCAGTGCATCGTCAACGCCAACAAAAGCGGCGTAACCGCGCCATGCTTGAATCAATGGTTGTCTTCAACAAGGAAGATCCCGACCAGTATTTCGAGCTCGCCGAACTGCACGACCACTCTATTGCTAACCCTGAAATTCGCCGTGGCGAGATGTTTGTTCGTCTGCGTGGTTTTGAGTCGATTGCCATTGAACAAGGACATTCGGCACTTTTTGTTACTTCCACGGCGCCTAGTCGCTTCCATGCGGTGAGTAAAGGTAAGGTTAACCAAGCTTGGTTGGATGCAGGAAAGCCAGACGCGAAAGCAGCACACACTCATTTGATGAGTGTTTGGAAGTCCTTCCGCAAGACCATTGATAAAGCGCAAATAAAAGTATACGGGATGCGAATTGTTGAGCCACATCAGGACGGCACGCCGCATCACCATATGCTTTTGTTTTGTATGCCCGAGCACACTCAATTCGTGGTTGAGGCATTCCGTCACCATTCACTAGCGGATTCACCAAACGAGAAAGGCGCTCAGAAGTACCGCTTTAAGGTTGAGCATATTGATTTTTCTCGCGGCTCTGCGGTGGGCTACGTGGCTAAGTACCTGTCTAAAAATATCGACGGTAAGCACATCGATACAGATAAGGGAACCAACCTTTCAGGCATTGAAGCGGCTGAACGTGTTACCGCCTTTGCTCGTGTGAATGGCATTCGACAATTTCAATTTATCGGAGGGGCTCCGGTGACTGTTTGGCGTCAGTTCCGCAAGCTACGTAATGAGTTTAAAGAGGATGATGCTTTGTTTACTGACCTAACTGAAACCGAGCATTTCTTGCTTGAGTCTATTCGCAAATCAGCCGATGAAGGCGATTGGAAAGCCTTCACCTATGCGATGGGCGGCGTGTTTGTTAAGCGCGGCGATGAAGAGGTTAAGGTGGCTTATGATGCGCCATCTACCGTTCAAAAGCTGCTTGAAAGTGGTGAATTATCAACGACTCGCTATGGTGATGCGGCTCACGCTCGCGCGGTGGGCTTGATGTTTAAGAAGGTGTTTTTGGCTACTCGCTTTGCTGACTTTGAAATTGAAAACAGAGCGAAATACTTATCAGCTCAAAAACGAATTATGTCTGGTGTCTCTGATTTCTTTGATGCGCTTGAGCTTGAAAAGGAATACGAGCGCATGAACGAAGAGGCCTACCAGCGCTATCTGCTGCGAGTTCAAATTGATGAGGAGCTTAATACCATGGTTCTTCTTGGCTGCACGGATGAGGAGATTAGCGCCTTTCTCAGTGTGGTTTCTCAGGCTGAGGCCGCTTTAGCGGCGTCTGTCTGAGCTTGGACTTGTGTCAATAACTGTCGTTTAAATAAATAGGAATGAAATATGAAGCTCGAAGGTTTGATTTTAGATAAAAGTGACATCATCGGTGAAGTTAAAAAACGGTTTGGCACCGAGCAAACGTTCACAGTAGGCAAGGTTAATCTTATCACCACCAATCCTACTCAAACTATCACCTTTCACGTAAGTGAAGAGCTTTGGAGTGATGGCAAGGGTGGGGATGCTCTCCTTTCTCTGGTGGGGCAGCGCACTTCATTTGATCTTGAATTTAAACAATCCAAGTATGGCGACACCGAAGGCCGCCACCGTGAAATCACGGGCTTTCATCTCTTCAAATTTCCCTCAGTTTCTCCAATGAAATCTTGATGGACTTAACTCATTACGTCTGGAACGAGGCGCTCTATTTCGCGGTGGTCAAGGCCGTTCTCGTTCTGTTCTTTACATCCTTTGGGATTGGCGCGGTTGCCAGTCTCATTTTATCCACGGTAAAGGAGAAGCTACATGTTTAGCTCACTGAAAAACAAACTTAATACCTTTAAAAGCACCCTTTCACTCGGGGTTTTCTTGCTGTTTTCCGCATTTGCTAACCAAGCACTCGCGGCTGCTGATACGGGTTTGGTCGCGGAAGTCACCAAAACACTGGGCACCAGTAAAGATACGGTGATTGCGCTTGGGCCGCTTATCATGGGCGTGGTGGGAGCAATTGTTCTGATTGTTACCGTGATTGGCTTAATTCGTAAGGCTAAATAGTGCTTGAGTTGTGGCTGGGTCTCTTTGGCTCAGCGGTCATCATTATCGGCTTTGTGTCGGGCTTATATTTGGTTTAAGGGAGGAGGGCGAGCGTTCGCCCTTTTTTATGCGCTATTTTCTACTGTTTTTGACATTGCTCTTTCTTTCTCCATCGGTAACAGCTTCCTCCATCAATTGTGATCCTAATACTACTACGTCACACCAGTTACTTTTCGGTTTTGGCTCTCCCATTGTGCAATCGGTGTTATTTGATGGCTGCATGCTTGATATTGAAAAAGATGACTATGGTTTTGTTTGGTCTTGTCTTTCAAATGAAAATGGGGACTATTGCAAGGGGTTCTACAAACCCCGTTTTACACAAGGGGTATCCCCGAACTGGCCGATGTGCGACTTGTCCGGAGCATCTGCAGAGCGCTGCATTTATCCTTATTGCCCTGAGGGGGAAGAGTGCGTTCCCTTGCCACCTTCACCGCCCAGTGATTCCCCTGTTGATGGGCTGAGCAGCTCGTTTAAGTCTGCGTTCAATCATGTCTATAAAAACCAATCAGAGATGGCTTCGACTCTCAATCATGTCAGTGGTCAGGTATCCCATTCTCAAGATATGGTTCAGCTCAATACGAAGTTTCACGCGGACCGTGTTCTTGAGAGTGTCACCGCAGTCAACAATCGTTTGGGTGGGCAAATGGAGTATCTTAAAGAAATCCGCATTGATGTTTGGGATACGCAACGGGAGGTCAGAAAAGCCAAGGATGAGCTTTACTCTCGTGTTGCATCTGTTGAATACCATGTCCTTAATAGTGAGTATGATGTCCTTCGGGCGATTGATGAACTTAAAGATTCACTCGGTGGGGTTGTCGTTCCGCCTAACCCAGACCAACCCAATCCCACGCCACCCGATAGCAGCAGCCCCAATTATACAGGGGCTCTTAATACCATCTCTAAAAAGCTCAATACCTTAGAGACGATTTCACAGCAACTCGACACCATGAACACGGCGCTATCAGGGCGCTGTAGTAACCCTGAACGCTGTCAGTTTCCGATACGAGAGGCCGAGACCGAGTTAGAAACGGCTCAGCAGAATTTAAAGC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| 87,067
|
MW507000.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Cano,I., Santos,E.M., Moore,K., Farbos,A., van Aerle,R., Stone,D.M., Tyson,P.A., Savage,J., Wood,G., Dodge,M.J., Woolford,G., Dixon,P.F., Feist,S.W., Way,K.
|
Centre for Environment Fisheries and Aquaculture Science (Cefas), International Centre of Excellence for Aquatic Animal Health
|
United Kingdom
|
2021-06-30
| null |
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,154
|
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
2006-05
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus strain UK-J167, complete genome
|
GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTACAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAGATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTGGACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGAATTCGTGAAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACTGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGCGACGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGAGGGAGATAGAAAGGTGGTTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTACAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAACACACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGTCAGGGCCACGAGCATCGAGGCGGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTCAAGGGGACCTTGATGACATGCTCTCTTCTCACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTAGCAGACACCCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCGTTCATCCTGACCGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGCATGACCATGATTGGGCTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACCTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAGGTCCATCCAAGAACGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTTGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCCGGACATCTGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTTCACAGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGGGGGGTCCGATGATGACGACTACCCCGAAGACTCCGACTGAGGGGCACTCCCGTCTCACAACCAACACAGATAGAAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAACGCAAGACAAACACCGAAATCACACAATGGCTGACATTGAGATGAGTGAGTCCTTGGTCCTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAAGAGACTAGACAACGCCCCCAAAGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCCACCTCAGGGTCTACCAGGCAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACCCTGGAAGAAATCATTGGACACTTCGTCCCCGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAGGAAAACGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGGTTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATTGCCATGAAGAAGTTCAAGCTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCTACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAACTAGAGTAGGGACAACACAACGCATCACACAGACAGAAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAACCAACAACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTAGTTCCTCCTCCTCACCTCACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGTAGAAACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATTTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTACACCACCCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGAACCCTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCCGTCGAAGAGGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCCGGAACCTCCTCTGTCCGACCTTGGTAGACCGAAAGGACCGACTCAGGCTTGAGACCACACTCTCACTAGATAGAAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAACAAGCTATACCCACAATGGAATGGAATACTTTCTTCTTGGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTTGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCTAACTGCAGGGACGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAGGACATAAACAGGGGACTGGTTTCCGTCCCAACCAAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGCGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATTGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAAACTGTCTCGTCAGGAGGCCACAGACGAGGCAAGCAAGGACCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATCGAAGGGGTCTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTACTGGGTCGGCGCCACACCCAAAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGGAAGACTGGATCAAGACTGACCTGGGAGACCTGATCCAGGTGACAGGACCGGGGGGCACGGGGAAACTGACTCCAAATAAGTGTGTCAACACTGATGTCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCACAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAGTGTCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGGCCCGGCAAGGCACACTATCTTCTAGACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAACAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTGGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCCGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCCACTGGAGTCTTTGGCCCTCATTGTCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTGCTGGTGCTTTGCTGTTGCTGCAGGGCGTCCCCTCCAACTCCAAACTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGATGGTCTGAGCACACCTGTCCGAGCGACCACTATTCCTCTCCTAGGTAGATAGAAAAAAAATGGCACCTTTATGACAAAGAAACATGACGACCCAACCAGCGCTCAGCACAACCAGCTTTTCTCCGCTCGTCCTCCGTGAGATGATCACACACAGACTCAAATTTGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCCCCGTGGACTTCTTTGAGACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCTCACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTTCTAGAGAGAACCTACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCTGAACTCGTCATCATTTCACATGCAGAGGTGGGGCTATTGACAAGAGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCGACGTCCCTCAGATAGAAAAAAAAGGCACTTTTGTTGTTTGAAATCCTACACTCAACAAAAAGCGACCCTACAGGGGGTAATACCTGACAAAACAAAGTTAGATCACCTCACAACAACCATGGAAATGTTTGAACTAGACCGGGAAGTACACCAGGAACGACTTCCTTCGGAATGTTCACTCAACTCTCCCCTAAACCTCTCCCTATCCCTCCAGCTCTTCGGGCGCTTGGCTCCCAAGACAGAGCACATAAGGTACCAAGCCGGGAGGATCAAGAGATGGCTCACAAGACAGCACCAGCTGGTGCACCTCAGAGAGCTCGAGATTGACTCAACAAGAATCCAAGGATACCTGATCCCCCATCTTTTGAAGACACAGAGCAATGAGTTAGGATCATCGGTGATGAAAAACTGGGGGATGGTCTCTAAGTACTACCTATCCCTGGGTTACACCCTTCCTCCAAAGGACAAGTTCGAGTTTCGAGAAGTTGCTCCTTACTGGAACTTGGCCTCACAGTTGAGAGAGGTCACATTAGAGAGCCAGAAGGTGGACGCCAGAGGGAAAGAAAAGAGAAAGTTGTACCAGGTGGAGGATGTAGAGTTCGAATTTAAAGAGGGGGTGGTGGTGATTCGCGCGGGTCCGGATGGACTCCTGAATGAGTTCCTTGGGGGGACAAAGCTTGGGGCAGTAACATATGTGGAGTACTTGGCCCTCTTCAAAATCATCAACCAAAGAGCACAAGCACTCCTGCTCACGGCCATCTGCCAGACCCTTGAACCCGATCTAGTTCCCCCCTGTAGTGGAATACTCTCCATCTATGCAGAGGTCGACTCCGTGCTCCGTCGGGCGGGACAATCCGCTATTGACTTGCTAAAACTGTGGGAACCTCTTGTTCTTACAAAACTGGGGGACGTACTCGGCGACAGATTCGGCCTTGAGGACGACTTCAAAGATACAATTAGGGGAGAGGCGAACAAATTGGCCAAGAGACTACATGTTACCAGATCCTACAAACGGATGATGAAGACTCTAGATCAGGAGACTAGGGCACAGGCTCTCTTCCAATACTTTGGACTGTTCAAACATTTCGCGTACCCCCGCGTCTATTCGAGAGAAACCATCGAGGCAATTCAGGAGGTCAGTGACAAACCAAGCGACTCATCTCCACTCAATTACCTAAGTGACCAATGCAAGATCAGGGAAGAATTCTACATCCGATACACCAAGGCCTATCACAGGGCACCAGCCATGAATCTGGGTCAACTAGGACAGGGTTCCTACCTACGCCAGGTTTTGGAAGCAGGAAAGATCCCCAACACCAAGAATGCCCTTTACTCACTCCTAGAGTGGTTCTTCGTTCGTTTTGAGAAGAGCATCGAGTGGCCACTCAGTGACACCCTATCCACTTTCCTCTCCGACAAGGCGATCACCCAAAATAGGGATGTCTGGTATGACGGGGGATCATCAGGAAGAGACACCACAGAAAAGAGACTACTTCTGAAGTTCATCAAGGAGAATGAAGACAGCGTGGAAAAGGTGATCCTCAAGGCCGATGAAATCTACGACAAAAAGGCAGATCAGATCATCGCACTGAAAGTCAAGGAGATGGAACTCAAAATCAAAGGTAGAGGATTTGGCCTGATGGCCTTTAGACCAAGACTTCTTCAGGTTCTCCGAGAGAGCATCGCCAAAAAGACCAGTAAATTATTCCCAGAAATCACCATGACCTTCTCAGACCTCGAGTTGAAGAAGAAAAAATTTCAACTTTCAAGGAAGAGTGATGACAGGAGAGGATATATCCATATCAGCAAAAGTCTCGATATAAACAAGTTTTGCACCAGTCAACGCCAATTCAACTCCCTGGCGGTTTTCCAGAGTCTAGATGAACTTCTGGGGACGGATCAGCTCTTCACGAGAGTGCACGAGATCTTCGAAAAAACATGGATTGTGGACGGATCCGCCAGTGACCCCCCAGATCTGGTGACGTTCAAGGCCAGGTATGAAGAGGCACTGGCCCTAGGGATAGAGGCCCCGCACGTATGGGCAGATGGAGCATTCTCTGGACTGATGGGTGGAATTGAGGGTCTCTGCCAATACGTCTGGACAATCTGTCTATTACTCCGGGTGGAACGCGTCCTCGCTGTGACACAACTGACCCATTTTGTCATGGCGCAAGGAGACAACGTAATCATCAACCTCATCATCCCTGTCGAGGTGGACCGGGTGGGTGGGGTTGTCGAAGGAGAACGCGCCAGAATTCAACACATCAGCAAAGACATCGATTCCGCTCTCGAACGAGAGCTGCTAAGGAGTGGCCTGACTCTTAAGATAGAAGAGACCCTGACCAGTGAAAACCTCTCAATCTATGGAAAAGACCTCCATTGCCCGCAACACCTTACCCTTGCCGTGAAGAAGGCAGGATCCGCCTCTATCATATCAAGCGAACAATATCAAGACGTACCCACATTTCTTTCAGGCCTAGGAACGGGAATGGAGACAATCTCAGAGTGTGTCAACAACAAAGTGAGTGCTCATTTGTTCGGGGTCATTCTGGGAGCGGCTGGATGGAAGAGCCTCGCACAGAGACAAACGTGGAAAGGGTGGGAATACCCCTTTCAGAATGAGGCCACCCGGAGACAGGTCAGGTCACAAGGAATCCTTCTTCAAAAAGGGGAGTCCACAATGGTCCACAAGGAGCCCGAGGTCAACCCAGAAAAACGGACTATAGAGCTACTCCTGGTGAGCAGTCTCTTCGGGTCAGCTCTGGGGATGCTCCCCTTTCCCACCCCCATTGACCTCGAGAAAAGAGGTGTGGGAGACTACGTTACTCACCGGCTCTCGATCATCAAGATGGCCCTGGTCTCCAAAAAACTCCCAAACAGGATGGTCGAGATGATTGTCTCGACCATGAACCTTCCTCTTTCCCGAGAACAGGACCTCACGAAATTATTCGATTCCCCATTCTCCCTCAATCTTGCCACAGAGGAAGACGCTGCATCTGTGATTAAGAGACTCGCAAGGGGCACATTGAGGGGGCTCGACATCAAAAACAAAAAACTGGCAGATCACATAGCCACCATGGATCAGGGAATAACCCAAATTGACGACGCACTGGCCAGTGCAGACACAATCAACCCCCGAATTGCCTACCAATTTCGAAACATCACAGATCAGAAAGAATCCGAGATGTTCGTCACCAAATTCGCCACCGCAAAAACCATGCGAATGGTTGCTCTATCTTCGTCCCAAGATGTCTCAGTTGTGGGACTTCTGAACAAGCGCAGCCAGGCAAAGGAGATCTACACCATTTGGCGGACACAGAGGAAGGGGGAGACACTCTGGACATGCTCGACTAAACAGGCAAAGAAGCTCAGGGATCTATCTTGGGGAAAAAACATAATTGGGGTCACCTCTCCTTCTCCTCTGGAAGCCACCCGCTTCAAACTAATTGACCCAATCTCATGGGAGGAAGAAAAAGAGGCACACCACTTCACCATCCATTACTACCTCTCAAAACCCAGTCTTTCTTCAAAGACAGCCCACACAACCAGGGGTCCATTAGTTCCCTACTTCGGGACCCAGACCAAGCCACTGATCGCAAAAGCCTACATGGAGCTCAAGGGAAACCCCAGGACCAACAAGGCTCTGCAGTTGCTCAGCATGAGGGAGACAATGATTAAGGTAGGGTCCAATCTAGACAAACTCCTCCTGTCCCTGTGTTCCAATGCCCTAGATATCGACGTCAACTCCCTCCCCTCCCTCCAAGCACAAGAGGAGGCCAGCGCCGGAGAGGGGGTCCGAGGGGGCATCAAAGAGTCCATGTCCCCAGTTGGACCAGACAATCTCTATACACACATCACCCACAAGGTGTTCGAGCGCCAGTGGTTGTCCGAGTTTCATGTAAACATCGCGGACTTCATCATCTGGGGAATCACGAAGACTCGGCAGCATCTCCAGGTTGCCACCGACCTGGGTGGGAGTCTTCCGATCTGTGTCCCAGCGTGTCCAGAGTGTTACAGAGAGAAAGAACGGGTCTTCCTGGACATCCCAAAAGAAGTGGAATGGGTCAACACCTCCACCACCTCAGACAAGGCCCAAACCTACTTCTCCACCTGGTGTGATCTCCCAAGAGTGTCCACCCTCCCCTCATTAGACCAGAAGGATGCAACCTGTCTGATGGGGAGGTCCATGGCAACTCAAAAATCCACCCCGGGAGAGTCCATCACCAAGTTCTACAGCACAGCCCCAGACACCCACAGACTTCTCCATCCTGTGACCTTGGTCCTGGGCTATGCGGAGGGAACAATTTTTTCCTACATGAAAAGCCAGCACAACATTCATGGGTCTCTTTACCATCCGCATATCGATGAGATCGAACCAGCTCTTGAAAAGTATGTGATCGACACGAAGATATCCCACACCAAACACCTTGGATACCTGTTTCAAGATGCCGACTCCCTCCAGGAACTCCTCGAGACGGGAATGACACCATACATCCCTCGATCCATTCCTCTCACGATCACTGAATTGACAAGTGCATGCTGCATGACACTTGCCAAAGCAATCTCCATTGTCCTCAGAACTGGAGTGACCATTCCATTGATGCCAGAAAATGGATACGGAGAAAACGATATCCAAGTGGCAAGACTCACCGCTAACTCCTTTTCTCGACTCATGCCCAGGGGGAGGATTCAGCTAGTCTACTTGGACTGTGACCTGACCTCGCAGATGACCGCGTGGGTACCAACCAGCCAGCCGAGCGTCCTAGGATCCGTCAACTTCCACATCGAGGGAATTGCCATCCCCCTCACAGCGACAGAGATGAGAGTAGGACAAGAAAGCTGGGAAGAGAGAAAGTGGACATGCTCAAACAACCGACACATCATAGCAAAGGGGGTCAAGACCAAATCTCTGTTCATACATCAGAGCGTCCCCGAGATTATCACACACCCTCCCGACCTCATTGTGGTGATCGGAGGAGGCCTAGGGGGCTGTGTGGTTCCCTATCTTCAAAAGTGGAGAGACCCCAAAGTGATCTTCTGCACTCTATTTGATGAACGAGAGCGGATCTCGGAGGACGGAGACCTGATCATTCCCCCGGAGCTCCTGGTCCGAGGACTTGCTGGGAGAATGGTCGAGAAAGAACTCCTGGAGGCCGAGATGTGTGACATCACGGTCACGGGAAACAGGGACCTCCTCATCAAAGTTGTGCAAAAATGGGTTCAGCCGAACGGACATGTCCTTCTAATTGATGAGATCGAAAATCGGGGGGATCAAGAGTCAGTACTTCAATCTTCCATCAGTGAGCTTCTGGCGAGAATGGACAACGTGTGCAACCTCACCTCTGTTCACACCATCCGGGAGACCGGACCCCGACAATTCGCCCAGAGGGTAAACATAATTAGGAGAGGAAGAAAGACAGCAACACTCCACTGGAACCAGTACAACCGACGAGACCAAGTGGAGGCTCTTTTGCTTATTGAGAGCCACACCAGAAAGACCGAACTGCACGTCACATCATCTGTTGTACAGGCAGCATTCAGGAAGATCGACGAGAAGCTCGAGTCAGAGAGTCGACTTGAACACAGCAAATGGTCACTCCCTGAGCTCCCCCCAAGGGAGAAGGACATCCTACTTGGATATGTGGCATCTGTCTTTCTAAAGCTGGGGCTGGTTGTGACAGACAGACACATGTCGGCTGCCGCGCTCATCACTCTTCTTGAAGAAGCTGGGCCAAAGATGATATCCTGGGACAAGAAGATGGAACATCGGACCTGGGCCTCCTCAGATGCCATTACCGAGAAGGGGGTCACCCAGGACCAGATCTTTTCTCTTCTCTGCTTTGCATGGGCCCTTAGGGGACTAAAATCAGGAGACTGGGAACACAACGCAGACGCCATCATCCTCCAGGATGTCCACATAGACACAGGTCCGAGGCTCTGTCAGATGGGTGAGTCTCCCAAGAGGACATTTGCATCTTTCAGGTTGCACAACACAAAAAAAGCGGAGGATCTCAAGGGGTACCTAGGTGCTCTGCTCCACCTGGAGTCCTTCTTTCCATTTGGAGAACAGTGATGGAATCGCCCCGTTCATCAACTAGATTGAAAAAAACCATGACCTGGGTTCAATGGCCAGGTGAACCTCCGTGGGCGCCAGGCCACAGGCCTCCCACCTCGGATTTCTTGTTCTTTATTCTTTCGATTGTGGTATGTATTAT
| 40,793
|
MW574348.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Warg,J.V., Killian,M.L., Franzen,K.M., Love,E.R.
|
National Veterinary Services Laboratories (NVSL), USDA, Diagnostic Virology Laboratory
|
USA
|
2021-04-04
|
Coho salmon/Washington/20-036527/2020
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,144
|
GenBank
| null |
USA: WA, Big Quilcene River
|
USA
|
Oncorhynchus kisutch
| null |
2020-10-06
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate Coho salmon/Washington/20-036527/2020, complete genome
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| 43,113
|
MT162435.1
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Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
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National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
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2020-12-28
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4p101
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Novirhabdovirus piscine
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Novirhabdovirus
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Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,159
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GenBank
| null |
Denmark
|
Denmark
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Merlangius merlangus
| null |
1997
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate 4p101, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTACAGGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTGGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAAATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCGTAATCTTTGAACAAAAGAACTCAGTTGAAGAATGGACGGAGGAATTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGACATCAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTGCTTGTACCTGGTGAGGTGGAGCTCATTGTGTATGTGGGTGGGTTTAGTGCAGAAGATGGGAAGGTGATCGTAGATGCACTTGCTGCACTTGGGGGACCCCAGACTGTGCAGGCATTGTCCGTTCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAACACACAGGAGGACCTGGAGGCAAAGTGCAAGGTACTCACAGACATGGGATTCAGGGTGACACAGTCAACCAGGGCGACGGGCATCGATGCAGGAATCCTGATGCCTATGAGAGAGCTGGCCCTGACCGTCAATGACGACAACCTCATGGACATCGTTAAGGGGACCCTGATGACATGTTCCCTTCTGACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAGCTTGGGGACCTGGCAGACACTCAGGGAATTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCCGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCATTCATCCTGACCGAGATCGCAGATCCCACCACCCAGTCAAGGGCCCGAGCCATGGGGGCATTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATCGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACCTGGGCATTGCCCCGGCGAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCTCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGCTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCAAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAATCCTACTACAAGTCGTACGGACTAAATGACAACTCCAAGATCTCCTACATTCTGTCGCAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAAGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCCGAGGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAAGATTGGGGAGGACAGTACTGAGGTTTCCGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCCGCCAAGCCAGAACCCAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCCCCACCGGAAGAGGGAAGGAGCAAGATACAGAGGGGTCTGACGATGAGGACTACCCCGAAGACTCCGACTAAGAAGCACTCTCGTCTCATGGCCAACATAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGGCAAACACCGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAATCCTTGGTCCTGTCCCATGGGTCCCTAGCTGACCTGGATAGGAAACTAGACAACGCCCCCAAGGACACTAGGTCAGCTCTTTTTTCATCTACCTCAGGGTTCACCAAACAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCTTACAACGCTGGAGGAACTCATTGGACACTTCGTCCCTGAGGATCGCCAGCTAGACGCCACAAAGGCCTTCGGACAGCTCCTAAGACGCATCAAGATGTCCCACCAGGAAGAGCTTACTCAACATCTGGAGAAGGTCAACGGAGAGAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCCCAGAAAGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCTCCATGCGAGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTCCTAGATGGAGATCAGGTCCGGAACGAGAGGGCACTTGGATTCAACAGGGGACTGACTACGGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGTTGGAAGATCCTCTCGCACTCTGTAAAGGCTCCGTCAAACGAGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATACGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTCTCAAAAGCGATTAAGGCGGAGCTGGACAAGCTAGAGTAGGGACAACACAATGCATCGCACAGATAGAAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCAAACCTACTCCAAAAAAGAGACGCTCCAGCAGCCAGCAAACCCCAGACAACCCACAACTCAAGACATGACTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCCCCTCCTCACATCACGTCCAACGACGAGGACCGTGTCTCAACCATCCTGACGGAAGGCACTCTAACTATCACGGGTCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAGCACCCAGCATTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAGACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGTAGCAAGACCCTGATCACAAGCTTCAAGATAGCTGAGGCAAAGGCCATCTACCTGGACTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTATACCACTCCCATCAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGCCCGTTCGTGTTTGCGGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAACTGGGGGCACTATGTGGGTTTCTCCAGTCGGGACCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAGGAAGAAATGGGCATTCTCCCGAGGGACCCAAAGCGCAGATCTGGAGCCTCTCCTGCTCGGCCCCGGTAAGTCCAAACGACAAATTCAGGGGTGAGACCATACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAACAAACTATACCTACAATGGAATGGAATACTTTTTTCTTGGTGATCTTGATCATTCTCATAAAGAGCACCACATCACAGATCACCCAAAGACCTCCGACTGAGAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGTTATACACTCACCCCTCCAACTGCAGAGAAGACTCCTTTGTCCCGATTCGACCCGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACACCAACAAAGGACTGGTCTCCGTCCCAACTCAGATCATTCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTTGCAAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACCTATCGAGTCACCTGCTCAACCAGCTTCTTTGGGGGACAAACCATCGAAAAGACCATCCTGGAAGCAAAATTGTCTCGTCAGGAGGCCGCAAATGAGGCAAGCAAAGACCATGAGTACCCGTTCTTTCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAATAATGTCCATAAGGATATAACTCACTATTATAAGACCCCAAGAACAGTCTCTGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTTAGCCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGTGCGACCTCGCCCTGTCAGACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCCACAGCCCATTGTCCCACTTCAGAAACACTAGAGGGGCACCTGTTCACCAGAACTCATGATCACAGAGTGGTCAAGGCCATTGTGGCGGGCCATCACCCATGGGGACTCACGATGGCATGCACAGTGACATTCTGTGGGACAGATTGGATCAAGACCGACCTGGGGGACCTGATCAAGGTGATAGGACAGGGGGGCGAAAAAGAACTGACTCCAAAAAAATGTGTCAATACTGACATCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTCTCCTATCTCAACCATCTCATCACAAACATGGCTCAAAGGACCGAGTGTCTAGACGCCCATAGTGACATCACTGCCTCCGGGAAAATATCCTCGTTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCCGGACCCGGCAAGGCACATTACCTCCTCGATGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCGGTAGTCAGTATCAACTACAATAGCGCTCGGTACAAGACGGTGAACAACACATGGAAGTCATGGAAACGGATAGACAACAATACAGATGGGTACGATGGGATGATATTTGGAGACAAACTGATCATCCCAGACATCGAGAAATATCAGAGTATCTATGATAGTGGGATGCTCGTTCAAAGGAACCTGGTGGAAGTTCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTCTCCACCAATCACATCCACACCAACTTAATCCCCTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGCCTCTGGCCGTCATTATCAGGGATGGGAGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTATTGGTACTTTGTTGTTGTTGCAAAGCGTCTCCTCCTATTCCAAATTACGGGATTCCTATGCAGCAATTCTCCAGAAATCAGATGGTCTGAACACACCTGCCCGAATGAACATAATTATCCTCATAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTTTGAAAAAGAGGCATGACAACCCAACTCGCGCTCGACACAGTCAGCTTTTCTCCACTCGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGGCTCACATTCGACCCAAGCAACTACCTCAACTGCGACATCGATCGGTCGGACATATCCACCATGAGTTTCTTCGAAACGACTCTTCCCAGGATCCTGGATGACTTGAGGGCTTGCACACGGCTTCCCTACCTCCATGTACTCGACATGAGGATAAGTCTCCTGGAGAGAACCCACTACATGTTCAAAAATGTCCCCTCCAGTCCCGCCACAACCGGCAGACCGACAGATCCTGGACTCATCATTATTTCACGTGCAGAAGTTGGGGTCCTAACAAATGGCTCCGGGTTCACTTCATGAGCCTCCCCCCCGCCCCTCAGATAGAAAAAAATGGCACTCTTGTTGTTTGTAATCCTACGCTCAACAAAGAAGT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| 44,925
|
MT162436.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
NO-2007-50-385
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,065
|
GenBank
| null |
Norway
|
Norway
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
2007
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate NO-2007-50-385, complete genome
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AATAACGGCACATAAGTGGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAAATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCGTAATCTTTGAACAAAAGAACTCAGTTGAAGAATGGACGGAGGACTTCGTGCAGCGTTCTCAGGTTTGAATGACGTCAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAGGTGGAGCTCATTGTGTATGTGGGTGGGTTTAGTGCAGATGATGGGAAGGTGATCGTAGATGCACTTTCTGCACTTGGGGGACCCCAGACTGTGCAGGCATTGTCCGTTCTTCTCTCCTATGTACTTCAAGGGAACAAACAGGAGGACCTGGAGGCAAAGTGCAAGGTGCTCACAGACATGGGCTTCAGGGTGACACAGTCAACCAGGGCGACGGGCATCGATGCAGGAATCCTGATGCCTATGAGAGAGCTGGCCCTGGCCGTCAATAACGACAGCCTCATGGACATCGTTAAGGGGACCCTGATGACATGTTCCCTTCTGACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAGCTTGGGGACCTGGCAGACACTCAGGGAATTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCCGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCATTCATCCTGACCGAGATCGCAGATCCCACCACCCAATCAAGGGCCCGAGCCATGGGGGCATTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATCGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACCTGGGCATTGCCCCGGCGAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCTCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGCTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCAAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGGGAATCCTACTACAAGTCGTACGGACTAAATGACAACTCCAAGATCTCCTACATTCTGTCGCAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAACTTGTTGCCGAGGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAAGATTGGGGAGGACAGTACTGAGGTTTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCTAGACAGCACGCGCGCAGGACATCCGCCAAGCCAGAGCCCAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCCCCACCGGAAGAGGGAAGGAGCAGGATACAGAGGAGTCTGACGATGAGGACTACCCCGAAGACTCCGATTAAAAAGCACTCTCGTCTCATGACCAACATAGATAGAAAAAAATGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGGCAAACACCGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGTGAATCCTTGGTCCTGTCCCATGGGTCCCTAGCTGACCTGGATAGGAAACTAGACAACGCCCCCAAGGACACTAGGTCAGCTCTTTTTTCATCTACCTCAGGGTTCACCAAACAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCTACAACGCTGGAAGAACTCATTGGACACTTCGTCTCTGAGGATCTCCAGCTAGACGCCACAAAGGCCTTCGGACAGCTCCTAAGACGTATCAAGATGTCCCATCAGGAAGAACTTACTCAACATCTGGAGAAGGTCAACGGAGAGAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAGAAAGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCTCCATGCGAGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTCCTAGATGGGGATCAGGTCCGGAACGAGAGGGCACTTGGATTCAACAGGGGACTGACTACGGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGTTAGAAGATCCTCTCGCACTCTGCAAAGGCTCAGTCAAACGAGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATACGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTCTCAAAAGCGATTAAGGCGGAGCTGGACAAGCTAGAGTAGGGACAACACAATGCATCGTACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCGAGCAAACTTACTCCCAAAAAGAGACACTCCAGCAGCCAGCAAACCCCAGACAATCCACAACTCAAGACATGACTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCCCCTCCTCACATCACGTCCAACGACGAGGACCGTGTCTCAACCATCCTGACGGAAGGCACTCTAACCATCACGGGTCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTGGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAGCACCCAGCATTCAATCCCCTGGTTTATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAGACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGTAGCAAGACCCTGATCACAAGCTTCAAGATAGCTGAGGCAAAGGCCATCTACCTGGAATCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAAGCCAAGAAGTATACCACTCCCATCAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGCCCGTTCGTGTTTGCGGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAACTGGGGGCACTATGTGGGTTTCTCCAGTCGGGACCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAGGAAGAAATGGGCATTCTCCCGAGGGACCCAAAGCGCAGATCTGGAGCCTCTTCTGCTCAGCCCCGGTAGGTCCAAATGACAAACTCAGGGGTGATACCATACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAACAAGCTATACCTACAATGGAATGGAATACTTTTTTCTTGGTGATCTTGATCATTCTCATCAAGAGCACCACATCACAGATCACCCAAAGACCTCCGATCGAGAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGTTGTACACTCACCCCTCCAACTGCAGAGAAGACTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATCAACAAGGGACTGGTCTCCGTTCCAACTCAGATCATTCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTTGCAAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACCTATCGAGTCACCTGCTCAACCAGCTTCTTTGGGGGACAAACCATCGAAAAGACCATCCTGGAAGCAAAATTGTCTCGTCAGGAGGCCGCAAATGAGGCAAGCAAAGACCATGAGTACCCGTTCTTTCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAATAATGTCCATAAGGATATAACTCACTATTATAAGACCCCAAAAACAGTCTCTGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTTAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGTACGACCTCGCCCTGTCAGACTCATTGGCAAGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCCACAGCCCATTGTCCCACTTCAGAAACACTAGAGGGGCACCTGTTCACCAGAACCCATGATCACAGAGTGGTCAAGGCAATTGTGGCGGGCCATCACCCATGGGGACTCACGATGGCATGCACAGTGACATTCTGTGGGACAGATTGGATCAAGACCGACCTGGGAGACCTGATCAAGGTGGTAGGACAGGGGGGCGAAACAAAACTGACTCCAAAAAAATGTGTCAATGCTGACATCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTCTCATATCTCAACCATCTCATCACAAACATGGCTCAAAGGACCGAGTGTCTAGACGCCCATAGTGACATCACTGCCTCCGGTAAAATATCCTCGTTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCCGGACCCGGCAAGGCACATTACCTCCTTGATGGTCTAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCGGTAGTCAGTATCAACTACAATAGCGCTCAGTACAAGACGGTGAACAACACATGGAAGTCATGGAAACGGATAGACAACAATACAGATGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAACTGATCATCCCAGACATCGAGAAATATCAGAGTATCTATGATAGTGGGATGCTCGTTCAAAGGAACCTGGTGGAAGTTCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTCTCCACCAATCACATCCACACCAACTTAATCCCCTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGCCTCTGGCCGTCATTATCAGGGATGGGAGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTATTGGTACTTTGCTGTTGTTGCAAAGCGTCTCCTCCTATTCCAAATTACGGGATTCCTATGCAGCAATTCTCCAGAAATCAGATGGTCTGAACACACCTGCCCGAATGAACATCATTATCCTCATAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACTTCTTTGAAAAAGAAACATGACAACCCAACTCGCGCTCGACACAGTCAGCTTTTCTCCACTCGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGGCTCACATTCGACCCAAGTAACTACCTCAACTGCGACATCGATCGGTCGGACGTATCCACCATGAGTTTCTTCGAAACGACTCTTCCCAGGATCTTGGATGACTTGAGGGCTTGCCCACGGCTTCCCTACCTCCATGTACTCGACATGAGGATAAGTCTCCTGGAGAGAACCCATTACATGTTCAAAAACGTCCCCTCCAGTCCCGCCACAACCGGCAGACCGACTGATCCTGGACTCATCATTATTTCATGTGCAGATGTTGGGGTCCTAACAAATGGCTCCGGGTTCACTTCATGAGCCTCCCCCCCGCCCCTCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCTACGCTCAACAAAGAAGTGACCCTACAGGGGGTAATACCTGACACAATCAAATTAGATCACCTTATA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| 44,926
|
MT162437.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
2009-50-315-1
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,845
|
GenBank
| null |
Turkey
|
Turkey
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
2009
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate 2009-50-315-1, complete genome
|
ATGGAAGGAGGATTTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAACGATGTTAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGAGGGCGATGGGAAGATGATTGCGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTGCAGGCATTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTCCTTCAAGGGACTGCAAAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCACCCAGGGCTACGGGCATCGAGGCAGGGCTCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCACTGACGACAACCTCATGGAAATCGTTAAGGGGACCCTGATGACATGCTCCCTCCTGACCAAGTACTCGGTGGAAAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGAGAACTGGCAGACACTCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGAGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCATTCATCCTGACTGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCAAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGCTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGCTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGTATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGCTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGCCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGGCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAAATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGAAAGTACGCAGTGGAATCTCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAGGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTAGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCGCGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCATGCGCGCAGGACATCCGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGTTCCACCGGAAGGGGGAAGGAGCGGGAGACAGAGGAGTCCGATGATGAAAACTACCCCGGGGACTCTGACTAGAAGACACTCTCATCTCATAGCCAACATAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGACAAACACCGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCCTGGTCTTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGATAATAAACTAGACAACGCCCCCAAGGACAAAAAGTCAGTTCTTTTTTCATCTGCCTCAGGGTCTATCAGGCAAAAATCAAATCCTAAGAAGAAGTCCAATCCGACGACGCTGGAGGAAATCATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTCGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTCACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCCCAAAAGGAAAATGGGAAGAAGACTGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCCATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCATAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGCTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCGGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAGTCAGAGTAGGGACAACACAATGTATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCAAACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAACCCACAACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCTTCTCCTCACCTTACGTCCAGTGATGAGGACAGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCATTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGCGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTTAAGGTAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTATACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTAACTTACTATGGTCCATTCGTATTTGCAGATGACCACGTTGGACTGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGGATCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAAGAAGAGATGGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCCCCTCTGTCCGACCCCAGTAGACCAAAAGGACTGACTCAGGGTTGAGACCACACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAACAAGCTAGACCTACAATGGAATGGAACACTTTTTTCTTGGTGATCCTGATCATCATCATAAAGAGCACCACGTCACAGATCACTCAACGACCGCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCGACTGCAGGGAAGATTCCTTTGTCCCGATCCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACTCAGATCATCCATCTCCCGCTATCGGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGACAAACCATCGAGAAGACCATCTTAGAGGCGAAATTGTCTCATCAGGAGGCCACAAATGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCATTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGTAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGTACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAAGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCTACAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGACAGAATGGATCAAAACCGACCTGGGGGACTTGATCCAGGTGACAGGACCGGGGGGCGCGAAGAGACTGACTCCTAAAAAGTGTGTCAATGCCGATATCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGACATCACCGCTTCTGGGAAAATATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTCGATGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGGCAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTATCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACTTAATCCCTTCAGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTCTGGCCATCATTATCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCTATTCCAAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTTTCCAGAAGCCAGATGGTCTGAGCACACCTGTCCTAATGACCACAATTCTTTTTTCAGATAGATAGAAAAAAATGGCACCCTTATGACAAAGAAACATGACGACCCAGCCCGCGCTCAGCACAGTCAGCTTCTCTCCGCTAGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGACTCAAGTTCGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCACCATGGACTTCTTTGAAACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGCACACGGCTTCCCTATCTCCATGTGCTAGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAGAACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCTTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCTGGACTCATCATTATTTCACATGCGGAGGTGGGGATATTGACAAGTGGCCCTGGGCTCACTTCATGAACCTCCCCGCCGTCTCTCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCTACACTCAACAAAAAGTGACCCTACAGGGGGTAATACCTGACAAAACAAAGTTAGATCGCCTTACAGCAACCATGGAAATGTTTGAACTAGACCGGGAAGTACACCAGGAACGACTTCCTTCAGAATGTTCGCTCAACTCTCCCCTAAACCTTTCCCTATCCCTCCAGCTCTTCGGACGCTTGGT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AACATGTCCTTCTCATTGATGAGATCGAAAATCGGGGGGATCAAGAGTCAGTACTTCAATCTTCTATCAGTGAGCTTCTGACAAGAATGGATAGCGTGTGCAACCTCACCTCTGTTCACACCATCCGGGAGACCGGACCCCGACAATTCGCCCAGAGGGTAAACACAATTAGGAGAGGAAGAAAGACGGCAACACTCCACTGGAACCAGTACAACCGACGAGATCAAGTGGAGGCCCTTCTACTTATTGAAAGCCACACCAGAAAGACCGAATTGCACGTCACATCGTCTGCTGTACAGGCAGCATTCAGGAAGATCGACGAGAAGCTCGAGTCGGAGAGTCGACTCGAACACAGCAAATGGTCACTCCCTGAGCTCCCCCCAAGAGAAAAGGACATCCTACTTGGATATGTGGCATCTGTCTTTCTAAAGTTGGGGCTGGTTGTGACGGACAGACACATGTCGGCTGCCGCGCTCATCACTCTTCTTGAAGAAGCTGGGCCAAAGATGATATCCTGGGACAAGAAGATGGAACATCGGACCTGGGCCTCCTCGGATGCCATTACTGAGAAGGGGGTCACCCAGGACCAGATCTTTTCTCTCCTCTGCTTTGCATGGGCCCTTAGGGGACTAAAATCAGGAGACTGGGAACACAACGCAGACGCCATCATTCTCCAGGATGTCCACATTGACACAGGTCCGAGGCTCTGTCAGATGGGTGAGTCTCCCAAGAGGACATTTGCATCTTTCAGGTTGCACAACACCAAAAAAGCGGAGGATCTCAAGGGGTACCTAGGTGCTCTGCTCCACCTGGAGTCCTTCTTTCCATTTGGAGAACAGTGATGG
| 44,927
|
MT162438.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
GE 1.2
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,845
|
GenBank
| null |
Georgia
|
Georgia
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
1981
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate GE 1.2, complete genome
|
ATGGACGGAGGATTTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGAGGACGATGGGAAGATGATTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTGCAGGCATTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTTCAAGGGAGTACACGGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGACAGGGCTACGAGCATCGAGGCAGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCACTGACGACAACCGCATGGAAATCGTTAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTGACCAAGTACTCGGTGGAAAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAACTGGCAGACACTCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCATTCATCCTGACTGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGCTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGCCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGGCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTACGCAGCGGACTCTCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAGGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCACGCAGGACATCCGCCAAACCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTCCACCGGAAGGAAGAAGGAGCAGGAGACGGAGGAGTCCGATGATGAAAACTACCCCGGGGACTCTGACTAGAAGACACTCTCGTCTCATAGCCAACATAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGGTCAAAGCAAGACAAACACTGAAATCACACAATGGATGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCCTGTCCAATGGGTCCCTAGCTGACCTGGATAAGAAACTAGACAACGCCCCTAAGGACAAAAAGTCAGTTCTTTTTTCATCTACCTCAGGGTCTACCAGGCAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCGACGACGCTGGAGGAAATCATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTCGGACAGCTCCTGAGACGCATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTCACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCCCAGAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCATAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGTTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTGCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTAGACAAGTTAGAGTAGGGACAACATAATGTATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACAAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAACCTACAACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGATTCCTTCTCCTCACCTTACGTCCAGTGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCATTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAATAAGACCCTGATAACAAGCTTTAAGGTAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAAAAGTATACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCATTCGTATTTGCAGATGACCACGTTGGACTGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGGACCTTACGAGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAAGAAGAGATGGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCCCCTCTGTCCGACCCCGGTAGACCAAAAGGACTGACTCAGGGTTGAGACCACACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAACAAGCTAGACCCACAATGGAATGGAACACTTTTTTCTTGGTGATCCTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCCCCGGTCGAAAACATCTCGACTTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGAGGACTCCTTTGTCCCGATCCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAGGGGACTGGTTTCTGTCCCAACTCAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGACAAACCATCGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAAATTGTCTCGTCAGGAGGCCACAAATGAGGCCAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCATTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGTACAACCTCACCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCTACAGCCCATTGCCCCACATCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCGTGCACAGTGACATTCTGCGGGACAGAATGGATCAAGACCGACCTGGGGGACCTGATCAAGGTGACAGGACCGGGGGGCGCGAGGAGACTGACTCCTAAAAAGTGTGTCAATGCCGATATCCAGATGAGGGGGGCAACAGATGACTTCTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTGGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAATATCCCCGTTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTCGATGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTGGACAACAACACAGACGGGTATGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTATCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAGACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACTTAATCCCTTCAGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTTTGGCCATCATTATCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCATTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCTATTCCAAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGATGGTCTGAGCACACCTGTCCGAATGACCACAATTCTTCTCTCAGATAGATAGAAAAAAATGGCACCCTTATGATACAGAAACATGACGACCCAGCCCGCTCTCAGCACAATCAGCTTCTCTCCGCTAGTCCTCCGCGCGATGATCACACACAGACTCAAATTTGACCCAAGCAACTACCTAAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCACCATGGGCTTCTTTGAAACAACCCTCCCCAGGATCCTAGACGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCCTACCTCCATGCGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAGAACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCCGACAGATCCTGGACTCATCATTATTTCATATGCGGAGGTGGGGATATTGACAAGTGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCACCTTCTCTCAGATAGRAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCTACACTCAACTAAAAGTGACCCTACAGGGGGTAATACCTGACAAAACAAAGTTAGATCGCCTTACAGCAACCATGGAAATGTTTGAACTAGACCGGGAAGTACACCAGGAACGACTTCCTTCGGAATGTTCACTCAACTCTCCCCTAAACCTCTCCCTATCCCTCCAGCTTTTCGGGCGCTTGGC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AACATGTCCTTCTCATTGATGAGATCGAAAATCGGGGGGATCAAGAGTCAGTACTTCAATCTTCTATCAGTGAGCTACTGACAAGGATGGATAGCGTGTGCAACCTCACCTCTGTTCACACCATCCGGGAGACCGGACCCCGACAATTCGCCCAGAGGGTAAACACAATTAGGAGAGGAAGAAAGACAGCAACACTCCACTGGAACCAGTACAACCGACGAGACCAAGTGGAGGCCCTTCTCCTTATTGAAAGCCACACCAGAAAGACCGAATTGCACGTCACATCATCTGCTGTACAGGCAGCATTCGGGAAGATCGACGAGAAGCTCGAGTCGGAGAGTCGACTTGAACACAGTAAATGGTCACTCCCTGAGCTCCCCCCAAGAGAGAAGGACATTCTACTTGGATATGTGGCATCTGTCTTTCTAAAGCTGGGGCTGGTTGTGACAGACAGACACATGTCGGCTGCCGCGCTCATCACTCTTCTTGAAGGAGCTGGACCAAAGATGATATCCTGGGACAAAAAGATGGAACATCGGACCTGGGCCTCCTCGGATGCCATTACCGAGAAGGGGGTCACCCAGGACCAGATCTTTTCTCTTCTCTGCTTTGCATGGGCCCTTAGGGGACTAAAATCAGGAGACTGGGAACACAACGCAGACGCCATCATTCTCCAGGATGTCCATATTGACACAGGTCCAAGGCTCTGTCAGATGGGTGAGTCTCCCAAGAGGGCATTTGCCTCTTTCAGGTTGCACAACACCAAAAAAGCGGAGGATCTCAAGGGGTACCTAGGTGCTCTGCTCCACCTGGAGTCCTTCTTTCCATTTGGAGAACAGTGATGG
| 44,928
|
MT162439.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
DK-2149
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,159
|
GenBank
| null |
Denmark
|
Denmark
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
1978
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate DK-2149, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTACAAGGGGCAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAAATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTGAACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGAATTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGCAAGGAAGATGGGAAGGTGATTGCGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTGCAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAGTGCACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGCCAGGGCTACGAGCATCGAGGCAGGGATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGGCAACCTCATGGAAATCGTTAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTGACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTGGCAGACACTCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGCGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCATTCATCCTGACTGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGCTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTATGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCCGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTTTACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGGGGGGTCCGATGATGACGACTACCCCGAGGACTCTGACTAAAAGACACTCCCGTCTCATAACCAACACAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGACAAATACTGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCTTGTCCAATGGATCCCTAGCTGACCTGGATAAGAAACTAGACAACGCCCCCAAGGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCTACCTCAGGGTCTCCCAGGCAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCGACTACGCTGGAGGAAATTATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGAGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAAGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAGAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGTTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGCTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATACGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTGTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGTTGGACAAGTTAGAGTAGGGACAACACAATGTATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCGACCCACAACTCAAGACATGACTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGCGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTATACCACTCCCATTAGATATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGACACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGGACCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAAGAAGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCGGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTCGGTAGACCGAAAGGACTGACTCAGGTTTGAGACCACACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGCACACAACAAGCTAGACCCACAATGGAATGGAATACGTTTTTCTTAGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCTCCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGAAGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACTCAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATCGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAGATTGTCTCGTCAGGAGGCCACAAACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGAAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTCTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTACTGGGTCGGTGCCACACCCACAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACGCTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTTAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACCATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGACAGACTGGATCAAGACCGACCTGGGGGACCTGATCAAGGTGACAGGACCGGGGGGCGCGAGGAAACTGACTCCAAGGAAGTGTGTCAATGCCGATATCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAATATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTCGACGGTCAAATCATGCGAGGCGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATAGCGCTCAGTACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGGATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCCGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCCTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTTTGGCCATCATTATCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCACTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCTATTCCAAGTTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGACGGTCTGAGCACACCTGTCCGAATGACCACAACTCTTCTCCTAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGACAAAGAAACATGGCGACCCAACCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGACTGAAATTCGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGCCTGACATATCCACCAGGGACTTCTTTGAAAAGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGTAAACGGCTTCCCTACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGGGGACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCTGGACTCATCATTATTTCACATGCGGAGGTGGGGATATTGACAAGTGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCGCCGTCTCTCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCTACACTCAACAAAACGCGA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| 44,929
|
MT162440.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
DK-3612
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,845
|
GenBank
| null |
Denmark
|
Denmark
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
1986
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate DK-3612, complete genome
|
ATGGAAGGAGGAATTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGCGAGGAAGATGAGAAGGTGATTGCGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTGCAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAGTGCACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGCCAGGGCTACGAGCATCGAGGCAGGGATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGGCAACCTCATGGAAATCGTTAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTGACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTGGCAGACACTCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCCGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGCGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCATTCATCCTGACTGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGCTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTATGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCCTCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTTTACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGGGGGGTCCGACGATGACGACTACCCCGAGGACTCTGACTAAAAGACACTCCCGTCTCATAACCAACACAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGACAAATACTGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCATTGGTCTTGTCCAATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAAGAAACTAGACAACGCCCCCAAGGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCTACCTCAGGGTCTCCCAGGCAAAAATCAGGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCGACTACGCTGGAGGAAATCATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGTCTTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGAGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAAGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCCATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAGAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGTTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGCTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATACGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTGTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGTTGGACAAGTTAGAGTAGGGACAACACAATGTATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCGACCCACAACTCAAGACATGACTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGCGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTATACCACTCCCATTAGATATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGACACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGGACCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAAGAAGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCGGATCCGGAACCTCCTCTGTCCGACCTCGGTAGACCGAAAGGACTGACTCAGGTTTGAGACCACACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGCACACAACAAGCTAGACCCACAATGGAATGGAATACGTTTTTCTTAGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCTCCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGAAGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACTCAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATCGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAGATTGTCTCGTCAGGAGGCCACAAACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGAAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTCTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTACTGGGTCGGTGCCACACCCACAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTTAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACCATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGACAGACTGGATCAAGACCGACCTGGGGGACCTGATCAAGGTGACAGGACCGGGGGGCGCGAGGAAACTGACTCCAAGGAAGTGTGTCAATACCGATATCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAATATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTCGACGGTCAAATCATGCGAGGAGACTGTGACTATGAAGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATAGCGCTCAGTACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGGATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCCGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCCTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTTTGGCCATCATTGTCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCACTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCTATTCCAAGTTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGACGGTCTGAGCACACCTGTCCGAATGACCACAACTCTTCTCCTAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGACAAAGAAACATGGCGACCCAACCCGCGCTCAGCACGACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGACTGAAATTCGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGCCTGACATATCCACCAGGGACTTCTTTGAAAAGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGTAAACGGCTTCCCTACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGGGGACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCCGGACTCATCATTATTTCACATGCGGAGGTGGGGATATTGACAAGTGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCGCCGTCTCTCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCCACACTCAACAAAACGCGACCCCACAGGGGGTAATACCTGACAAAATAAAGTTAGATCGCCTTACAGCAACCATGGAAATGTTTGAACTAGACCGGGAAGTACACCAGGAACGACTTCCTTCGGAATGTTCACTCAACTCTCCCCTAAACCTCTCCCTATCCCTCCAGCTCTTCGGGCGCTTGGC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AACATGTCCTTCTCATTGATGAGATCGAAAATCGGGGGGATCAAGAGTCAGTACTTCAATCCTCCATCAGTGAGCTTCTGACTAGAATGGATAGCGTGTGCAACCTCACCTCTGTTCATACCATCCGGGAGACCGGACCCCGACAATTCGCCCAGAGGGTAAACACAATTAGGAGAGGAAGAAAGACAGCAACACTTCACTGGAACCAGTACAACCGACGAGACCAAGTGGAGGCCCTTTTACTCATTGAGAGCCACACCAGAAAGACCGAATTGCACGTCACATCATCTGTTGTACAGGCAGCATTCAGGAAGATCGACGAGAAGCTCGAGTTGGAAAGTCGACTTGAACACAGTAAATGGTCACTCCCTGAGCTCCCCCCAAGGGAGAAGGACATCCTACTTGGATATGTGGCATCTGTCTTTCTAAAGCTGGGGCTGGTTGTGACAGACAGACACATGTCGGCTGCCGCGCTCATCACTCTTCTTGAAGAAGCTGGGCCAAAGATGATATCCTGGGACAAGAAGATGGAACATCGGACCTGGGCCTCCTCGGATGCCATTACCGAGAAGGGGGTCACCCAGGACCAGATCTTTTCTCTTCTCTGCTTTGCATGGGCCCTCAGGGGACTAAAATCAGGAGACTGGGAACACAACGCGGATGCCATCATCCTCCAGGATGTCCACATTGACACAGGTCCGAGGCTCTGTCAGATGGGTGAGTCTCCCAAGAGGACATTTGCATCTTTCAGGTTGCACAACACCAAAAAAGCGGAGGACCTTAAGGGGTACCTGGGTGCTCTGCTCCACCTGGAGTCCTTCTTTCCATTTGGAGAACAGTGATGG
| 44,930
|
MT162441.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
DK-M.rhabdo
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,845
|
GenBank
| null |
Denmark
|
Denmark
|
Gadus morhua
| null |
1979
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate DK-M.rhabdo, complete genome
|
ATGGACGGAGGAATTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGAGGAAGATGGGAAGGTGATTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTGCAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAATACACAGGAGGACCTAGGAATGAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGCCAGGGCTACGAGCATCGAGGCAGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTTAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTGACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTGGCAGACACTCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGACAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCATTCATCTTGACTGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACAGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCCGCCAGGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTCCACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGAGGGATCCGATGATGACGACTACCCCGAGGACTCTGACTAAAAGACACTCCCGTATCATAACCAACATAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTCGATCAAAGCAAGACAAACACCGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCTTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGATAAGAAACTAGACAACGCCCCTAAGGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCCTCTCCCTCAGAGTCTACCAGGCAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACGCTGGAGGAAATTATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCCTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAGGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGTTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAAGCGGAGCTGGACAAGTTAGAGTAGGGACAACACAATGTATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAATCTACAACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGCTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATAACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGCGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTATACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGGACCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAAGAAGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTCGGTAGACCGAAAGGACTGACTCAGGTTTGAGACCACACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTATGCACACAACAAGCTAGGTCCACAATGGAATGGAATACTTTTTTCTTGGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGAAGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACTCAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTGGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATCGAAAAGACAATCTTGGAGGCGAAATTGTCTCGTCAGGAGGCCACAAACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTAAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCTACAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTTTGCGGGACAGAATGGATCAAGACCGACCTGGGGGACCTGATCCAGGTTACAGGACCGGGGGGCGCGAGGAAACTGACTCCAAAAAAGTGTGTCAATACCGATATCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAATATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTCGACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAAAGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTTTGGCCATCATTATCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTGCTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCATCCCCTCCTATTCCAAACTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGCCAGATGGTCTGAGCACACCTGTCCGAATGACCACAATTCTTCTCTTAGGCAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGATAAAGAAACATGGCGACCCAACCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGACTCAAATTTGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCACCATGGACTTCTTTGAAACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCCTACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAGAACCCACTACATGTTCAGAAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCTGGACTCATCATTATTTCACATGCGGAGGTGGGGCTATTGACAAGTGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCTCCGTCTCTCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCTACACTCAACAAAAAGTGACCCTACAGGGGGTAATACCTGACAAAATAAAGTTAGATCGCCTTACAGCAACCATGGAAATGTTCGAACTAGACCGGGAAGTACACCAGGAACGACTTCCTTCTGAATGTTCACTCAACTCTCCCCTAAACCTCTCCCTATCCCTCCAGCTCTTCGGGCGCTTGGC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AACATGTCCTTCTCATTGATGAGATCGAAAATCGGGGGGATCAAGAGTCAGTACTTCAATCTTCCATCAGTGAGCTTCTGACAAGAATGGATAACGTGTGCAACCTCACCTCTGTTCACACCATCCGGGAGACCGGACCCCGACAATTCGCCCAGAGGGTAAACACAATTAGGAGAGGAAGAAAGACAGCAACACTCCACTGGAACCAGTACAACCGACGAGACCAAGTGGAGGCCCTTTTACTTATTGAGAGCCACACCAGAAAGACCGAATTGCACGTCACATCATCTGTTGTACAGGCAGCATTCAGAAAGATCGACGAGAAGCTCGAGTCGGAGAGTCGACTCGAACACAGTAAATGGTCACTCCCTGAGCTCCCCCCAAGGGAGAAGGACATCCTACTTGGATATGTGGCATCTGTCTTTCTAAAGCTGGGGCTGGTTGTGACAGACAGACACATGTCGGCTGCCGCGCTCATCACTCTTCTTGAGGAAGCTGGGCCAAAGATGATATCCTGGGACAAGAAGATGGAACATCGGACCTGGGCCTCCTCGGATGCCATTACCGAGAAGGGGGTCACCCAGGACCAGATCTTTTCTCTTCTCTGCTTTGCATGGGCCCCTAGGGGACTAGGATCAGGAGACTGGGAACACAACGCAGACGCCATCATCCTCCAGGATGTCCACATTGACACAGGTCCGAGGCTCTGTCAGATGGGTGAGTCTCCCAAGAGGACATTTGCATCTTTCAGGTTGCACAACACCAAAAAAGCGGAGGATCTCAAGGGGTACCTAGGTGCTCTGCTCCACCTGGAGTCCTTCTTTCCATTTGGAGAACAGTGATGG
| 44,931
|
MT162442.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
DK-5p276
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,159
|
GenBank
| null |
Denmark
|
Denmark
|
Pleuronectes platessa
| null |
1998
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate DK-5p276, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTACAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAAATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAATTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTGAACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGAATTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTCGGTGAGGAAGATGGGAAGGTGATTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTGCAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAATACACAGGAGGACCTAGGAATGAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGCCAGGGCTACGAGCATCGAGGCAGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTTAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTGACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTGGCAGACACTCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGTACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCATTCATCTTGACTGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATCGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATTCAAGAGCGATACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACAGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCTGCCAGGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTCCACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGAGGGATCCGATGATGACGACTACCCCGGGGACTCTGACTAAAAGACACTCCCGTATCATAACCAACATAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTCGATCAAAGCAAGACAAATACCGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCTTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGATAAGAAACTAGACAACGCCCCTAAGGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCCTCTCCCTCAGAGTCTACCAGGCAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACGCTGGAGGAAATTATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCCTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAGGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGTTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAGTTAGAGTAGGGACAACACAATGTATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAATCTACAACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGCGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTATACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGGACCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAAGAAGAGACAGGCATTCCCCCACGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTCGGTAGACCGAAAGGACTGACTCAGGTTTGAGACCACACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTATGCACACAACAAGCTAGGCTCACAATGGAATGGAATACTTTTTTCTTGGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCTAACTGCAGGGAAGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACTCGGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTGGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATCGAGAAGACAATCTTGGAGGCGAAATTGTCTCGTCAGGAGGCCACAAACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCCGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCTACAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCAATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTTTGCGGGACAGAATGGATCAAGACCGACCTGGGGGACCTGATCCAGGTTACAGGACCGGGGGGCGCGAGGAAACTGACTCCAAAAAAGTGTGTCAATACCGATATCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAATCTCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTCGACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAGCGGGTAAACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAAAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCACCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTTTCCACTAATCACATCCACACTAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTTTGGCCATCATTATCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTCCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCATCCCCTCCTATTCCGAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGATGGTCTGAGCACACCTGTCCGAATGACCACAATTCTTCTCTTAGGCAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGATAAAGAAACATGGCGACCCAACCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGACTCAAATTTGACCCAAGTAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCACCATGGACTTCTTTGAAACGACCCTCCCCAGGATCCTAAATGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCCTACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAAAACCCACTACATGTTCAGAAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACTGGTAGGCTGACAGATCCTGGACTCATCATTATTTCACATGCGGAGGTGGGGATATTGACAAGTGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCTCCGTCTCTCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAACCCTACACTCAACAAAAAGTGA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| 44,932
|
MT162443.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
FR-07-71
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,159
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
1971
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate FR-07-71, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTACAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAAATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTGAACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGAATTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATTGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGAATTTGGTGAGGAAGATAGGAAGGTGATTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTACAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAACACACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGTCAGGGCCACGAGCATCGAGGCGGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTCAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTTACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTGGCAGACACCCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCGTTCATCCTGACTGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGACTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCTGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTCCACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGGGGAGTCCGATGATGACGACTACCCCGAGGACTCTGACTAAAAGGCACTCCCGTCTCATAACCAACATAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGACAAACACTGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCCTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAAGAGACTAGACAACGCCCCTAAAGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCTACCTCAGGGTCTACCAGGCAAAAATCAAGTTCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACACTGGAGGAAATTATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGCTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAGCTAGAGTAGGGACAACACAACGCATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAACCAACAACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGTATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACATCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTACACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGGACCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCCGTCGAAGAAGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTTGGTAGACCGAAAGGACTGACCCAGGTTTGAGACCACACTCTCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAACAAGCTAGACCCACAATGGAATGGAACACTTTTTTCTTGGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGACTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGACGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACCAGGATCATCCATCTCCCGCTATCGGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATCGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAAACTGTCTCGTCAGGAGGCCACAGACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCTAAAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGACAGAATGGATCAAGACTGACCTGGGGGACCTGATCCAGGTGACAGGACCGGGGGGCACGAGGAAACTGACTCCAAACAAGTGTGTCAATACCGATATCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAGTATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCTGGCAAGGCACACTATCTTCTCGACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATCGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAAAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTTTGGCCATCATTATCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCCATTCCAAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGACGGTCTGAGCACACCTGTCCGAATGACCACAATTCCTCTCTTAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGATAAAGAAACATGGCGACCCAACCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGTGAGATGATCACACACAGACTCAAATTTGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACTTTGATCGGTCGGACATATCCACCGTGGACTTCTTTGAGACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCTCACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAGAACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCTGGACTCGTCATCATTTCACATGCAGAGGTGGGGCTATTGACAAGAGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCGACGCCTCTCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCTACACTCAACAAAAAGTGA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| 44,933
|
MT162444.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
FR-02-84
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,159
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
1984
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate FR-02-84, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTACAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAGATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTGAACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGAATTCGTGAAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGACGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGAGGAAGATAGGAAGGTGATTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTACAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAACACACAGGAGGACCTGGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGTCAGGGCCACGAGCATCGAGGCGGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTCAAGGGTACCTTGATGACATGCTCCCTTCTTACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACTAAGAAACTCGGGGAGCTAGCAGACACCCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCGTTCATCCTGACCGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTATGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCTGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTCCACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGGGGAGTCCGACGATGACGACTACCCCGAGGACTCCGACTAAAAGGCACTCCCGTCTCATAACCAACCCAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGACAAACACTGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCCTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAAGAGACTAGACAACGCCCCCAAAGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCCAACTCAGGGTCTACCAGGCAAAAGTCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACACTGGAGGAAATCATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTCACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGCTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTCTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAGCTAGAGTAGGGACAACACAACGCATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTCAGCAAACCCCAGGCAACCAACAACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTAGTTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATTACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCAGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTACACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGAAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGACACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGAACCTTACGGGCAGGCGAAGGACCACTACAATCGTGCCGTCGAAGAAGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTTGGTAGACCGAAAGGACCGACCCAGGCTTGAGACCACACTCTCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAACAAGCTAGACCCACAATGGAATGGAACACTTTTTTCTTGGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGACGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACCAGGATCATCCATCTCCCGCTATCGGTCAACAGCGTCTCCGCAGTGGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATTGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAAACTGTCTCGTCAGGAGGCCACAGACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCTAAAGCCCATTGCCCCACGTCAGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGAGACAGAATGGATCAAGACTGACCTGGGAGACCTGATCCAGGTGACAGGACTKGGGGGCACGGGGAAACTGACTCCAAAGAGGTGTGTCAATACTGATGTCCAGATGAGAGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAATATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTCGACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAACAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCCACTGGAGTCTTTGGCCCTCATTATCTGGAATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCCATTCCAAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGACGGTCTGAGCACACCTGTCCGAGTGACCACAATTCCTCTCTTAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGATAAAGAAACATGGCGACCCAATCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGACTCAAGTTTGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCCCCGTGGACTTCTTTGAAACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCTCACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAGAACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCTGAACTCGTCATCATTTCACATGCAGAGGTGGGGCCATTGACAAGAGGCTCTGGACTCACCTCCTGAACCTCCCCGACGTCTCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCTACACTCAACAAAAAGTGA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| 44,934
|
MT162445.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
FR-14-58
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,159
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
1990
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate FR-14-58, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTACAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAAATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCGTAATCGTTGAACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGACTTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTCGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAGGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGAGGACGATAAGAAGGTGATTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTACAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAACACACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGTCAGGGCCACCAGCATCGAGGCGGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTCAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTTACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTGGCAGACACCCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCCGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCGTTCATCCTGACCGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACCTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTATGCTATCATGATGAGCCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCCCAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGTGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCGGATGTCATAAGGGAGGCGGCCAAACAGCACGCGCGCAGGACATCTGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTTCACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGGGGGGTCCGACGATGACGACTACCCCGAGGACTCTGACTAGAAGGCACTCCCGTCTCATAACCAACCTAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGACAAACACCGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCCTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAAGAGACTAGACAACGCCCCCAAAGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCCACCTCAGGGTCTACCAGGCAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGACCAATCCAACGACGCTGGAGGAAATCATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTGAGACGCATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAGAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCGATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGCTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGCTCGGTCAAACGGGCAGCTCTTTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAGCTAGAGTAGGGACAACACAACGCATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAACGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAACCAACAACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGGTAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTACACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGACGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGGACCTTACGGACAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCCGTCGAAGAAGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTTGGTAGACCGAAAGGACCGACTCAGGCCTGAGACCACACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAACAAGCGAGACCCACAATGGAATGGAACACTTTTTTCTTGGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGATACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGACGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACCCAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTAACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATCGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAAACTGTCTCGTCAGGAGGCCACAAACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACTCCTACAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTTACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGACAGACTGGATCAAGACCGACCTGGGGGACCTGATCCAGGTGACAGGACCGGGGGGCACGAGGAAACTGACTCCAAGGAAGTGTGTCAATACCGATGTCCAGATGAGGGGGGCAACGGACGACTTTTCCTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCACAGTGACATCACCGCCTCTGGGAAAATATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCGCACTATCTTCTGGACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTACGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGTACTGTGTTTGTCTCCAACACATCCGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTTTGGCCATCATTATCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCCATTCCAAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGCTCTCCAGAAGTCAGACGGTCTGAGCACACCTGTCCGAATGACCACAACTCCTCTCCTAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTGTGACAAAGAAACATGGCGACCCAACCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGCGAAATGATCACACACAGACTCAAATTTGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCACCGTGGACTTCTTTGAGACGACCCTCCCCAGGATCCTGGATGATCTGAGGGCCAGTGCACGGCTTCCTCACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAGAACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGCAGGCCGACAGATCCTGGACTCGTCATCATCTCACATGCAGAGGTGGGGCTATTGACAAGAGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCGCCGTCTCTCAGATAGAAAAAAATGGTACTTTTGTTGTTTGTAATCCTACACTCAACAAAAAGTGA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| 44,935
|
MT162446.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
3771P
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,165
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
1990
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate 3771P, complete genome
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GTATAATAAAAAGATGATGAGTTATGTTACAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATTAACGGCACATAAGTAGCAAAAAAGTTTTTCAAAGTTTGAGATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTGGACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGAATTCGTGAAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACTGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGACGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGCGGAAGATAGGAAGGTGATTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTACAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAACACACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGCCAGGGCCACGAGCATCGAGGCGGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTCAAGGGGACCTTGATGACATGCTCTCTTCTCACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACTAAGAAACTCGGGGAGCTAGCAGACACCCAAGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCGTTCATCCTGACCGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGTATGACCATGATTGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACCTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAGGTCCATCCAAGAACGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCTGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTTCACAGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGGGGGGTCCGATGATGACGACTACCCCGAAGACTCCGACTAAAAGGCACTCCCGTCTCATAACCAACACAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGACAAACACTGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCCTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAAGAGACTAGACAACGCCCCTAAAGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCCACCTCAGGGTCTACCAGGCAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACCCTGGAAGAAATCATTGGACACTTCGTCCCCGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAGGAAAACGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCCATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATTGCCATGAAGAAGTTCAAGCTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGTGGAGCTGGACAAACTAGAGTAGGGACAACACAACGCATCACACAGATAGAAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAACCAACAACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTAGTTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTACACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGAACCCTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCCGTCGAAGAGGAGCTAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCCTGGTAGACCGAAAGGACCGACTCAGGCTTGAGACCACACTCTCACTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAACAAGCTAGACCCACAATGGAATGGAACACTTTCTTCTTGGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTTGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGACGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACCAAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGCGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATTGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAAACTGTCTCGTCAGGAGGCCACAGACGAGGCAAGCAAGGACCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTACTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATCGAAGGGGTCTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGCGCCACACCCAAAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGGCAGATTGGATCAAGACTGACCTGGGAGACCTGATCCAGGTGACAGGACCGGGGGGCACGGGGAAACTGACTCCAAATAAGTGTGTCAATACTGATGTCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAATATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTAGACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAACAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCCACTGGAGTCTTTGGCCCTCATTGTCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTACTGGTGCTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCAACTCCAAACTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGACGGTCTGAGCACACCTGTCCGAGCGACCACAATTCCTCTCTTAGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGACAAAGAAACATGGCGACCCAACCAGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGTGAGATGATCACACACAGACTCAAATTTGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCCCCGTGGACTTCTTTGAGACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGCACACGGCTTCCTCACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAGAACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCTGAACTCGTCATCATTTCACATGCAGAGGTGGGGCTATTGACAAGAGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCGACGTCTCCCAGATAGAAAAAAAAAGGCACTTTTGTTGTTTGAAATCCTACACTCAACAAA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| 44,936
|
MT162447.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
MM73
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,159
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
2014
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate MM73, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTGCAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTCTGAAATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTAAACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGAATTCGCTCAGCGTTCTCAGGCCTGAATGATGTCAGGATTGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGAGGAAGATAGGAAGTTGGTTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTGCAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAACACACAAGAGGACCTAGAAACCAAGTGCGGGGTCCTTACAGACATGGGCTTCAGGGTGACACAGGCAGTCAGGGCCACGAGCATTGAGGCGGGAATCGTGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGACATCGTCAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTTACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTGGCAGATACCCAGGGAGTTGGGGAGCTGCAGCACTTCACCGCCGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGCGTGCGTCCCGGTCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCGTTCATCCTGACCGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGACTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGTTGTTCACACAGGCCGCCAACAACCTGGGCATTGCCCCGGCAAGGCTGCTCGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCGGAGGCTAAGTCAATCCAAGAGCGCTACGCCATTATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCCTACATTTTGTCACAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTTGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTTCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCATGCGCACAGGACATCCAACAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTCCACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGATGGGGGAGTCCGATGATGACGACTACCCCGAGGACTCTGACTAAAAGGCACTCCCGTCTCACAACCAACACAGATAGAAAAAAATGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGTAAGACAAACACTGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCCTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAGGAGACTGGACAACGCCCCTAAGGACAACAGGTCAGCTCTTTTCTCATCTACCTCAGGGTCCACCAGGCAAAAATCAAGTTCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACACTGGAGGAAATGATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTTAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACCCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAATCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCCCAAAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATCCTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAATCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGCTGGAGGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAGCTAGAGTAGAGACAACACAACGCATCACACAGACAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACAAACTCCCAAAGAGATACGCTCCAGCAGTCAGCAAACCCCAGACAACCAACCACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCTCCCCCCCACCTCACGTCCAACGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACATCCAGCCTTCAATCCCCTGGCTCATCTGTTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGTGAGAAGATCGACTTCGGGACTCGCAGCAAGACCCTGACAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTACACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACCTACTATGGTCCGTTCATATTTGCGGACGACCACGTCGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAACTAGGGGCACTACATGGATTCCTCCAGTCCGGACCCTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCCGTCGAAGAAGAGATGGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGCTCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTTGGTAGACCGAAATGACTGACCCAGGCTTGAGACCACACTCTCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGCACACAACGAGCTAGACCCACAATGGAATGGAACACTTTTTTCTTGGTGGTCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAGAATATCTCGACGTACCATGCAGACTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGACGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCGGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTCTCCGTCCCAACCAGGATCATCCATCTCCCGCTATCGGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGTGGCCACTACCTGCACAAAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATCGAAAAGACCATCTTGGAGGCAAAACTGTCTCGTCAGGAGGCCACAGACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCACAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTCTCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTCTGCAAAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAAGGAGTCTATTGGGTCGGTGACACACCCGAAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGGTCCATGATCACATGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTTTGCGGGGAAAATTGGATCAAGACTGACCTGGGGGATCTGATCCAGGTGACAGGACCGGAGGGCACGAGGAAACTGACTCCAAACAAGTGTGTCAACACCGATGTCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTCTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCACAGTGACATCACCGCTTCTGGGAAAGTATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGGCCTGGCAAGGCACACTATCTTCTCGATGGCCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACGGCACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAAAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCCCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTTTCCACTAATTACATCCACACCAACCTAATTCCTTCGGATTGGTCATTCCACTGGAGTCTTTGGCCATCATTATCGGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCCATTCCAAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGATGGTCTGAGCACACCTGTCCGAACTACCACAATTCCTCTCTTAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGACAAAGAAACATGGCGACCAAATCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGCACTCCGCGAGATGATCACACACAGACTCAAGTTTGATCCAAGCAACTATCTCAACTGTGACTTCGATCGGTCGGACATATCCACCGTGGACTTCTTTGAAACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGCACACGGCTTCCTCACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGGGAACCCACTACATGTTCAGGAATGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGCAGGCCGACAGACCCCGGACTCGTCATCATTTCACATGAAGAGGTGGGACTATTGACAAGAGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCGACGCCTCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCTCCACTCAGCAAAAAGTGA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| 44,937
|
MT162448.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
1236.01
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,158
|
GenBank
| null |
France
|
France
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
2014
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate 1236.01, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTGCAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAAATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTGAACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGACTTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTCAGGATTGACCCCACTGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGAGGAAGACAGGAAGGTGATTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTACAGGCGCTGTCCGTGCTCCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAACATACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCGGGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACGCAGGGAGTCAGGGCCACGAGCATTGAGGCGGGAATCACGATGCCCATGAGAGAACTGGCCTTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGACATCGTCAAGGGGACCCTGATGACATGCTCCCTTCTTACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTTGGGGAGCTGGCAGATACCCAGGGAGTTGGGGAGCTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCGTTCATCCTGACTGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGACTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACCTGGGCATTGCCCCGGCAAGGCTGCTTGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAGGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCCGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCACAGGACATCTGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTCCACCGGAAGGGGGAAGGGGCAGGAGACGGGGGAGTCCGATGATGACGACTACCCCGAGGACTCCGACTAAAAGGCACTCCCGTCTCACAACAAACACAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGAAAAACACTGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCCTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAGGAAACTGGACAACGCCCCTAAGGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCTACCTCAGGGTCCACCAGGCAAGGGTCAGGCTCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACACTGGAGGAAATGATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTGGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTCACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCCCAAAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAGGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGCTGGAAGACCCCCTTGCACTCTGCAAAGGCTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATACGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAGCTAGAGTAGAGACAACACAACGCACCACACAGACAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCGAGCACACAAACCTCCAAAGAGATACGCTCCAGCAGCCAGCAAACCTCAGGCAACCAACCACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCTCCTCCTCACCTCACGTCCAACGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGCCGACAAGATCTGTATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACATCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTGTTCCAGAGTGCCATGATCTTTGGAGAAACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGCAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAGGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTACACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACCTACTATGGTCCGTTCATATTTGCGGATGACCACGTCGGAGGGAAAGGCCATCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCCGGACCCTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAAGAAGAGATGGGCATCCCCCCAGGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTTGGTAGACCAAAAGGACTGACCCAGGCTTGAGACCACACTCTCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAAAAAGCGAGACCAACAATGGAATGGAACACTTTTTTCCTGGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGACTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGACGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCGTCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACCAGGATCATCCATCTCCCGCTATCGGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCGGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATCGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAAACTGTCCCGTCAGGAGGCCTCAGACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAGACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTACTACAAGACCCCAAAAACCGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACCCACTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGACACACCCAAGGCCCATTGCCCCACGCCAGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCACGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGGGAGCGTGGATTAAGACTGACCTGGGGGACCTGATCCAGGTGACAGGACCGGAGGGCACGAGGAAACTGACTCCAAACAAGTGTGTCAACACCGATGTCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTCTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAGTATCCCCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGGCCTGGCAAGGCACACTATCTTCTCGACGGCCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTGGACAACAACACAGATGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAAAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATCGTGTTCGTCTCCAACACATCTGACCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTTTGGCCATCATTATCGGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCCTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCCATTCCAAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGATGGTCTGAGCACACCCGTTCGAACTACCACAATTCCTCTCCTAGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGATAAAGAAACATGGCGACCAAACCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTAGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGACTCAAATTCGATCCAAGCCACTATCTCAACTGTGACTTCGATCGGTCGGACATATCCACCGTGGACTTCTTTGAAACGACCCTCCCAAGGATCCTAGAAGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCTCACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGGGAACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACTACCGGCAGGCTGACAGATCCTGGACTCGTCATCATTTCACATGCAGAGGTGGGACTACTGACAAGAGGCTCTGGGCTCACCTCTTGAACCTCCCCGCCGTCCCTCAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTGTTGTTTGTAATCCTACACTCAACCAAAAGTAAC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| 44,938
|
MT162449.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
DK-3592B
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,183
|
GenBank
| null |
Denmark
|
Denmark
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
1986
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate DK-3592B, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTACAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAAATTCCAAGGATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTGAACAAAAGAACTCCAGAGCAGATCTAGTCGAAGAATGGAAGGAGGACTTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGACGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGATGAAGACAGGAAGGTGATTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTACAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAACACACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGTCAGGGCCACGAGCATCGAGGCGGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTCAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTTACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTGGCAGACACCCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCGTTCATCCTGACCGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCAATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTACTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATTAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAAGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCTGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTCCACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGGGGAGTCCGATGATGACGACTACCCCGAGGACTCCGACTAAAAGGCACTCAGAGCGAGATCTCCGTCTCATAACCAACACAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGACAAACACTGAAATCACACAATGGCTGACATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCCTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAAGAGACTAGACAACGCCCCCAAAGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCCACCTCAGGGTCCACCAGGCAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACACTGGAGGAAATTATTGGCCACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCCTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAACGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGCTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAGCTAGAGTAGGGACAACACAACGCATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAACCAACAACTCAAGACATGACTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACTATCCTGGTTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGGTCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAAGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTACACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTTCAGTCTGAACCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCCGTCGAAGAAGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTTGGTAGACCGAAAGGACCGACTCAGGCTTGAGACCACACTCTCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTATACAACAAGCTAGACCCACAATGGAATGGAACACTTTTTTCTTGGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGACGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTCTCCGTCCCAACCAAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTCGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATTGAAAAGACCATCTTAGAGGCGAAACTGTCTCGTCAGGAGGCCACAGACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCCAAAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGGCAGAATGGATCAAGACTGACCTGGGAGACCTGATCCAGGTAACAGGACCGGGGGGCACGGGGAAACTGACTCCAAAGAAGTGTGTCAATGCTGATGTCCAGATGAGGGGGGCAACAGATGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAATATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTCAACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAACAGCGCTCAATACAAGACAGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCACCGTGTTTGTCTCCAACACATCCGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCCACTGGAGTATTTGGCCCTCATTATCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCCATTCCAAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGACGGTCTGAACACACCTGTCCGAATGACCACAATTCCTCCATTAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGATAAAGAAACATGGCGACCCAACCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGACTCAAATTTGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCCCCGTGGACTTCTTTGAAACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCTCACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAGAACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGCAGGCTGACAGATCCTGAACTCGTCATCATCTCACATGCAGAGGTGGGGCTATTGACAAGAGGCTCTGGGCTCCCCTCCTGAACCTCCCCGACGTCTCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGT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| 44,939
|
MT162450.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
DK-203490
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,157
|
GenBank
| null |
Denmark
|
Denmark
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
2003
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate DK-203490, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTACAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAGATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTGGACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGAATTCGTGAAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACTGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGACGTGGAGCTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGAGGAAGATAAAAAGGTGGTTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTACAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCTTATGTACTCCAAGGGAACACACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGTCAGGGCCACGAGCATCGAGGCGGGAATCACGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTCAAGGGGACCTTGATGACATGCTCTCTTCTCACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACTAAGAAACTCGGGGAGCTAGCAGACACCCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCGTTCATCCTGACCGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGCATGACCATGATTGGGCTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACCTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAGGTCCATCCAAGAACGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTTGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCTGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTTCACAGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGGGGGGTCCGATGATGACGACTACCCCGAAGATTCCGACTGAGGGGCACTCCCGTCTCACAACCAACACAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAACGCAAGACAAACACCGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCCTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAAGAGACTAGACAACGCCCCTAAAGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCCACCTCAGGGTCTACCAGGCAAAAATCAAATCCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACCCTGGAAGAAATCATTGGACACTTCGTCCCCGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAGGAAAACGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTTGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGGTTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATTGCCATGAAGAAGTTCAAGCTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATACGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAACTAGAGTAGGGACAACACAACGCATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTCAGCAAAACCCCAGGCAACCAACAACCCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTAGTTCCTCCTCCTCACCTCACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGTGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATTTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTACACCACCCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGAACCCTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCCGTCGAAGAGGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCCGGAACCTCCTCTGTCCGACCTTGGTAGACCGAAAGGACCGACTCAGGCCCGAGACCACACTCTCACTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGTACACAACAAGCTATACCCATGGAATGGAATACTTTCTTCTTGGTGATCTTGATCATCATTATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTTGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGACGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAGGACATAAACAGGGGACTGGTTTCCGTCCCAACCAAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGCGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATTGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAAACTGTCTCGTCAGGAGGCCACAGACGAGGCAAGCAAGGACCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATCGAAGGGGTCTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGCGCCACACCCAAAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGAAAGACTGGATCAAGACTGACCTGGGAGACCTGATCCAGGTGACAGGACCGGGGGGCACGGGGAAACTGACTCCAAATAAGTGTGTCAACACTGATGTCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAGTGTCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTAGACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAACAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTGGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCTGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCCACTGGAGTCTTTGGCCCTCATTGTCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTACTGGTGCTTTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCAACTCCAAACTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGATGGTCTGAGCACACCTGTCCGAGCGACCACTATTCCTCTCTTAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGACAAAGAAACATGGCGACCCAACCAGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGTGAGATGATCACACACAGACTCAAATTTGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCCCCGTGGACTTCTTTGAGACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCTCACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTTCTAGAGAGAACCTACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCTGAACTCGTCATCATTTCATATGCAGAGGTGGGGCTATTGACAAGAGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCGACGTCCCTCAGATAGAAAAAAAAGGCACTTTTGTTGTTTGAAATCCTACACTCAACAAAAAGCGACC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| 44,940
|
MT162451.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
DK-Hededam
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,160
|
GenBank
| null |
Denmark
|
Denmark
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
1970
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate DK-Hededam, complete genome
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GTATCATAAAAGATGATGAGTTATGTTACAAGGGACAGGAAAAAAGAAAATAACGGCACATAAGTAGCAAAAAGTTTTCAAGTTTGAAATTCCAAGAATTTGGAAAGTGAAAGTTGAACACAGAGTCATATCTCATAATCGTTGAACAAAAGAACTCAGTCGAAGAATGGAAGGAGGAATTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATTGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAGCTCGTCGTGTATGTCGGTGGACCCGGCGAGGAAGATAGGAAGGTGACCGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTACAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAATACACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGCCAGGGCTACGAGCATCGAGGCAGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTTAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTGACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTGGCAGACACCCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCATTCATCCTGACTGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGTTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCCTACATTCTGTCACAGATCAGCGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCGGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCCGCCAAGCCAGAGCCAAGGGCCCGCAACTTCAGGAGCTTCACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGAAGGAGGGGTCCGATGATGACGACTACCCCGAGGACTCTGACTAAAAGACACTCCCGTCTCACAACCAACATAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGACAAACACTGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCTTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGATAAGAAACTAGACAACGCCCCTAAGGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCTACCTCAGGGTCTACCAGGCAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACGACGCTGGAGGAAATCATTGGACACTTCGTCCCTGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTGAGACGCATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTAGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTTTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGAGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGTTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAGTTAGAGTAGGGACAACACAATGCATCACACAGATAGAAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAACCTACAACTAAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGGAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGCGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATAACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTATACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGGACCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAAGAAGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTTGGTAGACCGAAAGGACCGACTCAGGTTTGAGACCACACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGCACACAACAAGCTAGACCCACAATGGAATGGAATACTTTTTTCTTGGTGATCTTGATCATCATCATAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTCTACACTCATCCCTCCAACTGCAGGGAAGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTCTCCGTCCCAACTCAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGAGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGACAAACCATCGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAAATTGTCTCGTCAGGAGGCCACAAACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTTTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCTAAAGCCCATTGCCCCACGTCGGAAACACTAGAGGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGACAGACTGGATCAAGACCGACCTGGGGGACCTGATCAAGGTGACAGGACCGGGGGGCGCGAGGAAACTGACTCCAAAAAAGTGTGTCAATGCCGACATCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCTGGGAAAATATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTCGACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATAGCGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCCGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCCGATCTTTCCACTAATCACATCCAAACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTTTGGCCATCATTATCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGCCCTCTCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCTATTCCAAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGACGGTCTGAGCACACCTGTCCGAATGACCACAATTCTTCTCTTAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGATAAAGAAACATGGCGACCCAACCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGCGAGATGATCACATACAGACTCAAATTCGACCCAAGCAACTATCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCTCCATGGACTTCTTTGAAACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCCTACCTCCATGTGCTTGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAGAACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCTGGACTCATCATTATTTCACATGCGGAGGTGGGGATATTGACAAGTGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTACCCGCCGTCTCTCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCTACACTCAACAAAAAGTG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| 44,941
|
MT162452.1
|
Viral hemorrhagic septicemia virus
|
Panzarin,V., Cuenca,A., Gastaldelli,M., Alencar,A.L.F., Pascoli,F., Morin,T., Blanchard,Y., Cabon,J., Louboutin,L., Ryder,D., Abbadi,M., Toffan,A., Dopazo,C.P., Biacchesi,S., Bremont,M., Olesen,N.J.
|
National Institute of Aquatic Resources, Unit for fish and shellfish diseases
|
Denmark
|
2020-12-28
|
F1
|
Novirhabdovirus piscine
|
Novirhabdovirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,845
|
GenBank
| null |
Denmark
|
Denmark
|
Oncorhynchus mykiss
| null |
1962
| null | null |
Viral hemorrhagic septicemia virus isolate F1, complete genome
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ATGGAAGGAGGAATTCGTGCAGCGTTTTCAGGCCTGAATGATGTTAGGATCGACCCCACCGGTGGAGAGGGACGGGTACTTGTACCTGGTGAAGTGGAACTCATCGTGTATGTTGGTGGATTTGGTGATGAAGATAGGAAGGTGATTGTGGATGCACTCTCCGCACTCGGGGGACCCCAGACTGTGCAGGCGTTGTCCGTGCTTCTCTCCTATGTACTCCAAGGGAATACACAGGAGGACCTAGAAACAAAGTGCAAGGTCCTCACAGACATGGGCTTCAAGGTGACACAGGCAGCCAGGGCTACGAGCATCGAGGCAGGAATCATGATGCCCATGAGAGAACTGGCCCTGACTGTCAATGACGACAACCTCATGGAAATCGTGAAGGGGACCTTGATGACATGCTCCCTTCTGACCAAGTACTCGGTGGACAAGATGATCAAGTACATCACCAAGAAACTCGGGGAGCTGGCAGACACTCAGGGAGTTGGGGAACTGCAGCACTTCACCGCTGACAAGGCAGCCATCAGGAAACTCGCAGGGTGTGTGCGTCCCGGGCAGAAGATCACCAAGGCCCTCTATGCATTCATCCTGACCGAGATCGCAGACCCCACCACCCAGTCGAGGGCCCGAGCCATGGGGGCGTTGAGGCTCAACGGGACAGGAATGACCATGATTGGGCTGTTCACCCAGGCCGCCAACAACTTGGGCATTGCCCCGGCAAAGCTGCTGGAGGACCTCTGCATGGAGTCCCTGGTTGAGTCAGCCAGACGGATCATCCAGTTGATGAGACAGGTGTCAGAGGCGAAGTCCATCCAAGAGCGCTACGCCATCATGATGAGTCGGATGCTGGGAGAGTCCTACTACAAGTCGTATGGACTCAATGACAACTCCAAGATCTCTTACATTCTGTCACAGATCAGTGGGAAGTACGCAGTGGACTCCCTGGAAGGCCTGGAGGGGATCAAGGTGACAGAGAAGTTCCGCGAGTTCGCTGAGCTTGTTGCAGAAGTCCTGGTGGACAAGTACGAGAGGATTGGAGAGGACAGCACGGAGGTCTCAGATGTCATCAGGGAGGCGGCCAGACAGCACGCGCGCAGGACATCCGCCAAGCCAGAGCCAAAGGCCCGCAACTTCAGGAGCTCCACCGGAAGGGGGAAGGAGCAGGAGACGGGGGGGTCCGATGATGACGACTACCCCGAGGACTCTGACTAAAAGACACTCCCGTCTCATAACCAACATAGATAGAAAAAAACGGCACGATTATAAGAATTTCTCTTTGATCAAAGCAAGACAAACACTGAAATCACACAATGGCTGATATTGAGATGAGCGAGTCCTTGGTCCTGTCCCATGGATCCCTAGCTGACCTGGACAAGAAACTAGACAACGCCCCTAAGGACAACAGGTCAGCTCTTTTTTCATCTACCTCAGGGTCTACCAGGCAAAAATCAAGTCCCAAGAAGAAGCCCAATCCAACAACGCTGGAGGAGATTATTGGACACTTCGTCCCCGAAGATCTCCAACTAGACGCCACAAAGGCCTTTGGACAGCTCCTGAGACGTATCAAGATGTCCCATCAAGAAGAACTTACTCAACACCTGGAGAAGGTCAACGGGGAAAACCGGGCCAAGATGGGAGCCCTCCTGGAGTCTCAAAAGGAAAATGGGAAGAAGACCGACAACATACTCTCAATCCTCATCGCTATGCGGGGAGAAGGGGCGGAAAATGCATCCAAAAAGCCCAAGGTTCTCGATGGGGACCAGGTCCGGAATGAGAGGGCACTTGGATTCAACCGGGGACTGACCACAGCTGCCATCGCCATGAAGAAGTTCAAGTTGGAAGATCCCCTTGCACTCTGCAAAGGTTCGGTCAAACGGGCAGCTCTCTCCGCCATGGAAAAGGAGGAATATGACGGGGAGCGAGAGACCTACTCCACAGTTTCAAAAGCGATCAAGGCGGAGCTGGACAAGTTAGAGTAGGGACAACACAATGTATCACACAGATAGAAAAAAACGGCACGACTGTTCAAGCACACCAACTCCCAAAGAGAGACGCTCCAGCAGTTAGCAAACCCCAGGCAACCTACAACTCAAGACATGGCTCTGTTCAAAAGAAAGCGCACCATCCTGGTTCCTCCTCCTCACCTTACGTCCAATGATGAGGACCGTGTCTCCACCATCCTGACGGAAGGCACCCTCACCATCACGGGCCCTCCTCCGGGAAACCAGGTCGACAAGATCTGCATGGCTATGAAGCTTGCTCGAGCCATTCTCTGCGAGGATCAACACCCAGCCTTCAATCCCCTGGTTCATCTATTCCAGAGTGCTATGATCTTTGGAGAAACCAGCGAGAAGATTGACTTCGGGACTCGCAGTAAGACCCTGATCACAAGCTTCAAGATAGCTGAAGCAAAGGCCATCTACCTGGATTCAAGTCCGGTGAGATCTCGCATAGAGGCCAAGAAGTATACCACTCCCATTAGACATGGGAGTGTGACTTACTATGGTCCGTTCATATTTGCAGATGACCACGTTGGAGGGAAAGGCCACCGCGAGAAGCTAGGGGCACTATGTGGATTCCTCCAGTCTGGACCTTACGGGCAGGCGAAGGACTACTACAATCGTGCTGTCGAAGAAGAGATAGGCATTCCCCCAAGGGACCCGAAGCGCAGATCTGGAACCTCCTCTGTCCGACCTCGGTAGACCGAAAGGACTGACTCAGGTCTGAGACCACACTCCCATTAGATAGAAAAAAATGGCACATTTGTGCACACAATAAGCTAGACCCACAATGGAATGGAATACTTTTTTCTTGGTGATCTTGATCATCATCTTAAAGAGCACCACACCACAGATCACTCAACGACCTCCGGTCGAAAACATCTCGACGTACCATGCAGATTGGGACACTCCGCTATACACTCATCCCGCCAACTGCAGGGAAGATTCCTTTGTCCCGATTCGACCAGCTCAACTCAGGTGTCCTCATGAATTTGAAGACATAAACAAGGGACTGGTTTCCGTCCCAACTCAGATCATCCATCTCCCGCTATCAGTCACCAGCGTCTCCGCAGTAGCGAGTGGCCACTACCTGCACAGAGTGACTTATCGCGTCACCTGTTCGACCAGCTTCTTTGGAGGGCAAACCATCGAAAAGACCATCTTGGAGGCGAAATTGTCTCGTCAGGAGGCCACAAACGAGGCAAGCAAGGATCACGAGTACCCGTTCTTCCCTGAACCCTCCTGCATCTGGATGAAAAACAATGTCCATAAGGACATAACTCACTATTACAAGACCCCAAAAACAGTATCGGTGGATCTCTACAGCAGGAAATTTCTCAACCCTGATTTCATAGAGGGGGTCTGCACAACCTCGCCCTGTCAAACTCATTGGCAGGGAGTCTATTGGGTCGGTGCCACACCTACAGCCCATTGCCCCGAGTCGGAAACACTAGAAGGACACCTGTTCACCAGGACCCATGATCACAGGGTGGTCAAGGCAATTGTGGCAGGCCATCATCCCTGGGGACTCACAATGGCATGCACAGTGACATTCTGCGGGACAGAATGGATCAAGACCGACCTGGGGGACCTGATCAAGGTGACAGGACCGGGGGGCGCGAGGAAACTGACTCCAAAAAAATGTGTCAATGCCGATATCCAGATGAGGGGGGCAACAGACGACTTTTCTTATCTCAACCATCTCATCACCAACATGGCTCAAAGAACCGAGTGCCTAGATGCCCATAGTGATATCACCGCTTCGGGGAAAATATCCTCATTTCTCCTCTCAAAGTTTCGTCCCAGCCACCCTGGACCCGGCAAGGCACACTATCTTCTCGACGGTCAAATCATGCGAGGTGACTGTGACTATGAGGCAGTAGTCAGCATCAACTACAATCGTGCTCAATACAAGACGGTGAACAACACATGGAAATCATGGAAACGGGTAGACAACAACACAGACGGGTACGATGGGATGATATTTGGGGACAAATTGATCATCCCGGACATCGAGAAGTATCAGAGTGTCTATGACAGTGGAATGCTCGTTCAAAGAAACCTTGTGGAAGTCCCTCATCTGAGCATTGTGTTTGTCTCCAACACATCCGATCTTTCCACTAATCACATCCACACCAACCTAATCCCTTCGGATTGGTCATTCAACTGGAGTCTTTGGCCATCATTATCTGGGATGGGGGTTGTGGGAGGGGCCTTCCTTCTACTGGTACTCTGCTGTTGCTGCAAGGCGTCCCCTCCTATTCCAAATTACGGGATTCCGATGCAGCAGTTCTCCAGAAGTCAGACGGTCTGAGCACACCTGTCCGAATGACCACAATTCTTCTCTTAGGTAGATAGAAAAAAATGGCACCTTTATGATAAAGAAACATGGCGACCCAACCCGCGCTCAGCACAACCAGCTTCTCTCCGCTCGTCCTCCGCGAGATGATCACACACAGACTCAAATTTGACCCAAGCAACTACCTCAACTGTGACCTTGATCGGTCGGACATATCCACCATGGACTTCTTTGAAACGACCCTCCCCAGGATCCTAGATGATCTGAGGGCCAGTACACGGCTTCCCTACCTCCATGTGCTCGACATGAGGATAAGTCTCCTAGAGAGAACCCACTACATGTTCAGGAACGTCCCCTCTAGTCCCGCCACAACCGGTAGGCTGACAGATCCTGGACTCATCATTATTTCACATGCGGAGGTGGGGATATTGACAAGTGGCTCTGGGCTCACCTCCTGAACCTCCCCGCCGTCTCTCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTTGTTTGTAATCCTACACTCAACAAAAAGTGACCCTACAGGGGGTAATACCTGACAAAATAAAGTTAGATCGCCTTACAGCAACCATGGAAATGTTTGAACTAGACCGGGAAGTACACCAGGAACGACTTCCTTCGGAATGTTCACTCAACGCTCCCCTAAACCTCTCCCTATCCCTCCAGCTCTTCGGGCGCTTGGC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