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MH108977.1
Citrus tatter leaf virus
Tan,S.-H., Osmen,F., Bodaghi,S., Dang,T., Greer,G., Abu-Hajar,S., Hammado,S., Vidalakis,G.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2018-10-28
TL102
Apple stem grooving virus
Capillovirus
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67,712
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Citrus tatter leaf virus
Tan,S.-H., Osmen,F., Bodaghi,S., Dang,T., Greer,G., Abu-Hajar,S., Hammado,S., Vidalakis,G.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2018-10-28
TL103
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Citrus tatter leaf virus
Tan,S.-H., Osmen,F., Bodaghi,S., Dang,T., Greer,G., Abu-Hajar,S., Hammado,S., Vidalakis,G.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
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TL104
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
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GenBank
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China
China
Citrus
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1987
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Citrus tatter leaf virus isolate TL104, complete genome
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67,714
MH108980.1
Citrus tatter leaf virus
Tan,S.-H., Osmen,F., Bodaghi,S., Dang,T., Greer,G., Abu-Hajar,S., Hammado,S., Vidalakis,G.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2018-10-28
TL110
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
6,495
GenBank
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USA: California
USA
Citrus
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1989
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University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2018-10-28
TL111
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
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GenBank
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67,716
MH108982.1
Citrus tatter leaf virus
Tan,S.-H., Osmen,F., Bodaghi,S., Dang,T., Greer,G., Abu-Hajar,S., Hammado,S., Vidalakis,G.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
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2018-10-28
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China
China
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67,718
MH108984.1
Citrus tatter leaf virus
Tan,S.-H., Osmen,F., Bodaghi,S., Dang,T., Greer,G., Abu-Hajar,S., Hammado,S., Vidalakis,G.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
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2018-10-28
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China
China
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67,720
MH108986.1
Citrus tatter leaf virus
Tan,S.-H., Osmen,F., Bodaghi,S., Dang,T., Greer,G., Abu-Hajar,S., Hammado,S., Vidalakis,G.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2018-10-28
IPPN122
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
6,497
GenBank
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China
China
Citrus
null
1992
null
null
Citrus tatter leaf virus isolate IPPN122, complete genome
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67,721
KY706358.1
Citrus tatter leaf virus
Chang,L., Su,H.-J., Hung,T.-H.
National Taiwan University, Plant Pathology and Microbiology
Taiwan
2018-02-20
Ponkan 8
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
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GenBank
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Taiwan
Taiwan
Citrus reticulata
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2012-02
null
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Citrus tatter leaf virus isolate Ponkan 8, complete genome
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72,071
KC588947.1
Citrus tatter leaf virus
Song,Z., Chou,C.Y., Liu,K.H., Li,Z.A.
Citrus Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Science
China
2013-05-19
null
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
6,497
GenBank
null
China
China
Citrus sinensis
null
null
null
null
Citrus tatter leaf virus strain CTLV-XHC, complete genome
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94,120
KC588948.1
Citrus tatter leaf virus
Song,Z., Chou,C.Y., Liu,K.H., Li,Z.A.
Citrus Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Science
China
2013-05-19
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Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
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China
China
Citrus unshiu
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Citrus tatter leaf virus strain CTLV-MTH, complete genome
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94,121
NC_001661.1
Citrus tristeza virus
Karasev,A.V., Hilf,M.E., Garnsey,S.M., Dawson,W.O., Boyko,V.P., Gowda,S., Nikolaeva,O.V., Koonin,E.V., Niblett,C.L., Cline,K., Gumpf,D.J., Lee,R.F., Lewandowski,D.J., Pappu,H.R., Anderson,E.J., Pappu,S.S., Febres,V., Eckloff,R.M.G., McCaffery,M., Boyko,V., Dolja,V.V.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
1995-05-16
null
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,296
RefSeq
4
null
null
null
null
null
null
PRJNA485481
Citrus tristeza virus, complete genome
AATTTCACAAATTCAACCTGTTCGCCCAGAAAATACGTCTGGCACAACAGGGATCCGGAATAGGTCCAGCCTTTAAGCTCTAATATTCCCACAACAAAAATTACACTATGTCGAAACTCAGAGGAAGCTTCTGGTCTTCGGCCATCGCTGTTAACAGCGATTACACGATATCGCGCATCTGGCGCAAACTTAACACCATAGTAGTCCTGCACTACTTTGGTTTTGTTAGAATCACCAAGGTGATTCGTGACAAATCGGCTGATATGCCGATAGTCCCTTTACGGAAATCTGTATTTCCGTTTTCTGTTCGCGCGGCTGTCACGAGCTTCGTGCTGCTGGGCGTCCTCTTGACGCTCCGCATTCAGGGTGCCTCTGTGGCCTTCCCGTTATCAACGCATCTGGCGTTGTTCGTCCCCGCTCTGTTCGCGGGTTTTTCGAGGTTTTCTCTGTGCAAACCTCCGCTCACCTCTGCCGCTAAGAGGTCCCTCCGTCAGGCAAAGCGGGAATCTGTTTCCCTTTCTAGCCGGGCCTCTTCTCGCTTCTCTAGGGAAGTCCCTCGCGGCACACGTTCAAGACTTCACAGACGTGTGGTGAGACGAGCTGACACTGCCCCAGTTGAGAGTCCCCAAGACAAGCCTACCCGACGAAACAGCCGACTTGGTAAGACTTCTCACCTCCCTTACGTGGGGGAGGCAGCGTTGGATGATATCCTTCGCTGGATCGAAGAGGTTAATCCTCATCCCTCGATGGTCGCTATTCCAGTGCCCATCACTTTTGGAACCATGCCTGCAACGGCTTGGTGTTCCCACTCTGAAGCCGCAGTTTTGCGTGCCGCCTTGACTATCACGCGGCTGAAACTGATTTCTCCACTCAGGAGAAACACGTACGGTACGTCTATAATGACGTATCTTCTGCCACTAACCGTCCCCGTACGGTTTCTCCCCGCAAGTGCGTCCATTTTTCCCAGTAAATCTAAACTGGGCGTTGAGGTCCCCTCTGGTAGGGACCTTCACACTGCGTTCGTGAGATCTTCTCACGCGAGCGCTTTCTTCTCTGACGCGGTTCGCGCTTCGTTTGTTCCGTCCAGCGCGGAACAATTTTTTCACTTCCGTCGTCAGCGGACGCATGTTCTTGCTATTACAGACCCGGTCCTGTGTGGTACGGTGTCTGTTTTAATGTCGGACGGTGTTAACACAGCACGTCTCGACGTTGTTGCTCCGGCGTACTATGCGTACGCTGAATCTTTGGGCGCCAGAGTGCGCTTTTTGTGGGAGTCGTCCGACGTGGACGACGCTAAAGTTCGTGACGGTCAATGTTATGTCCGTCATGTGTTCGACGTGGCTCTCTACTTTGGGAGACGCGCCGACCTTTCCGTGCGTAGAGCGCTGGGTATGTACCCCACAGTGGGTGCACTAAAGGCTTATCTTGTTCGCGAATACGGTCGCGACTCTCTTAAGGTTCCTATGCGTGGGACCTACACTTTTGGCAGTGTGTTTCACTGCTTGTCGCTAAATCTTCAAGTCGACCTGCGATCTATTCCTAACCATCATTTAGTTGGTGGGACGTCTGCCCACGTCTTAATTGGGCAGGTTCGAGTCAGTGTTCCTGGCTCGATTGTTAAACCTTCACGTTCGGCCGTTCGTAGGCGTAATAGACGCATGCGACGTGATGGTTTTCTCGGTAGTTCCGGTTCTTCTTCTTCTGCGGGGGAGTCGACTCGCTGTTCGGACTGCTCTTCTCCTCGCGGTTTACCTTCTCCTTCCGTTTTAAAACCTTCCCTAGGTCGGATCCCGAGTATAGATCGGCGGTTCCGGTTTCCTGCGGGTACGCAGTTGCGCGTCTCCGTACCTAGGCGGGTCGATGACCATGTTTACGTGTCGACTGGTAGCAACTTCGATGAGTTGTGCCATGCAGTTTTGACACGTATGTCAAAAGGTACAACTCTAGAAATCCTTTTACACTCGATTCGAGAGCGGAAGGGACTACTTGGTTTTGCGGCGTGCTTCCGTTGGGGGTCTTCACACGTGTTTGTAAAGCGTGGCAACTTTACTGCCCGATTTCCTATTTCGGCGGTCAGGTATGAGAATCAGTATGCCGCGGTTATGATGGATGTGGGGACTAGTTGGGTTCCGAAGGGCTACGTTCCCGATGTTGATGTTGTGAAACGTCGGAGAAGTCGTAATCGTCGTTTTCCTCTTTCCCATCGTGCGGTGGATCAGTCGGTCCCCGCGTTACAGTCGAGTCCTGTCGAGGTTGCTTCGGTTTCGAGTGATAAGCCTTCATCGTCGCAGAAGGCTTCTTCACCTTCTACTTCTTCTTCTTCTTCTTTTAACTCGACAAGGAGTTCAGACTGGGTGAATGTCGGTTTCTCTCATCGAACTACTAATAAGGTTCGTGAACCGCGTTATGCTGGTCATCGTAGGATCGGAAATTTTACTTTCCCGAGGGGCACAGTGTACAACACGCCTGTCGATGAGCGCGCCTATAAACGTGTTCTTAGATTGCGAGATACCACAGCCTGTTCCTTTCTCCGTATACTGCTAGCTCGTTTGTCGGGTTACAGACCTTTAAGTGACGAGTTCTTTAACAAGTGTGTCACTTCCCGGTTTGTCGCGTGCATTGAACCTGTGGAATCAGGTCTCGTTAAGGTGCATTTCCGTTCTGATGTTTTCCGTGCCTCTTTCCCGTTTGACGGTCAACCTATACACCCCGCCACGGCTTTGACATTGGAAGTGGTGGTCTCTTGGGATTGGATGGTTACGGCTTTTCAGAATCCCTTGAAGGATGGATATTGCTACATTCGCCATTTCGCCGAAGTTAGTTTGAGCATGGGGCGAATTTTCTTCAGGAGGGACGTCGACTTGGGACCTTTCCCATACGTTTTCGAAGTGCAACACCGTCTTGAAAGGTTGTACGGGAAAGCTGCGTTAAGATACGGTGTTAGGGGTCAATATTCAGCCCCGCGCTGTTTTCACTGTTGCTACAACGATTCACCGAGACCGATGGCGTCCTTTAATGGGTACCATAAGATGGGTGGTGAAGATAACTCCCTGATAATCACAGACACCGACAGGTTGCGTGCTGTGGGGAGTGCCTATGAAAAAGTGAAGAGAAACATACCAGATTCGTTATTGGTTCGGTCTGTAGAAAAGGACCTTATAGAGTTTAATCAGACTCTAGTCGACATGCATCGATCCAGACCGGGCGTTGTCGTACCTTTCCAAATGAGTGAGAATCAGCAAGTGATGCTTACTAGGGCGTACCCGGAATTTAATATTAATTTTATTCATTCCGTACATTCCGATCATCCGGTGGCAGCAGGTTCTAGGGCGTTGGAGAATCATCTCGTTCGTAAACACGCTGGTACCGATTATTCGGATGTGGGGGGTTGTCCGCTGTTTCATTTACGTGCGGGTCACTCCGGCGTTCACGTTTGTAGACCGGTGTACGATGTTAAAGACGCTCATCGTAGAGTAGTCCGTCATCACCAACTTAGTAAGGTTTCGCTAGATCAGAGTGACGGTGTTAAACAAGTTGGCTGGACCGTAAACACGAATTCTGTATGCGGTAACATTTTGGGAGAGTGTTATCATGCATCGGAGGCGATGGTTATGGTTCAAGTTTATGACGTACCGCTACGTGAGTTGTGTAGGGCTATGATAAACAAGAAAACTTCCGTGTGTTATATGACCATGGTTACACCTGGTGAGTTGTTGGACGCCCGCGAGTCCTTTTTTATTAAGGACTTGGATTGTTCGGTTGAGTTAGATCCCATTGCAGACAGGGTTGTTTACTGTTTCAACAATTCTGCGTATACACACACGTACTCCACTATATGTGAGTGTATGCGAACTCCTTGCTTGGTAGTGGACGGGTTTTTGTTTACTATCGAAATGGTATCGCTCAGGTGTAGCGTTAATTACTATTGTATCACCAAGTCGTCGGTCTGTCCGAGAATTAGTGAGACTAAGCGGTTGCGCTACCGTCGGTGTGATAGCGACTTGATTAGAATCAAAATTCCCCGGTACTCCAGTAAGACTCGTAGTTGTTTACCTGGGTGTTACTATTTGTACTTGGACGCCAAGTTTGTAAGTCGCGTGTACGAGTACGTGGTCAATAACTGCGTTGTGGTGAACGCGAAAACTTTTGAGTGGACTTGGAATTACATCAAATCTTGCAAGTCGAGAGTGGTGATCAGCGGGAAGATTATACACCGAGACGAACCAATCGCTTTAGAGTACTTAGATGGGTTTTCTGCGGTTATGCTGTCCGCTGGCGTGAAGGGTAGGCAAAACGCGGACGTTTCTAGACGCTTAGCCGCTTTTTCGGGTGAAACTTCGATTTTCGAGTTAGTGGGGTTTGCTATATCCGAGAAGTGCCGCGACTTGTTCTTGGGTATTCAGGACGCTGTGGAAAGATGCGTGAAGTCGTACCTCAGGAATTCGTTTAATATGAGTTTCGTGGACTTGTCCGACCCCTTACTTACGATTAGCGAATATTCAGAATTGGACGTTCCTATCGACTTACCGGGTTTCGGTGGAATAGTGGACGGTAACGAAACTAGACTTATGGAAGACGGTGTTAAATCGGCTTTATTACGTAAAGCGGTTCAAGCCGAGGCTCAGTTGAGTCTTAAGAGAGGCAATACTTCCGAAATCGTTCCGTGTGATGACGATGACGACTCGAACGGTGATGATTCGCGTGTTTCGCTCGATACGGACTGGTGGTTCGTCCTTCGGGGTGGTAGTTCTGGCGGGTTGCGAGCTGGAGCCGCCCCTTCTTTGTTTAGGTGTTTACTCAGGAAATTGGGTGGGGGTTTATGTTTGGCAAAGAAAGTGTTGGAACTGTTAGTCAAGCGGGTGGTTGAATCGTTTTCTCGTTTGAAGCGGAAAACCGCTCGTTTAACGTCCTTCGCTAATTTGTTGCTTGCGAGGCTCTCTTGCGGGTTTTTCGATGACACTGTTTTTTCTGCGGTCTGGGAAATAGCGATCAACCTGACC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8,905
OR387854.1
Citrus tristeza virus
Licciardello,G., Scuderi,G., Russo,M., Bazzano,M., Bar-Joseph,M., Catara,A., Ferraro,R.
Council of Agriculture Research and Economics, CREA-OFA, Plant Pathology
Italy
2023-10-03
M39D
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,250
GenBank
null
Italy
Italy
Citrus x paradisi
null
null
null
null
Citrus tristeza virus isolate M39D, complete genome
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12,450
OR184846.1
Citrus tristeza virus
Knierim,D., Margaria,P., Skoric,D.
University of Zagreb, Faculty of Science, Department of Biology
Croatia
2023-09-05
9A
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,235
GenBank
null
Croatia: Opuzen
Croatia
Citrus sinensis
null
2022-10
null
null
Citrus tristeza virus isolate 9A, complete genome
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13,090
OR122725.1
Citrus tristeza virus
Zindovic,J., Cizmovic,M., Bozovic,V., Skoric,D., Knierim,D., Margaria,P.
University of Montenegro - Biotechnical Faculty, Department of Plant Protection
Montenegro
2023-08-29
167/18
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,254
GenBank
null
Montenegro
Montenegro
null
null
2018
null
null
Citrus tristeza virus isolate 167/18, complete genome
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13,214
OR122726.1
Citrus tristeza virus
Zindovic,J., Cizmovic,M., Bozovic,V., Skoric,D., Knierim,D., Margaria,P.
University of Montenegro - Biotechnical Faculty, Department of Plant Protection
Montenegro
2023-08-29
127/22
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,253
GenBank
null
Montenegro
Montenegro
Citrus sinensis
null
2022
null
null
Citrus tristeza virus isolate 127/22, complete genome
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13,215
OR122727.1
Citrus tristeza virus
Zindovic,J., Cizmovic,M., Bozovic,V., Skoric,D., Knierim,D., Margaria,P.
University of Montenegro - Biotechnical Faculty, Department of Plant Protection
Montenegro
2023-08-29
151/22-1
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,092
GenBank
null
Montenegro
Montenegro
null
null
2022
null
null
Citrus tristeza virus isolate 151/22-1, complete genome
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13,216
OR122728.1
Citrus tristeza virus
Zindovic,J., Cizmovic,M., Bozovic,V., Skoric,D., Knierim,D., Margaria,P.
University of Montenegro - Biotechnical Faculty, Department of Plant Protection
Montenegro
2023-08-29
151/22-2
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,164
GenBank
null
Montenegro
Montenegro
null
null
2022
null
null
Citrus tristeza virus isolate 151/22-2, complete genome
AACAGGGATCCGGAATAGGTCCAGCCTTTAAGCTCTAATATTCCCACAACAAAAATTACACTATGTCGAAACTCAGAGGAAGCTTCTGGTCTTCGGCTTTCGCTGCTAGCAGCGATTACACGATCTCGCGCATCTGGCGCAAACTTAACACCATAGTAGTCCTGCACTACTTTGGTTCTGATAGAATCACCAAGGTGATTCGTGACGAATCGGCCGATATGCCGATAGTCCCTCTACGGAAATCTGTATTTCCGTTCTCTGTTCGCGCGGCTGTTCGCGCAATTCGTGCCGCCGGGCGTCCTCTTGACGCTCCGCGTTCTGGGTGCCTCTGTGGCAATCCCGTTATCAACGCATCTGGCGTTGTTAGTCCCCGCTCTGTCGCGGGTTTTTCGAGGTTTTCTCTGTGCAAACCTCCCCTCTCCTCCGCCGCTAAGAAGTCCATTCGTCAGGCAAAGCGGGAATCTGTTTCCCCTTTTAGCCGGGCTTCTTCTCTCTTCTCTAGGGAAGTCCCTCGCGGCACACGTTCTAAACTTAGAAGACGTGTAGTGAGAAAATCTGACACCACCCTACCTGAGAGTCCCCAAGACAAGCCGATCCGACAAAACCGCCGACTTGGTAAGACTTCTCACCTCCCTTATATGGGGGAGGCAGCGTTGGATGATATCCTTCGCTGGATTGAAGGGGTTAATCCTCATCCTTCGATGGTCGCTATCCCAGTGCCCATCGCTTTCGGAACCATGTCCGCAACGGCATGGTGTTCTAAGTCTGATGCCGCTGTTTTGCGGTGCCGCTTAAACTATCACGCGGCTGAAACTGATTTCTCCACTCAGGAGAAACATGTGCGGTACGTCTATAATGACGTATCTTCTGCTGCTAACCGTCCTCGTACGGTTTCACCCCGCAAATGCGGGTCTGTTTTTCCCAGTAAATCTAAACTGGGCGTTGAGGTCCCCTCTGGTAGGGACCATCACACTGCGTTCGTGAGATCTTCTCACGCCAGTGCTTTCTTCTCGGACGCGGTTCGCCGCGTTCGTTTGTTCCGCCCTGCGCGGAATAATTTTTTCACTTCCGTCGTCAGCGGACGACGTGTTTGCTACTACAGACCCGGTCCTTGCGGTACGGTGTCTGTCTTCATGTCGGACGGTGTTAACACAGCACGTCTCGACGTCGTTGCTCCGGCGTACTATGCGTACGCTAAGTCTTTGGGCGCCAAAGCGCGCTTTTTGTGGGAGTCGTCCGATTTGGACGACGCTAAAATTCGTGACGGTCAGTGCTATGTCCGTCACGTGTTCGACGTGGCTCTCTACTTTGGGAGACGCGCCGATTTTTCTGTGCGTAGAGCACTGGGCTTGTACCCCACAGTGGGTGCATTTAAAGCTTATCTTGTTCGCGAATATGGTCGCGACTCTCTTAAGGTTCCTATGCGTGGGACCTACACTTTTGGCAGTGTTTTTCACTGCTTGTCGACTGAATCTTCAGTCGACCTGCGATCTATTCCTAACCACCATTTAGTTGGTGGGACATCTGCCCATGTCTTAATTGGGCAGATTCGAGTCAATGTTCCTGGCTCAACTTCTAAACCCTCACGGTCGGCTGTTCGTAGGCGTAACAGACGCATGCGACGTGACGGTTATCTCGGTAGTTCCGGTTCTTCTTCTTTTGTAGAGGAATCGAATTACTGCTCGGATTGCTCTTCTCCTCGCAGTACGCCATCTCCTTCCATTTTAAAACCTTCCCTAGGTCGGGTTCCGAGCATAGATCAGCGGTTCCGGTTTCCTGCGGGTACGCAGTTGCGCGTTTCCGTGCCTAGGCGTGTCGATGACCATGTTTACGTGTCGACCGGTCAAAACTTTGATGAGTTGTGCCACGCGGTTTGCACATACGTCAAAAGGTACAACTCTAGGAAATCCTTTTATACTCGATTCGAGAGTGGTGGAGATTACGTTGTTCTTCGGCGTGCTTCCGTTGGGGGCCTTCACGTATTTGTGAAGCGTGGTAACTTTACTGCTCGATTTCCTATTTCAGCAGTCAGGTATGAGAATCACTACGCCGCAACTATGAAGGATGATAGGATTGGTTGGGTTCCGAAGGGTTACGTTCCCGATGTTGAGATCGTGAAACGTCGGAGAAGTCGTAATCGTCGTCTTCCTCTATCCCGTCGTGTGGTGGACCAATCGGTCCCAGCATTACCGTCGAGTTCCGTTGAGGTTACTTCGGCTTCGAGTGATAGGTCTTCATCATCAGAGAAGGCTTCTACACCTTCATGTGACTCGGTAAGGAGTTCGGATTGGGTGAACGTTGGCTACTCTCGCCGAACTACTACTAATGTTCGTGAATCGCGTTTTACCGGTCGTGGTAAGATAGGGAATTTTACTTTCCCGAGAGGCACTGTGTACAATACACCTGTCGATGAATGTGCCTATAAACGTGTTCTTAAGTTGCGAGATACTACAGCCTGTTCCTTTCTCCGCATATTGCTAGCTCGTTTGTCGAGTTACAGGCCTTTGAGTGATGACTTCTTTAATAAGTGTGTCACTTCTCGATTCGTCGCGTGTATTGAACCTGTGGAATCAGGTCTAGTTAAAGTGCACTTCCGTTCTGATGTTTTCCGTGCTTCTTTCCCGTTTGGGGTTAATCTGTATACCCGCCACGCGTTTGACATTGGAAGTGGTAGTCTTTTGAGATTGGATACTTATGGCTTTTCTGAATCCCTGAAGGAGGGATATTGCTACATTCGCCATTTCGCCGAAGTTAGTTTGAGCATGGGGCGGATTTTCTTCAGGAGGGACGTCGATTTGGGACCTTTCCCTTACATTTTCGAAGTGCAACACCGTCTTGAAAGGTTGTACGGGAAAGCTGCGTCAAGATATGGTGTTAGAGGTCACTACTCAGCCTCGCGCTACTTTCACTGTTGCTACGATGATTCGCCGAAACCGTTGACTTCCTTTAACAAGTACCATAAGATGGGCGGTGAAGATAACTCACTGATAATCACGGACACCGATAGGTTGCGTGCTGTGGGGAGTGCCTATGAAAAGGTGAAAAGAAATATACCCGATTCGTTATTGATTCGGTCCGTGGAAAAGGACCTCATAGAGTTTAATCAGACTCTGGTTGATATGCATCGATCCAGACCGGGTGTTGTCGTACCTTTTCAAATGAGTGAGAACCAGCAAGTAATGCTCACTAGGGCGTACCCAGAGTTTAATATTAATTTTATTCACTCCGTACATTCCGATCATCCGGTAGCTGCAGGTTCTAGGGCGTTGGAGAATCATCTCGTTCGTAAACACGCTGGTACCGATTATTCGGATGTGGGGGGTTGTCCGCTGTTTCATCTACGCGCGGGTCACTCCGGTGTTCATGTTTGTAGACCGGTGTACGATGTTAAAGACGCTCACCGTAGAGTAGTCCGTCATCACCAACTTAACAAGGTTTCGCTAGATCAGAGCGACGGCGTTAAACAAGTTGGTGCGGTAAACACGAACTCCGTGTGTGGTAATACTTTGGGAGAGTGTTATCATGTATCGGAGGCGATAGTTATGGTTCAAGTTTATGACGTACCGCTACATGAGTTGTGTAGGGCTATGATAAACAAGAAAGCTTCCGTGTGTTATATGACCATGGTTACGCCTGGCGAGTTGTTGGATGCCCGTGAGTCCTTTTTTATTAAGGACTTAGATTGTTCGGTCGAGTTGGATCCCGTCGCGGACCAGGTCGTTTACTGTTTCAACAATTCCGCGTATACACACACGTACTCCACTATATGTGAGTATATGCGCACTCCTTGCTTGGTGGTGGACGGGTTTTTGTTTACTATTGAAATGGTGTCGCTCAGGTGTAGTGTTAATTACTATTGCATCACTAAATCGTCGGTCTGTCCAAGAATTAGTGAGACTAAGCGGTTACGCTACCGTCGGTGTGACAGCGACTTGATTAGAATCAAGATTCCCCGGTACTCTAGTAAAACCCGTAGTTGTTTACCTGGGTGTTACTATTTGTACTTGGACGCCAAGTTCGTAAGTCGCGTGTACGAGTACGTGGTCAATAACTGCGTCGTGGTGAACGCAAAAACTTTTGAGTGGACTTGGAATTACATCAAATCTTGCAAGTCGAGAGTGGTGATCAGCGGGAAGATTATACACCGAGACGTTCCGATCGCTCTAGAGTACTTAGACGGGTTTTCTGCCGTTATGTTGTCCGCTGGTGTGAAGGGTAGGCAAAACGCGGAAGCGTTTTCTAGACGCTTAGCTGCTTTTTCAGGTGAAACTTCAATTTTCGAGTTAGTGAGGTTTGCTATTTCCGAGAAGTGCCGCGATTTATTCATGGGTATTCAGGACGCTGTGGAAAGATGCGTGAAATCGTACCTTAGGAACTCGTTTAACATGAGTTTCGTGGACTTGTCCGATCCCTTACTTACGATTAGCGAGTATTCGGAGCTGGACGTTCCTATCAACTTACCAGGTTTCGGTAGGATAGTGGATGGTGACGAAACTAGACTTATGGAAGACGGTATTAAATCGGCATTATTGCGGAAAGCGGTTCGAGACGAGGCACAGTTGAATCTTAAGAGAGGTAACACTTCCGAAATCGTTCCGTGTGAAGACGATGATGACTCGAACGGTGATGATTCACGTGATTCACGCGACTCGGATGGTGGTTCGTCTTCGGGCGGTAGTTCCGGCGGGTTGCGAGCTGGAGCTGCCCCTTCTTTGTTTAGGTGTTTACTCAGGAAGCTGGGTGGGGGTTTATGTTTGGCAAAGAAAGTGTTGGAACTGTTACTCAAGCAGGTGGTTGAATCATTTTCACGTCTGAAACGAAAGACCACTCGTTTAACGTCTTTCGCTAATTTGTTGCTTGCGAGGCTTTCTTGCGGGTTTTTCGATGATTCCGTTTTTTCTGCGGTCTGGGAAATTGCGGTCAACCTGATCAGGATCGTCGATGGAGTAGTTAAGACGAAATTAGAGTGCTTTCGAAATTTGTTTCGATTGATTCCTAAG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13,217
OR122729.1
Citrus tristeza virus
Zindovic,J., Cizmovic,M., Bozovic,V., Skoric,D., Knierim,D., Margaria,P.
University of Montenegro - Biotechnical Faculty, Department of Plant Protection
Montenegro
2023-08-29
151/22-3
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,104
GenBank
null
Montenegro
Montenegro
null
null
2022
null
null
Citrus tristeza virus isolate 151/22-3, complete genome
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13,218
OR122730.1
Citrus tristeza virus
Zindovic,J., Cizmovic,M., Bozovic,V., Skoric,D., Knierim,D., Margaria,P.
University of Montenegro - Biotechnical Faculty, Department of Plant Protection
Montenegro
2023-08-29
166/22
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,228
GenBank
null
Montenegro
Montenegro
Citrus sinensis
null
2022
null
null
Citrus tristeza virus isolate 166/22, complete genome
ACCTGTACCCTCCGGTAAACACGACCGGACGCTGCAGGATTTGGTGTAGGTCCAGCCTTAGGCTCAGCTACCCCCATACAAACAAAACATACATGTCGAAACTCGAAGCTAGCTTCAGGTCCTCGGCTTTCGCTCTACGGAGCGATTATGTAATCTCGCGCATCTGGCGCGCTTTTAACACCATTGGAGTCCTGCACTTCTTTGGCCATGGAAAAATCACTACGGTGATTAAGGAATTTTCGGCTGCTGGGCCGATAGTCCCATTACGGAAATCCTGTTTTCCGTTTTCTGTTCGCGCTGCTGTTCGCGCGATTCTTGCTGCCGGACGTCCCATCGACGCTCCGCGCTCTGGGTGCCTCTGTGGTTCCCCTGTTATCGACGCATCTGGCGTCGTGCGTCCCCGCTCTGTTGCGGGCGTTTGGAGGTATTCTCTGTGCAAACCTCCCCTGACTTCTGCCGCTAAGAGGTCCCTCCGTAAAGCTAAGAAAGATTCTGCCTGCTTTCTTAGCCGGGCTTCTTCACTCTTCTCTCGAAGAGTCCCCTGCGGCACGCGTCATAAACTTCGCCGACGCGTTGTGAACCGACGTAAACCTACCGTGAATGAAGGTCCCCAAGACGAGACAAGAAATCAGGGACGCCGGCACGGCAAGACTTCTGACCTCCCGTACATGGGAGAAGCAGCGTTGGATGATATCCTACGCTGGATCGAGGAGGTTAATCCTCCAGCCTCGATGGTTGCCATCCCGGTACCCATCTCTTTTGGAGCTCTGCCTACTACGGCTTGGTGCTCCCCTTCTGACGCGGCGGTTCTTCGGTGTCGTCTTGACTACCATGCCGCGGAGACTTCTTTTCGTTCAGAGGAGAAGCACGTGAAGTATGTCTACAATGACATATCTTCAACCGCTCACCGTCTTCGTACGGTATCTCCCCGCAAGTGCGGGCGTGTCTTCCCCAGCAATTCCGTGCTGGGTGTCAAGATCCCGACTGGTAGGGATCGTCACACTGCTTTTGTGAGATCTACTCACATTGGGGTGTTTTTCTCTGACGCGGTCCGCCGCGTTCGTATGTTTTGTCCCGCACGGAACAACTTTTTCACTAGCGTCGTCAGCGGGCGGCGTGTTTGTTACTATAGACCTGGGCCTAACGGCACGGTGTCTATCTTTATGTCGGACGGTGCCAATACAGCACGTCTCGACGTTGTTGCTCCTGCGTACTATGCGTACGCTAAAGCTTTGGGTGCCAAAGCTCGTTACTTGTGGGAGTCGTCCGACTTGGACGACGCTAAAGTGCGTGACGGTCAGTGTTACATCCGTCACGTGTATGACGTGGCTCTCTATTACGGGAGGCGCGTTGACCTATTTTCGTGCCGCGCTTTAGGTTTGTATCCTACAGTGGGTGCTTTTAAAAATTTTCTTGTTCGCGAGTATGGTCGCGACTCTCTAAAGGTTCCAATGCGTGGGACCTACACATTTGGAAGTGTTTTTCACTGCCTGTCGACCAAACAATCGGTCGACTTGAGAATTATTCCTAACCACCATTTGGTCGGTGGTAATTCTGCTCAAATTCTGATTGGGCAGATTCGTGTCGACGTTGCTGGGAGCGTCGCTAAACCGTCCCGATCTGCCATTCGTAGGCGTAACAGGCGCCTGCGAAAAGACGGTTTCATCGGCAGTTCTGAGTCGTCTTCGTCGGGGTGGTCGAGGCACTGTTCGGACTGTTCTACTCCTCGCGCTCCACCTTCTCCCTCGGTTTTGAAACCTAATCTCGGTAGAATACCGAGTATAAACCGGAAATTCCAATACCCGGTGGACACTCAGCTGAGAGTTTCTATCCCCAAACGTACTGACGACCGAGTGTACGTGTCGGTCGGTCAGGACTTTGATGATCTGTGCCACTCGGTTTGTACCTATGTTAAAAGGTATAATTCGAGGAAGTCCTTCTATACGCGTTTCGAAAACGGCAAGGATTTTGTCGTCCTTCGACGCGCTTCTGTCGGGGGTCTCTACGTGTTTACAAAACGTGGTAGTCGTACGGCTCGGTTTTCTCTAACGGCTTCGAGGTACGAGGCTAAATACGACGAGTATATGAAGGACAATAATTTGTTGTGGGTTAGGAAGGATCGTTGTCGTGATGTTGAGGTGATACGCCGCAGGAGAAGTCGTGTTGATTATTCTTCGGTTGACCCTTCGAGTGTGGATGTACGGGTTAGTTCTGATCAAAGGTCGGGGTCGACCGAGGCAGTTCCTGCGTTAGTTGACGATCTTTCGCCGCGTCGCAGTACCTCGTCATCCCAACCTGATGCTGAGTCGGGTTGGTTCGAAGTTAGTTCCCAAGATCGGCGTACTCGCGCCGTTCTCGGACAACATTCCGCCAACAAACGGAAGATTGGGGATTTCGATTTCCCAAAGGGCACCGTGTACAATACGTACGTTGATGAGAGTGCTTATAAGCGGGTGTTGAAACTGCGGGATACTTCGGCGTCTTCTTTTCTTCGTATAGTTTTGGCCCGTTTGTCGAGCTACAGGCCTCTTAGTGATGAGTTTTTCAATAAGTGCGTCACGTCTCGGTTTGTGGCATGCGTTGAGGCGGTGGAGTCGGGCCTCGTTACAGTGCACTTTCGCTCCGACGTTTTCCGCGCATCATTTCCGTTCGGAGTATACTTGTACACCCGTCATGCGTTTGACATTTACAGTGGTAAACTCCTGGCGTTAGACGGCTACGGGTTTTCGGAAAATCTGAGAGACGGTTACTGTTATATCCGTCACATCGCTGAGGTTTGCTTGAGCATGGGGAGGATTTTCTTTAGGAGGGACGTCAATTTGGGGGCGTATCCTTATGTCTTTGAAGTGCAACACCGTCTCGAGAGATTGTATGGTAAGCAAGCACTGAAGTACGGTGTCAGAGGTTATTATTCAGCGTCGCGTCTTTACCACTGTAGTTACAGCGATTCACCGAGGCCTATGAGATTATTTAATAAGTATCACAAGATGGGCGGTGAGGAAGGATCGTTGTTGATTACGGATACGGATAGGTTGCGTGCCGTGGGTAGTGCCTACGAAAAGGTGAAGGGGCGTTTGCCCGATTCGCTGCTCGTTCGATCGGTGGAAAAGGATTTGATAGAGTTCAACCAAACCCTAGTCGACGCGCAGCGGGCTAGACCGGGCGTTGTTGTCCCCTTCCAAATGAGTGAGATCCAACAGGTGATGCTTACTAGGGCTTATCCCGAGTTTAATATAAACTTCACTCATTCTGTGCACTCTGATCATCCAGTGGCCGCAGGTTCTAGAGCGTTGGAAAACCACCTCGTTCGTAAATACGCCGGCAGCGATTACTCGGACGTAGGAGGTTGCCCGTTGTTTCATTTGCGTGCGGGTCATTCTGGCGTTCACGTGTGCAGACCAGTATATGATATTAAGGACGCTCACCGTAGAGTGATCCGTCACCACCAACTCGGCAGAGTCGAGTTGAACAATACCGATGGTTCGAAACAGGTTGGTGCCGTTAACACGAATTCTGTGTGTGGTAACGTTTTAGGGGAGTGTTTTCATGCGTCTGATGCCATTGTTATGGTGCAAGTCTACGATGTACCGTTACGTGAATTGTGCAGGGCTATGATAAACAAGAGAGCCTCGGTATGTTACATGACCGTGGTTACACCTGGCGAGCTGTTGGACGCTCGTGAGTCTTTCTTTATCAAGGAGCTGGACTGTTCGGTGGAATTGGACACCGTCGCCGATAGGGTCGTTTATTGTTTTAACAATTCAGCGTATACGCATGTTTACTCTACGATACGCGAGTACATGTGCACCCCTTGTATCATAATGGACGGTTTTCTATTTACTGTCGAGATGGTTTCGCTGAGGTGTAGCGTTAATTATTACTGCATCACCAAATCACGAGTATGTCCGAGGATTAGTGAGACTAAGCGGCTGCGTTACCGTCGGTGCGACAGCGATTTAATCAGGATTAAAATCCCTCGGTATTCTAACAAAACCCGTAGTTGTTTGCCGGGTTGTTACTATCTGTACTTAGACTCCAAGTTTGTGAGTCGCGTATACGAGTACGTGGTTAACAACTGCGTGGTGGTAAATGCGAAAACTTTTGAATGGACTTGGAACTATATCAAGTCTTGTAAGTCGAGGGTGGTTATAAGTGGTAAGATCATCCATAGGGATGTGCCCATAGCTTTGGAGTACTTGGACGGATTCTCCGCTGTCATGTTGTCAGCGGGTGTGAGAGGTAGGCAAAACGCGGAGGCGTTTTCCAGACGTTTGGCTGCGTTCTCAGGTGACACATCACTTTTCGAATTGGTGAAGTTCGCCATATCCGAGAAGTGCCGCGACTTATTTGTCGGCATTCAAGAAAGTGTGGAGAGGTGTGTGAAATCATACCTTAGAAACGCATTTAACATGAGCTTCGTGGATTTGTCTGACCCCTTGCTTACGATTAGTGAATATTCTGAGTTGGACGTTCCTGTTAACTTACCAGGTTTCGGTAGTATGACGGAAGGTGACGAAGCTAAATTAATAGAAGACGGGGTGAAGTCGGCTTTACTGCGGAAGGCAGTTCAAGATGAAGCGCGATTGATTATCGAGCGAGGAGGTACGTCCGAAATCGTTCCTTGTAGTGATGATGAAAAATCGAGCGTTGATGGTTCGGACCAGTCGCACGAGGCCGGTAGTGATACACCCTCTAACACTAGTTCCGGAGGCTTGCGAGCTGGTGCCGCCCCTTCGTTGTTTAGGAGCTTGTTAAGGAAGTTAGGTGGGGGATTCTGTTTGGCCAAAAGAGTACTGGATTTGTTGTGTGAGAGGGTGATTGGGTGTTTTTCGCGGTTGAAGTACAGCACCGTTCGTCTAGCTTCGATCCTTAACACGTTGCGCGCTAAGTTTTCTTGTGATTTCTTTGATGATTCGGTTTTCGTCACCGTCTGGGAGATTGTCTTAAACTTCTTTAGGATTGTTAGTGGGGTGACTAAGACGAAGCTGGAGTGTCTTCGT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13,219
OQ848758.1
Citrus tristeza virus
Ruiz-Garcia,A.B., Moran,F., Olmos,A.
Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias (IVIA), Plant Protection and Biotechnology
Spain
2023-08-08
141.5
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,270
GenBank
null
Spain
Spain
Citrus sinensis
null
2023-03
null
null
Citrus tristeza virus isolate 141.5 genotype RB, complete genome
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14,120
OQ708956.1
Citrus tristeza virus
Yang,Z., Wang,G., Hong,N.
Huazhong Agricultural University, College of Plant Science & Technology
China
2023-08-02
S45-1
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,255
GenBank
null
China
China
Citrus sinensis
null
2008
null
null
Citrus tristeza virus isolate S45-1, complete genome
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14,322
OQ708957.1
Citrus tristeza virus
Yang,Z., Wang,G., Hong,N.
Huazhong Agricultural University, College of Plant Science & Technology
China
2023-08-02
S45-2
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,254
GenBank
null
China
China
Citrus sinensis
null
2008
null
null
Citrus tristeza virus isolate S45-2, complete genome
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14,323
OQ714508.1
Citrus tristeza virus
Ruiz-Garcia,A.B., Moran,F., Olmos,A.
Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias (IVIA), Plant Protection and Biotechnology
Spain
2023-08-02
137.4
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,250
GenBank
null
Spain
Spain
Citrus sinensis
null
2023-02
null
null
Citrus tristeza virus isolate 137.4, complete genome
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14,324
LC775311.1
Citrus tristeza virus
Jeong,R.D., Kim,H.J.
Department of Applied Biology; 77 Yongbong-ro Buk-gu, Gwangju, Jeollanam-do 61186
Korea
2023-08-01
CNU-ONT
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,257
GenBank
null
South Korea
South Korea
Citrus unshiu
null
2022-06-22
null
null
Citrus tristeza virus CNU-ONT RNA, complete genome
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14,358
OP900953.1
Citrus tristeza virus
Ghorbani,A., Izadpanah,K.
Shiraz uni, plant protection
Iran
2023-05-10
Sari
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,297
GenBank
null
Iran
Iran
Citrus
null
2022
null
null
Citrus tristeza virus isolate Sari, complete genome
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15,949
OP448604.1
Citrus tristeza virus
Rubio,L.L., Arruabarrena,A.A., Salvo,M.M., Castells,M.M., Bertalmio,A.A., Hernandez-Rodriguez,L.L., Benitez-Galeano,M.J.M.J., Maeso,D.D., Colina,R.R., Rivas,F.F.
INIA, Salto
Uruguay
2023-04-19
RB-UY1
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,175
GenBank
null
Uruguay
Uruguay
Citrus trifoliata
null
2015
null
null
Citrus tristeza virus isolate RB-UY1, complete genome
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OP345181.1
Citrus tristeza virus
Ferraro,R., Scuderi,G., Russo,M., Bazzano,M., Catara,A., Licciardello,G.
Agrobiotech, Plant Pathology
Italy
2023-04-11
N3
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,250
GenBank
null
Italy
Italy
null
null
null
null
null
Citrus tristeza virus isolate N3, complete genome
AATTTCTCAAATTCACCCGTACCCTCCGGAAATCACGTCCGGACGCTGCGGGAATCGGTGTAAATCCCGGCAAATTGCCCCACTACGCCCATACAAACAACAACAATATGTCGAAACTCGGAGCTCGCTTCAAGTCCTCGACTTTCGCTGTACGCAGCGATTACATCATCTCGCGCATCTGGCGCGCCTTTAACACCGTTGGAGTCCTGCACTTCTTCGGTACTGAAACAACCACCAAGGTGGTTAAGGAGTTTTCGGCCCCTATGCCGATAGTCCCTTTACGGAAATCCTGTTTTCCGTTTTCTGTTCGCGCTGCTGTTCGCGCGATTAAAGCTGCCGGACGTCCTATTGACGCTCCGCGCTCCGGATGCCTCTGTGGCCTCCCTGTTATCGACACATCTGGTGTCGTGCGTCCCCGCTCTGTCGCGGGCATTTGGAGGTATTCTCTGTGTAAACCTCCCCTTACTGCCGCCGCCAAGAAGTCCTTTCGCAAGGCGAAGAAAGATTCTGCTTTCTTTCTTAGCCGGGCTTCTTCACTCTTCTCACGGGAAGTCCCCTGCGGCACGCGTCATAGACTTCGTAGGCGCGTTATGAAACGAGTAGACCCCACCATGCACGAGAGTCCCCAAGACGAGATCAAACATAAGGGACGCCGACATGGCAAGACTTCTGACCTCCCGTATATGGGGGAAGCGGCGTTGGATGATATCCTTCGCTGGATTGAGGGGGTAAATCCCCCGCCGTCGATGGTCGCCATTCCGGTGCCCATCTCTTTCGGCGCCGTGCCCACAACGGCATGGTGCTCTCCAGCCGACGCGGCTGTTTTGCGGTGTCGCATAGACTACCACACCGCTGAAACTTCCTTTCGTAACGAAGGGAAGCACGTGAGATACGTCTATAATGACGTGTCTTCTGCTGCCAACCGTCCTCGTACGGTTTCTCCCCGCAAGTGCGGGCGTGTTTTCCCCAGCGGTTCTGCGCTGGGTGTTGAGGTCCCGAGCACTAGGGATCGCCATACCGCTTTCGTGAGATCTACTCACGCTAGCGTTTTCTTCTCCGACGCGGTTCGCCGCGTTCGCATGTTCCGTCCTGGGCGGAATAATTTCTTCACTAGCGTCGTTAGTGGGCGGCGCGTTAGTTACTTTAGACCCGGACCTAATGGTACGGTGTCTGTTTTAATGTCGGACGGTGTCAACACGGCGCGTCTCGACGTTGTCGCTCCTGCGTACTACGCGTACGCTAAAGCGTTAGGCGCCAAAGTGCGCTGTTTGTGGGAGTCGTCCGATTTGGACGATGCTAAAATACGTGACGGCCAATGCTACGTTCGTCACGTGTGCGACGTGGCCCTTTACTTCGGAAGGCGCGTCGATCTTTCTGTGCGCCGAACTTTGGGTTTGTTTCCCACAGTGGGTGCACTAAAAGCTTATCTTGTTCGCGAGTACGGTCGCGAATCTTTGAAGGTTCCGATGCGCGGGACTTACACTTTTGGCAGTGTATTTCATTGCCTGTCGACTAAATCTTGTGTCGACTTGAGATCTATTCCTAACCATCACTTGGTTGGTGGTGCGTCTGCTCACGTGTTTATTGGGCAGATTCGTGTTGACGTTCCTGGTGGTGTCACTAAGCCATCACGAGCAGCTGTTCGCAGGCGTAATAGGCGTTTGCGTGAAGACGGGTTTTTAAGTAATACCGGTTCGTCTTCTTCAGGAGGGTCGAGATACTGTTCGGATTGTTCAACTCCTCGCAGTCCACCCTCTCCGTCGATTGTTGGACCAACTCTTGGCCGGATACCAAGTATAAACCGGAAGTTCCGGTTTCCAGCAGGCACTCAGTTGAGTGTTTCTATCCCTAAACGCGATGACGATCGCGTGTACGTGTCGGTCGGCCAAGACTTTGATGAGTTGTGCCATGCCGTGTGTACCTACGTTAAGAGGTACAACTCGAGAAAAGCCTTTTACACGCGGTTTGAAAATGGTGATGATTTTGCCGTCATTCGGCGTGCTTCCGTCGGAGGTCTTCACGTGTTCGTGAAACGCGGCAACTTTACGGCTCGGTTCCCTATGTCGGCTTCAAGGTATGAGCATCATTATGATGCAAGTATGAAAGGCGCCGGTTTGTCGTGGGTGCGGAAGAGTCGGTTTCCGAATGTTGAAGTTATACGCCGTCGAAGGAGTCGGACGGGCGGTTCTTTGGCTAGCTTTCCGGACGCGAATTTACGGATTAATTCTGACCAACCGTCGGATTCTGTTCAAGCAGTTCCGGTGTCGGGTGAGAATTCTCCATCGTCTCGAGGAGCGTCTTCGCCCCGACGTGATCCTGTTGAAGGGTCGGGCTGGTATAAGGTGGGTTCTCCTAGTCATCAATCGAGTGCCGCTCGTGGGCAACGTTCCACTGAACGTAGGAAGATTGGGGATTTCAGTTTTCCGAGTAGCACCGTGTACAATGCACGTGTAGACGAGCGTGCTTATAAACGTGTCTTGAAATTGCGGGACACGTCGGCGTCCTCTTTTCTTCGTATAGTTTTGGCTCGTTTGTCGAGTTATCGGCCTCTTAGTGACGAGTTCTTTAACAAGTGCGTTACTTCTCGGTTTGTAGCTTGTATCGAGGCGGTTGAATCGGGTCTCGTTACAGTACACTTTCGATCCGACGTGTTTCGCGCCTCATTCCCGTTTGGTGTTCATTTGTATACTCGTCACGCATTTGATATTTACAGTGGTAAGCTCCTGCAACTAGATAGCTACGGGTTTTCGGAAGACCTGAAGGACGGCTACTGTTATATTCGTCATATTGCCGAGGTCTGTTTGAGTATGGGAAAAGTTTTCTTTAGGAGGGACGTTAACTTAGGGGCGTTCCCTTATGTTTTCGAGGTACAACACCGTCTTGAGCGGTTGTATGGTAAGCGGGCTGTTGAATACGGCGTTAGAGGGTATTTTTCAGCAACGCGTCTTTACCACTGTTGCTTTACCGATTCACCGAGACCCTTCAAATCTTTAAATATGTATCATAAGATGGGTGGTGAAGAAGGTGCGTTATTAATCACAGACACTGATAGATTGCGTGCCGTGGGGAGTGCTTACGAGAAGGTGAAGGGGCGTTTGCCTGATTCTTTACTCGTTCGATCAGTGGAGAAAGATTTGATAGAATTCAATCAAACTCTGGTTGATACGCAACGGGCTAGACCCGGTGTTGCAGTGCCTTTTCAGATGAGTGAGAACCAACAGGTGATGCTCACTAGAGCTTATCCTGAGTTTAATATAAACTTTACTCATTCCGTACACTCCGATCACCCCGTGGCTGCGGGTTCTAGAATGTTAGAGAATCACCTTGTTCGTAAATACGCAGGTAGCGATTATTCGGACGTAGGTGGTTGCCCATTATTTCATTTACGTGCGGGTCATACAGGAGTTCACGTTTGCAGACCAGTGTACGACATTAAAGACGCCCACCGTAGAGTCGTTCGTCATCATCAACTTAGTAAAGTAGCTTTTGATCACACTGACGGGTCTAAGCAGGTTGGTGCTGTCAATACGAATACCGTGTGTGGTAACGTTTTAGGGGAGTGTTTTCATGCGTCTGACGCGATTGTTATGGTGCAAGTTTATGACGTGCCATTGCGAGAGTTGTGTAGAGCTATGGTGAACAAGAAAGCTTCGGTGTGTTATATGACCGTGGTTACGCCTGGTGAGCTGTTGGACGCCCGTGAGTCCTTCTTCATCAAAGAGTTAGACTGTTCGGTGGAGTTGGACGCTGTCGCCGATAGGGTTGTCTACTGCTTTAACAATTCAGCGTATACGCACACCTATTCTACGATATGCGAATACATGCGTACTCCTTGTGTAGTGGTGGATGGTTTTCTGTTTACTATAGAGATGGTTTCACTCAGATGTAGCGTTAACTATTATTGTATCACCAAATCGCGGGTTTGTCCGAGAATCAGCGAGATTAAACGGTTACGCTATCGTCGGTGTGATAGTGACTTGATTAGAATTAAGATTCCTCGGTACTCTAGTAAGACTCGTAGTTGTTTACCAGGGTGCTATTACTTGTATTTGGACGCTAAGTTTGTGAGTCGTGTATACGAGTACGTGGTTAATAATTGTGTTGTGGTGAATGCTAAGACTTTTGAATGGACTTGGAACTATATCAAGTCCTGTAAGTCGAGAGTGGTCATCAGTGGGAAGATCATCCATAGGGACGTTCCTATCGCATTGGAGTATTTGGATGGGTTTTCCGCAGTTATGCTGTCCGCGGGCGTGAAAGGTAGGCAGAACGCAGAAGCGTTTTCTAGGCGTCTAGCGGCCTTTTCAGGAGATACTTCTCTTTTCGAATTGGTGAGGTTCGCCATTTCAGAGAAGTGTCGCGATTTATTTCTGGGCATTCAGGAGGCCGTGGAGAGATGCGTGAAATCATACCTCAGAAACTCGTTTAATATGAGTTTCGTAGACTTGTCTGATCCTCTGCTCACTATCAGTGAGTACTCGGAGTTAGATGTTCCTATTGATTTACCGGGTTTCGGCTGCATAACGGAGGAGGACGAGGCTAGACTTATAGAAGATGGAGTTAAGTCGGCTTTACTGCGAAAAGCAGTTCGTGACGAAGCGCAACTCATTCTCGAAAGGGGCGGCACGTCAGAGATCGTTCCGTGTGGGGATGAAGAGAGTTTAGGCGGCGACGGTTCTGACAGTTTAATCGGGTCCGGTAGTGATTCGCCTTCTAATACTAGTTCTGGTGGTTTGCGGGCCGGAGCTGCCCCTTCACTGTTTAGAAGTTTGTTGAAGAAGTTGGGTGGGGGTTTTTGCATGGCTAAAAGGTTGTTGGACTTGTTGTGCGAGCGATTAGTTGCTTCGTTATCGCGCCTAAAGTTCGGTACAANTCATTTAACCTCACTCTTTAGCATGTTACGTATTAAGCTTTCGCGTAATTTCTTCGACGACTCGATTTTTACCGCTGTTTGGGACACAGTAATGAACTTAACTAGAATCGTCAATGGGGTGACCAAG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16,724
OP345182.1
Citrus tristeza virus
Ferraro,R., Scuderi,G., Russo,M., Bazzano,M., Catara,A., Licciardello,G.
Agrobiotech, Plant Pathology
Italy
2023-04-11
N1
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,250
GenBank
null
Italy
Italy
null
null
null
null
null
Citrus tristeza virus isolate N1, complete genome
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16,725
OP345183.1
Citrus tristeza virus
Ferraro,R., Scuderi,G., Russo,M., Bazzano,M., Catara,A., Licciardello,G.
Agrobiotech, Plant Pathology
Italy
2023-04-11
M55
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,250
GenBank
null
Italy
Italy
Citrus macrophylla
null
null
null
null
Citrus tristeza virus isolate M55, complete genome
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16,726
OP006456.1
Citrus tristeza virus
Zindovic,J., Bozovic,V., Margaria,P., Knierim,D.
University of Montenegro - Biotechnical Faculty, Department of Plant Protection
Montenegro
2023-03-22
60/20
Citrus tristeza virus
Closterovirus
Closteroviridae
ssRNA(+)
19,236
GenBank
null
Montenegro
Montenegro
Citrus limon
null
2020-06-17
null
null
Citrus tristeza virus isolate 60/20, complete genome
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NC_021564.1
Citrus vein enation virus
Vives,M.C., Velazquez,K., Pina,J.A., Moreno,P., Guerri,J., Navarro,L., Vives,M.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2013-06-24
VE-1
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
RefSeq
1
Spain:Castellon
Spain
Citrus
null
null
null
PRJNA485481
Citrus vein enation virus, isolate VE-1, complete genome
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6,897
ON494593.1
Citrus vein enation virus
Dou,R., Huang,Q., Hu,T., Yu,F., Hu,H., Wang,Y., Zhou,X., Qian,Y., Dou,R.R., Huang,Q.Q., Qian,Y.Y.
Zhejiang University, Institute of Biotechnology
China
2023-05-14
CVEV-DT1
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
1
China
China
Citrus
null
2014-06-12
null
null
Citrus vein enation virus isolate CVEV-DT1, complete genome
ATATAAGCTATAAAAGAAAAGTGCGTTTACGCTTCCTTCTTTGAGCTTATACAAGTCGTATGTTCTGTGCTTTGATTGTGTTGACTGTCCAGCTAGTTCTGTTGACTCTCGCATACGCTTTCGGCACTCTGTTGTGGTCTTACATATTCGGACTCTCGGTATCCCCAATACTCCTTGAGATCGAAAGACTACTTTTGCTGTGGTAGAATGATCAAGGAATGCCTTGCTACCATGTCATCCCCTACGACTACTTTCAGCCTATCCACTCTTCTAACTGGTTGGGAGCTAGCTTACTTGCTCTCATTAATTATGTTGGGATGGGCTGTCCTACACAGGAGGGAACGCCATGCGAGGAACCAACTTGCGTGGCGCTTCCCTACGTCCTATTATGTGCTCTTGCTTTGTTATGGGGTCACCCTCGTAGCTGCGGGAGGCGTGGCGGGGTCTCGCTTGAGGCCCTCACTCTGCCACGCGGGTTCAACATCGTTGGGCCTCCCGATTTCTTGTGGCACTTTAGAATTTGTGCCGCTCGAATCGGGCTTATCATCCCCCAATCTTACTGGCGGGATGACGGACGTAGGGCGATCCCCCTCACTCACTGTGCGCTATTCACCTCTCTTCCATGTTGGCTCATGGCTGCAAGTGGCAAGGCAGAATACCACTGTCAGGGTTACGTTGCGCCTGAGCTTCAGTTACCTGGTAACGGCCCGGACCATACTGTCTGGGTGGAAGAGAAATGGGCTCGCTGGCATGAGCTTATTGTTGGGTTGCTTGGAACCCATACGAATGTTGCCAGCATACTCCGTGTACTGCCTGACGGAGGCGTTACTCCTCACAGCCAAGTGTTTGGAAAACGCAATCTTATCGTGGATGCTTTTACTAGCATCAGCACTATGGCAGTTGGCACGGATCAACCCCCTCCGAACCGCTATATGGATGATTGTTCTCTCACTAGGCTCTTTTGCCTACGAGAACCGTATCTGTCGGGCTATGATACAGATAATTTTAGCCCCGGTTTACATATTACCCTCCCTTGGCCTGAAATTCCTGAGGGTGGCGAGTATCTTGCCCACTCTTTTGCTGAACTGGACCAAGAATTTGCTGATCTTTTGGCTCACCTTCACGTCCATGATGACGAGGAGGATCTTGGTTGGTTCTCTGATGATGGTGAGGGTGATATTGAGAATCCCCCTGCTCCCCATAATACTGATGAAGAAGATTTTGGGGATTCTGATGATGATGACTCCATCGGTGGAAACGCCGGTAGCGGACCCGAGGCTTAGATTTGTTAATCGTGAGCGGTCCGTGTCATTGGAGGGGCAAGCCAGGCAAGTGTGTCTCCCCGCTGTACCCCCGAAAGGGGTTATAGGAAAAGTTCTGAATGCTAATAACATTCAGATCGGGTACTTTTCCTGTGTAAAACTCATGGGAGGTACGGATGGGATAATGGTTCCCATCCACGTTTTTGAAGACGCCCACATGTTTATGGGCAACAACCTCGCCCTGTCAAGAGACGCATTCACGGTTATGTACCGTGATGTGGAAGGGGATGTCCTAATCCTGAAAGGACCCCCAAATTATAGGGTTGTATTAGGAGTGAAACCCCGACTCCTACTTACTGCAAACTTCGCCCGGCTGGGATTCCACTCCCTCTATTTCGAGAGAGATGGACAGTGGAAAGTCCAATCAGCCAATGTAAAAGGGGCGGAGGATGGTTTTCTGGCCGTTGTTTCCCAGACACTTCCTGGGGACTCCGGACTTCCCCTCTTCGACACAAAACACCGTATTTGTGCCATGCATATTGGCCACTATGGTGAGAAGAGACCGGAGAATATGGCCACGGTTGTTCTTCCTATCAGGGGGTTTTCTGTCCCTGATACTGAGGTTTTCAAGCCCCAAGCCAAGACTACCGAGTCCTTGTATGAGGACGATAAGATCTTCGACCTAGTTGAGGATCTTGAGAGGGAAATTGACGAGGGAGTGGTCCGAGACTTGGAGTTCGAGGGCCAACATTATAAAACCGTCATCGGTAAGACTTCCATAGCCCTGCTCAAGGAGGCTGAGTTCCTCGATCATATGAAGCAGGTCGGCAGGGATGCCGTAAAAGGGAAGCAGCCATGGAGTGATTGGCTAGATGACGAAGAGGATGAGCGGGAATGCTTGCGCCCCATCGTTGATACTAAATCCAAGTATCAACAGCCTTTAAACTGCGAGCCCCAGTACGCTCTGGGAAACCAAAAGCGGCAGGACGGTGCCTCCACCTCGGAAACGAGGATTGTTGTTGGTGCCGTTGCCTGCCCGGTACCCCAACCCAAAGAATCCAAAATTCCCTCCACCAAGGCGGTTCCAAAGCTGCCGGGAAAGTCAAAGCGAGCCGAAAGGTTCGCCCAGATGAGTCCCGAGGAAGCAGCGGCCAAACGTGCCGCGGAAAACCGAAGGAGGAGAAACTCCCGAAAGGGAAAGAAAGTTCCACCTCTCGCAGTGAAAGGACCTCTGCCCATGAAAATGGAGGAGGTATCCAAACTGGTGGACAAGAAGCTGGCCGAATTTGTAAAGGTTCGGCCAAGGAGGAATGTGCCCAAGGCACAACTAGCCTCGAAGTCCTCTTCGACGGCTTTTACCACTGGCTCCCAGAGCTATGTGGTTCCTCCGAGAAGGCGTGGGAACAAATGGCGCAACACGAGCGCCCCCATCAACCCGACGAACGCTCAGACGGGGGGACGCCCCTACATAATGACGAGCGAAGGGTTAACCTTCTTGGATTCTGTAAAGTCGGTTCCTGTGACTTTACAAAATGGAAAAGCCCCACCAAAGAACTCTCAGAATGGGGATTCCATCGAGCTCAGGCCTCAACGCTCTTACAAGCCTGTCAGGAAAGCTACGGCTGGCCAGACACAGGTGCAGAGGCCGAACTGAGCTCTCTGCGGTACCAAGCAGCCCGACGGGCGGCTGCTCAAACAAAAGCCCAAACTCCAAGCAAAGCCGCGCGTTGGAGTGTAATACAGCGCACCTGTGTTGCATATGGCGTTACACGACGCCATGCTCCCCGTTGGACACGCACAATGAACCGGGCTGATGCTCGGTTCTATTTCTGTGAAGCTGTCCGAAGTCTGAAACCAGACTCTGGAAGTGGTCTTCCTTTCGCTGCGTTCTATAATAGAACAACTCACAGCGACTGGTGCTACGATGATGCCTCTTTTGAGGCGTTGTTTGACCTAGTCTGGGCCCGTTTGGGTAGACTTCGTTCGGGGTCTTTTCGCAACCCAGTTCAGGCCGTGCAAGACGGCCTTTGCGACCCTATCCGCCTGTTTGTGAAGCTCGAACCTCACAAACGCGCTAAGATTGAGCAGAAGCGGTTTCGTTTAATCGCTTCAGTATCTTTGGCGGATCAGTTGGTCGCTCGGATGCTCTTCCAGGAACAAAACCAGGCAGAGCTTGACATGTACATGTACATTCCTTCCAAGCCGGGGCTTGGATTCTCAAAGGATAGTCAAGTTCTGGAGTTTACGAAGAGCATAGCCTATCTTGCCCACACCACCCCCGAAGACCTAGTGAATAACTGGTCGGAACACTTAATCCCAACTGACTGCTCGGGATTTGACTGGAGTGTTCCAATGTGGTTGTTGGAGGATGATTTAGCAGTCCGCAACGAGTTGACCATCGACTGTTCCGATGACCTCATTAAGATGAGGTCTGAGTGGCTTCGATGCCTAGGGCAGAGCATATTTGTTCTGTCAAATGGAATGATGGTTGCCCAGCTCGAACCGGGGATTCAAAAGAGTGGGAGTTTTAACACTTCCTCTACAAATTCCCGGATGAGGTATATGGCGTCTCTCTACGCCGGAGCTTCGTGGGCCGTCACAATGGGTGACGACGCGTTGGAGTCAGTTGATTCTGACTTGTCCCAGTATGCCTTACTGGGTTTGATATGTGAGCGCGCTGAAGAGTTCGACTTTTGTTCTCACATCTTTAAGGCGCCCTCTGTAGTCGTGCCGAAGAATATTCATAAGATGATCTTCGGTCTCCTTTCTGGAGTGTCTCCGATAAGTCCTGTTCAAGAGGCAAGGATACAATGGCTGCAGGCCTTCCAGTCAATCTCTGAGGAGATGAGGCATATGCCAGCGGAGTTTTGGGAAGAATTCCGCACCGCTATTGGCATATTAGGGGACGGGTGGTAGAAGGTTACCACCCTTGGAAGAGGGATGCCCCCCGAAAGGGGACCATGAATTGACATGGTCTTGGAATGCCGTAATGCTGGACCTGGCTAGAGATAAAATCTATAAATAATTACGGCATTACTATGGTGAGTCGCAATCAGAGACGAAGAAATCGTCCACGCAGAATGCGAAGAAGACAGGCACCGAATAGGGTCGTGGTGATGGGCAACAACCCCACACGTTCCCGAAGACGCAACGCCCCCGCTCGTCGGCGGCGTGCGGTTAATAGATCAACCGGAGAGATGCGTCCTTACCACTTGTATGGGCTTAAATGCAACGACAAGGGTTATCTCACTTTTGGTCCTTCTGGACAAACCCCATCCTTGGGTGGCGGTATCCTAAAGGCCTTCTCTGAGTATAAAATAACCCAGTTGAGAGTACAGTGGAAGGCGCAGGCTTCTTCGACTGCCGCAGGTTCCATGGCCATTCAAATTGGCCTCGGTACAAGCCTGACCGCTCTGGACAACCGGGCTATCTCATTTAAGTTGACCAGTTCGGGGCAGCGAGTGTTCACCGCCCGAGATCTCGGCGGTGACGGTAGAATGTATAACGCCTCTAACGAGGACCAATTCCGCCTTGCCTACCAGGGGAATGGAGATTCTACCCTCGGAGGGGATCTATTATGTTTCTTTCGCCTGGAAACGCGACTTCCCAAATAGGTAGACGCGGACCCCCCCAGTCCACCATCCCCGGAACCTTCTCCGGGGCCCCCACCCCAACCACCAGCTCCGACACCGGCGAGATGCCGCTTCTGGGGATACGAAGGTATCCCTAGTGTAAGAG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15,897
MZ330095.1
Citrus vein enation virus
Keremane,M., Singh,K., Ramadugu,C., Skaggs,T.
USDA ARS, National Clonal Germplasm Repository for Citrus and Dates
USA
2022-08-27
YV 920/CVEV
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,981
GenBank
null
USA
USA
Citrus medica
null
null
SAMN18377111
PRJNA715742
Citrus vein enation virus isolate YV 920/CVEV, complete genome
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26,596
MZ330112.1
Citrus vein enation virus
Keremane,M., Singh,K., Ramadugu,C., Skaggs,T.
USDA ARS, National Clonal Germplasm Repository for Citrus and Dates
USA
2022-08-27
IV 400/CVEV
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
null
USA
USA
Citrus medica
null
null
SAMN18377114
PRJNA715742
Citrus vein enation virus isolate IV 400/CVEV, complete genome
ATATAAGCTATAAAAGAAAAGTGCGTTTACGCTTCCTTCTTTGAGCTTATACTAGTCGTATGTTTTGTGCCTTGCTTTTGTTGACTGTTCAGCTTGTTCTGTTGACTATCGCATACGCTTTCGGCACTCTTTTGTGGTCTTACATTTTCGGACTCTCGGTTTCTCCTATACTCCTTGAGATCGAAAGACTACTTTTGTTGTGGTAGAATGATCAAGGAATGCCTTGCTACCATGTCATCCCCTACGACTACTTTCAGCCTATCCACTCTTCTAACTGGTTGGGAGCTAGCTTACTTGCTCTCATTAATTATGTTGGGATGGGCTGTCCTACACAGGAGGGAACGCCATGCGAGGAACCAACTTGCGTGGCACTTCCCTACGTCCTATTATGTGCTCTTGCTTTGCTATGGGGTCACCCTCGTAGCTGCGGGAGGCGTGGCGGGGTCTCGCTTGAGGCCCTCACTTTGCCACGCGGGTTCAACATCGTTGGGCCTCCCGATTTCTTGCGGTACTTTAGAATTTGTGCCGCTCGAATCGGGCTTATCATCCCCCAATCTTACTGGCGGGATGATGGACGTAGGGCGATCCCCCTCACTCACTGTGCGCTATTCACCTCTCTTCCATGTTGGCTCATGGCTGCAAGTGGCAAGGCAGAATACCACTGTCAGGGTTACGTTGCGCCTGAGCTTCAGTTACCTGGTGACGGCCCAGAACATACTGTCTGGGTGGAAGAGAAGTGGGCTTGCTGGCATGAGCTTATTGTTGGGTTGCTTGGAACCCATACGAATGTTGCCAGCATACTCCGTGTACTGCCTGACGGAGGCGTTACTCCTCACAGCCAAGTGCTTGGAAAACGCAATCTTATCGTGGATGCTTTTACTAGCATCAGCACTATGGCAGTTGGCACGGATCAACCCCCTCCGAACCGCTATATGGATGATTGTTCTCTCACTAGGCTCTTTTGCCTACGAGAACCGTATCTGTCGGGCTATGATACAGATAATTTTAGCCCCGGTTTACATATTGCCCTCCCTTGGCCTGAAATTCCTGAGGGTGGCGAGTATCTTGCCCACTCTTTTGCTGAACTGGACCAAGAATTTGCTGATCTTTTGGCTCACCTTCACGTCCATGATGATGAGGAGGATCTTGGTTGGTTCTCTGATGATGGTGAGGGTGATATTGAGAATCCCCCTGCTCCCCATAATACTGATGAAGAAGATTTTGGGGATTCTGATGATGATGACTCCATCGGTGGAAACGCCGGTAGCGGACCCGAAGCTTAGATTTGTTAATCGTGAGCGGTCCGTGTCATTGGAGGGGCAAGCCAGGCAAGTGTGTCTCCCCGCTGTACCCCCGAAAGGGGTTATAGGAAAGGTTCTGAATGCTAACAACATTCAGATCGGGTACTTTTCCTGTGTAAAACTCATGGGAGGTACGGATGGGATAATGGTTCCCATCCACGTTTATGAAGACGCCCATATGTTTATGGGCAACAACCTCGCCCTATCAAGAGATGCATTCACGGTTGTGTACCGTGATGTGGAAGGGGATGTCCTAATTTTGAAAGGACCCCCAAATTATAGGGTTGTATTAGGAGTGAAACCCCGACTCCTACTTACTGCAAACTTCGCCCGGCTGGGATTCCACTCTCTCTATTTCGAAAGAGATGGACAGTGGAAAGTCCAATCAGCCAATGTAAAAGGGGCGGAGGATGGTTTCTTGGCCGTTGTTTCCCAAACACTTCCTGGGGACTCCGGACTTCCCCTCTTCGATACAAAACACCGTATTTGTGCCATGCATATTGGCCATTATGGTGAGAAGAGACCGGAGAATATGGCCACGGTTGTTCTTCCTATCAGGGGGTTTTCTGTCCCTGATACTGAGGTTTTCAAGCCCCAAGTCAAGACTACTGAGTCCTTGTATGAGGATGATAAGATTTTCGACTTAGTCGAGGATCTTGAGAAGGAAATTGACGAGGGAGTGGTCCGAGACTTAGAGTTCGAGGGCCAACATTATAAGACCGTCATCGGTAAGACTTCCATAGCCCTGCTCAAGGAGGCTGAGTTCCTCGATCATATGAAGCAGGTCGGCAGGGATGCCGTAAAAGGGAAGCAGCCATGGAGTGATTGGCTAGATGACGAGGAGGATGAGCGGGAATGCTTGCGCCCCATCGTTGATACTAAATCCAAGTATCAGCAGCCTTTAAACTGCGAGCCCCAGTATGCTCTGGGAAAACAAAAGCGGCAGGATGGTGCCTCTACCTCGGAAACGAGGATTGTTGTTGGTGCCGTTGCCTGCCCGGTACCCCAACCCAAAGAATCCAAAATCCCCTCCACCAAGGCGGTTCCAAAGCTGCCGGGAAAATCAAAACGCGCCGAAAGGTTCGCTCAGATGAGTCCCGAGGAAGCAGCGGCCAAACGTGCCGCGGAAAACCGAAGGAGGAGAAATTCCCGAAAGGGAAGGAAAGTTCCACCTCTTGCAGTGAAAGGACCTCTGCCCATGAAAATGGAGGAGGTATCCAAACTGGTGGACAAGAAGTTGGCCGAGCTTGTGAAGGTTCGGCCAAGGAGGAGTGTGCCCAAGGCACAACTAGCCTCGAAGTCCTCTTCGATGGCTTCTACCACTGGCTCCCAGAGCTATGTGGTTCCTCCGAGAAGGCGTGGGAACAAATGGCGCAATACGAGCGCCCCCATCAACCCGACGAACGCTCAAACGGGGGGACGCCCCTATATAATGACGAGCGAAGGGTTAACCTTCTTGGATTCTGTAAAGTCGGCTCCTGTGACTTTACAAAATGGAAAAGCCCCACCAAAGAACTCTCAGAATGGGGATTCCATCGAGCTCAGGCCTCAACGCTCTTACAAGCCTGTCAGGAAAGCTACGGCTGGCCAGACACAGGTGCAGAGGCCGAATTGAGCTCTTTGCGGTACCAAGCAGCCAAACGGGCGGCTGCTCAAACAAAAGCCCTAACTCCAAGCAAAGTCGCGCGTTGGAGTGTAATACAGCGCACCTGTGTTGCATATGGCGTCACACGACGCCATGCTCCTCGTTGGACACGCACAATGAATCGGGCTGATGCTCGATTCTATTTCTGTGAAGCTGTCCGAAGTCTGAAACCAGACTCTGGAAGTGGTCTTCCTTTCGCTGCGTTCTATAATAGAACAACTCACAGCGACTGGTGCTACGATGATGCCTCTTTTGAGGCGTTGTTTGACCTAGTCTGGGCCCGTTTGGGTAGACTTCGTTCGAGGTCGTTCCGCAACCCAGTTCAGGCTGTGCAAGACGGCCTTTGTGACCCTATCCGCCTGTTTGTGAAGCTCGAACCTCACAAACGTGCTAAGATTGAGCAGAAGCGATTTCGTTTAATTGCTTCAGTATCTTTGGCGGATCAGTTGGTCGCCCGGATGCTCTTCCAGGAACAAAACCAGGCAGAGCTTGACATGTACATGTACATTCCTTCCAAGCCGGGGCTTGGATTCTCAAAGGATAGTCAAGTTCTGGAGTTTACGAAGAGCATAGCCTATCTTGCCCACACCACCCCCGAAGACCTAGTGAATAACTGGTCGGAACACTTAATCCCAACTGACTGCTCGGGATTTGACTGGAGTGTTCCAATGTGGTTGTTGGAGGATGATCTTGCAGTCCGCAACGAGTTGACCATCGACTGTTCCGATGACCTCATTAAGATGAGGTCTGAGTGGCTTCGATGCCTAGGGCAGAGCGTATTTGTTCTGTCAAATGGAATGATGGTTGCCCAGCTCGAACCGGGAATCCAGAAAAGTGGGAGTTTTAATACTTCCTCAACGAATTCTCGGATGAGGTATATGGCGTCACTCTACGCCGGAGCTTCATGGGCCGTCACAATGGGTGACGACGCGTTGGAGTCAGTTGATTCTGACTTGTCCCAGTATGCCTTACTGGGTTTAATATGTGAGCGCGCTGAAGAGTTCGACTTTTGTTCTCACATCTTTAAGGCGCCCTCTGTAGTCGTACCGAAGAATATTCATAAGATGATCTTCGGTCTCCTTTCTGGAGTGTCTCCGATAAGTCCTGTTCAAGAGGCAAGGATACAATGGCTGCAGGCCTTCCAGTCAATCTCTGAGGAGATGAGGCATATGCCAGCGGAATTTTGGGAAGAATTCCGCACCGCTATTGGCATATTAGGGGACGGGTGGTAGAAGGTTACCACCCTTGGAAGAGGGATGCCCCCCGAAAGGGGACCATGAATTGACATGGTCTTGGAATGCCGTAATGCTGGACCTGGCTAGAGATAAAATCTATAAATAATTACGGCATTTCTATGGTGAGTCGCAATCAAAGACGAAGAAATCGTCCACGCAGAATGCGAAGAAGACAGGCACCGAATAGGGTCGTGGTGATGGGCAACAACCCCACACGTTCCCGAAGACGCAACGCCCCCGCTCGTCGGCGGCGTGCGGTTAATAGATCAACCGGAGAGATGCGTCCTTACCATTTGTATGGGCTTAAATGCAACGACACGGGTTATCTCACTTTTGGTCCTTCTGGACAAACTCCATCCTTGGGTGGTGGTATCCTAAAGGCCTTCTCTGAGTATAAAATAACCCAGTTGAGAGTACAATGGAAGGCGCAGGCTTCTTCGACTGCCGCAGGTTCCATGGCCATTCAAATTGGCCTTGGTACAAGCCTGACCGCTCTGGACAACCGGGCTATCTCATTTAAGTTGACCAGTTCGGGGCAGCGAGTGTTCACCGCCCGAGATCTCGGCGGTGACGGTAGAATGTATAACTCCTCTAACGAGGACCAGTTCCGCCTTGCCTACCAGGGGAATGGAGATTCTACCCTCGGAGGGGATCTATTATGTTTCTTTCGCCTGGAAACGCGACTGCCCAAATAGGTAGACGCGGACCCCCCCAGTCCACCATCTCCGGAACCTTCTCCGGAGCCCCCACCCCAACCACCAGCTCCGACACCGGCGAGATGCCGCTTCTGGGGATACGAAGGTATCCCTAGTGTAAGAG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26,598
ON229074.1
Citrus vein enation virus
Yang,H.-J., Choi,E.J., Lee,S.-H., Woo,J.-H., Lim,S., Lee,S.-J.
Animal and Plant Quarantine Agency, Department of Plant Quarantine
null
2022-05-31
KYZ
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
null
South Korea
South Korea
Citrus junos
null
2021
null
null
Citrus vein enation virus isolate KYZ, complete genome
ATATAAGCTATAAAAGAAAAGTGCGTTTACGCTTCCTTCTTTGAGCTTATACAAGTCGTATGTTTTGTGCCTTGATTTCGTTGACTGTCCAGTTTATTCTGTTGACTCTCGCATACGCTTTCGGCACTTTGTTGTGGACTTACGCTTTCGGACTCTCGGTTTCTCCTGTACTCCTTGAGATCGAAAGACTACTTTTGCTGTGGTAGAATGATCAAGGAATGCCTTGCTACCATGTCATCCCCTACGACTACTTTCAGCCTATCCACTCTTCTAACTGGTTGGGAGCTAGCTTACTTGCTCTCCTTAATTATGTTGGGATGGGCTGTCCTACACAGGAGGGAACGCCATGCGAGGAACCAACTTGCGTGGCACTTCCCTACGTCCTACTATGTGCTCTTGCTCTGCTATGGGGTCACCCTCGTAGCTGCGGGAGGCGTGGCGGGGTCTCGCTTGAGGCCCTCACTTTGCCACGCGGGTTCAACATCGTTGGGCCTCCCGATTTCTTGTGGCACTTTAGAATTTGTGCCGCTCGAATCGGGCTTATCATCCCCCAATCTTACTGGCGGGATGACGGACGTAGTGCGATCCCCCTCACTCACTGTGCGCTATTCACCTCTCTTCCATGTTGGCTCATGGCTGCAAGTGGCAAGGCAGAATACCACTGTCAGGGTTACGTTGCGCCTGAGCTTCAGTTACCTGGTAACGGCCCAGACCATACTGTCTGGGTGGAAGAGAAATGGGCTCGCTGGCATGAGCTTATTGTTGGGTTGCTTGGAACCCATACGAATGTTGCCAGCATACTCCGTGTACTGCCTGACGGAGGCGTTACTCCTCACAGCCAAGTGCTTGGAAAACGCAATCTTATCGTGGATGCTTTTACTAGCATCAGCACTATGGCAGTTGGCACGGATCAACCCCCTCCGAACCGTTATATGGATGACTGTTCTCTCACTAGGCTCTTTTGCCTACGAGAACCGTATCTGTCGGGCTATGATACAGATAATTTTAGCCCCGGTTTACATATTACCCTCCCTTGGCCTGAAATTCCTGAGGGTGGCGAGTATCTTGCCCACTCTTTTGCTGAACTGGACCAAGAATTTGCTGATCTTTTGGCTCACCTTCACGTCCATGATGACGAGGAGGATCTTGGTTGGTTCTCTGATGATGGTGAGGGTGATATTGAGAATCCCCCTGTTCCCCATAATACTGATGAAGAAGATTTTGGGGATTCTGATGATGATGACTCCATCGGTGGAAACGCCGGTAGCGGACCCGAGGCTTAGATTTGTTAATCGTGAGCGGTCCGTGTCATTGGAGGGGCAAGCCAGGCAAGTGTGTCTCCCCGCTGTACCCCCGAAAGGGGTTATAGGAAAGGTTCTGAATGCTAACAACATTCAGATCGGGTACTTTTCCTGTGTAAAACTCATGGGAGGTACGGATGGGATAATGGTTCCCATCCACGTTTATGAAGACGCCCACATGTTTATGGGCAACAACCTCGCCCTATCAAAAGATGCATTCACGGTTATGTACCGTGATGTGGAAGGGGATGTCCTAATTTTGAAAGGACCCCCAAATTATAGGGTTGTATTAGGAGTGAAACCCCGACTCCTACTTACTGCAAACTTCGCCCGGCTGGGATTCCACTCCCTCTATTTCGAAAGAGATGGACAGTGGAAAGTCCAATCAGCCAATGTAAAAGGGGCGGAGGATGGTTTCTTGGCCGTTGTTTCCCAGACACTTCCTGGGGACTCCGGACTTCCCCTCTTCGATACAAAACACCGTATTTGTGCCATGCACATTGGCCATTATGGTGAGAAGAGACCGGAGAATATGGCCACGGTTGTTCTTCCTATCAGGGGGTTTTCTGTCCCTGATACTGAGGTTTTCAAGCCCCAAGTCAAGACTACTGAGTCCTTGTATGAGGACGATAAGATTTTCGACTTAGTCGAGGATCTTGAGAAGGAAATTGACGAGGGAGTGGTCCGAGACTTGGAGTTCGAGGGCCAACATTATAAGACCGTCATCGGTAAGACTTCCATAGCCCTGCTCAAGGAGGCTGAGTTCCTCGATCATATGAAGCAGGCCGGCAGAGATGCCGTAAAAGGGAAGCAGCCATGGAGTGATTGGCTAGATGACGAAGAGGATGAGCGGGAATGCTTGCGCCCCATCACTGATACTAAGTCCAAGTATCAGCAGCCTTTAAACTGCGAGCCCCAGTACGCTCTGGGAAAACAAAAGCGGCAGGACGGTGCCTCCACCTCGGAAACGAGGATTGTTGTTGGTGCCGTTGCCTGCCCGGTACCCCAACCCAAAGAATCCAAAATTCCCTCCACCAAGGCGGTTCCAAAGCTGCCGGGAAAGTCGAAGCGCGCCGAAAGGTTCGCTCAGATGAGTCCCGAGGAAGCAGCGGCCAAACGTGCCGCGGAAAACCGAAGGAGGAGAAATTCCCGAAAGGGAAAGAAAGTTCCACCTCTTGCAGTGAAAGAACCTCTGTCCATGAAAATGGAGGAGGTATCCAAACTGGTGGACAAGAAGTTGGCCGAGCTTGTGAAGGTTCGGCCGAGGAGGAATGTGCCCAAGGCACAACTAGCCTCGAAGTCCTCTTCGACGGCTTCTACCACTGGCTCCCAGAGCTATGTGGTTCCTCAGAGAAGGCGTGGGAACAAGTGGCGCAATACGAGCGCCCCCATCAACCCGACGAACGCTCAAACGGGGGGACGCCCCTACATAATGACGAGCGAAGGGTTAACCTTCTTGGATTCTGTAAAGTCGGTTCCTGTGACTTTACGAAATGGAAAAGCCCCACCAAAGAACTCTCAGAATGGGGATTCCATCGAGCTCAGGCCTCAATGCTCTTACAAGCCTGTCAGGAAAGCTACGGCTGGCCAGACACAGGTGCAGAGGCCGAACTGAGCTCTTTGCGGTACCAAGCAGCCAAACGGGCGGCTGCTCAAACAAAAGCCCTAACTCCAAGCAAAGCCGCGCGTTGGAGTGTTATACAGCGCACCTGTGTTGCATATGGCGTCACACGACGCCATGCTCCCCGTTGGACACGCACAATGAATCGGGCTGATGCTCGGTTCTATTTCTGTGAAGCTGTCCGAAGTCTGAAGCCAGACTCTGGAAGTGGTCTTCCTTTCGCTGCATTCTATAATAGAACAACTCACAGCGACTGGTGCTACGATGATGCCTCTTTTGAGGCGTTGTTTGACCTAGTCTGGGCCCGTTTGGGTAGACTTCGTTCGGGGTCTTTTCGCAACCCAGTTCAGGCCGTGCAAGACGGCCTTTGTGACCCTATCCGCCTGTTTGTGAAGCTCGAACCTCACAAACGTGCTAAGATTGAGCAGAAGCGGTTTCGTTTAATCGCTTCAGTATCTTTGGCGGATCAGTTGGTCGCCCGGATGCTCTTCCAGGAACAAAACCAGGCAGAGCTTGACATGTACATGTACATTCCTTCCAAGCCGGGGCTTGGATTCTCAAAGGATAGTCAAGTTCTGGAGTTTACGAAGAGCATAGCCTATCTTGCCCACACCACCCCCGAAGACCTAGTGAATAACTGGTCGGAACACTTGATCCCAACTGACTGCTCGGGATTTGACTGGAGTGTTCCAATGTGGTTGTTGGAGGATGATCTTGCAGTCCGCAACGAGTTGACCATCAACTGTTCCGATGACCTCATTAAGATGAGGTCTGAGTGGCTTCGATGCCTAGGGCAGAGCGTACTTGTTCTGTCAAATGGAATGATGGTTGCCCAGCTCGAACCGGGAATCCAGAAAAGTGGGAGTTTTAATACTTCCTCAACAAATTCCCGGATGAGGTATATGGCGTCACTCTACGCCGGAGCTTCGTGGGCCGTCACAATGGGTGACGACGCGTTGGAGTCAGTTGATTCTGACTTGTCCCAGTATGCCTTACTGGGTTTAATATGTGAGCGCGCTGAAGAGTTCGACTTTTGTTCTCACATCTTTAAGGCGCCCTCTGTAGTCGTGCCGAAGAATATTCACAAGATGATCTTCGGTCTCCTTTCTGGAGTGTCTCCGATAAGTCCTGTTCAAGAGGCAAGGATACAATGGCTGCAGGCCTTCCAGTCAATCTCTGAGGAGATGAGGCATATGCCAGCGGAATTTTGGGAAGAGTTCCGCACCGCTATTGGCATATTAGGGGACGGGTGGTAGAAGGTTACCACCCTTGGAAGAGGGATGCCCCCCGAAAGGGGACCATGAATTGACATGGTCTTGGAACGCCGTAATGCTGGACCTGGCTAGAGATAAAATCTATAAATAATTACGGCGTAACTATGGTGAGTCGCAATCAAAGACGAAGAAATCGTCCACGCAGAATGCGAAGAAGACAGGCACCGAATAGGGTCGTGGTGATGGGCAACAACCCCACACGTTCCCGAAGACGCAACGCCCCCGCTCGTCGGCGGCGTGCGGTTAATAGATCAACCGGAGAGATGCGTCCTTACCACTTGTACGGGCTTAAATGCAACGACAAGGGTTATCTCACTTTTGGTCCTTCTGGACAAACCCCATCCTTGGGTGGTGGTATCCTAAAGGCCTTCTCTGAGTATAAAATAACCCAGTTGAGAGTACAATGGAAGGCGCAGGCTTCTTCGACTGCCGCAGGTTCCATGGCCATCCAAATTGGCCTTGGTACAAGCCTGACCGCTCTGGACAACCGGGCTATCTCATTTAAGTTGACCAGTTCGGGGCAGCGAGTGTTCACCGCCCGAGATCTCGGCGGTGACGGTAGAATGTATAACTCCTCTAACGAGGACCAGTTCCGCCTTGCCTACCAGGGGAATGGAGATTCTACCCTCGGAGGGGATCTATTATGTTTCTTTCGCCTGGAAACGCGACTGCCCAAATAGGTAGACGCGGACCCCCCCAGTCCACCATCTCCGGAACCTTCTCCGGAGCCCCCACCCCAACCACCAGCTCCGACACCGGCGAGATGCCGCTTCTGGGGATATGAAGGTATCCCTAGTGTAAGAG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30,460
MW167082.1
Citrus vein enation virus
Minutolo,M., Cinque,M., Altamura,G., Di Serio,F., Alioto,D., Navarro,B.
Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto per la Protezione Sostenibile delle Piante
Italy
2021-11-01
14Q
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
null
Italy:Campania region
Italy
Citrus sinensis
null
2018
null
null
Citrus vein enation virus isolate 14Q, complete genome
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36,294
MN596377.1
Citrus vein enation virus
Huang,A.J., Song,Z., Cao,M.J., Chen,H.M., Li,Z.A., Zhou,C.Y.
Southwest University/Chinese Academy of Agricultural Sciences, Citrus Research Institute
China
2020-06-29
CVEV-XZG
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
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China
China
Citrus
null
2012-01-01
null
null
Citrus vein enation virus isolate CVEV-XZG, complete genome
ATATAAGCTATAAAAGAAAAGTGCGTTTACGCTTCCTTCTTTGAGCTTATATAAGTCGTATGTTTTGTGCCTTGATTGTGTTGACTGTCCAGTTCATTCTGTTGACTATCGCTTACGCTTTTGGCACTCTGTTGTGGTCATACATTTTCGGACTCTCGGTTTCTCCTATACTCCTTGAGATCGAAAGACTACTTCTCCTGTGGTAGAATGATCAAGGAATGCCTTGCTACCATGTCATCCCCTACGACTATTTTCAGCCTATCCACTCTTCTAACTGGCTGGGAGCTAGCTTACTTGCTCTCATTAATTATGTTGGGATGGGCTGTCCTACACAGGAGGGAACGCCATGCGAGGAACCAACTTGCGTGGCGCTTCCCTACGTCCTACTATGTGCTCTTGCTTTGCTATGGGGTCACCCTCGTAGCTGCGGGAGGCGCGGCGGGGTCTCGCTTGAGGCCCTCACTCTGCCACGCGGGTTCAACATCGTTGGGCCTCCCGATTTCTTGTGGTACTTTAGAATTTGTGCCGCTCGAATCGGGCTTATCATCCCCCAATCTTACTGGCGGGATGACGGACGTAGGGCGATCCCCCTCACTCACTGTGCGTTATTCACCTCTCTTCCATGTTGGCTCATGGCTGCAAGTGGCAAGGCAGAATACCACTGTCAGGGTTACGTTGCGCCTGAGCTTCAGTTACCTGGTAACGGCCCGGACCATACTGTCTGGGTGGAAGAGAAATGGGCTCGCTGGCATGAGCTTATTGTTGGGTTGCTTGGAACCCATACGAATGTTGCCAGCATACTCCGTGTACTGCCTGACGGAGGCGTTACTCCTCACAGCCAAGTGCTTGGAAAACGCAATCTTATCGTGGATGCTTTTACTAGCATCAGCACTATGGCAGTTGGCACGGATCAACCCCCTCCGAACCGCTATATGGATGATTGTTCTCTCACTAGGCTCTTTTGCCTACGAGAACCGTATCTGTCGGGCTATGATACAGATAATTTTAGCCCCGGTTTACATATTACCCTCCCTTGGCCTGAAATTCCTGAGGGTGGCGAGTATCTTGCCCACTCTTTTGCTGAACTGGACCAAGAATTTGCTGATCTTTTGGCTCACCTTCACGTCCATGATGACGAGGAGGATCTTGGTTGGTTCTCTGATGATGGTGAGGGCGATATTGAGAATCCCCCTGCTCCCCATAATACTGATGAAGAAGACTTTGGGGATTCTGATGATGATGATTCCGTCGGCGGAAATGCCGGTAGCGGACCCGAAGCTTAGATTTGTCAATCGTGAGCGGTCCGTATCGTTGGAGGGGCAAGCCAGGCAAGTGTGTCTCCCCGCTGTACCCCCGAAAGGGGTTATAGGAAAGGTTCTGAATGCTAACAACATTCAGATCGGGTACTTTTCCTGTGTAAAACTCATGGGAGGTACGGATGGGATAATGGTTCCCATCCACGTTTTTGAAGACGCCCACATGTTTATGGGCAACAACCTCGCCCTATCCAAAGATGCATTCACGGTTATGTATCGTGATGTAGAAGGGGATGTCCTGATTCTGAAAGGACCCCCAAATTATAGGGTTGTATTAGGAGTGAAACCCCGACTCCTACTTACTGCAAACTTCGCCCGGCTGGGATTTCACTCCCTCTATTTCGAAAGAGATGGACAGTGGAAAGTCCAATCAGCCAATGTAAAAGGGGCGGAGGATGGTTTCTTGGCCGTTGTTTCCCAGACACTTCCTGGGGACTCCGGACTTCCCCTCTTCGATACAAAACACCGTATTTGTGCCATGCACATTGGCCATTATGGTGAGAAGAGACCGGAGAATATGGCCACGGTTGTTCTTCCTATCAGGGGGTTTTCTGTCCCTGATACTGAGGTTTTCAAGCCCCAAGTCAAAACTACTGAGTCCTTATATGAGGATGATAAGATCTTCGACCTAGTTGAGGATCTTGAGAAGGAAATTGACGAGGGAGTGGTCCGAGACTTGGAGTTCGAGGGCCAACATTATAAGACCGTCATCGGTAAGACTTCCATAGCCCTGCTCAAAGAGGCTGAGTTCCTCGATCATATGAAGCAGGTCGGCAGGGATGCCGTAAAAGGGAAGCAGCCATGGAGTGATTGGCTAGATGACGAAGAGGATGAGCGGGAATGCTTGCGCCCCATCGCTGATACTAAATCCAAGTATCAGCAGCCTTTAAACTGCGAGCCCCAGTACGCTCTGGGAAACCAAAAGCGGCAGGACGGTGCCTCCACCTCGGAAACGAGGATTGTTGTTGGTGCTGTTGCCTGCCCGGTACCCCAACCCAAAGAATCCAAAATTCCCTCCACCAAGGCGGTTCCAAAGCTGCCGGGAAAGTCAAAGCGAGCCGAAAGGTTCGCCAAGATGAGTCCCGAGGAAGCAGCGGCCAAGCGTGCCGCGGAAAACCGAAGGAGGAGAAACTCCCGAAAGGGAAAGAAAGTTCCACCTCTTGCAGTGAAAGGACCTCCACCCATGAAAATGGAGGAGGTATCCAAACTGGTGGACAAGAAGTTGGCCGAGCTTGTAAAAGTTCGGCCAAGGAGGAATGTGCCCAAGGCACAACTAGCCTCGAAGTCCTCTTCGACGGCTTCTACCACTGGCTCCCAGAGCTATGTGGTTCCTCCGAGAAGGCGTGGGAACAAATGGCGCAATACGAGCGCCCCCATCAACCCGACGAACGCTCAAACGGGGGGACGCCCCTACATAATGACGAGCGAAGGGTTAACCTTCTTGGATTCTGTAAAGTCGGCTCCTGTGACTTTACGAAATGGAAAAGCCCCACCAAAGAACTCTCAGAATGGGGATTCCATCGAGCTCAGGCCTCAACGCTCTTACAAGCCTGTCAGGAAAGCTACGGCTGGCCAGACACAGGTGCAGAGGCCGAACTGAGCTCTTTGCGGTACCAAGCAGCCAGACGGGCGGCTGCTCAAACAAAAGCCCAAACTCCAAGCAAAGCCGCGCGTTGGAGTGTAATACAGCGCACCTGTGTTGCATATGGCGTTACACGACGCCATGCTCCCCGTTGGACACGCACAATGGATCGGGCTGATGCTCGGTTCTATTTCTGTGAAGCTGTCCGAAGTCTGAAACCAGACTCTGGAAGTGGCCTTCCTTTCGCTGCGTTCTATAATAGAACTACTCACAGCGACTGGTGCTACGATGATGCCTCTTTTGAGGCGTTATTTGACCTAGTCTGGGCCCGCTTGGGTAGACTTCGTTCGGGGGCCTTCCGCAACCCAGTTCAGGCCGTGCAAGACGGCCTTTGCGACCCTATCCGCCTGTTTGTGAAGCTCGAACCTCACAAACGCGCTAAAATTGAGCAGAAGCGGTTTCGTTTAATCGCTTCGGTATCTTTGGCGGATCAGTTGGTCGCCCGGATGCTCTTCCAGGAACAAAACCAGGCAGAGCTTGACATGTACATGTACATTCCTTCCAAGCCGGGGCTTGGATTCTCAAAGGATAGTCAAGTTCTGGAGTTTACGAAGAGCATAGCCTATCTTGCCCACACCACCCCCGAAGACCTAGTGAATAACTGGTCGGAATACTTGATCCCAACTGACTGCTCGGGATTTGACTGGAGTGTTCCAATGTGGTTGTTGGAGGATGATTTAGCAGTCCGCAACGAGTTGACCATCGACTGTTCCGATGACCTCATCAAGATGAGGTCTGAGTGGCTTCGATGCCTAGGGCAGAGCATATTTGTTCTGTCAAATGGAATGATGGTTGCCCAGCTCGAACCGGGGATTCAGAAAAGTGGGAGTTTTAATACTTCCTCAACGAATTCCCGGATGAGGTATATGGCGTCTCTCTACGCCGGAGCTTCGTGGGCCGTCACAATGGGTGATGACGCGTTGGAGTCAGTTGATTCTGACTTGTCCCAGTATGCCTTACTGGGTTTGATATGTGAGCGCGCTGAAGAGTTCGACTTTTGTTCTCACATCTTTAAGGCGCCCTCTGTAGTCGTGCCGAAGAATATTCATAAGATGATCTTCGGTCTCCTTTCTGGAGTGTCTCCGATAAGTCCTGTTCAAGAGGCGAGGATACAATGGCTGCAGGCCTTCCAGTCAATCTCTGAGGAGATGAGGCATATGCCAGCGGAATTTTGGGAAGAATTCCGCACCGCTATTGGCATATTAGGGGACGGGTGGTAGAAGGTTACCACCCTTGGAAGAGGGATGCCCCCCGAAAGGGGACCATGAATTGACATGGTCTTGGAATGCCGTAATGCTGGACCTGGCTAGAGATAAAATCTATAAATAATTACGGCATTACTATGGTGAGTCGCAATCAAAGACGAAGAAATCGTCCACGCAGAATGCGAAGAAGACAGGCACCGAATAGGGTCGTGGTGATGGGCAACAACCCCACACGTTCCCGAAGACGCAACGCCCCCGCTCGTCGGCGGCGTGCGGTTAATAGATCAACCGGAGAGATGCGTCCTTATCACTTGTATGGGCTTAAATGCAACGACAAGGGTTATCTCACTTTTGGTCCTTCTGGACAAACCCCATCCTTGGGTGGTGGTATCCTAAAGGCCTTCTCTGAGTATAAAATAACCCAGTTGAGAGTACAGTGGAAGGCGCAGGCTTCTTCGACTGCCGCAGGTTCCATGGCCATTCAAATTGGCCTTGGTACAAGCCTGACCGCTCTGGACAACCGGGCTATCTCATTTAAGTTGACCAGTTCGGGGCAGCGAGTGTTCACCGCCCGAGATCTCGGCGGTGACGGTAGAATGTATAACGCCTCTAACGAGGACCAGTTCCACCTTGCCTACCAGGGGAATGGAGATTCTACCCTCGGAGGGGATCTATTATGTTTCTTTCGCCTGGAAACGCGACTGCCCAAATAGGTAGACGCGGACCCCCCCAGTCCACCATCCCCGGAACCTTCTCCGGGGCCCCCACCCCAACCACCAGCTCCGACACCGACGAGATGCCGCTTCTGGGGATACGAAGGTATCCCTAGTGTAAGAG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48,804
MN187035.1
Citrus vein enation virus
Tan,S.-H., Osman,F., Dang,T., Bodahgi,S., Greer,G., Huang,A., Hammado,S., Chen,X., Vidalakis,G., Bodaghi,S.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2019-10-27
VE701
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
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USA: California
USA
Citrus sinensis
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1973
null
null
Citrus vein enation virus isolate VE701, complete genome
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58,526
MN187036.1
Citrus vein enation virus
Tan,S.-H., Osman,F., Dang,T., Bodahgi,S., Greer,G., Huang,A., Hammado,S., Chen,X., Vidalakis,G., Bodaghi,S.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2019-10-27
VE702
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
null
USA: California
USA
Citrus sinensis
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1974
null
null
Citrus vein enation virus isolate VE702, complete genome
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58,527
MN187037.1
Citrus vein enation virus
Tan,S.-H., Osman,F., Dang,T., Bodahgi,S., Greer,G., Huang,A., Hammado,S., Chen,X., Vidalakis,G., Bodaghi,S.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2019-10-27
VE703
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
null
USA: California
USA
Citrus sinensis
null
1983
null
null
Citrus vein enation virus isolate VE703, complete genome
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58,528
MN187038.1
Citrus vein enation virus
Tan,S.-H., Osman,F., Dang,T., Bodahgi,S., Greer,G., Huang,A., Hammado,S., Chen,X., Vidalakis,G., Bodaghi,S.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2019-10-27
VE704
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
null
USA: Louisiana
USA
Citrus unshiu
null
1991
null
null
Citrus vein enation virus isolate VE704, complete genome
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58,529
MN187039.1
Citrus vein enation virus
Tan,S.-H., Osman,F., Dang,T., Bodahgi,S., Greer,G., Huang,A., Hammado,S., Chen,X., Vidalakis,G., Bodaghi,S.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2019-10-27
VE705
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
null
USA: California
USA
Citrus sinensis
null
1997
null
null
Citrus vein enation virus isolate VE705, complete genome
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58,530
MN187040.1
Citrus vein enation virus
Tan,S.-H., Osman,F., Dang,T., Bodahgi,S., Greer,G., Huang,A., Hammado,S., Chen,X., Vidalakis,G., Bodaghi,S.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2019-10-27
VE706
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
null
USA: California
USA
Citrus sinensis
null
2002
null
null
Citrus vein enation virus isolate VE706, complete genome
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58,531
MN187041.1
Citrus vein enation virus
Tan,S.-H., Osman,F., Dang,T., Bodahgi,S., Greer,G., Huang,A., Hammado,S., Chen,X., Vidalakis,G., Bodaghi,S.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2019-10-27
VE707
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
null
USA: California
USA
Citrus reticulata x Citrus sinensis
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2010
null
null
Citrus vein enation virus isolate VE707, complete genome
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58,532
MN187042.1
Citrus vein enation virus
Tan,S.-H., Osman,F., Dang,T., Bodahgi,S., Greer,G., Huang,A., Hammado,S., Chen,X., Vidalakis,G., Bodaghi,S.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2019-10-27
VE708
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
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USA: California
USA
Citrus reticulata x Citrus sinensis
null
2010
null
null
Citrus vein enation virus isolate VE708, complete genome
ATATAAGCTATAAAAGAAAAGTGCGTTTACGCTTCCTTCTTTAAGCTTATACTAGTCGTATGTTTTGTGCCTTGTTTTCGTTGACTGTCCAGCTTGTTCTGTTGACTATCGCATACGCTTTCGGCACTCTCTTGTGGTCTTATATTTTCGGACTCTCGGTTTCTCCTATACTCCTTGAGATCGAAAGACTACTTTTGCTGTGGTAGAATGATCAAGGAATGCCTTGCTACCATGTCATCCCCTACGACTACTTTCAGCCTATCCACTCTTCTAACTGGTTGGGAGCTAGCTTACTTGCTCTCATTAATTATGTTGGGATGGGCTGTCCTACACAGGAGGGAACGCCATGCGAAGAACCAACTTGCGTGGCGCTTCCCTACGTCCTATTATGTGCTCTTGCTTTGCTATGGGGTCACCCTCGTAGCTGCGGGAGGCGTGGCGGGGTCTCGCTTGAGGCCCTCACTTTGCCACGCGGGTTCAACATCGTTGGGCCTCCCGATTTCTTGTGGTACTTTAGAATTTGTGCCGCTCGAATCGGGCTTATTATCCCCCAATCTTACTGGCGGGATGACGGACGTAGGGCGATCCCCCTCACTCACTGTGCGCTATTCACCTCTCTTCCATGTTGGCTCATGGCTGCAAGTGGCAAGGCAGAATACCACTGTCAGGGTTACGTTGCGCCTGAGCTTCAGTTACCTGGTGACGGCCCAGAACACACTGTCTGGGTGGAAGAGAAGTGGGCTTGCTGGCATGAGCTTATTGTTGGGTTGCTTGGAACCCATACGAATGTTGCCAGCATACTCCGTGTATTGCCTGACGGAGGCGTTACTCCTCACAGCCAAGTGCTTGGAAAACGCAATCTTATCGTGGATGCTTTTACTAGCATCAGCACTATGGCAATTGGCACGGATCAACCCCCTCCGAACCGCTATATGGATGATTGTTCTCTCACTAGGCTCTTTTGCCTACGAGAACCGTATCTGTCGGGCTATGATACAGATAATTTTAGCCCCGGTTTACATATTGCCCTCCCTTGGCCTGAAATTCCTGAGGGTGGTGAGTATCTTGCCCACTCTTTTGCTGAACTGGACCAAGAATTTGCTGATCTTTTGGCTCACCTTCACGTCCATGATGACGAGGAGGATCTTGGTTGGTTCTCTGATGATGGTGAGGGCGATATTGAGAATCCCCCTGCTCCCCATAATACTGATGAAGAAGATTTTGGGGATTCTGATGATGATGACTCCATCGGTGGAAACGCCGGTAGCGGACCCGAAGCTTAGATTTGTTAATCGTGAGCGGTCCGTGTCATTGGAGGGGCAAGCCAGGCAAGTGTGTCTCCCCGCTGTACCCCCGAAAGGGGTTATAGGAAAGGTTCTGAATGCTAACAACATTCAGATCGGGTACTTTTCCTGTGTAAAACTCATGGGAGGTACGGATGGGATAATGGTTCCCATCCACGTTTATGAAGACGCCCATATGTTTATGGGCAACAACCTCGCCCTATCTAGAGATGCATTCACGGTTATGTACCGTGATGTGGAAGGGGATGTCCTAATTTTGAAAGGACCCCCAAATTATAGGGTTGTATTAGGAGTGAAACCCCGACTCCTACTTACTGCAAACTTCGCCCGGCTGGGATTCCACTCCCTCTATTTCGAAAGAGATGGACAGTGGAAAGTCCAATCAGCCAATGTAAAAGGGGCGGAGGATGGTTTCTTGGCCGTTATTTCCCAAACACTTCCTGGGGACTCCGGACTTCCCCTCTTCGATACAAAACACCGTATTTGTGCCATGCATATTGGCCACTATGGTGAGAAGAGACCGGAGAATATGGCCACGGTTGTTCTTCCTATCAGGGGGTTTTCTGTCCCTGATACTGAGGTTTTCAAGCCCCAAGTCAAGACTACTGAGTCCTTGTATGAGGATGATAAAATTTTCGACTTAGTCGAGGATCTTGAGAAGGAAATTGACGAGGGAGTGGTCCGAGACTTAGAGTTCGAGGGCCAACATTATAAGACCGTCATCGGTAAGACTTCCATAGCCCTGCTCAAGGAGGCTGAGTTCCTCGATCATATGAAGCAGGTCGGCAGGGATGCCGTAAAAGGGAAGCAGCCATGGAGTGATTGGCTAGATGACGAGGAGGATGAGCGGGAATGCTTGCGCCCCATCGTTGATACTAAATCCAAGTATCAGCAGCCTTTAAACTGCGAGCCCCAGTACGCTCTGGGAAAACAAAAGCGGCAGGACGGTGCCTCCACCTCGGAAACGAGGATTGTTGTTGGTGCCGTCACCTGCCCGGTACCCCAACCCAAAGAATCCAAAACTTCCTCCACCAAGGCGGTTCCAAAGCTGCCGGGAAAGTCAAAGCGCGCCGAAAGGTTCGCTCAGATGAGTCCCGAGGAAGCAGCGGCCAAACGTGCCGCGGAAAACCGAAGGAGGAGAAATTCCCGAAAGGGAAAGAAAGTTCCACCTCTTGCAGTGAAAGGACCTCTGCCCATGAAAATGGAGGAGGTATCCAAACTGGTGGACAAGAAGTTGGCCGAGCTTGTGAAGGTTCGGCCAAGGAGGAGTGTGCCCAAGGCACAACTAGCCTCGAAGTCCTCTTCGACGGCTTCTACCACTGGCTCCCAGAGCTATGTGGTTCCTCAGAGAAGGCGTGGGAACAAATGGCGCAATACGAGCGCCCCCATCAACCCGACGAACGCTCAAACGGGGGGACGCCCCTATATAATGACGAGCGAAGGGTTAACCTTCTTGGATTCTGTAAAGTCGGCTCCTGTGACTTTACAAAATGGAAAAGCCCCACCAAAGAACTCTCAGAATGGGGATTCCATCGAGCTCAGGCCTCAACGCTCTTACAAGCCTGTCAGGAAAGCTATGGCTGGCCAGACACAGGTGCAGAGGCCGAATTGAGCTCTTTGCGGTACCAAGCAGCCAAACGGGCGGCTGCTCAAACAAAAGCCCTAACTCCAAGCAAAGCCGCGCGTTGGAGTGTAATACAGCGCACCTGTGTTGCATATGGCGTTACACGACGCCATGCTCCTCGTTGGACACGCACAATGAATCGGGCTGATGCTCGATTCTATTTCTGTGAAGCTGTCCGAAGTCTGAAACCAGACTCTGGAAGTGGTCTTCCTTTCGCTGCGTTCTATAATAGAACAACCCACAGCGACTGGTGCTACGATGATGCTTCTTTTGAGGCGTTGTTTGACCTAGTCTGGGCCCGTTTGGGAAGACTTCGTTCGAGGTCATTCCGCAACCCAGTTCAGGCCGTGCAAGACGGCCTTTGTGACCCTATCCGCTTGTTTGTGAAGCTCGAACCTCACAAACGTGCTAAGATTGAGCAGAAGCGATTTCGTTTAATTGCTTCAGTATCCTTGGCGGATCAGTTGGTCGCCCGGATGCTCTTCCAGGAACAAAACCAGGCAGAGCTTGACATGTACATGTACATTCCTTCCAAGCCGGGGCTTGGATTCTCAAAGGATAGTCAAGTTCTGGAGTTTACGAAGAGCATAGCCTATCTTGCCCACACCACCCCCGAAGACCTAGTGAATAACTGGTCGGAACACTTAATCCCAACTGACTGCTCGGGATTTGACTGGAGTGTTCCAATGTGGTTGTTGGAGGATGATCTTGCAGTCCGCAACGAGTTGACCATCGACTGTTCCGATGACCTCATTAAGATGAGGTCTGAGTGGCTTCGATGCCTAGGGCAGAGCGTACTTGTTCTGTCAAATGGAATGATGGTTGCCCAGCTCGAACCGGGAATCCAGAAAAGTGGGAGTTTTAATACTTCCTCAACGAATTCCCGGATGAGGTATATGGCGTCACTCTACGCCGGAGCTTCGTGGGCCGTCACAATGGGTGACGACGCGTTGGAGTCAGTTGATTCTGACTTGTCCCAGTATGCCTTACTGGGTTTGATATGTGAGCGCGCTGAAGAGTTCGACTTTTGTTCTCACATCTTTAAGGCGCCCTCTGTAGTCGTGCCGAAGAATATTCACAAGATGATCTTCGGTCTCCTTTCTGGAGTGTCTCCGATAAGTCCTGTTCAAGAGGCAAGGATACAATGGCTGCAGGCCTTTCAGTCAATCTCTGAGGAGATGAGGCATATGCCAGCGGAATTTTGGGAAGAGTTCCGCACCGCTATTGGCATATTAGGGGACGGGTGGTAGAAGGTTACCACCCTTGGAAGAGGGATGCCCCCCGAAAGGGGACCATGAATTGACATGGTCTTGGAATGCCGTAATGCTGGACCTGGCTAGAGATAAAATCTATAAATAATTACGGCGTATTTATGGTGAGTCGCAATCAAAGACGAAGAAATCGTCCACGCAGAATGCGAAGAAGACAGGCACCGAATAGGGTCGTGGTGATGGGCAACAACCCCACACGTTCCCGAAGACGCAACGCCCCCGCTCGTCGGCGGCGTGCGGTTAATAGATCAACCGGAGAGATGCGTCCTTACCACTTGTATGGGCTTAAATGCAACGACAAGGGTTATCTCACTTTTGGTCCTTCTGGACAAACCCCATCCTTGGGTGGTGGAATCCTAAAGGCCTTCTCTGAGTATAAAATAACCCAGTTGAGAGTACAATGGAAGGCGCAGGCTTCTTCAACTGCCGCAGGTTCCATGGCCATCCAAATTGGCCTTGGTACAAGCCTGACCGCTCTGGACAACCGGGCTATCTCATTTAAGTTGACCAGTTCGGGGCAGCGAGTGTTCACCGCCCGAGATCTCGGCGGTGACGGTAGAATGTATAACTCCTCTAACGAGGACCAGTTCCGCCTTGCCTACCAGGGGAATGGAGATTCTACCCTCGGAGGGGATCTATTATGTTTCTTTCGCCTGGAAACGCGACTGCCCAAATAGGTAGACGCGGACCCCCCCAGTCCACCATCTCCGGAACCTTCTCCGGAGCCCCCACCCCAACCACCAGCTCCGACACCGGCGAGATGCCGCTTCTGGGGATATGAAGGTATCCCTAGTGTAAGAG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58,533
MN187043.1
Citrus vein enation virus
Tan,S.-H., Osman,F., Dang,T., Bodahgi,S., Greer,G., Huang,A., Hammado,S., Chen,X., Vidalakis,G., Bodaghi,S.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2019-10-27
VE709
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,983
GenBank
null
Australia
Australia
Citrus australasica
null
2013
null
null
Citrus vein enation virus isolate VE709, complete genome
ATACAAGCTATAAAAGAAAAGTGCGTTTACGCTTCCTTCTTTGAGCTTATACAAGTCGTATGTTTTGTGCCTTGATTTTGCTGACTGTCCAGTTCGTTCTGTTGACTATCGCATACGCTTTCGGCACTCTTTTGTGGTCTTACATTTTCGGACTCTCGGTTTCTCCTATACTCCTTGAGATCGAAAGACTACTCTTGCTGTGGTAGAATGATCAAGGAATGCCTTGCTACCATGTCATCCCCTACGACTACTTTCAGCCTATCCACTCTTCTAACTGGTTGGGAGCTAGTTTACTTGCTCTCATTAATTATGCTGGGATGGGCTGTCCTACACAGGAGGGAACGCCATGCGAGGAACCAACTTGCGTGGCGCTTCCCTACGTCCTATTATGTGCTCTTGCTTTGCTATGGGGTCACCCTCGTAGCTGCGGGAGGCGTGGCGGGGTCTCGCTTGAGGCCCTCACTTTGCCACGCGGGTTCAACATCGTTGGGCCTCCCGATTTCTTGTGGTACTTTAGAATTTGTGCCGCTCGAATCGGGCTTATCATCCCCCAATCTTACTGGCGGGATGACGGACGTAGGGCGATCCCCCTCACTCACTGTGCGCTATTCACCTCTTTTCCATGTTGGCTCATGGCTGCAAGTGGCAAGGCAGAATACCACTGTCAGGGTTACGTTGCGCCTGAGCTTCAGTTACCTGGTAACTACCCAGAACATACTGTCTGGGTGGAAGAGAAATGGGCTCGCTGGCATGAGCTTATTGTTGGGTTGCTTGGAACCCATACGAATGTTGCCAGCATACTCCGTGTACTGCCTGACGGAGGCGTTACTCCTCACAGCCAAGTGCTTGGAAAACGCAATCTTATCGTGGATGCTTTTACTAGCATCAGCACTATGGCAGTTGGCACGGATCAACCCCCTCCGAACCGCTATATGGATGATTGTTCTCTCACTAGGCTCTTTTGCCTACGAGAACCATATCTGTCGGGCTATGATACAGATAATTTTAGCCCCGGTTTACATATTGCCCTCCCTTGGCCTGAAATTCCTGAGGGTGGCGAGTATCTTGCCCACTCTTTTGCTGAACTGGACCAAGAGTTTGCTGATCTTTTGGCTCACCTTCACGTCCATGATGACGAGGAGGATCTTGGTTGGTTCTCTGATGATGGTGAGGGTGATATTGAGAATCCCCCTGCTCCCCATAACACTGATGAAGAAGATTTTGGGGATTCTGATGATGATGACTCCATCGGTGGAAACGCCGGTAGCGGACCCGAGGCTTAGATTTGTTAATCGTGAGCGGTCCGTGTCATTGGAGGGGCAAGCCAGGCAAGTGTGTCTCCCCGCTGTACCCCCGAAAGGGGTTATAGGAAAGGTCCTGAATGCTAACAACATTCAGATCGGGTACTTTTCCTGTGTAAAACTCATGGGAGGTACGGATGGGATAATGGTTCCCATCCACGTTTATGAAGACGCCCATATGTTTATGGGCAACAACCTCGCCCTATCAAGAGATGCATTCACGGTTATGTACCGTGATGTGGAAGGGGACGTCCTAATTTTGAGAGGACCCCCAAATTATAGGGTTGTATTAGGAGTGAAACCCCGACTCCTACTTACTGCAAACTTCGCCCGGCTGGGATTCCACTCCCTCTATTTTGAAAGAGATGGACAGTGGAAAGTCCAATCAGCCAATGTAAAAGGGGCGGAGGATGGTTTCTTGGCCGTTGTTTCCCAGACACTTCCTGGGGACTCCGGACTTCCCCTCTTCGATACGAAACACCGTATTTGTGCCATGCATATTGGCCATTATGGTGAGAAGAGACCGGAGAATATGGCCACGGTTGTTCTTCCTATCAGGGGGTTTTCTGTCCCTGATACTGAGGTTTTCAAGCCCCAAGTCAAGACTACTGAGTCCTTGTATGAGGATGATAAGATTTTCGACTTAATCGAGGATCTTGAGAAGGAAATTGACGAGGGAGTGGTCCGAGACTTAGAGTTCGAGGGCCAACACTATAAGACCGTCATCGGTAAGACTTCCATAGCCCTGCTCAAGGAGGCTGAGTTCCTCGATCATATGAAGCAGGTCGGCAGGGATGTCGTAAAAGGGAAGCAGCCATGGAGTGATTGGCTAGATGACGAGGAGGATGAGCGGGAATGCTTGCGCCCCATCGTTGATACTAAGTCCAAGTATCAACAGCCTTTAAACTGCGAGCCCCAGTACGCTGTGGGAAAACAAAAGCGGCAGGACGGTGCCTCCACCTCGGAAACGAGGATTGTTGTTGGTGCCGTTGCCTGCCCGGTACCCCAACCCAAAGAATCCAAAATTCCCTCCACCAAGGCGGTTCCAAAGCTGCCGGGAAAGTCAAAGCGCGCCGAAAGGTTCGCTCAGATGAGTCCCGAGGAAGCAGCGGCCAAACGTGCCGCGGAAAACCGAAGGAGGAGAAATTCCCGAAAGGGAAAGAGAGTTCCACCTCTTGCAGTGAAAGGACCTCTGCCCATGAAAATGGAGGAGGTATCCAAACTGGTGGACAAGAAGTTGGCCGAGCTTGTGAAGGTTCGACCAAGGAGGAGTGTGCCCAAGGCACAACCAGCCTCGAAGTTCTCTTCGACGGCTTCTACCACTGGCTCCCAGAGCTATGTGGTTCCTCCGAGAAGGCGTGGGAACAAGTGGCGCAATACGAGCGCCCCCATCAACCCGACGAACGCTCAAACGGGGGGACGCCCCTATATAATGACGAGCGAAGGGTTAACCTTCTTGGATTCTGTAAAGTCGGCTCCTGTGACTTTACAAAATGGAAAAGCCCCACCAAAGAGCTTTCAGAATGGGGATTCCATCGAGCTCAGGCCTCAACGCTCTTACAAGCCTGTCAGGAAAGCTACGGCTGGCCAGACACAGGTGCAGAGGCCGAATTGAGCTCTTTGCGGTACCAAGCAGCCAAACGGGCGGCTGCTCAAACAAAAGCCCTAACTCCAAGCAAAGCCGCGCGTTGGAGTGTAATACAGCGCACCTGTGTTGCATATGGCGTTACACGACGCCATGCTCCTCGTTGGACACGCACAATGAATCGGGCTGATGCTCGATTCTATTTCTGTGAAGCTGTCCGAAGTCTGAAACCAGACTCTGGAAGTGGTCTTCCTTTCGCTGCGTTCTATAATAGAACAACCCACAGCGACTGGTGCTACGATGATGCCTCTTTTGAGGCGTTGTTTGACCTAGTCTGGGCCCGTTTGGGTAGACTTCGTTCGAGGTCATTCCGCAACCCAGTTCAGGCCGTGCAAGACGGCCTTTGTGACCCTATCCGCCTGTTTGTGAAGCTCGAACCTCACAAACGTGCTAAGATTGAGCAGAAGCGATTTCGTTTGATTGCTTCAGTATCCTTGGCGGATCAGTTGGTCGCCCGGATGCTCTTCCAGGAACAAAACCAGGCAGAGCTTGACATGTACATGTACATTCCTTCCAAGCCGGGGCTTGGATTCTCAAAGGATAGTCAAGTTCTGGAGTTTACGAAGAGCATAGCCTATCTTGCCCACACCACCCCCGAAGTCCTAGTGAATAACTGGTCGGAACACTTAATCCCAACTGACTGCTCGGGATTCGACTGGAGTGTTCCAATGTGGTTGATGGAGGATGATCTTGCAGTCCGCAACGAGTTGACCATCAACTGTTCCGATGACCTCATTAAGATGAGGTCTGAGTGGCTTCGATGCCTAGGGCAGAGCGTACTTGTTCTGTCAAATGGAATGATGGTTGCCCAGCTCGAACCGGGAATTCAGAAAAGTGGGAGTTTTAATACTTCCTCAACGAATTCTCGGATGAGGTATATGGCGTCACTCTACGCCGGAGCTTCGTGGGCCGTCACAATGGGTGACGACGCGTTGGAGTCAGTTGATTCTGACTTGTCCCAGTATGCCTTACTGGGTTTAATATGTGAGCGTGCTGAAGAGTTCGACTTTTGTTCTCACATCTTTAAGGCGCCCTCTGTAGTCGTGCCGAAGAATATTCACAAGATGATCTTCGGTCTCCTTTCTGGAGTGTCTCCGACAAGTCCTGTTCAAGAGGCAAGGATACAATGGCTGCAGGCCTTCCAGTCAATCTCTGAGGAGATGAGGCATATGCCAGCGGAATTTTGGGAAGAGTTCCGCACCGCTATTGGCATATTAGGGGACGGGTGGTAGAAGGTTACCACCCTTGGAAGAGGGATGCCCCCCGAAAGGGGACCATGAATTGACATGGTCTTGGAACGCCGTAATGCTGGACCTGGCTAGAGATAAAATCTATAAATAATTACGGCGTAACTATGGTGAGTCGCAATCAAAGACGAAGAAATCGTCCACGCAGAATGCGAAGAAGACAGGCACCGAATAGGGTCGTGGTGATGGGCAACAACCCCACACGTTCCCGAAGACGCAACGCCCCCGCTCGTCGGCGGCGTGCGGTTAATAGATCAACCGGAGAGATGCGTCCTTACCATTTGTATGGGCTTAAATGCAACGACAAGGGTTATCTCACTTTTGGTCCTTCTGGACAAACCCCATCTTTGGGTGGTGGTATCCTAAAGGCCTTCTCTGAGTATAAAATAACCCAGTTGAGAGTACAATGGAAGGCGCAGGCTTCTTCGACTGCCGCAGGTTCCATGGCCATTCAAATTGGCCTTGGTACAAGCCTGACCGCTCTGGACAACCGGGCTATCTCATTTAAGTTGACCAGTTCGGGGCAGCGAGTGTTCACCGCCCGAGATCTCGGCGGTGACGGTAGAATGTATAACTCCTCTAACGAGGACCAGTTCCGCCTTGCCTACCAGGGGAATGGAGATTCTACCCTCGGAGGGGATCTTTTATGTTTCTTTCGCCTGGAAACGCGACTGCCCAAATAGGTAGACGCGGACCCCCCCAGTCCACCATCTCCGGAACCTTCTCCGGAGCCCCCACCCCAACCACCAGCTCCGACACCGGCGAGATGCCGCTTCTGGGGATATGAAGGTATCCCTAGTGTAAGAG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58,534
MN187044.1
Citrus vein enation virus
Tan,S.-H., Osman,F., Dang,T., Bodahgi,S., Greer,G., Huang,A., Hammado,S., Chen,X., Vidalakis,G., Bodaghi,S.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2019-10-27
VE823
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,982
GenBank
null
USA
USA
Citrus
null
1983
null
null
Citrus vein enation virus isolate VE823, complete genome
ATATAAGCTATAAAAGAAAAGTGCGTTTACGCTTCCTTCTTTGAGCTTATATAGTCGTATGTTTTGTGCCTTGCTCTTGTTGACTGTCCAGTTTGTTCTGTTGACTATCGCATACGCTTTCGGCACTCTTTTGTGGTCTTATATTTTCGGACTCTCGGTTTCTCCTATACTCCTTGAGATCGAAAGACTACTTTTGCTGTGGTAGAATGATCAAGGAATGCCTTGCTACCATGTCATCCCCTACGACTACTTTCAGCCTATCCACTCTTCTAACTGGTTGGGAGCTAGTTTACTTGCTCTCATTAATTATGTTGGGATGGGCTGTCCTACACAGGAGGGAACGCCATGCGAGGAACCAACTTGCGTGGCGCTTCCCTACGTCCTATTATGTGCTCTTGCTCTGCTATGGGGTCACCCTCGCAGCTGCGGGAGGCGTGGCGGGGTCTCGCTTGAGGCCCTCACTTTGCCACGCGGGTTCAACATCGTTGGGCCTCCCGATTTCTTGTGGTACTTTAGAATTTGTGCCGCTCGAATCGGGCTTATCATCCCCCAATCTTACTGGCGGGATGACGGACGTAGGGCGATCCCCCTCACTCACTGTGCGCTATTCACCTCTCTTCCATGTTGGCTCATGGCTGCAAGTGGCAAGGCAGAATACCACTGTCAGGGTTACGTTGCGCCTGAGCTTCAGTTACCTGGTAACGGCCCAGAACATACTGTCTGGGTGGAAGAGAAGTGGGCTTGCTGGCATGAGCTTATTGTTGGGTTGCTTGGAACCCATACGAATGTTGCCAGCATACTCCGTGTACTGCCTGACGGAGGCGTTACTCCTCACAGCCAAGTGCTTGGAAAACGCAATCTTATCGTGGATGCTTTTACTAGCATCAGCACTATGGCAGTTGGCACGGATCAACCCCCTCCGAACCGCTATATGGATGATTGTTCTCTCACTAGGCTCTTTTGCCTACGAGAACCGTATCTGTCGGGCTATGATACAGATAATTTTAGCCCCGGTTTACATATTGCCCTCCCTTGGCCTGAAATTCCTGAGGGTGGCGAGTATCTTGCCCACTCTTTTGCTGAACTGGACCAAGAATTTGCTGATCTTTTGGCTCACCTTCACGTCCATGATGACGAGGAGGATCTTGGTTGGTTCTCTGATGATGGTGAGGGTGATATTGAGAATCCCCCTGCTCCCCATAATACTGATGAAGAAGATTTTGGGGATTCTGATGATGATGACTCCATCGGTGGAAACGCCGGTAGTGGACCCGAGGCTTAGATTTGTTAATCGTGAGCGGTCCGTGTCATTGGAGGGGCAAGCCAGGCAAGTGTGTCTCCCCGCTGTACCCCCGAAAGGGGTTATAGGAAAGGTTCTGAATGCTAACAACATTCAGATCGGGTACTTTTCCTGTGTAAAACTCATGGGAGGTACGGATGGGATAATGGTTCCCATCCACGTTTTTGAAGACGCCCACATGTTTATGGGCAACAACCTTGCCCTATCTAGAGATGCATTCACGGTTATGTACCGTGATGTGGAAGGGGATGTCCTAATTTTGAAAGGACCCCCAAATTATAGGGTTGTATTAGGAGTGAAACCCCGACTCCTACTTACTGCAAACTTCGCCCGGCTGGGATTCCACTCCCTCTATTTCGAAAGAGATGGACAGTGGAAAGTCCAATCAGCCAATGTAAAAGGGGCGGAGGATGGTTTCTTGGCCGTTGTTTCCCAAACACTTCCTGGGGACTCCGGACTTCCCCTCTTCGACACAAAACACCGTATTTGTGCCATGCATATTGGCCATTATGGTGAGAAGAGACCGGAGAATATGGCCACGGTTGTTCTTCCTATCAGGGGGTTTTCTGTCCCTGATACTGAGGTTTTCAAGCCCCAAGTCAAGACTACTGAGTCCTTGTATGAGGATGATAAGATTTTCGACTTAATCGAGGATCTTGAGAAGGAAATTGACGAGGGAGTGGTCCGAGACTTAGAGTTCGAGGGCCAACATTATAAGACCGTCATCGGTAAGACTTCCATAGCCCTGCTCAAGGAGGCTGAGTTCCTCGATCATATGAAGCAGGTCGGCAGGGATGCCGTAAAAGGGAAGCAGCCATGGAGTGATTGGCTAGATGACGAGGAGGATGAGCGGGAATGCTTGCGCCCCATCGTTGATACTAAATCCAAGTATCAGCAGCCTTTAAACTGCGAGCCCCAGTACGCTCTGGGAAAACAAAAGCGGCAGGACGGTGCCTCCACCTCGGAAACGAGGATTGTTGTTGGTGCCGTTGCCTGCCCGGTACCCCAACCCAAAGAATCCAAAATCCCCTCCACCAAGGCGGTTCCAAAGCTGCCGGGAAAGTCAAAGCGCGCCGAAAGGTTCGCTCAGATGAGTCCCGAGGAAGCAGCGGCCAAACGTGCCGCGGAAAACCGAAGGAGGAGAAATTCCCGAAAGGGAAAGAAAGTTCCACCTCTTGCAGTGAAAGGACCTCTGCCCATGGAAATGGAAGAGGTATCCAAACTGGTGGACAAGAAGTTGGCCGAGCTTGTGAAGGTTCGGCCAAGGAGGAGTGTGCCCAAGGCACAACTAGCCTCGAAGTCCTCTTCGACGGCTTTTACCACTGGCTCCCAGAGCTATGTGGTTCCTCAGAGAAGGCGTGGGAACAAATGGCGCAATACGAGCGCCCCCATCAACCCGACGAACGCTCAAACGGGGGGACGCCCCTATATATTGACGAGCGAAGGGTTAACCTTCTTGGATTCTGTAAAGTCGGCTCCTGTGACTTTACAAAATGGAAAAGCCCCACCAAAGAACTCTCAGAATGGGGATTCCATCGAGCTCAGGCCTCAACGCTCTTACAAGCCTGTCAGGAAAGCTACGGCTGGCCAGACACAGGTGCAGAGGCCGAATTGAGCTCTTTGCGGTACCAAGCAGCCAAACGGGCGGCTGCTCAAACAAAAGCCCTAACTCCAAGCAAAGCCGCGCGTTGGAGTGTAATACAGCGCACCTGTGTTGCATATGGCGTTACACGACGCCATGCTCCTCGTTGGACACGCACAATGAATCGGGCTGATGCTCGATTCTATTTCTGTGAAGCTGTCCGAAGTCTGAAACCAGACTCTGGAAGTGGTCTTCCTTTCGCTGCGTTCTATAATAGAACAACCCACAGCGACTGGTGCTACGATGATGCCTCTTTTGAGGCGTTGTTTGACCTATTCTGGGCCCGTTTGGGTAGACTTCGTTCGAGGTCATTCCGCAACCCAGTTCAGGCCGTGCAAGACGGCCTTTGTGACCCTATCCGCTTGTTTGTGAAGCTCGAACCTCACAAACGTGCCAAGATTGAGCAGAAGCGATTTCGTTTAATTGCTTCAGTATCTTTGGCGGATCAGTTGGTCGCCCGGATGCTCTTCCAGGAACAAAACCAGGCAGAGCTTGACATGTACATGTACATTCCTTCCAAGCCGGGGCTTGGATTCTCAAAGGATAGTCAAGTTCTGGAGTTTACGAAGAGCATAGCCTATCTTGCCCACACCACCCCCGAGGACCTAGTGAATAACTGGTCGGAACACTTAATCCCAACTGACTGCTCGGGATTTGACTGGAGTGTTCCAATGTGGTTGTTGGAGGATGATCTTGCAGTCCGCAACGAGTTGACCATCGACTGTTCCGATGACCTCATTAAGATGAGGTCTGAGTGGCTTCGATGCCTAGGGCAGAGCGTACTTGTTCTGTCAAATGGAATGATGGTTGCCCAGCTCGAACCGGGAATCCAGAAAAGTGGGAGTTTTAATACTTCCTCAACGAATTCCCGGATGAGGTATATGGCGTCACTCTACGCCGGAGCTTCGTGGGCCGTCACAATGGGTGACGACGCGTTGGAGTCAGTTGATTCTGACTTGTCCCAGTATGCCTTACTGGGTTTGATATGTGAGCGCGCTGAAGAGTTCGACTTTTGTTCTCACATCTTTAAGGCGCCCTCTGTAGTCGTGCCGAAGAATGTTCACAAGATGATCTTCGGTCTCCTTTCTGGAGTGTCTCCGATAAGTCCTGTTCAAGAGGCAAGGATACAATGGCTGCAGGCCTTTCAGTCAATCTCTGAGGAGATGAGGCATATGCCAGCGGAATTTTGGGAAGAGTTCCGCACCGCTATTGGCATATTAGGGGACGGGTGGTAGAAGGTTACCACCCTTGGAAGAGGGATGCCCCCCGAAAGGGGACCATGAATTGACATGGTCTTGGAACGCCGTAATGCTGGACCTGGCTAGAGATAAAATCTATAAATAATTACGGCGTTTTCATGGTGAGTCGCAATCAAAGACGAAGAAATCGTCCACGCAGAATGCGAAGAAGACAGGCACCGAATAGGGTCGTGGTGATGGGCAACAACCCCACACGTTCCCGAAGACGCAACGCCCCCGCTCGTCGGCGGCGTGCGGTTAATAGATCAACCGGAGAGATGCGTCCTTACCATTTGTATGGGCTTAAATGCAACGACAAGGGTTATCTCACTTTTGGTCCTTCTGGACAAACCCCATCCTTGGGTGGTGGAATCCTAAAGGCCTTCTCTGAGTATAAAATAACCCAGTTGAGAGTACAATGGAAGGCGCAGGCTTCTTCGACTGCCGCAGGTTCCATGGCCATCCAAATTGGCCTTGGTACAAGCCTGACCGCTCTGGACAACCGGGCTATCTCATTTAAGTTGACCAGTTCGGGGCAGCGAGTGTTCACCGCCCGAGATCTCGGCGGTGACGGTAGAATGTATAACTCCTCTAACGAGGACCAGTTCCGCCTTGCCTACCAGGGGAATGGAGATTCTACCCTCGGAGGGGATCTATTATGTTTCTTTCGCCTGGAAACGCGACTTCCCAAATAGGTAGACGCGGACCCCCCCAGTCCACCATCTCCGGAACCTTCTCCGGAGCCCCCACCCCAACCACCAGCTCCGACACCGGCGAGATGCCGCTTCTGGGGATATGAAGGTATCCCTAGTATAAGAGT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58,535
LC433634.1
Citrus vein enation virus
Yang,H.J., Lee,H.K., Kim,S.Y., Lee,D.S., Kwon,B., Oh,J., Lee,S.H.
College of Agriculture and Life Sciences, Kyungpook National University, Plant virus laboratory; 80 Daehakro, Bukgu, Daegu 41544
Korea
2018-11-13
PCJ
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,982
GenBank
null
South Korea:Jeju
South Korea
Citrus trifoliata
null
2018-07-29
null
null
Citrus vein enation virus PCJ genomic RNA, complete genome
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67,204
LC433635.1
Citrus vein enation virus
Yang,H.J., Lee,H.K., Kim,S.Y., Lee,D.S., Kwon,B., Oh,J., Lee,S.H.
College of Agriculture and Life Sciences, Kyungpook National University, Plant virus laboratory; 80 Daehakro, Bukgu, Daegu 41544
Korea
2018-11-13
PTC
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,979
GenBank
null
South Korea:Gyeongsangnam-do, Changwon
South Korea
Citrus trifoliata
null
2018-08-12
null
null
Citrus vein enation virus PTC genomic RNA, complete genome
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67,205
LC360112.1
Citrus vein enation virus
Yang,H.J., Lee,H.K., Kim,S.Y., Lee,D.S., Oh,J.H., Lee,S.H.
College of Agriculture and Life Sciences, Kyungpook National University, Department of Applied Biosciences, Plant virus laboratory; 80 Daehakro, Bukgu, Daegu 41566
Korea
2017-12-28
JJ
Citrus vein enation virus
Enamovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
5,982
GenBank
null
South Korea:Jeju island, Jeju
South Korea
Citrus unshiu
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2016-10-26
null
null
Citrus vein enation virus JJ genomic RNA, complete genome
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72,855
NC_078103.1
Citrus virus A
Navarro,B., Zicca,S., Minutolo,M., Saponari,M., Alioto,D., Di Serio,F.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2023-05-06
W4
Coguvirus eburi
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,691
RefSeq
1
Italy
Italy
Citrus sinensis
null
null
null
PRJNA485481
Citrus virus A isolate W4 segment RNA1, complete sequence
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77
OM272943.1
Citrus virus A
Donovan,N.J., Chambers,G.A., Englezou,A.
Elizabeth Macarthur Agricultural Institute, NSW Department of Primary Industries
Australia
2022-06-20
CL223
Coguvirus eburi
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,673
GenBank
null
Australia
Australia
Citrus sinensis
plant stem
null
null
null
Citrus virus A isolate CL223 segment RNA1, complete sequence
CAAACTTTTATAAGTTTTTTATCAAGAATCAAATAACTTAATTATGTTAAGGCCTTTGTGCGAGTAGTCATTTAAATCTCAACTCTATGAATTCCTTCAGTCTTGTAACCACAACAAGTTATTGCTAGGCTATATCTAGAACTAAGCATATCCAATGTAAGTGTTGTTAGATAAGGCTTACCAATCGCTTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAATGTTAATCTGTCTTCTCTGGTTAAATTATCAACATGTTGATCCAGTTCAGCTCTTAATATATGAAGGAAAACCCCTTTATTCAAAAGTTTATAACTCTCTGGGATATAATTGTTTTCTAATAATAAAGGTTTTAATTTTTCTGCTACATCTATTACTTTTATTGAGTCCATGTCACTGTTCTTTGTAGCACTTAATTTTGAAATAGTTCTTGCATTCTCATACCTAATTTTGATATTGTTCAACATGTTGAAGAGATCAGCTGGGGCACCATCCATTTGTTTTTCTAAATAATCAATTCTCGAGTCTAAGTCAACCGGATCTAATTTTGCAATCTCTGTTGCATCAGAAGCCATGGATGAAATTTTGGCACTATCCTTATCTAACTCACTAATAGCTCCATAAATCTCATCCGGAGCAGGCATGCAAACTCTACCACAGAAGAATGACAATAGCATACCCATGAACCCTGGTGCTGTTAGATTATTATTTAGCTTAAATCTTTTAATTGTTTGTAATATCCCTTCATCCCCCATAAGTACTCTGCTGAGAGTATCTATATTGGATAGAGCTAAATTGGATTTTGGCATGCTAGTTTTATCATTCAGTGTAAACTCTTCAATCAAAGGGTTAACAGTAAATAATGCTAGCTGATTTTCAATTTGTTCAAACATATCAATGTTAGTGCTAAACAAATCCTCTTCAAGGTTTAGATCCTCAATGTCATCAAATCTATCATCTAGTGTCCAATCCAGTGTGTCTGTCATGTCCATATTCATCTCATCTAGCAAGGCCTCAACATCTAAATCTACATCATAATCTTCAACAATTGGCTCTTCGTGCTCTAAAATATCTTCAGTAGATAAGAGTTGTTTCTTTACAGTATCTAAAAAGTCTCCTAATACCCACCCAGACTTTGTCAATGCTTCTCTTCTATTTCTAAAAGCTTTTAAGATTTGTCCAGGTAGAGGTTTGCAGATGGAGTTTATTTCTTCTTCTATTGTTTCAATAGGTATAGGTGTTCCTGAAGACCAATGTTTTAATAAGATATCATCAGCAATAATGAAATCAGGATCCCAATCTTTGCTAGTGAAACCCTCACTCAAAATTGTCATGCGCTGATTTTCGCCATACTCAGCTTGCAATCTGATTCTATTATTTGAGACAGACCAGCTCCAGGTGTAATCTGATATTTGGTCTATGATGTCTATCTTTAGCGATGTGTCAATATCAATTGGGTAGTAAGCAGCCTTACCATATCCTCCAGTTATCCTGCCACTTCCGGTAAGCCAGTGATCATACTTGTCATTTTCAATATTAGGGGTGTTTAAGGAAAAACTGTTCATTAATTCTAAGAGTAGTGGACCAAGAGTCTTAAGGTCTATTAACTTGCTTACAGTGATTTTAGAACAATAATTATCCCTCATGCTAACAACAACAGACACATCTAAACATTTCCCTCTCCATTCTCCTCTTCCAGATCTTGTTTTACCCCATCCCTTTTGTCTACTAGTAAAAAAACCAACTGTTCCTAATTTCTCTTCTGAAATGTATCTAACTATTGATGCTTTGTCTTGATCAGCAAACCATTTTCTCAGAGCCCTAAGTTTTTTTATTCTATGAGGAACTAGTATCTTATTCAATGCAGGACTCTCAGTAATTATCTCTTGTATTTTTTTCTTTTTAATTGTTTCAGAGTACCAACTAGACACAACAGTGAATATCTTTGATCTTATGGAGTAAGAAGTCTCCTCTTCATCTGACCTACCTGGCAATACTAGTTTAACCCCATTCCAGAAAATTCTTGATATAGAGTTGAACAAAGATGCAGATTTTGCACTGGTATCTAAAAGTACAATGTGCCTTGGTTTAGATGTTATAGACTCTAAAAATCCCTTTAGCTCAACCTCATTGTAGTTTAACATCTCTTTAGTTTCATTTCTATTATCTTTTAGAAAAGGATATTTTAATTTTGCTTCATTCCAAAAACTGTCAAATTGTCTTCTAGAAAGAGGTAACCTTCCAATTCCAAACCATTTTTTCCTGCATAAGTCCACTATTGGTACATCATCTAATGACCGCTCGAAAACAGAAATCTTTTGCTTGTTTCTTGTTCTTAATCTGGAAGGAACCATTGTAGACTTTGTTTCTAGATCCTCAATATATTCCATAACTTCCTTATACTCTTCTGCATGGGTGAATGCCAAGTTAGGTTCTAGTTTGGCTTTACCTTCTTTATCAATCTTGTTATATGCCAAAGCTCTTAACAAACTCACTTTACACACATCACCATTTATATAAATTGTGACACAAGGCCTAGAGATCATATATGCTGATGCTGACATTAACCGAGCTGTTGCTGCATGTCGACTTATTGATTCTTTGACACCAGGTTGGAACATTTTTAAGAAAACTGCAAACTTAGCTTCTGACCAAGCTTTGTGCCTAGCATAGATTAGATATGGATTCTCTTCCACTTCTAAAATCAATTCCTCTAGATCTGGCATGCCCATTCTCCTTACTTGCTCTTGCCATAATTTCATGTTTGAGAATGTTACTCTAGCAGATCTTAATGCTTTACTCACTGATTGATCAGGAAGTTCTTCTTCCTCATACTTGGTATTTGACTCATGAATGTTCGCATAAGACAAGCCACAACCGTAGTTCGTTCGCACAAACAGTCTGTAAATTTGGAACTCAACACCAGTGATGCCAGCACAAAAGTCAGAATCTAATGGATAAAATCCTAGAGAAGGATCCAACTGATCAATCATGAATGAACAGGCTTTTGTTGCAAGTTTTGACGTGTGTAATCCTAATAACAAGTAGTGCATCCATGCTTGACATAATTGAACTAATGCCACTTCTAGCACTTTACCCCCCCCTTCCAACACTTGGGATGCAACATTGTAGTTGATTCTTATTCTGTCAATAAACCTCTCTGTGACAGTTGTCTCCAAGCAAGCTGACACCCACCTGAAGGTTGGCTTCACCACATTGTTCCTCACCATCCATTCAGAGTTGTATTCTATTAGGTCCAGGCAGCCTATTGAAGATTTAGCTCTGCTAGTGTAAATTGAAAAGTACTTGGATACATTTTCCTTCCAATGTAACAAAGTAGTAGCCAATCTGGTCTTATTATGGGTTGGCAGCCCTGTTAAGCTGATCAACTGAGCTGAGTCATCACTTCCTTGAACTACTGTGATGCTGCAGTGTATTCCTCTTCTCTTTAAGTAGTCTATCTGCAATTTCTTCATGACTTCCTGGATGAGAGTGTGTGTGAAAGAGCTCGTATAATGTAAAATTCCTTGCATCATGCCTGAACGTATAAACATTTTGTTACTTTGAGCTTGCTGGAAGATACCCTCTCCTGAAAAAAACTCCTCTTTCATTCTCATGTAAATCTTATTGGATTTAACGTTCTTGTTAGCTTGAAAATTTGCTGCAAACTGAACAGGGAAGCTTATCCTTTTAACCTTCCATAGACTCATTACATGAATAAAGAAAGATCTAAATTCAATTGGGAGGAAAGGAGAAATTACCGCAGCAAATTTTGAGCTATCATTCCTTTGACACCATTTTGTAGCATCAGCAGACTTCCCCATTGTGAAAAATTGTTTTCCTAGTTTGTTGGCAGAGTCTTGATAATGTTTTCTAACAAAGGATTCTTTTTCATATGGGTGTGTTAGTGTGTCTGAGGGGACCAATCTGCATAGAGATTTACTCATGCTCTCACAAAAGAATTGCAGGACTCTCATTTTAATTTCTAAGACATGTATTTCCCTATCTCCTCCATGCTGTGACTTAGGGAATATGTCACTGTCCCAAAATCCCCTCTTGTCTATCTCTTTTAAGCAGTAAGGAATTAATTCAACAGGGTGTCTTATCTTTTTACACTCAACTTTCTCATACTCTTCTACAAGAAGGCTTATTGATTCCATAACTCTAGGTCTCTTTGTTTTCTCTTTTGGATTTGATTTTTCATATAAGTCTCTTATGACCTTATTGGCCATATCTTCTTTGATATTTGGTATTATTAGAGAGTCATCATAGGATCTGGATGACACTTTCAGAGTGGCTAGGTCTTCAAAAGAACACTGTGCCATGGATTTTATTATTTCTTTTTTAATTATTAAAGCATAATCCTTCCCTAGGATTTCAATTAATATAGATTTAAATATGTGCACAAAGACTTTTATCACAACAGGATTACTCACATGTATTTTGGGTTCCAAGCTTCTGCTGAAGGTGGAAGTGACTGTGTCTCTGAACCTATACTCCTCAGCAACGATCTTCTTCATTATTTTGAAGTTTCTATCACTACCTCTACCTCTCTCTTTACTAACTACATAACCAAAATAGAACTCATTTACTTTCTGCTTTAAAGAAGGCTCATAATCCCCAAAAAGACTTTTTAAACCTGAGTACACTATATCGTATTCTAGTGTTTCTTTATTTGGTATTTTAAGGACTTTTGTCTCTGCATAATATTGCATGTGAGAAATAGTTTTTTTGAGGAAATAACTAGTTAGTCTAGATCTTAAAACTTCTGGAAGTCTTTCACAGAACCTATAGGGATTTGGATCTAATTCTTCTAGTATTCCCATTGTTAAATATCTCTGATTTGTAATCAGTTCTTCGCAATCTGTTTTATTGTTTAAGAAGAGCAAGAGAATTGAAGCTAAATGTTGATTAAGAACCTTACTAGATAAGTTTATGTTAGACAAATCAAATTCTAGATGAGATATTAGATGAGAAATGATTGAGCAGATATATGGACCGCTTTT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30,082
MT720883.1
Citrus virus A
Bester,R., Karaan,M., Cook,G., Maree,H.J.
Stellenbosch University, Genetics
South Africa
2021-05-15
1.5
Coguvirus eburi
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,670
GenBank
null
South Africa
South Africa
Citrus sinensis
null
2018
null
null
Citrus virus A isolate 1.5 segment RNA1, complete sequence
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41,956
MT720885.1
Citrus virus A
Bester,R., Karaan,M., Cook,G., Maree,H.J.
Stellenbosch University, Genetics
South Africa
2021-05-15
1.8
Coguvirus eburi
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,690
GenBank
null
South Africa
South Africa
Citrus sinensis
null
2018
null
null
Citrus virus A isolate 1.8 segment RNA1, complete sequence
ACACAAAGACTCCCAAACTTTTATAAGTTTTTTTATCAAGAATCGAATAACTAAATTGTGTTAAGGCCTTTGTGCGAGCAGTAATTTAAATCTCAACTCTATGGATTCCTTCAGTCTTGTAACCACAACAAGTTATTGCTAGGCCATATCTAGAACTAAGCATATCCAATGTAAGTGTTGTTAGATAGGGCTTACCAATTGCTTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAATGTTAATCTGTCTTCTCTGGTTAAATTATCAACATGTTGATCCAGCTCAGCTCTTAATATTTGAAGAAAAACCCCTTTATTCAAGAGTTTATAACTCTCTGGGATATAATTGTTTTCTAACAATAAAGGTTTTAGTTTTTCTGCCACATCTATTACTTTTATTGAGTCCATGTCACTGTTCTTTGTAGCACTTAATTTTGAAATGGTTCTTGCATTCTCATACCTAATTTTAATATTGTTTAACATGTTGAAGAGATCAGCTGGGGCACAATCCATTTGTTTTTCTAAATAATCAATTCTCGTGTCTAATTCAACCGGATCTAATTTTGCAATCTCTGTTGCATCAGAAGCCATGGATGAAATTTTGGCACTATCCTTATCTAACTCACTAATAGCTCCATAAACCTCATCTGGAGCAGGCAAGCAAACTCTACCACAGAAGAATGACAATAGCATACCCATGAACCCTGGTGCTGTTAGATTATTATTTAGCTTAAATCTTTTAATTGTTTGTAGTATCCCGTCATCCCCCATAAGTACTCTGCTGAGAGTGTCTATGTTGGATAGAGCTAAATTGGATTTTGGCATGCTAGTTTTATCATTCAGTGTGTACTCTTCAATCAAAGGGTTAACAGTAAATAATGCTAGCTGATTTTCAATTTGTTCAAACATATCAATGTTAGTGCTAAACAAATCCTCTTCAAGGTTTAGATCCTCAATGTCATCAAATCTATCATCTAGTGTCCAATCCAGTGTGTCTGTCATATCCATATTCATTTCATCTAACAAAGCCTCAACATCTAAATCAACATCATAATCTTCAAAAATTGGCTCTTCGTGCTCTAAAATATCTTCAGTAGATAAGAGTTGTTTCTTTACAATATCTAAAAAGTCTCCTAACACCCACCCAGACTTTGTCAATGCCTCTCTTCTATTTCTAAAAGCTTTTAAGATTTGTCCAGGTAGGGGTTTGCAGATGGAGACTATTTCCTCTTCTATTGTTTCAATAGGTATAGGTGTTCCTGAAGACCAATGTTTTAATAAGATATCATCATCAATAATGAAATCAGGATCCCAGTCTTTGCTAGTGAAGCCCTCACTCAAAATTGTTATGCGCTGATTTTCACCATACTCAGCTTGCAATCTGATTCTATTATTTGAGACAGACCAGCTCCAGGTGTAATCTGATATTTGGTCTATGATGTCTATCTTTAGCGATGTGTCAATATCAATTGGGTAGTAAGCAGCCTTACCATACCCTCCAGTTATCCTGCCACTTCCGGTTAGCCAGTGGTCATACTTGTCATTCTCAATATTAGGGGTGTTTAAAGAAAAACTGTTCATTAATTCTAAGAGAAGTGGACCAAGAGTCCTAAGGTCTATTAACTTGCTTACAGTGATTTTAGAACAATAATTATCCCTCATACTAACGACAACAGATACATCTAAACATTTCCCTCTCCATTCTCCTCTTCCAGATCTTGTTTTGCCCCATCCCTTTTGCCTACTAGTAAAAAAACCAACTGTTCCCAATTTCTCTTCTGAAATGTATCTAACTATTGATGCTTTGTCTTGATCTGCAAACCATTTTCTCAGAACTCTAAGTTTTTTTATTCTATGAGGAACTAGTATCTTATTCAATGCAGGACTCTCAGTAATTATTTCCTGTATTTTTTTCTTTTTAATTGTTTCAGAGTACCAACTAGACACAACAGTGAATATCTTTGATCTTATAGAGTAAGAAGTCTCCTCTTCATCTGATCTACCTGGCAATACTAGTTTAACCCCATTCCAGAAAATTCTTGATATGGAGTTGAACAAAGATGCAGATTTTGCATTGGTATCTAAAAGTACAATGTGCCGTGGTTTAGATGTTATAGACTCTAAAAATCCCTTTAGCTCAACCTCATTGTAGTTTAATACCTCTTTAGTTTCATTTCTATTATCTTTTAGAAAAGGATATTTTAATTTTGCTTCATTCCAAAAGCTGTCAAATTGTCTTCTAGAAAGAGGCAACCTTCCAATTCCAAACCATTTTTTTCTGCATAAATCCACTATTGGTACATCATCTAATGACCGCTCGAAAACAGAAATCTTTTGCTTGTTTCTTGTTCTTAATCTAGAAGGAACCATTGTAGACTTTGTTTCTAGATTCTCAATATACTCCATAACTTCCTTATACTCTTCCGCATGGGTGAATGCCAAGTTAGGTTCTAGTTTGGTCTTACCTTCTTTGTCAATCTTGTTATATGCCAGAGCTCTTAACAAGCTCACTTTACACATATCACCATTTATATAGATTGTGACACAAGGCCTAGAGATCATATATGCTGATGCCGACATTAACCGAGCTGTTGCTGCATGTCGACTTATTGATTCTTTGACTCCAGGTTGGAACATTTTTAAGAAAACTGCAAACTTAGCTTCTGACCAAGCTTTGTGCCTAGCATAGATTAGATATGGATTCTCTTCCACTTCTAAAATCAATTCTTCTAGGTCTGGTATGCCCATTCTCCTTATTTGCTCTTGCCATAATTTCATGTTTGAGAATGTTACTTTAGCAGATCTTAAAGCTTTACTCACTGATTGATCAGGAATTTCTTCTTCTTCATACTTGGTATTTGACTCATGAATGTTTGCATAAGACAAGCCACAGCCATAGTTTGTTCGCACAAACAGTCTGTAAATTTGAAACTCAACACCAGTGATGCCAGCACAAAAGTCAGAATCTAATGGATAAAATCCTAGAGAAGGATCCAACTGATCAATCATGAATGAGCAGGCTTTTGTTGCAAGTTTTGACGTGTGTAATCCTAATAACAAGTAGTGCATCCATGCCTGACATAATTGTATTAATGCCACTTCTAGCACTTTACCCCCCCCTTCCAACACTTGGGATGCAACATTATAGTTGATTCTTATTCTGTCAATAAACCTCTCTGTAACAGTTGTCTCCAAGCAAGCTGACACCCACCTGAAGGTTGGTTTTACCACATTGTTCCTCACCATCCATTCAGAGTTGTATTCTACTAGGTCCAGGCAGCCTATTGAAGATTTAGCTCTACTAGTGTAAATTGAAAAGTACTTGGATACATTTTCCTTCCAATGTAATAAAGTAGTGGCCAATCTGGTCTTATTATGGGATGGCAGCCCTGTTAAGCTGATCAACTGAGCTGAGTCATCACTTCCTTGAACTACTGTGATGTTACAGTGTATTCCTCTTCTCTTTAAGTAGTCTATCTGCAATTTCTTCATGACTTCCTGAATGAGAGTGTGTGTGAAAGAGCTCGTATAATGTAATATTCCTTGCATCATGCCTGAGCGTATAAACATTTTGTTACTTTGAGCTTGCTGGAAGATACCCTCCCCTGAAAAGAACTCTTCTTTCATTCTCATGTAAATCTTATTGGATTTGACATTCCTGTTAGCTTGAAAATTTGCTGCAAACTGAACAGGAAAGCTTATCCTTTTGACCTTCCATAGACTCATTACATGAATGAAGAAAAACCGAAATTCAATTGGGAGGAAAGGAGAAATTACCGCAGCAAATTTTGAGCTATCGTTCCTTTGACACCATTTTGTAGCATCAGCAGACTTCCCCATTGTAAAAAATTGTTTCCCTAGTTTGTTGGCTGAGTCTTGATAATGTTTCCTAACAAAAGATTCTTTTTCATATGGGTGTGTTAGTGTGTCTGAGGGGACCAATCTGCATAGAGATTTACTCATGCTCTCACAAAAGAATTGCAGGACTCTCATTTTAATTTCTAAGACATGTATTTCCCTATCTCCTCCATGCTGTGACTTAGGGAAAATGTCACTGTCCCAAAATCCCCTCTTGTCTATCTCTTTTAAGCAGTAGGGAATTAATTCAACTGGGTGTCTTATCTTTTTACACTCAACCTTCTCATATTCTTCCACAAGAAGGCTTATTGATTCCATAACTCTAGGTCTCTTTGTTTTCTCTTTTGGATTTGATTTTTCATATAAGTCTCTCATGACCTTATTGGCCATATCTTCTTCGATATTTGGTATTATTAGAGAGTCATCATAGGATCTGGATGATACTTTCAGAGTAGCTAGGTCTTCAAAAGAACACTGTGCCATGGATTTTATTATTTCTTTTTTGATTATTAAAGCATAATCCTTTCCTAGGATTTCAATTAATATAGATTTAAATATGTGCACAAAGACTTTTATCATAACAGGATTGCTCACATGTATTTTAGGTTCCAAGCTTCTGCTGAAGGTAGAAGTGACTGTGTCTCTGAACCTATACTCCTCAGCAACGATCTTCTTCATTATTTTGAAGTTTCTATCACTACCTCTACCTCTTTCTTTACTGACCACATAACCAAAATAGAACTCATTTACCTTTTGCTTTAAAGAAGGCTCATAATCCCCAAAAAGACTTTTTAAACCTGAGTACACTATATCATATTCTAGTGTTTCTCTATTTGGTATTTTAAGAACTTTTGTCTCTGCATAATATTGCATGTGAGAAATAGATTTTTTGAGGAAATAACTAGTTAGTCTAGATCTTAAAACTTCTGGAAGTCTTTCGCAGAACCTATAGGGATTTGGATCTAACTCCTCTAGTATTCCCATCGTTAAATATCTCTGATTTGTAATCAGTTCTTCACAATCTGTTTTATTGTTTAAGAAGAGCAAGAGAATTGAAGCTAAATGTTGATTAAGAACCTTACTTGATAAGTCTATATTAGACAAATCAAATTCTAGATGAGATATTAGATGAGATATGATTGAGCAGACA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41,957
MT922052.1
Citrus virus A
Park,J.-W., Kunta,M., Louzada,E.S., da Graca,J.V.
Texas A&M University-Kingsville, Citrus Center
USA
2020-11-24
CG301
Coguvirus eburi
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,689
GenBank
null
USA
USA
Citrus sinensis
plant leaf
2018-09-06
null
null
Citrus virus A isolate CG301 segment RNA1, complete sequence
ACACAAAGACTCCCAAACTTTTTATTAAGTTTTTATCAAGAATCGAATAACTTAATCATGTTAAGGCCTTTGTGCGAGTAGTGATTAAATCTCAACTCTGTGAATTCCTTCAGTCTTGTAACCACAACAAGTTATTGCTAGGCCATATCTAGAACTAAGCATATCCAATGTAAGTGTTGTTAGATAAGGCTTACCAATCGCTTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAATGTTAATTTGTCTTCTTTGGTTAAATTGTCAACATGTTGATCCAGCTCAGCTCTTAATATTTGAAGGAAAACCCCTTTATTCAAAAGTTTATAACTCTCTGGGATATAATTGTTTTCTAACAATAAAGGTTTTAATTTTTCTGCTACATCTATTACTTTTATTGAGTCCATGTCACTATTCTTTGTAGAACTTAATTTTAAAATAGTTCGTGCATTCTCATACCTAATTTTAATATTGTTCAACATGTTGAAGAGATCAGCTGGAGCACCATCCATTTGTTTTCCTAAATAATCAATTCTCGAGTCTAAGTCATCCGGATCTAATTTCGCAATCTCTGTTGCATCAGAAGCCATGGATGAAATTTTGGCACTATCTTTATCTAACTCACTAATAGCTCCATAAACCTCATCCGGAGCAGGCATGCAAACTCTACCACAGAAGAAAGATAATAGCATACCCATGAACCCTGGTGCTGTTAGATTATTATTTAGCTTAAATCTTCTAATTGTTTGTAATATCCCTTCATCCCCCATAAGTACTCTGCTGAGAGTGTCTATATTGGATAGAGCTAAGTTGGATTTTGGCATGCTAGTTTTATCATTCAGCGTATACTCTTCAATCAAAGGGTTAACAGTAAATAATGCTAGCTGATTTTCAATTTGCTCAAACATATCAATGTTAGTGCTAAACAAATCCTCTTCAAGGTTTAGATCCTCAATGTCATCAAATCTATCATCTAGTGTCCAATCCAGTGTGTCTGTCATATCCATATTCATTTCATCTAACAAAGCTTCAACATCTAAATCAACATCATAATCTTCAAAAATTGGCTCTTCGTGCTCTAAAATATCTTCAGTAGATAAGAGTTGTTTCTTTACAGTATCTAAGAAGTCTCCTAACACCCACCCAGACTTTGTCAATGCTTCTCTTCTATTTCTAAAAGCCTTTAAGATTTGTCCAGGTAGAGGTTTGCAGATGGAGATTATTTCTTCTTCTATTGTTTCAATAGGTATAGGTGTTCCTGAAGACCAATGCTTTAATAAGATATCATTACCAATAATGAAATCAGGATCCCAGTCTTTGCTAGTGAAGCCCTCACTCAAAATTGTCATGCGCTGATTTTCACCATACTCTGCTTGCAATCTGATTCTATTATTTGAGACAGACCAGCTCCAGGTGTAATCTGATATTTGGTCTATGATGTCTATCTTTAGCGATGTGTCAATATCAATTGGGTAGTAAGCAGCCTTACCATATCCTCCAGTTATCCTGCCACTTCCGGTTAGCCAGTGGTCATACTCGTCATTTTCAATATTAGGGGCATTTAAGGAAAAGCTGTTCATTAATTCTAAGAGTAGTGGACCTAGAGTCCTAAGGTCTATTAACTTGCTTACAGTGATTTTAGAACAATAATTATCCCTCATGCTAACAACAACAGATACATCTAGACATTTCCCTCTCCACTCTCCTCTTCCAGTTCTTGTTTTGCCCCATCCCTTTTGCCTACTAGTAAAAAAACCAACTGTTCCCAATTTCTCTTCTGAAATGTATCTAACTATTGATGCTTTGTCTTGATCAGCAAACCATTTTCTCAGAACCCTAAGTTTTTTTATTCTATGAGGAACTCGTATCTTATTCAATGCAGGACTCTCAGTAATTATCTCTTGTATTTTGTTCTTTTTAATTATTTCAGAGTACCAACTAGACATAATAGTGAATATTTTTGATCTTATGGAGTAAGAAGTCTCCTCTTCATCTGACCTACCTGGCAATACTAGTTTAACCCCATTCCAGAAAATTCTTGTTATGGAGTTGAACAAAGATGCAGATTTTGCACTGGTATCTAAAAGTACAATGTGCCGTGGTTTAGATGTTACAGACTCTAAAAATCCCTTTAGTTCAACCTCATTGTAGTTTAGCATCTCTTTAGTTTCATTTCTATCATCTTTTAGAAAAGGATATTTTAATTTTGCTTCATTCCAAAAGCTGTCAAATTGTCTTCTGGAAAGAGGCAACCTTCCAATACCAAACCATTTTTTCCTGCATAAATCTACTATTGGTACATCATCTAATGGCCGCTCAAAAACAGAAATCTTTTGCTTGTTTCTTGTTTTTAATCTAGAAGGAACCATTGTAGACCTTGTTTCTAGATCCTCAATATACTCCATAACTTCCTTATACTCTTCCGCATGGGTGAATGCCAAGTTGGGTTCTAGTTTGGTCTTACCTTCTTTATCAATCTTGTTATATACCAGAGCTCTTAACAAACTCACTTTACACACATCACCATTTATATAGATTGTGACACAAGGCCTAGAGATCATATATGCTGATGCTGACATTAACCGAGCTGTTGCTGCATGTCGACTTATTGATTCTTTGACTCCAGGTTGGAACATTTTTAAGAAAACTGCAAACTTAGCTTCTGACCAAGCTTTGTGCCTAGCATAGATTAGATATGGATTCTTTTCAACTTCTAAAATTAATTCTTCTAGGTCTGGCATGCCCATTCTCCTTACTTGCTCTTGCCATAATTTCATGTTTGAGAATGTTACTTTAGCAGATCTTAAAGCTTTACTCACTGATTGATCAGGAATTTCTTCTTCCTCATACTTGGTATTTGACTCATGAATGTTTGCATAAGACAAGCCACAACCGTAGTTTGTTCGCACAAACAGTCTGTAAATTTGGAACTCAACACCAGTGATGCCAGCACAAAAGTCAGAATCTAATGGATAAAATCCTAGAGAAGGATCCAACTGATCAATCATGAATGAACAGGCTTTTGTTGCAAGTTTTGACGTGTGTAATCCCAACAACAAGTAGTGCATCCATGCCTGACATAATTGAACTAAAGCCACTTCTAGCACTTTACCCCCCCCTTCCAACACTTGGGATGCAACATTGTAGTTGATTCTTATTCTGTCAATAAACCTCTCTGTAACAGTTGTCTCCAAGCAAGCTGACACCCACCTGAAGGTTGGTTTCACCACATTGTTTCTCACCATCCATTCAGAGTTGTATTCTATTAAGTCCAGGCAGCCTATTGAAGATTTAGCCCTACTAGTGTAGATTGAAAAGTACTTGGATACATTTTCCTTCCAGTGCAACAAAGTAGTGGCTAATCTGGTCTTATTGTGGGATGGCAGCCCTGTTAAGCTGATTAACTGAGCTGAGTCATCACTTCCTTGAACTACTGTGATATTACAGTGTATTCCTCTTCTCTTTAAGTAGTCTATCTGCAATTTCTTCATAACTTCCTGGATGAGAGTGTGTGTGAAAGAGCTTGTATAATGTAATATTCCTTGCATCATGCCTGAACGTATAAACATTTTGTTACTTTGAGCTTGCTGGAAGATACCCTCCCCTGAAAAAAACTCTTCCTTCATTCTCATGTAAACCTTATTGGATTTAACGTTCTTGTTAGCTTGAAAATTTGCTGCAAACTGAATAGGGAAGCTTATCCTTTTAACCTTCCATAGACTCATCACATGAATGAAGAAAAACCTAAATTCAATTGGAAGGAAAGGAGAAATTACTGCAGCAAATTTTGAGCTATCATTCCTTTGACACCATTTTGTAGCATCAGCAGACTTCCCCATTGTGAAAAATTGTTTCCCTAGTTTGTTGGCAGAGTCTTGATAATGTTTTCTAACAAAGGAATCTTTTTCATATGGGTGTGTTAGTGTGTCTGAGGGGATCAATCTGCATAGAGATTTACTCATGCTCTCACAAAAGAATTGCAGGACTCTCATTTTAATTTCTAAGACATGTATTTCCCTATCTCCTCCATGCTGCGACTTGGGGAAAATGTCACTGTCCCAAAATCCTCTCTTGTCTATCTCTTTTAAGCAGTAGGGAATTAATTCAACAGGGTGTCTTATCTTTTTGCACTCAACTTTCTCATACTCTTCCACAAGAAGGCTTATTGATTCCATAACTCTAGGTCTCTTTGTTTTCTCTTTTGGATTTGATTTTTCATATAAGTCTCTCATGACCTTATTAGCCATATCCTCTTTGATATTTGGTATTATTAGAGAATCATCATAGGATCTGGATGACACTTTCAGAGTGGCTAGGTCTTCAAAAGAACATTGTGCCATGGATTTTATTATTTCTTTTTTGATTATTAAAGCATGATCCTTCCCCAGGATTTCAATTAATATAGATTTAAATATGTGCACAAAGACTTTTATCATAACAGGATTGCTCACATGTATCTTGGGTTCCAAGCTTCTGCTGAAGGTGGAAGTGACCGTGTCTCTGAATCTATACTCCTCAGTAACAATCTTCTTCATTATTTTGAAGTTTCTATCACTACCTCTACCTCTTTCTTTACTGACCACATAACCAAAATAGAACTCATTTACCTTCTGCTTTAAAGAAGGCTCATAATCCCCAAAAAGACTTTTTAAACCTGAGTACACTATATCATATTCTAGTGTCTCTTTATTTGGTATTTTAAGAACTTTTGTCTCTGCATAATATTGCATGTGAGAAATAGATTTTTTAAGGAAATAACTAGTTAGTCTAGATCTTAGAACTTCTGGAAGTCTTTCACAGAACCTATAGGGATTTGGATCTAATTCTTCTAGTATTCCCATTGTTAAATATCTCTGATTTGTAATCAGTTCTTCGCAATCTGTTTTATTGTTTAAGAAGAGCAAGAGAATTGATGCTAAATGTTGATTAAGAACCTTACTAGATAAGTCTATGTTAGACAAATCAAATTCTAGATGAGATATTAAATGAGAAATGATTGAGCAGATAT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45,602
MG764565.1
Citrus virus A
Navarro,B., Zicca,S., Minutolo,M., Saponari,M., Alioto,D., Di Serio,F.
Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto per la Protezione Sostenibile delle Piante
Italy
2018-10-30
W4
Coguvirus eburi
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(+/-)
6,691
GenBank
1
Italy
Italy
Citrus sinensis
null
null
null
null
Citrus virus A isolate W4 segment RNA1, complete sequence
ACACAAAGACTCCCAAACTTTTATTAAGTTTTTTTATCAAGAATCGAATAACTTAATTATGTTAAGGCCTTTGTGCGAGTAGTAAATCAAATCTCCACTCTGTGAATTCCTTCAGTCTTGTAACCACAACAAGTTATTGCTAGGCCATATCTAGAACTAAGCATATCTAATGTAAGTGTTGTTAGATAAGGCTTACCAATCGCTTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAATGTTAATCTGTCTTCTTTGGTTAAATTATCAACATGTTGATCCAGCTCAGCTCTTAATATTTGAAGGAAAACCCCTCTATTCAAAAGTTTATTACTCTCTGGGATATAATTGTTTTCTAGCAATAAAGGTTTCAATTTTTCTGCTACATCTATTACTTTTATCGAGTCCATGTCACTGTTCTTTGTAGCACTTAATTTTAAAACAGTTCTTGCATTCTCATACCTAATTTTAATATTGTTCAACATGTTGAAGAGATCAGCTGGGGCACCATCCATTTGTTTTCCTAAATAATCAATTCTCGAATCTAAGTCAACTGGATCTAATTTTGCAATCTCTGTTGCATCGGAAGCCATGGATGAAATTTTGGCACTATCCTTATCAAACTCACTGATAGCTCCATAAACCTCATCCGGAGCAGGCATACAAACTCTACCACAGAAGAATGACAATAGCATACCCATGAACCCTGGTGCTGTTAGATCATTACTTAGTTTAAATTTTTTAACAGTTTGTAACATCCCTTCATCTCCCATAAGTACTCTGCTGAGAGTATCTAAATTAGATAGAGCTAAATTGGATTTTGGCATGCTAGTTTTATCATTCAGTGTATACTCCTCAATTAAAGGGTTAACAGTAAATAATGCTAGCTGATTTTCAATCTGTTCAAACATATCAATGTTAGTGCTAAACAAATCCTCTTCAAGGTTTAGATCCTCAATGTCATCAAATCTATCATCTAGTGTCCAATCCAGTGTGTCTGTCACATCCATATTCATTTCATCTAATAAAGCCTCAACATCTAAATCAACATCATAATCTTCAAAAATTGGCTCTTCGTGCTCTAAAATATCTTCAGTAGATAAGAGTTGTTTTTTTACAGTATCTAGAAAATCTCCTAACACCCACCCAGACTTTGTCAATGCTTCTCTTCTATTTCTAAAAGCTTTTAAGATCTGTCCAGGTAGAGGTTTGCAGATGGAGACTATTTCTTCTTCTATTGTTTCAATAGGAATAGGTGTCCCTGAAGACCAATGTTTTAATAAGATATCATCATCAATAACGAAATCAGGATCCCAGTCTTTGCTAGAGAAGCCCTCACTCAAAATTGTCATGCGCTGATTTTCGCCATACTCAGCTTGCAATCTGATTCTATTATTTGAGACAGACCAGCTCCAGGTGTAATCTGATATTTGGTCTATGATGTCTATCTTTAGCGATGTGTCAATATCAATTGGGTAGTAAGTAGCTTTGCCATATCCTCCAGTTATCCTGCCACTTCCAGTTAGCCAGTGGTCATACTTGTCATTTTCAATATTAGGGGTGTTTAAGGAAAAACTGTTCATTAATTCTAAGAGTAGTGGACCAAGAGTCCTAAGATCTATTAACTTGCTTACTGTGATTTTAGAACAATAATTATCCCTCATGCTAACAACAACAGACACATCTAAACATTTCCCTCTCCATTCTCCTCTTCCAGATCTTGTTTTGCCCCATCCCTTTTGCCTGCTAGTAAAAAAGCCAACTGTTCCCAGCTTCTCTTCTGAAATGTATCTAACTATTGAAGCTTTGTCTTGATCAGCAAACCATTTCCTCAAAACCCTAAGTTTTTTTATTCTATGAGGAACTCGTATCTTACTCAATGCAAGACTCTCAGTAATTATCTCTTGTATTTTCCCCTTTTTAATTGTTTCAGAGTACCAACTAGACATAATAGTGAATATCTTTGATCTTATGGAGTAAGAAGTCTCCTCTTCATCTGACCTACCTGGCAATACTAGTTTAACCCCATTCCAGAAAATTCTTGATATGGAGTTGAACAGAGATGCAGATTTTGCACTGGTATCCAAAAGTACAATGTGCCGTGGTTTAGATGTTATAGATTCTAAAAATCCCTTTAGCTCAACCTCATTGTAGTTTAATATCTCTTTAGTTTCATTTCTATTATCTTTTAGAAAAGGATATTTTAATTTTGCTTCATTCCAAAAGCTGTCAAATTGTCTTCTAGAAAGAGGCACCCTTCCAATTCCAAACCATTTTTTCCTGCATAAATCCACTATTGGCACATCATCTAATGACCGCTCGAAAACAGAAATCTTTTGCTTGTTTCTTGTTCTTAGTCTAGAAGGAACCATTGTAGATTTTTTTTCTAGATCCTCAATATACTCCATAATTTCCTTATACTCTTCCGCATGGGTGAATGCTAAGTTTGGCTCCAGTTTGGTCTTACCTTCTTTATCAATCTTGTTGTATGCCAGAGCTCTTAACAAACTCACTTTACACGTATCACCATTTATATAGATTGTGACACAAGGCCTAGAGATCATATATGCTGATGCCGACATTAACCTAGCTGTTGCTGCATGTCGACTTATTGATTCTTTGACTCCAGGCTGGAACATTTTTAAGAAAACTGCAAACTTAGCTTCTGACCAAGCTTTGTGCCTAGCATAGATTAGATATGGATTCTCCTCCACTTCTAAAATCAATTCCTCTAGGTCTGGTATGCCCATTCTCCTTACTTGCTCTTGCCATAATTTCATGTTTGAGAATGTTACTTTAGCAGATCTTAAAGCTTTACTCACTGATTGATCAGGAACTTCTTCTTCTTCATACTTGGTATTTGACTCATGAATGTTCGCATAAGACAGGCCACAACCATAGTTTGTTTGTACAAACAATCTGTAAATTTGGAACTCAACACCAGTGATGCCAGCACAAAAGTCAGAATCTAATGGATAAAATCCTAGAGAAGGATCCAACTGATCAATCATAAATGAACAGGCTTTTGTTGCAAGCTTTGACGTGTGTAACCCTAATAACAAGTAGTGCATCCATGCCTGACATAGTTGAACCAAAGCCACTTCTGGCACTTTACCCCCCCCTTCTAACACTTGGGATGCAACATTGTAGTTGATTCTTATTCTGTCAATGAACCTCTCTGTAACAGTTGTCTCCAAGCAAGCTGACACCCACCTGAAGGTTGGTTTCACCACATTGTTCCTCACCATCCATTCAGAGTTGTATTCTATTAGGTCCAGGCAGCCTATTGAAGATTTAGCCCTACTAGTGTAAATTGAAAAGTACTTGGATACATTTTCCTTCCAATGTAATAAAGTAGTGGCCAATCTGGTCTTATTATGGGATGGCAGCCCTGTTAAGCTGATCAACTGAGCTGAATCATCACTTCCTTGAACTACTGTGATGTTGCAGTGTATACCTCTTCTCTTTAAGTAGTCTATCTGCAATTTCCTCATGACTTCCTGGATGAGAGTGTGTGTGAAGGAGCTCGTATAATGTAATATTCCTTGCATCATGCCTGAACGTATAAACATTTTGTTACTTTGAGCTTGCTGGAAGATACCCTCTCCTGAGAAAAACTCTTCTTTCATTCTCATGTAAATCTTATTGGATTTAATGTTCTTGTTAGCTTGAAAATTTGCTGCAAATTGAACAGGGAAGCTTATTCTTTTAACTTTCCATAGACTCATTATATGAATGAAGAAAAACCTAAATTCTATTGGGAGGAAAGGAGAAATTACCGCAGCAAATTTTGAGCTATCATTCCTTTGACACCATTTTGTAGCATCAGCAGATTTCCCCATTGTAAAAAATTGTTTCCCTAGTTTGTTGGCAGAGTCTTGATAATGTTTTTTAACAAAGGATTCTTTTTCATATGGGTGTGTTAGTGTGTCTGAGGGGACCAATCTGCATAGAGATTTACTCATGCTCTCACAAAAGAATTGCAGGACTCTCATTTTAATTTCTAAGACATGTATTTCCCTATCTCCTCCATGCTGTGCCTTAGGGAAAATGTCACTGTCCCAAAACCCCCTCTTGTCTATCTCTTTTAAGCAGTAGGGAATTAATTCAACAGGGTGTCTTATCTTTTTACCCTCAACTTTCTCATACTCTTCCACAAGAAGGCTTATTGATTCCATAACTCTAGGTCTTTTTGGTTTCTCTTTTGGATTTGATTTTTCATATAAGTCTCTCATGACCTTATTGGACATGTCTTCTTTGATATTTGGTATTATTAGAGAGTCATCATAGGATCTAGATGACACTTTCAGAGTGGCTAGATCTTCAAAAGAGCACTGTGCCATGGATTTTATTATTTCTTTTTTGATTATTAAAGCATAATCCTTCCCTAGGATTTCAATTAATATAGATTTAAATATGTGCACAAAGACTTTTATTATAACAGGATTGCTCACATGTATTTTAGGTTCCAAGCTTCTGCTGAAGGTGGAAGTGACTGTGTCTCTGAATCTATACTCTTCAGCAACGATCTTCTTCATTATTTTGAAGTTTCTGTCACTACCTCTACCTCTTTCTTTACTGACCACATAACCAAAATAGAACTCATTTACCTTCTGCTTTAAAGAAGGCTCATAATCCCCGAAAAGACTTTTTAAACCTGAGTATATTATATCATATTCTAGTGTTTCTTTATTTGGTATTTTAAGAACTTTTGTCTCTGCATAATATTGCATGTGAGAAATAGATTTCTTGAGGAAATAACTAGTTAGTCTAGATCTTAAGACTTCTGGGAGTCTTTCGCAGAACCTATAGGGACTTGGGTCTAATTCTTCTAGTATTCCCATTGTTAAATATCTCTGATTTGTAATCAGTTCTTCGCAATCTGTTTTATTGCTTAAGAAGAGCAAGAGAATTGAAGCTAAATGTTGATTAAGAACCTTACTAGACAAGTCTATGTTAGACAAATCAAATTCTAGATGAGATATTAGATGAGAAATGATTGAGCAGATATATGGACCGCTTTTAACAAAGTGTTCTATGGATGGTTCATTGAAAGAGCAAACATCTGTAAAGAAGTATTGATTGGACTCCCAAATTGTTGGCCCTATTTTCCCAGTCTCTATGCTCTTGCATGAAGATTTTGGAAATGCAAAAATAGCAAAAATATGATCACCAGTACATCTAATTAGTATGTGTATGCCTTGATGTATCTTATGGTAGAAATCTGATCTCTTAATCCAATATTTATGGGAATAACAAATTTCAGTCATAATATTTGACACTGTCTGGCCAAAATTGCAGGCAATAGTGTACTGTAGCTTGTTAAATATATTTAAAGATAGTGACTTCTCACCACCCCAAACTTGTTTTCCTTTTTTCATTAATTGGAAAATCTCTTTGGGGACTATAGTGTGATCACATTCAGCTAGCAGTCTGGTGTTTACAAACTTGGAAATATCCTCTGTGTCTGTTAGTATAGGATGGAAGCTCTTCTTATCTTCTGCACATTTTGTCACTAGCTCTGGATGTTGGCTTAAAGCGTTTGCCCACAGTCCACTCTTTGCTGCTTCAATTTTATCTGATTCAGTTAAATTCTTCACATTAAAAGCTGCACCTTTCTGTACTCTATGACGTTCATATGTCTTTACTCCCATTGCCTCATCCAATTGTTGCTGGTAAGAAAGGCTTTGTGGTTTAGCTGAACTCGATGCTCCCCAAATTTTCTTTAAGTATAGTGGCATATCCCTGCAGGTTTCTTCATCTGTCTCAGTGTCAGCTTGTGGTTTTTTAAACTGATAAATTTGAGGTATATTTGTCACCCTTTTGTTTGAAATTTTGCTTGTGTCTTCAAATTTATCTAAATATTTTTTTAAGTCCTCAGAATTGCATTCACTTCCCTGTGTAGATTCCATTAGAGAAGCTTTAAGAGCCTTTCCAACCATTCTTTGATCTTCTTTAGTCACAGGGTCAGACATAGAATTTATGATTCCAATATCAAAACCATGTTTAGATTCAGTGTCAAACTTTAAACCCCTAAAGACATCTTTGACAATTGCTTCATCAGCAGTTAGATCCTCTGAGAAAACATCCTGACCAATATATTCACTTATCACAGACTCCAATGCCAATCCCACTCTAGCTCGATAACACAAACAGTTGACAATATCTTGTGTAAGCTCAAAATTGCAATAAACTCTGGATGGGGACACTATCAAGAGGAAAGGAGTATAGCCTGTAGGGTCTATTAAGTAAGAATATTTTACCATCTTACCTGTGTACATTTTCTTTAATGCAAAGAGTTCTGATATGGCTGTTGTGCCCACTTCTAAAACTGATTTGAAGTTTGAATTAATGTAATCTGGAGTAAGGTCAGATTCTTCCCCTTTAATTCCTATCTTGGACAGTGGGTCATCTGTTTCAAACAACATCACACTGCTGACTATTTCATGTCTAATCTTCCTTAAGTTTTCAGAGGACACATCTAACTCTCTCTCTCTGCCATTTACTTTTATTGTAAAAGTTTTCCCATTATAAGAACATGAATAAATAGGTTCTGGCAGCTCAGAGCAAACGTACAGAGTTGGCTCTATCTTGTTAAGCTTCAAAGAACCAACAGAGAAGTTTGAGTCTACCCTCAATTTAGTTGTCATTTCTATAAGTAGCTGATTGAACTTTGTTTTAAAGTTTGGGATCTGTGTGT
67,687
NC_003382.1
Citrus yellow mosaic virus
Huang,Q., Hartung,J.S.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2001-10-25
null
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,559
RefSeq
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA485481
Citrus yellow mosaic virus, complete genome
TGGTATCAGAGCTTGGTTATGTTCTTACAACGATGGGAGCTTAAGTTCTTCCATTAGGTCTGAGGAAAGAGTTGGTTGTATGGTGTGTTTAGTTCCTATCTGTATTGTTATTCCTGTGTTCATGATATAGAAAACGATCATCGCGAAAAGGGTGAAGGCACTATATCTGGCAGCGAGAGGAGAGTAAGTCCAGTGAAACCCTTCGCATGACGCTAAAGGTGATCTAATCTATGTCTAGAATTTGGGAAGAAGCAATACAGAAATGGTATGAGACATCCCATACAGCTAATCTCGAGTACTTAGATCTAGCTTCAAAACCAAAAGTTTCCAATTCAGAAATTTCACACAACCTTGCTGTAGTTTATGATCGTTTGAATCTGTTTAGCCGTGTCTCTATTAAAAATTTCAAAAGTATCCAAGAAACCTTAGAAAAACAAGACCTTAGAATTCGAAAGCTTGAGTCTAGTTTGAAAACCTTAACCAGTGAGTTTATAGCCCATAAACCTTTGTCCAAAAGTGAGGTAAAAGCCTTAGTCACAGAAATTGCCAAACAGCCAAAGCTTGTTGAAGCACAGGCCCTTCAGTTGACCGAGTCTCTTAACCAAAAGCTTGATAGGGTTGAAACCCTAATAGCTAAGGTTGAACGGTGGGTTCATTCATGACCTACCAGAATACTGAAAAGACTCCTACATACAAAAGAGCTTTAGAAGCAACCGAGCCTATCAACAGTCCCGCCCTAGGTTTTATAAATCCAGAAGATTATTCAGGAGGCATTACTGGTACGAAGGCTTTGATTAAGCAAAACAACCTGCTCATTCAACTTGTGGTGGAACTTTCTGTCAACGTCAACAGCTTATCTGAACAGGTTGCTCAACTTACAAGGCAACTTGGAAAGCAACCCCAGCAAGGCTCATCAACAGCAACCTTACCTGACGATTTGGTTGACAAACTCAAGAACCTTTCCTTAGGTACTGAGAAAAAGAAGGAGAAGCGTGGTACCTTCTACGCTTACAAAGACCCATACCTGATCTACAAGGAAGAGGTAGAAAAGTTAAAGAAGCAACAACAATGAGTACCAGTCGTGCTCGTACAGTTATAGAGCAACTCCCTCCGGCTACAACAGCTCGGGTGGAAGAAAGGGATAATACTCCCCTCTATGATGACCAAATCAGAGATTATAGGCAGTGGCAGCGGCGGCGGCACAACATGGGGCGGAGATGGAATCAGTTGATAGGACGACCCTACAATCAGACCTTGGAACAGGTTGTGGACCCTGAAGTAGCTTTACAGCTATCAATGCAGGAGCGTGCCAGACTAGTACCAGCAGAGGTACTTTACAGATCAAGAACTGATGATCGGCACCATCAAGTCTACATTCACAAGTCAGAGGAGGCTATCCTTTGTGTAGATGGTGATCAAGTTGACCGGTTACTAATTCAACCGGAAAGTGCTGAACAGTTAAGCAGGAGCGGTATGTCCTTCATTCATATGGGCATAGTTCAGGTTCGGATCCAGATCTTACACAGACAGCATGAGGGAACAACAGCCCTTGTGGTGTTTAGAGACAATCGGTGGCAAGGAGACCAGTCAATATTTGCCACCATGGAGCTGGATTTAACTAAAGGTATGCAGATGGTGTACATAATCCCGGACACCATGATGACAGTCAGAGACTTCTGCCGGAATGTTCAAATTTCCATATTAACAAAAGGATATGGGAATTGGCAGAATGGCGAGGCAAATCTGCTTGTTACAAGGGGAATTGTTGGACGGTTATCAAATACCCCTAATGTGGCCTTTGCCTATCAGATCCAAAATGTTACCGACTACTTGGTCAGTCATGGAATTCAGGCCCTGCCAGGACGGCGATATTCTACTGCAGATATACAGGGCCAACAATGGTTCCTAAGACCATCCAATATCCCAGCAGTCCCAATGGCCCCCACCAACGTGGATACAAGAAACATGATTGATGGATCTATTTCTCTTAGATTCAACAGTTACCAACCAGCTCCAGATCCAACCCCTGTTGCTTATAATCAGCATGATGAGGAAGTACCCCCTGATGAAGATGAAGAGCAGATCCGTAATCATACCATCGCTTTATGGCGGGAAGATGACGAGGTATGGGATACACTTGGTGAACCTTCGGGCAAATTTGATTTTTATGTCCGTTATACTCGACCTGCACATGCTCTACAAGATCCTGCTCATATTGTTGCTACTGGATGGGATGACCTTGACAATGATCCATCCACCTCAAGTCCTTCTAATAATATCCTTACTTACCTCACCCCTTCTTCCTCTTCTGATGAGGATGATGACATGTCCTATCTCCAATACCTTGCTCAACAATCACCTGTTCCTTCTCCTACACAGGATTTCACCAATCCTTTTTCGGAAGGTGGTGGGGAATCTACCTACCCTTACCCCTCATTTCAACCACCATTCGACCTTCAATCAGACGACTCATATGGTACTTTGGCAACTTGGAGTGAATATGATGCTATGAGTCAATCAAACAGTCCTTCATCACACTCAGATGCTATTCAACATCTTAGTTTCCAGCACCCAAGTGCAGATACTGTCCTTGATTTTGACAGATATTCTTTTACAACAAGTGAGGATGACGTGGTTCAATCAGCCTGGATATCTGAAAATCTATTTCGTGAAAACACCGGAAACGGTGAAGTTCACAATCTTGTTCCACCTAGACCGGACACCCCTCGGGGTGATGAGGTCAAAGGAACTCAGGAATCCATGGCCCATACTGTTGCAGTAACCACAGAGGAATCAAAACATGAGGCTGAATTTGACTATCCGGCTTTTGCCAGATTACAAGCCCATGAAGAGTCAGGGCGGCCCAAACCCAAAACTGAGAAAGTCTTATCCTCAGCAATTTCTTCATATACCCCACCAACGGATACTGCAATGACACCTGTTGCGTACCCCCCAGCCCAAAATATAGCCAGCCCAAGTTACAATCCAAGCCCACAAATGCCCATGTTCGAAGGGTATTATCCCAAAAGGCCAAATTTTAAGAGGGATAATCATGCCTTTATCAGTCTTCCCTCGGCCCAACAAAATACTGGGGCTTTATTCATTATGCCTCAACAAATTGGCCTGTTTCATGAGGTTTTTACTTCATGGGAAGCTATAACAAAGGCCTATGTTGCTCAACAGGGTATCACAGACCCAAGGGATAAAGCCGAGTTCATTGAAAACATGTTGGGTCCAACAGAAAAGATAATTTGGACTCAATGGCGTATGGGCTACGCCGATGAATATGAGAACCTTGTTACAACTGCTGATGGTCGTGAGGGTACTCAAAATATACTCTCTCAGATGCGAAGGGTCTTTTCCTTAGAAGATCCAACCACAGGTTCAACTGCAGTCCAAGATGAAGCCTACAGAGACTTGGAGAGGCTTACTTGTGATTCTGTCAAGCATATAGTCCAATACTTAAATGACTTTATGCGGATTGCAGCAAAGACTGGGCGCATGTTCATAGGCCCAGAATTGAGTGAAAAGTTATGGCTTAAAATGCCAGGTGACCTAGGCCAAAGAATGAAGAAGGCCTATGAAGAAAAACATCCAGGGAACATTGTTGGTGTTTGCCCTCGGATTCTGTTTGCTTATAAGTACCTTGAAGGCGAATGCAAAGATGCAGCGTTCAGACGCTCCCTGAAAAATCTATCCTTTTGCAGCTCAATCCCTATCCCAGGCTATTACGGTGGTAAAAGTGGAGAGAAACGTTATGGTGTAAGGCGCACAACCACTTATAAGGGAAAGCCTCATAGCACCCATGCAAGGATTGAAAAGACAAAACATTTGCGCAATAAAAAGTGCAAGTGTTATCTGTGTGGGGAAGAAGGTCACTTCGCCCGGGAATGTCCAAATGACCGGCGAAATGTGAAACGAGTTGCAATGTTCGAAGGTTTAGACCTCCCAGATGACTGTGAGATAGTCTCCATCGATGAAGGTGATCCAGATAGTGATGCAATCTTCAGTATTTCCGAAGGAGAAGAAGCTGGAACTCTTGAAGAACAATGTTTTGTGTTCCAGGAAGAATGCAATGGAACATATTGGCTTGGTAAAAGAGGTGGATACCAGGATCTCGTGCAAATCTCTAAGGAGATCTACTATTGCCAGCATGAATGGGAGGAGAATCAACCCATTAATGATCCAGCACATGTTCGGTGTTACCCTTGTAAAAGGGAAACCACTCAGAGAGCTCGCTTACATTGCAAGCTATGCCACATAACATCTTGCCTTATGTGTGGCCCCACCTATTTCAACAAAAAGATTACTGTCCAGCCAATGCCTCAAGCACCCTTCAACCAAAAGGGATTGTTACAGCAACAGCAGGAGTACATCGCCTGGTGCAATAATGAAATTGCCAGGTTAAAGGAAGAAGTTGCTTTTTACAAGCAGCTCGCCCAGGAGAGAGAATTGCAGTTGCAACTTGAGCAATCAAGGAAGGAGCTAGCAGGAGTAGACTCTCGCAGGCGAAAAGACAAAGGAATAGTAATCGATGAAGGGTCATGCTACTTCAATCCTGAAGAAACAACCAGGATAATTGCTCACGGTGACACACAAGTTACCAAAACTCGACCAGTTAAGAATATGCTCTACAACATGGATGTGCGAATGGAAATTCCAGGCATCCCAGCTTTTACAGTAAAGGCGATTCTTGACACAGGAGCAACAACCTGCTGTATTGACAGCAGAAGTGTACCAAAAGATGCCCTTGAAGAGAATTCATTTGTGGTAAATTTCTCAGGCATCAATTCCAAGCAACAAGTCAAGCAGAAGCTTAAAACTGGAAAAATGTTCATCAATGAGCATTACTTCCGGATCCCATATTGTTACAGCTTTGAGATGCAAATTGGTGATGGCATCCAACTTATCCTTGGGTGCAACTTTATACGAAGTATGTATGGTGGTGTACGATTAGAAGGTAATACTATAACCTTCTACAAGCAGATAACAAGTATCAA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8,629
OR765856.1
Citrus yellow mosaic virus
Venkataravanappa,V., Madhu,G.S., Muralidhara,B.M.
ICAR-Indian Institute of Horticultural Research, Division of Crop Protection
India
2023-11-18
CBMV-CM
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,473
GenBank
null
India: Karnataka, Madikeri
India
null
plant leaf
2021
null
null
Citrus yellow mosaic virus isolate CBMV-CM, complete genome
TGGTATCAGAGCTTGGTTGTGTTCTTACAACGATGGGAGCTTAAGTTCTTTCAATAGGTCTGAGGAAAGAGTTGGTTGTATGGTGTGTTAAGTTCCTATTTGTGTTGTTATTCCTTTATTTTAAACATAGAAAACGATCATCGCGAAAAGGGTGAAGGCACTATATCTGGCAGCAAGAGGAGAGTAAGTCCAGTGAAACCCTTCGCATGACGCTAAAGGTGATCTAATCTATGTCTAGAATTTGGGAAGAAGCAATACAGAGGTGGTATGAGACATCCCATACAGCTAATCTCGAGTACTTAGATCTAGCTTCCAAACCAAAAGTTTCCAATTCAGAAATCTCACACAACCTTGCTGTAGTTTATGATCGTTTGAGTTTATTTAGCCGTGTGTCTATTAAAAATTTCAAAAGTATTCAAGAAACCCTAGAAAAGCAGGACCTTAGGATTCAAAAACTTGAATCTAGTTTAAGAACCTTAACCAGTGAGTTTATAGCCCATAAACCCTTGTCTAAAACTGAGGTGAAAACCTTAGTCACAGAGATTGCCAAGCAGCCTAAGCTTGTTGAAGCACAGGCCCTTCAGCTCACAGAAAGTTTGAACCAAAAGCTTGATAGGGTTGAGTCCTTGATAGCTAAGGTGGAAAGGTGGGTTCATTCATGACCTACCAGGCTACTGAGAAGACCCCAACATACAAACGTGCTCTTGAGGCGACCGAGCCTATTAACAGTCCATCACTTGGATTTGTTAATCCAGAGGAATATTCTGGTGGTATTACTGGTACTAAAGCTCTCATTAAGCAAAACAATTTGCTTATCCAACTTGTGGTGGGGCTTTCTATCAACGTCAACAGTTTGTCTGATCAGGTTGCTCAACTAGCAGGGCAACTTGGAAAGCAACCTCAGCAGGGCTCATCAACAACAGCCTTACCTGACGATTTGGTTGACAAACTCAGAAACCTTTCTTTAGGTACTGAAAAAAAAAAGGAAAAGCGTGGTACCTTCTACGCTTACAAAGACCCCTACTTGATCTACAAGGAAGAAGTAGAAAAGCTAAAGAAGCAGCAGCAATGAGCAGTAGCCGAGCAAGAACTGTGGTAGAACAACTTCCACCTGCAACTACGTCCCGAGTGGAGGAGCGAGATAACACCCCCCTCTATGATGATCAAATACGGGATTACAGGCAGTGGCAGCAGCGGCGTCACAACATGGGAAGGAGATGGAATCAATTGATAGGTCGACCCTACAATCAGACCTTGGAGCAGGTAGTAGATCCTGAGGTAGCTTTACAGTTATCTATGCAGGAACGTGCAAGGCTAGTACCAGCAGAGGTACTTTACAGATCAAGGAGTGATGATCGGCACCATCAGGTCTACATACACAGATCAGAGGAGGCTATCCTTTGTGTTGACGGAGATCAAGTTGACCGGTTACTGATACAACCGGAAAGTGCTGAACAGCTAAACAGGAGTGGTATGCCCTTTATCCATATGGGCATAGTTCAGGTTCGGATCCCGATCTTGCACAGACAGCATGAGGGAACAACAGCCCTCGTTGTGTTCAGAGATAATCGGTGGCAAGGAGATCAATCAATATTCGCCACCATGGAGCTCGATTTAACTAAAGGGATGCAGATGGTGTACATAATCCCAGACACCATGATGACAGTAAGAGACTTCTGCCGGAATGTTCAAATTTCCATATTAACAAAAGGATATGGGAATTGGCAGAATGGTGAGGCAAATTTGCTTGTTACAAGGGGAATCGTTGGAAGGTTATCAAATACCCCTAATGTAGCCTTTGCCTATCAGATCCAAAATGTTACAGACTACTTAGTCAGTCATGGAATTCAAGCATTGCCGGGACGGCGATATTCAGCCGCCGATGTACAGGGCCAACAATGGTTTCTAAGACCATCCAATATTCCAGCAGTCCCTATGGCCCCCACCAACGTGGATACACGTAATATGATCGATGGATCCATTTCTCTCAGATTCAACAGTTACCAACCAGCTCCAGATCCAACACCTGTTGCCTATAATCAACATGATGAGGAAGTACCCCCTGATGAAGATGAAGAACAGATCCGTAATCATACCATTGCTTTATGGCGTGAAAATGATGAGGTATGGGATACACTGGGTGAACCTTCGGGCAAATTTGACTTTTATGTTCGTTATACCCGACCTGCACATGCTTTACAAGACCCTGCTCATATCATTGCTACTGGTTGGGATGATCTTGATGATAATCCTTCCCCATCCAGCCCATCCAATAATATTCGTACCTACATTACCCCTTCCTCTCCTTCCTCTTCTGATGAGGATGATGATATGTCTTATCTCCAATATCTTGCTCAACAATCACCTGTCCCTCCTCCTACACAGGATTTCACCAATCCTTTTTCGGAAGGTGGTGGGGAGTCTACCTACCCTTACCCTTCATTTCAACCACCATTTGACCTACAATCAGATGATTCATATGGTACTTTGGCAACTTGGAATGAATATGATGCTATGAGTCAATCAAACAGTCCTTCATCACACAGTCCTAGTGCGGATACTGTCCTTGATTTTGACAGATATTCTTTTACAACAAGTGAGGATGACGTGGTTCAATCAGCCTGGATCTCTGAAAATCTATTTCGTGAAAACACCGGAAACGGTGAAGTTCACAATCTTGTTCCACCTAGACCGGACACCCCTCGGGGTGATGAGGTCAAAGGAACTCAAGAATCCATGGCCCATACTGTTGCAGTGACTACAGAGGGACCAAAGCAGGAAGCTGAGTTTGACTATCCGGCCTTTGCCAGGTTACAAGACCATGAAGAGTCAGAAAGGCCCAAGCCCAAAAATGAGAAAATCCTGTCCTCAGCAATTTCTTCATATACCCCACCAAGGGATACTGCAATGACACCTGTTGCGTACCCCCCTGCTCAGAATATAGCAGGCCCAAGCTACAATTCAAGCCCACAGATGCCTATGTTTGAAGGTTACAGTCCTAAACGGCCCAACTTCAAACGAGACAACCATGCTTTCATAAGCCTTCCTTCGGCCCAACAGAATACTGGGGCTTTGTTCATCATGCCACAGCAGATTGGCTTGTTTCATGAGGTATTCACCTCCTGGGAAGCAATTACCAAAGCCTATGTTGCTCAACAGGGTATCACAGACCCAAGGGATAAGGCCGAGTTCATTGAAAACATGTTGGGTCCAACAGAGAAAATAATTTGGACTCAATGGCGTATGGGCTACGCTGATGAATATGAGAATCTTGTAACAACAGCAGATGGTCGTGAGGGTACTCAGAATATCCTCTCTCAAATGCGACGGGTCTTTTCATTAGAAGATCCAGCTACAGGTTCAACTGCAGTCCAAGATGAAGCTTACAGAGACTTAGAGAGGCTTACTTGTGACTCAGTCAAGCATATAGTCCAATACTTGAATGACTTTATGCGAATTGCAGCAAAGACTGGGCGCATGTTCATAGGCCCAGAGTTGAGTGAGAAATTATGGCTTAAGATGCCAGGTGATTTAGGCCAAAGAATGAAGAAGGCCTATGAGGAAAAGCATCCGGGGAATATTGTTGGAGTCTGCCCTCGGATCTTATTCGCTTACAAGTACCTTGAAGGCGAGTGTAAAGATGCAGCGTTCAGACGCTCCTTGAAGAATCTATCTTTTTGCAGCTCAATCCCTATCCCAGGCTATTACGGTGGTAGAAGTGGTGAAAAGCGTTACGGTGTAAGGCGCACAACCACTTATAAAGGGAAGCCTCACAACACACATGCAAGAATTGAGAAAACAAAGCATTTGCGCAACAAAAAGTGCAAGTGTTATCTCTGTGGAGAAGAAGGTCACTTCGCCCGTGAATGTCCAAATGACAGGCGAAATGTGAAACGAGTTGCAATGTTTGAAGGATTAGATCTACCAGACGACTGTGAAATAGTTTCCATTGATGAAGGCGATCCAGACAGTGACGCTATCTTCAGCATTTCAGAAGGAGAAGAAGCTGGAGCTCTTGATGAACAATGTTTTGTATTCCAAGAAGAATGCAATGGAACATATTGGCTTGGTAAAAGAGGTGGATACCAGGATCTCGTGCAGATTTCCAAAGAGATCTACTACTGTCAACATGAATGGGAAGAGAATCAACCCATTGATGATCCAGCACATGTTAGATGCTACCCTTGCAAGAGAGAAACCACCCAAAGAGCTCGCTTACTTTGCAAGCTATGCCACATAACATCTTGTCTTATGTGTGGCCCCACCTATTTCAACAAAAAGATTACTGTCCAGCCAATGCCTCAAGCACCCTTCAACCAAAAAGGATTGTTACAGCAACAACAGGAGTACATCGCCTGGTGCAACAATGAAATTGCCAGATTAAAGGAAGAAGTTGCTTTTTACAAGCAGCTTGCCCAGGAGAGAGAGTTGCAATTACAGTTAGAACAGTCTAGAAAGGAGTTAGCAGGAGCAGACTCTCGCAGGCGAAAAGACAAAGGGGTAGTAATTGATGAAGGGTCATGCTACTTCAATCCAGAGGAAACAACCAGAATAGTTGCTCATGGAGATACACAGGTTACCAAAACTAGACCTGTGAAAAATATGTTATATAACATGGATGTGCGAATAGAGATTCCAGGCATCCCAGCTTTTACAGTAAAGGCGATTCTTGACACAGGAGCAACAACCTGCTGCATTGACAGCAGAAGTGTGCCAAAAGATGCCCTTGAAGAGAATTCGTTTGTGGTGAATTTCTCAGGCATCAACTCAAAACAGCAAGTTAAGCAGAAGATTAAGCCGGGAAAAATGTTCATCAGTGAGCATTACTTCCGAATTCCATATTGCTACAGCTTCGAGATGCAAATTGGTGATGGCATCCAACTCATTCTTGGGTGCAACTTTATACGGAGCATGTATGGTGGTGTACGACTAGAAGGTAATACCATAACCTTCTACAAGCAGATCACAAGTATCAACACCAGACTTGCTGCACCTCTCCTCCAGCAGGAAGAAGAAGAGAAAGAAGAGGAGCTTAACCTGGAAGAACACAGGTTAATTCAGGAAATGGTTGCATACTCTACTGAGCGGCCATTTGTTCATTTCCAACAAAAGTTTGCAGGGCTTATTCAGGAGTTGAAAGCCCAGGGTTACATTGGGGAAGAGCCTATGAAATATTGGGCCAAAAATCAAGTTGTTTGCCATCTGGACATCAAAAATCCAGATATGGTAATTGAAGATCGCCCACTGAAGCATGTGACACCCCAAATGGAAGGAAGCTTTCGCAAGCATGTGGAAGCACTGTTAAAAATTGGTGCGATCCGACCCAGTAAAAGTCGACACAGGACAACAGCCATTATAGTCAACTCTGGAACCAGTATTGATCCTCTCACAGGCAAAGAAGTCAAAGGCAAAGAGAGGATGGTCTTTAACTATAAAAGGTTAAATGACCTCACAAACAAAGATCAATACAGCCTTCCGGGCATCCAAACGATCCTGCAAAGGTTAAAGGGGAGTACTATATTCTCCAAATTTGACCTTAAAAGTGGCTTTCACCAGGTAGCAATGCATCCAGATTCAATTGAATGGACAGCTTTTTGGGTGCCTAGCGGTCTCTATGAATGGTTAGTCATGCCATTCGGGTTAAAGAATGCTCCAGCAGTTTTTCAGAGAAAAATGGATCACTGCTTCAAAGGGACAGAGGCCTTTATCGCTGTTTATATTGATGACATCCTGGTGTTCTCAAAGACTGAAAGGGAACATGAAGAGCATTTACAGATTATGCTCTCGATCTGCCAAAAGAATGGGCTTATCTTGAGCCCAACAAAGATGAAAATTGCCCAAGCTGAAATTGAATTCCTCGGGGCAATCATTCACAAAGGGCTTATTAAATTACAGCCCCATATTGTCCAAAAGTTGCTAACTTTCACCAACAAGCAACTCGAGGAAGTGAAAGGGCTCAGATCATGGTTGGGCCTACTAATAAACTATGCAAGGAGTTACATTCCTCACATGGGCCGTTTACTCAGCCCATTGTATGCCAAAGTCAGCCCAACTGGTGAACGGAGAATGAATAGGCAAGATTGGGCCTTGATCGACAAAATAAGAGCCCAAGTCCAGAACCTTCCAGCCCTGGAATTACCACCTGCGGACTGTTTCATCATCATCGAAACAGATGGATGCATGGATGGTTGGGGAGGTGTCTGCAAATGGAAGCTAGCACAATATGACTCTAGGAGTTCAGAAAAGGTTTGTGCTTATGCAAGTGGGAAGTTCAACCCACCAAAGTCAACAATCGATGCGGAGATACGTGCAGTGATGAACAGCCTCAACAATTTCAAAATCTATTACCTAGACAAATCCAGCTTATGTTTAAGGACTGACTGTCAAGCTATTATTAGCTTCTTTAATAAGTCCAATGTTAACAAACCATCTAGGGTTAGATGGATTGCTTTCACAGATTTCCTTACTGGTCTAGGAATCCCTGTAAATATAGAGCACATAGATGGGAAGAATAACCATCTGGCTGATGCTCTGTCCAGGTTAGTAACTGGTTTTGTTTTTGCAGAACCACAATGTCAAGACAAGTTCCAGGACGATTTAGGGAAGTTGGAAGCAGCTCTTCTGGAGAAGAAAGAGGCTCCGCAAGCAATGCACGAAGAATATGTCTCCCTGTTGACCAGATCAGCGGACCGCATTACCCTCTCGCTCTACTCTATGAGGGACTCGTCTCCCAGCAGAATCTACTCATGCAGGTCAGGCAAAGAACCAATGAAGGCCTTAATTTGCGAACAGAAGTCATGCCTATCCAAAGGCGACTTGGGGAGTATGAAGACTGTGCACTCCAGGAGTGCATCCAATCAGCAAGGCAACTGGTGGCCCTCCACCAGCATAAACTCAGTTACATCAGAGGCAAAGCGACAAGAGACAACGCATATGCCGATAAACTGCCCACATGCAATAGGGACCACGAACAGCTGTGTGAAGTGGTCGAGCTGTTAGAGGGAATCTCAGAAAGGATCAGTGATACAGCTGTCTAGGATAGCTGGCTTCAATTATGGAGCATGATGGACCCCCCCGCAATAATCCAAAGTGTGGAGTGCTTTTATTGTATAATTTTATGCTTTTGCTTTTGTAAGTGCGCTGTAGTGCGCCTGTCTTTATGCTTTCTTATCCTTTAAGCATCTTTTGCTTTTTGCGTGGCATCCTTTAGTTCACAATTTAAAGAATGACGATGGGGCCCAAGATGTGCACCCGGTTCTCTAAATTGCCTATATAAGGATATGCCATAGCCTTGTTTTTGCAAGTCAGGAATACCTGAGCATAACTTGGCTAAGCAAAAGAATTGTAAGTTTTCTTTCTAAGCTTTTTGTTTGTAAGCTTTTCAGTTCTTAATAAATCTCTCGTTAATCGTTGTGAACACATCTTGTCTTTTGAGTAGTTGTTTTTGTATTTGCTATTTGCTATTTCCTGGAA
10,830
JN006805.1
Citrus yellow mosaic virus
Anthony Johnson,A.M., Borah,B.K., Sai Gopal,D.V., Dasgupta,I., Sai Gopal,D.V.R.
Sri Venkateswara University, Department of Virology
India
2011-10-25
SO JNTU
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,544
GenBank
1
India: JNTU Pulivendula A.P.
India
Citrus sinensis
null
2007
null
null
Citrus yellow mosaic virus isolate SO JNTU, complete genome
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97,959
JN006806.1
Citrus yellow mosaic virus
Anthony Johnson,A.M., Borah,B.K., Sai Gopal,D.V., Dasgupta,I., Sai Gopal,D.V.R.
Sri Venkateswara University, Department of Virology
India
2011-10-25
ROL
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,462
GenBank
1
India: Pichatur, A.P.
India
Citrus jambhiri
null
2006
null
null
Citrus yellow mosaic virus isolate ROL, complete genome
TGGTATCAGAGCTTGGTTGTGTTCTTACAACGATGGGAGCTTAAAACCTTCCATTAGGTCTGAGGAAAGAGTTAACTGTATGGTGTGTTTAGTTCCTATTTGTATTGTTATTCCTTTGTTCATAATATAGAAAACGATCATCGCGAAAAGGGTGAAGGCACTATATCTGGCAGCAAGAGGAGAGTAAGTCCAGTGAAACCCTTCGCATGACGCTAAAGGTGATCTAATCTATGTCTAGAATCTGGGAAGAAGCAATACAAAGATGGTATGAGACATCCCATACAGCCAATCTCGAGTACTTAGATCTAGCTTCAAAACCAAAAGTTTCCAATTCCGAAATCTCACACAACCTTGCAGTAGTTTACGATCGTTTGAGTCTTTTTAGCCGTGTTTCCATTAAGAATTTCGAAAGTATCCAAGAAACCCTAGAAAAGCAAGACCTTAGAATCCAAAAACTTGAATCCAGTCTGAAAACCCTAACTAGTGAGTTTATAGCCCATAAACCTTTATCCAAAGCTGAGGTGAAAACCTTAGTTACAGAAATTGCCAAACAGCCAAAGCTTGTTGAAGCACAAGCCCTCCAGCTTACAGAAAACCTGAACCAAAAGCTTGATCGGGTAGAAGCCTTGATATCTAAGGTAGAACGTTGGGTTCATTCATGACCTATCAGGCTACTGAGAAAACCCCAACATACAAGCGTGCTCTTGCGGCAACCGAGCCTATTAACAGTCCATCACTTGGATTTGTTAACCCAGAGGAATATTCTGGTGGTATGACTGGTACTAAAGCTCTCATTAAGCAAAACAATTTGCTTATTCAGCTCGTAGTAGAGCTTTCTGTCAACGTCAACAGTTTGTCAGAACAAGTTGATCAGCTAGCAAAACAACTTGGGAAACAACCTCAGCAAGGCTCATCAACAACAGCCTTACCTGACGATCTTGTTGACAAACTCAGAAACCTTTCTTTAGGTACTGAGAAGAAGAAGGAAAAGCGTGGTACCTTCTACGCTTACAAAGACCCCTACTTGATCTACAAGGAAGAAGTAGAAAAGCTAAAGAAGCAGCAGCAATGAGCAGTAGCCGAGCAAGAACTGTGGTAGAACAACTTCCACCTGCAACTACGTCCCGAGTGGAGGAGCGAGATAACACCCCCCTCTATGATGATCAAATACGGGATTACAGGCAGTGGCAGCAGCGGCGTCACAACATGGGAAGGAGATGGAATCAATTGATAGGTCGACCCTACAATCAGACCTTGGAGCAGGTAGTAGATCCTGAGGTAGCTTTACAGTTATCTATGCAGGAACGTGCAAGGCTAGTACCAGCAGAGGTACTTTACAGATCAAGGAGTGATGATCGGCACCATCAGGTCTACATACACAGATCAGAGGAGGCTATCCTTTGTGTTGACGGAGATCAAGTTGACCGGTTACTGATACAACCGGAAAGTGCTGAACAGCTAAACAGGAGTGGTATGCCCTTTATCCATATGGGCATAGTTCAGGTTCGGATCCCGATCTTGCACAGACAGCATGAGGGAACAACAGCCCTTGTGGTGTTCAGAGATAATCGGTGGCAAGGCGATCAATCTATATTCGCCACCATGGAACTTGATTTGACCAAAGGAATGCAAATGGTATACATAATCCCAGATACAATGATGACAGTCAGAGACTTCTGCCGGAATGTTCAAATTTCCATATTAACAAAAGGATATGGGAATTGGCAGAACGGTGAGGCAAATTTGCTTGTCACAAGGGGAATCGTTGGACGGTTATCTAATACCCCTAATGTGGCCTTTGCCTATCAGATCCAAAATGTTACAGATTATCTAGTCAGTCATGGGATTCAGGCGTTGCCAGGACGACGCTATTCAGCTGCAGATGTACAGGGCCAGCAATGGTTTCTACGACCATCCAATATTCCAGCAGTTCCAATGGCCCCTACTAACGTGGATACACGTAACATGATAGATGGATCCATTTCTCTCAGATTCAATAGTTATCAACCAGCTCCGGATCCAGCACCTGTTGCCTATAATCAACATGATGAGGAAATACCCCCTGATGAAGATGAAGAACAGATCCGTAATCATACCATTGCGCTATGGCGTGAAAATGATGAGGTATGGGATACACTGGGTGAACCTTCGGGTAAATTTGACTTTTATGTTCGCTATACCCGACCTGCACATGCTTTACAAGACCCTGCCCATATTATTGCTACTGGTTGGGATGATCTTGATGATAATCCTTCTCCATCCAGTCCATCCAACAATATTCGTACTTACCAAACCCCTTCCCCTCCTTCCTCTTCTGACGAGGATGATGATATGTCCTACCTTCAATACCTTGCTCAGCAATCACCTGTCCCTCCTCCTACACAGGATTTTACCAATCCTTTTTCGGAAGGTGGTGGGGAGTCTACCTACCCTTACCCCTCATTTCAGCCACCATTTGACCTACAATCAGATGATTCATATGGTACTTTGGCAACTTGGAGTGAATATGATGCCATGAGCCAAACTAATAGCTCACCTGCACTTAGTCCTAGTGCAAAAACTGTTTTTGATTTTGACAGGTACTCCCACACAACAAATGAAGATGACGTGGTTCAATCAGCCTGGATTTCTGAAAATCTATTTCGTGAAAACACCGGAAACGGCGAAGTTCACAATCTTGTTCCGCCTGGACCGGACACCCCTCGGGGTGATGAGGTCAAAGGAACCCAAGAATCCATGGCCCATACTGTTGCAGTAACCACAGAAGGACCAAAGCAGGAAGCTGAGTTTGACTATCCGGCCTTTGCCAAATTACAAGACTATGAAAAGCGCAGCAGGCCTAAGCCCAAAACTGAGAAAGTCCTGTCTTCAGCGATTTCTTCATATACTCCACCAAGTGATACTGCAATGACACCTGTTGCGTACCCCCCAGCGCAGAATATAGCTAGCCCAAGCTACAACCCAAGCCCACAAATACCTATGTTTGAAGGTTACAGCCCAAAAAGACCCCACTTCAAAAGGGATAATCATACTTTTATAAGCCTTCCCTCAGCCCAACAAAATACTGGGGCTTTATTTATCATGCCTCAACAGATAGGCCTGTTTCATGAGGTCTTCACCTCTTGGGAAGCAATTACAAAAGCCTATGTTGCTCAACAGGGTATCACAGACCCTAGAGATAAGGCCGAGTTCATTGAAAACATGTCGGGTCCAACAGAGAAAATAATTTGGACTCAATGGCGTATGGGCTACGCTGATGAATATGAGAACCTTGTAACAACAGCTGACGGACGTGAGGGTACTCAAAATATACTCTCCCAGATGCGAAGGGTCTTTTCATTGGAAGATCCAGCAACTGGTTCAACTGCAGTCCAAGATGAAGCTTACAGAGACTTGGAGAGACTCACTTGTGATTTAGTCAAGCATATAGTCCAATACTTGAATGACTTTATGCGAATTGCAGCAAAAACTGGGCGCATGTTCATAGGCCCCGAATTGAGTGAAAAACTATGGCTCAAAATGCCAGGTGATCTAGGCCAAAGGATGAAGAAGGCCTATGAGGAAAAACATCCAGGGAACATCGTTGGTGTGTGCCCTCGGATCTTGTTCGCTTACAAGTACCTTGAAGGCGAGTGTAAAGATGCAGCGTTCAGACGCTCCCTGAAGAACTTATCATTTTGCAGCTCAATCCCTATCCCAGGCTATTATGGTGGTAGAAGTAGTGAGAAGCGTTATGGTATAAGACGCACAACCACTTACAAAGGGAAACCTCATAACACACATGCAAGAATTGAAAAGACAAAACATTTGCGCAATAAAAAGTGCAAGTGTTATCTTTGTGGCGAGGAACGTCACTTCGCACGGGAATGTCCAAATGACCGGCGAAATGTGAAGCGAGTTGCAATGTTTGAAGGACTAGATCTCCCTGATGACTGTGAAATCGTCTCTATTGATGAAGGAGATCCAGACAGTGATGCTATCTTCAGCATCTCAGAGGGAGAAGAAACTGGAGCATTTGAAGAACAGTGTTTTGTGTTCCAGGAAGAATGTAATGGAACATACTGGCTTGGTAAGAGAGGTGGATACCAGGATCTCGTGCAAATTTCCAAAGAAACCTACTATTGTCAGCACGAATGGGAGGAGAATCAACCCATTGATGATCCAGCGCATGTTCGATGTTACCCTTGCAAAAGGGAAACTACTCAAAGAGCTCGCTTACATTGTAAGCTATGCCACATAACATCCTGTCTTATGTGTGGCCCCACCTATTTCAACAAAAAGATCACTGTCCAGCCAATACCTCAAGCACCCTTCAACCAAAAGGGATTGTTACAACAGCAACAGGAATACATCGCCTGGTGCAATAATGAAATTGCCAGATTAAAGGAAGAAGTTGCTTTTTACAAGCAGCTTGCCCAGGAGAGAGAGTTGCAATTACAGTTAGAACAGTCTAGAAAGGAGTTAGCAGGAGCAGACTCTCGCAGGCGAAAAGACAAAGGGGTAGTAATTGATGAAGGGTCATGCTACTTCAATCCAGAGGAAACAACCAGAATAGTTGCTCATGGAGATACACAGGTTACCAAAACTAGACCTGTGAGAAATATGTTATACAACATGGATGTGCGAATGGAGATTCCAGGCATCCCAGCTTTTACAGTAAAGACGATTCATGACACAGGAGCGACAACCTGCTGCATTGACAGCAGGAGTGTGCCAAAAGATGCTCTTGAAGAAAATTCATTTGTGGTTAATTTCTCTGGCATCAACTCTAAGCAGCAAGTCAAGCAGAAGATTAAATCTGGAAAGATGTTCATTAATGAGCATTATTTCAGAATTCCATATTGCTACAGCTTCGAGATGCAAATTGGTGATGGCATCCAACTCATTCTCGGGTGCAACTTCATCCGAAGTATGTATGGTGGTGTTCGATTAGAAGGTAATACTATAACCTTCTACAAACAGATCACAAGTATCAACACCAGACTGGCTGCACCTCTCCT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97,960
FJ617224.1
Citrus yellow mosaic virus
Baranwal,V.K., Gupta,K.N., Haq,Q.M.R.
Division of Plant Pathology, Indian Agriculture Research Institute, Advanced Center for Plant Virology
India
2010-03-01
Nagri
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,558
GenBank
null
India: Nagri, Andhra Pradesh
India
Citrus sinensis
null
null
null
null
Citrus yellow mosaic virus isolate Nagri, complete genome
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101,254
EU884191.1
Citrus yellow mosaic virus
Baranwal,V.K., Singh,J.
Indian Agriculture Research Institute, Plant Virology Unit, Division of Plant Pathology
India
2008-09-13
null
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,522
GenBank
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India: Tirupati, Andhra Pardesh
India
Citrus limonia
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null
null
Citrus yellow mosaic virus from India, complete genome
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104,736
EU708316.1
Citrus yellow mosaic virus
Baranwal,V.K., Prasanna Kumar,B.K., Singh,J., Ahlawat,Y.S.
Indian Agriculture Research Institute, Plant Virology Unit, Division of Plant Pathology
India
2008-06-21
SOP
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,497
GenBank
null
India
India
Citrus sinensis
null
null
null
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Citrus yellow mosaic virus isolate SOP, complete genome
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Citrus yellow mosaic virus
Baranwal,V.K., Prasanna Kumar,B.K., Singh,J., Ahlawat,Y.S.
Indian Agriculture Research Institute, Plant Virology Unit, Division of Plant Pathology
India
2008-06-21
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Badnavirus tessellocitri
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GenBank
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India
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Citrus yellow mosaic virus, complete genome
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Citrus yellow mosaic virus
Borah,B.K., Johnson,A.M., Sai Gopal,D.V., Dasgupta,I., Johnson,A.M.A., Saigopal,D.V.R.
Delhi University South Campus, Plant Molecular Biology
India
2008-04-15
AL
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,473
GenBank
1
India
India
Citrus
null
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null
Citrus yellow mosaic virus isolate AL, complete genome
TGGTAACAGAGCTTGGTTGTGTTCTTACAACGATGGGAGCTTAAAACCTTCCATTAGGTCTGAGGAAAGAGTTAACTGTATGGTGTGTTTAGTTCCTATTTGTATTGTTATTCCTTTGTTCATGATATAGAAAACGATCATCGCGAAAAGGGTGAAGGCACTATATCTGGCAGCAAGAGGAGAGTAAGTCCAGTGAAACCCTTCGCATGACGCTAAAGGTGATCTAATCTATGTCTAGAATCTGGGAAGAAGCAATACAAAGATGGTATGAGACATCCCATACAGCCAATCTCGAGTACTTAGATCTAGCTTCAAAACCAAAAGTTTCCAATTCCGAAATCTCACACAACCTTGCAGTAGTTTACGATCGTTTGAGTCTTTTTAGCCGTGTTACCATTAAGAATTTCAAAAGTATCCAAGAAACCCTAGAAAAGCAAGACCTTAGAATCCAAAAACTTGAGTCCAGTCTGAAAACCCTAACTAGTGAGTTTATAGCCCATAAACCTTTATCCAAAGCTGAGGTGAAAACCTTAGTTACAGAAATTGCCAAACAGCCAAAGCTTGTTGAAGCACAAGCCCTCCAGCTTACAGAAAACCTGAACCAGAAGCTCGATCGGGTAGAAGCCTTGATATCTAAGGTGGAACGTTGGGTTCATTCATGACCTATCAGGCTACTGAGAAAACCCCAACATACAAGCGTGCTCTTGCGGCAACCGAGCCTATTAACAGTCCATCACTTGGATTTGTTAACCCAGAGGAATATTCTGGTGGTATAACTGGTACTAAAGCTCTCATTAAGCAAAACAATTTGCTTATTCAGCTCGTAGTAGAGCTTTCTGTCAACATCAACAGTTTGTCAGAACAAGTTGATCAGCTAGCAAAACAACTTGGGAAACAACCTCAGCAAGGCTCATCAACAACAGCCTTACCTGACGATCTTGTTGACAAACTCAGAAACCTTTCTTTAGGTACTGAGAAGAAGAAGGAAAAGCGTGGTACCTTCTACGCTTACAAAGACCCCTACTTGATCTACAAGGAAGAAGTAGAAAAGCTAAAGAAGCAGCAGCAATGAGCAGTAGCCGAGCAAGAACCGTGGTAGAACAACTTCCACCTGCGACTACGTCCCGAGTGGAGGAGCGAGATAACACCCCCCTCTATGATGATCAAATACGGGATTACAGGCAGTGGCAGCGGCGGCGTCACAACATGGGAAGGAGATGGAATCAATTGATAGGTCGACCCTACAATCAGACCTTGGAGCAGGTAGTAGATCCTGAGGTAGCTTTACAGTTATCTATGCAGGAACGTGCAAGGCTAGTACCAGCAGAGGTACTTTACAGATCAAGGAGTGATGATCGGCACCATCAGGTCTATATACACAGATCAGAGGAGGCTATCCTTTGTGTTGACGGAGATCAAGTTGACCGGTTACTGATACAACCGGAAAGTGCTGAACAGCTAAACAGGAGTGGTATGTCCTTTATCAATATGGGCATAGTTCAGGTTCGGATCCAGATCTTGCACAGACAGCATGAGGGAACAACAGCCCTTGTGGTGTTCAGAGATAATCGGTGGCAAGGCGATCAATCTATATTCGCCACCATGGAACTTGATTTGACCAAAGGAATGCAAATGGTATACATAATCCCAGATACAATGATGACAGTCAGAGACTTCTGCCGGAATGTTCAAATTTCCATATTAACAAAAGCATATGGGAATTGGCAGAACGGTGAGGCAAATTTGCTTGTCACAAGGGGAATCGTTGGACGGTTATCTAATACCCCTAATGTGGCCTTTGCCTATCAGATCCAAAATGTTACAGATTATCTAGTCAGTCATGGGATTCAGGCGTTGCCAGGACGACGCTATTCAGCTGCAGATGTACAGGGCCAGCAATGGTTTCTACGACCATCCAATATTCCAGCAGTTCCAATGGCCCCTACTAACGTGGATACACGTAACATGATAGACGGATCCATTTCTCTCAGATTCAATAGTTATCAACCAGCTCCGGATCCAGCACCTGTTACCTATAATCAACATGATGAGGAAATACCCCCTGATGAAGATGAAGAACAGATCCGTAATCATACCATTGCGCTATGGCGTGAAAATGATGAGGTATGGGATACACTGGGTGAACCTTCGGGTAAATTTGACTTTTATGTTCGCTATACCCGACCTGCACATGCTTTACAAGACCCTGCCCATATTATCGCTACTGGTTGGGATGATCTTGATGATAATCCTTCTCCATCCAGTCCATCCAACAATATTCGTACTTACCAAACCCCTTCCCCTCCTTCCTCTTCTGACGAGAATGATGATATGTCCTACCTTCAATACCTTGCTCAGCAATCACCTGTCCCTCCTCCTACACAGGATTTTACCAATCCTTTTTCGGAAGGTGGTGGGGAGTCTACCTACCCTTACCCCTCATTTCAGCCACCATTTGACCTACAATCAGATGATTCATATGGTACTTTGGCAACTTGGAGTGAATATGATGCCATGAGCCAAACTAATAGCTCACCTGCACTTAGTCCTAGTGCAAAAACTGTTTTTGATTTTGACAGGTACTCCCACACAACAAATGAAGATGACGTGGTTCAATCAGCCTGGATTTCTGAAAATCTATTTCGTGAAAACACCGGACACGGTGAAGTTCACAATCTTGTTCCGCCTGGACCGGACACCCCTCGGGGTGATGAGGTCAAAGGAACCCAAGAATCCATGGCCCATACTGTTGCAGTAACCACAGAAGGACCAAAGCAGGAAGCTGAGTTTGACTATCCGGCCTTTGCCAAATTACAAGACCATGAAAAGTGCAGCAGGCCTAAGCCCAAAACTGAGAAAGTCCTGTCTTCAGCAATTTCTTCATATACTCCACCAAGTGATACTGCAATGACACCTGTTGCGTACCCCCCAGCGCAGAATATAGCTAGCCCAAGCTACAACCCAAGCCCACAAGTACCTATGTTCGAAGGTTACAGCCCAAAAAGACCCCACTTCAAAAGGGATAATCATACTTTTATAAGCCTTCCCTCAGCCCAACAAAATACTGGGGCTTTATTTATCATGCCTCAACAGATAGGCCTGTCTCATGAGGTCTTCACCTCTTGGGAAGCAATTACAAAAGCCTATGTTGCTCAACAGGGTATCACAGACCCTAGAGATAAGGCTGACTTCATTGAGAACATGTTGGGTCCAACAGAGAAAATAATTTGGACTCAATGGCGTATGGGCTACGCTGATGAATATGAGAACCTTGTAACAACAGCTGACGGACGTGAGGGTACTCAAAACATACTCTCCCAGATGCGAAGGGTCTTTTCATTGGAAGATCCAGCAACTGGTTCAACTGCAGTCCAAGATGAAGCTTACAGAGACTTGGAGAGACTCACTTGTGATTCAGTCAAGCATATAGTCCAATACTTGAATGACTTTATGCGAATTGCAGCAAAAACTGGGCGCATGTTCATAGGCCCAGAATTGAGTGAAAAACTATGGCTCAAAATGCCAGGTGATCTAGGCCAAAGGATGAAGAAGGCCTATGAGGAAAAACATCCAGGAAACATCGTTGGTGTGTGCCCTCGGATCTTGTTCGCTTACAAGTACCTTGAAGGCGAGTGTAAAGATGCAGCGTTCAGACGCTCCCTGAAGAACTTATCATTTTGCAGCTCAATCCCTATCCCAGGCTATTATGGTGGTAGAAGTAGTGAGAAGCGTTATGGTATAAGACGCACAACCACTTACAAAGGGAAACCTCATAACACACATGCAAGAATTGAAAAGACAAAACATTTGCGCAATAAAAAGTGCAAGTGTTATCTTTGTGGAGAAGAAGGTCACTTCGCACGGGAATGTCCAAATGACCGGCGAAATGTGAAGCGAGTTGCAATGTTTGAAGGACTAGATCTCCCTGATGACTGTGAGATCGTCTCTATTGATGAAGGAGATCCAGACAGTGATGCTATCTTCAGCATCTCAGAGGGAGAAGAAACTGGAGCATTTGAAGAACAGTGTTTTGTGTTCCAGGAAGAATGTAATGGGACATACTGGCTTGGTAAGAGAGGTGGATACCAGGATCTCGTGCAAATTTCCAAAGAAATCTACTATTGTCAGCACGAATGGGAGGAGAATCAACCCATTGATGATCCAGCGCATGTTCGATGTTACCCTTGCAAAAGGGAAACTACTCAAAGAGCTCGCTTACATTGTAAGCTATGCCACATAACATCCTGTCTTATGTGTGGCCCCACCTATTTCAACAGAAAGATCACTGTCCAGCCAATACCTCAAGCACCCTTCAACCAAAAGGGATTGTTACAACAGCAACAGGAATACATCGCCTGGTGCAATAATGAAATTGCCAGATTAAAGGAAGAAGTTGCTTTTTACAAGCAGCTTGCCCAGGAGAGAGAGTTGCAATTACAGTTAGAACAGTCTAGAAAGGAGTTAGCAGGAGCAGACTCTCGCAGGCGAAAAGACAAAGGGGTAGTAATTGATGAAGGGTCATGCTACTTCAATCCAGAGGAAACAACCAGAATAGTTGCTCATGGAGATACACAGGTTACCAAAACTAGACCTGTGAAAAATATGTTATATAACATGGATGTGCGAATAGAGATTCCAGGCATCCCAGCTTTTACAGTAAAGGCGATTCTTGACACAGGAGCAACAACCTGCTGCATTGACAGCAGAAGTGTGCCAAAAGATGCCCTTGAAGAGAATTCGTTTGTGGTGAATTTCTCAGGCATCAACTCAAAACAGCAAGTTAAGCAGAAGATTAAGCCGGGAAAAATGTTCATCAGTGAGCATTACTTCCGAATTCCATATTGCTACAGCTTCGAGATGCAAATTGGTGATGGCATCCAACTCATTCTTGGGTGCAACTTTATACGGAGCATGTATGGTGGTGTACGACTAGAAGGTAATACCATAACCTTCTACAAGCAGATCACAAGTATCAACACCAGACTTGCTGCACCTCTCCT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105,590
EU489745.1
Citrus yellow mosaic virus
Borah,B.K., Johnson,A.M., Sai Gopal,D.V., Dasgupta,I., Johnson,A.M.A., Saigopal,D.V.R.
Delhi University South Campus, Plant Molecular Biology
India
2008-04-15
PM
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,487
GenBank
1
India
India
Citrus maxima
null
null
null
null
Citrus yellow mosaic virus isolate PM, complete genome
TGGTATCAGAGCTTGGTTGTGTTCTTACAACGATGGGAGCTTAAAACCTTCCATTAGGTCTGAGGAAAGAGTTAACTGTATGGTGTGTTTAGTTCCTATTTGTATTGTTATTCCTTTGTTCATGATATAGAAAACGATCATCGAGAAAAGGGTGAAGGCACTATATCTGGCAGCAAGAGGAGAGTAAGTCCAGTGAAACCCTTCGCATGACGCTAAAGGTGATCTAATCTATGTCTAGAATCTGGGAAGAAGCAATACAAAGATGGTATGAGACATCCCATACAGCCAATCTCGAGTACTTAGATCTAGCTTCAAAACCAAAAGTTTCCAATTCCGAAATCTCACACAACCTTGCAGTAGTTTACGATCGTTTGAGTCTTTTTAGCCGTGTTTCCATTAAGAATTTCAAAAGTATCCAAGAAACCCTAGAAAAGCAAGACCTTAGAATCCAAAAACTTGAGTCCAGTCTGAAAACCCTAACTAGTGAGTTTATAGCCCATAAACCTTTATCCAAAGCTGAGGTGAAAAACTTAGTTACAGAAATTGCCAAACAGCCAAAGCTTGTTGAAGCACAAGCCCTCCAGCTTACAGAAAACCTGAACCAAAAGCTCGATCGGGTAGAAGCCTTGATATCTAAGGTGGAACGTTGGGTTCATTCATGACCTATCAGGCTACTGAGAAAACCCCAACATACAAGCGTGCTCTTGCGGCAACCGAGCCTATTAACAGTCCATCACTTGGATTTGTTAACCCAGAGGAATATTCTGGTGGTATAACTGGTACTAAAGCTCTCATTAAGCAAAACAATTTGCTTATTCAGCTCGTAGTAGAGCTTTCTGTCAACGTCAACAATTTGTCAGAACAAGTTGATCAGCTAGCAAAACAACTTGGGAAACAACCTCAGCAAGGCTCATCAACAACAGCCTTACCTGACGATCTTGTTGACAAACTCAGAAGCCTTTCTTTAGGTACTGAGAAGAAGAAGGAAAAGCGTGGTACCTTCTACGCTTACAAAGACCCCTACTTGATCTACAAGGAAGAAGTAGAAAAGCTAAAGAAGCAGCAGCAATGAGCAGTAGCCGAGCAAGAACCGTGGTAGAACAACTTCCACCTGCAACTACGTCCCGAGTGGAGGAACGAGATAACACCCCCCTCTATGATGATCAAATACGGGATTACAGGCAGTGGCAGCGGCGGCGTCACAACATGGGAAGAAGATGGAATCAATTGATAGGTCGACCCTACAATCAGACCTTGGAGCAGGTAGTAGATCCTGAGGTAGCTTTACAGTTATCTATGCAGGAACGTGCAAGGCTAGTACCAGCAGAGGTACTTTACAGATCAAGGAGTGATGATCGGCACCATCAGGTCTATATACACAGATCAGAGGAGGCTATCCTTTGTGTTGACGGAGATCAAGTTGACCGGTTACTGATACAACCGGAAAGTGCTGAACAGCTAAACAGGAGTGGTATGTCCTTTATCAATATGGGCATAGTTCAGGTTCGGATCCAGATCCTGCACAGACAGCATGAGGGAACAACAGCCCTTGTGGTGTTCAGAGATAATCGGTGGCAAGGCGATCAATCTATATTCGCCACCATGGAACTTGATTTGACCAAAGGAATGCAAATGGTATACATAATCCCAGATACAATGATGACAGTCAGAGACTTCTGCCGGAATGTTCAAATTTCCATATTAACAAAAGGATATGGGAATTGGCAGAACGGTGAGGCAAATTTGCTTGTCACAAGGGGAATCGTTGGACGGTTATCTAATACCCCTAATGTGGCCTTTGCCTATCAGATCCAAAATGTTACAGATTATCTAGTCAGTCATGGGATTCAGGCGTTGCCAGGACGGCGCTATTCAGCTGCAGATGTACAGGGCCAGCAATGGTTTCTACGACCATCCAATATTCCAGCAGTTCCAATGGCCCCTACTAACGTGGATACACGTAACATGATAGACGGATCCATTTCTCTCAGATTCAATAGTTATCAACCAGCTCCGGATCCAGCACCTGTTGCCTATAATCAACATGATGAGGAAATACCCCCTGATGAAGATGAAGAACAGATCCGTAATCATACCATTGCGCTATGGCGTGAAAATGATGAGGTATGGGATACACTGGGTGAACCTTCGGGTAAATTTGACTTTTATGTTCGCTATACCCGACCTGCACATGCTTTACAAGACCCTGCCCATATTATTGCTACTGGTTGGGATGATCTTGATGATAATCCTACTCCATCCAGTCCATCCAACAATATTCGTACTTACCAAACCCCTTCCCCTCCTTCCTCTTCTGACGAGAATGATGATATGTCCTACCTTCACTACCTTGCTCAGCAATCACCTGTCCCTCCTCCTCCACAGGATTTTACCAATCCTTTTTCGGAAGGTGGTGGGGAGTCTACCTACCCTTACCCCTCATTTCAGCCACCATTTGACCTACAATCAGATGATTCATATGGTACTTTGGCAACTTGGAGTGAGTATGATGCCATGAGCCAAACTAATAGCTCACCTGCACTTAGCCTAAGTGCAAAAACTGTTTTTGATTTTGACAGGTACTCCCACACAACAAATGAAGATGACGTGGTTCAATCAGCCTGGATTTCTGAAAATCTATTTCGTGAAAACACCGGAAACGGTGAAGTTCACAATCTTGTTCCGCCTGGACCGGACACCCCTCGGGGTGATGAGGTCAAAGGAACCCAAGAATCCATGGCCCATACTGTTGCAGTAACCACAGAAGGACCAAAGCAGGAAGCTGAGTTTGACTATCCGGCCTTTGCCAAATTACAAGACCATGAAAAGTGCAGCAGGCCTAAGCCCAAAACTGAGAAAGTCCTGTCTTCAGCGATTTCTTCATATACTCCACCAAGTGATACTGCAATGACACCTGTTGCGTACCCCCCAGCGCAGAATATAGCTAGCCCAAGCTACAACCCAAGCCCACAAATACCTATGTTTGAAGGTTACAGCCCAAAAAGACCCCACTTCAAAAGGGATAATCATACTTTTATAAGCCTTCCCTCAGCCCAACAAAATACTGGGGCTTTATTTATCATGCCTCAACAGATAGGCCTGTTTCATGAGGTCTTCACCTCTTGGGAAGCAATTACAAAAGCCTATGTTGCTCAACAGGGTATCACAGACCCTAGAGATAAGGCTGACTTCATTGAGAACATGTTGGGTCCAACAGAGAAAATAATTTGGACTCAATGGCGTATGGGCTACGCTGATGAATATGAGAACCTTGTAACAACAGCTGACGGACGTGAGGGTACTCAAAATATACTCTCCCAGATGCGAAGGGTCTTTTCATTGGAAGATCCAGCAACTGGTTCAACTGCAGTCCAAGATGAAGCTTACAGAGACTTGGAGAGACTCACTTGTGATTCAGTCAAGCATATAGTCCAATACTTGAATGACTTTATGCGAATTGCAGCAAAAACTGGGCGCATGTTCATAGGCCCAGAATTGAGTGAAAAACTATGGCTCAAAATGCCAGGTGATCTAGGCCAAAGGATGAAGAAGGCCTATGAGGAAAAACATCCAGGAAACATCGTTGGTGTGTGCCCTCGGATCTTGTTCGCTTACAAGTACCTTGAAGGCGAGTGTAAAGATGCAGCGTTCAGACGCTCCCTGAAGAACTTATCATTTTGCAGCTCAATCCCTATCCCAGGCTATTATGGTGGTAGAAGTAGTGAGAGGCGTTATGGTATAAGACGCACAACCACTTACAAAGGGAAACCTCATAACACACATGCAAGAATTGAAAAGACAAAACATTTGCGCAATAAAAAGTGCAAGTGTTATCTTTGTGGAGAAGAAGGTCACTTCGCACGGGAATGTCCAAATGACCGGCGAAATGTGAAGCGAGTTGCAATGTTTGAAGGACTAGATCTCCCTGATGACTGTGAAATCGTCTCTATTGATGAAGGAGATCCAGACAGTGATGCTATCTTCAGCATCTCAGAGGGAGAAGAAACTGGAGCATTTGAAGAACAGTGTTTTGTGTTCCAGGAAGAATGTAATGGGACATACTGGCTTGGTAAGAGAGGTGGATACCAGGATCTCGTGCAAATTCCAATTTCCAAAGAAATCTACTATTGTCAGCACGAATGGGAGGAGAATCAACCCATTGATGATCCAGCGCATGTTCGATGTTACCCTTGCAAAAGAGAAACTACTCAAAGAGCTCGCTTACATTGTAAGCTATGCCACATAACATCCTGTCTTATGTGTGGCCCCACCTATTTCAACAAAAAGATCACTGTCCAGCCAATACCTCAAGCACCCTTCAACCAAAAGGGATTGTTACAACAGCAACAGGAATACATCGCCTGGTGCAATAATGAAATTGCCAGATTAAAGGAAGAAGTTGCTTTTTACAAGCAGCTTGCCCAGGAGAGAGAGTTGCAATTACAGTTAGAACAGTCTAGAAAGGAGTTAGCAGGAGCAGACTCTCGCAGGCGAAAAGACAAAGGGGTAGTAATTGATGAAGGGTCATGCTACTTCAATCCAGAGGAAACAACCAGAATAGTTGCTCATGGAGATACACAGGTTACCAAAACTAGACCTGTGAAAAATATGTTATATAACATGGATGTGCGAATGGAGATTCCAGGCATCCCAGCTTTTACAGTAAAGGCGATTCTTGACACAGGAGCAACAACCTGCTGCATTGACAGCAGAAGTGTGCCAAAAGATGCCCTTGAAGAGAATTCGTTTGTGGTAAATTTCTCAGGCATCAACTCAAAACAGCAAGTTAAGCAGAAGATTAAGCCGGGAAAAATGTTCATCAGTGAGCATTACTTCCGAATTCCATATTGCTACAGCTTCGAGATGCAAATTGGTGATGGCATCCAACTCATTCTTGGGTGCAACTTTATACGGAGCATGTATGGTGGTGTACGACTAGAAGGTAATACCATAACCTTCTACAAGCAGATCACAAGTATCAACACCAGACTTGCTGCACC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105,591
DQ875213.1
Citrus yellow mosaic virus
Baranwal,V.K., Singh,J., Charaya,M.U.
Department of Plant Pathology, Indian Agriculture Research Institute, Advanced Center for Plant Virology
India
2007-03-01
null
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,522
GenBank
null
India: Tirupati (AP)
India
Citrus limonia
null
null
null
null
Citrus yellow mosaic virus from India, complete genome
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107,334
AF347695.1
Citrus yellow mosaic virus
Huang,Q., Hartung,J.S.
USDA/ARS, Fruit Lab
USA
2001-10-25
null
Badnavirus tessellocitri
Badnavirus
Caulimoviridae
dsDNA-RT
7,559
GenBank
1
null
null
null
null
null
null
null
Citrus yellow mosaic virus, complete genome
TGGTATCAGAGCTTGGTTATGTTCTTACAACGATGGGAGCTTAAGTTCTTCCATTAGGTCTGAGGAAAGAGTTGGTTGTATGGTGTGTTTAGTTCCTATCTGTATTGTTATTCCTGTGTTCATGATATAGAAAACGATCATCGCGAAAAGGGTGAAGGCACTATATCTGGCAGCGAGAGGAGAGTAAGTCCAGTGAAACCCTTCGCATGACGCTAAAGGTGATCTAATCTATGTCTAGAATTTGGGAAGAAGCAATACAGAAATGGTATGAGACATCCCATACAGCTAATCTCGAGTACTTAGATCTAGCTTCAAAACCAAAAGTTTCCAATTCAGAAATTTCACACAACCTTGCTGTAGTTTATGATCGTTTGAATCTGTTTAGCCGTGTCTCTATTAAAAATTTCAAAAGTATCCAAGAAACCTTAGAAAAACAAGACCTTAGAATTCGAAAGCTTGAGTCTAGTTTGAAAACCTTAACCAGTGAGTTTATAGCCCATAAACCTTTGTCCAAAAGTGAGGTAAAAGCCTTAGTCACAGAAATTGCCAAACAGCCAAAGCTTGTTGAAGCACAGGCCCTTCAGTTGACCGAGTCTCTTAACCAAAAGCTTGATAGGGTTGAAACCCTAATAGCTAAGGTTGAACGGTGGGTTCATTCATGACCTACCAGAATACTGAAAAGACTCCTACATACAAAAGAGCTTTAGAAGCAACCGAGCCTATCAACAGTCCCGCCCTAGGTTTTATAAATCCAGAAGATTATTCAGGAGGCATTACTGGTACGAAGGCTTTGATTAAGCAAAACAACCTGCTCATTCAACTTGTGGTGGAACTTTCTGTCAACGTCAACAGCTTATCTGAACAGGTTGCTCAACTTACAAGGCAACTTGGAAAGCAACCCCAGCAAGGCTCATCAACAGCAACCTTACCTGACGATTTGGTTGACAAACTCAAGAACCTTTCCTTAGGTACTGAGAAAAAGAAGGAGAAGCGTGGTACCTTCTACGCTTACAAAGACCCATACCTGATCTACAAGGAAGAGGTAGAAAAGTTAAAGAAGCAACAACAATGAGTACCAGTCGTGCTCGTACAGTTATAGAGCAACTCCCTCCGGCTACAACAGCTCGGGTGGAAGAAAGGGATAATACTCCCCTCTATGATGACCAAATCAGAGATTATAGGCAGTGGCAGCGGCGGCGGCACAACATGGGGCGGAGATGGAATCAGTTGATAGGACGACCCTACAATCAGACCTTGGAACAGGTTGTGGACCCTGAAGTAGCTTTACAGCTATCAATGCAGGAGCGTGCCAGACTAGTACCAGCAGAGGTACTTTACAGATCAAGAACTGATGATCGGCACCATCAAGTCTACATTCACAAGTCAGAGGAGGCTATCCTTTGTGTAGATGGTGATCAAGTTGACCGGTTACTAATTCAACCGGAAAGTGCTGAACAGTTAAGCAGGAGCGGTATGTCCTTCATTCATATGGGCATAGTTCAGGTTCGGATCCAGATCTTACACAGACAGCATGAGGGAACAACAGCCCTTGTGGTGTTTAGAGACAATCGGTGGCAAGGAGACCAGTCAATATTTGCCACCATGGAGCTGGATTTAACTAAAGGTATGCAGATGGTGTACATAATCCCGGACACCATGATGACAGTCAGAGACTTCTGCCGGAATGTTCAAATTTCCATATTAACAAAAGGATATGGGAATTGGCAGAATGGCGAGGCAAATCTGCTTGTTACAAGGGGAATTGTTGGACGGTTATCAAATACCCCTAATGTGGCCTTTGCCTATCAGATCCAAAATGTTACCGACTACTTGGTCAGTCATGGAATTCAGGCCCTGCCAGGACGGCGATATTCTACTGCAGATATACAGGGCCAACAATGGTTCCTAAGACCATCCAATATCCCAGCAGTCCCAATGGCCCCCACCAACGTGGATACAAGAAACATGATTGATGGATCTATTTCTCTTAGATTCAACAGTTACCAACCAGCTCCAGATCCAACCCCTGTTGCTTATAATCAGCATGATGAGGAAGTACCCCCTGATGAAGATGAAGAGCAGATCCGTAATCATACCATCGCTTTATGGCGGGAAGATGACGAGGTATGGGATACACTTGGTGAACCTTCGGGCAAATTTGATTTTTATGTCCGTTATACTCGACCTGCACATGCTCTACAAGATCCTGCTCATATTGTTGCTACTGGATGGGATGACCTTGACAATGATCCATCCACCTCAAGTCCTTCTAATAATATCCTTACTTACCTCACCCCTTCTTCCTCTTCTGATGAGGATGATGACATGTCCTATCTCCAATACCTTGCTCAACAATCACCTGTTCCTTCTCCTACACAGGATTTCACCAATCCTTTTTCGGAAGGTGGTGGGGAATCTACCTACCCTTACCCCTCATTTCAACCACCATTCGACCTTCAATCAGACGACTCATATGGTACTTTGGCAACTTGGAGTGAATATGATGCTATGAGTCAATCAAACAGTCCTTCATCACACTCAGATGCTATTCAACATCTTAGTTTCCAGCACCCAAGTGCAGATACTGTCCTTGATTTTGACAGATATTCTTTTACAACAAGTGAGGATGACGTGGTTCAATCAGCCTGGATATCTGAAAATCTATTTCGTGAAAACACCGGAAACGGTGAAGTTCACAATCTTGTTCCACCTAGACCGGACACCCCTCGGGGTGATGAGGTCAAAGGAACTCAGGAATCCATGGCCCATACTGTTGCAGTAACCACAGAGGAATCAAAACATGAGGCTGAATTTGACTATCCGGCTTTTGCCAGATTACAAGCCCATGAAGAGTCAGGGCGGCCCAAACCCAAAACTGAGAAAGTCTTATCCTCAGCAATTTCTTCATATACCCCACCAACGGATACTGCAATGACACCTGTTGCGTACCCCCCAGCCCAAAATATAGCCAGCCCAAGTTACAATCCAAGCCCACAAATGCCCATGTTCGAAGGGTATTATCCCAAAAGGCCAAATTTTAAGAGGGATAATCATGCCTTTATCAGTCTTCCCTCGGCCCAACAAAATACTGGGGCTTTATTCATTATGCCTCAACAAATTGGCCTGTTTCATGAGGTTTTTACTTCATGGGAAGCTATAACAAAGGCCTATGTTGCTCAACAGGGTATCACAGACCCAAGGGATAAAGCCGAGTTCATTGAAAACATGTTGGGTCCAACAGAAAAGATAATTTGGACTCAATGGCGTATGGGCTACGCCGATGAATATGAGAACCTTGTTACAACTGCTGATGGTCGTGAGGGTACTCAAAATATACTCTCTCAGATGCGAAGGGTCTTTTCCTTAGAAGATCCAACCACAGGTTCAACTGCAGTCCAAGATGAAGCCTACAGAGACTTGGAGAGGCTTACTTGTGATTCTGTCAAGCATATAGTCCAATACTTAAATGACTTTATGCGGATTGCAGCAAAGACTGGGCGCATGTTCATAGGCCCAGAATTGAGTGAAAAGTTATGGCTTAAAATGCCAGGTGACCTAGGCCAAAGAATGAAGAAGGCCTATGAAGAAAAACATCCAGGGAACATTGTTGGTGTTTGCCCTCGGATTCTGTTTGCTTATAAGTACCTTGAAGGCGAATGCAAAGATGCAGCGTTCAGACGCTCCCTGAAAAATCTATCCTTTTGCAGCTCAATCCCTATCCCAGGCTATTACGGTGGTAAAAGTGGAGAGAAACGTTATGGTGTAAGGCGCACAACCACTTATAAGGGAAAGCCTCATAGCACCCATGCAAGGATTGAAAAGACAAAACATTTGCGCAATAAAAAGTGCAAGTGTTATCTGTGTGGGGAAGAAGGTCACTTCGCCCGGGAATGTCCAAATGACCGGCGAAATGTGAAACGAGTTGCAATGTTCGAAGGTTTAGACCTCCCAGATGACTGTGAGATAGTCTCCATCGATGAAGGTGATCCAGATAGTGATGCAATCTTCAGTATTTCCGAAGGAGAAGAAGCTGGAACTCTTGAAGAACAATGTTTTGTGTTCCAGGAAGAATGCAATGGAACATATTGGCTTGGTAAAAGAGGTGGATACCAGGATCTCGTGCAAATCTCTAAGGAGATCTACTATTGCCAGCATGAATGGGAGGAGAATCAACCCATTAATGATCCAGCACATGTTCGGTGTTACCCTTGTAAAAGGGAAACCACTCAGAGAGCTCGCTTACATTGCAAGCTATGCCACATAACATCTTGCCTTATGTGTGGCCCCACCTATTTCAACAAAAAGATTACTGTCCAGCCAATGCCTCAAGCACCCTTCAACCAAAAGGGATTGTTACAGCAACAGCAGGAGTACATCGCCTGGTGCAATAATGAAATTGCCAGGTTAAAGGAAGAAGTTGCTTTTTACAAGCAGCTCGCCCAGGAGAGAGAATTGCAGTTGCAACTTGAGCAATCAAGGAAGGAGCTAGCAGGAGTAGACTCTCGCAGGCGAAAAGACAAAGGAATAGTAATCGATGAAGGGTCATGCTACTTCAATCCTGAAGAAACAACCAGGATAATTGCTCACGGTGACACACAAGTTACCAAAACTCGACCAGTTAAGAATATGCTCTACAACATGGATGTGCGAATGGAAATTCCAGGCATCCCAGCTTTTACAGTAAAGGCGATTCTTGACACAGGAGCAACAACCTGCTGTATTGACAGCAGAAGTGTACCAAAAGATGCCCTTGAAGAGAATTCATTTGTGGTAAATTTCTCAGGCATCAATTCCAAGCAACAAGTCAAGCAGAAGCTTAAAACTGGAAAAATGTTCATCAATGAGCATTACTTCCGGATCCCATATTGTTACAGCTTTGAGATGCAAATTGGTGATGGCATCCAACTTATCCTTGGGTGCAACTTTATACGAAGTATGTATGGTGGTGTACGATTAGAAGGTAATACTATAACCTTCTACAAGCAGATAACAAGTATCAA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110,966
NC_026592.1
Citrus yellow vein clearing virus
Cao,M., Wu,Q., Su,H., Yu,Y., Chen,H., Atta,S., Zhou,C.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2015-03-04
CQ
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,531
RefSeq
null
China: Chongqing
China
Citrus limon
null
2012-12-01
null
PRJNA485481
Citrus yellow vein clearing virus isolate CQ, complete genome
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6,211
OR251443.1
Citrus yellow vein clearing virus
Kumar,R., Gupta,N., Kumar,A., Srivastava,N., Sharma,S.K., Kishan,G., Baranwal,V.K.
Indian Agricultural Research Institute, Plant Pathology
India
2024-02-04
CYVCV-Kin-Del-Dec-2022
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,553
GenBank
null
India: IARI, New Delhi
India
Citrus
plant leaf
2022-12-15
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CYVCV-Kin-Del-Dec-2022, complete genome
CAAACATAACCAACACACACCCAAAATTGTGATCATCGTCTCTGCATCAACAGCTCAGCTAAGAACCAGAGAAATGGCCACTATTAGGGGTGCCATCGAACGCATTACAGACACCACCGTACGCACTACACTTCAAGAGGAGGCATGTCGCCAAATACGCGCTGAACTTAAAAACGTCGAACACATCAACCGTTACGCTATACAGCCTGACGCCGCCGACGCACTCGAACACCTAGGCATTGGTTCTAACCCCTTCTCTGTGGCACTGCACACGCACGGTGCCTGTAAAGCGATTGAGAACCAATTACTCTATGTAGTTGGTACCTTACTCCCAAAAGAACGTGTCACCATGCTCTTCCTTAAGAAAAGCAAGCTCAACATCATGAAACGTTGCCCTAAATTCCAAGACATCTTCCTGAACCAACATATCGAACCACGTGACGTTTCTAGGTACTGCGACTTTAACGTCCAATCCACCTCCACCAGCATACCCACACGAACGGCTTACATCAGTGACACACTCCACTTTATGGACCGTAGAGACCTAGTCCGACTATTTCTAAACAGCCCAAATCTAGAGACCCTCTACGCCACCATTGTCCTCCCAGTCGAGGCTGCTTACAAACAACCGAGCCGCTACCCAGAGATATACCAGATCAACTATGACTTCGACGGCTTCCAGTACATACCTGGAGGCCATGGGGGCGGCGCCTACCACCACGAGTTCGAACAGCTGCAATGGCTAGACACTGGCCATATCCACTGGCGTGGGCCCGACTGCAAAGAGATTCGCATGACAATTACCGCCCAAATGCTCGAAAGCTTAGGTGCGAATCATCTTTTCTGCTTCAAACGTGGGAAACTACTCACCCCACGTGTACGCACTTTCGGCCGAGATACCCAAGTGCTCTTGCCCAAAATCTTCCGCCCGGCCGACAAAAACTTTAACAGGGCAATACCACTGACCCTAGCTAACAAACTACTCCTGTACGCCAAATCCATTAACACAGTGACCTTCCGCGACGTCGTTGCCAAGACACGCCAACTTATGAAGGACAAGGAGCTTGAAACATACACCGGCAACGACCTGTTGCATATGGCCAACTATTTCTTCGCTGTTGGAGCACTGTCAGGCGTTAACTCCTATGACCAATTGCTTGGCCTATCCGCCTGGGAAGCCTGCACTGTCCGTATCAAGAACACCATAACAAATCTCTGGGAAAAGATCGCCGGAAAGAAAGAGTTCGGCAAGCTATTGGAGGCCCTTGAGTGGGAAACATTCACGTACTCACGCCAAGTGACCGAATTCACCATTACGGGACTGCCCGCCCTGCTCCCCCTCCCAGACATCTCAGACCAAGAAGAGATTTTCGCCCAGCAGGACGAGTTAAACAAAATCACCGCCAGCGCTACCAAGATACGGACCATTGACATCATGCGAGGACAAGCTAATCGCGCTAACCCAAAAACTCCGATCAACCCAACACCGGCCCATGGACCCCAACTGCCCGATACCCGCAATCCAATCGACCAAGCTGCCTCTAAAGAGCTCGTCACCAAGCTTCAGAAAAACAAACGCATTTACATCCAAGACGACGGGCCGGAATACCTTATGGGACACATGGCCGAAGTCCCCGCCTGGTATCTTGAACAAGATGATACCACCACTAGACTCAAAAACCGCTGCGCTTGGTTCTTCGGCCCACCCACCTACAGATACGGGCACAACGACATTGAGTACACCACCATAGAATACTACCCCTGGGTCGAGCGTATTGGAGCCATTTTCGGCAAGTACAACACCTGTCTCGCTCAGACTTACGACGCCGGAGCTCGTATCGGATACCACGCTGACGACGAAGACTGCTACGACCCTGACGTCACCGTGGTCACCGTCAACCTCACTGGGAACGCCACCTTCCTGCTCAAGACCCCAACCGGCACTAGGACCTGGAAACTCAAACCTGGTGACTTCATTATCATGAAACCCGGTGCCCAAAGGTGCACAAAACATGCCATTAGAGATTGCACGACTAACCGCACATCCCTAACCTTTAGATGGCAGGCGCGCACTTGCCCCACTAACCTCAGAAAGATCATTAACCTACCCAAAGCCACCAACCAACCCCAAACCACTGAATGGCGTCCTGTAACTAAACCACGCCCTAGCACCACCGCTTCCAGTGACACCCAGACCCCACTTGTCACAGACCAGGAACAAGGGTATACCACCACCCCCGACGTGACACCAACGATTAGGCTGCCCGCCGAAAATGGTAATAACGCCGGTGCTGGACCCTCCTCCGCATTAACTCTCGCCGACCTGAATGACAACCATGCGCCGACCACTAACAAAGGGAAAGAGAAACTTGAGGATATGGTCGAAACTGGCCCAACTGTCATGGAGCGCTTCCTCAACACCGTTCAGGAACCAACACAAGATTTATGGGACTCCACCTCTGAATCCGCTGCGAGCTACCTCGCTGAAGGTCTCGGTATCTCTGCCATCCAAGCACTCCCTTGGGCACCTCACTTGGAACTCATCAATGCATTAGGCTTCCAGGGCACTGAAAGGCAATACGGCCCAGACAACTGTCTCATATGGCCCATCACGCATTACAGAGAATTGCCCAGAAGCAACAATGTCGAAGCCCCTCCGGAAGTGCTTGAGCTGCTCGACTGCATCAATAGATACCCCACTGACGTCCCAATGCTCAAAACTCGAGCCGCCGCCTTCGGTTCAGACGTCAAGAATCTACGCATAGGGGCACTTGTTAAGAACCAGGACAAACAGTGGCGCGCATCACTCGCACTACTTTGCGAGGAAAATGAACACCTCCTCCCTACCACTGTAATACACGGCGCTGGTGGCTCCGGGAAATCCCACTTACTCCAACAGTGGGTGGCGTCCACTGAGCGTGGAAACGTAGTCACCATCTTGCCCACTATCGAACTCCTTCGAGACTGGCAAAACAAATGTCCACATGCACCCAAAGAGACTTTCAAAACCTTCGAGAAAGCGCTCATCCAGAATAGCGCCCCTGTGGTTATCATGGACGACTACTCCAAACTTCCCCCAGGGTATATTGAAGCCTACGTCAGCCTCAAGGGCCAGTGCAAACTTCTCATACTCACTGGAGACCCTAGACAAAGCCACTACCATGAGGAGAACCCTGAGGCCTTAATCTCCACTCTTGACCCCGCCACGGACTACTTTGGCAAATTTTGTGCATACAACATCAACGCCACTCATAGAAATGCCAAAACCTTCGCCAATGCGCTTGGGGTGTACTCTGAAAAAGAAATCCCCACCACTATCACCTGCTCATCCTACCAGAAAAGCGGTTGGCCAACACTTGTCCCATCCATTCTTAAAAGAACTGCGCTCAACGACATGGGGCAGCGCTCACTAACCTACGCAGGCTGTCAGGGACTCACCACCCCAAAAGTGCAGATAGTTCTTGACAACGCCACACCACTATGCTCTGACAAGGTCATGTACACCGCACTATCTAGAGCGGTGGACCAAATTCACTTCTTCAACACTGGCCCAAATCACACTGATTACTGGGAAAAGATGAACGCCACACCGTTCCTCAAAACTTTCATCGACCACACACGTGAGGAGACCTTTGCTGAGCACCAACCTGCCGAACCCACAGTGCGTGAGTACGCACCAGCAACGCATTTCCCACCGGCTAACGAGAACCTAGCACTGGAACCGTGGGTCGAACCGCTGACTGATAAACACTCGCGGGAACTCTTCCACTCTGCCTTAGGCCACAGCAACTGCGTCCAGACTGAAAACACCGTAGTCCAACTTTTTCCCCACCAACAGGCCAAAGACGAGACGCTCTTCTGGAAAACAATAGATGCCAGAATCAAGATAACCACCCCGGAAGAGAACTTCAGGGCTTGCAACATGGCCACTGACATTGGCGACATCTTGTTCCTAAATTACAAAGAAGCCATGGGGTTACCACAAGACCCCATACCCTTCGAACAAGCACTCTGGGACTCTTGTCAAGCCGAGGTGCAACTAACCTACCTCAGCAAACCTCTGGCAGCGCTCGCAAATGCCGCCCAAAGACAAGACCCCGACTTTGACTCCAACAAAATCCAACTCTTCCTGAAATCACAATGGGTCAAGAAAGTCGAGAAGATGGGCTGCCTTAAGATCAAACCCGGCCAAACTATTGCGTCCTTCATGCAACAGACTGTCATGCTATACGGAACTATGGCTCGGTACATGCGCCGCATCCGCACCTCACTCTGCCCACCCGAAATTATGATCAACTGCGAGACCAACCCAAACCAAATCGGAACATGGGTGCGTGAGTATTGGAACTTCAACACCCAGAGCCATGAGAATGACTTTGAAGCGTTCGACCAATCCCAGGACGCCAACATGTTACAATTCGAGCTCATTAAGGCCAAATACCACTCAATCCCCGAGGAGATTATCGCCGGGTATCGACACCTGAAATGCAACGCTCACATCTTCCTTGGGACTATTTCGATCATGAGGTTATCTGGTGAAGGGCCGACCTTCGACGCCAACACAGAGTGTTCCATTGCATACAACCACACAAGGTATTTTGTGCCGAAAGGCACCGCCCAGCTCTACGCCGGAGACGACTCTGCATGCGCGTCGCCCCTCTCTGAAAAACCCAGCTTCCAACATATCTCACCAGAGCTCAGCCTCAAGTCTAAGGCCAAAATTAGAACCCAACAGAAAGGAGACTTTGCAACCTTCTGTGGCTGGCTCATCACTCCTAAAGGCCTGATCAAAAACCCCACCCAGCTTTACGCCTCCTGGTTATTGGCTAAGCATAACAAAGATCTCGCGGACGTGGCTAGAAACTATGCCTTGGACTTACGCATTGCCTATCAACTTAAAGACGAGCTCTATGAGTTATTATCACCTGAAGAACTTGACCACCACCAACTGCTCGTCCGAGAGATGATCAAGCACAAAATGGGCCATCTCCTCAACCTCC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9,110
OR670060.1
Citrus yellow vein clearing virus
Sun,Y., Yokomi,R.
USDA-ARS PWA, San Joaquin Valley Agricultural Sciences Center, Crop Diseases, Pests and Genetics
USA
2024-01-31
CA2
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
null
USA
USA
Citrus x limon
plant leaf
2023-06-01
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA2, complete genome
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9,246
OR670061.1
Citrus yellow vein clearing virus
Sun,Y., Yokomi,R.
USDA-ARS PWA, San Joaquin Valley Agricultural Sciences Center, Crop Diseases, Pests and Genetics
USA
2024-01-31
CA3
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
null
USA
USA
Citrus hystrix
plant leaf
2023-06-01
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA3, complete genome
GAAAAGCAAACATAACCAATACACACCCAAAATTGTGATCATCGTCTCTGCATCAACAGCTCAGCTAAGAACCAGAGAAATGGCCACTATTAGGGGTGCCATCGAACGCATTACAGACACCACCGTACGCACCACACTTCAAGAGGAGGCATGCCGCCAAATACGCGCTGAACTTAAAAACATCGAACACATCAACCGTTACGCTATACAGCCTGACGCCGCCGACGCACTCGAACACCTAGGTATTGGCTCTAACCCCTTCTCTGTGGCACTGCACACGCACGGTGCCTGCAAAGCGATTGAGAACCAATTACTCTATGTAGTTGGTACCTTACTCCCAAAAGAACGTGTCACCATGCTCTTCCTTAAGAAAAGCAAGCTCAACATCATGAAACGCTGCCCTAAATTTCAAGACATCTTCCTGAACCAACACATAGAACCACGTGACGTTTCTAGGTACTGCGACTTTAACGTCCAATCCACCTCCACCAGCATACCCACACGAACGGCTTACATCAGTGACACACTCCACTTCATGGACCGTAGAGACCTAGTCAGACTATTTCTAAACAGCCCAAATCTAGAGACTCTCTACGCCACCATTATCCTCCCAGTCGAGGCTGCTTACAGACAACCAAGCCGCTACCCAGAGATATACCAGATTAACTATGACTTCGACGGCTTCCAGTACATACCTGGGGGCCATGGGGGCGGCGCCTACCACCACGAGTTCGAACAGCTGCAATGGCTAGACACTGGCCATATCCACTGGCGTGGGCCCGACTGTAAAGAGATTCGCATGACAATTACCGCCCAAATGCTCGAAAGCTTAGGTGCGAATCATCTTTTCTGCTTCAAACGTGGGAAACTACTCACCCCACGTGTACGCACTTTCGGCCGAGATACCCAAGTGCTCTTGCCCAAAATCTTCCGCCCGGCTGACAAAAACTTTAACAGGGCAATACCACTAACCCTAGCTAACAAACTACTCCTGTACACTAAATCCATTAACACAGTGACCTTCCGCGACGTCGTTGCCAAGACACGCCAACTTATGAAGGACAAGGAGCTTGAAACATACACCGGCAACGACCTGTTGCATATGGCCAACTATTTCTTCGCTGTTGGAGCATTGTCAGGAGTTAACTCCTATGACCAACTGCTTGGCCTATCTGCCTGGGAAGCCTGCACTGTCCGTATCAAGAACACCATAACAAATCTCTGGGAAAAGATCGCCGGAAAGAAAGAGTTCGGCAAGCTATTGGAGGCCCTTGAATGGGAAACATTCACGTACTCACGCCAAGTGACCGAATTCACCGTTACGGGACTGCCCGCCCTGCTCCCCCTCCCAGACATCTCAGACCAAGAAGAGATTTTCGCCCAGCAGGACGAGTTAGACAAAATCACTGCCGGCGCCACCAAGATACGAACCATTGACATCATGCGGGGACAAGCTAACCGCGCTAACCCAAAAACTCCGATCCACCCAACACCGGCCCAGGGACCCCAACTGCCCGACACCCGCAATCCAATCGACCAAGTCGCCTCTAAAGAGCTCGTCACCAAGCTTCAGAAAAACAAACGCATTTACATCCAAGACGACGGGCCGGAATACCTTATGGGACACATGGCTGAAGTCCCCGCCTGGTATCTTGAACAAGACGATACCACCACTAGACTCAAAAACCGCTGCGCTTGGTTCTTCGGCCCACCCACCTACAGATACGGGCATAACGACATCGAGTACACCACCATAGAATACTACCCCTGGGTCGAGCGTATTGGAGCCATCTTCGGCAAGTACAACACCTGTCTCGCTCAAACTTACGACGCCGGAGCTCGTATCGGATACCACGCTGACGACGAAGACTGCTACGACCCTGACGTCACCGTGGTCACCGTCAACCTCACTGGGAACGCCACCTTCCTGCTCAAGACCCCAACTGGCACTAGGACCTGGAAACTTAAACCTGGCGACTTCATTATCATGAAACCCGGTGCCCAAAGGTGCACAAAACATGCCATTAGAGATTGCACGACTAACCGCACATCCTTAACCTTTAGATGGCAGGCGCGCACTTGCCCCACTAACCTCAGAAAGATCACTAACTTACCCAAAGCCACCAACCAACCCCAAACCACTGAATGGCGTCCTGTAACTAAACCACGCCCTAGCACCACCGCTTCCAGTGACACCCAGATCCCACTTGCCACAGACCAGGAACAAGGGTATACCACCACCTCCGACGTGACACCAACGATTAGGCTGCCCGCCGAAAATGGTAATAACGCCGGAGCTGGACCCTCCTCCGCATTAACTCTCGCCGACCTCAATGATAACCAAGCGCCGACCACTCACAAAGGGAAAGAGAAACTTGAGGAAATGGTCGAAACTGGCCCAACTATCATGGAACGCTTCCTCAACACCGTTCAGGAACCAACACAAGATTTATGGGACTCCACCTCTGAATCCGCTGCGAGCTACCTCGCTGAAGGTCTCGGTATCTCTGCCATCCAAGCACTCCCTTGGGCACCTCACTTAGAACTTATCAATGCATTAGGCTTCCAGGGCACTGAAAGGCAATACGGCCCAGACAACTGTCTCATATGGCCCATCACGCATTACAGAGAATTGCCCAGAAGCAACAATGTCGAAGCCCCTCCGGAAGTGCTTGAGCTGCTCGACTGCATCAATAGATACCCCACTGACGTCCCAATGCTCAAAACTCGAGCCGCCGCCTTCGGTTCAGACGTCAAGAATCTACGTATAGGAGCACTTGTTAAGAACCAGGACAAACAGTGGCGCGCATCACTCGCACTACTTTGTGAGGAAAATGAACACCTCCTCCCTACCACTGTAATACACGGCGCTGGTGGCTCCGGGAAATCCCATTTACTCCAACAGTGGGTGGCGTCTACTGAGCGTGGAAATGTAGTCACCATCTTGCCCACTATCGAACTTCTTCGAGATTGGCAGAACAAATGTCCACATGCACCGAAAGAGACTTTCAAAACCTTCGAGAAAGCGCTCATCCAGAATAGCGCCCCTGTGGTCATCATGGACGACTACTCCAAACTTCCTCCAGGGTATATTGAAGCCTACGTCAGCCTCAAGGGCCAGTGCAAACTTCTCATACTCACCGGAGACCCTAGACAAAGCCACTACCATGAGGAGAACCCTGAGGCCTTAATCTCCACTCTCGACCCCGCCACGGACTACTTTGGCAAATTTTGTGCGTACAACATCAACGCCACTCATAGGAATGCCAAAACCTTCGCAAATGCGCTTGGGGTGTACTCTGAGAAAGAAATCCCCACAACCATCACCTGCTCATCCTACCAGAAAAGCGGTTGGCCAACACTCGTCCCATCCATCCTTAAAAGAACCGCGCTCAACGACATGGGGCAGCGCTCACTAACCTACGCAGGCTGTCAGGGACTCACCACCCCAAAAGTGCAGATAGTTCTTGACAACGCCACACCACTATGCTCTGACAAGGTCATGTACACCGCACTATCTAGAGCGGTGGACCAAATTCACTTCTTCAACACTGGCCCAAATCACACTGACTACTGGGAAAAAATGAACGCCACACCTTTCCTCAAAACTTTCATCGACCACACACGTGAGGAGACCTTTGCTGAACACCAACCTGCCGAACCCACAGTGCGCGAGTACGCACCAACAACGCATTTCCCACCGGCTAACGAGAACCTAGCACTGGAGCCGTGGGTCGAACCGCTGACTGATAAACACTCGCGGGAACTCTTCCACCCTGCCTTAGGCCACAGCAACTGCGTCCAGACTGAAAACACCGTAGTCCAACTCTTCCCCCACCAACAGGCCAAAGACGAAACGCTCTTCTGGAAAACAATAGATGCCAGAATCAAGATAACCACCCCGGAAGAGAACATCAGGGCTTGCAACATGGCCACTGACATTGGAGACATCTTGTTCCTAAATTACAAAGAAGCCATGGGGTTACCACAAGACCCTTTACCCTTCGAACAAGCACTCTGGGACTCTTGTCAAGCCGAGGTGCAACTAACCTACCTCAGCAAACCTCTGGCAGCACTCGCAAATGCCGCCCAAAGACAAGACCCCGACTTTGACTCCAACAAAATCCAACTCTTCCTGAAGTCACAATGGGTCAAGAAGGTCGAGAAGCTGGGTTGCCTTAAGATCAAACCCGGCCAAACTATTGCGTCCTTCATGCAACAGACCGTCATGCTATACGGAACCATGGCTCGGTACATGCGCCGCATCCGCACCTCACTCTGCCCACCCGAAATTATGATCAACTGCGAGACCAACCCAAACCAAATCGGAACATGGGTGCGTGAGTATTGGAACTTCAACACCCAGAGCCATGAGAATGACTTTGAAGCGTTCGACCAGTCCCAAGACGCCAACATGTTACAATTTGAGCTCATTAAGGCCAAATACCACTCCATCCCCGAGGAGATTATCGCCGGGTATCGACACCTGAAATGCAACGCTCACATCTTCCTTGGGACTATATCGATCATGAGGTTGTCTGGTGAAGGGCCGACCTTCGACGCCAACACAGAGTGTTCCATTGCATACAACCACACAAGGTATTTTGTGCCGAAAGGCACCGCCCAGCTCTACGCCGGAGACGACTCTGCATGCGCGTCGCCCCTCTCTGAAAAACCCAGCTTCCAACATATCTCACCAGAGCTCAGCCTCAAGTCTAAGGCCAAAATTAGAACCCAACAGAAAGGAGACTTTGCAACCTTCTGTGGCTGGCTCATCACTCCAAAAGGCCTGATCAAGAACCCCACCCAGCTTTACGCCTCCTGGTTATTGGCTAAGCACAACAAAGATCTCGCGGACGTGGCCAGAAACTATGCCTTGGACTTACGCATTGCCTATCAACTTAAAGACGAGCTCTATGAGTTATTATCACCTGAAGAACTTGACCACCACCAACTGCTCGTCCGAGAGATGATCAAGCACAAAATGGGCCATCTCCTCA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9,247
OQ418489.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA1
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus x limon
null
2022-02
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA1, complete genome
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9,622
OQ418490.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA2
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus reticulata
null
2022-03
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA2, complete genome
GAAAAGCAAACATAACCAATACACACCCAAAATTGTGATCATCGTCTCTGCATCAACAGCTCAGCTAAGAACCAGAGAAATGGCCACTATTAGGGGTGCCATCGAACGCATTACAGACACCACCGTACGCACCACACTTCAAGAGGAGGCATGCCGCCAAATACGCGCTGAACTTAAAAACATCGAACACATCAACCGTTACGCTATACAGCCTGACGCCGCCGACGCACTCGAACACCTAGGTATTGGCTCTAACCCCTTCTCTGTGGCACTGCACACGCACGGTGCCTGCAAAGCGATTGAGAACCAATTACTCTATGTAGTTGGTACCTTACTCCCAAAAGAACGTGTCACCATGCTCTTCCTTAAGAAAAGCAAGCTCAACATCATGAAACGCTGCCCTAAATTTCAAGACATCTTCCTGAACCAACACATAGAACCACGTGACGTTTCTAGGTACTGCGACTTTAACGTCCAATCCACCTCCACCAGCATACCCACACGAACGGCTTACATCAGTGACACACTCCACTTCATGGACCGTAGAGACCTAGTCAGACTATTTCTAAACAGCCCAAATCTAGAGACTCTCTACGCCACCATTATCCTCCCAGTCGAGGCTGCTTACAGACAACCAAGCCGCTACCCAGAGATATACCAGATTAACTATGACTTCGACGGCTTCCAGTACATACCTGGGGGCCATGGGGGCGGCGCCTACCACCACGAGTTCGAACAGCTGCAATGGCTAGACACTGGCCATATCCACTGGCGTGGGCCCGACTGTAAAGAGATTCGCATGACAATTACCGCCCAAATGCTCGAAAGCTTAGGTGCGAATCATCTTTTCTGCTTCAAACGTGGGAAACTACTCACCCCACGTGTACGCACTTTCGGCCGAGATACCCAAGTGCTCTTGCCCAAAATCTTCCGCCCGGCTGACAAAAACTTTAACAGGGCAATACCACTAACCCTAGCTAACAAACTACTCCTGTACACTAAATCCATTAACACAGTGACCTTCCGCGACGTCGTTGCCAAGACACGCCAACTTATGAAGGACCAGGAGCTTGAAACATACACCGGCAACGACCTGTTGCATATGGCCAACTATTTCTTCGCTGTTGGAGCATTGTCAGGAGTTAACTCCTATGACCAACTGCTTGGCCTATCCGCCTGGGAAGCCTGCACTGTCCGTATCAAGAACACCATAACAAATCTCTGGGAAAAGATCGCCGGAAAGAAAGAGTTCGGCAAGCTATTGGAGGCCCTTGAATGGGAAACATTCACGTACTCACGCCAAGTGACCGAATTCACCGTTACGGGACTACCCGCCCTGCTCCCCCTCCCAGACATCTCAGACCAAGAAGAGATTTTCGCCCAGCAGGATGAGTTAGACAAAATCACTGCCGGCGCCACCAAGATACGAACCATTGACATTATGCGGGGACAAGCTAACCGCGCTAACCCAAAAACTCCGATCCACCCAACACCGGCCCAGGGACCCCAACTGCCCGACACCCGTAATCCAATCGACCAAGTCGCCTCTAAAGAGCTCGTCACCAAGCTTCAGAAAAACAAACGCATTTACATCCAAGACGACGGGCCGGAATACCTTATGGGACACATGGCTGAAGTCCCCGCCTGGTATCTTGAACAAGACGATACCACCACTAGACTCAAAAACCGCTGCGCTTGGTTCTTCGGCCCGCCCACCTACAGATACGGGCATAACGACATCGAGTACACCACCATAGAATACTACCCCTGGGTCGAGCGTATTGGAGCCATTTTCGGCAAGTACAACACCTGTCTCGCTCAAACTTACGACGCCGGAGCTCGTATCGGATACCACGCTGACGACGAAGACTGCTACGACCCTGACGTCACCGTGGTCACCGTCAACCTCACTGGGAACGCCACCTTCCTGCTCAAGACCCCAACTGGCACTAGGACCTGGAAACTTAAACCTGGCGACTTCATTATCATGAAACCCGGTGCCCAAAGGTGCACAAAACATGCCATTAGAGATTGCACGACTAACCGCACATCCCTAACCTTTAGATGGCAGGCGCGCACTTGCCCCACTAACCTCAGAAAGATCACTAACTTACCCAAAGCGACCAACCAACCCCAAACCACTGAATGGCGTCCTGTAACTAAACTACGCCCTAGCACCACCGCTTCCAGTGACACCCAGACCCCACTTGCCACAGACCAGGAACAAGGGTATACCACCACCTCCGACGTGACACCAACGATTAGGCTGCCCGCCGAAAATGGTAATAACGCCGGAGCTGGACCCTCCTCCGCATTAACTCTCGCCGACCTCAATGATAACCAAGCGCCGACCACTCACAAAGGGAAAGAGAAACTTGAGGAAATGGTCGAAACTGGCCCAACTATCATGGAACGCTTCCTCAACACCGTTCAGGAACCAACACAAGATTTATGGGACTCCACCTCTGAATCCGCTGCGAGCTACCTCGCTGAAGGTCTCGGTATCTCTGCCATCCAAGCACTCCCTTGGGCACCTCACTTAGAACTTATCAATGCATTAGGCTTCCAGGGCACTGAAAGGCAATACGGCCCAGACAACTGTCTCATATGGCCCATCACGCATTACAGAGAATTGCCCAGAAGCAACAATGTCGAAGCCCCTCCGGAAGTGCTTGAGCTGCTCGACTGCATCAACAGATACCCCACTGACGTCCCAATGCTCAAAACTCGAGCCGCCGCCTTCGGTTCAGACGTCAAGAATCTACGTATAGGAGCACTTGTTAAGAACCAGGACAAACAGTGGCGCGCATCACTCGCACTACTTTGCGAGGAAAATGAACACCTCCTCCCTACCACTGTAATACACGGCGCTGGTGGCTCCGGGAAATCCCATTTACTCCAACAGTGGGTGGCGTCTACTGAGCGTGGAAATGTAGTCACCATCTTGCCCACTATCGAACTTCTTCGAGATTGGCAGAACAAATGTCCACATGCACCGAAAGAGACTTTCAAAACCTTCGAGAAAGCGCTCATCCAGAATAGCGCCCCTGTGGTCATCATGGACGACTACTCCAAACTTCCTCCAGGGTATATTGAAGCCTACGTCAGCCTCAAGGGCCAGTGCAAACTTCTCATACTCACCGGAGACCCTAGACAAAGCCACTACCATGAGGAGAACCCTGAGGCCTTAATCTCCACTCTCGACCCCGCCACGGACTACTTTGGCAAATTTTGTGCGTACAACATCAACGCCACTCATAGGAATGCCAAAACCTTCGCAAATGCGCTTGGGGTGTACTCTGAGAAAGAAATCCCCACCACCATCACCTGCTCATCCTACCAGAAAAGCGGTTGGCCAACACTCGTCCCATCCATCCTTAAAAGAACCGCGCTCAACGACATGGGGCAGCGCTCACTAACCTACGCAGGCTGTCAGGGACTCACCACCCCAAAAGTGCAGATAGTTCTTGACAACGCCACACCACTATGCTCTGACAAGGTCATGTACACCGCACTATCTAGAGCGGTGGACCAAATTCACTTCTTCAACACTGGCCCAAATCACACTGACTACTGGGAAAAAATGAACGCCACACCTTTCCTCAAAACTTTCATCGACCACACACGTGAGGAGACCTTTGCTGAACACCAACCTGCTGAACCCACAGTGCGCGAGTACGCACCAACAACGCATTTCCCACCGGCTAACGAGAACCTAGCACTGGAGCCGTGGGTCGAACCGCTGACTGATAAACACTCGCGGGAACTCTTCCACCCTGCCTTAGGCCACAGCAACTGCGTCCAGACTGAAAACACCGTAGTCCAACTCTTCCCCCACCAACAGGCCAAAGACGAAACGCTCTTCTGGAAAACAATAGATGCCAGAATCAAGATAACCACCCCGGAAGAGAACATCAGGGCTTGCAACATGGCCACTGACATTGGCGACATCTTGTTCCTAAATTACAAAGAAGCCATGGGGTTACCACAAGACCCCTTACCCTTCGAACAAGCACTCTGGGACTCTTGTCAAGCCGAGGTGCAACTAACCTACCTCAGCAAACCTCTGGCAGCACTCGCAAATGCCGCCCAAAGACAAGACCCCGACTTTGACTCCAACAAAATCCAACTCTTCCTGAAGTCACAATGGGTCAAGAAGGTCGAGAAGCTGGGTTGCCTTAAGATCAAACCCGGCCAAACTATTGCGTCCTTCATGCAACAGACTGTCATGCTATACGGAACCATGGCTCGGTACATGCGCCGCATCCGCACCTCACTCTGCCCACCCGAAATTATGATCAACTGCGAGACCAACCCAAACCAAATCGGAACATGGGTGCGTGAGTATTGGAACTTCAACACCCAGAGCCATGAGAATGACTTTGAAGCGTTCGACCAGTCCCAAGACGCCAACATGTTACAATTTGAGCTCATTAAGGCCAAATACCACTCCATCCCCGAGGAGATTATCGCCGGGTATCGACACCTGAAATGCAACGCTCACATCTTCCTTGGGACCATATCGATCATGAGGTTGTCTGGTGAAGGGCCGACCTTCGACGCCAACACAGAGTGTTCCATTGCATACAACCACACAAGGTATTTTGTGCCGAAAGGCACCGCCCAGCTCTACGCCGGAGACGACTCTGCATGCGCGTCGCCCCTCTCTGAAAAACCCAGCTTCCAACATATCTCACCAGAGCTCAGCCTCAAGTCTAAGGCCAAAATTAGAACCCAACAGAAAGGAGACTTTGCAACCTTCTGTGGCTGGCTCATCACTCCAAAAGGCCTGATCAAAAACCCCACCCAGCTTTACGCCTCCTGGTTATTGGCTAAGCACAACAAAGATCTCGCGGACGTGGCCAGAAACTATGCCTTGGACTTACGCATTGCCTATCAACTTAAAGACGAGCTCTATGAGTTATTATCACCTGAAGAACTTGACCACCACCAACTGCTCGTCCGAGAGATGATCAAGCACAAAATGGGCCATCTCCTCA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9,623
OQ418491.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA3
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus japonica
null
2022-03
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA3, complete genome
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9,624
OQ418492.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA4
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus sinensis
null
2022-03
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA4, complete genome
GAAAAGCAAACATAACCAATACACACCCAAAATTGTGATCATCGTCTCTGCATCAACAGCTCAGCTAAGAACCAGAGAAATGGCCACTATTAGGGGTGCCATCGAACGCATTACAGACACCACCGTACGCACCACACTTCAAGAGGAGGCATGCCGCCAAATACGCGCTGAACTTAAAAACATCGAACACATCAACCGTTACGCTATACAGCCTGACGCCGCCGACGCACTCGAACACCTAGGTATTGGCTCTAACCCCTTCTCTGTGGCACTGCACACGCACGGTGCCTGCAAAGCGATTGAGAACCAATTACTCTATGTAGTTGGTACCTTACTCCCAAAAGAGCGTGTCACCATGCTCTTCCTTAAGAAAAGCAAGCTCAACATCATGAAACGCTGCCCTAAATTTCAAGACATCTTCCTGAACCAACACATAGAACCACGTGACGTTTCTAGGTACTGCGACTTTAACGTCCAATCCACCTCCACCAGCATACCCACGCGAACGGCTTACATCAGTGACACACTCCACTTCATGGACCGTAGAGACTTAGTCAGACTATTTCTAAACAGCCCAAATCTAGAGACTCTCTACGCCACCATTATCCTCCCAGTCGAGGCTGCTTACAGACAACCAAGCCGCTACCCAGAGATATACCAGATTAACTATGACTTCGACGGCTTCCAGTACATACCTGGGGGCCATGGGGGCGGCGCCTACCACCACGAGTTCGAACAGCTGCAATGGCTAGACACTGGCCATATCCACTGGCGTGGGCCCGACTGTAAAGAGATTCGCATGACAATTACCGCCCAAATGCTCGAAAGCTTAGGTGCGAATCATCTTTTCTGCTTCAAACGTGGGAAACTACTCACCCCACGTGTACGCACTTTCGGCCGAGATACCCAAGTGCTCTTGCCCAAAATCTTCCGCCCGGCTGACAAAAACTTTAACAGGGCAATACCACTAACCCTAGCTAACAAACTACTCCTGTACACTAAATCCATTAACACAGTGACCTTCCGCGACGTCGTTGCCAAGACACGCCAACTTATGAAGGACAAGGAGCTTGAAACATACACCGGCAACGACCTGTTGCATATGGCCAACTATTTCTTCGCTGTTGGAGCATTGTCAGGAGTTAACTCCTATGACCAACTGCTTGGCCTATCCGCCTGGGAAGCCTGCACTGTCCGTATCAAGAACACCATAACAAATCTCTGGGAAAAGATCGCCGGAAAGAAAGAGTTCGGCAAGCTATTGGAGGCCCTTGAATGGGAAACATTCACGTACTCACGCCAAGTGACCGAATTCACCGTTACGGGACTACCCGCCCTGCTCCCCCTCCCAGACATCTCAGACCAAGAAGAGATTTTCGCCCAGCAGGACGAGTTAGACAAAATCACTGCCGGCGCCACCAAGATACGAACCATTGACATTATGCGGGGACAAGCTAACCGCGCTAACCCAAAAACTCCGATCCACCCAACACCGGCCCAGGGACCCCAACTGCCCGACACCCGCAATCCAATCGACCAAGTCGCCTCTAAAGAGCTCGTCACCAAGCTTCAGAAAAACAAACGCATTTACATCCAAGACGACGGGCCGGAATACCTTATGGGACACATGGCTGAAGTCCCCGCCTGGTATCTTGAACAAGACGATACCACCACTAGACTCAAAAACCGCTGCGCTTGGTTCTTCGGCCCGCCCACCTACAGATACGGGCATAACGACATCGAGTACACCACCATAGAATACTACCCCTGGGTCGAGCGTATTGGAGCCATCTTCGGCAAGTACAACACCTGTCTCGCTCAAACTTACGACGCCGGAGCTCGTATCGGATACCACGCTGACGACGAAGACTGCTACGACCCTGACGTCACCGTGGTCACCGTCAACCTCACTGGGAACGCCACCTTCCTGCTCAAGACCCCAACTGGCACTAGGACCTGGAAACTTAAACCTGGCGACTTCATTATCATGAAACCCGGTGCCCAAAGGTGCACAAAACATGCCATTAGAGATTGCACGACTAACCGCACATCCTTAACCTTTAGATGGCAGGCGCGCACTTGCCCCACTAACCTCAGAAAGATCACTAACTTACCCAAAGCCACCAACCAACCCCAAACCACTGAATGGCGTCCTGTAACTAAACCACGCCCTAGCACCACCGCTTCCAGTGACACCCAGACCCCACTTGCCACAGACCAGGAACAAGGGTATACCACCACCTCCGACGTGACACCAACGATTAGGCTGCCCGCCGAAAATGGTAATAACGCCGGAGCTGGACCCTCCTCCGCATTAACTCTCGCCGACCTCAATGATAACCAAGCGCCGACCACTCACAAAGGGAAAGAGAAACTTGAGGAAATGGTCGAAACTGGCCCAACTATCATGGAACGCTTCCTCAACACCGTTCAGGAACCAACACAAGATTTATGGGACTCCACCTCTGAATCCGCTGCGAGCTACCTCGCTGAAGGTCTCGGTATCTCTGCCATCCAAGCACTCCCTTGGGCACCTCACTTGGAACTCATCAATGCATTAGGCTTCCAGGGCACTGAAAGGCAATACGGCCCAGACAACTGTCTCATATGGCCCATCACGCATTACAGAGAATTGCCCAGAAGCAACAATGTCGAAGCCCCTCCTGAAGTGCTTGAGCTGCTCGACTGCATCAATAGATACCCCACTGACGTCCCAATGCTCAAAACTCGAGCCGCCGCCTTCGGTTCAGACGTCAAGAATCTACGTATAGGAGCACTTGTTAAGAACCAGGACAAACAGTGGCGCGCATCACTCGCACTACTTTGTGAGGAAAATGAACACCTCCTCCCTACCACTGTAATACACGGCGCTGGTGGCTCCGGGAAATCCCATTTACTCCAACAGTGGGTGGCATCTACTGAGCGTGGAAATGTAGTCACCATCTTGCCCACTATCGAACTTCTTCGAGATTGGCAGAACAAATGTCCACATGCACCGAAAGAGACTTTCAAAACCTTCGAGAAAGCGCTCATCCAGAATAGCGCCCCTGTGGTCATCATGGACGACTACTCCAAACTTCCTCCAGGGTATATTGAAGCCTACGTCAGCCTCAAGGGCCAGTGCAAACTTCTCATACTCACCGGAGACCCTAGACAAAGCCACTACCATGAGGAGAACCCTGAGGCCTTAATCTCCACCCTCGACCCCGCCACGGACTACTTTGGCAAATTTTGTGCGTACAACATCAACGCCACTCATAGGAATGCCAAAACCTTCGCAAATGCGCTTGGGGTGTACTCTGAGAAAGAAATCCCCACCACCATCACCTGCTCATCCTACCAGAAAAGCGGTTGGCCAACACTCGTCCCATCCATCCTTAAAAGAACCGCGCTCAACGACATGGGGCAGCGCTCACTAACCTACGCAGGCTGTCAGGGACTCACCACCCCAAAAGTGCAGATAGTTCTTGACAACGCCACACCACTATGCTCTGACAAGGTCATGTACACCGCACTATCTAGAGCGGTGGACCAAATTCACTTCTTCAACACTGGCCCAAATCACACTGACTACTGGGAAAAAATGAACGCCACACCTTTCCTCAAAACTTTCATCGACCACACACGTGAGGAGACCTTTGCTGAACACCAACCTGCCGAACCCACAGTGCGCGAGTACGCACCAACAACGCATTTCCCACCGGCTAACGAGAACCTAGCACTGGAGCCGTGGGTCGAACCGCTGACTGATAAACACTCGCGGGAACTCTTCCACCCTTCCTTAGGCCACAGCAACTGCGTCCAGACTGAAAACACCGTAGTCCAACTCTTCCCCCACCAACAGGCCAAAGACGAAACGCTCTTCTGGAAAACAATAGATGCCAGAATCAAGATAACCACCCCGGAAGAGAACATCAGGGCTTGCAACATGGCCACTGACATTGGCGACATCTTGTTCCTAAATTACAAAGAAGCCATGGGGTTACCACAAGACCCCTTACCCTTCGAACAAGCACTCTGGGACTCTTGTCAAGCCGAGGTGCAACTAACCTACCTCAGCAAACCTCTGGCAGCACTCGCAAATGCCGCCCAAAGACAAGACCCCGACTTTGACTCCAACAAAATCCAACTCTTCCTGAAATCACAATGGGTCAAGAAAGTCGAGAAGCTGGGTTGCCTTAAGATCAAACCCGGCCAAACTATTGCGTCCTTCATGCAACAGACTGTCATGCTATACGGAACCATGGCTCGGTACATGCGCCGCATCCGCACCTCACTCTGCCCACCCGAAATTATGATCAACTGCGAGACCAACCCAAACCAAATCGGAACATGGGTGCGTGAGTATTGGAACTTCAACACCCAGAGCCATGAGAATGACTTTGAAGCGTTCGACCAGTCCCAAGACGCCAACATGTTACAATTTGAGCTCATTAAGGCCAAATACCACTCCATCCCCGAGGAGATTATCGCCGGGTATCGACACCTGAAATGCAACGCTCACATCTTCCTTGGGACTATATCGATCATGAGGTTGTCTGGTGAAGGGCCGACCTTCGACGCCAACACAGAGTGTTCCATTGCATACAACCACACAAGGTATTTTGTGCCGAAAGGCACCGCCCAGCTCTACGCCGGAGACGACTCTGCATGCGCGTCGCCCCTCTCTGAAAAACCCAGCTTCCAACATATCTCACCAGAGCTCAGCCTCAAGTCTAAGGCCAAAATTAGAACCCAACAGAAAGGAGACTTTGCAACCTTCTGTGGCTGGCTCATCACTCCAAAAGGCTTGATCAAAAACCCCACCCAGCTTTACGCCTCCTGGTTATTGGCTAAGCACAACAAAGATCTCGCGGACGTGGCCAGAAACTATGCCTTGGACTTACGCATTGCCTATCAACTTAAAGACGAGCTCTATGAGTTATTATCACCTGAAGAACTTGACCACCACCAACTGCTCGTCCGAGAGATGATCAAGCACAAAATGGGCCATCTCCTCA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9,625
OQ418493.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA6
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus x limon
null
2022-03
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA6, complete genome
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9,626
OQ418494.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA8
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus x limon
null
2022-03
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA8, complete genome
GAAAAGCAAACATAACCAATACACACCCAAAATTGTGATCATCGTCTCTGCATCAACAGCTCAGCTAAGAACCAGAGAAATGGCCACTATTAGGGGTGCCATCGAACGCATTACAGACACCACCGTACGCACCACACTTCAAGAGGAGGCATGCCGCCAAATACGCGCTGAACTTAAAAACATCGAACACATCAACCGTTACGCTATACAGCCTGACGCCGCCGACGCACTCGAACACCTAGGTATTGGCTCTAACCCCTTCTCTGTGGCACTGCACACGCACGGTGCCTGCAAAGCGATTGAGAACCAATTACTCTATGTAGTTGGTACCTTACTCCCAAAAGAACGTGTCACCATGCTCTTCCTTAAGAAAAGCAAGCTCAACATCATGAAACGCTGCCCTAAATTTCAAGACATCTTCCTGAACCAACACATAGAACCACGTGACGTTTCTAGGTACTGCGACTTTAACGTCCAATCCACCTCCACCAGCATACCCACACGAACGGCTTACATCAGTGACACACTCCACTTCATGGACCGTAGAGACCTAGTCAGACTATTTCTAAACAGCCCAAATCTAGAGACTCTCTACGCCACCATTATCCTCCCAGTCGAGGCTGCTTACAGACAACCAAGCCGCTACCCAGAGATATACCAGATTAACTATGACTTCGACGGCTTCCAGTACATACCTGGGGGCCATGGGGGCGGCGCCTACCACCACGAGTTCGAACAGCTGCAATGGCTAGACACTGGCCATATCCACTGGCGTGGGCCCGACTGTAAAGAGATTCGCATGACAATTACCGCCCAAATGCTCGAAAGCTTAGGTGCGAATCATCTTTTCTGCTTCAAACGTGGGAAACTACTCACCCCACGTGTACGCACTTTCGGCCGAGATACCCAAGTGCTCTTGCCCAAAATCTTCCGCCCGGCTGACAAAAACTTTAACAGGGCAATACCACTAACCCTAGCTAACAAACTACTCCTGTACACTAAATCCATTAACACAGTGACCTTCCGCGACGTCGTTGCCAAGACACGCCAACTTATGAAGGACAAGGAGCTTGAAACATACACCGGCAACGACCTGTTGCATATGGCCAACTATTTCTTCGCTGTTGGAGCACTGTCAGGAGTTAACTCCTATGACCAACTGCTTGGCCTATCCGCCTGGGAAGCCTGCACTGTCCGTATCAAGAACACCATAACAAATCTCTGGGAAAAGATCGCCGGAAAGAAAGAGTTCGGCAAGCTATTGGAGGCCCTTGAGTGGGAAACATTCACGTACTCACGCCAAGTGACCGAATTCACCGTTACGGGACTACCCGCCCTGCTCCCCCTCCCAGACATCTCAGACCAAGAAGAGATTTTCGCCCAGCAGGATGAGTTAGACAAAATCACTGCCGGCGCCACCAAGATACGAACCATTGACATTATGCGGGGACAAGCTAACCGCGCTAACCCAAAAACTCCGATCCACCCAACACCGGCCCAGGGACCCCAACTGCCCGACACCCGCAATCCAATCGACCAAGTCGCCTCTAAAGAGCTCGTCACCAAGCTTCAGAAAAACAAACGCATTTACATCCAAGACGACGGGCCGGAATACCTTATGGGACACATGGCTGAAGTCCCCGCCTGGTATCTTGAACAAGACGATACCACCACTAGACTCAAAAACCGCTGCGCTTGGTTCTTCGGCCCGCCCACCTACAGATACGGGCATAACGACATCGAGTACACCACCATAGAATACTACCCCTGGGTCGAGCGTATTGGAGCCATTTTCGGCAAGTACAACACCTGTCTCGCTCAAACTTACGACGCCGGAGCTCGTATCGGATACCACGCTGACGACGAAGACTGCTACGACCCTGACGTCACCGTGGTCACCGTCAACCTCACTGGGAACGCCACCTTCCTGCTCAAGACCCCAACTGGCACTAGGACCTGGAAACTTAAACCTGGTGACTTCATTATCATGAAACCCGGTGCCCAAAGGTGCACAAAACATGCCATTAGAGATTGCACGACTAACCGCACATCCCTAACCTTTAGATGGCAGGCGCGCACTTGCCCCACTAACCTCAGAAAGATCACTAACTTACCCAAAGCCACCAACCAACCCCAAACCACTGAATGGCGTCCTGTAACTAAACTACGCCCTAGCACCACCGCTTCCAGTGACACCCAGACCCCACTTGCCACAGACCAGGAACAAGGGTATACCACCACCTCCGACGTGACACCAACGATTAGGCTGCCCGCCGAAAATGGTAATAACGCCGGAGCTGGACCCTCCTCCGCATTAACTCTCGCCGACCTCAATGATAACCAAGCGCCGACCACTAACAAAGGGAAAGAGAAACTTGAGGAAATGGTTGAAACTGGCCCAACTATCATGGAACGCTTCCTCAACACCATTCAGGAACCAACACAAGATTTATGGGACTCCACCTCTGAATCCGCTGCGAGCTACCTCGCTGAAGGTCTCGGTATCTCTGCCATCCAAGCACTCCCTTGGGCACCTCACTTAGAACTTATCAATGCATTAGGCTTCCAGGGCACTGAAAGGCAATACGGCCCAGACAACTGTCTCATATGGCCCATCACGCATTACAGAGAATTGCCCAGAAGCAACAATGTCGAAGCCCCTCCGGAAGTGCTTGAGCTGCTCGACTGCATCAACAGATACCCCACTGACGTCCCAATGCTCAAAACTCGAGCCGCCGCCTTCGGTTCAGACGTCAAGAATCTACGTATAGGAGCACTTGTTAAGAACCAGGACAAACAGTGGCGCGCATCACTCGCACTACTTTGTGAGGAAAATGAACACCTCCTCCCTACCACTGTAATACACGGCGCTGGTGGCTCCGGGAAATCCCATTTACTCCAACAGTGGGTGGCGTCTACTGAGCGTGGAAATGTAGTCACCATCTTGCCCACTATCGAACTTCTTCGAGATTGGCAGAACAAATGTCCACATGCACCGAAAGAGACTTTCAAAACCTTCGAGAAAGCGCTCATCCAGAATAGCGCCCCTGTGGTCATCATGGACGACTACTCCAAACTTCCTCCAGGGTATATTGAAGCCTACGTCAGCCTCAAGGGCCAGTGCAAACTTCTCATACTCACCGGAGACCCTAGACAAAGCCACTACCATGAGGAGAACCCTGAGGCCTTAATCTCCACTCTCGACCCCGCCACGGACTACTTTGGCAAATTTTGTGCGTACAACATCAACGCCACTCATAGGAATGCCAAAACCTTCGCAAATGCGCTTGGGGTGTACTCTGAGAAAGAAATCCCCACCACCATCACCTGCTCATCCTACCAGAAAAGCGGTTGGCCAACACTCGTCCCATCCATCCTTAAAAGAACCGCGCTCAACGACATGGGGCAGCGCTCACTAACCTACGCAGGCTGTCAGGGACTCACCACCCCAAAAGTGCAGATAGTTCTTGACAACGCCACACCACTATGCTCTGACAAGGTCATGTACACCGCACTATCTAGAGCGGTGGACCAAATTCACTTCTTCAACACTGGCCCAAATCACACTGACTACTGGGAAAAAATGAACGCCACACCTTTCCTCAAAACTTTCATCGACCACACACGTGAGGAGACCTTTGCTGAACACCAACCTGCTGAACCCACAGTGCGCGAGTACGCACCAACAACGCATTTCCCACCGGCTAACGAGAACCTAGCACTGGAGCCGTGGGTCGAACCGCTGACTGATAAACACTCGCGGGAACTCTTCCACCCTGCCTTAGGCCACAGCAACTGCGTCCAGACTGAAAACACCGTAGTCCAACTCTTCCCCCACCAACAGGCCAAAGACGAAACGCTCTTCTGGAAAACAATAGATGCCAGAATCAAGATAACCACCCCGGAAGAGAACATCAGGGCTTGCAACATGGCCACTGACATTGGCGACATCTTGTTCCTAAATTACAAAGAAGCCATGGGGTTACCACAAGACCCCATACCCTTCGAACAAGCACTCTGGGACTCTTGTCAAGCCGAGGTGCAACTAACCTACCTCAGCAAACCTCTGGCAGCACTCGCAAATGCCGCCCAAAGACAAGACCCCGACTTTGACTCCAACAAAATCCAACTCTTCCTGAAATCACAATGGGTCAAGAAAGTCGAGAAGATGGGCTGCCTTAAGATCAAACCCGGCCAAACTATTGCGTCCTTCATGCAACAGACTGTCATGCTATACGGAACCATGGCTCGGTACATGCGCCGCATCCGCACCTCACTCTGCCCACCCGAAATTATGATCAACTGCGAGACCAACCCAAACCAAATCGGAACATGGGTGCGTGAGTATTGGAACTTCAACACCCAGAGCCATGAGAATGACTTTGAAGCGTTCGACCAGTCCCAAGACGCCAACATGTTACAATTTGAGCTCATTAAGGCCAAATACCACTCCATCCCCGAGGAGATTATCGCCGGGTATCGACACCTGAAATGCAACGCTCACATCTTCCTTGGGACTATATCGATCATGAGGTTGTCTGGTGAAGGGCCGACCTTCGACGCCAACACAGAGTGTTCCATTGCATACAACCACACAAGGTATTTTGTGCCGAAAGGCACCGCCCAGCTCTACGCCGGAGACGACTCTGCATGCGCGTCGCCCCTCTCTGAAAAACCCAGCTTCCAACATATCTCACCAGAGCTCAGCCTCAAGTCTAAGGCAAAAATTAGAACCCAACAGAAAGGAGACTTTGCAACCTTCTGTGGCTGGCTCATCACTCCAAAAGGCCTGATCAAAAACCCCACCCAGCTTTACGCCTCCTGGTTATTGGCTAAGCACAACAAAGATCTCGCGGACGTGGCCAGAAACTATGCCTTGGACTTACGCATTGCCTATCAACTTAAAGACGAGCTCTATGAGTTATTATCACCTGAAGAACTTGACCACCACCAACTGCTCGTCCGAGAGATGATCAAGCACAAAATGGGCCATCTCCTCA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9,627
OQ418495.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA9
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
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USA: California
USA
Citrus
null
2022-03
null
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Citrus yellow vein clearing virus isolate CA9, complete genome
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9,628
OQ418496.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA10
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus x paradisi
null
2022-03
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA10, complete genome
GAAAAGCAAACATAACCAATACACACCCAAAATTGTGATCATCGTCTCTGCATCAACAGCTCAGCTAAGAACCAGAGAAATGGCCACTATTAGGGGTGCCATCGAACGCATTACAGACACCACCGTACGCACCACACTTCAAGAGGAGGCATGCCGCCAAATACGCGCTGAACTTAAAAACATCGAACACATCAACCGTTACGCTATACAGCCTGACGCCGCCGACGCACTCGAACACCTAGGTATTGGCTCTAACCCCTTCTCTGTGGCACTGCACACGCACGGTGCCTGCAAAGCGATTGAGAACCAATTACTCTATGTAGTTGGTACCTTACTCCCAAAAGAGCGTGTCACCATGCTCTTCCTTAAGAAAAGCAAGCTCAACATCATGAAACGCTGCCCTAAATTTCAAGACATCTTCCTGAACCAACACATAGAACCACGTGACGTTTCTAGGTACTGCGACTTTAACGTCCAATCCACCTCCACCAGCATACCCACGCGAACGGCTTACATCAGTGACACACTCCACTTCATGGACCGTAGAGACTTAGTCAGACTATTTCTAAACAGCCCAAATCTAGAGACTCTCTACGCCACCATTATCCTCCCAGTCGAGGCTGCTTACAGACAACCAAGCCGCTACCCAGAGATATACCAGATTAACTATGACTTCGACGGCTTCCAGTACATACCTGGGGGCCATGGGGGCGGCGCCTACCACCACGAGTTCGAACAGCTGCAATGGCTAGACACTGGCCATATCCACTGGCGTGGGCCCGACTGTAAAGAGATTCGCATGACAATTACCGCCCAAATGCTCGAAAGCTTAGGTGCGAATCATCTTTTCTGCTTCAAACGTGGGAAACTACTCACCCCACGTGTACGCACTTTCGGCCGAGATACCCAAGTGCTCTTGCCCAAAATCTTCCGCCCGGCTGACAAAAACTTTAACAGGGCAATACCACTAACCCTAGCTAACAAACTACTCCTGTACACTAAATCCATTAACACAGTGACCTTCCGCGACGTCGTTGCCAAGACACGCCAACTTATGAAGGACAAGGAGCTTGAAACATACACCGGCAACGACCTGTTGCATATGGCCAACTATTTCTTCGCTGTTGGAGCATTGTCAGGAGTTAACTCCTATGACCAACTGCTTGGCCTATCCGCCTGGGAAGCCTGCACTGTCCGTATCAAGAACACCATAACAAATCTCTGGGAAAAGATCGCCGGAAAGAAAGAGTTCGGCAAGCTATTGGAGGCCCTTGAATGGGAAACATTCACGTACTCACGCCAAGTGACCGAATTCACCGTTACGGGACTACCCGCCCTGCTCCCCCTCCCAGACATCTCAGACCAAGAAGAGATTTTCGCCCAGCAGGACGAGTTAGACAAAATCACTGCCGGCGCCACCAAGATACGAACCATTGACATTATGCGGGGACAAGCTAACCGCGCTAACCCAAAAACTCCGATCCACCCAACACCGGCCCAGGGACCCCAACTGCCCGACACCCGCAATCCAATCGACCAAGTCGCCTCTAAAGAGCTCGTCACCAAGCTTCAGAAAAACAAACGCATTTACATCCAAGACGACGGGCCGGAATACCTTATGGGACACATGGCTGAAGTCCCCGCCTGGTATCTTGAACAAGACGATACCACCACTAGACTCAAAAACCGCTGCGCTTGGTTCTTCGGCCCGCCCACCTACAGATACGGGCATAACGACATCGAGTACACCACCATAGAATACTACCCCTGGGTCGAGCGTATTGGAGCCATCTTCGGCAAGTACAACACCTGCCTCGCTCAAACTTACGACGCCGGAGCTCGTATCGGATACCACGCTGACGACGAAGACTGCTACGACCCTGACGTCACCGTGGTCACCGTCAACCTCACTGGGAACGCCACCTTCCTGCTCAAGACCCCAACTGGCACTAGGACCTGGAAACTTAAACCTGGCGACTTCATTATCATGAAACCCGGTGCCCAAAGGTGCACAAAACATGCCATTAGAGATTGCACGACTAACCGCACATCCTTAACCTTTAGATGGCAGGCGCGCACTTGCCCCACTAACCTCAGAAAGATCACTAACTTACCCAAAGCCACCAACCAACCCCAAACCACTGAATGGCGTCCTGTAACTAAACCACGCCCTAGCACCACCGCTTCCAGTGACACCCAGACCCCACTTGCCACAGACCAGGAACAAGGGTATACCACCACCCCCGACGTGACACCAACGATTAGGCTGCCCGCCGAAAATGGTAATAACGCCGGAGCTGGACCCTCCTCCGCATTAACTCTCGCCGACCTCAATGATAACCAAGCGCCGACCACTCACAAAGGGAAAGAGAAACTTGAGGAAATGGTCGAAACTGGCCCAACTATCATGGAACGCTTCCTCAACACCGTTCAGGAACCAACACAAGATTTATGGGACTCCACCTCTGAATCCGCTGCGAGCTACCTCGCTGAAGGTCTCGGTATCTCTGCCATCCAAGCACTCCCTTGGGCACCTCACTTAGAACTTATTAATGCATTAGGCTTCCAGGGCACTGAAAGGCAATACGGCCCAGACAACTGTCTCATATGGCCCATCACGCATTACAGAGAATTGCCCAGAAGCAACAATGTCGAAGCCCCTCCGGAAGTGCTTGAGCTGCTCGACTGCATCAATAGATACCCCACTGACGTCCCAATGCTCAAAACTCGAGCCGCCGCCTTCGGTTCAGACGTCAAGAATCTACGTATAGGAGCACTTGTTAAGAACCAGGACAAACAGTGGCGCGCATCACTCGCACTACTTTGCGAGGAAAATGAACACCTCCTCCCTACCACTGTAATACACGGCGCTGGTGGCTCCGGGAAATCCCATTTACTCCAACAGTGGGTGGCATCTACTGAGCGTGGAAATGTAGTCACCATCTTGCCCACTATCGAACTTCTTCGAGATTGGCAGAACAAATGTCCACATGCACCGAAAGAGACTTTCAAAACCTTCGAGAAAGCGCTCATCCAGAATAGCGCCCCTGTGGTCATCATGGACGACTACTCCAAACTTCCTCCAGGGTATATTGAAGCCTACGTCAGCCTCAAGGGCCAGTGCAAACTTCTCATACTCACCGGAGACCCTAGACAAAGCCACTACCATGAGGAGAACCCTGAGGCCTTAATCTCCACTCTCGACCCCGCCACGGACTACTTTGGCAAATTTTGTGCGTACAACATCAACGCCACTCATAGGAATGCCAAAACCTTCGCAAATGCGCTTGGGGTGTACTCTGAGAAAGAAATCCCCACCACCATCACCTGCTCATCCTACCAGAAAAGCGGTTGGCCAACACTCGTCCCATCCATCCTTAAAAGAACCGCGCTCAACGACATGGGGCAGCGCTCACTAACCTACGCAGGCTGTCAGGGACTCACCACCCCAAAAGTGCAGATAGTTCTTGACAACGCCACACCACTATGCTCTGACAAGGTCATGTACACCGCACTATCTAGAGCGGTGGACCAAATTCACTTCTTCAACACTGGCCCAAATCATACTGACTACTGGGAAAAAATGAACGCCACACCTTTCCTCAAAACTTTCATCGACCACACACGTGAGGAGACCTTTGCTGAACACCAACCTGCCGAACCCACAGTGCGCGAGTACGCACCAACAACGCATTTCCCACCGGCTAACGAGAACCTAGCACTGGAGCCGTGGGTCGAACCGCTGACTGATAAACACTCGCGGGAACTCTTCCACCCTGCCTTAGGCCACAGCAACTGCGTCCAGACTGAAAACACCGTAGTCCAACTCTTCCCCCACCAACAGGCCAAAGACGAAACGCTCTTCTGGAAAACAATAGATGCCAGAATCAAGATAACCACCCCGGAAGAGAACATCAGGGCTTGCAACATGGCCACTGACATTGGCGACATCTTGTTCCTAAATTACAAAGAAGCCATGGGGTTACCACAAGACCCCTTACCCTTCGAACAAGCACTCTGGGACTCTTGTCAAGCCGAGGTGCAACTAACCTACCTCAGCAAACCTCTGGCAGCACTCGCAAATGCCGCCCAAAGACAAGACCCCGACTTTGACTCCAACAAAATCCAACTCTTCCTGAAGTCACAATGGGTCAAGAAGGTCGAGAAGCTGGGTTGCCTTAAGATCAAACCCGGCCAAACTATTGCGTCCTTCATGCAACAGACTGTCATGCTATACGGAACCATGGCTCGGTACATGCGCCGCATCCGCACCTCACTCTGCCCACCCGAAATTATGATCAACTGCGAGACCAACCCAAACCAAATCGGAACATGGGTGCGTGAGTATTGGAACTTCAACACCCAGAGCCATGAGAATGACTTTGAAGCGTTCGACCAGTCCCAAGACGCCAACATGTTACAATTTGAGCTCATTAAGGCCAAATACCACTCCATCCCCGAGGAGATTATCGCCGGGTATCGACACCTGAAATGCAACGCTCACATCTTCCTTGGGACTATATCGATCATGAGGTTGTCTGGTGAAGGGCCGACCTTCGACGCCAACACAGAGTGTTCCATTGCATACAACCACACAAGGTATTTTGTGCCAAAAGGCACCGCCCAGCTCTACGCCGGAGACGACTCTGCATGCGCGTCGCCCCTCTCTGAAAAACCCAGCTTCCAACATATCTCACCAGAGCTCAGCCTCAAGTCTAAGGCCAAAATTAGAACCCAACAGAAAGGAGACTTTGCAACCTTCTGTGGCTGGCTCATCACTCCAAAAGGCTTGATCAAAAACCCCACCCAGCTTTACGCCTCCTGGTTATTGGCTAAGCACAACAAAGATCTCGCGGACGTGGCCAGAAACTATGCCTTGGACTTACGCATTGCCTATCAACTTAAAGACGAGCTCTATGAGTTATTATCACCTGAAGAACTTGACCACCACCAACTGCTCGTCCGAGAGATGATCAAGCACAAAATGGGCCATCTCCTCA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9,629
OQ418497.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA12
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus japonica
null
2022-03
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA12, complete genome
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9,630
OQ418498.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA13
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus japonica
null
2022-03
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA13, complete genome
GAAAAGCAAACATAACCAATACACACCCAAAATTGTGATCATCGTCTCTGCATCAACAGCTCAGCTAAGAACCAGAGAAATGGCCACTATTAGGGGTGCCATCGAACGCATTACAGACACCACCGTACGCACCACACTTCAAGAGGAGGCATGCCGCCAAATACGCGCTGAACTTAAAAACATCGAACACATCAACCGTTACGCTATACAGCCTGACGCCGCCGACGCACTCGAACACCTAGGTATTGGCTCTAACCCCTTCTCTGTGGCACTGCACACGCACGGTGCCTGCAAAGCGATTGAGAACCAATTACTCTATGTAGTTGGTACCTTACTCCCAAAAGAACGTGTCACCATGCTCTTCCTTAAGAAAAGCAAGCTCAACATCATGAAACGCTGCCCTAAATTTCAAGACATCTTCCTGAACCAACACATAGAACCACGTGACGTTTCTAGGTACTGCGACTTTAACGTCCAATCCACCTCCACCAGCATACCCACACGAACGGCTTACATCAGTGACACACTCCACTTCATGGACCGTAGAGACCTAGTCAGACTATTTCTAAACAGCCCAAATCTAGAGACTCTCTACGCCACCATTATCCTCCCAGTCGAGGCTGCTTACAGACAACCAAGCCGCTACCCAGAGATATACCAGATTAACTATGACTTCGACGGCTTCCAGTACATACCTGGGGGCCATGGGGGCGGCGCCTACCACCACGAGTTCGAACAGCTGCAATGGCTAGACACTGGCCATATCCACTGGCGTGGGCCCGACTGTAAAGAGATTCGCATGACAATTACCGCCCAAATGCTCGAAAGCTTAGGTGCGAATCATCTTTTCTGCTTCAAACGTGGGAAACTACTCACCCCACGTGTACGCACTTTCGGCCGAGATACCCAAGTGCTCTTGCCCAAAATCTTCCGCCCGGCTGACAAAAACTTTAACAGGGCAATACCACTAACCCTAGCTAACAAACTACTCCTGTACACTAAGTCCATTAACACAGTGACCTTCCGCGACGTCGTTGCCAAGACACGCCAACTTATGAAGGACAAGGAGCTCGAAACATACACCGGCAACGACCTGTTGCATATGGCCAACTATTTCTTCGCTGTTGGAGCATTGTCAGGAGTTAACTCCTATGACCAACTGCTTGGCCTATCCGCCTGGGAAGCCTGCACTGTCCGTATCAAGAACACCATAACAAATCTCTGGGAAAAGATCGCCGGAAAGAAAGAGTTCGGCAAGCTATTGGAGGCCCTTGAATGGGAAACATTCACGTACTCACGCCAAGTGACCGAATTCACCGTTACGGGACTACCCGCCCTGCTCCCCCTCCCAGACATCTCAGACCAAGAAGAGATTTTCGCCCAGCAGGATGAGTTAGACAAAATCACTGCCGGCGCCACCAAGATACGAACCATTGACATTATGCGGGGACAAGCTAACCGCGCTAACCCAAAAACTCCGATCCACCCAACACCGGCCCAGGGACCCCAACTGCCCGACACCCGCAACCCAATCGACCAAGTCGCCTCTAAAGAGCTCGTCACCAAGCTTCAGAAAAACAAACGCATTTACATCCAAGACGACGGGCCGGAATACCTTATGGGACACATGGCTGAAGTCCCCGCCTGGTATCTTGAACAAGACGATACCACCACTAGACTCAAAAACCGCTGCGCTTGGTTCTTCGGCCCGCCCACCTACAGATACGGGCATAACGACATCGAGTACACCACCATAGAATACTACCCCTGGGTCGAGCGTATTGGAGCCATTTTCGGCAAGTACAACACCTGTCTCGCTCAAACTTACGACGCCGGAGCTCGTATCGGATACCACGCTGACGACGAAGACTGCTACGACCCTGACGTCACCGTGGTCACCGTCAACCTCACTGGGAACGCCACCTTCCTGCTCAAGACCCCAACTGGCACTAGGACCTGGAAACTTAAACCTGGCGACTTCATTATCATGAAACCCGGTGCCCAAAGGTGCACAAAACATGCCATTAGAGATTGCACGACTAACCGCACATCCCTAACCTTTAGATGGCAGGCGCGCACTTGCCCCACTAACCTCAGAAAGATCACTAACTTACCCAAAGCCACCAACCAACCCCAAACCACTGAATGGCGTCCTGTAACTAAACTACGCCCTAGCACCACCGCTTCCAGTGACACCCAGACCCCACTTGCCACAGACCAGGAACAAGGGTATACCACCACCTCCGACGTGACACCAACGATTAGGCTGCCCGCCGAAAATGGTAATAACGCCGGAGCTGGACCCTCCTCCGCATTAACTCTCGCCGACCTCAATGATAACCAAGCGCCGACCACTCACAAAGGGAAAGAGAAACTTGAGGAAATGGTCGAAACTGGCCCAACTATCATGGAACGCTTCCTCAACACCGTTCAGGAACCAACACAAGATTTATGGGACTCCACCTCTGAATCCGCTGCGAGCTACCTCGCTGAAGGTCTCGGTATCTCTGCCATCCAAGCACTCCCTTGGGCACCTCACTTAGAACTTACCAATGCATTAGGCTTCCAAGGCACTGAAAGGCAATACGGCCCAGACAACTGTCTCATATGGCCCATCACGCATTACAGAGAATTGCCCAGAAGCAACAATGTCGAAGCCCCTCCGGAAGTGCTTGAGCTGCTCGACTGCATCAACAGATACCCCACTGATGTCCCAATGCTCAAAACTCGAGCCGCCGCCTTCGGTTCAGACGTCAAGAATCTACGTATAGGAGCACTTGTTAAGAACCAGGACAAACAGTGGCGCGCATCACTCGCACTACTTTGTGAGGAAAATGAACACCTCCTCCCTACCACTGTAATACACGGCGCTGGTGGCTCCGGGAAATCCCATTTACTCCAACAGTGGGTGGCGTCTACTGAGCGTGGAAATGTAGTCACCATCTTGCCCACTATCGAACTTCTTCGAGATTGGCAGAACAAATGTCCACATGCACCGAAAGAGACTTTCAAAACCTTCGAGAAAGCGCTCATCCAGAATAGCGCCCCTGTGGTCATCATGGACGACTACTCCAAACTTCCTCCAGGGTATATTGAAGCCTACGTCAGCCTCAAGGGCCAGTGCAAACTTCTCATACTCACCGGAGACCCTAGACAAAGCCACTACCATGAGGAGAACCCTGAGGCCTTAATCTCCACTCTCGACCCCGCCACGGACTACTTTGGCAAATTTTGTGCGTACAACATCAACGCCACTCATAGGAATGCCAAAACCTTCGCAAATGCGCTTGGGGTGTACTCTGAGAAAGAAATCCCCACCACCATCACCTGCTCATCCTACCAGAAAAGCGGTTGGCCAACACTCGTCCCATCCATCCTTAAAAGAACCGCGCTCAACGACATGGGGCAGCGCTCACTAACCTACGCAGGCTGTCAGGGACTCACCACCCCAAAAGTGCAGATAGTTCTTGACAACGCCACACCACTATGCTCTGACAAGGTCATGTACACCGCACTATCTAGAGCGGTGGACCAAATTCACTTCTTCAACACTGGCCCAAATCACACTGACTACTGGGAAAAAATGAACGCCACACCTTTCCTCAAAACTTTCATCGACCACACACGAGAGGAGACCTTTGCTGAACACCAACCTGCTGAACCCACAGTGCGCGAGTACGCACCAACAACGCATTTCCCACCGGCTAACGAGAACCTAGCACTGGAGCCGTGGGTCGAACCGCTGACTGATAAACACTCGCGGGAACTCTTCCACCCTGCCTTAGGCCACAGCAACTGCGTCCAGACTGAAAACACCGTAGTCCAACTCTTCCCCCACCAACAGGCCAAAGACGAAACGCTCTTCTGGAAAACAATAGATGCCAGAATCAAGATAACCACCCCGGAAGAGAACATCAGGGCTTGCAACATGGCCACTGACATTGGCGACATCTTGTTCCTAAATTACAAAGAAGCCATGGGGTTACCACAAGACCCCTTACCCTTCGAACAAGCACTCTGGGACTCTTGTCAAGCCGAGGTGCAACTAACCTACCTCAGCAAACCTCTGGCAGCACTCGCAAATGCCGCCCAAAGACAAGACCCCGACTTTGACTCCAACAAAATCCAACTCTTCCTGAAGTCACAATGGGTCAAGAAGGTCGAGAAGCTGGGTTGCCTTAAGATCAAACCCGGCCAAACTATTGCGTCCTTCATGCAACAGACTGTCATGCTATACGGAACCATGGCTCGGTACATGCGCCGCATCCGCACCTCACTCTGCCCACCCGAAATTATGATCAACTGCGAGACCAACCCAAACCAAATCGGAACATGGGTGCGTGAGTATTGGAACTTCAACACCCAGAGCCATGAGAATGACTTTGAAGCGTTCGACCAGTCCCAAGACGCCAACATGTTACAATTTGAGCTCATTAAGGCCAAATACCACTCCATCCCCGAGGAGATTATCGCCGGGTATCGACACCTGAAATGCAACGCTCACATCTTCCTTGGGACCATATCGATCATGAGGTTGTCTGGTGAAGGGCCGACCTTCGACGCCAACACAGAGTGTTCCATTGCATACAACCACACAAGGTATTTTGTGCCGAAAGGCACCGCCCAGCTCTACGCCGGAGACGACTCTGCATGCGCGTCGCCCCTCTCTGAAAAACCCAGCTTCCAACATATCTCACCAGAGCTCAGCCTCAAGTCTAAGGCCAAAATTAGAACCCAACAGAAAGGAGACTTTGCAACCTTCTGTGGCTGGCTCATCACTCCAAAAGGCCTGATCAAAAACCCCACCCAGCTTTACGCCTCCTGGTTATTGGCTAAGCACAACAAAGATCTCGCGGACGTGGCCAGAAACTATGCCTTGGACTTACGCATTGCCTATCAACTTAAAGACGAGCTCTATGAGTTATTATCACCTGAAGAACTTGACCACCACCAACTGCTCGTCCGAGAGATGATCAAGCACAAAATGGGCCATCTCCTCA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9,631
OQ418499.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA14
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus sinensis
null
2022-06
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA14, complete genome
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9,632
OQ418500.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA15
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus x limon
null
2022-06
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA15, complete genome
GAAAAGCAAACATAACCAACACACACCCAAAATTGTGATCATCGTCTCTGCATCAACAGCTCAGCTAAGAACCAGAGAAATGGCCACTATTAGGGGTGCCATCGAACGCATTACAGACACCACCGTACGCACTACACTTCAAGAGGAGGCATGCCGCCAAATACGCGCTGAACTTAAAAACGTCGAACACATCAACCGTTACGCTATACAGCCTGACGCCGCCGACGCACTCGAACACCTAGGCATTGGATCTAACCCCTTCTCTGTGGCACTGCACACGCACGGTGCCTGTAAAGCGATCGAGAACCAATTACTCTATGTAGTTGGTACCCTACTCCCAAAAGAACGTGTCACCATGCTCTTCCTTAAGAAAAGCAAACTCAACATCATGAAACGCTGCCCTAAATTCCAAGACATCTTCCTGAACCAACATATCGAGCCACGTGACGTTTCTAGGTACTGCGACTTTAACGTCCAATCCACTTCCACCAGCATACCCACAAGAACGGCTTACATCAGTGACACACTCCACTTCATGGACCGTAGAGATCTAGTCCGACTATTTCTAAACAGCCCAAATCTAGAGACTCTCTACGCCACCATTGTCCTCCCAGTCGAAGCTGCCTACAAACAACCGAGCCGCTACCCAGAGATATACCAGATTAACTACGACTTCGACGGCTTTCAGTACATACCTGGAGGCCATGGGGGCGGCGCCTACCACCACGAGTTCGAACAGCTGCAATGGTTAGACACTGGCCATATCCACTGGCGTGGGCCCGACTGTAAAGAGATTCGCATGACAATTACCGCCCAAATGCTCGAAAGCTTAGGTGCGAATCATCTTTTCTGCTTCAAACGTGGGAAACTACTCACCCCACGTGTACGCACTTTCGGCCGAGATACCCAAGTGCTCTTGCCCAAAATCTTCCGCCCGGCCGACAAAAACTTTAACAGGGCAATACCACTAACCCTAGCTAACAAACTACTCCTGTACGCTAAATCCATTAACACAGTGACCTTCCGCGACGTCGTTGCCAAGACACGCCAACTTATGAAGGACAAGGAGCTGGAAACATACACCGGCAACGACCTGTTGCATATGGCCAACTATTTCTTCGCTGTTGGAGCACTGTCAGGAGTTAACTCCTATGACCAACTGCTTGGCTTATCCGCCTGGGAAGCCTGCACTGTCCGTATCAAGAACACCATAACAAATCTCTGGGAAAAGATCGCCGGAAAGAAAGAGTTCGGCAAGTTATTGGAGGCCCTCGAGTGGGAAACATTCACGTACTCACGCCAAGTGACCGAATTCACCGTCACGGGACTGCCTGCCCTGCTCCCCCTCCCAGACATCTCAGACCAAGAAGAGATTTTCGCCCAGCAGGACGAGTTAGACAAAATCACGGCCGGCGCTACCAAGATACGGACTATTGACATTATGCGGGGACAAGCTAACCGCGCTAACCCAAAAACTCCGATCAACTCAACACCGGCCCAGGAACCCCAACTGCCCGATACCCGCAATCCAATTGACCAAGCTGCCTCCAAAGAGCTCGTCACCAAGCTTCAGAAAAACAAACGCATTTACATCCAAGACGACGGGCCGGAATACCTTATGGGACACATGGCCGAAGTCCCCGCCTGGTATCTTGAACAAGATGATACCACCACTAGACTTAAAAACCGCTGCGCTTGGTTCTTCGGCCCACCCACCTACAGATATGGGCACAACGACATTGAGTACACCACCGTAGAGTACTACCCTTGGGTCGAGCGCATCGGAGCCATTTTCGGCAAGTACAACACCTGTCTCGCTCAAACTTACGACGCCGGGGCTCGTATCGGATACCACGCTGACGACGAAGACTGCTACGACCCCGACGTCACCGTGGTCACCGTCAACCTCACTGGGAACGCCACCTTCCTGCTCAAGACCCCAACCGGCACTAGGACCTGGAAACTTAAACCCGGTGACTTCATTATCATGAAGCCCGGTGCCCAAAGGTGTACAAAACATGCCATTAGAGATTGCACGACTAACCGCACATCCTTAACCTTTAGATGGCAGGCGCGCACCTGCCCCACCAACCTCAGAAAGATCACTAACCTACCCAAAGCCACCAACCAACCCCAAACCACTGAATGGCGTCCTGTAACTAAACCACGCCCTAGCACCACCACTTCCAGCGACACCCAGACCCCACTTGTCACAGACCAGGAACGAGGGTATACCACCACCTCCGACGTGACACCAACGATTAGGCTGCCCGCCGAAAATGGTAATAACGCCGGTGCTGGACCCTCCTCCTCATTAACCCTCGCCGACCTGGATGATAACCAAGCGCCGACCACTAACAAAGGGAAAGAGAAACTTGAGGAAATGGTCGAAACTGGCCCAACTATCATGGAACGCTTCCTCAACACCGTTCAGGAACCAACACAGGATTTATGGGACTCCACCTCCGAATCCGCTGCGAGCTACCTCGCTGAAGGTCTCGGCATCTCTGCCATCCAAGCACTCCCTTGGGCACCTCACTTGGAACTCATCAATGCATTAGGCTTCCAGGGCACTGAAAGGCAATACGGCCCAGACAACTGTCTCATATGGCCCATCACGCATTACAGAGAACTGCCCAGAAGCAACAGTGTCGAAGCCCCTCCGGAAGTGCTTGAGCTGCTCGACTGCATCAATAGATACCCCACTGACGTCCCAATGCTCAAAACTCGAGCCGCCGCCTTCGGCTCAGACGTCAAGAATTTACGCATAGGAGCACTTGTTAAGAACCAGGACAAACAGTGGCGCGCATCACTCGCACTACTTTGTGAGGAAAATGAACACCTCCTCCCTACCACTGTAATACACGGCGCTGGTGGCTCCGGGAAATCCCATTTACTCCAACAGTGGGTGGCGTCTACTGAGCGTGGAAATGTGGTCACCATCTTGCCCACAATCGAACTCCTTCGAGATTGGCAAAACAAATGTCCACACGCACCGAAAGAAACTTTCAAAACCTTCGAGAAAGCGCTCATCCAGAACAGCGCCCCTGTGGTTATCATGGACGACTACTCCAAACTTCCCCCAGGGTATATTGAAGCCTACGTCAGCCTTAAGGGCCAGTGCAAACTTCTCATACTCACTGGAGACCCTAGACAAAGCCACTACCATGAGGAGAACCCTGAGGCCTTAATCTCCACTCTTGACCCCGCCACGGACTACTTTGGCAAATTTTGTGCATACAACATCAACGCCACTCATAGAAATGCCAAAACCTTCGCCAATGCGCTTGGGGTGTACTCTGAAAAAGAAATCCCCACCACTATCACCTGCTCATCCTACCAGAAAAGCGGTTGGCCAACCCTTGTCCCATCCATCCTTAAAAAGACTGCGCTCAACGACATGGGACAGCGCTCACTAACCTACGCAGGCTGTCAGGGACTTACCACCCCAAAAGTGCAGATAGTTCTTGATAACGCCACACCACTATGCTCTGACAAGGTCATGTACACCGCACTATCCAGAGCGGTGGACCAAATTCACTTCTTCAACACTGGCCCAAATCACACTGATTACTGGGAAAAGATGAACGCCACACCTTTCCTCAAAACTTTCATCGACCACACACGTGAGGAGACCTTTGCGGAGCACCAACCTGCCGAACCCACAGTGCGTGAGTACGCACCGGCAACACATTTCCCACCGGCCAACGAGAACCTAGCACTGGAGCCGTGGGTCGAGCCGCTGACTGATAAACACTCGCGGGAACTCTTCCACTCTGCCTTAGGCCACAGCAACTGCGTCCAGACTGAAAATACCGTAGTCCAACTTTTCCCCCACCAACAGGCCAAAGACGAAACGCTTTTCTGGAAAACAATAGATGCCAGAATCAAGATAACCACCCCGGAAGAGAACATCAGGGCTTGCAACATGGCCACCGACATCGGCGACATCTTGTTCCTAAATTACAAAGAAGCCATGGGGTTACCACAAGACCCCATACCCTTCGAACAAGCACTCTGGGACTCTTGTCAAGCCGAGGTGCAACTAACCTACCTCAGCAAACCTCTGGCAGCACTCGCAAATGCCGCCCAAAGACAAGACCCCGACTTTGACTCCAACAAAATCCAACTCTTCCTGAAATCACAATGGGTCAAGAAAGTCGAGAAGATGGGCTGCCTTAAGATCAAACCCGGCCAAACTATTGCGTCCTTCATGCAACAGACTGTCATGCTATACGGAACTATGGCTCGGTACATGCGCCGAATCCGCACATCACTTTGCCCACCCGAAATTATGATCAACTGCGAGACCAACCCAAACCAAATCGGAACATGGGTGCGTGAGTATTGGAACTTCAACACCCAGAGCCATGAGAACGACTTTGAAGCGTTTGACCAGTCCCAAGACGCCAACATGTTACAATTCGAGCTCATTAAGGCCAAATACCACTCAATCCCCGAGGAGATTATCGCCGGGTATCGGCACCTGAAATGCAACGCTCACATCTTCCTTGGGACTATATCGATCATGAGGTTGTCTGGTGAAGGGCCGACCTTCGACGCCAACACAGAGTGTTCCATTGCATACAACCACACAAGGTATTTTGTGCCGAAAGGCACCGCCCAGCTCTACGCCGGAGACGACTCTGCATGCGCGTCGCCCCTCTCTGAAAAACCCAGCTTCCAACATATCTCACCAGAGCTCAGCCTCAAATCTAAGGCCAAAATTAGAACCCAACAGAAAGGAGACTTTGCAACTTTCTGTGGCTGGCTCATCACTCCAAAAGGCCTGATCAAAAACCCCACCCAGCTCTACGCCTCCTGGTTATTGGCTAAACACAACAAAGATCTTGCGGACGTGGCCAGAAACTATGCCTTGGACTTACGCATTGCCTATCAACTTAAAGACGAGCTCTATGAGTTATTATCACCTGAAGAACTTGACCACCACCAACTGCTCGTCCGAGAGATGATCAAGCACAAAATGGGCCATCTCCTCA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9,633
OQ418501.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA16
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus reticulata
null
2022-06
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA16, complete genome
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9,634
OQ418502.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA17
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus x limon
null
2022-06
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA17, complete genome
GAAAAGCAAACATAACCAACACACACCCAAAATTGTGATCATCGTCTCTGCATCAACAGCTCAGCTAAGAACCAGAGAAATGGCCACTATTAGGGGTGCCATCGAACGCATTACAGACACCACCGTACGCACTACACTTCAAGAGGAGGCATGCCGCCAAATACGCGCTGAACTTAAAAACGTCGAACACATCAACCGTTACGCTATACAGCCTGACGCCGCCGACGCACTCGAACACCTAGGCATTGGTTCTAACCCCTTCTCTGTGGCACTGCACACGCACGGTGCCTGCAAAGCGATCGAGAACCAATTACTCTATGTAGTTGGTACCCTACTCCCAAAAGAACGTGTCACCATGCTCTTCCTTAAGAAAAGCAAACTCAACATCATGAAACGCTGCCCTAAATTCCAAGACATCTTCCTGAACCAACATATCGAACCACGGGACGTTTCTAGGTACTGCGACTTTAACGTCCAATCCACTTCCACCAGCATACCCACAAGAACGGCTTACATCAGTGACACACTCCACTTCATGGACCGTAGAGACCTAGTCCGACTATTTCTAAACAGCCCAAATCTAGAGACTCTCTACGCCACCATTGTCCTCCCAGTCGAGGCTGCCTACAAACAACCGAGCCGCTACCCAGAGATATACCAGATTAACTATGACTTCGACGGCTTTCAGTACATACCTGGAGGCCATGGGGGCGGCGCCTACCACCACGAGTTCGAACAGCTGCAATGGTTAGACACTGGCCATATCCACTGGCGTGGGCCCGACTGTAAAGAGATTCGCATGACAATTACCGCCCAAATGCTTGAAAGCTTAGGTGCGAATCATCTTTTCTGCTTCAAACGTGGGAAACTACTCACCCCACGTGTACGCACTTTCGGCCGAGATACCCAAGTGCTCTTGCCCAAAATCTTCCGCCCGGCCGACAAAAACTTTAACAGGGCAATACCACTAACCCTAGCTAACAAACTACTCCTGTACGCTAAATCCATTAACACAGTGACCTTCCGCGACGTCGTTGCTAAGACACGCCAACTTATGAAGGACAAGGAGCTGGAAACATACACCGGCAACGACCTGTTGCATATGGCCAACTATTTCTTCGCTGTTGGAGCACTGTCAGGAGTTAACTCCTATGACCAACTGCTTGGCCTATCCGCCTGGGAAGCCTGCACTGTCCGTATCAAGAACACCATAACAAATCTCTGGGAAAAGATCGCCGGAAAGAAAGAGTTCGGCAAGTTATTGGAGGCCCTCGAGTGGGAAACATTCACATACTCACGCCAAGTGACCGAATTCACCGTCACGGGACTGCCTGCCCTGCTCCCCCTCCCAGACATCTCAGACCAAGAAGAGATTTTCGCCCAGCAGGACGAGTTAGACAAAATCACTGCCGGCGCTACCAAGATACGGACTATTGACATTATGCGGGGACAAGCTAACCGCGCTAACCCAAAAACTCCGATCAACTCAACACCGGCCCAGGGACCCCAACTGCCCGACACTCGCAATCCAATTGACCAAGCTGCCTCCAAAGAGCTCGTCACCAAGCTTCAGAAAAACAAACGCATTTACATCCAAGACGACGGGCCGGAATACCTTATGGGACACATGGCTGAAGTCCCCGCCTGGTATCTTGAACAAGATGATACCACCACTAGACTTAAAAACCGCTGCGCTTGGTTCTTCGGCCCACCCACCTACAGATATGGGCACAACGACATTGAGTACACCACCGTAGAGTACTACCCTTGGGTCGAGCGTATCGGAGCCATTTTCGGTAAGTACAACACCTGTCTCGCTCAAACTTACGACGCCGGGGCTCGTATCGGATACCACGCTGACGACGAAGACTGCTACGACCCCGACGTCACCGTGGTCACCGTCAACCTCACTGGGAACGCCACCTTCCTGCTCAAGACCCCAACCGGCACTAGGACCTGGAAACTTAAACCTGGTGACTTCATTATCATGAAACCCGGTGCCCAAAGGTGTACAAAACATGCCATTAGAGATTGCACGACTAACCGCACATCCTTAACCTTTAGATGGCAGGCGCGCACTTGCCCCACCAACCTCAGAAAGATCACTAACCTACCCAAAGCCACCAACCAACCCCAAACCACTGAATGGCGTCCTGTAACTAAACCACGCCCTAGCACCACCGCTTCCAGCGACACCCAGACCCCACTTGTCACAGACCAGGAACGAGGGTACACCACCACCTCCGACGTGACACCAACGATTAGGCTGCCCGCCGAAAATGGTAATAACGCCGGTGCTGGACCCTCCTCCTCATTAACCCTCGCCGACCTGGATGATAACCAAGCGCCGACCACTAACAAAGGGAAAGAGAAACTTGAGGAAATGGTCGAAACCGGCCCAACTATCATGGAACGCTTCCTCAACACCGTTCAGGAACCAACACAGGATTTATGGGACTCCACCTCCGAATCCGCTGCGAGCTACCTCGCTGAAGGTCTCGGCATCTCTGCCATCCAAGCACTCCCTTGGGCACCTCACTTGGAACTCATCAATGCATTAGGCTTCCAGGGCACTGAAAGGCAATACGGCCCAGACAACTGTCTCATATGGCCCATCACGCATTACAGAGAACTGCCCAGAAGCAACAGTGTCGAAGCCCCTCCGGAAGTGCTTGAGCTGCTCGACTGCATCAATAGATACCCCACTGACGTCCCAATGCTCAAAACTCGAGCCGCCGCCTTCGGCTCAGACGTCAAGAATTTACGCATAGGAGCACTTGTTAAGAACCAGGACAAACAGTGGCGCGCATCACTCGCACTACTTTGTGAGGAAAATGAACACCTCCTCCCTACCACTGTAATACACGGCGCTGGTGGCTCCGGGAAATCCCATTTACTCCAACAGTGGGTGGCGTCTACTGAGCGTGGAAATGTGGTCACCATCTTGCCCACAATCGAACTCCTTCGAGATTGGCAAAACAAATGTCCACACGCACCGAAAGAGACTTTCAAAACCTTCGAGAAAGCGCTCATCCAGAACAGCGCCCCTGTGGTTATCATGGACGACTACTCCAAACTTCCCCCAGGGTATATTGAAGCCTACGTCAGCCTTAAGGGCCAGTGCAAACTTCTCATACTCACTGGAGACCCTAGACAAAGCCACTACCATGAGGAGAACCCTGAGGCCTTAATCTCCACTCTTGACCCCGCCACGGACTACTTTGGCAAATTTTGTGCATACAACATCAACGCCACTCATAGAAATGCCAAAACCTTCGCCAATGCGCTTGGGGTGTACTCTGAAAAAGAAATCCCCACCACTATCACCTGCTCATCCTACCAGAAAAGCGGTTGGCCAACACTTGTCCCATCCATCCTTAAAAAGACTGCGCTCAACGACATGGGGCAGCGCTCACTAACCTACGCAGGCTGTCAGGGACTCACCACCCCAAAAGTGCAGATAGTTCTTGATAACGCCACACCACTATGCTCTGACAAGGTCATGTACACCGCACTATCCAGAGCGGTGGACCAAATTCACTTCTTCAACACTGGCCCAAATCACACTGATTACTGGGAAAAGATGAACGCCACACCTTTCCTCAAAACTTTCATCGACCACACACGTGAGGAGACCTTTGCGGAGCACCAACCTGCCGAACCCACAGTGCGTGAGTACGCACCGGCAACACATTTCCCACCGGCTAACGAGAACCTAGCACTGGAGCCGTGGGTCGAGCCGCTGACTGATAAACACTCGCGGGAACTCTTCCACTCTGCCTTAGGCCACAGCAACTGCGTCCAGACTGAAAACACCGTAGTCCAACTTTTCCCCCACCAACAGGCCAAAGACGAAACGCTTTTCTGGAAAACAATAGATGCCAGAATCAAGATAACCACCCCGGAAGAGAACATCAGGGCTTGCAACATGGCCACCGACATCGGCGACATCTTGTTCCTAAATTACAAAGAAGCCATGGGGCTACCACAAGACCCCATACCCTTCGAACAAGCACTCTGGGACTCTTGTCAAGCCGAGGTGCAACTAACCTACCTCAGCAAACCTCTGGCAGCACTCGCAAATGCCGCCCAAAGACAAGACCCCGACTTTGACTCCAACAAAATCCAACTCTTCCTGAAATCACAATGGGTCAAGAAAGTCGAGAAGATGGGCTGCCTTAAGATCAAACCCGGCCAAACTATTGCGTCCTTCATGCAACAGACTGTCATGCTATACGGAACTATGGCTCGGTACATGCGCCGAATCCGCACATCACTTTGCCCACCCGAAATTATGATCAACTGCGAGACCAACCCAAACCAAATCGGAACATGGGTGCGTGAGTACTGGAACTTCAACACCCAGAGCCATGAGAATGACTTTGAAGCGTTTGACCAGTCCCAAGACGCCAACATGTTACAATTCGAGCTCATTAAGGCCAAATACCACTCAATCCCCGAGGAGATTATCGCCGGGTATCGGCACCTGAAATGCAACGCTCACATCTTCCTTGGGACTATATCGATCATGAGGTTGTCTGGTGAAGGGCCGACCTTCGACGCCAACACAGAGTGTTCCATTGCATACAACCACACAAGGTATTTTGTGCCGAAAGGCACCGCCCAGCTCTACGCCGGAGACGACTCTGCATGCGCGTCGCCCCTCTCTGAAAAACCCAGCTTCCAACATATCTCACCAGAGCTCAGCCTCAAATCTAAGGCCAAAATTAGAACCCAACAGAAAGGAGACTTTGCAACCTTCTGTGGCTGGCTCATCACTCCAAAAGGCCTGATCAAAAACCCCACCCAGCTTTACGCCTCCTGGTTATTGGCTAAACACAACAAAGATCTTGCGGACGTGGCCAGAAACTATGCCTTGGACTTACGCATTGCCTATCAACTTAAAGACGAGCTCTATGAGTTATTATCACCTGAAGAACTTGACCACCACCAACTGCTCGTCCGAGAGATGATCAAGCACAAAATGGGCCACCTCCTCA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9,635
OQ418503.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA18
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
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Citrus x limon
null
2022-06
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null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA18, complete genome
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9,636
OQ418504.1
Citrus yellow vein clearing virus
Abrahamian,P., Tian,T., Posis,K., Guo,Y.Y., Yu,D., Blomquist,C.L., Wei,G., Adducci,B.A., Vidalakis,G., Bodaghi,S., Osman,F., Roy,A., Nunziata,S., Nakhla,M.K., Mavrodieva,V., Rivera,Y.
USDA-APHIS S&T, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostic Laboratory
USA
2024-01-15
CA19
Citrus yellow vein clearing virus
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
7,530
GenBank
1
USA: California
USA
Citrus x latifolia
null
2022-12
null
null
Citrus yellow vein clearing virus isolate CA19, complete genome
GAAAAGCAAACATAACCAATACACACCCAAAATTGTGATCATCGTCTCTGCATCAACAGCTCAGCTAAGAACCAGAGAAATGGCCACTATTAGGGGTGCCATCGAACGCATTACAGACACCACCGTACGCACTACACTTCAAGAGGAGGCATGCCGCCAAATACGCGCTGAACTTAAAAACATCGAACACGTCAACCGTTACGCTATACAGCCTGACGCCGCCGACGCACTCGAACACCTAGGTATTGGCTCTAACCCCTTCTCTGTGGCACTGCACACGCACGGTGCCTGCAAAGCGATTGAGAACCAATTACTCTATGTAGTTGGTACCTTACTACCAAAAGAACGTGTCACCATGCTCTTCCTTAAGAAAAGCAAGCTCAACATCATGAAACGCTGCCCTAAATTTCAAGACATCTTCCTGAACCAACATATAGAACCACGTGACGTTTCTAGGTACTGCGACTTTAACGTCCAATCCACCTCCACCAGCATACCCACACGAACGGCTTACATCAGTGACACACTCCACTTCATGGACCGTAGAGACCTAGTCAGACTATTTCTAAACAGCCCAAATCTAGAGACTCTCTACGCCACCATTATCCTCCCAGTCGAGGCTGCTTACAGACAACCAAGCCGCTACCCAGAGATATACCAGATTAACTATGACTTCGACGGCTTCCAGTACATACCTGGGGGCCATGGGGGCGGCGCCTACCACCACGAGTTCGAACAGCTACAATGGCTAGACACTGGCCATATCCACTGGCGTGGGCCCGACTGTAAAGAGATTCGCATGACAATTACCGCCCAAATGCTCGAAAGCTTAGGTGCGAATCATCTTTTCTGCTTCAAACGTGGGAAACTACTCACCCCACGTGTACGCACTTTCGGCCGAGATACCCAAGTGCTCTTGCCCAAAATCTTCCGCCCGGCTGACAAAAACTTTAACAGGGCAATACCACTAACCCTAGCTAACAAACTACTCCTGTACACTAAATCCATTAACACAGTGACCTTCCGCGACGTCGTTGCCAAGACACGCCAACTTATGAAGGACAAGGAGCTTGAAACATACACCGGCAACGACCTGTTGCATATGGCCAACTATTTCTTCGCTGTTGGAGCACTGTCAGGAGTTAACTCCTATGACCAACTGCTTGGCCTATCCGCCTGGGAAGCCTGCACCGTCCGTATCAAGAACACCATAACAAATCTCTGGGAAAAGATCGCCGGAAAGAAAGAGTTCGGCAAGCTATTGGAGGCCCTTGAGTGGGAAACATTCACGTACTCACGCCAAGTGACCGAATTCACCGTTACGGGACTGCCCGCCCTGCTCCCCCTCCCAGACATCTCAGACCAAGAAGAGATTTTCGCCCAGCAGGACGAGTTAGACAAAATCACTGCCGGCGCTACCAAGATACGAACCATTGACATTATGCGGGGACAAGCTAACCGCGCTAACCCAAAAACTCCGATCCACCCAACACCGGCCCAGGGACCCCAACTGCCCGACACCCGCAATCCAATCGACCAAGTCGCCTCTAAAGAGCTCGTCACCAAGCTTCAGAAAAACAAACGCATTTACATCCAAGACGACGGGCCGGAATACCTTATGGGACACATGGCTGAAGTCCCCGCCTGGTATCTTGAACAAGATGATACCACCACTAGACTCAAAAACCGCTGCGCTTGGTTCTTCGGCCCGCCCACCTACAGATACGGGCATAACGACATCGAGTACACCACCATAGAATACTACCCCTGGGTCGAGCGTATTGGAGCCATCTTCGGCAAGTACAACACCTGTCTCGCTCAAACTTACGACGCCGGAGCTCGTATCGGATACCACGCTGACGACGAAGACTGCTACGACCCTGACGTCACCGTGGTCACCGTCAACCTCACTGGGAACGCCACCTTCCTGCTCAAGACCCCAACTGGCACTAGGACCTGGAAACTTAAACCTGGCGACTTCATTATCATGAAACCCGGTGCCCAAAGGTGCACAAAACATGCCATTAGAGATTGCACGACTAACCGCACATCCTTAACCTTTAGATGGCAGGCGCGCACTTGCCCCACTAACCTCAGAAAGATCACTAACTTACCCAAAGCCACCAACCAACCCCAAACCACTGAATGGCGTCCTGTAACTAGACCACGCCCTAGCACCACCGCTTCCAGTGACACCCAGACCCCACTTGTCACAGACCAGGAACAAGGGTATACCACCACCTCCGACGTGACACCAACGATTAGGCTGCCCGCCGAAAATGGTAATAACGCCGGAGCTGGACCCTCCTCCGCATTAACTCTCGCCGACCTGAATGATAACCAAGCGCCGACCACTCACAAAGGGAAAGAGAAACTTGAGGAAATGGTCGAAACTGGCCCAACTATCATGGAACGCTTCCTCAACACCGTTCAGGAACCAACACAAGATTTATGGGACTCCACCTCTGAATCCGCTGCGAGCTACCTCGCTGAAGGTCTCGGTATCTCTGCCATCCAAGCACTCCCTTGGGCACCTCACTTAGAACTCATCAATGCATTAGGCTTCCAGGGCACTGAAAGGCAATACGGCCCAGACAACTGTCTCATATGGCCCATCACGCATTACAGAGAATTGCCCAGAAGCAACAATGTCGAAGCCCCTCCGGAAGTGCTTGAGCTGCTCGACTGCATCAATAGATACCCCACTGACGTCCCAATGCTCAAAACTCGAGCCGCCGCCTTCGGTTCAGACGTCAAGAATCTACGTATAGGAGCACTTGTTAAGAACCAGGACAAACAGTGGCGCGCATCACTCGCACTACTTTGTGAGGAAAATGAACACCTCCTCCCTACCACTGTAATACACGGCGCTGGTGGCTCCGGGAAATCCCATTTACTCCAACAGTGGGTGGCGTCTACTGAGCGTGGAAATGTAGTCACCATCTTGCCCACTATCGAACTTCTTCGAGATTGGCAGAACAAATGTCCACATGCACCGAAAGAGACTTTCAAAACCTTCGAGAAAGCGCTCATCCAGAATAGCGCCCCTGTGGTCATCATGGACGACTACTCCAAACTTCCTCCAGGGTATATTGAAGCCTACGTCAGCCTCAAGGGCCAGTGCAAACTTCTCATACTCACTGGAGACCCTAGACAAAGCCACTACCATGAGGAGAATCCTGAGGCCTTAATCTCCACTCTCGACCCCGCCACGGACTACTTTGGCAAATTTTGTGCGTACAACATCAACGCCACTCATAGGAATGCCAAAACCTTTGCAAATGCGCTTGGGGTGTACTCTGAGAAAGAAATCCCCACCACCATCACCTGCTCATCCTACCAGAAAAGCGGTTGGCCAACACTCGTCCCATCCATCCTTAAAAGAACCGCGCTCAACGACATGGGGCAGCGCTCACTAACCTACGCAGGCTGTCAGGGACTCACCACCCCAAAAGTGCAGATAGTTCTTGACAACGCCACACCACTATGCTCTGACAAGGTCATGTACACCGCACTATCTAGAGCGGTGGACCAAATTCACTTCTTCAACACTGGCCCAAATCACACTGACTACTGGGAAAAGATGAACGCCACACCTTTCCTCAAAACTTTCATCGACCACACACGTGAGGAGACCTTTGCTGAACACCAACCTGCCGAACCCACAGTGCGCGAGCACGCACCAACAACGCATTTCCCACCGGCTAACGAGAACCTAGCACTGGAGCCGTGGGTCGAACCGCTGACTGATAAACACTCGCGGGAACTCTTCCACCCTGCCTTAGGCCACAGCAACTGCGTCCAGACTGAAAACACCGTAGTCCAACTTTTCCCCCACCAACAGGCCAAAGACGAAACGCTCTTCTGGAAAACAATAGATGCCAGAATCAAGATAACCACCCCGGAAGAGAACATCAGGGCTTGCAACATGGCCACTGACATTGGCGACATCTTGTTCCTAAATTACAAAGAAGCCATGGGGTTACCACAAGACCCCTTACCCTTCGAACAAGCACTCTGGGACTCTTGTCAAGCCGAGGTGCAACTAACCTACCTCAGCAAACCTCTGGCAGCACTCGCAAATGCCGCCCAAAGACAAGACCCCGACTTTGACTCCAACAAAATCCAACTCTTCCTGAAGTCACAATGGGTCAAGAAAGTCGAGAAGCTGGGTTGCCTTAAGATCAAACCCGGCCAAACCATTGCGTCCTTCATGCAACAGACTGTCATGCTATACGGAACCATGGCTCGGTACATGCGTCGCATCCGCACCTCACTCTGCCCACCCGAAATTATGATCAACTGCGAGACCAACCCAAACCAAATCGGAACATGGGTGCGTGAGTATTGGAACTTCAACACCCAGAGCCATGAGAATGACTTTGAAGCGTTCGACCAGTCCCAAGACGCCAACATGTTACAATTTGAGCTCATTAAGGCCAAATACCACTCCATCCCCGAGGAGATTATCGCCGGGTATCGACACCTGAAATGCAACGCTCACATCTTCCTTGGGACTATATCGATCATGAGGTTGTCTGGTGAAGGGCCGACCTTCGACGCCAACACAGAGTGTTCCATTGCATACAACCACACAAGGTATTTTGTGCCGAAAGGCACCGCCCAGCTCTACGCCGGAGACGACTCTGCATGCGCGTCGCCCCTCTCTGAAAAACCCAGCTTCCAACATATCTCACCAGAGCTCAGCCTCAAGTCTAAGGCCAAAATTAGAACCCAACAGAAAGGAGACTTTGCAACCTTCTGTGGCTGGCTCATCACTCCAAAAGGCCTGATCAAAAACCCCACCCAGCTTTACGCCTCCTGGTTATTGGCTAAGCACAACAAAGATCTCGCGGACGTGGCCAGAAACTATGCCTTGGACTTACGCATTGCCTATCAACTTAAAGACGAGCTCTATGAGTTATTATCACCTGAAGAACTTGACCACCACCAACTGCTCGTCCGAGAGATGATCAAGCACAAAATGGGCCATCTCCTCAGCCTCCCTGAGGGGTTTAAAACAAACTAGCTCGAAATGGACTTACCTGAGCTCCTGCTATCCAAAAACTTCATTCGCACTCGTTTGCCCCTCACCAAACCCATTGTCATACACGGTGTTGCCGGCGCCGGCAAGACACAACTTCTTGAAGAATTCGCGCGGTCCTCACCCTCAACCAAAATCTACTCGCCTGTGAAACATCACTCTAACTCACTGCTGCTCTCGCCCTTCCACAAAGCTCTCTCTGAAGCTTCCATTGTCGACGAGTACCCTCTAAGCCAGATACACGAGAACGTCGAGTACATCTTCGCTGACCCCATCCAATACCTCGGTAACCCAAACCTTAGAAAACCCCACTACATCTGCGCCTCTTCCCACCGATTTGGCCATTCCACTGCTGCCCTCCTAACAAAACTTGGCATCGAAACTTACGCACATAAAGAAGATACCGTCCGGGTAGACAACATCTTCCAGGCTGAACCAGACGGCCAAATCATCGCCTGCGACCGACCCACTCAAGAGCTTGCTGCCAGACACACACTAGACTACTTGAGGCCCTGCGAAAGCATAGGACTAACTTTCCCACGAACCACGATCCTGATCTCTCACGAACTTACTGCAGATACCCTCACTAAAGAGATTTACATCGGTTTGACCCGCCACTCTAACCATCTTCTCATACTCACCCCGGATGCCTCTACAACCTCCTCCTGACCACACTTGGGCTTTCCGACTACTAGCTCTTGGCGCCGCCTTGGCACTGCTCACTTTCACGCTCAACCGAGACACAAGTCGTCACGTTGGAGATCCTTCTCACTCACTTCCTTTTGGAGGGTACTACCGGGACGGCAGCAAAGTAGTCCACTACAACTCCCCGAGAGCCACGAAACCTAGCACCCCTTCCTTCCTGTATCTGGCCCCAATCTTACTGATCTTACTAATTCATGCAGTCAATAGATTTACTAATCCTCGCCATTCTTGTCCTTGCACTCATTGCCAGCCTATTCCCCGCGCCTGAGCCTTGCACAATTGTAGTCTCTGGTGCCTCAGCCTCCGTAACTAATTGCCCAAACCCCGAACAACTCGCAGAGCTAGTCAGAGCGCTTAAACCGGCTAAACCGGTTTAAAACTTAACACAAACTCGAACTCATGAGCTTCGACTACACTCACCCTCTCTACCGCAGCTATCCATTTCCACATTACTGCGAGTTCGACCGGCACCAACTCTGCGACCATCATCCAGTACTCAAACCTCCAACTCACAAACCCAGCGCCCCGAACTCTCTCATGTCTACCGACAACAACAAGGGCAAACAACCACTTCACCCGACACCTTCGGGCCCTAACGACACGACCCCGAAACCTATCCCTGTACCCACTCCCTCAGCTACGCCCACAGCGGCAGGTAAGGAAAACCAAGAGCCCATCGAAAAGCGTATCATACACGCTTTCCACGCTGAAGCAAAGACCCACAACAATGGGGTCTCTCCACCTGCCTTTAACCCGAACAATATGAATGCTGTGCCGCTGAACCTGCTCAACCTCAACCTAAGATACTCACCAGTCACTAACTCCATAGCTAACCCTAAACAGACCGAGGCTATCGGGAAAGCTTGGGTCCGCATCTTGAACATCGATCCTGCCAACGTGTTCTTATACGCCATTGACCTCGCCAGAGCTTGCGCCGACGCGGGCTCTTCTCCTGAAGCTGATATTATTGGAGCGAACGAAGATCTCAACCCCGTCGTTGAACGAAACGCATTGGCCCTAGTGGTTAGGGACTTCTGCCCACTGCGCGCTTTTTGCGCTTACTACTCTCGAGTGGTATGGAACCTCATGATCAAGGCGGACCAGCCCCCGGCCAACTGGATGAAATCCGGGGTAGACGAGAACGCGAAATTCGCGGCATTCGACTTCTTCCATGGTATCCTCTCGCCCGCTTCCCTGTATGTGCCCCTAGAGAGACACCCTACTTCCGCGGAGAGGATCGCAAATCAGGCCATGTTCGCTGTGAAAATTGCCAACTCTCCAGGAAATGGCACGGACCTCACGATGGACCACGTTGCCTTCACCAAAGGAAGGACTACCCACTCCTCCGGCCTCCGCCCGACCCCTTTCAACATCTAACCACCTTTGAACCAATACTCCTAGCGTGCCTACAAGCCCTTAAACCACTTCCCCCCGAAATCCAAATTGCTATCATTTCATGTGTGTGTGACTTCTTTAATTTCGTACGCTGTGCCAGTAGCAAGTACCAGGGCACCAGCCGCTCAGCTGTCAAACGTCGAGCGGCGCGCCTGAACTACTGCTACAAGTGTGGGCACCCCTTATATCTAAATAAACCTCACCCCTGCCGACCAGGTCAATTGTGCTCTGCATCTATCTCCGAGCGCCTCTGTTTGCTCCACACAGGACCGATTAGGTTTCTAACCGAAAATCCTGTTAGTGCCAGAGCGGCTCACTTCCTAGCGCACGAGCTCCTTGACCCCAGATGAAACATAAATATTCAGGCTTTCAGTTTCCATTTTCTG
9,637
OP689651.1
Citrus-associated rhabdovirus
Feng,G.
China National Rice Research Institute, State Key Laboratory of Rice Biology
China
2022-10-30
Dd_DN69067
Cytorhabdovirus caricae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,463
GenBank
null
China
China
Glycine max
null
2022-08-28
null
null
Citrus-associated rhabdovirus isolate Dd_DN69067, complete genome
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GATGACTTGTGCATCCGTTTGACATCTAACGATTCCTTGAATGTCAGGTTTCTGCATGATATAATGGGTTCTACCTTGTTCGGGTATTGTGATTCTGTATCCTCTAAGATCGACAAAACTGTAACCCTCAGTAGAATGACCTCGTTTTCTCACAATGTTGTGGGTGTGCTGGCAAAAGGGGAAAAGAACGTATGGGACTACTTTAAGTGGAGGATATTACACTCAAAAGGAAGGAAAGTGAAGGAGACTTGCCCCACTGAATTTGTTAGGAACATCAGAGACGAAGGATGGAAGAAGCACATTATAGGCGTGACCACTCCGTTTCCGTTCCACTTTCTCACCACAGACTCTTCTCTGGCTATCAAAGAGAGAATAGGAAGCTACTTGTACGCGGTGATATCAGAGTACGCTCTCAGAGACCCAGGGTATCTATTCCTAACGTTAGGAAAATCACTCCCTTATTTGGGAAGTGTCATAAAAGAGAAGCTGCAGAGAAGTGAAGTCTCTCTAGCGTTTGGCTCCGAGCCGCTTATCTCCCGCCCAGTTCGGATGTTACGAACCATAGGATGGTTTATCCCCGAAAGTTCCAATTGGGCAGAGTTGTTAAAGCAACTGGTGAAAGCAGTAGCCGACATAGACCCAGAGATACTGATTACAGTTCCTGACGAGGTCAAAGGATCCATGGAGCATAGGTACCAGGATTTTTCAACTTCTCACGGGACATTTTGGGGGACTCTCTTCGGACCTTGTACCCATGTTAATATGTCTACCAACAAGTGGACCAACTACCAAAGGGACGGAACCAACTATACTTTGCAGTATCAGGCAGTATTATGTTTCATGCAAGCGGTCATCATTAACAACTCTACGACCCCGTCTGCAACTAAGATGATGAAGTTTTTTGAAAGTTGCCCTCAATGCATTGTCCCAGTTGAGACAAATTTTCCAGAGCTCCAGGAGCCAGTACCCCCTTCCTCCATCCCTTCCGAACCTAGCAATCCCTATTTGTTCTTGCAGAAGGACGACGTTGATTTGATGCAGGAGGACATCTTCACTAGTCTTAAAGGCCGTTCCAAAGTCTCAACTGAGAATTTCACTGAGAACTCCCGAGACATGTACTGGTACTTGGTAGAAAGCCTAGCGTCTAAGTTTTCTTATTCAAGTAGGCCACTGGGAAATATTCAGAGTGATCCTTTGGACATGAATAGCAAAAACAAGTCCGGTTTTAAAAAGGTTAGGCCAGCTGATCTGTTTAAGGTCGTTCTTCGTAATTGTTGGGTCAATTACCATAATGAAAACAACAAGGGCCGAAGAACTCCATCTTGGGAAAGGGACAAAATCTACATATCAAGACAACTTAGCCTATTGCCGCCCAAGAGTTTTTCCTGCCTTGGAGGTTTTTTCTTTTGGGATAGTTCCCTTAAGGCACTAAAACAGGAGAGGTGGTTCACTCCTCCAGTTTCATATCCAGCGACTCCGCTAGGGATTGCTATATCATGCAAAAGCTCGTTAATTGCTATGGCTAACTCTCTGCCCAGTCTGGAGGTCCCTATATCTGCCATCATTGATGTCACAAAGGAAAGAGATAGTGTGGTGACAAAGAATCAGCTGTGTTTCGACGTCACCGGGGAGATCCGGAACAAGTGTACCTCTTGTGCTATGGAATCTTTCTCCACTCGAGTCACCAGGAAGACAACTCAGGAAAATCTACTAAAGCTCAAATGCGAGTGGGGACATAGTGTATATGACAACACCTCCGAGAAGAGGAAGAAGTTTACCTTGTTGTCTCTAGATCAGGTAGCAGATTTGTTAACTCCGCCTATAGTAGTTGACATGAGGGCCGGCCGACATGAACCTATCCAGTTTCCCCCTCCTTTCCTGTTGTTCAGCTCGGCATCTTCCCCGCAATATCAAGATGAGCCCACAATCTGTGAGAATGTGTCGTTCAACAGGGAGCTATTAGAAGCGAAACTTATAAGCTTTGTGCAGATACCGACTAGATCCTACGGTAGGGTTTACGAGATACTCTCTGGATTGAAGATAACCCATAGACACAACAGACTACTTGTTATGGGGGACGGTTTTGGATGGTCCTCGGTGGTAACGAAGATGCTGAACCCACTTTCTGAGGTTTGGTCATGGGATTTGATTGACATCTCTCAATCCCCTCCTCACATACTGCACCAGTCGTCTCCTCCAACACACTACAAATTTGAAATGGAGATAAAGAATGAGCTCAGTTACTCCAAGATCTCAGATATATTCCATGACGGTTTTGAGAGATCTATCGAGGATTTAGATAGTACTGCGGGGAAATTCCACCTAGTAATCTCAGAAATAGAGCTGTGTCATAATCCAGGGGAGGGAGATTATACATATGTGGACGTCATAAAGAGACTTATGCTCATACGTTCGAACTCTTTTCTGGTGAAAGTAGTAGTCCAGGACTCTCCCCGTCTGATGGATATTGTAAACTTCATAGCTAATCATTTCAGCACATGGGCGGTGTTTAACAGCTTAGAATCTCCTGCATATAGTGGGATATTTTGGTTGCTCTTGACAGGACCTAGAGAGAGGGAGAGCGTTAGGTATCTAAGTGATGAGTGTGCTGAATCGTTGATAGATAGTATCAAGGAGCAACTGTTAAGCCCCAAGATTGAGCTGATGGGAGTGTTGAGACCCTTCTCGAAGAGTCATGAGCTGCTAGCGTTGAGCTCAGTAGGTACCAGCTCATATGACACCATAGCTAGCATGACAAATGAGTGGCTTGGCCAGGTTGGAATGGTAAGTTGGAGAGGTTCTAATTTCACTAGGATGTTGAACGAGTTAAGGCATTTCAAACTTCCTTACGAACTATTGGACCTGGAGGGAAGGGACAAGAAGTATTATTTCAAAGAGGACCATGAGAGATTGCGACTTCGCCTGATATGCTTAGCAGGGTCTATGTTAACAACGCAGTATCTGCAAGCCGAGTTTTTGACTACCAAGTGGAAATTGGTATGGTCAACGAAGGGAAGCAAGGGGATGCTGGATGATGATTATTATTACAATCCTGTCTTGATCGCAAATGGAACTGAGGAGGATAACGATATCATCAGAGTGTTATCTAGACAGGTGAAATCTATCCAACTGTGCAGAATGACAACCCCGAAAGCGGTGGTTTTTTCTAAATTTGGGAAGAGAGTGGCCTTCCAGTACATTCCCCATAAAGAATTGTCCGGAAATGCAGATGGTACTCTTTTGAGCGCCTCGATGTTGTGTTTTCCAGTTAGTAAAAACTCGTCATACAGGTTGGCTTTTCTTGCTGAATGATCAAATATCATAAAATTAGTATAGGACTTATCGTAGGTGCGCCCTCTTTCTGCGTATCCGCCTTTAACTTCAGAAACTTCTAAAAATTATTAAAGAAAAACTGGGCCACAGTGACTAACGCTATTGTGACAAAAGAAAATTTCGATATTTT
22,491
MT302541.1
Citrus-associated rhabdovirus
Zhang,S., Huang,A., Zhou,X., Li,Z., Dietzgen,R.G., Zhou,C.Y., Cao,M.
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences., National Center for Citrus Virus Exclusion
China
2020-08-05
PF1
Cytorhabdovirus caricae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,485
GenBank
1
China
China
Passiflora edulis
null
2018
null
null
Citrus-associated rhabdovirus isolate PF1, complete genome
GCGAACATAAAAGTTCGAAATTTTATATCCGCAGGAGGGCAATGGGCGAAATGCAATAGGCAAAAAAGGTACAAGTGGGAGCTACACTCAGCTGTAGTGCAAAACTAGATTGTTCTGAAATTTTCCGTCCGAAGTAGGATCTTAATCAAGATGCCGAAAGTATATAAGGATAACTCTGCTTATGCTAAAGAGATATTCACCCCGATAACCAAGGAAATATCTCATGGTAGGATCCAAAAGCAAACATGGACGGACCAAGTGTTCGAAGAGATGCAGGTGTACAAGATTAACAAGTTCACTACGGGGGACCTTGAGCGGTATGGGATGTACATGGTCGACTCAATCTCGAAAAAGGAGGTGTCTATGGATACTTGTTACGCCATACTCATCTTGGCTTGTCACCTGCACAAGATTGCCCCAGACAAGGAATTTGCCTTGTTTGAACTCCCGGTGAAAGGAGGTCTTCCCCTACCCAAGATGGAGGTGTTTGCAGCATGGAACAAAGAGCAAGCTGAGGAGGGAGGAGAGGAAGAAGGCAAAGGATCTGAGGAGAGTGGCAGCGATAGTGAGCACGAGGAGATCCATGTAGACCCGCCGAAAGGGGGAGAGAAAAAGGCCTTAGACCCTCAGTCCGCCACGGCTATTGATAAGGAACGGGCTGCCAACTGTGTGAGGTTCTTTTGCTTCTGTGCTGCTTTTTACCTACGGTTGTGTATCAAGGATATCCAGGACCTGAGCACTCCATACACAAGGATGAAAGAGCGCTACACTCGATTCTATCAGGGTGTCATCCCGACTAGTGGAGTAGACGCCCCCCCGTCTGAGAGTGTAAGATCGTTAAAGACGTTCTTTGCAGGGGACAGGATAATAAGCAGGACTTGGGTGAAGTTGTTCGTTCCTTGGCACGACAAAGCAGAGGTCGGGTCGCCTCAAGACGGGATGGTAATCTACCTGGCAGTTCTCCCTTTCGCTTTTTCTGGTATGCATGCTTTGAAGCTGATGGACGATGTGATCGAAATGACTCATCTTAAAGACACGGATCTGATCTACCAGATGATGCATCCCAGGCACAATTCTGCATTGGCCTCCATCTCTGAGATATATGCCAAGCACTACCCCGAGGAAGGAAGCAAAAAGAACACCTACGTGAAGTATGCTCGAGTTGTAGGGCCTCAGTTCTTTCCTGCATTACAAACGAAGAAATGCAAGGGCCTGGTGTGCGTATTGGCCAATCTTGTGGTTCTACACCAAAAGACTACAGAAGAGACTGGGGATCCCAGGAGCATAGCTGGAATCGATGACATCTCCGATGAGTTGATGAAGTTCGGAAAGAGGATGGCAAAGATAATGATGAGGAATGCACCGAAGACTGCTTCATACATGTATTCTAGCACAGCTAGGGAAGCAGAAGAGGGAGGGGATTCAACAGATGAGGAGTCAGAAGAAGATGAGGAGGATATCGATACAGAGCCTCTCAAAGTGGGCAGGCGAATCTACAAGCCTTGATAATCGTATGGTTCATTCTAGTCATGAGTATGGTAATCTTTCTATAATATCATGTCAGTCGCAGCGCTTCTCATTCTCAACCTTATCAAAACATGTATGTTTTTCGATTATTTAAGAAAAACTGGGAGCGAGACTCAAGCTTTAACTGTTTAGTGTTATTTGATTGCTAGTTCCGTTCTACTACAGAGTAAAGATGTCCGGTGACGAGATCGATGACAAGACTCTCCAAAAGGTTATTCAGGATAATATAGAAGAGATCGCGAAGAAGGGCCCTCTACAGCGGGAAAATCTGTCAGGAGTGGACGAGGAAACTAGTAATGCTTCTCCTCAAGAACCGGAGGTTCCTGAAGAGAACATTACTACAACTCCTCCACTGACTACGACGGCAGAGATCCATGCTGAGCCGGAGAAAGAGAAGGTTAAGGTGACCCCCCCTGCGAAAACAACTCCTGCTAAGCCTGGGACCCCTAAGTATGTTGTCAAAGATAAGAAGAATGCTCTGCTGAGTGCTATCACCTCTCCCAGTAAGTCTCGTGACACAACTAAACCACCCTTGTCCTCTCCTCGCAAATCCGGGGCGACAAGCGAAACTTCCTCTCTAAAAGGGAGCTCTGATGACAACTCTGCATCGGAGTCTGAGAAGCCGAAGGGTGCTTCTTACAGTGTGGATGACCTGGAGAAGCTAGGGAAAAAACTGGCTACCAAGAAAGAGATTGAGGATTTCATGACCGAATTGTGTAAACAGAAAGGGATAAACTACAAAAGGCAATGGGGGAATGAGCTCACGTCTCGCCTGATCAAGGGACAGCTGATGACTGAAGGGATTGTCGAAATCTTCTTGGCTGGGATAACCATGGAGAGGGCATATTCAGTCACCGAGGGATTTGAAAAGACCGTGAAAGAACTGGCCGAGAAGGTCGCCAAGCTAGACAAGGTGAGCAACAACCTTATAGGGGGGGTCAAGAAGATGGACTCATCTATTAAGCGGTTAGATGAGGTGAACCAGGATTCTATGAAAGAGGTTGAGACTGTTATGGCAGATCATAGACATGCATTGGTGGAGGTGATTTCGATGATACCCTCTGACGCTCCTTCGTCTGAAAATCCCACTAAGAGCAAAAATGAGAAAAAGAAACCTCCAAAGGTTGAAAAGCCGGCAAGTAAGGAAGAGGAGGTCCTTGGTGAGGAGGTCAGCCTGTCCGAGCTGGATGAGGGAGGACTTGCGCTGGCGTTCTTAGACGAGATAGGAGCTAATGTAAAGGCTTCTGATCTGACAATCGTATCTGACGCAATATGCCATTACATCGACTCTGATGAGATAAGGGGCTATTTACTAGAGGGGATACCCAATGACGAGCGCAGAGGCCACCGTGACAGAGTAAAGAAATGTGTCAAGATGTATGTGGCTTATCTAGAGACAGAGAAAGAGAAGAAGGGGAAGGAGGCAAAGACCGAGGCTAAAGAGAAGGGAGAGGGTGAAAAGAAGCGGAAGAAGAATATCAAGTCATACTATTAAAGCTGATTCTATTACTCTAAAATGGCCGTCAAAGACCTTATTACTATAACCCCCATATCACCAGGTATCTGTTTCAATATATGTTGTGTCTTTACGTTCTACCAGATTACTATATTCGCCTTCGCTCTTATTTAAGAAAAACTGGGATCCAAAGATAATCATCGGATGGAGAAGAATAACCCAGAGAAAGGCTCGTTTTCTTCCCTGGTCTCGGCTCATGTTTCCTCTAGCAAACGAATTAATGTGAGGGTCCAACAGCATCAAGAGGAATATAGTATCAAGCTACCGTTCTCGACCAAAAAGCTGATATCTGAATATGCCACTGTGACCCTCTTAGAGATCTTTTATAAAGGTTACATTTTCAACGCTCAGGGGTCAACTATCGAGATAGTTATACGGGACAAGAGGTCTGTCTCGCAAACAGAACAGAAGAGGCTATCGGTCATTATCCCAGCTTCTAAGTCTTGCTATTTGACAGTTAAGGGGTTTTCATCCTCCCCGATAGGAGAAGGGTGTCCGTATGAGGTTTCCTTAAAGACTGTGGTTCGCAATATAAAGTTTGGTGTCACCCTAGGGAAGTTAGACATACGGCCTCACCTATTCTATTCGAATCACTTTGAGGACGGTGACTATCTGACGGTCAGCAAAGTTGAAGGGCCGGAGTTAAGTCTTAAGAAAGGTTCACCCACAGACAGAGAGGCCCCTTATACAGTCTCTCTGATCCCCTCTGAATAAGACCTATTATATTATGGAGGGTCAATGCAGGGAATATAGAGGGCCCTGGTATACCCAGTATAAGGTGTGGATATGTATTGCCGTCGTTATTATCATGCTGGTGTGTTGTTACCTATTCCTGTGTGATATGTTGTCCCCAGAGATTCCTGTTGATGAGTTTCTAGATAACGAGGATTACACTTATAACACCGGGCCTGTCCCTCTCTATGAGCAATGGCTCAACTTCTGGCTTCCTGGCGAAGGGGACGAATGATACTATATAACTAAGTGATTCTGCAGTTTAGTGTGTAAATGGTGTCGTGTGAGAGCACAGGTCTCTTGTAGGTTTTGTGTCATCGGTCTGTCACGTCCGTTCTTATTGAAACTCTTTCTAATGCGTAAATGGAAGTAAAGTAGTTGTAGAGCCTGGGTACTGTCTCTAGGTCGAAGCTGCAGGTTTAGGTCGAGTGTTGCAATTACTGCAAACATATAAGAAAAACTGGGATCATAATAAGGGAGATTAGACAATCTACTGGAGCTGTCCGTTATGTCGATTCTGAAATATATATCTTCGTCTCCCTCTCCCATCGTATCTGTCACTTACAAATACTGGGGCCTGAGGATGGACATTTCGCTAGAGATGTCTAGCTCCTCAGAGATAGAGGGCACTAAAGTGCTTGAGGATTATTTGGTAGACGCAGCAGTTAGGATTGATCAAGATAACAAAGTGGAAGTTAGGAGAGAAGCCTTGCTATTTTACCTAATATTGTGGCTGTGTAAGAAGTTGCCGGGTGCTGTGAAATTCTCAAAGACCTCGATAAGGAAGGGGAGGGGGCCCTATCTATATAGGCTGGAGATCCCATCGCTACTGTTTTTGAAGACGGTGGGGTTGGAAATGGGAGAGCCGGTTATCGAAGGCTTTGAGCGGGAGCTATGCTTAATGAAAGACGACAAGATCATCAGAGAATCCAGACTCTCAGTGAAGTCTATGTCAATTAAGACATTCAAAAACTCCACGGTTGAGAACTTTATGGAAGCCAATCCTCATTGTGTCTGTTCACCTGTCATGACTGTTTCCAACTTCTGGTCGGTGGAAACCGTTATTAGAGATAAAGATGTCTTGAACACCATCTCATCCGTTTTCTCAAAGAAAAAGGAGAACAACCTAACTCTGTTTAGGTCTGTGAAATAAGAGAGACTCCCCGGTTATGTGATGTGCCAGCGCGTGTTTTTAGTTTTTCGTCAATGGCCTCTCTTTAGTAGC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48,094
MT302542.1
Citrus-associated rhabdovirus
Zhang,S., Huang,A., Zhou,X., Li,Z., Dietzgen,R.G., Zhou,C.Y., Cao,M.
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences., National Center for Citrus Virus Exclusion
China
2020-08-05
PF2
Cytorhabdovirus caricae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,485
GenBank
1
China
China
Passiflora edulis
null
2018
null
null
Citrus-associated rhabdovirus isolate PF2, complete genome
GCGAACATAAAAGTTCGAAATTTTATATCCGCAGGAGGGCAATGGGCGAAATGCAATAGGCAAAAAAGGTACAAGTGGGAGCTACACTCAGCTGTAGTGCAAAACTAGATTGTTCTGAAATTCTCCGTCCAAAGTAGGATCTTAATCAAGATGCCGAAAGTATATAAGGATAACTCTGCTTATGCTAAAGAGATATTCACCCCGATAACCAAGGAAATATCTCATGGTAGGATCCAAAAGCAAACATGGACGGACCAAGTGTTCGAAGAGATGCAGGTGTACAAGATTAACAAGTTCACTACGGGGGACCTTGAGCGGTATGGGATGTACATGGTCGACTCAATCTCGAAAAAGGAGGTGTCTATGGATACTTGTTACGCCATACTCATCTTGGCTTGTCACCTGCACAAGATTGCCCCAGACAAGGAATTTGCCTTGTTTGAACTCCCGGTGAAAGGAGGTCTTCCCCTACCCAAGATGGAGGTGTTTGCAGCATGGAACAAAGAGCAAGCTGAGGAGGGAGGAGAGGAAGAAGGCAAAGGATCTGAGGAGAGTGGCAGCGAGAGTGAGCACGAGGAGATCCATGTAGACCCGCCGAAAGGGGGAGAGAAAAAGGCCTTAGACCCTCAGTCCGCCACGGCTATTGATAAGGAACGGGCTGCCAACTGTGTGAGGTTCTTTTGCTTCTGTGCTGCTTTTTACCTACGGTTGTGTATCAAGGATATCCAGGACCTGAGCACTCCATACACAAGGATGAAAGAGCGCTACACTCGATTCTATCAGGGTGTCATCCCGACTAGTGGAGTAGACGCCCCCCCGTCTGAGAGTGTAAGATCGTTAACGACGTTCTTTGCAGGGGACAGGATAATAAGCAGGACTTGGGTGAAGTTGTTCGTTCCTTGGCACGACAAAGCAGAGGTCGGGTCGCCTCAAGATGGGATGGTAATCTACCTGGCAGTTCTCCCTTTCGCTTTTTCTGGTATGCATGCTTTGAAGCTGATGGACGATGTGATCGAAATGACTCATCTTAAAGACACGGATCTGATCTACCAGATGATGCATCCCAGGCACAATTCTGCATTGGCCTCCATCTCTGAGATATATGCCAAGCACTACCCCGAGGAAGGAAGCAAAAAGAACACCTACGTGAAGTATGCTCGAGTTGTAGGGCCTCAGTTCTTTCCTGCATTACAAACGAAGAAATGCAAGGGCCTGGTGTGCGTATTGGCCAATCTTGTGGTTCTACACCAAAAGACTACAGAAGAGACTGGGGATCCCAGGAGCATAGCTGGAATCGATGACATCTCCGATGAGTTGATGAAGTTCGGAAAGAGGATGGCAAAGATAATGATGAGGAATGCACCGAAGACTGCTTCATACATGTATTCTAGCACAGCTAGGGAAGCAGAAGAGGGAGGGGATTCAACAGATGAGGAGTCAGAAGAAGATGAGGAGGATATCGATACAGAGCCTCTCAAAGTGGGCAGGCGAATCTACAAGCCTTGATAATCGTATGGTTCATTCTAGTCATGAGTATGGTAATCTTTCTATAATATCATGTCAGTCGCAGCGCTTCTCATTCTCAACCTTATCAAAACATGTATGTTTTTCGATTATTTAAGAAAAACTGGGAGCGAGACTCAAGCTTTAACTGTTTAGTGTTATTTGATTGCTAGTTCCGTTCTACTACAGAGTAAAGATGTCCGGTGACGAGATCGATGACAAGACTCTCCAAAAGGTTATTCAGGATAATATAGAAGAGATCGCGAAGAAGGGCCCTCTACAGCGGGAAAATCTGTCAGGAGTGGACGAGGAAACTAGTAATGCTTCTCCTCAAGAACCGGAGGTTCCTGAAGAGAACATTACTACAACTCCTCCACTGACTACGACGGCAGAGATCCATGCTGAGCCGGAGAAAGAGAAGGTTAAGGTGACCCCCCCTGCGAAAACAACTCCTGCTAAGCCTGGGACCCCTAAGTATGTTGTCAAAGATAAGAAGAATGCTCTGCTGAGTGCTATCACCTCTCCCAGTAAGTCTCGTGACACAACTAAACCACCCTTGTCCTCTCCTCGCAAATCCGGGGCGACAAGCGAAACTTCCTCTCTAAAAGGGAGCTCTGATGACAACTCTGCATCGGAGTCTGAGAAGCCGAAGGGTGCTTCTTACAGTGTGGATGACTTGGAGAAGCTAGGGAAAAAACTGGCTACCAAGAAAGAGATTGAGGATTTCATGACCGAATTGTGTAAACAGAAAGGGATAAACTACAAAAGGCAATGGGGGAATGAGCTCACGTCTCGCCTGATCAAGGGACAGCTGATGACTGAAGGGATTGTCGAAATCTTCTTGGCTGGGATAACCATGGAGAGGGCATATTCAGTCACCGAGGGATTTGAAAAGACCGTGAAAGAACTGGCCGAGAAGGTCGCCAAGCTAGACAAGGTGAGCAACAACCTTATAGGGGGGGTCAAGAAGATGGACTCATCTATTAAGCGGTTAGATGAGGTGAACCAGGATTCTATGAAAGAGGTTGAGACTGTTATGGCAGATCATAGACATGCATTGGTGGAGGTGATTTCGATGATACCCTCTGACGCTCCTTCGTCTGAAAATCCCACTAAGAGCAAAAATGAGAAAAAGAAACCTCCAAAGGTTGAAAAGCCGGCAAGTAAGGAAGAGGAGGTCCTTGGTGAGGAGGTCAGCCTGTCCGAGCTGGATGAGGGAGGACTTGCGCTGGCGTTCTTAGACGAGATAGGAGCTAATGTAAAGGCTTCTGATCTGACAATCGTATCTGACGCAATATGCCATTACATCGACTCTGATGAGATAAGGGGCTATTTACTAGAGGGGATACCCAATGACGAGCGCAGAGGCCACCGTGACAGAGTAAAGAAATGTGTCAAGATGTATGTGGCTTATCTAGAGACAGAGAAAGAGAGGAAGGGGAAGGAGGCAAAGACCGAGGCTAAAGAGAAGGGAGAGGGTGAAAAGAAGCGGAAGAAGAATATCAAGTCATACTATTAAAGCTGATTCTATTACTCTAAAATGGCCGTCAAAGACCTTATTACTATAACCCCCATATCACCAGGTATCTGTTTCAATATATGTTGTGTCTTTACGTTCTACCAGATTACTATATTCGCCTTCGCTCTTATTTAAGAAAAACTGGGATCCAAAGATAATCATCGGATGGAGAAGAATAACCCAGAGAAAGGCTCGTTTTCTTCCCTGGTCTCGGCTCATGTTTCCTCTAGCAAACGAATTAATGTGAGGGTCCAACAGCATCAAGGGGAATATAGTATCAAGCTACCGTTCTCGACCAAAAAGCTGATATCTGAATATGCCACTGTGACCCTCTTAGAGATCTTTTATAAAGGTTACATTTTCAACGCTCAGGGGTCAACTATCGAGATAGTTATACGGGACAAGAGGTCTGTCTCGCAAACAGAACAGAAGAGGCTATCGGTCATTATCCCAGCTTCTAAGTCTTGCTATTTGACAGTTAAGGGGTTTTCATCCTCCCCGATAGGAGAAGGGTGTCCGTATGAGGTTTCCTTAAAGACTGTGGTTCGCAATATAAAGTTTGGTGTCACCCTAGGGAAGTTAGACATACGGCCTCACCTATTCTATTCGAATCACTTTGAGGACGGTGACTATCTGACGGTCAGCAAAGTTGAAGGGCCGGAGTTAAGTCTTAAGAAAGGTTCACCCACAGACAGAGAGGCCCCTTATACAGTCTCTCTGATCCCCTCTGAATAAGACCTATTATATTATGGAGGGTCAATGCAGGGAATATAGAGGGCCCTGGTATACCCAGTATAAGGTGTGGATATGTATTGCCGTCGTTATTATCATGCTGGTGTGTTGTTACCTATTCCTGTGTGATATGTTGTCCCCAGAGATTCCTGTTGATGAGTTTCTAGATAACGAGGATTACACTTATAACACCGGGCCTGTCCCTCTCTATGAGCAATGGCTCAACTTCTGGCTTCCTGGCGAAGGGGACGAATGATACTATATAACTAAGTGATTCTGCAGTTTAGTGTGTAAACGGTGTCGTGTGAGAGCACAGGTCTCTTGTAGGTTTTGTGTCATCGGTCTGTCACGTCCGTTCTTATTGAAACTCTTTCTAATGCGTAAATGGAAGTAAAGTAGTTGTAGAGCCTGGGTACTGTTTCTAGGTCGAAGCTGCAGGTTTAGGTCGAGTGTTGCAATTACTGCAAACATATAAGAAAAACTGGGATCATAATAAAGGAGATTAGACAATCTACTGGAGCTGTCCGTTATGTCGATTCTGAAATATATATCTTCGTCTCCCTCTTCCATCGTATCTGTCACTTACAAATACTGGGGCCTGAGGATGGACATTTCGCTAGAGATGTCTAGCTCCTCAGAGATAGAGGGCACTAAAGTGCTTGAGGATTATTTGGTAGACGCAGCAGTTAGGATTGATCAAGATAACAAAGTGGAAGTTAGGAGAGAAGCCTTGCTATTTTACCTAATATTGTGGCTGTGTAAGAAGTTGCCGGGTGCTGTGAAATTCTCAAAGACCTCGATAAGGAAGGGGAGGGGGCCCTATCTATATAGGCTGGAGATCCCATCGCTACTGTTTTTGAAGACGGTGGGGTTGGAAATGGGAGAGCCGGTTATCGAAGGCTTTGAGCGGGAGCTATGCTTAATGAAAGACGACAAGATCATCAGAGAATCCAGACTCTCAGTGAAGTCTATGTCAATTAAGACATTCAAAAACTCCACGGTTGAGAACTTTATGGAAGCCAATCCTCATTGTGTCTGTTCACCTGTCATGACTGTTTCCAACTTCTGGTCGGTGGAAACCGTTATTAGAGATAAAGATGTCTTGAACACCATCTCATCCGTTTTCTCAAAGAAAAAGGAGAACAACCTAACTCTGTTTAGGTCTGTGAAATAAGAGAGACTCCCCGGTTATGTGATGTGCCAGCGCGTGTTTTTAGTTTTTCGTCAATGGCCACTCTTTAGTAGC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48,095
MT302543.1
Citrus-associated rhabdovirus
Zhang,S., Huang,A., Zhou,X., Li,Z., Dietzgen,R.G., Zhou,C.Y., Cao,M.
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences., National Center for Citrus Virus Exclusion
China
2020-08-05
PF3
Cytorhabdovirus caricae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,505
GenBank
1
China
China
Passiflora edulis
null
2018
null
null
Citrus-associated rhabdovirus isolate PF3, complete genome
GCGAACATAAAAGTTCGAATTTTTATATCCGCAGGAGGGCAATGAGCGAAATGCAATAGGCAGAAAGAATATAATTGGGAGCTATACTCAGCGATAGCGCAAAACTAGATTGTTCTGAAATTCTCTGTTCGAAGTAGGATCTTCATCAAGATGCCGAAAGTGTATAAGGATAACTCTGCTTACGCTAAAGAGATATTCACCCCGATAACTAAGGAAATATCTCACGGTAGGATCCAAAAGCAAACATGGACAGACCAGGTATTCGAGGAGATGCAAGTGTACAAGATCAACAAGTTCACTCCAGAGGACCTAGAGCGGTACGGGATGTACATGGTGGACTCAATCTCGAAAAAAGAGGTGTCCATGGACACTTGTTACGCTATACTCATCCTGGCTTGCCATCTGCACAAGATTGCTCCAGGAAAAGAATTCACCTTGTTTGAACTCCCGTTAAAGGGAAGTCTGCCCCTACCTAAGATGGAGGTGTTTGCAGCGTGGAACAAAGAGCAGGCTGAAGAGGGGGGAGAGGAAGACGGTAAAGGATCCGAGGATAGTGGTAGCGAGAGTGAACAGGAAGAGATCAGCGTGGACCCGAAAAAAGGAGTAGGAAAAAAGGCCTCAGATCCTCAGTCTGCAACAGCTATCGACAAGGAACGGGCCGCCAACTGTGTTAGGTTCTTTTGCTTTTGTGCTGCCTTCTATCTAAGGTTGTGTATCAAGGACATCCAGGATCTGAGTACTCCATACACAAGGATGAAGGAGCGATATACTCGGTTCTATCAAGGTGTCATCCCGTCTAGCGGAGAAGATGTTCCTCCCTCTGAGAGCGTAAAATCACTAAAGACGTTCTTTGCAGGGGATAGGATAATCAGCAGGACTTGGGTGAAGTTGTTTGTTCCTTGGCACGATAAGGCGGAAGTCGGCTCACCTCAAGACGGGATGGTAATCTATCTGGCCGTTCTACCTTTCGCTTTTTCTGGGATGCACGCCTTGAAGCTGATGGACGACGTGATCGAAATGACTCATCTTAAGGACACTGATCTGATCTACCAGATGATGCATCCTAGGCACAATGCTGCATTAGCTTCTATCTCTGAGATATATGCCAAGCACTACCCTGAAGAAGGAAGCAAAAAGAACACTTACGTGAAGTATGCTCGAGTCGTAGGGCCTCAGTTCTTCCCTGCATTGCAAACAAAGAAATGTAAGGGCTTGGTGTGTGTATTAGCCAATCTCGTGGTTTTGCACCAGAAGACCACAGAGGAGACTGGAGATCCTAGGAGTATAGCTGGAATTGATGACATTTCCGATGAGTTAATGAAGTTCGGAAGGAGGATGGCCAAGATAATGATGAGGAATGCACCAAAAACTGCCTCATACATGTATTCCAGCACAGCTAGGGAAGCAGAAGAGGGGGGCGATTCGACAGATGAGGAGTCGGAGGAAGACGAGGAGGATATCGATACGGAGCCTCTCAAAGTGGGCAGGCGAATCTACAAGCCCTGAAGATGATATGGTTCTGTCTAATAACAAGTGTTATAACCTTCTTATCATACCATGTCAATCGCAGTCTCTCCCTATGTCAGATCTATCACGACGCTTGAGTTTATCTGATTATTTAAGAAAAACCGGGAGCAAGACTCAAGCTTTAACTGTTTAGTGTTATTTGATTGCCAGTTGCGTTTCACTGCAGAGCAGAGATGTCAGGTGAAGAGATTGATGACAAGACCCTCCAAAAGGTCATCCAGGAAAATATCGAAGAGATTGCGAGGAAAGGCCCTCTACAGCGTGAAAACCTGTCTGGAGTGGAAGAGGAGACCAGTGACGCTTCCCCCCAAGAGCCGGAGGTTCCTGAAGAGAAGATTGTGGCGAATCCTCCTATGACTACTAAGGCCGAGGTTCATGCTGAACCAGAAAAAGAGGGGGTCCAAGTGACCCCTCCTGCAAAGACAACTCCTGCTAAGCAGGTGACCCCTAAGTATGTCGTTAAAGACAAGAAGAATGCGCTACTGAATGCCATTACCTCTCCTAGTAAGCCCCGTGACATAGCCAAGCCACCCTTGTCTTCTCCTCGCAAATCAGGGACAACAAGCGAAGCTTCCTCTCTAAAGGGGAGCTCCGATGACAACTCTGCATCAGAGTCAGAGAAGCCAAAGGGAGTTTCCTACAGTGTGGACGACCTAGAGAAGCTAGGGAAGAAACTGGCCACTAAGAAAGAAATTGAGGATTTCATGACCGAGCTGTGTAAACAGAAAGGGATAAACTACAAGAGGCAGTGGGGAAATGAGCTTACATCACGCCTGATCAAAGGCCAGCTAATGACTGAGGGGATCGTCGAAATCTTCTTAGCGGGGATAACTATGGAGAGGGCATATTCAGTCACAGAGGGGTTTGAGAAGACCGTGAAAGAACTGGCCGAGAAGGTAGCCAAGCTAGACAAGGTGAGCAACAACCTTATAGGGGGAGTCAAGAAAATGGACTCATCTATCAAGCGATTAGATGAGGTGAACCAGGATTCTATGAAAGAGGTTGAGACTGTTATGGCGGACCATAGGCATGCACTGGTGGAGGTGATTTCGATGATACCCTCTGACGTTCCTTCATCTGAAAATCCCACTAAGAGCAAAGATGAGAAAAAGAAACCTCCGAAGGTTGAGAAACCGCCAAGTAAGGAAGAAGAAGTCCTTGGTGAAGAGGTTAGCCTGTCCGAGCTGGATGAAGGAGGACTTGCTCTGGCGTTCTTAGACGAGATAGGGGCCAATGTCAAAGCTTCTGATCTTACAATAGTGTCCGATGCAATATGCCACTACATTGACTCTGATGAGATAAAGGGCTATCTATTAGAGGGGATACCCAACGGAGAGCGCCGAGGCCATCGTGATAGAGTGAAGAAATGTGTCAAGATGTACGTGGCCTATCTAGAGGCAGAGAAAGCGAGGAAGGGGAAAGAAGTAGGAAACGAGACCAAGGAGATGGGAGAAGGTGAAAAAGGGAAGAAGCGGAAGAAAAATATCAAGTCGTACTATTAGAGTCGGTGCCATTGACCTAAAACGGCCGTCTGGGCCTTTATTACTATGACCTCCACATAAATATCTATCTGTTTCGATGTTTGCTACGTCTCTATGTCCTAATATATATTAATGCGTTCGCTTTTACGTTCATTTAAGAAAAACTGGGATCTAAAGATAATCGTCGGATGGAGAAGACTAATTCAGAGAAAGGCTCGATTTCTTCCTTGGTTTCAGCTCATGTTTCTTCTAGCAAACGAATCCACGTGAGGGTCCAACAGCACCAAGAAGAGTATAGTATCAAGCTCCCGTTCTCAACTAAGAAGTTAACATCTGAGTACGCCACTGTGACCCTTTTAGAAATCTTCTATAAAGGTTACATTTTCAATGCTCAGGGGTCAACTATTGAGATAGTCATCCGAGATAAGAGGTCGGTTTCTCAAACTGAACAGAAGAGGTTATCGATTATTATCCCGGCTGCTAAGTCTTGCTACTTAACGGTTAAAGGGTTTTCATCTTCTCCGATAGGAGAGGGATGTCCGTATGAGGTTTCGTTAAAGACTGTGGTCCGCAACATAAAGTTTGGTATTACCCTAGGGAGGTTGGACATACGCCCCCACCTGTACTATTCTAATCATTTTGAGGACGGGGACTATCTGACAGTAAGCAAAGTTGAGGGGCCGGAGTTAAGTCTTAAGAAGGGTTCACCCACGGACAAAGAGGCTCCTTATACAGTCTCGCTCATCCCTTCTGAATAAGACCTCTTAGATATTGAAATGGAAGGACAGTGCAGGGAATATAGGGGACCCTGGTACACTCAGTGTAAGGTGTGGGCGTGTGTTGCTACTATTATCATCCTACTAGTGTGTTGTTACGTGTTCTTGTTTGATATGCTGTCACCAGAGATATCTGTTGATGAGCTCTTAGATACTGAAGATTACACTTATAACACTGGGCCTGTACCTCTATATGAACAATGGCTCAACTTCTGGCTTCCTGGTGATAGGGACGAATGATGCTGTATAATTAAGTTGTCTGGCAGTTCCGTTTGTATGTGTAACGGATGTTGTGTGGGAACACAAGTTCCTTATAGGTTTTATGTAGTCAGCTTGTTGTGTCTATTACAGTAAAAACCCCTTCAATGAGTGAGTTCAGCCGAACGTATTATTATGCTTGGGTATTGTTTCTAAGTCGAAACTGCAAGTGTTGGTCGAGTGTTGTAGTTACTACAAATATATAAGAAAAACTGGGATCACAATAAAAGAGATTACAGATTCTACCGGAGCTGTCCGTTATGTCGATTATGAAATATATATCTTCATCTCCCTCTCCCGTCTTGTCCGTTACTTACAAATATTGGGGACTAAGGATGGACATTTCACTAGAAATGTCCAGTTCATCAGAGATAGAGGGTACGAAAGTGCTTGAGGATTATTTGGTAGATGCTGCAGTCAGGATTGATCATGATAACAAAGTGGAGGTTAGAAGAGAAGCTCTACTATTTTACCTTATATTATGGTTGTGTAAGAAGTTGCCGGGTGCTGTGAAGTTCTCTAAGACCTCGATAAGGAAGGGGAGGGGTCCTTATTTGTATAGGTTGGAGATCCCACCTCTGCTGTTTTTGAAGACGGTAGGATTGGAAATGGGAGAACCGGTTATCGAGGGCTTTGAGCGGGAGCTATGCCTAATGAAGGATGACAAGATTATTAGAGAATCTAGATTGTCAGTGAAGTCGATGTCAATTAAGACATTTAAGAACTCCACGGTCGAGAACTTTATGGGAGCCAACCCTCATTGTGTTTGTTCACCAGTCATGACCGTCTCCAATTTCTGGTCGGTGGAAACTGTTATCAGGGATAAAGATGTCTTGAACACTATTTCATCCGTCTTTTCAAAGAAAAAGGAGAACAATCTAACTCTATTTCGGTCTGTCAAATAAAGGAGGCTCCCTGTTTGAGTGATGCACTAGTGTATGGTTCTGGTTTTCTTTAA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48,096
MT302544.1
Citrus-associated rhabdovirus
Zhang,S., Huang,A., Zhou,X., Li,Z., Dietzgen,R.G., Zhou,C.Y., Cao,M.
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences., National Center for Citrus Virus Exclusion
China
2020-08-05
PB1
Cytorhabdovirus caricae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,497
GenBank
1
China
China
null
null
2018
null
null
Citrus-associated rhabdovirus isolate PB1, complete genome
GCGAACATAAAAGTTCGAAATTTTATCTCCGCAGGAGGGCAATGGGCGAAATGCAATAGGCAGAAAGAATATAATTGGGAGCTACACTCAGCGATAGCGCAAAACTAGATTGTTCTGAAATTCTCTGTTCGAAGTAGGATCTTCATCAAGATGCCGAAAGTGTATAAAGATAACTCTGCTTACGCTAAAGAGATATTCACCCCGATAACTAAGGAAATATCTCACGGTAGGATCCAAAAGCAAACATGGACAGACCAGGTATTCGAGGAGATGCAAGTGTACAAGATCAACAAGTTCACTCCAGAGGACCTAGAGCGGTACGGGATGTACATGGTGGACTCAATCTCGAAAAAAGAGGTGTCTATGGACACTTGTTACGCTATACTCATCCTGGCTTGCCATCTGCACAAGATTGCTCCAGGAAAAGAATTCACCTTGTTTGAACTCCCGTTAAAGGGAAGTCTGCCCCTACCTAAGATGGAGGTGTTTGCAGCGTGGAACAAAGAGCAGGCTGAAGAGGGGGGAGAGGAAGACGGTAAAGGATCCGAGGAGAGTGGTAGCGAGAGTGAACAGGAAGAGATCAGCGTGGACCCGAAAAAAGGAGTAGGAAAAAAGGCCTCAGATCCTCAGTCTGCAACAGCTATCGACAAGGAACGGGCCGCCAACTGTGTTAGGTTCTTTTGCTTTTGTGCTGCCTTCTATCTAAGGTTGTGTATCAAGGACATCCAGGATCTGAGTACTCCATACACAAGGATGAAGGAGCGATATACTCGGTTCTATCAAGGTGTCATCCCGTCTAGCGGAGAAGATGTTCCCCCCTCTGAGAGCGTAAAATCACTAAAGACGTTCTTTGCAGGGGACAGGATAATCAGCAGGACTTGGGTGAAGTTGTTTGTTCCTTGGCACGATAAGGCGGAAGTCGGCTCACCTCAAGACGGGATGGTAATCTATCTGGCCGTTCTACCTTTCGCTTTTTCTGGGATGCACGCCTTGAAGCTGATGGACGACGTGATCGAAATGACTCATCTTAAGGACACTGATCTGATCTACCAGATGATGCATCCTAGGCACAATTCTGCATTAGCTTCTATCTCTGAGATATATGCCAAGCACTACCCTGAAGAAGGAAGCAAAAAGAACACTTACGTGAAGTATGCTCGAGTCGTAGGGCCTCAGTTCTTCCCTGCATTGCAAACAAAGAAATGTAAGGGCTTGGTGTGTGTATTAGCCAATCTCGTGGTTTTGCACCAGAAGACCACAGAGGAGACTGGAGATCCTAGGAGTATAGCTGGAATTGATGACATTTCCGATGAGTTAATGAAGTTCGGAAGGAGGATGGCCAAGATAATGATGAGGAACGCACCAAAAACTGCCTCATACATGTATTCCAGCACAGCTAGGGAAGCAGAAGAGGGGGGCGATTCAACAGATGAGGAGTCGGAGGAAGACGAGGAGGATATCGATACGGAGCCTCTCAAAGTGGGCAGGCGAATCTACAAGCCCTGAAGATGATATGGTTCTGTCTAATAACAAGTGTTATAACCTTCTTATCATACCATGTCAATCGCAGTCTCTCCCTATGTCAGATCTATCATGACGCTTGAGTTTATCTGATTATTTAAGAAAAACTGGGAGCAAGACTCAAGCTTTAACTGTTTAGTGTTATTTGATTGCCAGTTGCGTTTCACTGCAGAGCAGAGATGTCAGGTGAAGAGATTGATGACAAGACCCTCCAAAAGGTCATCCAGGAAAATATCGAAGAGATTGCGAGGAAAGGCCCTCTACAGCGTGAAAACCTATCTGGAGTGGAAGAGGAGACCAATGACGCTTCCCCCCAAGAGCCGGAGGTTCCTGAAGAGAAGATTGTGGCGAATCCTCCTATGACTACTAAGGCCGAGGTTCATGCTGAACCAGAAAAAGAGAGGGTCCAAGTGACCCCTCCTGCAAAGACAACTCCTGCTAAGCAGGTGACCCCTAAGTATGTCGTTAAAGACAAGAAGAATGCGCTACTGAATGCCATTACCTCTCCTAGTAAGCCCCGTGACATAGCCAAGCCACCCTTGTCTTCTCCTCGCAAATCAGGGACAACAAGCGAAGCTTCCTCTCTAAAGGGGAGCTCCGATGACAACTCTGCATCAGAGTCAGAGAAGCCAAAGGGGGCTTCCTACAGTGTGGACGACCTAGAGAAGCTAGGGAAGAAACTGGCCACTAAGAAAGAAATTGAGGATTTCATGACCGAGCTGTGTAAACAGAAAGGGATAAACTACAAGAGGCAGTGGGGAAATGAGCTTACATCACGCCTGATCAAAGGCCAGCTAATGACTGAGGGGATCGTCGAAATCTTCTTAGCGGGGATAACTATGGAGAGGGCATATTCAGTCACAGAGGGGTTTGAGAAGACCGTGAAAGAACTGGCCGAGAAGGTAGCCAAGCTAGACAAGGTGAGCAACAACCTTATAGGGGGAGTCAAGAAAATGGACTCATCTATCAAGCGATTAGATGAGGTGAACCAGGATTCTATGAAAGAGGTTGAGACGGTTATGGCGGACCATAGGCATGCACTGGTGGAGGTGATTTCGATGATACCCTCTGACGTTCCTTCATCTGAAAATCCCACTAAGAGCAAAGATGAGAAAAAGAAACCTCCGAAGGTTGAGAAACCGCCAAGTAAGGAAGAAGAAGTCCTTGGTGAAGAGGTTAGCCTGTCCGAGCTGGATGAAGGAGGACTTGCTCTGGCGTTCTTAGACGAGATAGGGGCCAATGTAAAAGCTTCTGATCTTACAATAGTGTCCGATGCAATATGCCACTACATTGACTCTGATGAGATAAAGGGCTATTTATTAGAGGGGATACCCAACGAAGAGCGCCGAGGCCATCGTGATAGAGTGAAGAAATGTGTCAAGATGTACGTGGCCTATCTAGAGGCAGAGAAAGCGAGGAAGGGGAAAGAAGCAGGAAACGAGACCAAGGAGATGGGAGAAGGTGAAAAAGGGAAGAAGCGGAAGAAAAATATCAAGTCGTACTATTAGAGTCGGTGTCATTGACCTAAAACGGCCGTCTGGGCCTTTATTACTATGACCTCCACATAAATATCTATCTGTTTCGATGTTTGCTACGTCTCAATGTCTTAATATATATTAATGCGTTCGCTTTTACGTTCATTTAAGAAAAACTGGGATCTAAAGATAATCATCGGATGGAGAAGACTAATTCAGAGAAAGGCTCGATTTCTTCCTTGGTTTCAGCTCATGTTTCTTCTAGCAAACGGATCAACGTGAGGGTCCAACAGCACCAAGAAGAGTATAGTATCAAGCTCCCGTTCTCAACTAAGAAGCTGACATCTGAGTACGCCACTGTGACCCTTTTAGAAATCTTCTATAAAGGTTACATTTTCAATGCTCAGGGGTCAACTATTGAGATAGTCATCCGAGATAAGAGGTCGGTTTCTCAAACTGAACAGAAGAGGTTATCGATTATTATCCCGGCTGCTAAGTCTTGCTACTTAACGGTTAAAGGGTTTTCATCTTCTCCGATAGGAGAGGGATGTCCGTATGAGGTTTCGTTAAAGACTGTGGTCCGCAACATAAAGTTTGGTATTACCCTAGGGAGGTTGGACATACGCCCCCACCTGTACTATTCTAATCATTTTGAGGACGGGGACTATCTGACAGTAAGCAAAGTTGAGGGGCCGGAGTTAAGTCTTAAGAAGGGTTCACCCACGGACAAAGAGGCTCCTTATACAGTCTCGCTCATCCCTTCTGAATAAGACCTCTTATATATTGAAATGGAAGGACAGTGCAGGGAATATAGGGGACCCTGGTACACTCAGTGTAAGGTGTGGGCGTGTGTTGCTACTATTATCATCCTACTAGTGTGTTGTTACGTGTTCTTGTTTGATATGCTGTCACCAGAGATACCTGTTGATGAGCTCTTAGATACTGAAGATTACACTTATAACACTGGGCCTGTACCTCTATATGAACAATGGCTCAACTTCTGGCTTCCTGGTGATAGGGACGAATGATGCTACATAATTAAGTTGTCTGGCAGTTCCGTTTGTGTGTGTAACGGATGTTGTGTGGGAACACGAGTTCCTTATAGGTTTTATGTAGTCAGCTTGTTGTGTCTATTACAGCAGAAACTCCTTTAATGAGTAAGTTCAGCCGAACGTATTATTATGCTTGGGTATTGTTTCTAAGTCGAAACTGCAAGTGTTGGTCGAGTGTTGTAGCTACTACAAATATATAAGAAAAACTGGGATCACAAGAAAAGAGATTACAGATTCTACTGGAGCTGTCCGTTATGTCGATTATGAAATATATATCTTCATCTCCTTCTCCCGTCTTGTCCGTTACTTACAAATATTGGGGACTAAGGATGGACATTTCACTAGAAATGTCCAGTTCATCAGAGATAGAGGGTACGAAAGTGCTTGAGGATTATTTGGTAGATGCTGCAGTCAGGATTGATCAAGATAACAAAGTGGAGGTTAGAAGAGAAGCTCTACTATTTTACCTTATATTATGGTTGTGTAAGAAGTTGCCGGGTGCTGTGAAGTTCTCTAAGACCTCGATAAGGAAGGGGAGGGGTCCTTATTTATATAGGTTGGAGATCCCACCTCTGCTGTTTTTGAAGACGGTAGGATTGGAAATGGGAGAACCGGTTATCGAGGGCTTTGAGCGGGAGCTATGCCTAATGAAGGATGACAAAATTATTAGAGAATCTAGATTGTCAGTGAAGTCGATGTCAATTAAGACATTTAAGAACTCCACGGTCGAGAACTTTATGGGAGCCAACCCTCATTGTGTTTGTTCACCTGTCATGACCGTCTCCAATTTCTGGTCAGTGGAAACTGTTATAAGGGATAAAGATGTCTTAAACACTATTTCATCCGTCTTTTCAAAGAAAAAGGAGAACAATCTAACTCTATTTCGGTCTGTCAAATAAAGGAGGCTCCTTGGTTGAGTGATGCACTAGTGTATGGTTCTGGTTTTTCTTTA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48,097
MT302545.1
Citrus-associated rhabdovirus
Zhang,S., Huang,A., Zhou,X., Li,Z., Dietzgen,R.G., Zhou,C.Y., Cao,M.
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences., National Center for Citrus Virus Exclusion
China
2020-08-05
C1
Cytorhabdovirus caricae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,496
GenBank
1
China
China
Citrus
null
2018
null
null
Citrus-associated rhabdovirus isolate C1, complete genome
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48,098
MT302546.1
Citrus-associated rhabdovirus
Zhang,S., Huang,A., Zhou,X., Li,Z., Dietzgen,R.G., Zhou,C.Y., Cao,M.
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences., National Center for Citrus Virus Exclusion
China
2020-08-05
C2
Cytorhabdovirus caricae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,498
GenBank
1
China
China
Citrus
null
2018
null
null
Citrus-associated rhabdovirus isolate C2, complete genome
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48,099
MT302547.1
Citrus-associated rhabdovirus
Zhang,S., Huang,A., Zhou,X., Li,Z., Dietzgen,R.G., Zhou,C.Y., Cao,M.
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences., National Center for Citrus Virus Exclusion
China
2020-08-05
C3
Cytorhabdovirus caricae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,526
GenBank
1
China
China
Citrus
null
2018
null
null
Citrus-associated rhabdovirus isolate C3, complete genome
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48,100
NC_002657.1
Classical swine fever virus
Mayer,D., Thayer,T.M., Hofmann,M.A., Tratschin,J.D., Thayer,T.T.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2001-01-28
null
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,301
RefSeq
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA485481
Classical swine fever virus, complete genome
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