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Classical swine fever virus
Choudhury,F.A., Rajkhowa,T.K., Kiran,J.
C. V. Sc & A. H., Central Agricultural University, Veterinary Pathology
India
2024-02-05
CSFV/ASM/IND/L1
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
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Classical swine fever virus isolate CSFV/ASM/IND/S1, complete genome
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9,105
PP209412.1
Classical swine fever virus
Choudhury,F.A., Rajkhowa,T.K., Kiran,J.
C. V. Sc & A. H., Central Agricultural University, Veterinary Pathology
India
2024-02-05
CSFV/ASM/IND/S2
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,301
GenBank
null
India: Sonapur
India
Sus scrofa
null
2023-07-12
null
null
Classical swine fever virus isolate CSFV/ASM/IND/S2, complete genome
GTATACGAGGTTAGTTCATTCTCGTATGCATGATTGGGCAAACTAAAATTCCGATTTGGTTTAGGGCGCCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCCCATAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCCGTAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGGGCATAAGCCCACCTCGAGATGCTACGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTGGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACGACGTGATGGGGGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTAACAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCATATGGAGTTGAATCATTTTGAACTATTATACAAAACAAACAAACAAAGACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTGTACGACATCACAGGGAGACCATTATTTGGGGGCTCAAGTGAGGTACACCCACAGTCAACACTGAAGCTGCCGCACGACAGGGGGAGAGGCAACGTCAGAACAACACTGAAAGACCTACCTAGGAAAGGTGACTGTAGGAGTGGCAACCATCTAGGCCCGGTTAGTGGGATATACGTGAAGCCTGGCCCCGTATTCTATCAGGACTACATGGGCCCCGTTTATCACAGGGCTCCTTTAGAGTTCTTCGATGAGGCCCAATTTTGTGAGGTGACCAAGAGAATAGGTAGGGTGACGGGTAGTGACGGAAAACTCTACCACATGTACGTGTGCACTGATGGTTGCATACTGCTGAAGCTAGCCAAGAGGGACGAGCCAAGAACCCTAAAGTGGACAAGGAATTTCACCAACTGTCCATTGTGGGTTACTAGTTGTTCAGATGACGGCGCGAGTGGCGGTAAGGATAAGAAGCCGGACAGAATGAACAAGGGTAAATTGAAGATAGCCCCAAGAGAACACGAGAAGGACAGCAAAACTAAGCCTCCTGATGCCACGATCGTGGTGGAAGGAGTAAAATATCAAGTAAAAAAGAAAGGTAAAGTCAAAGGGAAAAATACTCAAGATGGCCTATACCATAACAGGAACAAACCACCGGAGTCCAGGAAGAAACTAGAAAAAGCCCTGTTGGCTTGGGCGGTAATAGCAATTATGTTGTACCAACCAGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGACAACGGCACTAATGGTATCCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTTAGCAGGAGCTTGCACGGGATCTGGCCTGAAAAAATATGCAAAGGAGTCCCCACCTACCTGGCCACAGACACGGAACTGAAAGAAATACAGGGGATGATGGATGCAAGTGAGAGAACAAACTACACATGCTGTAGGTTACAGAGACACGAATGGAACAAACATGGATGGTGCAACTGGTACAACATAGACCCTTGGATTCAGTTGATGAACAGGACCCAAACAAATTTGACAGAGGGCCCCCCAGATAAAGAGTGTGCAGTGACTTGCAGGTACGATAGAAATGCTGATGTCAACGTGGTCACTCAGGCCAGAAATAGGCCAACCACTCTGACTGGTTGCAAGAAGGGAAAAAACTTTTCCTTCGCAGGTACAGTCATAGAAGGCCCATGCAACTTCAACGTATCCGTGGAGGACATTTTATATGGAGATCATGAGTGTGGCAGCCTGCTTCAGGACACGGCTCTGTACCTACTGGATGGGATGACTAACACTATAGAGGATGCCAGACAGGGAGCAGCGAGGGTAACATCTTGGCTCGGGAGGCAACTCAGCACTGCCGGGAAGAGGTTGGAGGGTAGGAGCAAAACTTGGTTCGGCGCCTATGCCCTGTCACCCTACTGCAACGTAACAAGGAAAATAGGGTACATATGGTACACAAACAATTGCACCCCGGCATGTCTCCCCAGAAACACAAAAATAATAGGCCCTGGGAAATTTGACACCAACGCAGAAGACGGGAAGATTCTCCATGAAATGGGGGGCCACTTATCAGAATTCTTGTTGCTTTCCCTGGTAATCCTGTCTGACTTCGCCCCTGAGACGGCCAGTGCGTTGTACCTGATCTTACACTATGCGATCCCTCAGTCCTACGAAGAACCTGAAAGTTGTGACACGAACCAGCTCAACCTAACAGTGGGGCTTAAGACAGAAGATGTAGTGCCGTCATCGGTCTGGAATATAGGCAAATATGTGTGTGTTAGACCAGACTGGTGGCCGTATGAAACCAAAGTAGCCCTGCTATTTGAAGAGGCAGGACAGGTCATAAAACTAGTCCTAAGGGCACTGAGAGACCTGACTAGGGTTTGGAATAGCGCATCAACCACCGCATTCCTCATCTGCCTGATAAAAGTACTGAGAGGGCAGATTGTGCAAGGTATAATATGGCTACTGCTGGTGACCGGGGCTCAAGGGCGATTAGCCTGCAAGGAAGACTACAGGTATGCGATATCGTCAACCGATGGGATAGGGCTGCTGGGGGCTGAAGGCCTCACCACCACATGGAAAGAATACAGCCATGGTTTGCAGCTGAATGACGGGACCGTCAAGGCCATTTGCATTGCAGGGTCTTTTAAAGTCACAGCCCTTAATGTGGTCAGTAGGAGGTATTTGGCATCATTGCATAAGGAGGCTTCACTCACTTCCGTGACATTTGAGCTCCTGTTCGACGGGACCAACCCATCAACTGAGGAGATGGGAGATGATTTTGGGTTTGGACTGTGCCCATTTGACACGAGTCCAGTGGTCAAAGGGAAGTACAACACCACTCTATTAAACGGCAGCGCTTTCTACCTAGTCTGCCCAATAGGATGGACGGGTGTCATAGAGTGCACTGCGGTGAGCCCCACAACTTTGAGGACGGAGGTGGTAAAAACTTTTAGGAGAGAGAAGCCTTTTCCGCACAGAATGGATTGTGCGACCACCACAGTGGAAAATGGAGATTTATTCTACTGTAAGTTGGGGGGTAACTGGACTTGTGTGAAAGGCGATCCAGTGACCTACATAGGGGGGCAAGTGAAACAATGCAGGTGGTGCGGTTTTGACTTCAAGGAGCCTAACGGGCTCCCACACTACCCTATAGGCAAATGCATCTTAGCAAATGAGACAGGTTACAGGATAGTGGATTCCACAGGCTGCAACAGAGATGGTGTTGTAATCAGCACAGATGGGAGTCATGAGTGCTTGATTGGCAATACAACCGTCAAGGTGCACGCGTCCGACGAAAAGCTGGGCCCTATGCCGTGCAGACCCAAGGAAATCGTCTCTAGCGCGGGGCCCGTAAGGAAAACTTCCTGTACATTCAACTACACAAAGACTCTGAGAAATAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGTTACTTCCAGCAATATATGCTTAAGGGTGAGTACCAATACTGGTTTGATCTGGACGTGACCGACCATCACACAGATTACCTTGCAGAATTTGTCGTCATGGTGGTGGTAGCACTATTGGGGGGAAGGTACGTGCTATGGCTAATAGTGACCTATATTGTCTTAACAGAGCAACTTGCTGCTGGTCTACAACTAGGCCAGGGCGAGGTAGTACTGATAGGGAATTTAATTACTCACACAGACAATGAGGTAGTGGTATACTTCTTACTACTCTACCTAATAATAAGGGATGAGCCCATAAAGAGATGGATACTACTGCTGTTCCATGCAATGACCAACAACCCAATTAAAACCATAACGGTGGCATTGCTAATGATCAGTGGGGTTGCCAGGGGTGGTAAGATGGATGGTGGTTGGCAGAGGCAGCCTGAGAACGGTTTTGACATCCAACTTGCGTTGGCTGTCATAGTAGTCGTTGTGATGCTATTGGCAAAGAGGGACCCAACTACTTTCCCCTTGGTTATAACAGTGGCAACCCTGAGAACGGCTAAGATGACTAATGGACTTAGCACGGATATAGCCATAGCTACAGTGTCAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTATATCAGTGACTATTACAAATACAAGACCTGGCTACAGTACCTTATTAGCACAGTGACAGGTATCTTCTTAATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGTTGGATTTACACACTCCAACCTTGCCATCTTACAGACCCCTCTTCTTCATTCTCGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGAATCTGGACATAGCCGGATTGCTGTTGCAGTGTGTCCCAACCCTTTTGATGGTTTTTACGATGTGGGCGGATATTCTCACCCTAATTCTAATACTGCCCACTTATGAGCTAACAAAATTGTACTACCTTAAGGAAGTGAAGACTGGGGCAGAAAAGGGCTGGTTATGGAAGACCAACTTCAAGAGGGTAAACGACATATACGAAGTTGACCAATCTGGTGAAGGGGTTTACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCAATAACAGGTACCATGTTGCCGCTGATTAAAGCCATACTCATTAGTTGCATTAGTAATAAATGGCAACTCATATACTTACTGTACCTGATATTTGAAGTGTCCTACTACCTCCACAAGAGAGTCATAGATGAAATAGCAGGTGGGACCAACTTCGTCTCAAGACTCGTGGCTGCTTTAATTGAAGTTAATTGGGCTTTCGACAATGAAGAAGTTAAAGGTTTGAAGAAATTCTTCCTGTTGTCTAGTAGGGTCAAAGAGCTGATCATCAAACACAAAGTCAGGAATGAAGTAGTAGCCCACTGGTTTGGAGAAGAAGAAATTTATGGGATGCCGAAGTTGGTCGGCTTGGTTAGGGCAGCAACACTAAGTAGAAGCAAACACTGCATCTTGTGCACCGTCTGTGAGGACAGAGACTGGAGGGGAGAAACTTGCCCGAAATGCGGGCGTTTCGGGCCACCAGTGATCTGTGGCATGACTCTAGCCGATTTTGAAGAAAAACACTATAAGAGGATCTTTTTTAGAGAGGATCAATCAGAAGGGCCGGTTAGAGAGGAGTACG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9,106
OR997840.1
Classical swine fever virus
Hinojosa,Y., Liniger,M., Gerber,M., Coronado,L., Frias,M.T., Perera,C.L., Ganges,L., Ruggli,N.
Institute of Virology and Immunology IVI, Virology
Switzerland
2024-01-10
CSFV/Margarita/1958
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,298
GenBank
null
Cuba
Cuba
Sus scrofa domesticus
null
1958
null
null
Classical swine fever virus isolate CSFV/Margarita/1958, complete genome
GTATACGAGGTTAGCTCATTCTCGTATACATGATCGGACAAATCAAAATCTCAATTTGGTTCAGGGCCTCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCCCACAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCCATAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGCCCTGAGTACAGGGCAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCAGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACTCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACATCACGTGATGGGAGTACGACCTGATAGGGCGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCATTTTGAACTTTTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTGTACGATATCACGGGGAGGCCGTTGTTTGGAGACCCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACATTGAAGATACCACACGACAGGGGGAGAGGCAATATCAAAACAACACTGAATAACCTACCCAGGAAAGGCGACTGCAGGAGTGGCAACCACCTAGGCCCAGTTAGCGGGATATACGTAAAGCCTGGCCCTGTCTTTTATCAGGACTACATGGGTCCAGTCTACCATAGGGCCCCTCTAGAGTTTTTTGGCGAAGCGCGGTTTTGTGAGGTAACCAAAAGGATTGGTAGGGTGACAGGTAGTGACGGAAAGCTTTACCATATATACGTGTGCATCGATGGTTGCATACTGTTGAAGCTAGCAAAAAAGGGCGAGCCAAGAACCCTGAAGTGGATTAGAAACTTCACCGACTGCCCATTGTGGGTCACCAGTTGTTCTGATGATGGCGCAAGTGGGAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGTAAGTTAAAGATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAGAACCAAGCCACCTGATGCTACTATTGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTCAAGAAGAAAGGTAAAGTTAAAGGAAAGAATACCCAAGACGGCCTGTATCACAACAAGAATAAACCACCAGAGTCCAGGAAGAAATTGGAAAAAGCCCTATTGGCATGGGCAGTAATAGCAATTTTCATGTACCAACCTGTTGCAGCTGAAAACATAACTCAATGGAACCTGAGTGACAACGGCACTAATGGTATCCAGCATGCTATGTACCTAAGAGGGGTTAACAGAAGCTTGCATGGGATCTGGCCGGAAAAAATATGCAAGGGAGTCCCCACCCACCTGGCTACAGACATGGAACTGAAAGAAATACAGGGAATGATGGACGCCAGTGAGGGGACAAACTATACATGCTGTAAGTTGCAGAGACATGAATGGAACAAACATGGATGGTGTAACTGGTATAATATAGACCCTTGGATCCAGTTGATGAATAGAACCCAAGCAAACTTGACGGAAGGCCCTCCGGAAAGGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTATGATAAAGATGCTGACATCAACGTGGTTACCCAGGCTAGAAACAGGCCAACCACCCTAACTGGATGCAAGAAAGGGAAAAATTTTTCATTTGCAGGCACAGTTATAGAAGGCCCATGCAATTTCAACGTTTCCGTGGAGGACATCTTGTATGGGGACCATGAGTGTAGCAGCCTACTCCAGGACACGGCTCTGTACCTAGTAGATGGAATGACCAACACTATAGAGAATGCCAGGCAAGGAGCGGCAAGGGTAACTTCTTGGCTCGGGAGGCAACTCAGAACTGCCGGGAAGAGGTTGGAGGGTAGAAGCAAAACCTGGTTTGGTGCCTATGCCCTATCACCTTATTGCAACGTAACAAGTAAGATAGGCTACGTATGGTATACTAACAACTGTACCCCTGCTTGCCTCCCCAAAAACACAAAGATAATAGGCCCCGGAAAATTTGACACTAATGCGGAAGACGGAAAGATTCTCCATGAGATGGGGGGCCACCTATCAGAATTTCTGTTGCTCTCGCTGGTCGTTCTGTCCGATTTTGCCCCTGAAACGGCCAGCATGCTATACCTCATCCTACACTACGCCATCCCTCAATACCATAAAGAACCTGAAGGCTGTGACACTAACCAACTGAATCTAACAGTGGAGCTCAGGACTGAGGACGTAATACCTTCATCAGTCTGGAACCTTGGCAAATATGTATGTGTTAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTGGCCTTGTTATTTGAAGAGGCAGAACAGGTCATAAAGTTAGCCTTACGGGCAGTGAGGGATCTGACCAGGGTTTGGAATAGCGCATCAACAACGGCATTCCTCATCTGCTTGATAAAAGTATTACGAGGACAGATCGTACAAGGTGTGATATGGCTGCTGCTGGTTACTGGAGCACAAGGGCGGCTAGCCTGCAAGGAAGATTTCAGGTACGCAATATCATCAACCAATGAGATAGGGCTGCTTGGGGCTGAAGGTCTCACCACCACCTGGAAAGATTACGACCACAATTTACAACTGGATGACGGGACCATCAAGGCTATCTGCACGGCAGGTTCTTTTAAAGTCATAGCGCTTAATGTGGTCAGTAGGAGGTACCTGGCATCATTGCATAAGGGGGCTTTACCCACTTCCGTGACATTCGAGCTCCTGTTTGACGGGACCAGCCCATCAATTGAGGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGACTGTGCCCATTCGATACGAGCCCTGTAGTCAAAGGAAGGTACAATACAACCTTGCTGAACGGTAGTGCTTTCTATCTTGTCTGCCCGATAGGGTGGACGGGTGTCATAGAGTGCACGGCAGTGAGCCCGACAACTCTGAGAACAGAAGTGGTAAAGACATTCAGGAGAGAGAAGCCCTTCCCGCACAGAAAGGATTGCGTGACCACTACAGTGGAAAATGAAGATCTATTCTACTGTAGGTTAGGTGGCAATTGGACATGTGTAAAAGGTGAACCAGTGATCTACACGGGGGGGTTAGTTAAACAATGCAGGTGGTGCGGCTTCGACTTCAATGAGCCTGACGGACTCCCACACTACCCCATAGGTAAGTGTATCCTGGCAAATGAGACAGGTTACAGAATAGTGGATTCTACGGACTGTAACCGAAATGGCGTCGTAATCAGCACAGAGGGGAGTCACGAATGCCTGATCGGTAACACCTCTGTCAAGGTGCATGCATTGGATGAAAGACTGGGACCTATGCCGTGCAGACCTAAAGAGATCGTCTCTAGTGAGGGACCTGTGAGGAAGACTTCCTGCACATTTAACTACACAAAAACTTTGAGGAACAAGTACTATGAACCCAGGGACAGCTATTTCCAGCAATATATGCTTAAGGGTGAGTATCAGTACTGGTTTGACCTGGACGTGACTGACCACCACTCAGACTACTTTACGGAATTTCTTGTCTTGGTGGTGGTGGCACTGTTAGGGGGAAGGTATGTCCTGTGGCTAATAGTGACCTATGTAGTTCTAACAGAACAACTCGCCGCTGGCCTACAGTTGGGCCAGGGTGAGGTAGTATTAATAGGGAACTTAATCACCCACACAGACATTGAGGTTGTAGTATATTTCTTACTGCTCTATTTGATCATGAGAGATGATCCTATAAAGAAATGGATACTGCTGCTGTTCCACGCTATGACTAACAATCCAGTTAAGACCTTAACGGTAGCGTTGCTTATGATTAGCGGGGTTGCCAAGGGTGGAAGGATAGATGGCGGTTGGCAACGGCAGCCGGAGACCAGCTTCGACATCCAACTCGCACTGACAGTTGTAGTGGTCGCTGTGATGTTGCTAGCAAGGAGAGACCCGACCACCGTTCCCCTGGTCATAACAGTAGCAGCCCTGAGAACGGCTAAGATAACTAATGGACTTAGTACAGATCTAGCCATAGCTACAGTGTTAACAGCGTTACTGACCTGGACCTACATTAGTGACTATTATAGATACAAGACTTGGCTACAGTACCTTATCAGCACAATGACAGGTATCTTCTTAATAAGGGTACTGAAGGGGATAGGTGAGTTAGATTTGCACACCCCAACCTTGCCATCTTACAGACCCCTCTTCTTTATCCTCGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGAATCTGGACGTAGCCGGATTGCTGTTACAGTGTGTCCCAACCCTTCTAATGGTTTTTACGATGTGGGCAGACATCCTCACCCTGATCCTCATACTGCCCACCTACGAGTTGACAAAACTGTATTACCTCAAGGAAGTGAAGATCGGGGCAGAGAGGGGTTGGCTATGGAAGACCAACTACAAGAGGGTGAACGACATATATGAAGTTGACCAAGCTAGTGAAGGGGTGTACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCAATAACAGGTACTATGTTGCCATTAATCAAAGCTATACTCATCAGCTGCATCAGTAATAAGTGGCAGTTCATATACCTATTGTACTTAATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCACAAAAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGAACCAACTTCATCTCAAGACTTGTAGCTGCTTTGATCGAAGCCAATTGGGCCTTTGACAACGAAGAAGTTAGAGGTTTAAAGAAGTTCTTCCTATTGTCTAGTAGGGTTAAAGAACTGATCATCAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAATGGTCCACTGGTTCGGTGACGAAGAGGTTTATGGGATGCCGAAGTTGGTTGGCTTGGTCAAGGCAGCAACATTGAGTAAAAATAGGCACTGTATTTTGTGCACCGTCTGTGAAGACAGGGAGTGGAGAGGTGAAACCTGCCCAAAATGCGGGCGTTTTGGGCCACCAGTGACCTGTGGCATGACTCTAGCCGACTTTGAAGAAAAACACTATAAGAGGATCTTTATTAGAGAGGATCAATCAGAAGGACCGGTTAGAGAGGAGTATG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9,675
OR459954.1
Classical swine fever virus
Zhang,F., Dong,Y., Cui,J., Zhang,H.
China Animal Health and Epidemiology Center, Department of Livestock Diseases Surveillance
China
2023-10-04
null
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,222
GenBank
null
China
China
Sus scrofa
null
2018
null
null
Classical swine fever virus strain LX/2018, complete genome
CAATCAAATTTTCAATTTGGTTCAGGGCCTCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCCCACAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCCGTAGTGGCGAGCCCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCAGAAGCCCACCTCGAGATGCTACGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCACGTGATGGGAGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCATTTTGAACTTTTATACAAAACAAATAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTATACGATGCCACGGGGAGACCACTGTTTGGAGACCCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACACTGAAGCTACCACATGATAGGGGGAGAGGCAACATCAAAACAACACTGAAGAACCTACCTAGGAAAGGCGACTGCAGGAGCGGCAACCATCTAGGCCCGGTTAGCGGGATATATGTAAAGCCTGGCCCCGTCTTTTATCAGGACTACATCGGCCCAGTCTACCATAGAGCCCCCCTAGAGTTTTTTAATGAGGCGCAGTTTTGTGAGGTGACCAAAAGGATAGGTAGGGTGACAGGTAATGACGGAAAGCTTTACCATATATATGTGTGCATCGATGGTTGCATACTACTGAAGCTAGCCAAGAGGGGCGAGCCAAGAACCCTGAAGTGGATTAGAAATTTCACCGACTGCCCATTGTGGGTTACCAGTTGCTCTGATGATGGCGCGAGTGGAAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGTAAATTAAAGATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAGAACTAAGCCACCTGACGCTACGATTGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTCAAAAAGAAAGGCAAAGTTAAAGGAAGGAATACCCAAGACGGCCTGTACCACAACAAGAACAAACCACCAGAATCTAGGAAGAAATTAGAAAAAGCCCTGTTGGCATGGGCGGTAATAGCAATTGTGTTGTACCAACCAGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGACAACGGCACTAATGGTATCCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTCAGAAGAAGCTTGCATGGGATCTGGCCAGAAAAAATATGTGAAGGAGTCCCCACCCATCTGGCCACAGACACAGAACTGAGAGAAATACAGGGAATGATGGATGCCAGCGAGGGAACAAACTATACGTGCTGTAAGTTACAGAGACATGAATGGAACAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAATATAGACCCCTGGATACAGTTGATGAATAGAACCCAAGCAAAATTGGCAGAAGGCCCTCCGGCCAAGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTACGATAAAGATGCTGACATCAACGTGGTCACCCAGGCCAGAAACAGGCCAACGACCTTGACCGGCTGCAAGAAAGGGAAAAATTTTTCTTTTGCGGGTACAATTATAGAGGGCCCATGTAATTTCAATGTTTCAGTGGAGGACATCTTGTATGGGGATCATGAGTGCGGCAGTTTGCTCCAAGACACGGCTCTGTACCTAGTAGATGGAATGACCAACACTATAGAGAATGCCAGGCAGGGAGCAGCGAGGGTAACATCTTGGCTCGGGAGGCAACTCAGAATTGCCGGGAAGAGGTTGGAGGGTAGAAGCAAAACCTGGTTCGGTGCCTATGCCCTATCACCTTACTGTAATGTAACAAGCAAAATAGGGTACATATGGTACACTGATAACTGCACCCCGGCTTGCCTCCCCAAAAATACAAAGATAATAGGCCCCGGTAAATTTGACACTAATGCGGAAGATGGAAAGATTCTCCATGAGATGGGGGGCCATCTGTCAGAATTTCTGCTGCTCTCTCTGGTTGTTCTGTCTGACTTCGCCCCTGAAACAGCCAGCGCGTTATACCTCATTTTTCACTACGTGATTCCTCAATCTCATGAAGAACCTGAAGGCTGCGACACAAACCAGCTGAATCTAACAGTGGAACTCAGGACTGAAGACGTAATACCGTCATCAGTCTGGAATGTTGGCAAATATGTGTGTGTTAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTGGCTTTGGTATTTGAAGAGGCAGGACAGATCGTAAAGTTGGCCTTACGGGCGCTGAGGGATTTAACCAGGGTTTGGAATAGCGCATCAACCACGGCATTCCTCATCTGCTTGATAAAAGTATTAAGAGGACAGATCGTGCAAGGTGTGATATGGCTGCTACTAGTAACTGGGGCACAAGGCCGGCTAGCCTGCAAGGAAGATTACAGGTACGCAATATCATCAACTAATGAGATAGGGCTACTCGGGGCCGGAGGTCTCACCACCACCTGGAAAGAATACAGCCACGATTTGCAATTGAATGACGGGACCGTTAAGGCCATTTGCGCGGCAGGTTCTTTTAAAGTCATAGCACTTAATGTGGTCAGTAGGAGGTATTTGGCATCATTGCATAAGGAGGCTTTACCCACTTCCGTGACATTCGAGCTCCTATTCCACGGGACCAACCCATCAACTGAGGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGGCTGTGCCCGTTCGATACGAGTCCTGTCGTCAAGGGAAAGTACAATACAACCTTGTTGAACGGTAGTGCTTTCTATCTTGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGTGTTATAGAGTGCACAGCAGTGAGCCCAACAACTCTGAGAACAGAAGTGGTAAAGACCTTCAGGAGAGAGAAGCCCTTTCCGCACAGAATGGATTGTGTAACCACAACAGTGGAAAATGAAGATTTATTCTACTGTAAGTTGGGGGGCAACTGGACATGTGTGAAAGGTGAACCAGTGGTTTACACAGGGGGGCTGGTAAAACAATGCATATGGTGTGGCTTCGACTTCAATGAGCCTTACGGACTCCCACACTACCCCATAGGTAAGTGCATTTTGGCAAATGAGACAGGTTACAGAATAGTAGATTCAACGGACTGTAACAGGGATGGTGTTGTAATCAGCACAGATGGGAGTCATGAGTGCCTGATCGGTAACACAACTGTCAAGGTGCATGCATCAAATGAAAGACTGGGCCCTATGCCATGCAGACCTAAAGAGATTGTCTCTAGTGCAGGACCTGTAAGGAAAACTTCCTGTACATTCAACTACGCAAAAACTTTGAAGAACAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGCTACTTCCAGCAATATATGCTTAAGGGCGAGTATCAGTACTGGTTTGACCTGGACGTGACTGACCACCACTCAGATTACTTCGCAGAATTTGTTGTCTTGGTGGTGGTAGCACTGTTAGGAGGAAGATATGTCCTGTGGCTAATAGTGACCTACATAGTTCTAACAGAACAACTCGCCGCTGGTTTACCATTGGGCCAGGGTGAGGTAGTGTTGGTAGGGAACTTAATTACCCACACAGACATTGAGGTCGTAGTATATTTCTTACTACTCTATTTGGTCATGAGGGATGAGCCTATAAAGAAATGGATACTGCTGCTGTTCCATGCTATGACTAACAGTCCAGTCAAGACCATAACAGTGGCATTGCTTATGTTTAGCGGGGTCGCCAGGGGTGGAAAGATAGATGGCGGTTGGCAGCGTCTGCCGGAGACCAGCTTTGACATCCAACTCGCACTGACAGTTATAGTAGTCTCTGTAATGTTGCTGGCAAAGAGAGATCCGACTACTGTCCCCTTGGTTATAACGGTGGCAACCCTGAGAACGGCTACGGTGACTAGTGGACTTGGCACGGATATGGCCATAGCTACAGTGTTAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTACATTTGTGACTATTATAGATACAAGACTTGGCTACAGTACCTTATTAGCACAGTGACAGGCTTCTTTTTGATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGTTGGATTTACACACTCCAACCTTGCCATCTTATAGACCCCTCTTCTTCATTCTCGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGAATCTGGACATAGCCGGATTGCTGTTGCAGTGTGTCCCAATCCTTTTGATGGTTTTCACGATGTGGGCAGACATTCTCACCTTGATCCTCATACTGCCCACTTACGAGTTAACTAAATTATATTACCTCAAGGAAGTGAAGATTGGGGCAGAAAGGGGCTGGCCATTGAAGACCAATTTCAAGAGGGTAAAAGACATGTACGAAGTCGACCAAGCTGGTGAAGGGGTATACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCAATAACAGGTACCATGTTGCCATTGATCAAAGCCATACTCATCAGCTGCATCAGTAATAAGTGGCAGTTCATATACCTATTGTACCTGATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCACAAGAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGGACCAACTTTATCTCAAGACTTGTAGCCGCCTTGATCGAAGCCAATTGGGCCTTTGACAACGAAGAAGTTAGGGGTTTAAAGAAATTCTTCTTATTGTCTAGTAGGGCTAAAGAACTGATCATCAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAATGGTCCACTGGTTTGATGAAGAAGAGGTTTATGGGATGCCGAAATTGGTTGGCTTAGTCAAGGCAGCAACATTGAGTAAAAATAAACATTGTATTTTGTGCACCGTCTGTGAAGACAGAGAATGGAGAGGAGAAATCTGCCCAAAATGCGGGGGTTTTGGGCCACCAGTGATCTGTGGCATGACCCTAGCCGACTTTGAAGAAAAACACTATAAGAGGATCTTTTTTAGAGAGGATCAATCAGAAGGGCCGGTTAGAGAGGAGTACGCAGGGTATCTGCAATATAGAGCCAGAGGCCAATTATTAC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12,330
OQ883956.1
Classical swine fever virus
Yu,S., Yin,Y.G., Xian,W.X.
Yunnan Agricuture University, College of Veterinary Medicine
China
2023-08-19
null
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,288
GenBank
null
China
China
Sus scrofa
null
2022
null
null
Classical swine fever virus strain YN-WS, complete genome
GTATACGAGGTTAGTTCATTCTCGTATGCATGATTGGACAAAACAAAATTTCAATTTGGTTCAGGGCCCCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCCCATAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCCGTAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCCGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCAGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCACGTGATGGGAGTACGACCTGATAGGGCGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCATTTTGAATTTTTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTATACGATGTCACGGGGAGACCATTGTTTGGAGACCCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACACTGAAGCTACCACACGATAGGGGGAGAGGTAACATCAAAACAACACTGAATAACCTACCTAGGAAAGGAGACTGCAGGAGTGGCAACCATCTAGGCCCGGTTAGCGGGATATATGTAAAGCCCGGCCCTGTCTTTTATCAGGACTACATGGGCCCGGTCTACCATAGGGCCCCTCTAGAGTTTTTCAATGAGACGCAGTTTTGTGAGGTGACCAAAAGGATAGGTAGGGTGACAGGTAGTGACGGAAAGCTTTACCATATATATGTGTGCATCGATGGTTGCATACTGCTGAAGCTAGCCAAGAGAGGCGAGCCAAGAACCCTGAAGTGGATTAGAAACTTCACCGACTGTCCATTGTGGGTTACCAGTTGCTCTGATGATGGCGCAAGTGGAAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGTAAGTTAAAAATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAGAACTAAGCCACCCGACGCTACGATTGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTCAAAAAGAAAGGTAAAGTTAAAGGAAAGAATACCCAAGACGGCCTGTACCACAACAAGAATAAACCACCAGAATCTAGGAAGAAATTAGAAAAAGCCCTATTGGCATGGGCGGTAATAACAATTATGTTGTATCAACCAGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGATAACGGCACTAATGGTATTCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTTAGCAGAAGCTTGCATGGGATCTGGCCGGAAAAAATATGCAAAGGAGTCCCCACCTACCTGGCCACAGACACGGAACTGAAAGAAATACAGGGAATGATGGATGCCAGCGAGGGGACAAACTATACGTGTTGTAAGTTACAGAGACATGAATGGAACAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAATATAGACCCATGGATACAGTTGATGAATAGAACCCAAGCAAACTTGGCAGAAGGCCCTCCGGCCAAGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTACGATAAAGATGCCGACATCAACGTGGTCACCCAGGCCAGAAACAGGCCAACAACCCTGACCGGCTGCAAGAAAGGAAAAAATTTTTCTTTTGCGGGTACAATTATAGAGGGCCCATGTAATTTCAATGTTTCCGTGGAGGATATCTTGTATGGGGATCATGAGTGCGGCAGTTTGCTCCAGGACACGGCTCTGTACCTAGTAGATGGAATGACCAACACTATAGAGAATGCCAGACAGGGAGCAGCCAGGGTAACATCTTGGCTCGGGAGGCAACTCAGCACTGCCGGGAAGAGGTTGGAGGGTAGAAGCAAAACCTGGTTTGGCGCCTATGCCCTATCACCTTACTGTAATGTAACAAGCAAAATAGGGTACATATGGTATACTAACAACTGTACCCCGGCTTGCCTCCCCAAAAATACAAAGATAATAGGCCCCGGTAAATTTGACACTAATGCGGAAGACGGAAAGATTCTCCATGAGATGGGGGGCCACCTATCAGAATTTCTGCTGCTCTCTCTGGTTGTTCTGTCTGACTTCGCCCCTGAAACAGCCAGCGCGTTATACCTCATATTGCACTACGTGATTCCTCAATCCTATGAAGAACCTGAAGGCTGCGACACAAACCAGCTGAATCTAACAGTGGAACTCAGGACTGAAGACGTAATACCGTCATCAGTCTGGAATGTTGGCAAATATGTGTGTGTTAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTGGCTTTGTTATTTGAAGAGGCAGGACAGGTCGTAAAGTTAGCCTTACGGGCGCTGAGGGATTTAACCAGGGTCTGGAATAGCGCATCAACCACGGCATTCCTCATCTGCTTGATAAAAGTATTAAGAGGACAGATCGTGCAAGGTGTGATATGGCTGCTACTAGTAACTGGGGCACAAGGCCGGCTAGCCTGCAAGGAAGATTACAGGTACGCACTATCGTCAACCAATGAGATAGGGCTACTCGGGGCCGGAGGTCTCACTACCACCTGGAAAGAATACAGCCACGATTTGCAACTGAATGACGGGACCGTTAAGGCCATTTGCGTGGCAGGTTCCTTTAAAGTCACAGCACTTAATGTGGTCAGTAGGAGGTATTTGGCATCATTGCATAAGGGGGCTTTACTCACTTCCGTGACATTCGAGCTCCTGTTCGACGGGACCAACCCATCAACCGAAGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGGCTGTGCCCGTTTGATACGAGTCCTGTTGTCAAGGGAAAGTACAATACAACCTTGTTGAACGGTAGTGCTTTCTACCTTGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGTGTTATAGAGTGCACAGCAGTGAGCCCAACAACTCTGAGAACAGAAGTGGTAAAGACCTTCAGGAGAGAGAAGCCTTTTCCACACAGAATGGATTGTGTGACCACCACAGTGGAAAATGAAGATCTATTCTACTGTAAGTTGGGGGGCAACTGGACATGTGTGAAAGGTGAACCAGTGGTCTACACAGGGGGGCAAGTAAAACAATGCAAATGGTGTGGCTTCGGCTTCAACGAGCCTGACGGACTCCCACACTACCCCATAGGTAAGCGCATTTTGGCAAATGAGACAGGTTACAGAATAGTAGATTCAACGGACTGTAACAGAGATGGCGTTGTAATCAGCGCAGAGGGGAGTCATGAGTGCTTGATCGGCAACACAACTGTCAAGGTGCATGCATCAGATGAGAGGCTGGGCCCTATGCCATGCAGACCTAAAGAGATTGTCTCTAGTGCAGGACCTGTAAGGAAAACTTCCTGTACATTCAACTACGCAAAAACTTTGAAGAACAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGCTACTTCCAGCAATATATGTTCAAGGGCGAGTATCAGTACTGGTTTGACCTGGACGTGACAGACCGCCACTCAGATTACTTCGCAGAATTTGTTGTCTTGGTGGTGGTAGCACTGTTAGGAGGAAGATATGTCCTGTGGCTGATAGTGACCTACATAGTTCTAACAGAACAACTCGCCGCTGGTCTACCATTGGGCCAGGGTGAGGTAGTGTTGATAGGGAACTTAATTACTCACACAGACATCGAGGTCGTAGTATATTTCTTACTACTCTATTTGGTCATGAGGGATGAGCCTATAAAGAAATGGATACTGTTGCTGTTCCATGCTATGACTAACAATCCAGTCAAGACCATTACAGTGGCATTGCTTATGGTTAGCGGGGTTGCCAAGGGTGGAAAGATAGATGGCGGTTGGCAGCGGCTGCCGGAGACCAGCTTTGACATCCAACTCGCGCTGACAGTTATAGTAGTCGCTGTGATGTTGCTGGCAAAGAGAGACCCGACTACTGTCCCCTTGGTTATAACGGTGGCAACCCTGAGAACGGCTAAGATGACTAATGGACTTAGTACGGATATAGCCATAGCTACAGTGTCAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTACATTAGTGACTATTATAGATACAAGACTTGGCTACAATACCTTATTAGCACAGTGACAGGTATCTTTTTAATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGTTGGATTTACACACTCCAACCTTGCCATCTTATAGACCCCTCTTCTTCATTCTCGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGAATCTGGACATAGCCGGATTGCTGTTGCAGTGTGTCCCAACCCTTTTGATGGTCTTTACGATGTGGGCAGACATTCTCACCCTGATCCTCATACTGCCCACTTACGAGTTAACAAAGCTATATTACCTCAAGGAAGTGAAGATTGGGGCAGAAAGGGGCTGGTTATGGAAGACCAACTTTAAGAGGGTAAACGACATATATGAAGTTGACCAAGCTGGTGAAGGGGTATACCTTTTTCCATCAAAACAAAAGACAAGTTCAATAACAGGTACCATGTTGCCGTTGATCAAAGCCATACTCATCAGTTGCATCAGTAATAAGTGGCAGTTCATATACCTATTGTACTTGATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCACAAGAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGGACCAACTTCATCTCAAGACTTGTAGCCGCTTTGATCGAAGCCAATTGGGCCTTTGACAACGAAGAAGTTAGAGGTTTAAAGAAGTTCTTCCTGTTGTCTAGTAGGGTTAAAGAACTGATCATCAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAATGGTCCACTGGTTTGGTGACGAAGAGGTTTATGGGATGCCGAAGTTGGTCGGCTTAGTCAAGGCAGCAACATTGAGTAAAAATAAACATTGTATTTTGTGCACCGTCTGTGAAGACAGAGAGTGGAAAGGAGAAACCTGCCCAAAATGCGGGCGTTTTGGGCCACCAATGACCTGTGGCATGACCCTAGCCGACTTTGAAGAAAAACACTATAAGAGGATCTTTTTTAGAGAGGATCAATCAGAAGGGCCGGTTAGAGAGGAGTACG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13,578
OM817560.1
Classical swine fever virus
Arainga,M., Hisanaga,T., Hills,K., Handel,K., Rivera,H., Pasick,J., Perez,O., Lamboo,L., Erdelyan,C., Ambagala,A.
Canadian Food Inspection Agency, National Centre for Foreign Animal Diseases
Canada
2023-01-23
Peru-A-42
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,221
GenBank
null
Peru: Arequipa, Cerro Colorado
Peru
Sus scrofa domesticus
null
2008
null
null
Classical swine fever virus isolate Peru-A-42, complete genome
CAGGGCCCCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCTCACAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCTATAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCGGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCAGGTGATGGGGGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCACTTTGAACTTTTATACAAAACAAGCAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTATATGATGCCACAGGGAGACCGTTGTTTGGAGAACCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACACTGCAGCTACCACACGACAGGGGGAGAGGCAACATCAAGACAACACTGAAGAACCTACCTAGAAAAGGCGACTGCAGGGGTGGTAACCATCTAGGCCCGGTTAGTGGGATATACGTAAAGCCTGGCCCTGTCTTTTATCAGGACTATATGGGTCCGGTTTACCATAGAGCCCCTCTGGAGTTCTTCAACGAAGCGCAGTTTTGTGAGGTGACCAAAAGGATAGGTAGGGTGACAGGCAGCGACGGGAAACTTTACCATATATATGTGTGCATCGATGGTTGCATCCTGCTCAAGCTAGCCAAGAGGGACGAACCGCGAACCCTAAAGTGGATTAGAAATTTCACCGACTGCCCACTGTGGGTTACTAGTTGCTCTGACGGTGGCGGGAGTGGAAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGCAAATTAAAAATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACTAAGCCGCCCGATGCTACGATCGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTCAAAAAGAAAGGCAAGGTTAAAGGAAAGAACACCCAAGATGGTCTGTACCACAACAAGAACAAACCACCGGAATCTAGGAAGAAACTAGAAAAAGCCCTGTTGGCATGGGCGGTAATAGCAATTGTGTTGTACCAACCAGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGATAATGGCACTAGTGGTATCCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTTAACAGAAGCTTGCATGGAATCTGGCCGGAAAAAATATGCAAAGGAGTCCCCACTCACCTGGCCACAGACACAGAATTGAAAGAAATACAGGGAATGATGGATGCCAGTGAGGGGACAAATTATACGTGCTGTAAGTTGCAGAGACATGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAATATAGACCCCTGGATACAGTTGATGAATAGAACCCAAGCAAACCTGACAGAAGGCGCCCCTGCTAAGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTACGATAAATATGCCGACATCAACGTGGTCACCCAGGCCAGAAACAGGCCAACGACCCTGACCGGCTGCAAGAAAGGGAAAAATTTTTCTTTTGCGGGTACAGTCATAGAGGGTCCATGTAATTTCAATGTTTCCGTGGAGGATATATTGTATGGGGATCACGACTGTGGCAGTCTGCTCCAAGACACAGCTCTGTACCTAGTAGATGGAATGACCAACACTATAGAGAAAGCCAGACAGGGGGCGGCGAGGGTAACATCTTGGCTTGGAAGGCAACTTAGCACTGCTGGGAAGAGGTTAGAGAGTAGAAGCAGGACCTGGTTTGGTGCCTATGCCCTATCACCTTACTGTAATGTGACAAACAAAATAGGGTACATATGGTACACTAATAATTGCACCCCGGCCTGCCTCCCCAAAAATACAAAGATAATAGGCCCCGGTAAATTTGACACTAATGCGGAAGAAGGGAAAATTCTCCATGAGATGGGGGGCCACCTATCAGAATTTCTGCTGCTCTCTCTAGTTGTTCTGTCTGACTTCGCCCCTGAAACGGCCAGTGCGTTGTATCTCGTCTTGCACTACGTGATACCACAATCCCACGAAGAATCTGAAGGCTGTGACACAAACCAGTTGAACTTAACAGTGGGACTCAGGACTGAAGACGTAATACCATCATCAGTTTGGAATGTTGGCCAATATGTGTGTGTCAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTAGCTTTGTTATTTGAAGAAGCAGGACAGGTCGTAAAATTAGCCTTACGGGCACTGAGGGACTTAACCAGGGTCTGGAATAGCGCATCGACTACGGCGTTCCTCATATGCTTGATAAAAGTATTAAGGGGACAGATCGTGCAAGGTGTGATATGGTTGCTACTAGTAACCGGGGCACAAGGCCGGCTAGCCTGCAAGGAAGATTACAGGTACGCATTATCATCAACCAATGAGATAGGGCTACTAGGGGCCGAAGGTCTCACTACCACCTGGCAAGAATACAGCCACAATCTGCAACTGAATGACGGGACCGTCAAGGCCATTTGCGTGGCAGGTTCTTTCAAAGTCACAGCACTTAACGTGGTCAGTAGGAGGTACTTGGCATCATTGCATAAGAGGGCTTTACCCACTTCTGCTACATTTGAGCTCCTGTTCGATGGGACCAACCCATCAGTTGAGGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGGCTGTGCCCGTTTGATACGAGCCCTGTTGTCAAGGGAAAATACAATACAACCTTATTGAACGGTAGTGCCTTCTATCTCGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGTGTTATAGAGTGCACAGCAGTGAGCCCAACAACTCTGAGAACAGAAGTGGTAAAGACCTTCAGGAGAGAAAAACCTTTTCCACACAGAATGGACTGCGTAACCACCACGGTGGAAAATGAAGACTTATTCTACTGTAAGTTAGGGGGCAACTGGACTTGCGTGAAAGGTGAACCAGTGGTCTACACGGGGGGGCTAGTAAAGCAATGTAGATGGTGTGGCTTCGACTTCTATGAACCTGACGGACTTCCACACTACCCCATAGGTAAGTGCATTTTGGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCAACGGACTGTAACAGAGACGGCGTAGTGATCAGCGCAGATGGGAGTCACGAGTGCATGATCGGCAACACAACTGTCAAGGTGCATGCATCAGATGAAAGATTGGGCCCTATGCCATGTAGACCTAAGGAGATTGTCTCTAGTGCAGGACCTGTAAGGAAAACCTCCTGTACATTCAACTACACAAAAACTCTGAAGAACAAGTACTACGAGCCCAGGGACAGCTACTTCCAGCAATATATGCTCAAGGGCGAGTATCAGTACTGGTTTGACCTGGACGTGACCGACCACCACTCGGATTACTTCGCAGAGTTTGTTGTTTTAGTGGTGGTAGCACTGTTAGGAGGAAGATACGTCCTGTGGTTAATAGTGACCTACATAGTTCTAACAGAACAACTCGCTGCTGGTTTACCATTGGGCCAGGGTGAGGTAGTGTTGATAGGGAACTTAATTACCCACACAGACATTGAGGTCGTAGTATACTTCTTACTACTCTATTTGGTCATGAGGGATGAGCCTATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTCCATGCTATGACTAACAACCCAGTCAAGACCATGACTGTAGCATTGCTTATGGTTAGCGGGGTTGCCAAGGGTGGAAGGATAGATGGCAGTTGGCAGCGGCTGCCAGGGACCAGCTTTGACATCCAACTCGCGCTGACAGTCGTAGTAGTTGCTGTGATGTTGCTGGCAAAGAAAGATCCAACCACTGTCCCTTTGGTTATAACGGTGGCAACCCTGAGAACGGCTAAGATGACTAATGGGCTTAGTACGGATATAGCCATAGCTACAGTGTCAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTACATTAGTGACTACTACAGATATAAGACTTGGCTGCAATACCTTATTAGTACAGTGACAGGTATCTTTTTGATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGCTGGATTTACACACCCCAACCTTGCCATCTTATAGACCCCTCTTCTTCATCCTAGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGGATCTGGACGTAGCCGGATTGCTGTTGCAGTGTGTCCCAACCCTTTTGATGGTTTTTACGATGTGGGCAGACATTCTCACTTTGATCCTCATACTGCCCACTTACGAGTTAACAAAACTATACTACCTCAAGGAGGTGAAGACTGGGGCAGAAAAAAGCTGGTTATGGAAGACCAACTTCAAGAGGGTAAATGACATATACGAAGTTGACCAAGCTGGTGAAGGGGTATACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCTATAACAGGCACCATGTTGCCACTTATCAAAGCCATACTCATCAGCTGCATCAGTAATAGGTGGCAGTTCATATATCTATTGTATTTGATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCACAAGAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGGACCAACTTCACCTCAAGACTCGTAGCCGCACTGATTGAAGCCAATTGGGCCTTTGATAACGAAGAGGTCAGGGGTTTAAAGAAGTTCTTCCTGTTGTCTAGCAGGGTTAGAGAATTGATCATTAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAATGGCCCACTGGTTTGGTGACGAAGAGGTCTATGGGATGCCTAAGTTGGTTGGTTTGGTCAAGGCAGCAACATTGAGCAAAAACAAACATTGCATTTTGTGCACGGTCTGTGAGGACAGGGAGTGGAGAGGAGAAACCTGCCCAAAGTGCGGTCGTTTTGGGCCACCAATGACCTGTGGCATGACCCTAGCCGACTTCGAAGAGAAACATTACAAGAGGATCTTTTTCAGAGAGGACCAATCAGAAGGGCCGGTTAGAGAGGAGCACGCAGGGTATCTGCAATATAGAGCTAGAGGACAATTATTCCTGAGGAATCTCCCAGTACTAGC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19,207
OM817561.1
Classical swine fever virus
Arainga,M., Hisanaga,T., Hills,K., Handel,K., Rivera,H., Pasick,J., Perez,O., Lamboo,L., Erdelyan,C., Ambagala,A.
Canadian Food Inspection Agency, National Centre for Foreign Animal Diseases
Canada
2023-01-23
Peru-P-19
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,143
GenBank
null
Peru: Puno, Tampopata
Peru
Sus scrofa domesticus
null
2008
null
null
Classical swine fever virus isolate Peru-P-19, complete genome
CAGGGCCCCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCTCACAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCTATAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCGGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCAGGTGATGGGGGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCACTTTGAACTTTTATACAAAACAAACAAACAAAAACCGATGGGAGTGGAGGAACCGGTATATGATGCCACAGGGAGACCATTGTTTGGAGAACCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACACTGCAGCTACCACACGATAGGGGGAGAGGCAACATCAAGACAACACTGAAGAACCTACCTAGAAAGGGCGACTGCAGGGGTGGTAACCATCTAGGCCCGGTTAGTGGGATATACGTAAAGCCTGGCCCTGTCTTTTATCAGGACTATATGGGTCCGGTTTACCATAGAGCCCCTCTGGAGTTCTTCAACGAAGCGCAGTTTTGTGAGGTGACCAAAAGGATAGGTAGGGTGACAGGCAGCGACGGGAAACTTTACCATATATATGTGTGCATCGATGGTTGCATCCTGCTCAAGCTAGCCAAGAGGGACGAGCCGAGAACCCTAAAGTGGATTAGAAATTTCACCGACTGCCCACTGTGGGTTACTAGTTGCTCTGACGGTGGCGGGAGTGGAAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGCAAATTAAAAATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACTAAGCCGCCCGATGCTACGATCGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTCAAAAAGAAAGGCAAGGTTAAAGGAAAGAACACCCAAGATGGTCTGTACCACAACAAGAACAAACCACTGGAATCTAGGAAGAAACTAGAAAAAGCCCTGTTGGCATGGGCGGTAATAGCAATTGTGTTGTACCAACCAGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGATAATGGCACTAGTGGTATCCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTTAACAGAAGCTTGCATGGGATCTGGCCGGAAAAAATATGCAAAGGAGTCCCCACTCACCTGGCCACAGACACAGAATTGAAAGAAATACAGGGAATGATGGATGCCAGTGAGGGGACAAATTATACGTGCTGTAAGTTGCAGAGACATGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAATATAGACCCCTGGATACAGTTGATGAATAGAACCCAAGCAAACCTGACAGAAGGCGCCCCTGCTAAGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTACGATAAATATGCCGACCTCAACGTGGTCACCCAGGCCAGAAACAGGCCAACGACCCTGACTGGCTGCAAGAAAGGGAAAAATTTTTCTTTTGCGGGTACAGTCATAGAGGGTCCATGTAATTTCAATGTTTCCGTGGAGGATATATTGTATGGGGATCACGACTGTGGCAGTCTGCTCCAAGACACAGCTCTGTACCTAGTAGATGGAATGACCAACACTATAGAGAAAGCCAGACAGGGGGCGGCGAGGGTAACATCTTGGCTTGGAAGGCAACTTAGCACTGCTGGGAAGAGGTTAGAGAGTAGAAGCAGGACCTGGTTTGGTGCCTATGCCCTATCACCTTACTGTAATGTGACAAACAAAATAGGGTACATATGGTACACTAATAATTGCACCCCGGCCTGCCTCCCCAAAAATACAAAGATAATAGGCCCCGGTAAATTTGACACTAATGCGGAAGATGGGAAAATTCTCCATGAGATGGGGGGCCACTTATCAGAATTTCTGCTGCTCTCTCTAGTTGTTCTGTCTGACTTCGCCCCTGAAACGGCCAGTGCGTTGTATCTCGTCTTGCACTACGTGATACCACAATCCCACGAAGAATCTGAAGGCTGTGACACAAACCAGTTGAACTTAACAGTGGGACTCAGGACTGAAGACGTAATACCATCATCAGTTTGGAATGTTGGCAAATATGTGTGTGTCAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTAGCTTTGTTATTTGAAGAAGCAGGACAGGTCGTAAAATTAGCCTTACGGGCACTGAGGGATTTAACCAGGGTCTGGAATAGCGCATCGACTACGGCGTTCCTCATATGCTTGATAAAAGTATTAAGGGGACAGATCGTGCAAGGTGTGATATGGTTGCTACTAGTAACCGGGGCACAAGGCCGGCTAGCCTGCAAGGAAGATTACAGGTACGCATTATCATCAACCAATGAGATAGGGCTACTAGGGGCCGAAGGTCTCACTACCACCTGGCAAGAATACAGCCACAATCTGCAACTGAATGACGGGACCGTCAAGGCCATTTGCGTGGCAGGTTCCTTTAAAGTCACAGCACTTAACGTGGTCAGTAGGAGGTACTTGGCATCATTGCATAAGAGGGCTTTACCCACTTCTGCTACATTTGAGCTCCTGTTCGACGGGACCAACCCATCAGTTGAGGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGGCTGTGCCCGTTTGATACGAGCCCTGTTGTCAAGGGAAAATACAATACAACCTTATTGAACGGTAGTGCCTTCTATCTCGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGTGTTATAGAGTGCACAGCAGTGAGCCCAACAACTCTGAGAACAGAAGTGGTAAAGACCTTCAGGAGAGAAAAACCTTTTCCGCACAGAATGGACTGCGTAACCACCACGGTGGAAAATGAAGATTTATTCTACTGTAAGTTAGGGGGCAACTGGACATGCGTGAAAGGTGAACCAGTGGTCTACAAGGGGGGGCTAGTAAAGCAATGTAGATGGTGTGGCTTCGACTTCTATGAACCTGACGGACTTCCACACTACCCCATAGGTAAGTGCATTTTGGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCAACGGACTGTAACAGAGACGGCGTAGTGATCAGCGCAGATGGGAGTCACGAGTGCATGATCGGCAACACAACTGTCAAGGTGCATGCATCAGATGAAAGATTGGGCCCTATGCCATGTAGACCTAAGGAGATTGTCTCTAGTGCAGGACCTGTAAGGAAAACCTCCTGTACATTCAACTACACAAAAACTCTGAAGAACAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGCTACTTCCAGCAATATATGCTCAAGGGCGAGTACCAGTACTGGTTTGACCTGGACGTGACCGACCACCACTCGGATTACTTCGCAGAGTTTGTTGTTTTAGTGGTGGTAGCACTGTTAGGAGGAAGATACGTCCTGTGGTTAATAGTGACCTACATAGTTCTAACAGAACAACTCGCTGCTGGTTTACCATTGGGCCAGGGTGAGGTAGTGTTGATAGGGAACTTAATTACCCACACAGACATTGAGGTCGTAGTATACTTCTTACTACTCTATTTGGTCATGAGGGATGAGCCTATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTCCATGCTATGACTAACAACCCAGTCAAGACCATGACTGTAGCATTGCTTATGGTTAGCGGGGTTGCCAAGGGTGGAAGGATAGATGGCAGTTGGCAGCGGCTGCCAGGGACCAGCTTTGACATCCAACTTGCGCTGACAGTCGTAGTAGTTGCTGTGATGTTGCTGGCAAAGAAAGATCCAACCACTGTCCCTTTGGTTATAACGGTGGCAACCCTGAGAACGGCTAAGATGACTAATGGGCTTAGTACGGATATAGCCATAGCTACAGTGTCAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTACATTAGTGACTACTATAGATACAAGACTTGGCTGCAATACCTTATTAGTACAGTGACAGGTATCTTTTTGATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGCTGGATTTACACACCCCAACCTTGCCATCTTATAGACCCCTCTTCTTCATCCTAGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGGATCTGGACGTAGCCGGATTGCTGTTGCAGTGTGTCCCAACCCTTTTGATGGTTTTTACGATGTGGGCAGACATTCTCACCTTGATCCTCATACTGCCCACTTACGAGTTGACAAAACTATACTACCTCAAGGAGGTGAAGACTGGGGCAGAAAGAAGCTGGTTATGGAAGACCAACTTCAAGAGGGTAAATGACATATACGAAGTTGACCAAGCTGGTGAAGGGGTATACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCTATAACAGGCACCATGTTGCCACTTATCAAAGCCATACTCATCAGCTGCATCAGTAATAGGTGGCAGTTCATATACCTATTGTATTTGATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCACAAGAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGGACCAACTTCACCTCAAGACTCGTAGCCGCACTGATTGAAGCCAATTGGGCCTTTGATAACGAAGAGGTCAGGGGTTTAAAGAAGTTCTTCCTGTTGTCTAGCAGGGTTAGAGAATTGATCATTAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAATGGCCCACTGGTTTGGTGACGAAGAGGTCTATGGGATGCCTAAGTTGGTTGGTTTGGTCAAGGCAGCAACATTGAGCAAAAACAAACATTGCATTTTGTGCACGGTCTGTGAGGACAGGGAGTGGAGAGGAGAAACCTGCCCAAAGTGCGGTCGTTTTGGGCCACCAATGACCTGTGGCATGACCCTAGCCGACTTCGAAGAGAAACATTACAAGAGGATCTTTTTCAGAGAGGACCAATCAGAAGGGCCGGTTAGAGAGGAGCACGCAGGGTATCTGCAATATAGAGCTAGAGGACAATTATTCCTGAGGAATCTCCCAGTACTAGC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19,208
OM817562.1
Classical swine fever virus
Arainga,M., Hisanaga,T., Hills,K., Handel,K., Rivera,H., Pasick,J., Perez,O., Lamboo,L., Erdelyan,C., Ambagala,A.
Canadian Food Inspection Agency, National Centre for Foreign Animal Diseases
Canada
2023-01-23
Peru-An-5
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,220
GenBank
null
Peru: Ancash, Huaraz
Peru
Sus scrofa domesticus
null
2008
null
null
Classical swine fever virus isolate Peru-An-5, complete genome
CAGGGCCCCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCTCATAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCCATAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCGGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCAGGTGATGGGGGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCACTTTGAACTTTTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTATATGATGCCACAGGGAGACCATTGTTTGGAGAACCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACACTGCAGCTACCACACGATAGGGGGAGAGGCAACATCAAGACAACACTGAAGAACCTACCTAGAAAAGGCGACTGCAGGGGTGGCAATCACCTAGGCCCGGTTAGTGGGATATACGTAAAGCCTGGCCCTGTCATTTATCAGGACTATATGGGCCCGGTTTACCATAGAGCCCCTCTGGAGTTCTTCAACGAAGCGCAGTTCTGTGAGGTGACCAAAAGGATAGGTAGGGTGACAGGCAGTGACGGAAAACTTTACCATATATATGTGTGCATCGATGGTTGCATCCTGCTCAAGCTAGCCAAGAGGGACGAGCCAAGAACCCTAAAGTGGATTAGAAATTTCACCGACTGCCCACTGTGGGTTACTAGTTGCTCTGACGGTGGCGGGAGTGGAAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGCAAATTAAAAATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACTAAGCCGCCCGATGCTACGATCGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTCAAAAAGAAAGGCAAGGTTAAAGGAAAGAACACCCAAGATGGTCTGTACCACAACAAGAACAAACCACTGGAATCTAGGAAGAAACTAGAAAAAGCCCTGTTGGCATGGGCGGTAATAGCAATTGTGTTGTACCAACCAGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGATAATGGCACTAGTGGTATCCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTTAACAGAAGCTTGCATGGGATCTGGCCGGAAAAAATATGCAAAGGAGTCCCCACTCACCTGGCCACAGACACAGAATTGAAAGAAATACAGGGAATGATGGATGCCAGTGAGGGGACAAATTATACGTGCTGTAAGTTGCAGAGACATGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAATATAGACCCCTGGATACAGTTGATGAATAGAACCCAGGCAAACCTGACAGAAGGAGCTCCTGCTAAGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTACGATAGATATGCCGACCTCAACGTGGTCACCCAGGCCAGAAACAGGCCAACGACCCTGACTGGCTGCAAGAAAGGGAAAAATTTTTCTTTTGCGGGTACAGTCATAGAGGGTCCATGTAATTTCAATGTTTCTGTGGAGGATATATTGTATGGGGATCACGACTGTGGCAGTTTGCTCCAAGACACAGCTCTGTACCTAGTGGATGGAATGACCAACACTATAGAGAAAGCCAGACAGGGGGCGGCGAGGGTAACATCTTGGCTTGGAAGGCAACTTAGCACTGCTGGGAAGAGGTTAGAGAGTAGAAGCAGGACCTGGTTTGGTGCCTATGCCCTATCACCTTACTGTAATGTAACAAACAAAATAGGGTACATATGGTACACTAATAATTGCACCCCGGCCTGCCTCCCCAAAAATACAAAGATAATAGGCCCCGGTAAATTTGACACTAATGCGGAAGATGGGAAAATTCTCCATGAGATGGGGGGCCACCTATCAGAATTTCTGCTGCTCTCTCTGGTAGTTCTGTCTGACTTCGCCCCTGAAACGGCCAGTGCATTATATCTCATCTTGCACTACGTGATACCACAATCCCACGAAGAATCTGAAGGCTGTGACACAAACCAGTTGAACTTAACAGTGGGACTCAGGACTGAAGACGTAATACCATCATCAGTTTGGAATGTTGGCAAATATGTGTGTGTCAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTAGCTTTGTTATTTGAAGAAGCAGGACAGGTCGTAAAATTAGCCTTACGGGCGCTGAGGGATTTAACTAGGGTCTGGAATAGCGCATCGACTACGGCGTTCCTCATATGCTTGATAAAAGTATTAAGGGGACAGATAGTGCAAGGTGTGATATGGTTGCTACTAGTAACCGGGGCACAAGGCCGGCTAGCCTGCAAGGAAGATCACAGGTACGCATTATCATCAACCAATGAGATAGGGCTACTAGGGGCCGAAGGCCTCACCACCACTTGGCAAGAATACAGCCACAATCTGCAACTGAATGACGGGACTGTCAAGGCCATTTGCGTGGCAGGTTCCTTTAAAGTCACAGCACTTAACGTGGTCAGTAGGAGGTACTTGGCATCATTGCATAAGAGGGCTTTACCCACTTCTGCTACATTTGAGCTCCTGTTCGACGGGACCAACCCATCAGTTGAGGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGGCTGTGCCCGTTTGATACGAGCCCTGTTGTCAAGGGAAAATACAATACAACCTTATTGAACGGTAGTGCCTTCTATCTCGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGTGTTATAGAGTGCACAGCAGTGAGCCCAACGACTCTGAGAACAGAAGTGGTAAAGACCTTCAGGAGAGAAAAACCTTTTCCGCACAGAATGGATTGCGTAACTACCACGGTGGAAAATGAAGATCTATTCTACTGTAAGTTAGGGGGCAACTGGACATGCGTGAAAGGTGAACCAGTGGTCTACACGGGGGGGCTAGTGAAGCAATGTAGATGGTGTGGCTTCGACTTCTATGAACCTGACGGACTTCCACACTACCCCATAGGTAAGTGCATTTTGGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCAACGGACTGTAACAGAGACGGCGTAGTGATCAGCGCAGATGGGAGTCACGAGTGCATGATCGGCAACACAACTGTCAAGGTGCATGCATCAGATGAAAGATTGGGCCCTATGCCATGTAGACCTAAGGAGATTGTCTCTAGTGCAGGACCTGTAAGGAAAACCTCCTGTACATTCAACTACACAAAAACTCTGAAGAATAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGCTACTTCCAGCAATATATGCTCAAGGGCGAGTACCAGTACTGGTTTGACCTGGACGTGACCGACCACCACTCGGATTACTTCGCAGAGTTTGTTGTCTTAGTGGTGGTAGCACTGTTAGGAGGGAGATACGTCCTGTGGTTAATAGTGACCTACATAGTTCTAACAGAACAACTCGCCGCTGGTTTACCATTGGGCCAGGGTGAGGTAGTGTTGATAGGGAACTTAATAACCCACACAGACATTGAGGTTGTAGTATACTTCTTACTACTCTATTTGGTCATGAGGGATGAGCCTATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTCCATGCTATGACTAACAACCCAGTCAAGACCATGACTGTAGCATTGCTTATGGTTAGCGGGGTTGCCAAGGGTGGAAGGATAGATGGCAGTTGGCAGCGGCTGCCAGGGACCAGCTTTGACATTCAACTTGCGCTGACAGTCGTAGTAGTTGCTGTGATGTTGCTGGCAAAGAAAGATCCAACTACTGTCCCTTTGGTTATAACGGTGGCAACCCTGAGGACGGCTAAGATGACTAATGGACTTAGTACGGATATAGCCATAGCTACAGTGTCAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTACATTAGTGACTACTATAGATACAAGACTTGGCTGCAATACCTTATTAGTACAGTGACAGGTATCTTTTTAATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGCTGGATTTACACACCCCAACCTTGCCATCTTATAGACCCCTCTTCTTCATCCTAGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGGATCTGGACGTAGCCGGATTGCTATTGCAGTGTGTCCCAACCCTTTTGATGGTTTTTACGATGTGGGCAGACATTCTCACCCTGATCCTCATACTGCCCACTTACGAGTTAACAAAACTATACTACCTCAAGGAGGTGAAGACTGGGGCAGAAAGAAGCTGGTTATGGAAGACCAACTTCAAGAGGGTAAATGACATATACGAAGTTGACCAAGCTGGTGAAGGGGTATACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCAATAACAGGCACCATGTTGCCACTTATCAAAGCCATACTCATCAGTTGCATCAGTAATAGGTGGCAGTTCATATACCTATTGTATTTGATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCACAAGAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGGACCAACTTCACCTCAAGACTCGTAGCCGCTCTGATTGAAGCCAATTGGGCCTTTGATAACGAAGAGGTCAGGGGTTTAAAGAAGTTCTTCCTGTTGTCTAGCAGGGTTAGAGAATTGATCATTAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAATGGCCCACTGGTTTGGTGACGAAGAGGTCTATGGGATGCCGAAGTTGGTTGGTTTGGTCAAGGCAGCAACATTGAGCAAAAACAAACATTGCATTTTGTGCACGGTCTGTGAGGACAGGGAGTGGAGAGGAGAAACCTGCCCAAAGTGCGGTCGTTTTGGACCACCAATGACCTGTGGCATGACCCTAGCCGACTTCGAAGAGAAACATTACAAGAGGATCTTTTTCAGAGAGGACCAATCAGAAGGGCCGGTTAGAGAGGAGCACGCAGGGTATCTGCAATATAGAGCTAGAGGACAATTATTCCTGAGGAACCTCCCAGTATTAGC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19,209
OM817563.1
Classical swine fever virus
Arainga,M., Hisanaga,T., Hills,K., Handel,K., Rivera,H., Pasick,J., Perez,O., Lamboo,L., Erdelyan,C., Ambagala,A.
Canadian Food Inspection Agency, National Centre for Foreign Animal Diseases
Canada
2023-01-23
Peru-L-2
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,224
GenBank
null
Peru: Lima, Villa El Salvador
Peru
Sus scrofa domesticus
null
2008
null
null
Classical swine fever virus isolate Peru-L-2, complete genome
CAGGGCCCCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCTCACAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCCGTAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCGGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCAGGTGATGGGGGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCACTTTGAACTTTTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTATATGATGCCACAGGGAGACCATTGTTTGGAGAACCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACACTGCAGCTACCACACGATAGGGGGAGAGGCAACATCAAGACAACGCTGAAGAACCTACCTAGAAAAGGCGACTGCAGGGGTGGTAACCATCTAGGCCCGGTTAGTGGGATATACGTAAAGCCTGGCCCTGTCTTTTATCAGGACTATATGGGCCCGGTTTACCATAGAGCCCCTCTGGAGTTCTTCAACGAAGCGCAGTTCTGCGAGGTGACCAAAAGGATAGGTAGGGTGACAGGCAGTGACGGGAAACTTTACCATATATATGTGTGCATCGATGGTTGCATCCTGCTCAAGCTAGCCAAGAGGGACGAGCCAAGAACCCTAAAGTGGATTAGAAATTTCACCGACTGCCCACTGTGGGTTACTAGTTGCTCTGACGGTGGCGGGAGTGGAAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGCAAATTAAAAATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACTAAGCCGCCCGATGCTACGATCGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTCAAAAAGAAAGGCAAGGTTAAAGGAAAGAACACCCAAGATGGTCTGTACCACAACAAGAACAAACCACTGGAATCCAGGAAGAAACTGGAAAAAGCCCTGTTGGCATGGGCGGTAATAGCAATTGTGTTGTACCGACCAGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGATAATGGCACTAGTGGTATCCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTTAACAGAAGCTTGCATGGGATCTGGCCGGAAAAAATATGCAAAGGAGTCCCCACTCACCTGGCCACAGACACAGAATTGAAAGAAATACAGGGAATGATGGATGCCAGTGAGGGGACAAATTATACGTGCTGTAAGTTGCAGAGACATGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAATATAGACCCCTGGATACAGTTGATGAATAGAACCCAGGCAAACCTGACAGAAGGAGCTCCTGCTAAGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTACGATAAATATGCCGACCTCAACGTGGTCACCCAGGCCAGAAACAGGCCAACGACCCTGACTGGCTGCAAGAAAGGGAAAAATTTTTCTTTTGCGGGTATAGTCATAGAGGGTCCATGTAATTTCAATGTTTCCGTGGAGGATATACTGTATGGGGATCACGATTGTGGCAGTTTGCTCCAAGACACAGCTCTGTACCTAGTAGATGGAATGACCAATACTATAGAGAAAGCCAGACAGGGGGCGGCGAGGGTAACGTCTTGGCTTGGAAGGCAACTTAGCACTGCTGGGAAGAGGTTAGAGAGTAGAAGCAGGACCTGGTTTGGTGCCTATGCCCTATCACCTTACTGTAATGTAACAAACAAAATAGGGTACATATGGTACACTAATAATTGCACCCCGGCCTGCCTCCCCAAAAATACAAAGATAATAGGCCCCGGTAAATTTGACACTAATGCGGAAGATGGGAAAATTCTCCATGAGATGGGGGGCCACCTATCAGAATTTCTGCTGCTCTCTCTGGTTGTTCTGTCTGACTTCGCCCCTGAAACGGCCAGTGCGTTATATCTCATCTTGCACTACGTGATACCACAATCCCACGAGGAATCTGAAGGCTGTGACACAAACCAGTTGAACTTAACAGTGGGACTCAGGACTGAAGACGTAATACCATCATCAGTTTGGAATGTTGGCAAATATGTGTGTGTCAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTAGCTTTGTTATTTGAAGAAGCAGGACAGGTCGTAAAATTAGCCTTACGGGCGCTGAGGGATTTAACTAGGGTCTGGAATAGTGCATCGACTACGGCGTTCCTCATATGCTTGATAAAAGTATTAAGGGGACAGATCGTGCAAGGTGTGATATGGTTGCTACTAGTAACCGGGGCACAAGGCCGGCTAGCCTGCAAGGAAGATTACAGGTACGCACTATCATCAACCAATGAGATAGGGCTACTAGGGGCCGAAGGCCTCACCACCACCTGGCAAGAATACAGCCACAATCTGCAACTGAATGACGGGACCATCAAGGCCATTTGCGTGGCAGGTTCTTTTAAAGTCACAGCACTTAACGTGGTCAGTAGGAGGTACTTGGCATCATTGCATAAGAGGGCTTTACCCACTTCTGTTACATTTGAGCTCCTGTTCGACGGGACTAACCCATCAGTTGAGGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGGCTGTGCCCGTTTGATACGAGCCCTGTTGTCAAAGGAAAATACAATACAACCTTATTGAACGGTAGTGCCTTCTATCTCGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGTGTTATAGAGTGCACAGCAGTGAGCCCAACAACTCTGAGAACAGAAGTGGTAAAGACCTTCAGGAGAGAAAAACCTTTTCCGCACAGAATGGATTGCGTAACTACCACGGTGGAAAATGAAGATTTATTCTACTGTAAGTTAGGGGGCAACTGGACATGCGTGAAAGGTGAACCAGTGGTCTACACGGGGGGGCTAGTAAAGCAATGTAGATGGTGTGGCTTCGACTTCTATGAACCTGACGGACTTCCACACTACCCCATAGGTAAGTGCATTTTGGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCAACGGACTGTAACAGAGACGGCGTAGTGATCAGCGCAGATGGAAGTCACGAGTGTATGATCGGCAACACAACTGTCAAGGTGCATGCATCAGATGAAAGATTGGGCCCTATGCCATGTAGACCTAAGGAGATTGTCTCTAGTGCAGGACCTGTAAGGAAAACCTCCTGTACATTCAACTACACAAAAACTCTGAAGAATAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGCTACTTCCAGCAATATATGCTCAAGGGCGAGTACCAGTACTGGTTTGACCTGGACGTGACCGACCACCACTCTGATTACTTCGCAGAGTTTGTTGTCTTAGTGGTGGTAGCACTGTTAGGAGGGAGATACGTCCTGTGGTTAATAGTGACCTACATAGTTCTAACAGAACAACTCGCCGCTGGTTTACCATTGGGCCAGGGTGAGGTAGTGTTGATAGGGAACTTAATTACCCACACAGACATTGAGGTTGTAGTATACTTCTTACTACTCTATTTGGTCATGAGGGATGAGCCTATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTCCATGCTATGACTAACAACCCAGTCAAGACCATGACTGTAGCATTGCTCATGGTTAGCGGGGTTGCCAAGGGTGGAAGGATAGATGGCAGTTGGCAGCGGCTGCCAGGGACCAGCTTTGACATTCAACTCGCGCTGACAGTCGTAGTAGTTGCTATGATGTTGCTGGCAAAGAAAGATCCAACTACTGTCCCCTTGGTTATAACGGTGGCAACCCTGAGAACGGCTAAGATGACTAATGGACTTAGTACGGATGTAGCCATAGCTACAGTGTCAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTACATTAGTGACTACTATAGATACAAGACTTGGCTGCAATACCTTATCAGTACAGTGACAGGTATCTTTTTAATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGCTGGATTTACACACCCCAACCTTGCCATCTTATAGGCCCCTCTTCTTCATCCTAGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGGATCTGGACGTAGCCGGATTACTGTTGCAGTGTGTCCCAACCCTTTTGATGGTTTTTACGATGTGGGCAGACATTCTCACCCTGATCCTCATACTGCCCACTTACGAGTTAACAAAACTATACTACCTCAAGGAGGTGAAGAATGGGGCAGAAAGAAGCTGGTTATGGAAGACCAACTTCAAGAGGGTAAATGACATATACGAAGTTGACCAAGCTGGTGAAGGGGTATACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCAATAACAGGCACCATGTTGCCACTTATCAAAGCCATACTCATCAGCTGCATCAGTAATAAGTGGCAGTTCATATACCTATTGTATTTGATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCACAAGAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGGACCAACTTCACCTCAAGACTTGTAGCCGCTCTGATTGAAGCCAATTGGGCCTTTGATAACGAAGAGGTCAGGGGTTTAAAGAAGTTCTTCCTGTTGTCTAGCAGGGTTAGAGAATTGATCATTAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAATGGCCCACTGGTTTGGTGACGAAGAGGTCTATGGGATGCCGAAGTTGGTTGGTTTGGTCAAGGCAGCAACATTGAGCAAAAACAAACATTGCATTCTGTGCACGGTCTGTGAGGACAGGGAGTGGAGAGGAGAAACCTGCCCAAAGTGCGGTCGTTTTGGGCCACCAATGACCTGTGGCATGACCCTAGCCGACTTCGAAGAGAAACATTACAAGAGGATCTTTTTCAGAGAGGACCAATCAGAAGGGCCGGTCAGAGAGGAGCACGCAGGGTATCTGCAATATAGAGCTAGAGGACAATTATTCCTGAGGAATCTCCCAGTATTAGC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19,210
OM817564.1
Classical swine fever virus
Arainga,M., Hisanaga,T., Hills,K., Handel,K., Rivera,H., Pasick,J., Perez,O., Lamboo,L., Erdelyan,C., Ambagala,A.
Canadian Food Inspection Agency, National Centre for Foreign Animal Diseases
Canada
2023-01-23
Peru-L-20
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,226
GenBank
null
Peru: Lima, Cajamarquilla
Peru
Sus scrofa domesticus
null
2008
null
null
Classical swine fever virus isolate Peru-L-20, complete genome
CAGGGCCTCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCTCATAGTAGGACTAGCAGACGGAGGGACTAGCCATAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCGGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCAGGTGATGGGGGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCACTTTGAACTTTTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGCGGAGGAACCGGTATATGATGCCACAGGGAGACCATTGTTTGGAGAACCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACACTGCAGCTACCACACGATAGGGGGAGAAGCACCATCAAGACAACACTGAAGAACCTACCTAGAAAAGGCGACTGCAGGGGTGGTAACCATCTAGGCCCGGTTAGTGGGATATACGTAAAGCCCGGCCCTGTCTTTTATCAGGACTATATGGGCCCGGTTTACCATAGAGCCCCTCTGGAGTTCTTCAATGAAGCGCAGTTCTGTGAGGTGACCAAAAGGATAGGTAGGGTGACAGGCAGTGACGGGAAACTTTACCATATATATGTGTGCATCGATGGTTGCATCCTGCTCAAGCTAGCCAAGAGGGACGAGCCAAGAACCCTAAAGTGGATCAGAAATTTCACCGACTGCCCACTGTGGGTTACTAGTTGCTCTGACGGTGGCGGGAGTGGAAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGCAAATTAAAAATAACCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACTAAGCCGCCCGATGCTACGATCGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTAAAAAAGAAAGGCAAGGTTAAAGGAAAGAACACCCAAGATGGTCTGTACCACAACAGGAACAAACCACTGGAATCTAGGAAGAAACTAGAAAAAGCCCTGTTGGCATGGGCGGTAATAACAATTGTGTTGTACCAACCGGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGATAATGGCACTAGTGGTATCCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTTAACAGAAGCTTGCATGGGATCTGGCCGGAAAAAATATGCAAAGGAGTCCCCACTCACCTGGCCACAGACACAGAATTGAAAGAAATACAGGGAATGATGGATGCCAGTGAGGGGACAAATTATACGTGCTGTAAGTTGCAGAGACATGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAATATAGACCCCTGGATACAGTTGATGAATAGAACCCAAGCAAACCTGACAGAAGGCGCTCCTGCTAAGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTACGATAAATATGCCGACCTCAACGTGGTCACCCAGGCCAGAAATAGGCCAACGACCCTGACTGGCTGCAAGAAAGGGAAAAATTTTTCTTTCGCGGGTACAGTCATAGAGGGTCCATGTAATTTCAATGTTTCCGTGGAGGATATATTGTATGGGGATCACGACTGTGGCAGTTTGCTCCAAGACACAGCTCTGTACCTAGTAGATGGGATGACCAACACTATAGAAAAAGCCAGACAGGGGGCGGCGAGGGTAACATCTTGGCTTGGAAGGCAACTTAGCACTGCTGGGAAGAGGTTAGAGAGTAGAAGCAGGACCTGGTTTGGTGCCTATGCCCTATCACCTTACTGTAATGTAACAAACAAAATAGGGTACATATGGTACACTAATAATTGCACCCCGGCCTGCCTCCCCAAAAATACAAAGATAATAGGCCCCGGTAAATTTGACACTAATGCGGAAGATGGGAAAATTCTCCATGAGATGGGGGGCCACCTATCAGAATTTCTGCTGCTCTCCCTGGTTGTTCTGTCAGACTTCGCCCCTGAAACGGCCAGTGCGTTATATCTCGTCTTGCACTACGTGACACCACAATCCCACGAAGAACCTGAAGGCTGTGACACAAACCAGTTGAACTTAACAGTGGGAATCAGGACTGAAGACGTAATACCATCATCAGTTTGGAATGTAGGCAAATATGTGTGTGTCAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTAGCTTTGTTATTTGAAGAAGCAGGACAGGTCGTAAAATTAGCCTTACGGGCGCTGAGGGATTTAACCAGGGTCTGGAATAGCGCATCGACTACGGCGTTCCTCATATGCTTGATAAAAGTATTAAGGGGACAGATCGTGCAAGGTGTGATATGGTTGCTACTAGTAACCGGGGCACAAGGCCGGCTGGCCTGCAAGGAAGACTACAGGTACGCATTATCATCAACCAATGAGATAGGGCTACTAGGGGCCGAAGGTCTCACCACTACCTGGCAAGAATACAGCCACAATCTGCAACTGAATGACGGGACCGTCAAGGCCATTTGCGTGGCAGGTTCCTTTAAAGTCACAGCACTTAACGTGGTCAGTAGGAGGTACTTGGCATCATTGCATAAGAGGGCTTTACCCACTTCTGCTACATTTGAGCTCCTGTTCGACGGGACCAACCCATCAGTTGAGGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGGCTGTGCCCGTTTGATACGAGCCCCGTTGTCAAGGGCAAATACAATACAACCTTATTGAACGGTAGTGCCTTCTATCTCGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGTGTTATAGAGTGCACAGCAGTGAGCCCAACAACTCTGAGAACAGAAGTGGTAAAGACCTTCAGGAGAGAAAAACCTTTTCCGCACAGAATGGATTGCGCAACTACCACGGTGGAAAATGAAGATTTATTCTACTGTAAGTTAGGGGGCAACTGGACATGCGTGAAAGGTGAACCAGTGGTCTACAGGGGGGGGCTAGTAAAGCAATGTAGGTGGTGTGGCTTCGACTTCTATGAACCTGACGGACTTCCACACTACCCCATAGGTAAGTGCATTTTGGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCAACGGACTGTAACAGAGACGGCGTAGTGATCAGCGCAGATGGGAGTCACGAGTGCATGATCGGCAACACAACTGTCAAGGTGCATGCATCAGATGAAAGATTGGGCCCTATGCCATGTAGACCTAAGGAGATTGTCTCTAGTGCAGGACCTGTAAGGAAAACCTCCTGTACATTCAACTACACAAAAACTCTGAAGAACAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGCTACTTCCAGCAATATATGCTCAAGGGCGAGTACCAGTACTGGTTTGACCTAGACGTGACCGACCACCACTCGGATTACTTCGCAGAGTTTGTTGTCTTAGTGGTGGTAGCACTGTTAGGAGGAAGATACGTCCTGTGGTTAATAGTGACCTACATAGTTCTAACAGAACAGCTCGCTGCTGGTTTACCATTGGGCCAGGGTGAGGTAGTGTTGATAGGGAACTTAATTACCCACACAGATATTGAGGTCGTAGTATATTTCTTACTACTCTATTTGGTCATGAGGGATGAGCCTATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTCCATGCTATGACTAACAACCCAGTCAAGACCATGACTGTAGCATTGCTTATGGTTAGCGGGGTTGCCAAGGGTGGAAGGATAGATGGCAGTTGGCAGCGGCTGCCGGGGGCCAGCTTTGACATTCAACTTGCGCTGACAGTCGTAGTAGTTGCTGTGATGTTGCTGGCAAAGAAAGATCCAACTACTGTCCCTTTGGTTATAACGGTGGCAACCCTGAGAACGGCTAAGATGACTAATGGACTTAGTACGGATATAGCCATAGCTACAGTGTCAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTACATTAGTGACTACTATAGATACAAGACTTGGCTGCAATACCTTATTAGTACAGTGACAGGTATCTTTTTAATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGCTGGATTTACACACCCCAACCTTGCCATCTTATAGACCCCTCTTCTTCATCCTAGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGGATCTGGACGTAGCCGGATTGCTGTTGCAGTGTGTCCCAACCCTTTTGATGGTTTTTACGATGTGGGCAGACATTCTCACCCTGATCCTCATACTGCCCACTTACGAGTTAACAAAACTATACTACCTCAAGGAGGTGAAGACTGGGGCAGAAAGAAGCTGGTTATGGAAGACCAACTTCAAGAGGGTAAATGACATATATGAAGTTGACCAAGCTGGTGAAGGGGTATACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCAATAACAGGCACCATGTTGCCACTTATCAAAGCCATACTCATCAGCTGCATCAGTAATAGGTGGCAGTTTATATACCTATTGTATTTGATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCACAAGAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGGACCAACTTCACCTCAAGACTCGTAGCCGCTCTGATTGAAGCCAATTGGGCCTTTGATAACGAAGAGGTCAGGGGTTTAAAGAAGTTCTTCCTGTTGTCTAGCAGGGTTAGAGAATTGATCATTAAACATAAAGTGAGGAATGAAGTAATGGCCCACTGGTTTGGTGACGAGGAGGTCTATGGGATGCCGAAGTTGGTTGGTTTGGTCAAGGCAGCAACATTGAGCAAAAACAAACATTGCATTTTGTGCACGGTCTGTGAGGACAGGGAGTGGAGAGGAGAAACCTGCCCAAAGTGCGGTCGTTTTGGGCCACCAATGACCTGTGGCATGACCCTAGCCGACTTCGAAGAGAAACATTACAAGAGGATCTTTTTCAGAGAGGACCAATCAGAAGGGCCGGTTAGAGAGGAGCACGCAGGGTATCTACAATATAGAGCTAGAGGGCAATTATTCCTGAGGAATCTCCCAGTACTAGC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19,211
OM817565.1
Classical swine fever virus
Arainga,M., Hisanaga,T., Hills,K., Handel,K., Rivera,H., Pasick,J., Perez,O., Lamboo,L., Erdelyan,C., Ambagala,A.
Canadian Food Inspection Agency, National Centre for Foreign Animal Diseases
Canada
2023-01-23
Peru-L-24
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,224
GenBank
null
Peru: Lima, Lurin
Peru
Sus scrofa domesticus
null
2008
null
null
Classical swine fever virus isolate Peru-L-24, complete genome
CAGGGCCTCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCTCACAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCCGTAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCGGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCAGGTGATGGGGGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCACTTTGAACTTTTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTATATGATGCCACAGGGAGACCATTGTTTGGAGAACCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACACTGCAGCTACCACACGATAGGGGGAGAGGCAACATCAAGACAACGCTGAAGAACCTACCTAGAAAAGGCGACTGCAGGGGTGGTAACCATCTAGGCCCGGTTAGTGGGATATACGTAAAGCCTGGCCCCGTCTTTTATCAGGACTATATGGGCCCGGTTTACCATAGAGCCCCTCTGGAGTTCTTCAACGAAGCGCAGTTCTGTGAGGTGACCAAAAGGATAGGTAGGGTGACAGGCAGTGACGGGAAACTTTACCATATATATGTGTGCATCGATGGTTGCATCCTGCTCAAGCTAGCCAAGAGGGACGAGCCAAGAACCCTAAAGTGGATTAGAAATTTCACCGACTGCCCACTGTGGGTTACTAGTTGCTCTGACAGTGGCGGGAGTGGAAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGCAAATTAAAAATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACTAAGCCGCCCGATGCTACGATCGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTCAAAAAGAAAGGCAAGGTTAAAGGAAAGAACACCCAAGATGGTCTGTACCACAACAAGAATAAACCACTGGAATCCAGGAAGAAACTGGAAAAAGCCCTGTTGGCATGGGCGGTAATAGCAATTGTGTTGTACCGACCAGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGATAATGGCACTAGTGGTATCCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTTAACAGAAGCTTGCATGGGATCTGGCCAGAAAAAATATGCAAAGGAGTCCCCACTCACCTGGCCACAGACACAGAATTGAAAGAAATACAGGGAATGATGGATGCCAGTGAGGGGACAAATTATACGTGCTGTAAGTTGCAGAGACATGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAATATAGACCCCTGGATACAGTTGATGAATAGAACCCAGGCAAACCTGACAGAAGGAGCTCCTGCTAAGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTACGATAAATATGCCGACCTCAACGTGGTCACCCAGGCCAGAAACAGGCCAACGACCCTGACTGGCTGCAAGAAAGGGAAAAATTTTTCTTTTGCGGGTACGGTCATAGAGGGTCCATGTAATTTCAATGTTTCCGTGGAGGATATATTGTATGGGGATCACGATTGTGGCAGTTTGCTCCAAGACACAGCTCTGTACCTAGTAGATGGAATGACCAATACTATAGAGAAAGCCAGACAGGGGGCGGCGAGGGCAACGTCTTGGCTTGGAAGGCAACTTAGCACTGCTGGGAAGAGGTTAGAGAGTAGAAGCAGGACCTGGTTTGGTGCCTATGCCCTATCACCTTACTGTAATGTAACAAACAAAATAGGGTACATATGGTACACTAATAATTGCACTCCGGCCTGCCTCCCCAAAAATACAAAGATAATAGGCCCCGGTAAATTTGACACTAATGCGGAAGATGGGAAAATTCTCCATGAGATGGGGGGCCACTTATCAGAATTTCTGCTGCTCTCTCTGGTTGTTCTGTCTGACTTCGCCCCTGAAACGGCCAGTGCGTTATATCTCATCTTGCACTACGTGATACCACAATCCCACGAAGAATCTGAAGGCTGTGACACAAACCAGTTGAACTTAACAGTGGGACTCAGGACTGAAGACGTAATACCATCATCAGTTTGGAATGTTGGCAAATATGTGTGTGTCAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTAGCCTTGTTATTTGAAGAAGCAGGACAGGTCGTAAAATTAGCCTTACGGGCGCTGAGGGATTTAACTAGGGTCTGGAATAGTGCATCGACTACGGCGTTCCTCATATGCTTGATAAAAGTATTAAGGGGACAGATCGTGCAAGGTGTGATATGGTTGCTACTAGTAACCGGGGCACAAGGCCGGCTAGCCTGCAAGGAAGATTACAGGTACGCACTATCATCAACCAATGAGATAGGGCTACTAGGGGCCGAAGGCCTCACCACCACCTGGCAAGAATACAGCCACAATCTGCAACTGAATGACGGGACCATCAAGGCCATTTGCGTGGCAGGTTCCTTTAAAGTCACAGCACTTAACGTGGTCAGTAGGAGGTACTTGGCATCATTGCATAAGAGGGCTTTACCCACTTCTGCTACATTTGAGCTCCTGTTCGACGGGACTAACCCATCAGTTGAGGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGGCTGTGCCCGTTTGATACGAGCCCTGTTGTCAAGGGAAAATACAATACAACCTTATTGAACGGTAGTGCCTTCTATCTCGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGTGTTATAGAGTGCACAGCAGTGAGCCCAACAACTCTGAGAACAGAAGTGGTAAAGACCTTCAGGAGAGAAAAACCTTTTCCGCACAGAATGGATTGCGTAACTACCACGGTGGAAAATGAAGATTTATTCTATTGTAAGTTAGGGGGCAACTGGACATGCGTGAAAGGTGTACCAGTGGTCTACACGGGGGGGCTAGTAAAGCAATGTAGATGGTGTGGCTTCGACTTCTATGGACCTGACGGACTTCCACACTACCCCATAGGTAAGTGCATTTTGGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCAACGGACTGTAACAGAGACGGCGTAGTGATCAGCGCAGATGGGAGTCACGAGTGCATGATCGGCAACACAACTGTCAAGGTGCATGCATCAGATGAAAGATTGGGCCCTATGCCATGTAGACCTAAGGAGATTGTCTCTAGTGCAGGACCCGTAAGGAAAACCTCCTGTACATTCAACTACACAAAAACCCTGAAGAATAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGCTACTTCCAGCAATATATGCTCAAGGGCGAGTACCAGTACTGGTTTGACCTGGACGTGACCGACCACCACTCTGATTACTTCGCAGAGTTTGTTGTCTTAGTGGTGGTAGCACTGTTAGGAGGGAGATACGTCCTGTGGTTAATAGTGACCTACATAGTTCTAACAGAACAACTCGCCGCAGGTTTACCATTGGGCCAGGGTGAGGTAGTGTTGATAGGGAACTTAATTACCCACACAGACATTGAGGTTGTAGTATACTTCTTACTACTCTATTTGGTCATGAGGGACGAGCCTATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTCCATGCTATGACTAACAACCCAGTCAAGACCATGACTGTAGCATTGCTTATGGTTAGCGGGGTTGCCAAGGGTGGAAGGATAGATGGCAGTTGGCAGCGGCTGCCAGGGACCAGCTTTGACATTCAACTCGCGCTGACAGTCGTAGTAGTTGCTGTGATGTTGCTGGCAAAGAAAGATCCAACTACTGTCCCCTTGGTTATAACGGTGGCAACCCTGAGAACGGCTAAGATGACTAATGGACTTAGTACGGATATAGCCATAGCTACAGTGTCAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTACATTAGTGACTACTATAGATACAAGACTTGGCTGCAATACCTTATTAGTACAGTGACAGGTATCTTTTTAATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGCTGAATTTACACACCCCAACCTTGCCATCTTATAGGCCCCTCTTCTTCATCCTAGTGTACCTCATCTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGGATCTGGACGTAGCCGGATTACTGTTGCAGTGTGTCCCAACCCTTTTGATGGTTTTTACGATGTGGGCAGACATTCTCACCCTGATCCTCATACTGCCCACTTACGAGTTAACAAAACTATACTACCTCAAGGAGGTGAAGACTGGGGCAGAAAGAAGCTGGTTATGGAAGACCAACTTCAAGAGGGTAAATGACATATACGAAGTTGACCAAGCTGGTGAAGGGGTATACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCAATAACAGGCACCATGTTGCCACTTATCAAAGCCATACTCATCAGCTGCATCAGTAATAAGTGGCAGTTCATATACCTATTGTATTTGATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCACAAGAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGGACCAACTTCACCTCAAGACTTGTAGCCGCTCTGATTGAAGCCAATTGGGCTTTTGATAACGAAGAGGTCAGGGGTTTAAAGAAGTTCTTCCTGTTGTCTAGCAGGGTTAGAGAATTGATCATTAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAATGGCCCACTGGTTTGGTGACGAAGAGGTCTATGGGATGCCGAAGTTGGTTGGTTTGGTCAAGGCAGCAACATTGAGCAAAAACAAACATTGCATTCTGTGCACGGTCTGTGAGGACAGGGAGTGGAGAGGAGAAACCTGCCCAAAGTGCGGTCGTTTTGGGCCACCAGTGACCTGTGGCATGACCCTAGCCGACTTCGAAGAGAAACATTACAAGAGGATCTTTTTCAGAGAGGACCAATCAGAAGGGCCGGTTAGAGAGGAGCACGCAGGGTACCTGCAATATAGAGCTAGAGGACAATTATTCCTGAGGAATCTCCCAGTATTAGC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19,212
OM817566.1
Classical swine fever virus
Arainga,M., Hisanaga,T., Hills,K., Handel,K., Rivera,H., Pasick,J., Perez,O., Lamboo,L., Erdelyan,C., Ambagala,A.
Canadian Food Inspection Agency, National Centre for Foreign Animal Diseases
Canada
2023-01-23
Peru-L-39
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,221
GenBank
null
Peru: Lima, Huachipa
Peru
Sus scrofa domesticus
null
2008
null
null
Classical swine fever virus isolate Peru-L-39, complete genome
CAGGGCCTCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCTCACAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCCGTAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCGGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCAGGTGATGGGGGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCACTTTGAACTTTTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTATATGATGCCACAGGGAGACCATTGTTTGGAGAACCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACACTGCAGCTACCACACGATAGGGGGAGAGGCAACATCAAGACAACGCTGAAGAACCTACCTAGAAAAGGCGACTGCAGGGGTGGTAACCATCTAGGCCCGGTTAGTGGGATATACGTAAAGCCTGGCCCTGTCTTTTATCAGGACTATATGGGCCCGGTTTACCATAGAGCCCCTCTGGAGTTCTTCAATGAAGCGCAGTTCTGTGAGGTGACCAAAAGGATAGGTAGGGTGACAGGCAGTGACGGGAAACTTTACCATATATATGTGTGCATCGATGGTTGCATCCTGCTCAAGCTAGCCAAGAGGGACGAGCCAAGAACCCTAAAGTGGATTAGAAATTTCACCGACTGCCCACTGTGGGTTACTAGTTGCTCTGACGGTGGCGGGAGTGGAAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGCAAATTAAAAATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACTAAGCCGCCCGATGCTACGATCGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTCAAAAAGAAAGGCAAGGTTAAAGGAAAGAACACCCAAGATGGTCTGTACCACAACAAGAACAAACCACTGGAATCCAGGAAGAAACTGGAAAAAGCCCTGTTGGCATGGGCGGTAATAGCAATTGTGTTGTACCGACCAGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGATAATGGCACTAGTGGTATCCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTTAACAGAAGCTTGCACGGAATCTGGCCGGAAAAAATATGCAAAGGAGTCCCCACTCACCTGGCCACAGACACAGAATTGAAAGAAATACAGGGAATGATGGATGCCAGTGAGGGGACAAATTATACGTGCTGTAAGTTGCAGAGACATGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAATGTAGACCCCTGGATACAGTTGATGAATAGAACCCAGGCAAACCTGACAGAAGGAGCTCCTGCTAAGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTACGATAAATATGCCGACCTCAACGTGGTCACCCAGGCCAGAAACAGGCCAACGACCCTGACTGGCTGCAAGAAAGGAAAAAATTTTTCTTTTGCGGGTACAGTCATAGAGGGTCCATGTAATTTCAATGTTTCCGTGGAGGATATATTGTATGGGGATCACGATTGCGGCAGTTTGCTCCAAGACACAGCTCTGTACCTAGTAGATGGAATGACCAATACTATAGAGAAAGCCAGACAGGGGGCGGCGAGGGTAACGTCTTGGCTTGGAAGGCAACTTAGCACTGCTGGGAAGAGGTTAGAGAGTAGAAGCAGGACCTGGTTTGGTGCCTATGCCCTATCACCTTACTGTAATGTAACAAACAAAATAGGGTACATATGGTACACTAATAATTGCACCCCGGCCTGCCTCCCCAAAAATACAAAGATAATAGGCCCCGGTAAATTTGACACTAATGCGGAAGATGGGAAAATTCTCCATGAGATGGGGGGCCACATATCAGAATTTCTGCTGCTCTCTCTGGTTGTTCTGTCAGACTTCGCCCCTGAAACGGCCAGTGCGTTATATCTCATCTTGCACTACGTGATACCACAATCCCACGAAGAATCTGAAGGCTGTGACACAAACCAGTTGAACTTAACAGTGGGACTCAGGACTGAAGACGTAATACCATCATCAGTTTGGAACGTTGGCAAATATGTGTGTGTTAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTAGCTTTGTTATTTGAAGAAGCAGGACAGGTCGTAAAATTAGCCTTACGGGCGCTGAGGGATTTAACTAGGGTCTGGAATAGTGCATCGACTACGGCGTTCCTCATATGCTTGATAAAAGTATTAAGGGGGCAGATCGTGCAAGGTGTGATATGGTTGCTACTAGTAACCGGGGCACAAGGCCGGCTAGCCTGCAAGGAAGATTACAGGTACGCACTATCATCAACCAATGAGATAGGGCTACTAGGGGCCGAAGGCCTCACCACCACCTGGCAAGAATACAGCCACAATCTGCAACTGAATGACGGGACCATCAAGGCCATTTGCGTGGCAGGTTCTTTTAAAGTCACAGCACTTAATGTGGTCAGTAGGAGGTACTTGGCATCATTGCATAAGAGAGCTTTACCTACTTCTGCTACATTTGAGCTCCTGTTCGACGGGACTAACCCATCAGTTGAGGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGGCTGTGCCCGTTTGATACGAGCCCTGTTGTCAAGGGAAAATACAATACAACCTTATTGAACGGTAGTGCCTTCTATCTCGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGTGTTATAGAGTGCACAGCAGTGAGCCCAACAACTCTGAGAACAGAAGTGGTAAAGACCTTCAGGAGAGAAAAACCTTTTCCGCACAGAATGGATTGCGTAACTACCACGGTGGAAAATGAAGATTTATTCTACTGTAAGTTAGGGGGCAACTGGACATGCGTGAAAGGTGAACCAGTGGTCTACACGGGGGGGCTAGTAAAGCAATGTAGATGGTGTGGCTTCGACTTCTATGAACCTGACGGACTTCCACACTACCCCATAGGTAAGTGCATTTTGGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCAACGGACTGTAACAGAGACGGCGTAGTGATCAGCGCAGATGGAAGTCACGAGTGCATGATCGGCAACACAACTGTCAAGGTGCATGCATCAGATGAAAGATTGGGCCCTATGCCATGTAGACCTAAGGAGATTGTCTCTAGTGCAGGACCTGTAAGGAAAACCTCCTGTACATTCAACTACACAAAAACTCTGAAGAATAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGCTACTTCCAGCAATATATGCTCAAGGGCGAGTACCAGTACTGGTTTGACCTGGACGTGACCGACCACCACTCTGATTACTTCGCAGAGTTTGTTGTCTTAGTGGTGGTAGCACTGTTAGGAGGGAGATACGTCCTGTGGTTAATAGTGACCTACATAGTTCTAACAGAACAACTCGCCGCTGGTTTACCATTGGGCCAGGGTGAGGTAGTGTTGATAGGGAACTTAATTACCCACACAGACATTGAGGTTGTAGTATACTTCTTACTACTCTATTTGGTCATGAGGGATGAGCCTATAAAGAAATGGATACTGCTGCTGTTCCATGCTATGACTAACAACCCAGTCAAGACCATGACTGTAGCATTGCTTATGGTTAGCGGGGTTGCCAAGGGTGGAAGGATAGATGGCAGTTGGCAGCGGCTGCCAGGGACCAGCTTTGACATTCAACTCGCGCTGACAGTCGTAGTAGTTGCTGTGATGTTGCTGGCAAAGAAAGATCCAACTACTGTCCCTTTGGTTATAACGGTGGCAACCCTGAGAACGGCTAAGATGACTAATGGACTTAGTACGGATATAGCCATAGCTACAGTGTCAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTACATTAGTGACTACTATAGATACAAGACTTGGCTGCAATACCTTATTAGTACAGTGACAGGTATCTTTTTAATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGCTGGATTTACATACCCCTACCTTGCCATCTTATAGGCCCCTTTTCTTCATCCTAGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGGATCTGGACGTAGCCGGATTGCTGTTGCAGTGTGTCCCAACCCTTTTGATGGTTTTTACGATGTGGGCAGACATTCTCACCCTGATCCTCATACTGCCCACTTACGAGTTAACAAAACTATACTACCTCAAGGAGGTGAAGACTGGGGCAGAAAGAAGCTGGTTATGGAAGACCAACTTCAAGAGGGTAAATGACATATACGAAGTTGACCAAGCTGGTGAAGGGGTATACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCAATAACAGGCACCATGTTACCACTTATCAAAGCCATACTCATCAGCTGCGTCAGTAATAAGTGGCAGTTCATATACCTATTGTATTTGATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCATAAGAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGGACCAACTTCACCTCAAGACTTGTAGCCGCTCTGATTGAAGCCAATTGGGCCTTTGATAACGAAGAGGTCAGGGGTTTAAAGAAGTTCTTCCTGTTGTCTAGCAGGGTTAGAGAATTGATCATTAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTGATGGCCCACTGGTTTGGTGACGAAGAGGTCTATGGGATGCCGAAGTTGGTTGGTTTGGTCAAGGCAGCAACATTGAGCAAAAACAAACATTGCATTCTGTGCACGGTCTGTGAGGACAGGGAGTGGAGAGGAGAAACCTGCCCAAAGTGCGGTCGTTTTGGGCCACCAATGACCTGTGGCATGACCCTAGCCGACTTCGAAGAGAAACATTACAAGAGGATCTTTTTCAGAGAGGACCAATCAGAAGGGCCGGTTAGAGAGGAGCACGCAGGGTATCTGCAATATAGAGCTAGAGGACAATTATTCCTGAGGAATCTCCCAGTATTAGC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19,213
OM817567.1
Classical swine fever virus
Arainga,M., Hisanaga,T., Hills,K., Handel,K., Rivera,H., Pasick,J., Perez,O., Lamboo,L., Erdelyan,C., Ambagala,A.
Canadian Food Inspection Agency, National Centre for Foreign Animal Diseases
Canada
2023-01-23
Peru-L-8
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,221
GenBank
null
Peru: Lima, Villa El Salvador
Peru
Sus scrofa domesticus
null
2008
null
null
Classical swine fever virus isolate Peru-L-8, complete genome
CAGGGCCTCCCTCCAGCGACGGCCGAACTGGGCTAGCCATGCTCACAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCCGTAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCGGAAGCCCACCTCGAGATGCTATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTAGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCAGGTGATGGGGGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTATTAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCACTTTGAACTTTTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTATATGATGCCACAGGGAGACCATTGTTTGGAGAACCGAGTGAGGTACACCCACAATCAACACTGCAGCTACCACACGATAGGGGGAGAGGCAACATCAAGACAACGCTGAAGAACCTACCTAGAAAAGGCGACTGCAGGGGTGGTAACCATCTAGGCCCGGTTAGTGGGATATACGTAAAGCCTGGCCCTGTCTTTTATCAGGACTATATGGGCCCGGTTTACCATAGAGCCCCTCTGGAGTTCTTCAACGAAGCGCAGTTCTGTGAGGTGACCAAAAGGATAGGTAGGGTGACAGGCAGTGACGGGAAACTTTACCATATATATGTGTGCATCGATGGTTGCATCCTGCTCAAGCTAGCCAAGAGGGACGAGCCAAGAACCCTAAAGTGGATTAGAAATTTCACCGACTGCCCACTGTGGGTTACTAGTTGCTCTGACGGTGGCGGGAGTGGAAGTAAAGAGAAGAAGCCAGATAGGATCAACAAGGGCAAATTAAAAATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACTAAGCCGCCCGATGCTACGATCGTAGTGGAAGGAGTAAAATACCAGGTCAAAAAGAAAGGCAAGGTTAAAGGAAAGAACACCCAAGATGGTCTGTACCACAACAAGAACAAACCACTGGAATCCAGGAAGAAACTGGAAAAAGCCCTGTTGGCATGGGCGGTAATAGCAATTGTGTTGTACCGACCAGTTGAAGCCGAAAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGATAATGGCACTAGTGGTATCCAGCATGCTATGTACCTTAGAGGGGTTAACAGAAGCTTGCACGGAATCTGGCCGGAAAAAATATGCAAAGGAGTCCCCACTCACCTGGCCACAGACACAGAATTGAAAGAGATACAGGGAATGATGGATGCCAGTGAGGGGACAAATTATACGTGCTGTAAGTTGCAGAGACATGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAATATAGACCCCTGGATACAGTTGATGAATAGAACCCAGGCAAACCTGACAGAAGGAGCTCCTGCTAAGGAGTGCGCTGTGACTTGCAGGTACGATAAATATGCCGACCTCAACGTGGTCACCCAGGCCAGAAACAGGCCAACGACCCTGACTGGCTGCAAGAAAGGAAAAAATTTTTCTTTTGCGGGTACAGTCATAGAGGGTCCATGTAATTTCAATGTTTCCGTGGAGGATATATTGTATGGGGATCACGATTGCGGCAGTTTGCTCCAAGACACAGCTCTGTACCTAGTAGATGGAATGACCAATACTATAGAGAAAGCCAGACAGGGGGCGGCGAGGGTAACGTCTTGGCTTGGAAGGCAACTTAGCACTGCTGGGAAGAGGTTAGAGAGTAGAAGCAGGACCTGGTTTGGTGCCTATGCCCTATCACCTTACTGTAATGTAACAAACAAAATAGGGTACATATGGTACACTAATAACTGCACCCCGGCCTGCCTCCCCAAAAATACAAAGATAATAGGCCCCGGTAAATTTGACACTAATGCGGAAGATGGGAAAATTCTCCATGAGATGGGGGGCCACCTATCAGAATTTCTGCTGCTCTCTCTGGTTGTTCTGTCTGACTTCGCCCCTGAAACGGCCAGTGCGTTATATCTCATCTTGCACTACGTGATACCACAATCCCACGAAGAATCTGAAGGCTGTGACACAAACCAGTTGAACTTAACAGTGGGACTCAGGACTGAAGACGTAATACCATCATCAGTTTGGAATGTTGGCAAATATGTGTGTGTTAGACCAGACTGGTGGCCATATGAAACCAAGGTAGCTTTGTTATTTGAAGAAGCAGGACAGGTCGTAAAATTAGCCTTACGGGCGCTGAGGGATTTAACTAGGGTCTGGAATAGTGCATCGACTACGGCGTTCCTCATATGCTTGATAAAAGTATTAAGGGGACAGATCGTGCAAGGTGTGATATGGTTGCTACTAGTAACCGGGGCACAAGGCCGGCTAGCCTGCAAGGAAGATTACAGGTACGCACTATCATCAACCAATGAGATAGGGCTACTAGGGGCCGAAGGCCTCACCACCACCTGGCAAGAATACAGCCACAATCTGCAACTGAATGACGGGACCATCAAGGCCATTTGCGTGGCAGGTTCTTTTAAAGTCACAGCACTTAATGTGGTCAGTAGGAGGTACTTGGCATCATTGCATAAGAGGGCTTTACCTACTTCTGCTACATTTGAGCTCCTGTTCGACGGGACTAACCCATCAGTTGAGGAAATGGGAGATGACTTCGGGTTCGGGCTGTGCCCGTTTGATACGAGCCCTGTTGTCAAGGGAAAATACAATACAACCTTATTGAACGGTAGTGCCTTCTATCTCGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGTGTTATAGAGTGCACAGCAGTGAGCCCAACAACTCTGAGAACAGAAGTGGTGAAGACCTTCAGGAGAGAAAAACCTTTTCCGCACAGAATGGATTGCGTAACTACCACGGTGGAAAATGAAGATTTATTCTACTGTAAGTTAGGGGGCAACTGGACATGCGTGAAAGGTGAACCAGTGGTCTACACGGGGGGGCTAGTAAAGCAATGTAGATGGTGTGGCTTCGACTTCTATGAACCTGACGGACTTCCACACTACCCCATAGGTAAGTGCATTTTGGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCAACGGACTGTAACAGAGACGGCGTAGTGATCAGCGCAGATGGAAGTCACGAGTGCATGATCGGCAACACAACTGTCAAGGTGTATGCATCAGATGAAAGATTGGGCCCTATGCCATGTAGACCTAAGGAGATTGTCTCTAGTGCAGGACCTGTAAGGAAAACCTCCTGTACATTCAACTACACAAAAACTCTGAAGAATAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGCTACTTCCAGCAATATATGCTCAAGGGCGAGTACCAGTACTGGTTTGACCTGGACGTGACCGACCACCACTCTGATTACTTCGCAGAGTTTGTTGTCTTAGTGGTGGTAGCACTGTTAGGAGGGAGATACGTCCTGTGGTTAATAGTGACCTACATAGTTCTAACAGAACAACTCGCCGCTGGTTTACCATTGGGCCAGGGTGAGGTAGTGTTGATAGGGAACTTGATTACCCACACAGACATTGAGGTTGTAGTATACTTCTTACTACTCTATTTGGTCATGAGGGATGAGCCTATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTCCATGCTATGACTAACAACCCAGTCAAGACCATGACTGTAGCATTGCTTATGGTTAGCGGGGTTGCCAAGGGTGGAAGGATAGATGGCAGTTGGCAGCGGCTGCCAGGGACCAGCTTTGACATTCAACTCGCGCTGACAGTCGTAGTAGTTGCTGTGATGTTGCTGGCAAAGAAAGATCCAACTACTGTCCCTTTGGTTATAACGGTGGCAACCCTGAGAACGGCTAAGATGACTAATGGACTTAGTACGGATATAGCCATAGCTACAGTGTCAACAGCGTTGCTAACCTGGACCTACATTAGTGACTACTATAGATACAAGACTTGGCTGCAATACCTTATTAGTACAGTGACAGGTATCTTTTTAATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGTGAGCTGGATTTACACACCCCAACCTTGCCATCTTATAGGCCCCTTTTCTTCATCCTAGTGTACCTCATTTCCACTGCAGTGGTAACAAGATGGGATCTGGACGTAGCCGGATTGCTGTTGCAGTGTGTCCCAACCCTTTTGATGGTTTTTACGATGTGGGCAGACATTCTCACTTTGATCCTCATACTGCCCACTTACGAGTTAACAAAACTATACTACCTCAAGGAGGTGAAGACTGGGGCAGAAAGAAGCTGGTTATGGAAGACCAACTTCAAGAGGGTAAATGACATATACGAAGTTGACCAAGCTGGTGAAGGGGTATACCTTTTCCCGTCAAAACAAAAGACAAGTTCAATAACAGGCACCATGTTGCCACTTATCAAAGCCATACTCATCAGCTGCATCAGTAATAAGTGGCAGTTCATATACCTATTGTATTTGATATTTGAAGTGTCTTACTACCTCCATAAGAAGATCATAGATGAAATAGCAGGAGGGACCAACTTCACCTCAAGACTTGTAGCCGCTCTGATTGAAGCCAATTGGGCCTTTGATAACGAAGAGGTCAGGGGTTTAAAGAAGTTCTTCCTGTTGTCTAGCAGGGTTAGAGAATTGATCATTAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAATGGCCCACTGGTTTGGTGACGAAGAGGTCTATGGGATGCCGAAGTTGGTTGGTTTGGTCAAGGCAGCAACATTGAGCAAAAACAAACATTGCATTCTGTGCACGGTCTGTGAGGACAGGGAGTGGAGAGGAGAAACCTGCCCAAAGTGCGGTCGTTTTGGGCCACCAATGACCTGTGGCATGACCCTAGCCGACTTCGAAGAGAAACATTACAAGAGGATCTTTTTCAGAGAGGACCAATCAGAAGGGCCGGTTAGAGAGGAGCACGCAGGGTATCTGCAATATAGAGCTAGAGGACAATTATTCCTGAGGAATCTCCCAGTATTAGC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19,214
OM925903.1
Classical swine fever virus
Fan,J., Chen,J.
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
China
2022-12-20
null
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
12,295
GenBank
null
China
China
Sus scrofa
null
2020
null
null
Classical swine fever virus strain SC5, complete genome
GTATACGAAGTTAGCTCGTCCTCGTGTACAAAATTGGACAAATTAAAATTCTGATTCGGCCTAGGGCATCCCTCCAGCGACGGCCGACCTGGGCTAGCCATGCCCACAGTAGGACTAGCAAACGGAGGGACTAGCCGTAGTGGCGAGCTCCCTGGGTGGTCTAAGTCCTGAGTACAGGACAGTCGTCAGTAGTTCGACGTGAGCAGGAGCCCATCTCGAGATGCTACGTGGACGAGGGCATGCCCAAGACACACCTTAACCCTGGCGGGGGTCGCTAGGGTGAAATCACACCATGTGATGGGGGTACGACCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTAACAGGCTAGTATAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGAATCATTTTGAACTATTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAAGAACCGGTGTATGACATCGCAGGAAGGCCACTATTTGGGGACCCAAGTGAGGTGCACCCACAATCAACACTGAAGCTGCCACATGACAGGGGAAGAGGTAATGTCAGGACAACACTGAAGAACCTACCTAGGAAAGGCGACTGCAGGAGTGGAAACCATCTAGGACCAGTCAGTGGGATATACATAAAGCCCGGCCCTGTCTTCTTTCAGGATTACATGGGCCCCGTCTATCATAGAGCCCCACTAGAGTTCTTTGAAGATGCCCAATTCTGTGATGTCACCAAGAGAATAGGTAGGGTGACGGGTAGTGATGGAAAACTCTACCACATATACGTGTGCATCGACGGTTGCATATTGCTGAAGTTAGCCAAAAGGGACACGCCCAGATCCCTGAAATGGACTAGGAACTTCACCGACTGTCCACTGTGGGTCACTAGTTGTTCTGATGATGGTGCAGGTGGTGGTAAGGACAAGAAACCAGACAGGATGAATAAGGGTAAATTGAAGATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACCAAGCCACCTGACGCCACGATTGTGGTAGAGGGAGTGAAATACCAAGTAAAAAAGAAAGGCAAGGTCAAAGGGAAGAACACTCAAGATGGTCTGTACCATAATAAGAACAAACCACCAGAATCCAGGAAGAAATTAGAAAAAGCCCTATTGGCTTGGGCAATAATAACGATTGTGATGTACCAGCCTGTAGCAGCTGAGAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGACAATGGCACAAGCGGCGTCCAGCAAGCCATGTATCTTAGAGGGGTCAATAGGAGCTTACATGGAATCTGGCCTGAAAAAATTTGTAAAGGGGTCCCTACCCATCTGGCCACTGACACGGAACTAACAGAGATACGTGGGATGATGGACGCCAGCGAGAGGACAAACTATACGTGTTGTAGGCTGCAGAGGCACGAATGGAATAAACATGGATGGTGCAACTGGTATAACATAGACCCTTGGATTCAGTTAATGAACAGGACTCAAGCAAATTTGACAGAAGGCCCTCCGGATAAAGAATGCGCCGTGACCTGCAGATATGACAATAATGCCGACGTTAACGTGGTCACCCAGGCCAGGAATAGACCAACCACTCTGACTGGCTGCAAGAAAGGGAAAAATTTTTCATTTGCAGGTACGGTTATAGAGGGTCCTTGCAATTTCAATGTATCCGTGGAGGACATCTTATATGGAGACCATGAGTGTGGCAGTCTGTTCCAGGACACGGCTCTGTACCTATTAGATGGGATGACCAACACTATAGAGAAAGCCAGGCAGGGTGCGGCGAGAGTTACATCTTGGCTTGGGAGGCAACTTAGTACCACAGGGAAGAAGTTGGAGAGAGGAAGCAAAACCTGGTTCGGTGCCTATGCCCTGTCACCTTACTGCAATGTGACAAGGAAGATAGGGTACATATGGTACACGAACAATTGCACTCCGGCATGCCTCCCAAAAAACACAAAAATAATAGGCCCAGGAAAATTTGACACCAACGCGGAGGATGGGAAGATTCTTCATGAAATGGGGGGGCACCTATCAGAATTCCTGCTGCTTTCTCTAGTAATCCTATCTGACTTCGCCCCAGAAACGGCTAGCACGTTATACCTGATCTTACACTACGCAGTCCCCCAGTCCTATGAGGAACCAGAAGGTTGCGATACAAATCAGCTCAACCTAACAGTGGGACTTAGGACAGAAGATGTGGTACCATCATCAGTTTGGAATATTGGCAAATATGTGTGTGTGAGACCAGACTGGTGGCCGTATGAAACTAAGGTGGCTCTGCTGTTTGAAGAGGCAGGACAGGTCATAAAGCTAGCCCTAAGGGCACTGAGAGATTTAACTAGAGTTTGGAACAGCGCATCAACTACTGCATTCCTCATTTGCCTGATAAAAGTATTAAGAGGACAGGTTGTGCAAGGTGTAATATGGCTACTGCTGGTGACCGGGGCACAAGGGCGGTTGTCCTGTAAGGAAGACTACAGGTATGCTATATCATCAACTAATGAGATAGGGCCACTAGGGGCTGAAGGTCTCACCACCACCTGGAAAGACTACAACCACGGTCTGCAGTTGGACGACGGGACTGTCAGGGCCATCTGCACCGCAGGGTCCTTCAAAGTTACAGCACTTAATGTGGTTAGTAGGAGGTACCTAGCATCATTACATAAGAGGGCTTTGCCCACCTCAGTTACATTTGAACTCCTATTTGATGGGACCACCCCAGTAATTGAGGAAATGGGAGATGACTTTGGATTTGGGCTATGCCCTTTTGACACAATCCCTGTGGTCAAAGGGAAGTACAACACCACTTTATTAAACGGCAGTGCTTTCTATCTAGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGCGTCATAGAGTGCACGGCAGTGAGCCCCACTACCTTGAGAACAGAAGTGGTAAAAACCTTTAAGAGAGAGAAGCCCTTCCCGCCCAGAGTGGATTGCGTGACCACTATAGTAGAAAAAGAGGACCTGTTCTACTGCAAGTTGGGGGGCAATTGGACGTGTGTGAAAGGCGACCCGGTGACCTACGCGGGGGGGCAAGTAAAGCAATGCAGGTGGTGTGGGTTCGACTTCAAAGGACCCGATGGGCTCCCGCACTACCCCATAGGCAAGTGCATCCTAGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCCACAGATTGCAACAGAGATGGTGTTGTTATCAGTACTGAAGGAGAACATGAGTGTTTGATTGGCAATACCACCGTAAAAGTACACGCATTGGATGGAAGACTAGCCCCTATGCCGTGTAGACCCAAAGAAATCGTCTCTAGCGCGGGACCCGTAAGGAAAACTTCTTGCACTTTCAACTATACAAAGACTCTAAGAAACAAGTACTATGAGCCTAGGGACAGCTACTTCCAGCAGTATATGCTTAAGGGAGAGTACCAATACTGGTTTGATCTGGACGTGACTGACCACCACACAGACTACTTTGCTGAATTTGTTGTCTTGGTGGTAGTGGCATTACTGGGGGGGAGGTACGTTCTGTGGCTAATAGTAACCTATATAGTACTAACAGAGCAACTTGCTGCCGGTTTACAACTAGGCCAGGGTGAGGTGGTACTGATAGGGAACTTAATTACCCACACGGACAATGAGGTAGTAGTATACTTCTTACTGCTCTACCTAATAATAAGAGATGAGCCCATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTTCATGCTATGACCAACAACCCAGTTAAGACCATGACGGTAGCATTGCTAATGATCAGTGGGGCCGCCAAGGGTGGAAGGACAGAAGGTGGTTGGCAGAGGCAGCTAGAGGCCAATTTTGACGTCCAACTCGCACTGGCAGTCATAGTGGTAGTCGTGATGTTGCTGGCAAAGAGGGATCCGACTACTTTCCCCCTGGTTATCACAGTGGCAACCCTAAGAACGGCCAAGATAACCAATGGTTTCAGCACAGATCTAGTCATAGCCACAGTGTCGGCAGCTTTGCTAACCTGGACTTATATTAGTGACTATTACAAATACAAGACTTGGCTACAGTACCTCATCAGCACGGTGACTGGAATCTTCCTTATAAGGGTGCTGAAGGGAATAGGCGAGTTGGACTTGCACGCCCCAACTTTACCATCTCACAGACCCCTGTTCTACATCCTTGTGTACCTCATTTCCACTGCTGTGGTGACCAGATGGAACCTGGACATAGCCGGACTGCTGCTACAGTGTATCCCAACGCTCCTAATGGTGTTTACGATGTGGGCTGACATTCTCACCCTGATCCTCGTACTACCCACTTATGAGCTAACAAAGTTATACTACCTTAAGGAAGTGAAGATCGGAACGGAAAAAGGATGGCTGTGGAAAACTAACTATAAGAGGGTGAATGACATCTACGAAGTCGACCAAGCTGGCGAGGGGGTTTACCTCTTCCCTTCAAAACAAAAGACTAGTGCTATAACGAGCACCATGTTGCCGTTGATCAAAGCCATACTCATTAGCTGCATTAGTAATAAGTGGCAACTAATATACTTACTGTACTTAATATTTGAAGTGTCTTACTACCTTCACAAGAAAGTCATAGATGAGATAGCCGGCGGGACCAACTTCATTTCAAGACTAGTGGCAGCTTTAATTGAAGTTAATTGGGCCTTCGACAATGAAGAAGTTAAAGGCCTAAAAAAATTTTTCTTGCTGTCCAGTAGGGTTAAAGAGTTGGTCATTAAACACAAAGTGAGAAATGAAGTAGTGGCCCGCTGGTTTGGGGATGAAGAGATCTACGGGATGCCAAAATTGATCGGCTTAGTCAAGGCAGCAACACTGAGCAAGAGCAAACACTGTATCTTGTGCACTGTCTGTGAGGACAGAGATTGGAGAGGGGAAACTTGCCCAAAATGCGGGCGTTTTGGACCACCAGTGATCTGTGGTATGACCCTAGCAGACTTTGAGGAGAAACACTATAAGAGGATTTTTATCAGAGAGGACCAATCAGACGGGCCACTCAGGGAGGAGCATG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CAGAATAGAACCACTCATATGGTCTCAGCTTACCAACTGGCCCAAGGGAACTGGATGCCAGTTGGTTGCCACGTGTTCATGGGGACTATACCAGCTAGAAGAACCAAGACTCATCCCTATGAGGCATATGTCAAGCTGAGGGAGTTGGTAGAGGAACATAGGATGAAGACATTATGTGGCAGTTCAGGCCTATGTAAGCACAATGAATGGGTAATCCGCAAGATTAAGCATCACGGGAACCTAAGGACCAAACACATGTTGAACCCCGGGAAGGTTGCAGAGCAGCTACACAGAGGAGGGCACAGACATAACGTATATAATAAGACCATAGGCTCAGTGATGACAGCAACTGGTATCAGGCTGGAAAAATTACCCGTGGTCAGGGCCCAAACAGATACAACCAACTTCCATCAAGCAATAAGGGATAAAATAGACAAAGAAGAAAACCTGCAGACCCCGGGCTTGCACAAGAAGTTAATGGAAGTCTTCAATGCATTAAAAAGACCTGAGCTTGAGGCCTCTTACGACGCTGTGGAGTGGGAGGAACTGGAGAGAGGAATAAATAGGAAGGGTGCTGCGGGTTTCTTCGAACGCAAGAACATAGGAGAAGTCCTGGATTCAGAAAAAAATAAAGTTGAAGAGATCATAGACAGTTTGAGGAAAGGTAGGAGTATTAAATACTATGAAACTGCGATCCCAAAAAATGAAAAGAGGGACGTCAATGATGACTGGACTGCCGGTGACTTTGTGGATGAGAAAAAACCCAGGGTGATACAATACCCTGAGGCTAAAACCAGGTTGGCCATCACTAAAGTGATGTACAAGTGGGTGAAACAGAAACCAGTAGTCATACCTGGCTACGAAGGCAAGACACCCCTGTTCCAGATCTTTGACAAAGTGAAGAAAGAATGGGACCAGTTCCAAAATCCAGTGGCTGTGAGCTTCGACACCAGAGCGTGGGACACCCAGGTGACTACAAGAGACCTGGAACTAATAAGAGATATACAGAAGTTCTATTTCAAGAAGAAGTGGCACAAATTCATTGACACCCTAACTATGCACATGTCAGAAGTACCCGTAATTAGTGCCGACGGGGAGGTGTATATAAGGAAGGGGCAGAGAGGCAGTGGACAACCTGACACGAGCGCAGGCAACAGCATGCTGAATGTACTAACAATGGTCTATGCCTTCTGTGAGGCCACGGGGGTACCCTATAAGAGTTTCGACAGAGTGGCAAAGATCCACGTTTGCGGGGATGATGGCTTCTTGATCACTGAAAGGGCTCTTGGTGAGAAATTTGCGAGTAAAGGAGTCCAGATTCTATATGAAGCCGGGAAGCCCCAAAAAATCACAGAAGGGGATAAGATGAAAGTGGCCTATCAGTTTGATGACATCGAGTTCTGTTCCCATACACCAGTGCAAGTAAGGTGGTCAGACAACACTTCTAGTTACATGCCGGGGAGGAACACGACTACAATCCTGGCAAAAATGGCAACAAGGTTAGATTCCAGTGGTGAGAGGGGCACTATAGCATATGAGAAGGCAGTGGCATTTAGCTTCTTGTTGATGTACTCCTGGAATCCATTGATCAGAAGGATATGCCTACTAGTGCTGTCAACCGAACTGCAAGTGAGACCAGGGAAGTCAACCACTTATTACTATGAAGGGGACCCGATATCTGCTTACAAGGAGGTCATCGGCCATAATCTCTTTGACATTAAAAGAACAAGCTTCGAGAAGCTAGCTAAATTAAATCTTAGTATGTCCACACTCGGGGTTTGGACCAAGCACACTAGCAAAAGATTACTACAAGACTGCGTCAATGTCGGTGCTAAAGAGGGCAACTGGTTGGTTAACGCAGACAGACTGGTGAGCAGCAAGACAGGAAATAGGTATATACCAGGAGAGGGCCATACCCAACAAGGGAAACACTATGAAGAATTGATATTGGTAAGAAAACCGATCAGTAATTTTGAGGGGACTGATAGATATAATTTGGGTCCAATAGTCAACGTAGTGTTGAGGAGGCTGAGAGTCATGATGATGGCTCTTATAGGAAGGGGGGTGTAAGAACAGCCGGCCCTTGACCGGGCCTTATCAGTAGAACCCTGTTGTAAATAACACTAACTTATTATTTATTTGAATACTATTTTATTTATTTATTTATTTATTGAATGAGCAAGTATTGGTGCTAACTACCTCATGTTACCACACTACACTCATTTTTAACAGCACTTTAGCTGGAAGGAAAATCCTGACGTCCATAGTTGGACTAAGGTAATTTCCTAACGGCCC
20,326
OM201200.1
Classical swine fever virus
Huang,X., Wu,W., Tian,X., Hou,X., Cui,X., Xiao,Y., Jiao,Q., Zhou,P., Liu,L., Shi,W., Chen,L., Sun,Y., Yang,Y., Chen,J., Zhang,G., Liu,J., Holmes,E.C., Cai,X., An,T., Shi,M.
Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology
China
2022-08-30
CSFV/G123
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
11,697
GenBank
1
China
China
Sus scrofa
null
2018
null
null
Classical swine fever virus isolate CSFV/G123, complete genome
ATGGAGTTGAATCATTTTGAACTATTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTGTATGACATCGCAGGAAGGCCACTATTCGGGGACCCAAGTGAGGTGCACCCACAATCAACACTGAAGTTGCCACATGACAGGGGAAGAGGTAATGTCAGAACAACACTGAAGAACCTACCTAGGAAAGGCGACTGCAGGAGTGGAAACCATCTAGGACCAGTCAGTGGGATATACATAAAACCCGGCCCTGTCTTCTTTCAGGATTACATGGGCCCCGTCTACCATAGAGCCCCACTAGAGTTCTTTGAAGAGGCCCAACTCTGTGATGTGACCAAGAGAATAGGTAGGGTGACGGGTAGCGATGGAAAGCTCTACCACATATACGTGTGCATCGACGGTTGCATATTGTTGAAGTTAGCCAAAAGGGGCACGCCCAGATCCCTGAAATGGACTAGGAACTTCACCGACTGTCCACTGTGGGTCACTAGTTGTTCTGATGATGGTGCAGGTGGTGGTAAGGACAAGAAACCAGACAGGATGAACAAGGGTAAATTAAAGATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACCAAGCCACCTGACGCCACGATTGTGGTAGAGGGAGTGAAATACCAAGTAAAAAAGAAAGGCAAGGTCAAAGGGAAGAGCACTCAAGATGGCCTGTACCATAATAAGAACAAACCACCAGAGTCCAGGAAGAAATTAGAAAAAGCCCTATTGGCTTGGGCAATAATAACAATTGTGATGTATCAGCCTGTAGCAGCTGAGAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGACAATGGCACTAGCGGCGTCCAGCAAGCCATGTATCTTAGAGGGGTCAATAGGAGCTTACATGGAATCTGGCCTGAAAAAATTTGTAAAGGGGTCCCTACCCATCTGGCCACTGACACGGAACTAACAGAGATACGTGGGATGATGGACGCCAGCGAGAGGACAAACTATACGTGTTGCAGGCTGCAGAGACACGAATGGAATAAACATGGATGGTGCAACTGGTATAACATAGACCCCTGGATTCAGTTAATGAACAGGACCCAAGCAAATTTGACAGAAGGCCCTCCAGATAAAGAGTGCGCCGTGACCTGCAGATACGACAAAAATGCAGACGTTAACGTGGTCACCCAGGCCAGGAATAGACCAACCACTCTAACTGGCTGCAAGAAAGGAAAAAATTTTTCATTTGCAGGTACGGTTATAGAGGGTCCTTGCAATTTCAATGTATCTGTGGAGGACATCTTATATGGAGACCATGAGTGTGGCAGTCTGTTTCAGGACACGGCTCTGTACCTATTAGATGGGATGACCAACACTATAGAGAAAGCCAGGCAGGGTGCGGCGAGAGTTACATCTTGGCTTGGGAGGCAACTCAGTACCACGGGGAAGAAGTTGGAGAGAGGAAGCAAAACCTGGTTCGGTGCCTATGCCCAGTCACCTTACTGCAATGTGACAAGGAAGATAGGGTACATATGGTACACGAACAATTGCACTCCGGCATGCCTCCCAAAAAACACAAAAATAATAGGCCCAGGAAAATTTGACACCAACGCGGAGGATGGGAAGATTCTTCATGAAATGGGGGGCCACCTATCAGAATTCCTGCTGCTTTCTCTAGTAATCCTATCTGACTTCGCCCCAGAAACGGCTAGCACGTTATACCTAATCTTACACTATGCAGTCCCCCAGTCCTATGAGGAACCAGAAGGTTGCGATACGAATCAGCTCAACCTAACAGTGGGGCTTAGGACAGAAGATGTGGTACCATCATCAGTTTGGAATATCGGCAAATATGTGTGTGTAAGACCAGACTGGTGGCCGTATGAAACTAAGGTGGCTCTGCTGTTTGAAGAGGCAGGACAGGTCATAAAGCTAGCTCTAAGGGCACTGAGAGATTTAACTAGAGTCTGGAACAGCGCATCTACTACTGCATTCCTCATTTGCCTGATAAAAGTATTAAGAGGACAGGTTGTGCAAGGTGTAATATGGCTGCTGCTGGTAACCGGGGCACAAGGGCGGTTGTCCTGCAAGGAAGATTACAGGTATGCTATATCATCAACCAATGAGATAGGGCCACTAGGGGCTGAAGGTCTCACCACCACCTGGAAAGAATACAACCACGGCCTGCAGCTGGACGACGGGACTGTCAGGGCCATCTGCACCGCAGGGTCTTTCAAAGTTACAGCACTTAATGTGGTTAGTAGGAGGTACCTAGCATCATTACATAAGAGGGCTTTGCCCACCTCAGTTACATTTGAACTCCTATTTGATGGGACCACCCCAGTAATTGAGGAAATGGGAGATGACTTTGGGTTTGGGCTATGCCCTTTTGACACAATCCCTGTGGTCAAAGGGAAGTACAACACTACTTTATTAAACGGCAGTGCTTTCTATCTAGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGCGTCATAGAGTGCACGGCAGTGAGCCCCACTACCTTGAGAACAGAAGTGGTAAAAACCTTTAAGAGAGAGAAGCCCTTCCCGCACAGAGTGGATTGCGTGACCACTATAGTAGAAAGAGAGGACCTGTTCTACTGCAAGTTGGGGGGCAATTGGACATGCGTGAAAGGCAACCCGGTGACCTACACGGGGGGGCAAGTAAAGCAATGCAGGTGGTGCGGGTTCGACTTCAAAGAACCCGATGGGCTCCCACACTACCCCATAGGCAAGTGCATCCTAGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCCACAGACTGCAACAGGGATGGTGTAGTTATCAGTACTGAAGGAGAACATGAGTGTTTGATCGGCAACACCACCGTAAAAGTACACGCGTTGGATGGAAGACTGGCCCCTATGCCGTGTAGACCCAAAGAAATCGTCTCTAGCGCGGGACCTGTAAGAAAAACTTCTTGCACTTTCAACTATACAAAGACTCTAAGAAACAAGTACTATGAGCCTAGGGACAGCTACTTCCAGCAGTATATGCTTAAGGGAGAGTACCAATACTGGTTTGATCTGGACGTGACTGACCACCACACAGACTACTTTGCTGAATTTATTGTCTTGGTGGTAGTGGCATTACTGGGGGGAAGATATGTTCTGTGGCTAATAGTAACCTATATAGTACTAACAGAGCAACTTGCTGCTGGTATACAACTAGGCCAGGGTGAGGTGGTACTGATAGGAAACTTAATTACCCACACGGACAATGAGGTAGTAGTATACTTCTTACTGCTCTACCTAATAATAAGAGATGAGCCCATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTTCATGCTATGACCAACAACCCAGTTAAGACCATGACAGTAGCATTGCTAATGATCAGTGGGGCCGCCAAGGGTGGAAGGATAGAAGGTGGTTGGCAGAGACAGCTAGAGGCCAATTTTGACATCCAACTCGCACTGGCAGTCATAGTGGTAGTCGTGATGTTGCTGGCAAAGAGAGATCCGACTACTTTCCCCCTGGTGATCACAGTGGCAACCCTAAGAACGGCTAAGATAACCAATGGTTTCAGCACAGATCTAGCCATAGCCACAGTGTCGGCAGCTTTGCTAACCTGGACTTATATCAGTGACTATTACAAATACAAGACTTGGCTACAGTACCTTATCAGCACGGTGACTGGAATCTTCCTTATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGCGAGTTGGACTTGCACGCCCCAACTTTACCGTCTCACAGACCCCTGTTCTACATTCTTGTGTACCTCATTTCCACTGCTGTGGTAACCAGATGGAACCTGGACGTAGCCGGACTGCTGCTACAGTGTGTCCCAACGCTCCTAATGGTGTTTACGATGTGGGCTGACTTTCTTACCCTGATCCTCGTACTACCCACCTATGAGCTAACAAAGTTATACTACCTTAAGGAAGTGAAGATCGGAACAGAAAAAGGATGGCTGTGGAAAACTAACTATAAGAGGGTGAATGACATCTACGAAGTTGACCAAGCTGGCGAGGGGGTTTACCTCTTCCCTTCAAAACAAAAGACTAGTGCCATACCGAGCACTATGTTGCCGTTGATCAAAGCCATACTCATTAGCTGCATTAGTAACAAGTGGCAACTTATATATTTACTGTACTTAATATTTGAAGTGTCCTACTACCTTCACAAGAAAGTCATAGATGAGATAGCCGGCGGGACCAATTTCGTTTCAAGACTAGTGGCAGCTTTAATTGAAGTTAATTGGGCCTTCGACAATGAAGAAGTTAAAGGCCTAAAAAAATTTTTCTTGCTGTCCAGTAGGGTTAAAGAGTTGGTCATCAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAGTGGTCCGCTGGTTTGGGGATGAAGAGATCTACGGGATGCCAAAGTTGATCGGCTTAGTTAAGGCAGCAACACTGAGCAAGAGCAAACACTGTATCTTGTGCACCGTCTGTGAGGACAGAGATTGGAGAGGGGAAACTTGCCCAAAATGCGGACGTTTTGGACCACCAGTGATCTGTGGTATGACCCTAGCAGACTTCGAGGAGAAACACTATAAGAGGATTTTTATCAGAGAGGACCAATCAGATGGGCCACTCAGGGAGGAGCATGCAGGGTACTTGCAGTACAAAGCTAGGGGTCAACTTTTTCTGAGGAATCTCCCGGTGTTGGCGACAAAAGTCAAGATGCTCCTGGTTGGCAACCTCGGGACAGAGGTCGGAGATTTGGAGCATCTTGGCTGGGTGCTCAGAGGGCCCGCCGTCTGTAAGAAAGTCACTGAACACGAAAAGTGCGCTACGTCTATAATGGACAAGTTGACAGCTTTCTTCGGTGTTATGCCAAGAGGTACTACTCCCAGAGCTCCAGTAAGGTTTCCCACTTCCCTCCTAAAGATAAGAAGAGGGTTGGAGACGGGTTGGGCTTACACACATCAAGGTGGCATTAGCTCAGTTGACCATGTGACTTGTGGGAAAGACTTGCTGGT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26,527
OM201201.1
Classical swine fever virus
Huang,X., Wu,W., Tian,X., Hou,X., Cui,X., Xiao,Y., Jiao,Q., Zhou,P., Liu,L., Shi,W., Chen,L., Sun,Y., Yang,Y., Chen,J., Zhang,G., Liu,J., Holmes,E.C., Cai,X., An,T., Shi,M.
Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology
China
2022-08-30
CSFV/G124
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
11,697
GenBank
1
China
China
Sus scrofa
null
2018
null
null
Classical swine fever virus isolate CSFV/G124, complete genome
ATGGAGTTGAATCATTTTGAACTATTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTGTATGACATCGCAGGAAGGCCACTATTCGGGGACCCAAGTGAGGTGCACCCACAATCAACACTGAAACTGCCACATGACAGGGGAAGAGGTAATGTCAGAACAACACTGAAGAACCTACCTAGGAAAGGCGACTGCAGGAGTGGAAACCATCTAGGACCAGTCAGTGGGATATACATAAAACCCGGCCCTGTCTTCTTTCAGGATTACATGGGCCCCGTCTACCATAGAGCCCCACTAGAGTTCTTTGAAGAGGCCCAACTCTGTGATGTGACCAAGAGAATAGGTAGGGTGACGGGTAGCGATGGAAAGCTCTACCACATATACGTGTGCATCGACGGTTGCATATTGTTGAAGTTAGCCAAAAGGGGCACACCCAGATCCCTGAAATGGACTAGGAACTTCACCGACTGTCCACTGTGGGTCACTAGTTGTTCTGATGATGGTGCAGGTGGTGGTAAGGACAAGAAACCAGACAGGATGAACAAGGGTAAATTAAAGATAGCCCCAAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACCAAGCCACCTGACGCCACGATTGTGGTAGAGGGAGTGAAATACCAAGTAAAAAAGAAAGGCAAGGTCAAAGGGAAGAGCACTCAAGATGGCCTGTACCATAATAAGAACAAACCACCAGAGTCCAGGAAGAAATTAGAAAAAGCCCTATTGGCTTGGGCAATAATAACAATTGTGATGTATCAGCCTGTAGCAGCTGAGAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGACAATGGCACTAGCGGCGTCCAGCAAGCCATGTATCTTAGAGGGGTCAATAGGAGCTTACATGGAATCTGGCCTGAAAAAATTTGTAAAGGGGTCCCTACCCATCTGGCCACTGACACGGAACTAACAGAGATACGTGGGATGATGGACGCCAGCGAGAGGACAAACTATACGTGTTGCAGGCTGCAGAGACACGAATGGAATAAACATGGATGGTGCAACTGGTATAACATAGACCCCTGGATTCAGTTAATGAACAGGACCCAAGCAAATTTGACAGAAGGCCCTCCAGATAAAGAGTGCGCCGTGACCTGCAGATACGACAAAAATGCAGACGTTAACGTGGTCACCCAGGCCAGGAATAGACCAACCACTCTAACTGGCTGCAAGAAAGGAAAAAATTTTTCATTTGCAGGTACGGTTATAGAGGGTCCTTGCAATTTCAATGTATCTGTGGAGGACATCTTATATGGAGATCATGAGTGTGGCAGTCTGTTTCAGGACACGGCTCTGTACCTATTAGATGGGATGACCAACACTATAGAGAAAGCCAGGCAGGGTGCGGCGAGAGTTACATCTTGGCTTGGGAGGCAACTCAGTACCACGGGGAAGAAGTTGGAGAGAGGAAGCAAAACCTGGTTCGGTGCCTATGCCCAGTCACCTTACTGCAATGTGACAAGGAAGATAGGGTACATATGGTACACGAACAATTGCACTCCGGCATGCCTCCCAAAAAACACAAAAATAATAGGCCCAGGAAAATTTGACACCAACGCGGAGGATGGGAAGATTCTTCATGAAATGGGGGGCCACCTATCAGAATTCCTGCTGCTTTCTCTAGTAATCCTATCTGACTTCGCCCCAGAAACGGCTAGCACGTTATACCTAATCTTACACTATGCAGTCCCCCAGTCCTATGAGGAACCAGAAGGTTGCGATACGAATCAGCTCAACCTAACAGTGGGACTTAGGACAGAAGATGTGGTACCATCATCAGTTTGGAATATTGGCAAATATGTGTGTGTAAGACCAGACTGGTGGCCGTATGAAACTAAGGTGGCTCTGCTGTTTGAAGAGGCAGGACAGGTCATAAAGCTAGCTCTAAGGGCACTGAGAGATTTAACTAGAGTCTGGAACAGCGCATCTACTACTGCATTCCTCATTTGCCTGATAAAAGTATTAAGAGGACAGGTTGTGCAAGGTGTAATATGGCTGCTGCTGGTAACCGGGGCACAAGGGCGGTTGTCCTGCAAGGAAGATTACAGGTATGCTATATCATCAACCAATGAGATAGGGCCACTAGGGGCTGAAGGTCTCACCACCACCTGGAAAGAATACAACCACGGCCTGCAGCTGGACGACGGGACTGTCAGGGCCATCTGCACCGCAGGGTCTTTCAAAGTTACAGCACTTAATGTGGTTAGTAGGAGGTACCTAGCATCATTACATAAGAGGGCTTTGCCCACCTCAGTTACATTTGAACTCCTATTTGATGGGACCACCCCAGTAATTGAGGAAATGGGAGATGACTTTGGGTTTGGGCTATGCCCTTTTGACACAATCCCTGTGGTCAAAGGGAAGTACAACACTACTTTATTAAACGGCAGTGCTTTCTATCTAGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGCGTCATAGAGTGCACGGCAGTGAGCCCCACTACCTTGAGAACAGAAGTGGTAAAAACCTTTAAGAGAGAGAAGCCCTTCCCGCACAGAGTGGATTGCGTGACCACTATAGTAGAAAGAGAGGACCTGTTCTACTGCAAGTTGGGGGGCAATTGGACATGCGTGAAAGGCAACCCGGTGACCTACACGGGGGGGCAAGTAAAGCAATGCAGGTGGTGCGGGTTCGACTTCAAAGAACCCGATGGGCTCCCACACTACCCCATAGGCAAGTGCATCCTAGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCCACAGACTGCAACAGAGATGGTGTAGTTATCAGTACTGAAGGAGAACATGAGTGTTTGATCGGCAACACCACCGTAAAAGTACACGCGTTGGATGGAAGACTGGCCCCTATGCCGTGTAGACCCAAAGAAATCGTCTCTAGCGCGGGACCTGTAAGAAAAACTTCTTGCACTTTCAACTATACAAAGACTCTAAGAAACAAGTACTATGAGCCTAGGGACAGCTACTTCCAGCAGTATATGCTTAAGGGAGAGTACCAATACTGGTTTGATCTGGACGTGACTGACCACCACACAGACTACTTTGCTGAATTTATTGTCTTGGTGGTAGTGGCATTACTGGGGGGAAGATACGTTCTGTGGCTAATAGTAACCTATATAGTACTAACAGAGCAACTTGCTGCTGGTATACAACTAGGCCAGGGTGAGGTGGTACTGATAGGAAACTTAATTACCCACACGGACAATGAGGTAGTAGTATACTTCTTACTGCTCTACCTAATAATAAGAGATGAGCCCATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTTCATGCTATGACCAACAACCCAGTTAAGACCATGACAGTAGCATTGCTAATGATCAGTGGGGCCGCCAAGGGTGGAAGGATAGAAGGTGGTTGGCAGAGACAGCTAGAGGCCAATTTTGACATCCAACTCGCACTGGCAGTCATAGTGGTAGTCGTGATGTTGCTGGCAAAGAGAGATCCGACTACTTTCCCCCTGGTGATCACAGTGGCAACCCTAAGAACGGCTAAGATAACCAATGGTTTCAGCACAGATCTAGCCATAGCCACAGTGTCGGCAGCTTTGCTAACCTGGACTTATATCAGTGACTATTACAAATACAAGACTTGGCTACAGTACCTTATCAGCACGGTGACTGGAATCTTCCTTATAAGGGTACTGAAGGGAATAGGCGAGTTGGACTTGCACGCCCCAACTTTACCGTCTCACAGACCCCTGTTCTACATTCTTGTGTACCTCATTTCCACTGCTGTGGTAACCAGATGGAACCTGGACGTAGCCGGACTGCTGCTACAGTGTGTCCCAACGCTCCTAATGGTGTTTACGATGTGGGCTGACTTTCTTACCCTGATCCTCGTACTACCCACCTATGAGCTAACAAAGTTATACTACCTTAAGGAAGTGAAGATCGGAACAGAAAAAGGATGGCTGTGGAAAACTAACTATAAGAGGGTGAATGACATCTACGAAGTTGACCAAGCTGGCGAGGGGGTTTACCTCTTCCCTTCAAAACAAAAGACTAGTGCCATACCGAGCACTATGTTGCCGTTGATCAAAGCCATACTCATTAGCTGCATTAGTAACAAGTGGCAACTTATATATTTACTGTACTTAATATTTGAAGTGTCCTACTACCTTCACAAGAAAGTCATAGATGAGATAGCCGGCGGGACCAATTTCGTTTCAAGACTAGTGGCAGCTTTAATTGAAGTTAATTGGGCCTTCGACAATGAAGAAGTTAAAGGCCTAAAAAAATTTTTCTTGCTGTCCAGTAGGGTTAAAGAGTTGGTCATCAAACACAAAGTGAGGAATGAAGTAGTGGTCCGCTGGTTTGGGGATGAAGAGATCTACGGGATGCCAAAGTTGATCGGCTTAGTTAAGGCAGCAACACTGAGCAAGAGCAAACACTGTATCTTGTGCACCGTCTGTGAGGACAGAGATTGGAGAGGGGAAACTTGCCCAAAATGCGGACGTTTTGGACCACCAGTGATCTGTGGTATGACCCTAGCAGACTTCGAGGAGAAACACTATAAGAGGATTTTTATCAGAGAGGACCAATCAGATGGGCCACTCAGGGAGGAGCATGCAGGGTACTTGCAGTACAAAGCTAGGGGTCAACTTTTTCTGAGGAATCTCCCGGTGTTGGCGACAAAAGTCAAGATGCTCCTGGTTGGCAACCTCGGGACAGAGGTCGGAGATTTGGAGCATCTTGGCTGGGTGCTCAGAGGGCCCGCCGTCTGTAAGAAAGTCACTGAACACGAAAAGTGTGCTACGTCTATAATGGACAAGTTGACAGCTTTCTTCGGTGTTATGCCAAGAGGTACTACTCCCAGAGCTCCAGTAAGGTTTCCCACTTCCCTCCTAAAGATAAGAAGAGGGTTGGAGACGGGTTGGGCTTACACACATCAAGGTGGCATTAGCTCAGTTGACCATGTGACTTGTGGGAAAGACTTGCTGGT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26,528
OM201202.1
Classical swine fever virus
Huang,X., Wu,W., Tian,X., Hou,X., Cui,X., Xiao,Y., Jiao,Q., Zhou,P., Liu,L., Shi,W., Chen,L., Sun,Y., Yang,Y., Chen,J., Zhang,G., Liu,J., Holmes,E.C., Cai,X., An,T., Shi,M.
Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology
China
2022-08-30
CSFV/Y112
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
11,697
GenBank
1
China
China
Sus scrofa
null
2019
null
null
Classical swine fever virus isolate CSFV/Y112, complete genome
ATGGAGTTGAATCATTTTGAACTATTATACAAAACAAGCAAACAAAAACCAATGGGAGTGGAGGAACCGGTGTATGACATCGCAGGAAAGCCACTATTCGGGGACCCAAGTGAGGTGCACCCACAATCAACGCTGAAGCTGCCACACGACAGGGGGAGAGGTAATGTCAGAACAACACTGAAGAACCTACCTAGGAAAGGCGACTGCAGGAGTGGAAACCATCTAGGACCAGTCAGTGGGATATACATAAAGCCCGGCCCTGTTTTCTTTCAAGATTACATGGGCCCCGTCTACCATAGAGCCCCACTAGAGTTCTTTGAAGAGGCCCAATTCTGTGATGTGACCAAGAGAATAGGTAGGGTGACGGGTAGTGATGGAAAGCTCTACCACATATACGTGTGCATCGACGGTTGCATATTGTTGAAGTTAGCCAAAAGGGGCACGCCCAGATCCCTGAAATGGACTAGGAACTTCACCGACTGTCCGCTGTGGGTCACTAGTTGTTCTGATGATGGTGCAGGTAATGGCAAGGACAAGAAACCAGACAGGATGAACAAGGGTAAATTAAAGATAGCCCCTAAAGAGCATGAGAAGGACAGCAAAACCAAGCCACCTGATGCCACGATTGTGGTAGAGGGAGTGAAATACCAAGTAAAAAAGAAAGGCAAGGTCAAAGGGAAGAGCACCCAAGATGGTCTGTACCATAATAAGAACAAACCACCAGAGTCCAGGAAGAAATTAGAAAAAGCTCTATTGGCTTGGGCAATAATAACAATTGTGATGTATCAGCCTGTAGCAGCTGAGAATATAACCCAATGGAACCTGAGTGACAATGGCACAAGCGGCGTCCAGCAAGCCATGTATCTTAGAGGGGTTAATAGAAGCTTACATGGAATCTGGCCTGAAAAAATTTGTAAAGGGGTTCCTACCCATCTGGCTACTGATACGGAACTAACAGAGATACGTGGGATGATGGACGCCAGCGAGAGGACAAACTACACATGTTGTAGGTTGCAGAGACACGAATGGAATAAACATGGGTGGTGCAACTGGTACAACATAGACCCTTGGATTCAGTTGATGAACAGGACCCAAGCAAATTTGACGGAAGGCCCCCCAGATAAAGAGTGCGCCGTGACCTGCAGATATGACAAAAATGCCGACGTTAACGTGGTCACCCAGGCCAGGAATAGACCAACCACTCTGACTGGCTGCAAGAAAGGGAAAAATTTTTCATTTGCAGGTACGGTTATAGAGGGTCCCTGCAATTTCAATGTATCTGTGGAGGACATCTTATATGGAGACCATGAGTGTGGCAGTCTGTTCCAGGACACGGCTCTGTACCTATTAGATGGAATGACCAACACTATAGAGAGAGCCAGGCAGGGTGCGGCGAGAGTTACATCTTGGCTTGGGAGGCAACTCAGTACCACAGGGAAGAAGTTGGAGAGAGGGAGCAAAACCTGGTTCGGTGCCTATGCCCTGTCACCTTATTGCAATGTGACAAGGAAGATAGGGTACATATGGTACACGAACAATTGTACTCCGGCATGCCTCCCAAAAAACACAAAAATAATAGGCCCAGGAAAATTTGACACCAATGCGGAGGATGGGAAGATTCTTCATGAAATGGGGGGCCACCTATCAGAATTCCTGTTGCTTTCTCTAGTAATCCTATCCGACTTCGCCCCTGAAACGGCTAGTACGTTATACCTAATCTTACACTATGCAGTCCCCCAGTCCTATGAGGAACCAGAAGATTGCGATACGAATCAGCTCAACCTAACAGTGGGACTTAGGACAGAAGATGTAGTACCATCATCAGTTTGGAATATCGGCAAATATGTGTGTGTAAGACCAGATTGGTGGCCGTATGAAACTAAGGTGGCTCTACTGTTTGAAGAGGCAGGACAGGTCATAAAGCTAGCCCTAAGGGCACTGAGAGATTTAACCAGAGTCTGGAACAGTGCATCTACTACTGCATTCCTCATTTGCCTGATAAAAGTGTTAAGAGGACAGGTTGTACAAGGTGTAATATGGCTGCTGCTGGTGACCGGGGCACAAGGGCAGTTGTCCTGTAAGGAAGACTACAGGTATGCTATATCGTCAACCAATGAGATAGGGCCACTAGGGGCTGAAGGTCTCACTACCACTTGGAAAGAATACAACCACGGCCTGCAGCTGGATGACGGAACTGTCAGGGCCATTTGCATTGCAGGGTCTTTCAAAGTTACAGCACTTAATGTGGTTAGTAGGAGGTACCTAGCATCATTACATAGGAGGGCTTTGCCCACCTCAGTTACATTTGAACTCCTATTTGATGGGACCACCCCAGTAGTTGAGGAAATGGGAGATGGTTTTGGATTTGGGCTGTGCCCTTTTGACACAACCCCTGTGGTCAAAGGGAAGTACAACACCACTTTATTAAACGGCAGTGCTTTCTATCTAGTCTGCCCAATAGGGTGGACGGGCGTCATAGAGTGCACGGCAGTGAGCCCCACTACCTTGAGAACAGAAGTGGTAAAAACCTTTAAGAGAGAGAAGCCCTTCCCGCACAGAATGGATTGCGTGACCACTATAGTAGAAAATGAGGACTTGTTCTACTGCAAGTTGGGGGGCAATTGGACATGTGTGAAAGGCAGCCCGGTGACCTACTCAGGGGGGCAAGTAAGGCAATGCAGGTGGTGCGGTTTCGACTTCAAAGAACCCGATGGGCTCCCGCACTACCCAATAGGCAAGTGCATCCTAGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTGGTGGATTCCACAGACTGCAACAGAGATGGTGTTGTTATCAGTACTGAAGGAGAACATGAGTGCTTGATCGGCAACACCACCGTAAAAGTACACGCGTTGGATGGAAGACTGGCCCCTATGCCGTGCAGACCCAAAGAGATCGTCTCTAGTGCGGGACCAGTAAGGAAAACTTCTTGCACTTTCAACTATACAAAGACTCTAAGAAACAAGTACTATGAGCCTAGGGACAGCTACTTCCAGCAGTATATGCTTAAGGGAGAGTACCAATACTGGTTTGATCTGGACGTGACTGACCACCACACAGACTACTTTGCTGAATTTATTGTCTTGGTGGTAGTGGCATTATTAGGGGGAAGGTACGTTCTGTGGCTAATAGTAACCTATATAGTACTAACAGAGCAACTTGCTGCCGGTTTACAACTAGGCCAGGGTGAGGTGGTACTGATAGGAAACTTAATTACCCACACGGACAATGAGGTAGTAGTATACTTCTTACTGCTCTACCTAATAATAAGAGATGAGCCCATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTTCATGCCATGACCAACAACCCAGTTAAAACCATGACAGTAACATTGCTAATGATCAGTGGGGTCGCCAAGGGTGGAAGGACAGAAGGTGGTTGGCAGAGGCAGCTAGAGACCAATTTTGACATCCAACTCGCACTGGCAGTCATAGTAGTAGTCGTGATGTTGTTGGCAAAGAGAGATCCGACTACTTTCCCCCTGGTGATCACAGTGGCAACCCTAAGAACGGCTAAGATAACCAATGGTTTCAGCACAGATCTAGCCATAGCCACAGTGTCGGCAGCTTTGCTAACCTGGACTTATATCAGTGACTATTACAAATACAAGACTTGGCTACAGTACCTCATCAGCACGGTGACTGGAATCTTCCTTATAAGGGTATTGAAGGGAATAGGCGAGTTGGACCTGCACGCCCCAACTTTACCATCTCACAGACCCCTGTTCTATATCCTTGTGTACCTCATTTCCACTGCTGTGGTAACCAGATGGAACCTGGACATAGCCGGACTGCTGCTGCAGTGCGTCCCAACACTCCTAATGGTGTTTACGATGTGGGCTGACATTCTCACTCTGATNNNNNNNNNNNNNACTTATGAGCTGACAAAATTATACTACCTCAAGGAAGTGAAGATCGGAACAGAAAAAGGATGGCTGTGGAAAACAAACTATAAGAGGGTGAATGACATCTACGAAGTCGACCAAGCTGGCGAGGGGGTTTACCTCTTCCCTTCAAAACAAAAGACTAGTGCTATAACGAGCACCATGTTGCCGTTGATTAAAGCCATACTCATCAGCTGCATCAGTAACAAGTGGCAACTTATATACTTACTGTACTTGATATTTGAAGTGTCCTACTACCTCCACAAGAAAGTCATAGATGAGATAGCCGGCGGGACCAATTTCGTCTCAAGGCTAGTGGCAGCTTTGATTGAAGTCAACTGGGCCTTCGACAATGAAGAAGTTAAAGGCCTGAAAAAGTTTTTCTTGCTGTCCAGTAGGGTTAAAGAGTTGGTCATCAAACACAAAGTGAGAAATGAAGTGGTGGTCCGCTGGTTTGGGGATGAAGAGATCTACGGGATGCCAAAGTTAATCGGCTTAGTTAAGGCAGCAACACTGAGCAAAAGCAAACACTGTATCTTGTGCACCGTCTGTGAGGACAGAGATTGGAGAGGTGAAACTTGCCCAAAATGCGGGCGTTTTGGGCCACCAGTGATCTGTGGTATGACCCTAGCAGACTTCGAGGAGAAACACTATAAGAGGATTTTTATCAGAGAGGACCAATCAGATGGGCCACTCAGGGAGGAGCATGCAGGGTACTTGCAGTATAAAGCTAGGGGTCAACTTTTTCTGAGGAACCTCCCGGTGTTGGCGACAAAAGTCAAGATGCTCCTGGTTGGTAATCTCGGGACAGAGGTCGGGGATCTGGAGCATCTTGGCTGGGTGCTCAGAGGGCCTGCCGTCTGTAAGAAGGTCACTGAACACGAAAAGTGCACTACGTCTATAATGGACAAGTTGACAGCTTTCTTCGGTGTTATGCCAAGAGGTACTACTCCCAGAGCTCCTGTAAGGTTTCCCACTTCCCTTCTAAAGATAAGAAGAGGGTTGGAGACGGGTTGGGCTTACACACATCAAGGTGGTATTAGCTCAGTTGACCATGTGACTTGTGGGAAAGACTTGCTGGT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CCGTGGTCAGGGCCCAAACAGATACAACCAACTTCCATCAAGCAATAAGGGATAAAATAGACAAGGAAGAAAACCTGCAGACCCCAGGCCTGCACAAGAAGTTGATGGAAGTCTTCAATGCATTAAAAAGACCTGAGCTTGAGGCCTCTTACGACGTTGTGGAGTGGGAGGAATTGGAGAGAGGAATAAACAGGAAGGGTGCTGCGGGTTTCTTTGAACGCAAGAATATAGGAGAAGTCTTGGATTCAGAAAAAAATAAAGTTGAAGAGATCATAGACAGTTTGAGGAAAGGTAGGAGTATCAAATACTATGAAACTGCGATCCCGAAAAATGAAAAGAGGGACGTCAATGATGACTGGACTGCTGGTGACTTTGTGGATGAGAAAAAGCCCAGGGTGATACAATACCCCGAGGCTAAAACCAGGTTGGCCATCACTAAAGTAATGTACAAGTGGGTGAAACAGAAACCAGTAGTTATACCTGGCTATGAAGGTAAGACACCCCTGTTCCAGATCTTTGACAAAGTGAAGAAAGAATGGGACCAATTCCAAAATCCAGTGGCTGTGAGCTTCGACACCAAAGCGTGGGATACCCAGGTGACTACAAGAGACCTAGAACTAATAAGGGATATACAGAAGTTCTATTTCAAGAAGAAGTGGCACAAATTCATTGACACCCTAACTATGCACATGTCAGAAGTACCCGTAATTAGTGCTGACGGGGAGGTGTATATAAGGAAGGGGCAGAGGGGCAGTGGACAACCTGACACGAGCGCAGGCAACAGCATGCTGAATGTACTAACAATGGTCTACGCCTTCTGTGAGGCCACGGGGGTCCCCTATAAGAGTTTTGACAGAGTGGCAAAGATCCACGTCTGCGGGGATGATGGTTTCTTGATTACTGAAAGGGCTCTTGGTGAGAAATTTGCTAGTAAAGGAGTCCAGATTCTATATGAAGCCGGGAAGCCCCAAAAAATCACAGAAGGGGATAAGATGAAAGTGGCCTATCAGTTTGACGACATCGAGTTCTGTTCCCATACACCAGTGCAAGTAAGGTGGTCAGACAACACCTCTAGTTATATGCCGGGGAGGAACACGACTACAATCCTGGCAAAAATGGCAACAAGGTTAGATTCCAGTGGTGAGAGGGGCACTATAGCATATGAGAAGGCAGTGGCATTTAGCTTCTTGTTGATGTACTCCTGGAACCCACTGATCAGAAGGATATGCCTGCTAGTGTTGTCAACCGAACTGCAAGTGAGACCAGGGAAGTCAACCACTTATTACTATGAAGGGGACCCGATATCTGCTTACAAGGAGGTCATCGGCCATAATCTCTTTGACCTTAAAAGAACAAGCTTCGAGAAGCTAGCTAAATTAAATCTTAGCATGTCCACACTCGGGGTTTGGACCAAGCACACCAGCAAAAGATTACTACAAGACTGCGTCAACGTCGGTGCTAAAGAGGGCAACTGGTTGGTTAACGCAGACAGACTGGTGAGCAGCAAGACAGGAAATAGGTATATACCCGGAGAGGGCCACACCCAACAAGGAAAACACTACGAAGAACTGATATTGGTAAGAAAGCCGATCAGTAATTTTGAGGGGACTGATAGATATAATTTGGGTCCAATAGTCAACGTAGTGTTGAGGAGGCTGAGAGTAATGATGATGGCTCTTATAGGGAGGGGGGTGTAA
26,529
OM201203.1
Classical swine fever virus
Huang,X., Wu,W., Tian,X., Hou,X., Cui,X., Xiao,Y., Jiao,Q., Zhou,P., Liu,L., Shi,W., Chen,L., Sun,Y., Yang,Y., Chen,J., Zhang,G., Liu,J., Holmes,E.C., Cai,X., An,T., Shi,M.
Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology
China
2022-08-30
CSFV/H013
Pestivirus suis
Pestivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
11,697
GenBank
1
China
China
Sus scrofa
null
2018
null
null
Classical swine fever virus isolate CSFV/H013, complete genome
ATGGAGTTGAATCATTTTGAACTATTATACAAAACAAACAAACAAAAACCAGTGGGAGTGGAGGAACCGGTGTATGACACCGCAGGGAGACCATTATTTGGGGACCCAAGTGAGGTGCACCCACAATCAACACTGAAGCTACCACACGACAGGGGGAGAGGTAACATCAGAACTACGCTGAAGGACCTACCTAGGAAAGGCGACTGTAGGAGTGGAAACCACCTAGGACCAGTTAGTGGGATATACATAAAGCCTGGCCCTGTCTTCTATCAGGACTACATGGGCCCTGTCTACCATAGAGCCCCATTAGAGTTTTTTGGTGAGGCCCAATTTTGTGAGGTGACCAAGAGAATAGGTAGGGTGACGGGTAGTGACGGAAAGCTCTACCATATATACGTGTGCATCGACGGTTGCATACTGTTGAAGTTAGCCAAGAGGGGTGCGCCCAGATCCCTAAAGTGGACTAGGAACTTCACCGACTGCCCACTGTGGGTCACTAGTTGTTCTGATGATGGCGCAGGCGGCAGCAAGGATAAGAAACCAGACAGGATGAACAAGGGTAAATTAAAGATAGCCCCAAAAGAGCATGAAAAGGACAGCAGGACCAAGCCACCTGATGCTACGATTGTGGTAGAGGGAGTAAAATACCAAGTAAAAAAGAAAGGCAAAGTCAAAGGGAAGAATACTCAAGATGGCCTATACCATAATAAGAACAAACCACCAGAGTCCAGGAAGAAACTGGAAAAAGCCCTATTGGCTTGGGCAGTGATAACAATTGTGCTGTACCAGCCCGTAGTAGCTGAGAATATAACTCAATGGAACCTGAGTGACAACGGCACAAGCGGCATCCAGCAAGTTATGTATCTCAGAGGGGTCAATAGGAGCTTACATGGGATCTGGCCTGAAAAAATATGCAAGGGGGTCCCTACTCATCTGGCCACTGACACGGAACTGATAGAGATACGTGGGATGATGGACGCCAGTGAGAGGACGAACTACACGTGTTGTAGGTTGCAGAGACATGAATGGAATAAACATGGATGGTGTAACTGGTACAACATAGACCCTTGGATCCAGTTAATGAACAGGACCCAAGCAAATCTGACAGAAGGCCCTCCGGATAAAGAGTGCGCCGTGACTTGCAGGTATGATAAAAATACCGACGTTAACGTGGTCACACAGGCTAGGAATAGACCAACTACCCTGACTGGCTGCAAGAAAGGAAAAAATTTTTCATTTGCAGGTACGGTCATAGAGGGCCCATGCAATTTCAATGTATCCGTGGAGGACATCTTATATGGAGATCATGAGTGTGGCAGCCTGTTCCAGGACACGGCTCTGTACCTATTAGATGGAATGACTAACACAATAGAGAAAGCCAGGCAGGGTGCGGCAAGGGTCACATCTTGGCTAGGGAGGCAACTCAGTACTACTGGGAAGAAGCTGGAGAGAGGAAGCAAAACTTGGTTCGGTGCCTATGCCCTGTCACCTTACTGCAATGTAACAAGGAAAATAGGGTACATATGGTACACGAACAATTGCACTCCGGCATGCCTCCCTACAAACACAAAAATAATAGGCCCAGGAAAATTTGACACCAACGCAGAAGACGGGAAGATTCTTCATGAAATGGGGGGCCACCTATCAGAATTCTTGTTGCTCTCTCTGGTAATCCTGTCTGACTTCGCCCCAGAAACGGCCAGTACATTATACCTGATCTTACACTATGCAATCCCTCAGTCCCATGAAGAACCTGAGGGCTGCGACACGAACCAGCTCAACCTAACAGTGGGACTTAGGACAGAAGATGTGGTACCATCATCAGTCTGGAACATTGGTAAATATGTGTGTGTTAGACCAGATTGGTGGCCGTATGAAACTAAGGTGGCCCTACTGTTTGAAGAGGCGGGACAGGTCGTAAAGTTAGCTCTACGGGCACTGAGGGATTTAACCAGAGTCTGGAACAGTGCATCAACTACTGCATTCCTCATCTGCTTGATAAAAATATTAAGAGGGCAGGTTGTGCAAGGTATAATATGGCTGCTGCTAGTGACCGGGGCACAGGGGCGGCTGTCCTGTAAGGAAGACTACAGGTATGCGATATCATCAACCAATGAGATAGGGCCGCTAGGGGCTGAAGGTCTCACCACCACCTGGAGAGAGTATAGCCATGGTTTGCAGCTGGATGACGGGACTGTCAGGGCCATTTGCACTGCAGGGTCCTTTAAAGTTATAGCACTCAATGTGGTCAGCAGGAGGTACCTGGCATCATTACACAAGAGGGCTTTACCCACCTCAGTAACATTTGAACTCCTATTTGATGGGACTAGTCCAGCGATTGAGGAGATGGGAGATGACTTTGGATTTGGGCTGTGTCCTTTTGACACAACTCCAGTGGTAAAAGGGAAGTACAATACTACTCTATTGAACGGTAGTGCTTTCTACCTAGTCTGCCCAATAGGATGGACGGGTGTCATAGAGTGCACGGCAGTAAGCCCTACAACCTTGAGAACAGAAGTGGTGAAGACCTTCAAGAGAGAGCGACCTTTCCCACACAGAGTGGATTGCGTGACCACTATAGTAGAGAAAGAAGACCTGTTCTACTGTAAGTGGGGGGGTAATTGGACATGTGTGAAAGGCAACCCGGTAACCTACATGGGGGGGCAAGTAAAACAATGCAAGTGGTGTGGTTTTGACTTCAAGGAGCCCAACGGGCTCCCACATTACCCCATAGGCAAGTGCATCCTAGCAAATGAGACGGGTTACAGGGTAGTGGATTCCACAGACTGCAATAGAGATGGCGTTGTTATCAGCACTGAAGGAGAACACGAGTGCCTGATAGGCAACACCACCGTCAAGGTGCACGCGTTGGATGGAAGACTGGGCCCTATGCCATGCAGACCCAAAGAAATCGTCTCTAGTGCGGGACCTGTAAGGAAAACTTCCTGTACCTTCAATTACACAAAGACACTAAAAAACAAGTACTATGAGCCCAGGGACAGTTATTTTCAGCAATATATGCTTAAGGGCGAGTACCAATACTGGTTTGACCTGGACGCGACTGACCACCACACAGACTACTTCGCCGAATTTGTTGTCTTGGTGGTAGTGGCACTATTGGGTGGGAGGTACGTCCTGTGGCTAATAGTGACCTATATAGTTCTAACAGAGCAACTTGCTGCCGGTTTACAGCTGGGTCAAGGCGAGGTGGTACTGATAGGGAACTTAATTACCCACACGGATAATGAGGTAGTAGTGTACTTCTTAATGCTCTACCTAATAATAAGGGATGAGCCCATAAAGAAATGGATACTACTGCTGTTTCATGCCATGACCAACAACCCAGTTAAGACTATGACAGTAGCATTGCTGATGATCAGCGGGGTCGCCAAGGGTAGGATAACAGATGGTGGTTGGCAGAGACAGCCGGAGACCAATTTTGACATCCAACTCGCACTGGCAGTTATAGTAGTAGTTGTGATGTTATTGGCAAAGAGAGATCCGACCACTCTCCCCCTGGTGATCACAGTGGCAACCTTAAGAACAGCTAAGATAACCAATGGTTTCAGCACAGATCTAGCTATAGCCACGGTGTCGGCAGCTTTGCTAACCTGGACTTATATCAGTGACTACTACAAATACAAGACTTGGCTACAGTACCTCATCAGCACGGTGACTGGAATCTTCCTGATAAGGGTACTGAAGGGAGTAGGTGAGTTAGACCTGCACGCCCCAGCTCTGCCGTCTCACAGACCCCTTTTCTACATCCTCGTGTATCTCATCTCCACTGCTGTGGTAACTAGATGGAACCTGGACATAGCCGGACTGCTGTTACAGTGTGTCCCAACACTTCTAATGGCGTTCACGATGTGGGCTGACATTCTCACCCTAATTCTCATATTACCCACTTATGAGCTGGCAAAGTTATACTACCTTAAGGAAGTGAAGATTGGAACCGAAAGAGGATGGTTGTGGAAAACTAACTATAAGAGGGTAAATGACATCTATGAAGTCGACCAAGCTGGTGAGGGGGTCTACCTCTTCCCTTCGAAACAAAAGACTGGTGCTATAACGAGCACCATGTTGCCGTTGATCAAAGCCATACTCATTAGCTGCATCAGTAACAAGTGGCAATTCATATATTTGCTGTACTTGATATTTGAAGTGTCCTACTACCTCCACAGAAAAGTTATAGATGAAATAGCTGGCGGGACCAACTTCGTTTCAAGACTAGTGGCAGCCTTAATTGAAGTTAATTGGGCCTTCGACAATGAAGAAGTTAGAGGCCTAAAGAAGTTCTTCTTGCTGTCTAGTAGAGTTAAAGAGTTGGTCATCAAACACAAGGTGAGGAATGAAGTAGTGGCCCGCTGGTTTGGAGATGAAGAGATCTACGGGATGCCAAAGTTGATCGGCTTAGTTAAGGCAGCAACTCTAAGTAAAAACAAACACTGTATCTTGTGCACCGTCTGTGAGGACAGAGACTGGAGAGGAGAAACTTGCCCGAAATGCGGGCGTTTCGGGCCACCAGTGATCTGTGGTATGACCCTAGCTGACTTCGAGGAGAAGCACTATAAGAGGATATTCATCAGGGAGGACCAATCAGATGGGCCACTCAGGGAGGAGCATGCAGGGTACTTGCAGTACAAAGCTAGGGGTCAATTGTTTCTGAGGAATCTCCCAGTGTTGGCGACAAAAGTCAAGATGCTCCTGGTCGGTAACCTCGGGACAGAGGTTGGGGATTTGGAGCACCTTGGCTGGGTGCTTAGAGGGCCCGCTGTCTGCAAGAAGGTTACTGAACATGAAAAGTGTGCCACGTCTATAATGGATAAGTTGACTGCTTTCTTCGGTGTTATGCCAAGAGGTACCACCCCCAGAGCTCCCGTAAGATTCCCCACTTCCCTCCTGAAGATAAGAAGAGGGCTGGAGACGGGCTGGGCCTACACACACCAAGGCGGCATCAGCTCAGTTGACCATGTCACTTGTGGGAAAGACCTGCTGGT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26,530
NC_043648.1
Clerodendrum chlorotic spot virus
Ramos-Gonzalez,P.L., Chabi-Jesus,C., Banguela-Castillo,A., Tassi,A.D., Rodrigues,M.D., Kitajima,E.W., Harakava,R., Freitas-Astua,J.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2019-06-28
Prb1
Dichorhavirus clerodendri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,524
RefSeq
1
Brazil: Piracicaba, Sao Paulo
Brazil
Clerodendrum sp.
plant leaf
2017
null
PRJNA485481
Clerodendrum chlorotic spot virus isolate Prb1 segment RNA1, complete sequence
CACGGGATAGCCCATCAAATCCGGCATTGGTGCAACTAGAGACACTCTGGTAAGCATCCATATCAATGGAGAGAGCCAATCGTTTGGTGTAAGCGATTCCCCGTCCTTCTCAACCCCCGTTGGGTCCGATTAGGATATTAAAACAGCAAAGATAATATTGTAAGAATCACAAGTACAGATACTGCTCATCTTTCACTGTCTATTGCAGGTTCGATTCACCTTACCAAATGGCCAGGTACACAGATGTGGATTATGCTTCAGTTCTTGACATATACTCTGACACGCCAGAGGAGAGTCAAGTGGCTTCCAGCGCACCGACACCAATCACGTACAGCAGGGAGGCAGCCGTCGCGAAGCCTATAGTGGCCCTGGAGAATCCCCCTGAGACGCACACTGATGTGATCACCCTATTTCAAACAATCATGGAGCACTCAAGCAGCCGGATGACCAAGAAGGATCTCTTGATAATTATGTCGTTGGGATTCTGCCTCACACCTCCTGGATGTGAAGGGCCAGCAATGTGGCCTGTGGCCCAAGGTGCCAATGTTCAGCCCCTCTCCATGCCAGGGATCACTGCTGTGTATGATTCCAGGGCCGCTGCCTCAAGCTCAACCATGAACATTGACCCAGATGAGGGGGAACAGTCTGAGAGCACACAGGCCCCTGCAGAGGAGGAGGACATTGCATCCCAATGCAGGGCCATATCCTACATCTGTCTCAGTCTGATGAGGCTTGCTGTGAAAAGGGTGGAGACATTCATGAAGGGGACACCCCAACTGATAACAGCCTACCATGTGCTGATGGGTGATCACTCGCCCTTCCTGTCATCCTTCAACTACAGCAGGGGCCTATGTTCCAACATAAGCTCCCTCTTTAATCAGTGCGATGACATGAAGAGGACACTGGCACACCACTGTGCTGTTGCAGATGAGAGCCACCATAGCAACAGGACTGTCCATGGGCCACTGAGGTTCCTGATCCTGCAACACATGGATCTGAACGGTATGGTGCCATACGGAATGTATGTGGACATGAAGAGAGGTCTGCCACTACTGAGCCCGGGATCAATACTCACATGGTTGCATGATGCTCAGGTGGCGCCAATCCTATTACTCCTGTCCAAAATCAACAAAGAGCATGACAGAGTGGACAAGCCGGACAGGTTCTGGAGGTACAGCAGATCCATTGACCCAGGGTTCTTCGTAGAGCTTCAACAGTCCAGATGCTACATACTGATAGCCCGGATGGCTGACATCCTCGTGAGAGGAGGGTGTGTCAATGTCACTGAATACTCCGACCCCAAGAAGGCGGAGAGTATCAAAGACAAGGCCAATATAATGGCCAATGCTGAGAGGTTTGGCACAGAGTTCATGCTGTCATACAATGCACTATCGGGAGCTGCCGAAGGGGCAGGACCAGTTGCCAGAGCTCTGGCAAATGCAGCAGCAGGAAATCCCATGAGGAGGATACTGGTTCAAAGGAACCCAAGGCCTCAGCCTGCAGTCAATGTGACTGTCAACCAGCCTCCCAGGGTGGGGGCACTGGACAGCATGATTCCAGAGTAGTGAGCACCGTCATTTCAGGACACATCCCTCCGCACATGTGCCAAACCAGATGTCAGGGTCTAGTACTGCCCCAAACCCAACACCTCAATGTGCCATGATCAATCCAAATAATGTCGTCATAATAGCAGGCATTTAAATAAAACATCAAGATATAATCCAATAGTTTTCCCAATACTACACAAACTCATTGTTCAAATCACTAATTGACTGTTCTCTTCACAAACCAACAGGTATGGCTCATATCGGTTCCACAACATCCCTATACCCCGACATCCCTAACATGTCCCAGGTCCAGCAGGACTTAGACAACCAGACAATGAATGACCCGGTTGATGCATTCCTGTCCAAATGGCCTGTCTTGGGAATCACCCCTCCATTGTCTCTGTCATCCAAGATCAAAACCCTCATCTCCAAGAAGTATGCTGGGAAGAATGTTATCCTGGATGAATTCACCACAGACCTATGCTGCCTGGTGTGGAATGTCAGCTCAGAGCATCATCATCTGATCAACAAGTCACAGGTCAACAAGATGAGCCAGTTGATAGACCAGCTTTCTGAGATGATGAGGGATCAACCCCCTGCACCATCAGTAGATCTGTCTCCCCCTAAGCCTCCAGTAAAAAGGAAGGCCACCACTAATGACGGGGAAACTGACATCCAAAATCTCATTGCAGATGCTTGGACTCCTGGCAGAGCATCAAACTGGTCAAAGAAACCCATCAGCGAGCACTTTGAGTCATTGGTCTGGCTCCTAAAGGATCACCTGAAGTTGGTAACCAAGGACTTCAGCGAGGAGTGGGTCAAGAAGCAAGATCTTCCAAACCTTTTGGGGGATATAACGGTATTCTGCTACATTAATAGGGGAACACAAACGGAGGAACAGCTGGAAACCATAAGAGCCATTGTGGTTGACCGGATGAACAAGAAAAAGAAGAGATGCCTGGACTAGCTGATATAGCTCACTTTGCGTCTTATCTGTTGTTGTCCTATTCTGTCATGAAGACTTTGATGTTGGCCATTGAGAGGGAGGACACTGAAACTTGTTCCTTGATTGTAGTAATCATGATATGTATGCTGGTGATGTTTTCCTATCATAACAATAAGTAACATATAAATAAAACATCAATGACATGACAGTCACGTTGGTCGGCATAATAATCATCATTTATATCATAGTTCTAGTGATATCAATAATCTCTGAGATAAGATGTCCACATTGCCACCGTCAGTTGTTTCAGGGCCCGTACATAGGGACGAGGTACGAGAGACCGCCGGTAGACGGATGGCCAGCAGGGATGAGTCACTAGATGAATTCAACAAGGAGCTCCAGACCGCTCAGGCATGGCAGAGGAAACTAATCCAGAAGCACCCCATCAAGGTGTTAGGCAAGGAGGGTGAGGGTAAGATAACCATGCTGAGAAGGCCCATAGTCATCAACGTGGCAAACATGATATCACGGACTGTGGGTGGGGCAGTCAAACCGATCTGGATTGTTGGCATTGCGATCAAATGGAAGCCGTCATGTGACTTGGCAACCTCCGGGGTTCTCAAGCTGTCCATCCAAAACAAAGCAGTCAACAACCCTGTGCTGAAAGATCACACGGTTGTTCAGATCAGTCAAAGAGTCTCATCAACATTTGACATCCAGTACACGTCCTCATCTAAGCACAATGAGAGCGGCAACCCCTGGTCCTACAGCTATGAGATCAGTAACATGGATGATGCTCCGGCCAACATGGAGCTGGGAACTGCAGTCATAATGCCCATCATCAAGCAGGACAACTCCAACACTCAGGTGTTTGGCGGTGTTCAATGTGAGATCTATGGAGGACATTTCCCCCTGAACATACCGGCAGTGTGCTATTGTGCACCTGGGCCCAGATTCAAAACAAACTTGGCGGAGATTGAGAAAAACATTCAGATGATTTTCAGGTTCCTCAACGTGCAAGGAGTGACTGATATAGATGAGGAACTGGCGTACAAGGTGATTCAATGCTGTGATCCTGAAACAGCTAGGATATTATACTCAGGGGTGAAGAAACAAGTGTGGAGCATGCTAGACAAAGAGAGTGTTGATGTTATCAAATCACTTGTGTACGACTGCAAATCGGGGAGGGCTGTCTCCTACATCACGCTAGAATACATGAGAAACCTCGGGAGTATTGGAGGAACCAAGACACACACCTATTCCTGATCCGTGGGATGATCAAGCCATCAATGCCAGAATAAAGTCACACCATCGCCCAAATCTCATCTTATCATTTAAATAAAACATCAAGATCATCCTTACATAACGAGCTGCTTCCAGCATTAACATTGTTCTAATCAGTAACATTCTTCCCTCTTTTTTAGACACATCATGTCCACCTCCATTAATGATGCAGGAGAGCTATGCACGGTCATGTCTGTCAGGTCGAGAGTTGTCCTGACCTCACAGTCCAAACCTCCCATGGATGCAGCCACCATTGCAAGCATGGTTAAGGCCATCAGCGGCATGAAGTCCAAGGCCATATCCTCTGAGGGGTCAGAGGTTGCAGGAGACTGGCCTGCTCTCATGGTAGAAATTGCCAAGCAATCAAAGCCCCAGGTTTCAGGACCCTTCCTGTCAAAGGACCTGGTTTATGGGAACATCTACACCATCAACATGATCATCGGGGGGCCTCTGAACATAAAGGATAACACCCATGGCAGAGTGATGACTCTGAGATCTGGGCCTCTGTACGACACCCCTCATTATACATCAGAGGACAAGGCGGAAATATCAATCAGCAGTGGAAGGGCATCTGTCGGGATCACCACCTCAGTGGCCACTGTGAAGCGCCCCAGGTCCAGCTGTGAAAGGCTTCTCAGCCAGTACATCATCCTCCCTAAGGAGAAAATTAATCCCCCCTCAGCCAGACCCAGTGGTTAGAGCCGTCTCTGGGAAACCAGGAGATTCTCTCCCTCCTATCAGACGTGGCTGAGATACTAAAGACAAGAAAAGGTCCCAGGCAAGGATATAGTCTTCATGATGGCGAAATAATATGAATGTCAAGTCTTCGTCAGTGTCAACAGGCAGTCAGTCAACCAGAGTCAGCCATCATGATTGCACCCGTGCAGTCTACATCCTTGGATTTAAATAAAACAACAAGACAAAGTGTCTATTGCTGAAGTTCCCCCGTTCATCCACACCATGACCCGTTATTTGTTATCAATTCTAACCATCTCTTTCCTTCCTCTGATTATAGGAACAGGTTGCACAAACATTCTGCCATCAACCCTATGTGACCACAAGGAGGGGGTGTCTCTCAATGACTGGAGGCACCTATGCCTTGGAGCATGCAGCCCCACCGACATACAGCCGGGAACACACAGATACATGATAATGCACAACACCCTCATGGACTACAGGACTTATGGGTATCGTATATCTGCTGAAAAGAGAACCCTCTCATC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3,480
NC_043649.1
Clerodendrum chlorotic spot virus
Ramos-Gonzalez,P.L., Chabi-Jesus,C., Banguela-Castillo,A., Tassi,A.D., Rodrigues,M.D., Kitajima,E.W., Harakava,R., Freitas-Astua,J.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2019-06-28
Prb1
Dichorhavirus clerodendri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,105
RefSeq
1
Brazil: Piracicaba, Sao Paulo
Brazil
Clerodendrum sp.
plant leaf
2017
null
PRJNA485481
Clerodendrum chlorotic spot virus isolate Prb1 segment RNA2, complete sequence
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3,481
MG938506.1
Clerodendrum chlorotic spot virus
Ramos-Gonzalez,P.L., Chabi-Jesus,C., Banguela-Castillo,A., Tassi,A.D., Rodrigues,M.D., Kitajima,E.W., Harakava,R., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
null
2018-06-18
Prb1
Dichorhavirus clerodendri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,524
GenBank
1
Brazil: Piracicaba, Sao Paulo
Brazil
Clerodendrum sp.
plant leaf
2017
null
null
Clerodendrum chlorotic spot virus isolate Prb1 segment RNA1, complete sequence
CACGGGATAGCCCATCAAATCCGGCATTGGTGCAACTAGAGACACTCTGGTAAGCATCCATATCAATGGAGAGAGCCAATCGTTTGGTGTAAGCGATTCCCCGTCCTTCTCAACCCCCGTTGGGTCCGATTAGGATATTAAAACAGCAAAGATAATATTGTAAGAATCACAAGTACAGATACTGCTCATCTTTCACTGTCTATTGCAGGTTCGATTCACCTTACCAAATGGCCAGGTACACAGATGTGGATTATGCTTCAGTTCTTGACATATACTCTGACACGCCAGAGGAGAGTCAAGTGGCTTCCAGCGCACCGACACCAATCACGTACAGCAGGGAGGCAGCCGTCGCGAAGCCTATAGTGGCCCTGGAGAATCCCCCTGAGACGCACACTGATGTGATCACCCTATTTCAAACAATCATGGAGCACTCAAGCAGCCGGATGACCAAGAAGGATCTCTTGATAATTATGTCGTTGGGATTCTGCCTCACACCTCCTGGATGTGAAGGGCCAGCAATGTGGCCTGTGGCCCAAGGTGCCAATGTTCAGCCCCTCTCCATGCCAGGGATCACTGCTGTGTATGATTCCAGGGCCGCTGCCTCAAGCTCAACCATGAACATTGACCCAGATGAGGGGGAACAGTCTGAGAGCACACAGGCCCCTGCAGAGGAGGAGGACATTGCATCCCAATGCAGGGCCATATCCTACATCTGTCTCAGTCTGATGAGGCTTGCTGTGAAAAGGGTGGAGACATTCATGAAGGGGACACCCCAACTGATAACAGCCTACCATGTGCTGATGGGTGATCACTCGCCCTTCCTGTCATCCTTCAACTACAGCAGGGGCCTATGTTCCAACATAAGCTCCCTCTTTAATCAGTGCGATGACATGAAGAGGACACTGGCACACCACTGTGCTGTTGCAGATGAGAGCCACCATAGCAACAGGACTGTCCATGGGCCACTGAGGTTCCTGATCCTGCAACACATGGATCTGAACGGTATGGTGCCATACGGAATGTATGTGGACATGAAGAGAGGTCTGCCACTACTGAGCCCGGGATCAATACTCACATGGTTGCATGATGCTCAGGTGGCGCCAATCCTATTACTCCTGTCCAAAATCAACAAAGAGCATGACAGAGTGGACAAGCCGGACAGGTTCTGGAGGTACAGCAGATCCATTGACCCAGGGTTCTTCGTAGAGCTTCAACAGTCCAGATGCTACATACTGATAGCCCGGATGGCTGACATCCTCGTGAGAGGAGGGTGTGTCAATGTCACTGAATACTCCGACCCCAAGAAGGCGGAGAGTATCAAAGACAAGGCCAATATAATGGCCAATGCTGAGAGGTTTGGCACAGAGTTCATGCTGTCATACAATGCACTATCGGGAGCTGCCGAAGGGGCAGGACCAGTTGCCAGAGCTCTGGCAAATGCAGCAGCAGGAAATCCCATGAGGAGGATACTGGTTCAAAGGAACCCAAGGCCTCAGCCTGCAGTCAATGTGACTGTCAACCAGCCTCCCAGGGTGGGGGCACTGGACAGCATGATTCCAGAGTAGTGAGCACCGTCATTTCAGGACACATCCCTCCGCACATGTGCCAAACCAGATGTCAGGGTCTAGTACTGCCCCAAACCCAACACCTCAATGTGCCATGATCAATCCAAATAATGTCGTCATAATAGCAGGCATTTAAATAAAACATCAAGATATAATCCAATAGTTTTCCCAATACTACACAAACTCATTGTTCAAATCACTAATTGACTGTTCTCTTCACAAACCAACAGGTATGGCTCATATCGGTTCCACAACATCCCTATACCCCGACATCCCTAACATGTCCCAGGTCCAGCAGGACTTAGACAACCAGACAATGAATGACCCGGTTGATGCATTCCTGTCCAAATGGCCTGTCTTGGGAATCACCCCTCCATTGTCTCTGTCATCCAAGATCAAAACCCTCATCTCCAAGAAGTATGCTGGGAAGAATGTTATCCTGGATGAATTCACCACAGACCTATGCTGCCTGGTGTGGAATGTCAGCTCAGAGCATCATCATCTGATCAACAAGTCACAGGTCAACAAGATGAGCCAGTTGATAGACCAGCTTTCTGAGATGATGAGGGATCAACCCCCTGCACCATCAGTAGATCTGTCTCCCCCTAAGCCTCCAGTAAAAAGGAAGGCCACCACTAATGACGGGGAAACTGACATCCAAAATCTCATTGCAGATGCTTGGACTCCTGGCAGAGCATCAAACTGGTCAAAGAAACCCATCAGCGAGCACTTTGAGTCATTGGTCTGGCTCCTAAAGGATCACCTGAAGTTGGTAACCAAGGACTTCAGCGAGGAGTGGGTCAAGAAGCAAGATCTTCCAAACCTTTTGGGGGATATAACGGTATTCTGCTACATTAATAGGGGAACACAAACGGAGGAACAGCTGGAAACCATAAGAGCCATTGTGGTTGACCGGATGAACAAGAAAAAGAAGAGATGCCTGGACTAGCTGATATAGCTCACTTTGCGTCTTATCTGTTGTTGTCCTATTCTGTCATGAAGACTTTGATGTTGGCCATTGAGAGGGAGGACACTGAAACTTGTTCCTTGATTGTAGTAATCATGATATGTATGCTGGTGATGTTTTCCTATCATAACAATAAGTAACATATAAATAAAACATCAATGACATGACAGTCACGTTGGTCGGCATAATAATCATCATTTATATCATAGTTCTAGTGATATCAATAATCTCTGAGATAAGATGTCCACATTGCCACCGTCAGTTGTTTCAGGGCCCGTACATAGGGACGAGGTACGAGAGACCGCCGGTAGACGGATGGCCAGCAGGGATGAGTCACTAGATGAATTCAACAAGGAGCTCCAGACCGCTCAGGCATGGCAGAGGAAACTAATCCAGAAGCACCCCATCAAGGTGTTAGGCAAGGAGGGTGAGGGTAAGATAACCATGCTGAGAAGGCCCATAGTCATCAACGTGGCAAACATGATATCACGGACTGTGGGTGGGGCAGTCAAACCGATCTGGATTGTTGGCATTGCGATCAAATGGAAGCCGTCATGTGACTTGGCAACCTCCGGGGTTCTCAAGCTGTCCATCCAAAACAAAGCAGTCAACAACCCTGTGCTGAAAGATCACACGGTTGTTCAGATCAGTCAAAGAGTCTCATCAACATTTGACATCCAGTACACGTCCTCATCTAAGCACAATGAGAGCGGCAACCCCTGGTCCTACAGCTATGAGATCAGTAACATGGATGATGCTCCGGCCAACATGGAGCTGGGAACTGCAGTCATAATGCCCATCATCAAGCAGGACAACTCCAACACTCAGGTGTTTGGCGGTGTTCAATGTGAGATCTATGGAGGACATTTCCCCCTGAACATACCGGCAGTGTGCTATTGTGCACCTGGGCCCAGATTCAAAACAAACTTGGCGGAGATTGAGAAAAACATTCAGATGATTTTCAGGTTCCTCAACGTGCAAGGAGTGACTGATATAGATGAGGAACTGGCGTACAAGGTGATTCAATGCTGTGATCCTGAAACAGCTAGGATATTATACTCAGGGGTGAAGAAACAAGTGTGGAGCATGCTAGACAAAGAGAGTGTTGATGTTATCAAATCACTTGTGTACGACTGCAAATCGGGGAGGGCTGTCTCCTACATCACGCTAGAATACATGAGAAACCTCGGGAGTATTGGAGGAACCAAGACACACACCTATTCCTGATCCGTGGGATGATCAAGCCATCAATGCCAGAATAAAGTCACACCATCGCCCAAATCTCATCTTATCATTTAAATAAAACATCAAGATCATCCTTACATAACGAGCTGCTTCCAGCATTAACATTGTTCTAATCAGTAACATTCTTCCCTCTTTTTTAGACACATCATGTCCACCTCCATTAATGATGCAGGAGAGCTATGCACGGTCATGTCTGTCAGGTCGAGAGTTGTCCTGACCTCACAGTCCAAACCTCCCATGGATGCAGCCACCATTGCAAGCATGGTTAAGGCCATCAGCGGCATGAAGTCCAAGGCCATATCCTCTGAGGGGTCAGAGGTTGCAGGAGACTGGCCTGCTCTCATGGTAGAAATTGCCAAGCAATCAAAGCCCCAGGTTTCAGGACCCTTCCTGTCAAAGGACCTGGTTTATGGGAACATCTACACCATCAACATGATCATCGGGGGGCCTCTGAACATAAAGGATAACACCCATGGCAGAGTGATGACTCTGAGATCTGGGCCTCTGTACGACACCCCTCATTATACATCAGAGGACAAGGCGGAAATATCAATCAGCAGTGGAAGGGCATCTGTCGGGATCACCACCTCAGTGGCCACTGTGAAGCGCCCCAGGTCCAGCTGTGAAAGGCTTCTCAGCCAGTACATCATCCTCCCTAAGGAGAAAATTAATCCCCCCTCAGCCAGACCCAGTGGTTAGAGCCGTCTCTGGGAAACCAGGAGATTCTCTCCCTCCTATCAGACGTGGCTGAGATACTAAAGACAAGAAAAGGTCCCAGGCAAGGATATAGTCTTCATGATGGCGAAATAATATGAATGTCAAGTCTTCGTCAGTGTCAACAGGCAGTCAGTCAACCAGAGTCAGCCATCATGATTGCACCCGTGCAGTCTACATCCTTGGATTTAAATAAAACAACAAGACAAAGTGTCTATTGCTGAAGTTCCCCCGTTCATCCACACCATGACCCGTTATTTGTTATCAATTCTAACCATCTCTTTCCTTCCTCTGATTATAGGAACAGGTTGCACAAACATTCTGCCATCAACCCTATGTGACCACAAGGAGGGGGTGTCTCTCAATGACTGGAGGCACCTATGCCTTGGAGCATGCAGCCCCACCGACATACAGCCGGGAACACACAGATACATGATAATGCACAACACCCTCATGGACTACAGGACTTATGGGTATCGTATATCTGCTGAAAAGAGAACCCTCTCATC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70,248
MG938507.1
Clerodendrum chlorotic spot virus
Ramos-Gonzalez,P.L., Chabi-Jesus,C., Banguela-Castillo,A., Tassi,A.D., Rodrigues,M.D., Kitajima,E.W., Harakava,R., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
null
2018-06-18
Prb1
Dichorhavirus clerodendri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,105
GenBank
1
Brazil: Piracicaba, Sao Paulo
Brazil
Clerodendrum sp.
plant leaf
2017
null
null
Clerodendrum chlorotic spot virus isolate Prb1 segment RNA2, complete sequence
CACGGGCAAGGTCAAAAGTCATAGTTTTTCACATGATTTCGCTTGGTTGCATGGTCCTCATCGACCGATGTATACTGGGTAGGTCAACCTCTTAGCCCTCTTCCACCTCAATCTATAGGGTCCAGAGCAATTCAAGGCATAAAACATCAATTGGTAGAATAGCATTAAAATGGACGCATTATTGAATGTATCATACACTGAAACCAACCTCTCTGACAATGTTCAACAGGATTATGCCGAGGGGGAGGCAGTGGAGACTGGGGGGTCTTACCATCTCAAGTCTGCTCTGAGAACACATGATGACTATAGGAAGAACTATAGGTGTCGGCAAGACCTAACGATCCTCATGGAGTACAAGACTGGACACATTGCATACAATCCATGCAAGCTCCTCCCACTCTTGTGGTCGCATATCATTGTTGGGATAGGGACCATGTTCAATAGTAATGCCTACGAGGAAATTAAAGACCATTACAGAGATGAGGACATGTTGTCGGAGCTGCTTCATTTGACTGAGGAGGAGCTACCACTGGTCATGAGTCAAGAGGATGCATCCTTGATCAATGAGGAGGCTACCAGGATTGTGGATGAGTCCTGGAGGCTTGATACATTCCTAGGGAGGCTCAACGGGGTACGATGGTTCCTGACACATCTAATAATCAATCACAACAGAGGGGAGAGTGGGATAGAGGATGGGCTATGCTACAGGGAGGGGATGGGAGTTTTCACATATTATCTGGGAGACACATTCTCAATAACCACTTCCAAAATGTGGGCCAATGTTGACATAAACGGGGATAAGTGTATCATTCATATGGATCATATAGTTAATGTACTTGATAAGCTAACAGAGAGATACAACTCCATCATATACAATCGCATGTGTAGGTCAACATCCATGAGCACTATATACCCACCAGACAATATGCTTCAGAGGGTTATTGCAATCGGTGATGGGCTAATCATGTCAGAGGGTAATGAGGCATACAGGGGGCTGGCTTGCTTTGAAGCACTTTGTGTCGGGGAGATTATCAACAAGGGGGACAGCGGGGTTTGGGACGTTAACAAATTCTTGAGAACTATGAAGCATGAAGTAGGACAGCTTGGAGCACAATTCGACCACTGGTGCACTACTTTGTGCAAGATACTTGCAGACATGAACACCCAGCAGATATCGTGTCTTCACGGCCTGTACAGGATATGGGGGCATCCTGTAGTAGATCTGGAGAAGGGGCTTGAAAAGCTAAGATCCGTGGCACTAGTGGAGAAATGCATACCCAGGGCCTTCTCAGTAAACACCTCCAACATGTTCAAGGAGACATTCTTCATGAACTACTACAAGAAGCACAAGTTCTACCCCCCATACACCTGGGTAGGGCCCTCTGGGTCTCACTATCTGCAACAGAACCTGATCCTGGAGAAGGAGATTGACCGCCATAACATCAGGTACCACATAGAGGACTGGCAGAATGTCCAGTGTGAGAAGACCTTCGAGATCCCAGCAACATACAGCCTGGCATCATGCATCAAGGATCGGGCAATATCGCCAACCAGGTCCGAGCTCTCCCGGATGGTCCAGTCTAACAGATCCGTGATGAATCAAGAGGCCAGGAGAGGAGTCCTGAAGTGGTTGAACAGCAGCATGGTGCCTGTCAGGGAATTCCTACAAGACATAAATGATAACAGCCTTCACATTGATGACTGTATAATAGGCCTTTATCCGAAGGAAAGGGAGTTGAAGCTTGAGGCCAGATATTTCGCACTTATGTCTTTCAGAATGAGGCTATATTTCACCATCACTGAGCATTTGGCCAATGACCATCTGCTTGAGTACTTCCCTATGGTAACCATGTCAGACAGTATGCTGGAACTCCAAAAGAAACTTGACGCTCTAAGTCGCAAGCAGACATCATCAAAGAGGGGGGTCATACATTATGTGGTTAACATTGATTTCAGGAAGTGGAATCAGCAGATGAGAGAGGAGATGACGATAGATCTGTTCAATGACACTGACAGGCTTTTCGGGTTCAACAACTTGGTCGGCCGCACTCATGAGATATTCCGGAGGTCCTACATATACTTATCATCAGGGGAATACGTGCCGTCTCTGAACGGGAGAGGCGGTCTGAGGACTGAAGCCCCATACAGCTGGACGAAGGATCCTTCGGGGAAAGAGGGGTTGAGGCAAAAATATTGGACAATCATGACGGCATGCGATCTCATGGTCGTTGCAAGGAAGTTCAATATGAAGATAGATCTGGTAGGCGGGGGCGATAATCAGGTGCTAATTGTGGAGGTAAGCACGGACAGAATCAACCATGACGGCACTATGAGTGATGAGGGTAAGGCCGAGTGCCAAGAAAAGATGAACTCCTTCATGACATCTCTGTCAGAGTACATGGAGAGTAAGGGTCTCCCACTGAAGGTGGAGGAAACATGGATCTCCCCTGACCTACTCATGTTCTTCAAGATGATGTATTTCAGGCATGTCACCCTGATATCCCCCCTCAAGCAGGCATCCAGGGTGTTTCCCCTCTCGAATGATCAAGTGATGACTATAGGGAATATGGCATCCACCATATCATCAGCAGTAACGGTGCTGTCATCCAAGGATATGCAGATCGGCCCTGCAATTATGCTAGGAAGGATGTCAGTTGGTGACCTAAGCGTGATGGTCTGCAATAACCACCCTCTGTCAGTGGATAAGAGGATGTGGTCAGAAAAAGTGTCAATATGCAGAGGTGGGGCTAGAAGGACGATCAGTGTACCGCCTCACAGAAGGACCCCTACAAGAATATTCCAGTCATTAACCCTTCATCACAAGGTGCTGGGCGGGTCTGCGATCATAAGCCCCCTAGGCATGCTAATGAGAGGCTTCCCGGACCCACTGTGTGAGCACTTGACTTGGATGTCCATGCTTACAAGGCCACGGCCAGAATATAAGGTGTTCTCCTGCATGTCTATGAACAACAAGACCCCGTGGTCTCATCTGCTTGAGGATCCGGTGAGTGTGAATCATGATGCCCCTATACACGGCCTGGCTGTACTTAGACGGGAGGCTGAAAACGCACTGGCCTCGGCAAGCAAATACACAAACAAGGACTTCCTGGAGTTGGCACATACATGCAACAAACAGATGGTGGAGGGGCTGGCAGATGCTCTATGCTCGGGGGACAACATTGATATCAGGATCCTCCATGACATCATGGGGGCAAACTTAGGAGGATACTTCAACTCCATAGCCTCAAAGGTCAACAAGGCATCCACTGTGCTGAGGATGAACAAAACGTCCAAGGTGATAGAGACGATAACCGGCCAGGAAAAGGTCTGCATGTCATACTATGTGTCCTACGGGATGGTAGACCATGACCTGGCGCCGATGTCCTGCCCCACGGCTACAGCAAGGCGCTATAGGACCATCAGCTGGGGTAAGAATATCATGGGAATAACCACCCCCCACCCTGCAGCATTCCTCAGCTATACAACCGGCCCTCATGAGTGTGATCATAATTACGTCCAGACAAAGACAATGTCCGCAGGGGTCGTTGACCCACTATCTCGAGGCCCGTTCCATGTGTATCAAGGGTCGTACACCAAAGAAAAGTTTAAACCGACGGAGATGGCAGCAGCATATGGAGAGGAGGACCTGCTATCAAGAGCCATCCATCTTATGAAGCTAATCAACTGGAGATATTCCCAGGATTCATCAATGGCAAGGGTCATAAGAGGTCTCCTGGGCTCTCTAACTGATGCTGATCCCTCCATGTTTTATGGCATGATGGAATGGATTTCCGGTGACGCGGAACACAGGTATCAGGATATGGCCACCAAGCATGGGGGAGTGCCTAATATAGCCTATTCAATACTGTCATATGTAAGGGCAAATACATCCACCTTCCGAAGGCACTCAAGGGGAGGGAAGAATGAGACCATACACTTCCAAGCTGTCATCATATACACCTCCATGATGAGCCTGTTCAAACACTACGGAGGGATTGGTCATTGGCATGAAACATGTGACAAGTGCATTTCAAGAACAACTGTAGACCCTGACTTCCAGTTCAAAAGAAGGGTGGCTTTCCCAATGTTGCCTGGTAACATGTTTGCATATGTGCCATCTGAAATGATCAAGTTCCATTATCATGATCTAAGAAGAATCAAGGCTCAAGAGATGGCAGATGAAAGGATCATCAGTCTGAGCTGCATGAACGATGGTGACAGGGCTGTGGCTGCATGTAGCCTCTTGTCGGGAGTCATAGCAGCCAGTCAGAGCAAAGACAGATCCAGTGACACTGTAAGCAGTATCACAATGTGGTCATCCATTATACATGCTAAGGATCTCATACCCATGGTGTGCCTCAGACTTTCGGTAGATCATCTTATGAAGCGTAAGGAGTGGGTGTGGCCAAAACCTCATGTACCTCAGAAAGTTGCCATGCTGTTGGAGCCATTCATCATGTCCCCGTCAGGGAGATGCTGGCTGTCCTCCATGGGGCTGGACATCTCCGAGCTGGGTGTCGGCCAGATAGGGGTGCTAAGGGACATCATTCACAATGTTGTAGATGGAAGGATAATACCCAGAGTTATCCCGAACAGGGTGTCACCACTGTGGACAAATGATGTTATTTGCGCTAAGATATTTGAAAACACCCACATTGTACAGTGTGATGACTGTCTTAACAGAGGCTCAACACTGGTGAGGACAGAGATATGTAATGACATGCGGATGGAGTATTTGTTCAAAATATGCTCAATAACTCTCCCTGTCTTCAAAGGGGATATGACCCAGATTGAGATGCCCCTGCCCATAACTCCACTGTATGATTGGGAATCATCCCCTGTTCAAGTTTACAACGTGCTCTCTGACGGGACCGATTATATCCCATTTCCGAAAGATGGGCCTATAACCCGATCAATACCGCTGGGTGCGTCCGGTGTCTCATCCATGCTAGACATTCTTCATGAAACAAAGGGAACAATCCTGGTGTCTACTGATGCAG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70,249
MG983788.1
Clerodendrum chlorotic spot virus
Ramos-Gonzalez,P.L., Chabi-Jesus,C., Banguela-Castillo,A., Tassi,A.D., Rodrigues,M.D., Kitajima,E.W., Harakava,R., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
null
2018-06-18
SBO1
Dichorhavirus clerodendri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,508
GenBank
1
Brazil: Santa Barbara d'Oeste, Sao Paulo
Brazil
Hibiscus rosa-sinensis
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2017
null
null
Clerodendrum chlorotic spot virus isolate SBO1 segment RNA1, complete sequence
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TCATGTGTCATTCTTCGGGAGCTGTCACATATCCGAGTCCACAGTGCCAATGGATGCTGGTGCTGTCACGGGAGGGGACATTCAGGAGGTCCTTGCCCACGGCGGAGCAGGAGGAGTGATGGACCATGTGCGTCCCCCCTCGTGCGACTGGATGGCAGACAACCACGTCAGCGGCATCAGGCTGACCTATCAGAGGGTGGCAATAAGCATCACAGAGGACAGCGGGAAAATTGTGGTGGAGTTTCCCTCCCAGTCATTGCAAGGAGAAGGGATATCAGGAAGGATATATTCAGACAACACACTGTATGCATGGGATTTGGAAGGCAAACTACCAACATGCAGGAGAAGGGCTGTAGGGAGCACATTTTGCAGAGTGTCATCGGAATTCATTGCCTGTAGGGGGGAGAAGCCTCATCCCATAATTCGCAACATGACAGACTGCGGGATCAAGATGATGGTGACTTACGGGGCTGACTATGCCTTATATGATGAGGAAAAGGCAAAGTCTGTGGAGGATGTAAAGGAGGAAAACTCTGCAGTGCTGGGGAAAGTTCTGGATATGGAGAACATAGTATGTCACCACTTGTGCCAGGAGGCTGAGACAGTAATGAATCATGATGAGTTCTTGATGGCCACACCCATCGGAAAATGGCTCTCCGTCAAGGCTGAGGATCATTTCATATTCTACAAATGTGTCGACATAGATGCCGCCCTTGTCAGGCCAGTTGTTGTGTGCGGGTCAGGCCCCATGATTCAGATCACAACTATAAACGGAATATATTGGTGGAATGTCTCAAGCCCGTATATCAACCCTTCTGCCACGTGTAACCCTGCAACATCATCAAGCATCATGAGGGGGAATGTAATACGCACATGGGTTGGAGATTTAATCTTGAACGGGAGTGATGTGTCCTTCGCTCACCGCTTCAGAGATGCGGCCTTCCACCCCGCTTTCAGGCCAGTCAATCAGTTGTTTAGTGAGCACCACCTCCACATGAGTGAGATTGCTGCAGGCCTAAAATATGCCTCCACCATACAAGTAAAGAAGGAGAACATTGAGGAAAGGAGAATTTCCATGGGAGAATCCATTGGTGACAGGGCAGTAGGGGCGGTAGAGGCAGCTGAGGAATGGGTAAAATCTAAGTGGCCTGACATCAAGGCTTGGATCATCAGAATAGGACTATGGGTTGCTGCCGTAATGGCCGTTCTGCTTGTTTTGTGGTGCCTGTTCAAGCTTATTATTGCAATCTTAACCAGACCCAGGAATGTCATCAGAGTGGAGAACAGGGAGTCAAAGGGGTCAGACACCAGCCTTGTTGCATGGGCGAAACAGAAATGACCTATAGGTCTCCTGCCATGGTACTCCCTGCGGTCACAAAAGGTGTCATCCTCGAATTTAAATAAAACTAAACTATATAACCCAAGGTGTCTTTGGAAGGACCCGCAACGTTAAGAACCGCGGGAGATCAAGTCAAAAGAAGGTTCGCACAGTACTTGAAGTCGTGCTA
70,250
MG983789.1
Clerodendrum chlorotic spot virus
Ramos-Gonzalez,P.L., Chabi-Jesus,C., Banguela-Castillo,A., Tassi,A.D., Rodrigues,M.D., Kitajima,E.W., Harakava,R., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
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2018-06-18
SBO1
Dichorhavirus clerodendri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
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6,098
GenBank
1
Brazil: Santa Barbara d'Oeste, Sao Paulo
Brazil
Hibiscus rosa-sinensis
null
2017
null
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Clerodendrum chlorotic spot virus isolate SBO1 segment RNA2, complete sequence
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70,251
MG983790.1
Clerodendrum chlorotic spot virus
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Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
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2018-06-18
SPa1
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Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,112
GenBank
1
Brazil: Sao Paulo
Brazil
Clerodendrum sp.
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2017
null
null
Clerodendrum chlorotic spot virus isolate SPa1 segment RNA1, complete sequence
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70,252
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Clerodendrum chlorotic spot virus
Ramos-Gonzalez,P.L., Chabi-Jesus,C., Banguela-Castillo,A., Tassi,A.D., Rodrigues,M.D., Kitajima,E.W., Harakava,R., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
null
2018-06-18
SPa1
Dichorhavirus clerodendri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
5,625
GenBank
1
Brazil: Sao Paulo
Brazil
Clerodendrum sp.
null
2017
null
null
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70,253
NC_003536.1
Clover yellow vein virus
Takahashi,Y., Takahashi,T., Uyeda,I., Tahakashi,Y.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
1998-03-14
null
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,584
RefSeq
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA485481
Clover yellow vein virus, complete genome
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8,814
OR607765.1
Clover yellow vein virus
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
Leibniz Institute DSMZ-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
Germany
2023-10-31
DSMZ PV-0848
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,585
GenBank
null
Colombia
Colombia
Limonium sinuatum
null
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Clover yellow vein virus isolate DSMZ PV-0848, complete genome
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11,419
OP868578.2
Clover yellow vein virus
Hu,H., Jin,M., Zhang,Y., Wang,J.
Yunnan University (YNU), School of Ecology and Environmental Science
China
2023-06-06
SS
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,596
GenBank
null
China
China
Senna septemtrionalis
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2022-09-20
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Clover yellow vein virus isolate SS, complete genome
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15,312
OP296251.1
Clover yellow vein virus
Tu,L., Gao,X., Ji,Y.
Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences
China
2023-04-05
ClYVV-TZ
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,585
GenBank
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China: Taizhou, Jiangsu Province
China
Vicia faba
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2018-04
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Clover yellow vein virus isolate ClYVV-TZ, complete genome
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16,877
OP296252.1
Clover yellow vein virus
Tu,L., Ji,Y.
Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences
China
2023-04-05
ClYVV-YC
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,585
GenBank
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China: Yancheng,Jiangsu Province
China
Vicia faba
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2018-04
null
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Clover yellow vein virus isolate ClYVV-YC, complete genome
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16,878
ON456384.1
Clover yellow vein virus
Tu,L., Gao,X., Ji,Y.
Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences
China
2022-12-19
JS
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,585
GenBank
null
China: Jiangsu Province
China
Vicia faba
null
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Clover yellow vein virus isolate JS, complete genome
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20,339
LC729726.1
Clover yellow vein virus
Oh,B.G., Yoon,J.Y., Ju,H.J.
Department of Agricultural Biology; 567 Baekje-daero, Deokjin-gu, Jeonju, Jeonbuk 54896
Korea
2022-09-23
ClYVV-Ce-JH
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
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9,549
GenBank
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South Korea
South Korea
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2022-08-08
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Clover yellow vein virus ClYVV-Ce-JH RNA, complete genome
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24,335
MW675690.1
Clover yellow vein virus
Rashid,S., Wani,S., Dar,Z.A., Ali,G., Hamid,A.
Sher-e-Kashmir University of Agriculture sciences & Technology of Kashmir, Plant Pathology
India
2022-02-14
Kash7
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,757
GenBank
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India
India
Phaseolus vulgaris
null
2020-05
null
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Clover yellow vein virus isolate Kash7, complete genome
TAAAGTTAGAGGTGTATCTGAGGAAATGATCTTGACGCTTAGCCAGCTGACATCTGAAACTGAAAATGCAAGGCGGGAAGCAGAAGATATGAAGAAAAAAACAGCATCAATACAAGACAAATACAGACAAAGCAATCAAACTCTCGAATTTTCAAGCATTCAAGCAAGTTCACACAAACGAAGCAAAGTAAGCCAACAATTTTCTGTAAGATTACTTCAATTCCGCATTCCTTTAATTTTATTTGCAATCTCTTATTTGTAATTTTAGTATAATTTTATATAAGCAATGGCACAAATTATGATTGGAAGCATCATGGTTCCCTTAAACAAGGAATCTAAGGTTTCTGAAACTAATATAAGTACTAGTAGTAATATTTCTAAAACAAAAACCAGTACTCACATCGAGGCTGGACCCAAAAACATGTCTTTTAACTTACAACCAACCACTGATCCATTCAAAGCGATAACTCTAGCTTGCAAAGAAAGAGTTGCAAAGTTTGGTGACATGGTCTTTCAGACTAGAAGAGGCATCACCACAATGGTGCCAAAACCAGCACGTTTGGTGGAGGAGGAAAAGAGAGCAGCTGAAGCTCTAAAGCGATTCATGGAAGTGGAGTGGACTCTGGAAGAAATTGATCCTGATGCTGAATACCAAGTACCAGATTTAAGACAGAGGGGTTCCCAAGTGTCATTTAAGAGCCCTTACCACAAGAGGACTCAAAAAATAGCAAGGAAACTTAAAGTGATTAAGCCAGTGCAAGGGAACAAGAAAATTCAGCATGTAACAAATGCACTGCTCAAGATTGTTAAGAATAACGATCTAGTCCTTGAAGTTGCTGACAGGAATAAGAAAGCAAATCACGCAACTTTCTCAAGATATGGCTCAACTTATGGCATGCACATAATTGTTAACCATATGGTTCGAAAGAGACGTTCAGTTGATGTACGACTTAATGGTCTCATGACAAGCATTGCAAAGCAGGAAGCAATTGGATTTGAAAAGTTGAATGTTAGCACATTAAAAGAGGGGCACAGTGGACTTGTGTTGCAAACCAAAACAGTCCCAAACTGCCATTTCAATAATGATGACATAACAATTGTAAGAGGTGTAATAAAGAGTCATGGAATACCTTGCTTAGTAGATGCTAGACAGAGTTTGAATCATCAGCAACTGAGTAGGATAAGGGAATTCTCTGCAGGAGATCTGTTTTGGAAAGGATACAATCAGACTTTCATAGATAATAGACCAAAAGACATTGGACACACATGTACATCTGATCTTAACGTAGTCCAATGTGGTTCCGTGATGGCGTTGATGACTCTGGCACTATTCCCGTGTGGAAGAATCACCTGCAAAGAATGTGTGGAGGATTTTCATAATCAGAACAATAGGGAGAGATATGCAAGAACAGAAAGATTCTTAAGCCAGGCAATGACTCTCCTAGCACAAACATACCCAGAATTCAAACACTCAAGAGACATTTTGCAATTATTTCGTGAGCGTTTGAGTATGGAAAACTCAAATGCAGAGGCCTGTGTTGAGACAAACAAAGCCATAACATCACTTACAGAGACTCCATTTAATCACATAAGGAAAATAAATGAGGTGCTTATAAGATATGGTAGTTTAACAAATGATGAAGTGGGGGCTGCAAGTGCGAGCTTACTTGAAATTACTAGGTACATTCGAAACAGAACTGATTCCATCCAGAGGAATGACCTAAGTAAGTTCAGAAACAAGATTTCCTCAAAGACACACATCAACTTAGATTTGATGTGTGATAACCAACTTGACAAAAATGCAAACTTCATGTGGGGTCAGAGAGCATACCATGCGAAACGATTTTTGTCGAACTATTTCAGTGTGATTGATCCATCTGAAGGTTACGACAAATTCATCAAGAGAAAGTTACCCAATGGTACAAGAGAACTTGCAACTGGCAGATTGATCGTTCCTACAAACTTTGAATCTTTTAGAGATCAGATGAAAGGAACCATGGTGGACAATAGACCGATTGGCAAAGAATGTGTTTCGCGTGTTAAAGGAGCCTTTTGTTACCCGTGCTGTTGCACAACTGATGATATTGGCAATGCAATTTTGTCTGAATTTAAAATGCCAACAAAATATCATTTAGTTCTTGGTGGTCAGGAAGCAGCGAAGTACATAGAGTTACCATCAGATAGCAGTGGCATGATGTACATAGCAAAAGATGGATATTGTCATATCAATATATTCTTTGCTATGTTAGTGAATGTGTCAGAAGATAAATCAAAGGATTTCACCAAAATGGTGCGAGATCAGATAATGCCGAAGCTAGGTCAGTGGCCAACAATGCTAGATGTTGCAACAGCATGTTGGTACTTAACAGTTTGGTTTCCTGATACACTTAGTGCTGAACTTCCAAGAATACTTGTGGATCACAAGCTTAGCACCATGCATGTTCTAGATTCATATGGTTCAATAAGCACAGGATATCATGTTCTCAAGGCAAATATTGTTTCTCAATTGATCAAGTTTGCTAGTGATGATCTTGAGTCAGATTTGAAATTTTACAGAGTTGGTGGCAAATCATTAACAGGGCAAGTGATACAGTTTGACACAAAAATGTTAATCTCAAGTATCTACCGACCAAGACAGATGGAGAAGATCATCAATGAAGAACCCTTTGTGCTAGTTTTAGCAATGCAATCACCATCAGTTCTTTTAGCCTTATTCAATAGTGCCTCGCTAGAGAAAGCCGTAGAGGTTTGGCTACACAAGGACATGCGCGTTTCACATGTGATGACAATGCTTGCCCTCCTGGCAGCAAAAGTAAGTGCAGCCAAGATGGTGAATTTACAGATGGAGATAATAGAAGCTAGTGCTAGCCACTTTCTCGCTGCAATGGACACCATTCACAAGCCAATGCATTCCATCAACACAGCGAACATTTTCTTGATGAACTTAGAAGAAGGGAGATCAACTGACAGAACAATTGATGAACTTGGGTTCCACTCTTTGAAAAAGTCTAGCCAAGTACTCATGGAAAAAATCTGGGCAGAGGATTTAGAGCAGCAATGGCTAGGTTTAAGATTGTCACAAAAGTTTTATTTAATAAGGCAGTCATGGAAGCAGCGGGCAAAGTATTCCAAAATACTAGCCCAGAGAGACGAGCTAGGTGTCAGCGACAAGTTCAGCGCATCACTCAGATTGTCAGTAACAAGCGTCAAGAATCAAGCAATCAGTTGTAGGAAGAGAATGGTCGCAACAAGTAAGAAGTGTTTGTTCAGTGTGCAGAAAATGGTAGCAATGCAAGCCTTAAGGGTGTTCAAGCGATGCATGAGTAATATGGTGGATGTTCTCAACGTGTTAGCAACAATAACACTCCTGATGGGCATCCTGAGCCAAGTGAGATCCCACATCAAAACTGTTACATCGTACAAGAGCATTTCAAAGGAAGCAAAAGTTCAAGATGACTTGTACAGAATCAATGAGTATTATGAGTTGTTGAAAGCTCGTGATAGGTATACAGTAGATGAGTTCCGCAGTAAGCTGGAATCATTGAACCCAGAACTCCTAGAAACTTTTGATGAGTACTACAAGGAACCAAAGTGGTTTGTCATGGAGTCAAAGTCAAATGACATGGTTGCTCTTGAGAAAGTAGTGGCTTTTACAGCGTTAGTCATGATGATATTTGATGGAGAGAGGAGTGATTGTGTCTACAAAATACTGAACAAGCTTAAAGGTATAATCTCAACAACAACTCAAGATGGTTACAAATTTCAAAGTCTTGATGACATCAAACCCATGTTAGAAGACAAGAAGGGTGTTATTGATTTTGAGATTGATGAGGGTGATAGCAAGATCATATGCAGTAACCAAACAACATTCGTTCAGTGGTGGGATAATCAACTTCAGAATGGGAATGTCATCACACACTATAGAACAGAAGGCCATTTCATGGAATTCACCAGAGAGACAGCACAAGAGGTTGCACATACGATAGCCCACAGTGATTTTAAAGACATCTTAGTGAGAGGGGCTGTTGGATCGGGAAAATCAACTGGTTTACCATCATATCTTAGTGAAAAGGGGAAGGTGTTGATGCTGGAATCAACAAGACCATTAGCAGAAAATGTGTTCAAACAGCTCAAGAGTGATCCCTTCTATAAAAACCCAACACTTCGCATGAGAGGAACAACGAGTTATGGCTCAACACCTATCACAATCATGACAAGTGGTTTTGCACTTCATTTCTATGCAAACAATCCTCAGTTACTGAAGGAATTCCAATTCATTATCATAGATGAGTGCCATGTTCTGGATGCTAATGCAATTGCATTTGTCAGCCTGCTCAAGGAATTTTCATTTCAGGGGAAACTTGTCAAAGCATCAGCAACACCACCAGGGAGAGAAACTGAATTCACAACACAACACAAAGTTTCACTAGTTACGCAAGACCAACTTTCATTTGATCAATTTGTGGCCCAGCAAGGTACAGGTTCTAATTGCGACATGATTGATGTGTGTGACAATATACTGGTTTATGTCGCGAGTTACAATGAAGTGGACCAACTCTCAAAGATGTTACTGGAGAAAGGATTTTTGGTTACGAAAGTTGACGGAAGAACCATGAAAGGAGGAAAGACTGAGATTGAGACAAGGGGAACAAAAGCAAAGAAGCATTTCGTTGTCGCAACAAACATCATAGAGAATGGAGTGACACTTGATATAGAGGGTGTTGTAGACTTTGGGTTAAAGGTCGTCCCTGAGTTGGACGCGGATAGCAGAGTGATGCGCTATTCGAAGCACAGAGTCTCATTTGGTGAGAGGATTCAGAGAATCGGAAGAGTTGGTAGGCACAAAGCTGGTAAAGCACTCAAAATTGGAACAACAGAGAGGAACCTTCAAAAGATCCCAGAGTTGGTTGCTACAGAGGCAGCATTCTACTGCTTTGCGTACGGACTTCCAGTTATGTCTGAAGGAGTCTCATCCAACATGCTGAGTAAATGCACAGTAC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32,921
MW848532.1
Clover yellow vein virus
Gaafar,Y.Z.A., Westenberg,M., Botermans,M., Laszlo,K., De Jonghe,K., Foucart,Y., Ferretti,L., Kutnjak,D., Pecman,A., Mehle,N., Kreuze,J., Muller,G., Vakirlis,N., Beris,D., Varveri,C., Ziebell,H.
Julius Kuehn Institute, Institute for Epidemiology and Pathogen Diagnostics
Germany
2021-10-10
NGSTPS18
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,585
GenBank
1
Germany
Germany
Vicia faba
null
2018
null
null
Clover yellow vein virus isolate NGSTPS18, complete genome
AAAATATAAAATCAATACAAGACAAATACAGACAAAGCAATCAAACTCTCGAATTTTCAAGCGTTTAACCAAGTTTCTGCAAACAAAGCAAAGTGAATTTACAGTCATCTACAAAATCACATAAATTTCTATTTCCTTTAACTTTAAACTCATTCTCTCATCTGTAATTTAATTGTAATTTTATATAAGCAATGGCACAAATCATGATAGGAAGCATCGTAGTCCCTCTACAAAAGGATGCTGATGTTCCCAAATTTAATATTAATATCACTAATACTACTCCACAAGCAAAACCCAGTACTCTTACTGAGGCTGGACCCAAAAATATGTCTTTTAATTCAGATTGCACTACTGATCCTTTTAGAGCTTTAACTATAGCCTGCAAGGAAAGAGTCTCAAAGTTTGGTGATATGGTCTTTAAAACTAGAAGAGGCATCACCACACTGGTGCCAAAACCTGCACACCTGGTGGAGAAGGAAAAGAGAGCAGCTGAAGCTCTAAAGCGATTCATGGAAGTTGAGTGGACTCTAGAGAAAATTGACCCTGATGCTGAGTACCATGTACCAGATTATAGGAATAAGGGTTCGCAGGTTTCCTTCAAAAGTCCTCACTATAAAAGGACTCCAAAAATGGCCAAGAAGTTGAGTGTGACCAAGGTAGTGAAAGGTAAAAGCAAAATTCAGCATGTCACTAACGCACTACTGAAAATTGCAAAGACCAATAATCTTATCTTGGAGGTGGTTGATGATGGTAAGAGGGTAAATCATGCAACTTTTACGAAATATGGTTCTACTTATGGCATGCACATAGTTGTAAACCATATGGTTCGGAAAAGGCGATCTGTTGATGTTCAACTCAATGACCTGATGGCGAGTATTGCACAACAAGAAGCTATTGAATTCAACAGTCTGAATGTCAGCACCCTAAAAGAAGGACATAGTGGCCTTGTGTTGCGAACTGAAACGGTTCCGAACTGTCATTTTAATAACGATGATATAACAATTGTTAGGGGTGTTATCAAGAGTCATGGAGTGTCTTGCCTAATAGATGCTAGACAGAGTCTAAATTCTCAGCAATTAGGTAGAATAAGGGAGTTTTCAGCAGGTGACTTATTTTGGAAAGGATATAACCAAACCTTCATTGACAATAGACCAAAGGACATTGGGCATTCATGTACATCTGATCTTAATGTAGTCCAATGTGGTTCTGTGATGGCTTTGATGACTTTGGCATTGTTCCCATGTGGTAGAATTACTTGCAAGGAGTGTGTTGAAGATTTTCATAATCAAAACAACAGGGAAAGGTATGCAAGAACAGAAAAGTTCTTAGATCAAGCGATGGTTCTTTTATCACAGTCATATCCAGAGTTTAAGCATTCGAGAGATATTTTGCAGCTGTTTAGAGAAAGATTGAGTATGGAAAACGCGAATGCTGACGCTTGCGTTGAGACAAATAAAGCCATAACTTCGCTCACAGAGACTCCATTCAACCACATAAGGAAGATAAATGAGGTGTTCATAAAATATGGTAGTTTGACAAATGATGAGGTGGGGTTGGCAAGCACAAGTTTGCTCGAAGTTGCTAGGTACATTCGAAATAGAACAGATTCCATTCAAAGAAATGACCTAAGCAAATTTAGAAACAAAATCTCTTCAAAAACACACATTAACTTGGATTTGATGTGTGACAATCAACTTGATAAGAATGCAAACTTCATGTGGGGTCAAAGAGCTTATCATGCAAAGCGGTTTTTGTCAAATTACTTTAGTGTAATTGATCCATCAGAAGGTTATGACAAGTTCGTGAAGAGAAAGCTACCCAATGGTACAAGGGAGTTGGCAACTGGTAGACTAATTGTTCCTACAAATTTTGAATCTTTTAGAGATCAAATGAAGGGAACCATGGTTGACAATAGACCAATAGGCAAGGAATGCGTCTCGCGCGTGAAAGGAGCGTTTTGTTATCCATGTTGTTGTACCACTGATGACGTTGGTAATGCAATCCTATCTGAATTCAAGATGCCTACAAAATATCATTTGGTTCTTGGTGGGCAAGAGGCAGCAAAGTATATAGAGTTACCATCTGACAGTAGTGGAATGATGTACATAGCAAAAGATGGTTATTGTCATATCAACATATTCTTTGCTATGTTAGTGAATGTTTCAGAGGATAAATCAAAGGATTTCACAAAGATGGTGCGGGATCAAATAATGCCAAAGCTAGGTCAATGGCCAACAATGTTGGATGTGGCAACAGCATGCTGGTATTTAACAGTTTGGTACCCTGATACACTTAGTGCTGAGTTACCAAGAATACTTGTGGATCATAAATTGAGTACTATGCATGTTCTTGATTCATATGGTTCAATAAGCACTGGATATCACGTCCTCAAGGCAAATATCGTTTCTCAGCTTATCAAATTCGCGAGTGACGATCTTGAATCAGATTTGAAGTTTTATAGAGTTGGTGGCATGTCCTTAACGGGACAAGTTATACAGTTTGATACTAAAATGCTAATATCAAGTATTTATAGGCCAAAGCAGATGGAGAAAATCATCAACGAAGAGCCTTTTATACTGGTGTTAGCAATGCAATCACCATCAGTTCTTTTAGCCCTGTTCAATAGTGCTTCTTTGGAAAAAGCCGTTAATGTGTGGTTACACCAAGATATGCGTGTATCACACGTGATGACAATGCTTGCTCTTCTAGCGGCAAAGGTGAGTGCAGCTAAGATGGTGAATTTGCAGATGGAAATAATTGAATCTAGTGCTAGCCACTTTCTCGCAGCCATGGACACAATTCACAAACCAATGCATTCCATTAATACGGCAAACATTTTCTTGATGAATCTTGAGGAAGGAAGATCAACAGACAGAACTATTGATGAACTTGGATTCCACTCTTTGAAGAAATCTAGCCAAGTTTTGATGGAAAAAATCTGGGCAGAGGATTTGGAGCAGCAATGGCTAGGCTTAAGATTGTCACAAAAGTTTTATTTAATAAAGCAGTCATGGAAGCAGCGGGTAAAGTATTCCAAAATACTAGCCCAAAGAGACGAGCTCGGTGTCAGCGACAAATTCAGTGCATCTCTCAGATTATCAGCAAAAAGCATCAAAAATCAGGCAGTCAGCTGTAAGAAAAGAATGGTTGTTGTGTGTAAAAGAGGCATTGTTAGTGCACAGAAAATGATTGCAATGCATGCCTTGAGAGTTTTTAAAAGGTGCATGGGAAACTTCGTCGACGTTCTTAATGTGCTAGCAACAATAACTCTCTTGATGGGAGTTTTAAGCCAGGTTAGATCACACATTCAAACCGTCACAACATATAAGCGGGTTTCAAAGGAGGCAAGAGTTCAGGATGATTTGCACAGAATAAATGAATATTATGAGCTACTTAGAGCTCGTGACAGATACACAGTTGATGAGTTCCGCGCTAAATTAGAATCACTAAATCCAGAGCTTCTGGAAACCTTTGATGAGTACTATAAAGAGCCAAAGTGGTTTGTCATGGAATCAAAATCTAATGATATGGTGGCTCTTGAAAAAGTAGTGGCTTTTACAGCGCTAGTCATGATGGTCTTTGATGGAGAGAGGAGCGACTGTGTGTATAAAATTCTGAACAAATTGAAGGGCATAATCTCAACAACCACACAAGATGGTTACAAATTCCAAAGCCTCGATGATATTAAACCATTGTTAGAGGATAAGAAGGGTGTAATTGATTTTGAGATTGATGAAGGTGATAGCAAGATAATATGCAGCAACCAAACAACTTTTGTCCAGTGGTGGGATAATCAACTTCAAAATGGCAATGTCATAACCCACTACAGAACTGAAGGACATTTCATGGAGTTCACCAGAGAAACAGCACAGGAAGTGGCGCATATGATAGCACACAACGAGTTCAAGGATATTTTGGTGAGGGGTGCTGTTGGTTCAGGAAAATCAACTGGCTTACCATCATATCTTAGTGAAAAAGGAAAAGTGCTGATGTTGGAGTCAACAAGACCGCTGGCGGAGAATGTTTTCAAACAGCTCAAGAGTGATCCTTTCTACAAAAACCCCACACTTCGTATGAGAGGAACAACAAGTTATGGCTCCACACCAATCACTATAATGACAAGTGGTTTTGCTCTTCACTTCTATGCCAATAATCCTCAATTGTTGAAAGAATTCCAGTTCATAATCATAGATGAGTGCCATGTGTTGGATGCCAATGCAATCGCATTTGTTAGCCTACTTAAGGAATTTGCATATCAAGGCAAGCTCGTGAAAGCGTCAGCTACACCACCAGGAAGAGAAACTGAGTTCACAACACAGCATAAAGTGTCATTGATAACACAAGACCAACTTTCTTTTGACCAATTTGTTGCTCAACAAGGCACTGGTTCTAATTGTGACATGATTGATGTGTGTGATAACATATTAGTTTATGTTGCGAGCTACAATGAGGTTGATCAGCTCTCGAAGATGCTACTGGAGAAAGGATACCTAGTCACGAAGGTTGATGGTAGAACTATGAAGGGTGGAAAAACTGAGATTGAAACAAAAGGGACAAAAGCAAAGAAGCATTTCGTGGTGGCAACAAACATTATTGAGAATGGTGTTACACTAGACATAGAGGGTGTTGTCGATTTTGGCTTGAAGGTGGTTCCTGAACTAGATGCAGATAGCAGAGTCATGCGATACTCAAAGCATAGGGTTTCATTTGGAGAAAGGATCCAGAGGATTGGAAGAGTTGGCAGACACAAAGCTGGAAAGGCACTCAAGATTGGGACAACAGAGAGAAATCTTCAAAAGATTCCAGAGCTGGTGGCGACAGAGGCTGCATTTTACTGTTTTGCTTATGGGCTCCCAGTCATGTCCGAAGGCGTGTCATCCAACATGCTAAGTAAGTGCACAGTGCCACAGGCAAAGACCATGATGAGTTTTGAATTACCAATCATGTACACTACCAATCTAGTTCGTTTTGACGGCTCAATGCACCCAGCGATTCATGAA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37,344
LC643587.1
Clover yellow vein virus
Park,C.Y., Lee,D.H., Jung,Y.H., Kim,K.M., Kim,H.M., Na,C.
Wild Plant and Seeds Research; 2160-53, Munsu-Ro, Chunyang, Bonghwa, Gyeonsangbuk-Do 36209
Korea
2021-07-22
BH
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
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GenBank
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South Korea: Gyeeongbuk Province, Bonghwa
South Korea
Aquilegia buergeriana
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2019-05-03
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Clover yellow vein virus BH RNA, complete genome
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MW287328.1
Clover yellow vein virus
Zheng,L., Li,R.
USDA-ARS, National Germplasm Resources Laboratory
USA
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Ca
Clover yellow vein virus
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Potyviridae
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USA
USA
Centella asiatica
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Clover yellow vein virus isolate Ca, complete genome
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MK292120.1
Clover yellow vein virus
Elmore,M.G., Groves,C., Mueller,D.S., Smith,D., Whitham,S.A.
Iowa State University, Plant Pathology & Microbiology
USA
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IA-2016
Clover yellow vein virus
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USA
USA
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Clover yellow vein virus isolate IA-2016, complete genome
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Clover yellow vein virus
Elmore,M.G., Groves,C., Mueller,D.S., Smith,D., Whitham,S.A.
Iowa State University, Plant Pathology & Microbiology
USA
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IA-2017
Clover yellow vein virus
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Potyviridae
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GenBank
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USA
USA
Glycine max
plant leaf
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Clover yellow vein virus isolate IA-2017, complete genome
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47,147
LC506604.1
Clover yellow vein virus
Yoon,J.Y., Kwon,S.J., Cho,I.S., Kwon,T.R.
Horticultural and Herbal Crop Environment Division; 100, Nongsaengmyeong-ro, Iseo-myeon, Wanju 55365
Korea
2019-10-24
Dendrobium
Clover yellow vein virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,606
GenBank
null
South Korea
South Korea
Dendrobium
null
null
null
null
Clover yellow vein virus Dendrobium genomic RNA, complete genome
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Clover yellow vein virus
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CnPV1BHB
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Cnidium polerovirus 1 isolate CnPV1BHB, complete genome
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12,807
OR352921.1
Cnidium polerovirus 1
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-09-18
CnPV1SCA
Cnidium polerovirus 1
Polerovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
6,085
GenBank
null
South Korea: Eo-ri, Samcheok
South Korea
Cnidium officinale
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2021-06
null
null
Cnidium polerovirus 1 isolate CnPV1SCA, complete genome
AAAGAAACCAAGAAAGAAAATTGTTTTATGCTTACTCTCCTTCACAACGGAGCTTTGACTTACAACAACAAAGTCGACAAAGCATTCAGGGAACCCTTAGACCTCCTCTTTTGGTCTACATTTTTAGTGAACAACTATTATGGGCTCCATGGGTTTGATCATGCCACAAATCCTGTTTTTCTTTCTTCTCTGCACTTTCTGCTACCCGTCCATTGCAACCGACAATTTCATATTAAAGCTGGACGGGTTGTCTTCAAGAAACGCCTCCTACGAGGTGTTCTCTACTGGGGTCTCCACACCCGCCACACTCCCCATTTTCTCGTTCGAGGAGATAGGGTTGAGTTACACCTTACCACCTCCGCCCCCCCAAGCTCTTACAGAGACTTCTTATGGGGACTTGAGCATAGTACTCTGGGAGAAAATCTCATTAGATTTCCTGAGACTTTGTTCAGGGGCTTGGATGTTCTTGGTCCTTTGCTGCAAAGCTATAGAAAGTTTCACAATCGAGTGGAGCTTTTATCTGACTGGACTAATCCTCGACCTCGTGGCTTTCATTTGGTGGAAGATTTTGTGCGCCCTTTTCAACGGACTATACAAGCTGATCACGAATTTTGCAATGCAATTTTTGACGATCTGTATTCTGGCTGCTGTTACAGCTATTATCTGGAAGGGGCTCCGATGGATCTGTGGAAATCTCCCCATGTTTCTTCTTACCTTCCCCCTGAAAATCATTTGGAAGGTTCTTTGGTGCAGACCCAGCTCGCCTCGTGAGTTTAAAAACGAGAAAGCCGTAGATGGATACATTTCCATCCCTATCACCATGTCCCCCCCCAGCAATTCTATTGTTGAAATCATATATGAGGGGAGTGAAGCCCATGCTGGCTATGCCACTTGTGTCAAATTACACAATGGGCACAATGGTCTGCTTACATCCTCGCATATCTTCACCTCAAATGGGAAATATGCGGTGCGATCTTTGAGGGAATCCTCAAAAGGTGCTACCATCGGAATCAAAGATTTCGTAGTGAAGTACCAAAGCGACCATCATGATATCACCATATTTACTGGACCACCAAGTTGGGAAAGTAGATTGGGATGTGGGGCAGCTAACATAATGACTGCCGATAGGATAACCAGGGGTGAGGTTTGCTACTACACCCACAGTTTCGGGAAATGGAGGAGGTACAACGCCAAACTAACTGGCAACTACTTCAATCTCGCGACTGTTTTGTCCAACACTGAAGCCGGAGACAGCGGCTCAGCTTACTGGTACGGCAAATCTGTCTTAGGAGTCCACAAGGGTTGTACCCTTGATGAGCGAGATAATTTTAATCTTATGGCTCCTATCCCTAACATTCCCGGACTCACTAGCTCCAAGCTAGTTTTTGAGACATCTTCGCCCCAAGGCAAAATCTTTGATGATTGGGCGAAGATCCAGGAGGAATATGAAGAGCTTTTGGAAGACCTTTCTGGAACAGAAGCTATCAGCGTTATGAAGAAAAGGCGCCCTGAGCTCTTTAGGGATGAATTAAAATCCCTGGTGGTAGCCCTGAAAGGGGAATTCACACCTGTTGATGCTTTGATCGCCAACAATTTCATGGAGAAGTGTGCTGAAATAATAGACACTGACCATGAGCGTATTGAGCTCAACTATATTCCAAACTGGGAATTCTCTGATGAAGCAAAGCCCCCTCCAACTATGAAAACCGACGTTGATTACATCCGTCGTGAATTGGAGGTTATGCACGCTGTGAATAAAAAGCAGCAAGATCTGGCGGACAATTTTATGCGCCAGAATCTGGATCTGATGAAGGCGATGAAGACGCCTCCAGCTCCTTTTGTGCATGAGGCTAAGCCTGAGGTCTCGGGAAACGGACAGCGCGGCGCCGACCGCGAAACAACCGGAAACACCCCAAACAAATCCAAAGAGATTATCTTCGGCACTGTGGACCCTGTCAAAGCGACTGTGGTGGCCACTCCATCGCCATCCCCTGTAAGGAGGAAGGCGTCTTCAAAAGGAATGCCCGAAATAAGCTCATCCCCGTCGACGGATGCCCCTACTGGGAGCAACACGATTGTTGCGGATGCGCTAAAATTGATAGTCTCACAAGCAGTCTCCCAGCTCAACATGAAAGAGCTACAAACGAAAATAGCGGAGATTGCTGCAAGCCAGCTGAAGAAACCGCGTCAAGGCAAACGCGGGAAGAATGGAGGAAACAAGAAGCAAACGAAATCACCTCCTACTTCGCCTCCCTCTACAACTGGGGCTTATCAACCCCCACATGTGAGGTCTCCTGGTTCCGTCACGTCGGAAACCTGCCCCAGTTCTACCACTCCAAACAGAAAACAACCTCAGAGTGGGGGAAAGGGCTCATCGAGCTCTACCCAGAATTGGCGGAGAAAACCAAAGGCTTCGGCTGGCCCGAGTTTGGGGCCAAAGCAGAGTTAAAATCTCTGCAATTACAAGCATCACGCTGGCAGCAACGCGCTCTGTCAGCCAAAATCCCATCTGATGCTCAAAGAAGGCGCGTCATTGCAAAAACGGCAGTCGAGTATTCCTCCTGCCGTTCCCAAAATCCAAATTTTTGCAATGGCTCTAGCTTGGAGTGGCGCAGCTTTATTGAAGACTTTAAGGCTGCTGTGTCCTCCCTAGAACTGGACGCCGGTGTTGGAGTACCTTTAGTTGCACTAAAGAGGAAAACTCACCGTTCCTGGGTTGAAGGCACCAAAAACGAAGAAAGCCTTCTTCCCCAGCTTGCTCAACTCACTTTCGATCGATTACAGAAGTTATCGGAAGTCAGTTTCGAAGCATTGAAGCCTGAGGAACTCGTCCAGCAGGGGCTCTGTGATCCTATACGTTTATTCGTCAAAGGAGAGCCCCATAAGCAGAGCAAACTTGATGAGGGGCGCTACCGCCTCATCATGTCGGTTAGCTTGATTGACCAATTGGTAGCCCGGGTTTTATTCCAAGCACAAAACAAGCTGGAAATTGCTTTATGGCGAGCAGTTCCAAGCAAACCCGGTTTTGGACTCTCCACTGATGAACAAATCGTCGATTTTGTGGAGTGCCTAGCCAAACAAGCAGGGTTGACACCCGAGGAAGTGACTACCTCGTGGGAAGCCCATCTGTACCCCACTGACTGTTCCGGTTTTGACTGGTCAGTTTCACAGTGGATGTTGGAGGATGATATGCAGGTGCGAAATGAATTGACAATCAACTGCACCCCTCTAACTCGCAAGCTTCGCGCTGCGTGGTTGCATTGCATCGGTAACTCGGTGCTTTGCCTTTCAGATGGCACCTTGCTAGCTCAGACTCATCCTGGAGTCCAAAAGAGTGGAAGTTATAATACTAGCTCCTCCAACTCCAGGATTCGAGTGATGGCCGCTTATCATTGCGGTGCATCCTGGGCAATGGCAATGGGGGATGACGCCCTCGAGTCCAAAGACAGTTCCCTAGAGCTGTATAAAGATCTAGGTTTTAAAGTCGAGGTTTCAGGACAACTGGAATTTTGCTCTCACATCTTTGAGAAGCCTGACCTCGCCATTCCGGTTAACATCAGCAAGATGTTATATAAGTTGATACATGGGTATGAACCGGGATGTGGAAACTTTGAGGTGATGCTGAATTATATCAGCGCCGTAGCGTCTGTTCTCAATGAACTCCGCTATGATCCCGAACTAGTTTCCAAGCTCCGAGTGTGGCTTCTTCCGGTAGAGTCACAAAAGAAATCAAGCTAAACATACCGGAGCAAAAACAGCCGAACATACATCAGTTGCAAGTGTCGGAGTTTTAGTCTGATTACCAAGGCCACCATAGATTACAAGTTTCTAGCTGGGATCTCAACAGGAATTATAATTTCGATCCCGATCTGTGTTATTGGCCTTTATTACATATATCTCAGAATCTCATCTAACGTGCGATCTATAGTCAACGAATACGGTCGAGGATGAGATATGGATTCACTGAGGCTGATCTCAAACAGATCAAACCCCGAAGAGGAAAACGTTCGCGTAGACGAGTCCGAATTGTCCGGCCTAAGCCGGTGGTTGTGGTGCAAACCAATCAACCCCGAAGGCGCCGTGGACGACGAGGACGAGGAAATCGTCGCTCTTCAGGAGGAATACAGCGATCAGGAGGCTTTCGCCACCAACTCGTGTTTTCAAAGGACGACCTCAAAGGCAATTCATCCGGAATCATCAAATTCGGACCGGATCTGGCAGAGCACCAGGCTTTCTGCAAAGGACTACTCAACGCGTACCATCAATATAAGATCACGAACGTTCGAGTACAGTACAAGTCGGAAGCCTCTTCAACTCTGTCCGGCTCCATTGCTTACGAGTTGGACCCCAGTTGCAAACTCACTGCGCTTGAATCAAAACTCCGAAAATTCCCGATCACAAGAAACGCATCAGCGTCGTGGTCTGCTAGGGAAATTAATGGGGAAGTCTGGCAAAACTCCACGGAGAACCAGTTCTTCTTCCTCTATAAAGGGAACGGAGATTCAGGAGTAGCCGGGTCATTACTGATCAGCTATAATGTCTTAGTTCAGAATGCCAAACAAAAATGAAATATTTCGGAGCCGGGCCCTAGTCCAGGGCCCTCACCACCCCCCCCCTTTCCACCCACTCCCATACCTACTGAAAAGGAAAGATTTATCTGCCTGATAGGTACCCCACGGCTTGTTATACAAGCCAAAGAAAACTCGGATGTAATAGTCCTGAGGAACATCCCTGACCAAGATTTCAAACGAATCGAGGACGAGAAGCAAGAATGGACAAACGTCCCTGCCGAATGGTACAGTCAATCTCAATTGGCTAACATTCCCATGTTCTACTTCAGCGTTCCGAAAGGTGAATGGTCGGTCAATGTGTCTTGTGAAGGTTATCAAATCTCCAAGAGCACGACTGAGCCTAACAAAGGTCGGGTTGATGGCTTTATCGCTTACAACGATCAAAGCGGGATTTGGAATGTGGGTGAAGGTAAGAATGTCAAAATCACC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12,808
OR352922.1
Cnidium polerovirus 1
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-09-18
CnPV1SCB
Cnidium polerovirus 1
Polerovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
6,074
GenBank
null
South Korea: Yongha-ri, Samcheok
South Korea
Cnidium officinale
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2021-06
null
null
Cnidium polerovirus 1 isolate CnPV1SCB, complete genome
GAAGAAAATTGCTTTATGCTCACATTGCTACACAGCGGAGCTTTGACTTACAACAACAAAGTCGATAAAGCATTCAGAGAGCCCTTAGACCTCCTCTTTTGGTCTACATTTTTAGTTAACAACTACTATGGGCTCCATGGGTTTGATCATGCCACAAATCCTATTTTTCTTTCTTCTCTGCACTTTCTGTTACCCGTCCATTGCAACAGACAATTTCATATTAAAGCTGGACGGGTTATCTTCAAGAAACGCCTCTTACGAGGCGTTCTCTACTGGGGTCTCCACACCCGCCACACTCCCCATTTTCTCATTCGAGGAGATAGGGTTGAGTTACATCTTACCACCTCCGCCCCCCCAAGCTCTTACAGAGACTTCTTATGGGGACTTGAGCATGATACTTTGGGAGAAAATCTCGTCAGATTTCCTGAGGTTCTGTTCAGGGGCTTGGATGTTCTTGGTCCTCTGCTACAAAGCTTCAGAAAGTTTCATAATCGAGTGGAGCTTCTATCTGACTGGACTAATCCTCGACCTCGTGGCTTTCATTTGGTGGAAGATTTTGTGCGCCCTTTTCAACGGACTATACAAGCTGATCACGAATTTTGCAATGCAATTTTTGACGATCTGTATTCTGGCTGCTGTTACAGCTATTATCTGGAAGGGGCTCCGATGGATTTGTGGAAATCTCCCCATGTTTCTTCTTACCTTCCCCCTGAAAATCATTTGGAAGGTTCTTTGGTGCAGACCCAGCTCGCCTCGTGAGTTTAAAAACGAGAAAGCCGTAGATGGATATATATCCATCCCTATCACCATGTCCCCCCCCAGCAATTCAATAGTTGAAATCATTTATGAGGGGAGTGAAGCCCATGCTGGCTATGCCACCTGTGTTAAATTGCACAATGGGTATAATGGTCTGCTGACCTCTTCGCACATCTTTACCTCTAACGGAAAGTATGCAGTGAGGTCTTTGAGGGAATCCTCAAAAGGTGCTACTATCGGAATCAAAGATTTCGTGGTAAAGTACCAGAGCGACCATCACGATATCACCATATTTACTGGACCACCAAGCTGGGAAAGTAGATTGGGATGTGGGGCAGCTAACATAATGACTGCCGATAGGATAACCAGGGGTGAAGTTTGCTACTACACCCACAGTTTCGGGAAATGGAGGAGATATAACGCCAAATTAACTGGCAACTACTTCAATCTCGTAACTGTTCTGTCCAACACTGAAGCCGGAGACAGCGGCTCAGCTTACTGGTACGGCAAATCTGTCTTAGGAGTCCACAAGGGTTGTACCCTTGATGAGCGTGATAATTTCAATCTTATGGCTCCTATTCCAAATATTCCCGGACTCACCAGCTCTAAGCTGGTTTTCGAGACATCTGCGCCCCAAGGCAAAATCTTTGATGATTGGGCGAAGATCCAGGAGGAATACGAAGAGCTCTTGGAGGACCTTTCTGGAACAGAGGCTATTAGCGTTATGAAGAAAAGGCGCCCCGAGCTCTTTAGGGATGAATTAAAATCCCTGGTGGTGGCTCTAAAAGGGGAGTTCACACCTGTTGATGCTTTGATCGCCAACAATTTCATGGAGAAGTGTGCTGAAATAATAAACACTGACCATGAGCGTGTCGAGCTCAACTATATTCCAAACTGGGAATTCTCTGATGAGGCCAAGCCCCCTCCAACTATGAAAACTGACGTTGATTATATCCGTCGTGAATTGGAGGTTATGCACGCTGTGAATAAAAAGCAGCAAGATCTGGCAGACAAATTTATGCGCCAGAATCTGGACCTGATGAAGGCGATGAAGACGCCTCCAGCTCCCTTTGTGCATGAGGCCAAGCCTGAGGTCTCGGGAAACGGACAGCGCGGCGCCGACCGCGAAACAACCGGAAACACCCCAAACAAATCCAAAGAGATTATCTTCGGCACTGTGGACCCTGTCAAAGCGACTGTGGTAGCCACTCCATCGCCATCCCCTGCAAGGAAGAAGGCGTCTTCAAAAGGAATGCCCGAAATAAGCTCATCCCCGTCGATGGATGCCCCTACTGGGAGCAACACGATTGTTGCGGATGCGCTAAAATTGATAGTCTCGCAAGCAGTCTCCCAGCTCAATATGAAAGAGCTACAAACGAAAATAGCGGAGATTGCTGCAAGCCAGCTGAAGAAACCGCGCCAAGGCAAACGCGGGAAGAATGGAGGAAACAAGAAGCAAATGAAATCACCTCCTACTTCGCCTCCCTCTACAACTGGGGCTTATCAACCCCCACATGTGAGGTCTCCTGGTTCCGTCACGTCGGAAACCTGCCCCAGTTCTACCACTCCAAACAGAAAACAACCTCAGAGTGGGGGAAAGGGCTCATTGAGCTCTACCCAGAGCTGGCGGAGAAAACCAAAGGCTTCGGCTGGCCCGAGTTTGGGGCCAAAGCAGAGTTAAAATCTCTGCAACTACAAGCATCACGCTGGCAGCAACGCGCCCTGTCAGCCAAAATCCCATCTGATGCTCAAAGAAGGCGCGTCATTGCAAAAACGGCAGTCGAGTATTCCTCCTGCCGTTCCCAAAATCCAAATTTCTGCAATGGCTCTAGCTTGGAGTGGCGCAGCTTTATTGAAGACTTTAAAGCTGCTGTGTCCTCCCTAGAACTGGACGCCGGTGTTGGAGTACCTTTAGTTGCACTAAAGAGGAAAACTCACCGTTCCTGGGTCGAAGGCACCAAAAACGAAGAAAGCCTTCTTCCCCAGCTTGCTCAACTCACTTTCGATCGTCTACAGAAGTTATCGGAAGTCAGTTTCGAAGCGTTAAAGCCTGAGGAACTCGTTCAGCAGGGGCTCTGCGATCCTATACGTTTATTCGTCAAAGGAGAGCCCCATAAGCAGAGCAAACTTGATGAGGGGCGCTACCGCCTCATCATGTCGGTTAGCTTGATTGACCAATTGGTAGCCCGGGTTTTATTCCAAGCACAAAACAAGCTGGAAATTGCTTTATGGCGAGCAGTTCCAAGCAAACCCGGATTTGGACTCTCCACTGATGAACAAATCGTCGATTTTGTGGAGTGCCTAGCCAAACAAGCAGGGTTGACACCCGAGGAAGTGACTACCTCGTGGGAAGCCCATCTGTACCCCACTGACTGTTCCGGTTTTGACTGGTCAGTTTCACAGTGGATGTTGGAGGATGATATGCAGGTGCGAAATGAATTGACAATCAATTGCACCCCTCTAACTCGCAAGCTTCGCGCTGCGTGGTTGCATTGCATCGGCAACTCGGTGCTTTGCCTTTCAGATGGCACCTTGCTAGCTCAGACTCATCCTGGAGTCCAAAAGAGTGGAAGTTATAATACTAGCTCCTCTAACTCCAGGATTCGAGTGATGGCCGCTTATCATTGCGGTGCATCCTGGGCAATGGCAATGGGGGATGACGCCCTCGAGTCCAAAGACAGTTCCCTAGAGCTGTATAAAGATCTAGGTTTTAAAGTCGAGGTTTCAGGACAACTGGAATTCTGCTCTCACATCTTTGAGAAGCCTGACCTCGCCATTCCGGTTAACATCAGTAAGATGTTATATAAGTTGATACATGGGTATGAACCGGGATGTGGAAACTTTGAGGTGATGCTGAATTATATCAGCGCCGTAGCGTCTGTTCTCAATGAACTCCGCTATGATCCCGAACTAGTTTCCAAGCTCCGAGTGTGGCTTCTTCCGGTAGAGTCACAAAAGAAATCAAGCTAAACATACCGGAGCAAAAACAGCCGAACATACATCAGTTGCAAGTGTCGGAGTTTTTAGTCTGATTACCAAGGCCACCATAGATTACAAGTTTCTAGCTGGGATCTCAACAGGAATTATAATTTCGATCCCGATCTGTGTTATTGGCCTTTATTACATATATCTCAGAATCTCATCTAGCGTGCGATCTATAGTCAACGAATACGGTCGAGGATGAGATATGGATTCACTGAGGCAGATCTCAAACAGATCAAACCCCGAAGAGGAAGACGTTCGCGTAGACGAGTCCGAATTGTCCGGCCTAAGCCGGTGGTTGTGGTGCAAACCAATCAACCCCGAAGGCGCCGTGGACGACGAGGACGAGGAAATCGTCGCTCTTCAGGAGGAATACAGCGATCAGGAGGCTTTCGCCACCAACTCGTGTTTTCAAAGGACGACCTCAAAGGCAATTCATCCGGAATTATCAAATTCGGACCGGATCTGGCAGAGCACCAGGCTTTCTGCAAAGGACTACTCAACGCGTACCATCAATATAAGATCACGAACGTTCGAGTACAGTACAAGTCGGAAGCCGCTTCAACTCTGTCCGGCTCCATTGCTTACGAGTTGGACCCCAGTTGCAAACTCACTACGCTTGAATCAAAACTCCGAAAATTCCCGATCACAAGAAACGCATCAGCGTCGTGGTCTGCTAGGGAAATTAATGGGGAAGTCTGGCAAAACTCCACGGAGAACCAGTTCTTCTTCCTCTATAAAGGGAACGGAGATTCAGGAGTTGCCGGGTCATTACTGATCAGCTACAATGTCTTAGTTCAGAATGCCAAACAAAAATGAAATATTTCGGAGCCGGGCCCTAGTCCAGGGCCCTCCCCACCCCCCCCCTCTCCACCTACTCCAGTACCTACTGAAAAGGAAAGATTTATCTGCCTAATAGGTACCCCACGGCTTGTTATACAGGCTAAGAAAAACTCGGACGTCATAGTCCTGAGGAACATCCCTGACCAAGACTTCAAACGCATTGAAGACGAAAAGCAAGAATGGACAAATGTCCCAGCGGAATGGTACAGCCAATCACAATTGGCTAACATCCCAATGTTCTACTTTAGCGTCCCGAAAGGCGAGTGGTCGGTTAATGTCTCTTGTGAAGGTTATCAAATCTCCAAGAGTACCACTGAACCTAATAAAGGTCGGGTTGATGGCTTTATCGCTTACAACGATCAAAGCGGGATTTGGAATGTGGGTGAAGGTAAGAATGTTAAAATCACCAACCTGGAGAA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12,809
OR352923.1
Cnidium polerovirus 1
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-09-18
CnPV1JC
Cnidium polerovirus 1
Polerovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
6,079
GenBank
null
South Korea: Jecheon
South Korea
Cnidium officinale
null
2022-06
null
null
Cnidium polerovirus 1 isolate CnPV1JC, complete genome
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12,810
OR352924.1
Cnidium polerovirus 1
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-09-18
CnPV1JA
Cnidium polerovirus 1
Polerovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
6,078
GenBank
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South Korea: Jinan
South Korea
Cnidium officinale
null
2022-06
null
null
Cnidium polerovirus 1 isolate CnPV1JA, complete genome
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GGAGAACAACAGCTCGCTTCGTGCCGGGCACCCAGAATTGGTCGTGAATGATTGCCATTTCAACAATGGTCAAGTCATCGAGAGGGATTCTAAAATGTCCTTTCACGCATCCGCAACCACAGCAGGAGAATTTTTCCTCGTGGGACCCCCTATACAGAAACAAGAAAAGTATAATTATACGGTTTCGTATGGTGGCTGGTCTGATCGTGAATTGGAATTGGGGTGTGTTACAGTTATGATGGATGAACACATAACAGGCTCTGGAAATCATTTGAGATATGTAACAAGACCTTTAAGAGTTGGACACTCTAAGGCAGTCACGGTAACAACTATAATGCCACCCAAGAAGGAAAACTTGTTAACACCGGGGGATTCAGACAACCTCCTTCAACAACTGAACGAGACGGAAAACTCAGACGATTATCGTCCAGCGGAACCAGACTATGGCAATGTCTCTGACACAGAGATTGACTACCCAACTATTGGGTTCGGTCCTGGCCAAGTTCGAATGAAACTACCAGAAGAACCAGCAAAGACGGATAAAGATTCGGGCTATCTATTGAGAACTCGCGGAATCTATTCCCCCCATTTGGAGACATCCTATTCCGATAACGTCGTACCTCGGCGTGAGGAAGACCCATGGGAAGCAGTGAGGGCTTTCAAGGAAGCCAATCCCACTCATAGCAGCAAATCTGTTGCTTCAGGCTCTTTATCTGGTGGATCTCTTCGAGGTTCCCTGAAACCACCTCCCCCCCCACCCAGGATCACCCCTCAAGAAAAACTTGAAATTGAGGGTGAGATGGAAGCACTTGAACCGGATGCGGATCATAGAATAGCTTCTGATCCTTCCAGAACTTTGGAATATCGAGGTGGTGCCTTAGGAAAGAAGACAGACAAGTACGGACAACCTAAAAGTCGCTTCTCCTTTGGCCGGAGGTAGCTTAGCTCAAGCTTTATATGAGCACGGATGCGCCAAACATCTTTAAAATTGGAATGAAAGGTTTATAAACCGAGTAAGCACGTAAAATTCAGTAGGGCAGCGGTCGGTAATGCGAACCTACCCTGCTGGGTTTTCGGT
12,811
OR352925.1
Cnidium polerovirus 1
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-09-18
CnPV1PC
Cnidium polerovirus 1
Polerovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
6,055
GenBank
null
South Korea: Pyeongchang
South Korea
Cnidium officinale
null
2022-07
null
null
Cnidium polerovirus 1 isolate CnPV1PC, complete genome
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12,812
OR352926.1
Cnidium polerovirus 1
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-09-18
CnPV1HS
Cnidium polerovirus 1
Polerovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
6,092
GenBank
null
South Korea: Hoengseong
South Korea
Cnidium officinale
null
2021-06
null
null
Cnidium polerovirus 1 isolate CnPV1HS, complete genome
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12,813
OR352927.1
Cnidium polerovirus 1
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
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2023-09-18
CnPV1GC
Cnidium polerovirus 1
Polerovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
6,060
GenBank
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South Korea: Geochang
South Korea
Cnidium officinale
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2022-05
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Cnidium polerovirus 1 isolate CnPV1GC, complete genome
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12,814
OP067680.1
Cnidium polerovirus 1
Park,Y.C., Kim,K.-K., Jun,H.J., Kang,E.-H., Lee,S.-R., Ahn,J.K., Seo,H.K., Lee,S.-H., Hoe,K.-L.
NEXBIO co., Ltd.
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2023-01-11
SK
Cnidium polerovirus 1
Polerovirus
Solemoviridae
ssRNA(+)
6,090
GenBank
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South Korea
South Korea
Cnidium officinale
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2021-06-12
null
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Cnidium polerovirus 1 isolate SK, complete genome
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19,584
OR475303.1
Cnidium virus 2
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-10-11
CnV2GC
Cnidium virus 2
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Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,526
GenBank
null
South Korea: Geochang
South Korea
Cnidium officinale
null
2022-05
null
null
Cnidium virus 2 isolate CnV2GC, complete genome
ACGTAAGAGTTCCATATAACGTTTTTAAAGTATCAGAAACCTCATAATATCCCAATACCGGTAGCTCACAATGTCAGGGAACAATGAGACCATGAAGGCAAGACTGGCCGCTTTAAGAAGAAAATCACCACTCGACAACGACAAGAGTGTACCTGATTCATCAAAATCAGAAGTAAAAAAGACACCGAAGGCTTTCGGTGATAATGCTAGATTATTTAGTAGTGTAAAAGGTATGACAACACCTGGGAAAACTATTCCTAAAGCTTGGAGCAATGCAGAACTTTCAAAAATCCCAATCTATGCCATTAGTCCTTTGACTCCTACTGAAGCTGTGGTTCTTGGTAAGCAAATGATAGGAATGCTGCTAGGAAACAATGCTACCCGGGACTTGATCGACATAATGTTGTTTTTGGCTGTATCACTTAGAGATCCCAATAATCCAGCAAATTTACTCTTAGCTGCACCTTCTGCTGAATTCGGAGCAAAAACTGCTCTAGGAAAGCCTAATGTATCTGTCTCTGAGGAACAGAATGCTCCAAGTTCGGATTCTGCATTTGCTTCAGGAAGCTCGAAATCAGATATTGCGAGTCGACTGGCTGAGAGGAAAGCCGCAAGGAATGTATCTGGCGTGATAACAAAAGCTACCGCTGGAACCAATCAAACAGATACCTCTGGAGTGTCCAGTGAAAATAAGGCGGCTATATATAGCTTTGTTGCAGCATTCTTCCTAAGGGCTCACTCAAGACAACCAGACAGTCTTATAGATTCTATTCCTCGAATGATTGAGAGATGCGCCAGTTGGTATGATGGGGCTGAGAGAATGTTAGAGAATTTGATAGTTGAGAAAGGAATGATAGACAGTATTAAAAATCTGCTTGCAAGACGGGAAGAGGTGATGTCCACGTGGGTTATGTGGGTAGCTTACAACGAAAATGAGATACCGATAGGAAAGAACAGTCAAGGGATGATATCTTACCTTGCCGGACAGATATATCAGTACACTGGTCTTCATGCTGTGGTGCAAGTGTTAGCAATACAGCAAGTCACAAAGGTTCCTATGGATCAATTACTCGGTGAGTTGAATCATAGGTCCACTAGACAGGCTTTGCTGGCCTTATATGACCTACTTCAGCATCACGAACTTGTGAAAGAGAAGCCAGGAAGGAAAACATACTTCCGATACGCTAGGATATGGGATTCCGGATATTTTCATGAGCTTCAATCAAAACAGTGCCCTGATCTTGTCTTTCTGGCTGCTAGGATTCTTAAAGAGGTGTCTCCTACAGGTGCAAGGTCTGACCCAACCAAGATTTATGCTATTCAAGATTTAGGAGATATCAAGAAGGAGTTTCTGACAGAGGTGGCCATGAAGATCTCTAGATGGTTGGTCTCTGCTGATGATGAGACTGGAGATTCAGGAGCCGCCTGGGCCAATTAATGAATCTGATTTACTTTAATTTATTCTATTCGCTTGTTTCTATTTATCTTTTGGTGATTTAATAAAACTAGAAATCGCAAGAGCAACATCTGTGTGCTTTATCAATTGATTAAAGACTCATTCAGAGAATTCATATCAATATGTCTAATGTTAACAAGGACGAGTTCAAGGGCGTCTATACCCCGGCAGGTGAAATCGATTATCTGTCTATGGCTAATGATGACCTTGAGACAGTGGATGACATACCTGACAAATCTGTTCAGGTTCCCACTAACAGTGATCAGGCTTCTGACCTTGGCAAGCCAGTATCTGTGGGAGATGTTAAAAAGACTTTGGAAAATCTTAGAGTTTATGCTACTGCACATGGTGCAATTGTTGATAGTAACATGGAATCGCTGTTTAAACATTACTGCATAACTGAGATGATGGATGCACGGGATGTGGAACTCTGGATACGCGGTTATGTGTACTCTACAGGATCTCAGGTAGGTCCTCGTATTACTGAGGTCACTGAGACACTCAAAAATGAAGTCCGATCCCTACAAAGGACTAATGCTACTTTGTTAGAGACAATCAAGCTTTTAGCAAGTCAAGCTGTTGCTGTTGAAAAGGAAATAGCCTCAGTAACAGTAAACATCAAGTCAGATATCACGGCAGCATTAAAATCCGTGTTAGAAGGTCAGGCAAAGATTTATGAGAAGAGCAAGCCTGTCGGGGCAGTTAAGAAGCTTAACCTTTCTCCGCCGGATTTGGTCCCGATTATTGAGCCAAAGAAAATTCCTGAAACCCTGAAAGCCGGAGCACCTACAGACCCTTCTACATCGAACTTTTCAGACAAGTCACAGTTCATGAAGATGCGTGCTGTGATGAGGAGAGTAGGAGTGGACGATGCGATATTAGAGTATCTAGCAGACGAGGACCTAGCTGTTGTGTATCCAGAGGAAGATTTGCAAGAATATATGAATCATCTTGATGATCCAGATGTCCAGCAAATATTTCGAGAAGAGATCACAAAGAATATAGAGGAGAGGATTCTTTCTTAAGCTCATTCGGACAAGCTGCATTGTTGTTTTATTGTATGTGTGCGTTATGTTTCTGTAATTCTAGAATATGTGTGCCAAGGTGTTTAAGATTTAATAAAACTAGATACCATAAGAACACCAGATAGGTCTCTGGAGAATATCCTTTTTGAAAATTATGGAAACGTATATGACTGTGGTATCCGGGGAGTTTGTAACAGGACAAACTGACGGGGTAATATCGCTATCTAAGAGAATTGGTCTCTTTAACAAGATTTTGACCAAGTTCGGGTACACCAATATAGCTATCAAAAATGTATCTTTCATATTTAAGTCTAGATGCGCTGCGCAGGCTACAGGCACAATGAAGATGAAGTTGGTGGACCGAAGGCTCGAAGATCCTGATGACCAGTACATAGACGGGATTTCTTTTGATGTGAAAGATTGGATTAAATTCTCCTGGAATTATCCTTGTTGGTTTCATTATAAAGACTTTGAAGTAGGTGACAAAGAATTAATTGAGATAGAATGGGATATAGATCAATCAAATATGATCGACTCCATTTCAGTGGGGCATTTCAAGGTGAAAATTGCTTATTCAATGCAAAATGATATCACAATCCTTAAGAATATGCCTAACGTGGCGTCGAAGATGCACTCACAGTTATCCTCAAGCAAATTCTTAAAGAGAGGTAAAGGAGGAAAGCAGTACAAGTCAACTTCAGACTTGTTAAATATCTCATACTCTCCTAATGTGGTAATTGATAGAAACTATGAGGCTTCAGATAGGAGGAAGAAAGAATTGCTCTCCAAGTCTTCATTATCCCTTTTTACACCACGTGAATAATATATTTTGCTGTCTTACTAGGAAGAATGATGATCAAACTAAGCATAAAAGATGCATAATGGAGAGTGCTGGAACGAGACGTGATTGGTGTATTGATGATTTAATAAAACTAGAAAAGTTAAGATCAACAGATCATATTTATCCGAGATAAATCATGGAGTCTCACATGACAGTAGTTACAGGGGAGTTCGTTGCAGGACAAGTCGATGGTGTAATTTCTCTCTCGAAGAAGATCGGCTTATTCAATAGGATCCTCACCAAATTTGGCTACACAAACATCGCTATCAGGGAGGTGATGTTTAGTTTCAAGTCCCGATGTGCCTCGCAAGCCTTGGGTACAATGAAACTGAGATTGATGGACAGGAGGCTCGAGGATCCCGATGATCAATATATAGATGGAATAGCATTTGATGTGAAGGACTGGATAACTTTCTCATGGAATTACCCCTGTTGGTTTCATTATAAGGATTTTGAGGTGGGGGACAAGGATCTAATAGAGGTTGAATGGGATATAGAGAGATCCAATATGGTGGATTCCATTTCTGTCGGCCATTACAAAGTGAAAATCACTTATGCGATGCAGAATGAGATAACCAGGCTGAAGAGTGTACCTAATGTAGCTGCGAAGGTTCACACGCAAGTTTCGTCTAGCAAGTTCCTCAAGAAATCCAAGACAGGCCGAGTCTACAAGTCTGCGGACACTCTCTTAAATGTTTCCAACACGCCCAACAGAGAGGCCCCAAAAGGAACCAAATCTTTCCTAGATAGGAAAGAAGAACTGCTCACTAAGTCTATGGGTTCGCTATTCCCTCCTAGATAACTCTGAAGGCTTGCAACTTCGAGGAGTTGACATAAGCAATAATCAATTTCCTTCGCATAATGAATACTTGAGTGCTGTGAGATGGTGTGTAGTATTATGTTTGTGTGTTTGTATAAGATGTACTCGTTGAGAGACTTCACATCATATCGAGTGTGATTTAATAAAACTAGAAAACATAAGATTAACAAGATCAACATTTTAGAATCTATGGAACATACTTCCGGAGAGATCATGGATTGCAAATTCTATGCCATATCATGTGTCGGAACCCCTGTGTCATTTTCTCTTATGGCCAGAAGAAAAGCGTCTTCATTAACTCACGACGAAAGAGCGACAGCATTCAAGGCAGTGCTTGAGAAAACTGGGAAGATAGACAAGTCACTACAGGGGGCCATGCTCCATCTCATGGGTATCGGTCGTTTTGCTTCTGTGGATGATGAAACTCAAGACATGTTTTTAGGTCCGAAGACTCAACGCATAACATATAATATGCCTGAGTTTACCCTGGTCCCGTGTTTCGAGGATCTTAAAGAAGAGACTATCCAGCTCACATTACTAGGAGGTTTGTTAAGCATTGATCATGTCAAGCTGATTGCACGGGCAGATGTTCTAATAAAGGTGTCTCAGTTGTCTTTCCCTGATGCGATCACCGTGTTTCGCGAGAGACCCAATGAATGTGTAGAAGCTTACATTCCCCAATCCATCATAACATCCACTCCTGAGGCTTCGTCATCTGACAAGCAGACAGCCGACATAAAGAAGAAGTGAGCACAAGAGGGAGACCAGACACTCGATACAACCCCCAGCCACCCTATGCCTTTATCCGAATGTTTATTTTTGAAATAAAAACCAGAATCTCTGTATCCTAGGTATCTA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12,044
OR475304.1
Cnidium virus 2
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-10-11
CnV2HS
Cnidium virus 2
null
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,525
GenBank
null
South Korea: Hoengseong
South Korea
Cnidium officinale
null
2021-06
null
null
Cnidium virus 2 isolate CnV2HS, complete genome
ACGTAAGAGTTCCATATAACGTTTTTAAAGTATCAGAAACCTCATAATATCCCAACACCGGTAGCTCACAATGTCAGGAAACAATGAGACCATGAAGGCAAGACTGGCCGCTTTAAGAAAAAAATCACCACTCGACAACGACAAGAGTGTACCTGATTCATCAAAATCAGAAGTCAAAAAGACACCGAAGGCTTTCGGTGATAATGCTAGATTATTTAGTAGTGTAAAAGGTATGACAACACCTGGAAAAACTATTCCTAAAGCTTGGAGCAATGCGGAACTTTCAAAAATCCCAATCTATGCCATTAGTCCTTTGACTCCTACTGAAGCTGTGGTTCTTGGTAAGCAAATGGTAGGAATGCTGCTAGGAAACAATGCTACCCGGGACTTGATCGATATAATGTTGTTTTTGGCTGTATCACTTAGAGATCCCAATAATCCAGCAAATTTACTCTTAGCTGCACCTTCTGCTGAATTCGGAGCGAAAACTGCTCTAGGAAAGCCGAATGTGTCTGTCTCTGAGGAACAGAATGCTCCAAGTTCTGATTCTGCATTTGCTTCAGGAAGTTCGAAATCAGATATTGCGAGTCGACTGGCTGAGAGAAAAGCCGCGAGGAATGTATCTGGCGTGATAACAAAAGCTACCGCTGGAACCAATCAAGCAGATACCTCTGGAGTGTCCAGTGAAAATAAGGCGGCTATATACAGCTTTGTTGCAGCATTCTTCCTAAGGGCTCACTCAAGACAACCAGACAGTCTTATCGATTCTATTCCTCGAATGATTGAGAGATGCGCCAGTTGGTATGATGGGGCTGAGGTTATTTTAGAGAATTTGATTGTTGAGAAAGGAATGATAGACAGTATTAAAAATCTGCTTGCAAGACGGGAAGAGGTGATGTCCACATGGGTTATGTGGGTAGCTTACAACGAAAATGAGATACCGATAGGAAAGAACAGTCAAGGGATGATATCTTACCTTGCCGGACAGATATATCAGTACACTGGTCTTCATGCTGTGGTGCAAGTGTTAGCAATACAGCAAGTCACAAAGGTTCCGATGGATCAATTACTCGGTGAGTTGAATCATAGGTCCACTAGACAGGCTTTGCTGGCCTTATATGACCTGCTTCAGCATCACGAACTTGTGAAAGAGAAGCCAGGAAGGAAAACATACTTCCGATATGCTAGGATATGGGATTCCGGATATTTTCATGAGCTTCAATCAAAACAGTGCCCGGATCTTGTCTTTCTGGCTGCTAGGATTCTTAAAGAGGTGTCTCCTACAGGTGCAAGGTCTGACCCAACCAAGATTTATGCTATTCAAGATTTAGGAGATATCAAGAAGGAGTTTCTGACAGAGGTGGCCATGAAGATCTCTAGATGGTTGGTCTCTGCTGATGATGAGACTGGAGATTCAGGAGCCGCCTGGGCCAATTAATGAATCTGATTTACTTTAATTTATTCTATTCGCTTGTTTCTATTTATCTTTTGGTGATTTAATAAAACTAGAAATCGCAAGAGCAACATCTGTGAGCTTTATCAATTGATTAAAGACTCATTCAGAGAATTCATATCAATATGTCTAATGTTAACAAGGACGAGTTCAAGGGCGTCTATACCCCGGCAGGTGAAATCGATTATCTGTCTATGGCTAATGATGACCTTGAGACAGTGGATGATATACCTGACAAATCTGTTCAGGTTCCCACAAACAGTGATCAGGCTTCTGACCTTGGCAAGCCAGTATCTGTGGGAGATGTGAAAAAGACTTTGGAAAATCTTAGAGTTTATGCTACTGCACATGGTGCAATTGTTGATAGTAACATGGAATCGCTGTTTAAACATTACTGCATAACTGAGATGATGGATGCACGGGATGTGGAACTTTGGATACGCGGTTATGTGTACTCTACAGGATCTCAGGTAGGTCCTCGTATTACTGAGGTCACTGAGACACTCAAAAATGAAGTCCGATCTCTGCAAAGGACTAATGCTACTTTGTTAGAGACAATTAAGCTTTTAGCAAGTCAAGCTGTTGCTGTTGAAAAGGAAATAGCCTCAGTAACAGTAAACATCAAGTCAGATATCACGGCAGCATTAAAATCCGTGTTAGAAGGTCAGGCAAAGATTTATGAGAAAAGCAAGCCTGTCGGGGCAGTTAAGAAGCTTAACCTTTCTCCGCCGGATTTGGTCCCGATTATTGAGCCAAAGAAAATCCCTGAAACCCTGAAAGCTGGAGCACCTACAGACCCTTCTACATCGAACTTTTCAGACAAGTCACAGTTCATGAAGATGCGTGCTGTGATGAGGAAAGTAGGAGTAGACGATGCGATATTAGAGTATCTAGCAGACGAGGATCTAGCTGTTGTGTATCCAGAGGAAGATTTGCAAGAATATATGAATCATCTTGATGATCCAGATGTCCAGCAAATATTTCGAGAAGAGATCACAAAGAATATAGAGGAGAGGATTCTTTCTTAAGCTCATTCGGACAAGCTGTATTGTCATTTTATTTTATGTGTGCGTTATGTTTTCGTAATTCTAGAATATGTGTGCCAAGGTGTTTAAGATTTAATAAAACTAGATACCATAAGAACACCAGATAAGTCTCTGGAGAATATCCTTTTGAAATTATGGAGACGTATATGACTGTGGTATCCGGGGAGTTTGTAACAGGACAAACTGACGGGGTAATATCGCTATCTAAGAGAATTGGTCTCTTTAACAAGATTTTGACCAAGTTCGGGTACACCAATATAGCTATCAAAAATGTATCTTTCATATTTAAGTCTAGATGCGCTGCGCAGGCTACAGGCACAATGAAGATGAAGTTGGTGGACCGAAGGCTCGAAGATCCTGATGACCAGTACATAGACGGGATTTCTTTTGATGTGAAAGATTGGATTAAATTCTCCTGGAATTATCCTTGTTGGTTTCATTATAAGGACTTTGAAGTAGGTGACAAAGAATTAATTGAGATAGAATGGGATATAGATCAATCAAATATGATCGACTCCATTTCAGTGGGGCATTTCAAGGTGAAAATTGCTTATTCAATGCAAAATGATATCACAATCCTTAAGAACATGCCTAACGTGGCGTCGAAGATGCACTCACAGTTATCCTCAAGCAAATTCTTAAAGAGAGGTAAAGGAGGAAAGCAGTACAAGTCAACTTCAGACTTGTTAAATATCTCATATTCTCCTAATGAGGTAATTGATAGAAACTATGAGGCTTCAGATAGGAGGAAGAAAGAATTACTCTCCAAGTCTTCATTATCCCTTTTTACGCCACGTGGATAATATATTTTGCTGTCTTACTAGGAAGAATGATGATCAAACTAAGTATAAGAGAGGCATAATGGAGAATGCTGGAGCGAGACGTGATTAGTGGATTGATGATTTAATAAAACTAGAAAAGTTAAGATCAACAGATCATATTTATCCAAGATAAATCATGGAGTCTCACATGACAGTAGTTACAGGGGAGTTCGTTGCAGGACAAGTCGATGGTGTAATTTCTCTCTCGAAGAAGATCGGCTTATTCAATAGGATCCTCACCAAATTTGGCTACACAAACATCGCTATCAGGGAGGTGATGTTTAGTTTCAAGTCCCGATGTGCCTCGCAAGCCTTGGGTACAATGAAACTGAGATTGATGGACAGGAGGCTCGAGGATCCCGATGATCAATATATAGATGGAATAGCATTTGATGTGAAGGACTGGATAACTTTCTCATGGAATTACCCCTGTTGGTTTCATTATAAGGATTTTGAGGTGGGGGACAAGGATCTAATAGAGGTTGAATGGGATATAGAGAGATCCAATATGGTGGATTCCATTTCTGTCGGCCATTACAAAGTGAAAATCACTTATGCGATGCAGAATGAGATCACCAGGCTGAAGAGTGTACCTAATGTAGCTGCGAAGGTTCACACGCAAGTTTCGTCTAGCAAGTTCCTCAAGAAATCCAAGACAGGCCGAGTCTATAAGTCTGCGGACACTCTCTTAAATGTTTCCAACACGCCCAACAGAGAGGCCCCAAAAGGAACCAAATCTTTCCTAGATAGGAAAGAAGAACTGCTCACTAAGTCTATGGGTTCGCTATTCCCTCCTAGATAACTCTGAAGGCTTGCAACTTCGAGGAGTTGACATGAGCAATAATCAATTTCCTTCGCATAATGAATACTTGAGTGCTGTGAGATGGTGTGTAGTATTATGTTTGTGTGTTTGTATAAGATGTACTCGTTGAGAGACTCCACATCATATCGAGTGTGATTTAATAAAACTAGAAAACATAAGATTAACAAGATCAACATTTTAGAATCTATGGAACATACTTCCGGAGAGATCATGGATTGCAAATTCTATGCCATATCATGTGTCGGAACCCCTGTGTCATTTTCTCTTATGGCCAGAAGAAAAGCGTCTTCATTAACTCACGACGAAAGAGCGACAGCATTCAAGGCAGTGCTTGAGAAAACTGGGAAGATAGACAAGTCACTACAGGGGGCCATGCTCCATCTCATGGGTATCGGTCGTTTTGCTTCTGTGGATGATGAAACTCAAGACATGTTTTTAGGTCCGAAGACTCAACGCATAACATATAATATGCCTGAGTTCACCCTGGTCCCGTGTTTCGAGGATCTTAAAGAAGAGACTATCCAGCTCACATTGCTAGGAGGTTTGTTAAGCATTGATCATGTCAAGCTGATTGCACGGGCAGATGTTCTAATAAAGGTGTCTCAGTTGTCTTTCCCTGATGCGATCACCGTGTTTCGCGAGAGACCCAATGAATGTGTAGAAGCTTACATTCCCCAATCCATCATAACATCCACTCCGGAGGCTTCGTCATCTGACAAGCAGACAGCCGACATAAAGAAGAAGTGAGCACAAGAGGGAGACCAGACACTCGATACAACCCCCAGCCACCCTATGCCTTTATCCGAATGTTTATTTTTGAAATAAAAACCAGAATCTCTGTATCCTAGGTATCTATC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12,045
OR475305.1
Cnidium virus 2
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-10-11
CnV2PC
Cnidium virus 2
null
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,512
GenBank
null
South Korea: Pyeongchang
South Korea
Cnidium officinale
null
2022-07
null
null
Cnidium virus 2 isolate CnV2PC, complete genome
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12,046
OR475306.1
Cnidium virus 2
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-10-11
CnV2JA
Cnidium virus 2
null
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,523
GenBank
null
South Korea: Jinan
South Korea
Cnidium officinale
null
2022-06
null
null
Cnidium virus 2 isolate CnV2JA, complete genome
ACGTAAGAGTTCCATATAACGGTTTTAAAGTATCAGAAACCTCATAATATCCCAACACCGGTAGCTCACAATGTCAGGGAACAATGAGACCATGAAGGCAAGACTGGCCGCTTTAAGAAGAAAATCACCACTCGACAACGACAAGAGTGTACCTGATTCATCAAAATCAGAAGTCAAAAAGACACCGAAGGCTTTCGGTGATAATGCTAGATTATTTAGTAGTGTAAAAGGTATGACAACCCCTGGAAAAACTATTCCTAAAGCTTGGAGCAATGCGGAACTTTCAAAAATCCCAATCTATGCCATTAGTCCTTTGACTCCTACTGAAGCTGTGGTTCTTGGTAAGCAAATGATAGGAATGCTGCTAGGAAACAATGCTACCCGGGACTTGATCGATATAATGTTGTTTTTGGCTGTATCACTTAGAGATCCCAATAATCCAGCAAATTTACTCTTAGCTGCACCTTCTGCTGAATTCGGAGCAAAAACTGCTCTAGGAAAGCCGAATGTGTCTGTCTCTGAGGAACAGAATGCTCCAAGTTCTGATTCTGCATTTGCTTCAGGAAGTTCGAAATCAGATATTGCGAGTCGACTGGCTGAGAGGAAAGCCGCAAGGAATGTATCTGGCGTGATAACAAAAGCTACCGCTGGAACCAATCAAGCAGATACCTCTGGAGTGTCCAGTGAAAATAAGGCGGCTATATATAGCTTTGTTGCAGCATTCTTCCTAAGGGCTCACTCAAGACAACCAGACAGTCTTATCGATTCTATTCCTCGAATGATTGAGAGATGCGCCAGTTGGTATGATGGGGCTGAGAGAATGTTAGAGAATTTGATAGTTGAGAAAGGAATGATAGACAGTATTAAAAATCTGCTTGCAAGACGGGAAGAGGTGATGTCCACGTGGGTTATGTGGGTAGCTTACAACGAAAATGAGATACCGATAGGAAAGAACAGTCAAGGGATGATATCTTACCTTGCCGGACAGATATATCAGTACACTGGTCTTCATGCTGTGGTGCAAGTGTTAGCAATACAGCAAGTCACAAAGGTTCCTATGGATCAATTACTCGGTGAGTTGAATCATAGGTCCACTAGACAGGCTTTGCTGGCCTTATATGACCTACTTCAGCATCACGAACTTGTGAAAGAGAAGCCAGGAAGGAAAACATACTTCCGATATGCTAGGATATGGGATTCCGGATATTTTCATGAGCTTCAATCAAAACAGTGCCCTGATCTTGTCTTTCTGGCTGCTAGGATTCTTAAAGAGGTGTCTCCTACAGGTGCAAGGTCTGACCCAACCAAGATTTATGCTATTCAAGATTTAGGAGATATCAAGAAGGAGTTTCTGACAGAGGTGGCCATGAAGATCTCTAGATGGTTGGTCTCTGCTGATGATGAGACTGGAGATTCAGGAGCCGCCTGGGCCAATTAATGAATCTGATTTACTTTAATTTATTCTATTCGCTTGTTTCTATTTATCTTTTAGTGATTTAATAAAACTAGAAATCGCAAGAGCAACATCTGTGTGCTTTATCAATTGATTAAAGACTCATTCAGAGAATTCATATCAATATGTCTAATGTTAACAAGGACGAGTTCAAGGGCGTCTATACCCCGGCAGGTGAAATCGATTATCTGTCTATGGCTAATGATGACCTTGAGACAGTGGATGATATACCTGACAAATTTGTTCAGGTTCCTACTAACAGTGATCAGGCTTCTGACCTTGGCAAGCCAGTATCTGTGGGAGATGTTAAAAAGACTTTGGAAAATCTTAGAGTTTATGCTACTGCACATGGTGCAATTGTTGATAGTAACATGGAATCGCTGTTTAAACATTACTGCATAACTGAGATGATGGATGCACGGGATGTGGAACTCTGGATACGCGGTTATGTGTACTCTACAGGATCTCAGGTAGGTCCTCGTATTACTGAGGTCACTGAGACACTCAAAAATGAAGTCCGATCCCTGCAAAGGACTAATGCTACTTTGTTAGAGACAATTAAGCTTTTAGCAAGTCAAGCTGTTGCTGTTGAAAAGGAAATAGCCTCAGTAACAGTAAACATCAAGTCAGATATCACGGCAGCATTAAAATCCGTGTTAGAAGGTCAGGCAAAGATTTATGAGAAGAGCAAGCCTGTCGGGGCAGTTAAGAAGCTTAACCTTTCTCCGCCGGATTTGGTCCCGATTATTGAGCCAAAGAAAATTCCTGAAACCCTGAAAGCTGGAGCACCTACAGACCCTTCTACATCGAACTTTTCAGACAAGTCACAGTTCATGAAGATGCGTGCTGTGATGAGGAAAGTAGGAGTAGACGATGCGATATTAGAGTATCTAGCAGACGAAGACCTAGCTGTTGTGTATCCAGAGGAAGATTTGCAAGAATATATGAATCATCTTGATGATCCAGATGTCCAGCAAATATTTCGAGAAGAGATCACAAAGAATATAGAGGAGAGGATTCTTTCTTAAGCTCATTCGGACAAGCTGTATTGTTATTTTATTGTATGTGTGCGTTATGTTTTCGTAATTCTAGAATATGTGTGCCAAGGTGTTTAAGATTTAATAAAACTAGATACCATAAGAACACCAGATAGGTTTCTGGAGAATATCCTTTTTGAAATTATGGAAACGTATATGACTGTGGTATCCGGGGAGTTTGTAACAGGACAAACTGACGGAGTAATATCGCTATCTAAGAGAATTGGTCTCTTTAACAAGATTTTGACCAAGTTCGGGTACACCAATATAGCTATCAAAAATGTATCTTTCATATTTAAGTCTAGATGCGCTGCGCAGGCTACAGGCACAATGAAGATGAGGTTGGTGGACCGAAGGCTCGAAGATCCTGATGACCAATACATAGACGGGATTTCTTTTGATGTGAAAGATTGGATTAAATTCTCCTGGAATTATCCTTGTTGGTTTCATTATAAGGACTTTGAAGTAGGTGACAAAGAATTAATTGAGATAGAATGGGATATAGATCAATCAAATATGATCGACTCCATTTCAGTGGGGCATTTCAAGGTGAAAATTGCTTATTCAATGCAAAATGATATCACAATCCTTAAGAACATGCCTAACGTGGCGTCGAAGATGCACTCACAGTTATCCTCAAGCAAATTCTTAAAGAGAGGTAAAGGAGGAAAGCAGTACAAGTCAACTTCAGACTTGTTAAATATCTCATACTCTCCTAATGTGGTAATTGATAGAAACTATGAGGCTTCAGATAGGAGGAAGAAAGAATTACTCTCCAAGTCTTCATTATCCCTTTTTACGCCACGTGAATAATATATTTTGCTGTCTTACTAGGAAGAATGATGATCAAACTAAGTATAAGAGATGCATAATAGAGAGTGCTGGAACGAGACGTGATTGGTGGATTGATGATTTAATAAAACTAGAAAAGTTAAGATCAACAGATCATATTTATCCGAGATAAATCATGGAGTCTCACATGACAGTAGTTACAGGGGAGTTCGTTGCAGGACAAGTCGATGGTGTAATTTCTCTCTCGAAGAAGATCGGCTTATTCAATAGGATCCTCACCAAATTTGGCTACACAAACATCGCTATCAGGGAGGTGATGTTTAGTTTCAAGTCCCGATGTGCCTCGCAAGCCTTGGGTACAATGAAACTGAGATTGATGGACAGGAGGCTCGAGGATCCCGATGATCAATATATAGATGGAATAGCATTTGATGTGAAGGACTGGATAACTTTCTCATGGAATTACCCCTGTTGGTTTCATTATAAGGATTTTGAGGTGGGGGACAAGGATCTGATAGAGGTTGAATGGGATATAGAGAGATCCAATATGGTGGATTCCATTTCTGTCGGCCATTACAAAGTGAAAATCACTTATGCTATGCAGAATGAGATCACCAGGCTGAAGAGTGTACCTAATGTAGCTGCGAAGGTTCACACGCAAGTTTCGTCTAGCAAGTTCCTCAAGAAATCCAAGACAGGCCGAGTCTATAAGTCTGCGGACACTCTCTTAAATGTTTCCAACACGCCCAACAGAGAGGCCCCAAAGGGAACCAAATCTTTCCTAGATAGGAAAGAAGAACTGCTCACTAAGTCTATGGGTTCGCTATTCCCTCCTAGATAACTCTGAAGGCTTGCAACTTCGAGGAGTTGACATAAGCAATAATCAATTTCCTTCGCATAATGAATACTTGAGTGCTGTGAGATGGTGTGTAGTATTATGTTTGTGTATTTGTATAATATGTACTCGTTGAGAGACTTCACATCATATCGAGTGTGATTTAATAAAACTAGAAAACATAAGATTAACAAGATCAACATTTTAGAATCTATGGAACACACTTCCGGAGAGATCATGGATTGCAAATTCTATGCTATATCATGTGTCGGAACCCCTGTGTCATTTTCTCTTATGGCCAGAAGACAAGCGTCTTCATTAACTCACGACGAAAGAGCGACAGCATTCAAGGCAGTGCTTGAGAAAACTGGGAAGATAGACAAGTCACTACAGGGGGCCATGCTCCATCTCATGAGTATCGGTCGTTTTGCTGCTGTGGATGATGAAACTCAAGACATGTTTTTAGGTCCGAAGACTCAACGCATAACATATAATATGCCTGAGTTCACCCTGGTCCCGTGTTTCGAGGATCTTAAAGAAGAGACTATCCAGCTCACATTACTAGGAGGTTTGTTAAGCATTGATCATGTCAAGCTGATTGCACGGGCAGATGTTCTAATAAAGGTGTCTCAGTTGTCTTTCCCTGATGCGATCACCGTGTTTCACGAGAGACCCAATGAATGTGTAGAAGCTTACATTCCCCAATCCATCATAACATCCACTCCTGAGGCTTCGTCATCTGACAAGCAGACAGCCGACATAAAGAAGAAGTGAGCACAAGAGGGAGACCAGACACTCGATACAACCCCCAGCCACCCTATGCCTTTATCCGAATGTTTATTTTTGAAATAAAAACCAGAATCTCTGTATCCTAGGTATCTAT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12,047
OR475307.1
Cnidium virus 2
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-10-11
CnV2JC
Cnidium virus 2
null
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,515
GenBank
null
South Korea: Jecheon
South Korea
Cnidium officinale
null
2022-06
null
null
Cnidium virus 2 isolate CnV2JC, complete genome
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12,048
OR475308.1
Cnidium virus 2
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-10-11
CnV2SCB
Cnidium virus 2
null
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,521
GenBank
null
South Korea: Yongha-ri, Samcheok
South Korea
Cnidium officinale
null
2021-06
null
null
Cnidium virus 2 isolate CnV2SCB, complete genome
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12,049
OR475309.1
Cnidium virus 2
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-10-11
CnV2BHA
Cnidium virus 2
null
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,515
GenBank
null
South Korea: Eo-ri, Samcheok
South Korea
Cnidium officinale
null
2021-06
null
null
Cnidium virus 2 isolate CnV2BHA, complete genome
ACGTAAGAGTTCCATATAACGTTTTTAAAGTATCAGAAACCTCATAATATCCAAATACCGGTAGCTCACAATGTCAGGGAACAATGAGACCATGAAGGCAAGACTGGCCGCTTTAAGAAGAAAATCACCACTCGACAACGACAAGAGTGTACCTGATTCATCAAAATCAGAAGTAAAAAAGACACCGAAGGCTTTCGGTGATAATGCTAGATTATTTAGTAGTGTAAAAGGTATGACAACACCTGGAAAAACTATTCCTAAAGCTTGGAGCAATGCGGAGCTTTCAAAAATCCCAATCTATGCCATTAATCCTTTGACTCCTACTGAAGCTGTGGTTCTTGGTAAGCAAATGATAGGAATGCTGCTAGGAAACAATGCTACCCGGGACTTGATCGATATAATGTTGTTTTTGGCTGTATCACTTAGAGATCCCAATAATCCAGCAAATTTACTCTTAGCTGCACCTTCTGCTGAATTCGGAGCAAAAACTGCTCTAGGAAAGCCTAATGTGTCTGTCTCTGAGGAACAGAATGCTCCAAGTTCGGATTCTGCATTTGCTTCAGGAAGCTCGAAATCAGACATTGCGAGTCGACTGGCTGAGAGGAAAGCCGCAAGGAATGTATCTGGCGTGATAACAAAAGCTACCGCTGGAACCAATCAAGCAGATACCTCTGGAGTGTCCAGTGAAAATAAGGCGGCTATATATAGCTTTGTTGCAGCATTCTTCCTAAGGGCTCACTCAAGACAACCAGACAGTCTTATAGATTCTATTCCTCGAATGATTGAGAGATGCGCCAGTTGGTATGATGGGGCTGAGAGAATGTTAGAGAATTTGATAGTTGAGAAAGGAATGATAGACAGTATTAAAAATCTGCTTGCAAGACGGGAAGAGGTGATGTCCACGTGGGTTATGTGGGTAGCTTACAACGAAAATGAGATACCGATAGGAAAGAACAGTCAAGGGATGATATCTTACCTTGCCGGACAGATATATCAGTACACTGGTCTTCATGCTGTGGTGCAAGTGTTAGCAATACAGCAAGTCACAAAGGTTCCTATGGATCAATTACTCGGTGAGTTGAATCATAGGTCCACTAGACAGGCTTTGCTGGCCTTATATGACCTACTTCAGCATCACGAACTTGTGAAAGAGAAGCCAGGAAGGAAAACATACTTCCGATACGCTAGGATATGGGATTCCGGATATTTTCATGAGCTTCAATCAAAACAGTGTCCGGATCTTGTCTTTCTGGCTGCTAGGATTCTTAAAGAGGTGTCTCCTACAGGTGCAAGGTCTGACCCAACCAAGATTTATGCTATTCAAGATTTAGGAGATATCAAGAAGGAGTTTCTGACAGAGGTGGCCATGAAGATCTCTAGATGGTTGGTCTCTGCTGATGATGAGACTGGAGATTCAGGAGCCGCCTGGGCCAATTAATGAATCTGATTTACTTTAATTTATTCTATTCGCTTGTTTCTATTTATCTTTTGGTGATTTAATAAAACTAGAAATCGCAAGAGCAACATCTGTGTGCGTTATCAATTGATTAAAGACTCATTCAGAGAATTCATATCAATATGTCTAATGTTAACAGGGACGAGTTCAAGGGCGTCTATACCCCGGCAGGTGAAATCGATTATCTGTCTATGGCTAATGATGACCTTGAGACAGTGGATGATATACCTGACAAATCTGTTCAGGTTCCCACTAACAGTGATCAGGCTTCTGACCTTGGCAAGCCAGTATCCGTGGGAGATGTTAAAAAGACTTTGGAAAATCTTAGAGTTTATGCTACTGCACATGGTGCAATTGTTGATAGTAACATGGAATCGCTGTTTAAACATTACTGCATAACTGAGATGATGGATGCACGGGATGTGGAACTCTGGATACGCGGTTATGTGTACTCTACAGGATCTCAGGTAGGTCCTCGTATTACTGAGGTCACTGAGACACTCAAAAATGAAGTCCGATCCCTGCAAAGGACTAATGCTACTTTGTTAGAGACAATTAAGCTTTTAGCAAGTCAAGCTGTTGCTGTTGAAAAGGAAATAGCCTCAGTAACAGTAAACATCAAGTCAGATATCACGGCAGCATTAAAATCCGTGTTAGAAGGTCAGGCAAAGATTTATGAGAAGAGCAAGCCTGTCGGGGCAGTTAAGAAGCTTAACCTTTCTCCGCCGGATTTGGTCCCGATTATTGAGCCAAAGAAAATTCCTGAAACCCTGAAAGCTGGAGCACCTACAGACCCTTCTACATCGAACTTTTCAGACAAGTCACAGTTTATGAAGATGCGTGCTGTGATGAGGAAAGTAGGAGTAGACGATGCGATATTAGAGTATCTAGCAGACGAGGACCTAGCTGTTGTGTATCCAGAGGAAGATTTGCAAGAATATATGAATCATCTTGATGATCCAGATGTCCAGCAAATATTTCGAGACGAGATCACAAAGAATATAGAGGAGAGGATTCTTTCTTAAGCTCATTCGGATAAGCTGCATTGTTGTTTTATTGTATGTGTGCGTTATGTTTTCGTAATTCTAGAATATGTGTGCCAAGGTGTTTAAGATTTAATAAAACTAGATACCATAAGAACACCAGATAGGTCTCTGGAGAATATCCTTTTTGAAAATTATGGAAACGTATATGACTGTGGTATCCGGGGAGTTTGTAACAGGACAAACTGACGGGGTAATATCGCTATCTAAGAGAATTGGTCTCTTTAACAAGATTTTGACCAAGTTCGGGTACACCAATATAGCTATCAAAAATGTATCTTTCATATTTAAGTCTAGATGCGCTGCGCAGGCTACAGGCACAATGAAGATGAAGTTGGTGGACCGAAGGCTCGAAGATCCTGATGACCAGTACATAGACGGGATTTCTTTTGATGTGAAAGATTGGATTAAATTCTCCTGGAATTATCCTTGTTGGTTTCATTATAAGGACTTTGAAGTAGGTGACAAAGAATTAATTGAGATAGAATGGGATATAGATCAATCAAATATGATCGACTCCATTTCAGTGGGGCATTTCAAGGTGAAAATTGCTTATTCAATGCAAAATGATATCACAATCCTTAAGAACATGCCTAACGTGGCGTCGAAGATGCACTCACAGTTATCCTCAAGCAAATTCTTAAAGAGAGGTAAAGGAGGAAAGCAGTACAAGTCAACTTCAGACTTGTTAAATATCTCATACTCTCCTAATGTGGTAATTGATAAAAACTATGAGGCTTCAGATAGGAGGAAGAAAGAATTACTCTCCAAGTCTTCATTATCCCTTTTTACGCCACGTGAATAATATATTTTGCTGTCTTACTAAGAAAAATGATGATCAGCCTAAGGAAAGGAGATGCATAATGGAGAGTGCTGGAACGAGACGTGATTGGTGGATTGATGATTTAATAAAACTAGAAAAGTTAAGATCAACAGATCATATTTATCCGAGATAAATCATGGAGTCTCACATGACAGTAGTTACAGGGGAGTTCGTTGCAGGACAAGTCGATGGTGTAATTTCTCTCTCGAAGAAGATCGGCTTATTCAATAGGATCCTCACCAAATTTGGCTACACAAACATCGCTATCAGGGAGGTGATGTTTAGTTTCAAGTCCCGATGTGCCTCGCAAGCCTTGGGTACAATGAAACTGAGATTGATGGACAGGAGGCTCGAGGATCCCGATGATCAATATATAGATGGAATAGCATTTGATGTGAAGGACTGGATAACTTTCTCATGGAATTACCCCTGTTGGTTTCATTATAAGGATTTTGAGGTGGGGGACAAGGATCTAATAGAGGTTGAATGGGATATAGAGAGATCTAATATGGTGGATTCCATTTCTGTCGGCCATTACAAAGTGAAAATCACTTATGCGATGCAGAATGAGATCACCAGGCTGAAGAGTGTACCTAATGTAGCTGCGAAGGTTCACACGCAAGTTTCGTCTAGCAAGTTCCTCAAGAAATCCAAGACAGGCCGAGTCTACAAGTCTGCGGACACTCTCTTAAATGTTTCCAACACGCCCAACAGAGAGGCCCCAAAAGGAACCAAATCTTTCCTAGATAGGAAAGAAGAACTGCTCACTAAGTCTATGGGTTCGCTATTCCCTCCTAGATAACTCTGAAGGCTTGCAACTTCGAGGAGTTGACATAAGCAATAATCAATTTCCTTCGCATAATGAATACTTGAGTGCTGTGAGATGGTGTGTAGTATTATGTTTGTGTGTTTGTATAAGATGTACTCGTTGAGAGACTTTACATCATATCGAGTGTGATTTAATAAAACTGGAAAACATAAGATTAACAAGATCAACATTTTAGAATCTATGGAACATACTTCCGGAGAGATCATGGATTGCAAATTCTATGCCATATCATGTGTCGGAACCCCTGTGTCATTTTCTCTTATGGCCAGAAGAAAAGCGTCTTCATTAACTCACGACGAAAGAGCGACAGCATTCAAGGCAGTGCTTGAGAAAACTGGGAAGATAGACAAGTCACTACAGGGGGCCATGCTCCATCTCATGGGTATCGGTCGTTTTGCTTCTGTGGATGATGAAACTCAAGACATGTTTTTAGGTCCGAAGACTCAACGCATAACATATAATATGCCTGAGTTTACCCTGGTCCCGTGTTTCGAGGATCTTAAAGAAGAGACTATCCAGCTCACATTACTAGGAGGTTTGTTAAGCATTGATCATGTCAAGCTGATTGCACGGGCAGATGTTCTAATAAAGGTGTCTCAGTTGTCTTTCCCTGATGCGATCACCGTGTTTCGCGAGAGACCCAATGAATGTGTAGAAGCTTACATTCCCCAATCCATCATAACATCCACTCCTGAGGCTTCGTCATCTGACAAGCAGACAGCCGACATAAAGAAGAAGTGAGCACAAGAGGGAGACCAGACACTCGATACAACCCCCAGCCACCCTATGCCTTTATCCGAATGTTTATTTTTGAAATAAAAACCAGAATCTCTGTATCCTAGGTATCTA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12,050
OR475310.1
Cnidium virus 2
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-10-11
CnV2BHB
Cnidium virus 2
null
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,510
GenBank
null
South Korea: Socheon-myeon, Bonghwa
South Korea
Cnidium officinale
null
2021-06
null
null
Cnidium virus 2 isolate CnV2BHB, complete genome
ACGTAAGAGTTCCATATAACGTTTTTAAAGTATCAGAAACCTCATAATATCCCAACACCGGTAGCTCACAATGTCAGGGAACAATGAGACCATGAAGGCAAGACTGGCCGCTTTAAGAAGAAAATCACCACTCGACAACGACAAGAGTGTACCTGACTCATCAAAATCAGAAGTCAAAAAGACACCGAAGGCTTTCGGTGATAATGCTAGATTATTTAGTAGTGTAAAAGGTATGACAACACCTGGAAAAACTATTCCTAAAGCTTGGAGCAATGCGGAACTTTCAAAAATCCCAATCTATGCCATTAGTCCTTTGACTCCTACTGAAGCTGTGGTTCTTGGTAAGCAAATGGTAGGAATGCTGCTAGGAAACAATGCTACCCGGGACTTGATCGATATAATGTTGTTTTTGGCTGTATCACTTAGAGATCCCAATAATCCAGCAAATTTACTCTTAGCTGCACCTTCTGCTGAATTCGGAGCAAAAACTGCTCTAGGAAAGCCGAATGTGTCTGTCTCTGAGGAACAGAATGCTCCAAGTTCTGATTCTGCATTTGCTTCAGGGAGTTCGAAATCAGATATTGCGAGTCGACTGGCTGAGAGAAAAGCCGCAAGGAATGTATCTGGCGTGATAACAAAAGCTACCGCTGGAACCAATCAAGCAGATACCTCTGGAGTGTCCAGTGAAAATAAGGCGGCTATATACAGTTTTCTTGCTGCATTTCTGCTTCGAGCTCACTCAAGACAACCGGATAGTCTTGTCGACTCGCTCCCTAGGATGATAGAGAGGTGTGCTAGTTGGTATGACGGTGCAGAGGTTATTTTAGAGAATTTGATAGTTGAGAAAGGAATGATAGACAGTATTAAAAATCTGCTTGCAAGACGGGAAGAGGTGATGTCCACATGGGTTATGTGGGTAGCTTACAACGAAAATGAGATACCGATAGGAAAGAACAGTCAAGGGATGATATCTTACCTTGCCGGACAGATATATCAGTACACTGGTCTTCATGCTGTGGTGCAAGTGTTAGCAATACAGCAAGTCACAAAGGTTCCGATGGATCAATTACTCGGTGAGTTGAATCATAGGTCCACTAGACAGGCTTTGCTGGCCTTATATGACCTACTTCAGCATCACGAACTTGTGAAAGAGAAGCCAGGAAGGAAAACATACTTCCGATATGCTAGGATATGGGATTCCGGATATTTTCATGAGCTTCAATCAAAACAGTGCCCGGATCTTGTCTTTCTGGCTGCTAGGATTCTGAAAGAGGTGTCTCCCACAGGTGCAAGGTCTGACCCAACCAAGATTTATGCTATTCAAGATTTAGGAGATATCAAGAAGGAGTTTCTGACAGAGGTGGCCATGAAGATCTCTAGATGGTTGGTCTCTGCTGATGATGAGACTGGAGATTCAGGAGCCGCCTGGGCCAATTAATGAATCTGATTTGCTTTAATTTATTCTATTCGCTTGTTTCTATTTATCTTTTGGTGATTTAATAAAACTAGAAATCGCAAGAGCAACATCTGTGAGCTTTATCAATCGATTAAAGACTCATTCAGAGAATTCATATCAATATGTCTAATGTCAACAAGGACGAGTTCAAGGGCGTCTATACCCCGGCAGGTGAAATCGATTATCTGTCTATGGCTAATGATGACCTTGAGACAGTGGATGATATACCTGACAAATCTGTTCAGGTTCCCACTAACAGTGATCAGGCGTCTGACCTTGGCAAGCCAGTATCTGTGGGTGATGTTAAAAAGACTTTGGAAAATCTTAGAGTTTATGCTACTGCACATGGTGCAATTGTTGATAGTAACATGGAATCGCTGTTTAAACATTACTGCATAACTGAGATGATGGATGCAAGGGATGTGGAACTTTGGATACGCGGTTATGTGTACTCTACAGGATCTCAAGTAGGTCCTCGTATTACTGAGGTCACTGAGACACTCAAAAATGAAGTCCGATCTCTGCAAAGGACTAATGCTACTTTGTTAGAGACAATTAAGCTTTTAGCAAGTCAAGCTGTTGCTGTTGAAAAGGAAATAGCCTCAGTAACAGTAAACATCAAGTCAGATATCACGGCAGCATTAAAATCCGTGTTAGAAGGTCAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCGCCGGATTTGGTCCCGATTATTGAGCCAAAGAAAATTCCTGAAACCCTGAAAGCTGGAGCACCTACAGACCCTTCTACATCGAACTTTTCAGACAAGTCACAGTTCATGAAGATGCGTGCTGTGATGAGGAAAGTAGGAGTAGACGATGCGATATTAGAGTATCTAGCAGACGAGGATCTAGCTGTTGTGTATCCAGAGGAAGATTTGCAAGAATATATGAATCATCTTGATGATCCAGATGTCCAGCAAATATTTCGAGAAGAGATCACAAAGAATATAGAGGAGAGGATTCTTTCTTAAGCTCATTCGGACAAGCTGTATTGTCATTTTATTTTATGTGTGCGTTATGTTTTCGTAATTCTAGAATATGTGTGCCAAGGTGTTTAAGATTTAATAAAACTAGATACCATAAGAACACCAGATAGGTCTCTGGAGAATATCCTTTTTGAAATTATGGAGACGTATATGACTGTGGTATCCGGGGAGTTTGTAACAGGACAAACTGACGGGGTAATATCGCTATCTAAGAGAATTGGTCTCTTTAACAAGATTTTGACCAAGTTCGGGTACACCAATATAGCTATCAAAAATGTATCTTTCATATTTAAGTCTAGATGCGCTGCGCAGGCTACAGGCACAATGAAGATGAAGTTGATGGATCGAAGGCTCGAAGATCCTGATGACCAGTACATAGACGGGATTTCTTTTGATGTGAAAGATTGGATTAAATTCTCCTGGAATTATCCTTGTTGGTTTCATTATAAGGACTTTGAAGTAGGTGACAAAGAATTAATTGAGATAGAATGGGATATAGATCAATCAAATATGATCGACTCCATTTCAGTGGGGCATTTCAAGGTGAAAATTGCTTATTCAATGCAAAATGATATCACAATCCTTAAGAACATGCCTAACGTGGCGTCGAAGATGCACTCACAGTTATCCTCAAGCAAATTCTTAAAGAGAGGTAAAGGAGGAAAGCAGTACAAGTCAACTTCAGACTTGTTAAATATCTCATATTCTCCTAATGAGGTAATTGATAAAAACTATGAGGCTTCAGATAGGAGGAAGAAAGAATTACTCTCCAAGTCTTCATTATCCCTTTTTACGCCACGTGAATAATATATTTTGCNNNNNNNNNNNGAAAAATGATGATCAGCCTAAGGAAAGGAGATGCATAATGGAGAGTGCAGGAACGAGCCGTGATTAGTGGATTGATGATTTAATAAAACTAGAAAAGTTAAGATCAACAGATCATATTTATCCAAGATAAATCATGGAGTCTCACATGACAGTAGTTACAGGGGAGTTCGTTGCAGGACAAGTCGATGGTGTAATTTCTCTCTCGAAGAAGATCGGCTTATTCAATAGGATCCTCACCAAATTTGGCTACACAAACATCGCTATCAGGGAGGTGATGTTTAGTTTCAAGTCCCGATGTGCCTCGCAAGCCTTGGGTACAATGAAACTGAGATTGATGGACAGGAGGCTCGAGGATCCCGATGATCAATATATAGATGGAATAGCATTTGATGTGAAGGACTGGATAACTTTCTCATGGAATTACCCCTGTTGGTTTCATTATAAGGATTTTGAGGTGGGGGACAAGGATCTAATAGAGGTTGAATGGGATATAGAGAGATCCAATATGGTGGATTCCATTTCTGTCGGCCATTACAAAGTGAAAATCACTTATGCGATGCAGAATGAGATCACCAGGCTGAAGAGTGTACCTAATGTAGCTGCGAAGGTTCACACGCAAGTTTCGTCTAGCAAGTTCCTCAAGAAATCCAAGACAGGCCGAGTCTATAAGTCTGCGGACACTCTCTTAAATGTTTCCAACACGCCCAACAGAGAGGCCCCAAAAGGAACCAAATCTTTCCTAGATAGGAAAGAAGAACTGCTCACTAAGTCTATGGGTTCGCTATTCCCTCCTAGATAACTCTGAAGGCTTGCAACTTCGAGGAGTTGACATAAGCAATAATCAATTTCCTTCGCATAATGAATACTTGAGTGCTGTGAGATGGTGTGTAGTATTATGTTTGTGTGTTTGTATAAGATGTACTCGTTGAGAGACTCCACATCATATCGAGTGTGATTTAATAAAACTAGAAAACATAAGATTAACAAGATCAACATTTTAGAATCTATGGAACATACTTCCGGAGAGATTATGGATTGCAAATTCTATGCCATATCATGTGTCGGAACCCCTGTGTCATTTTCTCTTATGGCCAGAAGAAAAGCGTCTTCATTAACTCACGACGAAAGAGCGACAGCATTCAAGGCAGTGCTTGAGAAAACTGGGAAGATAGACAAGTCACTACAGGGGGCCATGCTCCATCTCATGGGTATCGGTCGTTTTGCTTCTGTGGATGATGAAACTCAAGACATGTTTTTAGGTCCGAAGACTCAACGCATAACATATAATATGCCTGAGTTCACCCTGGTCCCGTGTTTCGAGGATCTTAAAGAAGAGACTATCCAGCTCACATTACTAGGAGGTTTGTTAAGCATTGATCATGTCAAGCTGATTGCACGGGCAGATGTTCTAATAAAGGTGTCTCAGTTGTCTTTCCCTGATGCGATCACCGTGTTTCGCGAGAGACCCAATGAATGTGTAGAAGCTTACATTCCCCAATCCATCATAACATCCACTCCTGAGGCTTCGTCATCTGACAAGCAGACAGCCGACATAAAGAAGAAGTGAGCACAAGAGGGAGACCAGACACTCGATACAACCCCCAGCCACCCTATGCCTTTATCCGAATGTTTATTTTTGAAATAAAAACCAGAATCTCTGTATCCTAGGTATCTAT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CACATAAGGCTTCTTCACGATATATATTCATCCACGATAATAGGATATGTTGATGGTATCATCAGTAAGGTGACAAAAGCATCCACAATCCAAAGACTTGCAGTCGACGCAGATAATCGAGATATTATGCAGGGTGTGGCATTAGATGAGATAAACTTCTTTAGGTATTTTGTGTGGAGATCTAGTGTGAGGTCCGATCTATCTATAGATGAATGTCCTTCCATGATGGCACAAAAGATGAGAAGAGAAGGATGGGGAAAAATATTGAGGGGAGTAAGCACTCCTTTTCCAATGGCGTACCTTTCACCAACCTCATGTGATGAAACTAGCATATGTGGATGCACAGATGGTTATATCTCTGTGCATTTCCCAGACAAGCAAGAAACAAATAGCTCTTGGAATCTTTCGCTAGGCTCAAATGCCCCTTATTTAGGGAGTATCACAAAGGAGAAAGTCATAACAGGACTCGGAAGCAAGGTATACTCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTCTAAACTTGCTGCGGGCAATTAACTGGTTTGTTCCTCCCCAGTCAGTAACTGCAATGGTTATCAGAAGTTTAACTCATGCAGTGACGGATGTGAAGACCGGGAAGTTTGAGGGGTTAGCAGAAGGAACAGCAGGAGCAGAAGTTCATCGCTATAGAGACATGAGCTTGAAACATGGGGCACTGGCATCTAGCAATTATTTGTACACTACTCGAATGCACATATCCACTGATAACTTCACTAGATATTCGAAAGGTGGCGATAATTACGACGTTCACTTCCAAGCTTGTTTATGCAGCTTGACTGAATGGTGCAATACTTCTTTACTCTCATGGTTTTATCATGGCGACTCTGTCCCGAAGTTTAAACACTTTAAACAGACTTGTCAAAGATGTGTGTCGAGGGTAGATGAATCATTTTGCGATCTAGATGATCCCCTTACTCCGCATTATATACCATCGAGAAAGAATAACCCATACCTGTTTGTGCCGCAGGACGCATTGGTCCAGGTCCATAAAATGAAACCATGGTTTGAGTTGTCTCTAACCTATATGAGATCGGAGGATTATGTGAATCTGACTAACAGCCAGAAAATGAGATGGGCAACAGACCTCATCGCAGATATGGTCTTTATGGATATTGTTACTGCGAAAGGAGAAGAGACAGCTTTTAGTGTTTGTCTTACAGACGTGAAAGCGTACGAGAGAACTGTGTTCTTGAAGCTGAACCCGGAGAAAACATTCTTAGCAGTGTTAGAGAGATTGAGGACACACGCAGAGATATTAGCAGGAAACACAGTACCCGGGTTTATTTCAAGCAAGAAACATCAGAAAAATAAGATAGCTTCTATACTGTATGAATGCCCTGCTTCAACCTTCCTAGGACTCGGCATGTTTTACTCTTGGGAAGAAACGTTCAACCGTATGGCTGATATGACATACATGTCAATGCCCAATACATTCCCGATGACGATTGATTCTATGTGTTCAGCGGCTCGCACTACCCTTTTGTGTCTTTTGGATAGGAATGTTCCCAGTCAGAAAAGAGGATTTTACGTCATTCCTCATGATCTGGTCAACAGCTTGAGAATTCACAAGATGGTGGCATATGAGTCTGTTCGTGATTCCTTCAATTGTGATGAATGCAATAAAGAAATTTCGTCAACGGATCACAGCCAATTCGGTGGAGCTCTTCCGATCCTAGAATGCGCAAAAGGACATAATGTCTTGGATAGGGTTAAGCACAAATGTCGAATGTCTCACGTTACCATGGAGAGGCTACGGAAGGACATAGAATACATTCATGAAGAACGGCAGCTCAGAAAAACAGATGGAACGCTAGTTCCTATGACAAAGAATGAAGTCAAAGTATTGATTGACTTATCTGAAACTAGACAATCCTTAATAGCCTATTCATCCGATATGCCATATCCTCAAGGACTGTTGTCATTTTCGCCTGTCAGAGGAAGCGTGTCGGAATCCAGTTTAACCAAGGTCATTTCTCTCCCCANNNNNNNCTCATACAAATATTTGGAAATCTTGTCCAAATACACGTCTAACATAGTCGGAAGGGTTATGATTGTGGGAGACGGATTAGGTCAGACATCAGAATTAGTAGCCACATACTGCAATGTTTCAAAGATCACAATTTCGACTTTAGCAGACACAGGCTTAGCAGCACCCCAGACATACCCTCATGCCATTCAACCCACAAGAAGGATGAAAAGCGTTGAAATGGATGCGAAAACCATGTTAAGTAAACATAATGATATTTTGTCTGATGATTACCTGAGAGATTGGGGTGACATTTTTAAGATTCACGACGTTCTGATAAGCGATATCGAAATAATGGGGGAAGAGTTATGGAAAGAAAGAGACGAGGCGATGGAGAAGCTAGTCTCCAACAATGATTGGAAATTTTTCCTCATAAAGGATTATTTGTACACCTTGAAAGAGTTTACAAGAAGAAGCTCATTCTTGATCCCAAAATGCGGACGAGGTCTTAGAATAATAACAAATAATATGAGATCGATGCAGGCACCTGAAGTTTGGTGGGTTGGGGGACCAACTGAAAGCTGTTATAAGGTTAGGCGATGTTATGAGCCCAGATCTCTTAAAAACGAATGGAACAATATAATCAGATCGCTGATGTTTGATAGAGAATATCAAGACAAATCAATATTGGACGATTTGCATAACAGGATAGTAGATATCTATTCTTTGTCACAAATGTACGGCTCTGTTCTTGATTGGAGCTCAATATCAGGATTGGGAAGAACCTTGCCTTCGAATGGGAATTACACTGATCTCTTTTACAGTCTGCAGCACTACAAGCACCCGGAAAAGGTAATCAGAGAAAATGTCGACTCAAAGAAAAAATTGCATATGTCGGATTATCTAAAGCTAAGAGAGGTTTTGTTCAGCTTCTTTGTTGCTATGTTGGCTGACGTTCAACAAAGGAAGACAGCATTAGAATCTTCTTTTAGATGGGCACTAAATTTGGAACACAACAAAACAAAGACAATGTGGGTACCTTCGCTGTATTTTTCTGATGAGAGAAAGAACCGTCCTATGAAAGATGTGAAAGATTATTTGTCGTATCTATGTCTGCAAAAAACCAAGCATCGATTGTTACTTAGGAGATTTAAAACCAATATCATATTTAGACATGCGGGTGGAAAGCGGGATGTTGTATATTTTCCCATATCAGGGGTGACCTACCGATCATTCTCATCGAAAATAAAGAGAGGAAAGAATAGTAAGATAAAAGCGTAATTGGCAACGATCTAGGATTTCGAGTCTGCTGCGATTAATCACTTTGATCCAATAAAACTAGAGGATTACAACATTTCAATATATTTTGACTAAATATTTCCCTAATTCACGGAAAATCAAAAATCCCATCTTTTGATCACCCTGAGATCATGAATATTTTTAACCTATACTACGGAAAATTAATTATGAGGGGTGAAAGATTTATAGTTTTCTTTGATTTATCATCCG
12,051
OR475311.1
Cnidium virus 2
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-10-11
CnV2BHA
Cnidium virus 2
null
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,533
GenBank
null
South Korea: Myeongho-myeon, Bonghwa
South Korea
Cnidium officinale
null
2021-06
null
null
Cnidium virus 2 isolate CnV2BHA, complete genome
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12,052
OQ442952.1
Cnidium virus 2
Park,Y.C., Kim,K.-K., Jun,H.J., Lee,S.-R., Ahn,J.K., Seo,H.K., Hoe,K.-L., Lee,S.-H.
NEXBIO Co., Ltd.
null
2023-07-04
SK
Cnidium virus 2
null
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
13,527
GenBank
null
South Korea
South Korea
Cnidium officinale
null
2021-06-12
null
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Cnidium virus 2 isolate SK, complete genome
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14,779
NC_055546.1
Cnidium virus X
Honma,H., Tsushima,D., Kawakami,H., Fujihara,N., Tsusaka,T., Kawashimo,M., Nishimura,T., Fuji,S.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2021-06-01
null
Cnidium virus X
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
5,964
RefSeq
null
Japan
Japan
Cnidium officinale
null
2018
null
PRJNA485481
Cnidium virus X RNA, complete genome
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1,927
OR352928.1
Cnidium virus X
Kang,J.-H., Jung,C.R., Kil,E.-J.
Andong National University, Department of Plant Medicals
null
2023-09-18
CnVXBHA
Cnidium virus X
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
5,962
GenBank
null
South Korea: Myeongho-myeon, Bonghwa
South Korea
Cnidium officinale
null
2021-06
null
null
Cnidium virus X isolate CnVXBHA, complete genome
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12,815
MW280188.1
Cnidium virus X
Chung,B.N.
National Institute of Horticultural and Herbal Science, Horticultural and Herbal Crop Environment Division
null
2021-05-31
CnVX-cnidium-kr1
Cnidium virus X
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
5,964
GenBank
null
South Korea
South Korea
Cnidium officinale
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2020-10
null
null
Cnidium virus X isolate CnVX-cnidium-kr1, complete genome
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41,732
MW346676.1
Cnidium virus X
Chung,B.
National Institute of Horticultural and Herbal Science, Horticultural and Herbal Crop Environment Division
null
2021-05-31
CnVX-Cnidium-kr6
Cnidium virus X
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
5,964
GenBank
null
South Korea
South Korea
Cnidium officinale
null
2020-09
null
null
Cnidium virus X isolate CnVX-Cnidium-kr6, complete genome
GGAAAACCATCCGCACCTACCCACCTACGCATATCCCGAAAATCAAACGGAAATCCCTGAGATCTTCAGATATGTCTCTTGTGCGTGCAGCCCTTGACCGACTGACCGATGTCAGTGTTAAATCAGCACTTCAAGAAAGTGCTTATGCACAGATATCAGCCACACTACGGCAAGCCCAAACAGTCAATCCTTTTGCAGTACCCGCAGATGCTGCTGATTGCTTAGAAAAATTAGGTATATTAACAAATCCTTTTAATGTAGCTGTACATACTCATTCAGCCGCTAAGGCTATAGAAAATAAACTTTTAGAGATTGTAGGTCACAACCTCCCCAAGGAGCCTGTGAATTTGCTTTTCCTTAAGAAAAGCAAACTTAATCAATTGAGGAGAGGGCCTCAGAATAAAGATGTTTTCCAAAATTGCAATGTCGAAGCACGAGACTTTGCAAGGTATGACGCCGACACCCTAGTAGATAATCTTTGTCGGATACATACCAGAGTCGCCTACATCAGCGACACTCTTCACTTTCTCAAGCCGGAATTTATACTAGACATATTTCATAACAATCCGATGCTTGACGTGCTCTATGCCACCATTGTGCTCCCCGTAGAGGCAATGTACCAGCATAATTCTGTACAGCCCGAGCTTTACTCTATCAATTATGCACATGGTGGTTTCCAATACCTCCCAGGAGGTCATGGCGGTGGGGCATACTCTCACGAATTCCCTGATCTAAACTGGCTCAAATATGGCTATTTCCGCGGCACTGACAAGTATCCAGGCACGGTAGTCACATGTCAACAATTGGAATCTCTTGGTGCCAATCACTTATTTGTGTACCAAAGAGGAGAGCTCAAAACTCCTAGGGTCCGAACTTTCTATGCAGACTCCTTTGTCAAATTCCCTAGAGTTTTCCACCCCCGCCACCTAAATTCCACCAGACCCATCAAACATAAGCTTGCCATGCAAATGTTCGCTTATGTTAAGTCGGTTAAGGCAGTCACCGAGAGAGACATTTACGCCAAGTTGCGTCAACTCATCAAGACGGATGAGCTGGATAAATTTTCCCCAGACGAGATAGTTCACATAGTGAACTATTTCCTCTTCGTTTCCAGTATGGAGGGGAAAAACTCCTACACAGAAATGATTGGTGCCTCCCTCTGGAAGCGCATTACTGCCCCCGTCCGCAACTCCATAAATACTCTCTATCAGCTCATCACAGGAGCTGACCCTTTCAAGAAACTGCTTTTATCCCTCCAGTGGACCAGCTTCTCATACTCCTTAGAAGTGGAAGAGTTTTCCGAGCTCCATAAAGATTCCTGGTACCCACCCACCGACTACATCCCTGAGCAGTGGCCTTTTGATGAAAGAGAACCAGCAGAAACCACACCAGAGGCTACAGACTCAGACTGTGAAGACCAACCCTCCCCCACCAAGAAGGAAGCTCCAAAGCCGGCTCCAAAAGTGATAACCCCCTGGACAAACATTTTGACCAGGCACGGATTTGCCGGTGACCACACCGTACTTGATCCTGCCGGCGAGCCTATCTCCCCCATCACCAATGTGCTCTCCTTCGAAAAGATCGAGCTTCCTTCGCATTTTCCGAGTTTTCTAGCTAAACAGCTTAAGGAATTAGGTAGATTACCTTGCTGGTACCCTGTTGATAAAACTAGGGCCCAGTCCTTTGGCAGTGACGTTAAAAACTCACGCATAGGAAGCCTTCTTAAAGCTCAGCCAGCTGATTTCAAGCAATCCTTCGCTGGCATGTGTGAATTCACGGAGAAGAAGGTCCTGCTCACAGTCATCCATGGTGCAGGAGGCTCCGGCAAATCCCAAGCTCTCCAAGATTGGCTCCGCGCCAGTGGTAAGAAGTTCCGTGACTGCGTCGTCGTCCTCCCCACAGTTGAACTCAGAAAAGATTGGGAAGATAAAGTTATGAATATGCCAAGGATGACTTTCAAGACATGGGAAAAAGCTCTAACCCAGGCGGCTGCAAAAACTGTAATTTTTGATGATTATGGTAAACTGCCCGCCGGCTACATAGATGCATACCTAGCCACACAACCACAGTGTGAACTAGCCATTCTGACAGGTGATCCCAATCAAAGCATCTATCACGAGCCAAACTCCCAAGCAGCCACTGCAGGCCTCAGCGACAACATCACTCATTTCGCCCAATTTTGTCGCTTCCATCTTAATGCCACCCACAGGAATGCCCTCAAGATAGCCTCCGCTCTCGGCGTCTACGCGGAGAATACCATCCCGGCTAAAATCACATGCTCATCACAAATGAAGGAAGGTTGGCCAACTCTAACGCCAAGCCTAGAGAAGAAAGCATGTCTGCAAGAGATGGGCCGCTCTAGCTACACCTATGCTGGATGCCAGGGGCTCACCACTCCTAAAATCCAAATCCTCTTGGACACCAACACACCCCTGTGTTCGGAGAAAGTCTTGTACACCGCCCTTTCCAGAGCTGTCAGCACCATACACTTCGTTAACACCGGCCCTAACGCCGCTGAATTTTGGGACAAGCTCGACGCCACACCCTATTTAAAGACTTTTATCGACAACGCCAGGGAAAACATCGCCAATCCAGAGATGGAACCGGCCTCTGATGCCCCCACAGAACCTGACGCCCCTGCCACCCACTTCCCAGTAGAGAATGATGCTTGTGCCCTCGGGATTTTCACGGATGCCCTCCCTGATAAGGAGTCTAGAGAAATCTTCTCTAAGGATTCAGGTCACAGCAACGCTGTCCAAACTTCTGACCCAGTTGTACAGCTTTTTGCGCATCAGCAAGCCAAAGATGAAACTCTCTTCTGGGCCACTGTGGATCAAAGAATCACCACCACTACCCCAGAAGAGAATCTAAAAGAGTTGGTGCTTAAGAAGGACCTGGGAGACATACTCTTCGAAAACTACAAGAAAGCCATGGGTCTCCCCTCTGATCCGATTCCTTTTGATCAGCGTCTTTGGGACAACTGCAAAGCAGAAGTCACTAATGCTTACCTTGCGAAACCCATAGCCAACCTGATGAATGGAGCTTCTAGACAGGACCCCGACTTTGACTCCAATGCCATCTCCCTCTTCTTGAAATCTCAGTGGGTCAAGAAAACTGAGAAACTAGGTTCTCTCATCAAGCCAGGCCAAACCATTGCCGCTTTCATGCAAGAAACCGTGATGATTTACGGTACCATGGCTAGGTATATGAGACGCATGCGTGAGATCTATCAGCCTTCAAATATTTTCATCAATTGTGAGAAAACTCCACAAGACTTGGATTCTTTCATACATGAACATTGGAGTTTTAACACACCGGCACATGGCAATGATTTCTCAGCCTTTGACCAGTCTCAAGATGGAGCCATGCTTCAATTTGAAGTATTGAAGGCTAAATTCCATAACATCCCTGAAGAAATCATAGAAGGCTACATCTACATCAAAACTCATGCAAAGATCTTCTTAGGGACCATTGCCATTATGCGCTTATCTGGAGAAGGCCCTACTTTCGATGCTAACACTGAATGCTCCATCGCATACCACCACACTCGTTTCCATGTCCACCCATCCACTGCTCAAGTCTATGCCGGTGATGACATGGCACAAGACTGTGAACCTGTGGAGAAAGCCAGCTTCCGAGCCATCCAAGACAGACTTGCTCTGACCTCCAAACCTGAGCGTTTTGAGCAAACCCCTGGAGATTACGCCTCTTTCTGCGGCTGGCGTTTCACCCCTATTGGCATCATCAAGGACCCCCTCAAGCTCTATTCCTCTTTTGAGCTTGCCAAAAGAACTGGAAAAACGGCAGATATAGGCTCTAGCTACGCGATAGATGCCTCTTTTGCCTACAAGAAAGGGGATGCCCTCCATGAAATTCTCACAGATGATCAGGCTCGTTGGCATCAACTGGTCATCCGCAACTTACATCGCCTACGTAATGCTGACGTAGAGATGTTCTTGCATCAAGGGGCTTAACAGCCCCCAACAAGGCAAATTCTTGTACCACATCGCTCATGTGGGGCCGGGTTAACTACCCACCATGACTACACATGGTTTTCTAGAGCACCTGTAAATACTTAATTGTTTAATGTTAAGTTTTCATTCTAGGTTGATGTCTAATACTCTGCTGTTTAATCTTCTTGCAAGAGCTGAGTTTGAACGCACTGATACTCCATCTTCAACGCCCATTGTGATACACGCAGTCGCCGGGGCAGGAAAATCTTCCCTCCTTCGCCAACTCACTGCATACTACAAAGTTGGAACAGCCGCCAAACCAGACCCCCCTTCTTTTAAAGGGGACCACTTCACTGCTTGTGTCGAAGGCATTGATATTCTCGACGAGTATCAATCTGCCCAGACCATCCCTAAGTCTGCCTCCATTCTCTTCGGAGACCCCTTGCAAGATCCTTCTCAGGCGCATTTCCTTAGACCACATTACCTGAAGACCAAATCCTACAGAATCGGCCCCGAGATAGCTCAAGCCCTTAGCCAAATACTTGTTATTCAGGCTTTCGGTTCCTCAAAGCTGCTCCGTGGTTCCGCCTATTTAGAAGATCCGGTAGGCCTCGTTATCGCATTCGAGGACCAGGTTTGTGCAATTCTTAGGAAGCATCAAGTCGAACACTCCCACCCCTCGGAAATCCGTGGAGTTGAAGTCGACACAGTCACTCTCTACACATCAACCAGTGTTCTCCCAAAAGAGCACCATTCTGATTTGTACGTTGCGTTGACTCGAAGTTTAGCTAAGACTCTTTGGCTAACTCTTGATGCCACTGACGCCAGACACCCAACAGCAGACGTTTAGAACTTTAATAGCTTGTGTGTGTGTAGTTGCTGCCTTTTGGGCTCTTACCAGATCCACACTTCCTCACGTCGGTGACCCGTCCCACTCCCTACCTTTCGGAGGTTGGTACAAGGACGGAACCAAATCTTTCGCCTTCAACGGCCAGCAGTCTGGTCCCAACAGCAACCACAAGTCTTTAGCCCTAGTTTTAGCCTTAG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41,735
LC460456.1
Cnidium virus X
Honma,H., Tsushima,D., Kawakami,H., Fujihara,N., Tsusaka,T., Kawashimo,M., Nishimura,T., Fuji,S.
Department of Biological Production, Faculty of Bioresource Sciences; 241-438 Kaidobata-Nishi Nakano Shimoshinjo, Akita, Akita 010-0195
Japan
2019-03-19
null
Cnidium virus X
Potexvirus
Alphaflexiviridae
ssRNA(+)
5,964
GenBank
null
Japan
Japan
Cnidium officinale
null
2018
null
null
Cnidium virus X RNA, complete genome
GGAAAACCATCCGCACCTACCCACCTACGCATATCCCGAAAATCAAACGGAAATCCCTGAGATCTTCAGATATGTCTCTCGTGCGTGCAGCCCTTGACCGACTGACCGATGTTAGTGTTAAATCAGCACTTCAAGAAAGTGCTTACGCACAAATTTCGGCCACATTACGGCAAGCCCAAACCGTCAACCCTTTCGCAGTACCCGCAGATGCTGCCGATTGCTTAGAAAAATTAGGAATTTTAACAAATCCCTTTTATGTAGCTGTACATACCCATTCAGCCGCTAAGGCTATAGAAAATAAACTTTTAGAAATTGTAGGTCACAACCTCCCTAAGGAGCCTGTGAATTTGCTTTTCCTTAAGAAAAGCAAACTTAATCAACTGAGGAGAGGGCCTCAGAATAAAGATGTTTTCCAAAATTGCAACGTCGAAGCACGAGACTTTGCAAGGTACGATGCCGACACCCTAGTAGATAATCTTTGTCGGATACATACCAGAGTCGCCTACATCAGCGACACTCTTCACTTCCTCAAGCCGGATTTCATACTTGACATATTTCATAATAATCCGATGCTTGACGTGCTATATGCCACCATTGTGCTACCTGTAGAGGCAATGTACCTGCATAATTCTGTACAGCCCGAGCTTTACTCCATCAATTATGCACATGGCGGTTTCCAATACCTCCCAGGAGGTCATGGTGGCGGGGCATACTCTCACGAGTTCCCTGATCTAAACTGGCTCAAATATGGCTACTTCCGCGGTACTGACAAGTATCCGGGCACAGTAGTCACATGTCAACAGTTGGAATCTCTTGGTGCCAATCACTTATTTGTGTACCAAAGAGGAGAGCTCAAAACTCCTAGGGTCCGAACCTTCTACGCAGACTCTTTTGTCAAGTTCCCTAGAGTTTTCCACCCCCGTCACCTTAATTCCACAAGACCCATTAAACATAAGCTTGCCATGCAGATGTTCGCTTATGTTAAGTCGGTTAAGGCAGTCACCGAGAGAGACATATACGCAAAGTTGCGTCAACTCATCAAGACGGATGAGCTGGATAAATTTTCCCCAGACGAGATAGTTCACATAGTGAACTACTTTCTCTTTGTTTCCAGTATGGAGGGGAAAAACTCCTACACAGAAATGATTGGCGCCTCCCTCTGGAAGCGCATTACCGCTCCCGTCCGCAACTCCATAAATACTCTCTATCAGCTCATCACCGGAGCTGACCCTTTCAAAAAACTGCTTTTATCCCTCCAGTGGACCAGCTTCTCATACTCCTTAGAAGTGGAAGAGTTCTCTGAGCTCCATAAGGATTCCTGGTATCCACCCACCGACTACATCCCTGAGCAGTGGCCTTTTGATGAAAGAGAACCAGCAGAAACCACACCGGAAGCTTCTGACTCAGACTGTGACGAACAACCCTCCCCCACCAAGGAGGAAGCTCCCAAGCCGGCTCCTAAAGTGATAACACCTTGGACAAATATTTTGACCAGGCACGGATTTGCTGGTGACCACACCGTCCTTGACCCTGCCGGCGAGCCTATCTCCCCAATCACCAATGTGCTCTCCTTTGAAAAGATCGAGCTTCCTTCGCACTTTCCAAGCTTTCTGGCCAAACAGCTTAAGGAATTAGGTAGATTACCTTGCTGGTACCCAGTTGATAAGACTAGGGCCCAGTCCTTTGGCAGTGACGTTAAGAACTCACGTATAGGAAGTCTTCTCAAAGCTCAGCCAGCTGACTTTAAGCAATCATTCGCTGGCATGTGTGAATTCACGGAGAAGAGAGTCTTGCTCACAGTCATCCATGGTGCAGGAGGCTCCGGTAAATCCCAAGCTCTCCAAGATTGGTTACGCGCTAGTGGTAAGAAGTTTCGTGATTGCGTTGTTGTCCTCCCTACTGTTGAACTCCGAAAAGATTGGGAAGATAAAGTCATGAATATGCCAAGGATGACCTTCAAGACGTGGGAAAAAGCGCTGACCCAGGCAGCCGCAAAAACCGTAATTTTTGATGATTATGGTAAACTGCCCGCCGGCTATATAGATGCATACCTAGCCACACAACCACAGTGTGAACTAGCGATTCTGACAGGTGATCCCAATCAAAGCATCTACCACGAGCCCAACTCTCAGGCAGCCACTGCAGGCCTCAGCGACAACGTCACTCATTTCGCCCAGTTTTGTCGCTTCCATCTTAATGCCACCCACAGGAATGCTCTCAAGATTGCCTCTGCTCTCGGCGTCTACGCGGAGAATACCATCCCGGCTAAAATCACATGCTCATCACAAATGAAAGAAGGTTGGCCAACTCTAACGCCAAGCCTAGAGAAGAAAGCATGTCTGCAAGAGATGGGCCGCTCTAGCTACACCTACGCCGGATGCCAGGGGCTCACCACTCCAAAAATCCAAATTCTGTTGGACACCAACACACCCCTGTGTTCGGAGAAAGTCTTGTATACCGCCCTTTCCAGAGCTGTCAGTACCATACACTTCGTCAACACCGGCCCTAACGCTGCAGAATTCTGGGACAAGCTAGACGCCACACCTTACTTGAAGACTTTTATCGACAATGCCAGGGAAAACATAGCCAATCCAGAAATGGAACCGGCTTCTGATGCCCCCACAGAACCTGACGCCCCTGCCACCCACTTCCCGGTAGAGAATGATGCTTGTGCCCTCGGAGTTTTCACGGATGCCCTCCCTGATAAGGAGTCTAGAGAGATCTTCTCTAAGGATTCAGGCCACAGCAACGCAGTCCAAACTTCTGACCCAGTTGTGCAGCTTTTTGCGCATCAGCAAGCCAAAGACGAAACTCTCTTCTGGGCCACTGTGGACCAAAGAATTACCACCACGACCCCAGAAGAGAATCTCAAAGAGTTGGTTCTAAAGAAAGACCTAGGAGATATACTCTTTGAAAACTATAAGAAAGCCATGGGTCTTCCCTCTGACCCAATTCCTTTTGACCAGCGTCTTTGGGACAACTGTAAAGCTGAAGTCACTAATGCCTACCTCGCAAAACCCATGGCTAACCTTATGAATGGAGCTTCTAGACAGGACCCAGATTTTGACCCGAATGCCATCTCCCTTTTCCTAAAGTCCCAGTGGGTCAAGAAAACTGAGAAGCTAGGTTCACTTATCAAGCCAGGACAAACGATAGCTGCTTTCATGCAAGAAACCGTTATGATTTACGGTACCATGGCTAGGTATATGCGACGCATGCGTGAGGTTTATCAGCCTTCTAATATATTCATAAATTGTGAGAAAACTCCGCAAGATCTGGACTCTTTCATACATGAGCATTGGAGTTTTAACACACCGGCACATGGCAATGATTTCTCGGCCTTCGACCAGTCTCAAGATGGAGCCATGCTCCAATTTGAAGTATTGAAGGCTAAATTCCACAACATCCCTGAAGAAATCATAGAAGGCTACATCTACATCAAAACTCATGCAAAGATCTTCTTAGGGACCATTGCCATTATGCGCCTATCTGGAGAAGGCCCTACTTTCGATGCTAATACTGAATGCTCCATCGCATACCACCACACTCGTTTCCAGGTCCACCCATCCACTGCTCAAGTCTATGCCGGCGATGATATGGCGCAAGATTGTGAACCTGTGGAAAAACCCAGCTTCCGAGCCATCCAGGACAGACTTGCTCTGACTTCCAAGCCTGAACGTTTTGAACAAACCCCTGGAGATTACGCCTCTTTCTGTGGTTGGCGTTTCACCCCTATCGGCATCATCAAAGACCCCCTCAAGCTCTATTCCTCTTTCGAGCTTGCCAAAAGAACTGGAAAGACGGCAGACATAGGCTCTAGCTACGCGATAGATGCCTCTTTTGCCTACAAGAAAGGGGATGCCCTCCAGGAAATTCTCACTGATGACCAGGCTCGTTGGCATCAACTGGTCATCCGCAACTTACATCGCCTACGTAACGCAGACGTAGAGATGTTCTTGCATCAAGGGGCTTAACAGCCCCCAAAAAGGCAAATTCTTGTACCACATCGCTCATGTGGGGCCGGGTTAACTACCCACCATGACTACACATGGTTTTCTAGAGCACCTGTAAATACTTAATTGTTTAATGTTAAGTTTTCATTCTAGGTTGATGTCTAATACTCTGCTGTTTAATCTTCTTGCAAGAGCTGAGTTTGAACGCACTGATACTCCATCTTCAACGCCCATTGTGATACACGCAGTCGCCGGGGCAGGAAAATCTTCCCTCCTTCGCCAGCTCACTGCATACTACAAAGTTGGAACAGCCGCCAAACCAGACCCCCCTTCTTTCAAAGGGGACCACTTCACTGCTTGTGTCGAAGGCATTGATATTCTCGACGAGTATCAATCTGCTCAGACCATCCCAAAGTCTGCCTCCATTCTATTCGGAGACCCCTTGCAAGATCCTTCTCAGGCGCACTTCCTCAGACCACATTACCTGAAGACCAAATCCTACAGAATCGGCCCCGAGATAGCTCAAGCCCTCAGCCAAATACTTGCTATTCAGGCTTTCGGTTCCTCGAAGCTGCTCCGTGGTTCCGCATATTTAGAAGATCCAGTAGGCCTCGTTATCGCATTCGAGGACCAGGTTTGTGCAATTCTTAGGAAGCATCAAGTCGAACACTCCCACCCCTCAGAAATCCGTGGAGTTGAGGTCGACACAGTCACCCTCTACACATCAACCAGTGTTCTCCCAAAAGAGCACCATTCTGATTTGTACGTTGCGTTGACTCGAAGTTTAGCTAAGACTCTTTGGCTAACTCTTGATGCCACTGACGCCAGACACCCAACAGCAGACGTTTAGAACTTTAATAGCTTGTGTGTGTGTAGTTGCTGCCTTTTGGGCTCTTACCAGATCCACACTTCCTCACGTCGGTGACCCGTCCCACTCCCTACCTTTCGGAGGTTGGTACAAGGACGGAACCAAATCCTTCGCCTTCAACGGCCAGCAGTCTGGTCCCAACAGCAACCACAAGTCCCTAGCTCTAGTTTTAGCCTTAGTTATCATCATCGTCTTGCATGCATTGGCAAGACGCAGTAATAATAATCAGTGTGCTCGTTTTGTTAATTAGTCTTTATTATGGTTCTCACAGCAGAAGAGACGGCTGCTTCATCCACATCGACGGCGCCACCGCCTCCGCCTCCAATTGCTCCCCAGAGCAACTCTCAGCCATCTCCCACGGATTTCTCAAACCCATTAGCCATGCCTGCACTGAAAGATCTAGTCGCGGCTGGTTCGGCCAGCAACGCTGTTGCTGAACCCTCCACTATTTCCGCCATCGCGAACAGCATCGGCTTGCTAGGGCTCAACAGAGCCAATATAGCCAAAGGGTTCTGGGATATCGCTCTCCATTGCGCAGATGTTGGATCTTCAGCTTCCGTCACTTTAGTAGGCCGCTGCGAACCTCTCGGTGAAACTCGTGCAGAGATTGCCCGCGTCATCAAACAACACTGCACTCTTCGGCAATTCTGCATGTTTTATTCCAGAATCGTCTGGAACATCCTGATTAAAGAGAAGCGCGCTCCTGCCGGATGGATGCGCCACAACTATACGGAAGCGGATCGATATGCCGCTTTCGACTTCTTCTCTGGGGTACTCAATTCTGCATCCTTACAAGTACCCCTGATTAGGCAACCTACTGCCACTGAGATCTTGGCTCACAACACCAATGCCAGAGTTTCTATTTATAGAACAAGAATAGACCAATCTCAGAAAGCCACCACGGCAGTAGAAATCACCGGAGGCACTGCCAGGCCGACCCCTCTATTACTTCTGCCCCCACCTTAGGTGGGTTGTTCAATATGTGTGATATTGTGTTATAAGTGTGTATTGTGCAATAAAGGAGTGGACACCTCCTCCCACTGGGTTTACTGTCCCGACTAACCATCGTTAAATAGGTTCTTTACTTCCCGCCGTACTTAACAGGCGGGTCTTTTGGTTTTTCCCTGTTTTTCCTTTTTAATT
64,611
NC_034551.1
Colocasia bobone disease-associated virus
Higgins,C.M., Bejerman,N., Li,M., James,A.P., Dietzgen,R.G., Pearson,M.N., Revill,P.A., Harding,R.M.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2017-05-15
null
Cytorhabdovirus colocasiae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
12,193
RefSeq
1
Solomon Islands
Solomon Islands
Colocasia esculenta
plant leaf
null
null
PRJNA485481
Colocasia bobone disease-associated virus strain SI, complete genome
CACGACCAGTGATCGTATAATGATCTGTCTGGTCTACAGGCATAGGGTTCTAATACTCTAACCATTCTAATATCTGTATATCCCATCTACAGTAATATTCTAACAAGGAAAAACTTGAGACCCTAATTCTCTAAGAATTAATCGTCTTATGTTAGTTGCTGTTTCTTTCTCTTTGCAATGGCACAACACACTATTGATGCGAAGATCACAGCTCTCTTTGATGGAATTCCTGAGGATGTATGTTTGGGCCCAGTGACAGGAGTAAAGTTCACAAACGATGCATTTGATGCTCTGACTTGTTACAGGCTAGAAGCAGTCGCGGACGCTAAAGTGAGGTACATGGCTGAGAAAGCTATGTCAGAGATATTCCAATCCGCTGCTACATGCAAAGATTATCATCCTTATATGATATTGACTCTAGCATCCCAATTGTATACACCGGGAAAATCCGCGACAACTAAGATGGTGGTTGATTATTTYCCAACATCTCAGACGGGAATCCCGACTGCCACTTCAGATGAGTGGAAGCTCCCGACCAAAAATACATCGGACACTGACACCACTCAGATCGATGATGAGGCAGCGGTTTTTACAGGGAGAACAGCTAAGGCAGGAAATGCCACGGTGAAAGAAGTATGCTTTGCTAGTGCATTCTTATTAAGAGGATTGGTTAAGACTGTGACCAACATAACAAAAGCGTTCGAGAAATTAGGAGGAAGGTTCGTATCATTGTACAATCTTCCTAAAGATGATACATTTGTGTGTCCTCCGGCAGCATGGTTGACATCATATAAAGAGTTTTTGACTGCAGATCCTATGATTGCAAGAACATGGATCAAGATAGTGGCGGCAGCAGAGCAGGGGTTGGATGCTGGATCGAATGATATGGGAGTGCTACGGTTCTTGGCATGTCAGCCTTTGAGTTATTCAGGGATGCACGCGATGAAGCTATATTTAACCATAAAGGACAAAACAAAATTGAGTCACAAATGGCTCTTGGAAAAGATGGTCATGCCCGCCACAACACCGGCTTTAACTGAGATCGCAAACCTCTTGAAGAATTTTGAGTCCACTGAATCGGCTAAAAAGCCTACTAAGTTCAGGTATGCACGTCTTGGCAGTCCGGTATACTTCCAAAAACTTCAGACCAAGAACTGCCTTGAACTGGTATTCCTGGAGGTTTGCATATTAAATCACTTCACTACCTTTGCTGAGGATTATCAGAATCCTACAAAAATAGTAGGGGTAGAGAGAATACCAGAGGCGATGAAGACCAAATTAAAAGCAGCTGCCAATGCTATAGTTTCGAGGGCACCAGTCTTGAACCCCAGCTTGTACTCTGATATTATGTCAGGAGTATTTTTGAGTAAGACTGAAGCCTCTACATCAGGGACAGCTGCTCAGACTAGCGGGACTAAATTGACTGAGCAGGCTATCTTTGGTTAACATACTGGTCAGATGTCTATTTGACAGAGGGACCGTCTATCTGCAGGTCCCCATGGGCGTGTGTACTGTGTGATGTGGTTAATTAAGAAAAACTGAGACCGAAACTGTCCGAAATTGTCTCTGGCAAAATTTCCACCTTGAATTGTCTTCTTGCATGACCACAGAATTCATACGAATATGTCTGAGTCTGATCTTTTCGGTGATATCCATGAGAATATCCTTCCTGCTGACTTCGATCTGGACGATGATCAGATTGACTTTCCTACTGAAGCACGAGGAGTTGGATCAGGTTCGAGAGGAACTGGAATCGAGGTTGCGGGAGAAGTTGAGGGAGACAATGATTGTTATGTTGATACTGAAGACATGTATTCTGATGTTAATTCTGCTTTAAAGAGCCTGTCTACAAAGTTGAGTGATCATGGGATTAAATTGAGAAAGGAGTGGACCACTATGATATCTCGCAGATTCCACGTCTCAGGGCCATTATATCCAAGTCATCTTGATATGTTCGTCCTGGGTATTCAGGCCGAACGAAATGTAGGACTAAACTCGGACTTGAAGGAGACAGCAAAAAGGGTCCAGGAAGAAGCGAATCATATGTGTGGGGAGCGAAAAAAGATGAGTGATTCAGCTGAGAAGGTGATAAGTGACTTCACCAAAATTATAAGGGATATGCAACATCAGATCCTGGAGATGTCACAAGTAACCGAAAACATTAAGGCAGCATCCAGAGAAGCGTCTGAGATTGGTTCTATTTCGGATGCTCTGGAGTTAACAAAGCCCAAGACGGTTCAAGACCTACTTCGGGACCTGGGGTTTCAGGAGAGCAGCATAAATCACCCTCTTATGAGAGACTATATAGACAAAGTCGCCCCTGCTAGCTTCGTAGAGCGGTATTTCAAGAGTCGAGACCGCCAGGATAGAGAAAAGGTTAGAGAATATATTCTTGCTGGCGTTAAAGAACACAAGGAAGCTGCTGAGAGAGCCAAACTGTCAAAAGCAAAATCGGTATTAGTTTGAATCAACTAGAGCCTCTGGGGCTGCTTTCTTTATTGTCCTCTTGGTGAAGGCCTTATTATGCTGGATACTCTAGATATATTATGGATCCTATTGCATTTTGTCATTTTGTGCTATTTTGCTTATTTATGTTTCTGTCTGTAGTATCTAGGGAGGGCTTGCGTTTCATGGTTAATTAAGAAAAACCGAGAACATCCAGCCATGAATCAACCAAGTAAGAAGGAGAGAGGGACTAAAGGCGGTCTTATGATGAGAATCACGAATGAACAGATTAGCCAACAGATCGAGATCAAGACCAGTGCATCGTTTATGGAATGCATCGAAATTCCTAAGCCCTACGTAAACCCGCAGTGCGTTTACACCGAGTATATGCCGGTTATCACCACTCGAGATATAGGTAGGGTGCAGGTAGAATTCGTGGATTCTCGTTTCCTTGGAGATGGGAGGATAATTGCAGTAGAGTTCCCAGCAAACAGAAAATGCTCATTCACTGTTTACGGATTTGATAGTTTCTTTGCAGATGATCCGTGCCCGATGGCAGTGAATGTGAATCCAAAGCTAACTGGTATTGGACTTGATTATCACGTCGGAACCCTTATCGGTTATCCTCAATTTATAATGGCAAAGAAGCCATTTCCTGCAGTTCCTCTTCTGGTTGAAGACAACATTACTAAGAACAAATTCGATGAAAAGGCCGGGGAGGATCGAACCATCTCCATTGACATCTCTCCTCCTACTGAGGTCAAGATTATTCGTCGTCCCGTGCTCTCTGAGTACTAACTGATGYTTTCCGTTGTACGGAAACAATATCCTATCTAGCGTGATCTGCAGTCATCAGAATCCGTCCTATCCTTAATTAAGAAAAACCGAGAACGAGAGTAACCATAACACACAAGAAGATGTCGCTCAAGTTTCTGTTTGTGATGTTGGACGTTGAAATAAAGACTGAAATGGCGGGGTCCTTGAAGCCCTCCCGTGTGGATGAGGCTTGCTTCACTGACCTGCTCAAAAAGGCCGAAATCCCAGAAAAAGAAGTTGGCATGATTACTAAGTTGCTAGTATGGTATCTGAACTCAGACGCAACTAGAGACAACTATCATATTGAGGAGACAAGCGGTCCGACGCTAGACTTCAACAGCGCCATTACCCATGAGTACAAGCTCCCATCTTATGTCTTAGTCAGGTACATAGGTCCGGATTTTCCGGAACAAGGAATCGAGAAGATATCGGGGAGGTCTGAGTACCTGCAAGGAGGAAACATCATAGGCAGTTGCAGCATCAAGATCAACAATCTAAAGATCAAAGAGGTGAGTAGGTCAGTTGCTGAGGCAATGTTTCGGAAGAATCAGAGTTACCTGATCCGTGAGACATTTGACTTGACCGCTCCTTCGACCTCTAAGAAGAAGACTTAATTTATGAGATTTTGGTCGAAGTAGTATTAAGCTAGTATCCGTACAATAAAATGCTCTCTATCTAGTATCGTTAAATAAGAAAAACCGAGACCAAAAGTATCAAAAGATTCCTATTCAAGATGTCTGGGTGCYGTCTTTTCCTTTGCTTTTTCATCATCTGGCTATTGTCAACGTCTATATTTGTAAAAATAACATTTGGTTTCTCGACGTTGTCTTGTAATGACCACCCGGGGGTCCCATCTGTAGTGAGCTGTCTGCAGACTTGTCACAACTTCTCCTACAACAAACCGATTGCAATTTCTATTTTGCCCCAAACGATTAAGCAGTCCCTAATACTAGTAAAATGTGAAAAGGTCACTATCTCGAAAGCATTCACTGAGACCTGGATATTGTCCCGAATAGAAGGAGAAAGGACAGAGAAAACAGAAGCAACCACCATTCAAGCATGTTTGAAAGAGTGGGAAACAAAATGTGACAAAAAGGAATGCCGCACCAAGGATCCTCAGATCTCAGAGCATTATTCTTGGGCAACTACTGAGGTTTCTTCTCTCGAGTTCATCAGAGTTTATGCTGAGAGAGTTGCAGTAATCGAGATAATTTCAGAAGACCCCAAAATCAATATAGAAGGGAGGTCAGTGTCTATACATGATCAAGGATATCAGACCCCGGGACACACGTATGCATGGGAAGTGACCCCGATCGACACAAAATGTCCTTGGGATGCTCCTTCTCACACCACGGTCTGTTATGATATAGGAGGGAGAATGGCCTGTCCATCACAGGGGATATCGATAAGTAAAGCAGTCGAGCTGAAGACTAACTGTAAATTCACTGTGTTCAGAGACAGAACAGGAATTGTCTTTTCGCCAGTTGGGGCTTTGAACCATGAGTATTACCCCGTTCCGGCTCTAACAATAGATACAGGCCTAAAGCAAACTATAGAAGGGGTGAGACTTGCTCTCAGTATAAGGGATATGCAGGATTGCAGATATAGGTGTATCTCGATGTCTAGTGGATATCTAAAGATAGATGATTATTACTACATCCGGAACAACAAAAGATGGTTGGAATGTTCTCTGCTTCCCAATTGTACAGTAGGATCAGAGTCCTTATCTTGCAATGATG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4,404
OR233192.1
Colocasia bobone disease-associated virus
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
Leibniz Institute DSMZ-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
Germany
2023-09-16
DSMZ PV-1165
Cytorhabdovirus colocasiae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
12,192
GenBank
null
Solomon Islands
Solomon Islands
Colocasia
null
null
null
null
Colocasia bobone disease-associated virus, complete genome
CACGACCAGTGATCGTATAATGATCTGTCTGGTCTACAGGCATAGGGTTCTAATACTCTAACCATTCTAATATTTGTATATCCCATCTACAGTAATATTCTAACGAGGAAAAACTTGAGACCCTAATTCTCTAAGAATTAATCGTCTTATGTTAGTTGCTGTTTCTTTCTCTCTGCAATGGCACAACACACTATCGATGCGAAGATCACGGCTCTCTTTGATGGAATTCCTGAGGATGTATGTTTGGGCCCGGTGACAGGAGTAAAGTTCACTAACGATGCATTTGATGCTCTGACTTGTTATAGGCTAGAGGCAGTCGCGGACGCTAAAGTGAGGTACATGGCTGAGAAAGCTATGTCAGAGATATTCCAATCCGCTGCTACATGCAAAGATTATCATCCTTATATGATATTGACTCTAGCATCCCAATTGTACACACCGGGAAAATCTGCGACGACTAAGATGGTGGTGGATTATTTCCCAACATCTCAGACTGGAATCCCGACTGCCACTTCAGATGAGTGGAAGCTCCCGACCAAAAATACATCCGACACTGACACTACTCAGATCGATGATGAGGCAGCGGTCTTTACAGGAAGAACAGCTAAGGCAGGAAATGCCACGGTGAAAGAAGTATGCTTTGCTAGTGCATTCTTATTAAGAGGATTGGTTAAGACTGTGACCAACATCACAAAAGCATTCGAGAAATTAGGAGGAAGGTTCGTATCACTGTACAATCTTCCTAAAGATGATACAGTGGTGTGTCCTCCGACAGCGTGGTTGACATCATATAAAGAGTTTTTGACCGCAGATCCAATGATTGCAAGAACATGGATCAAGATAGTGGCGGCAGCAGAGCAGGGATTGGATGCTGGATCGAATGATATGGGAGTACTACGGTTCTTAGCATGTCAGCCTTTGAGTTATTCTGGGATGCACGCAATGAAGCTGTACTTAACCATAAAGGACAAAACAAAATTGAGTCACAAATGGCTCTTAGAAAAGATGGTCATGCCCGCCACAACACCGGCTTTAACTGAGATCGCAAACCTCTTGAAGAATTTCGAGTCCACTGAATCGGCTAAAAAGCCTACTAAGTTCAGGTATGCACGTCTAGGCAGTCCGGTATACTTCCAAAAACTTCAGACCAAGAACTGCCTTGAACTGGTATTCCTGGAGGTTTGCATATTAAATCACTTCACTACCTTTGCTGAGGACTATCAGAATCCTACAAAAATAGTAGGGGTAGAGAGAATACCAGAGGCGATGAAGACAAAATTAAAAGCAGCTGCCAATGCTATAGTTTCGAGGGCACCAGTCTTGAACCCCAGCTTGTACTCTGATATTATGTCAGGAGTATTTCTGAGTAAGACTGAAGCCTCTACATCAGGGACAGCTGCTCAGACTAGCGGGACTAAACTGACTGAGCAGGCTATCTTTGGTTAACATACTGGTCAAATGTCTATTTGACAGAGGGACCGTCTATCTGCAGGTCCCCATGAGCGTGTGTGCTGTGTGATGTAGTTAATTAAGAAAAACTGAGACCGAAACTGTCCGAAATTGTCTCTGGCAAAATTTCCACCTTGAATTGTCTTCTTGCATGACCACAGAATTCATACGAATATGTCTGAGTCTGATCTTTTCGGTGATATCCATGAGAATATCCTTCCTGCTGACTTCGATCTGGACGATGATCAGATTGACTTTCCTACTGAAGCACGAGGAGCTGGATCAGGTTCGAGAGGAACTGGAATCGAGGTTGCGGGAGAAGTTGAGGGAGACAATGATTGTTATGTTGATACTGAAGACATGTATCCTGATGTTAATTCTGCTTTAAAGAGTCTGTCTACGAAGTTGAGTGATCATGGGATTAAATTGAGGAAGGAGTGGACCACTATGATATCTCGCAGATTCCACGTCTCAGGGCCATTATATCCGAGCCATCTTGATATGTTCGTCCTGGGGATTCAGGCCGAACGAAATGTAGGACTAAACTCAGACTTGAAAGAGACAGCAAAGAGGGTCCAGGAAGAAGCGAATCATATGTGTGGGGAGCGAAAAAAGATGAGTGATTCAGCTGAGAAGGTGATAAGTGACTTCACCAAAATTATGAGGGATATGCAACACCAAATCCTGGAGATGTCACAAGTGACTGAAAACATTAAGGCAGCATCCAGAGAAGCGTCTGAAATTGGTTCTATTTCGGATGCTCTGGAGTTAACCAAGCCCAAGACGGTTCAAGACCTACTTCGGGACTTGGGGTTTCAGGAGAGCAGTATAAATCACCCTCTTATGAGAGACCACATAGACAAAGTCGCCCCTGCTAGCTTCGTAGAGCGGTATTTCAAGAGTCGAGACCGCCAGGATAGAGAGAAGGTTAGGGAATACATTCTTGCTGGCGTTAAAGAACACAAGGAGGCTGCTGAGAGAGCCAAACTGTCGAAAGCAAAGTCGGTATTAGTTTGAATCAACCAGAGCATCTGGGGCTGCTTTCTTTATTGTCCTCTTGGTGAAGTACCTATTATGCTGGATACTCTAGATATATTATGGATCCTATTGCATTTTGTCATTTTGTGTTACTTTGCTTATTTATGCTTCTGTCTGTAGTGTCTAGGGAGGGCTTGCGCTTCATGGTTAAGTAAGAAAAACCGAGAACATCCAGCCATGAATCAACCAAGTAAGAAGGAGAGAGGGACTAAAGGGGGTCTTATGATGAGAATCACGAATGAACAGATCAGCCAACAGATCGAGATCAAGACCAGTGCATCGTTTATGGAATGCATCGAAATTCCTAAGCCTTACGTAAACCCGCAGTGCGTTTACACCGAGTATATGCCGGTTATCACCACTCGAGATATAGGTAGGGTGCAGGTAGAATTCGTGGATTCTCGTTTCCTTGGAGATGGGAGGATAATTGCAGTAGAGTTCCCAGCAAACAGAAAATGCTCATTCACTGTTTACGGATTTGATAGTTTCTTTGCAGATGATCCATGCCCAATGGCAGTGAATGTGAATCCAAAGCTAACTGGTATTGGACTTGATTATCATGTCGGAACCCTTATCGGTTACCCTCAATTTATAATGGCAAAGAAGCCATTCCCTGCAGTTCCTCTTCTGGTTGAAGACAACATTACTAAGAACAAATTCGATGAAAAGGCCGGGGAGGATCGAACCATCTCCATTGACATCTCTCCTCCTACCGGGGTCAAGATTATTCGTCGTCCCGTGCTCTCTGAGTACTAACTGATGCTTTCCGTTGTACGGAAACAGTATCCTATCTAGTGTGATCTACGGTCATCAGAATCCATCCTATCCTTAATTAAGAAAAACCGAGAACGAGAGTAACCATAACACACAAGAAGATGTCGCTCAAGTTTCTGTTTGTGATGTTGGACGTTGAAATAAAGACTGAAATGGCGGGGTCCTTGAAGCCCTCCCGTGTGGATGAGGCTTGCTTCACTGACCTGCTCAAAAAGGCCGAAATCCCAGAAAAAGAAGTTGGCATGATTACCAAGTTGCTAGTATGGTATCTGAACTCAGACGCAACTAGAGACAACTATCATATTGAGGAGACGAGCGGTCCGACGCTAGACTTCAACAGCGCCATTACCCATGAGTACAAGCTTCCATCTTATGTCTTAGTCAGGTACATAGGTCCTGATTTTCCGGAACAAGGAATCGAGAAGATATCGGGGAGATCTGAGTACCTGCAAGGAGGAAACATCATAGGCAGTTGTAGCATCAAGATCAACAATCTAAAGATCAAAGAGGTGAGTAGGTCAGTTGCTGAGGCAATGTTTCGGAAGAATCAGAGTTACCTGATACGTGAGACATTTGACTTGACCGCCCCATCTACCTCTAAGAAGAAGACTTAATTTATGAGATTTTGGTAGAAGTAGTATTAAGCTAGTACCCGTGCAATAAAATGCTCTCTATCTAGTATCGTTAAATAAGAAAAACCGAGACCAAAAGTATCAAAAGATTCCTATTCAAGATGTCTGGGTGCTGTCTTTTCCTCTGCTTTTTCATCATCTGGCTACTGTCAACGTCGATATTCGTAAAAATAACATTTGGTTTCTCGACGTTGTCTTGTAACGATTACCCGGGAGTCCCATCTGTAGTGAGCTGTCTGCAGACCTGTCACAATTTCACCTATAACAAACCGATTGCAATTTCTATTTTGCCCCAAACGATTAAGCAATCCCTAATATTGGTAAAATGTGAAAAGGTCACTATATCGAAAGCATTCACTGAGACTTGGACATTGTCCCGAATAGAAGGAGAAAGGACAGAGAAAACAGAAGCAACCACCATTCAAGCCTGTTTGAAAGAGTGGGAGACTAAGTGTGACAAAAAGGAATGCCGCACCAAGGATCCTCAGATCTCTGAGCATTACTCTTGGGCAACTACTGAGATTTCTTCTCTCGAGTTTATCAGAGTATATGCTGAGAGAGTTGCAGTGATCGAGATAATTTCGGAAGATCCCAAAATCAATATAGAAGGGAGGTCAGTGTCTATACATGATCAAGGATATCAGACCCCGGGACACACGTATGCATGGGAAGTGACCCCGATCGACACAAAATGTCCTTGGGATGCTCCTTCTCACACCACAGTCTGTTATGATATTGGGGGGAGAATGGCCTGTCCATCACAGGGGATATCGATAAGTAAAGCAGTCGAGCTGAAGACTAATTGTAAATTCACTGTGTTCAGAGATAGAACAGGAATTGTCTTTTCGCCAGTTGGAGCTTTGAACCATGAGTATTACCCCGTTCCGGCTCTAACAATAGATACAGGCCTAAAGCAAACTATAGAAGGGGTGAGACTTGCTCTCAGTATAAGGGATATGCAGGATTGCAGATATAGGTGTATATCGATGTCTAGTGGATATCTAAAGATCGATGATTATTACTACATCCGGAACAACAAAAGATGGTTGGAATGTTCTCTGCTTCCCAATTGTACAGTAGGATCAGAGTCCTTATCTTGCAATGATG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12,955
ON086740.1
Colocasia bobone disease-associated virus
Olmedo-Velarde,A., Loristo,J., Kong,A., Waisen,P., Wang,K.H., Hu,J., Melzer,M.
University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
USA
2022-08-10
PNG P
Cytorhabdovirus colocasiae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
12,205
GenBank
1
Papua New Guinea
Papua New Guinea
Colocasia esculenta
null
2019-05
null
null
Colocasia bobone disease-associated virus isolate PNG P, complete genome
CACGACCAGTGATCGTATAATGATCTGTCTGGTCTACAGGCATAGGGTTCTAATATGCTAACCATTCTGAAATTTGTGAATCCCGTCTATAGTAATATCCTAATAAAAAGAAAATTGAGACCCTAATTCTCTCAGAATTAAGCGTCTTATGATAGTGGCTGTTTCCTTCGTTTCAGAATGGCACAACATACCATTGATGCTAAGATCACAGCTCTTTTTGATGGAATTCCGGAGGATGTGTGTTTGGGCCCGGTAACAGGTGTCAAATTTACAAACGATGCGTTTGATGCTCTGACTTGTTATCGGCTGGAGGCTGGTGCTGATGCGAAGGTGAGATACATGGCGGAGAAGGCTATGTCGGAAATCTTTCAGTCTGCTGCAACTTGCAAGGACTATCATCCTTATATGATATTGACTCTTGCATCTCAATTGTATACGCCAGGAAAATCTGCAACGACCAAGATGCTTGTTGATTATTTTCCGGCATCTCAGACAGGGATTCCTACTGCCACGTCGGACGAGTGGAAACTCCCAACGAAAAATACATCGGATACGGATACCACTCAGATTGACGATGAAGCAGCGGTCTTCACAGGAAGAACAGCGAAGGCAGGAAATGCCACAGTCAAAGAAGTCTGCTTTGCTAGTGCATTTTTGCTAAGGGGGTTAGTCAAAACAGTGACGAATATCACGAAGGCATTCGAGAAATTAGGGGGAAGATTCGTGTCACTGTACAATCTCCCGAAGGATGACACGGTTGTATGTCCTCCGGTAGCGTGGTTGACTTCATACAAAGAATTTTTGACTGCAGATCCGATGATTGCAAGAACATGGATCAAAATAGTGGCAGCAGCAGAACAAGGATTGGATGCAGGATCGAATGACATGGGGGTGTTAAGATTTTTGGCATGTCAGCCTCTAAGCTACTCGGGGATGCACGCGATGAAGCTGTATTTGACGATCAAAGACAAGACGAAGTTGAGCCACAAGTGGCTCTTAGAGAAGATGGTTATGCCTGCTACGACACCTGCTTTAACTGAGATCGCCAACCTTTTAAAGAACTTTGAGTCGACTGAATCGGCCAAAAAGCCTACTAAATTCAGGTATGCACGTCTCGGCAGTCCTGTTTACTTCCAAAAGCTTCAAACCAAGAATTGTCTTGAACTGGTTTTTCTGGAGGTTTGTATATTGAACCACTTTACTACCTTTGCTGAGGACTACCAGAATCCTACAAAGATAGTAGGGGTAGAGAGAATCCCCGAGGCTATGAAGACTAAGCTAAAAGCAGCTGCAAATGCTATAGTTTCGAGAGCGCCCATCTTGAATCCCAGCCTGTACTCTGACATTATGTCAGGAGTGTTCCTCAACAAGACTGAAGCTTCGACATCAGGGACAGCCGCTCAGACCAGTGGGACCAAACTAACAGAGCAGGCAATCTTCGGATAATAGATTGGCTAGATGGTCTTCAGAGACCGGGACAATATATATATGAGTCCCTCTAAGTTTGTGTATTGTGTTGTGTGGTTAATTAAGAAAAACCGAGACCAGAACTGTCAAAAGTTGACTCTCGTAAAGCTTCCTACTTGCATTGCTTTAGCGCATGACCACAGAATTCATACGAATATGTCTGAGTCTGATCTTTTCGGTGATATCCATGAGAATATCCTTCCTGCTGACTTCGATCTGGACGATGATCAGATTGACTTTCCTACTGAAACACGAGGAGCTGGATCAGGTTCGAGAGGACCTGGAATTGAAGTTGCGGGAGAAGTTGAGGGAGACGATGGTTGTTATGTTGATACTGAAGACATGTATCCTGATCTTAATTCTGCTTTAAAGAGTCTTTCCACGAAATTGAGTGATCATGGGATCAAACTCAGAAAAGAATGGACCACTATGATATCCCGCAGGTTCCACGTATCTGGACCATTGTATCCGAGCCACCTTGATATGTTCGTCCTGGGGATACAAGCTGAGAGAAACGTGGGTTTAAATTCCGACTTGAAAGAAACTGCCAAAAGAGTTCAAGAAGAGGCGAATCACATGTGTGGGGAGCGGAAAAAGATGAGTGATTCTGCCGAAAAAGTAATAAGTGATTTCTCTAAAATTATGAGGGATATGCAACATCAGATCCAGGAGATGTCACAAGTTACTGAGAACATTAAGGCGGCATCTAGGGAGGCATCTGAGATTGGTTCTATCTCAGATGCTTTAGAGTTGACCAGGCCCAAAACTGTTCAAGACCTGCTTAGGGACCTAGGGTTCCAAGAGAGCAGTATAAATCACCCTATCATGAAGGACCATATAGATAAAGTAGCCCCGGCCAGCTTTGTGGAGCGGTATTTCAAGAGTCGAGATCGCCAAGACAAAGAAAAAGTTAGGGAATACATTCTCGCTGGTGTGAAAGAGCACAAAGAGGCTGCTGAGAGGGCCAAGCTATCAAAGGCCAAGTCGGTACTAGTCTGAGTCACCCTTAATACAACAGACTACTCTTATTATTATCCCCTTGTTAGCGTCCCTACTATGCTGGATACTCTAGATGTATGCTGGATCTTGTTACATCTTGTCATCTTATGTTGGTTTGCTTATGTTTGTTTCTTTTGGTAGTATTTAGAGGGTGTTTGCATTTCATGGTTAATTAAGAAAAACTGAGAACATCCAACCATGAATCAACCAAGTAAGAAAGAGAGAGGCGCTAAAGGGGGTCTTATGATGAGAATCACCAATGAGCAAATAAGTCAACAGATTGAGATCAAGACCAGTGCATCTTTTATGGAGTGCATCGAGATCCCAAAACCCTATGTGAACCCACAATGTGTCTATACCGAGTACATGCCAGTCATCACTACTCGCGACATAGGTAGAGTGCAGGTTGAATTCGTGGACTCACGTTTCCTCGGGGACGGCAGAATTATTGCTGTAGAATTCCCCGCAAACAGGAAATGCTCATTTACTGTCTACGGATTTGATAGTTTCTTTGCAGACGATCCGTGTCCTATGGCCGTAAATGTCAATCCCAAACTGACTGGTATTGGGCTCGATTACCATGTTGGTACTCTTATTGGTTATCCTCAATTTATAATGGCAAAGAAACCGTTTCCAGCAGTCCCTCTTCTTGTTGAGGACAATATAACCAAAAATAAGTTTGATGAAAAAGCAGGGGAGGACCGAACCATTTCAATTGATATCTCTCCTCCTACAGGGGTAAAGATTATCCGTCGTCCTGTACTCTCTGAGTACTAACTAGTATTTTCTATTTTAATCAAGCAATATCCCATCTAAGACCACCTACGGGGGGAGAAGTCTGTCCTTTTACTAATTAAGAAAAACCGAGAACAAGAGTAACCGAGACAAGCGAGAAGATGTCGCTCAAATTTTTGTTTGTGATGTTGGATGTTGAAATCAAGACAGAGATGGCTGGTTCATTGAAGCCCTCTCGGGTCGACGAGGCTTGCTTTAATGACCTGCTCAAAAAGGCTGACATCCCTGAAAAAGAAGTCGGCATGGTCACCAAGTTGTTGGTGTGGTATTTGAACTCTGATGCAACTAGAGATAATTATCATATCGAAGAGACTAGCGGTCCCACGTTGGACTTCAATAGTGCTATCACCCATGAGTATAAGCTCCCATCTTATGTCTTGGTCAGGTACATAGGCCCAGACTTTCCGGAGCAAGGAGTTGAGAAGATATCAGGGAGATCCGAGTATCTTCAAGGAGGAAACATCATAGGTAGCTGTAGCATCAAGATCAACAACTTAAAGATCAAGGAGGTTAACAGGTCTGTTGCTGAAGCGATGTTCAGGAAGAATCAGAGTTACCTCATCCGCGAGACTTTTGACTTGACCACCCCTCCGACCTCAAAGAAGAAGACCTGATCAGCAGAATATTAGCATAGAATAGTATGAAGCTAGTTCGTGGACAATAAAGAGCTCTCTATCTAGATTAGTTAAATAAGAAAAACTGAGACTAAAAGCATCATAAAGAGACTATTATTCACAATGTCTGGGTGCTGTCTATTTCTCTGCTTCTTCATCATCTGGTTGCTGTCCACTTCCATATTTGTAAAAATAACATTTGGATTTTCTACATTATCTTGCAATGATTATCCGGGGACTCCTTCTGTAGTGAGCTGTTTGCAGACTTGTCATAACTTTTCTTACAATAAGCCTCTAGCGATCTCCATCCTGCCCCAGACCATTAAGCAGTCCCTTATATTGGTGAAATGTGAGAAGGTCACGATATCAAAGGCATTCACTGAGACCTGGACGTTGTCCAGAATCGAAGGAGAAGGAGTTGAAAAAACTGAAGCAACCACTATTCAGGCTTGTCTAAAAGAGTGGGAAACAAAGTGTGACAAGAAAGAATGCCGAACTAAAGATCCTCAAATTTCGGAGCATTATTCCTGGGCAACTACTGAAGTATCCTCGCTAGAGTTCATCAGAGTTTATGCAGAGAGGGTAGCAGTAATTGAAGTAATTTCAGAAGACCCGAAGATAAATATCGAAGGAAGATCAGTATCTGTGAACGATCGGGGATACCGGACCCTCGGGCATACATATGCATGGGAGGTAAGTCCTATCGACACAAAGTGCCCATGGGATGCTCCTTCTCATACCACAGTCTGCTATGATTTAGGGGGAAGGATGGCTTGCCCATCACAAGGGATATCAATAAGCAAAGCTGTCGAGCTGAAGACTAACTGTAAATTCACTGTATTTCGAGACAAAACTGGAATTGTCTTCTCACCAGTTGGAGCCTTGAATCATGAATACTATCCAGTGCCGACATTAACGATAGATACAGGCCTGAAGCAGACTATAGAAGGGGTGAGACTTGCTCTCAGTATACGGGATATGCAGGATTGCAGGTATCGATGTATATCTATGTCTAGTGGATACCTGAAAATCGATGATTATTATTACATCCAGCAAAATAAGAAATGGTTAGAGTGTTCTTTGCTTCCCAACTGTACAGTGGGATCAGAATCACTGTCTTGCAAC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27,270
ON086741.1
Colocasia bobone disease-associated virus
Olmedo-Velarde,A., Loristo,J., Kong,A., Waisen,P., Wang,K.H., Hu,J., Melzer,M.
University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
USA
2022-08-10
PNG K
Cytorhabdovirus colocasiae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
12,205
GenBank
1
Papua New Guinea
Papua New Guinea
Colocasia esculenta
null
2019-05
null
null
Colocasia bobone disease-associated virus isolate PNG K, complete genome
CACGACCAGTGATCGTATAATGATCTGTCTGGTCTACAGGCATAGGGTTCTAATATGCTAACCATTCTAAAATTTGTGAATCCCGTCTATAGTAATATCCTAATAAAAAGAAAATTGAGACCCTAATTCTCTCAGAATTAAGCGTCTTATGATAGTGGCTGTTTCCTTCGTTTCAGAATGGCACAACATACCATTGATGCTAAGATCACAGCTCTTTTTGACGGAATTCCGGAGGATGTGTGTTTGGGCCCGGTAACAGGTGTCAAATTTACAAACGATGCGTTTGATGCTCTGACTTGTTATCGGCTGGAGGCTGGTGCTGATGCGAAGGTGAGATACATGGCGGAGAAGGCTATGTCGGAAATCTTTCAGTCTGCTGCAACTTGCAAGGACTATCATCCTTATATGATATTGACTCTTGCATCTCAATTGTATACGCCAGGAAAATCTGCAACGACCAAGATGCTTGTTGATTATTTTCCGGCATCTCAGACAGGGATTCCTACTGCCACGTCGGACGAATGGAAACTCCCAACGAAAAATACATCGGATACGGATACCACTCAGATTGACGATGAAGCGGCGGTCTTCACAGGAAGAACAGCGAAGGCAGGAAATGCCACAGTCAAAGAAGTCTGCTTTGCTAGTGCATTTTTGCTAAGGGGGTTGGTCAAAACAGTGACGAATATCACGAAGGCATTCGAGAAATTAGGGGGAAGATTCGTGTCACTGTACAATCTCCCGAAGGATGACACGGTGGTATGCCCTCCGGTAGCGTGGTTGACTTCATACAAAGAATTTTTGACTGCTGATCCGATGATTGCAAGAACATGGATCAAAATAGTGGCAGCAGCAGAACAAGGATTGGATGCAGGATCGAATGACATGGGGGTGTTAAGATTTTTGGCATGTCAGCCTCTAAGCTACTCGGGGATGCACGCGATGAAGCTGTATTTGACAATCAAAGACAAGACGAAGTTGAGCCACAAGTGGCTCTTAGAGAAGATGGTTATGCCTGCTACGACACCTGCTTTAACTGAGATCGCCAACCTTTTAAAGAACTTTGAGTCGACTGAATCGGCCAAAAAGCCTACTAAATTCAGGTATGCACGTCTCGGCAGTCCTGTTTACTTCCAAAAGCTTCAAACCAAGAATTGTCTTGAACTGGTTTTTCTGGAAGTTTGCATATTGAACCACTTTACTACCTTTGCTGAGGACTACCAGAATCCTACAAAAATAGTAGGGGTAGAGAGAATCCCCGAGGCTATGAAGACTAAGCTAAAAGCAGCTGCAAATGCTATAGTTTCGAGAGCGCCCATCTTGAATCCCAGCCTGTACTCTGACATTATGTCAGGAGTGTTCCTCAACAAGACTGAAGCTTCGACATCAGGGACAGCCGCTCAGACCAGTGGGACCAAACTAACAGAGCAGGCAATCTTCGGATAATGGATTGGCTAGATGGTCTTCAGAGACCGGGACAATATATATATGAGTCCCTCCAAGTTTGTGTATTGTGTTGTGTGGTTAATTAAGAAAAACCGAGACCAGAACTGTCAAAAGTTGTCTCTCGTAAAGCTTCCTACTTGCATTGTTTTAGCGCATGACCACAGAATTCATACGAATATGTCTGAGTCTGATCTTTTCGGTGATATCCATGAGAATATCCTTCCTGCTGACTTCGATCTGGACGATGATCAGATTGACTTTCCTACTGAAACACGAGGAGCTGGATCAGGTTCGAGAGGACCTGGAATTGAAGTTGCGGGAGAAGTTGAGGGAGACGATGGTTGTTATGTTGATACTGAAGACATGTATCCTGATCTTAATTCTGCTTTAAAGAGTCTTTCCACGAAATTGAGTGATCATGGGATCAAACTCAGAAAAGAATGGACCACTATGATATCCCGCAGGTTCCACGTATCTGGACCATTGTATCCGAGCCACCTTGATATGTTCGTCCTGGGGATACAAGCTGAGAGAAACGTGGGTTTAAATTCCGACTTGAAAGAAACTGCCAAAAGAGTTCAAGAAGAGGCGAATCACATGTGTGGGGAACGGAAAAAGATGAGTGATTCTGCCGAAAAAGTAATAAGTGATTTCTCTAAAATTATGAGAGATATGCAACATCAGATCCAGGAGATGTCACAAGTTACTGAGAACATTAAGGCGGCATCTAGGGAGGCATCTGAGATTGGTTCTATCTCAGATGCTTTAGAGTTGACCAGGCCCAAAACTGTTCAAGACCTGCTTAGGGACCTAGGGTTCCAAGAGAGCAGTATAAATCACCCTCTCATGAAGGACCATATAGATAAAGTAGCCCCGGCCAGCTTTGTGGAGCGGTATTTCAAGAGTCGAGATCGCCAAGACAAAGAAAAAGTTAGAGAATACATTCTCGCTGGTGTGAAAGAGCACAAAGAGGCTGCTGAGAGGGCCAAGCTATCAAAGGCCAAGTCGGTATTAGTCTGAGTCACCCTTAGCACAACAGACTACTCTTTTTATTATCCCCTTGTTAGCGTCCCTACTATGCTGGATACTCTAGATGTATGCTGGATCTTGTTACATCTTGTCATCTTATGTTGGTTTGCTTATGTTTGTTTCTTTTGGTAGTATTTAGAGGGTGTTTGCATTTCATGGTTAATTAAGAAAAACTGAGAACATCCAACCATGAATCAACCAAGTAAGAAAGAGAGAGGTGCTAAAGGGGGTCTTATGATGAGAATCACCAATGAGCAAATAAGTCAACAGATTGAGATCAAGACCAGTGCATCTTTTATGGAGTGCATCGAGATCCCAAAACCCTATGTGAACCCACAATGTGTCTATACCGAGTACATGCCAGTCATCACTACTCGCGACATAGGTAGAGTGCAGGTTGAATTCGTGGACTCACGTTTCCTCGGGGACGGTAGAATTATTGCTGTAGAATTCCCCGCAAACAGGAAATGCTCATTTACTGTCTACGGATTTGATAGTTTCTTTGCAGACGATCCGTGTCCTATGGCCGTAAATGTCAATCCCAAACTGACTGGTATTGGGCTCGATTACCATGTTGGAACTCTTATTGGTTATCCTCAATTTATAATGGCAAAGAAACCGTTTCCAGCAGTCCCTCTTCTTGTTGAGGACAATATAACCAAAAATAAGTTTGATGAGAAAGCAGGGGAGGACCGAACCATCTCAATTGATATCTCTCCTCCTACAGGGGTGAAGATTATCCGTCGTCCTGTACTCTCTGAGTACTAACTAGTGTTTTCTATTTTAATTCAGCAATATCCTATCTAAGACCACCTACGGGGGGAGAAGTCTGTCCTTTTACTAATTAAGAAAAACCGAGAACAAGAGTAACCGAGACAAGCGAGAAGATGTCGCTCAAATTTTTGTTTGTGATGTTGGATGTTGAAATCAAGACAGAGATGGCTGGTTCATTGAAGCCTTCTCGGGTCGACGAGGCTTGCTTTAATGACCTGCTCAAGAAGGCTGACATCCCTGAAAAAGAAGTCGGCATGGTCACCAAGTTGTTGGTGTGGTACTTGAACTCTGATGCAACTAGAGATAATTATCATATCGAAGAGACTAGCGGTCCAACGTTGGACTTCAATAGTGCTATCACCCATGAGTATAAGCTCCCATCTTATGTCTTGGTCAGGTACATAGGCCCAGACTTTCCGGAGCAAGGAGTTGAGAAGATATCAGGGAGATCCGAGTATCTTCAAGGAGGAAACATCATAGGTAGCTGTAGCATCAAGATCAACAACTTAAAGATCAAGGAGGTTAGTAGGTCTGTTGCTGAAGCGATGTTCAGGAAGAATCAGAGTTACCTCATCCGCGAGACTTTTGACTTGACCACCCCTCCGACCTCGAAGAAGAAGACCTGATCAGCAGAACATTAGCATAGAATAGTATGCAGCTAGTTCGCGGACAATAAAGAGCTCTCTATCTAGATTAGTTAAATAAGAAAAACTGAGACTAAAAGCATCATAAAGAGACTATTATTCACAATGTCTGGGTGCTGTCTTTTTCTCTGCTTCTTCATCATCTGGTTGCTGTCCACTTCCATATTTGTAAAAATAACATTTGGGTTTTCTACATTATCTTGCAATGATTATCCGGGGACTCCTTCTGTAGTGAGCTGTTTGCAGACTTGTCATAACTTTTCTTACAATAAGCCTCTAGCGATCTCCATCCTGCCCCAGACCATTAAGCAGTCCCTTATATTGGTGAAATGTGAGAAGGTCACGATATCAAAGGCATTCACTGAGACCTGGACGTTGTCCAGAATCGAAGGGGAAGGAGTTGAAAAAACTGAAGCAACCACTATTCAGGCTTGTCTAAAAGAGTGGGAAACAAAGTGTGACAAAAAAGAATGCCGAACTAAAGATCCTCAAATTTCGGAGCATTATTCCTGGGCAACTACTGAAGTATCCTCGCTAGAGTTCATCAGAGTTTATGCAGAGAGGGTAGCAGTAATTGAAGTAATTTCAGAAGACCCGAAGATAAATATCGAAGGAAGATCAGTATCTGTGAATGATCGGGGATACCAGACCCTCGGGCATACATATGCATGGGAGGTAAGTCCTATCGACACAAAGTGCCCATGGGATGCTCCTTCTCATACCACAGTCTGCTATGATTTAGGGGGAAGGATGGCTTGCCCATCACAAGGGATATCAATAAGCAAAGCTGTCGAACTGAAGACTAACTGTAAATTCACTGTATTTCGAGACAAAACTGGAATTGTCTTCTCACCAGTTGGAGCCTTGAATCATGAATACTATCCAGTGCCGACATTAACGATAGATACAGGCCTGAAGCAGACTATAGAAGGGGTGAGACTTGCTCTCAGTATACGGGATATGCAAGATTGTAGGTATCGATGTATATCTATGTCTAGTGGATACCTGAAAATCGATGATTATTATTACATCCAGCAAAATAAGAAATGGTTAGAGTGTTCTTTGCTTCCTAACTGTACAGTGGGATCAGAATCACTGTCTTGCAAT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27,271
KT381973.1
Colocasia bobone disease-associated virus
Higgins,C.M., Bejerman,N., Li,M., James,A.P., Dietzgen,R.G., Pearson,M.N., Revill,P.A., Harding,R.M.
Auckland University of Technology, School of Applied Sciences
New Zealand
2015-12-29
null
Cytorhabdovirus colocasiae
Cytorhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
12,193
GenBank
1
Solomon Islands
Solomon Islands
Colocasia esculenta
plant leaf
null
null
null
Colocasia bobone disease-associated virus strain SI, complete genome
CACGACCAGTGATCGTATAATGATCTGTCTGGTCTACAGGCATAGGGTTCTAATACTCTAACCATTCTAATATCTGTATATCCCATCTACAGTAATATTCTAACAAGGAAAAACTTGAGACCCTAATTCTCTAAGAATTAATCGTCTTATGTTAGTTGCTGTTTCTTTCTCTTTGCAATGGCACAACACACTATTGATGCGAAGATCACAGCTCTCTTTGATGGAATTCCTGAGGATGTATGTTTGGGCCCAGTGACAGGAGTAAAGTTCACAAACGATGCATTTGATGCTCTGACTTGTTACAGGCTAGAAGCAGTCGCGGACGCTAAAGTGAGGTACATGGCTGAGAAAGCTATGTCAGAGATATTCCAATCCGCTGCTACATGCAAAGATTATCATCCTTATATGATATTGACTCTAGCATCCCAATTGTATACACCGGGAAAATCCGCGACAACTAAGATGGTGGTTGATTATTTYCCAACATCTCAGACGGGAATCCCGACTGCCACTTCAGATGAGTGGAAGCTCCCGACCAAAAATACATCGGACACTGACACCACTCAGATCGATGATGAGGCAGCGGTTTTTACAGGGAGAACAGCTAAGGCAGGAAATGCCACGGTGAAAGAAGTATGCTTTGCTAGTGCATTCTTATTAAGAGGATTGGTTAAGACTGTGACCAACATAACAAAAGCGTTCGAGAAATTAGGAGGAAGGTTCGTATCATTGTACAATCTTCCTAAAGATGATACATTTGTGTGTCCTCCGGCAGCATGGTTGACATCATATAAAGAGTTTTTGACTGCAGATCCTATGATTGCAAGAACATGGATCAAGATAGTGGCGGCAGCAGAGCAGGGGTTGGATGCTGGATCGAATGATATGGGAGTGCTACGGTTCTTGGCATGTCAGCCTTTGAGTTATTCAGGGATGCACGCGATGAAGCTATATTTAACCATAAAGGACAAAACAAAATTGAGTCACAAATGGCTCTTGGAAAAGATGGTCATGCCCGCCACAACACCGGCTTTAACTGAGATCGCAAACCTCTTGAAGAATTTTGAGTCCACTGAATCGGCTAAAAAGCCTACTAAGTTCAGGTATGCACGTCTTGGCAGTCCGGTATACTTCCAAAAACTTCAGACCAAGAACTGCCTTGAACTGGTATTCCTGGAGGTTTGCATATTAAATCACTTCACTACCTTTGCTGAGGATTATCAGAATCCTACAAAAATAGTAGGGGTAGAGAGAATACCAGAGGCGATGAAGACCAAATTAAAAGCAGCTGCCAATGCTATAGTTTCGAGGGCACCAGTCTTGAACCCCAGCTTGTACTCTGATATTATGTCAGGAGTATTTTTGAGTAAGACTGAAGCCTCTACATCAGGGACAGCTGCTCAGACTAGCGGGACTAAATTGACTGAGCAGGCTATCTTTGGTTAACATACTGGTCAGATGTCTATTTGACAGAGGGACCGTCTATCTGCAGGTCCCCATGGGCGTGTGTACTGTGTGATGTGGTTAATTAAGAAAAACTGAGACCGAAACTGTCCGAAATTGTCTCTGGCAAAATTTCCACCTTGAATTGTCTTCTTGCATGACCACAGAATTCATACGAATATGTCTGAGTCTGATCTTTTCGGTGATATCCATGAGAATATCCTTCCTGCTGACTTCGATCTGGACGATGATCAGATTGACTTTCCTACTGAAGCACGAGGAGTTGGATCAGGTTCGAGAGGAACTGGAATCGAGGTTGCGGGAGAAGTTGAGGGAGACAATGATTGTTATGTTGATACTGAAGACATGTATTCTGATGTTAATTCTGCTTTAAAGAGCCTGTCTACAAAGTTGAGTGATCATGGGATTAAATTGAGAAAGGAGTGGACCACTATGATATCTCGCAGATTCCACGTCTCAGGGCCATTATATCCAAGTCATCTTGATATGTTCGTCCTGGGTATTCAGGCCGAACGAAATGTAGGACTAAACTCGGACTTGAAGGAGACAGCAAAAAGGGTCCAGGAAGAAGCGAATCATATGTGTGGGGAGCGAAAAAAGATGAGTGATTCAGCTGAGAAGGTGATAAGTGACTTCACCAAAATTATAAGGGATATGCAACATCAGATCCTGGAGATGTCACAAGTAACCGAAAACATTAAGGCAGCATCCAGAGAAGCGTCTGAGATTGGTTCTATTTCGGATGCTCTGGAGTTAACAAAGCCCAAGACGGTTCAAGACCTACTTCGGGACCTGGGGTTTCAGGAGAGCAGCATAAATCACCCTCTTATGAGAGACTATATAGACAAAGTCGCCCCTGCTAGCTTCGTAGAGCGGTATTTCAAGAGTCGAGACCGCCAGGATAGAGAAAAGGTTAGAGAATATATTCTTGCTGGCGTTAAAGAACACAAGGAAGCTGCTGAGAGAGCCAAACTGTCAAAAGCAAAATCGGTATTAGTTTGAATCAACTAGAGCCTCTGGGGCTGCTTTCTTTATTGTCCTCTTGGTGAAGGCCTTATTATGCTGGATACTCTAGATATATTATGGATCCTATTGCATTTTGTCATTTTGTGCTATTTTGCTTATTTATGTTTCTGTCTGTAGTATCTAGGGAGGGCTTGCGTTTCATGGTTAATTAAGAAAAACCGAGAACATCCAGCCATGAATCAACCAAGTAAGAAGGAGAGAGGGACTAAAGGCGGTCTTATGATGAGAATCACGAATGAACAGATTAGCCAACAGATCGAGATCAAGACCAGTGCATCGTTTATGGAATGCATCGAAATTCCTAAGCCCTACGTAAACCCGCAGTGCGTTTACACCGAGTATATGCCGGTTATCACCACTCGAGATATAGGTAGGGTGCAGGTAGAATTCGTGGATTCTCGTTTCCTTGGAGATGGGAGGATAATTGCAGTAGAGTTCCCAGCAAACAGAAAATGCTCATTCACTGTTTACGGATTTGATAGTTTCTTTGCAGATGATCCGTGCCCGATGGCAGTGAATGTGAATCCAAAGCTAACTGGTATTGGACTTGATTATCACGTCGGAACCCTTATCGGTTATCCTCAATTTATAATGGCAAAGAAGCCATTTCCTGCAGTTCCTCTTCTGGTTGAAGACAACATTACTAAGAACAAATTCGATGAAAAGGCCGGGGAGGATCGAACCATCTCCATTGACATCTCTCCTCCTACTGAGGTCAAGATTATTCGTCGTCCCGTGCTCTCTGAGTACTAACTGATGYTTTCCGTTGTACGGAAACAATATCCTATCTAGCGTGATCTGCAGTCATCAGAATCCGTCCTATCCTTAATTAAGAAAAACCGAGAACGAGAGTAACCATAACACACAAGAAGATGTCGCTCAAGTTTCTGTTTGTGATGTTGGACGTTGAAATAAAGACTGAAATGGCGGGGTCCTTGAAGCCCTCCCGTGTGGATGAGGCTTGCTTCACTGACCTGCTCAAAAAGGCCGAAATCCCAGAAAAAGAAGTTGGCATGATTACTAAGTTGCTAGTATGGTATCTGAACTCAGACGCAACTAGAGACAACTATCATATTGAGGAGACAAGCGGTCCGACGCTAGACTTCAACAGCGCCATTACCCATGAGTACAAGCTCCCATCTTATGTCTTAGTCAGGTACATAGGTCCGGATTTTCCGGAACAAGGAATCGAGAAGATATCGGGGAGGTCTGAGTACCTGCAAGGAGGAAACATCATAGGCAGTTGCAGCATCAAGATCAACAATCTAAAGATCAAAGAGGTGAGTAGGTCAGTTGCTGAGGCAATGTTTCGGAAGAATCAGAGTTACCTGATCCGTGAGACATTTGACTTGACCGCTCCTTCGACCTCTAAGAAGAAGACTTAATTTATGAGATTTTGGTCGAAGTAGTATTAAGCTAGTATCCGTACAATAAAATGCTCTCTATCTAGTATCGTTAAATAAGAAAAACCGAGACCAAAAGTATCAAAAGATTCCTATTCAAGATGTCTGGGTGCYGTCTTTTCCTTTGCTTTTTCATCATCTGGCTATTGTCAACGTCTATATTTGTAAAAATAACATTTGGTTTCTCGACGTTGTCTTGTAATGACCACCCGGGGGTCCCATCTGTAGTGAGCTGTCTGCAGACTTGTCACAACTTCTCCTACAACAAACCGATTGCAATTTCTATTTTGCCCCAAACGATTAAGCAGTCCCTAATACTAGTAAAATGTGAAAAGGTCACTATCTCGAAAGCATTCACTGAGACCTGGATATTGTCCCGAATAGAAGGAGAAAGGACAGAGAAAACAGAAGCAACCACCATTCAAGCATGTTTGAAAGAGTGGGAAACAAAATGTGACAAAAAGGAATGCCGCACCAAGGATCCTCAGATCTCAGAGCATTATTCTTGGGCAACTACTGAGGTTTCTTCTCTCGAGTTCATCAGAGTTTATGCTGAGAGAGTTGCAGTAATCGAGATAATTTCAGAAGACCCCAAAATCAATATAGAAGGGAGGTCAGTGTCTATACATGATCAAGGATATCAGACCCCGGGACACACGTATGCATGGGAAGTGACCCCGATCGACACAAAATGTCCTTGGGATGCTCCTTCTCACACCACGGTCTGTTATGATATAGGAGGGAGAATGGCCTGTCCATCACAGGGGATATCGATAAGTAAAGCAGTCGAGCTGAAGACTAACTGTAAATTCACTGTGTTCAGAGACAGAACAGGAATTGTCTTTTCGCCAGTTGGGGCTTTGAACCATGAGTATTACCCCGTTCCGGCTCTAACAATAGATACAGGCCTAAAGCAAACTATAGAAGGGGTGAGACTTGCTCTCAGTATAAGGGATATGCAGGATTGCAGATATAGGTGTATCTCGATGTCTAGTGGATATCTAAAGATAGATGATTATTACTACATCCGGAACAACAAAAGATGGTTGGAATGTTCTCTGCTTCCCAATTGTACAGTAGGATCAGAGTCCTTATCTTGCAATGATG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84,409
NC_020072.1
Colombian datura virus
Glover,R.H., Adams,I.P., Thwaites,R., Hany,U.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2013-01-04
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Colombian datura virus
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Potyviridae
ssRNA(+)
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RefSeq
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Nicotiana tabacum
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Colombian datura virus, complete genome
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7,063
LC771070.1
Colombian datura virus
Chen,Y.K., Yang,Y.S., Chen,Y.
Plant Pathology; 145 Shin-Dar Road, Taichung 402
Taiwan
2023-12-16
Si-Tou
Colombian datura virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,621
GenBank
null
Taiwan
Taiwan
Brugmansia suaveolens
plant leaf
2022-12-04
null
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Colombian datura virus Si-Tou RNA, complete genome
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10,215
OR082761.1
Colombian datura virus
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
Leibniz Institute Dsmz-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
Germany
2023-06-27
DSMZ PV-0373
Colombian datura virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,641
GenBank
null
Germany: Surroundings of Braunschweig
Germany
Brugmansia
null
null
null
null
Colombian datura virus isolate DSMZ PV-0373, complete genome
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14,894
OQ847405.1
Colombian datura virus
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
Leibniz Institute Dsmz-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
Germany
2023-06-21
DSMZ PV-0602
Colombian datura virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,641
GenBank
null
Germany: Calberlah
Germany
Solanum lycopersicum
null
null
null
null
Colombian datura virus isolate DSMZ PV-0602, complete genome
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15,068
OL999301.1
Colombian datura virus
Byun,H.-S., Kwak,H.-R., Choi,H.-S.
National Institute of Agricultural Sciences, Crop Protection
null
2022-11-19
TA-Br2
Colombian datura virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,608
GenBank
null
South Korea: Taean-gun
South Korea
Brugmansia suaveolens
plant leaf
2020-11-27
SAMN24200569
PRJNA790478
Colombian datura virus isolate TA-Br2, complete genome
AAGCATTCAAGCATTCAAGCATTTCAAGTTTCAAACAGAAAAAGCAAAAATACTTACTGGTTTTATTTGATTTCCGTGTTAATTTTCTACATTCTCATCACAATTTGCTAAGTTACAATGACAACAATCATGACTACACACGCACAAGGATCAGTGATGATGGGCAATCTGCCATCATCTTATTTCAATGGGAACGTACTGAGAGGCGTAACAGGTGCCTCATTCTTAATTGGATCTATGGAGATCCAATCACCAGTGGAACTTATTCCACCAAAGGTTGTGGCACAACAACCGATCAAGCCATACGTGCCACCAACTCGTCCGTTCACAGAGGACGACGCATACAATCCATTTGAATTGTATGTACCAGTCACTGCTCAAATGGAGCGTCAGGTGCAATTGCACCATTTTGGCTCACACAAAAGAGCCAAAAAGTTGGTTGTGCGCAAAAAGCGCACAAAGAAAGTATGGCAAATGAAGTTCGATAAGGACTTCATTGTCAGAAAGATTGAAGTGTCAATCGCTGGTGGACCATCACCATCGATGATGCCAGAAATCAAACGCTGCGCAACTGCTACATCTAAGCGCAGTAAGCTTAACCGGTCTAAACCGGCATTCGTCCACGCTTCAGTGGATAAGTTGATTGATGAACTACTTGTAGAACTACAAACGAGGAAGTTCACAATGGAGCTGATTGGAAGCAGGAAGAGAACCTGCAAACTTAATCTGAAGCGGTTTCATTCACAAGACCGCATCTTTGTGCAAACAAAGCACGAAGCTGGCAGAGTAGCATCACATGTTGATGTTAACTTGGATAGCTGGTGTGAACAAGTTGTGCTGAAGTGCACCAATAAGTTCAACAAGATGCTCAGAGTGAATGGAGGTCTGACATATGGATCGAGCGGCCTATGTATTCTATCAAGGAACATGTGTGCGCCGTCTTTTAGACCACAGCGTCAAGTTTTTATAGTTCGTGGTGAAAACCATAATCTACTATGTGATGCACGTGATTATTTGTGTGATGATCTTCGTTACACAACAAAGCATTTTTCAGATGAGCAAATTTCAAAGGAGTTCTTCCTGTCATTTTGTAAAACATACAAAGCGGGAAGACCTGAAATTGATCACTCTTGTGAAAGAGGAATTTCGGTTTCTTTATGTGGTGAAGTCGCGGGTTTAGTGACACAGTTACTATTTCCAAGTGGCAAAATTACATGCACAAAGTGTTTTGCTGAAAGCACATTGAAACCGTCTGTCACGGAAGATGAATTTGCTCTTAATGTTGATGTTTGTTGTAAACAAATAAGTTCATCATATCCGCAGTTCACACATGTCTTGAGTTTTCTGAAAGAACTGAGGAAACCAAAGCCTCAAGTAAACCCCAACATTGATACGTTTGCAGAGATCAAACTACTTGTTGGAGGACGGAACAAGGCACCCTTCACTCATGTTCTTAAAATGAATGATCTATTATTGAAGGGATCTCTAATGAGTGCAGAGGAGTATGGTGTAATGACAAGTCATTTGCTTGAAGTCGCACGATACTTGAACAACAGGACTGAGAACATGATGCTTGGCAGTTTAGCAAGTTTTAGAAATAAGATATCTGCTAAAGCGCACATAAATTTAACTTTAATGTGCGACAATCAATTGGACAGAAATGGCAACTTTGTTTGGGGTGCTCGTGGGTATCATGCGAAGAGGTTCTTTACAAACTTCTTTGATGAAGTTAAGCCAGATGAAGGATATGACCAGCATGTCGTTCGGAAGAGTCCGAATACAAGCAGAAAGCTAGCAATTGGCAATCTGATTATGTCAACAAACTTTGAGTCTCTTCGGAATCAACTTGTCGGGGAGAAGATAACAGCATGTCCCTTAACTGAAAATTGCATAAGCAAACGTGATGATAATTTCTTATACTCATGTTGCTGTGTAACTTTAGATGATGGCAAACCATTGCTATCTGATTTGAAGACTCCAACCAAGAAACATCTTGTGGTTGGCAATTCTGATGATGCAAAATTTATAGATCTTCCTAAGGAAGTTAGTGAAGGGATGTACATTGTGAAGGAAGGATATTGCTATCTTAATATTTTTCTAGCTATGCTAGTGAATGTTAATGAAAATGATGCAAAGGACTTCACGAAGTTTGTGAGAGACACTCTTGTGCCAAAACTTGGAAAGTGGCCAAAAATGATAGATGTGGCAACTGCTTGTTACATGCTCAAAGTGCTGTATCCTGATGTTCATAATGCTGAATTACCACGCATTCTAGTGGATCATGAGCACAAAACCATGCATGTTTTAGATTCCTACGGATCTTTAACAACAGGATACCATGTTCTGAAGGCAAATACTGTGACACAATTGTGTGAGTTTGCTAGTTATTCATTGAACTCATCAATGAAGGAGTATTTAGTCGGAGGCAAAATACCATTGGAACAACATTGTGACACAACCTTGAGGTTATTGATCAAGAGTATTTATAGACCAAAATTGTTTAGAGAACTCTTGATCGATGAGCCATATCTGTTAGCATTGTGTGTCTGTTCACCCACTATTATAGTTGCTATGTATAATAATGGTTCTTTTGAACAAGCACTTTCTTTGTGGCTTGGGAAGGATATGGAGCTTTGCAATATGGTTGCAATTCTAACAACATTAGCTCAGAAAGTTTCAGTTGCTGAATTGGTCACAGAGCAAAATGTTGCAATCAGTCAATATGCTGAGCAGATGCTTGACAGTGTTTTCCATGGTACTAAACCATCACACTCATATGGTCTTGCTCTGCACTACTTGACATTGAAAGCAGGCCAGCATGAAGTTGATGCGTCACTTCGAGCAACAGGATATGACACAATATCTGATGCAGCTCAAGCACGCATGGAAAAAAACTATGCAGACTTGTTAAGGATGGAGTGGGACGCTTTAACCTCATTGGAAAAGTGGTATTCAATCAGATCTTCATTGAAATGGTTAAAGTTTGGGCGAAAACAGTTAAATCTGAGAAAATCCACAGACTTCGGGGCTGTTTACACATTCTCACTAAAGCAATTACTCGCCGAGAAGTTACAGTTTCCCAAGGTCGTCTCCAAAACCACAAATGGTGCAAAAGAATGCGTGTACAGACTAGCTAGGTTCACCAACAAGAAATGGTGGTCAGCTGTTAGTTATTGTATACCTGATGTGTACAAATTTATAACGGTTTTGAGTGCAATTCTGATGCTAACCGCAGTCATGCGAGAAGTTCATGCATACATTGTGCAAATGAGGAATTGGAAAGCAATAGAGGCACAAAACAAGGCAGATGCGTGCGAGGATGAAATTGGTAGAATCATCGATGCATTCGAGTTCAGTAATGGTCGTTTACCGACTATTTCTGAAATCAGAAGCAAGGTGAACCCATCTGATACACAGCTAATCAAGTATATTGACCATTATTATCAGTTTGAGGAAACTACTTTGCAGAAGGGTAGGCAGGAATTCGCCTACATGGAGCGCACAATAGCAGTCATAACTCTGCTTGTAATGGCTTTTGATGCTGAGAGGAGTGATTGTGTTTACAAAATCCTCAGCAAATTTAAAGGATTAGTGGTTTCTGTTGATAAGGAAACTACTCGTTTGGAGAGTTCTCTTGATGACATTTGTGACATCGCAGAGAATAAGCAAATGACAGTGGATTTTGAACTTAATACTGATGATCATGTCATTGAAGATTTGAGGGGTATTTCATTTAGAGCTTGGTGGGATAATCAGATCAACAGATCAAACACTCGTCCACACTACCGCACTGAAGGAAAGTTCATTGAGTTTACTCGAAGCACTGCAAGCTCAGTGGCTTCAGAGATTTCACATTCAGAAACCAAGGATTGGTTAGTGAGAGGTGCAGTTGGTTCTGGTAAATCAACTGGTTTACCATACAATTTGTGCAAAAGAGGCAAAGTCTTAATGCTGGAGCCAACAAGACCTTTGGCAAATAATGTGTTTCAGCAATTGAAGGCACAGCCATTCATGGCTAGTCCAACATTGAGGATAAGAGGCAAATCGTCATTTGGTTCATCACCAATCACTATTATGACAACAGGTTTTGCTTTGCATTATTATGCACATAATTTGGCACAATTACAAGATTTTGACTATGTCATTTTTGATGAGTGCCATGTGAATGATGCATCTGGAATGGCTTTCAGAAATTTGCTTTTTGAACATGAATTTAATGGAAGAGTTTTGAAGGTGTCAGCCACACCGCCAGGCAGAGAAGTTGAATTCTCAACACAATATCCAGTGGAAATCAAGATTGAAGATAACCTATCTTTCCAGGAATTTGTGTCAGCACAAGGTACACAGTCAAATGCTGATGTTATCCGACATGGAAACAACATATTAGTGTATGTTGCTAGTTACAATGAAGTTGATTCACTTAGCAAATTACTTGTTGCGAAGAACTTCATGGTAACCAAAGCTGATGGCCGGACAATGAAGGAAAGTGGCCTAGAAATTCAAACAAAAGGCACTGACAGCAAGAAACACTTTGTCGTTGCAACTAACATCATTGAAAATGGTGTTACATTAGACATAGATGTTGTCGTTGACTTTGGCATGAAAGTTACACCAGTGCTAGATTTTGATAACCGAGCTATTTGCTACCATAAGGTTGAAATTAGCTATGGTGAAAGAATCCAAAGACTTGGAAGAGTTGGGAGACATAAACCTGGTGTAGCTTTAAGAATTGGCCACACAGTGAAAGGACTGATTGATATTCCTGAGATGATTGCTACAGAGGCAGCATTCCTGTGCTTTATGTATAATTTACCTGTGACTACACAAAATGTGTCAACATCTATCTTGGAGAAGTGCACACTTCCACAAGCTAAGACAATGGCACAGTTTGAGCTACCATATTTCTATACGTACAATTTGGTACGTCATGATGGGAGCATGCATCCAGCAATATACGACATCTTGAAGAAGTACAAGCTGAGGGATTCCAACACATTTTT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22,141
MW075268.1
Colombian datura virus
Kwak,H.R., Byun,H.S., Hong,S.B., Lee,J.Y., Baek,E., Han,J., Kim,H.R., Choi,H.S., Kim,M., Kwak,H.-R., Hong,S.-B., Back,E., Byun,H.-S., Lee,K.-H., Choi,H.-S.
National Institute of Agricultural Sciences, Crop Protection
Korea
2021-05-31
AT-Kr
Colombian datura virus
Potyvirus
Potyviridae
ssRNA(+)
9,620
GenBank
1
South Korea
South Korea
Brugmansia suaveolens
null
2019
null
null
Colombian datura virus isolate AT-Kr, complete genome
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41,729
JQ801448.1
Colombian datura virus
Glover,R.H., Adams,I.P., Thwaites,R., Hany,U.
Food and Environment Research Agency, Plant Protection Programme
United Kingdom
2012-12-31
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Colombian datura virus
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Potyviridae
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9,621
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Nicotiana tabacum
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Colombian datura virus, complete genome
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95,462
EF067319.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
14,184
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S10, complete sequence
ACTACAGTCTTGACAATAATAATTAATAACCATAAACCATCCCAAAAAATTGTACTAATACACTATCATCAACCTAATAAATAGTCATAAATTTTACTATTATAAATAATGCATCTAGACAATACAACTTTAAATCTTAACAATATTAGGACGGGAACACTATTCACTAATAATAATAGCTGACATTTGTACTACACGTTTTTCTAACGCTCTAAAAACTAAAATTATTGAGCGCATTAAAGATAGAATGCAATAAGTTAGTATGATTGAAGATCTTTGAAAGTGATTGATTAAATGAACAAATTAATAAATAAATGGCAAGATTCTTAGCTTCAATAATTGAGAACATAAGATAACTTGACTAACATTCAACCATTACACCATATCTGAACCGAATCTCTTGCATCTTACTGTGTAAGATACTGAGGATAGGTTCTAGATCAGTATTCCAACCACGTTGGAGTCCATGCTCTATAACAAAATTTAACAGCACCGAACACGCATGATCATCTAAATCTGGCCGTATACTAGAGCCAACATTATTAGCAGCCTGCGCTTTCTCACTCATTGATAAACAAATACTCAGTGCATTTCTGCTGAAGACTTGTGGTAATAATCGTTGAGCTAATGATTTGCAATCTTTCGATACTTGCTGACAGTATAGGAGGTCTCCTTTGCTGACGTAAACACCACTCTGAGGCATAAGTTCTACGAGTCCTGGCAGATTTGTTTGATACTTCAACGTCCATCTTGTATCATAAGCATCATATTCCGGTGGTAGAACGAACCGGTATAACTTGTTGTGTTTCTTTTCCGGCGTTTTGTCAGCACCATCATTAGTATGTTGATCTTGATTACTAGAACTAGCACTCGCCGTTACTTTAGTGTGTCTTGCTTCAGGAGACCGTGGACTTTCTGGTCTTAACTTGCTCGAAGGAGATGCGATGGTAGCAGCGTTTCCTGCTGTGTTAAATTGTTCGACGGCACCCAATAACTTTTTGTATGTCTCAGCAGTATCGAGGATCGAACTCCGTAAGGTGTTGTACATGTCAGTCGTATGACGCAAAGTAGAGCCCATTTGCATAAAGAGAGATGCAAAGTTGTCCAACATTTGCTGCTCTAAAACAACTTTTCGATTCATCTGGTGGCTTTTTGCCGTAGAGTTTTGGGCTACGGTTGGTTTATCTGCAGAACCACAATTAGAATCATTTGTAGTATTGTGAACGTTGTTCGTTGTCTTAACAGGTGATTCGTCTGTAGACATCTCGTGATCTGAAATTTCTTCTTGATCCGTAACAGAATCGGAATCTGAAGTTACTGCATGATATGGTGACAGACTTTCATCTATCATGCACTCGTCCGGTTGACACGCATCGCCAATTACGTTTTGATGAGTTCTATCAACAAGTACACTTCCATTTGGACTTGCTTCACGTTGCTGATTATTTTGGAGGTAGGTGTCGTGAGTAGTTGAAAGTGCTTGTCGTACTGAATTTAGAACCTTCGTAAGAATAGGTGACAGCGTTTTTTTCGTGACTCTTTGAAGAGGTGTTGGCTGATTGTTTTTTGGCTTCATAGTGATACCAATACGTATTTTCGGTTTCTGTAGTTGCCTTTGTGAGTCTCGCTGAGTTGGTTGCAGCTGCTTCTGCTGTAGACGTTTAAATATCTGATCTCGTACACCATCTCGAATTTGATTCTGAGTTACTACTGGTAGTTGTTGTACTGAGCTCGTTGATGATGGTATGGTTCGGTCCATCAAATTCGATAAATTCTGTGAGGTAGTGGCGACAGTTCTTTCAATTTTCATGGGCTGTATACTCTTCTCAACCGTTCTTTGAGTCGGTACTAAACATCGTGCTCCACTTATTTTACAGTATAGATTAGCCGACATTTTTAGTGAATTTAGTAATTGATGTGATTGAGGATTGTTATTTGAGAAATCATCAGTGAGGGTTTCTTGATTATCTCTAAACGTTTCTTTCGGTGGAGCCACAGTAATTCTGGATTCTTGGACGTCATCAACAACTGCATTGGACGAATGAGCAGCTTCCTCTAGTTTCAACCGTTTTGCATCGAGTTCTGCCTTTAATTCTGATTGTGCTGGTCGCTTGATTGATATTCTAGGAAGAGGTTTCCGAAAATTATCATTGGATTTGGACATATGGTTCTGTTTAGCGCTGCGCAATTTCTTGTTTACCGGAAGCTTTGGTTGTATTTCTGAAAATAAAAATTCTCATTAATATTTTGAAAACTCGAAGTTTAAAATAAGTAGTATTTACAAATGATTTTACAATGAAAATGCAATTGTGAACACTGACAAAATAATTTGATTCTCACCTGTTACTTCGGATTCTTTTTCAACCAAAGGTCCATAATCATTTCTCGTAGCGATCCAAAATTCTGCATCATTGTAAGAATCTGAAAAAAATATATCAATGTTATTTCCTTTTAATCTATAATATATTCTGAATGTGAAAATACTTCAATGATCCAACGCACGATCTATTAACTAATACGTTTGTTTGAACTCACCAGATCCACGTTTGACAGCGGCCATATAAAATCCCCACGCGTCATTGTATCTCTCTTTCCTCTTGGCACGATCTCTTGTATCAAAAGGATCTTCGTCTTTAGGGTACGCAACGACGGCCCTCTGTTCCGTCACTTGATGCATTATCAGCCACGTGTACGGCACGCATACGTAATCATCAATACCTTCAAAAGGCAATTCTATGAATTGAACAACATAGAATGCTCGCTCATTATCACTTTTACGCGTCATCTGAAACAATAAAAAACAATTCCGTAAATATCAAGTAATTTAATATCTTCAAAACAACATCAGTCACGTGTCAGTATAACGTTGTTGGTCACCTTAGTGGGCCTCATCTATTAATAATCGTGACTCACACTCTACTGCCACGTGGAATTCCCCCTTAACATTTTACCGTCGCATTAATATTCTATTTCAAAGAACTAAAAATAAAACTTACCGTTGTGATACTTCTTGGTATTCTATGTATGAGTTCCAGATATTTCCATCAGAATTTTGCCTTCTTGTAAGTTGATGAGTCACTTTCTTCCACTTTTTTTTTGCACTTACTGATCAAGCAGATAAGATGTTTCACGTTCGAAGTCAACTTGTGAATGGAGTCTGCGCAGGTGCGCATGCCGTATTTGACGGAGTTTGGTACCCTAAAAATTCAAGAGTGGGGGAAACCTACAGGGCGTGACAACAACACGTTTTTGTAATAATAACCCAACGGCCATTATCACTAATTGATCCAAAAAGTACTTTTGGTATTTCTGCACGTGGGCGCTGAATTACAGTATAAGTGTAAACAACTCACGGCACTGTCTTCAAATTCCTCTAGTCGATGCAAAAGTAATGTTCACTCGATCGCTTTTGGAATCGAGCCAAACTCTTGATACTTTATTGATTTGCTAAAAGTTAAAATGTAGATTACATTTCATTGAGTTTAGCCTAAACAAAAAGATTTTATTCAACGTATCTTAAGCATTCAGATTCAATAAGAAATCGACTAATTGTTGTGATTGCTATTGAGACTATACTGTGTCAAACAATGTGTAACTGGCTGAAGCACATAAATCTATGACAAATTACATCGAAAAACATGCCATAACGCAGAAAAATGGAGTTCCGCTCGAAAAATCATCGCTGAACTATTACTGACGATAGGATTGATGACGATAAGCGGTTGGGTTAACTTTGAAAATTCTGACTTGAAAATAGGTCTTTTAAATGATTGACAAATATCTTCTAGTTGGAAGTTTAACCAAAATTCTATCATCTTTAATGAACGAGATGACTATTGCAATATTCATCTAGATTTTAATCTTACATCAGATATGTCCCTCAAGAAAGTCAAAAAAACTTTTTTTTTATTTTTCAATACTCTTGAGGCTTAAAAATAATAAGAGTTTTAATCAATTTTTTACTTATATTTTATTTAATCTATAATCACATTACATAACTTTTTGACTCGAAAAATTCTATTCAGTACATTGGCAGTGTACTAAAAAATCACACGTCTTATAGAGTTTATTAAACTTATTATAAAACTAATCTATGTAATACTTAAAATTATTTATTAGCTAACAGAGATTTGATCTGATGAGACTTGTATTGTGTTTTCCTGTGTTTCATACGAGTTTCCTTTTTGCACAATAGTTGGTCCAAATGTGAGTTTGCCGCCTGATGAGACGGGGTATATAGTGTTCCCGTGTTGAATATTAACTGATCCAAAAATGTTATGAGCTTTGACCACGTAATTATAAGACGGTTTATTTCTTCTTTCGATCTCTTCGAGCTTTGATCCGTAGTGGGTTGGAATCTTTAATTCTTTCTCCAACCATAAGTAACCTTTCTCCATGAACCACCAATTATACCCGATTGGAATTTGTGACCGGACTTCGGCTATACTCTCGACAATACCATCGAGAAGTTTAGGATTTGATACTTCGCGGACAAAATCGTCGAAAAATGAAGGTCTTGCAAATGCAAGTCCACGTGTGCTGCTACCTGGAGTCCCTGTTAAACAAATAGTCATGATTACAACAGCGTACTTTTGCCCAACAGATAACTAAAATCGTAGCGGTTCAATAAAAAATTCATTTTAAAGAAGTTTATATAAATTATGCAGATGATAACTTACATATTGTGCCAATGGTAGCGACGAAAAAGAATACCAAGGCTTTGCTGTATACCATGTTTGCTCGATGATCGAATCCAACTGTGTCGGAAATTGTCTGTTGTTCCTTATATACGAATGGTAACTTGAGGGCTCAACTATGATTCATTTCTATCAGTAGATAGCTGATGAAAAAGGTTAACGACATGATTCACCCCAAAAAAATCGAAGCACCGGGTTAAAGGTTACATCAGGACTGATAAAGTGTGTAGTATCGAAAATGACGAATTTACCATAATTTTTAAGAGAATTTATTCATGCGCAGCTCTAGAGATTACACAAGCG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107,667
EF067320.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
6,349
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
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null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S14, complete sequence
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107,668
EF067321.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
7,482
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S16, complete sequence
TCTAACAGAACAAAACGGAAAGAAGATATACACCAGCCAATACTGAACCGTAATTGCTGGCAAAAATAGTTCAAGTCCGAACAAAGAACTGAAACGTCTTATGACGACGTAACAGTTTCGCTTCTAAGAATTTTAATCAGCTCATTCTTAAAATAGCTAGGCTATCCTGATTGGAAGCGTAATTTGACTAGTACTCTGCGTGGACAACGCTCATTCGTCGTTTTGATCCAACTACGCCGAATAATGAAGATAAGAGCTAATGGGATTACAAATCAGGCAACTGAGGCCAACATCACACCAACGAACGCCATACTGATCTGCCATTTTGCTCTGAGACTTCGAAGTGTACAAACGAGTCTTTCATTGTGAAATTTTGGCGATGATAATTTTATTCAAGCCAGATTATGACTGGAATTTAAGTTTATAGTATTTCTGTGCCTTTTTCAAGTTATTGGTTTAATGTGTTAAGACGTCTAATGTAGGTAAACAGACGTCTTGGCATGATTCTGCCGATTGAGGCATAATTACACTATTTTTTGGGTGTTAAAATAATAAACATGTGGTAAAATTATAAGTTTATTTTATTGTATCAAAAATATTTATAATGAGTATCCGGTGAACTTAAAAATAATGCAGATCATAAGTTTCTTTGATCACAGCACATTGTTGAAGTCCGAACCTCATTATGGACATTCGATGTAGTATTTAATCTAGAATATACTCAATACCAATTTTGACGTGAGTATGAATCTTGCCATCCTCCTGTGACGTGTTTGTATAAACCGTCGTTCCAACTGTTACGAGGATCTCTGGAGTAATGGGTTTCAAATGTGTAGGGGCTCTGAAAACAAAAATTTTTATTCGGAGTTACTTTGAGAGTGAGCTAATAAAAGAGCTGTTGCTGTAGATCAGTCAATACCTTGGAAGTATGAAATTTAATTTGGAAAATTATAAAAGTCAAACCATAATGTGACAAAACACTGTACAGCTGAAAGATTACATAGTGACATTGGTGTTGTTAGAAGTATTTTACAGGTTCTTTATAGATTTATCAAATGTCCTTTCACTTACCCAATCCTGACCATACGGCTTTGCATTGACTACAACCACAATCAGCATGCAGAATAGAAGAGTTAACATCAGTAGAGTACTCGTCATCTTGTATGGAATATCTGTTGATCAAAAACATTTTCTTATTTGAGGCGCACAGGCGTTTTGAGGACGTTCTATTTGAAAATTTTCCAAACCGTCCAATTTAGCGTAGAATACCCAAAATTTCAATATTGTTTCGTTACTGACTTGGATTTTTATTTACACTAACTCATACTAAAAGAGGAAGAAATAAGGGTGAAGCTAGATTGGAGCTCACATGAAAATTTCAATTTTTCTTGAAAATAAAGAGTTATCCAAAAGTATGACAAGTTAATCTATTTGTTAAGTTAGACAAAAGCTCAGACACAATTTTTTGAAAATTACTGAAAATCTTAAAAATCTTAAAATAAAAACAGAGTAAAAAATACTTACGTATCCAACTGGGATCAAACAGGAGCACGGTAAAGTCAGAGCAAAGACTGAATATTGGTCTAGATCGGCGATCCTTATATACTGACCAGCCGAGCTCTAGAATTCGTTATCAAGGTTCAAAATTGTTCAGGGTAACGACCTGAAAGGCTTATGTTGGGACACATTTTTATAGGCGCACTCAACAATTTACGCTGGTCCTAGCTCTAACCGTGGGAGCATACAATATTAAAGTACCATAGGCACGTCCTTGAGATTTTCTAGGAAATATTTTTATTAACTCAAATTGATAAATGACGTCGCAAAGTAGATCAAAGTGATAAATTGCTACATCCACTTGCTAATAATAAAACACATGGCTGATAAAATTTGCGTTGCTGGGTTATCAGTTTAATTGACATGTTGTCGACCACCCCAGTTTACAAAACGAGCTGAGATCCAGAGTTCAAGGATATTATCGCAGCAATACATGCCGAAAAACTTTGTTAATGGTTAATGGTTAATTTTTAAAAGTTAATGGAAGATTAATCTTTAAGAATTAGCAAGCTTCTTGTATTTAATCTTATTAATTAAGAGCTGATAAATAACTCAGAAACATGCAGTGCAGTACAAAATAGTATTTTGGATTTGTTGAGATGAGAAATAATCTATCTCTAGAAGTCCTAATTGTCACTAGTCACCACATCCTACATTGACAAATCGATATCATACTTTCTTTTTCATTGATAAAGTCACACATATTCAGTTCTTAACCGACTATGATTATGATTTTGAATCACGATCAAATTGCGGCTCAGGAACGAACTAAGTATGAATACTGCAGTAATAAGTTTAATATTTTACAGCTTATTGAATATTGAACAAAAATACTGAACAAAATCTAGTCAATAAGCCTTTAAGTCGTCATAATTATACTTGACGTCGTCGTTCACCAGGAACCTCATTCAAACAATTATCAGCTCGGATCCATTAATCATAGTCAAGCAATCAGGGAACTGACCTCGTTGCCTATAAGTTATGACGTTGTGGCAAACTATTAATAGCGTAACGAGATAGTGGGACTTCCGTCTCTATGACCAATATTTTATTCCGTCATTTAATAATCTATGAGTGTTATTCAAGGTTCATTCAAACAGCCTTCAATACGTTGAAGCAGTGATAAGAGTATCTTTTATTTCTCTGATTAAAAAGTTTATTTTAGATTGATTTGAAATAATTTAAAAGCATCTGATTTTAATAACGATTAACATAAAGGTAATCATTTCAAATCATCTTTCTGAATTAGGGTTTCTAATATTGGGTGACACGATAAATGTTTCCAATTTTAAACACTGGTTTTGTGCTGTTCGGTTAGAAAAACCTAAAAGAACCTGGCATACAAATTTTACGACGTAGCAGAGGAAACAGAACAACCAAAAGATTTTAGCATTTAAAATAAAATACAGTATTAAATTTTGGTATATTTAATAGTATACAATTTTAATATAATTCATTTTTCTAAAACTAGAGTTTTAATTCTAAATTTCTCATCTATGACGTCGTAGCGGCGCCACTAACTTATCTAGAACTAGGTACAAGGGTTCTAAGAGAAAATTTTTGAATCGTCTAGATGACTCTGAATTTTGCTTATAAAGTATACTTAACTATTAAGTGTGTTTAAGAGCCAATTACATTTTAAAATTTTTAAACTATACGACAAGTATCACAAGGACAATGAAAACACTATTTTACATATGCTGATTTATGGAAAATCAGAATGTTAATCCTAATTTTTTCAATTATGTCGTTGTTGCTGCGTCGCTGATTATTTTAATTAATTAGAAACAATTTCAAAGGTTACAATAGTATATTACAACCCTGGGGAAGGAAAATAAGAAAAGCCTCAGATCACATGTAATAGGGCTGTATACTATTTTTTCGTCCGACGAAGGCGGAAAGCGGTAACTTTGTTTAGCGCAGCGGGAAGGCAAAAAAAATTTTGAATGGTCTAAATTACTTTGAATTTTGCTTATAAAGTTTATTTAACTACTAAGTGTACTTGTGGGCCAATTACATTACAACATGTTTTAACGGTACGACAAGTATGACAAGAACAACGAAAAGACTATTTTATATATGTTAATCATATTCTGATTTATTTGAAGCTAGAATTTTAATTCTAATTTTTTCAATAATGTCGTTGTTGCTGCGTCGCTGATTATTCTAATTAATTAAAACTAACTACAAAGGTTACGAAAGAGAATTTTTAAATGGTCTATATGACTCTGAATTTTGTGTATAAAGTATACTTAACTACTAATTATGTTTAAACGTTAATTACATATATTTTTAAGTGACACGACAAGTATAACAGAGATAACAATAACACTAACTTATATATAACTAACAATAAAACTTAATCTAATAGATGTCAACCAATTAAGCAAGCTAACACTTCTTTCAAGGAACTTCATACCGTGCTTCTCAGATTTTATTATCAACTTCTACATCAGACACTTCACATTGAGCACCATACACTTGTAGCAGCCACATCATAATCCGATCCTTCAGTTCATAAGCGATACGCCACGGAGTTTTCTGATCGAAGTTGCAGACGTCGAGCGCCGTGCCTGGTTGCTGGCAAATCCAATTTGCCAGTCTGTAGTTCTTGGTGAGCGCTGCGATGTGCAGAGGAGTGTCACCAAGACACTTGTCTTGGCTATTGATGTCAGCACCCCATCGAATTAGAAACTCGAACTTCCTTTGGGCTTCAGGAGTGACTCGATTAGCTACGATATGCACACATTGCTGTCCACAGGAATTATACTGCTGCAGCAAGTAACTGTTGACTTTTTTGACGAGCATTTGCATTGTTTGTAAGCTGTCGTCACTTTCGTCGCAACAAAGACAGTGGAAAATGTTTTCACCTTTCTTGTCGGAGTTATCGAAAAGCACGAAATTGCCGGACCAATCCATTGTATAGCGACGATGATGCGACGTAGCAGATGAAGCTTACTGACGCGAACCAACTGTATTAATGATCGTGCAAAATATTGGGGACTAATTAGGTTCGTCGCATACAGTATCTTTAATTGGTAGAATCAAAATCCAGGTCAGCGCTTATCAACTTAGTTATTGGTCATTAAGAAGCGATATCAGTTATGATGGTAGTCAATTATAAACGGCTCTTACTTTTATCAGCTAAACCTTCACGAACTGTCATTAGAGATTTTATTACATGTAAGATTGCCTTCAGCAAATTTGAACTTGCATCTTAATATTTTGTAATTAGGCAGTTGATGATTCAGATTCTTCTGTAGTGATTGCGTTGATGGGGTTCAAAAGTTTGATTCTGTATCAGAATCTAAAGTCAGATTTTCAATTACATGCCAATCGAAGTACTTCAGGTGATAGACATTAAGGGCTAAACATAAGGCGCCAGCGTGAACAAGAATCATCTGCGCAATAAAATTTAATTGGCTTAACTATTGTTGGAACTC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107,669
EF067322.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
12,172
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S21, complete sequence
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107,670
EF067323.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
18,065
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S22, complete sequence
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107,671
EF067324.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
13,909
GenBank
1
South Korea
South Korea
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null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S27, complete sequence
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107,672
EF067325.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
11,724
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S35, complete sequence
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107,673
EF067326.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
18,893
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
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null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S36, complete sequence
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107,674
EF067327.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
14,945
GenBank
1
South Korea
South Korea
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null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S37, complete sequence
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107,675
EF067328.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
14,096
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
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null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S38, complete sequence
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107,676
EF067329.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
17,528
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S41, complete sequence
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107,677
EF067330.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
15,432
GenBank
1
South Korea
South Korea
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Cotesia plutellae polydnavirus segment S48, complete sequence
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107,678
EF067331.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
13,251
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
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null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S50, complete sequence
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107,679
EF067332.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kwon,S.-J., Park,B.-S.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2006-11-22
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
17,543
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
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null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment S51, complete sequence
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107,680
DQ075354.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kang,J.N., Choi,H.K.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2005-07-12
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
13,848
GenBank
1
South Korea
South Korea
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Cotesia plutellae polydnavirus segment CpBV-S2, complete sequence
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108,874
DQ075355.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kang,J.N., Choi,H.K.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2005-07-12
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
11,017
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
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Cotesia plutellae polydnavirus segment CpBV-S3, complete sequence
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108,875
DQ075356.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kang,J.N., Choi,H.K.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2005-07-12
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
14,943
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment CpBV-S4, complete sequence
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108,876
DQ075357.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kang,J.N., Choi,H.K.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2005-07-12
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
14,572
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment CpBV-S5, complete sequence
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108,877
DQ075358.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kang,J.N., Choi,H.K.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2005-07-12
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
10,763
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment CpBV-S8, complete sequence
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108,878
DQ075359.1
Cotesia plutellae polydnavirus
Choi,J.Y., Kwon,S.J., Roh,J.Y., Yang,T.J., Yoon,S.H., Kim,H., Li,M.S., Park,B.S., Woo,S.D., Jin,B.R., Kim,Y., Je,Y.H., Kang,J.N., Choi,H.K.
Seoul National University, School of Agricultural Biotechnology
South Korea
2005-07-12
null
Cotesia plutellae polydnavirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
10,741
GenBank
1
South Korea
South Korea
null
null
null
null
null
Cotesia plutellae polydnavirus segment CpBV-S9, complete sequence
TTACAAAGCTTCCGCAATAATGTTCTCAAGTTTGATAGTTGCTAACGTAGATGTTCCACCTAGGGGTCTTGCTGCGGGTAGTTATAACAGGTAACAATTGCCAATTTTGTGCAAACTTTCCACAAAAATTTGACTCTGTCATATCACAGTAAACTATACATCTTTCACTCTGTACCTTTTCAAGCCATGTGCAAACTTTTTGCGTACAACAATAGGCAAATCATAGACATTTCTTAAGTTGGTTCCTTGTAACACAATCTCGCGCAAGACACATACGTAGATGTAGACGTTAGTAACTATAAGTTCTGCACAAGCTTTTGCTAAAGCACATGTTTCTTGGAGTACAAGCAAACTGAACTACTTAAAACTTTAATTATAGAACCTAGTCACTGTAAAAAGTCTTACATCATAATCACAACTGAAGCCTTTGAGTCTTGCACTCTGGTTGGTAGTCCTCATCATAAGAATTGGTTTCCGATTGCAGGGGAACCCTGCATTGTACACCGTTCTGCTTCAAGATGCCCATCATCTTATCATCCCTGGCGAAGAAGGCGATGTGGTACGGCGTCATTAAGTCGTTGTTCATAGCTTCTCTGTTGACGTTAGGCTGTTGACACAGCCATTCTACCAAGGTGTAGTTTTCAGCCCTCACTGCTATATGCAAGGGTGTATCCCCTCCTTTGAACTCCTTTCCATTGACGTCTGCGCCCCAGAGTATCAGGAATTTCACCTTTTCGACGGCGTATTCTAGCTGAGATGCAACAATGTGTACACTGTTGGCATTTAGCATTGCATTTCATCAAAGTGCAGCGATTCTCTTTTTACCCTTCTGTTTACGCAAGGTTTATAATAAGATAAGACGTCGCTTGAGTCGTTTCGTCAGTTAGAGTTTATCTCTTGCCCCCGAATTTTTATAATGCCACAGCTGTGTTGGCGTGATGCCTACCAATTGATAGAGTAATTTATGAGTCGTTATGAAAGTTAATCTACTAGTTGAATGTTTTCAACGACGTATCAAAGCAAGTGTAGGCATCTTAAGATCCGACGAAAGATATAAACTCATAGGATATATTGCAGTAATGGAATTAGTACAAACGAGCTAAGTAATAGCCCGGGGAAATTGGTGAATTCCGGTAAGCTCAATGATAAACAAAAGTTCATGTTCAGTTACATTCGACTTTCACACAGTGCAAGACGTGTTGATCTAGGTCGTAAATCATGGAAGAAAATGGAGCTGCTAACGGCGAACATTTTGTTGAGCCGACTGACTACGAAGGCAACGTTTTTCAGTACATCTGTCGAGTAGGCGAGGTCAGAGAGCTTTTAGAGGCTCTAGAATCCATGCGGTGGACTGACGTCCTGCATCAGTATGACTTCTGTGGAAGACAGGTCACTCACGCCGTAGCTGAGGACGACCAAGCTAACGCCAAGTCGAAAATCGAGTTACTCTGGATCATGGGTGCTGATATCAATGCTAAGGAGCTTGTTATGGGAAACACCTTGCTGCATATTGCGGTGGTCACTAGGAATCATCTTCTGGCTGAGTGGATTTGCCAAACACCTGGTGCAGACCTAGGAGCTGTTAACTATTTGCAGGATACTGCCTATCAAGTTGCCTACAGAATTGCAGACCTTGGAATGATGGAAACCCTAAGGATTAACGGTGCTGTGTGTGTTGATCCTTCCGACGAGTCTGACACGTCGAGTGAAAGTCTTGCGTTGACTCCGAGGTAACTTATCACGATATTCGGCGAAATGTAAACAAGTAACGTAGCAATGTCCACTAATAAGGAAAAGGTGATGCAATTCTAACAAGGAATAGTTGTAATAACAAATAACTAACAATGAGATTTAGAATCTTTGTTTTTTCTTGTAATTTATTTAGAATAGTTATTTATGATATTGTTGAAAATTTAAGCCATTAATCTTGTTTCAATATTCAAATATTTACAGTTCAAACACGTGAAAACTGTTTTGTAATACTTTACAGCTTTTTTAATCACATGTTTGTTTTTTAATAATATAATGTAGGGTTTGTATTAATATATTAATAGAAATATTGAGAATAATGTAAAATAGCTTTTTCATAATTTATTATAATTTGATATTTATCATAAAGTAGGTGAAAAAAATCACTTGTAAAATGTGAAAATGCCACAATTGTAACATTTACATAAACATATCATAAGCAATACGATTTAATTAAAATATTTAATTATTTACAATATTATTGACTCAAGTGTATTTCATTCAGAAACCAAATATTTATTTAATTGAATGAAATTGAAGAAAAGTTTTTCTACTTACAATTACATTACAAATGCGGCTGTGTTATGTTACAATTATATAGTTCAAGTGATAACTTGTGACCTTGGTAAGAATCTGTTATCACGCGTCGACACATATTTAACGTGTGATCAAATAATAACGAATCATTTGTGTTGTAACAGTCAAGCTACGTGCAAGCGAAATGAATAAGTCAAATATAGTATTTACCGGAATGATGAATGAAGAAGGTGACAACTTGGTGCACTTCTTTTGCCACAGCGGTACCGTCAATGAATTGTTTTTGTTGAATGATTTTATCAACGACACGAACCGGTACACTTTGTTGGAATACAATTGGAAAAGACAACAGTGTGTACACATTGCTGCGTCTCAGCAAGAAGACGCCGTCGAAAAGATGAAACTCCTGATACTCTGGGGCGCAGACGTCAATGGAAAGGAGTTGAAGGGAGGGGATACACCCTTGCATATAGCAGTGAGGGCTGAAAACTACACCTTGGTAGAATGGCTGTGTCAACAGCCTAACGTCAACAGAGAAGCTATGAACAACGACTTAATGACGCCGTACCACATCGCCTTCTTCGCCAGGGATGATAAGATGATGGGCATCTTGAAGCAGAACGGTGTACAATGCAGGGTTCCCCTGCAATCGGAAACCAATTCTTATGATGAGGACTACCAACCAGAGTGCAAGACTCAAAGGCTTCAGTTGTGATTGTGATGTAAGACTTTTTACAGTGACTAGGTTCTATAATTAAAGTTTTAAGTAGTTCAGTTTGCTTGTACCCCAAGAAACATATGCTTTAGCAAAAGCTTGTGCAGAACTTATAGTTACTAGCGTCTACATCTACGTGTGTGTCTTGCGCGAGATTGTGTTACAAGGAACCAACTCAAGAAATGTCTATGACTTGCCTATTGTTGTACGCAAGAAGTTTGCACATGGCTTGAGAAGGTACAGAGTGAAAGATGTATAGTTTACTGTGATATGACAGAGTCAAATTCTTGTGGAAGGTTTGCAGAAAATTGGCAATTATTACCTGTTATAATTATTCGCAGTAAGACTCCTAGGTACGACAAGCCTTGTAAAAGATTGGTATATAGAGAATAACTGCTCATCATCGGTTGTGAAAAAGTATCTTAACCTTTCAAGTGATTGTTTCTCGTCACAATTCTTAATCTAATTAGTTTTTGGTTAGCGTCCTAAATAGTTAGAATACTTTTATAGCTTAATAGGTAAGAAACTCTGTTATCTTTCCGGTGATCACAAAAAATGTTCAAGTTCTACATAGTTACTGCAGCAAGTTAACAGATAGTTAAGTAAGAACGTTACCGCGTGACTCACTCATGTGCTACGTCAGAAAGACTTGTGCTTATACGTATTGCGGTGGAACTACATCGTCGCATTAGTGCATAGTTTATAGAAATATTAGAGTAAATATTATAATATATCGACGTCGGGCTTATATTTTATTTTCAGTCTGAGTAAATTTAGTCATTATTTACGTTACATAAATTAAAACTAATTGACTGTATCACTGTCGTAAAAATGATTTTTGGCAAGGATATAAAGCAATCAACATGTAAACATTGTATGACACCATTCGTTATGACGCGGAGATGTGTATTACATATGCGCAGAAATACGAGAGTGTTTATCAAGGCCACCGGTCATCAGCCTTTTTTCGTACTGGCCAAAGAGTATAATAAAACAAAAAAGTCCTTTTTTTTTTGTTCTTTGTAAATATCTTTGGGCCGAAAAACTTGGCCCGATTCTAAAAGACCTAATCGATGAAGTTCCGCTGATAAAACAGGTTCTTGAGACATTTAACCGCAGAACGGATTACCATACGATGGTTTTTAGCGCATCTAAGTTGTCTTTATGAAGACTAAAAGGATTCGAACAAAATGTACGCAGAATTACACGGCTTAAGTGTCGTAAAATTAGCATAGGTGTGTGTTACATTATTATCGATCTCATTGAGTTTCTCTGAGAAACTACATCTACCTTGTAGCTAAGACTTTGTTATTTTCACACGTTTTTACCATGCAATATTGTTAAGGGAAGAATAATGCAATTGAAACTTTTGTAATGCTTGAATATAGCTTCCAGATGTATTCTTTTTCTTCAGCTGTTAAGGAACCTTACTTATATGTATTGTACATGCATTTGTGGTACATTTTTATTCGTTATTAGGAAAGCTATAAGAATACCGTATCTGCACAACGTCAAATCATCTTTGAATCTATAAGTAGGCAACATTTATGCACGATTGGAATTCACTGTATGCCGGCCGCAAAAACAACCATATTTCAAGTCAGTGGCTCCTTTATAGCTACTATGCCATCTAGACTTCACCTTCGTCGAGGACGAACGATACGTAGTATACTAGGGTCGTTGATTCCTCTGTGGGGGATATAAACACTGGATGTACTCTGGTGATTCATTCTATCTAAATTCACCACGCTGTACAGACTGCGAAATTTTCAGGGCAATAATGCCTGACATTCCGGTCATAATACCAAGTGTGTGGAATTACTATCCATGCTTCTTGGTCGGGCGGTTAGTTCACGCTCACCTGGTCGAGCATTGGGACCAATATCATAGCCTGACTGGTGTCACGATCACCCTGGAAAATGTCACGGCGGTCTCGGAGTATTACGTCCTCGACATTATTTGGTTCCGAATTGTGGGAGACGTTAATGATAATCCGTTT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TTTTATAAATGAATCTCGTTAGCAGTTTAATAGTCGTCACATCTACTAGTAGTAGACGTCACAATAACATCCAATCAGTCATTCGGGAATCGCTGAGCAAAACGCTCTTCGTTGGGCATTTAAGTCACACCTCAATCTGCTTGTTTGCATTTTAGTAAGCAAAAAAAAAAGTAAGACGTAATTCAGGCCATCGCCCCGATGATGTATAGCTCGGCTACAAAACAAATGGACCTTCGACACTGTCAATGGCGTTAGGCCAATGAACGTATGATATCACTCGATGCCAGCGTGCTTTGTTGAATGTATAAATATGCGCAACGTTATATTACAGTATAAAAACAACCGCGATAGTTTTGTCGAAATTGGTTGACTAAGGTCAGTTCAAGGTTGTCCATATTGATGACTCGTTCGCCGTACGGATAGAACATTCGTAGGCAAAACTAGAGTGTCCATTTTTTTTATATAAATAAACTTGTATCAATGAAGTGATGATAGATATGCACTTTGAGACGTATAGCATTGTGACGTAGAACATTGTGACGTATAGCATTGTAATCTTGACATTATTGGATGTTTCAAAGGTAACGAGATAAGAGTTGCATAATAGACTTGTTGCATTCTATGGAATGTTTACGAGTAGGGTAGAGTAGGATTAGTTCCTGTTTTTTCAATATATATGACTTGTAATTAAAAACACTTATAAATTTTGCATCTTTTAATAGTTATCTATGTAACAATCGT
108,879
HF562907.1
Cotesia sesamiae Kitale bracovirus
Jancek,S., Bezier,A., Gayral,P., Paillusson,C., Kaiser,L., Dupas,S., Le Ru,B.P., Barbe,V., Periquet,G., Drezen,J.M., Herniou,E.A.
IRBI UMR CNRS 7261, Universite Francois Rabelais, Parc Grandmont - 31 avenue Monges, Tours, F-37200
France
2013-06-04
null
Cotesia sesamiae bracovirus
Bracoviriform
Polydnaviriformidae
dsDNA
17,579
GenBank
1
Kenya
Kenya
Cotesia sesamiae
null
null
null
PRJEB1050
Cotesia sesamiae Kitale bracovirus segment 2, strain Kitale
AGCTTTTCAAATAATGAATTAAAATATTGATCAAATAGTCAGGGCATGAGGAAAAGGTGTTTAATTATTATTAACTCATTGCTTGCAGCTATATCATAGAAAAAGGATATTGCGCAACATTCAGCACCCCAATATCAACACGTGATTGGGAATTCCATCGGTCATAAAAAAATTCCCAGAATTTATCTATAAATAGTTTTCCTGTTGTCGTGCCTATGCTAGGCATAGGTCAAAAAAATAATGATCTAATAGTCTGTTGTTTGGCATATGGCCAAATAGTCCGAATAATCGGGGGTGAGCGAAAATCTGGTTTGCAACTGTTTGTAAATCACGTGATGATCTGTGGGAAACTTTTTTTATGAATTCGTAAATATACGTCACACGGCCTATATAATCAGCCAAGAACAGTAACGAATATCATTCTCGTTTAGAAAACGGAGTAATCATGATGTCTACCAAAGAAACGGCGTTATTGCTGGTCGCCATCATGGGTGTCTCATGTAAGTATATTTATTATTTATTCTCATATATAATCAGTGATTGAAATTGTCGCTTCTTGTGCTCACTAATATCATTTACCGTAACTTGAAGTATTTAAGGATTTTTCACAAGACATTCCGTAAGACAAAATACTGTAACTTGTTTTACTTGATTTTTTCATGAAATTATATTTATGATTTTTTTTTCTAGTTGCTGATCCGTTGCTAAACAGAAAAAATAATCAGAATCCAAATAGTGAATCATGGTATGATCAAAATCCGGTTAATACTGCATCACAGTACGGACAAAATTTTGGGTATCAGAATCCAGTGGGGAACAATCAGCAGAATGATAGACAAAGTTATCCTCAAGAACTGACTCCTACCAGACCATCGTACAGTCCTGCATATAAACGTTCGGCAAATACTGGATCACAGTATGAACAATACTCTAGGTATCAGAATCCAGTGGGGAACAATCAGCAGAGTGATAGACAAAGTTATCCTCAAGAACCGACTCCTACCAGACCACCGTACAATCCTGGTTATCAACATCAGGTTAATATTGCATCACAGTATGGACAACATTCTGGGTATCAGAATTCAGTGGGGAACAAACAGCCGAATGATAGACAAAGTTATCCTCTACAACCGATTCCTACCAGACCATCGTTTAATCTAACCTTTATGGATCCATTGCCTGAAATCAAACCGTTCACGGAATCACCAAACCTGAAAAGTGTGTATGATCGCATTAGTAGTCAACAGCCAACGGATTCTAAGCAGAAGAACTTCTTCGGATCTGTAACTATCCAGAAGGACAATTCTTACAACGTGGATCCAAATTCTACAAACTATTTTGGATCGATCACTAGTGTTTCGGGTGCGTTTCTGTCTCCTAGGGAACAAGAATTTTTAGATGGCATAGACAAACAATCTTTGAGCTCAGGCAATTCAGAACCTAAAACATTGCAAACGCGTGATGGCAAAGTTGTAAACCTGTATGGAACGGCAACTAATATAGCTTATACACCTCAGTCGCAACACTCGACTCAGCAATCAACTGGAAGTCGTCAAACTATCAGCACTCAGCACCCTGCTCAAGAATCTTCCGAAGCGCAACAATTACAATATTTGATACAGAAAATTGCCGATCTGACAAAAGAAGTCCAGAGCCAAAAAGCTGAAATAAAGGCCATGCAAACTTCTTTAAAGGAAGTCGATCGATCTCTAGTGAATATTGCTAGCATGGTCTATGAATTGGTACAAAAAGCTCGAGTTAAACGCAACTGAACAAATTTTTTTTTTCGATGTTAAGTACTGAATAATAATTACTGTAGATACATTTTTTACTTAACTTAAGAGCATAATTGTAATTTAAAAATAGTTATTAATCAATTAAATAAACCTATTACAGCATTTTTATTCTGTTTATTTATCACAGTAAGAACTTGTATGAATTCGACCAACCCAACTGTGACTTACTCAAATACTTATAGGGAAGATCGGTTTTCCCACTCCTGGTCTCAATCTAATGTTTTATTGCGCAGATCGTAATAGCAAAGAGGAATTGAGATAAATAGCTATTATTATTTCTACGAACTAGCTATTTTAATGAGCAATAACTTCCTTGAAAATTGACTCATCAGAACGCTCTAGATTAGCTTCAATTGTATACTTGTTTGTAACCGAATTTTTTGGACTTGATTAGCACCCACTTCAAACGGGCCGATTTCATTTAAACTTCGTACACTTATCGAGGATCAATGACAATACGCTAATTTGATAAGATTATTCCATCATCCTAATTAGGATCGTCAGGATTAAATGATTTTTTCACGTATCCTTTGCGTGAGAGCAAGAGAGATAGGGTCTTACGCATGCGTACCCGTAATAAATTTGAATTAAGAATGGTGTAATAAATATTAATAAATATTAGTCTAGATAAAAAAAAAAATGTATCTTATTTTAAAAAAAGCGTGAGGTGCTTTTTAAGATATTATCGAAATGATTATCCTTTTACTTATATCTGTCAATAAAATTATTATTATTTGCACCATGCATTCCAGGCTTTTTTTTACAGTGAAATCCATTTTATCCTTATTTACATTATTATTAAATTATATTTATTAAAATTTTTTACACTATCCTTAATTCAAATTTATTAAAGTTTATTTTTTTTTTTTTAAGTTTAGTTTTCTATATATAGCGTATTTTATAGTTTTTTTTAAATGATTATTTTATTTCTGTTTAAATCGAGAAAAAACAATTCTTTTAATTTAGCTTATTGCTCATAACAACATTCTAGAAATTGATAAGAATATTCAAAGAACTTTAGATATTATTGTAAAAATAAAATTAAATAAAATAAAGTAGTATTCATCGAGGAAAATGTTGATTTTTTTAAAAAAATTAAGAAAAAAAGCATAAAATGATTTGGAACATTTTTTTTTGTATATTTATCCAGAAACTAATTGAAGAAAACAGTGATTTGAATGTTTGATTTAAGATGACAATCGTTAGGTATTTTTCATAAAATATTAATTATATTGTTATGAGACATAATTCAAACATATAACCGACCTTATTTGACAATTTAGATTATTTCCCGGTAATAAAAAATTTCTTGGAACTGTAAAAACCAACTATTAAACGCAAACAAACTTTATCATGCTCTTTATAGGCATTTGACCTTCTGATGTTCCTGGGCGTTTCCCCCACTCTACGGGCTATCTACCTACTATAGTTTTAAATAGAAATAGGATATTTTTAAACGGGACACTTACAGAATCCATTTTATAGCTGTTAGTCAGTGAGCACATGTTATTTGCGATCCTCACTCTAGGGTCACGTGGCTCACTTAGTCCAACTTCGGCGTTTGGGTTAAAAATGACGTCAGTGCGTCGGTGTGTATATAAGAGAGTAAAAAAATCAGTGGACCGCATAATTCGTCGAGACATGGAATAGTCATGTTTAACAATAAGTTAATAGCTCTGTTGCTCATCACAACTATCGACATACCCAGTAAGTATTTTTAATTACTCTTAATGCTTATTTTTCTTTATTTTTCTTTAAAAAATTCGGATCTATTTTAACTGCAATTTTTTTTTCATCCCTACTGAGTATGATTTGGCAATGAGTGGAGTGTCAAGGTCAGCCAGTAAAATATTAAAATGTAATAAACTTCCGGTCTAAAAAAAATTAATCAGCACACGGTAACATCTTTCTAAGTGTTAAAACTACTAATTAAAATAACATTTTTTTTCTTCGAAGGGGCCGAGTCAGCACATAGCCGCGATTTATGGCTCAAGCGACACAGAAGAGCAATTGATGAACAGTCAAAGTGGGTGAATTTTGGATCGCTCAATCGGCACTATGAAAACAATTACTACTTAAATCAGAAGCCGGAAGGTGGCGATGGTTCTCAAAACCCGTCGGTTATTATAGGATCGATAACTAATCAAGACAGCAATTCTTATACCAGTGTTGACCACGCTACTAACGTTTATCTTGTTTTGCCTTATTGGTACAATGTTTCGAATCAGCAGACACCCTCCGCCGTTCACAGAAGTTTAGGAACAAGGATTTCACAGCAGAGATATCATGTAGTAAATAATAAAATAGAGCAATTTAAGCAAACTTTGGCAGTAATACAGAGCAGAGTAAGACAGATAGAGAGCAGAATTCATCGAGGCTTAGACCGAATGTTTGAAAAGTCTACTGACGAGGACTTGAACATGTCATCAAAGCTAAATACTTTATTCCACAAATGTGACTCGTTGAAGGCAAGACTCGACTACCAAAAACTACGTCTTAGACATTTTAACGATGATACTCTGCCGATGCATGATATTTTTGACGGAGATTTGGCTCACTTGAAAACGATATTAGAAACAGCGAATTTAGAGCTAATATCTTTGCAGGCCGGTTAGAATAGTTAAGTTGTGTATATCCCTACTAGTTTTTTAAATGTAAATGTAGGTTTGTTTGTTACGCTTTCACGCGAAAATTACTTAGCCGATCATCCTGAAACTTTGTACTAATATTTTTATAGATATTAGAAGATAAGATACTTTTGTTAAAAAAAAAAAAAATATTTTTTACACAAAATGAAAAAATTGTTTGCCAAAAAATTAGAATCACATCGATTTAGTTCTATTGATTGTGACGTATCTTGGGCCCAAGATATGTTTGATAATAAGTATACTACAAGTTGGTAATAATATTAAAATTCAATAGATATGTAATTGATTTAGATAAAAATTGTTATTTATTGATTAAATATAATATCATCAATATACATGTTTTTTGATTAAATTTGGGACAGTCTGAGCTGTCCCAATTATTTTTTACCGAAAAAGATTTCCACTGAGTTATTTCCTCTTTCCCTTATCCTTAATTTCTTCCCTCTCCTAAATTCGTCTTCTGTGATGAATTTGTCATTAAATATGGCTTTTTATTAAATACTTTACACTCTCATTGTGTTTATACTCTACTTATTGGACCCTAGCGCATCCATTA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