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Ichnoviriform sonorense
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Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
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China
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PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_2, complete genome
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20,410
ON811755.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_1
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,364
GenBank
null
China:Lhasa
China
Alveonasus lahorensis
null
2017
SAMN28697496
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
AATTATAGTAAGATTTTCTTTGAGCTTGTGTTCCCTATTTTTTGTCGCTGAACGTTAGAGTTCGGACTAACCAAGGAGTTAGAGTTTCTCCTGGTTTTGATTTAGTGAACATTTATCTGTGTGGTAATTATCTTACTACATTTTGTTTTGCGGTCGAACGATGGGCTTTGACCGTTTTTCCTTGGGAAGGGCAGTAAAATTTACTGCTCTCCGCTTTTCTCGCACGCAAGTGCGAGTTATTTTTTTTATCTTTTCGTTTGAACGCAATGAGTGGGTGACCGCTCATGAAGAGGTGGTCAGTAGTGACCACCGCGCTGAGCTTGCCGCTCTCATATGGAGGGTGGTCAAGCGAGTCTTTGCAGACTATGTCTGCAAGACTTACATGGAGCGTTCGCGCTCCGCTTTGAAGGGAGAATTTATCTCCCGCGGCAGTATCATCAATTGCCGCCCGCTTGCTGCCGATCTCACCGGCATTATAAATGTAGTGAGAGGTTTGGGCTCCATGAAGGGGCTCAAATCCAATCTCGAGAGCTTGCGAGCTCTCGCAGAGGCCGCCGGCAATTTCGTCGGTGATGAGGTGACTCCTTGGGGTCACCGTAACTTGATTGATTTTTCAATCAAGAAGATCACAGTTAGCTGGACCAACCGGCTAACAACTTACCTGCGAGGTAAGTTGCAGCAACGTAAGCTTGCTGCGAAAGCGCGCGCGGCGCTAAACCGCGCAAAATGGGAAGCGGGCATGGCCCGCGCTGCCTCCAAAGAACGGAGGTGGCTGGCAAAATATCTTGCCACGCAGCAGCTGAGGCTGCTGGAAGAGGAAGCGCGGGCATTTGCCCGTGAAGTCAAAGCTGCCAAGTTGGCAGCAAAGCAGGCACGACGTGCCGCTCGGGGCCCATCAACATGGGTCCCTTTAAGCGCTGACGAGCGCGAACAAGTACGTGCTCGCCTGGGAGCTAAGTGCCAGGAGGCCAGACTGGCACGGTCTGGCAAAGCGGCTTACGCAAAAGCCGCACGTCAAGCGACCTCACTCGGGTCGTTTTTCTTTTTTCTCCGTAAACTCAATCTTGGCCCAGCACAGCTGAGGCACATTATGAAGAAGCGGAGGGGAGTGAGGTACACGCGACATGCGGGTGAGTCATGGCGTCAAACATTTGTAAATATTTTTGGATATGGCATAATATATGCCAAAGACGCTGTGTGTAAATATGTAGATAGAAGTGTTTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAATTTCTTCATTTTTGTCTATTATGGGTGTAGAGTCTATCGACTTTAATCTTGAGCATAAATATGTGGTATCCAGACGTAAAGTTGGTAGACTCTTTGTGAATTCAGATTTCCAAGTATTGCCCCGATGCATTGAGCATCAGGGCGATGATGATGACCCACTGTCCGTAGATCCTGTTGCAGTAACCTCGGTAGAACAGACATCAAATGTAGTGAATGTCGATCAGGGGGCAGTGGCGTCAGTTGCTAGCGAGTCCCATGTAAATTATCCATGTCGTATGAATGAAGGGGGTGAGGCTGCCATGATCCGTGAGTTGTGTAATCGTTATATGTTATTGGATACTGGTGACTGGAAAACTAGCTCTCCCAGAGATTCAGTTTTATTCCAATATAATGTACCTAAGGATATCTTCTCAAAAATCAGTTCAAGTCCTAACGTTATTGCTTTAAAGCGCTGGGAGTATTTGTCGTTTGACTTGCATATAAGAGTACAAGTAAATGCCACTCGTATGCAAGCTGGACAGATAATGATTGGTTGGAATTATAATCCAGATGGTTTAAAGATTCATAATATTTATGAATTATCTCAGGCCCCTCATGTTATTCTCAGTTCTCCTGGCAGTAATGTGGCTGAACTATTTATACCGTTTAAGTGGAAATATCCATATTGGAGTGTTGGTCGTATAGCTAGTACTAACCATTTAATAACAGTTAAGGCATTAGTATTAACAGCATTAAATAGTCCAGATCGAGTTAGTCCGTCGTGTTCGTATAACGTCCAGATTCGATTAGCGAATATGAAAGTTGCTGGAATGCGAGTACCTTCTCAGCGATTGTTTGTAGAGCATCAAATGTTTAAGAGTGTACTAAATGTAGCAGAAGGTTTATTGAGACAATTCGGTGCGGACCTCAATCGAGATAATCCTACGGAAGCTCAGCAACAATCAGCAATGATACCATATACAAGTCATTCTTGGTGTATTGGTACTAATCAGGTAGAGGTTTTAAATCAACTTCGCTTGGATGCTATAGCTACGACGCCACATTATGAGCCTAGTGATGAGATGCGTGTAGATTTTATATGTCGTCATTATGGTTATTTGGGATCGTTTTTGTGGGCTACTAATTATTCTACTGGGAGAGAGTTGAACAGTTACAGTGTAGGTCCTATGTGTTTGAGTAGTTGTGCTGCAGTTGCTACTGGCGATGCAACAAAGCAAACACTAAATGAGTATATGTGTCCTCCTATTCATGTTATTAGTTCTATGTTTGCTTATTGGAGAGGTAGCCTAGAGTTTAGATTTGATTTTGTTGCTACGATGTTTCACACTGGTCGTGTTGTTGCGTGTTTTGTCCCAGGTCCTGATAGTTTAACTAAGATGCGTGATTGTGTACAGTCGTATACTCAATATTTTGACCTGTCTAATACTAATAGTTTTACTTTTGTTTGTCCGTATGTGTGCGATAAAACTTGGTGTGAGACACATCCACCTGAAAAGGTTGGTATTCTCCAGAAGGAGAATAGTAGTATTGGGACTCTTAAGCTTTTTGTAGTTAATCCATTAGTAGCCATCACTGGAGTTTCGAATCAGATTACAGTGAACGTGTATCTTCGTGCTGGAACTGATTTTGCCTTTGCTGTTCCGTGTGCACCATGTTATTTTCCTGCTGATCTGGGTAATACATATATTCCTAGTGATTTAACTGTTTCCATTTTACCTAAATATTTTCCTTGCTTTAGTGGTGTCTGGAGATATTTTGGCGATTCACGTTATTGTATATGTCGTTATTCTAATATAACTGATCAGATAGCTCAATTTGGCCCTGATTTGGGATATAATCATGTATATAAAGCACAATGGGGTATGCCTGTTTATACCTCACCTACAGAGCAAATGCAGTGTGTTTATTTTGTTCGTGCTAGAGTTGCGAGTGATAATCATTTCTATATGGCACCGTGTAGAACTCAAACCGAAGCGAGAAATTATGTAACTACTGGTAGTCTCAATTGGCTGATGCCTCATTATGTAGATGGAGCATATACGTGGTCCGGTAATTGTACATTTAATGTTGTAGAAACTATTAGCAACGTTAGTAATAGATTAGAGCATCAGGGGGATGAAAGACTAGAGGATCATTGTAATGTTAGTTTTGGTATTAAGAATTGTTTAACTGCGATGCATAGTTTTAATGAAGATTTTAATGATCTTAAAACCCTATGTAGAAGATATCAACTCTTAACTGATTTCAGTGCTTATATCGAAGCCAATAGTCCTTTCGGAGCAACTTTCTTTAGACTCCCAATAGTACCGTATGGGCTGGTTGTAGATTATAGTAAGCTTAGTAGAGGTAATAAAATAGCAGAATTTGCCAATAGAGTTCGTAGTGGTCCAATAGGTATATTGGCAAATGGTTTTAGATTTTTCAGAGGTGGTTTAAGATTTAAAATCCTGTTTAAAGAAAAGAGTAATCAAGAGGTAATTATAGGCGTAACTCACGTTCCAGATAGATTTGATGCTAATAAAATGTCTTTAGTTAAAGCCAGTTCCACTGGTGATTTTGTTACTCATGGTTATGCTTATATATGTCAGTCTGCTAAAGTGAATGAATGCATCGAAATTGAAGTTCCTTATTATCTTAATGCAGATTATGGCATCTTAGCCGATCCTAGTAGAGTTATCGATGAGGATCGGTTGCAGTGTACGCTTGGTCATTTAGCTTTTTGTATTATGAGTAGGATACCGCAAGATATAGATCTTGGAATTCAAATTTATTATGCTTTTGCTGATGATATGCGCTTTAGTAGTTTTCAAGGATTTGGGCCGGTTTGTACTCAATATGAGATACCCGAAAATAAAGACTCTATCACATTGGAATCCACTACTACCGTTGCTACGGTTGGTAGTCAGCCTCAACTTTCATATGACAGTAGTGGATCTTTTGTTTTAATTGAGCACGAAATGTGGGGTGTCCCTAATATAAAAGAGCAAATTAGTGAGGGGGTTGGCGAGGCTTTAGAGCGCCTTGAAGTACGATTACCAACAATTGCACATGACTGTGCAAATGAATTTAGATTTGTTGCAGGGCGAATGACTAATGATATCATAGAGAAAACTGGTGAGGTTCTAAATAAAATTAAAGAATTATTTGGTGACATTTTTAATAGTAGTAAAGCTTCGATAGTTGCAATAGTATCTAATTTAGTTCACTTGCTGCTTAATCCCTGTTGGAAGGCTTTGTTTGTGTGTCTCACATCCATTATATGTATTGTGTTTAACTTGAGTGAGTGTGATGCTGTTAATCGACTTGTCAATAGTGTTATGTCTGTTCTCCATTTAATACGGGGTAATGAGTGTGAAGAAAAAGAAGATAGTAATACTAATAGTGAGAGTATTGAGCATCAGGGGGTTGAGATACCAGTTGATAAGATTGCTATGATTAGTGAAGCATCAGCTACTTATATTAGCATGGTAGCCACAATTTTTAATCTTAAGTATGGAGAAAAAAAAAAAAAATATCCCAATTTCTTATCTCTGATTATCACTAGTTTAAAGGAATTTAACTTTAGTGTATCTGGATTGAGTAAGTTTTTAAAGGTTAATTTAGAATTATTGAGTAGAGTGTTAATATATCTAACAAATAAAGTATGCGGGACAGAATTGGATTATATAATCAGTAATTATGGTGAGGATCTTAAGAACTGGTGTCGTCATGCCAATATGTTGCTTAATCCTCTTAACAAGTGTCGTGTCGAGTCTG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20,412
ON811756.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_1
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,274
GenBank
null
China:Tongren
China
Haemaphysalis hystricis
null
2019
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PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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20,413
ON811757.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_1
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,540
GenBank
null
China:Daqing
China
Dermacentor nuttalli
null
2019
SAMN28704271
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_1, complete genome
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20,414
ON811758.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_5
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,683
GenBank
null
China:Nanning
China
Amblyomma varanense
null
2019
SAMN28688352
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_5, complete genome
AAAAGAGACAGTTAATCTGTGGCGATATTGACTCAAACGAGTCATTGTTTGCTCAGAACGCGTACTCTTTCTAAGAGGATTACCGGAGATAAGTCGGTCTGCTGTTAGCGCAACCCTAACGGGACGCTGTACAGGGACTATCGCCCGGTCCCCCCGCTCTCAGACAACGGCCCAGAGTCTATCTGAGTAGCCCGCTGCCTTTCTCTTCTTGGAGAATAAAAGTTACTTTTATTTTATATTTTCTTTTTTGAATATTTAGTTTTTAAATTTTCATAATTTTCTTCTTTTTATACTTTTTTCTCATAGAAAAAAAGTAACCATGTCGAGGGGGCTCCCCCCCATCGGCGGAGTGCGCCTGTTGGCGCACTCGGGGACGGAAACGTCCCAAGTGCTGGAGGCTACGGTCTTCAGCACCAAGACCCTGTCCTGGAGGTCAGTATCCAGGAAACTTGTGGGTTGGTCCCCTGAGACCACCCTCAAGCGCCGCGCCCAGCTCATCACTGGGGCCGCGAAGGAGTGCGTCTGGGACGCACTCGAGGAGACCGTTCCCCTCCGCGAGGGGTGGCTCCGCGAGCATTTTGCTCGCAACGGGGTGATTGACCCGAAATCAATCACGGTGGACATGTCCCAGGTCCACCGGCTGTACAACGGCCTGCCCGTTGTGCAGAAAATTATCGCCGGAGAAATCCGGCGAACTGTGACCGCCTTCTGCTGGAAGGTGACCGGGATGCTGACCCCGCTCAGCGTCTCGAGGCCTGTGCTCACAGGCTATATCAAGCGGGCTTCGGCCTCGCTTGAAAATGAGCTACGCACTTACCTTCGTGGTAAAGTGCAGGCCCGGCGCCGACGCGCCGCGGCTAAGCGCGCGGCGGCCCAGCACCGCCGCGAAGAGCTGGCTGAAAAACGCCGGCTTAACCAGCAGTATTGCGCTGCTGCTGGGGCTCGCCGCTGCCAAATGCGGGAGGAGCGCCGCAAGGCGCACCTGGACCTGGTGGCCCGTCAAAAGGCCGCCAAAGAGCAACGCCGTCTGGCGAAGCTCGCTGCGTACGTGCGAGCGTACGATGCGCAGCCCCCTCGCCCGCCCCGTGAGGAGCGGTGCGAATGCGAGATGGAGAAGCTCGCCCAGCATCTCCACCGCATTCTCGAGGCAGCCCGAGAGGCTCGGCTGCCAGGCTTTGCCGCCTATAAAAGGCAAATTTTTTCTTCTTTTTCATTTTTTAAATCAGACATCTGTAGCGCACTTTGCGCTTTTCATTTGACTGCTCAATGCTATCATCCTATTGATAGCTATGAGTTTCATTTATGTACTCGCGACGGACCCGTCACTCGATGGTGTCCAAGAATTTTTTGTGATTGTCCTTTTGGCTCACGGCAACGTAAGCCAAAACATTTTTGTAATGTTCGAGTGGGCGGCCACCCTATGTATCCGCATGGCTGCGCTCACCAAAAATATAAAGGGCGATTTCAATTTGAAAAAATTGAGCATCAAATGGAATCTGACCCGACGAATGTCGCTCCTGATTCTTCTACCAATATTATTGCTTCAAGTAATATTCTTGGTGTTGAGGACGCAACTCCTCAAACTGTGAGAGTTTCGGCTCCCACATGTTGGGAAGGTGCAGCCTCAGAGGGATCTGAGGAGCATGTTTCTCGGGAAATGATGTCCCGTTACACATTGTTTGATCAATTTACTTGGTCAGGCAATGATGAAGATGGTAAGGTCCTTAAGACCTATGAGTTCCCGAATGCACTATTTGAGAGTGCTTTTATTAACATGCCTAATGCTATGATCTTAAAGAAATTTAATTATTATCAATTTGATATTAAGCTTAAAGTTAGTATTAATGCTACTAAATTTCACACGGGAAAACTCATTTGTTGTTGGAATTATAATTTTGGAAATCGCCCTTCGTATTTTGTTAATCGAGGTGCATTATCTCAAATGCCTCATGCTTTCATCAGTGTACCTTGTATCAACCCTGTAGAGTTAGTTATACCTTTTAAATATGTCTTTCCTTATTGGTCTCTTGAAGATATATTGAACAAGGACCACTATTTACGCGTGTATTTAGCTTCTTTCAATCATTTACAGGCTACAGAATCCGTCCCTAATCAAGTTTCTGTAGTTGTTCAATTGCAGCTTTGTAATATACGTGTTTGTGGTATGTCCGCTAATTCTGAGCTTCGTCGTCTTGAGATCGAGCATCAAATGCTTGGTTCTCTTCTTGGTTCTGTTGAGGGCTTGCTCCGGAATGTTCTGAGTGACGGAAATCGTGATAACCCTACTGAGCCTCGTGCTCATATGGCCATGATTCCGTACTCATCACATTCCTGGAGTATAGGAACTAACCAGAATCAAGTCTTGAACCCTTTGAGACTTGATCCGCTTGCCGTTACGCCTCATTGTAATCCTACAGATGAAATGAGAGTTTCTTATATAGCATCCCACTCTGGTCTACTAGAGACTTTTGAGTGGAAGGAAACTCATAATCCTGGTGATTTGCTTTGGTCCGCTGCTGTTACGCCTTTCAATCCTTTGCTTTGGCCCAATATTAAGGGCGACATTATTTATGCCCAAATGGATCAATATTTAGCTCCTCCAGTATCTGTACTCGCTTCCATGTTTGCTTACTGGAGAGGATCCTTGAAATTTGAATTTTCTTTTGTTTCTAATCTCTTTCAATCTGGTCGTTTAGCTTTTGTATTTGTTCCTAAGCGTAAGCAGTCTACTCCCCCAACCCTCAATCAAGCTTATAATTCTTATGTGTTGCAATTTTCGTTGGGAGAGCAGACTACTTTTGAGTATGTCTGTCCTTATATTTGTAATCAAGACTTTCTTCGTTGTCGGTCAGTGGACTCATCATTCCCTCTTACTCTCAAGGATGTTGAGCGCACTGGCACTCTTTATTGTTATGTTGTAAATAAACTTGTTTGTGTCCAAGGGTCACCTTCTGTTGTCCCTGTTAATGTTTTTCTTTCTGGAGGGTCAGACTTCCAAGTAGCTTTGCCTTGTAATCCTGCTTTGGCTCCTTCTACTTTAGGAACTACCTATTCTCCTATCACTAATTTTGTATTTACTCAATCAATTCCTCCTTTCCAACTTGTTGCTGATCCGGATCTTCCTGAGCCGGCTGAGCAGCTATTTGGAATGAAGATTGTAAAGGAAACCGACGATGTTGAATTTCAACCTCAGTATGATGTTTCTAAGGCTTACTTTGAATTTACTCCTGGCTTTAGACATCCTGAGGACCCTACTAAAGTTGTCAAATTTTTTGTTAGGTATTTTAACAATCCTGATCGTATGATTTTGTTGGGATGTAAAGATGAACCCTCAGCGAAAACTTACTGTTTGGATAGTAACAGAGGTGATACGTTCGCGAATTACCTCTGGAACGTTCCAAATGGTGAGACATGGGCAATGAATCCGCCCTATGCTGGTTACTTTTCTGTGCATCATATTCTTGAGACACAGGCTGGTGACGAGCGTAGGGAGGATCATTTCCCTGTATCTTTTCCTGGGGCTTCTTCTCTTACGGCCCAGCAATTTTATAATGAATCATTTGATGATCTTAAGACCTTATGTCGCCGGTTTCATCTCTATGATGATACCATTTTTAAATTAAATAAGAATACACCAATTGGCAAAATTATTTATAGAGTTCCACTTAATCCCGCCGGTTTCTTTTATGATTATTCTTTGCTTCCCGCTGGTAGTGGAGTCCGCGAGTTCCTCTCTAAGTCTCGTGGTTCTCCTATGAATATTCTTGCTTCCTGCTTTCGCTTTTTTAAAGGAGGTCTCAGATGTAAACTAATTTTCAAGTCTGATTCTACTGAGCCTCTTATAATTAGTGTATCTCATATCCCCGATCGAGTAGTTGTAGACAAACCCTCTACCTCTCTGGTTGATTCAACCGAAAACTTTAGCTCTCAAGGCTATGCGTATTATACGCAAAGTGTTCGGTTGAATGAAATCATTGAGATAGAGTGTCCCTATTATCTTAATAGTGAATATGGTGTGCTTTGTACATATGCTGAAGCTGACCCTAGTATTCGTCCCTATATATCTTTGGGTGATCTTTGTGTCTCTATTGTTTCTCGCCCTCTCGCCGAGCTTAATGTAGTTGTTGAAGTATATGTTGCTTTTGCTGATGATATGCGCTTTTCTTCTTTTCAAGGCTTTCCCCTGTGTGTATCACCTTTCCTCATACCATCTCGACCTGCTTCTCTCCCTGTTCCGCCCCAACTTTCGAAGGGCAGTGAGCCGGAGCAGATCGAGCATCAAATGTTTACTCCTCGCTCCACCGTTGCTAAGTGTACGTCTGTTGTTTTTGACAAAGTTGCTCAATGTTACGACGGCGCTCGTGATAGAGTTACAGCCGACATTAAGACCGCTATTGCAGAGGGAGCTGCTGAGCCCCTGGAAACGCTCAATCGTTTGGTTGACACTACTATTGAAAGTGTCGACCAGCGGCTTGATCGAGCCCAGAGTCTCGTCAGTACTCTCTGTGACAGTCTTCGTACTGCCGGTAGTGAACTGTATTCACTAGCTGTCGTCGTTGTGTCCAACTGTATCCATGTTTGTCGTAAGCCTGATGTTGTGTCTATTATTGTTGCTATTTCTGCTATTTTTATGCAAATCCTTAATCATTTTGGTTTTTCTATAGCCTATGATGTTGTTTATGATTTCTTTAAGTATCTTGTTGAAAAAATTGGGGATATTTGTGCTTGGTTTAGACCTAGAGATAGTATTGAGCACCAAGATGACAAACTTCGGCGCTTGTCTTTAATAGATGTCTGCAAACAGTATGGTAAATTTTTAGCTTCCATTTTTAGTTTTTCAGGCTGCAAAGACAAGTCTTGGCCCAATTTCTTTTCCCACTTTGCTCTCAATATGAGTAAAATGGGACCTGGAATTGAGTCAATAATTGACTTTGTTAAATTTAATATTGATATTCTTCATTCTTGTGTTGATTGGCTCTTAATGAAAACTACTGGAACGA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20,415
ON811759.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_6
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,655
GenBank
null
China:Nanning
China
Amblyomma varanense
null
2019
SAMN28697452
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_6, complete genome
AAAGAGACAGTTAATCTGTGGCGATATTGACTCAAACGAGTCATTGTTTGCTCAGAACGCGTACTCTTTCTAAGAGGATTACCGGAGATAAGTCGGTCTGCTGTTAGCGCAACCCTAACGGGACGCTGTACAGGGACTATCGCCCGGTCCCCCCGCTCTCAGACAACGGCCCAGAGTCTATCTGAGTAGCCCGCTGCCTTTCTCTTCTTGGAGAATAAAAGTTACTTTTATTTTATATTTTCTTTTTTGAATATTTAGTTTTTAAATTTTCATAATTTTCTTCTTTTTATACTTTTTTCTCATAGAAAAAAAGTAACCATGTCGAGGGGGCTCCCCCCCATCGGCGGAGTGCGCCTGTTGGCGCACTCGGGGACGGAAACGTCCCAAGTGCTGGAGGCTACGGTCTTCAGCACCAAGACCCTGTCCTGGAGGTCAGTATCCAGGAAACTTGTGGGTTGGTCCCCTGAGACCACCCTCAAGCGCCGCGCCCAGCTCATCACTGGGGCCGCGAAGGAGTGCGTCTGGGACGCACTCGAGGAGACCGTTCCCCTCCGCGAGGGGTGGCTCCGCGAGCATTTTGCTCGCAACGGGGTGATTGACCCGAAATCAATCACGGTGGACATGTCCCAGGTCCACCGGCTGTACAACGGCCTGCCCGTTGTGCAGAAAATTATCGCCGGAGAAATCCGGCGAACTGTGACCGCCTTCTGCTGGAAGGTGACCGGGATGCTGACCCCGCTCAGCGTCTCGAGGCCTGTGCTCACAGGCTATATCAAGCGGGCTTCGGCCTCGCTTGAAAATGAGCTACGCACTTACCTTCGTGGTAAAGTGCAGGCCCGGCGCCGACGCGCCGCGGCTAAGCGCGCGGCGGCCCAGCACCGCCGCGAAGAGCTGGCTGAAAAACGCCGGCTTAACCAGCAGTATTGCGCTGCTGCTGGGGCTCGCCGCTGCCAAATGCGGGAGGAGCGCCGCAAGGCGCACCTGGACCTGGTGGCCCGTCAAAAGGCCGCCAAAGAGCAACGCCGTCTGGCGAAGCTCGCTGCGTACGTGCGAGCGTACGATGCGCAGCCCCCTCGCCCGCCCCGTGAGGAGCGGTGCGAATGCGAGATGGAGAAGCTCGCCCAGCATCTCCACCGCATTCTCGAGGCAGCCCGAGAGGCTCGGCTGCCAGGCTTTGCCGCCTATAAAAGGCAAATTTTTTCTTCTTTTTCATTTTTTAAATCAGACATCTGTAGCGCACTTTGCGCTTTTCATTTGACTGCTCAATGCTATCATCCTATTGATAGCTATGAGTTTCATTTATGTACTCGCGACGGACCCGTCACTCGATGGTGTCCAAGAATTTTTTGTGATTGTCCTTTTGGCTCACGGCAACGTAAGCCAAAACATTTTTGTAATGTTCGAGTGGGCGGCCACCCTATGTATCCGCATGGCTGCGCTCACCAAAAATATAAAGGGCGATTTCAATTTGAAAAAATTGAGCATCAAATGGAATCTGACCCGACGAATGTCGCTCCTGATTCTTCTACCAATATTATTGCTTCAAGTAATATTCTTGGTGTTGAGGACGCAACTCCTCAAACTGTGAGAGTTTCGGCTCCCACATGTTGGGAAGGTGCAGCCTCAGAGGGATCTGAGGAGCATGTTTCTCGGGAAATGATGTCCCGTTACACATTGTTTGATCAATTTACTTGGTCAGGCAATGATGAAGATGGTAAGGTCCTTAAGACCTATGAGTTCCCGAATGCACTATTTGAGAGTGCTTTTATTAACATGCCTAATGCTATGATCTTAAAGAAATTTAATTATTATCAATTTGATATTAAGCTTAAAGTTAGTATTAATGCTACTAAATTTCACACGGGAAAACTCATTTGTTGTTGGAATTATAATTTTGGAAATCGCCCTTCGTATTTTGTTAATCGAGGTGCATTATCTCAAATGCCTCATGCTTTCATCAGTGTACCTTGTATCAACCCTGTAGAGTTAGTTATACCTTTTAAATATGTCTTTCCTTATTGGTCTCTTGAAGATATATTGAACAAGGACCACTATTTACGCGTGTATTTAGCTTCTTTCAATCATTTACAGGCTACAGAATCCGTCCCTAATCAAGTTTCTGTAGTTGTTCAATTGCAGCTTTGTAATATACGTGTTTGTGGTATGTCCGCTAATTCTGAGCTTCGTCGTCTTGAGATCGAGCATCAAATGCTTGGTTCTCTTCTTGGTTCTGTTGAGGGCTTGCTCCGGAATGTTCTGAGTGACGGAAATCGTGATAACCCTACTGAGCCTCGTGCTCATATGGCCATGATTCCGTACTCATCACATTCCTGGAGTATAGGAACTAACCAGAATCAAGTCTTGAACCCTTTGAGACTTGATCCGCTTGCCGTTACGCCTCATTGTAATCCTACAGATGAAATGAGAGTTTCTTATATAGCATCCCACTCTGGTCTACTAGAGACTTTTGAGTGGAAGGAAACTCATAATCCTGGTGATTTGCTTTGGTCCGCTGCTGTTACGCCTTTCAATCCTTTGCTTTGGCCCAATATTAAGGGCGACATTATTTATGCCCAAATGGATCAATATTTAGCTCCTCCAGTATCTGTACTCGCTTCCATGTTTGCTTACTGGAGAGGATCCTTGAAATTTGAATTTTCTTTTGTTTCTAATCTCTTTCAATCTGGTCGTTTAGCTTTTGTATTTGTTCCTAAGCGTAAGCAGTCTACTCCCCCAACCCTCAATCAAGCTTATAATTCTTATGTGTTGCAATTTTCGTTGGGAGAGCAGACTACTTTTGAGTATGTCTGTCCTTATATTTGTAATCAAGACTTTCTTCGTTGTCGGTCAGTGGACTCATCATTCCCTCTTACTCTCAAGGATGTTGAGCGCACTGGCACTCTTTATTGTTATGTTGTAAATAAACTTGTTTGTGTCCAAGGGTCACCTTCTGTTGTCCCTGTTAATGTTTTTCTTTCTGGAGGGTCAGACTTCCAAGTAGCTTTGCCTTGTAATCCTGCTTTGGCTCCTTCTACTTTAGGAACTACCTATTCTCCTATCACTAATTTTGTATTTACTCAATCAATTCCTCCTTTCCAACTTGTTGCTGATCCGGATCTTCCTGAGCCGGCTGAGCAGCTATTTGGAATGAAGATTGTAAAGGAAACCGACGATGTTGAATTTCAACCTCAGTATGATGTTTCTAAGGCTTACTTTGAATTTACTCCTGGCTTTAGACATCCTGAGGACCCTACTAAAGTTGTCAAATTTTTTGTTAGGTATTTTAACAATCCTGATCGTATGATTTTGTTGGGATGTAAAGATGAACCCTCAGCGAAAACTTACTGTTTGGATAGTAACAGAGGTGATACGTTCGCGAATTACCTCTGGAACGTTCCAAATGGTGAGACATGGGCAATGAATCCGCCCTATGCTGGTTACTTTTCTGTGCATCATATTCTTGAGACACAGGCTGGTGACGAGCGTAGGGAGGATCATTTCCCTGTATCTTTTCCTGGGGCTTCTTCTCTTACGGCCCAGCAATTTTATAATGAATCATTTGATGATCTTAAGACCTTATGTCGCCGGTTTCATCTCTATGATGATACCATTTTTAAATTAAATAAGAATACACCAATTGGCAAAATTATTTATAGAGTTCCACTTAATCCCGCCGGTTTCTTTTATGATTATTCTTTGCTTCCCGCTGGTAGTGGAGTCCGCGAGTTCCTCTCTAAGTCTCGTGGTTCTCCTATGAATATTCTTGCTTCCTGCTTTCGCTTTTTTAAAGGAGGTCTCAGATGTAAACTAATTTTCAAGTCTGATTCTACTGAGCCTCTTATAATTAGTGTATCTCATATCCCCGATCGAGTAGTTGTAGACAAACCCTCTACCTCTCTGGTTGATTCAACCGAAAACTTTAGCTCTCAAGGCTATGCGTATTATACGCAAAGTGTTCGGTTGAATGAAATCATTGAGATAGAGTGTCCCTATTATCTTAATAGTGAATATGGTGTGCTTTGTACATATGCTGAAGCTGACCCTAGTATTCGTCCCTATATATCTTTGGGTGATCTTTGTGTCTCTATTGTTTCTCGCCCTCTCGCCGAGCTTAATGTAGTTGTTGAAGTATATGTTGCTTTTGCTGATGATATGCGCTTTTCTTCTTTTCAAGGCTTTCCCCTGTGTGTATCACCTTTCCTCATACCATCTCGACCTGCTTCTCTCCCTGTTCCGCCCCAACTTTCGAAGGGCAGTGAGCCGGAGCAGATCGAGCATCAAATGTTTACTCCTCGCTCCACCGTTGCTAAGTGTACGTCTGTTGTTTTTGACAAAGTTGCTCAATGTTACGACGGCGCTCGTGATAGAGTTACAGCCGACATTAAGACCGCTATTGCAGAGGGAGCTGCTGAGCCCCTGGAAACGCTCAATCGTTTGGTTGACACTACTATTGAAAGTGTCGACCAGCGGCTTGATCGAGCCCAGAGTCTCGTCAGTACTCTCTGTGACAGTCTTCGTACTGCCGGTAGTGAACTGTATTCACTAGCTGTCGTCGTTGTGTCCAACTGTATCCATGTTTGTCGTAAGCCTGATGTTGTGTCTATTATTGTTGCTATTTCTGCTATTTTTATGCAAATCCTTAATCATTTTGGTTTTTCTATAGCCTATGATGTTGTTTATGATTTCTTTAAGTATCTTGTTGGAAAAATTGGGGATATTTGTGCTTGGTTTAGACCTAGAGATAGTATTGAGCACCAAGATGACAAACTTCGGCGCTTGTCTTTAATAGATGTCTGCAAACAGTATGGTAAATTTTTAGCTTCCATTTTTAGTTTTTCAGGCTGCAAAGACAAGTCTTGGCCCAATTTCTTTTCCCACTTTGCTCTCAATATGAGTAAAATGGGACCTGGAATTGAGTCAATAATTGACTTTGTTAAATTTAATATTGATATTCTTCATTCTTGTGTTGATTGGCTCTTAATGAAAACTACTGGAACGAC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20,416
ON811760.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_7
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,649
GenBank
null
China:Nanning
China
Haemaphysalis longicornis
null
2018
SAMN28669503
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_7, complete genome
CTGTGGCGATATTGACTCAAACGAGTCATTGTTTGCTCAGAACGCGTACTCTTTCTAAGAGGATTACCGGAGATAAGTCGGTCTGCTGTTAGCGCAACCCTAACGGGACGCTGTACAGGGACTATCGCCCGGTCCCCCCGCTCTCAGACAACGGCCCAGAGTCTATCTGAGTAGCCCGCTGCCTTTCTCTTCTTGGAGAATAAAAGTTACTTTTATTTTATATTTTCTTTTTTGAATATTTAGTTTTTAAATTTTCATAATTTTCTTCTTTTTATACTTTTTTCTCATAGAAAAAAAGTAACCATGTCGAGGGGGCTCCCCCCCATCGGCGGAGTGCGCCTGTTGGCGCACTCGGGGACGGAAACGTCCCAAGTGCTGGAGGCTACGGTCTTCAGCACCAAGACCCTGTCCTGGAGGTCAGTATCCAGGAAACTTGTGGGTTGGTCCCCTGAGACCACCCTCAAGCGCCGCGCCCAGCTCATCACTGGGGCCGCGAAGGAGTGCGTCTGGGACGCACTCGAGGAGACCGTTCCCCTCCGCGAGGGGTGGCTCCGCGAGCATTTTGCTCGCAGCGGGGTGATTGACCCGAAATCAATCACGGTGGACATGTCCCAGGTCCACCGGCTGTACAACGGCCTGCCCGTTGTGCAGAAAATTATCGCCGGAGAAATCCGGCGAACTGTGACCGCCTTCTGCTGGAAGGTGACCGGGATGCTGACCCCGCTCAGCGTCTCGAGGCCTGTGCTCACAGGCTATATCAAGCGGGCTTCGGCCTCGCTTGAAAATGAGCTACGCACTTACCTTCGTGGTAAAGTGCAGGCCCGGCGCCGACGCGCCGCGGCTAAGCGCGCGGCGGCCCAGCACCGCCGCGAAGAGCTGGCTGAAAAACGCCGGCTTAACCAGCAGTATTGCGCTGCTGCTGGGGCTCGCCGCTGCCAAATGCGGGAGGAGCGCCGCAAGGCGCACCTGGACCTGGTGGCCCGTCAAAAGGCCGCCAAAGAGCAACGCCGTCTGGCGAAGCTCGCTGCGTACGTGCGAGCGTACGATGCGCAGCCCCCTCGCCCGCCCCGTGAGGAGCGGTGCGAATGCGAGATGGAGAAGCTCGCCCAGCATCTCCACCGCATTCTCGAGGCAGCCCGAGAGGCTCGGCTGCCAGGCTTTGCCGCCTATAAAAGGCAAATTTTTTCTTCTTTTTCATTTTTTAAATCAGACATCTGTAGCGCACTTTGCGCTTTTCATTTGACTGCTCAATGCTATCATCCTATTGATAGCTATGAGTTTCATTTATGTACTCGCGACGGACCCGTCACTCGATGGTGTCCAAGAATTTTTTGTGATTGTCCTTTTGGCTCACGGCAACGTAAGCCAAAACATTTTTGTAATGTTCGAGTGGGCGGCCACCCTATGTATCCGCACGGCTGCGCTCACCAAAAATATAAAGGGCGATTTCAATTTGAAAAAATTGAGCATCAAATGGAATCTGACCCGACGAATGTCGCTCCTGATTCTTCTACCAATATTATTGCTTCAAGTAATATTCTTGGTGTTGAGGACGCAACTCCTCAAACTGTGAGAGTTTCGGCTCCCACATGTTGGGAAGGTGCAGCCTCAGAGGGATCTGAGGAGCATGTTTCTCGGGAAATGATGTCCCGTTACACATTGTTTGATCAATTTACTTGGTCAGGCAATGATGAAGATGGTAAGGTCCTTAAGACCTATGAGTTCCCGAATGCACTATTTGAGAGTGCTTTTATTAACATGCCTAATGCTATGATCTTAAAGAAATTTAATTATTATCAATTTGATATTAAGCTTAAAGTTAGTATTAATGCTACTAAATTTCACACGGGAAAACTCATTTGTTGTTGGAATTATAATTTTGGAAATCGCCCTTCGTATTTTGTTAATCGAGGTGCATTATCTCAAATGCCTCATGCTTTCATCAGTGTACCTTGTATCAACCCTGTAGAGTTAGTTATACCTTTTAAATATGTCTTTCCTTATTGGTCTCTTGAAGATATATTGAACAAGGACCACTATTTACGCGTGTATTTAGCTTCTTTCAATCATTTACAGGCTACAGAATCCGTCCCTAATCAAGTTTCTGTAGTTGTTCAATTGCAGCTTTGTAATATACGTGTTTGTGGTATGTCCGCTAATTCTGAGCTTCGTCGTCTTGAGATCGAGCATCAAATGCTTGGTTCTCTTCTTGGTTCTGTTGAGGGCTTGCTCCGGAATGTTCTGAGTGACGGAAATCGTGATAACCCTACTGAGCCTCGTGCTCATATGGCCATGATTCCGTACTCATCACATTCCTGGAGTATAGGAACTAACCAGAATCAAGTCTTGAACCCTTTGAGACTTGATCCGCTTGCCGTTACGCCTCATTGTAATCCTACAGATGAAATGAGAGTTTCTTATATAGCATCCCACTCTGGTCTACTAGAGACTTTTGAGTGGAAGGAAACTCATAATCCTGGTGATTTGCTTTGGTCCGCTGCTGTTACGCCTTTCAATCCTTTGCTTTGGCCCAATATTAAGGGCGACATTATTTATGCCCAAATGGATCAATATTTAGCTCCTCCAGTATCTGTACTCGCTTCCATGTTTGCTTACTGGAGAGGATCCTTGAAATTTGAATTTTCTTTTGTTTCTAATCTCTTTCAATCTGGTCGTTTAGCTTTTGTATTTGTTCCTAAGCGTAAGCAGTCTACTCCCCCAACCCTCAATCAAGCTTATAATTCTTATGTGTTGCAATTTTCGTTGGGAGAGCAGACTACTTTTGAGTATGTCTGTCCTTATATTTGTAATCAAGACTTTCTTCGTTGTCGGTCAGTGGACTCATCATTCCCTCTTACTCTCAAGGATGTTGAGCGCACTGGCACTCTTTATTGTTATGTTGTAAATAAACTTGTTTGTGTCCAAGGGTCACCTTCTGTTGTCCCTGTTAATGTTTTTCTTTCTGGAGGGTCAGACTTCCAAGTAGCTTTGCCTTGTAATCCTGCTTTGGCTCCTTCTACTTTAGGAACTACCTATTCTCCTATCACTAATTTTGTATTTACTCAATCAATTCCTCCTTTCCAACTTGTTGCTGATCCGGATCTTCCTGAGCCGGCTGAGCAGCTATTTGGAATGAAGATTGTAAAGGAAACCGACGATGTTGAATTTCAACCTCAGTATGATGTTTCTAAGGCTTACTTTGAATTTACTCCTGGCTTTAGACATCCTGAGGACCCTACTAAAGTTGTCAAATTTTTTGTTAGGTATTTTAACAATCCTGATCGTATGATTTTGTTGGGATGTAAAGATGAACCCTCAGCGAAAACTTACTGTTTGGATAGTAACAGAGGTGATACGTTCGCGAATTACCTCTGGAACGTTCCAAATGGTGAGACATGGGCAATGAATCCGCCCTATGCTGGTTACTTTTCTGTGCATCATATTCTTGAGACACAGGCTGGTGACGAGCGTAGGGAGGATCATTTCCCTGTATCTTTTCCTGGGGCTTCTTCTCTTACGGCCCAGCAATTTTATAATGAATCATTTGATGATCTTAAGACCTTATGTCGCCGGTTTCATCTCTATGATGATACCATTTTTAAATTAAATAAGAATACACCAATTGGCAAAATTATTTATAGAGTTCCACTTAATCCCGCCGGTTTCTTTTATGATTATTCTTTGCTTCCCGCTGGTAGTGGAGTCCGCGAGTTCCTCTCTAAGTCTCGTGGTTCTCCTATGAATATTCTTGCTTCCTGCTTTCGCTTTTTTAAAGGAGGTCTCAGATGTAAACTAATTTTCAAGTCTGATTCTACTGAGCCTCTTATAATTAGTGTATCTCATATCCCCGATCGAGTAGTTGTAGACAAACCCTCTACCTCTCTGGTTGATTCAACCGAAAACTTTAGCTCTCAAGGCTATGCGTATTATACGCAAAGTGTTCGGTTGAATGAAATCATTGAGATAGAGTGTCCCTATTATCTTAATAGTGAATATGGTGTGCTTTGTACATATGCTGAAGCTGACCCTAGTATTCGTCCCTATATATCTTTGGGTGATCTTTGTGTCTCTATTGTTTCTCGCCCTCTCGCCGAGCTTAATGTAGTTGTTGAAGTATATGTTGCTTTTGCTGATGATATGCGCTTTTCTTCTTTTCAAGGCTTTCCCCTGTGTGTATCACCTTTCCTCATACCATCTCGACCTGCTTCTCTCCCTGTTCCGCCCCAACTTTCGAAGGGCAGTGAGCCGGAGCAGATCGAGCATCAAATGTTTACTCCTCGCTCCACCGTTGCTAAGTGTACGTCTGTTGTTTTTGACAAAGTTGCTCAATGTTACGACGGCGCTCGTGATAGAGTTACAGCCGACATTAAGACCGCTATTGCAGAGGGAGCTGCTGAGCCCCTGGAAACGCTCAATCGTTTGGTTGACACTACTATTGAAAGTGTCGACCAGCGGCTTGATCGAGCCCAGAGTCTCGTCAGTACTCTCTGTGACAGTCTTCGTACTGCCGGTAGTGAACTGTATTCACTAGCTGTCGTCGTTGTGTCCAACTGTATCCATGTTTGTCGTAAGCCTGATGTTGTGTCTATTATTGTTGCTATTTCTGCTATTTTTATGCAAATCCTTAATCATTTTGGTTTTTCTATAGCCTATGATGTTGTTTATGATTTCTTTAAGTATCTTGTTGAAAAAATTGGGGATATTTGTGCTTGGTTTAGACCTAGAGATAGTATTGAGCACCAAGATGACAAACTTCGGCGCTTGTCTTTAATAGATGTCTGCAAACAGTATGGTAAATTTTTAGCTTCCATTTTTAGTTTTTCAGGCTGCAAAGACAAGTCTTGGCCCAATTTCTTTTCCCACTTTGCTCTCAATATGAGTAAAATGGGACCTGGAATTGAGTCAATAATTGACTTTGTTAAATTTAATATTGATATTCTTCATTCTTGTGTTGATTGGCTCTTAATGAAAACTACTGGAACGACACTAGAGCGTTTCAT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20,417
ON811762.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_2
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
8,263
GenBank
null
China:Linzhi
China
Ixodes ovatus
null
2018
SAMN28669595
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_2, complete genome
TAGGCCTGTTTCCTCATTGACTAAATTAGTCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGAAAAGATTCGGCTCCGTCGAGAGCTTCGACGCCAGCAATTGCTGGAAAAAATTTCAAAAAAAAAAAAAACTAGATTTTCGGTATTAACTCATGACGAGTTAGTGGAGCGGCTTAGAGCCGTGGTGCGGCCTCTGATTGAGGCAAGAAAAAAAAAATTTTTTTCTTTGGAGCATCTCTTCAATGGAAGAGATTTTAAAAGTTCGACAAAAATCCAAGTATTGCCCCCCAGAGTCGATTGGCAAATGGACTCGGAGGGCACTAGTGTGAACCCTATAGAGAGTTCTACAGTAGAGCAAACCTCTAATGTAGTTAATGTTGATCAGGGTTCGACGACAACTGTTGATACCCAAGCAAACATACGGTATAATACTCGTGTGTGTGAGGGTTCTCAAAATCAGGCTCTTACCGAAATGATAGAGCGATTTGTTGCCTTTGATCAGATTAAATGGGCTTCAAAGCATGTAGCTAATGAATTGTTAAAGGTTTATAGATTACCAGAAACTTTGTTTAAGAATATCTCTAAAACTTCTCCTAATACTTTGATCTTCACTAAGTGGATGTATTTTAGCTTTGATATGGAATTTAGAGTTCAATTAAATGCTAATCGTTATCAAGTAGGTCAGCTTCTTGTGGCTTGGAATTATGATTATGGAGCTCAAAGAATACAGAATATTAGTGATGCTGTTCAAGCTCCTCATCATATTATAGCTGCACCAGGCAATAACGTAATAACTTTTGTTATTCCTTATAAATGGTGCTATCCTTATTGGTCAATTAAAGATGTCCAGGATAAAATTAATATGATAAGTTTAAAATTTTTTGTCTTATCACCACTGAGTGTTCCTGGCACTACTGGAAGTGAATGTAATGTATTTATTCAAACACGTTTTAAGAATATGCAACTTAGCGGTATGCGAGATATGACTATAAATCCATCTCATCAGATGTTTAGGGCAGTTTTAACTGGAGTTGAGAGCATGTTGCGCTCTTATAATTCAGATCGTAATCGAGATAATCCTACTGATCCTAGACCTGCTTCTGCCATGGTTCCATTTTCTTCTCATTCATGGTGTATTGGTACTAATCAGGTCGAGGTATCTAATATTTTGCGATTAGATGCTGTAGCTACGACTCCTCATTATGATGAGCCGGATGAAATGTCAGCATTGTTGATAGCTCGACATTTTGGAGTGTTGACAACGCAGAAGTGGACAACGGCTGATGTTTATAAGACTAAATTGTTTTCTTTCGCCGTTGCTCCTCTTACTGTTTCTAATGTTCGTTATAAGGAAGCAGGCGGAGATAATGGATTAGATAAATTTGGTCTTTCTCCCTTGGGAAGAATGGCCAGTTTGTATGCTTATTGGCGAGGTAGTATTGAATATCGGTTTGATTTTGTTGCTAGTATGTTTCATACTGGTCGTATTGCCGTTTGTTTTGTTCCTTATTCAGCTAGTGGGGTATTCGATAATGATGTTCAATCTTATGTAGAGTATTTTGATTTAATGGATAATTTAAGTTTTACTTTTTCTTGTCCGTATTTGTGTAATATTCCATGGCTTCCAACGAGTTCAGCTGAAGCAAGGTTCCCTTATGACTCTACTCCGCCACGTATCGGAGATTTAATTGTTTATGTAGTTAATCCATTAATTGCGATTGATGGGGTTTCTAATAGTGTCAATATAATACCGTATGTTCGTGCTGGCAATGATTTTAAATTTGCTGTTCCTATTTTTCCTTTATCTTTTCCTCTGTCTATAGGAAATGATTATCATATAGCTTCTGGTGCAGGTCAAACTAAAGCTGGTTACTTTCCCGTTTATTCTGGATCTTGGAGGTTGTTTAGTGGTAAAGTAATTTTGAGATATGGTAATGTTTCTGATCATATTGCTCAGTTTGATGGAGTTAAATATGGCCAGGTTTATAAGAGTACTGAGCCAATATTGGTTAAAACTTCTTCAGCGGCATTATATTGTCGGTATTTTGCTCGACCAAAAATTTCGGGTCAGGAAACTTATGCCTATTTGGCTCCTTTTGCAGAATATAAGGATGCTTTAAAATTTGCCACTACTAATGACGTCGCCAATTGTATTACGTTTGTTGCTGATGGCGATTTTAGTTGGAAGAATGGTCAGGTTTTGGAACCTGTTTCTGAGATCTCTCATGAAGGAGATGATCGTTTAAATGCGAATCAGCAGATTCGACCGGGGTGTGCCGATTCTTCATCATCATCATCTTTCTTTAATGAGGAATTTATGGACTTAAAGACTCTTCTTAGACGTTATTCGTTATATTGTGATATTAGTGTCTTAGTTGAGAAGGATATTCCTTATGGGGCTGTATTTTATGTAGTTCCTTTGATTCCTAGTGGTATTCGAATGAACTTTGCCCATGTTCCAAAGGGTAATAAGTCTTTGGAATTTCAATCTCGTACTAGAGGGGGGGTTATGGCTTCAATAGCTGATGGCTTCCGTTTCTTTAAGGGAGGTATGCGTGTTAGAATAGTGTTTAGAAATTTAAATGGTAAAGATCTATTTTTGCAAGTAACACATGTTCCCGACAGGTATATAGGACCTACACCTCGTCCTATTGTAAAATTTGACACTCAAAATTTTGTTGGTAATGGGTATGCTTATTATTCTCAAAGTTCTCGTATGAACGAGTGTATTGAGATGGAGATACCTTATTATCTTAACGCCGATTATGGTCTCTTGTGTTCGCCTGATAGGCTTCCTGAACGTTATCAGCAACAGTGTACGTTAGGTTATTTGGCTTTTTCAACACTTTCTCGGTTGGAAGAAAATTATGATCTAACAATTCAGGTTTTTACGTCATTTGCGGATGATATGAGATTTTCGTCATATCAAGGTTTTGGTCTTAGTTGTAGTGCTTTTCAACTGCCGGACGAGCAATCGATGAGCGTGCAGTCGCTCAAACTTTCACAGACTGTACGTTCTAGAACGTCGTCCGATGATTTTGAAAAAATAGAGCATCAGATGGAGCGGATTCAATCTGCTGTCTCCTCCTCGGTTCGATCTTTAGCTCAGGTTGCGGGTCAATCATTTTCTAGTGAAGTTAGATCTACCGGAATAGAATTGGGTGAGCGTTGGCAGGATCAGTTACGAGATGTATCTCATCAGTTTAGCGAAGAGGTTATGTCTAAGATTGAGGAGGTTTTGAAGATGGTTAAGGACACAGCTTCAGATATATTCGCTAAGAGTAAAAATTTTTTTGTTACTGTAGTATCCCAATTGGCTCATCTTTTGATGAATCCTTCTCTTACGGCTTTGTCTATAGCTACTGCTACTTTGTGGTGTTCTTTCTTGCCTAGTGACACTGGTTTTTCAATGTTTAATACCATCTTGAGTATTTTGCGACATCCTTATGTTCAGAATTTTATGAGTGTAATTGTTGGATTCGGAACATTTAATTGTTTTGCTGATATTAGAGAGCGTGTTGTTCATCAGTATGATTCTGATGATCTCATTACACTTTCATCAACCTTGATAACTGCCGTCGCTACTGCGCTCGGTTATAAATTGAGTGCTAATAGTTTAAAAAACTGTCCCAATTTTATGCATTATTTATTAACTCATATTCGTGAGATTACTTTAACAGCAACTGGCTTAGTTTCGTTTTTAAAGATCAATTTGAAGGTCTTTTCAGCTATTGTTGATTGGATTTTGCGTAGTGTTTTGGGGCTAGGTTTAGATGCTATTGTTAGTTCTGATGATGCTAATATGCGTAAGTGGTGCCGAAATGCTCAGATGCTTACTCAGTCGTCAAACCGTCATATGGTATTTTCCGATGATTATCTGCAACGTGGTGTCTTTAGAATGTATGCTGTAGGACAACAGATGCTTATTGAGGACGCCAATTCCAAAGGTCAAACTAAGATTAGCTCTTTGGTTCGTGAATTAGTAACTAAATTGGGTAAGCTTCAGGAAGATTTGATAGAGCAGTGTTTTTGTCCAAATGCCCGTTATGATCCTTTTGTTCTTCAGATTGTGGGACCACCGGGTATAGGTAAGTCCGAACTTTATACAACTCTAGGTATAGAGATGCTTGAGTCTATAGAATATGTTGCTTTTGGTGATCCTATTTTTGTTAAAACTTCAGGGCCAGCATATTGGAATGGCGTTCGAAATCAGCCTGTACTTATTTACGATGATTTTTTCTTTTTGAGATCGGGAACCATGCTTGAGGAGCAGATCGCCGAATTTAACCAGATCAAGTCTTGTGCTCCATTTAACCCCCCTATCGCTGAACTTGAAAATAAGAAGTTGCGATATAATCCGCTAATTGTTTTATTGGCAAGTAATGCAGCATATTGGCCAGACACTGTTCAGGTTCGTGATTTGGACGCTTTACATCGTCGTCGCGATATGCTATTTGAGGTTAGATTAAAAGATACTTATACTATGGATCGGGTTCGTAGAGAATTTATTGAGCGTGGCTCAAAGAGTTACGATCATTTGGAGTTTGCTAGGTATAATTCGGTTTTGACACCTGAGGAAGGTAAAAGCGAATGGATGAGTTATTCTTCCTTTCATAGTTGGGTAATGACTGAGTGGAAGAACTATCATAAAATTCAATTAGAGCTTTACAAGCAGCGCTTGCAAACACTAGATAGGTTAAGACCGCCTAGTGTGCCTCTGGAGTTGGAGGAATTGGCTAGTGTTTATATCCCCATAGTGTTGTCTGGGATGTCTCAGACTTGTCAAAAAGCTAATATAGAGGAATTCTCGCGTTTAACTCGAGATAGAAACGATACTACTATTAGAACTGTGCAGGGCTATCCTAGTGAGTTTGCAGAGGCGCGTACTATCTTGCGAGATGAACATCCTAAGTGGGATATTCATTGTCAGGAGCGACCTAAAGAAAATTTAGCCGATAAGGCCGCTAAACATAGAGAAGAGCTGGCTCGTAGAGCCAAAGTTGAAG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20,419
ON811763.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_3
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
8,263
GenBank
null
China:Lhasa
China
Ixodes ovatus
null
2018
SAMN28669595
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_3, complete genome
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20,420
ON811764.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_4
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
8,310
GenBank
null
China:Lhasa
China
Ixodes ovatus
null
2018
SAMN28688443
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_4, complete genome
TGACGTTATGCTCGTATCGAATGCGTTTATACGGATTGTGCTAAAACTCTGTCTTGATGATATTTCGGAAAGCAAGCATAACACTCCAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTGAGAGAATTCGCCTTCGTCGCGAATTGCGGCGCCAGCAATTGCTGGAAAAGATTTCAAAAAAAAAAAAAACTAGATTTTCTGTTCTAACTCATGAGGAGTTAGTAGAGCGGCTTAAAGCCGTAGTGCGGCCTCTTGTTGAGGCAAGAAAAAAAAAATTTTTTTCTTTGGAGCGTCTCTTCAATGGAAGAGACTTAAAAAATTCAACGAAAATCCAAGTATTGCCCCCCAGAGTCGATTGGCAAATGGACTCGGAGGGCACAAGTGTGAACCCTGTTGAGAGTTCAACAGTAGAACAAACTTCTAATGTTGTTAATGTTGATCAGGGTTCAACGACGACTGTTGATACCCAAGCTAACATAAAGTATAATACTCGTGTTTGTGAAGGGTCTCAGAATCAGGCTTTGACTGAAATGATTGAACGGTTTGTAGCTTTTGATCAAATTAAGTGGGCATCTAAACACGTAGCTAACGAACTGCTTAAAGTTTATAGGTTACCTGAAACTCTGTTTAAAAATATTTCTAAGACTTCGCCTAATACTTTAATTTTCACAAAATGGATGTATTTTAGTTTTGATATGGAATTTAGAGTGCAATTAAATGCTAACCGTTATCAAGTTGGTCAGCTTTTGGTGGCTTGGAATTATGATTATGGTGCTCAGAGAATTCAAAACATTAGTGATGCTGTTCAGGCGCCACATCATATTATAGCTGCTCCAGGTAATAATGTAATAACATTTGTTATTCCTTATAAGTGGTGTTATCCCTATTGGTCTATTAAAGATGTGCAAGATAAAATTAATATGATAAGTTTAAAATTTTTTGTTTTGTCTCCTTTGAGTGTTCCTGGAACTACAGGAAGTGAATGTAATGTTTTTATACAAACTCGCTTTAAAAATATGCAGCTGAGTGGTATGCGTGACATGACTATTAATCCTTCTCATCAAATGTTTAGAGCTGTTTTAACTGGTGTAGAAAGTATGTTACGATCTTATAACTCTGATCGTAATCGTGATAATCCTACAGATCCTAGACCAGCTTCAGCGATGGTTCCTTTTTCTTCTCATTCGTGGTGTATTGGAACTAATCAAGTTGAGATTTCCAATGTTTTGCGACTTGATGCTATAGCAACAACTCCTCATTATGATGAGCCTGATGAAATGTCCGCTTTGTTGATAGCTCGACATTTTGGAGTTTTGACAACTCAAAAGTGGACGACGGCTGATGTGTATAAAACTAAACTGTTTTCGTTCGCCGTCGCTCCTCTTACTGTTTCTAATGTTCGATATAAGGAAGCAGGCGGTGATAATGGTTTAGACAAGTTTGGCCTTTCTCCTTTGGGACGAATGGCTAGTTTGTACGCTTATTGGCGAGGTAGTATTGAATACCGATTTGATTTTGTAGCGAGCATGTTCCATACTGGTCGTATTGCTGTATGTTTTGTTCCTTATTCGGCCAGTGGAGTATTTGATAATGATGTTCAATCTTATGTAGAGTATTTTGATTTGATGGACAATTTGAGCTTTACTTTTACATGCCCTTATTTATGCAATATTCCGTGGCTTCCTACCAGTTCGGCTGAGGCTAGGTTTCCCTATGATTCTACTCCACCTCGCATAGGAGATTTGATTGTTTATGTTGTTAACCCGTTAATAGCGATTGACGGTGTAACAAATAGTGTTAATATTATACCCTATGTTCGAGCTGGTAGTGATTTTAAATTTGCAGTTCCTATTTTTCCTTTATCTTTCCCTTTATCTATTGGTAATGACTATCATATAGCATCAGGAGCTGGGCAGACAAAGGCTGGTTATTTTCCGATTTATTCAGGATCATGGAGATTATTTAGTGGTAAAGTTATTTTAAGATATGGTAATGTTTCTGACCATATCGCTCAGTTCGATGGAGTAAATTATGGTCAAGTTTATAAGAGTACTGAGCCTATTTTAGTTAAGACCTCTTCAGCAGCATTGTATTGTAGATATTTTGCTCGACCTAAAATTTCAGGTCAAGAGACCTATGCTTATTTGGCTCCTTTTGCAGAATTTAAGGATGCGCTTAAATTTGCTACTACTAATGATGTGGCCAATTGTATAACTTATATAGCCGATGGAGATTTTAGTTGGAAGAATGGTCAAGTTTTAGAGCCTGTTTCCGAAATTTCACATGAGGGAGATGATCGACTTAATGCAAATCAACAAATTCAACCTGGTTGTGCCGATTCTTCGTCATCATCATCATTTTTTAATGAAGAATTTATGGATTTAAAGACTCTCTTGAGACGTTATTCGCTTTATTGTGACATTAGTGTATTAGTTGAAAAAGATATACCCTATGGTGCAGTTTTTTATGTAGTTCCTTTGATTCCTAGTGGTATTCGAATGAATTTTGCGCATGTTCCTAAGGGGAATAAATCTCTAGAATTTCAATCTCGTACTAGGGGAGGGGTAATGGCCTCCATTGCTGATGGTTTTCGATTCTTTAAGGGAGGTATGAGAGTTAGGATAGTTTTCAGAAATTTAAATGGAAAAGACCTCTTTTTACAAGTTACCCATGTTCCTGATAGGTATATTGGCCCTACGCCGCGTCCTATTGTAAAGTTTGATACTCAAAATTTTGTTGGCAATGGGTATGCTTATTATTCTCAGAGTTCGCGTATGAATGAGTGCATTGAGATGGAGATACCCTATTATCTTAACGCTGATTATGGTTTGTTGTGCTCTCCCGATAGACTTCCGGAGCGTTATCAGCAACAATGTACATTGGGTTATTTGGCCTTTTCTACGTTATCTCGTTTAGAGGAAAATTATGATTTGACTATTCAGGTATTTACCTCGTTTGCTGATGACATGAGATTTTCCTCGTATCAGGGTTTCGGGTTGAGTTGCAGCGCGTTCCAGTTACCAGACGAACAATCTTCGAGTGTACAGTCGCTCAAACTTTCACAGACTGTGCGCTCGAGAACGTTATCTGATGAGTTCGAGAAAATTGAACACCAAATGGAGCGAATTCAGTCTGCTGTCTCTTCCTCCGTTAGGTCTTTGGCTCAGGTTGCTGGTCAATCCTTTTCTAGTGAAGTCCGCTCCACAGGTATAGAGCTAGGGGAGCGTTGGCAGGATCAACTCCGAGATGTATCTCATCAGTTTAGTGAAGAAGTAATGTCTAAGATAGAGGAGGTTTTGAAGATGGTAAAAGAAACTGCTTCAGATGTATTTGCTAAAAGTAAAAATTTTTTTGTAACTGTTGTTTCTCAGTTAGCTCATTTGCTTATGAACCCTTCTTTAATGGCATTGTCTATAGCTACTGCTACTTTGTGGTGCTCTTTTCTTCCAAGTGATACAGGGTTTTCTATGTTTAATACTATCCTAAGTATTTTACGTCACCCTTATGTTCAAAATTTTATGTCTGTTATTGTTGGCTTTGGAACATTGAATTGTATTAATGATATTAGAGAGCGTGTAGTCCATCAGTATGATTCAGATGATCTTATAACTCTTTCGTCTACATTGATTACTGCAGTTGCTACAGCTTTGGGATATAAGTTAAGTGCTAATAGTTTGAAAAATTGTCCTAATTTCATGCATTACTTGCTTACTCATATTCGAGAAATTACTATGACTGCAGCAGGTTTGGTTTCGTTTTTAAAGATAAATTTGAAGGTATTTTCTGCGATAGTTGATTGGATTTTGAGAAGTGTTTTGGGTTTGGGATTGGACGCTATTGTTAGCTCAGACGATGCTAATATGCGTAAATGGTGTCGCAATGCTCAAATGTTGACTCAGTCGTCGAATCGACACATGGTGTTTTCTGACGATTATTTGCAACGTGGAGTCTTTAGAATGTATGCTGTGGGTCAGCAGATGCTTATTGAGGACGCTAATTCTAAAGGTCAAACTAAGATTAGCTCATTGGTTCGTGAGTTGGTTACTAAATTGGGTAAGTTGCAGGAGGATTTAATAGAACAATGCTTTTGCCCTAATGCCCGTTATGACCCCTTTGTTCTCCAAATTGTGGGGCCTCCTGGGATAGGTAAATCAGAACTTTATACAACGCTTGGAATAGAGATGCTCGAGTCTATAGAGTATGTTGCTTTCGGTGATCCTATTTTTGTTAAAACTTCGGGGCCAGCTTACTGGAACGGTGTGCGTAACCAGCCAGTTCTTATTTATGATGATTTCTTTTTCTTAAGATCGGGAACTATGCTTGAAGAGCAGATTGCGGAATTCAATCAGATTAAATCTTGTGCTCCTTTTAATCCGCCTATTGCTGAACTTGAAAATAAGAAGTTACGTTATAATCCATTAATCGTTTTGTTGGCAAGTAATGCAGCTTATTGGCCTGATACTGTTCAGGTTCGAGATTTGGATGCTTTGCATCGTCGTCGGGACATGCTATTCGAAGTTAGATTAAAAGATACTTACACTATGGATCGCGTTCGTAGAGAATTTATTGAGCGTGGTTCGAAAAGTTACGATCATCTTGAGTTTGCTAGGTATAATTCCGTTTTAACCCCTGAGGAAGGTAAGAGTGAGTGGATGAGCTACTCCTCTTTTCATAGTTGGGTAATGACTGAATGGAAGAAGTATCATAAAATTCAGTTGGAGCTTTATAAGCAGCGTCTTCAGACTTTAGATAGATTAAGGCCGCCGAGTGTACCTCTAGAGTTAGAGGAGTTAGCTAGTGTATATATCCCCATAGTCTTATCAGGTATGTCTCAAACCTGTCAAAAAGCTAACATTGAGGAATTCTCGCGTTTAACGCGCGATAGAAATGACACTACTATTAGAACTGTGCAAGGTTATCCTAGTGAATTCGCTGAGGCCCGTACTATTTTGCGAGATGAGCATCCTAAATGGGATATCCATTGTCAGGAGAGACCTAAAGA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20,421
ON811766.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_2
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,278
GenBank
null
China:Tongren
China
Haemaphysalis hystricis
null
2019
SAMN28669380
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_2, complete genome
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20,422
ON811767.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_4
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,273
GenBank
null
China:Tongren
China
Haemaphysalis hystricis
null
2019
SAMN28704304
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_4, complete genome
AAGAAGAGTAAGATTCTTTGAGTGCTTTGTGAGCTAAACAACGTCGGCCCGTTTTTAAGCGGTTAACCACGTTTGATGTTCGCTGCGATTCTCAGTTTTGCGCTCCAATTTGCCTTTGGGTATTTTGCAACGCGTTATCTTTTGAGATCACGTCACTTGGCCGATTTCGTACGTGAGTACGGAATTTTGATTCTTGCTCTTATTTTACCAGTTTCTCTTGTTATAATAAGTCATTTCATTTTTCTTCGACTGCACTAACATGTTTTATTATAAGACTCCTCAGTGTTTGCCCCTTCCCCTTTTGAAGTTTGAAGTCTTTGAGTTGGAGAATGGACGTTATCAGTTTAGGGCTATTGTCTTTAAGTGGGCTGTTAATAGTTGGTCTTGGTTTGATGATTTTGATATTTTATTTCAGGATATTGATTCTTTTGGTCAGAGATTATGTAGTTGGGTATCGCGCACTTTAGCACGATTTCTACATTCTCATGTTCCACTTCGTGAGTCATGGCTTCGTCAGCAGATGCGTTTTGAGGGTCAACTTGTCCCTCTTATGCTTCATGTTGATATTGCTAATATTTTGAAGTCTTTTTATTTTTCACAGGCTCCACAGTATGCCCAGGCGTTGCGCCGGGATATTATTGGGGATCTTATGGCCCACAGCCGAGAGATAAGTAAGCTTATTTCTCCTCTCGGGGGACGGTTGTCTCCCATGTATTTTAATCTGGATCGTACTAACATGCGATCTTTGTTTGAGGAGTTTCATGTTTACCGTACTGCTAAGGCTGTTCAGCGACGAGATCGAGCACGTGAAATGGAGGAGCTTCAAGAACGTCGTCGGATGGCAGGTCGTCTGAATGCCACCCGTGCTCAAATTCGAGCTGAGCGTAGGGAGCTTCATGAGCAGTTGCAAGCTCAGTATCATGCTGAGCGTATTAATAAGCGACTGCGTGATTCTATTCGTCGGAGTCAAAACTTCATGAAGGAGTGGTGGCGAAAGGTTGATGCCGGAATTGTTTATGAACCTCTTTCAGAAGAGGATCATAAGATTGTTGCTGAGAAATATCAACAGTTGTTGATACAGTTTCAAGAGCAACGTAAACCAAAGAATCTTTCTAAGATAAAGTACTTAGGTTGCCCAGTGATAGACTTATTTTATACATCATCTTATCAGATGTTTCGTCGGATATTAAGATGTCGGCGAGTAAAATATTGTAATGAGTGTTTTCGACTCACTCGTCTGATATGTGTCGACGGAGCGGCTGCGATGTTTCCGCGTTACCGGCGACTTTTTACAGAGTCTTCAGAGTTCCAAGTATTGCCCCTTTCGGGGCCAGAGTGTGTTATTGAACATCAGGCTGGAGAGGAGGATATTGTAAATACAGATCCTGTGGCGGTATCTGAGGTAACAACTTCCTCGAATGTCCAATTGGTGGATGAGTCTGTTGCGGCGAATGTGGTCTCACAGTCGCCCATACAGTACCCCTCATTGATTGATGGAGGTAGAGAAGCTACTATTGTTGCAGAGCAGTGTTCTCGTTATGCTTATTTTGATAGCTTTGAGTGGAATGCTAACTCTAGTATTCAGTTAAAGAAATATACTTTTCCTAGTGGATTAATAAGTAGTGCTTTTTATTCTACTCCAAACATGATTTTGCTTAGTAAGTGGTACTACTGGCAATTTGATATAGATATTAGGTTTAGCGTTAATGCTAACCGTTATCAGACTGGTCAATTGTTGATTGGATGGAATTATGACCACTCTTTCGGGAGTAAGGGCATGGCATCAAATCATGAGGTTGTTCAAGCTCCCCATTCAATATTGTACGCTCCTGTTAATAATGTGGTAGAGTTGATAATACCTTATAAGTTTTATTATCCTTATTGGGCTCATGATTCAGCAGTTTCTCCTCCAGATTTTATTACCGTTCGTGTTAACGTGTTGAACGCATTATCAACTGGTGATGGGGTTGCTGCTTCCTGTCGTGTTATGGTCACTATTCGGTTACGTAATGTGAAGGTAGCAGGTATGCGGAGTATGGCTGGTGTTTCTCGTATTGAACATCAGATGTTTTCTATGGCGGTTAAAGCAGTTCAGTCTTCATTGCGTAGTGTTATGGAAGATTTGAATAGGGATAATCCTACTGCTCCAACGCCTCATCCTGCTGTAGTTCCTTACTCTGCTCATTCTTGGAGTGTAGGTACTAATCAAGTTGAATTGTTGAATCCTCTTCGTTTGGACCCATTAGGAGTGACTCCTCATTTTGAGCCCTCAGATGAGATGACAGTGAGTAATATTGTTAGTCATTTTGGCTTAATAAAAACTTTGGAGTGGAATATGTCACAGCCTAGTGAAACACTTTTGGCTACCTTTCTGGTTACTCCAATGAATATAGCTGATCTTCCTGTTCGTATTTCGGGAAAGCCTGAGGAGAATTCCCTTACTTCTTATGAGAGTACACCGTTGGCTGTTATATCCTCTTTATTTGCTTATTGGCGTGGGAGTATACAGTTTAGGTTTGATTTTGTAGCTAGTATGTTTCATACAGGTCGATTGGCCTTTTGTTTTATACCCACACTTCGAGGGGTGGAAGCTGTCACTTTTGCTAATGCTCTACAGTCATATGTGACTTATTTTGATTTGGGAGGGGATCCTTCAATAACTATTAATTGTGATTATATTTGTAATAATACATGGAGGCCCACCCATCAGGAGGGACAGTTTCCTAACACTAATGATACTAGTGCAGTTATAGGAAAACTTTTTATATATGTGGTTAATCCGTTAGTCGCCGTCTCAGGTGTTTGTAATAAAGTTTTGATTAATACTTATATTCGCGGTGGTTCTGATTTCCACGTGGCTGTACCTGTGTTTCCGATGCTGTTCCCCATTTGTTTAGGGACAGATTATATCCCGGTTACGACTTCAATCCGACCTAAAGAGGGGTATACTCCGGTATATTCCTCAACTTGGCGTTATTTTTATAGCGCTACTAAGGTAATATTACGTTATGGTGATGTAACTGATCATATAGCTCAGTTTACTCCCGTTATGAAGTTTGGGGAGGTCTATTTCTGTAGAGTTGGAGTTCCAGTTGAATTCCGTAGACAGTCACATGAGTGTAATTATTTTGTGAAGGCAGACATAGGTGATGAATATATGTATTTAACACCTTTTTATTCATATAATGCTGCCATTAAATTTATTCGGACGCGAAAAGCTGATGATTTGATCACTTATGAGCGTGAGGGAGCTAAAGTTGAATGGACTAAAGATACAGTTTTAATTCCTGTTACGGGTCCTCAATTTGATGATGAAGATTTTGAAGTTGTTCATGAGGCAGGAGATGATCGATGTGACCCGCATCTGCCTACAGCTCGATTGAGTGTTAATCGTCTTACAGCTCTTAATAGTTTTAATGAGGACTTTAACGATTTAAAGACTCTCTGTCGTCGTTATCAAATATGTGCTGATGTAGTAGTGCCTATTACACCTAATTTGGCCTTCGGTGAAGTGTTTTACTGTGTTCCTTTATTTCCTGCAGGTAATTATATTCCCTTTAGTTCTCAAGGTCCAGGTAATCTTTTTTATGAGTTTTTGAACCGAGCTAGAGCCTCACCTATGACTATTCTCGCGAATGGTTTTCGGTATTTCCGTGGGGGTCTTCGGGCAAAGATTCTAGTTAAATCGGGATCTGGTGTTGATGTTGTTGTTAGTGTTACCCATATTCCGGACAGATTGATGGCTAAGAAACCTTCAATTATTAGGTCGGAGAATACCAATGGGTATGCTTCACATGGGTATGCTTATTATGCACAGTCTACTCGAGTAAATGAGTGTATCGAAATTGAGATACCTTATTATCTCAATAGTGATTATGGGGTTCTTCTAGACCCCGCAACTATTGTGGATCAAAGTGAGTTACAATGTAGTCTTGGTACTCTCGCTTTTAGTCTACTAAATCGAGTAGATAAGGATATTACTTTGTCTATTCAGGTTTTTCTAGCGTTTGCAGATGATATGCGCTTTTCTTCTTTTCAGGGTTTTGGGGCTGTTGCTTCTACCTTTCAGATTCCTAATCATACCCCTCGTCCTAAATTGGCTTCGATAGAACTTTCGCAGGAGCCAATTATAGAGCATCAGGGATTATTGGGAGTCGATCAGGAGATTGTGCGTGGAGTACGTATGGCTAAGGCTGAAATGGAGGAAGCATTAGCTGAGCAATATCCCACTATCCGAGAAACAATAAGAGCAGATGTTCGTCAGGTGGTTAACGATAGTGTTAATGACGTGTGGGAGCAGGCTCAGCAGATAATGAATCAGCTCAAAGATTATATAGGTGATATAGGTTCTTCAGCAAAGAACTTGTTTATGAGCGTTATTTCTAATATCGTTCATGTTTTGCTTAATCCCTGTTTAAAGAGTGTTATAGTGGCACTGTGCTGCATCATAGGTTTGTGTATAGATGGAGCAAATTGGTGTTTAGGATCGCTAGTAGCTTTTTACACCAAGTTTATGGAATTTGTTCAGGTATCCTATAATAGCGTTAGAGATTTTACTCGCAAGTGTCTTAATTGTATGGGTATTGGCTGTCCCCGATGTGGTTTGGTTGAGCGCAACCATGTTCTATGCCCGGATGTGATTCAACACCAAGCTGGTGTGGAAGCATTATCCACCATTGAACCGCTAACTATAAATTATGTCACCTTAATTGCCTCTTTCTTTGGTTATAAGGAGATTGCAAAAAATCGGAGTTTTCCTAACTTTTTATCTTATGCATTTCTTAATTATGGCAAGTATTCTTCTGGTGTTACCGGGTTGGTTGAGTTTATAAAAACTAATATAAGGGCTCTTTATTCGTGTATAGATTGGTTATCAGTACAAATTACGGGGTCTGGAATTGATTACTACATTTGCAGTTATCCCACTGAGCTTCAGAAATTTTGCCAAAATGCACAGGCTCTCTTGTCTCCCATGAATCGAGAGAGGGTATATGCAGAGC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20,423
ON811768.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_5
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,274
GenBank
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China:Tongren
China
Haemaphysalis hystricis
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2019
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20,424
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_6
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,271
GenBank
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China:Tongren
China
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2019
SAMN28669381
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_6, complete genome
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20,425
ON811770.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_7
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,276
GenBank
null
China:Tongren
China
Haemaphysalis hystricis
null
2019
SAMN28669382
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_7, complete genome
TGAAGAAGAGTAAGATTCTTTAAGTGTTTTGTGAGCTAAACAACGTCGGCCCGTTTTTAAGCGGTTAACCACGTTTGATGTTCACTGCGATTCTCAGTTTTGCGCTTCAATTCGCCTTTGGGTATTTTGCAACGCGTTATCTTTTGAGATCACGTCACTTGGCTGATTTCGTACGAGAGTACGGAATTTTGATTCTTGCTCTTATTTTACCAGTTTCTCTTGTTATAATAAGTCATTTCGTTTTTCTTCGACTGCACTAACATGTTTTATTATAAGACTCCCCAGTGTTTGCCCCTTCCCCTTTTGAAGTTTGAAGTCTTCGAGTTAGAGAATGGACGTTACCAGTTTAGGGCTATTGTCTTTAAGTGGGCTGTTAATAGCTGGTCTTGGTTTGATGATTTTGATATTTTATTTCAGGATATTGATTCTTTTGGTCAGAGATTATGTAGTTGGGTATCGCGCACTTTAGCACGATTTCTGCATTCTCATGTTCCACTTCGTGAGTCATGGCTTCGTCAGCAAATGCGTTTTGAGGGTCAACTTGTCCCTCTTATGCTTCATGTTGATATCGCTAATATTTTGAAGTCTTTTTATTTTTCACAGGCTCCGCAATATGCCCAGGCTTTGCGCCGGGATATTATTGGAGATCTTATGGCTCATAGCCGAGAGATAAGCAAACTTATTTCTCCTCTTGGGGGGCGGTTATCTCCCATGTATTTTAACCTGGATCGTACTAATATGCGATCTTTGTTTGAGGAGTTTCATGTTTATCGTACAGCTAAGGCTGTTCAGAGACGAGATCGAGCACGTGAAATGGAGGAGCTTCAGGAGCGTCGTCGGATGGCAGGTCGTTTGAATGCTACCCGTGCTCAAATTCGAGCCGAGCGTAGGGAGCTTCATGAGCAGTTGCAGGCTCAGTATCATGCTGAGCGTATCAATAAGCGACTGCGCGACTCCATTCGTCGTAGCCAAAACTTCATGAAGGAGTGGTGGCGAAAGGTTGATGCTGGGATTGCTTATGAACCTCTTTCAGATGAAGATCATAAGATTGTTGCTGAGAAATATCAACAGCTGTTGATACAATTTCAAGAGCAACGTAAACCAAAGAATCTTTCTAAGATAAAGTACTTAGGTTGCCCAGTGGTAGACTTATTTTATACATCATCTTATCAGATGTTTCGTCGGATATTAAGATGTCGGCGAGTAAAATATTGTAATGAGTGTTTTCGACTCACTCGTCTGATATGTGTCGACGGAGCGGCAGCAATGTTTCCGCATTACCGGCGACTTTTTACAGAGTCTTCAGAGTTCCAAGTATTGCCCCTTTCGGGGCCAGAGGGTGTTATTGAACATCAGGCTGGAGAGGAAGATATTGTAAATACAGACCCTGTGGCGGTGTCTGAGGTAACAACTTCCTCGAATGTTCAATTGGTGGATGAGTCTGTTGCGGCGAATGTGGTTTCACAGTCGCCGATACAGTACCCTTCGCTGATAGATGGAGGTAGAGAAGCTACTATTGTTGCAGAGCAGTGTTCTCGTTATGCTTATTTTGATAGTTTTGAGTGGAACGCTAATTCTAGTATTCAATTAAAGAAATATACTTTTCCTAGTGGACTAATAAGTAGTGCTTTTTATTCTACTCCAAATATGATTTTGCTTAGTAAGTGGTATTACTGGCAATTTGATATAGATATCAGGTTTAGCGTTAATGCTAATCGTTATCAGACAGGTCAATTGTTGATTGGCTGGAATTATGATCACTCCTTTGGGAGTAAAGGTATGGCTTCAAATCATGAAGTTGTTCAAGCTCCCCACTCAATATTGTATGCTCCTGTTAATAATGTGGTAGAGTTGATAATACCTTATAAGTTTTATTATCCTTATTGGGCTCATGATTCAGCAGTTTCTCCGCCAGATTTCATCACCGTTCGTGTTAATGTGTTGAATGCTTTGTCAACCGGTGATGGAGTTGCTGCTTCCTGTCGCGTTATGGTTACAATTCGTTTGCGTAATGTGAAGGTGGCAGGTATGCGGAGTATGACTGGCGTTTCTCGTATTGAACATCAGATGTTCTCTATGGCTGTTAAAGCAGTGCAGTCTTCATTACGTAGTGTTATGGAAGATTTAAATAGGGATAACCCCACCGCCCCAACACCTCATCCTGCTGTAGTTCCTTATTCTGCCCATTCTTGGAGTGTGGGCACTAATCAAGTTGAATTGTTGAATCCTCTTCGTTTGGATCCATTAGGAGTGACTCCTCATTTTGAGCCTTCAGATGAGATGACAGTCAGTAATATTGTTAGCCATTTTGGTTTAATAAAAACTCTGGAGTGGAATATGTCACAGCCTAGTGAAACACTTCTGGCTACATTTCTGGTCACTCCAATGAATATAGCTGACCTTCCTGTTCGTATTTCAGGAAAGCCTGAGGAAAATTCTCTTACTTCTTATGAGAGTACACCGTTGGCTGTTATTTCTTCTTTATTTGCCTACTGGCGTGGGAGTATACAGTTTAGGTTTGATTTTGTAGCCAGTATGTTTCATACAGGCCGATTGGCTTTTTGTTTTATACCCACACTTCGAGGGGTGGAAGCTGTCACTTTTGCTAACGCTTTACAGTCATATGTGACCTATTTTGATTTGGGAGGGGATCCTTCAATAACCATTAATTGTGATTATATTTGTAATAATACATGGAGGCCCACCCATCAGGAAGGACAGTTTCCCAACACTAATGATACAAGCGCAGTTATTGGGAAACTTTTCATATATGTAGTTAATCCGTTAGTTGCCGTTTCAGGCGTCTGTAATAAGGTTTTGATTAATACATATATTCGTGGTGGCTCTGATTTTCATGTGGCTGTACCTGTGTTTCCAATGCTGTTCCCTATTTGTTTAGGAACAGACTATATCCCGGTTACCACTTCGATTCGACCCAAGGAGGGGTATACTCCAGTGTACTCCTCAACTTGGCGATACTTTTATAGTGCTACTAAGGTTATATTACGCTATGGAGACGTAACTGATCATATAGCTCAGTTTACTCCCGTTATGAAGTTTGGGGAGGTCTACTTTTGTAGAGTTGGAGTTCCAGTTGAATTCCGTAGACAGTCACATGAGTGTAATTATTTTGTGAAGGCAGATATAGGTGATGAATATATGTATTTAACACCTTTTTATTCATATAATGCTGCTATTAAATTTATTCGAACGCGAAAAGCTGATGATTTGATCACTTATGAGCGAGAGGGAGCTAAAGTTGCATGGACTAAAGATACAGTTCTTATTCCTGTTACGGGTCCTCAGTTTGATGATGAAGATTTTGAAGTTGTTCATGAGGCAGGTGATGATCGATGTGACCCGCATCTGCCTACAGCTCGACTGAGTGTTAATCGTCTTACAGCTCTTAATAGTTTTAATGAGGATTTTAATGATTTAAAAACTCTTTGCCGTCGTTATCAGATTTGTGCTGATGTGGTAGTGCCTATTACACCTAATTTGGCTTTTGGTGAAGTATTTTACTGTGTTCCTTTATTTCCTGCAGGAAATTATATTCCTTTTAGTTCTCAAGGTCCAGGAAATCTTTTCTATGAGTTTTTGAACCGTGCTAGAGCCTCTCCTATGACCATTCTTGCGAATGGCTTTCGATATTTTCGTGGAGGTCTTCGGGCAAAAATCCTAGTTAAGTCGGGATCTGGTGTCGATGTTGTTGTTAGTGTTACCCATATTCCGGATAGGTTGATGGCTAAGAAACCTTCAATTATTAGGTCGGAGAATACAAATGGGTATGCTTCGCATGGATATGCTTATTATGCACAGTCTACCCGAGTAAACGAGTGTATTGAAATTGAGATACCCTATTATCTTAATAGTGATTATGGGGTTCTCTTAGACCCCGCGACCATTGTGGATCAAAGTGAGTTACAATGTAGTCTTGGAACTCTTGCTTTTAGTCTACTAAATCGAGTAGATAAAGACATTACTTTATCTATTCAAGTCTTCTTAGCGTTTGCGGATGACATGCGCTTTTCCTCTTTTCAGGGTTTTGGAGCTGTAGCTTCTACTTTTCAGATTCCTAATCATACCCCTCGTCCTAAATTGGCTTCGATAGAACTTTCGCAGGAGTCAATTATAGAGCATCAGGGGTTATTGGGAGTTGATCAGGAGATTGTGCGTGGGGTACGCATGGCTAAGGCTGAAATGGAGGAAGCATTAGCTGAGCAGTATCCTACTATTCGAGAGACAATAAGAGCAGATGTCCGTCAGGTTGTTAACGACAGTGTTAACGACGTGTGGGAGCAGGCTCAGCAGATAATGAATCAGCTTAAAGATTATATAGGTGATATAGGTTCTTCAGCTAAGAATTTGTTTATGAGTGTCATCTCTAATATAGTACATGTTCTACTCAATCCTTGCTTGAAGAGTGTTATAGTGGCACTGTGTTGTATTATAGGTTTGTGTATAGATGGAGCAAATTGGTGTTTAGGATCGTTAGTAGCTTTTTACACCAAGTTTATGGAGTTTGTTCAGGTGTCCTATAATAGTGTTCGAGAGTTTACTCGAAAGTGCCTTAATTGTATGGGCATTGGCTGTCCTCGTTGTGGTTTGGTTGAGCGTAATCATGTTCTATGTCCGGATGTAATTCAACATCAAGCTGGTGTGGAAGCGTTATCCACTATTGAACCATTAACTATAAATTATGTCACTTTAATTGCCTCCTTTTTCGGCTATAAGGAGATTGCCAAAAATCGGAGCTTTCCTAATTTTTTATCTTATGCATTTCTTAACTATGGCAAGTATTCTTCTGGTGTTACTGGTTTAGTTGAGTTTATAAAAACTAATATAAGGGCTCTTTATTCGTGTATAGATTGGTTATCGGTACAGATTACGGGGTCTGGAATTGATTACTACATTTGTAGTTATCCGACTGAGCTTCAGAAATTTTGCCAGAATGCACAGGCTCTCCTATCTCCCATGAATCGAGAGAGAGTATACGCAGA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20,426
ON811771.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_10
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,270
GenBank
null
China:Tongren
China
Haemaphysalis hystricis
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2019
SAMN28704307
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_10, complete genome
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20,427
ON811772.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_11
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
9,270
GenBank
null
China:Tongren
China
Haemaphysalis hystricis
null
2019
SAMN28704307
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_11, complete genome
GAAGAAGAGTAAGATTCTTTGAGTGCTTTGTGAGCTAAACAACGTCGGCCCGTTTTTAAGCGGTTAACCACGTTTGATGTTCGCTGCGATTCTCAGTTTTGCGCTCCAATTTGCCTTTGGGTATTTTGCAACGCGTTATCTTTTGAGATCACGTCACTTGGCCGATTTCGTACGTGAGTACGGAATTTTGATTCTTGCTCTTATTTTACCAGTTTCTCTTGTTATAATAAGTCATTTCATTTTTCTTCGACTGCACTAACATGTTTTATTATAAGACTCCTCAGTGTTTGCCCCTTCCCCTTTTGAAGTTTGAAGTCTTTGAGTTGGAGAATGGACGTTATCAGTTTAGGGCTATTGTCTTTAAGTGGGCTGTTAATAGTTGGTCTTGGTTTGATGATTTTGATATTTTATTTCAGGATATTGATTCTTTTGGTCAGAGATTATGTAGTTGGGTATCGCGCACTTTAGCACGATTTCTACATTCTCATGTTCCACTTCGTGAGTCATGGCTTCGTCAGCAGATGCGTTTTGAGGGTCAACTTGTCCCTCTTATGCTTCATGTTGATATTGCTAATATTTTGAAGTCTTTTTATTTTTCACAGGCTCCACAGTATGCCCAGGCGTTGCGCCGGGATATTATTGGGGATCTTATGGCCCACAGCCGAGAGATAAGTAAGCTTATTTCTCCTCTCGGGGGACGGTTGTCTCCCATGTATTTTAATCTGGATCGTACTAACATGCGATCTTTGTTTGAGGAGTTTCATGTTTACCGTACTGCTAAGGCTGTTCAGCGACGAGATCGAGCACGTGAAATGGAGGAGCTTCAAGAACGTCGTCGGATGGCAGGTCGTCTGAATGCCACCCGTGCTCAAATTCGAGCTGAGCGTAGGGAGCTTCATGAGCAGTTGCAAGCTCAGTATCATGCTGAGCGTATTAATAAGCGACTGCGTGATTCTATTCGTCGGAGTCAAAACTTCATGAAGGAGTGGTGGCGAAAGGTTGATGCCGGAATTGTTTATGAACCTCTTTCAGAAGAGGATCATAAGATTGTTGCTGAGAAATATCAACAGTTGTTGATACAGTTTCAAGAGCAACGTAAACCAAAGAATCTTTCTAAGATAAAGTACTTAGGTTGCCCAGTGATAGACTTATTTTATACATCATCTTATCAGATGTTTCGTCGGATATTAAGATGTCGGCGAGTAAAATATTGTAATGAGTGTTTTCGACTCACTCGTCTGATATGTGTCGACGGAGCGGCTGCGATGTTTCCGCGTTACCGGCGACTTTTTACAGAGTCTTCAGAGTTCCAAGTATTGCCCCTTTCGGGGCCAGAGTGTGTTATTGAACATCAGGCTGGAGAGGAGGATATTGTAAATACAGATCCTGTGGCGGTATCTGAGGTAACAACTTCCTCGAATGTTCAATTGGTGGATGAGTCTGTTGCGGCGAATGTGGTCTCACAGTCGCCCATACAGTACCCCTCATTGATTGATGGAGGTAGAGAAGCTACTATTGTTGCAGAGCAGTGTTCTCGTTATGCTTATTTTGATAGCTTTGAGTGGAATGCTAACTCTAGTATTCAGTTAAAGAAATATACTTTTCCTAGTGGATTAATAAGTAGTGCTTTTTATTCTACTCCAAACATGATTTTGCTTAGTAAGTGGTACTACTGGCAATTTGATATAGATATTAGGTTTAGCGTTAATGCTAACCGTTATCAGACTGGTCAATTGTTGATTGGATGGAATTATGACCACTCTTTCGGGAGTAAGGGCATGGCATCAAATCATGAGGTTGTTCAAGCTCCCCATTCAATATTGTACGCTCCTGTTAATAATGTGGTAGAGTTGATAATACCTTATAAGTTTTATTATCCTTATTGGGCTCATGATTCAGCAGTTTCTCCTCCAGATTTTATTACCGTTCGTGTTAATGTGTTGAACGCATTATCAACTGGTGATGGGGTTGCTGCTTCCTGTCGTGTTATGGTCACTATTCGGTTACGTAATGTGAAGGTAGCAGGTATGCGGAGTATGGCTGGTGTTTCTCGTATTGAACATCAGATGTTTTCTATGGCGGTTAAAGCAGTTCAGTCTTCATTGCGTAGTGTTATGGAAGATTTGAATAGGGATAATCCTACTGCTCCAACGCCTCATCCTGCTGTAGTTCCTTACTCTGCTCATTCTTGGAGTGTAGGTACTAATCAAGTTGAATTGTTGAATCCTCTTCGTTTGGACCCATTAGGAGTGACTCCTCATTTTGAGCCCTCAGATGAGATGACAGTGAGTAATATTGTTAGTCATTTTGGCTTAATAAAAACTTTGGAGTGGAATATGTCACAGCCTAGTGAAACACTTTTGGCTACTTTTCTGGTTACTCCAATGAATATAGCTGATCTTCCTGTTCGACTTGCAGGTAAACCGGAGGAGAATTCTCTTACATCTTATGAGAGCACTCCGCTTGCTGTTATTTCTTCCTTGTTTGCTTATTGGCGTGGAAGTATCCAATTTAGGTTTGACTTTGTGGCAAGTATGTTTCATACTGGTCGACTGGCTTTCTGTTTTATACCGACACTTCGAGGAGTGGAAGCTGTTACTTTTGCTAATGCTTTGCAGTCATACGTCACTTATTTTGATTTGGGTGGAGATCCTTCTATAACTGTTAATTGTGATTATATTTGCAATAACACATGGAGGCCCACACATCAGGAAGGGCAGTTTCCTAACACTAATGATACTAGCGCAGTTATAGGAAAACTTTTTATATATGTGGTTAATCCGTTAGTTGCTGTTTCAGGTGTTTGCAATAAAGTTTTGATTAATACATATATTCGTGGCGGCTCTGATTTTCATGTCGCAGTGCCTGTGTTTCCAATGCTGTTTCCTATTTGTCTAGGAACAGATTATATTCCTGTTACGACCTCAATACGGCCTAAAGAGGGGTACACTCCTGTATATTCTTCAACTTGGCGTTATTTTTATAGCGCCACTAAGGTTATATTGCGCTATGGTGATGTGACTGATCACATAGCCCAATTCACCCCTGTTATGAAGTTTGGGGAAGTTTATTTTAGTCGGGTCGGAGTTCCAGTGGAATTTCGGAGGCAGTCGCATGAATGTAATTATTTTGTGAAGGCTGACATAGGTGATGAATATATGTATTTAACACCTTTTTACTCGTTCAACGCAGCAATTAAATTTATTCGGACTCGTAAGGCTGATGATTTGATCACCTATGAGCGTGAGGGTTCTAAAGTGGCATGGACTAAAGATACAGTTTTGATTCCTGTTACCGGTCCTCAATTTGATGATGAAGATTTTGAGGTTGTTCATGAAGCGGGTGATGATCGATGCGATCCGCATTTGCCTACAGCTCGATTAAGTATTAATCGTCTCACAGCACTTAATAGTTTTAATGAAGATTTTAATGATTTAAAGACTTTGTGTCGCCGCTATCAAATCTGCGCTGATGTAGTTGTACCTATTACACCAAATTTGGCTTTTGGTGAAGTATTTTACTGTGTTCCTTTATTTCCTGCAGGAAATTATATTCCTTTTAGTTCTCAAGGTCCAGGAAATCTTTTTTACGAGTTTTTGAATCGAGCTAGAGCCTCACCTATGACCATTTTGGCAAATGGTTTTCGGTATTTTCGTGGTGGTCTCCGAGCCAAAATTTTAATTAAATCAGGGTCGGGTATGGATGTAGTTGTCAGTGTTACACATATTCCTGATAGGCTTATGGCTAAGAAACCTTCGATTATAAGGTCTGAAAATACTAATGGTTATGCATCACATGGGTATGCTTATTATGCGCAGTCCACTCGAGTTAATGAGTGCATTGAGATTGAGATACCTTATTACCTTAATAGTGACTATGGGGTTCTTTTAGATCCTGCAACTATAGTGGATCAGAGCGAGCTGCAATGTAGCCTCGGTACTCTTGCCTTTAGCTTACTAAATCGAGTGGATAAGGATATTACCTTGTCCATTCAGGTTTTTCTTGCGTTTGCAGATGACATGCGTTTTTCCTCTTTTCAGGGTTTTGGGGCTGTGGCCTCTACTTTCCAGATTCCTAATCATACTCCTCGTCCTAAATTGGCTTCGATAGAACTTTCGCAGGAGCCAATTATAGAACATCAGGGGTTATTGGGAGTTGATCAGGAGATTGTGCGTGGCGTTCGTATGGCCAAAGCCGAAATGGAAGAGGCATTGGCAGAGCAGTACCCGACTATTCGAGAAACAATAAGAGCTGATGTTCGTCAGGTTGTCAATGATAGTGTTAACGATGTGTGGGAACAGGCTCAGCAGATAATGAATCAACTTAAGGACTATATAGGTGATATAGGTTCTTCAGCTAAGAATTTGTTTATGAGTGTCATCTCTAATATAGTACATGTTCTACTCAATCCTTGCTTGAAGAGTGTTATAGTGGCATTATGTTGTATAATTGGCCTTTGTATTGATGGCGCAAACTGGTGTTTAGGATCATTAGTGGCTTTTTATACTAAATTTATGGAATTTGTCCAAGTGGCTTATAATAATGCGAGAGATTTCACTCGAAAGTGTCTTAATTGCATGGGTATTGGGTGTCCTCGTTGTGGTTTAATAGAGCGTAATCATATTTTATGTCCGGATGTTATCCAACACCAGGCAGGCGTCGAGGCATTGTCTACTATTGAACCTTTAACTATAAACTATGTTACTTTGATCGCTTCTTTCTTTGGTTATAAAGAAATTGCCAAGAATCGAAGCTTTCCAAATTTTCTGTCTTATGCATTTCTTAACTATGGTAAGTATTCTTCTGGTGTTACTGGTTTAGTAGAGTTTATTAAAACCAATATAAGAGCTTTATATTCATGCATAGATTGGTTATCTGTACAGATTACGGGGTCTGGTATTGACTATTATATATGTAGTTATCCCACTGAACTTCAGAAGTTTTGTCAGAATGCTCAAGCTTTGCTCTCCCCCATGAATAGAGAGAGAGTTTATGCTGAG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20,428
ON811773.1
Iflaviridae sp.
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
China
2022-12-16
TIGMIC_3
Iflaviridae sp.
null
Iflaviridae
ssRNA(+)
8,790
GenBank
null
China:Daqing
China
Dermacentor silvarum
null
2019
SAMN28704284
PRJNA841744
MAG: Iflaviridae sp. isolate TIGMIC_3, complete genome
GTCAAATCGAGCTCTAAAGAATTATTTCGAAAAATTTGGTAAGTTAGAATCCCGACGAATCCATTGTGATTTTTCTAATGTTAGATTTTTTTTTCTTAAAAATGGTTTCAATGATTTGTGGAATGAAATATATAAAAATGTTGCATTTAATTTAAGATCAGTATGTCTTGAAGTGGAAAAGAGGCTTCATAATTACGGGTTTAATTTTAATTTATTGAAGTTTTCGTTAAAATCCAATACAACAAGTTATTTTAATTCTTTGGGGTTCTATCTGAGGAATAAGATTGAGAAGAAGGTTTTAGAAGAAAAAAAAAAAAAAGAATTTTCTAGCAAATTGTCTAAGATTAATAGTAATTTTTGTGATATTTATAGGGAAAAAAAAAAAATTCTGAGCCAAAAAAAGGTGGAATTATACTCCAACTTACTTAATGAAAAAAAAAAAAATTTTTCTGAATGGCAATCATTGTTGTTTAAATATGAATTTAAACAGATACTTTTTAAGGTCGTTAGAGGCTCTCGAAAGAGTAGATATTTGCAAATAAAACTTGGCCGAAAGCTTGCCTTAATGGCTGAGGCAAGAAAAAAAAAAAATTCTTCTATTGTGAAAATATTTGGTAAAGTTGAAAAGATTTTTTGTCGTGCGCAAAAAAAAACAAAAATCCAAGTATTGCCCCCCAAAGTTGTATGGCAGATGGATTCAGCAAATGTAGATCCGACTACCGCAACAACAGTAACTAAAACTTCTAATGTGGTTAGTGTTGATCAGGGGGCTCAAGATAAAGTTGTTACTCAGAGACAAGTAAATTATATTACGAGAATGAGTGAGGGTGACCAGACTAATATTGTCTCTGAGATGGTAGAGCGATTTGCTCCTTTTGATCAATTTCAGTGGCGAGAATCTGATGGTTCGGGCTCTAGAAGAAAATTGTATGAGCTGCCAAAAGATCTTTCTACTAATTTGATGGAGAAATCGCCTAATTTATTATTCTTTCAGAAATATAAATATTTGAGTTTTGATATGGAATTTAAAATTCAAGTTAATGCTACTAGGTTTCAGGTTGGTCAGATGCTAGTAGCATGGAATTATGCTGTAGGGCAGGGTATTTTAGATGATATTTCTCATGCTATTCAATCGCCTCATCATATTTTAAATGCGCCTGGTAATAATGTATTAACTTTTGTGATTCCTTTTAAGTGGGCGTATCCATATTGGAATAATGGCTTAGATTGGGCGCCTATTAAGCTGGCTTTTTTTGTTAATAGTGCTTTGTCGGTGCCTGGTTCTGCATCGGCATCTTGTAATGTTTTTATTCAAGCTCGTCTGGTTAATGTAAAAGTAGCTGGAATGAGACATATTTCGCATCAAATGATGAGGACTCTAGTTAATGTAGCAGAGCGGGGTTTGCGCTATCTTTTGGCTGATCCGAATAGAGACAATCCAACTGATGTATCCCCCGCGACTGCGGTGGTTCCTAATTCTACTCATTCTTGGTGTATTGGCGACAATTCTACAGAAGTAGTTAATGTTTTGAGATTAGACGCTATAGCTACTACTCCTCATTTTGAGACTGTTGATGAAATGCAAGTTAGTTTTGTAGTAAAACATTGGGGAGCATTGGGACTTCAAGCTTGGAGAACTAACCAGTCTACTGGCACTTCTATTTTGAAATATCAAGTTAGTCCTGTAAATATTAGAGATGCTCGTATATCATATCCAGAAACAGCTCGTAAGCTTCCTCGTTATGGTTTGTCTCCTGTATCTAGAATAGCATCAATGTTCGCTTATTGGCGTGGATCGATAGAATTTCGCTTTGATTTTGTAGCCGGTATGTTTCATACAGGTAGAGTGGCTGTTTGTTTTGTTCCAGGAGATAGTAATAATTCTTTTAAACGAGATGCTCAGTCATATGTAGAATTTTTTGATCTCCAGGATAATGTTTCTTTTACTTATAGTTGTCCTTTTATTAGTGATGTTCCTTGGGTTCCGACTATGGACCCTGATAGTCGTCTTACTAAATCGAATCCCCCCCCCAAAATTGGTGATTTAATTATGTATGTAGTTAATCCTTTGGTTGCAATCGATGGAGTTAGTGACTCTGTCACTATTGTACCTTATATTAGAGGAGGATCTGATTTTGAAGTTGCTGTTCCAGTTTTTCCTGGTTCGTTTCCTTCCTCAATAGGTATAGACTACCATCCATCTCCTTCGGCCGTTTTTGTTAAACAAGGTTATTTTCAATGTTTTACGGGACGATGGAGATTAACTGGTAATGGTTGTATTGTACGATATGGTAATGTAACAGATCACATTGCTCAATTTACGGGCGGTGATTTTGAAACCGTGTATTATAGTGAGGAGCCTGCATATTTAAAAACTAGTGCGACTGAGCAAATTTATGTAAATTATTTTGCTAGAGTTAAAGTTCCAGGTCAAGATGAGTATGTGTATATGGCTCCATTTCAGACTTATAATCAAGCATTGACTTATATTAGAGCTGAGGTTAAAGATAAGATTTCCAAGATGACTCAATATGTAGCTGATTCGGGTTGGTATTGGGGACATAATACAGTCCTGGAGCCAGTTTCGGGCATAGCTCATCAGATGATGAGTGATGCAGTAGAATCTGCTTTAACTATAAAACCAGGACCTTTAGTAAATTCTAGTTCGGTGATGTTTTTTAATGAAGGCTTTAATGATCTAAAGTCTTTATTAAGAAGATATTCTCTTTATTGTGATATTTCAGTTAAAATTCCTTCCGATACTCCATATGGAGGTGTGTTTTATGTAGTACCTATTATACCGACGGGTTTAAGAGTTCATTTTGGAAATGTAGGTCCTAATAATAAGTCTATAGAGTTTCAATCAAGGATTAGAGGAGGTGTTATAGCTAATATTGCAGACGGTTATAGATTTTGGCGTGGCGGTATTCGCATGAAAATTATCTTTAGAAATCTTAATGGAAAAGATTTATTTTTACAAGTTACACATGTTCCTGATAGATTCATTGGTTCTTTACCAGTTTCTGTTAAGCCCAAAACTGCTTTAGACTTTATAGGCAATGGTTATGCTTATTATAGCCAGTGTTCTCGAATTAATGAGTGTATGGAAATTAGCGTTCCATATTATTTAAATGCTGACTTTGGTTTGTTAGCAAACCCAGATGATGTTCCTCCTTCTTTGAGATTGGCTTGTACATCAGGTTATTTAGCTTTTTCAACCTTGAGTCGTTTAGAAGAAGAATATGATTTAACTATGCAGGTTTTTATAGCCTTTGATGATGATATGCGCTTTAGCTCTTTTCAAGGTTTTAGATTGAGTAGTAGTGCTATGGAGTTGCCTAAACAGCTAACCAGTACATCGTTAGAACTTTCACAGATTGCTGGTTCGCGTTTGCCCTCTTTAGACTTTGAGTTGCTTGACCATCCTCATGTTTCTCACCAGATGGATAGGGTAAAAGAAAAATTTTCTAATTCTCTAAAATATGTGGGTAGCCTATTAGGTGAAGGGATGAGTGGACCCGGAGAAGAGATGGGCCGTAGTTGGGGTCAACAAATTAGAGATGCTGGCGTTGCAGTGACCAATGACGCCTTATCTAAGGTTAGTGAAATTCTAGAGTTGATTAAGTCTATGGTTGGTTCTGCTTTTGAGACTGGTAAACATTTCTTTATTTCGATAGCTTCACAGCTTGTTCACCTAATGCATAATCCTAGTTATGCAACTTTTGTTATTTGTTGTGCCACTATTTGGGCGTCGATGCTACCTAAAGATACTTCCTATTCTCTGTTTAATACTTTTATTCGTTTTTTAAATCATCCCACAGTTCTGTCCATTGTAGGGATGATAGGAGGTATCTCATTCGCCAATGTTATAATTGAGCACGCTCATCAAAATTTTAGGGCTTCTCACCAGTATGATTCTGATATAGTTGCTGAGTTTACGGCGATGGTCGTTACTTGTATAGCTTCTGTTTTAGGTTTTAAGATGAATCGAAAGGCGATGGCTAATTGCCCGAATTTTATGTATTATTTATTGACACACATTAAGGAAATAACTATGACCGGTGTGGGTTTAGTCGCCTTCTTAAAGCTAAATATGAAAGTTTTTGGTAATATTGTCGATTGGCTACTACAGACATTTAGTGGTGTGGGGTTAGATATGTTGTGCTTAACAAAAAGTGCAACGTTAAAAACTTGGGCTCGGGCTGCTCAGCAGATGTTAGATCCGTTGCATAAAGAAGCAATTTTTAGTAATTCTACACTTCAGCGTAGAGTTTTTGTTTTAGTTACTCAGGGGCAACAAATGATGCTGGCAGATGCTTTAAATGGTGAGAGTGCACAAATTGGTCAATATATTAAGGCTCTGTTAGACAAGCTTGTTAAGTTACAAGATGAACTTATAGATAATTGTTATTGTCCTAATGCTAGATACGTCCCTTTTGTTATGCAATTAGTTGGTCCTCCAGGAATAGGTAAGTCAGAGCTCTATTGCGAACTTGGTATAAGTATGCTTGAAGCAATTAATTATGTTTGCTGTGGAGATCCTATTTTTACAAAAAATTCTGGTCCCAGTTACTGGAATGGGGTTAAACAACAGGCTATTCTGCTATATGACGAATTTGGTCTCTTTAGATCTGGAACAGCTTATGAGGAGCAGATTGCAGAGTTTATGCAGATTAAGTCATCGGCTGTATTTAATCCATCAATAGCTGAATTAGAAAATAAGAAATTAAGATATAATCCCTTAATTGTTCTTCTAGCCAGTAATACAGCCTTTTGGAATGATACCACTGTTATTAGAGAGCCGGATGCTTTGCATAGAAGAAGGGATTTGTTAGTTCAGTGTAGATTAAAAGAAGGAGTTACCATGGCTGAGGTTAGAGAGCAATTCGTCGCTCGAGGTTATAAGACATATGATCATTTAGAGTTTGCCGTTTACAATAGTGTTCTTCGTGAGTCAGATGGGTTAGGTATCTGGATGAGTTATGCTTCTTTTAAGGATT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20,429
OP947882.1
Ilheus virus
Plante,J.A., Plante,K.S., Popov,V.L., Shinde,D.P., Widen,S.G., Buenemann,M., Nogueira,M.L., Vasilakis,N.
University of Texas Medical Branch, World Reference Center for Emerging Viruses and Arboviruses
USA
2023-02-01
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,758
GenBank
1
Brazil
Brazil
null
null
1953
null
null
Ilheus virus strain 331, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTTTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGACTGTCAATATGCTAAAACGCCTGGCTAGCGTGTCCCCCCTCAAGGGGGCGAAGAAGCTATTCGGAGAACTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTAGCCCTCATGGCTTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACTCTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATCTGACCAACTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAGCGCAAGGAAAAGAAGAAGAGCTTCTCAACGGCCCTGCTCTGGATTACCATGATCACAGCGGTCGCCGGCCTCAAGATCTCATCACACAGAGACCGGCCTCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTGCCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACGATCAGGGCTTTGGACGTAGGCTACACTTGCGCTTATGACACAACTTACGAGTGCCCTCACCTGGAAGTGACCATGGATCCGGAAGACATAGATTGTTGGTGCACACTTGAATCTGTTTATGTTAACTACGGACTCTGCAAGCAAAACCATCATGTTAGAAGGGGCCGACGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGCCATCTTGAAAACCGGGCGACTCCATGGATGGACACCACCAAGACAACCAAGTATCTAACTAAAGTTGAGAATTGGGTTATACGCAATCCTGGATATGCACTAGTAGCATTGGCCACAGCCTGGATGTTAGGTAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTCATTGCTCCAGCATACAGCTTGAACTGCTTGGGAATCTCAAACCGAGATTTTGTTGAAGGCTTGTCTGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTGGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTTATGGCCAAGGACAAACCAACACTAGACATCAAGTTGATAAGAATGGAAGCCAAGGACCTGGCCACGGTTCGTAGTTACTGCTACCAGGCCACTGTCACCGACTCGTCAACTGAGGCCAGATGCCCTACCATGGGTGAAGCCCACAACTCCAAATCTCTTGACGCCAGCTACGTCTGCAAATCATCATACGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGCGGGCTCTTTGGGAAAGGGAGCATCCAAACTTGTGTGAAGTTTTCATGTCCTGGAAAGGCTACTGGGAAAAGCATTCAGAGGGAGAATCTGAACTATGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAATAAGCGCAGCCGCACACGGCAACTACACCGCCCAATTGACAGGGAAGTACGCTGCCAAATTCTCTATCACTCCAAGTGCACCAACATACACTGCAAATTTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCCGCCTTGGACATTGACAACTACTATGTCATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAACCGTGACTGGTTCCATGATCTGGATCTACCCTGGACTGGACCCGCCACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATCGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAAACAGTAGTTGCTTTGGGTAACCAAGAGGGCGCTCTGCATACGGCTTTGGCAGGTGCCATACCCGTGGAAGTCTCAAGCACGACTCTCACTTTGAACTCTGGACACCTCAAGTGCAGGTTGAAGCTGGATAAGCTCAAGATCAAAGGGACAACTTACGCTATGTGCAAAGGGACTTTCGCGTTTGCCCAAACCCCAGTGGATACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAGCTGACCTACACAGGGACGGACGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGATTTGCGGGACATGACTCCAATCGGAAGACTTGTCACAGTCAATCCAATAATCCCAAGCTCGGCCAAATCCCAAAAGATTCTGGTTGAACTTGAGCCCCCCTTTGGGAGCTCGTTCATCCTCGTGGGCCGAGAAAACAACCAGATTAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGAAATGCTCTGAAAACGACTTGGAAGGGAGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGACACAGCTTGGGACTTTGGTTCTGTGGGTGGAATTTTCAATTCCATTGGGAAAACCATTCATGGAGTGTTTGGCACCGCCTTCAGGTCATTGTTTGGAGGTATGTCGTGGGTAACGCAAGCTCTCATGGGAGCTCTTCTGCTCTGGCTCGGCATCAGTGCTCGTGAAAGGACGGTGTCTTTGATAATGCTGAGTGTGGGTGGCATCCTCCTTTTCTTGGCTGTCAATGTGCATGCTGACACCGGTTGTGCTATTGACATGGCACGTCGTGAGCTGAAATGTGGAAGTGGTATCTTCATCCACAACGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAATACCACCCACTCACGCCACGCGGCTTTGCCAAGGTCATTCAGATGTCAAAGGATAAAGGTGTCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGACTTGAGCACGAGATGTGGGAGGCCATCGCACCTGAGTTGAACGCCATCTTCGAGGACAATGGAGTGGACCTCAGCGTTGTCGTGAAAGGCCAGACAGGGATTTACAAACGTGCACCCAAACGCCTCACCGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTTGGATGGAAGAATTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACCGAAACAGCCAACTCCACATTCATTGTCGATGGACCAGAAAGTAAAGAGTGCCCGACATCAGACCGGGCTTGGAACTCCCTAGAATTGGAGGATTTCGGGTTCGGAATCATCTCAACCAAGATTTTCCTAAAGGTCAACGAGCAACGGGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATTGGAACAGCCGTCAAGGGCAATGAAGCTGTCCATAGTGACTTGGGATACTGGATCGAGAGCAAAAAGAATGAATCCTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAGGTCAAGTCGTGCACATGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGACGGAGTTGAGGAGAGTGACTTGATTATTCCAATCACGCTGGCCGGACCAAAAAGCCACCACAACATGCGCCCAGGGTACAAGACTCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCTCTCGTCATCGAGTTTGCTGAATGTCCAGGGACCACAGTGACCCAGGAAGAGAGTTGTGGCGGTAGAGGACCATCAATTAGGACAACAACAGCAAGTGGAAGGACCATTCGCGATTGGTGTTGCAAGAACTGCACCCTTCCTCCACTCCGATTTATGGCCGGGGAAAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAGGAAACCCTAATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTCCAACTCGGGATCCTAATGGCATTTGTGTTCACCCAAGAAGTCCTGAGGAGGAGGTGGACGGCGAACCTAGCGTTGCCCACCTCAGCCTTGCTAATGGCTTGTTTCATCTTTGGCGGCTTCACCTACCTGGACCTGTTCAGGTATTTTATCCTTGTGGGTGCGGCCTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACGTCGTTCATCTAGCCATGATAGCTGCTTTTAACATCCAGCCAGTGGCACTAGTCACTACCTTCTTCAGGAAAAATTGGACCAACCGGGAGAACATGATTCTCATCATCGCTGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGTTGTTTCATGTCATGAATTCACTTTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACTGGCACGACTTCGACTCTTGCAATGCCGTTTCTGGCAGCTCTGTCCCCACCCATGAACTGGCTTGGGCTGGACGTAGTAAGGTGTCTTCTGATCATGGCTGGAGTTGCAGCGCTCATTAGTGAGCGTAGGGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGGGCCTTGCTCATCTCTGCAGCCTTAGCTTTGACGGGAGCTTTCTCGCCGCTGGTTCTGCAGGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGTTTGGGAAAACGGGGATGGCCTGCCAGTGAAGTACTAACAGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCCAGACTGGACGGAGGGACTATGGCCATCCCATTGGCCACCATGGCCATACTGGCTGTTGCCTATGTCCTCTCAGGAAAATCCACTGACATGTGGTTGGAACGCTGCGCTGACATCTCATGGATCAATGAGGCTGAGATCACAGGGACCAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGATTCCAACGGAGACTTCAAGATGATCAATGACCCTGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGTAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCAGCATACAACCCCGTGCTTATTCCAGTGTCCATGGCCGGATACTGGATGACAGTGAAAATCCACAAGCGTGGAGGGGTCATGTGGGACGTTCCAGCTCCCAAGCAATTTGGCAAGACGGAGTTAAAACCCGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAATTCTGGGACGGTACCAGTCAGGTGTGGGGGTCATGTGGGATGGAGTCTTCCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTCAACCCCACTTGGGGGAGTGTGCGTGATGACTTAATATCCTATGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACATGGAATGGAAGTGAGGAGGTCCAGATGATCGCCGTGGAACCAGGAAAGGCTGCAAAAAACTACCAAACCAAGCCAGGAGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCCC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CTGTTCAGCAGTGCCTGTGGATTGGGTCCCGACTGGACGAACCACATGGTCCATCCACGGAAAAGGAGAATGGATGACCACAGAGGACATGCTCCAAGTGTGGAACAGGGTCTGGATTGAGGACAATGAGCACATGGAGGACAAGACACCCATCACGTCTTGGACTGACATCCCCTACATCGGAAAGAGGGAGGACCAATGGTGTGGTAGTCTGATTGGAACCCGACAGAGAGCAACATGGGCGGAGAATATATATACACCAATAATGCAAATCCGCAACTTGATCGGGGATGAGAAGTATGTGGACTGCATGGTGTCCCAGCACAGGTTCGAAACACCTTCGCCCGTGCTGTTCACCGGCGCCATCTAAACCCAAAAGACCAAAAAAGGACAATTGTGTCAGGCCATGGAAACATGCCACCCAAAGCTTGTAGAGGGTGCAGCCTGCGCCAAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTAGGCCCCCACGGCCCATTTCAGGAGACAGCGCGACTCCTGGAGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACATCGCTGAGGCCCAAACCAGCCCGAAGCTGTAGGACTGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGTGGAGACCCCTCAGCACCAAGCGCGAAACAAACAGCATATTGACGCCTGGGAAAGACCGGGAGATCCTCTGCTTTCCATCACCAGCCACTAGGCACAGATCGCCGCAAGTTGTGGCTGGTGGTGAAAAACACAGGATCT
18,794
OP947883.1
Ilheus virus
Plante,J.A., Plante,K.S., Popov,V.L., Shinde,D.P., Widen,S.G., Buenemann,M., Nogueira,M.L., Vasilakis,N.
University of Texas Medical Branch, World Reference Center for Emerging Viruses and Arboviruses
USA
2023-02-01
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,759
GenBank
1
Ecuador: Hospital Militar
Ecuador
Homo sapiens
null
2004-03-01
null
null
Ilheus virus strain FSE 0800, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTTTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGACTGTCAATATGCTAAAACGCTTGGCTAGCGTGTCCCCCCTCAAGGGGGCGAAGAAGCTACTCGGAGAATTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTAGCCCTCATGGCTTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACCTTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATCTGACCAACTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAACGCAAGGAAAAGAAGAAGAGTTTCTCAATGGCCCTGCTCTGGATTACCATGATCACAGTGGTCGCTGGCCTCAAGATTTCATCACACAGAGGCCGACCCCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTGCCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACGATTAGGGCTTTGGACGTAGGCTATACGTGCGCTTATGATACAACTTATGAGTGCCCCCACCTGGAAGTGACCATGGACCCAGAGGACATAGATTGTTGGTGCACACTTGAATCCGTCTATGTTAACTACGGACTCTGCAAGCAAAACCACCATGTCAGAAGGGGCAGGCGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGTCATCTCGAAAACCGGGCGACTCCTTGGATGGACACCACCAAGACAACCAAATATCTAACCAAAGTTGAGAATTGGGTCATACGCAATCCTGGATACGCACTAGTAGCATTGGCCACAGCCTGGATGCTAGGTAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTCATTGCTCCAGCGTACAGCTTGAACTGCTTGGGAATCTCGAACCGAGACTTCGTTGAGGGCTTGTCTGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTAGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTCATGGCTAAGGACAAACCCACGCTGGACATCAAGCTGATAAGAATGGAAGCCAAGGATCTGGCCACGGTTCGTAGCTACTGCTACCAGGCCACTGTCACTGACTCGTCAACTGAGGCCAGATGCCCTACCATGGGTGAAGCTCACAACTCCAAATCTCTTGACGCTAGCTACGTCTGCAAATCATCATACGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGTGGGCTCTTTGGGAAAGGGAGTATCCAAACTTGTGTGAAGTTTTCATGTCCTGGAAAGGCTACTGGGAAAAGTATCCAGAGGGAGAACCTGAACTATGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAACAAGTGCGGCCGCACACGGCAACTACACCGCCCAGTTGACAGGGAAGTACGCCGCCAAATTCTCGATTACTCCAAGTGCACCAACATACACTGCAAACTTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCCGCCCTGGACATTGACAACTACTATGTCATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAACCGTGACTGGTTCCATGATCTAGATCTACCCTGGACCGGACCCGCTACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATCGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAAACAGTAGTCGCCTTGGGCAACCAAGAGGGTGCTCTGCACACGGCTTTGGCAGGGGCCATACCCGTGGAAGTCTCAAGCACGACTCTCACGTTGAACTCTGGACATCTCAAGTGCAGGTTGAAGCTGGACAAGCTCAAGATTAAAGGGACAACTTATGCTATGTGCAAAGGGACTTTCGCGTTTGCTCAAACCCCAGTGGACACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAACTGACCTACACAGGGACGGACGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGATCTGCGGGACATGACTCCAATCGGAAGGCTTGTTACAGTCAATCCAATAATTCCAAGCTCGGCCAACTCTCAAAAGATTTTGGTTGAACTTGAGCCCCCTTTTGGGAGTTCGTTCATCCTTGTTGGCCAAGAAAACAACCAGATCAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGGAATGCTCTGAAAACGACTTGGAAGGGAGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGACACAGCTTGGGATTTTGGTTCTGTGGGTGGAATTTTCAATTCCATTGGGAAAACCATCCATGGGGTTTTTGGTACCGCCTTCAGGTCATTGTTTGGAGGCATGTCGTGGGTAACACAAGCTCTCATGGGAGCTCTCCTGCTCTGGCTTGGCATCAGTGCCCGTGAGAGGACGGTGTCTTTGATAATGTTGAGTGTGGGGGGCATCCTCCTTTTCTTGGCTGTCAATGTGCACGCTGACACCGGCTGTGCCATTGACATGGCGCGTCGCGAGCTGAAATGTGGAAGTGGTATCTTCATCCACAATGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAATACCACCCACTCACGCCACGCGGCTTTGCCAAGGTCATCCAGATGTCAAAGGACAAAGGTGTCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGGCTTGAGCACGAGATGTGGGAAGCCATTGCACCTGAGTTGAACGCCATCTTTGAGGACAACGGAGTGGACCTCAGCGTTGTCGTAAAAGGCCAGACAGGGATCTACAAACGTGCACCCAAACGCCTCACTGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTTGGATGGAAGAACTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACCGAAACAGCCAACTCCACATTCATTGTTGATGGACCAGAAAGCAAAGAGTGCCCGACATCAGACCGGGCTTGGAACTCCCTAGAATTGGAGGACTTCGGTTTTGGTATCATCTCAACTAAGATTTTCCTAAAGGTCAACGAGCAGCGAGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATCGGAACAGCCGTCAAAGGCAATGAAGCCGTCCATAGTGACCTGGGATACTGGATTGAGAGCAAGAAGAATGAATCCTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAAGTCAAGTCGTGCACATGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGATGGAGTTGAGGAGAGTGACTTGATTATTCCAATCACGCTGGCTGGACCAAAAAGCCACCATAACATGCGCCCAGGGTACAAGACTCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCTCTCGTCATTGAGTTTGCTGAGTGTCCGGGGACTACAGTGACCCAAGAAGAGAGTTGTGGCGGCAGGGGACCATCAATCCGGACTACAACAGCAAGTGGAAGGACCATTCGTGATTGGTGTTGCAAGAACTGCACCCTCCCTCCGCTCCGATTCATGGCCGGGGACAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAGGAAACCCTGATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTTCAACTTGGGATCCTAATGGCATTTGTGTTCACTCAAGAAGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCGAACCTAGCGCTACCCACCTCAGCCTTGCTAATGGCCTGTTTCATCTTTGGCGGCTTCACCTACCTGGACTTGTTTAGATACTTTATCCTTGTGGGTGCGGCCTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACGTCGTCCATCTAGCCATGATAGCTGCTTTTAACATCCAGCCAGTGGCACTAGTCACCACCTTCTTCAGGAAAAATTGGACCAACCGGGAGAACATGATTCTCATCATCGCCGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGTTGTTTCATGTCATGAATTCGCTCTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACTGGCACGACTTCGACTCTTGCAATGCCGTTTCTGGCAGCCCTGTCCCCACCCATGAATTGGCTTGGACTGGACGTGGTGAGATGTCTTCTGATTATGGCTGGGGTTGCAGCGCTCATTAGCGAGCGTAGGGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGAGCCTTGCTCATCTCTGCAGCCTTGGTTTTGACAGGAGCTTTCTCACCGTTGGTTCTGCAAGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGTTTGGGCAAACGGGGATGGCCTGCCAGTGAAGTACTAACAGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCCAGACTGGATGGAGGTACAATGGCCATTCCATTGGCCACCATGGCCATATTGGCTGTTGCTTATGTCCTTTCAGGAAAATCCACTGACATGTGGCTGGAACGCTGCGCTGACATCTCATGGATCAATGAGGCTGAAATTACAGGGACTAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGATTCCAACGGAGACTTTAAGATGATCAATGACCCTGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGCAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCCGCATACAACCCTGTGCTGATTCCAGTGTCCATGGCTGGATACTGGATGACAGTGAAAATTCACAAGCGTGGAGGGGTTATGTGGGACGTCCCAGCTCCCAAGCAATTCGGCAAGACGGAGTTAAAACCCGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAATTTTGGGAAGGTACCAGTCAGGCGTGGGAGTCATGTGGGATGGAGTTTTCCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTCAACCCCACTTGGGGAAGTGTGCGTGACGACTTGATATCCTATGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACTTGGAATGGAAGTGAGGAGGTCCAGATGATTGCCGTGGAGCCAGGAAAGGCCGCAAAAAACTACCAAACCAAGCCAGGAGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCC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TCTGCTCAGCAGTGCCCGTGAATTGGGTCCCGACTGGACGAACCACATGGTCCATCCACGGGAAAGGAGAATGGATGACCACAGAGGACATGCTCCAAGTGTGGAACAGGGTCTGGATTGAGGACAATGAGTACATGGAGGACAAGACGCCCATCACGTCTTGGACTGACATCCCCTACCTCGGAAAGAGGGAGGACCAATGGTGTGGCAGTCTGATTGGAACCCGACAGAGAGCCACATGGGCGGAGAACATATATACACCAATAATGCAAATCCGCAACCTAATTGGGGATGAGAAGTACGTGGATTACATGGTGTCCCAGCACAGGTTCGAAACACCTTCACCTGTGCTGTTCACCGGCGCCATTTAAACCCAAAAGACCAAAAAAGGACAATTGTGTCAGGCCATGGAAACATGCCACCCAAAGCTTGTAGAGGGTGCAGCCTGCGCCAAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTAGGCCCCCACGGCCCATTCCAGGAGACAGCGCGACTCCTGGAGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACATTGCTGAGGCCCAAACCAGCCCGAAGCTGTAGGACTGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGTGGAGACCCCTCAGCACCAAGCGCAAAACAAACAGCATATTGACGCCTGGGAAAGACCGGGAGATCCTCTGCTTTCCATCACCAGCCACTAGGCACAGATCGCCGCAAGTTGTGGCTGGTGGTGAAAAACACAGGATCT
18,795
OP947884.1
Ilheus virus
Plante,J.A., Plante,K.S., Popov,V.L., Shinde,D.P., Widen,S.G., Buenemann,M., Nogueira,M.L., Vasilakis,N.
University of Texas Medical Branch, World Reference Center for Emerging Viruses and Arboviruses
USA
2023-02-01
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,759
GenBank
1
Peru: Iquitos, Loreto
Peru
null
null
1997-06-18
null
null
Ilheus virus strain H 2944, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTTTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGACTGTCAATATGCTAAAACGCTTGGCTAGCGTGTCCCCCCTCAAGGGGGCGAAGAAGCTACTCGGAGAATTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTAGCCCTCATGGCTTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACTCTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATTTGACCAACTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAACGCAAGGAAAAGAAGAAGAGTTTCTCAACGGCCCTGCTCTGGATTACCATGATCACAATGGTCGCTGGCCTCAAGATTTCATCACACAGAGGCCGACCTCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTGCCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACGATCAGGGCTTTGGACGTAGGCTATACGTGCGCTTATGACACAACTTATGAGTGCCCTCACCTGGAAGTGACCATGGACCCGGAGGACATAGACTGTTGGTGCACACTTGAATCTGTCTATGTTAACTACGGACTCTGCAAGCAAAACCACCATGTTAGAAGGGCCAGGCGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGTCATCTCGAAAACCGGGCGACTCCATGGATGGACACCACCAAGACAACCAAATATCTAACCAAAGTTGAGAATTGGGTCATACGCAATCCTGGATACGCACTAGTAGCATTGGCTACAGCCTGGATGCTAGGTAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTCATTGCTCCAGCGTACAGCTTGAACTGCTTGGGAATCTCGAACCGAGACTTCGTTGAGGGCTTGTCTGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTAGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTCATGGCTAAGGACAAACCCACGCTAGACATCAAGCTGATAAGAATGGAAGCCAAGGATCTGGCCACGGTTCGTAGCTACTGCTACCAGGCCACTGTCACTGACTCGTCAACTGAGGCCAGATGCCCTACCATGGGTGAAGCTCACAACTCCAAATCTCTTGACGCTAGCTACGTCTGCAAATCATCATACGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGTGGGCTCTTTGGGAAAGGGAGTATCCAAACTTGTGTGAAGTTTTCATGTCCTGGAAAGGCTACTGGGAAAAGTATCCAGAGGGAGAACCTAAACTATGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAACAAGTGCGGCCGCACACGGCAACTACACCGCCCAGTTGACAGGGAAGTACGCCGCCAAATTCTCGATTACTCCAAGTGCACCAACATACACTGCAAATTTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCCGCCTTGGACATTGACAACTACTATGTCATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAATCGTGACTGGTTCCATGATCTGGATCTACCCTGGACCGGACCCGCTACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATCGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAAACAGTGGTCGCCTTGGGTAACCAAGAGGGTGCTCTGCACACGGCTTTGGCAGGGGCCATACCCGTGGAAGTCTCAAGCACGACTCTCACTTTGAACTCTGGACATCTCAAGTGCAGGTTGAAGCTGGACAAGCTCAAGATTAAAGGGACAACTTATGCTATGTGCAAAGGGACTTTCGCGTTTGCTCAAACCCCAGTGGACACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAACTGACCTACACAGGGACGGACGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGATCTGCGAGACATGACTCCAATCGGAAGGCTTGTTACAGTCAATCCAATAATTCCAAGCTCGGCCAACTCCCAAAAGATTCTGGTCGAACTCGAGCCCCCCTTTGGGAGTTCGTTCATCCTTGTTGGCCAAGAAAGCAACCAGATCAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGGAATGCTCTGAAAACGACTTGGAAGGGAGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGACACAGCTTGGGATTTTGGCTCTGTGGGTGGAATTTTCAACTCCATTGGGAAAACCATCCATGGAGTTTTTGGTACCGCCTTCAGGTCATTGTTCGGAGGCATGTCGTGGGTAACACAAGCTCTCATGGGAGCTCTCCTGCTCTGGCTCGGCATCAGTGCCCGTGAGAGGACGGTGTCTTTGATAATGCTGAGTGTGGGGGGCATCCTCCTTTTCTTGGCTGTCAATGTGCATGCTGACACCGGCTGTGCCATTGACATGGCACGTCGCGAGCTGAAATGTGGAAGTGGTATCTTCATCCACAATGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAGTACCACCCACTCACGCCACGCGGCTTTGCCAAGGTCATTCAGATGTCAAAGGACAAAGGTGTCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGGCTTGAGCACGAGATGTGGGAAGCCATTGCACCTGAGTTGAATGCCATCTTTGAGGACAACGGAGTGGACCTCAGCGTTGTCGTAAAAGGCCAGACAGGGATCTACAAACGTGCACCCAAACGTCTCACTGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTCGGATGGAAGAATTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACCGAAACAGCCAACTCCACATTCATTGTTGATGGACCAGAAAGCAAAGAGTGCCCGACATCAGACCGGGCTTGGAACTCCCTAGAATTGGAGGATTTCGGTTTTGGTATCATCTCAACCAAGATTTTCCTAAAGGTCAACGAGCAGCGAGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATCGGAACAGCCGTCAAGGGCAATGAAGCCGTCCATAGTGACCTGGGATACTGGATTGAGAGCAAGAAGAATGAATCCTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAAGTCAAGTCGTGCACATGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGATGGAGTTGAGGAGAGTGACTTGATCATTCCAATCACGCTGGCTGGACCAAAAAGTCACCATAACATGCGCCCAGGGTACAGGACTCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCTCTCGTCATCGAGTTTGCTGAGTGTCCGGGGACCACAGTGACCCAGGAAGAGAGTTGTGGCGGCAGGGGACCATCAATCCGGACTACAACAGCAAGTGGAAGGACCATTCGTGATTGGTGTTGCAAGAACTGCACCCTCCCTCCGCTCCGATTCATGGCCGGGGACAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAAGAAACCCTGATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTTCAACTTGGGATCCTAATGGCATTTGTGTTCACTCAAGAAGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCGAACCTAGCGCTACCCACCTCAGCCTTGCTAATGGCTTGTTTCATTTTTGGCGGCTTCACCTACCTGGACTTGTTCAGATATTTCATCCTTGTGGGTGCGGCCTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACGTCGTCCATCTAGCCATGATAGCTGCTTTTAACATCCAGCCAGTGGCACTAGTCACCACCTTCTTCAGGAAAAATTGGACCAATCGGGAGAACATGATTCTCATCATCGCCGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGTTGTTTCATGTCATGAATTCACTCTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACTGGCACGACTTCGACTCTTGCAATGCCGTTTCTGGCAGCCCTGTCCCCACCCATGAATTGGCTTGGACTGGATGTGGTGAGATGTCTTCTGATCATGGCCGGGGTTGCAGCGCTCATTAGCGAGCGTAGGGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGGGCCTTGCTCATCTCTGCAGCCTTGGTTTTGACAGGAGCTTTCTCACCGCTGGTTCTGCAAGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGTTTGGGAAAACGGGGATGGCCTGCCAGTGAAGTACTAACAGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCCAGACTGGACGGAGGTACAATGGCCATCCCATTGGCCACCATGGCCATATTGGCTGTTGCCTATGTCCTCTCAGGAAAATCCACTGACATGTGGCTGGAACGCTGCGCTGACATCTCATGGATCAATGAGGCTGAAATTACAGGGACTAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGATTCCAACGGAGACTTTAAGATGATCAATGACCCTGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGCAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCTGCATACAACCCTGTGCTAATTCCAGTGTCCATGGCTGGATACTGGATGACAGTGAAAATTCACAAGCGTGGAGGGGTCATGTGGGATGTCCCAGCTCCCAAGCAATTCGGCAAGACGGAGTTAAAACCCGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAATCCTGGGAAGGTACCAGTCAGGCGTGGGAGTCATGTGGGATGGAGTTTTCCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTTAACCCCACCTGGGGAAGTGTGCGTGACGACTTGATATCCTACGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACATGGAATGGAAGTGAGGAGGTCCAGATGATCGCCGTGGAGCCAGGAAAGGCAGCAAAAAACTACCAAACCAAGCCAGGAGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCC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TCTGTTCAGCAGTGCCCGTGGATTGGGTCCCGACTGGACGAACCACATGGTCCATCCACGGAAAAGGAGAATGGATGACCACAGAGGACATGCTCCAAGTGTGGAACAGGGTCTGGATTGAGGACAATGAGCACATGGAGGACAAGACGCCCATCACGTCTTGGACTGACATCCCCTACCTCGGAAAGAGGGAGGACCAATGGTGTGGCAGTCTGATCGGAACCCGACAGAGAGCCACATGGGCGGAGAACATATATACACCAATAATGCAAATCCGCAACCTAATTGGGGATGAGAAGTACGTGGATTACATGGTGTCCCAGCACAGGTTCGAAACACCTTCACCTGTGCTGTTCACCGGCGCCATCTAAACCCAAAAGACCAAAAAAGGACAATTGTGTCAGGCCATGGAAACATGCCACCCAAAGCTTGTAGAGGGTGCAGCCTGCGCCAAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTAGGCCCCCACGGCCCATTCCAGGAGACAGCGCGACTCCTGGAGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACATCGCTGAGGCCCAAACCAGCCCGAAGCTGTAGGGCTGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGTGGAGACCCCTCAGCACCAAGCGCAAAACAAACAGCATATTGACGCCTGGGAAAGACCGGGAGATCCTCTGCTTTCCATCACCAGCCACTAGGCACAGATCGCCGCAAGTTGTGGCTGGTGGTGAAAAACACAGGATCT
18,796
OP947885.1
Ilheus virus
Plante,J.A., Plante,K.S., Popov,V.L., Shinde,D.P., Widen,S.G., Buenemann,M., Nogueira,M.L., Vasilakis,N.
University of Texas Medical Branch, World Reference Center for Emerging Viruses and Arboviruses
USA
2023-02-01
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,759
GenBank
1
Brazil
Brazil
Homo sapiens
null
1957
null
null
Ilheus virus strain BeH 7445, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTTTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGACTGTCAATATGCTAAAACGCTTGGCTAGCGTGTCCCCCCTCAAGGGGGCGAAGAAGCTACTCGGAGAACTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTAGCCCTCATGGCTTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACTCTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATTTGACCAATTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAGCGCAAGGAAAAGAAGAAGAGTTTCTCAACGGCCCTGCTCTGGATTACCATGACCACAGCGGTCGCCGGCCTCAAGATTTCATCACACAGAGACCGACCTCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTGCCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACGATAAGGGCTTTGGACGTAGGCTATACTTGCGCTTATGACACAACTTACGAGTGCCCTCACCTGGAAGTGACCATGGATCCGGAGGACATAGATTGTTGGTGCACACTTGAATCTGTTTATGTTAACTACGGACTCTGCAAGCAAAACCACCATGTTAGAAGGGGCAGACGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGCCATCTTGAAAACCGGGCGACTCCATGGATGGACACCACCAAGACAACCAAATATCTAACCAAAGTTGAGAATTGGGTTATACGCAATCCTGGATATGCACTGGTAGCATTGGCTACAGCCTGGATGCTAGGCAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTTATTGCTCCAGCATACAGCTTGAACTGCCTGGGAATTTCGAACCGAGACTTCGTTGAAGGCTTGTCTGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTGGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTTATGGCCAAGGATAAACCAACACTAGACATTAAGTTGATAAGAATGGAAGCCAAGGACCTGGCCACGGTTCGTAGTTACTGCTACCAGGCCACCGTCACTGACTCATCAACTGAGGCCAGATGCCCTACCATGGGTGAAGCCCACAACTCCAAATCTCTTGACGCTAGCTACGTCTGCAAATCATCATACGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGTGGGCTCTTTGGGAAAGGGAGTATCCAAACTTGTGTGAAGTTTTCATGCCCTGGAAAAGCTACTGGGAAAAGTATTCAGAGGGAGAACCTGAATTATGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAACAAGTGCGGCCGCACACGGCAACTACACCGGCCAATTGACAGGGAAGTACGCTGCCAAATTCTCGATTACTCCAAGTGCACCAACATACACTGCAAATTTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCCGCCTTGGACATTGACAACTACTATGTTATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAACCGTGACTGGTTCCATGATCTGGATCTACCCTGGACCGGACCCGCCACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATTGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAGACAGTAGTCGCCTTGGGTAACCAAGAGGGCGCTCTGCACACGGCTCTGGCAGGGGCCATACCCGTGGAAGTTTCAAGCACGACTCTCACTTTGAACTCTGGACATCTCAAGTGCAGGTTGAAGCTGGACAAGCTCAAGATCAAAGGGACAACTTATGCTATGTGCAAAGGGACTTTCGCGTTTGCTCAGACCCCAGTGGACACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAACTGACCTACACAGGGACGGATGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGATCTGCGGGACATGACTCCAATCGGAAGACTTGTTACAGTCAATCCAATAATTCCAAGCTCGGCCAAATCCCAAAAGATTCTGGTCGAACTTGAGCCCCCCTTTGGGAGTTCGTTCATCCTTGTGGGCCAAGAAAACAACCAGATTAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGGAATGCTCTGAAGACGACTTGGAAGGGGGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGATACAGCTTGGGATTTCGGTTCTGTGGGTGGAATTTTCAATTCCATTGGGAAAACCATCCATGGAGTGTTTGGCACCGCCTTCAGGTCATTGTTTGGAGGCATGTCGTGGGTAACACAAGCTCTCATGGGAGCTCTACTGCTCTGGCTCGGCATCAGTGCTCGTGAGAGGACGGTGTCTTTGATAATGCTGAGTGTGGGGGGCATCCTCCTTTTCCTGGCTGTCAATGTGCATGCTGACACCGGCTGTGCCATTGACATGGCACGTCGTGAGCTGAAATGTGGAAGTGGTATCTTCATCCACAACGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAATACCACCCACTCACGCCACGCGGCTTTGCCAAGGTCATTCAGATGTCAAAGGACAAAGGTGTCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGGCTTGAGCACGAGATGTGGGAAGCCATTGCACCTGAGTTGAACGCCATCTTTGAGGACAATGGAGTGGACCTCAGCGTCGTCGTGAAAGGCCAGACAGGGATTTACAAACGTGCACCCAAACGCCTCACTGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTTGGATGGAAGAATTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACCGAAACAGCCAACTCCACATTCATTGTTGATGGACCAGAGAGCAAAGAGTGCCCGACATCAGACCGGGCTTGGAACTCCCTAGAATTGGAGGATTTCGGGTTTGGCATCATCTCAACTAAGATTTTCCTAAAGGTCAATGAGCAGCGGGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATCGGAACAGCCGTCAAGGGTAATGAAGCCGTCCACAGTGACCTGGGATACTGGATCGAGAGCAAGAAGAATGAATCTTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAAGTCAAGTCGTGCACATGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGACGGAGTTGAGGAGAGTGACTTGATTATTCCAATCACGCTGGCCGGACCAAAAAGCCATCATAACATGCGCCCAGGGTATAAGACTCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCCCTCGTCATTGAGTTTGCTGAGTGTCCGGGGACCACAGTGACTCAGGAAGAGAGTTGTAGTGGCAGGGGACCATCAATTCGGACTACAACAGCAAGTGGAAGGACCATTCGCGATTGGTGTTGCAAGAACTGCACCCTCCCTCCACTCCGATTCATGGCCGGGGACAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAGGAAACCCTGATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTCCAACTTGGGATCCTAATGGCATTTGTGTTCACTCAAGAAGTCCTGAGGAGGAGGTGGACGGCGAACCTAGCGTTGCCCACCTCAGCCTTGCTAATGGCTTGTTTCATCTTTGGCGGCTTCACCTACCTGGACCTGTTCAGATATTTCATCCTTGTGGGTGCGGCTTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACGTCGTTCATCTAGCCATGATAGCTGCTTTTAACATCCAGCCAGTGGCACTAGTCACCACCTTCTTCAGGAAAAATTGGACCAATCGGGAGAACATGATTCTCATCATCGCCGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGTTGTTTCATGTCATGAATTCACTCTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACTGGCACGACTTCAACTCTTGCAATGCCGTTTTTGGCAGCCCTGTCCCCACCCATGAATTGGCTTGGGCTGGACGTGGTGAGGTGTCTTCTGATCATGGCTGGGGTTGCAGCGCTCATTAGTGAGCGTAGGGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGGGCCTTACTCATCTCTGCAGCCTTGGTTTTGACGGGAGCTTTTTCGCCGCTGGTTCTGCAAGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGCTTGGGAAAACGGGGATGGCCTGCCAGTGAAGTACTAACAGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCCAGACTGGATGGAGGTACAATGGCAATCCCATTGGCCACCATGGCCATATTGGCTGTTGCCTATGTCCTCTCAGGAAAATCCACTGACATGTGGCTGGAACGCTGCGCTGACATCTCATGGATCAATGAGGCTGAAATCACAGGGACTAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGACTCCAACGGAGACTTCAAGATGATCAATGACCCTGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGCAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCAGCATACAACCCTGTGCTTATTCCAGTGTCCATGGCCGGATACTGGATGACAGTGAAAATCCACAAGCGTGGAGGGGTCATGTGGGACGTCCCAGCTCCCAAGCAATTTGGCAAGACGGAGTTAAAACCCGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAATTCTGGGAAGGTACCAGTCAGGTGTGGGAGTCATGTGGGATGGAGTTTTCCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTCAACCCCACTTGGGGAAGTGTGCGTGACGACCTGATATCCTACGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACATGGAATGGAAGCGAGGAGGTCCAGATGATCGCCGTGGAACCAGGAAAGGCTGCAAAAAACTACCAAACCAAGCCAGGAGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCC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TCTGTTCAGCAGTGCCCGTGGATTGGGTCCCGACTGGACGGACCACATGGTCCATCCACGGGAAAGGAGAATGGATGACCACAGAGGACATGCTCCAAGTGTGGAACAGGGTCTGGATTGAGGACAATGAGCACATGGAGGACAAGACACCCATCACGTCTTGGACTGACATCCCCTACATTGGAAAGAGGGAGGACCAATGGTGTGGTAGTCTGATTGGAACTCGACAGAGAGCCACATGGGCGGAGAACATATACACACCAATAATGCAAATCCGCAATTTAATCGGGGATGAGAAGTACGTGGATTACATGGTGTCCCAGCACAGGTTCGAAACACCTTCACCTGTGCTGTTCACCGGCGCCATCTAAACCCAAAAGACCAAAAAAGGACAATTGTGTCAGGCCATGGAAACATGCCACCCAAAGCTTGTAGAGGGTGCAGCCTGCGCCAAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTAGGCCCCCACGGCCCATTCCAGGAGACAGCGCGACTCCTGGAGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACATCGCTGAGGCCCAAACCAGCCCGAAGCTGTAGGACTGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGTGGAGACCCCTCAGCACCAAGCGCAAAACAAACAGCATATTGACGCCTGGGAAAGACCGGGAGATCCTCTGCTTTCCATCACCAGCCACTAGGCACAGATCGCCGCAAGTTGTGGCTGGTGGTGAAAAACACAGGATCT
18,797
OP947886.1
Ilheus virus
Plante,J.A., Plante,K.S., Popov,V.L., Shinde,D.P., Widen,S.G., Buenemann,M., Nogueira,M.L., Vasilakis,N.
University of Texas Medical Branch, World Reference Center for Emerging Viruses and Arboviruses
USA
2023-02-01
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,758
GenBank
1
Brazil: near Ilheus-Fazenda Pirataquiscol
Brazil
null
null
1944-03-12
null
null
Ilheus virus strain Original, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTTTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGACTGTCAATATGCTAAAACGCCTGGCTAGCGTGTCCCCCCTCAAGGGGGCGAAGAAGCTATTCGGAGAACTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTAGCCCTCATGGCTTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACTCTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATCTGACCAACTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAGCGCAAGGAAAAGAAGAAGAGCTTCTCAACGGCCCTGCTCTGGATTACCATGATCACAGCGGTCGCCGGCCTCAAGATCTCATCACACAGAGACCGGCCTCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTGCCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACGATCAGGGCTTTGGACGTAGGCTACACTTGCGCTTATGACACAACTTACGAGTGCCCTCACCTGGAAGTGACCATGGATCCGGAAGACATAGATTGTTGGTGCACACTTGAATCTGTTTATGTTAACTACGGACTCTGCAAGCAAAACCATCATGTTAGAAGGGGCCGACGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGCCATCTTGAAAACCGGGCGACTCCATGGATGGACACCACCAAGACAACCAAGTATCTAACTAAAGTTGAGAATTGGGTTATACGCAATCCTGGATATGCACTAGTAGCATTGGCCACAGCCTGGATGTTAGGTAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTCATTGCTCCAGCATACAGCTTGAACTGCTTGGGAATCTCAAACCGAGATTTTGTTGAAGGCTTGTCTGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTGGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTTATGGCCAAGGACAAACCAACACTAGACATCAAGTTGATAAGAATGGAAGCCAAGGACCTGGCCACGGTTCGTAGTTACTGCTACCAGGCCACTGTCACCGACTCGTCAACTGAGGCCAGATGCCCTACCATGGGTGAAGCCCACAACTCCAAATCTCTTGACGCCAGCTACGTCTGCAAATCATCATACGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGCGGGCTCTTTGGGAAAGGGAGCATCCAAACTTGTGTGAAGTTTTCATGTCCTGGAAAGGCTACTGGGAAAAGCATTCAGAGGGAGAATCTGAACTATGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAATAAGCGCAGCCGCACACGGCAACTACACCGCCCAATTGACAGGGAAGTACGCTGCCAAATTCTCTATCACTCCAAGTGCACCAACATACACTGCAAATTTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCCGCCTTGGACATTGACAACTACTATGTCATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAACCGTGACTGGTTCCATGATCTGGATCTACCCTGGACTGGACCCGCCACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATCGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAAACAGTAGTTGCTTTGGGTAACCAAGAGGGCGCTCTGCATACGGCTTTGGCAGGTGCCATACCCGTGGAAGTCTCAAGCACGACTCTCACTTTGAACTCTGGACACCTCAAGTGCAGGTTGAAGCTGGATAAGCTCAAGATCAAAGGGACAACTTACGCTATGTGCAAAGGGACTTTCGCGTTTGCCCAAACCCCAGTGGATACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAGCTGACCTACACAGGGACGGACGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGATTTGCGGGACATGACTCCAATCGGAAGACTTGTCACAGTCAATCCAATAATCCCAAGCTCGGCCAAATCCCAAAAGATTCTGGTTGAACTTGAGCCCCCCTTTGGGAGCTCGTTCATCCTCGTGGGCCAAGAAAACAACCAGATTAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGAAATGCTCTGAAAACGACTTGGAAGGGAGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGACACAGCTTGGGACTTTGGTTCTGTGGGTGGAATTTTCAATTCCATTGGGAAAACCATTCATGGAGTGTTTGGCACCGCCTTCAGGTCATTGTTTGGAGGTATGTCGTGGGTAACGCAAGCTCTCATGGGAGCTCTTCTGCTCTGGCTCGGCATCAGTGCTCGTGAAAGGACGGTGTCTTTGATAATGCTGAGTGTGGGTGGCATCCTCCTTTTCTTGGCTGTCAATGTGCATGCTGACACCGGTTGTGCTATTGACATGGCACGTCGTGAGCTGAAATGTGGAAGTGGTATCTTCATCCACAACGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAATACCACCCACTCACGCCACGCGGCTTTGCCAAGGTCATTCAGATGTCAAAGGATAAAGGTGTCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGACTTGAGCACGAGATGTGGGAGGCCATCGCACCTGAGTTGAACGCCATCTTCGAGGACAATGGAGTGGACCTCAGCGTTGTCGTGAAAGGCCAGACAGGGATTTACAAACGTGCACCCAAACGCCTCACCGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTTGGATGGAAGAATTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACCGAAACAGCCAACTCCACATTCATTGTCGATGGACCAGAAAGTAAAGAGTGCCCGACATCAGACCGGGCTTGGAACTCCCTAGAATTGGAGGATTTCGGGTTCGGAATCATCTCAACCAAGATTTTCCTAAAGGTCAACGAGCAACGGGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATTGGAACAGCCGTCAAGGGCAATGAAGCTGTCCATAGTGACTTGGGATACTGGATCGAGAGCAAAAAGAATGAATCCTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAGGTCAAGTCGTGCACATGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGACGGAGTTGAGGAGAGTGACTTGATTATTCCAATCACGCTGGCCGGACCAAAAAGCCACCACAACATGCGCCCAGGGTACAAGACTCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCTCTCGTCATCGAGTTTGCTGAATGTCCAGGGACCACAGTGACCCAGGAAGAGAGTTGTGGCGGTAGAGGACCATCAATTAGGACAACAACAGCAAGTGGAAGGACCATTCGCGATTGGTGTTGCAAGAACTGCACCCTTCCTCCACTCCGATTTATGGCCGGGGAAAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAGGAAACCCTAATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTCCAACTCGGGATCCTAATGGCATTTGTGTTCACCCAAGAAGTCCTGAGGAGGAGGTGGACGGCGAACCTAGCGTTGCCCACCTCAGCCTTGCTAATGGCTTGTTTCATCTTTGGCGGCTTCACCTACCTGGACCTGTTCAGGTATTTTATCCTTGTGGGTGCGGCCTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACGTCGTTCATCTAGCCATGATAGCTGCTTTTAACATCCAGCCAGTGGCACTAGTCACTACCTTCTTCAGGAAAAATTGGACCAACCGGGAGAACATGATTCTCATCATCGCTGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGTTGTTTCATGTCATGAATTCACTTTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACTGGCACGACTTCGACTCTTGCAATGCCGTTTCTGGCAGCTCTGTCCCCACCCATGAACTGGCTTGGGCTGGACGTAGTAAGGTGTCTTCTGATCATGGCTGGAGTTGCAGCGCTCATTAGTGAGCGTAGGGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGGGCCTTGCTCATCTCTGCAGCCTTAGCTTTGACGGGAGCTTTCTCGCCGCTGGTTCTGCAGGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGTTTGGGAAAACGGGGATGGCCTGCCAGTGAAGTACTAACAGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCCAGACTGGACGGAGGGACTATGGCCATCCCATTGGCCACCATGGCCATACTGGCTGTTGCCTATGTCCTCTCAGGAAAATCCACTGACATGTGGTTGGAACGCTGCGCTGACATCTCATGGATCAATGAGGCTGAGATCACAGGGACCAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGATTCCAACGGAGACTTCAAGATGATCAATGACCCTGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGTAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCAGCATACAACCCCGTGCTTATTCCAGTGTCCATGGCCGGATACTGGATGACAGTGAAAATCCACAAGCGTGGAGGGGTCATGTGGGACGTTCCAGCTCCCAAGCAATTTGGCAAGACGGAGTTAAAACCCGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAATTCTGGGACGGTACCAGTCAGGTGTGGGGGTCATGTGGGATGGAGTCTTCCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTCAACCCCACTTGGGGGAGTGTGCGTGATGACTTAATATCCTATGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACATGGAATGGAAGTGAGGAGGTCCAGATGATCGCCGTGGAACCAGGAAAGGCTGCAAAAAACTACCAAACCAAGCCAGGAGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCCC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CTGTTCAGCAGTGCCTGTGGATTGGGTCCCGACTGGACGAACCACATGGTCCATCCACGGAAAAGGAGAATGGATGACCACAGAGGACATGCTCCAAGTGTGGAACAGGGTCTGGATTGAGGACAATGAGCACATGGAGGACAAGACACCCATCACGTCTTGGACTGACATCCCCTACATCGGAAAGAGGGAGGACCAATGGTGTGGTAGTCTGATTGGAACCCGACAGAGAGCAACATGGGCGGAGAATATATATACACCAATAATGCAAATCCGCAACTTGATCGGGGATGAGAAGTATGTGGACTGCATGGTGTCCCAGCACAGGTTCGAAACACCTTCGCCCGTGCTGTTCACCGGCGCCATCTAAACCCAAAAGACCAAAAAAGGACAATTGTGTCAGGCCATGGAAACATGCCACCCAAAGCTTGTAGAGGGTGCAGCCTGCGCCAAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTAGGCCCCCACGGCCCATTTCAGGAGACAGCGCGACTCCTGGAGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACATCGCTGAGGCCCAAACCAGCCCGAAGCTGTAGGACTGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGTGGAGACCCCTCAGCACCAAGCGCGAAACAAACAGCATATTGACGCCTGGGAAAGACCGGGAGATCCTCTGCTTTCCATCACCAGCCACTAGGCACAGATCGCCGCAAGTTGTGGCTGGTGGTGAAAAACACAGGATCT
18,798
OP947887.1
Ilheus virus
Plante,J.A., Plante,K.S., Popov,V.L., Shinde,D.P., Widen,S.G., Buenemann,M., Nogueira,M.L., Vasilakis,N.
University of Texas Medical Branch, World Reference Center for Emerging Viruses and Arboviruses
USA
2023-02-01
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,759
GenBank
1
Peru: Iquitos, Loreto
Peru
null
null
1997-06-18
null
null
Ilheus virus strain PE 20545, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTTTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGACTGTCAATATGCTAAAACGCTTGGCTAGCGTGTCCCCCCTCAAGGGGGCGAAGAAGCTACTCGGAGAATTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTAGCCCTCATGGCTTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACTCTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATTTGACCAACTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAACGCAAGGAAAAGAAGAAGAGTTTCTCAACGGCCCTGCTCTGGATTACCATGATCACAATGGTCGCTGGCCTCAAGATTTCATCACACAGAGGCCGACCTCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTGCCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACGATCAGGGCTTTGGACGTAGGCTATACGTGCGCTTATGACACAACTTATGAGTGCCCTCACCTGGAAGTGACCATGGACCCGGAGGACATAGACTGTTGGTGCACACTTGAATCTGTCTATGTTAACTACGGACTCTGCAAGCAAAACCACCATGTTAGAAGGGGCAGGCGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGTCATCTCGAAAACCGGGCGACTCCATGGATGGACACCACCAAGACAACCAAATATCTAACCAAAGTTGAGAATTGGGTCATACGCAATCCTGGATACGCACTAGTAGCATTGGCCACAGCCTGGATGCTAGGTAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTCATTGCTCCAGCGTACAGCTTGAACTGCTTGGGAATCTCGAACCGAGACTTCGTTGAGGGCTTGTCTGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTAGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTCATGGCTAAGGACAAACCCACGCTAGACATCAAGCTGATAAGAATGGAAGCCAAGGATCTGGCCACGGTTCGTAGCTACTGCTACCAGGCCACTGTCACTGACTCGTCAACTGAGGCCAGATGCCCTACCATGGGTGAAGCTCACAACTCCAAATCTCTTGACGCTAGCTACGTCTGCAAATCATCATACGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGTGGGCTCTTTGGGAAAGGGAGTATCCAAACTTGTGTGAAGTTTTCATGTCCTGGAAAGGCTACTGGGAAAAGTATCCAGAGGGAGAACCTAAACTATGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAACAAGTGCGGCCGCACACGGCAACTACACCGCCCAGTTGACAGGGAAGTACGCCGCCAAATTCTCGATTACTCCAAGTGCACCAACATACACTGCAAATTTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCCGCCTTGGACATTGACAACTACTATGTCATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAATCGTGACTGGTTCCATGATCTGGATCTACCCTGGACCGGACCCGCTACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATCGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAAACAGTGGTCGCCTTGGGTAACCAAGAGGGTGCTCTGCACACGGCTTTGGCAGGGGCCATACCCGTGGAAGTCTCAAGCACGACTCTCACTTTGAACTCTGGACATCTCAAGTGCAGGTTGAAGCTGGACAAGCTCAAGATTAAAGGGACAACTTATGCTATGTGCAAAGGGACTTTCGCGTTTGCTCAAACCCCAGTGGACACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAACTGACCTACACAGGGACGGACGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGATCTGCGAGACATGACTCCAATCGGAAGGCTTGTTACAGTCAATCCAATAATTCCAAGCTCGGCCAACTCCCAAAAGATTCTGGTCGAACTCGAGCCCCCCTTTGGGAGTTCGTTCATCCTTGTTGGCCAAGAAAGCAACCAGATCAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGGAATGCTCTGAAAACGACTTGGAAGGGAGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGACACAGCTTGGGATTTTGGCTCTGTGGGTGGAATTTTCAACTCCATTGGGAAAACCATCCATGGAGTTTTTGGTACCGCCTTCAGGTCATTGTTCGGAGGCATGTCGTGGGTAACACAAGCTCTCATGGGAGCTCTCCTGCTCTGGCTCGGCATCAGTGCCCGTGAGAGGACGGTGTCTTTGATAATGCTGAGTGTGGGGGGCATCCTCCTTTTCTTGGCTGTCAATGTGCATGCTGACACCGGCTGTGCCATTGACATGGCACGTCGCGAGCTGAAATGTGGAAGTGGTATCTTCATCCACAATGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAGTACCACCCACTCACGCCACGCGGCTTTGCCAAGGTCATTCAGATGTCAAAGGACAAAGGTGTCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGGCTTGAGCACGAGATGTGGGAAGCCATTGCACCTGAGTTGAATGCCATCTTTGAGGACAACGGAGTGGACCTCAGCGTTGTCGTAAAAGGCCAGACAGGGATCTACAAACGTGCACCCAAACGTCTCACTGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTCGGATGGAAGAATTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACCGAAACAGCCAACTCCACATTCATTGTTGATGGACCAGAAAGCAAAGAGTGCCCGACATCAGACCGGGCTTGGAACTCCCTAGAATTGGAGGATTTCGGTTTTGGTATCATCTCAACCAAGATTTTCCTAAAGGTCAACGAGCAGCGAGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATCGGAACAGCCGTCAAGGGCAATGAAGCCGTCCATAGTGACCTGGGATACTGGATTGAGAGCAAGAAGAATGAATCCTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAAGTCAAGTCGTGCACATGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGATGGAGTTGAGGAGAGTGACTTGATCATTCCAATCACGCTGGCTGGACCAAAAAGTCACCATAACATGCGCCCAGGGTACAGGACTCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCTCTCGTCATCGAGTTTGCTGAGTGTCCGGGGACCACAGTGACCCAGGAAGAGAGTTGTGGCGGCAGGGGACCATCAATCCGGACTACAACAGCAAGTGGAAGGACCATTCGTGATTGGTGTTGCAAGAACTGCACCCTCCCTCCGCTCCGATTCATGGCCGGGGACAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAAGAAACCCTGATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTTCAACTTGGGATCCTAATGGCATTTGTGTTCACTCAAGAAGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCGAACCTAGCGCTACCCACCTCAGCCTTGCTAATGGCTTGTTTCATTTTTGGCGGCTTCACCTACCTGGACTTGTTCAGATATTTCATCCTTGTGGGTGCGGCCTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACGTCGTCCATCTAGCCATGATAGCTGCTTTTAACATCCAGCCAGTGGCACTAGTCACCACCTTCTTCAGGAAAAATTGGACCAATCGGGAGAACATGATTCTCATCATCGCCGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGTTGTTTCATGTCATGAATTCACTCTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACTGGCACGACTTCGACTCTTGCAATGCCGTTTCTGGCAGCCCTGTCCCCACCCATGAATTGGCTTGGACTGGATGTGGTGAGATGTCTTCTGATCATGGCCGGGGTTGCAGCGCTCATTAGCGAGCGTAGGGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGGGCCTTGCTCATCTCTGCAGCCTTGGTTTTGACAGGAGCTTTCTCACCGCTGGTTCTGCAAGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGTTTGGGAAAACGGGGATGGCCTGCCAGTGAAGTACTAACAGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCCAGACTGGACGGAGGTACAATGGCCATCCCATTGGCCACCATGGCCATATTGGCTGTTGCCTATGTCCTCTCAGGAAAATCCACTGACATGTGGCTGGAACGCTGCGCTGACATCTCATGGATCAATGAGGCTGAAATTACAGGGACTAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGATTCCAACGGAGACTTTAAGATGATCAATGACCCTGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGCAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCTGCATACAACCCTGTGCTAATTCCAGTGTCCATGGCTGGATACTGGATGACAGTGAAAATTCACAAGCGTGGAGGGGTCATGTGGGATGTCCCAGCTCCCAAGCAATTCGGCAAGACGGAGTTAAAACCCGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAATCCTGGGAAGGTACCAGTCAGGCGTGGGAGTCATGTGGGATGGAGTTTTCCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTTAACCCCACCTGGGGAAGTGTGCGTGACGACTTGATATCCTACGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACATGGAATGGAAGTGAGGAGGTCCAGATGATCGCCGTGGAGCCAGGAAAGGCAGCAAAAAACTACCAAACCAAGCCAGGAGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCC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TCTGTTCAGCAGTGCCCGTGGATTGGGTCCCGACTGGACGAACCACATGGTCCATCCACGGAAAAGGAGAATGGATGACCACAGAGGACATGCTCCAAGTGTGGAACAGGGTCTGGATTGAGGACAATGAGCACATGGAGGACAAGACGCCCATCACGTCTTGGACTGACATCCCCTACCTCGGAAAGAGGGAGGACCAATGGTGTGGCAGTCTGATCGGAACCCGACAGAGAGCCACATGGGCGGAGAACATATATACACCAATAATGCAAATCCGCAACCTAATTGGGGATGAGAAGTACGTGGATTACATGGTGTCCCAGCACAGGTTCGAAACACCTTCACCTGTGCTGTTCACCGGCGCCATCTAAACCCAAAAGACCAAAAAAGGACAATTGTGTCAGGCCATGGAAACATGCCACCCAAAGCTTGTAGAGGGTGCAGCCTGCGCCAAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTAGGCCCCCACGGCCCATTCCAGGAGACAGCGCGACTCCTGGAGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACATCGCTGAGGCCCAAACCAGCCCGAAGCTGTAGGGCTGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGTGGAGACCCCTCAGCACCAAGCGCAAAACAAACAGCATATTGACGCCTGGGAAAGACCGGGAGATCCTCTGCTTTCCATCACCAGCCACTAGGCACAGATCGCCGCAAGTTGTGGCTGGTGGTGAAAAACACAGGATCT
18,799
OP947888.1
Ilheus virus
Plante,J.A., Plante,K.S., Popov,V.L., Shinde,D.P., Widen,S.G., Buenemann,M., Nogueira,M.L., Vasilakis,N.
University of Texas Medical Branch, World Reference Center for Emerging Viruses and Arboviruses
USA
2023-02-01
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,759
GenBank
1
Peru: Iquitos, Loreto
Peru
null
null
1999
null
null
Ilheus virus strain PE 163615, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTTTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGACTGTCAATATGCTAAAACGCTTGGCTAGCGTGTCCCCCCTCAAGGGGGCGAAGAAGCTACTCGGAGAATTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTAGCCCTCATGGCTTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACTCTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATTTGACCAACTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAACGCAAGGAAAAGAAGAAGAGTTTCTCAACGGCCCTGCTCTGGATTACCATGATCACAATGGTCGCTGGCCTCAAGATTTCATCACACAGAGGCCGACCTCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTGCCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACGATCAGGGCTTTGGACGTAGGCTATACGTGCGCTTATGACACAACTTATGAGTGCCCTCACCTGGAAGTGACCATGGACCCGGAGGACATAGACTGTTGGTGCACACTTGAATCTGTCTATGTTAACTACGGACTCTGCAAGCAAAACCACCATGTTAGAAGGGGCAGGCGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGTCATCTCGAAAACCGGGCGACTCCATGGATGGACACCACCAAGACAACCAAATATCTAACCAAAGTTGAGAATTGGGTCATACGCAATCCTGGATACGCACTAGTAGCATTGGCCACAGCCTGGATGCTAGGTAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTCATTGCTCCAGCGTACAGCTTGAACTGCTTGGGAATCTCGAACCGAGACTTCGTTGAGGGCTTGTCTGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTAGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTCATGGCTAAGGACAAACCCACGCTAGACATCAAGCTGATAAGAATGGAAGCCAAGGATCTGGCCACGGTTCGTAGCTACTGCTACCAGGCCACTGTCACTGACTCGTCAACTGAGGCCAGATGCCCTACCATGGGTGAAGCTCACAACTCCAAATCTCTTGACGCTAGCTACGTCTGCAAATCATCATACGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGTGGGCTCTTTGGGAAAGGGAGTATCCAAACTTGTGTGAAGTTTTCATGTCCTGGAAAGGCTACTGGGAAAAGTATCCAGAGGGAGAACCTAAACTATGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAACAAGTGCGGCCGCACACGGCAACTACACCGCCCAGTTGACAGGGAAGTACGCCGCCAAATTCTCGATTACTCCAAGTGCACCAACATACACTGCAAATTTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCCGCCTTGGACATTGACAACTACTATGTCATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAATCGTGACTGGTTCCATGATCTGGATCTACCCTGGACCGGACCCGCTACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATCGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAAACAGTGGTCGCCTTGGGTAACCAAGAGGGTGCTCTGCACACGGCTTTGGCAGGGGCCATACCCGTGGAAGTCTCAAGCACGACTCTCACTTTGAACTCTGGACATCTCAAGTGCAGGTTGAAGCTGGACAAGCTCAAGATTAAAGGGACAACTTATGCTATGTGCAAAGGGACTTTCGCGTTTGCTCAAACCCCAGTGGACACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAACTGACCTACACAGGGACGGACGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGATCTGCGAGACATGACTCCAATCGGAAGGCTTGTTACAGTCAATCCAATAATTCCAAGCTCGGCCAACTCCCAAAAGATTCTGGTCGAACTCGAGCCCCCCTTTGGGAGTTCGTTCATCCTTGTTGGCCAAGAAAGCAACCAGATCAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGGAATGCTCTGAAAACGACTTGGAAGGGAGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGACACAGCTTGGGATTTTGGCTCTGTGGGTGGAATTTTCAACTCCATTGGGAAAACCATCCATGGAGTTTTTGGTACCGCCTTCAGGTCATTGTTCGGAGGCATGTCGTGGGTAACACAAGCTCTCATGGGAGCTCTCCTGCTCTGGCTCGGCATCAGTGCCCGTGAGAGGACGGTGTCTTTGATAATGCTGAGTGTGGGGGGCATCCTCCTTTTCTTGGCTGTCAATGTGCATGCTGACACCGGCTGTGCCATTGACATGGCACGTCGCGAGCTGAAATGTGGAAGTGGTATCTTCATCCACAATGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAGTACCACCCACTCACGCCACGCGGCTTTGCCAAGGTCATTCAGATGTCAAAGGACAAAGGTGTCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGGCTTGAGCACGAGATGTGGGAAGCCATTGCACCTGAGTTGAATGCCATCTTTGAGGACAACGGAGTGGACCTCAGCGTTGTCGTAAAAGGCCAGACAGGGATCTACAAACGTGCACCCAAACGTCTCACTGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTCGGATGGAAGAATTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACCGAAACAGCCAACTCCACATTCATTGTTGATGGACCAGAAAGCAAAGAGTGCCCGACATCAGACCGGGCTTGGAACTCCCTAGAATTGGAGGATTTCGGTTTTGGTATCATCTCAACCAAGATTTTCCTAAAGGTCAACGAGCAGCGAGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATCGGAACAGCCGTCAAGGGCAATGAAGCCGTCCATAGTGACCTGGGATACTGGATTGAGAGCAAGAAGAATGAATCCTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAAGTCAAGTCGTGCACATGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGATGGAGTTGAGGAGAGTGACTTGATCATTCCAATCACGCTGGCTGGACCAAAAAGTCACCATAACATGCGCCCAGGGTACAGGACTCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCTCTCGTCATCGAGTTTGCTGAGTGTCCGGGGACCACAGTGACCCAGGAAGAGAGTTGTGGCGGCAGGGGACCATCAATCCGGACTACAACAGCAAGTGGAAGGACCATTCGTGATTGGTGTTGCAAGAACTGCACCCTCCCTCCGCTCCGATTCATGGCCGGGGACAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAAGAAACCCTGATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTTCAACTTGGGATCCTAATGGCATTTGTGTTCACTCAAGAAGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCGAACCTAGCGCTACCCACCTCAGCCTTGCTAATGGCTTGTTTCATTTTTGGCGGCTTCACCTACCTGGACTTGTTCAGATATTTCATCCTTGTGGGTGCGGCCTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACGTCGTCCATCTAGCCATGATAGCTGCTTTTAACATCCAGCCAGTGGCACTAGTCACCACCTTCTTCAGGAAAAATTGGACCAATCGGGAGAACATGATTCTCATCATCGCCGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGTTGTTTCATGTCATGAATTCACTCTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACTGGCACGACTTCGACTCTTGCAATGCCGTTTCTGGCAGCCCTGTCCCCACCCATGAATTGGCTTGGACTGGATGTGGTGAGATGTCTTCTGATCATGGCCGGGGTTGCAGCGCTCATTAGCGAGCGTAGGGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGGGCCTTGCTCATCTCTGCAGCCTTGGTTTTGACAGGAGCTTTCTCACCGCTGGTTCTGCAAGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGTTTGGGAAAACGGGGATGGCCTGCCAGTGAAGTACTAACAGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCCAGACTGGACGGAGGTACAATGGCCATCCCATTGGCCACCATGGCCATATTGGCTGTTGCCTATGTCCTCTCAGGAAAATCCACTGACATGTGGCTGGAACGCTGCGCTGACATCTCATGGATCAATGAGGCTGAAATTACAGGGACTAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGATTCCAACGGAGACTTTAAGATGATCAATGACCCTGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGCAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCTGCATACAACCCTGTGCTAATTCCAGTGTCCATGGCTGGATACTGGATGACAGTGAAAATTCACAAGCGTGGAGGGGTCATGTGGGATGTCCCAGCTCCCAAGCAATTCGGCAAGACGGAGTTAAAACCCGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAATCCTGGGAAGGTACCAGTCAGGCGTGGGAGTCATGTGGGATGGAGTTTTCCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTTAACCCCACCTGGGGAAGTGTGCGTGACGACTTGATATCCTACGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACATGGAATGGAAGTGAGGAGGTCCAGATGATCGCCGTGGAGCCAGGAAAGGCAGCAAAAAACTACCAAACCAAGCCAGGAGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCC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TCTGTTCAGCAGTGCCCGTGGATTGGGTCCCGACTGGACGAACCACATGGTCCATCCACGGAAAAGGAGAATGGATGACCACAGAGGACATGCTCCAAGTGTGGAACAGGGTCTGGATTGAGGACAATGAGCACATGGAGGACAAGACGCCCATCACGTCTTGGACTGACATCCCCTACCTCGGAAAGAGGGAGGACCAATGGTGTGGCAGTCTGATCGGAACCCGACAGAGAGCCACATGGGCGGAGAACATATATACACCAATAATGCAAATCCGCAACCTAATTGGGGATGAGAAGTACGTGGATTACATGGTGTCCCAGCACAGGTTCGAAACACCTTCACCTGTGCTGTTCACCGGCGCCATCTAAACCCAAAAGACCAAAAAAGGACAATTGTGTCAGGCCATGGAAACATGCCACCCAAAGCTTGTAGAGGGTGCAGCCTGCGCCAAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTAGGCCCCCACGGCCCATTCCAGGAGACAGCGCGACTCCTGGAGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACATCGCTGAGGCCCAAACCAGCCCGAAGCTGTAGGGCTGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGTGGAGACCCCTCAGCACCAAGCGCAAAACAAACAGCATATTGACGCCTGGGAAAGACCGGGAGATCCTCTGCTTTCCATCACCAGCCACTAGGCACAGATCGCCGCAAGTTGTGGCTGGTGGTGAAAAACACAGGATCT
18,800
OP947889.1
Ilheus virus
Plante,J.A., Plante,K.S., Popov,V.L., Shinde,D.P., Widen,S.G., Buenemann,M., Nogueira,M.L., Vasilakis,N.
University of Texas Medical Branch, World Reference Center for Emerging Viruses and Arboviruses
USA
2023-02-01
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,758
GenBank
1
Venezuela: Catatumbo, Zulia
Venezuela
null
null
1998-11-19
null
null
Ilheus virus strain ZCM 228, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTCTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGACTGTCAATATGCTAAAACGCTTGGCTAGCGTGTCCCCCCTCAAAGGGGCGAAGAAGCTACTCGGAGAATTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTCGCCCTCATGGCCTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACTCTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATCTGACCAACTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAGCGCAAGGAAAAGAAGAAGAGTTTTTCAACGGCTCTGCTTTGGATTACCATGATCACAGTGGTTGCCGGCCTCAAGATATCATCACATCGAGGCCGACCTCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTGCCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACAATTAGGGCCTTGGACGTAGGCTATACGTGTGCTTATGACACAACTTACGAGTGCCCTCACCTGGAAGTGACCATGGATCCGGAGGACATAGATTGTTGGTGCACACTTGAATCTGTTTACGTCAATTACGGACTCTGCAAGCAAAACCACCATATTAGGAGGGGCAGACGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGTCACCTTGAAAACCGGGCGACTCCATGGATGGACACCACCAAGACAACCAAATATCTGACCAAAGTTGAGAATTGGGTTATACGCAATCCTGGATATGCACTAGTAGCATTGGCTACAGCCTGGATGCTCGGTAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTCATTGCTCCAGCATACAGCCTGAACTGCCTGGGAATCTCAAACCGAGACTTTGTTGAAGGTTTGTCTGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTGGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTCATGGCCAAGGATAAACCAACACTAGACATCAAGCTGATAAGAATGGAAGCCAAAGATCTGGCCACGGTTCGTAGTTACTGCTACCAGGCCACTGTCACTGACTCGTCAACTGAGGCCAGATGCCCTACTATGGGTGAAGCTCACAACTCCAAATCTCTTGACGCTAGCTACGTCTGCAAATCATCATATGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGTGGGCTCTTTGGGAAAGGGAGTATCCAAACTTGTGTGAAGTTTTCATGTCCTGGAAAGGCTACTGGGAAAAGTATCCAGAGGGAGAACCTGAACTATGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAACAAGTGCGGCTGCACACGGCAACTATACCGCCCAGTTGACAGGGAAGTACGCCGCCAAATTCTCGATCACTCCAAGTGCACCAACATACACTGCAAACTTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCCGCCCTGGACATTGACAACTACTATGTCATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAACCGTGACTGGTTCCATGATCTGGATCTACCCTGGACCGGACCCGCCACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATCGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAAACAGTAGTCGCCTTGGGTAACCAAGAGGGCGCTCTGCACACGGCTCTGGCAGGGGCCATACCCGTGGAAGTCTCAAGCACGACTCTCACTTTGAACTCTGGACATCTCAAGTGCAGGTTGAAGCTAGACAAGCTCAAGATCAAAGGGACAACTTATGCTATGTGCAGAGGGACTTTCGCGTTTGCTCAAACCCCAGTGGACACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAACTGACCTACACAGGGACGGACGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGATTTGCGGGACATGACTCCAATCGGAAGACTTGTTACAGTCAATCCAATAATTCCAAGCTCGGCCAACTCCCAAAAGATTCTGGTCGAGCTTGAGCCCCCCTTTGGGAGTTCGTTCATCCTTGTGGGCCAAGAAAACAACCAGATCAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGGAATGCTCTGAAAACGACTTGGAAGGGAGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGATACAGCTTGGGATTTCGGTTCCGTGGGTGGAATTTTCAATTCCATTGGGAAAACCATCCATGGAGTGTTCGGCACCGCCTTCAGGTCACTGTTTGGAGGCATGTCGTGGGTAACACAAGCTCTCATGGGAGCTCTCCTACTTTGGCTCGGCATTAGTGCTCGTGAAAGGACGGTGTCTTTGATAATGCTGAGTGTGGGGGGCATCCTCCTTTTCTTGGCTGTCAACGTGCATGCTGACACCGGCTGTGCCATTGACATGGCACGTCGTGAGCTGAAATGTGGAAGTGGTATCTTCATCCACAACGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAATACCACCCACTCACGCCACGCGGCTTTGCCAAGGTCATTCAGATGTCAAAGGACAAAGGTATCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGGCTTGAGCATGAGATGTGGGAAGCCATTGCACCTGAGTTGAATGCCATCTTCGAGGACAATGGAGTGGACCTCAGCGTTGTCGTGAAAGGCCAGACAGGGATCTATAAACGAGCACCCAAACGCCTCACTGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTTGGATGGAAGAACTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACCGAAACAGCCAACTCCACATTCATTGTTGATGGACCAGAAAGCAAAGAGTGCCCGACATCAGACCGGGCTTGGAACTCCCTAGAATTGGAGGATTTCGGGTTTGGCATCATTTCAACTAAAATTTTCCTAAAGGTCAACGAGCAGCGAGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATCGGAACAGCTGTCAAGGGCAATGAAGCCGTCCATAGCGACCTGGGGTACTGGATCGAGAGCAAGAAGAATGAATCCTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAAGTCAAGTCATGCACATGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGACGGAGTTGAGGAGAGCGACTTGATCATTCCAACTACGCTGGCCGGACCAAAAAGCCACCACAACATGCGCCCAGGGTACAAGACTCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCTCTCGTCATTGAGTTTGCTGAGTGTCCGGGGACCACAGTGACCCAGGAAGAGAGTTGTGGCGGCAGGGGACCATCAATTCGGACCACAACGGCAAGTGGAAGGACCATTCGCGACTGGTGTTGCAAGAACTGCACCCTCCCCCCACTCCGATTCATGGCCGGGGACAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAGGAAACCCTGATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTCCAACTTGGGATCCTGATGGCATTTGTGTTCACTCAAGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCAAATCTAGCGTTACCCACCTCAGCCTTGTTAATGGCTTGTTTCATCTTTGGCGGCTTCACCTACCTGGACTTGTTCAGATATTTCATCCTTGTGGGTGCGGCCTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACATCGTTCATCTAGCCATGATAGCTGCCTTCAATATCCAACCAGTGGCACTAGTCACCACCTTCTTCAGGAAAAACTGGACCAATCGGGAGAACATGATTCTCATCATTGCCGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGTTGTTTCATGTCATGAATTCACTCTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACCGGCACGACTTCGACTCTTGCAATGCCGTTTCTGGCAGCCCTGTCCCCACCCATGAATTGGCTTGGACTGGACGTGGTGAGGTGTCTTCTGATCATGGCTGGGGTTGCAGCGCTCATTAGTGAGCGTAGAGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGGGCCTTGCTCATCTCTGCAGCCTTGGTTTTGACGGGAGCTTTCTCACCACTGGTTCTGCAAGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGCTTGGGAAAACGGGGATGGCCTGCTAGTGAAGTGCTAACGGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCCAGACTGGACGGAGGCACAATGGCCATCCCATTGGCCACCATGGCCATATTGGCTGTTGCCTATGTCCTCTCAGGGAAATCCACTGACATGTGGCTGGAACGCTGCGCTGACGTCTCATGGATCAATGAGGCTGAAATCACAGGGACTAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGATTCCAACGGAGACTTCAAGATGATCAATGACCCCGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGTAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCTGCATACAACCCTGTGCTTATTCCAGTGTCCATGGCCGGGTACTGGATGACAGTGAAGATCCACAAGCGTGGAGGGGTCATGTGGGACGTCCCAGCTCCCAAGCAATTCGGCAAGACAGAGTTAAAACCTGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAATTCTGGGAAGGTACCAGTCAGGTGTGGGAGTCATGTGGGATGGAGTTTTCCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTCAACCCCACCTGGGGAAGTGTGCGTGACGACTTGATATCCTATGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACATGGAATGGAAGTGAGGAGGTCCAGATGATCGCCGTGGAGCCAGGAAAGGCTGCAAAAAACTACCAAACCAAGCCAGGCGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCC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TCTGTTCAGCAGTGCCCGTGGATTGGGTCCCGACAGGACGAACCACATGGTCCATCCACGGAAAAGGAGAATGGATGACTACAGAGGATATGCTCCAAGTGTGGAACAGGGTCTGGATTGAGGACAATGAGCATATGGAGGACAAGACGCCTATCACGTCCTGGACTGACATCCCCTACCTCGGAAAGAGGGAGGACCAATGGTGTGGTAGTCTGATTGGAACCCGACAGAGAGCCACATGGGCGGAGAACATATACACACCAATAATGCAAATCCGCAACTTAATTGGGGATGAAAAGTATGTGGATTACATGGTGTCCCAGCACAGGTTCGAAACACCTTCACCTGTGCTGTTCACCGGTGCCATCTAAATCCAAAAGACCAAAAAGGACAATTGTGTCAGGCCATGGAAACATGCCACCCAAAGCTTGTAGAGGGTGCAGCCTGCGCCAAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTAGGCCCCCACGGCCCATTCCAGGAGACAGCGCGACTCCTGGAGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACATTGCTGAGGCCCAAGCCAGCCCGAAGCTGTAGGACTGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGTGGAGACCCCTCAGCACCAAGCGCAAAGCAAACAGCATATTGACGCCTGGGAAAGACCGGGAGATCCTCTGCTTTCCATCACCAGCCACTAGGCACAGATCGCCGCAAGTTGTGGCTGGTGGTGAAAAACACAGGATCT
18,801
OP947890.1
Ilheus virus
Plante,J.A., Plante,K.S., Popov,V.L., Shinde,D.P., Widen,S.G., Buenemann,M., Nogueira,M.L., Vasilakis,N.
University of Texas Medical Branch, World Reference Center for Emerging Viruses and Arboviruses
USA
2023-02-01
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,758
GenBank
1
Venezuela: Zulia
Venezuela
null
null
1997
null
null
Ilheus virus strain ZPC 659, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTCTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGACTGTCAATATGCTAAAACGCTTGGCTAGCGTGTCCCCCCTCAAAGGGGCGAAGAAGCTACTCGGAGAATTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTCGCCCTCATGGCCTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACTCTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATCTGACCAACTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAGCGCAAGGAAAAGAAGAAGAGTTTTTCAACGGCTCTGCTTTGGATTACCATGATCACAGTGGTTGCCGGCCTCAAGATTTCATCACATCGAGGCCGACCTCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTGCCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACAATTAGGGCCTTGGACGTAGGCTATACGTGTGCTTATGACACAACTTACGAGTGCCCTCACCTGGAAGTGACCATGGATCCGGAGGACATAGATTGTTGGTGCACACTTGAATCTGTTTACGTCAATTACGGACTCTGCAAGCAAAACCACCATATTAGGAGGGGCAGACGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGTCACCTTGAAAACCGGGCGACTCCATGGATGGACACCACCAAGACAACCAAATATCTAACCAAAGTTGAGAATTGGGTTATACGCAATCCTGGATATGCACTAGTAGCATTGGCTACAGCCTGGATGCTCGGTAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTCATTGCTCCAGCATACAGCCTGAACTGCCTGGGAATCTCAAACCGAGACTTTGTTGAAGGTTTGTCTGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTGGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTCATGGCCAAGGATAAACCAACACTAGACATCAAGCTGATAAGAATGGAAGCCAAAGATCTGGCCACGGTTCGTAGTTACTGCTACCAGGCCACTGTCACTGACTCGTCAACTGAGGCCAGATGCCCTACTATGGGTGAAGCTCACAACTCCAAATCTCTTGACGCTAGCTACGTCTGCAAATCATCATATGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGTGGGCTCTTTGGGAAAGGGAGTATCCAAACTTGTGTGAAGTTTTCATGTCCTGGAAAGGCTACTGGGAAAAGTATCCAGAGGGAGAACCTGAACTACGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAACAAGTGCGGCTGCACACGGCAACTATACCGCCCAGTTGACAGGGAAGTACGCCGCCAAATTCTCGATCACTCCAAGTGCACCAACATACACTGCAAACTTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCCGCCCTGGACATTGACAACTACTATGTCATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAACCGTGACTGGTTCCATGATCTGGATCTACCCTGGACCGGACCCGCCACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATCGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAAACAGTAGTCGCCTTGGGTAACCAAGAGGGCGCTCTGCACACGGCTCTGGCAGGGGCCATACCCGTGGAAGTCTCAAGCACGACTCTCACTTTGAACTCTGGACATCTCAAGTGCAGGTTGAAGCTAGACAAGCTCAAGATCAAAGGGACAACTTATGCTATGTGCAAAGGGACTTTCGCGTTTGCTCAAACCCCAGTGGACACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAACTGACCTACACAGGGACGGACGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGATCTGCGGGACATGACTCCAATCGGAAGACTTGTTACAGTCAATCCAATAATTCCAAGCTCGGCCAACTCCCAAAAGATTCTGGTCGAGCTTGAGCCCCCCTTTGGGAGTTCGTTCATCCTTGTGGGCCAAGAAAACAACCAGATCAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGGAATGCTCTGAAAACGACTTGGAAGGGAGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGATACAGCTTGGGATTTCGGTTCCGTGGGTGGAATTTTCAATTCTATTGGGAAAACCATCCATGGAGTGTTCGGCACCGCCTTCAGGTCACTGTTTGGAGGCATGTCGTGGGTAACACAAGCTCTCATGGGAGCTCTCCTACTTTGGCTCGGCATTAGTGCTCGTGAAAGGACGGTGTCTTTGATAATGCTGAGTGTGGGGGGCATCCTCCTTTTCTTGGCTGTCAACGTGCATGCTGACACCGGCTGTGCCATTGACATGGCACGTCGTGAGCTGAAATGTGGAAGTGGAATCTTCATCCACAACGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAATACCACCCACTCACGCCACGCGGCTTTGCCAAGGTCATTCAGATGTCAAAGGACAAAGGTGTCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGGCTTGAGCATGAGATGTGGGAAGCCATTGCACCTGAGTTGAATGCCATCTTCGAGGACAATGGAGTGGATCTCAGCGTTGTCGTGAAAGGCCAGACAGGGATCTATAAACGAGCACCCAAACGCCTCACTGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTTGGATGGAAGAACTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACCGAAACAGCCAACTCCACATTCATTGTTGATGGACCAGAAAGCAAAGAGTGCCCGACATTAGACCGGGCTTGGAACTCCCTAGAATTGGAGGATTTCGGGTTTGGCATCATCTCAACTAAAATTTTCCTAAAGGTCAACGAGCAGCGAGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATCGGAACAGCTGTCAAGGGCAATGAAGCCGTCCATAGTGACCTGGGGTACTGGATCGAGAGCAAGAAGAATGAATCCTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAAGTCAAGTCATGCACGTGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGACGGAGTTGAGGAGAGCGACCTGATCATTCCAACTACGCTGGCCGGACCCAAAAGCCACCACAACATGCGCCCAGGGTACAAGACTCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCTCTCGTCATTGAGTTTGCTGAGTGTCCGGGGACCACAGTGACCCAGGAAGAGAGTTGTGGCGGCAGGGGACCATCAATTCGGACCACAACGGCAAGTGGAAGGACCATTCGCGACTGGTGTTGCAAGAACTGCACCCTCCCCCCACTCCGATTCATGGCCGGGGACAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAGGAAACCCTGATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTCCAACTTGGGATCCTGATGGCATTTGTGTTCACTCAAGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCAAATCTAGCGTTACCCACCTCAGCCTTATTAATGGCTTGTTTCATCTTTGGCGGCTTCACCTACCTGGACTTGTTCAGATATTTCATCCTTGTGGGTGCGGCCTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACGTCGTTCATCTAGCCATGATAGCTGCCTTCAATATCCAACCAGTGGCACTAGTCACCACCTTCTTCAGGAAAAACTGGACCAATCGGGAGAACATGATTCTCATCATTGCCGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGTTGTTTCATGTCATGAATTCACTCTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACCGGCACGACTTCGACTCTTGCAATGCCGTTTCTGGCAGCCCTGTCCCCACCCATGAATTGGCTTGGACTGGATGTGGTGAGGTGTCTTCTGATCATGGCTGGGGTTGCAGCGCTCATTAGTGAGCGTAGAGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGGGCCTTGCTCATCTCTGCAGCCTTGGTTTTGACGGGAGCTTTCTCACCACTGGTTCTGCAAGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGCTTGGGAAAACGGGGATGGCCTGCTAGTGAAGTACTAACGGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCCAGACTGGACGGAGGCACAATGGCCATCCCATTGGCCACCATGGCCATATTGGCTGTTGCCTATGTCCTCTCAGGGAAATCCACTGACATGTGGCTGGAACGCTGCGCTGACGTCTCATGGATCAATGAGGCTGAAATCACAGGGACTAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGATTCCAACGGAGACTTCAAGATGATCAATGACCCCGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGTAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCTGCATACAACCCTGTGCTTATTCCAGTGTCCATGGCCGGGTACTGGATGACAGTGAAGATCCACAAGCGTGGAGGGGTCATGTGGGACGTCCCAGCTCCCAAGCAATTCGGCAAGACAGAGTTAAAACCTGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAATTCTGGGAAGGTACCAGTCAGGTGTGGGAGTCATGTGGGATGGAGTTTTCCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTCAACCCCACCTGGGGAAGTGTGCGTGACGACTTGATATCCTATGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACATGGAATGGAAGTGAGGAGGTCCAGATGATCGCCGTGGAGCCAGGAAAGGCTGCAAAAAACTACCAAACCAAGCCAGGAGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCC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TCTGTTCAGCAGTGCCCGTGGATTGGGTCCCGACTGGACGAACCACATGGTCCATCCACGGAAAAGGAGAATGGATGACTACAGAGGATATGCTCCAAGTGTGGAACAGGGTCTGGATTGAGGACAATGAGCATATGGAGGACAAGACGCCTATCACGTCCTGGACTGACATCCCCTACCTCGGAAAGAGGGAGGACCAATGGTGTGGTAGTCTGATTGGAACCCGGCAGAGAGCCACATGGGCGGAGAACATATATACACCAATAATGCAAATCCGCAACTTAATTGGGGATGAAAAGTATGTGGATTACATGGTGTCCCAGCACAGGTTCGAAACACCTTCACCTGTGCTGTTCACCGGTGCCATCTAAATCCAAAAGACCAAAAAGGACAATTGTGTCAGGCCATGGAAACATGCCACCCAAAGCTTGTAGAGGGTGCAGCCTGCGCCAAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTAGGCCCCCACGGCCCATTCCAGGAGACAGCGCGACTCCTGGAGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACATTGCTGAGGCCCAAGCCAGCCCGAAGCTGTAGGACTGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGTGGAGACCCCTCAGCACCAAGCGCAAAACAAACAGCATATTGACGCCTGGGAAAGACCGGGAGATCCTCTGCTTTCCATCACCAGCCACTAGGCACAGATCGCCGCAAGTTGTGGCTGGTGGTGAAAAACACAGGATCT
18,802
OP947891.1
Ilheus virus
Plante,J.A., Plante,K.S., Popov,V.L., Shinde,D.P., Widen,S.G., Buenemann,M., Nogueira,M.L., Vasilakis,N.
University of Texas Medical Branch, World Reference Center for Emerging Viruses and Arboviruses
USA
2023-02-01
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,758
GenBank
1
Venezuela: Las Nubes, Jesus Ma. Sempum (Catatumbo), Zulia
Venezuela
null
null
1997-12-15
null
null
Ilheus virus strain ZPC 804, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTCTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGGCTGTCAATATGCTAAAACGCTTGGCTAGCGTGTCCCCCCTCAAAGGGGCGAAGAAGCTACTCGGAGAATTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTCGCCCTCATGGCCTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACTCTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATCTGACCAACTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAGCGCAAGGAAAAGAAGAAGAGTTTTTCAACGGCTCTGCTTTGGATTACCATGATCACAGTGGTTGCCGGCCTCAAGATTTCATCACATCGAGGCCGACCTCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTGCCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACAATTAGGGCCTTGGACGTAGGCTACACGTGTGCTTATGACACAACTTACGAGTGCCCTCACCTGGAAGTGACCATGGATCCGGAGGACATAGATTGTTGGTGCACACTTGAATCTGTTTACGTCAATTACGGACTCTGCAAGCAAAACCACCATATTAGGAGGGGCAGACGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGTCACCTTGAAAACCGGGCGACTCCATGGATGGACACCACCAAGACAACCAAATATCTAACCAAAGTTGAGAATTGGGTTATACGCAATCCTGGATATGCACTAGTAGCATTGGCTACAGCCTGGATGCTCGGTAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTCATTGCTCCAGCATACAGCCTGAACTGCCTGGGAATCTCAAACCGAGACTTTGTTGAAGGTTTGTCTGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTGGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTCATGGCCAAGGATAAACCAACACTAGACATCAAGCTGATAAGAATGGAAGCCAAAGATCTGGCCACGGTTCGTAGTTACTGCTACCAGGCCACTGTCACTGACTCGTCAACTGAGGCCAGATGCCCTACTATGGGTGAAGCTCACAACTCCAAATCTCTTGACGCTAGCTACGTCTGCAAATCATCATATGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGTGGGCTCTTTGGGAAAGGGAGTATCCAAACTTGTGTGAAGTTTTCATGTCCTGGAAAGGCTACTGGGAAAAGTATCCAGAGGGAGAACCTGAACTACGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAACAAGTGCGGCTGCACACGGCAACTATACCGCCCAGTTGACAGGGAAGTACGCCGCCAAATTCTCGATCACTCCAAGTGCACCAACATACACTGCAAACTTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCTGCCCTGGACATTGACAACTACTATGTCATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAACCGTGACTGGTTCCATGATCTGGATCTACCTTGGACCGGACCCGCCACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATCGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAAACAGTAGTCGCCTTGGGTAACCAAGAGGGCGCTCTGCACACGGCTCTGGCAGGGGCCATACCCGTGGAAGTCTCAAGCACGACTCTCACTTTGAACTCTGGACATCTCAAGTGCAGGTTGAAGCTAGACAAGCTCAAGATCAAAGGGACAACTTATGCTATGTGCAAAGGGACTTTCGCGTTTGCTCAAACCCCAGTGGACACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAACTGACCTACACAGGGACGGACGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGATCTGCGGGACATGACTCCAATCGGAAGACTTGTTACAGTCAATCCAATAATTCCAAGCTCGGCCAACTCCCAAAAGATTCTGGTCGAGCTTGAGCCCCCCTTTGGGAGTTCGTTCATCCTTGTGGGCCAAGAAAACAACCAGATCAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGGAATGCTCTGAAAACGACTTGGAAGGGAGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGATACAGCTTGGGATTTCGGTTCCGTGGGTGGAATTTTCAATTCTATTGGGAAAACCATCCATGGAGTGTTCGGCACCGCCTTCAGGTCACTGTTTGGAGGCATGTCGTGGGTAACACAAGCTCTCATGGGAGCTCTCCTACTTTGGCTCGGCATTAGTGCTCGTGAAAGGACGGTGTCTTTGATAATGCTGAGTGTGGGGGGCATCCTCCTTTTCTTGGCTGTCAACGTGCATGCTGACACCGGCTGTGCCATTGACATGGCACGTCGTGAGCTGAAATGTGGAAGTGGTATCTTCATCCACAACGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAATACCACCCACTCACGCCACGCGGCTTTGCCAAGGTCATTCAGATGTCAAAGGACAAAGGTGTCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGGCTTGAGCATGAGATGTGGGAAGCCATTGCACCTGAGTTGAATGCCATCTTCGAGGACAATGGAGTGGATCTCAGCGTTGTCGTGAAAGGCCAGACAGGGATCTATAAACGAGCACCCAAACGCCTCACTGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTTGGATGGAAGAACTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACCGAAACAGCCAACTCCACATTCATTGTTGATGGACCAGAAAGCAAAGAGTGCCCGACATTAGACCGGGCTTGGAACTCCCTAGAATTGGAGGATTTCGGGTTTGGCATCATCTCAACTAAAATTTTCCTAAAGGTCAACGAGCAGCGAGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATCGGAACAGCTGTCAAGGGCAATGAAGCCGTCCATAGTGACCTGGGGTACTGGATCGAGAGCAAGAAGAATGAATCCTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAAGTCAAGTCATGCACGTGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGACGGAGTTGAGGAGAGCGACCTGATCATTCCAACTACGCTGGCCGGACCCAAAAGCCACCACAACATGCGCCCAGGGTACAAGACTCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCTCTCGTCATTGAGTTTGCTGAGTGTCCGGGGACCACAGTGACCCAGGAAGAGAGTTGTGGCGGCAGGGGACCATCAATTCGGACCACAACGGCAAGTGGAAGGACCATTCGCGACTGGTGTTGCAAGAACTGCACCCTCCCCCCACTCCGATTCATGGCCGGGGACAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAGGAAACCCTGATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTCCAACTTGGGATCCTAATGGCATTTGTGTTCACTCAAGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCAAATCTAGCGTTACCCACCTCAGCCTTGTTAATGGCTTGTTTCATCTTTGGCGGCTTCACCTACCTGGACTTGTTCAGATATTTCATCCTTGTGGGTGCGGCCTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACGTCGTTCATCTAGCCATGATAGCTGCCTTCAATATCCAACCAGTGGCACTAGTCACCACCTTCTTCAGGAAAAACTGGACCAATCGGGAGAACATGATTCTCATCATTGCCGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGTTGTTTCATGTCATGAATTCACTCTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACCGGCACGACTTCGACTCTTGCAATGCCGTTTCTGGCAGCCCTGTCCCCACCCATGAATTGGCTTGGACTGGACGTGGTGAGGTGTCTTCTGATCATGGCTGGGGTTGCAGCGCTCATTAGTGAGCGTAGAGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGGGCCTTGCTCATCTCTGCAGCCTTGGTTTTGACGGGAGCTTTCTCACCACTGGTTCTGCAAGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGCTTGGGAAAACGGGGATGGCCTGCTAGTGAAGTACTAACGGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCCAGACTGGACGGAGGCACAATGGCCATCCCATTGGCCACCATGGCCATATTGGCTGTTGCCTATGTCCTCTCAGGGAAATCCACTGACATGTGGCTGGAACGCTGCGCTGACGTCTCATGGATCAATGAGGCTGAAATCACAGGGACTAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGATTCCAACGGAGACTTCAAGATGATCAATGACCCCGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGTAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCTGCATACAACCCTGTGCTTATTCCAGTGTCCATGGCCGGGTACTGGATGACAGTGAAGATCCACAAGCGTGGAGGGGTCATGTGGGACGTCCCAGCTCCCAAGCAATTCGGCAAGACAGAGTTAAAACCTGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAGTTCTGGGAAGGTACCAGTCAGGTGTGGGAGTCATGTGGGATGGAGTTTTCCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTCAACCCCACCTGGGGAAGTGTGCGTGACGACTTGATATCCTATGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACATGGAATGGAAGTGAGGAGGTCCAGATGATCGCCGTGGAGCCAGGAAAGGCTGCAAAAAACTACCAAACCAAGCCAGGAGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCC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TCTGTTCAGCAGTGCCCGTGGATTGGGTCCCGACTGGACGAACCACATGGTCCATCCACGGAAAAGGAGAATGGATGACTACAGAGGATATGCTCCAAGTGTGGAACAGGGTCTGGATTGAGGACAATGAGCATATGGAGGACAAGACGCCTATCACGTCCTGGACTGACATCCCCTACCTCGGAAAGAGGGAGGACCAATGGTGTGGTAGTCTGATTGGAACCCGGCAGAGAGCCACATGGGCGGAGAACATATATACACCAATAATGCAAATCCGCAACTTAATTGGGGATGAAAAGTATGTGGATTACATGGTGTCCCAGCACAGGTTCGAAACACCTTCACCTGTGCTGTTCACCGGTGCCATCTAAATCCAAAAGACCAAAAAGGACAATTGTGTCAGGCCATGGAAACATGCCACCCAAAGCTTGTAGAGGGTGCAGCCTGCGCCAAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTAGGCCCCCACGGCCCATTCCAGGAGACAGCGCGACTCCTGGAGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACATTGCTGAGGCCCAAGCCAGCCCGAAGCTGTAGGACTGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGTGGAGACCCCTCAGCACCAAGCGCAAAACAAACAGCATATTGACGCCTGGGAAAGACCGGGAGATCCTCTGCTTTCCATCACCAGCCACTAGGCACAGATCGCCGCAAGTTGTGGCTGGTGGTGAAAAACACAGGATCT
18,803
KC481679.1
Ilheus virus
Pauvolid-Correa,A., Kenney,J.L., Couto-Lima,D., Campos,Z.M., Schatzmayr,H.G., Nogueira,R.M., Brault,A.C., Komar,N., Campos,Z.M.S., Nogueira,R.M.R.
Instituto Oswaldo Cruz, Laboratorio de Flavivirus
Brazil
2013-04-23
null
Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,759
GenBank
1
Brazil: Nhecolandia Sub-region of Pantanal, Corumba, MS
Brazil
Ochlerotatus scapularis
null
2010-04-18
null
null
Ilheus virus strain BrMS-MQ10, complete genome
AGAAATTCACCTGTGTGAAATTTCACTAACCGTTTTAGTGGAGAGAACTTTTGTTTAACACAGTCTGAATAGTTTTTTAGCAAGGGATTTCCCATGTCTAAAAAACCAGGAAAGTCCGCTGCAAAGCGGACTGTCAATATGCTAAAACGCTTGGCTAGCGTGTCCCCTCTCAAGGGGGCGAAGAAGCTACTCGGAGAATTGCTAAGTGGGAAAGGAGCAATAAGATTGATCCTAGCCCTCATGGCTTTTTTCCGTTTCGCAGCAATCAAGCCCACTTTGGGCTTGAAAAAACGATGGCGTTCTGTCAACAAGACAGTCGCTGTCAAACATCTGACCAACTTCAAAAAGGAACTGACCACCATGCTCGACTCAGTCAACAAACGCAAGGAAAAGAAGAAGAGTTTCTCAACGGCCCTGCTCTGGATCACCATGATCACAGTGGTCGCTGGCCTCAAGATTTCATCACACAGAGGCCGACCTCTGCTGATGGTGAACAAAACTGATGTGTCGGATGCCATCCCAGTACCCTCAGTGAAAGGAACCAACATGTGCACGATTAGGGCTTTGGACGTAGGCTACACGTGCGCTTATGACACAACTTATGAGTGCCCTCACCTGGAAGTGACCATGGACCCGGAGGACATAGATTGTTGGTGCACACTTGAATCCGTCTATGTTAATTACGGACTCTGCAAGCAAAACCACCATGTTAGAAGGGGCAGACGTGCGATCAACATTCCTCACCACGGAGAGAGTCATCTCGAAAACCGGGCGACTCCATGGATGGACACCACCAAGACAACTAAATATCTAACCAAAGTTGAGAATTGGGTCATACGCAATCCTGGATACGCACTAGTAGCATTGGCCACAGCCTGGATGCTAGGTAGCAACACCCCGCAGAGGGTGGTCTTCATGATCATGATGATGCTCATTGCTCCAGCGTACAGCTTGAACTGCTTGGGAATCTCGAACCGAGACTTCGTTGAGGGCTTGTCCGGAGGCACATGGGTGGACATTGTGCTAGAAGGAGGGAGCTGTGTGACAGTCATGGCTAAGGACAAACCCACGCTAGACATCAAGCTGATTAGAATGGAAGCCAAGGATCTGGCCACGGTTCGTAGCTACTGCTACCAGGCCACTGTCACTGACTCGTCAACTGAGGCCAGATGCCCTACCATGGGTGAAGCTCACAACTCCAAATCTCTTGACGCTAGCTACGTCTGCAAATCATCATACGTGGATCGCGGATGGGGCAATGGATGTGGGCTCTTTGGAAAAGGGAGTATCCAAACTTGTGTGAAGTTCTCATGTCCTGGAAAGGCTACTGGGAAAAGTATCCAGAGGGAGAACCTGAACTATGACGTTGCAGTGTACGTGCACGGACCAACAAGTGCGGCCGCACATGGCAACTACACCGCCCAGTTGACAGGGAAGTACGCCGCCAAATTCTCGATTACTCCAAGTGCACCAACATACACCGCAAACCTGGGGGAATATGGAGAAGCAACAATGGAGTGTGAACCACGGGCCGCCCTGGACATTGACAACTACTATGTCATGTCACTCAACAACAAACATTGGCTTGTCAACCGTGACTGGTTTCATGATCTGGATCTACCCTGGACCGGACCCGCTACTGAGTCGTGGAAGAACCGTGAGAGCCTCATCGAGTTTGAGGAGCCCCATGCTACTCGACAAACAGTAGTCGCCTTGGGTAACCAAGAGGGTGCTCTGCACACGGCTTTGGCAGGGGCCATACCCGTGGAAGTCTCAAGCACGACTCTCACTTTGAACTCTGGACATCTCAAGTGCAGGTTGAAGTTGGACAAGCTCAAGATTAAAGGGACAACCTATGCTATGTGCAAAGGGACTTTCGCGTTTGCCCAAACCCCAGTGGACACAGGCCATGGCACCATCGTGGCTGAACTGACCTACACAGGGACGGACGGACCGTGCAAGATCCCCATCTCCATGACTGCAGACCTGCGGGACATGACTCCAATCGGAAGGCTTGTTACAGTCAATCCAATAATTCCAAGCTCGGCCAACTCCCAAAAGATTCTGGTTGAACTTGAGCCCCCCTTTGGGAGTTCGTTCATCCTTGTCGGCCAAGAAAACAGCCAGATCAAGTACCAATGGCACAAGACTGGCAGCACAATTGGGAATGCCCTGAAAACGACTTGGAAGGGAGCTCAAAGGTTTGCTGTCCTCGGAGATACAGCTTGGGATTTTGGTTCTGTGGGTGGAATTTTCAATTCCATTGGGAAGACCATCCATGGAGTTTTTGGTACCGCCTTCAGGTCATTGTTCGGAGGCATGTCGTGGGTAACACAAGCTCTCATGGGAGCTCTCCTACTCTGGCTCGGCATCAGTGCCCGTGAGAGGACGGTGTCTTTGATAATGCTGAGTGTGGGGGGCATCCTCCTTTTCTTGGCTGTCAATGTGCATGCTGACACCGGCTGTGCCATTGATATGGCACGTCGCGAGCTGAAATGTGGAAGTGGCATCTTCATCCACAATGATGTTGAGACATGGAGGAACAATTACAAATACCACCCACTCACGCCGCGCGGCTTTGCCAAGGTCATTCAGATGTCAAAGGACAAAGGTGTCTGCGGCATAAGATCAGTGGGCAGGCTTGAGCACGAGATGTGGGAAGCCATTGCACCTGAGTTGAACGCAATCTTTGAGGACAATGGAGTGGACCTCAGCGTTGTCGTGAAAGGCCAGACAGGGATCTACAAACGTGCACCCAAACGCCTCACTGAGACGAAAGATGAAATGAGCTTTGGATGGAAGAATTGGGGAAAGAGCTTTATCTTTTCAACTGAGACAGCCAACTCCACATTCATTGTTGATGGACCAGAAAGCAAAGAGTGCCCGACATCAGACCGGGCTTGGAATTCCCTAGAATTGGAGGATTTTGGTTTTGGCATCATCTCAACCAAGATTTTCCTAAAGGTCAATGAGCAGCGAGGAAACTCATGCGACTCAGCGGTGATCGGAACAGCTGTCAAGGGCAATGAAGCCGTCCATAGTGACCTGGGATACTGGATTGAGAGCAAGAAGAATGAATCCTGGCAACTGGAGAGAGCAGTCCTTGGGGAAGTCAAGTCGTGCACATGGCCGGAAAGCCACACATTGTGGGGCGATGGAGTTGAGGAGAGTGACCTGATTATTCCAATCACGCTGGCAGGACCAAAAAGCCACCACAACATGCGCCCGGGGTACAAGACCCAAACCAAAGGGCCCTGGCATGAGGAGACACCTCTCGTCATCGAGTTTGCTGAGTGTCCGGGGACCACAGTGACCCAGGAAGAGAGTTGTGGCGGCAGGGGACCATCAATCCGGACTACAACAGCAAGTGGAAGGACCATTCGTGATTGGTGTTGCAAGAATTGCACCCTCCCTCCGCTCCGATTCATGGCCGGGGACAACTGCTGGTATGGCATGGAAGTCAGACCCAAGCGCGAAAATGAGGAAACCCTGATCAAGTCAAAAGTCTCAGCGGGGAATGGCCAGACCATTGAGCCCTTTCAACTTGGGATTCTAATGGCATTTGTGTTCACTCAAGAAGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCGAACCTAGCGCTACCCACCTCAGCCTTGCTAATGGCTTGTTTCATCTTTGGTGGCTTCACCTACTTGGACTTGTTCAGATACTTCATCCTTGTGGGTGCGGCCTTTGCAGAGGCAAACAGCGGTGGGGACGTCGTCCATCTAGCTATGATAGCCGCTTTTAACATCCAGCCAGTGGCACTAGTCACCACCTTCTTCAGGAAAAATTGGACCAATCGGGAGAACATGATTCTCATCATTGCCGCAGCATGCACACAGATGGCGTGCATGGAGTTGAAGATTGAGCTGTTTCATGTCATGAATTCACTCTCTTTGGCATGGATGATACTCAAGGCCCTGACAACTGGCACGACTTCGACTCTTGCAATGCCGTTTCTGGCAGCCCTGTCTCCACCCATGAATTGGCTTGGACTGGACGTGGTGAGATGTCTTCTGATCATGGCTGGGGTTGCAGCGCTCATTAGCGAGCGTAGGGAGAGCTTGGCCAAGAAAAAAGGAGCCTTGCTCATCTCTGCAGCCTTGGTTTTGACGGGAGCTTTCTCACCGCTGGTTCTGCAAGGAGCCCTGATGTTCACTCAAAGTTTGGGAAAACGGGGATGGCCTGCCAGTGAAGTACTAACAGCCGTGGGCATGACTTTCGCTCTTGCGGGGAGTGTTGCTAGACTGGATGGAGGCACAATGGCCATCCCATTGGCCACCATGGCCATATTGGCTGTTGCCTATGTCCTCTCAGGAAAATCCACTGACATGTGGCTGGAACGCTGCGCTGACATCTCATGGATCAATGAAGCTGAAATTACAGGGACTAGCCCACGTCTTGATGTCGAACTTGATTCCAACGGAGACTTTAAGATGATCAATGACCCTGGAGTTCCAATGTGGATGTGGACTTGCAGAATGGGCCTCATGGCAATGGCTGCATACAACCCAGTGCTAATTCCAGTGTCCATGGCTGGATACTGGATGACAGTGAAAATTCACAAGCGTGGAGGGGTCATGTGGGACGTCCCAGCTCCCAAGCAATTCGGCAAGACGGAGTTAAAACCCGGAGTCTACAGAGTCATGACCATGGGAATTCTGGGAAGGTACCAGTCAGGCGTAGGAGTCATGTGGGATGGAGTTTTTCACACCATGTGGCATGTCACACAGGGAGCCGCCTTGCGAAATGGTGAAGGACGCCTTAACCCCACCTGGGGAAGTGTGCGTGACGACTTGATATCCTATGGGGGCAAGTGGAAACTCTCAGCCACATGGAATGGAAGTGAGGAGGTCCAGATGATCGCCGTGGAGCCAGGAAAGGCTGCAAAAAACTACCAAACCAAACCAGGAGTGTTCAAAACGCCGGCAGGAGAAATTGGTGCCATCACACTGGATTTTCCCAAGGGCACCTCGGGATCGCC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94,289
AY632539.4
Ilheus virus
Kuno,G., Chang,G.J., Chang,G.-J.J., Tsuchiya,K.R.
Centers for Disease Control and Prevention, Arbovirus Diseases Branch, Division of Vector-Borne Infectious Diseases
USA
2005-10-30
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Orthoflavivirus ilheusense
Orthoflavivirus
Flaviviridae
ssRNA(+)
10,755
GenBank
1
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Ilheus virus strain Original, complete genome
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108,710
NC_003625.1
Impatiens necrotic spot virus
van Poelwijk,F., Prins,M., Goldbach,R., Van Poelwijk,F.A.J.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
1995-11-21
null
Orthotospovirus impatiensnecromaculae
Orthotospovirus
Tospoviridae
ssRNA(+/-)
8,776
RefSeq
1
null
null
null
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null
null
PRJNA485481
Impatiens necrotic spot virus segment L, complete sequence
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8,890
OR082780.1
Impatiens necrotic spot virus
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
Leibniz Institute Dsmz-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
Germany
2023-06-27
DSMZ PV-1189
Orthotospovirus impatiensnecromaculae
Orthotospovirus
Tospoviridae
ssRNA(+/-)
8,778
GenBank
null
Germany: Bayern
Germany
Ocimum basilicum
null
null
null
null
Impatiens necrotic spot virus isolate DSMZ PV-1189 segment L, complete sequence
AGAGCATTCAGGCACAACTAAAATCTTAATCTAACCGTACTAAATATATAAAAACTAATATTAAGATCAAAATCATGGCACTATTTGCTCTTTCAGTTGTATGGCTACTTATGCTAGATGCTCATGTAAAAATATTTTTGGTTCTTGTTTTAGTTTGCTTCATTCAAATATTTCAAAAGTACTTCTATGCTGTCTGAAGAATCACTATCATCAAGTTCTTTGATTTTATTTATAATTATTTCTCTAGTTTCCATGATGTATCTGTTGATATCTTCAAATGTCATTCTACCGTATAATGTTTTGTCTGTCAAGCATAAAGGGTTGTTTGATAAAAACCCATATATTGCTCTGAAGACTTCCAATTTCTTGCTCTTGTTTTTTTCATTTCTTAATTGAATCAAAACCTTCTTTAATTTCCCCTCAAGTATAGGTTCAGAAATTTCTGATTTGGTTATTTTTAAAAATCCTTCCAGGCACTCTGATATCTCATTCAAAGGGCAATCACGTTTTTCATATTCCATGAAGACTGTTGAATAGATCTTCAAAGAAGGAACACTAGTGCTTACTTTCCCTAATCTGCTTCCGGCAAAAATAGTCACATTGAAACTGTTTCTAAGCAAACTCTCTACATCAAAACTGGTTCCTTTTATTCCATTTATCAAGAATTTTATCATTTCGCTAAGTATGAGAGTGTTAGAAGGAAACAAATATCCTTTCTTTTTTCTTTTTATTTTCATATCTTTTACTATTTCATCATACATTTGCTCTTCATCCAATCTCATGACATCAAAACTAGCTAGACCAACAAAATCTTCATCACCAATCTCTCTATCTATTTTTATGTTCTCACCAGAAACAACAAAACCATTTTCTTTCAGTATTTCTTTTGAATAATCAGACAGATTAATATCTGGTAAAACTAATGTCTTGAAATCATAACTCCTCTCCATCAAATCATTCTGTAAGTTTATATCATAATATAGTTGGATTTTCCTACTAGAAATGGTATATGTTTTGCTTAGAACATTTCTCAAGCTCACTAGATTCAATATAGAATCACTATTATGGCAAGACTCGCAAGCTTTGATCAACTGTATCAAGCCTAATAAGTTGAATTCTCCTATCTCAATATGTTTTTTCATTGTTAAATCAATTGCATGTGCACCAGTAGCTCTGTAACTTTTGAAGCCAGAAGCATCATTCACTAGAGAATACTTCAACATCAACAACATTGACTTGAAATTTCCTAAATCCTCGGAGAATTTTTGATATTTGTCAGTTATATTCAAGAATATAGGGCTATATTCAGAATCCAATGATTCTAAACTCTCTATCATGTTTTTAAAGAGGCTAACAGTTTCCCTAAACCCATGGGTGTCCAAAAATTCTTCATACTCTTCAACACTTTTGCAAGTTTCTAAACCTTCTAGACAATCATTCCTTATACTATCTATGAAATCAAAAATGGTTTCTCTTGTGACTTCATCATCTATAGAATAAACAGATTCATTCAGATCTGCAAATGTGTTTATAAAAGTCAATGACTTAATCAAATTAGATTTCATTTCATAAATCAAACCCTGCTCCGAATCAATTGTTTTATACATTTCAGAGTAACATTCACCTGTTTCTGGGAATCTTAAGTCAATTTGTTTTTGACTCTCTATTATAGACCAAACATCAGAGTTCACATTTTCATAATTGATGTCCATTATTAGTTTTACATTGTCAACTTTCAGCAATTTAGGAGTCGGATTTACTTTTGCAATAAGCTTACCATCAGTTGTTGTTCTTAGACAAGCTTGGCCTGGGTTTAGGAAAACTGTTTGGCTCTGTTTGGATCGTATCACATTACCTTTGTCAAACAAAAATTTTGATAAAAGTTTCTCAATGCTATCTTTATGGGCACTGTATAGCACATCCCTTTCATCTCTTATATCATATGGTGTTCTCAAGGAGATTGCAATATCTGTTTCAGAAGCCATCAGTTGTACATAATTATTTTGATTCATGATGCCAATCTTATAAACTGTCCCTGAAACATAGTTTCCAAAACTGTCCTGTTCTTCTGTCCTAACATATCTGACATCACTTCTCCTTATATATCTTATAACAAAGTTCAGTGTCTTTTTAGAACATAGACCCATATTATACAACCAAATTATTTGTTTCTGAATTGTGTTTAATTCACTGTTATGAGACAGAAGAATGTTAGATGTAGTCATTTTCCTTTCCATAGCATGATTTATTTTATCCATTTTTGAATCTAATGTATCCCAAATGGAAACACTGTCAATGCAAACATTTTTCAAAATAGTCATGATGTCAAATCTGGTTATGTCTGGGAAAATAGCTTGTATCTTATCAGAAATGTACACAGCAGTGTCCAAAATTCTCTCCAAATTTAGATCTTGTTGTGCACTTATTATAGCTCTTATGGATTTGTCTATTTTAAAATGCACATTTGACATAAAATGAAATGATTCTTCTTTACTGTAAATGCTTGACATTAATGCCAATGTGTTTGATACAAATCCTCTGCCTAAATTGAATTTAGAATAGAAGGGGAAATTTTTTCTTGAAAAACACGTGTTAATAGCAAGCAACCTATTTTGTGCTGTTATCATGTAATTGCAAGCTTTCACTGCTCTCTGGCAGCTATTAGAATTTTGGAATTCTTCAGTCTCGAATACTTCAAGGCCTTTGACATAATATTTTACATCCTCCAACATCAAGCTGGATCCAAATGTGCTAGTTAAGACAACCATGCTATTATCTGTCAAGGGTATATTTTTCAGCCCTAATTTTTCTATATAGTCAGAACCATATATTGAATACATCACAACTAATCCTGGTGAACCTTCTACAACTGGTATCCATTTTTCTGTTTGAAACCAGCGGAAATTGTAGTTATCTCTTCTCCTGGCTTCACATGGATAAATGTTATCAATAATTGGTATAGCCATAGCAAAATTCACATCCTTCAGCACCAAATTTATGCATGTTTTGAATACACTCACAGAGTCCTCATTCAATGTTTTCATTGTACTAATTTTCTTTTCCAAGTTTTCATCATAAGTCATTTTTGTATCAGAATCTGGGTTTATGAAGGTTCTAGCTTTTGATCTTAAAATCCTGTCTAATGCCAATTTCTCAGTTGATTGACTTGACAATTGATTCCTCTTTGCAGGGCTTGTGTACAGAAATAATTGGCTCAACAAAAAATCTCTGTCATTTAATGGTGCTATTAAAATAGTTTCAGGGTTCTTTATCATTATTTCATGCACCTCCTCCATCTCATTTGCGGGAGCTATTTTCTCATAATCATCTAAATCGTCAATCAGCATGTCTTCGTCAGACTTGATTTCCTTAGTGCTATTATGAAGTTGTTGATTCTTTCTTAGATGAGGGTATAATTTGCAAAAATCATTATAGCTGGACATTTTTGACAAAGCATTTTCATTTATAAACTGAGGCAACCTAATTATTTGAGTCATCATTGTCTGAAATTTCATCCCTATATTTAAAACATCTGAATCTTCAGATACAGAAGACTGCTCAAATAGATTCATTAAAAAGATCATCTTTTTATCATTAAGTTCTAATTTATCTCTTTCTTTTTTCTGTTTAAGTTCTTCAAATCTTAAATCAAGGAACCTTTCAGAGGATGTGCTTTGTTTTACTTGCTCAAAATCATCTTTCTTTAAGAAATCTCTGATTATATTGTAATAGATGGTCTGATCATTAGATGATGGACCTAATAGTGACAATGATTCCACATTTGCAGTTAACCATCCACCTAGATTTGTGGGTATTTCATTATGTTCCAGATTCACACCTGCTTTCTTGCATATCCTCATGGTATCATTAATTTCACCTGGTAACATAGAATAAATGGATAATGCTTGTGTTTGAACAGCTCCATAAGAAAATGGAATGACTTCATTTGGGCATCCTTTCCTTAAAAGCATTGTTACGTTTATACTTAGTGACATTAAGTCATCAAAATAACTTATATGTGACGATTCAGTGCAGCAATTGGCTAAATGTCTACAATATAAAGGTATAATAGCTCCATTTACTATTCTTTCGGAGATAAATTCAACTTCTGAAGAGGAAGCATAGCTTTTTTTAGGATTCAGAGTTATACAAAAACTCTTAAAATGTGATTCAATGCTTCTAAAAACCATTTCAGAAAGACTTTTGCTGCTAAAATCTGTTAACATTTGGTCAATATCACCATCAGCAATTAAAGATGTCGCATTGTCATCGGAATGAACAATCCATCTTGTTTGGAACTCACATTTTTTGTAACTTTCAAGCATTCTATGATAAGCTTTCATAGCGCAAGAATGATAAACTGAAGATAAATAATTAAGATTCCCTTGTAACCAATTCATGCTTACTGGATAAGAATTAGTAGAAAGACCTTTGGTGAGCAACCCAATGGCTGTTTCATTAGTCCCAAATTTCTCTTGTGAATTCCTTAAACCTAAGAAAATGTCTGTTGGAATGCACACCTTTTTTAATTTCACATACATCATCAGACAATCAACCATTAATGTGCACTCACCTGATGTCAATATAGGATTCATTATAATGGCCAATATATACTTGTATGTTAAATCAGAAGCTGACCACTTAGATTGATCAGCTGATAAAAATGCTAACTTAGATTTGTTCTTGCTGTTTTTCAATATATCATTGTATGATGTTATTGTGTCCATCGACAACATGGATAATGCTCTTATTTTATTGTCACCACTAATGGATATGGCCTCTGAAGGGTCACTTTGGGCAACATGCTTGAAAGTATGTTCTATGAAATAAAGCATCATTTTTACTTTCATACTCATGAGGTAAATTTCTCTATCTGTTTTAGTTCTTTGCATCTTTTCAAATACAGAAACTAAAAAATCTATTGCATCAGAAGCATTTTTAGCTTTAGACATGACGAATTCTAACATTTGTAGGAAAGTGTGTTTTTTTCCTTCTAGACC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14,901
ON529552.1
Impatiens necrotic spot virus
Hu,J.Y., Dong,J.H.
Yunnan University of Chinese Medicine, College of Pharmaceutical Science
China
2023-02-18
null
Orthotospovirus impatiensnecromaculae
Orthotospovirus
Tospoviridae
ssRNA(+/-)
8,778
GenBank
null
China
China
Tulbaghia violacea
null
2021-06
null
null
Impatiens necrotic spot virus segment L, complete sequence
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18,227
GU112505.1
Impatiens necrotic spot virus
Liu,Y.T., Zheng,Y.X., Li,Y.Z., Li,Z.Y.
Yunnan Agricultural University, Biotechnology
China
2009-12-13
HDL
Orthotospovirus impatiensnecromaculae
Orthotospovirus
Tospoviridae
ssRNA(+/-)
8,776
GenBank
null
China
China
Hymenocallis littoralis
null
2009-07-24
null
null
Impatiens necrotic spot virus isolate HDL nonfunctional RNA-dependent RNA polymerase gene, complete sequence
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101,578
GQ336991.1
Impatiens necrotic spot virus
Cheng,X.F., Dong,J.H., Zhang,Z.K.
Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Biotechnology and Genetic Germplasm Institute
China
2009-08-17
Phalaenopsis
Orthotospovirus impatiensnecromaculae
Orthotospovirus
Tospoviridae
ssRNA(+/-)
8,778
GenBank
null
China
China
Phalaenopsis amabilis
null
2006-06-06
null
null
Impatiens necrotic spot virus segment L, complete sequence
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102,413
DQ425094.1
Impatiens necrotic spot virus
Finetti-Sialer,M.M., Pasciuto,M., Gallitelli,D.
Universita degli Studi di Bari, Protezione Piante e Microbiologia Applicata
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2006-03-28
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Orthotospovirus impatiensnecromaculae
Orthotospovirus
Tospoviridae
ssRNA(+/-)
8,780
GenBank
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Italy
Italy
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plant leaf
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null
null
Impatiens necrotic spot virus segment L, complete sequence
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108,322
NC_048213.1
Infectious bronchitis virus
Senthil Kumar,V., Raja,A., Vijayarani,K., Roy,P.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2020-05-15
Ind-TN92-03
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,464
RefSeq
null
India
India
Gallus gallus
kidney
2003
null
PRJNA485481
Infectious bronchitis virus isolate Ind-TN92-03, complete genome
ACTTAAGATAGATATTAATATATATCTATCACACTAGCCTTGCGCTAGATTTCCAACTTAACAAAACGGACTTAAATACCTACAGCTGGTCCTCATAGGTGTTCCATTGCAGTGCACTTTAGTGCCCTGGATGGCACCTGGCCACCTGTCAGGTTTTTGTTATTAAAATCTTATTGTTGCTGGTATCACTGCTTGTTTTGCCGTGTCTCACTTTATACATCCGTTGCTTGGGCTACCTAGTATCCAGCGTCCTACGGGCGCCGTGGCTGGTTCGAGTGCGAAGAACCTCTGGTTCATCTAGCGGTAGGCGGGTGTGTGGAAGTAGCACTTCAGACGTACCGGTTCTGTTGTGTGAAATACGGGGTCACCTCCCCCCACATACCTCTAAGGGCTTTTGAGCCTAGCGTAGGGCTACGTTCTCGCATAAGGTCGGCTATACGACGTTTGTAGGGGGTAGTGCCAAACAACCCCTGAGGTGACAGGTTCTGGTGGTGTTTAGTGAGCAGACATACAATAGACAGTGACAACATGGCTTCAAGCCTAAAACAGGGAGTATCTCCCAAACTAAGGGATGTCATTCTTGTATCCAAAGACATTCCTGAACAACTTTGTGACGCTTTGTTTTTCTATACGTCACACAACCCTAAGGATTACGCTGATGCTTTTGCAGTTAGGCACAAGTTTGACCGTAGTCTGCAGACTGGGAAACAGTTCAAATTTGAAACTGTGTGTGGTCTCTTCCTCTTGAAGGGAGTTGACAAAATAACACCTGGTGTCCCAGCAAAGGTTTTAAAATCCACTTCTAAGTTGGCAGATTTAGAAGACATCTTTGGTGTCTCTCCATTTGCACGGAAGTACCGTCATTTGTTGAAAACAGCATGCCAGTGGTCTCTTACTGTAGAGACACTGGATGCTCGTGCACAAACTCTTGATGAAATTTTTGACCCTACTGAAATACTTTGGCTTCAGGTGGCTGCAAAAATTCAAGTTTCAGCTATGGCAATGCGCAGGCTTGTTGGAGAAGTAACTGCAAAAGTCATGGAAGCTCTTGGCTCAAATCTGAGTGCTCTCTTTCAAATTGTTAAACAACAAATAGCCAGAATCTTTCAAAAGGCACTGGCTATTTTTGAAAATGTGAGTGAATTACCACAGCGTATTGCAGCACTTAAGATGGCCTTTGCCAAGTGTGCTAAGTCAATTACTGTTGTGGTTGTGGAAAGAACTCTAATTGTTAAAGAGTTCGCAGGAACTTGTCTTGCAAGCATTAATGGTGCTGTTGCAAAATTCTTTGAAGAACTTCCAAATGGTTTTATGGGTTCTAAAATCTTCACAACATTGGCCTTCTTTAAAGAAGCAGCTGTGAAAATTGTGGAAAATATACCAAATGCACCAAGAGGCACTAAGGGTTTTGAAGTTGTTGGCAATGCCAAAGGTACACAAGTTGTTGTGCGTGGCATGCGAAATGACCTAACATTGCTTGACCAAAAAGTTGAAATTCCTGTTGAGTCAGAAGGTTGGTCTGCAATTTTAGAAGGACATCTCTGTTATGTCTTTAAGAGTGGTGATCGTTTTTATGCGGCACCTCTTTCTGGAAATTTTGCGTTGCATGATGTGCATTGTTGTGAGCGTGTTGTTTGTCTATCTGATGGTGTAACACCGGAGATAAATGATGGACTCATTCTCGCTGCAATTTACTCATCTTTTAGTGTCTCAGAACTCATGGCAGCCCTTAAAAAGGGTGAACCATTTAAGTTTTTGGGCCATAAATTTGTGTATGCAAAGGATGCAGCAGTGTCTTTTACTTTAGCGAAGGCTGCCACTATTGCAGATGTTTTGAAGCTGTTTCAATCAGCGCGTGCGAAAGTCGAAGATGTTTGGTCTTCATTTACTGAAAAGTCTTTTGAATTCTGGAAGCTTGCATATGGAAAAGTGCGCATCCTTGAAGACTTTGTGAGACCTCAGCTTGTAAGGCTCAAATGGTCAATGGGGATTCTGGCGACAGTGCTTGGAGAGGGCATTTGGCATCTTGTTTCACAAGTCATCTATAAAGTAGGTGGTCTTTTTACTAAAGTTGTTGACTTCTGTGAGAAATATTGGAAAGGTTTTTGTGCACAGTTGAAAAGGCCTAAGCTCATTGTCACTGAAACCCTCTGTGTTTTAAAAGGAGTTGCACAGCATTGTTTTCAACTGTTGCTGGATGCAATACATTCTATGTATAAGAGTTTTAAGAAGTGTGCACTTGGTAGAATTCATGGAGATTTGCTCTTCTGGAAAGGAGGTGTGCACAAAATTATTCAAGAGGGCGATGAAATTTGGTTTGACGCCATTGATAGCATTGATGTTGAAGATCTGGGTGTTGTTCAAGAAAAATCGATTGATTTTGAGGTTTGCGATAATGTGACACTTCCAGAAAACCAACCTGGTCATATGGTTCAAATCCAGAATGAGGATAAGAACTATATGTTCTTCCGTTTTAAAAAGGATGAGAACATTTATTATACACCAATGTCTCAACTTGGTGTAATTAATGTAGTTTGCAAAGCCGGCGGTAAAACCGTCACCTTTGGAGAAACTACTGTGCAAGAAATACCACCACCTGATGTTGTGCCTATTAAGGTTAGCATCGAGTGTTGTGGTGAACATGGAACACAATTTTCAAGAAAGCCTATTAAAGAGCCCATTGAAGTTGAGACGGACTTCACAGTTGAACAATTGCTCTCTGTGATCTATGAGAAAATGTGTGACGACCTCAAGTTGTTTCCAGAGGCACCCGAGCCTCCACCATTTGAGAAAGTTTCACTTGTTGAAAAGCAGGGTAAAGATTTGGATTGTATAAAATCTTGCCATTGGATCTATCGTGACTATGAGAGCGATGATGACATCGAGGAAGAAGATGCAGAAGAATGTGACACGGATTCAGGTGATGCTGAGGAGTGTGACACTAATTCAGAATGTGAAGAAGAAGATGAGGATACTAAAGGGTTGGCCCTTATACAAGACCAGCCAAGTTATAAATACCCTCTTCCACTGGAAGAAGATTATAGCGTCTACAATGGATGTATTGTTCATAAAGACGCTCTTGATGTTGTGAATCTACCATCTGGTGAAGAAACTTTTGTTGTTAATGACTGTTTTGAGGGAGCTGTAAAACCGCTTCCGCAGAAAGTTATTGATGTTCTTGGTGACTGGGGTGAGGCTGTTGATGCGCAAGAACAATTGTGTCAACAAGAATCTACTCAAGCCGCATTTGAGAGATCAGTTGAGGATTCTATTGGTGGTTGTGAGGCAATGGCTGAACAATCTGTCGTTGACGAGCATGAATTATTACTTGTAGTTGAAGAAAATCAGCATGGGGTTGTTTATACACCTGCCGATCTAGAAGGTGTAAAAGAAACAGCAGAAGAGGTTGATGAATTTATTCTCATTGCTGATGTTTCCAAAGAAGAAGTTGTGCCTCAAGGGAAAGGGGAGTCACAAGTTGAGCAAGAGCCTATTCAAGTTGTTAAATCACAACGTGAGAAGAAGGCTAAAAAATTCAGAGTTAAACCAGCCACATGCGAAAAACCCAAATTTTTGGAGTATAAAACCTGTGTGGGTGATTTAACTGTTGTAATTGCCAAGGCATTGGACGAGTTTAAAGAGTTCTGTATTGTAAACGCCGCGAATGAGCATATGTCTCATGGTGGTGGCGTTGCAAAGGCAATTGCAGACTTTTTTGGACCTGATTTTGTGGAATATTGTGAGGACTATGTTAAAAAACATGGGCCGCAACAGAGACTTGTCACACCTTCGTTTGTTAAAGGCATTCAATGTGAGAATAATGTTGTGGGACTACGCCATGGAGACATTAATTCGCGTCAGAAGCTTGTTGCTGCATACAAGAATGTGCTTGTAGATGGCGTAGTCAATTATGCTGTGCCAGTTCTTTCATTAGGAATTTTTGGTGTGGATTTTAAAATGTCAATAGACGCAATGCGTGAAGCCTTTGAAGGTTGCACCATACGCGTTCTTTTGTTCTCTCTGAGTCAAGAACACATCGATTATTTCGATGTAACTTGCAAGCAGAAGACACTCTATCTTACGGAGGATGGTGTTAAATACCGCTCCGTTGTTGTAAAACCTGGTGACTCATTGAGTCAATTTGGACAGGTTTTTGCTAAAAATAAGGCAGTCTTTACAGCTGATGATGTTGAGGATAAAGAAATCCTCTTCGTACCCACTACTGACAAGACTGTTCTTGAATATTATCCTTTAGATGCGCAAAAGTATGTAATATATTTGCAAACGCTTGCGCAGAAATGGAATGTCCAATATAGGGACAATTTTCTTATACTAGAGTGGCGTGATGGAAACTGCTGGATTAGTTCAGCAATTGTTCTCCTTCAAGCTGCTAAAATTAGGTTTAAAGGTTTTCTATCAGAAGCATGGGCTAAACTGTTGGGTGGAGATCCTACAGACTTTGTTGCCTGGTGTTATGCAAGTTGCAATGCTAAAGTTGGTGATTTTTCAGATGCTAATTGGCTTTTGGCCAATTTTGCAGAACATTTTGACGCAGATTACAAAAATGCCTTTCTTAAGAAGCGCGTTTCGTGCAACTGTGGTGTTAAAAGTTATGAGCTTAGGGGCCTTGAAGCTTGTATTCAGCCAGTTCGGGCAACTAATCTGCTACATTTTAAAACGCAATATTCAAATTGCCCAACCAGTGGGGCAAGTAATACGGATGAAGTATTTGAAGCTTCGTTACCGTACTTATTGCTTTTTGCTACTGATGGTCCTGCTACAGTTGATTGTGATGAAGATGCAGTGGGGACTGTCGTGTTTGTTGGTTCTACTAATAGTGTCCATTGTGATACACAAGCTGCACGGCAAGCTTTTGATAATCTTGCTAAAGATAGAAAATTTGGAAAGAAGTCGCCTTACAAGACTGCAATGTATACGCGATTCGCTTTTAAGAATGAAAATCCTTTGCCTGTTGCTAAACATAGTAAGGGTAAGTCTAA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3,263
NC_001451.1
Infectious bronchitis virus
Ziebuhr,J., Snijder,E.J., Gorbalenya,A.E., Brierley,I., Boursnell,M.E., Binns,M.M., Bilimoria,B., Blok,V.C., Brown,T.D., Inglis,S.C., Foulds,I.J., Green,P.F., Tomley,F.M., Cavanagh,D., Pappin,D.J.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
1993-06-12
null
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,608
RefSeq
8
null
null
null
null
null
null
PRJNA485481
Avian infectious bronchitis virus, complete genome
ACTTAAGATAGATATTAATATATATCTATTACACTAGCCTTGCGCTAGATTTTTAACTTAACAAAACGGACTTAAATACCTACAGCTGGTCCTCATAGGTGTTCCATTGCAGTGCACTTTAGTGCCCTGGATGGCACCTGGCCACCTGTCAGGTTTTTGTTATTAAAATCTTATTGTTGCTGGTATCACTGCTTGTTTTGCCGTGTCTCACTTTATACATCTGTTGCTTGGGCTACCTAGTGTCCAGCGTCCTACGGGCGTCGTGGCTGGTTCGAGTGCGAGGAACCTCTGGTTCATCTAGCGGTAGGCGGGTGTGTGGAAGTAGCACTTCAGACGTACCGGTTCTGTTGTGTGAAATACGGGGTCACCTCCCCCCACATACCTCTAAGGGCTTTTGAGCCTAGCGTTGGGCTACGTTCTCGCATAAGGTCGGCTATACGACGTTTGTAGGGGGTAGTGCCAAACAACCCCTGAGGTGACAGGTTCTGGTGGTGTTTAGTGAGCAGACATACAATAGACAGTGACAACATGGCTTCAAGCCTAAAACAGGGAGTATCTCCCAAACCACGGGATGTCATTCTTGTGTCCAAAGACATCCCTGAACAACTTTGTGACGCTTTGTTTTTCTATACGTCACATAACCCTAAGGATTACGCTGATGCTTTTGCAGTTAGGCAGAAGTTTGACCGTAGTCTCCAGACTGGGAAACAGTTCAAATTTGAAACTGTGTGTGGTCTCTTCCTCTTGAAGGGAGTTGACAAAATAACACCTGGCGTCCCAGCAAAAGTTTTAAAAGCCACTTCTAAGTTGGCAGATTTAGAAGACATCTTTGGTGTCTCTCCTTTAGCGCGGAAGTACCGTGAATTGTTGAAAACAGCGTGTCAGTGGTCTCTTACTGTAGAAGCACTGGATGTTCGTGCACAAACTCTCGATGAAATTTTTGACCCCACTGAAATACTTTGGCTTCAGGTGGCTGCAAAAATTCATGTTTCATCTATGGCAATGCGCAGGCTTGTTGGAGAAGTAACTGCAAAAGTCATGGATGCTCTGGGCTCAAACTTGAGTGCTCTTTTTCAAATTGTTAAACAACAAATAGCCAGAATCTTTCAAAAGGCACTGGCTATTTTTGAGAATGTGAATGAATTACCACAGCGTATTGCAGCACTTAAGATGGCTTTTGCCAAGTGTGCTAGGTCAATTACTGTTGTGGTTGTTGAAAGAACTCTAGTTGTTAAAGAGTTCGCAGGAACTTGTCTTGCAAGCATTAATGGTGCTGTCGCAAAATTCTTTGAAGAGTTGCCAAACGGCTTCATGGGTTCTAAGATTTTCACAACACTTGCCTTCTTTAAAGAGGCAGCTGTGAGAGTTGTGGAGAACATACCAAATGCACCGAGAGGTACTAAGGGATTTGAAGTTGTTGGCAATGCCAAAGGCACACAGGTAGTTGTGCGCGGCATGCGAAATGACTTAACATTGCTTGACCAAAAAGCTGATATTCCTGTTGAACCAGAAGGTTGGTCTGCAATTTTGGATGGACATCTTTGCTATGTCTTTAGGAGTGGTGATCGCTTTTATGCTGCACCTCTTTCAGGAAATTTTGCTTTGAGTGATGTTCATTGCTGTGAGCGTGTAGTCTGTCTATCTGATGGTGTAACACCGGAGATAAATGATGGACTCATTCTAGCTGCAATCTACTCTTCTTTTAGTGTCTCTGAGCTTGTAACAGCTCTTAAAAAGGGTGAACCATTCAAGTTCTTGGGCCATAAATTCGTGTATGCGAAGGATGCAGCAGTGTCTTTTACTTTAGCGAAGGCTGCCACTATTGCAGATGTCTTGAGGCTGTTTCAATCAGCTCGTGTGATAGCAGAAGATGTTTGGTCTTCATTTACTGAAAAGTCTTTTGAATTCTGGAAGCTTGCATATGGAAAAGTGCGCAACCTTGAAGAATTTGTGAAGACCTATGTTTGTAAGGCTCAAATGTCGATTGTGATTCTAGCAGCAGTGCTTGGAGAGGACATTTGGCATCTTGTCTCACAAGTCATCTATAAATTAGGTGTTCTTTTTACTAAAGTCGTTGACTTTTGTGACAAACACTGGAAAGGTTTTTGTGTACAGTTGAAAAGAGCTAAGCTCATTGTCACCGAAACCTTCTGTGTTTTAAAAGGAGTTGCACAGCATTGTTTTCAACTGCTGCTAGATGCAATACACTCTTTGTACAAGAGTTTTAAGAAGTGTGCACTTGGTAGAATCCATGGAGATTTGCTCTTCTGGAAAGGAGGTGTGCATAAAATTGTTCAAGATGGCGATGAAATATGGTTTGACGCCATTGATAGTGTTGATGTTGAAGATCTGGGTGTTGTTCAGGAAAAATCGATTGATTTTGAGGTTTGCGATGACGTGACACTTCCAGAAAACCAACCTGGTCATATGGTTCAAATAGAGGATGATGGTAAGAACTACATGTTCTTCCGTTTTAAAAAGGATGAGAACATTTATTATACACCAATGTCTCAACTTGGTGCTATTAATGTGGTTTGCAAAGCAGGCGGTAAGACTGTCACCTTTGGAGAAACTACAGTACAAGAGATACCACCACCTGATGTCGTGCCTATTAAGGTTAGCATAGAATGTTGTGGTGAACCATGGAATACGATCTTCAAGAAGGCTTATAAAGAGCCTATAGAAGTAGATACAGACCTCACAGTAGAACAATTGCTCTCTGTGATCTATGAGAAAATGTGTGACGACCTTAAATTGTTTCCAGAGGCACCAGAGCCTCCACCATTTGAGAATGTCGCACTTGTTGATAAGAACGGTAAAGATTTGGATTGTATAAAATCTTGCCATTTGATCTATCGTGACTATGAGAGCGATGATGACATCGAGGAGGAAGATGCTGAGGAGTGTGACACAGACTCAGGTGAAGCTGAGGAGTGTGACACTAATTCAGAATGTGAAGAAGAGGATGAGGATACTAAAGTGTTGGCTCTTATACAAGACCCGGCAAGTATTAAATACCCTCTGCCTCTTGATGAAGATTATAGCGTCTATAATGGATGTATTGTACACAAGGACGCTCTTGATGTTGTGAATTTACCATCTGGTGAAGAAACTTTTGTTGTCAATAACTGTTTTGAGGGAGCTGTTAAACCACTTCCACAGAAGGTAGTTGATGTTCTTGGTGACTGGGGAGAGGCTGTTGATGCGCAAGAACAACTGTGTCAACAAGAGCCTCTGCAACATACCTTTGAAGAACCAGTCGAAAATTCTACTGGTAGTTCTAAGACAATGACTGAACAAGTCGTTGTAGAAGATCAAGAACTACCTGTTGTTGAACAAGATCAGGATGTAGTTGTTTATACACCTACAGATCTTGAAGTTGCAAAAGAAACAGCAGAAGAGGTTGATGAGTTTATTCTCATTTTTGCTGTTCCTAAAGAAGAAGTTGTGTCCCAGAAAGATGGGGCACAGATTAAACAAGAGCCTATTCAAGTTGTTAAACCACAACGTGAGAAGAAGGCTAAAAAGTTCAAAGTTAAACCAGCCACATGTGAGAAACCTAAATTTTTGGAGTATAAAACATGTGTGGGTGATTTGACTGTTGTAATTGCCAAAGCATTGGATGAGTTTAAAGAGTTCTGCATTGTAAATGCTGCAAATGAGCATATGACTCATGGTAGTGGCGTTGCAAAGGCAATTGCAGACTTTTGTGGACTGGATTTTGTTGAATATTGTGAGGACTATGTTAAGAAACATGGGCCACAACAGAGACTTGTTACACCTTCGTTTGTCAAAGGCATTCAATGTGTGAATAATGTTGTAGGACCCCGCCATGGAGACAACAACTTGCATGAGAAGCTTGTTGCTGCCTACAAGAATGTGCTTGTAGATGGCGTAGTCAATTATGTTGTGCCAGTTCTTTCATTAGGAATTTTTGGTGTAGATTTTAAAATGTCAATAGACGCAATGCGTGAAGCTTTTGAAGGTTGCACCATACGCGTTCTTTTGTTTTCTCTGAGCCAAGAACACATCGATTATTTCGATGTAACTTGCAAACAGAAGACAATTTATCTTACGGAGGATGGTGTTAAATACCGCTCCATTGTTCTAAAACCTGGTGACTCATTGGGTCAATTTGGACAGGTTTATGCTAAAAACAAGATAGTTTTTACAGCCGATGATGTTGAGGACAAAGAAATTCTCTACGTCCCCACGACTGATAAAAGCATTCTTGAATACTATGGTTTAGATGCGCAAAAGTATGTAATATATTTGCAAACGCTTGCGCAGAAATGGAATGTCCAATATAGGGACAATTTTCTTATACTAGAGTGGCGCGATGGAAATTGTTGGATTAGTTCAGCAATAGTTCTCCTTCAAGCTGCTAAAATTAGGTTTAAAGGTTTTCTAACAGAAGCGTGGGCTAAACTGTTAGGTGGAGATCCTACAGACTTTGTTGCCTGGTGTTATGCAAGTTGTACTGCTAAAGTAGGTGATTTCTCAGATGCTAATTGGCTTTTAGCGAATTTAGCAGAACATTTTGACGCAGATTACACAAATGCGTTTCTTAAGAAGCGCGTTTCGTGTAACTGTGGTATTAAGAGCTATGAGCTTAGAGGCCTTGAAGCTTGTATTCAGCCAGTTCGGGCAACTAATCTGCTACATTTTAAGACGCAATATTCAAATTGCCCAACCTGTGGCGCAAATAATACGGATGAAGTAATAGAAGCTTCGTTACCGTACTTATTGCTTTTTGCTACTGATGGTCCTGCTACAGTTGATTGTGATGAAGATGCTGTGGGGACTGTCGTGTTTGTTGGTTCTACTAATAGTGGCCATTGTTATACACAAGCTGCAGGGCAAGCTTTTGATAATCTTGCTAAAGATAGAAAATTTGGAAAGAAGTCGCCTTACATTACTGCAATGTATACGCGATTCGCTTTTAAGAATGAAACCTCTTTGCCTGTTGCTAAACAGAGCAAGGGTAAGTCTAAGTCGGT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9,016
OR268739.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-56-10
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,627
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2007
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-56-10, complete genome
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9,474
OR268740.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-56-6
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,598
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2007
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-56-6, complete genome
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9,475
OR268741.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-56-8
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,627
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2007
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-56-8, complete genome
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9,476
OR268742.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-20
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,671
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2019
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-20, complete genome
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9,477
OR268743.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-Ark1
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,584
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2018
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-Ark1, complete genome
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9,478
OR268744.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-15
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,618
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2020
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-15, complete genome
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9,479
OR268745.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-1
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,551
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2019
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-1, complete genome
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9,480
OR268746.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-07-1
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,624
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2007
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-07-1, complete genome
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9,481
OR268747.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-07-2
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,606
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2007
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-07-2, complete genome
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9,482
OR268748.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-07-3
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,600
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2007
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-07-3, complete genome
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9,483
OR268749.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-14P
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,680
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2020
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-14P, complete genome
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9,484
OR268750.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-56-7
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,630
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2007
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-56-7, complete genome
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9,485
OR268751.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-12
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,665
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2020
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-12, complete genome
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9,486
OR268752.1
Infectious bronchitis virus
Marandino,A., Mendoza-Gonzalez,L., Panzera,Y., Tomas,G., Williman,J., Techera,C., Gayosso-Vazquez,A., Ramirez-Andoney,V., Alonso-Morales,R., Realpe-Quintero,M., Perez,R.
Facultad de Ciencias, UdelaR, Seccion Genetica Evolutiva
Uruguay
2024-01-24
Mex-3009
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,625
GenBank
1
Mexico
Mexico
Gallus gallus
null
2019
null
null
Infectious bronchitis virus isolate Mex-3009, complete genome
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9,487
OP868815.1
Infectious bronchitis virus
Li,S.
Sichuan Agricultural University, College of Veterinary Medicine
China
2024-01-18
China/Sichuan/QX-like/SczyC30/2020
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,697
GenBank
null
China
China
Gallus gallus
null
2018
null
null
Infectious bronchitis virus isolate China/Sichuan/QX-like/SczyC30/2020, complete genome
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9,604
OM970248.1
Infectious bronchitis virus
Wang,C.-Y., Hou,B.
Fujian Academy of Agricultural Sciences, Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine
China
2024-01-17
CK/CH/GX/202109
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,647
GenBank
null
China
China
Gallus gallus
null
2021
null
null
Infectious bronchitis virus isolate CK/CH/GX/202109, complete genome
GATATTAATATATATCTATTGCACTAGCCTTGCGCTAGATTTTCAACTTAACAAAACGGACTTAAATACCTACAGCTGGTCCCCATAGGTGTTCCATTGCAGTGCACTTTAGTGCCCTGGATGGCACCTGGCCACCTGTCAGGTTTTTGTTGTTAAAATATCATTGTTGCTGGTATCACTGCTTGTTTTGCCGTGTCTCACTTTATACATCCGTTGCTTGGGCTACCTAGTATCCAGCGTCCTACGGGCGCCGTGGTCGGTTCGAGTGCGAAGGACCTCTGGTTCATCTAGCGGTAGGCGGGTGTGTGGAAGTAGCGCTTCAGACGTACTGGTTCTGTTGCGTGAAACGCGGGGTCACCTCCCCCCACATACCTCTAAGGGCTTTTGAGCCTAGCGTTGGGCTACGTTCTCGCACAAGGTCGGCTATACGACGTTTGTAGGGGGTAGTGCCAAACAACCCCTGAGGTGACAGGTTCTGGTGGTGTTTAGTGAGCAGACATACAATAGACAGTGACAACATGGCTTCAAGCCTAAAACAGGGAGTATCTCCCAAACCAAGGGATGTCATTCTTGTTTCCAAAGACATTCCCGAACAACTCTGTGACGCTTTATTTTTCTACACGTCACACAACCCTAAGGATTACGCTGATGCTTTTGCATTTAGGCAAAAGTTTGACCGTAATCTGCAGACTGGGAAGCAGTTCAAATTTGAAACTGTTTGTGGTCTCTTCCTATTGAAGGGAGTTGACAAAATAACACCTGGCGTCCCAGCAAAAGTTTTAAAAGCCACTTCTAAGTTGGCAGATTTAGAAGACATCTTTGGTGTCTCTCCTTTTGCACGGAAGTACCGTGAATTGTTGAAAACAGCATGCCAGTGGTCTCTTACTGTAGAAACACTGGATGCTCGTGCACAAACGCTTGACGAAATTTTTGACTCTACTGAAATACTTTGGCTTCAGGTGGCTGCAAAAATTCAAGTTTCAGCTATGGCAATGCGCAGGCTTGTTGGAGAAGTAACTGCAAAAGTCATGGAAGCTCTTGGCTCAAATTTGAGTGTTCTCTTTCAAATTGTTAAACAACAAATAGCCAGAATCTTTCAAAAGGCACTGGCTATTTTTGAAAATGTGAGTGAATTACCACAGCGTATTGCAGCACTTAAGATGGCCTTTGCCAAGTGTGCCAAGTCAATTACTGTTGTGGTTGTGGAAAGAACTCTAGTTGTTAGAGAGTTCGCAGGAACTTGTCTTGCAAGCATCAATGGTGCTGTTGCAAAATTCTTTGAAGAACTTCCAAATGGCTTTATGGGTTCTAAAATCTTCACAACATTGGCCTTCTTTAAAGAAGCAGCTGTGAAAATTGTGGAAAATATACCAAATGCACCAAGAGGTACTAGAGGTTTTGAAGTCGTTGGTAACGCCAAGGGAACGCAAGTTGTTGTGCGTGGCATGCGAAATGATTTAACTCTGCTCGACCAAAAAGCTGACATTCCTGTTGAGAAAGAAGGTTGGTCTGCAATTCTTGAAGGACATCTGTGTTATGTCTTTAAGAGTGGTGATCGTTTTTATGCGGCACCTCTTTCTGGGAATTTTGCATTGCATGATGTGCATTGTTGTGAGCGTGTTGTCTGTCTGTCTGATGGTGTAACACCAGAGATAAATGATGGACTCATTCTAGCAGCAATCTATTCATCTTTTAGTGTCTCAGAACTCGTGGCAGCACTTAAAAAGGGTGAACCATTCAAGTTCTTGGGTCATAAATTTGTGTATGCGAAGGATGCAGCAGTCTCTTTCACTCTTGCAAAAGCAGCCACTATTGCAGATGTACTGAAGCTGTTTCAATCAGCTCGTGTGCAAACAGAAGATGTGTGGTCTGCATTTACTGAAAAGTCTTTTAATTTCTGGAAACTCGCATATGGAAAAGTGCGTAATCTTGAAGAAGTTGTGAAGACTCATTTTTGTAAAGCTCAAATGTCAATTATCATTCTAGCAGCAGTGCTTGGCGAAGGCATTTGGCATCTTGTTTCACAGGTCATCTATAAAGTAGGTGGTCTTTTTACTAGAGTCGTTGACTTTTGTGAAAAACACTGGAAGGGTTTCTGTGCACAACTTAAAAAGGCTAAGCTCGTTGTCACAGAAACTCTTTGTGTTCTTAAGGGAGTGGCACAGCATTGTTTTCAACTATTGCTGGATGCAATACATTCTTTGTATATGAGTTTTAAGAAGTGTGCACTTGGTAGAATTTATGGAGACTTACTCTTCTGGAAAGGGGGTGTACACAGAATTGTTCAAGATGGCGATGAAGTTTGGTTTGACGCCATTGATAGTATTGATGTTGAAGATCTGGGTGTTGTCCAAGAAAAACCCATAGATTTTGAGGTTTGTGAAGACGTAACACTTCCAGAAAATCAACCTGGTCATATGGTTCAAATCGAGGATGACGGAAAGAACTATATGTTCTTCCGCTTCAAAAGGGATGAGAACATCTACTATACACCAATGTCTCAACTTGGTGCAATTAATGTAGTTTGCAAAGCAGGCGGTAAAACCGTTACCTTTGGAGACACCATTGTGAAAGAAATACCGCCACCTGATGTTGTGCCTATTAAGGTTAGCATAGAGTGTTGTGGTGAACCATGGAATACAATCTTCAAGAAAGCTTATAAAGAGCCCATTGAAGTTGAAACTGACCTCACAGTAGAACAATTGCTCTCTGTGATCTATGAGAAAATGTGCGACGACCTCAAATTGTTTCCAGAGGCACCAGAGCCACCGCCATTTGAGAATGTCGCACTTGTTGATAAAAACGGTAAAGACTTGGATTGCATAAAATCATGCCATCTTATCTACTGTGATTATGAGAGTGATGATGACATCGAGGAAGAAGATGCTGAGGAGTGTGATACTGATTTAGAATGTGAAGAAGAGGATGAGGATACTAAAGTGTTGGCTCTTATACAAGACCCTGCAAGTAATAAATACCCTCTTCCTCTTGATGATGATTATAGCGTCTTTAATGGATGTATTGTACATAAGGACGCTCTTGACGTCGTAAATCTACCATCTGGTGAAGAAACCTTTGTTGTCAACAACTGCTTTGAGGGAGCTGTAAAACCACTGCCTCAGAAAGTTGTTGATGTTCTAGGTGACTGGGGTGAGGCTGTTGATGCGCAAGAGCAAATTGCACAAACTACTTCAGAGGAAACCCCTATCAGTAGTTTGGAGGCAACTATTGAGCAAGTTGTTGTTGAGGAACAGAAAATAATTTCTGTTGTTGAAGAAGAACAGCAGGTGGCGGTCTACACACCTGCAGACCTACAAGTTGTTGAAGAAACACCAGATGAGTTTATTCTTATTGCTGATGTTTCCACAGAAGAAATTGTGCCTCATGAAGAAAAGGAGTCACAGATTGAACAGGAGCCTATTCAAGTTGTTAAATCACAACGTGAAAAGAAGGCTAAAAAGTTCAAGGTTAAATCTACTACATGTGAGAAACCCAAATTTTTGGAGTACACAACATGTGTGGGTGACCTAACGGTAGTGATTGCCAAAGCATTGGATGAGTTTAAAGAGTTCTGCATTGTAAATGCTGCTAATGAGCATATGTCTCACGGTGGCGGCGTTGCTAAGGCAATTGCGGACTTTTGTGGACCTGATTTTGTGGAGTATTGTGAGGACTATGTTAAGAAACATGGGCCTCAACAAAGACTTGTCACACCTTCATTTGTCAAAGGCATTCAATGTGTGAACAATGTTGTAGGACCTCGCCATGGAGACAGTAACTTGCATGATAAGCTTGTTGCTGCTTACAAGAATGTTCTTGTAGATGGTGTTGTCAATTATGTTGTGCCAGTCCTCTCATCAGGAATTTTTGGTGTTGATTTTAAGATGTCTATAGACGCTATGCGCAAGGCTTTTGAAGGTTGCGACATACGCGTTCTTCTTTTCTCCTTGTCTCAAGAACACATCGATTATTTCGATGTTACTTGTAAACAGAAGACAATTTATCTTACAGAGGACGGTGTTAAATACCGCTCTGCTACTGTGAAACCAGGTGACTCTTTGAGTCAATTTGGACCGGTTTTTGCTAGAAACAAGACAGTCTTTACAGCAGACGATGTTGAGGATAAAGAAATTCTCTTCATTCCTACTACTGACAAGACTGTCCTTGAATATTATGGTTTGGATGCGCAAAAGTATGTAATATACTTGCAAACTCTTGCACAGAAGTGGAATGTCCAATATAGGGACAATTTTGTTATACTTGAGTGGCGTGATGGAAATTGCTGGATTAATGCAGCAGTAGTGCTCCTTCAAGCTGCTAAGATTAGGTTTAAAGGTTTTCTTGCAGAAGCATGGGCACAACTTTTGGGTGGAGACCCAACTGATTTTGTAGCCTGGTGCTATGCAAGTTGCAATGCTAATGTTGGTGAGTTTTCAGATGCTAATTGGCTTCTTGCTAATTTGGCAGAATACTTTGATGCTGATTACACGAATGCATTCCTTAAGAGGCGTGTGTCATGTAACTGTGGGGTTAAGAATTGTGAAGTTAGAGGCCTTGAAGCTTGTATTCAACCAGTAAAGGCACCCAATCTTCTTCATTTTAAGACTCAGTACACAAATTGTACAGTGTGTGATGCAAATAGTGTGGATGAGGTGGTAGAAGCCTCACTACCATATCTGTTGCTCCTTGCTACTGATGGTCCTACTACAGTGGATTGTGATGAAAATGCTGTAGGGAATGTTGTTTTCATTGGCTCTACTAATAGTGGCCATTGTTACACGCAAGCCATTGGTAAGGCTTTTGATAATCTTGCTAAGGATAGAAAATTTTCAAAGAATTCGCCATACATTACAGCAATGTATACGCGCTTCTCTCTTAAGAGTGAAAGCTCTCTGTCTGTTGTTAAACAGAGTAAGAGTAAAACTAAAGTAGTAAAAGAAGATGTTGCCAACCTTGTTACTAGTTCTAAAGCCAGTTTTGATGATCTTACTGACTTTGAA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9,605
OP881969.1
Infectious bronchitis virus
Wang,K., Wang,S., Zhou,K.
China Animal Health and Epidenmiology Center, Avian Disease
China
2023-12-31
IBV/chicken/Anhui/A1214/2021
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,788
GenBank
null
China
China
Gallus gallus
null
2021-04-12
null
null
UNVERIFIED: Infectious bronchitis virus isolate IBV/chicken/Anhui/A1214/2021, complete genome
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9,876
OP881970.1
Infectious bronchitis virus
Wang,K., Wang,S., Zhou,K.
China Animal Health and Epidenmiology Center, Avian Disease
China
2023-12-31
IBV/chicken/Sichuan/C1131/2021
Avian coronavirus
Gammacoronavirus
Coronaviridae
ssRNA(+)
27,732
GenBank
null
China
China
Gallus gallus
null
2021-03-16
null
null
UNVERIFIED: Infectious bronchitis virus isolate IBV/chicken/Sichuan/C1131/2021, complete genome
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9,877
NC_001652.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Morzunov,S.P., Winton,J.R., Nichol,S.T.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
1995-03-22
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,131
RefSeq
1
null
null
Oncorhynchus tshawytscha
null
null
null
PRJNA485481
Infectious hematopoietic necrosis virus, complete genome
GTATAAGAAAAGTAACTTGACTAAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTTAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACCACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAGGATCCAGAGACGGAGTATCGTCCCAGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGACTTAGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAAGGCATTGAGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGGCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGTTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCTACCTTCGCAGATCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACTAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGCGAGTTGGTTAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAAGATCGGGGCGGTGCTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGGCTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTTTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAGACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTGTCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGATGGGACCTCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTCTCCGACCCTTTCAGGAAGCTGGCGAGGGAGATCGCTCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCAGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGGTGAGGAGGAGGAGGAGGACGAGGAGGACGACGACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGACTCATTCCACTGAACACAAACAGCCCCCCCTCTCATCCCGCCCCTCGACCCATCCAGATGTTCACTCCACTCTGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGTCTGAAAACCCCACGAAATGACGGGCAAATCGGCAAGAACCCCAGGCGACGGAAGGAGGACCAGGCGCCTCAAGAGGAACCAAAGAAAACCACCAGGAGGCCCGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAAATGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCACAGTCCCCTACCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATCAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACTTGGCCATTCGGGCGGCGGAAGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGGCATCCTCCTCCAGGATCCCGGCTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTCCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAAAACAGTTCTGATCCCTCCTCCTCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTGACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCTTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGCTCTCGGAAACCAGCACCTCAGACCACCTACCAGGTAACGAAGGCGAGGGAAGTCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGAGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGATGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCGACCAGGCCGTCTCTCACTCACCCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCTCCATCCCCAGAGTCCATCCACTCCTCATTCCGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACTAAAACAATGGACACCATGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACAGCCAAACCGTCAAACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCTAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTATCCCACATCCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGACATTCACACCCAAGGGAACCACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACAATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAAAAATGAAACTCTCTACGAAAGAAGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACACAAAAGAGTGTTCTTAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGTACCAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGCTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCAGGCCTGTATGATTGAATTCTGTGGGCAACAGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGTATACAATTCTGGATCAGAAATCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAAGACAAGACCGTGGGAATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTGGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAATTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACGTACAGGGCCCATCGCGCTACCAGCTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGATGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCCGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCCTCTACAATGAGACAGACGTGTCAGGGATCTCCATCAGGAAACTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGAATTCCCTTTGTTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACCTCCCACTCCCTCCGTGCCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAGGACTCAATCTTCACTTCCTCCCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATTTGTGCTGCAAAAAGAGACAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGCTCTGCGATACAAGAACGAGGTGGCCGGACACGGCTTCTCTTTTGATGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGAGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATTTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTCTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGTACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAATACAACCAGCAACGACAGCA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8,909
OQ801357.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Li,Y., Ouyang,P., Yang,Q.
Sichuan Agricultural University, College of Veterinary Medicine
China
2023-05-20
SCCD
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,161
GenBank
null
China
China
Oncorhynchus mykiss
null
2017
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus isolate SCCD, complete genome
GCTCAAAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAGACAGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAAACGTTCACTGGGCTCAGGGACATCAAGGGGGGGGTCCTCGAGGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGCACGATAACCCTCCCTCTCTTCTTCTCCAAGGCAGACTTTGAACTAGAGATGATTAAGCGGGCGGTGAGTCACGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCGTTGGGCCTTTTGTGCGCGTTCGTCATTGCGGAGACGGTCCCATCGGGGACAGGCACGGTCGCCGAAACTCTGGAAGCCCTGGGCTTCTTGCTGGAGTCCTTGGACACTGGGGCACCACTGGACGCCACTTTCGCAGATCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGGAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACTGGCCTCCTCTTCACCTGCGCTCTACTGACGAAGTATGACGTGGACAAGATGGCCATATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGACGAGTTGGTCAACTTCAACTCCAACAGGGGAGTGCTGGCCAAGATCGGGGCGGTACTTAGACCTGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATTTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCTGACCCAGCAACCGCCGCTAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGGATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCAGACCTTCTAGAAGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCTAGACGCATTGTAAGACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTGTCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGTCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGAATCACCTGCATCCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGAACCTCAGGAGGACTGGCAGGGATGAAGGTATCCGAACCCTTCAGGAAGCTGGCAAGAGAGATCGCCCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGACGGCGATGGCTCAACTGGAGAGGGGGCCTCTGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGACGGCATCCAGGAGACCAGACCCGGATGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGGCGATGACACCAGCGAGCCAGAAGACTCCGACTCATTCCACTGAACACCAACAGTCCCCTCTCCTCTCCCGCCCCTCGACCCATCCAGATGTTCACCCCCACCTGACTCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACCCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCGATCTAGAAGGCAAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAACCCCACGGAATGACGGGCAAATAGACAAGGACCCCAGACAACAGAAGGGGGGCCGGGTGCCTCGAGAGGAACCAAAGAAACCCACTAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCCCAACTGGAGCAACTAATCCTAAAATACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATAGCTAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAAATGACATCTCACTTGGAAAAGGTTGCCACGGAGCACCGAGCCAACCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGATCCAACCTCAACGAGAACCACAATCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCCTCGACCGAATCAAGGGAGTCACCCCAGACACCGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCACTCGGGCGGCGGAGGACGATGAATACGAGGGGAGTCCCACTTTCTTCAGGAGGGTGATAGACACCGTGAAGAAGCGCATGAAGCAGGGTCAATAGACATCCTCCTCCAGGCCCCCGGTTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAGTTCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCCATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTCCTGATCCCTCCTCCTCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTGACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTTTCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGGTCTAGGAAACCCGCACCTCAGACCACCTACCAGGTGATGAAGGCGAGGGAGGTCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGCTGTGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGATGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCACCGCTCCCGAAAAACGGGGGAAGGAAAAATAGGGGTCGACCATGCCATCTCCCACTCACCCATCCATTGACCGGCACAACCCTCCTCAATCCCCAGAGTCCCCCCGCTCCTCACTCTGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACCGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCGAAACAATGGACGCCATGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTAATCACCTGTGGAGCAAACAGCCAAACAGTCCCCCCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTACCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAACTCTCCAAGGTCAATGCTTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGATGATGAGAACAGGGGGCTAATTTCTTATCCCGCCTCCATCCGGTCCCTGGTGGTCGGAAACGACCTCGGGGCGATTCACACCCAAGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGTGCTTGTAGAAATGAAACTCTCAACGAGAGAAGCAGGGGCATATGACACCACAACCGCGGCTGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTGTTGGAGGAAAATGCACTAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATTGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGACGCCAGCTCAGAAATAAACGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCGGTCGAGCCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCGGGCCTGTATGATTACCTTCTGTAAGGGGCAGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTGATATCCGTAGGATACAATTCTGGATCAAAAACCCTCTCTTTCCCGAAGTGTGAGGACAAGACGGTGGGGATGAGGGGAAACCTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGACCTGGTGAAGGCCTCAGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCATGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCATGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACGACGTACAGGGCCCATCACGCCACCAACTTCACTAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAAGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACATCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGATGAGCATGATGGAACCGATGGGCATCAAATCCGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCTTCTACAATGAGACAGAAGTATCGGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCGTTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCACACTGGGTGGGATTCCCCTGGTTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACTTCCCACTCCCTCCGCGCCGCAGAGTATCCCCATGTATCACTTGGCAAACAGGTCCTAGAGGACCTCAATCTTCACTTCCCCACCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATTTGTGCTGTAAAAAGAGACAATGGACCACCGTGAAATAAACACGTACATGGAGGCACTCAGAGAAGCTCTGCGATACAAGAACGAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTCGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGCCGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCTAAGAGGATGCAGCGAGCATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGACGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTTTACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATCGAAGAATTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCAGCGACAGCACCCCATCACAGAAACATGGACTTC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GGCACCCAGGATGATCGAGAGAGAAATCCTAGAAGCAGAGCTATGTGATATCACCAATGAGGGGAATCGTCGCTTGCTAATTCGACTGGTCAAGAAAAACAAAGGAGGAGGCAAGGTGGTGCTCATAGACGAGATCGAGAACCGAGGGGCCCCAGAATCCCTTCTACAGAGCTCGCTCCAAGACCTATTCGAGAAACTGGACAAAGTCTGCACACTCACCTCTGTGCACACAGTCAGAGAGTCAACAGTGGAACAATTCTCCCAGAGGGTCAACTCCATCAAACGCAGCAGGAAGGCAGTAACACTGCATTGGAACCGCTACAACAGAAGAGACCAGTTCGAGGCCCTTGTCATCGTAAAGGGCGAAGAGGCAAAGTCCGACTACCGGATCTCTACAATCACCTCGGCAAAGGCATTTCGCAAGATCGACGAACAGCTCGAGATAGACGGGCGACTCTCGTCGACACAGTGGTCTCTTCCCGCGCTTCCCTCTCGAGAAAAAAACATTCTTTTTGGGTACGTGTCATCCGTCTTCCTGAAGATGAACCTCGCACTCTCAGCCAACGACATGGACCGAGAGCGACTGATCGAGACCATTGAAGGAACCGCCCCAGGGTTGATCTCCTGGAAAGAGAAACTCGAACACAGGGACCATGCACATCGCTCCGACATTGAAGAGAAAGGAATAACTCAGGACAAGATCTTCAACCTCATCTGCCTCTCCTGGGTCCTCAAGGGTCTGAGACACGGTGTGTGGGACACCGACGCGCAATCCATTGTAGCCCAAACGGTGTACATCACTCGAGGGCCAAAGCTCTGTCCATTGGGGGAGAAGCCCAAGCGCATCTTCGCATCATTCAAATTGCAAAGCGGAAAGCGAGTGGAAGATGCCAAGGGATTCCTGAGCGCACTACTTCACCTTGAGGGCTTCTTTCCACTAGGCGAACCATAGGCGCACTCCAGCAGCACCCGAGTGCCAAGGGCCAAACCACCAGATACAAAAAAATGGCTCCCGACTCTCATGGTGGGGGAACCAGCCATTGTTCGCTGCCACCAAAAACCTTTTTTAACTACCTTTTGAGAACAACAACCTTGACAATCATCCATACATCTCTAGTAACTGCATAGCAATACCTACTTAGCTACAGACCCCCTATCAAC
15,663
MT242597.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Zhao,J., Xu,L., Lu,T.
Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Heilongjiang River Fisheries Research Institute
null
2022-03-25
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,131
GenBank
null
China
China
Oncorhynchus mykiss
null
2012
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain Sn1203, complete genome
GTATAAAAAAAGTAACTTGACTATGCTCAAAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAGACAGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGGCTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAGGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTCTTCTTCTCCAAGGCAGACTTTGAACTAGAGATGATTAAGCGGGCGGTGAGTCACGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGCCTCTTGTGCGCGTTCGTCATTGCGGAGACGGTCCCATCGGGGACAGGCACGGTCGCCGAAACTCTGGAAGCCCTGGACTTCTTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACTGGACGCCACTTTCGCAGATCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGGAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCTCTACTGACGAAGTATGACGTGGACAAGATGGCCATATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGACGAGTTGGTCAACTTCAACTCCAACAGGGGAGTGCTGGCCAAGATCGGGGCGGTACTTAGACCTGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATTTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCTGACCCAGCCACCGCCGCTAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGGATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCAGACCTTCTAGAAGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCTAGACGCATTGTAAGACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTGTCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGTCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGAATCACCTGCATCCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACCTCGGGAGGACTGGCAGGGATGAAGGTATCCGAACCCTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCCCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGACGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCCTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGACGGCATCCCGGAGACCAGACCCGGACGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACGACCCCAGCGAGCCAGAAGACTCCGACTCATTCCACTGAACACCAACAGTCCCCTCTCCTCTCCCGCCCCTCGACCCATCCAGATGCTCACCCCCACCTGACTCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACCCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCGATCTAGAAGGCAAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCTTGAAAACCCCGCGGAATGACGGGCAAATAGACAAGGACCCCAGACAACAGAAGGGGGGCCGGGTGCCTCGAGAGGAACCAAAGAAACCCACCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTTTATCCCAACTGGAGCAACTAATCCTAAAATACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATAGCTAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAAATGACATCTCACTTAGAAAAGGTTGCCACGGAGCACCGAGCCAACCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGATCCAACCTCAACGAGAACCACAATCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATCAAGGGAGTCACCCCAGACACCGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGATGATGAATACGAGGGGAGTCCCACTTTCTTCAGGAGGGTGATAGACACCGTGAAGAAGCGCATGAAGCAGGGTCAATAGACATCCTCCTCCGGGCCCCCGGTTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAGTCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCCATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCTCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTGACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAAAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTTTCTGTTTCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAAGTCAACTTCGGGTCTAGGAAACCCGCACCTCAGACCACCTACCAGGTGATGAAGGCGAGGGAGGTCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCTACCATCAACTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGCTGTGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGATGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAACGGGGGAAGGAAAAATAGGGGTCGACCATGCCGTCTCCCACTCACCCATCCATTGACCGGCACAACCCTCCTCCATCCCCAGAGTCCCTCCGCTCCTCACTCTGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACCGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCGAAACAATGGACACCATGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTAATCACCTGTGGAGCAAACAGCCAAACAGTCCCCCCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTACCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAACTCTCCAAGGTCAATGCTTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGATGATGAGAACAGGGGGCTAATTTCTTATCCCGCCTCCATCCGGTCCCTGGCGGTCGGAAACGACCTCGGGGCGATTCACACCCAAGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGTACTTGTAGAAATGAAACTCTCAACGAGAGAAGCAGGGGCATATGACACCACAACCGCGGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAATGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTCCTGGACTCAGATTTTGTTGGAGGAAAATGCACTAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATTGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGACGCCAGCCCAGAAATAAACGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAGTCGAGCCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCGGGCCTGTATGATTGAATTCTGTGGGAAACAGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTGATATCTGTAGGATACAATTCTGGAGCAAAAACCCTCTCCTTCCCGAAGTGTGAGGACGAGACGGTGGGGATGAGGGGAAACCTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGACCTGGTGAAGGCCTCAGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCATGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCATGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACGACGTACAGGGCCCATCACGCCACCAACTTCACTAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAAGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACATCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGATGAGCATGATGGAACCGATGGGCATCAAATCCGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCTTCTACAATGAGACAGAAGTATCGGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCGTTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCACACTGGGTGGGATTCCCCTGGTTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACTTCCCACTCCCTCCGCGCCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTGAAGGACCTCAATCTTCACTTCCTCACCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATTTGTGCTGTAAAAAGAGACAATGGACCATCGTGAAATAAACACGTACATGGAGGCACTCAGAGAAGCTCTGCGATACAAGAACGAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGCCGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCTAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGACGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGTACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGAATTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCAGCGACAGCA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32,230
MN914161.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Abbadi,M., Gastaldelli,M., Pascoli,F., Zamperin,G., Buratin,A., Bedendo,G., Toffan,A., Panzarin,V.
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie (IZSVe), Department of Comparative Biomedical Sciences
Italy
2021-01-01
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,110
GenBank
null
Italy
Italy
Oncorhynchus mykiss
null
2016-02-10
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain IHNV/O.mykiss/I/TN/72/Feb16, complete genome
GCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACAGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAAACAGATCACTAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAGGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGAATTTGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGGCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCTACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGCGAGTTGGTTAACTTCAACGCCAACAGAGGGGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATCGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACCTCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCTGACCCTTTCAGGAAACTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTTGTCCTCAAGTATGATGGCGATGGCTCAACCGGGGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGACGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGACTCATTCCGCTGAACACAAACAGCCCCCCCCTCCTCCTCYCTCGCCCCTCGACCCATCCAGATGCCCACTCCATCCTGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAGGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCTCAAGAGGAACCCAAGAAAACCACCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGTTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAAGCCGAACTGACATCTCACCTAGAGAAGGTTGCTACGGAACATCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCTCAGTCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGAAGCCGTGAAGAGGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCCCCAGGATCCCGGCCACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCCCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTCACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCCTTCAAATCTATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGGAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGCTCTCGGAAACCAGCACCTCAGACCACCTACCAGGTAATGAAGGCGAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCGATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAAGGGGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCCTGAACTTCGCCGCTCCCGAAAAGCGGGGGAAAGAAAAATAGGAGTCGACCACGCCGTCTCTCACTCACCCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCTCCATCCCCAGAGTCCCTCCACTCCTCACTCTGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAACGATGGACACCATGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAATAGCCAAACTGTCGAACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCAGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGACTAATTGCCTATCCCAYATCCGTCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGAGATTCACACCCAAGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAAATGAAACTCTCCACGAAGGAAGCAGGGGTGTATGACACCACAACAGCATCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGCACCAAATCACCCTGTCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGCGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCAGGCCTGTATGATTGAATTCTGTGGGGGGCAGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGTATACAAGTCTGGATCAAAAATCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAAGACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAGGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTATGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCGCGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGAGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGACTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGCACCCCATCCAAGCATCCTGGCCCTCTACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGATCTTCAATCACTCCATTGGAGTTTTTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCGGGGAGACCTCCCATTCCCTCCGCGTCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGATCCTAAAGGACCTCAATCCTCACTTTATCCCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAGGAGACAATGGACCACCGTGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACTTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCGTCAACTCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGCACTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGGTCCTGATTGAGGACTTTCTTGCTTATTCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCAACGAAAGCACCCCATTACAGAAAAATGG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44,845
MN914162.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Abbadi,M., Gastaldelli,M., Pascoli,F., Zamperin,G., Buratin,A., Bedendo,G., Toffan,A., Panzarin,V.
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie (IZSVe), Department of Comparative Biomedical Sciences
Italy
2021-01-01
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,112
GenBank
null
Italy
Italy
Oncorhynchus mykiss
null
2019-02-18
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain IHNV/O.mykiss/I/TN/91/Feb19, complete genome
CAGAAGGACACARGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTAAAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAATAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGGCAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGCCTTAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTAACATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGGCTTTGACCTAGAGATGGTCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAAGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGACAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACAGGGGCACCACCAGACGCCACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGAGAGTTGGCCAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAATGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACATCGAGAGGACTGACAGGGATAAAAGTATCCGACCCCTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTCGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCAGATTCATTCCGCTGAGCACAAACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCGACCCATCCAGATGTTTACTCCACCCTGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATAATGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGGATGACGGGCAAATCGGCAGGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCATCAGGAGGAACCCAAGAGAACCACCAGGAGACCCGACAAAAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGTTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTGATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCTCAGTCCCCGGCCCAAGCCACTTGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGGATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTAAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGCCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTGAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCTCCAGGAACCCGACTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCCCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGTTCTCGGAAACCAGAACCTCAGACCACCTACCAGGTGATGAAGGCAAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCCACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGACTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCACAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGTTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCAACCATGCCGTCTCTCACTCACCCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCGCCATCTCCAGGGTCCCTCCACTCCTCACTCCGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTCGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAACAATGGACACCACTATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACGGCCAAACCGTCAAACCCGGCACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTATCCCACATTCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGCGATTCACACCCAAGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAAATGAAACTCTCTACGAGAGAAGCAGGGGCGTATGACACCTCAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACACAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACAAGAGACTTTCTGGACTCAGACTTCATTGGAGGAAAATGCACCAAGTCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTGGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGCGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGACAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCGGGCCTGTATGATTGCATTCTGTGGGAAACAGTGGATACGAACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGAATACAAGTCTGGAGCAGAAATCCTCTCGTTCCCAAAGTGTGAGGACAATACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGGGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCAATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACAGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCTCGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTAGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGTCCTCCACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACCTCTCACTCCCTCCGCATCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCTAATCGGTCCTAAAGGATCTCAATCCTCACTTCCTCTCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGAGACAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCATCAGCGCACTGATCTCTTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTGTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGACCCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACCTCAAGCGCGACTCACAGAGAAAACAACCAGCAACGACAGCACCTCATCACAGAAAAAT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44,846
MN914163.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Abbadi,M., Gastaldelli,M., Pascoli,F., Zamperin,G., Buratin,A., Bedendo,G., Toffan,A., Panzarin,V.
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie (IZSVe), Department of Comparative Biomedical Sciences
Italy
2021-01-01
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,106
GenBank
null
Italy
Italy
Oncorhynchus mykiss
null
2018-03-27
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain IHNV/O.mykiss/I/TN/220/Mar18, complete genome
CACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAGGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGAATTTGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGACTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCGTCGGAGGCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCTTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCGGACGCTACCTTCGCAGATCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTTACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCGCATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGCGAGTTGGTTAATTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTACTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCTGACCTTCTGGAGGATCTGTGTATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCCGGAGTAGCAGCAAAGTACGGCATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGATGGGACCTCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGAACCCTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCTTCTCGGAGACCAGACATGGATGAGGAGGATGAGGAGGACGAGGAGGAAGACGACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGATTCATTCCACTGAGCGCAAACAGCCCCCCCTCTCTCCTYTCTCCTCTCCCGCCCCTCGACCCATCCAGACACCCACTCCTCCCCGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGACGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGACGAAGACATACTGAGGCTAGAGTCCCGCCTAAAGACCCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAAGAACCGCAGGCAACAGAAGGAGGACCAGGCGCCCCAAGAGGAACCAAAGAAAACCACCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAGGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATCTTGTCTGCGGTAATTGCCATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCACAATCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCAGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATTAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCTCCAGGATCCCGGCTACCAAGACAGAAAAAAACGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCCATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCTCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTGACAACACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGGAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAAGCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGCTCTCGAAAACCAGCACCTCAGACCACCTACCAGGTAATGAAGGCGAGGGAAGTCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTGGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGACGGGTTCACAATCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCATGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAGAGTGGGAAGGGAAAATAGGAGTCCACCATGCCGTCTCTAACCCATCCATCCATCGGCCGACCCACCCCTCCTCCATCCCCCGAGTCCCTCCACCTCTCACTCCGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGATAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAGCAATGGACACCATGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACAGCCAAACAGTCCAACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCTCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTTCCTACCCCACATCCATCCAGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGAATATTCACACCCAAGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTATAGAAATGAAACTCTCGACGAGAGAAGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACTGACAACGTACAAAACGATCTTGTTTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTATACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGCACCAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTCGTTTGGATGGGTGATGCGGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGGGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCATGCCTGTATGATTGACTTCTGTGGGAAACCGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCACATACAATTCTGGAGCAAAAACCCTCTCGTTCTCGAAGTGTGAGGACAAGACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGACCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCGCGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGGAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAGTACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCAATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCGAGCATCCTGGCCCACTACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCAGCGTGCTGCTGTTGGTCAGGGAGACCTTCCACTCCCTCCTCGTCGCAGAGCATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAGGACCTCAATTTTCACCTCCTCCCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCAGCAAAAAGGGACAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACGAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAAGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTGCTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGACCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCAACGACAGCACCACATCATAGAAGAATGGACTT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44,847
MN914164.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Abbadi,M., Gastaldelli,M., Pascoli,F., Zamperin,G., Buratin,A., Bedendo,G., Toffan,A., Panzarin,V.
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie (IZSVe), Department of Comparative Biomedical Sciences
Italy
2021-01-01
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,111
GenBank
null
Italy
Italy
Oncorhynchus mykiss
null
2018-03-27
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain IHNV/O.mykiss/I/TN/223/Mar18, complete genome
GCTCAGAAGGACACARGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTAAAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAATAACACCTGAGAGACAGACACGGATCACGAACGATGGCAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGCCTTAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTAACATAACCCTCCCTCTATTCTTCTCCAAGACAGGCTTTGACCTAGAGATGGTCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAAGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGACAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTAGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACAGGGGCACCACCAGACGCCACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGAGAGTTGGCCAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCCGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAATGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACATCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCCTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTCGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCAGATTCATTCCGCTGAGCACAAACTGTCCCCCCCTCCTTCCTCTCCCGCCCCCCGACCCATCCAGATGTTTACTCCACCCTGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAGGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCTCAAGAGGAACCCAAGAGAACCACCAGGAGACCCGACAAAAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGTTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTGATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCTCAGTCCCCGGCCCAAGCCACTTGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGGATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTAAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTGAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCTCCAGGAACCCGACTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCCCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGTTCTCGGAAACCGGAACCTCAGACCACCTACCAGGTGATGAAGGCAAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCCACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGACTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCACAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGTTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCAACCATGCCGTCTCTCACTCACCCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCGCCATCTCCAGGGTCCCTCCACTCCTCACTCCGGCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTCGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAACAATGGACACCACCATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACGGCCAAACCGTCAAACCCGGCACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTATCCCACATTCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGCGATTCACACCCAGGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAAATGAAGCTCTCTACGAGAGAAGCAGGGGCGTATGACACCTCAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACAAGAGACTTTCTGGACTCAGACTTCATTGGAGGAAAATGCACCAAGTCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTGGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGCGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGACAAAATCTCCAATCGAGCCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCGGGCCTGTATGATTGCATTCTGTGGGAAACAGTGGATACGAACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGAATACAAGTCTGGAGCAGAAACCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAATACTGTGGGGATGAGAGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGGGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCAATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACAGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCTCGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTAGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGTCCTCCACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACCTCTCACTCCCTCCGCATCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAATCGGTCCTAAAGGATCTCAATCCTCACTTCCTCTCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGAGACAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGATGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCATCAGCGCACTGATCTCTTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTGTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGACCCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAACCTCAAACGCGACTCACAGAGAAAACAACCAGCAACGACAGCACCTCATCACAGAAAAATG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44,848
MN914165.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Abbadi,M., Gastaldelli,M., Pascoli,F., Zamperin,G., Buratin,A., Bedendo,G., Toffan,A., Panzarin,V.
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie (IZSVe), Department of Comparative Biomedical Sciences
Italy
2021-01-01
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,114
GenBank
null
Italy
Italy
Oncorhynchus mykiss
null
2018-03-27
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain IHNV/O.mykiss/I/TN/224/Mar18, complete genome
GCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGATACTAAAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAATAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAAAGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGCCTTAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACGGAGTACCGTCCAGGCAATATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGGCTTTGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGGGGAGAGGGAACGAGAAAGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGACAGGTACGGTCGCCGAACTCCTGGAGGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACAGGGGCACCACCAGACGCCACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCTTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTAGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGTATTGGCGAGTTGGCCAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCAGTGCTTAGACCCGGACAAAAGCTCACCAAGGCCATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAATGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACATCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCCTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTCGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGACGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGATGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCAGATTCTTTCCGCTGAGCACAACCTGCCCCCCCCTCCTTTTCCCTCTCCCGCCCCCCGACCCATCCAGATGTTCACTCCACCCTGACCCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAGGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAAGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCTCAAGAGGAACCCAAGAGAACCACCAGGAGACCCGACAAAAACAAGAGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGTTGTCAGGATGCCTTGAAGGACTTCGGAGGTCTGATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACAGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATCTTGTCTGCGGTCATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCTCAGTCCCCGGCCCAAGCCACTTGACCCGGACCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAATATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGACGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACACCGTGAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCTCCAGGAACCCGACTACCGAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAAAGAGCAAAGAGAACAGTCCTGATCCCTCCTCCCCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGTTCTCGGAAACCAGAACCCCAGACCACCTACCAGGTGATGAAGGCAAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGGGGGGGCCACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCACGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGACTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATTCACAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGTTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCAACCATGCCGTCTCTCACTCATCTATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCTCCATCCCCAGAGCCCCTCCACTCCTCACTCCGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTCTGTGCTTCGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAACAATGGACACCGCGATCACCACTTCGCTCATTCTCATCCTGATCACCTGCGGAGCAAACGGCCAAACCGTCAAACCCGGCACCGCAAGCGAATCAGATCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTATCCCACAGTCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGCGATTCACACCCAAGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAAATGAAACTCTCTACGAGAGAAGCAGGGGCGTATGAAACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAATGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCCGAGACTTTCTGGACTCAGACTTCATTGGAGGAAAATGCACCAAGTCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTGGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTTTTTGTTGACAAAATCTCCAATCGAGCCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCAGGCCTGTATGATTACCTTCTGTGGGAAACCGTGGACACGAACGGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGAATACAAGTCCGGAGCAGAAATCCTCTCGTTCCAGAAGTGTGAGGACAATACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGACCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGGGAGGAATGTCTTGAGGCACACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACCCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCAATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACAGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATAGCGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGACGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATATGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGTCCTCCACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCCGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACCTCCCACTCCCTCCGCGTCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAATCGGTCCTAAAGGACCTCAATCCTCACTTCCTCTCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGAGACAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCATCAGCGCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGACCCGCCTGCACAAAGAACCCCAATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAACCTCAAGCGCGACTCACAGAGAAAACAACCAGCAACGACAGCACCCCATCACAGAAAA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44,849
MN914166.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Abbadi,M., Gastaldelli,M., Pascoli,F., Zamperin,G., Buratin,A., Bedendo,G., Toffan,A., Panzarin,V.
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie (IZSVe), Department of Comparative Biomedical Sciences
Italy
2021-01-01
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,098
GenBank
null
Italy
Italy
Oncorhynchus mykiss
null
1997-09-25
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain IHNV/O.mykiss/I/TN/459/Sep97, complete genome
GGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAGCCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGAATTTGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGTCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCCACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAACCAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATAGGCGAGTTGGTTAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGTGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGTAGGATGCTAGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACCTCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCTTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCCCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGATTCATTCCGCTGAACACAAACAGCCCCCCCCTCCTTTTTCCTCTCCCGCCCCTCGACCCATCCAGATGTTCACTCCACCCTGACTCTTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAAATCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAAGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCTCAAGAGGAACCAAAGAAAACCACCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCCATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCACAGTCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAAGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATATGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCTCCAGGATCCCGGCTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCCCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGCTCTCGGAAACCAGCACCTCAGACCACCTACCAGGTAATGAAGGCGAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAAAGGGTCAAAGACCACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCATGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCGACCATGCCGTCTCCCACTCACCCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCTCCATCCCCAGAGTCCCTCCACTCCTCACTCCGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTCGAGACAGAACGCAACCCGCAGAGACCCACCAAAACAATGGACACCACGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCATTTGCGGAGCAAACAGCCAAACCATCAAACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGTCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAACCGCCTATCCCACRTCCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGCGATTCACACCCAAGGGAACCACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAGATGAAACTCTCCACGAAAGAAGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGCGCCAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCAAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCAGGCCTGTATGATTGAATTCTGTGGGAAACCGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGAATACAATTCTGGATCAAAAATCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAAGACTGTGGGAATGAGGGGAAACCTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTAAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCTGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCACGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACACCACCATCATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCCTCTACAATGAGACAGACGTCTCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGTGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACCTCCCACTCCCTCCGCGTCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAGGACCTCAATCCTCACTTCCTCCCCCCCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGAGACAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTGTGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCATCAACGCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCAACGACAGCACCCCATCACAGAAAAATGGACTTCTTCGATC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44,850
MN856664.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Cabon,J., Almeras,F., Baud,M., Pallandre,L., Morin,T., Louboutin,L.
ANSES Laboratoire de Poufragan-Plouzane, Unite Pathologies Virales des Poissons
France
2020-06-17
OO121.8
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,137
GenBank
1
France: Moselle
France
Esox lucius
null
2016-10
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus isolate OO121.8, complete genome
GTATAAAAAAAGTAACTTGACTAAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTAAAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAATAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGGCAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGCCTTAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTAACATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGGCTTTGACCTAGAGATGGTCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAAGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGACAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACAGGGGCACCACCAGACGCCACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGAGAGTTGGCCAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGGCGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAATGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACATCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCCTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTCGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCAGATTCATTCCGCTGAGCACAAACTGCCCCCCCCTCCTTCTTCCTCTCCCGCCCCCCGACCCATCCAGATGTTTACTCCACCCTGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAGGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCTCAAGAGGAACCCAAGAGAACCACCAGGAGACCCGACAAAAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGTTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTGATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCTCAGTCCCCGGCCCAAGCCACTTGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCTCTCAATGTCTTCGACAGGATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTAAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTGAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCTCCAGGAACCCGACTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCCCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAAGTCAACTTCGGTTCTCGGAAACCAGAACCTCAGACCACCTACCAGGTGATGAAGGCAAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCCACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGACTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCACAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGTTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCAACCATGCCGTCTCTCACTCACCCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCGCCATCTCCAGGGTCCCTCCACTCCTCACTCCGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTCGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAACAATGGACACCACTATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACGGCCAAACCGTCAAACCCGGCACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTATCCCACAATCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGCGATTCACACCCAAGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAAATGAAACTCTCTACGAGAGAAGCAGGGGCGTATGACACCTCAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACAAGAGACTTTCTGGACTCAGACTTCATTGGAGGAAAATGCACCAAGTCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTGGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGCGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGACAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCGGGCCTGTATGATTGCATTCTGTGGGAAACCGTGGATACGAACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGAATACAAGTCTGGAGCAGAAATCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAATACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGGGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCAATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACAGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCTCGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTACACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTAGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGTCCTCCACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACCTCTCACTCCCTCCGCATCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAATCGGTCCTAAAGGATCTCAATCCTCACTTCCTCTCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGAGACAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCATCAGCGCACTGATCTCTTCCAAGAGGATGCAGCGAGCATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTGTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGACCCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAACCTCAAGCGCGACTCACAGAGAAAACAACCAGCA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GATTGTTCCCCCAGAGCTCCTAGTGAGGGGCATGGCACCTAGGATGATCGAGAGAGAGATCCTAGAAGCAGAGCTGTGTGATATCACCAATGAGGGGAATCGTCGCCTGCTAATTCGACTGGTCACGAAAAACAAGGGAGGAGGCAAGGTAGTGCTCATAGACGAGATCGAGAATCGAGGGGCCCCAGAATCCCTTCTACAGAGCTCGCTCCAAGACCTATTCGAGAAACTGGACAAAGTCTGCAAACTCACCTCTGTGCACACAGTCAGAGAGTCAACAGTGGAACAATTCTCCCAGAGGGTAAATTCTATCAAACGCAGCAGGAAGGCAGTAACACTACACTGGAACCGCTACAACAGAAGAGACCAATTTGAGGCCCTGGTCATCGTGAAGGGCGAAGAGGCCAAGTCCGATTACCGGATCTCCACTATCACCTCGGCAAAGGCATTTCGCAAGATCGACGAACAGCTCGAGATAGACGGGAGACTCTCGTCGACACAGTGGTCCCTCCCCACGCTTCCATCTCGAGRAAAAAACATTCTTTTTGGGTACGTGTCATCCGTCTTCCTGAAGATGAACCTTGCACTCTCAGCCAACGACATGGACCGAGAGCGACTGATCGAGACCATTGAGGGAACCGCCCCAGGGTTGATCTCCTGGAAGGAAAAACTCGAACACAGGGACCATGCACATCGCTCCGACATTGAAGAGAAAGGAATAACTCAGGATAAGATCTTCAACCTAATCTGCCTCTCCTGGGTCCTCAAGGGTCTGAGATACGGAGTATGGGACACCGACGCTCAGTCCATTGTAGCTCAAACTGTGTACATCACTCGAGGGCCAAAGCTCTGTCCATTGGGGGAGAAGCCCAAGCGCATCTTCGCATCATTCAAACTACAAAGCGGAAAGCGAGTTGAAGATGCCAAGGGATTCCTGAGCGCACTGCTTCACCTTGAGGGCTTCTTTCCACTAGGCGAACAATAGGTACACCCCAGCAGAACCCAGCGCCAGGGACCAAACTCCCAGATACAAAAAAATGGCTCCCGATTCCCATGGTAAGGGAACCAGTAATTGTTTTCTGTTATTAAAAACCTTTTTTAACTGCCTTTTGAGAACCCTTCTGTTACTTTTTTTAT
49,028
MN225937.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Oh,W.T., Park,S.C.
Seoul National University, Department of Veterinary medicine
South Korea
2019-12-24
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,132
GenBank
null
South Korea
South Korea
Oncorhynchus mykiss
null
2019-05-06
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain SNUV1, complete genome
GTATAAGAAAAGTAACTTGACTAAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGGAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAATTATTTTCACTGAAAACCACACCTGAGAGACAGAAACAGATCACGAACGATGACAAGCGAACTCAAAGAGACGTTCACTGGGCTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAGGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCAGTACGATAACCCTCCCTCTCTTCTTCTCCAAGGCAGACTTTGAACTAGAGATGATTAAGCGGGCGGTGAGTCACGTAGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGCCTCTTGTGCGCGTTCGTCATTGCGGAGACGGTCCCATCGGGGACAAGCACGGTCGCCGAAATTCTGGAAGCCCTGGGCTTCTTGTTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACTGGACGCCACCTTCGCAGATCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCTCTACTGACAAAGTATGACGTGGACAAGATGGCCATATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGTGAGTTGGTCAACTTCAACTCCAACAGGGGAGTGCTGGCCAAGATCGGGGCGGTACTGAGACCTGGGCAGAAGCTAACCAAGGCCATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCACTGCCGCTAGAGCCAAGGCACTTTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGGATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCTGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCAGACCTTCTAGAAGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTAAGACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCCAAGTACGGTGTCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGTCCTACGGGATCAACGAGAACTCCAGGATCACCTGCATCCTAATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACCTCGGGAGGACTGGCAGGGATGAAGGTATCCGAACCCTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTCGTTCTCAAGTACGACGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGACGGCATCCCGGAGACCAGACATGGACGAGGAAGAAGAGGAGGACGAGGAGGACGACGACCCCAGTGAGCCAGAAGACTCCGACTCATTCCGCTGAACACCAACAGCCCCCCCTCCTCTCCCGCCCCTCGACCCATCCAAATGCCCACCCCCCCCTGACTCCCAGACAGAAAAAAATGGCACTATGGTGCTTTTCAACCCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCGATCTAGAAGGCAAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAACACCACGGAATGACGGGCAAATAGACAAAAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGTGCCTCGAGAGGAACCAAAGAAACCCACCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCCCAGCTAGAGCAACTGATCCTAAAATATGTTGAGGAGGAGAGCTGCCAGGATGCCCTAAAGGACTTCGGAGGTCTAATAGCCAACATCAGACAGGCCCCCCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCCACGGAGCACCGAGCCAACCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATCCTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACATCAACGAGAACAACAGTCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGGTGAAAGCCGCCCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGATATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAGTCAAGGGAGTCACCCCAGACACCGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCACTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGTAGTCCCACTTTCTTCAGGAGGGTAATAGACACCGTAAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCCTCTCCATGCCCCCGGCTACTAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAGTCCAAGAGTCAGTTCCAACTAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCTCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTGACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCGGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTTCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAAGTCAACTTCGGGTCTCGGAAACCAGCACCTCAGACCACCTACCAGGTGATGAAGGCGAGGGAAGTCTACCTTCAAACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGCTGTGACGACAACAGGACCAAGCTGGCGGGGCTTGATGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAACGGGGAAAGGAAAAATAGGAGTCGACCATGCCGTCTCCCACTCACCCATCCATCGACCGACCCAACCCTCCTCCGTCCCCAGAGTCCTTCCACTCCTCACTCTGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAGCCAATGGACACTATGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTAATCACCTGTGGAGCAAACAGCCAAACCGTCCCACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTACCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAACTCTCCAAGGTCAATGCTTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATTTTCGATGATGAGAACAGGGGGCTGACTTCCTATCCCACCTCTATCCGGTCCCTGGCGGTCGGAAACGACCTCGGGGCGATTCACACCCAGGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACCGGGTTTTTTGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGTGCTTGTAGAGATGAAACTCTCTACGAGAGAAGCAGGAGCATATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTATACCGACAACGTACAAAATGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGCACTAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGACGCCAGCCCAGAGATAAACGGTCATCTCTTTGTTGACAAAATCTCCAATCGAGCCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCGGGCCTGTATGATTACCTTCTGTGGGCAACAGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTGATATCTGTAGGATACAATTCTGGAGCAAAAACCCTCTCGTTTCCGAAGTGTGATGACAACACGGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCTTATCTAGATGACCTGGTGAAGGCCTCGGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCGTACCTCCTATCTAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAACGATGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAAGACAGGAAGACGTACAGGGCCCACCACGCAACCAACTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAATATCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGGTGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCCGTACCCCATCCGAGCATCCTAGACTTCTACAATGAGACAGACGTATCTGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCGTTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCACCCTGAGTGGGGTTCCCCTGGTTCTCCTCCTCGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACCCCCCACTCCTTCCGCGCCGCAGAGCATCCCCATGTATCGCCCGGCAAACAGGTCCTAAAGGACCTCAATCTTCACTTCCTCACCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATTTGTGCTGTAAAAAGAGACAATGAACCACCGTGAAATAAACACGTACATGGAGGAACTCAGAGAAGCTCTGCGATACAAGAACGAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGCGAAGATGACGACGCAACATGGAGGCGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCTAAGAGGATGCACCGAGTACTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGTACAAAGAACCCCGATTCAGGAAACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTCTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCAACGACAGC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57,315
MN083249.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Zamperin,G., Lucas,P., Cano,I., Ryder,D., Abbadi,M., Stone,D., Cuenca,A., Vigouroux,E., Blanchard,Y., Panzarin,V., Louboutin,L., Cabon,J.
Anses, GVB
France
2019-12-10
3Lot1
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,144
GenBank
1
France: Vaucluse
France
Oncorhynchus mykiss
null
2000
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus isolate 3Lot1, complete genome
GTATAAAAAAAGTAACTTGACTAAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGAATTTGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGCCTACTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGGCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCCTTGGACACCGGGGCACCACCAGACGCCACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCGCATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGAGAGTTGGTTAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCTGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCGCTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACTTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACCTCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCTTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAAATCGCTCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGATTCATTCCGCTGAACACAAACAGCCCCCCCCCCTTTCCCTCTTCCTCTCCCGCCCCTCGACCCATCCAGATGCTCACTCCACCCTGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGAAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGACTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAAGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCTCAAGCGGAACCAAAGAAAACCGCCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCACAGTCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCAGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAAGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCTCCAGGATCCCGGCTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAGCGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCCCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACGCTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGCTCTCGGAAACCAGCACCTCAGACCACCTACCAGGTAACGAAGGCGAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCGACCATGCCGTCTCTCACTCACTCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCTCCATCCCCAGAGTCCCTCCACTCCTCACTCCGCCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACAGAACACAACTCGCAGAGACCCTCCAAAACAATGGACACCACGATCACCACTCCGCTCATTCTAATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACAGCCAAACCGTCAAACCCGGCACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTAGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGACTAATTGCCTATCCCACATCCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGAATATTCACACCCAAGGGAACCACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAAATGAAACTCTCTACGAAAGAAGCAGGGGTGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCCAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGTACCAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCAGGCCTGCACGATTGAATTCTGTGGGAAACCGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGAATACAATTCTGGAGCAACAACCCTCTCGTTCCCGAAGTGTAAGGACAAGACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCGTACCTTCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCGCACTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAACCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCCTCTACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCCTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACCTCCCACTCCCTCCGCGTCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAGGACCTCAATCCTCACTTCCTCCCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGTTGCAAAAAGGGACAATGGACCACCGCGATATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTACTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATTCTGATTGAAGACTTTATTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAGCTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACC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57,700
MN083250.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Zamperin,G., Lucas,P., Cano,I., Ryder,D., Abbadi,M., Stone,D., Cuenca,A., Vigouroux,E., Blanchard,Y., Panzarin,V., Louboutin,L., Cabon,J.
Anses, GVB
France
2019-12-10
23/94
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,138
GenBank
1
France: Cote d'Or
France
Oncorhynchus mykiss
null
1994
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus isolate 23/94, complete genome
GTATAAAAAAAGTAACTTGACTAAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGACTTTGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGGCAAGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTAGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCTACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGCGAGTTGGTTAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTAGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGACGGGACCTCTAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCTTTCAGGAAGCTAGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGATGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGATTCATTCCGCTGAACACAAACAGCCCCCCCCTCCCTTTTCCTCTCCCGCCCCTCGACCCATCCAGATGTTTACTCCACCCTGACTCTTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAAGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCGCAAGAGGAACCAAAGAAAACCACCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCTCAGTCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCTTCCTCCAGGATCCCTGCTACTAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCTCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGCTCTCGGAAACCAGCACCTCAGACCATCTACCAGGTAATGAAGGCGAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCCACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCGACCATGCCGTCTCTCACTCACCCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCTCCATCCCCAGAGTCCCTCCACTCCTCACTCTGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAACAATGGACACCACGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACAGCCAAACCGTCAAACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTATCCCACATCCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGAGATTCACACCCAAGGGAACCACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAAATGAAACTCTCTACGAAAGAAGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGCACCAAGTCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCAGGCCTGTATGATTGGATTCTGTGGGAAACAGTGGATACGAACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGAATACAACTCTGGAGCAGAAATCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAAGACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCGCGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGAGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCCTCTACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCCGGGAGACCTCCCACTCCCTCCGCGTCGCAGAGCATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAGGACCTCAATCCTCACCTCCTCACCACCAGAAAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGAGACAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGCTTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCA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GATTGTTCCCCCAGAGCTCCTGGTGAGGGGCATGGCACCTAGGATGATCGAGAGAGAGATCTTAGAAGCAGAGCTGTGTGATATCACCAATGAGGGGAATCGTCGCCTGCTAATTCGACTGGTCACGAAAAACAAGGGAGGAGGCAAGGTGGTGCTCATAGACGAGATCGAGAATCGAGGGGCCCCAGAATCCCTTCTACAGAGCTCGCTCCAAGACCTATTCGAGAAACTGGACAAAGTCTGCAAACTCACCTCTGTGCACACAGTCAGAGAGTCAACAGTGGAACAATTCTCCCAGAGGGTAAATTCTATCAAACGCAGCAGGAAGGCAGTAACACTGCATTGGAACCGCTACAACAGAAGAGACCAATTTGAGGCCCTGGTCATCGTGAAGGGCGAAGAGGCCAAGTCCGACTACCGGATCTCCACGATCACCTCGGCAAAGGCATTTCGCAAGATCGACGAACAGCTCGAGATAGACGGGAGACTCTCGTCGACACAGTGGTCCCTCCCCGCGCTTCCTTCCCGAGAAAAAAACATTCTTTTTGGGTACGTGTCATCCGTCTTCCTGAAGATGAACCTCGCACTCTCAGCCAACGACATGGACCGAGAGCGACTGATCGAGACCATTGAGGGAACCGCCCCAGGGTTGATCTCCTGGAAGGAAAAACTCGAACACAGGGACCATGCACATCGCTCCGACATTGAAGAGAAAGGAATAACTCAGGACAAGATCTTCAACCTCATCTGCCTCTCCTGGGTCCTCAAGGGTCTGAGATACGGAGCATGGGACACCGACGCTCAATCCATTGTAGCTCAAACGGTGTACATCACTCGAGGGCCAAAGCTCTGTCCATTGGGGGAGAAGCCCAAGCGCATCTTCGCATCATTCAAACTACAAAGCGGAAAGCGAGTTGAAGATGCCAAGGGATTCCTGAGCGCACTGCTTCACCTTGAGGGCTTCTTTCCACTAGGCGAACAATAGGTACACTCCAGCAGAACCGGAGTGCCAGGGACCAAACTCCTAGATACAAAAAAATGGCCTCCGACTCCCATGGCAAGGGAACCAGTCATTGTTTTCTGTTATTAAAAACCTTTTTTAACTGCCTTTTGAGAACCCTTCTGTTACTTTTTTTAT
57,701
MN083251.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Zamperin,G., Lucas,P., Cano,I., Ryder,D., Abbadi,M., Stone,D., Cuenca,A., Vigouroux,E., Blanchard,Y., Panzarin,V., Louboutin,L., Cabon,J.
Anses, GVB
France
2019-12-10
NN108
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,139
GenBank
1
France: Seine-Maritime
France
Oncorhynchus mykiss
null
2015
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus isolate NN108, complete genome
GTATAAAAAAAGTAACTTGACTAAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTGTTTTTCTCCAAGACAGAATTTGACCTAGAGTTGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATCGCAGAGACGGTCCCGTCGGAGGCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCTACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAACGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATCGGCGAGTTGGCTAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGACCCGGGCAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAAGGGACCTCTAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCTTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGATGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGATTCATTCCGCTGAACACAAACAGCCCCCCCTCCCTTTTCCTCTCCCGCCCCTCGACCACTCCAGATGTCTACTCCACCCCGACTCTTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGAATGACGGGCAAATTGGCAAGAACCCCAGGCAGCGGAAGGAGGACCAGGCGCCTCAAGAGGAACCAAAGAGAACCACCAGGAGACCAGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCTCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCAGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATCCTGTCCGCGGTAATTGCCATTCGGTCTAACCTCAACGAGAACCTCAGTCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGACGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATGAAGCACGGTCAATAGACATCTTCCTCCAGGATCCCGGCTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAGCGAAAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCTCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGCTCTCGGAAACCAGCACCTCAGACCACCTACCAGGTAATGAAGGCAAGGGAAATCTACCTTCAGACACAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCAACCATCACCTTCACAGGACGGTTTCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGAGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAGAGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCGACCAGGTCGTCTCTCACACACCCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCTCCATCCCCAGAGCCCCTCCACTCCTCACCCTGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAACAATGGACACCACGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACAGCCAAACCGTCAAACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGATGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTATCCCACATCCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGAGATTCACACCCAAGGGAACCACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCACTTGTAGAAATGAAACTCTCCACGAAAGAAGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTTTACTATACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGGGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGCACCAAATCGCCCTGCCAGACTCACTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGCGATGCAGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGTTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCAGGCCTGTATGATTGAATTCTGTGGGAAACAGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTAATATCCGTCGAATACAATTCTGGAGCAGAAATCCTCTCGTTCCCGAAATGTGAGGACAAGACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCGCGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATATGTTGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCCTCTACAATGAGACAGACACATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCGTTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCCGGGAGACCTCCCACTCCCGCCGCGTCGCAGAGCATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAGGACCTCAATCCTCACTTCCTCCCCACCAGAAAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGAGACAATGGACCACCGCGACATAAATACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCAATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACAACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCAA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57,702
MN083252.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Zamperin,G., Lucas,P., Cano,I., Ryder,D., Abbadi,M., Stone,D., Cuenca,A., Vigouroux,E., Blanchard,Y., Panzarin,V., Louboutin,L., Cabon,J.
Anses, GVB
France
2019-12-10
T00121
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,140
GenBank
1
France: Drome
France
Oncorhynchus mykiss
null
2007
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus isolate T00121, complete genome
GTATAAAAAAAGTAACTTGACTAAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGRAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAAACACTATAAATCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGCTAGAAACGGATTACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTTCTTGAAGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCAGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGGCTTTGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAAGGCATTGGGCCTCCTTTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACAGTTCCATCGGAGGCAGGTACGGTCGCAGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCCACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATCGGCGAGTTGGTCAACTTCAACTCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGGCCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGATCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTATGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCTGACCTTCTCGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTATGGGATCAACGAGAATGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACCTCAAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCTTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGACGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGCACCAGACATGGATGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGATTACTCAAGTGAGCCAGGAGACTCCGATTCATTCCGCTGAACACAAACAGCACCCCCCTCCTTCTTCCCATCCCTCCCCTCGACCCATCCAGACTCTTACTCCACCATGACTCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACCCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGTGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGTAACGACGGGCAAATCGGCAAGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCTCAAGAGGAACCAAAGAAAACCACCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCCCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGACCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCTAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCACAGTCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGATGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAACGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAGGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGGAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGTATGAAGCAAGGCCAATAGACATCCTCCTCCAGGATCCCGGCTACTAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGATCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCCCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTCACAATCCTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTAGAGGAGAAGATCTACTACTCCATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAGGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGCTCTCGGAAACCAGAACCTCAGACCACCTATCAGGTGACGAAGGCGAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGCTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGACGGGTTCACAACCTCCAGCAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCTCAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAGCGGGGGAAAGAAAAATAGGAGCTGACCATGCCATCTCTCACTCACCCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCTCCATCCCCAGAGTCCCTCCACTCCTCACTATGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAGACAATGGGCACCACGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGGGCAAACAGCCAAACCGTCAAACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTAGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCCCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAGTTGCATATCCCACATCCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGAGATTCACACCCAAGGGAACCACATCCACAAAGTCCTGTACCGTACCATCTGCTCAACGGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAAATGAAACTCTCTACGAAAGAGGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGCACCAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCTCAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTGGATAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCATCCTTGGGGACTGCATCAGGCCTGTATGATTGAATTCTGTGGGGGACAGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTAATATCAGTCACATACAAGTCTGGATCAGAAATCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAAGACTGTGGGGATGAGAGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATGTCAACAAATAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCGCGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAAAAATACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGTATCAAATCAGTACCCCACCCAAGCATCCTGGCCCTCCACAATGAGACAGACGTATCAGGAATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGCTTCTGGCCCACTATCTCCACACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCCGGGAGACCTCCCATTCCCTCCGCGTCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGACAAATCGGTCCTAAAGGGCCTCAATCCTCACTTCCTCCCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAACAGAGACAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGTACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACAAGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAAGCGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCTAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTCTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCCGATTGAGGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCA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GATTGTTCCCCCAGAGCTCCTGGTGAGGGGCATGGCACCTAGGATGATCGAGAGAGAGATCTTAGAAGCAGAGCTGTGTGATATCACCAATGAGGGGAATCGTCGCCTGCTAATTCGACTGGTCACGAAAAACAAGGGAGGAGGCAAGGTGGTGCTCATAGACGAGATCGAGAATCGAGGGGCCCCAGAATCCCTTCTACAGAGCTCGCTCCAAGACCTATTCGAGAAACTGGACAAAGTCTGCAAACTCACTTCTGTGCACACAGTCAGAGAGTCAACAGTGGAACAATTCTCCCAGAGGGTAAATTCCATCAAACGCAGCAGGAAGGCAGTAACACTGCATTGGAACCGCTACAACAGAAGAGACCAATTTGAGGCCCTGGTCATCGTGAAGGGCGAAGAGGCCAAGTCCGACTACCGGATCTCCACGATCACCTCGGCAAAGGCATTTCGAAAGATCGACGAACAGCTCGAGATAGACGGGAGACTCTCGTCGACACAGTGGTCCCTCCCCGCGCTTCCATCTCGAGAAAAGAACATTCTTTTTGGGTACGTGTCATCCGTCTTCCTGAAGATGAACCTTGCACTCTCAGCCAACGACATGGACCGAGAGCGACTGATCGAGACCATTGAGGGAACCGCCCCAGGGTTGATCTCCTGGAAGGAAAAACTCGAACACAGGGACCATGCACATCGCTCCGACATTGAAGAGAAAGGAATAACTCAGGACAAGATCTTCAACCTCATCTGCCTCTCCTGGGTTCTCAAAGGTCTGAGATACGGAGTATGGGACACCGACGCTCAATCCATTGTAGCTCAAACGGTGTACATCACCCGAGGGCCAAAGCTCTGTCCATTGGGGGAGAAGCCCAAGCGCATCTTTGCATCATTCAAGCTACAAAGCGGAAAGCGGGTTGAAGATGCCAAGGGATTCCTGAGCGCACTGCTTCACCTTGAGGGCTTCTTTCCACTAGGCGGACAATAGGCACACTCCAGCAGAACCCGAGTGCCAGGGACCAAACCCCCAGATACAAAAAAATGGCTCCCGACTCCCATAGCAAGGGAACCAGTCATTGTCCCTTGTTATTNAAAACCTTCCTTAACTTCCTTTTGAGAACCCTTCTGTTACTTTTTTTATAC
57,703
MN083253.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Zamperin,G., Lucas,P., Cano,I., Ryder,D., Abbadi,M., Stone,D., Cuenca,A., Vigouroux,E., Blanchard,Y., Panzarin,V., Louboutin,L., Cabon,J.
Anses, GVB
France
2019-12-10
VP0614.8
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,137
GenBank
1
France: Manche
France
Oncorhynchus mykiss
null
2014
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus isolate VP0614.8, complete genome
GTATAAAAAAAGTAACTTGACTGAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCTAGACAGAACAAGCAGAACAATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGACCTTGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCTGAGGCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCCTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCCACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTATTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAGAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGCGAGTTGGTTAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTGAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGGATGACAATGGTGGGACTGTTTAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAAGGGACCTCTAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCTTTCAGGAAGTTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGATGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGACTCATTCCACTGAACACAAACAGCCCCCCCCTCCTTTCTCCTCTCCCGCCCATCGACCCATCCAGATGTTCACTCCACCCCGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAAGCACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCTCAAGAGGAACCAAAGAAAACCACCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTATGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTTCAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACTGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATCTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCTCAGTCCCAGGCCCAAGCCACTCGATCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTTAATGTCTTCGACCGAGTGAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCTCCCGGATCCCGGCTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCTCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGGCCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAAATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGCTCTCGGAAACCAGCACCTCAGACCACCTACCAGGTAATGAAGGCGAGGGAAATTTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCCACCATCACTTTCACAGGACGGTTCTTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGACGGGTTCACAACCTCAAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAAACAGCCCTGGCCCTGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCGACCATGCCTTCTCTCACCCACCCATCCATCGGCCGACCCAACCCTCCTCCATCCCCAGAGTCCCTCCACTCCTCACCCCGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAGAACAATGGACACCACCATCACCACTCCGCTCATCCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACAGCCAAACCGTCAAACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAACTCTCCAAGGTCAATGCCTCCCAGCTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTATCCCACATCCATCCGGTCCCTATCAGTCGGAAACGACCTCGGGGAGATTCACACCCAAGGGAACCACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATCGAGAAGGCGCTTGTAGAAATGAAACTCTCCGCGAAAGAAGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACTCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGCACCAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCATCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCAGGCCTGTATGATTGAATTCTGTGGGAAACCGTGGATACGGACAGATCTCGGTGATCTAATATCTGTCGAATACAATTCTGGATCAGAAATCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAAGACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCGCGCTACCAGTTTCACGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGGAATAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGATGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCCTCTACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTCCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTACTGCTGGTCAGGGAGAACTCCCACTCCCTCCGCGTCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAAGGCCTCAATCCTCACCTCCTCCCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGAGACAATGGACCACCGCGACGTAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAACTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTCGACGACGGGGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGCGACTCTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTACTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACAAAGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAAACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCA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GATTGTTCCCCCAGAGCTCCTGGTGAGGGGCATGGCACCTAGGATGATCGAGAGGGAGATCCTAGAAGCAGAGCTGTGTGACATCACCAATGAGGGGAATCGTCGCCTGCTAATTCGACTGGTCACGAAAAACAAGGGAGGAGGCAAGGTGGTGCTCATAGACGAGATCGAGAATCGAGGGGCCCCAGAATCCCTTCTACAGAGCTCGCTCCAAGACCTATTCGAGAAACTGGACAAAGTCTGCAAACTCACCTCTGTGCACACAGTCAGAGAGTCAACAGTGGAACAATTCTCCCAGAGGGTAAATTCCATCAAACGCAGTAGGAAGGCAGTAACACTGCATTGGAACCGCTACAACAGAAGAGACCAATTTGAGGCCCTGGTCATCGTGAAGGGCGAAGAGGCCAAGTCCGACTACCGGATCTCCACGATCACCTCGGCAAAGGCATTTCGCAAGATCGACGAACAGCTCGAGATAGACGGGAGACTCTCGTCGACACAGTGGTCCCTCCCCACGCTTCCTTCTCGAGAAAAGAACATTCTTTTTGGGTACGTGTCATCCGTCTTCCTTAAGATGAACCTTGCACTCTCAGCCAACGACATGGACCGAGAGCGACTGATCGAGACCATTGAGGGAACCGCCCCAGGGTTGATCTCCTGGAAGGAAAAACTCGAACATAGGGACCATGCACATCGCTCCGACATTGAGGAGAAAGGAATAACTCAGGACAAGATCTTCAACCTCATCTGCCTCTCCTGGGTCCTCAAGGGTCTGAGATACGGAACGTGGGACACCGACGCTCAATCCATTGTAGCTCAAACGGTGTACATCACTCGAGGGCCAAAGCTCTGTCCATTGGGGGAGAAGCCCAAGCGCATCTTCGCATCATTCAAACTACAAAGCGGAAAGCGAGTTGAAGACGCCAAAGGATTCCTGAGCGCACTGCTTCACCTTGAGGGCTTCTTTCCACTAGGCGAACAATAGGTACACTCCAGCAGCACCCAGTGCCAGGGACCAAACTCCCAGATACAAAAAAATGGCTCCCGACTCCCATGGCAAGGGAACCAGCCACCGTCCTCCGCCATTAAAAACCTCCTTTAACTGCCTTTTGAGAACCCTTCTGTTACTTTTTTTAT
57,704
MK829690.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Zamperin,G., Lucas,P., Cano,I., Ryder,D., Abbadi,M., Stone,D., Cuenca,A., Vigouroux,E., Blanchard,Y., Panzarin,V.
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie, Department of Comparative Biomedical Sciences
Italy
2019-11-26
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,116
GenBank
1
Italy
Italy
Oncorhynchus mykiss
null
2001-03-27
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain IHNV/O.mykiss/I/TN/139/Mar01, complete genome
AAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTTACTGAAAACAAAACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCTAAGACAGAATTTGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGGCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCTACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGACGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGCGAGTTGGTTAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATTATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACCTCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCTTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGACCAGACATGGGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGATTCATTCCGCTGAACACAAACAGCTCCCCCCTCTTTCCTCCTCTCCCTCCCCTCGACCCATCCAGATGTTCACTCCACCCTGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAAGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGACTCAAGAGGAACCAAAGAAAACCACCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAAGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAATTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCACAGTCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCTCCAGGATCCCGGCTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCTATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCCCACCTCCTTAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAGTCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGTTCTCGGAAACCAGAACCTCAGACCACCTACCAGGTAATGAAGGCGAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCCACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCCAGACCTTCGCCACTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCGACCATGCCGCCTCTCACTCACCCATCCATCGGCCGACCCAACTCTCCTCCATCACCAGAGTCCCTCCACTCCTCACTCCGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAACAACGGACACCATGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACAGTCAAACCGTCAAACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTATCCCACATCCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGGCGATTCACACCCAAGGGAACCACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTATAGAAATGAAACTCTCTACGAAAGAAGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACTGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTCATTGGAGGAAAATGCGCCAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCAGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACAAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCAGGCCTGTATGATTGAATTCTGTGGGAAACCGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGAATACAATTCTGGAGCAGAAATCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAAGACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCTATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCTAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCACGCTACCAGTTTCACGAAATGGGGACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAATACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCCTCTACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACCTCCCACTCCCTCCGCGTCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAGGACCTCAATCCTCACTTCCTCCCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGAGATAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTCGCGATGTCATCAACGCACTGATTTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACAAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGCACAAGGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCAACGACAGCACCCCATCACAGAA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57,883
MK829692.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Zamperin,G., Lucas,P., Cano,I., Ryder,D., Abbadi,M., Stone,D., Cuenca,A., Vigouroux,E., Blanchard,Y., Panzarin,V.
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie, Department of Comparative Biomedical Sciences
Italy
2019-11-26
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,116
GenBank
1
Italy
Italy
Oncorhynchus mykiss
null
2002-12-30
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain IHNV/O.mykiss/I/TV/3/Dec02, complete genome
AAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGCCTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAAGATGCAGAGACAGAGTATCGTCCCGGTGCGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGAATTTGACCTAGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGCCTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACGGTCCCATCGGAGGCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCTACCTTCGCAGACCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTACGATGTGGACAAGATGGCCACATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGCGAGTTGGTTAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTTAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGGATGACTATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCCGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCAGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGAGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAATATCAACGATAGGTATGACGAGGGGACCTCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGACCCTTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCTCGTCTYCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCATCTCGGGGGCCAGACATGGGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGACTACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCAGATTCATTCCGCTGAACACAAACAGCCCCCTCCTCCCTTTTTCTCTCCCGTCTCTCGACCCATCCAGATGTTTGCTCCACCCTGACTCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGACGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGGCGAAGACATACTGAGGCTAGAATCCCGCCTGAAAAACCCCCGGAATGACGGGCAAATCGGCAAGAACCCCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCCAAAGAGGAACCAAAGAAAACCACCAGGAGACCCGACAAAAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGAATTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATTTTGTCTGCGGTAATTGCTATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCTCAGTCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGATCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCTCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACCTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATGAAGCAAGGTCAATAGACATCCTCCTCCAGGATCCCGGCTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCCATTTTCAAGAGAGCAAAGAAAACAGTTCTGATCCCTCCTCCCCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTTACAATACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAATCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTCAACTTCGGATCTCGGAAACCAGCACCCCAGACCACCTACCAGGTAATGAAGGCGAGGGAAATCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTCTCATCCAGCCATGTAGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTTGACGGGTTCACAACCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCCTGACCTTCACCGCTCCCGAAAAGCGGGGGAAGGAAAAATAGGAGTCGACCATGCCGTCTCTCACTCACCCGTCCATTGGCCGACCCAACCCTCCTCCATCCCCAGAGCCCCTCCACTCCTCACTCCGTCCAAGACAGAAAAAAACGGCACTTTTGTGCTTCGAGACAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAACAATGGACACCACGATTGCCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACAGCCAAACCGTCAAACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGGCAAACCCGCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTATCCCACATCCATCCGGTCCCTGTCGGTCGGAAACGACCTCGGGGCGATTCACACCCAAGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATCGAGAAGGCGCTTGTGGAAATGAAATTCTCTACGAGAGAAGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACCGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTATACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTTATTGGAGGAAAATGCACCAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGAAGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGGGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCGGGCCTGTATGATTGGATTCTGTGGGGGGCAGTGGATACGGACGGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGTGTACCAGTCTGGAGCAGAAACCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAATACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATTTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCACGCTACCAATTTCACGAAATGGGAACGGCCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGATTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAATACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCGATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCACCCTGGCCCTCTACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCCGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGTTCTCCTCCTTGTTGTTGCCGCGTGCTGCTGCTGGTCAGGGAGACCTCCCACTCCCTCCGCGTCGCAGAGTATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAGGACCTCAATCCTCACTTCCTCCCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGAGACAATGGACCACCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACAAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGATATGGCGTGAAGAGGACGACGCAACGTGGAGGCGACTTTGCGATGTCATCAACGCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTGGATCTCCAGGGGACCAAGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCCAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCCGTAACGACAGCACCCCATCACAGAA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57,884
MK829693.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Zamperin,G., Lucas,P., Cano,I., Ryder,D., Abbadi,M., Stone,D., Cuenca,A., Vigouroux,E., Blanchard,Y., Panzarin,V.
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie, Department of Comparative Biomedical Sciences
Italy
2019-11-26
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,111
GenBank
1
Italy
Italy
Oncorhynchus mykiss
null
2005-05-30
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain IHNV/O.mykiss/I/TV/310/May05, complete genome
AAGCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAGGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGAATTTGACCTGGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGACTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACAGTCCCGTCAGAGGCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCTACCTTCGCAGATCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCGCATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGCGAGTTGGTTAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTCAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCTGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCCGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGATGGGACCTCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGAACCTTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCCCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCCTCTCGGAGACCAGACATGGATGATGAAGAGGAGGAGGACGAGGAGGAAGACGACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGATTCATTCCACTGAGCGCAAACAGCCCCCCCCTCTCTCCTCTCCTTCCTCTCCCGCCCCTCGACCCATCCAGACATCCACTCCTCCCCGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGACGAAGACATACTGAGGCTAGAGTCCCGCCTAAAGACCCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAAGAACCGCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCCCAAGAGGAACCAAAGAAAACCACCAGGAGACCTGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATCTTGTCTGCGGTAATTGCCATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCACAATCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGACCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATTAAGCAAGGTCAATAGACATCCGCCTCCAGGATCCCGGCTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCCATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCTCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTGACAACACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAAGCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTTAACTTCGGCTCCCGAAAACCAGCACCTCAGACCACCTACCAGGTAATGAAGGCGAGGGAGGTCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTGGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTGGACGGGTTCACAATCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCATGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAGCGTGGGAAGGAAAAGTAGGAGTCGACCATGCCGTCTCTCACCCACCCATCCATCGGCCGACCCACCCCTCCTCCATCCCCAGAGTCCCTCCACCTCTCACTCTGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGATAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAGCAACGGACACCATGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACAGCCAAACCGTCCCACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCTCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTACCCCACATCCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGAATATTCATACCCAAGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAGATGAAATTCTCGACGAGGGAAGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACTGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTCATTGGAGGAAAATGCACCAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCGGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCATGCCTGTATGATTGACTTCTGTGGGAAACCGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGAATACAATTCTGGAGCAAAAACCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAAGACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCTCGCTACCAGTTTCATGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGGTTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAGTACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCAATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCCACTACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCAGCGTGCTGCTGTTGGTCAGGGAGACCTTCCACTCCCTCTGCGTCGCAGAGCATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAGGACCTCAACTTTCACCTCCTCTCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGGGACAATGGACCATCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACGAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGCATGGCGTGAAGAAGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTTGACCTCCAGGGGACCAGGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCAACGACAGCACCACATC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57,885
MK829695.1
Infectious hematopoietic necrosis virus
Zamperin,G., Lucas,P., Cano,I., Ryder,D., Abbadi,M., Stone,D., Cuenca,A., Vigouroux,E., Blanchard,Y., Panzarin,V.
Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie, Department of Comparative Biomedical Sciences
Italy
2019-11-26
null
Novirhabdovirus salmonid
Novirhabdovirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
11,122
GenBank
1
Italy
Italy
Oncorhynchus mykiss
null
2005-05-30
null
null
Infectious hematopoietic necrosis virus strain IHNV/O.mykiss/I/TV/310-3.4/May05_L.2, complete genome
GTGCTCAGAAGGACACAAGGACAGAAAAAAGAAAAAGGTGGCACTTCAGTTGTAACCTGATAACGTGCTTCAGACACTATAAACCGAGACAGAACAAGCAGAACTATTTTCACTGAAAACAACACCTGAGAGACAGAAACGGATCACGAACGATGACAAGCGCACTCAGAGAGACGTTCACTGGACTCAGAGACATCAAGGGGGGAGTCCTCGAGGATGCAGAGACGGAGTATCGTCCCGGTACGATAACCCTCCCTCTATTTTTCTCCAAGACAGAATTTGACCTGGAGATGATCAAGCGGGCGGTGAGTCAAGTCGGAGGAGAGGGAACGAGAAGGGCATTGGGACTCCTGTGCGCGTTCGTCATTGCAGAGACAGTCCCGTCAGAGGCAGGTACGGTCGCCGAACTTCTGGAAGCCCTGGGCTTCGTGCTGGAGTCTTTGGACACTGGGGCACCACCAGACGCTACCTTCGCAGATCCCAACAACAAGCTTGCAGAAACGATCGTAAAGGAAAATGTCCTTGAGGTTGTGACCGGCCTCCTCTTCACCTGCGCCCTACTGACAAAGTATGATGTGGACAAGATGGCCGCATACTGCCAAAACAAGCTCGAGCGTCTTGCAACCAGCCAAGGGATTGGCGAGTTGGTTAACTTCAACGCCAACAGGGGAGTCCTGGCCAGGATCGGGTCGGTGCTCAGACCCGGACAGAAGCTCACCAAGGCTATCTATGGGATCATTCTCATCAACCTGTCCGACCCAGCCATCGCTGCCAGAGCCAAGGCACTGTGCGCCATGAGACTGAGCGGGACAGGAATGACAATGGTGGGACTGTTCAACCAAGCCGCAAAGAACCTGGGCGCCCTTCCAGCTGACCTTCTAGAGGATCTGTGCATGAAGTCAGTGGTGGAGTCCGCCAGACGCATTGTCAAACTGATGAGGATCGTAGCAGAGGCCCCCGGGGTAGCAGCAAAGTACGGTATCATGATGAGCAGGATGCTCGGGGAGGGGTACTTCAAGGCCTACGGGATCAACGAGAACGCCAGGATCACCTGCATTCTCATGAACATCAACGATAGGTATGACGATGGGACCTCGAGAGGACTGACAGGGATAAAGGTATCCGAACCTTTCAGGAAGCTGGCGAGAGAGATCGCCCGTCTCCTTGTCCTCAAGTACGATGGCGATGGCTCAACCGGAGAGGGGGCGTCCGAGCTGATCCGCCGGGCGGAGATGGCCTCTCGGAGACCAGACATGGATGATGAAGAGGAGGAGGACGAGGAGGAAGACGACTCCAGTGAGCCAGGAGACTCCGATTCATTCCACTGAGCGCAAACAGCCCCCCCCTCTCTCCTCTCCTTCCTCTCCCGCCCCTCGACCCATCCAGACATCCACTCCTCCCCGACTCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTATAGTGCTTTTCAACTCAAACCACAACAATGTCAGATGGAGAAGGAGAACAGTTCTTCAACCTAGAAGACGAAGACATACTGAGGCTAGAGTCCCGCCTAAAGACCCCACGGAATGACGGGCAAATCGGCAAGAACCGCAGGCAACGGAAGGAGGACCAGGCGCCCCAAGAGGAACCAAAGAAAACCACCAGGAGACCCGACAAGAACAAGGGTCTATCTCAACTGGAGCAACTCATCCTAAAGTACGTTGAGGAGGAGAGCTGTCAGGATGCCCTGAAGGACTTCGGAGGTCTAATTGCCAACATCAGACAGGCCCACCAGGCCGAACTGACATCTCACCTAGAAAAGGTTGCTACGGAACACCGAGCCAATCTTCAGGCTCTTACAAAGTCCCAGCAAGAGCACGAGAAAGTCTCGAAGGAGATCTTGTCTGCGGTAATTGCCATTCGGTCCAACCTCAACGAGAACCACAATCCCCGGCCCAAGCCACTCGACCCGGACCAGGTGAAGGCCGCTCGTGCCCTTGGATTCGGAATTGGGTATCGAACGGCCCTCAATGTCTTCGACCGAATAAAGGGAGTCACCCCAGACAACGCAGGATCCCAAGAGGTGAAGAACATGGCCATTCGGGCGGCGGAGGAGGATGAATACGAGGGAAGTCCCACTTTCTTCAGGAAGGTGATAGACGCCGTAAAGAAGCGCATTAAGCAAGGTCAATAGACATCCGCCTCCAGGATCCCGGCTACCAAGACAGAAAAAAATGGCACGCAAGTGTATCGTTCCAAACGAAATCCAAGAGTCAGTTCAAACGAGAGCATGTCCATTTTCAAGAGAGCAAAGAGAACAGTTCTGATCCCTCCTCCTCACCTCCTCAGCGGAGACGAGGAGAGGGTGACAACACTCAGTGCAGAGGGGGAGATCAAGGTGACTGGAAGAAGACCAACCACACTTGAGGAGAAGATCTATTACTCTATGAATCTGGCGGCTGCCATCGTAGGGGGAGATCTACACCCCTCATTCAAAGCCATGACCTATCTGTTCCAGAAAGAGATGGAGTTCGGAAGCACCCAAGAAAAGGTTAACTTCGGCTCCCGAAAACCAGCACCTCAGACCACCTACCAGGTAATGAAGGCGAGGGAGGTCTACCTTCAGACCCAGCCTCTCGAGAAGAAGATCCCAATGCAGACCTACTCAGTCAGCACAGAGGGGGCTACCATCACCTTCACAGGACGGTTCCTGTTTTCATCCAGCCATGTGGGTTGCGACGACAACAGGACCAAACTGGCGGGGCTGGACGGGTTCACAATCTCCAACAGCTACCAGAGGGTCAAAGACTACTATGCCCAGGAGACAGCCCTGGCCATGACCTTCGCCGCTCCCGAAAAGCGTGGGAAGGAAAAGTAGGAGTCGACCATGCCGTCTCTCACCCACCCATCCATCGGCCGACCCACCCCTCCTCCATCCCCAGAGTCCCTCCACCTCTCACTCTGTCCAAGACAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCTTTGAGATAGAACGCAACTCGCAGAGACCCACCAAAGCAACGGACACCATGATCACCACTCCGCTCATTCTCATTCTGATCACCTGCGGAGCAAACAGCCAAACCGTCCCACCCGACACCGCAAGCGAATCAGACCAACCCACCTGGTCAAACCCTCTCTTCACCTATCCCGAGGGATGCACTCTGGACAAGCTCTCCAAGGTCAATGCCTCTCAACTGAGATGCCCAAGGATCTTCGACGATGAGAACAGGGGGCTAATTGCCTACCCCACATCCATCCGGTCCCTGTCAGTCGGAAACGACCTCGGGAATATTCATACCCAAGGGAACTACATCCACAAAGTCCTGTACCGCACCATCTGCTCAACAGGGTTCTTCGGGGGTCAGACGATAGAGAAGGCGCTTGTAGAGATGAAATTCTCGACGAGGGAAGCAGGGGCGTATGACACCACAACCGCAGCCGCTCTGTACTTCCCAGCTCCCCGATGCCAATGGTACACTGACAACGTACAAAACGATCTCATCTTCTACTACACAACCCAAAAGAGTGTTCTGAGAGATCCCTACACCAGAGACTTTCTGGACTCAGATTTCATTGGAGGAAAATGCACCAAATCACCCTGCCAGACTCATTGGTCCAACGTAGTTTGGATGGGTGATGCGGGGATACCAGCCTGTGATTCCAGCCAAGAGATAAAAGGTCACCTCTTTGTTGATAAAATCTCCAATCGAGTCGTGAAGGCAACGAGCTACGGACACCACCCCTGGGGACTGCATCATGCCTGTATGATTGACTTCTGTGGGAAACCGTGGATACGGACAGATCTCGGTGACCTAATATCTGTCGAATACAATTCTGGAGCAAAAACCCTCTCGTTCCCGAAGTGTGAGGACAAGACTGTGGGGATGAGGGGAAACTTGGATGACTTTGCCTATCTAGACGATCTTGTGAAGGCCTCTGAGAGCAGAGAGGAATGTCTTGAGGCGCACGCCGAGATAATATCAACAAACAGTGTGACTCCATACCTCCTATCCAAGTTCCGATCTCCACATCCCGGAATAAATGACGTCTACGCTATGCACAAAGGCTCCATCTATCACGGGATGTGCATGACGGTCGCTGTGGACGAGGTATCCAAGGACAGGACAACTTACAGGGCCCATCTCGCTACCAGTTTCATGAAATGGGAACGACCCTTTGGGGATGAGTGGGAGGGCTTTCACGGGTTGCACGGAAACAACACCACCATTATTCCAGACCTGGAGAAGTACGTCGCCCAGTACAAGACGAGCATGATGGAACCAATGAGCATCAAATCAGTACCCCATCCAAGCATCCTGGCCCACTACAATGAGACAGACGTATCAGGGATCTCCATCAGGAAATTGGACTCATTCGACCTTCAATCACTCCACTGGAGTTTCTGGCCCACAATCTCCGCACTGGGTGGGATTCCCTTTGCTCTCCTCCTTGCTGTTGCAGCGTGCTGCTGTTGGTCAGGGAGACCTTCCACTCCCTCTGCGTCGCAGAGCATCCCCATGTATCACCTGGCAAACCGGTCCTAAAGGACCTCAATTTTCACCTCCTCTCCACCAGACAGAAAAAAACGGCACATCTGTGCTGCAAAAAGGGACAATGGACCATCGCGACATAAACACGAACATGGAGGCACTCAGAGAAGTTCTGCGATACAAGAACGAGGTGGCCGGACACGGCTTCCTCTTTGACGACGGAGACCTGGTATGGCGTGAAGAAGACGACGCAACGTGGAGGCGGCTTTGCGATGTCGTCAACGCACTGATCTCCTCCAAGAGGATGCAGCGAGTATTGTACATGGACCTCAGCATCACCAAGGGCGAGGGGCATCTACTTTTTGTTGACCTCCAGGGGACCAGGAACCGCCTGCACAAAGAACCCCGATTCAGGAGACATCTGATCCTGATTGAAGACTTTCTTGCTTATCCTAGATAGAAAAAAATGGCACTTTTGTGCAAAAAAACTCAAGCGCGACTCACAGAGAACACAACCAGCAACGACAGCACCACATC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57,886
OQ709403.1
Inoviridae sp.
Cao,L., Wang,X.
Jiangsu University, School of Medicine
China
2023-05-02
SHuIno3-2
Inoviridae sp.
null
Inoviridae
ssDNA(+)
9,351
GenBank
null
China: Zhenjiang, Jiangsu
China
null
feces
2019-12
SAMN33735046
PRJNA944100
MAG: Inoviridae sp. isolate SHuIno3-2, complete genome
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Jiangsu University, School of Medicine
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Jiangsu University, School of Medicine
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16,242
MW202693.1
Inoviridae sp.
Malki,K., Breitbart,M.
University of South Florida, College of Marine Science
USA
2022-04-10
ctcp9890
Inoviridae sp.
null
Inoviridae
ssDNA(+)
6,466
GenBank
null
USA
USA
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null
2019-01-01
null
null
Inoviridae sp. isolate ctcp9890, complete genome
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31,433
MW202882.1
Inoviridae sp.
Malki,K., Breitbart,M.
University of South Florida, College of Marine Science
USA
2022-04-10
ctiKU136
Inoviridae sp.
null
Inoviridae
ssDNA(+)
5,531
GenBank
null
USA
USA
null
null
2019-01-01
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null
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31,472
MN855892.1
Inoviridae sp.
Deboutte,W.
KULeuven, Microbiology and Immunology
Belgium
2020-04-09
381
Inoviridae sp.
null
Inoviridae
ssDNA(+)
6,503
GenBank
null
Belgium
Belgium
null
null
2013
SAMN13135928
PRJNA579886
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52,735
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Deboutte,W.
KULeuven, Microbiology and Immunology
Belgium
2020-04-09
382
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Inoviridae
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6,496
GenBank
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Belgium
Belgium
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null
2013
SAMN13135928
PRJNA579886
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Belgium
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USA
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USA
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2017-06-01
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Inoviridae sp.
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National Cancer Institute, Lab of Cellular Oncology
USA
2018-08-05
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Inoviridae sp.
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Inoviridae
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USA
USA
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null
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National Cancer Institute, Lab of Cellular Oncology
USA
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ctbh31
Inoviridae sp.
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Inoviridae
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USA
USA
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null
2017-06-01
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69,457
MT135284.1
Inovirus sp.
He,B., Tu,C.
Military Veterinary Institute, Virology Department
China
2021-02-23
VIRES_GX01_2265051
Inovirus sp.
Inovirus
Inoviridae
ssDNA(+)
5,343
GenBank
null
China
China
null
null
2017-04
null
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UNVERIFIED: Inovirus sp. isolate VIRES_GX01_2265051, complete genome
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43,932
MT135287.1
Inovirus sp.
He,B., Tu,C.
Military Veterinary Institute, Virology Department
China
2021-02-23
VIRES_GX05_2265092
Inovirus sp.
Inovirus
Inoviridae
ssDNA(+)
5,617
GenBank
null
China
China
null
null
2017-04
null
null
UNVERIFIED: Inovirus sp. isolate VIRES_GX05_2265092, complete genome
TTTTGGCAACAGGCAACAACGATTGCCTTAGACGTAGCCCGGGCAATCGTTGCCAAGTGGGGAAAACAGCCCCAAATGGCAACGCCCAGACGAAAGAAAAAAAGGAGACGGGAAGGAAAACATCCGCGCCGCTGCGGCGCGGGGATTCTCATACAAGAGGGCAAATATGCAAGGAAGAGAGTGCCTGCAACGCCCGGAAGACAGCTAGAGAAAGAACTGCCAGCGGGTGCGCGAGGGATTCTCAGACATGCCAGCCGCTTCGCTCTGGCATATCAAAGACTATCAACTTCATGCTGAATGTGACGCAGCCGTTCAAGAACCTCAGAATAAATGCTATAAAGCCCATCTAAACGGCGAGAAAGAGAAGCAAGAGAGGATTCCATACCAGGAACACGCTTGGATGTCTCAATAAGAGTCATAAGCTCAGACAAACTAATAGTGATCTGCAAATCATCCATTAGAAATAACCACCATTATAAAGAAATTCAATGAGAATCTGAGCAGCAGCAGCATCCAGCATGGAAATTTGCTTTTCTTCCATATAGCGCTCCAAAGCAGCCTGCATGGAAGAAGTCAAACAAATCTCAATGTATTTTCTCATTACACAATACGGATTTCCTCAACAGAACCATAGCGATTATAGACGCAGGAGATCTCAGAGCCAATCTGCAAATCACCGGGGACAAGATCAGCTTTCACAAAGAGATCAAATGCCGCAACGCCGACAACCTGATTCCGTTCCTCAGTGCAATACAAATTTGCTGCGGGGTAGGTATTACCAGTCTTTTTACTAGTATACTGAAATTTTCTCATACCAACAACCTTCATAAAAAACAGTCCTTTCAAAATAAAATAAATACATTCAATAAAATGTTCTAGAAAAAAGATACACCCAAAAAAACAAGGAGTCAAGAGAAAAATGAATAAATTGAAAACAATCAGAAAAATGAATAAAATCGAACAGGTAAAATTGGCAAAAGTGATGAAAAAAACACAGCAAAATAATCAGAAAAGGGGACCCGCATATTTTTAGCGGGTCCCCTTTTCTTTAGCGACTATCTTAAATTGTATCCGGCGAGCACACAAAAGACCGCTGCCAAAGCCAATAGAAAGCAAAGATAAAGCAAAAGCAAAGAATCCGGCAAGACCAACCGTGAAGAAAGATAAAACCAGAAGCAACAGCCCAAGACCAATAAGACACCAAGAAACCATAACATTTTATTCCTCTCTGTCACGTCTATGACGCTTCATAGTACGGCGAACATTTTTATCGGTAAGATCAGCCACAACCTCTGTAAAAGGCATAGGAGGTCGCTCAGGGGCTGCGAAACTATCGAAATATTTGAAATACTTTGGAAGATAAGTAATCTGCCACTTAAAAAGAGACTCAAACTTGAGACGATCTGCAATCCTGCTTTCAGCCTCAGCTGACGGCTCAGTAAGAGTGATAGACCGGCGAATAGGACGATAGATAGAAAACACATTACCGATAGAAACCATCAAACCCATTTGATCGGTGACATCACGAATCTTCTTGTCAATATCAAAAGACTGAGAGTTCAAAAAGACACGACATTTGTACTTTCGTTGAAGCTTAAAAAAATCACGAAGACCAGAATTAAAGTTTTTGAAATTGCGATTATCAAAGAGAATACCAGCTTCATCGAGGAAAATAGCAGAATTTTCCTCAGGCGCGAACTCGGACAAATCCATAGCTTTCATGATACGGACACCGGGCAAATTACAATTATCAATGTCAGTATAGACAGTCCATCCCTTTTTGAGATAACGAATCATCTGCTTGACCATATAAAGAGACTTGCCGGCACCTTTTTTTCCGAAAATAAAAATAAGGCGATAAGGATTATTGTACCGGCGAGACTGAAAAGAGAACCAGATAAAGAAAACACCACAAAGAATCAAAAAAATAGTCATAATTAAAAAAAGAGGGGCGGGAAGCCCGCCCCAAGTCGAAGGTTAAACACGAATAAGGCGGTTAATAACGCCAATGCCAGTGCCGATCAGAGCGACCAGCACGAAGCCGAGAATCAGCTTGTTATCGGTAATAGCACCGACAAACTCGCCAACCCACGTCACGGACGAAGTGACCCAGCTACCAATATCGGTAAGCATGGTCTGGATAGAATAAGCGGCAGAAGTAGACTGAAAAATCACACCTTTCAAAAAAAATTATTTAATATTCATTAAACGAGCAATAAGCCCGATAATGGCAAAAGAGAAGAAAAAACCGACAAAATAGCAGACAGGTTCAGCCATCAAAAATGTAGGTACCTGATCTATAAACCAGAGGCAAAAGTCTTTCATACTTTGCATAACAGCGCACCCCCAGCTTTGAAAATACAGAAAAGAACAACAATGAGAAGGAAAAGCGATGCAAGCCAATTTGCATCATAATCAAGCTGTTCAGTGACATAACCAATACGATCATAATCACTAGAAGTACGAACCTTATAAGTATAAGACGTTACCGGTTTGCCAAGTAATCCATACAGAACAGCAAGTAAAGTGCCAGAAGAAGCGTCAGGAGCATATTCAATATTTATAAGCTCAGGTTGGATATAAGACAAGCCAGAAGTTGGCACACTCGCCGCCGCAAACAAAGCAGGTTGCGAACTGCGCGATTCCGACCCCGAGGCGAACGAAGCAGCTTCCAGATGTCGCGAATCTGATTCACTATGAAGATCAGCAGAAACAGAATCCCCGACAGACAAAGAAGATTTATCGGGGACAAATTCAACAACTCGGGAATCTTCTGATTCAGCATTTCCGGATTTTTCAGAAGCAGCAAGTTTTGCATTATAATCATCCTCATCTATATGAATAGGGTAAAGTTCTTCCGTACCACCATATGAATACATTCCGAGCCAAATATTATGGTTTTCTTCCGTATCCTTAAGATCATAGAAGAAAAGCCAAGGCTCATACATCAAAATGATTGTATTACCAGCAAAAGCAGAAATTGAAAGCGTCAACAAAAGGAAGACACAAAGAAAAATACAAAAAAATCGTTTCAATCAGAATCACCAACCTTCCGAGAAGAACCACCGCCAGAAGCATCAGGCGTATTGAGCAGACGCTTAAAAAGACGGATAAAAACAGGAATCAAAAGCAGGAACAAAGCCCATGCAATAGGGGTTACATTAGTACCAGGCAGTTTCCAGCCATTAAAAAGCTTCCAAATATGAGCAAAAAAGCCGGCAAGAAAAGTAGAAGCCTCAACAGTCATACAAACACCCCCTTACACAAAAGGCAGCGCGTCAAGAATCGTCTTAATAATCTTGAGAATGAACATCACAAGAATAAAGGCAAAAATGACAGAAAATGCAATCCAAACCCACGAAGGAAGAAAAGCAAAAACAAACTGCAAAGTCTGAATGAAATTACTCATTTAATCCAATCCTTTACAACATAATATAGACCGACAACGATGAAAGCACCAAGAACCCAACGAACAAAAGCGATAATAGACGGGGGCAGAACATTCCACATCTGCAAAAACAGATTCATAGAAGGCAAAAGAGAGTTAATCATAATAACCACCTACAATCTGCGCCCAATTTTCGGAATAGGCATCAACAATCCGCTGCTCAGGTGGAACATAGGCGGGAGCGCGAGAAGAATAAGAAGAAGAGGAAGAATTACCATTGATATCATCAGAAACACCCTGCGACCAAAATTCATAACTGTTATCATTGACAGCAGTAAAACCATCAGCAATAGTAGAATCCGGTGCACCTGCAAAAGCATCCTTAAAAGCAGAACCAGTATTATTCAACTTGTCATACTTATCAGAATCAGCCTTGTCACCAGAACCATTAAAATAATTTTTCACCCAGTCGCGCTCAGAGGTTGTAGCATCCTTAATTGCAAGATCTTCGTCATTAGCAAGAACAGAGAGAATCTGGTTAACACGATAATTCAAATAAGAGAAGTCAGAAGAAATAGAACCATACCAAGAACCAGAGACATCGTTATTCCAAAGCTTATTGCCCCAGAAATAATTATAAACAGAAGTACGATAAAGCATATCAGCCCAAGAACCTTCCTGTTCAGCCAAAACAGAAAACTTAGGTAAACCAGTCTGAGGGTCAATAGACCATTTCCATTTTTGATAGGTCAAAGAAGCAAGCATTTTAGTTCTTGCATAATAACCAGGAAGTTCAGCTTCGGTAGTACCGACAACAACGTCAAGATGTCCAACACGATCATAGCCAGAGCCATTAGTATACCAATGTTCCTGCTCAAGAAAACGAAGGGTAAAGAGAGTCTCACCAGTCCAACCGAACATAGAACCAGTACCAGCATAAGGGTCTTCAGGGTCAGGAGTAGAACCACCACCAGAACCAGAAGGAGTAAAAGAGGATGAAAAGGTAGCAGAAGAAGAAGAACCAGAAGGAAAAGACTGAAAACCAGATAAAGCAACTTTAACAGGGTTAGTAGAACCATCAGAAACGATAGTTAAAGTAGAACCATTAGCAGAAACAGTTACACCCTGAGAATCAGAAGAATAAGAAGGAACACTACAAGGAAAATTGACAACAAGAGTTCCAGCAGGAATAGTGGCAAGTAAAGGATTATAAGAAGGAAATTTCAATCCAACAACTTCATAATCACGAGAAAGAGTGACAGAAGGCTTAGAAGAAGACATAGCAAATTGAGCATTTCCAAGAGTATCAGTGCCATTAGACCAATAAGAATTTACAGTAACAGCATATTCACCGTCAGAAATAGTAGAAACACCATAATCAGACAAAGAAGAGTGTCCAAAAGTATCAAAATTATCAGGGTCAACAATTAAAAGATCATCAGCAGCAAAAGCAAAAGAAGAAAGGAGACAAAGACAAAGAAAAAAAATAAGCAGCTTTTTCAAAATCTGATAAATCATCCTTTCATAAAATGGTTGCGGGTGACCGAATCGAACAGCCGGCTGCAGGTTCAGAGCCTACCGTGTTACCACTACACCAACCCGCGATATATAT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43,933