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|
China
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China
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China
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|
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Inovirus
|
Inoviridae
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China
|
China
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2017-04
| null | null |
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Inovirus sp.
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Military Veterinary Institute, Virology Department
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China
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Inovirus
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China
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China
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2017-04
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| 43,946
|
MT135314.1
|
Inovirus sp.
|
He,B., Tu,C.
|
Military Veterinary Institute, Virology Department
|
China
|
2021-02-23
|
VIRES_ZJ01_2311516
|
Inovirus sp.
|
Inovirus
|
Inoviridae
|
ssDNA(+)
| 7,970
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null |
2017-04
| null | null |
UNVERIFIED: Inovirus sp. isolate VIRES_ZJ01_2311516, complete genome
|
TATATTCGTTTGATGGCCATAGGATGTTCATTCTGATGCCTGTTAGCATGTTGTCCATGCATATTTCTCTGGTACTTCGTTTTCTATTAATGACGTTTTTGCGAATTTCGATGGTTTTCATTGGTGGATAGAAGGTGATAGATTTTATTTCTTCTCTGAACGTGACGCCGACTGGGTGCGTGTATATGTATCCTACAATCATTATAACAACACTGCTCAAACTTACTATAGTAACAACACTCCACCTCGTTCGGATGAGCCTGTTACTTTGTCTGATATTCCCCCTAATATGGATGCTGCTACGGCTCAGGATATTCTTACAGCACTTAATAATATTAATAGTTCTGTGTCTACTGCTGATTCTGAAGCGCGGAAACGTCTTGAAGCTATCAATAATACACTCAACAATAATTACAATGATTTGACGCGGCCTCCTGATTCTGCCGTTTCTTCTGCTAGTGATTCTCTTTCTGATACTTCGGATGTTGAAGCCGCTACTGGTTTGTTTACCTCTATTGACAACTTGACGCAAGGTGTATTTAATTGTTTTTCTAATCCCGGGAGTACCGAGCTTATTTTTCCGGGTTTTGGTTTAAATATTGACGGTGTGTCTTATAACGTCTGGGAAGATACTGCATACAATCTATCAGACATTGATGATAAGTTTGGTGGTCTTATGTCTGCTGTTCGATTTGCTACAACGCTTCTGGTTTACCTTGCTTTGATACGGTACCTTGTTGCCACTTATAATAGGATTTTCGGTGGGGGTGAATAGTATGCTGACTTTAATACAGAAACTTGCTCATCTTTGTCTTGCTCCGTTGATTGCACTCTTTGACTTTCCTATCGTCCCGGCCGAGTTGACAATGCTTGTGAACAAGCTCTTTGAGTATATTCAGGCTGGCACCGGCATACTGAATTTTTTTGTCCCGTTCAACGTGATCCGACCAGCTATTGATGTGTTCCTTGCTGTGTGGGCTATTGAGCACGGCTACGAGCTTGTTTTGTGGGTGCTCCGGAAGGTCCCGTTGCTGGGTATCAAATGAGAAATGCCGCTCCCGCGGGGCGGCCCGTGGGGCCGCCGCGGGGCGGCAAACTGTTATCTTGATAATATAGAAATAACTGAAGCCAACCGCGAAACCTTATTACTTGCCTGTCCTTTTTGTGAAAAGTATTGAAAAAAGAGACCGGGCCGTTTATAATAAGAGTATGCCACTACACTTAAAATAACGGGGGTCTCTTTGCATGTTATATGATACAACTTCTTTGATGAAATGTCAAGCGAAGAAATATGCTGGTCTTAATTTCTCGCGAAAAATTCGTGTTGTTGCTCCTGACATATCTTCTAAAATATGGTATTGTGGTACTTCTATCGGTCTTACTTATGATGGATTGATTGCTTCGGCTAATTTTTGTAAAAACCGTTTCTGTCCTACTTGTCAGTGGCGCAGGTCTGTCAAGCTTTTTCGGCAGAATTACGAGTGTTTTGAATGGGTTAAGTCAAAGTATCCGGGTTGCCGTTTTGTTTTTCTGACATTAACTGTTCGTAACGTTCCGATTGATTCTCTCGCTTCTCGTCTTTGTGATATGTCTGAAGCTTGGCATCGTTTTACCATGCGGCGCGATTTTAAGTCTCTGGGTTTACTTGGATGGTTGCGTGTTCTAGAGGTTACTCGTAATTCTCAAACTGGTACATACCACCCGCATTTTCATGTTGTTCTTGTTGTTCCTGCTGGTTGTTGGCTTCCTGATCATGATTGGTGGCTCCGGTGCTGGAAGCTGGCGGCTCGAGATGATTCTATCATGTTCGTTAATCTTCGCGTTGTTGATGGTTCGAAGTCTTCTATCGAAGAGGTTTCAAAGTATGTTGTTAAAGATTCTGATTTTTCCGGGTCGGCTTGGGTTCCTGAGTTTCCACAACTCTATAAGGCTTTGTCTCACGTCCGTTTTTTTTGTCCCGCTGGCTGTTGGCGTGATGCTCGGCGCGCGTTGGGTTTTGTCGATCCGGATAAAGATTCTCTGACTGATGATGTGTCAGCTCGCGGGAAGATTAAGGATTTTGTGTATTTGTATAACTTCAAAATGTTCGCGTGTATCGGTTTCCATTAATTTGTCTCGTCAAGTTTGTGCACTTTGCCTTGTTGCGTTTTTCTTTTTTTTGGTATATACTTAGTGTATGAAGGAGGTGCTACTATGGGTGTTACTGTCTTAGGTATTCAGCATAGGACCGGCGAGTTTCAGGGCGTACGTTATGACAATTTCAATTTGCACTGTACTGAAGAAGTATCTGGTGATACTTGGCAGCGCGGAAGTCGCATCACGTATGTGGAAAAAGTCCCCGCCGATGTGTTCTATCAGGCGAATGCCGTCGATCAGATTCTCCCCGGGCATGAATATAATATCGTTCATAATCGTTATGGACGCCCGATTGATGTACAGCTGATTAAGTGAGGTGTTTTCTGTGTCCCCTATTGATGTTCTTTCCGTTTCTGCCGGCTCCCAGATGATTCCGCTGGAGGGACCGTCTACTGTAGTGACTGCCAATGACTGGGCTTCGGTCATTACTGCAATGACTGGTCAGATCTCCGTTTCTACTGTCGTTGCCACCCTTGCGACACTTGTCACTGCCGGTATCGGCCTTGTGTTCATGTGGTGGGGCGTTCGCAAGGCCGTTGGCAGTCTGATGGGTAGTTTCCGTTCCGGTCGGATTCGTCTGTGACTTTCTCTTTTTGTCACTGTCTTTCGGGTCAGTGTGGATAGAAATATTTTCTCTATTTGCTAGGCATTTTTGGCCGGGCCGGTCTGGCCCGGCCATTACTGTTATAGAACTCTTGCCTCGGGGGGCTGGGGGCGCGGCCCCCAGGGTTGCTACACTTTTAAGGAGGTATTACACTTGGATAGATGGTTGGCGGGCCTAAAGGGCACCCTGAATCTTTGGGATGCGCATCGCGTTAAGGTGTATAACAAGGAGTTTCGGGCAGAGCATCCAGAGTATTTTGACCCTGATGGCATCATGGTTTTTTGTGGCCCTCAAGGCTCCGGGAAAACTTTGTCAATGATACAATATGCTTATCGGTTGTCCCTTGCGTATCCTGATATGATTATTTGTACCAATGTTGAGTTACACGATTGGCCCCCCGTGCGTGACATCATTCAATGGGAGGGCATGAAAAGTCTTTCAGAAATCGAAAACGGCTTTGCCGGGGTGCTCTTCCTGATTGATGAGATTCAATTGGAATTTAACTCGCTTGAGTCGAAACAAATTGACCCGTCCGTTATGCAGGAGATTGCACAGCAACGAAAACAGCGAAAGCACATTGTAGGCACTTCGCAGGTGTTCCAGCGCATTGCCAAGCCTTTCCGTGAGCAATTCAAGTATGTTGTCCAGTGCCGGAAAGTGATGGGTGTCTTGCAGTGTAATACTGTCATTGATGGGCAGTCTGCCGTTGTCAATGATGATGGCACGATTCAGGCCGCAAGCGTTAAAACTTATCATTGGATTCACAAGCCGTCACTCTATCAGTTGTATGACACCTATGCCAAGGTGTTGCGTGTCAATGAAGACAGATATGGCCAACAGTATTGGAGGAAATGACCATGAATATTGATGTTACTGAAATTATCGCATTATTTGCTCAACTTGCAGGCCCTGCTTTTTCCGTGGCATTCGTTTTTGGCTTTGGGGCCAAACTTGTCCATTCTTTCTTGTCCATGGGTCTTGATGGGAGGTTTAAGCTGTGATGGAAGATGATATTATTCGTGACGAACAGCTGGAACAAGATTCTATTCCTGAAGAGGTGCTGACTAATGAAGAACAGATGGAACAAGGCGCTACTGATAGTCTTGATAGTATCCTTGCTGGTGTCAATGAGTTGTTGGAGCAATCAGCCAGCTACAGCGCCGTATTGGAAAATGAAGAATCCGAACGCCAAAGCGAGATTATCGCTTACGATAATGGAAATGCCGTGGCTGTATCAGATCTAGATGCAATCGCCGCTCAGGCTGCTAACAGCTCTGTATATCCGGGTACTTGGGCTGGTTCTATTCTTGATTATTTTTCTGCTGTGATGCGCCAAAATCCCGGTAAACATTACGTTGCATTCCGCAATAGTCAGAAGAGTTATTTTTTGTTTTATGGGGATGATTTGACTTTTGCGGATGGAGCTGTCTCTGGTTCTGGTGATTATGTAGAGTACAGTTACAACTATGATAACTATATTGTTACGAGGGGGTATGACAATGTTAATATCAACATTAGCTCCGGTGTTGTCTATACAGATCTTAACCCAGCTTATGGTGCGCTTGAGGGAGCGTCTGAAATTACATTGCAGACGGTACTTCTTGTGTCTGTCCTCGTTTGCCTTGGTTTCTCTCTTCTGTGTCGTATCCTCTTTAGGCGTTAAAGCTGACAGTCCGTCTGGTTTTAATGCTCGGTGGATTTTATCGAATCATCAGTCTGTTAATTATACTCTCGATCCGGGCACATCTGTTTTGCGTGGTTGGACATTTATTCCTGATATGCCTTTGACTAAAGGCCAAGTATACTATGTTCGTAATTCTCCTGCACTCTCCGAGAACGACCAGAATTCTGGTACTTCTTTTTCTATCAACGATGTCTTTGCCAATTTTGACGGGTTTCACTGGTGGGTCGAAGGTGATAGGTTTTATTATTTTTCAGACCGCGATGCTGATTGGGTGCGCGTGTATGTATCTTATAATCATTACAACAACACAACTACACAATGGCATAGTATTAATAACCCGTCTATGTATGTTGAGCCTATTAATTTGTCTGATATTCCAGCCAATTACGATATTGCTACGGCTACGAATATTTTAACAGCTCTCAATAATATTAATAGCTCTGTTAATACCGCTGATCAGGAAGCTAGAAAACGTCTTGAAGCTATCAATAATTCACTTAACAACAATTACAATGATTTGACGCGGCCTTCTGATTCGGCCGTTTCTTCTGCTAGTGATTCTTTATCTGATACTTC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| 43,947
|
OQ363750.1
|
Insectivora picornavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-11
|
SC/C4-29.18b/2021
|
Insectivora picornavirus
| null |
Picornaviridae
|
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| 11,426
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sorex bedfordiae
| null |
2021-08
|
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|
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|
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| 16,737
|
OQ363756.1
|
Insectivora picornavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-11
|
SC/C4-29.18c/2021
|
Insectivora picornavirus
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 10,955
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sorex bedfordiae
| null |
2021-08
|
SAMN32394792
|
PRJNA901878
|
MAG: Insectivora picornavirus isolate SC/C4-29.18c/2021, complete genome
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| 16,743
|
OQ363760.1
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Insectivora picornavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
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South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-11
|
SC/C4-16.18c/2021
|
Insectivora picornavirus
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,432
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Uropsilus sp.
| null |
2021-07
|
SAMN32394789
|
PRJNA901878
|
MAG: Insectivora picornavirus isolate SC/C4-16.18c/2021, complete genome
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| 16,746
|
OQ363762.1
|
Insectivora picornavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-11
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|
Insectivora picornavirus
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
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|
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| null |
China
|
China
|
Sorex bedfordiae
| null |
2021-08
|
SAMN32394792
|
PRJNA901878
|
MAG: Insectivora picornavirus isolate SC/C4-29.18a/2021, complete genome
|
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MAG: Insectivora picornavirus isolate SC/C4-29.18d/2021, complete genome
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| 16,751
|
OQ363776.1
|
Insectivora picornavirus
|
Cui,X., Shen,Y.
|
South China Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-04-11
|
SC/C4-16.18b/2021
|
Insectivora picornavirus
| null |
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,775
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Uropsilus sp.
| null |
2021-07
|
SAMN32394789
|
PRJNA901878
|
MAG: Insectivora picornavirus isolate SC/C4-16.18b/2021, complete genome
|
CAAACTCTACGACAAAGGTCAATAAAAGGCTGAATTCAGTTCGTCTGTCAGTACTATTGATCTGTATTCGCGAATTCAAAGATAACATTAACCACTACAATAGCACAAGTAAACAATCTCGAACGAGAAATATCACAAGAAATATCAATAAAAACATCAATACAAATAATATTAATATCATCACATATAATAAGCACGCAAATAAAGTATATATTAATAAAATCAGTACATACAGTAGTAAATAGAATATATAATAAATATCAGCAAATTAAATTTTTCTTCTTTTCACAATAGAAAATAATTTTAGAAATAGTAGAAATTTGCGAAAGCACCCCGCTCGTTTAGCAATGGACGGTCGTGACATAGCAAAGATCTGTCGTTCACTGGGACGACTTCAATCATACAGAATTAAACCAATAAATAAAAGAAAATTCTATATTACCCCAAAATATAACAATATATTAGAAAAAGGTAGATCTATGCACACAGATTCACCAATTCCTGAATTAATGTACCACTTAGACAAACAAATTTTTATAGAAAAACTTAAATCCTTAGGTATAGAAACAGTAGAAAATCCTCTAGAATATAACAAAGAATATTTACTTTTTTCCACCCCCGTTTTTATGACCTATGCAACCACCAATTTTTCCCCAAATCAGAAAAAGTTTTCAACTATGATTGGACCAGATAATTTACTTCACTTCTTACAGACCCATGAAGCTCGCAGACATTTTAGTAGGCAGCATACCTACTATCATTTCTCAAATGACTTATTCACAGATGTATTCCCTACCAAGATGTTCGCACGAAAGGTCCCTTCTCAGACAGAGAAATGCCCTTTCTTTTGTAGATCGTTCCGTCAAGATTGCTCGTGGCACTCAGGCTGGGACCCAGAATCAGACGAGTCCTGGCGGGTAATTGAAAGACGGCGACAGTTTATGAACACATTCAGAAACCACTGGGACGACTCTGATTTCTGGTGTTCTCTGGTCATGGAGGTGAACCACGAAGAGAACAGGAAGATGGCTGGCAAACACATAGAGACATATAAACAGTCTTATCAAATGTTTTCGGAGTGGGCCAATCAACATGCCCAGAGCGTAGACTGGCAGAAATGGGCAGAACCCTATCCATGGGAAGTGGAGCAAGCCCAAGGAGATAAGCCTGATGTTGTTGAAGAGAAGAAGGATGAGGAGGAAGAGACTTCAAGTCCGGAAGCTTCAATACCAAAGGACTTATACTCCACAATATATTCAAAGCTTTCTACAGTCATGCAGGCTATGCAGGATGCACGTGAACATGTACCAGATTTTATTAAGAAGCACCAAACGAGTATAATAAATATTGTGATTGCTCTTATAAACATGGTGCTTGTTCCCAAGTGGCAAACTATTGGTCTGATGACACTCTTGATAACCAACTGTATCCTTGCTATCTGTGGCGATGAAGTCAAAGCTGCGGTCACTAAAATGATAGAAGCCTTCAAGAAAGTGATGACGAAGTTCTTCTGTCACACAGAGGCCGCACCAACAGCTGCGGATGATTACAAGGCATACAATGAGTCTTTCATAACGTCCTTGTTTGGGCTGCTTTCCTCCGTTGCTCCCTGGGCTAAGGAGGTTGAGCCAGGCATTTACAAGGCACGCATTGAACGAATCAAGAAGTCAGCCCTCGTCCTTGGTACTGCCACATCAATCGTGGCCTTCATTACAGTTTTCCTGGAAAAGATTTGGAAATGGATCCAGATCTGGTGGAAAGGAGGCTCGCGTGAAGATTACGAGGAGGTGGTAGGTATCATAAGCGAGAAGCGCATTGAAAAGTGGATACAGGAAGTAGAAGATTTTGAGTTGCAACCCATGAAAAACGGTACTTTGCAATCAGGCCTTTCCACACTGGTGTATAATGAAGAATCGCGTAATAAGGTTATTGAACTGCGCAAGCAGGGAGAGGCTCTCTTACGCAAACTCAACATACATGCCCCAAAGTCGATCGGTTTGATCAATATTGTAAAGGACACGCTGCGTAAAGTCAACGGTTGGTTTAAAGTCATCGAACCAATGTTAGGTCTTTCAAAGAACAAGCATGAGCCTTTTGTCATCCATCTGTATGGTGCACCGGGAATTGGAAAATCGCATGCGGTTAACTATATCCTGGCAGCACTGTGTCGCGTTCTTGAGTCTAAGACCTTCCGTCCGAATGTGGACACCTTCACGAAGCCCCGAGATTCAGAGTACTTTGATGGTTACACAGGCCAATTTGGATTCATCATGGATGATTTCTTGCAAATGACAGACCCACTCCTTCGCGCTGCAGAAGTGGCTTTCCTCGTAGACGCAGCTAGCAGATCAGATTTTCATTTGAATATGTCTGCTGTTGAGGATAAAGCATGCACCTATTTCCGGTCACCTGTTATTGTTCTAACCACAAATAAACCCTTGAGTCAAGAATTTGTTGGTAACGTCATAACAGAGTATGGTGCCATTGCACGCCGAATTGATCTTTCCGTGGAAGTAGTGAAACACCGTGAAATCGACTACTCACAGCCATTTGACACGGGAGCTTGTTCATACAAAATTGAAAAGTACGTCACAGATCCTAGCAACTTGAATGGCACATGGCGCCCTCTTTCTCAATGTAATCTACACTGGGATCTGTTCGTTCAGACCATCTGTTCATATGCTCTCGTGAAACGTCAAGTCCAAGAGCGACAGGATCAAATGCCCAACCTATACGACTTGAATTTTGAAAGCACAGTGAACTACAACACCGCACTGCTTAAGACTACAGCCAAGAATGGCAGCCCCTGGCAGGCCATGCAAGAATACATAGCCGTCCACACAAGCCCGGACCCAGGGAAGATCGAGCGAGTTGGCGAGGTTGGCCCAGGCTTCGACAATAGGTACGATATTGTTCACTTGCGGAATCGTGATGAGCAAGGTCTGTTTAACTTCACACCCGAGGAGCCATACAAATCGTATGTTACAGGATACCACAAGGTGGGAGTTACAGACGAATCAATACGTGTCCAAGCAGAGAAATATCGACAGCTTTCAGAAATCACCCGATATGAAAAGGATGCAGAGTTCATGGAAAAGAAGTTGCACAAGGAAGCCGAAAATAAGAACAAGGTTCTGAAAACAGAATTGTCCCAAGTTAATATCCGAGTTCCTACGCCAGATGCTGCGAAACATCCACTCGTGCCAAAAGAACACGCAGGCACAGATCCACTTGTGCCAACCGCATTGCGCGGAATGCCAGATGAGGATGGACAAATAGAGGATTTTGTGGATGCTACAGAAGTTGAGACGGAAGGTCCCCATCATCGAGCGGCACAAACTTATGCTGACCAATTGAAGCACTCAGAACGAGTGTGGAGAAAGGCACATAGGGGCAAATTGCCAACGATCCTTGATGTACTAGGTGGAGTGTCAGTGCGACGAGATATTTCAATTCCTGGTTGTAACGTGATACGCGAGCCAGTGAATGGCAAGCTCTTCCCCAATCGGATAGACTCATCGCACAAGCCCTTAAATCAAGCTGATACCGGTGCCCAAACGGTGCGTCGACCATATCCACCTGAGCCCGAGGATGAAATACTGCCTGATTTGAAGTACCTGTTGGTGAAAGAGGAAGCTCAGGGAGCTCATACTTGGATTCCAGCACGTTCGCACTTGTACTCCTCAAAGGACATCATTGGTGCAACAGCAATCACAATTGAAGACGGTTCACAGTATTCCATCTGGGTTCGAAAGACGTGTCGAGTTGAAAATTTGGCAGAAGGCGAGGCAACTAGCAAAGACAATTCATGCTTCTATGACTCATTTGCTCAGCTCATGAGTCAAGTCACTGGCGTCCACTACGACTACGAAGAAGTCCGGAGCAAGGTGATGGAGTACGAAAGCAAGAAAGCAAATAGGTTGACAAACCTGCGCTCACCCTTCAGGCGAGGCCAGATGTTGGACACAGATTACATTCATATCTTCTGTGAGGTTTTCCATGTCAATGTCTGTCTGCACGTTCCACACTACGCAGAGTACTCTGAGCCGTGCTGTATGCAATGGAACCATTATGAGGATGCCTCGGCTCCTCTTTTGCATATCCAGTACCGCAACCACCATTTCACCCCTCTGTTTCCTATTCAGGCTCGCGTGCCTGAAGCTATTCGCACCTACACATGTGTGGCTTGCAACCGCCAGATATCTAGTGTGAGCAATCATGCAGAGTTGGCACGCCATATACTCTCGTCAATGAGGTGCAGCGATGAATCCTTCGAGATCCACTCTAGCCGGAAACATGATCTAGCAGCGCAACTCCACAAGATGGCCCTGCCCCAGGGTCGCTTTCTCACAGCTGCAGAAGAACGTGTCAGGAAAGAAATGATCCGAACCAAGTACGAGATTAAAGGAGCTCCTTTGCAGATTTCAGATCTCACGATGTACGTACAAACTCGACCGGAGTTGGTCAGAGCCTATATAGACTACTACCAACTCTATGATCGACCCACCATCATTGAACGTTACATAGTTAAGCCATTAGAGTATGTGTTAACCCCATCTTTGAAGTTCGCACATTACTTTGGTGAACTAGTTGAATCTGCAACGAGTGGCGCCCGCCAATACGTCTCGAAGTGGTTCCCTACTGAAATCAAAGAGCAAGTTCAAGAAGCATTGAAAGCTGCCAAGGAGGCCATTAATTCCTTCAAGAAATGGGCGATAGTGGGCGTTCTGGGCATTGTGGGTGCCGCCACTCTTGGTTTGGTGCTCGCAACCCGGCGCTCACAGGAGTCCAATGAAGGGTATGGTCCTTCTTCATCTGAACGAATTCCTGCTGGCAAGAGGAAGAAGACGATTGTTGGAACTAGATTCTCAACTGAAGCAAATCTTCCTAAGGTGACCTACAACGGCGGATTCAAGGGCATGCAGTCAAGCTCCAACGCATTTGAGTTTGAACACGTAGGCCTAAACGATGATGCTGACATAGAGATCCGGCGGGAGATG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| 16,761
|
NC_029076.1
|
Iris severe mosaic virus
|
Li,Y., Deng,C., Shang,Q., Zhao,X., Liu,X., Zhou,Q.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2016-02-05
|
BJ
|
Iris severe mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,423
|
RefSeq
| 1
|
China
|
China
|
Iris
| null |
2013
| null |
PRJNA485481
|
Iris severe mosaic virus isolate BJ, complete genome
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| 5,627
|
MN520154.1
|
Iris severe mosaic virus
|
Naseri,A., Moradi,Z., Mehrvar,M., Zakiaghl,M.
|
Ferdowsi University of Mashhad, Department of Plant Pathology Science, Faculty of Agriculture
|
Iran
|
2022-11-16
|
Ir
|
Iris severe mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,454
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Iris severe mosaic virus isolate Ir, complete genome
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| 22,146
|
LC433737.1
|
Iris severe mosaic virus
|
Nishikawa,M., Yoshida,T., Nijo,T., Maejima,K., Yamaji,Y., Namba,S.
|
Graduate School of Agricultural and Life Sciences; 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8657
|
Japan
|
2018-11-14
|
J
|
Iris severe mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,403
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Iris tectorum
| null |
2018
| null | null |
Iris severe mosaic virus J genomic RNA, complete genome
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AAATTAAAACAGAACAGAACAGAACAGAAAAGACAAGCACAGCACAGCAAAACAAACTCAAGCAATTACAATCCTAGCAATTCAAAAACTTTTGACTCAAATTCAAAACTTTTTGCTAACGAGATGGCTTTCGTTTGCAAGAACTCTGAGTGCAGGTACGGATGTTTTCGAGGAGAAGGATTCAGTAAACGCTATATCAAACTGAATTTTCCTCGCGGTTCGTGTGACCTCTGCGGTTCCTTCTTTGTTATGAAGGAGGAAGCTTTGGAGAATGCAGCGATACTACAGAGTCTCGCTGCAAAGCTGTGTGCTGGCCCTGCTGCCTACGGAGGTAGGGCGCCAGCAATGGCGCGACAGAGAGTGGCGGAGCATGGAACTGAAGAAAATGCAGTTATAAAACCCCAATCAAAAGAACAGACTCCTACTGAAAAGATGGAGTCGGCTGAACAGGAAGCACTGCCGTCTACTGAGTACGCGCCGGTAGGGCAGGATCCGGTATCTACCCCGGAAGTTGTTGAGAAGGTTCACATAGCCGATATCAAGGCTCCGGTATCCGCGACACCTGTGCACGAAAGTTCCGCAAAGGTATTCCTCGGTGCCAATCGTTCAGTTAAGCCAGCACGGAAGGTTTGGGTACCTAAAGTGCAAAGACTTGAATGTAAGGCTGTGCAAGAAATTGCAAAAGCTGACCCATTCACAAACCCACAGTTTTTCTTTGGTAGTTTAACACAATTTGTGGTAGACAACCAAGAGAAACAACAAAGTACAAAACCAATTGCAGCAAAACAAATGAACCTATTCAAAAACTGCAAGAAGGTTACAGTACATAGCGCTAAGAAAGTTGTAGTAGCGCAGAGCGTAGATTTTCCAGCTGAACAAATCATTCTCACGAAAATCAACGCAAACCAAGACAATGAGGTCATCACTAAAATCGTTAAACACGATTGCGACCAAGTGAGTGATGAGCGATCAAAACCAATCTGGAAGCAGTCACATAAAAGAGTGAAACCCAATATCGTTCGCTGCAAAAATGAACGAATTGTTGAGAATCTAATGGCATTCACGCAAAATATTATGAAGAAACGAGACATTAATGTTTGTGTTATTGGTAGGCGATCAGCCTACTTTAATGCACATGTTAGGTCTAATAAAAAGGAATACTTTGCTATGACCAACCATCAAATTGGAAAGTTTAAACGCACGGATTTACCAAATGAGAAGATAATAAACGATTTTGTGAGATTAGCAGCTGAAAAGAACCATGCTTTTGGTCAGATCAATGAAAAAGATATCACTTTTGGTGATAGCGGTTTGATAATACACCACAATCGTTTGAATGGTAAATTTGAAAAACATGGTTCAGGAGCACTGGTCGTCAGAGGGAGAGAATCCCAGCTAGTTGACGCTCGCAGTGAGCTAACACCACATAGGATCCAAGGAATAGAGCACTATTCTAGAGCATTCGAACAGAGAGGTGCTCTTTTCTGGGATTCTTTAAATGCAAACTCCACTAAGTACAAAAAGAAAGATGTTAATCACAATTGTGAAAACACATATGACATTGAAGAGAGTGGTTTGTATTTAACACTGTTAGTCCAAATGTTGCAACCATGCGGGAAGATTGGTTGTGAAGATTGTCATAAAGAACTATCTCAGATGTCAGCCGAAGAATTAAGCAAAGCAGTGGTGAATGAACAATTGATGCAAGCAGCACAAACAAAGCTTAAAGGTTACAGAAGAGACAGTTTGAACAACTTAGCACAGATAATTCATCAAAAATGTTCGAGTATTTCAGTGGATTTTGATATAGTTAAAAGCATAACGCTTGCAACGAATGGAAAAACTCAAAGTCCTTTTACACATATTCAAAGAATCGCTGATGAATTGATTAGAGCTGAAAATGGAAATGAAGGATTGTCGCACTTACTTGAAGTCACACGATGGATAATCAACAAATTGAAACAAAGTAAGGAATTGCCTTTGCAATTCAGGAACAAAATTTCAAGTAAGGCGCACGCAAATTTCGCTCTCTTATGTGATAACCAGTTGAATCAAAATGGTGTGTTCCAATGGGGAGAGCGTGGCGTGCATGCAAAGCGTTTCTTTTCAAGGTATCACGACATAATCACTTCAAGCACTGAATACGAGAAGTATAAGATCCGAAAACACGTACGAGGAGAAAGATGCTTAGCAATCAAAAATCTACTGGTGTCATCAGACTTCAACCAACTCAGGAGGTCACTGAAGGGTGAACAAATAACATTCACAACAATTGGAGAACAATGCTTCACAAGGCTGAATGGTGAATATCTCTATAATTGTTGTTGTGTAACCCTTGACAATGGACAACCTCTACTATCAAATCTCAAATTACCAACACAAAATCATCTTGTTATTGGTAACACAGGTGATTCAAAACTCATTGAGTTACCTGAAATACCGGAAGGAGGAATGTACATTGCCAAAGAAGGATACTGTTACATCAACATCTTTTTGGCAATGCTGGTAAACATACAAGAGGAAAATGCGAAAGATTTCACTAAGCGAGTCAGGGACTCCATCATAGAGAAACTTGGTAAGTGGCCAACAATGAAAGATGTCGCCACAGCATGTTACTACATAGCAGCATATTTTCCATCCGTGAGGACAGCTGAACTACCAAGGATATTCATAGATCATGGAAACAAAACGATGCACGTCATCGACGCTTTTGGATCTATGAATACTGGATACCACATACTGAAGGCTGGGACAGTTGAACAGCTGTTTCAATTTGCAAGTGATGATAATACTGGAGAACTCCAAAACTATAATGTGGGCGGAGACTACTGGTATCCACAAAACTTCAACTGTTCACTCAAGGAAATGGAAGAAATCGAAGCTGAATATGAAAGGGAGAGAAGATCGTTCCACTCACAAGCTAGTGCCATTGAGGATGACATAGTTATTATTGAGGAGGAAGAAGAAGCGTTTAGTGAATGTGAAGATTTCGAAGTTGAACACCACGAAATTGAAGAAATTTCAAACAGCTCAGCGAGTGAAGGCGATGCTACACCAAGTGAACAATACAGACAACAATTCAGAGACACATGGGAAGAGCAACGGAGACAGCTTTCATCAGCGGAAGTTGAAAATGGAACCACTGAACGACGAACAGAATCTGAAGAACTCCATGAAATGTATAACAATCCAAATGAAAGACCACAAACTGAAATTGAAGTTTTTCGAATCCTAATGAAAGCAGTTTTCAACAAGGAGAAATTTGAGAAGTTAATAAAGAAGGAGCCCTATATTCTGTTAATTGCATTGATCTCACCGAGTGCAATGCGTCTTTTATATAAAGATGGATTGTTGACGCAAGCGATTAATATGATGATGGGATTGGATGAGGATATGGCTAGTTTGATAACCTACATTCATCAACTGAGCAGAAACGTAACCATGGCAGAAGCATTTGATACAAAAATGCATATCATCTCTATGGCATCTCAAAACATCCTTGACAAGATAGATGCAGTACCACAAGGTAGCCAGATTTATAAAACAATTCATGCAATGCTACATGTGTCAATGGTACGACATCAGGCTGATTATACACTGGCGCAAAATGGATTCTTTTTGAACATGGATGGTATCTATGAAAAAAAAGAAGACTTTTGCATTCAAATCATAAACGAATGTTGGTCAGAGCTAACATTGTATCAAAAGCTATCGTATTCTTGGCAAAGGCGCAATTCAGAGAAACTTGGTATCGATTCACGTGTAGAAGAAAGATTCACAACTTCGAGAGAAACATGGAATGGTTATATTTCTACGCATTTAAAGGCGAGCGTAAATGGAACGAAAACATATGCAAAAACCTGTTTGGCTCGTGTTCAGAATAAATATCAAACAGCGAAACAACGTTTCCTCACCTCAACAATTGTAACTGCTTACAATTGTCTACCTGATGTTATTAAAGTTGTGAATGTGTTGATAATTACCAAGATGCTCATTGAAATTTATAAAAGTGTCGGAGGAATGCTTAAACATATGCGAGAAACGAAAGAACAGGCAAAAGCATTCGAGGAGGAACAAATATGGAGAAGGTTGATGATTCAGCATAAAGTTCTATCCAAAGAACTGGGTGAGGAACCAACGGAGGAAGAATTTATAGATCATTTGAAGCGCGTCGACCCAATGTTAGCAGATTATATGGAAAAATATTATGCAATCGATGTTTCATTCCAAGCAGGGACTCCATCAACACGAAAGTTAGAAAGTGCAATTGCAGCAACTGCTTTAGTGATGATGATATTTGATTCAAATCGTTGCGATGTATTAGTCAAAATACTCAATAAACTCAAAACAATATTCGCAGCACTAAACTTTGGAGTTCGATTTGAAGCACTTGATGATATTCTCCAATCAGACACGGACAACAATTTAACAGTTGATTTTGAAATCACTACAAATGAAAGATCTGATACTCCACGACTACAAACAACTTTTAATGAGTTCTGGCAAAATCAAATGAATTGTAGTCGAACAGTTCCACACTACAGGAGCAATGGGACTTTTATAGAGTTCAGCAGAGATAAGCTTCACACTATAGCACATACGATTGACAACATTGAAGACACGGATCTGATCATTCGCGGAGCAGTTGGCTCTGGCAAATCAACTGGGATTCCGAGCTCTCTGATGTTGCGTGGTGCTGTATTGCTGATAGAACCTACAAGACCACTCACTGAAAATGTTGCGAAACAGCTTATGGGAGCACCATTTCATCTCAGCCCAACAGTGATGATGCGTGGGAAAGTTACATTTGGTTCGTCACCTATCACTGTGATGACGACAGGATACGCACTTCACTACCTGGCCAATAACATAAATCGAATAAACAACTTCAAATATATAATGTTCGATGAGTGTCATGTGATGGACGCAAATGCAATGGCATTGTACTGTTTGCTCAAAGACAATGGAATGTTCAAAGGAAAGATACTCAAAGTGTCAGC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AAGAGAACACAGAAAGGCACACATCTGATGATGTGAATGAAACGATGCACAACTTAAATGGTGTGCGAATTTGAGCCTTTCAATTACATGAACAAGCTATTAATATATATTATTAAGTATTTTGTTTCAGTTTCGTGTGTTTCGGAGTGAGCTTCTCACGTGCAAGCACACACTAGTATTTAGTTAATGCAAGTGTGGGCCTCCCACCGTCTATTTACAATGCTTGTTATTGTAGTTCGTCGTATACTTCTTTCGGGAAAAAGGCATAACTGAGTGTGGTCTCACCACGAGGGTTTTGTCAGGTTTCCATTCACTCTTTTGTTTGTATGTTTAGCATCATGAACTTAGTGTGGTTTTACCACGTGTGAATGGTGTTGGCATATATGCAAAATGTTTGTGAGAC
| 67,197
|
MF385582.1
|
Iris severe mosaic virus
|
Tang,W., Lu,X., Sun,H., Lin,Y., Li,H., Xu,X.H.
|
Shandong Plant Protection Station
|
China
|
2018-05-22
|
Tai'an
|
Iris severe mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,406
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Iris
| null |
2015-07-01
| null | null |
Iris severe mosaic virus isolate Tai'an, complete genome
|
AAAAAATTAAAACAGAACAGAACAGAACAGAAAAGACAAGCACAGCACAGCAAAACAAATTCAAGCAATTACAATCTTAGCAATTCAAAAACTTCCAACTCAAATTCAAAACTTCTTTCTGACGAAATGGCTTTCGTTTGCAAGAACTCGGAATGTAGGTATGGATGTTTTCGAGGAGAAGGATTCAGTAAACGCTATATCAAACTGAGTTTTCCTCGTGGTTCATGTGACCTCTGCGGTTCCTTCTTTGTTACAAAGGAGGAAGCTTTGGAGAATGCAGCAAAACTACAGAGTCTCGCTGCAAAGCTGTGTGCTGGCCCTGCTGCCTACGGAGGTAGGGCGCCAGCAATGGCGCAACAGAGAGTGGCGGAGCATGTAACTAAAGAAGATGCAGTTATAAAACCAAAACCAAAAGACCAGACTCCTACTGAAAAGATGGAGTCGACTGAACAGGAAGCACTGCCGTCTACTGAGTACGCGCCGGTAGGGCAGGATCCGGTATCTACCCCGGAAGTTGTTGAGAAGGTTCACATAGCCGATATCAAGGCTCCGGTATCCGCGACACCTGTGCACGAAAGTTCCGCAAAGGTATTCCTCGGTGCCGATCGTTCAGTTAAGCCAGCACGGAAGGTTTGGGTACCTAAAGTGCAAAGACTCGAATGTAAAGCTGTGCAAGAAATTGCAAAAGCTGACCCGTTCGCAAACCCACAGTTCTTCTTTGGTAGTCTAACACAGTTTGTGGTGGACAACCAAGAAAAACAACAAAATATAAAACCAATTGCAGCAAAACCTTTGAACTTATTCAAAAACTGCAAGAAGGTTACAGTGCATAGCGCTAAGAAAGTTGTAGTAGCGCAAAGCGTAGATTTTCCAGCTGAACAAATCATTCTTACGAAAATCAACGCAAACCAAGATAATGAAGTTATCACAAAAATTGTTAAACACGATTGCAACCAAGTGTGTGATGAGCGATCAAAACCAATTTGGAAGCAACCGCACAAAAGAGTGAAACCCAATATCATCCACTGCAAAAATGGACGAATTGTCGAAAATCTTATGGCATTCACGCAAAATATTATGAAGAAACGAGACATTAACGTTTGTGTTATTGGTAGGCGACCGGCTTACTTTAATGCACATGTTAGGTCTAATAAAAAAGAATATTTTGCTATGACTAATCATCAAATTGGAAAGTTCAAACGCACGGATCTACCAAATGAAAAGATAATAAATGATTTCGTGAAATTAGCAGCCGAGAAAAACCATGCTCTCGGTTCGATCAATGAAAAAGATATCACGTTTGGTGATAGTGGTCTAATACTACATCACGATCGTTTGAACGGTAAATTTGAAAAACATGGTTCAGGAGCATTGGTCGTCAGAGGGAGAGAATCCCAACTAGTTGATGCTCGCAATGAACTAACACCATATAGAATTCAAGGAATAGAGCACTATTCTAAAGCATTAGAACAGAGAGGTGCTCTTTTCTGGAATTCCTTAAATGCAAACTCCACTAAGTACAAGAAGAAAGATGTTAATCACGAATGTGAAAATACATATGACATTGAAGAGAGTGGTTTGTATTTAACACTGTTAATCCAAATGTTACAACCATGCGGGAAGATTGGTTGCGAAAATTGTCATAAGGAATTATCTCAGACGTCAGCTAATGAATTAAGCAAAGCAGTGGTGAATGAACAGTTGATGCAAGCAGCACAAACAAAGCTCAAAGGCTACAGAAGAGATAGCTTGATTAATCTGGCGCAAATCATTCATCAGAAATGTTCGAGTATTGCAGTGGATTTTGACATAGTAAAAAGTATAACGCTTGCGATAAATGGAAAAAATCAAAGTCCCTTTACACATATTCAAAGAGTCGCTGATGAATTGATTAGAGCTGAAAATGGAAATGAAGGATTGTCGCACTTACTTGAAATCACAAGATGGATAATCAACAAACTGAAACAAAGTAAGGAATTGCCTTTGCAATTCAGAAATAAAATTTCAAGTAAGGCCCATGCGAATTTCGCTCTTCTATGTGACAACCAGTTGAATCAAAATGGCGTATTCCAATGGGGAGAGCGTGGTGTACATGCAAAACGTTTCTTTTCAAGGTATCACGACATAATCACTTCAAGTGCTGAGTATGAGAAGTACAAGATCCGCAAACACATACGAGGAGAAAGGTGCTTGGCAATCAAAAACCTACTGGTATCATCAGACTTCCACCAACTCAGGAAGTCACTGAAGGGTGAACAAATAGCATTTACAACAATTGGAGAACAGTGCTTCACGAGGCTGAATGGTGAATATCTTTATAATTGTTGTTGTGTAACTCTTGACAATGGACAACCACTATTATCAAATCTCAAATTACCAACGCAAAATCATCTCGTCATTGGCAACACAGGTGACTCAAAACTCGTTGAGTTACCCGAAATACCAGATGGAGGAATGTACATTGCCAAAGAAGGATACTGTTACATCAACATTTTTTTGGCAATGCTGGTAAACATACAAGAGGAAAATGCGAAAGATTTCACTAAGCGAGTCAGGGACTCCACCATAGAGAAACTTGGCAAGTGGCCAACAATGAAAGATGTAGCCACAGCATGTTACTACATAGCAGCATACTTCCCATCCGTGAGGACAGCTGAACTACCAAGAATATTCATAGACCATGAAAACAAAACAATGCACGTCATCGACGCTTTTGGATCTATGAACACTGGATACCACATACTGAAGGCTGGGACAGTCGAACAACTGTTTCAGTTCGCAAGTGATGATAATACTGGAGAGCTCCAAAACTACAATGTGGGTGGAGACTACTGGTATCCACAAAATTTCAATTGTTCACTCAAAGAAATGGAAGAAATCGAAGCTGAATATGAAAGGGAGAGAAGATCGTTCCACTCACAAGCAAGTGCCATTGAAGACGACATGATAATTGTTGAGGAGGAAGAAGAAGCATTCAGCGAATGTGAAGATTTCGAAGTTGAAAACCACGAAATTGAAGAAATTTCAAGCAGCTCAACAAGTGAAGGCAATGATACACCAAGTGAACAATACAGACAACAATTCAGAGACACATGGGAAGAGCAACGGAGGCGGCTTTCATCAGTAGAAGTTGAAAATGGAACCACTGAACGACAAACAGAATTCGAAGAACTTCATGAAATGTATAACAATCCAAATGAAAGACCACAAACTGAAACTGAAGTTTTTCGAATTTTAATGAAAGCAGTTTTCAACAAGGAGAAATTTGAGAAGTTGATAAAGAAGGAGCCCTATATTCTGTTAATTGCATTAATCTCACCGAGCGCAATGCGTCTTTTATATAAAGATGGATTGTTGACACAAGCAATCAACATGATGATGGGATTAGATGTGGACATGGCTAGCTTGATAACCTACATCCATCAGCTGAGTAGAAACGTTACTATGGCAGAAGCATTTGATACAAAAATGCATATCATCTCTATGGCATCGCAAAACATCCTTGATAAGATAGATGTGATACCACAAGGCAGTCAGATTTACAAAACAATTCATGCAATGCTACATGTGTCAATGGTACGACATCAGGCTGATTACACACTGGCGCAAAATGGATTCCTTTTGAACATGGATGGCATCTATGAAAAAAAAGAAGACTTTTGCGTTCAGATCATAAACGAATGTTGGTCAGAGCTAACATTGTATCAAAAGCTATCCTATTCTTGGCAAAGGCGCAACTCAGAGAAACTTGGTATCGATTTACGTGCAGACGAAAGATTTACAACTTCGAGAGAAACATGGAATGGCTATATTTCCACGCATTTAAAGGCGAGCGCAAATGGAACAAAAACATATGTAAAAACCTGTTTGGCTCGTGTTCAGAATAAATATCAAACGGTGAAACAACGTTTCCTTACATCAACAATTGTAACTGCTTACAATTGTTTACCTGATGTAATTAAAGTTGTGAATGTGTTGATAATTACCAAGATGCTCATTGAAATCTATAAAAGTGTTGGGGGAATGCTTAAACATATGCGAGAAACGAAAGAACAGGCGAAAGCATTTGAAGAAGAACAAATATGGAGAAGATTGATGATCCAGCACAAAGTTCTATCCAAAGAACTGGGTGAGGAACCAACGGAGGAAGAATTTATAGAACATTTAAAGCGCGTTGACCCAATGCTTGCAGATTATATGGAGAAATACTATGCAATTGATGTTTCATTCCAAGCAGGGACTCCATCAACACGAAAGTTAGAAAGTGCAATTGCAGCAACTGCTTTAGTGATGATGATCTTCGACTCAAATCGTTGCGATGTATTAGTCAAAATACTAAATAAACTCAAAACGATATTCGCAGCACTAAACTTTGGAGTTCGATTTGAAGCGCTCGATGATATTCTTCAATCAGACACGGACAACAATTTAACAGTTGATTTTGAAATCACCACAAATGAAAGGTCTGATACTCCACGACTACAAACAACTTTCAATGAATTCTGGCAAAATCAAATGAATTGTGGTCGAACAGTTCCACACTACAGGAGTAATGGGACGTTTATAGAATTCAGCAGAGATAAGCTTCACACAATAGCACATACAATTGACAACATTGAAGACACGGATCTGATTATTCGTGGAGCAGTTGGCTCTGGGAAATCAACTGGGATTCCAAGCGCTCTGATGTTACGTGGTGCTGTATTACTGATAGAACCAACGAGACCACTCACTGAAAATGTTGCAAAGCAGCTTATGGGAGCACCATTTCACCTCAGTCCAACAGTAATGATGCGTGGAAAAGTAACATTTGGCTCGTCACCTATCACCGTGATGACAACGGGATATGCACTTCACTACCTGGCCAATAACATAAATCGAATAAATAACTTCAAATATATAATGTTCGATGAGTGTCATGTGATGGATGCAAATGCAATGGCATTATACTGTTTGCTCAAAGACAATGGAATGTTTAAAGGAAAAATACTCAAAGTATC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| 70,648
|
KT692938.1
|
Iris severe mosaic virus
|
Li,Y., Deng,C., Shang,Q., Zhao,X., Liu,X., Zhou,Q.
|
Beijing University of Agriculture, Plant Protection
|
China
|
2016-01-19
|
BJ
|
Iris severe mosaic virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,423
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Iris
| null |
2013
| null | null |
Iris severe mosaic virus isolate BJ, complete genome
|
AAATTAAAACAGAACAGAACAGAACAGAAAAGACAAGCACAGCACAGCAAAGCAAATTCAAGCAATTACAATCTTAGCAACTCACAAACTTTCCACTTAAATTCAGAACCTTTTTTTAACGAAATGGCTTTCGTTTGCAAGAACTCTGAATGCAGGTACGGATGTTTTAGAGGAGAAGGATTCAGTAAACGCTATATCAAACTGAGTTTTCCTCGTGGAACTTGTGACCTCTGCGGTTCCTTCTTTGTCTCAAAGGAGGAAGCACTGGAGAATGCAGCAAACTTACAGAAGCTTGCTGCAAAGCTATGTGCTGGTCCCGCTGCCTACGGAGGCAGGGCGCCAGCTGTGGCGCGACAGGAAGTGGTGGAGCAAGCTGAAACTGAGGGGCTAGTTATAAAACCCCAACCAAAAGAACAGATTCCTACTGAAAAGATGGAATCGACTGAACAGGAAGCACTGCCGTCTACTGAGTACGCGCCGGTAGGGCAGGATCCGGTATCTACCCCGGAAGTTGTTGAGGTGGTTCACATAGCTAAACTCAAGGCTCCGGTATCCGCGACACCTGTGCACGAAAGTTCCGCAAAGGTATTCCTCGGTGCCGATCGTTCAGTTAAGCCAGCACGGAAGGTTTGGGTACCTAAAGTGCAAAGACTTGAATGTAAGGCTGTGCAAGAAATTGCAAAAGCTGACCCATTCACAAACCCACAGTTTTTCTTTGGCAGTTTAACACAATTTGTGGTGGATAACCAAGAAAAACAACAAATTACAAAACCAATTGCAGCAAAACGTATGAATTTATTCAAAAACTGCAAGAAGGTTACAGTGCATAGCGCTAAGAAAGTTGTGGTAGCGCAAAGCGTTGATTTTCCAGCTGAACAAATCATTCTCACGAAAATCAACGCAAACCAAGACAATGAGGTTATCACGAAAATCGTTAAACATGATTGCGACCAAGTGTGTGATGAGAGATCAAAACCAATTTGGAAGCAACCACATAAAAGAGTGAAACCCAACATCATTCACTGCAAAAATGAACGAATTATCGAGAATCTCATGGCATTCACGCAAAATATTATGAAGAAACGAGACATTAATGTTTGTGTTATTGGTAGGCGACCGGCCTACTTTAATGCACATGTTAGGTCCAATAGAAAGGAATATTTTGCCATGACTAATCATCAAATTGGGAAATTCAAACGCACGGATCTACCAAATGAAAAGATAATAAACGATTTCGTGAGATTAGCAGCTGAGAAGAACCATGCTTTTACTCCAATCGATGAAAAAGATATCACTTTTGGTGATAGTGGTTTAATAATACATCACGATCGTTTGAATGGTAGATTTGAAAAACATGGTTCAGGGGCATTGGTTGTTAGAGGGAGAGAGTCCCAGCTAGTTGATGCACGCAGTGAGTTAACACCGCATAGAATTCAAGGAATAGAGCACTATTCTAAAGCGTTAGAACAGAGAGGTGCTCTTTTCTGGGATTCTTTAAATGCAAATTCCACTAAGTACAAAAAGAAAGATGTTGATCACAATTGTGAAAATACATATGATATTGAAGAGAGTGGGTTGTATTTAACACTGTTAATTCAAATGTTGCAACCATGTGGGAAGATTGGTTGCGAAGATTGTCATAAAAAGTTATCTCAGATGTCAGCTGATGAACTAAGCAAAGCAGTGGTAAACGAACAATTGATGCAAGCAGCACAAACAAAGCTTAAGGGCTACAGAAGAGAAAGCTTGAACAATCTAGCACAAATAATTCATCAAAAATGTTCGAGTATTGCAGTGGACTTTGATATAGTAAGGAGCATAACGCTTGCAACAAATGGAAAAACTCAAAGTCCTTTCACGCATATTCAAAGAGTTGCTGATGAACTAATTAGAGCTGAGAATGGAAATGAAGGATTGTCGCACTTACTTGAAATTACAAGATGGATAATCAACAAATTGAAACAAAGTAAGGAATTGCCTTTGCAATTCAAGAACAAAATTTCAAGTAAGGCGCACGCAAATTTCGCTCTCTTGTGCGACAACCAGTTGAATCAAAATGGTGTATTCCAATGGGGAGAGCGTGGTGTGCATGCAAAGCGTTTCTTTTCAAGATACCACGACATAATCACTTCAAGTGCTGAGTATGAAAAGTACAAGGTTCGCAAACACGTACGAGGAGAAAGGTGCTTAGCAATTAAAAATCTACTGGTATCATCAGACTTCAACCAACTTAGGAAGTCACTGAAGGGTGAACAAATAGCATTCACAACAATTGGAGAACAATGCTTCACAAGACTAAATGGTGAATATCTTTACAATTGTTGTTGTGTGACCCTTGACAATGGTCAACCACTACTGTCAAATCTTAAATTACCAACACAAAATCATCTCGTCATTGGTAACACAGGTGATTCAAAACTCATTGAATTACCCGAAATACCGGAAGGAGGAATGTACATTGCCAAAGAAGGATACTGTTACATCAACATCTTTTTGGCAATGCTGGTAAACATACAAGAAGAAAATGCAAAAGATTTCACTAAGCGAGTCAGGGATTCCATCATAGAGAAGCTTGGCAAGTGGCCGACAATGAAGGATGTAGCCACAGCATGTTACTACATAGCAGCATACTTCCCATCCGTGAGAACAGCTGAGCTACCAAGGATTTTCATAGACCATGAAAACAAAACAATGCACGTCATCGACGCTTTTGGATCTATGAACACTGGATATCACATACTGAAGGCTGGAACAGTCGAACAGCTGTTTCAATTTGCAAGTGATGACAATACTGGAGAACTCCAAAACTATAATGTGGGCGGAGACTACTGGTATCCACAAAATTTCAATTGTTCACTCAAGGAAATGGAAGAAATTGAAGCTGAGTATGAAAGAGAAAGAAGATCGTTCCACTCACAAGCTAGTGCCATTGAGGATGATATAAATATCGCTGAGGAGGAAGAAGAAGCATTCAGCGAATGTGAAAACTTCGAAGTTGAAAACCGCGAAATTGAGGAAATTTCAGACAGCTCGACAAGTGAGGGCAATGCTACGCCAAGTGGACAATACAGACAACAATTCAGAGACACATGGGAAGAGCAACGGAGACAACTTTTATCAGCAGAAGCTGAAAATGAAACTACTGAACGACAAATAGAATCTGAAGAACTTCATGAAATGTATAACAATCCAAATGAAAGACCACAAACTGAAATTGAAGTTTTTCGGATCTTAATGAAAGCAGTTTTCAACAAGGAGAAGTTCGAAAAGTTGATAAAGAAGGAACCCTATATTTTGTTAATTGCATTGATTTCACCAAGTGCAATGCGTCTTTTATATAAAGATGGATTGCTAACGCAAGCAATTAATATGATGATGGGATTGGATGAGGAAATGGCTAGTTTGATAACATACATTCATCAACTGAGCAGAAACGTCACCATGGCAGAAGCATTTGACACAAAAATGCATATCATTTCTATGGCGTCTCAAAACATCCTTGATAAGATAGATGCAGTGCCACAAGGTAGCCAGATTTATAAAACAATTCATGCAATGCTACATGTGTCAATGGTACGACATCAAGCAGATTATACACTGGCGCAAAATGGATTCTTCTTGAACATGGATGGCATCTATGAGAAAAAAGAAGACTTTTGCGTTCAAATCATAAACGAATGTTGGTCAGAGCTAACATTATATCAAAAGCTATCTTATTCTTGGCAAAGGCGCAATTCAGAGAAACTTGGTATCGATTCACGTGTAGACGAAAGATTCACAACTTCGAGAGAAACATGGAATGGTTATATTTCTACGCGTTTAAAGGCGAGCGCAAATGGAACGAAAACATATGCAAAAACTTGTTTGGCTCGTGTTCAGAATAAATATCAAACGGCGAAACAACGTTTCCTCACATCAACAATTGTAACTGCTTACAATTGTTTACCTGAAGTTATTAAAGTTGTGAATGTGTTGATAATTACCAAGATGCTCATTGAAATTTACAAAAGTGTCGGAGGAATGCTTAAACACATGCGAGAAATGAAAGAACAAGCAAAAGCATTCGAGGAAGAACAAATATGGAGAAGATTAATGATTCAGCATAAAGTTCTATCCAAAGAATTGGGTGAGGATCCAACGGAGGAAGAATTTATAAATCATTTAAAGCGCGTTGACCCAATGCTCGCAGATTATATGGAGAAATATTATGCAATTGATGTTTCATTCCAAGCAGGGACTCCATCAACACGAAAGTTGGAAAGTGCAATCGCAGCAACTGCTTTAGTGATGGTGATCTTTGATTCAAATCGTTGCGATGTTTTAATCAAAATACTCAATAAACTCAAAACAATATTCGCGGCACTAAACTTTGGTGTTCGATTTGAAGCGCTCGATGATATTCTCCAATCAGACACAGACAACAATTTAACAGTTGATTTTGAAATCACTACAAATGAAAGGTCTGATACTCCACGACTACAAATAACTTTCAATGAGTTCTGGCAGAATCAAATGAGTTGTGGTCGAACAGTTCCACACTACAGGAGCAATGGGACGTTTATAGAGTTCAGCAGAGACAAGCTTCACACTATTGCACACACAATTGACAACATTGAAGACACGGATCTGATCATTCGCGGAGCAGTTGGCTCTGGAAAATCAACTGGGATTCCAAGCTCTCTGATGTTACGTGGTGCTGTATTGTTGATAGAACCAACGAGACCACTCACTGAAAATGTTGCAAAGCAGCTCATGGGAGCACCATTTCATCTCAGTCCAACGGTAATGATGCGTGGGAAAGTGACATTTGGTTCGTCACCTATCACCGTGATGACGACAGGATACGCACTTCACTACCTGGCCAATAACATAAATCGAATAAACAACTTCAAATATATAATGTTCGATGGGTGTCATGTGATGGATGCCAATGCAATGGCATTGTACTGCTTGCTCAAAGATAATGGAATGTTTAAAGGAAAAATACTCAAAGTGTCAGC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AAGAGAACACAGAAAGGCACACATCTGATGATGTGAATGAAACGATGCACAACTTAAATGGTGTGCGAATTTAAACCTTTCAATTACATGAACAAGCTATTAATATATAGTATTAAGTATTTTGTTTCAGTATCGTGTGTTTCGGAGTGAGCTTCTCACGTGTAAGCACACACTAGTATTTAGTTAATGCAAGTGTGGGCCTCCCACCGTCTATTTGCAATGCTTGTTATTGTAGTTCGTCGTATACTTCTTTCGGGAAAAAGGCATAACTGAGTGTGGTCTCACCACGAGGGTTTTGTCAGGTTTCCATTCACTCTTTTGTTTGTATGTTTAGCATCATGAACTTAGTGTGGGTTTCCCACGTGTGAATGGTGTTGGCATATATGCAAAATGTTTGTGAGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 84,069
|
KF917537.1
|
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus
|
Moureau,G., Cook,S., Lemey,P., Nougairede,A., Forrester,N.L., Khasnatinov,M., Charrel,R.N., Firth,A.E., Gould,E.A., de Lamballerie,X., Forrester,N., Baronti,C., Gould,E.
|
Universite Aix-Marseille II & Institut de Recherche pour le Developpement, UMR 190 Emergence des Pathologies Virales
|
France
|
2015-03-03
| null |
Orthoflavivirus israelense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,284
|
GenBank
| 1
|
Israel
|
Israel
|
Meleagris gallopavo
| null |
1959
| null | null |
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus strain ME 30502, complete genome
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| 87,600
|
KC734549.1
|
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus
|
Fernandez-Pinero,J., Davidson,I., Elizalde,M., Perk,S., Khinich,Y., Jimenez-Clavero,M.A.
|
Centro de Investigacion en Sanidad Animal (CISA-INIA)
|
Spain
|
2014-01-30
| null |
Orthoflavivirus israelense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,792
|
GenBank
| 1
|
Israel
|
Israel
|
Meleagris gallopavo
| null |
1985
| null | null |
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus, complete genome
|
ACTTTGTGATTGACAGCTCAACACAAGTGCGGATTACCGTAAACACAGTTTGAACGTTTTTTGGAGAGAGACTACTATGTCTAACAAAAAACCAGGAAAACCCGGGGCAACCCGGGTTGTCAATATGCTAAAGCGCGGTGCATCCCGCGGAAATCCGATATCTCGGATCAAGAGGATGCTTGATGGACTACTCAGAGGAGTAGGACCAGTCAGAATCGTCTTGGCGATCTTGACCTTTTTCAAATTTACAGCTTTGAAACCAACGGCGGGATTGTTAAGACGATGGAAGCTGGTGGGGGTGGTTGAGGCTACTCGCCACTTGAAGAGCTTCCGAAAGGACATAGGACAAATGCTAGATGGGCTAAATAGACGCGGCAAAAAGAAGCGTGGGGGGACCACTGTGAGCGTCGTCATCCTTGTGGTATTAGGGRTGGCCCAGGCTATTAAGATCGGATCTTTGAATGGACGGCCACTTGTCACAGTTAACCAGACCGATGTGCTAGAGGCGGTTATGATCCCAACTGCTGGAGGAAACAATCGCTGCGTTGTGAAAGCCTTGGATGTTGGACTGATGTGCCCTGATGACATCACGTATTTATGCCCCAAGCTAGAGGATGGATATGACCCAGAGGACATAGACTGCTGGTGTAACACCACGGAGATCTACATCCACTACGGCCGATGCACTCCAACTCGACACGCGAGACGATCGAGGCGGTCTATCACAGTGCACCATCACGGAGAGAGCCTGCTAGAAGCAAAGAATACACCATGGATGGACTCAACTAAGGCTACCAAATACCTGACCAAGGTGGAAAACTGGGCCATACGTAACCCTGGATACGCATTAGCGGCGGCTATAATAGGATGGAACTTGGGGACAACAAAATCTCAAAAGATTATCTTTACAATTATGCTTATGCTCATTGCTCCGGCCTATAGCTTCAATTGCCTGGGAATGCAAAACAGAGATTTTGTAGAAGGTGTCAATGGAGTTGAGTGGATTGATGTCGTGATGGAAGGTGGAGGCTGTGTGACCATCACAGCGAAGGATAAGCCCACAATCGATGTGAAGATGATGAACATGGAAGCCACTGATTTGGCGCTTGTGAGATCATATTGTTATGAACCTAAAATCACTGATGTCAGTACTGAATCGAGATGTCCTACCATGGGAGAGGCCCACAACACCAAAGCAAATAACCAGAAKTATGTGTGTAAGAAAGGCTATACTGACAGAGGTTGGGGTAATGGTTGTGGACTGTTCGGGAAGGGCAGTATTCACACATGCACCAAATTTGAGTGCACCAATAAGGCTGAAGGAAGAATTGTGCAGAAGGAAAATGTCCATTTCGAGTTGGCTGTGTTTGTGCACGGTTCAACAGAAATGGGAACCCACTATAACTACTCCATACAGCAGTCATTGAAGCAGGCAGCGAGGTTCATTGTCACACCCAAAGCACCAGTGTACACGGCTGAACTCAATGAGTATGGGACGGTGACTCTGGAATGTGAGCCCCGCTCCGGAATGGACATGAGCCAGTTTTATGTGCTAACCATGAATTCGAAGAGCTGGCTTGTGAACAGAGACTGGTTCCATGACTTAAACCTTCCGTGGACTGGATCATCTGCTGRCTCATGGCAAAACAGAGAATCACTGGTGGAGTTTGAAGAAGCTCATGCAACTAAACAATCAGTAGTGGCACTGGCTTCGCAAGAAGGGGCGTTACACGCGGCTCTGGCTGGAGCCATTCCAGTGAAATATGCCAGCAGTAAGCTTGAGATGACTTCTGGGTACTTAAAGTGCCGTGTGAAATTACAAGGACTGAAGTTGAAAGGAATGACTTACCCCATGTGCTCAAACAAGTTCACTCTAGCCAAGAACCCTACAGACACAGGGCATGGGACAGTTGTTGTGGAACTCAGCTATTCTGGATCTGATGGACCATGTCGCATACCCATATCAATGACAGCCAACCTGCAGGATTTGACCCCGATAGGAAGGCTCATAACGGTCAATCCATATGTGTCCACATCATCATCAGGGACAAAAGTGGTTGTTGAGCTTGAACCCCCATTTGGGGATTCATTCATTTTGGTTGGAACAGGAGAAAATCAGATAAAGTATCAATGGCACAAGAGTGGAAGCTCCATCGGCAAGGCATTCATGTCCACCGTGAGGGGAGCTCAGAGAATGGTAGCACTAGGAGACACCGCATGGGACTTTGGATCAGTCGGAGGGTTCTTCACGTCGCTAGGTAAAGGGATACACCAAGTGTTCGGAACGGCCTTCAGAAGCCTCTTTGGAGGAATGTCATGGATAACCCAGGGCCTGCTGGGAGCACTCCTGTTGTGGATGGGACTTAACGCAAGAGATAGATCGATTTCACTGACGTTCTTGGCCGTTGGAGCGATCCTCATATTCCTAGCTACGAATGTACATGCCGACACTGGTTGCGCAGTGGACATGGACAGGAAAGAACTGAAGTGCGGAAGTGGCATTTTCATATTCAATGATGTGGAAACCTGGAGGGACAATTACAAGTATTACCCATCAACTCCGCGGAATCTGGCTAAAGTCATAATGGAATCACGGGAAAAAGGAATCTGTGGTGTGAGGTCCGTGGGAAGATTGGAACATAACATGTGGAACTCAATCAAGCATGAGCTGAATGCCATACTTGAGGACAACGGGCAGGACTTGACAGTCGTCGTTGAACAGCCAACTGGTAGATTCAGGAAAACCCACCGGCGTCTAGTGTGGACAGACGAGGAATTGGAATACGGGTGGAAAAAATGGGGGAAAACATTGTTTGTAACTCCACCCATGTCCAATAACACATTTGTTGTGGATGGTCCAAAAACAAGAGAATGCCCAGATGAGAACAGAGCCTGGAACAGTCTAGAGGTGGAGGACTTCGGATTTGGGCTAACAGCAACGAAAGTTTGGTTGGGATTAAGGAAAGAAAACACAACTGAATGTGACACGGCCGTGATGGGCACAGCCATCAAGGGTGACAAAGCAGTTCACAGTGATTTGAGCTACTGGATTGAAAGCAGAAACAATGGCAGCTGGAAGCTTGAAAGAGCTGTGCTGGGAGAAGTCAAGTCATGCACTTGGCCAGATACCCACACTCTGTGGGGGGAGAGCGTCCAGGAGAGTGAATTGATCATTCCAGTCACACTGGCCGGGCCCAGGAGCAAACACAACATGAGGCCAGGCTACAAGGTGCAAGTTTCAGGACCATGGGATGAGAGAGACATCACTATCGACTTTGACTACTGTCCAGGTACCAAAGTGACAGTCACCCCAACATGCAGAGATAGGGCTGCCTCCGCTAGAACAACAACGGCTAGCGGCAAGCTGATCACAGATTGGTGTTGTAGGTCATGCACTCTCCCTCCATTGCGGTACATGACAAAGAGCGGCTGCTGGTATGGAATGGAAATTAGACCTACAGTACATGGAGACGACATGTTGATAAAATCAAGAGTCACCGCTTATGACGGAGCAGGCATGGAACCATTTCAGCTGGGTGTACTCATGATGTTTGTGGCCACGCAAGAGGTGCTGCGGAAAAGATGGACAGGCCGGATGGCCGGTCCAGCACTGGTGGGTCTATTATGTGCTATGATTTTTGGAGGGATAACTTATAGGGACATGGTGAAGTATGTCTTGTTGGTGGCGGCTGCTTTTGCCGAAAGCAACAGCGGGGGTGACGTGATCCACCTTGCTCTGATAGCAACTTTTAACGTGCAACCTGGACTGCTGGTGGCGTACTCTTTGCGGCGGAAATGGAGTAACCAGGATGCCACCCTCTTAGGCGTGGCACTAGCAATGATAACCATGGCGCTACACGACTGGAACATGACCATACCCAGCTTGTTGAACTCAGGAGCCACAGCGTGGCTGTTGCTGCGCGCAGTGAGTGAAGGGACCGTCAGCGCGGCTTGTATTCCCATCCTCGGAGTTTTGGCTCCAGGAATGAAGATAGTTGGGGTTGATGTATTTCGAATTGGATTGCTTATCATCGGAGTTATGTCACTCCTGAAAGAAAGAAACAATGCCATCGCAAAAAAGAAAGGTGGAGTGCTGATTGGTTTGGCCCTGGCCCAAGATGGCTGGGTGAACCCACTGGTGTACGCAGGACTGACGTTGGCTCTAAAACCCAGTAATAGAAGAGGATGGCCAGTAAGTGAAGCCCTCACAGCAGTAGGATTGACCTTCGCGCTAGCTGGTGGGATCGCACACTTTGACGAAGGAGACATGGCCATCCCACTGGCTGTGGGAGGAATCATGCTGGTGGTAGCTGTGGTCACAGGATTCACAACTGACTTGTGGTTGGAGCGAGCTGGAGACATCTCATGGATTGAGGATGCCCAAATCACAGGAAGCTCACAACGGTATGACGTTGAGATAGATTGTGATGGGAACATGAAATTGATGAATGATCAAGGAGTCCCTTTCTCAATTTGGGCCCTCAGGACAGGACTCATTCTAGCGTCGGCCTACAATCCATATATTCTGCCAGTGACATTAGGAGCTTACTGGATGACGATACACTCTCCGAAGAGAAGTGGAGCCATCTGGGATGTTCCGGCTCCCAGGGAAAAGAAGAGAGCTGAATTGARCACTGGAGTCTTTAGAATCATGGCTAGAGGGATACTCGGAAAATATCAAGCCGGAGTGGGAGTGATGTTTGATGGGGTCTTCCACACGATGTGGCATGTGACGAATGGGGCCACCATTAACGTGGGGGACGGTTGCTTAGTTCCCTATTGGGCTAGTGTGAGAGATGACTTGATATCGTATGGAGGGCCTTGGAAGATGGGCACGAAATGGAATGGGATTGATGAGGTGCAAGTTATTGTTGTCCAACCAGGAAAATCAGTAATGAATGTGCAAACAAAGCCGGGGGTCTTTAAGACCTCTACTGGAGAAATCGGGGCAGTTACCCTAGACTATCCAACGGGAACATCAGGCTCGCCCATCGTAGACA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| 91,822
|
KC734550.1
|
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus
|
Fernandez-Pinero,J., Davidson,I., Elizalde,M., Perk,S., Khinich,Y., Jimenez-Clavero,M.A.
|
Centro de Investigacion en Sanidad Animal (CISA-INIA)
|
Spain
|
2014-01-30
|
Israel/618/1995
|
Orthoflavivirus israelense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,792
|
GenBank
| 1
|
Israel
|
Israel
|
Meleagris gallopavo
| null |
1995
| null | null |
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus isolate Israel/618/1995, complete genome
|
ACTTTGTGATTGACAGCTCAACACAAGTGCGGATTACCGTAAACACAGTTTGAACGTTTTTTGGAGAGAGACTACTATGTCTAACAAAAAACCAGGAAAACCCGGGGCAACCCGGGTTGTCAATATGCTAAAGCGCGGTGCATCCCGCGGAAATCCGATATCTCGGATCAAGAGGATGCTTGATGGACTACTCAGAGGAGTAGGACCAGTTAGAATCGTCTTGGCGATCTTGACCTTTTTCAAATTTACAGCTTTGAAACCAACGGCGGGATTGTTAAGACGATGGAAGCTGGTGGGGGTGGTTGAGGCTACTCGCCACTTGAAGAGCTTCCGAAAGGACATAGGACAAATGCTAGATGGGCTAAATAGACGCGGCAAAAAGAAGCGTGGGGGGACCACTGTGAGCGTCGTCATCCTTGTGGTATTAGGGGTGGCCCAGGCTATTAAGATCGGATCTTTGAATGGACGGCCACTTGTCACAGTTAACCAGACCGATGTGCTAGAGGCGGTTATGATCCCAACTGCTGGAGGAAACAATCGCTGCGTTGTGAAAGCCTTGGATGTTGGACTGATGTGCCCTGATGACATCACGTATTTATGCCCCAAGCTAGAGGATGGATATGACCCAGAGGACATAGACTGCTGGTGTAACACCACGGAGATCTACATCCACTACGGCCGATGCACTCCAACTCGACACGCGAGACGATCGAGGCGGTCTATCACAGTGCACCATCACGGAGAGAGCCTGCTAGAAGCAAAGAATACACCATGGATGGACTCAACTAAGGCTACCAAATACCTGACCAAGGTGGAAAACTGGGCCATACGTAACCCTGGATACGCATTAGCGGCGGCTATAATAGGATGGAACTTGGGGACAACAAAATCTCAAAAGATTATCTTTACAATTATGCTTATGCTCATTGCTCCGGCCTATAGCTTCAATTGCCTGGGAATGCAAAACAGAGATTTTGTAGAAGGTGTCAATGGAGTTGAGTGGATTGATGTCGTGATGGAAGGTGGAGGCTGTGTGACCATCACAGCGAAGGATAAGCCCACAATCGATGTGAAGATGATGAACATGGAAGCCACTGATTTGGCGCTTGTGAGATCATATTGTTATGAACCTAAAATCACTGATGTCAGTACTGCATCGAGATGTCCTACCATGGGAGAGGCCCACAACACCAAAGCAAATAACCAGATGTATGTGTGTAAGAAAGGCTATACTGACAGAGGTTGGGGTAATGGTTGTGGACTGTTCGGGAAGGGCAGTATTCACACATGCACCAAATTTGAGTGCACCAATAAGGCTGAAGGAAGAATTGTGCAGAAGGAAAATGTCCATTTCGAGTTGGCTGTGTTTGTGCACGGTTCAACAGAAATGGGAACCCACTATAACTACTCCATACAGCAGTCATTGAAGCAGGCAGCGAGGTTCATTGTCACACCCAAAGCACCAGTGTACACGGCTGAACTCAATGAGTATGGGACGGTGACTCTGGAATGTGAGCCCCGCTCCGGAATGGACATGAGCCAGTTTTATGTGCTAACCATGAATTCGAAGAGCTGGCTTGTGAACAGAGACTGGTTCCATGACTTAAACCTTCCGTGGACTGGATCATCTGCTGGCTCATGGCAAAACAGAGAATCACTGGTGGAGTTTGAAGAAGCTCATGCAACTAAACAATCAGTAGTGGCACTGGCTTCGCAGGAAGGGGCGTTACACGCGGCTCTGGCTGGAGCCATTCCAGTGAAATATGCCAGCAGTAAGCTTGAGATGACTTCTGGGTACTTAAAGTGCCGTGTGAAATTACAAGGACTGAAGTTGAAAGGAATGACTTACCCCATGTGCTCAAACAAGTTCACTCTAGCCAAGAACCCTACAGACACAGGGCATGGGACAGTTGTTGTGGAACTCAGCTATTCTGGATCTGATGGACCATGTCGCATACCCATATCAATGACAGCCAACCTGCAGGATTTGACCCCGATAGGAAGGCTCATAACGGTCAATCCATATGTGTCCACATCATCATCAGGGACAAAAGTGGTTGTTGAGCTTGAACCCCCATTTGGGGATTCATTCATTTTGGTTGGAACAGGAGAAAATCAGATAAAGTATCAATGGCACAAGAGTGGAAGCTCCATCGGCAAGGCATTCATGTCCACCGTGAGGGGAGCTCAGAGAATGGTAGCACTAGGAGACACCGCATGGGACTTTGGATCAGTCGGAGGGTTCTTCACGTCGCTAGGTAAAGGGATACACCAAGTGTTCGGAACGGCCTTCAGAAGCCTCTTTGGAGGAATGTCATGGATAACCCAGGGCCTGCTGGGAGCACTCCTGTTGTGGATGGGACTTAACGCAAGAGATAGATCGATTTCACTGACGTTCTTGGCCGTTGGAGCGATCCTCATATTCCTAGCTACGAATGTACATGCCGACACTGGTTGCGCAGTGGACATGGACAGGAAAGAACTGAAGTGCGGAAGTGGCATTTTCATATTCAATGATGTGGAAACCTGGAGGGACAATTACAAGTATTACCCATCAACTCCGCGGAATCTGGCTAAAGTCATAATGGAATCACGGGAAAAAGGAATCTGTGGTGTGAGGTCCGTGGGAAGATTGGAACATAACATGTGGAACTCAATCAAGCATGAGCTGAATGCCATACTTGAGGACAACGGGCAGGACTTGACAGTCGTCGTTGAACAGCCAACTGGTAGATTCAGGAAAACCCACCGGCGTCTAGTGTGGACAGACGAGGAATTGGAATACGGGTGGAAAAAATGGGGGAAAACATTGTTTGTAACTCCACCCATGTCCAATAACACATTTGTTGTGGATGGTCCAAAAACAAGAGAATGCCCAGATGAGAACAGAGCCTGGAACAGTCTAGAGGTGGAGGACTTCGGATTTGGGCTAACAGCAACGAAAGTTTGGTTGGGATTAAGGAAAGAAAACACAACTGAATGTGACACGGCCGTGATGGGCACAGCCATCAAGGGTGACAAAGCAGTTCACAGTGATTTGAGCTACTGGATTGAAAGCAGAAACAATGGCAGCTGGAAGCTTGAAAGAGTTGTGCTGGGAGAAGTCAAGTCATGCACTTGGCCAGATACCCACACTCTGTGGGGGGAGAGCGTCCAGGAGAGTGAATTGATCATTCCAGTCACACTGGCCGGGCCCAGGAGCAAACACAACATGAGGCCAGGCTACAAGGTGCAAGTTTCAGGACCATGGGATGAGAGAGACATCACTATCGACTTTGACTACTGTCCAGGTACCAAAGTGACAGTCACCCCAACATGCAGAGATAGGGCTGCCTCCGCTAGAACAACAACGGCTAGCGGCAAGCTGATCACAGATTGGTGTTGTAGGTCATGCACTCTCCCTCCATTGCGGTACATGACAAAGAGCGGCTGCTGGTATGGAATGGAAATTAGACCTACAGTACATGGAGACGACATGTTGATAAAATCAAGAGTCACCGCTTATGACGGAGCAGGCATGGAACCATTTCAGCTGGGTGTACTCATGATGTTTGTGGCCACGCAAGAGGTGCTGCGGAAAAGATGGACAGGCCGGATGGCCGGTCCAGCACTGGTGGGTCTATTATGTGCTATGATTTTTGGAGGGATAACTTATAGGGACATGGTGAAGTATGTCTTGTTGGTGGCGGCTGCTTTTGCCGAAAGCAACAGCGGGGGTGACGTGATCCACCTTGCTCTGATAGCAACTTTTAACGTGCAACCTGGACTGCTGGTGGCGTACTCTTTGCGGCGGAAATGGAGTAACCAGGATGCCACCCTCTTAGGCGTGGCACTAGCAATGATAACCATGGCGCTACACGACTGGAACATGACCATACCCAGCTTGTTGAACTCAGGAGCCACAGCGTGGCTGTTGCTGCGCGCAGTGAGTGAAGGGACCGTCAGCGCGGCTTGTATTCCCATCCTCGGAGTTTTGGCTCCAGGAATGAAGATAGTTGGGGTTGATGTATTTCGAATTGGATTGCTTATCATCGGAGTTATGTCACTCCTGAAAGAAAGAAACAATGCCATCGCAAAAAAGAAAGGTGGAGTGCTGATTGGTTTGGCCCTGGCCCAAGATGGCTGGGTGAACCCACTGGTGTACGCAGGACTGACGTTGGCTCTAAAACCCAGTAATAGAAGAGGATGGCCAGTAAGTGAAGCCCTCACAGCAGTAGGATTGACCTTCGCGCTAGCTGGTGGGATCGCACACTTTGACGAAGGAGACATGGCCATCCCACTGGCTGTGGGAGGAATCATGCTGGTGGTAGCTGTGGTCACAGGATTCACAACTGACTTGTGGTTGGAGCGAGCTGGAGACATCTCATGGATTGAGGATGCCCAAATCACAGGAAGCTCACAACGGTATGACGTTGAGATAGATTGTGATGGGAACATGAAATTGATGAATGATCAAGGAGTCCCTTTCTCAATTTGGGCCCTCAGGACAGGACTCATTCTAGCGTCGGCCTACAATCCATATATTCTGCCAGTGACATTAGGAGCTTACTGGATGACGATACACTCTCCGAAGAGAAGTGGAGCCATCTGGGATGTTCCGGCTCCCAGGGAAAAGAAGAGAGCTGAATTGAGCACTGGAGTCTTTAGAATCATGGCTAGAGGGATACTCGGAAAATATCAAGCCGGAGTGGGAGTGATGTTTGATGGGGTCTTCCACACGATGTGGCATGTGACGAATGGGGCCACCATTAACGTGGGGGACGGTTGCTTAGTTCCCTATTGGGCTAGTGTGAGAGATGACTTGATATCGTATGGAGGGCCTTGGAAGATGGGCACGAAATGGAATGGGATTGATGAGGTGCAAGTTATTGTTGTCCAACCAGGAAAATCAGTAATGAATGTGCAAACAAAGCCGGGGGTCTTTAAGACCTCTACTGGAGAAATCGGGGCAGTTACCCTAGACTATCCAACGGGAACATCAGGCTCGCCCATCGTAGACA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| 91,823
|
KC734551.1
|
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus
|
Fernandez-Pinero,J., Davidson,I., Elizalde,M., Perk,S., Khinich,Y., Jimenez-Clavero,M.A.
|
Centro de Investigacion en Sanidad Animal (CISA-INIA)
|
Spain
|
2014-01-30
|
Israel/107458/2010
|
Orthoflavivirus israelense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,794
|
GenBank
| 1
|
Israel
|
Israel
|
Meleagris gallopavo
| null |
2010
| null | null |
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus isolate Israel/107458/2010, complete genome
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ACTTTGTGATTGATAGTTCAACACAAGTGCGGAACACCGTAAACACAGTTTGAACGTTTTTTGGAGAGAGACTACTATGTCTAACAAAAAACCAGGAAAACCCGGGGCAACCCGGGTTGTCAATATGCTAAAGCGCGGTGCATCCCGCGGAAATCCGATATCTCGGATCAAGAGGATGCTGGATGGACTACTCAGAGGAGTAGGGCCAATCAGAATCGTATTGGCGATCCTAACCTTTTTCAAATTTACAGCTTTGAAACCAACGGCAGGATTGTTGAGACGATGGAAGTTGGTGGGAGTGGTTGAAGCCACCCGCCACTTGAAGAGCTTCCGAAAGGACATAGGACAAATGCTAGATGGACTAAACAGACGCGGCAAAAAGAAGCGTGGGGGAACCACCGTAGGCATCGCTGTTCTTGTGGTGTTGGGGGTGGCTCAGGCCATAAAGATTGGATCCTTGAATGGACGGCCACTTGTCACAGTCAACCAGACCGATGTGCTAGAGGCGGTCATGATCCCAACTACTGGAGGAAACAACCGTTGTGTTGTGAAAGCCCTGGATGTTGGACTGATGTGCCCTGATGACATTACGTACCTGTGCCCTAAGTTAGAGGATGGGTATGATCCAGAGGATATAGACTGCTGGTGCAACACCACGGAGATCTACATTCACTATGGCCGATGTACCCCAACGCGACACGCGAGACGATCGAGGCGGTCTATCACAGTGCATCATCACGGAGAGAGCTTGCTGGAAGCAAAGAATACACCATGGATGGATTCTACCAAGGCTACCAAGTATTTGACCAAGGTGGAGAATTGGGCCATACGTAACCCTGGATACGCACTAGCGGCGGCCATAATAGGATGGAATTTGGGGACAACTAAATCTCAAAAGATTATCTTTACAATCATGCTCATGCTCATTGCTCCGGCCTACAGCTTCAATTGCCTGGGAATGCAAAACAGAGATTTTGTGGAAGGTGTCAATGGAGTTGAGTGGATTGATGTCGTGATGGAAGGTGGAGGCTGCGTGACCATCACAGCGAAGGACAAACCCACAATCGATGTGAAGATGATGAATATGGAAGCCACTGATTTGGCGCTCGTGAGATCATATTGCTATGAACCCAAAATCACTGATGTTAGTACTGAACCAAGGTGCCCCACCATGGGAGAGGCCCACAACACCAAAGCAAACAATCAGGAGTATGTGTGCAAGAAAGGTTATACTGACAGAGGTTGGGGTAATGGCTGTGGACTGTTCGGAAAGGGCAGCATTCACACATGCGCCAAATTTGAATGCACCAACAAGGCTGAGGGAAGGATTGTGCAGAAGGAAAATGTTCATTTTGAGTTGGCTGTGTTTGTGCACGGTTCAACAGAAATGGGAACCTACAATAATTACTCTATACAGCAGTCATTGAAGCAGGCAGCAAGGTTCATTGTCACACCAAAAGCACCAGTGTACACGGCTGAACTCAATGAGTATGGGACGGTGACACTGGAATGTGAGCCCCGCTCTGGGATGGACATGAGCCAGTTTTATGTGCTAACCATGAATTCGAAGAGTTGGCTTGTGAACAGAGACTGGTTCCATGACCTAAACCTTCCGTGGACTGGATCATCCGCTGGCTCGTGGCAGAACAGAGAATCACTGGTTGAGTTTGAAGAAGCTCATGCAACTAAACAATCAGTGGTGGCACTGGCCTCGCAAGAAGGGGCGTTACACGCTGCCCTGGCCGGAGCCATTCCAGTGAAATACACCAGCAGCAAGCTTGAGATGACTTCGGGGCACTTAAAGTGTCGTGTGAAACTACAAGGGCTGAAATTGAAAGGAATGACTTACCCCATGTGCTCAAATAAGTTCACTCTAGCCAAGAACCCTACAGACACAGGGCACGGGACAGTTGTTGTGGAACTCAGTTATTTTGGATCTGATGGACCATGTCGTATACCCATATCAATGACAGCCAACCTGCAGGACTTGACCCCGATAGGAAGGCTCATAACGGTAAATCCATATGTGTCCACATCATYATCGGGAACAAAAGTGGTTGTTGAGCTTGAACCCCCATTTGGGGATTCATTCATTCTGGTTGGAACAGGAGAAAATCAGATAAAGTATCAATGGCACAAGAGCGGAAGTTCTATCGGCAAGGCATTCATGTCCACCGTGAGGGGAGCACAGAGAATGGTTGCACTTGGAGACACCGCATGGGACTTTGGATCAGTCGGAGGTTTCTTCACGTCACTAGGCAAAGGAATACACCAAGTGTTTGGAACGGCCTTTAGAAGCCTCTTCGGAGGAATGTCATGGATAACCCAGGGACTGCTGGGAGCACTTCTGTTGTGGATGGGATTGAATGCAAGAGACAGGTCGATCTCACTGACGTTCTTGGCTGTTGGAGCAATCCTTATATTCCTAGCTACCAATGTACATGCCGACACTGGTTGCGCGGTGGACATGGACAGGAAGGAACTGAAGTGCGGAAGTGGCATTTTTATATTCAATGACGTGGAAACCTGGAGGGACAATTATAAGTACTACCCATCAACTCCGCGGAATCTGGCTAAAATCATAATGGAATCACGGGAAAAAGGAATCTGTGGTGTACGGTCTGTGGGAAGACTGGAACACAACATGTGGAATTCGATCAAGCATGAGCTGAATGCCATACTTGAGGACAACGGGCAAGACTTGACAGTCGTTGTTGAACAGCCAACTGGTAGATTCAGGAAAACCCACCGACGTCTAGTGTGGACAGATGAGGAATTGGAATACGGGTGGGAAAAATGGGGGAAAACATTGTTTGTCACTCCACCCATGTCCAATAACACTTTTGTTGTGGATGGTCCTAAAACGAAAGAATGCCCAGATGAGAATAGAGCCTGGAACAGTCTAGAGGTGGAGGACTTCGGATTTGGGCTAACATCAACGAAAGTATGGTTAGGATTAAGGAAAGAAAACACAACTGAATGTGACACGGCCGTGATGGGCACAGCCATCAAGGGCGACAAAGCAGTTCACAGTGACTTGAGCTACTGGATTGAAAGCAGAAACAATGGCAGTTGGAAACTCGAAAGAGCGGTGCTGGGAGAAATCAAGTCATGCACTTGGCCAGACACCCACACTCTGTGGGGAGAGAGTGTTCAGGAGAGTGAATTGATCATTCCAGTTACATTGGCTGGACCCAGGAGCAAACACAACATGAGGCCAGGCTACAAGGTGCAAGTTTCAGGACCATGGGATGAGAGAGACATCACCATCGACTTTGACTACTGTCCAGGCACCAAAGTAACAGTCACCCCAACATGCAGAGATAGAGCTGCCTCCGCCAGAACAACAACGGCAAGTGGTAAATTGATTACAGATTGGTGCTGCAGGTCATGCACTCTCCCTCCACTGCGGTACATGACAAAGAGCGGCTGCTGGTATGGAATGGAGATTAGGCCTACAGTACATGGAGACGACATGTTGATAAAATCAAGAGTCATTGCTTATGACGGTGCAGGCATGGAACCATTTCAGCTGGGTGTGCTCATGATGTTCGTGGCCACGCAAGAGGTGCTGCGAAAAAGATGGACAGGCCGGATGGCCGGTCCAGCACTGGTAGGTCTACTATGTGCCATGATTTTCGGAGGGATAACCTACAGGGACATGGTGAAGTACGTCTTGTTGGTGGCTGCTGCTTTTGCCGAAAGCAACAGCGGGGGTGACGTGATCCACCTTGCTCTGATAGCAACTTTCAACGTGCAACCTGGACTGCTGGTAGCGTATTCCTTGCGACGGAAATGGAGTAACCAGGATGCCACCCTCTTAGGTGTAGCACTGGCAATGATAACTATGGCGTTGCACGACTGGAACATGACCATACCCAGCCTGCTGAATTCAGGAGCCACAGCGTGGCTGTTGCTGCGCGCAGTGAGTGAAGGGACCGTCAGTGCGGCCTGCATTCCCATTCTAGGACTTTTGGCTCCAGGAATGAAGATGGTTGGAATTGATGTATTTCGGATCGGACTGCTCATCGTCGGAGTTATGTCACTCCTGAAAGAAAGAAACAATGCCATTGCAAAGAAGAAAGGTGGAGTGCTGATTGGCTTAGCCCTGGCCCAAGATGGCTGGGTGAACCCACTGGTGTATGCAGGATTGACGTTGGCTCTAAAACCCAGCAATAGAAGAGGATGGCCAGTGAGTGAAGCCCTCACGGCAGTAGGACTGACCTTCGCGCTAGCTGGTGGGATCGCACACTTTGACGAAGGAGACATGGCCATTCCACTGGCTGTAGGAGGAATAATGCTGGTGGTAGCTGTGGTTACAGGATTCACGACTGATTTGTGGTTGGAGCGAGCTGGAGACATCTCATGGATTGAGGATGCCCAAATCACAGGAAGCTCACAACGGTATGACGTTGAGATAGATTGTGACGGGAATATGAAATTGATGAATGATCAAGGAGTTCCTTTTTCAATTTGGGCCCTCAGGACAGGACTCATTCTAGCATCGGCCTACAATCCATACATTCTGCCAGTGACATTAGGAGCTTACTGGATGACGATACACTCCCCGAAGAGAAGTGGAGCCATCTGGGATGTTCCGGCTCCCAAGGAAAAGAAGAGAGCTGAACTGAGCACCGGAGTCTTCAGAATTATGGCCAGAGGAAYACTTGGAAAATATCAAGCTGGAGTGGGAGTGATGTTTGATGGGGTCTTCCACACGATGTGGCATGTGACGAATGGGGCCACCATTAACGTGGGGGACGGTTGCTTAGTCCCCTATTGGGCTAGTGTAAGAGATGACTTGATATCGTATGGAGGACCTTGGAAGATGGGCACGAAATGGAACGGGGTTGATGAGGTGCAAGTTATTGTTGTCCAGCCAGGGAAATCAGTCATGAATGTGCAAACAAAGCCAGGAGTTTTTAAGACCTCTACTGGAGAAATTGGGGCAGTCACCCTAGACTATCCAACAGGAACATCAGGCTCTCCCATCGTGGACA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| 91,824
|
KC734552.1
|
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus
|
Fernandez-Pinero,J., Davidson,I., Elizalde,M., Perk,S., Khinich,Y., Jimenez-Clavero,M.A.
|
Centro de Investigacion en Sanidad Animal (CISA-INIA)
|
Spain
|
2014-01-30
|
Israel/106819/2010
|
Orthoflavivirus israelense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,794
|
GenBank
| 1
|
Israel
|
Israel
|
Meleagris gallopavo
| null |
2010
| null | null |
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus isolate Israel/106819/2010, complete genome
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ACTTTGTGATTGATAGTTCAACACAAGTGCGGAACACCGTAAACACAGTTTGAACGTTTTTTGGAGAGAGACTACTATGTCTAACAAAAAACCAGGAAAACCCGGGGCAACCCGGGTTGTCAATATGCTAAAGCGCGGTGCATCCCGCGGAAATCCGATATCTCGGATCAAGAGGATGCTGGATGGACTACTCAGAGGAGTAGGGCCAATCAGAATCGTATTGGCGATCCTAACCTTTTTCAAATTTACAGCTTTGAAACCAACGGCAGGATTGTTGAGACGATGGAAGTTGGTGGGAGTGGTTGAAGCCACCCGCCACTTGAAGAGCTTCCGAAAGGACATAGGACAAATGCTAGATGGACTAAACAGACGCGGCAAAAAGAAGCGTGGGGGAACCACCGTAGGCATCGCTGTTCTTGTGGTGTTGGGGGTGGCTCAGGCCATAAAGATTGGATCCTTGAATGGACGGCCACTTGTCACAGTCAACCARACCGATGTGCTAGAGGCGGTCATGATCCCAACTACTGGAGGAAACAACCGTTGTGTTGTGAAAGCCCTGGATGTTGGACTGATGTGCCCTGATGACATTACGTACCTGTGCCCTAAGTTAGAGGATGGGTATGATCCAGAGGATATAGACTGCTGGTGCAACACCACGGAGATCTACATTCACTATGGCCGATGTACCCCAACGCGACACGCGAGACGATCGAGGCGGTCTATCACAGTGCATCATCACGGAGAGAGCTTGCTGGAAGCAAAGAATACACCATGGATGGATTCTACCAAGGCTACCAAGTATTTGACCAAGGTGGAGAATTGGGCCATACGTAACCCTGGATACGCACTAGCGGCGGCCATAATAGGATGGAATTTGGGGACAACTAAATCTCAAAAGATTATCTTTACAATCATGCTCATGCTCATTGCTCCGGCCTACAGCTTCAATTGCCTGGGAATGCAAAACAGAGATTTTGTGGAAGGTGTCAATGGAGTTGAGTGGATTGATGTCGTGATGGAAGGTGGAGGCTGCGTGACCATCACAGCGAAGGACAAACCCACAATCGATGTGAAGATGATGAATATGGAAGCCACTGATTTGGCGCTCGTGAGATCATATTGCTATAAACCCAAAATCACTGATGTTAGTACTGAACCAAGGTGCCCCACCATGGGAGAGGCCCACAACACCAAAGCAAACAATCAGGAGTATGTGTGCAAGAAAGGTTATACTGACAGAGGTTGGGGTAATGGCTGTGGACTGTTCGGAAAGGGCAGCATTCACACATGCGCCAAATTTGAATGCACCAACAAGGCTGAGGGAAGGATTGTGCAGAAGGAAAATGTTCATTTTGAGTTGGCTGTGTTTGTGCACGGTTCAACAGAAATGGGAACCTACAATAATTACTCTATACAGCAGTCATTGAAGCAGGCAGCAAGGTTCATTGTCACACCAAAAGCACCAGTGTACACGGCTGAACTCAATGAGTATGGGACGGTGACACTGGAATGTGAGCCCCGCTCTGGGATGGACATGAGCCAGTTTTATGTGCTAACCATGAATTCGAAGAGTTGGCTTGTGAACAGAGACTGGTTCCATGACCTAAACCTTCCGTGGACTGGATCATCCGCTGGCTCGTGGCAGAACAGAGAATCACTGGTTGAGTTTGAAGAAGCTCATGCAACTAAACAATCAGTGGTGGCACTGGCCTCGCAAGAAGGGGCGTTACACGCTGCCCTGGCCGGAGCCATTCCAGTGAAATACACCAGCAGCAAGCTTGAGATGACTTCGGGGCACTTAAAGTGTCGTGTGAAACTACAAGGGCTGAAATTGAAAGGAATGACTTACCCCATGTGCTCAAATAAGTTCACTCTAGCCAAGAACCCTACAGACACAGGGCACGGGACAGTTGTTGTGGAACTCAGTTATTCTGGATCTGATGGACCATGTCGTATACCCATATCAATGACAGCCAACCTGCAGGACTTGACCCCGATAGGAAGGCTCATAACGGTAAATCCATATGTGTCCACATCATCATCGGGAACAAAAGTGGTTGTTGAGCTTGAACCCCCATTTGGGGATTCATTCATTCTGGTTGGAACAGGAGAAAATCAGATAAAGTATCAATGGCACAAGAGCGGAAGTTCTATCGGCAAGGCATTCATGTCCACCGTGAGGGGAGCACAGAGAATGGTTGCACTTGGAGACACCGCATGGGACTTTGGATCAGTCGGAGGTTTCTTCACGTCACTAGGCAAAGGAATACACCAAGTGTTTGGAACGGCCTTTAGAAGCCTCTTCGGAGGAATGTCATGGATAACCCAGGGACTGCTGGGAGCACTTCTGTTGTGGATGGGATTGAATGCAAGAGACAGGTCGATCTCACTGACGTTCTTGGCTGTTGGAGCAATCCTTATATTCCTAGCTACCAATGTACATGCCGACACTGGTTGCGCGGTGGACATGGACAGGAAGGAACTGAAGTGCGGAAGTGGCATTTTTATATTCAATGACGTGGAAACCTGGAGGGACAATTATAAGTACTACCCATCAACTCCGCGGAATCTGGCTAAAATCATAATGGAATCACGGGAAAAAGGAATCTGTGGTGTACGGTCTGTGGGAAGACTGGAACACAACATGTGGAATTCGATCAAGCATGAGCTGAATGCCATACTTGAGGACAACGGGCAAGACTTGACAGTCGTTGTTGAACAGCCAACTGGTAGATTCAGGAAAACCCACCGACGTCTAGTGTGGACAGATGAGGAATTGGAATACGGGTGGGAAAAATGGGGGAAAACATTGTTTGTCACTCCACCCATGTCCAATAACACTTTTGTTGTGGATGGTCCTAAAACGAAAGAATGCCCAGATGAGAATAGAGCCTGGAACAGTCTAGAGGTGGAGGACTTCGGATTTGGGCTAACATCAACGAAAGTATGGTTAGGATTAAGGAAAGAAAACACAACTGAATGTGACACGGCCGTGATGGGCACAGCCATCAAGGGCGACAAAGCAGTTCACAGTGACTTGAGCTACTGGATTGAAAGCAGAAACAATGGCAGTTGGAAACTCGAAAGAGCGGTGCTGGGAGAAATCAAGTCATGCACTTGGCCAGACACCCACACTCTGTGGGGAGAGAGTGTTCAGGAGAGTGAATTGATCATTCCAGTTACATTGGCTGGACCCAGGAGCAAACACAACATGAGGCCAGGCTACAAGGTGCAAGTTTCAGGACCATGGGATGAGAGAGACATCACCATCGACTTTGACTACTGTCCAGGCACCAAAGTAACAGTCACCCCAACATGCAGAGATAGAGCTGCCTCCGCCAGAACAACAACGGCAAGTGGTAAATTGATTACAGATTGGTGCTGCAGGTCATGCACTCTCCCTCCACTGCGGTACATGACAAAGAGCGGCTGCTGGTATGGAATGGAGATTAGGCCTACAGTACATGGAGACGACATGTTGATAAAATCAAGAGTCATTGCTTATGACGGTGCAGGCATGGAACCATTTCAGCTGGGTGTGCTCATGATGTTCGTGGCCACGCAAGAGGTGCTGCGAAAAAGATGGACAGGCCGGATGGCCGGTCCAGCACTGGTAGGTCTACTATGTGCCATGATTTTCGGAGGGATAACCTACAGGGACATGGTGAAGTACKTCTTGTTGGTGGCTGCTGCTTTTGCCGAAAGCAACAGCGGGGGTGACGTGATCCACCTTGCTCTGATAGCAACTTTCAACGTGCAACCTGGACTGCTGGTAGCGTATTCCTTGCGACGGAAATGGAGTAACCAGGATGCCACCCTCTTAGGTGTAGCACTGGCAATGATAACTATGGCGTTGCACGACTGGAACATGACCATACCCAGCCTGCTGAATTCAGGAGCCACAGCGTGGCTGTTGCTGCGCGCAGTGAGTGAAGGGACCGTCAGTGCGGCCTGCATTCCCATTCTAGGACTTTTGGCTCCAGGAATGAAGATGGTTGGAATTGATGTATTTCGGATCGGACTGCTCATCGTCGGAGTTATGTCACTCCTGAAAGAAAGAAACAATGCCATTGCAAAGAAGAAAGGTGGAGTGCTGATTGGCTTAGCCCTGGCCCAAGATGGCTGGGTGAACCCACTGGTGTATGCAGGATTGACGTTGGCTCTAAAACCCAGCAATAGAAGAGGATGGCCAGTGAGTGAAGCCCTCACGGCAGTAGGACTGACCTTCGCGCTAGCTGGTGGGATCGCACACTTTGACGAAGGAGACATGGCCATTCCACTGGCTGTAGGAGGAATAATGCTGGTGGTAGCTGTGGTTACAGGATTCACGACTGATTTGTGGTTGGAGCGAGCTGGAGACATCTCATGGATTGAGGATGCCCAAATCACAGGAAGCTCACAACGGTATGACGTTGAGATAGATTGTGACGGGAATATGAAATTGATGAATGATCAAGGAGTTCCTTTTTCAATTTGGGCCCTCAGGACAGGACTCATTCTAGCATCGGCCTACAATCCATACATTCTGCCAGTGACATTAGGAGCTTACTGGATGACGATACACTCCCCGAAGAGAAGTGGAGCCATCTGGGATGTTCCGGCTCCCAAGGAAAAGAAGAGAGCTGAACTGAGCACCGGAGTCTTCAGAATTATGGCCAGAGGAATACTTGGAAAATATCAAGCTGGAGTGGGAGTGATGTTTGATGGGGTCTTCCACACGATGTGGCATGTGACGAATGGGGCCACCATTAACGTGGGGGACGGTTGCTTAGTCCCCTATTGGGCTAGTGTAAGAGATGACTTGATATCGTATGGAGGACCTTGGAAGATGGGCACGAAATGGAACGGGGTTGATGAGGTGCAAGTTATTGTTGTCCAGCCAGGGAAATCAGTCATGAATGTGCAAACAAAGCCAGGAGTTTTTAAGACCTCTACTGGAGAAATTGGGGCAGTCACCCTAGACTATCCAACAGGAACATCAGGCTCTCCCATCGTGGACA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| 91,825
|
KC734553.1
|
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus
|
Fernandez-Pinero,J., Davidson,I., Elizalde,M., Perk,S., Khinich,Y., Jimenez-Clavero,M.A.
|
Centro de Investigacion en Sanidad Animal (CISA-INIA)
|
Spain
|
2014-01-30
|
Israel/105520/2010
|
Orthoflavivirus israelense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,777
|
GenBank
| 1
|
Israel
|
Israel
|
Meleagris gallopavo
| null |
2010
| null | null |
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus isolate Israel/105520/2010, complete genome
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TCAACACAAGTGCGGAACACCGTAAACACAGTTTGAACGTTTTTTGGAGAGAGACTACTATGTCTAACAAAAAACCAGGAAAACCCGGGGCAACCCGGGTTGTCAATATGCTAAAGCGCGGTGCATCCCGCGGAAATCCGATATCTCGGATCAAGAGGATGCTGGATGGACTACTCAGAGGAGTAGGGCCAATCAGAATCGTATTGGCGATCCTAACCTTTTTCAAATTTACAGCTTTGAAACCAACGGCAGGATTGTTGAGACGATGGAAGTTGGTGGGAGTGGTTGAAGCCACCCGCCACTTGAAGAGCTTCCGAAAGGACATAGGACAAATGCTAGATGGACTAAACAGACGCGGCAAAAAGAAGCGTGGGGGAACCACCGTAGGCATCGCTGTTCTTGTGGTGTTGGGGGTGGCTCAGGCCATAAAGATTGGATCCTTGAATGGACGGCCACTTGTCACAGTCAACCAGACCGATGTGCTAGAGGCGGTCATGATCCCAACTACTGGAGGAAACAACCGTTGTGTTGTGAAAGCCCTGGATGTTGGACTGATGTGCCCTGATGACATTACGTACCTGTGCCCTAAGTTAGAGGATGGGTATGATCCAGAGGATATAGACTGCTGGTGCAACACCACGGAGATCTACATTCACTATGGCCGATGTACCCCAACGCGACACGCGAGACGATCGAGGCGGTCTATCACAGTGCATCATCACGGAGAGAGCTTGCTGGAAGCAAAGAATACACCATGGATGGATTCTACCAAGGCTACCAAGTATTTGACCAAGGTGGAGAATTGGGCCATACGTAACCCTGGATACGCACTAGCGGCGGCCATAATAGGATGGAATTTGGGGACAACTAAATCTCAAAAGATTATCTTTACAATCATGCTCATGCTCATTGCTCCGGCCTACAGCTTCAATTGCCTGGGAATGCAAAACAGAGATTTTGTGGAAGGTGTCAATGGAGTTGAGTGGATTGATGTCGTGATGGAAGGTGGAGGCTGCGTGACCATCACAGCGAAGGACAAACCCACAATCGATGTGAAGATGATGAATATGGAAGCCACTGATTTGGCGCTCGTGAGATCATATTGCTATGAACCCAAAATCACTGATGTTAGTACTGAACCAAGGTGCCCCACCATGGGAGAGGCCCACAACACCAAAGCAAACAATCAGGAGTATGTGTGCAAGAAAGGTTATACTGACAGAGGTTGGGGTAATGGCTGTGGACTGTTCGGAAAGGGCAGCATTCACACATGCGCCAAATTTGAATGCACCAACAAGGCTGAGGGAAGGATTGTGCAGAAGGAAAATGTTCATTTTGAGTTGGCTGTGTTTGTGCACGGTTCAACAGAAATGGGAACCTACAATAATTACTCTATACAGCAGTCATTGAAGCAGGCAGCAAGGTTCATTGTCACACCAAAAGCACCAGTGTACACGGCTGAACTCAATGAGTATGGGACGGTGACACTGGAATGTGAGCCCCGCTCTGGGATGGACATGAGCCAGTTTTATGTGCTAACCATGAATTCGAAGAGTTGGCTTGTGAACAGAGACTGGTTCCATGACCTAAACCTTCCGTGGACTGGATCATCCGCTGGCTCGTGGCAGAACAGAGAATCACTGGTTGAGTTTGAAGAAGCTCATGCAACTAAACAATCAGTGGTGGCACTGGCCTCGCAAGAAGGGGCGTTACACGCTGCCCTGGCCGGAGCCATTCCAGTGAAATACACCAGCAGCAAGCTTGAGATGACTTCGGGGCACTTAAAGTGTCGTGTGAAACTACAAGGGCTGAAATTGAAAGGAATGACTTACCCCATGTGCTCAAATAAGTTCACTCTAGCCAAGAACCCTACAGACACAGGGCACGGGACAGTTGTTGTGGAACTCAGTTATTCTGGATCTGATGGACCATGTCGTATACCCATATCAATGACAGCCAACCTGCAGGACTTGACCCCGATAGGAAGGCTCATAACGGTAAATCCATATGTGTCCACATCATCATCGGGAACAAAAGTGGTTGTTGAGCTTGAACCCCCATTTGGGGATTCATTCATTCTGGTTGGAACAGGAGAAAATCAGATAAAGTATCAATGGCACAAGAGCGGAAGTTCTATCGGCAAGGCATTCATGTCCACCGTGAGGGGAGCACAGAGAATGGTTGCACTTGGAGACACCGCATGGGACTTTGGATCAGTCGGAGGTTTCTTCACGTCACTAGGCAAAGGAATACACCAAGTGTTTGGAACGGCCTTTAGAAGCCTCTTCGGAGGAATGTCATGGATAACCCAGGGACTGCTGGGAGCACTTCTGTTGTGGATGGGATTGAATGCAAGAGACAGGTCGATCTCACTGACGTTCTTGGCTGTTGGAGCAATCCTTATATTCCTAGCTACCAATGTACATGCCGACACTGGTTGCGCGGTGGACATGGACAGGAAGGAACTGAAGTGCGGAAGTGGCATTTTTATATTCAATGACGTGGAAACCTGGAGGGACAATTATAAGTACTACCCATCAACTCCGCGGAATCTGGCTAAAATCATAATGGAATCACGGGAAAAAGGAATCTGTGGTGTACGGTCTGTGGGAAGACTGGAACACAACATGTGGAATTCGATCAAGCATGAGCTGAATGCCATACTTGAGGACAACGGGCAAGACTTGACAGTCGTTGTTGAACAGCCAACTGGTAGATTCAGGAAAACCCACCGACGTCTAGTGTGGACAGATGAGGAATTGGAATACGGGTGGGAAAAATGGGGGAAAACATTGTTTGTCACTCCACCCATGTCCAATAACACTTTTGTTGTGGATGGTCCTAAAACGAAAGAATGCCCAGATGAGAATAGAGCCTGGAACAGTCTAGAGGTGGAGGACTTCGGATTTGGGCTAACATCAACGAAAGTATGGTTAGGATTAAGGAAAGAAAACACAACTGAATGTGACACGGCCGTGATGGGCACAGCCATCAAGGGCGACAAAGCAGTTCACAGTGACTTGAGCTACTGGATTGAAAGCAGAAACAATGGCAGTTGGAAACTCGAAAGAGCGGTGCTGGGAGAAATCAAGTCATGCACTTGGCCAGACACCCACACTCTGTGGGGAGAGAGTGTTCAGGAGAGTGAATTGATCATTCCAGTTACATTGGCTGGACCCAGGAGCAAACACAACATGAGGCCAGGCTACAAGGTGCAAGTTTCAGGACCATGGGATGAGAGAGACATCACCATCGACTTTGACTACTGTCCAGGCACCAAAGTAACAGTCACCCCAACATGCAGAGATAGAGCTGCCTCCGCCAGAACAACAACGGCAAGTGGTAAATTGATTACAGATTGGTGCTGCAGGTCATGCACTCTCCCTCCACTGCGGTACATGACAAAGAGCGGCTGCTGGTATGGAATGGAGATTAGGCCTACAGTACATGGAGACGACATGTTGATAAAATCAAGAGTCATTGCTTATGACGGTGCAGGCATGGAACCATTTCAGCTGGGTGTGCTCATGATGTTCGTGGCCACGCAAGAGGTGCTGCGAAAAAGATGGACAGGCCGGATGGCCGGTCCAGCACTGGTAGGTCTACTATGTGCCATGATTTTCGGAGGGATAACCTACAGGGACATGGTGAAGTACGTCTTGTTGGTGGCTGCTGCTTTTGCCGAAAGCAACAGCGGGGGTGACGTGATCCACCTTGCTCTGATAGCAACTTTCAACGTGCAACCTGGACTGCTGGTAGCGTATTCCTTGCGACGGAAATGGAGTAACCAGGATGCCACCCTCTTAGGTGTAGCACTGGCAATGATAACTATGGCGTTGCACGACTGGAACATGACCATACCCAGCCTGCTGAATTCAGGAGCCACAGCGTGGCTGTTGCTGCGCGCAGTGAGTGAAGGGACCGTCAGTGCGGCCTGCATTCCCATTCTAGGACTTTTGGCTCCAGGAATGAAGATGGTTGGAATTGATGTATTTCGGATCGGACTGCTCATCGTCGGAGTTATGTCACTCCTGAAAGAAAGAAACAATGCCATTGCAAAGAAGAAAGGTGGAGTGCTGATTGGCTTAGCCCTGGCCCAAGATGGCTGGGTGAACCCACTGGTGTATGCAGGATTGACGTTGGCTCTAAAACCCAGCAATAGAAGAGGATGGCCAGTGAGTGAAGCCCTCACGGCAGTAGGACTGACCTTCGCGCTAGCTGGTGGGATCGCACACTTTGACGAAGGAGACATGGCCATTCCACTGGCTGTAGGAGGAATAATGCTGGTGGTAGCTGTGGTTACAGGATTCACGACTGATTTGTGGTTGGAGCGAGCTGGAGACATCTCATGGATTGAGGATGCCCAAATCACAGGAAGCTCACAACGGTATGACGTTGAGATAGATTGTGACGGGAATATGAAATTGATGAATGATCAAGGAGTTCCTTTTTCAATTTGGGCCCTCAGGACAGGACTCATTCTAGCATCGGCCTACAATCCATACATTCTGCCAGTGACATTAGGAGCTTACTGGATGACGATACACTCCCCGAAGAGAAGTGGAGCCATCTGGGATGTTCCGGCTCCCAAGGAAAAGAAGAGAGCTGAACTGAGCACCGGAGTCTTCAGAATTATGGCCAGAGGAATACTTGGAAAATATCAAGCTGGAGTGGGAGTGATGTTTGATGGGGTCTTCCACACGATGTGGCATGTGACGAATGGGGCCACCATTAACGTGGGGGACGGTTGCTTAGTCCCCTATTGGGCTAGTGTAAGAGATGACTTGATATCGTATGGAGGACCTTGGAAGATGGGCACGAAATGGAACGGGGTTGATGAGGTGCAAGTTATTGTTGTCCAGCCAGGGAAATCAGTCATGAATGTGCAAACAAAGCCAGGAGTTTTTAAGACCTCTACTGGAGAAATTGGGGCAGTCACCCTAGACTATCCAACAGGAACATCAGGCTCTCCCATCGTGGACAAGGAAGGGAACATAATT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| 91,826
|
NC_009025.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Maori,E., Lavi,S., Mozes-Koch,R., Gantman,Y., Peretz,Y., Edelbaum,O., Tanne,E., Sela,I.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2007-02-20
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,499
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Israel acute paralysis virus of bees
|
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| 8,009
|
OP972881.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Kwon,M., Jung,C., Kil,E.-J.
|
Andong National University, Department of Plant Medicals
| null |
2023-06-11
|
Hwasun_A
|
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,602
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apis mellifera
| null |
2022-04-03
|
SAMN32235558
|
PRJNA912226
|
MAG: Israeli acute paralysis virus isolate Hwasun_A, complete genome
|
CTTTTATGTCCCTACGTACAATTTTTGCTGAGATTAGCGATATAATTTCAAAATATTTCGCGGCGCCTGAGCAGCCTTTTCAATGGTAGGAGCGTCGATCCCCCGTATGGAGTGGAGAATATAAGGCTCAGTTAGGATGACACGCCTGTACACTGTCAACATTAGTTAAGTTACAATTACACGTCTTTTGCCGAAGAAACCATTTTAGTCAACTGATTATGATTTTTGTATAACGACAAACAGTGGTGAACTGTATAACTCATCAATGATAAAACGGATTACGAACCTGTTAGTAACTATCTTGATCGAAGTCTAGTAGATCCCAAATATAGCCTTGAAAAGCTTGATGGACGAGATAGCTCTATTAACAGACGTGAGGCTTTAAATCCTGATAAGTACATTACCTGAGAATTCCTCCTTTTGGAGTTTGAATTTATATAAGTTAGTACCAATAGTTAATATCATTTAAGTATGTTATTATCGCTGAAGGCATGTATTTCGGATAATAACCTCTACATTGATATATAAACTATATGCAAGTCTCGGTGGATATTGCGTTATGGTCGCAGTTAACCTGTAGCTTATATATTCCTGTGTCGGAGCAGTGGTAATGGAGCCGGACAATTTCGCCAAAATGTTTACTTCTCAACAAAATACTAAAATTACCAAACAACCCGCCCCCCTTTCTTATCTTGCAAGTATGCGAGCAATTACTATGGACGAAGAGCAAGAATATTTTCTTACTCTAAAGTCTGTAGAAAGAGCTCAAATACTGAAGATGGTTTATGTGGATCAAATTGATTTCTTTATTTTACATCAAGATATCAATTGTATTGGTTTTACATTGACCATAGTAGATAAGGATGAAAGAACGAAGGACCTCGAGTATTTTGATCTTAATTGTGAGTATTATGAAAACCTATATGATGCATTAATGGATTCCGAATTTTCTAAAATTTGGTTTACATTGTTGCTAAAATATATTGATTATGCTCCAATTAGTATGAATAGTCGAGGAATGCCCCGTTCAGAGACCATCTGTGTTTCAAAACACTGGTGGTATGAGTTGTACAGGATTGGATTCTTAAATCAGTTATGTCGATGTGGTGACTGGGATAGTATTTTGCTTCTCCTTTCAGGAGATATTGAAGAAAACCCAGGACCCGTTGAGATATCTTATAAGGAATCTTGTAGACAGAAGAGAATGAAGAAACGCGTTTCTAAGACTTATGAGGAAATTAAAATGCAGCAGCATATTGATAGAATCAATAATGAAGAGAAACGTGCACATATGACGAAACTACGCAAGTTAAGGGATTTGATTGAAGTTGAAATGCAAGGAATGTTTAATTGGACTGAAGAGAGAGAAATCTTGAAAAGTACTGCATTCAAATTCAATCATTCTATGGACCGAGCGAATCATATTATGGATAATCTGATCCCACAACTTGAGGATACTTTGTCTGGTTTCAGACAAACGTATGCAAAGTGTGAAGCGAAATTCTTTGGATCAATAAGTGTTATTGATGTCTGCATAGATATCATTAGTGCTTTGTTACAAGTGAGCTTTGCTAAACCTGGACTTAAGTTAGCTTCTATTGCAGTAGAAGTGTTTAGACTTATCAAGAAATATGTTTCAGGAATTAAGATTAACACTGATAAGATAAAAGAACTTTTGACTTTTGGTAAACAAGCCTTAAGTGGTAGCAACCCTATTATTCAGGTTTCCATGCAGATGGATATGCCAGAAGTCGATCCTTCAATTTTATTGCAACCCGGTGTTATAGTAAGCGCAATATTTTTAGTTTTAAGTGTGGTTTTTACTAAAACACTCCCAAGTAAGACTGGTGTTGAGGCGATGTTAAAGAGGACTGGAGAATTAGGGCGCTCTGCAAAGGGCATTATGGATCTTAATACAGTTCTTAATACATCAGTAACCTCAATGCTTGAATATTTTGGAGTACATACTTTAGGATTAAGACAAGAAGCTGAACTTCAAGTTCTCGTAGAAGGTTATAAAACCTGGTGCGATGAAGTTGCGGCTTTAGTAGGACATAAGATTAACATGGATGGTACTTTTGATGGAAGAAGTATTGTTGAAGATATTATGAGAGATACAAAAGAAATCCAACGTGTAGAGAATCTCTACAAACGTGGATTGGAAATTTCTCGTAATATTGCAGACATGAAACTTCCAACAAAATTAACCATTAGTTTTAATACACACATGAGATACTTGACTGAAGTTTTCAAGGCAGTAGATACATCTGGTGCTTTTGGAAATAAACCCCGAACTCAACCTGTAGTTATTTGGCTATATGGTGAGTCTGGAGTTGGTAAGTCAGGTATGACATGGCCCCTAGCTGTAGATCTTAATAATAGTTTAGTAGATAATGTAGAAGAGATGCGTAATTTTTCCAAGAATATATATATGAGAAATGTAGAACAAGAATTTTGGGATAATTATCAAGGACAAAATGTTGTAGTTTATGACGATTTTGGACAGATGAGAGATTCAACATCTAATCCTAATCCTGAATTTATGGAATTAATACGCACAGCTAATATAGCTCCTTATCCTCTACATATGGCCCATTTAGAAGATAAGCGTAAAACTAAATTTACATCTAAAGTAATTATCATGACATCTAATGTTTTTGAACAGTCTGTTAATTCGCTAACTTTTCCTGATGCTTTTAGACGCAGAGTTGATCTGTGTGCTGAAGTACGTAATAAGGATGAGTTTACGAAGGAAGGATATTCAAAGACTAAAGGATGCATGGTAAGACGCTTAGATAAGGATTTGGTTAAGAAGAAGACTGGAGACATATGTTCAACAGAATGTTATTTAGTAGATTTGGTGAATCCCGAAACCGGAGAGAAATACCAAACCAATTTAGAATATGAGGATTTTCTAGATATGTGTTTGGAGAAAACTCAAGAGTGTAGAGATAATTCTGCTAAGTTGAACGAATTTCTGATGAACTATGCCGAAAGTCGATCAAAACGACCTGAACAAAAACATGACAAGTGCCCTGAATTGGAATTTGAAGATGCAATTGAAGTGTCTATGCAAGTAGACGCTGATTCGTCTCTAGTTCCAATTGAGAAATCTCGTCTTCAAGAGATGATTGAGAGTTGCCAAGGAGTTGTGTATGATGCCTGTGGCAAGACCGTATACATTTCTAAGTTAGCTTTTGAATTAGCCCCTCTTGAATATGAGAAACAAATGGAAAGAATTTCAGAGATGAAATTTTATCAGAAAATGGCAAGTGGTGTTGTATATCTTCATCAAGTTCGTGATACGAGTATGAAAATGCTCAATTCATGGATGGAAGAGTGTATGCAATACGCAAAGGATCACCCTTGGACAATAGTAGCTGGAGTTCTAGGAACCTTCATTGGCATTCTTACCATTGTTGGTTTTTGGAAATGGCTATGCTCTGATGGACAGAAGAAGAAACAGGCAATTAAGCGTCATTTCATTAATACTGGATATACACTTATTATACCTGAACGAGAATTGAATAAATTTTGGGAGTTGGATGAAACTCTTGATTTACGTAGAATGCCTGTAAATCAAATAGAGGAACATCTCGCTCTATTACTGAAGCCGCGTCATCGCGTAGTTTTAGTACCTAAAGCCACTAAGTACATAATAAGTTTAGTAGATAATCATGCCAAATTGACAGAGAAGATTATTCTTATAACTGCTAATAGGTATGTGTTTTATAAAAATCAAAATTATGAATTAGTGTTTGGAGAATTAAATCAATTTTTCGAAAAAGATCCAGAATCCCTTGTGAATACTCCTAAGGTTGAAGCTTTTGCTTCTGCTGATTTGAGTACTTACAAAAATAGGACCCCAATTGTGATCGAAGCACAGACATCTGGAGATAATGTGACTCTTAAACAACAAAAGGTTAAAGTAATTGAAGCAAAAACATCTACTGATGAAGCTACTTTGAAACAACAAAAACCTATTGTTATAGAGGCACAGTCTTCTGGTGATTGTGTGACCCGAAAACGACAAGTACAACGAGTGATTGAAGCATTTGCAAGTAGTGATGCTGTGACATTGAAGAAACCTACTGCGAAATTCGTGGAAAGTGACCCAAATGACATAGTTGATGTTACAATGCAGATGTGGAAAGATCAAGTTGCTCAACGATTGATAACCAATCGTGTATTGACAAATTTGTATAAAGTTTGTTTGGTACACGATGACGATCGAATAACACCTCTTTTGAATGGACTTTTTGTTCGTTCAAATTTAATGCTAGTACCTGGACATCTTCTTGGATTCATTGCTGAGTATGATACAATTGAAATTCGAAATCTCTTTGACGTGGTATTTAGAGTGCCATGGAAAGATGTGAAGAAAATTCCAATTGTTAATGCTCTTGGTGAATCTAAAGAAGCAGCGTTGTTGGCCTTCCCAAAATTTGTTTGCCAACATTCTGATTTAGTTAAGCATTTCCAAAATGCTGAATCTATGTCGAAATTTAAACGATGTGAAGTTACTCTACCCGTTTTACGTTTCTCTGAGAAAGTTGGTAAATTCTTATCAACACTCATTGAGTGTGATCGAGTGGAGGCTTATGATAGGCCTTATACGCTGAATGATTCTCAAAAAGGACAATATATTCTACGTCAAGGCTTAGAATATGCGATGCCCACGACTAATGGTGATTGTGGTTCGCCGCTCATCATTAATGAAACCCAAGTTTTGAGGAAAATTGCTGGTATTCATGTAGCTGGAGCTACAACTGGCAAAGCCTATGCTGAGTCTATAACCCAAAAAGATCTTGAGCGAGCATTTACTAAAATAGATGTAAGCATGCAGATCCAACTGGATTTGGATTCAACATTGGACTTCTCAAAACCCGAACCCAAATTACCTTCTGGTACTGAATTTGGTCCTGAAGATCTCAGCTTTTGTGATCTTCCTGCCCTAAAAATGTTACCAGTTGGTAGACTTTCCGAATCCTTATTCGAAC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| 15,240
|
OP972882.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Kwon,M., Jung,C., Kil,E.-J.
|
Andong National University, Department of Plant Medicals
| null |
2023-06-11
|
Hwasun_B
|
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,633
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apis mellifera
| null |
2022-04-03
|
SAMN32235559
|
PRJNA912226
|
MAG: Israeli acute paralysis virus isolate Hwasun_B, complete genome
|
CTTAATACATCAGTAACCTCAATGCTTGAATACTTTGGCTACGTACAATTTTCGCTGAGATTAGCGATATAATTTCAAAATTATTTTGCGGCGCCTGAGCAGCCTTTCCAATGGTAGGAGCGTCGATCCCCCGTATGGAGTGGAGAATATAAGGCTCAGCTAGGATGACACGCCTGTACACTGTCAACATTAGTTAAGTTACAATTACACGTCTTTTGCCGAAGAAACCATTTTAGTCAACTGATTATGATTTTTGTATAACGATAAACAGTGGTGAACTGTATAACTCATCAAAAATAAAACGGATTACGAACCTGTTATTAACTATCTTGATCGAAGTCTAGTAGATCCCAAATATAGCCCTGAAAAGCTTGATGGATGAGATAGCTCTATTAACAGACGTGAGGCTTTAAATCCTGATAAGTACATTACCTGAGAATTCCTCCTTTTGGAGTTTGAACTTATGTAAGTTAGTACCAATAGTTAATATCATTTAAGTATGTTATTATCGCTGAAGGCATGTATTTCGGATAATAACCTCTACATTGATATATAAACTATATGCAAGTCTCGGTGGATATTGCGTTATGGTCGCAGTTAACCTGTAGCTTATATATTCCTGTGTCGGAGCAGTGGTAATGGAGCCGGACAATTTCGCCAAAAATGTTTACTTCTCAACAAAATTATAAAATTACCAAACAACCCGCCCCCCTTTCTTATCTTGCAAGTATGCAAGCAATTACTATGGATGAAGAACGAGAATATTTTCTTACTCTAAAGTCCGTAGAAAGAGCTCAAATACTGAAGATGGTTTATGTGGGCCAAATTGATTTCTTTATTTTACATCAAGATATCAATTGTATTGGTTTTACATTGACCGTAGTAGATAAGGATGAAAGAACGAAGGACCTCGAGTATTTTGATCTTAATTGTGAGTATTATGAAAATTTGTATGACGCATTAATGGATTCCGAATTTTCTAAAATTTGGTTTACATTGTTGCTAAAATATATTGATTATGCTCCAATTAGTATGAATAGCCGAGGAATGCCCCGTTCAGAGACCATCTGTGTTTCAAAACACTGGTGGTATGAGTTGTACAGGATTGGATTCTTAAATAAGTTATATCGATGTGGTGATTGGGATAGTATTTTGCTTCTCCTTTCAGGAGATATTGAAGAAAACCCAGGACCCGTTGAGATATCTTATAAGGAATCTTGTAGACAGAAGAGAATGAAGAAACGCGTTTCTAAGACTTATGAGGAAATTAAAATGCAGCAGCATATTGATAGAATCAATAATGAAGAGAAACGTGCACATATGACGAAACCACGCAAGCTAAAGGATTTGATTGAAGTTGAAATGCAAGGAATGTTTAATTGGACTGAAGAGAGAGAAATCTTGAAAAGTACTGTATTCAAATTCAATCATTCGATGGACCGAGCAAATCATATTATGGATAATTTGATCCCACAACTTGAGGATACTTTGTCTGGTTTCAGACAAACGTATGCAAAGTGTGAAGCGAAATTCTTTGGATCAGTAAGTGTTATTGATGTCTGCATAGATATCATTAGTGCTTTGTTACAAGTGAGCTTCGCTAAGCCTGGACTTAAGTTAGCTTCTATTGCAGTAGAAGTGTTCAGACTTATCAAGAAATATGTTTCAGGAATTAAGATTAACACCGATAAGATAAAAGAACTTTTGACTTTTGGTAAACAAGCCTTAAGTGGTAGCAACCCTATTATTCAGGTTTCCATGCAAGTGGATATGCCAGAAGTCGATTCTTCAATTTTATTGCAACCCGGTGTTATAGTAAGCGCAATATTTTTAGTTTTAAGTGTGGTTTTTACTAAAACACTCCCAAGCAAGACTGGTGTTGAGGCGATGCTAAAGAGGACTGGAGAACTAGGGCGCTCTGCTAAGGGCATTATGGATCTTAATACAGTTCTTAATACATCAGTAACCTCAATGCTTGAATACTTTGGAGTACATACTTTAGGATTAAGACAAGAAGCTGAACTTCAAGTTCTTGTAGAAGGTTATAAAACCTGGTGCGATGAAGTTGCGGCTTTAGTAGGACATAAGATTAACATGGATGGTACTTTTGATGGAAGAAGTATTGTTGAAGATATTATGAGAGATACAAAAGAAATCCAACGTGTAGAGAATCTCTACAAACGTGGATTGGAAATTTCTCGTAATATTGCAGACATGAAACTTCCAACAAAATTAACCATTAGTTTTAATACACACATGAGATACTTGACTGAAGTTTTCAAGGCAGTAGATACATCTGGTGCTTTTGGAAATAAACCCCGAACCCAACCTGTAGTTATTTGGCTATATGGTGAGTCTGGAGTTGGTAAGTCAGGTATGACATGGCCCCTAGCTGTAGATCTTAATAATAGTTTAGTAGATAATGTAGAAGAGATGCGTAATTTTTCCAAGAATATTTATATGAGAAATGTAGAACAAGAGTTTTGGGATAATTATCAAGGACAAAATGTTGTAGTTTATGACGATTTTGGACAGATGAGAGATTCAACATCTAATCCTAATCCTGAATTCATGGAATTAATACGCACAGCTAATATAGCTCCTTATCCTTTACATATGGCCCATTTAGAAGATAAGCGCAAAACTAAATTTACATCTAAAGTAATTATCATGACATCTAATGTTTTTGAACAGTCTGTTAATTCGCTAACTTTTCCTGATGCTTTCAGACGCAGAGTTGATCTGTGTGCTGAAGTACGTAATAAGGATGAGTTTACGAAGGAAGGATATTCAAAGACTAAAGGATGCATGGTAAGACGCTTGGATAAGGATCTGGTTAAGAAGAAGACTGGAGACATATGTTCAACAGAATGTTATTTAGTAGACTTGGTGAATCCTGAAACCGGAGAGAAATACCAAACCAATTTAGAATATGAGGATTTTCTAGATATGTGTTTGGAGAAAACTCAAGAGTGTAGAGATAATTCTGCTAAGTTGAACGAATTTCTGATGAATTATGCTGAAAGTCGATCAAAACGACCTGAACAAAAACATGACAAGTGCCCTGAATTGGAATTTGAAGATGCAATTGAAGTGTCTATGCAAGTAGACGCTGACTCGTCTTTAGTTCCAATTGAGAAATCTCGTCTTCAAGAGATGATTGAGAGTTGCCAAGGAGTTGTGTACGATGCCTGTGGCAAGACCGTATACATTTCTAAGTTAGCTTTTGAATTAGCCCCCCTTGAATATGAGAAACAAATGGAAAGAATTTCAGAGATGAAATTTTATCAGAAAATGGCAAGTGGTGTTGTATACCTTCGTCAAGTTCGTGATACGAGTATGCAAATGCTCAATTCATGGATGGAAGAATGTATACAATACGCAAAGGATCACCCTTGGACAATAGTAGCTGGAATTCTAGGAACCTTCATTGGCATTCTTACCATTGTTGGTTTTTGGAAATGGCTATGCTCTGATGGACAGAAGAAGAAACAGGCAATTAAGCGTCATTTCATTAATACTGGATACACACTTATTATACCTGAACGAGAATTGAATAAATTTTGGGAGTTGGATGAAACTCTTGATTTACGTAGAATGCCTGTAAATCAAATAGAGGAACATCTCGCTCTATTGCTGAAGCCGCGTCATCGCGTAGTTTTAGTACCTAAAGCCACTAAGTACATAATAAGTTTAGTAGATAATCATGCCAAATTGACAGAGAAGATCATTCTTATAACTGCTAATAGGTATGTGTTTTATAAAAATCAAAATTATGAATTAGTGTTTGGAGAATTAAATCAATTCTTCGAAAAAGACCTAGAATCCCTTGTGAATACTCCTAAGGTTGAAGCTTTTGCTTCTGCTGATTTGAGTACTTATAAAAATAAGACTCCAATTGTGATCGAAGCACAGACATCTGGAGATAATGTGACTCTTAAACAACAAAAGGTTAAAGTAATTGAAGCAAAAATATCTACTGATGAAGCTACTTTGAAACAACAAAAACCTATTGTTATAGAGGCACAGTCTTCTGGTGATTGTGTGATCCGAAAACAACAAGTACAACGAGTGATTGAAGCATTTGCAAGTAGTGATGCTGTGACATTGAAGAAACCTACTGCGAAATTCGTAGAAAGTGACCCAAATGACATAGTTGATGTTACAATGCAGATGTGGAAAGATCAAGTTGCTCAACGATTGATAACCAATCGTGTATTGACAAATTTGTATAAAGTTTGTTTGGTACACAATGACGATCGAATAACACCTCTTTTGAATGGACTTTTTGTTCGTTCAAATTTGATGCTAGTACCTGGACATCTTCTTGGATTCATTGCTGAGTATGACACAATCGAAATTCGAAATCTCTTTGACGTGGTATTTAGAGTGCCATGGAAAGATGTGAAGAAAATTCCAATTGTTAATGCTCTTGGTGAATCTAAAGAAGCAGCGTTGTTGGCCTTCCCAAAATTCGTTTGCCAACATTCTGATTTAGTTAAGCATTTCCAAAATGCTGAATCTATGTCGAAATTTAAACGATGTGAAGTTACTCTACCCGTTTTACGTTTCTCTGAGAAAGTTGGTAAATTTTTATCAACACTCATTGAGTGTGATCGAGTGGAGGCTTATGATAGGCCTTATACGCTGAATGATTCTCAAAAAGGACAATATATTCTACGTCAAGGCTTAGAATATGCAATGCCCACGACTAATGGTGATTGTGGTTCGCCACTCATCATTAACGAAACCCAAGTTTTGAGGAAGATTGCTGGTATTCATGTAGCTGGAGCTACAACTGGCAAAGCCTATGCTGAGTCTATAACCCAAAAAGATCTTGAGCGAGCATTTACTAAAATAGATGTAAGCATGCAGATCCAACTGGATTTGGATTCAACATTGGACTTCTCAAAACCCGAACCCAAATTACCTTCTGGTACTGAATTTGGTCCTGAAGATCTCAGCTTTTGTGATCTTCCTGCCCTAAAAATGTTACCAGT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| 15,241
|
OP972883.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Kwon,M., Jung,C., Kil,E.-J.
|
Andong National University, Department of Plant Medicals
| null |
2023-06-11
|
Yeongdong_B
|
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,550
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Apis mellifera
| null |
2022-04-01
|
SAMN32235555
|
PRJNA912226
|
MAG: Israeli acute paralysis virus isolate Yeongdong_B, complete genome
|
TTTTCGCTGAAATTAGCGATAAAATTTCAAAACCGTTTTGCGGCGCCTGAGCAGCCTTTCCAATGGTAGGAGCGTCGATCCCCCGTATGGAGTGGAGAATATAAGGCTCAGCTAGGATGACACGCCTGTACACTGTCGACATTAGTTAAGTTGCAATTACACGTCTGTTGCCGAAGAAACCATTTTAGTCAACTGATTATGATTTTTGTATAATGACAAACAGTGATGAACTGTATAACTCATCAACAACAAAACGGATTACGAACCTATTTGTAACTATCTTGATCGAAGTCTAGTAGATCCCCAATATAGCCCTGAAAAGCTTGAGGGATGAGATAGCTCTATAAATAGACGTGAGGCTTTAAATCCTGATAAGTACATTACCTGAGAATTCCTCCTTTTGGAGTTTGAATTTATATAAGTTAGTACCAATAGTTAATATCATTTAAGTACGTTATTATCGCTGAAGGCATGTATTTCGGATAATAACCTCTACATTGATATATAAACTATATGCAAGTCTCGGTGGATATTGCGTTATGGTCGCAGTTAACCTGTAGCTTATATATTCCTGTGTCGGAGCAGTGGTAATGGAGCCGGACAATTTCGCCAAAAATGTTTACTTCTCAACAAAATAATAAAATCACCAAACAACCCGCCCCCCTTTCTTATCTTGCAAGTATGCGAGCAATTACTATGGACGAGGAGCAAGAATATTTTCTTACTCTAAAGTCTGTAGAAAGAGCTCAAATATTGAAGATGGTTTATGTGGACCAAATTGATTTCGTTATTTTACATCAAGATATCAATTGTATTGGTTTTACATTGACCATAGTAGATAAGGATGAAAGAACGAAGGACCTCGAGTATTTTGATCTTAATTGCGAGTATTATGAAAATTTATATGATGCATTAATGGATTCCGAGTTTTCTAAAACTTGGTTTACATTGTTGCTAAAATATATTGATTATGCTCCAATTAGTATGAACAGTCGAGGAATACCCCGCTCAGAGACCATCTGTGTTTCAAAACACTGGTGGTATGAGTTGTACAGGATTGGATTCTTGAATAAGTTATATCGATGTGGTGACTGGGATAGTATTTTGCTTCTCCTTTCAGGAGATATTGAGGAAAACCCAGGACCCGTTGAGATGTCTTATAAGGAATCTTGTAGACAGAAGAGAATGAAGAAACGCGTTTCTAAGACTTATGAGGAAATTAAAATGCAGCAGCATATTGATAGAATCAATAATGAAGAGAAACGTGCACATATGACGAAACCACGCAAGTTAAAGGATTTGATTGAAGTTGAAATGCAAGGAATGTTCAATTGGACTGAAGAAAGGGAAATCTTGAAGAGTACTGCATTTAAATTCAATCATTCAATGGACCGAGCAAATCATATTATGGATAATCTGATCCCACAACTTGAGGATACTTTGTCTGGTTTCAGACAAACGTATGCAAAGTGTGAAGCGAAATTCTTTGGGTCAATAAGTGTTATTGATGTCTGTATAGATATCATTAGTGCTTTGTTACAAGTGAGCTTTGCTAAACCTGGACTTAAGTTAGCTTCTATTGCAGTAGAAGTGTTTAGACTTATCAAGAAATATGTTTCAGGAATTAAGATTAATACTGATAAGATAAAAGAACTTCTGACTTTTGGTAAACAAGCTTTGAGTAGTAGTAACCCTATTATTCAGGTTTCCATGCAAATGGATATGCCAGAAGTTGATCCTTCAATTTTATTGCAACCCGGTGTTATAGTAAGTGCAATCTTTTTAGTTTTAAGTGTAGTTTTTACCAAAACACTCCCAAGTAAGACTGGTGTTGAGGCGATGTTAAAGAGGACTGGAGAACTAGGGCGCTCTGCAAAGGGCATCATGGATCTTAATACAGTTCTTAATACATCAGTAACCTCAATGCTTGAATACTTTGGAGTACATACTTTAGGATTAAGACAAGAAGCTGAACTTCAAGTTCTCGTAGAAGGTTATAAAACCTGGTGCGATGAAGTTGCGGCTTTAGTAGGACATAAGATTAATATGGATGGTTCTTTTGATGGAAGAAGTATTGTTGAAGATATTATGAGAGATACAAAAGAAATCCAACGTGTAGAGAATCTCTACAAACGTGGATTGGAAATTTCTCGTAATATTGCAGACATGAAACTTCCAACAAAATTAACTATTAGTTTTAATACACACATGAGATATTTGACTGAAGTTTTCAAAGCAGTAGATACATCTGGTGCTTTTGGAAATAAACCCCGAACTCAACCTGTAGTTATTTGGCTATATGGTGAGTCTGGAGTTGGTAAGTCAGGTATGACATGGCCCCTAGCCGTAGATCTTAATAATAGTTTAGTAGATAATGTGGAAGAGATGCGTAACTTTTCTAAGAATATTTATATGAGAAATGTAGAACAAGAATTTTGGGATAATTATCAAGGACAAAATGTCGTAGTTTATGACGATTTTGGACAGATGAGAGATTCAACATCTAATCCTAATCCTGAATTTATGGAATTAATACGCACAGCTAATATAGCTCCTTATCCTTTACATATGGCCCATTTAGAAGATAAGCGCAAAACTAAATTTACATCTAAAGTAATTATCATGACATCTAATGTTTTTGAACAGTCTGTTAATTCACTAACTTTTCCTGATGCTTTTAGACGCAGAGTTGATCTGTGTGCTGAAGTACGTAATAAGAATGAGTTTACAAAGGAAGGATACTCAAAGACTAAAGGATGCATGGTAAGACGCTTGGATAAGGATTTGGTTAAGAAGAAGACTGGAGACATATGTTCAACAGAATGTTATTTAGTAGACTTGGTTAATCCCGAAACTGGAGAGAAATATCAAACTGATTTAGAATATGAAGATTTTCTAGATATGTGTTTGGAGAAAACTCAAGAGTGTAGAGATAATTCTGCTAAGTTGAACGAATTTCTGATGAACTACGCTGAAAGTCGATCAAAACGACCTGAACAAAAACATGACAAGTGCCCTGAATTGGAATTTGAAGATGCAATTGAAGTGTCTATGCAAGTAGACGCTGATTCGTCTTTAGTTCCAATTGAGAAGTCTCGTCTTCAAGAGATGATTGAGAGTTGCCAAGGAGTTGTGTATGATGCCTATGGTAAAACCGTATACATTTCTAAGTTGGCTTTTGAACTAGCCCCTCTTGAATATGAGAAACGAATGGAAAGAATTTCAGAGATGAGATTTTACCAGAAAATGGCAAGTGGTGTTGTATACCTTCGTCAAGTTCGTGATACGAGTATGAAAATGCTCAATTCATGGATGGAAGAATGTGTACAATACGCAAAGGATCACCCTTGGACAATAGTAGCTGGAGTTCTAGGAACCTTCATTGGTATTCTTACCATTGTTGGTTTCTGGAAATGGCTATGCTCTGATGGACAGAAGAAGAAACAGGCAATTAAGCGTCATTTTATTAATACTGGATATACACTTATTATACCTGAACGAGAATTGAACAAATTCTGGGAGTTGGATGAAACTCTTGATTTACGTAGAATGCCTGTAAATCAAATAGAGGAACATCTTGCTCTACTACTGAAGCCGCGTCATCGCGTGGTTTTAGTACCTAAAGCCACTAAGTATATAATAAGTTTAGTAGATAATCATGCCAAATTGACAGAGAAGATTATTCTTATAACTGCTAATAGGTATGTGTTTTATAAAAATCAAAATTATGAATTGGTGTTTGGAGAATTAAATCAATTCTTCGAAAAAGACCCAGAATCCCTTGTAAATACTCCTAAGGTTGAAGCTTTTGCTTCTGCTGATTTGAGTACTTACAAAAATAGGACCCCAATTGTGATCGAAGCACAGACATCTGGAGATAATGTGACTCTTAAACAACAAAAGGTTAAAGTAATTGAAGCAAAGACATCTACCGATGAAGCTACTTTGAAACAACAAAAACCTATTGTTATAGAGGCACAGTCTTCTGGTGATTGTGTGACCCGAAAACAACAAGTACAACGAGTGATTGAAGCATTTGCAAGTAGTGATGCTGTGACATTGAAGAAACCTACTGCGAAATTCGTAGAAAGTGACCCAAATGACATAGTTGATGTTACAATGCAGATGTGGAAAGATCAAGTTGCTCAACGATTGATAACCAATCGTGTATTGACAAATTTGTATAAAGTTTGTTTGGTACACAATGATGATCGAATAACACCTCTTTTGAATGGACTTTTTGTTCGTTCAAATTTGATGCTAGTACCTGGACATCTTCTTGGATTCATTGCCGAGTATGACACAATTGAAATTCGAAATCTCTTTGACGTGGTATTTAGAGTACCATGGAAAGATGTGAAGAAAATTCCAATTGTTAATGCTCTTGGTGAATCTAAAGAAGCAGCGTTATTGGCCTTTCCAAAATTCGTTTGCCAACATTCTGATTTAGTTAAGCATTTCCAAAATGCTGAATCTATGTCAAAATTTAAACGATGTGAAGTTACTCTACCCGTTTTACGTTTCTCTGAGAAGGTTGGTAAATTTTTATCAACACTCATTGAATGTGATCGAGTGGAGGCTTATGATAGGCCTTATACGTTGAATGATTCTCAAAAAGGACAATATATTCTACGTCAAGGCTTAGAATATGCAATGCCCACGACTAATGGTGATTGTGGTTCACCGCTCATCATTAACGAAACCCAAGTTTTGAGAAAAATTGCTGGTATTCATGTAGCTGGGGCTACAACCGGCAAAGCCTATGCTGAGTCTATAACCCAAAAAGATCTTGAGCGAGCATTTACTAAAATAGATGTAAGCATGCAGATCCAATTGGATTTGGATTCAACATTGGATTTCTCAAAACCCGAACCCAAATTACCTTCTGGTACTGAGTTTGGTCCTGAAGATCTCAGCTTTTGTGACCTTCCCGCCCTAAAAATGTTACCAGTTGGTAAACTTTCTGAATCCTTATTTGAACCTGGCAAGACAGATATAAG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| 15,242
|
MZ269472.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Ma,M., Sun,Q., Li,M., Sun,L., Fei,D., Ma,Y.
|
Jinzhou Medical University, Institute of Animal Husbandry and Veterinary
|
China
|
2022-09-18
|
IAPV-LN
|
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,597
|
GenBank
| null |
China: Liaoning, Jinzhou
|
China
|
Apis mellifera
| null |
2019-05-20
| null | null |
Israeli acute paralysis virus isolate IAPV-LN, complete genome
|
GGGACTTTTATGTCCCTACGTACAATTTTCGCCGAAATTAGCGATATAATTTCAAAACCGTTTCGCGGCGCCTGAGCAGCCTTTCCAATGGTAGGAGCGTCGATCCCCCGTATGGAGTGGAGAATATAAGGCTCAGCTAGGATGACACGCCTGTACACTGTCGACATTAGTTAAGTTGCAATTACACGTCTGTTGCCGAAGAAACCATTTTAGTCAACTGATTATGATTTTTGTATAATGACAAACAGTGATGAACTGTATAACTCATCAACAACAAAACGGATTACGAACCTATTTGTAACTATCTTGATCGAAGTCTATTAGATCCCCAATATAGCCCTGAAAAGCTTGAGGGACGAGATAGCTCTATAAATAGACGTGAGGCTTTAAATCCTGATAAGTACATTACCTGAGAATTCCTCCTTTTGGAGTTTGAATTTATATAAGTTAGTACCAATAGTTAATATCATTTAAGTATGTTATTATCGCTGAAGGCATGTATTTCGGATAATAACCTCTACATTGATATATAAACTATATGCAAGTCTCGGTGGATATTGCGTTATGGTCGCAGTTAACCTGTAGCTTATATATTCCTGTGTCGGAGCAGTGGTAATGGAGCCGGACAATTTCGCCAAAAATGTTTACTTCTCAACAAAATAATAAAATCATCAGACAACCCGCCCCTCTTTCTTATCTTGCAAGTATGCGAGCAATTACTATGGACGAAGAGCAAGAATATCTTCTTACTCTAAAGTCTGTAGAAAGAGCTCAAATACTGAAGATGGTTTATGTGGACCAAATTGATTTCGTTATTTTACATCAAGATATCAATTGTATTGGTTTTACATTGACCATAGTAGATAAGGATGAAAGAACGAAGGACCTCGAGTATTTTGATCTTAATTGCGAGTATTATGAAAATTTATATGACGCATTAATGGATTCTGAATTTTCTAAAACTTGGTTTATATTGTTGTTAAAATATATTGATTATGCTCCAATTAGTATGAACAGTCGGGGAATGCCCCGCTCAGAGACCATCTGTGTTTCAAAACACTGGTGGTATGAGTTGTACAGGATTGGATTCTTAAATAAGTTATATCGATGTGGTGACTGGGATAGTATTTTGCTTCTCCTTTCAGGAGATATTGAAGAAAACCCAGGACCCGTTGAGATGTCTTATAAGGAATCTTGTAGACAGAAGAGAATGAAGAAACGCGTTTCTAAGACTTATGAGGAAATTAAAATGCAGCAGCATATTGATAGAATCAATAATGAAGAGAAACGTGCACATATGACGAAACCACGCAAGTTAAAGGATATGATTGAAGTCGAAATGCAAGGAATGTTTAATTGGACTGAAGAAAGGGAAATCTTGAAGAGTACTGCATTTAAATTCAATCATTCAATGGACCGAGCGAATCATATTATGGATAATCTGATCCCACAACTTGAGGATACTTTGTCTGGTTTCAGACAAACATATGCAAAGTGTGAAGCGAAATTCTTTGGGTCAATAAGTGTTATTGATGTTTGTATAGATATCATTAGTGCTTTGTTACAAGTGAGCTTTGCTAAACCTGGACTTAAGTTAGCTTCTATTGCAGTAGAAGTGTTTAGACTTATCAAGAAATATGTTTCAGGAATTAAGATTAACACTGATAAGATAAAAGAACTTCTGACTTTTGGTAAACAAGCTTTGAGTAGTAGTAACCCTATTATTCAGGTTTCCATGCAAATGGATATGCCAGAAGTTGATCCTTCAATTTTATTGCAACCCGGTGTTATAGTAAGTGCAATCTTTTTAGTTTTAAGTGTAGTTTTTACTAAAACACTCCCAAGTAAGACTGGTGTTGAGGCGATGTTAAAGAGGACTGGAGAATTAGGGCGCTCTGCAAAGGGCATCATGGACCTTAACACAGTTCTTAATACATCAGTAACCTCAATGCTTGAATACTTTGGAGTACATACTTTAGGATTAAGACAAGAAGCTGAACTTCAAGTTCTCGTAGAAGGTTATAAAGCCTGGTGCGATGAAGTTGCGGCCTTAGTAGGACATAAGATTAACATGGATGGTACTTTTGATGGAAGAAGTATTGTTGAAGATACTATGAGAGATACAAAAGAAATCCAACGTGTAGAGAATCTCTACAAACGTGGATTGGAAATTTCTCGCAATATTGCAGACATGAAACTTCCAACAAAATTAACCATTAGTTTTAATACACACATGAGATACTTGACTGAAGTTTTCAAAGCAGTAGACACATCTGGTGCTTTTGGAAATAAACCCCGAACTCAACCTGTAGTTATTTGGCTATATGGTGAGTCTGGAGTTGGTAAGTCAGGTATGACATGGCCCCTAGCCGTAGATCTTAATAATAGTTTAGTAGATAATGTGGAAGAGATGCGTAATTTTTCCAAGAATATTTATATGAGAAATGTAGAACAAGAATTTTGGGATAATTATCAAGGACAAAATGTTGTAGTTTATGACGATTTTGGACAGATGAGAGATTCAACATCTAATCCTATTCCTGAATTTATGGAATTAATACGCACAGCTAATATAGCTCCTTATCCTTTACATATGGCCCATTTAGAAGATAAGCGCAAAACTAAATTTACATCTAAAGTAATTATCATGACATCTAATGTTTTTGAACAGTCTGTTAATTCACTAACTTTTCCTGATGCTTTTAGACGCAGAGTTGATCTGTGTGCTGAAGTGCGTAATAAGGATGAGTTTACGAAGGAAGGATATTCAAAGACTAAAGGATGCATGGTAAGACGCTTGGATAAGGATTTGGTTAAGAAGAAGACTGGAGACATATGTTCAACAGAGTGTTATTTAGTGGACTTGGTTAATCCCGAAACTGGAGAGAAATATCAAACTGATTTGGAATATGAAGATTTTCTAGATATGTGTTTGGAGAAAACTCAAGAGTGTAGAGGTAATTCTGCTAAGTTGAACGAATTTCTGATGAACTACGCTGAAAGTCGATCAAAACGACCTGAACAAAAACATGACAAGTGCCCTGAATTGGAATTTGAAGATGCAATTGAAGTGTCTATGCAAGTAGACGCTGATTCATCTTTAGTTCCAATTGAGAAGTCTCGTCTTCAAGAGATGATTGAGAGTTGCCAAGGAGTTATGTATGATGCCTATGGTAAAACCGTATATATTTCTAAGTTGGCTTTTGAACTAGCCCCTCTTGAATATGAGAAACAAATGGAAAGAATTTCAGAGATGAGATTTTATCAGAAAATGGCAAGTGGTGCTGTATACCTTCGTCAAGTTCGTGATACGAGTATGAAAATGCTCAATTCATGGATGGAAGAATGTATACAATACGCAAAGGATCACCCTTGGACAATAGTAGCTGGAGTTCTAGGAACCTTCATTGGTATTCTTACCATTGTTGGTTTCTGGAAATGGCTATGCTCTGATGGACAGAAGAAGAAACAGGCAATTAAGCGTCATTTTATTAATACTGGATACACACTTATTATACCTGAACGAGAATTGAACAAATTCTGGGAGTTGGATGAAACTCTTGATTTACGTAGAATGCCTGTAAATCAAATAGAGGAACATCTTGCTCTACTACTGAAGCCGCGTCATCGCGTGGTTTTAGTACCTAAAGCCACTAAGTACATAATAAGTTTAGTAGATAATCATGCCAAATTGACAGAGAAGATTATTCTTGTCACTGCTAATAGGTATGTGTTTTATAAAAATCAAAATTATGAATTGGTGTTTGGAGAATTAAATCAATTCTTCGAAAAAGACCCAGAATCCCTTGTAAATACTCCTAAGGTTGAAGCTTTTGCTTCTGCTGATTTGAGTACTTACAAAAATAGGGCCCCAATTGTGATTGAAGCACAGACATCTGGAGATAATGTGACTCTTAAACAACAAAAGGTTAAAGTAATTGAAGCAAAGACATCTACCGATGAAGCTACTTTGAAACAACAAAAACCTATTGTTATAGAGGCACAGTCTTCTGGTGATTGTGTGACCCGAAAACAACAAGTACAACGAGTGATTGAAGCATTTGCAAGTAGTGATGCTGTGGCATTGAAGAAGCCTACTGCGAAATTCGTAGAAAGTGACCCAAATGACATAGTTGATGTTACAATGCAGATGTGGAAAGATCAAGTTGCTCAACGATTGATAACCAATCGTGTATTGACAAATTTGTATAAAGTTTGTTTGGTACACAATGACGATCGAATAACACCTCTTTTGAATGGACTTTTTGTTCGTTCAAATTTGATGCTAGTACCTGGACATCTTCTTGGATTCATTGCTGAGTATGGCACAATTGAAATTCGAAATCTCTTTGACGTGGTATTTAGAGTACCATGGAAAGATGTGAAGAAAATTCCAATTGTTAATGCTCTTGGTGAATCTAAAGAAGCAGCATTATTGGCCTTTCCAAAATTCGTTTGTCAACATTCTGATTTAGTTAAGCATTTCCAAAATGCTGAATCTATGTCGAAATTTAAACGATGTGAAGTTACTCTACCCGTTTTACGTTTCTCTGAGAAAGTTGGTAAATTTTTATCAACACTCATTGAATGTGATCGAGTGGAGGCTTATGATAGGCCTTATACGCTGAATGATTCTCAAAAAGGACAATATATTCTACGTCAAGGTTTAGAATATGCAATGCCCACGACTAATGGTGATTGTGGTTCGCCGCTCATCATTAACGAAACCCAAGTTTTGAGAAAAATTGCTGGTATTCATGTAGCTGGGGCTACAACCGGCAAAGCCTATGCTGAGTCTATAACCCCAAAAGATCTTGAGCGAGCATTTACTAAAATAGATGTAGGCATGCAGATCCAATTGGATTTGGATTCAACATTGGATTTCTCAAAACCCGAACCCAAATTACCTTCTGGTACTGAATTTGGTCCTGAAGATCTCAGCTTTTGTGATCTTCCCGCCCTAAAAATGTTACCAGTTGGTAAACTTTCCGAATCCTTAT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| 24,505
|
MG599488.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Deng,S., Hou,C., Yang,D., Yang,S.
|
Institute of Apicultural Research of CAAS, Department of Honeybee Protection and Biosafety
|
China
|
2018-10-06
|
BJ2
|
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,599
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Apis mellifera
| null |
2016-07
| null | null |
Israeli acute paralysis virus isolate BJ2, complete genome
|
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| 68,051
|
KY243933.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Mullapudi,E., Pridal,A., Palkova,L., de Miranda,J.R., Plevka,P.
|
Swedish University of Agricultural Sciences, Ecology
|
Sweden
|
2017-02-07
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,500
|
GenBank
| 1
|
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Apis mellifera
| null |
2014
| null | null |
Israeli acute paralysis virus strain PP, complete genome
|
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| 78,251
|
KC690268.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Reddy,K.E., Noh,J.H., Kim,Y.H., Yoo,M.S., Doan,H.T., Ramya,M., Jung,S.C., Quyen,D.V., Kang,S.W., Doan,T.T.H.
|
National Veterinary Research and Quarantine Service, Parasitology and Insect Disease Research Laboratory
|
South Korea
|
2013-05-13
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,478
|
GenBank
| 1
|
South Korea: Andong
|
South Korea
|
Apis mellifera
| null | null | null | null |
Israeli acute paralysis virus strain Korea1, complete genome
|
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| 94,155
|
KC690269.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Reddy,K.E., Noh,J.H., Kim,Y.H., Yoo,M.S., Doan,H.T., Ramya,M., Jung,S.C., Quyen,D.V., Kang,S.W., Doan,T.T.H.
|
National Veterinary Research and Quarantine Service, Parasitology and Insect Disease Research Laboratory
|
South Korea
|
2013-05-13
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,480
|
GenBank
| 1
|
South Korea: Gangneung1
|
South Korea
|
Apis mellifera
| null | null | null | null |
Israeli acute paralysis virus strain Korea2, complete genome
|
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| 94,156
|
KC690270.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Reddy,K.E., Noh,J.H., Kim,Y.H., Yoo,M.S., Doan,H.T., Ramya,M., Jung,S.C., Quyen,D.V., Kang,S.W., Doan,T.T.H.
|
National Veterinary Research and Quarantine Service, Parasitology and Insect Disease Research Laboratory
|
South Korea
|
2013-05-13
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,470
|
GenBank
| 1
|
South Korea: Gurye
|
South Korea
|
Apis mellifera
| null | null | null | null |
Israeli acute paralysis virus strain Korea3, complete genome
|
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| 94,157
|
HQ897161.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Ai,H., Yan,X., Han,R.
|
Guangdong Entomological Institute
|
China
|
2011-08-03
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,482
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Apis mellifera
| null |
2008
| null | null |
Israel acute paralysis virus of bees strain Wus-China-2008, complete genome
|
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| 98,414
|
EU218534.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Chen,Y.
|
USDA-ARS-PSI, Bee Research Laboratory
|
USA
|
2009-11-30
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
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ssRNA(+)
| 9,613
|
GenBank
| null |
USA: CA
|
USA
| null | null | null | null | null |
Israel acute paralysis virus of bees from USA, complete genome
|
TAAAATTGTACGTAGGGACTTTTATGTCCCTACGTACAATTTACGCAGAAATTAGCGATATAATTTCAAAATTGTTTTGTGGCGCCTGAGCAGCCTTTTTAATGGTAGGAGCGTCGATCCCCCGTATGGAGTGGAGAATATAAGGCTCAGCTAGGATGACACGCCTGTACACTGTCGACATTAGTTAAGTTACAATTACACGTCTTTTGCCGAAGAAACCATTTTAGTCAATTGATTATGATTTTTGTATAATGATAAACAGTGATGAACTGTATAACTCATCGATAACAAAACGGATTACGAACCTATTTGTAACTATCTTGATCGAAGTCTAGTAGATCCCCAATATAGCCCTGAAAAGCTTGAGGGACGAGATAGCTCTATAAATAGACGTGAGGCTTTAAATCCTGATAAGTACATTACCTGAGAATTCCTCCTTTTGGAGTTTGAATTTATATAAGTTAGTACCAATAGTTAATATCATTTAAGTATGTTATTATTGCTGAAGACATGTATTTCGGATAATAACCTCTACATTGATATATAAATTATATGCAAGTCTCGGTGGATATTGCATTATGGTCGCAGTTAACCTGTAGCTTATATATTCCTGTGTCGGAGCAGTGGTAATGGAGCCGGATAATTTCGCCAAAAATGTTTACTTCTCAACAAAACAACAAAATCACCAAACGACCCGCCCCCCTTTCTTATCTTGCAAGTATGCGAGCAATTACTATGGATGAAGAGCAAGAATGTTTTTTTACTCTAAAATCTGTAGAAAGAGCTCAAATACTGAAGATGGTCTATGTGGACCAAATTGATTTCTTTATTTTACATCAAGATATCAATTGTATTAGTTTCACATTGACCATAGTAGATAAGGATGAGAGAACAAAGGACCTTGAGTATTTTGACCTTAATTGTGAGTATCATGAAAATTTATATGATGCATTGATGGATTCTGAGTTTTCTAAAACTTGGTTTATATTATTGCTAAAATATATTGATTATGTTCCAATTAGTATGAATAGTCGAGGAATGCCCCGCTTGGAGACCATCTGTGTTTCAAAACACTGGTGGTATGAGTTGTATAGAATTGGATTCTTAAATAGGTTGTATCGATGTGGTGACTGGGATGGTATTTTACTTCTCCTTTCAGGAGATATTGAAGAAAACCCAGGACCTGTTGACATTTCTTATAAAGAATCTTGTAGACAGAAGAGAATGAGGAAACGCGTTTCTAAAACTTATGAGGAAATTAAAATGCAACAGCATATTGATAGAATTAATAATGAAGAGAAACGTGCACATATGACGAAACCACGCAAGCTAAAGGATTTGATTGAAGTTGAAATGCAAGGAATGTTTAATTGGACTGAGGAGAGAGAAATCTTGAAGAGTACTGCATTCAAATTCAATCATTCGATGGATCGAGCGAATCATATTATGGATAATCTGATCCCACAGCTTGAGGATACTTTGTCTGGTTTCAGACAAACGTATGCAAAGTGTGAAGCAAAATTTTTCGGATCAATAAGTGTTATTGATGTTTGTATAGATATTATTAGTGCTTTGTTACAAGTGAGTTTTGCTAAACCTGGACTCAAGTTGGCTTCTATTGCAGTAGAAGTGTTCAGACTTATTAAGAAACATGTGTCAGGAATTAAGATTAACACTGATAAGATAAAAGAACTATTGACTTTTGGAAGACAGGCCTTGAGTAGTAGTAACCCTATTATTCAAGTTTCTATGCAAATGGATATGCCAGCAGTTGATTCTTCAATTTTATTGCAACCTGGTGTTATAGTTAGTGCAATCTTTTTAGTTTTAAGTGTAGTTTTTACTAAAACTCTCCCAAGTAAAACTGGCATTGAGGCAATGTTAAAGAGGACTGGAGAATTAGGACGCTCTGCAAAGGGCATCATGGATCTCAATACAGTTCTCAATACAGGAGTAACCTCAATGTTGGAATACTTTGGAGTACATACTTTAGGATTAAGACAAGAAGCTGAACTTCAGGTTCTTGTTGAAGGTTATAAGACCTGGTGCGATGAAGTTGCAGCTTTAGTAGGTCATAAGATTAATATGGATGGCACTTTTGATGGAAGAAGTATTGTTGAGGATATTATGAGAGATACTAAAGAAATTCAACGTGTAGAGAATCTTTACAAACGTGGATTAGAGATTTCTCGTAATATTGCAGACATGAAACTTCCGACAAAATTGACCATTAGTTTTAATACACACATGAGGTATTTGACTGAAGTTTTCAAAGCAGTGGATACATCCGGTGCTTTCGGAAATAAACCCCGGACTCAACCTGTAGTTATTTGGCTATATGGTGAGTCTGGAGTTGGTAAGTCAGGTATGACATGGCCCCTAGCCGTAGATCTTAATAATAGTTTAGTAGATAATGTAGAAGAGATGCGTAATTTTTCCAAGAATATTTACATGAGAAATGTAGAGCAGGAATTTTGGGACAATTATCAAGGACAAAATGTTGTAGTTTATGATGATTTCGGACAGATGAGAGATTCAACATCTAATCCCAACCCTGAATTCATGGAATTAATACGCACAGCTAATATAGCCCCTTATCCCCTACATATGGCCCATTTAGAAGATAAGCGTAAGACTAAATTTACATCTAAGGTGATTATCATGACATCTAATGTTTTTGAGCAATCCGTTAATTCATTAACTTTTCCTGATGCTTTTAGACGCAGAGTTGATCTGTGTGCTGAAGTACGTAATAAGGATGAGTTTACGAAGGAAGGATATTCAAAAACTAAAGGATGCATGGTAAGACGTTTGGATAAGGATTTAGTTAAGAAGAAGACTGGAGATATATGTTCGACAGAATGTTATTTGGTAGACTTGGTTAATCCCGAAACTGGAGAGAAATATCAAACTGATTTAGAATATGAAGATTTTCTAGATATGTGTTTGGAGAAAACTCAAGAGTGTAGAGATAATTCTGCCAAGTTGAATGAATTTTTAATGAATTATGCCGAAAGTCGATCAAAACGACCTGAACAAAAATATGATAAATGTCCTGAATTGGAATTTGAAGATGCAATTGAGGTATCTATGCAAGTGGATGCTGATTCGTCTTTAGTTCCAATTGAGAAGTCTCGTCTTCAAGAGATGATTGAAAGCTGTCAAGGAGTTGTATATGATGCCTGTGGTAAAACAGTACATATTTCTAAATTAGCTTTCGAATTAGCTCCTCTTGAATATGAGAAACAAATAGAAAGAATTTCAGAAATGAAATTCTATCAGAAAATGGCAAGTGGTGTTGTATATCTTCGTCAAGTTCGTGATACGAGCATGAAAATGCTTAATTCATGGATGGAAGAATGTATACAATACGCAAAGGATCACCCCTGGACAATAGTAGCTGGAGTTCTAGGAACCTTCATTGGCATTCTTACCATTGTTGGTTTCTGGAAATGGCTATGCTCTGATGGACAGAAGAAGAAACAAGTAATTAAGCGTCATTTCATTAATACTGGACACACGCTTATTATACCTGAACGAGAATTGAATAAATTTTGGGAGTTGGATGAAACTCTTGATTTACGTAGAATGTCCGTAAATCAAATAGAGGAACATCTCGCTCTATTACTGAAGCCGCGTCACCGCGTGGTTTTAGTACCCAAAGCCACTAAGTACATAATAAGTTTAGTAGATAATCATGCTAAATTGACAGATAAGATTATTCTTATAACTGCTAATAGACATGTGTTTTACAAAAATCAAAATTATGAATTAGTGTTTGGGGAATTGAATCAGTTTTTCGAAAAAGATCCGGAATCTCTTGTGAGCACTCCTAAGGTTGAAGCTTTTGCTTCTGCCGATTTGAGTACTTACAAAAACAGGACCCCGATTGTGATTGAAGCACAAACATCTGGAGACAATGTGACTCTTAAACAACAAAAAGTTAAAGTAATTGAGGCAAAAACATCTGATGATGAAGTTACTTTAAAACAACAAAAACCTATTGTTATAGAGGCACAGTCTTCTGGTGATTGTGTGACTCGAAAACAACAAGTGCAACGAGTGATTGAAGCATTTGCAAGTAGTGATGCTGTGACATTGAAGAAACCTACTGCGAAATTCGTAGAAAGTGACCCAAATGACATAGTTGATGTTACAATGCAGATGTGGAAGGATCAAGTTGCTCAGCGACTGATAACCAATCGTGTGCTAACAAATTTGTATAAAGTTTGTTTGGTACATAATGATGACCGCATAACACCTCTTTTGAATGGACTTTTTGTTCGTTCAAATTTGATGTTAGTACCTGGACATCTTCTTGGATTTATCGCTGAATATGATACAATTGAAATTCGAAATCTCTTTGACGTAGTATTTAGAGTACCATGGAAAGATGTAAAGAAAATTCCAATCGTTAATGCTCTTGGTGAATCTAAGGAGGCAGCGTTACTGGCCTTTCCAAAATTTGTTTGTCAACATTCTGATTTGGTGAAGCATTTTCAAAATGCTGAATCTATGTCAAAATTCAAACGATGTGAAGTTACTCTACCCGTTTTACGTTTTTCTGAGAAAGTTGGTAAATTTTTATCAACGCTCATTGAATGTGATCGAGTGGAGGCTTATGATAGACCTTATACGCTGAATGATTCTCAAAAAGGACAATATATTCTACGTCAAGGCTTAGAATATGTAATGCCCACGACTAATGGTGATTGTGGTTCGCCGCTCATCATTAATGAAACCCAAGTTTTGAGGAAAATTGCTGGTATTCATGTAGCTGGAGCTACAACTGGTAAAGCCTATGCTGAGTCTATAACCCAAAAAGATCTTGAGCGAGCATTTACTAAAATAGATGTAAGCATGCAGATCCAATTGGATTTGGATTCAACATTGGATTTCTCAAAACCTGAACCTAAATTACCTTCTGGTACTGAATTTGGTCCTGAAGATCTCAGCTTTTGTGATCTTCCCGCCCTAAAGATGTTACCAGTTGGTAAACT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| 101,629
|
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|
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|
Chen,Y.
|
USDA-ARS-PSI, Bee Research Laboratory
|
USA
|
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Aparavirus israelense
|
Aparavirus
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Dicistroviridae
|
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| 101,630
|
EU224280.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Chen,Y.C., Evans,J.D.
|
USDA-ARS-PSI, Bee Research Laboratory
|
USA
|
2009-11-30
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,580
|
GenBank
| null |
USA: Pennsylvania
|
USA
| null | null | null | null | null |
Israel acute paralysis virus of bees from USA, complete genome
|
CGTACAATTTTCGCCGAAATTAGCGATATAATTTCAAAATCGTTTCGCGGCGCCTGAGCAGCCTTTCCAATGGTAGGAGCGTCGATCCCCCGTATGGAGCGGAGAATATAAGGCTCAGCTAGGATGACACGCCTGTACACTGTCGACATTAGTTAAGTTGCAATTACACGGTCTGTTTGCCGAAGAAACCATTTTAGTCAACTGATTATGATTTTTGTATAATGACAAACAGTGATGAACTGTATAACTCATCAACAACAAAACGGATTACGAACCTATTTGTAACTATCTTGATCGAAGTCTAGTAAATCCCCAATATAGCCCTGAAAAGCTTGAGGGACGAGATAGCTCTATAAATAGACGTGAGGCTTTAAATCCTGATAAGTACATTACCTGAGAATTCCTCCTTTAGGAGTTTGAATTTATATAAGTTAGTACCAATAGTTAATATCATTTAAGTATGTTGTTATCGCTGAAGCCATGTATTTCGGATAATAACCTCTACATTGATATATAAACTATATGCAAGTCTCGGTGGATATTGCGTTATGGTCGCAGTTAACCTGTAGCTTATATATTCCTGTGTCGGAGCAGTGGTAATGGAGCCGGACGATTCCGCCAAAAATGTTTACTTCTCAACAAAATAACAAAATCACCAAACAACCCGCCCCCCTTTCTTATCTTGCAAGTATGCGAGCGATTACTATGGATGAAGAGCAAGAACATTTTCTTACTCTAAAATCTGTAGAAAGAGCTCAAATACTGAAGATGGTTTATGTGGACCAAATTGATTTCTTTATTTTACATCAAGATATCAATTGTATTGGTTTTACATTGACCATAGTAGATAAGGATGAAAGAACAAAGGACCTTGAGTATTTTGATCTTAATTGCGAGTATCATGAAAATTTATATGATGCATTGATGGATTCTGAGTTTTCTAAAACTTGGTTTACATTGTTGTTAAAATATATTGATTATGCTCCACTTAGTATGAATAGTCGAGGAATGCCCCGCCCGGAGACCATCTGTGTTTCAAAACACTGGTGGTATGAGTTGTATAGGATTGGATTCTTAAATAAGTTATATCGATGTGGTGACTGGGAAAGTATTTTACTTCTCCTTTCAGGAGATGTTGAAGAAAACCCAGGACCCGTTGACATTTCTTATAAGGAATCTTGCAGACAGAAGAGAATGAAGAAACGCGTTTCTAAGACTTATGAGGAAATCAAAATGCAGCAGCATATTGATAGAGTCAATAATGAAGAGAAACGCGCTCATATGACGAAACCCCGCAAGTTAAAGGACTTGATTGAAGTTGAAATGCAAGGAATGTTTAATTGGACCGAAGAAAGAGAAATCTTGAAGAGTACTGCATTCAAATTCAATCATTCGATGGACCGAGCGAATCATATTATGGATAATTTGATCCCACAGCTTGAGGATACTTTGTCTGGTTTCAGACAAACGTATGCAAAATGTGAAGCAAAATTCTTTGGATCAATAAGTGTTATTGATGTTTGTATAGACATCATGAGTGCTTTATTACAAGTGAGTTTTGCAAAACCTGGACTCAAGTTGGCTTCTATTGCAGTAGAAGTGTTCAGACTTATTAAGAAATATGTTTCAGGAATAAAGATTAACACCGATAAAATAAAAGAACTTTTGACTTTTGGTAAACAAGCCTTAAGTAGTAGTAATCCTATTATTCAGGTTTCCATGCAAATGGATATGCCAGAAGTCGATCCTTCAATTTTATTGCAACCCGGTGTTATAGTAAGCGCAATATTTTTAGTTTTAAGTGTAGTTTTTACTAAAACACTCCCAAGTAAGACTGGTATTGAGGCGATGTTAAAGAGGACTGGAGAACTAGGACGCTCTGCAAAGGGCATCATGGATCTCAATACAGTTCTTAATACATCAGTAACCTCAATGCTTGAATACTTTGGAGTACATACTTTAGGATTAAGACAAGAAGCTGAACTTCAAGTTCTCGTAGAAGGTTATAAGATCTGGTGCGATGAAGTTGCAGCTTTAGTAGGACATAAGATTAACATGGATGGCACTTTTGATGGAAGAAGTATTGTTGAAGATATTATGAGAGATACTAAAGAAATTCAACGTGTAGAGAATCTTTATAAACGTGGATTAGAAATTTCTCGTAATATTGCAGACATGAAACTTCCAACAAAGTTGACCATTAGTTTTAACACACACATGAGCTATTTGACTGAAGTTTTCAAAGCAGTGGATACATCCGGTGCTTTCGGAAACAAACCCCGGACTCAACCTGTAGTCATTTGGCTATATGGTGAGTCTGGAGTTGGTAAGTCGGGTATGACATGGCCTCTAGCCGTAGATCTTAATAATAGTTTAGTAGATAATGTAGAAGAGATGCGTAATTTTTCCAAGAATATTTATATGAGAAATGTAGAGCAGGAATTTTGGGACAATTATCAAGGACAAAACGTTGTAGTTTACGACGATTTTGGACAGATGAGAGATTCAACATCTAATCCCAATCCTGAATTCATGGAATTAATACGCACTGCTAATATAGCCCCTTACCCCCTACATATGGCCCATTTAGAAGATAAGCGCAAGACTAAATTTACATCTAAGGTGATTATCATGACATCTAATGTTTTTGAGCAATCTGTTAATTCGTTAACCTTTCCTGATGCTTTTAGACGTAGAGTTGATCTGTGTGCTGAAGTACGTAATAAGGATGAGTTTACGAAGGAAGGATATTCAAAAACTAAAGGATGCATGGTGAGACGTTTGGATAAGGATTTAGTTAAGAGGAAGACTGGAGACATATGTTCGACAGAATGTTATTTAGTAGAGTTGGTTAATCCTGAAACTGGAGAGAAATATCAAACTGATTTAGAATATGAAGACTTTCTAGATATGTGTTTGGAGAAAACTCAAGAGTGTAGAGATAATTCTGCCAAGTTGAATGAATTTTTGATGAATTATGCCGAAAGTCGATCAAAACGACCCGAACAAAAACACGACAAATGCCCTGAATTGGAATTTGAAGATGCGATTGAGGTATCTATGCAAGTAGATGCTAATCCGTCTTTAGTTCCAATTGAGAAGTCTCGTCTTCAAGAGATGATCGAAAGCTGTCAAGGAGTTGTATATGATGCCTGTGGTAAAACGGTACATATTTCTAAATTAGCTTTCGAATTAGCTCCTCTTGAATATGAGAAACAAATGGAAAGAATTTCAGAAATGAAATTCTATCAGAAAATGGCAAGTGGTGTTGTATATCTTCGTCAAGTTCGTGATACGAGCATGAAAATGCTTAATTCGTGGATGGAAGAATGTATACAATACGCAAAGGATCTCCCCTGGACAATAGTAGCCGGAGTACTTGGAACCTTCATTGGTATTCTTACCATTGTAGGTTTCTGGAAATGGTTATGTTCTGATGGACAAAAGAAGAAACAGGCAATTAAGCGTCATTTCATTAATACTGGATATACGCTTATTATACCTGAAAGAGAATTGAATAAATTCTGGGAGTTGGATGAAACTCTTGACTTACGGCGTATGCCCGTAAATCAAATAGAGGAACATCTTGCTCTACTATTGAAGCCGCGTCACCGCGTGGTTTTAGTACCCAAGGCCACTAAGTACATAATAAGTTTAGTAGATAATCATGCTAAATTGACAGATAAGATTATTCTTATAACTACCAATAGATATGTGTTCTACAAAAATCAAAATTATGAATTAGTGTTTGGAGAATTGAATCAATTCTTCGAAAAAGGGCCTGAATCCCTTGTGAATACTCCCAAGGTTGAAGCTTTTGCTTCTGCTGATTTGAGTACTTACAAAAATAGGACCCCAATTGTGATTGAAGCACAGACATCTGGAGATAATGCGACTCTTAAACAACAAAAGGTTAAAGTAATTGAAGCAAAAACATCTACTGATGAAGTTACTTTGAAACAACAAAAACCTATTGTTATAGAGGCACAGTCTTCTGGTGATTGCGTGACTCGAAAACAACAAGTACAACGAGTGATTGAAGCATTTGCAAGTAGTGATGCTATGACATTGAAGAAACCTACCGCGAAATTCGTAGAAAGTGACCCAAATGACATAGTTGATGTTACAATGCAGATGTGGAAGGATCAAGTTGCTCAGCGGCTGATAACCAATCGTGTGCTAACAAATTTGTATAAAGTTTGTTTAGTACACAATGACGACCGCATAACACCTCTTTTGAATGGACTTTTTGTTCGTTCAAATTTGATGTTAGTACCTGGACATCTTCTTGGATTTATTGCTGAGTACGATATAATTGAAATTCGAAATCTCTTTGACGTAGTATTTAGAGTACCATGGAAAGATATAAAGAAAATTCCAATTGTTAATGCTCTTGGTGAATCTAAGGAGGCAGCGTTACTGGCTTTTCCAAAATTCGTTTGTCAACATTCTGATTTGGTGAAGCACTTTCAAAATGCTGAATCTATGTCAAAATTCAAACGATGTGAAGTTACTCTACCCGTTTTACGTTTTTCTGAGAAAGTTGGTAAATTTTTATCAACACTCATTGAATGTGATCGAGTGGAGGCTTATGATAGACCTTATACGCTGAATGATTCTCAAAAAGGACAATATATTCTACGTCAAGGCTTAGAATATATAATGCCCACGACTAATGGTGATTGTGGTTCGCCGCTCATCATTAACGAAACCCAAGTTTTGAGGAAAATTGCTGGTATTCATGTAGCTGGAGCTACAACTGGCAAAGCCTATGCTGAGTCTATAACCCAAAAAGATCTTGAGCGAGCATTTACTAAGATAGATGTAAGCATGCAGATCCAATTGGATTTGGACTCAACATTGGATTTCTCAAAACCTGAACCTAAGTTGCCTTCCGGTACTGAATTTGGACCTGAAGATCTCAGTTTTTGTGATCTCCCCGCCCTTAAGATGTTACCAGTTGGTAAACTTTCCGAACCCTTATTTGAACCTGGCAAGAC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| 101,631
|
EU436423.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Palacios,G., Hui,J., Quan,P.L., Kalkstein,A., Honkavuori,K.S., Bussetti,A.V., Conlan,S., Evans,J., Chen,Y.P., vanEngelsdorp,D., Efrat,H., Pettis,J., Cox-Foster,D., Holmes,E.C., Briese,T., Lipkin,W.I., VanEngelsdoorp,D., Chen,J., Holmes,E.
|
Columbia University, Center for Infection and Immunity
|
USA
|
2008-06-18
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,580
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Israel acute paralysis virus of bees strain DVE31-OP3-PA-USA-2007, complete genome
|
CGTACAATTTTCGCCGAAATTAGCGATATAATTTCAAAATCGTTTCGCGGCGCCTGAGCAGCCTTTCCAATGGTAGGAGCGTCGATCCCCCGTATGGAGCGGAGAATATAAGGCTCAGCTAGGATGACACGCCTGTACACTGTCGACATTAGTTAAGTTGCAATTACACGTCTGTTGCCGAAGAAACCATTTTAGTCAACTGATTATGATTTTTGTATAATGATAAACAGTGATGAACTGTATAACTCATCAACAACAAAATGGATTACGAACCTATTTGTAACTATCTTGATCGAAGTCTAGTAAATCCCCAATATAGCCCTGAAAAGCTTGAGGGACGAGATAGCTCTATAAATAGACGTGAGGCTTTAAATCCTGATAAGTACATTACCTGAGAATTCCTCCTTTTGGAGTTTGAATTTATATAAGTTAGTACCAATAGTTAATATCATTTAAGTATGTTGTTATCGCTGAAGGCATGTATTTCGGATAATAACCTCTACATTGATATATAAACTATATGCAAGTCTCGGTGGATATTGCGTTATGGTCGCAGTTAACCTGTAGCTTATATATTCCTGTGTCGGAGCAGTGGTAATGGAGCCGGACGATTCCGCCAAAAATGTTTACTTCTCAACAAAATAACAAAATCACTAAACAACCCGCCCCCCTTTCTTATCTTGCAAGTATGCGAGCAATTACTATGGTTGAAGAGCAAGAACATTTTCTTACTCTAAAATCTGTAGAAAGAGCTCAAATACTGAAGATGGTTTATGTGGACCAAATTGATTTCTTTATTTTACATCAAGATATCAATTGTATTGGTTTTACATTGACCATAGTAGATAAGGATGAAAGAACAAAGGATCTTGAGTATTTTGATCTTAATTGTGAGTATTATGAAAATTTATATGATGCATTGATGGATTCTGAGTTTTCTAAAACTTGGTTTACATTGTTGTTAAAATATATTGATTATGCTCCAGTTAGTATGAATAGTCAAGGAATGCCCCGCCCGGAGACCATCTGTGTTTCAAAACACTGGTGGTATGAGTTGTATAGGATTGGATTTTTAAATAAGTTATATCGATGTGGTGACTGGGAAAGTATTTTACTTCTCCTTTCAGGAGATGTTGAAGAAAACCCAGGACCCGTTGATATTTCTTATAAGGAATCTTGCAGACAGAAGAGAATGAAGAAACGCGTTTCTAAGACTTATGAGGAAATCAAAATGCAACAGCATATTGATAGAGTTAATAATGAAGAGAAACGCGCTCATATAACGAAACCCCGCAAGTTAAAGGACTTGATTGAAGTTGAAATGCAAGGAATGTTTAATTGGACCGAAGAAAGGGAAATCTTGAAGAGTACTGCATTTAAATTCAATCATTCGATGGACCGAGCGAATCATATTATGGATAATTTGATCCCACAGCTTGAGGATACTTTGTCTGGTTTCAGACAAACGTATGCAAAATGTGAAGCAAAATTCTTTGGATCAATAAGTGTTATTGATGTTTGTATAGATATTATTAGTGCTTTATTACAAGTGAGTTTTGCTAAACCTGGACTCAAGTTGGCTTCTATTGCAGTAGAAGTGTTCAGACTTATTAAGAAATATGTTTCAGGAATAAAGATTAACACTGATAAAATAAAAGAACTTTTGACTTTTGGTAAACAAACCTTAAGTAGTAGTAATCCTATTATTCAGGTTTCCATGCAAATGGATATGCCAGAAGTCGATCCTTCAATTTTATTGCAACCCGGTGTTATAGTAAGCGCAATATTTTTAGTTTTAAGTGTAGTTTTTACTAAAACACTCCCAAGTAAGACTGGTATTGAGGCGATGTTAAAGAGGACTGGAGAACTAGGACGCTCTGCAAAGGGCATCATGGATCTCAATACAGTTCTTAATACATCAGTAACCTCAATGCTTGAATACTTTGGAGTACATACTTTAGGATTAAGACAAGAAGCTGAACTTCAAGTTCTCGTAGAAGGTTATAAGATCTGGTGCGATGAAGTTGCAGCTTTAGTAGGACATAAGATTAACATGGATGGCACTTTTGATGGAAGAAGTATTGTTGAAGATATTATGAGAGATACTAAAGAAATTCAACGTGTAGAGAATCTTTATAAACGTGGATTAGAAATTTCTCGTAATATTGCAGACATGAAACTTCCAACAAAGTTGACCATTAGTTTTAATACACACATGAGGTATTTGACTGAAGTTTTCAAAGCAGTGGATACATCCGGTGCTTTCGGAAACAAACCCCGGACTCAACCTGTAGTCATTTGGCTATATGGTGAGTCTGGAGTTGGTAAGTCGGGTATGACATGGCCTCTAGCCGTAGATCTTAATAATAGTTTAGTAGATAATGTAGAAGAGATGCGTAATTTTTCCAAGAATATTTATATGAGAAATGTAGAGCAGGAATTTTGGGACAATTATCAAGGACAAAACGTTGTAGTTTACGACGATTTTGGACAGATGAGAGATTCAACATCTAATCCCAATCCTGAATTCATGGAATTAATACGCACTGCTAATATAGCCCCTTACCCCCTACATATGGCCCATTTAGAAGATAAGCGCAAGACTAAATTTACATCTAAGGTGATTATCATGACATCTAATGTTTTTGAGCAATCTGTTAATTCGTTAACCTTTCCTGATGCTTTTAGACGTAGAGTTGATCTGTGTGCTGAAGTACGTAATAAGGATGAGTTTACGAAGGAAGGATATTCAAAAACTAAAGGATGCATGGTGAGACGTTTGGATAAGGATTTAGTTAAGAGGAAGACTGGAGACATATGTTCGACAGAATGTTATTTAGTAGACTTGGTTAATCCTGAAACTGGAGAGAAATATCAAACTGATTTAGAATATGAAGACTTTCTAGATATGTGTTTGGAGAAAACTCAAGAGTGTAGAGATAATTCTGCCAAGTTGAATGAATTTTTGATGAATTATGCCGAAAGTCGATCAAAACGACCCGAACAAAAACACGATAAATGCCCTGAATTGGAATTTGAAGATGCGATTGAGGTATCTATGCAAGTAGATGCTAATCCGTCTTTAGTTCCAATTGAGAAGTCTCGTCTTCAAGAGATGATCGAAAGCTGTCAAGGAGTTGTATATGATGCCTGTGGTAAAACGGTACATATTTCTAAATTAGCTTTCGAATTAGCTCCTCTTGAATATGAGAAACAAATGGAAAGAATTTCAGAAATGAAATTCTATCAGAAAATGGCAAGTGGTGTTGTATATCTTCGTCAAGTTCGTGATACGAGCATGAAAATGCTTAATTCGTGGATGGAAGAATGTATACAATACGCAAAGGATCATCCCTGGACAATAGTAGCTGGAGTTCTAGGAACCTTCATTGGTATTCTTACCATTGTTGGTTTCTGGAAATGGCTATGCTCTGATGGACAGAAGAAGAAACAAGCAATTAAGCGTCATTTTATTAATACTGGATATACGCTTATTATACCTGAACGAGAATTGAATAAATTCTGGGAGTTGGATGAAACTCTTGATTTACGTGGAATGTCCGTAAATCAAATAGAGGAACATCTCGCTCTACTATTGAAGCCGCGTCACCGCGTGGTTTTAGTACCCAAGGCCACTAAGTACATAATAAGTTTAGTAGATAATCATGCTAAATTGACAGATAAGATTATTCTTATAACTACTAATAGATATGTGTTCTACAAAAATCAAAATTATGAATTAGTGTTTGGAGAATTGAATCAATTCTTCGAAAAAGACCTAGAATCCCTTGTGAATACTCCCAAGGTTGAAGCTTTTGCTTCTGCTGATTTGAGTACTTACAAAAATAGGACCCCAATTGTGATTGAAGCACAGACATCTGGAGATAATGCGACTCTTAAACAACAAAAGGTTAAAGTAATTGAAGCAAAAACATCTACTGATGAAGTTACTTTGAAACAACAAAAACCTATTGTTATAGAGGCACAGTCTTCTGGTGATTGCGTGACTCGAAAACAACAAGTACAACGAGTGATTGAAGCATTTGCAAGTAGTGATGCTATGACATTGAAGAAACCTACCGCGAAATTCGTAGAAAGTGACCCAAATGACATAGTTGATGTTACAATGCAGATGTGGAAGGATCAAGTTGCTCAGCGGCTGATAACCAATCGTGTGCTAACAAATTTGTATAAAGTTTGTTTAGTACACAATGACGACCGCATAACACCTCTTTTGAATGGACTTTTTGTTCGTTCAAATTTGATGTTAGTACCTGGACATCTTCTTGGATTTATTGCTGAATATGACATAATCGAAATTCGAAATCTCTTTGACGTGGTATTTAGAGTACCATGGAAAGATGTAAAGAAAATTCCAATTGTTAATGCTCTTGGTGAATCTAAGGAGGCAGCGTTACTGGCCTTTCCAAAATTCGTTTGCCAACATTCTGATTTGGTGAAGCATTTTCAAAATGCTGAATCTATGTCAAAATTCAAACGATGTGAAGTCACTCTACCTGTATTGCGCTTCTCTGAGAGAGTTGGTAAATTTTTATCAACTCTCATTGAGTGTGATCGAGTTGAAGCTTATGATAGGCCTTATACGCTGAATGATTCTCAAAAAGGACAATATATTCTACGTCAAGGTTTAGAATATACAATGCCAACGACTAATGGTGATTGTGGTTCACCACTAATCATTAACGAGACTCAGGTTTTGAGGAAAATTGCTGGTATTCATGTGGCAGGAGCTACAACTGGCAAAGCTTATGCTGAGTCCATAACCCAAAAAGATCTTGAGCGAGCATTTACTAAAATAGATGTTAGTATGCAGATCCAATTAGATTTGGACTCAACATTGGATTTCTCAAAACCTGAACCTAAGTTGCCTTCCGGTACTGAATTTGGACCTGAAGATCTCAGTTTTTGTGATCTCCCCGCCCTTAAGATGTTACCAGTTGGTAAACTTTCCGAACCCTTATTTGAACCTGGCAAGACTG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| 105,233
|
EU436455.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Palacios,G., Hui,J., Quan,P.L., Kalkstein,A., Honkavuori,K.S., Bussetti,A.V., Conlan,S., Evans,J., Chen,Y.P., vanEngelsdorp,D., Efrat,H., Pettis,J., Cox-Foster,D., Holmes,E.C., Briese,T., Lipkin,W.I., VanEngelsdoorp,D., Chen,J., Holmes,E.
|
Columbia University, Center for Infection and Immunity
|
USA
|
2008-06-18
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,281
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Israel acute paralysis virus of bees strain IS1-ISRAEL-2007, complete genome
|
TTTANTCNCTGATTATGATTTTTGTATAACGATAAACAGTGATGAACTGTATAACTCATCAACAACAAAACGGATTACGAACCTATTTGTAACTATCTTGATTGAAGTCTAGTAGATCCCCAATATAGCCCTGAAAAGCTTGAGGGACGAGATAGCTCTATGAATAGACGTGAGGCTTTAAATCCTGATAAGTACATTACCTGAGAATTCCTCCTTTTGGAGTTTGAATTTATATAAGTTAGTACCAATAGTTAATATCATTTAAGTATGTTATTATTGCTGAAGGCATGTATTTCGGATAATAACCTCTACATTGATATATAAACTATATGCAAGTCTCGGTGGATATTGCGTTATGGTCGCAGTTAACCTGTAGCTTATATATTCCTGTGTCGGAGCAGTGGTAATGGAGCCAGATGATTTCGCCAAAAATGTTCATTTCTCAACAAAATAACAAAATTACCAAACAACCCGCACCCCTTTCTTATCTTGCAAGTATGCGAGCAATTACTATGGATGAAGAGCAAGAATATTTTCTTACTCTAAAGTCTGTAGAAAGAGCTCAAATATTGAAGATGGTTTATGTGGACCAAATTGATTTCTTTATATTACATCAAGATATCAATTGTATTGGTTTTACATTAACTATAGTAGATAAGGATGAAAGAACAAAGGACCTTGAGTATTTTGACCTTAATTGTGAGTATTATGAGAATTTGTATGATGCATTAATGGATTCTGAGTTTTCTAAAACTTGGTTTACATTGTTGCTAAAATATATTGATTATGCTCCAATTAGTACGAACAGTCGAGGAATGCCCCGTCCGGAGACTATCTGTGTTTCAAAACATTGGTGGTATGAGTTATATAAGATTGGATTCTTGAATAAGTTGTGCCAATGTGGAGACTGGGATAGTATTTTACTTCTCCTTTCAGGAGATATTGAAGAAAACCCGGGACCTGTTGATATTTCTTATAAAGAATTTTGCAGACAGAAGAGAATGAAGAAATGCGTTTCTAAGACTTATGAGGAAATCAAAATGCAACAGCATATTGATAGAATTAATAATGAAGAGAAACGTGCTCATATGACGAAACCCCGTAAGTTAAAGGATTTGATTGAAGTTGAAATGCAAGGAATGTTTAATTGGACTGAAGAAAGGGAAATCTTGAAGAGTACTGCATTCAAATTCAATCATTCGATGGACCGAGCGAATCATATTATGGATAATCTGATCCCACAACTTGAGGATACTTTGTCTGGTTTCAGACAAACGTATGCAAAGTGTGAAGCGAAATTCTTTGGATCAATAAGTGTTATTGATGTCTGCATAGATATCATTAGTGCTTTGTTGCAAGTGAGCTTCGCTAAACCTGGACTCAAGTTAGCTTCTATTGCAGTGGAAGTGTTCAGACTTATTAAGAAATATGTCTCAGGAATTAAGATTAACACCGATAAGATAAAAGAACTTTTGACTTTTGGTAAACAAGCTTTGAGTAGTAGTAACCCTATTATTCAGGTTTCCATGCAAATGGATATGCCAGAAGTTGATCCTTCAATTTTATTGCAACCTGGTGTTATAGTAAGTGCAATCTTTTTAGTTTTAAGTGTAGTTTTTACTAAGACCCTCCCAAGTAAGACTGGTGTTGAGGCGATGTTAAAGAGGACTGGAGAACTAGGACGCTCCGCAAAGGGCATCATGGATCTTAATACAGTTCTTAATACATCAGTAACCTCAATGCTTGAATACTTTGGAGTACATACTTTAGGATTAAGACAAGAAGCTGAACTTCAAGTCCTCGTAGAAGGTTATAAAACCTGGTGTGATGAAGTTGCGGCTTTAGTAGGACATAAGATTAACATGGATGGTACTTTTGATGGAAGAAGTATTGTTGAAAATATTATGAGAGATACAAAGGAAATCCAACGTGTAGAAAATCTCTACAAACGTGGATTGGAAATTTCTCGTAATATTGCAGACATGAAACTTCCAACAAAATTAACCATTAGTTTTAATACACACATGAGATATTTGACTGAAGTTTTCAAAGCAGTAGATACGTCTGGTGCTTTTGGAAATAAACCCCGAACTCAACCTGTAGTTATTTGGCTATATGGTGAGTCTGGAGTTGGTAAGTCAGGTATGACATGGCCCCTAGCCGTAGATCTTAATAATAGTTTAGTAGATAATGTAGAAGAGATGCGTAATTTTTCCAAGAATATTTACATGAGAAATGTAGAACAGGAATTTTGGGATAATTATCAAGGACAGAACGTTGTAGTTTATGATGATTTTGGACAGATGAGGGATTCAACATCCAATCCTAATCCTGAATTCATGGAATTAATACGCACAGCTAATATAGCCCCTTATCCTTTACATATGGCCCATTTAGAAGATAAGCGTAAAACTAAATTTACATCTAAAGTAATTATCATGACATCTAATGTTTTTGAACAGTCTGTAAATTCATTAACTTTTCCTGATGCTTTTAGACGCAGAGTTGATCTGTGTGCTGAAGTGCGTAATAAGGATGAGTTTACGAAGGAAGGATATTCAAAGACTAAAGGATGCATGGTAAGGCGCTTGGATAAGGATTTAGTTAAGAAGAAGACTGGAGACATATGTTCAACAGAATGTTATTTAGTAGACTTGGTTAATCCCGAAACTGGAGAGAAATACCAAACTGATTTAGAATATGAAGATTTTCTAGATATGTGTTTGGAGAAAACTCAGGAGTGTAGAGATAATTCTGCTAAGTTGAACGAATTTCTGATGAACTATGCTGAAAGTCGATCGAAACGACCCGGACAAAAACACGATAAGTGCCCTGAATTGGAATTTGAAGATGCAATTGAAGTGTCTATGCAAGTAGACGCTGACTCATCTTTAGTTCCAATTGAGAAGTCTCGTCTTCAAGAGATGATTGAGAGTTGCCAAGGAGTTGTGTATGATGCCTGCGGCAAGACCATATACATTTCTAAGTTAGCTTTTGAACTAGCCCCTCTTGAATATGAGAAACAAATGGAAAGAATTTCAGAAATGAAATTTTATCAGAAAATGGCAAGTGGTGTTGTATACCTTCGTCAAGTTCGTGATACGAGTATGAAAATGCTTAATTCATGGATGGAAGAATGTATACAATATGCAAAGGATCACCCTTGGACAATAGTAGCTGGAGTTCTAGGAACCTTCATTGGCATTCTTACCATTGTTGGTTTCTGGAAATGGCTATGCTCTGATGGACAGAAGAAGAAACAGGCAATTAAGCGTCATTTCATTAATACTGGATATACGCTTATTATACCTGAACGAGAATTGAATAAATTCTGGGAGTTGGATGAAACTCTTGATTTACGTGGAATGCCTGTAAATCAAATAGAGGAACATCTTGCTCTACTACTGAAGCCGCGTCATCGCGTGGTTTTAGTACCTAAAGCCACTAAGTACATAATAAGTTTAGTAGATAATCATGCCAAATTGACAGATAAGATTATTCTTATAACTGCTAATAGGTATGTGTTTTATAAAAATCAAAATTATGAATTAGTGTTTGGAGAATTAAATCAATTTTTCGAAAAAGACCCAGAATCCCTTGTGAATACTCCTAAGGTTGAGGCTTTTGCTTCCGCCGATTTGAGTACTTATAAAAATAGGACCCCGATCGTGATTGAAGCACAGACATCTGGAGATAATGTGACTCTTAAACAACAAAAGGTTAAAGTAATTGAAGCAAAAACATCTACTGATGAAGTTACTTTGAAACAACAAAAACCTATTGTTATAGAGGCACAGTCTTCTGGTGATTGTGTGACCCGAAAACAACAAGTACAACGAGTGATTGAAGCATTTGCAAGTAGTGATGCTGTGACATTGAAGAAATCTACTGCGAAATTCGTAGAAAGTGACCCAAATGACATAGTTGATGTTACAATGCAAATGTGGAGAGATCAAGTTGCTCAACGATTGATAACCAACCGTGTATTGACAAATTTGTATAAAGTTTGTTTGGTACACAATGACGATCGAATAACACCTCTTTTGAATGGACTTTTTGTTCGTTCAAATTTGATGTTAGTACCTGGACATCTTCTTGGATTCATTGCTGAGTATGATACAATTGAAATTCGAAATCTTTTTGACGTGGTATTTAGAGTGCCATGGAAAGATGTGAAGAAAATTCCAATTGTTAATGCTTTTGGTGAATCTAAAGAAGCAGCGTTATTGGCCTTTCCAAAATTCGTTTGCCAACATTCTGATTTAGTTAAGCATTTCCAAAATGCTGAGTCTATGTCGAAATTTAAACGATGTGAAGTTACTCTACCCGTTTTACGTTTCTCTGAGAAAGTTGGTAAATTTTTATCGACACTCATTGAATGTGATCGAGTGGAGGCTTATGATAGACCTTATACGCTGAACGATTCTCAAAAAGGACAATATATTCTACGTCAAGGCTTAGAATATACGATGCCCACAACTAATGGTGATTGTGGCTCGCCGCTCATCATTAATGAAACCCAAGTTTTGAGGAAAATTGCGGGTATTCATGTAGCTGGAGCTACAACTGGCAAAGCCTATGCTGAGTCTATAACCCAAAAAGATCTTGAGCGAGCATTTATTAAAATAGATGTAAGCATGCAGATCCAATTGGATTTGGACTCAACATTGGATTTCTCAAAACCTGAACCCAAATTGCCTTCCGGTACTGAATTTGGTCCTGAAGATCTCAGTTTTTGTGATCTTCCCGCCCTAAAGATGTTACCAGTTGGTAAACTTTCTGAATCCTTATTCGAACCTGGCAAGACGGATATAAGGCCCTCTTTGGTACATGGTCAAATTAGTGACATAAAAACAAAACCAGCCTATTTACGTAATGTAATTAAGGATGGAGATTTTGTTAATATGAAACATAAAAATTTGATGAAATGTGCTATGGATACACCCTATATCGATAAGGACATGATTGATGAGGCATATCAGTTAACTAAATCTGTTTGG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| 105,234
|
EU436456.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Palacios,G., Hui,J., Quan,P.L., Kalkstein,A., Honkavuori,K.S., Bussetti,A.V., Conlan,S., Evans,J., Chen,Y.P., vanEngelsdorp,D., Efrat,H., Pettis,J., Cox-Foster,D., Holmes,E.C., Briese,T., Lipkin,W.I., VanEngelsdoorp,D., Chen,J., Holmes,E.
|
Columbia University, Center for Infection and Immunity
|
USA
|
2008-06-18
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,480
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Israel acute paralysis virus of bees strain OZ6-AUSTRALIA-2007, complete genome
|
GCGTCGATCCCCCGTATGGAGTGGAGAATATAAGGCTCAGCTAGGATGACACGCCTGTACACTGTCGACATTAGTTAAGTTACAATTACACGTCTTTTGCCGAAGAAACCATTTTAGTCAACTGACTATGATTTTTGTATAACGACAAACAGTGATGAACTGTATAATTCATCAACAACAAAACGGATTACGAACCTATTTGTAACTATCTTGGTCGAAGTCTAGTAGATCCCCAATATAGCCCTGAAAAGCTTGAGGGACGAGATAGCTCTATAAATAGACGTGAGGCTTTAAATCCTGATAAGTACATTACCTGAGAATTCCTCCTTTAGGAGTTTGAATTTATATAAGTTAGTACCAATAGTTAATATCATTTAAGTATGTTATTATTGTTGAAGACATGTATTTCGGATAATAACCTCTACATTGATATATAAACTATATGCAAGTCTCGGTGGATATTGTATTATGGTCGCAGTTAACCTGCAGCTTATATATTCCTGTGTCGGAGCAGTGGTAATGGAGCCGGACAATTTCGCCAAAATGTTTACTTCTCAACAAAATAACAAAATCACCAAACAACCCGCCCCCCTTTCTTATCTTGCAAGTATGCGAGCGATTACTATGGATGAAGAACAAGAATATTTTCTTACTCTAAAATCTGTAGAAAGAGCTCAAATACTGAAGATGGTTTATGTAGATCAAATTGATTTCTTTATTTTACATCAAGATATCAATTGTATTGGTTTTACATTGACCATAGTAGATAAGGATGAAAGAACGAAGGACCTCGAATATTTTGACCTTAATTGTGAGTATTATGAAAATTTATATGACGCATTAATGGACTCTGAGTTTTCTAAAACTTGGTTTACATTGTTGCTAAAATATATTGATTATGCTCCAATTAGTATGAACAGTCGAGGAATGCCCCGCTCGGAGACCATCTGTGTTTCAAAACATTGGTGGTATGAGTTGTATAGGATGGGATTCTTAAATAAGTTGTATCGATGTGGTGACTGGGATAGTATTTTACTTCTCCTTTCAGGAGATATTGAAGAAAACCCAGGACCCGTTGATATTTCTTATAAGGAATCTTGCAGACAGAAGAGAATGAAGAAACGCGTTTCTAAGACTTATGAGGAAATCAAAATGCAACAGCATATTGATAGAATTAATAATGAAGAGAAACGTGCTCATATGACGAAACCCCGCAAGTTAAAGGATTTGATTGAAGTTGAAATGCAAGGAATGTTTAATTGGACCGAAGAAAGGGAAATCTTGAAAAGTACTGCATTCAAATTCAATCATTCAATGGACCGAGCGAATCATATTATGGATAATCTAATTCCACAACTTGAGGATACTCTGTCTGGTTTCAGACAGACGTATGCAAAGTGTGAAGCAAAATTCTTTGGATCAATTAGTGTTATTGATGTTTGTATAGACATCATTAGTGCGTTGTTACAAGTGAGTTTTGCTAAACCTGGACTCAAGTTAGCCTCTATTGCAGTAGAGGTATTTAGACTTATTAAGAAATATGTTTCAGGAATTAAGATTAACACCGATAAAATAAAAGAACTTTTAACTTTTGGTAAACAAGCTTTGAGTAGTAGTAACCCTATTATTCAGGTTTCCATGCAAATGGATATGCCAGAAGTTGATCCTTCGATTTTATTACAACCCGGTGTTATAGTAAGTGCAATATTTTTAGTTTTAAGTGTAGTTTTTACTAAAACACTCCCAAGTAAGACTGGTATTGAGGCAATGTTAAAGAGAACTGGAGAACTAGGACGCTCTGCAAAGGGTATCATGGATCTCAATACAGTTCTTAATACTGGCGTAACCTCAATGCTTGAGTATTTTGGAGTGCATACTTTAGGATTAAGACAAGAAGCTGAACTTCAAGTCCTCGTAGAGGGTTATAAGACTTGGTGCGATGAAGTTGCAGCTTTAGTAGGACATAAGATTAATATGGATGGTACTTTTGATGGAAGAAGTATTGTTGAAGAAATTATGAGAGATACAAAAGAAATCCAACGTGTAGAGAATCTCTACAAACGTGGATTGGAAATTTCTCGTAATATTGCAGACATGAAACTTCCAACAAAATTAACTATTAGTTTTAATACTCACATGCGATATTTGACTGAAGTTTTCAAAGCAGTGGATACATCTGGTGCTTTTGGAAATAAACCCCGAACTCAACCTGTAGTTATTTGGCTGTATGGTGAGTCTGGAGTTGGTAAGTCAGGTATGACATGGCCTTTAGCTGTAGATCTTAATAATAGTTTAGTAGATAATGTAGAAGAAATGCGTAACTTTTCCAAGAATATTTACATGAGAAATGTAGAACAGGAATTTTGGGATAATTATCAAGGACAAAACGTTGTAGTCTACGACGATTTTGGACAGATGAGAGATTCAACATCTAATCCCAATCCTGAATTCATGGAATTGATACGTACCGCTAATATAGCCCCTTATCCCCTACACATGGCCCATTTAGAAGATAAGAGGAAGACTAAATTTACATCAAAAGTGATTATCATGACATCTAATGTTTTTGAACAATCTGTTAATTCGTTAACTTTTCCTGATGCTTTCAGACGTAGAGTTGATCTGTGTGCTGAAGTGCGTAATAAGGAAGAATTTACGAAGGAAGGATATTCGAAGACTAAAGGATGCATGGTAAGACGCTTGGATAAAGATTTAGTAAAGAAGAAGACTGGAGACATATGTTCAACAGAATGTTATCTAGTAGATTTAGTAAATCCTGAAACTGGAGAGAAATACCAAACTGATCTAGAATATGAAGATTTTCTAGATATGTGTTTGGAAAAGACTCAAGAGTGTAGAGATAATTCTGCTAAGTTGAATGAGTTTCTGATGAATTATGCCGAAAGTCGATCAAAACGACCAGAACAAAAACATGACAAATGCCCTGAATTGGAATTTGAGGATGCAATCGAAGTGTCAATGCAAGTAGACGCTGATTCATCCTTAGTTCCAATTGAGAAAATCCGACTTCAAGAGATGATTGAAAGCTGTAAGGGAGTTGTATATGACGCTTACGGCAACACAGTACAAATTTCCAAATTAGCTTTTGAATTGGCTCCTCTTGAATTTGAGAAACAAATGGAAAGAATCTCAGAAATGAAATTCTACCAGAAAATGGCAAGTGGTGTTGTATACCTTCGTCAAGTCCGAGATACAAGCATGAAAATGCTTAATTCTTGGATGGAAGAATGTTTACAATACGCAAAGGACCACCCCTGGACAATAGTAGCCGGAGTACTTGGAACCTTCATTGGTATTCTTACCATTGTAGGTTTCTGGAAATGGTTATGTTCTGATGGACAAAAGAAGAAACAGGCAATTAAGCGTCATTTCATTAATACTGGATATACGCTTATTATACCTGAAAGAGAATTGAATAAATTCTGGGAGTTGGATGAAACTCTTGACTTACGGCGTATGCCCGTAAATCAAATAGAGGAACATCTTGCTCTATTACTGAAGCCGCGTCACCGCGTGGTTTTGGTACCCAAAGCCACCAAATACATAATAAGTTTAGTAGATAATCATGCTAAATTGACAGATAAGATTATTCTTATAACTGCCAATAGGCATGTGTTTTATAAAAACCAAAATTATGAATTGGTGTCTGGCGAATTGAATCAATTCTTTGAAAAAGACCCGGAATCTCTTGTGAATACTCCCAAAGTAGAAGCTTTTGCTTCTGCTGATTTGAGTACTTACAAAAACAGGACCCCGATTGTTATTGAAGCACAATCTTCTGGAGATAATGTGACTCTTAAACAACAAAAGGTTAAAGTAATTGAAGCTAAGACATCTGTTGATGAAGTTACTTTGAAACAACAGAAACCTATTGTTATAGAGGCGCAGTCTTCTGGTGATTGTGTGACCCGGAAACAACAAGTGCAACGAGTGATTGAAGCATTTGCGAGTAGTGATGCTGTGACATTGAAGAAACCAACTGCAAAATTTGTAGAAAGTGATCCCAATGACATAGTTGATGTTACAATGCAAATGTGGAAAGATCAAGTCGCCCAACGATTGATCACGAATCGTGTACTGACAAACTTATATAAAGTTTGTTTAGTACATAACGACGACCGCATAACACCTCTTTTGAATGGACTTTTTGTTCGTTCAAATTTGATGTTAGTACCTGGACATCTTCTTGGATTTATTGCTGAGTACGATATAATTGAAATTCGAAATCTCTTTGACGTGGTATTTAGAGTACCATGGAAAGATGTAAAGAAAATTTCAATTGTTAATGCTCTTGGTGAATCTAAGGAGGCAGCGTTATTAGCCTTTCCAAAATTCGTTTGCCAACATTCTGATTTGGTGAAGCATTTCCAAAATGCTGAGTCTATGTCAAAGTTCAAACGATGCGAAGTTACTCTACCTGTACTGCGTTTTTCTGAGAAAGTTGGTAAATTTTTATCAACTCTCATTGAATGTGATCGGGTGGAGGCTTATGATAGGCCTTATACGCTGAATGATTCTCAAAAAGGACAATATATTCTACGTCAAGGCTTAGAATATACAATGCCGACGACCAGTGGTGATTGTGGTTCTCCACTAATTATCAATGAGACCCAAGTTTTGAGGAAAATTGCTGGTATTCATGTAGCGGGAGCTACAACCGGCAAAGCCTATGCTGAATCCATAACCCAAAAGGATCTTGAGCGAGCATTTACTAAAATAGATGTTAGCATGCAGATCCAATTGGATTTGGACTCGACATTGGATTTCTCAAAACCCGAACCTAAGTTGCCTTCTGGTACTGAATTTGGACCTGAGGATCTCAGTTTCTGTGATCTTCCTGCCCTTAAGATGTTACCAGTTGGTAAACTTTTCGAACCCTTATTCGAACCTGGCAAGACTGATATAAGACCTTCCTTGGTGCATGGTCAAATCAGTGACATAAAAACGAAACCTGCTTATTTGCGTAATGTAATTAAGGA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| 105,235
|
EF219380.1
|
Israeli acute paralysis virus
|
Maori,E., Lavi,S., Mozes-Koch,R., Gantman,Y., Peretz,Y., Edelbaum,O., Tanne,E., Sela,I.
|
The Hebrew University of Jerusalem, Faculty of Agriculture
|
Israel
|
2007-02-11
| null |
Aparavirus israelense
|
Aparavirus
|
Dicistroviridae
|
ssRNA(+)
| 9,499
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Israel acute paralysis virus of bees, complete genome
|
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| 107,390
|
NC_001699.1
|
JC polyomavirus
|
Miyamura,T., Furuno,A., Yoshiike,K., Martin,J.D., King,D.M., Slauch,J.M., Frisque,R.J., Kenney,S., Natarajan,V., Strike,D., Khoury,G., Salzman,N.P., Bream,G.L., Cannella,M.T., Jikuya,H., Soeda,E.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-02
| null |
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,130
|
RefSeq
| 6
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
JC polyomavirus, complete genome
|
GCCTCGGCCTCCTGTATATATAAAAAAAAGGGAAGGGATGGCTGCCAGCCAAGCATGAGCTCATACCTAGGGAGCCAACCAGCTAACAGCCAGTAAACAAAGCACAAGGCTGTATATATAAAAAAAAGGGAAGGGATGGCTGCCAGCCAAGCATGAGCTCATACCTAGGGAGCCAACCAGCTAACAGCCAGTAAACAAAGCACAAGGGGAAGTGGAAAGCAGCCAAGGGAACATGTTTTGCGAGCCAGAGCTGTTTTGGCTTGTCACCAGCTGGCCATGGTTCTTCGCCAGCTGTCACGTAAGGCTTCTGTGAAAGTTAGTAAAACCTGGAGTGGAACTAAAAAAAGAGCTCAAAGGATTTTAATTTTTTTGTTAGAATTTTTGCTGGACTTTTGCACAGGTGAAGACAGTGTAGACGGGAAAAAAAGACAGAGACACAGTGGTTTGACTGAGCAGACATACAGTGCTTTGCCTGAACCAAAAGCTACATAGGTAAGTAATGTTTTTTTTTGTGTTTTCAGGTTCATGGGTGCCGCACTTGCACTTTTGGGGGACCTAGTTGCTACTGTTTCTGAGGCTGCTGCTGCCACAGGATTTTCAGTAGCTGAAATTGCTGCTGGAGAGGCTGCTGCTACTATAGAAGTTGAAATTGCATCCCTTGCTACTGTAGAGGGGATTACAAGTACCTCTGAGGCTATAGCTGCTATAGGCCTTACTCCTGAAACATATGCTGTAATAACTGGAGCTCCGGGGGCTGTAGCTGGGTTTGCTGCATTGGTTCAAACTGTAACTGGTGGTAGTGCTATTGCTCAGTTGGGATATAGATTTTTTGCTGACTGGGATCATAAAGTTTCAACAGTTGGGCTTTTTCAGCAGCCAGCTATGGCTTTACAATTATTTAATCCAGAAGACTACTATGATATTTTATTTCCTGGAGTGAATGCCTTTGTTAACAATATTCACTATTTAGATCCTAGACATTGGGGCCCGTCCTTGTTCTCCACAATCTCCCAGGCTTTTTGGAATCTTGTTAGAGATGATTTGCCAGCCTTAACCTCTCAGGAAATTCAGAGAAGAACCCAAAAACTATTTGTTGAAAGTTTAGCAAGGTTTTTGGAAGAAACTACTTGGGCAATAGTTAATTCACCAGCTAACTTATATAATTATATTTCAGACTATTATTCTAGATTGTCTCCAGTTAGGCCCTCTATGGTAAGGCAAGTTGCCCAAAGGGAGGGAACCTATATTTCTTTTGGCCACTCATACACCCAAAGTATAGATGATGCAGACAGCATTCAAGAAGTTACCCAAAGGCTAGATTTAAAAACCCCAAATGTGCAATCTGGTGAATTTATAGAAAGAAGTATTGCACCAGGAGGTGCAAATCAAAGATCTGCTCCTCAATGGATGTTGCCTTTACTTTTAGGGTTGTACGGGACTGTAACACCTGCTCTTGAAGCATATGAAGATGGCCCCAACAAAAAGAAAAGGAGAAAGGAAGGACCCCGTGCAAGTTCCAAAACTTCTTATAAGAGGAGGAGTAGAAGTTCTAGAAGTTAAAACTGGGGTTGACTCAATTACAGAGGTAGAATGCTTTTTAACTCCAGAAATGGGTGACCCAGATGAGCATCTTAGGGGTTTTAGTAAGTCAATATCTATATCAGATACATTTGAAAGTGACTCCCCAAATAGGGACATGCTTCCTTGTTACAGTGTGGCCAGAATTCCACTACCCAATCTAAATGAGGATCTAACCTGTGGAAATATACTCATGTGGGAGGCTGTGACCTTAAAAACTGAGGTTATAGGGGTGACAAGTTTGATGAATGTGCACTCTAATGGGCAAGCAACTCATGACAATGGTGCAGGGAAGCCAGTGCAGGGCACCAGCTTTCATTTTTTTTCTGTTGGGGGGGAGGCTTTAGAATTACAGGGGGTGCTTTTTAATTACAGAACAAAGTACCCAGATGGAACAATTTTTCCAAAGAATGCCACAGTGCAATCTCAAGTCATGAACACAGAGCACAAGGCGTACCTAGATAAGAACAAAGCATATCCTGTTGAATGTTGGGTTCCTGATCCCACCAGAAATGAAAACACAAGATATTTTGGGACACTAACAGGAGGAGAAAATGTTCCTCCAGTTCTTCATATAACAAACACTGCCACAACAGTGTTGCTTGATGAATTTGGTGTTGGGCCACTTTGCAAAGGTGACAACTTATACTTGTCAGCTGTTGATGTCTGTGGCATGTTTACAAACAGGTCTGGTTCCCAGCAGTGGAGAGGACTCTCCAGATATTTTAAGGTGCAGCTAAGGAAAAGGAGGGTTAAAAACCCCTACCCAATTTCTTTCCTTCTTACTGATTTAATTAACAGAAGGACTCCTAGAGTTGATGGGCAGCCTATGTATGGCATGGATGCTCAAGTAGAGGAGGTTAGAGTTTTTGAGGGAACAGAGGAGCTTCCAGGGGACCCAGACATGATGAGATACGTTGACAAATATGGACAGTTGCAGACAAAAATGCTGTAATCAAAAGCCTTTATTGTAATATGCAGTACATTTTAATAAAGTATAACCAGCTTTACTTAACAGTTGCAGTTATTTTGGGGGAGGGGTCTTTGGTTTTTTGAAACATTGAAAGCCTTTACAGATGTGAAAAGTGCAGTTTTCCTGTGTGTCTGCACCAGAGGCTTCTGAGACCTGGGAAAAGCATTGTGATTGTGATTCAGTGCTTGATCCATGTCCAGAGTCTTCTGCTTCAGAATCTTCCTCTCTAGGAAAGTCAAGAATGGGTCTCCCCATACCAACATTAGCTTTCATAGTAGAAAATGTATACATGCTTATTTCTAAATCCAGCCTTTCTTTCCACTGCACAATCCTCTCATGAATGGCAGCTGCAAAGTCAGCAACTGGCCTAAACCAGATTAAAAGCAAAAGCAAAGTCATACCACTTTGCAAAATCCTTTTTTCTAGCAAATACTCAGAGCAGCTTAGTGATTTTCTCAGGTAGGCCTTTGGTCTAAAATCTATCTGCCTTACAAATCTGGCCTGTAAAGTTCTAGGCACTGAATATTCATTCATGGTTACAATTCCAGGTGGAAACACCTGTGTTCTTTTGTTTTGGTGTTTTCTCTCTAAATTAACTTTTACACTTCCATCTAAGTAATCTCTTAAGCAATCAAGGTTGCTTATGCCATGCCCTGAAGGTAAATCCCTTGACTCTGCACCAGTGCCTTTTACATCCTCAAATACAACCATAAACTGATCTATACCCACTCCTAATTCAAAGTTTAATCTTTCTAATGGCATATTAACATTTAATGACTTTCCCCCACAGAGATCAAGTAAAGCTGCAGCTAAAGTAGTTTTGCCACTGTCTATTGGCCCCTTGAATAGCCAGTACCTTTTTTTTGGAATGTTTAATACAATGCATTTTAGAAAGTCATAAATAACAGTGTCCATTTGAGGCAGCAAGCAATGAATCCAGGCCACCCCAGCCATATATTGCTCTAAAACAGCATTGCCATGTGCCCCAAAAATTAAGTCCATTTTATCAAGCAAGAAATTAAACCTTTCAACTAACATTTCTTCTCTGGTCATGTGGATGCTGTCAACCCTTTGTTTGGCTGCTACAGTATCAACAGCCTGCTGGCAAATGCTTTTTTGATTTTTGCTATCTGCAAAAATTTGGGCATTATAATAGTGTTTTTCATGATGGTTAAAGTGATTTGGCTGATCCTTTTTTTCACATTTTTTGCATTGCTGTGGGTTTTCCTGAAAGTCTAAGTACATGCCCATAAGCAAAAAAACATCCTCACACTTGGTTTCCAAGGCATACTGTGTAACTAATTTCCATGAAACCTGCTTAGTTTCTTCTGGTTCTTCTGGGTTAAAGTCATGCTCCTTAAGGCCCCCCTGAATACTTTCTTCCACTACTGCATATGGCTGTCTACACAGGGCACTATAAAACAAGTATTCCTTATTCACACCTTTACAAATTAAAAAACTAAAGGTACATAGTTTTTGACAGTAGTTATTAATTGCTGACACTCTATGTCTATGTGGTGTTAAGAAAAACAAAATATTATGACCCCCAAAACCATGTCTACTTATAAAAGTTACAGAATATTTTTCCATAAGTTTCTTATATAAAATTTGAGCTTTTTCTTTAGTGGTATACACAGCAAAAGAAGCAACAGTTCTATTACTAAACACAGCTTGACTGAGGAATGCATGCAGATCTACAGGAAAGTCTTTAGGGTCTTCTACCTTTTTTTTCTTTTTAGGTGGGGTAGAGTGTTGGGATCCTGTGTTTTCATCATCACTGGCAAACATTTCTTCATGGCAAAACAGGTCTTCATCCCACTTCTCATTAAATGTATTCCACCAGGATTCCCATTCATCTGTTCCATAGGTTGGCACCTAAAAAAAAACAATTAAGTTTATTGTAAAAAACAAAATGCCCTGCAAAAGAAAAATAGTGGTTTACCTTAAAGCTTTAGATCCCTGTAGGGGGTGTCTCCAAGAACTTTCTCCCAGCAATGAAGAGCTTCTTGGGTTAAGTCACACCCAAACCATTGTCTGAAGCAATCAAAGCAATAGCAATCTATCCACACAAGTGGGCTGCTTCTTAAAAATTTTCTGTTTCTATGCCTTAATTTTAGCATGCACATTAAACAGGGGCAATGCACTGAAGGATTAGTGGCACAGTTAGGCCATTCCTTGCAATAAAGGGTATCAGAATTAGGAGGAAAATCACAACCAACCTCTGAACTATTCCATGTACCAAAATCAGGCTGATGAGCAACTTTTACACCTTGTTCCATTTTTTTATATAAAAAATTCATTCTCTTCATCTTGTCTTCGTCCCCACCTTTATCAGGGTGGAGTTCTTTGCATTTTTTCAGATAAGCTTTTCTCATGACAGGAATGTTCCCCCATGCAGACCTATCAAGGCCTAATAAATCCATAAGCTCCATGGATTCCTCCCTATTCAGCACTTTGTCCATTTTAGCTTTTTGCAGCAAAAAATTACTGCAAAAAAGGGAAAAACAAGGGAATTTCCCTGGCCTCCTAAAAAGCCTCCACGCCCTTACTACTTCTGAGTAAGCTTGGAGGCGGAGGCG
| 9,004
|
OR661738.1
|
JC polyomavirus
|
Guo,Y.
|
Zhejiang University, Infectious Diseases
|
China
|
2023-10-31
|
2023050806
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,154
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null |
2022-10-12
| null | null |
UNVERIFIED: JC polyomavirus isolate 2023050806, complete genome
|
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| 11,435
|
OQ230875.1
|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
|
Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2023-08-08
|
B9jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,122
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Homo sapiens
|
urine
|
2015-05-18
| null | null |
JC polyomavirus isolate B9jc, complete genome
|
GCCTCGGCCTCCTGTATATATAAAAAAAAGGGAAGGTAGGGAGGAGCTGGCTAAAACTGGATGGCTGCCAGCCAAGCATGAGCTCATACCTAGGGAGCCAACCAGCTGACAGCCAGAGGGAGCCCTGGCTGCATGCCACTGGCAGTTATAGTGAAACCCCTCCCATAGTCCTTAATCACAAGTAAACAAAGCACAAGGGGAAGTGGAAAGCAGCCAAGGGAACATGTTTTGCGAGCCAGAGCTGTTTTGGCTTGTCACCAGCTGGCCATGGTTCTTCGCCAGCTGTCACGTAAGGCTTCTGTGAAAGTTAGTAAAACCTGGAGTGGAACTAAAAAAAGAGCTCAAAGGATTTTAATTTTTTTGTTAGAATTTTTGCTGGACTTTTGCACAGGTGAAGACAGTGTAAACGGGAAAAAAAGACAGAGACACAGTGGTTTGACTGAGCAGACATACAGTGCTTTGCCTGAACCAAAAGCTACATAGGTAAGTAATGTTTTTTTTTGTGTTTTCAGGTTCATGGGTGCCGCACTTGCACTTTTGGGGGACCTAGTTGCTACTGTTTCTGAGGCTGCTGCTGCCACAGGATTTTCAGTAGCTGAAATTGCTGCTGGAGAGGCTGCTGCTACTATAGAAGTTGAAATTGCATCCCTTGCTACTGTAGAGGGGATTACAAGTACCTCTGAGGCTATAGCTGCTATAGGCCTTACTCCTGAAACATATGCTGTAATAACTGGAGCTCCGGGGGCTGTAGCTGGGTTTGCTGCATTGGTTCAAACTGTAACTGGTGGTAGTGCTATTGCTCAGTTGGGATATAGATTTTTTGCTGACTGGGATCATAAAGTTTCAACAGTTGGGCTTTTTCAGCAGCCAGCTATGGCTTTACAATTATTTAATCCAGAAGACTACTATGATATTTTATTTCCTGGAGTGAATGCCTTTGTTAATAATATTCACTATTTAGATCCTAGACATTGGGGCCCGTCCTTGTTCTCCACAATCTCCCAGGCTTTTTGGAATCTTGTTAGAGATGATTTGCCAGCCTTAACCTCTCAGGAAATTCAGAGAAGAACCCAAAAACTATTTGTTGAAAATTTAGCAAGGTTTTTGGAAGAAACTACTTGGGCAATAGTTAATTCACCAGCTAACTTATATAATTATATTTCAGACTATTATTCTAGATTGTCTCCAGTTAGGCCCTCTATGGTAAGGCAAGTTGCCCAAAGGGAGGGAACCTATATTTCTTTTGGCCACTCATACACCCAAAGTATAGATGATGCAGACAGCATTCAAGAAGTTACCCAAAGGCTAGATTTAAAAACCCCAAATGTGCAATCTGGTGAATTTATAGAAAAAAGTATTGCACCAGGAGGTGCAAATCAAAGATCTGCTCCTCAATGGATGTTGCCTTTACTTTTAGGGTTGTACGGGACTGTAACACCTGCTCTTGAAGCATATGAAGATGGCCCCAACAAAAAGAAAAGGAGAAAGGAAGGACCCCGTGCAAGTTCCAAAACTTCTTATAAGAGGAGGAGTAGAAGTTCTAGAAGTTAAAACTGGGGTTGACTCAATTACAGAGGTAGAATGCTTTTTAACTCCAGAAATGGGTGACCCAGATGAGCATCTTAGGGGTTTTAGTAAGTCTATATCTATATCAGATACATTTGAAAGTGACTCCCCAAATAAGGAAATGCTTCCTTGTTACAGTGTGGCCAGAATTCCACTACCCAATCTAAATGAGGATCTAACCTGTGGAAATATACTCATGTGGGAGGCTGTGACCTTAAAAACTGAGGTTATTGGGGTGACAACTTTGATGAATGTGCACTCTAATGGGCAAGCAAGTCATGACAATGGTGCAGCAAAGCCAGTGCAGGGCACCAGCTTTCATTTTTTTTCTGTTGGGGGGGAGGCTTTAGAATTACAGGGGGTGGTTTTTAATTACAGAACAACGTACCCAGATGGAACAATTTTTCCAAAGAATGCCACAGTGCAATCTCAAGTCATGAACACAGAGCACAAGGCGTACCTAGATAAGAACAAAGCATATCCTGTTGAATGTTGGGTTCCTGATCCCACCAGAAATGAAAACACAAGATATTTTGGGACACTAACAGGAGGAGAAAATGTTCCTCCAGTTCTTCATATAACAAACACTGCCACAACAGTGTTGCTTGATGAATTTGGTGTTGGGCCACTTTGCAAAGGTGACAACTTATATTTGTCAGCTGTTGATGTCTGTGGCATGTATACTAACAGGTCTGGTTCCCAGCAGTGGAGAGGACTCTCCAGATATTTTAAGGTTCAGCTAAGGAAAAGGAGGGTTAAAAACCCCTACCCAATTTCTTTTCTTCTTACTGATTTAATTAACAGAAGGACTCCTAGAGTTGATGGGCAGCCTATGTATGGCATGGATGCTCAAGTAGAGGAGGTTAGAGTTTTTGAGGGAACAGAGGAGCTTCCAGGGGACCCAGACATGATGAGATACGTTGACAGATATGGACAGTTGCAGACAAAAATGCTGTAATCAAAAGCCTTTATTGTAATATGCAGTACATTTTAATAAAGTATAACCAGCTTTACTTAACATTTGCAGTTATTTTGGGGGAGGGGTCTTTGGTTTTTTGAAACATTGAAAGCCTTTACAGATGTGATAAGTGCAGTTTTCCTGTGTGTCTGCACCAGAGGCTTCTGAGACCTGGGAAAAGCATTGTGATTGTGATTCAGTGCTTGATCCATGTCCAGAGTCTTCTGCTTCAGAATCTTCCTCTCTAGGAAAGTCAAGAATGGGTCTCCCCATACCAACATTAGCTTTCATAGTAGAAAATGTATACATGCTTATTTCTAAATCCAGCCTTTCTTTCCACTGCACAATCCTCTCATGAATGGCAGCTGCAAAGTCAGCAACTGGCCTAAACCAGATTAAAAGCAAAAGCAAAGTCATACCACTTTGCAAAATCCTTTTTTCTAGCAAATACTCAGAGCAGCTTAGTGATTTTCTCAGGTAGGCCTTTGGTCTAAAATCTATTTGCCTTACAAATCTGGCCTGTAAAGTTCTAGGCACTGAATATTCATTCATGGTTACAATTCCAGGTGGAAACACCTGTGTTCTTTTGTTTTGGTGTTTCCTCTCTAAATTAACTTTTACACTTCCATCTAAGTAATCTCTTAAGCAATCAAGGTTGCTTATGCCATGCCCTGAAGGTAAATCCCTTGACTCTGCACCAGTTCCTTTTACATCCTCAAATACAACCATAAACTGATCTATACCCACTCCTAACTCAAAGTTTAATCTTTCTAATGGCATATTAACATTTAATGACTTTCCCCCACAGAGATCAAGTAAAGCAGCAGCTAAAGTAGTCTTGCCACTGTCTATTGGCCCCTTGAATAGCCAGTACCTTTTTTTTGGAATGTTTAATACAATGCATTTTAGAAAGTCATAAATAACAGTGTCCATTTGAGGCAGCAAGCAATGAATCCAGGCCACCCCAGCCATATATTGCTCTAAAACAGCATTGCCATGTGCCCCAAAAATCAAGTCCATTTTATCAAGCAAGAAATTAAACCTTTCAACTAACATTTCTTCTCTGGTCATGTGGATGCTGTCAACCCTTTGTTTGGCTGCTACAGTATCAACAGCCTGCTGGCAAATGCTTTTTTGATTTTTGCTATCTGCAAAAATTTGGGCATTATAATAGTGTTTTTCATGATGGTTAAAGTGATTTGGCTGATCCTTTTTCTCACATTTTTTGCATTGCTGTGGGTTTTCCTGAAAGTCTAAGTACATGCCCATAAGCAAAAAAACATCCTCACACTTGGTTTCCAAGGCATACTGTGTAACTAATTTCCATGACACCTGCTTAGTTTCTTCTGGTTCTTCTGGGTTAAAGTCATGCTCCTTAAGGCCCCCCTGAATACTTTCTTCTACTACTGCATATGGCTGTCTACACAGGGCACTATAAAACAAGTATTCCTTATTCACACCTTTACAAATTAAAAAACTAAAGGTACACAGTTTTTGACAGTAATTATTAATTGCTGACACTCTATGTCTATGTGGTGTTAAGAAAAACAAAATATTATGACCCCCAAAACCATGTCTACTTATAAAAGTTACAGAATATTTTTCCATAAGTTTCTTATATAAAATTTGAGCTTTTTCTTTAGTGGTATACACAGCAAAAGAAGCAACAGTTCTATTACTAAACACAGCTTGACTGAGGAATGCATGCAGATCTACAGGAAAGTCTTTAGGGTCTTCTACCTTTTTTTTCTTCTTAGGTGGGGTAGAGTGTTGGGATCCTGTGTTTTCATCATCACTGGCAAACATTTCTTCATGGCAAAACAGGTCTTCATCCCACTTCTCATTAAATGTATTCCACCAGGATTCCCATTCATCTGTTCCATAGGTTGGCACCTAAAAAAAAAACAATTAAGTTTATTGTAAAAAACAAAATGCCCTGCAAAAGCAAAATAGTGGTTTACCTTAAAGCTTTAGATCCCTGTAGGGGGTGTCTCCAAGAACCTTCTCCCAGCAATGAAGAGCTTCTTGGGTTAAGTCACACCCAAACCATTGTCTGAAGCAATCAAAGCAATAGCAATCTATCCACACAAGTGGGCTGCTTCTTAAAAATTTTCTGTTTCTATGCCTTAATTTTAGCATGCACATTAAACAGGGGCAATGCACTGAAGGATTAGTGGCACAGTTAGGCCATTCCTTGCAATAAAGGGTATCAGAATTAGGAGGAAAATCACAACCAACCTCTGAACTATTCCATGTACCAAAATCAGGCTGATGAGCAACTTTTACACCTTGTTCCATTTTTTTATATAAAAAATTCATTCTCTTCATTTTGTCTTCGTCCCCACCTTTATCAGGGTGGAGTTCTTTGCATTTTTTCAGATAAGCTTTTCTCATGATAGGAATGTTTCCCCATGCAGACCTATCAAGGCCTAATAAATCCATAAGCTCCATGGATTCCTCCCTATTCAGCACTTTG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|
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|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
|
Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2023-08-08
|
B9T2jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,122
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Homo sapiens
|
urine
|
2017-05-24
| null | null |
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|
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TCCATTTTAGCTTTTTGCAGCAAAAAATTACTGCAAAAAAGGGAAAAACAAGGGAATTTCCCTGGCCTCCTAAAAAGCCTCCACGCCCTTACTACTTCTGAGTAAGCTTGGAGGCGGAGGCG
| 14,104
|
OQ230877.1
|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
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Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
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2023-08-08
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B077T2jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
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Polyomaviridae
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dsDNA
| 5,122
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GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
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Homo sapiens
|
urine
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2014-03-20
| null | null |
JC polyomavirus isolate B077T2jc, complete genome
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| 14,105
|
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|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
|
Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2023-08-08
|
C094T2jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,122
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Homo sapiens
|
urine
|
2015-01-19
| null | null |
JC polyomavirus isolate C094T2jc, complete genome
|
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|
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|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
|
Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2023-08-08
|
B124jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,122
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
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|
urine
|
2015-08-20
| null | null |
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|
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TCCATTTTAGCTTTTTGCAGCAAAAAATTACTGCAAAAAAGGGAAAAACAAGGGAATTTCCCTGGCCTCCTAAAAAGCCTCCACGCCCTTACTACTTCTGAGTAAGCTTGGAGGCGGAGGCG
| 14,107
|
OQ230880.1
|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
|
Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2023-08-08
|
B124T2jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
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Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,122
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
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Homo sapiens
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urine
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2017-08-21
| null | null |
JC polyomavirus isolate B124T2jc, complete genome
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| 14,108
|
OQ230881.1
|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
|
Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2023-08-08
|
B129jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,107
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Homo sapiens
|
urine
|
2015-11-12
| null | null |
JC polyomavirus isolate B129jc, complete genome
|
GCCTCGGCCTCCTGTATATATAAAAAAAAGGGAAGGTAGGGAGGAGCTGGCTAAAACTGGATGGCTGCCAGCCAAGCATGAGCTCATACCTAGGGAGCCAACCAGCTGACAGCCAGAGGGAGCCCTGGCTGCATGCCACTGGCAGTTATCATAGTCCTTAATCACAAGTAAACAAAGCACAAGGGGAAGTGGAAAGCAGCCAAGGGAACATGTTTTGCGAGCCAGAGCTGTTTTGGCTTGTCACCAGCTGGCCATGGTTCTTCGCCAGCTGTCACGTAAGGCTTCTGTGAAAGTTAGTAAAACCTGGAGTGGAACTAAAAAAAGAGCTCAAAGGATTTTAATTTTTTTGTTAGAATTTTTGCTGGACTTTTGCACAGGTGAAGACAGTGTAGACGGGAAAAAAAGACAGAGACACAGTGGTTTGACTGAGCAGAAATACAGTGCTTTGCCTGAACCAAAAGCTACATAGGTAAGTAATGTTTTTTTTTGTGTTTTCAGGTTCATGGGTGCCGCACTTGCACTTTTGGGGGACCTAGTTGCTACTGTTTCTGAGGCTGCTGCTGCCACAGGATTTTCAGTAGCTGAAATTGCTGCTGGAGAGGCTGCTGCTACTATAGAAGTTGAAATTGCATCCCTTGCTACTGTAGAGGGGATTACAAGTACCTCTGAGGCTATAGCTGCAATAGGCCTTACTCCTGAAACATATGCTGTGATTACTGGAGCTCCGGGGGCTGTAGCTGGGTTTGCTGCATTGGTTCAAACTGTAACTGGTGGTAGTGCTATTGCTCAGTTGGGATATAGATTTTTTGCTGACTGGGATCATAAAGTTTCAACAGTTGGGCTTTTTCAGCAGCCAGCTATGGCTTTACAGTTATTTAATCCAGAAGACTACAATGATATTTTATTTCCTGGAGTGAATGCCTTTGTTAACAATATTCACTATTTAGATCCTAGACATTGGGGCCCTTCTTTGTTCTCCACAATCTCCCAGGCTTTTTGGAATCTTGTTAGAGATGATTTGCCATCTTTAACATCTCAGGAAATTCAAAGAAGAACCCAAAAACTATTTGTTGAAAGTTTAGCAAGGTTTTTGGAAGAAACTACTTGGGCAATAGTTAATTCACCAGTTAACTTATATAATTATATTTCAGACTATTATTCTAGATTGTCTCCAGTTAGGCCCTCTATGGTAAGGCAGGTTGCCCAAAGGGAGGGAACCTATATTTCCTTTGGCCACTCATACACCCAAAGTATAGATGATGCAGACAGCATTCAGGAAGTTACCCAAAGGCTAGATTTAAAAACTCCAAATGTGCAATCTGGTGAATTTATAGAAAAAAGTATTGCACCAGGAGGTGCAAATCAAAGATCTGCTCCTCAATGGATGTTGCCTTTACTTTTAGGGTTGTACGGGACTGTAACACCTGCTCTTGAAGCATATGAAGATGGCCCCAACAAAAAGAAAAGGAGAAAGGAAGGACCCCGTGCAAGTTCCAAAACTTCTTATAAGAGGAGGAGTAGAAGTTCTAGAAGTTAAAACTGGGGTTGACTCAATTACAGAGGTAGAATGCTTTTTAACTCCAGAAATGGGTGACCCAGATGAGCATCTTAGGGGTTTTAGTAAGTCAATTTCTATATCAGCTACATTTGAAAGTGACTCCCCAAATAAGGACATGCTTCCTTGTTACAGTGTGGCCAGAATTCCACTACCCAATCTAAATGAGGATCTAACCTGTGGAAATATACTAATGTGGGAGGCTGTTACCTTAAAAACTGAGGTTATAGGGGTGACAACTTTGATGAATGTGCACTCCAATGGTCAAGCAGCTCATGACAATGGTGCAGGAAAGCCAGTGCAGGGCACCAGCTTTCATTTTTTTTCTGTTGGGGGGGAGGCTTTAGAATTACAAGGAGTGGTTTTTAATTACAGAACAAAGTACCCAGATGGAACAATTTTTCCAAAGAATGCAACAGTGCAATCTCAAGTCATGAACACAGAGCACAAGGCGTACCTAGATAAGAACAAAGCATATCCTGTTGAATGTTGGGTTCCTGATCCCACCAGAAATGAAAACACAAGATATTTTGGGACACTAACAGGAGGAGAAAATGTTCCTCCAGTTCTTCATATAACAAACACTGCCACAACAGTGCTGCTTGATGAATTTGGTGTTGGGCCACTTTGCAAAGGTGACAACTTGTATTTGTCAGCTGTTGATGTTTGTGGCATGTTTACTAACAGATCTGGTTCCCAGCAGTGGAGAGGACTGTCCAGATATTTTAAGGTTCAGCTAAGAAAAAGGAGGGTTAAAAACCCCTACCCAATTTCTTTTCTTCTTACTGATTTAATTAACAGAAGGACCCCTAGAGTTGATGGGCAGCCTATGTATGGCATGGATGCTCAGGTAGAGGAGGTTAGAGTTTTTGAGGGGACAGAGGAACTTCCAGGGGACCCAGACATGATGAGATATGTTGACAGATATGGACAGTTGCAGACAAAGATGCTGTAATCAAAAGCCTTTATTGTAATATGCAGTACATTTTAATAAAGTATAACCAGCTTTACTTGACAGTTGCAGTTATTTTGGGGGAGGGGTCTTTGGTTTTTTGAAACATTGAAAGCCTTTACAGATGTGATAAGTGCAGTGTTCCTGTGTGTCTGCACCAGAGGCTTCTGAGACCTGGGAAGAGCATTGTGATTGAGATTCAGTGCTTGATCCATGTCCAGAGTCTTCTGCTTCAGAATCTTCCTCTCTAGGAAAGTCAAGAATGGGTCTCCCCATACCAACATTAGCTTTCATAGTAGAAAATGTATACATGCTTATTTCTAAATCCAGCCTTTCTTTCCACTGCACAATCCTCTCATGAATGGCAGCTGCAAAGTCAGCAACTGGCCTAAACCAGATTAAAAGCAAAAGCAAAGTCATGCCACTTTGCAAAATCCTTTTTTCTAGTAAATATTCAGAGCAGCTTAGTGATTTTCTCAGGTAGGCCTTAGGTCTAAAATCTATTTGCCTTACAAATCTGGCTTGTAAAGTTCTAGGCACTGAATATTCATTCATGGTTACAATTCCAGGTGGAAACACCTGTGTTCTTTTGTTTTGGTGTTTTCTCTCTAAATTAACTTTCACACTTCCATCTAAGTAATCTCTGAGGCAATCAAGGTTGCTTATGCCATGCCCTGAAGGTAAATCCCTTGACTCTGCACCAGTGCCTTTTACATCCTCAAATACAACCATAAACTGATCTATACCCACTCCTAACTCAAAGTTTAATCTTTCTAATGGCATATTAACATTTAATGACTTTCCCCCACAGAGATCAAGTAAAGCTGCAGCTAAAGTAGTTTTGCCACTGTCTATTGGCCCCTTGAATAGCCAGTACCTTTTTTTTGGAATGTTTAATACAATGCATTTTAAGAACTCATAAATGACAGTGTCCATTTGAGGCAGCAAACAATGAATCCAGGCCACCCCAGCCATATATTGCTCTAAAACAGCATTGCCATGTGCCCCAAAAATTAAGTCCATTTTATCAAGCAAAAAATTAAACCTTTCAACTAACATTTCTTCTCTGGTCATATGGATACTGTCAACCCTTTGTTTGGCTGCTACAGTATCAACAGCCTGCTGGCAAATGCTTTTTTGATTTTTGCTATCTGCAAAAATTTGGGCATTATAATAGTGCTTTTCATGATGGTTAAAGTGATTTGGCTGATCTTTTTTTTCACATTTTTTGCATTGCTGTGGGTTTTCCTGAAAGTCTAAGTACATGCCCATAAGCAAGAAAACATCCTCACACTTGGTGTCCAAAGCATACTGTGTAACTAATTTCCATGAAACCTGCTTAGTTTCTTCTGGTTCTTCTGGGTTAAAGTCATGCTCCTTAAGGCCCCCCTGAATACTTTCTTCCACTACTGCATATGGCTGTCTACACAAGGCACTGTAAAACAAGTATTCCTTATTCACACCTTTACAAATTAAAAAACTAAAGGTACATAGTTTTTGACAGTAATTATTAATTGCTGAAACTCTATGTCTATGTGGTGTTAAGAAAAACAAAATATTATGACCCCCAAAACCATGTCTACTTATAAAGGTTACAGAATATTTTTCCATAAGTTTCTTATATAAAATTTGAGCTTTTTCTTTAGTGGTATACACAGCAAAAGAAGCAACAGTTCTATTACTAAACACAGCTTGACTGAGGAATGCATGCAGATCTACAGGAAAGTCTTTAGGGTCTTCTACCTTTTTTTTCTTCTTAGGTGGGGTAGAGTGTTGGGATCCTGTGTTTTCATCATCACTGGCAAACATTTCTTCATGGCAAAACAGGTCTTCATCCCACTTCTCATTAAATGTATTCCACCAGGATTCCCATTCATCTGTTCCATAGGTTGGCACCTAAAAACAAAAAATTGAGTTTATTGTAAAAAACAAAATGCCCTGCAAAAGAAAAATTGTGGTTTACCTTAAAGCTTTAGATCCCTGTAGGGGGTGTCTCCAAGAACCTTCTCCCAGCAATGAAGAGCTTCTTGGGTTAAGTCACACCCAAACCATTGTCTGAAGCAATCAAAGCAATAGCAATCTATCCACACAAGTGGGCTGCTTCTTAAAAATTTTCTGTTTCTATGCCTTAATTTTAGCATGCACATTAAACAGGGGCAATGCACTGAAGGATTAGTGGCACAATTAGGCCATTCCTTGCAATAAAGGGTATCAGAATTAGGAGGAAAATCACAACCAACCTCTGAACTATTCCATGTACCAAAATCAGGCTGATGAGCAACTTTTACACCTTGTTCCATTTTTTTATATAAAAAATTCATTCTCTTCATTTTGTCTTCGTCCCCACCTTTATCAGGGTGAAGTTCTTTGCATTTTTTCAGATAAGCTTTTCTCATGACAGGAATGTTTCCCCATGCAGATCTATCAAGGCCTAATAAATCCATAAGCTCCATGGATTCCTCCCTATTCAGCACTTTGTCCATTTTTGCTTTT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|
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|
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|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
|
Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2023-08-08
|
B129T2jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,107
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Homo sapiens
|
urine
|
2017-08-13
| null | null |
JC polyomavirus isolate B129T2jc, complete genome
|
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TGTAGCAAAAAATTAGTGCAAAAAAGGGAAAAACAAGGGAATTTCCCTGGCCTCCTAAAAAGCCTCCACGCCCTTACTACTTCTGAGTAAGCTTGGAGGCGGAGGCG
| 14,110
|
OQ230883.1
|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
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Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
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2023-08-08
|
B148T2jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,122
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Homo sapiens
|
urine
|
2012-09-12
| null | null |
JC polyomavirus isolate B148T2jc, complete genome
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TCCATTTTAGCTTTTTGCAGCAAAAAATTACTGCAAAAAAGGGAAAAACAAGGGAATTTCCCTGGCCTCCTAAAAAGCCTCCACGCCCTTACTACTTCTGAGTAAGCTTGGAGGCGGAGGCG
| 14,111
|
OQ230884.1
|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
|
Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2023-08-08
|
B167jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,122
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Homo sapiens
|
urine
|
2013-11-07
| null | null |
JC polyomavirus isolate B167jc, complete genome
|
GCCTCGGCCTCCTGTATATATAAAAAAAAGGGAAGGTAGGGAGGAGCTGGCTAAAACTGGATGGCTGCCAGCCAAGCATGAGCTCATACCTAGGGAGCCAACCAGCTGACAGCCAGAGGGAGCCCTGGCTGCATGCCACTGGCAGTTATAGTGAAACCCCTCCCATAGTCCTTAATCACAAGTAAACAAAGCACAAGGGGAAGTGGAAAGCAGCCAAGGGAACATGTTTTGCGAGCCAGAGCTGTTTTGGCTTGTCACCAGCTGGCCATGGTTCTTCGCCAGCTGTCACGTAAGGCTTCTGTGAAAGTTAGTAAAACCTGGAGTGGAACTAAAAAAAGAGCTCAAAGGATTTTAATTTTTTTGTTAGAATTTTTGCTGGACTTTTGCACAGGTGAAGACAGTGTAGACGGGAAAAAAAGACAGAGACACAGTGGTTTGACTGAGCAGACATACAGTGCTTTGCCTGAACCAAAAGCTACATAGGTAAGTAATGTTTTTTTTTGTGTTTTCAGGTTCATGGGTGCCGCACTTGCACTTTTGGGGGACCTAGTTGCTACTGTTTCTGAGGCTGCTGCTGCCACAGGATTTTCAGTAGCTGAAATTGCTGCTGGAGAGGCTGCTGCTACTATAGAAGTTGAAATTGCATCCCTTGCTACTGTAGAGGGGATTACAAGTACCTCTGAGGCTATAGCTGCTATAGGCCTTACTCCTGAAACATATGCTGTAATAACTGGAGCTCCGGGGGCTGTAGCTGGGTTTGCTGCATTGGTTCAAACTGTAACTGGTGGTAGTGCTATTGCTCAGTTGGGATATAGATTTTTTGCTGACTGGGATCATAAAGTTTCAACAGTTGGGCTTTTTCAGCAGCCAGCTATGGCTTTACAATTATTTAATCCAGAAGACTACTATGATATTTTATTTCCTGGAGTGAATGCCTTTGTTAATAATATTCACTATTTAGATCCTAGACATTGGGGCCCGTCCTTGTTCTCCACAATCTCCCAGGCTTTTTGGAATCTTGTTAGAGATGATTTGCCAGCCTTAACCTCTCAGGAAATTCAGAGAAGAACCCAAAAACTATTTGTTGAAAATTTAGCAAGGTTTTTGGAAGAAACTACTTGGGCAATAGTTAATTCACCAGCTAACTTATATAATTATATTTCAGACTATTATTCTAGATTGTCTCCAGTTAGGCCCTCTATGGTAAGGCAAGTTGCCCAAAGGGAGGGAACCTATATTTCTTTTGGCCACTCATACACCCAAAGTATAGATGATGCAGACAGCATTCAAGAAGTTACCCAAAGGCTAGATTTAAAAACCCCAAATGTGCAATCTGGTGAATTTATAGAAAAAAGTATTGCACCAGGAGGTGCAAATCAAAGATCTGCTCCTCAATGGATGTTGCCTTTACTTTTAGGGTTGTACGGGACTGTAACACCTGCTCTTGAAGCATATGAAGATGGCCCCAACAAAAAGAAAAGGAGAAAGGAAGGACCCCGTGCAAGTTCCAAAACTTCTTATAAGAGGAGGAGTAGAAGTTCTAGAAGTTAAAACTGGGGTTGACTCAATTACAGAGGTAGAATGCTTTTTAACTCCAGAAATGGGTGACCCAGATGAGCATCTTAGGGGTTTTAGTAAGTCTATATCTATATCAGATACATTTGAAAGTGACTCCCCAAATAAGGACATGCTTCCTTGTTACAGTGTGGCCAGAATTCCACTACCCAATCTAAATGAGGATCTAACCTGTGGAAATATACTCATGTGGGAGGCTGTGACCTTAAAAACTGAGGTTATAGGGGTGACAACTTTGATGAATGTGCACTCTAATGGGCAAGCAACTCATGACAATGGTGCAGCAAAGCCAGTGCAGGGCACCAGCTTTCATTTTTTTTCTGTTGGGGGGGAGGCTTTAGAATTACAGGGGGTGGTTTTTAATTACAGAACAACGTACCCAGATGGAACAATTTTTCCAAAGAATGCCACAGTGCAATCTCAAGTCATGAACACAGAGCACAAGGCGTACCTAGATAAGAACAAAGCATATCCTGTTGAATGTTGGGTTCCTGATCCCACCAGAAATGAAAACACAAGATATTTTGGGACACTAACAGGAGGAGAAAATGTTCCTCCAGTTCTTCATATAACAAACACTGCCACAACAGTGTTGCTTGATGAATTTGGTGTTGGGCCACTTTGCAAAGGTGACAACTTATATTTGTCAGCTGTTGATGTCTGTGGCATGTTTACTAACAGGTCTGGTTCCCAGCAGTGGAGAGGACTCTCCAGATATTTTAAGGTTCAGCTAAGGAAAAGGAGGGTTAAAAACCCCTACCCAATTTCTTTTCTTCTTACTGATTTAATTAACAGAAGGACTCCTAGAGTTGATGGGCAGCCTATGTATGGCATGGATGCTCAAGTAGAGGAGGTTAGAGTTTTTGAGGGAACAGAGGAGCTTCCAGGGGACCCAGACATGATGAGATACGTTGACAGATATGGACAGTTGCAGACAAAAATGCTGTAATCAAAAGCCTTTATTGTAATATGCAGTACATTTTAATAAAGTATAACCAGCTTTACTTAACATTTGCAGTTATTTTGGGGGAGGGGTCTTTGGTTTTTTGAAACATTGAAAGCCTTTACAGATGTGATAAGTGCAGTTTTCCTGTGTGTCTGCACCAGAGGCTTCTGAGACCTGGGAAAAGCATTGTGATTGTGATTCAGTGCTTGATCCATGTCCAGAGTCTTCTGCTTCAGAATCTTCCTCTCTAGGAAAGTCAAGAATGGGTCTCCCCATACCAACATTAGCTTTCATAGTAGAAAATGTATACATGCTTATTTCTAAATCCAGTCTTTCTTTCCACTGCACAATCCTCTCATGAATGGCAGCTGCAAAGTCAGCAACTGGCCTAAACCAGATTAAAAGCAAAAGCAAAGTCATACCACTTTGCAAAATCCTTTTTTCTAGCAAATACTCAGAGCAGCTTAGTGATTTTCTCAGGTAGGCCTTTGGTCTAAAATCTATTTGCCTTACAAATCTGGCCTGTAAAGTTCTAGGCACTGAATATTCATTCATGGTTACAATTCCAGGTGGAAACACCTGTGTTCTTTTGTTTTGGTGTTTCCTCTCTAAATTAACTTTTACACTTCCATCTAAGTAATCTCTTAAGCAATCAAGGTTGCTTATGCCATGCCCTGAAGGTAAATCCCTTGACTCTGCACCAGTTCCTTTTACATCCTCAAATACAACCATAAACTGATCTATACCCACTCCTAACTCAAAGTTTAATCTTTCTAATGGCATATTAACATTTAATGACTTTCCCCCACAGAGATCAAGTAAAGCAGCAGCTAAAGTAGTCTTGCCACTGTCTATTGGCCCCTTGAATAGCCAGTACCTTTTTTTTGGAATGTTTAATACAATGCATTTTAGAAAGTCATAAATAACAGTGTCCATTTGAGGCAGCAAGCAATGAATCCAGGCCACCCCAGCCATATATTGCTCTAAAACAGCATTGCCATGTGCCCCAAAAATCAAGTCCATTTTATCAAGCAAGAAATTAAACCTTTCAACTAACATTTCTTCTCTGGTCATGTGGATGCTGTCAACCCTTTGTTTGGCTGCTACAGTATCAACAGCCTGCTGGCAAATGCTTTTTTGATTTTTGCTATCTGCAAAAATTTGGGCATTATAATAGTGTTTTTCATGATGGTTAAAGTGATTTGGCTGATCCTTTTTCTCACATTTTTTGCATTGCTGTGGGTTTTCCTGAAAGTCTAAGTACATGCCCATAAGCAAAAAAACATCCTCACACTTGGTTTCCAAGGCATACTGTGTAACTAATTTCCATGACACCTGCTTAGTTTCTTCTGGTTCTTCTGGGTTAAAGTCATGCTCCTTAAGGCCCCCCTGAATACTTTCTTCTACTACTGCATATGGATGTCTACACAGGGCACTATAAAACAAGTATTCCTTATTCACACCTTTACAAATTAAAAAACTAAAGGTACACAGTTTTTGACAGTAATTATTAATTGCTGACACTCTATGTCTATGTGGTGTTAAGAAAAACAAAATATTATGACCCCCAAAACCATGTCTACTTATAAAAGTTACAGAATATTTTTCCATAAGTTTCTTATATAATATTTGAGCTTTTTCTTTAGTGGTATACACAGCAAAAGAAGCAACAGTTCTATTACTAAACACAGCTTGACTGAGGAATGCATGCAGATCTACAGGAAAGTCTTTAGGGTCTTCTACCTTTTTTTTCTTCTTAGGTGGGGTAGAGTGTTGGGATCCTGTGTTTTCATCATCACTGGCAAACATTTCTTCATGGCAAAACAGGTCTTCATCCCACTTCTCATTAAATGTATTCCACCAGGATTCCCATTCATCTGTTCCATAGGTTGGCACCTAAAAAAAAAACAATTAAGTTTATTGTAAAAAACAAAATGCCCTGCAAAAGCAAAATAGTGGTTTACCTTAAAGCTTTAGATCCCTGTAGGGGGTGTCTCCAAGAACCTTCTCCCAGCAATGAAGAGCTTCTTGGGTTAAGTCACACCCAAACCATTGTCTGAAGCAATCAAAGCAATAGCAATCTATCCACACAAGTGGGCTGCTTCTTAAAAATTTTCTGTTTCTATGCCTTAATTTTAGCATACACATTAAACAGGGGCAATGCACTGAAGGATTAGTGGCACAGTTAGGCCATTCCTTGCAATAAAGGGTATCAGAATTAGGAGGAAAATCACAACCAACCTCTGAACTATTCCATGTACCAAAATCAGGCTGATGAGCAACTTTTACACCTTGTTCCATTTTTTTATATAAAAAATTCATTCTCTTCATTTTGTCTTCGTCCCCACCTTTATCAGGGTGTAGTTCTTTGCATTTTTTCAGATAAGCTTTTCTCATGATAGGAATGTTTCCCCATGCAGACCTATCAAGGCCTAATAAATCCATAAGCTCCATGGATTCCTCCCTATTCAGCACTTTGTCCATTTTAGCTTTTTGCAGCAAAAAATTACTGCAAAAAAGGGAAAAACAAGGGAATTTCCCTGGCCTCCTAAAAAGCCTCCACGCCCTTACTACTTCTGAGTAAGCTTGGAGGCGGAGGCG
| 14,112
|
OQ230885.1
|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
|
Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2023-08-08
|
B182jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,121
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Homo sapiens
|
urine
|
2015-03-16
| null | null |
JC polyomavirus isolate B182jc, complete genome
|
GCCTCGGCCTCCTGTATATATAAAAAAAAGGGAAGGTAGGGAGGAGCTGGCTAAAACTGGATGGCTGCCAGCCAAGCATGAGCTCATACCTAGGGAGCCAACCAGCTGACAGCCAGAGGGAGCCCTGGCTGCATGCCACTGGCAGTTATAGTGAAACCCCTCCCATAGTCCTTAATCACAAGTAAACAAAGCACAAGGGGAAGTGGAAAGCAGCCAAGGGAACATGTTTTGCGAGCCAGAGCTGTTTTGGCTTGTCACCAGCTGGCCATGGTTCTTCGCCAGCTGTCACGTAAGGCTTCTGTGAAAGTTAGTAAAACCTGGAGTGGAACTAAAAAAAGAGCTCAAAGGATTTTAATTTTTTTGTTAGAATTTTTGCTGGACTTTTGCACAGGTGAAGACAGTGTAGACGGGAAAAAAAGACAGAGACACAGTGGTTTGACTGAGCAGACATACAGTGCTTTGCCTGAACCAAAAGCTACATAGGTAAGTAATGTTTTTTTTTGTGTTTTCAGGTTCATGGGTGCCGCACTTGCACTTTTGGGGGACCTAGTTGCTACTGTTTCTGAGGCTGCTGCTGCCACAGGATTTTCAGTAGCTGAAATTGCTGCTGGAGAGGCTGCTGCTACTATAGAAGTTGAAATTGCATCCCTTGCTACTGTAGAGGGGATTACAAGTACCTCTGAGGCTATAGCTGCTATAGGCCTTACTCCTGAAACATATGCTGTAATAACTGGAGCTCCGGGGGCTGTAGCTGGGTTTGCTGCATTGGTTCAAACTGTAACTGGTGGTAGTGCTATTGCTCAGTTGGGATATAGATTTTTTGCTGACTGGGATCATAAAGTTTCAACAGTTGGGCTTTTTCAGCAGCCAGCTATGGCTTTACAATTATTTAATCCAGAAGACTACTATGATATTTTATTTCCTGGAGTGAATGCCTTTGTTAACAATATTCACTATTTAGATCCTAGACATTGGGGCCCGTCCTTGTTCTCCACAATCTCCCAGGCTTTTTGGAATCTTGTTAGAGATGATTTGCCAGCCTTAACCTCTCAGGAAATTCAGAGAAGAACCCAAAAGCTATTTGTTGAAAATTTAGCAAGGTTTTTGGAAGAAACTACTTGGGCAATAGTTAATTCACCAGCTAACTTATATAATTATATTTCAGACTATTATTCTAGATTGTCTCCAGTTAGGCCCTCTATGGTAAGGCAAGTTGCCCAAAGGGAGGGAACCTATATTTCTTTTGGCCACTCATACACCCAAAGTATAGATGATGCAGACAGCATTCAAGAAGTTACCCAAAGGCTAGATTTAAAAACCCCAAATGTGCAATCTGGTGAATTTATAGAAAGAAGTATTGCACCAGGAGGTGCAAATCAAAGATCTGCTCCTCAATGGATGTTGCCTTTACTTTTAGGGTTGTACGGGACTGTAACACCTGCTCTTGAAGCATATGAAGATGGCCCCAACAAAAAGAAAAGGAGAAAGGAAGGACCCCGTGCAAGTTCCAAAACTTCTTATAAGAGGAGGAGTAGAAGTTCTAGAAGTTAAAACTGGGGTTGACTCAATTACAGAGGTAGAATGCTTTTTAACTCCAGAAATGGGTGACCCAGATGAGCATCTTAGGGGTTTTAGTAAGTCAATATCTATATCAGATACATTTGAAAGTGACTCCCCAAGTAAGGACATGCTTCCTTGTTACAGTGTGGCCAGAATTCCACTACCCAATCTAAATGAGGATCTAACCTGTGGAAATATACTCATGTGGGAGGCTGTGACCTTAAAAACTGAGGTTATAGGGGTGACAAGTTTGATGAATGTGCACTCTAATGGTCAAGCAGCTCATGACAATGGTGCAGGGAAGCCAGTGCAGGGCACCAGCTTTCATTTTTTTTCTGTTGGGGGGGAGGCTTTAGAATTACAGGGGGTGGTTTTTAATTACAGAACAAAGTACCCAGATGGAACAATTTTTCCAAAGAATGCCACAGTGCAATCTCAAGTCATGAACACAGAGCACAAGGCGTACCTAGATAAGAACAAAGCATATCCTGTTGAATGTTGGGTTCCTGATCCCACCAGAAATGAAAACACAAGATATTTTGGGACACTAACAGGAGGAGAAAATGTTCCTCCAGTTCTTCATATAACAAACACTGCCACAACAGTGTTGCTTGATGAATTTGGTGTTGGGCCACTTTGCAAAGGTGACAACTTATACTTGTCAGCTGTTGATGTTTGTGGCATGTTTACTAACAGGTCTGGTTCCCAGCAGTGGAGAGGACTGTCCAGATATTTTAAGGTTCAGCTAAGGAAAAGGAGGGTTAAAAACCCCTACCCAATTTCTTTCCTTCTTACTGATTTAATTAACAGAAGGACTCCTAGAGTTGATGGGCAGCCTATGTATGGCATGGATGCTCAAGTAGAGGAGGTTAGAGTTTTTGAGGGAACAGAGGAGCTTCCAGGGGACCCAGACATGATGAGATACGTTGACAGATATGGACAGTTGCAGACAAAAATGCTGTAATCAAAAGCCTTTATTGTAATATGCAGTACATTTTAATAAAGTATAACCAGCTTTACTTAACATTTGCAGTTATTTTGGGGGAGGGGTCTTTGGTTTTTTGAAACATTGAAAGCCTTTACAGATGTGAAAAGTGCAGTTTTCCTGTGTGTCTGCACCAGAGGCTTCTGAGACCTGGGAAGAGCATTGTGATTGTGATTCAGTGCTTGATCCATGTCCAGAGTCTTCTGCTTCAGAATCTTCCTCTCTAGGAAAGTCAAGAATGGGTCTCCCCATACCAACATTAGCTTTCATAGTAGAAAATGTATACATGCTTATTTCTAAATCCAGCCTTTCTTTCCACTGCACAATCCTCTCATGAATGGCAGCTGCAAAGTCAGCAACTGGCCTAAACCAGATTAAAAGCAAAAGCAAAGTCATACCACTTTGCAAAATCCTTTTTTCTAGCAAATACTCAGAGCAGCTTAGTGATTTTCTCAGGTAGGCCTTTGGTCTAAAATCTATTTGTCTTACAAATCTGGCCTGTAAAGTTCTAGGCACTGAATATTCATTCATGGTTACAATTCCAGGTGGAAACACCTGTGTTCTTTTGTTTTGGTGTTTCCTCTCTAAATTAACTTTTACACTTCCATCTAAGTAATCTCTTAAGCAATCAAGGTTGCTTATGCCATGCCCTGAAGGTAAATCCCTTGACTCTGCACCAGTGCCTTTTACATCCTCAAATACAACCATAAACTGATCTATACCCACTCCTAACTCAAAGTTTAATCTTTCTAATGGCATATTAACATTTAATGACTTTCCCCCACAGAGATCAAGTAAAGCTGCAGCTAAAGTAGTTTTGCCACTGTCTATTGGCCCCTTGAATAGCCAGTACCTTTTTTTTGGAATGTTTAATACAATGCATTTCAGAAAGTCATAAATAACAGTGTCCATTTGAGGCAGCAAGCAATGAATCCAGGCCACCCCAGCCATATATTGCTCTAAAACAGCATTGCCATGTGCCCCAAAAATCAAGTCCATTTTATCAAGCAAGAAATTAAACCTTTCAACTAACATTTCTTCTCTGGTCATGTGGATGCTGTCAACCCTTTGTTTGGCTGCTACAGTATCAACAGCCTGCTGGCAAATGCTTTTTTGATTTTTGCTATCTGCAAAAATTTGGGCATTATAATAGTGTTTTTCATGATGGTTAAAGTGATTTGGCTGATCCTTTTTTTCACATTTTTTGCATTGCTGTGGGTTTTCCTGAAAGTCTAAGTACATGCCCATAAGCAAAAAAACATCCTCACACTTGGTTTCCAAGGCATACTGTGTAACTAATTTCCATGAAACCTGCTTAGTTTCTTCTGGTTCTTCTGGGTTAAAGTCATGCTCCTTAAGGCCCCCCTGAATACTTTCTTCCACTACTGCATATGGCTGTCTACACAGGGCACTATAAAACAAGTATTCCTTATTCACACCTTTACAAATTAAAAAACTAAAGGTACATAGTTTTTGACAGTAGTTATTAATTGCTGACACTCTATGTCTATGTGGTGTTAAGAAAAACAAAATATTATGACCCCCAAAACCATGTCTACTTATAAAAGTTACAGAATATTTTTCCATAAGTTTCTTATATAAAATTTGAGCTTTTTCTTTAGTGGTATACACAGCAAAAGAAGCAACAGTTCTATTACTAAACACAGCTTGACTGAGGAATGCATGCAGATCTACAGGAAAGTCTTTAGGGTCTTCTACCTTTTTTTTCTTCTTAGGTGGGGTAGAGTGTTGGGATCCTGTGTTTTCATCATCACTGGCAAACATTTCTTCATGGCAAAACAGGTCTTCATCCCACTTCTCATTAAATGTATTCCACCAGGATTCCCATTCATCTGTTCCATAGGTTGGCACCTAAAAAAAAACAATTAAGTTTATTGTAAAAAACAAAATGCCCTGCAAAAGAAAAATAGTGGTTTACCTTAAAGCTTTAGATCCCTGTAGGGGGTGTCTCCAAGAACTTTCTCCCAGCAATGAAGAGCTTCTTGGGTTAAGTCACACCCAAACCATTGTCTGAAGCAATCAAAGCAATAGCAATCTATCCACACAAGTGGGCTGCTTCTTAAAAATTTTCTGTTTTTATGCCTTAATTTTAGCATGCACATTAAACAGGGGCAATGCACTGAAGGATTAGTGGCACAGTTAGGCCATTCCTTGCAATAAAGGGTATCAGAATTAGGAGGAAAATCACAACCAACCTCTGAACTATTCCATGTACCAAAATCAGGCTGATGAGCAACTTTTACACCTTGTTCCATTTTTTTATATAAAAAATTCATTCTCTTCATCTTGTCTTCGTCCCCACCTTTATCAGGGTGGAGTTCTTTGCATTTTTTCAGATAAGCTTTTCTCATGACAGGAATGTTCCCCCATGCAGACCTATCAAGGCCTAATAAATCCATAAGCTCCATGGATTCCTCCCTATTCAGCACTTTGTCCATTTTAGCTTTTTGCAGCAAAAAATTACTGCAAAAAAGGGAAAAACAAGGGAATTTCCCTGGCCTCCTAAAAAGCCTCCACGCCCTTACTACTTCTGAGTAAGCTTGGAGGCGGAGGCG
| 14,113
|
OQ230886.1
|
JC polyomavirus
|
Mineeva-Sangwo,O., Van Loon,E., Andrei,G., Kuypers,D., Naesens,M., Snoeck,R.
|
Rega Institute for Medical Research, Department of Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2023-08-08
|
B217jc
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,099
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Homo sapiens
|
urine
|
2017-03-06
| null | null |
JC polyomavirus isolate B217jc, complete genome
|
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| 14,114
|
ON023008.1
|
JC polyomavirus
|
Pyoria,L., Pratas,D., Toppinen,M., Hedman,K., Sajantila,A., Perdomo,M.F.
|
University of Helsinki, Department of Virology
|
Finland
|
2023-01-14
|
AA-31
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,074
|
GenBank
| 1
|
Finland
|
Finland
|
Homo sapiens
|
kidney, abdominal cavity
|
2015
| null | null |
JC polyomavirus isolate AA-31, complete genome
|
CTCCTGTATATATAAAAAAAAGGGAAGGTAGGGAGGAGCTGGCTAAAACTGGATGGCTGCCAGCCAAGCATGAGCTCATACCTAGGGAGCCAACCAGCTGACAGCCAGAGGGAGCCCTGGCTGCATGCCACTGGCAGTTATAGTGAAACCCCTCCCATAGTCCTTAATCACAAGTAAACAAAGCACAAGGGGAAGTGGAAAGCAGCCAAGGGAACATGTTTTGCGAGCCAGAGCTGTTTTGGCTTGTCACCAGCTGGCCATGGTTCTTCGCCAGCTGTCACGTAAGGCTTCTGTGAAAGTTAGTAAAACCTGGAGTGGAACTAAAAAAAGAGCTCAAAGGATTTTAATTTTTTTGTTAGAATTTTTGCTGGACTTTTGCACAGGTGAAGACAGTGTAGACGGGAAAAAAAGACAGAGACACAGTGGTTTGACTGAGCAGACATACAGTGCTTTGCCTGAACCAAAAGCTACATAGGTAAGTAATGTTTTTTTTTGTGTTTTCAGGTTCATGGGTGCCGCACTTGCACTTTTGGGGGACCTAGTTGCTACTGTTTCTGAGGCTGCTGCTGCCACAGGATTTTCAGTAGCTGAAATTGCTGCTGGAGAGGCTGCTGCTACTATAGAAGTTGAAATTGCATCCCTTGCTACTGTAGAGGGGATTACAAGTACCTCTGAGGCTATAGCTGCTATAGGCCTTACTCCTGAAACATATGCTGTAATAACTGGAGCTCCGGGGGCTGTAGCTGGGTTTGCTGCATTGGTTCAAACTGTAACTGGTGGTAGTGCTATTGCTCAGTTGGGATATAGATTTTTTGCTGACTGGGATCATAAAGTTTCAACAGTTGGGCTTTTTCAGCAGCCAGCTATGGCTTTACAATTATTTAATCCAGAAGACTACTATGATATTTTATTTCCTGGAGTGAATGCCTTTGTTAATAATATTCACTATTTAGATCCTAGACATTGGGGCCCGTCCTTGTTCTCCACAATCTCCCAGGCTTTTTGGAATCTTGTTAGAGATGATTTGCCAGCCTTAACCTCTCAGGAAATTCAGAGAAGAACCCAAAAACTATTTGTTGAAAATTTAGCAAGGTTTTTGGAAGAAACTACTTGGGCAATAGTTAATTCACCAGCTAACTTATATAATTATATTTCAGACTATTATTCTAGATTGTCTCCAGTTAGGCCCTCTATGGTAAGGCAAGTTGCCCAAAGGGAGGGAACCTATATTTCTTTTGGCCACTCATACACCCAAAGTATAGATGATGCAGACAGCATTCAAGAAGTTACCCAAAGGCTAGATTTAAAAACCCCAAATGTGCAATCTGGTGAATTTATAGAAAAAAGTATTGCACCAGGAGGTGCAAATCAAAGATCTGCTCCTCAATGGATGTTGCCTTTACTTTTAGGGTTGTACGGGACTGTAACACCTGCTCTTGAAGCATATGAAGATGGCCCCAACAAAAAGAAAAGGAGAAAGGAAGGACCCCGTGCAAGTTCCAAAACTTCTTATAAGAGGAGGAGTAGAAGTTCTAGAAGTTAAAACTGGGGTTGACTCAATTACAGAGGTAGAATGCTTTTTAACTCCAGAAATGGGTGACCCAGATGAGCATCTTAGGGGTTTTAGTAAGTCTATATCTATATCAGATACATTTGAAAGTGACTCCCCAAATAAGGACATGCTTCCTTGTTACAGTGTGGCCAGAATTCCACTACCCAATCTAAATGAGGATCTAACCTGTGGAAATATACTCATGTGGGAGGCTGTGACCTTAAAAACTGAGGTTATAGGGGTGACAACTTTGATGAATGTGCACTCTAATGGGCAAGCAACTCATGACAATGGTGCAGCAAAGCCAGTGCAGGGCACCAGCTTTCATTTTTTTTCTGTTGGGGGGGAGGCTTTAGAATTACAGGGGGTGGTTTTTAATTACAGAACAACGTACCCAGATGGAACAATTTTTCCAAAGAATGCCACAGTGCAATCTCAAGTCATGAACACAGAGCACAAGGCGTACCTAGATAAGAACAAAGCATATCCTGTTGAATGTTGGGTTCCTGATCCCACCAGAAATGAAAACACAAGATATTTTGGGACACTAACAGGAGGAGAAAATGTTCCTCCAGTTCTTCATATAACAAACACTGCCACAACAGTGTTGCTTGATGAATTTGGTGTTGGGCCACTTTGCAAAGGTGACAACTTATATTTGTCAGCTGTTGATGTCTGTGGCATGTTTACTAACAGGTCTGGTTCCCAGCAGTGGAGAGGACTCTCCAGATATTTTAAGGTTCAGCTAAGGAAAAGGAGGGTTAAAAACCCCTACCCAATTTCTTTTCTTCTTACTGATTTAATTAACAGAAGGACTCCTAGAGTTGATGGGCAGCCTATGTATGGCATGGATGCTCAAGTAGAGGAGGTTAGAGTTTTTGAGGGAACAGAGGAGCTTCCAGGGGACCCAGACATGATGAGATACGTTGACAGATATGGACAGTTGCAGACAAAAATGCTGTAATCAAAAGCCTTTATTGTAATATGCAGTACATTTTAATAAAGTATAACCAGCTTTACTTAACATTTGCAGTTATTTTGGGGGAGGGGTCTTTGGTTTTTTGAAACATTGAAAGCCTTTACAGATGTGATAAGTGCAGTTTTCCTGTGTGTCTGCACCAGAGGCTTCTGAGACCTGGGAAAAGCATTGTGATTGTGATTCAGTGCTTGATCCATGTCCAGAGTCTTCTGCTTCAGAATCTTCCTCTCTAGGAAAGTCAAGAATGGGTCTCCCCATACCAACATTAGCTTTCATAGTAGAAAATGTATACATGCTTATTTCTAAATCCAGCCTTTCTTTCCACTGCACAATCCTCTCATGAATGGCAGCTGCAAAGTCAGCAACTGGCCTAAACCAGATTAAAAGCAAAAGCAAAGTCATACCACTTTGCAAAATCCTTTTTTCTAGCAAATACTCAGAGCAGCTTAGTGATTTTCTCAGGTAGGCCTTTGGTCTAAAATCTATTTGCCTTACAAATCTGGCCTGTAAAGTTCTAGGCACTGAATATTCATTCATGGTTACAATTCCAGGTGGAAACACCTGTGTTCTTTTGTTTTGGTGTTTCCTCTCTAAATTAACTTTTACACTTCCATCTAAGTAATCTCTTAAGCAATCAAGGTTGCTTATGCCATGCCCTGAAGGTAAATCCCTTGACTCTGCACCAGTTCCTTTTACATCCTCAAATACAACCATAAACTGATCTATACCCACTCCTAACTCAAAGTTTAATCTTTCTAATGGCATATTAACATTTAATGACTTTCCCCCACAGAGATCAAGTAAAGCAGCAGCTAAAGTAGTCTTGCCACTGTCTATTGGCCCCTTGAATAGCCAGTACCTTTTTTTTGGAATGTTTAATACAATGCATTTTAGAAAGTCATAAATAACAGTGTCCATTTGAGGCAGCAAGCAATGAATCCAGGCCACCCCAGCCATATATTGCTCTAAAACAGCATTGCCATGTGCCCCAAAAATCAAGTCCATTTTATCAAGCAAGAAATTAAACCTTTCAACTAACATTTCTTCTCTGGTCATGTGGATGCTGTCAACCCTTTGTTTGGCTGCTACAGTATCAACAGCCTGCTGGCAAATGCTTTTTTGATTTTTGCTATCTGCAAAAATTTGGGCATTATAATAGTGTTTTTCATGATGGTTAAAGTGATTTGGCTGATCCTTTTTCTCACATTTTTTGCATTGCTGTGGGTTTTCCTGAAAGTCTAAGTACATGCCCATAAGCAAAAAAACATCCTCACACTTGGTTTCCAAGGCATACTGTGTAACTAATTTCCATGACACCTGCTTAGTTTCTTCTGGTTCTTCTGGGTTAAAGTCATGCTCCTTAAGGCCCCCCTGAATACTTTCTTCTACTACTGCATATGGCTGTCTACACAGGGCACTATAAAACAAGTATTCCTTATTCACACCTTTACAAATTAAAAAACTAAAGGTACACAGTTTTTGACAGTAATTATTAATTGCTGACACTCTATGTCTATGTGGTGTTAAGAAAAACAAAATATTATGACCCCCAAAACCATGTCTACTTATAAAAGTTACAGAATATTTTTCCATAAGTTTCTTATATAAAATTTGAGCTTTTTCTTTAGTGGTATACACAGCAAAAGAAGCAACAGTTCTATTACTAAACACAGCTTGACTGAGGAATGCATGCAGATCTACAGGAAAGTCTTTAGGGTCTTCTACCTTTTTTTTCTTCTTAGGTGGGGTAGAGTGTTGGGATCCTGTGTTTTCATCATCACTGGCAAACATTTCTTCATGGCAAAACAGGTCTTCATCCCACTTCTCATTAAATGTATTCCACCAGGATTCCCATTCATCTGTTCCATAGGTTGGCACCTAAAAAAAAAACAATTAAGTTTATTGTAAAAAACAAAATGCCCTGCAAAAGCAAAATAGTGGTTTACCTTAAAGCTTTAGATCCCTGTAGGGGGTGTCTCCAAGAACCTTCTCCCAGCAATGAAGAGCTTCTTGGGTTAAGTCACACCCAAACCATTGTCTGAAGCAATCAAAGCAATAGCAATCTATCCACACAAGTGGGCTGCTTCTTAAAAATTTTCTGTTTCTATGCCTTAATTTTAGCATGCACATTAAACAGGGGCAATGCACTGAAGGATTAGTGGCACAGTTAGGCCATTCCTTGCAATAAAGGGTATCAGAATTAGGAGGAAAATCACAACCAACCTCTGAACTATTCCATGTACCAAAATCAGGCTGATGAGCAACTTTTACACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCAGGGTGGAGTTCTTTGCATTTTTTCAGATAAGCTTTTCTCATGATAGGAATGTTTCCCCATGCAGACCTATCAAGGCCTAATAAATCCATAAGCTCCATGGATTCCTCCCTATTCAGCACTTTGTCCATTTT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|
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|
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|
Pyoria,L., Pratas,D., Toppinen,M., Hedman,K., Sajantila,A., Perdomo,M.F.
|
University of Helsinki, Department of Virology
|
Finland
|
2023-01-14
|
AA-32
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,121
|
GenBank
| 1
|
Finland
|
Finland
|
Homo sapiens
|
kidney, abdominal cavity
|
2015
| null | null |
JC polyomavirus isolate AA-32, complete genome
|
GCCTCGGCCTCCTGTATATATAAAAAAAAGGGAAGGTAGGGAGGAGCTGGCTAAAACTGGATGGCTGCCAGCCAAGCATGAGCTCATACCTAGGGAGCCAACCAGCTGACAGCCAGAGGGAGCCCTGGCTGCATGCCACTGGCAGTTATAGTGAAACCCCTCCCATAGTCCTTAATCACAAGTAAACAAAGCACAAGGGGAAGTGGAAAGCAGCCAAGGGAACATGTTTTGCGAGCCAGAGCTGTTTTGGCTTGTCACCAGCTGGCCATGGTTCTTCGCCAGCTGTCACGTAAGGCTTCTGTGAAAGTTAGTAAAACCTGGAGTGGAACTAAAAAGAGAGCTCAAAGGATTTTAATTTTTTTGTTAGAATTTTTGCTGGACTTTTGCACAGGTGAAGACAGTGTAGACGGGAAAAAAAGACAGAGACACAGTGGTTTGACTGAGCAGACATACAGTGCTTTGCCTGAACCAAAAGCTACATAGGTAAGTAATGTTTTTTTTTGTGTTTTCAGGTTCATGGGTGCCGCACTTGCACTTTTGGGGGACCTAGTTGCTACTGTTTCTGAGGCTGCTGCTGCCACAGGATTTTCAGTAGCTGAAATTGCTGCTGGAGAGGCTGCTGCTACTATAGAAGTTGAAATTGCATCCCTTGCTACTGTAGAGGGGATTACAAGTACCTCTGAGGCTATAGCTGCTATAGGCCTTACTCCTGAAACATATGCTGTAATAACTGGAGCTCCGGGGGCTGTAGCTGGGTTTGCTGCATTGGTTCAAACTGTAACTGGTGGTAGTGCTATTGCTCAGTTGGGATATAGATTTTTTGCTGACTGGGATCATAAAGTTTCAACAGTTGGGCTTTTTCAGCAGCCAGCTATGGCTTTACAATTATTTAATCCAGAAGACTACTATGATATTTTATTTCCTGGAGTGAATGCCTTTGTTAACAATATTCACTATTTAGATCCTAGACATTGGGGCCCGTCCTTGTTCTCCACAATCTCCCAGGCTTTTTGGAATCTTGTTAGAGATGATTTGCCAGCCTTAACCTCTCAGGAAATTCAGAGAAGAACCCAAAAGCTATTTGTTGAAAATTTAGCAAGGTTTTTGGAAGAAACTACTTGGGCAATAGTTAATTCACCAGCTAACTTATATAATTATATTTCAGACTATTATTCTAGATTGTCTCCAGTTAGGCCCTCTATGGTAAGGCAAGTTGCCCAAAGGGAGGGAACCTATATTTCTTTTGGCCACTCATACACCCAAAGTATAGATGATGCAGACAGCATTCAAGAAGTTACCCAAAGGCTAGATTTAAAAACCCCAAATGTGCAATCTGGTGAATTTATAGAAAGAAGTATTGCACCAGGAGGTGCAAATCAAAGATCTGCTCCTCAATGGATGTTGCCTTTACTTTTAGGGTTGTACGGGACTGTAACACCTGCTCTTGAAGCATATGAAGATGGCCCCAACAAAAAGAAAAGGAGAAAGGAAGGACCCCGTGCAAGTTCCAAAACTTCTTATAAGAGGAGGAGTAGAAGTTCTAGAAGTTAAAACTGGGGTTGACTCAATTACAGAGGTAGAATGCTTTTTAACTCCAGAAATGGGTGACCCAGATGAGCATCTTAGGGGTTTTAGTAAGTCAATATCTATATCAGATACATTTGAAAGTGACTCCCCAAGTAAGGACATGCTTCCTTGTTACAGTGTGGCCAGAATTCCACTACCCAATCTAAATGAGGATCTAACCTGTGGAAATATACTCATGTGGGAGGCTGTGACCTTAAAAACTGAGGTTATAGGGGTGACAAGTTTGATGAATGTGCACTCTAATGGTCAAGCAGCTCATGACAATGGTGCAGGGAAGCCAGTGCAGGGCACCAGCTTTCATTTTTTTTCTGTTGGGGGGGAGGCTTTAGAATTACAGGGGGTGGTTTTTAATTACAGAACAAAGTACCCAGATGGAACAATTTTTCCAAAGAATGCCACAGTGCAATCTCAAGTCATGAACACAGAGCACAAGGCGTACCTAGATAAGAACAAAGCATATCCTGTTGAATGTTGGGTTCCTGATCCCACCAGAAATGAAAACACAAGATATTTTGGGACACTAACAGGAGGAGAAAATGTTCCTCCAGTTCTTCATATAACAAACACTGCCACAACAGTGTTGCTTGATGAATTTGGTGTTGGGCCACTTTGCAAAGGTGACAACTTATACTTGTCAGCTGTTGATGTTTGTGGCATGTTTACTAACAGGTCTGGTTCCCAGCAGTGGAGAGGACTCTCCAGATATTTTAAGGTTCAGCTAAGGAAAAGGAGGGTTAAAAACCCCTACCCAATTTCTTTCCTTCTTACTGATTTAATTAACAGAAGGACTCCTAGAGTTGATGGGCAGCCTATGTATGGCATGGATGCTCAAGTAGAGGAGGTTAGAGTTTTTGAGGGAACAGAGGAGCTTCCAGGGGACCCAGACATGATGAGATACGTTGACAGATATGGACAGTTGCAGACAAAAATGCTGTAATCAAAAGCCTTTATTGTAATATGCAGTACATTTTAATAAAGTATAACCAGCTTTACTTAACATTTGCAGTTATTTTGGGGGAGGGGTCTTTGGTTTTTTGAAACATTGAAAGCCTTTACAGATGTGAAAAGTGCAGTTTTCCTGTGTGTCTGCACCAGAGGCTTCTGAGACCTGGGAAGAGCATTGTGATTGTGATTCAGTGCTTGATCCATGTCCAGAGTCTTCTGCTTCAGAATCTTCCTCTCTAGGAAAGTCAAGAATGGGTCTCCCCATACCAACATTAGCTTTCATAGTAGAAAATGTATACATGCTTATTTCTAAATCCAGCCTTTCTTTCCACTGCACAATCCTCTCATGAATGGCAGCTGCAAAGTCAGCAACTGGCCTAAACCAGATTAAAAGCAAAAGCAAAGTCATACCACTTTGCAAAATCCTTTTTTCTAGCAAATACTCAGAGCAGCTTAGTGATTTTCTCAGGTAGGCCTTTGGTCTAAAATCTATTTGCCTTACAAATCTGGCCTGTAAAGTTCTAGGCACTGAATATTCATTCATGGTTACAATTCCAGGTGGAAACACCTGTGTTCTTTTGTTTTGGTGTTTCCTCTCTAAATTAACTTTTACACTTCCATCTAAGTAATCTCTTAAGCAATCAAGGTTGCTTATGCCATGCCCTGAAGGTAAATCCCTTGACTCTGCACCAGTGCCTTTTACATCCTCAAATACAACCATAAACTGATCTATACCCACTCCTAACTCAAAGTTTAATCTTTCTAATGGCATATTAACATTTAATGACTTTCCCCCACAGAGATCAAGTAAAGCTGCAGCTAAAGTAGTTTTGCCACTGTCTATTGGCCCCTTGAATAGCCAGTACCTTTTTTTTGGAATGTTTAATACAATGCATTTCAGAAAGTCATAAATAACAGTGTCCATTTGAGGCAGCAAGCAATGAATCCAGGCCACCCCAGCCATATATTGCTCTAAAACAGCATTGCCATGTGCCCCAAAAATCAAGTCCATTTTATCAAGCAAGAAATTAAACCTTTCAACTAACATTTCTTCTCTGGACATGTGGATGCTGTCAACCCTTTGTTTGGCTGCTACAGTATCAACAGCCTGCTGGCAAATGCTTTTTTGATTTTTGCTATCTGCAAAAATTTGGGCATTATAATAGTGTTTTTCATGATGGTTAAAGTGATTTGGCTGATCCTTTTTTTCACATTTTTTGCATTGCTGTGGGTTTTCCTGAAAGTCTAAGTACATGCCCATAAGCAAAAAAACATCCTCACACTTGGTTTCCAAGGCATACTGTGTAACTAATTTCCATGAAACCTGCTTAGTTTCTTCTGGTTCTTCTGGGTTAAAGTCATGCTCCTTAAGGCCCCCCTGAATACTTTCTTCCACTACTGCATATGGCTGTCTACACAGGGCACTATAAAACAAGTATTCCTTATTCACACCTTTACAAATTAAAAAACTAAAGGTACATAGTTTTTGACAGTAGTTATTAATTGCTGACACTCTATGTCTATGTGGTGTTAAGAAAAACAAAATATTATGACCCCCAAAACCATGTCTACTTATAAAAGTTACAGAATATTTTTCCATAAGTTTCTTATATAAAATTTGAGCTTTTTCTTTAGTGGTATACACAGCAAAAGAAGCAACAGTTCTATTACTAAACACAGCTTGACTGAGGAATGCATGCAGATCTACAGGAAAGTCTTTAGGGTCTTCTACCTTTTTTTTCTTCTTAGGTGGGGTAGAGTGTTGGGATCCTGTGTTTTCATCATCACTGGCAAACATTTCTTCATGGCAAAACAGGTCTTCATCCCACTTCTCATTAAATGTATTCCACCAGGATTCCCATTCATCTGTTCCATAGGTTGGCACCTAAAAAAAAACAATTAAGTTTATTGTAAAAAACAAAATGCCCTGCAAAACAAAAATAGTGGTTTACCTTAAAGCTTTAGATCCCTGTAGGGGGTGTCTCCAAGAACTTTCTCCCAGCAATGAAGAGCTTCTTGGGTTAAGTCACACCCAAACCATTGTCTGAAGCAATCAAAGCAATAGCAATCTATCCACACAAGTGGGCTGCTTCTTAAAAATTTTCTGTTTCTATGCCTTAATTTTAGCATGCACATTAAACAGGGGCAATGCACTGAAGGATTAGTGGCACAGTTAGGCCATTCCTTGCAATAAAGGGTATCAGAATTAGGAGGAAAATCACAACCAACCTCTGAACTATTCCATGTACCAAAATCAGGCTGATGAGCAACTTTTACACCTTGTTCCATTTTTTTATATAAAAAATTCATTCTCTTCATCTTGTCTTCGTCCCCACCTTTATCAGGGTGGAGTTCTTTGCATTTTTTCAGATAAGCTTTTCTCATGACAGGAATGTTCCCCCATGCAGACCTATCAAGGCCTAATAAATCCATAAGCTCCATGGATTCCTCCCTATTCAGCACTTTGTCCATTTTAGCTTTTTGCAGCAAAAAATTACTGCAAAAAAGGGAAAAACAAGGGAATTTCCCTGGCCTCCTAAAAAGCCTCCACGCCCTTACTACTTCTGAGTAAGCTTGGAGGCGGAGGCG
| 19,439
|
ON023010.1
|
JC polyomavirus
|
Pyoria,L., Pratas,D., Toppinen,M., Hedman,K., Sajantila,A., Perdomo,M.F.
|
University of Helsinki, Department of Virology
|
Finland
|
2023-01-14
|
AA-33
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,120
|
GenBank
| 1
|
Finland
|
Finland
|
Homo sapiens
|
kidney, abdominal cavity
|
2015
| null | null |
JC polyomavirus isolate AA-33, complete genome
|
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| 19,440
|
OP549862.1
|
JC polyomavirus
|
Jimoh,A., Balle,C., Brown,B., Feng,C., Havyarimana,E., Konstantinus,I.N., Gill,K., Bekker,L.-G., Passmore,J.-A.S., Happel,A.-U., Jaspan,H.B., Varsani,A.
|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
|
2022-10-26
|
UC156V1_C027
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,112
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
2017-04-11
|
SAMN30889842
|
PRJNA881266
|
JC polyomavirus isolate UC156V1_C027, complete genome
|
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| 22,669
|
OP549863.1
|
JC polyomavirus
|
Jimoh,A., Balle,C., Brown,B., Feng,C., Havyarimana,E., Konstantinus,I.N., Gill,K., Bekker,L.-G., Passmore,J.-A.S., Happel,A.-U., Jaspan,H.B., Varsani,A.
|
Arizona State University, The Biodesign Center of Fundamental and Applied Microbiomics
|
USA
|
2022-10-26
|
UC167V3_C026
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,121
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
2017-11-30
|
SAMN30889845
|
PRJNA881266
|
JC polyomavirus isolate UC167V3_C026, complete genome
|
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GTTCTTTGCATTTTTTTAGATAAGCTTTTCTCATGACAGGAATGTTTCCCCATGCAGATCTATCAAGGCCTAATAAATCCATGAGCTCCATGGATTCCTCCCTATTCAGCACTTTGTCCAT
| 22,670
|
MT448660.1
|
JC polyomavirus
|
Tyumentseva,M.A., Tyumentsev,A.I., Matosova,S.V., Domonova,E.A., Shipulina,O.Y., Akimkin,V.G.
|
Federal Budget Institution of Science "Central Research Institute of Epidemiology", The Federal Service on Customers' Rights Protection and Human Well-being Surveillance
|
Russia
|
2022-06-21
|
188_2016
|
Betapolyomavirus secuhominis
|
Betapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,131
|
GenBank
| null |
Russia
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2016-02-15
| null | null |
JC polyomavirus isolate 188_2016, complete genome
|
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|
NC_001494.1
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
York,D.F., Vigne,R., Verwoerd,D.W., Querat,G.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-02
| null |
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 7,462
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
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|
Jaagsiekte sheep retrovirus, complete genome
|
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| 8,991
|
ON204347.1
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Liu,S.Y., Zhang,P., Duan,X.J., Du,X.Y., Wang,X.J., Shi,X.N., Chen,S.X., Yang,X.L., Liu,R.
|
Inner Mongolia Agricultural University, Veterinary College
|
China
|
2023-01-29
|
NMJS12
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 7,572
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ovis aries
| null |
2020-05-21
| null | null |
Jaagsiekte sheep retrovirus isolate NMJS12, complete genome
|
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| 18,989
|
MZ931278.1
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
baloch,Z., Xia,X.
|
Kunming University of Science and Technology, Faculty of Life Science and Technology
|
China
|
2022-02-06
|
Shangri-la
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 7,917
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Naemorhedus goral
| null |
2020-02
| null | null |
UNVERIFIED: Jaagsiekte sheep retrovirus isolate Shangri-la, complete genome
|
TGCGGGGGACTGCCCGTGAAGGGTTAAGTCCTGGGAGCTGCTCCGCAGGTATGCGGAGCCCTAGGCATTGTCCTAAACTCCCTGTCCCAACACCCTCAAGAATTTTTATAGCCCTTAAGGCTCCAGGTCATCTTGCTCCAGGATGTCTTGTTCCTGCAACATGTCATAGAAGATAGATTATCTTATAGAATTCTGTATACAATGGTAAGGGTCTGATGATTGTATTCTGAGATTAAAGAATAGCCCTGTACATGTCTTAAGTCACGTACATTATCCTATATATACTGTGGCCTAATAAAGGAAGGCATCAGACATATTGGTCTGATCCTCTCAACCCCATCTTTTGTCTCTCTCTTATTTTTCTTAGCGGGGACGCTCCGTTCTCTCCCTTTGCAGGTGCGACTCTTGCTTGTGCTGGCCGCGGCAGGTGGCGCCCAACGTGGGGCTCGAGATCGACAGTTTTCTTCGCCACTGCTCATATTAAGCTGAAAAGAGTGAGTATATAAGTATACAAGTGATTTAAATTAATGAGGAGCAGTAAGGTATATAGTTGAGAGTATAAATATGGGACAGACACATAGTCGTCAATTGTTTGCACATATGTTATCTGTAATGTTAAAACACCGGGGGATTACTATTTCCAAACCTAAATTAATCAATTTTCTTTCATTTATTGAGGAAGTTTGCCCTTGGTTCCCCAGAGAAGGCACAGTAAGTTTAGAGACATGGAAAAAGGTAGGGGAACAAATTCGGACTCACTATACTTTACATGGCCCTGAAAAGGTTCCTGTAGAAACTTTATCCTTTTGGACACTAGTTCGTGATTGCCTGGACTTTGATAATGATGAATTAAAACGTTTAGGAAATGTATTAAAACAGGAAGAAAATCCTCTTCATGTTCCTGATTCGGAGTCCAGGTATGCTGTTCCCGAGGGAATTGAAGGTGACTTTCCGTTTTGTAACTTATCGCGTCCTTCCGATAGTGATGACTCACTTTCATCCACAGATGAGGCGGAATTAGACGAAGAGGCTGCTAAATACCATCAAGAAGATTGGGGTTTTTTGGCACAAGAAAAGGGGGCGTCAACATCTAAAGATGATTTGGTTGAATGTTTAAAAAATCTCACTGTTGCTTTGCAGAACTCAGGAATTAAGTTTCCTAGTAACAATTTAAAATCCCCTTCTGCTCCGCCTCTTCCTCCTGCCTATGCTCCTTCCGTTGTTGCTGGTCTCGATCCCCCTCCGGGGCCTCCTCCTCCTCCATCTGAAATTGTGTCTCCGCTGCAAAAGGCATTGAGACAAGCACAACGACTTGGTGAGGTTGTCTCCGATTTTTCTCTTGCTTTTCCTGTCTTTGAAAATAACAACCAGCGTTTCTATGAAGCGCTGCCTTTCAAACAATTGAAAGAGTTAAAGATTGCTTGCTCACAATACGGTCCTACCGCTCCATTCACTATTGCTATGATGGAAAATTTGGGTACTCAAAATCTACCCCCAGATGATTGGAAACAAATAGCTAGAGCTTGTCTTTTGGGGGGAGATTATTTATTATGGAAATCTGAATATTTTGAACAGTGTGCTCATATAGCCGATGTTAATCGGCAGCAAGGTATACAAACCTCCTATGAAATGTTAATTGGTGAAGGCGCTTTCCAGGCTACTAATACTCAACTTAATTTCTTACCTGGTGCATATCCACAAATCTCAAACGCAGCCCGACAGGCATGGAAAAAACTTCCTAGCTCCAGTACTAAGACAGAAGATCTTTCAAAAGTCTAACAGGGACCTGATGAGCCTTATCAGGACTTCGTGGCACGACTCTTAGATACTATAGGTAAGATAATGTCAGATGAAAAGGCTGGGACGGTATTAGCAAAACAATTGGCTTTTGAAAACGCTAACTCTGCCTGTCAAGCTGCTTTACGATCTTATAGAAAGAAGGGAGATCTGTGTGATTTTATTCGCATTTGTGCTGACATTGGACCCTCCTACATGCAAGGCATTGCCATGGCAGTAGCATTACAAGGAAAAAGCATTAAAGAGGTACTTTTTCAGCAGCAAGCCAGGAACAAGAAAGGATATCGAAAGTCAGGTAATTCGGGTTGTTTTGTTTGTGGTCAACCTGGTCATCGGGCTGTAATGTGCCCCAAAAAACAACAACAACAAATTCCTGCTAATCCTCCTAATTTATGCCCACGATGTAAAACGGGAAAGCATTGGGCCCGAGATTGTCGTTCTAAAACGGATGTTCAAGGTAATCCTTTACCCCCAGTTTTGGGAAACTGGGTGAGGGGCCAGCCCCTGGCCCCGAAACAATGTTATGGGGCAACACTGCAGGTTCCCAAAGAACCATTGCAGACCTCTATCGAGCCACAAGAGGCAGCGCGGGATTGGACCTCTGTGCCACCTCCTATACAGTATTAACTCCGGAGATGGGGGTTCAAACCCTTGCTACAGGAGTGTTTGGGCCTTTGCCTCCAGGAACTGCTGGACTGCTTTTGGGGCGCAGCAGTGCGTCTTTAAAAGGAATACTTATTCATCCTGGTGTGATTGACTCTGATTATACAGGAGAGATAAAAATATTAGCCTCTGCTCCTAACAAAATTATTGTAATCAATGCAGGACAACGTATAGCTCAGCTCCTTTTAGTTCCATTAGTTATACAAGGAAGAACAATTAACCGAGACCGTCAGGACAAAGGTTTCGGGTCCTCTGACGCCTATTGGGTGCAAAATGTTACCGAGGCACGACCAGAATTTGAACTGCACATCAATGGTAAGCTTTTCCGCAGAGTGCTTGATACAGGGGCTGATATTAGTGTTATTTCTGAAAAACACTGGCCTATTACATGGCCCAAACAAATAGTCATTTCCACTCTTCAAGGTATTGGCCAAACTACTAATCCAGAACAAAGTTCGTCCCTTCTTACTTGGAAGGATAAAGACGGCCATTCAGGCCAATTTAAACCTTATATTCTGCCCCATCTTCCAGTTAATCTGTGGGGGCGTGATATATTAAGCAAAATGGGTGTATATTTATATTGTCCTTCACCCACCGTAACAGATTTGATGTTAGATCAGGGTTTACTCCCTAACCAAGGTTTAGGTAAACAACATCAAGGCATCATTTTACCCCTTGATTTAAAATCTAATCAAAGTCGAAAGGGCTTGGGGTGTTTTCCCTAGGGACCTCTGATTCTCCTGTGACACATGCCGATCCTATTGATTGGAAATCTGAGGAACCGGTATGGGTCGATCAGTGGCCCCTAACACAAGAAAAACTTTCTGCCGCACAACAGCTGGTGCAGGAACAGCTGAGACTTGGGCATATTGAACCTTCTACCTCTGCGTGGAATTCCCCAATTTTTGTTATTAAAAAGAAATCGGGAAAATGGAGATAACTACAAGACCTTCGTAAGGTAAATGAAACAATGATGCATATGGGAGCCCTACAACCTGGGTTACCCACTCCTTCCGCTATACCTGATAAATCCTTTATCATTGTTATAGATTTAAAAGATTGTTTTTACACTATTCCTCTTGCACCCCAAGATTGTAAAAGATTTGCCTTTAGTTTGCCCTCTGTCAATTTTAAAGAGCCTATGCAACGCTATCAATGGAGAGTCCTTCCACAAGGAATGGCTAATAGCCCTACATTGTGTCAAAAATTTGTTGCCACAGCGTTAGCTCCCGTTCGTCAGCATTTTCCTCAGTTATATTTAGTTCATTATATGGATGATATATTACTAGCCCATGCTGACGAACACCTGTTGTATCAGGCTTTTTCTATTCTAAAACAACACTTGAGTCTTAATGGTCTTGTCATAGCTGATGAAAAAATTCAAACTCACTTTCCCTATAATTATGTGGGCTTCTCCTTATATCCTCGGGCTTATAGTACTCAATTAGTCAAGTTACAGACTGATCATTTAAAAACTCTAAACGATTTTCAAAAGCTCCTGGGAGATATTAATTGGATACGCCCTTATTTAAAATTACCCACTTACACCTTGCAACCATTATTTGACATCCTTAAAGGTGACTCTGACCCTGCGTCACCCCGAACACTTTCTTTAGAAGCACGATCAGCCTTACAATCAATAGAAGAAGCTATTAGACAACAACAGATTACTTATCTTGATTACCAACGATCATGGGGTCTGTATATACTTTCCACCCCTCGAGCACCCACAGGGGTTCTTTATCAAGATAAGCCTTTGCGATGGATATATCTATCGGCTACTCCAACTAAACATTTGCTTCCTTATTATGAGCTTGTTGCAAAAGCTGTAGCAAAAGGACGTCATGAAGCCATCCAATATTTTGGTATGGAACCCCCTTTCGTTTGTATTCCTTATGCTTTGGAACAACAAGATTGGCTTTTTCAATTTTCAGATAATTGGCCTATAGCTTTCGCAAATTACCCGGGACGGATTACTCATCATTATCCTTCTGATAAATTGCTACAATTTGCTAGCCTTCATGCCTTTATTTTTCCAAAAATAGTTCGCCGACAACCCATTCCTGAAGCAACACTTATATTTACAGATGGATCTTCTAATGGTACTGCAGCTTTAATTATTAACCATCAAATCTATTATGCACATACCAGTTTCTCTTCTGCCCAGGTTGTGGAATTATTTGCAGTCCACCAAGCATTACTAACTGTACCCACTTCTTTCAATTTATTTACAGACAGCTCCTATGTGGTCGGTGCTTTACAAATGATTGAAACTGTTCCAATTATTGGCACAACCTCTCCTGACGTTCTTAACTTATTTACATTAATTCAACAGGCCCTTCACCGTCGTCAATACCCGTGTTTTTTTGGACATATTCGTGCACATTCCACCCTTCCTGGTGCCCTGGTACAAGGCAATCACATTGCGGACGTTCTTACTAAACAGGTGTTTTTTCAATCAGCTATCGATGCAGCCCAAAAATCTCATAACTTACATCACCAAAATAGTCATTCTTTACGGTTACAATTTAAGATTTCCC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| 33,078
|
MN161849.1
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Mishra,S., Kumar,P., Dar,J.A., Kumar,K., Singh,V.
|
Indian Veterinary Research Institute, Division of Pathology
|
India
|
2020-02-23
| null |
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 7,460
|
GenBank
| null |
India
|
India
|
Ovis aries
|
lung
|
2017-02-26
| null | null |
Jaagsiekte sheep retrovirus strain DL37, complete genome
|
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| 53,809
|
KX817296.1
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Fan,W.W., Wang,Z.Z., Sun,C., Bai,J.
|
Northeast Agricultural University, Animal Medicine
|
China
|
2017-03-26
|
HH13
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 6,943
|
GenBank
| null |
China: heilongjiang
|
China
|
Ovis aries
| null |
2013-08-03
| null | null |
UNVERIFIED: Jaagsiekte sheep retrovirus isolate HH13, complete genome
|
ATGGGACAAACGCATAGTCGTCAATTGTTTGTACATATGTTATCTGTAATGTTAAAACAAGGGGGAATTACTGTTTCCAAACCTAAATTAATCAATTTTCTTTCATTTATTGAGGAAGTTTGCCCTTGGTTCCCCAGAGAAGGCACAGTAAATTTAGAGACATGGAAGAAGGTAGGGGAACAAATTCGGACTCATTATACTCTACATGGCCCTGAAAAAGTCCCTGTTGAAACTTTATCCTTTTGGACACTAATTCGTGATTGCCTGGATTTTGATAATGATGAATTAAAACGTTTAGGAAATTTATTAAAACAGGAAGAAAATCCTCTCCATGTTCCTGATTTGGAACCCAGGTATGCTGTTCCCGAGGGAGTTGAAGGCGACCCTCCGTTTTTTAAATTATCGCGTCCTTCGGATAATGATGATTCACTTTCATCCACAGATGAGGCGGAGTTAGACGAAGAAGCTGCTAAATACCATCAAGAGGATTGGGGTTTTTTGGCACAAGAAAAGGGGGCGTCAACATCTAAAGATGATTTGGTTGAATGTTTAAAAAACCTCACTGTTGCTTTACAGAACTCAGGAATTAAGCTTCCTAGTAACAATTCTAAACCTTCTGCTCCGCCTCTTCCCCCTGCCTATGCTCCTTCCGTTGTGGCTGGTCTCGATCCCCCTCCGGGGCCTCCTCCTCCATCTGAGATTGTGTCTCCACTGCAGAAGGCATTGAGACAAGCACAACGACTTGGTGAGTTTGTCTCCGATTTTTCTCTTGCTTTTCCTGTCTTTGAAAATAACAACCAGCGTTTTTATGAAGCGCTGCCTTTCAAACAACTAAAAGAGTTAAAGATTGCTTGCTCACAATACGGTCCTACCGCTCCATTCACTATTGCTATGATAGAAAATTTGGGTACTCAAGCTTTACCTCCAAATGATTGGAAGCAGACAGCTAGGGCATGTCTCTCAGGGGGAGATTATTTATTATGGAAATCTGAATTTTTTGAACAATGTGCTCATATAGCTGATGTTAACCGACAGCAAGGTATACAGACCTCCTATGAAATGTTGATTGGTGAAGGCCCTTACCAGGCTACTGATACTCAACTTAATTTCTTACCTGGTGTATATGCACAAATATCAAATGCGGCTCGGCAGGCATGGAAAAAACTTCCTAGCTCCAGTACTAAGACAGAGGATCTTTCAAAAGTCCGGCAGGGACCTGATAAGCCTTACCAAGACTTCGTGGCACGGCTCTTAGATACTATAGGTAAGATAATGTCAGATGAACAGGCTGGGATGTTATTGGCAAAACAATTGGCTTTTGAAAATGTTAACTCTGCTTGTCAAGCTGCTTTAAGGCCTTATCGAAAAAAGGGAGATTTGTCTGATTTTATTCGCATTTGTGCTGACATTGGACCCTCCTACATGCAAGGCATTGCTATGGCAGCAGCATTACAAGGAAAAAGCATAAAAGAGGTACTTTTTCAGCAGCAAGCCCGGAACAAGAAAGGACTTCAAAAGTCAGGTAATTCAGGTTGCTTTGTTTGTGGTCAACCTGGCCATCGAGCTGCAGTGTGCCCCCCAAAACAACAAAGCCCTGTTAACACTCCTAATTTATGCCCACGATGTAAAAAGGGGAAGCATTGGGCCCGGGATTGTCGTTCAAAAACGGATGTTCAAGGTAATCCTTTACCCCCGGTTTCGGGAAACTGGGTGAGGGGCCAGCCCCTGGCTCCGAAACAATGTTATGGGGCAACACTGCAGGTTCCCAAAGAACCATTGCAGACCTCTGTCGAGCCGCGAAAGGCAGTGCAGGATTGGACCTCTGTGCCACCTCCTACACAGTATTAACCCCCGAGATGGGGGTTCAAACCCTTGCCACAGGAGTGTTTGGGCCTTTACCTCCAGGGACAGCTGGACTGCTTTTGGGGCGCAGCAGTGCATCTTTAAAGGGAATACTTATTCATCCTGGTGTGATTGACTCTGATTATACAGGAGAGATAAAAATACTAGCCTCCGCTCCTAACAAAATTATTGTAATCAATGCAGGACAGCGTATAGCTCAACTCCTTTTAGTTCCGTTAGTTATACAGGGAAAAACAATCAATAGAGACCGTCAAGATAAAGGTTTCGGGTCCTCTGACGCCTATTGGGTGCAAAATGTTACCGAGGCACGACCAGAACTTGAGCTACGCATTAATGGTAAGCTTTTCCGCGGAGTGCTTGATACAGGGGCTGATACTAGCGTTATCTCTGATAAATACTGGCCTACTACATGGCCTAAACAGATGGCTATTTCCACTCTTCAGGGTATTGGCCAAACTACCAACCCAGAACAAAGTTTGTCCCTTCTTACTTGGAGGGATAAAGATGGCCATACAGGCCAATTTAAACCTTATATTCTGCCCCATCTTCCAGTTAATCTATGGGGGCGTGATATATTAAGCAAAATGGGTGTTTATTTATATAGTCCTTCACCCACTGTAACAGATTTGATGTTAGATCAGGGCTTACTTCCAAATCAAGGTTTAGGTAAACAACATCAAGGCATCATTTTGCCCCTTGATTTAAAACCTAATCAAAACCGAAAAGGCTTGGGGTGTTTTCCCTAGGGGGACCTCTGATTCTCCCGTGACACATGCCGATCCTATTGATTGGAAATCTGAGGAACCGGTATGGGTCGATCAGTGGCCCCTAACACAGGAAAAACTTTCTGCTGCACAACAGCTGGTGCAGGAACAGCTGAGACTTGGGCATATTGAACCCTCTACCTCTGCTTGGAATTCCCCAATTTTTGTTATTAAAAAGAAGTCTGGGAAATGGAGATTGCTACAAGACCTTCGTAAGGTAAATGAAACAATGACGCATATGGGAGCCCTACAACCTGGGTTGCCCACTCCTTCTGCTATACCTGATAAATCCTATATCATTATTATAGATTTAAAAGATTGTTTTTACACTATTCCTCTTGCACCTCAAGATTGTAAAAGATTTGCTTTCAGTTTACCCTCTGTTGATTTTAAAGAGCCTATGCAACGCTATCAATGGAGAGTTCTCCCGCAAGGAATGACTAATAGCCCTACGCTGTGCCAAAAATTTGTTGCTACAGCAATAGCTCCCGTTCGTCAACGTTTTCCTCAGCTATATTTGGTTCATTATATGGATGATATATTACTAGCTCATGCTGACGAACATCTATTGCATCAAGCTTTTTCGATTCTAAAACAACATTTAAGCCTTAATGGTCTTGTTATTGCTGATGAAAAAATTCAGACTCATTTTCCTTATAATTATTTGGGTTTCTCCTTATATCCTCGCGTTTATAATACCCAATTAGTAAAATTACAGACTGATCATTTAAAAACTCTAAATGACTTTCAAAAACTTCTAGGAGACATTAATTGGATACGTCCTTATTTAAAATTACCCACTTATACCTTACAGCCTTTATTTGACGTCCTTAAAGGTGACTCTGACCCTGCGTCACCCCGAACACTTTCTTTAGAAGGACAATCAGTCTTACAATCAATAGAAGAAGCTATTAGACAACAACAGATTACTTATTGTGATTACCAACGATCATGGGGTTTGTATATACTTCCTACCCCCCGAGCACCCACAGGGGTTCTCTATCAAGATAAACCTTTGAGATGGATATATCTATCTGCTACTCCAACTAAACATCTGCTCCCTTACTATGAGCTTGTTGCAAAAACTGTAGCAAAGGGACGTCATGAGGCCATCCAGTATTTTGGTATGGAACCCCCTTTCATTTGTGTTCCTTATGCTTTAGAACAACAAGATTGGCTTTTTCAATTTTCAGATAATTGGTCCATAGCTTTCGCAAATTACCCGGGGATTACTCATCATTATCCTTCTGATAAATTGTTACAATTTGCTAGCTCTCATGCCTTTATTTTTCCAAAAATAGTTCGCCGACAACCTATTCCCGAAGCAACACTTATATTTACAGATGGATCTTCTAATGGAACTGCAGCTTTAATTATTAACCATCAAACCTACTATGCACATACCAATTTCTCTTCTGCTCAGGTCGTGGAATTATTTGCAGTCCATCAAGCATTGCTGACTGTATCCACTTCCTTCAATTTATTTACAGACAGCTCCTATGTAGTCAGTGCCTTACAGATGCTTGAAACTGTTCCAATTATCGGCACAACTTCTCCTGAAGTTCTTAACTTATTTACATTGATTCAACAGGTTCTTCACCGTCGCCAACACCCGTGTTTCTTTGGGCATATTCGTGCACATTCCACCCTTCCTGGTGCCCTCGTACAAGGCAATCACACTGCGGACGTTCTTACTAAAAAAGTGTTTTTTCAATCAGCTATCGATGCAGCCCGAAAATCCCATGACTTACATCACCAAAATAGTCATTCTTTACGGTTGCAATTTAAGATTTCCCGTGAAGCTGCACGACAAATTGTTAAATCTTGCTCTACTTGTCCTCAATTCTTTGTTCTCCCTCAATATGGTGTCAACCCTCGAGGTTTACGCCCTAATCACCTTTGGCAAACAGATGTTACTCACATTCCTCAATTTGGGCGTCTTAAATATGTTCATGTCTCTATTGACACTTTTTCCAATTTTCTCATGGCCTCCCTTCACACTGGAGAATCGACACGTCACTGTATTCAACATTTGCTGTTTTGCTTTTCTATTTCAGGAATCCCACAAACCCTTAAAACAGATAATGGACCTGGTTATACTAGCCGTTCTTTTCAACGTTTTTGTCTTTCTTTCCAAATTCATCATAAAACAGGAATTCCATACAATCCGCAGGGACAGGGTATTGTAGAACGAGCCCATCAACGCCTTAAACATCAATTATTAAAACAAAAAAAGGGGAATGAACTGTATAGCCCCTCACCGCATAACGCCTTAAATCATGCTCTCTATGTTTTAAATTTTTTAACTTTAGACGCAGAAGGCAATTCAGCAGCCCAGCGTTTTTGGGGAGAACGATCCTCATGCAAAAAACC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| 77,594
|
KP691837.1
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Yang,S., Sheng,J., Yang,X., Liang,T.
|
Shihezi University, Animal Science and Technology
|
China
|
2015-05-04
|
sheep/C1/China/2013/G1
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 7,456
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Ovis aries
|
lung
|
2013-11-04
| null | null |
Jaagsiekte sheep retrovirus isolate sheep/C1/China/2013/G1, complete genome
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DQ838494.1
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Jaagsiekte sheep retrovirus
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Liu,S.Y., Wang,Y., Li,J.Y.
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Inner Mongolia Agricultural University, Animal Science and Medicine
| null |
2006-09-12
| null |
Jaagsiekte sheep retrovirus
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Betaretrovirus
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Retroviridae
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ssRNA-RT
| 7,430
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GenBank
| null | null | null |
Ovis aries
| null | null | null | null |
Jaagsiekte sheep retrovirus, complete genome
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| 107,988
|
AF105220.1
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Palmarini,M., Sharp,J.M., de las Heras,M., Fan,H.
|
University of California Irvine, Cancer Research Institute
|
USA
|
1999-07-22
| null |
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 7,455
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Ovine pulmonary adenocarcinoma virus, complete genome
|
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| 111,498
|
M80216.1
|
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
York,D.F., Vigne,R., Verwoerd,D.W., Querat,G.
| null | null |
1993-08-02
| null |
Jaagsiekte sheep retrovirus
|
Betaretrovirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 7,462
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Jaagsiekte sheep retrovirus, complete genome
|
GCAAGGTATCAGCCGTTCTGGTCTGATCCTCTCAACCCCATCTTTTGTCTTTCTCAGTTTCTTAGCGGGGACCGTCCGTTCTCTCCCTGTGCAGGTGCGACTCTTGTTTGTGCTGGTCGCGGCAGGTGGCGCCCAACGTGGGGCTCGAGCTCGACAGTTTTCTTCCGCCACTACTCTCATTAATTGAACTAAGTAAGTATATGGATAAACAAGTAGCCTAAATTAAGGAGGAGTAGTAAGGTATATAGTTGAGAGTATAAATATGGGACACACGCATAGTCGTCAGTTGTTTGTGCATATGTTATCTGTAATGTTAAAACATAGGGGGATCACTGTTTCTAAAACTAAATTAATTAATTTTCTTTCATTTATTGAGGAAGTTTGCCCTTGGTTTCCTAGGGAAGGCACAGTGAATTTGGAGACATGGAAGAAGGTGGGAGAGCAAATTCGGACGCATTATACCTTACACGGCCCTGAAAAGGTCCCTGTCGAGACATTATCTTTTTGGACATTGATTCGTGACTGCCTGGATTTTGATAATGATGAATTGAAACGTTTAGGAAATTTGTTAAAACAGGAAGAAGATCCTCTCCATACCCCTGATTCGGTACCTAGTTATGATCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCATCTCTGAAAATGCACCCTTCTGATAATGATGATTCACTTTCATCTACAGATGAGGCAGAATTAGACGAGGAAGCTGCTAAGTATCATCAAGAAGATTGGGGTTTTTTAGCACAAGAAAAAGGGGCATTAACATCTAAAGATGAATTGGTTGAGTGCTTTAAAAATCTTACTATTGCCTTACAGAATGCAGGGATTCAGCTTCCTAGTAATAACAATACCTTTCCCTCTGCTCCGCCTTTTCCTCCTGCTTATACTCCCACTGTTATGGCTGGCCTTGATCCCCCTCCCGGGTTTCCTCCGCCGTCTAAACATATGTCTCCATTGCAAAAGGCATTAAGACAGGCACAACGACTCGGTGAAGTTGTTTCTGATTTCTCTCTTGCCTTTCCTGTCTTCGAAAATAACAACCAGCGTTACTATGAATCACTGCCGTTTAAACAACTAAAAGAGTTAAAGATTGCTTGTTCGCAATATGGTCCTACCGCTCCATTTACTATTGCTATGATAGAAAGTTTGGGTACTCAAGCTTTGCCCCCGAATGACTGGAAACAGACCGCTAGGGCATGTCTCTCAGGGGGAGATTATTTATTATGGAAATCTGAATTTTTTGAACAATGTGCTCGTATAGCTGATGTTAACCGACAGCAAGGTATACAGACCTCCTATGAAATGTTGATTGGCGAAGGCCCTTATCAGGCTACTGATACGCAGCTTAATTTCTTACCTGGTGCATATGCACAAATATCGAATGCGGCTCGACAGGCATGGAAAAAACTTCCTAGCTCCAGTACTAAGACAGAGGACCTTTCAAAGGTCCGGCAGGGACCTGATGAGCCTTACCAGGACTTCGTGGCACGACTTTTAGATACTATAGGTAAGATAATGTCAGATGAAAAGGCTGGGATGGTGCTGGCAAAACAATTAGCTTTTGAAAACGCTAACTCTGCTTGTCAAGCTGCTTTGAGACCTTATCGAAAAAAGGGAGATCTATCTGATTTTATTCGCATTTGTGCTGATATTGGACCCTCCTACATGCAAGGCATTGCTATGGCAGCAGCATTACAAGGAAAAAGCATAAAAGAAGTACTTTTCCAGCAGCAAGCCCGGAACAAGAAAGGACTTCAAAAGTCAGGTAATTCGGGTTGCTTTGTTTGTGGTCAGCCTGGCCATCGGGCTGCAGTATGCCCTCAAAAACATCAAACCTCTGTTAATACCCCTAATTTGTGCCCACGCTGTAAAAAAGGAAAGCATTGGGCACGAGACTGCCGTTCCAAGACAGATGTTCAAGGCAATCCTTTGCCCCCGGTTTCGGGAAACTGGGTGAGGGGCCAGCCCCTGGCCCCGAAACAATGTTATGGGGCAACACTGCAGGTTCCAAAAGAACCATTGCAGACCTCTGTCGAGCCACAAGAGGCAGCGCGGGATTGGACCTCTGTGCCACCTCCTATACAGTATTAACCCCTGAGATGGGAGTTCAAACTCTTGCCACAGGAGTGTTTGGGCCTTTACCTCCAGGGACAGTTGGATTACTTCTGGGACGCAGCAGTGCGTCTTTAAAGGGAATACTTATTCACCCTGGTGTTATTGACTCCGATTATACAGGAGAGATAAAAATATTAGCCTCCGCTCCTAACAAAATTATTGTAATTAATGCGGGACAGCGAATAGCTCAACTTCTTTTAGTTCCATTAGTCATACAGGGAAAAACAATTAACAGAGACCGTCAAGATAAAGGTTTCGGATCCTCTGACGCCTATTGGGTGCAAAATGTTACTGAGGCACGGCCAGAACTCGAGCTACGCATTAATGCAAACTTTTTCCGCGGGGTACTAGATACAGGGGCCGATATTAGTGTCATTTCTGATAAATATTGGCCTACCACATGGCCAAAACAGATGGCTATTTCCACTCTCCAGGGTATTGGCCAAACTACCAATCCAGAACAGAGTTCATCCCTTCTTACTTGGAAGGATAAAGATGGACATACAGGCCAATTTAAACCTTATATTCTGCCCTATCTTCCAGTTAATCTATGGGGGCGTGATATATTAAGCAAAATGGGTGTTTATTTATATAGTCCTTCACCCACTGTGACAGATTTGATGTTAGATCAGGGCTTACTTCCAAATCAAGGTTTAGGTAAACAACATCAAGGCATCATTTTGCCCCTTGATTTAAAACCTAATCAAGATCGAAAAGGCTTGGGGTGTTTTCCCTAGGGACCTCTGATTCTCCTGTGACGCATGCCGATCCTATCGATTGGAAATCTGAGGAACCGGTATGGGTCGATCAGTGGCCCCTAACACAAGAAAAACTTTCTGCCGCACAACAGCTGGTGCAGGAACAGCTGAGACTTGGTCATATTGAACCTTCTACTTCTGCTTGGAATTCTCCAATTTTTGTTATAAAAAAGAAGTCTGGTAAATGGAGGTTGTTACAAGATCTCCGTAAGGTAAATGAGACGATGATGCATATGGGAGCCTTACAACCTGGGTTGCCCACTCCTTCTGCTATACCTGATAAATCCTATATTATTGTTATAGATTTAAAAGATTGTTTTTACACTATTCCTCTTGCACCTCAAGATTGCAAAAGATTCGCTTTCAGTTTACCCTCTGTTAATTTTAAAGAGCCTATGCAACGCTATCAATGGAGAGTTCTCCCGCAAGGAATGACTAATAGCCCTACGCTGTGCCAAAAATTTGTTGCTACAGCAATAGCTCCGGTTCGTCAACGTTTTCCGCAGCTATATTTAGTTCATTATATGGATGATATATTACTAGCTCATACTGACGAACATCTATTGTATCAAGCTTTTTCGATTCTAAAACAACATTTAAGCCTTAATGGTCTTGTTATTGCTGATGAAAAAATTCAGACTCATTTTCCTTATAATTATTTGGGTTTCTCCTTATATCCTCGTGTTTATAATACCCAATTGGTAAAATTGCAGACTGACCATTTAAAAACTCTAAATGACTTTCAAAAACTTTTAGGAGACATTAATTGGATACGTCCTTATTTAAAATTACCCACTTATACCTTGCAGCCATTATTTGACATCCTTAAAGGTGACTCTGATCCTGCGTCACCCCGAACGCTTTCTTTAGAAGGACGAACTGCTTTACAATCAATAGAAGAAGCTATTAGACAACAACAGATTACTTATTGTGATTACCAACGATCATGGGGTTTGTATATACTTCCTACCCCCCGAGCACCCACAGGGGTTCTCTATCAAGATAAACCTTTGCGATGGATATATTTGTCTGCTACTCCAACTAAACATCTGCTCCCTTACTATGAACTTGTTGCAAAAATTATAGCAAAGGGACGTCACGAGGCCATCCAATATTTTGGTATGGAACCCCCCTTCATTTGTGTTCCTTATGCTTTAGAACAACAAGATTGGCTTTTTCAATTTTCAGATAATTGGTCTATAGCTTTTGCAAATTACCCCGGACAGATTACTCATCATTACCCTTCTGATAAATTGTTACAATTTGCTAGCTCTCATGCCTTTATTTTTCCAAAAATAGTTCGCCGACAACCTATTCCCGAAGCGACACTTATATTTACAGATGGATCTTCTAATGGAACTGCAGCTTTAATCATTAACCATCAAACCTATTACGCACAAACCAGTTTTTCTTCTGCTCAAGTTGTCGAATTATTTGCAGTCCACCAAGCGTTGCTAACTGTACCTACTTCCTTCAATTTATTTACAGACAGCTCCTATGTGGTCGGTGCCTTACAGATGATTGAAACTGTTCCAATTATCGGCACCACCTCTCCTGAAGTTCTTAACTTATTTACATTGATTCAACAGGTTCTCCATTGCCGCCAACACCCCTGTTTCTTTGGACATATTCGTGCACACTCCACCCTTCCTGGTGCCCTCGTACAAGGCAATCACACTGCGGACGTTCTTACTAAACAAGTGTTTTTCCAATCAGCTATTGATGCAGCCCGAAAATCCCATGATTTACATCACCAAAATAGTCATTCTTTACGCTTGCAATTTAAAATTTCCCGTGAAGCTGCACGGCAAATTGTTAAATCTTGCTCTACTTGTCCTCAATTCTTTGTTCTCCCTCAATATGGTGTCAACCCTCGAGGTTTACGCCCTAATCACCTCTGGCAAACAGATGTTACTCACATTCCTCAATTTGGGCGTCTTAAATATGTTCATGTTTCTATTGACACTTTTTCCAATTTTCTCATGGCTTCCCTTCACACTGGAGAATCAACACGTCACTGTATTCAACATTTGCTGTTTTGCTTTTCTACTTCAGGAATCCCACAAACCCTTAAAACAGATAATGGACCTGGTTATACTAGCCGTTCTTTTCAACGT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| 112,075
|
NC_043559.1
|
Jamestown Canyon virus
|
Bennett,R.S., Nelson,J.T., Gresko,A.K., Murphy,B.R., Whitehead,S.S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-06-28
| null |
Orthobunyavirus jamestownense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,960
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
|
Culiseta inornata
| null |
1961
| null |
PRJNA485481
|
Jamestown Canyon virus strain 61V2235 L protein gene, complete cds
|
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| 3,450
|
MN135991.1
|
Jamestown Canyon virus
|
Kinsella,C.M., Paras,M.L., Smole,S., Mehta,S., Ganesh,V., Chen,L.H., McQuillen,D.P., Shah,R., Chan,J., Osborne,M., Hennigan,S., Halpern-Smith,F., Brown,C.M., Sabeti,P., Piantadosi,A.
|
Amsterdam UMC, location AMC, Medical Microbiology
|
Netherlands
|
2019-09-02
|
16/MA/01
|
Orthobunyavirus jamestownense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,856
|
GenBank
| 1
|
USA: Bristol County, Massachusetts
|
USA
|
Ochlerotatus canadensis
| null |
2016-06
| null | null |
Jamestown Canyon virus isolate 16/MA/01 segment L, complete sequence
|
TAGTTATGGATAACGCAGAATATCAACAATTCCTTGCTCGTATCAATACTGCTAAGGATGCATGTGTAGCGAAGGATATCGATGTGGACTTGCTGATGGCAAGGCATGATTACTTTGGAAAAGAATTGTGCAAGTCATTAAACATAGAATACAGAAATGATGTCCCATTTGTAGATATACTACTAGACATAAGGCCTGATATAGATCCTTTAACATTAGAAATCCCCCACATAACTCCAGATAATTACTTATACTTAAATAATATCCTATATATCATAGATTATAAAGTTTCCGTATCCAATGAAAGTAGTATTATAACTAATACAAAATACTTTGAAATGACAAGAGATATAGCATCTATATTAAATTTGCATATAGAAATAGTCATAATTAGAATAGATCCTATTAGTCGTGATTTATATATTAGCTCAGATAGGTTCAAAGATTTATTTCCTACATTAGTAGTTGATATCAATTTTAACCAATTCTTTGATTTAAAACAAGCATTGTATGAAAAGTTTGGTGATGATGAAGAATTCTTACTTAAAGTCGCACATGGCGATTTCACATTAACAGCACCTTGGTGTAAGACAGGATGCCCACAGGTTTGGCAACATCCCATATACAAAGAATTCAAACTTAGCATGCCTATTCCAGAAAGAAGACTCTTTGAGGAGTCAATGAAATTCAACTCATATGAATCAGAAAGATGGAATACTAACCTTATTAAAATCCGAGAATACACAAAGAAAGAATACAATGACTTTGTAACAAAATCGGCAAAGGAGGTCTTTTTAGCCACTGGAGATTACAAACAGCCCAATAAAAATGAAATCCTAGAAGGCTGGGAGATGATGGTTGAAAGAGTGCATCAACAGAGGGAAGTTAGTAAATCCATTCATGATCAAAAACCTAGTATCCATTTTATATGGTCTGCGCATAATCCGAACAATAGTAATAATGCTACTTTTAAACTGATCTTATTATCAAAGTCACTCCAATCCATTAAAGGTAATTCAACTTATACGGATTCGTTTAGATCATTGGGGAAAATGATGGATATTGGTGATAAAATAACTGATTATGAATCACACTGTGATTACCTAAAGACGCAGGCAAGATTAAGCTGGCGACAAGTTATGAATAAGAAATTGGAACCAAAGAAGATAAATGACGCCTTGGTTCTTTGGGAGCAACAATTTATGGTAAATTCAGAGCTTATAAATAAGAATGACAAGCTTAAACTTTTTAGAGACTTCTGCGGAATAGGTAAACATAAGCAATTCAAAAATAAAATGCTAGAAGATATTGAACTATCAAAGCCTAAGATATTAGACTTCAATGATGAAAACATTTATTTAGCAAGCTTAACCATGGTTGAACAATGTAAAATCACATTATCTGAACAGAGCGGCTTAAAAAGCAACAATTTTATACTAGATGAGTTCGGGAAAAAAATAGGGGATTGCAACAAGAACACACTAGATATCATGACCTCTATTTTTGAGACCAAATTCTGGCAATGTATCTCTGACTTCTCAACACTAATGAAAAATATTTTATCTGTCTCACAGTACAATAGGCATAACACATTTAGAATAGCAATGTGTGCCAATAATAACTTGTTTGCATTAGTTTACCCTTCAGCTGATATAAAAACAAAAAAAGCAACTGTAGTCTATAGCATAATTGCCCTTCACAAGAATGAAACTGATATATTCAATCCTGGGTGCTTACATGGAACTTTCAAATGCAATAATGGTTATATTTCTATATCCCGGGCTATCAGACTAGATAAAGAACGCTGCCAGAGAATAGTATCTTCTCCTGGCCTTTTTCTGACAACATGCCTGTTATTTAAACATGAGAATCCAACTATTAGATTAGATGATATTATGACATTTTCTCTATTCACTAGTTTATCTATAACCAAGAGTGTGTTATCTCTAACTGAGCCTGCACGTTACATGATAATGAATTCTTTAGCTATTTCAAGCAATGTTAAAGATTATATCGCTGAGAAGTTCTCACCTTACACAAAGACACTTTTTAGTGTTTATATGACTAGATTAATAAAGAATGCATGTTTTGAGGCATATAACCAACGGCAAAAAGTTCAACTTAGAGACATTTATTTATCAGATTATGATATAACTCAAAAAGGTATTAAGGACAATAGAGAATTAACAAGTATTTGGTTTCCTGGCTGTGTAACACTCAAAGAATATTTGACACAAATTTACCTACCATTTTATTTTAATGCTAAGGGTTTACATGAGAAACATCATGTTATGGTGGATTTGGCCAAAACAATTTTGGAAATAGAAAATGAGCAAAGAAACGAAATTACAAAAATCTGGTCAAAGGATCTGACCAAGCAAACAGTTAATTTACAAATCCTAATACATTCCTTATGCAAAAATTTACTTGCTGATACTTCCAGACATAATCACCTAAGGAATAGAATTGAAAATAGGAACAACTTTAGAAGATCAATAACAACAATATCAACGTTTACCAGTTCAAAATCTTGCATTAAAATTGGGAATTTCCACAAGGAGAAAGAAGTCCAGTATACAAAACAGAAGAGGAATATTGAGATTGAGAGTAGGAAAAGGAGATTGGCAAATCCTCTGTTTGTTTCAGATGAAGAAATAGGGTTAGAAGTAGGACACTGCAACTATAATATGTTAAGAGAGGCAATGCCAGAGTATAGAGATTACATCTCAACCAAAGTTTTTGATCGTCTATATGAAATGTTAGATACTAATCAAGTCTCTGAAAAGCCTACTATAGAGCTAATCATGGATATGATGGCAGAACATACAAATTTTTATTTCACATTTTTTAATAAAGGCCAAAAAACTTCCAAAGATAGAGAAATATTTGTAGGAGAATATGAAGCCAAAATGTGCATGTATGCTGTGGAAAGAATAGCCAAAGAGCGCTGCAAATTAAATCCAGATGAGATGATTTCAGAGCCTGGTGATGGGAAACTTAAAGTGCTGGAACAAAAATCTGAGCAAGAGATTCGTTTCCTAGTTGAAACTACTAGGCAAAAAAATAGGGAAATAGATGAGGCTATTGAAGCTTTAGCTGCAGAGAATTTTGAAGATAATATTTCAAAAATAGAGAAATTGGCTAAAGGGAAGTCAAGGGGTTTAAAAATGGAAATCAATGCAGATATGTCCAAATGGAGTGCTCAGGATGTCTTTTTTAAATATTTCTGGTTGATAGCATTGGATCCAATATTGTACCCTCAAGAGAAGGAAAGAATTATTTTCTTCTTTTGCAATTATATGCAAAAAAAACTGATCTTGCCAGACGATCTTATGTGTAATTTGCTAGATCAAAAAGCCACTTATAGAGATGATATCATATCTATAATGACTAATCAACTACAAACTAATTGTGTAGAAATTAAGCGTAATTGGTTGCAAGGTAACTTTAACTATACAAGTAGTTATGTTCATAGCTGTGCCATGTCTGTATATAAAGATGTTTTAAAGGAAGCCATGTCTTATCTTGATGGGTCAATTGTAGTTAATTCATTAGTGCATTCAGATGATAATCAAACTTCAGTAACAATAGTTCAAGATAAGGCCCCTGATGAGGTTTTAATAGAATTTAGTATTACACAATTCCAAAAAATATGTCTCGCATTTGGATGTCAAGCCAATATGAAAAAAACATACGTCACTAATTGCATAAAGGAGTTTGTTTCACTTTTCAATTTATATGGAGAACCTTTTTCAATTTATGGCAGATTCCTACTAACATCTGTAGGTGACTGTGCATATATTGGCCCATATGAAGATCTTGCAAGTAGAATTTCATCAGCTCAAACTGCCATAAAACATGGTTGTCCACCAAGTTTAGCATGGGTCTCTATAGCAATAAGCCACTGGATAACTGGGTTAACTTACAATATGTTACCTGGGCAAAGCAACGACCCTATGGATTATTTCCCTGCAGAGACTAGGAGAGATATACCAATAGAATTAAATGGTGTTTTAGATGCTCCATTGTCTATGATTAGCACAGTTGGTTTGGAAGCTGGAAACTTATGGTTCCTTATTAAAATGTTAAATAAGCACACACCAATAATGCAGAAGAGGGAATCAGTTGTGAATCAGATAGCTGAAATAAGAAATTGGGACCTAACTCGGATGGATGACAATGAAATATTCAAATTGAAAATATTAAGGTACTTGGTCTTGGATGCTGAAATGGATCCAAGTGATATCATGGGTGAGACAAGTGACATGAGGGGTAGATCCATACTAACACCTAGGAAGTTTACGACAAGTGGTAGCCTTAGGAAGCTATACTCATTCTCAAAATACCAAGACAGATTATCATCACCAGGAGGCATGAATGACTTGTTTCAATATCTTCTCGAAAAACCAGAGCTTCTTGTTACAAAGGGAGAAGATAAGAAAGATTATATGGAATCTGTAATCTTTAGATACAATTCAAAAAGATTCAAAGAAAGTCTTTCTATACAAAACCCTGCACAATTATTCATTGAGCAGATATTATTTTCTAATAAACCAATAATAGATTTTTCCGGTGTTAGAGATAAATATGTCAATCTTCATGATAGCAGGGCACTGGAAAAAGAACCTGATATCATTGGCAAAGTCACATTCCGGGAAGCCTATAGGATATTGATGAAGGATTTAAATAGCCTGCCTTTAACGAATGATGATATACAAGTTGTCTATTCATATATAATTTTAAATGACCCGCTAATGATAACAATTGCGAACACGCAAATCTTATCCATTTACGGTAGTCCCCAAAAAAGAACTGGAATGTCTTGCTCTACAATGCCAGAATTCCGGAATCTGAAGTTAATACACCATTCACCTGCATTGGTGCTCAGAGCATATAGTAAGAATACCCCAGATATACAAGGTGCAGACCCAACAGAGATGTCAAGGGATTTAGTGCATTTGAAAGAATTCATAGACAATACAAATTTAAAAATCAAAATG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| 59,976
|
MH900530.1
|
Jamestown Canyon virus
|
Hughes,H.R., Russell,B.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-borne Diseases
|
USA
|
2019-04-29
|
NM5-4BU
|
Orthobunyavirus jamestownense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,960
|
GenBank
| null |
USA: New Mexico
|
USA
|
Culiseta inornata
| null |
1977
| null | null |
Jamestown Canyon virus isolate NM5-4BU segment L, complete sequence
|
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| 63,017
|
MH370815.1
|
Jamestown Canyon virus
|
Hughes,H.R., Russell,B.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-borne Diseases
|
USA
|
2018-09-22
|
L36708
|
Orthobunyavirus jamestownense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,960
|
GenBank
| null |
USA: Simsbury, CT
|
USA
|
Ochlerotatus abserratus
| null |
1966
| null | null |
Jamestown Canyon virus isolate L36708 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATTTACAAAACTTACAAATACAGGTAACTACCTTGGAATAGTTATGGATAACGCAGAATATCAACAATTCCTTACTCGTATCAATACTGCTAAGGATGCATGTGTAGCGAAGGATATCGATGTGGACTTGCTGATGGCAAGGCATGATTACTTTGGAAAAGAATTGTGCAAGTCATTAAACATAGAATACAGAAATGATGTCCCATTTGTAGACATACTACTAGACATAAGGCCTGATATAGATCCTTTAACATTAGAAATCCCCCACATAACTCCAGATAATTACTTATACTTAAATAATATCCTATATATCATAGATTATAAAGTTTCCGTATCCAATGAAAGTAGTATTATAACTAATACAAAATACTTTGAAATGACAAGAGATATAGCATCTATATTAAATTTGCATATAGAAATAGTCATAATTAGAATAGATCCTATTAGCCGTGATTTATATATTAGCTCAGATAGGTTCAAAGATTTATTTCCTACATTAGTAGTTGATATCAATTTTAACCAATTCTTTGATTTAAAACAAGCATTGTATGAAAAGTTTGGTGATGATGAAGAATTCTTACTTAAAGTCGCACATGGCGATTTCACATTAACAGCACCTTGGTGTAAGACAGGATGCCCACAGGTTTGGCAACATCCCATATACAAAGAATTCAAACTTAGCATGCCTATTCCAGAAAGAAGACTCTTTGAGGAGTCAATGAAATTCAACTCATATGAATCAGAAAGATGGAATACTAACCTTATTAAAATCCGAGAATACACAAAGAAAGAATACAATGACTTTGTAACAAAATCGGCAAAAGAGGTCTTTTTAGCCACTGGAGATTACAAACAGCCCAATAAAAATGAAATCCTAGAAGGCTGGGAGATGATGGTTAAAAGAGTGCATCAACAGAGGGAAGTTAGTAAATCCATTCATGATCAAAAACCTAGTATCCATTTTATATGGTCTGCACATAATCCGAACAATAGTAATAATGCTACTTTTAAACTGATCTTATTATCAAAGTCACTCCAATCTATTAAAGGTAATTCAACTTATACGGATTCGTTTAGATCATTGGGGAAAATGATGGATATTGGTGATAAAATAACTGATTATGAATCACACTGTGATTACCTAAAGACGCAGGCAAGATTAAGCTGGCGACAAGTTATGAATAAGAAATTGGAACCAAAGAAGATAAATGACGCCTTGGTTCTTTGGGAGCAACAATTTATGGTAAATTCAGAGCTTATAAATAAGAATGACAAGCTTAAACTTTTTAGAGACTTCTGCGGAATAGGTAAACATAAGCAATTCAAAAATAAAATGCTAGAAGATATTGAACTATCAAAGCCTAAGATATTAGACTTCAATGATGAAAACATTTATTTAGCAAGCTTAACCATGGTTGAACAATGTAAAATCACATTATCTGAACAGAGCGGCTTAAAAAGCAACAATTTTATACTAGATGAGTTCGGGAAAAAAATAGGGGATTGCAACAAGAACACACTAGATATCATGACCTCTATTTTTGAGACCAAATTTTGGCAATGTATCTCTGACTTCTCAACACTAATGAAAAATATTTTATCTGTCTCACAGTACAATAGGCATAACACATTTAGAATAGCAATGTGTGCCAATAATAACTTGTTTGCATTAGTTTACCCTTCAGCTGATATAAAAACAAAAAAAGCAACTGTAGTCTATAGCATAATTGCCCTTCACAAGAATGAAACTGATATATTCAATCCTGGGTGCTTACATGGAACTTTCAAATGCAATAATGGTTATATTTCTATATCCCGGGCTATCAGACTAGATAAAGAACGCTGCCAGAGAATAGTATCTTCTCCTGGCCTTTTTCTGACAACATGCCTGTTATTTAAGCATGAGAATCCAACTATTAGATTAGATGATATTATGACATTTTCTCTATTCACTAGTTTATCTATAACCAAGAGTGTGTTATCTCTAACTGAGCCTGCACGTTACATGATAATGAATTCTTTAGCTATTTCAAGCAATGTTAAAGATTATATCGCTGAGAAGTTCTCACCTTACACAAAGACACTTTTTAGTGTTTATATGACTAGATTAATAAAGAATGCATGTTTTGAGGCATATAACCAACGGCAAAAAGTTCAACTTAGAGACATTTATTTATCAGATTATGATATAACTCAAAAAGGTATTAAGGACAATAGAGAATTAACAAGTATTTGGTTTCCTGGCTGTGTAACACTCAAAGAATATTTGACACAAATTTACCTACCATTTTATTTTAATGCTAAGGGTTTACATGAGAAACATCATGTTATGGTGGATTTGGCCAAAACAATTTTGGAAATAGAAAATGAGCAAAGAAACGAAATTACAAAAATCTGGTCAAAGGATCTGACCAAGCAAACAGTTAATTTACAAATCCTAATACATTCCTTATGCAAAAATTTACTTGCTGATACTTCCAGACATAATCACCTAAGGAATAGAATTGAAAATAGGAACAACTTTAGAAGATCAATAACAACAATATCAACGTTTACCAGTTCAAAATCTTGCATTAAAATTGGGAATTTCCACAAGGAGAAAGAAGTCCAGTATACAAAACAGAAGAGGAATATTGAGATTGAGAGTAGGAAAAGGAGATTGGCAAATCCTCTATTTGTTTCAGATGAAGAAATAGGGTTAGAAGTAGGACACTGCAACTATAATATGTTAAGAGAGGCAATGCCAGAGTATAGAGATTACATCTCAACCAAAGTTTTTGATCGTCTATATGAAATGTTAGATACTAATCAAGTCTCTGAAAAGCCTACTATAGAGCTAATCATGGATATGATGGCAGAACATACAAATTTTTATTTCACATTTTTTAATAAAGGCCAAAAAACTTCCAAAGATAGAGAAATATTTGTAGGAGAATATGAAGCCAAAATGTGCATGTATGCTGTGGAAAGAATAGCCAAAGAGCGCTGCAAATTAAATCCAGATGAGATGATTTCAGAGCCTGGTGATGGGAAACTTAAAGTGCTGGAACAAAAATCTGAGCAAGAAATTCGTTTCCTAGTTGAAACTACTAGGCAAAAAAATAGGGAAATAGATGAGGCTATTGAAGCTTTAGCTGCAGAGAATTTTGAAGATAATATTTCAAAAATAGAGAAATTGGCTAAAGGGAAGTCAAGGGGTTTAAAAATGGAAATCAATGCAGATATGTCCAAATGGAGTGCTCAGGATGTCTTTTTTAAATATTTCTGGTTGATAGCATTGGATCCAATATTGTACCCTCAAGAGAAGGAAAGAATTATTTTCTTCTTTTGCAATTATATGCAAAAAAAACTGATCTTGCCAGACGATCTTATGTGTAATTTGCTAGATCAAAAAGCCACTTATAGAGATGATATCATATCTATAATGACTAATCAACTACAAACTAATTGTGTAGAAATTAAGCGTAATTGGTTACAAGGTAACTTTAACTATACAAGTAGTTATGTTCATAGCTGTGCCATGTCTGTATATAAAGATGTTTTAAAAGAAGCCATGTCTTATCTTGAAGGGTCAATTGTAGTTAATTCATTAGTACATTCAGATGATAATCAAACTTCAGTAACAATAGTTCAAGATAAGGCCCCTGATGAGGTTTTAATAGAATTTAGTATTACACAATTCCAAAAAATATGTCTCGCATTTGGATGTCAAGCCAATATGAAAAAAACATACGTCACTAATTGCATAAAGGAGTTTGTTTCACTTTTCAATTTATATGGAGAACCTTTTTCAATTTATGGCAGATTCCTACTAACATCTGTAGGTGACTGTGCATATATTGGCCCATATGAAGATCTTGCAAGTAGAATTTCATCAGCTCAAACTGCCATAAAACATGGTTGTCCACCAAGTTTAGCATGGGTCTCTATAGCAATAAGCCACTGGATAACTGGGTTAACTTACAATATGTTACCTGGGCAAAGCAACGACCCTATGGATTATTTCCCTGCAGAGACTAGGAGAGATATACCAATAGAATTAAATGGTGTTTTAGATGCTCCATTGTCTATGATTAGCACAGTTGGTTTGGAAGCTGGAAACTTATGGTTCCTTATTAAAATGTTAAATAAGCACACACCAATAATGCAGAAGAGGGAATCAGTTGTGAATCAGATTGCTGAAATAAGAAATTGGGACCTAACTCGGATGGATGACAATGAAATATTCAAATTGAAAATATTAAGGTACTTGGTCTTGGATGCTGAAATGGATCCAAGTGATATCATGGGTGAGACAAGTGACATGAGGGGTAGATCCATACTAACACCTAGGAAGTTTACGACAAGTGGTAGCCTTAGGAAGCTATACTCATTCTCAAAATACCAAGACAGATTATCATCACCAGGAGGCATGAATGACTTGTTTCAATATCTTCTCGAAAAACCAGAGCTTCTTGTTACAAAGGGAGAAGATAAGAAAGATTATATGGAATCTGTAATCTTTAGATACAATTCAAAAAGATTCAAAGAAAGTCTTTCTATACAAAACCCTGCACAATTATTCATTGAGCAGATATTATTTTCTAATAAACCAATAATAGATTTTTCCGGTATTAGAGATAAATATGTCAATCTTCATGATAGCAGGGCACTGGAAAAAGAACCTGATATCATTGGCAAAGTCACATTCCGGGAAGCCTATAGGATATTGATGAAGGATTTAAATAGCCTGCCTTTAACGAATGATGATATACAAGTTGTCTATTCATATATAATTTTAAATGACCCGCTAATGATAACAATTGCGAACACGCAAATCTTATCCATTTACGGTAGTCCCCAAAAAAGAACTGGAATGTCTTGCTCTACAATGCCAGAATTCCGGAATCTGAAGTTAATACACCATTCACCTGCATTGGTGCTCAGAGCATATAGTAAGAATACCCCAGATATACAAGGTGCAGACCCAACAGAGATGTCAAGGGA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| 68,556
|
MH370818.1
|
Jamestown Canyon virus
|
Hughes,H.R., Russell,B.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-borne Diseases
|
USA
|
2018-09-22
|
MN256-260
|
Orthobunyavirus jamestownense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,905
|
GenBank
| null |
Canada: Manitoba
|
Canada
|
Aedes sp.
| null |
1979
| null | null |
Jamestown Canyon virus isolate MN256-260 segment L, complete sequence
|
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| 68,557
|
KX817315.1
|
Jamestown Canyon virus
|
Hughes,H.R., Lanciotti,R.S., Blair,C.D., Lambert,A.J.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-borne Diseases
|
USA
|
2016-11-07
| null |
Orthobunyavirus jamestownense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,957
|
GenBank
| null |
USA: Colorado
|
USA
|
Culiseta inornata
| null |
1961
| null | null |
Jamestown Canyon virus strain 61V2235 segment L, complete sequence
|
AGTGTACTCCTATTTACAAAACTTACAAATACAAATAATTGCTCTTATATAACTATGGATAACACAGAGTATCAACAATTCCTTGCTCGTATTAATGCAGCAAGGGATGCATGTGTGGCAAAGGATATTGATGTAGATTTGCTGATGGCAAGGCATGACTACTTTGGGAGAGAGTTGTGCAAATCACTGAATATAGAATATAGAAATGATGTCCCGTTTGTAGATATACTACTAGACATAAGGCCTGATATAGATCCTTTAACTCTAGATATTCCTCATATAACCCCAGATAATTACTTATATTTAGACAATATTTTATATATTATAGATTATAAGGTCTCCGTATCTAATGAAAGTAGTATTATAACTAACACAAAATATTTTGAGATGACAAGAGATATAGCATCTGTACTGGGTTTGCATATAGAAATAGTTGTCATTAGAATAGATCCTATTAGTCGTGATCTATATATTAGTTCAGATAGATTTAAAGATTTATTTCCTACATTAGTAGTTGATATCAACTTCAATCAGTTCTTCGACTTAAAACAAGCATTGTATGAAAAGTTTGGGGACGATGAAGAATTTCTACTTAAGGTCGCACATGGCGATTTTACATTAACAGCGCCTTGGTGTAAGACAGGGTGTCCACAAGTCTGGCAACACCCTATTTATAAAGAATTTAAATTAAGTATGCCAGTCCCAGAGAGAAGGCTTTTTGAAGAATCTATGAAATTTAATTCATATGAATCAGAGAGGTGGAATACTAATTTGATAAAGATTAGGGAATACACAAAAAAAGAATACAATGACTTTATAACAAAATCAGCAAAAGAAGTCTTCTTGGCCACAGGGAACTACAAACAACCTAACAAAAGTGAAATTTTAGAAGGCTGGGAAATGATGGTAGAGAGAGTTCACCAACAAAGGGAAGTTAGCAACTCTATTCATGATCAAAAGCCTAGTATTCATTTTATATGGTCTACACATAACCCTAATAATAGCAACAATGCCACATTCAAACTGATTTTATTATCAAAGTCACTTCAATCTATAAGAGGTAATTCAACCTATACAGACTCATTCAAATCGTTGGGAAAGATGATGGACATTGGTGACAAAATAACAGATTATGAGTCACACTGTGATTACTTAAAAACGCAAGCAAGATTGAGTTGGCGACAAGTTATGAATAAGAAATTAGAGCCAAAGAAGATAAATGATGCTTTAGTTCTTTGGGAACAGCAATTTATGGTAAATTCAGAACTTATAAACAAGAATGATAAGCTAAAACTTTTTAGGGATTTTTGTGGTATAGGTAAACATAAACAATTCAAGAACAAAATGTTAGAAGATATTGAATTGTCAAAGCCCAAAATATTGGACTTCAACGATGAAAACATTTATTTGGCAAGTTTGACTATGATTGAACAATGCAAAATTATGCTATCAGAACAGAGTGGCTTGAAAAGTAATAATTTTATATTAGATGAGTTTGGAAAGAAGATAGGGGATTGCAACAAAAATACATTGGACATCATGACTTCCATTTTTGAGACTCGGTTTTGGCAGTGTATTTCTGATTTCTCAACACTAATGAAGAACATTTTATCGGTATCACAATATAATAGACACAATACATTTAGAATAGCAATGTGCGCCAATAATAATTTGTTTGCAATAGTCTATCCATCTGCAGATATTAAGACAAAAAAAGCAACTGTAGTTTATAGCATAATTGCTCTTCATAAAAATGAGACTGATGTCTTCAATCCCGGATGTTTGCATGGAACTTTCAAATGTAACAACGGCTATATTTCAATATCTAGAGCAATTAGATTGGACAAAGAGCGTTGTCAAAGAATAGTATCTTCTCCTGGCCTTTTCTTAACAACATGCCTTTTATTCAAACATGAGAATCCGACTGTTAGACTAGAGGATGTCATGACTTTTTCTTTATTCACTAGCTTATCTATAACAAAGAGTGTGTTGTCCTTAACTGAGCCTGCACGCTATATGATAATGAACTCTCTAGCTATTTCAAGTAATGTCAAAGATTATATCGCAGAGAAATTTTCACCTTATACTAAAACACTCTTTAGTGTTTATATGACTAGACTAATAAAAAATGCATGTTTTGAAGCTTACAATCAGCGACAAAAAGTTCAACTTAGGGATATTTATTTATCGGATTATGACATAACTCAAAAAGGCATTAAAGACAATAGGGAGTTAACAAGTATATGGTTCCCCGGTAGTGTGACACTAAAAGAATATCTAACGCAAATTTACCTACCATTCTACTTCAATGCTAAAGGATTGCACGAGAAGCACCATGTTATGGTAGACTTAGCTAAAACAATTCTGGAGATAGAAAGCGAACAGAGGAGTGAGATTACAAGGATTTGGTCAAAAGATTTAACTAAACAAACTGTCAATTTGCAAATCCTAATACATTCTTTATGTAAGAATCTACTTGCTGATACCTCTAGACACAATCATTTGAGAAATAGAATTGAGAATAGGAATAATTTTAGACGATCTATAACAACAATATCAACATTTACAAGCTCGAAATCTTGTATAAAAATTGGAAATTTCCAAAAGGAAAAGGAAATACAATATACAAAACAAAAGAAGAACATAGAGATTGAAAGTAGAAAGAGGAGATTAGCAAATCCTCTGTTTGTCTCAGATGAAGAAATAGGATTGGAAGTGGGGCATTGCAATTATAATATGCTAAGAGAAGCTATGCCAGAATACAGAGATTACATCTCAACTAAGGTATTCGACCGTTTATATGAAATGCTGGATACCGATCAAGTTTCTGATAAGCCCACTATAGAATTAATCATGGATATGATGGCAGACCATACAGATTTTTATTTTACATTCTTTAACAAAGGCCAGAAAACATCTAAAGACAGAGAAATATTCGTGGGAGAGTACGAGGCTAAAATGTGCATGTATGCTGTGGAAAGGATAGCTAAGGAACGTTGCAAGTTAAATCCAGATGAAATGATATCCGAGCCTGGTGATGGAAAACTAAAGGTGTTAGAACAAAAATCTGAACAAGAGATCCGATTCTTAGTTGAAACTACAAGACAAAAGAATAGGGGGATAGATGAAGCTATTGAAAGTTTGGCTGCAGAAAATTTTGAAGGAAATATCTCAAAAATTGAAAAGTTAGCCAAGGGTAAAGCAAGGGGTCTGAAAATGGAGATCAATGCAGATATGTCTAAATGGAGTGCTCAAGATGTCTTCTTTAAATATTTCTGGTTGATAGCATTAGACCCAATATTGTACCCTCAAGAAAAGGAAAGAATTATTTTCTTCTTTTGTAATTATATGCAAAAGAAGTTAATTTTACCGGATGACTTGATGTGCAATCTATTAGATCAAAAGGCCACTTACAGAGATGATATCATATCTATAATGACCAATCAGTTACAGACCAACTGTGTAGAAATTAAACGCAATTGGCTTCAGGGTAATTTCAACTATACGAGCAGTTATGTACATAGCTGTGCTATGTCTGTATATAAGGATGTTTTAAAAGAAGCAATGTCTTATCTCGAAGGGTCAATTGTAATAAATTCATTAGTGCACTCTGATGACAATCAGACTTCTGTAACGATAGTTCAAGACAAAGCACCAGATGAGGTTTTAATAGAATTTAGTATCACACAATTTCAGAAAATATGTCTTGCTTTTGGATGTCAAGCCAATATGAAAAAGACATATGTCACTAATTGTATAAAAGAGTTTGTTTCACTTTTCAATTTGTACGGAGAACCTTTTTCCATTTATGGGAGATTCTTGCTAACGTCTGTAGGTGATTGTGCATATATAGGTCCATATGAGGATCTTGCAAGTAGAATATCATCGGCCCAGACTGCTATAAAGCATGGTTGTCCACCAAGTTTAGCATGGGTTTCTATAGCTATAAGTCATTGGATAACTGGGTTAACATATAATATGCTACCTGGGCAAAGTAATGATCCTATGGATTACTTTCCTGCAGAAAATAGGAAAGATATACCAATAGAGCTAAATGGTGTCCTAGATGCTCCGTTGTCTATGATCAGTACAGTGGGATTAGAAGCTGGGAATCTATGGTTTCTTATCAAAATGTTAAACAAACACACACCAATAATGCAAAAAAGAGAGTCAGTTGTAAATCAAATTTCTGAGATAAGGAATTGGGACTTAAATCGAATGGATGATAATGAAATATTCAAGTTAAAAATACTAAGATATTTAGTTTTGGATGCTGAAATGGATCCAAGTGATATTATGGGTGAAACAAGCGATATGAGAGGTAGATCTATATTAACACCTAGAAAATTCACAACAAGTGGCAGTCTTAGGAAGTTGTACTCATTTTCAAAATACCAAGATAGACTGTCATCACCAGGAGGTATGAATGAGTTATTTCAATATCTTCTTGAGAAACCAGAGCTCCTTGTTACAAAAGGTGAAGATAAGAGAGATTACATGGAATCTGTGATTTTTAGATACAATTCCAAGAGATTCAAAGAAAGTCTTTCTATTCAAAATCCAGCTCAATTATTCATTGAACAGATATTATTTTCAAATAAGCCAGTAATTGATTTCTCAGGTATCAGAGATAAATATATAAATCTTCATGATAGTAGAGCATTGGAAAAAGAACCAGACATCATTGGTAAAGTTACATTTAGAGAAGCATATAGAATACTGATGAAAGATTTGAATAGTTTGCCTTTAACAAACGATGATATACAGGTGGTTTATTCGTATATAATCTTAAATGACCCGCTAATGATAACAATTGCAAATACACAAATTTTGTCTATATATGGTAGTCCTCAGAAGCGGACTGGAATGTCTTGCTCTACTATGCCAGAGTTTAGGAACTTGAAATTGATACATCATTCTCCTGCATTAGTTCTTAGAGCATATAGTAAGAACACTCCAGATGTGCAAGGTGCAGATCCAACAGAGATGTCAAGAGATTTAGTGCATTTAAAAGAGTTTGTAGACAATACAAACCTAAGAACTAAAATGGAGAAAAGGATAGCAGAAAATGAATTAGAAAAGGGAGCTAGAGATATTGTTTTCGAGCTAAAGGAGATGACAAGATTTTACCAAGTCTGCTATGAATATATAAAGTCTACTGAACATAAAATAAAAGTATTCATATTACCTGCCAAAGCATATACTACGACTGATTTTTGCTCATTAATGCAAGGTAATCTCATAAAAGATAAAGAGTGGTATACAGTACACTATTTGAAGCAAATTCTATCTGGAGGACATAAAGCAATCATGCAACATAACTCAACCAGTGAGCAAAATATAGCTTTTGAGTGTTTCCGATTGATAACTCATTTTGCGGACTCGTTCATAGATGCTGGTTCTAGACCCGCTTTCTTACAATTAGTTTTAGATAGTTTCAGTTACAAAGACGTAAAAGTTAATAAGCTATATGAGATAATAAAAAATGGTCACAATAGAACAGATTTCATCCCTTTATTATTCAGAACTGGTGACTTAACTCAATATGACCTTGATAAATACGATGCTATGAAAAGCCAAGAAAGGGTTACTTGGAATGATTGGCAAACATCAAGACATTTAGACATGGGAGCAATAAACTTAACAATAAGTGGCTACAATAGAGCTATAACTATAATCGGTGAGGACAATAAGCTAACCTACTCTGAGTTAAATATTACTAGGAAAACACCAGAAAATATATCAATAAGTGGTAGGAAATTACTGAGTTCTAGACATGGCTTGAAATTTGAAAACATGGCAAAGGTTACTACATACCCAGGGAATYACTACATCACTTATAGGAAGAAAGATAGGCACCAATATATTTATCAAATACATACACATGAATCAATTTTACGAAGAAATGAGGAACATATGGCAATACGAACAAGGATATTTAATGAAATTGTGCCAGTATGTTTGGTAAATGTAGCAGAGATAGATGGAGATCAGAGAATTTTGATTAGGAAGTTAGATTACCTAAACAATGACATCTTTTCATTGGCAAGGATAAAAGTTGGTATTGATGAGTATGCAGTGATAAAAAAAGCGCATTTCAGCAAAATGGTCTCATTTGATGGGCCACCTATAAAGACAGGATTATTGAATTTAACAGAACTAATGAAATCACAAGACCTATTAAATTTGAATTATGACAATATAAGGAATAGTAATCTGATTTCATTTTCGAAAATAATTTGCTGTGAGGGAACAGACAATATAGATGAGGGTTTGGAGTTCCTTTCTGATGATCCAATGGCATTTACAGAAGGAGAAACCATTCATTCTACCCCTATTTTCAATATTTACTATTCAAAAAAAGGAGAGAGGCATATGACATATCGTAATGCTATAAAATTATTAATAGAGCGGGAGACAAGTAATTTTGAAGAAGCATTTACATTTTACAAAGATGGTTTTCTATCCCCTGAAAATTTAGGGTGTTTAGAGGCCATTATTTCCTTAATCAGAGTCTTAAAAACAAATGAGTGGTCTACTGTAATAGACAAGTGTATACATATTTGTTTGATAAAAAATAACATGGATTATCTTTACCACAAGTTTGATATGCCCTCTTGTTTCATAGATGATCCAATATCTAGAAATATAAATTGGCTGATGTATAGGGATTTCATCTCCACACTGCCACCTACTTATATTGCTCCCTGGAACATTATGTTAGAGCATTTTAGAACAAAATGTTCGACATTAATTATGGATAAAATGGAAACACAACGGAACTTTCAAGACTTTGCAAAGATGATGAGAAGGTCTGAAGGAAGGACAAATTTAGATTTCAGTTAAGCAGGGTGAGTATATAAGAGAGGATTTAGACATAAAATTACATAATTGGCCATATTCAAATTGAAAATATAACAGCTTATAGTATATATTTGTAAATAGGAGCACACTACT
| 79,450
|
LC789557.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Matsui,K., Tajima,S., Lim,C.K.
|
Department of Medical Technology, School of Life and Environmental Science; 1-17-1 Fuchinobe Chuouku, Sagamihara, Kanagawa 252-5201
|
Japan
|
2023-12-07
| null |
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,640
|
GenBank
| null |
Japan:Kochi
|
Japan
|
Sus scrofa
| null |
2017-08-14
| null | null |
Japanese encephalitis virus sw/Kochi/215/2017 RNA, complete genome
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| 10,398
|
LC786330.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Matsui,K., Tajima,S., Lim,C.K.
|
Department of Medical Technology, School of Life and Environmental Science; 1-17-1 Fuchinobe Chuouku, Sagamihara, Kanagawa 252-5201
|
Japan
|
2023-11-14
| null |
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,898
|
GenBank
| null |
Japan:Kochi
|
Japan
|
Sus scrofa domesticus
|
blood
|
2023-07-04
| null | null |
Japanese encephalitis virus sw/Kochi/104/2023 RNA, complete genome
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CTTAGTATCGTTGAGAAGAATCGAAAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGAACAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGAAAAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGATTACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTAATGAGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTACGATTTGTGCTGGCTCTTATCACGTTCTTCAAGTTTACAGCATTAGCCCCGACCAAGGCGCTTTTGGGCCGCTGGAGAGCAGTGGAGAAAAGTGTGGCAATGAAACATCTTACCAGTTTCAAACGAGAACTTGGAACACTCATCGACGCCGTGAACAAGCGGGGCAAAAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGAAAGCTCGATTATGTGGCTTGCCAGCTTGGCAATCGTAACAGCCTGTGCCGGAGCCATGAAGCTATCAAACTTTCAAGGAAAGCTTCTGATGACCATCAACAACACGGACATTGCGGACGTCATCGTGATCCCCACCTCAAAAGGTGAAAACAGATGTTGGGTCCGAGCAATTGACGTCGGTTACATGTGTGAAGACACCATCACGTACGAATGTCCGAAGCTTGCCGTGGGCAACGATCCGGAAGACGTGGACTGCTGGTGCGACAATCAAGAAGTCTACGTGCAGTATGGTCGCTGCACACGGACCAGGCATTCCAAACGAAGCAGAAGATCCGTTTCGGTCCAAACGCATGGGGAAAGCTCACTAGTGAACAAAAAAGAGGCTTGGCTGGATTCAACGAAGGCCACACGATACCTCATGAAAACGGAGAACTGGATCATAAGGAACCCTGGTTATGCTTTCTTGGCGGCGGCACTTGGATGGATGCTTGGCAGCAACAGTGGCCAACGTGTGGTGTTCACTATTCTCTTGCTGTTGGTCGCTCCGGCTTACAGTTTCAACTGCTTGGGAATGGGGAATCGGGACTTCATAGAAGGAGCCAGCGGAGCCACTTGGGTGGATCTGGTGCTAGAAGGAGATAGCTGTTTGACGATCATGGCAAGCGACAAACCAACACTAGATGTCCGCATGATCAACATTGAAGCTAGCCAACTTGCTGAAGTCAGGAGTTACTGCTATCATGCTTCAGTCACTGACATTTCAACGGTGGCTCGATGCCCCACGACAGGAGAAGCTCACAACGAAAAACGTGCCGACAGCGGCTACGTGTGCAAACAAGGCTTTACTGATCGCGGATGGGGAAATGGATGTGGACTTTTCGGGAAAGGAAGCATTGATACATGCGCAAAATTTTCTTGCACCAGCAAGGCCATTGGAAGAATGATCCAACCAGAGAACATCAAGTACGAGGTTGGCATATTCGTGCACGGAACCACCACCTCGGAAAATCATGGGAATTACTCAGCGCAAGTAGGAGCGTCTCAAGCAGCAAAGTTTACTGTAACTCCAAATGCTCCCTCAATAACCCTCAAGCTTGGTGATTACGGAGAGGTCACACTGGATTGTGAACCTAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTCTATGTCATGACCGTGGGTTCGAAGTCATTCTTAGTCCATAGGGAATGGTTCCATGACCTTTCTCTTCCCTGGACGTCCCCCTCAAGCACGGCATGGAGAAACAGAGAACTCCTCATGGAATTTGAAGAGGCACATGCCACAAAACAATCTGTCGTAGCTCTTGGGTCACAGGAGGGAGGCCTCCATCAAGCGTTGGCAGGAGCCATAGTGGTGGAGTACTCGAGCTCAGTGAAGTTGACATCAGGTCACCTGAAATGCAGGCTAAAAATGGACAAACTAGCTCTGAAGGGCACGACTTATGGCATGTGTACAGAGAAATTCTCGTTCGCGAAAAATCCAGCGGACACAGGCCATGGAACAGTTGTCATTGAGCTCACATACTCTGGAAGTGATGGTCCCTGTAAAATCCCGATCATCTCAGTCGCGAGCTTAAACGACATGACCCCTGTGGGGAGGCTGGTAACAGTAAACCCCTTCGTCGCGACATCTAGCTCCAACTCAAAGGTGCTGGTTGAGATGGAACCTCCCTTCGGAGACTCTTATATCGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATTAACCATCACTGGCACAAAGCTGGAAGCACGCTGGGCAAAGCCTTCTCAACAACTTTGAAAGGGGCTCAGAGACTAGCAGCGCTAGGCGACACAGCCTGGGACTTCGGCTCCATTGGAGGGGTATTCAACTCCATAGGGAAAGCTGTTCACCAGGTATTTGGTGGTGCATTTAGAACGCTCTTTGGGGGAATGTCTTGGATCACACAAGGACTAATGGGGGCCTTACTTCTTTGGATGGGTGTCAACGCACGAGACCGGTCAATCGCCCTGGCTTTTCTGGCCACGGGAGGTGTGCTCGTGTTTTTAGCGACCAATGTGCACGCCGACACTGGCTGTGCCATTGACATCACAAGAAAAGAGATGAGGTGTGGAAGTGGCATCTTCGTGCATAATGACGTAGAGGCTTGGGTAGATAGGTACAAATATCTGCCAGAGACGCCCAGATCCTTAGCGAAGATCGTCCATAAAGCACATCAAGAAGGAGTGTGCGGGGTCAGATCCGTCACTAGACTGGAACACCAGATGTGGGAATCTGTGCGGGACGAACTGAATGTCTTGCTCAAAGAGAACGCGGTGGATCTCAGCGTGGTGGTGAACAAGCCCGTGGGGAGATACCGCTCAGCCCCCAAACGCCTATCCATGACTCAAGAAAAGTTTGAGATGGGCTGGAAAGCATGGGGAAAAAGCATTCTCTTCGCCCCCGAATTGGCCAATTCCACGTTCGTCGTGGATGGACCTGAGACAAAGGAATGCCCTGATGAGCGCAGAGCCTGGAACAGCATGCAAATCGAAGACTTCGGCTTCGGCATCACATCAACCCGGGTGTGGCTGAAAATTAGAGAGGAGGACACTGATGAGTGTGATGGAGCAATCATAGGGACAGCTGTTAAAGGGCATGTGGCAGTTCATAGTGACTTGTCATACTGGATTGAGAGCCGTCTCAATGACACCTGGAAACTTGAGAGGGCTGTCTTCGGAGAAGTGAAATCTTGCACTTGGCCCGAGACACACACTCTTTGGGGTGACGGTGTTGAGGAGAGCGAGCTTATCATCCCACACACCATAGCTGGACCGAGAAGCAAGCACAACCGAAGAGAAGGGTATAAAACACAAAACCAGGGACCTTGGGATGAGAACGGCATCGTCCTTGACTTTGACTATTGTCCAGGAACAAAAGTTACCATCACAGAGGACTGTGGCAAGAGGGGTCCCTCAATCAGAACTACTACTGACAGTGGAAAGCTGATTACCGATTGGTGCTGCCGCAGCTGTTCTCTTCCGCCTTTACGGTTCCGGACAGAAAATGGCTGCTGGTATGGGATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGATGAAACAACACTCGTTAGATCACAGGTTGACGCTTTCAACGGCGAAATGATTGACCCTTTTCAGCTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACGATTCCTGCGGTTTTGGGGGCCCTACTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACTTACACTGACCTGGCAAGATATGTGGTGCTAGTTGCTGCGGCTTTCGCAGAGGCCAATAGTGGAGGAGATGTTCTGCACCTCGCTTTGATAGCCGTCTTCAAGATCCAACCAGCTTTTCTGGTCATGAACATGCTTAGCGCGAGATGGACGAACCAAGAGAACGTGGTTCTGGTCCTGGGGGCGGCTTTTTTTCAACTAGCTTCAGTGGACTTACAGATTGGGGTCCACGGAATCTTGAATGCCGCAGCCATAGCATGGATGATCGTTCGAGCGATCACATTTCCCACAACCTCTACCGTTGTCATGCCTGTCTTGGCGCTCCTAACTCCAGGAATGAGGGCCTTGTATCTGGACACTTACAGAATCATTCTTCTTGTCATAGGAATTTGTTCCCTGCTGCAAGAGAGGAGAAAGACCATGGCGAAGAAGAAAGGAGCCGTGCTCTTGGGCTTAGCGCTCACATCCACCGGATGGTTTTCGCCTACCACTATCGCAGCCGGACTAATGGTATGCAACCCAAACAAGAAGAGAGGGTGGCCAGCCACCGAGTTCCTTTCAGCGGTTGGGTTGATGTTTGCCATTGTGGGAGGTCTAGCCGAGTTGGACATCGAATCTATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGGCTTATGACAGTGTCCTACGTGGTATCAGGAAAGGCAACCGACATGTGGCTGGACCGGGCTGCTGATATCAGCTGGGAAATGGAGGCTGCAATCACAGGAAGTAGCCGGAGGCTAGATGTTAAGTTAGACGACGACGGCGACTTTCACCTGATTGATGATCCCGGTGTTCCATGGAAAGTCTGGCTCTTGCGCATGTCTTGCATCGGTTTAGCCGCTCTGACACCCTGGGCTATCGTCCCCGCCGCTTTTGGCTATTGGCTCACTCTGAAAACAACGAAAAGAGGGGGCGTGTTCTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCTTGCTTAAAGGGGGACACCACCACAGGAGTTTACCGAATTATGGCCAGGGGGATTCTCGGCACTTACCAGGCCGGCGTTGGAGTCATGTACGAGAATGTTTTCCACACATTGTGGCACACAACTAGAGGAGCCGCCATCATGAGTGGAGAAGGAAAGCTAACGCCATACTGGGGTAGTGTGAAGGAAGACCGCATAAGCTATGGAGGCCCGTGGAGGTTCGACCGGAAGTGGAATGGAACAGATGATGTGCAAGTGATCGTGGTGGAACCAGGGAAACCTGCAGTGAACATCCAGACAAAACCGGGAGTGTTTCGCACCCCTTTCGGGGAGATTGGAGCAGTCAGCTTGGACTACCCACGGGGAACATCCGGCTCACCCATCCT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| 10,985
|
LC785647.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Matsui,K., Tajima,S., Lim,C.K.
|
Department of Medical Technology, School of Life and Environmental Science; 1-17-1 Fuchinobe Chuouku, Sagamihara, Kanagawa 252-5201
|
Japan
|
2023-11-10
| null |
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,929
|
GenBank
| null |
Japan:Kochi
|
Japan
|
Sus scrofa domesticus
|
blood
|
2019-08-20
| null | null |
Japanese encephalitis virus sw/Kochi/174/2019 RNA, complete genome
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AGAAAGTTTATCTGTGTGAACTTCTTAGCTTAGTATCGTTGAGAAGAATCGAAAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGAACAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGAAAAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGATTACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTAATGAGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTACGATTTGTGCTGGCTCTTATCACGTTCTTCAAGTTTACAGCATTAGCCCCGACCAAGGCGCTTTTGGGCCGCTGGAGAGCAGTGGAAAAAAGTGTGGCAATGAAACATCTTACCAGTTTCAAACGAGAACTTGGAACACTCATCGACGCCGTGAACAAGCGGGGCAAAAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGAAAGCTCGATTATGTGGCTTGCCAGCTTGGCAATCGTAACAGCCTGTGCCGGAGCCATGAAGCTATCAAACTTTCAAGGAAAGCTTCTGATGACCATCAACAACACGGACATTGCGGACGTCATCGTGATCCCCACCTCAAAAGGTGAAAACAGATGTTGGGTCCGAGCAATTGACGTCGGTTACATGTGTGAAGACACCATCACGTACGAATGTCCGAAGCTTGCCGTGGGCAACGATCCGGAAGACGTGGACTGCTGGTGCGACAATCAAGAAGTCTACGTGCAGTATGGTCGCTGCACACGGACCAGGCATTCCAAACGAAGCAGAAGATCCGTTTCGGTCCAAACGCATGGGGAAAGCTCACTAGTGAACAAAAAAGAGGCTTGGCTGGATTCAACGAAGGCCACGCGATACCTCATGAAAACGGAGAACTGGATCATAAGGAACCCTGGTTATGCTTTCTTGGCGGCGGCACTTGGATGGATGCTTGGCAGCAACAGTGGCCAACGTGTGGTGTTCACTATTCTCTTGCTGTTGGTCGCTCCGGCTTACAGTTTTAACTGTTTGGGAATGGGGAATCGGGACTTCATAGAAGGAGCCAGCGGAGCCACTTGGGTGGATCTGGTGTTAGAAGGAGATAGCTGTTTGACGATCATGGCAAGCGACAAACCAACACTAGATGTCCGCATGATCAACATTGAAGCTAGCCAACTTGCTGAAGTCAGGAGTTACTGCTATCATGCTTCAGTCACTGACATTTCAACGGTGGCTCGATGCCCCACGACAGGAGAAGCTCACAACGAAAAACGTGCCGACAGCAGCTACGTGTGCAAACAAGGCTTTACTGATCGCGGATGGGGAAATGGATGTGGACTTTTCGGGAAAGGAAGCATTGATACATGCGCAAAATTTTCTTGCACCAGCAAGGCCATTGGAAGAATGATCCAACCAGAGAACATCAAGTACGAGGTTGGCATATTCGTGCACGGAACCACCACCTCGGAAAACCATGGGAATTACTCAGCGCAAGTAGGAGCGTCTCAAGCAGCAAAGTTTACTGTAACTCCAAATGCTCCCTCAATAACCCTCAAGCTTGGTGATTACGGAGAAGTCACACTGGATTGTGAACCTAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTCTATGTCATGACCGTGGGTTCGAAGTCATTCTTAGTCCATAGGGAATGGTTCCATGACCTTTCTCTTCCCTGGACGTCCCCCTCAAGCACGGCATGGAGAAACAGAGAACTCCTCATGGAATTTGAAGAGGCACATGCCACAAAACAATCTGTCGTAGCTCTTGGGTCACAGGAGGGAGGCCTCCATCAAGCGTTGGCAGGAGCCATAGTGGTGGAGTACTCGAGCTCAGTGAAGTTGACATCAGGTCACCTGAAATGCAGGCTAAAAATGGACAAACTAGCTCTGAAGGGCACGACTTATGGCATGTGTACAGAGAAATTCTCGTTCGCGAAAAATCCAGCGGACACAGGCCATGGAACAGTTGTCATTGAGCTCACATACTCTGGAAGTGATGGTCCCTGTAAAATCCCGATTATCTCAGTCGCGAGCTTAAACGACATGACCCCTGTGGGGAGGCTGGTAACAGTAAACCCCTTCGTCGCGACATCTAGCTCCAACTCAAAGGTGCTGGTTGAGATGGAACCTCCCTTCGGAGACTCTTATATCGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATTAACCATCACTGGCACAAAGCTGGAAGCACGCTGGGCAAAGCCTTCTCAACAACTTTGAAAGGGGCTCAGAGACTAGCAGCGCTAGGCGACACAGCCTGGGACTTCGGCTCCATTGGAGGGGTATTCAACTCCATAGGGAAAGCTGTTCACCAGGTATTTGGTGGTGCATTCAGAACGCTCTTTGGGGGAATGTCTTGGATCACACAAGGACTAATGGGGGCCTTACTTCTTTGGATGGGTGTCAACGCACGAGACCGGTCAATCGCCCTGGCTTTTCTGGCCACGGGAGGTGTGCTCGTGTTTTTAGCGACCAATGTGCACGCCGACACTGGCTGTGCCATTGACATCACAAGAAAAGAGATGAGGTGTGGAAGTGGCATCTTCGTGCATAACGACGTAGAGGCTTGGGTAGATAGGTACAAATATCTGCCAGAGACGCCCAGATCCTTAGCGAAGATCGTCCATAAAGCACATCAAGAAGGAGTGTGCGGGGTCAGATCCGTCACTAGACTGGAACACCAGATGTGGGAATCTGTGCGGGACGAACTGAATGTCTTGCTCAAAGAGAACGCGGTGGATCTCAGCGTGGTGGTGAACAAGCCCGTGGGGAGATACCGCTCAGCCCCCAAACGCCTATCCATGACTCAAGAAAAGTTTGAGATGGGCTGGAAAGCATGGGGAAAAAGCATTCTCTTCGCCCCCGAATTGGCCAACTCCACGTTCGTCGTGGATGGACCTGAGACAAAGGAATGCCCTGATGAGCGCAGAGCCTGGAACAGCATGCAAATCGAAGACTTCGGCTTCGGCATCACATCAACCCGGGTGTGGCTGAAAATTAGAGAGGAGGACACTGATGAGTGTGATGGAGCAATCATAGGGACAGCTGTTAAAGGGCATGTGGCAGTTCATAGTGACTTGTCATACTGGATTGAGAGCCGTCTCAATGACACCTGGAAACTTGAGAGGGCTGTCTTCGGAGAAGTGAAATCTTGCACTTGGCCCGAGACACACACTCTTTGGGGTGACGGTGTTGAGGAGAGCGAGCTTATCATCCCACACACCATAGCTGGACCGAGAAGCAAGCACAACCGAAGAGAAGGGTATAAAACACAAAACCAGGGACCCTGGGATGAGAACGGCATCGTCCTTGACTTTGACTATTGTCCAGGAACAAAAGTTACCATCACAGAGGACTGTGGCAAGAGGGGTCCCTCAATCAGAACTACTACTGACAGTGGAAAGCTGATTACCGATTGGTGCTGCCGCAGCTGTTCTCTTCCGCCTTTACGGTTCCGGACAGAAAATGGCTGCTGGTATGGGATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGATGAAACAACACTCGTTAGATCACAGGTTGACGCTTTCAACGGCGAAATGATTGACCCTTTTCAGCTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACGATTCCTGCGGTTTTGGGGGCCCTACTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACTTACACTGACCTGGCAAGATATGTGGTGCTAGTTGCTGCGGCTTTCGCAGAGGCCAATAGTGGAGGAGATGTTCTGCACCTCGCTTTGATAGCCGTCTTCAAGATCCAACCAGCTTTTCTGGTCATGAACATGCTTAGCGCGAGATGGACGAACCAAGAGAACGTGGTTCTGGTCCTGGGGGCGGCTTTTTTCCAACTAGCTTCAGTGGACTTACAGATTGGGGTCCACGGAATCTTGAATGCCGCAGCCATAGCATGGATGATCGTTCGAGCGATCACATTTCCCACAACCTCTACCGTTGTCATGCCTGTCTTGGCGCTCCTAACTCCGGGAATGAGGGCCTTGTATCTGGACACTTACAGAATCATTCTTCTTGTCATAGGAATTTGTTCCCTGCTGCAAGAGAGGAGAAAGACCATGGCGAAGAAGAAAGGAGCCGTGCTCTTGGGCTTAGCGCTCACATCCACCGGATGGTTTTCGCCCACCACTATCGCAGCCGGACTAATGGTATGCAACCCAAACAAGAAGAGAGGGTGGCCAGCCACCGAGTTCCTTTCAGCGGTTGGGTTGATGTTTGCCATTGTGGGAGGTCTAGCCGAGTTGGACATCGAATCTATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGGCTTATGGCAGTGTCCTACGTGGTATCAGGAAAGGCAACCGACATGTGGCTGGACCGGGCTGCTGATATCAGCTGGGAAATGGAAGCTGCAATCACAGGAAGTAGCCGGAGGCTAGATGTTAAGTTAGACGACGACGGCGACTTTCACCTGATTGATGATCCCGGTGTTCCATGGAAAGTCTGGCTCTTGCGCATGTCTTGTATCGGTTTAGCCGCTCTGACACCCTGGGCTATCGTCCCCGCCGCTTTTGGCTATTGGCTCACTCTGAAAACAACGAAAAGAGGGGGCGTGTTCTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCTTGCTTAAAGGGGGACACCACCACAGGAGTTTACCGAATTATGGCCAGGGGGATTCTCGGCACTTACCAGGCCGGCGTTGGAGTCATGTACGAGAATGTTTTCCACACATTGTGGCACACAACTAGAGGAGCAGCCATCATGAGTGGAGAAGGAAAGCTAACGCCATACTGGGGTAGTGTGAAGGAAGACCGCATAAGCTATGGAGGCCCGTGGAGGTTCGACCGGAAGTGGAATGGAACAGATGATGTGCAAGTGATCGTGGTGGAACCAGGGAAACCTGCAGTGAACATCCAGACAAAACCGGGAGTGTTTCGCACCCCTTTCGGGGAGATTGGAGCAGTCAGCTTGGACTACC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| 11,144
|
OR711406.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Li,C., Zhao,W.
|
Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-11-08
| null |
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,965
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Anatidae
| null |
2022-10
| null | null |
Japanese encephalitis virus strain duck/2022-SD-1, complete genome
|
AGAAGTTTATCTGTGTGAACTTCTTGGCTTAGTATCGTTGAGAAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGAACAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGAAAAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGATTACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTTATGAGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTACGATTTGTGCTGGCTCTTATCACGTTCTTCAAGTTTACAGCATTAGCCCCGACCAAGGCGCTTTTGGGCCGCTGGAGAGCAGTGGAAAAAAGTGTGGCAATGAAACATCTTACCAGTTTCAAACGAGAACTTGGAACACTCATTGACGCCGTGAACAAGCGGGGCAAAAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGAAAGCTTGATTATGTGGCTTGCCAGCTTGGCAATCGTAACAGCCTGTGCCGGAGCCATGAAGCTATCAAACTTTCAAGGAAAGCTTCTGATGACCATCAACAACACGGACATTGCGGATGTCATCGTGATCCCCACCTCAAAAGGTGAAAACAGATGCTGGGTACGAGCAATCGACGTTGGTTACATGTGTGAAGACACCATCACGTATGAATGTCCGAAGCTTGCCGTGGGCAACGATCCGGAAGACGTGGACTGCTGGTGCGACAATCAGGAAGTCTACGTGCAGTATGGTCGCTGCACACGGACCAGGCATTCCAAACGAAGCAGAAGATCCGTTTCGGTCCACACGCATGGGGAAAGCTCACTAGTGAACAAAAAAGAGGCTTGGCTGGATTCAACGAAGGCCACGCGATACCTCATGAAAACGGAGAACTGGATCATAAGGAACCCTGGTTATGCTTTCCTGGCGGTGGCACTTGGATGGATGCTTGGCAGCAACAATGGCCAACGTGTGGTGTTCACTATTCTCTTGCTATTGGTCGCCCCGGCTTACAGTTTTAACTGTCTGGGAATGGGGAATCGGGATTTCATAGAAGGAGCCAGTGGAGCCACTTGGGTGGATCTGGTGTTGGAAGGAGATAGCTGTTTGACAATTATGGCAAACGACAAACCAACACTAGATGTCCGCATGATCAACATTGAAGCTAGCCAACTTGCTGAAGTCAGGAGTTACTGCTATCACGCTTCAGTCACTGACATTTCAACGGTGGCTCGATGCCCCACGACTGGAGAAGCCCACAATGAAAAACGTGCTGACAGCAGCTACGTGTGCAAACAAGGCTTTACTGACCGCGGATGGGGAAATGGATGTGGACTTTTCGGGAAAGGAAGCATTGACACATGCGCAAAATTTTCGTGTACCAGTAAGGCCATTGGAAGAATGATCCAACCAGAGAACATCAAGTACGAGGTTGGCATATTCGTGCACGGAACCACTACCTCGGAAAACCATGGGAATTACTCAGCGCAAGTAGGAGCGTCTCAAGCAGCAAAGTTTACTGTAACTCCAAATGCTCCTTCAATAACCCTCAAGCTTGGTGATTATGGAGAAGTCACACTGGATTGTGAACCAAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTCTATGTCATGACCGTGGGTTCGAAGTCATTCTTAGTCCATAGGGAATGGTTCCATGACCTTTCTCTTCCCTGGACGTCCCCCTCAAGCACGGCATGGAGAAACAGAGAACTCCTCATGGAATTTGAAGAGGCACATGCCACAAAACAATCTGTCGTAGCTCTTGGGTCACAGGAGGGAGGCCTCCATCAAGCGTTGGCAGGAGCCATCGTGGTGGAGTACTCGAGCTCAGTGAAATTGACATCAGGTCACCTGAAATGCAGGCTAAAAATGGACAAACTGGCTCTGAAGGGCACGACTTATGGCATGTGTACAGAAAAATTCTCGTTCGCGAAAAATCCAGCGGACACGGGCCATGGAACAGTTGTCATTGAGCTCACATATTCTGGAAGTGATGGTCCCTGTAAAATTCCGATTGTCTCAGTCGCTAGTTTAAACGACATGACCCCTGTGGGGAGGCTGGTAACAGTAAACCCCTTCGTCGCAACATCTAGCTCCAACTCAAAGGTGCTGGTTGAGATGGAACCTCCCTTCGGAGACTCTTATATCGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATTAACCATCACTGGCACAAAGCTGGAAGCACGCTGGGCAAAGCTTTCTCAACAACTTTGAAAGGGGCTCAGAGACTAGCAGCGCTAGGTGACACAGCCTGGGACTTCGGTTCCATTGGAGGGGTATTCAACTCCATAGGGAAAGCTGTTCACCAAGTATTTGGCGGTGCATTCAGAACGCTCTTTGGGGGAATGTCTTGGATCACACAAGGACTAATGGGGGCCTTACTTCTTTGGATGGGTGTCAACGCACGAGACCGGTCAATCGCCCTGGCTTTTCTGGCCACGGGAGGTGTGCTCGTGTTTTTAGCGACCAATGTGCATGCCGACACTGGCTGTGCCATTGACATCACAAGAAAAGAGATGAGGTGTGGAAGTGGCATCTTCGTGCACAACGACGTAGAGGCTTGGGTAGATAGGTACAAATATTTGCCAGAGACGCCCAGATCCTTAGCGAAGATCGTCCACAAAGCACATCAAGAAGGAGTGTGCGGGGTCAGATCCGTCACTAGACTGGAACACCAGATGTGGGAGTCTGTGCGAGACGAACTGAATGTCTTGCTCAAAGAGAACGCGGTGGATCTCAGTGTGGTGGTGAACAAGCCCGTGGGGAGATATCGCTCAGCCCCCAAACGCCTATCCATGACTCAAGAAAAGTTTGAGATGGGCTGGAAAGCATGGGGAAAAAGCATTCTCTTCGCCCCCGAATTGGCCAACTCCACGTTCGTCGTGGATGGACCCGAGACAAAGGAATGCCCTGATGAGCGCAGAGCCTGGAACAGCATGCAAATCGAAGATTTCGGCTTCGGCATCACATCAACCCGAGTGTGGCTGAAAATTAGAGAGGAGAACACTGATGGGTGTGATGGAGCAATCATAGGGACAGCTGTTAAAGGGCATGTGGCAGTTCATAGTGACTTGTCATACTGGGTCGAGAGCCGTCTCAATGACACCTGGAAACTTGAGAGGGCTGTCTTCGGGGAGGTGAAATCTTGCACTTGGCCCGAGACACACACTCTTTGGGGTGACGGTGTTGAGGAGAGCGAGCTTATCATCCCACACACCATAGCTGGACCGAGAAGCAAGCACAACCGGAGAGAAGGGTATAAAACACAAAACCAGGGACCCTGGGATGAGAACGGCATCGTTCTTGACTTTGACTATTGTCCAGGAACAAAAGTCACCATCACAGAGGACTGTGGCAAGAGGGGTCCCTCAATCAGAACCACTACTGACAGTGGAAAGCTGATCACCGATTGGTGCTGCCGCAGCTGTTCTCTACCGCCTTTGCGGTTCCGGACAGAAAATGGTTGCTGGTATGGGATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGACGAAACAACACTCGTTAGGTCACAGGTTGACGCTTTCAACGGCGAAATGATTGACCCTTTTCAGCTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACGATTCCTGCGGTTTTGGGGGCTCTACTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACTTACACTGACCTGGCAAGATATGTGGTGCTAGTTGCTGCGGCTTTCGCGGAGGCCAACAGTGGAGGAGATGTTCTGCACCTCGCTCTGATAGCCGTCTTCAAGATCCAACCAGCTTTTCTGGTCATGAACATGCTTAGCGCGAGATGGACGAACCAAGAGAACGTGGTTCTGGTCCTGGGGGCGGCTTTTTTCCAACTAGCTTCAGTGGATTTACAGATCGGAGTCCACGGAATCCTGAACGCTGCAGCCATAGCATGGATGATCGTTCGAGCGATCACATTTCCCACAACTTCTACCGTTGCCATGCCAATCTTAGCGCTCCTAACTCCGGGAATGAGGGCTTTGTATCTGGACACTTATAGAATCATTCTTCTTGTCATAGGAATTTGTTCCCTGCTGCAAGAGAGGAGAAAGACCATGGCGAAGAAGAAAGGAGCCGTGCTCTTGGGCTTAGCGCTCACATCCACCGGATGGTTTTCGCCCACCACTATCGCAGCCGGACTAATGGTCTGCAACCCAAACAAGAAGAGGGGGTGGCCAGCCACCGAGTTCCTTTCAGCGGTTGGGTTGATGTTTGCCATTGTGGGAGGTCTAGCCGAGTTGGACATCGAATCTATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGGCTCATGGCAGTGTCCTACGTGGTATCAGGAAAGGCAACCGACATGTGGCTGGACCGGGCTGCCGATATCAGCTGGGAGATGGAGGCTGCAATCACAGGAAGTAGCCGGAGGCTAGATGTTAAGTTGGATGACGACGGCGACTTTCACTTGATTGATGATCCCGGTGTTCCATGGAAGGTCTGGCTTCTGCGCATGTCTTGTATCGGTTTAGCCGCTCTGACACCCTGGGCTATCGTTCCCGCCGCTTTTGGCTATTGGCTCACTCTGAAAACAACAAAAAGAGGGGGCGTGTTCTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCTTGCTTAAAGGGGGACACCACCACAGGAGTTTACCGAATTATGGCCAGGGGGATTCTAGGCACTTACCAGGCCGGAGTTGGAGTCATGTATGAGAATGTTTTCCACACATTGTGGCACACAACTAGAGGAGCAGCCATCATGAGTGGAGAAGGAAAGCTAACGCCATACTGGGGTAGTGTGAAGGAAGACCGCATAAGCTATGGAGGCCCGTGGAGGTTTGACCGGAAGTGGAATGGAACAGATGATGTGCAAGTGATTGTGGTGGAACCAGGGAAACCTGCAGTAAACATCCAGACAAAACCGGGAGTGTTTCGCACCCCTTTCGGGGAAGTTGGAGCAGTCAGCTTGGACTACCC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| 11,162
|
OR605600.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Yeh,J.-Y., Kim,S.H., Ga,Y.J., Cho,Y.H., Kim,J.W., Kim,C.
|
Incheon National University, Incheon National University
| null |
2023-10-30
|
K12IN0325
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,919
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Sus scrofa
| null |
2010
| null | null |
Japanese encephalitis virus isolate K12IN0325, complete genome
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CTGTGTGAACTTCTTGGCTTAGTATCGTTGAGAAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGAACAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGAAAAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGATTACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTGATGAGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTACGATTTGTGCTGGCTCTTATCACGTTCTTCAAGTTTACAGCATTAGCCCCGACCAAGGCGCTTTTGGGCCGCTGGAGAGCAGTGGAAAAAAGTGTGGCAATGAAACATCTTACCAGTTTCAAACGAGAACTTGGAACACTCATCGACGCCGTGAACAAGCGGGGCAAAAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGAAAGCTCGATTATGTGGCTTGCCAGCTTGGCAATCGTAACAGCCTGTGCCGGAGCCATGAAGCTATCAAACTTTCAAGGAAAGCTTCTGATGACCATCAACAACACGGACATTGCGGACGTCATCGTGATCCCCACCTCAAAAGGTGAAAACAGATGTTGGGTCCGAGCAATCGACGTTGGTTACATGTGTGAAGACACCATCACGTACGAATGTCCGAAGCTTGCCGTGGGCAACGATCCGGAAGACGTGGACTGCTGGTGCGACAATCAAGAAGTCTACGTGCAGTATGGTCGCTGCACACGGACCAGGCATTCCAAACGAAGCAGAAGATCCGTTTCGGTCCAAACGCATGGGGAAAGCTCACTAGTGAACAAAAAAGAGGCTTGGCTGGATTCGACGAAGGCCACGCGATACCTCATGAAAACGGAGAACTGGATCATAAGGAACCCTGGTTATGCTTTCCTGGCGGCGGCACTTGGATGGATGCTTGGCAGCAACAGTGGCCAACGTGTGGTGTTCACTATTCTCTTGCTGTTGGTCGCTCCGGCTTACAGTTTTAACTGTCTGGGAATGGGGAATCGGGATTTCATAGAAGGAGCCAGTGGAGCCACTTGGGTGGATCTGGTGTTAGAAGGAGATAGCTGTTTGACAATCATGGCAAACGACAAACCAACACTAGATGTCCGCATGATCAACATTGAAGCTAGCCAACTTGCTGAAGTCAGGAGTTACTGTTATCACGCTTCAGTCACTGACATTTCAACGGTGGCTCGATGCCCCACGACTGGAGAAGCCCACAACAAAAAACGTGCTGACAGCAGCTACGTGTGCAAACAAGGCTTTACTGACCGCGGATGGGGAAATGGATGTGGACTTTTCGGGAAAGGAAGCATTGACACATGCGCAAAATTTTCTTGTACCAGTAAGGCCATTGGAAGAATGATCCAACCAGAGAACATCAAGTACGAGGTTGGCATATTCGTGCACGGAACCACCACCTCGGAAAACCATGGGAATTACTCAGCGCAAGTAGGAGCGTCTCAAGCAGCAAAGTTTACTGTAACTCCAAATGCTCCCTCAATAACCCTCAAGCTTGGTGATTATGGAGAAGTCACACTGGATTGTGAACCAAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTCTATGTCATGACCGTGGGTTCGAAGTCATTCTTAGTCCATAGGGAATGGTTCCATGACCTTTCTCTTCCCTGGACGTCCCCCTCAAGCACGGCATGGAGAAACAGAGAACTCCTCATGGAATTTGAAGAGGCACATGCCACAAAACAATCCGTCGTAGCTCTTGGGTCACAGGAGGGAGGCCTCCATCAAGCGTTGGCAGGAGCCATCGTGGTGGAGTACTCGAGCTCAGTGAAGTTGACATCAGGTCACCTGAAATGCAGGCTAAAAATGGACAAACTGGCTCTGAAGGGCACGACTTATGGCATGTGTACAGAAAAATTCTCGTTCGCGAAAAATCCAGCGGACACAGGCCATGGAACAGTTGTCATTGAGCTCACATACTCTGGAAGTGATGGTCCCTGTAAAATTCCGATTGTCTCAGTCGCGAGTTTAAACGACATGACCCCTGTGGGGAGGCTGGTAACAGTAAACCCCTTCGTCGCGACATCTAGCTCCAACTCAAAGGTGCTGGTTGAGATGGAACCTCCCTTCGGAGACTCTTATATCGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATTAACCATCACTGGCACAAAGCTGGAAGCACGCTGGGTAAAGCCTTCTCAACAACTTTGAAAGGGGCTCAGAGACTAGCAGCGCTAGGTGACACAGCTTGGGACTTCGGCTCCATTGGAGGGGTATTCAACTCCATAGGGAAAGCTGTTCACCAAGTATTTGGCGGTGCATTCAGAACGCTCTTCGGGGGAATGTCTTGGGTCACACAAGGACTAATGGGGGCCTTACTTCTTTGGATGGGTGTCAACGCACGAGACCGGTCAATCGCCCTGGCTTTTCTGGCCACGGGAGGTGTGCTCGTGTTTTTAGCGACCAATGTGCATGCCGACACTGGCTGTGCCATTGACATCACAAGAAAAGAAATGAGGTGTGGAAGTGGCATCTTCGTGCACAACGACGTAGAGGCTTGGGTAGATAGGTACAAATATCTGCCAGAGACGCCCAGATCCTTAGCGAAGATCGTCCACAAAGCACATCAAGAAGGAGTGTGCGGGGTCAGATCCGTCACTAGACTGGAACACCAGATGTGGGAATCTGTGCGGGACGAACTGAATGTCTTGCTCAAAGAGAACGCGGTGGATCTCAGTGTGGTGGTGAACAAGCCCGTGGGGAGATATCGCTCAGCCCCCAAACGCCTATCCATGACTCAAGAAAAGTTTGAGATGGGCTGGAAAGCATGGGGAAAAAGCATTCTCTTCGCCCCCGAATTGGCCAACTCCACGTTCGTCGTGGATGGACCCGAGACAAAGGAATGCCCTGATGAGCGCAGAGCCTGGAACAGCATGCAAATCGAAGATTTCGGCTTTGGCATCACATCAACCCGAGTGTGGCTGAAAATTAGAGAGGAGAACACTGATGAGTGTGATGGAGCAATCATAGGGACAGCTGTCAAAGGGCATGTGGCAGTTCATAGTGACTTGTCATACTGGATTGAGAGCCGTCTCAATGACACCTGGAAACTTGAGAGGGCTGTCTTCGGAGAGGTGAAATCTTGCACTTGGCCCGAGACACACACTCTTTGGGGTGACGGTGTTGAGGAGAGCGAGCTTATCATCCCACACACCATAGCTGGACCGAGAAGCAAGCACAACCGGAGAGAAGGGTATAAAACACAAAACCAGGGACCCTGGGATGAGAACGGCATCGTCCTTGACTTTGACTATTGTCCAGGAACAAAAGTCACCATCACAGAGGACTGTGGCAAGAGGGGTCCCTCAATCAGAACCACTACTGACAGTGGAAAGCTGATCACCGATTGGTGCTGCCGCAGCTGTTCTCTACCGCCTTTACGGTTCCGGACAGAAAATGGTTGCTGGTATGGGATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGATGAAACAACACTCGTTAGATCACAGGTTGACGCTTTCAACGGCGAAATGATTGACCCTTTTCAGCTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACGATTCCTGCGGTTTTGGGGGCTCTACTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACTTACACTGACCTGGCAAGATATGTGGTGCTAGTTGCTGCGGCTTTCGCGGAGGCCAACAGTGGAGGAGATGTTCTGCACCTCGCTTTGATAGCCGTATTCAAGATCCAACCAGCTTTTCTGGTCATGAACATGCTTAGCGCGAGATGGACGAACCAAGAGAACGTGGTTCTGGTCCTGGGGGCGGCTTTTTTCCAACTGGCTTCAGTGGATTTACAGATCGGAGTCCACGGAATCCTGAATGCCGCAGCCATAGCATGGATGATCGTTCGAGCGATCACATTTCCCACAACTTCTACCGTTGCCATGCCAGTCTTAGCGCTCCTAACTCCGGGAATGAGGGCCTTGTATCTGGACACTTACAGAATCATTCTTCTTGTCATAGGAATTTGTTCCCTGCTGCAAGAGAGGAGAAAGACCATGGCGAAGAAGAAAGGAGCCGTGCTCTTGGGCTTAGCGCTCACATCCACCGGATGGTTTTCGCCCACCACTATCGCAGCCGGACTAATGGTCTGCAACCCAAACAAGAAGAGAGGGTGGCCAGCTACCGAGTTCCTTTCAGCGGTTGGGTTGATGTTTGCCATTGTGGGAGGTCTAGCCGAGTTGGACATCGAATCTATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGGCTCATGGCAGTGTCCTACGTGGTATCAGGAAAGGCAACCGACATGTGGCTGGACCGGGCTGCCGATATCAGCTGGGAGATGGAAGCTGCAATCACAGGAAGTAGCCGGAGGCTAGATGTTAAGTTGGATGACGACGGCGACTTTCACTTGATTGATGATCCCGGTGTTCCATGGAAAGTCTGGCTCTTGCGTATGTCTTGTATCGGTTTAGCCGCTCTGACACCCTGGGCTATCGTTCCCGCCGCTTTTGGCTATTGGCTCACTCTGAAAACAACGAAAAGAGGGGGCGTGTTCTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCTTGCTTAAAGGGGGACACCACCACAGGAGTTTACCGAATTATGGCTAGGGGGATTCTCGGCACTTACCAGGCCGGCGTTGGAGTCATGTACGAGAATGTTTTCCACACATTGTGGCACACAACTAGAGGAGCAGCCATCATGAGTGGAGAAGGAAAGCTAACGCCATACTGGGGTAGTGTGAAGGAAGACCGCATAAGCTATGGAGGCCCGTGGAGGTTCGACCGGAAGTGGAATGGAACAGATGATGTGCAAGTGATCGTGGTGGAACCAGGGAAACCTGCAGTAAACATCCAGACAAAACCGGGAGTGTTCCGCACCCCTTTCGGGGAGGTTGGAGCAGTCAGCTTGGACTACCCACGGGGAACA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| 11,440
|
OR531689.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Li,C., Zhao,W.
|
Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-10-24
|
SDWF-2021
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,965
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Culex
| null |
2021-07
| null | null |
Japanese encephalitis virus isolate SDWF-2021, complete genome
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| 11,701
|
OR119827.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Marano,J.M., Bowen,R.A., Bosco-Lauth,A.M.
|
Colorado State University, Biomedical Sciences
|
USA
|
2023-07-19
|
JKT5441
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,961
|
GenBank
| null |
Indonesia
|
Indonesia
|
Culicidae
| null |
1980-06
| null | null |
Japanese encephalitis virus isolate JKT5441, complete genome
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| 14,644
|
OP588746.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Li,C., Li,Y., Chen,X., Zhang,L.
|
Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-04-29
|
Beijing/2020-1
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,977
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2020-10
| null | null |
Japanese encephalitis virus isolate Beijing/2020-1, complete genome
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AGAAGTTTATCTGTGTGAACTTCTTGGCTTAGTATCGTTGAGAAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGATAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGTAAAAACCGGGCTATCAATATGCTGAAACGCGGCCTACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTAATGAGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTACGTTTCGTGCTGGCTCTTATCACGTTCTTCAAGTTTACAGCATTAGCCCCGACCAAGGCGCTTTTAGGCCGATGGAAAGCAGTGGAAAAGAGTGTAGCAATGAAACATCTCACTAGTTTCAAACGAGAACTTGGAACACTCATTGACGCCGTGAACAAGCGGGGCAGAAAGCAAAACAAAAGAGGAGGAAATGAAGGCTCAATCATGTGGCTCGCGAGCTTGGCAGTTGTCATAGCTTGTGCAGGAGCCATGAAGTTGTCAAATTTCCAGGGGAAGCTTTTGATGACCATTAACAACACGGACATTGCAGACGTTATCGTGATTCCCACCTCAAAAGGAGAGAACAGATGCTGGGTCCGGGCAATCGACGTCGGCTACATGTGTGAGGACACTATCACGTACGAATGTCCTAAGCTTACCATGGGCAATGATCCAGAGGATGTGGATTGCTGGTGTGACAACCAAGAAGTCTACGTCCAATATGGACGGTGCACGCGGACCAGGCATTCCAAGCGAAGCAGGAGATCCGTGTCGGTCCAAACACATGGGGAGAGTTCACTAGTGAATAAAAAAGAGGCTTGGCTGGATTCAACGAAAGCCACACGATATCTCATGAAAACTGAGAACTGGATCATAAGGAATCCTGGCTATGCTTTCCTGGCGGCGGTACTTGGCTGGATGCTTGGCAGTAACAACGGTCAACGCGTGGTATTCACCATCCTCCTGCTGCTGGTCGCTCCGGCTTACAGTTTTAATTGTCTGGGAATGGGCAATCGTGACTTCATAGAAGGAGCCAGTGGAGCCACTTGGGTGGACTTGGTGCTAGAAGGAGATAGCTGCTTGACAATTATGGCAAACGACAAACCAACATTGGACGTCCGCATGATCAACATCGAAGCTAGCCAACTTGCTGAGGTCAGAAGTTACTGTTATCATGCTTCAGTCACTGACATCTCGACGGTGGCTCGGTGCCCCACGACTGGAGAAGCCCACAACGAGAAGCGAGCTGATAGTAGCTATGTGTGCAAACAAGGCTTCACTGATCGTGGGTGGGGCAACGGATGTGGACTTTTCGGGAAGGGAAGCATTGACACATGTGCAAAATTCTCCTGCACCAGGAAAGCGATTGGGAGAACAATCCAGCCAGAAAACATCAAATACGAAGTTGGCATTTTTGTGCATGGAACCACCACTTCGGAAAACCATGGGAATTATTCAGCGCAAGTTGGGGCGTCCCAGGCGGCAAAGTTTACAGTAACACCCAATGCTCCTTCGATAACCCTCAAACTTGGTGACTACGGAGAAGTCACACTGGACTGTGAGCCAAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTTTACGTCATGACCGTGGGGTCAAAGTCATTTCTGGTCCATAGGGAATGGTTTCATGACCTCGCTCTCCCCTGGACGCCCCCTTCGAGCACAGCGTGGAGAAACAGAGAACTCCTCATGGAGTTTGAAGAGGCGCACGCCACAAAACAGTCCGTTGTTGCTCTTGGGTCACAGGAAGGAGGCCTCCATCAGGCGTTGGCAGGAGCCATCGTGGTGGAGTACTCAAGCTCAGTGAAGTTAACATCAGGCCACCTGAAATGTAGGCTGAAAATGGACAAACTGGCTCTGAAAGGCACAACCTATGGCATGTGCACAGAAAAATTCTCGTTCGCGAAAAATCCGGCGGACACTGGTCACGGAACAGTTGTCATTGAACTCTCCTACTCTGGGAGTGATGGCCCCTGCAAAATTCCGATTGTCTCCGTTGCGAGCCTCAATGACATGACCCCCGTTGGGCGGCTGGTGACAGTGAACCCCTTCGTCGCGACTTCCAGTGCCAATTCAAAGGTGCTGGTCGAGATGGAACCCCCCTTCGGAGACTCCTACATCGTAGTTGGAAGGGGAGACAAGCAGATCAACCACCATTGGCACAAAGCTGGAAGCACGCTGGGCAAAGCCTTTTCAACAACTTTGAAGGGAGCTCAGAGACTGGCAGCGTTGGGTGACACAGCCTGGGACTTTGGCTCCATTGGAGGGGTCTTCAACTCCATAGGAAAAGCCGTTCACCAAGTGTTTGGTGGTGCCTTCAGAACACTCTTTGGGGGAATGTCTTGGATCACACAAGGGCTAATGGGTGCCCTACTACTCTGGATGGGCGTCAACGCACGAGACCGATCAATTGCTTTGGCCTTCTTAGCCACAGGAGGTGTGCTCGTGTTCTTAGCGACCAATGTGCATGCTGACACTGGATGTGCCATTGACATCACAAGAAAAGAGATGAGGTGTGGAAGTGGCATCTTCGTGCACAACGACGTGGAAGCCTGGGTGGATAGGTATAAATATTTGCCAGAAACGCCCAGATCCCTAGCGAAGATCGTCCACAAAGCGCACAAGGAAGGCGTGTGCGGAGTCAGATCTGTCACTAGACTGGAGCATCAAATGTGGGAAGCCGTACGGGATGAATTGAACGTCCTGCTCAAAGAGAATGCAGTGGACCTCAGTGTGGTTGTGAACAAGCCCGTGGGGAGATATCGCTCAGCCCCTAAACGCCTATCCATGACGCAAGAGAAGTTTGAAATGGGCTGGAAAGCATGGGGAAAGAGCATTCTTTTTGCCCCGGAATTGGCTAACTCCACATTTGTCGTAGATGGACCTGAGACAAAGGAATGCCCTGATGAGCACAGAGCTTGGAACAGCATGCAAATCGAAGACTTCGGCTTTGGCATCACATCAACCCGTGTGTGGCTGAAGATTAGAGAGGAGAGCACTGACGAGTGTGATGGAGCGATCATAGGTACGGCTGTCAAAGGACATGTGGCAGTCCATAGTGACTTGTCGTACTGGATTGAGAGTCGCTACAACGACACATGGAAACTTGAGAGGGCAGTCTTTGGAGAGGTTAAATCTTGCACTTGGCCAGAGACACACACCCTATGGGGAGATGGTGTTGAGGAAAGTGAACTCATCATTCCGCATACCATAGCCGGACCAAAAAGCAAGCACAATCGGAGGGAAGGGTATAAGACACAAAACCAGGGACCTTGGGACGAGAATGGCATAGTCTTGGACTTTGACTATTGCCCAGGGACAAAAGTCACCATTACAGAGGATTGTGGCAAGAGAGGCCCTTCGGTCAGAACCACTACTGACAGTGGAAAGTTGATCACTGACTGGTGCTGTCGCAGTTGCTCCCTTCCGCCCCTACGATTCCGGACAGAAAATGGCTGCTGGTACGGAATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGATGAAACAACACTCGTCAGATCGCAGGTTGATGCTTTTAATGGTGAAATGGTTGACCCTTTTCAGCTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACCATTCCTGCGGTTTTGGGGGCCCTACTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACTTACACTGATTTGGCGAGGTATGTGGTGCTAGTCGCTGCTGCTTTCGCAGAGGCCAACAGTGGAGGAGACGTCCTGCACCTTGCTTTGATTGCCGTTTTTAAGATCCAACCAGCATTTCTAGTGATGAACATGCTTAGCACGAGATGGACGAACCAAGAAAACGTGGTTCTGGTCCTAGGGGCTGCCTTTTTCCAATTGGCCTCAGTAGATCTGCAAATAGGAGTTCACGGAATCCTGAATGCCGCCGCTATAGCATGGATGATTGTCCGGGCGATCACCTTCCCCACAACCTCCTCCGTCACCATGCCAGTCTTAGCGCTTCTAACTCCGGGTATGAGGGCTCTATACCTAGATACTTACAGAATCATCCTCCTCGTCATAGGGATTTGCTCTCTGCTGCAAGAGAGGAAAAAGACCATGGCAAAAAAGAAAGGAGCTGTACTCTTGGGCTTAGCGCTCACATCCACTGGATGGTTTTCGCCCACCACTATAGCTGCCGGACTAATGGTCTGCAACCCAAACAAGAAGAGAGGGTGGCCAGCTACTGAGTTTTTGTCGGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTAGGTGGTTTGGCAGAGTTGGATATTGAATCCATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGTCTCATGGCAGTGTCCTACGTGGTGTCAGGAAAAGCAACAGATATGTGGCTTGAACGGGCCGCCGACATCAGCTGGGAGATGGATGCTGCAATCACAGGAAGCAGTCGGAGGCTGGATGTGAAGCTGGATGAAGACGGAGATTTTCACTTGATTGATGATCCCGGTGTTCCATGGAAGGTCTGGGTCCTGCGCATGTCTTGCATTGGCTTAGCTGCCCTCACGCCTTGGGCCATTGTTCCCGCCGCTTTTGGTTATTGGCTCACTTTAAAAACAACAAAAAGAGGAGGCGTGTTTTGGGACACGCCATCCCCAAAACCTTGCTCAAAAGGAGACACCACTACAGGAGTTTACCGCATTATGGCTAGAGGGATTCTTGGCACTTACCAGGCCGGCGTCGGAGTCATGTACGAGAATGTTTTCCACACACTATGGCACACAACTAGAGGAGCAGCCATTATGAGTGGAGAAGGAAAATTGACGCCATACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACCGCATAGCTTACGGAGGCCCATGGAGGTTTGATCGAAAATGGAATGGAACAGATGACGTGCAAGTGATCGTGGTAGAACCGGGGAAGGCTGCAGTAAACATCCAGACAAAACCAGGGGTGTTTCGGACTCCCTTCGGGGAGGTTGGGGCTGTTAGTCTGGATTACCCG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GGACTTGCGTCTCATGGCAAATGCGATTTGCTCAGCAGTGCCAGTGGATTGGGTGCCCACGGGCAGGACATCCTGGTCGATACACTCGAAAGGAGAGTGGATGACCACAGAAGACATGCTGCAGGTCTGGAACAGAGTCTGGATTGAAGAAAATGAATGGATGATGGACAAGACTCCAATCACAAGCTGGACAGACGTTCCGTACGTGGGAAAGCGTGAGGACATCTGGTGTGGCAGCCTCATCGGAACGCGATCCAGAGCAACCTGGGCTGAGAACATCTACGCGGCGATAAACCAGGTTAGAGCTGTCATTGGGAAAGAAAATTATGTTGACTACATGACCTCACTCAGGAGATACGAAGACGTCTTGATCCAGGAAGACAGGGTCATCTAGTGTGATTTAAGGTAGAAAAGTAGACTATGTAAATAATGTAAATGAGAAAATGCATGCATATGGAGTCAGGCCAGCAAAAGCTGCCACCGGATACTGGGTAGACGGTGCTGCCTGCGTCTCAGTCCCAGGAGGACTGGGTTAACAAATCTGACAACAGAAAGTGAGAAAGCCCTCAGAACCGTCTCGGAAGCAGGTCCCTGCTCACTGGAAGTTGAAGGACCAACGTCAGGCCACAAATTTGTGCCACTCCGCTGGGGAGTGCGGCCTGCGCAGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGTTGAGGCCCCCACGGCCCAAGCCTCGTCTAGGATGCAATAGACGAGGTGTAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAAACAACAACATGCGGCCCAAGCCCCCTCGAAGCTGTAGAGGAGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCATTTGCATCAAACAGCATATTGACACCTGGGAATAGACTGGGAGATCTTCTGCTCTATCTCAACATCAGCTACTAGGCACAGAGCGCCGAAGTATGTAGCTGGTGGTGAGGAAGAACACAGGATCT
| 16,422
|
ON804797.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Lim,M.J., Loh,Z.Y., Yeo,H.L., Yenamandra,S.P., Kong,M., Pang,H.Y., Lee,M.H., Humaidi,M., Chua,C., Griffiths,J., Ng,L.C., Hapuarachchi,H.C., Mailepessov,D.
|
Environmental Health Institute, Field Ecology, EETD
|
Singapore
|
2022-12-10
|
SG/EHI-CT1372_Nov_2019
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
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Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,949
|
GenBank
| null |
Singapore
|
Singapore
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2019-11
| null | null |
Japanese encephalitis virus isolate SG/EHI-CT1372_Nov_2019, complete genome
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AACTTCTTGGCTTAGTAGCGTTGAGAAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGAACAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGAAAGAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGATTACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTGATGAGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTACGATTTGTGCTGGCTCTTATCACGTTCTTCAAGTTTACAGCATTAGCCCCGACTAAGGCGCTTTTGGGCCGCTGGAGAGCAGTGGAAAAAAGTGTGGCAATGAAACATCTTACCAGTTTCAAACGAGAACTCGGAATACTCATCGACGCCGTGAACAAGCGGGGCAAAAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGAAAGCTCGATCATGTGGCTTGCCAGCTTGGCAATCGTAACAGCCTGTGCCGGAGCCATGAAGTTATCAAACTTTCAAGGAAAGCTTTTGATGACCATCAACAATACGGACATTGCGGACGTCATCGTGATCCCCACCTCAAAAGGTGAAAACCGATGTTGGGTCCGAGCAATCGACGTTGGTTACATGTGTGAAGACACCATCACGTACGAATGTCCGAAGCTTGCCGTGGGCAACGATCCGGAAGACGTGGACTGCTGGTGCGACAATCAAGAAGTCTACGTGCAGTATGGTCGCTGCACACGGACCAGGCACTCCAAACGAAGCAGGAGATCCGTCTCGGTCCAGACGCATGGGGAAAGCTCACTAGTGAACAAAAAAGAGGCCTGGCTGGATTCAACGAAGGCCACGCGATACCTCATGAAAACGGAGAACTGGATCATAAGGAACCCTGGTTATGCTTTCCTAGCGGCGGCACTTGGATGGATGCTTGGCAGCAACAGTGGCCAACGTGTGGTGTTTACTATTCTCCTGCTGTTGGTCGCTCCGGCTTACAGTTTTAACTGTTTGGGAATGGGGAATCGGGACTTCATAGAAGGAGCCAGTGGAGCCACTTGGGTGGATCTGGTGTTAGAAGGAGACAGCTGTTTGACAATCATGGCAAACGACAAACCAACGCTAGATGTCCGCATGATCAATATTGAAGCTAGCCAACTTGCTGAAGTCAGGAGTTACTGCTATCACGCTTCAGTCACTGACATCTCAACAGTGGCTCGGTGCCCCACGACTGGAGAAGCCCACAACGAAAAACGTGCTGACAGCAGCTACGTGTGCAAACAAGGTCTTACTGACCGCGGATGGGGAAATGGATGTGGACTCTTCGGGAAAGGAAGCATTGATACATGCGCAAAATTTTCCTGTACAAGTAAGGCCATTGGAAGAATGATCCAACCAGAGAACATCAAGTACGAGGTTGGCATATTCGTGCACGGAACCACCACCTCGGAAAACCATGGAAATTACTCAGCGCAAGTAGGAGCGTCTCAAGCAGCAAAGTTTACTGTAACTCCAAATGCTCCATCAATAACCCTCAAGCTCGGTGATTATGGAGAAGTCACATTGGATTGTGAACCAAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTCTATGTCATGACCGTGGGTTCGAAGTCATTCTTAGTCCATAGGGAATGGTTCCATGACCTTTCTCTTCCCTGGGCGTCCCCCTCAAGCGCGGCATGGAGAAACAGAGAACTCCTCATGGAATTTGAAGAGGCACATGCCACAAAACAATCTGTCGTAGCTCTTGGGTCACAGGAAGGAGGCCTCCATCAAGCGTTGGCAGGAGCCATCGTGGTGGAGTACTCGAGTTCAGTGAAACTGACATCAGGTCACCTGAAATGCAGGCTAAAAATGGACAAACTGGCTTTGAAAGGCACGACTTATGGCATGTGTACAGAAAAATTCTCGTTCGCGAAAAATCCAGCGGACACAGGCCATGGAACAGTTGTCATTGAGCTCACATACTCTGGAAGTGATGGTCCCTGTAAAATTCCGATTGTCTCAGTCGCGAGTTTAAACGACATGACCCCTGTGGGGAGGCTGGTAACAGTAAACCCCTTCGTCGCGACATCTAGCTCCAACTCAAAGGTGCTGGTTGAGATGGAACCTCCCTTCGGAGACTCTTATATTGTGGTTGGCAGAGGGGACAAGCAGATTAACCACCACTGGCACAAAGCTGGAAGCACGCTGGGTAAAGCTTTCTCAACGACTTTGAAAGGGGCTCAGAGGCTAGCAGCGCTAGGTGACACAGCCTGGGACTTTGGCTCCATAGGAGGGGTATTCAACTCCATAGGAAAAGCTGTTCACCAAGTGTTTGGCGGTGCATTCAGAACGCTCTTTGGGGGAATGTCTTGGATCACACAAGGACTGATGGGAGCCCTACTTCTTTGGATGGGTGTCAACGCACGAGACCGGTCAATCGCCCTGGCTTTTCTGGCCACGGGAGGTGTGCTCTTGTTTTTAGCGACCAATGTGCATGCCGACACTGGCTGCGCCATTGACATCATAAGAAAAGAGATGAGGTGTGGAAGCGGCATCTTCGTGCACAATGACGTAGAGGCTTGGGTAGATAGGTACAAATATCTGCCAGAGACGCCCAGATCCTTAGCAAAGATCGTCCACAAAGCACATCAAGAAGGAGTGTGCGGGGTCAGATCCGTCACCAGACTGGAACACCAGATGTGGGAATCTGTGCGTGACGAACTGAACGTTTTGCTCAAAGAGAACGCGGTGGATCTTAGCGTGGTGGTGAACAAGCCCGTGGGGAGATATCGCTCAGCTCCCAAACGCCTATCCATGACTCAAGAAAAGTTTGAGATGGGCTGGAAAGCATGGGGAAAAAGCATTCTCTTCGCTCCCGAATTGGCCAACTCCACGTTCGTCGTGGATGGACCCGAGACAAAGGAATGCCCTGATGAGCGCAGAGCCTGGAACAGCATGCAAATCGAAGACTTCGGTTTCGGCATCACATCAACCCGAGTGTGGCTTAAAATTAGGGAGGAGGACACTGATGAGTGTGACGGAGCAATCATAGGGACAGCCGTTAAAGGGCACGTGGCAGTTCATAGTGACCTGTCATACTGGATTGAGAGCCGTCTCAATGACACCTGGAAACTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAAGTGAAATCTTGCACTTGGCCCGAGACACACACTCTTTGGGGTGACGGTGTTGAGGAGAGCGAGCTTATCATCCCACACACCATAGCTGGACCGAGAAGCAAGCACAACCGGAGAGAAGGGTACAAAACACAAAACCAGGGACCCTGGGATGAGAACGGCATCGTCCTTGACTTTGATTATTGTCCAGGAACAAAAGTCACCATTACAGAGGACTGTGGCAAGAGGGGACCCTCAATTAGAACCACTACTGACAGCGGAAAGCTGATCACCGATTGGTGCTGTCGCAGCTGTTCTCTACCGCCTTTACGGTTCCGGACAGAAAATGGTTGCTGGTATGGGATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGATGAAACAACACTCGTTAGATCACAGGTTGACGCTTTTAACGGCGAAATGATTGACCCTTTTCAGCTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACGATTCCTGCGGTTTTGGGGGCTCTACTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACTTACACTGACCTGGCAAGATATGTGGTGCTGGTTGCTGCGGCTTTCGCGGAAGCCAACAGTGGGGGAGATGTTCTGCACCTCGCTCTGATAGCCGTCTTCAAGATCCAACCAGCTTTCTTGGTCATGAACATGCTTAGCGCGAGATGGACGAATCAAGAGAACGTGGTCCTGGTCTTGGGGGCGGCTTTTTTCCAACTAGCTTCAGTGGATTTACAGATCGGAGTCCACGGAATCCTGAATGCCGCAGCCATAGCATGGATGATCGTTCGAGCGATCACATTTCCCACAACTTCTACTGTCGCCATGCCAGTCTTAGCGCTCCTAACTCCGGGAATGAGGGCCTTGTATCTGGACACTTACAGAATCATTCTTCTTGTCATAGGAATTTGTTCCCTGCTGCAAGAGAGGAGAAAGACCATGGCGAAGAAGAAAGGAGCCGTGCTCTTGGGCTTAGCGCTCACATCCACCGGATGGTTTGCGCCCACCACTATCGCAGCCGGACTAATGGTCTGCAACCCAAACAAGAAGAGAGGGTGGCCAGCCACTGAGTTCCTTTCAGCGGTTGGGTTGATGTTTGCCATTGTGGGAGGTCTAGCCGAGTTGGACATCGAATCTATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGGCTCATGGCAGTGTCCTACGTGGTATCAGGAAAGGCGACCGACATGTGGCTGGACCGGGCTGCCGACATCAGCTGGGAGATGGAAGCTGCGATCACAGGAAGTAGCCGGAGGCTAGATGTTAAGTTGGATGACGACGGCGACTTTCACTTGATTGATGACCCCGGTGTGCCATGGAAGGTCTGGCTCCTGCGTATGTCTTGCATCGGTCTAGCTGCTCTGACGCCCTGGGCCATCGTTCCCGCCGCCTTTGGCTATTGGCTCACTCTGAAAACAACAAAAAGAGGGGGTGTGTTCTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCCTGCTTAAAGGGGGACACCACCACAGGAGTTTACCGAATCATGGCTAGGGGGATTCTCGGCACTTACCAGGCCGGCGTTGGAGTCATGTACGAGAATGTTTTTCATACATTGTGGCACACAACTAGAGGAGCAGCCATCATGAGTGGAGACGGAAAGCTAACGCCATATTGGGGTAGTGTGAAGGAAGACCGCATAAGCTATGGAGGCCCATGGAGGTTCGACCGGAAGTGGAATGGAACAGATGATGTGCAAGTGATCGTGGTGGAACCAGGGAAACCTGCAGTAAACATACAGACAAAACCGGGAGTGTTTCGCACCCCTTTTGGGGAAGTTGGAGCAGTCAGCCTGGACTACCCACGGGGAACATCCGGTT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GCAAATGCAATCTGCTCAGCAGTTCCAGTGGACTGGGTGCCTACAGGCAGAACATCCTGGTCAATACACTCAAGAGGAGAGTGGATGACCACTGAAGACATGCTGCAAGTCTGGAACAGGGTATGGATTGAAGAAAATGAATGGATGATGGACAAGACCCCAATCACAAGCTGGACAGACGTTCCGTACGTGGGGAAGCGTGAGGATATCTGGTGTGGCAGTCTCATCGGAACGCGATCCAGGGCAACATGGGCTGAGAACATCTACGCAGCAATAAACCAAGTGAGGGCCATTATTGGAAAAGAAAACTATGTTGATTACATGACTTCCCTCAGAAGATATGAGGATGTATTGATTCAAGAGGACAGGGTTATTTAGATAGGATTAAGTCATGTGTGTAATGTGAGATAAGAAAATGTGCATGTGGAGTCAGGCCAGCAAAAGCTGCCACCGGATACTGAGTAGACGGTGCTGCCTGCGTCTCAGTTCCAGGAGGACTGGGTCAACAAATCTGACAACGGAAGGTGGGAAAGCCCTCAGAACCGTCTCGGAAGCAGGTCCCTGCTCACCGGAAGTTGAAAGACCAACGTCAGGCCACAATTCTGTGCCACTCCGCTGGGGAGTGCGGCCTGCGCAGCCCCAGGAGGACTGGGTTAACAAAGCCGTTGAGGCCCCCACGGCCCAAGCCTCGTCTAAGATGCAATGGACTAGGTGTAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAAACAACATTATGCGGCCCAAACCCCCTCGAAGCTGTAGAGGGGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCATTTGCATCAAAACAGCATATTGACACCTGGGAATAGACTGGGAGATCTTCTGCTCTATCTCAACATCAGCTACTAGGCACAGAGCGCCGAAATATGTAGCTGGTGGTGAGGAAGAACACAGGATCTC
| 21,302
|
ON804798.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Lim,M.J., Loh,Z.Y., Yeo,H.L., Yenamandra,S.P., Kong,M., Pang,H.Y., Lee,M.H., Humaidi,M., Chua,C., Griffiths,J., Ng,L.C., Hapuarachchi,H.C., Mailepessov,D.
|
Environmental Health Institute, Field Ecology, EETD
|
Singapore
|
2022-12-10
|
SG/EHI-CX135_Oct2019
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,946
|
GenBank
| null |
Singapore
|
Singapore
|
Culex
| null |
2019-10
| null | null |
Japanese encephalitis virus isolate SG/EHI-CX135_Oct2019, complete genome
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TGTGTGAACTTCTTGGCTTAGTATCGTTGAGAAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGAACAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGAAAAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGACTACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTGATGGGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTGCGATTCGCGCTGGCTCTTATCGCATTCTTCAAGTTCACAGCATTAGCCCCGACCAAGGCGCTTTTGGGCCGATGGAGGGCAGTGGAGAAGAGTGTAGCAATGAAACACCTTACCAGTTTCAAACGAGAACTTGGGACACTCATCGACGCTGTGAATAAACGGGGCAAGAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGAGAGCTCGATCATGTGGCTTGCTAGCTTGGCAATCGTAACAGCTTGTGCCGGAGCCATGAAGCTATCAAACTTTCAAGGAAAGCTTCTGATGACCATCAACAACACGGACATTGCGGACGTCATCGTGATCCCCACCTCAAAAGGCGAAAACAGATGTTGGGTCCGAGCGATCGACGTTGGTTACATGTGTGAAGACACCATCACGTACGAATGTCCAAAGCTAGCAGTGGGCAACGATCCAGAAGATGTGGACTGCTGGTGCGACAACCAAGAAGTCTTTGTGCGGTATGGTCGCTGCACACGGACTAGGCATTCCAAACGAAGCAGAAGATCCGTTTCGGTCCAAACGCATGGGGAAAGCTCACTGGTGAACAAGAAAGAGGCCTGGCTGGATTCAACGAAAGCCACGCGATACCTCATGAAAACGGAGAATTGGATCATAAGGAATCCTGGTTATGCTTTCCTGGCGGCGGCACTTGGTTGGATGCTTGGCAGCAACAGTGGTCAACGCGTGGTGTTCACCATCCTCTTGCTGTTGGTCGCTCCGGCTTATAGCTTCAACTGTCTTGGAATGGGGAACCGAGATTTCATAGAAGGAGCCAGTGGAGCCACTTGGGTGGATCTGGTGTTAGAAGGAGACAGTTGTTTGACAATTATGGCGAATGACAAGCCAACACTAGATGTCCGCATGATCAACATTGAGGCCAGCCAACTTGCCGAAGTCAGGAGCTACTGCTATCACGCTTCAGTCACTGACATTTCAACGGTGGCTCGATGCCCCACGACTGGAGAAGCTCACAACGAGAAACGTGCTGATAGCAACTACGTATGCAAGCAAGGCTTTACTGACCGCGGATGGGGAAATGGATGTGGACTTTTCGGGAAAGGAAGCATTGACACCTGTGCGAAGTTTTCTTGCACCAATAAGGCCGTTGGAAGAACAATCCAACCAGAGAACATCAAGTATGAAGTTGGTGTATTCGTGCACGGAACCACCACCTCGGAAAACCATGGGAATTACTCAGCGCAGGTTGGAGCGTCTCAAGCAGCAAAGTTCACTGTGACTCCAAATGCTCCTTCAATAACCCTCAAGCTTGGTGAYTATGGAGAAGTTACACTGGATTGTGAACCAAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTCTATGTCATGACTGTGGGTTCGAAGTCATTCTTAGTCCATAGGGAATGGTTTCATGACCTTTCTCTTCCCTGGACGTCCCCCTCAAGCACGGCATGGAGGAATAGAGAACTCCTCATGGAATTTGAAGAGGCACATGCCACAAAACAATCTGTCGTGGCCCTTGGGTCACAGGAGGGAGGTCTCCATCAAGCGTTAGCAGGAGCCATTGTGGTGGAGTATTCAAGCTCAGTGAAGTTGACATCAGGCCACCTGAAATGCAGACTGAAAATGGACAAACTGGCCCTGAAGGGCACGACTTATGGCATGTGTACAGAGAAATTCTCGTTCGCGAAAAACCCAGCGGACACAGGCCATGGAACAGTTGTTATTGAGCTCACATACTCTGGAAGTGATGGTCCCTGCAAAATTCCGATTGTTTCAGTCGCGAGTTTAAATGACATGACCCCTGTGGGAAGGCTGGTAACAGTAAACCCCTACGTCGCTACATCCAGCTCCAACTCGAAGGTGCTGGTGGAGATGGAACCTCCCTTCGGAGACTCTTATATCGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATTAACCATCACTGGCACAAAGCTGGAAGCACGTTGGGCAAAGCCTTCTCAACAACTTTGAAAGGGGCTCAAAGACTGGCAGCGCTAGGGGACACAGCCTGGGACTTTGGTTCCATTGGGGGAGTGTTCAACTCCATAGGGAAGGCTGTTCACCAAGTCTTCGGTAGCGCATTTAGAACGCTCTTTGGGGGAATGTCTTGGATTACGCAAGGGCTAATGGGGGCTTTACTTCTCTGGATGGGTGTTAACGCACGAGATCGGTCAATCGCCTTGGCTTTTTTGGCTACGGGAGGTGTGCTCGTCTTTTTAGCGACCAATGTGCACGCTGACACCGGCTGTGCCATTGACATCACGAGAAAAGAAATGAGGTGTGGAAGTGGCATCTTCGTGCACAACGATGTAGAGGCCTGGGTAGACAGGTACAAGTATCTGCCAGAGACGCCTAGATCCCTAGCAAAGATCGTCCACAAAGCACATCTGGAAGGAGTGTGTGGGGTCAGATCCGTCACCAGATTGGAACACCAGATGTGGGAATCTGTGCGGGACGAATTGAATGTCTTGCTTAAAGAGAACGCGGTGGATCTCAGTGTGGTGGTTAACAAGCCTGTGGGGAGATACCGCTCAGCTCCCAAACGCCTGTCTATGACTCAAGAGAAGTTTGAGATGGGCTGGAAAGCGTGGGGAAAAAGCATTCTCTTCGCCCCCGAACTAGCCAACTCCACGTTCGTCGTGGATGGACCTGAGACCAAGGAATGCCCTGACGAGCGCAGAGCCTGGAACAGCATGCAAATCGAAGATTTCGGCTTTGGCATCACATCAACCCGCGTGTGGCTGAAAATTAGGGAGGAGGACACTGATGAGTGTGATGGAGCGATCATAGGCACAGCTGTAAAAGGGCATGTGGCAGTTCATAGTGACTTGTCATACTGGATTGAGAGCCGTTTCAATGAAACCTGGAAACTAGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAAGTGAAATCATGCACTTGGCCTGAGACACACACTCTTTGGGGTGATGGCGTTGAGGAGAGCGAGCTCATCATCCCACACACCATAGCTGGACCGAGAAGCAAGCACAATCGGAGAGAAGGGTACAAGACACAAAACCAGGGACCCTGGGATGAGAACGGCATTGTCCTTGATTTTGACTATTGTCCAGGGACTAAAGTCACCATCACAGAGGATTGTGGCAAGAGGGGGCCCTCAATCAGGACCACCACTGATAGTGGAAAGCTGATCACCGATTGGTGCTGTCGCAGCTGTTCCCTACCGCCCTTACGGTTCCGGACAGAAAATGGCTGCTGGTATGGGATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGATGAAACAACACTCGTTAGATCACAGGTTGACGCTTTCAATGGCGAAATGATTGACCCTTTTCAGCTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACGATTCCTGCGGTTTTGGGRGCYCTACTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACWTACACTGAYCTGGCAAGATATGTGGTGCTRGTTGCTGCGGCTTTCGCGGARGCCAACAGAGGRGGAGATGTTCTGCACCTCGCTCTGATAGCCGTCTTCAAGATCCAACCAGCTTTYYTGGTCATGAACATGCTYAGYGCRAGATGGACRAATCAAGAGAAYRTGGTYYTGGTCTTRGGGGCGGCTTTTTTCCAAYTAGCTTCRGTGGATTTACAGATCGGAGTCCACGGRATCCTGAAYGCCGCAGCYATAGCATGGATGATCGTTCGAGCGATCACWTTTCCCACAACTTCYACYGTYRCCATGCCAGTCTTAGCGCTCCTAACYCCRGGAATGAGRGCYTTGTATCTGGACACTTACAGAATCATTCTTCTYGTCATAGGAATTTGTTCCCTGCTRCAAGAGAGGAGAAAGACCATGGCGAAGAAGAAAGGRGCYGTGSTSYTGGGCYTRGCGCTCACATCCACCGGATGGTTYKCGCCCACCACYATCGCAGCCGGACTAATGGTCTGCAAYCCAAACAAGAAGAGAGGGTGGCCRGCCACTGAGTTCCTTTCAGCRGTTGGGTTGATGTTTGCCATTGTGGGRGGTCTAGCCGAGYTGGACATCGAATCYATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGKCTCATGGCAGTGTCCTACGTGGTATCAGGRAAGGCGACCGACATGTGGCTGGACCGGGCYGCCGACATCAGCTGGGAGATGGAAGCTGCRATCACAGGAAGTAGCCGGAGGYTRGATGTTAAGYTGGAYGACGACGGYGACTTYCAYTTGATTGATGACCCCGGTGTKCCATGGAARGTYTGGCTCYTGCGYATGTCYTGYATCGGYYTRGCYGCTCTRACRCCCTGGGCCATCGTYCCCGCCGCCTTTGGCTAYTGGCTYACTCTGAAAACAACRAAAAGAGGGGGYGTGTTCTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCYTGCTTAAAGGGGGAYACCACYACAGGAGTTTACCGAATCATGGCTAGGGGRATTCTCGGCACTTACCAGGCCGGCGTTGGRGTCATGTACGARAATGTTTTYCAYACAYTGTGGCAYACAACYAGAGGAGCAGCCATYATGAGTGGAGAMGGAAARCTAACGCCATAYTGGGGTAGTGTGAAGGAWGACCGCATAAGCTATGGAGGCCCRTGGAGGTTCGACCGGAAGTGGAATGGAACAGAYGATGTGCAAGTGATYGTGGTGGARCCRGGGAARCCTGCAGTAAACATMCAGACAAAACCGGGAGTGTTTCGMACCCCTTTTGGGGARRTTGGAGCAGTCAGCCTRGACTACCCRCGRGGAACAT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CTCATGGCAAATGCAATCTGCTCAGCAGTTCCAGTAGACTGGGTGCCTACAGGCCGAACATCCTGGTCAATACACTCAAAAGGAGAGTGGATGACCACTGAAGACATGCTGCAAGTCTGGAACAGGGTATGGATTGAAGAGAATGAATGGATGGCGGACAAGACCCCGATCACAAGCTGGACGGACGTCCCGTACGTGGGAAAACGTGAGGACATCTGGTGTGGCAGCCTCATCGGAACGCGATCCAGGGCAACTTGGGCAGAGAACATCTATGCAGCAATAAACCAAGTGAGAGCCGTCATTGGAAAAGAAAATTATGTTGATTACATGACTTCCCTCAGAAGATATGAGGATGTCTTGATCCAGGAGGACAGGGTCATCTAGACAGGAGATCAAGTTATGTGTGGAATGTGAGGTAAGAAAATGTGCATGTGGAGTCAGGCCAGCAACAGCTGCCACCGGATACTGGGTAGACGGTGCTGCCTGCGCCTCAGTCCCAGGAGGACTGGGTTAACAAATCTGACAACGGAAGGTGGGAAAGCCCTCAGAACCGTTTCGGAAATAGGTCCCTGCCCACCGAAAGTTGAAAGACCAACGTCAGGCCACAAATTTGTGCCACTCCGCTGGGGAGTGCGGCCTGCGCAGCCCCAGGAGGACTGGGTTAACAAAGCCGTTGAGGCCCCCACGGCCCAAGCCTCGTTTAGGATGCAATGGACGAGGTGTAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAAACAACAACATGCGGCCCAAACCCCCTCGAAGCTGTAGAGGAGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCATTTGCATCAAAAACAGCATATTGACACCTGGGAATAGACTGGGAGATCTTCTGCTCTATCTCAACATCAGCTACTAGGCACAGAGCGCCGAAACATGTAGCTGGTGGTGAGGAAGA
| 21,303
|
ON804799.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Lim,M.J., Loh,Z.Y., Yeo,H.L., Yenamandra,S.P., Kong,M., Pang,H.Y., Lee,M.H., Humaidi,M., Chua,C., Griffiths,J., Ng,L.C., Hapuarachchi,H.C., Mailepessov,D.
|
Environmental Health Institute, Field Ecology, EETD
|
Singapore
|
2022-12-10
|
SG/EHI-MS_CT261_Nov2020
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,941
|
GenBank
| null |
Singapore
|
Singapore
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2020-11
| null | null |
Japanese encephalitis virus isolate SG/EHI-MS_CT261_Nov2020, complete genome
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TGAACTTCTTGGCTTAGTATCGTTGAGAAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGAACAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGAATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTAATGAGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTGCGATTTGTGCTGGCTCTTGTCGCATTCTTCAAGTTCACAGCATTAGCCCCGACCAAGGCGCTTTTGGGCCGATGGAGAGCAGTGGAGAAGAGTGTGGCAATGAAACATCTTACCAGTTTCAAACGAGAACTTGGGACACTCATCGATGCCGTGAACAAACGGGGCAAAAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGAGAGTTCAATTATGTGGCTTGGTAGCTTGGCAATCGTAACAGCTTGCGCCGGAACCATGAAGCTATCAAACTTTCAAGGAAAGCTTCTGATGACCATCAACAACACGGACATTGCGGACGTCATCGTGATCCCCACCTCAAAAGGCGAAAACAGATGTTGGGTCCGAACAATCCACGTTGGTTACATGTGTGAAGACACCATCACGTACGAATGTCCAAAGCTAGCCGTGGGTAACGACCCAAAAGACGTGGACTGCTGGTGCGACAATCAAGAAGTCTTCGTACAGTATGGTCGCTGCACACGAACCAGGCATTCCAAACGAAGCAGAAGATCCGTTTCGGTCCAGACGCATGGGGAAAGCTCACTAGTGAACAAAAAAGAAGCTTGGCTGGATTCAACGAAGGCCACGCGATACCTCATGAAAACGGAGAATTGGATCATAAGGAATCCTGGTTATGCTTTCCTGGCGGCGGCACTTGGCTGGATGCTTGGCAGCAACAGTGGTCAGCGTGTGGTGTTCACCATCCTCCTACTGTTGGTCGCTCCGGCCTACAGTTTTAACTGTCTGGGAATGGGGAACCGGGATTTCATAGAAGGAGTCAGTGGAGCCACCTGGGTGGATCTGGTGTTGGAAGGAGACAGTTGTTTGACAATCATGGCAAGCGATAAGCCAACACTAGATGTCCGCATGATCAACATTGAAGCCAGCCAACTTGCTGAAGTTAGGAGCTACTGTTATCACGCTTCAGTCACTGACATTTCAACGGTGGCTCGATGCCCCACGACTGGAGAAGCTCACAACGAGAAACGTGCTGATAGCAGCTACGTGTGCAAGCAAGGCTTTACTGACCGCGGATGGGGAAACGGATGTGGACTTTTTGGAAAAGGAAGCATTGACACATGCGCAAAGTTTTCTTGCACCAGTAAAGCCACTGGAAAGATGATCCAACCAGAGAACATCAAGTATGAAGTTGGAATATTCGTGCACGGAACCACCACCTCGGAAAACCATGGAAATTACTCAGCGCAGGTTGGAGCGTCTCAAGCAGCAAAGTTTACTATAACTCCAAATGCTCCTTCAATAACCCTCAAGCTTGGTGATTATGGAGAAGTCACACTGGATTGTGAACCAAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTCTATGTCATGACTGTGGGTTCGAAGTCATTCTTAGTCCATAGGGAATGGTTTCATGACCTTTCTCTTCCCTGGACGTCCCCCTCAAGCACGGCATGGAGGAATAGAGAACTCCTTATGGAATTTGAAGAGGCACATGCCACAAAACAGTCTGTCGTGGCCCTTGGGTCACAGGAGGGAGGTCTCCATCAAGCGTTGGCAGGAGCCATCGTGGTGGAGTACTCAAGCTCAGTGAAGTTAACATCAGGCCACCTGAAATGCAGGCTGAAAATGGACAAACTGGCTCTGAAGGGCACGACTTATGGCATGTGCACAGAAAAATTCTCGTTCGCGAAAAACCCAGCGGACACAGGCCATGGAACAGTTGTTATTGAGCTCACATACTCYGGAAGTGATGGTCCCTGCAAAATTCCGATTGTGTCAGTCGCGAGTCTAAACGACATGACTCCTGTGGGAAGGCTGGTGACAGTAAACCCCTTCGTCGCGACATCCAGTTCCAACTCGAAGGTGCTGGTTGAGATGGAACCTCCTTTCGGAGACTCTTATATCGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATTAACCATCATTGGCACAAAGCTGGAAGCACGTTGGGCAAAGCCTTCTCAACAACTTTGAAAGGAGCCCAGAGACTGGCAGCGTTAGGGGACACGGCTTGGGACTTTGGTTCTATTGGGGGGGTGTTCAACTCCATAGGGAAAGCTGTTCACCAAGTGTTCGGCGGTGCATTTAGAACGCTCTTTGGAGGAATGTCCTGGATCACGCAAGGGCTAATGGGGGCCCTACTTCTCTGGATGGGTGTCAACGCACGAGATCGGTCGATCGCCTTGGCTTTTTTGGCCACGGGAGGTGTGCTCATTTTTTTAGCGACCAATGTGCATGCAGACACTGGCTGTGCCATTGACATCACGAGAAAAGAAATGAGGTGTGGAAGTGGCATTTTCGTGCACAACGACGTAGAGGCCTGGGTAGATAGGTACAAATATCTGCCAGAGACGCCCAGATCCCTAGCGAAGATCGTCCACAAAGCACATCTAGAAGGAGTGTGTGGGGTCAGATCCGTCACCAGATTAGAACACCAGATGTGGGAATCCGTGCGGGACGAACTGAATGTCTTGCTTAAAGAGAACGCGGTGGATCTGAGCGTGGTGGTTAACAAGCCTGTGGGGAGATATCGCTCAGCCCCTAAACGCCTATCCATGACTCAGGAGAAGTTTGAGATGGGCTGGAAAGCATGGGGAAAAAGCATTCTCTTCGCCCCCGAACTAGCCAACTCCACGTTCGTCGTGGATGGACCTGAGACGAAGGAATGTCCTGACGAGCGCAGAGCCTGGAACAGCATGCAAATCGAAGACTTCGGCTTCGGCATCACATCAACTCGCGTGTGGCTGAAGATTAGAGAGGAGGACACTGAGGAGTGTGATGGAGCGATCATAGGCACAGCTGTAAAAGGGCATGTGGCAGTTCATAGTGACTTGTCATACTGGATTGAAAGCCGTTTCAATGACACCTGGAAACTTGAGAGGGCTGTCTTCGGAGAGGTGAAATCTTGCACTTGGCCCGAGACACACACTCTTTGGGGTGACGGCGTTGAGGAGAGCGAACTCATCATCCCACACACCATAGCTGGACCGAGAAGCAAGCACAATCGGAGAGAAGGATACAAGACACAAAACCAGGGACCCTGGGATGAGAACGGCATTGTCCTTGATTTTGACTATTGTCCAGGAACAAAAGTCACCATCACAGAGGATTGTGGCAAGAGGGGGCCCTCAATCAGAACCACCACTGACAGTGGAAAGCTGATCACCGATTGGTGCTGCCGCAGCTGTTCTCTACCGCCCTTACGTTTCAGGACAGAAAATGGCTGCTGGTATGGGATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGATGAAACAACACTCGTCAGATCACAGGTTGATGCCTTCAACGGCGAAATGATTGACCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGACTGACGATTCCTGCGGTTTTGGGGGCCCTACTTGTACTGATGCTTGGGGGCATCACTTACACTGATCTTGCAAGATATGTGGTGCTAGTTGCTGCGGCTTTCGCGGAGGCCAACAGCGGAGGAGATGTCCTGCACCTCGCCCTGATAGCCGTTTTCAAGATCCAACCAGCTTTTTTGGTCATGAACATGCTTAGTGCGAGATGGACAAACCAAGAAAACATGGTTCTGGTCTTAGGGGCGGTTTTTTTCCAACTAGCTTCGGTGGATTTACAGATCGGAGTCCACGGAATCCTGAACGCCGCAGCTATAGCATGGATGATCGTTCGAGCGATCACATTCCCCACAACTTCTACCGTTACCATGCCAGTCTTAGCTCTCCTAACTCCGGGGATGAGAGCCTTGTATCTGGACACTTACAGAATCATTCTTCTCGTTATAGGAATTTGTTCCTTGCTACAAGAGAGGAGAAAGACCATGGCGAAGAAGAAAGGGGCCGTGCTTTTGGGCCTAGCGCTCACATCCACCGGATGGTTTTCGCCCACCACCATCGCAGCTGGACTAATGGTCTGCAACCCAAATAAGAAGAGAGGGTGGCCAGCCACCGAGTTTCTTTCAGCAGTTGGTTTGATGTTTGCCATTGTGGGAGGTCTAGCTGAGTTGGACATCGAATCCATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGTCTTATGGCAGTGTCCTATGTGATATCAGGAAAGGCAACCGACATGTGGCTGGACCGGGCCGCCGACATCAGCTGGGAGATGGAAGCTGCAATCACAGGAAGTAGCCGGAGGTTGGATGTCAAGCTGGACGACGACGGTGACTTTCATTTAATTGATGATCCCGGTGTTCCATGGAAAGTCTGGCTCTTGCGCATGTCCTGTATCGGTTTGGCCGCTCTAACACCCTGGGCCATCGTCCCCGCCGCTTTTGGCTACTGGCTCACTCTGAAAACAACAAAAAGAGGAGGCGTGTTTTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCTAGCTTGAAGGGGGACACCACCACAGGAGTTTACCGAATCATGGCTAGGGGAATTCTTGGCACCTACCAGGCCGGCGTTGGAGTCATGTACGAAAACGTTTTTCACACACTGTGGCACACAACCAGAGGAGCAGCCATTATGAGTGGAGAAGGAAAACTAACGCCATACTGGGGTAGTGTGAAGGAGGACCGCTTAAGCTATGGAGGCCCGTGGAAGTTCGACCGGAAGTGGAATGGAACGGATGATGTGCAAGTGATCGTGGTGGAACCGGGGAAACCTGCAGTGAACATCCAGACAAAACCGGGAGTGTTTCGCACCCCTTTTGGGGAGATTGGAGCAGTCAGCCTGGACTACCCGCGAGGAACATCCGGC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GGCAAACGCAATCTGCTCAGCAGTTCCAGTGGACTGGGTGCCTACAGGCCGAACATCCTGGTCAATACACTCCAAAGGAGAGTGGATGACCACTGAAGACATGCTGCAGGTCTGGAACAGGGTATGGATTGAAGAAAATGAATGGATGACGGACAAGACCCCGATCACGAGCTGGACGGACGTTCCGTACGTGGGAAAGCGTGAGGACATCTGGTGTGGCAGCCTCATCGGAACGCGATCCAGGGCAACTTGGGCTGAGAACATCTACGCAGCAATAAATCAGGTCAGAGCCGTCATTGGAAAAGAAAATTATGTTGATTACATGACTTCCCTCAGAAGATATGAGGATGTTTTGATTCAGGAGGATAGAGTTATTTAGACAGGAAATCAAGTCATGTGTGCAATGTGAGGTAAGAAAATGGGCATGTGAAGTCAGGCCAGCAAAAGCTGCCACCGGATACTGGGTAGACGGTGCTGCCTGCGCCTCAGTTCCAGGAGGACTGGGTTAACAAATCTGACAACGGAAGGTGGGAAAGCCCTCAGAACCGTCTCGGAAGCAGGTCCCTGCTCACCGGAAGTTGAAAGACCAACGTCAGGCCACAATTTCGTGCCACTCCGCTGGGGAGTGCGGCCTGCGCAGCCCCAGGAGGACTGGGTKAACAAAGCCGTTGAGGCCCCCACGGCCCAAGCCTCGTCTAGGATGCAATAGACGAGGTGTAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAAACAACAACATGCGGCCCAAGCCCCCTCGAAGCTGTAGAGGAGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCATTTGCATCAAAACAGCATATTGACACCTGGGAATAGACTGGGAGATCTTCTGCTCTATCTCAACATCAGCTACTAGGCACAGAGCGCCGAACTATGTACCTGGTGGTGAGGAAGAC
| 21,304
|
OP904182.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Eden,J.-S., Kim,K., Kirkland,P.D.
|
The University of Sydney, Sydney Institute for Infectious Diseases
|
Australia
|
2022-12-04
|
O-0883/NSW/22
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,970
|
GenBank
| null |
Australia: New South Wales
|
Australia
|
Sus scrofa
| null |
2022-02
| null | null |
Japanese encephalitis virus isolate O-0883/NSW/22, complete genome
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AGAAGTTTATCTGTGTGAACTTCTTGACTTAGTATTGTTGAGGAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGATAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGGAAAAACCGGGCTATCAATATGCTGAAACGCGGTCTACCCCGCGTGTTCCCACTCGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTGATGAGCTTGTTGGACGGTAGAGGGCCAGTGCGATTCGTGCTGGCTCTTGTAGCGTTCTTCAAGTTTACAGCTTTAGCCCCGACTAAGGCGCTCTTGGGCCGGTGGAAAGCAGTGGAGAAGGGTGTTGCAATGAAACACCTCACTAGCTTCAAACGGGAACTTGGGACGCTCATTGACGCTGTCAACAAACGGGGCAGAAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGGAGGAACAGTCTTGTGGCTCATGAGCTTGACAATTGCTGCAGTCAGTGTAGGAGCGTTGAAGTTGTCGAACTTTCAAGGCAAGCTACTAATGACTATCAACAATACGGACATTGCGGATGTCATCGTGATCCCCACCTCTAAGGGAGAAAATAGATGCTGGGTCAGGGCAATCGACGTGGGATACACGTGTGAAGATACCATCACGTACGAATGCCCAAGACTTGCCCCTGGCAATGACCCAGAGGATGTTGACTGCTGGTGTGACAACCAAGATGTGTACGTTCAATATGGACGGTGCACACGAACCAGACACTCCAAGAGAAGTAGGAGATCCGTGTCGGTCCAGACGCATGGGGAGAGTTCGCTAGTAAACAAAAAAGAAGCCTGGCTGGATTCAACGAAAGCCACCCGGTATCTCATGAAAACTGAAAATTGGATCATAAGGAATCCTGGTTATGCCTTCCTAGCAGTTGCGCTCGGCTGGATGCTTGGCAGTAATAGTGGCCAGCGCATGGTGTTCACCATTCTCTTGCTACTGGTCGCTCCGGCATACAGTTTCAATTGCTTGGGTATGGGTAACCGTGATTTCATAGAGGGTGTTAGTGGGGCTACCTGGGTGGACTTGGTGCTAGAAGGAGACAGCTGCCTGACAATCATGGCGCACGATAGACCAACATTGGACGTTCGTATGATCAATATTGAAGCCAGCCAACTTGCTGAAGTCAGGAGTTATTGCTATCATGCTTCAGTCACTGACATCTCGACGGTGGCTCGCTGCCCCACGACTGGAGAGGCCCACAACGAAAAACGTGCAGATAGCAGTTATGTTTGCAAGCAAGGCTTCACTGATCGCGGATGGGGAAATGGATGTGGACTTTTTGGAAAAGGAAGCATTGACACATGTGCTAAGTTCTCCTGCACTAGCAAGGCAATTGGGAAGACGATTCAGCCAGAAAATATCAAGTATGAAGTTGGTGTATTCGTGCACGGAACCACGACCTCAGAAAATCATGGCAACTACACAGCACAAATCGGGGCGTCTCAGGCAGCGAAATTCACCATCACGCCCAACGCCCCTTCAATAACCCTGAAGCTTGGCGACTACGGAGAGGTGACATTAGATTGTGAACCACGGAACGGACTCAACACTGAGGCGTTTTACGTCATGACTGTGGGCTCAAAGTCATTCTTGGTCCATCGAGAATGGTTTCATGATCTCGCTCTCCCTTGGACGTCCTCTTCAAACACTGCATGGAGAAACAGAGAATTCCTTATGGAATTCGAGGAGGCTCATGCCACCAAGCAGTCCGTTGTTGCCCTCGGGTCACAAGAAGGAGCCCTCCATCAGGCGTTGGCAGGTGCCATCGTCGTGGAATATTCAAGCTCAGTGAAGCTGACTTCAGGCCACTTGAAATGCAGGCTGAAGATGGACAAGTTAACCTTAAAGGGCACAACCTATGGAATGTGCACAGAAAAGTTCTCGTTTGCAAAGAATCCAGCGGACACTGGCCATGGGACAGTCGTCATCGAACTCCAATACTCGGGAAGTGACGGACCCTGTAAAATCCCAATTGTCTCAGTGGCCAGTCTAAACGACATGACTCCAGTTGGAAGGTTGGTAACAGTAAACCCCTTCGTGGCCACATCCAGCTCCAATTCAAAGGTCTTGGTTGAGATGGAACCCCCTTTTGGAGACTCCTACATTGTGGTCGGAAGAGGAGATAAACAGATCAACCACCATTGGCACAAACCTGGAAGCACATTGGGCAAAGCCTTCTCAACAACGTTGAAAGGTGCCCAAAGATTGGCAGCGTTGGGAGATACAGCTTGGGATTTTGGCTCCATTGGAGGGGTCTTCAATTCCATTGGGAAGGCCGTCCACCAGGTGTTCGGTGGCGCATTCAGAACGCTTTTTGGTGGAATGTCCTGGATCACGCAAGGCCTGATGGGAGCTCTGCTACTCTGGATGGGAATAAACGCTAGAGATCGCTCAATCGCCGTGGCCTTCTTGGTCACAGGTGGAACACTCTTGTTTTTAGCAACCAATGTGCACGCTGATACTGGCTGTGCTATTGACATCACAAGGAAAGAGATGAGGTGTGGGAGTGGCATCTTTGTGCACAACGACGTGGAAGCTTGGGTGGATAGGTACAAGTACTTGCCTGAAACACCTAGGTCTCTAGCAAAAATTGTCCACAAAGCGCACATGGAAGGAATTTGTGGAGTGAGGTCTGTCACCAGACTAGAACACCAAATGTGGGAGGCTGTACGCGATGAGCTGAACGTTTTACTCAAAGAAAACGCAGTGGATCTCAGCGTAGTAGTCAACAAGCCTGTAGGCAGATACCGCTCAGCCCCGAAACGTCTGCCCATGACACAAGAGAAGTTTGAAATGGGATGGAAAGCATGGGGAAAAAGCATTCTTTTTGCTCCAGAGTTGGCCAACTCCACATTTGTCGTTGATGGACCTGAAACAAAAGAATGCCCCGATGAACACAGAGCCTGGAATAGCATGCAAATTGAGGATTTTGGCTTTGGCATCACATCAACCCGGGTGTGGTTAAAGATCAGAGAGGAGAACACTGATGAGTGCGATGGAACAATCATAGGGACGGCCATCAAGGGACATGTGGCAGTCCACAGTGACCTGTCGTACTGGATCGAGAGTCACCTGAACGACACCTGGAAGCTTGAGAGGGCCGTCTTTGGAGAGATCAAATCTTGCACGTGGCCAGAAACACACACACTCTGGGGAGATGGCGTTGAGGAAAGTGAACTCATCATCCCACACACGATAGCTGGACCCAAAAGCAAACACAACAGGAGAGAAGGGTACAAAACTCAGAATCAGGGGCCCTGGGACGAAGATGGCATCGTCTTAGACTTTGATTATTGCCCAGGAACAAAGGTCACCATCACGGAAGATTGTGGGAAGAGAGGTCCCTCAGTCAGAACCACCACTGACAGTGGAAAATTGATCACTGATTGGTGTTGCCGCAGCTGTACGCTGCCGCCCCTACGTTTCCGGACAGGAAGTGGCTGCTGGTATGGAATGGAAGTCAGGCCTGTCAAGCATGACGAGGCCACACTTGTCAGATCGCAGGTCGATGCTTTCAGTGGTGAGATGATTGACCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACAGTTCCTGCGGTTTTGGGGGCCCTGCTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACGTACACTGATCTGGCGAGGTACGTAGTGCTAGTCGCCGCCGCTTTTGCAGAAGCTAATAATGGAGGGGACGTTTTGCATCTCGCCCTGATTGCCGTCTTCAAAATTCAGCCGGCATTCCTGGTTGCGAACATGCTCAGCACGAGATGGACGAATCAGGAAAATGTAGTTCTGGTCCTTGGAGCAGCCTTCTTCCAACTGGCATCGGCAGACCTGCAGATTGGAGTTCATGGAATGTTAAATGCCGCAGCTATAGCTTGGATGATCATTAAAGCGATCACCTTTCCCACAACTTCCACCATTACCATGCCACTGCTGGCGTTGCTGGCTCCGGGCATGAGGGCTCTCTACTTGGACACATACAGGATCATTCTCCTAATTATTGGGGTCTGTTCCCTGTTGCAGGAGAGAAGGAGGACCATGGCGAAAAAGAAAGGAGCCGTGCTCTTGGGTTTGGCGCTCACATCCACTGGTTGGTTTTCACCTACCACAATCGCCGCTGGACTCATGGTCTGCAACCCAAACAAGAAGAGAGGATGGCCTGCTACTGAGTTCCTGTCGGCAGTTGGCTTAATGTTTGCCATCGTGGGTGGCTTAGCTGAATTAGACATTGAATCAATGTCAATACCCTTCATGCTAGCAGGACTCATGGCAGTGTCTTACGTGGTGTCAGGAAAGGCGACAGACATGTGGCTCGAGCGTGCCGCTGAAATCAGCTGGGAGATGGACGCCGCAATCACAGGAAGCAGCCGACGGTTGGATGTTAAGCTGGACGATGATGGAGACTTCCACCTGATAGATGATCCAGGTGTCCCTTGGAAGGTTTGGGTCTTGCGCATGTCTTGCATTGGCCTAGCGGCTCTCACCCCGTGGGCGATCGTTCCTGCTGCGTTTGGCTACTGGCTCACTCTGAAAACAACAAAAAGAGGAGGTGTGTTTTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCTTGCACAAAGGGAGACACCACAACCGGTGTCTACCGGATTATGGCAAGAGGAATCCTTGGCACCTACCAAGCCGGTGTTGGAGTCATGTATGAGGGAGTGTTCCACACGTTATGGCATACCACGCGAGGGGCCGCGATAATGAGTGGGGAAGGAAAATTGACTCCATACTGGGGAAGTGTAAAAGAAGACCGCATAGCCTATGGAGGTCCATGGAGGTTTGACCGGAAGTGGAATGGAAAAGATGATGTACAGGTGATCGTAGTGGAACCAGGAAAGGCTGCGATAAATATCCAGACGAAGCCGGGAGTGTTTTGCACTCCTTTCGGAGAAGTTGGAGCCGTTAGTCTGGACTACCCG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| 21,633
|
ON875960.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Pegu,S.R., Das,P.J., Sonowal,J., Sengar,G.S., Deb,R., Rajkhowa,S., Choudhury,M., Gulati,B.R., Gupta,V.K.
|
ICAR-National Research Centre on Pig, Animal Genetics and Breeding
|
India
|
2022-11-15
| null |
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,965
|
GenBank
| null |
India
|
India
|
Culex tritaeniorhynchus
| null |
2019-06-28
| null | null |
Japanese encephalitis virus strain JEV/GIII, complete genome
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AGAAGTTTTATCGTGTGAACTTCTTGGCTTAGTATCGTTGAGAAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGAACAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGAAAAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGATTACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTGATGAGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTACGATTTGTGCTGGCCCTTATCACGTTCTTCAAGTTTACAGCATTAGCCCCGACCAAGGCGCTTTTGGGCCGCTGGAGAGCAGTGGAAAAAAGTGTGGCAATGAAACATCTTACCAGTTTCAAACGAGAACTTGGAACACTCATTGACGCCGTGAACAAGCGGGGCAAAAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGAGAGCTCAATTATGTGGCTTGCCAGCTTGGCAATCGTAATAGCCTGTGCCGGAGCCATGAAGCTATCAAACTTTCAAGGAAAACTTCTGATGACCATCAACAACACGGACATTGCGGACGTCATCGTGATCCCCACCTCAAAAGGTGAAAACAGATGTTGGGTCCGAGCAATCGACGTTGGTTACATGTGTGAAGACACCATCACGTATGAATGTCCGAAGCTTGCCGTGGGCAACGATCCGGAAGACGTGGACTGCTGGTGCGACAATCAGGAAGTCTACGTGCAGTATGGTCGCTGCACACGGACCAGGCATTCCAAACGAAGCAGAAGATCCGTTTCGGTCCAAACGCATGGGGAAAGCTCACTAGTGAACAAAAAAGAGGCTTGGCTGGATTCAACGAAAGCCACGCGATACCTCATGAAAACGGAGAACTGGATCATAAGGAACCCCGGTTATGCTTTCCTGGCGGCGGCACTTGGATGGATGCTTGGCAGCAACAATGGCCAACGTGTGGTGTTCACTATTCTCTTGCTATTGGTCGCTCCGGCTTACAGTTTTAACTGTCTGGGAATGGGGAATCGGGATTTCATAGAAGGAGCCAGTGGAGCCACTTGGGTAGATCTGGTGTTGGAAGGAGATAGCTGTTTGACAATCATGGCAAACGACAAACCAACACTAGATGTCCGCATGATCAACATTGAAGCTAGCCAACTTGCTGAAGTCAGGAGTTACTGCTATCACGCTTCAGTCACTGATATTTCAACGGTGGCTCGATGCCCCACGACCGGAGAAGCCCACAACGAAAAACGTGCCGACAGCAGCTACGTGTGCAAACAAGGCTTTACTGATCGCGGATGGGGAAATGGATGTGGGCTTTTCGGGAAAGGAAGCATTGACACATGCGCAAAATTTTCTTGTACCAACAAGGCCATTGGAAGAATGATCCAACCAGAAAACATCAAGTACGAGGTTGGCATATTCGTGCACGGAACTACCACCTCGGAAAACCATGGGAATTACTCAGCGCAAGTAGGAGCGTCTCAAGCGGCGAAGTTTACTGTGACTCCAAATGCTCCTTCAATAACCCTTAAGCTTGGTGATTATGGAGAAGTCACACTGGATTGTGAACCAAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTCTATGTCATGACCGTGGGTTCGAAGTCATTCTTAGTCCATAGGGAATGGTTCCATGACCTTTCTCTTCCCTGGACGTCCCCCTCAAGCACGGCATGGAGAAACAGAGAACTCCTCATGGAATTTGAAGAGGCACATGCCACAAAACAATCTGTCGTAGCTCTTGGGTCACAGGAGGGAGGTCTCCATCAAGCGCTGGCAGGAGCCATCGTGGTGGAGTACTCGAGCTCAGTGAAGTTGACATCAGGTCACCTGAAATGCAGGCTGAAAATGGACAAACTGGCTCTGAAGGGCACGACTTATGGCATGTGTACAGAAAAATTCTCGTTCGCGAAAAATCCAGCGGACACAGGCCACGGAACAGTTGTCATTGAGCTCACATATTCTGGAAGTGATGGTCCCTGCAAAATTCCGATTGTCTCAGTCGCGAGCTTAAACGACATGACCCCTGTGGGGAGGTTGGTAACAGTAAACCCCTTCGTCGCAACATCTAGCTCCAACTCAAAGGTGCTGGTTGAGATGGAACCTCCCTTCGGAGATTCTTATATCGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATTAACCATCACTGGCACAAAGCTGGAAGCACGCTGGGCAAAGCTTTCTCAACAACTTTGAAAGGGGCTCAGAGACTAGCAGCGCTAGGTGACACAGCCTGGGACTTCGGCTCCATTGGAGGGGTATTCAACTCCATAGGGAAAGCTGTTCACCAAGTATTTGGCGGTGCATTCAGAACGCTCTTTGGGGGAATGTCTTGGATCACACAAGGACTAATGGGAGCCTTACTTCTTTGGATGGGTGTCAACGCACGAGACCGGTCAATCGCCCTGGCTTTTCTGGCCACGGGAGGTGTGCTCGTGTTTTTAGCGACCAATGTGCATGCCGACACTGGCTGTGCCATTGACATCACAAGAAAAGAGATGAGGTGTGGAAGTGGCATCTTCGTGCACAACGACGTAGAGGCTTGGGTAGATAGGTACAAATATCTGCCAGAGACGCCCAGATCCTTAGCGAAGATCGTCCACAAAGCACATCAAGAAGGAGTGTGCGGGGTCAGATCCGTCACTAGACTGGAACACCAGATGTGGGAATCTGTGCGGGACGAATTGAATGTCTTGCTCAAAGAGAACGCGGTGGATCTCAGTGTGGTGGTGAACAAGCCCGTGGGGAGATATCGCTCAGCCCCCAAACGCCTATCCATGACTCAAGAAAAGTTTGAGATGGGCTGGAAAGCATGGGGAAAAAGCATTCTCTTCTCCCCCGAATTGGCCAACTCCACGTTCGTCGTGGATGGGCCCGAGACAAAGGAATGCCCTGATGAGCGCAGAGCCTGGAACAGCATGCAAATCGAAGATTTCGGCTTCGGCATCACATCAACCCGCGTGTGGCTGAAAATTAGAGAGGAGAACACTGATGAGTGTGATGGAGCAATCATAGGGACAGCTGTCAAAGGGCATGTGGCAGTTCATAGTGACTTGTCATACTGGATTGAGAGCCGTCTCAATGACACCTGGAAACTTGAGAGGGCTGTCTTCGGAGAGGTGAAATCTTGCACTTGGCCCGAGACACACACTCTTTGGGGTGACGGTGTTGAGGAGAGCGAGCTTATCATCCCACATACCATAGCTGGACCGAGAAGCAAGCACAACCGGAGAGAAGGGTATAAAACACAAAACCAGGGACCCTGGGATGAGAACGGCATCGTCCTTGACTTTGACTATTGTCCGGGAACAAAAGTCACCATCACAGAGGACTGTGGCAAGAGGGGTCCCTCAATCAGAACCACTACTGACAGTGGAAAGCTGATCACCGATTGGTGCTGCCGCAGCTGTTCTCTACCGCCTTTACGGTTCCGGACAGAAAATGGTTGCTGGTATGGGATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGACGAAACAACACTCGTTAGATCACAGGTTGACGCTTTCAACGGCGAAATGATTGACCCTTTTCAGCTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACGATTCCTGCGGTTTTGGGGGCTCTACTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACTTACACTGACCTGGCAAGATATGTGGTGCTGGTTGCTGCGGCTTTTGCGGAGGCCAACAGTGGAGGAGATGTTCTGCACCTCGCTCTGATAGCTGTCTTCAAAATCCAACCAGCTTTTCTGGTCATGAACATGCTTAGTGCGAGATGGACGAACCAAGAGAACGTGGTTCTGGTCCTGGGGGCGGCTTTTTTCCAACTAGCTTCGGTGGATTTACAGATCGGAGTCCACGGAATCCTGAACGCCGCAGCCATAGCATGGATGATCGTTCGGGCGATCACATTTCCCACGACTTCTACCGTTGCCATGCCAATCTTAGCGCTCCTAACTCCGGGAATGAGGGCTTTGTATCTGGACACTTACAGAATCATTCTTCTTGTCATAGGAATTTGTTCCCTGCTGCAAGAGAGGAGAAAGACCATGGCGAAGAAGAAAGGAGCCGTGCTCTTGGGCTTAGCGCTCACATCCACCGGATGGTTTTCGCCCACCACTATCGCAGCCGGACTAATGGTCTGCAACCCAAACAAGAAGAGAGGGTGGCCGGCCACCGAGTTCCTCTCAGCGGTTGGGTTGATGTTTGCCATTGTGGGAGGTCTAGCCGAGTTGGACATCGAATCTATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGGCTCATGGCAGTGTCCTACGTGGTATCAGGAAAGGCAACTGACATGTGGCTGGACCGGGCTGCCGATATCAGCTGGGAGATGGAGGCTGCAATCACAGGAAGTAGCCGGAGGCTGGATGTTAAGTTGGATGACGACGGCGACTTTCACTTGATTGATGATCCCGGTGTTCCATGGAAAGTCTGGCTCTTGCGCATGTCTTGTATCGGTCTAGCCGCTCTGACACCCTGGGCTATCGTTCCCGCCGCTTTTGGCTATTGGCTCACTCTGAAAACAACAAAAAGAGGGGGCGTGTTCTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCTTGCTTAAAGGGGGACACCACCACAGGAGTTTACCGAATTATGGCCAGGGGGATTCTCGGCACTTACCAGGCCGGCGTTGGAGTCATGTACGAGAATGTTTTCCACACATTGTGGCACACAACTAGAGGAGCAGCCATTATGAGTGGAGAAGGAAAGCTAACGCCATACTGGGGCAGCGTGAAGGAAGACCGCATAAGCTATGGAGGCCCGTGGAGGTTCGACCGGAAGTGGAATGGAACAGATGATGTGCAAGTGATTGTGGTGGAACCAGGGAAACCTGCAGTAAACATCCAGACAAAGCCGGGAGTGTTTCGCACCCCTTTCGGGGAGGTTGGAGCAGTCAGTTTGGACTACCC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| 22,235
|
MZ923735.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Luo,R., Zhou,P., Ma,L., Li,Y.
|
College of Veterinary Medicine Huazhong Agricultural University, State Key Laboratory of Agricultural Microbiology
|
China
|
2022-10-19
|
WH
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,977
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2014
| null | null |
Japanese encephalitis virus isolate WH, complete genome
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AGAAGTTTATCTGTGTGAACTTCTTGGCTTAGTATCGTTGAGAAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGATAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGTAAAAACCGGGCTATCAATATGCTGAAACGCGGCTTACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTAATGAGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTACGTTTCGTACTGGCTCTTATCACGTTCTTCAAGTTTACAGCATTAGCCCCGACCAAGGCGCTTTTAGGCCGATGGAAAGCAGTGGAAAAGAGTGTAGCAATGAAACACCTTACCAGTTTCAAACGAGAACTTGGAACACTCATTGACGCCGTGAACAAGCGGGGCAGAAAGCAAAACAAAAGAGGAGGAAATGAAGGCTCAATCATGTGGCTCGCGAGCTTGGCAGCTGTCATAGCGTGTGCAGGAGCTATGAGGTTGTCAAATTTCCAGGGGAAGCTTTTGATGACCATCAACAACACGGACATTGCAGACGTTATCGTGATTCCCACCTCAAAAGGAGAGAACAGATGCTGGGTCCGGGCAATTGACGTCGGCTACATGTGTGAGGACACTATCACGTACGAATGTCCTAAGCTTACCATGGGCAATGATCCAGAGGATGTGGACTGTTGGTGTGACAACCAAGAAGTCTACGTCCAATATGGACGGTGCACGCGGACCAGGCATTCCAAGCGAAGCAGGAGATCCGTGTCGGTCCAAACACATGGGGAGAGTTCACTAGTGAATAAAAAAGAGGCTTGGCTGGATTCAACGAAAGCCACACGATATCTCATGAAAACTGAGAACTGGATCATAAGGAATCCTGGCTATGCTTTCCTGGCGGCGGTACTTGGCTGGATGCTTGGCAGCAACAACGGTCAACGCGTGGTATTTACCATCCTCCTGCTGTTGGTCGCTCCGGCTTACAGTTTTAACTGTCTGGGAATGGGCAATCGTGACTTCATAGAAGGAGCCAGTGGAGCCACGTGGGTGGACTTGGTGCTAGAAGGAGATAGCTGCTTGACAATCATGGCAAACGACAAACCAACATTGGACGTCCGCATGATCAACATCGAAGCTAGCCAACTTGCTGAAGTCAGAAGTTACTGCTATCATGCTTCAGTCACTGACATCTCGACGGTGGCTCGGTGCCCCATGGCTGGAGAAGCCCACAACGAGAAGCGAGCTGATAGTAGCTATGTGTGCAAACAAGGCTTCACTGATCGTGGGTGGGGCAACGGATGTGGACTTTTCGCGAAAGGAAGCATTGATACATGTGCAAAATTCTCCTGCACCAGTAAAGCGATTGGGAGAACAATCCAGCCAGAAAACATCAAATATGAAGTTGGCATTTTTGTGCATGGAACCACCACTTCGGAAAACCATGGGAATTATTCAGCGCAAGTTGGGGCGTCCCAGGCGGCAAAGTTTACAGTAACACCCAATGCTCCTTCGATAACCCTCAAACTTGGTGACTACGGAGAAGTTACACTGGACTGTGAGCCAAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTCTACGTCATGACCGTGGGGTCAAGGTCATTTTTGGTCCATAGGGAATGGTTTCATGACCTCGCTCTCCCCTGGACGCCCCCTTCGAGCACAGCGTGGAGAAACAGAGAACTCCTCATGGAATTTGAAGAGGCGCACGCTACAAAACAGTCCGTTGTTGCTCTTGGGTCACAGGAAGGAGGCCTCCATCAGGCGTTGGCAGGAGCCATCGTGGTGGAGTACTCAAGCTCAGTGAAGTTAACATCAGGCCACCTGAAATGTAGGCTGAAAATGGACAAACTGGCTCTGAAAGGCACAACCTATGGCATGTGCACAGGAAAATTCTCGTTCGCGAAAAATCCGGCGGACACTGGTCACGGAACAGTTGTCATTGAACTCTCCTACTCTGGGAGTGATGGCCCTTGCAAAATTCCGATTGTCTCCGTTGCGAGCCTCAATGACATGACCCCCGTTGGGCGGCTGGTGACAGTGAACCCCTTCGTCGCGACTTCCAGTGCCAACTCAAAGGTGCTGGTCGAGATGGAACCCCCCTTCGGAGACTCCTACATCGTAGTTGGAAGGGGAGACAAGCAGATCAACCACCATTGGCACAAAGCTGGAAGCACGCTGGGCAAAGCCTTTTTAACAACTTTGAAGGGAGCTCAAAGACTGGCAGCGTTGGGCGACACAGCCTGGGACTTTGGCTCCATTGGAGGGGTCTTCAACTCCATAGGAAAAGCCGTTCACCAAGTGTTTGGTGGTGCCTTCAGAACACTCTTTGGGGGAATGTCTTGGATCACACAAGGGCTAATGGGTGCCCTACTACTCTGGATGGGCGTTAATGCACGAGACCGATCAATTGCTTTGGCCTTCTTAGCCACAGGAGGTGTGCTCGTGTTCTTAGCGACCAATGTGCATGCTGACACTGGATGTGCCATTGACATCACAAGAAAAGAGATGAGGTGTGGAAGTGGCATCTTCGTGCACAACGACGTGGAAGCCTGGGTGGATAGGTATAAATATTTGCCAGAAACGCCCAGATCCCTGGCGAAGATCGTCCACAAAGCGCACAAGGAAGGCGTGTGCGGAGTCAGATCTGTCACTAGACTGGAGCACCAAATGTGGGAAGCCGTACGGGACGAATTGAACGTCCTGCTCAAAGAGAATGCAGTGGACCTCAGTGTGGTGGTGAACAAGCCCGTGGGGAGATATCGCTCAGCCCCTAAACGCCTATCCATGACGCAAGAGAAGTTTGAAATGGGCTGGAAAGCATGGGGGAAAAGCATTCTCTTTGCCCCGGAATTGGCTAACTCCACATTTGTCGTAGATGGACCTGAGACAAAGGAATGCCCTGATGAGCACAGAGCTTGGAACAGCATGCAAATCGAAGACTTCGGCTTTGGCATCACATCAACCCGTGTGTGGCTGAAAATTAGAGAGGAGAGCACTGACGAGTGTGATGGAGCGATCATAGGCACGGCTGTCAAAGGACATGTGGCAGTCCATAGTGACTTGTCGTACTGGATTGAGAGTCGCTACAACGACACATGGAAACTTGAGAGGGCAGTCTTTGGAGAGGTCAAATCTTGCACTTGGCCAGAGACACACACCCTTTGGGGAGATGGTGTTGAGGAAAGTGAACTCATCATTCCGCATACCATAGCCGGACCAAAAAGCAAGCACAATCGGAGGGAAGGGTATAAGACACAAAACCAGGGACCCTGGGACGAGAATGGCATAGTCTTGGACTTTGATTATTGCCCAGGGACAAAAGTCACCATTACAGAGGATTGTGGCAAGAGAGGCCCTTCGGTCAGAACCACTACTGACAGTGGAAAGTTGATCACTGACTGGTGCTGTCGCAGTTGCTCCCTTCCGCCCCTACGATTCCGGACAGAAAATGGCTGCTGGTACGGAATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGATGAAACAACACTCGTCAGATCACAGGTTGATGCTTTTAATGGTGAAATGGTTGACCCTTTTCAGCTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACCATTCCTGCGGTTTTGGGGGCCCTACTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACTTACACTGATTTGGCGAGGTATGTGGTGCTAGTCGCTGCTGCTTTCGCAGAGGCCAACAGTGGAGGAGACGTCCTACACCTTGCTTTGATTGCCGTTTTTAAGATCCAACCAGCATTTCTAGCGATGAAAATGCTCAGCACGAGATGGACGAACCAAGAAAACGTGGTTCTGGTCCTAGGGGCTGCCTTTTTCCAATTGGCCTCAGTAGATCTGCAAATAGGAGTCCACGGAATCCTGAATGCCGCCGCTATAGCATGGATGATTGTCCGAGCGATCACCTTCCCCACAACCTCCTCCGTCACCATGCCAGTCTTAGCGCTTCTAACTCCGGGAATGAGGGCTCTATACCTAGACACTTACAGAATCATCCTCCTCGTCATAGGGATTTGCTCCCTACTGCAAGAGAGGAAAAAGACCATGGCAAAAAAGAAAGGAGCTGTACTCTTGGGCTTAGCGCTCACATCCACTGGATGGTTCTCGCCCACCACTATAGCTGCCGGACTAATGGTCTGCAACCCAAACAAGAAGAGAGGGTGGCCAGCTACTGAGTTTTTGTCGGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTAGGTGGTTTGGCCGAGTTGGACATTGAATCCATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGTCTCATGGCAGTGTCCTACGTGGTGTCAGGAAAAGCAACAGATATGTGGCTTGAACGGGCCGCCGACATCAGCTGGGAGATGGATGCTGCAATCACAGGAAGCAGTCGGAGGCTGGATGTGAAGCTGGATGATGACGGAGATTTTCACTTGATTGATGATCCCGGTGTTCCATGGAAGGTCTGGGTCCTGCGCATGTCTTGCATTGGCTTAGCCGCCCTCACGCCTTGGGCCATTGTTCCCGCCGCTTTTGGTTATTGGCTCACTTTAAAAACAACAAAAAGAGGGGGCGTGTTTTGGGACACGCCATCCCCAAAACCTTGCTCAAAAGGAGACACCACCACAGGAGTCTACCGAATTATGGCTAGAGGGATTCTTGGCACTTACCAGGCCGGCGTTGGAGTCATGTACGAGAATGTTTTCCACACATTATGGCACACAACTAGAGGAGCGGCCATTATGAGTGGAGAAGGAAAATTGACGCCTTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACCGCATAGCTTACGGAGGCCCATGGAGGTTTGATCGAAAATGGAATGGAACAGATGACGTGCAAGTGATCGTGGTAGAACCGGGGAAGGCTGCAGTAAACATCCAGACAAAACCAGGAGTGTTTCGGACTCCCTTCGGGGAGGTTGGGGCTGTTAGCCTGGATTACCCG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| 22,847
|
OM867669.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Waller,C., Tiemensma,M., Currie,B.J., Williams,D.T., Baird,R.W., Krause,V.L., Sikazwe,C., Neave,M.J., Michie,A., Mileto,P., Levy,A., Imrie,A., Speers,D., Mackenzie,J.S., Smith,D.W.
|
CSIRO, Australian Animal Health Laboratory
|
Australia
|
2022-10-18
|
21-02409-01
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,949
|
GenBank
| null |
Australia: Northern Territory, Tiwi Islands
|
Australia
|
Homo sapiens
| null |
2021-03-10
| null | null |
Japanese encephalitis virus strain JEV/Human/NT_Tiwi Islands/2021, complete genome
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GTGTGAACTTCTTGACTTAGTATTGTTGAGGAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGATAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGGAAAAACCGGGCTATCAATATGCTGAAACGCGGTCTACCCCGCGTGTTCCCACTCGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTGATGAGCTTGTTGGACGGTAGAGGGCCAGTGCGATTCGTGCTGGCTCTTGTAGCGTTCTTCAAGTTTACAGCTTTAGCCCCGACTAAGGCGCTCTTGGGCCGGTGGAAAGCAGTGGAGAAGGGTGTTGCAATGAAACACCTCACTAGCTTCAAACGGGAACTTGGGACGCTCATTGACGCTGTCAATAAACGGGGCAGAAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGGAGGAACAGTCTTGTGGCTCATGAGCTTGACAATTGCTGCAGTCAGTGTAGGAGCGTTGAAGTTGTCGAACTTTCAAGGCAAGCTACTAATGACTATCAACAATACGGACATTGCGGATGTCATCGTGATCCCCACCTCTAAGGGAGAAAATAGATGCTGGGTCAGGGCAATCGACGTGGGATACACGTGTGAAGATACCATCACGTACGAATGCCCAAGACTTGCCCCTGGCAATGACCCAGAGGATGTTGACTGCTGGTGTGACAACCAAGATGTGTACGTTCAATATGGACGGTGCACACGAACCAGACACTCCAAGAGAAGTAGGAGATCCGTGTCGGTCCAGACGCATGGGGAGAGTTCGCTAGTAAACAAAAAAGAAGCCTGGCTGGATTCAACGAAAGCCACCCGGTATCTCATGAAAACTGAAAATTGGATCATAAGGAATCCTGGTTATGCCTTCCTAGCAGTTGCGCTCGGCTGGATGCTTGGCAGTAATAGTGGCCAGCGCATGGTGTTCACCATTCTCTTGCTACTGGTCGCTCCGGCATACAGTTTCAATTGCTTGGGTATGGGTAACCGTGATTTCATAGAGGGTGTTAGTGGGGCTACCTGGGTGGACTTGGTGCTAGAAGGAGACAGCTGCCTGACAATCATGGCGCACGACAGACCAACATTGGACGTTCGTATGATCAATATTGAAGCCAGCCAACTTGCTGAAGTCAGGAGTTATTGCTATCATGCTTCAGTCACTGACATCTCGACGGTGGCTCGCTGCCCCACGACTGGAGAGGCCCACAACGAAAAACGTGCAGATAGCAGTTATGTTTGCAAGCAAGGCTTCACTGATCGCGGATGGGGAAATGGATGTGGACTCTTTGGAAAAGGAAGCATTGACACATGTGCTAAGTTCTCCTGCACTAGCAAGGCAATTGGGAAGACGATTCAGCCAGAAAACATCAAGTATGAAGTTGGTGTATTCGTGCACGGAACCACGACCTCAGAAAATCATGGCAACTACACAGCACAAATCGGGGCGTCTCAGGCAGCGAAATTCACCATCACGCCCAACGCCCCTTCAATAACCCTGAAGCTTGGCGACTACGGAGAGGTGACATTAGATTGTGAACCACGGAACGGACTCAACACTGAGGCGTTTTACGTCATGACTGTGGGCTCAAAGTCATTCTTGGTCCATCGAGAATGGTTTCATGATCTCGCTCTCCCTTGGACGTCCTCTTCAAACACTGCATGGAGAAACAGAGAACTCCTTATGGAATTCGAGGAGGCTCATGCCACCAAGCAGTCCGTTGTTGCCCTCGGGTCACAAGAAGGAGCCCTCCATCAGGCGTTGGCAGGTGCCATCGTCGTGGAATATTCAAGCTCAGTGAAGCTGACTTCAGGCCACTTGAAATGCAGGCTGAAGATGGACAAGTTAACCTTAAAGGGCACAACCTATGGAATGTGCACAGAAAAGTTCTCGTTTGCAAAGAATCCAGCGGACACTGGCCATGGGACAGTCGTCATCGAACTCCAATACTCGGGAAGTGACGGACCCTGTAAAATCCCAATTGTCTCAGTGGCCAGTCTAAACGACATGACTCCAGTTGGAAGGTTGGTAACAGTAAACCCCTTCGTGGCCACATCCAGCTCCAATTCAAAGGTCTTGGTTGAGATGGAACCCCCTTTTGGAGACTCCTACATTGTGGTCGGAAGAGGAGATAAACAGATCAACCACCATTGGCACAAACCTGGAAGCACATTGGGCAAAGCCTTCTCAACAACGTTGAAAGGTGCCCAAAGATTGGCAGCGTTGGGAGATACAGCTTGGGATTTTGGCTCCATTGGAGGGGTCTTCAATTCCATTGGGAAGGCCGTCCACCAGGTGTTCGGTGGCGCATTCAGAACGCTTTTTGGTGGAATGTCCTGGATCACGCAAGGCCTGATGGGAGCTCTGCTACTCTGGATGGGAATAAACGCTAGAGATCGCTCAATCGCCGTGGCCTTCTTGGTCACAGGTGGAACACTCTTGTTTTTAGCAACCAATGTGCACGCTGATACTGGCTGTGCTATTGACATCACAAGGAAAGAGATGAGGTGTGGGAGTGGCATCTTTGTGCACAACGACGTGGAAGCTTGGGTGGATAGGTACAAGTACTTGCCTGAAACACCTAGGTCTCTAGCAAAAATTGTCCACAAAGCGCACATGGAAGGAATTTGTGGAGTGAGGTCTGTCACCAGACTAGAACACCAAATGTGGGAGGCTGTACGCGATGAGCTGAACGTTTTACTCAAAGAAAACGCAGTGGATCTCAGCGTAGTAGTCAACAAGCCTGTGGGCAGATACCGCTCAGCCCCGAAACGTCTGCCCATGACACAAGAGAAGTTTGAAATGGGATGGAAAGCATGGGGAAAAAGCATTCTTTTTGCTCCAGAGTTGGCCAACTCCACATTTGTCGTTGATGGACCTGAAACAAAAGAATGCCCCGATGAACACAGAGCCTGGAATAGCATGCAAATTGAGGATTTTGGCTTTGGCATCACATCAACCCGGGTGTGGTTAAAGATCAGAGAGGAGAACACTGATGAGTGCGATGGAACAATCATAGGGACGGCCATCAAGGGACATGTGGCAGTCCACAGTGACCTGTCGTACTGGATCGAGAGTCACCTGAACGACACCTGGAAGCTTGAGAGGGCCGTCTTTGGAGAGATCAAATCTTGCACGTGGCCAGAAACACACACACTCTGGGGAGATGGCGTTGAGGAAAGTGAACTCATCATCCCACACACGATAGCTGGACCCAAAAGCAAACACAACAGGAGAGAAGGGTACAAAACTCAGAATCAGGGGCCCTGGGACGAAGATGGCATCGTCTTAGACTTTGATTATTGCCCAGGAACAAAGGTCACCATCACGGAAGATTGTGGGAAGAGAGGTCCCTCAGTCAGAACCACCACTGACAGTGGAAAATTGATCACTGATTGGTGTTGCCGCAGCTGTACGCTGCCGCCCCTACGTTTCCGGACAGGAAGTGGCTGCTGGTATGGAATGGAAGTCAGGCCTGTCAAGCATGATGAGGCCACACTTGTCAGATCGCAGGTCGATGCTTTCAGTGGTGAGATGATTGACCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACAGTTCCTGCGGTTTTGGGGGCCCTGCTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACGTACACTGATCTGGCGAGGTACGTAGTGCTAGTCGCCGCCGCTTTTGCAGAAGCTAATAATGGAGGGGACGTTTTGCATCTCGCCCTGATTGCCGTCTTCAAAATTCAGCCGGCATTCCTGGTTGCGAACATGCTCAGCACGAGATGGACGAATCAGGAAAATGTAGTTCTGGTCCTTGGAGCAGCCTTCTTCCAACTGGCATCGGCAGACCTGCAGATTGGAGTTCATGGAATGTTAAATGCCGCAGCTACAGCTTGGATGATCATTAAAGCGATCACCTTTCCCACAACTTCCACCATTACCATGCCACTGCTGGCGTTGCTGGCTCCGGGCATGAGGGCTCTCTACTTGGACACATACAGGATCATTCTCCTAATTATTGGGGTCTGTTCCCTGTTGCAGGAGAGAAGGAGGACCATGGCGAAAAAGAAAGGAGCCGTGCTCTTGGGTTTGGCGCTCACATCCACTGGTTGGTTTTCACCTACCACAATCGCCGCTGGACTCATGGTCTGCAACCCAAACAAGAAGAGAGGATGGCCTGCTACTGAGTTCCTGTCGGCAGTTGGCTTAATGTTTGCCATCGTGGGTGGCTTAGCTGAATTAGACATTGAATCAATGTCAATACCCTTCATGCTAGCAGGACTCATGGCAGTGTCTTACGTGGTGTCAGGAAAGGCGACAGACATGTGGCTCGAGCGTGCCGCTGATATCAGCTGGGAGATGGACGCCGCAATCACAGGAAGCAGCCGACGGTTGGATGTTAAGCTGGACGATGATGGAGACTTCCACCTGATAGATGATCCAGGTGTCCCTTGGAAGGTTTGGGTCTTGCGCATGTCTTGCATTGGCCTAGCGGCTCTCACCCCGTGGGCGATCGTTCCTGCTGCGTTTGGCTACTGGCTCACTCTGAAAACAACAAAAAGAGGAGGTGTGTTTTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCTTGCACAAAGGGAGACACCACAACCGGTGTCTACCGGATTATGGCAAGAGGAATCCTTGGCACCTACCAAGCCGGTGTTGGAGTCATGTATGAGGGAGTGTTCCACACGTTATGGCATACCACGCGAGGGGCCGCGATAATGAGTGGGGAAGGAAAATTGACTCCATACTGGGGAAGTGTAAAAGAAGACCGCATAGCCTATGGAGGTCCATGGAGGTTTGACCGGAAGTGGAATGGAAAAGATGATGTACAGGTGATCGTAGTGGAACCAGGAAAGGCTGCGATAAATATCCAGACGAAGCCGGGAGTGTTTTGCACTCCTTTCGGAGAAGTTGGAGCCGTTAGTCTGGACTACCCGCGAGGAACATCT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| 22,893
|
MZ540901.1
|
Japanese encephalitis virus
|
Li,C., Chen,X.
|
Yangzhou University, The College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-10-11
|
YZ-1
|
Orthoflavivirus japonicum
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,965
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null | null | null | null |
Japanese encephalitis virus isolate YZ-1, complete genome
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AGAAGTTTATCTGTGTGAACTTCTTGGCTTAGTATCGTTGAGAAGAATCGAGAGATTAGTGCAGTTTAAACAGTTTTTTAGAACGGAAGAACAACCATGACTAAAAAACCAGGAGGGCCCGGAAAAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGATTACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTTATGAGCTTGTTGGACGGCAGAGGGCCAGTACGATTTGTGCTGGCTCTTATCACGTTCTTCAAGTTTACAGCATTAGCCCCGACCAAGGCGCTTTTGGGCCGCTGGAGAGCAGTGGAAAAAAGTGTGGCAATGAAACATCTTACCAGTTTCAAACGAGAACTTGGAACACTCATTGACGCCGTGAACAAGCGGGGCAAAAAACAAAACAAAAGAGGAGGGAATGAAAGCTTGATTATGTGGCTTGCCAGCTTGGCAATCGTAACAGCCTGTGCCGGAGCCATGAAGCTATCAAACTTTCAAGGAAAGCTTCTGATGACCATCAACAACACGGACATTGCGGATGTCATCGTGATCCCCACCTCAAAAGGTGAAAACAGATGCTGGGTACGAGCAATCGACGTTGGTTACATGTGTGAAGACACCATCACGTATGAATGTCCGAAGCTTGCCGTGGGCAACGATCCGGAAGACGTGGACTGCTGGTGCGACAATCAGGAAGTCTACGTGCAGTATGGTCGCTGCACACGGACCAGGCATTCCAAACGAAGCAGAAGATCCGTTTCGGTCCACACGCATGGGGAAAGCTCACTAGTGAACAAAAAAGAGGCTTGGCTGGATTCAACGAAGGCCACGCGATACCTCATGAAAACGGAGAACTGGATCATAAGGAACCCTGGTTATGCTTTCCTGGCGGTGGCACTTGGATGGATGCTTGGCAGCAACAATGGCCAACGTGTGGTGTTCACTATTCTCTTGCTATTGGTCGCCCCGGCTTACAGTTTTAACTGTCTGGGAATGGGGAATCGGGATTTCATAGAAGGAGCCAGTGGAGCCACTTGGGTGGATCTGGTGTTGGAAGGAGATAGCTGTTTGACAATTATGGCAAACGACAAACCAACACTAGATGTCCGCATGATCAACATTGAAGCTAGCCAACTTGCTGAAGTCAGGAGTTACTGCTATCACGCTTCAGTCACTGACATTTCAACGGTGGCTCGATGCCCCACGACTGGAGAAGCCCACAATGAAAAACGTGCTGACAGCAGCTACGTGTGCAAACAAGGCTTTACTGACCGCGGATGGGGAAATGGATGTGGACTTTTCGGGAAAGGAAGCATTGACACATGCGCAAAATTTTCGTGTACCAGTAAGGCCATTGGAAGAATGATCCAACCAGAGAACATCAAGTACAGGGTTGGCATATTCGTGCACGGAACCACTACCTCGGAAAACCATGGGAATTACTCAGCGCAAGTAGGAGCGTCTCAAGCAGCAAAGTTTACTGTAACTCCAAATGCTCCTTCAATAACCCTCAAGCTTGGTGATTATGGAGAAGTCACACTGGATTGTGAACCAAGGAGTGGACTGAACACTGAAGCGTTCTATGTCATGACCGTGGGTTCGAAGTCATTCTTAGTCCATAGGGAATGGTTCCATGACCTTTCTCTTCCCTGGACGTCCCCCTCAAGCACGGCATGGAGAAACAGAGAACTCCTCATGGAATTTGAAGAGGCACATGCCACAAAACAATCTGTCGTAGCTCTTGGGTCACAGGAGGGAGGCCTCCATCAAGCGTTGGCAGGAGCCATCGTGGTGGAGTACTCGAGCTCAGTGAAATTGACATCAGGTCACCTGAAATGCAGGCTAAAAATGGACAAACTGGCTCTGAAGGGCACGACTTATGGCATGTGTACAGAAAAATTCTCGTTCGCGAAAAATCCAGCGGACACGGGCCATGGAACAGTTGTCATTGAGCTCACATATTCTGGAAGTGATGGTCCCTGTAAAATTCCGATTGTCTCAGTCGCTAGTTTAAACGACATGACCCCTGTGGGGAGGCTGGTAACAGTAAACCCCTTCGTCGCAACATCTAGCTCCAACTCAAAGGTGCTGGTTGAGATGGAACCTCCCTTCGGAGACTCTTATATCGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATTAACCATCACTGGCACAAAGCTGGAAGCACGCTGGGCAAAGCTTTCTCAACAACTTTGAAAGGGGCTCAGAGACTAGCAGCGCTAGGTGACACAGCCTGGGACTTCGGTTCCATTGGAGGGGTATTCAACTCCATAGGGAAAGCTGTTCACCAAGTATTTGGCGGTGCATTCAGAACGCTCTTTGGGGGAATGTCTTGGATCACACAAGGACTAATGGGGGCCTTACTTCTTTGGATGGGTGTCAACGCACGAGACCGGTCAATCGCCCTGGCTTTTCTGGCCACGGGAGGTGTGCTCGTGTTTTTAGCGACCAATGTGCATGCCGACACTGGCTGTGCCATTGACATCACAAGAAAAGAGATGAGGTGTGGAAGTGGCATCTTCGTGCACAACGACGTAGAGGCTTGGGTAGATAGGTACAAATATTTGCCAGAGACGCCCAGATCCTTAGCGAAGATCGTCCACAAAGCACATCAAGAAGGAGTGTGCGGGGTCAGATCCGTCACTAGACTGGAACACCAGATGTGGGAGTCTGTGCGAGACGAACTGAATGTCTTGCTCAAAGAGAACGCGGTGGATCTCAGTGTGGTGGTGAACAAGCCCGTGGGGAGATATCGCTCAGCCCCCAAACGCCTATCCATGACTCAAGAAAAGTTTGAGATGGGCTGGAAAGCATGGGGAAAAAGCATTCTCTTCGCCCCCGAATTGGCCAACTCCACGTTCGTCGTGGATGGACCCGAGACAAAGGAATGCCCTGATGAGCGCAGAGCCTGGAACAGCATGCAAATCGAAGATTTCGGCTTCGGCATCACATCAACCCGAGTGTGGCTGAAAATTAGAGAGGAGAACACTGATGGGTGTGATGGAGCAATCATAGGGACAGCTGTTAAAGGGCATGTGGCAGTTCATAGTGACTTGTCATACTGGGTCGAGAGCCGTCTCAATGACACCTGGAAACTTGAGAGGGCTGTCTTCGGGGAGGTGAAATCTTGCACTTGGCCCGAGACACACACTCTTTGGGGTGACGGTGTTGAGGAGAGCGAGCTTATCATCCCACACACCATAGCTGGACCGAGAAGCAAGCACAACCGGAGAGAAGGGTATAAAACACAAAACCAGGGACCCTGGGATGAGAACGGCATCGTTCTTGACTTTGACTATTGTCCAGGAACAAAAGTCACCATCACAGAGGACTGTGGCAAGAGGGGTCCCTCAATCAGAACCACTACTGACAGTGGAAAGCTGATCACCGATTGGTGCTGCCGCAGCTGTTCTCTACCGCCTTTGCGGTTCCGGACAGAAAATGGTTGCTGGTATGGGATGGAAATCAGACCTGTTAGGCATGACGAAACAACACTCGTTAGGTCACAGGTTGACGCTTTCAACGGCGAAATGATTGACCCTTTTCAGCTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTTCGCAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACGATTCCTGCGGTTTTGGGGGCTCTACTTGTGCTGATGCTTGGGGGCATCACTTACACTGACCTGGCAAGATATGTGGTGCTAGTTGCTGCGGCTTTCGCGGAGGCCAACAGTGGAGGAGATGTTCTGCACCTCGCTCTGATAGCCGTCTTCAAGATCCAACCAGCTTTTCTGGTCATGAACATGCTTAGCGCGAGATGGACGAACCAAGAGAACGTGGTTCTGGTCCTGGGGGCGGCTTTTTTCCAACTAGCTTCAGTGGATTTACAGATCGGAGTCCACGGAATCCTGAACGCTGCAGCCATAGCATGGATGATCGTTCGAGCGATCACATTTCCCACAACTTCTACCGTTGCCATGCCAATCTTAGCGCTCCTAACTCCGGGAATGAGGGCTTTGTATCTGGACACTTATAGAATCATTCTTCTTGTCATAGGAATTTGTTCCCTGCTGCAAGAGAGGAGAAAGACCATGGCGAAGAAGAAAGGAGCCGTGCTCTTGGGCTTAGCGCTCACATCCACCGGATGGTTTTCGCCCACCACTATCGCAGCCGGACTAATGGTCTGCAACCCAAACAAGAAGAGGGGGTGGCCAGCCACCGAGTTCCTTTCAGCGGTTGGGTTGATGTTTGCCATTGTGGGAGGTCTAGCCGAGTTGGACATCGAATCTATGTCAATACCCTTCATGCTGGCAGGGCTCATGGCAGTGTCCTACGTGGTATCAGGAAAGGCAACCGACATGTGGCTGGACCGGGCTGCCGATATCAGCTGGGAGATGGAGGCTGCAATCACAGGAAGTAGCCGGAGGCTAGATGTTAAGTTGGATGACGACGGCGACTTTCACTTGATTGATGATCCCGGTGTTCCATGGAAGGTCTGGCTTCTGCGCATGTCTTGTATCGGTTTAGCCGCTCTGACACCCTGGGCTATCGTTCCCGCCGCTTTTGGCTATTGGCTCACTCTGAAAACAACAAAAAGAGGGGGCGTGTTCTGGGACACGCCATCTCCAAAGCCTTGCTTAAAGGGGGACACCACCACAGGAGTTTACCGAATTATGGCCAGGGGGATTCTAGGCACTTACCAGGCCGGAGTTGGAGTCATGTATGAGAATGTTTTCCACACATTGTGGCACACAACTAGAGGAGCAGCCATCATGAGTGGAGAAGGAAAGCTAACGCCATACTGGGGTAGTGTGAAGGAAGACCGCATAAGCTATGGAGGCCCGTGGAGGTTTGACCGGAAGTGGAATGGAACAGATGATGTGCAAGTGATTGTGGTGGAACCAGGGAAACCTGCAGTAAACATCCAGACAAAACCGGGAGTGTTTCGCACCCCTTTCGGGGAAGTTGGAGCAGTCAGCTTGGACTACCC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