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Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_4
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
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|
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|
China
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Rhipicephalus microplus
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|
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ON812189.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_5
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
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RNA
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China
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Rhipicephalus microplus
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|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_6
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
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|
GenBank
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China:Chongqing
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669349
|
PRJNA841744
|
MAG: Lihan tick virus isolate TIGMIC_6, complete genome
|
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| 20,564
|
ON812191.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
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China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_7
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
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Phenuiviridae
|
RNA
| 6,498
|
GenBank
| null |
China:Chongqing
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669350
|
PRJNA841744
|
MAG: Lihan tick virus isolate TIGMIC_7, complete genome
|
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| 20,565
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Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-12-16
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TIGMIC_8
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Uukuvirus lihanense
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Uukuvirus
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Phenuiviridae
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| 6,498
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GenBank
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China:Chongqing
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China
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Rhipicephalus microplus
| null |
2019
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ON812193.1
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Lihan tick virus
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Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-12-16
|
TIGMIC_9
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Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
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Phenuiviridae
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RNA
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|
GenBank
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China:Fujiang
|
China
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Rhipicephalus microplus
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2019
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| 20,567
|
ON812194.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_10
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
| 6,498
|
GenBank
| null |
China:Fujiang
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28688339
|
PRJNA841744
|
MAG: Lihan tick virus isolate TIGMIC_10, complete genome
|
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| 20,568
|
ON812206.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_13
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
| 6,492
|
GenBank
| null |
China:Guangdong
|
China
|
Haemaphysalis hystricis
| null |
2019
|
SAMN28669359
|
PRJNA841744
|
MAG: Lihan tick virus isolate TIGMIC_13, complete genome
|
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| 20,577
|
ON812207.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_14
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
| 6,494
|
GenBank
| null |
China:Guangdong
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669360
|
PRJNA841744
|
MAG: Lihan tick virus isolate TIGMIC_14, complete genome
|
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|
ON812208.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_15
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
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|
GenBank
| null |
China:Guangdong
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
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|
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|
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| 20,579
|
ON812271.1
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Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-12-16
|
TIGMIC_16
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
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Phenuiviridae
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|
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Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
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|
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Lihan tick virus
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Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
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China
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2022-12-16
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TIGMIC_17
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Uukuvirus lihanense
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Uukuvirus
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Phenuiviridae
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RNA
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|
GenBank
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China:Hubei
|
China
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Rhipicephalus microplus
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2019
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|
ON812273.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_18
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
| 6,500
|
GenBank
| null |
China:Hubei
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28697459
|
PRJNA841744
|
MAG: Lihan tick virus isolate TIGMIC_18, complete genome
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|
ON812274.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_21
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
| 6,495
|
GenBank
| null |
China:Hubei
|
China
|
Rhipicephalus microplus
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2019
|
SAMN28669404
|
PRJNA841744
|
MAG: Lihan tick virus isolate TIGMIC_21, complete genome
|
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ON812275.1
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Lihan tick virus
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Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2022-12-16
|
TIGMIC_22
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
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Phenuiviridae
|
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| 6,487
|
GenBank
| null |
China:Hubei
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China
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Rhipicephalus microplus
| null |
2019
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SAMN28669404
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PRJNA841744
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|
ON812276.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_23
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
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|
GenBank
| null |
China:Hubei
|
China
|
Rhipicephalus microplus
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2019
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|
MAG: Lihan tick virus isolate TIGMIC_23, complete genome
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|
ON812277.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_24
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
| 6,491
|
GenBank
| null |
China:Hubei
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28669406
|
PRJNA841744
|
MAG: Lihan tick virus isolate TIGMIC_24, complete genome
|
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| 20,640
|
ON812278.1
|
Lihan tick virus
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_25
|
Uukuvirus lihanense
|
Uukuvirus
|
Phenuiviridae
|
RNA
| 6,517
|
GenBank
| null |
China:Hubei
|
China
|
Rhipicephalus microplus
| null |
2019
|
SAMN28704366
|
PRJNA841744
|
MAG: Lihan tick virus isolate TIGMIC_25, complete genome
|
GCCGAAGCAAGAACCTCAGGCGCAGAGACCCCAGCTATAATGCCTGCAACTAGATTGCATTCACTCAAAGCGTTAGCACAATTAACTGATCTTGTGTCCTACAAATCATTGTATGTCCCCGCTAGGAGGACCATAAACATAAACAGGGAACAGTTCCCTGCACCGCTCATCTCAGCCGAAAGATCCTATGAAACCGTCACACTCAAGATCCACTTAGACGAGGGAGGGAGTGAAGCAGGGTCCTCTCTGCATCAGCAGGGGGACATTGTTGTCACTGTTGATTCAGCACACACTTTCATCCATGATTTCACATTTGCACATCTTTCTCGAGAGACTGATGTGAAATTCAGCAAGCATTTTCCACAGTATAATGACGACTTCGACAACTACACGCCAGATGTCATATTGAGTGAGATAGGTGATAGGACTGTGATCATTGAATTTGCCACCTGCAGAGCCACAGAGGAACGTGCATTAGAAGTAGCTTACGAGAACAAAATTGGTAAGTACTACATGGCCTGCAAAAACCGTGCCTCTCAGAAATGCAAAATTGCATTACTTTGCATCGTTGTGGGTTATGACACGATAGTAACCAATATGAACATTCCACAGCTTGACGCAGAAGAACTATGTCTTCGATTCAGTACTGCAGTTGATTCTTATTCCTACATGTCAAGCAGATCCATGCTTCCAGACCTCCGTGAAGGGGATGTGACCACCAACGGGATGTCAGTCCAAAATGCATTTAAAGACATAAGATTCAATTGGGAGGTAACAGAAGAAAAGTTCCCCCCCTTCTCTCAGGAAATGTATGATGGATGGTTCACCCCCCCTGATGAGAAATATATAGAGCAGATGGTTTACAACAGTTTCCAAAAAGTAAATGATGATCTACTGTATCAGCACATGTACAATCTAGACGACATTAGTTGGAAAAGCACTAGGATGGGGTGGAGAGCAGACTCTGAGTGTTCTCGATACTGCCAAACGATGAGTTATGAAAAAACCAGACTGATGAATACCATCAAGAGCACCATTCCCATACCGGGAGTGGTCCTGAGACTGTGTAGAGATCCCGGCCTGAACCCAACAAACATGCTTATGAAAGACACAATCATGATCGACGGTGAATCTGCAATGTCCCGATTGTGGAGGAAAGCAGCCTATGAATTGAATCTGGGCACTGTAAGCCGAGTGGAAGAGGACAGGGAGTATGAGGAGAAAATTATGAGAGGTGAGGCCACTACGATAGAGGAGCACACAGCAAAGGCAATGCGAAAGGAGTTTCATAGACTCAAGGTTCCGCTCTCAGAGGATGACCGAGTTGAATTAGCGAAGAGAGGGATCGACGGAAAGAGATTCAAGAACCACCCAGACGTGAAAAGAAACAGAGAGGAAAAGAAGAGAGGTTTTGACCTGTTCACAGATGTCACCATGTTTGACTGCTTTCTTGAAGAGCCATTTGAAGATTTCATAGGGTGGGAGGCCTGTGCCTTGCCTGATTATGTGGAACAAATCATTGAGGCTGATGTTGAATCACTTAATGCACATGGCTTTAGGTCAGAGGATGAGACGCCCATGATAGACAGCATCAAGGGTTTCTGGAGCTCTCCCATAATGAGATGGGCATTCATGGTGACGTGCATTGGAGTGGAGTTAGCAATTGCTAGCAAGCAGCACTGTTCCAAGGATGAGTTCATCATTAAGAAGTTGAGAGATTATGATCTGTTCATGCTAATAAAGCCAACGAACAGTGGAGGCCCCATGTTTGTGTCCTTTGCATGGCACACCACAGATGTGGATAGATATTTGACAGAAACTAAGGTGTTCAAGAAATTTGAAATGTTGAACAGGTGGTGCTTCACCAACTTCCACTCATTCAAAGCCTCCAAAATAGAAACCTTGGTAAAGGCAGCCTCTCGAATTAACAACCTTTACTGGTTCTGGAGGGAACAATATGAGATAATACCGTGGAGAATTGAAGCCAAGGCCCCACATCTCATCGATGTGGGAAAAATGCTGAAGATTAGTGTGATGGTTATGATGGAGGATAAGTCTCGAACTGAAGAGATCATCACAAACTTAAGGTACATCATGTTGGAGGGGTTTGTGTCAGAGCCATGCATGCCTCGACCTCAAAAAATGCTTGAAAAGATGCCAACTGTTGCAAGAACTCTACTGCAAGTTTGGTTGATTCATAAGTCACTCAATGCCATTAAGAGAGTGGCCAAGAACCCTTTCAGGACCGAGCCAAGAGAGAGGAAGGTTGTCTGGAACAACATCTTCAATCCCTTTACGATGACCAAAGTGGAGGACCCCCTTAGACTGGTGAACCTGTTCTATCTAGGATATCTGAAAAATAAAGATGAACCTGGTGAGAAGAACTCAGCTCCAGCCCTCGTGAGGAAGATCATTGAGATGGAGGCCCAGCATCCAGGGAGATATGATTACTTAGGCTATGGTGACCCCCCCTTCGGGAAAATGAAGACCCATGAGTACTCCATCTCCTTTCAGAAACTGGTCTGCCAAACAGGACTAGATGTTTTGAAGGCCAGATGGGGAGAAAGCATCATTGACTCAATGCACATAGACATCCTGAATGCATTTGGCAACTTGACTCTAGATAGAGTCTCAACCTTAAAAGCATCCAGCGCATTTGATGAGTCATGGTACACTTACAACCCAGACAAATCATATCACCGTAAAAAAGTGATCGAAAATTTTCAGAAATTCATAACTGCGGAGCACACACATGTCCACCATGTGTTAAAAGAGTGCCTTGAGACAATAGAGAAGAGAGGGTGCATGCACATAGATATATTCAAGAAGAATCAACATGGTGGGTTGAGAGAGATATATGTTCTGGGTGCTGAGGAGAGAGTGGTGCAGTTAGCTCTAGAGACCATTGCTCGCCAAGTGTGCAAGAAGTTTTCTTCTGAGACTTTGACCAATCCTGGAAACAAGACTAAGATACCTGAAACTCATGGAGCAAGGGCCAGAGCTGCCATCAGGGATTTGTCTTCACAGAAGATAGAGACAGTCGGAACTTCTGATGACCTCAAAACATTCAATCAGACCCAACACACCACCAAACTTGCATTCACACTGATCAAATTTACCAGACCGGAATTGCACCCCTTCATCATCAGGGCCTGCAGCTTATTCATGCGGAAGAGAATAAAGTTGGATGATGATCTCCTGCAGATCTTGGTCACAAACTCAGAAATAGAGACAACAGACAGAGTCCTGTGGACCTTACACGAGGCATACCGGGGAAGGATCACTCCTCCCCCAAAATGGGCAGCAGTCGGCAGGTCCTACATTGAGACTGAGACAGGGATGATGCAAGGCATACTACACTTCCTATCAAGCCTGCACCACACTTGTCTCCAGGAGTGGTACAGACTTTTTTGCATGGGTGCATATGGAAACATCTTTAAGACGAGGGGCACAGGGGTGATCGTTGATGTGATGCAGAGTTCTGATGACTCCGCAGTCCTCATATCCTACCCCCTTTCTGATGAGGAGACAAACACAAGGTGCAGGGTTGCTGCAGCCCAACTGTTCCTCCTGAAGAAAGAGTTTGGCACATTTTTGGCCCTATACCCGTCTGTAAAGTGCACAACCAACACCCTTTACTTTGTTGAATTCAACTCTGAGTTCTTCTTCCACAACAATCACATTAGACCAACACTGAAATGGGTAATATCTTGCGATCAGATATCTGAGCAAGAGGCACTAGTCTCCAGGCAGGAAGAGTTGTCTAGTGCTCTAACAGGTGTTCTTGAGGGCGGTGGCTCCATAAGTCTGTGTCACTTATGTCAATTTGGTCAAAGCATCCTTCATTATACATTGCTAGGAGCAGGAGTGACTTTCCTCTTTGAGAAGTTCCTTTTGGAAGCAAGGGATTTTAAGGACCCATCTTTGGGGTTCTTTCTAATGGATCATCCTTTTGGTGCTGGACTGGCTGGGTTCAAATACAACTTATGGAACCAGGTTAGGGGCGCTCAGTTGGGTGCTGTTTACAAGGTGTTCCTTACAGCTGTCAAGTCTGACACTCCTCCAGAGGAGAAGGAACGAGTGTACCGTTCTATAGAGACAACTGGATGTGGAGCTTTGGCAAGTTCAGTAACCATTAGACATGGGAATCGGGAGCTTTGGAAAGCCCTGAAGGAAAGATGCCAAGTGGATGAGGATTGGGAGAAAAGGTTTGATGAGAACCCTGAGGCTCTCTATCGTCAGGCAAGGACCAGGGAGGAGGTGAAGTTGAAGATTGCAGAGAAACTGCACTCACCAGGTGTGAGTGCCTCCTTGTCAAAGGGCAATTCAACGATAAAAATCATCAGTTCATCAATCTACATACTGTCCAGGAATGTCATCACTCAAGGGTCAGCATGGATGGATCCTGATCCATCAGTTTTAAAACAGAAGAAGCCCTTAATGCGAGCAGTCCTCGAGGAGAAAAACATCTCGCTGGGCGATTATGTCCAGGTGACCGAAGAGGAGCTGCGAAGCTTATTTCCCCAGCATGACGAATTTTGCAGGTTGAAGGACATTATGGCCGACCATCAATACATAACTGGAGGGCAGTCTGTTGGAATGAGGAAAACAGTGCAGACTAAGGTTGTCCTAGTGCAAAGGGAGGATTTTTCCAAAGTGCGCCCTGAGGATATCTTGACTGATGTCTGGTTCAGCTTCAAAAGGAGCGCACTCACCAAGCCAGTCTTGATGGAAATGTTTGAGTCACTTAAAGAGACAATCCCCTGGATCAGAGACACAGCAGAGGAGACACTAAAGGCCTCCCCATTTCTTCACCAGCACCAACTGCGGAACTTCATCAGCAGAATGGACTTTGAGGGTCGAGTAGTCAGGCTTGTTGGGGCTCCTTTGAAAGCAAAAGTCGAGACAAACGTGGCAACGGTCATATGTAGAAACTTCTTTCCTACTTGGGAATTGCACATGCACTTTGACGAGAGATCAAAGACTGCCTCTCAAAAAGCCCTCAGTCTGAAACACTTCGTGGCCCTAACTCTGTCTGGACCATTAGAGGAGAGAGCCAAGAGAGATAGGATCAGAGACACTTTGACTGAATTCCCTGATCTAGAGGTCGTGGTGGGGGGTGGGAAGACCCGGAGAAACACATTAGCATTGTTCAAGGATTACTTTGTGAAAGGGAGAGCAGGAGCTGGTCAATTCAACGTCAGCCTAAGAACTGCAAACTGTGGGATCATAGGAGGCTTCACCCTTCCTCAACGATCAAGGAGAGATGATGATGGCAGGATTGTATACTATGGGACAGGAATATGGGAGGGTTCTGTTAATGGCCACTACGTCAGGATAAAAATAGAAACAATTGATGGAAAGAACCAGTTGACTGAGGTGAAGGCGTATGAGGATAACTTTGTCCGACTGCAACTAACACCTTTTCTCCGACAGTGGTGCAGGGACATGGGTGTGTCCAACACACACAGGAGTCTAAACAAGGACGGGTGCATGGTCGTCATAAATTTCGAATTGAGGACCTATGGGACTGGCTGTCCAGTCCGTCTGGTCCCCTCGATGGGCTATGTCGGTGACATATCTTATGACCAAATGGAGTTCAGAATCGAGGGACATTCAATGCACCTGCTCCAGATTTTAGGATGGGGAAGATCCTGTAAGATCCTGTCCTACCACAGTCGCACTAGCGACATTACTGATGAGGGGGCCGACATGCTTGAGAGAATTGCCACGTCATCAAATTGGTCATGGTTTAAGCAAGAACCTTCTCATAGTTGGTATACGTTGACCAGCCTAAACTACGACACTTACAAATTTCACAAAGAGATCATGGAGAAAGGAGGTCGACTAGGAAACATTGACATTCAAGCCTACAGGGAAATTCTAAAGCAGTCAGCCCACTACACATTGGCCATGCGAGGGTTTACCATGCACGACATACCACCGCAGACCATAACCTCTGGGAGGGCCAGAGACTTTGATAAACAAATGTGGAAGATGATCAAAGAAGGGGGCATGAGCAAGATGTTCGAGACTGAGCAGGCTAGAGCACTTCTTGAGGGCGCAGAGTATGAGGAGGGAGAGGACCGGCAAGGAGCGGGGCCATCGACGTCTAGAGAGGATGAGGACAGGCGCAGAATTGCCATTGGGCTCTTCCCTATGGGTGTAAACAAGGGGAGGATAATGGAAAGCATTGATGTCGACCTGTTCGGTGAACCAGATCATCCCATCATTCCTGCCACTCTCTTCCGCCACCCCACCCTGTCTGCCAATTGTGTAGATAACATAATTGGCACCGAGATGACACCCACAGAGGTCACAGCTGTGCTGGAAAAGTGGATGGTGACAGAGGGGCTCGAGACAAGAGCCAAGGAGCTGCTATGGCTTCTAATGCGCGACTCATCTAAACTAGTTTCTGTTCCAAAGAGGGATCCTGACTTTGAGGCTAGTTATAAGGTGTCTGAACCACAACTTGATCCTTCTATGATTGGTTAAAATGTTATTGGATTACCAAGAT
| 20,641
|
NC_005288.1
|
Lily mottle virus
|
Zheng,H.Y., Chen,J., Zhao,M.F., Lin,L., Chen,J.P., Antoniw,J.F., Adams,M.J.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-12-06
|
Sb
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,644
|
RefSeq
| 1
|
China:Zhejiang, Hangzhou
|
China
|
Lilium
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Lily mottle virus, complete genome
|
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| 8,430
|
OM311161.1
|
Lily mottle virus
|
Chen,L., Li,Y.
|
Beijing Forestry University, School of grassland science
|
China
|
2023-01-28
|
LMV/BJ-1
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,629
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
| null |
2019-07
| null | null |
Lily mottle virus isolate LMV/BJ-1, complete genome
|
CAACAAGACTCAATACAACACAACCCAGCAGCTTTCAAACTCTCTTCTTTGCTTTCAAGCAAGTTTCTGATTCCTCTTTTGGACTCACAACCAGTTTCAAAGCACTCTTCTCCACTCAACGCATTCACAACTGAAAGATATGGCCTCATTCATGGTCGGATCGATCCTTGTGGACACCGCAAGCGTCCTGAAAGAAAGCTTTGCACAGAAAGTGCTCACAACACCTCCAGTGTTGGTAGCACAGCCTGTGCAGAGGAGCTTTGGTGCGGCACGGATGTGTGCACGCGAAGCAATTGCAGATGATGAAGAGAAGGTGGCCAAAGCCTTCTCAGCTCTGGAAGCACGGTGTGCTGCCAGGGTCTCAAGGATGGGAACCATCCGCGTGAAGGTCACGCGGTCTGGAACCCTGCGGGCGCAGCCACTTCCAAAAAGGGAGCAGGCACGTCTTAGGAAGGCTGAACGTAAGGCGCGCTTGGATCGTGAAGAGTTTCTGAAAGGAAGCCCCACTGTCATTGATCACATCAGTATAGCTGGTGGCGCGCAGCCTTCACAGGACATGGTGGAGCCAATGTCCACACGAAAGGCACCATGGCATTCAGAGAGCAAGAAAGCTCGAAAAGCAATCCCGCGCTCCCCAACACTGAATGAAACTGGGCTTGCATCATTGATGCGAGCCATCGCAAAGATTGGGGCCAAGAATTCCATAAAAATTGAAATCGTGGATGAGCGAAAAGTGCAAGCACGCTACATAAAGCGTGATGCAGGGTCATACCTGCAAGTGCGCGTCGCGCACCATGAGGGCCTAAGGCGTAGGCGTGACTTGAAACTCTCTGCATTTGCAGACCAGTGCTTAACACAACTTGCCAGCACCACCCACGGGACGAAGTACCACCACGTAACCCAGCTTAAAGCAGGTGACAGTGGGATCGTTCTGTTAGCACGCAGACTCTTTGGGTGGCACAGCGGTAGTTGTAGTCAAATTTTTGTCGTGCGTGGGAATCATGAAGGCAAGTTATATGAGGCACGGCGCAAGGTAACTCTAACTATGACACACAAGATGATCCACTACTCGGGCCCAGGCGATAAATTCTGGGCAGGATTCAACTCCCAATTCCTCAGGATCAAACCCAAGGAAATACCACACACTTGCACATCAAACTTCAACGTCTTCGAGTGTGGGCAGGTCGCGGCTCTTATGTGTCAAGCTCTGTATCCATGTGGGAGAATTACATGTCAACAGTGTGCGTCCGAGTATCTGGAGCTGACGAAGGTTGAACTCGGGGAAAAGCTCAGCGATGGTTTGTATAGAACAAGTTCGCAAATTCGTGAAAACCACCGAGAGTTCGCCCATGTGGCACACATACTCAACGTAATAGCTGATCTTCTGAGCCTCAAGAACAACAACATGGAGGCGTTCACAGAAGTTCACAAACTCATAGGTGAGCAAACACAGTCACCATTCACACACCTCAATCGCTTGAACTCAATACTGATCAAAGGCAGCGATATGAGCAGCAATGAGCTGTACGAATGTTCAGATTGCATTCGTGAGCTAGCGCGATTCCAGAAGAACAGGACAGATAACATCAAGAAACTGGACGTTAGCGTGTTTCGGAACAAAGCATCCTCCAAGTCATACTTCAACCTGGACTTGATGTGTGACAACCAACTTGACAAGAACGGAAACTTCGAATGGGGCCAGCGAGGCTATCATGCCAAACGGTTCTTATCGAATTATTTTGAGGTTGTCAACACACAGAATGCCTACCGAGAGCACACACTGAGGAAGCATCCGAATGGCACGCGAGAGCTCGCAATTGGGAAATTTATAGTGTCAACAAACTTCGAAGTGTTTCGCAAGAGCATGGAAGGGAAGCGCATACCACAAATGCCTGTTACTGAGGCTTGCCTGAGTCAGCGTGGTGAGCGTTTCATTTACCAGTGCTGCTGTGTAACAAACGAAGATGGCACTCCACTCGAGTCGACATTCAAAATGCCAACGAAGAACACACTCGTGCTTGGGAACACGGGTGATGAGAAATTTGTCGACATGCCCACCGACACGGATGAGAAGATGTATATAGCTCGAGAGGGCTACTGCTACATCAACATATTTTTCGCCATGCTAATAAACGTTCGCGAAAGTCAAGCAAAGGCATTCACGAAGATGGTGCGAGACCGCCTCGTACCCGAGCTTGGAACATGGCCAACCATGATCGATGTGGCAACAGCATGCCACACATTGACTGTCTTTTTCCCAGACACACTGAGCGCAGAACTCCCGCGAATTCTCGTGGACCACAACACTAAGACGATGCATGTGATTGACTCATACGGATCTGTTAGCACTGGCTACCACCAGTTAAAGGCTAACACAGTGAGTCAGCTAGTCCTCTTTGCTAGTGACACGCTGAAGTCAGAAATGAAGCACTACCAGGTCGGCGGGAAGAAGTTCACAGTCGAATACGAAGCAGTTAAGCTACTAATAAAGGCTATATATAGGCCTAAGCTTATGCGGACACTGATGGAGGATGAGCCCTACCTAATTTGTCTCGCAATGTGCTCTCCAGGAGTGCTTATTGCTCTGTTCAATAGTGGATCCCTCGAAACCGCAATCAACTACTGGATTGCGCGGCACAAAGACACTGCACAAATTTTTGCGCTACTCACTGTACTCGCCACAAAAGTGTCAGTCGCTCGCACACTCACAGAGCAACTGGCAATATTGAGCGATCATGCGACAGATGTGCTCAAGATCATGGATAGAACGTTTGCCACGCAGCACTCTGTTTCACTAGTGCATACGTTCTTGATGCAACTGGAGGAGAAGCGACACACGGATGTCTCACTGGTGGGCTCAGGTTTCGCCAATTTGAGTGCAACAACGCATGAGCTTATGGAAAAAAATTATCTGGCGGAGTTGGATGCGTCCTGGCGAGATCTAAGCTTGTTGGAAAAGTGCTCACAAATGCGTTGGTCATTTCGATCACCACAGCAGTTTTCAAACGAATTGCACCCCAGCGCGTCAACCGATTTGAACGGTCGGTACAACACATCTGTGCGTGCGCTTTCCACAAGATATATGAATAACCTACGTAAGAGTGTATGTACAAAGTATCATAATATGAAAATACGAACGCATCAGTTTATAGGTAGACAAGTGTGTAATTCAATAATGGGATCGAGTAGATTCTTCCCGGATTTAGCACAATGCGTGCATATATTAGCGATATTTAGTATATTGTTAAATATTATTCGCACTATTAACATATATACTAGTGAGTACATACGCCTGAAGAACTGCGAACTCTCGCAGATTGAAGAGAAACGCTGGAATAAACTACTCCATACATTTGATATGATGGAGAAGATAGATGGACAGAAACCTACGCTAATTGAATTCACTAAGCACCTTAAACAATGGGATCCAGAGTTGTACTCTGAGTTTCATAGCATATTACAGGATGAGGAAGAGGATACTGAGGAGGTGCAATTCCAGGCTAAACCGGACGGGGAGAGAAACCTCGAACGAATTATGGCTATAATTGCACTGACTATGATGGTCTTTGACGCTGATCGTAGTGATTGCGTGTATAAGGTACTCAACAAGTTGAAAGGTTTGCTGAACACAGTGCACCAAGAGCCGGTGAAATTTCAGAGTATTGATGACATCCAAGACTATCTCGAAGAGCGTGAAATGGTCATCGACTTTGAGATCTCAGCGGACGACCACAACATCAACAAACTCGCTGGTGCTACATTCGAACAGTGGTGGAGCAACCAGATGGAATGCAATAATGTGCTGCCACACTATAGAACGGAAGGCTTCTTCATGGAGTTTACACGAGCGAACGCAGCGCATGTAGCGAATGAAATAGCACACGGCCCACACAAGGACTTGCTGATCCGTGGTGCTGTTGGATCTGGAAAGTCGACAGGGCTCCCTTTCTATTTGAGCAAGCGCGGACGCGTTTTGATGCTTGAGCCCACTAGGCCATTGGCCAGTAATGTGCACAAGCAACTGGCAGGGGATCCGTTCCTGGTCAGCGCAACGCTAAAGATGCGGGGAGAAACCACATTTGGCTCAGCTCCAATCACAGTGATGACAAGTGGATATGCGTTCCATTACTACGCCAACAATCCCAACCAGCTACGCGACTTTGAGTTCATCATCTTTGATGAGTGCCATGTCAATGACAGCTCAGCGATGGCTTTCCGGAGCCTGCTCGCAGAGTACACGTACGACGGACGCATCATCAAGGTGTCGGCAACACCACCAGGGCGAGAGGTTGAGTTCACCACGCAGCATCCTGTCGAAATAATACCCATCGAGCGGTTGACGTTTCAGCAGTTCGTTGCAGTGCAGGGGACTGGAGCGGTCGGTGATGTAACCACGAAAGGGGACAACATTTTAGTGTATGTCGCTAGCTACAGCGAAGTTGACAATCTCAGCAAAGGGTTAGTGGAAAAGGGTCACAAAGTCACGAAAGTAGACGGTAGGACCATGAAAGTCGGAGGTGTGGAGATCATCACTAGCGGTAGCCAAGCGAAGAAACACTTTGTTGTGGCCACGAATATCATCGAGAACGGTGTCACATTGGACATCGATGTTGTGGTGGACTTTGGATTGAAAGTTGTGGCAGAGGTGGACATCGACTCGCGTCTCACGCGCTACGTCAAGAAGTCGATATCATATGGAGAACGCATACAGAGGTTGGGGCGTGTCGGACGGAATAAACCTGGTGTCGCTGTTCGGGTTGGCACCACGGAGAAAGGATTACAGGCAATCCCTGTAACGACGGCCACGGAGGCAGCATTCCTGTGCTTCGCTTATGGTCTACCGGTAATGACTAATAATGTGTCTACAAACATACTGACTAATTGCACAGTTCTGCAAGCTCGAACGATGATGCTCTTTGAGATCAACCCGTTTTATATGTGTCATTTCGTTCGATTTGATGGAACTATGCACCCAGAGGTACATAGAATACTAACACCAT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| 19,003
|
OM311162.1
|
Lily mottle virus
|
Chen,L., Li,Y.
|
Beijing Forestry University, School of grassland science
|
China
|
2023-01-28
|
LMV/BJ-2
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,645
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
| null |
2019-07
| null | null |
Lily mottle virus isolate LMV/BJ-2, complete genome
|
CAACAAGACTCAATACAACACAACCCAGCAGCTTTCAAACTCTCTTCTTTGCTTTCAAGCAAGTTTCTGATTCCTCTTTTGGACTCACAACCAGTTTCAAAGCACTCTTCTCCACTCAACGCATTCACAACTGAAAGATATGGCCTCATTCATGGTCGGATCGATCCTTGTGGACACCGCAAGCGTCCTGAAAGAAAGCTTTGCACAGAAAGTGCTCACAACACCTCCAGTGTTGGTAGCACAGCCTGTGCAGAGGAGCTTTGGTGCGGCACGGATGTGTGCACGCGAAGCAATTGCAGATGATGAAGAGAAGGTGGCCAAAGCCTTCTCAGCTCTGGAAGCACGGTGTGCTGCCAGGGTCTCAAGGATGGGAACCATCCGCGTGAAGGTCACGCGGTCTGGAACCCTGCGGGCGCAGCCACTTCCAAAAAGGGAGCAGGCACGTCTTAGGAAGGCTGAACGTAAGGCGCGCTTGGATCGTGAAGAGTTTCTGAAAGGAAGCCCCACTGTCATTGATCACATCAGTATAGCTGGTGGCGCGCAGCCTTCACAGGACATGGTGGAGCCAATGTCCACACGAAAGGCACCATGGCATTCAGAGAGCAAGAAAGCTCGAAAAGCAATCCCGCGCTCCCCAACACTGAATGAAACTGGGCTTGCATCATTGATGCGAGCCATCGCAAAGATTGGGGCCAAGAATTCCATAAAAATTGAAATCGTGGATGAGCGAAAAGTGCAAGCACGCTACATAAAGCGTGATGCAGGGTCATACCTGCAAGTGCGCGTCGCGCACCATGAGGGCCTAAGGCGTAGGCGTGACTTGAAACTCTCTGCATTTGCAGACCAGTGCTTAACACAACTTGCCAGCACCACCCACGGGACGAAGTACCACCACGTAACCCAGCTTAAAGCAGGTGACAGTGGGATCGTTCTGTTAGCACGCAGACTCTTTGGGTGGCACAGCGGTAGTTGTAGTCAAATTTTTGTCGTGCGTGGGAATCATGAAGGCAAGTTATATGAGGCACGGCGCAAGGTAACTCTAACTATGACACACAAGATGATCCACTACTCGGGCCCAGGCGATAAATTCTGGGCAGGATTCAACTCCCAATTCCTCAGGATCAAACCCAAGGAAATACCACACACTTGCACATCAAACTTCAACGTCTTCGAGTGTGGGCAGGTCGCGGCTCTTATGTGTCAAGCTCTGTATCCATGTGGGAGAATTACATGTCAACAGTGTGCGTCCGAGTATCTGGAGCTGACGAAGGTTGAACTCGGGGAAAAGCTCAGCGATGGTTTGTATAGAACAAGTTCGCAAATTCGTGAAAACCACCGAGAGTTCGCCCATGTGGCACACATACTCAACGTAATAGCTGATCTTCTGAGCCTCAAGAACAACAACATGGAGGCGTTCACAGAAGTTCACAAACTCATAGGTGAGCAAACACAGTCACCATTCACACACCTCAATCGCTTGAACTCAATACTGATCAAAGGCAGCGATATGAGCAGCAATGAGCTGTACGAATGTTCAGATTGCATTCGTGAGCTAGCGCGATTCCAGAAGAACAGGACAGATAACATCAAGAAACTGGACGTTAGCGTGTTTCGGAACAAAGCATCCTCCAAGTCATACTTCAACCTGGACTTGATGTGTGACAACCAACTTGACAAGAACGGAAACTTTGAATGGGGCCAGCGAGGCTATCATGCCAAACGGTTCTTATCGAATTATTTTGAGGTTGTCAACACACAGAATGCCTACCGAGAGCACACACTGAGGAAGCATCCGAATGGCACGCGAGAGCTCGCAATTGGGAAATTTATAGTGTCAACAAACTTTGAAGTGTTTCGCAAGAGCATGGAAGGGAAGCGCATACCACAAATGCCTGTCACTGAGGCTTGCCTGAGTCAGCGTGGAGAGCGTTTCATTTACCAGTGCTGTTGTGTAACAAATGAAGATGGCACTCCACTCGAGTCGACATTCAAAATGCCAACGAAGAACACACTCGTGCTTGGGAACACGGGTGATGAGAAATTTGTCGACATGCCCACCGACACGGATGAGAAGATGTATATAGCTCGAGAGGGCTACTGCTACATCAACATATTTTTCGCCATGCTAATAAACGTTCGTGAAAGTCAAGCAAAGGCGTTCACGAAGATGGTGCGAGACCGCCTCGTACCCGAGCTTGGAACATGGCCAACCATGATCGATGTGGCAACAGCATGCCACACATTGACTGTCTTCTTCCCAGATACACTGAGCGCAGAGCTCCCGCGAATTCTCGTGGACCACAACACTAAGACGATGCATGTGATTGACTCATACGGATCTGTTAGCACTGGCTACCACCAGTTAAAGGCTAACACAGTGAGTCAGCTAGTCCTCTTTGCTAGTGACACGCTGAAGTCAGAAATGAAGCACTACCAGGTCGGCGGGAAGAAGTTCACTGTCGAATACAAAGCAGTTAAGCTACTAATAAAGGCTATATATAGGCCTAAGCTTATGCGGACACTGATGGAGGATGAGCCCTACCTGATTTGTCTCGCAATGTGCTCTCCAGGAGTGCTTATTGCTCTGTTCAACAGTGGATCCCTCGAAACCGCAATTAACTACTGGGTTGCGCGGCACAAAGACACTGCACAAATTTTTGCGCTACTCACTGTACTCGCCACAAAAGTGTCAGTCGCTCACACACTCACAGATCAACTGGCACTATTGAGCGATCATGCGACAGATGTGCTCAGGATCATGGATAGAACGTTTGCCACGCAGCACTCTGTTTCACTAGTGCATACGTTCTTGATGCAACTGGAGGAGAAGCGACACACGGATGTCTCACTCGTGGGCTCAGGTTTCTCCAATTTGTGTGCAACAACGCATGAGCTTATGGAAAAAAATTATCTGGCGGAGTTGGATGCGTCCTGGCGAGATCTAAGCTTGTTGGAAAAGTGCTCACAAATGCGTTGGTCATTTCGATCACCACAGCAGTTTTCAAACGAATTGCACCCCAGCGCGTCAACCGATTTGAACGGTCGGTACAACACATCTGTGCGTGCGCTTTCCACAAGATATATGAATAACCTACGTAAGAGTGTATGTACAAAGTATCATAATATGAAAATACGAACGCATCAGTTTATAGGTAGACAAGTGTGTAATTCAATAATGGGATCGAGTAGATTCTTCCCGGATTTAGCACAATGCGTGCATATATTAGCGATATTTAGTATATTGTTAAATATTATTCGCACTATTAACATATATACTAGTGAGTACATACGCCTGAAGAACTGCGAACTCTCGCAGATTGAAGAGAAACGCTGGAATAAACTACTCCATACATTTGATATGATGGAGAAGATAGATGGACAGAAACCTACGCTAATTGAATTCACTAAGCACCTTAAACAATGGGATCCAGAGTTGTACTCTGAGTTTCATAGCATATTACAGGATGAGGAAGAGGATACTGAGGAGGTGCAATTCCAGGCTAAACCGGACGGGGAGAGAAACCTCGAACGAATTATGGCTATAATTGCACTGACTATGATGGTCTTTGACGCTGATCGTAGTGATTGCGTGTATAAGGTACTCAACAAGTTGAAAGGTTTGCTGAACACAGTGCACCAAGAGCCGGTGAAATTTCAGAGTATTGATGACATCCAAGACTATCTCGAAGAGCGTGAAATGGTCATCGACTTTGAGATCTCAGCGGACGACCACAACATCAACAAACTCGCTGGTGCTACATTCGAACAGTGGTGGAGCAACCAGATGGAATGCAATAATGTGCTGCCACACTATAGAACGGAAGGCTTCTTCATGGAGTTTACACGAGCGAACGCAGCGCATGTAGCGAATGAAATAGCACACGGCCCACACAAGGACTTGCTGATCCGTGGTGCTGTTGGATCTGGAAAGTCGACAGGGCTCCCTTTCTATTTGAGCAAGCGCGGACGCGTTTTGATGCTTGAGCCCACTAGGCCATTGGCCAGTAATGTGCACAAGCAACTGGCAGGGGATCCGTTCCTGGTCAGCGCAACGCTAAAGATGCGGGGAGAAACCACATTTGGCTCAGCTCCAATCACAGTGATGACAAGTGGATATGCGTTCCATTACTACGCCAACAATCCCAACCAGCTACGCGACTTTGAGTTCATCATCTTTGATGAGTGCCATGTCAATGACAGCTCAGCGATGGCTTTCCGGAGCCTGCTCGCAGAGTACACGTACGACGGACGCATCATCAAGGTGTCGGCAACACCACCAGGGCGAGAGGTTGAGTTCACCACGCAGCATCCTGTCGAAATAATACCCATCGAGCGGTTGACGTTTCAGCAGTTCGTTGCAGTGCAGGGGACTGGAGCGGTCGGTGATGTAACCACGAAAGGGGACAACATTTTAGTGTATGTCGCTAGCTACAGCGAAGTTGACAATCTCAGCAAAGGGTTAGTGGAAAAGGGTCACAAAGTCACGAAAGTAGACGGTAGGACCATGAAAGTCGGAGGTGTGGAGATCATCACTAGCGGTAGCCAAGCGAAGAAACACTTTGTTGTGGCCACGAATATCATCGAGAACGGTGTCACATTGGACATCGATGTTGTGGTGGACTTTGGATTGAAAGTTGTGGCAGAGGTGGACATCGACTCGCGTCTCACGCGCTACGTCAAGAAGTCGATATCATATGGAGAACGCATACAGAGGTTGGGGCGTGTCGGACGGAATAAACCTGGTGTCGCTGTTCGGGTTGGCACCACGGAGAAAGGATTACAGGCAATCCCTGTAACGACGGCCACGGAGGCAGCATTCCTGTGCTTCGCTTATGGTCTACCGGTAATGACTAATAATGTGTCTACAAACATACTGACTAATTGCACAGTTCTGCAAGCTCGAACGATGATGCTCTTTGAGATCAACCCGTTTTATATGTGTCATTTCGTTCGATTTGATGGAACTATGCACCCAGAGGTACATAGAATACTAACACCAT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| 19,004
|
OM311163.1
|
Lily mottle virus
|
Chen,L., Li,Y.
|
Beijing Forestry University, School of grassland science
|
China
|
2023-01-28
|
LMV/BJ-3
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,629
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
| null |
2019-07
| null | null |
Lily mottle virus isolate LMV/BJ-3, complete genome
|
CAACAAGACTCAATACAACACAACCCAGCAGCTTTCAAACTCTCTTCTTTGCTTTCAAGCAAGTTTCTGATTCCTCTTTTGGACTCACAACCAGTTTCAAAGCACTCTTCTCCACTCAACGCATTCACAACTGAAAGATATGGCCTCATTCATGGTCGGATCGATCCTTGTGGACACCGCAAGCGTCCTGAAAGAAAGCTTTGCACAGAAAGTGCTCACAACACCTCCAGTGTTGGTGGCCCAGCCTGTGCAGAGGAGCTTTGGTGCGGCACGGATGTGTGCACGCGAAGCAATTGCAGATGATGAAGAGAAGGTTGCCAAAGCCTTCTCAACTCTGGAAGCACGGTGTGCTGCCAGGGTCTCAAGGATGGGAACCATTCGCGTGAAGGTCACGCAGTCTGGAACCTTGCGGGCGCAGCCACTCCCAAAAAGGGAGCAGGCACGTCTTAGGAAGGCTGAGCGTAAGGCACGCTTGGAGCATGAAGAGTTTCTGAAAGGAAGCCCCACTGTCATTGCTCACATCAGCATAGCTGGTGGCGCGCAGCCTTCACAGGACATGGTGGAGCCAGTGTCCACACGAAAGGCACCATGGCATTCAGTGAGCAAGAAAGCTCGAAAAGCAATCCCGCGCTCCCCAACACTGAATGAAACTGGGCTTGCATCATTGATGCGAGCCATCGCAAAGATTGGGGCCAAGAATTCCATAAAAATTGAAATCGTGGATAAGCGAAGAGTGCAAGCACGCTACATAAAGCGTGTTGCAGGGTCATACCTGCAAGTGCGCGTCGCGCACCATGAGGGCTTAAGGCGTAGGCGTGACTTGAAACTCTCTGCATTTGCAGACCAGTGCTTAACACAACTTGTCAGCACCACCCACGGGACGAAGTACCACCACGTAACCCAGCTTAAAGCGGGTGACAGTGGGATCGTTCTGTTAGCACGCAGACTCTTTGGGTGGCACAGCGGTAGTTGTAGTCAAATTTTCGTCGTGCGTGGGAATCATGAAGGCAAGTTGTACGAAGCACGGCGCAAGGTGACTCTAACTATGACACACAAGATGATCCACTACTCGGGCCCAGGCGATAAATTCTGGGCAGGCTTCAACTCTCAATTCCTCAGGATCAAACCCAAGGAAATACCACACACTTGCACATCAAACTTCAACGTCTTCGAGTGTGGACAGGTCGCGGCTCTTATGTGCCAAGCACTGTACCCATGTGGGAGAATTACATGTCAACAGTGTGCGTCCGAGTATCTGGAGCTGACGAAGGTTGAACTCGGGGAAAAGCTCAGCGATGGTTTGTATAGAACAAGTTCGCAAATTCGTGAAAACCATCAAGAGTTCGCCCATGTGGCACACATACTCAACGTGATAGCTGATCTTCTGAGCCTCAAGAACAACAACATGGAGGCGTTCACAGAAGTCCACAAACTCATAGGTGAGCAAACACAGTCACCATTCACACACCTCAATCGCTTGAATTCAATACTGATCAAAGGCAGCGATATGAGCAGCAATGAGCTGTATGAATGTTCAGACTGCATTCGTGAGCTAGCGCGATTCCAGAAGAACAGGACAGATAACATCAAGAAACTGGACGTTAGCGTGTTTCGGAACAAAGCATCCTCCAAGTCATACTTCAACCTGGACTTGATGTGTGACAACCAACTTGACAAGAATGGAAATTTCGAATGGGGCCAGCGAGGCTATCATGCCAAACGGTTCTTATCGAATTACTTTGAGGTTGTCAACACACAGAATGCCTACCGAGAGCACACACTGAGAAAGCATCCGCATGGCACGCGAGAGCTCGCAATTGGGAAATTTATAGTGTCAACAAACTTTGAAGTGTTTCGCAAGAGCATGGAAGGGAAGCGCATACCACAAATGCCTGTTACTGAGGCTTGCCTGAGTCAGCGTGGAGAGCGTTTCATTTACCAGTGCTGCTGTGTAACAAACGAAGATGGCACTCCACTCGAGTCGACATTCAAAATGCCAACGAAGAACACACTCGTGCTTGGGAACACGGGTGATGAGAAATTTGTCGACATGCCCACCGACACGGATGAGAAGATGTATATAGCTCGAGAGGGCTACTGCTACATCAACATATTTTTCGCCATGCTAATAAATGTTCGTGAAAGTCAAGCAAAGGCATTTACGAAGATGGTGCGAGACCGCCTCGTACCCGAACTTGGAACATGGCCAACCATGATCGATGTGGCAACAGCATGCCACACACTGACTGTCTTCTTCCCAGACACACTGAGCGCAGAACTCCCGCGAATTCTCGTGGACCACAACACTAAGACGATGCATGTGATTGACTCATACGGATCTGTTAGCACTGGCTACCACCAGTTAAAGGCTAACACAGTGAGTCAACTAGTCCTCTTTGCTAGTGACACGCTGAAGTCAGAAATGAAGCACTACCAGGTCGGCGGGAGGAAGTTCACAGTCGAATACGAAGCAGTTAAGCTACTAATAAAGGCTATATATAGGCCTAAGCTTATGCGGACACTGATGGAGGATGAACCCTACCTAATTTGTCTCGCAATGTGCTCTCCAGGAGTACTTATTGCTCTGTTCAACAGTGGATCCCTCGAAATCGCAATCAACTACTGGATTGCGCGGCACAAAGACACTGCACAAATTTTCGCGCTACTCACTGTACTCGCCACAAAGGTGTCAGTCGCTCGCACACTCACAGAGCAACTGGCACTATTGAGTGATCATGCGACAGATGTGCTCAAGATCATGGATAGAACGTTTGCCACGCAGCACTCTGTTTCACTTGTGCATACGTTCTTGATGCAACTGGAGGAGAAGCGACACACGGATGTCTCGCTCGTGGGCTCAGGTTTCGCCAATTTGTGTGCAACAACGCATGAGCTTATGGAAAAAAATTATCTGGCGGAGTTGGATGCATCCTGGCGAGAGCTAAGCTTGTTGGAAAAGTGCTCACAAATGCGTTGGTCATTTCAATCACCACAGCAGTTTTCAAACGAATTGCACCCCAGCGCGTCAACCGATTTGAACGGTCGGTACAACACATCTGTGCGTGCGCTTTCCACAAGATATATGAATAACCTACGTAAGAGTGTATGTACAAAGTATTATAATATGAAAATACGAACGCATCAATTTATAGGTAAACAAGTGTGTAATTCAATAACGGGATCGAGTAGGTTCTTCCCGGATTTAGCACGATGGGTGCATATATTAGCGATATTTAGTATAATGTTAAATATTATTCGCACTATTAACATATATACTAGTGAGTACATACGCCTGAAGAACTGCGAACTCTCGCAGATTGAAGAAAAACGCTGGAATAAACTACTCCATACATTCGACATGATGGAGAAGATAGATGGACAGAAACCTACGCTAATTGAATTCCCTAAGCACCTTAAACAATGGGATCCAGAGTTGTACTCTGAATTTCATAGCATATTACAGGATGAGGAAGAGGATACTGAGGAGGTGCAATTCCAGGCTAAACCGGACGGGGAGAGAAACCTCGAACGGATCATGGCTATCATTGCACTGACTATGATGGTCTTTGACGCTGATCGTAGTGATTGCGTGTATAAGGTACTCAACAAGTTGAAAGGTTTGCTGAACACAGTGCACCAAGAGCCGGTGAAATTTCAGAGTATTGATGACATCCAAGACTATCTCGAAGATCGTGAAATGGTCATCGACTTTGAGATCTCAGCGGACGACCACAACATCAACAAACTCGCTGGTGCTACATTCGAACAGTGGTGGAGCAACCAGATGGAATGCAATAATGTGCTGCCACACTATAGAACGGAAGGCTTCTTCATGGAGTTTACACGAGCGAACGCAGCGCATGTAGCGAATGAAATAGCACACGGCCCACACAAGGACTTGCTGATCCGTGGTGCTGTTGGATCTGGAAAGTCGACAGGGCTCCCTTTCTATTTGAGCAAGCGCGGACGCGTTTTGATGCTTGAGCCCACTAGGCCATTGGCCAGTAATGTGCACAAGCAACTGGCAGGGGATCCGTTCCTGGTCAGCGCAACGCTAAAGATGCGGGGAGAAACCACATTTGGCTCAGCTCCAATCACAGTGATGACAAGTGGATATGCGTTCCATTACTACGCCAACAATCCCAACCAGCTACGCGACTTTGAGTTCATCATCTTTGATGAGTGCCATGTCAATGACAGCTCAGCGATGGCTTTCCGGAGCCTGCTCGCAGAGTACACGTACGACGGACGCATCATCAAGGTGTCGGCAACACCACCAGGGCGAGAGGTTGAGTTCACCACGCAGCATCCTGTCGAAATAATACCCATCGAGCGGTTGACGTTTCAGCAGTTCGTTGCAGTGCAGGGGACTGGAGCGGTCGGTGATGTAACCACGAAAGGGGACAACATTTTAGTGTATGTCGCTAGCTACAGCGAAGTTGATAATCTCAGCAAAGGGTTAGTGGAAAAGGGTCACAAAGTCACGAAAGTAGACGGTAGGACCATGAAAGTCGGAGGTGTGGAGATCATCACTAGCGGTAGCCAAGCGAAGAAACACTTTGTTGTGGCCACGAATATCATCGAGAACGGTGTCACACTGGACATCGATGTTGTGGTGGACTTTGGGTTGAAAGTTGTGGCAGAGGTGGACATCGACTCGCGTCTCACGCGCTACATCAAAAAGTCGATATCATATGGAGAACGCATACAGAGGTTGGGGCGTGTCGGACGGAATAAACCTGGTGTCGCTGTTCGGGTTGGCACCACGGAGAAAGGATTACAGGCAATCCCTGTAACGACGGCCACGGAGGCAGCATTCCTGTGCTTCGCTTATGGTCTACCGGTAATGACTAATAATGTGTCTACAAACATACTGACTAATTGCACAGTTCTGCAAGCTCGAACGATGATGCTCTTTGAGATCAACCCGTTTTATATGTGTCATTTCGTTCGATTTGATGGAACTATGCACCCAGAGGTACATAAAATACTAACACCAT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| 19,005
|
OM311164.1
|
Lily mottle virus
|
Chen,L., Li,Y.
|
Beijing Forestry University, School of grassland science
|
China
|
2023-01-28
|
LMV/BJ-4
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,641
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
| null |
2019-07
| null | null |
Lily mottle virus isolate LMV/BJ-4, complete genome
|
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| 19,006
|
OM311165.1
|
Lily mottle virus
|
Chen,L., Li,Y.
|
Beijing Forestry University, School of grassland science
|
China
|
2023-01-28
|
LMV/BJ-5
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,626
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
| null |
2019-07
| null | null |
Lily mottle virus isolate LMV/BJ-5, complete genome
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| 19,007
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LC704533.1
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Lily mottle virus
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Jeong,R.D., Lee,H.J.
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Department of Applied Biology; 77 Yongbong-ro Buk-gu, Gwangju, Jeollanm-do 61186
|
Korea
|
2022-04-05
|
LMoV_KL
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Lily mottle virus
|
Potyvirus
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Potyviridae
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ssRNA(+)
| 9,647
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
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Lilium
| null | null | null | null |
Lily mottle virus LMoV_KL RNA, complete genome
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| 31,765
|
MT795719.1
|
Lily mottle virus
|
Zhang,C., Wang,Y., Li,X., Liu,J., Su,Y.
|
Institute of Plant Protection, Jilin Academy of Agricultural Sciences
|
China
|
2021-09-27
|
Baishan-Jingyu
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,648
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
| null |
2019-07-25
| null | null |
Lily mottle virus isolate Baishan-Jingyu, complete genome
|
AAAATAAAACAACCCAACAAGACTCAACACAACACAACCCAGCAACTCTCAAACTCTCCTCTTTGCTTTCAAGCAAGTTTCTGATTCCTCTTTTGGACTCACAACCAGTTTCAAAGCACTCTTCTCCACTCAACGCATTCACAACTGAAAGAAATGGCCTCATTCATGGTCGGATCGATCCTTGTGAACACCGCAAGCGTCCTGAAAGAAAGCTTTGCACAGAAAGTGCTCACAACACCTCCAGTGTTGGTAGCACAGCCTGTGCAAAGGAGCTTTGGTGCGGCACGGATGTGTGCACGCAAAGCAATTGCAGATGATGAAGAGAAGGTGGCCAAAGTCTTCTCAGCTCTGGAAGCACGGTGCGCTGCTAGAGTTTCAAGGATGGGAACCATCCGCGTGAAGGTCACGCGGTCTGGTACCTTGCGGGCGCAGCCACTCCCAAAAAGGGAGCAGGCACGTCTGAGGAAGGCTGAGCGTAAGGCACGCTTGGAGCATGAAGAGTTTCTGAAAGGAAGCCCCACTGTCATTGCTCACATCAGCATAGCTGGTGGCGCGCAGCCTTCACAGGACATGGTGGAGCCAATGTCCACACGAAAGGCACCATGGCATTCAGTGAGCAAGAAAGCTCGAAAAGCAATCCCGCGCTCCCCAACACTGAATGAAACTGGGCTTGCATCATTGATGCGAGCCATTGCAAAGATTGGGGCCAAAAATTCCACGAAAGTTGAAATCGTGGATAAGCGAAGAGTGCAAGCACGCTACATAAAGCGTGATGCAGGGTCATACCTGCAAGTGCGCGTCGCGCACCATGAGGGCCTAAGGCGTAGGCGTGACTTGAAACTCTCTGCATTTGCAGACCAGTGCTTAACACAACTTGTCAGCACCACCCACGGGACGAAGTACCACCACGTAACCCAGCTTAAAGCGGGTGACAGTGGGATCGTTCTATTAGCACGTAGACTCTTTGGGTGGCACAGCGGTAGTTGTAGCAAAATTTTCGTCGTGCGTGGGAATCATGAAGGCAAGTTATATGAAGCACGGCGCAAGGTGACTCTAACTATGACACACAAGATGATCCACTACTCGGGCCCGGGTGATAAATTCTGGGCAGGATTTAACTCCCAATTCCTCAGGATTAAACCCAAGGAAATACCACACACTTGCGCATCAAACTTCAACGTCTTCGAGTGTGGGCAGGTCGCGGCTCTTATGTGCCAAGCACTGTACCCATGTGGGAGAATTACATGTCAACAGTGTGCGTCCGAGTATCTGGAGCTGACGAAGGTTGAACTCGGGGAAAAGCTCAGCGATGGTTTGTATAGAACAAGTTCACAAATTCGTGAAAACCACCAAGAGTTCGCCCATGTGGCACACATACTCACTGTGATAGCTGATCTTCTGAGCCTCAAGAACAACAACATGGAGGCGTTCGCAGAAGTTCACAAACTCATAGGTGAGCAAACACAGTCACCATTCACACACCTCAATCGCTTGAACTCAATACTGATCAAAGGCAGCGATATGAGCAGCAATGAGCTGCATGAATGTTCAGACTGCATTCGAGAGCTAGCGCGATTCCAGAAGAACAGGACAGATAACATCAAGAAACTGGACGTTAGCGTGTTTCGGAATAAAGCATCCTCCAAGTCATACTTCAACCTGGACTTGATGTGTGACAACCAACTCGACAAGAATGGAAATTTCGAATGGGGCCAGCGAGGCTATCATGCCAAACGGTTCTTATCGAATTATTTTGAGGTTGTCAACACACAGAATGCCTACCGAGAGCACACACTGAGGAAGCATCCGAATGGCACGCGAGAGCTCGCAATTGGGAAATTTATAGTGTCAACAAACTTTGAAGTGTTTCGCAAGAGCATGGAAGGGAAGCGCATACCACAGATGCCTGTTACTGAGGCTTGCCTGAGTCAGCGTGGAGAGCGTTTCATTTACCAGTGCTGCTGTGTGACAAACGAAGATGGCACTCCACTCGAGTCGACATTCAAAATGCCAACGAAGAACACACTCGTGCTTGGGAACACGGGTGACGAGAAATTTGTCGACATGCCCACCGACACGGATGAGAAGATGTATATAGCTCGAGAGGGCTACTGCTACATCAACATATTTTTCGCCATGCTAATAAACGTTCGTGAAAGTCAAGCAAAGGCATTTACGAAGATGGTGCGAGACCGCCTCGTACCCGAGCTTGGAACATGGCCAACCATGATCGATGTGGCAACAGCATGTCACACATTGACTGTCTTCTTCCCAGACACACTGAGCGCAGAACTCCCGCGAATTCTTGTGGACCACAACACTAAGACGATGCATGTAATTGACTCATACGGATCTGTTAGCACTGGCTACCACCAGTTAAAGGCTAACACAGTGAGTCAGCTAGTCCTCTTTGCTAGTGACACGCTGAAGTCAGAAATGAAGCACTACCAGGTCGGCGGGAAGAAGTTCACAGTCGAATACGAAGCAGTTAAGCTACTAATAAAGGCTATATATAGGCCTAAGCTTATGCGGACACTGATGGAGGATGAGCCCTACCTAATTTGTCTCGCAATGTGCTCTCCAGGAGTGCTTATTGCTCTGTTCAACAGTGGATCCCTCGAAACCGCAATCAACTACTGGATTGCGCGGCACAAAGACACTGCACAAATTTTTGCGCTACTCACTGTACTCGCCACAAAGGTGTCAGTCGCTCGCACACTCACAGAGCAACTGGCACTATTGAGCGATCATGCGACAGATGTGCTCAAGATCATGGATAGAACGTTTGCCACGCAGCACTCTGTTTCACTTGTGCATACGTTCTTGATGCAACTGGAGGAGAAGCGACACACGGATGTCTCACTCGTGGGCTCAGGTTTCGCCAATTTGTGTGCAACAACGCATGAGCTTATGGAAAAAAATTATCTGGCGGAGTTGGATGCATCCTGGCGAGATCTAAGCTTGTTGGAAAAGTGCTCACAAATGCGTTGGTCATTTCGATCACCACAGCAGTTTTCAAACGAATTGCACCCCAGCGCGTCAACCGATTTGAACGGTCGATACAACACATCTGTGCGTGCGCTTTCCACAAGATATATAAATAACCTACGTAAGAGTGTATGTACAAAGTATAATAATATGAAAATACGAACGCATCAGTTTATAGGTAGACAAGTGTGTAATTCAATAACGGGATCGAGTAGGTTCTTCCCGGATTTAGCACGATGGGTGCATATATTAGCGATATTTAGTATAATGTTAAATATTATTCGCACTATTAACATATATACTAGTGAGTACATACGCCTGAAGAACTGCGAACTCTCGCAGATTGAAGAGAAACGCTGGAATAAACTACTCCATACATTTGATATGATGGAGAAGATAGATGGACAGAAACCTACGCTAATTGAATTCACTAAGCACCTTAAACAATGGGATCCGGAGTTGTACTCTGAGTTTCATAGCATATTACAGGATGAGGAAGAGGATACTGAGGAGGTGCAATTCCAGGCTAAACCGGATGGGGAGAGAAACCTCGAACGGATTATGGCTATAATTGCACTGACTATGATGGTCTTTGACGCTGATCGTAGTGATTGCGTGTATAAGGTGCTCAACAAGTTGAAAGGTTTGCTGAACACAGTGCACCAAGAGCCGGTGAAATTTCAAAGTATTGATGACATCCAAGACCTTCTCGAAGAGCGTGAAATGGTCATCGACTTTGAGATCTCAGCGGACGACCACAACATCAACAAACTCGCTGGTGCAACATTCGAACAGTGGTGGAGCAACCAGATGGAATGCAATAATGTGCTGCCACACTATAGAACGGAAGGCTTCTTCATGGAGTTCACACGAGCGAACGCAGCACATGTGGCGAACGAAGTAGCCCACGGCCCACACAAGGACTTGCTGATCCGTGGTGCTGTTGGATCTGGAAAGTCGACAGGGCTCCCTTTCTATTTGAGCAAGCGCGGACGCGTTTTGATGCTTGAGCCCACTAGGCCATTGGCCAGTAATGTGCACAAGCAACTGGCAGGGGATCCGTTCCTGGTCAGCGCAACGCTGAAGATGCGGGGAGAAACCACATTTGGCTCAGCTCCAATCACAGTGATGACAAGTGGATATGCGTTCCATTATTACGCCAACAATCCCAACCAGCTACGCGACTTTGAGTTCATCATCTTTGATGAGTGCCATGTCAATGACAGTTCAGCGATGGCTTTCCGGAGCTTGCTCGCAGAGTACACGTACGACGGACGCATCATCAAGGTGTCGGCAACACCACCAGGGCGAGAGGTTGAGTTCACTACGCAGCATCCTGTTGAAATAATACCCATCGAGCGGTTGACGTTTCAGCAGTTCGTTGCAGTGCAAGGGACTGGAGCGGTCGGTGATGTGACCACGAAAGGGGACAATATTCTAGTGTATGTCGCTAGCTACAGCGAAGTTGACAATCTTAGCAAAGGGTTAGTGGAAAAGGGTCACAAAGTCACGAAAGTGGACGGTAGGACCATGAAAGTCGGAGGTGTGGAGATCATCACTAGCGGTAGCCAAGCGAAGAAACACTTTGTTGTGGCCACGAATATCATCGAGAACGGTGTCACATTGGATATTGATGTTGTGGTGGACTTTGGGTTGAAAGTTGTGGCAGAGGTGGACATCGACTCGCGTCTCACGCGCTACATCAAAAAGTCGATATCATATGGAGAACGCATACAGAGATTGGGGCGTGTCGGACGGAATAAACCTGGTGTCGCTGTTCGGGTTGGCACCACGGAGAAAGGATTACAGGCAATTCCTGTAACTACGGCCACGGAGGCAGCATTCCTGTGCTTCGCTTATGGTCTACCAGTAATGACTAACAATGTATCTACAAACATACTGACTAATTGCACAGTTCTGCAAGCTCGAACGATGATGCTCTTTGAGATCAATCCGTTCTACATGTGCCATTTCGTTCGATTTGATGGAACTATGCACCCAGAGGTACATAA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| 37,731
|
GU440578.1
|
Lily mottle virus
|
Jung,Y.-T., Lim,J.H., Bae,E.H.
|
Dankook University, Department of Microbiology
|
Korea
|
2013-12-31
|
LMoV-Gang Medusa
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,640
|
GenBank
| null |
South Korea: Gangwon do
|
South Korea
|
Lilium
|
plant leaf
|
2009-07-21
| null | null |
Lily mottle virus isolate LMoV-Gang Medusa, complete genome
|
AAAATAAAACAAACCAACAAGACTCAACACAACCCAGCAACTTTCAAACTCTCTTCTTTGCTTTCAAGCAAGTTTCTGATTCCGCTTTTGGACTCACACCCAGTCTCAAAGCACTCTTCTCCACTCAACGCATTCACAACTGAAAGAGATGGCCTCATTCACGGTCGGATCGATCCTTGTGAACACCGCAAGCGTCCCGAAAGAAAGCTTTGCACAGAAAGTGCTCACAACACCTCCAGTGTTGGTAGCACAGCCTGTGCAGAGGAGCTTTGGTGCGGCACGGATGTGTGCACGCGAAGCAATTGCAGATGATGAAGAGAAGGTGGCCAAAGCCTTCTCAGCTCTGGAAGCACGGTGTGCTGCCAGGGTCTCAAGGATGGGAACCATCCGCATGAAGGTCACGCGGTCTGGAACCTTGCGGGCGCAGCCACTTCCAAAAAGGGAGCAGGCACGTCTTAGGAAGGCTGAACGTAAGGCGCGCTTGGATCGTGAAGAGTTTCTGAAAGGAAGCCCCACTGTCATTGATCACATCAGTATAGCTGGTGGCGCGCAGCCTTCACAGGACATGGTGGAGCCAATGTCCACACGAAAGGCACCATGGCATTCAGAGAGCAAGAAAGCTCGAAAAGCAATCCCGCGCTCCCCAACACTGAATGAAACTGGGCTTGCATCATTGATGCGAGCCATCGCAAAGATTGGGGCCAAGAATTCCATAAAAATTGAAATCGTGGATGAGCGAAAAGTGCAAGCACGCTACATAAAGCGTGATGCAGGGTCATACCTGCAAGTGCGCGTCGCGCACCATGAGGGCCTAAGGCGTAGGCGTGACTTGAAACTCTCTGCATTTGCAGACCAGTGCTTAACACAACTTGCCAGCACCACCCACGGGACGAAGTACCACCACGTAACCCAGCTTAAAGCAGGTGACAGTGGGATCGTTCTGTTAGCACGCAGACTCTTTGGGTGGCACAGCGGTAGTTGTAGTCAAATTTTTGTCGTGCGTGGGAATCATGAAGGCAAGTTATATGAGGCACGGCGCAAGGTAACTCTAACTATGACACACAAGATGATCCACTACTCGGGCCCAGGCGATAAATTCTGGGCAGGATTCAACTCCCAATTCCTCAGGATCAAACCCAAGGAAATACCACACACTTGCACATCAAACTTCAACGTCTTCGAGTGTGGGCAGGTCGCGGCTCTTATGTGTCAAGCTCTGTATCCATGTGGGAGAATTACATGTCAACAGTGTGCGTCCGAGTATCTGGAGCTGACGAAGGTTGAACTCGGGGAAAAGCTCAGCGATGGTTTGTATAGAACAAGTTCGCAAATTCGTGAAAACCACCGAGAGTTCGCCCATGTGGCACACATACTCAACGTAATAGCTGATCTTCTGAGCCTCAAGAACAACAACATGGAGGCGTTCACAGAAGTTCACAAACTCATAGGTGAGCAAACACAGTCACCATTCACACACCTCAATCGCTTGAACTCAATACTGATCAAAGGCAGCGATATGAGCAGCAATGAGCTGTACGAATGTTCAGATTGCATTCGTGAGCTAGCGCGATTCCAGAAGAACAGGACAGATAACATCAAGAAACTGGACGTTAGCGTGTTTCGGAATAAAGCATCCTCCAAGTCATACTTCAACCTGGACTTGATGTGTGACAACCAACTTGACAAGAACGGAAACTTCGAATGGGGCCAGCGAGGCTATCATGCCAAACGGTTCTTATCGAATTATTTTGAGGTTGTCAACACACAGAATGCCTACCGAGAGCACACACTGAGGAAGCATCCGAATGGCACGCGAGAGCTCGCAATTGGGAAATTTATAGTGTCAACAAACTTCGAAGTGTTTCGCAAGAGCATGGAAGGGAAGCGCATACCACAAATGCCTGTTACTGAGGCTTGCCTGAGTCAGCGTGGTGAGCGTTTCATTTACCAGTGCTGCTGTGTAACAAACGAAGATGGCACTCCACTCGAGTCGACATTCAAAATGCCAACGAAGAACACACTCGTGCTTGGGAACACGGGTGATGAGAAATTTGTCGACATGCCCACCGACACGGATGAGAAGATGTATATAGCTCGAGAGGGCTACTGCTACATCAACATATTTTTCGCCATGCTAATAAACGTTCGTGAAAGTCAAGCAAAGGCATTCACGAAGATGGTGCGAGACCGCCTCGTACCCGAGCTTGGAACATGGCCAACCATGATCGATGTGGCAACAGCATGCCACACATTGACCGTCTTTTTCCCAGACACACTGAGCGCAGAACTCCCGCGAATTCTCGTGGACCACAACACTAAGACGATGCATGTGATTGACTCATACGGATCTGTTAGCACTGGCTACCACCAGTTAAAGGCTAACACAGTGAGTCAGCTAGTCCTCTTTGCTAGTGACACGTTGAAGTCAGAAATGAAGCACTACCAGGTCGGCGGGAAGAAGTTCACAGTCGAATATGAAGCAGTTAAGCTACTAATAAAGGCTATATATAGGCCTAAGCTTATGCGGACACTGATGGAGGATGAGCCCTACCTAATTTGTCTCGCAATGTGCTCTCCAGGAGTGCTTATTGCTCTGTTCAATAGTGGATCCCTTGAAACCGCAATCAACTACTGGATTGCGCGGCACAAAGACACTGCACAAATTTTTGCGCTACTCACTGTACTCGCCACAAAAGTGTCAGTCGCTCGCACACTCACAGAGCAACTGGCAATATTGAGCGATCATGCGACAGATGTGCTCAAGATCATGGATAGAACGTTTGCCACGCAGCACTCTGTTTCACTAGTGCATACGTTCTTGATGCAACTGGAGGAGAAGCGACACACGGATGTCTCACTCGTGGGCTCAGGTTTCGCCAATTTGAGTGCAACAACGCATGAGCTTATGGAAAAAAATTATCTGGCGGAGTTGGATGCGTCCTGGCGAGATCTAAGCTTGTTGGAAAAGTGCTCACAAATGCGTTGGTCATTTCGATCACCACAGCAGTTTTCAAACGAATTGCACCCCAGCGCGTCAACCGATTTGAACGGTCGGTACAACACATCTGTGCGTGCGCTTTCCACAAGATATATGAATAACCTACGTAAGAGTGTATGTACAAAGTATCATAATATGAAAATACGAACGCATCAGTTTATAGGTAGACAAGTGTGTAATTCAATAATGGGATCGAGTAGATTCTTCCCGGATTTAGCACAATGCGTGCATATATTAGCGATATTTAGTATAGTGTTAAATATTATTCGCACTATTAACATATATACTAGTGAGTGCATACGCCTGAAGAACTGCGGACTCTCGCAGATTGAAGAGAAACGCTGGAATAAACTACTCCATACATTTGATATGATGGAGAAGATAGATGGACAGAAACCTACGCTAATTGAATTCACTAAGCACCTTAAACAATGGGATCCAGAGTTGTACTCTGAGTTTCATAGCATATTACAGGATGAGGAAGAGGATACTGAGGAGGCGCAATTCCAGGCTAAACCGGACGGGGAGAGAAACCTCGAACGAATTATGGCTATAATTGCACTGACTATGATGGTCTTTGACGCTGATCGTAGTGATTGCGTGTATAAGGTGCTCAACAAGTTGAAAGGTTTGCTGAACACAGTGCACCAAGAGCCGGTGAAATTTCAGAGTATTGATGACATCCAAGACTATCTCGAAGAGCGTGAAATGGTCATCGACTTTGAGATCTCAGCGGACGACCACAACATCAACAAACTCGCTGGTGCCACATTCGAACAGTGGTGGAGCAACCAGATGGAATGCAATAATGTGCTGCCACACTATAGAACGGAAGGCTTCTTCATGGAGTTTACACGAGCGAACGCAGCACATGTAGCGAATGAAATAGCACACGGCCCACACAAGGACTTGCTGATCCGTGGTGCTGTTGGATCTGGAAAGTCGACAGGGCTCCCTTTCTATTTGAGCAAGCGCGGACGCGTTTTGATGCTTGAGCCCACTAGGCCATTGGCCAGTAATGTGCACAAGCAACTGGCAGGGGATCCGTTCCTGGTCAGCGCAACGCTAAAGATGCGGGGAGAAGCCACATTTGGCTCAGCTCCAATTACAGTGATGACAAGTGGATATGCGTTCCATTACTACGCCAACAATCCCAACCAGCTACGCGACTTTGAGTTCATCATCTTTGATGAGTGCCATGTCAATGGCAGCTCAGCGATGGCTTTCCGGAGCCTGCTCGCAGAGTACACGTACGACGGACGCATCATCAAGGTGTCGGCAACACCACCAGGGCGAGAGGTTGAGTTCACCACGCAGCATCCTGTCGAAATAGTACCCATCGAGCGGTTGACGTTTCAGCAGTTCGTTGCAGTGCAGGGGACTGGAGCGGTCGGTGATGTAACCACGAAAGGGGACAATATTTTAGTGTATGTCGCTAGCTACAGCGAAGTTGACAATCTCAGCAAAGGGTTAGTGGAAAAGGGTCACAAAGTCACGAAAGTAGACGGTAGGACCATGAAAGTCGGAGGTGTGGAGATCATCACTAGTGGTAGCCAAGCGAAGAAACACTTTGTTGTGGCCACGAATATCATCGAGAACGGTGTCACATTGGACATCGATGTTGTGGTGGACTTTGGATTGAAAGTTGTGGCAGAGGTGGACATCGACTCGCGTCTCACGCGCTACGTTAAGAAGTCAATATCATATGGAGAACGCATACAGAGGTTGGGGCGTGTCGGACGGAATAAACCTGGTGTCGCTGTTCGGGTTGGCACCACGGAGAAAGGATTACAGGCAATCCCTGTAACGACGGCCACGGAGGCAGCATTTCTGTGCTTCGCTTATGGTCTACCGGTAATGACTAATAATGTGTCTACAAACATACTGACTAATTGCACAGTTCTGCAAGCTCGAACGATGATGCTCTTTGAGATCAACCCGTTTTATATGTGTCATTTCGTTCGATTTGATGGAACTATGCACCCAGAGGTACATAGAATAC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| 92,173
|
JN127341.2
|
Lily mottle virus
|
Wylie,S.J., Luo,H., Li,H., Jones,M.G.
|
Murdoch University, Plant Virus Group, WA State Agricultural Biotechnology Centre
|
Australia
|
2011-12-01
|
Bate5
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,636
|
GenBank
| 1
|
Australia
|
Australia
|
Lilium longiflorum
| null |
2010-11-01
| null | null |
Lily mottle virus isolate Bate5, complete genome
|
CCCAACAAGACACAATACAAAACAAACCAACAACTCTCAAGCTCTCTTCTTTGCTTTCAAGCAAGTTCCTGATTCCAACTTCGGACTCACAACCAGTTTCAAAGCACTCTCAAGCACCCAACTCGTCCATAACATCGAAATGGCCTCCTTCATGGTCGGATCGATTCTTGTGGATACCACAGCAACTCTGAAGGAAAGCTTCGCACAGAAACTGCTTTCAACACCTCAAGTGTTGATAGCACAGCCTGTGAGGAGGAGCTTTGATGCGGCACGGATGTGCGCACGCAAAGCAATGGTGGACTATGATGAGAAGGTCGCTAAGGCATTCTCAGATCTAGAGGCACGGAGTGCCGCTAGGGTCGAGCGGATGGGAACCATTCGCGTGAAGGTCACGCAGTCTGGAACCCTGCGAGCGCAGCCACTTCCCAAGAGGGAGCAGGCACGCTTGAAGAGGGATGAGCGCAAGAAGCGCTTAGAGCACGAAGAGTTTCTGAAAGGGAGCCCTACTGTCGTTGCTCACATCAGCATAGCTGGTGGCGCACTACCATCGCAGAATACAGGCGAAGAAACACCCGTAAAGCGACCCCAATGGCATTCCAACAACAAGAGGGTTCGCAAGCCAATCCCGCGTTCGCCCACACTCAATGCTGAGGGACTTGCTTCGCTCATGCGAGCGATGGGCAAGATCGGGGCAAGGAATTCCACAAAAATTGAAATTGTGGACAAGAAGAAGGTAAGTGCTCGCTTCGTCACTCGAGATGCGGGTTCATACTTACAAGTGCGGGTTGCGCACCACGACGGATTACGCCGGAAGCGTGACCTGAAGTTATCTGCCTTTGCGGATCAGTGTTTGCAGCACTTGAGCAGCAAGACCCATGGCTCAACCTATCACCATGCAACTCAACTCAAGGCAGGTGATAGCGGATTGGTCCTCTCAGCACGAAGACTCTTTGGTTGGCACAGCGGAAGTTGTAGCCAAATCTTTATCGTGCGGGGAAACCACGAGGGAAAATTATACGAGGCTCGTCGCAAAGTGACTCTCATGATGGCACACAAGATGATTCATTACTCAGGACCTGGCGACAAATTCTGGGCAGGATTCAATTCACAATTTCTCAGAATAAAGCCCAAGTCACTGCAACACACATGTACATCAAACTTCAGTGTGTTTGAGTGCGGGCAAGTGTCAGCCCTCATGTGTCAAGCCTTGTATCCATGTGGGAGGATCACATGTCAGCAGTGTGCGTCAGAGTACCTTGAGCTGACGAAGGTGGAGCTTGGAGAGAGGCTCAGCGAAGGACTCTACAGGACAAGTGCGCAAATTCGCGAAGACCACCAGGAATTTGCTCACGTCGCGCACATTCTCACCGTTATTGCTGATCTCTTAAGCCTCAAGAACAACAACATGGAGGCCTTCACAGAGGTGCATAAACTCATAGGCGAGCAGACTCAGTCACCATTCACGCACATCAATCGATTAAATTCGATACTGATCAAAGGCAGTGATATGAGCAGCAATGAGCTACACGAGTGTTCGGACTGTGTACGCGAGTTAGCGAGATTCCAGAAGAACAGAACTGATAACATCAAGAGACTTGACATTAGTGTCTTCCGGAATAAAGCTTCCTCCAAGTCTTACTTCAACTTGGACTTGATGTGCGACAACCAACTCGACAAGAATGGAAATTTCGAATGGGGGCAGCGGGGCTACCATGCCAAGCGGTTTCTGTCGAATTACTTTGAGGTTGTCAACACACAGAACGCGTACCGAGAGCACACCCTGAGGAAGCATCCACGCGGCACACGGGAATTGGCGATTGGAAAATTCATCGTGTCTACAAACTTTGAAGTGTTCCGTAAGAGCATGGAAGGGAAGCGCATACCACATATGCCAGTGACTGAGGCTTGCCTTAGCCAGCGTGGTGAGCGATTCATTTACCAGTGCTGTTGCATAACACATGAAGATGGCACACCACTCGAGTCAACCTTCAAGATGCCAACCAAGAACACACTTGTCTTGGGAAATACAGGTGATGAGAAGTTTGTCGACATGCCCACCGATGCAGATGAGAAGATGTACATTGCTCGAGAGGGCTATTGTTACATCAACATATTCTTTGCCATGTTGATAAACGTTCGTGAGAGTCAAGCAAAGGCATTCACCAAAATGGTGCGAGATCGTCTCGTACCTGAACTTGGGACGTGGCCAACCATGATAGACGTGGCTACGGCATGTCACACATTAACTGTGTTCTTCCCAGACACACTGAGTGCTGAGCTCCCAAGAATACTTGTCGACCACAACACGAAAACCATGCATGTGATTGACTCATACGGATCCGTTAGCACCGGGTACCACCAGTTAAAGGCTAACACAGTGAGTCAACTGGTGCTATTTGCTAGCGATACGTTGAAGTCCGAGATGAAGCACTACCAGGTGGGTGGTCAGAAATTCACAGTGGAATATGAGGCAGTGAAGCTACTGATCAAAGCCATTTACAGACCAAAACTGATGCGGACATTGCTAGAGGACGAGCCTTACTTGATTTGTCTCGCGATGTGCTCTCCAGGTGTTCTTATAGCCCTATTCAATAGTGGCTCTCTGGAACTTGCGATCAACTACTGGATTGCGAGACATAAGGACACTGCACAGATTTTCGCGTTGTTGACAGTCCTCGCCACAAAGGTGTCCGTCGCACGAACACTCACAGAGCAACTAGCACTTCTTAGCGATCATGCTACGGATGTGCTCAAAATCATGGATAGGACATTCGCAACGCAACATTCTGTGTCGTTGGTGCACACTTTTCTGATGCAGTTGGAGGAGAAGCGCCATACTGATGTTTCACTTGTTGGCTCAGGTTTTGCCAATTTGTGTGCATCAACACATGAGCTCATGGAAAAAAATTATCTGGCGGAGTTGGATGCGTCATGGCACGCATTAAGCTTGTGGGAAAAGTGCTCACAAACGCGTTGGTCGTTTCAACCACCAAAGCAGTTCTCACACGATTTGCACCCCAGCGCGTCGACCGATTTGAACGGTCGCTACAACACATCTGTGCAAGCGCTTTTCACGAGGAACTTGCGTAATCTGAAGAAACGCGTGTGTACGAAGTATCATAATATGAAAATAAAGACCCACCAATTCATTGGTAGGCAAGTTTGCAACTCAATAACAGGGTCGAGTAGATTCTTCCCTGATCTAGCACGGTGGGTCCATATACTAGCTATTTTTGGTGTTATGCTAAATATTGTACGTACTATAAATCTATATACTAGCGAGTACATACGTTTGAAGAATAATGAACTCTCTCAAATAGAAGAGAGGCGATGGAACAAATTGCTCCACACATTCGACATGTTGGAGAAAACGGAAGGACAGAAGCCTACACTCATCGAATTCACGAAACACCTTAAGCAGTGGGATCCAGAATTGTATGCTGAGTTCCATAGCATTCTGCAGGACGATGTTGAAGACTCTGAGGAGGTGCAATTTCAAGCCAAACCGGACGGGGAGAGAAACCTTGAACGAATCATGGCTATAATCGCACTAACAATGATGGTGTTTGACGCAGATCGCAGCGATTGCGTGTATAAGGTGCTCAACAAACTAAAAGGCTTGCTGAATACAGTGCACCAGGAGCCAGTGAAGTTTCAAAGCATAGATGACATTCAGGACATTCTCGAGGAGCGTGAGATGGTCATCGATTTCGAGATCTCCGCAGACGACCACAACATCAATAAACTCGCTGGCGCGACATTCGAGCAGTGGTGGAGCAACCAGATGGAGTGCAATAACGTGCTACCTCATTACAGGACAGAGGGATTTTTCATGGAGTTCACTCGAGCTAACGCAGCGCATGTCGCTAATGAAATTGCTCACGGACCCCATAAGGATCTACTGGTGCGAGGTGCTGTTGGATCTGGTAAATCTACAGGGCTGCCTTTCTACTTAAGTAAGCGTGGACGAGTGTTGATGCTTGAGCCCACTAGGCCGTTGGCCAGTAATGTGCACAAGCAATTGGCAGGAGACCCGTTCTTGGTGAGTGCAACCCTGAAGATGCGTGGCGAGACTACATTTGGTTCAGCTCCAATAACAGTGATGACGAGTGGATATGCATTCCACTACTACGCCAACAACCCTAACCAACTGCGTGATTTCGAATTTGTCATCTTCGATGAATGCCATGTCAATGATAGCTCAGCAATGGCTTTCAGGAGTCTACTCGCAGAGTACAACTATGACGGACGCATAATCAAGGTGTCAGCAACACCCCCAGGGCGTGAGGTGGAGTTTGCAACGCAACATCCTGTTGAAATAATACCCATTGAACGATTAACATTTCAGCAGTTTGTGGCAGTGCAAGGGACTGGAGCAGTTGGGGACGTGACCACGAAAGGGGACAACATCCTCGTGTACGTTGCTAGTTACAGCGAAGTTGATAATCTCAGCAAGGGACTGGTTGAGAAGGGTCACAAAGTCACGAAAGTTGACGGCAGGACTATGAAAGTTGGTGGTGTTGAGATAATCACTAGCGGCAGCCAAGCAAAGAAGCACTTCGTGGTGGCCACTAACATCATTGAGAACGGAGTCACACTGGACATTGATGTTGTGGTTGATTTCGGGCTGAAGGTGTCGGCGGAGGTTGATATTGATTCACGGCTCACACGATACGTAAAGAAGTCAATTTCATATGGTGAGCGAATTCAGAGACTGGGACGCGTTGGCAGAAACAAATCTGGCGTAGCGGTAAGAATCGGGGCAACTGAGAAAGGTCTACAGGCAATCCCTGTGACCACAGCGACTGAGGCAGCATTCCTATGCTTTGCATACGGTTTGCCCGTGATGACTAACAACGTATCTACTAATATACTAACAAATTGTACAGTATTGCAAGCTCGAACCATGATGTTATTCGAGATTAATCCATTCTATATGTGTCATTTTGTTCGTTTTGACGGGACTATGCACCCGGAAGTTCATAAAATACTGACACCAT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| 97,803
|
HM222521.1
|
Lily mottle virus
|
Li,H., Xu,P., Liu,J., Bai,J.
|
Dalian University of Technology, School of Life Science and Biotechnology
|
China
|
2010-10-19
| null |
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,648
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
|
plant leaf
|
2010-01
| null | null |
Lily mottle virus strain LMoV-DL, complete genome
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| 100,139
|
AB570195.1
|
Lily mottle virus
|
Sato,H., Nakamura,S., Seo,N.
|
Kawakami, Natori, Miyagi 981-1243
|
Japan
|
2010-07-02
|
ML61
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,645
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Lily mottle virus RNA, complete genome, isolate: ML61
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| 100,811
|
AM048875.1
|
Lily mottle virus
|
Li,F., Sun,J., Ma,K., Chen,H.
|
Li F., Department of Phytopathology, Yunnan Agricultural University, Key Laboratory for Plant Pathology of Yunnan Province, Kunming, 650201, Yunnan Province
|
China
|
2005-07-12
|
SMi
|
Lily mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,648
|
GenBank
| null |
China:Yunnan
|
China
| null | null | null | null | null |
Lily mottle virus complete genome, genomic RNA, isolate SMi
|
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|
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|
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|
Choi,S.A., Ryu,K.H., Ryu,K.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-10-15
| null |
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
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| 8,394
|
RefSeq
| 1
|
South Korea
|
South Korea
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| 8,453
|
OM311155.1
|
Lily symptomless virus
|
Chen,L., Li,Y.
|
Beijing Forestry University, School of grassland science
|
China
|
2023-01-28
|
LSV/BJ-2
|
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,394
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
| null |
2019-07
| null | null |
Lily symptomless virus isolate LSV/BJ-2, complete genome
|
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| 19,001
|
OM311158.1
|
Lily symptomless virus
|
Chen,L., Li,Y.
|
Beijing Forestry University, School of grassland science
|
China
|
2023-01-28
|
LSV/BJ-6
|
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,394
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
| null |
2019-07
| null | null |
Lily symptomless virus isolate LSV/BJ-6, complete genome
|
GGATTCACACTCCCGATAATAACTGTTAATAAACGACAAGTTCATAACAGTTACTAGATGGCCCTCACATACCGAAGTCCAGTCGAGGAAGTGTTGACTCTTTTCGAGCCCGCCGCCCAATCACTTGTAGCTGCAACTGCCACCGCAAGCTACCAACAAAACGAGAAGGATAATTTCGAGTGGTTCAACTTCTCCATGCCAGCAATCGCTAAGGAGCGCCTAAGCACTGCTGGGATATATTTGAGCCCATACTCCGGTTACCCTCACTCACACCCAGTGTGTAAAACACTGGAAAATTACATATTGTACAAAGTACTACCTAGTATTATCAATAACTCTTTTTATTTCGTAGGTATAAAACAATTTAAAATTAACTTTTTAAAAAAAAGGTTCAAGCATTTATCCTTGGTCCACGCAATAAATAGGTACGTAAGCAGCGCGGACAAGATAAGATATGGCAACGAATTCGTCGTACGGGCGAGTTCAGAAAGTAGGCTGCTAAAGCGGCATAGGAGCATCGAGCAGTCATGCACACTGTCCAGCCTAGTCCCCAATATTAAAACAGGCGCGAACTTGTTCCTCCACGATGAGCTGCATTACTGGAGCAAGGATGATATTATCGACTTTCTCGAGGTCTGCCAACCCGAGATAATGCTGGGCACTGTAGTGTACCCCACTGAAATCTTCGCTGGAGCGAAACACTCACTAAACCCATGGTGCTACGAGTTTGAAGTCAAGGGCAGAGTGCTGATCTATTATCCAGATGGGGTACGGAGTGAGGGGTACGAACAGCCAATTGACGGAGGTTATTTGTTGCAGGCAAATAGAATCCTACTGCCTAATGGCATCACTTACTGCGTTGATGTTATTGCAAGCAAGTTCTCACACCACCTCGTGAGCATAACCCGTGGGGACTTGGTTGTGCCTAAATACCGTTCATTTGGCCCATTTGACGCCGTCCGTGCACGTGGCGCAGCAGACATCGCGCGGAAGAACACACTTTTCTTCCCAGTGTCACATCTGACAATTCTGCGCGTCTACCGGTACTTACGCTCTTTGAAGAAACCTGATAAGCAGTCTGCCATGGCTAAATTTTCACAGTTATGCCATGATCCTTCTGGCGAGGCCATCAAATTCATGGAAGAGTTCAGTACACTGGTCATGGAGACGAACAACACTCGGACGATCCTAAGGCCAGAACTCATTAAATCTTTCTTCGGGAACCTCGGCAGGAGGCTACCATCCTGCTTTGCTGCCATGTTTGCTCGTACGTGTTCCATGTGCCTAGATGAGTTCATCACCTTTCTTGAGCCACTGACCATTGACGTCACACTGCAGACTCTGTGCAAAAATTCTCTCTACTATGCGCTAATTGATCAGGGTGAGGCGGAATCTTTTGTAGACCCATTCGAGGAACTGGAGTGTGCTTGGGAGGGCCGCGATTCGTTCTTACTTGATCGGCCTAGCGCCAAATACGCCGGTCTGTTGCCGCTTACTGACTGCAAGGGCAAATGGGCCCTCCCGTTTAACATGGATAAACTACGCCATGGACTCTTGAAGCTATACATGGGAGCGTCCCAGAGCTGCTACACTGGGCGCAGTTGGACGATCCAGGATTATATCAACTCCATTCTGACCAACACAACAGTGATTGGGCGGGCATTTCTAAAGTCACTGACGCCCGAATTGCTCGATTGGCTGCAGTATAACGCCGATTGTCTTGAGCCCAAACCAGCCTTGTGGCATGACTGCGGTGTTCGTTGGTTCATACATGGCACACGAAACAGCGCTAAAATTGCTTTTCTTGAGTCGAGTGTACAAATTGATGCCAGGGCGCAGCACGAGTCCTGCGGGTACATGACTCCAGGAAGGACGAGGACCTTCAAGCTCATACCAACCTTAACGGATACTGAAATTTATACTTTCTATGAACCAGAAATTATCCGCCGCAGCCCACCACCACTTGAACCTTCAGGTGCACTGCAGGGCACACCTTTGACTGTTGGGAACACCGCAGCAGATTCTCTGCAACAGCCAATTCCGATTGCCGGGGCTCTGACCTGCGATTGTGGCATCGTCATGAACTTGAAAGACGTCCTTGGGCACACCGAGAGGATGGATGAGTTCACTGATAACCTCCGGGGACGTCAGGCAGCATGGTACTCCATAGATGGGCGGCCCTACAAATACAATGGTGGCGATCATGCGTCTAAAGGTTGGCCCAACTGGCTGCAAATGTGGATGGCATTGAATGGAGTGGACAAAAAGTACAACTGCATGCTCGCTCAGAAATACCAAGCAGATTCATGCCTTGGCTTCCACGCGGATGACGAAGCCCTTTTTGTTGCTGGAGAATCAATCCTCACAGTAAATATCACTGGGGAGGCCGACTTCAAAGTCACATGCCCCAACGGCGCAGGGGAATTAAGATTACAGGAAGCACAGATGTTTGAGATGCCTCCCGGCTTTCAGCAGACACATAAACACGCTGTGGCCAACTGCACCGCAGGCAGAATTTCATACACATTCCGCGTCGCTACCACTATGGCGCCTGAACTACCAGTTGAACCTAGCGACGAAGAAGATGATGGGCGCAGGGGTTACACCGATGGAGCAGTGGAGGTGAGTTACCAGCCGCTCGAAGGCGCAAACTTCCAGTATAGAATCATTAAGAATCAAGGCGGCGGTGATTGTTTTTGGCTGGCGCTCGAACATTACACCGGGGTGAAAACAAGGGATATGAAGAAAGCACTCCTAGCTGCTTGCAAACCTATCCCCGGGAGTGCGCTGGCCGAACAATTGAGACCAACCGTGTGGGCCAGCGATGAATCAATTAAAGCAGTGTGCACCCACCTGGGTTGGGACATAACGATTGTTGATGAGATGCTAAATACTAAAGTTGTTTATAGCAACCCGGGTAATGAAAATATGGCCATCATTCGACGCAAGCGCTGGCACTTTGAGGCTATTGAACCCCTCGCAGCCTGCACAATCAAAGCGCTCGCATCTTGCTTAGATAGAAGGTTCACTGAGGTATCCAGCTTGCTATACAAAAGGCTGGGAACTGACTTCATGGACAATGCGCTCGCGGGCCAAGGGATGGAACTGGAAACTTTCCGGGAAATGCTGGTTGAACTGCAAATCTGCGCAGTAGTGGAGCAAGCCGGGGGCACAATAATACTGAATGATAAAGGACAAACCAAGGGTATCTTCAAATTCCTTGATGGTCATGCAGAGTATGTCAAGGATGCAGCCTTTGCGCCCCATGAGCAATTAAATGTGTACAAGGCTGACTTAGAATGCACACCGGAAATGTACCTCCCCATACGTGAGGCCTGCACCGCGATGAGCTATACCCCAGACGTAGCACGCGCAACTTTATTAGCGAGTTGTCTCCTAAATGGCAGCACCGGAGTACTTTGTTCCGAATTGTTTAATGACAGAGGAACTCTCATGCCAACTGAACCATGCACGTCTGAGCGCGAGATGATGCTCCTGCTAGGGGTACCCGGGTGTGGTAAAAGCCGAGCTATCCGAGAAACACTGCCACGTGCACGAGGTCGCGCATTACTTTACATCACGCCAAGACGAGTCCTACTAGATGAGTTTGAGGAGCATCTGAACTCCCTTAGGAAGCGGATGGGTGCAGGGGCTTGCAGGAACTTCAAAGCTCTGACTTTTGAGAAAGCGCTGATCAATGGAGAAAAATTTTCACCCGGTGCTTTGGTGGTATTGGATGAGATCCAACTTTACCCACCTGGTTATCTAGACCTGCTGTGCTGTAGGCTCGATCCTACCATTCGCTTGGTACTACTCGGGGACCCCTGCCAGAGTGACTATGACTCCAAAAAAGATCGTAACGTGCTTGGGGCCATACCGTCAGACATACTGAACTTACTTGAAGGCACCAAGTATAAGTACAACATTCTGAGTCGCCGCTTTCAAAGCGAGATATTCATCAGCAGACTCCCATGCACACTCCAGTCCAACCTCCAGTACAAAGGTTCTCTGAAGATCGTCGAAGGTCTTGACGCCATAGATTTGAGAGCAAGATCCTCTGAAGTCTGCTTGGTCTCATCCTTTGACGAGAAAAAAATTGCAACAGCTTACTTTGGAGTGCAGTGTAAAACTATGACTTTTGGCGAGAGCACTGGAGCCACTTTCACCACGGGCAGTATCTTGGTCACGAGCGTGTCACAACATACCAACGAGGGGCGCTGGATCACAGCCCTTAGTAAGTTCAGGAGAAATATCACGATTGTAAATGCAACAGGGGTGAGTATCGAAATCGTGCAGAAAACATATGCAAATCGAGCTTTTGGCCGCTTCCTATGCAGGTCAGCCAAGAACTCAGACCTTTTGACTTTACTACCTGGGGAACCTGAATTCACAGTTGGATTCACGTGCGAGAAGTACGGGGCAGATGAAGGGAAACGCGAAGAAAAACTCCAAGGTGATCCGTGGCTCAAGACGATGGTTGATTTATTGCAAGTTGAAGACATCGAAACCATCGAGGAAGCAAAGGAGATCATCGAGGATGAATGGTGCAAAACGCACCTGCCACAATGCGAGCTCGAGGGTGTTAGGGCACGTTGGGTCCACAAGATACTTGCCAAAGAAAGCCGCGAGAAACGCATGGGACATCTTGTGTCTGAGCAATTCACTGACGAACATTCAAAACAGCCAGGGCACAGACTTACCAATGCCGCCGAACGCTTCGAAACCATTTACCCCAGACACAAAGCGGCCGACACTGTGACTTTTATCATGGCCGTGAGGAAGCGATTGCGTTTTTCACACCCTGTGAAAGAAGCCGCCAAACTGAACCAAGCACTACCATATGGCCCATTTCTACTGAAAGAATTCCTTGCACGCGTGCCGCTTAAACCAGCGCATAATGCCAGGATGATGGCTGAGTCGAAGTTTGACTTTGAGGAAAAGAAAACAAGCAAGAGCGCAGCTATCATAGAGAATCACAGCAATCGGTCGATGCGCGAGTG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| 19,002
|
OM311167.1
|
Lily symptomless virus
|
Chen,L., Li,Y.
|
Beijing Forestry University, School of grassland science
|
China
|
2023-01-28
|
LSV/BJ-3
|
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,393
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
| null |
2019-07
| null | null |
Lily symptomless virus isolate LSV/BJ-3, complete genome
|
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| 19,009
|
LC720794.1
|
Lily symptomless virus
|
Jeong,R.D., Lee,H.J.
|
Department of Applied Biology; 77 Yongbong-ro Buk-gu, Gwangju, Jeollanm-do 61186
|
Korea
|
2022-07-28
|
LSV_KSC
|
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,396
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Lilium
| null |
2021-06-01
| null | null |
Lily symptomless virus LSV_KSC RNA, complete genome
|
AGAGTCAACACTCCCGATAATAACTGTTAATAAACGACAAGTTCATAACAGTTACTAGATGGCCCTCACATACCGAAGTCCAGTCGAGGAAGTGTTGACTCTTTTCGAGCCCGCCGCCCAATCACTTGTAGCTGCAACTGCCACCGCAAGCTACCAACAAAACGAGAAGGATAATTTCGAGTGGTTCAACTTCTCCATGCCAGCAATCGCTAAGGAGCGCCTAAGCACTGCTGGGATATATTTGAGCCCATACTCCGGTTATCCTCATTCACACCCAGTGTGTAAAACACTGGAAAATTACATATTGTACAAAGTACTACCTAGTATTATCAATAATTCTTTTTATTTTGTAGGTATCAAACAATTTAAAATTAACTTTTTAAAAAAAAGGTTCAAGCATCTATCCTTGGTCCACGCAATAAATAGGTACGTAAGCAGCGCGGACAAGATAAGATATGGCAACGAATTCGTCGTACGGGCGAGTTCAGAAAGTAGGCTGCTAAAGCGGCATAGGAGCATCGAGCAGTCATGCACACTGTCCAGCCTAGTCCCCAATATTAAAACAGGCGCGAACTTGTTCCTCCACGATGAGCTGCATTACTGGAGCAAGGATGATATTATCGACTTTCTCGAGGTCTGTCAACCCGAGATAATGCTGGGCACTGTAGTGTACCCCACTGAGATCTTCGCTGGAGCGAAACACTCACTCAACCCATGGTGCTACGAGTTTGAAGTCAAGGGCAGAGTGCTGATCTATTATCCAGATGGGGTACGGAGTGAGGGGTACGAACAGCCAATTGACGGAGGTTATTTGTTGCAGGCAAATAGAATCCTACTGCCTAATGGCATCACTTACTGCGTTGATGTTATTGCAAGCAAGTTCTCACACCACCTCGTGAGCATAACCCGTGGGGACTTGGTTGTGCCTAAATACCGTTCATTTGGCCCATTTGACGCCGTCCGTGCACGTGGCGCAGCAGATATCGCGCGGAAGAACACACTTTTCTTCCCAGTGTCACATCTGACAATTCTGCGCGTCTACCGGTACTTACGCTCTTTGAAGAAACCTGATAAGCAGTCTGCCATGGCTAAATTTTCACAGTTATGCCATGATCCTTCTGGCGAGGCCATCAAATTCATGGAAGAGTTCAGTACACTGGTCATGGAGACGGACAACACTCGAACGGTCCTAAGGCCAGAACTCATTAAATCTTTCTTCGGGAACCTCGGCAGGAGACTACCCTCCTGCTTTGCTGCCATGTTTGCTCGTACGTGTTCCATGTGCCTAGATGAGTTCATCACCTTTCTTGAGCCGCTGACCATTGACGTCACACTGCAGACTCTGAGCAAAAATTCTCTCTACTATGCGCTAATTGATCAGGGTGAGGCGGAAACTTTTGTAGACCCATTCGAGGAACTGGAGTGTGCTTGGGAGGGCCGCGATTCGTTCTTACTTGATCGGCCTTGCGCCAAATACGCCGGTCTGTTGCCACTCACTGACTGCAAGGGCAAATGGGCCCTCCCGTTTAACATGGAGAAACTACGCCATGGACTCTTGAAGCTATACATGGAAGCGTCCCAGAGCTGCTACACTGGGCGCAGTTGGACGATCCAGGATTATATCAACTCCATTCTGACCAACACAACAGTGATTGGGCGGGCATTTCTAAAGTCACTGACGCCCGAATTGCTCGATTGGCTGCAGTATAACGCCGATTGTCTTGAGCCCAAACCAGCCTTGTGGCATGACTGCGGTGTTCGTTGGTTCATACATGGCACACGCAACAGCGCTAAAATTGCTTTTCTTGAGTCGAGTGTACAAATTGATGCCAGGGCGCAGCACGAGTCCTGCGGGTACATGACTCCAGGAAGGACGAGGACCTTCAAGCTCATACCAACCCTAACGGATACTGAAATTTATACTTTCTATGAACCAGAAATTATCCGCCGCAGCCCATCACCACTTGAACCTTCAGGTGCACTGCAGGGCACACCTTTGACTGTTGGGAACACCGTAGCAGATTCTCTGCAACAGCCAATACCGATTGCCGGAGCTCTGACCTGCGATTGTGGCATTATCATGAACTTGAAAGACGTCCTTGGGCACACCGAGAGGATTGATGAGTTCACTGATAACCTCCGGGGACGCCAGGCAGCATGGTACTCCATGGATGGGCGGCCCTACAAATACAATGGTGGCGATCATGTGTCTAAAGGTTGGCCTAACTGGCTGCAAATGTGGATGGCATTGAATGGAGTGGACAAAAAGTACAACTGCATGCTCGCCCAGAAATACCAAGCAAATTCATGCCTTGGCTTCCACGCGGATGACGAAGCCCTTTTTGTTGCAGGAGAATCAATCCTCACAGTAAATATCACTGGGGAGGCCGACTTCAAAGTCACATGCCCCAACGGCGCAGGGGAATTAAGATTACAGGAAGCACAGATGTTTGAGATGCCTCCCGGCTTTCAGCAGACACATAAACACGCTGTGGCCAACTGCACCGCAGGCAGAATTTCATACACATTCCGAGTCGCTACCACTATGGCGCCTGAACTACCAGTAGAACCTAGCGACGAAGAAGATGACAGGCGTATGGGTTACACCGATGGAGCCGTGGAAGTGAGTTACCAGCAGCTCGAAGGCGCAAACTTCCAGTATAGAATCATTAAGAATCAAGGCGGCGGTGATTGTTTTTGGCTGGCGCTCGAACATTACACCGGGGTGAAAACAAGGGATATGAAGAAAGCACTCCTAGCTGCTTGCAAACCTATCCCTGGGAGTGCGCTGGCCGAACAATTGAGACCAACCGTGTGGGCCAGCGATGAATCAATTAAAGCAGTGTGCACCCACCTGGGTTGGGACATAACTATTATTGATGAGATGCTAAATACTAAAGTTGTTTATATCAACCCGGGTAATGAAAACATGGCCATCATTCGACGCAAGCGCTGGCACTTTGAGGCTATTGAACCCCTCGCAGCATGCACAATCAAAGCGCTCGCATCTTGCTTAGATAGAAGGTTCACTGAGGTATCCAGCTTGCTATACAAAAGGCTGGGAACTGACTTCATGGACAATGCGCTCGCGGGCCAAGGGATGGAACTGGAAACTTTCCGGGAAATGCTGGTTGAACTGCAAATCTGCGCAGTAGTGGAGCAAGCCGGGGGCACAATAATACTGAATGATAAAGGACAAACCAAGGGTATCTTCAAATTCCTTGATGGTCATGCAGAGCATGTCAAGGAAGCAGCCTTTGCGCCCCATGAGCAATTAAATGTGTACAAGGCTGACTTAGAATGCACACCGGAAATGTACCTCCCCATACGTGAGGCCTGCACCGCGATGAGCTATACCCCAGACGTAGCACGCGCAACTTTATTAGCGAGTTGTCTCCTAAATGGCAGCACCGGAGTACTTTGTTCCGAATTGTTTAACGACAGAGGAACTCTCATGCCAACTGAACCATGCACGTCTGAGCGCGAGATGATGCTCCTGCTAGGGGTACCCGGGTGTGGTAAAAGCCGAGCTATCCGAGAAACACTGCCACGCGCACGAGGTCGCGCATTACTTTACATCACGCCAAGACGAGTCCTACTAGATGAGTTTGAGGAGCATCTGAACTCCCTTAGGAGGCGGATGGGTGCAGGGGCTTGCAGGAACTTCAAAGCTCTGACCTTTGAGAAAGCACTGATTAATGGAGAAAAATTTTCACCCGGTGCTTTGGTGGTACTGGATGAGATCCAACTTTACCCACCTGGTTATCTAGATCTGCTGTGCTGTAGGCTCAATCCTACTATTCGCTTGGTACTACTCGGGGACCCCTGCCAGAGTGACTATGACTCCAAAAAAGATCGTAACGTGCTTGGGGCCATACCGTCAGACATACTGAACTTACTTGAAGGCACCAAGTATAAGTACAACGTTCTGAGTCGCCGCTTCCAAAGCGAGATATTCATCAGCAGACTCCCATGTACACTCCAATCCAACCTCCAGTATAAAGGTTCTCTGAAGATCGTCGAAGGTCTTGACGCCATAGATTTGAGAGCAAGATCCTCTGAAGTCTGCTTGGTCTCATCCTTTGATGAGAAAAAAATTGCAACGGCTTACTTTGGAGTGCAGTGTAAAACTATGACTTTTGGCGAGAGCACTGGAGCCACTTTCACCACGGGTAGTATCTTGGTTACAAGCGTGTCACAACATACCAACGAGCGGCGCTGGATCACAGCCCTTAGTAGGTTCAGGAAAAATATCACGATTGTAAATGCAACAGGGGTGAGTATCGAAATCGTGCAGAAAACATATGCAAATCGAGTTTTTGGCCGCTTCTTATGCAGGTCAGCCAAGAACTCAGACCTTTTGACTTTACTACCTGGGGAACCTGAATTCACAGTTGGATTCACGTGCGAGAAGTACGGGGCAGATGAAGGGAAACGCGAAGAAAAACTCCAAGGTGATCCGTGGCTCAAGACGATGGTTGATTTATTGCAAGTTGAAGACATCGAAACCATCGAGGAAGCAAAGGAGATCATCGAGGATGAATGGTGCAAAACGCACCTGCCACAATGCGAGCTCGAGGGTGTTAGGGCACGTTGGGTCCACAAGATACTTGCCAAAGAAAGCCGCGAGAAACGCATGGGACATCTTGTGTCTGAGCAATTCACTGACGAACATTCAAAACAACCAGGGCACAGACTTACAAATGCCGCCGAACGTTTCGAAACCATTTACCCCAGACACAAAGCGGCCGACACTGTGACTTTTATCATGGCCGTGAGGAAGCGACTGCGTTTTTCACACCCTGTGAAAGAAGCCGCCAAACTGAACCAAGCACTACCATATGGCCCATTCCTACTAAAAGAATTCCTTGCACGCGTGCCGCTTAAACCAGCGCATAATGCCAGGATGATGGCTGAGTCGAAGTTTGACTTTGAGGAAAAGAAAACAAGCAAGAGCGCAGCTATCATAGAGAATCACAGCAATCGGTCGATGCGCGAGT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| 27,615
|
MK649770.1
|
Lily symptomless virus
|
Flores,F.J., Guevara,F.E., Granda,R., Garrido,P.
|
Universidad de las Fuerzas Armadas, Life and Agricultural Sciences
|
Ecuador
|
2019-04-08
|
LSV_EC
|
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,391
|
GenBank
| null |
Ecuador: Lasso
|
Ecuador
|
Alstroemeria
|
plant leaf
|
2018-11-20
| null | null |
Lily symptomless virus isolate LSV_EC, complete genome
|
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| 64,052
|
LC004126.1
|
Lily symptomless virus
|
Hiratsuka,K., Takeda,T.
|
Graduate School of Environment and Information Sciences; 79-7 Tokiwadai, Hodogayaku, Yokohama, Kanagawa 240-8501
|
Japan
|
2015-11-03
|
LSV-Jp1
|
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,387
|
GenBank
| null |
Japan:Wakayama
|
Japan
|
Lilium longiflorum
|
flower
| null | null | null |
Lily symptomless virus genomic RNA, complete genome, isolate: LSV-Jp1
|
GGATTCACACTCCCGATAATAACTGTTAATAAACGACAAGTTCATAACAGTTACTAGATGGCCCTCACATACCGAAGTCCAGTCGAGGAAGTGTTGACTCTTTTCGAGCCCGCAGCCCAATCTCTTGTAGCAGCAACTGCCACTGCAAGTTACCAACAAAACGAGAGGGATAATTTTGAATGGTTCAACTTCTCCATGCCAGCAATCGCTAAGGAGCGCCTAAGCACTGCTGGGATTTATTTGAGTCCATACTCTGGTTACCCCCACTCGCATCCAGTGTGCAAAACACTGGAAAACTACTTATTGTACAAAGTACTACCTAGTATTATTAACAACTCCTTTTACTTTGTAGGCATTAAACAATTTAAAATTAATTTTTTAAAAAAAAGATTCAAACATCTATCTTTGGTCCAAGCAATAAATAGATATGTAAGTAGCGCGGACAAGATAAGATATGGCAATGAATTCGTTGTTCGAGCGAGTTCTGAGAGTAGGTTGCTGAAGCGTCATAGGAGCATCGAGCAGTCTTGCACACTGTCTAGCCTCGTACCCAACGTCAAAACTGGTGCAAACTTGTTCCTGCACGATGAGCTACATTACTGGAGCAAAGATGACATTATCGATTTTCTCGAGGTTTGCCAACCCGAAATACTACTGGGCACTGTTGTGTACCCCACTGAGATCTTCGCTGGAGCAAAACACTCACTCAACCCATGGTGCTACGAATTTGAAATCAAGGGCAGAGTGCTGATCTATTACCCCGATGGGGTACGAAGTGAGGGGTACGAGCAACCAATTGACGGTGGCTATTTGTTGCAGGCCAACAGAATCGTACTGCCGAACGGCATCACTTACTGCGTTGATGTCATCGCAAGCAAGTTCTCACACCACCTCGTGAGTATAACCCGTGGGGATTTGGTTGTACCAAAGTACCGTTCATTTGGCCCATTCGATGCTGTTCGAGCACGTGGCGCAGCAGACATCGCGCGGAGGAACACTTTCTTTTTCCCGGTATCCCACCTGACCATCTTGCGCGTCTACCGGTATTTACGCTCTTTAAAGAAGCCTGATAAGCAGTCGGCCATGGCTAAGTTCTCACAATTATGCCACGATCCCTCAGGTGAGGCCATTAAATTCATGGAAGAGTTCAGCACTTTGGTTATGGAAACTGACAACACCCGGACAATCCTTAGGCCTGAACTTATCAAATCTTTCTTCGGGAACCTCGGCAGAAAACTACCTTCTTGCTTCGCTGCCATGTTTGCACGAACATGCTCCATGTGCTTGGACGAGTTCATCACCTATCTCGAGCCGCTGACCATCGATGTCACACTGCAAACGCTGTGCAAGAATTCCCTCTACTATGCGATAATTGAACAGGGTGAAGCAGAATCTTTTGTGGACCCATTTATGGAGCTCGAGTCTGCTTGGGCGGGACGCGACTCTAACTTACTCGATAGGCCAAGCGCCAGGTACTCTGGTTTGTTGCCACTCACTGATTGCAAGAAGAAGTGGGCCCTCCCGTTCAACATGGAACAATTGCGCCATGGATTCTTGAAGCTGTACATGAACGCATCTCAGAGCTGCTACACCGGACGCAGTTGGTCGATCCAGGAGTATGTCAACGCCATTTTGAGCAGCACAACGGTCATTGGGAGGGCATTCCTAAGATCACTGACACCCACATTGCTCGATTGGTTGCAATACAATGCCGATTGTCTGGAGCCTAAACCAGCCCTGTGGCACGATTGTGGCATTCGCTGGTTCATCCACGGCACACGCAACAGCGCCAAAATTGCCTTTCTCGAGTCGAGTGTGCAAATTGATGCCAGGGCGCAGCACGAGACTTGCGGGCACATGCTGCCAAGAAGGAAGAGGACATTCAAATTCATACCGACCTTGACCGATGCTGAAGTCTACACTTTTTATGAACCCGAGCGCCACAGCCCACTACCACTTGAACCCCAGGGCGCACCGCAGAGCTTACCATTGCCTGATACGAACACTGTGGTCGATTCCCTGCAATCACCAATCCCAAATCCCGGGGGCCTGACCTGCGGTTGCGGTATAACTATGGCCTTGAAGGCCGTCCTTAGGCACACTGAAAGGATTGATGAATTCACTGATAACCTCCGCGGGCGCCAGGCCGCATGGTACTCAATAGATAGGCAGCCATACAAATACAATGGTGGTAATCACGTGTCAAAAGGTTGGCCGAATTGGTTGCAGATGTGGATGGCATTGAACGGCGTGGACAAAAAATACAACTGCATGCTCGCTCAAAAGTACCAAGCGAATTCATGCCTCGGCTTCCACGCGGATGATGAAGCCATTTTTGTTGCGGGTGAGACCATCCTAACTGTCAACATCACAGGGGAGGCTGATTTCAAAATCACATGCTTTAACGGTGCAGGTGAGTTGAGGCTACAGGAAGCGCAGATGTTCGAAATGCCACCTGGGTTTCAGCAGACACACAAGCACGCTGTGGCCAATTGTACCGAAGGTAGAATCTCATACACCTTTCGTGTAGCCACCCCAATCGCACCTGAACCACCAGTGGTGCCAAGCGATGAAGAGGATTGTGGGCGTAAGGGTTACACAGATGGCGCTGTGGAAGTTAGCTACCAGCCACTCGAAGGGACAAACTTCCAGTACAAAATAATCAAAAATCAAGGCGGCGGCGATTGCTTTTGGTTGGCACTCGAACATTACACTGGGGTGAAGACAAGAGAAATGAAGAAAGCGCTCTTTACTGCTTGCAAACCCACCCCTGGGTGTGCATTGGCTGAGCAATTAAGGCCAACTGTGTGGGCCAGCGATGAAGCAATTAAGGCAGTTTGCACTCATTTGGGTTGGGACATAACAATCATAGATGAAATGCTAAACACAAAAGTAGTGTATGCCAACCCAGGTAATGAGAACATGGCTATCATTCGACGAAAGCGCTGGCATTTTGAGGCAATCGAACCTCTCGCAGCTTGCACTATCAAGGCTCTCGCCTCTTGCATGGATAGAAGGTTCACTGAGGTGTCCAGCCTGCTGTACAAAAGGCTGGGGACTGAATTTATGGACAACGCGCTCGCTGGACATGGGATGGAACTAGAAACCTTTCGGGAGATGCTAGTCGAATTGCAGATCTGCGCTGTGGTGGAGCAAGCCGGGGGCACCATCATACTGAACGACAAGGGACAAACTAAGGGCATCTTCAAATTCTTCGATGGCCATGCAGAACACGTCAAAGAAGCTGCTTTTGCGCCCCATGAGCAATTGAACGTGTACAAGGCTGACTTGGAGTGCACCCCCGAGATGTTCCTCCCCATTCGGGAAACCTGCACAGCGATACACTACACCCCAGACGTTGCACGAGCCAAATTACTAGCGAGTTGTCTCCTAAACGGCAGCACAGGAGTGCTTTGCTCCGAACTTTTCAACGACCGTGGAACTCTCCTGCCAACTGAACCTTGCACGTCTGAGCGCGAGGTCATGCTCCTGCTCGGAGTACCTGGCTGTGGTAAGAGCCGTGCAATCCGAGAAACACTACCACGCGCACGGGGTCGTGCGCTACTTTATATCACTCCTAGACGGGTCCTACTTGAGGAGTTTGAGGAACACTTGAACGCCCTAAGGAAGCGGGTGGGTGCCGGGGCTTGCCGGAATTTTAAGGCATTGACCTTTGAAAAAGCATTGATCATGGGGGAAAAGTTCTCACCCGGTGCACTTGTGGTACTTGATGAAATCCAACTCTACCCGCCTGGTTATTTGGACCTACTATGCTGCCGGCTTGACCCCACAATCCGTTTGGTGCTGCTCGGGGATCCCTGCCAGAGCGACTATGACTCTAAAAAAGATCGTAACGTGCTTGGAGCCATACCGTCAGATATTCTCAATTTACTCGACGGAACCAAGTACAAGTACGACGTGCTGAGTCGTCGCTTCCAAAGCGGAATTTTTTCAAACAGGCTTCCTTGCACACTCCAGTCCAACCTCCAGTACAAAGGTTCACTAAAGATCGTCGAGGGCCTAGATTCTATTGACTTAAGGGCCAAATCGTCTGAAGTCCGCCTGGTTTCATCCTTTGATGAAAAGAAAATCGCGGCGGCCTATTTCGGGGTGCAATGTAAGACTATGACCTTCGGTGAAAGTACCGGGGCCACCTTCACCACTGGAAGTATCCTGGTCACGAGTGTGTCGCAACACACTAACGAGCGGCGCTGGATCACAGCGCTAAGCAGATTCAGGAGAAACATTACAATCGTGAATGCAACCGGGGTAAGCATCGATATTGTGCAGAAAACATACGCGAATCGAGTTCTCGGGCGTTTCTTGAGCGTGTCCGCCAAGAACTCGGACCTTTTAACATTACTGCCAGGTGAACCAGACTTCACAGTGGGATTCATAAGTGAGAAGTTTGGGGCAGACGAGGGAAAACGCGAAGAAAAACTCCAAGGTGACCCATGGCTCAAGACAACGGTTGACTTATTGCAAGTAGAAGATATTGCAACCATCGAGGAGGCTAAGGAAATTATCGAGGATGAGTGGTGCAAAACGCACCTGCCTCAATGCGAGCTCGAGGGGGTAAGGGCTCGCTGGGTCCACAAGATATTAGCTAAGGAATATCGCGAGAAGCGCATGGGGCATCTAGTGTCTGAGCAATTCACCGATGAACACTCGAAACAATTAGGGCACAAACTCACCAATGCCGCTGAGCGCTTCGAAACCATTTACCCCAGACACAAAGCGGCTGATACGGTCACATTTGTAATGGCCGTAAGGAAGCGTTTACGGTTTTCACATCCTGTGAAAGAAGCCGCAAAGCTAAACCAAGCACTACCTTATGGTCCATTCCTACTGAAAGAATTCCTAGAACGCGTACCACTAAAACCCGCGCACGATGTTAGGATGATGGCCGAGTCAAAGTTCGACTTTGAAGAGAAAAAGACAAGCAAGAGTGCAGCCATCATAGAGAATCACAGCAATCGATCGATGCGAGAGTGGGCTGT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| 84,934
|
GU440579.1
|
Lily symptomless virus
|
Jung,Y.-T., Lim,J.H., Bae,E.H.
|
Dankook University, Department of Microbiology
|
Korea
|
2013-12-31
|
LSV-jj
|
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,392
|
GenBank
| null |
South Korea: Jeju
|
South Korea
|
Lilium
|
plant leaf
|
2009-03-20
| null | null |
Lily symptomless virus isolate LSV-jj, complete genome
|
GGATTCACACTCCCGATAATAACTGTTAATAAACGACAAGTTCATAACAGTTACTAGATGGCCCTCACATACCGAAGTCCAGTCGAGGAAGTGTTGACTCTTTTCGAGCCCGCCGCCCAATCACTTGTAGCTGCAACTGCCACCGCAAGCTACCAACAAAACGAGAAGGATAATTTCGAGTGGTTCAACTTCTCCATGCCAGCAATCGCTAAGGAGCGCCTAAGCACTGCTGGGATATATTTGAGCCCATACTCCGGTTATCCTCATTCACACCCAGTGTGTAAGACACTGGAAAATTACATATTGTACAAAGTACTACCTAGTATCATCAATAACTCTTTTTATTTCGTAGGTATCAAACAATTTAAAATTAACTTTTTAAAAAAAAGGTTCAAGCATCTATCCTTGGTCCACGCAATAAATAGGTACGTAAGCAGCGCGGACAAGATAAGATATGGCAACGAATTCGTTGTACGGGCGAGTTCAGAATGTAGGCTGCTAAAGCGGCATAGGAGCGTCGAGCAGTCATGCACACTGTCCAGCCTAGTCCCCAATATTAAAACCGGCGCAAACTTGTTCCTCCACGATGAGCTGCATTACTGGAGCAAGGATGACATTATCGACTTTCTCGAGGTCTGCCAACCCGAGATAATGCTGGGCACTGTAGTGTATCCCACTGAGATCTTCGCTGGAGCGAAACACTCACTCAACCCATGGTGCTACGAGTTTGAAGTCAAGGGCAGAGTGCTGATTTATTATCCAGATGGGGTACGGAGCGAGGGGTACGAACAGCCAATTGACGGAGGTTATTTGTTGCAGGCAAATAGAATCCTACTGCCTAATGGCATCACTTACTGCGTTGATGTCATTGCAAGCAAGTTCTCACACCACCTCGTGAGCATAACCCGTGGGGACTTGGTTGTGCCTAAATACCGTTCATTTGGCCCATTTGACGCCGTCCGTGCACGTGGCGCAGCAGATATCGCGCGGAAGAACACATTTTTCTTCCCAGTATCACATCTGACAATTCTGCGCGTCTACCGGTACTTACGCTCTTTGAAGAAACCTGATAAGCAGTCTGCCATGGCTAAATTTTCACAGTTATGCCATGATCCTTCTGGTGAGGCCATCAAATTCATGGAAGAGTTCAGTACACTGGTTATGGAGACGGGCAACACTCGGACGGTACTAAGGCCAGAACTCATTAAATCTTTCTTCGGGAACCTCGGCAGGAAACTACCCTCCTGCTTTGCTGCCATGTTTGCTCGTACGTGTTCCATGTGCCTAGATGAGTTCATCACCTTTCTTGAGCCGCTGACCATTGACGTCACACTGCAGACTCTGAGCAAAAATTCTTTCTACTATGCGCTAATTGATCAGGGTGAGGCAGAATCTTTTGTAGACCCATTCGAGGAACTGGAGTGTGCTTGGGAGGGCCGCGATTCGTTCTTACTTGATCGGCCTTGCGCCAAATACGCCGGTCTGTTGCCGCTCACTGACTGCAAGGGCAAATGGGCCCTCCCGTTTAACATGGAGAGACTACGCCATGGACTTTTGAAGCTATACATGGAAGCGTCCCAGAGCTGCTACACTGGGCGCAGTTGGACGATCCAAGATTACATCAACTCCATTTTGACCAACACAACAGTGATTGGGCGGGCATTTCTAAAATCACTGACGCCCGAATTGCTCGATTGGCTGCAGTATAACGCCGATTGTCTTGAGCCCAAACCAGCCTTGTGGCATGACTGCGGTGTTCGTTGGTTCATACATGGCACACGCAACAGCGCTAAAATTGCTTTTCTTGAGTCGAGTGTGCAAATTGATGCCAGGGCGCAGTACGAGTCCTGCGGGTACATGACTCCAGGAAGGACGAGGACCTTCAAGCTCATACCAACATTAACGGATACTGAAATTTACACTTTCTATGAACCAGAAATTATCCGCCGCAGCTCACCACCACTTGAACCATCAGGTGCACTGCAGGGCACACCTTTGACTGTTGGGAACACCGTAGCAGATACTCCGCAACAGCCAATTCCGATTGCCGGGGCTCTGACTTGCGATTGTGGCATTATCATGAACTTGAAAGACGTCCTTGGGCACACCGAGAGGATTGATGAGTTCACTGATAACCTCCGGGGACGCCAGGCAGCATGGTACTCCATGGATGGGCGGCCCTACAAATACAATGGTGGTGATCATGTGTCTAAAGGTTGGCCCAACTGGCTGCAAATGTGGATGGCATTGAATGGAGTGGACAAAAAGTACAACTGCATGCTCGCTCAGAAATACCAAGTAAATTCATGCCTTGGCTTCCACGCGGATGACGAAGCCCTTTTTGTTGCAGGAGAATCCATCCTCACAGTAAATATCACTGGGGAGGCCGACTTCAAAGTCACATGCCCCAACGGCGCAGGGGAATTAAGATTACAGGAAGCACAGATGTTTGAGATGCCTCCCGGCTTTCAGCAGACACATAAACACGCTGTGGCCAACTGCACCGCAGGCAGAATTTCATACACATTCCGAGTCGCTACCACTATGGCGCCTGAACTACCAGTTGCACCTAGCGACGAAGAAGATGATGGGCGTAAGGGTTACACCGATGGAGCCGTGGAGGTGAGTTACCAGCAGCTCGAAGGCGCAAACTTCCAGTATAGAATCATTAAGAATCAAGGCGGTGGTGATTGTTTTTGGCTGGCGCTCGAACATTACACCGGGGTGAAAACAAGGGATATGAAGAAAGCACTCCTTGCTGCTTGCAAGCCTATCCCTGGGAGTGCGTTGGCCGAACAATTGAGACCAACCGTGTGGGCCAGCGATGAATCAATTAAAGCAGTGTGCACCCACCTGGGTTGGGACATAACGATTATTGATGAGATGCTAAATACTAAGTCGTTTATATCAACCCCGGGTAATGAAAATATGGCCATCATTCGACGCAAGCGCTGGCACTTTGAGGCTATTGAACCCCTCGCAGCATGCACAATCAAAGCGCTCGCATCTTGCTTAGATAGAAGGTTCACTGAGGTATCCAGCTTGCTATACAAAAGGCTGGGAACTGACTTCATGGACAATGCGCTCGCGGGCCAAGGGATGGAACTGGAAACTTTCCGGGAAATGCTGGTTGAACTGCAAATCTGCGCAGTAGTGGAGCAAGCCGGGGGCACAATAATGCTGAATGATAAAGGACAAACCAAGGGTATCTTCAAATTCCTTGATGGTCATGCAGAGCATGTCAAGGAAGCAGCCTTTGCGCCCCATGAGCAATTAAATGTGTACAAGGCTGACTTAGAATGCACACCGGAAATGTACCTCCCCATCCGTGAGGCCTGCACCGCGATGAGCTATACCCCAGACGTATCACGCGCAACTTTATTAGCGAGTTGTCTCCTAAATGGCAGCACCGGAGTACTTTGTTCCGAATTGTTTAACGACAGAGGAACTCTCATGCCAACTGAACCATGCACGTCTGAGCGTGAGATGATGCTCCTGCTAGGAGTACCCGGGTGTGGTAAAAGCCGAGCTATCCGAGAAACACTGCCACGCGCACGAGGTCGCGCATTACTCTACATCACGCCAAGACGAGTCCTACTAGATGAGTTTGAGGAGCATCTGAACTCCCTTAGGAAGCGGATGGGTGCAGGGGCTTGCCGGAACTTCAAAGCTCTGACCTTTGAGAAAGCACTGATTAATGGAGAAAAATTTGCACCCGGTGCTTTGGTGGTACTGGATGAGATCCAACTTTACCCACCTGGTTATCTAGACCTGCTGTGCTGTAGGCTCAATCCTACCATTCGCTTGGTACTACTCGGGGATCCCTGCCAGAGTGACTATGACTCCAAAAAAGATCGTAACGTGCTTGGGGCCATACAGTCAGACATACTGAACTTACTTGAAGGCACCAAGTATAAGTACAACGTTCTGAGTCGCCGATTCCAAAGCGAGATATTCATCAGCAGGCTCCCATGCACACTCCAGCCCAACCTCCAGTACAAAGGTTCTCTGAAGATCGTCGAAGGTCTTGACGCCATAGATGTGAGAGCAAGATCCTCTGAAGTCTGCTTGGTCTCATCCTTTGATGAGAAGAAAATTGCAACAGCTTACTTTGGAGTGCAATGTAAAACTATGACTTTTGGCGAGAGCACTGGAGCAACTTTCACCACGGGTAGTATCTTGGTTACAAGCGTGTCACAACATACCAACGAGCGGCGCTGGATCACAGCCCTTAGTAGGTTCAGGAGAAATATCACGATTGTAAATGCAACCGGGGTGAGTATCGAAATCGTGCAGAAAACATATGCAAATCGAGCTTTTGGCCGCTTCCTATGCATGTCAGCCAAGAACTCAGACCTTTTGACTTTACTACCTGGGGAACCTGAATTCACAGTTGGATTCACGTGCGAGAAGTACGGGGCAGATGAAGGGAAACGCGAAGAAAAACTCCAAGGTGATCCGTGGCTCAAGACGATGGTTGATTTATTGCAAGTTGAAGACATCGGAACCATCGAGGAAGCAAAGGAGATCATCGAGGATGAGTGGTGCAAAACGCACCTGCCACAATGCGAGCTCGAGGGTGTTAGGGCACGTTGGGTCCACAAGATACTTGCCAAAGAAAGCCGCGAGAAACGCATGGGACATCTTGTGTCTGAGCAATTCACTGACGAACATTCAAAACAGCCAGGGCACAGACTTACCAATGCCGCTGAACGTTTCGAAACCATTTACCCCAGACACAAAGCGGCCGACACTGTGACTTTTATCATGGCCGTGAGGAAGCGATTGCGTTTTTCACACCCTGTGAAAGAAGCTGCCAAACTGAACCAAGCACTACCATATGGCCCATTCCTACTGAAAGAATTCCTTGCACGCGTACCGCTTAAACCAGCGCATAATGCCAGGATGATGGCTGAGTCGAAGTTTGACTTTGAGGAAAAGAAAACAAGCAAGAGCGCAGCCATCATAGAGAATCACAGCAATCGGTCGATGCGCGAATG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| 92,174
|
HM222522.1
|
Lily symptomless virus
|
Xu,P., Li,H., Liu,J., Luan,Y., Yin,Y., Bai,J., Li,H.G., Xu,P.S., Liu,J.W., Yin,Y.L., Bai,J.F.
|
Dalian University of Technology, School of Life Science and Biotechnology
|
China
|
2010-10-19
| null |
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,394
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Lilium
|
plant leaf
|
2009-04
| null | null |
Lily symptomless virus strain LSV-DL, complete genome
|
GGATTCACACTCCCGATAATAACTGTTAATAAACGACAAGTTCATAACAGTTACTAGATGGCCCTCACATACCGAAGTCCAGTCGAGGAAGTGTTGACTCTTTTCGAGCCCGCCGCCCAATCACTTGTAGCTGCAACTGCCACCGCAAGCTACCAACAAAACGAGAAGGATAATTTCGAGTGGTTCAACTTCTCCATGCCAGCAATCGCTAAGGAGCGCCTAAGCACTGCTGGGATATATTTGAGCCCATACTCCGGTTATCCTCACTCACACCCAGTGTGTAAAACACTGGAAAATTACATATTGTACAAAGTACTACCTAGTATTATCAATAACTCTTTTTATTTCGTAGGTATCAAACAATTTAAAATTAACTTTTTAAAAAAAAGGTTCAAGCATCTATCCTTGGTCCACGCAATAAATAGGTACGTAAGCAGCGCGGACAAGATAAGATATGGCAACGAATTCGTCGTACGGGCGAGTTCAGAAAGTAGGCTGCTAAAGCGGCATAGGAGCATCGAGCAGTCATGCACACTGTCCAGCCTAGTCCCCAATATTAAAACAGGCGCGAACTTGTTCCTCCACGATGAGCTGCATTACTGGAGCAAGGATGATATTATCGACTTTCTCGAGGTCTGCCAACCCGAGATAATGCTGGGCACTGTAGTGTACCCCACTGAGATCTTCGCTGGAGCGAAACACTCACTCAACCCATGGTGCTACGAGTTTGAAGTCAAGGGCAGGGTGCTGATCTATTATCCAGATGGGGTACGGAGTGAGGGGTACGAACAGCCAATTGACGGAGGTTATTTGTTGCAGGCAAATAGAATCCTACTGCCTAATGGCATCACTTACTGCGTTGATGTTATTGCAAGCAAGTTCTCACACCACCTCGTGAGCATAACCCGTGGGGACTTGGTTGTGCCTAAATACCGTTCATTTGGCCCATTTGACGCCGTCCGTGCACGTGGCGCAGCAGATATCGCGCGGAAGAACACACTTTTCTTCCCAGTGTCACATCTGACAATTCTGCGCGTCTACCGGTACTTACGCTCTTTGAAGAAACCTGATAAGCAGTCTGCCATGGCTAAATTTTCACAGTTATGCCATGATCCTTCTGGCGAGGCCATCAAATTCATGGAAGAGTTCAGTACACTGGTCATGGAGACGGACAACACTCGGACGGTCCTAAGGCCTGAACTCATTAAATCTTTCTTCGGGAACCTCGGCAGGAGGCTACCCTCCTGCTTTGCTGCCATGTTTGCTCGTACGTGTTCCATGTGCCTAGATGAGTTCATCACCTTTCTTGAGCCGCTGACCATTGACGTCACACTGCAGACTCTGAGCAAAAATTCTCTCTACTATGCGCTAATTGATCAGGGTGAGGCAGAATCATTTGTAGACCCATTCGAGGAACTGGAGTGTGCTTGGGAGGGCCGCGATTCGTTCTTACTTGATCGGCCTAGCGCCAAATACGCCGGTCTGTTGCCACTCACTGACTGCAAGGGCAAATGGGCCCTCCCGTTTAACATGGAGAAACTACGCCATGGACTCTTGAAGCTATACATGGAAGCGTCCCAGAGCTGCTACACTGGGCGCAGTTGGACGATCCAGGATTATATCAACTCCATTCTGACCAACACAACAGTGATTGGGCGGGCATTTCTAAAGTCACTGACGCCCGAATTGCTCGATTGGCTGCAGTATAACGCCGATTGTCTTGAGCCCAAACCAGCCTTGTGGCATGACTGCGGTGTTCGTTGGTTCATACATGGCACACGCAACAGCGCTAAAATTGCTTTTCTTGAGTCGAGTGTACAAATTGATGCCAGGGCGCAGCACGAGTCCTGCGGGTACATGACTCCAGGAAGGACGAGGACCTTCAAGCTCATACCAACCTTAACGGATACTGAAATTTATACTTTCTATGAACCAGAAATTATCCGCCGCAGCCCACCACCACTTGAACCTTCAGGTGCACTGCAGGGCACACCTTTGACTGTTGGGGACACCGCAGCAGATTCTCTGCAACAGCCAATTCCGATTGCCGGGGCTCTGACCTGCGATTGCGGCATTATTATGAACTTGAAAGACGTCCTTGGGCACACCGAGAGGATTGATGAGTTCACTGATAACCTCCGGGGACGCCAGGCAGCATGGTACTCCATGGATGGGCGGTCCTACAAATACAATGGTGGCGATCATGTGTCTAAAGGTTGGCCTAACTGGCTGCAAATGTGGATGGCATTGAATGGAGTGGACAAAAAGTACAACTGCATGCTCGCCCAGAAATACCAAGCAAATTCATGCCTTGGCTTCCACGCGGATGACGAAGCCCTTTTTGTTGCAGGAGAATCAATCCTCACAGTAAATATCACTGGGGAGGCCGACTTCAAAGTCACATGCCCCAACGGCGCAGGGGAATTAAGATTACAGGAAGCACAGATGTTTGAGATGCCTCCCGGCTTTCAGCAGACACATAAACACGCTGTGGCCAACTGCACCGCAGGCAGAATTTCATACACATTCCGAGTCGCTACCACTATGGCGCCTGAACTACCAGTAGCACCTAGCGACGAAGAAGATGACAGGCGTATGGATTACACCGATGGAGCCGTGGAAGTGAGTTACCAGCAGCTCGAAGGCGCAAACTTCCAGTATAGAATCATTAAGAATCAAGGCGGCGGTGATTGTTTTTGGCTGGCGCTCGAACATTACACCGGGGTGAAAACAAGGGATATGAAGAAAGCACTCCTAGCTGCTTGCAAACCTATCCCTGGGAGTGCGCTGGCCGAACAATTGAGACCAACCGTGTGGGCCAGCGATGAATCAATTAAAGCAGTGTGCACCCACCTGGGTTGGGACATAACTATTATTGATGAGATGCTAAATACTAAAGTTGTTTATATCAACCCGGGTAATGAAAACATGGCCATCATTCGACGCAAGCGCTGGCACTTTGAGGCTATTGAACCCCTCGCAGCATGCACAATCAAAGCGCTCGCATCTTGCTTAGATAGAAGGTTCACTGAGGTATCCAGCTTGCTATACAAAAGGCTGGGAACTGACTTCATGGACAATGCGCTCGCGGGCCAAGGGATGGAACTGGAAACTTTCCGGGAAATGCTGGTTGAACTGCAAATCTGCGCAGTAGTGGAGCAAGCCGGGGGCACAATAATACTGAATGATAAAGGACAAACCAAGGGTATCTTCAAATTCCTTGATGGTCATGCAGAGCATGTCAAGGAAGCAGCCCTTGCGCCCCATGAGCAATTAAATGTGTACAAAGCTGACTTAGAATGCACACCGGAAATGTACCTCCCCATACGTGAGGCCTGCACCGCGATGAGCTATACCCCAGACGTATCACGTGCAACTTTATTAGCGAGTTGTCTCCTAAATGGCAGCACCGGAGTACTATGTTCCGAATTGTTTAACGACAGAGGAACTCTCATGCCAACTGAACCATGCACGTCTGAGCGCGAGATGATGCTCCTGCTAGGGGTACCCGGGTGTGGTAAAAGCCGAGCTATCCGAGAAACACTGCCACGCGCACGAGGTCGCGCATTACTTTACATCACGCCAAGACGAGTCCTACTAGATGAGTTTGAGGAGCATCTGAACTCCCTTAGGAGGCGGATGGGTGCAGGGGCTTGCAGGAACTTCAAAGCTCTGACCTTTGAGAAAGCACTGATTAATGGAGAAAAATTTTCACCCGGTGCTTTGGTGGTACTGGATGAGATCCAACTTTACCCACCTGGTTATCTAGACCTGCTGTGCTGTAGGCTCAATCCTACCATTCGCTTGGTACTACTCGGGGACCCCTGCCAGAGTGACTATGACTCCAAAAAAGATCGTAACGTGCTTGGGGCCATACCGTCAGACATACTGAACTTACTTGAAGGCACCAAGTATAAGTACAACGTTCTGAGTCGCCGCTTCCAAAGCGAGATATTCATCAGCAGACTCCCATGTACACTCCAATCCAACCTCCAGTACAAAGGTTCTCTGAAGATCGTCGAAGGTCTTGACGCCATAGATTTGAGAGCAAGATCCTCTGAAGTCTGCTTGGTCTCATCCTTTGATGAGAAAAAAATTGCAACGGCTTACTTTGGAGTGCAGTGTAAAACTATGACTTTTGGCGAGAGCACTGGAGCCACTTTCACCACGGGTAGTATCTTGGTTACAAGCGTGTCACAACATACCAACGAGCGGCGCTGGATCACAGCCCTTAGTAGGTTCAGGAGAAATATCACGATTGTAAATGCAACAGGGGTGAGTATCGAAATCGTGCAGAAAACATATGCAAATCGAGCTTTTGGCCGCTTCCTATGCATGTCAGCCAAGAACTCAGACCTTTTGACTTTACTACCTGGGGAACCTGAATTCACAGTTGGATTCACGTGCGAGAAGTACGGGGCAGATGATGGGAAACGCGAAGAAAAACTCCAAGGTGATCCGTGGCTCAAGACGATGGTTGATTTATTGCAAGTTGAAGACATCGAAACCATCGAGGAAGCAAAGGAGATCATCGAGGATGAATGGTGCAAAACGCACCTGCCACAATGCGAGCTCGAGGGTGTTAGGGCACGTTGGGTCCACAAGATACTTGCCAAAGAAAGCCGCGAGAAACGCATGGGACATCTTGTGTCCGAGCAATTCACTGACGAACATTCAAAACAGCCAGGGCACAGACTTACCAATGCCGCTGAACGTTTCGAAACCATTTACCCCAGACACAAAGCGGCCGACACTGTGACTTTTATCATGGCCGTGAGGAAGCGATTGCGTTTTTCACACCCTGTGAAAGAAGCTGCCAAACTGAACCAAGCACTACCATATGGCCCATTCCTACTGAAAGAATTCCTTGCACGCGTACCGCTTAAACCAGCGCATAATGCCAGGATGATGGCTGAGTCGAAGTTTGACTTTGAGGAAAAGAAAACAAGCAAGAGCGCAGCCATCATAGAGAATCACAGCAATCGGTCGATGCGCGAGTGGGCCATTGACATAGGTTTGATTTTTTCGAGAAGTCAAATATGCACGAAATATGACAACCGTTTCAGAGATGCTAAAGCAGCCCAAACAATCGTGTGCTTTCAACACTCGGTACTATGCAGATTCGCACCCTATATGCGTTACATCGAGAAAAAACCGAACGAAGCTTTGCCCGCAAAGTATTACATCCACTCAGGCAAAGGACTGGACGAGCTCAGTGCTTGGGTCAAAATAGGCGGGTTCGGGGACGTATGCACTGAATCCGACTACGAGGCCTTTGACGCCAGCCAGGATCAATACATCATGGCTTTTGAGATTTGCCTAATGCGCTACCTAGGCCTACCCCATAGCTTAGTTGAAGATTACAAATTCATTAAGACGCATCTTGGTTCGAAACTCGGGAATTTCGCGATTATGCGTTTCTCTGGCGAGGCTAGCACATTTCTCTTTAACACGATGGCAAACATGCTATTTACTTTCCTGAGGTACGACATCAAAGGCAATGAGCGTATATGTTTTGCAGGCGACGACATGTGCTCCAACAAGAGGCTATTTGTATCATCTAAACATGCTGATTTCCTCGGCAAGTTGAAACTCAAAGCTAAAGTGGCCCATACAAAGACCCCGACCTTCTGTGGTTGGAACCTTTGTCCACATGGGATCTTTAAGAAGCCCCAGCTAGTGTTCGAACGACTATGCATAGCAAAAGAAACAAACAACCTAGTAAATTGCATAGATAACTACGCTATTGAGGTCGCTTTCGCCTACAAGATGGGTGAAAGAGCACGTGAGCGCATGGATGAAGAAGAGCTTGAAGCGTTTTACAATTGCGTGCGTATAATTGTCAAAAATAAGCATCTGTTGAAATCAGACGTGCGTAACGTGTATGAGGAACAATTAGATTAGAAGCTTAGGTTATAGCATTATTATTGTATATGGATGTTTTACTAAGTTTGTTGAGTGAGTTTGGTTTTGAGCGTTTGAGTAGTGAATTGAGTCTGCCTATCGTTGTTCATAGTGTGCCAGGTGGTGGGAAGTCTAGTTTAATACGTAAGTTAATAAATAAGGATCGACGCTTCTCTGCATACACTTTTGGACTTGAAGATTGCGAGAGCATCACTGGTGTCCGGATTAAGAAAGCTCACGCTAGCATCCCGCGCTCAGAGTTTGTTGTGTTCGACGAATACATTGAGGGTGACACACCACCGTGGGCTTTCGCAGTATTTGCTGACCCGCTCCAAGGCGGGCCTGGTCCAGTCCTTCGTGCTCATTTTATCAAACGACGCTCCCACAGATTCGGGAAGTGCACGGCGCAACTGCTCAACGACTTGAGCTACGAGGTTGAATCAGATCTTGCGGACGTGGTTCAAATTCAAGGCCTCTACGAGACTGATCTGCAGGGCACTGTTGTGTATTACGAAGCTTGCGTCGGCAACCTACTACGTGCACACTCTGTACCTGCTTACTGCATTAGTGAGATTCGAGGCCAAACTTTCGAGAGCGTCACTTTCGTAACCAGCGAAAACTATCCAGTGGACAGAGCTTTAGCGTTCCAGTGTCTCACCAGGCACCGCTCATCATTATTGATTTTGAGCCCCAATGCCGCTTACACCACCTCCTGACTATACAAGAGTTTACACCGCACTCGCCATTGGCGCTTCCATCGCATTTTTCACTGGATTGATCACGCGTAACACACTACCTTCCGTTGGTGATTTGCAGCACAACTTGCCCCACGGTGGGAGGTACCGGGACGGTACAAAAAGTGTAGAGTACTGTGGCCCCCGAAAACTGAATTCTGTCGAGAGTGGTAGCCGTTGGACCTTCCAGCCTTGGCTCTTGGTCATCGTGCTTGTTGCACTGATCATCGCTCTTGGTCGACAGGGACATAACTGTCGGGCATGCGGTCGGTCGCACTAACACTTTGCGCCATCATCGTTGGCTATTTGCTCGTGTCTAACTTGCAAAACGTATTCTCGCCCGAGGTTTGCACTTTAGTCATTACTGGGGAGTCCATCCGTATAAACGGCTGTAACCTTAGTCCAGCACATTTCCGAGCAATCTCACACTTGAAAGTGCTACAAGTTCACCTTTAGGTTTACAGGCTGGCGGACGATTAAACTCTCACTTGTTACCGCGAGATGCAATCAAGACCAGCACAAGAATCCGGCTCGGCAAGCGAGACCCCTGCACGTGGCAGGCCCACACCCAGTGATGCACCAAGAGACGAGCCTACCAATTACAATAATAACGCTGAGTCACTGTTAGAGCAACGACTAACCCGGCTGATCGAGAAGCTCAATGCTGAAAAGCACAATTCCAATCTGCGAAATGTGGCTTTCGAGATCGGGAGGCCCTCGCTGCAACCCACGAGTGCCATGCGAAGGAACCCTGCGAACCCCTACGGGAGATTCTCAATTGACGAACTCTTCAAGATGAAGGTTGGCGTCGTATCTAACAACATGGCAACCACTGAACAAATGGCCAAGATAGCGTCAGACATCGCAGGGCTTGGGGTACCAACGGAGCACGTCGTATCAGTAATATTGCAAATGGTCATCATGTGTGCTTGCGTGAGCAGTTCGGCGTTCCTTGACCCTGAGGGCAGCATTGAGTTTGAGAATGGAGCGGTGCCCGTCGACTCCATCGCTGCGATCATGAAGAAGCACGCTGGACTGCGGAAAGTCTGCCGGCTCTATGCCCCAATCGTGTGGAACAGCATGCTTGTGCGAAATCAACCACCAGCTGATTGGCAAGCTATGGGCTTCCAATACAACACGCGGTTCGCAGCTTTTGACACCTTCGACTACGTGACTAACCAGGCGGCTATCCAACCTGTCGAGGGGATCATCAGGCGACCCACTTCTGCTGAGGTCATTGCCCACAACGCGCACAAGCAATTAGCCCTGGATAGGTCAAACCGCAATGAGCGTCTGGGGAGTCTGGAAACCGAATACACTGGTGGGGTACAAGGAGCTGAAATCGTCCGAAATCATCGATACGCAAATAATGGATGAAGCATTGAAGCGACGAACTACCATAGTGTTGTGTTTGCTTTCTGCATTTCCGCGTGATATTTGCCGCGATATATTGCGGCGCACCTCTAGTCACATTGTTGGGCTCGGAAGATCTAGGTATGCTAGACGACGCCGAGCTCTCCAAATTGGCAGGTGTGAGAGGTGTTATCGAGTGTATCCACCTGTCTGTGGATCTAAGTGTGACAATAAGACCTGCTGGCCAGGCCTATCTATAAATACCAACGTGGCCAACTATATAGATCATGGAGTAACCGAGGTGATACCATGGATCTCACCACATCGTGGCCAGTTCTACCTAAGACCTAAATAATTTTAAGGGTAAAACTATAAAAAAAATTTGTTTTTAAAATTTTAGCAG
| 100,140
|
AM263208.1
|
Lily symptomless virus
|
Li,F., Sun,J., Chen,H.
|
Li F., Department of Phytopathology, Yunnan Agricultural University, Key Laboratory for Plant Pathology of Yunnan Province, Kunming, 650201, Yunnan Province
|
China
|
2007-05-01
|
SMi
|
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,393
|
GenBank
| null |
China:Yunnan
|
China
|
Lilium
| null | null | null | null |
Lily symptomless virus complete genome, isolate SMi
|
GGATTCACACTCCCGATAATAACTGTTAATAAACGACAAGTTCATAACAGTTACTAGATGGCCCTCACATACCGAAGTCCAGTCGAGGAAGTGTTGACTCTTTTCGAGCCCGCCGCCCAATCACTTGTAGCTGCAACTGCCACCGCAAGCTACCAACAAAATGAGAAGGATAATTTCGAGTGGTTCAACTTCTCCATGCCAGCAATCGCTAAGGAGCGCCTAAGCACTGCTGGTATATATTTGAGCCCATACTCCGGTTATCCTCATTCACACCCAGTGTGTAAGACACTGGAAAATTACATATTGTACAAAGTACTACCTAGTATCATCAATAACTCTTTTTATTTCGTAGGTATCAAACAATTTAAAATTAACTTTTTAAAAAAAAGGTTCAAGCATCTATCCTTGGTCCACGCAATAAATAGGTACGTAAGCAGCGCGGACAAGATAAGATATGGCAACGAATTCGTCGTACGGGCGAGTTCAGAATGTAGGCTGCTAAAGCGGCATAGGAGCATCGAGCAGTCATGCACACTGTCCAGCCTAGTCCCCAATATTAAAACAGGCGCAAACTTGTTCCTCCACGATGAGCTGCATTACTGGAGCAAGGATGACATTATCGACTTTCTCGAGGTCTGCCAACCCGAGATAATGCTGGGCACTGTAGTGTATCCCACTGAGATCTTCGCTGGAGCGAAACACTCACTCAACCCATGGTGCTACGAGTTTGAAGTCAAGGGCAGAGTGCTGATTTATTATCCAGATGGGGTGCGGAGCGAGGGGTACGAACAGCCAATTGACGGAGGTTATTTGTTGCAGGCAAATAGAATCCTACTGCCTAATGGCATCACTTACTGCGTTGATGTCATTGCAAGCAAGTTCTCACACCACCTCGTGAGCATAACCCGTGGGGACTTGGTTGTGCCTAAATACCGTTCATTTGGCCCATTTGACGCCGTCCGTGCACGTGGCGCAGCAGATATCGCGCGGAAGAACACATTTTTCTTCCCAGTATCACATCTGACAATTCTGCGCGTCTACCGGTACTTACGCTCTTTGAAGAAACCTGATAAGCAGTCTGCCATGGCTAAATTTTCACAGTTATGCCATGATCCTTCTGGCGAGGCCATCAAATTCATGGAAGAGTTCAGTACACTGGTCATGGAGACGGGCAACACTCGGACGGTACTAAGGCCAGAACTCATTAAATCTTTCTTCGGGAACCTCGGCAGGAAGCTACCCTCCTGCTTTGCTGCCATGTTTGCTCGTACGTGTTCCATGTGCCTAGATGAGTTCATCACCTTTCTTGAGCCGCTGACCATTGACGTCACACTGCAGACTCTGAGCAAAAATTCTTTCTACTATGCGCTAATTGATCAGGGTGAGGCAGAATCTTTTGTAGACCCATTCGAGGAACTGGAGTGTGCTTGGGAGGGCCGCGATTCGTTCTTACTTGATCGGCCTTGCGCCAAATACGCCGGTCTGTTACCGCTCACTGACTGCAAGAGCAAATGGGCCCTCCCGTTTAACATGGAGAGACTACGCCATGGACTTTTGAAGCTATACATGGAAGCGTCCCAGAGCTGCTACACTGGGCGCAGTTGGACGATCCAAGATTACATCAACTCCATTTTGACCAACACAACAGTGATTGGGCGGGCATTTCTAAAATCACTGACGCCCGAATTGCTCGATTGGCTGCAGTATAACGCCGATTGTCTTGAGCCCAAACCAGCCTTGTGGCATGACTGCGGTGTTCGTTGGTTCATACATGGCACACGCAACAGCGCTAAAATTGCTTTTCTTGAGTCGAGTGTGCAAATTGATGCCAGGGCGCAGTTCGAGTCCTGCGGGTACATGACTCCAGGAAGGACGAGGACCTTCAAGCTCATACCAACCTTAACGGATACTGAAATTTACACTTTCTATGAACCAGAAATTATCCGCCGCAGCCCACCACCACTTGAACCATCAGGTGCACTGCAGGGCACACCTTTGACTGTTGGGAACACCGTAGCAGAAACTCCGCAACAGCCAATTCCGATTGCCGGGGCTCTGGCCTGCGATTGTGGCATTATCATGAACTTGAAAGACGTCCTTGGGCACACCGAGAGGATTGATGAGTTCACTGATAACCTCCGGGGACGCCAGGCAGCATGGTACTCCATGGATGGGCGGCCCTACAAATACAATGGTGGTGATCATGTGTCTAAAGGTTGGCCCAACTGGCTGCAAATGTGGATGGCATTGAATGGAGTGGACAAAAAGTACAACTGCATGCTCGCTCAGAAATACCAAGTAAATTCATGCCTTGGCTTCCACGCGGATGACGAAGCCCTTTTTGTCGCAGGAGAATCCATCCTCACAGTAAATATCACTGGGGAGGCCGACTTCAAAGTCACATGCCCCAACGGCGCAGGGGAATTAAGATTACAGGAAGCACAGATGTTTGAGATGCCTCCCGGCTTTCAGCAGACACATAAACACGCTGTGGCCAACTGCACTGCTGGCAGAATTTCATACACATTCCGAGTAGCTACCACTATGGCGCCTGAACTACCAGTTGCACCTAGCGACGAAGAAGATGATGGGCGTAGGGGTTACACCGATGGAGCCGTGGAGGTGAGTTACCAGAAGCTCGAAGGCGCAAACTTCCAGTATAGAATCATTAAGAATCAAGGCGGTGGTGATTGTTTTTGGCTGGCGCTCGAACATTACACCGGGGTGAAAACAAGGGATATGAAGAAAGCACTCCTTGCTGCTTGCAAGCCTATCCCTGGGAGCGCGTTGGCCGAACAATTGAGACCAACCGTGTGGGCCAGCGATGAATCAATTAAAGCAGTGTGCACCCACCTGGGTTGGGACATAACGATTATTGATGAGATGCTAAATACTAAGTCGTTTATATCAACCCCGGGTAATGAAAATATGGCCATCATTCGACGCAAGCGCTGGCACTTTGAGGCTATTGAACCCCTCGCAGCATGCACAATCAAAGCGCTCGCATCTTGCTTAGATAGAAGGTTCACTGAGGTATCCAGCTTGCTATACAAAAGGCTGGGAACTGACTTCATGGACAATGCGCTCGCGGGCCAAGGGATGGAACTGGAAACCTTCCGGGAAATGCTGGTTGAACTGCAAATCTGCGCAGTAGTGGAGCAAGCCGGGGGCACAATAATGCTGAATGATAAAGGACAAACCAAGGGTATCTTCAAATTCCTTGATGGTCATGCAGAGCATGTCAAGGAAGCAGCCTTTGCGCCCCATGAGCAATTAAATGTGTACAAGGCTGACTTAGAATGCACACCGGAAATGTATCTCCCCATCCGTGAGGCCTGCACCGCGATGAGCTATACCCCAGACGTATCACGCGCAACTTTATTAGCGAGTTGTCTCCTAAATGGCAGCACCGGAGTACTTTGTTCCGAATTGTTTAACGACAGAGGAACTCTCATGCCAACTGAACCATGCACGTCTGAGCGTGAGATGATGCTCCTGCTAGGAGTACCCGGGTGTGGTAAAAGCCGAGCTATCCGAGAAACACTGCCACGCGCACGAGGTCGCGCCTTACTCTACATCACGCCAAGACCAGGTCTACTAGATGAGTTTGAGGAGCATCTGAACTCCCTTAGGAAGCGGATGGGTGCAGGGGCTTGCCGGAACTTCAAAGCTCTGACCTTTGAGAAAGCACTGATTAATGGAGAAAAATTTGCACCCGGTGCTTTGGTGGTACTGGATGAGATCCAACTTTACCCACCTGGTTATCTAGACCTGCTGTGCTGTAGGCTCAATCCTACCATTCGCTTGGTACTACTCGGGGATCCCTGCCAGAGTGACTATGACTCCAAAAAAGATCGTAACGTGCTTGGGGCCATACCGTCAGACATATTGAACTTACTTGAAGGCACCAAGTATAAGTACAACGTTCTGAGTCGCCGATTCCAAAGCGAGATATTCATCAGCAGGCTCCCATGCACACTCCAGTCCAACCTCCAGTACAAAGGTTCTCTGAAGATCGTCGAAGGTCTTGACGCCATAGATGTGAGAGCAAGATCCTCTGAAGTCTGCTTGGTCTCATCCTTTGATGAGAAGAAAATTGCAACAGCTTACTTTGGAGCGCAATGTAAAACTATGACTTTTGGCGAGAGTACTGGAGCAACTTTCACCACGGGTAGTATCTTGGTTACATGCGTGTCACAACATACCAACGAGCGGCGCTGGATCACAGCCCTTAGTAGGTTCAGGAGGAATATCACGATTGTAAATGCAACAGGGGTGAGTATCGAAATCGTGCAGAAAACATATGCAAATCGAGCTTTTGGCCGCTTCCTATGCATGTCAGCCAAGAACGCAGACCTTTTGACTTTACTACCTGGGGAACCTGAATTCACAGTTGGATTCACGTGCGAGAAGTACGGGGCAGATGAAGGGAAACGCGAAGAAAAACTCCAAGGTGATCCGTGGCTCAAGACGATGGTTGATTTATTGCAAGTTGAAGACATCGAAACCATCGAGGAAGCAAAGGAGATCATCGAGGATGAGTGGTGCAAAACGCACCTGCCACAATGCGAGCTCGAGGGTGTTAGGGCACGTTGGGTCCACAAGATACTTGCCAAAGAAAGCCGCGAGAAACGCATGGGACATCTTGTGTCTGAGCAATTCACTGACGAACATTCGAAACAGCCAGGGCACAGACTTACCAATGCCGCTGAACGTTTCGAAACCATTTACCCCAGACACAAAGCGGCCGACACTGTGACTTTTATCATGGCCGTGAGGAAGCGATTGCGTTTTTCACACCCTGTGAAAGAAGCTGCCAAACTGAACCAAGCACTACCATATGGCCCATTCCTACTGAAAGAATTCCTTGCACGCGTACCGCTTAAACCAGCGCATAATGCCAGGATGATGGCTGAGTCGAAGTTTGACTTTGAGGAAAAGAAAACAAGCAAGAGCGCAGCCATCATAGAGAATCACAGCAATCGGTCGATGCGCGAGTG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| 107,217
|
AM422452.2
|
Lily symptomless virus
|
Singh,A.K., Mahinghara,B.K., Hallan,V., Ram,R., Zaidi,A.A.
|
Singh A.K., Floriculture Division, Institute of Himalayan Bioresource Tech., PO.Box #6, Palampur, Distt. Kangra, Himachal Pradesh 176061
|
India
|
2007-01-10
|
India
|
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,394
|
GenBank
| 1
|
India:northern Himalayan Region
|
India
|
Lilium longiflorum
| null | null | null | null |
Lily symptomless virus complete genome, genomic RNA, isolate India
|
GGATTCACACTCCCGATAATAACTGTTAATAAACGACAAGTTCATAACAGTTACTAGATGGCCCTCACATACCGAAGTCCAGTCGAGGAAGTGTTGACTCTTTTCGAGCCCGCCGCCCAATCACTTGTAGCTGCAACTGCCACCGCAAGCTACCAACAAAACGAGAAGGATAATTTCGAGTGGTTCAACTTCCCCATGCCAGCAATCGCTAAGGAGCGCCTAAGCACTGCTGGGATATATTTGAGCCCATACTCCGGTTATCCTCATTCACACCCAGTGTGTAAAACACTGGAAAATTACATATTGTACAAAGTACTACCTAGTATTATCAATAACTCTTTTTATTTCGTAGGTATCAAACAATTTAAAATTAACTTTTTAAAAAAAAGGTTCAAGCATCTATCCTTGGTTCACGCAATAAATAGGTACGTAAGCAGCGCGGACAAGATAAGATATGGCAACGAATTCGTCGTACGGGCGAGTTCAGAAAGTAGGCTGCTAAAGCGGCATAGGAGCATCGAGCAGTCATGCACACTGTCCAGCCTAGTCCCCAATATTAAAACAGGCGCAAACTTGTTCCTCCACGACGAGCTGCATTACTGGAGCAAGGATGATATTATCGACTTTCTCGAGGTCTGCCAACCCGAGATAATGCTGGGCACTGTAGTGTACCCCACTGAGATCTTCGCTGGAGCGAAACACTCACTCAACCCATGGTGCTACGAGTTTGAAGTCAAGGGCAGAGTGCTGATCTATTATCCAGATGGGGTACGGAGTGAGGGGTACGAACAGCCAATTGACGGAGGCTATTTGTTGCAGGCAAATAGAATCCTACTGCCTAATGGCATCACTTACTGCGTTGATGTTATTGCAAGCAAGTTCTCACACCACCTCGTGAGCATAACCCGTGGGGACTTGGTTGTGCCTAAATACCGTTCATTTGGCCCATTTGACGCCGTCCGTGCACGTGGCGCAGCAGATATCGCGCGGAAGAACACACTTTTCTTCCCAGTGTCACATCTGACAATTCTGCGCGTCTACCGGTACTTACGCTCTTTGAAGAAACCTGATAAGCAGTCTGCCATGGCTAAATTTTCACAGTTATGCCATGATCCTTCTGGCGAGGCCATCAAATTCATGGAAGAGTTCAGTACACTGGTCATGGAGACGGACAACACTCGGACGGTCCTAAGGCCAGAACTCATTAAATCTTTCTTCGGGAACCTCGGCAGGAGGCTACCCTCCTGCTTTGCTGCCATGTTTGCTCGTACGTGTTCCATGTGCCTAGATGAGTTCATCACCTTTCTTGAGCCGCTGACCATTGACGTCACACTGCAGACTCTGAGCAAAAATTCTCTCTACTATGCGCTAATTGATCAGGGTGAGGCGGAATCTTTTGTAGACCCATTCGAGGAACTGGAGTGTGCTTGGGAGGGCCGCGATTCGTTCTTACTTGATCGGCCTTGCGCCAAATACGCCGGTCTGTTGCCGCTCACTGACTGCAAGGGCAAATGGGCCCTCCCGTTTAACATGGAGACACTACGCCATGGACTCTTGAAGCTATACATGGAAGCGTCCCAGAGCAGCTACACTGGGCGCAGTTGGACGATCCAGGATTATATCAACTCAATTCTGACCTACACAACAGTGATTGGGCGGGCATTTCTAAAGTCACTGACGCCCGAATTGCTCGATTGGCTGCAGTATAACGCCGATTGTCTTGAGCCCAAACCAGCCTTGTGGCATGACTGCGGTGTTCGTTGGTTCATACATGGCACACGCAACAGCGCTAAAATTGCTTTTCTTGAGTCGAGCGTACAAATTGATGCCAGGGCGCAGCACGAGTCCTGCGGGTACATGACTCCAGGAAGGACGAGGACCTTCAAGCTCATACCAACCTTAACGGATACTGAAATTTATACTTTCTATGAACCAGAAATTATCCGCCGCAGCCCACCACCACTTGAACCTTCAGGTGCACTGCAGGGCACACCTTCGACTGTTGGGAACACCGTAGCAGATTCTCCGCAACCGCCAATACCGATTGCCGGGGCTCTGACCTGCGATTGTGGCATTATCATGAATTTGAAAGACGTCCTTGGGCACACCGAGAGGATTGATGAGTTCACTGATAACCTCCGGGGACGCCAGGCAGCATGGTACTCCATAGATGGGCAGCCCTACAAATACAATGGTGGCGATCATGTGTCTAAAGGTTGGCCCAACTGGCTGCAAATGTGGATGGCATTGAATGGAGTGGACAAAAAGTACAACTGCATGCTCGCTCAGAAATACCAAGCAAATTCATGCCTTGGCTTCCACGCGGATGACGAAGCCCTTTTTGTTGCAGGAGAATCAATCCTCACAGTAAATATCACTGGGGAGGCCGACTTCAAAGTCACATGCCCCAACGGCGCAGGGGAATTAAGATTACAGGAAGCACAGATGTTTGAGATGCCTCCCGGCTTTCAGCAGACACATAAACACGCTGTGACCAACTGCACCGCAGGCAGAATTTCATATACATTCCGAGTCGCTACCACTATGGCGCCTGAACTACCAGTTGCACCTAGCGACGAAGAAGATAATGGGCGTATGGGTTACACCGATGGAGCCGTGGAGGTGAGTTACCAGCAGCTCGAAGGCGCAAACTTCCAGTATAGAATCATTAAGAATCAAGGCGGCGGTGATTGTTTTTGGCTGGCGCTCGAACATTACACCGGGGTGAAAACAAGGGATATGAAGAAAGCACTCCTAGCTGCTTGCAAACCTATCCCTGGGAGTGCGCTGGCCGAACAATTGAGACCAACCGTGTGGGCCAGCGATGAATCAATTAAAGCAGTGTGCACCCACCTGGGTTGGGACATAACGATTATTGATGAGATGCTAAATACTAAAGCTGTTTATATCAACCCGGGTAATGAAAATATGGCCATCATTCGACGCAAGCGCTGGCACTTTGAGGCTATTGAACCCCTCGCAGCATGCACAATCAAAGCGCTCGCATCTTGCTTAGATAGAAGGTTCACTGAGGTATCCAGCTTGCTATACAAAAGGCTGGGAACTGACTTCATGGACAATGCGCTCGCGGGCCAAGGGATGGAACTGGAAACTTTCCGGGAAATGCTGGTTGAACTGCAAATCTGCGCAGTAGTGGAGCAAGCCGGGGGCACAATAATACTGAATGATAAAGGACAAACCAAGGGTATCTTCAAATTCCTTGATGGTCATGCAGAGCATGTCAAGGAAGCAGCCTTTGCGCCCCATGAGCAATTAAATGTGTACAAGGCTGACTTAGAATGCACACCGGAAATGTACCTCCCCATACGTGAGGCCTGCACCGCGATGAGCTATACCCCAGACGTAGCACGCGCAACTTTATTAGCGAGTTGTCTCCTAAATGGCAGCACCGGAGTACTTTGTTCCGAATTGTTTAACGACAGAGGAACTCTCATGCCAACTGAACCATGCACGTCTGAGCGCGAGATGATGCTCCTGCTAGGGGTACCCGGGTGTGGTAAAAGCCGAGCTATCCGAGAAACACTGCCACGCGCACGAGGTCGCGCATTACTTTACATCACGCCAAGACGGGTCCTACTAGATGAATTTGAGGAGCATCTGAACTCCCTTAGGAAGCGGATGGGTGCAGGGGCTTGCAGGAACTTCAAAGCTCTGACCTTTGAGAAAGCACTGATTAATGGAGAAAAATTTTCACCCGGTGCTTTGGTGGTACTGGATGAGATCCAACTTTACCCACCTGGTTATCTAGACCTGCTGTGCTGTAGGCTCAATCCTACCATTCGCTTGGTACTACTCGGGGACCCCTGCCAGAGTGACTATGACTCAAAAAAAGATCGTAACGTGCTTGGGGCCATACCGTCAGACATACTGAACTTACTTGAAGGCACCAAGTATAAGTACAACGTTCTGAGTCGCCGCTTCCAAAGCGAGATATTCATCAGCAGACTCCCATGCACACTCCAGTCCAACCTCCAGTACAAAGGTTCTCTGAAGATCGTCGAAGGTCTTGATGCCATAGATTTGAGAGCAAGATCCTCTGAAGTCTGCTTGGTCTCATCCTTTGATGAGAAAAAAATTGCAACAGCTTACTTTGGAGTGCAGTGTAAAACTATGACTTTTGGCGAGAGCACTGGAGCCACTTTCACCACGGGTAGTATCTTGGTTACAAGTGTGTCACAACATACCAACGAGCGGCGCTGGATCGCAGCCCTTAGTAGGTTCAGGAGAAATATCACGATTGTAAATGCAACAGGGGTGAGTATCGAAATCGTGCAAAAAACATATGCAAATCGAGCTTTTGGCCGCTTCCTATGCATGTCAACCAAGAACTCAGACCTTTTGACTTTACTACCTGGGGAACCTGAATTCACAGTTGGATTCACCTGTGAGATGTACGGGGCAGATGAAGGGAAACGCGAAGAAAAACTCCATGGTAATCCGTGGCTCAAGACGATGGTTGATTTATTGCAAGTTGAAGACATCGAAACCATCGAGGAAGCAAAGGAGATCATCGAGGATGAATGGTGCAAAACGCACCTGCCACAATGCGAGCTCGAGGGTGTTAGGGCACGTTGGGTCCACAAGATACTAGCCAAAGAAAGCCGCGAGAAACGCATGGGACATCTTGTGTCTGAGCAATTCACTGACGAACATTCAAAACAGCCAGGGCACAGACTTACCAATGCCGCCGAACGTTTCGAAACCATTTACCCCAGACACAAAGCGGCCGACACTGTGACTTTTATCATGGCCGTGAGGAAGCGATTGCGTTTTTCACACCCTGTGAAAGAAGCCGCCAATCTAAACCAAGCACTACCATATGGCCCATGCCTACTGAAAGAATTCCTTGCACGCGTGCCGCTTAAACCAGCGCATAATGCCAGGGTGATGGCTGAGTCGAAGTTTGACTTTGAAGAAAAGAAAACAAGCAAGAGCGCAGCTATCATAGAGAATCACAGCAATCGGTCGATGCGCGAGTG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| 107,507
|
AJ516059.1
|
Lily symptomless virus
|
Choi,S.A., Ryu,K.H., Ryu,K.
|
Ryu K., Department of Horticultural Science, Plant Virus GenBank, Seoul Women's University, Seoul, 139-774
|
South Korea
|
2003-09-22
| null |
Lily symptomless virus
|
Carlavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,394
|
GenBank
| 1
|
South Korea
|
South Korea
| null | null | null | null | null |
Lily symptomless virus complete genome
|
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|
Lily virus X
|
Chen,J., Shi,Y.H., Adams,M.J., Chen,J.P.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-07-19
| null |
Lily virus X
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
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| 5,823
|
RefSeq
| 1
|
Netherlands
|
Netherlands
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Lily virus X, complete genome
|
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| 8,210
|
OM100017.1
|
Lily virus X
|
Wang,Z., Chen,Z., Gao,L., Li,S., Zhao,M., Chu,B.
|
Yunnan Agricultural University, Key Laboratory of Ministry of Education Agriculture Biodiversity for Plant Disease Management
|
China
|
2023-09-01
|
PP
|
Lily virus X
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 5,981
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Paris polyphylla var. yunnanensis
| null |
2019-06-04
| null | null |
Lily virus X isolate PP, complete genome
|
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| 13,139
|
OM311166.1
|
Lily virus X
|
Chen,L., Li,Y.
|
Beijing Forestry University, School of grassland science
|
China
|
2023-01-28
|
LVX/BJ
|
Lily virus X
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 5,823
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Lilium
| null |
2019-07
| null | null |
Lily virus X isolate LVX/BJ, complete genome
|
GAAAACTAAACGAAACAAATCGACTCGGCCAACCCGTAACGTACTCAAATCTAACTAAAGCCTGACACGTAATGGCTTTGATATCACAGGCCCTCGATAGATTCACAGACGTGTCCCTCAAGGCAGTGATCCAGGAGGAACAATTACAGAACCTCCGCACCACACTGCGCCAGGCGAACACCATCATGCCGTATGCTGCATCCACATCAGCAGCAACCGCTCTTGAATCCCTAGGGATACTGACGAACCCATACTCAGTATCTCTCCACACCCATGCCGCCTGTAAAGCCATCGAAAACCAACTGCTGGCAATCGTTGGCCGACTACTCCCGCAAAGTCCTGTCACCTTCTACTTCCTAAAGCGTTCCAAACTCAACGCTCTAGGTCGAAACCCTCGGCTCAAAGACGTCTTTAACAACGCCACCATTGAGCCCCGCGACTTTGCCCGCTACGAGCCAGATACCCTTCGGGAACACCTCGTAGCCCCGACCACGCCCATCGTATACATATCCGACACTCTCCACTTTTTACCGATGAGCTTCGTGGCCTCACTTTTCGCCCACAACCCGGTGGTACAAACCCTATACGCCACCGTGGTACTTCCTCCAGAGGCCCTGTACAAGCATCCAACGCAACTGCCGGACATATACTCTATCAATTATGATTACGGCGGCTTCCAGTACATCCCTGGAGCTCATGGTGGGGGAGCCTACCACCATGAATTCTCGACTTTAGATTGGCTCAAGGTCGGGCACATACTCAATAAAGGGAGTGGTGAGTATGTGACTTGTCAGATGATAGAGTCCCTTGGGGCCAATCATCTGATGGTTTTTAGGCGTGGGAAACTCCTCACTCCCAGGGTGAGGACATTCCGGAAAGACGAGTACGTGCTACTCCCCAAACTTTTCCACCCTAAGCAAGCCAACTCTTCCAAGCCCATAGCTATGACCTTCGCTATGCAATTACTTCTATACGTGAAGAGTATCAAAGAGGTCACCTTCCGCGACGTCTGCGCGAAAATCAGGCAGCTCATACCCACTTCTGAGCTCCACAGACATCAACCCGACGAAATAATTCACATAGCGAATTTTTTCTACTTCGTCGGGCACCGAGATGCCATCTGCCACAACCATCATCTTATGGACGATGGCATCATCACGCAAGGATTCCACGAAATCATGGCTAGAGTCAAGACGGTCTGGGAGAAGGTCTTCGGCAGATCACACTTCTCCCAGGTCATCGCCCTACTAGAGTGGAAGACCTTCACCTACTCCATTGAGCCCGAAACCTTCACTGTAGATGACAAGAATCCGTTGGCTCAACTTACTAATGGAGAGGCCGACCCATGGCAACTTCCCACGGTGGATGACGTTGGCGACAACGGGGATGATGAGGTGGAGCTGATTGAGAAGCTTCCGTGCGCGCCCACGACGACTCCAGTGGCACCGGCCACAACCACGGGCGACGAACTCCCTTGGTCCCAATGTGCACACATACTGCAGTCATGCGGTTTCCGAGGGGGACAACGGCAGGACAAAGATGGGGAATTGATATACCCCATTGAGTCCATACTCCAGCTGCCAAATGAACCATGCCCAAAAGCCCCAGCTGGTTTAATAAGCAAGTTAGAGAGCTTGCGCCGCCACGCCGTGCTAGTGACTCTCTCTCCCGCACGCGGCCATGCCTTCGCCTCTGACGTTAAAAACAATAGGATAGGCATGTGCACGCGTAATGAGTCTACCGAGTGGAAGAAAAACTTCGACACTCGTGTTGAACTCGGCCAACGCACCATTCCCGTGATTGTCATCCACGGTGCGGGTGGCTCTGGAAAGTCCTATGCCATTCAGGACTTTCTACGTACCCAATCTCACGGGTATGATAAGGGGGGCTTGGTGCTGCCCACCGTGAAGCTTAGGACCGATTGGATGGCCAAGATACCGAAAATGTCTGAAAGACATTTCCGGACCTATGAGAAGGCCCTCATCCAGCACTCGCCCGGCACTGTGGTCATGGACGACTACACTAAACTGCCTGCCGGATACATTGAGGCGTTCTGCTTATTCCACCCAGAGGTCCACACCCTGATACTTACCGGGGACCCTAAGCAGACATCACACCACGAGACGAACGACCAGGCTCTCATAGCACATCTAGAGCCTGCCCACGTCGTGTTCTCGTCACACTGTAGATACTACCTGAACGCCACCCATCGCAACCGCCAAGACTTGGCGAACATGCTAGGCGTCTACAGTGAAACCAGTGGGGTGACTCGCATCACCTGCTCCTCACTGGTCATGGGAGGGTGGCCCATTATCGCGCCATCCTTGGCAAAGAAAACCTGCCTTACTGAGTTGGGCCATCGCGCTTACTCATACGCAGGTTGTCAAGGACTCACCACCCCCTCTGTGCAGGTGTTGCTGGACAACAACACCCCCCTTTGCTCCCCTGCTGCCATGTACACGACACTATCCCGGGCCCGGGACGCCATTCATTTCATCAACACGGGCCCCGACTCTAGGGAACAGTGGGCAAAGCTGGATGCCACCCCGTACCTCAAAACGTTCTTAGACCTGGCGAGGGGTGTGGCCGCACAGAGAGTAACTCCACCAGCAGCGTCTGAACCCGCCCCAGTCCCACCACCAGTCACCCACTTCCCAGTGGAAAATAGGGACATGCTGCTGGAGCCACTGATTGCCCAACTGCCTGACAAGTACGACCGTGAGCTACGTGACTCACGCCATGGCTACACCAATGCCATTCAGACTGATGACACAGTCGTACAACTCTTCCAGCACCAGCAGGCTAAAGATGAGGCCCTACTGTTCCAAACTATAGAGGCCCGGATCAAGCTGGCCACACCAGCTGATAACGAGAAAGAAATGCTTATGAAACGGGACATTGGGGACATACTGTTCCTCAATTACCAAAAGGCCATGAAACTGCCCGTCGAGCCAATTCCTTTCTCCAAAGAATTGTGGCAAGCATGCCGTGAGGAGGTCCAGGACAAATACCTGCAGAAACCCTTAGCCAACCTCATTAACGGCAAAGACCGCCAGTCCCCCGATTTTCCTAAAGACAAGATAGCGCTCTTCCTGAAATCACAATGGGTTAAAAAGACTGAGAAAATCGGGGCCATCAAAGTTAAACCTGGACAGACTATCGCGTCTTTCATGCAGGACACTGTCATGGTCTATGGCACCATGGCAAGATACATGAGACGCATTCGCAGGGCTTATCAACCTGATAATATCTTCATCACCTGCGAGAATACACCTGAAGAGCTCAATGAGTGGGCTATGGAGAAGTGGTGCTTCAGGGGAAATGCCCACTCCAACGATTTCACCGCCTTCGATCAATCTCAGGACGGAGCGATGCTCCAATTTGAAGTGCTGAAGGCGAAACATCACTGCATACCGCCAGACATCATTGAGTCTTATATCATGCTCAAGACCAATGCGCACATCTTTCTGGGCACTATCGCTATAATGCGGATGTCAGGCGAAGGACCCACCTTTGACGCCAACACGGAATGTGCCATCGCTTACCACCACACAAAATACCAGGTGGAGCAGGGCACCGCCCAACTCTATGCGGGCGACGACATGGCTCAGGACACAGCACCGATCCTTAAGCCATCCTTTAGACTTATCGCTGACAGGATCGAGCTGAAGTCTAAAGAGGTCACCCATACGCAAGTTCCTGGGGAGTACGCCACCTTCTGCGGGTGGTGCATTACACCTAAGGGTATCATCAAAGAACCCAGGAAACTCTTTGCCTCACTCCAACTGGCTAAGCACATTGGCAAGACTGCAGAAGTCAAAACAAATTACGCCCATGACTTGGCCCATGCTTACCGCCTCGGAGATGAGCTGCAAGATGTCCTCACCCCTGATGAGGCCGCCTTCCACCAAGCTACTGTCAGAGACTTGGTGACCATGGGAGGCGTCGACTTCCAATGGCACCCCTAAAGAAGGGGTTAAGTTACCGCTGATTTTGAATGGAGTTTTGCGGCGGTACACTACGAACTCGTTTCCAGCGCACCAGTGTTCCTAATTCACCTGTCACTGTCGTGCACACCGTAGCTGGAAGCGGAAAAACCACATTCATCAGGAACCTCCTGATTGACCATCCACAACTAGTGCGCGGACTACGCACCCCAGAAGTACCTAATCTTCTAGGTTACGGCATCCGCGATTGTCACGGTGACGCTCACATCGTCGACGAGTATCCTGCTGCAGACTTGAGGTCACACCCATCTGTCTCAATTGTCTTTGCTGACCCACTGCAGCATCACGGCGAGGCCAGGCCCGCCCATTTCACCTGCTCTCACACGCACAGGTTCGGCAAGTCCACTTGTTCGTTACTCGGCACCCTCGGAGTTTACTGCACATCTGATAAAGAGGACTCTGTCACTTTCGCCGGGGCATATCTCGCCGAGCCTGTGGGCACTTTAATTGCGTTAGGTGAAGACGCTGAGCTCGTACTCGACAACCACAGAGTCGAGTATCTTACCCCGTGTCAAGCGCTAGGCTTAACTTTCCCGTCTGTTACCTTGTTAACAGACGCACCTATCGAAGACCAACCACCCGTCTCTCGGTACATTGCCTTGACACGGCACACTGATTCACTGCTGATTCTCAACTGATGCCTCTCACCCCACCACCAGACTACACAAAACAAAAGCCTTTATTGCAGTCGTGTTGGAGGCACTCTAGCAGCTTTTGTACGTTACTCACGGGCAACACCCTCCCACACACAGGAGACAATTTACACAGTCTGCCTCACGGAGGAACCTATTGCGACGGTACGAAACGAATCAGGTACGGCGGTCCACACCGCTCACACGTCCCAGAACTACCCGCCAAGTCCTGGGCCCTCATCACCGTCGTGGCTATACTCATCGCCCTACATTTTAGCTGCCTACGCACTCATCGCGTTCACCGCTGTGTGTTATGTCACACAACCAGCGGCTGAAACGTGCTACATTGAGGTAACTGGGC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| 19,008
|
LC335818.1
|
Lily virus X
|
Nijo,T., Okano,Y., Kondo,M., Okuhara,H., Sekimura,H., Fujimoto,Y., Hosoe,N., Maejima,K., Yamaji,Y., Namba,S., Hashimoto,M.
|
Graduate School of Agricultural and Life Sciences; 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8657
|
Japan
|
2017-11-21
|
J
|
Lily virus X
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 5,824
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Lilium
| null |
2016
| null | null |
Lily virus X isolate J genomic RNA, complete genome
|
GAAAACTAAACGAAACAAATCGACTCGGCCAACCCGTAACGTACTCAAATCTCCCACGAGCTAGACTACGTAATGGCTTTGATATCACAGGCCCTCGATAGATTCACAGACGTGTCCCTCAAGGCAGTGATCCAGGAGGAACAATTACAGAACCTCCGCACCACACTGCGCCAGGCGAACACCATCATGCCGTATGCTGCATCCACATCAGCAGCAACCGCTCTTGAATCCCTAGGGATACTGACGAACCCATACTCAGTATCTCTCCACACCCATGCCGCCTGTAAAGCCATCGAAAACCAGTTGCTGGCAATCGTTGGCCGACTACTCCCGCAAAGTCCTGTCACCTTCTACTTCCTAAAGCGTTCCAAACTCAACGCTCTAGGTCGAAACCCTCGGCTCAAAGACGTCTTTAACAACGCCACCATTGAGCCCCGCGACTTTGCCCGCTACGAGCCAGATACCCTTCGGGAACACCTCGTAGCCCCGACCACGCCCATCGTATACATATCCGACACTCTCCACTTTTTACCGATGAGCTTCGTAGCCTCACTTTTCGCCCACAACCCGGTGGTACAAACCCTATACGCCACCGTGGTACTTCCTCCAGAGGCCCTGTACAAGCATCCAACGCAACTGCCGGACATATACTCTATCAATTATGATTACGGCGGCTTCCAGTACATCCCTGGAGCTCATGGTGGGGGAGCCTACCACCATGAATTCTCGACTTTAGATTGGCTCAAGGTCGGGCACATACTCAATAAAGGGAGTGGTGAGTATGTGACTTGTCAGATGATAGAGTCCCTTGGGGCCAATCATCTGATGGTTTTTAGGCGTGGGAAACTCCTCACTCCCAGGGTGAGGACATTCCGGAAAGACGAGTACGTGCTACTCCCCAAACTTTTCCACCCTAAGCAAGCCAACTCTTCCAAGCCCATAGCTATGACCTTCGCTATGCAATTACTTCTATACGTGAAGAGTATCAAAGAGGTCACCTTCCGCGACGTCTGCGCGAAAATCAGGCAGCTCATACCCACTTCTGAGCTCCACAGACATCAACCCGACGAAATAATTCACATAGCGAATTTTTTCTACTTCGTCGGGCACCGAGATGCCATCTGCCACAACCATCATCTTATGGACGATGGCATCATCACGCAAGGATTCCACGAGATCATGGCTAGAGTCAAGACGGTCTGGGAGAAGGTCTTCGGCAGATCACACTTCTCCCAGGTCATCGCCCTACTAGAGTGGAAGACCTTCACCTACTCCATTGAGCCCGAAACCTTCACTGTAGATGACAAGAATCCGTTGGCTCAACTTACTAATGGAGAGGCCGACCCATGGCAACTTCCCACGGTGGATGACGTCGGCGACAACGGGGATGATGAGGTGGAGCTGATTGAGAAGCTTCCGTGCGCGCCCACGACGACTCCAGTGGCACCGGCCACAACCACGGGCGACGAACTCCCTTGGTCCCAATGTGCACACATACTGCAGTCATGCGGTTTCCGAGGGGACCAACGGCAGTACAAAGATGGGGAATTGATATACCCCATTGAGTCCATACTCCAGCTGCCAAATGAACCATGCCCAAAAGCCCCAGCTGGTTTAATAAGCAAGTTAGAGAGCTTGCGCCGCCACGCCGTGCTAGTGACTCTCTCTCCCGCACGCGGCCATGCCTTCGCCTCTGACGTTAAAAACAATAGGATAGGCATGTGCACGCGTAATGAGTCTACCGAGTGGAAGAAAAACTTCGACACTCGTGTTGAACTCGGCCAACGCACCATTCCCGTGGTTGTCATCCACGGTGCGGGTGGCTCTGGAAAGTCCTATGCCATTCAGGACTTTCTACGTACCCAACCTCACGGGTATGATAAGGTGGGCTTGGTGCTGCCCACCGTGGAGCTGAGGGCTGATTGGATGGCCAAGATACCGAAAATGTCTGAAAGACATTTCCGGACCTATGAGAAGGCCCTCATCCAGCACTCGCCCGGCACTGTGGTCATGGACGACTACACTAAACTGCCTGCCGGATACATTGAGGCGTTCTGCTTATTCCACCCAGAGGTCCACACCCTGATACTTACCGGGGACCCTAAGCAGACATCACACCACGAGACGAACGACCAGGCTCTCATAGCACATCTAGAGCCTGCCCACGTCGTGTTCTCGCCACACTGTAGATATTATCTGAACGCCACCCATCGCAACCGCCAAGACTTGGCGAACATGCTAGGCGTCTACAGTGAAACCAGTGGGGTGACTCGCATCACCTGCTCCTCACTGGTCATGGGAGGGTGGCCCATTATCGCGCCATCCTTGGCAAAGAAAACTTGCCTTACTGAGTTGGGCCATCGCGCTTACTCATACGCAGGTTGTCAAGGACTCACCACCCCCTCTGTGCAGGTGTTGCTGGACAACAACACCCCCCTTTGCTCCCCTGCTGCCATGTACACGACACTATCCCGGGCCCGGGACGCCATTCATTTCATCAACACGGGCCCGGACTCTAGGGAACAGTGGGCAAAGCTGGATGCCACCCCGTACCTCAAAACGTTCTTAGACCTGGCGAGGGGTGTGGCCGCACAGAGAGTAACTCCACCAGCAGCGTCTGAACCCGCCCCAGTCCCACCGCCAGTCACCCACTTCCCAGTGGAAAATAGGGACATGCTGCTGGAGCCACTGATTGCCCAACTGCCTGACAAGTACGACCGTGAGCTACGTGACTCACGCCATGGCTACACCAATGCCATTCAGACTGATGACACAGTCGTACAACTCTTCCAGCACCAGCAGGCTAAAGATGAGGCCCTACTGTTCCAAACTATAGAGGCCCGGATCAAGCTGGCTACACCAGCTGATAACGAGAAAGAAATGCTTATGAAACGGGACATTGGGGACATACTGTTCCTCAATTACCAAAAGGCCATGAAACTGCCCGTCGAGCCAATTCCTTTCTCCAAAGAATTGTGGCAAGCATGCCGTGAGGAGGTCCAGGACAAATACCTGCAGAAACCCTTAGCCAACCTCATTAACGGCAAAGACCGCCAGTCCCCCGATTTTCCTAAAGACAAGGTAGCGCTCTTCCTGAAATCACAATGGGTTAAAAAGACTGAGAAAATCGGGGCCATCAAAGTTAAACCTGGACAGACTATCGCGTCTTTCATGCAGGACACTGTCATGGTCTATGGCACCATGGCAAGATACATGAGACGCATTCGCAGGGCTTATCAACCTGATAATATCTTCATTACCTGCGAGAATACACCTGAAGAGCTCAATGAGTGGGCTATGGAGAAGTGGTGCTTCAGGGGAAATGCCCACTCCAACGATTTCACCGCCTTCGACCAATCTCAGGACGGAGCGATGCTCCAATTTGAAGTGCTGAAGGCGAAACATCACTGCATACCGCCAGACATCATTGAGTCTTATATCATGCTCAAGACCAATGCGCACATCTTTCTGGGCACTATCGCTATAATGCGGATGTCAGGCGAAGGACCCACCTTTGACGCCAACACGGAATGTGCCATCGCTTACCACCACACAAAATACCAGGTGGAGCAGGGCACCGCCCAACTCTATGCGGGCGACGACATGGCTCAGGACACAACACCGATCCTTAAGCCATCCTTTAGACTTATCGCTGACAGGATCGAGCTGAAGTCTAAAGAGGTCACCCATACGCAAGTTCCTGGGGAGTACGCCACCTTCTGCGGGTGGTGCATTACACCTAAGGGTATCATTAAAGAACCCAGGAAACTCTTTGCCTCACTCCAACTGGCTAAGCACATTGGCAAGACTGCAGAAGTCAAAACAAATTACGCCCATGACTTGGCCCATGCATACCGCCTCGGAGATGAGCTGCAAGATGTCCTCACCCCTGATGAGGCCGCCTTCCACCAAGCTACTGTCAGAGACTTGGTGACCATGGGAGGCGTCGACTTCCAATGGCACCCCTAAAGAAGGGGTTAAGTTACCGCCGATTTTGAATGGAGTTTTGCGGCGGTACACTACGAACTCGTTTCCAGCGCACCAGTGTTCCTAATTCACCTGTCACTGTCGTGCACACCGTAGCTGGAAGCGGAAAAACCACATTCATCAGGAACCTCCTGATTGACCATCCACAACTAGTTGCGCGGACTTACGGCACCCCAGACGTACCTAATCTTCTAGGTTACGGCATCCGCGACCGTCACGGTGACGCTCACATCGTCGACGAGTATCCTGCTGCAGACTTGAGGTCACACCCATCTGTCTCAATTGTCTTTGCTGACCCACTGCAGCATCACGGCGAGGCCAGGCCCGCCCATTTCACCTGCTCTCACACGCACAGGTTCGGCAAGTCCACTTGTTCGTTACTCGGCACCCTCGGAGTTTACTGCACATCTGATAAAGAGGACTCTGTCACTTTCGCCGGGGCATATCTCGCCGAGCCTGTGGGCACTTTAATTGCGTTAGGTGAAGACGCTGAGCTCGTACTCGACAACCACAGAGTCGAGTATCTTACCCCGTGTCAAGCGCTAGGCTTAACTTTCCCGTCTGTTACCTTGTTAACAGACGCACCTATCGAAGACCAACCACCCGTCTCTCGGTACATTGCCTTGACACGGCACACTGATTCACTGCTGATTCTCAACTGATGCCTCTCACCCCACCACCAGACTACACAAAGCCTTTTATTGCAGTTGTGGTTGGAGGCACTCTAGCAGCTTTCGTACTGTTACTCACGCGCAACACCCTCCCACACACAGGAGACAATTTACACAGTCTGCCTTACGGAGGAACCTATTGCGACGGTACGAAACGAATCAGGTACGGCGGTCCACACCGCTCACACGTCCCAGAACTACCCGCCAAGTCCTGGGCCCTCATCACCGTCGTGGCTATACTCATCGCCCTACATTTTAGCTGCCTACGCACTCATCGCGTTCACCGCTGTGTGTTATGTCACACAACCAGCGGCTGAAACGTGCTACATTGAGGTAACTGGG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| 73,636
|
AJ633822.2
|
Lily virus X
|
Chen,J., Shi,Y.H., Adams,M.J., Chen,J.P.
|
Adams M.J., Plant Pathogen Interactions Division, Rothamsted Research, Harpenden, Herts, AL5 2JQ
|
United Kingdom
|
2005-07-05
| null |
Lily virus X
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 5,823
|
GenBank
| 1
|
Netherlands
|
Netherlands
| null | null | null | null | null |
Lily virus X complete genome, genomic RNA
|
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| 108,911
|
NC_001836.1
|
Little cherry virus 1
|
Jelkmann,W., Fechtner,B., Agranovsky,A.A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1997-09-12
| null |
Little cherry virus 1
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,934
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Little cherry virus 1, complete genome
|
CGTTTTTATCTCCCAGCTTTGTGCCTAAGAGATATTAAATCAAAATTTTACTTTTCAGCAACTTTCCTTTCCAGCAATGGCCTTTCTATTTTCAAATGTTGTCGAAGTTACCCTTTTTACCTGCATTTCACCAAACATAAAAATATCAAAAACAAAAGTTCCTACACCTGAATACCTAAAGCTGATGAAACGCGAGATCGAAAAATCTCTTGCATTAGCTAACGCTCGTTCTTCACCCAGAATCAGCGTTCCTGTTGCCGGTCCCATCACCCCCACTGCTATGATGACATTCTCTGAGTCTTCTGATATCAGCAGTCGTCTTATCGGAAAACTTCCCAAATTCATTCTGAAGAACTCGCGGGAAGCTGTTCTTGATAAACAAATGCATTTGACCAGGAATCCTGAAAATGCTACTGGGTTTTTCAAATGCCTGCCCAAACTTGCATCGAAGCCGACCTCAACCATTCGTTCTAAGACTCCTGCTGTTCGTACAGCAAAACTGTCTTTTAACGATGTTTTCTCTGATGCTGGGTCAATCAACAAACCAGCTGTGTCCAAACTTGAGTTGTCTGCTCAATTGGCTGCTCTATTCTCACCTGAGGCTAGAGTTGGTGCTGCGCCGGTTCAACAATCTAGCTTGCACTGGACTCTCAACGCTGACATCATCAGATCCAATCTTCCACGAGGGTTGGTTTGTGAGATTTATGTTTCTGAAAACTTGAACAAGCTCTTAATCAAGCTTGTCTCCAGCTTTGATAAGAATTTCCCCGAACTCTTAATAGCTGAAGTCAATATTCCCAAACCTAACAATTCTGGTAAAGTGCACCCTACTGTTAATTTTGTTATCGCACCTTCGGCAGGAGTCGATTCAAAATTGCCTAGGTCATATTATCTCTACAACCCACATGGCCATTTTGAATCTCTCCTGTCCTTCTTGATTATTCACAACACTCGTCCTTTTGAGGACATTGTTGATGCTCTGAATTTGTTCAAACCTGATAGGTTCCATCTCGCATTACATTACAGGGACTTTTGCATCAACCACCTAATCGATGTTGGGAACAACATCCTGTTCAACTCCGGACGTACGCTTCGTCGTCCTGCGTCTACTGGTTATGTTCGTAAACCAGTTTTACGCGCACATCAGGCTGCTCAGACTGCAAAAATTTTCAGTTCATTCTCTGAATTTTCTATTGCCTTGGAGAAGCAAAAAGCAGCATCCACGGCATCAGCCATTAAATTTGGTGATTTCGAAGTTTTTGACTTGAGAGAACCTGATAATGTTATCAAGTCATACGCTCAGGCTCTGACTTCAAACTTGCCTGTTGACGATCGGATATTGAAATTGAACATCCCTGTTTCGTCCGAAGTTAAGACTGAGTGCCCATCGACCATGAATCCGTCTAATCCGAAATCTGAAATTGCTAAGCGAGCGGTTGAGCTGTCTTCTCGCGCGACTAGTGATTCGTCTGGTGAGATTTATTCAAAAACTTTTAATCAACTACTGAATATTCCAACTGGTGGGACTATAATAAGACATTTCATCAATGGTGTCTGCAGGTCATTTACTCTTAACCGCAGCGATGGGCGTGTTTTTAACATTCTCAACAATAGAAATGCTGCTAAGATTATGTTCAATCTCTCGCTGAAACATAAGAAATTTTATGTTGACGGCTATTGCAGAACACCATCTGGAAAATTATTTTCTGAGTATGATAACGGATTCTGTTGGTTACAAGCTTTCGCGATGTTTGGGAAGATCATACCCACTTTCGTTGAATTTATCCCCAACTTGAATGTTAGTTGCTTACTTCAGGCTGGTTTACCAAAGTCTTGCTTGAAATATATGCATAAGACCGGTAACGCTTTGTATCATTTCGACCCTAACAAGATCAATAATATATATCATGCAAACCTCAACTTTCTAGTTGGGTCTGCAATGAACGAAAACAAAGATATATTGGAATCAGATAATATTGACCTGATAGTGGAGGGTTTTACAAAGCAAGTCATCGCTAAAGCCTATCCAAAATCTGATAATCAAGCAGTTACCAATATATTGAACCGTGTAGGTTGCCGTATAAACACTTGGTGTGATAGGAAGAATGATTTAATGATATTTGTTCATCTGAGTACCAGGCAGAAGAAAATCGTTTGCGATCTATTTCCTCATTTAAAATTTGAATTCAAAGAGACAACCCAAAGTAGTCACCCAGTTTTCAATGTTGTTAGAACAGTCTCTAACTTTGTTCTTTACAAAATGCAGGAAGGTCGACATTTTGTCGATTTTGGTGGCAATATTGGTACTGTGATCAATTCTGAATGCGATGATGTTCATATCTGTAACCCTGTTGCAGATTCACGTGACGCTAAAAGACATGTTGATAATGGTTTATTTCTGGCTAAGAGTGTTGGAGTCTCCAATAACATTTCAGTCTGCAATAAACTGGCTCAACACTGCAATCACAAGTCTGATCGCGCTGTTATGGTTGAAGTTTACGATATGACTCTCACTGAAATGTGTCAAGCCATGTTGGCACATGGAACTATCAGATTAGACTTTATATTGTTATTACCTGGTGACCTTCTTGAGGATTTCAATACAATAACAATTTTCGACGGTGGTTGTAAGATCACGAAAGATGATGACAAGGTTTATTACTATTACGGTGATGCTGCAGAAGCATATACCCACGACCTGAACAATCTCCGTAATATTATGACTGATAATCTTGTTTGTGTTGATGGTACAGCCTTCAAGAAAACTTTGGAAACTAGTTACGGTCCATTTCGTCATTTCTCATTAACCAAGTTGGAAACCTTTCCTAGTGGTAAAATTGAATTTCTTACCATGTATGATAAGTGTGAGAAGAATAAGATGTTAGTCAAAGTGCCGATGAGAAATATCAATGGTATGGTGACTTTGCATGATTTGATCGTAGACCGCTCAATGTTGATGAATTTAATAGAATATTGCGCAAATTGTGTTGAAAATTTTAACAGGAAAGGCTTTGAGCATATAATGTCTCAGTATCGTTCTAGGAAGAACTATGTCATTTACAATGGCAAAGTGATCCACGATCAAGTTGATATTCCTTTAGATTTACTCCCTGGATTTATTGGAGTTTGTCTATCAGAGGGAATCCGTCTGGCTGAGAAAGTTCACTACTTAGCGAAGTATTCCTACTATCAATACTATGCTCCCGGAATTTTTAATTGTATGATTTATAGCATTCGTCAATTATTCTTACGCTTCAAGACTGTTTGCTATGAGAAAGTCCTAGATTTAATGGATTTTTTATTTGGAGAATGGATCACTACAACAGCACGTAACTCTGGGACAAAAATATTCGATATCTCAGCTTCCGTAGTGGTTAAGCAAAGTTTATTGATTAGTGCAGACGGGGATGTCCATTCTATCTTTACAGAGAACTTTGAAAAATATCAACAAAGGTGTGCAGATCTAGAGCAGCATGCTTCCGAATATGATACCGCGTCAGAATTATCCGACGCAATCGACAGTGGAGGCATGGGTGTCTCTGACTTAAAAATTTTTGAGAAATTCATTACAAAATTAGCTGAATTAGGTTTTGGAGAGCGAAATGTCTTAAGATTTTCAGCTAAGCTGTACTCTTGTTTCGATTGGTTGCGACGTCAATCCAATAACGATTCTGTTCTTCGGAGAGTCATTGGCTACTTCAAGTCTTTATTTTCACTCTCTACTCTGAAGAATATTTTAATTTCTCCTTATCTTCTAATTAAGTGGATCTGCGATTGTGGGAAAGCTAGCTTTAAGACGTTCGTTTCAGGATTATTGAATGTTTTTCAAACATTTTCGGATAGAATAAATTTTTTAGTAAAGATTGCATTAGACTCTGATGAAGATTTCCAAAATGAGGTTGTTGCAGCCTTTAGAAATCATGATTTAGAAGCTTTTGACGATACCGTTGGCAAGGTGTTTACAAAAAATTTTGATGTCGTTGTGTCTGATGACTTCACTAAGAAGAAGATCATATCAATCATTGAAGATGAACTCAGCTATGAACGAGGCATTGATGTCGACGTTCAAGATGTCAAAAAGGAGATTCTAGAAATAGCCAGTTCTGCAGACACTCCAACAATAACTAAAGTGAATAACTTGGGCCACTTGGATGATGCATTAGAGAATGACGTCAGGCATTTAGTTCTTGACATTCAACTCAGGAAAGAAGTGTTGAGGATGGTTGACGAAGACCTTAATGAAGCTTTAGAATCAGGTGGTGCGGGCAAATCGAAGTTATGTGATAAGATTTTTAACTATATCTTAGATCGCTTAAACTTATTTAAGCATTACATCACATCTAAGTTTGGATGGGATTTTTATGATATTTTGCATGAATCTTTCGAGGAAGTTAAAGTGCGGAAGTCCGCCATCCTATGTGCTTATCATGATGATTTGTCAGACATTTATACTGACAATGGTTTGGTTTTAAAACCCTTGAATAAGTCAGCTCGCGAAGTTCTTTATGCCCGACTGATTGCTAAGATGAAGTTTATTTACAGGAACTTTATGACAACTTTTATCCCCAGCATGCGATTTCTGAGTGGGATAAAAAATAAAATTATGTCTCACATTTGTGACGCTGAAAAGAGGCAAGCTATCTTTGACAAATGTTTAGATGCCACTCTAACTGTGTCATGCACTGCTACAGCTCAACTTTTTGGAGGGAATTTCTGTCTTATTAGATTGATACTTTCACCTATTTTAAGTGCTTACCTTAAGAAATCTTGGACATATTATTTTGGCGAACATGATGGTATTATCAGTACTATTATTGCTTCGACTTTATTAGGTGGTGGGAATTATAGTGTTAATAAAATGGCAATAGTTTCTGGTTCATACTTCCATTTCAAGCCTTACTTTTGCAATAAGGCAATGAAGTATAATTCTTTCAAGCAATACGTTACAGATTATATTGCTCGTCACAACTTTTTTACAACGGCAAAAACAACAGTTGGTT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| 8,849
|
OR519885.1
|
Little cherry virus 1
|
Alizadeh Arimi,F., Shams-bakhsh,M., Yadollahi,A., Salami,S.A., ghorbani,A.
|
Plant Pathology Department, Tarbiat Modares
|
Iran
|
2023-10-25
|
sh31
|
Little cherry virus 1
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,933
|
GenBank
| null |
Iran
|
Iran
|
Prunus dulcis
| null |
2020
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate sh31, complete genome
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| 11,578
|
OR260412.1
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Little cherry virus 1
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Chirkov,S., Sheveleva,A., Sharko,F., Tsygankova,S.
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Lomonosov Moscow State University, Virology
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Russia
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2023-08-29
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Stepnoe
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,930
|
GenBank
| null |
Russia
|
Russia
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Prunus
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plant leaf
|
2020
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate Stepnoe, complete genome
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| 13,222
|
MZ570904.1
|
Little cherry virus 1
|
Safarova,D., Lemberk,J., Navratil,M.
|
Palacky University, Olomouc, Dept. of Cell Biology and Genetics, Faculty of Science
|
Czech Republic
|
2022-10-25
|
Alm138
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Little cherry virus 1
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,878
|
GenBank
| null |
Czech Republic: South Moravia
|
Czech Republic
|
Prunus dulcis
| null |
2019-05
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate Alm138, complete genome
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| 22,691
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MZ291927.1
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Little cherry virus 1
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Phelan,J., Boyes,I., Rott,M.
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Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
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Canada
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2021-10-11
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19SP003A
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,937
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GenBank
| null | null | null | null | null |
2019
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate 19SP003A, complete genome
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| 37,317
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MZ291928.1
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Little cherry virus 1
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Phelan,J., Boyes,I., Rott,M.
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Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
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Canada
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2021-10-11
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19SP003B
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,920
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GenBank
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2019
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Little cherry virus 1 isolate 19SP003B, complete genome
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| 37,318
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MZ291929.1
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Little cherry virus 1
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Phelan,J., Boyes,I., Rott,M.
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Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
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Canada
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2021-10-11
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19SP003C
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,929
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GenBank
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2019
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Little cherry virus 1 isolate 19SP003C, complete genome
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| 37,319
|
MN242215.1
|
Little cherry virus 1
|
Safarova,D., Sevcikova,V., Neumanova,K., Sucha,J., Necas,T., Navratil,M.
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Palacky University, Dept. of Cell Biology and Genetics, Faculty of Science
|
Czech Republic
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2020-07-22
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Apr153
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,927
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GenBank
| null |
Czech Republic: South Moravia
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Czech Republic
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Prunus armeniaca
| null |
2017
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate Apr153, complete genome
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| 48,250
|
MN242216.1
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Little cherry virus 1
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Safarova,D., Sevcikova,V., Neumanova,K., Sucha,J., Necas,T., Navratil,M.
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Palacky University, Dept. of Cell Biology and Genetics, Faculty of Science
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Czech Republic
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2020-07-22
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Apr156
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,927
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GenBank
| null |
Czech Republic: South Moravia
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Czech Republic
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Prunus armeniaca
| null |
2017
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate Apr156, complete genome
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| 48,251
|
MN242217.1
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Little cherry virus 1
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Safarova,D., Sevcikova,V., Neumanova,K., Sucha,J., Necas,T., Navratil,M.
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Palacky University, Dept. of Cell Biology and Genetics, Faculty of Science
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Czech Republic
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2020-07-22
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Apr161
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,927
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GenBank
| null |
Czech Republic: South Moravia
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Czech Republic
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Prunus armeniaca
| null |
2017
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate Apr161, complete genome
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| 48,252
|
MN242218.1
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Little cherry virus 1
|
Safarova,D., Sevcikova,V., Neumanova,K., Sucha,J., Necas,T., Navratil,M.
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Palacky University, Dept. of Cell Biology and Genetics, Faculty of Science
|
Czech Republic
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2020-07-22
|
Apr172
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,927
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GenBank
| null |
Czech Republic: South Moravia
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Czech Republic
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Prunus armeniaca
| null |
2017
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate Apr172, complete genome
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| 48,253
|
MN242219.1
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Little cherry virus 1
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Safarova,D., Sevcikova,V., Neumanova,K., Sucha,J., Necas,T., Navratil,M.
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Palacky University, Dept. of Cell Biology and Genetics, Faculty of Science
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Czech Republic
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2020-07-22
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Apr184R
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,800
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GenBank
| null |
Czech Republic: South Moravia
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Czech Republic
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Prunus armeniaca
| null |
2018
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate Apr184R, complete genome
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| 48,254
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MK775591.1
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Little cherry virus 1
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Chen,L., Li,Y., Zhang,K.
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Beijing Academy of Foresty and Pomology Sciences, Cherry Group
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China
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2020-04-18
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BJ
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,928
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GenBank
| null |
China: Beijing
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China
|
Prunus avium
| null |
2017-06-05
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate BJ, complete genome
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| 51,851
|
LC523019.1
|
Little cherry virus 1
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
QLD13
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Little cherry virus 1
|
Velarivirus
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Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,927
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus domestica
| null | null | null | null |
Little cherry virus 1 QLD13 RNA, complete genome
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| 53,983
|
LC523020.1
|
Little cherry virus 1
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS16
|
Little cherry virus 1
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,927
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 1 TAS16 RNA, complete genome
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| 53,984
|
LC523021.1
|
Little cherry virus 1
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
LV16_LChV1
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Little cherry virus 1
|
Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,975
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 1 LV16_LChV1 RNA, complete genome
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| 53,985
|
LC523022.1
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Little cherry virus 1
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Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
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2020-02-11
|
LV27S1
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 16,937
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 1 LV27S1 RNA, complete genome
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| 53,986
|
LC523023.1
|
Little cherry virus 1
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
LV27S2
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,928
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 1 LV27S2 RNA, complete genome
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| 53,987
|
LC523024.1
|
Little cherry virus 1
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
LVV
|
Little cherry virus 1
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,939
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 1 LVV RNA, complete genome
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| 53,988
|
MN508820.1
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Little cherry virus 1
|
Simkovich,A.J., Wang,A.
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University of Western Ontario, Biology
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Canada
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2020-02-09
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Niagara-A22
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Little cherry virus 1
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Velarivirus
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Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 16,934
|
GenBank
| null |
Canada
|
Canada
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Prunus avium
| null |
2019-07-07
| null | null |
Little cherry virus 1 isolate Niagara-A22, complete genome
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| 54,041
|
NC_005065.1
|
Little cherry virus 2
|
Rott,M.E., Jelkmann,W.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
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USA
|
2003-08-13
|
USA6b
|
Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,045
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
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Little cherry virus 2, complete genome
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TTACGACATTAGTCGGGGGGGCTTACAGCATTTGCTGTAAGTACC
| 8,469
|
MW249041.1
|
Little cherry virus 2
|
Tahzima,R., Foucart,Y., Peusens,G., Reynard,J.S., Massart,S., Belien,T., De Jonghe,K., DeJonghe,K.
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University of Liege-GemblouxAgroBiotech, Plant Pathology
|
Belgium
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2021-10-31
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GBVC_LChV-2_201
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Little cherry virus 2
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Ampelovirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 15,100
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GenBank
| 1
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Belgium
|
Belgium
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Prunus serrulata
| null |
2017
| null | null |
Little cherry virus 2 isolate GBVC_LChV-2_201, complete genome
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TAATAAAAGAAAATCCAAAAAGATTTTATTTTTTCTAGAATAGTATGTAAGTACCCTACTGCCCTAGTCGGGGGGGCTTACAGCATTTGCTGTAAGTACC
| 36,306
|
MW249042.1
|
Little cherry virus 2
|
Tahzima,R., Foucart,Y., Peusens,G., Reynard,J.S., Massart,S., Belien,T., De Jonghe,K., DeJonghe,K.
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University of Liege-GemblouxAgroBiotech, Plant Pathology
|
Belgium
|
2021-10-31
|
GBVC_LChV-2_202
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Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
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Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,855
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
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Prunus serrulata
| null |
2017
| null | null |
UNVERIFIED_ASMBLY: Little cherry virus 2 isolate GBVC_LChV-2_202, complete genome
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| 36,307
|
MW249043.1
|
Little cherry virus 2
|
Tahzima,R., Foucart,Y., Peusens,G., Reynard,J.S., Massart,S., Belien,T., De Jonghe,K., DeJonghe,K.
|
University of Liege-GemblouxAgroBiotech, Plant Pathology
|
Belgium
|
2021-10-31
|
GBVC_LChV-2_203
|
Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,621
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Prunus serrulata
| null |
2017
| null | null |
UNVERIFIED_ASMBLY: Little cherry virus 2 isolate GBVC_LChV-2_203, complete genome
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| 36,308
|
LC523025.1
|
Little cherry virus 2
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS12
|
Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,040
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 2 TAS12 RNA, complete genome
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ACCCTACGACAATAGTCGGGGGGGCTTACAGCATTTGCTG
| 53,989
|
LC523026.1
|
Little cherry virus 2
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS16
|
Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,036
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 2 TAS16 RNA, complete genome
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CTACGACATTAGTCGGGGGGCTTACAGCATTTGCTG
| 53,990
|
LC523027.1
|
Little cherry virus 2
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
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Bundoora, VIC 3083
|
Australia
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2020-02-11
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LV16
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Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
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Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,043
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 2 LV16 RNA, complete genome
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TAGAATAGTATGTAAGTACCTTACGACATTAGTCGGGGGGGCT
| 53,991
|
LC523028.1
|
Little cherry virus 2
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
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Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
LV27
|
Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
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Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,031
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 2 LV27 RNA, complete genome
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ACAATAGTCGGGGGGCTTACAGCATTTGCTG
| 53,992
|
LC523029.1
|
Little cherry virus 2
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
LV35
|
Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
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Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,045
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 2 LV35 RNA, complete genome
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TTACGACATTAGTCGGGGGGGCTTACAGCATTTGCTGTAAGTACC
| 53,993
|
LC523030.1
|
Little cherry virus 2
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
LVV
|
Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
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Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,047
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Little cherry virus 2 LVV RNA, complete genome
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CCCTACGACAGTAGTCGGGGGGGCTTACAGCATTTGCTGTAAGTACC
| 53,994
|
MK895513.1
|
Little cherry virus 2
|
Tahzima,R., Foucart,Y., Peusens,G., Belien,T., Massart,S., De Jonghe,K.
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Flanders Research Institute for Agriculture, Fisheries and Food, Plant Science
|
Belgium
|
2019-08-03
|
GBVC_LChV2_071
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Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,040
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Prunus avium
| null |
2017
| null | null |
Little cherry virus 2 isolate GBVC_LChV2_071, complete genome
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TACGACAGTAGTCGGGGGGGCTTACAGCATTTGCTGTAAG
| 60,447
|
MK803502.1
|
Little cherry virus 2
|
Tahzima,R., Foucart,Y., Peusens,G., Belien,T., Massart,S., De Jonghe,K.
|
Flanders Research Institute for Agricultural and Fisheries (ILVO), Department of Plant Virology & Phytoplasmology
|
Belgium
|
2019-07-16
|
GBVC_LChV2_100 BEREF16
|
Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,037
|
GenBank
| 1
|
Belgium
|
Belgium
|
Prunus avium
| null |
2016
| null | null |
Little cherry virus 2 isolate GBVC_LChV2_100 BEREF16, complete genome
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GACAGTAGTCGGGGGGGCTTACAGCATTTGCTGTAAG
| 61,717
|
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Little cherry virus 2
|
Zhu,D., Wang,J., Liu,Q.
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Shandong Institute of Pomology, Biotechnology Laboratory
|
China
|
2018-10-07
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LChV-2-TA
|
Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,031
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GenBank
| null |
China: Shandong
|
China
| null | null |
2016-03
| null | null |
Little cherry virus 2 isolate LChV-2-TA, complete genome
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GGGGGGGCTTACAGCATTTGCTGTAAGTACC
| 68,047
|
MF069043.2
|
Little cherry virus 2
|
Pribylova,J., Lenz,O., Franova,J., Koloniuk,I., Spak,J.
|
Biology centre of CAS, Institute of Plant Molecular Biology, Virology
|
Czech Republic
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2017-09-19
|
Rube 74
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Little cherry virus 2
|
Ampelovirus
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Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 15,425
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Prunus
| null |
2014
| null | null |
Little cherry virus 2 isolate Rube 74, complete genome
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| 74,592
|
AF531505.1
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Little cherry virus 2
|
Rott,M.E., Jelkmann,W.
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Federal Biological Research Centre for Agriculture and Forestry (BBA), Institute for Plant Protection in Fruit Crops
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Germany
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2003-07-31
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USA6b
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Little cherry virus 2
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Ampelovirus
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Closteroviridae
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ssRNA(+)
| 15,045
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GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Little cherry virus 2 isolate USA6b, complete genome
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| 110,316
|
NC_077130.1
|
Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1
|
Tan,Z., Nie,F.-Y., Zhang,Y.-Z.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
LQS_baifu
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Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1
|
Ledantevirus
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Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
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|
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Leopoldamys edwardsi
| null |
2016
| null |
PRJNA485481
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Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1, complete genome
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| 810
|
ON812527.1
|
Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_2
|
Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1
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Ledantevirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,872
|
GenBank
| null |
China:Guangdong
|
China
|
Haemaphysalis hystricis
| null |
2019
|
SAMN28697446
|
PRJNA841744
|
MAG: Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1 isolate TIGMIC_2, complete genome
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CTCCAACTGAGCAATCTCTATCATATAGAGCTCAACAGCCATCAACATGGCTAGCGGTGCGACATACCGTGTCAAGACCAAGCAGTTGGTCCAAGTTACCAGCCCTCAGGAGGATACCCCACCGGCTTACCCATCAAAATGGTTTGAAAGTCACAAGGGGAAGAAACCTCTTTTGGTCGTAAAATACAAGACATCTTCTCTGGACAACCTAAGGGGGGTGGTCAAAGCTGGGATCAAGGGACAAAAACTTGACGTGCAGGTGGCTGTTGCGTTCCTTTACGGTGTCTTTAAGGATGTCACTGGAGTGTTGGCAGATGATTGGAACTCGTTTGGTGTTGAGATCGGGAAAGCAGGGGAGGCAATCAACCCTTTCAAGTTACTCGATGTTGACACCAAGGAAGAAGACCCTCCTAATGCTGGAACTATCACTGCCACAAAAGGCGAGGACATGTGGCTTTGCTTTTTCCTCCTGAGCCAATACCGACTACAAAAGGTCACAAATGCGGAGTATGAGAAGATCCTGATCAAGAAGGCCAATTTGCATCTGAATGCAATGCCCGAGCAAAACGAGCACACCTCAATCAGCACAAAAGGAGGATTCGCTGCATACCTCATGAATCCCAACTATCTGAGGGTGGTGGCTGCCTTGGATATGTTCTTCCACAAGTTCAAAGAACATGAATTTGCCATTATGCGGTTTGGAACACTTGGGTCCCGGTACAAAGACTGCTCTGCTCTGACTTCGCTCAACCACATCAAGAAGTTGACAGGCCTCAGTATGGAGGACTTCATGCTATGGATCTTCACCGATTCCATTGCAGATGACTTGGAACAACTTGCACAACCCGGACAAGAGCTGGACAAGCATGACTCGTATGCCCCCTATATGCGGGACATGGGAGTCTCAGACAAGTCCCCCTACTCGGCCCAAGCCAACCCCTCCATCCATTTGTTTTGCCATGCGATCGGGACTTTACTCCATTCTCGTCGCTCAATCAACGCCAGGATGGGACCTGAGGTAGATACCATGTCAACCATCAAAAATGCGCAGGTAGTGGCCTATGTCTTGAGCACTTGCCCTACCTTCGCAAAGGGATTCACCAAGTCCCTTGACACCGTACCAGGCCTCGCCTCAAAGGAAGTCATGGGAGAACTCCCCGGAGAGCCTGACCCCGAGCGCTGGTTTGATTTCCTCTCTGAACAAGGCTTCAAGATCCCACTCCCGATCGAACAACATTCCCACGACGCCGCAAAGAGCCTCACAAACCTTCGTCCTGACACTGTGGGCCAGCATCTGGCTGGACTTCTAGGAGTATGAACATGAAAAAAACTAACAGCAATCATGCTGCGGACCCGTGTGAAGGCAGCTGCAGGGAACTATGACTACACAAAAGCCGCCAAAAGTCTAGACGGAAACATCGAGGATGAAGACGAGCTGTTGATGAAGGAACATCTAATGGATGCACGTAAGCCACTCACAGTGGCTCCAAGTCCAGAAGACTCTGACTCATCTGAGGACGAGGACGATGATGAAGAGCCTGATGAAGTCGATTACCACAGCTTGGAAGAACCTAGCGCTAAGGACCCATTTGACAAGGCTCTGGACAGCGCTGGATCGTCAGACAAAGAGCATAGACGTCACGATAAGAAATTAAATTTGGGACCATTGAGGTCTTTTCAAGAACTCAAAACTCAAGAGGATTATGAGGACCAGCTTGTCAAACTTGTCAGTGTGACTGTCGCCCAGCTAGGCTGGAATCTGGATCCACTCTCTGTGGCACGAACCAAGACAGGGATGAGGGTCGGCCTCAATCTGGTCCGGGGCCGGACTGACTCGGTGAGTGATGGGGGCAGCACAAGCGATGGAGAGGCAGTGAATGGACTGCTCAGATCGCAGGAACCAGCAGTTCCAACTCCTCAAGAGTTAACAGCATTCTACGATATGATGGTGATCAAGCTGGAACAGGGCATCAAATTCCCCAAGAGGAATGGGAAGGGGTGGATGGAGCTGAGTTTCAAGACCCCAGGACTCAACCCAGATTTGTTAAAAAAGCTCTGTGAACAATCTCTTATTGAAGAGGAAGTTATTAAGGGACTATTGACAGAACTACGCCTGTACTCCATGGTTCACAAGTACTGCAACTATCCATGAAAAAAAGTAACAGCAATCATGTTGTCCAAGCTCCGCAAGAAGCTGTCCAAGAAGGCCGATCCGACACTTCTGCCACCATCTGCTCCCATGGCGTGCTATTTTGATCTTCCGGTCGAGGGGACCTCAAGAGACTGGGTGACAGAGTCTCTGAAGATTGCTGTTAAACTGGAAGTCCGGACTCCTGTGCCATTCAAGACAATGGATGATTGTCTTAAGACCCTAGAGGTCTGGGTCGATGACTCCCACTGTCCTATTTGGCAGTCTCACCTGGACACATGGTGTTATCTTTGTTTAGCTGTTCACCTTCGCCGAGATCCAGTCTGTACATACACCAACCTGTACAGAGCTGCCATCCAGGACATTGTGGAGTTCATCCACATGCCCATGAGCTCAGCTGAGGTCCAGTACCTCAAGCATGAGCAAGTCCTGCTATCCACCTTCCAGGGGCAGCAGTGTGAAATTCGATATTGGTCAGAATTCAAGCCCAGCACCAGGAAAGGGATTCCGGCTCACGCGGTGTATCGGACACCACTCAAGAATGGTGAGCTGCCTCCCCTGCTCGACAAGGTTGCGGAATCTTACCCCCTCCAGGTGGAGTATTCTGTGACAGGTGCCCACAAGATCAGTTCCCCATGAAAAAAACTAACAGGCATCATGCTTCCACTGTGTCTTTGGGTGACCTGCGTCCTTGCTCGTGCTGAAGAGTATCGGCATTTTGAAAACCCTCTTCACGAGCAGCACTCAGTTCTCGTTCCTCTGACATCACCCGTCAAATGGTTGCCTGCGAGCTTAGCCTCCCTGAGGTGCCCAACACACACCGAGTTGGGCCCAGATGCTGGACACACGCTCGAGCGGTGGTTGATCCAACGCCCCCACAATCCAAATGTGCCCAAGGTGGAAGGCTATCTGTGTCATGTTGCTAAATGGATCACCAGATGTGAATTTACTTGGTACTTCTCCAAGACAATCTCCAGAAAAATTGAGCCACTCGATGTCAGCCAAACCCAATGCTCCGATGCCATCAGAGCATATAAAACAGGTTCTCTAACACCGGGGTCTTTCCCACCCGAGGTTTGCTCATGGGCTCACACAAATGATGAAACCCTAATTGCAGTCACCATCACCCCCCATTCCGTCACTTATGATCCGTATAAAAATGCCTACCTGGATCAACTCTTTACCGGCGGGTCCTGTAAAGATGTCTACTGCCCCACATTGTACCAATCTACTGCCTGGCTAACTATGTCGAGTGGCACCCCCAAGTATTGTGATTTCCCCGGGAATGAGCCAGTCGAATTAGTCTTAGGATACAAAGACTCAATGAGTGGCAGGTTTCATGAGGGACTCTGGCTGCGGGGCCCCCATCTGGCTCATGAGCCTTTCCAACGGCTCTGCAAAAAAGGATTTTGTGGACATGAGGGCCTCATGACCGACAGAGGGTTTTGGTTCTTCATTGACGAAGTCGTCTGGCAATACAACAAATCTGTTCTCTTCACGGCAGACATCACCACATGCAATTCAGATGAGCCTATCCAAGTGTCTGACGACGTAACTGATCCTTCAACAATTCGAGCTACGATAGCCGAGTTGATGTGGGACCTCAATTGCTTGAATACTCTTGAGAACATTCTGCATCACAACAAGATCAGTCTTCATGACATTTTCCAGATTTCCCCTCAGGAGCCCGGGCCAGGTCCAATTTACCGTATAAAGGATGGGTCACTAGAGACCACAACAGTGCAGTTAGTGCGGGTGGTCCTCGATTCCAAGCCCCGGCGGGAATGTATCGGTAAATATCACACCAAGACCAATGAGGTGTGCCTGGGTTGGTCTGACTGGCTACTGATAGGAAATAGAACCTACCAAGGATACAACGGAATCACGGAGGTCAATGGGCAATTAGTCTTTCCACCCATGAGAGTCATTGGTAGACGCTGGGATGAGGAGTATATTACTAAACACCACCTCCACCGGATTGCTCACCCAGTTCTAGGGAACCTCTCGCGGAAAGTCCATGAAAACCTGCACAATGTCGACATAAAACACCATCCCGGCAATCTGGGAGATCTGATGGGCGGATGGGTGGTCAGTGCAGAACACAAAGTTGGCGCATTTTTCCGGACAGTGGGGGGTACATTCATGTCCCTGGGGGTGGTCCTAGCATTTGGGATTATTGTGTATCTTTTTATTCAGCTCTGTCGGCTTCTCCAGAAGAGGCGCCCCCCTATTCCGAAGGCAGAAGGCAACGAGCTCAAGACCACCACCGCCTTCGGTGCTTAAGCGTGAAAAAAACTAACAGTCATCATGGACTGGGACCAAGATGAAGATCCCATCTGGGATGATGAATGGGAAGGTGATGAGGATGAGTTCTCCCAGAAATTGTCAGAGTTTCATCACTTCACAGAGCTTAACCAGACTGATTACAGCCTCAATTCTCCGTTGATTCCTGATGAGGTCGTCAGCTTCCTGGAGACCGCACTGGGGGCTACTCCTTCCACCTTATTCAAAACCACTCAATGGGAAACCAGACTACTGTACTTAACCCAAACTGGTTTGAACCTGGCTCCCTGTTTAAGCCCTCTCTCCAATCACGAGTGGTGGGGAGATATCAACGGGCATTGGATTGAGAGGACCGACAAGATAGATCACCTGCTGAGGTCTGTCGCGGAGTCCCATACCATCACGTTTCCGGTCCTTGATGCTTTCCTCAGAGGGTGGATTGGAAGTAGAGCTGAACCGCTGTCGGGGCTAATTGTCAACATGCCCAAATGTGTTCGATCTTGGGGGGAGAGGTACTTAGAAACCCACCACATCACCCTTATACTCAATGCAAAGTCGGAGAAGGAGA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CAATATGTCCTCAAGGAGGATTTGTGGAAAAGCCTCTCAGACATTGCATGTATGCACACGGAAGATGAGGAACTGGACAGAGCATGCCTAGTCAAACCTCTTGAATTACTGCAAGGCATACCCCCCGAGCTAATTCCTGATCTAGAGGTTGAGCTCTGCACTTTCCTAGGCATTTTGGGGGTTAGTGATGGGGTGGCCAGCCTTATGGCTAGAGAGCTGCTGCTAACCCATAGGCATCTCCGCTTGGATGCGATCTGGGGGATTTTTTTGGCAAGTGGTAGTGCCATCATCAACACTACTGGAGAGTATGTGGGTGATGCTCCGATTCCATCAGACCCAGTGTGTGAGAGTGTATCCATCTTGGTGGTTGGCTTTGTCTACTGGTTGGCGTGGTTTACTGCCGACAAAGCTTTGTTTCAATACGCGAACCGTGTAAATGACACCTCTTTCACCTTTGGCTTCTTAAGAAAGTACTCAGAAAGAGAGAACCTGAAAGTGTCCAGACTCCACTGGTGTGTTCATAAAGAGAGAAGAATCATGAAACAGGTTCCACTCCAAAGCTCACAAGCGGGCATAGGACAGTGGATCCGGCTCCTTGCTAGGCTAAACCCAAAGCCGAAAGAACTGGACAAGGGGGTAGTGGACATTGTCCTGGGGCGATACAACCGAGCATTAAGCTACAGCCACATAAAGAGAAGCTCTGGACTATTGTGCTTCAGACAGCAGAAAGCACACTGGGGGAGTGGATCATACATCACACGGGGGGAGGTGGAAAATGATGAAACTGCATGGCGCTCTTGAGTCCATGAAAAAAACACAAATGGAAGAGGACCTTGAGTTGGAGAATTTTGGACTCTATAAATGGTTTTTTG
| 20,851
|
ON812535.1
|
Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_3
|
Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1
|
Ledantevirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,895
|
GenBank
| null |
China:Guizhou
|
China
|
Haemaphysalis hystricis
| null |
2019
|
SAMN28697454
|
PRJNA841744
|
MAG: Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1 isolate TIGMIC_3, complete genome
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AAATCATTGAAGTTAATACATGTCTTCAATTGAGCAATCTCTATCAAATAGAGCCTAACAGCCATCAACATGGCTAGCGGTGCGACATACCGGGTCAGGACCAAACAGTTGGTCCAAATCACCAGCCCTCAGGAGGACACCCCGCCGGCATACCCGTCAAAATGGTTTGAAAGCCACAAAGGGAAGAAACCTCTTTTGGTCGTAAAATACAAAACATCCCCTTTGGACAACCTACGGGGAGTAGTGAAAGCTGGGATCAAGGGGCAAAAGCTGGATGTGCAGGTGGCTGTTGCATTCCTTTACGGTGTCTTCAAGGATGTCACTGGAGTACTGGCCGATGATTGGAACTCGTTTGGTGTCGAAATTGGGAAAGCAGGAGAAGCAGTCAACCCTTTCAGGTTGCTCGATGTTGACACCAAGGAAGAAGACCCTCCTAATGCCGGAACTATAACTGCCACAAAGGGCGAAGACATGTGGCTCTGCTTCTTCCTCCTGAGCCAATACCGGCTCCAAAAAGTTACAAATGCGGAGTATGAAAAGATCCTGATTAAGAAAGCCAACCTGCATCTGAATGCGATGCCCGAGCAGAATGAGCACACCTCAATCAGCACAAAAGGGGGTTTCGCTGCATACCTCATGAACCCCAATTATCTGAGGGTGGTGGCAGCCTTGGACATGTTCTTTCACAAATTCAAGGAGCATGAATTTGCCATTATGCGGTTCGGAACACTGGGCTCCCGGTACAAAGATTGCTCCGCTCTGACTTCGCTCAATCACATCAAGAAGTTAACCGGCCTCAGTATGGAGGATTTTATGTTGTGGATCTTCACCGATTCAATTGCAGATGACCTAGAGCAACTTGCGCAACCTGGACAAGAGCTTGACAAGCATGACTCGTATGCTCCATATATGCGGGATATGGGAGTCTCAGACAAATCTCCTTACTCGGCCCAAGCCAATCCTTCCATCCATCTGTTCTGTCACGCGATTGGGACTCTACTCCACTCTCGTCGCTCAATCAACGCCAGAATGGGCCCGGAGGTAGACACCATGTCAACGATTAAAAATGCGCAGGTAGTTGCTTATGTTTTAAGCACTTGCCCCACCTTCGCAAAGGGATTTACCAAGTCCCTTGACACCATACCAGGCCTCGCCTCAAAGGAAGTCATGGGAGAACTCCCAGGGGAGCCTGACCCAGATCGTTGGTTCGATTACCTCTCTGAACAAGGATTCAAGATCCCACTCCCGATCGAACAACATTCTCACGATGCGGCAAGGAGCCTAACAAACCTCCGTCCGGACACAGTGGGCCAACATCTGGCTGGACTTCTGGGGGTATGAACATGAAAAAAACCAACAGCAATCATGCTGCGGACCCGTGTGAAAGCAGCCGCAGGGAACTACGACTACACGAAAGCCGCTAAAAGTCTAGACGGAAATATCGAGGATGAAGATGAGCGGTTGATGAAGGAGCATATAATGGATGCATATAAACCACTCACAGTAGCCCCAAGTCCGGAAGATCCTGACTCGTCCGAGGAGGAAGAAGATGATGAGGAACCTGATGAAGTTGACTACCATAGTCTGGAAGAGCCGAGTGCTAAAGACCCATTTGACAAGGCTTTGGACAGCGCTGGATCATCAGACAAAGAGCACAGACGTCATGATAAGAAGTTGAATCTAGGGCCATTAAAGGCTTTCCAAGAACTCAAAACTCAGAAGGATTATGAAGACCAGCTTGTAAAACTTGTCAGCGTGACTGTCGCCCAACTGGGCTGGAATCTGGATCCACTCTCGGTAGCACGAACCAAGACAGGGATGAGAGTCGGCATTAATCTAGTCCGGGGCCGGGCCGACTCAGTGAGTGATGGGGGCAGTACAAGTGATGGAGAGGCAGTAAACGGGCTGCTCAGATCGCAGGAACCGGCAGTCCCAACTCCTCAGGAGTTAACGGCATTTTATGATATGATGGTGATCAAGCTGGAACAGGGCATCAAATTCCCAAAGCGGAACGGAAAGGGGTGGATGGAGCTGAGCTTCAAGACCCCAGGGCTCAACCCAGATCTGTTAAAAAAGCTCTGTGAACAATCTCTCATTGAAGAGGAAGTTGTTAAGGGGCTTTTGACGGAACTACGTTTGTATTCCATGGTCCACAAGTATTGCAATTACCCATGAAAAAAATTAACAGCAATCATGTTGTCCAAGCTCCGCAAGAAGCTGTCCAAGAAGGCCGCTCCGACATTGCTGCCACCATCTGCTCCCGTGGCATGCTACTTTGACCTTCCGGTTGAGGGGTCCTCAAGGGATTGGGTGACGGAGTCCCTGAAGATTGCTGTTAAACTGGAAGTCAGGACTCCTGTGCCATTCAAGACAATGGATGATTGTCTGAAAACCCTGGAAGTCTGGGTTGACGACTCCCACTGCCCAATCTGGCAGTCCCACCTGGACACATGGTGTTATCTGTGTCTGGCTGTTCACCTTCGCCGTGATCCCGTCTGTACTTACACCAACCTATACAGAGCTGCCATCCAGGACATTGTGGAGTTCGTGCACATGCCCATGAGCTCGGCTGAGGTACAGTACCTCAAGCATGAGCAAATCCTGCTGTCTACCTTCCAGGGGCAGCAGTGTGAGATTAGATATTGGTCGGAACTCAAGCCCAGCACCAGGAAGGGAGTCCCAGCCCATGCCGTGTATCGGACTCCACTCAAGAACGGTGAGTTGCCCCCCCTACTCGATAAGGTTGCGGAATCGTACCCACTCCAGGTGGAGTATTCAGTGACGGGTGCTCACAAAATCAGCTCCCCATGAAAAAAACTAACAGGAATCATGCTTCTGTTGTGTCTCTGGGTGACCTGCGTCCTTGCTCGTGCCGACGAGTATCGGCATTTTGAAAACCCCCTTCATGATCAACGCTCAGTTCTTGTTCCTCTCACATCTCCCGCCACTTGGCTGCCTGCGAACCCAGCCTCATTGAGGTGCCCGACACACACCGAGTTGGGTCCCGATGCTGGAAACACGCTCGAACGGTGGTTGATTCGACGCCCGCACAATCCAAACGTGCCCAAGGTAGAAGGCTATCTGTGTCACGTGGCGAAATGGATCACCAGATGTGAATTCACTTGGTACTTCTCCAAAACAATCTCCAGAAAAATTGAGCCACTGGATGTCAGCCAAACCCAATGCTCTGATGCCATCAGGGAATACAAAACAGGCTCTCTAACTCCTGGGTCTTTCCCACCTGAAGTTTGTTCATGGGCTCACACCAACGATGAAACCATGAGTGCAGTCACCATCACCCCCCACTCCGTCACCTATGATCCCTACAAAAACGCTTACTTAGATCAGCTCTTTGTTGGCGGGTCCTGCAAGGATGTCTACTGCCCCACACTATACCAATCTACTGCCTGGCTAACAATGTCAAGTGGCACCCCCAAGTATTGTGATTTCCCCGGGGATGAGCCAGTTGAATTGGTACTAGGGTACAAAGACTCTATGAATGGTAGGTTTCATGAGGGACTCTGGTTGCGGGGGCCCCATCTGGCTCATGAGCCCTTCCAACGGCTCTGCAAAAAGGGATTCTGTGGACGTGAAGGTTTCATGACCGAGAGAGGGTTTTGGTTCTTCATTGATAACGTTGTTTGGCAATACAACAAATCCATTCTCTTCATGGCAGACATCGCTCCATGCAATTCAGACGAGCCGATTCAGGTGTCAGATGACGTTACCGATCCGTCAACAATTAGGGCTACTATTGCCGAACTGATGTGGGACCTCAATTGTTTGAATACTCTTGAGAACATTTTGCATCACAACAAAATCAGTCTTCATGACATTTTCCAGATTTCCCCTCAGGAACCCGGCCCTGGTCCGATATATCGTATAAAGGACGGGTCACTCGAGACCGCGACAGTGCAACTGGTGCGGGTGGTTCTTGATCCCAGCCCCCGGAGAGAATGCATAGGTAAATATCACACTAAAACTAATGAGGTGTGTTTGGGTTGGTTGGACTGGCTGCTGATGGGAAACCGCACCTACCAAGGGTACAACGGAATCACGGAGGTCAATGGGCAATTGGTCTTTCCACCCATGAGAGTCATTGGCAGACGCTGGGATGAAGAGTATATTACCAAACACCACCTCCACCGGATTGCTCACCCCGTTCTAGGGAACCTCTCGTGGAAAGTCCACGAAAACCTTCACAATGTCGACCTAAGACATCATCCCAGCAATCTGGGGGATCTGATGGGTGGATGGGTTGTCAGTGCAGAACATAAGGTGGGTGCATTTTTCAGAACAGTGGGGGGGACATTCATGTCCTTGGGGGTGGTCATGGCGTTTGGGATTATTGTGTATCTTTTTATTCAGCTGTGTCGGCTTCTCCAAAAGAGGCGCCCCTCTACTCCGAAGACGGACGGCACCGAACTCAAGGCTGCCACCGCCTTCGGTGCTTGACCATGAAAAAAACTAACAGTCATCATGGACTGGGACCAAGACGATGATCCCATCTGGGACGATGAATGGGAAGGTGATGAGGATGAGCTCTCCCAGAAACTGTCCGAGTTTCATCACTTCACAGAACTTAACCAGACTGATTACAGCCTTAATTCCCCCCTGATTCCTGATGAGGTCGTCAGTTTTCTAGAGACTGCATTGGGGGCCACTCCTTCCACCTTGTTTAAAACCACCCAATGGGAAACCAGACTACAGTACTTAAGCCTAACTGGCTTAAACCTGGCCCCATGTTCAAGCCCTCTCTCAAATCACGAGTGGTGGGGAGATATCAATGGGCATTGGATCGAGCGGACCGACAAAATAGATCACCTGCTGAGGTCTGTCGCAGAATCCCACACCATCACGTTTCCTATCCTTGATGCTTTTCTCCGAGGGTGGATTGGAAGTAGAGCAGAATGCCTGTCCGGGCTAATCGTCAACATGCCCAAATGTGTTCGATCCTGGGGGGAGAGGTACTTGGAAACCCACCATATCACTCTTATCCT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| 20,859
|
ON812536.1
|
Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1
|
Cao,W., Jia,N., Lam,T.T.-Y., Ni,X., Liu,J.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2022-12-16
|
TIGMIC_4
|
Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1
|
Ledantevirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,898
|
GenBank
| null |
China:Guizhou
|
China
|
Haemaphysalis hystricis
| null |
2019
|
SAMN28704306
|
PRJNA841744
|
MAG: Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1 isolate TIGMIC_4, complete genome
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AGAAATCATTGAAGTTAATACATGTCTTCAATTGAGCAATCTCTATCAAATAGAGCCTAACAGCCATCAACATGGCTAGCGGTGCGACATACCGGGTCAGGACCAAACAGTTGGTCCAAATCACCAGCCCTCAGGAGGACACCCCGCCGGCATACCCGTCAAAATGGTTTGAAAGCCACAAAGGGAAGAAACCTCTTTTGGTCGTAAAATACAAAACATCCCCTTTGGACAACCTACGGGGAGTAGTGAAAGCTGGGATCAAGGGGCAAAAGCTGGATGTGCAGGTGGCTGTTGCATTCCTTTACGGTGTCTTCAAGGATGTCACTGGAGTACTGGCCGATGATTGGAACTCGTTTGGTGTCGAAATTGGGAAAGCAGGAGAAGCAGTCAACCCTTTTAGGTTGCTCGATGTTGACACCAAGGAAGAAGACCCCCCTAATGCCGGAACTATAACTGCCACAAAGGGTGAAGACATGTGGCTCTGCTTCTTCCTCCTGAGCCAATACCGGCTCCAAAAAGTTACAAATGCGGAGTATGAAAAGATCCTGATTAAGAAAGCCAACCTGCATCTGAATGCGATGCCCGAGCAAAATGAGCACACCTCAATCAGCACAAAAGGGGGTTTCGCTGCATACCTCATGAACCCCAATTATCTGAGGGTGGTGGCAGCCTTGGACATGTTCTTTCACAAATTCAAGGAGCATGAATTTGCCATTATGCGGTTCGGAACACTGGGCTCCCGGTACAAAGATTGCTCCGCTCTGACTTCGCTCAATCACATCAAGAAGTTAACCGGCCTCAGTATGGAGGATTTTATGTTGTGGATCTTCACCGATTCAATTGCAGATGACCTAGAGCAACTTGCGCAACCTGGACAAGAGCTTGACAAGCATGACTCGTATGCTCCATATATGCGGGACATGGGAGTCTCAGACAAATCCCCTTACTCGGCCCAAGCCAATCCTTCCATCCATCTGTTCTGTCACGCGATTGGGACTCTACTCCACTCTCGTCGCTCAATCAACGCCAGAATGGGCCCGGAGGTAGACACCATGTCAACGATTAAAAATGCGCAGGTAGTTGCTTATGTCTTAAGCACTTGCCCCACCTTCGCAAAGGGATTTACCAAGTCCCTTGACACCATACCAGGCCTCGCCTCAAAGGAAGTCATGGGAGAACTCCCAGGGGAGCCTGACCCAGATCGTTGGTTCGATTACCTCTCTGAACAAGGATTCAAGATCCCACTCCCGATCGAACAACATTCTCACGATGCGGCAAGGAGCCTAACAAACCTCCGTCCGGACACAGTGGGCCAACATCTGGCTGGACTTCTGGGGGTATGAACATGAAAAAAACCAACAGCAATCATGCTGCGGACCCGTGTGAAAGCAGCCGCAGGGAACTACGACTACACGAAAGCCGCTAAAAGTCTAGACGGAAATATCGAGGATGAAGATGAGCGGTTGATGAAGGAGCATATAATGGATGCACATAAACCACTCACAGTAGCCCCAAGTCCGGAAGATCCTGACTCGTCCGAGGAGGAAGAAGATGATGAGGAACCTGATGAAGTTGACTACCATAGTCTGGAAGAGTCGAGTGCTAAAGACCCATTTGACAAGGCTTTGGACAGCGCTGGATCATCAGACAAAGAGCACAGACGTCATGATAAGAAGTTGAATCTAGGACCATTAAAGGCTTTCCAAGAACTCAAAACTCAGAAGGATTATGAAGACCAGCTTGTAAAACTTGTCAGCGTGACTGTCGCCCAACTGGGCTGGAATCTGGATCCACTCTCGGTAGCACGAACCAAGACAGGGATGAGAGTCGGCATTAATCTAGTCCGGGGCCGGGCCGACTCAGTGAGTGATGGGGGTAGTACAAGTGATGGAGAGGCAGTAAACGGGCTGCTCAGATCACAGGAACCGGCAGTCCCAACTCCTCAGGAGTTAACGGCATTTTATGATATGATGGTGATCAAGCTGGAACAGGGCATCAAATTCCCAAAGCGGAACGGAAAGGGGTGGATGGAGCTGAGCTTCAAGACCCCAGGGCTCAACCCAGATCTGTTAAAAAAGCTCTGTGAACAATCTCTCATCGAAGAGGAAGTTGTTAAGGGGCTTTTGACGGAACTACGTTTGTATTCCATGGTCCACAAGTATTGCAATTACCCATGAAAAAAAAATAACAGCAATCATGTTGTCCAAGCTCCGCAAGAAGCTGTCCAAGAAGGCCGCTCCGACATTGCTGCCACCATCTGCTCCCGTGGCATGCTACTTTGACCTTCCGGTTGAGGGGACCTCAAGGGATTGGGTGACGGAGTCCCTGAAGATTGCTGTCAAACTGGAAGTCAGGACTCCTGTGCCATTCAAGACAATGGATGATTGTCTGAAAACCCTGGAAGTCTGGGTTGACGACTCCCACTGCCCAATCTGGCAGTCCCACCTGGACACATGGTGTTATCTGTGTCTAGCTGTTCACCTTCGCCGTGATCCCGTCTGTACTTACACCAACCTATACAGAGCTGCCATCCAGGACATTGTGGAGTTCGTGCACATGCCCATGAGCTCGGCTGAGGTACAGTACCTCAAGCATGAGCAAATCCTGCTGTCTACCTTCCAGGGGCAGCAGTGTGAGATTAGATATTGGTCGGAACTCAAGCCCAGCACCAGGAAGGGAGTCCCAGCCCATGCCGTGTATCGGACTCCACTCAAGAACGGTGAGTTGCCCCCCCTACTCGATAAGGTTGCGGAATCGTACCCACTCCAAGTGGAGTATTCAGTGACGGGTGCTCACAAAATCAGCTCCCCATGAAAAAAACTAACAGGAATCATGCTTCTGTTGTGTCTCTGGGTGACCTGCGTCCTTGCTCGTGCCGACGAGTATCGGCATTTTGAAAACCCCCTTCATGATCAACGCTCAGTTCTTGTTCCTCTCACATCTCCCGCCACCTGGCTGCCTGCGAACCCAGCCTCATTGAGGTGCCCGACACACACCGAGTTGGGTCCCGATGCTGGAAACACGCTCGAACGGTGGTTGATTCGACGCCCGCACAATCCAAACGTGCCCAAGGTAGAAGGCTATCTGTGTCACGTGGCGAAATGGATCACCAGATGTGAATTCACTTGGTACTTCTCCAAAACAATCTCCAGAAAAATTGAGCCACTGGATGTCAGCCAAACCCAATGCTCTGATGCCATCAGGGAATACAAAACAGGCTCTCTAACTCCTGGGTCTTTCCCACCTGAAGTTTGTTCATGGGCTCACACCAACGATGAAACCATGAGTGCAGTCACCATCACCCCCCACTCCGTCACCTATGATCCCTACAAAAACGCTTACTTAGATCAGCTCTTTGTTGGCGGGTCCTGTAAGGATGTCTACTGCCCCACACTATACCAATCCACTGCCTGGCTAACAATGTCAAGTGGCACCCCCAAGTATTGTGATTTCCCCGGGGATGAGCCAGTTGAATTGGTACTAGGGTACAAAGACTCTATGAATGGTAGGTTTCATGAGGGACTCTGGTTGCGGGGGCCCCATCTGGCTCATGAGCCCTTCCAACGGCTCTGCAAAAAGGGATTCTGTGGACGTGAAGGTTTCATGACCGAGAGAGGGTTTTGGTTCTTCATTGATAACGTTGTTTGGCAATACAACAAATCCATTCTCTTCATGGCAGACATCGCTCCATGCAATTCAGACGAGCCGATTCAGGTGTCAGATGACGTTACCGATCCGTCAACAATTAGGGCTACTATTGCCGAACTGATGTGGGACCTCAATTGTTTGAATACTCTTGAGAACATTTTGCATCACAACAAAATCAGTCTTCATGACATTTTCCAGATTTCCCCTCAGGAACCCGGCCCTGGTCCGATATATCGTATAAAGGACGGGTCACTCGAGACCGCGACAGTGCAACTGGTGCGGGTGGTTCTTGATCCCAGCCCCCGGAGAGAATGCATAGGTAAATATCACACTAAAACTAATGAGGTGTGTTTGGGTTGGTTGGACTGGCTGCTGATGGGAAACCGCACCTACCAAGGGTACAACGGAATCACAGAGGTCAATGGGCAATTGGTCTTTCCACCCATGAGAGTCATTGGCAGACGCTGGGATGAAGAGTATATTACCAAACACCACCTCCACCGGATTGCTCACCCCGTTCTAGGGAACCTCTCGTGGAAAGTCCACGAAAACCTTCACAATGTCGACCTAAGACATCATCCCAGCAATCTGGGGGATCTGATGGGTGGATGGGTTGTCAGTGCAGAACATAAGGTGGGTGCATTTTTCAGAACAGTGGGGGGGACATTCATGTCCTTGGGGGTGGTCATGGCGTTTGGGATTATTGTGTATCTTTTTATTCAGCTGTGTCGGCTTCTCCAAAAGAGGCGCCCCTCTACTCCGAAGACGGACGGCACCGAACTCAAGGCTGCCACCGCCTTCGGTGCTTGACCATGAAAAAAACTAACAGTCATCATGGACTGGGACCAAGACGATGATCCCATCTGGGACGATGAATGGGAAGGTGATGAGGATGAGCTCTCCCAGAAACTGTCCGAGTTTCATCACTTCACAGAGCTTAACCAGACTGATTACAGCCTTAATTCCCCCCTGATTCCTGATGAGGTCGTCAGTTTTCTAGAGACTGCATTGGGGGCCACTCCTTCCACCTTGTTTAAAACCACCCAATGGGAAACCAGACTACAGTACTTAAGCCTAACTGGCTTAAACCTGGCCCCATGTTCAAGCCCTCTCTCAAATCACGAGTGGTGGGGAGATATCAATGGGCATTGGATCGAGCGGACCGACAAAATAGATCACCTGCTGAGGTCTGTCGCAGAATCCCACACCATCACGTTTCCTATCCTTGATGCTTTTCTCCGAGGGTGGATTGGAAGTAGAGCAGAATGCCTGTCCGGGCTAATCGTCAACATGCCCAAATGTGTTCGATCCTGGGGGGAAAGGTACTTGGAAACCCACCATATCACTCTTAT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| 20,860
|
MZ328293.1
|
Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1
|
Tan,Z., Nie,F.-Y., Zhang,Y.-Z.
|
National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Department of Zoonosis
|
China
|
2021-09-26
|
LQS_baifu
|
Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1
|
Ledantevirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 10,853
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Leopoldamys edwardsi
| null |
2016
| null | null |
Longquan Niviventer coninga ledantevirus 1, complete genome
|
CAATACATGTCTCCAACTGATCAATCTCTATCATATAGAGCTTAACAGCCATCAATATGGCTAGCGGTGCGACATACCGTGTCAAGACCAAGCAGTTGGTCCAAGTTACCAGCCCTCAGGAGGACACCCCGCCGGCTTACCCATCAAAATGGTTTGAAAGTCACAAGGGGAAGAAACCTCTTTTGGTCGTAAAATACAAGACATCTTCTCTGGACAACCTAAGGGGAGTAGTCAAGGCTGGGATCAAGGGGCAAAAGCTTGACGTGCAGGTGGCTGTTGCGTTCCTTTACGGTGTCTTTAAGGATGTTACTGGAGTGCTGGCAGATGATTGGAACTCGTTTGGTGTTGAGATTGGGAAGGCAGGGGAGGCAATCAATCCCTTTAAGTTACTCGATGTTGACACCAAGGAAGAAGACCCTCCTAATGCTGGAACTATCACTGCCACAAAAGGCGAGGACATGTGGCTTTGCTTTTTCCTCCTGAGCCAGTACCGACTACAAAAGGTCACAAATGCGGAGTACGAGAAGATCCTGATCAAGAAAGCCAATTTGCATCTGAATGCAATGCCCGAGCAGAACGAGCACACCTCAATCAGCACAAAGGGGGGTTTCGCTGCATACCTCATGAACCCCAATTATCTGAGGATGGTGGCCGCCTTGGATATGTTCTTCCACAAGTTCAAAGAACATGAATTTGCCATTATGCGGTTTGGAACACTTGGGTCCCGGTACAAAGATTGCTCCGCTCTGACTTCGCTCAACCACATCAAGAAGTTGACAGGCCTCAGTATGGAGGACTTCATGCTATGGATCTTCACCGATTCCATTGCAGATGACTTGGAACAACTCGCACAACCCGGACAAGAGCTGGACAAGCATGATTCGTATGCCCCATACATGCGGGACATGGGAGTCTCAGACAAGTCCCCCTACTCGGCCCAAGCCAACCCCTCCATCCATTTGTTTTGCCATGCGATCGGGACTCTACTCCATTCTCGTCGCTCAATCAACGCCAGGATGGGACCCGAGGTGGACACCATGTCAACCATCAAAAATGCGCAGGTAGTGGCTTATGTCTTGAGCACTTGCCCTACCTTCGCAAAGGGATTCACCAAGTCCCTTGACACCATACCGGGCCTCGCCTCAAAGGAAGTCATGGGAGAACTCCCCGGAGAGCCTGACCCCGAGCGTTGGTTTGATTTCCTCTCTGAACAAGGCTTCAAGATCCCACTCCCGATCGAACAACATTCTCACGATGCCGCAAAGAGCCTCACAAACCTTCGCCCTGACACGGTGGGCCAACATCTGGCTGGACTTCTGGGAGTATGAACATGAAAAAAACCAACAGCAATCATGCTGCGAACCCGTGTGAAGGCAGCTGCAGGGAACTATGACTACACAAAAGCCGCCAAAAGTATAGACGGAAACATCGAGGATGAAGACGAGCTGTTGATGAAAGAACATCTAATGGATGCACGTAAGCCACTCACAGTGGCTCCAAGCCCAGAAGACCCTGACTCATCTGAGGAAGAGGATGATGATGAAGAGCCTGATGAAGTCGACTACCACAGCTTGGAAGAACCCAGCGCTAAGGACCCGTTTGACAAGGCTCTGGACAGCGCTGGATCGTCAGACAAAGAGCACAGACGTCACGATAAGAAATTAAATTTGGGACCATTGAGGTCTTTTCAAGAACTCAAAACTCAGGAGGATTATGAGGACCAGCTTGTTAAACTTGTCAGTGTGACCGTCGCCCAGCTAGGCTGGAATCTGGACCCACTCTCTGTGGCACGAACCAAGACGGGGATGAGGGTGGGCCTCAATCTGGTCCGGGGCCGGACTGACTCGGTGAGTGATGGGGGCAGCACAAGCGATGGGGAGGCAGTGAACGGACTGCTCAGATCGCAGGAACCGGCAGTTCCAACTCCCCAAGAGCTGACCGCATTTTACGATATGATGGTGATCAAGCTGGAACAGGGCATCAAATTCCACAAGAGGAATGGGAAAGGGTGGATGGAGCTGAGTTTCAAGACCCCAGGACTCAACCCAGATTTGTTAAAAAAGCTCTGTGAACAATCTCTTATTGAAGAGGAAGTTATTAAGGGACTTTTGACAGAACTGCGTCTGTACTCCATGGTTCACAAGTATTGCAACTATCCATGAAAAAAAGTAACAGCAATCATGTTGTCCAAGCTCCGCAAGAAGCTGTCCAAGAAGGCCGGTCCGGCACTTCTGCCACCATCTGCTCCCATGGCGTGCTACTTTGATCTTCCAGTCGAGGGGACCTCAAGAGACTGGGTGACAGAGTCTCTGAAGATTGCGGTCAAACTGGAAGTCCGGACTCCTGTGCCATTCAAGACAATGGATGATTGTCTTAAGACCCTAGAGGTCTGGGTCGATGACTCCCACTGCCCTATTTGGCAGTCTCACCTGGACACATGGTGTTATCTTTGTTTAGCTGTTCACCTTCGCCGAGATCCAGTCTGTACATACACCAACCTGTACAGAGCTGCCATCCAGGACATTGTGGAGTTCATACACATGCYCATGAGCTCMGCTGAGGTCCAGTACCTCAAGCATGAGCAAGTCCTGCTGTCCACCTTCCAGGGGCAGCAGTGTGAGATTCGATATTGGTCGGAATTCAAGCCCAGCACCAGGAAAGGGATTCCAGCTCACGCGGTGTATCGGACACCACTCAAGAATGGTGAGCTGCCTCCCCTGCTCGACAAGGTTGCGGAATCTTACCCCCTCCAGGTGGAGTATTCTGTGACAGGTGCCCACAAGATCAGTTCCCCATGAAAAAAACTAACAGGTATCATGCTTCCACTGTGTCTCTGGGTGACCTGCGTCCTTGCTCGTGCCGAGGAATATCGGCATTTTAAAAACCCCCTCTATGAGCAGCACTCAGTTCTTGTTCCTCTCACATCACCCGTCAACTGGCTGCCTGCGAGCTTAGCCTCCTTGAGGTGCCCGACACACACCGAGTTGGGCCCAGATGCTGGACACACGCTCGAGCGGTGGTTGATCCAACGCCCCCACAATCCAGATGTGCCCAAGGTGGAAGGCTATCTGTGTCATGTTGCTAAATGGATCACCAGATGTGAATTTACTTGGTACTTCTCCAAGACAATCTCCAGAAAAATTGAGCCACTTGATGTCAGCCAAACCCAATGCTCCGATGCCATCAGAGAATACAAAACAGGTTCTCTAACCCCTGGATCTTTCCCACCCGAGGTTTGTTCATGGGCTCACACAAATGATGAAACCCTGATTGCCGTCACCATCACCCCCCATTCCGTCACTTATGATCCGTATAAAAACACCTACCTGGATCAACTCTTTATCGGCGGGTCCTGTAAAGATGTCTACTGCCCCACATTGTACCAATCTACTGCCTGGCTAACTATGTCGAGTGGCACCCCCAAGTATTGTGATTTCCCCGGGAATGAGCCGGTCGAATTGGTCTTAGGATACAAAGACTCAATGAGTGGTAGGTTTCATGAGGGACTCTGGTTGAGGGGCCCCCATCTGGCCCATGAGCCTTTCCAACGGCTCTGCAAAAAAGGATTTTGTGGACGTGAGGGCTTCATGACTGACAGAGGGTTTTGGTTCTTCATTGATAACGTCGTTTGGCAATACAACAAATCCGTTCTCTTCATGGCAGACATCACCGAATGCAGTTCAGATGAGCCTATCCAGGTGTCCGACGACGTAACTGATCCTTCAACAATTCGAGCGACTATAGCCGAGTTGATGTGGGACCTCAATTGCTTGAATACTCTTGAGAACATTTTGCATCACAACAAAATCAGTCTTCATGACATTTTCCAGATTTCCCCTCAAGAGCCTGGCCCGGGTCCAATTTACCGTATAAAGGATGGGTCACTAGAGACCGCAACAGTGCAGCTAGTGCGGGTGGTCCTTGATTCCAAGCCCCGGCGGGAATGCATCGGCAAATATCACACCAAGACCAATGAGGTGTGCCTGGGTTGGTCTGACTGGCTACTGGTAGGAAATCAAACCTACCAAGGATACAACGGAATCACGGAGGTCAATGGGCAATTAGTCTTTCCACCCATGAGAGTCATTGGTAGACGCTGGGATGAGGAGTATATAACCAAACACCACCTCCACCGGATTGCTCACCCAGTTCTAGGGAATCTTTCGCGGAAAGTCCATGAAAACCTGCACAATGTTGACCTAAAACACAATCCCAGCAATCTGGGAGATCTGATGGGTGGATGGGTGGTCAGTGCAGAACACAAGGTTGGCGCCTTTTTCCGAACAGTGGGGGGTACATTCATGTCTTTGGGGGTGGTCCTAGCATTTGGGATCATTGTGTATCTTTTTATTCAGCTCTGTCGGCTTCTCCAGAAGAGGCGCCCCTCTATTCCGAAGGCAGAAGGCAACGAACTCAAGGCCACCACCGCCTTCGGTGCTTAGGCGTGAAAAAAACTAACAGTCATCATGGACTGGGATCAAGATGAAGATCCCATTTGGGACGATGAATGGGAAGGTGATGAGGATGAGTTCTCCCAGAAATTGTCAGAGTTTCATCACTTCACAGAGCTCAACCAGACTGATTACAGCCTCAATTCGCCGTTGATTCCTGATGAGGTCGTCAGCTTCTTGGAGACTGCATTGGGGGCTACTCCTTCCACCTTATTCAAAACCACCCAATGGGAAACCAGACTACAGTACTTAAACCAAACTGGTTTAAACCTGGCTCCCTGTTTAAGCCCTCTCTCCAATCACGAGTGGTGGGGAGATATCAACGGGCATTGGATTGAAAGGACCGACAAGATAGATCACCTGTTGAGGTCTGTCGCAGAGTCCCATACCATCACGTTTCCTGTCCTTGAGGCCTTCCTCCGAGGGTGGATTGGAAGTAGAGCTGAACCCCTGTCGGGGCTAATTGTCAACATGCCCAAATGTGTTCGATCCTGGGGGGAGAGGTACTTGGAAACCCACCACATCACCCTTATCCTCAATGCACAGTCA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| 37,767
|
NC_001809.1
|
Louping ill virus
|
Gritsun,T.S., Venugopal,K., Zanotto,P.M., Mikhailov,M.V., Sall,A.A., Holmes,E.C., Polkinghorne,I., Frolova,T.V., Pogodina,V.V., Lashkevich,V.A., Gould,E.A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1997-04-29
| null |
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,871
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Louping ill virus, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACATTTTTTTTTCTTTCATCAGCCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAATCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTCCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTTCGGAAGATAAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACGAACTGGATGAACTGGTTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCGACAGTAAGGAAAGAAGGGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATCTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGCGAGTTGACGGGGAGGGGACGCAAATGGTTGGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCTCTGGCGATGGTCGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCACGCTGCACACACTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAAAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACCAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTCCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGAAATCACTGTGGTTTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCTACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAATGAGACGCACAAGGGGAGGAAGACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCCTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGGGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTCCCGTGGAAGCATGATGGAAACCCACATTGGAACAATGCAGAGAGACTGGTTGAGTTTGGCGCTCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAGGGCACTAGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGCGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCTCCTGATGTCAATGTGGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGGGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGCATTGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGATCCGCTGGTGGCTTCTTTGGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTCCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCTTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGTGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAAGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAGTAAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTGGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTTTAGTGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCTACTGACTACCGAGGTGGAGTTCCTGGCACGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGTATCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGACTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTCAAAAACGACATGGCGGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAATGACACAGGTACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCTTGGCCCGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGTCTCCGAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAAACACACGCCCCTCCGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACCATAAACGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGTTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCCCAGGGAGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCACTGTTTGTGGTCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTCGTCCTTGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTACGTGGTGGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTGCTCCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGGCTTCTCAGCGCCTTTGCATTGCGCAGAGGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACCACCTACTTTCTTTTGCTGGTCCTGGAATTGGGACTGTCGAGTGCGGGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATAGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGAGAGGGCTCCGTGATCAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACCGTGGTAGTGGTCATGCTGACACTGGCAAGCGGTATGATGCGTCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTTGTGTCCGGGACGAGGAAAATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAAACGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGTCAAGACTCGATGGGAAACTTTCATTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTGGTGGCTTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATAATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAAGAACGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATTTTCAGTCCCGGCTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGATGATGCAGTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAGGGCGCACGAGGTGCACCAGTGCCAGCCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGCAAA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TCAGCCCAGCAGTGCCCGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGGGTGTGGATCCTAGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCCTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGCCTAGCTTGTGACAGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGCAAGGAAACCATGGAATGATGCGGCACGGCGCGACAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCCTGGCCAGGAAAGGGGAAAACAGGCCAGGGGTGAAAACACCCCCAGAGTGCACCACGGCAACACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGGAGATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAGATTTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGAGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGGTTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 8,859
|
MN844186.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., Gilray,J., Orton,R.J., Baird,M., Wilkie,G., Filipe,A.D.S., Johnson,N., McInnes,C.J., Kohl,A., Biek,R., da Silva Filipe,A.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2021-07-25
|
PRES1
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,878
|
GenBank
| 1
|
United Kingdom: England
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
1991
| null | null |
Louping ill virus isolate PRES1, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACATTTTTTCACTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGGCCGCGACGAAGACGCGTCAATTTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGGTCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTTCGGCACTTCGGAAGATCAAGAGGGCAGTGAGTGTTTTGATGGTTGGCCTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACAAACTGGATGAACTGGTTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCGACGGTAAGGAAAGAAAAGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGTTGATCCCCACCCATGCCCAAGGAGAGTTGACGGGAAGGGGACGCAAATGGTTGGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAGGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCTCTAGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTAGCCGTGCTTGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACACATTTGGAAAACAGGGATTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACGAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCTTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAATTGTCAGAGACCAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTCCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGATCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAACCACTGTGGATTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAGACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGGGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTTGACGACCTGGCTCTCCCTTGGAAGCATGATGGAAACCCACACTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAAACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTCGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAAATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCAAGGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGCGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCGGTGGCACATGGATCTCCTGATGTTAATGTAGCCATGCTGATAACACCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATCGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGATCCGCTGGTGGCTTCTTTAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCTTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGCGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGTCTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTGGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCAGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGATTACCGAGGTGGAGTTCCTGGCTTGCTGAAAAAAGGGAAAGACATGAAGGTCTCCTGGAGGAGCTGGGGTCATTCAATGATCTGGAGTATCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAGACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTTTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGCGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCAATGAGAAACGACACAGGTACTTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGTCTTGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAAGCACACGCCCCTCCGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAACGCCAAGTGTGAAAAAAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGTTGGTATGCCATGGAGATAAGGCCAGTGCACGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTTGTAGTCCTGGAATGTATCATCCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTTGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTGGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCTTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGGCTTCTTAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGATGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACTACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTTGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCACGGAGGGAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATAGCTCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGATCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGGGAGGGCTCCGGGATCAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAAACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACTGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGTATGATGCGTCACACCTCCCAGGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCACCCGGAACTAGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCATTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTAGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAGATAATGAGGTCATCCAGGCGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCACGAATGTGGCGCCAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCCGGCTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTTTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGATGATGCATTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAGGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCGTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCTCCGGGGAAGGCCCACGAGGTGCACCAGTGCCAACCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACCTGGC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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAGGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGAAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGATTCAAGGACTATCTCTCCTGCATGGACCGCCATGACCTTCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCGATAATCTAAGTCTAGCATGTGACAGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGCAAGGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAAGAGGGGGCAAACAGGCCAGGGGTGAAGAACGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAAATTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGGTTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTTGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 40,129
|
MK007532.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
SCO_31_1931
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,875
|
GenBank
| null |
United Kingdom: Scotland
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
1931
| null | null |
Louping ill virus isolate SCO_31_1931, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGTGCTTTTGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGTTTTGAAAGAGACATTTTTCACTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGTAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCAACGAAGACGCGTCAACCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGCTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTCCCGTTGAGGCAGGCCATTGCAGCACTTCGGAAGATCAAGAGGACAGTGAGTGTCTTGATGGTTGGTTTGCAAAGGCGCGGGAAAAGGAGGTCAGTGACAAACTGGATGAGCTGGTTGCTGGTCATTGCCCTGCTGGGGATGACACTCGCAGCAACAGTAAGGAAAGAACAGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGATGCGGCAACTCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGAGAAGAGCCTGTTGACGTGGACTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCGCGGACAAGACGCTCGGTGCTGATCCCATCCCATGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGGGGACGCAAATGGCTGGAAGGAGACTCACTGCGGACTCACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAATAAACTACTTGCTCTGGCGATGGTTGCCATTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCCGTGTTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGCTGTACACATTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAAGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAGTGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTCTGCACGCTAAGTTATCAGAAACCAAGGTTGCTGCCAGATGTCCAACGATGGGACCAGCCGCCCTGGCTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGGTGGGGCAACCACTGTGGATTGTTTGGAAAGGGCAGCATCGTGGCCTGTGTCAAGGCGGCTTGTGGAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGCTACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAAGGGAGGAAGACGGCGACTTTTACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGGGAATATGGGGACGTCTCACTGCTATGTAGAGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTTGACAAGACAGCGGAGCACCTCCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGATTGGTTCAATGACCTGGCTCTGCCGTGGAAGCATGAGGGGAACCCACACTGGAACAACGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTCGCAGGGGTTCCTGTTGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAGGTGGGACTGGAAAAATTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGTGGGCATGACACAGTGGTCATGGAAGTCACATTTTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCTGTGGCACATGGATCTCCTGATGTTAATGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCTACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATTATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTGATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGATCCGCTGGTGGCTTCTTCAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCTTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCTTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGCTGGGACTTAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCTTGACTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGCGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTTCGCTGTGGTGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACGCCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTGGTCCCCCAGAATAGACTCGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTGGATAAAAACGACCCCATTGACTACCGAGGTGGAGTTCCTGGCTTGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCCTGGAGGAGTTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGTGTCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGCGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGAGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACATGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCTGTCAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAGAGCCTTTGGATGAAATCGATGAGAAATGACACAGGCACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCGGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCGGAACTCTTTCTTCCGGCGAGCCTCGCAGGCCCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAGACACACGCCCCTCCGAGTCATCAGAGAGGAGTGCCCAGGAACGACCGTCACAATAAATGCCAAGTGTGAAAAAAGAGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGCGGCAAGGTGATTCCGGAGTGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGTTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTAGCAGACAATGGTGAACTGCTCAGTGAGGGGGGAGTCCCCGGGATAGTGGCACTGTTTGTGGTCCTGGAATGCATCATCCGGAGGAGACCTTCTACAGGAATGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTTGTGCGCTATGTGGTAGCGGTGGGGATTGTGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCCCTGATGCTACTTCAAGCTGTGTTTGAACTAAGAGTTGGGCTTCTTAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGAGGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACTACCTATTTCCTCCTGCTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCGCGGAAGGAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATGGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTGCACCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTTTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGGGAGGGCTCCGGGATCAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACTGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGTATGATGCGTCACACCTCTCAAGAAGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCGGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCATTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTTCTTGCCGGCCTGGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTTACAGAAATAATGAGATCGTCCAGAAGGTCTGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAGGAATGTGGCGACAGGCCTTTTGAAGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCCGGCTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAGGGGTGTTTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCTTTGTCCATTGATGATGCAGTGGCCGGTCCTTACTGGGCTGATGTGAAGGAGGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCCCACGAGGTGCACCAGTGCCAACCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGCA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CATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTGCCTACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGTGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCATTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGGAGAAAAGAAAGAGCGGAGTGGGCAAGGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGCGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGATTCAAGGACTATCTCTCCTGCATGGACCGCTATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTGGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAACTTGGGATAGAGCAAAACTTGAAGAGCCCGCAAGGGGACCATGGAGTGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGGAAAGGGGGCAAATAGGCCAGGGGCGAAGAACGCCCCCAGGGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAAAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAAATTTGTGAGACCCCCTGCACCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGGTTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,116
|
MK007533.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
ENG_PEN6_2009
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,850
|
GenBank
| null |
United Kingdom: England
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
2009
| null | null |
Louping ill virus isolate ENG_PEN6_2009, complete genome
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GCGCGTGCTACAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACACTTGTTTCACTTTCATCGGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGTAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCTCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAATCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTTCGGAAGATCAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACAAACTGGATGAACTGGTTGCTGGTCATAGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCGACAGTAAGGAAAGAAAGAGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAGGGAAGGGATGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGGGGACGCAAATGGCTGGAAGGAGACTCACTGCGGACACATCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCCCTGGCGATGGTTGCCGTCGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACGCATTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATTTACCAGGAGAGTCCTGCTAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACCAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTCCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGACCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGACTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATATGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAGACGGCGACCTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGGGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTCCCGTGGAAGCATGATGGAAACCCATACTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTGGAGTTTGGTGCCCCTCACGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACGGGAGTGCTGCTGAAAGCGCTCGCAGGGGTTCCTGTGGCCCACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACTGATAGCGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCAGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCTCCTGATGTTAATGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGAAGGGTGTTTCAAACAACTAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGATCCGCTGGTGGCTTCTTTAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTTTGCCTAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACTCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCTTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTAGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGCGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAGGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTGGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCTTGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCCTGGAAGAGCTGGGGGCACTCAATGATCTGGAGTATCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTCGAGAGACGAAAAACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGAGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGACCAAAGCCTCTGGATGAAATCGACGAGAAACGACACAGGGACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCATACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGTCTTGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAAATACACGCCCCTCCGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAATGCCAAGTGTGAAAAAAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACTGACTGCTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTTGTGGTCCTGGAATGTGTCATTCGGAGGAGACCTTCGACAGGAGTGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTGGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAAACTGTGGCCTTGATGCTACTCCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGGCTTCTTAGCGCCTTTGCGTTGCGCAGAGGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACCACTTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGTGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAAGTCTGGAACGGGGCTCTTGCTCATGGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGCTTCTTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAAGGGACACAGAGAGCAGAAGGGACTGACTTGGATCATCCCCTTGGCTAGATTGCTTGGGGGGGAGGGCTCCGGGATCAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACTGTGGTGGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGCATGATGCGTCACACCTCCCAAGAGGCTCTCTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAGTGGAGTGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAAGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCATTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTAGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGATTGTGGACACTCACAGAAATAATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAAGAACGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGAAGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCCGGCTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAAGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTTTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCTGCGCTGTCCATTGATGATGCAGTGGCTGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCGTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCTCATGAGGTGCACCAGTGCCAACCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGCAAAGGGAACATCT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AGTGCCTGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCCTTTATGCAGAACAAAGAGAGGGTCCTGGAGTGGAGGGACGTGCCATATCTCCCTAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATTGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCCTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGCTTGTGACACAGCAAAACTCGAAGAGCTCGTAAGGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAGAGGGGCAAACAGGCCAGGGATGAGGAACGCCCCCAGGGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAAATTTGCGAGACCCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTAAAGGGGAGGCCCCCGGAAGCACGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGGTTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTC
| 54,117
|
MK007534.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
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Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
ENG_PEN4_1983
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,877
|
GenBank
| null |
United Kingdom: England
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
1983
| null | null |
Louping ill virus isolate ENG_PEN4_1983, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGTGCTATAGCTTCGGATAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACATTTTTTCACTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGCGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAATCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGCTCTGAAGGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTACGGAAAATCAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACAAACTGGATGAACTGGTTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCGACAGTAAGGAAAGAAAGGGATGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGGGGGCGTAAATGGCTGGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAATAAACTGCTTACTCTGGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACACATTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACTTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACTGCTGAAGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACCAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTTCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGGTTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGCGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAGACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGGGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAAGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTACCGTGGAAGCATGATGGAAACCCATATTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGACCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTCGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAAGGAAACAAGTATCACCTGAGGAGTGGTCATGTGACCTGCGAGGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGCGGGCATGACACAGTGGTTATGGAGGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCCCCTGATGTTAATGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGGGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGAGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGAAGGGTGTTCCAGACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGTCAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGATCCGCTGGTGGCTTCTTCAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAATACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTTTTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGCGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAAGGCTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGTTGTGGCGTGGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCTTGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCCTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGTGTCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTGGAGAGACGAAAAACAGGCGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAATCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGAGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGTACCTACATAGTTGAACTCCTAGTCACTGACTTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTAGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGTCTCGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAGGTGAAGGGACCATGGAAACACACGCCCATCCGAGTCATTAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAATGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGTTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACATGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTCGTGGTCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGTGTGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTTACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTGGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAACTGGGCTTCTCAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGAGGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTCACTACCTATTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAAGACTGGAACGGGGCTCCTGCTCATAGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTCAGGGGACACAGGGAACAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGGGAGGGCTCCGGGATCAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACTGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGTATGATGCGTCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGTTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGGTCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCATTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGTCTAGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATAATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAAGAACGTGGCGACAGGCCCTTTGAGGTCAAGGATGGAGTCTACAGAATCTTCAGTCCCGGCTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCATAGGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATCGATGATGCAGTGGCCGGTCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCCTACGAGGTGCACCAGTGCCAACCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGC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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTGCCCACTGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGTTCCTCCCTTATTGGGAGGAAAGAAAGAGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAAGTGAGAAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCCTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGCTTGTGACAGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGCAAGGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCTCTGGCCAAGAAAAGGGGGGCAAACAGGCCAGGGGTGAAGAAAGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAAATTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCACGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGGTTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGGCAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,118
|
MK007535.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
ENG_PEN3_1983
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,876
|
GenBank
| null |
United Kingdom: England
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
1983
| null | null |
Louping ill virus isolate ENG_PEN3_1983, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACATTTTTCCACTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGCGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAATCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGCTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTACGGAAAATCAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACAAACGGGATGAACTGGTTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCGACAGTAAGGAAAGAAAGGGATGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAACCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCACGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGGGGGCGTAAATGGCTGGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAATAAACTGCTTACCCTTGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACACATTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACTTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAAGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACCAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTTCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGGTTGTTTGGAAAGGGTAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCAGCTTGTGAGGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGCGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAGACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGGGTAGCCAGCGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAAGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTACCGTGGAAGCATGATGGAAACCCACACTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCTCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGACCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTCGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGCGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCCCCCGATGTTAATGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGGGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGAGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGCATTGGAAGGGTGTTCCAGACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGTCAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGATCCGCTGGTGGCTTCTTTAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTTTTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGCGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAAGGCTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGTTGTGGCGTGGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTCCCTGGTTTGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCCTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGTGTCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTGGAGAGACGAAAAACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAATCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGAGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGTACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACTTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCCGACGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGTCTCGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAGGTGAAGGGACCATGGAAACACACGCCCATCCGAGTCATTAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAATGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGTTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACATGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTCGTGGTCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTCGTCTTCGCTCTGCTCGTTACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTGGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAACTGGGCTTCTCAGCGCTTTTGCGCTGCGCAGAGGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTCACTACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAATGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATAGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTCAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGGGAGGGCTCCGGGATCAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACTGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGTATGATGCGTCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGTTGTGTTGAATGGCATCAGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGGTCAGCCTGCGGGTTCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCATTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGTCTAGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATAATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAAGAACGTGGCGACAGGCCCTTTGAGGTCAAGGATGGAGTCTACAGAATCTTCAGTCCCGGCTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAGGGGTGTTTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATCGATGATGCAGTGGCCGGTCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAATAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCCTACGAGGTGCACCAGTGCCAACCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGC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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTGCCTACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGATATGATATGCTCCTCCCTTATTGGGAGAAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAAGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCCTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGCTTGTGACAGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGCGAGGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCTCTGGCCAGGAAAAGGGGGCAAACAGGCCAGGGGTGAAGAAAGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAAATTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGGTTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGGCAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,119
|
MK007536.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
SCO_LOCH6_1993
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,877
|
GenBank
| null |
United Kingdom: Scotland
|
United Kingdom
|
Lagopus lagopus scotica
| null |
1993
| null | null |
Louping ill virus isolate SCO_LOCH6_1993, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACATTTTTTCACTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAATCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTCCGGAAGATCAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACGAACTGGATGAACTGGTTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCAACAGTAAGGAAAGAAAGGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACGAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGAGGACGCAAATGGTTAGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCTCTGGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCTCCGGTCTACGCCTCGCGTTGCACACATCTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGCTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACCAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTCCTGACTGAAGAGCACCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGGTTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAAACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGGGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTCCCGTGGAAGCATGATGGAAACCCACATTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCCCCCCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTAGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTACCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACCATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGTGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCTCCTGATGTCAATGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGGTCCGCTGGGGGCTTTTTTAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGATTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCCTGGCCGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGTGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTAGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAGACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCATGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGCATCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTTATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGTGTATTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGTACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGTCTCGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAAGTGAAAGGACCATGGAAACACACGCCCCTCAGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAACGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCCTCCGTGAGGAGTACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGCTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTTGTGGTCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGCATGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTAGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGACTTCTTAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGAGGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACTACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATAGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTAGCTAGATTGCTTGGAGGAGAGGGCTCCGGGATAAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACCGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGCATGATGCGCCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTTGTACTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCATCTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTAGTGGCCTCAGCACTCCACTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATAATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTATTCAGGACAGGGAGGCCAAGAACGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCCGGTTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGACGATGCATTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAATAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCTCACGAGGTGCACCAGTGCCAGCCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGC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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCTTGCATGGACCGCCATGACCCACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCGCAATAATTTAAGTCTAGCTTGTGACGGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGCAAGGAGAACATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAAGGGGGGCAAACAGGCCAGGGGTGAAGAACGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGGTCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAAATTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGGGTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,120
|
MK007537.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
SCO_LOCH2_1993
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,877
|
GenBank
| null |
United Kingdom: Scotland
|
United Kingdom
|
Lagopus lagopus scotica
| null |
1993
| null | null |
Louping ill virus isolate SCO_LOCH2_1993, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACATTTTTTCACTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAATCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTCCGGAAGATCAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACGAACTGGATGAACTGGTTGCTGGTCATTGCTCTGTTGGGGATGACACTTGCAGCAACAGTAAGGAAAGAAAGGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGATTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTCTGCCGGAATGTTGACGGAGTCCATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACGAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGAGGACGCAAATGGTTAGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCTCTGGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCTCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACACATCTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACCAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTCCTGACTGAAGAACACCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGGTTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTATGATGCCAACAAAATAGTGTACATAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAAACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGCAGGGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTCCCGTGGAAGCATGATGGAAACCCACATTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTAGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACCATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGTGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTAAGAGCAGTGGCACATGGATCTCCTGATGTCAATGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGGTCCGCTGGGGGCTTCTTTAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGATTCCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCCTGGCCGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGTGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTAGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCATGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGCATCCCTGAAGCTCCTCGGCGTTTTATGGTGGGTACTGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGTGTATTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGTACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGTCTCGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAAGTGAAAGGACCATGGAAACACACGCCCCTCAGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAACGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCCTCCGTGAGGAGTACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGCTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTTGTGGTCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGCATGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTAGCGGTGGGGATCGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGACTTCTTAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGAGGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTATTACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGAGATCTCTGGAAGTGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATAGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGAGAGGGCTCCGGGATAAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTGACCGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGCATGATGCGCCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGCGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCATCTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTAGTGGCCTCAGCGCTCCACTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATGATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTATTCAGGACAGGGAGGCCAAGAACGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTCTACAGAATCTTCAGTCCCGGTTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGACGATGCATTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAATAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCCCACGAGGTGCACCAGTGCCAGCCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGC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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCTTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGATTGTGACGGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGCAGTGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAAGGGGGGCAAACAGGCCAGGGGTGAAGAACGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGGTCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAAATTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGGGTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,121
|
MK007538.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
SCO_K_1980
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,877
|
GenBank
| null |
United Kingdom: Scotland
|
United Kingdom
|
Lagopus lagopus scotica
| null |
1980
| null | null |
Louping ill virus isolate SCO_K_1980, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGGTTGAAAGAGATATTTTTTCACTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAATCTAGAGTCCAAGTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTCCGGAAGATCAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACGAACTGGATGAACTGGCTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCAACAGTAAGGAAAGAAAGGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACGAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGAGGACGCAAATGGTTAGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCTCTGGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTCGCCGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCTCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACACATCTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCTATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACTAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTCCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGGTTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAAACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATTTTGACCTTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGCAGGGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTCCCGTGGAAGCATGATGGAAACCCACATTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTAGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACCATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGTGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCTCCTGATGTCAATGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGGTCCGCTGGGGGCTTCTTTAGCTCAATTGGAAAGGCAGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGATTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCCTGGCCGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGTGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTAGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCATGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGCATCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTTATGGTGGGTACTGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGTGTATTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCAGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGTACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGTCTCGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAAGTGAAAGGACCATGGAAACACACGCCCCTCAGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAACGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCCTCCGTGAGGAGTACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGCTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTTGTGGTCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGCATGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTAGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGACTTCTTAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGAGGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACTACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCGAGGAGGGAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATAGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGAGAGGGCTCCGGGATAAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACCGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGCATGATGCGCCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGCAACTTTCATCTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTAGTGGCCTCAGCACTCCACTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATGATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTATTCAGGACAGGGAGGCCAAGAACGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCCGGTTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGACGATGCATTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGATGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAATAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCCCACGAGGTGCACCAGTGCCAGCCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGC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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCTTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGCTTGTGACGGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGCAAGGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAAGGGGGGCAAACAGGCCAGGGGTGAAGAACGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGGTCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAAATTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGGGTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,122
|
MK007539.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
IRE_IRE3_1968
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,877
|
GenBank
| null |
Ireland
|
Ireland
|
Ovis aries
| null |
1968
| null | null |
Louping ill virus isolate IRE_IRE3_1968, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGTGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACATTTTTTCACTTTCGTCAGCCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGCGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAATCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTTCGGAAGATAAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACGAACTGGATGAACTGGTTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCGACAGTAAGGAAAGAAAAGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATATGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGCGAGCTGACAGGGAGGGGACACAAATGGTTGGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTTACGAGAGTGGAGGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCTCTGGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACACATTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACCAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTCCTGGCTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGATTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACCGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAATGAGACGCACAAGGGGAGGAAGACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCCTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGCAGGGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTTGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTCCCGTGGAAGCATGATGGAAACCCACACTGGAACAATGCAGAGAGACTGGTTGAGTTTGGCGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAGGGCGCTAGCAGGGGTCCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGCGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCAGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCTCCTGATGTTAACGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGATCCGCTGGTGGCTTCTTTAGCTCAATTGGAAAGGCAGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTAAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCTTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACCCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGTGCAGTTGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGCTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCGTACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTGGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAACCTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCACGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAAGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGTATCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGACTTCAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTCAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGACCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGTACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCATACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGTCTCGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAAACTCACGCCCCTCCGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAACGCCAAGTGTGAAAAAAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACGGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGTTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTCGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCACTGTTTGTGATCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTGGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTGAGAGTTGGGCTTCTTAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGAGGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACTACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCGCGGAGGAAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATGGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTGTTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGAGAGGGCTCCGGGATCAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACCGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGTATGATGCGTCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCAGTGGCCTCGTTTCTCTTGCTGATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAAATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCATTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTAGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATAATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAAGAACGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCCGGCTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAAGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGGGCGGCGTTGTCCATTGATGACGCAGTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAATGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCCCACGAGGTGCACCAGTGCCAGCCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGC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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAAGATCATGGAGTGGAGGGACGTGCCATATCTCCCCAAAACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCCTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGCTTGTGACAGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGTAAGGATACCATGGAATGGTGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGGAAAGGGGGGCAAACAGGCCAGGGGTGAAGAACGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAAATTTGTGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATCAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCGGGGTTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,123
|
MK007540.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
IRE_IRE2_1971
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,877
|
GenBank
| null |
Ireland
|
Ireland
|
Ixodes ricinus
| null |
1971
| null | null |
Louping ill virus isolate IRE_IRE2_1971, complete genome
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TGATTTTCTTGCACGTGCATGTCTTTGCTTCGGACAGCATTGGCAGCGGCAGGTCTGAGAGAGGTATCTTTCCGCTTTCACCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAAGAAGACCATCCTGAAAGGTAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCAACGAAGACGCGTCAACCTAGAGTTCAAATGCCAAATGGGCTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTTCTAAAAACATTCTGGAACTCTGTTCCATTGAGGCAGGCCATTGCAGCGCTCCGGAAGATTAAGAGGACAGTGAGTGCTCTGATGGTTGGCTTGCAGAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACAGACTGGATGAACTGGTTGCTGGTTATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCTGCAACAGTGAGGAAAGAAAGGGACGGCACAACTGTGATCAGAGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACTCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTAGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCACTGTCCTACGAGTGCGTGACCATAGAGCAAGGTGAAGAGCCTGTTGACGTGGACTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATCTGGAGTATGGACGCTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGTTGATCCCATCCCATGCTCAGGGAGAGCTGACAGGGAGGGGAAGCAAATGGCTGGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTCACCAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAGAACAAATTACTTGCTCTGGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCGCTGGAGAGTGTGGTGACCAAGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCTTGTGCTTGGCCCCGGTCTATGCCTCACGCTGCACACACTTGGAGAACAGGGATTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGGGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGTGTTACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCTTCAATGGATGTATGGCTTGACGCCATTTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCGGAAACCAAGGTTGCAGCCAGATGTCCAACGATGGGGCCAGCTGTTCTGGCGGAAGAACACCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGTTGGGGCAACCACTGTGGATTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAAGCGGCCTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATATGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAGCCACACACAGGGGATTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAAGGGAGGAAGACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCCTAGGGGATTATGGAGATGTCTCGCTGCTGTGCAGGGTCGCCAGTGGCGTTGACTTGGCTCAGACTGTCATTCTGGAGCTTGATAAGACAGCGGAACACCTCCCAACGGCTTGGCAGGTCCACCGAGATTGGTTCAATGATTTGGCCCTGCCATGGAAGCATGATGGGGGCCCACGTTGGAACAACGCAGAGAGATTGGTTGAATTCGGGGCTCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTATAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTCGCAGGGGTTCCTGTAGCGCACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGCCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAATTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCAAAGTTCGCATGGAAGAGAGCTCCAACAGACAGCGGGCATGACACAGTGGTTATGGAGGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCTTGTAGGATCCCGGTGAGAGCAGTAGCACATAGATCTCCTGATGTCAATGTGGCTATGCTGATAACGCCAAACCCCACGATTGAAAACGACGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTCCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGAGAACTGAGTCACCAATGGTTCCAGAAAGGGAGCAGCATTGGAAGGGTCTTCCAAACAACCAGGAAAGGCATAGAAAGGCTGACAGTGATAGGAGAACATGCCTGGGACTTTGGATCTGTTGGCGGCTTCTTAAGCTCAGTCGGAAAAGCAGTGCACACGGTTCTTGGTGGAGCCTTCAACAGTATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGTTTGAACACGAGGAATCCTACAATGTCCATGAGCTTTCTCTTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTTGGCTGCGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTTCGCTGTGGTGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAATGGTATGACAACTACGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCGTTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTGGTCCCCCAGAACAGACTCGAGATGGCCATGTGGAGAGGCTCGGTCACGGAACTGAATTTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGTGGAGTTCCTGGCTTGCTGAAAAAAGGGAAGGACATAAAGGTCTCTTGGAAGAGTTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGTATTCCTGAAGCTCCACGGCGCTTCATGGTGGGCACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCGCTAGAGAGGCGAAAAACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCTGCCGTCAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAGATCGGTGAGAAATGACACAGGCACTTACATAGTTGAACTTCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACTATCGACAACGCCGAAGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGCCTCGCGGGACCCAGGTCTTGGTACAATAGGATCCCTGGTTACTCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAAATACACGCCCCTCCGGGTCATCAGGGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAATGCCAAGTGTGAAAAAAGGGGGGCTTCTGTGAGGAGCACTACAGAGAGCGGCAAGGTGATTCCGGAGTGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTGACGTTCCGTACTGGAACCGACTGCTGGTATGCTATGGAAATAAGGCCGGTACACGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTCGCGGACAATGGTGAGCTACTAAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTTGTGGTCCTTGAATGTATCATCCGGAGGAGACCCTCCACAGGAACAACGGTCGTGTGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGGATGGTAAGGATTGAGAGTCTTTTACGCTACGTGGTGGCGGTAGGGATTGCGTTCCATCTTGAGCTGGGACCGGAGACTGTGGCCCTGATGCTACTCCAGGCTGTGTTTGAGCTGAGAGTAGGGCTTCTAGGCGCCTTTGCATTGCGTAGAGGCCTCACTGCTCGAGAAATGGTTACCACCTATTTCCTTCTGCTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCTTCGAGGACCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGTACCGTAGAGGGAAAGACTGGGACAGGGCTCTTGCTCATAGCCCTTATGACACAGAGGGACGTGGTGACCGTGCATCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCCACAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATCCCCTTGGCCAGATTGCTTGGAGGGGAGGGCTCCGGGATCAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCCTTCAGCGAACCGCTGACTGTGGTGGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGTATGATGCGTCACACCTCCCAGGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTCTTCTTGTTGATGCTCGTGCTTGGAACGAGGAAGATGCAACTGGTTGCCGAGTGGAGCGGCTGTGTCGAATGGCACCCAGAATTGGTGAATGAAGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGTCAGGACTCGATGGGAAATTTTCATTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGTTGCTTGCTGGCCTGGTGGCCTCGGCATTCCATTGGTCAGGCATCCTCGGTGTAATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATGATGAGGTCATCCAGAAGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGGAGCCAAAAATGTGGCGACAAGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTCTACAGAATCTTCAGTCCCGGCTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTCGGCTACGGCTACAAGGGCGTTCTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGATGATGCTGTGACCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTATGCTACGGGGGAGCCTGGAGTCTAGAGGAAAAATGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCAGGGAAGGCCCATGAGGTGCACCAGTGCCAACCCGGAGAGCTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCCATTGACTTGGC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CCATCGGCTCAGCAGTACCTGTCGATTGGGTCCCTACCGGTCGCACGACTTGGAGCATCCATGCTAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTATGGATCTTAGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTTCCGTATCTCCCCAAGACCCAAGACATGGTATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAGAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTAGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTTAAGGACTATCTCTCCTGCATGGACCGCCATGACCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGCCTAGCCCATGACAGAGAAAAACTTGAAGAGCTCGCAAGGTAACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCGACAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAACAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCTAGGAAAAGAGGGGCAAATAGGCCAGGGGTGAAGAACGCCCCCGGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAAAGCGGTCGCTCCCGACGTAGGGCACTCTGCGAAATTTGTGAGACCCCTAGCACCATGACAAGGCCGAACATGGTGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAGGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGATTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGATAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGCGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,124
|
MK007541.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
SCO_INV14_1992
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,875
|
GenBank
| null |
United Kingdom: Scotland
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
1992
| null | null |
Louping ill virus isolate SCO_INV14_1992, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACATTTTTCTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAATCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTCCGGAAGATCAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACGAACTGGATGAACTGGTTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCAACAGTAAGGAAAGAAAGGGACGGCACCATTGTGATCAGAGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCAGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGGGGACGCAAATGGTTAGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCTTTGGCGATGGTTGCTGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGTTGCACACATTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCGATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACCAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTCCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAACCACTGTGGATTGTTTGGAAAGGGTAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGCGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGCGGAAAACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGGGTAGCCAGTGGCGTCGACTTAGCCCAGACCATCATCCTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCATCTTCCAACAGCCTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTCAATGACCTGGCTCTCCCATGGAAGCATGATGGCAACCCACACTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAGGGCGCTAGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACCATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGTGGGCATGACACAGTGGTTATGGAGGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCTCCTGATGTTAATGTGGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGGAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGATCCGCTGGTGGCTTCTTTAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCCTGGCGGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGTGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCATTTGAGGAGGGGAGCTGTGGCGTAGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAACCTGGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCTACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCATGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAGTGATCTGGAGTATCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTACACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGTACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGTGAGTCTCGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAAACACACGCCCCTCCGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACTACCGTCACAATAAACGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGCTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCTCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTTGTGGTCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTAGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGACTTCTTAGCGCCTTTGCGCTACGCAGAGGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACTACTTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAAGACTGGAACAGGGCTCTTGCTTATAGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGAGAGGGCTCCGGGATAAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCCTTCAGTGAGCCACTGACCGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGTATGATGCGTCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTGGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTACGGGTCCGCCAGGATTCGATGGGAAACTTTCATTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTAGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATAATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAAGAACGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCCGGTTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGCTGTCCATTGATGATGCATTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGAAAGGCCCACGAGGTGCACCAGTGCCAGCCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGCAAA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