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|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
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|
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|
Orthoflavivirus
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Flaviviridae
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Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
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2020-02-05
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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTCGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCTTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGCTTGTGACAGAGCAAAACTTGAGAGCTCGCAAGGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAACAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAAGGGGGGAAAACAGGCCAGGGGTGAAGAACGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGTGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGTAAAATTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGATTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,127
|
MK007544.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
WA_I_1980
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,876
|
GenBank
| null |
United Kingdom: Wales
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
1980
| null | null |
Louping ill virus isolate WA_I_1980, complete genome
|
AGATTTTCTTGCACGTGCATGTCTTTGCTTCGGATAGCATTGGCAGCGGCAGGTCTGAAAGAGACATTCTTTCGCTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGGCCATCCTGAAAGGTAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCAGTGAAGACGCGTCAACCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGATTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATACTGTGGCTGGCACTGCGAGAAGCCCTGTTTTGAAAACATTTTGGAATTCTGTTCCCTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTCCGGAAGATCAAGAGGGCAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAGAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACAGACTGGATGAGCTGGTTGCTGGTTATTGCTCTGTTGGGAATGACTCTTGCTGCAACAGTAAGGAAGGAAAGGGACGGCACTACTGTGATCAGAGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACCCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCTTAGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGTTATCCTACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGACTGTTTTTGCCGAAATGTTGACGGAGTCTACTTAGAGTATGGACGGTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGTTGATCCCATCCCATGCCCAGGGAGAGCTGACGGGGAGGGGACGCAAGTGGCTGGAAGGAGACTCACTGCGGACGCACCTCACTAGAGTGGAAAGATGGGTCTGGAAGAACAAATTACTTGCTCTGGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGTTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCCGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTTTTGTGTTTGGCCCCGGTCTATGCCTCGCGCTGCACACACTTGGAGAACAGGGACTTCGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGGGTCACCTTGGTGCTGGAGTTGGGTGGATGCGTTACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCTTCAATGGACGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTCTGCACGCCAAGTTATCGGAAACCAAGGTCGCAGCCAGATGTCCAACGATGGGACCAGCCGTTCTGACTGAAGAGCACCAGGCTGGCGCAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAACCACTGTGGGTTGTTTGGAAAGGGTAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCGAAGAAGAAAGCCATGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAGCCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAGACGGCGACTTTCACGGTTTCCTCAGAGAAAACCATCTTAACCCTAGGGGATTATGGAGATGTCTCATTGCTGTGCAGGGTTGCCAGTGGCGTTGACCTGGCTCAGACCATCATTCTGGAGCTGGACAAGACGGCGGAACACCTCCCAACTGCTTGGCAGGTCCATCGAGATTGGTTCAATGATCTGGCTCTGCCATGGAAGCATGTTGGGAGCCCACATTGGAACAACGCAGAGAGATTGGTCGAATTTGGGGCCCCCCACGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTGGCAGGGGTTCCTGTAGCGCACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCACAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGCGGGCATGACACCGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCTGGGTCAAAGCCCTGTAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCTCCTGATGTTGATGTAGCCATGCTGATAACTCCAAACCCCACAATTGAAAACGACGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTCCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGCCATCAATGGTTCCAGAAAGGGAGCAGCATTGGAAGGGTTTTCCAAACAACTAGGAAAGGCATAGAAAGACTGACAGTGATAGGAGAACATGCCTGGGATTTTGGATCCGCTGGCGGCTTCTTAAGCTCAGTCGGAAAGGCAGTGCACACAGTTCTTGGTGGTGCCTTCAACAGTATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAACTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCATGGTTGGGATTGAACACGAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTTTTGGCTGGAGGTCTGGTCCTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTTGGCTGCGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGTTGTGGCGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAATTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCGTTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTGGTCCCCCAAAATAGACTCGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCCCTAGCGGAAGGGGACGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAATGACCCCACTGACTACCGAGGTGGAGTTCCTGGCTTGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAGGAGTTGGGGACACTCAATGATCTGGAGTGTTCCTGAAGCTCCCCGGCGCTTCATGGTGGGCACAGAGGGACAGAGTGAGTGCCCGCTAGAGAGACGAAAAACGGGTGTGTTCACAGTCGCAGAGTTTGGGTTCGGTCTGAGAACAAAGGTCTTTCTAGATCTTAGACAGGAACCAACACATGAGTGCGACACAGGAGTGATGGGGGCTGCCGTCAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAGAGCCTTTGGATGAGATCGGTGAGAAATGACACAGGCACTTACATAGTTGAACTTCTGGTCACTGACTTGAGGAACTGCTCATGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCCGATGTGGTGAACTCGGAGCTTTTCCTTCCGGCGAGCCTTGCGGGACCCAGGTCCTGGTATAATAGGATCCCTGGTTACTCGGAACAGGTGAAGGGACCATGGAAATACACACCCCTCCGAGTCGTCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAATGCTAAGTGTGAAAAAAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACTACAGAGAGCGGCAAGGTGATTCCGGAGTGGTGCTGCAGGGCATGCACAATGCCCCCAGTGACGTTTCGGACTGGAACCGACTGCTGGTACGCCATGGAAATAAGGCCAGCACACGCCCAGGGGGGGCTTGTTCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTACTAAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCACTGTTTGTGGTCCTTGAATGTATCATCCGAAGGAGACCCTCCACAGGAACAACTGTCATGTGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGGATGGTCAGGATTGAGAGTCTTGTGCGCTATGTGGTGGCGGTTGGGATCGCGTTCCACCTCGAGTTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTCCAGGCTGTGTTTGAGCTAAGAGTGGGGCTTCTCAGCGCCTTTGCATTGCGCAGGAGCCTTACCGTTCGGGAGATGGTCACCACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGGCTGCCGAGTGCGAGCCTCGCGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATGTTCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAGGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCGTGGCCCTCATGACACAGCAGGACGTTGTGACCATGCATCACGGACTTGTGTGCTTCTTGGCTGCGGCTACGGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTGTCCCTCTGGCTAGATTGCTTGGAGGGGAAGGTTCCGGGATCAGGTTGTTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACGGTGGTGGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGCATGATGCGTCACACTTCCCAGGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCAATGGCCTCGTTTCTCTTGTTAATGCTTGTGCTAGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCCGAATGGAGTGGCTGTGTTGAGTGGCACCCAGAACTGGTGAATGAGGGCGGAGAAATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCATTTAACTGAACTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTGGTGGCCTCGGCACTTCATTGGTCAGGCATCCTTGGCGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATGATGAGATCATCCAGAAGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGGGGTCAAGAGCGCAACGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTCTACAGAATCTTCAGTCCCGGCCTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGCTACGGCCACAAGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCTATTGATGATGCTGTGACCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTCTGCTACGGGGGAGCCTGGAGCCTGGAGGAAAAATGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCAGGGAAAGCCCATGAGGTGCACCAATGCCAACCTGGAGAGTTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGAGCAATACCCATTGATTTGGC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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTTCCTACCGGCCGCACGACATGGAGTATCCATGCTAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTTTGGATTTTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTTCCATACCTCCCCAAGGCCCAAGATATGGTATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATTTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGAAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTTAAGGATTATCTTTCCTGCATGGACCGTCATGACCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCGATAATCTAAGCCCAACCTGTGACAGAGAAAAGCTTGAGGAGCCCGCAAGGGGACCATGGAGTGATGCGGCAGCGCGCGACAGCGACGGGGGAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAACAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAAAGGGGGAAATGGGCCAGGGGTGAAGAATGCCCCCAGGGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGTGAAATTTGTGAGACCCCCCGCACCATGACAAGGCCGAACACGGTGCACTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGATTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGCGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,128
|
MK007545.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
SCO_G_1979
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,878
|
GenBank
| null |
United Kingdom: Scotland
|
United Kingdom
|
Sus scrofa domesticus
| null |
1979
| null | null |
Louping ill virus isolate SCO_G_1979, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTCTGAAAGGGACATTTTTTCACTTTCATCAGCCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAATCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTTTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTTCGGAAGATAAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAAGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACGAACTGGATGAACTGGTTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCGACAGTTAGGAAAGAAAGGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGATTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTACGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGCGAGTTGACGGGGAGGGGACGCAAATGGTTGGAAGGAGACTCACTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTACTCTGGCGATGGTAGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGATGACGAGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACACATTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTGACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAAACACGCGAGTACTGCTTACACGCCAAGTTGTCAGAGACCAAGGTTGCTGCTAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGTCCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGATTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCTAATGAGACGCACAAGGGGAGGAAGACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCCTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGGGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTCAATGACCTGGCTCTCCCATGGAAGCATGATGGAAACCCACACTGGAACAATGCAGAGAGACTGGTTGAGTTTGGCGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTATACAATCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTAGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGGAACAAGTACCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGCGGGCATGACACAGTGGTTATGGAGGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCTCCTGATGTTAATGTAGCTATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAACATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGCAGCAGTATTGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGATCCGCTGGTGGCTTCTTTAGCTCAGTTGGAAAGGCGGTGCACACGGTCCTTGGCGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTTTTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGTGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGTCTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCATTTGAGGAAGGAAGCTGTGGCGTAGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTAGCTCTAGCGGAAGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCACGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGTGTCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTTTGGACTTTAGACAAGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGACCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGTACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGTCTCGCAGGACCCAGGTCCTGGTATAATAGGATCCCTGGCTACTCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAAACACACGCCCCTCCGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAACGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGTTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTGCACGCCCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCACTGTTTGTGGTCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTCGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGAATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTGGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGCTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGGCTCCTTAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGAGGCCTTACCGCCCGAGAGATGGTTACTACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAACGTGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATTCAGAGCCTGCACCGCGGAGGGAAAGACTGGAATGGGGCTCTTGCTCATAGCCCTCATGACACAGAGGGATGTTGTGACTGTACACTACGGACTTGTGTGCTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGAGAGGGCTCCGGGATCAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACCGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGTGGTATGATGCGTCACACCTCCCAGGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTGATGCTTGTGCTAGGGACGAGGAAAATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGTCAGGACTCGATGGGAAACTTTCATTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTGGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGCGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATGATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAAGAACGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCAGGCTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGATGATGCAGTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTAGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCCCACGAGGTGCACCAGTGCCAGCCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGGAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGC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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTTGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCCGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAGAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTTAAAGACTATCTCTCCTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGCTTGTGACAGAGCAAAACTTGAAGAGCTCACAAGGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAGCAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGGAAAGGGGGGAAAACAGGCCAGGGGTGAAGAACGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGTAAAATTTGCGAGACCCCTCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGGTTTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,129
|
MK007546.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
ENG_DEV4_1995
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,877
|
GenBank
| null |
United Kingdom: England
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
1995
| null | null |
Louping ill virus isolate ENG_DEV4_1995, complete genome
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AGATTTTCTTGCACGTGCGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACATTTTTTCACTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAACCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTCTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTCCGGAAGATCAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACGAACTGGATGAACTGGCTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCAACAGTAAGGAAAGAAAGGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGGGGACGCAAATGGTTAGAAGGAGACTCATTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCTCTGGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCTGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACACATTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACTAAGGTTGCTGCCAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGCCCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGGTTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAAACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGAGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCTTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTCCCGTGGAAGCATGATGGAAACCCACACTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTAGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACCATGTGTGAAAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGTGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGACACATGGATCTCCTGATGTCAATGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGGTCCGCTGGGGGCTTCTTTAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTTAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCCTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGTGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAGTGAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTAGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAGGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCATGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGCATCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGAACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCAGAGCTTTTCCTTCCGGCGAGTCTTGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACGCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAAACACACGCCCCTCCGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAACGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGCTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCTCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTTGTGGTCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTTGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTAGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGTTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGACTTCTTAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGAAGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACTACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATCCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATGGCCCTCATGACACAGAGGAATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGTTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGAGAGGGCTCCGGGATAAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACCGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGCATGATGCGTCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTAATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCACTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTAGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATAATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAAGAATGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCCGGTTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGATGATGCATTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAATAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCCCACGAGGTGCACCAGTGCCAACCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGC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CCATCAGCTCAGCAGTGCCTGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAGCAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCTTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGCTTGTGACAGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGCAAGGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAACAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAAAGGGGGCAAACAGGCCAGGGGTGAAGAACGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGCAAAATTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTGAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGATTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTGACTCGGAAAAACACCCGCT
| 54,130
|
MK007547.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
ENG_DEV2_1989
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,816
|
GenBank
| null |
United Kingdom: England
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
1989
| null | null |
Louping ill virus isolate ENG_DEV2_1989, complete genome
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GCGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACATTTTTTCACTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAACCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTCTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTCCGGAAGATCAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACGAACTGGATGAACTGGCTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCAACAGTAAGGAAAGAAAGGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCAGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGGGGACGCAAATGGTTAGAAGGAGACTCATTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCTCTGGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCTGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACACATTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACTAAGGTTGCTGCCAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGCCCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGGTTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAAACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGAGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGAGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCTTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTCCCGTGGAAGCATGATGGAAACCCACACTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTAGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACCATGTGTGAAAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGTGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGACACATGGATCTCCTGATGTCAATGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGGTCCGCTGGGGGCTTCTTTAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTTAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCCTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGTGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAGTGAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTAGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAGGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCATGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGCATCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGAACCTACATAGTTGAACTCTTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCAGAGCTTTTCCTTCCGGCGAGTCTTGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACGCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAAACACACGCCCCTCCGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAACGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGCTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCTCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTTGTGGTGCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTTGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTAGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGTTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGACTTCTTAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGAAGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACTACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATCCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATAGCCCTCATGACACAGAGGAATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGTTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGAGAGGGCTCCGGGATAAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACCGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGCATGATGCGTCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTAATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCACTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTAGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATAATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAAGAATGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCCGGTTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGATGATGCATTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAATAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCCCACGAGGTGCACCAGTGCCAACCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGCAAAGGGAACATCTGGT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GCCTGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAGCAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCTTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGCTTGTGACAGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGCAAGGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAACAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAGAAGGGGGGGCAAACAGGCCAGGGGTGAAAGACGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGCAANAATTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGAACATGGGGCATTGAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGATTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGAC
| 54,131
|
MK007548.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
ENG_DEV1_1983
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,847
|
GenBank
| null |
United Kingdom: England
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
1983
| null | null |
Louping ill virus isolate ENG_DEV1_1983, complete genome
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CGTGCTATAGCTTCGGACAGCTTTGGCAGCGGCAGGTTTGAAAGAGACANTTTTTTCACTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGACCATCCTGAAAGGCAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGACGAAGACGCGTCAACCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAACCCTGTCTTGAAAGCATTCTGGAATTCCGTTCCGTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTCCGGAAGATCAAGAGGACAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACGAACTGGATGAACTGGCTGCTGGTCATTGCTCTGCTGGGGATGACACTTGCAGCAACAGTAAGGAAAGAAAGGGACGGCACCACTGTGATCAGGGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACGCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCCTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGACTCGCTGTCATACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGATTGTTTTTGCCGGAATGTTGACGGAGTCTATTTGGAGTATGGCCGTTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGCTGATCCCAACCCATGCCCAGGGAGAGTTGACGGGGAGGGGACGCAAATGGTTAGAAGGAGACTCATTGCGGACACACCTCACGAGAGTGGAAGGATGGGTTTGGAAAAACAAACTGCTTGCTCTGGCGATGGTTGCCGTTGTGTGGCTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCAGGGTTGCTGTGCTGGTTGTGCTCCTGTGTTTGGCCCCGGTCTACGCCTCGCGCTGCACACATTTGGAAAACAGGGACTTTGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGAGTCACCTTGGTGCTGGAGCTGGGTGGATGCGTAACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCCTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGCGAGTACTGTTTGCACGCCAAGTTGTCAGAGACTAAGGTTGCTGCCAGATGTCCAACGATGGGACCAGCTGCCCTGACTGAAGAACGCCAGATTGGCACAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGGTTGTTTGGAAAGGGCAGCATTGTGGCCTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCACGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAACCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAAACGGCGACTTTCACGGTTTCTTCAGAGAAGACCATCTTGACCTTAGGGGAATATGGAGACGTCTCACTGCTATGTAGAGTAGCCAGTGGCGTCGACTTGGCTCAGACCATCATCTTGGAGCTCGACAAGACAGCGGAGCACCTTCCAACAGCTTGGCAGGTCCACCGAGACTGGTTTAATGACCTGGCTCTCCCGTGGAAGCATGATGGAAACCCACACTGGAACAATGCAGAGAGATTGGTTGAGTTTGGTGCCCCTCATGCTGTCAAGATGGATGTGTACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTAGCAGGGGTTCCTGTGGCACACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACCATGTGTGAAAAATCAAAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGTGGGCATGACACAGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCATGCAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGACACATGGATCTCCTGATGTCAATGTAGCCATGCTGATAACGCCAAACCCCACAATTGAAAATGATGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTTCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGTCATCAATGGTTCCAGACAGGGAGCAGTATTGGAAGGGTGTTCCAAACAACCAGGAAAGGTATAGAAAGACTGACAGTAATAGGAGAGCACGCCTGGGACTTTGGGTCCGCTGGGGGCTTCTTTAGCTCAATTGGAAAGGCGGTGCACACGGTTCTTGGTGGTGCCTTTAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAGCTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACAAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTCCTGGCTGGAGGTCTGGTCTTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTCGGCTGTGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGTGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAACTATGCATACTACCCGGAGACACCAGGGGCTCTTGCATCGGCAGTGAAAGAGGCATTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTAGTCCCCCAGAACAGACTTGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCTCTAGCGGAGGGGGATGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAACGACCCCACTGACTACCGAGGCGGAGTTCCTGGCATGCTGAAAAAAGGGAAGGACATGAAGGTCTCCTGGAGGAGCTGGGGCCACTCAATGATCTGGAGCATCCCTGAGGCTCCTCGGCGTTTCATGGTGGGTACAGAGGGACAAAGTGAGTGCCCACTAGAGAGACGAAAAACAGGTGTGTTCACGGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAAGTCTTTCTGGATTTTAGACAGGAACCAACACACGAGTGTGACACAGGAGTGATGGGGGCCGCCGTTAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAAAGCCTCTGGATGAAATCGATGAGAAACGACACAGGAACCTACATAGTTGAACTCCTGGTCACTGACCTGAGGAACTGCTCCTGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCAGACGTGGTGAACTCAGAGCTTTTCCTTCCGGCGAGTCTTGCAGGACCCAGGTCCTGGTACAATAGGATCCCTGGCTACGCGGAACAAGTGAAGGGACCATGGAAACACACGCCCCTCCGAGTCATCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAACGCCAAGTGTGAAAAGAGGGGGGCTTCCGTGAGGAGCACCACAGAGAGTGGCAAGGTGATTCCGGAATGGTGCTGCCGAGCATGCACAATGCCTCCAGTAACGTTCCGAACTGGAACCGACTGCTGGTATGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCTCAGGGGGGGCTTGTCCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGCTGCTCAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCATTGTTTGTGGTCCTGGAATGTATCATTCGGAGGAGACCTTCTACAGGAGTGACGGTCGTATGGGGAGGTGTTGTTGTCCTCGCTCTGCTCGTCACTGGAATGGTCAGGATTGAGAGCCTCGTGCGCTATGTGGTAGCGGTGGGGATTGCGTTCCACCTTGAGTTGGGACCAGAGACTGTGGCCTTGATGCTACTTCAGGCCGTGTTTGAGCTAAGAGTTGGACTTCTTAGCGCCTTTGCGCTGCGCAGAAGCCTCACCGTCCGAGAGATGGTTACTACCTACTTCCTCCTGTTGGTCCTGGAGATGGGACTGCCGAGTGCGAGCCTCGGGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATATCCAGAGCTTGCACCGCGGAGGGAAAGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCATAGCCCTCATGACACAGAGGAATGTTGTGACTGTACACCACGGACTTGTGTGTTTCCTGGCTGCGGCTGCAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTAGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTATTCCCTTGGCTAGATTGCTTGGAGGAGAGGGCTCCGGGATAAGATTGCTGGCTTTCTGGGAACTGGCAGCCCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTGACCGTGGTAGGGGTCATGCTGACACTGGCTAGCGGCATGATGCGTCACACCTCCCAAGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCGGTGGCCTCGTTTTTCTTGCTAATGCTTGTGCTCGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCTGAATGGAGCGGCTGTGTTGAATGGCATCCGGAACTGGTGAATGAGGGTGGAGAGATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTTCACTTGACTGAGCTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTAGTGGCCTCAGCACTCCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATAATGAGGTCATCCAGACGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGAGGCCAAGAATGTGGCGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTTTACAGAATCTTCAGTCCCGGTTTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTTGGTTACGGCCACAAGGGTGTCTTGCACACGATGTGGCACGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGATGATGCATTGGCCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAAGGAAGACGTCGTGTGCTACGGGGGAGCTTGGAGCCTGGAGGAAAAGTGGAAAGGTGAAATAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAGGCCCACGAGGTGCACCAGTGCCAACCCGGAGAATTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGGGCAATACCAATTGACTTGGCAAAGGGAACATCTGGT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GCCTGTCGACTGGGTGCCCACCGGCCGCACGACATGGAGCATCCATGCCAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTGTGGATCCTGGACAACCCTTTCATGCAGAGCAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTACCATATCTCCCCAAGACCCAGGACATGATATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGGAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTCAAAGACTATCTCTCTTGCATGGACCGCCATGACCTACACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCAATAATCTAAGTCTAGCTTGTGACAGAGCAAAACTTGAAGAGCTCGCAAGGAGACCATGGAATGATGCGGCAGCGCGCAGCAGCGACGGGGAAATGGTCGCACCCGACGCACCATCCATGAGGCAACAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAGAAGGGGGGGCAAACAGGCCAGGGGTGAAAGACGCCCCCAGAGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGCAANAATTTGCGAGACCCCCCGCCCCATGACAAGGCCGCACATGGGGCATTGAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGATTTTTCCTCCTCCTATACCAAANTTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACACAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGTGTG
| 54,132
|
MK007549.1
|
Louping ill virus
|
Clark,J.J., McInnes,C., Kohl,A., Biek,R.
|
Moredun Research Institute, Vaccines & Diagnostics
|
United Kingdom
|
2020-02-05
|
WA_AB2_2010
|
Orthoflavivirus loupingi
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| null |
United Kingdom: Wales
|
United Kingdom
|
Ovis aries
| null |
2010
| null | null |
Louping ill virus isolate WA_AB2_2010, complete genome
|
GCTTCGGATAGCATTGGCAGCGGCAGGTCTGAAAGAGACATTCTTTCGCTTTCATCAGTCGTGAACGTGTTGAGAAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGGCAGGAAGGCCATCCTGAAAGGTAAGGGGGGCGGTCCCCCTCGACGAGTGTCGAAAGAGACCGCGGTGAAGACGCGTCAACCTAGAGTCCAAATGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGGATCTTGTGGCATGCTGTGGCTGGCACTGCGAGAAGCCCTGTTTTGAAAACATTTTGGAATTCTGTTCCTTTGAGGCAGGCCACTGCAGCACTCCGGAAGATCAAGAGGGCAGTGAGTGCTTTGATGGTTGGCTTGCAAAGGCGCGGAAAAAGGAGGTCAGTGACAGACTGGATGAGCTGGTTGCTGGTTATTGCTCTGTTGGGGATGACTCTTGCTGCAACAGTAAGGAAGGAAAGGGACGGCACTACTGTGATCAGAGCTGAAGGAAGGGACGCGGCAACTCAGGTGCGTGTGGAGAACGGCACCTGTGTGATCTTGGCCACAGACATGGGGTCATGGTGTGATGATTCGTTATCCTACGAGTGTGTGACCATAGAGCAAGGGGAAGAGCCTGTTGACGTGGACTGTTTTTGCCGAAATGTTGACGGAGTCTACTTAGAGTATGGACGGTGTGGGAAACAGGAGGGCTCACGGACAAGACGCTCGGTGTTGATCCCATCCCATGCCCAGGGAGAGCTGACGGGGAGGGGACGCAAGTGGCTGGAAGGAGACTCACTGCGGACGCACCTCACTAGAGTGGAAGGATGGGTCTGGAAGAACAAATTACTTGCTCTGGCGATGATTGCCGTTGTGTGGTTAGCACTGGAGAGTGTGGTGACCCGGGTTGCCGTGCTGGTTGTGCTCTTGTGTTTGGCCCCGGTCTATGCCTCGCGCTGCACACACTTGGAGAACAGGGACTTCGTCACTGGCACCCAGGGGACTACAAGGGTCACCTTGGTGCTGGAGTTGGGTGGATGCGTTACCATAACCGCTGAGGGGAAGCCTTCAATGGATGTGTGGCTTGACGCCATCTACCAGGAGAGCCCTGCCAAGACACGTGAGTACTGTCTGCACGCCAAGTTATCGGAAACCAAGGTTGCAGCCAGATGTCCAACGATGGGACCAGCCGTTTTGACTGAAGAGCACCAGGCTGGCGCAGTGTGCAAGAGGGACCAGAGTGATCGAGGCTGGGGCAATCACTGTGGATTGTTTGGAAAGGGTAGCATTGTGGCTTGCGTCAAGGCGGCTTGTGAAGCAAAGAAGAAAGCCATGGGATACGTGTACGATGCCAACAAAATAGTGTACACAGTGAAGGTTGAGCCACACACGGGAGACTATGTTGCCGCCAACGAGACGCACAAGGGGAGGAAGACGGCGACTTTCACGGTTTCCTCAGAGAAAACCATCTTGACCCTAGGGGAGTATGGAGATGTCTCGTTGCTGTGCAGGGTTGCCAGTGGCGTTGACCTGGCTCAGACCATCATCCTGGAGCTGGACAAGACGGCGGAACACCTCCCAACTGCTTGGCAGGTCCATCGAGATTGGTTCAATGATCTGGCTTTGCCATGGAAGCATGTTGGGAGCCCACATTGGAACAACGCAGAGAGATTGGTCGAATTTGGGGCCCCCCACGCCGTCAAGATGGATGTATACAACCTTGGAGATCAGACTGGAGTGCTGCTGAAGGCGCTCGCAGGGGTTCCTGTAGCGCACATTGAGGGAAACAAGTATCACCTGAAGAGTGGTCATGTGACCTGCGAAGTGGGACTGGAAAAACTAAAGATGAAAGGTCTCACGTACACAATGTGTGATAAATCACAGTTTGCATGGAAGAGAACTCCAACAGACAGCGGGCATGACACCGTGGTTATGGAAGTCACATTCTCCGGGTCAAAGCCCTGTAGGATCCCGGTGAGAGCAGTGGCACATGGATCTCCTGATGTTGATGTAGCCATGCTGATAACTCCAAACCCCACAATTGAAAACGACGGAGGAGGCTTCATAGAGATGCAGCTCCCCCCAGGGGACAATATCATCTATGTTGGGGAACTGAGCCATCAGTGGTTCCAGAAAGGGAGCAGCATTGGAAGGGTTTTCCAAACAACCAGGAAAGGCATAGAAAGACTGACAGTGATAGGAGAACATGCCTGGGATTTTGGATCCGCTGGCGGCTTCCTAAGCTCAGTCGGAAAGGCAATGCACACAGTCCTTGGTGGTGCCTTCAACAGCATCTTTGGAGGAGTGGGGTTTCTGCCAAAACTCCTAATGGGAGTGGCACTGGCCTGGTTGGGACTGAACACGAGGAACCCCACAATGTCCATGAGCTTTCTTTTGGCTGGAGGTCTGGTCCTGGCCATGACTCTCGGGGTGGGAGCGGATGTTGGCTGCGCAGTGGACACAGAGCGAATGGAGCTCCGCTGTGGCGAGGGTTTGGTTGTGTGGAGAGAGGTTTCAGAGTGGTATGACAATTATGCATTCTACCCGGAGACACCGGGGGCTCTTGCATCGGCAATAAAAGAGGCGTTTGAGGAGGGAAGCTGTGGCGTGGTCCCTCAAAATAGACTCGAGATGGCCATGTGGAGAAGCTCGGTCACGGAACTGAATCTGGCCCTAGCGGAAGGGGACGCAAATCTCACAGTGGTGGTAGACAAAAATGACCCCACTGACTACCGAGGTGGAGTTCCTGGCTTGCTGAAAAAGGGGAAGGACATGAAGGTCTCTTGGAGGAGTTGGGGACACTCAATGATCTGGAGTGTTCCTGAAGCTCCCCGGCGTTTCATGGTGGGCACAGAGGGACAGAGTGAGTGCCCGCTAGAGAGACGAAAAACGGGTGTGTTCACAGTTGCAGAGTTTGGGGTCGGTCTGAGAACAAAGGTCTTTCTAGATTTTAGACAGGAACCAACACATGAGTGCGACACAGGAGTGATGGGGGCTGCCGTCAAAAACGGCATGGCGGTCCACACAGATCAGAGCCTTTGGATGAGATCGGTGAGAAATGACACAGGCACTTACATAGTTGAACTTCTGGTCACTGACTTGAGGAACTGCTCATGGCCTGCTAGTCACACCATCGACAACGCCGATGTGGTGAACTCGGAGCTTTTTCTTCCGGCGAGCCTTGCAGGACCCAGGTCTTGGTATAATAGGATCCCTGGTTACTCGGAACAGGTGAAGGGACCATGGAAATACACACCCCTCCGAGTCGTCAGAGAGGAGTGTCCAGGAACGACCGTCACAATAAATGCTAAGTGTGAAAAAAGAGGGGCTTCCGTGAGGAGCACTACAGAGAGCGGCAAGGTGATTCCGGAGTGGTGCTGCAGGGCATGCACAATGCCCCCAGTGACGTTCCGGACTGGAACCGACTGCTGGTACGCCATGGAAATAAGGCCAGTACACGCCCAGGGGGGGCTTGTTCGCTCAATGGTGGTTGCGGACAATGGTGAGTTACTAAGTGAGGGAGGAGTCCCCGGGATAGTGGCACTGTTTGTGGTCCTTGAATGCATCATCCGAAGAAGACCTTCCACAGGAACAACTGTCGTGTGGGGAGGTGTTGTCGTCTTCGCTCTGCTCGTCACTGGGATGGTCAGGATTGAGAGTCTTGTGCGTTATGTGGTGGCGGTGGGGATCGCGTTCCACCTTGAACTGGGACCAGAGATTGTGGCCTTGATGCTACTCCAGGCTGTGTTTGAGCTGAGAGTGGGGCTTCTCAGCGCCTTTGCATTGCGCAGAGGCCTTACCGTCCGGGAGATGGTCACCACCTACTTCCTCCTGTTGGTCTTGGAGATGGGGCTGCCGAGTGCGAGCTTCGCGGATCTCTGGAAATGGAGTGATGCGCTGGCCATGGGGGCACTGATGTTTAGAGCCTGCACCGCGGAGGGAAGGACTGGAACGGGGCTCTTGCTCGTGGCCCTCATGACACAGCAGGACGTTGTGACCATGCATCACGGACTTGTGTGCCTTTTGACTGTGGCCACAGCCTGCTCGGTCTGGAGACTGCTTCGGGGACACAGGGAGCAGAAGGGACTGACCTGGATTGTCCCTCTGGCTAGATTGCTTGGAGGGGAAGGTTCCGGGATCAGGTTGTTGGCTTTCTGGGAACTGGCGGCTCACAGAGGAAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTAACAGTGGTGGGGGTCATGCTGACACTGGCCAGCGGCATGATGCGTCACACTTCCCAGGAGGCTCTTTGTGCGCTCGCAATGGCCTCGTTTCTCTTGTTAATGCTTGTGCTAGGGACGAGGAAGATGCAGCTGGTTGCCGAATGGAGTGGCTGTGTTGAATGGCACCCAGAACTGGTGAATGAAGGTGGAGAAATCAGCCTGCGGGTCCGCCAGGACTCGATGGGAAACTTCCATTTGACTGAACTTGAGAAAGAGGAAAGGATGATGGCTTTTTGGCTGCTTGCCGGCCTGGTGGCCTCGGCACTTCATTGGTCAGGCATCCTTGGTGTGATGGGACTGTGGACACTCACAGAAATGATGAGATCATCCAGAAGGTCCGACCTGGTCTACTCAGGACAGGGGGGTCAAGAGCGCAACGACAGGCCTTTTGAGGTCAAGGATGGAGTCTACAGAATCTTCAGTCCCGGCCTGTTCTGGGGTCAGAGGCAGGTGGGAGTCGGCTACGGCCACAAGGGTGTTTTGCACACGATGTGGCATGTGACTAGAGGAGCGGCGTTGTCCATTGATGATGCTGTGACCGGCCCCTACTGGGCTGATGTGAGGGAAGACGTCGTCTGCTACGGGGGAGCCTGGAGCCTGGAGGAAAAATGGAAAGGTGAAACAGTACAGGTCCATGCCTTCCCACCGGGGAAAGCCCATGAGGTGCACCAGTGCCAACCTGGAGAGTTGATCCTTGACACAGGAAAGAGGCTTGGAGCAATACCCATTGATTTGGCAAAGGGAACATCTGGTAGCCCCATTC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TGGGTTCCTACCGGCCGCACGACATGGAGTATCCATGCTAGCGGGGCCTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGACGTCTGGAACCGAGTTTGGATTTTGGACAACCCTTTCATGCAGAACAAAGAGAGGATCATGGAGTGGAGGGACGTTCCATACCTCCCCAAGGCCCAAGACATGGTATGCTCCTCCCTTGTTGGAAGGAAAGAAAGAGCAGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGAGCGGTGGAAAAGGTGAGAAAGATGATAGGTCCTGAGAGGTTTAAGGATTATCTTTCCTGCATGGACCGTCATGACCTGCACTGGGAGCTCAAGCTAGAGAGCTCGATAATCTAAGCTCAACCTGTGACAGAGAAAAGCTTGAGGAGCCCGCAAGGGGACCATGGAGTGATGCGGCAGCGCGCGACAGCGACGGGGGAATGGTCGCACCCGACGCATCATCCATGAGGCAACAATTCGTGAGACCCCCCCTGGCCAGGAAAAAGGGGGGAACGGGCCAGGGGTGAAAGAAGCCCCCAGGGTGCACCACGGCAGCACGCCAGTGAGAGTGGCGACGGGAGAATGGTCGATCCCGACGTAGGGCACTCTGTGANAATTTGTGAGACCCCCCGCACCATGACAAGGCCGAACATGGTGCATTAAAGGGAGGCCCCCGGAAGCATGCTTCCGGGAGGAGGGAAGAGAGAAATTGGCAGCTCTCTTCAGGATTTTTCCTCCTCCTATACCAAATTCCCCCTCGACAGAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCTGAGCCACCATCACCCAGACMCAGATAGTCTGACAAGGAGGTGATGCGTGACTTG
| 54,133
|
NC_032730.1
|
Lucheng Rn rat coronavirus
|
Lin,X.D., Wang,W., Hao,Z.Y., Wang,Z.X., Guo,W.P., Guan,X.Q., Wang,M.R., Wang,H.W., Zhou,R.H., Li,M.H., Tang,G.P., Wu,J., Holmes,E.C., Zhang,Y.Z., Wang,C.Q., Ge,S., Mei,S.H., Shi,M., Lin,X.-D., Zhou,R.-H., Guo,W.-P., Zhang,Y.-Z.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2017-01-17
|
Lucheng-19
|
Lucheng Rn rat coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,763
|
RefSeq
| 2
|
China
|
China
|
Rattus norvegicus
| null |
2013
| null |
PRJNA485481
|
Lucheng Rn rat coronavirus isolate Lucheng-19, complete genome
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| 4,596
|
MT820625.1
|
Lucheng Rn rat coronavirus
|
Lin,X.-D., Zhang,H.-L., Wang,M.-R., Guan,X.-Q., Zhang,Y.-Z.
|
National Institute of Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Department of Zoonoses
|
China
|
2020-10-06
|
Lijiang-170
|
Lucheng Rn rat coronavirus
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,563
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Apodemus chevrieri
| null |
2015
| null | null |
Lucheng Rn rat coronavirus isolate Lijiang-170, complete genome
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| 46,553
|
MT820626.1
|
Lucheng Rn rat coronavirus
|
Lin,X.-D., Zhang,H.-L., Wang,M.-R., Guan,X.-Q., Zhang,Y.-Z.
|
National Institute of Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Department of Zoonoses
|
China
|
2020-10-06
|
Ruian-83
|
Lucheng Rn rat coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,599
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rattus norvegicus
| null |
2014
| null | null |
Lucheng Rn rat coronavirus isolate Ruian-83, complete genome
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| 46,554
|
MT820627.1
|
Lucheng Rn rat coronavirus
|
Lin,X.-D., Zhang,H.-L., Wang,M.-R., Guan,X.-Q., Zhang,Y.-Z.
|
National Institute of Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Department of Zoonoses
|
China
|
2020-10-06
|
Lijiang-71
|
Lucheng Rn rat coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,147
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Eothenomys miletus
| null |
2014
| null | null |
Lucheng Rn rat coronavirus isolate Lijiang-71, complete genome
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Lucheng Rn rat coronavirus
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Wang,W., Lin,X.D., Guo,W.P., Zhou,R.H., Wang,M.R., Wang,C.Q., Ge,S., Mei,S.H., Li,M.H., Shi,M., Holmes,E.C., Zhang,Y.Z., Hao,Z.Y., Wang,Z.X., Guan,X.Q., Wang,H.W., Tang,G.P., Wu,J., Lin,X.-D., Zhou,R.-H., Guo,W.-P., Zhang,Y.-Z.
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National Institute of Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Department of Zoonoses
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China
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2014-10-30
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Lucheng-19
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Lucheng Rn rat coronavirus
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 28,763
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GenBank
| 2
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China
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China
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Rattus norvegicus
| null |
2013
| null | null |
Lucheng Rn rat coronavirus isolate Lucheng-19, complete genome
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ACTTTTAGAGTATAATCTATTATACATAGATTTGCACTAACCCCTCTCTTGACTTCGGTCAACTCAACTCAACTAAACGAAATCCCTTTACATGGTTCCGTCCTGTGTAAGGGTGTGCATTTCGTGCAGCCTCTGCTCCTACTACGTGTAGCGGCAGAGACATTTCCAGGTTCGCACGTCTTGTAGGAAACGGTGTGTACTTTTAGTGTTTACGCTTGTATCGGTTCCGCCCGATAGGTATTGCACTAACAGTCTTGTGGGTTGTTCCGACCTTCCCCTTGTGTGGCACTCCTATTCCGACTAGTGAGGTCACCACACACGTCCTTTAGACATGGCCAACCAGTATGTACTGCGTATTGCAGACTGCACAAACATTCACTACGACCGCTTGTGGTCCCTTTCACGCGCTGTAACGGATTACGGAGCAGCAGCGGCTTGTGGATTCACCAACTGTAGGTTTGTAGCTTTTGGACTTGAGCACCTGCTTTACGGTTATGATGATGAACATTGGGTTTTGATTCTTTCCGGTAATCAGGTCCTCAATGTTGAACTAGGTCAGTTCAAGGATCGACCGGATAACATTTGTGGTTATCTCGTCATTTCTGACTGTACCTATTTTGAAGAAACTTTCGATCTCTTTCTTGGCAGAAGTCGTGGTGGCATAGCTCCTAATCCAATTTATGTGGATCAGTACCTATGTGGCCCAGATGGAACTCCTGTTAAGAAGGGTCTGGAGTTTAAGGATTACTTTATGAATGGGGGGGACATCTATGTGGAACCCGGCAAAACATACGTTCGCGTGTGGGATGTCGAGCGTAAGCAGGATGATCTTACTCTTGATGGAATTCTAAGCATTAAGTACCTCAGTGACAAGCCTCACAAACTTCGTGACGGTGCCATTCAGGGTGTTGCTGACGCTGTGAGCGAACTTAATGATACCAATCAGATGGTTCGTTTCATTCATGCCTTTGTCTCTTGCCCCTGTGGTAAGAGCGCATTCACCGTTGGTAGTTGGATGGGTTTTGCTACAGTTTGCTGTGGTAAAATCGTGAAGACTCCAATGTGCGTGAAATTCTCTGGTGAAGCGGGGTCCATCTTCGCTTTGCCAGTTGGTTCCCGTGGCTTTAGTGCTAACGGTAAGCGTAGCTATGCAGGCGCTGAATTTCAGTTTTGCTGTGAGCTTTCTGGCGTTGAGATTTGGTGTACTACAAAAACATTCTCCGTTGATGGGGTCTGTACTGTGGGCGCACATCTGATTACTGCTAGTGACCCAATCTATGCTACGCTCTTTCCCACTAACTGCATGCTTGGAGATGATGGTCTATCCACAGATTATGATCTGTGCTACTCCATCATTGCTAAGTGTGCTAATGATGGTTTGTCCCAGCGTATTATCAGAGGAGCTTTGAATGCTTCTGCACAACTCTTCTCTAATACAGTGGACTTGTTTATGTCTGCAAAACTGTGGTTTATGGAGCATTGCACACCCATGTTTTCTTCAGCAATGAAGTATCTATGGGATGCTATTAAGAAATTGGCCTGTACCACGAAGGAGCTCAAACGATTTTGGGATCATCTTTGTAATGCCAAGCTCTATGTTGAAAATCACATTTTGCGTTTTAGCATTACTACTTCCACTAAATTTAAGAACATTGTTGGACGGTTTCTTGAAATGCTTCGAGTTTCCTTTAACATTCTTTGTATTGATGCTAGCGACCGTTACTTTTGCTGCAAGGATGTCACTGGTACAAACCTCAAGCTTTTCAAGACTCTGCTTGTCTCTTGGTACGAGAGTGTCATAAACGGTGCTAAGGAGGCTGGTTTAACTACTGCAAAGTACTTTACCAGCGTTACTGGCAAACTGCGTGCAGTTACTGTGCGTAGAACCGAGGCTGGTGGTGACACTGTTCTAGAGGAAGTAGACGATAAGGTGGATCCTCCTCCAAGTGGAATCTGTCGTCTAATTAATGACTACGCATTCTACTATGGTGGTGGTTATTACTTTCCACTTACGGCATCTGATCAGATTATTGAGGGTGCTGTTTTTAAAGCTGCTGGTAGTCCTCTGGCTACAGATGATGAGCAGCCCTTCGTGGAGAAGCCACCTAATGTTAAACTTGAATTCGAGTTTGACAATGATTTAGTTATGTCTTTTCTTAGAAAGTCTTTAGGGACTTCTTCGAAAGGATTCCACAATTTTGATGATTTTGAAGAGTATATGCAAGGGAAAATTGAAAAGCTGCGTCAAGCTGTTGCCGCCGCTGAGTATGACTTTGAGATACCAGAGTGCTACATATATAGTTGCAATGGCACCTATGAGATGGCACATACCATGCGTATCTCGGAGTTTTCCTTTGATGATGACCCAATTATGGAAGAACTTGTAGCTGTTTCAGAAGAATGTGCTTGTGATGATGCTGCTGAAGAATCTGGTGCCAACGCTGATGACGTTGATGATGTCGACAGTGTTGCTGACGAGACTGATGTTGCAGATGATTGTGTACAGAGTGATGAGCCAGTTACACAGGAATCAGATAGTGTTGAAATCGATTGTGCACCTCTTGAGAGCACCATCGCCGACGACACTCTCTATTTGGGTCGCAGTGAATTCTGGAAAAATCATTGGAATTTGGATTGTAAACCTATGGTAAGTAAGGAAGTTGAAGGCATGAAATTTTGGTTTCCTGCTTTTAACGAATGGAATTGTACTATTAGAACTCTAGCTGTCTTTGTTGGGCAAATGTTTAGGCTCGCTGGTGATGATCTTAAATGGTGTGATATGGAACTACAGAAATTGTGGGAAACCAAATCACAGTATCTTTGGTATAAGTTAGCAGTTGCAGCTGAGCCGGACAAGGTTGAACGTGGAAATGAGGGTAGCTATTCTGGAAACGGGATGGATTACAACACTGTTTTTCGCGTGGCATTACGTAAACTTAAACTTAGCAATGCTAAGGCTTGCTGGGTTTGTAAGTGTGGTGCTCAAGTTGAACTTGATGGTCTGGATGCATGCGTTGGACACTTTTCGAAGGTCCAGTGCTTATGTGGCGCTATCATGGTTGCACGTGAGCTTAAAGTTCCCTTTGAGCTCATTGCACCAGGTTACGCTATGGGGCCTGTCGACATTGCCTTGTCTCGTGCATGTGTTGTTGCAGCTATTGGTTATATGGCTACAGCACATACATCCGCTGTTGTTCATGTTGGAGCTAGACCTCTGCTGATTGATGATGATAATGATGTTGCTTTTGATTATAAGCCACTGCCCTATTATGCATACGCCGTTCTCAATCGTGGTTACACTGTTGAGAGCGATGATGTATCTTTTGAGGGTGGTGTTGCGCAATACGAATGTAACATCAGCTTTGCAAAGAAACCCTTTTCAAAGTTACACACCAAATATCAGCATGTTCTTCTCCCAGGCATGTTTCCATGCATAGAAGGAACTAATGGTGCAAAATTGCTTACAGATCTAGGTTTGCAAAACCTTAAACCTGGTATTATTGGTGCTCTACACGAGGCTGGTTCGTACTGGTGCTCTGTTACATCAGGAACCACCACCTACCACTGCCTTGGAAATCCGAACGGATTTAATGCACGTGATCAGCTTCGCACCGCAATCAGTAAGTGCCCAGATGGTAGCGAAATCCTCTTTCCTAAAGTGAATATTCGCATTCGCGATCTGGTACTTGTCTGTGCTAGTAAGAAGCTTTCTTTTGTTCTCGCTGACTACGATGCAGATGATTTTAATGCTCATGTCGCAAAGGTTCACACTAAGTTTCCAGTGACGGCCATTGACGATAGGGGTGGTTATAAACATCTGCGCCTCCGTGATAATAATTGTTGGGCCAATGCAGTCTTTGTGGGACTTCAGCTCTGCGACTACTACACGAAGGATGACATGGTCTGGCAATGTGCTCTTCGTGGCGCCAATTCCAGGTTTCTTGAGAAGCTATATAACGCTAATAAGACATTTTATGGTTCAACAGCAGATGCAGCGCAGGCTCTTGAGAGGTTGCTTGATGGTGATGCTTGCATGACTGTCAAGCTTGCACTCTCCTGCTTCTGCGGTGACAGTACTGTTGAACTGCGTAGTAGTGTGCTCAAGTTCAGACCTATTAATGGCTTTTTTGATTATGGTTATTGCAATGTCTGTGAAACAACAATTCAGGCACTCATCCTTCATGTAGAGGGTAAAGGCTTCTTTTGTTACACAGCCACTAAGGATAGTAAGATGCTATTTCCAGGTTGCGTCGGTGAAATTGTCTACACGGGTCCCGATCAGGGTGGCCACTACTATATTAAGTATGGTGGTGGATATCATGATGGTACTGGTTCTAGGCGTTCTGCTGATGCTCGTAGCCAGGTTGCTGTCTACAATGTTGATGGCTTACCAGAACCTCTTTTTGTTAGACAAGGTGTTAGATTTTATAAGGCAGATTTCACAGTCATGCTTAAATTTAAGCCTGCTTGTGTTGTTAATGCTGCTAATTCCAACTTATCACACGGGGGTGGTATTGCCAGAGCCATAAACCAAGCTACTAATGGTGAGTTGCAGAAGCTTTCTGATCGCTGTAGGAACAAGCCTAAGGTAGGTTCCTGCACAGCTGTAAAGTGTAGAAATTTTGAAGTTCTTAATGCAGTTGGTCCTCGTGATACTGATACTAATGTAGATGGTTTGTTGCGCAGTGCCTATGACTCTGTTAGAAAACAGGGTCATGGGCTTGTTGTGACACCACTTCTTAGTGTTGGTATATTTAATGTCCCAATTGCAACATCATTGGCGCAGTTTCTTGATGCTTTTGATGGTTTTACTAATTTCTATTGTTATGTTTACACTGATGCTGAAGCTGCTGCACTCTATCAGTATTTTGAGAACCTCAATAGTTTGACTTTTGAGGCTGCTGTGTCCTCAGGTGATGTTGAACCTACTCAAATTACTGAGGATGTCACTGTTACATTTGGTACCACTGACACCTCAAGTATTGAGGAGGTTCTTGCCG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| 88,764
|
OR553423.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
Hok1-Y
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,854
|
GenBank
| 1
|
Japan: Hokkaido
|
Japan
|
Glycine max
| null |
1981
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate Hok1-Y, complete genome
|
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| 9,407
|
OR553424.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
Hok2-D
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,696
|
GenBank
| 1
|
Japan: Hokkaido
|
Japan
|
Glycine max
| null |
1981
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate Hok2-D, complete genome
|
AGTAAAGTTGACACCTTTACAGAAGTGTTCTTGCTAGTAAGAGTTATTTCCTTGTGAAGTAATACAAGAACCTCCTCCCGGCATCTTCGTATCGTGTTTGAGGAATCTCTAGTGTTATTGTTGGTTATGTTTAACTTCGATAGCTTAGTTACAGCCACCGCTAGGGTGGTTAAAGATTTTATTTCTTTTTGCTACAGCAGGGCACGGCATGTTTATTATGCCCTAAAAAGATGGCTCTGGGAACTCCAGGGTGTATTTGCTGCACATGACGCCTTTGTCGACATGTGCTATGACGCCATGTATGGCGTTGAGGAGTTCGAGTGGGAACTGCAAAAGCAGTATTCCACTGCAGAGATTGACGTGCAACTAGCTGAGCACGAATACAAGCGCCTACTTGCCGATGGCGCTCCACTAGGGTCATGGCCACAACCATGTGCGCCCCAAGGCTCATTCAGGTCGTCTGACGACTTTGATGTAGCTGCTAGGGCTGCTGAGGCAAACCCTATTGTGGACCCACTACCCTCCTTAATTAAAGGGTGTGGCGATAAATCACCTTCCAATCCCACTAGGATTGAGAAGTTCATCAACCTCGTTCAAAAGAAGGAGGTACTTTCCGCTACTGAGGCTCTAATCAGACATACATATGAAGAGCAAATCGGTGAATCACCATTCGGAAAGTGGTTCAACACTCTGCCCAATAGAATGAATCACATTAAGAGGGCAGCAGCAAAACAAGCCAAGGCGGCTAAACGATCTGAATCTGTCCGCCAAATGGTTACTGAGGTAAACGTCATCCCCGACTTTATCTCTTGCTGTGATGTTGTCCAGGTGGACACTGGTGAAAAGCTCCCTTCTAAGAAAGATAAAGAAGGGAATGAATTGCCACCTGAGCCTAAATTTAAAATGTTTAGAAGGGTGAAGCCTGAGCATGTTGGTGATGCCAGGAAATACATCTGTCAACACATTCGCAACAATAATATGAGGTTGATAGACGGCTCTGATGTTTCTCATGCAACCATCAACCGATATGCGCTCAAGTTCTGCGAAGACTTGGAGCTTGATATGACCAGTACTGAAATGCTTATCAAATATGCAATGGTCATGGTCCCACTACCTCGAAAATCTGATATTGAGGCTGCTAAAATCGTCCAATCTCCTGCTGCCAGGCAAATAAGGCATGAGTTGGGCGTGCTTAACGCCGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCTATTTTGGGGTTGCCAGAGATCGTGGTGCGAAGTGGGGCTATCCCTAGGAAGAGTCGTAGTACTATTAATTATTTGAGTCAGTTTAGCTTAGGTCTAGATTACCAATGCCCTAATCCCAGTTTACACAACGCATTGGTGGCGGTTGAACGTAGAGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTAGTGTTACCTTACAAGAACATACCAGGAATCTTCTCTAATCTTGATTATTTCCGCAAATCCATTGTGGATAAGGTTGGTTGTCCTAGGACGTTCTCCCCTGAAGAACTTGCAGCGACGTACCACTCTGGTAAGAGGACGTTGTATAACGCTGCTGTGCATAGTCTTAAACGTAAGGCTATTGAGAGGAGTGACGCGAATGTGACAGCTTTCCTCAAGATGGAGAAACATCTTATGTGTAAGAAGATAGCACCCAGGTTGATATGTCCTCGTAACAAAAGATATAATGTTGAATTGGGACGTCGATTGAAATTCAATGAAAAGAAATTCATGCATGCAATCGACTCAACTTTTGATTCCCCAACTGTATTAAGTGGATATGATAGTTTTAAAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCGAAATTCAAACGACCAGTTGCAATAGGTGTTGATGCAAGCAGATTTGATCAACATGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCACTCAATCTACAACGGTGCATTTAATGACCCCATTCTGAAGGAGTTGCTTCACTGGCAAACAGAGAACAAAATAATGCTGTTTGTTGAAGATAAAATCCTCAAGTTTAAGGTCAAAGGACACAGAATGTCCGGCGACATTAACACCTCTTCTGGCAACAAATTAATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAGTCACTTGGAGTCAAAGCCGAACTCTGCAATAACGGCGATGATTGTGTTATCATTTGCGAGAAGAAAGATGAAAATAAGTTCTCACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGGTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCAGTTAAAATTAATGGCTATTATAGAATGGTGCGTAAACAAGAAAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTCATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACATTTATGAGTGCCACCGCTCAATGCGGGATGATCTTGAATAGTGGTGTACCTGTTCTTGATGCTTTTCACAAATGCCTATACAAAGCATCGGGGTACAAGAAAGTGTCGCAGGAAGCGATCGAGAGGATAGTCTCCTTCGGAACGCAGGACAAACTCGGGCTTAGGAAAGAGCGAGTTGAAGAACCGATAACGATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCTTTGGGGTTGACCCGCAGACACAGGTCCTTGTCGAACGATATTTTGACAATCTGCAGGTCCATATCGAACCCCGCGGCGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTCGATAAGACTTTGCTTTCAATTGCGAGTGTAGCACGAACATCTGTGTCGCTACCAATACTTTCAAAATAGAGGCACTCATAATCACCATAGTAGTTATAATACTAGTAGTAGTTAGTTGTTTAGATTACACTAGTTCGTACAAGTAAGTTGCAACGGATTACCGATTTTTATCTGGTTTTGCTATCGGCTTCATAGCTAGCATACCAATATCAATATTGGCAATTTACTTTGTTTACCTAAAAATTTCAAAGAATCTGAGAGGAATCATCAACGAATATGGTCGCGGTTAGCAATGTCACAATACAACGACGACGCAATCGTAGGGTCGCACGAAGCACTCCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGACCACCAGCGCAACACAGCGCAGAAGAAGACAACGACGACGAAGGAGAAATAATAGAGGAGGAGGCAATATTTCCGGAGGATCAAGCAAGGCTCACACATTCCAGTTTTCGAAGGACGGCATCAATGGCAGTTCCAAAGGAACTATCACTTTCGGGCCGTCTTTATCAGAGTGCAAGCCACTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTATCTTATTACAGTTCATCTCCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGCTCCATCGCTTATGAGCTTGACCCACACTGCAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCTCAATTACAAAGAGCGGTTCGAAACGATTCCCCACCAAGGTTATCAATGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGACCAGTTTAAGGTCCACTACAAGGGGAACGGAGACGCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCACGATCGTTGTCTTAACTCAGAATCCCAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGTCCGAAACCAGGTCCAGACCCAGCACCCCAGCCAACACCAACACCCGAACCAACGCCAGCCAAACACGAGAGATTTATCGCGTACACCGGTACGTTGTCCACGCTTATTAGTGCGCGACAGTCTTCTGACAGTATCTCACTCTACTCCATCCGGAGTCAGAGGATTAGATATATCGAAGATGAAAATTCCAGTTGGACGAACATAGATGCAAAATGGTACTCACAGAATTCTGTTGAGGCCATTCCAATGTTTGTTTATCCAGTGCCCGAAGGCACTTGGTCAATTGAAATATCTTGTGAAGGTTACCAGGCAGCGTCAAGTACATCAGACCCCCATCGTGGAAAATGCGATGGCATGATTGCTTACGACGACGATTCATCGAAGGTGTGGAATGTTGGTCAGCAGAATAACGTAACCATTACCAATAATAAGGCCGATAATGATTGGAAATATGGTCACCCTGATCTCACGATTAATGGTGACAGATTCGATCAGAATCAAGTAGTCGAGAAAGATGGAATCATTTCATTCCATTTAGTAACTACTGGCCCAAACGCAAGTTTCTTTCTCGTCGCTCCAGCTGTTAAGAAAACAGCTAAATACAACTTTTGTGTATCATATGGAGATTGGACGGATAGAGATATGGAGTTTGGAATGGTATCAGTAGTGCTCGATGAGCACTTGGAGGGAGCAAGGAGTTCTCAGTATGTTAGGAAAACGCTAAGACCAGGTCATATTAGCGTCAATCGTTCCCACCGATTGCAAGAAATGCCTCCCACGCGAGAGGATTTCAGTGAGGAAGATAATGGTAGTAGTGTTAATACATATATAACAGACAATTCTCCCATAACCGTTCACCTTGTTGATAACGAGGAGAATTATACAACAGATCAATCGGATGATGTTGACCCTACACTTCGTGATGCTGAAGTCATGAAGTTTGCTGGGTTTGTTGGAGCTAAAGACAGATTTGCACTACAAGGTGCCAAGCCAATTGGCCCTGGTGATAGATCTATCCGTAGATTCAAACCGTCCGCCACATTGAAGTCTGCGTTCCATTTGGGACCGACTCCCGATGAGTTGTATAATGCTGGTGCTGAACAAGCGGACCACGACTTCGAACACTTTGTCTCCCGTGGCAAAGAGAAGCTGCAAGAAGAAGATCCAATGGCTAAACTCGAAAGAGAGGTTGAGGATCTGAAACCTGACAGTGACAACGAAGGTAACGATTATGATCAAACCGCACTGTTCAATCCAGCAGATGGTGACCCCTGGTCCGGCATTAATATTAAGCCAAGATTGAAAGACCAAGATATGAGGTCCACCTTAAGCACCGGCACCTTGAAAGGTGGTTCACTGAGA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| 9,408
|
OR553425.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
NZ-Y
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,854
|
GenBank
| 1
|
New Zealand
|
New Zealand
|
Trifolium repens
| null |
1986
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate NZ-Y, complete genome
|
AGTAAAGTTGACACCTTTACAGAAGTGATCTTGCAAGCAAGAGTTAATTCCTTGAGAGTTAATACAAGATCCACCTCCCGGCATCTTCGTATCGTGTTTGAGGTATCTCTAGTGTTTGGTTGTTTAAATACTAGTTAATTTTAATGTTTAGTTTCGATAGTTTAGTGTCGGCCACCGCTAAGGTGGTCAAAGATTTTATACATTTTTGTTATAATAGGGCGAGGCATGTTTATTATGCTCTCAAACGCTGGCTCTGGGAACTCCAGGGCGTGTTTGCTGCACATGACGCATTTGTGGACATGTGTTACGACGCCATGTATGGTGTCGAAGAGTTTGAATGGGAGCTGCAAAAGCAGTTCTCAAGTGCCGAACATGACGTGCTTATCGCCAAGCACGAATTTGAGCGCCTGTTAAGGGATGGCGCCCCATTGAGGACATGGCCACAACCATGTGCTCCCATTGGCAGTTTCCGGTCGTCTGATGACTTCCAAGAGGCTGCTAGGGAAGCTGAAAACCTGTCCTTAATGGACCCAGAACCCTCCTTGATTAAAGGGTCTGGTGATTACTCGCTTGACAATCCTAATAGGATTGAAAAGTTCATTAACCTCGTTCAAAAGAAGGAGGTACTTTCCGCCACCGAGCAAATGATAAAACATGCTTATGAAGAGCATATCGGTGAGGCACCATTCGGAAAGTGGTTCAACACCCTACCCTCTCGTATGAATTATATTAAGAGGGCTGCTTCAAAGAAGGCCAAGGCGGCTAAGAGATCAAACTCTGTCCGCCAAATGGTAAACGAGGTAAATGTCATTCCTGACTTTATCTCAATATGTGATGTTGTCCAGGTGGATACTGGCGAGAAGCTCCCCCCCAAGAAAGACAAAGACGGGGAGCCATTAGAGCCTGAACCCAAAATGAAAATGATGAGAAGGGTCAGGCCCGAGCATTATGGTGATGCTCGTTCATACATTAGGCAGCATATTCGCAATAACAACATGCGCCTAATTGACGGCTCTGATGTTAGCCATGCTACCATCAACCGATATGCTCTCAAGTTTTGCGAAGACTTAGAGCTTGATATGACCAGTACTGCAATGCTGGTTGATTATGCTATGACAATGGTGCCCATACCCCTCAAAAATGACATTGAAAGGGCGAAGATTGTCCATTCTCCTGCTGCCAGGCAAATTAGACAGGAGTTGGGCGTTCTAAACGCTGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCTATTTTGGGGTTACCAGAGATCGTGGTGCGTAGTGGAGCCACACCTAGGAAGAGTCGTAGTGTTATTAGCTTTCTTTCGCAGTTTACTTTAGGTCTAGATTACCAATGCCCTAATCCCAGTTTGCACAATGCATTGGTGGCGGTTGAACGTAGAGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTAGTGCTACCTTACAAGAACAAACCAGGAATATTTACTAATCTTGATTACTTTCGCGACTCAATTGTCAACAAAGTTGGTTGTCCAAGGACCCACACTCCTGAGGAACCAGCCGCAACGTACCACTCTGGAAAGAGAAGTCTGTACAATGCTGCAGTTCAAAGTCTTAAAAAGAAGGCGGTCGAAAGGAGTGATGCTAACGTGACAGCCTTTCTCAAGATGGAGAAACATCTTATGAGTAAGAAGATAGCACCCAGGTTGATATGTCCCCGCAACAAAAGATACAATGTTGAATTGGGACGTCGGTTGAAGTTTAATGAGAAGAAATTCATGCATGCAATCGACTCAACCTTTGAATCCCCAACTGTTCTTAGTGGATATGACAGTTTTAGAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCCAAATTTAAGAGACCAGTTGCAATAGGTGTTGATGCGAGCAGATTTGATCAACACGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCACTCGATTTACAACGGTGCGTTCAAAGATCCCATTTTAAAGGACTTGCTACACTGGCAGACAGAGAATAAAATTATGCTGTTTGTTGAAGATAAAATCCTCAAGTTCAAGGTCAAAGGACACAGGATGTCTGGCGACATCAACACCTCTTCTGGCAACAAATTGATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAGACACTTGGAGTCAAAGCCGAACTCTGCAACAACGGTGATGATTGTGTAATCATATGTGAACGGAAAGATGAAAACAAATTCCAACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGGTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCAGTTAAAATTAATGGCTATTATAGAATGGTGCGTAAACCAGAGAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTCATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACCTTCATGAGTGCTACCGCCCAGTGCGGTATGATCTTGAATAGTGGTGTACCCATTCTTGATGCTTATCACAAATGCCTATTTAAAGCATCAGGGTACAAGAAAGTATCGCAAGAAGCAATAGAAAGAATTGTCTCTTTTGGAACGCAGGACAAACTCGGGCTCAGGAAAGAGCGAGTTGATGAACCAATAACTATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCAGCGGGGTTGACCCACAGACACAGGTCCTTGTTGAACGATATTTCGACAATCTGTTGGTCCATATCGAACCCCGCGGTGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTAGATAAAACTTTGCTTTCAATTGCGAGTGTAGCACGAAATTCTGTGTCGCTACCAATACTTTCAAAATAACAGCACTCATTTTAACCATAGTAGTAATAATAGTAGTAGTAGTTAGTTTATTAGATTACGCTAGTACATACCGATAAATTGCAACGGATTACAAATTCCTATCAGGTTTTGCTTCTGGATTTATTTCCAGCATCCCTGTATCAATATTGGCAATTTATTTTGTCTACCTAAAAATTTCAAAGAATCTGCGCGAGATAATAAACGAGTATGGTCGCGGTTAGCAATGTCGCAATACAACGACGACGCAATCGTAGGGCAGCAAGACGCGCTCCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGGCCACCAGCCGACCACAACGCAGAGGACGACAACGACGACGAAGGAGAAATAATAGAGGAGGAAGCTATATTTCCGGAGGATCAGGCAAAGCTCACACATTCGTGTTTTCAAAGGACGGCATCAATGGTAGTTCCAAGGGAAGTATCACTTTCGGGCCGTCTTTATCAGAATGCAAGCCATTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTGTCTTATTACAGTTCATCACCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGTTCCATCGCTTATGAACTTGACCCACACTGCAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCAGTATCACAAAGAGCGGTTCGAAACGTTTCCCAACCAGAGCTATCAATGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGATCAATTCAAGATCCACTATAAAGGGAACGGAGAGTCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCTCGATCAATGTCCTAACGCAGAATGCTAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGTCCGAAACCAGGTCCAGACCCAGCACCCCAACCAACACCAACACCTGAACCAACGCCAGCCAAACACGAGAGATTTATCGCGTACACCGGTACGTTGTCTACACTCATTAGTGCTAGACAGTCTTCCGACAGTATTTCCTTATATTCCATCCGGAGTCAGAGGATCAGATACATCGAAGATGAAAATTCCAGTTGGACAAACATAGATGCAAAATGGTACTCACAGAATTCTGTTGAGGCCATCCCTATGTTTGTATATCCAGTGCCTGAAGGTACTTGGTCAATTGAGATCTCTTGTGAAGGCTACCAGGCAGCGTCTAGCACTTCAGACCCGCATCGTGGAAAATGCGATGGCATGATTGCTTATGACGACGATTCATCTAAGGTGTGGAATGTTGGCCAGCAGAACAATGTAACCATAACCAATAACAAGGCCGATAATGATTGGAAGTATGGTCATCCAGATCTAACGATCAATGGTGACAGATTCGATCAAAATCAAGTAGTCGAGAAAGATGGAATTATCTCATTCCATTTAGTAACTACCGGCCCTAATGCAAGTTTCTTTCTTGTCGCTCCAGCTGTGAAGAAAACAGCTAAGTATAACTTTTGTGTTTCTTACGGAGATTGGACAGATAGAGATATGGAATTTGGTATGGTATCAGTAGTGCTTGATGAGCACTTAGAAGGTGCAAGGAGTTCTCAGTACATTAGGAAATCGCCAAGACCAGGTCATTTTGGCGTCAATCGTTCTCACCGATTGCAAGATAGTTCCACTCCTGTGGAATATGTCAGTGAAGATGATAGTAGTAGTAGTAGTAATATAGTTAGTAATCGACCATCAACTCCGGTTAGTGATAGTGATGTCCAATTCGCAGAATCACTTAAGGGGAAGCTCCCAACACAATCGGAGCTTCCACCCAAAGGGTTCCTATCACGGTTAAGTGTCAAAGAAAAAGAAGAGATTTCTAAGTCAAGGCCTTCAAATGTTGAAAACCAGGTTGAGCCTCTCGTTAAAGCTTATGGATACCCGTCTCAGACAGGTGTTTATGATGCCGCCAGAGAGATCCTGCAAGCTAAAGAAGCTGCAGAAAACTTGGCCGAATTAGAAAGGGACTTAAAGGAAATCAACAGGCTAGAACCACCGGACGTAATAGTTCAGGAAGAAATCCCTGACTTTGTGCCGCCCTCGGAGAAGGTTGTTCAGGAAGATAATCCTGAATACATACCTCCGATTTGGCGTAATGCCGACCAGGCTGTGACGGTCTCATCATATGAGCCTCCAGACTGGAGTCGGCCAGCTAATGAGTCAGGTGACCCACCTAAGAAGGCAGGAACACTCAAAG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| 9,409
|
OR553426.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
SY-Y
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,855
|
GenBank
| 1
|
Syria: Aleppo
|
Syria
|
Lens culinaris
| null |
1994
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate SY-Y, complete genome
|
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| 9,410
|
OR553427.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
KY-Y
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,857
|
GenBank
| 1
|
USA: Nebo, KY
|
USA
|
Trifolium repens
| null |
1990
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate KY-Y, complete genome
|
AGTAAAGTTGACACCTTTACAGAAGTGATCTTGCTAGTAAGAGTTAATTCTTTAAGAGTTAATACAAGATCCACCTCCCGGCACCTTCGTATCGTGTTTGAGGTATCTCTAGTGTTTGGTTGTTTAAATACTAGTTAATATTAAATGTTTAATTTCGATAGTTTAGTGTCGGCCACCGCTAAGGTGGTCAAAGATTTTATACATTTTTGTTATAATAGGGCGAGGCATGTATATTATGCTCTCAAACGCTGGCTCTGGGAACTCCAGGGAGTGTTTGCTGCACATGACGCTTTTGTCGACATGTGCTACGACGCTATGTATGGCGTCGAAGAGTTTGAATGGGAGCTGCAAAAGCAGTTCTCAAGTGCCGAACATGACGTGCTGGTCGCCAAGCACGAATTTGAGCGCCTGTTACGGGATGGCGCCCCATTAAGGACATGGCCACAACCATGTGCTCCTGTCGGTAGTTTCCGGTCGTCTGACGACTTCCATGAAGCTGCCAAGGAAGCTGAAAACTTGTCCTTGATGGACCCAGAACCCGAATTGATTAAAGGGTCTGGTGATTACTCACTTGACAATCCTAACAGGATTGAAAAGTTCATCAACCTCGTTCAAAAAAAAGAGGTACTTTCCGCCACCGAGCAAATGATTAAACATGCTTATGAAGAGCATATCGGTGAAGCACCATTCGGAAAGTGGTTCAACACACTGCCCTCTCGGATGAATTACATCAAGAGGGCTGCTTCAAAGAAGGCCAAGGCGGCCAAGAGATCCAATTCTGTCCGCCAAATGGTAAACGAGGTAAACGTCATTCCTGACTTTATCTCAATATGTGAAGTTGTCCAGGTGGACACTGGTGAGAAGCTCCCCCCCAAGAAAGATAAAGACGGGGAGCCATTAGAGCCTGAACCCAAAATGAAAATGATGAGAAGGGTCAGGCCCGAGCATTATGGTGATGCTCGTTCTTACATAAGGCAGCATATTCGCAACAATAACATGCGCCTTATTGACGGCTCTGATGTTAGCCACGCTACCATCAACCGATATGCTCTTAAGTTTTGCGAAGACTTAGAGCTTGACATGACCAGTACTGCGATGCTGGTTGATTATGCTATGACAATGGTGCCCATCCCCCTCAAGAATGATATTGAAAGGGCGAAGATTGTCCACTCTCCTGCTGCCAGGCAAATAAGGCAGGAGTTGGGCGTTCTAAACGCTGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCCATTTTAGGGTTACCAGAGATCGTGGTGCGTAGTGGAGCTACACCTAGGAAGAGTCGTAGTGTAATTAGTTTTCTTTCGCAGTTTACTTTAGGTCTAGATTACCAATGCCCAAATCCCAGTTTACACAATGCATTGGTGGCGGTAGAACGTAGAGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTAGTGCTACCTTACAAAAACAAGCCAGGAATATTTTCCAATCTTGATTACTTCCGCGACTCAATAGTCAACAAAGTTGGTTGTCCAAGGACCCATACTCCTGAGGAACTTGCGGCAACGTACCACTCTGGAAAGAGAAGTTTGTACAATGCTGCTGTTCAGAGCCTCAAAAGGAAGGCAGTCGAAAGGAGTGATGCTAACGTGACAGCCTTCCTCAAGATGGAAAAACATCTGATGAGTAAGAAGATAGCACCCAGGTTGATATGTCCTAGAAACAAAAGATATAATGTTGAGTTAGGACGTCGATTGAAGTTTAATGAGAAGAAATTCATGCATGCAATCGACTCAACCTTTGAATCCCCAACTGTTCTTAGTGGATATGACAGTTTTAGAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCTAAGTTCAAAAGACCAGTTGCAATAGGTGTTGATGCGAGCAGATTTGATCAACACGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCACTCGATTTACAACGGTGCATTTAAGGATCCCATTCTCAAGGAGTTGCTACACTGGCAAACAGAAAACAAAATTATGCTGTTTGTTGAAGATAAAATCCTCAAGTTCAAGGTCAAAGGGCACAGAATGTCCGGCGACATCAACACCTCTTCAGGCAACAAATTAATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAAACACTTGGAGTGAAAGCCGAACTCTGCAATAACGGCGATGATTGTGTAATCATATGTGAGCGGAAAGATGAGAACAAATTCCAACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGGTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCAGTTAAAATTAATGGCTATTATAGAATGGTGCGTAAACCAGAGAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTCATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACTTTCATGAGTGCGACCGCCCAGTGCGGTATGATCTTGAATAGTGGTGTACCTGTTCTTGATGCTTATCATAAATGCCTATTTAAAGCATCGGGGTACAAGAAAGTATCGCAAGAAGCTATTGAAAGGATAGTCTCTTTTGGAACGCAGGACAAACTAGGGCTCAGGAAAGAGCGAGTTGAGGAACCAATAACAATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCAGCGGGGTTGACCCTCAGACGCAGGTCCTTGTCGAACGATATTTTGACAATCTGACGGTCCATATCGAGCCCCGTGGCGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTAGATAAAACTCTGCTTTCAATTGCGAGTGTAGCACGAACATCTGTGTCGCTACCAATACTTTCAAAATAGGAGCACTCATAGTAACCATAGTAGTAATAGTAATAGTAGTAGTTAGTTTATTAGACTACTCTTGTTCGTACAAATAAATTGCAACGGATTACAAATTCCTATCAGGTTTTGCTTCTGGATTCATTTCCAGCATTCCTGTATCAATATTGGCAATTTATTTTGTCTACCTAAAAATTTCAAAGAATCTGCGCGAAATAATCAACGAGTATGGTCGCGGTTAGCAATGTCGCAATACAACGACGACGCAATCGTAGGGCAGCAAGACGCGCTCCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGACCACCAGCAGACCACAACGCAGAGGACGACAACGACGACGAAGGAGAAATAATAGAGGAGGAAGCTATATTTCCGGAGGATCAGGCAAGGCTCACACATTCGTGTTTTCAAAGGACGGCATCAATGGTAGTTCCAAGGGAAGTATCACTTTCGGGCCGTCTTTATCAGAATGCAAGCCACTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTATCTTATTACAGTTCATCACCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGCTCCATCGCTTATGAGCTTGACCCACACTGCAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCAGTATCACAAAGAGCGGTTCGAAGAGATTCCCCACAAGAGCTATCAATGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGATCAATTCAAGATCCACTACAAGGGGAATGGAGACTCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCTCGATCAATGTCCTAACACAGAATGCTAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGGCCGAAACCAGGTCCGGACCCCACACCCCCACCAGCACCACCACCTGAACCGACGCCAGCCAAACATGAGAGATTCATTGTTTACACCGGTACCATGTCAACACTCATCAGTGCTCGACAAAACTCGGACAGTATATCACTCTACTCAATTAGAGACCAGAGGATTAGGTATATTGAAGACGAGAACGCCAACTGGACGAACATTAAAGCGCAATGGTATTCACAGAACTCTGTGGAAGCCGTTCCAATGTTTATCTACCCAGTTCCGCAAGGTACGTGGTCAATTGAAATCTCATGTGAAGGCTACCAGGCAACGTCGAGCACCACAGATCCCCACCGGGGGAAGTCTGATGGAATGATTGCTTACGACGATGATCAAAACAAGGTGTGGAATATTGGTGTGCAAAATAATGTAACCATAACCAACAACAAGGCCGATGCTGATTGGAAATACGGACACCCAGATTTAACGATCAACGGTGAACGTTTTGACCAGAAGCAAGTAGTCGAGAAAGATGGAACAATTTCGTTTCATTTAGTAACTACTGGGCCTAACGCGAGTTTCTTTTTAGCCGGCCCTGCCGTTAAGAAGACTGCCAAGTACAACTTTTGTATATCATACGGAGCTTGGACAGATCGCGATATGGAATTTGGTTTGGTATCAGTTGTTCTTGATGAACACTTAGAGGGTGTTAGAGGTTCTCAGTACGTTAGGAAAACGCTAAGATCAGGTCATGTTAGCGTCAATCGTTCTCACCGATTGCAAGACAGTTTCACGCCGGTGGAATATGTCAGTGATGAAGATATTAGTAGTAGTAGTAGTATAGTTAGTAACCAACCATCAACTCCGGATAATGGTAGTGATGCCCAATTTGTTGAATCATTGAAAGGCAAGCTTCCAACACAGTCGAAGCTTCCTCCTAAAGGGTTCCTATCAAGGTTAAGTGCCAAAGAAAAAGAAGAGATCGCTTCTTCGAAGCCCTCCAACGTTGAACGCCAAGTTGAACCTCTTGTTAAAACCTATGGATATCCGTCTCAAACGGGTGTTTATGAGGCTGCTGAAGAGATACTGCGAGCTAAAGAAGCAGCAGAAAACTTGGCAGAATTAGAAAGGGATTTGAAGGAGATCAATAGGCTAGAACCTCCGGATACAATAGTTCAGGAAGAAATCCCTGACTTCATACCACCATCGGAGAAGGTGATCCAGGAAGATGATCCTGATTACGTACCTCCGATCTGGCGGAATGCCGACCAGGCTGTGACGATTGCAACAAATATCGTGCCGGACTGGAGTCGGCCAGCTTATGAGTCAGGTGATCCACCTAAGAAGGCGGGAATACTCAAG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| 9,411
|
OR553428.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
MD1-Y
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,855
|
GenBank
| 1
|
USA: Frederick Co., MD
|
USA
|
Trifolium repens
| null |
1986
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate MD1-Y, complete genome
|
AGTAAAGTTGACACCTTTACAGAAGTGATCTTGCTAGTAAGAGTTAATTCTTTAAGAGTTAATACAAGATCCACCTCCCGGCACCTTCGTATCGTGTTTGAGGTATCTCTAGTGTTTGATTGTTTAAATACTGGTTAATATTAAATGTTCAATTTCGATAGTTTAGTGTCGGCCACCGCTAGGGTGGTCAAAGATTTTATACATTTTTGTTATAATAGGGCGAGGCATGTATATTATGCTCTCAAACGCTGGCTCTGGGAACTCCAGGGAGTGTTTGCTGCACATGACGCTTTTGTCGACATGTGCTACGACGCTATGTATGGCGTCGAAGAGTTTGAATGGGAGCTGCAAAAACAGTTCTCAAGTGCCGAACATGACGTGCTGGTCGCCAAGCACGAATTTGAGCGCCTGTTACGGGATGGCGCCCCATTAAGGACATGGCCACAACCATGTGCTCCTGTCGGTAGTTTCCGGTCGTCTGACGACTTCCATGAAGCTGCCAAGGAAGCTGAAAACTTGTCCTTGATGGACCCAGAACCCGAATTGATTAAAGGGTCTGGTGACTACTCACTTGACAATCCTACCAGGATTGAAAAATTCATCAACCTCGTTCAAAAGAAGGAGGTACTTTCCGCCACCGAGCAAATGATTAAACATGCTTATGAAGAGCATATCGGTGAAGCACCATTCGGAAAGTGGTTCAACACACTGCCCTCTCGGATGAATTACATCAAGAGGGCTGTTTCAAAGAAGGCCAAGGCGGCCAAGAGATCCAATTCTGTCCGCCAAATGGTAAACGAGGTAAACGTCATTCCTGACTTTATCTCAATATGTGAAGTTGTCCAGGTGGACACTGGTGAGAAACTCCCTTCCAAGAAAGATAAAGACGGGGAGCCATTAGAGCCTGAACCCAAAATGAAAATGATGAGAAGGGTCAGGCCCGAGCATTATGGTGATGCTCGTTCTTACATAAGGCAGCATATTCGCAACAATAACATGCGCCTTATTGACGGCTCTGATGTTAGCCACGCTACCATCAACCGATATGCTCTTAAGTTTTGCGAAGACTTGGAGCTAGACATGACCAGTACTGCGATGCTGGTTGATTATGCTATGACAATGGTGCCCATTCCCCTCAAGAATGATATTGAAAGGGCGAAGATTGTCCATTCCCCTGCCGCTAGGCAAATAAGGCAGGAGTTGGGCATTTTAAACGCTGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCCATTTTGGGGTTACCAGAGATCGTGGTGCGTAGTGGAGCTACACCTAGGAAGAGTCGTAGTGTAATTAGTTTTCTTTCGCAGTTTACTTTAGGTCTAGATTACCAATGCCCAAATCCCAGTTTACACAATGCATTGGTGGCGGTTGAACGTAGAGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTAGTGCTACCTTACAAAAACAAGCCAGGAATATTTTCCAATCTTGATTACTTCCGCGACTCAATAGTCAACAAAGTTGGTTGTCCAAGGACCCATACTCCTGAGGAACTTGCTGCAACGTACCACTCTGGAAAGAGAAGTTTGTACAATGCTGCTGTTCAGAGCCTCAAAAAGAAGGCAGTCGAAAGGAGTGATGCTAACGTCACGGCCTTCCTCAAGATGGAAAAACATTTGATGAGTAAGAAGATAGCACCCAGGTTGATATGTCCTAGAAACAAAAGGTATAATGTTGAGTTAGGACGTCGATTGAAGTTTAATGAAAAGAAATTCATGCATGCAATCGACTCAACCTTTGAATCCCCAACCGTTCTTAGTGGATATGACAGTTTTAGAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCTAAGTTCAAAAGACCAGTTGCAATAGGTGTTGATGCGAGCAGATTTGATCAACACGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCACTCGATTTACAACGGTGCATTTAAGGATCCCATTCTCAAGGAGTTGTTACACTGGCAAACAGAAAACAAAATTATGCTGTTTGTTGAAGATAAAATCCTCAAGTTCAAAGTCAAAGGGCACAGAATGTCCGGCGACATCAACACCTCTTCAGGCAACAAATTAATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAAACACTTGGAGTGAAAGCCGAACTCTGCAATAACGGCGATGATTGTGTAATCATATGTGAGCGGAAAGATGAGAACAAATTCCAACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGGTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCAGTTAAAATTAATGGCTATTATAGAATGGTGCGTAAACCAGAGAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTTATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACTTTCATGAGTGCGACCGCCCAGTGCGGTATGATCTTGAATAGTGGTGTACCTGTTCTTGATGCTTATCATAAATGCCTATTTAAAGCATCGGGGTACAAGAAAGTATCTCAAGAAGCTATTGAAAGGATAGTCTCTTTTGGAACGCAGGACAAACTAGGGCTCAGGAAAGAGCGAGTTGAGGAACCAATAACAATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCAGCGGGGTTGACCCTCAGACGCAGGTCCTTGTCGAACGATATTTTGACAATCTGACGGTCCATATCGAGCCCCGTGGCGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTAGATAAAACTTTGCTTTCAATTGCGAGCGTAGCACGAACATCTGTGTCGCTACCAATACTTTCAAAATAGGAGCACTCATAGTAACCATAGTAGTAGTAGTAATAGTAGTAGTTAGTTTATTAGACTACTCTAGTTCGTACAAATAAATTGCAACGGATTACAAATTCCTATCAGGTTTTGCTTCTGGATTCATTTCCAGCATTCCTGTATCAATATTGGCAATTTATTTTGTCTACCTAAAAATTTCAAAGAATCTGCGCGAGATAATCAACGAGTATGGTCGCGGTTAGCAATGTCGCAATACAACGACGACGCAATCGTAGGGCAGCAAGACGCGCTTCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGGCCACCAGCAGACCACAACGCAGAGGACGACAACGACGACGAAGGAGAAATAATAGAGGAGGAAGCTATATTTCCGGAGGATCAGGCAAGGCTCACACATTCGTGTTTTCAAAGGACGGCATCAATGGTAGTTCCAAGGGAAGTATCACTTTCGGGCCGTCTTTATCAGAATGCAAGCCACTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTGTCTTATTACAGTTCATCACCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGCTCCATCGCTTATGAGCTTGACCCACACTGCAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCAGTATCACAAAGAGCGGTTCGAAGAGATTCCCCACAAGAGCTATCAATGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGATCAATTCAAGATCCACTACAAGGGGAATGGAGACTCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCTCGATCAATGTCCTAACACAGAATGCTAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGGCCGAAACCAGGTCCGGACCCCACACCCCCACCAGCACCACCACCTGAACCGACGCCAGCCAAACATGAGAGATTCATTGTTTACACCGGTACCATGTCGACACTCATCAGTGCTCGACAAAACTCGGACAGTATATCACTCTACTCAATTGGAGACCAGAGGATTAGGTATATTGAAGACGAGAACGCCAACTGGACGAACATCAAAGCGCAATGGTATTCACAGAACTCTGTGGAAGCCGTTCCAATGTTTATCTACCCAGTTCCGCAAGGTACGTGGTCAATCGAAATCTCATGTGAAGGCTACCAGGCAACATCGAGCACCACAGACCCCCACCGGGGGAAGTCTGATGGAATGATTGCTTACGACGATGATCAAAACAAGGTGTGGAATATTGGTGTGCAAAATAATGTAACCATAACCAACAACAAGGCCGATGCTGATTGGAAATACGGACACCCAGATTTAACGATCAACGGTGAACGTTTTGACCAGAAGCAAGTAGTCGAGAAAGATGGGACAATTTCGTTTCATTTAGTAACTACTGGGCCTAACGCGAGTTTCTTTTTAGCCGGCCCTGCCGTTAAGAAGACTGCCAAGTACAACTATTGTATATCATACGGAGCTTGGACAGATCGCGATATGGAATTTGGTTTGGTGTCAGTTGTTCTTGATGAACACTTAGAGGGTGTTAGAGGTTCTCAGTACGTTAGGAAAACGCTAAGACCAGGTCATTTTAGCGTCAATCGTTCTCACCGATTGCAAGACAGTTTCACGCCTGTGGAATATGTCAGTGATGAAGATATTAGTAGTAGTAGTAGTATAGTTAGTAATCAACCATCAACTCCGGATAATGATAGTGATGCCCAATTTGTTGAATCATTGAAAGGCAAGCTTCCAACACAGTCGAAGCTTCCTCCTAAAGGGTTCCTATCAAGGTTAAGTGCCAAAGAAAAAGAAGAGATCGCTTCTTCGAAGCCCTCCAACGTTGAACGCCAAGTTGAACCTCTTGTTAAAGCCTATGGATATCCGTCCCAAACGGGTGTTTATGACGCTGCTAATGAGATACTGCAAGCTAAAGAAGCTGCAGAAAACTTGGCAGAATTAGAAAGGGATTTGAAGGAGATCAATAGGCTAGAACCTCCGGATACAATAGTTCAGGAAGAAATCCCTGACTTCATACCACCATCGGAGAAGGCGATCCAGGAAGATGATCCTGATTACGTACCTCCGATTTGGCGGAATGCCGACCAGGCTGTGACGATTGCAACAAATATCGCGCCGGACTGGAGTCGGCCAGCTTATGAGTCAGGTGATCCACCTAAGAGAGCGAGAACACTCAAG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| 9,412
|
OR553429.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
MD2-D
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,708
|
GenBank
| 1
|
USA: Anne Arundel Co., MD
|
USA
|
Trifolium repens
| null |
1991
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate MD2-D, complete genome
|
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| 9,413
|
OR553430.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
MD2-Y
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,860
|
GenBank
| 1
|
USA: Anne Arundel Co., MD
|
USA
|
Trifolium repens
| null |
1991
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate MD2-Y, complete genome
|
AGTAAAGTTGACACCTTTACAGAAGTGATCTTGCTTGTAAGAGTTAATTCATCAAGAGTTAATACAAGATCCACCTCCCGGCACCTTCGTATCGTGTTTGAGGTATCTCTAGTGTTTGGTTGTTTGAATACTAGGTAATGCTTAATGTTTAATTTTGATAGTTTAGTGTCGGCCACCGCCAAGGTGGTCAAAGATTTTATACATTTTTGTTATAATAGGGCGAGGCACGTATACTATGCTCTCAAACGCTGGCTCTGGGAACTCCAGGGTGTGTTTGCTGCACATGACGCTTTTGTCGACATGTGCTACGACGCCATGTATGGCGTCGAGGAGTTTGAATGGGAACTGCAAAAACAGTTTTCAAGTGCTGAACACGACGTGATGATCGCCAAGCTTGAATTTGAGCGTCTATTGAAGGATGGCGCCCCATTAAGGACATGGCCACAACCATGCGCTCCTATGGGCAGTTTCCGGTCGTCTGATGACTTCCAGGAGGCAGCCCGGGAAGCTGAAAACCTGTCCATAATGGACCCAGAACCCTCCTTGATTAAAGGGTCTGGTGATTACTCACTTGACAATCCTAATAGGATTGAAAAGTTCATCAACCTCGTTCAAAAGAAGGAGGTACTTTCCGCCACCGAGCAATTGATCAAAAATGCTTATGAAGAGCATATCGGTGAGGCTCCATTCGGAAAGTGGTTCAACACACTGCCCTCTCGCATGAATTACATTAAGAGGGCTGCTTCAAAGAAGGCCAAGGCGGTAAAGAGATCCAACTCAGTCCGCCAAATGGTAAACGAGGTAAATGTCATCCCTGACTTTATCTCAATTTGTGATGTTGTCCAGGTAGACACTGGTGAGAAGCTCCCCCCCAAGAAAGACAAAGACGGGGAGCCATTAGAGCCTGAACCTAAATTGAAAATGATGAGAAGGGTCAGGTCCGAGCACTATGGTGATGCTCGTTCATACATAAGGCAGCATATTCGCAATAATAACATGCGCCTTATTGACGGCTCTGATGTTAGCCATGCTACCATCAACCGATATGCTCTTAAGTTCTGCGAAGACTTAGAGCTTGACATGACCAGTACTGCAATGCTGGTTGATTATGCTATGACAATGGTGCCCATTCCCCTCAAGAATGACATTGAAAGGGCGAAGATTGTCCATTCTCCTGCAGCCAGGCAGATAAGGCAGGAGTTGGGCGTTCTAAACGCTGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCTATTTTGGGGTTACCAGAGATCGTGGTGCGTAGTGGAGCTACACCTAGGAAGAGTCGTAGTGTAATTAGCTTTCTTTCGCAGTTTACTTTAGGTTTAGATTACCAGTGTCCAAATCCCAGCTTGCACAATGCACTGGTGGCGGTTGAACGTAGAGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTAGTGCTACCTTACAAGAACAGGCCAGGAATATTTTCCAATCTTGATTACTTTCGCGACTCCATAGTCAACAAAGTTGGTTGTCCAAGGACCCACTCTCCTGAGGAACTTGCCGCAACGTACCACTCTGGAAAGAGAAGTTTGTACAATGCTGCTGTTCAAAGCCTTAAAAAGAAGGCAGTCGAAAGGAGTGATGCTAACGTGACAGCCTTTCTCAAGATGGAGAAACATCTGATGTGTAAGAAGATAGCGCCCAGGTTGATATGTCCCCGAAACAAAAGGTACAATGTTGAATTGGGACGTCGGTTGAAGTTTAATGAGAAGAAATTCATGCATGCAATCGACTCAACCTTTGAATCCCCAACTGTTCTTAGTGGATATGACAGTTTCAGAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCCAAATTTAAGAGACCAGTTGCGATAGGTGTTGATGCGAGCAGATTTGATCAACATGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCATTCAATTTACAACGGTGCATTTAAAGATCCCATTCTCAAGGAGTTGCTACACTGGCAAACAGAGAACAAAATTATGCTGTTTGTTGAAGACAAAATCCTCAAGTTTAAGGTCAAAGGACACAGGATGTCCGGCGACATTAACACCTCTTCTGGCAACAAATTAATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAGACACTTGGAGTCAAAGCCGAACTCTGCAATAACGGCGATGATTGTGTGATCATATGTGAGCGGAAAGATGAAAATAAATTCCAACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGGTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCGGTTAAGATTAATGGCTATTATAGAATGGTGCGTAAACCAGAGAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTCATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACTTTCATGAGTGCAACCGCCCAATGCGGTATGATCTTGAATAGTGGTGTACCTGTTCTTGATGCTTATCACAAATGCCTATTTAAAGCATCGGGGTATAAGAAGGTATCGCAAGAAGCAATGGAAAGAATAGTCTCTTTTGGAACGCAGGACAAACTCGGGCTCAGGAAAGAGCGAGTTGAGGAACCAATAACAATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCAGTGGGGTTGACCCTCAGACACAGGTCCTTGTCGAACGATATTTTGACAATCTGACGGTCCATATCGAACCCCGCGGCGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTAGATAAAACTTTGCTTTCAATTGCGAGTGTAGCACGAAAATCTGTGTCGCTACCAATACTTTCAAAATAGAAGCACTCATAGTAACCATAGTAGTAATAATATTAGTAATAGTTAGTCTATTAGATTACGCTAGTACATACCGATAAATTGCAACGGATTATAAATTCCTATCAGGTTTTGCTTCTGGATTCATTTCCAGCATCCCTGTGTCAATATTGGCAATTTATTGTGTCTACCTAAAAATTTCAAAGAACCTGCGCGAGATAATAAACGAGTATGGTCGCGGTTAGCAATGTCGCAATACAACGACGACGCACTCGTAGGGCAGCAAGACGCGCTCCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGGCCACCAGCAGACCACAACGCAGAGGACGACAACGACGACGAAGGAGAAGTAATAGAGGAGGAAGCTATATTTCCGGAGGATCAGGCAAGGCTCACACATTCGTGTTTTCAAAGGACGGCATCAATGGTAGTTCCAAGGGAAGTATCACTTTCGGGCCGTCTCTATCAGAATGCAAGCCACTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTATCTTATTACAGTTCATCACCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGCTCCATCGCTTATGAGCTTGACCCACACTGCAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCAGTATCACAAAGAGCGGTTCGAAGAGATTCCCCACAAGAGCTATCAACGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGATCAATTCAAGATCCACTATAAGGGGAACGGAGACTCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCTCGATCAATGTCTTAACGCAGAATGCTAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGGCCGAAACCAGGTCCGGACCCCACACCCCCACCAGCACCACCACCTGAACCGACGCCAGCCAAACACGAGAGATTCATTGTTTACACCGGTACCATGTCAACACTCATCAGTGCTCGACAGAACTCAGATAGTATATCACTCTACTCAATCAGAGACCAGAGGATCAGATACATTGAGGATGAAAATGCGAACTGGACGAACATTAAGGCGCAATGGTATTCACAGAACTCTGTGGAAGCCGTGCCTATGTTTATTTACCCAGTCCCACAAGGTACTTGGTCAATTGAAATCTCTTGTGAAGGTTACCAGGCAACATCTAGCACTTCAGACCCGCATCGTGGGAAATCTGATGGCATGATTGCTTACGACGACGATTCATCTAAGGTGTGGAATGTTGGCCAGCAGAACAATGTAACCATAACCAATAACAAGGCCGATAATGATTGGAAGTATGGTCATCCAGATCTAACGATCAATGGTGACAGATTCGATCAAAATCAGGTAGTCGAGAAAGATGGAACAATTTCATTTCATTTAGTAACTACTGGGCCCAACGCGAGTTTCTTCTTGCTGGCTCCAGCCGTGAAGAAAACAGCTAAGTACAACTTTTGTGTTTCATACGGAGATTGGACAGATAGAGATATGGAATTTGGTATGGTATCAGTAGTGCTTGATGAGCACTTAGAAGGTGCAAGGAGTTCTCAGTATGTTAGGAAAACGCTAAGACCAGGTCATGTTAGCGTCAATCGTTCTCACCGATTGCAAGACAGTTTCACACCAGTGGAATATGTCAGTGATGAAGATAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTACAGTTAGTAATCGACCATCAACTCCGGATCATGATAGTGATGCCCAATTTGCTGAATCTCTCAGAGGTAAGCTTCCGTCTCAGACTAAGCTACCACCTAAAGGGTTCCTATCAAGGTTAAGCGCTAAAGAAAAAGAAGAAATCTCCTCTTCAAAACCCTCAAATGTTGAGCGCCAGGTTGGTCCTCTTGTTGCAGCTTACGGATACCCGTCTCAAACAGGTGTTTATGATGCTGCCAGAGAGATCCTGCAAGCTAAAGAAGCTGCAGAAAACTTGGCAGAATTAGAAAGGGATTTGAAAGAGATCAATAGGCTAGAACCACCGGATACAATAGTTCAGGAAGAAATCCCTGACTTCATACCGCCATCGGAGAAGGTGATCCAGGAAGATGATCCTGATTACGTACCTCCTATATGGCGTAATGCCGACCAGGCTGTTACGATTGCCAAAAGCGATCATATAGACTGGAGTAGGCCAGCTTATGAGTCAGGTGATCCACCTAAGAAGGCAGGAACACTC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| 9,414
|
OR553431.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
MD3-D
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,708
|
GenBank
| 1
|
USA: Washington Co., MD
|
USA
|
Chenopodium
| null |
1991
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate MD3-D, complete genome
|
AGTAAAGTTGACACCTTTACAGAAGTGTTCTTGCTAGTAAGAGTTATTTCCTTGTGAAGTAATACAAGAACCTCCTCCCGGCATCTTCGTATCGTGTTTGAGGAATCTCTAGTGTTATTGTTAGTTATGTTTAACTTCGATAGCTTAGTTACAGCCACCGCTAGGGTGGTTAAAGATTTTATTTCTTTTTGCTATAATAGGGCACGGCATGTTTATTATGCCCTAAAAAGATGGCTCTGGGAACTCCAGGGTGTATTTGCTGCGCATGACGCCTTTGTCGACATGTGCTATGACGCCATGTATGGCGTTGAGGAGTTCGAGTGGGAACTGCAAAAACAGTATTCCACTGCAGAGATTGACGTGCAATTAGCTGAGCACGAATACAAGCGCCTACTTGCCGATGGCGCTCCACTAGGGTCATGGCCACAACCATGTGCGCCCCAAGGCTCATTCAGGTCGTCTGACGACTTTGATGTAGCTGCTAGGGCTGCTGAGGCAAACCCTATTGTGGACCCACAACCCTCTTTGATCAAAGGGTGTGGCGATAAATCACCTTCCAATCCCACTAGGATTGAGAAGTTCATCAACCTCGTTCAAAAGAAGGAGGTACTTTCCGCTACTGAGGCTCTAATCAAACATACATATGAAGAGCAAATCGGTGAATCACCATTCGGAAAGTGGTTTAACACTCTGCCCAATAGAATGAATTACATAAAGAGGGCAGCAGCAAAACAAGCCAAGGCGGCTAAACGATCTAAATCTGTCCGCCAAATGGTTACCGAGGTAAACGTCATTCCCGACTTTATCTCTTGCTGTGATGTTGTCCAGGTGGACACTGGTGAAAAGCTCCCTTCTAAGAAGGATAAAGAAGGGAATGAATTGCCACCTGAGCCTAAACTCAAAATGTTTAGAAGGGTGAAGCCTGAGCATGTTGGTGATGCCAGGAAATACATCTGTCAACATATTCGCAACAATAATATGAGGTTGATAGACGGCTCTGATGTTTCCCATGCAACCATCAACCGATATGCGCTCAAGTTTTGCGAAGACTTGGAGCTTGACATGACCAGCACTGAAATGCTCATTAAATATGCTATGGTCATGGTCCCACTCCCTCGAAAATCTGATATCGAGGCTGCTAAAATCGTCCAATCTCCTGCTGCCAGGCAAATAAGGCATGAGTTGGGCGTGCTTAACGCCGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCTATCTTGGGGTTACCAGAGATCGTGGTGCGAAGTGGGGCTATCCCTAGGAAGAGTCGTAGTACTATTAATTATTTGAGTCAGTTTAGTTTAGGTCTAGATTACCAATGCCCTAACCCCAGTTTGCACAACGCATTGGTAGCGGTTGAACGTAGAGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTAGTGCTACCTTACAAGAACATACCAGGAATCTTCTCTAATCTTGATTATTTCCGCAAGTCTATTGTGGATAAGGTTGGTTGTCCCAGGACGTTCTCCCCTGAAGAACTTGCAGCGACGTATCACTCTGGTAAGAGAACGTTGTATAATGCTGCTGTTCAAAGTCTTAAACGTAAGGCTGTTGAGAGGAGTGACGCGAATGTGACAGCTTTCCTTAAGATGGAGAAGCATCTTATGTGTAAGAAGATAGCACCCAGGTTGATATGTCCTCGCAACAAAAGATACAATGTTGAATTGGGACGTCGATTGAAATTCAATGAGAAGAAATTCATGCATGCAATCGACTCAACTTTTGATTCCCCAACTGTATTAAGTGGATATGACAGTTTTAAAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCGAAATTCAAACGACCAGTTGCAATAGGTGTTGATGCAAGCAGATTTGATCAACATGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCACTCGGTCTATAACGGTGCATTCAATGATCCCATTCTGAAGGAGTTGCTACACTGGCAAACAGAGAATAAAATAATGCTGTTTGTTGAAGACAAAATCCTCAAGTTCAAGGTCAAAGGACACAGAATGTCCGGTGACATTAACACCTCTTCTGGCAACAAATTAATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAGTCAATTGGAGTCAAAGCCGAACTCTGCAATAACGGCGATGATTGTGTTATCATATGCGAGAAGAAAGATGAAAATAAGTTCTCACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGGTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCAGTTAAAATTAATGGCTATTATAGAATGGTGCGTAAACAAGAAAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTCATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACATTTATGAGTGCCACCGCTCAATGCGGGATGATCTTGAATAGTGGTGTACCTGTTCTTGATGCTTTTCACAAATGCCTATACAAAGCATCTGGGTACAAGAAAGTATCGCAGGAAGCGATTGAGAGGATAGTCTCCTTCGGAACGCAGGACAAACTCGGGCTCAGGAAAGAGCGAGTTGAAGAACCAATAACGATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCTTTGGGGTTGACCCGCAGACACAGGTCCTTGTCGAACGATATTTTGACAATCTGCAGGTCCATATCGAACCCCGCGGCGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTCGATAAAACTTTGCTTTCAATCGCGAGTGTAGCACGAACATCTGTGTCGCTACCAATACTTTCAAAATAGAAGCACTCATAATCACCATAGTAGTTATAGTACTAGTAGTAGTTAGCTGTTTAGATTACGCTAGTTCGTACAAGTAAGTTGCAACGGATTACCGATTTTTATCTGGTTTTGCTATCGGCTTTATAGCTAGCATACCAATATCAATATTGGCAATTTACTTTGTTTACCTAAAAATTTCAAAGAACCTGAGAGGAATCATCAACGAATATGGTCGCGGTTAGCAATGTCACAATTCAACGACGACGTAATCGTAGAGCCGCACGAAGCGCTCCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGACCACCGGCGCAACACAGCGCAGAAGAAGACAACGACGACGAAGGAGAAATAATAGAGGAGGAGGCAATATTTCCGGAGGATCAGGCAAGGCTCACACATTCCAGTTTTCGAAGGACGGCATCAATGGCAGTTCCAAGGGAACTATCACTTTCGGGCCGTCTTTATCAGAGTGCAAGCCACTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTATCTTATTACAGTTCATCTCCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGCTCCATCGCTTATGAGCTTGACCCACACTGCAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCTCAATTACAAAGAGCGGTTCGAAACGATTCCCCACCAAGGTTATCAATGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGACCAATTCAAGGTCCACTACAAGGGGAACGGAGACGCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCACGATCGTTGTCTTAACTCAGAATCCTAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGGCCGAAACCAGGTCCGGACCCCACACCCCCACCAGCACCACCACCTGAACCGACGCCAGCCAAACATGAGAGATTCATTGTGTACACCGGTACACTGTCAACACTCATYAGTGCYCGACAAAACTCAGACAGCATATCACTCTACTCAATCCGAGACCAGAGGGTTAGRTATATYGAGGATGARAATGCGAACTGGACGAACATCCAAGCACAATGGTATTCACAGAATTCTGTGGAGGCAATACCAATGTTTATCTACCCAGTTCCGCAAGGCACATGGTCAATTGAAATCTCTTGTGAAGGCTAYCAGGCGACGTCAAGCACCACRGACCCCCACCGGGGGAAGTCTGATGGAATGATTGCTTACGACGATGATCAAAATAAAGTGTGGAATATTGGTGTACAAAATAATGTAACCATTTCCAACAACAAAGCCGATGCTGACTGGAAATATGGTCACCCTGATTTAACAATCAACGGTGAACGTTTTGATCAGAAGCAGGTAGTCGAGAAAGATGGAACAGTTTCGTTTCATTTAGTAACTACCGGGCCCAACGCGAGTTTCTTTTTAGCTGGCCCTGCCGTTAAGAAGACTGCCAAGTACAACTACTGTATATCATACGGGGCTTGGACAGACCGCGACATGGAATTTGGAATGGTCTCTGTTGTTCTCGATGAACATTTAGAGGGTGTTAGAGGTTCTCAGTACGTTAGGAAAACGCTAAGACCAGGTCATATTAGCGTCAATCGTACCCACCGATTGCAAGAAATGCCTCCCATGCGAGAGGACTTCAGTGAGGAAGATAATAGTAGTAGTGATAGTAATACGTATAAAACGGACAACTCTCCCTTGACCGTTCACCTTGTAAAAGCAGGTGACGAGGAGAATTATACAACAGATCGATCGGACGATGCTGAACCCACACTTCATGATGCTGATGTCATGAAGTTCTCCGGGTTTGTTGGAGCCAAAGATAGGTTTACGTTGCAGGGCGCTGATCCAATCGGCCCTGGTGACAGATCTGTCCGTCGCTTCAGACCGTCTGCCACATTGAAGTCTGCGTTCCATTCGGGACCTACTCCTGATGAGTTGTACAACGCTGGTGCTGAACAAGCGGATCACGACTTCGAACACTTTGTCTCACGAGGCAAAGAGAAGCTACAGGATGAAGATCCAATGGCCAAACTCGAAAGAGAGGCTGAGGATTTAAAACCTGATAGTGACAACGAAGACAACGATTATGATCGAACCGCTCCTGTGTTCAACCCAGCAGATGGTGACCCCTGGTCAGGTATTAAAATAAAGCCTAGATTAAAAGACCAGGATATGAGGTCCACCTTGAGCACTGGCACCTTGAAAGGT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| 9,415
|
OR553432.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
MD7-D
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,710
|
GenBank
| 1
|
USA: Prince George's Co., MD
|
USA
|
Glycine max
| null |
1993
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate MD7-D, complete genome
|
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|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
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|
2024-01-28
|
MD8-D
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,710
|
GenBank
| 1
|
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USA
|
Medicago lupulina
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1988
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate MD8-D, complete genome
|
AGTAAAGTTGACACCTTTACAGAAGTGTTCTTGCTTGTAAGAGTTATTTCCTTGTGAAGTAATACAAGAACCTCCTCCCGGCATCTTCGTATCGTGTTTGAGGAATCTCTAGTGTTATTGTTAGTTATGTTTAACTTCGATAGCTTAGTTACAGCCACCGCTAGGGTGGTTAAAGATTTTATTTCTTTTTGCCATAATAGGGCACGGCATGTTTATTATGCCCTAAAAAGATGGCTCTGGGAACTCCAGGGTGTATTTGCTGCACATGACGCCTTTGTCGACATGTGCTATGACGCCATGTATGGCGTTGAGGAGTTCGAGTGGGAACTGCAAAAGCAGTATTCCACTGCAGAGATTGACGTGCAATTAGCTGAGCACGAATACAAGCGCCTACTTGCCGATGGCGCTCCACTAGGGTCATGGCCACAACCATGTGCGCCCCAAGGCTCATTTAGGTCGTCTGATGACTTTGATGTAGCTGCTAGGGCTGCTGAGGCAAACCCTATAGTGGACCCACAACCCTCCTTGATTAAAGGGTGTGGCGATAAATCACCTTCCAATCCCACTAGGATTGAGAAGTTCATCAACCTCGTTCAAAAGAAGGAGGTACTTTCCGCTACTGAGGCTCTAATTAAACATACATATGAAGAGCAAATAGGTGAATCACCATTCGGAAAGTGGTTCAACACCCTGCCCAATAGAATGAATTACATTAAGAGGGCAGCAGCAAAACAAGCCAAGGCGGCTAAACGATCCAAATCTGTCCGCCAAATGGTTACCGAGGTAAATGTCATCCCCGACTTTATCTCTTGTTGTGATGTTGTCCAGGTGGACACTGGTGAAAAGCTCCCGTCTAAGAAAGATAAAGAAGGGAATGAATTACCACCTGAGCCTAAACTTAAAATGTTTAGAAGGGTGAAGCCTGAGCATGTTGGTGATGCCAGGAAATACATCTGTCAACACATTCGCAACAATAATATGAGGTTGATAGACGGCTCTGATGTTTCTCATGCAACCATCAACCGATATGCGCTCAAGTTTTGCGAAGACTTAGAGCTTGATATGACCAGCACTGAAATGCTCATCAAATATGCTATGGTCATGGTCCCACTCCCTCGAAAATCTGATATTGAGGCTGCTAAAATCGTCCAATCTCCTGCTGCCAGGCAAATAAGGCATGAGTTGGGCGTGCTTAACGCCGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCTATTTTAGGGTTGCCAGAGATCGTGGTGCGAAGTGGGGCTATCCCTAGGAAGAGTCGTAGTACTATTAATTATTTGAGTCAGTTTAGTTTAGGTCTAGATTACCAATGCCCTAATCCCAGTTTGCACAACGCATTGGTAGCGGTTGAACGTAGGGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTATTGCTACCTTACAAGAACATACCAGGAATCTTCTCTAATCTTGATTATTTCCGCAAATCTATTGTGGATAAGGTTGGTTGTCCCAGGACGTTCTCCCCTGAAGAACTTGCAGCGACGTATCACTCTGGTAAGAGAACGTTGTATAATGCTGCTGTTCAAAGTCTTAAACGTAAGGCTGTTGAGAGGAGTGACGCGAATGTGACAGCTTTTCTTAAGATGGAGAAGCATCTTATGTGTAAGAAGATAGCACCCAGGTTGATATGTCCCCGCAACAAAAGATATAATGTTGAATTGGGACGTCGATTGAAATTCAATGAGAAGAAATTCATGCATGCAATCGACTCAACTTTTGATTCCCCAACTGTATTAAGTGGATATGACAGTTTTAAAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCGAAATTCAAACGACCAGTTGCAATAGGTGTTGATGCAAGCAGATTTGACCAACATGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCACTCAATCTATAACGGTGCATTCAATGATCCCATTCTGAAGGAGTTGCTACACTGGCAAACAGAGAACAAAATAATGCTGTTTGTTGAAGACAAAATCCTCAAGTTCAAGGTCAAAGGACACAGAATGTCCGGTGACATTAACACCTCTTCTGGCAACAAATTAATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAGTCACTTGGAGTCAAAGCCGAACTCTGCAATAACGGCGATGATTGTGTTATCATATGCGAGAAGAAAGATGAAAATAAGTTCTCACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGGTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCAGTTAAAATTAATGGCTATTATAGAATGGTGCGTAAACAAGAAAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTCATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACATTTATGAGTGCCACCGCTCAATGCGGGATGATCTTGAATAGTGGTGTACCTGTTCTTGATGCTTTTCACAAATGCCTATACAAAGCATCGGGGTACAAGAAAGTATCGCAGGAAGCGATCGAGAGGATAGTCTCCTTCGGAACGCAGGACAAACTCGGGCTCAGGAAAGAGCGAGTTGAAGAACCAATAACGATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCTTTGGGGTTGACCCGCAGACACAGGTCCTTGTCGAACGATATTTTGACAATCTGCAGGTCCATATCGAACCCCGCGGCGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTCGATAAAACTTTGCTTTCAATTGCGAGTGTAGCACGAACATCTGTGTCGCTACCAATACTTTTAAAATAGAAGCACTCATAATCACCATAGTAGTTATAATACTAGTAGTAGTTAGCTGTTTAGATTACGCTAGTTCGTACAAGTAAGTTGCAACGGATTACCGATTTTTATCTGGGTTTGCTATCGGCTTTATAGCTAGCATACCAATATCAATATTGGCAATTTACTTTGTTTACCTAAAAATTTCAAAGAATCTGAGAGGGATCATCAACGAATATGGTCGCGGTTAGCAATGTCACAATACAACGACGACGCAATCGTAGAGCCGCTCGAAGCGCTCCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGACCACCGGCGCAACACAGCGCAGAAGAAGACAACGACGACGAAGGAGAAGTAATAGAGGAGGAGGCAATATTTCCGGAGGATCAGGCAAGGCTCACACATTCCAGTTTTCGAAGGACGGCATCAATGGCAGTTCCAAGGGAACTATCACTTTCGGGCCGTCTTTATCAGAGTGCAAGCCACTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTATCTTATTACAGTTCATCTCCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGCTCCATCGCTTATGAGCTTGACCCACACTGTAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCTCAATTACAAAGAGCGGTTCGAAACGATTCCCCACCAAGGTTATCAATGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGACCAATTCAAGGTCCACTACAAGGGGAACGGAGACGCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCACGATCGTTGTCTTAACTCAGAATCCAAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGGCCGAAACCAGGTCCGGACCCCACACCCCCACCAGCACCACCACCTGAACCGACGCCAGCCAAACATGAGAGATTCATTGTGTACACCGGTACACTGTCAACGCTCATCAGTGCCCGACAAAACTCAGATAGTATATCACTCTACTCGATCAGAGACCAGAGGGTTAGATATATTGAAGATGAAAATGCGAACTGGACGAACATCCAAGCACAATGGTATTCACAGAATTCTGTGGAGGCAATACCTATGTTTATCTACCCAGTTCCACAAGGCACATGGTCGATTGAAATCTCTTGTGAAGGCTACCAGGCGACGTCGAGCACCACGGACCCCCACCGGGGGAAGTCTGATGGAATGATCGCTTACGACGATGATCAAAATAAGGTGTGGAATATTGGTGTGCAAAATAATGTAACCATTTCCAATAACAAAGCCGACGCTGACTGGAAATACGGCCACCCTGATTTAACGATCAACGGTGAACGTTTTGACCAGAAGCAGGTAGTCGAGAAAGATGGAACGGTTTCGTTTCATTTAGTAACTACCGGGCCCAACGCGAGTTTCTTTTTAGCTGGCCCTGCCGTTAAGAAGACTGCCAAGTACAACTTCTGTATATCATATGGGGCTTGGACAGACCGCGACATGGAATTTGGAATGGTCTCTTTTGTTCTTGATGAACATTTAGAGGGTGTTAGAGGTTCTCAGTACGTTAGGAAAACGCTAAGACCAGGTCATATTAGCGTCAATCGCCCACACCGATTGCAAATCATGCCTCCCACGCGAGAGGATGATAGTGATGGATATAGTAGTAGTAGTAGTAATAGTAATACATATAAAACGGACAACTCTCCCTTGACCGTTCACATTGTAAAAGCAGGTGACGAGGAGAATTATACAACAGATCGATCGGACGATGTTGAACCCACACTTCATGATGCTGATGTCATGAAGTTCTCCGGGTTTGTTGGAGCCAAAGACAGGTTTACGTTGCAGGGTGCTGATCCAATCGGCCCTGGTGACAGATCTGTCCGTCGCTTCAGACCGTCTGCCACATTGAAGTCTGCGTTCCATTCGGGACCGACTCCTGATGAGTTGTACAACGCTGGTGCTGAACAAGCGGATCACGACTTCGAACACTTTGTCTCCCGAGGCAAAGAGAAGCTACAGGATGAAGATCCAATGGCCAAACTCGAAAGAGAGGCTGAGGATTTAAAACCTGATAGTGACAACGAAGATAACGATTATGATCGAACCGCTCCTGTGTTCAACCCAGCAGATGGTGACCCCTGGTCAGGCATTAAAATAAAGCCTAGATTAAAAGATCAGGATATGAGGTCTACCTTGAGCACTGGCACCTTGAAA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|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
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|
2024-01-28
|
MD9-D
|
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|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
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|
GenBank
| 1
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|
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Luteovirus glycinis
|
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|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
MD12-D
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,708
|
GenBank
| 1
|
USA: Prince George's Co., MD
|
USA
|
Trifolium incarnatum
| null |
2006
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate MD12-D, complete genome
|
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| 9,419
|
OR553436.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
MD13-Y
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,857
|
GenBank
| 1
|
USA: Prince George's Co., MD
|
USA
|
Trifolium repens
| null |
2006
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate MD13-Y, complete genome
|
AGTAAAGTTGACCCCCTTACAGAAGTGATCTTGCTTGTAAGAGTTAATTCTTTAAGAGTTAATACAAGATCCACCTCCCGGCACCTTCGTATCGTGTTTGAGGTATCTCTAGTGTTTGGTTGTTTGAATACTAGTTAATATTAAATGTTTAATTTCGATAGTTTAGTGTCGGCCACCGCTAAGGTGGTCAAAGATTTTATACATTTTTGTTATAATAGGGCGAGGCATGTTTATTATGCTCTCAAACGCTGGCTCTGGGAACTCCAGGGAGTGTTTGCTGCACATGACGCTTTTGTCGACATGTGCTACGACGCTATGTATGGCGTCGAAGAGTTTGAATGGGAGCTGCAAAAGCAGTTTTCAAGTGCCGAACATGACGTGCTGGTCGCCAAGCACGAATTTGAGCGCCTGTTACGGGATGGCGCCCCATTAAGGACATGGCCACAACCATGTGCTCCTGTCGGTAGTTTCCGGTCGTCGGACGACTTCCATGAAGCTGCCAAGGAAGCTGAAAACCTGTCCTTGATGGACCCAGAACCCGAATTGATTAAAGGGTCTGGTGATTACTCACTTGACAATCCTAACAGGATTGAAAAATTCATCAACCTCGTTCAAAAGAAGGAGGTACTTTCCGCCACCGAGCAAATGATTAAACATGTTTATGAAGAGCATATCGGTGAGGCACCATTCGGAAAGTGGTTCAACACACTGCCCTCTCGCATGAACTACATCAAGAGGGCTGCTTCAAAGAAGGCCAAGGCGGCCAAAAGATCCAATTCTGTCCGCCAAATGGTAAACGAGGTGAATGTCATTCCTGACTTTATCTCAATATGTGATGTTGTCCAGGTGGACACTGGTGAGAAGCTCCCCCCCAAGAAAGATAAAGACGGGGAGCCATTAGAGCCTGAACCCAAAATGAAAATGATGAGAAGGGTCAGGCCCGAGCATTATGGTGATGCTCGTTCATACATAAGGCAGCATATTCGCAATAATAACATGCGCCTTATTGACGGCTCTGATGTTAGCCATGCTACCATCAACCGATATGCTCTTAAGTTTTGCGAAGACTTAGAGCTTGACATGACCAGCACTGCGATGCTGGTTGATTATGCTATGACAATGGTGCCCATTCCCCTCAAAAATGATATTGAAAGGGCGAAGATTGTCCATTCTCCTGCTGCCAGGCAAATAAGGCAGGAGTTGGGCGTTCTAAACGCTGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCCATTTTGGGGTTACCAGAGATCGTGGTGCGTAGTGGAGCTACACCTAGGAAGAGTCGTAGTGTAATTAGCTTTCTTTCGCAGTTTACTTTAGGTCTAGATTACCAATGCCCAAATCCCAGTTTACACAATGCATTGGTGGCGGTTGAACGTAGAGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTAGTGCTACCTTACAAGAACAGGCCCGGAATATTTTCCAATCTTAATTACTTTCGCGACTCCATAGTCAACAAAGTTGGTTGTCCAAGGACCCACACTCCTGAGGAACTTGCCGCAACGTACCACTCTGGAAAGAGAAGTTTGTACAATGCTGCTGTTCAAAGCCTTAAAAAGAAGGCAGTCGAAAGGAGTGATGCTAACGTGACAGCCTTTCTCAAGATGGAAAAACATCTGATGTGTAAGAAGATAGCACCCAGGTTGATATGTCCCCGAAACAAAAGGTATAATGTTGAGTTGGGACGTCGGTTGAAGTTCAATGAGAAGAAATTCATGCATGCAATTGACTCAACCTTTGAATCCCCAACTGTTCTTAGTGGATATGACAGTTTCAGAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCCAAATTTAAAAGACCAGTTGCAATAGGTGTTGATGCGAGCAGATTTGATCAACATGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCACTCGATTTACAACGGTGCATTTAAAGATCCCATTCTCAAGGAGTTGCTACACTGGCAAACAGAGAACAGAATTATGCTGTTTGTTGAAGATAAAATCCTCAAGTTTAAGGTCAAAGGACACAGGATGTCCGGCGACATCAACACCTCTTCAGGCAACAAATTGATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAAACACTTGGAGTCAAAGCCGAACTCTGCAACAACGGCGATGATTGTGTAATCATATGTGAGCGGAAAGATGAGAACAAATTCCAACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGTTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCAGTTAAAATTAATGGCTATTATAGAATGGTGCGTAAACCAGAGAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTCATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACTTTCATGAGTGCAACCGCCCAGTGCGGTATGATCTTGAATAGTGGTGTACCTGTTCTTGATGCTTATCATAAATGCCTATTTAAAGCATCGGGGTACAAGAAAGTATCGCAAGAAGCTATTGAAAGGATAGTCTCTTTTGGAACGCAAGACAAACTAGGGCTCAGGAAAGAGCGAGTTGAAGAACCAATAACAATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCAGCGGGGTTGACCCTCAGACGCAGGTCCTTGTCGAACGATATTTTGACAATCTGACGGTCCATATCGAGCCCCGTGGCGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTAGATAAAACTTTGCTTTCAATTGCGAGTGTAGCACGAACATCTGTGTCGCTACCAGTACTTTCAAAATAGGAGCACTCATAGTAACCATAGTAGTAATAGTAATAGTAGTAGTTAGTTTATTAGACTACTCTAGTTCATACAGATAAATTGCAACGGATTACAAATTCCTATCAGGTTTTGCTTCTGGATTCATTTCCAGCATTCCTGTATCAATATTGGCAATTTATTTTGTCTACCTAAAAATTTCAAAGAATCTGCGCGAGATAATCAACGAGTATGGTCGCGGTTAGCAATGTCGCAATACAACGACGACGCAATCGTAGGGCAGCAAGACGCGCTCCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGGCCACCAGCAGACCACAACGCAGAGGACGACAACGACGACGAAGGAGAAATAATAGAGGAGGAAGCTATATTTCCGGAGGATCAGGCAAGGCTCACACATTCGTGTTTTCAAAGGACGGCATCAATGGTAGTTCCAAGGGAAGTATCACTTTCGGGCCGTCTTTATCAGAATGCAAGCCACTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTATCTTATTACAGTTCATCACCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGCTCCATCGCTTATGAGCTTGACCCACACTGCAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCAGTATCACAAAGAGCGGTTCGAAGAGATTCCCCACAAGAGCTATCAATGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGATCAATTCAAGATCCACTACAAGGGGAATGGAGACTCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCTCGATCAATGTCCTAACGCAGAATGCTAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGGCCGAAACCAGGTCCGGACCCCACACCCCCACCAGCACCACCACCTGAACCGACGCCAGCCAAACATGAGAGATTCATTGTTTACACCGGTACCATGTCAACACTCATCAGTGCTCGACAGAACTCAGATAGTATATCACTCTACTCAATCAGAGACCAGAGGATCAGATACATTGAGGATGAAAATGCGAACTGGACGAACATTAAAGCGCAATGGTATTCACAGAACTCTGTGGAAGCCGTGCCAATGTTTATTTACCCAGTTCCGCAAGGTACATGGTCAATTGAAATCTCTTGTGAAGGTTACCAGGCAACATCAAGCACCACAGATCCCCACCGGGGGAAATCTGATGGAATGATTGCTTATGATGATGATCAAAACAAGGTGTGGAATATTGGTGTGCAAAATAATGTAACCATAACCAACAACAAGGCCGATGCTGATTGGAAATACGGTCACCCAGATTTAACGATCAACGGTGAACGTTTTGACCAAAAGCAAGTAGTCGAGAAAGATGGAACAATTTCGTTTCATTTAGTAACTACTGGGCCCAACGCGAGTTTCTTTTTAGCCGGCCCTGCCGTTAAGAAGACTGCCAAGTACAACTTTTGTATATCATACGGAGCTTGGACAGATCGCGATATGGAATTTGGTTTGGTATCAGTTGTTCTTGATGAACACTTAGAGGGTGGTAGAGGTTCTCAGTATGTTAGGAAAACGCTAAGACCAGGTCATGTTAGCGTCAATCGCTCTCACCGATTGCAAGACAGTTTCACGCCGGTGGAATATGTCAGTGATGAAGATATTAGTAGTAATAGTAGTATAGTTAGTAATCAACCATCAACTCCGGATAATGATAGTGATGCCCAATTTGTTGAATCATTGAAAGGCAAGCTTCCAACACAGTCGAAGCTTCCTCCTAAAGGGTTCCTATCAAGGTTAAGTGCCAAAGAAAAAGAAGAGATCGCTTCTTCGAAGCCCTCCAACGTTGAACGCCAAGTTGAACCTCTTGTTAAAGCCTATGGATATCCGTCTCAAACGGGTGTTTATGACGCTGCTAGAGAGATACTGCAAGCTAAAGAAGCTGCAGAAAACTTGGCAGAATTAGAAAGGGATTTGAAGGAGATCAATAGGCTAGAACCACCGGATACAATAGTTCAGGAAGAAATCCCTGACTTCATACCACCATCGGAGAAGGTGATCCAGGAAGATGATCCTGATTACGTACCTCCGATCTGGCGGAATGCCGACCAGGCTGTGACGATTGCAACAAACGATCGTATAGACTGGAGTCGGCCAGCTAATGAGTCAGGTGATCCACCTAAGAAGGCAGGAACACTCAAG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| 9,420
|
OR553437.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
MS-Y
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,857
|
GenBank
| 1
|
USA: Starkville, MS
|
USA
|
Trifolium subterraneum
| null |
1989
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate MS-Y, complete genome
|
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| 9,421
|
OR553438.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
NC-Y
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,857
|
GenBank
| 1
|
USA: Rockingham Co., NY
|
USA
|
Trifolium repens
| null |
1990
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate NC-Y, complete genome
|
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| 9,422
|
OR553439.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
NY-D
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,708
|
GenBank
| 1
|
USA: Orange Co, NY
|
USA
|
Trifolium pratense
| null |
1988
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate NY-D, complete genome
|
AGTAAAGTTGACACCTTTACAGAAGTGTTCTTGCTTGTAAGAGTTATTTCCTTGTGAAGTAATACAAGAACCTCCTCCCGGCATCTTCGTATCGTGTTTGAGGAATCTCTAGTGTTATTGTTAGTTATGTTTAACTTCGATAGCTTAGTTACAGCCACCGCTAGGGTGGTTAAAGATTTTATTTCTTTTTGCTATAATAGGGCACGGCATGTTTATTATGCCCTAAAAAGATGGCTCTGGGAACTCCAGGGTGTATTTGCTGCACATGACGCCTTTGTCGACATGTGCTATGACGCCATGTATGGCGTTGAGGAGTTCGAGTGGGAACTGCAAAAGCAGTATTCCACTGCAGAGATTGACGTGCAATTAGCTGAGCACGAATACAAGCGCCTACTTGCCGATGGCGCTCCACTAGGGTCATGGCCACAACCATGTGCGCCCCAAGGCTCATTCAGGTCGTCTGACGACTTCGATGTAGCTGCTAGGGCTGCTGAGGCAAACCCTATTGTGGACCCACAACCCTCCTTGATTAAAGGGTGTGGCGATAAATCACCTTCCAATCCCACTAGGATTGAGAAGTTCATCAACCTCGTTCAAAAGAAGGAGGTACTTTCCGCTACTGAGGCTCTAATCAAACATACATATGAAGAGCAAATCGGTGAATCACCATTCGGAAAGTGGTTCAACACTCTGCCCAATAGAATGAATTACATAAAGAGGGCAGCAGCAAAACAAGCCAAGGCGGCTAAACGATCTAAATCTGTCCGCCAAATGGTTAACGAGGTAAACGTCATTCCCGACTTTATCTCTTGCTGTGATGTTGTCCAGGTGGACACTGGTGAAAAGCTCCCTACTAAGAAAGACAAAGAAGGGAATGAATTGCCACCTGAGCCTAACCTTAAAATGTTTAGAAGGGTGAAGCCTGAGCATGTTGGTGATGCCAGGAAACACATCTGTCAACATATTCGCAATTATAATATGAGGTTGATAGACGGCTCTGATGTTTCTCATGCAACCATCAACCGGTATGCGCTCAAGTTTTGCGAAGACTTGGAGCTTGACATGACCAGCACTGAAATGCTCATCAAATATGCTATGGTCATGGTCCCGCTCCCTCGAAAATCTGATATTGAGGCTGCTAAAATCGTCCAATCTCCTGCTGCCAGGCAAATAAGGCATGAGTTGGGCGTGCTTAACGCCGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCTATTTTGGGGTTGCCAGAGATCGTGGTGCGAAGTGGGGCTATCCCTAGGAAGAGTCGTAGTACTATTAATTATTTGAGTCAGTTTAGTTTAGGTCTAGATTACCAATGCCCTAATCCCAGTTTGCACAACGCATTGGTGGCGGTTGAGCGTAGAGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTAGTGCTACCTTACAAGAACATACCAGGAATTTTCTCTAATCTTGATTATTTCCGCAAATCTATTGTGGATAAGGTTGGTTGCCCCAGGACGTTCTCCCCTGAAGAACTTGCAGCGACGTATCACTCTGGTAAGAGAACGTTGTATAATGCTGCTGTTCAAAGTCTTAAACGTAAGGCTGTTGAGAGGAGTGACGCGAATGTGACAGCTTTCCTTAAGATGGAGAAGCATCTTATGTGTAAGAAGATAGCACCCAGGTTGATATGTCCCCGCAACAAAAGATATAATGTTGAATTGGGACGTCGATTGAAATTCAATGAGAAGAAATTCATGCATGCGATCGACTCAACTTTTGATTCCCCAACTGTATTAAGTGGATATGACAGTTTTAAAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCGAAATTCAAACGACCAGTTGCAATAGGTGTTGATGCAAGCAGATTTGATCAACATGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCACTCAATCTATAACGGTGCATTCAATGATCCCATTCTGAAGGAGTTGCTACACTGGCAAACAGAGAATAAAATAATGCTGTTTGTTGAAGACAAAATCCTCAAGTTCAAGGTCAAAGGACACAGAATGTCCGGTGACATTAACACCTCTTCTGGCAACAAATTAATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAGTCAATTGGAGTCAAAGCCGAACTCTGCAATAACGGCGATGATTGTGTTATCATATGCGAGAAGAAAGATGAAAATAAGTTCTCACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGGTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCAGTTAAAATTAATGGCTATTATAGAATGGTGCGTAAACAAGAAAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTCATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACATTTATGAGTGCCACCGCTCAATGCGGGATGATCTTGAATAGTGGTGTACCTGTTCTTGATGCTTTTCACAAATGCCTATACAAAGCATCTGGGTACAAGAAAGTATCGCAGGAAGCGATTGAGAGGATAGTCTCCTTCGGAACGCAGGACAAACTCGGGCTCAGGAAAGAGCGAGTTGAAGAACCAATAACGATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCTTTGGGGTTGACCCGCAGACACAGGTCCTTGTCGAACGATATTTTGACAATCTGCAGGTCCATATCGAACCCCGCGGCGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTCGATAAAACTTTGCTTTCAATTGCGAGTGTAGCACGAACATCTGTGTCGCTACCAATACTTTCAAAATAGAAGCACTCATAATCACCATAGTAGTTATAGTACTAGTAGTAGTTAGCTGTTTAGATTACGCTAGTTCGTACAAGTAAGTTGCAACGGATTACCGATTTTTATCTGGGTTTGCTATCGGCTTTATAGCTAGCATACCAATATCAATATTGGCAATTTACTTTGTTTACCTAAAAATTTCAAAGAATCTGAGAGGGATCATCAACGAATATGGTCGCGGTTAGCAATGTCACATTACAACGACGACGCAATCGTAGAGCCGCACGAAGCGCTCCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGACCACCGGCGCAACACAGCGCAGAAGAAGACAACGACGACGAAGGAGAAATAATAGAGGAGGAGGCAATATTTCCGGAGGATCAGGCAAGGCTCACACATTCCAGTTTTCGAAGGACGGCATCAATGGCAGTTCCAAGGGAACTATCACTTTCGGGCCGTCTTTATCAGAGTGCAAGCCACTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTATCTTATTACAGTTCATCTCCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGCTCCATCGCTTATGAGCTTGACCCACACTGCAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCTCAATTACAAAGAGCGGTTCGAAACGATTCCCCACCAAGGTTATCAATGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGACCAGTTCAAGGTCCACTACAAGGGGAACGGAGACGCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCACGATCGTTGTCTTAACTCAGAATCCCAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGGCCGAAACCAGGTCCGGACCCCACACCCCCACCAGCACCACCACCTGAACCGACGCCAGCCAAACATGAAAGATTCATTGTTTACACCGGTACACTGTCAACACTCATCAGTGCTCGACAGAACTCAGACAGTATATCACTCTACTCTATCCGAGACCAGAGGGTCAGATATATTGAAGATGAGAATGCAAACTGGGCGTACATCAAAGCGCAATGGTATTCACAGAATTCTGTGGAAGCAGTACCAATGTTTATCTACCCAGTTCCGCAAGGTACTTGGTCAATTGAAATCTCATGTGAAGGCTACCAGGCAACATCGAGCACCACGGATCCCCACCGGGGGAAGTCCGATGGAATGATTGCTTATGACGATGATCAGACCAAGGTGTGGAATATTGGTGTGCAAAATAATGTAACCATAACCAACAATAAAGCCGATGCTGATTGGAAATACGGCCATCCTAATTTAACAATTAATGGTGAACGTTTTGACCAGAAGCAAGTAGTCGAGAAAGATGGAACGGTCTCGTTTCATTTAGTAACTACTGGGCCCAATGCGAGTTTCTTTTTAGCCGGCCCTGCCGTTAAGAAGATTGCCAAGTATAATTTCTGTATATCATATGGAGCTTGGACTGATCGCGATATGGAGTTTGGTTTGGTATCTGTTGTTCTCGATGAACACTTAGAGGGTGTTAGAGGTTCTCAGTACGTTAGGAAAACGCTAAGACCAGGTCACATTAGCGTCAATCGTTCCCACCGATTGCAAGAAATGCCTCCCATGCGAGAGGATGATAGTGATGAAGATAGTAGTAGTAGTGATAGTAATACATATAAAACGGACAACTCTCCCTTGACCGTTCACCTTGTAAAAGCAGGTGACGAGGAGAATTATACAACAGATCGATCGGACGATGTTGAACCCACACTTCATGATGCTGATGTCATGAAGTTCTCCGGGTTCGTTGGAGCCAAAGATAGGTTTACGTTGCAGGGCGCTGATCCAATCGGCCCTGGTGACAGATCTGTCCGTCGCTTCAGACCGTCTGCCACATTGAAGTCTGCGTTCCATTCGGGACCGACTCCTGATGAGTTGTACAACGCTGGTGCTGAACAAGCGGATCACGACTTCGAACACTTTGTCTCTCGAGGCAAAGAGAAGCTACAGGATGAAGATCCAATGGCCAAACTCGAAAGAGAGGCTGAGGATTTAAAACCTGATAGTGACAACGAAGATAACGATTATGATCGAACCGCTCCTGTGTTCAACCCAGCAGATGGTGACCCCTGGTCAGGCATTAAAATAAAGCCTAGATTAAAAGATCAGGATATGAGGTCTACCTTGAGCACTGGCACCTTGAAAGGT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| 9,423
|
OR553440.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
PA-D
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,711
|
GenBank
| 1
|
USA: Monroe Co., PA
|
USA
|
Trifolium hybridum
| null |
1988
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate PA-D, complete genome
|
AGTAAAGTTGACACCTTTACAGAAGTGTTCTTGCTTGTAAGAGTTATTTCCTTGTGAAGTAATACAAGAACCTCCTCCCGGCATCTTCGTATCGTGTTTGAGGAATCTCTAGTGTTATTGTTAGTTATGTTTAACTTCGATAGCTTAGTTACAGCCACCGCTAGGGTGGTTAAAGATTTTATTTCTTTTTGCTATAATAGGGCACGGCATGTTTATTATGCCCTAAAAAGATGGCTCTGGGAACTCCAGGGTGTATTTGCTGCACATGACGCCTTTGTCGACATGTGCTATGACGCCATGTATGGCGTTGAGGAGTTCGAGTGGGAACTGCAAAAGCAGTATTCCACTGCAGAGATTGACGTGCAATTAGCTGAGCACGAATACAAGCGCCTACTTGCCGATGGCGCTCCACTAGGGTCATGGCCACAACCATGTGCGCCCCAAGGCTCATTTAGGTCGTCTGACGACTTTGATGTAGCTGCTAGGGCTGCTGAGGCAAACCCTATAGTGGACCCACAACCCTCCTTGATTAAAGGGTGTGGCGATAAATCACCTTCCAATCCCACTAGGATTGAGAAGTTCATCAACCTCGTTCAAAAGAAGGAGGTACTTTCCGCTACTGAGGCTCTAATTAAACATACATATGAAGAGCAAATAGGTGAATCACCATTCGGAAAGTGGTTCAACACCCTGCCCAATAGAATGAATTACATTAAGAGGGCAGCAGCAAAACAAGCCAAGGCGGCTAAACGATCCAAATCTGTCCGCCAAATGGTTACCGAGGTAAATGTCATCCCCGACTTTATCTCTTGCTGTGATGTTGTCCAGGTGGACACTGGTGAAAAGCTCCCGTCTAAGAAAGATAAAGAAGGGAATGAATTACCACCTGAGCCTAAACTTAAAATGTTTAGAAGGGTGAAGCCTGAGCATGTTGGTGATGCCAGGAAATACATCTGTCAACACATTCGCAACAATAATATGAGGTTGATAGACGGCTCTGATGTTTCTCATGCAACCATCAACCGATATGCGCTCAAGTTTTGCGAAGACTTAGAGCTTGATATGACCAGCACTGAAATGCTCATCAAATATGCTATGGTCATGGTCCCACTCCCTCGAAAATCTGATATTGAGGCTGCTAAAATCGTCCAATCTCCTGCTGCCAGGCAAATAAGGCATGAGTTGGGCGTGCTTAACGCCGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCTATTTTGGGGTTGCCAGAGATCGTGGTGCGAAGTGGGGCTATCCCTAGGAAGAGTCGTAGTACCATTAATTATTTGAGTCAGTTTAGTCTAGGTCTAGATTACCAATGCCCTAATCCCAGTTTGCACAATGCATTGGTGGCGGTTGAACGTAGAGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTAGTGCTACCTTACAAAAACATACCAGGAATCTTTTCTAATCTTGATTATTTCCGCAAATCTATTGTGGATAAGGTTGGTTGTCCCAGGACGTTCTCCCCTGAAGAACTTGCAGCAACGTATCACTCTGGTAAGAGAACGTTGTATAATGCTGCTGTTCAAAGTCTTAAACGTAAGGCTGTTGAGAGGAGTGACGCGAATGTGACAGCTTTCCTTAAGATGGAGAAGCATCTTATGTGTAAGAAGATAGCACCCAGGTTGATATGTCCCCGCAACAAAAGATATAATGTTGAATTGGGACGTCGATTGAAATTCAATGAGAAGAAATTCATGCATGCAATCGACTCAACTTTTGATTCCCCAACTGTATTAAGTGGATATGACAGTTTTAAAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCGAAATTCAAACGACCAGTTGCAATAGGTGTTGATGCAAGCAGATTTGACCAACATGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCACTCAATCTATAACGGTGCATTCAATGATCCCATTCTGAAGGAGTTGCTACACTGGCAAACAGAGAACAAAATAATGCTGTTTGTTGAAGATAAAATCCTCAAGTTCAAGGTCAAAGGACACAGAATGTCCGGTGACATTAACACCTCTTCTGGCAACAAATTAATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAGTCACTTGGAGTCAAAGCCGAACTCTGCAATAACGGCGATGATTGTGTTATCATATGCGAGAAGAAAGATGAAAATAAGTTCTCACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGGTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCAGTTAAAATTAATGGCTATTATAGAATGGTGCGTAAACAAGAAAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTCATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACATTTATGAGTGCCACCGCTCAATGCGGGATGATCTTGAATAGTGGTGTACCTGTTCTTGATGCTTTTCACAAATGCCTATATAAAGCATCGGGGTACAAGAAAGTATCGCAGGAAGCGATCGAGAGGATAATCTCCTTCGGAACGCAGGACAAACTCGGGCTCAGGAAAGAGCGAGTTGAAGAACCAATAACGATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCTTTGGGGTTGACCCGCAGACACAGGTCCTTGTCGAACGATATTTTGACAATCTGCAGGTCCATATCGAACCCCGCGGCGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTCGATAAAACTTTGCTTTCAATTGCGAGTGTAGCACGAACATCTGTGTCGCTACCAATACTTTCAAAATAGAAGCACTCATAATCACCATAGTAGTTATAGTACTAGTAGTAGTTAGTTGTTTAGATTACGCTAGTTCGTACAAGTAAGTTGCAACGGATTACCGATTTTTATCTGGGTTTGCTATCGGCTTTATAGCTAGCATACCAATATCAATATTGGCAATTTACTTTGTTTACCTAAAAATTTCAAAGAATCTGAGAGGAATCATCAACGAATATGGTCGCGGTTAGCAATGTCACAATACAACGAAGACGCAATCGTAGAGCCGCACGAAGCGCTCCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGACCACCGGCGCAACACAGCGCAGAAGAAGACAACGACGACGAAGGAGAAATAATAGAGGAGGAGGCAATATTTCCGGAGGATCAGGCAAGGCTCACACATTCCAGTTTTCGAAGGACGGCATCAATGGCAGTTCCAAGGGAACTATCACTTTCGGGCCGTCTTTATCAGAGTGCAAGCCACTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTATCTTATTACAGTTCATCTCCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGCTCCATCGCTTATGAGCTTGACCCACACTGTAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCTCAATTACAAAGAGCGGTTCGAAACGATTCCCCACCAAGGTTATCAATGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGACCAGTTCAAGGTCCACTACAAGGGGAACGGAGACGCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCACGATCGTTGTCTTAACTCAGAATCCCAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGGCCGAAACCAGGTCCGGACCCCACACCCCCACCAGCACCACCACCTGAACCGACGCCAGCCAAACATGAGAGATTCATTGTGTACACCGGTACACTGTCAACACTCATCAGTGCCCGACAAAACTCAGATAGTATATCACTCTACTCGATTAGAGACCAGAGGGTTAGATATATTGAGGATGAAAATGCGAACTGGACGAACATCCAAGCACAATGGTATTCACAGAATTCTGTGGAGGCAATACCTATGTTTATCTACCCAGTTCCACAAGGCACATGGTCGATTGAAATCTCTTGTGAAGGCTACCAGGCGACGTCGAGCACCACGGACCCCCACCGGGGGAAGTCTGATGGAATGATTGCTTACGACGATGATCAAAATAAGGTGTGGAATATTGGTGTGCAAAATAATGTAACCATTTCCAATAACAAAGCCGACGCTGACTGGAAATACGGCCACCCTGATTTAACAATCAACGGTGAACGTTTTGACCAGAAGCAGGTAGTCGAGAAAGATGGAACAGTTTCGTTTCATTTAGTAACTACCGGGCCCAACGCGAGTTTCTTTTTAGCTGGCCCTGCCGTTAAGAAGACTGCCAAGTACAACTTCTGTATATCATATGGGGCTTGGACAGACCGCGACATGGAATTTGGAATGGTCTCTGTTGTTCTTGATGAACATTTAGAGGGTGTTAGAGGTTCTCAGTACGTTAGGAAAACGCTAAGACCAGGTCATATTAGCGTCAATCGCCCACACCGATTGCAAATCATGCCTCCCACGCGAGAGGATGATAGTGATGGATATAGTAGTAGTAGTAGTAATAGTAATACATATAAAACGGACAACTCTCCCTTGACCGTTCACCTTGTAAAAGCAGGTGACGAGGAGAATTATACAACAGATCGATCGGACGATGTTGAACCCACACTTCATGATGCTGATGTCATGAAGTTCTCCGGGTTTGTTGGAGCCAAAGACAGGTTTACGTTGCAGGGTGCTGATCCAATCGGCCCTGGTGACAGATCTGTCCGTCGCTTCAGACCGTCTGCCACATTGAAGTCTGCGTTCCATTCGGGACCGACTCCTGATGAGTTGTACAACGCTGGTGCTGAACAAGCGGATCACGACTTCGAACACTTTGTCTCCCGAGGCAAAGAGAAGCTACAGGATGAAGATCCAATGGCCAAACTCGAAAGAGAGGCTGAGGATTTAAAACCTGATAGTGACAACGAAGATAACGATTATGATCGAACCGCTCCTGTGTTCAATCCAGCAGATGGTGACCCCTGGTCAGGCATTAAAATAAAGCCTAGATTAAAAGATCAGGATATGAGGTCTACCTTGAGCACTGGCACCTTGAAA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| 9,424
|
OR553441.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
SC-D
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,709
|
GenBank
| 1
|
USA: Clemson, SC
|
USA
|
Trifolium subterraneum
| null |
1991
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate SC-D, complete genome
|
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| 9,425
|
OR553442.1
|
Luteovirus glycinis
|
Stone,A.L., Damsteegt,V.D., Smith,O.P., Stewart,L.R., Damsteegt,V.
|
USDA, ARS, Foreign Disease-Weed Science Research Unit
|
USA
|
2024-01-28
|
VA20-D
|
Luteovirus glycinis
|
Luteovirus
|
Tombusviridae
|
ssRNA(+)
| 5,708
|
GenBank
| 1
|
USA: Blacksburg, VA
|
USA
|
Trifolium subterraneum
| null |
1990
| null | null |
Luteovirus glycinis isolate VA20-D, complete genome
|
AGTAAAGTTGACACCTTTACAGAAGTGTTCTTGCTAGTAAGAGTTATTTCCTTGTGAAGTAATACAAGAACCTCCTCCCGGCATCTTCGTATCGTGTTTGAGGAATCTCTAGTGTTATTGTTAGTTATGTTTAACTTCGATAGCTTAGTTACAGCCACCGCTAGGGTGGTTAAAGATTTTATTTCTTTTTGCTATAGCAGGGCACGGCATGTTTATTATGCCCTAAAAAGATGGCTCTGGGAACTCCAGGGTGTATTTGCTGCGCATGACGCCTTTGTCGACATGTGCTATGACGCCATGTATGGCGTTGAGGAGTTCGAGTGGGAACTGCAAAAACAGTATTCCACTGCAGAGATTGACGTGCAATTAGCTGAGCACGAATACAAGCGCCTACTTGCCGATGGCGCTCCACTAGGGTCATGGCCACAACCATGTGCGCCCCAAGGCTCATTCAGGTCGTCTGACGACTTTGATGTAGCTGCTAGGGCTGCTGAGGCAAACCCTATTGTGGACCCACAACCCTCTTTGATCAAAGGGTGTGGCGATAAATCACCTTCCAATCCCACTAGGATTGAGAAGTTCATCAACCTCGTTCAAAAGAAGGAGGTACTTTCCGCTACTGAGGCTCTAATCAAACATACATATGAAGAGCAAATCGGTGAATCACCATTCGGAAAGTGGTTCAACACTCTGCCCAATAGAATGAATTACATAAAGAGGGCAGCAGCAAAACAAGCCAAGGCGGCTAAACGATCTAAATCTGTCCGCCAAATGGTTACCGAGGTAAACGTCATTCCCGACTTTATCTCTTGCTGTGATGTTGTCCAGGTGGACACTGGTGAAAAGCTCCCTTCTAAGAAGGATAAAGAAGGGAATGAATTGCCACCTGAGCCTAAACTCAAAATGTTTAGAAGGGTGAAGCCTGAGCATGTTGGTGATGCCAGGAAATACATCTGTCAACATATTCGCAACAATAATATGAGGTTGATAGACGGCTCTGATGTTTCCCATGCAACCATCAACCGATATGCGCTCAAGTTTTGCGAAGACTTGGAGCTTGACATGACCAGCACTGAAATGCTCATTAAATATGCTATGGTCATGGTCCCACTCCCTCGAAAATCTGATATCGAGGCTGCTAAAATCGTCCAATCTCCTGCTGCCAGGCAAATAAGGCATGAGTTGGGCGTGCTTAACGCCGAGGTTTTTTAGAGGGGCTCTGCTCCGACTCTGGTTTTGAATCCCCGTTTTCTATCTTGGGGTTACCAGAGATCGTGGTGCGAAGTGGGGCTATCCCTAGGAAGAGTCGTAGTACTATTAATTATTTGAGTCAGTTTAGTTTAGGTCTAGATTACCAATGCCCTAATCCCAGTTTGCACAACGCATTGGTAGCGGTTGAACGTAGAGTGTTCACCGTTGGGAAAGGAAATGAGGTAGTGCTACCTTACAAGAACATACCAGGAATCTTCTCTAATCTTGATTATTTCCGCAAGTCTATTGTGGATAAGGTTGGTTGTCCCAGGACGTTCTCCCCTGAAGAACTTGCAGCGACGTATCACTCTGGTAAGAGAACGTTGTATAATGCTGCTGTTCAAAGTCTTAAACGTAAGGCTGTTGAGAGGAGTGACGCGAATGTGACAGCTTTCCTTAAGATGGAGAAGCATCTTATGTGTAAGAAGATAGCACCCAGGTTGATATGTCCTCGCAACAAAAGATACAATGTTGAATTGGGACGTCGATTGAAATTCAATGAGAAGAAATTCATGCATGCAATCGACTCAACTTTTGATTCCCCAACTGTATTAAGTGGATATGACAGTTTTAAAGTTGGGAAGATAATAGCCAATAAATGGTCGAAATTCAAACGACCAGTTGCAATAGGTGTTGATGCAAGCAGATTTGATCAACATGTGGGGGTAGAAGCACTCCAATGGGAGCACTCGGTCTATAACGGTGCATTCAATGATCCCATTCTGAAGGAGTTGCTACACTGGCAAACAGAGAACAAAATAATGCTGTTTGTTGAAGATAAAATCCTCAAGTTCAAGGTCAAAGGACACAGAATGTCCGGTGACATTAACACCTCTTCTGGCAACAAATTAATCATGTGTGGTATGATGCACTACTACTTCAAGTCACTTGGAGTCAAAGCCGAACTCTGCAATAACGGCGATGATTGTGTTATCATATGCGAGAAGAAAGATGAAAACAAGTTCTCACACATGCATAGCTGGTTTAAAGACTATGGGTTTGACATGCAGATTGAGACTCCTGTCTACAAGATTGGACAGATAGAGTTTTGTCAAAGTAAACCAGTTAAAATTAATGGCTATTACAGAATGGTGCGTAAACAAGAAAGCATATCCAAAGACGCCCATTCCCTCATTTCCATGGCATCAGCTGAAGATGTCAAAACATTTATGAGTGCCACCGCCCAGTGCGGGATGATCTTGAATAGTGGTGTACCTGTTCTTGATGCTTTTCACAAATGCCTATACAAAGCATCGGGGTACAAGAAAGTATCGCAGGAAGCGATCGAGAGGATAGTCTCCTTCGGAACGCAGGACAAACTCGGGCTCAGGAAAGAGCGAGTTGAAGAACCAATAACGATGGATAATAGGTTGAGTTATTGGGAGTCCTTTGGGGTTGACCCGCAGACACAGGTCCTTGTCGAACGATATTTTGACAATCTGCAGGTCCATATCGAACCCCGCGGCGTAAAGAGATTGACGCCTTTACTCGATAAAACTTTGCTTTCAATCGCGAGTGTAGCACGAACATCTGTGTCGCTACCAATACTTTCAAAATAGAAGCACTCATAATCACCATAGTAGTTATAGTACTAGTAGTAGTTAGCTGTTTAGATTACGCTAGTTCGTACAAGTAAGTTGCAACGGATTACCGATTTTTATCTGGTTTTGCTATCGGCTTTATAGCTAGCATACCAATATCAATATTGGCAATTTACTTTGTTTACCTAAAAATTTCAAAGAACCTGAGAGGAATCATCAACGAATATGGTCGCGGTTAGCAATGTCACAATTCAACGACGACGTAATCGTAGAGCCGCACGAAGCGCTCCACGAGTTCAGCTCATGGCTATTCCAACGACCACCGGCGCAACACAGCGCAGAAGAAGACAACGACGACGAAGGAGAAATAATAGAGGAGGAGGCAATATTTCCGGAGGATCAGGCAAGGCTCACACATTCCAGTTTTCGAAGGACGGCATCAATGGCAGTTCCAAGGGAACTATCACTTTCGGGCCGTCTTTATCAGAGTGCAAGCCACTCTCTGATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAATATAAGATCACGAGTATCTTATTACAGTTCATCTCCGAGGCCTCTTCCACCTCGTCAGGCTCCATCGCTTATGAGCTTGACCCACACTGCAAGTACTCCGAAATTCAATCGCTACTCAATAAATTCTCAATTACAAAGAGCGGTTCGAAACGATTCCCCACCAAGGTTATCAATGGCCTCGAATGGCATGATACCAGTGAAGACCAATTCAAGGTCCACTACAAGGGGAACGGAGACGCCAAGATCGCAGGCTCCTTCAAGATCACGATCGTTGTCTTAACTCAGAATCCTAAATAGGTAGACGGAGAACCGGGGCCGAAACCAGGTCCGGACCCCACACCCCCACCAGCACCACCACCTGAACCGACGCCAGCCAAACATGAGAGATTCATTGTGTACACCGGTACACTGTCAACACTCATTAGTGCCCGACAAAACTCAGATAGCATATCCCTCTACTCAATCAGAGACCAGAGGGTTAGGTATATCGAGGATGAAAATGCGAACTGGACGAACATCCAAGCACAATGGTATTCACAGAATTCTGTGGAGGCAATACCAATGTTTATCTACCCAGTTCCGCAAGGCACATGGTCAATTGAAATCTCTTGTGAAGGCTATCAGGCGACGTCAAGCACCACAGACCCCCACCGGGGGAAGTCTGATGGAATGATTGCTTACGACGATGATCAAAATAAAGTGTGGAATATTGGTGTACAAAATAATGTAACCATTTCCAACAACAAAGCCGATGCTGACTGGAAATATGGTCACCCTGATTTAACAATCAACGGTGAACGTTTTGATCAGAAGCAGGTAGTCGAGAAAGATGGAACAGTTTCGTTTCATTTAGTAACTACCGGGCCCAACGCGAGTTTCTTTTTAGCTGGCCCTGCCGTTAAGAAGACTGCCAAGTACAACTACTGTATATCATACGGGGCTTGGACAGACCGCGACATGGAATTTGGAATGGTCTCTGTTGTTCTCGATGAACATTTAGAGGGTGTTAGAGGTTCTCAGTACGTTAGGAAAACGCTAAGACCAGGTCATATTAGCGTCAATCGTACCCACCGATTGCAAGAAATGCCTCCCATGCGAGAGGACTTCAGTGAGGAAGATAATAGTAGTAGTGATAGTAATACGTATAAAACGGACAACTCTCCCTTGACCGTTCACCTTGTAAAAGCAGGTGACGAGGAGAATTATACAACAGATCGATCGGACGATGCTGAACCCACACTTCATGATGCTGATGTCATGAAGTTCTCCGGGTTTGTTGGAGCCAAAGATAGGTTTACGTTGCAGGGCGCTGATCCAATCGGCCCTGGTGACAGATCTGTCCGTCGCTTCAGACCGTCTGCCACATTGAAGTCTGCGTTCCATTCGGGACCTACTCCTGATGAGTTGTACAACGCTGGTGCTGAACAAGCGGATCACGACTTCGAACACTTTGTCTCACGAGGCAAAGAGAAGCTACAGGATGAAGATCCAATGGCCAAACTCGAAAGAGAGGCTGAGGATTTAAAACCTGATAGTGACAACGAAGACAACGATTATGATCGAACCGCTCCTGTGTTCAACCCAGCAGATGGTGACCCCTGGTCAGGTATTAAAATAAAGCCTAGATTAAAAGACCAGGATATGAGGTCCACCTTGAGCACTGGCACCTTGAAAGGTGGTTCACTGAAACCGAAGAAAGAACCAACCCCAAGGTTTGTGCCAGCGCCAAAGTCCGTTTTAGATAGGATTAGACGTAGGCAAGTTTAATCTTGCACCAATATAGAAGTAGTTAGCGCTTTCCATTGTCACTTATAGGAGCCAAATTTGGTGAGTCCCGATCGATGGATCCTGGGAAACAGGTTCGGTGAACAAAAAGCCGGTAATCTCGGGGAGATGTCAGCTCCCGTCGTATCACTTTCGGTTGCATATCCAAAGAATAACCCTATATTTAACAACTAAAAATTAGATAGTTTCCGCCTCTCTTGTAAACCACATACAAGATGCGAGCTTGTGGAGAGTACCTTCCCTTGAATAAGGAAGGTTGAAAGTTTCTGGTTCCCAAACCATTGATCAAAATTGGCTCTGCTTCTGGTGATTACACTGCCGCTGAATTAACAGCGTAAACAAATTCCTATTGGTCACTCCGTGAAAAGAGAGTGGCTAATACGCCCCTTTGATGGCGTTAAATGAAAGCGTAGGTCGCACGACACCCCCTGTCAAGGACAGCCAACCTTGCGAAGTCGGGAGAATACCCGATAGACTGTGGTCTAGTATTAAAATGACTCGAGGGCTCTTCCTCGTTAAAAAGGGGGCGACGGCAGGAAACTGCTGTCATTAGGCGAAAGCCTCTTTGTTGTTAAGGTGGCCATCAGGTCCACCTGCCCC
| 9,426
|
NC_024497.1
|
Lymantria dispar iflavirus 1
|
Carrillo-Tripp,J., Krueger,E.N., Harrison,R.L., Toth,A.L., Miller,W.A., Bonning,B.C.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-07-24
|
Ames
|
Iflavirus lineacelli
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 10,044
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
| null | null |
2011-11-17
| null |
PRJNA485481
|
Lymantria dispar iflavirus 1 isolate Ames, complete genome
|
CGATTGTATCAGAGTTTTCAAATTAATTAATGAGTCTCTTAAGTGAGTTTTATATTTCTTGAGTTTCATGTTCCGAAAAGGTTCGATGATTATACTCTTGGATAATATTTAATGACATTTTTGGATTGGCTCATTATTAAGTCTTTTCTCTGTACTTAGTTAAGGTTTATTTGCTTTTAAATTATATATATTATACAACTTATATGTTTTAAAAATTGAAATACTCGGTTCAGACCGGGGCTATATCTAACAACTTGTAATAAAGAATTTACCTATTTTCACTATCGGCCTCTCTTATTAGTCTTTTAGTAGCATAGAGAAATAGTGACATGAGCATAATCACCCCTCATGGCAACAAGTAGCTCTTTATTTTCTATTACAAGTATGATTTATAGTGTATAAAAATTAATTTTAAGGCAAGGCAACATAATATTGTAGATGTCTATGAGTAGATAAAACGTAGTTGGAATGTGTGTGCGATAAAATGGGGACCCCTCCAACTGGCTAACACCAGCGCCTACTACATTTCAACATATTGCGACATAATCGAAAATGACCGCTCTATGTGTTATGGTTGTGACCACTATTCTGATTTATTTTGGAGGTAGTGTTAATCCGGCTGAGTTTATCTCAAAACCTCGATGACAAGTGTATCCTTGGACTTCGGGCATATATCTCTAAGATATAGTCGGACTTCTGAACCGTAAATTTGCGGAGGCTTTAAGTACGAAGAATAAGCCTGTCCATTTTCTTTTTTCTTTTTCTTATGGTTACAATCTCAGAATATACTAAAGCGTTTTCATTGTTTATTGTTATTTCAATTATTCTCAATTGCAATCCTATTACCCCTTTGTTTTATTTTTATTCCAACCTTATAATTCTTTTGCTAATTGTTTCTCATACTGATTTTAAATTTGTATCAAAATATTTTTGAAGATGGCTTCTTTYAACGTATCTTTTCTCCAATCTGTTTTTAGTGATTTAATTTCAGCTGAGTTTGATTACGAAGTTACCTTACTTCGTAAAATTTTTGATGGAAAATATGAATTGCGTCATTCTTATGGACTGACATCATCMTTAGACGATAATCATCTTGAAGATGAATGGCGCTTTAGATWTTTTAAGTTAGAAAAACGTCGCAATTATCTTTGGTATTTAATGAAAACACAAAAATTTGTAGAATTAGATGATCATTTTAATACGGATTATACCTTTGGCGATTTAGATTTGAGATTGCGAGTAGAATTTAGTAGAYACGTTAAAGAACATAGTGATAGATATAAATATATTAACCGTAAATCACGATTTGTTCCRTTTAGTAAAAGTAGTCTCCCCGTTGAGGATATTGAAACGGAATATTATGATAATAATGATATAGATATTGATTTCTCAACAAATTCTGTTAGTTTTAGAAAGAAACGAAGTGTTTCTTTTGAATCATTAGTTGATAATAATCGTGTATATAGAAAATGTGAAGTAGATAATAGAGATTATAATCTTTTAGTTAGTTATGCTTTACGTTTAAGAGAATTAATAGAGAATGCAGTTTCGTTACGTCTTCCAAGACGAATTAGTAAAATCTTTCGAAAGAAACGAAAGGCAGAATGGGTTGAGATGATACCATTGCAATATCAAGGTGGTACTCCTGCGGCACCACTAACTAAAGGTATAGATCCTATACGAGATCTTACACAAGACGATAATAGACCAAAGTGTTGTGCTTACTGCCCCGCAATTGTATGTATGAAGTGTTACAAAGGTAGAGGGTGTTGTGAATGTTTTCCTCATTATCAAGGCAACGTTGAACAAGGTGTCGGTGGTGATACGAGTGTTGTACAAATTCATAAAGCGCATAATGTCGTTCTTACTGAAACTGAAATTACACAATCTGATACTACAGCCATATCAAACCCAAAGTGGGGTAGTTATGTGAGTTCTGATACTATATCTCAGATGGATACATTAGTTAACAGATGGTTTCGTGTTGGYACTTATACGTGGACTACCCAGATGAATCGTAATACTACTATTAAATCTATTAGTTTACCTAGAGATGCTGTTTTTTCTGGCAGCACTACATGTGATCAGCCAAATAAGATCCCATTCCGTATACATAGATATTGGCGAGGAGATATTACTGTTAAAATTCATATAAATTGCAATAAATTTCAAATAGGCCAATTACAGTGTAGTTGGTATTATCAACCAAAAGCAGATGATTCATTTGCTAGTAAGAATAGTGTATATACACGAAGTGGTACTCATCATTGTGTTATTTCAGCAGCCCCTAATAACGAGGTAGAGCTCCGTATTCCCTATAAAGCATATAAAAGTATGTATCATACTAAAACATATAATGGCGATGTCAAAGATCTTCCGCTCGATATGGGAACACTGTTTATAAGCGTGTTAAGTCCGTTGAAAACGACTGGAGAAACATCTCCTAGATGTAGTTTTACTGTTTTTGTTAAGTATGAAAATAATGAATTTACTGGTATGATTGCTGGAGATGTTGATACCCCTTCCCAAGTTTCTGAAAGTTTACAATATCAAATGGATGGTATGGGATCTATTTTATCTGCAGCCGTTCCAGTTGTAGAGAAATTATTGACTAGTAGTCCTAATGATAATAACCGTGATAATCCTCCTCTAAATTCAGCTCCTCGGTATTTTGTACCAACTGCAAGTCATTCATGGTCAGTTGGTACAGATTTAGTAGAACCCCTTCATAATTTACGCTTGAGTGGGCGAGCTCAAACACGTCATCCGGATGTGGATTTAGATGAGATGAAAGTAGATGTTCTGAAGCGTAAGTATATGTTGTGTGATGTATTTTCATGGTCGCAACAAGATCCTAATGGCCATAATTTGTGGAATTTCCCTGTTAATCCAATGCCACCTAAAGATCGATTGTATAAAGTTGCTCAAGCCGGTACCAATACATTATCTAAATATCAGATTACGCCTATAGGTTTCTTAAGTAGTTTATATCAATATTGGCGTGGTTCTATCGAATATAGATTTGATATAGTAGCTTCACAATTTCACAGTGGAAAATTATTGTTAGCATACATTCCAGGGCTGGAAGAAGGTGGTTCTGTTACGATTGAACAAGCGCGTGCTTCACCTCATATAATAATTTCTTTAGATAATGCTATGACATATACTTGGCGTGTTCCTTATGTTGCAGATAGACCATGGTGGCCTCGACGATATGCTGGCGAGTCTATATCTAATAATGTAACGTCTCCATCAAAAATTTTTGTATTTGTATTAAATGAGCTTGTCATGGCAGAAACTGTTGCAGATAGTATCGAAATTTTGGTATATATGCGTGGTGGTGAAGACATGGAATTTGCTGTGCCTGTTCAACCTTCAATAGGTTTGGGTCATGATAATAGTTATGTAGCAAGTCGAAATAATACTAATATATTTCCTGTATCCACAACTGATAGTTTCTATGCTGGAAATTGGCATTCTGCACCATTAGTTCTGGTTTTGCGTCACGCTGCTACATCAGACGCTGTTGGGCGATTTAGTGAGCCTATATTAGATCGTCCTGTTTATTATGTTTTGTCTTCGTCGCTTCCTACGGCAAATGTTAATTCTGGAGCTTTAACTTTACGATCAATTACACATTACATTTTCTTAAAAGGTATTGGTTTTAACGAATATATAGGTTTACCTGTTTATGCAGCTAATACTCAAATTGCTCTTAATAAGCTTGAACAGATAGCGCGTGCCGCATTTACTAATAAGTACACATATGGTTCTTGGGTAAGTTCATTTATGATAACTGCACCACTTTCAACATCAGCAGGCGGCTTCGGTTTCATACCCGCAGCATATGTTACAACGTCTAATACGTATGGAGGAGGGAAATCAATTCCCTTTAYAGCTATGAGTGTGTCACCTACCTTAGAAGATATGGAGTATCAAGGAAACAGAGAGGAATCACTAGCATTAGTAGATGATACACAAAATTTGCAAAGTACAGGTAGTGGCATGATGACTTATGGTGAGCGATTTGTGGATTTGAAAGATTTAGGTAGGCGTTACCAACTATATGGCTGGACATCTATACCGCGTGATCAAATAGAACGAGATCCAGGTGCGTGTAGTTTCTTATTCCCCGTTCTTCCTCAGGGGTTGAATTTGGCTATTAATACGCCTACTTCTGTTAATCAAATTTGGAATCGTGCTCGTGAGGGCCATATACCATTAATAGCAAGTTTATTCCGTTTTTACAGAGGTTCACTTCGAATTCGCATGGTATTCTCTAATGCATCAGGTTTAACAGCGTGGGTTCAACATCGCCCCGACCGTCGCTTAGATCGCGACGTTATTACTCCATGTACTCAAGTGACTACAGCAGAGGCTGTTTTTAATCATTCATATGGAGTCTATATGCAATCATTAAGTGTCAATAATATGATCGAGATAGAAGTTCCGTTTTATCAAATGGCCAATTTTGGTCTGTTACAAAAACCCATTATTGCTGTAGGTGGTCCCGTAACTGATTGGTCGCGCTTTTATAGCTTAGGCGAGCTGAGCGTGGGCTTTTTTGGCGATAAACCTACAGATGATATTAGGTGTACGATATATTATAGCATGGCTGATGATTGCCGATTTTCAACATATCAGGGAGTTCCTCCTGTTGTTTTAATTGATGATTTACCTGAATACCAAGGCTTTACAGATTATTTTAAATCGTCACCTAAAGAAATAGGTAATCAAGTAGCAGAGGGTGTTGCAGAGACTATACATTCCCAATTACAGCCAGCTGTTGATAATTTTGTAGCATCATTTAAAGAAAGAATGGGAGATGTGTATTCAAGTGTTTCACAGTCAATAAGTGATATTGAATTTTCTTCAAAAATTTCTGCTATAGGCTCTCAAATTATACATTCYGTTAATAACCCCTCCCCGTCAACTATAGCTATTTCAGTAGTCTCAATTTGTATTACTTTAGGATTAATAACGTATGCTACATATCATAT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ACGAGCGTTGTATTCCGATCTCTTCCTAAGGAGTAGCTTTTAAT
| 6,451
|
OP895018.1
|
Lymantria dispar iflavirus 1
|
Sparks,M.E., Wang,Y.-M., Shi,J., Harrison,R.L.
|
Beltsville Agricultural Research Center, USDA Agricultural Research Service, Invasive Insect Biocontrol and Behavior Laboratory
|
USA
|
2023-05-17
|
CT
|
Iflavirus lineacelli
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 10,078
|
GenBank
| null |
USA: Connecticut
|
USA
|
Lymantria dispar dispar
| null |
2021
| null | null |
Lymantria dispar iflavirus 1 isolate CT, complete genome
|
CGCGCAGCGATTGTATCAGAGTTTTCAAATTAATTAATGAGTCTCTTAAGTGAATTTTATATTTCTTGAGTTTCATGTTCCGAAAAGGTTCGATGATTATACTCTTGGATAATATTTAATGACATTTTTGGATTGGCTCATTATTAAGTCTTTTCTCTGTACTTAGTTAAGGTTTATTTGCTTTTAAATTATATGTATTATACAATTTATATGTTTTAGAAATTGAAATACTCGGTTCAGACCGGGGCTATATCTAACAACTTGTAATAAAGAATTTACCTATTTTCACTATCGGCCTCTCTTATTAGTCTTTTAGTAGCATAGAGAAATAGTGACATGAGCATAATCACCCCTCATGGCAACAAGTAGCTCTTTATTTTCTATTACAAGTATGATTTATAGTGTATAAATATTAATTTTAAGGCAAGGCAACATAATATTTTAGATGTCTATGAGTAGATGAAACGTAGTTGGAATGTGTGTGCGATAAAATGGGGACCCCTCCAACTGGCTAACACCAGCGCCTACTACATTTCAATATATTGCGACATAATCGAAAATGACCGCTCTATGTGTTAGGGTTGTGACCACTATTCTGATTTAGTTTGGAGGTAGTGTTAATCCGGCTGAGTTTATCTCAAAACCTCGATGACAAGTGTATCCTTGGACTTCGGGCATATATCTCTAAGATATAGTCGGACTTTTGAACCGTAAATTTGCGGAGGCTTTAAGTACGAAGAATAAGCCTGTCCATTTTCATTTTACTTTTTCTTATGGTTACAATTTCAGATTACATTAAAGCGATTTCATTGTTCATTGTTGTTTCAATTATTCTCAATTGCAATCCTATTACCCCTTTGTTTTATTTTTATTCCAATTTTATAATCCTTTTGTTAATTGCTTCTCATACTGATTTTAAATTTGTATCAAAATATTTTTAAAGATGGCTTCTTTCAATGTATCTTTTCTCCAATCTGTTTTTAGTGATTTAATTTCAGCTGAGTTTGATTACGAAGTTACCTTACTTCGTAAAATTTTTGATGGAAAATATGAATTGCGTCATTCTTATGGACTGACATCATCTGTAGACGATATTCATCTTGAAGATGAATGGCGCTTTAGATATCTTAAGTTAGAAAAACGTCGTAATTATCTTTGGTATTTAATGAAAACGCAAAAATTTGTAGAATTAGATGATCATTTTAATACGGATTATACTTTTAGCGATTTAGATTTGAGACTGCGAGTAGAATTTAGTAGACATGTTAAAGAACATAGTGATAGATTTAAATATATTAACCGTAAATCACGATTTGTGCCGTTTAGTAAGAGTAGTCTCCCCGTTGAGAATATTGAAACGGAATATTATGATAATAATGATATAGATATTGATTTCTCTACAAATTCTGTTAGTTTTAGAAAGAAACGAAGTGTTTCTTTTGAATCATTAGTTGATAATAATCGTATATATAGAAAATGTGAAGTAGATAATAGAGATTATAACCTTTTAGTTAGTTATGCTTTACGTTTAAGAGAATTATTAGAGAATGCAGTTTCATTACGTCTTCCAAGACGAATTAGTAAAATTTTTCAAAAGAAACGAAAGGCAGAATGGGTTGAGATGATACCATTGCAATATCAGGGTGGTACTCCTGCGGCACCAATAACTAAAGGTATAGATCCTATACGAGATCTTACACAAGATGATAATAGACCAAAGTGTTGTGCTTACTGCCCCGAAATTGTGTGTATGAAGTGTTATAAAGGTCGAGGGTGTTGTGAATGTTTTCCTCATTATCAAGGCAACGTTGAACAAGATGTTGGTGGTGATACGAGTGTTGTACAAATTCATAAAGCGCATAATGTCGTTCTTACTGAAACTGAAATTACACAATCTGATACTACAGCCATATCAAACCCAAAGTGGGGTAGTTATGTGAGTTCTGATACTATATCTCAGATGGATACATTAGTTAATAGATGGTTTCGTGTTGGTACTTATACGTGGACTACCCAGATGAATCGTAATACTACTATTAGATCTATTAGTTTACCTAGAGATGCTGTTTTTTCTGGCAGCACTACATGTGATCAGCCAAATAAAATCCCATTCCGTATACATAGATATTGGCGAGGAGATATTACTGTTAAAATTCATATAAATTGCAATAAATTTCAAATAGGCCAATTACAATGTAGTTGGTATTATCAACCAAAAGCAGATGATTCATTTGCTAGTAAGAATAGTGTATATACACGAAGTGGTACTCATCATTGTGTTATTTCAGCAGCCCCTAATAACGAGGTAGAGCTCCGTATTCCCTATAAAGCATATAAAAGTATGTATCATACTAAAACATATAATGGCGATGTCAAAGATCTTCCGCTTGATATGGGAACACTGTTTATAAGCGTGTTAAGTCCGTTGAAAACGACTGGAGAAACATCTCCTAGATGTAGTTTTACTGTTTTTGTTAAGTATGAAAATAATGAATTTACTGGTATGATTGCTGGAGATGTTGATACCCCTTCCCAAGTTTCTGAAAGTTTACAATATCAAATGGATGGTATAGGATCTATTTTATCTGCAGCCGTTCCAGTTGTAGAGAAATTATTGACTAGTAGTCCTAATGATAATAACCGTGATAATCCTCCTCTAAATTCAGCTCCTCGGTATTTTGTACCAACTGCAAGTCATTCATGGTCAATTGGTACAGATTTAGTAGAACCCCTTCATAATTTACGCTTGAGTGGGCGAGCTCAAACACGTCATCCGGATGTGGATTTAGATGAGATGAAAGTAGATGTTCTGAAGCGTAAATATATGTTGTGTGATGTATTTTCATGGTCGCAACAAGATCCTAATGGCCATAATTTGTGGAATTTCCCTGTTAATCCAATGCCACCTAAAGATCGATTGTATAAAGTTGCTCAAGCCGGTACCAATACATTATCTAAATATCAGATTACGCCTATAGGTTTCTTAAGTAGTTTATATCAATATTGGCGTGGTTCTATTGAATATAGATTTGATATAGTAGCTTCACAATTTCACAGTGGAAAATTATTGTTAGCATACATTCCAGGGCTGGAAGAAGGTGGTTCTGTTACGATTGAACAAGCGCGTGCTTCACCTCATATAATAATTTCTTTAGATAATGCTATGACATATACTTGGCGTGTTCCTTATGTTGCAGATAGACCATGGTGGCCTCGACGATATGCTGGCGAGTCTATATCTAATAATGTAACGTCTCCATCAAAAATTTTTGTATTTGTATTAAATGAGCTTGTCATGGCAGAAACTGTTGCAGATAGTATCGAAATTTTGGTATATATGCGTGGTGGTGAAGATATGGAATTTGCTGTGCCTGTTCAACCTTCAATAGGTTTGGGTTATGATAATAGTTATATAGCAAGTCGAAATAATACTAATGTATTTCCTGTATCCACAACTGATAATTTTTATGTTGGAAATTGGCATTCTACACCATTAGTTCAGGTTTTGCGTCACGCTACTACATCAGAAGCTGTTGGGCGATTTAGTGAGCCTATATTAGATCGTCCTGTTTATTATGTTTTGTCTTCGTCGCTTCCTACGGCAAATGTTAATTCTGCAGCTATAACTTTACGATCAATTACACATTACATTTTCTTAAAAGGTATTGGTTTTAATGAATATATAGGTTTACCTGTTTATGCAGTTGATACTCAAATTGCTCTTAGTAGGCTTGAACAGATAGCGCGTGCCGCATTTACTAATAATTACACATATGGTTCTTGGGTAAGTTCATTTATGATAACTGCACCACTTTCAACATCAGCAGGCGGCTTCGGTTTCATACCCGCAGCATATGTTACAACGTCTAATACGTATGGAGGAGGGAAATCAATTCCCTTTACAGCTACGAGTGTGTCACCTACCTTAGAAGATATGGAGTATCAAGGAAACAGAGAGGAATCACTAGCATTAGTAGATGATACACAAAATTTGCAAAGTACAGGTAGTGGTATGATGACTTATGGTGAGCGATTTGTGGATTTGAAAGATTTAGGTAGGCGTTACCAACTATATGGCTGGACATCTATACCGAGTGATCAAATAGAACGAGATCCAGGTGCGTGTAGTTTCTTATTCCCCGTTCTTCCTCAGGGGTTGAATTTGGCTATTAATACGCCTACTTCTGTTAATCAGATTTGGAATCGTGCTCGTGAGGGCCATATACCATTAATAGCAAGTTTATTCCGTTTTTACAGAGGTTCACTTCGAATTCGTATGGTATTCTCTAATGCATCAGGTCTAACAGCGTGGGTTCAACATCGCCCCGATCGTCGCTTAGATCGCGACGTTATTACTCCATGTACCCAAGTGACTACAGCAGAGGCTGTTTTTAATCATTCATATGGAGTTTATATGCAATCATTAAGTGTCAATAATATGATCGAGATAGAAGTTCCGTTTTATCAAATGGCCAATTTTGGTCTGTTACAAAAACCCATTATTGCTGTAGGTGGTCCCGTAACTGATTGGTCGCGCTTTTATAGCTTAGGCGAGTTGAGTGTGGGCTTTTTTGGCGATAAACCTACAGATGATATTAGGTGTACGATATATTATAGCATGGCTGATGATTGCCGATTTTCAACATATCAGGGAGTTCCTCCTGTTGTTTTAATTGATGATTTACCTGAATACCAAGGTTTTACAGATTATTTTAAAGCGTCACCTAAAGAATTAGGTAATCAAGTAGCAGAAGGTGTTGCAGAGACTATACATTCCCAATTACAGCCAGCTGTTGATAATTTTGTAGCATCATTTAAAGAAAGAATGGGAGATGTGTATTCAAGTGTTTCAAAGTCAATAAGTGATATTGAATTTTCTTCAAAAATTTCTTCTATAGGCTCTCAAATTATACATTCTGTTAATAACCCCTCCCCGTCAACTATAGCTATTTCAGTAGTCTCAATTTGTATTACTTTAGGATTAATAACGTATTCTACAT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GGCAGAAGTTGCGGAATCAACGAGCGTTGTAATCCGATCTCTTCCTAAGGAGTAGCTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 15,675
|
OP895019.1
|
Lymantria dispar iflavirus 1
|
Sparks,M.E., Wang,Y.-M., Shi,J., Harrison,R.L.
|
Beltsville Agricultural Research Center, USDA Agricultural Research Service, Invasive Insect Biocontrol and Behavior Laboratory
|
USA
|
2023-05-17
|
NJ
|
Iflavirus lineacelli
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 10,185
|
GenBank
| null |
USA: New Jersey
|
USA
|
Lymantria dispar dispar
| null |
2021
| null | null |
Lymantria dispar iflavirus 1 isolate NJ, complete genome
|
TAATTATACTCTTGGATAATATAATGACATTTTTGGATTGGCTCATTATTAAGTCTTTTCTCTGTACTTAGTTAAGGTTTATTGAAAATCGCTGCGCGGTTTTACCGCGCAGCGATTGTATCAGAGTTTTCAAATTAATTAATGAGTCTCTTAAGTGAATTTTATATTTCTTGAGTTTCATGTTCCGAAAAGGTTCGATGATTATACTCTTGGATAATATTTAATGACATTTTTGGATTGGCTCATTATTAAGTCTTTTCTCTGTACTTAGTTAAGGTTTATTTGCTTTTAAATTATATGTATTATACAATTTATATGTTTTAGAAATTGAAATACTCGGTTCAGACCGGGGCTATATCTAACAACTTGTAATAAAGAATTTACCTATTTTCACTATCGGCCTCTCTTATTAGTCTTTTAGTAGCATAGAGAAATAGTGACATGAGCATAATCACCCCTCATGGCAACAAGTAGCTCTTTATTTTCTATTACAAGTATGATTTATAGTGTATAAATATTAATTTTAAGGCAAGGCAACATAATATTTTAGATGTCTATGAGTAGATGAAACGTAGTTGGAATGTGTGTGCGATAAAATGGGGACCCCTCCAACTGGCTAACACCAGCGCCTACTACATTTCAATATATTGCGACATAATCGAAAATGACCGCTCTATGTGTTAGGGTTGTGACCACTATTCTGATTTATTTTGGAGGTAGTGTTAATCCGGCTGAGTTTATCTCAAAACCTCGATGACAAGTGTATCCTTGGACTTCGGGCATATATCTCTAAGATATAGTCGGACTTTTGAACCGTAAATTTGCGGAGGCTTTAAGTACGAAGAATAAGCCTGTCCACTTTCATTTTACTTTTTCTTATGGTTACAATTTCAGAATATATTAAAGCGATTTCATTGTTTATTGTTATTTCAATTATTCTCAATTGCAATCCTATTACCCCTCTGTTTTATTTTTATTCCAATCTTATAATTCTTTTGCTAATTGTTTCTCATACTGATTTTAAATTTGTATCAAAATATTTTTGAAGATGGCTTCTTTTAACGTATCTTTTCTCCAATCTGTTTTTAGTGATTTAATTTCAGCTGAGTTTGATTACGAAGTTACCTTACTTCGTAAAATTTTTGATGGAAAATATGAATTGCGTCATTCTTATGGACTAACATCATCTGTAGATGATATTCATCTTGAAGATGAATGGCGCTTTAGATATCTTAAGTTAGAAAAACGTCGTAATTATCTTTGGTATTTAATGAAAACGCAAAAATTTGTAGAATTAGATGATCATTTTAATACGGATTATACTTTTAGCGATTTAGATTTGAGACTGCGAGTAGAATTTAGTAGACATGTTAAAGAACATAGTGATAGATTTAAATATATTAACCGTAAATCACGATTTGTGCCGTTTAGTAAGAGTAGTCTCCCCGTTGAGAATATTGAAACGGAATATTATGATAATAATGATATAGATATTGATTTCTCTACAAATTCTGTTAGTTTTAGAAAGAAACGAAGTGTTTCTTTTGAATCATTAGTTGATAATAATCGTATATATAGAAAATGTGAAGTAGATAATAGAGATTATAACCTTTTAGTTAGTTATGCTTTACGTTTAAGAGAATTATTAGAGAATGCAGTTTCATTACGTCTTCCAAGACGAATTAGTAAAATTTTTCAAAAGAAACGAAAGGCAGAATGGGTTGAGATGATACCATTGCAATATCAGGGTGGTACTCCTGCGGCACCAATAACTAAAGGTATAGATCCTATACGAGATCTTACACAAGACGATAATAGACCAAAGTGTTGTGCTTACTGCCCCGAAATTGTATGTATGAAGTGTTATAAAGGTAGAGGGTGTTGTGAATGTTTTCCTCATTATCAAGGCAACGTTGAACAAGATGTTGGTGGTGATACGAGTGTTGTACAAATTCATAAAGCGCATAATGTCGTTCTTACTGAAACTGAAATTACACAATCTGATATTACAGCCATATCAAACCCAAAGTGGGGTAGTTATGTGAGTTCTGATACTATATCTCAGATGGATACATTAGTTAATAGATGGTTTCGTGTTGGTACTTATACGTGGACTACCCAGATGAATCGTAATACTACTATTAGATCTATTAGTTTACCTAGAGATGCTGTTTTTTCTGGCAGCACTACATGTGATCAGCCAAATAAGATCCCATTCCGTATACATAGATATTGGCGAGGAGATATTACTGTTAAAATTCATATAAATTGCAATAAATTTCAAATAGGCCAATTACAATGTAGTTGGTATTATCAACCAAAAGCAGATGATTCATTTGCTAGTAAGAATAGTGTATATACACGAAGTGGTACTCATCATTGTGTTATTTCAGCAGCCCCTAATAACGAGGTAGAGCTCCGTATTCCCTATAAAGCATATAAAAGTATGTATCATACTAAAACATATAATGGCGATGTCAAAGATCTTCCGCTTGATATGGGAACACTGTTTATAAGCGTGTTAAGTCCGTTGAAAACGACTGGAGAAACATCTCCTAGATGTAGTTTTACTGTTTTTGTTAAGTATGAAAATAATGAATTTACTGGTATGATTGCTGGAGATGTTGATACCCCTTCCCAAGTTTCTGAAAGTTTACAATATCAAATGGATGGTATAGGATCTATTTTATCTGCAGCCGTTCCAGTTGTAGAGAAATTATTGACTAGTAGTCCTAATGATAATAACCGTGATAATCCTCCTCTAAATTCAGCTCCTCGGTATTTTGTACCAACTGCAAGTCATTCATGGTCAATTGGTACAGATTTAGTAGAACCCCTTCATAATTTACGCTTGAGTGGGCGAGCTCAAACACGTCATCCGGATGTGGATTTAGATGAGATGAAAGTAGATGTTCTGAAGCGTAAATATATGTTGTGTGATGTATTTTCATGGTCGCAACAAGATCCTAATGGCCATAATTTGTGGAATTTCCCTGTTAATCCAATGCCACCTAAAGATCGATTGTATAAAGTTGCTCAAGCCGGTACCAATACATTATCTAAATATCAGATTACGCCTATAGGTTTCTTAAGTAGTTTATATCAATATTGGCGTGGTTCTATCGAATATAGATTTGATATAGTAGCTTCACAATTTCACAGTGGAAAATTATTGTTAGCATACATTCCAGGGCTGGAAGAAGGTGGTTCTGTTACGATTGAACAAGCGCGTGCTTCACCTCATATAATAATTTCTTTAGATAATGCTATGACATATACTTGGCGTGTTCCTTATGTTGCAGATAGACCATGGTGGCCTCGACGATATGCTGGCGAGTCTATATCTAATAATGTAACGTCTCCATCAAAAATTTTTGTATTTGTATTAAATGAGCTTGTCATGGCAGAAACTGTTGCAGATAGTATCGAAATTTTGGTATATATGCGTGGTGGTGAAGATATGGAATTTGCTGTGCCTGTTCAACCTTCAATAGGTTTGGGTTATGATAATAGTTATATAGCAAGTCGAAATAATACTAATGTATTTCCTGTATCCACAACTGATAATTTTTATGTTGGAAATTGGCATTCTACACCATTAGTTCAGGTTTTGCGTCACGCTACTACATCAGAAGCTGTTGGGCGATTTAGTGAGCCTATATTAGATCGTCCTGTTTATTATGTTTTGTCTTCGTCGCTTCCTACGGCAAATGTTAATTCTGCAGCTATAACTTTACGATCAATTACACATTACATTTTCTTAAAAGGTATTGGTTTTAACGAATATATAGGTTTACCTGTTTATGCAGTTGATACTCAAATTGCTCTTAGTAGGCTTGAACAGATAGCGCGTGCCGCATTTACTAATAATTACACATATGGTTCTTGGGTAAGTTCATTTATGATAACTGCACCACTTTCAACATCAGCAGGCGGCTTCGGTTTCATACCCGCAGCATATGTTACAACGTCTAATACGTATGGAGGAGGGAAATCAATTCCCTTTACAGCTACGAGTGTGTCACCTACCTTAGAAGATATGGAGTATCAAGGAAACAGAGAGGAATCACTAGCATTAGTAGATGATACACAAAATTTGCAAAGTACAGGTAGTGGTATGATGACTTATGGTGAGCGATTTGTGGATTTGAAAGATTTAGGTAGGCGTTACCAACTATATGGCTGGACATCTATACCGAGTGATCAAATAGAACGAGATCCAGGTGCGTGTAGTTTCTTATTCCCCGTTCTTCCTCAGGGGTTGAATTTGGCTATTAATACGCCTACTTCTGTTAATCAGATTTGGAATCGTGCTCGTGAGGGCCATATACCATTAATAGCAAGTTTATTCCGTTTTTACAGAGGTTCACTTCGAATTCGTATGGTATTCTCTAATGCATCAGGTCTAACAGCGTGGGTTCAACATCGCCCCGATCGTCGCTTAGATCGCGACGTTATTACTCCATGTACTCAAGTGACTACAGCAGAGGCTGTTTTTAATCATTCATATGGAGTTTATATGCAATCATTAAGTGTCAATAATATGATCGAGATAGAAGTTCCGTTTTATCAAATGGCCAATTTTGGTCTGTTACAAAAACCCATTATTGCTGTAGGTGGTCCCGTAACTGATTGGTCGCGCTTTTATAGCTTAGGCGAGCTGAGCGTGGGCTTTTTTGGCGATAAACCTACAGATGATATTAGGTGTACGATATATTATAGCATGGCTGATGATTGCCGATTTTCAACATATCAGGGAGTTCCTCCTGTTGTTTTAATTGATGATTTACCTGAATACCAAGGTTTTACAGATTATTTTAAAGCGTCACCTAAAGAATTAGGTAATCAAGTAGCAGAGGGTGTTGCAGAGACTATACATTCCCAATTACAGCCAGCTGTTGATAATTTTGTAGCATCATTTAAAGAAAGAATGGGAGATGTGTATTCAAGTGTTTCAAAGTCAATAAGTGATATTGAATTTTCTTCAAAAATTTCTTCTA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| 15,676
|
OP895020.1
|
Lymantria dispar iflavirus 1
|
Sparks,M.E., Wang,Y.-M., Shi,J., Harrison,R.L.
|
Beltsville Agricultural Research Center, USDA Agricultural Research Service, Invasive Insect Biocontrol and Behavior Laboratory
|
USA
|
2023-05-17
|
JGS
|
Iflavirus lineacelli
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 10,100
|
GenBank
| null |
China: Jingeshan, Hebei
|
China
|
Lymantria dispar asiatica
| null |
2019
| null | null |
Lymantria dispar iflavirus 1 isolate JGS, complete genome
|
TTACCGCGCAGCGATTGTATCAGAGTTTTCAAATTAATTAATGAGTCTCTTAAATGAGTTTTATATTTCTTGAGTTTCATGTTCCGAAAAGGTTCGATGATTATACTCTTGGATAATATTTAATGACATTTTTGGATTGGCTCATTATTAAGTCTTTTCTCTGTACTTAGTTAAGGTTTATTTGCTTTTAAATTATATGTATTATACAACTTATATGTTTTAGAAACTGAAATACTCGGTTCAGACCGGGGCTATATCTAACAACTTGTAATAAATAATTTACCTATTTTCACTATCGGCCTCTCTTATTAGTCTTTTAGTAGCATAGAGAAATAGTGACATGAGCATAATCACCCCTCATGGCAACAAGTAGCTCTTTATTTTCTATTACAAGTATGATTTATAGTGTATAAAAATTAATTTTAAGGCAAGGCAACATAATATTGTAGATGTCTATGAGTAGATGAAACGTAGTTGACATGTGTGTGCGATAAAATGGGGACCCCTCCAACTGGCTAACACCAGCGCCTACTACATTTCAATATATTGCGACATAATCGAAAATGACCGCTCTATATATTAGGGTTGTGACCACTATTCTGATTTATTTTGGAGGTAGTGTTAATCCGGCTGAGTTTATCTCAAAACCTCGATGACAAGTGTATCCTTGGACTTCGGGCATATATCTCTAAGATATAGTCGGACTTTTGAACCGTAAATTTGCGGAGGCTTTAAGTACGAAGAATAAGCCTGTCCATTTTCATTTTACTTTTTCTTATGGTTACAATTTCAGATTACATTAAAGCGATTTCATTGTTCATTGTTGTTTCAATTATTCTCAATTGCAATCCTATTACCCCTTTGTTTTATTTTTATTCCAATTTTATAATCCTTTTGTTAATTGCTTCTCATACTGATTTTAAATTTGTATCAAAATATTTTTAAAGATGGCTTCTTTTAACGTATCTTTTCTCCAATCTGTTTTTAGTGATTTAATTTCAGCTGAGTTTGATTACGAAGTTACCTTACTTCGTAAAATTTTTGATGGCAAATATGAATTGCGTCATTCTTATGGACTAACATCATCTGTAGACGATATTCATCTTGAAGATGAATGGCGCTTTAGATATCTTAAGTTAGAAAAACGTCGTAATTATCTTTGGTATTTAATGAAAACGCAAAAATTTGTAGAATTAGATGATCATTTTAATACGGATTATACTTTTAGCGATTTAGATTTGAGATTACGAGTAGAATTTAGTAGACATGTTAAAGAACATAATGATAGATTTAAATATATTAACCGTAAATCGCGATTCGTGCCGTTTAGTAAGAGTAGCCTCCCCGTTGAAAATATTGAAACGGAACATTATGATAATAATGATATAGATATTGATTTTTCTACAAATTCTGTTAGTTTTAGAAAGAAACGAAGTGTTTCTTTTGAATCATTAGTTGATAATAATCGTATATATAGAAAATGTGAAGTAGATAATAGAGATTATAACCTTTTAGTTAGTTATGCTTTACGTTTAAGAGAATTATTACAGAATGCAGTTTCATTACGTCTTCCAAGACGAATTAGTAAAATTTTTCAAAAGAAACGAAAGGCAGAATGGGTTGAGATGATACCATTGCAATATCAGGGTGGTACTCCTGCGGCACCAATAACTAAAGGTATAGATCCTATACGAGATCTTACACAAGATGATAATAGACCAAAGTGTTGTGCTTACTGCCCCGAAATTGTATGTATGAAGTGTTATAAAGGTAGAGGGTGTTGTGAATGTTTTCCTCATTATCAAGGCAACGTTGAACAAGATGTTGGTGGTGATACGAGTGTTGTACAAATTCATAAAGCGCATAATGTCGTTCTTACTGAAACTGAAATTACACAATCTGATACTACAGCCATATCAAACCCAAAGTGGGGTAGTTATGTGAGTTCTGATACTATATCTCAGATGGATACATTAGTTAATAGATGGTTTCGTGTTGGTACTTATACGTGGACTACCCAGATGAATCGTAATACTACTATTAGATCTATTAGTTTACCTAGAGATGCTGTTTTTTCTGGCAGCACTACGTGTGATCAGCCAAATAAAATCCCATTCCGTATACATAGATATTGGCGAGGAGATATTACTGTTAAAATTCATATAAATTGCAATAAATTTCAAATAGGCCAATTACAATGTAGTTGGTATTATCAACCAAAAGCAGATGATTCATTTGCTAGTAAGAATAGTGTATATACACGAAGTGGTACTCATCATTGTGTTATTTCAGCAGCCCCTAATAACGAGGTAGAGCTCCGTATTCCCTATAAAGCATATAAAAGTATGTATCATACTAAAACATATAATGGCGATGTCAAAGATCTTCCGCTTGATATGGGAACACTGTTTATAAGCGTGTTAAGTCCGTTGAAAACGACTGGAGAAACATCTCCTAGATGTAGTTTTACTGTTTTTGTTAAGTATGAAAATAATGAATTTACTGGTATGATTGCTGGAGATGTTGATACCCCTTCCCAAGTTTCTGAAAGTTTACAATATCAAATGGATGGTATAGGATCTATTTTATCTGCAGCCGTTCCAGTTGTAGAGAAATTATTGACTAGTAGTCCTAATGATAATAACCGTGATAATCCTCCTCTAAATTCAGCTCCTCGGTATTTTGTACCAACTGCAAGTCATTCATGGTCAATTGGTACAGATTTAGTAGAACCCCTTCATAATTTACGCTTGAGTGGGCGAGCTCAAACACGTCATCCGGATGTGGATTTAGATGAGATGAAAGTAGATGTTCTGAAGCGTAAATATATGTTGTGTGATGTATTTTCATGGTCGCAACAAGATCCTAATGGCCATAATTTGTGGAATTTCCCTGTTAATCCAATGCCACCTAAAGATCGATTGTATAAAGTTGCTCAAGCCGGTACCAATACATTATCTAAATATCAGATTACGCCTATAGGTTTCTTAAGTAGTTTATATCAATATTGGCGTGGTTCTATCGAATATAGATTTGATATAGTAGCTTCACAATTTCACAGTGGAAAATTATTGTTAGCATACATTCCAGGGCTGGAAGAAGGTGGTTCTGTTACGATTGAACAAGCGCGTGCTTCACCTCATATAATAATTTCTTTAGATAATGCTATGACATATACTTGGCGTGTTCCTTATGTTGCAGATAGACCATGGTGGCCTCGACGATATGCTGGCGAGTCTATATCTAATAATGTAACGTCTCCATCAAAAATTTTTGTATTTGTATTAAATGAGCTTGTCATGGCAGAAACTGTCGCAGATAGTATCGAAATTTTGGTATATATGCGTGGTGGTGAAGATATGGAATTTGCTGTGCCTGTTCAACCTTCAATAGGTTTGGGTTATGATAATAGTTATATAGCAAGTCGAAATAATACTAATGTATTTCCTGTATCCACAACTGATAATTTTTATGTTGGAAATTGGCATTCTACACCATTAGTTCAGGTTTTGCGTCACGCTACTACATCAGAAGCTGTTGGGCGATTTAGTGAGCCTATATTAGATCGTCCTGTTTATTATGTTTTGTCTTCGTCGCTTCCTACGGCAAATGTTAATTCTGCAGCTATAACTTTACGATCAATTACACATTACATTTTCTTAAAAGGTATTGGTTTTAACGAATATATAGGTTTACCTGTTTATGCAGTTGATTCTCAAATTGCTCTTAGTAGGCTTGAACAGATAGCGCGTGCTGCATTTACTAATAATTATACATATGGTTCTTGGGTAAGTTCATTTATGATAACTGCACCACTTTCGACATCGGCAGGTGGTTTTGGTTTTATACCTGCAGCATACGTTACAACATCTAATACGTATGGAGGAGGGAAATCAATTCCCTTTATAGCTACGAGTGTTTCGCCTACTTTAGAAGATATGGAATATCAAGGGAATAGAGAAGAATCATTAGCATTAGTAGATGATACACAAAATTTGCAAAGTACTGGCAGTGGCATGATGACTTATGGTGAGCGATTTGTGGATTTGAAAGATTTAGGTAGGCGTTACCAACTATATGGATGGACATCTATACCAAGCGATCAAATAGAACGAGATCCAGGTGCATGTAGTTTCTTATTCCCCGTTCTCCCTCAGGGGTTGAATTTGGCAATTAATACGCCTACTTCCGTTAATCAGATTTGGAATCGTGCTCGTGAGGGCCATATACCATTAATAGCAAGTTTATTCCGTTTTTATAGAGGTTCACTTCGAATTCGTATGGTATTCTCTAATGCGTCAGGTTTAACAGCGTGGGTTCAACATCGCCCCGATCGTCGCTTAGATCGCGACGTTATTACTCCATGTACTCAGGTAACTACAGCTGAGGCTGTTTTTAATCACTCATATGGAGTTTATATGCAATCATTAAGCGTTAATAATATGATCGAGATAGAAGTTCCCTTTTATCAAATGGCTAATTTTGGTCTTTTGCAAAAACCTATTATCGCTGTAGGTGGTCCTGTAACTGATTGGTCGCGCTTTTATAGCTTAGGCGAATTGAGCGTGGGCTTTTTTGGTGATAAACCTGCAGATGATATTAGGTGTACGATATATTATAGTATGGCTGATGATTGCCGGTTTTCAACGTACCAGGGAGTTCCTCCCGTTGTTTTAATTGACGATTTACCTGAATACCAAGGTTTTACAGATTATTTTAAAGCGTCACCCAAAGAATTAGGTAATCAAGTAGCAGAAGGTGTTGCAGAGACTATACATTCCCAATTACAGCCAGCTGTTGATAATTTTGTAGCATCTTTTAAAGAAAGAATGGGAGATGTATATTTAAGTGTTTCAAAATCAATAAGTGATATTGAATTTTCTTCAAAAATTTCTTCTATAGGCTCTCAAATTGTACATTCTGTTAATAACCCTTCCCCGTCAACTATAGCTATCTCAGTAGTTTCAATTTGTATTACTTTAGGATTAATAACGTATTCT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CAGAAGTTGCGGAATCAACGAGCGTTGTAATCCGATCTCTTCCTAAGGAGTAGCTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGGCTATCGG
| 15,677
|
OP895021.1
|
Lymantria dispar iflavirus 1
|
Sparks,M.E., Wang,Y.-M., Shi,J., Harrison,R.L.
|
Beltsville Agricultural Research Center, USDA Agricultural Research Service, Invasive Insect Biocontrol and Behavior Laboratory
|
USA
|
2023-05-17
|
ZY
|
Iflavirus lineacelli
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 10,185
|
GenBank
| null |
China: Zunyi, Guizhou
|
China
|
Lymantria dispar asiatica
| null |
2019
| null | null |
Lymantria dispar iflavirus 1 isolate ZY, complete genome
|
CTTGGATTATACTCTTGGATAATATTTAATGACATTTTTGGATTGGCTCATTATTAAGTCTTTTCTCTGTACTTAGTTAAGGTTTATTGAAAATCGCTGCGCGGTTTTACCGCGCAGCGATTGTATCAGAGTTTTCAAATTAATTAATGAGTCTCTTAAATGAGTTTTATATTTCTTGAGTTTCATGTTCCGAAAAGGTTCGATGATTATACTCTTGGATAATATTTAATGACATTTTTGGATTGGCTCATTATTAAGTCTTTTCTCTGTACTTAGTTAAGGTTTATTTGCTTTTAAATTATATGTATTATACAACTTATATGTTTTAGAAACTGAAATACTCGGTTCAGACCGGGGCTATATCTAACAACTTGTAATAAATAATTTACCTATTTTCACTATCGGCCTCTCTTATTAGTCTTTTAGTAGCATAGAGAAATAGTGACATGAGCATAATCACCCCTCATGGCAACAAGTAGCTCTTTATTTTCTATTACAAGTATGATTTATAGTGTATAAAAATTAATTTTAAGGCAAGGCAACATAATATTGTAGATGTCTATGAGTAGATGAAACGTAGTTGACATGTGTGTGCGATAAAATGGGGACCCCTCCAACTGGCTAACACCAGCGCCTACTACATTTCAATATATTGCGACATAATCGAAAATGACCGCTCTATATATTAGGGTTGTGACCACTATTCTGATTTATTTTGGAGGTAGTGTTAATCCGGCTGAGTTTATCTCAAAACCTCGATGACAAGTGTATCCTTGGACTTCGGGCATATATCTCTAAGATATAGTCGGACTTTTGAACCGTAAATTTGCGGAGGCTTTAAGTACGAAGAATAAGCCTGTCCATTTTCATTTTACTTTTTCTTATGGTTACAATTTCAGATTACATTAAAGCGATTTCATTGTTCATTGTTGTTTCAATTATTCTCAATTGCAATCCTATTACCCCTTTGTTTTATTTTTATTCCAATTTTATAATCCTTTTGTTAATTGCTTCTCATACTGATTTTAAATTTGTATCAAAATATTTTTAAAGATGGCTTCTTTTAACGTATCTTTTCTCCAATCTGTTTTTAGTGATTTAATTTCAGCTGAGTTTGATTACGAAGTTACCTTACTTCGTAAAATTTTTGATGGCAAATATGAATTGCGTCATTCTTATGGACTAACATCATCTGTAGACGATATTCATCTTGAAGATGAATGGCGCTTTAGATATCTTAAGTTAGAAAAACGTCGTAATTATCTTTGGTATTTAATGAAAACGCAAAAATTTGTAGAATTAGATGATCATTTTAATACGGATTATACTTTTAGCGATTTAGATTTGAGATTACGAGTAGAATTTAGTAGACATGTTAAAGAACATAATGATAGATTTAAATATATTAACCGTAAATCGCGATTCGTGCCGTTTAGTAAGAGTAGCCTCCCCGTTGAAAATATTGAAACGGAACATTATGATAATAATGATATAGATATTGATTTTTCTACAAATTCTGTTAGTTTTAGAAAGAAACGAAGTGTTTCTTTTGAATCATTAGTTGATAATAATCGTATATATAGAAAATGTGAAGTAGATAATAGAGATTATAACCTTTTAGTTAGTTATGCTTTACGTTTAAGAGAATTATTACAGAATGCAGTTTCATTACGTCTTCCAAGACGAATTAGTAAAATTTTTCAAAAGAAACGAAAGGCAGAATGGGTTGAGATGATACCATTGCAATATCAGGGTGGTACTCCTGCGGCACCAATAACTAAAGGTATAGATCCTATACGAGATCTTACACAAGATGATAATAGACCAAAGTGTTGTGCTTACTGCCCCGAAATTGTATGTATGAAGTGTTATAAAGGTAGAGGGTGTTGTGAATGTTTTCCTCATTATCAAGGCAACGTTGAACAAGATGTTGGTGGTGATACGAGTGTTGTACAAATTCATAAAGCGCATAATGTCGTTCTTACTGAAACTGAAATTACACAATCTGATACTACAGCCATATCAAACCCAAAGTGGGGTAGTTATGTGAGTTCTGATACTATATCTCAGATGGATACATTAGTTAATAGATGGTTTCGTGTTGGTACTTATACGTGGACTACCCAGATGAATCGTAATACTACTATTAGATCTATTAGTTTACCTAGAGATGCTGTTTTTTCTGGCAGCACTACGTGTGATCAGCCAAATAAAATCCCATTCCGTATACATAGATATTGGCGAGGAGATATTACTGTTAAAATTCATATAAATTGCAATAAATTTCAAATAGGCCAATTACAATGTAGTTGGTATTATCAACCAAAAGCAGATGATTCATTTGCTAGTAAGAATAGTGTATATACACGAAGTGGTACTCATCATTGTGTTATTTCAGCAGCCCCTAATAACGAGGTAGAGCTCCGTATTCCCTATAAAGCATATAAAAGTATGTATCATACTAAAACATATAATGGCGATGTCAAAGATCTTCCGCTTGATATGGGAACACTGTTTATAAGCGTGTTAAGTCCGTTGAAAACGACTGGAGAAACATCTCCTAGATGTAGTTTTACTGTTTTTGTTAAGTATGAAAATAATGAATTTACTGGTATGATTGCTGGAGATGTTGATACCCCTTCCCAAGTTTCTGAAAGTTTACAATATCAAATGGATGGTATAGGATCTATTTTATCTGCAGCCGTTCCAGTTGTAGAGAAATTATTGACTAGTAGTCCTAATGATAATAACCGTGATAATCCTCCTCTAAATTCAGCTCCTCGGTATTTTGTACCAACTGCAAGTCATTCATGGTCAATTGGTACAGATTTAGTAGAACCCCTTCATAATTTACGCTTGAGTGGGCGAGCTCAAACACGTCATCCGGATGTGGATTTAGATGAGATGAAAGTAGATGTTCTGAAGCGTAAATATATGTTGTGTGATGTATTTTCATGGTCGCAACAAGATCCTAATGGCCATAATTTGTGGAATTTCCCTGTTAATCCAATGCCACCTAAAGATCGATTGTATAAAGTTGCTCAAGCCGGTACCAATACATTATCTAAATATCAGATTACGCCTATAGGTTTCTTAAGTAGTTTATATCAATATTGGCGTGGTTCTATCGAATATAGATTTGATATAGTAGCTTCACAATTTCACAGTGGAAAATTATTGTTAGCATACATTCCAGGGCTGGAAGAAGGTGGTTCTGTTACGATTGAACAAGCGCGTGCTTCACCTCATATAATAATTTCTTTAGATAATGCTATGACATATACTTGGCGTGTTCCTTATGTTGCAGATAGACCATGGTGGCCTCGACGATATGCTGGCGAGTCTATATCTAATAATGTAACGTCTCCATCAAAAATTTTTGTATTTGTATTAAATGAGCTTGTCATGGCAGAAACTGTCGCAGATAGTATCGAAATTTTGGTATATATGCGTGGTGGTGAAGATATGGAATTTGCTGTGCCTGTTCAACCTTCAATAGGTTTGGGTTATGATAATAGTTATATAGCAAGTCGAAATAATACTAATGTATTTCCTGTATCCACAACTGATAATTTTTATGTTGGAAATTGGCATTCTACACCATTAGTTCAGGTTTTGCGTCACGCTACTACATCAGAAGCTGTTGGGCGATTTAGTGAGCCTATATTAGATCGTCCTGTTTATTATGTTTTGTCTTCGTCGCTTCCTACGGCAAATGTTAATTCTGCAGCTATAACTTTACGATCAATTACACATTACATTTTCTTAAAAGGTATTGGTTTTAACGAATATATAGGTTTACCTGTTTATGCAGTTGATTCTCAAATTGCTCTTAGTAGGCTTGAACAGATAGCGCGTGCTGCATTTACTAATAATTATACATATGGTTCTTGGGTAAGTTCATTTATGATAACTGCACCACTTTCGACATCGGCAGGTGGTTTTGGTTTTATACCTGCAGCATACGTTACAACATCTAATACGTATGGAGGAGGGAAATCAATTCCCTTTATAGCTACGAGTGTTTCGCCTACTTTAGAAGATATGGAATATCAAGGGAATAGAGAAGAATCATTAGCATTAGTAGATGATACACAAAATTTGCAAAGTACTGGCAGTGGCATGATGACTTATGGTGAGCGATTTGTGGATTTGAAAGATTTAGGTAGGCGTTACCAACTATATGGATGGACATCTATACCAAGCGATCAAATAGAACGAGATCCAGGTGCATGTAGTTTCTTATTCCCCGTTCTCCCTCAGGGGTTGAATTTGGCAATTAATACGCCTACTTCCGTTAATCAGATTTGGAATCGTGCTCGTGAGGGCCATATACCATTAATAGCAAGTTTATTCCGTTTTTATAGAGGTTCACTTCGAATTCGTATGGTATTCTCTAATGCGTCAGGTTTAACAGCGTGGGTTCAACATCGCCCCGATCGTCGCTTAGATCGCGACGTTATTACTCCATGTACTCAGGTAACTACAGCTGAGGCTGTTTTTAATCACTCATATGGAGTTTATATGCAATCATTAAGCGTTAATAATATGATCGAGATAGAAGTTCCCTTTTATCAAATGGCTAATTTTGGTCTTTTGCAAAAACCTATTATCGCTGTAGGTGGTCCTGTAACTGATTGGTCGCGCTTTTATAGCTTAGGCGAATTGAGCGTGGGCTTTTTTGGTGATAAACCTGCAGATGATATTAGGTGTACGATATATTATAGTATGGCTGATGATTGCCGGTTTTCAACGTACCAGGGAGTTCCTCCCGTTGTTTTAATTGACGATTTACCTGAATACCAAGGTTTTACAGATTATTTTAAAGCGTCACCCAAAGAATTAGGTAATCAAGTAGCAGAAGGTGTTGCAGAGACTATACATTCCCAATTACAGCCAGCTGTTGATAATTTTGTAGCATCTTTTAAAGAAAGAATGGGAGATGTATATTTAAGTGTTTCAAAATCAATAAGTGATATTGAATTTTCTTCAAAAATTTC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| 15,678
|
KJ629170.1
|
Lymantria dispar iflavirus 1
|
Carrillo-Tripp,J., Krueger,E.N., Harrison,R.L., Toth,A.L., Miller,W.A., Bonning,B.C.
|
Iowa State University, Plant Pathology and Microbiology
|
USA
|
2014-07-22
|
Ames
|
Iflavirus lineacelli
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 10,044
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
| null | null |
2011-11-17
| null | null |
Lymantria dispar iflavirus 1 isolate Ames, complete genome
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CGATTGTATCAGAGTTTTCAAATTAATTAATGAGTCTCTTAAGTGAGTTTTATATTTCTTGAGTTTCATGTTCCGAAAAGGTTCGATGATTATACTCTTGGATAATATTTAATGACATTTTTGGATTGGCTCATTATTAAGTCTTTTCTCTGTACTTAGTTAAGGTTTATTTGCTTTTAAATTATATATATTATACAACTTATATGTTTTAAAAATTGAAATACTCGGTTCAGACCGGGGCTATATCTAACAACTTGTAATAAAGAATTTACCTATTTTCACTATCGGCCTCTCTTATTAGTCTTTTAGTAGCATAGAGAAATAGTGACATGAGCATAATCACCCCTCATGGCAACAAGTAGCTCTTTATTTTCTATTACAAGTATGATTTATAGTGTATAAAAATTAATTTTAAGGCAAGGCAACATAATATTGTAGATGTCTATGAGTAGATAAAACGTAGTTGGAATGTGTGTGCGATAAAATGGGGACCCCTCCAACTGGCTAACACCAGCGCCTACTACATTTCAACATATTGCGACATAATCGAAAATGACCGCTCTATGTGTTATGGTTGTGACCACTATTCTGATTTATTTTGGAGGTAGTGTTAATCCGGCTGAGTTTATCTCAAAACCTCGATGACAAGTGTATCCTTGGACTTCGGGCATATATCTCTAAGATATAGTCGGACTTCTGAACCGTAAATTTGCGGAGGCTTTAAGTACGAAGAATAAGCCTGTCCATTTTCTTTTTTCTTTTTCTTATGGTTACAATCTCAGAATATACTAAAGCGTTTTCATTGTTTATTGTTATTTCAATTATTCTCAATTGCAATCCTATTACCCCTTTGTTTTATTTTTATTCCAACCTTATAATTCTTTTGCTAATTGTTTCTCATACTGATTTTAAATTTGTATCAAAATATTTTTGAAGATGGCTTCTTTYAACGTATCTTTTCTCCAATCTGTTTTTAGTGATTTAATTTCAGCTGAGTTTGATTACGAAGTTACCTTACTTCGTAAAATTTTTGATGGAAAATATGAATTGCGTCATTCTTATGGACTGACATCATCMTTAGACGATAATCATCTTGAAGATGAATGGCGCTTTAGATWTTTTAAGTTAGAAAAACGTCGCAATTATCTTTGGTATTTAATGAAAACACAAAAATTTGTAGAATTAGATGATCATTTTAATACGGATTATACCTTTGGCGATTTAGATTTGAGATTGCGAGTAGAATTTAGTAGAYACGTTAAAGAACATAGTGATAGATATAAATATATTAACCGTAAATCACGATTTGTTCCRTTTAGTAAAAGTAGTCTCCCCGTTGAGGATATTGAAACGGAATATTATGATAATAATGATATAGATATTGATTTCTCAACAAATTCTGTTAGTTTTAGAAAGAAACGAAGTGTTTCTTTTGAATCATTAGTTGATAATAATCGTGTATATAGAAAATGTGAAGTAGATAATAGAGATTATAATCTTTTAGTTAGTTATGCTTTACGTTTAAGAGAATTAATAGAGAATGCAGTTTCGTTACGTCTTCCAAGACGAATTAGTAAAATCTTTCGAAAGAAACGAAAGGCAGAATGGGTTGAGATGATACCATTGCAATATCAAGGTGGTACTCCTGCGGCACCACTAACTAAAGGTATAGATCCTATACGAGATCTTACACAAGACGATAATAGACCAAAGTGTTGTGCTTACTGCCCCGCAATTGTATGTATGAAGTGTTACAAAGGTAGAGGGTGTTGTGAATGTTTTCCTCATTATCAAGGCAACGTTGAACAAGGTGTCGGTGGTGATACGAGTGTTGTACAAATTCATAAAGCGCATAATGTCGTTCTTACTGAAACTGAAATTACACAATCTGATACTACAGCCATATCAAACCCAAAGTGGGGTAGTTATGTGAGTTCTGATACTATATCTCAGATGGATACATTAGTTAACAGATGGTTTCGTGTTGGYACTTATACGTGGACTACCCAGATGAATCGTAATACTACTATTAAATCTATTAGTTTACCTAGAGATGCTGTTTTTTCTGGCAGCACTACATGTGATCAGCCAAATAAGATCCCATTCCGTATACATAGATATTGGCGAGGAGATATTACTGTTAAAATTCATATAAATTGCAATAAATTTCAAATAGGCCAATTACAGTGTAGTTGGTATTATCAACCAAAAGCAGATGATTCATTTGCTAGTAAGAATAGTGTATATACACGAAGTGGTACTCATCATTGTGTTATTTCAGCAGCCCCTAATAACGAGGTAGAGCTCCGTATTCCCTATAAAGCATATAAAAGTATGTATCATACTAAAACATATAATGGCGATGTCAAAGATCTTCCGCTCGATATGGGAACACTGTTTATAAGCGTGTTAAGTCCGTTGAAAACGACTGGAGAAACATCTCCTAGATGTAGTTTTACTGTTTTTGTTAAGTATGAAAATAATGAATTTACTGGTATGATTGCTGGAGATGTTGATACCCCTTCCCAAGTTTCTGAAAGTTTACAATATCAAATGGATGGTATGGGATCTATTTTATCTGCAGCCGTTCCAGTTGTAGAGAAATTATTGACTAGTAGTCCTAATGATAATAACCGTGATAATCCTCCTCTAAATTCAGCTCCTCGGTATTTTGTACCAACTGCAAGTCATTCATGGTCAGTTGGTACAGATTTAGTAGAACCCCTTCATAATTTACGCTTGAGTGGGCGAGCTCAAACACGTCATCCGGATGTGGATTTAGATGAGATGAAAGTAGATGTTCTGAAGCGTAAGTATATGTTGTGTGATGTATTTTCATGGTCGCAACAAGATCCTAATGGCCATAATTTGTGGAATTTCCCTGTTAATCCAATGCCACCTAAAGATCGATTGTATAAAGTTGCTCAAGCCGGTACCAATACATTATCTAAATATCAGATTACGCCTATAGGTTTCTTAAGTAGTTTATATCAATATTGGCGTGGTTCTATCGAATATAGATTTGATATAGTAGCTTCACAATTTCACAGTGGAAAATTATTGTTAGCATACATTCCAGGGCTGGAAGAAGGTGGTTCTGTTACGATTGAACAAGCGCGTGCTTCACCTCATATAATAATTTCTTTAGATAATGCTATGACATATACTTGGCGTGTTCCTTATGTTGCAGATAGACCATGGTGGCCTCGACGATATGCTGGCGAGTCTATATCTAATAATGTAACGTCTCCATCAAAAATTTTTGTATTTGTATTAAATGAGCTTGTCATGGCAGAAACTGTTGCAGATAGTATCGAAATTTTGGTATATATGCGTGGTGGTGAAGACATGGAATTTGCTGTGCCTGTTCAACCTTCAATAGGTTTGGGTCATGATAATAGTTATGTAGCAAGTCGAAATAATACTAATATATTTCCTGTATCCACAACTGATAGTTTCTATGCTGGAAATTGGCATTCTGCACCATTAGTTCTGGTTTTGCGTCACGCTGCTACATCAGACGCTGTTGGGCGATTTAGTGAGCCTATATTAGATCGTCCTGTTTATTATGTTTTGTCTTCGTCGCTTCCTACGGCAAATGTTAATTCTGGAGCTTTAACTTTACGATCAATTACACATTACATTTTCTTAAAAGGTATTGGTTTTAACGAATATATAGGTTTACCTGTTTATGCAGCTAATACTCAAATTGCTCTTAATAAGCTTGAACAGATAGCGCGTGCCGCATTTACTAATAAGTACACATATGGTTCTTGGGTAAGTTCATTTATGATAACTGCACCACTTTCAACATCAGCAGGCGGCTTCGGTTTCATACCCGCAGCATATGTTACAACGTCTAATACGTATGGAGGAGGGAAATCAATTCCCTTTAYAGCTATGAGTGTGTCACCTACCTTAGAAGATATGGAGTATCAAGGAAACAGAGAGGAATCACTAGCATTAGTAGATGATACACAAAATTTGCAAAGTACAGGTAGTGGCATGATGACTTATGGTGAGCGATTTGTGGATTTGAAAGATTTAGGTAGGCGTTACCAACTATATGGCTGGACATCTATACCGCGTGATCAAATAGAACGAGATCCAGGTGCGTGTAGTTTCTTATTCCCCGTTCTTCCTCAGGGGTTGAATTTGGCTATTAATACGCCTACTTCTGTTAATCAAATTTGGAATCGTGCTCGTGAGGGCCATATACCATTAATAGCAAGTTTATTCCGTTTTTACAGAGGTTCACTTCGAATTCGCATGGTATTCTCTAATGCATCAGGTTTAACAGCGTGGGTTCAACATCGCCCCGACCGTCGCTTAGATCGCGACGTTATTACTCCATGTACTCAAGTGACTACAGCAGAGGCTGTTTTTAATCATTCATATGGAGTCTATATGCAATCATTAAGTGTCAATAATATGATCGAGATAGAAGTTCCGTTTTATCAAATGGCCAATTTTGGTCTGTTACAAAAACCCATTATTGCTGTAGGTGGTCCCGTAACTGATTGGTCGCGCTTTTATAGCTTAGGCGAGCTGAGCGTGGGCTTTTTTGGCGATAAACCTACAGATGATATTAGGTGTACGATATATTATAGCATGGCTGATGATTGCCGATTTTCAACATATCAGGGAGTTCCTCCTGTTGTTTTAATTGATGATTTACCTGAATACCAAGGCTTTACAGATTATTTTAAATCGTCACCTAAAGAAATAGGTAATCAAGTAGCAGAGGGTGTTGCAGAGACTATACATTCCCAATTACAGCCAGCTGTTGATAATTTTGTAGCATCATTTAAAGAAAGAATGGGAGATGTGTATTCAAGTGTTTCACAGTCAATAAGTGATATTGAATTTTCTTCAAAAATTTCTGCTATAGGCTCTCAAATTATACATTCYGTTAATAACCCCTCCCCGTCAACTATAGCTATTTCAGTAGTCTCAATTTGTATTACTTTAGGATTAATAACGTATGCTACATATCATAT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| 89,456
|
NC_003243.1
|
Lyssavirus australis
|
Gould,A.R., Kattenbelt,J.A., Gumley,S.G., Lunt,R.A., Hyatt,A.D.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1999-08-10
|
insectivorous isolate
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,822
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Australian bat lyssavirus, complete genome
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| 8,748
|
OU524430.1
|
Lyssavirus australis
| null |
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2021-12-01
|
13849
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,917
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Pteropus
| null |
1996
|
SAMEA9534574
|
PRJEB46947
|
Australian bat lyssavirus isolate 13849 genome assembly, complete genome: monopartite
|
GCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACTGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGAATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTATACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAAACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTGAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCACCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCCAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGTGAGGACTTCCAAATGGACGAAGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACAGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCATCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCCACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCCTGTACAACTTCGAGCAATTGAAGATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTCAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTTGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCCGGTGGACATCCGCTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAAATTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTTTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGCTATTCGTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCAGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGATTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCCTATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGGAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATGTGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAATCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTTAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTAGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGTTTTGTTGATGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCTGGTCTCAGGCTTATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGATGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCATCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAAGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCGTAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCTA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| 35,660
|
MK944082.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA001
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,912
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus scapulatus
| null |
2012
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA001, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTCGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAGTATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGACATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTCCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCGATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTACCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAATAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTACCCCTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTCCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAGAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGAGGACTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTTCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAAGAAGCCAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCAGGTGGATATCCACTGTTTGAGGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAATTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTACTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTAAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTCTCATATATGGAGCTAAAAGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTCATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAGGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCAGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,151
|
MK944083.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA002
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,909
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus scapulatus
| null |
2013
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA002, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTATGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTTCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCAACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTATTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAAGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAAAGTTCAGCAGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGAGGACTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGGATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTTAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCCGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCTGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCAGGTGGATATCCACTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATATTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATTAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCTGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCAGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTTATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTCTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGGGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAACAGCACATTGAGCTACTCGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTTATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAACCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,152
|
MK944084.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA003
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,918
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus alecto
| null |
2013
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA003, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAGTATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCTGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGACATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCGATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACTTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGGCCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAATAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAATTGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGAGGACTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAAGAAGCCAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTGATCCGTCCTGTTACACAGCTCAAGCTTTCAGGTGGATATCCACTGTTTGAGGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCCGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTAAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAAGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTCATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAAATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAATTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,153
|
MK944085.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA004
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,918
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus alecto
| null |
2013
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA004, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAGTATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCTGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGACATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCGATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACTTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGGCCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAATAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAATTGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGAGGACTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAAGAAGCCAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTGATCCGTCCTGTTACACAGCTCAAGCTTTCAGGTGGATATCCACTGTTTGAGGTAATTCATAAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGACGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCCGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTAAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAAGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTCATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAAATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAATTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,154
|
MK944086.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA006
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,919
|
GenBank
| null |
Australia: Central Queensland
|
Australia
|
Pteropus scapulatus
| null |
2013
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA006, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAGTATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGACATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGAGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTCGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCGATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTTGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGGTACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAATAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCTTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGAGGACTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAAGAAGCCAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCAGGTGGATATCCACTGTTTGAGGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTATCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAAGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGGAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTCATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAGCTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGGTTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAGAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAAATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,155
|
MK944087.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA007
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,908
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus scapulatus
| null |
2013
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA007, complete genome
|
AAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAGTATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCCTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACGGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGCACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCGATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCGTTTGCGGAGTTTCTCAATAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGATGACTTCCAAATGGACGACGTAGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATTTAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAGTCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAAGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCAGGTGGATATCCAATGTTTGAGGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCACATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTTTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAAGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTTATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCACCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCTACAATACTGTGTG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| 46,156
|
MK944088.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA008
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,918
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus scapulatus
| null |
2013
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA008, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAGTATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGACATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCGATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAATAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTTTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATTCATCTTAGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGAGGACTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAAGAAGCCAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCAGGTGGATATCCACTGTTTGAGGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCCGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCAGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAAGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTCATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAAGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAAGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAACACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAGAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,157
|
MK944089.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA009
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,885
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus alecto
| null |
2014
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA009, complete genome
|
ATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTGTTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAAAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACAGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATATTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGTTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAGACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGTGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACGTCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTCTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCTATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTCGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAAGGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGAGGACTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCCGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCAGGTGGATATCCGCTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAGGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTATCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAAGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTATACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAGGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGACTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTTATGGACGGGTCTTGGGTTTCTATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGATCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAATGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCTACAATACTGTGTGGCTCCCATACATCATCCCTA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| 46,158
|
MK944090.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA011
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,918
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus scapulatus
| null |
2014
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA011, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAACAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGAATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTATACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTAGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGAGGATTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAACGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAAATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCTAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCACCTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAATACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCAGGTGGATATCCGCTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGCTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTTCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAAGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCTGTCCCTTCGATTTTTTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTTATGGACGGATCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAACATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAGACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACACGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTAGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGAAACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,159
|
MK944091.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA012
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,908
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus scapulatus
| null |
2014
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA012, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAAGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCGAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGAAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAGGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGATATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACGGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTCTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTATTTTTCAGGAGAGACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTTCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATCAGTGAAGGAAGATCTAAAAGTTCAGCAGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGAGGACTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTTAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAACGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCTGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCAGGTGGATATCCACTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAACTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGTCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAAAATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCCACCCCAGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCTAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCATATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCAATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTTATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTCTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATCTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,160
|
MK944092.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA013
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,902
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus alecto
| null |
2014
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA013, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGGAAAGGAGATAAGATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACATGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGGAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGAATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAATTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTATACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTGAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACATTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCACCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAGATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCCAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGTGAGGACTTCCAAATGGACGAAGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGAGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACAGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCAGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCCTGTACAACTTCGAGCAATTGAAGATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTCAGATGTATACTTGGATGGGTTGGATCCTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTTGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCCGGTGGATATCCGCTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGCTATTCGTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAGGGAATGAACTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGATTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCTGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACCAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAATCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTAGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGCGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCTGGTCTCAGGCTTATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAAGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCCTCATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCATCTACTGTTTTTAAAAGAGATGATGAAGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCAGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTCATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTAATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCAGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,161
|
MK944093.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA014
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,918
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus alecto
| null |
2015
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA014, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCGGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAAGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGTGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACGTCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAAAGTTCGGCTGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGGGAGGACTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAGCTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCAGGTGGATATCCGCTGTTTGAAGTAGTTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCCCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAGGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTTAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCTTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGAAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACGGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTTATGGACGGGTCTTGGGTTTCTATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTCTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAATGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTTTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTCCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCTGGAGGTCATTTCAGGTCATGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,162
|
MK944094.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA015
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,912
|
GenBank
| null |
Australia: North Queensland
|
Australia
|
Pteropus alecto
| null |
2015
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA015, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAACAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAGTATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCCAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATCACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGACATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTGGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTGTACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCGATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTTATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTTGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAATAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCATCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAAATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCTAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGAGAGGACTTCCAAATGGACGACGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACTGTAGAGGAGATCATTTCCTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCCGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCTTGTACAACTTCGAGCAATTGAAAATGAATCTCGATGATATAGTGAAAGAAGCCAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTTAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTCGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCAGGTGGATATCCACTGTTTGAGGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGTTATTCCTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAAGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGACTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCGTGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAAGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACTAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAACCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTCGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCAGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAGGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGTGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCCGGTCTCAGGCTCATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCGTCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAGGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTAATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTGATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,163
|
MK944095.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoeger,A.C.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-10-31
|
QA017
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,918
|
GenBank
| null |
Australia: South East Queensland
|
Australia
|
Pteropus poliocephalus
| null |
2017
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA017, complete genome
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ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTTAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAGATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCCACAGTAGCAGAACATGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGCCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGAATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAATTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAGCACTTATACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTGAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACATTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCACCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCAATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAGATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACATCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAAAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCCAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGTGAGGACTTCCAAATGGACGAAGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACAGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGAGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCAGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCCTGTACAACTTCGAGCAATTGAAGATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTCAGATGTATACTTGGATGGATTGGATCCTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTTGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCCGGTGGATATCCGCTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGCTATTCGTTTAGGATTTTAAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAGGGAATGAACTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGATTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAACATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCCCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCTGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACCAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAATCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTAGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCTACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGCGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGCGGAATCTCTGGTCTCAGGCTTATGGACGGGTCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAGCTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAAGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCCTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCATCTACTGTTTTTAAAAGAGATGATGAAGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTCATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTAATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCAGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 46,164
|
MK492309.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoger,A.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-07-09
|
QA018
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,908
|
GenBank
| null |
Australia: Far North Queensland
|
Australia
|
Pteropus conspicillatus
| null |
2017
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA018, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTCAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCGACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGTCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGAATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAACACTTATACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCACCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAGATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACACCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAGAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCCAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGTGAGGACTTCCAAATGGACGAAGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACAGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCAGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCCTGTACAACTTCGAGCAATTGAAGATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTCAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTTGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCCGGTGGATATCCGCTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGCTATTCGTTTAGGATTTTGAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAGGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGATTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAATATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACCAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAATCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTAGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGCGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGTGGAATCTCTGGTCTCAGGCTTATGGACGGATCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAACTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCATCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAAGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTCATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTAATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 48,473
|
MK492310.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoger,A.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-07-09
|
QA019
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,908
|
GenBank
| null |
Australia: Far North Queensland
|
Australia
|
Pteropus conspicillatus
| null |
2017
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA019, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTCAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCGACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGTCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGAATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAACACTTATACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCACCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAGATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACACCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAGAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCCAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGTGAGGACTTCCAAATGGACGAAGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACAGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCAGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCCTGTACAACTTCGAGCAATTGAAGATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTCAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTTGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCCGGTGGATATCCGCTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGCTATTCGTTTAGGATTTTGAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAGGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGATTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAATATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACCAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAATCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTAGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGCGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGTGGAATCTCTGGTCTCAGGCTTATGGACGGATCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAACTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCATCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAAGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTCATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTAATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 48,474
|
MK492311.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoger,A.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-07-09
|
QA020
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,908
|
GenBank
| null |
Australia: Far North Queensland
|
Australia
|
Pteropus conspicillatus
| null |
2017
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA020, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTCAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCGACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGTCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGAATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAACACTTATACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCACCTCATCTTACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAGATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACACCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAGAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCCAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGTGAGGACTTCCAAATGGACGAAGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACAGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCAGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCCTGTACAACTTCGAGCAATTGAAGATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTCAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTTGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAACTCAAACTTTCCGGTGGATATCCGCTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGCTATTCGTTTAGGATTTTGAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAGGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGATTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAATATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACCAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAATCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTAGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGCGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGTGGAATCTCTGGTCTCAGGCTTATGGACGGATCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAACTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCATCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAAGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTCATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTAATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 48,475
|
MK492312.1
|
Lyssavirus australis
|
Barrett,J., Hoeger,A., Agnihotri,K., Oakley,J., Skerratt,L.F., Field,H.E., Meers,J., Smith,C., Hoger,A.
|
University of Queensland, School of Veterinary Science
|
Australia
|
2020-07-09
|
QA021
|
Lyssavirus australis
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,908
|
GenBank
| null |
Australia: Far North Queensland
|
Australia
|
Pteropus conspicillatus
| null |
2017
| null | null |
Lyssavirus australis isolate QA021, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAACCAGAGAAGGAGTAGACATGATCATTTGCGAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGATAAGATTGTCTTCAAGGTCAACAATCAGTTGGTGTCTGTTAAGCCGGAGGTGATAGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCTATTAAAGACCAAAAGAAGCCTAGTATAACTCTTGGGAAGGCTCCAGATTTAAATAAGGCATATAAGTCCATATTGTCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCCGATGATGTATGTTCTTACTTAGCTGCAGCTATGGAGTTATTTGAGGGGGTCTGCCCAGAAGATTGGACGAGTTATGGGATTTTGATTGCCAGAAAAGGAGATAAAATTACACCAGCCACCCTTGTTGACATAAAGAGAACAGATATTGAGGGCAACTGGGCATTGACGGGAGGACAAGACTTGACCAGGGATCCGACAGTAGCAGAACACGCTTCTTTAGTAGGTCTTCTTCTAAGTCTTTATAGGTTAAGCAAGATATCAGGCCAGAACACAGGAAATTATAAGACCAACATTGCAGATAGAATAGAACAGATTTTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGATTGTGGAACATCACACGTTAATGACTACTCATAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACGATCCCAAATTTTAGATTTTTGGCTGGAACTTATGACATGTTCTTTTCTCGAGTTGAACACTTATACTCTGCAATTCGAGTAGGGACGGTAGTAACCGCTTATGAAGATTGTTCTGGACTTGTCTCGTTTACAGGGTTTATCAAACAGATCAACCTCACTGCTAGGGAAGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAACTTCGAAGAAGAAATTAGAAGAATGTTTGAACCCGGACAAGAGACTGCAGTTCCTCACTCTTATTTCATCCATTTCAGATCTCTAGGACTTAGCGGAAAGTCCCCTTACTCCTCCAATGCAGTTGGCCATGTGTTCAATCTCATCCATTTCGTGGGATGTTACATGGGCCAGATAAGATCTTTAAATGCGACTGTCATATCCACCTGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTGGGAGGCTATCTTGGGGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGGACGTTTGAACGGAGATTCTTCAGAGATGAGAAAGAACTGCAAGATTATGAGGCAGCAGAGTCTATGAAAACAGACATTGCTTTGGCAGATGATGCAACCGTCAACTCAGATGATGAGGATTACTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAGGCAGTTTATACAAGAATAATGATGAATGGGGGTCGACTTAAAAGGTCACACATTAGGAGATACATCTCAGTCAGCTCCAACCATCAGTCCCGACCGAACTCATTTGCGGAGTTTCTCAACAAGACATATTCAAGTGACTCGTAATCAGATGTGTCAGGTCTTGCCCCTAAATTATTGAGAACATCACCTCATCTTACGAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTCGATCCATCTTCGCTATGAGCAAGATCTTTGTCAATCCGAGTGCGATCAGGGCAGGCATGGCCGACCTGGAGATGGCAGAGGAGACTGTTGATTTGATAAACAGAAACATTGAGGATAATCAGGCACACCTTCAGGGGGAGCCTATAGAGGTTGACAGTCTCCCTGAGGATATCAAGAAGCTTGATATTAGTGAAGGAAGATCCAAAAGTTCAGCGGATAATCCTCAGGATGTTGATTGCAGGATGAGTGAGGACTTCCAAATGGACGAAGTTGAAGACCCGAACATCCAATTTCAGTCTTACTTGGACAATATAGGAATCCAGATCGTCAGAAAGATGAGAACTGGGGAGCGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAAACAGTAGAGGAGATCATTTCTTATGTGGGGGTCAACTTTCCCAACCAATCAGGGAAGACAACCGAGAATAAATCCACTCAGACAACCCCCAAGAAAGTCAAAACTGAGCCCTCCTCAACTCCAGCCAAAAGATCAGATCAACTGTCCAAAACTGAGATGGCTGCCAAGACAGCCTCTGGCCCCCCTGCCTTAGAATGGTCTACAACCAATGATGAGGATGATGTCTCCGTGGAGGCAGAAATTGCACATCAAATTGCAGAGAGCTTCTCAAAGAAGTACAAGTTCCCCTCCAGATCATCTGGAATATTCCTGTACAACTTCGAGCAATTGAAGATGAATCTCGATGATATAGTGAAGGAAGCTAAGAGTGTGCCTGGTGTTACCAGCCTTGCCAGAGATGGTCTCCGGCTTCCTCTCAGGTGTATACTTGGATGGGTTGGATCTTCTCACTCCAAAAAGTTTCAACTACTGGTTGGGTCAGAAAAATTGAACAAGATTATGCAGGATGATCTGAACCGTTACATGTCATGTTAGTCCGTCCTGTTACACAGCTCAAACTTTCCGGTGGATATCCGCTGTTTGAAGTAATTCATGAAAAAAACTGTCAACACCACTGATAAAATGAACTTTCTCCGCAAGATAGTCAGGAATTGTAAGGATGAGGATGATCAGAAGCCCCCACTGGTATCCGCTCCACCAGATGATGATGATCTATGGCTTCCTCCTCCAGAGTATGTTCCTCTGACCGAGATCACTGGCAAGAGGAACATGCGAAACTTTTGTATCAATGGAGAGGTCAAAGTCTGTAGTCCTAATGGCTATTCGTTTAGGATTTTGAGACACATTTTGAAATCGTTTGACGAGATTTACTCTGGAAACCATAGAATGATCGGGCTGGTCAAGGTGGTCATAGGTCTGGCTCTGTCTGGAGCTCCCGTTCCGGAGGGAATGAATTGGGTCTACAAATTGAGGAGAACCCTGATATTTCAATGGGCTGAATCTCGTGGGCCGCTAGACGGGGAAGAATTGGAATATTCTCAAGAGATAACATGGGATGATGATTCAGAGTTTATAGGCCTGCAGATAAGAGTGAGTGCGAGGCAATGCCATATTCAGGGCCGGATTTGGTGCATCAATATGAACTCCCGGGCATGCCAGCTATGGTCTGACATGTCTCTCAAGACTCAGCAGTCTGAAGAGGACAAGAACAGTTCTCTCCTGTTAGAGTAGTGATTTCCCCCTCATGTCTACTCACTGATTTACCTCTGAGATGGAGAATGCACAGTTTTATCTTCAACTTCCTGTGAGCAATAGAACAAAAATATGTTATGGTGCCATACAATCGCTGCATTTTATCAAGATACCTGATTACATTTACATGTGAAACCTCCCAGATGTGAAAAAAACAGTTAACACCCCTCGAACATTCTGAGAAAGATGCTCCTTCAAATTGTCCTCCTTATGTCCCTGATGGTCTTCTCACCATGCCCTGGGAAATTCCCTCTCTACACAATACCCGACAAATTGGGCCCTTGGAGCCCGATAGATATTCATCATTTGAGCTGTCCAAACAACCTGATTGTTGAGGATGAGGGATGTACAAGCCTGTCCGGGTTTTCATATATGGAGCTAAAGGTTGGGTTTATAACCACTATAAAGGTTAGCGGGTTTACCTGCACTGGAGTTGTGACTGAGTCAGAGACCTACACCAACTTCTTTGGGTATGTCACGACTACTTTCAAGAGGAAACACTTTCGTCCTACCCCGGAGTTTTGTAGGAATGCATACAACTGGAAAGTTGCAGGTGACCCCAGGTATGAGGAGTCTTTGCACAATCCTTATCCAGACTATCACTGGTTGAGAACAGTTACAACCACTAAGGAGTCTCTCTTGATCATATCACCCAGTGTAGTAGACATGGACCCCTATGACAAATCCTTGCATTCGAAAATGTTCCCTAAAGGCACATGCTCGGGAGCCTCGGTCCCTTCGATTTTCTGCTCCACTAATCATGATTACACATTGTGGATGCCTGAGAATCCTAAACCAGGAATGTCATGTGACATCTTTACAACAAGCAAAGGAAAGAAAGCATCGAAGGGAGGAAAGGTGTGCGGGTTTGTTGACGAACGCGGATTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCATGCAAACTTAAGTTGTGTGGAATCTCTGGTCTCAGGCTTATGGACGGATCTTGGGTTTCCATCCAAAATCATGAGGAGGCCAAATGGTGCTCTCCTGATCAGTTGGTAAATATTCATGATTTTCATTCAGACGAGATAGAACACTTAATTGTAGAGGAACTGGTCAGGAAGAGAGAAGAATGTTTGGATGCACTGGAGTCAATAATGACTACCAAATCAGTCAGTTTTAGACGTCTCAGCCACCTAAGGAAACTTGTGCCAGGATTCGGGAAGGCTTATACCATTGTCAACAAAACACTCATGGAGGCTGATGCACACTATAAATCAGTCAGAACATGGAATGAGATCATACCATCTAAAGGGTGTCTAAAGGTTAGAGAGAGGTGTCATCCTCCTTATAACGGGGTGTTCTTTAACGGGATCATTTTGAGTCCAGACGGACATGTCTTAATTCCGGAGATGCAGTCCTCCTTGCTACAGCAGCACATTGAGCTACTTGAATCATCAGTAATACCTCTTATCCATCCTCTGGCAGATCCATCTACTGTCTTTAAAAGAGATGATGAAGCAGAAGACTTCATAGAAGTCCACCTTCCCGATGTCCAAAAGCAGGTCTCCGGGATCGACTTGGGTCTCTCGGAGTGGGAGAGATATCTGATCATCGGGGCTTCTGCTGTCATCTTGTTTGCTCTGGCAATAATTTTTGCAGTTTGTTGCAGAAGGTGTAAGAGACGGAAAAAGGCCAGAACTGATCGTATAGAGTTAGACCGTAAAGTGTCAGTAACATCTCAAAGTGGGAAAGTAATCCCTTCTTGGGAATCCTACAAAATTGAAGCCGGAGGTCATTTCAGGTCGTGAGATACTGGTTTCAGGTCAATTTTTAGGACAATCAACTCTCCTCATAACAGTGGAGAGCGGTCCAACTCATTGATTGTTCATGAGCCATATGCAATACTGAGATCT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| 48,476
|
NC_025251.1
|
Lyssavirus bokeloh
|
Freuling,C.M., Beer,M., Conraths,F.J., Finke,S., Hoffmann,B., Keller,B., Kliemt,J., Mettenleiter,T.C., Muhlbach,E., Teifke,J.P., Wohlsein,P., Muller,T., Mueller,T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-10-15
|
21961
|
Lyssavirus bokeloh
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,900
|
RefSeq
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Myotis nattereri
|
brain
|
2010
| null |
PRJNA485481
|
Bokeloh bat lyssavirus isolate 21961, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAATCAGAAAAGGAGTAGACACACTCATCTACAGAGCAAAAAGGTAACACCCCTACAATGGACTCTGACAAGATTGTCTTCAAAGTCCATAATCAGTTGGTGTCTGTAAAGCCAGAGGTGATTGTTGATCAATATGAGTACAAATATCCTGCTATCAGAGATCAGAAGAAACCTAGCATAACTCTGGGGAAAGCTCCTGATTTAAACAAGGCTTACAAATCTATTTTGTCAGGAATAAATGCGGCTAGATTGGATCCCGATGATGTATGTTCCTACCTAGCAGCAGCTATGGAACTGTTTGAAGGAATTTGCCCTGAAGACTGGCTAAGCTATGGGATTCTCATAGCAAGAAAGGGGGAGAAGATTACCCCTGCCACCTTGGTGAACATTCAGAGAACGAACATTGAAGGCAACTGGGCCTTGACCGGAGGATACGACCTTACAAGGGATCCAACTGTGGCCGAACATGCATCTCTAGTGGGCCTTCTGCTCTGCTTGTATAGACTAAGCAAGGTCTCCGGGCAGAACACAGGGAATTATAAGACTAACATAGCCGATCGAATGGAGCAAATCTTTGAGACCGCTCCTTTTGTCAAAATCGTGGAGCATCATACCTTAATGACCACTCACAAAATGTGTGCCAATTGGAGTACAATCCCAAATTTTAGGTTTCTTGCAGGCACATATGATATGTTCTTTTCTAGGATAGAGCATTTATTTTCTGCAATCCGGGTCGGAACTGTAGTGACGGCATATGAAGATTGTTCTGGACTGGTCTCTTTCACAGGATTCATCAAACAAATAAATTTGACGGCTAGGGAGGCTATATTGTATTTCTTCCACAAGAATTTTGAAGAGGAAATCAAGAGGATGTTTGAACCAGGGCAAGAGACTGCAGTTCCACACTCTTATTTTATACATTTCAGGTCCTTAGGGTTGAGTGGGAAGTCTCCTTATTCCTCAAATGCAGTAGGTCATGTGTTTAATCTGATCCATTTCGTTGGCTGTTACATGGGTCAAATCAGATCTCTAAATGCTACTGTTATCTCTAGTTGTGCACCACATGAAATGTCTGTGTTAGGGGGTTATCTGGGGGAGGAATTCTTTGGCAAGGGAACATTCGAGAGGAGGTTCTTCAGAGACGAAAAGGAGCTCCGAGATTATGAAGCCGCAGAGTCTGTCAAAAACGACGTCGCACTGGCAGATGATGGAACCGTCAACTCAGATGATGAGGACTTTTTTTCTGGGGAAACGAGAAGTCCGGAGGCCGTGTATGCGAAGATCATGATGAACGGGGGAAAATTGAAAAAGTCTCACATCCGGCGATATGTATCAGTCAGCTCAAACCACCAGGCCAGACCGAACTCCTTTGCAGAATTTTTGAACAAAACTTACCTAGGTGATCAGAGATAATCGAACCAGTGCCTCCCCTCAATCCGTCCCGCTGCTTCTCCAGACGAAACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCCTCAAATTCATTCCCGTCATGAGCAAAATCTTTGTAAATCCTAGTGCAATTCGTGCAGGACTGGCAGACCTTGAGATGGCTGAAGAGACAGTTGATTTGATCAACAGGAATCTTGAGGACAACCAGGCTCATCTTCAAGGAGAGCCCATCGAAGTGGATGCTCTTCCAGAGGATATGAGAAGGCTCCAGATAAGTGAACATGCACCTTGTCACCCGTCAGAGGGTGCCTGCAAGAAAGAAGAAGGGAGCGACGATGACTTCTACATGGCGGAGAGTGAGGACCCATATGTACCTCTTCAGTCCTATCTAGACAGTGTGGGAATTCAGATCGTGAGGCAGATGAAGACTGGGGAGAGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAGACCGTAGAAGAGATCATATCATATGTGACTGTCAACTTTCCTCTGCCATCTGGAAGACCAACTGAGGACAAATCTACCCAGACTGTAGGGGAGAAGCCTAGGTCAAATGTCCAGCAGGGATCTGCCAAGAAAGAGGATCACCTGTCTAAGGCCAAAATGACCTCCCAAGAAGCATCTGGGCCTCCGGCGCTCGAGTGGTCCACTACCAACGATGAAGATGATGCATCAATAGAAGCAGAGATAGCCCATCAGATTGCAGAAAGTTTCTCGAAGAAATATAAATTCCCTTCTAGATCTTCTGGGATATTTCTATATAACTTTGAGCAACTGAAGATGAATCTGGATGACATCGTGGGAGAGGCCAAAAAGATCCCAGGTGTGACCAGACTGGCTCAAGATGGTCTTAAGCTCCCACTCAGGTGTATATTAGGAGGGGTGGCCTCAACCCATTCAAAGAAGTTCCAACTCCTGGTTGGTTCCGATAAGCTGGGCAAAATCATGCAGGACGATCTCAACAGATATCTGGCTTATTAACTTATCCCCCAAGGATTCCTTCACCCCACAAGATCATCCAGAGCCTCATCTGACTCATGGAAAAAACAGGCAACACCACTGACGCAATGAATTTTTTCCGAAAGATAGTGAAAAGTTGCAAAGATGAGGAGGATCAAAAGCCAGCTCTGATGTCGGCTCCACCAGATGATGACGATCTGTGGCTTCCCCCGCCGGAGTATGTACCTTTGACCGAGATCACAGCTAAAAAGAATATGAGGAACTTTTGTGTCAATGGCGAGATTAAGATTTGCAGCCCCAACGGGTATTCCTTTAGGATCCTGAGACATATTCTGAGGTCTTTTGATGGAGTCTATTCTGGAAATCGGAGAATGATAGGACTTGTCAAGGTTGTGATCGGTCTAGCCCTCTCAGGTGCTCCGGTCCCGGAGGGGATGAACTGGGTCTACAAGATAAGACGCACCCTTGTTTTCCAATGGGCAGAGTCTCACGGCCCACTAGATGGAGAAGAGCTAGAATACTCACAGGAGATAACCTGGGATGATGATTCAGAGTTCATAGGTTTGCAAATAAGGATAAGTGCAAGGCAATGTCATATCCAAGGACGGATCTGGTGCATCAACATGAACTCCAGGGCATGTCAGTTATGGTCAGATATGTCTCTCAAGACCCAGCAGGCTGACGAGGACAGGAACACCTCTTTGTTGCTAGAATGACCTCCCCTTTACATAGCACCTTACTCAGTTACCTCTACACAAGGATGTACATGATTTTATCCTCCACCTTTTATGAGCAATAGAACAAAAATATGTAATGGTGCCACTCTACCGCTGCATTTTATTGAGACACCCTATTGAACATCTTCACATGTGAAACCTCTGCAATGTGAAAAAAACATTTAACATCCCTCAAGGATCCAAGGCACCATGCCAACTCAAGCCGTCCTCTCTGCATTTCTCGCAACAATCACAATTTGTGTAGGGAAATTCCCCATCTACACAATCCCCGATAAACTGGGTCCCTGGAGCCCCATTGACATCAATCACCTCAGCTGCCCAAACAATCTTGTCGTGGAAGATGAGGGGTGTACGAACCTGTCCGGGTTCACATATATGGAGCTAAAGGTCGGATACATAACAACAATAAAGGTGAGCGGATTTACATGTACAGGAGTGGTCACGGAAGCCGAGACTTACACCAACTTTGTAGGTTATGTCACAACCACTTTCAAGAGAAAGCACTTCCGTCCACGTCCTGATGCATGTAGGGAAGCTTATGATTGGAAGACCGCAGGAGACCCTAGATACGAGGAGTCATTGCATAACCCATATCCTGATTCCCATTGGCTGAGAACAGTCACCACCACGAAAGAGTCACTCCTGATAATAGGGCCAAGTGTGGCGGACATGGACGCCTATGACAAGTCTCTTTATTCCAAGATATTCCCAGATGGGAAATGTTCTGGAATCTCTGCTGTCTCTCCCTTCTGCCCGACGAACCATGAATATACAATATGGATGTCCGAGAATCAAAAGCCCGGTATGTCCTGTGACATATTCACCACTAGCAAGGGGAAGAAGGCCACGAAAAATGGCAAAATGTGTGGGTTTGTTGACGAGAGAGGATTATACAAATCCCTCAAAGGAGCCTGCAAACTGAAACTGTGCGGTGTCTCCGGCCTGAGACTAATGGACGGATCTTGGGTCTCTGTTCAGAACCCGGAGGATGCAAAATGGTGCTCTCCCGACCAGCTGGTGAACATTCATGACTTCCACTCAGATGAAGTTGAACATCTTATTGTGGAGGAGCTTGTTAAAAAGAGAGAAGAGTGTCTGGATGCTCTGGAATCAATCATGACCACCAAATCAGTAAGCTTCCGGCGATTGAGTCACTTGAGAAAGCTTGTTCCTGGATTTGGGAAGGCTTACACCATTATCAATAAAACCTTGATGGAGGCAGATGCCCACTACAAGTCAATTAGGCAATGGACTGAGATAATCCCTTCAAAGGGGTGTTTAATGGCAGGAGGGAGATGCTATCCTCACCATAATGGGGTCTTCTTCAACGGGATAATCCTCAGCCCGGATGGCCACGTGTTGATTCCAGAGATGCAATCTGCTTTGCTTCAGCAGCATATAGAGCTGCTGGAGTCATCTGTTATACCCCTCATGCATCCCCTGGCTGATCCCTCAACTGCCCTTAAAGGGGGAGACGGAGCAGAGGACTTTGTAGAGATCCATCTCCCCGATGTGCAAAAACAAATCTCGGGGATTGACTTGGGTCTCCCTGAGTGGAAGAGGTATTTCTTAATGGGGGTATCTGCTTTGGCCCTGCTTGCCTTAACAATAATTCTCGCCACGTGTTGTAAACGGATAAGGAGGAAAAAGAAGATGAAGTCAAGTCCTGTGGAGTTGATTCGAAAGGTGTCTGTGACCTCTCAAAGCGGGAAGGTAGTTCCATCGTGGGAATCTTATAAGGTTGATGCAGGAGGTCAAGCTTAGGTTCTGATCACATGGTTGACGATCAGAATATATAACAATCTATGCCTATTTAAATCAAGGGGTGTTAAGCCATGAGATCCTCCTGATGTCATCCTCAGTTCTGGAAAGG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| 6,401
|
OU524416.1
|
Lyssavirus bokeloh
| null |
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2021-12-01
|
45500
|
Lyssavirus bokeloh
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,896
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Myotis nattereri
| null |
2014
|
SAMEA9534145
|
PRJEB46019
|
Bokeloh bat lyssavirus isolate 45500 genome assembly, complete genome: monopartite
|
ACGCTTAACGACAAAATCAGAAAAGGAGTAGACATAATCATCTACATAGCAAAAAGGCAACACCCCTACAATGGACTCTGACAAGATTGTCTTCAAAGTCCATAATCAGTTGGTGTCTGTAAAGCCAGAGGTGATTGTTGATCAATATGAATACAAGTATCCCGCTATTAGAGATCAGAAGAAACCCAGCATAACTCTGGGGAGAGCCCCTGACTTAAACAAGGCTTACAAATCTATTTTATCAGGAATAAATGCAGCCAGATTGGATCCAGATGATGTATGTTCCTATTTAGCTGCAGCTATGGAGCTGTTTGAGGGAATTTGCCCTGAAGATTGGCTAAGTTATGGGATTCTCATAGCAAGAAAGGGAGAAAAGATCACCCCCGCCACCTTGGTAAACATTCAGAGAACGAACATTGAAGGCAATTGGGCCTTGACCGGAGGATATGACCTCACAAGGGATCCAACTGTGGCCGAACATGCATCTCTGGTAGGTCTTCTGCTCTGCTTGTATAGACTGAGTAAGGTTTCTGGACAGAACACAGGGAATTATAAGACCAACATAGCCGATCGAATGGAGCAAATTTTTGAGACTGCTCCTTTTGTCAAAATCGTGGAGCATCACACATTAATGACGACTCACAAGATGTGTGCCAATTGGAGTACAATCCCAAATTTTAGGTTTCTTGCAGGCACATATGACATGTTCTTCTCTAGGATAGAGCATTTATTTTCTGCAATTCGGGTGGGGACCGTAGTGACAGCGTATGAAGACTGTTCTGGACTAGTCTCTTTCACAGGATTCATCAAACAAATAAATTTGACAGCGAGGGAAGCTATATTATATTTCTTCCACAAGAATTTTGAAGAGGAAATCAAGAGGATGTTTGAACCGGGGCAAGAGACTGCAGTTCCACACTCCTATTTTATACATTTCAGGTCGTTAGGATTGAGTGGAAAGTCTCCTTATTCTTCAAATGCAGTAGGCCATGTATTTAATCTGATCCATTTTGTTGGCTGTTACATGGGTCAAATCAGATCTCTAAATGCCACTGTTATCTCCAGTTGTGCACCACATGAAATGTCTGTGCTAGGGGGTTATTTGGGGGAGGAATTTTTTGGCAAGGGAACATTCGAAAGGAGGTTTTTCAGAGATGAAAAGGAGCTCAGGGACTATGAAGCAGCAGAGTCTGTCAAAAATGACATAGCGCTGGCAGATGACGGAACCGTCAACTCAGATGACGAGGACTTTTTCTCTGGGGAGACGAGAAGTCCGGAGGCCGTATATGCGAAGATCATGATGAACGGAGGGAAATTGAAAAGGTCGCACATCCGACGATATGTATCAGTCAGTTCAAATCATCAGGCCAGACCAAACTCCTTTGCAGAATTTTTGAACAAGACTTACCTGAGTGATCAGAGATAACTGAACCAGTGATTCTCCTCTATTTGTCTTGTTGTTCCCCCAGATAAAACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCCTCAAATTCATTCCAATCATGAGCAAAATCTTTGTAAATCCTAGTGCAATTCGTGCAGGAATGGCAGACTTGGAGATGGCTGAAGAGACAGTAGATTTGATCAATAGGAATCTCGAAGACAATCAGGCTCATCTTCAAGGAGAGCCCATCGAGGTGGATGCTCTTCCAGAGGATATGAGGAGGCTCCAGATAAGTGAGCATGCACCTTGTCACCCATCAGAGGGTGCTTGCAAGAAAGAAGACGGGAGTGATGATGACTTCTACATGGCTGAGAGTGAGGACCCCTATGTACCTCTTCAGTCTTATCTGGACAGTGTAGGGATTCAGATCGTGAGGCAGATGAAAAATGGGGAGAGATTCCTCAAAATCTGGTCCCAGACCGTAGAAGAGATCATATCATATGTAACTGTCAACTTTCCTCTGCCGTCGGGAAAACCAACCGATGACAAATCCACCCAGACTGTAGGGGAGAAGCCCAGGTCAAATGTCCAGCCGGGATCTGCCAAGAAAGAGGATCACCTGTCTAAGGCCAAAATGACTTCTCAAGAAGCATCTGGGCCTCCTGCACTCGAGTGGTCCACCACCAACGATGAGGATGATGCATCAATAGAAGCAGAGATAGCCCATCAAATTGCAGAAAGTTTCTCTAAAAAGTATAAATTCCCTTCTAGATCTTCTGGAATATTTCTATACAACTTTGAGCAACTGAAGATGAATCTGGACGACATCGTGGGAGAGGCCAAAAAGATCCCCGGTGTGACAAGATTGGCTCAGGATGGTCTTAAGCTCCCACTCAGGTGCATATTAGGAGGGGTGGCCTCGACCCATTCAAAGAAGTTCCAACTCCTGGTTGGTTCCGATAAGCTGGGCAAGATCATGCAGGATGATCTTAACCGATATTTGGCCTACTAACTTATCCTCCAAGGGTCCCCCCACCCCGCAAGGCCATCTAGTGCCTCATCTGACTCATGAAAAAAACAGGCAACACCACTGACGCAATGAACTTCTTCAGAAAGATAGTGAAAAGTTGCAAAGATGAGGAGGATCAAAAGCCAGCTCTAATGTCGGCTCCTCCAGATGATGACGATCTGTGGCTTCCCCCGCCGGAGTATGTACCTCTTACCGAGATCACAGCTAAAAAGAATATGAGGAACTTTTGTGTCAATGGTGAGATTAAGATTTGCAGCCCTAACGGGTATTCCTTTAGGATCCTGAGACATATTCTGAGATCGTTTGATGGAGTATATTCTGGAAATCGGAGAATGATAGGACTTGTCAAGGTTGTGATTGGTTTGGCCCTCTCAGGTGCTCCGGTTCCGGAGGGGATGAATTGGGTCTACAAGATAAGACGCACCCTTGTGTTCCAGTGGGCAGAGTCTCACGGCCCATTAGATGGAGAAGAGCTGGAATACTCACAGGAGATAACCTGGGATGATGATTCAGAGTTCATAGGTCTACAAATAAGGATAAGTGCAAGACAATGTCACATCCAAGGAAGGATATGGTGCATCAACATGAACTCCAGGGCGTGTCAGTTATGGTCCGATATGTCTCTCAAGACCCAGCAGGCCGACGAGGACAGGAACACCTCTTTATTGCTAGAATGACCTCCCCTTCACATAGCATCTTACTCAGTTACCTCTACAAAAGGATGTACATGATTTTATCCTCCACCTCTTATGAGCAATAGAACAAAAATATGTAATGGTGCCACTCTACCGCTGCATTTTATTGAGACACCCTATTGAACATCTTCACATGTGAAACCTCTGCAATGTGAAAAAACATTTAACATCCCTCAAGAATCCAAGGCACCATGCCAACCCAAGCTGTCCTCACCGCATTCCTCACAACAATCACAGTTTGTGTAGGGAAATTCCCCATCTACACGATCCCTGACAAACTGGGTCCATGGAGCCCCATAGATATCAATCACCTCAGCTGCCCAAACAATCTGGTCGTGGAAGATGAGGGGTGTACGAACTTGTCCGGGTTCACATATATGGAGTTGAAGGTTGGATACATAACAACAATAAAGGTAGGCGGGTTCACCTGTACAGGAGTAGTCACCGAGGCAGAGACCTATACCAACTTTGTAGGTTATGTCACAACCACTTTCAAGAGGAAGCACTTCCGTCCACGTCCTGATGCATGCAGGGAAGCTTATGATTGGAAGACAGCAGGAGACCCTAGATACGAGGAGTCGTTGCATAACCCATACCCTGATTCTCATTGGCTAAGAACAGTCTCTACCACAAAAGAGTCATTCTTGATAATAGAGCCAAGTGTGGCGGACATGGACGCCTATGACAAATCTCTTTACTCCAAGATATTCCCGGACGGGAAGTGTTCTGGAGTCTCTGCTGTATCTCCCTTTTGCCCAACGAACCATGAATATACAATATGGATGTCCGAGAATCCGAAGCCCGGTATGTCCTGTGACATATTCACCACCAGTAAGGGGAAGAAGGCCATGAAAAATGGTAAAATGTGTGGGTTTGTTGACGAGAGAGGATTATACAAATCCCTCAAAGGAGCCTGCAAATTGAAACTGTGCGGAGTCTCCGGGTTGAGACTGATGGACGGGTCTTGGGTCTCTGTCCAGAACCCGGAGGATGCAAAGTGGTGCTCTCCTGACCAGCTGGTAAACATTCATGACTTCCACTCAGATGAGGTTGAACATCTTATTGTGGAAGAGCTTGTTAAGAAGAGAGAGGAGTGTCTGGATGCTCTGGAATCAATCATGACCACCAAATCAGTAAGCTTCAGACGATTGAGTCACTTAAGAAAGCTTGTTCCTGGATTCGGGAAGGCTTACACCATCATCAATAAAACCTTGATGGAGGCAGATGCCCACTACAAGTCAATTAGGCAATGGACTGAGATAATCCCCTCAAAGGGGTGTTTAATGGCAGGAGGGAGATGCTATCCTCACCATAACGGGGTCTTCTTCAACGGGATAATCCTCAGCCCAGATGGCCATGTATTGATTCCCGAGATGCAATCTGCTCTACTCCAGCAACACATAGAGCTGCTGGAGTCATCTGTTATACCCCTCATGCATCCCCTGGCTGATCCCTCAAATGCCCTCAAGGGGGGTGATGGAGCTGAGGACTTTGTGGAGGTCCATCTCCCCGATGTGCAGAAACAAATCTCAGGGATTGACTTGGGTCTCCCTGAATGGAAGAGGTATTTTCTAATGGGAGTATCTGCCTTGGCCCTGCTTGCCTTGATAATAATCCTCGCCACATGCTGTAAAAGGATAAAGAGGAAAAAGAAGATGGAGTCAAGCCCTGTGGAATTGATTCGGAAGGTGTCTGTGACCTCCCAAAGCGGGAGGGTAGTTCCATCGTGGGAATCTTATAAGGTTGATGCAGGAGGTCATGCTTAGGTTCTGATCACATGGCTGATGATCAGAGTATATAACAATCTATGCCTATCTAAATCAAAGGGTGTTAAGCCATGAGATCCTCCAGATGTCATCTTCAATTCTGGAAAGGA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| 35,646
|
MF197740.1
|
Lyssavirus bokeloh
|
Smreczak,M., Orlowska,A., Marzec,A., Trebas,P., Zmudzinski,J.F.
|
National Veterinary Research Institute, Virology Department
|
Poland
|
2018-05-06
|
080N
|
Lyssavirus bokeloh
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,887
|
GenBank
| null |
Poland: Greater Poland
|
Poland
|
Myotis nattereri
| null |
2016-10
| null | null |
Bokeloh Bat Lyssavirus isolate 080N complete genome
|
ACAAAATCAGAAAAGGAGTAGACATAATCATCTACATAGCAAAAAGGCAACACCCCTACAATGGACTCTGACAAGATTGTCTTCAAAGTCCATAATCAGTTGGTGTCTGTAAAGCCAGAGGTGATTGTTGATCAATATGAATACAAGTATCCCGCTATTAGAGATCAGAAGAAACCCAGCATAACTCTGGGGAGAGCCCCTGACTTAAACAAGGCTTACAAATCTATTTTATCAGGAATAAATGCAGCCAGATTGGATCCAGATGATGTATGCTCCTATTTAGCTGCAGCTATGGAGTTGTTTGAGGGAATTTGCCCTGAAGATTGGCTAAGTTACGGGATTCTCATAGCAAGAAAGGGAGAAAAGATCACCCCCGCCACCTTGGTAAACATTCAGAGAACGAACATTGAAGGCAATTGGGCCTTGACCGGAGGATATGACCTCACAAGGGATCCAACTGTGGCCGAACATGCATCTCTGGTAGGTCTTCTGCTCTGCTTGTATAGACTGAGTAAGGTTTCTGGACAGAACACAGGGAATTATAAGACCAACATAGCCGATCGAATGGAGCAAATTTTTGAGACTGCTCCTTTTGTCAAAATCGTGGAGCATCACACATTAATGACGACTCACAAGATGTGTGCCAATTGGAGTACAATCCCAAATTTTAGGTTTCTTGCAGGCACATATGACATGTTCTTCTCTAGAATAGAGCATTTATTTTCTGCAATTCGGGTGGGGACCGTAGTGACAGCGTATGAAGACTGTTCTGGACTAGTCTCTTTCACAGGATTCATCAAACAAATAAATTTGACAGCGAGGGAAGCTATATTATATTTCTTCCACAAGAATTTTGAAGAGGAAATCAAGAGGATGTTTGAACCGGGGCAAGAAACTGCAGTTCCACACTCCTATTTTATACATTTCAGGTCGTTAGGATTGAGTGGAAAGTCTCCTTATTCTTCAAATGCAGTAGGCCATGTATTTAATCTGATCCATTTTGTTGGCTGTTACATGGGTCAAATCAGATCTCTAAATGCCACTGTTATCTCCAGTTGTGCACCACATGAAATGTCTGTGCTAGGGGGTTATTTGGGGGAGGAATTTTTTGGCAAGGGAACATTCGAAAGGAGGTTTTTCAGAGATGAAAAGGAGCTCAGGGACTATGAAGCAGCAGAGTCTGTCAAAAATGACATAGCGCTGGCAGATGACGGAACCGTCAACTCAGATGACGAGGACTTTTTCTCTGGGGAGACGAGAAGTCCGGAGGCCGTATATGCGAAGATCATGATGAACGGAGGGAAATTGAAAAGGTCGCACATCCGACGATATGTATCAGTCAGTTCAAATCATCAGGCCAGACCAAACTCCTTTGCAGAATTTTTGAACAAGACTTACCTGAGTGATCAGAGATAACTGAACCAGTGATTCTCCTCTATTTGTCTTGTTGTTCTCCCAGATAAAACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCCTCAAATTCATTCCAATCATGAGCAAAATCTTTGTAAATCCTAGTGCAATTCGTGCAGGACTGGCAGACTTGGAGATGGCTGAAGAGACAGTAGATTTGATCAATAGGAATCTCGAAGACAATCAGGCTCATCTTCAAGGAGAGCCCATCGAGGTGGATGCTCTTCCAGAGGATATGAGGAGGCTCCAAATAAGTGAGCATGCACCTTGTCACCCATCAGAGGGTGCTTGCAAGAAAGAAGACGGGAGTGATGATGACTTCTACATGGCTGAGAGTGAGGACCCCTATGTACCTCTTCAGTCTTATCTGGACAGTGTAGGGATTCAGATCGTGAGGCAGATGAAGAATGGGGAGAGATTCCTCAAAATCTGGTCCCAGACCGTAGAAGAGATCATATCATATGTAACTGTCAACTTTCCTCTGCCGTCGGGAAAACCAACCGATGACAAATCCACCCAGACTGTAGGGGAGAAGCCCAGGTCAAATGTCCAGCCGGGATCTGCCAAGAAAGAGGATCACCTGTCTAAGGCCAAAATGACTTCTCAAGAGGCATCTGGGCCTCCTGCACTCGAGTGGTCCACCACCAACGATGAGGATGATGCATCAATAGAAGCAGAGATAGCCCATCAAATTGCAGAAAGTTTCTCTAAAAAGTATAAATTCCCTTCTAGATCTTCTGGAATATTTCTATACAACTTTGAGCAACTGAAGATGAATCTGGACGACATCGTGGGAGAGGCCAAAAAGATCCCCGGTGTGACAAGATTGGCTCAGGATGGTCTTAAGCTCCCACTCAGGTGCATATTAGGAGGGGTGGCCTCGACCCATTCAAAGAAGTTTCAACTCCTGGTTGGTTCCGATAAGCTGGGCAAGATCATGCAGGACGATCTTAACCGATATTTGGCCTACTAACTTATCCTCCAGGGGTCCCCCCACCCCGCAAGGCCATCTAGTGCCTCATCTGACTCATGAAAAAAACAGGCAACACCACTGACGCAATGAACTTCTTCAGAAAGATAGTGAAAAGTTGCAAAGATGAGGAGGATCAAAAGCCAGCTCTAATGTCAGCTCCACCAGATGATGACGATCTGTGGCTTCCCCCGCCGGAGTATGTACCTCTTACCGAGATCACAGCTAAAAAGAATATGAGGAACTTTTGTGTCAATGGTGAGATTAAGATTTGCAGCCCTAACGGGTATTCCTTTAGGATCCTGAGACATATTCTGAGATCGTTTGATGGAGTATATTCTGGAAATCGGAGAATGATAGGACTTGTCAAGGTTGTGATCGGTCTAGCCCTCTCAGGTGCTCCGGTTCCGGAGGGGATGAATTGGGTCTACAAGATAAGACGCACCCTTGTGTTCCAGTGGGCAGAGTCTCACGGCCCATTAGATGGAGAAGAGCTGGAATACTCACAGGAGATAACCTGGGATGATGATTCAGAGTTCATAGGTCTACAAATAAGGATAAGTGCAAGACAATGTCATATCCAAGGAAGGATATGGTGCATCAACATGAACTCCAGGGCGTGTCAGTTATGGTCCGATATGTCTCTCAAGACCCAGCAGGCCGACGAGGACAGGAACACCTCTTTATTGCTAGAATGACCTCCCCTTCACATAGCATCTTACTCAGTTACCTCTACAAAAGGATGTACATGATTTTATCCTCCACCTCTTATGAGCAATAGAACAAAAATATGTAATGGTGCCACTCTACCGCTGCATTTTATTGAGACACCCTATTGAACATCTTCACATGTGAAACCTCTGCAATGTGAAAAAAACATTTAACATCCCTCAAGGATCCAAGGCACCATGCCAACCCAAGCCGTCCTCACCGCATTCCTCACAACAATCACAGTTTGTGTAGGGAAATTCCCCATCTACACAATCCCTGACAAACTGGGTCCATGGAGCCCCATAGATATCAATCACCTCAGCTGCCCAAACAATCTGGTCGTGGAAGATGAGGGGTGTACGAACTTGTCCGGGTTCACATATATGGAGTTGAAGGTTGGATACATAACAACAATAAAGGTAAGCGGGTTCACCTGTACAGGAGTAGTCACCGAGGCAGAGACCTATACCAACTTTGTAGGTTATGTCACAACCACTTTCAAGAGGAAGCACTTCCGTCCACGTCCTGATGCATGCAGGGAAGCTTATGATTGGAAGACAGCAGGAGACCCTAGATACGAGGAGTCGTTGCATAACCCATACCCTGATTCTCATTGGCTAAGAACAGTCTCTACCACAAAAGAGTCATTCCTGATAATAGAGCCAAGTGTGGCGGACATGGACGCCTATGACAAATCTCTTTACTCCAAGATATTCCCGGACGGGAAGTGTTCTGGAGTCTCTGCTGTATCTCCTTTTTGCCCAACGAACCATGAATATACAATATGGATGTCCGAGAATCCGAAGCCCGGTATGTCCTGTGACATATTCACCACCAGTAAGGGGAAGAAGGCCATGAAAAATGGTAAAATGTGTGGGTTTGTTGACGAGAGAGGATTATACAAATCCCTCAAAGGAGCCTGCAAACTGAAACTGTGCGGAGTCTCCGGGTTGAGACTGATGGACGGGTCTTGGGTCTCTGTCCAGAACCCGGAGGATGCAAAGTGGTGCTCTCCTGACCAGTTGGTAAACATTCATGACTTCCACTCAGATGAGGTTGAACATCTTATTGTGGAAGAGCTTGTTAAGAAGAGAGAGGAGTGTCTGGATGCTCTGGAATCAATCATGACCACCAAATCAGTAAGCTTCAGACGATTGAGTCACTTAAGAAAGCTTGTTCCTGGATTCGGGAAGGCTTACACCATCATCAATAAAACCTTGATGGAGGCAGATGCCCACTACAAGTCAATTAGGCAATGGACTGAGATAATCCCCTCAAAGGGGTGTTTAATGGCAGGAGGGAGATGCTATCCTCACCATAACGGGGTCTTCTTCAACGGGATAATCCTCAGCCCAGATGGCCATGTATTGATTCCCGAGATGCAATCTGCTCTACTCCAGCAACACATAGAGCTGCTGGAGTCATCTGTTATACCCCTCATGCATCCCCTGGCTGATCCTTCAAATGCCCTCAAGGGGGGTGATGGAGCTGAGGACTTTGTGGAGGTCCATCTCCCCGATGTGCAGAAACAAATCTCAGGGATTGACTTGGGTCTCCCTGAATGGAAGAGGTATTTTCTAATGGGAGTATCTGCCTTGGCCCTGCTTGCCTTAATAATAATCCTCGCCACATGCTGTAAAAGGATAAAGAGGAAAAAGAAGATGAAGTCAAGCCCTGTGGAATTGATTCGGAAGGTGTCTGTGACTTCCCAAAGCGGGAGGGTAGTTCCATCGTGGGAATCTTATAAGGTTGATGCAGGAGGTCATGCTTAGGTTCTGATCACATGGCTGATGATCAGAGTATATAACAATCTATGCCTATCTAAATCAAAGGGTGTTAAGCCATGAGATCCTCCAGATGTCATCTTCAATTCTAGAAAGGAGGAAGTCCC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CTGGTAACTTATCAGTCACATATCTTACTTCTAAAGATTGAGAAGAGCCTCTCCAAGCAGATGAGAATCAGGCTTAGACAGTTGAGTTCACTGATGAGACAGGTCTTAGGAGGTCATGGAGAGGATTCGCTAGAGTCTGATGAGGACATTCAGGGGTTGTTAAGAGATGCCCTGCAAAGAACTCGATGGGTGGATCAAGAGGTCCGTCATGCAGCAAAGACTATGACGGGAGATCACAGCCCTAGTAGGAAGATTCCTCGGAAAGGAGGTTGTTCAGAATGGGTTTGTTCTGCCCAACAAGTTGCAATTTCAACTTCTTCTAATCCTGCCCCAATGTCTGAATTAGATGTTAGAGCTTTATCCAGGAAGCTCCAGAACCCACTAATATCGGGTTTGAGGGTGGTACAATGGGCCACAGGTGCTCACTACAAATTAAAGCCGATACTTGACGATCTTGATGCGTATCCATCCCTCTGTCTAGTTGTAGGAGATGGATCCGGCGGAATCTCAAGGACTGTGCTTAGCATGTTCCCCGATGCTAGATTGGTTTTTAATAGCTTGTTAGAGGTTAGCGATCTAATGGCCTCTGGGACACATCCATTACCCCCCTCAGCAATCATGAGTGGGGGAAGTGATATAGTGTCTAGGGTCATAGATTTCGGGTCAATCTGGGAGAAGCCTTCAGACCTAAGGAACCTTTCTACCTGGAGATACTTTCAGTCTATCCAGGGTCGCCTTAACATGTCCTATGATTTGATCATCTGCGATGCAGAAGTGACGGACATCCCATCAGTCAACAAGATCACTCTGTTGATGTCTGATTTCTCACTCTCAATTAATGGTCCCCTCAACCTAATCTTTAAAACCTATGGGACCATGCTGGTGAACTCAGATTATAAAGCCATCCAGCATCTCTCAAGGGCTTTCCCGTCTGTTGCAGGATATATCACCCAGATGACATCATCCTTTTCATCTGAAATCTACCTGAAGTTCTCTAAGAGGGGTAAATTCTTTAGAGATTCTGAGTATCTGACCTCCTCTACTCTGCGGGAGATGAGTCTTGTGCTATTCAATTGTAGCAGTCCTAAAAGCGAGATGCAAAGGGCCCGTTCCTTGAACTATCAGGACTTGGTGCGAGGTTTTCCTGAGGAGATTATTTCAAACCCTTACAATGAGATGATAATAACCCTTATAGACAGTGAAGTAGAGTCCTTCCTTGTTCACAAGATGGTGGATGATTTGGAGCTTCAGAGGGGGACTCTGTCGAAGATGTCCATCATTATCGCCATTGTCGTAGTCTTTTCGAATAGGGTGTTCAATGTGTCAAAGCCATTGAGCGGTTCAGTGTTCTACCCACCTTCGGACCCGAAGATTTTGAGACACTTCAACATTTGTTGCAGCACTCTGATGTATCTGTCGACTGCTTTGGGTGATGTGATGAATTTTGCTCGACTCCATGAGCTCTATAACAACCCGGTCACTTACTATTTTAAGAAGCAAGTCGTCAAGGGGAGCATATATCTATCGTGGAGCTGGTCGGATAGCACATCTGTCTTCAAGAGGGTGGCATGCAACTCCAATCTAAGTCTATCCTCTCACTGGATAAGACTGATTTACAAGGTAGTCCGGACAACTCGGTTTGTTGGAAACACCAATGAACTCTCTAAAGAGGTAGAAAAACACTTAAGGGGATACAACAGATGGATCAATCTCAAAGACATCCGATCTCGGTCCTCCATATTAGATTACAGTAGCTTATGACTCTGCTGAGCACCTCATATAGGCTCTTCCATCTTATTATACACTAAATCTTGAAAAAAACACTCCTAAGGGCCATAACCGGTGCCTCTCTGGGGGTTTCTTTTCTTTATTGTTTTTTTTGTTAAG
| 70,850
|
MF043188.1
|
Lyssavirus bokeloh
|
Eggerbauer,E., Troupin,C., Passior,K., Pfaff,F., Hoper,D., Neubauer-Juric,A., Haberl,S., Bouchier,C., Mettenleiter,T.C., Bourhy,H., Muller,T., Dacheux,L., Freuling,C.M.
|
Institut Pasteur, Unit Lyssavirus Dynamics and Host Adaptation
|
France
|
2018-03-15
|
13001FRA
|
Lyssavirus bokeloh
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,900
|
GenBank
| 1
|
France
|
France
|
Myotis nattereri
|
brain
|
2013-08-02
| null | null |
Lyssavirus bokeloh isolate 13001FRA, complete genome
|
ACGCTTAACGACAAAATCAGAAAAGGAATAGACACAATCATCTACATAGCAAAAAGGCAACACCCCTACAATGGACTCTGACAAGATTGTCTTCAAAGTCCATAATCAGTTGGTGTCTGTAAAGCCAGAGGTGATTGTTGATCAATATGAATACAAGTATCCTGCTATTAGAGATCAGAAGAAACCCAGCATAACTCTAGGGAGAGCTCCTGACTTAAACAAGGCTTACAAATCTATTTTATCAGGAATAAATGCAGCTAGATTGGATCCAGATGATGTATGTTCCTACTTAGCTGCAGCTATGGAACTGTTTGAGGGAATTTGCCCTGAAGATTGGCTAAGTTATGGGATTCTCATAGCAAGAAAAGGAGAAAAGATCACCCCCGCCACCTTGGTAAACATTCAGAGAACGAACATTGAAGGCAATTGGGCCTTGACCGGAGGATATGACCTCACAAGGGATCCTACTGTGGCTGAACATGCATCTCTGGTAGGTCTTCTGCTCTGCCTGTATAGACTGAGTAAGGTTTCCGGACAAAACACAGGAAATTATAAGACCAATATAGCCGATCGAATGGAGCAAATTTTTGAGACTGCTCCTTTTGTCAAAATCGTGGAGCATCACACATTAATGACAACTCACAAGATGTGTGCCAATTGGAGTACAATCCCGAATTTTAGGTTTCTTGCAGGCACATATGACATGTTCTTCTCTAGAATAGAGCATTTATTTTCTGCAATTCGGGTGGGGACCGTAGTGACAGCGTATGAAGATTGTTCTGGACTAGTCTCTTTCACAGGATTCATCAAACAGATAAATTTGACAGCGAGGGAAGCTATATTATATTTCTTCCACAAGAATTTTGAAGAGGAAATCAAGAGGATGTTTGAACCAGGGCAAGAAACTGCAGTCCCACACTCCTATTTTATACATTTCAGGTCGTTAGGACTGAGTGGAAAGTCTCCTTATTCTTCAAATGCAGTAGGTCATGTATTTAATCTGATCCATTTTGTTGGCTGTTACATGGGTCAAATCAGATCTCTAAATGCCACTGTTATCTCTAGTTGTGCACCACATGAAATGTCTGTGTTAGGAGGTTATTTGGGGGAGGAATTTTTCGGCAAGGGAACATTCGAAAGGAGGTTTTTCAGAGATGAAAAGGAGCTTAGGGATTATGAAGCAGCAGAGTCTGTCAAAAATGACATAGCACTGGCAGATGATGGAACCGTTAACTCAGATGACGAGGACTTTTTCTCCGGGGAAACGAGAAGTCCGGAGGCCGTATATGCGAAGATCATGATGAACGGAGGGAAATTGAAAAGGTCGCACATCCGACGATATGTATCAGTCAGTTCAAATCATCAGGCCAGACCAAACTCCTTTGCAGAATTTTTGAACAAGACTTATCTGAGTGATCAGAGATAACCGAACCAGTGCTTCTCCTTAATTTGTCTTGTTGTTCCCCCGGATGAAACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTCAAATTCATTCCAGTCATGAGTAAAATCTTTGTAAATCCTAGTGCAATTCGTGCAGGACTGGCAGACTTGGAGATGGCTGAAGAGACAGTAGATTTGATCAACAGGAATCTTGAGGACAATCAGGCTCATCTTCAAGGAGAGCCTATCGAAGTAGATGCTCTTCCAGAGGATATGAGGAGGCTCCAGATAAGTGAGCATGCACCTTGTCACCCATCAGAGGGTGCTTGCAAGAAAGAAGACGGGAGTGATGATGACTTCTACATGGCTGAGAGTGAGGACCCCTATGTACCTCTTCAGTCTTATCTGGACAGTGTAGGGATTCAGATCGTGAGGCAGATGAAGAATGGGGAGAGATTCCTCAAAATCTGGTCCCAGACTGTAGAAGAGATCATATCGTATGTAACTGTCAACTTTCCTCTGCCGTCGGGAAGACCAACCGAGGACAAATCCACCCAGACTGTAGGGGAAAAGCCCAGGTCAAATGTCCAGCCGGGATCTGGCAAGAAAGAGGATCACCTGTCCAAGGCCAAAATGACTTCTCAAGAAGCATCTGGGCCTCCTGCACTCGAGTGGTCTACCACCAACGATGAGGATGACGCATCAATAGAAGCAGAGATAGCCCATCAAATTGCAGAAAGTTTCTCTAAAAAGTATAAATTCCCTTCTAGATCTTCTGGAATATTTCTATACAACTTTGAGCAACTGAAGATGAATCTGGACGACATCGTGGGAGAGGCCAAAAAGATTCCCGGTGTGATAAGACTGGCTCAGGATGGTCTTAAGCTCCCACTCAGGTGCATATTAGGAGGGGTGGCCTCGACCCATTCCAAGAAGTTCCAACTCCTGGTTGGTTCCGATAAGCTGGGCAAGATCATGCAGGACGATCTTAACCGATATTTGGCCTACTAACTTATCCTCTAAGGGTCCCCTCACCCTACAAGGCCACCTAGTGCCTCACCTGAATCATGAAAAAAACAGGCAACACCACTGACGCAATGAACTTCTTCAGAAAGATAGTGAAAAGTTGCAAAGATGAGGAGGATCAAAAGCCGGCTCTGATGTCGGCTCCACCAGATGATGACGATCTGTGGCTTCCCCCGCCGGAGTATGTACCTCTTACCGAGATCACAGCCAAAAAGAATATGAGGAACTTTTGCGTCAATGGTGAGATTAAGATTTGCAGCCCTAACGGGTATTCCTTCAGGATCCTGAGACATATTCTGAGATCTTTTGATGGAGTCTATTCTGGAAATCGGAGAATGATAGGGCTTGTCAAGGTGGTGATCGGCCTAGCCCTCTCAGGTGCTCCGGTCCCGGAGGGGATGAATTGGGTCTACAAGATAAGACGCACCCTTGTGTTCCAGTGGGCAGAGTCTCATGGCCCACTAGATGGAGAAGAGCTAGAATACTCACAGGAGATAACCTGGGATGATGATTCAGAGTTCATAGGTCTACAAATAAGGATAAGTGCAAGACAATGTCATATCCAAGGAAGGATCTGGTGCATCAACATGAACTCCAGGGCGTGTCAGTTATGGTCCGATATGTCTCTCAAGACTCAGCAGGCCGACGAGGACAGGAACACCTCTTTATTGCTAGAATGACCTCCCCTTTACATAGCATCTTACTCAGTTACCTCTACAAAAGGATGTACATGATTTTATCCTCCACCTTTTATGAGCAATAGAACAAAAATATGTAATGGTGCCACTCTACCGCTGCATTTTATTGAGACACCCTATTGAACATCTTCACATGTGAAACCTCTGCAATGTGAAAAAAACATTTAACATCCCTCAAGGATCCAAGGCACCATGCCAACCCAAGCCGTTTTCACCGCATTCCTCACAACAATCACAATTTGTGTAGGGAAATTCCCCATCTACACAATCCCTGACAAACTGGGTCCTTGGAGCCCCATTGATATCAATCACCTCAGCTGCCCAAACAATCTGGTCGTGGAGGATGAGGGGTGTACGAACTTGTCCGGGTTCACATATATGGAGTTGAAGGTCGGATACATAACAACAATAAAGGTAAGCGGGTTTACATGTACAGGAGTAATCACAGAGGCGGAGACCTACACCAACTTTGTAGGTTATGTCACGACCACTTTCAAGAGGAAGCACTTCCGTCCACGTCCTGATGCATGCAGGGAAGCTTATGACTGGAAGACAGCAGGAGACCCTAGATACGAGGAGTCGTTGCACAACCCATACCCTGATTCCCATTGGCTAAGAACAGTCTCTACCACAAAAGAGTCATTCCTGATAATAGGGCCAAGTGTGGCGGACATGGATGCCTATGACAAATCTCTTTACTCCAAGATATTCCCAGACGGGAAATGTTCTGGAGTCTCCGCTGTCTCTCCTTTTTGCCCAACGAACCATGAATATACAATATGGATGTCCGAGAATCCGAAGCCTGGTATGTCCTGTGACATATTCACCACCAGTAAGGGGAAGAAGGCCATGAAAAATGGCAAAATGTGTGGGCTTGTTGACGAGAGAGGATTATACAAATCCCTCAAAGGAGCCTGCAAACTGAAACTGTGCGGTGTCTCCGGGTTGAGACTGATGGACGGGTCTTGGGTCTCTGTCCAGAACCCGGAGGATGCAAAGTGGTGCTCTCCCGACCAGCTGGTAAACATTCATGACTTTCACTCAGATGAGGTTGAACATCTTATTGTGGAAGAGCTTGTTAAGAAAAGAGAGGAGTGTCTGGATGCTCTGGAATCAATCATGACCACCAAATCAGTAAGCTTCAGACGATTGAGTCACTTAAGAAAGCTCGTTCCTGGATTCGGGAAGGCCTACACCATCATCAATAAAACCTTGATGGAGGCAGATGCCCACTACAAGTCAATTAGGCAATGGACTGAGATAATCCCCTCAAAGGGGTGTTTGATGGCAGGAGGGAGATGCTATCCTCACCATGACGGGGTCTTCTTCAACGGGATAATCCTCAGCCCAGATGGCCACGTGTTGATTCCAGAGATGCAATCTGCTCTACTCCAGCAACACATAGAGCTGTTAGAGTCATCTGTTATACCCCTTATGCATCCCCTGGCTGATCCCTCAAATGCCCTCAAGGGGGGTGATGGAGCTGAGAACTTTGTGGAGGTCCATCTCCCCGATGTGCAGAAACAAATCTCGGGGATTGACTTGGGTCTCCCTGAATGGAAGAGGTATTTTCTAATGGGAGTATCTGTCTTGGCCCTGTTTGCCTTCATAATAATCCTCGCCACATGCTGTAAAAGGATAAGGAGGAAAAAGAAGATGAAATCAAGCCCTGTGGAGTTGATTCGGAAGGTGTCTGTGACCTCCCAAAGCGGGAGGGTAGTTCCATCGTGGGAATCTTATAAGGTTGATGCAGGAGGTCATGCTTAGGTTCTGGTCACATGGCTGATGATCAGAGTATATAACAATCTATGCCTATCTAAATCAAAGGGTGTTAAGCCATGAGATCCTCCAGATGTCATCTTCAATTCTAGAAAGG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| 71,800
|
LT839617.1
|
Lyssavirus bokeloh
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2018-01-29
|
39608
|
Lyssavirus bokeloh
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,900
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Myotis nattereri
| null |
2015-05
|
SAMEA103975575
|
PRJEB20392
|
Bokeloh bat lyssavirus isolate 39608 genome assembly, complete genome: monopartite
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ACGCTTAACGACAAAATCAGAAAAGGAGTAGACATAATCATCTACATAGCAAAAAGGCAACACCCCTACAATGGACTCTGACAAGATTGTCTTCAAAGTCCATAATCAGTTGGTGTCTGTAAAGCCAGAGGTGATTGTTGATCAATATGAATACAAGTATCCCGCTATTAGAGATCAGAAGAAACCCAGCATAACTCTGGGGAGAGCCCCTGACTTAAACAAGGCTTACAAATCTATTTTATCAGGAATAAATGCAGCCAGATTGGATCCAGATGATGTATGTTCCTATTTAGCTGCAGCTATGGAGCTGTTTGAGGGAATTTGCCCTGAAGATTGGCTAAGTTATGGGATTCTCATAGCAAGAAAGGGAGAAAAGATCACCCCCGCCACCTTGGTAAACATTCAGAGAACGAACATTGAAGGCAATTGGGCCTTGACCGGAGGATATGACCTCACAAGGGATCCAACTGTGGCCGAACATGCATCTCTGGTAGGTCTTCTGCTCTGCTTGTATAGACTGAGTAAGGTTTCTGGACAGAACACAGGGAATTATAAGACCAACATAGCCGATCGAATGGAGCAAATTTTTGAGACTGCTCCTTTTGTCAAAATCGTGGAGCATCACACATTAATGACGACTCACAAGATGTGTGCCAATTGGAGTACAATCCCAAATTTTAGGTTTCTTGCAGGCACATATGACATGTTCTTCTCTAGGATAGAGCATTTATTTTCTGCAATTCGGGTGGGGACCGTAGTGACAGCGTATGAAGACTGTTCTGGACTAGTCTCTTTCACAGGATTCATCAAACAAATAAATTTGACAGCGAGGGAAGCTATATTATATTTCTTCCACAAGAATTTTGAAGAGGAAATCAAGAGGATGTTTGAACCGGGGCAAGAGACTGCAGTTCCACACTCCTATTTTATACATTTCAGGTCGTTAGGATTGAGTGGAAAGTCTCCTTATTCTTCAAATGCAGTAGGCCATGTATTTAATCTGATCCATTTTGTTGGCTGTTACATGGGTCAAATCAGATCTCTAAATGCCACTGTTATCTCCAGTTGTGCACCACATGAAATGTCTGTGCTAGGGGGTTATTTGGGGGAGGAATTTTTTGGCAAGGGAACATTCGAAAGGAGGTTTTTCAGAGATGAAAAGGAGCTCAGGGACTATGAAGCAGCAGAGTCTGTCAAAAATGACATAGCGCTGGCAGATGACGGAACCGTCAACTCAGATGACGAGGACTTTTTCTCTGGGGAGACGAGAAGTCCGGAGGCCGTATATGCGAAGATCATGATGAACGGAGGGAAATTGAAAAGGTCGCACATCCGACGATATGTATCAGTCAGTTCAAATCATCAGGCCAGACCAAACTCCTTTGCAGAATTTTTGAACAAGACTTACCTGAGTGATCAGAGATAACTGAACCAGTGATTCTCCTCCACCCGTCCCGTTGCTCCCCCAGATAAAACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCCTCAAATTCATTCCAATCATGAGCAAAATCTTTGTAAATCCTAGTGCAATTCGTGCAGGACTGGCAGACTTGGAGATGGCTGAAGAGACAGTAGATTTGATCAATAGGAATCTCGAAGACAATCAGGCTCATCTTCAAGGAGAGCCCATCGAGGTGGATGCTCTTCCAGAGGATATGAGGAGGCTCCAGATAAGTGAGCATGCACCTTGTCACCCATCAGAGGGTGCTTGCAAGAAAGAAGACGGGAGTGATGATGACTTCTACATGGCTGAGAGTGAGGACCCCTATGTACCTCTTCAGTCTTATCTGGACAGTGTAGGGATTCAGATCGTGAGGCAGATGAAAAATGGGGAGAGATTCCTCAAAATCTGGTCCCAGACCGTAGAAGAGATCATATCATATGTAACTGTCAACTTTCCTCTGCCGTCGGGAAAACCAACCGATGACAAATCCACCCAGACTGTAGGGGAGAAGCCCAGGTCAAATGTCCAGCCGGGATCTGCCAAGAAAGAGGATCACCTGTCTAAGGCCAAAATGACTTCTCAAGAAGCATCTGGGCCTCCTGCACTCGAGTGGTCCACCACCAACGATGAGGATGATGCATCAATAGAAGCAGAGATAGCCCATCAAATTGCAGAAAGTTTCTCTAAAAAGTATAAATTCCCTTCTAGATCTTCTGGAATATTTCTATACAACTTTGAGCAACTGAAGATGAATCTGGACGACATCGTGGGAGAGGCCAAAAAGATCCCCGGTGTGACAAGATTGGCTCAGGATGGTCTTAAGCTCCCACTCAGGTGCATATTAGGAGGGGTGGCCTCGACCCATTCAAAGAAGTTCCAACTCCTGGTTGGTTCCGATAAGCTGGGCAAGATCATGCAGGATGATCTTAACCGATATTTGGCCTACTAACTTATCCTCCAAGGGTCCCCCCACCCCGCAAGGCCATCTAGTGCCTCATCTGACTCATGAAAAAAACAGGCAACACCACTGACGCAATGAACTTCTTCAGAAAGATAGTGAAAAGTTGCAAAGATGAGGAGGATCAAAAGCCAGCTCTAATGTCGGCTCCTCCAGATGATGACGATCTGTGGCTTCCCCCGCCGGAGTATGTACCTCTTACCGAGATCACAGCTAAGAAGAATATGAGGAACTTTTGTGTCAATGGTGAGATTAAGATTTGCAGCCCTAACGGGTATTCCTTTAGGATCCTGAGACATATTCTGAGATCGTTTGATGGAGTATATTCTGGAAATCGGAGAATGATAGGACTTGTCAAGGTTGTGATCGGTCTAGCCCTCTCAGGTGCTCCGGTTCCGGAGGGGATGAATTGGGTCTACAAGATAAGACGCACCCTTGTGTTCCAGTGGGCAGAGTCTCACGGCCCATTAGATGGAGAAGAGCTGGAATACTCACAGGAGATAACCTGGGATGATGATTCAGAGTTCATAGGTCTACAAATAAGGATAAGTGCAAGACAATGTCACATCCAAGGAAGGATATGGTGCATCAACATGAACTCCAGGGCGTGTCAGTTATGGTCCGATATGTCTCTCAAGACCCAGCAGGCCGACGAGGACAGGAACACCTCTTTATTGCTAGAATGACCTCCCCTTCACATAGCATCTTACTCAGTTACCTCTACAAAAGGATGTACATGATTTTATCCTCCACCTCTTATGAGCAATAGAACAAAAATATGTAATGGTGCCACTCTACCGCTGCATTTTATTGAGACACCCTATTGAACATCTTCACATGTGAAACCTCTGCAATGTGAAAAAAACATTTAACATCCCTCAAGAATCCAAGGCACCATGCCAACCCAAGCCGTCTTCACCGCATTCCTCACAACAATCACAGTTTGTGTAGGGAAATTCCCCATCTACACGATCCCTGACAAACTGGGTCCATGGAGCCCCATAGATATCAATCACCTCAGCTGCCCAAACAATCTGGTCGTGGAAGATGAGGGGTGTACGAACTTGTCCGGGTTCACATATATGGAGTTGAAGGTTGGATACATAACAACAATAAAGGTAGGCGGGTTCACCTGTACAGGAGTAGTCACCGAGGCAGAGACCTATACCAACTTTGTAGGTTATGTCACAACCACTTTCAAGAGGAAGCACTTCCGTCCACGTCCTGATGCATGCAGGGAAGCTTATGATTGGAAGACAGCAGGAGACCCTAGGTACGAGGAGTCGTTGCATAACCCATACCCTGATTCTCATTGGCTAAGAACAGTCTCTACCACAAAAGAGTCATTCTTGATAATAGAGCCAAGTGTGGCGGACATGGACGCCTATGACAAATCTCTTTACTCCAAGATATTCCCGGACGGGAAGTGTTCTGGAGTCTCTGCTGTATCTCCCTTTTGCCCAACGAACCATGAATATACAATATGGATGTCCGAGAATCCGAAGCCCGGTATGTCCTGTGACATATTCACCACCAGTAAGGGGAAGAAGGCCATGAAAAATGGTAAAATGTGTGGGTTTGTTGACGAGAGAGGATTATACAAATCCCTCAAAGGAGCCTGCAAATTGAAACTGTGCGGAGTCTCCGGGTTGAGACTGATGGACGGGTCTTGGGTCTCTGTCCAGAACCCGGAGGATGCAAAGTGGTGCTCTCCTGACCAGCTGGTAAACATTCATGACTTCCACTCAGATGAGGTTGAACATCTTATTGTGGAAGAGCTTGTTAAGAAGAGAGAGGAGTGTCTGGATGCTCTGGAATCAATCATGACCACCAAATCAGTAAGCTTCAGACGATTGAGTCACTTAAGAAAGCTTGTTCCTGGATTCGGGAAGGCTTACACCATCATCAATAAAACCTTGATGGAGGCAGATGCCCACTACAAGTCAATTAGGCAATGGACGGAGATAATCCCCTCAAAGGGGTGTTTAATGGCAGGAGGGAGATGCTATCCTCACCATAACGGGGTCTTCTTCAACGGGATAATCCTCAGCCCAGATGGCCATGTATTGATTCCCGAGATGCAATCTGCTCTACTCCAGCAACACATAGAGCTGCTGGAGTCATCTGTTATACCCCTCATGCATCCCCTGGCTGATCCCTCAAATGCCCTCAAGGGGGGTGATGGAGCTGAGGACTTTGTGGAGGTCCATCTCCCCGATGTGCAGAAACAAATCTCAGGGATTGACTTGGGTCTCCCTGAATGGAAGAGGTATTTTCTAATGGGAGTATCTGCCTTGGCCCTGCTTGCCTTGATAATAATCCTCGCCACATGCTGTAAAAGGATAAAGAGGAAAAAGAAGATGGAGTCAAGCCCTGTGGAATTGATTCGGAAGGTGTCTGTGACCTCCCAAAGCGGGAGGGTAGTTCCATCGTGGGAATCTTATAAGGTTGATGCCGGAGGTCATGCTTAGGTTCTGATCACATGGCTGATGATCAGAGTATATAACAATCTATGCCTATCTAAATCAAAGGGTGTTAAGCCATGAGATCCTCCAGATGTCATCTTCAATTCTGGAAAGG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| 72,458
|
LT839642.1
|
Lyssavirus bokeloh
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2018-01-29
|
39068
|
Lyssavirus bokeloh
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,900
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Pipistrellus pipistrellus
| null |
2015-12
|
SAMEA103975576
|
PRJEB20392
|
Bokeloh bat lyssavirus isolate 39068 genome assembly, complete genome: monopartite
|
ACGCTTAACGACAAAATCAGAAAAGGAGTAGACACACTCATCTACAGAGCAAAAAGGTAACACCCCTACAATGGACTCTGACAAGATTGTCTTCAAAGTCCATAATCAGTTGGTGTCTGTAAAGCCAGAGGTGATTGTTGATCAATATGAGTACAAATATCCTGCTATCAGAGATCAGAAGAAACCTAGCATAACTCTGGGGAAAGCTCCTGATTTAAACAAGGCTTACAAATCTATTTTGTCAGGAATAAATGCGGCTAGATTGGATCCCGATGATGTATGTTCCTACCTAGCAGCAGCTATGGAACTGTTTGAAGGAATTTGCCCTGAAGACTGGCTAAGCTATGGGATTCTCATAGCAAGAAAGGGGGAGAAGATTACCCCTGCCACCTTGGTGAACATTCAGAGAACGAACATTGAAGGCAACTGGGCCTTGACCGGAGGATACGACCTTACAAGGGATCCAACTGTGGCCGAACATGCATCTCTAGTGGGCCTTCTGCTCTGCTTGTATAGACTAAGCAAGGTCTCCGGGCAGAACACAGGGAATTATAAGACTAACATAGCCGATCGAATGGAGCAAATCTTTGAGACCGCTCCTTTTGTCAAAATCGTGGAGCATCATACCTTAATGACCACTCACAAAATGTGTGCCAATTGGAGTACAATCCCAAATTTTAGGTTTCTTGCAGGCACATATGATATGTTCTTTTCTAGGATAGAGCATTTATTTTCTGCAATCCGGGTCGGAACTGTAGTGACGGCATATGAAGATTGTTCTGGACTGGTCTCTTTCACAGGATTCATCAAACAAATAAATTTGACAGCTAGGGAGGCTATATTGTATTTCTTCCACAAGAATTTTGAAGAGGAAATCAAGAGGATGTTTGAACCAGGGCAAGAGACTGCAGTTCCACACTCTTATTTTATACATTTCAGGTCCTTAGGATTGAGTGGGAAGTCTCCTTATTCCTCAAATGCAGTAGGTCATGTGTTTAATCTGATCCATTTCGTTGGCTGTTACATGGGTCAAATCAGATCTCTAAATGCTACTGTTATCTCTAGTTGTGCACCACATGAAATGTCTGTGTTAGGGGGTTATCTGGGGGAGGAATTCTTTGGCAAGGGAACATTCGAGAGGAGGTTCTTCAGAGACGAAAAGGAGCTCCGAGATTATGAAGCCGCAGAGTCTGTCAAAAACGACGTCGCACTGGCAGATGATGGAACCGTCAACTCAGATGATGAGGACTTTTTTTCTGGGGAAACGAGAAGTCCGGAGGCCGTGTATGCGAAGATCATGATGAACGGGGGAAAATTGAAAAAGTCTCACATCCGGCGATATGTATCAGTCAGCTCAAACCACCAGGCCAGACCGAACTCCTTTGCAGAATTTTTGAACAAAACTTACCTAGGTGATCAGAGATAATCGAACCAGTGCCTCCCCTCAATCCGTCCCGCTGCTTCTCCAGACGAAACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCCTCAAATTCATTCCCGTCATGAGCAAAATCTTTGTAAATCCTAGTGCAATTCGTGCAGGACTGGCAGACCTTGAGATGGCTGAAGAGACAGTTGATTTGATCAACAGGAATCTTGAGGACAACCAGGCTCATCTTCAAGGAGAGCCCATCGAAGTGGATGCTCTTCCAGAGGATATGAGAAGGCTCCAGATAAGTGAACATGCACCTTGTCACCCGTCAGAGGGTGCCTGCAAGAAAGAAGAAGGGAGCGACGATGACTTCTACATGGCGGAGAGTGAGGACCCATATGTACCTCTTCAGTCCTATCTAGACAGTGTGGGAATTCAGATCGTGAGGCAGATGAAGACTGGGGAGAGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAGACCGTAGAAGAGATCATATCATATGTGACTGTCAACTTTCCTCTGCCATCTGGAAGACCAACTGAGGACAAATCTACCCAGACTGTAGGGGAGAAGCCTAGGTCAAATGTCCAGCAGGGATCTGCCAAGAAAGAGGATCACCTGTCTAAGGCCAAAATGACCTCCCAAGAAGCATCTGGGCCTCCGGCGCTCGAGTGGTCCACTACCAACGATGAAGATGATGCATCAATAGAAGCAGAGATAGCCCATCAGATTGCAGAAAGTTTCTCGAAGAAATATAAATTCCCTTCTAGATCTTCTGGGATATTTCTATATAACTTTGAGCAACTGAAGATGAATCTGGATGACATCGTGGGAGAGGCCAAAAAGATCCCCGGTGTGACCAGACTGGCTCAAGATGGTCTTAAGCTCCCACTCAGGTGTATATTAGGAGGGGTGGCCTCAACCCATTCAAAGAAGTTCCAACTCCTGGTTGGTTCCGATAAGCTGGGCAAAATCATGCAGGACGATCTCAACCGATATCTGGCTTATTAACTTATCCCCCAAGGATTCCTTCACCCCACAAGATCATCCAGAGCCTCATCTGACTCATGAAAAAAACAGGCAACACCACTGACGCAATGAATTTCTTCCGAAAGATAGTGAAAAGTTGCAAAGATGAGGAGGATCAAAAGCCAGCTCTGATGTCGGCTCCACCAGATGATGACGATCTGTGGCTTCCCCCGCCGGAGTATGTACCTTTGACCGAGATCACAGCTAAAAAGAATATGAGGAACTTTTGTGTCAATGGCGAGATTAAGATTTGCAGCCCCAACGGGTATTCTTTTAGGATCCTGAGACATATTCTGAGGTCTTTTGATGGAGTCTATTCTGGAAATCGGAGAATGATAGGACTTGTCAAGGTTGTGATCGGTCTAGCCCTCTCAGGTGCTCCGGTCCCGGAGGGGATGAACTGGGTCTACAAGATAAGACGCACCCTTGTTTTCCAATGGGCAGAGTCTCACGGCCCACTAGATGGAGAAGAGCTAGAATACTCACAGGAGATAACCTGGGATGATGATTCAGAGTTCATAGGTTTGCAAATAAGGATAAGTGCAAGGCAATGTCATATCCAAGGACGGATCTGGTGCATCAACATGAACTCCAGGGCATGTCAGTTATGGTCAGATATGTCTCTCAAGACCCAGCAGGCTGACGAGGACAGGAACACCTCTTTGTTGCTAGAATGACCTCCCCTTTACATAGCACCTTACTCAGTTACCTCTACACAAGGATGTACATGATTTTATCCTCCACCTTTTATGAGCAATAGAACAAAAATATGTAATGGTGCCACTCTACCGCTGCATTTTATTGAGACACCCTATTGAACATCTTCACATGTGAAACCTCTGCAATGTGAAAAAAACATTTAACATCCCTCAAGGATCCAAGGCACCATGCCAACTCAAGCCGTCCTCTCTGCATTTCTCGCAACAATCACAATTTGTGTAGGGAAATTCCCCATCTACACAATCCCCGATAAACTGGGTCCCTGGAGCCCCATTGACATCAATCACCTCAGCTGCCCAAACAATCTTGTCGTGGAAGATGAGGGGTGTACGAACCTGTCCGGGTTCACATATATGGAGCTAAAGGTCGGATACATAACAACAATAAAGGTGAGCGGATTTACATGTACAGGAGTGGTCACGGAAGCCGAGACTTACACCAACTTTGTAGGTTATGTCACAACCACTTTCAAGAGAAAGCACTTCCGTCCACGTCCTGATGCATGTAGGGAAGCTTATGATTGGAAGACCGCAGGAGACCCTAGATACGAGGAGTCATTGCATAACCCATATCCTGATTCCCATTGGCTGAGAACAGTCACCACCACGAAAGAGTCATTCCTGATAATAGGGCCAAGTGTGGCGGACATGGACGCCTATGACAAGTCTCTTTATTCCAAGATATTCCCAGATGGGAAATGTTCTGGAATCTCTGCTGTCTCTCCCTTCTGCCCGACGAACCATGAATATACAATATGGATGTCCGAGAATCAAAAGCCCGGTATGTCCTGTGACATATTCACCACTAGCAAGGGGAAGAAGGCCACGAAAAATGGCAAAATGTGTGGGTTTGTTGACGAGAGAGGATTATACAAATCCCTCAAAGGAGCCTGCAAACTGAAACTGTGCGGTGTCTCCGGCTTGAGACTAATGGACGGATCTTGGGTCTCTGTTCAGAACCCGGAGGATGCAAAATGGTGCTCTCCCGACCAGCTGGTGAACATTCATGACTTCCACTCAGATGAGGTTGAACATCTTATTGTGGAGGAGCTTGTTAAAAAGAGAGAAGAGTGTCTGGATGCTCTGGAATCAATCATGACCACCAAATCAGTAAGCTTCCGGCGATTGAGTCACTTGAGAAAGCTTGTTCCTGGATTTGGGAAGGCTTACACCATTATCAATAAAACCTTGATGGAGGCAGATGCCCACTACAAGTCAATTAGGCAATGGACAGAGATAATCCCTTCAAAGGGGTGTTTAATGGCAGGAGGGAGATGCTATCCTCACCATAATGGGGTCTTCTTCAACGGGATAATCCTCAGCCCGGATGGCCACGTGTTGATTCCAGAGATGCAATCTGCTTTGCTTCAGCAGCATATAGAGCTGCTGGAGTCATCTGTTATACCCCTCATGCATCCCCTGGCTGATCCCTCAACTGCCCTTAAAGGGGGAGACGGAGCAGAGGACTTTGTAGAGATCCATCTCCCCGATGTGCAAAAACAAATCTCGGGGATTGACTTGGGTCTCCCTGAGTGGAAGAGGTATTTCTTAATGGGGGTATCTGCTTTGGCCCTGCTTGCCTTAACAATAATTCTCGCCACGTGTTGTAAACGGATAAGGAGGAAAAAGAAGATGAAGTCAAGTCCTGTGGAGTTGATTCGAAAGGTGTCTGTGACCTCTCAAAGCGGGAAGGTAGTTCCATCGTGGGAATCTTATAAGGTTGATGCAGGAGGTCAAGCTTAGGTTCTGATCACATGGTTGACGATCAGAATATATAACAATCTATGCCTATTTAAATCAAGGGGTGTTAAGCCATGAGATCCTCCTGATGTCATCCTCAGTTCTGGAAAGG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| 72,459
|
LT839643.1
|
Lyssavirus bokeloh
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2018-01-29
|
42052
|
Lyssavirus bokeloh
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,901
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Myotis nattereri
| null |
2016-08
|
SAMEA103975578
|
PRJEB20392
|
Bokeloh bat lyssavirus isolate 42052 genome assembly, complete genome: monopartite
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ACGCTTAACGACAAAATCAGAAAAGGAGTAGACATAATCATCTACATAGCAAAAAGGCAACACCCCTACAATGGACTCTGACAAGATTGTCTTCAAAGTCCATAATCAGTTGGTGTCTGTAAAGCCAGAGGTGATTGTTGATCAATATGAATACAAGTATCCCGCTATTAGAGATCAGAAGAAACCCAGCATAACTCTGGGGAGAGCCCCTGACTTAAACAAGGCTTACAAATCTATTTTATCAGGAATAAATGCAGCCAGATTGGATCCAGATGATGTATGTTCCTATTTAGCTGCAGCTATGGAGCTGTTTGAGGGAATTTGCCCTGAAGATTGGCTAAGTTATGGGATTCTCATAGCAAGAAAGGGAGAAAAGATCACCCCCGCCACCTTGGTAAACATTCAGAGAACGAACATTGAAGGCAATTGGGCCTTGACCGGAGGATATGACCTCACAAGGGATCCAACTGTGGCCGAACATGCATCTCTGGTAGGTCTTCTGCTCTGCTTGTATAGACTGAGTAAGGTTTCTGGACAGAACACAGGGAATTATAAGACCAACATAGCCGATCGAATGGAGCAAATTTTTGAGACTGCTCCTTTTGTCAAAATCGTGGAGCATCACACATTAATGACGACTCACAAGATGTGTGCCAATTGGAGCACAATCCCAAATTTTAGGTTTCTTGCAGGCACATATGACATGTTCTTCTCTAGAATAGAGCATTTATTTTCTGCAATTCGGGTGGGGACCGTAGTGACAGCGTATGAAGACTGTTCTGGACTAGTCTCTTTCACAGGATTCATCAAACAAATAAATTTGACAGCGAGGGAAGCTATATTATATTTCTTCCACAAGAATTTTGAAGAGGAAATCAAGAGGATGTTTGAACCGGGGCAAGAGACTGCAGTTCCACACTCCTATTTTATACATTTCAGGTCGTTAGGATTGAGTGGAAAGTCTCCTTATTCTTCAAATGCAGTAGGCCATGTATTTAATCTGATCCATTTTGTTGGCTGTTACATGGGTCAAATCAGATCTCTAAATGCCACTGTTATCTCCAGTTGTGCACCACATGAAATGTCTGTGCTAGGGGGTTATTTGGGGGAGGAATTTTTTGGCAAGGGAACATTCGAAAGGAGGTTTTTCAGAGATGAAAAGGAGCTCAGGGACTATGAAGCAGCAGAGTCTGTCAAAAATGACATAGCGCTGGCAGATGACGGAACCGTCAACTCAGATGACGAGGACTTTTTCTCTGGGGAGACGAGAAGTCCGGAGGCCGTATATGCGAAGATCATGATGAACGGAGGGAAATTGAAAAGGTCGCACATCCGACGATATGTATCAGTCAGTTCAAATCATCAGGCCAGACCAAACTCCTTTGCAGAATTTTTGAACAAGACTTACCTGAGTGATCAGAGATAACTGAACCAGTGATTCTCCTCTGTTTGTCTTGTTGTTCCCCCAGATAAAACAAGAAAAAAAACTAACACCCCTCCCTCAAATTCATTCCAATCATGAGCAAAATCTTTGTAAATCCTAGTGCAATTCGTGCAGGACTGGCAGACTTGGAGATGGCTGAAGAGACAGTAGATTTGATCAATAGGAATCTCGAAGACAATCAGGCTCATCTTCAAGGCGAGCCCATCGAGGTGGATGCTCTTCCAGAGGATATGAGGAGGCTCCAGATAAGTGAGCATGCACCTTGTCACCCATCAGAGGGTGCTTGCAAGAAAGAAGACGGGAGTGATGATGACTTCTACATGGCTGAGAGTGAGGACCCCTATGTACCTCTTCAGTCTTATCTGGACAGTGTAGGGATTCAGATCGTGAGGCAGATGAAGAATGGGGAGAGATTCCTCAAAATCTGGTCCCAGACTGTAGAAGAGATCATATCATATGTAACTGTCAACTTTCCTCTGCCGTCGGGAAAACCAACCGATGACAAATCCACCCAGACTGTAGGGGAGAAGCCCAGGTCAAATGTCCAGCCGGGATCTGCCAAGAAAGAGGATCACCTGTCTAAGGCCAAAATGACTTCTCAAGAAGCATCTGGGCCTCCTGCACTCGAGTGGTCCACCACCAACGATGAGGATGATGCATCAATAGAAGCAGAGATAGCCCATCAAATTGCAGAAAGTTTCTCCAAAAAGTATAAATTCCCTTCTAGATCTTCTGGAATATTTCTATACAACTTTGAGCAACTGAAGATGAATCTGGACGACATCGTGGGAGAGGCCAAAAAGATCCCCGGTGTGACAAGATTGGCTCAGGATGGTCTTAAGCTCCCACTCAGGTGCATATTAGGAGGGGTGGCCTCGACCCATTCAAAGAAGTTCCAACTCCTGGTTGGTTCCGATAAGCTGGGCAAGATCATGCAGGATGATCTTAACCGATATTTGGCCTACTAACTCATCCTCCAAGGGTCCCCCCACCCCGCAAGGCTGTCTAGTGCCTCATCTGACTCATGAAAAAAACAGGCAACACCACTGACACAATGAACTTCTTCAGAAAGATAGTGAAAAGTTGCAAAGATGAGGAGGATCAAAAGCCAGCTCTAATGTCGGCTCCACCAGATGATGACGATCTGTGGCTTCCCCCGCCGGAGTATGTACCTCTTACCGAGATCACAGCTAAAAAGAATATGAGGAACTTTTGTGTCAATGGTGAGATTAAGATTTGCAGCCCTAACGGGTATTCCTTTAGGATCCTGAGACATATTCTGAGATCGTTTGATGGAGTATATTCTGGAAATCGGAGAATGATAGGACTTGTCAAGGTTGTGATCGGTCTAGCCCTCTCAGGTGCTCCGGTTCCGGAGGGGATGAATTGGGTCTACAAGATAAGACGCACCCTTGTGTTCCAGTGGGCAGAGTCTCACGGCCCATTAGATGGAGAAGAGCTGGAATACTCACAGGAGATAACCTGGGATGATGATTCAGAGTTCATAGGTCTACAAATAAGGATAAGTGCAAGACAATGTCATATCCAAGGAAGGATATGGTGCATCAACATGAACTCCAGGGCGTGTCAGTTATGGTCCGATATGTCTCTCAAGACCCAGCAGGCCGACGAGGACAGGAACACCTCTTTATTGCTAGAATGACCTCCCCTTCACATAGCATCTTACTCAGTTACCTCTACAAAAGGATGTACATGATTTTATCCTCCACCTCTTATGAGCAATAGAACAAAAATATGTAATGGTGCCACTCTACCGCTGCATTTTATTGAAACACCCTATTGAACATCTTCACATGTGAAACCTCTGCAATGTGAAAAAAACATTTAACATCCCTCAAGGATCCAAGGCACCATGCCAACCCAAGCCGTCTTCACCGCATTCCTCACAACAATCACAGTTTGTGTAGGGAAATTCCCCATCTACACAATCCCTGACAAACTGGGTCCATGGAGCCCCATAGATATCAATCACCTCAGCTGCCCAAACAATCTTGTCGTGGAAGATGAGGGGTGTACGAACTTGTCCGGGTTCACATATATGGAGTTGAAGGTTGGATACATAACAACAATAAAGGTAAGCGGGTTCACCTGTACAGGAGTAGTCACCGAGGCAGAGACCTATACCAACTTTGTAGGTTATGTCACAACCACTTTCAAGAGGAAGCACTTCCGTCCACGTCCTGATGCATGCAGGGAAGCTTATGATTGGAAGACAGCAGGAGACCCTAGATACGAGGAGTCGTTGCATAACCCATACCCTGATTCTCATTGGCTAAGAACAGTCTCTACCACAAAAGAATCATTCCTGATAATAGAGCCAAGTGTGGCGGACATGGACGCCTATGACAAATCTCTTTACTCCAAGATATTCCCGGACGGGAAGTGTTCTGGAGTCTCTGCTGTATCTCCTTTTTGCCCAACGAACCATGAATATACAATATGGATGTCCGAGAATCCGAAGCCCGGTATGTCCTGTGACATATTCACCACCAGTAAGGGGAAGAAGGCCATGAAAAATGGTAAAATGTGTGGGTTTGTTGACGAGAGAGGATTATACAAATCCCTCAAAGGAGCCTGCAAACTGAAACTGTGCGGAGTCTCAGGGTTGAGACTGATGGACGGGTCTTGGGTCTCTGTCCAGAACCCGGAGGATGCAAAGTGGTGCTCTCCTGACCAGCTGGTAAACATTCATGACTTCCACTCAGATGAGGTTGAACATCTTATTGTGGAAGAGCTTGTTAAGAAGAGAGAGGAGTGTCTGGATGCTCTGGAATCAATCATGACCACCAAATCAGTAAGCTTCAGACGATTGAGTCACTTAAGAAAGCTTGTTCCTGGATTCGGGAAGGCTTACACCATCATCAATAAAACCCTGATGGAGGCAGATGCCCACTACAAGTCAATTAGGCAATGGACTGAGATAATCCCCTCAAAGGGGTGTTTAATGGCAGGAGGGAGATGCTATCCTCACCATAACGGGATCTTCTTCAACGGGATAATCCTCAGCCCAGATGGCCATGTATTGATTCCCGAGATGCAATCTGCTCTACTCCAGCAACACATAGAGCTGCTGGAGTCATCTGTTATACCCCTCATGCATCCCCTTGCTGATCCCTCAAATGCCCTCAAGGGGGGTGATGGAGCTGAGGACTTTGTGGAGGTCCATCTCCCCGATGTGCAGAAACAAATCTCAGGGATTGACTTGGGTCTCCCTGAATGGAAGAGGTATTTTCTAATGGGAGTATCTGCCTTGGCCCTGCTTGCCTTAATAATAATCCTCGCCACATGCTGTAAAAGGATAAAGAGGAAAAAGAAGATGAAGTCAAGCCCTGTGGAATTGATTCGGAAGGTGTCTGTGACCTCCCAAAGCGGGAGGGTAGTTCCATCGTGGGAATCTTATAAGGTTGATGCAGGAGGTCATGCTTAGGTTCTGATCAAATGGCTGATGATCAGAGTATATAACAATCTATGCTTATCTAAATCAAAGGGTGTTAAGCCATGAGATCCTCCAGATGTCATCTTCAATTCTAGAAAG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| 72,460
|
LT839644.1
|
Lyssavirus bokeloh
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2018-01-29
|
41021
|
Lyssavirus bokeloh
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,900
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Myotis nattereri
| null |
2016-08
|
SAMEA103975577
|
PRJEB20392
|
Bokeloh bat lyssavirus isolate 41021 genome assembly, complete genome: monopartite
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ACGCTTAACGACAAAATCAGAAAAGGAGTAGACACACTCATCTACAGAGCAAAAAGGTAACACCCCTACAATGGACTCTGACAAGATTGTCTTCAAAGTCCATAATCAGTTGGTGTCTGTAAAGCCAGAGGTGATTGTTGATCAATATGAGTACAAATATCCTGCTATCAGAGATCAGAAGAAACCTAGCATAACTCTGGGGAAAGCTCCTGATTTAAACAAGGCTTACAAATCTATTTTGTCAGGAATAAATGCGGCTAGATTGGATCCCGATGATGTATGTTCCTACCTAGCAGCAGCTATGGAACTGTTTGAAGGAATTTGCCCTGAAGACTGGCTAAGCTATGGGATTCTCATAGCAAGAAAGGGGGAGAAGATTACCCCTGCCACCTTGGTGAACATTCAGAGAACGAACATTGAAGGCAACTGGGCCTTGACCGGAGGATACGACCTTACAAGGGATCCAACTGTGGCCGAACATGCATCTCTAGTGGGCCTTCTGCTCTGCTTGTATAGACTAAGCAAGGTCTCCGGGCAGAACACAGGGAATTATAAGACTAACATAGCCGATCGAATGGAGCAAATCTTTGAGACCGCTCCTTTTGTCAAAATCGTGGAGCATCATACCTTAATGACCACTCACAAAATGTGTGCCAATTGGAGTACAATCCCAAATTTTAGGTTTCTTGCAGGCACATATGATATGTTCTTTTCTAGGATAGAGCATTTATTTTCTGCAATCCGGGTCGGAACTGTAGTGACGGCATATGAAGATTGTTCTGGACTGGTCTCTTTCACAGGATTCATCAAACAAATAAATTTGACAGCTAGGGAGGCTATATTGTATTTCTTCCACAAGAATTTTGAAGAGGAAATCAAGAGGATGTTTGAACCAGGGCAAGAGACTGCAGTTCCACACTCTTATTTTATACATTTCAGGTCCTTAGGATTGAGTGGGAAGTCTCCTTATTCCTCAAATGCAGTAGGTCATGTGTTTAATCTGATCCATTTCGTTGGCTGTTACATGGGTCAAATCAGATCTCTAAATGCTACTGTTATCTCTAGTTGTGCACCACATGAAATGTCTGTGTTAGGGGGTTATCTGGGGGAGGAATTCTTTGGCAAGGGAACATTCGAGAGGAGGTTCTTCAGAGACGAAAAGGAGCTCCGAGATTATGAAGCCGCAGAGTCTGTCAAAAACGACGTCGCACTGGCAGATGATGGAACCGTCAACTCAGATGATGAGGACTTTTTTTCTGGGGAAACGAGAAGTCCGGAGGCCGTGTATGCGAAGATCATGATGAACGGGGGAAAATTGAAAAAGTCTCACATCCGGCGATATGTATCAGTCAGCTCAAACCACCAGGCCAGACCGAACTCCTTTGCAGAATTTTTGAACAAAACTTACCTAGGTGATCAGAGATAATCGAACCAGTGCCTCCCCTCAATCCGTCCCGCTGCTTCTCCAGACGAAACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCCTCAAATTCATTCCCGTCATGAGCAAAATCTTTGTAAATCCTAGTGCAATTCGTGCAGGACTGGCAGACCTTGAGATGGCTGAAGAGACAGTTGATTTGATCAACAGGAATCTTGAGGACAACCAGGCTCATCTTCAAGGAGAGCCCATCGAAGTGGATGCTCTTCCAGAGGATATGAGAAGGCTCCAGATAAGTGAACATGCACCTTGTCACCCGTCAGAGGGTGCCTGCAAGAAAGAAGAAGGGAGCGACGATGACTTCTACATGGCGGAGAGTGAGGACCCATATGTACCTCTTCAGTCCTATCTAGACAGTGTGGGAATTCAGATCGTGAGGCAGATGAAGACTGGGGAGAGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAGACCGTAGAAGAGATCATATCATATGTGACTGTCAACTTTCCTCTGCCATCTGGAAGACCAACTGAGGACAAATCTACCCAGACTGTAGGGGAGAAGCCTAGGTCAAATGTCCAGCAGGGATCTGCCAAGAAAGAGGATCACCTGTCTAAGGCCAAAATGACCTCCCAAGAAGCATCTGGGCCTCCGGCGCTCGAGTGGTCCACTACCAACGATGAAGATGATGCATCAATAGAAGCAGAGATAGCCCATCAGATTGCAGAAAGTTTCTCGAAGAAATATAAATTCCCTTCTAGATCTTCTGGGATATTTCTATATAACTTTGAGCAACTGAAGATGAATCTAGATGACATCGTGGGAGAGGCCAAAAAGATCCCCGGTGTGACCAGACTGGCTCAAGATGGTCTTAAGCTCCCACTCAGGTGTATATTAGGAGGGGTGGCCTCAACCCATTCAAAGAAGTTCCAACTCCTGGTTGGTTCCGATAAGCTGGGCAAAATCATGCAGGACGATCTCAACCGATATCTGGCTTATTAACTTATCCCCCAAGGATTCCTTCACCCCACAAGATCATCCAGAGCCTCATCTGACTCATGAAAAAAACAGGCAACACCACTGACGCAATGAATTTCTTCCGAAAGATAGTGAAAAGTTGCAAAGATGAGGAGGATCAAAAGCCAGCTCTGATGTCGGCTCCACCAGATGATGACGATCTGTGGCTTCCCCCGCCGGAGTATGTACCTTTGACCGAGATCACAGCTAAAAAGAATATGAGGAACTTTTGTGTCAATGGCGAGATTAAGATTTGCAGCCCCAACGGGTATTCTTTTAGGATCCTGAGACATATTCTGAGGTCTTTTGATGGAGTCTATTCTGGAAATCGGAGAATGATAGGACTTGTCAAGGTTGTGATCGGTCTAGCCCTCTCAGGTGCTCCGGTCCCGGAGGGGATGAACTGGGTCTACAAGATAAGACGCACCCCTGTTTTCCAATGGGCAGAGTCTCACGGCCCACTAGATGGAGAAGAGCTAGAATACTCACAGGAGATAACCTGGGATGATGATTCAGAGTTCATAGGTTTGCAAATAAGGATAAGTGCAAGGCAATGTCATATCCAAGGACGGATCTGGTGCATCAACATGAACTCCAGGGCATGTCAGTTATGGTCAGATATGTCTCTCAAGACCCAGCAGGCTGACGAGGACAGGAACACCTCTTTGTTGCTAGAATGACCTCCCCTTTACATAGCACCTTACTCAGTTACCTCTACACAAGGATGTACATGATTTTATCCTCCACCTTTTATGAGCAATAGAACAAAAATATGTAATGGTGCCACTCTACCGCTGCATTTTATTGAGACACCCTATTAAACATCTTCACATGTGAAACCTCTGCAATGTGAAAAAAACATTTAACATCCCTCAAGGATCCAAGGCACCATGCCAACTCAAGCCGTCCTCTCTGCATTTCTCGCAACAATCACAATTTGTGTAGGGAAATTCCCCATCTACACAATCCCCGATAAACTGGGTCCCTGGAGCCCCATTGACATCAATCACCTCAGCTGCCCAAACAATCTTGTCGTGGAAGATGAGGGGTGTACGAACCTGTCCGGGTTCACATATATGGAGCTAAAGGTCGGATACATAACAACAATAAAGGTGAGCGGATTTACATGTACAGGAGTGGTCACGGAAGCCGAGACTTACACCAACTTTGTAGGTTATGTCACAACCACTTTCAAGAGAAAGCACTTCCGTCCACGTCCTGATGCATGTAGGGAAGCTTATGATTGGAAGACCGCAGGAGACCCTAGATACGAGGAGTCATTGCATAACCCATATCCTGATTCCCATTGGCTGAGAACAGTCACCACCACGAAAGAGTCATTCCTGATAATAGGGCCAAGTGTGGCGGACATGGACGCCTATGACAAGTCTCTTTATTCCAAGATATTCCCAGATGGGAAATGTTCTGGAATCTCTGCTGTCTCTCCCTTCTGCCCGACGAACCATGAATATACAATATGGATGTCCGAGAATCAAAAGCCCGGTATGTCCTGTGACATATTCACCACTAGCAAGGGGAAGAAGGCCACGAAAAATGGCAAAATGTGTGGGTTTGTTGACGAGAGAGGATTATACAAATCCCTCAAAGGAGCCTGCAAACTGAAACTGTGCGGTGTCTCCGGCTTGAGACTAATGGACGGATCTTGGGTCTCTGTTCAGAACCCGGAGGATGCAAAATGGTGCTCTCCCGACCAGCTGGTGAACATTCATGACTTCCACTCAGATGAGGTTGAACATCTTATTGTGGAGGAGCTTGTTAAAAAGAGAGAAGAGTGTCTGGATGCTCTGGAATCAATCATGACCACCAAATCAGTAAGCTTCCGGCGATTGAGTCACTTGAGAAAGCTTGTTCCTGGATTTGGGAAGGCTTACACCATTATCAATAAAACCTTGATGGAGGCAGATGCCCACTACAAGTCAATTAGGCAATGGACAGAGATAATCCCTTCAAAGGGGTGTTTAATGGCAGGAGGGAGATGCTATCCTCACCATAATGGGGTCTTCTTCAACGGGATAATCCTCAGCCCGGATGGCCACGTGTTGATTCCAGAGATGCAATCTGCTTTGCTTCAGCAGCATATAGAGCTGCTGGAGTCATCTGTTATACCCCTCATGCATCCCCTGGCTGATCCCTCAACTGCCCTTAAAGGGGGAGACGGAGCAGAGGACTTTGTAGAGATCCATCTCCCCGATGTGCAAAAACAAATCTCGGGGATTGACTTGGGTCTCCCTGAGTGGAAGAGGTATTTCTTAATGGGGGTATCTGCTTTGGCCCTGCTTGCCTTAACAATAATTCTCGCCACGTGTTGTAAACGGATAAGGAGGAAAAAGAAGATGAAGTCAAGTCCTGTGGAGTTGATTCGAAAGGTGTCTGTGACCTCTCAAAGCGGGAAGGTAGTTCCATCGTGGGAATCTTATAAGGTTGATGCAGGAGGTCAAGCTTAGGTTCTGATCACATGGTTGACGATCAGAATATATAACAATCTATGCCTATTTAAATCAAGGGGTGTTAAGCCATGAGATCCTCCTGATGTCATCCTCAGTTCTGGAAAGG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| 72,461
|
KC169985.1
|
Lyssavirus bokeloh
|
Picard-Meyer,E., Servat,A., Robardet,E., Moinet,M., Borel,C., Cliquet,F.
|
Anses Nancy, Lyssavirus Unit
|
France
|
2013-06-19
|
129700
|
Lyssavirus bokeloh
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,830
|
GenBank
| 1
|
France
|
France
|
Myotis nattereri
|
brain
|
2012
| null | null |
Lyssavirus bokeloh isolate 129700, complete genome
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CGCTTAACGACAAAATCAGAAAAAGAGTAGACACACTCATCTACAGAGCAAAAAGGTAACACCCCTACAATGGACTCTGACAAGATTGTCTTCAAAGTTCATAATCAGTTGGTGTCTGTAAAGCCAGAGGTAATTGTTGATCAATATGAGTACAAATATCCTGCTATCAGAGATCAGAAGAAACCTAGCATAACTCTGGGGAAAGCTCCTGATTTAAACAAGGCTTACAAATCTATATTGTCAGGAATAAATGCGGCTAGATTGGATCCCGATGATGTATGTTCCTACCTAGCGGCAGCTATGGAACTGTTTGAAGGAATTTGCCCTGAAGATTGGCTAAGTTATGGGATTCTCATAGCAAGAAAGGGGGAGAAGATTACCCCTGCCACCTTGGTGAACATTCAGAGAACGAACATTGAAGGCAACTGGGCCTTGACCGGAGGATACGACCTTACAAGGGATCCAACTGTGGCCGAACATGCATCTCTAGTGGGCCTTCTGCTCTGCTTGTATAGACTGAGCAAGGTCTCCGGGCAGAACACAGGGAATTATAAGACTAACATAGCCGATCGAATGGAGCAAATCTTTGAGACCGCTCCTTTTGTCAAAATCGTGGAGCATCATACCTTAATGACCACTCACAAAATGTGTGCCAATTGGAGTACAATCCCAAATTTTAGGTTTCTTGCAGGCACATATGATATGTTCTTTTCTAGGATAGAGCATTTATTTTCTGCAATCCGAGTCGGAACTGTAGTGACGGCATATGAAGATTGTTCTGGACTGGTCTCTTTCACAGGATTCATCAAACAAATAAATTTGACGGCTAGGGAAGCTATATTGTATTTCTTCCACAAGAATTTTGAAGAGGAAATCAAGAGGATGTTTGAACCAGGGCAAGAGACTGCAGTTCCACACTCTTATTTTATACATTTCAGGTCCTTAGGATTGAGTGGGAAGTCTCCTTATTCCTCAAATGCAGTAGGTCATGTGTTTAATCTGATCCATTTCGTTGGCTGTTACATGGGTCAAATCAGATCTCTAAATGCTACTGTTATCTCTAGTTGTGCACCACATGAAATGTCTGTGTTAGGGGGTTATCTGGGGGAGGAATTCTTTGGCAAGGGAACATTCGAGAGGAGGTTCTTCAGAGACGAAAAGGAGCTCCGGGATTATGAAGCCGTGGAGTCTGTCAAAAACGACGTTGCACTGGCAGATGACGGAACCGTCAACTCAGATGATGAGGACTTTTTTTCTGGGGAAACGAGAAGTCCGGAGGCCGTGTATGCGAAGATCATGATGAACGGGGGAAAATTGAAAAAGTCTCACATCCGGCGATATGTATCAGTCAGCTCAAACCACCAGGCCAGACCGAACTCCTTTGCAGAATTTTTGAACAAAACTTACCTAGGTGATCAGAGATAATTGAACCAGTGCCTCCCCTCAATCCGTCCCGCTGCTTCTCCAGACGAAACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCCTCAAATTCATTCCCGTCATGAGCAAAATCTTTGTAAATCCTAGTGCAATTCGTGCAGGACTGGCAGACCTTGAGATGGCTGAAGAGACAGTTGATTTGATCAACAAGAATCTCGAGGACAACCAGGCTCATCTTCAAGGAGAGCCCATCGAAGTGGATGCTCTTCCAGAGGATATGAGAAGGCTCCAGATAAGTGAGCATGCACCTTGTCACCCGTCAGAGGGTGCCTGCAAGAAAGAAGAAGGAAGCGACGATGACTTCTACATGGCGGAGAGTGAGGACCCATATGTACCTCTTCAGTCCTATCTAGACAGTGTGGGAATTCAGATCGTGAGGCAGATGAAGACTGGGGAGAGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAGACCGTAGAAGAGATCATATCATATGTGACTGTTAACTTTCCTCTGCCATCTGGAAGACCAACTGAGGACAAATCTACCCAGACTGTAGGGGAGAAGCCTAGGTCAAATGTCCAGCAGGGATCTGCCAAGAAAGAGGATCACCTGTCCAAGGCCAAGATGACCTCCCAAGAAGCATCTGGGCCTCCGGCGCTTGAGTGGTCCACTACCAACGATGATGATGATGCATCAATAGAAGCAGAGATAGCCCATCAGATTGCAGAAAGTTTCTCGAAGAAGTATAAATTCCCTTCTAGATCTTCTGGGATATTTCTATATAACTTTGAGCAACTGAAGATGAATCTGGATGACATCGTGGGAGAGGCCAAAAAGATCCCCGGTGTGACCAGACTGGCTCAAGATGGTCTTAAGCTCCCACTCAGGTGTATATTAGGAGGGGTGGCCTCAACCCACTCAAAGAAGTTCCAACTCCTGGTTGGTTCCGATAAGCTGGGCAAAATCATGCAGGACGATCTCAACCGATATCTGGCTTATTAACTTATCCCCCAAGGATCCTTTCACCCCACAAGATCGTCCAGAGCCTCATCTGACTCATGAAAAAAACAGGTAACACCACTGACGCAATGAATTTCTTCCGAAAGATAGTGAAAAGTTGCAAAGATGAGGAGGATCAAAAGCCAGCTCTGATGTCGGCTCCACCAGATGGTGACGATCTGTGGCTTCCCCCGCCGGAGTATGTACCTCTGACCGAGATCACAGCTAAAAAGAATATGCGGAACTTTTGTGTCAATGGCGAGATTAAGATTTGCAGCCCCAACGGGTATTCCTTCAGGATCTTGAGACATATTCTGAGATCTTTTGATGGAGTCTATTCTGGAAATCGGAGAATGATAGGACTTGTCAAGGTTGTGATCGGTCTAGCCCTCTCAGGTGCTCCGGTCCCGGAGGGGATGAACTGGGTCTACAAGATAAGACGCACCCTTGTTTTCCAATGGGCAGAGTCTCACGGCCCACTAGATGGAGAAGAGCTAGAATACTCACAGGAGATAACCTGGGATGATGATTCAGAGTTCATAGGTTTGCAAATAAGGATAAGTGCAAGGCAATGTCATATCCAAGGACGGATCTGGTGCATCAACATGAACTCCAGGGCATGTCAGTTATGGTCAGATATGTCTCTCAAGACCCAGCAGGCTGACGAGGACAGGAACACCTCTTTGTTGCTAGAATGACCTCCCCTTTACATAGCACCTTACTCAGTTACCTCTACACAAGGATGTACATGATTTTATCCTCCACCTTTTATGAGCAATAGAACAAAAATATGTAATGGTGCCACTCTACCGCTGCATTTTATTGAGACACCCTATTGAACATCTTCACATGTGAAACCTTTGCAATGTGAAAAAAACATTTAACATCCCTCAAGGATCCAAGGCACCATGCCAACTCAAGCCGTCCTCCCTGCATTTCTCGCAACAATCACAATTTGTGTAGGGAAATTCCCCATCTACACAATCCCCGATAAACTGGGTCCCTGGAGCCCCATTGACATCAATCACCTCAGCTGCCCAAACAATCTTGTCGTGGAAGATGAGGGGTGTACGAACCTGTCCGGGTTCACATATATGGAGCTGAAGGTCGGATACATAACAACAATAAAGGTGAGCGGATTTACATGTACAGGAGTGGTCACTGAAGCCGAGACTTACACCAACTTTGTAGGTTATGTCACAACCACTTTCAAGAGAAAGCACTTCCGTCCACGTCCTGATGCATGTAGGGAAGCTTATGATTGGAAGACCGCAGGAGACCCTAGATACGAGGAGTCGTTGCATAACCCATATCCTGATTCCCATTGGCTGAGAACAGTCACCACCACGAAAGAGTCATTCCTGATAATAGGGCCAAGTGTGGCGGACATGGATGCCTATGACAAGTCTCTTTATTCCAAGATATTCCCAGATGGGAAATGTTCTGGAATCTCTGCTGTCTCTCCCTTCTGCCCGACGAACCATGAATATACAATATGGATGTCCGAGAATCAAAAGCCTGGTATGTCCTGTGACATATTCACCACTAGCAAGGGGAAGAAGGCCACGAAAAATGGCAAAATGTGTGGGTTTGTTGACGAGAGAGGATTATACAAATCCCTCAAAGGAGCCTGCAAACTGAAACTGTGCGGTGTCTCCGGCTTGAGACTAATGGACGGATCTTGGGTCTCTGTTCAGAACCCGGAGGATGCAAAATGGTGCTCTCCCGACCAGTTGGTGAACATTCATGACTTCCACTCAGATGAGGTTGAACATCTTATTGTGGAGGAGCTTGTTAAAAAGAGAGAAGAGTGTCTGGATGCTCTGGAATCAATCATGACCACCAAATCCGTAAGCTTCCGGCGATTGAGTCACTTGAGAAAGCTTGTTCCTGGATTTGGGAAGGCTTACACCATTATCAATAAAACCTTGATGGAGGCAGATGCCCACTACAAGTCAATTAGGCAATGGACTGAGATAATCCCTTCAAAGGGGTGTTTAATGGCAGGAGGGAGATGCTATCCTCACCATAATGGGGTCTTCTTCAACGGGATAATCCTCAGCCCGGATGGCCACGTACTGATTCCAGAGATGCAATCTGCTTTGCTTCAGCAGCATATAGAGCTGCTGGAGTCGTCTGTTATACCCCTCATGCATCCCCTGGCTGATCCCTCAACTGCCCTTAAAGGGGGAGACGGAGCAGAGGACTTTGTAGAGATCCATCTCCCCGATGTGCAAAAACAAATCTCGGGGATTGACTTGGGTCTCCCTGAATGGAAGAGGTATTTCTTAATGGGGGTATCTGCTTTGGCCCTGCTTGCCTTAACAATAATTCTCGCCACGTGTTGTAAACGGATAAGGAGGAAAAAGAAGATGAAGTCAAGTCCTGTGGAGTTGATTCGGAAGGTGTCTGTGACCTCTCAAAGCGGGAAGGTAGTTCCATCGTGGGAATCTTACAAGGTTGATGCAGGAGGTCATGCTTAGGTTCTGATCACATGGTTGACGATCAGAATATATAACAATCTATGCCTATTTAAATCAAGGGGTGTTAAGCCATGAGATCCTCCTGATGTCATCCTCAGTTCTGGGAAGGA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| 93,883
|
JF311903.1
|
Lyssavirus bokeloh
|
Freuling,C.M., Beer,M., Conraths,F.J., Finke,S., Hoffmann,B., Keller,B., Kliemt,J., Mettenleiter,T.C., Muhlbach,E., Teifke,J.P., Wohlsein,P., Muller,T., Mueller,T.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Epidemiology
|
Germany
|
2011-08-09
|
21961
|
Lyssavirus bokeloh
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,900
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Myotis nattereri
|
brain
|
2010
| null | null |
Bokeloh bat lyssavirus isolate 21961, complete genome
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ACGCTTAACGACAAAATCAGAAAAGGAGTAGACACACTCATCTACAGAGCAAAAAGGTAACACCCCTACAATGGACTCTGACAAGATTGTCTTCAAAGTCCATAATCAGTTGGTGTCTGTAAAGCCAGAGGTGATTGTTGATCAATATGAGTACAAATATCCTGCTATCAGAGATCAGAAGAAACCTAGCATAACTCTGGGGAAAGCTCCTGATTTAAACAAGGCTTACAAATCTATTTTGTCAGGAATAAATGCGGCTAGATTGGATCCCGATGATGTATGTTCCTACCTAGCAGCAGCTATGGAACTGTTTGAAGGAATTTGCCCTGAAGACTGGCTAAGCTATGGGATTCTCATAGCAAGAAAGGGGGAGAAGATTACCCCTGCCACCTTGGTGAACATTCAGAGAACGAACATTGAAGGCAACTGGGCCTTGACCGGAGGATACGACCTTACAAGGGATCCAACTGTGGCCGAACATGCATCTCTAGTGGGCCTTCTGCTCTGCTTGTATAGACTAAGCAAGGTCTCCGGGCAGAACACAGGGAATTATAAGACTAACATAGCCGATCGAATGGAGCAAATCTTTGAGACCGCTCCTTTTGTCAAAATCGTGGAGCATCATACCTTAATGACCACTCACAAAATGTGTGCCAATTGGAGTACAATCCCAAATTTTAGGTTTCTTGCAGGCACATATGATATGTTCTTTTCTAGGATAGAGCATTTATTTTCTGCAATCCGGGTCGGAACTGTAGTGACGGCATATGAAGATTGTTCTGGACTGGTCTCTTTCACAGGATTCATCAAACAAATAAATTTGACGGCTAGGGAGGCTATATTGTATTTCTTCCACAAGAATTTTGAAGAGGAAATCAAGAGGATGTTTGAACCAGGGCAAGAGACTGCAGTTCCACACTCTTATTTTATACATTTCAGGTCCTTAGGGTTGAGTGGGAAGTCTCCTTATTCCTCAAATGCAGTAGGTCATGTGTTTAATCTGATCCATTTCGTTGGCTGTTACATGGGTCAAATCAGATCTCTAAATGCTACTGTTATCTCTAGTTGTGCACCACATGAAATGTCTGTGTTAGGGGGTTATCTGGGGGAGGAATTCTTTGGCAAGGGAACATTCGAGAGGAGGTTCTTCAGAGACGAAAAGGAGCTCCGAGATTATGAAGCCGCAGAGTCTGTCAAAAACGACGTCGCACTGGCAGATGATGGAACCGTCAACTCAGATGATGAGGACTTTTTTTCTGGGGAAACGAGAAGTCCGGAGGCCGTGTATGCGAAGATCATGATGAACGGGGGAAAATTGAAAAAGTCTCACATCCGGCGATATGTATCAGTCAGCTCAAACCACCAGGCCAGACCGAACTCCTTTGCAGAATTTTTGAACAAAACTTACCTAGGTGATCAGAGATAATCGAACCAGTGCCTCCCCTCAATCCGTCCCGCTGCTTCTCCAGACGAAACAAGAAAAAAACTAACACCCCTCCCTCAAATTCATTCCCGTCATGAGCAAAATCTTTGTAAATCCTAGTGCAATTCGTGCAGGACTGGCAGACCTTGAGATGGCTGAAGAGACAGTTGATTTGATCAACAGGAATCTTGAGGACAACCAGGCTCATCTTCAAGGAGAGCCCATCGAAGTGGATGCTCTTCCAGAGGATATGAGAAGGCTCCAGATAAGTGAACATGCACCTTGTCACCCGTCAGAGGGTGCCTGCAAGAAAGAAGAAGGGAGCGACGATGACTTCTACATGGCGGAGAGTGAGGACCCATATGTACCTCTTCAGTCCTATCTAGACAGTGTGGGAATTCAGATCGTGAGGCAGATGAAGACTGGGGAGAGATTCTTCAAAATCTGGTCCCAGACCGTAGAAGAGATCATATCATATGTGACTGTCAACTTTCCTCTGCCATCTGGAAGACCAACTGAGGACAAATCTACCCAGACTGTAGGGGAGAAGCCTAGGTCAAATGTCCAGCAGGGATCTGCCAAGAAAGAGGATCACCTGTCTAAGGCCAAAATGACCTCCCAAGAAGCATCTGGGCCTCCGGCGCTCGAGTGGTCCACTACCAACGATGAAGATGATGCATCAATAGAAGCAGAGATAGCCCATCAGATTGCAGAAAGTTTCTCGAAGAAATATAAATTCCCTTCTAGATCTTCTGGGATATTTCTATATAACTTTGAGCAACTGAAGATGAATCTGGATGACATCGTGGGAGAGGCCAAAAAGATCCCAGGTGTGACCAGACTGGCTCAAGATGGTCTTAAGCTCCCACTCAGGTGTATATTAGGAGGGGTGGCCTCAACCCATTCAAAGAAGTTCCAACTCCTGGTTGGTTCCGATAAGCTGGGCAAAATCATGCAGGACGATCTCAACAGATATCTGGCTTATTAACTTATCCCCCAAGGATTCCTTCACCCCACAAGATCATCCAGAGCCTCATCTGACTCATGGAAAAAACAGGCAACACCACTGACGCAATGAATTTTTTCCGAAAGATAGTGAAAAGTTGCAAAGATGAGGAGGATCAAAAGCCAGCTCTGATGTCGGCTCCACCAGATGATGACGATCTGTGGCTTCCCCCGCCGGAGTATGTACCTTTGACCGAGATCACAGCTAAAAAGAATATGAGGAACTTTTGTGTCAATGGCGAGATTAAGATTTGCAGCCCCAACGGGTATTCCTTTAGGATCCTGAGACATATTCTGAGGTCTTTTGATGGAGTCTATTCTGGAAATCGGAGAATGATAGGACTTGTCAAGGTTGTGATCGGTCTAGCCCTCTCAGGTGCTCCGGTCCCGGAGGGGATGAACTGGGTCTACAAGATAAGACGCACCCTTGTTTTCCAATGGGCAGAGTCTCACGGCCCACTAGATGGAGAAGAGCTAGAATACTCACAGGAGATAACCTGGGATGATGATTCAGAGTTCATAGGTTTGCAAATAAGGATAAGTGCAAGGCAATGTCATATCCAAGGACGGATCTGGTGCATCAACATGAACTCCAGGGCATGTCAGTTATGGTCAGATATGTCTCTCAAGACCCAGCAGGCTGACGAGGACAGGAACACCTCTTTGTTGCTAGAATGACCTCCCCTTTACATAGCACCTTACTCAGTTACCTCTACACAAGGATGTACATGATTTTATCCTCCACCTTTTATGAGCAATAGAACAAAAATATGTAATGGTGCCACTCTACCGCTGCATTTTATTGAGACACCCTATTGAACATCTTCACATGTGAAACCTCTGCAATGTGAAAAAAACATTTAACATCCCTCAAGGATCCAAGGCACCATGCCAACTCAAGCCGTCCTCTCTGCATTTCTCGCAACAATCACAATTTGTGTAGGGAAATTCCCCATCTACACAATCCCCGATAAACTGGGTCCCTGGAGCCCCATTGACATCAATCACCTCAGCTGCCCAAACAATCTTGTCGTGGAAGATGAGGGGTGTACGAACCTGTCCGGGTTCACATATATGGAGCTAAAGGTCGGATACATAACAACAATAAAGGTGAGCGGATTTACATGTACAGGAGTGGTCACGGAAGCCGAGACTTACACCAACTTTGTAGGTTATGTCACAACCACTTTCAAGAGAAAGCACTTCCGTCCACGTCCTGATGCATGTAGGGAAGCTTATGATTGGAAGACCGCAGGAGACCCTAGATACGAGGAGTCATTGCATAACCCATATCCTGATTCCCATTGGCTGAGAACAGTCACCACCACGAAAGAGTCACTCCTGATAATAGGGCCAAGTGTGGCGGACATGGACGCCTATGACAAGTCTCTTTATTCCAAGATATTCCCAGATGGGAAATGTTCTGGAATCTCTGCTGTCTCTCCCTTCTGCCCGACGAACCATGAATATACAATATGGATGTCCGAGAATCAAAAGCCCGGTATGTCCTGTGACATATTCACCACTAGCAAGGGGAAGAAGGCCACGAAAAATGGCAAAATGTGTGGGTTTGTTGACGAGAGAGGATTATACAAATCCCTCAAAGGAGCCTGCAAACTGAAACTGTGCGGTGTCTCCGGCCTGAGACTAATGGACGGATCTTGGGTCTCTGTTCAGAACCCGGAGGATGCAAAATGGTGCTCTCCCGACCAGCTGGTGAACATTCATGACTTCCACTCAGATGAAGTTGAACATCTTATTGTGGAGGAGCTTGTTAAAAAGAGAGAAGAGTGTCTGGATGCTCTGGAATCAATCATGACCACCAAATCAGTAAGCTTCCGGCGATTGAGTCACTTGAGAAAGCTTGTTCCTGGATTTGGGAAGGCTTACACCATTATCAATAAAACCTTGATGGAGGCAGATGCCCACTACAAGTCAATTAGGCAATGGACTGAGATAATCCCTTCAAAGGGGTGTTTAATGGCAGGAGGGAGATGCTATCCTCACCATAATGGGGTCTTCTTCAACGGGATAATCCTCAGCCCGGATGGCCACGTGTTGATTCCAGAGATGCAATCTGCTTTGCTTCAGCAGCATATAGAGCTGCTGGAGTCATCTGTTATACCCCTCATGCATCCCCTGGCTGATCCCTCAACTGCCCTTAAAGGGGGAGACGGAGCAGAGGACTTTGTAGAGATCCATCTCCCCGATGTGCAAAAACAAATCTCGGGGATTGACTTGGGTCTCCCTGAGTGGAAGAGGTATTTCTTAATGGGGGTATCTGCTTTGGCCCTGCTTGCCTTAACAATAATTCTCGCCACGTGTTGTAAACGGATAAGGAGGAAAAAGAAGATGAAGTCAAGTCCTGTGGAGTTGATTCGAAAGGTGTCTGTGACCTCTCAAAGCGGGAAGGTAGTTCCATCGTGGGAATCTTATAAGGTTGATGCAGGAGGTCAAGCTTAGGTTCTGATCACATGGTTGACGATCAGAATATATAACAATCTATGCCTATTTAAATCAAGGGGTGTTAAGCCATGAGATCCTCCTGATGTCATCCTCAGTTCTGGAAAGG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| 98,378
|
NC_020810.1
|
Lyssavirus duvenhage
|
Delmas,O., Holmes,E.C., Talbi,C., Larrous,F., Dacheux,L., Bouchier,C., Bourhy,H.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2013-03-26
|
86132SA
|
Lyssavirus duvenhage
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,976
|
RefSeq
| 1
|
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
1971
| null |
PRJNA485481
|
Duvenhage virus isolate 86132SA, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCATAAAAGGGGCAGACATGTTCATTTGTATAACACAAATGTAACACCCCTACAATGGATGCTGAAAGAATTGTCTTTAAGGTCCGTAATCAGCTAGTCTCTGTAAAACCAGAGGTCATCTCTGATCAGTATGAGTACAAATATCCTGCTATTACTGATAAGAAGAAGCCTAGTATCACACTTGGAAGGGCTCCGGACTTGAAGACAGCATACAAGTCCATCTTGTCGGGGATGAATGCCGCCAAGCTGGATCCAGATGACGTATGTTCATACTTAGCAGGTGCTATGATTTTGTTTGAGGGTGTGTGTCCCGAAGATTGGGTTAGTTATGGAATCCACATTGCCCGGAAAGGCGATAAAATAACCCCTGCTACGTTAGTTGACATAGTTAGAACAAATACAGAGGGTAACTGGGCTCAGACGGGAGGTCAGGAATTAACTAGAGATCCAACAATCTCAGAACATGCATCATTGGTAGGACTTTTACTTTGCCTATATAGGTTAAGCAAAATTGTAGGACAGAACACAGGGAATTACAAGACGAATGTGGCTGACCGGATGGAACAGATTTTTGAAACTGCTCCATTTGTCAAGATAGTCGAGCACCACACATTAATGACCACTCACAAAATGTGTGCGAATTGGAGCACAATACCCAATTTTAGATTTCTTGCAGGAACATATGACATGTTCTTCTCCAGGGTGGATCATTTGTACTCGGCTATTAGGGTTGGGACGGTAGTCACTGCATATGAAGATTGTTCAGGTTTAGTCTCCTTTACTGGGTTTATCAAGCAGATTAACTTGACCGCTAGAGAAGCCATATTATACTTCTTTCACAAGAACTTTGAGGAGGAGATCAAAAGAATGTTTGAGCCCGGACAGGAGACTGCTGTGCCTCACTCCTACTTTATCCACTTTAGATCCTTAGGTCTTAGCGGCAAGTCTCCTTACTCCTCCAATGCTGTCGGACATGTGTTCAACTTGATCCATTTTGTAGGTTGTTACATGGGTCAAATCAGATCATTAAACGCTACAGTTATCCAAAGTTGTGCCCCGCATGAGATGTCCGTATTGGGAGGTTATTTGGGAGAGGAATTCTTCGGAAAGGGGACCTTTGAGAGACGATTCTTTCGGGACGAGAAAGAGCTGCAAGACTATGAAGAAGCAGAGGCCACTAAGATTGAGGCTGCATTGGCTGATGATGGAACTGTGAACTCCGACGATGAAGACTTTTTCTCCGGAGATACGAGAAGTCCAGAAGCTGTTTACACAAGGATCATGATGAACGGAGGGCGGTTAAAGGGGGCACACATAAGAAGGTACGTCTCTGTAAGTTCTAGTCACCAAGCAAGACCAAACTCCTTTGCAGAGTTCCTCAACAAGACCTACTCCAGTGACTCCAGATAAGACTCTGCTCAAAGCAAAACAATGAGGCATCAATTCCGCTCAATTAGACATGAAAAAAACTAACACCACTCCGCAGGTCCATCAATCATCATGAGCAAGATTTTTATCAATCCTAGTGACATTCGATCAGGACTTGCAGATCTTGAGATGGCTGAAGAGACCGTCGAATTGGTCAACCGGAACATGGAAGACAGTCAAGCTCATCTCCAAGGGGTCCCCATAGATGTGGAGACCCTCCCTGAGGATATTCAGAGACTCCATATCACAGATCCTCAAGCCAGCCTCCGACAGGATATGGTTGATGAGCAAAAACACCAGGAGGATGAGGACTTTTACCTTACAGGAAGAGAAAACCCTCTTTCTCCGTTTCAGACACATCTTGATGCTATAGGACTTCGCATTGTGAGGAAGATGAAGACAGGGGAAGGTTTTTTCAAGATATGGTCACAGGCAGTGGAGGACATCGTCTCTTATGTAGCCCTTAACTTCTCCATTCCAGTGAACAAGCTGTTTGAAGACAAGTCCACCCAGACTGTTACTGAAAAGTCTCAACAGGCCTCTGCCTCGTCGGCTCCAAATCGGCATGAGAAATCATCTCAGAACGCCAGGGTCAACTCCAAGGATGCATCAGGTCCTGCAGCTCTAGACTGGACTGCCAGCAATGAAGCAGATGACGAGTCAGTCGAAGCTGAGATAGCTCATCAGATTGCAGAAAGCTTCTCTAAAAAGTACAAGTTCCCGTCTAGATCCTCAGGGATTTTCTTATGGAACTTTGAACAATTGAAAATGAACTTGGATGAAATAGTTCGGGAGGTCAAGGAAATTCCCGGAGTGATCAAGATGGCGAAAGACGGGATGAAGCTGCCTCTCAGGTGTATGCTGGGAGGAGTGGCTTCTACCCACTCTCGAAGGTTCCAGATTCTCGTGAATCCGGAAAAACTTGGAAAAGTTATGCAGGAGGATCTTGACAAATACCTGACCTATTAGATTAGGTTTTGATAATACACAAGACAACCATCTCATTCAGTTGTAGCATAGTCATGAAAAAAACATGCAACACCACTGACAAAATGAACATCATCCGTAAGATAGTAAAAAGCTGCAAAGAGGAGGAGGAGCAAAAGCCCAGTCCGGTTTCAGCCCCCCCCGATGACGATGACCTGTGGCTTCCCCCTCCAGAGTATGTCCCTCTGTCAGAGATCGCCAATAAGAAGAACATGAGGAATTTCTGTGTCAATGGTGAAATTAAAGTGTGTAGTCCGAACGGGTATTCTTTTCGAATTCTTAGGCACATCTTAAGATCCTTTGAAGGGGTATATTCAGGGAACAGAAGAATGATTGGACTGGTTAAGGTGGTGATTGGATTGGCCTTGTCAGGGGCACCTGTCCCTGATGGGATGAACTGGGTTTACAAAATTAGACGCACTTTAATATTTCAATGGGCAGACTCATCAGGCCCTCTTGATGGTGAGGAACTTGAATACCCTCAGGAAATAACTTGGGATGATGATTCCGAGTTTGTAGGACTGCAAATAAGAGTGAGTGCAAGACAATGTCATATCCAAGGGAGAATTTGGTGTATCAACATGAACTCACGGGCGTGTCAACTCTGGTCTGACATGTCTCTCAAAACCCAGCAGTCTGATGAAGACAAGAACACCTCTCTCCTGTTGGAATGACTATCTATTAAGATCATTGTGCACTGATAGACACTGGTGACTTCCACTCGTCTCCGAGAGCAATAGAACAACATATGTTATGGTGCCACACAATAGCTGCATAACTCCAAACTTGTGATCCAGAGCCTTCCTAAGTAAGATCTTAGCAATGTGAAAAAAACAGGCAACACCCCTCAAGGAGTTCAAGCGCCATGCCACTCAATGCAGTCATCTTTACTCTTCTCCTCAGATGTTCCATCTGCCTTGGAAAGTTTCCCATTTATACGATCCCTGACAAATTGGGGCCATGGAGCCCTATAGACATACATCATCTCAGTTGCCCAAATAACTTGGTTGTGGAAGACGAAGGATGTACAACTCTCACCCCTTTTTCATACATGGAGTTAAAGGTAGGTTACATTACATCAATAAAGGTGTCCGGTTTTACCTGCACTGGGGTAGTGACTGAAGCTGAGACTTATACCAATTTCGTTGGGTATGTGACGACAACATTTAGAAGAAGACATTTCCGTCCATCAGTAAACTCTTGTAGAGATGCATACAATTGGAAGATCGCAGGAGACCCTAGGTATGAAGAATCACTACACAACCCTTATCCAGACTCTCACTGGCTCAGAACTGTCAAGACTACAAAAGAATCTCTTTTGATAATCTCCCCCAGCGTGGCTGACATGGATGCTTATGACAAGAAGCTTTACTCCAAGATGTTTCCTAACGGAAGGTGTTCGGAAATATCTCCTGGTTCCCCCTTTTGTCCCACCAATCACGAATACACTATCTGGATGCCCGAGAGCTCAAACCCCGGAATATCCTGTGACATATTCACAAGAAGCATGGGGAAGAAAGCCACCAAAGATGGACAGTTATGTGGGTTTGTAGATGAGAGAGGACTGTACAAATCTTTGAAGGGAGCTTGTAGATTAAGACTCTGTGGGATCAGCGGACTGAGACTGATGGACGGGTCATGGGTTTCACTCCCACAGGTTAACAACTCAGAATGGTGCTCCCCAGACCAACTCGTCAACATTCACGACTTCCATTCAGATGAGATAGAGCATCTTGTCGCAGATGAGTTGGTGAAAAAGAGAGAGGATTGTCTAGACGCCCTTGAAACTATCATCTTCACCAAATCTATAAGTTTCCGGCGGTTAAGCCGTCTTCGGAAGCTGGTTCCAGGCTTTGGTAAGGCATATACTATCATAAATAGGACCCTTATGGAAGCAGAGGCTCATTACAAGTCAGTGCGGGAGTGGAAGGAAATTATTCCATCCAAGGGGTGTCTGAAGGCAGGAGGGAGGTGCTATCCTCATCACAATGGAATTTTCTTCAACGGGATCATTCTGGGTCCGGGAGGGGAGATCTTGATCCCTGAGATGCAGTCTGCCTTGCTCCAACAGCACATTGAGCTGTTAGAGTCCTCTGTAGTTCCCCTCAAACACCCCCTGGCAGACCCTTCGACTGTCTTCAAGAATGATGATGAAGCGGAGAGTTTCGTAGATGTTCACCTTCCTGATACAAACCAAAAAATATCTGGAATTGACTTAGGGTTGCCAGAGTGGAAACGTTACTTCCTAATAGGAGTCTCAGCAGTTGCTTTGTTGGCTTTATCTATAATTATCGCTGTCTGTTGCAAAAGGTTCAGGAAAAGGAGGAAATCCAAACCCAGTCCAGTAGAATTGACTAGAAAAGTGTCTGTCATATCCAAAGGAAATGGACCGGTCCCTTCCTGGGAATCTTATAAAGAAGGAACCACAGGAGATGTTCGTAATACGACTCCATCAACAAGGGAGTGAGAGGCCGGATGATGCTTGAGGATGTCCAGATGGATACATTCTTTATGATTTACCTCATCACTTAAGAGCGGTACACTTGATTGATATAATGTTTGAAGATTT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| 7,026
|
OU524420.1
|
Lyssavirus duvenhage
| null |
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2021-12-01
|
12862
|
Lyssavirus duvenhage
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,971
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
1971
|
SAMEA9534572
|
PRJEB46947
|
Duvenhage lyssavirus isolate 12862 genome assembly, complete genome: monopartite
|
ACGCTTAACAACAAAATCATAAAAGGGGCAGACATGTTCATTTGTATAACACAAATGTAACACCCCTACAATGGATGCTGAAAGAATTGTCTTTAAGGTCCGTAATCAGCTAGTCTCTGTAAAACCAGAGGTCATCTCTGATCAGTATGAGTACAAATATCCTGCTATTACTGATAAGAAGAAGCCTAGTATCACACTTGGAAGGGCTCCGGACTTGAAGACAGCATACAAGTCCATCTTGTCGGGGATGAATGCCGCCAAGCTGGATCCAGATGACGTATGTTCATACTTAGCAGGTGCTATGATTTTGTTTGAGGGTGTGTGTCCCGAAGATTGGGTTAGTTATGGAATCCACATTGCCCGGAAAGGCGATAAAATAACCCCTGCTACGTTAGTTGACATAGTTAGAACAAATACAGAGGGTAACTGGGCTCAGACGGGAGGTCAGGATTTAACTAGAGATCCAACAATCTCAGAACATGCATCATTGGTAGGACTTTTACTTTGCCTATATAGGTTAAGCAAAATTGTAGGACAGAACACAGGGAATTACAAGACGAATGTGGCTGACCGGATGGAACAGATTTTTGAAACTGCTCCATTTGTCAAGATAGTCGAGCACCACACATTAATGACCACTCACAAAATGTGTGCGAATTGGAGCACAATACCCAATTTTAGATTTCTTGCAGGAACATATGACATGTTCTTCTCCAGGGTGGATCATTTGTACTCGGCTATTAGGGTTGGGACGGTAGTCACTGCATATGAAGATTGTTCAGGTTTAGTCTCCTTTACTGGGTTTATCAAGCAGATTAACTTGACCGCTAGAGAAGCCATATTATACTTCTTTCACAAGAACTTTGAGGAGGAGATCAAAAGAATGTTTGAGCCCGGACAGGAGACTGCTGTGCCTCACTCCTACTTTATCCACTTTAGATCCTTAGGTCTTAGCGGCAAGTCTCCTTACTCCTCCAATGCTGTCGGACATGTGTTCAACTTGATCCATTTTGTAGGTTGTTACATGGGTCAAATCAGATCATTAAACGCTACAGTTATCCAAAGTTGTGCCCCGCATGAGATGTCCGTATTGGGAGGTTATTTGGGAGAGGAATTCTTCGGAAAGGGGACCTTTGAGAGACGATTCTTTCGGGACGAGAAAGAGCTGCAAGACTATGAAGAAGCAGAGGCCACTAAGATTGAGGCTGCATTGGCTGATGATGGAACTGTGAACTCCGACGATGAAGACTTTTTCTCCGGAGATACAAGAAGTCCAGAAGCTGTTTACACAAGGATCATGATGAACGGAGGGCGGTTAAAGGGGGCACACATAAGAAGGTACGTCTCTGTAAGTTCTAGTCACCAAGCAAGACCAAACTCCTTTGCAGAGTTCCTCAACAAGACCTACTCCAGTGACTCCAGATAAGACTCTGCTCAAAGCAAAACAATGAGGCATCAATTCCGCTCAATTAGACATGAAAAAACTAACACCACTCCGCAGGTCCATCAATCATCATGAGCAAGATTTTTATCAATCCTAGTGACATTCGATCAGGACTTGCAGATCTTGAGATGGCTGAAGAGACCGTCGAATTGGTCAACCGGAACATGGAAGACAGTCAAGCTCATCTCCAAGGGGTCCCCATAGATGTGGAGACCCTCCCTGAGGATATTCAGAGACTCCATATCACAGATCCTCAAGCCAGCCTCCGACAGGATATGGTTGATGAGCAAAAACACCAGGAGGATGAGGACTTTTACCTTACAGGAAGAGAAAACCCTCTTTCTCCGTTTCAGACACATCTTGATGCTATAGGACTTCGCATTGTGAGGAAGATGAAGACAGGGGAAGGTTTTTTCAAGATATGGTCACAGGCAGTGGAGGACATCGTCTCTTATGTAGCCCTTAACTTCTCCATTCCAGTGAACAAGCTGTTTGAAGACAAGTCCACCCAGACTGTTACTGAAAAGTCTCAACAGGCCTCTGCCTCGTCGGCTCCAAATCGGCATGAGAAATCATCTCAGAACGCCAGGGTCAACTCCAAGGATGCATCAGGTCCTGCAGCTCTAGACTGGACTGCCAGCAATGAAGCAGATGACGAGTCAGTCGAAGCTGAGATAGCTCATCAGATTGCAGAAAGCTTCTCTAAAAAGTACAAGTTCCCGTCTAGATCCTCAGGGATTTTCTTATGGAACTTTGAACAATTGAAAATGAACTTGGATGAAATAGTTCGGGAGGTCAAGGAAATTCCCGGAGTGATCAAGATGGCGAAAGACGGGATGAAGCTGCCTCTCAGGTGTATGCTGGGAGGAGTGGCTTCTACCCACTCTCGAAGGTTCCAGATTCTCGTGAATCCGGAAAAACTTGGAAAAGTTATGCAGGAGGATCTTGACAAATACCTGACCTATTAGATTAGGTTTTGATAATACACAAGACAACCATCTCATTCAGTTGTAGCATAGTCATGGAAAAAACATGCAACACCACTGACAAAATGAACATCATCCGTAAGATAGTAAAAAGCTGCAAAGAGGAGGAGGAGCAAAAGCCCAGTCCGGTTTCAGCCCCCCCCGATGACGATGACCTGTGGCTTCCCCCTCCAGAGTATGTCCCTCTGTCAGAGATCGCCAATAAGAAGAACATGAGGAATTTCTGTGTCAATGGTGAAATTAAAGTGTGTAGTCCGAACGGGTATTCTTTTCGAATTCTTAGGCACATCTTAAGATCCTTTGAAGGGGTATATTCAGGGAACAGAAGAATGATTGGACTGGTTAAGGTGGTGATTGGATTGGCCTTGTCAGGGGCACCTGTCCCTGATGGGATGAACTGGGTTTACAAAATTAGACGCACTTTAATATTTCAATGGGCAGACTCATCAGGCCCTCTTGATGGTGAGGAACTTGAATACTCTCAGGAAATAACTTGGGATGATGATTCCGAGTTTGTAGGACTGCAAATAAGAGTGAGTGCAAGACAATGTCATATCCAAGGGAGAATTTGGTGTATCAACATGAACTCACGGGCGTGTCAACTCTGGTCTGACATGTCTCTCAAAACCCAGCAGTCTGATGAAGACAAGAACACCTCTCTCCTGTTGGAATGACTATCTATTAAGATCATTGTGCACTGATAGACACTGGTGACTTCCACTCGTCTCCGCGAGCAATAGAACAACATATGTTATGGTGCCACACAATAGCTGCATAACTCCAAACTTGTGATCCAGAGCCTTCCTAAGTAAGATCTTAGCAATGTGAAAAAAACAGGCAACACCCCTCAAGGAGTTCAAGCGCCATGCCACTCAATGCAGTCATCTTTACTCTTCTCCTCAGATGTTCCATCTGCCTTGGAAAGTTTCCCATTTATACGATCCCTGACAAATTGGGGCCATGGAGCCCTATAGACATACATCATCTCAGTTGCCCAAATAACTTGGTTGTGGAAGACGAAGGATGTACAACTCTCACCCCTTTTTCATACATGGAGTTAAAGGTAGGTTACATTACATCAATAAAGGTGTCCGGTTTTACCTGCACTGGGGTAGTGACTGAAGCTGAGACTTATACCAATTTCGTTGGGTATGTGACGACAACATTTAGAAGAAGACATTTCCGTCCATCAGTAAACTCTTGTAGAGATGCATACAATTGGAAGATCGCAGGAGACCCTAGGTATGAAGAATCACTACACAACCCTTATCCAGACTCTCACTGGCTCAGAACTGTCAAGACTACAAAAGAATCTCTTTTGATAATCTCCCCCAGCGTGGCTGACATGGATGCTTATGACAAGAAGCTTTACTCCAAGATGTTTCCTAACGGAAGGTGTTCGGAAATATCTCCTGGTTCCCCCTTTTGTCCCACCAATCACGAATACACTATCTGGATGCCCGAGAGCTCAAACCCCGGAATATCCTGTGACATATTCACAAGAAGCATGGGGAAGAAAGCCACCAAAGATGGACAGTTATGTGGGTTTGTAGATGAGAGAGGACTGTACAAATCTTTGAAGGGAGCTTGTAGATTAAGACTCTGTGGGATCAGCGGACTGAGACTGATGGACGGGTCATGGGTTTCACTCCCACAGGTTAACAACTCAGAATGGTGCTCCCCAGACCAACTCGTCAACATTCACGACTTCCATTCAGATGAGATAGAGCATCTTGTCGCAGATGAGTTGGTGAAAAAGAGAGAGGATTGTCTAGACGCCCTTGAAACTATCATCTTCACCAAATCTATAAGTTTCCGGCGGTTAAGCCATCTTCGGAAGCTGGTTCCAGGCTTTGGTAAAGCATATACTATCATAAATAGGACCCTTATGGAAGCAGAGGCTCATTACAAGTCAGTGCGGGAGTGGAAGGAAATTATTCCATCCAAGGGGTGTCTGAAGGCAGGAGGGAGGTGCTATCCTCATCACAATGGAATTTTCTTCAACGGGATCATTCTGGGTCCGGGAGGGGAGATCTTGATCCCTGAGATGCAGTCTGCCTTGCTCCAACAGCACATTGAGCTGTTAGAGTCCTCTGTAGTTCCCCTCAAACACCCCCTGGCAGACCCTTCGACTGTCTTCAAGAATGATGATGAAGCGGAGAGTTTCGTAGATGTTCACCTTCCTGATACAAACCAAAAAATATCTGGAATTGACTTAGGGTTGCCAGAGTGGAAACGTTACTTCCTAATAGGAGTCTCAGCAGTTGCTTTGTTGGCTTTATCTATAATTATCGCTGTCTGTTGCAAAAGGTTCAGGAAAAGGAGGAAATCCAAACCCAGTCCAGTAGAATTGACTAGAAAAGTGTCTGTCATATCCAAAGGAAATGGACCGGTCCCTTCCTGGGAATCTTATAAAGAAGGAACCACAGGAGATGTTCGTAATACGACTCCATCAACAAGGGAGTGAGAGGCCGGATGATGCTTGAGGATGTCCAGATGGATACATTCTTTATGATTTACCTCATCACTTAAGAGCGGTACACTTGATTGATATAATGTTTGAAGATTTA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| 35,650
|
JN986749.1
|
Lyssavirus duvenhage
|
Koraka,P., Martina,B.E., Roose,J.M., van Thiel,P.P., van Amerongen,G., Kuiken,T., Osterhaus,A.D.
|
ErasmusMC, Dept. of Virology
|
Netherlands
|
2012-06-04
|
NL07
|
Lyssavirus duvenhage
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,977
|
GenBank
| 1
|
Netherlands
|
Netherlands
|
Homo sapiens
| null |
2007
| null | null |
Duvenhage virus isolate NL07, complete genome
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ACGCTTAACAACAAAATCAGAGAAGGGGCAGACATGTTCATTTGTATAACACAAATGTAACACCCCTACAATGGATGCCGAAAGAATTGTCTTTAAAGTCCGTAATCAGCTAGTCTCTGTGAAACCGGAGGTCATCTCAGATCAGTATGAGTATAAGTATCCTGCTATTACTGACAAGAAGAAGCCAAGTATCACACTTGGAAGGGCTCCAGATTTAAAGACAGCATACAAGTCCATCCTATCGGGAATGAATGCTGCAAAGCTGGACCCGGATGACGTGTGTTCATACCTAGCAGGTGCCATGGTTTTATTTGAGGGAGTGTGTCCCGAAGACTGGTTTAGTTATGGGATCCATATTGCCCGGAAAGGTGACAAAATAACCCCGGCTACGTTAGTTGATATAGTTAGAACAAATACAGAGGGTAACTGGGCTCAAACAGGAGGTCAAGACCTGACTAGAGATCCAACTATCTCCGAACATGCATCATTGGTAGGACTCTTGCTCTGCCTATATAGGTTGAGCAAAATCGTAGGACAAAATACAGGGAATTACAAGACGAATGTGGCAGACAGGATGGAACAGATTTTTGAAACCGCCCCATTTGTTAAGATAGTCGAACACCACACCTTGATGACCACTCACAAAATGTGTGCCAATTGGAGCACAATACCCAATTTTAGATTTCTTGCAGGGACTTATGACATGTTTTTCTCTAGGGTGGACCATTTGTACTCGGCGATTAGGGTTGGGACGGTAGTCACTGCATATGAAGATTGTTCAGGTTTAGTCTCCTTTACCGGGTTCATCAAGCAGATTAATTTGACTGCCAGAGAAGCTATATTATACTTCTTTCATAAGAACTTTGAGGAGGAAATCAAAAGAATGTTTGAACCCGGACAGGAGACTGCTGTACCTCACTCTTATTTCATTCACTTCAGATCCTTGGGTCTTAGCGGCAAGTCTCCTTACTCCTCCAATGCTGTTGGACATGTATTCAACTTGATTCATTTTGTGGGTTGTTACATGGGTCAAATTAGATCGTTAAACGCTACTGTCATCCAAAGTTGTGCCCCACATGAGATGTCCGTGTTGGGAGGTTATTTAGGAGAGGAATTCTTCGGAAAGGGGACTTTTGAGAGACGGTTCTTTCGGGATGAGAAAGAGCTACAAGACTATGAAGAAGCAGAGGCCACTAAGATTGAGGCTGCATTGGCTGATGATGGAACTGTGAACTCTGACGACGAAGACTTTTTCTCCGGAGATACACGAAGTCCAGAAGCTGTTTATACAAGGATCATGATGAATGGGGGGCGGCTAAAAGGGGCACATATAAGAAGGTATGTCTCTGTGAGTTCTAGTCACCAGGCAAGACCAAACTCCTTTGCAGAGTTCCTCAACAAGACCTATTCTAGTGACTCCAGATAAAACTCTGCCCCAGACTAAATAATGGGACATCAATCCTGCTCAATTGGGCATGAAAAAAACTAACACCACTCCGCTGGTCCATCAATCATCATGAGCAAGATTTTCATCAATCCTAGTGATATTCGATCAGGACTTGCTGATCTTGAGATGGCTGAAGAGACAGTCGATTTGGTCAACCGGAACATGGAAGATAGTCAGGCTCATCTCCAAGGAGTTCCTATAGATGTGGAGACCCTCCCTGAAGATATTCGAAGACTCCATATCACCGATCCTCAAGCCAGTCTCAGACAGGAGATGATTGAGGAGCAAAAACATCAAGAGGATGAGGACTTTTATCTTACAGAAAGAGAAAACCCTCTGTCTTCGTTTCAGACGCATCTTGATGCTGTAGGACTTCGAATTGTGAGGAAGATGAAGACAGGGGAAGGGTTTTTCAAGATATGGTCACAGGCAGTGGAGGACATCGTCTCTTATGTAGCCCTCAACTTCTCCATTCCAGTGAACAAGCTTTTTGAAGATAAGTCCACTCAGACTGTCACTGAAAAGTCTCAACAGGTCTCTGCCTCGTCGGCTCCCAGTCGACATGACAAATCATCTCAAGGTGCCAGGGTCGACTCCAAAGATGCATCAGGTCCTCCAGCTTTAGACTGGACTGTCAGTAATGAAGCAGATGACGAGTCAGTTGAAGCTGAGATAGCTCATCAGATTGCAGAAAGTTTCTCTAAAAAGTACAAGTTCCCATCTAGATCCTCAGGGATTTTCTTATGGAACTTTGAACAGTTGAAAATGAATCTAGATGAAATAGTTCGAGAGGTCAAGGAAATTCCCGGAGTGATCAAGATGGCGAAAGATGGGATGAAGCTGCCTCTTAGATGTATGTTGGGGGGGGTGGCTTCCACCCACTCCCGAAGGTTCCAAATTCTCGTGAACCCAGAAAAACTTGGGAAAGTTATGCAGGAGGACCTTGACAAATACCTTACCTATTAGATTGAGTTTTGAAAACACACATGATGATCATTTAATCCAATTGTAGCACAGCCATGAAAAGAACATGTAACACCACTGACAAAATGAACATCATCCGTAAGATAGTAAAGAGCTGCAAAGAAGAGGACGAGCAAAAGCCCAGTCCGGTTTCAGCCCCCCCTGATGACGATGATCTCTGGCTTCCCCCTCCAGAGTATGTCCCTCTGTCAGAGATTACTAATAAGAAGAACATGAGAAATTTCTGTGTCAACGGTGAAATTAAAGTGTGTAGCCCGAACGGGTATTCTTTTCGGATTCTTAGACACATCTTGAGATCCTTTGAGGGGGTATATTCAGGGAATAGAAGAATGATTGGACTGGTCAAAGTGGTGATCGGATTGGCCTTGTCAGGGGCACCTGTTCCTGATGGGATGAACTGGGTTTATAAAATTAGACGCACTTTAATATTTCAATGGGCAGACTCATCAGGCCCTCTTGATGGTGAGGAACTTGAATACTCTCAGGAAATAACTTGGGATGATGATTCTGAGTTTGTAGGATTACAAATAAGAGTGAGTGCGAGACAGTGTCATATTCAAGGGAGAATCTGGTGTATCAACATGAACTCACGAGCGTGTCAACTTTGGTCCGACATGTCTCTCAAAACCCAGCAGTCTGATGAAGACAAGAACACCTCTCTCCTGTTGGAATGACTATCTATTTAAAATCATTGTGCACTGATAGACACTGGTGACTTCCACTCGTCTCTGCGAGCAATAGAACAACATACGTTATGGTGCCACACAATAGCTGCATAACTTCAAACTTGTGATCCAGAGCCTTCCTAAGTAAGATCTTAGCAATGTGAAAAAAACAGGCAACACCCCTCAAGGAGTTCAAGCGCCATGCCTCTCAATGCAGTCATCCTTGCCTTTTTCCTCAGATGTTCCATCTGCTTTGGGAAGTTTCCCATTTATACAATCCCTGACAAGTTGGGGCCTTGGAGCCCTATAGACATACATCATCTTAGTTGCCCAAACAACTTAGTTGTGGAAGACGAAGGATGTACAACCCTCACCCCTTTCTCATACATGGAGTTAAAGGTAGGTTACATAACATCAATAAAAGTATCCGGTTTCACATGCACTGGGGTAGTGACTGAAGCTGAGACTTACACAAACTTCGTTGGGTATGTGACGACAACCTTTAGAAGAAGACACTTCCGTCCATCAGTCAACTCTTGTAGAGATGCATACAATTGGAAGATTGCAGGAGACCCTAGATATGAAGAATCGCTACACAACCCTTATCCAGACTCTCACTGGCTCAGAACCGTCAAGACTACAAAAGAATCTCTCTTAATAATCTCTCCCAGTGTGGCTGATATGGATGCCTATGACAAGAAACTTTATTCTAAAATGTTTCCCAATGGAAGGTGTCCAGAAATATCTCCAGGATCTCCCTTCTGTCCCACCAACCATGAATACACCCTCTGGATGCCTGAGAGCTCAAACCCCGGAATATCTTGTGACATATTCACAAGAAGTATGGGGAAGAAAGCCACCAAAAATGGACAGTTGTGTGGTTTTGTGGATGAGAGAGGATTGTACAAATCCTTAAAGGGGGCTTGTAGATTGAGACTCTGTGGAATAAGTGGGCTGAGACTGATGGACGGATCATGGGTTTCACTCCCACAGGTGAACAACTCAGAATGGTGCTCCCCAGACCAACTCGTCAACATTCATGACTTCCATGCAGATGAGATGGAGCATCTCATCGCCGACGAGTTGGTGAAAAAGAGAGAGGAATGTCTAGACGCCCTTGAAACTATCATCTTTACCAAGTCTATAAGTTTCCGGCGGTTGAGCTATCTTCGAAAGCTAGTTCCCGGCTTTGGGAAAGCATACACTATCATAAACAAGACTCTTATGGAAGCAGAGGCTCATTATAAGACAGTGAGAGAATGGAAAGAAATCATTCCATCCAAAGGGTGTCTAAAGGCAGGAGGGAGGTGTTACCCCCATCACAATGGAATCTTCTTTAATGGGATTATCCTGGGTCCGGGAGGAGAGATCTTAATCCCAGAGATGCAGTCTGCCTTACTCCAGCAGCACATTGAGCTGTTAGAGTCCTCCGTGGTTCCCCTGATACACCCCTTGGCAGACCCTTCGACTGTCTTCAAGAATGATGACGAGGCAGAGAATTTCGTAGAAGTTCACCTTCCTGATACAAACCAAAAAATATCTGGAATTGACTTAGGGCTGCCAGAGTGGAAACGTTACTTTCTGATAGGGGTCTCAGCAGTTGCTTTGTTGGCTTCATCTATAATCATCGCTGTCTGTTGCAAAAGGTTCAAGAAAAGGAGGAAATCCAAACCCAATCCAGTAGAGTTAACCCGGAAGGTGTCTGTTATATCCAAAGGAAATGGACCGGTCCCTTCCTGGGAGTCTTACAAAGAAGGGGCCACAGGAGAGCTTCGTAAGACTACTCCCTCAACAATAGATTGAGAGGTTGAATGATGCTTGAGGGTGTCCAGAACAATACATTCTTTATGATTTACCTCATCCACCCAAGAACGGTACATTTAACTGATATAATGTTTAAAGCT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| 96,917
|
EU623444.1
|
Lyssavirus duvenhage
|
van Eeden,C.
|
University of Pretoria, Microbiology and Plant Pathology
|
South Africa
|
2009-12-01
|
DUVVSA06
|
Lyssavirus duvenhage
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,975
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
|
brain
| null | null | null |
Duvenhage virus isolate DUVVSA06, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCATAAAAGGGGCAGACATGTTCATTTGTACAACACAAATGTAACACCCCTACAATGGATGCTGAAAGAATTGTCTTTAAGGTCCGTAATCAGCTAGTCTCTGTAAAACCAGAGGTCATCTCTGATCAGTATGAGTACAAATATCCTGCTATTACTGATAAGAAGAAGCCTAGTATCACACTTGGAAGGGCTCCGGACTTGAAGACAGCATACAAGTCCATCCTGTCGGGGATGAATGCCGCCAAGCTAGATCCAGATGACGTATGTTCATACTTAGCAGGTGCTATGATTTTGTTTGAGGGTGTGTGTCCTGAAGATTGGGTTAGTTATGGAATCCACATTGCCCGGAAAGGCGATAAAATAACCCCTGCTATGTTAGTTGACATAGTTAGAACAAATACAGAGGGTAACTGGGCTCAGACGGGAGGTCAGGATTTAACTGGAGATCCAACAATCTCAGAACATGCATCTTTGGTAGGACTTTTACTTTGCCTATATAGGTTAAGCAAAATTGTAGGACAGAACACAGGGAATTATAAGACGAATGTGGCTGACCGGATGGAACAGATTTTTGAAACTGCTCCATTTGTCAAGATAGTCGAGCACCACACATTAATGACCACTCACAAAATGTGTGCGAACTGGAGCACAATACCCAATTTTAGATTTCTTGCAGGAACATATGACATGTTCTTCTCCAGGGTGGATCATTTGTACTCGGCTATTAGGGTTGGGACGGTAGTTACTGCATATGAAGATTGTTCAGGTTTAGTCTCCTTTACTGGGTTTATCAAGCAGATTAACTTGACCGCTAGAGAAGCCATATTATACTTCTTTCACAAGAACTTTGAGGAGGAGATCAAAAGAATGTTTGAGCCCGGACAGGAGACTGCTGTGCCTCACTCCTACTTTATCCACTTTAGATCCTTAGGTCTTAGCGGCAAATCTCCTTACTCCTCCAATGCTGTCGGACATGTGTTCAACTTGATCCATTTTGTAGGTTGTTACATGGGTCAAATCAGATCACTAAACGCTACAGTTATCCAAAGTTGTGCCCCGCATGAGATGTCCGTATTGGGAGGTTATTTGGGAGAGGAATTCTTCGGAAAGGGGACCTTTGAGAGACGATTCTTTCGGGACGAGAAAGAGCTGCAAGACTATGAAGAAGCAGAGGCCACTAAGATTGAGGCTGCATTGGCTGATGATGGAACTGTGAACTCCGACGATGAAGACTTTTTCTCCGGAGATACAAGAAGTCCAGAAGCTGTTTACACAAGGATCATGATGAACGGAGGGCGGTTAAAGGGGGCACACATAAGAAGGTACGTCTCTGTAAGTTCTAGTCACCAAGCAAGACCAAACTCCTTTGCAGAGTTCCTCAACAAGACCTACTCCAGTGACTCCAGATAAGACTCTGCTCAAAGCAAAACAATGAGGCATCAATTCCGCTCAATTAGACATGAAAAAAACTAACACCACTCCGCTGGTCCATCAGTCATCATGAGCAAGATTTTTATCAATCCTAGTGACATTCGATCAGGACTTGCAGATCTTGAGATGGCTGAAGAGACCGTCGAATTGGTCAACCGGAACATGGAAGACAGTCAAGCTCATCTCCAAGGGGTCCCCATAGATGTGGAGACCCTCCCTGAGGATATTCAGAGACTCCATATCACAGATCCTCAAGCCAGCCTCCGACAGGATATGGTTGATGAGCAAAAACACCGGGAGGATGAGGACTTTTACCTTACAGGAAGAGAAAACCCTCTTTCCCCGTTTCAGACACATCTTGATGCTATAGGGCTTCGCATTGTGAGGAAGATGAAGACAGGGGAAGGTTTTTTCAAGATATGGTCACAGGCAGTGGAGGACATCGTCTCTTATGTAGCCCTTAACTTCTCCATTCCAGTGAACAAGCTGTTTGAAGACAAGTCCACCCAGACTGTTACTGAAAAGTCTCAACAGGCCTCTGCCTCGTCGGCTCCAAATAGGCATGAGAAATCATCTCAGAGCGCCAGGGTCAACTCTAAGGATGCATCAGGTCCTGCAGCTCTAGACTGGACTGCCAGCAATGAAGCAGATGACGAGTCAGTCGAAGCTGAGATAGCTCATCAGATTGCAGAAAGCTTCTCTAAAAAGTACAAGTTCCCGTCTAGATCCTCAGGGATTTTCTTATGGAACTTTGAACAATTGAAAATGAACTTGGATGAAATAGTTCGGGAGGTCAAGGAAATTCCCGGAGTGATCAAGATGGCGAAAGACGGGATGAAGCTGCCTCTCAGGTGTATGTTGGGAGGAGTGGCTTCTACCCACTCTCGAAGGTTCCAGATTCTCGTGAATCCGGAAAAACTTGGAAAAGTTATGCAGGAGGATCTTGACAAATACCTGACCTATTAGATTAGGTTCTGATAATACACAAGACAACCATCTCATTCAGTTGTAGCATAGTCATGAAAAAAACATGCAACACCACTGACAAAATGAACATCATCCGTAAGATAGTAAAAAGCTGCAAAGAGGAGGAGGAGCAAAAGCCCAGTCCGGTTTCAGCCCCCCCCGATGATGATGACCTGTGGCTTCCCCCTCCAGAGTATGTCCCTCTGTCAGAGATCGCTAATAAGAAGAACATGAGGAATTTTTGTGTCAATGGTGAAATTAAAGTGTGTAGTCCGAACGGGTATTCTTTCCGAATTCTTAGGCACATCTTAAGATCCTTTGAAGGGGTATATTCAGGGAACAGAAGAATGATTGGACTGGTTAAGGTAGTGATTGGATTGGCTTTGTCAGGAGCACCTGTCCCTGATGGGATGAACTGGGTTTACAAAATTAGACGCACTTTAATATTTCAATGGGCAGACTCATCAGGCCCTCTTGATGGTGAGGAACTTGAATACTCTCAGGAAATAACTTGGGATGATGATTCCGAGTTTGTAGGACTGCAAATAAGAGTGAGCGCAAGACAATGTCATATCCAAGGGAGAATTTGGTGTATCAACATGAACTCACGGGCGTGTCAACTCTGGTCTGACATGTCTCTCAAAACCCAGCAGTCTGATGAAGACAAGAACACCTCTCTCCTGTTGGAATGACTATCTATTAGAATCATTGTGCACTGATAGATACTGGTGACTTCCACTCGTCTCCGCGAGCAATAGAACAACATATGTTATGGTGCCACACAATAGCTGCATAACTTCAAACTTGTGATCCAGAGCCTTCCTAAGTAAGATCTTAGCAATGTGAAAAAAACAGGCAACACCCCTCAAGGAGTTCAAGCACCATGCCACTCAATGCAGTCATCTTTACTCTTCTCCTCAGATGTTCCATCTGCCTTGGAAAGTTTCCCATTTATACGATCCCTGACAAATTGGGGCCATGGAGCCCTATAGACATACATCATCTCAGTTGCCCAAATAACTTGGTTGTGGAAGACGAAGGATGTACAACTTTAACCCCTTTTTCATACATGGAGTTAAAGGTAGGTTACATTACATCAATAAAGGTGTCCGGTTTTACCTGCACTGGGGTAGTGACGGAAGCTGAGACTTATACCAATTTCGTTGGGTATGTGACGACAACATTTAGAAGAAGACATTTCCGTCCATCAGTCAACTCTTGTAGAGATGCATACAATTGGAAGATCGCAGGAGACCCTAGATATGAAGAATCACTACACAACCCTTATCCAGACTCTCACTGGCTCAGAACTGTCAAGACTACAAAAGAATCTCTTTTGATAATCTCCCCCAGCGTGGCTGACATGGATGCTTATGACAAGAAGCTTTACTCCAAGATGTTTCCTAACGGAAGGTGTTCGGAAATATCTCCTGGGTCTCCCTTCTGTCCCACCAATCATGAATACACTATCTGGATGCCCGAGAGCTCAAACCCCGGAATATCCTGTGACATATTCACAAGAAGCATGGGGAAGAAAGCCACCAAAGATGGACAGTTATGTGGGTTTGTAGATGAGAGAGGACTGTACAAATCTTTGAAGGGAGCTTGTAGATTAAGACTCTGTGGGATCAGTGGACTGAGACTGATGGACGGATCCTGGGTTTCACTCCCACAGGTTAACAACTCAGAATGGTGCTCCCCAGACCAACTCGTCAACATTCACGACTTCCATTCAGATGAGATAGAGCATCTTGTCGCAGATGAGTTGGTAAAAAAGAGAGAGGATTGTCTAGACGCCCTTGAAACTATCATCTTCACCAAATCTATAAGTTTCCGGCGGTTAAGCCATCTTCGGAAGCTGGTTCCAGGCTTTGGTAAAGCATATACTATCATAAATAGGACCCTTATGGAAGCAGAGGCTCATTACAAGTCAGTGCGGGAGTGGAAGGAAATTATCCCATCCAAGGGGTGTCTGAAGGCAGGAGGGAGGTGCTATCCTCATCACAATGGAATTTTCTTCAACGGGATCATTCTGGGTCCGGGAGGGGAGATCTTGATCCCTGAGATGCAGTCTGCCTTGCTCCAACAGCACATTGAGCTGTTAGAGTCCTCTGTAGTTCCCCTCAAACACCCCCTGGCAGACCCTTCGACTGTCTTCAAGAACGATGATGAAGCGGAGAGTTTCGTAGATGTTCACCTTCCTGATACAAACCAAAAAATATCTGGAATTGACTTAGGGTTGCCAGAGTGGAAACGTTACTTCCTAATAGGAGTCTCAGCAGTTGCTTTGTTGGCTTTATCTATAATTATCGCCGTCTGTTGCAAAAGGTTCAGGAAAAGGAGGAAATCCAAACCCAGTCCAGTAGAATTGACTAGAAAAGTGTCAGTCATATCCAAAGGAAATGGACCGGTCCCTTCCTGGGAATCTTATAAAGAAGGAACCACAGGAGATGTTCGTAATATGACTCCATCAACAAGGGAGTGAGAGGCCGGATAATGCTTGAGGATGTCCAGATAGATACATTCTTTATGATTTACCTCATCACTTAAGAGCGGTACACTTGATTGATATAATGTTTGAAGATTT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| 101,625
|
EU293119.1
|
Lyssavirus duvenhage
|
Delmas,O., Holmes,E.C., Talbi,C., Larrous,F., Dacheux,L., Bouchier,C., Bourhy,H.
|
Institut Pasteur, UPRE Lyssavirus Dynamics and Host Adaptation, WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Rabies
|
France
|
2008-04-23
|
86132SA
|
Lyssavirus duvenhage
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,976
|
GenBank
| 1
|
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
| null |
1971
| null | null |
Duvenhage virus isolate 86132SA, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCATAAAAGGGGCAGACATGTTCATTTGTATAACACAAATGTAACACCCCTACAATGGATGCTGAAAGAATTGTCTTTAAGGTCCGTAATCAGCTAGTCTCTGTAAAACCAGAGGTCATCTCTGATCAGTATGAGTACAAATATCCTGCTATTACTGATAAGAAGAAGCCTAGTATCACACTTGGAAGGGCTCCGGACTTGAAGACAGCATACAAGTCCATCTTGTCGGGGATGAATGCCGCCAAGCTGGATCCAGATGACGTATGTTCATACTTAGCAGGTGCTATGATTTTGTTTGAGGGTGTGTGTCCCGAAGATTGGGTTAGTTATGGAATCCACATTGCCCGGAAAGGCGATAAAATAACCCCTGCTACGTTAGTTGACATAGTTAGAACAAATACAGAGGGTAACTGGGCTCAGACGGGAGGTCAGGAATTAACTAGAGATCCAACAATCTCAGAACATGCATCATTGGTAGGACTTTTACTTTGCCTATATAGGTTAAGCAAAATTGTAGGACAGAACACAGGGAATTACAAGACGAATGTGGCTGACCGGATGGAACAGATTTTTGAAACTGCTCCATTTGTCAAGATAGTCGAGCACCACACATTAATGACCACTCACAAAATGTGTGCGAATTGGAGCACAATACCCAATTTTAGATTTCTTGCAGGAACATATGACATGTTCTTCTCCAGGGTGGATCATTTGTACTCGGCTATTAGGGTTGGGACGGTAGTCACTGCATATGAAGATTGTTCAGGTTTAGTCTCCTTTACTGGGTTTATCAAGCAGATTAACTTGACCGCTAGAGAAGCCATATTATACTTCTTTCACAAGAACTTTGAGGAGGAGATCAAAAGAATGTTTGAGCCCGGACAGGAGACTGCTGTGCCTCACTCCTACTTTATCCACTTTAGATCCTTAGGTCTTAGCGGCAAGTCTCCTTACTCCTCCAATGCTGTCGGACATGTGTTCAACTTGATCCATTTTGTAGGTTGTTACATGGGTCAAATCAGATCATTAAACGCTACAGTTATCCAAAGTTGTGCCCCGCATGAGATGTCCGTATTGGGAGGTTATTTGGGAGAGGAATTCTTCGGAAAGGGGACCTTTGAGAGACGATTCTTTCGGGACGAGAAAGAGCTGCAAGACTATGAAGAAGCAGAGGCCACTAAGATTGAGGCTGCATTGGCTGATGATGGAACTGTGAACTCCGACGATGAAGACTTTTTCTCCGGAGATACGAGAAGTCCAGAAGCTGTTTACACAAGGATCATGATGAACGGAGGGCGGTTAAAGGGGGCACACATAAGAAGGTACGTCTCTGTAAGTTCTAGTCACCAAGCAAGACCAAACTCCTTTGCAGAGTTCCTCAACAAGACCTACTCCAGTGACTCCAGATAAGACTCTGCTCAAAGCAAAACAATGAGGCATCAATTCCGCTCAATTAGACATGAAAAAAACTAACACCACTCCGCAGGTCCATCAATCATCATGAGCAAGATTTTTATCAATCCTAGTGACATTCGATCAGGACTTGCAGATCTTGAGATGGCTGAAGAGACCGTCGAATTGGTCAACCGGAACATGGAAGACAGTCAAGCTCATCTCCAAGGGGTCCCCATAGATGTGGAGACCCTCCCTGAGGATATTCAGAGACTCCATATCACAGATCCTCAAGCCAGCCTCCGACAGGATATGGTTGATGAGCAAAAACACCAGGAGGATGAGGACTTTTACCTTACAGGAAGAGAAAACCCTCTTTCTCCGTTTCAGACACATCTTGATGCTATAGGACTTCGCATTGTGAGGAAGATGAAGACAGGGGAAGGTTTTTTCAAGATATGGTCACAGGCAGTGGAGGACATCGTCTCTTATGTAGCCCTTAACTTCTCCATTCCAGTGAACAAGCTGTTTGAAGACAAGTCCACCCAGACTGTTACTGAAAAGTCTCAACAGGCCTCTGCCTCGTCGGCTCCAAATCGGCATGAGAAATCATCTCAGAACGCCAGGGTCAACTCCAAGGATGCATCAGGTCCTGCAGCTCTAGACTGGACTGCCAGCAATGAAGCAGATGACGAGTCAGTCGAAGCTGAGATAGCTCATCAGATTGCAGAAAGCTTCTCTAAAAAGTACAAGTTCCCGTCTAGATCCTCAGGGATTTTCTTATGGAACTTTGAACAATTGAAAATGAACTTGGATGAAATAGTTCGGGAGGTCAAGGAAATTCCCGGAGTGATCAAGATGGCGAAAGACGGGATGAAGCTGCCTCTCAGGTGTATGCTGGGAGGAGTGGCTTCTACCCACTCTCGAAGGTTCCAGATTCTCGTGAATCCGGAAAAACTTGGAAAAGTTATGCAGGAGGATCTTGACAAATACCTGACCTATTAGATTAGGTTTTGATAATACACAAGACAACCATCTCATTCAGTTGTAGCATAGTCATGAAAAAAACATGCAACACCACTGACAAAATGAACATCATCCGTAAGATAGTAAAAAGCTGCAAAGAGGAGGAGGAGCAAAAGCCCAGTCCGGTTTCAGCCCCCCCCGATGACGATGACCTGTGGCTTCCCCCTCCAGAGTATGTCCCTCTGTCAGAGATCGCCAATAAGAAGAACATGAGGAATTTCTGTGTCAATGGTGAAATTAAAGTGTGTAGTCCGAACGGGTATTCTTTTCGAATTCTTAGGCACATCTTAAGATCCTTTGAAGGGGTATATTCAGGGAACAGAAGAATGATTGGACTGGTTAAGGTGGTGATTGGATTGGCCTTGTCAGGGGCACCTGTCCCTGATGGGATGAACTGGGTTTACAAAATTAGACGCACTTTAATATTTCAATGGGCAGACTCATCAGGCCCTCTTGATGGTGAGGAACTTGAATACCCTCAGGAAATAACTTGGGATGATGATTCCGAGTTTGTAGGACTGCAAATAAGAGTGAGTGCAAGACAATGTCATATCCAAGGGAGAATTTGGTGTATCAACATGAACTCACGGGCGTGTCAACTCTGGTCTGACATGTCTCTCAAAACCCAGCAGTCTGATGAAGACAAGAACACCTCTCTCCTGTTGGAATGACTATCTATTAAGATCATTGTGCACTGATAGACACTGGTGACTTCCACTCGTCTCCGAGAGCAATAGAACAACATATGTTATGGTGCCACACAATAGCTGCATAACTCCAAACTTGTGATCCAGAGCCTTCCTAAGTAAGATCTTAGCAATGTGAAAAAAACAGGCAACACCCCTCAAGGAGTTCAAGCGCCATGCCACTCAATGCAGTCATCTTTACTCTTCTCCTCAGATGTTCCATCTGCCTTGGAAAGTTTCCCATTTATACGATCCCTGACAAATTGGGGCCATGGAGCCCTATAGACATACATCATCTCAGTTGCCCAAATAACTTGGTTGTGGAAGACGAAGGATGTACAACTCTCACCCCTTTTTCATACATGGAGTTAAAGGTAGGTTACATTACATCAATAAAGGTGTCCGGTTTTACCTGCACTGGGGTAGTGACTGAAGCTGAGACTTATACCAATTTCGTTGGGTATGTGACGACAACATTTAGAAGAAGACATTTCCGTCCATCAGTAAACTCTTGTAGAGATGCATACAATTGGAAGATCGCAGGAGACCCTAGGTATGAAGAATCACTACACAACCCTTATCCAGACTCTCACTGGCTCAGAACTGTCAAGACTACAAAAGAATCTCTTTTGATAATCTCCCCCAGCGTGGCTGACATGGATGCTTATGACAAGAAGCTTTACTCCAAGATGTTTCCTAACGGAAGGTGTTCGGAAATATCTCCTGGTTCCCCCTTTTGTCCCACCAATCACGAATACACTATCTGGATGCCCGAGAGCTCAAACCCCGGAATATCCTGTGACATATTCACAAGAAGCATGGGGAAGAAAGCCACCAAAGATGGACAGTTATGTGGGTTTGTAGATGAGAGAGGACTGTACAAATCTTTGAAGGGAGCTTGTAGATTAAGACTCTGTGGGATCAGCGGACTGAGACTGATGGACGGGTCATGGGTTTCACTCCCACAGGTTAACAACTCAGAATGGTGCTCCCCAGACCAACTCGTCAACATTCACGACTTCCATTCAGATGAGATAGAGCATCTTGTCGCAGATGAGTTGGTGAAAAAGAGAGAGGATTGTCTAGACGCCCTTGAAACTATCATCTTCACCAAATCTATAAGTTTCCGGCGGTTAAGCCGTCTTCGGAAGCTGGTTCCAGGCTTTGGTAAGGCATATACTATCATAAATAGGACCCTTATGGAAGCAGAGGCTCATTACAAGTCAGTGCGGGAGTGGAAGGAAATTATTCCATCCAAGGGGTGTCTGAAGGCAGGAGGGAGGTGCTATCCTCATCACAATGGAATTTTCTTCAACGGGATCATTCTGGGTCCGGGAGGGGAGATCTTGATCCCTGAGATGCAGTCTGCCTTGCTCCAACAGCACATTGAGCTGTTAGAGTCCTCTGTAGTTCCCCTCAAACACCCCCTGGCAGACCCTTCGACTGTCTTCAAGAATGATGATGAAGCGGAGAGTTTCGTAGATGTTCACCTTCCTGATACAAACCAAAAAATATCTGGAATTGACTTAGGGTTGCCAGAGTGGAAACGTTACTTCCTAATAGGAGTCTCAGCAGTTGCTTTGTTGGCTTTATCTATAATTATCGCTGTCTGTTGCAAAAGGTTCAGGAAAAGGAGGAAATCCAAACCCAGTCCAGTAGAATTGACTAGAAAAGTGTCTGTCATATCCAAAGGAAATGGACCGGTCCCTTCCTGGGAATCTTATAAAGAAGGAACCACAGGAGATGTTCGTAATACGACTCCATCAACAAGGGAGTGAGAGGCCGGATGATGCTTGAGGATGTCCAGATGGATACATTCTTTATGATTTACCTCATCACTTAAGAGCGGTACACTTGATTGATATAATGTTTGAAGATTT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| 105,585
|
EU293120.1
|
Lyssavirus duvenhage
|
Delmas,O., Holmes,E.C., Talbi,C., Larrous,F., Dacheux,L., Bouchier,C., Bourhy,H.
|
Institut Pasteur, UPRE Lyssavirus Dynamics and Host Adaptation, WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Rabies
|
France
|
2008-04-23
|
94286SA
|
Lyssavirus duvenhage
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,975
|
GenBank
| 1
|
South Africa
|
South Africa
|
Miniopterus
| null |
1981
| null | null |
Duvenhage virus isolate 94286SA, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCATAAAAGGGGCAAACATGTTCATTTGTATAACACAAATGTAACACCCCTACAATGGATGCTGAAAGAATTGTCTTTAAGGTCCGTAATCAGCTAGTCTCTGTAAAACCAGAGGTCATCTCTGATCAGTATGAGTACAAATATCCTGCTATTACTGATAAGAAGAAGCCTAGTATCACACTTGGAAGGGCTCCGGACTTGAAGACAGCGTACAAGTCCATCTTATCGGGGATGAATGCCGCCAAGCTGGATCCAGATGACGTATGTTCATACTTAGCAGGTGCTATGATTTTGTTTGAGGGTGTGTGTCCCGAAGATTGGGTTAGTTATGGAATCCACATTGCCCGGAAAGGCGATAAAATAACCCCTGCTACGTTAGTTGACATAGTTAGAACAAATACAGAAGGTAACTGGGCTCAGACGGGGGGTCAGGAATTAACTAGAGATCCAACAATCTCAGAACATGCATCATTGGTAGGACTTTTACTTTGCCTATATAGGTTAAGCAAAATTGTAGGACAGAACACAGGGAATTATAAGACGAATGTGGCTGACCGGATGGAACAGATTTTTGAAACTGCTCCATTCGTCAAGATAGTCGAGCACCACACATTAATGACCACTCACAAAATGTGTGCGAATTGGAGCACAATACCCAATTTTAGATTTCTTGCAGGAACATATGACATGTTCTTCTCCAGGGTGGATCATTTGTACTCGGCTATTAGGGTTGGGACGGTAGTTACTGCATATGAAGATTGTTCAGGTTTAGTCTCCTTTACTGGGTTTATCAAGCAGATTAACTTGACCGCTAGAGAAGCCATATTATACTTCTTTCACAAGAACTTTGAGGAGGAGATCAAAAGAATGTTTGAGCCCGGACAGGAGACTGCTGTGCCTCACTCCTACTTCATCCACTTTAGATCCTTAGGTCTTAGCGGCAAGTCTCCTTACTCCTCCAATGCTGTCGGACATGTGTTCAACTTGATCCATTTCGTAGGTTGTTACATGGGTCAAATCAGATCATTAAACGCTACAGTTATCCAAAGTTGTGCCCCGCATGAGATGTCCGTATTGGGAGGTTATTTGGGAGAGGAATTCTTCGGAAAGGGGACCTTTGAGAGACGATTCTTTCGGGACGAGAAAGAGCTGCAAGACTATGAAGAAGCAGAGGCCACTAAGATTGAGGCTGCATTGGCTGATGATGGAACTGTGAACTCCGACGATGAAGACTTTTTCTCCGGAGATACAAGAAGTCCAGAAGCTGTTTACACAAGGATCATGATGAACGGAGGGCGATTAAAGGGAGCACACATAAGAAGGTACGTCTCTGTAAGTTCTAGTCACCAAGCAAGACCAAACTCCTTTGCAGAGTTCCTCAACAAGACCTACTCCAGTGACTCCAGATAAGACTCTGCTCAAAGCAAAACAATGAGGCATCAATTCCGCTCAATTAGACATGAAAAAAACTAACACCACTCCGCTGGTCCATCAATCATCATGAGCAAGATTTTTATCAATCCTAGTGACATTCGATCAGGACTTGCAGATCTTGAGATGGCTGAAGAGACCGTCGAATTGGTCAACCGGAACATGGAAGACAGTCAAGCTCATCTCCAAGGGGTCCCCATAGATGTGGAGACCCTCCCTGAGGATATTCAGAGACTCCACATCACAGATCCTCAAGCCAGCCTCCGACAGGATATGGTTGATGAGCAAAAACACCGGGAGGATGAGGACTTTTACCTTACAGGAAGAGAAAACCCTCTTTCTCCGTTTCAGACACATCTTGATGCTATAGGACTTCGCATTGTGAGGAAGATGAAGACAGGGGAAGGTTTTTTCAAGATATGGTCACAGGCAGTGGAGGACATCGTCTCTTATGTAGCCCTTAACTTCTCCATTCCAGTGAACAAGCTGTTCGAAGACAAGTCAACTCAGACTGTTACTGAAAAGTCTCAACAGGCCTCTGCCTCATCGGCTCCAAATCGGCATGAGAAATCATCTCAGAGCGCCAGGGTCAACTCCAAGGATGCATCAGGTCCTGCAGCTCTAGACTGGACTGCCAGCAATGAAGCAGATGACGAGTCAGTCGAAGCTGAGATAGCTCATCAGATTGCAGAAAGCTTCTCTAAAAAGTACAAGTTCCCGTCTAGATCCTCAGGGATTTTCTTATGGAACTTTGAACAATTGAAAATGAACTTGGATGAAATAGTTCGGGAGGTCAAGGAAATTCCCGGAGTGATCAAGATGGCGAAAGACGGGATGAAGCTGCCTCTCAGGTGTATGCTGGGAGGAGTGGCTTCTACCCACTCTCGAAGGTTCCAGATTCTCGTGAATCCGGAAAAACTTGGAAAAGTTATGCAGGAGGATCTTGACAAATACCTGACCTATTAGATTAGGTTCTGATAATACACAAGACAACCATCTCATTCAGTTGTAGCATAGTCATGGAAAAAACATGCAACACCACTGACAAAATGAACATCATCCGTAAGATAGTAAAAAGCTGCAAAGAGGAGGAGGAGCAAAAGCCCAGTCCGGTTTCAGCCCCCCCAGATGACGATGACCTGTGGCTTCCCCCTCCAGAGTATGTCCCTCTGTCAGAGATCGCTAATAAGAAGAACATGAGGAATTTCTGTGTCAATGGTGAAATTAAAGTGTGTAGTCCGAACGGGTATTCTTTTCGAATTCTTAGGCACATCTTAAGATCATTTGAAGGGGTATATTCAGGGAACAGAAGAATGATTGGACTGGTTAAGGTGGTGATTGGATTGGCCTTGTCAGGGGCACCTGTCCCTGATGGGATGAACTGGGTTTACAAAATTAGACGCACTTTAATATTTCAATGGGCAGACTCATCAGGCCCTCTTGATGGTGAGGAACTTGAATACTCTCAGGAAATAACTTGGGATGATGATTCCGAGTTTGTAGGACTGCAAATAAGAGTGAGTGCAAGACAATGTCATATCCAAGGGAGAATTTGGTGTATCAACATGAACTCACGGGCGTGTCAACTCTGGTCTGACATGTCTCTCAAAACCCAGCAGTCTGATGAAGACAAGAACACCTCTCTCCTGTTGGAATGACTATCTATTAAAATCATTGTGCACTGATAGACACTGGTGACTTCCACTCGTCTCCGCGAGCAATAGAACAACATATGTTATGGTGCCACACAATAGCTGCATAACTTCAAACTTGTGATCCAGAGCCTTCCTAAGTAAGATCTTAGCAATGTGAAAAAAACAGGCAACACCCCTCAAGGAGTTCAAGCGCCATGCCACTCAATGCAGTCATCTTTACTCTTCTCCTCAGATGTTCCATCTGCCTGGGAAAGTTTCCATTTTATACGATCCCTGACAAATTGGGGCCATGGAGCCCTATAGACATACATCATCTCAGTTGCCCAAATAACTTGGTTGTGGAAGACGAAGGATGTACAACTCTAACCCCTTTTTCATACATGGAGTTAAAGGTAGGTTACATTACATCAATAAAGGTGTCCGGTTTTACCTGCACTGGGGTAGTGACTGAAGCTGAGACTTATACCAATTTCGTTGGGTATGTGACGACAACATTTAGAAGAAGACATTTCCGTCCATCAGTCAACTCTTGTAGAGATGCATACAATTGGAAGATCGCAGGAGACCCTAGGTATGAAGAATCACTACACAACCCTTATCCAGACTCTCACTGGCTCAGAACTGTCAAGACTACAAAAGAATCTCTTTTGATAATCTCCCCCAGCGTGGCTGACATGGATGCGTATGACAAGAAGCTTTACTCCAAGATTGTTTCCAACGGAAGGTGTTCGGAAATATCTCCTGGGTCCCCTTTCTGTCCCACCAATCATGAATACACTATCTGGATGCCCGAGAGCTCAAACCCCGGAATATCCTGTGACATATTCACAAGAAGCATGGGGAAGAAAGCCACCAAAGATGGACAGTTATGTGGGTTTGTAGATGAGAGAGGACTGTACAAATCTCTGAAGGGAGCTTGTAGATTAAGACTCTGTGGGATCAGCGGACTGAGACTGATGGACGGGTCATGGGTTTCACTCCCACAGGTTAACAACTCAGAATGGTGCTCCCCAGACCAACTTGTTAACATTCACGACTTCCATTCAGATGAGATAGAGCATCTCGTCGCAGATGAGTTGGTGAAAAAGAGAGAGGATTGTCTAGACGCCCTTGAAACTATCCTCTTCACCAAATCTATAAGTTTCCGGCGTTTAAGCCATCTTCGGAAGCTAGTTCCAGGCTTTGGTAAGGCATATACTATCATAAATAGGACCCTTATGGAAGCAGAGGCTCATTACAAGTCAGTGCGGGAGTGGAAGGAAATTATTCCATCCAAGGGGTGTCTGAAGGCAGGAGGGAGGTGCTATCCTCATCACAATGGAATTTTCTTCAACGGGATCATTCTGGGTCCGGGAGGGGAGATCTTCATTCCGGAGATGCAGTCTGCCTTGCTCCAACAGCACATTGAGCTGTTAGAGTCCTCTGTAGTTCCCCTCAAACACCCCCTGGCAGACCCTTCGACTGTCTTCAAGAACGATGATGAAGCGGAGAGTTTCGTAGATGTTCACCTTCCTGATACAAACCAAAAAATATCTGGAATTGACTTAGGGTTGCCAGAGTGGAAACGTTACTTCCTAATAGGAGTCTCAGCAGTTGCTTTGTTGGCTTTATCTATAATTATCGCTGTCTGTTGCAAAAGGTTCAGGAAAAGGAAGAAATCCAAACCCGGTCCAGTAGAATTGACTAGAAAAGTGTCTGTCATATCCAAAGGAAATGGACCGGTCCCTTCCTGGGAATCTTATAAAGAAGGAACCACAGGAGATGTTCGTAATACGACTCCATCAACAAGGGAGTGAGAGGCCAGATGATGCTTGAGGAGGTCCGGATGGATACATTCTTTATGATTTACCTCATCTCTTAAGAGCGGTACACTTGATTGATATAATGTTTGAAGATTT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| 105,586
|
NC_020807.1
|
Lyssavirus lagos
|
Delmas,O., Holmes,E.C., Talbi,C., Larrous,F., Dacheux,L., Bouchier,C., Bourhy,H.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2013-03-26
|
0406SEN
|
Lyssavirus lagos
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,016
|
RefSeq
| 1
|
Senegal
|
Senegal
|
Eidolon helvum
| null |
1985
| null |
PRJNA485481
|
Lagos bat virus isolate 0406SEN, complete genome
|
ACGCTTAACAGCAAAATCAGAGAAGATATAGACAGCGACAATGCGCTGAACAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGACAAGATTGTTTTTAAGGTTCACAATCAGATCGTATCTTTAAAGCCTGAGATTATATCAGACCAATATGAATATAAGTATCCAGCTATCACAGATGGGAAGAAGCCGGGCATCACTCTCGGGAAGGCCCCAGACCTGAGTACGGCTTACAAGTCGATATTGTCAGGCATGAATGCTGCCAAATTAGATCCAGATGATGTGTGTTCTTATCTGGCCGCAGCAATGCAGTTCTTCGAAGGAGTGTGTCCTGAGGACTGGGTCAGCTATGGGATTATCATAGCGAAGAAAGGGGAGACAATAACTCCCAATGTTTTGGTAGATATAACCAGGACAAATGTGGAAGGAAACTGGGCGCAAGCAGGGGGGGCAGATATGACTAGGGACCCCACGATTGCTGAACATGCCTCTTTAGTGGGACTCTTGCTTTGTCTTTATAGACTGAGTAAGATAGTGGGTCAAAACACAGCTAATTACAAGACCAATGTAGCAGATAGGATGGAGCAGATCTTCGAAACTGCTCCCTTTATAAAAGTGGTGGAGCATCACACCCTGATGACAACTCACAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACTATCCCAAACTTCAGGTTTTTGGCAGGTACATATGACATGTTTTTTGCCAGAATTGAACATCTTTATTCTGCTATTAGGGTCGGCACTGTGGTGACTGCTTATGAAGACTGTTCAGGATTGGTATCTTTCACTGGATTCATTAAACAGATCAACTTATCCGCGAGAGATGCTCTCCTGTACTTTTTCCATAAAAACTTCGAAGAGGAAATTAAAAGAATGTTTGAGCCAGGACAAGAAACTGCTGTTCCCCATTCATATTTTATCCACTTCAGGGCTTTGGGACTCAGCGGGAAATCTCCTTACTCATCAAATGCTGTGGGTCATACCTTTAATTTGATCCATTTCATAGGTTGTTATATGGGGCAGATACGATCTCTAAATGCAACTGTGATTCAGACATGTGCACCCCATGAGATGTCTGTTTTGGGGGGATATTTAGGGGAGGAGTTTTTTGGGAAGGGAACTTTTGAGAGGAGATTCTTTAGAGATGAGAAGGAGATGCAAGACTATGCGGAGTTAGAGGGCGCAAAGGTTGAAGCATCTTTGGCGGATGATGGAACAGTTGATTCTGACGATGAGGAGTTTTTCTCTGGTGAAACCAGGAGTCCAGAGGCCGTATATAGCAGGATTATGATGAACAATGGTCGACTGAGGAAGTCTCATATACAGAGATATGTGTCTGTAAGCTCAAACCACCAGGCTCGCCCAAACTCTTTTGCGGAATTCCTCAACAAAGTGTACTCGGAGAGCTCTTGAGTCTTAAATTTTAGTTTTTGACACAAACAACGAAGGTGCATCGCTGTGCAGGAAGATTTAAGAAAAAAACTCAACACCACTCCTTGATCCATCATCTCAGCATGAGTAAGGATCTGGTGCATCCCAGCTTGGTGCGTGCAGGGTATGTGGAGTTGGAGATGGCCGATGAGACTGCTGATGTGGTCAATTTGACTATAGCGAGTAATCAGGCACATCTGCAAGGTGAGCCTTTCTACGTTGACTCCTTGCCCGAAGACATGAATAGAATGAGGCTCGCAGAAACATCTGGGAAAATGGAGGTTGCAGAGGATGATGAGGATGATTGCAGCTCAGAAGATGAGTTCTATTTGCCTAAGGGGCAAGATCCTCTGGTTCCCTTCCAGGGATTTCTTGAGGAAGTAGGGGCAAGGATTGTTAAAAGGATGAAGTCAGGGGAAGGGTTTTTTAAGATATGGTCTACAATGACAGAGGACATAAAAGGTTATGTACTCACGAATGTGATGAAGACCAGTTCTAAAACCGTGGAAAACAGGCAAACGCAAACTGACAAACAACTCTCCTCTAATCTGCCTCAAGAACTGACCCCGCCCAAGAGGGAAGAAGCACTCAATCCCAAAAAGGCAGAGGAGAGACCCAAGCCAAGCAAGGCTCCAGAGGTGAGTTGGACTAATGAGACTGAAGAAGTCAATGACATAGAGGGAGAGGTTGCCCATCAAGTTGCTGAAAGCTTTTCTAAAAAGTATAAGTTCCCATCTAGATCATCAGGGATCTTCTTATGGAACTTTGAACAGCTCAAAATGAATTTGGATGATATAGTCAAGGCATCAATGAACATACCGGGGGTGGAGAAGATCGCAGAAAAGGGAGGGAAGCTGCCTCTCAGATGTATCCTAGGGTTTGTGGCCTTAGACTCTTCTAAGAGGTTCAGACTATTGGCAGATACAGACAAGGTGGCCAGACTTATGCAAGATGATATCAACAGCTATATGGCAAGGCTGGAAGATGTAGACAGGAATTAGAATGTTGATCAAATTGACTCATTTCAATCAAATTTGGACAAAGCCATGAAAAAAACATGTAACATCCCTAAAAAGATGAATTTCCTGAAGAAAATAGTGAAGACTTGCAAAGATGAGGAGACTCCCAAGTATGGGGCAGCATCAGCTCCTCCTGATGATGATGACCTTTGGATGCCTCCGCCGGAGTATGTCCCTTTGACTCAGGTTAAAGGCAAAGCAAGTGTTCGAAATTTCTGTATCAATGGAGAGATTAAGACATGTAGTCCTAATGGATACTCCTTTAGAATTCTTCGACACATCTTGAAGTCGTTTGATAACGTCTATTCAGGAAACCGAAGAATGATCGGGCTGGTCAAAATAGTAATTGGCTTAGTGTTATCTGGGTCCCCCATCCCTGAAGGTATGAACTGGGTTTACAAACTTCGCAGAACCCTGATCTTTCAGTGGGCTGAATCTCATGGGCCTCTAGAAGGAGAAGAGCTAGAGTATTCTCAAGAAATAACATGGGATGACGAGGCAGAGTTCGTCGGCTTGCAGATAAGAGTGAGTGCAAGACAATGCCACATCCAGGGAAGGTTGTGGTGCATCAACATGAACTCTCGAGCCTGCCAGCTCTGGGCAGATATGGCCCTAAAGACACAACAATCTCAAGAGGACGAGAACACTTCCCTCCTTTTGGAGTAATTCAAGGCCCAACAAATATATCCGTGATTGTTACCTCCATCTTGAGTAGATATAATCTGTGAGCAATAGAACAAATACAGTAATGGTGCCTGCTTCCAGCACAACATCTATAACCTAAACACTTGTTTATCTCTAGATCCAGGGTTGAGCATAATGTGAAAAAAACTTGTGAACACGGAATAACAACCCTCCCTAATCGCCACCATGAGTCAATTGTTCTCAACCTTCATCTTTTGCTTGTTCATAGGAAGTTCCATAGGAGACTTCCCTCTATATACAATTCCCGAACGGCTTAATCCCTGGACTCCAATTGACTTAATCCACCTGAGCTGTCCTAACAACTTACTGTCTGATGCTGAGGGGTGCAGTGAAACTTCATCCTTTACCTATGTAGAGCTCAAAACCGGTTTTCTCGCCCATCAGAAAGTGCCGGGGTTCACTTGCACAGGTGTGATAAACGAGGCAGTCACATACACCAACTTTGTTGGATATGTTACTACCACATTTAAGAGAAAACATTTTAAACCAACTGTTTCCGCATGTAGGGATGCCTTCAACTGGAAAGTTTCTGGAGATCCTAGATACGAGGAGTCTTTACATACACCCTATCCGGATAACAGTTGGCTGCGAACTGTCACCACAACCAAAGAATCCTTGTTAATAATCTCTCCAAGCATTGTAGAGATGGATGTATACGGTAGAACTCTCCATTCCCCCATGTTTCCTACAGGAATCTGCTCTAAGTTTTATCCATCAATTCCCTCATGTGCTACCAATCATGATTACACGTTGTGGTTGCCTGAAGACCCTAACTTGAGTTTGATTTGTGACATATTTGTGACAAGCACAGGAAGAAAGGCAATGAATGGGTCTCGTATGTGTGGATTCACAGATGAACGAGGGTTTTATCGAACCCTGAAGGGAGCATGCAAGTTGACCTTGTGTGGGAAACCAGGCCTACGGTTATATGATGGGACATGGGTCTCGTTCACTAGGCCTGAAATCCATGTATGGTGCTCTCCTGATCAGCTGGTGAACGTGCATAACAACCGCATAGACGAAATTGAACATTTGATTGTAGATGACCTCATCAGGAAGAGAGAGGAGTGTTTGGATACACTAGAGACCGTCCTAATGTCTAAGTCGTTAAGTTTCAGAAGGCTCAGTCACTTCCGGAAGTTAGTCCCCGGGTATGGAAAGGCCTATACAATCCTCAATGGGAGTCTGATGGAAACCAATGTTCACTATAAAAGGGTGGATAATTGGGTCGACATACTGCCTTCCAAAGGGTGCCTTAAGGTAAACAATAAATGTATGGAGTCAGACACAGGGGTTTTCTTCAATGGAATCATTAAAGGGCCCGATGGTAGGATTCTCATCCCTGAAATGCAGTCTGGACTGCTAAAACAACATATGGACCTCTTGAAGGCTGCAGTGTTCCCTCTAAGACACCCATTAATTGACAAAGCCTCAGTGTTCAAAAAGGATGGTGATGCAGACGACTTCGTCGATGTCCACATGCCAGACATACAGAAGCTAGTATCTGATGTCGACTTGGGCTTGCCAAATTGGAGTTTCTTTGCTTTGATAGGTGCCAGTGTAATTGCACTGCTCATTCTAGTATGTCTTCTGAGGATGTGCTGCAAACGGATGAGGAGGAGAAGCTCTGTCAGGGATCAAGTAGCCCCACCGTTTAGCTTATCTTCTACTCCTTCTTCTAAGTCAAAGGTGGTGTCATCATGGGAGTCATATAAAGGGACATCAAGTGTCTAATTGACCACCCTTTAATGCGTTGTTGGTGGATGGAATACAACCCGATTAACTGCCTCTTCATCTGGAAACATTCCACGGTACAGTCGTATCATCTCAGTGGA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| 7,023
|
LC717429.1
|
Lyssavirus lagos
|
Horiya,M., Posadas-Herrera,G., Takayama-Ito,M., Yamaguchi,Y., Iizuka-Shiota,I., Kato,H., Okamoto,A., Saijo,M., Lim,C.K.
|
Department of Virology 1; 1-23-1 Toyama Shinjuku-ku, Tokyo, Tokyo 162-8640
|
Japan
|
2022-12-09
| null |
Lyssavirus lagos
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,986
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Eidolon helvum
| null |
1956
| null | null |
Lyssavirus lagos 8619NGA-NIID RNA, complete genome
|
ACAAAATCAGAGAAGACATAGACACCTACAATGAGGTAATCAAAATGTAACACTACTACAATGGATTCAGAAAGGATTGTTTTCAGAGTTCATAATCAGGTAGTGTCACTCAAACCAGAGATTATATCAGATCAATATGAATATAAATATCCAGCTATTACAGATGGGAAAAAACCAGGCATCACTTTAGGAAGGGCTCCTGATTTGAGCACAGCATACAAGTCTATATTGTCTGGTATGAATGCCGCCAAGTTAGATTCAGATGACGTTTGCTCCTATCTGGCTGCAGCTATGCAACTCTTTGAAGGGGTCTGTCCAGAGGATTGGATAAGTTACGGAATACATATAGCAACAAAAGGAGAAACCATCACTCCGGATGTTTTGATAGATGTGACCAGGACAAACGTGGAGGGGAATTGGGCTCAAGCAGGAGGAACAGACATGACAAGAGATCCCACAATTGCTGAACATGCTTCTCTAGTAGGACTTTTGCTGTGTCTATATCGTCTGAGCAAAATAGTGGGTCAGAACACAGCAAATTACAAAACCAATGTAGCAGACAGAATGGAGCAGATTTTCGAGACAGCCCCCTTTGTTAAAGTTGTAGAGCATCACACTTTGATGACCGTCCACAAAATGTGTGCAAATTGGAGCACAATCCCCAACTTCAGATTTTTGGCAGGGACTTACGACATGTTTTTTGCAAGGGTTGAACATCTCTACTCTGCTCTTAGGGTTGGCACAGTTGTAACTGCTTACGAGGATTGCTCCGGACTGGTGTCTTTTACAGGGTTCATTAAACAGATCAACCTATCTGCACGAGACGCGCTCTTATATTTCTTTCACAAGAGTTTTGAAGAAGAGATTAAAAGAATGTTTGAACCTGGTCAAGAAACAGCTGTTCCTCATTCATATTTCATACATTTTAGGGCATTGGGGTTGAGTGGAAAGTCTCCTTATTCATCCAACGCAGTGGGTCATACATTCAACCTGATTCACTTCATAGGATGTTATATGGGTCAGATAAGATCACTTAATGCGACCGTAATTCAGACTTGTGCACCTCATGAGATGTCAGTATTGGGGGGATATCTTGGTGAAGAGTTCTTTGGAAAGGGGACCTTCGAAAGAAGATTCTTCCGAGATGAGAAAGAAATGCAAGATTATGCCGACTTAGAAGGAGCAAGAGTAGAGGCATCTTTGGCAGATGACGGGACGGTAGACTCTGATGATGAGGACTTCTTCTCTGGAGAGACAAGGAGCCCTGAAGCAGTCTACAGCAGAATCATGATGAACAATGGCAGATTGAAGAAATCTCACATACGCAGATATGTTTCTGTCAGTTCGAACCATCAGGCCCGGCCGAATTCCTTTGCAGAATTCCTCAACAAGGTGTATTCAGAGAGCTCATAACTCTACTGCTTACGCTCCAAGCGCAAGCGCATCGAACGGTACATATTATTGAAGGAGGATAGAAAAAAACTCAACATCTCTCCTCAAGTCATCTCTCCAACATGAGCAAGGGATTAATACACCCTAGTGCCATCCGCTCAGGCTTGGTAGATTTGGAGATGGCTGAGGAAACTGTGGACTTGGTTCATAAAAATCTTGCAGACAGTCAAGCACATTTGCAAGGGGAGCCCTTAAATGTCGACTCCTTGCCGGAAGATATGAGGAAGATGAGGTTGACGAATGCCCCGAGTGAGAGAGAAATCATTGAAGAAGATGAAGAGGAATATAGCTCTGAGGATGAATACTATCTGTCTCAGGGGCAAGACCCTATGGTTCCATTCCAGAATTTCCTCGACGAACTTGGGACACAAATAGTCAGGAGGATGAAATCAGGAGATGGCTTTTTCAAAATCTGGTCCGCAGCATCAGAGGATATAAAAGGGTATGTTCTCTCCACCTTCATGAAGCCAGAAACACAGGCTACAGTGAGCAAACAAACACAGACAGACTCACTATCTGTTCCGAGACCTTCCCAGGGGTACACTTCTGTCCCGAGGGATAAGCCATCCAACTCTGAGTCACAAGGGGGAGGGGTCAAGCCTAAGAAAGTTCAGAAATCAGAGTGGACTAGAGATACTGATGAAATCAGTGATATTGAAGGAGAAGTCGCACATCAAGTTGCTGAGAGTTTTTCAAAGAAATATAAATTCCCGTCTAGATCATCTGGGATTTTCTTGTGGAACTTCGAACAACTCAAAATGAATCTGGATGACATAGTCAAAACCTCAATGAATGTCCCTGGAGTAGACAAAATTGCAGAGAAAGGAGGAAAGCTGCCGCTGAGGTGCATTTTGGGGTTCGTCTCTCTAGATTCTTCTAAGAGATTTCGCCTCCTTGCGGACACTGACAAGGTGGCCAGACTCATGCAGGATGACATCCACAACTACATGACTAGAATTGAGGAGATAGATCACAATTAGAAAATTCTCAAAAATGAGCTGATTCCGATCAACATGGGTAAAATCTTGAAAAAAACATGCAACACCCCTAGAACCATGAATTTCCTGAGGAAGATAGTGAAGAATTGCAAAGATGAAGAGATCCCAAAGCCCGGGACTCCATCAGCTCCTCCTGATGATGATGACCTTTGGATGCCTCCCCCAGAGTATGTGCCTTTGACTCAAATTAAGGGCAAAGAGAATGTTAGAAACTTTTGTATAAATGGAGAGATCAAAATATGTAGCCCCAATGGTTACTCTTTTAGGATCCTTAGACATATATTGAAATCTTTTGACAATGTTTATTCTGGGAATAGAAGACTGATCGGGGTAGTCAAAGTGGTGATCGGCCTGGTTTTATCTGGATCTCCTGTCCCGGAGGGCATGAATTGGGTTTATAAACTCCGTAGAACTTTGATTTTTCAATGGGCAGAGTCCCATGGTCCTCTTGAGGGAGAAGAACTAGAATACTCCCAAGAGATTACATGGGATGACGAGGCAGAGTTTGTAAGCCTACAAATTAGAGTCAGTGCCAAACAATGCCACATCCAGGGGAGGCTGTGGTGTATCAATATGAACTCTAAGGCATGTCAACTCTGGGCAGATATGGGCCTAAAAACCCAGCAATCTCAAGAAGATGAGAACACTTCACTTCTGTTGGAATAATATAGAGCTCAGTGAACATGTCTCTATCTGTTACCTCTGTTTTGAGTAGATATAATCTGTGAGCAATAGAACAAATACAGCTATGGTGCCTGCTTCAAATACAAAATCTATGAATTTCGCACTCGGTCATCTTTAGAATCAGGTCTGAGCAAAATGTGAAAAAAACTTTTTAATAAGATTTAACAGCCCTCCCCACTTGTCACCATGAGTCAACTAAATTTGATACCCTTTTTCTGTGTAATTATAGTCTTGTCTGTAGAGGACTTTCCTCTATATACAATTCCTGAAAAGATAGGTCCTTGGACTCCGATCGACCTGATCCATCTGAGCTGTCCTAATAATTTGCAGTCAGAGGATGAAGGATGTGGTACCTCATCAGTCTTCAGTTATGTAGAGCTCAAGACAGGTTATCTCACTCATCAGAAAGTGTCTGGGTTCACCTGTACAGGAGTGGTTAATGAGGCTGTCACATACACTAACTTTGTCGGATATGTGACAACCACCTTTAAGCGGAAACATTTCAAGCCGACGGCATTGGCTTGCAGAGATGCTTATCATTGGAAGATTTCTGGGGATCCAAGGTATGAGGAGTCTCTCCACACACCATATCCTGACAACAGCTGGTTGAGGACAGTTACCACAACCAAAGAATCTCTTGTGATAATCTCTCCAAGCATTGTGGAGATGGATGTATATAGTAGAACACTTCATTCTCCCATGTTTCCCACCGGGACCTGTTCTAGGTTCTATCCGTCATCCCCTTCTTGTGCCACAAATCATGATTACACTTTATGGCTTCCAGATGACCCTAATCTGAGTTTGGCATGTGATATCTTTGTGACCAGCACAGGGAAAAAGTCAATGAATGGCTCTAGAATGTGTGGATTTACAGACGAGAGAGGGTATTACCGGACAATAAAAGGAGCTTGTAAACTGACATTATGTGGGAAACCAGGTTTGAGGTTATTTGATGGCACATGGATATCCTTCACCCGCCCGGAAGTCACTACCTGGTGCCTTCCTAATCAGTTAGTCAATATTCACAACAATAGGATAGATGAAGTTGAGCATCTGATTGTAGAAGATCTCATTCGAAAAAGAGAAGAGTGTTTGGACACTTTAGAGACAGTTTTAATGTCCAAATCAATCAGTTTTAGACGACTAAGTCACTTCAGAAAATTAGTGCCAGGATATGGGAAGGCTTACACTATTTTAAATGGGAGCTTAATGGAAACTAACGTTCATTATTTAAAGGTTGACAATTGGAGTGAAATACTGCCTTCCAAGGGATGTTTAAAAATAAACAATCAGTGTGTTGCTCATTATAAGGGGGTCTTCTTTAACGGGATCATCAAGGGACCAGATGGTCATATTTTAATCCCCGAGATGCAGTCAAGTTTGTTGAAACAGCACATGGACCTCTTGAAGGCAGCGGTTTTTCCCTTGAGACATCCTCTGATTGAACCGGGCTCTTTGTTCAATAAGGATGGTGATGCCGATGAATTTGTTGATGTCCACATGCCTGATGTACATAAGTTGGTATCAGATGTCGACTTGGGGCTACCCGATTGGAGCCTTTATGCGTTGATAGGGGCAACTATTATAGCTTTCTTTATACTGATATGTCTTATTCGTATCTGCTGCAAGAAGAGGGGTCGGAGAAACTCTCCCACAAATAGACCTGATCTTCCTATAGGGTTGTCTACTACACCTCAACCCAAGTCTAAAGTGATATCATCATGGGAATCTTATAAGGGTACCTCTAATGTCTGATGCTGCCTTCTTGGAGGGATCTCCAGCAGATAACTTACAACCCAACTAACTGCCTCTTCATTTTTGAACATTCCACGATACAATCATCTCATTGGGTGATGGGTCATGTCG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| 21,325
|
MH643893.2
|
Lyssavirus lagos
|
Coertse,J., Geldenhuys,M., Weyer,J., Bloomberg,L., Le Roux,K., Nel,L.H., Markotter,W.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2019-08-01
|
LBV/UP6414/E.wahlbergi/RSA/2016
|
Lyssavirus lagos
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,011
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Epomophorus wahlbergi
| null |
2016
| null | null |
Lyssavirus lagos isolate LBV/UP6414/E.wahlbergi/RSA/2016, complete genome
|
ACGCTTAACAGCAAAATCAGAGAAGATATAGACATCTACAATGAGCGAATCAAAATGTAACACTACTAAAATGGATTCGGAAAAGATTGTTTTCAGGGTGCATAATCAAGTAGTGTCAGTTAAACCGGAAATCATCTTAGATCAATATGAGTATAAATATCCTGCAATTACAGATGGGAAGAAACCTGGTATTACATTGGGAAGGGCTCCAGATTTGAGCACTGCATATAAGTCTATATTATCTGGAATGAACGCTGCTAAGCTGGACCCAGATGATGTATGCTCTTATTTGGCTGCCGCTATGCAACTCTTCGAGGGAGTCTGCCCAGAAGATTGGATGAGTTATGGGATCCTTATAGCGAAAAAGGGAGAAACTATTACTCCTGATGTCTTAATAGACATAACTAGAACGAATGTGGAAGGAAACTGGGCTCAGACAGGAGGGGCAGATATGACGCGAGATCCTACAGTTGCTGAACATGCCTCTTTAATAGGACTTCTCTTGTGTTTATACCGACTGAGTAAAATAGTGGGTCAAAACACAGCTAATTATAAGACCAATGTTGCAGACAGGATGGAGCAGATTTTTGAAACTGCTCCGTTTGCAAAAGTGGTTGAACATCACACATTGATGACAACCCACAAAATGTGCGCAAACTGGAGTACAATTCCTAATTTCAGGTTTTTAGCAGGAACATATGATATGTTCTTTGCTCGCATCGAACATCTCTATTCGGCTATCAGGGTTGGTACAGTTGTGACAGCTTATGAAGATTGCTCAGGGCTTGTATCTTTTACAGGGTTTATTAAACAAATTAACTTATCTGCCAGGGATGCACTATTATACTTCTTCCATAAGAGTTTTGAAGAAGAGATTAAGAGGATGTTTGAACCCGGTCAAGAAACAGCAGTCCCCCATTCATACTTTATCCACTTTCGGGCACTAGGGTTAAGCGGGAAATCTCCCTACTCCTCAAATGCAGTGGGTCACACATTCAACCTGATCCATTTTATTGGATGTTATATGGGTCAAATAAGGTCTCTCAATGCTACTGTAATTCAGACTTGTGCTCCTCATGAGATGTCGGTTTTGGGAGGATATCTTGGTGAAGAATTCTTTGGAAAGGGGACCTTTGAGAGGAGGTTCTTTAGAGATGAGAAAGAGATGCAAGATTATGCGGACTTAGAGGGAGCAAGAATAGAAGCATCTCTTGCAGATGATGGTACTGTTGACTCAGATGATGAAGACTTTTTCTCTGGAGAGACAAGAAGTCCAGAAGCTGTCTACAGCAGGATTATGATGAACAATGGCAGGTTGAAGAAATCTCACATCCGCAGATATGTCTCTGTAAGTTCTAACCATCAGGCTAGGCCGAACTCATTTGCAGAATTTCTCAACAAGGTGTATTCGGAGAGCTCATAGGCTCCACATGAGGGGCTTCGGGACACAGGGTCAAAATGTCATCTCATATGAAATAGGAATAGAAAAAAACTCAACATCTCTCCTCAGTTCATCTCCTCGCCATGAGCAAGGGGCTCATACATCCCAGTTCCATCCGTTCCGGTTTAGTAGACTTAGAAATGGCAGAGGAGACTGTAGATCTAGTCCACAAGAATCTCACGGATGGTCAAGCACACCTGCAGGGGGAGCCATTCAGTGTAGATTCGTTGCCAGAAGATGTGAGGAGAATGAGGATCGTGGATGCATCAGGAGAGAGGGAGGTGGTTGAAGAAGACGAGGAAGAATACAGCTCTGAAGATGAGTACTATTTGCCTCAGGGGCTAGACCCTATGGTGCCCTTCCAGAGCTTTTTGGATGAGCTTGGAACTTTGATTGTACGAAGGATGAAGTCCGGAGATGGATTCTTTAAAATCTGGTCAGCAGCCTCAGAAGACATAAAAGGATATGTGTTGTCTACCTTCATGAAGTCGGAAGCCAAGATCACTGATAACAAGCAAACACAGACTGATCCGATGAATCTCCCAAAACCTCTTCCCAAGGCAAATCCTGTACAAAAAGAAGAACAGTCCAAACCTGGATCTGCTGGAGGCAGAGTCAAGCCCAAAATCCCACCCAAGTCTGAGTGGGCCAAAACCACTGAAGAAGTCAGCGATATAGAAGGAGAAGTTGCACACCAGGTTGCAGAGAGCTTTTCAAAGAGATATAAGTTCCCATCTAGATCTTCTGGGATCTTTTTGTGGAACTTTGAACAACTTAAGATGAACTTGGATGATATAGTCAAGGCCTCCATGAACATACCAGGAGTGGACAAAATAGCAGAAATTGGAGGAAAATTGCCTTTGAGATGTATTCTTGGGTTTGTCTCTCTTGATTCTTCTAAAAAGTTTCGACTCCTAGCAGATACTGACAAAGTGGCCAGGCTCATGCAAGATGATATCAACAATTATATGACCAGACTTGAAGAAATAGACCAAAATTAGGAAACTTAAAACACAGAAGGTTTATGATCATAACATATATGACCGTAAAAAAAACATGTAACACCCCTAAAAGAATGAATTTTCTACGGAAGATAGTAAAGAACTGTAAGGATGATGAGCTCCCAAAGCCAGGAACCCCTTCTGCTCCTCCAGATGATGATGATCTTTGGATGCCTCCTCCGGAGTATGTACCATTGACTCAAATTAAAGGCAAGGAGAATGTTAGAAATTTCTGTATAAATGGAGAAGTCAAAATTTGCAGTCCAAATGGTTATTCTTTCAGGATTCTAAGACACATTTTGAAGTCTTTTGATAGTGTTTATTCAGGAAATAGAAGGATGATCGGTCTAGTCAAAGTAGTTATTGGATTGGTCTTGTCCGGATCTCCTGTCCCAGAAGGGATGAATTGGGTGTATAAACTCCGTCGAACCCTGATCTTTCAATGGGCTGAATCCCATGGTCCCCTTGAGGGAGAAGAGCTTGAATACTCTCAGGAGATAACTTGGGATGATGACACAGAATTTGTGGGTCTGCAAATCAGGGTGAGTGCAAAACAATGTCATATTCAAGGGAGACTGTGGTGTATCAATATGAACTCTAGAGCATGTCAGCTTTGGGCTGACATGGCTCTAAAAACTCAACAATCCCAGGAGGATGAAAATACTTCACTTTTACTGGAGTAATTTCAAGCCTAGTGAATATGTCTTTACCTGTTACCTCCATCTCAAGTAGATATAATCTGTGAGCAATAGAACAATTACAGTAATGGTGCCTGCTTTCAGCACAACATCTATGATATTCGCACTTGTCCATCTTTAGATTCAGGTTTGAGCAAAATGTGAAAAAAACTTTTGATCACGGATTAACAGCCCTCCCTAATCGTCATCATGAGTCAGCTAATTCTGATACCATTTTTGTGTGTGGTTATAGTGACATCAGTGGGAGATTTTCCTTTATATACTATCCCGGAAAAGATAGGCACCTGGACTCCAATCGATCTGATTCATCTAACTTGTCCTAACAATCTGCTGTCAGGGGATGATGGGTGCAGTGATACTGCCACTTTTAGTTATATAGATCTTAAAACAGGTTACCTCACTCATCAAAAAGTTTCTGGCTTTACATGCACAGGTGTAGTTAATGAGGCTGTCACTTACACCAACTTTGTAGGATATGTGACCACCACCTTCAAAAGGAAGCATTTCAAACCCACAGCCTTAGCGTGTAGAGACGCCTTTCATTGGAAAATCTCTGGAGACCCGAGATATGAGGAGTCTTTGCACACACCATACCCTGACAATAGCTGGTTAAGAACAGTTACTACAACGAAGGAGTCCTTGCTAATAATCTCCCCCAGTATAGTTGAGATGGACGTTTATAGCAGAACCCTTCACTCTCCTATGTTTCCTGGTGGGGTATGCTCTAAATTCTATCCATCATCCCCTTCCTGTCCTACTAATCATGATTACACCCTATGGCTTCCTGAGGATGCCAATCTAAGTATGGCCTGTGATATATTTGTTACCAGTACAGGGAAAAAGTCAATGAATGGTTCAAGAATGTGTGGATTCACTGATGAAAGAGGATTCTACAGGACACTAAAAGGGGCATGTAAGCTGACTTTGTGCGGGAAGCCGGGATTGAGGTTATATGATGGAACATGGGTATCTTTCACACGCCCAGAGATTAACGTATGGTGTTCTCCCAACCAACTAGTCAATGTTCATAACAATCGATTGGATGAGATAGAACATCTAATTGTGGGAGACCTCATTCGGAAGAGAGAAGAGTGTCTGGACACTCTAGAGACCATTCTGATGTCCAAATCTATAAGCTTTAGGCGACTCAGTCATTTCAGAAAGTTGGTGCCTGGGTATGGGAAAGCTTATACAATTATTAACGGGAGTCTGATGGAAACCAATGTTCACTACCTTAGGGTTGACAGTTGGAATGATATATTGCCTTCCAAAGGATGCTTGAAAATGAACAAACAATGTGTCGATTCCTACAAAGGAGTCTTCTTCAATGGGATTATCAAAGGACTGGATGGACATATTTTGATTCCAGAGATGCAGTCCAGTCTACTGAAACAGCATATGGATCTCTTAAAGGCAGCAGTTTTTCCTCTACGACACCCCTTAATAGACCAAAATTCTTTGTTTAAGAAGGATGGTGATGCAGATGATTTTGTGGAAGTTCACATGCCAGATATACAAAAGTTGATCTCTGATGTAGACCTCGGATTGCCAAGTTGGAGTCTCTACGTCCTGATAGGAGCTGCTGTAATAGCTTTCCTGATCCTGATATGCTTAATCCACATTTGCTGCAAGAAGAGGGGTCGCACGCGCCCCTCGATAGAAAGACCAGATCCTCCCCTAAGCTTGTCCACTACTCCCCAGTCTCGGGCTAAAGTAGTGTCGTCTTGGGAGTCCTACAAGGGAACTTCAAATGTGTAGCAACACACTCTCCAAGAAACTTATAATGTATAACATACAACCCAACTAACTGCCTCTTCATCTTCGAACATTCCACGGTACAATCATCTCATTAGATGCTGA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| 60,464
|
LN849915.1
|
Lyssavirus lagos
|
Freuling,C.M., Binger,T., Beer,M., Drosten,C., Fischer,M., Hanke,D., Hoffmann,B., Hoeper,D., Mettenleiter,T.C., Schatz,J., Mueller,T.
|
Federal Resaerch Institute for Animal Health, Friedrich-Loeffler-Institute, Institue of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems 17493
|
Germany
|
2017-07-07
|
31225
|
Lyssavirus lagos
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,998
|
GenBank
| null |
Ghana:Kumasi
|
Ghana
|
Eidolon helvum
| null | null | null | null |
Lagos bat virus complete genome, isolate 31225
|
CAGAGAAGATATAGACAGCGACAATGCGCTAAACAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGACAAGATTGTTTTCAAGGTTCATAATCAGATCGTATCTTTAAAGCCTGAGATTATATCAGACCAATATGAATATAAGTATCCAGCTATCACAGATGGGAAGAAGCCGGGCATCACTCTCGGGAAGGCCCCAGACCTGAGTACAGCTTACAAGTCGATATTGTCAGGCATGAATGCTGCCAAATTAGACCCAGATGATGTGTGTTCTTATCTGGCCGCAGCAATGCAGTTCTTCGAAGGAGTGTGTCCTGAGGACTGGGTCAGCTATGGGATTATCATAGCGAAGAAAGGGGAGACAATAACTCCCAGTGTTTTGGTAGATATAACCAGGACAAATGTGGAAGGAAACTGGGCGCAAGCAGGGGGGGCAGATATGACAAGGGACCCCACGATTGCTGAACATGCCTCTTTAGTGGGACTCTTGCTTTGTCTTTATAGACTGAGTAAGATAGTGGGTCAAAACACAGCTAATTACAAGACCAATGTAGCAGATAGGATGGAGCAGATCTTCGAAACTGCTCCCTTTATAAAAGTGGTGGAGCATCACACCCTGATGACAACTCACAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACTATCCCAAACTTCAGGTTTTTGGCAGGTACATATGACATGTTTTTTGCCAGAATTGAACATCTTTATTCTGCTATTAGGGTCGGCACTGTGGTGACTGCTTATGAGGACTGTTCAGGATTGGTATCTTTCACTGGATTCATTAAACAGATCAACTTATCCGCGAGAGATGCTCTCCTGTACTTTTTCCATAAAAACTTCGAGGAGGAAATTAAAAGAATGTTTGAACCAGGACAAGAAACTGCTGTTCCCCATTCATATTTTATCCACTTCAGGGCTTTGGGACTCAGCGGGAAATCCCCTTACTCATCAAATGCTGTGGGTCATACCTTTAATTTGATCCATTTCATAGGTTGTTATATGGGGCAGATACGATCTCTAAATGCAACTGTGATTCAGACATGTGCACCCCATGAGATGTCTGTTTTGGGGGGATATTTAGGGGAGGAGTTTTTTGGGAAGGGAACTTTTGAGAGGAGATTCTTTAGAGATGAGAAGGAGATGCAAGACTATGCGGAGTTAGAGGGCGCAAAGGTTGAAGCATCTTTGGCGGATGATGGAACAGTTGATTCGGACGATGAGGAGTTTTTCTCCGGTGAAACCAGGAGTCCAGAGGCCGTATATAGCAGGATTATGATGAATAATGGTCGACTGAGGAAGTCTCATATACAGAGATATGTATCTGTAAGCTCAAACCACCAGGCTCGCCCAAACTCTTTTGCGGAATTCCTCAACAAAGTGTACTCGGAGAGCTCTTGAGTCTTAAATTTTAGTTTTTGACACAAACAACGAAGGTGCATCGCTGTGCAGGAAGATTTAAGAAAAAAACTCAACACCACTCCTTGATCCATCATCTCAGCATGAGTAAGGATCTGGTGCATCCCAGCTTGGTGCGTGCAGGGTATGTGGAATTGGAGATGGCCGATGAGACTGCTGATGTGGTCAATTTGACTATAGCGAGTAATCAGGCACATCTGCAAGGTGAGCCTTTCTACGTTGACTCCTTGCCCGAAGACATGAATAGGATGAGGCTCGCAGAAACATCTGGGAAAATGGAGGTTGCAGAGGATGATGAGGATGATTGCAGCTCAGAAGATGAGTTCTATTTGCCTAAGGGGCAAGATCCTCTGGTCCCCTTCCAGGGATTTCTTGAGGAAGTAGGGGCAAGGATTGTTAAAAGGATGAAATCAGGGGAAGGGTTTTTTAAGATATGGTCTACAATGACAGAGGACATAAAAGGTTATGTACTCACGAATGTGATGAAGACCAGTTCTAAAACCGTGGAAAACAGGCAAACGCAAACTGACAAACAACTCTCCTCTAATCTGCCTAAAGAACTGACCCCGCCCAAGAGGGAAGACGCACTCAATCCCAAAAAAGCAGAGGAGAGACCCAAGCCAAGCAAGGCTCCAGAGGCGAGCTGGACCAATGAGACTGAAGAAGTCAATGACATAGAGGGAGAAGTTGCCCATCAAGTTGCTGAAAGCTTTTCTAAAAAGTATAAGTTCCCATCTAGATCATCAGGGATCTTCCTATGGAACTTTGAACAGCTCAAAATGAACTTGGATGACATAGTCAAGGCATCCATGAACATACCGGGGGTGGAGAAGATCGCAGAAAAGGGAGGGAAGCTGCCTCTCAGATGTATCCTAGGGTTTGTGGCCTTAGACTCTTCTAAGAGGTTCAGACTATTGGCAGATACAGACAAGGTGGCCAGACTTATGCAAGATGATATCAACAGCTATATGGCCAGGCTGGAAGATGTAGACAGGAATTAGAATGTGGATCAAATTGACTCATTTCAATCAAATTTGGACAAAGCCATGAAAAAAACATGTAACATCCCTAAAAAGATGAATTTCCTGAAGAAAATAGTGAAGACTTGCAAAGATGAGGAGACTCCCAAGTATGGGGCAGCATCAGCGCCTCCTGATGATGATGACCTTTGGATGCCTCCGCCGGAGTATGTCCCTTTGACTCAGGTTAAAGGCAAAGCAAGTGTTCGAAATTTCTGTATCAATGGAGAGATTAAGATATGTAGTCCTAATGGATACTCCTTTAGAATTCTTCGACACATCTTGAAGTCGTTTGATAACGTCTATTCAGGAAACCGAAGAATGATCGGGCTGGTCAAAATAGTAATTGGCTTAGTGTTATCTGGGTCCCCCGTCCCTGAAGGTATGAACTGGGTTTACAAACTTCGCAGAACCTTGATCTTTCAGTGGGCTGAATCTCATGGGCCTCTCGAAGGAGAAGAGCTAGAGTATTCTCAAGAAATAACATGGGATGACGAGGCAGAGTTCGTCGGCTTGCAGATAAGAGTGAGTGCAAGACAATGCCACATCCAGGGAAGGTTGTGGTGCATCAACATGAACTCTAGAGCCTGCCAGCTCTGGGCAGATATGGCCCTAAAGACACAACAATCTCAAGAGGACGAGAACACTTCCCTCCTTTTGGAGTAATTCAAGGCCCAACAAATATATCCGTGATTGTTACCTCCATCTTGAGTAGATATAATCTGTGAGCAATAGAACAAATACAGTAATGGTGCCTGCTTCCAGCACAACATCTATAACCTAAACACTTGTTTATCTCTAGATCCAGGGTTGAGCATAATGTGAAAAAAACTTGTGAACACGGAATAACAACCCTCCCTAATCGCCACCATGAGTCAATTGTTCTCAACCTTCATCTTTTGCTTGTTCATAGGAAGTTCCATAGGAGACTTCCCTCTCTATACAATTCCCGAACGGCTTAATCCCTGGACTCCAATTGACTTAATCCACCTGAGCTGTCCTAACAACTTACTGTCTGATGCTGAGGGGTGCAGTGAAACTTCATCCTTTACCTATGTAGAGCTCAAAACCGGTTTTCTCGCCCATCAGAAAGTGCCGGGGTTCACTTGCACAGGTGTGATAAACGAGGCAGTCACATACACCAACTTTGTTGGATATGTTACTACCACATTTAAGAGAAAACATTTTAAACCAACTGTTTCCGCATGTAGGGATGCCTTCAACTGGAAAGTTTCTGGAGATCCTAGATACGAGGAGTCTTTACATACACCCTATCCGGATAACAGTTGGCTGCGAACTGTCACCACAACCAAAGAATCCTTGTTAATAATCTCTCCAAGCATTGTAGAGATGGATGTATACGGTAGAACTCTCCATTCCCCCATGTTTCCTACAGGAATCTGCTCTAAGTTTTATCCATCAATTCCCTCATGTGCTACCAATCATGATTACACGTTGTGGTTGCCTGAAGACCCTAACTTGAGTTTGATTTGTGACATATTTGTGACAAGCACAGGAAGAAAGGCAATGAATGGGTCTCGTATGTGTGGATTCACAGATGAACGAGGGTTTTATCGAACCCTGAAGGGAGCATGCAAGTTGACCTTGTGTGGGAAACCAGGCCTACGGTTATATGATGGGACATGGGTCTCGTTCACTAGGCCTGAAATCCATGTATGGTGCTCTCCTGATCAGCTGGTGAACGTGCATAACAACCGCATAGACGAAATTGAACATTTGATTGTAGATGACCTCATCAGAAAGAGAGAGGAGTGTTTGGATACACTAGAGACCGTCCTAATGTCTAAGTCGTTAAGTTTCAGAAGGCTCAGTCACTTCCGGAAGTTAGTCCCCGGGTATGGAAAGGCCTATACAATCCTCAATGGGAGTCTGATGGAAACCAATGTTCACTATAAAAGGGTGGATAATTGGGTCGACATACTGCCTTCCAAAGGGTGCCTTAAGGTAAACAATAAATGTATGGAGTCAGACACAGGGGTTTTCTTCAATGGAATCATTAAAGGGCCCGACGGTAGGATTCTCATCCCTGAAATGCAGTCTGGACTGCTAAAACAACATATGGACCTCTTGAAGGCTGCAGTGTTCCCTCTAAGACACCCATTAATTGACAAAGCCTCAGTGTTCAAAAAGGATGGTGATGCAGACGACTTCGTTGATGTCCACATGCCAGACATCCAGAAGCTAGTATCTGATGTCGACTTGGGCTTGCCAAATTGGAGTTTCTTTGCTTTGATAGGTGCCAGTGTAATTGCACTGCTCATTCTAGTATGTCTTCTGAGGATGTGCTGCAAACGGATGAGGAGAAGAAGCTCTGTCAGGGACCAAGTAGCCCCACCGTTTAGCTTATCATCTACTCCTTCTTCTAAGTCAAAGGTGGTGTCATCATGGGAGTCATATAAAGGGACATCAAGTGTCTAATTGACCGCCCTTTAATGCGTTGTTGGTGGATGGAATACAACCCGATTAACTGCCTCTTCATCTGGAAACATTCCACGGTACAGTCGTATCATCTCAGTGGAAGAATTGAGCTATTGCT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GGTATGAGAGAGACAGCATGTGTTCCTCGCCAGAAAGTGAGCTCCTCTGGATATTCTCTGATTTTAGAAGTATCAAAATGACCTATCTGACATTGATAACTTACCAGGCCCATCTATGGCTACAAAAGGTAGAAAGAAATTTGTCAAAACAGATGAGAGCCAAGTTACGCCAATTGAATTCCCTGATGAGGCAGGTGTTGGGGGGCCATGGTGAGGACAACGTAGAGTCAGATGAGGAGATACACTCTCTGCTAAAAGAGGCGTTGAGAAGAACCAGATGGGTGGATCAGGAGGTTCGTCATGCAGCTAAGTCGATGAGTCCAGACTTGAGTCCAATTCCAAGAATATCACGCAAAATCGGATCCTCTGAATGGATATGTTCTGCACAGCAGATCGCAATATCCACCTCTTTGAATCCAGCATTGGCATCAGACATTGATCTAAGATCTCTGTCCCGTCAATTTCAAAACCCGCTCATGTCAGGTCTAAGGATCGTTCAATGGGCGACAGGTGCTCACTACAAGGTAAAGCCCATACTGAATGAACTGGATGTGTGCCCTTGTTTGTCCCTTGTTATCGGGGACGGGTCCGGCGGAATATCTCGAGTCGTTTTGAGTATGTTCCCAGATTCCAAATTGGTCTTCAACAGCTTGTTGGAGGTGAATGATTTAATGGCTTCAGGCACTCACCCCTTGCCTCCGTCTGCACTAATGAGAGGAGGAGAGGAAATAACATCAAGAGTCATCGATTTTGACTCTATATGGGAGAAGCCCTCTGATCTGAGAAACCCTCTCACTTGGAAGTACTTTCATTCCGTGCAGTCTAAACTAAAAACTCAGTTTGACTTAATTGTATGCGATGCAGAGGTTACGGACATTGAGTCAGTAAATAAAATAACACTTCTATTGTCTGACTTCTCTATGTCTATTCGAGGCCCCTTGTGCTTGATTTTTAAAACCTATGGGACCATGCTGGTCAATCCAGATTATAAGGCAATTCACCACTTGTCCAGAGCGTTTCCGAACGTGACAGGGTTTGTCACCCAGATGACATCTTCTTTCTCTTCAGAGGTTTATCTGAAGTTTTCCAAAAAGGGTCACTTCTTTAGAGATCATGAGTTGCTTACGGCTTCTACTATCCGGGAGATGAGCCTGGTTTTGTTCAACTGCAGCAACACCAAAAGCGAGATGTTAAGGGCTAGAACTTTGAATTATCAGGACTTGGTAAGAGGCTTCCCTGAGGAGATTATATCAAACCCTTATAATGAGATGATCATAACGTTGATAGACAGCGAAGTAGAATCGTTCTTGGTTCATAAGATGGTGGATGAGTTGGAGTTGAAGAGAGGCTACCCATCTAAGATGGCTATAATACTCGCAATAACCATAGTATTCTCCAATAGGGTTTTCAATGTGTCTAAATCTCTCAAGGAGTCTAAGTTCTTCCCTCCCTCTGACCCAAAGCTATTGAGACATTTTAACATCTGTTCTAGCACACTTCTGTTTCTATCGACAACATTGGGAGATTTGCCTAACTTCACCAGAATCCACGAACTTTACAACCTCCCTGTCACTTACTACTTCAAGAAGCAAACCATCAGGAGCAAAAAGTACCTATCATGGAGCTGGGCAAGTCCTAGCCCGATATTCAAAAAGGTAGCGTGCAATTCATCTCTGAGTTTGTCAGCTCACTGGATAAGAATGATATACAAGATAGTAAAAACTACCAGACTGAGCTGTCGTCCGAAAGACCTAATCAGGGAGACAGAAGCTTGTCTCAAGAATTATAATAGATGGATAAATATGAGAGATATTAGATCAAGAACATCTCTTATGGATTATTGTTGTCTATAAAAGAGCTTAGGGATGACAAACTGTGTACTAGGTGAAAGTGACTGATACATGCCAAAGAATTTACAGTGAAAAAAACATCTGCAAGTCTCTGAGAGCATCTTAACTTGACTGTTTTTAATTCTTGTATTGTTTTTTTGTTAAGCGT
| 75,918
|
JX901139.1
|
Lyssavirus lagos
|
Kuzmin,I.V., Niezgoda,M., Gilbert,A.T., Markotter,W., Agwanda,B., Breiman,R.F., Rupprecht,C.E.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Rabies Program
|
USA
|
2012-11-14
|
KE476
|
Lyssavirus lagos
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,003
|
GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
|
Rousettus aegyptiacus
|
brain
|
2010
| null | null |
Lagos bat virus isolate KE476, complete genome
|
ACGCTTAACAGCAAAATCAGAGAAGATATAGACATCCACAATGGGATACGCAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCAGACAAGATTGTGTTTAAAGTCCGCAATCAGGTGGTGTCAGTTAAACCAGAAATCATTTCAGATCAGTATGAGTATAAATACCCTGCAATCACAGATGGGAAAAAGCCCGGCATTACACTGGGAAGGGCTCCAGACTTGAACACAGCATACAAGTCAATATTGTCTGGAATGAAGGCTGCCAAGTTAGACCCTGACGATGTGTGTTCTTATTTGGCTGCAGCCATGCAACTTTTCGAAGGCGTCTGTCCAGAAGATTGGGTGAGCTATGGGATCATTATAGCTAGGAAAGGAGAAACTATAACTCCGAATACTTTGATAGACATAACAAGGACAAATGTAGAGGGTAATTGGGCCCAAGCAGGTGGTACTGATGTGATTAGGGACCCAACAGTTGCAGAACATGCATCCCTTGTAGGACTTCTGCTGTGTCTTTATAGACTTAGCAAGATAGTAGGCCAAAATACTGCCAATTATAAGACCAATGTGGCGGACAGGATGGAACAGATTTTCGAGACTGCCCCTTTTGTGAAGATTGTAGAACATCACACTTTGATGACCACACATAAAATGTGTGCAAACTGGTGTACAATCCCGAATTTCAGATTCTTGGTTGGCACATACGACATGTTTTTTGCTCGAATTGAACATCTTTACTCTGCCCTCAGAGTAGGTACAGTGGTGACGGCTTATGAAGATTGCTCAGGATTGGTATCTTTCACAGGCTTCATCAAACAGATTAATTTGTCCGCAAGAGATGCACTTCTTTATTTCTTTCACAAAAACTTCGAGGAGGAGATCAAGAGGATGTTCGAACCAGGTCAGGAGACTGCAGTTCCTCACTCATACTTCATACATTTCAGAGCTCTAGGCCTCAGTGGGAAGTCTCCTTACTCATCTAATGCAGTAGGTCACACTTTCAATCTCATCCATTTTATTGGATGTTATATGGGTCAAATTAGATCTCTAAATGCCACAGTTATTCAGACGTGTGCGCCACACGAGATGTCTGTCTTAGGAGGATATCTAGGTGAAGAGTTCTTCGGGAAAGGAACTTTCGAACGTAGATTCTTTAGAGATGAGAAAGAAATGCAAGATTATGCAGAATTAGAGGGTGCAAAAGTCGAGGCTTCTCTTGCAGATGATGGGACTGTTGATTCAGATGACGAGGACTTCTTTTCAGGAGAAACAAGAAGTCCAGAAGCTGTTTACAGTCGGATAATGATGAACAATGGTAGATTGAAGAAGTCACATATTAGAAGGTACGTTTCTGTGAGCTCTAATCATCAGGCGCGACCGAATTCCTTTGCTGAGTTTCTCAACAAGGTGTACTCTGAAAGTTCATAACCTTGCTGTTTAAACTCAAAAAATCACTACTGGACATAGATCATTGTGATTCACAGAGATAAAGAAAAAAACTCAACACCACTCCTTAATCGATCTTCTCAAAATGAGCAAGGATCTTGTACATCCCAGCCTGCTCAGATCTGGTTTAGTCAAAATAGAGATGGCTGATGAGACTGCAGACCTGGTCAACCGGACCATTGCGGACAATCAGGCTCATTTACAAGGAGAGCCCTTTAGTGTTGACTCATTGCCGGAAGACATGAGTAGGATGAGGATTATTGAGACCTCGGGAAGAATGGAGGTGATCGAGGAAGGAGATGATGAATCCAGTTCAGAAGAGGAATACTATATGCCTCAAGGACAAGACCTGATGGTTCCTTTTCAGAGTTTTCTAGAAGAGGTCGGAGCTCAAGTGGTAAAAAGAATGAAATCAGGGGAGGGCTTTTTCAAAATCTGGTCCACAGTGTCCGAGGATATCAAAGGGTATGTCTCTTCCAACCTCATGAGACCTCGATCCAAATCAACAGAGAGCAAGAATACTCAGACTGACCCTGTCATCTCATCCAAACCGACCCAGGAAGTGGTCCTGACCAAAAAGGATGAAGCATCAGGATCTAGAGGTTTAGGAGGAAAGGGTCCATCCAAAAACACTCCAAAGCCAAGCTGGATCACTGACACAGAGGAAGTCAATGACATAGAGGGGGAAGTTGCCCATCAGGTGGCTGAGAGCTTCTCAAAGAAATACAAATTCCCGTCTCGATCCTCAGGCATCTTCCTCTGGAACTTTGAACAACTCAAGATGAATTTGGATGATATTGTGAAGGCCTCCATGAATATACCAGGGGTGGACAAACTAGCTGAAAGAGGGGGGAAGCTGCCACTAAGATGTATCCTGGGGTTCGTATCTCTGGATTCTTCGAAAAGATTCCGACTTCTAGCTGATGCTGACAAAGTGGCTAAACTCATGCAGGATGATATCAACAACTACATGACCAGATTGGAGGAAATAGACAAAAACTGAAGAATCCCCAAAAATCAGAACACAGATGACATTCGTCTAGATGATAATGAAAAAAACATTCAACACCCCTAACAAAATGAATTTTCTAAGAAAGATAGTTAAGACTTGCAAGGATGAAGAGGCCCCCAAGTATGAAGCAGCCTCTGCTCCTCCAGATGATGATGACCTCTGGATGCCACCCCCTGAATATGTGCCCTTGACTCAAGTCAAAGGCAAGGGAAGTGTTAGGAATTTCTGCATAAATGGAGAGGTCAAAATCTGTAGTCCAAATGGCTATTCTTTCAGGATCCTCAGACATATTCTAAAATCGTTTGACAATGTATACTCTGGGAATCGAAGGATGATCGGACTCGTCAAGATAATAATAGGACTGGTTTTATCTGGATCTCCAGTCCCAGAGGGTATGAACTGGGTTTACAAACTGCGCAGAACTCTGATTTTTCAGTGGGCCGAGTCTCATGGGCCTCTTGAAGGAGAGGAACTAGAGTATTCTCAGGAGATAACATGGGATGACGAGTCAGAATTTGTAGGCCTCCAAATTAGAGTGAGTGCCAAGCAATGCCACATTCAGGGACGATTGTGGTGTATCAACATGAACTCGAGGGCTTGCCAACTTTGGTCGGATATGGCACTGAGAACTCAGCAATCCCAAGAGGATGAGAACACTTCACTTTTGCTGGAGTAACTTCACACCTGGTGAATTTGTATGTGACTGTTACCTCCACATTGAGTAGATATAATCTGTGAGCAATAGAACAAATACTGTAATGGTGCCTGCTTTCAGCACAATGTCTATAACTTGCACACTTGTCTATTTCTAGATTCAGGTTTGAGCAAAATGTGAAAAAAACTCCGAGATAAGAGTCAACAGCACTCCCTGTTTGTCATCATGAGTTACTCGATTTCAACACCTTTTCTGTTCGCTGTGGCTGCAATTTCAGTTGCAGACTTCCCCCTTTACACAATTCCCGAGAAGATCGACTCCTGGACCCCTATAGATATGATCCATCTGAGTTGTCCAAACAACCTTCTGTCAGGGGATGACGGGTGCAGCACATCCACATCTTTCAGTTACGTGGAGCTCAAAACAGGTTATCTGACTCATCAGAAAGTGTCTGGGTTCACCTGTACCGGGGTCATCAATGAGGCTGTTACATACACAAACTTTGTAGGTTATGTGACAACCACATTTAAAAGGAAGCATTTCAAGCCCACGGTCTCAGCTTGTAGAGATGCATTTCATTGGAAGATCTCAGGGGATCCTAGATATGAAGAGTCTCTGCATACACCTTACCCTGACAGTAGTTGGCTAAGGACGGTTACTACAACAAAGGAGTCCTTGCTGATAATCTCCCCCAGCATTGTAGAGATGGATATATATAGTAGAACTCTTCACTCTCCTATGTTTCCCACAGGAACTTGTTCCAGATTTTATCCATCAGTTCCATCCTGCGCTACCAATCACGACTACACCTTGTGGTTGCCAGAAGATTCTAACTTAAGTCTCATCTGTGACATATTCATTACTAGCACAGGTAGAAAAGCAATGAACGGCTCCAAGATGTGTGGGTTCACAGATGAGAGGGGTTTTTACAGGACACTGAGAGGGGCCTGTAAATTGACGCTCTGCGGGAAACCAGGTCTAAGACTATATGATGGAACATGGGTATCCTTTACACGACCGGAAGTTCATGTATGGTGCTCTCCAAATCAACTAGTCAATGTACATAACAACCGTATCGATGAGCTTGAACATCTGATTGTGGATGACCTTATCCAAAAAAGAGAAGCATGTTTAGATACCCTGGAAACAATTCTGATGTCTAAGTCAATCAGTTTCAGGAGACTCAGTCATTTCAGAAAGTTGGTACCCGGATATGGAAAGGCTTACACCATATTAAATGGGAGCTTGATGGAGACAAATGTCCACTACAGAAGGGTGGACAATTGGACTGATATCTTGCCATCGAAAGGATGTCTGAAAGTGGGGAACAAATGCCTTGATCCCCATAAAGGAGTTTATTTCAATGGTATTATTAAGGGTCCTGATGGTCATATTTTAATCCCAGAGATGCAGTCGGGCATGCTGAAACAGCATATAGATCTTCTGAAGGCAGCGGTTTTTCCCCTCCGTCACCCTCTTATAGATCAGAGTTCTGTGTTCAAAAAAGATGGTGATGCAGATGATTTTGTTGATGTTCACATGCCGGATGTGAACAAGTTAGTATCGGACATAGATCTAGGGTTCCATCACTGGGGTCTGTTCATTCTGATAGGAGTGACAGTATTGGCGTTTCTAGTTCTGATATGTCTTCTTTGTATCTGTTGTAAGAGAGTGAAGAGTGGAAGGTCTACTAGGGATAGGACGGACCCGTCATTAGCATTATCTTCAATCTCTCAATCAAAACCGAAAGTGGTGTCATCTTGGGAGTCTTACAAGGGCTCTTCAAATGCCTAAGAGCTCGCTCTTCGGATGGGTCGGATAGGAAGATGCAACCCTATCAGCTGCCTCCTCATCTTAAAACATTCCACTATACGGTTTTTCATTTTTTTGAG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| 95,803
|
GU170202.1
|
Lyssavirus lagos
|
Kuzmin,I.V., Mayer,A.E., Niezgoda,M., Markotter,W., Agwanda,B., Breiman,R.F., Rupprecht,C.E.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Rabies Program
|
USA
|
2010-03-23
|
KE576
|
Lyssavirus lagos
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,003
|
GenBank
| 1
|
Kenya
|
Kenya
|
Rousettus aegyptiacus
|
brain
| null | null | null |
Lagos bat virus isolate KE576, complete genome
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ACGCTTAACAGCAAAATCAGAGAAGATATAGACATCCACAATGGGATACGCAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCAGACAAGATTGTGTTTAAAGTCCGCAATCAGGTGGTGTCAGTTAAACCAGAAATCATTTCAGATCAGTACGAGTATAAATACCCTGCAATCACAGATGGGAAAAAGCCCGGCATTACACTGGGAAGGGCTCCAGACTTGAACACAGCATACAAGTCAATATTGTCTGGAATGAAGGCTGCCAAATTAGACCCTGACGATGTGTGTTCTTATTTGGCTGCAGCCATGCAACTTTTCGAAGGCATCTGTCCAGAAGATTGGGTGAGCTATGGGATCATTATAGCTAGGAAAGGAGAAACTATAACTCCGAATACTTTGATAGACATAACAAGGACAAATGTAGAGGGTAATTGGGCCCAAGCAGGTGGTACTGATGTGATTAGGGACCCAACAGTTGCAGAACATGCATCCCTTGTAGGACTTCTGCTGTGTCTTTATAGACTTAGCAAGATAGTAGGCCAAAATACTGCCAATTATAAGACCAATGTGGCAGACAGGATGGAACAGATTTTCGAGACTGCCCCTTTTGTGAAAATTGTAGAACATCACACTTTGATGACCACACATAAAATGTGTGCAAACTGGTGTACAATCCCGAATTTCAGATTCTTGGTTGGCACATACGACATGTTTTTTGCTCGAATTGAACATCTTTACTCTGCCCTCAGAGTAGGTACAGTGGTGACGGCTTATGAAGACTGCTCAGGATTGGTATCTTTCACAGGCTTCATCAAACAGATTAATTTGTCCGCAAGAGATGCACTTCTTTATTTCTTTCACAAAAACTTCGAGGAGGAGATCAAGAGGATGTTCGAACCAGGTCAGGAGACTGCAGTTCCTCACTCATACTTCATACATTTCAGAGCTCTAGGCCTAAGTGGGAAGTCTCCTTACTCATCGAATGCAGTAGGTCACACTTTCAATCTCATCCATTTTATTGGATGCTATATGGGTCAAATTAGATCTCTAAATGCCACAGTTATTCAGACGTGTGCGCCACATGAGATGTCTGTTTTAGGAGGATATCTAGGTGAGGAGTTCTTCGGGAAAGGAACTTTCGAACGTAGATTCTTTAGAGATGAGAAAGAAATGCAAGATTATGCAGAATTAGAGGGTGCAAAAGTCGAGGCTTCTCTTGCAGATGATGGGACTGTTGATTCAGATGACGAGGACTTCTTTTCAGGAGAAACGAGAAGTCCAGAAGCTGTTTACAGTCGGATAATGATGAACAATGGTAGATTGAAGAAGTCACATATCAGAAGGTACGTTTCTGTGAGCTCTAATCATCAGGCGCGACCGAATTCCTTTGCTGAGTTTCTCAACAAGGTATATTCTGAAAGTTCATAACCTTGCTGTTCAAACTCAAAAGAGCACTGCTGAACATAGATCATTGTGATTCACAGAGATAAAGAAAAAAACTCAACACCACTCCTTAATCGATCTTCTCAAAATGAGCAAGGATCTTGTACATCCCAGCCTACTCAGATCTGGTTTAGTCAAAATAGAGATGGCTGATGAGACTGCGGACCTGGTCAACCGGACCATTGCGGACAATCAGGCTCATTTACAAGGAGAGCCTTTTAGTGTTGACTCACTGCCGGAAGACATGAGAAGGATGAGGATTATTGAGACCTCGGGAAGAATGGAGGTGATCGAGGAAGGAGATGATGAATCCAGTTCAGAAGAGGAATACTATATGCCTCAAGGACAAGACCTGATGGTTCCTTTTCAGAGTTTTCTAGAGGAGGTTGGAGCTCAAGTGGTAAAAAGAATGAAATCAGGGGAGGGCTTTTTCAAAATCTGGTCCACAGTGTCCGAAGATATCAAAGGGTATGTCTCTTCCAACCTCATGAGACCTCGATCCAAATCAACAGAGAGCAAGAATACTCAGACAGACCCTGTCATCCCATCCAAACCGACCCAGGAAGTGGTCTTGACCAAAAAGGATGAAGCATCAGGATCTAGAGGTGTGGGAGGAAAGGGTCCATCCAAAAACACTCCAAAGCCAAGCTGGATCAATGACACAGAGGAAGTCAATGACATAGAGGGGGAAGTTGCCCATCAGGTGGCTGAGAGCTTCTCAAAGAAATACAAATTCCCGTCTCGATCCTCAGGCATCTTCCTCTGGAACTTTGAACAACTCAAGATGAATTTGGATGACATTGTGAAGGCCTCCATGAATATACCGGGGGTGGACAAACTAGCTGAAAGAGGGGGGAAGCTGCCACTAAGATGTATCCTGGGGTTCGTATCTCTGGATTCTTCGAAAAGATTCCGACTTCTAGCTGATGCTGACAAAGTAGCTAAACTCATGCAGGATGATATTAACAACTACATGACCAGATTGGAGGAAATAGACAAAAACTGAAGAATCCCCAAAAATCAGAACACAGATGACATTCGTCTAGATGATAATGAAAAAAACATTCAACACCCCTAACAAAATGAATTTTCTAAGAAAGATAGTTAAGACTTGCAAGGATGAAGAGGCCCCCAAGTATGAAGCGGCCTCTGCTCCTCCAGATGATGATGACCTCTGGATGCCACCCCCTGAGTATGTGCCCTTGACTCAGGTCAAAGGTAAGGGAAGTGTTAGGAATTTCTGCATAAATGGAGAGGTCAAAATCTGTAGTCCAAATGGCTATTCTTTCAGGATCCTCAGACATATTCTAAAATCGTTTGACAATGTATACTCTGGGAATAGAAGGATGATCGGACTCGTCAAGATAATAATAGGACTGGTCTTATCTGGATCTCCGGTCCCAGAGGGTATGAACTGGGTTTACAAACTGCGCAGAACTCTGATTTTTCAGTGGGCCGAGTCTCATGGGCCTCTTGAAGGAGAGGAACTAGAGTATTCTCAGGAGATAACATGGGATGATGAGTCGGAATTTGTAGGCCTCCAAATTAGAGTGAGTGCCAGGCAATGCCACATTCAGGGACGATTGTGGTGTATTAACATGAACTCGAGGGCTTGCCAACTTTGGTCGGATATGGCACTGAGAACTCAGCAATCCCAAGAGGATGAGAACACCTCACTTTTGCTGGAGTAACTTCACACCTGGTGAATTTGTATGTGACTGTTACCTCCACATTGAGTAGATATAATCTGTGAGCAATAGAACAAATACTGTAATGGTGCCTGCTTTCAGCACAATGTCTATAACTTGCACACTTGTCTATTTCTAGATTCAGGTTTGAGCAAAATGTGAAAAAAACTCCGAGATAAGAGTCAACAGCACTCCCTGTTTGTCATCATGAGTTACTCGATTTCAACACCTTTTCTGTTCGCTGTGGCTGCAATTTCAGTTGCAGACTTCCCCCTTTACACAATTCCCGAGAAGATCGACTCCTGGACGCCTATAGATATGATCCATCTGAGTTGTCCAAATAACCTTTTGTCAGGGGATGACGGGTGCAGCACATCCACATCCTTCAGTTACGTGGAGCTCAAAACAGGTTATCTGACTCATCAGAAAGTGTCTGGGTTCACCTGTACCGGGGTCATCAGTGAGGCTGTTACATACACAAACTTTGTAGGTTATGTGACAACCACATTTAAAAGGAAGCATTTCAAGCCCACGGTCTCAGCCTGTAGAGATGCATTTCATTGGAAGATCTCAGGGGATCCTAGATATGAAGAGTCTCTGCATACGCCTTACCCTGACAGTAGTTGGTTAAGAACGGTCACCACAACAAAGGAATCCTTGCTGATAATCTCCCCCAGCATTGTAGAGATGGATATATATAGTAGAACTCTTCACTCTCCTATGTTTCCCACAGGAACTTGTTCCAGATTTTATCCATCAGTTCCATCCTGCGCTACCAATCACGATTACACCTTGTGGTTGCCAGAAGATTCTAACTTAAGTCTCATTTGTGACATATTCGTTACTAGCACAGGTAGAAAAGCAATGAACGGCTCCAAGATGTGTGGGTTCACAGATGAGAGGGGTTTTTACAGAACACTGAGAGGGGCCTGTAAATTGACGCTCTGCGGGAAACCAGGTCTAAGACTATATGATGGAACATGGGTATCCTTTACACGACCGGAAGTTCATGTATGGTGCTCCCCGAATCAACTAGTCAATGTGCATAATAACCGTATCGATGAGCTTGAGCATCTGATTGTGGATGACCTTATCCAAAAAAGAGAAGCATGTTTAGATACCCTGGAAACAATTCTGATGTCTAAGTCAATTAGTTTCAGGAGACTCAGTCATTTCAGAAAGTTGGTACCTGGATATGGAAAGGCTTACACCATATTAAACGGGAGCTTGATGGAGACAAATGTCCACTACAGAAGGGTGGACAATTGGACTGATATCTTACCATCGAAAGGATGTCTGAAAGTGGGGAACAAATGCCTTGATCCCCATAAAGGAGTTTATTTCAATGGTATTATTAAGGGTCCGGATGGTCATATTTTAATCCCAGAGATGCAGTCGGGCATGCTGAAACAGCATATAGATCTTCTGAAGGCAGCGGTTTTTCCCCTCCGTCACCCTCTTATAGATCAGAGTTCTGTGTTCAAAAAAGATGGTGATGCAGATGATTTTGTTGATGTTCACATGCCGGATGTAAACAAGTTAGTATCGGACATAGATCTAGGGTTCCATCACTGGGGTCTGTTCATTCTGATAGGGGTGACAGTATTGGCGTTTCTTGTTCTGATATGTCTTCTTTGTATTTGTTGTAAGAGAGTGAAGAGGGGAAGGTCTACTGGGGATAGGACGGACCCGTCATTAGCATTATCTTCAATCTCTCAATCAAAACCGAAAGTGGTGTCATCTTGGGAGTCTTACAAGGGCTCCTCAAATGCCTAAGATCTCGCTCTTCGGATAGGTCGGATAGGAAGATGCAACCCTATCAGCTGCCTCCTCATCTTAAAACATTCCACTATACGGTTTTTCATTTTTTTGAG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| 101,173
|
EU293108.1
|
Lyssavirus lagos
|
Delmas,O., Holmes,E.C., Talbi,C., Larrous,F., Dacheux,L., Bouchier,C., Bourhy,H.
|
Institut Pasteur, UPRE Lyssavirus Dynamics and Host Adaptation, WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Rabies
|
France
|
2008-04-23
|
0406SEN
|
Lyssavirus lagos
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,016
|
GenBank
| 1
|
Senegal
|
Senegal
|
Eidolon helvum
| null |
1985
| null | null |
Lagos bat virus isolate 0406SEN, complete genome
|
ACGCTTAACAGCAAAATCAGAGAAGATATAGACAGCGACAATGCGCTGAACAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGACAAGATTGTTTTTAAGGTTCACAATCAGATCGTATCTTTAAAGCCTGAGATTATATCAGACCAATATGAATATAAGTATCCAGCTATCACAGATGGGAAGAAGCCGGGCATCACTCTCGGGAAGGCCCCAGACCTGAGTACGGCTTACAAGTCGATATTGTCAGGCATGAATGCTGCCAAATTAGATCCAGATGATGTGTGTTCTTATCTGGCCGCAGCAATGCAGTTCTTCGAAGGAGTGTGTCCTGAGGACTGGGTCAGCTATGGGATTATCATAGCGAAGAAAGGGGAGACAATAACTCCCAATGTTTTGGTAGATATAACCAGGACAAATGTGGAAGGAAACTGGGCGCAAGCAGGGGGGGCAGATATGACTAGGGACCCCACGATTGCTGAACATGCCTCTTTAGTGGGACTCTTGCTTTGTCTTTATAGACTGAGTAAGATAGTGGGTCAAAACACAGCTAATTACAAGACCAATGTAGCAGATAGGATGGAGCAGATCTTCGAAACTGCTCCCTTTATAAAAGTGGTGGAGCATCACACCCTGATGACAACTCACAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACTATCCCAAACTTCAGGTTTTTGGCAGGTACATATGACATGTTTTTTGCCAGAATTGAACATCTTTATTCTGCTATTAGGGTCGGCACTGTGGTGACTGCTTATGAAGACTGTTCAGGATTGGTATCTTTCACTGGATTCATTAAACAGATCAACTTATCCGCGAGAGATGCTCTCCTGTACTTTTTCCATAAAAACTTCGAAGAGGAAATTAAAAGAATGTTTGAGCCAGGACAAGAAACTGCTGTTCCCCATTCATATTTTATCCACTTCAGGGCTTTGGGACTCAGCGGGAAATCTCCTTACTCATCAAATGCTGTGGGTCATACCTTTAATTTGATCCATTTCATAGGTTGTTATATGGGGCAGATACGATCTCTAAATGCAACTGTGATTCAGACATGTGCACCCCATGAGATGTCTGTTTTGGGGGGATATTTAGGGGAGGAGTTTTTTGGGAAGGGAACTTTTGAGAGGAGATTCTTTAGAGATGAGAAGGAGATGCAAGACTATGCGGAGTTAGAGGGCGCAAAGGTTGAAGCATCTTTGGCGGATGATGGAACAGTTGATTCTGACGATGAGGAGTTTTTCTCTGGTGAAACCAGGAGTCCAGAGGCCGTATATAGCAGGATTATGATGAACAATGGTCGACTGAGGAAGTCTCATATACAGAGATATGTGTCTGTAAGCTCAAACCACCAGGCTCGCCCAAACTCTTTTGCGGAATTCCTCAACAAAGTGTACTCGGAGAGCTCTTGAGTCTTAAATTTTAGTTTTTGACACAAACAACGAAGGTGCATCGCTGTGCAGGAAGATTTAAGAAAAAAACTCAACACCACTCCTTGATCCATCATCTCAGCATGAGTAAGGATCTGGTGCATCCCAGCTTGGTGCGTGCAGGGTATGTGGAGTTGGAGATGGCCGATGAGACTGCTGATGTGGTCAATTTGACTATAGCGAGTAATCAGGCACATCTGCAAGGTGAGCCTTTCTACGTTGACTCCTTGCCCGAAGACATGAATAGAATGAGGCTCGCAGAAACATCTGGGAAAATGGAGGTTGCAGAGGATGATGAGGATGATTGCAGCTCAGAAGATGAGTTCTATTTGCCTAAGGGGCAAGATCCTCTGGTTCCCTTCCAGGGATTTCTTGAGGAAGTAGGGGCAAGGATTGTTAAAAGGATGAAGTCAGGGGAAGGGTTTTTTAAGATATGGTCTACAATGACAGAGGACATAAAAGGTTATGTACTCACGAATGTGATGAAGACCAGTTCTAAAACCGTGGAAAACAGGCAAACGCAAACTGACAAACAACTCTCCTCTAATCTGCCTCAAGAACTGACCCCGCCCAAGAGGGAAGAAGCACTCAATCCCAAAAAGGCAGAGGAGAGACCCAAGCCAAGCAAGGCTCCAGAGGTGAGTTGGACTAATGAGACTGAAGAAGTCAATGACATAGAGGGAGAGGTTGCCCATCAAGTTGCTGAAAGCTTTTCTAAAAAGTATAAGTTCCCATCTAGATCATCAGGGATCTTCTTATGGAACTTTGAACAGCTCAAAATGAATTTGGATGATATAGTCAAGGCATCAATGAACATACCGGGGGTGGAGAAGATCGCAGAAAAGGGAGGGAAGCTGCCTCTCAGATGTATCCTAGGGTTTGTGGCCTTAGACTCTTCTAAGAGGTTCAGACTATTGGCAGATACAGACAAGGTGGCCAGACTTATGCAAGATGATATCAACAGCTATATGGCAAGGCTGGAAGATGTAGACAGGAATTAGAATGTTGATCAAATTGACTCATTTCAATCAAATTTGGACAAAGCCATGAAAAAAACATGTAACATCCCTAAAAAGATGAATTTCCTGAAGAAAATAGTGAAGACTTGCAAAGATGAGGAGACTCCCAAGTATGGGGCAGCATCAGCTCCTCCTGATGATGATGACCTTTGGATGCCTCCGCCGGAGTATGTCCCTTTGACTCAGGTTAAAGGCAAAGCAAGTGTTCGAAATTTCTGTATCAATGGAGAGATTAAGACATGTAGTCCTAATGGATACTCCTTTAGAATTCTTCGACACATCTTGAAGTCGTTTGATAACGTCTATTCAGGAAACCGAAGAATGATCGGGCTGGTCAAAATAGTAATTGGCTTAGTGTTATCTGGGTCCCCCATCCCTGAAGGTATGAACTGGGTTTACAAACTTCGCAGAACCCTGATCTTTCAGTGGGCTGAATCTCATGGGCCTCTAGAAGGAGAAGAGCTAGAGTATTCTCAAGAAATAACATGGGATGACGAGGCAGAGTTCGTCGGCTTGCAGATAAGAGTGAGTGCAAGACAATGCCACATCCAGGGAAGGTTGTGGTGCATCAACATGAACTCTCGAGCCTGCCAGCTCTGGGCAGATATGGCCCTAAAGACACAACAATCTCAAGAGGACGAGAACACTTCCCTCCTTTTGGAGTAATTCAAGGCCCAACAAATATATCCGTGATTGTTACCTCCATCTTGAGTAGATATAATCTGTGAGCAATAGAACAAATACAGTAATGGTGCCTGCTTCCAGCACAACATCTATAACCTAAACACTTGTTTATCTCTAGATCCAGGGTTGAGCATAATGTGAAAAAAACTTGTGAACACGGAATAACAACCCTCCCTAATCGCCACCATGAGTCAATTGTTCTCAACCTTCATCTTTTGCTTGTTCATAGGAAGTTCCATAGGAGACTTCCCTCTATATACAATTCCCGAACGGCTTAATCCCTGGACTCCAATTGACTTAATCCACCTGAGCTGTCCTAACAACTTACTGTCTGATGCTGAGGGGTGCAGTGAAACTTCATCCTTTACCTATGTAGAGCTCAAAACCGGTTTTCTCGCCCATCAGAAAGTGCCGGGGTTCACTTGCACAGGTGTGATAAACGAGGCAGTCACATACACCAACTTTGTTGGATATGTTACTACCACATTTAAGAGAAAACATTTTAAACCAACTGTTTCCGCATGTAGGGATGCCTTCAACTGGAAAGTTTCTGGAGATCCTAGATACGAGGAGTCTTTACATACACCCTATCCGGATAACAGTTGGCTGCGAACTGTCACCACAACCAAAGAATCCTTGTTAATAATCTCTCCAAGCATTGTAGAGATGGATGTATACGGTAGAACTCTCCATTCCCCCATGTTTCCTACAGGAATCTGCTCTAAGTTTTATCCATCAATTCCCTCATGTGCTACCAATCATGATTACACGTTGTGGTTGCCTGAAGACCCTAACTTGAGTTTGATTTGTGACATATTTGTGACAAGCACAGGAAGAAAGGCAATGAATGGGTCTCGTATGTGTGGATTCACAGATGAACGAGGGTTTTATCGAACCCTGAAGGGAGCATGCAAGTTGACCTTGTGTGGGAAACCAGGCCTACGGTTATATGATGGGACATGGGTCTCGTTCACTAGGCCTGAAATCCATGTATGGTGCTCTCCTGATCAGCTGGTGAACGTGCATAACAACCGCATAGACGAAATTGAACATTTGATTGTAGATGACCTCATCAGGAAGAGAGAGGAGTGTTTGGATACACTAGAGACCGTCCTAATGTCTAAGTCGTTAAGTTTCAGAAGGCTCAGTCACTTCCGGAAGTTAGTCCCCGGGTATGGAAAGGCCTATACAATCCTCAATGGGAGTCTGATGGAAACCAATGTTCACTATAAAAGGGTGGATAATTGGGTCGACATACTGCCTTCCAAAGGGTGCCTTAAGGTAAACAATAAATGTATGGAGTCAGACACAGGGGTTTTCTTCAATGGAATCATTAAAGGGCCCGATGGTAGGATTCTCATCCCTGAAATGCAGTCTGGACTGCTAAAACAACATATGGACCTCTTGAAGGCTGCAGTGTTCCCTCTAAGACACCCATTAATTGACAAAGCCTCAGTGTTCAAAAAGGATGGTGATGCAGACGACTTCGTCGATGTCCACATGCCAGACATACAGAAGCTAGTATCTGATGTCGACTTGGGCTTGCCAAATTGGAGTTTCTTTGCTTTGATAGGTGCCAGTGTAATTGCACTGCTCATTCTAGTATGTCTTCTGAGGATGTGCTGCAAACGGATGAGGAGGAGAAGCTCTGTCAGGGATCAAGTAGCCCCACCGTTTAGCTTATCTTCTACTCCTTCTTCTAAGTCAAAGGTGGTGTCATCATGGGAGTCATATAAAGGGACATCAAGTGTCTAATTGACCACCCTTTAATGCGTTGTTGGTGGATGGAATACAACCCGATTAACTGCCTCTTCATCTGGAAACATTCCACGGTACAGTCGTATCATCTCAGTGGA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| 105,574
|
EU293110.1
|
Lyssavirus lagos
|
Delmas,O., Holmes,E.C., Talbi,C., Larrous,F., Dacheux,L., Bouchier,C., Bourhy,H.
|
Institut Pasteur, UPRE Lyssavirus Dynamics and Host Adaptation, WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Rabies
|
France
|
2008-04-23
|
8619NGA
|
Lyssavirus lagos
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,006
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Eidolon helvum
| null |
1956
| null | null |
Lagos bat virus isolate 8619NGA, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCAGAGAAGACATAGACACCTACAATGAGGTAATCAAAATGTAACACTACTACAATGGATTCAGAAAGGATTGTTTTCAGAGTTCATAATCAGGTAGTGTCACTCAAACCAGAGATTATATCAGATCAATATGAATATAAATATCCAGCTATTACAGATGGGAAAAAACCAGGCATCACTTTAGGAAGGGCTCCTGATTTGAGCACAGCATACAAGTCTATATTGTCTGGTATGAATGCCGCCAAGTTAGATTCAGATGACGTTTGCTCCTATCTGGCTGCAGCTATGCAACTCTTTGAAGGGGTCTGTCCAGAGGATTGGATAAGTTACGGAATACATATAGCAACAAAAGGAGAAACCATCACTCCGGATGTTTTGATAGATGTGACCAGGACAAACGTGGAGGGGAATTGGGCTCAAGCAGGAGGAACAGACATGACAAGAGATCCCACAATTGCTGAACATGCTTCTCTAGTAGGACTTTTGCTGTGTCTATATCGTCTGAGCAAAATAGTGGGTCAGAACACAGCAAATTACAAAACCAATGTAGCAGACAGAATGGAGCAGATTTTCGAGACAGCCCCCTTTGTTAAAGTTGTAGAGCATCACACTTTGATGACCGTCCACAAAATGTGTGCAAATTGGAGCACAATCCCCAACTTCAGATTTTTGGCAGGGACTTACGACATGTTTTTTGCAAGGGTTGAACATCTCTACTCTGCTCTTAGGGTTGGCACAGTTGTAACTGCTTACGAGGATTGCTCCGGACTGGTGTCTTTTACAGGGTTCATTAAACAGATCAACCTATCTGCACGAGACGCGCTCTTATATTTCTTTCACAAGAAGTTTGAAGAAGAGATTAAAAGAATGTTTGAACCTGGTCAAGAAACAGCTGTTCCTCATTCATATTTCATACATTTTAGGGCATTGGGGTTGAGTGGAAAGTCTCCTTATTCATCCAACGCAGTGGGTCATACATTCAACCTGATTCACTTCATAGGATGTTATATGGGTCAGATAAGATCACTTAATGCGACCGTAATTCAGACTTGTGCACCTCATGAGATGTCAGTATTGGGGGGGTATCTTGGTGAAGAGTTCTTTGGAAAGGGGACCTTCGAAAGAAGATTCTTCCGAGATGAGAAAGAAATGCAAGATTATGCCGACTTAGAAGGAGCAAGAGTAGAGGCATCTTTGGCAGATGACGGGACGGTAGACTCTGATGATGAGGACTTCTTCTCTGGAGAGACAAGGAGCCCTGAAGCAGTCTACAGCAGAATCATGATGAACAATGGCAGATTGAAGAAATCTCACATACGCAGATATGTTTCTGTCAGTTCGAACCATCAGGCCCGGCCGAATTCCTTTGCAGAATTCCTCAACAAGGTGTATTCAGAGAGCTCATAACTCTACTGCTTACGCTCCAAGCGCAAGCGCATCGAACGGTACATATTATTGAAGGAGGATAGAAAAAAACTCAACATCTCTCCTCAAGTCATCTCTCCAACATGAGCAAGGGATTAATACACCCTAGTGCCATCCGCTCAGGCTTGGTAGATTTGGAGATGGCTGAGGAAACTGTGGACTTGGTTCATAAAAATCTTGCAGACAGTCAAGCACATTTGCAAGGGGAGCCCTTAAATGTCGACTCCTTGCCGGAAGATATGAGGAAGATGAGGTTGACGAATGCCCCGAGTGAGAGAGAAATCATTGAAGAAGATGAAGAGGAATATAGCTCTGAGGATGAATACTATCTGTCTCAGGGGCAAGACCCTATGGTTCCATTCCAGAATTTCCTCGACGAACTTGGGACACAAATAGTCAGGAGGACGAAATCAGGAGATGGCTTTTTCAAAATCTGGTCCGCAGCATCAGAGGATGTAAAAGGGTATGTTCTCTCCACCTTCATGAAGCCAGAAACACAGGCTACAGTGAGCAAACAAACACAGACAGACTCACTATCTGTTCCGAGACCTTCCCAGGGGTACACTTCTGTCCCGAGGGATAAGCCATCCAACTCTGAGTCACAAGGGGGAGGGATCAAGCCTAAGAAAGTTCAGAAATCAGAGTGGACTAGAGATACTGATGAAATCAGTGATATTGAAGGAGAAGTCGCACATCAAGTTGCTGAGAGTTTTTCAAAGAAATATAAATTCCCGTCTAGATCATCTGGGATTTTCTTGTGGAACTTCGAACAACTCAAAATGAATCTGGATGACATAGTCAAAACCTCAATGAATGTCCCTGGAGTAGACAAAATTGCAGAGAAAGGAGGAAAGCTGCCGCTGAGGTGCATTTTGGGGTTCGTCTCTCTAGATTCTTCTAAGAGATTTCGCCTCCTTGCGGACACTGACAAGGTGGCCAGACTCATGCAGGATGACATCCACAACTACATGACTAGAATTGAGGAGATAGATCACAATTAGAAAATTCTCAAAAATGAGCTGATTCCGATCAACATGGGTAAAATCTTGGAAAAAACATGCAACACCCCTAGAACCATGAATTTCCTGAGGAAGATAGTGAAGAATTGCAAAGATGAAGAGATCCCAAAGCCCGGGACTCCATCAGCTCCTCCTGATGATGATGACCTTTGGATGCCTCCCCCAGAGTATGTGCCTTTGACTCAAATTAAGGGCAAAGAGAATGTTAGAAACTTTTGTATAAATGGAGAGATCAAAATATGTAGCCCCAATGGTTACTCTTTTAGGATCCTTAGACATATATTGAAATCTTTTGACAATGTTTATTCTGGGAATAGAAGACTGATCGGGGTAGTCAAAATGGTGATCGGCCTGGTTTTATCTGGATCTCCTGTCCCGGAGGGCATGAATTGGGTTTATAAACTCCGTAGAACTTTGATTTTTCAATGGGCAGAGTCCCATGGTCCTCTTGAGGGAGAAGAACTAGAATACTCCCAAGAGATTACATGGGATGACGAGGCAGAGTTTGTAAGCCTACAAATTAGAGTCAGTGCCAAACAATGCCACATCCAGGGGAGGCTGTGGTGTATCAATATGAACTCTAAGGCATGTCAACTCTGGGCAGATATGGGCCTAAAAACCCAGCAATCTCAAGAAGATGAGAACACTTCACTTCTGTTGGAATAATATAGAGCTCAGTGAACATGTCTCTATCTGTTACCTCTGTTTTGAGTAGATATAATCTGTGAGCAATAGAACAAATACAGCTATGGTGCCTGCTTCAAATACAAAATCTATGAATTTCGCACTCGGTCATCTTTAGAATCAGGTCTGAGCAAAATGTGAAAAAAACTTTTTAATAAGATTTAACAGCCCTCCCCACTTGTCACCATGAGTCAACTAAATTTGATACCCTTTTTCTGTGTAATTATAGTCTTGTCTGTAGAGGACTTTCCTCTATATACAATTCCTGAAAAGATAGGTCCTTGGACTCCGATCGACCTGATCCATCTGAGCTGTCCTAATAATTTGCAGTCAGAGGATGAAGGATGTGGTACCTCATCAGTCTTCAGTTATGTAGAGCTCAAGACAGGTTATCTCACTCATCAGAAAGTGTCTGGGTTCACCTGTACAGGAGTGGTTAATGAGGCTGTCACATACACTAACTTTGTCGGATATGTGACAACCACCTTTAAGCGGAAACATTTCAAGCCGACGGCATTGGCTTGCAGAGATGCTTATCATTGGAAGATTTCTGGGGATCCAAGGTATGAGGAGTCTCTCCACACACCATATCCTGACAACAGCTGGTTGAGGACAGTTACCACAACCAAAGAATCTCTTGTGATAATCTCTCCAAGCATTGTGGAGATGGATGTATATAGTAGAACACTTCATTCTCCCATGTTTCCCACCGGGACCTGTTCTAGGTTCTATCCGTCATCCCCTTCTTGTGCCACAAATCATGATTACACTTTATGGCTTCCAGATGACCCTAATCTGAGTTTGGCATGTGATATCTTTGTGACCAGCACAGGGAAAAAGTCAATGAATGGCTCTAGAATGTGTGGATTTACAGACGAGAGAGGGTATTACCGGACAATAAAAGGAGCTTGTAAACTGACATTATGTGGGAAACCAGGTTTGAGGTTATTTGATGGCACATGGATATCCTTCACCCGCCCGGAAGTCACTACCCGGTGCCTTCCTAATCAGTTAGTCAATATTCACAACAATAGGATAGATGAAGTTGAGCATCTGATTGTAGAAGATCTCATTCGAAAAAGAGAAGAGTGTTTGGACACTTTAGAGACAGTTTTAATGTCCAAATCAATCAGTTTTAGACGACTAAGTCACTTCAGAAAATTAGTGCCAGGATATGGGAAGGCTTACACTATTTTAAATGGGAGCTTAATGGAAACTAACGTTCATTATTTAAAGGTTGACAATTGGAGTGAAATACTGCCTTCCAAGGGATGTTTAAAAATAAACAATCAGTGTGTTGCTCATTATAAGGGGGTCTTCTTTAACGGGATCATCAAGGGACCAGATGGTCATATTTTAATTCCGGAGATGCAGTCAAGTTTGTTGAAACAGCACATGGACCTCTTGAAGGCAGCGGTTTTTCCCTTGAGACATCCTCTGATTGAACCGGGCTCTTTGTTCAATAAGGATGGTGATGCCGATGAATTTGTTGATGTCCACATGCCTGATGTACATAAGTTGGTATCAGATGTCGACTTGGGGCTACCCGATTGGAGCCTTTATGCGTTGATAGGGGCAACTATTATAGCTTTCTTTATACTGATATGTCTTATTCGTATCTGCTGCAAGAAGAGGGGTCGGAGAAACTCTCCCACAAATAGACCTGATCTTCCTATAGGGTTGTCTACTACACCTCAACCCAAGTCTAAAGTGATATCATCATGGGAATCTTATAAGGGTACCTCTAATGTCTGATGCTGCCTTCTTGGAGGGATCTCCAGCAGATAACTTACAACCCAACTAACTGCCTCTTCATTTTTGAACATTCCACGATACAATCATCTCATTGGGTGATG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| 105,576
|
EU259198.1
|
Lyssavirus lagos
|
Kuzmin,I.V., Niezgoda,M., Franka,R., Agwanda,B., Markotter,W., Beagley,J.C., Urazova,O.Y., Breiman,R.F., Rupprecht,C.E.
|
Centers for Disease Control and Prevention, CCID/NCZVED/DVRD/PRB
|
USA
|
2008-04-03
|
KE131
|
Lyssavirus lagos
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 12,017
|
GenBank
| 1
|
Kenya
|
Kenya
|
Eidolon helvum
|
brain
| null | null | null |
Lagos bat virus isolate KE131, complete genome
|
ACGCTTAACAGCAAAATCAGAGAAGATATAGACAGCGACAATGCGCTAAACAAAATGTAACACCCCTACAATGGATTCTGACAAGATTGTTTTCAAGGTTCATAATCAGATCGTATCTTTAAAGCCTGAGATTATATCAGACCAATATGAATATAAGTATCCAGCTATCACAGATGGGAAGAAGCCGGGCATCACTCTCGGGAAGGCCCCAGACCTGAGTACAGCTTACAAGTCGATATTGTCAGGCATGAATGCTGCCAAATTAGACCCAGATGATGTGTGTTCTTATCTGGCCGCAGCAATGCAGTTCTTCGAAGGAGTGTGTCCTGAGGACTGGGTCAGCTATGGGATTATCATAGCGAAGAAAGGGGAGACAATAACTCCCAATGTTTTGGTAGATATAACCAGGACAAATGTGGAAGGAAACTGGGCGCAAGCAGGGGGGGCAGATATGACAAGGGATCCCACGATTGCTGAACATGCCTCTTTAGTGGGACTCTTGCTTTGTCTTTATAGACTGAGTAAGATAGTGGGTCAAAACACAGCTAATTACAAGACCAATGTGGCAGATAGGATGGAGCAGATCTTCGAAACTGCTCCCTTTATAAAAGTGGTGGAGCATCACACCCTGATGACAACTCACAAGATGTGTGCAAACTGGAGTACTATCCCAAACTTCAGGTTTTTGGCAGGTACATATGACATGTTTTTTGCCAGAATTGAACATCTTTATTCTGCTATTAGGGTCGGCACTGTGGTGACTGCTTATGAGGACTGTTCAGGATTGGTATCTTTCACTGGATTCATTAAACAGATCAACTTATCCGCGAGAGATGCTCTTCTGTACTTTTTCCATAAAAACTTCGAAGAGGAAATTAAAAGAATGTTTGAGCCAGGACAAGAAACTGCTGTTCCTCATTCATATTTTATCCACTTCAGGGCTTTGGGACTCAGCGGGAAGTCCCCTTACTCATCAAATGCCGTGGGTCATACCTTTAATTTGATCCATTTCATAGGTTGTTATATGGGGCAGATACGATCTCTAAATGCAACTGTGATTCAGACATGTGCACCCCATGAGATGTCTGTTTTGGGGGGATATTTAGGGGAGGAGTTTTTTGGGAAGGGAACTTTTGAGAGGAGATTCTTTAGAGATGAGAAGGAGATGCAAGATTATGCGGAGTTAGAGGGCGCAAAGGTTGAGGCATCTTTGGCGGATGATGGAACAGTTGATTCTGACGATGAGGAGTTCTTCTCTGGCGAAACCAGGAGTCCAGAGGCCGTATATAGCAGGATTATGATGAATAATGGTCGACTGAGGAAGTCTCATATACAGAGATATGTATCTGTAAGCTCAAACCACCAGGCTCGCCCAAACTCTTTTGCGGAATTCCTCAACAAAGTGTACTCGGAGAGCTCTTGAGTCTTAAATTTTAGTTTTTGACACAAACAATGAAGGTGCATCGCTGTGCAGGAAGATTTAAGAAAAAAACTCAACACCACTCCTTGATCCATCATCTCAGCATGAGTAAGGATCTGGTGCATCCCAGCTTGGTGCGTGCAGGGTATGTGGAGTTGGAGATGGCCGATGAGACTGCTGATGTGGTCAATTTGACTATAGCGAGTAATCAGGCACATTTGCAAGGTGAGCCTTTCTACGTTGACTCCTTGCCAGAAGACATGAATAGAATGAGGCTCGCAGAAACATCTGGGAAAATGGAGGTTGCAGAGGATGATGAGGATGATTGCAGCTCAGAAGATGAGTTCTATTTGCCTAAGGGGCAAGATCCTCTGGTCCCCTTCCAGGGATTTCTTGAGGAAGTAGGGGCAAGGATTGTTAAAAGGATGAAGTCAGGGGAAGGGTTTTTTAAGATATGGTCTACAATGACAGAGGACATAAAAGGTTATGTACTCACGAATGTGATGAAGACCAGTTCTAAAACCGTGGAAAATAGGCAAACGCAAACTGACAAACAACTCTCCTCTAATCTGCCTCAAGAACCGACCCCGTCCAAGAGGGAAGACGCACTCAATCCCAAAAAGGCAGAGGAGAGACCCAAGCCAAGCAAGGCTCCAGAGGTGAGTTGGACTAATGAGACTGAAGAAGTCAATGACATAGAGGGAGAGGTTGCCCATCAAGTTGCTGAAAGCTTTTCTAAAAAGTATAAGTTCCCATCTAGATCATCAGGGATCTTCCTATGGAACTTTGAACAGCTCAAAATGAACTTGGATGATATAGTCAAGGCATCAATGAACATACCGGGGGTGGAGAAGATCGCAGAAAAGGGAGGGAAGCTGCCTCTCAGATGTATCCTAGGGTTTGTGGCCTTAGACTCTTCTAAGAGGTTCAGACTATTGGCAGATACAGACAAGGTGGCCAGACTTATGCAAGATGATATCAACAGTTATATGGCAAGGCTGGAAGATGTAGACAGGAATTAGAATGTTGATCAAATTGACTCATTTCAATCAAATTTGGACAAAGCCATGAAAAAAACATGTAACATCCCTAAAAAGATGAATTTCCTGAAGAAAATAGTGAAGACTTGCAAAGATGAGGAGACTCCCAAGTATGGGGCAGCATCAGCTCCCCCTGATGATGATGACCTTTGGATGCCTCCGCCGGAGTATGTCCCTTTGACTCAGGTTAAAGGCAAAGCAAGTGTTCGAAATTTCTGTATCAATGGAGAGATTAAGATATGTAGTCCTAATGGATACTCCTTTAGAATTCTTCGACACATCTTGAAGTCGTTCGACAACGTCTATTCAGGAAACCGAAGAATGATCGGGCTGGTCAAAATAGTAATTGGCTTAGTATTATCTGGGTCCCCCGTCCCTGAAGGTATGAACTGGGTTTACAAACTTCGCAGAACCTTGATCTTTCAGTGGGCTGAATCTCATGGGCCTCTAGAGGGAGAAGAGCTAGAGTATTCTCAAGAAATAACATGGGATGACGAGGCAGAGTTCGTCGGCTTGCAGATTAGAGTGAGTGCAAGACAATGCCACATCCAGGGAAGGTTGTGGTGCATCAACATGAATTCTCGAGCCTGTCAGCTCTGGGCAGATATGGCACTAAAGACACAACAATCTCAAGAGGACGAGAACACTTCCCTCCTTTTGGAGTAATTCAAGGCCCAACAAATATATCCGTGATTGTTACCTCCATCTTGAGTAGATATAATCTGTGAGCAATAGAACAAATACAGTAATGGTGCCTGCTTCCAGCACAACATCTATAACCTAAACACTTGTTTATCTCTAGATCCAGGGTTGAGCATAATGTGAAAAAAACTTGTGAACACGGAATAACAACCCTCCCTAATCGCCACCATGAGTCAATTGTTCTCAACCTTCATCTTTTGCTTGTTCATAGGAAGTTCCATAGGAGACTTCCCTCTATATACAATTCCCGAACGGCTTAATCCCTGGACTCCAATTGACTTAATCCACCTGAGCTGTCCTAACAACTTACTGTCTGATGCTGAGGGGTGCAGTGAAACTTCATCCTTTACCTATGTAGAGCTCAAAACCGGTTTTCTCGCCCATCAGAAAGTGCCGGGGTTCACTTGCACAGGTGTGATAAACGAGGCAGTCACATACACCAACTTTGTTGGATATGTTACTACCACATTTAAGAGAAAACATTTTAAACCAACTGTTTCCGCATGTAGGGATGCCTTCAACTGGAAAGTTTCTGGAGATCCTAGATACGAGGAGTCTTTACATACACCCTATCCGGATAACAGTTGGCTGCGAACTGTCACCACAACCAAAGAATCCTTGTTAATAATCTCTCCAAGCATTGTAGAGATGGATGTATACGGTAGAACTCTCCATTCCCCCATGTTTCCTACAGGAATCTGCTCTAAGTTTTATCCATCAATTCCTTCATGTGCTACCAATCATGATTACACGTTGTGGTTGCCTGAAGACCCTAACTTGAGTTTGATTTGTGACATATTTGTGACAAGCACAGGAAGAAAGGCAATGAATGGGTCTCGTATGTGTGGATTCACAGATGAACGAGGGTTTTATCGAACCCTGAAGGGAGCATGCAAGTTGACCTTGTGTGGGAAACCAGGCCTACGGTTATATGATGGGACATGGGTCTCGTTCACTAGGCCTGAAATCCATGTATGGTGCTCTCCTGATCAGCTGGTGAACGTGCATAACAACCGCATAGACGAAATTGAACATTTGATTGTAGATGACCTCATCAGGAAGAGAGAGGAGTGTTTGGATACACTAGAGACCGTCCTAATGTCTAAGTCGTTAAGTTTCAGAAGGCTCAGTCACTTCCGGAAGTTAGTCCCCGGGTATGGAAAGGCCTATACAATCCTCAATGGGAGTCTGATGGAAACCAATGTTCACTATAAAAGGGTGGATAATTGGGTCGACATTCTGCCTTCCAAAGGGTGCCTTAAGGTAAACAATAAATGTATGGAGTCAGACACAGGGGTTTTCTTCAATGGAATCATTAAAGGGCCCGATGGTAGGATTCTCATCCCTGAAATGCAGTCTGGACTGCTAAAACAACATATGGACCTCTTGAAGGCTGCAGTGTTCCCTTTAAGACACCCATTAATTGACAAAGCCTCAGTGTTCAAAAAGGATGGTGATGCAGATGACTTCGTCGATGTCCACATGCCAGACATCCAGAAGCTAGTATCTGATGTCGACTTGGGCTTGCCAAATTGGAGTTTCTTTGCTTTGATAGGTGCCAGTGTAATTGCACTGCTCATTCTAGTATGTCTTCTGAGGATGTGCTGCAAACGGATGAGGAGAAGAAGCTCTGTCAGGGATCAAGTAGCCCCACCGTTTAGCTTATCTTCTACTCCTTCTTCTAAGTCAAAGGTGGTGTCATCATGGGAGTCATATAAAGGGACATCAAGTGTCTAATTGACCACCCTTTAATGCGTTGTTGGTGGATGGAATACAACCCGATTAACTGCCTCTTCATCTGGAAACATTCCACGGTACAGTCGTATCATCTCAGTGGA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| 105,631
|
NC_006429.1
|
Lyssavirus mokola
|
Le Mercier,P., Jacob,Y., Tordo,N.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2004-11-15
| null |
Lyssavirus mokola
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,940
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Mokola virus, complete genome
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| 8,351
|
MT524705.1
|
Lyssavirus mokola
|
McMahon,W.C., Coertse,J., Markotter,W.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2021-07-13
|
12/458
|
Lyssavirus mokola
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,872
|
GenBank
| null |
South Africa: Durban, KwaZulu-Natal
|
South Africa
|
Felis catus
| null |
2012
| null | null |
Lyssavirus mokola isolate 12/458, complete genome
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ACGCTTAACAACAAAATCAAAGAAGACATAGACAGTACCAATGACCTGGACAAAATGTAACACTCCTACAATGGAGTCAGATAAGATTGTATTCAAGGTGAACAACCAAGTTGTTTCTTTGAAGCCTGAGGTCATATCAGATCAATATGAGTATAAATATCCCGCTATCTTAGACGGGAAGAAGCCAGGGATAACTTTAGGGAAGGCACCCGATCTGAACACTGCCTACAAGTCCATCTTATCAGGTATGAAAGCCGCTAAGCTCGACCCCGACGATGTTTGCTCTTACTTGGCAGCTGCCATGCCTCTCTTCGAGGGGGTTTGTCCTGAGGACTGGGTCAGTTATGGGATTGTCATTGCAAAGAGGGGGGACAAAATCAACCCTAGCGTAATCGTTGACATAGTTCGAACAAACGTGGAGGGAAATTGGGCTCAAGCAGGAGGGACAGATGTGATCAGAGACCCTACAACTGCAGAGCATGCATCATTGGTTGGACTGTTGCTGTGTTTGTATCGGTTGAGCAAGATAGTTGGCCAGAACACAGCAAACTATAAAACTAATGTAGCTGATAGGATGGAGCAAATATTTGAAACAGCCCCTTTTGCGAAAGTGGTGGAACATCACACTTTAATGACTGCTCACAAAATGTGTGCTAACTGGAGCACTATACCCAACTTCAGATTCTTGGTGGGTACATATGATATGTTTTTTGCAAGAGTTGAGCATATATACTCGGCTCTTAGAGTAGGAACAGTGGTGACAGCGTATGAGGATTGCTCTGGGTTGGTCTCCTTCACCGGGTTTATTAAACAGATCAATCTATCCCCCAGAGATGCACTGCTATATTTCTTCCATAAAAACTTTGAGGGAGAGATCAAGAGAATGTTTGAGCCAGGGCAGGAAACAGCAGTCCCCCACTCATACTTCATTCATTTCCGAGCACTTGGTTTGAGTGGCAAATCTCCTTACTCGTCCAATGCTGTAGGTCACACTTTCAATCTAATTCACTTTGTGGGATGCTATATGGGTCAGATCAGGTCTTTAAATGCAACAGTGATCCAAACATGTGCACCTCACGAGATGTCAGTCTTAGGGGGATATCTTGGGGAAGAATTCTTTGGGAAGGGCACATTCGAGAGGAGGTTCTTCAGGGATGAAAAAGAAATGCAGGATTATGCAGAGCTAGAGGGGGCCAGAGTGGAAGCCTCACTTGCTGATGACGGGACTGTAGACTCAGATGAGGAAGATTTCTTTTCTGGAGAAACTAGAAGTCCTGAAGCAGTCTACAGTAGGATAATGATGAACGGTGGCAAGTTGAAGAAAGTTCATATACGTAGATATATAGCGGTGAGCTCAAATCACCAAGCTAGGCCAAACTCTTTTGCAGAATTCTTGAATAAAGTATATGCAGACGGATCATAATCCTAGAGCTCCATTGCAAAGGAGGGTCTATAGATGACTGATATTGCGAGATAAATTCAAGAAAAAAACATAACACCACTACTCGATTCGTGGTGTCAAAATGAGCAAAGATTTAGTACACCCTAGCCTTATCAGAGCAGGGATAGTAGACTTGGAAATGGCTGAAGAGACTACTGATCTAATCAATCGAACCATCGAGGGCAATCAAGCTCACCTTCAGGGGGAGCCTTTTGATGTTGATTCCTTGCCAGAAGATATGAGCAGATTAAAAATAAGGGGCGAATCTGGTAAGGCTAAAACAGAAGAGGAAGAGAGAGATGAGGGGAGCTCTGAGGAAGATGACTATCTGTCTGAGAGACAAAACCCATTGGTCTTATTTCAGAATTTCCTTGACGAAATCGGGGCCAAGGCGGTCAAGAAATTAAAGACCGGTGAGGGATTCTTCAGAATGTGGTCTGCTCTGTCAGATGATATAAAGGGGTACGTGTCGACCAACCTATTGCCATCTCATGCGAGAAAGACAAAGAGTGTACAAACTCAAACAGAACCGACTGCATTATCTAGTTTTGCAAGTGAGAGTCGGCCAGATTCATGGTGTATGCAAGACCAAAAAGACAAGGAAGACCATACTACTGACCACGATATGGTCTCGGATGTTGAATCAGCTACTGAGAAAGAAGAGATCAGAGATATAGAAGGAGAGGTTGCTCACCAGGTTGCAGAAAGCTTCTCAAAGAAGTACAAATTTCCTTCTAGATCCTCAGGAATATTTTTATGGAACTTTGAGCAGCTCAAAATGAATTTGGACGACATTGTAAAGGCAGCCATGAATGTACCGGGGGTTGATATGATCGCTGAAAAAGGAGGGAAGCTCCCCTTAAGATGCATTTTGGGATTTGTAGCGTTAGACTATTCAAAGAGATTTAGGCTCCTCGCAAACAACGACAAAGTGGCCAGACTCATACAAGATGATATCAACAGTTACATGGCCCGGCTGGAGGAGGCCGATTAGAGGTTATAAGGACCCATAACACAATCAATAACTGGGCAGTCCTGTCTTAAAATGAAAAAAACATTTAACATCCCTAAAAAAATGAATTTCCTAAAGAGAATGGTTAAAAGCTGCAAAGAGGAAGAGTCCCCTAAGTATCCATCAGCTTCTGCGCCGCCGGATGACGATGATCTTTGGATGCCTCCTCCTGAGTATGTCCCTTTGACTCAGATTACAGGTAAGGCCAGAGTGAGAAACTTTTGTATCAGTGGGGAGGTTAAGATATGTAGTCCAAACGGGTACTCTTTCAAGATACTCCGGCATATTTTGAAGTCATTAGACAGTGCTTACTCTGGGAACAGGAGGATGACAGGGTTAGTCAAAGTTGTCATAGGGCTTGTACTCTCTGGATCTCCAGTCCCGGAAGGCATGAACTGGGTTTATAAACTTCGCAGAACATTAATCTTTCAGTGGGCAGAGTCATATGGACCATTAGAAGGAGAAGAGCTCGAGTACTCCCAAGAAATTACATGGGATGACGAGGCAGAATTTGTTGGCTTGCAAATCCGAGTGAGTGCAAGACAATGTCACATCCAGGGTCGTCTCTGGTGTATAAATATGAACTCAAGGGCATGTCAGCTATGGGCTGATATGACCTTGAAGACCCAACAGTCCCCGGATGATGAAAACACCTCACTCTTACTAGAGTAGACTCTAGCCTGTGGCTGTGTATCTCAGTTGTTACCTCTGTCTGGAGTAGAGTAAAACCGCGAGCAATAGAACAATCACCGCAATGGTGCCCGCTTTCAGCACAACATATATAACCTAATAACTGGTTTGTCTTCCTATTCAGGGTTGAGCAAAAACGTGAAAAAAACTAAGGGGAAAGGCACAACAGCCCTCTCACTGCCATCATGAATGTACTCTGCCTTGCTATAATCCTTGGCTTCACAACTACATATTCTCTTGGGGAATTTCCTTTGTACACAATTCCCGAGAAGATAGAGAAATGGACCCCAATCGATATGATCCATCTAAGCTGCCCCAACAACTTGTTATCCGAGGAGGAAGGTTGCAATACAGAGTCGCCCCTCACCTACTTCGAGCTCAAGAGTGGTTACTTAGCTCACCAGAAAGTTCCGGGGTTTACTTGTACCGGGGTAGTGAATGAGGCGGAGACATACACAAATTTTGTCGGGTATGTCACCACAACCTTCAAAAGAAAACACTTTAGGCCTACAGTCTCCGCCTGTCGTGATGCCTACAACTGGAAAGTGTCCGGGGACCCCAGGTATGAGGAGTCACTGCACACTCCTTACCCTGACAGCAGCTGGTTGAGGACTGTAACCACCACCAAAGAATCCCTTCTTATAATATCGCCTAGCATCGTGGAGATGGATGTATATGGTAGGACTCTCCATTCCCCCATGTTCCCTTCAGGAATATGTTCTAAGCTCTATCCCTCTGTTCCATCCTGTAAAACCAACCATGATTACACATTGTGGCTGCCAGAAGATCCTAGTTTGAGCTTAATCTGTGATATCTTCACTTCTGGCAGCGGAAGGAAGGCCATGAATGGGTCCCGCATCTGCGGATTCAAGGATGAAAGGGGATTTTACAGATCTTTGAAAGGCGCTTGTAAGCTGACATTGTGCGGGAAGCCTGGGATCAGATTATTTGACGGAACTTGGGTCTCTTTTACAAGGCCAGAAGTTCACGTGTGGTGCACCCCTAACCAATTGGTCAATATGCACAATGATAGAATAGATGAGATCGAGCACCTGATTGTTGAAGACATTGTCAAAAGAAGAGAGGAGTGTTTAGACACTCTAGAGACAGTATTCATGTCTCAATCAATTAGTTTTAGGAGGTTGAGCCACTTTCGGAAATTGGTTCCAGGGTATGGGAAAGCTTACACCATTTTGAATGGTAGCCTGATGGAAGCAAATGTCTACTATAAAAGAGTTGACAGGTGGGCGGACATTTTACCCTCTAAGGGATGTCTGAAAGTCGGGCAACAATGTATGGACCCTGTCAACGGAGTCCTTTTCAATGGGATTATCAAAGGTCCGGATGGCCAGATCCTGATCCCTGAAATGCAGTCAGAGCAGCTCAAGCAGCATATGGACTTATTAAAGGCAGCAGTGTTCCCTCTCAGACATCCTTTAATCAGCCAAAACGCCGTCTTTAAGAAAGACGGGGAGGCAGATGATTTTGTGGACCTCCATATGCCAGATGTACACAAATCTGTATCAGATGTCGACTTGGGTTTGCCTCACTGGGGGTTCTGGCTGTTGATAGGGGCAACTGTAGTGGCATTTTTGGTCTTGGTGTGTCTGCTCCGTGTTTGCTGTAAGAGAGTGAGGAGGGGAGGTTCACGACGTACAACTCAGGAGATCCCCCTCAGCGTTTCCTCTGTCTCCGTCCCTCGGGCCACAGTGGTGTCATCATGGGAGTCTTATAAAGGGCTCCCAGGCACCTGAAACATCCAATTGCTTGGAACACTGCTCACAACCGGAACACCTGCCTCGGCACGACAAAACCTAACCACATGGTATCAAATCTCCGTTCTTACTCTCCAATGTA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| 40,601
|
MT524706.1
|
Lyssavirus mokola
|
McMahon,W.C., Coertse,J., Markotter,W.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2021-07-13
|
229/97
|
Lyssavirus mokola
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,872
|
GenBank
| null |
South Africa: Pinetown, KwaZulu-Natal
|
South Africa
|
Felis catus
| null |
1997
| null | null |
Lyssavirus mokola isolate 229/97, complete genome
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ACGCTTAACAACAAAATCAAAGAAGACATAGACAGTACCAATGACCTGGACAAAATGTAACACTCCTACAATGGAGTCAGATAAGATTGTATTCAAGGTGAACAACCAGGTTGTTTCTTTGAAGCCTGAGGTCATATCAGATCAATATGAGTATAAATATCCCGCTATCTTAGATGGGAAGAAGCCAGGGATAACTTTAGGGAAAGCACCAGATCTGAACACTGCCTACAAGTCTATCTTATCAGGTATGAAAGCCGCTAAGCTTGACCCAGACGATGTTTGCTCTTACTTGGCAGCTGCCATGCCTCTCTTCGAGGGGGTTTGTCCTGAGGACTGGGTCAGTTATGGGATTGTCATTGCAAAGAAGGGGGACAAAATCAACCCTAGCGTGATCGTTGACATAGTTCGAACAAACGTGGAGGGAAATTGGGCTCAAGCCGGAGGGACAGATGTGATCAGAGACCCTACAACTGCAGAGCATGCATCATTGGTTGGACTGTTGCTGTGTCTGTATCGGTTGAGCAAGATAGTTGGCCAGAACACAGCAAACTATAAGACTAATGTAGCTGATAGGATGGAGCAAATATTTGAAACAGCCCCTTTTGCGAAAGTGGTGGAACATCACACCTTAATGACTGCTCACAAGATGTGTGCTAACTGGAGCACTATACCCAACTTCAGATTCTTGGTGGGTACATACGATATGTTTTTTGCAAGAGTTGAGCATATATACTCGGCTCTTCGGGTAGGAACAGTGGTGACAGCATATGAGGATTGCTCCGGGTTGGTCTCCTTCACCGGGTTTATTAAACAGATCAATCTATCCCCCAGAGATGCACTGTTATATTTCTTCCATAAAAACTTTGAGGGAGAGATCAAGAGAATGTTTGAGCCAGGGCAAGAAACAGCAGTCCCCCACTCATACTTCATTCATTTCAGAGCACTTGGTTTGAGTGGCAAATCTCCTTACTCGTCCAATGCTGTAGGTCACACTTTCAATCTAATTCACTTTGTGGGGTGCTATATGGGTCAGATCAGGTCCTTAAATGCAACAGTGATCCAAACATGTGCACCTCACGAGATGTCAGTCTTAGGGGGATATCTTGGGGAAGAATTCTTTGGGAAGGGCACATTCGAGAGGAGGTTCTTCAGGGATGAAAAAGAAATGCAGGATTATACTGAGCTAGAGGGGGCCAGAGTGGAAGCCTCACTTGCTGATGACGGGACTGTAGACTCAGATGAGGAGGATTTCTTTTCTGGAGAAACTAGAAGTCCTGAAGCAGTCTACAGTAGGATAATGATGAACGGTGGCAAGTTGAAGAAAGTTCATATACGTAGATATATAGCGGTGAGCTCAAATCACCAAGCTAGACCAAACTCTTTTGCAGAATTCTTGAATAAAGTATATGCAGACGGATCATAATCCTAGAGCTCCTTTGCAAAGGAGGATCTACAGATGACTGATATTGCAGGATAGATTCAAGAAAAAAACATAACACCACTACTCGATTCGTGGTGTCAAAATGAGCAAAGATTTAGTACACCCTAGTCTTATCAGAGCAGGGATAGTAGACTTGGAAATGGCTGAAGAGACTACTGATCTAATCAATCGAACCATCGAGGGCAATCAAGCTCACCTTCAGGGGGAGCCTTTTGATGTTGATTCCTTGCCGGAAGATATGAGCAGATTAAAAATAAGGGGCGAATCTGGTAAGGCTAAAGCAGAAGAGGAAGAGAGAGATGAGGGGAGCTCTGAGGAAGATGACTATCTGTCTGATAGACAAAACCCATTGGTCTTATTTCAGAATTTCCTTGATGAAATCGGGGCCAAGGCGGTCAAGAAATTAAAGACCGGTGAGGGATTCTTCAGAGTGTGGTCTGCTCTGTCAGATGATATAAAGGGGTACGTGTCGACCAACCTAATGCCATCTAATGCGAGAAAGACAAAAAGTGTACAAATTCAGACAGAACCGACTACATTATCTAGTTCTGCAAGTGAGAGTCGGCCAGATTCCTGGTGTATGCAAGACCAAAAAGACAAGGAAGACCATACTACTGACCACGATATGGTCTCGGATGTTGAATCAGCTACTGAGAAAGAAGAGATCAGAGATATAGAAGGAGAGGTTGCTCACCAGGTTGCAGAAAGCTTCTCAAAGAAGTACAAATTCCCTTCTAGATCTTCAGGAATATTTTTATGGAACTTTGAGCAGCTCAAAATGAATTTGGACGACATTGTAAAGGCAGCCATGAATGTACCGGGGGTTGATATGATCGCTGAAAAAGGAGGGAAGCTTCCCTTAAGATGCATTTTGGGATTTGTAGCGTTAGACTCTTCAAAGAGATTTAGGCTCCTCGCAAACAACGACAAAGTGGCCAGACTCATACAAGATGATATCAACAGTTACATGGCCCGGCTGGAGGAGGCCGATTAGAGGTGATAAGGACCCATAAAACAATCAATAACTGGGCAGTCCTGTCTTAAAATGAAAAAAACATTTAACATCCCTAAAAAAATGAATTTCCTAAAGAGAATGGTTAAAAGCTGCAAAGAGGAAGAGTCCCCTAAGTATCCATCAGCTTCTGCGCCGCCGGATGATGATGACCTTTGGATGCCTCCTCCTGAGTATGTCCCTTTGACTCAGGTTACAGGTAAGGCCAGAGTGAGAAACTTTTGTATCAGTGGGGAGGTTAAGACATGTAGTCCAAACGGGTACTCTTTCAAGATACTCCGGCACATTTTGAAGTCATTAGACAGTGCTTACTCTGGGAACAGGAGAATGATAGGGTTAGTCAAAGTTGTCATAGGGCTTGCACTTTCTGGATCTCCAGTCCCGGAAGGCATGAACTGGGTTTATAAGCTTCGCAGAACATTAATCTTTCAGTGGGCAGAATCATATGGACCATTAGAAGGAGAAGAGCTCGAGTACTCCCAAGAAATCACATGGGATGACGAGGCAGAATTTGTAGGCTTGCAAATCCGAGTGAGTGCAAGACAATGTCACATCCAGGGTCGTCTCTGGTGTATAAATATGAACTCAAGGGCATGTCAGCTATGGGCCGATATGACTTTGAAGACCCAACAGTCCCCGGATGATGAAAACACCTCACTCTTACTAGAGTAGACTCTAGCCTGTGGCTGTGTATCTCAGTTGTTACCTCTGTCTGGAGTAGAGTAAAACCGCGAGCAATAGAACAATCACCGCAATGGTGCCCGCTTTCAGCACAATATATATAACCTAATAACCGGTTTGTCTTCCTATTCAGGGTTGAGCAAAAACGTGAAAAAAACTAAGAGAAAAGGCACAACAGCCCTCTCACTGCCATCATGAATATACCCTGCCTTGCTATAATCCTTGGATTCACAACTACATATTCTCTTGGGGAATTTCCTTTGTACACAATTCCCGAGAAGATAGAGAAATGGACCCCAATAGACATGATCCATCTAAGCTGCCCCAACAACTTATTATCCGAGGAGGAAGGTTGCAATACAGAGTCGCCCCTCACCTACTTCGAGCTCAAGAGTGGTTACTTAGCTCATCAGAAAGTTCCGGGGTTTACCTGTACAGGGGTAGTGAATGAGGCGGAGACATACACAAATTTTGTCGGGTATGTCACCACAAACTTCAAAAGAAAACACTTTAAGCCTACAGTCTCCGCCTGTCGTGATGCTTACAACTGGAAAGCGTCCGGGGATCCCAGGTATGAGGAGTCACTGCACACTCCTTACCCTGACAGCAGCTGGTTGAGAACTGTAACTACCACCAAAGAATCCCTTCTTATAATATCGCCTAGCATCGTGGAGATGGATGTATATGGCAGGACTCTCCATTCCCCCATGTTCCCTTCAGGGATATGTTCTAAGCTCTATCCCTCTGTTCCATCCTGCAAAACCAACCATGATTACACATTATGGCTGCCAGAAGATCCTAGTTTGAGTTTAATCTGTGATATTTTCACTTCTGGCAGCGGAAGGAAGGCCATGAATGGGTCCCGCATGTGCGGATTCAAGGATGAAAGGGGATTTTACAGATCTTTGAAAGGAGCTTGTAAGCTGACATTGTGCGGGAAGCCTGGGATCAGATTATTTGACGGAACTTGGGTCTCTTTTACAAGGCCAGAAGTTCACGTGTGGTGCACCCCTAACCAATTGGTCAATATACACAACGATAGAATAGATGAGATCGAGCACCTGATTGTTGAAGACATTGTCAAAAGAAGGGAGGAGTGTTTAGACACTCTAGAGACAGTATTTATGTCTCAATCAATTAGTTTTAGGAGGTTGAGCCACTTTCGGAAATTGGTTCCCGGATATGGGAAAGCTTACACCATTTTGAATGGTAGCCTGATGGAAGCAAATGTCTACTATAAAAGAGTTGACAGGTGGGCGGACATTTTACCCTCTAAGGGATGTCTGAAAGTCGGGCAACAATGTATGGACCCTGTCAACGGAGTCCTCTTCAATGGGATTATCAAAGGTCCAGATGGCCAGATCTTGATCCCTGAAATGCAGTCAGAGCAGCTCAAGCAGCATATGGACTTATTAAAGGCAGCAGTGTTCCCTCTCAGACATCCTTTAATCAGCCAAGACGCCATCTTTAAGAAAGACGGGGAGGCAGATGATTTTGTGGACCTCCATATGCCAGATGTACACAAATCTGTATCAGATGTCGACTTGGGTTTGCCTCACTGGGGGTTCTGGATGTTGATCGGGGCAACTGTAGTGGCATTTTTGGTCTTGGTGTGTCTGCTTCGTGTCTGCTGTAAGAGAGTGAGGAGGAGAGGTTCACAACGTACAACTCAGGAGATCCCCCTCAACGTTTCCTCTGTCCCCGTCCCTCGGGCCACAGTGGTGTCATCATGGGAGTCTTATAAAGGGCTCCCAGGCACCTGAAACTTCCAATTGCTTGAAACACTGCTCACAACCGGAACACCTGCCTCGGCACGACAACACCTAACCACATGGTATCAAATCTCCGTTCATACTCCCCAATGTA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| 40,602
|
MT524707.1
|
Lyssavirus mokola
|
McMahon,W.C., Coertse,J., Markotter,W.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2021-07-13
|
700/70
|
Lyssavirus mokola
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,872
|
GenBank
| null |
South Africa: Umhlanga Rocks, KwaZulu-Natal
|
South Africa
|
Felis catus
| null |
1970
| null | null |
Lyssavirus mokola isolate 700/70, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCAAAGAAGACATAGACAGTACCAATGACCTGGACAAAATGTAACACTCCTACAATGGAGTCAGATAAGATTGTATTCAAGGTGAACAACCAAGTTGTTTCTTTGAAGCCTGAGGTCATATCAGATCAATATGAGTACAAATATCCTGCTATCTTAGATGGGAAGAAGCCAGGGATAACTTTAGGGAAGGCACCAGATCTGAATACTGCCTACAAGTCCATCTTATCAGGTATGAAAGCCGCCAAGCTTGACCCAGACGATGTTTGCTCTTACTTGGCAGCTGCCATGCATCTCTTCGAGGGGGTTTGTCCTGAAGACTGGGTCAGTTATGGGATTGTCATTGCAAAGAAGGGGGAGAAAATCAACCCTAGCGTGATCGTTGACATAGTTCGAACCAACGTGGAGGGAAATTGGGCTCAAGCCGGAGGGACGGATGTAATCAGAGACCCTACAATTGCAGAGCATGCATCATTGGTTGGACTGTTGCTGTGTCTGTATCGGTTGAGCAAGATAGTTGGCCAGAACACAGCAAACTATAAAACTAATGTAGCTGATAGGATGGAGCAAATATTTGAAACCGCCCCTTTTGCGAAAGTGGTGGAACATCACACCTTAATGACTGCTCACAAAATGTGTGCTAACTGGAGCACTATACCCAACTTCAGATTCTTGGTGGGTACATACGATATGTTTTTTGCAAGAGTTGAGCATATATACTCGGCTCTCCGAGTAGGAACAGTGGTGACAGCATATGAGGATTGCTCTGGGTTGGTCTCCTTCACCGGGTTTATCAAACAGATCAATCTATCCCCTAGAGATGCACTGCTATATTTCTTCCATAAAAACTTTGAGGGAGAGATCAAGAGAATGTTTGAGCCAGGGCAAGAAACAGCAGTCCCCCACTCATACTTCATTCATTTCAGAGCACTTGGTTTGAGTGGCAAATCTCCTTACTCATCCAATGCTGTAGGTCACACTTTCAATCTAATTCACTTTGTGGGATGCTATATGGGTCAGATCAGGTCCTTAAATGCAACAGTGATCCAAACATGTGCACCTCATGAGATGTCAGTCTTAGGGGGATATCTTGGGGAAGAATTCTTTGGGAAGGGCACCTTCGAGAGGAGGTTCTTCAGGGATGAGAAAGAAATGCAGGATTATACAGAGTTGGAGGGGGCCAGAGTGGAAGCCTCACTTGCTGATGACGGGACTGTAGACTCAGATGAGGAGGATTTCTTTTCTGGAGAAACTAGAAGTCCTGAAGCAGTCTACAGTAGGATAATGATGAACGGTGGCAAGTTGAAGAAAGTTCATATACGTAGATATATAGCGGTGAGCTCAAATCACCAAGCTAGACCAAACTCTTTTGCAGAATTCTTGAATAAAGTATATGCAGACGGATCATAATCCTAGAGCTCCTTTGCAAAGGAGGATCTACAGATGACTGATATTGCGAGATAGATTCAAGAAAAAAACATAACACCACTATTCGATTCGTGGTGTCAAAATGAGCAAAGATTTAGTACACCCTAGCCTTATCAGAGCAGGGATAGTAGACTTGGAAATGGCTGAAGAGACTACTGATCTAATCAATCGAACCATCGAGGGCAATCAAGCTCACCTTCAGGGGGAGCCTTTTGATGTTGATTCCTTGCCGGAAGATATGAGCAGATTAAAAATAAGGGGCGAATCTGGTAAGGCTAAAACAGAAGAAGAAGAGAGAGATGAGGGGAGCTCTGAGGAAGATGACTATCAGTCTGGTAGACAAAACCCATTGGTCTTATTTCAGAATTTCCTTGACGAAATCGGGGCCAAAGCGGTCAAGAAATTAAAGACCGGTGAGGGATTCTTCAGAGTGTGGTCTGCTCTGTCAGATGATATAAAGGGGTACGTGTCGACCAACCTAATGCCATCTAATGCGAGAAAGACAAAGAGCGTACAAATTCAAACAGAACCGACTGCATTATCTAGTTTTGCAAGTGAGAGTCGGCCAGATTCCTGGTGTATGCAAGACCAAAAGGACAAGGAAGACCATACCACTGACCACGATATGGTCTCGGATGTTGAATCAGCTACTGAGAAAGAAGAGATCAGAGATATAGAAGGAGAGGTTGCTCACCAGGTTGCAGAAAGCTTCTCAAAGAAGTACAAATTCCCTTCTAGATCCTCAGGAATATTTTTATGGAACTTTGAGCAGCTCAAAATGAATTTGGACGACATTGTAAAGGCAGCCATGAATGTACCGGGGGTTGATATGATCGCTGAAAAAGGAGGGAAGCTTCCCTTAAGATGCATTTTGGGATTTGTAGCGTTAGACTCTTCAAAGAGATTTAGGCTCCTTGCAAACAATGACAAAGTGGCCAGACTCATACAAGATGATATCAACAGTTACATGGCCCGGCTGGAGGAGGCCGATTAGAGGTTATAAGGACCCATAACACAATCAATAACTGGGCAGTCCTGTCTTAAAATGAAAAAAACATTTAACATCCCTAAAAAAATGAATTTCCTAAAGAGAATGGTTAAAAGCTGCAAAGAGGAAGAGTCCCCTAAGTATCCATCAGCTTCTGCACCGCCGGATGATGATGACCTTTGGATGCCTCCTCCTGAGTATGTCCCTTTGACTCAGGTTACAGGCAAGGCTAGAGTGAGAAACTTTTGTATCAGTGGGGAGGTCAAGATATGTAGTCCAAACGGGTACTCCTTCAAGATACTCCGGCATATTCTGAAGTCATTAGACAGTGCTTACTCTGGGAACAGGAGGATGATAGGGTTAGTCAAAGTTGTCATAGGGCTTGTACTTTCTGGATCTCCAGTCCCGGAAGGCATGAACTGGGTTTATAAACTTCGCAGAACATTAATCTTTCAGTGGGCAGAGTCATATGGACCATTAGAAGGAGAAGAGCTCGAGTACTCCCAAGAAATTACATGGGATGACGAGGCAGAATTTGTAGGCTTGCAAATCCGAGTGAGTGCAAGACAATGTCACATCCAGGGTCGTCTCTGGTGTATAAATATGAACTCAAGGGCATGTCAGCTATGGGCTGATATGACCTTGAAGACCCAACAGTCCCCGGATGATGAAAACACCTCACTCTTACTAGAGTAGACTCTAGCCTGTGGCTGTGTATCTCAGTTGTTACCTCTGTCTGGAGTAGAGTAAAACCGCGAGCAATAGAACAATCACCGCAATGGTGCCCGCTTTCAGCACAATACATATAACCTAATAACCGGTTTGTCTTCCTATTCAGGGTTGAGCAAAAACGTGAAAAAAACTAAGGGAAAAGGCACAACAGCCCTCTCACTGCCATCATGAATATACCCTGCCTTGCTATGATCCTTGGCTTCACAACTACATATTCTCTTGGGGAATTTCCTTTGTACACAATTCCCGAGAAGATAGAGAAATGGACCCCAATAGACATGATCCATCTAAGCTGCCCCAACAACTTATTATCCGAGGAGGAAGGTTGCAATACAGAATCGCCCCTCACCTACTTCGAGCTCAAGAGTGGTTACTTAGCTCATCAGAAAGTTCCGGGGTTTACATGTACAGGGGTAGTGAATGAGGCGGAGACATACACAAATTTTGTCGGGTATGTCACCACAACCTTCAAAAGAAAACACTTTAGGCCTACAGTCGCCGCCTGTCGTGATGCCTACAACTGGAAAGCGTCAGGGGACCCCAGGTATGAGGAGTCACTGCACACTCCTTACCCTGACAGCAGCTGGTTGAGGACTGTAACCACCACCAAAGAATCCCTTCTTATAATATCGCCTAGCATCGTAGAGATGGATGTATATGGCAGGACTCTCCATTCCCCCATGTTCCCTTCAGGGATATGTTCTAAGCTCTATCCCTCTGTTCCATCCTGTAAAACCAACCATGATTACACATTATGGCTGCCAGAAGATCCTAGTTTGAGTTTAATCTGTGATATCTTCACTTCTGGCAGCGGAAGGAAGGCCATGAATGGGTCCCGCATCTGCGGATTCAAGGATGAAAGGGGATTTTACAGATCTTTGAAAGGCGCTTGTAAGCTGACATTGTGCGGGAAGCCTGGGATCAGATTATTTGACGGAACTTGGGTCTCTTTTACAAGGCCAGAAGTTCACGTGTGGTGCACCCCTAACCAATTGGTCAATATACACAATGATAGACTAGATGAGATCGAGCACCTGATTGTGGAAGACATTGTCAAAAGAAGAGAGGAGTGTTTAGACACTCTAGAGACAGTATTTATGTCTCAATCAATTAGTTTTAGGAGGTTGAGCCACTTTCGGAAATTGGTTCCAGGATATGGGAAAGCTTACACCATTTTGAATGGTAGCCTGATGGAAGCAAATGTCTACTATAAAAGAGTTGACAGGTGGGCGGACATTTTACCCTCTAAGGGATGTCTGAAAGTCGGGCAACAATGTATGGATCCTGTCAACGGAGTCCTCTTCAATGGGATTATCAAAGGTCCGGATGGCCAGATCTTAATCCCTGAAATGCAGTCAGAGCAGCTAAAACAGCATATGGACTTATTAAAAGCAGCAGTGTTCCCTCTCAGACATCCTTTAATCAGCCAAGAAGCAGTCTTTAAGAAAGACGGGGAGGCAGATGATTTTGTGGACCTCCATATGCCAGATGTCCACAAATCTGTATCAGATGTCGACCTGGGCTTGCCTCACTGGGGGTTCTGGCTGTTGATCGGGGCAACTGTAGTGGCATTTTTGGTCTTGGTGTGTCTGCTCCGTGTCTGTTGTAAGAGAGTGAGGAGGAGAGGTTCACGACGTACAACTCAGGAGATCCCCCTCAGCGTTTCCTCTGTCCCCGTCCCTCGAGCCACAGTGGTGTCATCATGGGAGTCTTATAAAGGGCTCCCAGGCACCTGAAACTTCCAATTGCCTGAAACACTGCTCACAACCGGAATACCTGCCTCGGCACGACAAAACCTAACCACATGGTGTCAAATCTCCGTTCACACTCTCCAATGTA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| 40,603
|
KF155005.1
|
Lyssavirus mokola
|
Marston,D.A., McElhinney,L.M., Ellis,R.J., Horton,D.L., Wise,E.L., Leech,S.L., David,D., de Lamballerie,X., Fooks,A.R., Freuling,C.M., Kgaladi,J., Wright,N., Coertse,J., Markotter,W., Sabeta,C., Mueller,T., Nel,L.
|
Animal Health and Veterinary laboratories Agency, Virology
| null |
2013-07-14
|
RV4
|
Lyssavirus mokola
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,935
|
GenBank
| 1
|
Nigeria
|
Nigeria
|
Crocidura
| null |
1968
| null | null |
Mokola virus isolate RV4, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCAAAGAAGACACAGACAGTATCAGTGACCTAAACAAAATGTAACACTCCTACAATGGAGTCTGACAAGATTGTGTTCAGAGTGAATAATCAAGTTGTTTCTTTGAAACCCGAAGTCATCTCGGATCAATATGAGTATAAATATCCTGCCATCTTAGATGGAAAGAAACCAGGGATAACTTTAGGGAAGGCCCCTGACCTGAACACTGCATACAAGTCCGTCTTATCAGGTATGAAAGCTGCAAAGCTCGACCCAGACGATGTTTGCTCTTACTTGGCAGCTGCTATGCATCTCTTCGAGGGAGTCTGCCCTGAGGACTGGGTCAGTTATGGGATCGTCATTGCAAAGAAGGGGGAGAGAATCAACCCTAGCGTAATTGTTGATATAGCTCGCACGAATGTTGAAGGGAATTGGGCTCAGGCCGGAGGAACCGATGTGATCAAAGACCCCACAACTGCAGAGCATGCATCTTTGGTGGGACTGTTATTGTGCCTTTATCGGTTGAGCAAGATAGTTGGCCAGAACACGGCAAACTATAAAACTAATGTGGCTGACAGAATGGAGCAAATATTCGAAACTGCCCCCTTTGCTAAAGTTGTGGAACATCACACATTGATGACCACTCACAAAATGTGCGCCAACTGGAGCACTATACCCAACTTCAGATTCCTGGTAGGTACATATGATATGTTTTTTGCAAGAGTTGAGCACATATATTCGGCCCTCAGAGTCGGAACGGTGGTGACAGCATATGAGGACTGCTCTGGGTTGGTCTCCTTCACCGGATTCCTCAAACAGATTAATTTATCTCCTAGAGATGCACTGTTATATTTCTTTCATAAAAACTTTGAGGGAGAGATCAAGAGAATGTTTGAGCCAGGGCAAGAAACAGCCGTTCCTCATTCATACTTCATTCATTTCAGAGCTCTCGGCCTGAGTGGTAAGTCCCCTTATTCGTCCAATGCTGTAGGTCATACTTTTAATCTGATTCACTTTGTAGGGTGTTATATGGGTCAGATCAGGTCTTTAAATGCAACGGTGATTCAAACATGTGCACCTCATGAGATGTCAGTCCTAGGAGGATATCTTGGGGAAGAATTCTTTGGGAAGGGCACCTTCGAGAGGCGGTTCTTCAGGGATGAAAAAGAAATGCAAGATTATACAGAGCTTGAGGGGGCTAGAGTGGAAGCTTCACTAGCCGATGACGGTACGGTAGACTCAGATGAGGAAGACTTCTTCTCTGGGGAAACCAGAAGTCCTGAAGCGGTTTACAGTCGGATAATGATGAATGGTGGCAAGTTGAAGAAGGTTCATATACGCCGGTACATAGCAGTGAGCTCTAATCATCAGGCTAGACCTAACTCTTTTGCTGAATTCTTAAACAAAGTATATGCAGATGGATCATAACTTGTTGGCCTCTCGAAAAATGATAATCTACGGGTAGATGAGGTTGTGAGACAGATCTAAAAGAAAAAAACTTAACACCACTCTTCAATTCGTGGTGTCAAAATGAGCAAGGACCTTGTGCATCCCAGTCTTATCAGGTCAGGGATAGTAGAATTGGAAATGGCAGAAGAAACCATGGATCTGATCAATAGAACCATAGAAAGCAATCAGGCTCACCTTCAGGGCGAGCCATTTTATGTTGATTCTTTGCCAGAAAATATGAGCAGATTGAGGATAGGAGAGAAATCGGGTCAGACCAAGACAGAAGGAGATGAGAAGGATGAGGACAGCTCTGAGGAAGATGACTATTTATCTGGGGAACAAGACCCCTTAGTTCCCTTTCAGAATTTCCTCGACGAAATTGGAGCCAAAGCGGTCAAGAAGTTGAAGACAGGAGAGGGATTCTTCAGGGTGTGGTCATCCCTGTCAGATGACATCAAAGGGTATGTGTCTACCCACATCATGATTCCCAGGCCGAGGAACCTTAAGAGCATTCAGATTCAAACTGAGCTAACTGTTCCATCTAGTTCAGACAATGAGGGTCTGCGAGATCCCCGGTGTATGCATGAGCAAAAGGATAAGAAAGGCCACACTACTGATCAAGATGGGGTCTCAGATATTGAGTCAGCTCCTGACAAGGAAGAGATTCGTGATATAGAGGGAGAAGTTGCCCATCAGGTCGCGGAAAGCTTTTCAAAGAAATACAAATTCCCTTCTAGATCCTCGGGAATATTCTTATGGAACTTCGAGCAGCTCAAGATGAATTTGGATGATATTGTGAAGGCGGCCATGAATGTGCCTGGTGTTGAGAAGATAGCCGAGAAGGGAGGCAAGCTTCCCTTGAGATGTATTTTGGGATTTGTGGCATTAGACTCCTCAAAGAGATTTAGGCTTCTTGCCAACAACGACAAAGTGGCCAGACTCATACAAGATGATATCAACAGTTACATGGCCCGGCTTGAGGATGCAGAATAGAAGCTGTCCGGACTAGTGTAGTCCAGTCTTGAAATGAAAAAAACATGTAACATCCCTAAAAAGATGAATTTCCTAAAGAAGATGGTCAGAAGCTGCAAGGATGAAGAGACCCAGAAGTATCCATCAGCAACGGCACCTCCAGACGATGATGACCTTTGGATGCCTCCGCCGGAGTATGTCCCTTTAACTCAGGTTAAAGGCAAAGCCAGCTTAAGGAACTTTTGCATCAGTGGGGAAGTCAAGATATGTAGTCCAAACGGATACTCCTTTAAGATACTCAGGCATATTTTAAAGTCTTTTGACAACGTTTACTCCGGGAACAGGAGGATGATAGGGTTAGTCAAGGTAGTCATAGGGCTTGTGCTTTCAGGGTCCCTAGTCCCAGAGGGAATGAACTGGGTTTATAAACTGCGTAGAACCTTAATATTTCAGTGGGCAGAGTCGTATGGACCATTGGAAGGGGAAGAACTTGAGTACTCACAAGAAATTACATGGGATGATGAGGCAGAGTTTGTAGGCCTGCAAATCAGAGTGAGCGCCAGACAATGTCACATCCAGGGTCGCCTCTGGTGCATAAACATGAACTCAAGGGCGTGTCAGTTATGGGCAGATATGATTTTAAAGACCCAACAATCACCGGACGATGAAAACACCTCACTTTTATTGGAATAAACTCTAGCCTGTAGCTTTGTCTCTCAGCTGTTACCTCTGTTTGCAGTAGAGAAAAACCGCGAGCAATAGAACAATTACCGCAATGGTGCCCGCTTTCAGCACAATAAATATAACCCACCAACAAGTTTGTCTTCCTATTCAGGGTTGAGCAAAGACGTGAAAAAAACTACATGAAAAGGCACAACAGCCCTCTCACTGCCATCATGAACCTACCCTGTCTGACTGTGATCCTCATTTTATTCACTAAATATTCCCTGGGAGAATTTCCCTTGTACACAATTCCGGAAAAGATAGAGAAATGGACCCCTATAGACATGATCCACCTAAGTTGCCCTAACAACCTGCTGTCTCAAGAAGAGGGCTGCAATGCAGAGACGCCCTTCACTTACTTCGAGCTCAAGAGTGGTTACTTAGCTCATCAGAAAGTACAGGGATTCACGTGTACCGGGGTTGTGAATGAGGCAGAGACATACACAAACTTTGTCGGATATGTCACCACAACCTTCAAGAGAAAGCACTTTAGGCCTACAGTTGCTGCATGTCGTGATGCATACAACTGGAAAGTGTCCGGAGACCCCAGGTATGAGGAATCACTACACACACCGTACCCTGACAGTAGCTGGTTAAGAACTGTGACCACAACCAAAGAATCCCTTCTTATAATATCACCCAGCATCGTGGAAATGGATATATACGGCAGGACTCTACATTCTCCCATGTTTCCGTCAGGGACATGTTCAAAGCTCTATCCCTCTGTCCCATCATGTAAGACTAATCATGATTATACTTTATGGTTGCCGGAAGATCCTAGTCTGAGTTTGATCTGTGATATCTTCACCTCAAGCAACGGACAGAAGGCCATGAACGGGTCTCGCATCTGCGGATTCAAGGATGAAAGGGGATTTTACAGATCTTTGAAAGGTGCTTGCAAGCTGACGTTGTGTGGGAAACCAGGAATCAGACTGTTCGACGGAACCTGGGTCTCCTTTGCAAGGCCGGATGTTCATGTATGGTGTACTCCTAACCAATTGGTGAATATCCACAATGACAGACTAGATGAGATTGAACACCTAATTGTGGAAGATATCATCAAGAGAAGAGAAGAATGTTTAGACACTCTGGAGACAATACTCATGTCTCAATCAATTAGCTTTAGACGATTGAGCCATTTCAGAAAGTTAGTTCCAGGATATGGAAAAGCCTACACCGTTTTGAACGGCAGCTTGATGGAAACGAATGTCTACTACAAGAGGGTAGACAAGTGGACTGACATTTTGCCTTCTAAAGGGTGTCTAAAGGTAGGACAGCAATGCATGGACCCTGTCAAAGGAGTCTTCTTCAACGGAATTATCAAGGGTCCTGATGGCCAGATACTAATTCCAGAGATGCAATCCGAGCAGCTCAAACAGCATATGGACTTGTTAAAAGCAGCTGTGTTTCCTCTTCGCCACCCTTTAATCGACAGAGGAGCGGTATTTAAAAAGGACGGAGATGCAGATGATTTTGTGGACCTCCACATGCCTGACGTTCACAAATCCGTGTCAGATGTTGATCTGGGCTTGCCTCACTGGGGGCTCTGGCTGATGATCGGGGCGGCAGTAGTGGCATTTATGGTCCTAATCTGCCTGCTCCGTGTATGTTGTAAAAGAGTGGGAAGAAGAAGATCACCACATGCGACTCAGGAGATCCCCCTCAGTGTTTCCTCTGCCCCTGTCCCTCGAGCCAAAGTGGTGTCATCATGGGAGTCATACAAAGGGCTCCCTGGTACATGATACTTCTATCAGATTGCCTGATACATAGCTCACAACCTGGTTACCTGCCTCGGCACGATAACAATCAATCACATGGTGTCAAGTCTTCGTTCATACCCTCCACTGTATAATGATTCATG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| 93,739
|
KF155006.1
|
Lyssavirus mokola
|
Marston,D.A., McElhinney,L.M., Ellis,R.J., Horton,D.L., Wise,E.L., Leech,S.L., David,D., de Lamballerie,X., Fooks,A.R., Freuling,C.M., Kgaladi,J., Wright,N., Coertse,J., Markotter,W., Sabeta,C., Mueller,T., Nel,L.
|
Animal Health and Veterinary laboratories Agency, Virology
| null |
2013-07-14
|
RV1035
|
Lyssavirus mokola
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,939
|
GenBank
| 1
|
Zimbabwe
|
Zimbabwe
|
Feliformia
| null |
1982
| null | null |
Mokola virus isolate RV1035, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCAAAGAAGACACAGATAGTATCAGTGACCTAAACAAAATGTAACACTCCTACAATGGAGTCTGACAAGATTGTGTTCAAGGTGAATAACCAAGTTGTTTCTTTGAAGCCTGAGGTCATATCAGATCAATATGAGTATAAATATCCCGCCATTCTAGATGGGAAGAAACCAGGGATCACCTTGGGGAAGGCACCTGATCTAAACACTGCATACAAATCCATCCTATCAGGTATGAAGGCTGCAAAGCTTGACCCAGACGATGTTTGCTCTTACTTAGCAGCTGCTATGCATCTATTCGAGGGGGTCTGTCCCGAGGACTGGGTTAGTTATGGGATTGTCATTGCGAAGAAGGGAGAGAAAATCAACCCCAGCGTGATCGTCGATATAGTTCGCACTAACGTTGAGGGGAATTGGGCTCAAGCGGGAGGAACTGATGTGATTAGAGATCCTACAATGGCAGAGCATGCTTCATTGGTCGGACTGTTATTATGTCTGTATCGATTGAGCAAGATAGTCGGTCAGAACACAGCAAACTATAAAACCAATGTAGCAGACAGAATGGAACAAATATTTGAGACTGCTCCTTTTGCGAAGGTGGTGGAACATCACACATTGATGACTACTCATAAGATGTGCGCTAACTGGAGCACTATACCTAACTTCAGATTCCTGGTGGGCACATATGATATGTTCTTTGCAAGAGTCGAGCATATATATTCGGCTCTCAGAGTCGGAACAGTCGTGACAGCCTACGAGGATTGCTCAGGCTTGGTCTCCTTTACCGGGTTTATCAAACAAATCAATCTATCTCCTAGAGATGCACTGCTATATTTCTTCCATAAAAACTTTGAAGGGGAGATTAAGAGAATGTTTGAGCCGGGGCAAGAAACAGCAGTTCCCCACTCATACTTCATTCATTTTAGAGCACTTGGCCTGAGTGGCAAGTCCCCGTACTCGTCCAATGCTGTAGGTCATACTTTCAATTTAATCCACTTTGTAGGATGCTATATGGGTCAGATCAGGTCTCTAAATGCAACTGTGATCCAAACATGTGCACCTCACGAGATGTCAGTACTGGGGGGATATCTTGGAGAAGAGTTCTTTGGGAAAGGCACCTTTGAGAGGAGGTTCTTTAGGGATGAAAAAGAGATGCAAGATTATACAGAGCTTGAGGAGGCCAGAGTAGAGGCTTCGCTCGCTGATGACGGGACTGTAGACTCAGATGAGGAGGACTTCTTCTCTGGAGAAACCAGAAGTCCTGAAGCAGTTTACAGTAGGATAATGATGAACAACGGTAAATTGAAGAAAGTTCACATACGTAGGTATATTGCGGTGAGTTCTAATCATCAAGCGAGGCCGAACTCTTTTGCAGAATTCTTAAACAAGGTGTATGCAGATGGATCATAATCAGAGAGCTTCTTGGAAGACGATGATCTCTAGAGGGGTATTATTGTGAGACAGATTCCAGAAAAAAACTTAACACCACTCCTCGATTCGTGGTGTCAAAATGAGCAAAGATTTGGTGCATCCTAGTCTTATCAGGGCAGGGATAGTAGAACTGGAAATGGCAGAAGAGACTACTGATCTGATTAACAGGACCATAGAGAGCAACCAAGCTCACCTTCAGGGGGAGCCGCTTTATGTTGATTCATTGCCGGAAGATATGAGCAGATTGAGAATAGGGGACAAATCTCGTAGGACTAAAACAGAAGAAGAAGAAAGAGATGAAGGTAGTTCTGAGGAGGATAACTATTTGTCTGAGGGACAAGATCCATTAATCCTCTTTCAGAATTTCCTTGATGAAATTGGGGCCAGAGCGGTCAAGAGATTGAAGACTGGCGAGGGATTCTTCAGGGTGTGGTCTGCTCTGTCAGATGACATAAAGGGGTATGTATCTACCAATATAATGACATCTGGGGAGAGAGATACTAGGAGCATACAAATTCAGACAGAACCAACCGCTTCAGTTAGCTCTGGAAACGAGAGTCGGCATGATTCTGAGAGCATGCATGATCCAAATGACAAGAAAGATCACACACCCGATCACGATGTGGTCCCGGACATTGAGTCTTCTACTGACAAAGGAGAGATTCGAGATATAGAAGGAGAAGTTGCCCATCAGGTAGCAGAAAGCTTTTCAAAGAAATACAAGTTCCCTTCTAGATCCTCGGGAATATTCTTGTGGAACTTTGAGCAGCTTAAAATGAATCTAGATGATATTGTGAAAGCAGCCATGAATGTACCAGGGGTTGAAAGGATCGCCGAAAAGGGAGGGAAGCTTCCCCTGAGATGTATTTTGGGGTTTGTGGCATTGGACTCTTCAAAGAGATTTAGACTTCTTGCAGACAATGACAAGGTGGCAAGACTCATCCAAGAAGATATCAACAGTTACATGGCCCGGCTCGAGGAGGCAGAGTAAAGGCTGAGAGGACCCATAAAAGAACTCGAATTTGGCAATCTGGTCTTGAAATGAAAAAAACATGTAACATCCCTAAAAAGATGAATTTCCTCAAGAAAATGATCAAGAGCTGTAAGGATGAAGAGACTCAGAAGTATCCATCAGCATCTGCGCCTCCAGACGATGATGACATTTGGATGCCCCCGCCTGAGTATGTCCCCTTAACCCAGGTCAAGGGCAAGGCCAGTGTGAGAAACTTTTGCATTAGTGGAGAGGTCAAGATATGTAGTCCAAACGGGTACTCCTTCAAGATACTCAGGCATATTTTGAAGTCGTTTGATAATGTTTACTCTGGGAACAGGAGGATGATCGGGTTAGTCAAGGTGGTTATCGGGCTTGTACTTTCAGGATCTCCAGTCCCGGAGGGCATGAACTGGGTTTATAAACTTCGTAGGACCTTAATATTTCAGTGGGCAGAGTCTCATGGACCGTTGGAAGGAGAAGAGCTTGAGTACTCACAAGAAATTACATGGGATGATGAGGCAGAGTTTGTAGGCCTCCAAATCAGAGTGAGCGCCAGACAATGTCACATCCAGGGTCGTCTCTGGTGCATTAACATGAACTCAAGAGCATGTCAATTATGGGCCGATATGATCTTGCAGACCCAACAGTCCCCGGATGATGAAAACACCTCACTTTTATTAGAGTAGACTCTAGCCTGTAGCTTTGCCTCTTAATTGTTACCTCTGTTTGGAGTAGAGAAAAACCGCGAGCAATAGAACAATTACCGCAACGGTGCCCGCTTTCAGCACAATACATATAACCTAACCACTGGTTTGTCTTCCTATTCAGGGTCGAGCGAAAACGTGAAAAAAACTACATAAAAAGGCACAACAGCCCTCTCACTGCCATCATGAATATACCTTGCTTTGTTGTGATTCTCAGCTTAGCCACTACACATTCTCTGGGAGAATTCCCCTTGTACACAATTCCTGAGAAGATAGAGAAATGGACTCCCATAGACATGATCCATCTGAGTTGCCCCAACAACCTATTATCTGAGGAAGAAGGTTGCAATGCAGAGTCATCCTTTACTTACTTTGAGCTCAAGAGTGGTTACCTAGCTCATCAGAAGGTTCCAGGGTTTACCTGTACCGGGGTCGTTAATGAGGCAGAGACATATACAAACTTCGTCGGGTACGTCACCACAACCTTCAAAAGGAAGCACTTTAGGCCTACAGTAGCCGCCTGTCGTGATGCCTACAACTGGAAAGTGTCAGGAGACCCCAGGTACGAAGAGTCACTCCACACTCCTTATCCTGACAGCAGTTGGTTGAGGACTGTGACTACAACCAAAGAATCACTTCTCATAATATCTCCCAGCATCGTGGAAATGGATATTTACGGCAGGACTCTCCATTCCCCCATGTTTCCTTCAGGAGTATGTTCCAAGCTATATCCCTCTGTCCCATCCTGTAAGACTAATCATGATTACACATTATGGCTGCCTGAAGATCCTAGTTTGAGTTTGGTCTGTGATATCTTTACTTCCAGCAACGGAAAGAAGGCCATGAACGGGTCACGCATCTGCGGATTCAAGGATGAAAGGGGATTCTACAGATCTTTAAAGGGCGCTTGCAAGCTGACATTGTGTGGAAGACCTGGAATTAGGTTATTCGACGGAACTTGGGTCTCTTTTACAAAGCCGGACGTGCACGTATGGTGCACTCCCAACCAATTGATCAATATACACAATGACAGACTAGATGAGATAGAACACCTGATCGTGGAAGACATCATAAAGAAAAGAGAAGAGTGCTTAGACACCCTGGAAACAATACTTATGTCTCAATCTGTTAGCTTTAGAAGGTTGAGCCATTTCCGAAAGTTAGTTCCAGGATATGGGAAGGCCTACACTATTTTAAACGGCAGCCTGATGGAAACAAATGTCTACTACAAAAGGGTCGACAAGTGGGCTGACATCTTACCCTCTAAGGGATGTCTGAAAGTCGGGCAACAATGCATGGAACCTGTCAAAGGAGTCCTCTTCAATGGGATTATCAAGGGCCCGGATGGCCAAATTTTGATCCCCGAGATGCAGTCAGAGCAGCTAAAGCAGCATATGGACCTGTTGAAGGCGGCTGTGTTTCCTCTCCGACACCCTTTAATCAGCCGGGAGGCAGTCTTTAAGAAAGACGGGGATGCCGATGATTTTGTGGATCTCCATATGCCTGATGTCCACAAGTCTGTGTCAGATGTCGACCTGGGCCTGCCTCATTGGGGTTTCTGGATGTTGATCGGGGCAACAATAGTAGCATTTGTGGTCTTGGTATGTTTACTCCGTGTATGTTGTAAGAGAGTGAGGAGGAGAAGATCAGGACGTGCAACTCAGGAGATCCCCCTGAGCTTTCCCTCTGCCCCTGTTCCTCGAGCCAAAGTGGTGTCATCTTGGGAGTCCTATAAAGGGCTTCCAGGTACATGAAACCTTCATCAGATTGCCTAACATATCCCCCACAACCGGATTACCTGCCTCGGCAAGACACAACTTGATCACATGGTGTCAAATCTCCTTTCAAACCCTCCAGT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| 93,740
|
KF155007.1
|
Lyssavirus mokola
|
Marston,D.A., McElhinney,L.M., Ellis,R.J., Horton,D.L., Wise,E.L., Leech,S.L., David,D., de Lamballerie,X., Fooks,A.R., Freuling,C.M., Kgaladi,J., Wright,N., Coertse,J., Markotter,W., Sabeta,C., Mueller,T., Nel,L.
|
Animal Health and Veterinary laboratories Agency, Virology
| null |
2013-07-14
|
RV1017
|
Lyssavirus mokola
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,952
|
GenBank
| 1
|
Zimbabwe
|
Zimbabwe
|
Feliformia
| null |
1993
| null | null |
Mokola virus isolate RV1017, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCAAAGAAGACACAGACAGTATCAGTGACCTAAACAAAATGTAACACTCCTACAATGGAGTCTGACAAGATTGTGTTCAAGGTGAATAACCAAGTTGTTTCTTTGAAGCCAGAGGTCATATCGGATCAATATGAGTACAAATATCCCGCCATTTTAGATGGAAAGAAACCAGGGATAACTTTAGGGAAAACGCCTGATCTGAACACTGCATACAAGTCCATCCTGTCAGGTATGAAAGCCGCGAAGCTTGACCCAGATGATGTTTGCTCTTACTTGGCAGCCGCTATGCATCTCTTCGAGGGGGTTTGCCCCGAGGACTGGGTCAGTTATGGAATTGTCATTGCAAAGAAGGGGGAGAAAATCAACCCTAGCGTGATTGTTGATATAGTTCGAACCAATGTTGAGGGGAATTGGGCTCAAGCTGGAGGAATGGATGTGATCAGAGACCCTACAACAGCAGAGCATGCGTCATTGGTTGGACTGCTGCTATGTCTTTATCGATTGAGCAAGATAGTCGGCCAGAACACAGCAAACTATAAAACTAATGTGGCTGACAGAATGGAGCAAATATTTGAGACTGCTCCTTTTGCAAAGGTGGTGGAACATCATACATTGATGACTACTCATAAAATGTGTGCTAACTGGAGCACTATACCCAACTTCAGATTCTTGGTAGGTACATATGATATGTTTTTTGCAAGGGTCGAACATATATATTCTGCTCTCAGAGTTGGAACAGTGGTGACAGCATATGAGGATTGCTCTGGGTTGGTCTCCTTCACCGGGTTTATCAAACAGATCAATCTATCTCCTCGAGATGCACTGCTCTACTTCTTCCATAAAAACTTTGAAGGAGAGATAAAGAGGATGTTCGAGCCAGGGCAAGAAACTGCAGTTCCCCATTCATACTTCATTCATTTTAGAGCGCTTGGCTTGAGTGGCAAATCCCCATACTCTTCCAATGCTGTAGGGCACACTTTTAATCTAATTCACTTTGTAGGATGCTATATGGGTCAGATCAGGTCTCTAAACGCAACAGTGATTCAAACATGTGCACCTCATGAAATGTCAGTCCTGGGGGGATATCTGGGAGAAGAATTCTTTGGGAAGGGCACCTTCGAAAGGAGGTTTTTCAGAGACGAAAAAGAGATGCAAGATTATACAGAGTTGGAGGAGGCCAGAGTAGAAGCTTCACTCGCTGATGATGGAACTGTAGACTCCGATGAGGAAGATTTCTTCTCTGGAGAGACTAGGAGTCCTGAGGCAGTTTATAGTAGGATAATGATGAATGGTGGCAAGTTGAAGAAAGTTCATATACGTAGGTATATTGCAGTGAGCTCTAATCATCAAGCTAGACCGAACTCTTTTGCCGAATTCTTAAACAAGGTGTATGCAGATGGGTCATAATCCGAGGGCTTCTTGGAAAACGAGGGTCTACAGATGAGTAGGGTTGTGGGACAGATTCCAAGAAAAAAACTTAACACCACTCTTTGATTCGTGGTGTCAAAATGAGCAAAGATTTGGTTCATCCTAGTCTTATCAGGGCAGGGATAGTGGAACTCGAAATGGCAGAAGAGACCACTGATCTGATCAACAGGACCATAGAGAGCAATCAAGCTCACCTCCAGGGCGAGCCATTTTATGTTGATTCATTGCCTGAAGATATGAGCAAGTTGAGAATAGAGGACCAATCTGGTAGGACTAAAACAGAAGAAGGCGAGGGAGATGAAGATAGCTCTGAGGAGGATGACTATCTGTTTGAGGGACAAGACCCGTTAATTCTCTTTCAGAATTTCCTTGACGAAATTGGGGCCAAAGCAGTAAAGAAGTTAAAGACTGGTGAGGGATTCTTCAGGGTGTGGTCTGCTCTGTCAGATGACATCAAGGGGTATGTATCTACCCATATAATGACACATAGGGCGAAAAATACTAAGAGTATACAAATTCAAACAGAACCAGCGGCATCATCTAGCCCTGGAGGTGCGGTTCTGCAGGATTCCAGGAGCAAGGATGACCCAAATGACAAAAAAGATCATACCGCCGATCATGATGTGGTCTCAGATGTTGAGTCAGCTATTGACAAAGACGAGAGCCGAGATATAGAGGGAGAAGTCGCTCATCAAGTTGCGGAAAGCTTTTCAAAGAAATACAAATTCCCTTCTAGATCTTCGGGAATCTTCCTATGGAACTTTGAGCAGCTCAAAATGAATCTGGATGATATTGTGAAAGCGGCCATGAATGTGCCAGGGGTTGAAAAGATAGCAGAAAAGGGAGGGAAGCTCCCTTTGAGATGTATTTTGGGATTTGTGGCATTAGACTCTTCAAAAAGATTTAGACTTCTTGCAAACAACGACAAGGTAGCAAGACTCATACAAGATGATATCAACAGTTACATGGCCCGGCTTGAGGAGGCGGAATGAAGGATGTAATGACCCACAAAAATCCATGAATTGGGCAGCCCTGTCTTGAAGTGAAAAAAACATGTAACATCCCTAAAAAGATGAACTTCCTCAAGAGGATGGTCAAAAGCTGCAAAGATGAGGAGACCCAGAAGTATCCACCAGCATCGGCGCCTCCAGACGATGATGACCTTTGGATGCCTCCGCCTGAGTATGTCCCTTTAACTCAGGTTAAGGGCAAGGCTAGTATAAGAAACTTTTGCATCAGTGGGGAGGTTAAGATATGTAGTCCTAACGGGTACTCTTTCAAGATACTCAGGCATATTCTGAAGTCTTTTGACAACATTTACTCTGGGAACAGAAGGATGATCGGATTAGTCAAGGTGGTTATAGGGCTCGTGCTTTCAGGATCCCCAATCCCAGAGGGCATGAACTGGGTTTATAAACTTCGTAGAACCCTAATCTTTCAGTGGGTCGAGTCATATGGACCCTTGGAAGGGGAAGAGCTGGAGTACTCACAAGAAATTACATGGGATGATGAGGCAGAGTTTGTAGGCCTACAAATCAGAGTGAGCGCCAGACAGTGTCACATCCAGGGTCGTCTCTGGTGCATAAACATGAACTCAAGAGCATGCCAGTTATGGGCCGATATGATCTTGAAGACCCAACAGTCCCCGGATGATGAAAACACCTCACTTTTATTAGAATAAAATCTAGCCTGCAGCTTCGTCTCTCAATTGTTACCTCTGTTTGGAGTAGAGAAAAACCGCGAGCAATAGAACAATTACTGCAACGGTGCCCGCTTTCAGCACAATACATATAACCTAACAACCAGTTTGTCTTCCTCTTCAGGTTTGAGCAAAAAAGTGAAAAAAACTACATGAAAAGGTACAACAGCCCTCTCACTGCCATCATGAGTACACTGTGCCTTGTTGTGATCCTCAGCTTAGCCACTACACATTCCCTTGGAGACTTTCCCTTGTACACAATTCCCGAGAAGATAGAGAAATGGACTCCTATAGACTTGATTCATCTAAGTTGCCCTAACAACCTCCTGTCTGAGGAGGAAGGATGCAATACAGAGTCATCCTTCACTTACTTTGAGCTCAAGAGTGGTTACTTAGCTCATCAAAAGGTTCCAGGGTTCACATGTACAGGGGTGGTGAATGAGGCAGAGACATACACAAACTTTGTGGGGTATGTCACCACAACCTTCAAAAGGAAGCACTTTAGGCCTACAGTAGCCGCTTGTCGGGATGCCTACAACTGGAAAGTGTCAGGAGACCCCAGGTACGAAGAGTCACTACACACCCCATATCCTGACAACAGCTGGTTGAGGACTGTTACCACAACCAAAGAGTCCCTTCTTATCATATCGCCCAGCATTGTGGAAATGGATGTGTATAGCAGGACTCTCCATTCACCCATGTTTCCGTCAGGAACATGTTCTAAGTTATATCCCTCTGTCCCTTCGTGTAAGACCAATCATGATTACACATTGTGGTTGCCAGAAGATCCTAATCTGAGTTTGGTCTGTGATATCTTCACTTCTAGTAACGGAAAGAAAGCTATGAACGGGTCCCGCATTTGTGGATTCAAGGATGAAAGAGGATTTTACAGATCTTTGAAGGGCGCTTGCAAGCTGACATTGTGCGGGAAACCTGGAATCAGGCTGTTTGACGGAACTTGGGTCTCTTTTGTGAAGCCGGATGTTCATGTGTGGTGCACTCCCAACCAATTAGTCAATATACATAATGACAGACTAGACGAGGTAGAACACTTGATCGTGGAGGACATCATCAAGAAAAGAGAAGAGTGCTTAGACACTCTAGAAACAATACTCATGTCTCAATCAATTAGTTTTAGACGATTGAGCCATTTCAGGAAACTAGTTCCAGGATATGGGAAGGCCTATACTCTTTTAAATGGCAGCCTGATGGAAACAAATGTCTACTACAATAGGGTTGACAAGTGGGCTGACATTCTGCCATCCAAAGGGTGTCTTAAAGTCGGGCAACAATGCATGAAGCCTGTTAAAGGAGTCCTCTTCAATGGAATTATCAAGGGCCCTGATGGCCAGATTCTGATTCCTGAGATGCAGTCAGAGCAACTCAAGCAACATATGGACTTGTTAAAAGCAGCTGTGTTCCCTCTCCGACACCCTTTAATCAGTGGAGATGCAGTCTTTAAGAAGGACGGAGATGCAGATGACTTTGTGGACCTTCATATGCCTGATGTCCACAAATCTGTATCCGATGTCGACCTAGGCCTGCCCCATTGGGGGTTCTGGCTGTTGATCGGGGCAACTGTAGTAGCATTTGTGGTCTTGGTATGCTTACTCCGTGTATGTTGTAGGCGAGTGAGGATGAGAAGATCAGTACGTGAGACTCAAGAGATCCCCCTAAGCATTTCATCTGCCTCTGCCCCTCGAGCTAGAGTTGTGTCTTCATGGGAGTCCTATAAAGGGCTCCCGGGTACATGAGACCTCCATCAGAATGCCTGACATATAACTCACAACCGGATTACCTGCCTCGGCACGACACAACTCAGCAACATGGTATCAAATCTCCTTTCATGCCCTCCCA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| 93,741
|
KF155008.1
|
Lyssavirus mokola
|
Marston,D.A., McElhinney,L.M., Ellis,R.J., Horton,D.L., Wise,E.L., Leech,S.L., David,D., de Lamballerie,X., Fooks,A.R., Freuling,C.M., Kgaladi,J., Wright,N., Coertse,J., Markotter,W., Sabeta,C., Mueller,T., Nel,L.
|
Animal Health and Veterinary laboratories Agency, Virology
| null |
2013-07-14
|
RV1021
|
Lyssavirus mokola
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,943
|
GenBank
| 1
|
South Africa
|
South Africa
|
Feliformia
| null |
1996
| null | null |
Mokola virus isolate RV1021, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAACCGAAGAAGATATAGACAGTACCAATGACCTAGACAAAATGTAACACTCCTACAATGGAGTCTGATAAGATTGTATTCAAGGTGAACAACCAAGTTGTTTCTTTGAAGCCTGAGGTCATATCAGATCAATATGAGTATAAGTATCCTGCCATCCTAGATGGGAAGAAACCAGGGATAACTTTAGGGAAGGCACCAGATCTGAATACTGCCTATAAGTCCATCTTATCAGGTATGAAAGCCGCCAAGCTCGACCCAGACGATGTTTGCTCTTACTTGGCAGCTGCCATGCATCTCTTCGAGGGGGTTTGTCCTGAAGACTGGGTCAGTTATGGGATTGTCATTGCAAAGAAAGGGGAGAAAATCAACCCTAGCGTGATCGTTGACATAGCTCGAACCAACGTGGAGGGGAATTGGGCTCAAGCCGGAGGAACGGATGTAATCAGAGACCCTACAATTGCGGAGCATGCATCATTGGTTGGACTGTTGCTGTGTCTGTATCGGTTGAGTAAGATCGTTGGCCAGAACACAGCAAACTATAAAACTAATGTAGCTGATAGGATGGAGCAAATATTTGAGACTGCCCCTTTTGCGAAAGTGGTGGAACATCACACCTTGATGACTGCTCACAAAATGTGTGCTAACTGGAGCACTATACCCAACTTCAGATTTTTGGTTGGCACATACGACATGTTTTTTGCAAGAGTTGAGCATATATACTCGGCTCTCAGAGTAGGAACAGTGGTAACAGCATATGAGGATTGTTCTGGGTTGGTCTCCTTCACAGGGTTTATCAAACAGATCAATCTATCCCCTAGAGACGCACTGCTATATTTCTTCCACAAAAACTTTGAGGGAGAGATCAAGAGAATGTTTGAGCCAGGGCAAGAAACAGCAGTCCCCCACTCATACTTCATTCATTTCAGGGCACTTGGATTGAGTGGCAAATCTCCTTACTCGTCCAATGCTGTAGGTCACACTTTCAATCTGATTCATTTTGTGGGATGCTATATGGGTCAGATCAGGTCTCTAAATGCAACAGTTATCCAAACCTGTGCACCTCATGAGATGTCAGTCTTAGGGGGATATCTTGGGGAGGAATTCTTTGGGAAGGGCACCTTCGAGAGGAGGTTCTTCAGAGATGAAAAAGAGATGCAGGATTATACAGAGCTGGAGGGGGCAAGAGTGGATGCCTCACTTGCTGATGACGGGACTGTAGACTCAGATGAGGATGATTTCTTTTCTGGAGAAACTAGAAGTCCTGAAGCAGTCTACAGTAGGATAATGATGAACGGTGGTAAGTTGAAGAAAGTTCATATACGTAGATATATAGCGGTGAGCTCAAACCACCAAGCTAGACCAAACTCTTTTGCAGAATTCTTGAATAAAGTATATGCAGACGGATCATAATCCTAGAGCTCCTTTACAAAGGAGGATCTACAGATGATTGAGATTGCAAGATAGATTCAAGAAAAAAACTTAACACCACTACTTGATTCGTGGTGTCAAGATGAGCAAAGATTTAGTACATCCGAGCCTCATCCGAGCAGGGATAGTAGACTTGGAGATGGCCGAAGAGACTACTGATCTAATCAATCGAACCATCGAGGGCAATCAAGCTCACCTTCAGGGGGAGCCTTTTTATGTTGATTCCTTGCCGGAAGATATGGGCAGATTGAAAATAGGGGGCGAATCTGATAAGGCTAAAACAGAAGAAGAAGAGAGAGATGAGGGGAGCTCTGAGGAAGATGACTATCTGTCTGATAGACAAGACCCATTAGTCTTATTTCAGAATTTCCTTGACGAAATCGGGGCCAAAGCAGTCAAAAAGTTAAAGACTGGTGAGGGATTCTTCAGAGTGTGGTCTGCTCTCTCGGATGATATAAAGGGGTACGTGTCAACCCACTTAATGCCATCTAAGGCGAGAAAGACAAAGAGCATACAAATTCAAACAGAACCGACTGCATTATCTAGTTTTGCAAGTGAGAGTCGGCCAGATTCCTGGTGTGTGCAAGACCAAACGGATAAGGGAGACCATGACACTGATCACGATATGGTCTCGGATGTTGAATCAGCCACTGAGAAAGAAGAGATCAGAGATATAGAGGGAGAGGTTGCTCACCAGGTTGCAGAAAGCTTCTCAAAGAAGTACAAATTCCCTTCTAGATCCTCAGGAATATTTTTATGGAACTTCGAGCAGCTCAAAATGAATTTGGACGACATTGTGAAGGCAGCCATGAATGTACCAGGGGTTGACATGATCGCCGAAAAAGGAGGGAAGCTCCCCTTAAGATGCATTTTGGGATTTGTAGCGTTAGACTCTTCAAAAAGATTCAGGCTCCTTGCAAACAACGACAAGGTGGCCAGACTCATACAAGATGATATCAACAGTTACATGGCCCGGCTGGAGGAGGCCGATTAGAGGTTATAAAGACCCATAACACAATCAATAACTGGGCAGTCTTGTCTTGAAATGAAAAAAACATGTAACACCCCTGAAAAGATGAATTTCCTAAAGAGAATGGTTAAAAGCTGCAAAGAGGAAGAGTCCCCCAAGTATCCATCAGCTTCTGCACCGCCGGACGACGATGACCTTTGGATGCCTCCTCCTGAGTATGTTCCTTTGACCCAGGTTACAAGCAAGGCCAGAGTAAGAAATTTTTGTATCAATGGGGAGGTCAAGATATGTAGTCCAAACGGGTACTCCTTCAAGATACTCCGGCATATTCTGAAGTCATTAGACAATGCTTACTCTGGAAACAGGAGGATGATAGGGTTAGTCAAAGTGGTCATAGGGCTTGTCCTTTCAGGATCTCCAATCCCGGAAGGCATGAACTGGGTTTATAAACTTCGCAGAACATTAATCTTTCAGTGGGCAGAGTCATATGGACCATTAGAAGGAGAAGAGCTTGAGTACTCCCAGGAAATTACCTGGGATGATGAGGCAGAATTCGTAGGCTTGCAAATCCGAGTGAGTGCAAGACAATGTCACATCCAGGGTCGTCTCTGGTGTATAAATATAAACTCAAGAGCATGTCAGCTGTGGGCTGATATGACCTTGAAGACCCAACAGTCCCCGGACGATGAAAACACCTCACTCCTGCTAGAGTAGACTCTAGCCTGTAGCTGTGTATCTCAGTTGTTACCTCTGTTTGGAGTAGAGTAAAACTGCGAGCAATAGAACAATCACCGCAATGGTGCCCGCTTTCAGCACAATACATATAACCTAATAACCGGTTTGTCTTCCTATTCAGGGTTGAGCAAAAACGTGAAAAAAACTCAGGGAAAAAGGCACAACAGCCCTCTCACTGCCATCATGAATATACAATGCCTTGCTGTGCTCCTTAGCTTCACCACTACCTATTCTCTGGGAGAATTTCCTTTGTACACAATTCCCGAGAAGATAGAGAAATGGACCCCAATAGACATGATCCATCTAAGCTGCCCCAACAACTTATTATCCGAGGAGGAAGGTTGCAACACAGAGTCACCCCTCACCTACTTCGAGCTCAAGATTGGTTACTTAGCTCATCAGAAAGTTCCTGGGTTTACATGTACAGGGGTGGTGACTGAGGCGGAGACATACACAAATTTTGTCGGGTATGTCACCACAACCTTCAAAAGAAAACACTTCAGGCCGACAGTAGCCGCCTGTCGTGATGCATACAACTGGAAAGTGTCCGGGGACCCCAGGTATGAAGAGTCACTGCACACCCCTTATCCGGACAGCAGCTGGTTGAGGACTGTAACCACCACCAAAGAATCCCTTCTTATAATATCACCTAGCATCGTAGAGATGGATGTATATGGCAGGACTCTCCATTCCCCCATGTTCCCTTCAGGGATATGTTCCAAGCTCTATCCCTCTGTTCCATCTTGTAAAACCAACCATGATTACACATTATGGCTGCCAGAAGATCCTAGTTTGAGTTTAATCTGTGATATCTTCACTTCTGGCAGCGGAAGGAAGGCCATGAATGGATCCCGCATCTGCGGATTCAAAGATGAAAGGGGATTTTACAGGTCTTTAAAAGGCGCTTGTAAGTTGACCTTGTGCGGGAAGCCTGGAATCAGATTATTTGACGGAACTTGGGTCTCTTTTACAAGGCCAGAAGTTCACGTGTGGTGCACTCCCAACCAATTGGTCAACATACACAATGACAGACTAGATGAGATTGAGCACTTGATCGTTGAAGACATTGTCAAAAGAAGAGAGGAGTGTTTAGACACTCTGGAGACGATATTTATGTCTCAATCAATTAGTTTTAGGAGGTTGAGCCACTTTCGGAAATTGGTTCCAGGATATGGGAAAGCTTACACCATTTTAAATGGTAGCTTGATGGAGGCAAATGTATACTATAAAAGAGTTGACAAGTGGGCGGACATTTTACCCTCTAAGGGATGTCTGAAAGTAGGGCAACAATGTATGGACCCTGTCAACGGAGTCTTCTTCAACGGAATTATCAAAAGCCCGGATGGCCAAATCTTGATCCCTGAGATGCAGTCAGAGCAGCTAAAACAGCATATGGACTTATTGAAAGCAGCAGTGTTCCCTCTCCGACATCCTTTGATCAGCCAAGAAGCAGTCTTTAAGAAAGACGGGGAGGCAGATGATTTTGTGGACCTCCATATGCCAGACGTCCACAAATCTATATCAGATGTAGACTTGGGCTTGCCTCACTGGGGGTTCTGGCTGTTGATCGGGGTGACCATAGTGGCATTTTTGGTCTTGGTGTGCTTGCTCCGTGTCTGTTGTAGGAGAGTGAGGAGGAGAGGTTCGCGACGTGCAACTCAGGAGATCCCCCTCAGCGTTTCCTCTGTCCCTGTCCCTCGAGCCACGGTGGTGTCATCATGGGAGTCTTACAAAGGGCTCCCAGGCACCTGAAGCTTCCAATTGACTGAAACAATACTCACAACCGGAACACCTGCCTCGGCACAACAAAACCCAACCACATGGTGTCAAATCTCGGTTCATGCTCTCCCATGT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| 93,742
|
EU293117.1
|
Lyssavirus mokola
|
Delmas,O., Holmes,E.C., Talbi,C., Larrous,F., Dacheux,L., Bouchier,C., Bourhy,H.
|
Institut Pasteur, UPRE Lyssavirus Dynamics and Host Adaptation, WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Rabies
|
France
|
2008-04-23
|
86100CAM
|
Lyssavirus mokola
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,949
|
GenBank
| 1
|
Cameroon
|
Cameroon
|
Soricidae
| null |
1974
| null | null |
Mokola virus isolate 86100CAM, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCAAAGAAGACATAGACAGTATCAGCGACCTAAACAAAATGTAACACTCCTACAATGGAGTCTGACAAGATTGTGTTCAAGGTGAACAACCAAGTCGTTTCTTTGAAGCCCGAGGTCATATCGGATCAATATGAGTATAAATATCCTGCCATCCTAGATGGAAAGAAACCAGGGATAACTTTAGGAAAAGCACCTGATCTAAGCACCGCCTACAAGTCCATCTTATCAGGTATGAAGTCTGCAAAGCTCGACCCAGACGATGTTTGTTCTTACTTGGCAGCTGCTATGCATCTCTTCGAGGGGGTCTGTCCCGAGGACTGGGTCAGTTATGGGATTGTCATTGCAAAGAAGGGGGAGAAGATTAACCCTAGTGTGATCGTTGATATAACCCGCACAAATGTTGAGGGAAATTGGGCTCAAGCGGGAGGAACTGAAGTGATCAGAGACCCTACCACGGCAGAGCATGCGTCATTGGTTGGGCTGTTACTGTGTCTGTATAGGTTAAGCAAGATAGTTGGCCAAAACACTGCAAACTATAAGACCAATGTGGCTGACAGAATGGAGCAAATATTCGAAACGGCTCCTTTTGCGAAGGTGGTAGAACATCACACATTGATGACTACCCACAAGATGTGTGCCAATTGGAGCACTATACCGAACTTCAGATTCTTGGTAGGTACATATGATATGTTCTTTGCAAGAGTTGAGCACATATATTCTGCTCTCAGAGTCGGAACAGTGGTGACTGCATATGAGGATTGCTCTGGGTTGGTCTCTTTCACCGGGTTCATCAAACAGATCAATCTATCTCCTAGGGATGCGCTGCTATATTTCTTTCATAAAAACTTTGAGGGAGAGATCAAGAGAATGTTTGAACCAGGGCAAGAGACAGCAGTCCCCCATTCATACTTCATTCATTTCAGGGCACTCGGATTGAGTGGCAAGTCCCCATATTCTTCCAATGCTGTGGGTCATACTTTCAATCTAATTCACTTTGTTGGATGCTATATGGGTCAGATCAGGTCTCTCAATGCTACAGTGATCCAAACATGTGCACCCCACGAAATGTCAGTCCTAGGAGGATATCTCGGAGAAGAGTTCTTTGGTAAAGGCACATTCGAGAGGAGGTTTTTCAGGGATGAGAAAGAAATGCAAGATTATACAGAGTTGGAGGGGGCCAGAGTGGAAGCTTCACTGGCTGATGATGGGACTGTGGACTCAGATGAGGAAGATTTCTTCTCTGGAGAAACTAGAAGTCCTGAAGCAGTCTACAGTCGGATAATGATGAATAACGGCAAGCTAAAGAAAGTCCATATACGCAGGTATATAGCAGTGAGCTCTAATCATCAAGCCAGACCGAACTCTTTTGCCGAATTCTTGAACAAGGTATATGCAGATGGTTCTTAATCTGAAGGTTTCTTGGGAGATGGAAATCTACAGATAAGTAAGGTTGTGAGACAGGCTCCAAGAAAAAAACTTAACACCACTCCTCGATTCGTGGTGGCACAATGAGCAAAGACTTGGTACACCCTAGTCTGATCCGAGCGGGGATAGTGGAATTGGAAATGGCAGAAGAGACCACTGATCTGATCAACAGGACCATTGAGAGCAATCAAGCTCACCTTCAGGGTGAGCCGTTTTATGTTGATTCCTTGCCAGAAAACATGGGCAGATTGAAAATAGAGGACAAATCTATTAGGACCAAGACCGAAGAAGAAGAGGGAGATGAATGCAGCTCTGAAGAGGATGACTATTTGTCTGAGGGACACGACCCATTAGTTCTCCTTCAAAATTTTCTTGACGAAATTGGGGCCAAAGCTGTCAAGAAGTTGAAGACTGGCGAGGGGTTCTTCAGGGTGTGGTCAGCTCTGTCGGATGACATAAAGGGGTATGTATCTACTCATGTAATAACATCTGGGGCTAGGAGCACTAAGAGCATACAAACTCAGACAGAACCAACTGCCTCATATAATTCAGGACACGAGAGTCTGCGGGACCCCTGGTGCATGCATGACCAGAAGGATAAGAAAGACAGCGCAATTGGGCCCGCAAGGGTCTCAGACGTTGAATCGGCTGCTGACAAGGAAGAGACTCGAGATATAGAAGGAGAAGTCGCCCATCAGGTCGCAGAAAGCTTCTCGAAGAAATACAAATTTCCTTCTAGATCTTCGGGAATATTCTTGTGGAATTTTGAACAGCTTAAGATGAATCTGGATGACATTGTGAAGGCAGCCATGAATGTACCTGGAGTTGATAAGATAGCTGAGAAAGGAGGCAAGCTTCCCCTGAGATGCATTCTAGGATTTGTAGCTTTAGACTCTTCAAAGAGATTTAGGTTGCTTGCAAACAACGACAAGGTGGCCAGACTCATCCAAGATGATATCAACAGTTACATGGCCCGGCTAGAGGATGCAGATTAGAGGCTATAAGGAACCATAATGAAATCCAGAATTAGGCAGTCCGATTTTGAAATGAAAAAAACGTGTAACATCCCTAAAAAGATGAACTTCCTAAAGAAGATGGTGAGAAGTTGCAAGGATGAAGAGACCCAAAAGTATCCGTCAGCATCGGCGCCTCCAGATGATGACGACCTTTGGATGCCTCCGCCTGAGTATGTCCCTTTAACTCAGGTTAAGGGGAAGGCCAGCATACGAAATTTTTGTATCAATGGGGAGGTCAAGATATGTAGTCCAAACGGTTACTCCTTTAAGATACTCAGGCATATCCTCAAGTCTTTTGATAACATTTACTCTGGGAACCGGAGGATGATCGGGTTAGTCAAAGTGGTTATAGGGCTGGTACTTTCAGGATCTCCAGTCCCGGAAGGAATGAACTGGGTTTACAAACTCCGTAGGACCTTAATATTTCAGTGGGCAGAGTCGTATGGACCATTGGAAGGAGAAGAGCTTGAGTACTCACAGGAAATTACATGGGATGACGAGGCAGAGTTTGTAGGCCTGCAAATCAGAGTGAGTGCCAGACAATGTCACATCCAGGGGCGTCTCTGGTGCATCAACATGAACTCTAGAGCATGTCAGTTATGGGCCGATATGATCTTGAAGACCCAACAATCTCCGGATGATGAAAACACCTCACTTTTATTAGAGTAGACTCTAGCCCACAGCTTTGTTTCTCAGTTGTTACCTCTGTCCGCAGTAGAGAAAATCCGCGAGCAATAGAACAATTAACGCACTGGTGCCCGCTTTCAGCACAATACATATAACCTACTAACCAGTTTGTCTTCCGATTCAGGTTCGAGCAAAAATGTGAAAAAAACTGCATGAAAAGACTCAACAGCCCTCTAACTGCCATCATGAATATACCTTGCTTTGCTGTGATCCTCAGCTTAGCTACTACACATTCTCTGGGAGAATTCCCCTTGTATACGATTCCCGAGAAAATAGAGAAATGGACCCCCATAGACATGATCCATCTTAGTTGCCCTAATAACCTGCTGTCTGAGGAAGAAGGTTGCAATACAGAGTCTCCTTTCACCTACTTCGAGCTCAAGAGTGGTTACCTAGCCCATCAGAAGGTCCCAGGATTTACATGCACTGGGGTTGTGAATGAGGCAGAGACATACACAAACTTTGTCGGATATGTCACCACCACCTTCAAAAGGAAGCACTTTAAACCTACAGTGGCTGCTTGTCGTGATGCCTACAACTGGAAAGTATCAGGGGACCCCCGATATGAAGAATCTCTACACACCCCGTATCCCGACAGCAGCTGGTTAAGGACTGTGACCACAACCAAAGAAGCCCTTCTTATAATATCGCCAAGCATTGTAGAGATGGACATATATGGCAGGACCCTTCACTCTCCCATGTTCCCTTCGGGGAAATGTTCCAAGCTCTATCCTTCTGTCCCCTCTTGTACAACCAACCATGATTACACATTGTGGTTGCCAGAAGATTCTAGTCTGAGTTTGATTTGCGACATCTTCACTTCCAGCAGTGGACAGAAGGCCATGAATGGGTCTCGCATCTGCGGATTCAAGGATGAAAGGGGATTTTACAGATCCTTGAAGGGATCCTGTAAGCTGACATTGTGCGGGAAACCTGGAATTAGGCTGTTCGACGGAACTTGGGTCTCTTTTACAAAGCCGGACGTTCATGTGTGGTGCACTCCCAACCAGTTAGTCAATATACATAACGACAGACTAGATGAGGTTGAACATCTGATCGTGGACGATATCATCAAGAAGAGAGAGGAGTGTTTAGACACGCTGGAAACTATACTTATGTCTCAATCAGTTAGTTTTAGACGGTTGAGCCATTTCAGAAAGTTAGTTCCAGGATATGGAAAAGCTTACACTATTTTGAACGGCAGCTTAATGGAAACAAATGTCTACTACAAAAGAGTTGACAGGTGGGCGGACATTTTGCCTTCTAGGGGATGTCTGAAAGTCGGACAACAGTGCATGGACCCTGTCAAAGGGGTCCTCTTCAACGGAATTATCAAGGGTCCGGATGGACAAATATTGATTCCAGAGATGCAGTCAGAGCAGCTCAAACAGCATATGGATCTGTTGAAAGCAGCTATGTTTCCTCTCCGTCATCCTTTAATCAACAGAGAGGCAGTCTTCAAGAAGGATGGAAATGCCGATGATTTTGTTGATCTCCATATGCCTGATGTTCAAAAATCTGTGTCGGATGTCGACCTGGGCCTGCCTCATTGGGGGTTCTGGTTGTTAGTCGGGGCAACAGTAGTAGCCTTTGTGGTCTTGGCGTGCTTGCTCCGTGTATGTTGTAGGAGAGTGAGAAGGAGAAGGTCACTGCGTGCCACTCAGGATATCCCCCTCAGCGTTGCCCCTGCCCCTGTCCCTCGTGCCAAAGTGGTGTCATCATGGGAGTCTTATAAAGGGCTCCCAGGTACTTGATGCCTTTATCATACTGCCTGACACATAGATCACAACCTGATTACCTGCCTCAGCACACCAGATCTCACCCACATGCTGTCAAATCTCAGTTCACAACCTCCA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| 105,583
|
EU293118.1
|
Lyssavirus mokola
|
Delmas,O., Holmes,E.C., Talbi,C., Larrous,F., Dacheux,L., Bouchier,C., Bourhy,H.
|
Institut Pasteur, UPRE Lyssavirus Dynamics and Host Adaptation, WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Rabies
|
France
|
2008-04-23
|
86101RCA
|
Lyssavirus mokola
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,957
|
GenBank
| 1
|
Central African Republic
|
Central African Republic
|
Rodentia
| null |
1981
| null | null |
Mokola virus isolate 86101RCA, complete genome
|
ACGCTTAACAACAAAATCAAAGAAGACATAGACAGTAGCAGTGACCTAAACAAGATGTAACACTCCTACAATGGAGTCTGACAAGATTGTGTTCAAGGTGAATAATCAAGTTGTGTCTTTGAAGCCTGAGGTCATATCTGATCAATATGAGTATAAATATCCTGCAATTCTAGATGGAAAGAAACCAGGGATAACCTTGGGGAAGGCCCCCGATTTAAATACTGCTTATAAGTCTATCTTGTCAGGAATGAAGGCTGCTAAGCTTGATCCAGACGATGTTTGCTCTTACTTGGCAGCTGCTATGCCTCTGTTCGAGGGGGTTTGTCCTGAGGACTGGGTCAGTTATGGGATCGTCATTGCAAAGAAGGGGGAGAAAATCAACCCTAGCGTAATCGTTGATATAGCTCGCACAAATGTAGAAGGGAATTGGGCTCAGGCCGGAGGAACTGATGTGATCAGAGACCCCACAACGGCAGAGCACGCGTCATTGGTGGGATTGTTGTTATGTCTGTATCGGTTGAGCAAGATAGTTGGTCAGAATACGGCAAATTATAAAACTAATGTGGCTGACAGAATGGAACAGATATTTGAAACTGCCCCTTTTGCAAAGGTGGTAGAACATCACACATTGATGACCACCCATAAAATGTGCGCTAACTGGAGCACTATACCCAACTTCAGGTTCTTGGTAGGTACATATGATATGTTCTTTGCAAGGGTTGAACATATATATTCAGCTCTCAGAGTCGGGACGGTGGTGACAGCATATGAAGATTGCTCTGGATTAGTCTCTTTCACAGGGTTTATCAAACAGATCAATCTATCTCCTAGAGATGCACTGCTATATTTCTTTCATAAAAACTTTGAGGGAGAGATCAAGAGAATGTTCGAGCCAGGACAAGAAACTGCTGTTCCCCATTCATACTTCATTCATTTCAGGTCACTTGGCTTGAGCGGCAAGTCCCCATACTCCTCCAATGCAGTAGGTCACACCTTCAATTTGATTCATTTTGTGGGATGCTATATGGGTCAAATCAGGTCGCTAAATGCGACGGTGATACAAACATGTGCACCTCATGAGATGTCAGTCCTAGGAGGATATCTGGGGGAAGAATTCTTCGGGAAAGGCACTTTCGAGAGGAGGTTCTTCAGGGATGAAAAAGAGATGCAGGACTATACAGAGCTGGAGGAGGCCAGAGTGGAAGCTTCACTTGCTGATGATGGGACTGTAGACTCAGATGAGGAGGATTTCTTCTCAGGAGAAACCAGAAGTCCAGAGGCAGTATACAGCCGAATAATGATGAACGGTGGCAAGTTGAAGAAAGTCCATATACGTAGGTATATAGCAGTGAGCTCTAATCATCAGGCGAGACCTAACTCTTTTGCCGAATTTTTGAACAAGGTCTATGCCGATGGATCATAATCAGAGGGCTTCTTAGAGGATGACAGTTTGCAGAAGATCAAAGTTGTGAGACGGACTCCAAGAAAAAAACTTAACACCACTCTTCAATTCGTGGTGAAAAAAATGAGTAAGGACTTGGTACATCCTAGTCTTATCAGAGCCGGGATAGTAGAACTAGAGATGGCAGAGGAGACCACTGATCTGATTAACAGGACCATAGAGAGCAATCAAGCCCACCTTCAGGGAGAGCCATTTTCTGTTGATTCCTTGCCAGAAGATATGAGCAGATTGAGAATTAGGGACAGTTCTGGCGGGACCAAAATGGAGGTGGAGGACAGAGAGGAAGGCAGCTCGGAGGAAGATGACTATATGTCTGAGGGACAAGACCCATTGGTCCTCTTTCAGAATTTCCTCGACGAGATTGGGGCCAAAGCGGTCAAAAAGTTGAAAACTGGTGAGGGATTCTTCAGAGTGTGGTCATCCCTTTCAGATGACATAAAGGGGTATGTCTCTACCCATATAATGAAATCCAAGGCGACAAATACTAAAAGTAGACAGACTCAAACAGAACCAACCACATCATCTAGTTCTGGAAATGAGAGTCTGTGGGATTCTCGGTGCATGTCTGATCAAAAGGATGAGAAAGACCACTCTACTGATCATGAGATGGTCTTAGATGTTGATTCTGCTACAGACAAAGAAGAGATTCGAGATATAGAAGGAGAAGTCGCTCACCAGGTCGCGGAAAGCTTTTCAAAGAAATACAAATTTCCTTCTAGATCTTCGGGAATATTCTTGTGGAATTTCGAGCAACTCAAAATGAATTTAGATGACATTGTGAAGGCAGCCATGAATGTACCCGGAGTTGACAAGATAGCAGAAAAGGGAGGGAAGCTTCCCTTGAGATGCATTTTAGGATTTGTAGCTTCAGACTCTTCAAAGAGATTCCGGCTTCTTGCCAATAATGACAAGGTGGCAAGACTCATACAAGAAGACATCAACAGCTACATGGCCCGGCTTGAGGATGCAGACTAGGGACTGTTCAACCCCCTAATAAAACCTTGAATTGGGAATTTCAGTCATGACATGAAAAAAACATGTAACATCCCTAAAAAGATGAATTTCCTAAAGAAGATGGTTAGAAGCTGCAAGGAGGAAGAGATTCAGAAGTGTCCATCAGCATCAGCGCCTCCGGACGATGATGACCTTTGGATGCCTCCACCAGAATATGTCCCTTTGACTCAGGTTAAAGGCAAAGCCAGCGTAAGAAACTTTTGTATAAGTGGGGAGGTCAAGATATGCAGTCCAAACGGGTATTCTTTCAAGATACTCAGGCATATCTTGAAGTCATTCGACAACGTTTACTCTGGGAACAGGAGGATGATAGGGTTGGTCAAGGTGGTTATAGGGCTTGTACTTTCAGGATCTCCAGTCCCAGAGGGAATGAACTGGGTTTACAAACTTCGTAGGACATTAATATTCCAGTGGGCAGAGTCCTACGGACCACTGGAAGGAGAAGAGCTTGAGTATTCACAAGAGATTACGTGGGATGATGAGGCAGAATTTGTTGGCTTACAGATCAGCGTGAGTGCTAGACAGTGTCACATCCAGGGTCGTCTCTGGTGTATAAACATGAACTCAAGAGCATGTCAGTTGTGGGCTGATATGATCTTGAAGACCCAACAGTCCCCAGATGATGAGAACACCTCACTTTTATTAGAGTAGACTTTAATTCACATCTCTGTCTCTCAGTTGTTACCTCTGTTTGCAGTAGAGAATAACCGCGAGCAATAGAACAATTACCGCAATGGTGCCCGCTTTCAGCACAACACATATAACCTACTAACCTGTTTGTCTTCCTATTCAGGGTTGAGCAAAAATGTGAAAAAAACTACATAAAAAGGCACAACAGCCCTCTCACAGCCATCATGAATATACCTTGCTTTGCTGTTATCTTCAGTTTAGCCATTACATATTCCTTGGGAGAGTTCCCCTTGTACACGATCCCCGAGAAGATAGAAAAATGGACTCCCATAGACATGATCCATCTGAGTTGCCCTAACAACCTATTGTCGGAGGAAGAGGGCTGCAACACAGAGTCTCCCTTCACATACTTTGAGCTCAAGAGTGGGTACCTCGCGCACCAGAAGGTCCCAGGGTTTACATGTACTGGGGTTGTAAATGAGGCAGAGACATACACAAACTTCGTCGGGTATGTCACCACTACCTTTAAAAGGAAACACTTCATGCCTACCGTGGCTGCCTGTCGCGATGCTTACAACTGGAAGGTGTCTGGAGACCCGAGGTATGAGGAGTCACTACACACTCCGTACCCTGACAGCAGTTGGTTAAGAACTGTCACCACAACCAAAGAATCTCTTCTCATAATATCGCCTAGTATCGTGGAGATGGATGTCTACGGCAGGACTCTTCACTCCCCCATGTTTCCATCAGGTATTTGTTCTAAGCTCTATCCTTCTGTCCCGTCATGCAAGACCAACCATGATTACACATTGTGGTTGCCCGAAGATCCTAGCTTGAGTTTGATCTGTGATATTTTCACCTCCAGCAGTGGACAAAAGGTCATGAACGGGTCTCGCATCTGCGGGTTCAGAGACGAGCGGGGATTTTACAGATCCTTGAAGGGCGCTTGTAAGCTGACGCTGTGCGGGAGACCTGGGATTAGATTGTTTGACGGGACTTGGGTATCTTTCACAAAGCCTGACATTCATGTGTGGTGCACCCCCAATCAATTAGTCAATATACACAATGATAGACTGGATGAGATTGAGCACTTAATTGTGGAAGACATTATAAAGAAAAGGGAAGAGTGTTTAGACACTCTGGAGACAATACTTATGTCTCAGTCAATTAGTTTTAGACGGTTGAGCCATTTCCGAAAATTGGTTCCTGGATATGGAAAAGCTTACACTATTTTAAACGGCAGCTTGATGGAAACAAACGTCTACTACAAAAGGGTTGACAAGTGGACTGACATTTTGCCTTCTAAGGGATGTCTCAAAGTCGGGCAGCAATGCATGGAGCCCGTCAACGGAGTCCTTTTCAACGGAATTATTAAGGGCCCTGATGGCCAGATCTTGATTCCGGAGATGCAGTCAGAGCAGCTCAAGCAACACATGGACTTGTTAAAGGCAGCTGTGTTTCCACTTCGTCATCCTTTAATTAAAAGAGAATCAGTTTTCAAAACGGATGGTGATGCTGATGACTTTGTGGATCTCCATATGCCCGATGTTCACAAATCTGTGTCAGGTGTCGACCTGGGCCTGCCTCATTGGGGGTTTTGGCTGTTGATCGGGGCGACGGCAGTCGCATTTGTGGTCTTGGTGTGCTTGCTTCGTGTGTGCTGTAGGAGAATAAGAAGGAGAAGATCTCTACATGCGACTCAAGAGATCCCCCTCAGCGTTTCCTCTGCCTCTGTCCCAAGAGCCAAAGTGGTGTCATCATGGGAGTCTTATAAAGGGCTCCCAGGTACTTGATACTTCTATCCAATTGCCTGACACATAACTCACAACCTGACTACCTGCCTCGGCACGCCCAAGATCAACCATATGGTGTCAAATCTCCGTTCATACCCTCC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| 105,584
|
NC_001542.1
|
Lyssavirus rabies
|
Tordo,N., Poch,O., Ermine,A., Keith,G., Rougeon,F.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-03
| null |
Lyssavirus rabies
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,932
|
RefSeq
| 2
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Rabies virus, complete genome
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| 8,960
|
PP068460.1
|
Lyssavirus rabies
|
Vinitha,V., Raja,P., Parthiban,M., Pazhanivel,N., Sathish,G., Yamini,C., Parthiban,S., Dhinakar Raj,G.
|
Madras Veterinary College, Department of Animal Biotechnology
|
India
|
2024-01-20
|
ABT/MVC/ICMR-Rabies/Dog/002
|
Lyssavirus rabies
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,887
|
GenBank
| null |
India
|
India
|
Canis lupus familiaris
|
brain
|
2023-06-20
| null | null |
Lyssavirus rabies isolate ABT/MVC/ICMR-Rabies/Dog/002, complete genome
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CAAAATCAGAGAAGAAGCAGACAGCGTCAATTGCAAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATGCCGACAAGATTGTATTCAAAGTCAATAATCAGGTGGTCTCTTTAAAACCTGAGATTATCGTGGATCAATATGAGTACAAGTACCCTGCTATCAAGGACTTGAAGAAGCCCAGTATCACCCTAGGGAAGGCCCCAGATTTGAACAAAGCATACAAGTCAGTTTTATCAGGCTTAAATGCTGCCAAGCTTGATCCTGATGATGTATGTTCTTACTTGGCAGCTGCAATGCAATTCTTTGAGGGGACATGTCCTGAAGATTGGACCAGCTACGGGATCTTGATCGCAAGAAAAGGAGATAAGATCACCCCGGATTCTCTTGTGGAGATAAAGCGTACTGATGTAGAAGGGAATTGGGCTTTGACGGGAGGAATGGAACTGACAAGGGACCCCACTGTTCCCGAGCATGCGTCTTTAGTCGGTCTTCTCTTGAGTCTGTACAGGTTGAGCAAAATATCTGGGCAAAACACCGGCAACTATAAAACAAATATTGCAGATAGGATAGAGCAGATCTTCGAGACAGCCCCTTTTATTAAAATCGTGGAACACCATACTCTGATGACAACTCACAAAATGTGTGCCAATTGGAGTACTATACCAAACTTCAGATTCTTAGCAGGGACCTACGACATGTTTTTCTCTCGGATTGAGCACTTGTATTCAGCGATCAGAGTAGGCACAGTAGTCACCGCTTATGAGGACTGCTCGGGGCTGGTGTCATTTACTGGATTCATAAAGCAGATAAATCTCACTGCAAGGGAGGCAATACTATATTTCTTCCACAAAAACTTCGAGGAAGAGATAAGAAGAATGTTTGAGCCAGGGCAAGAGACAGCTGTTCCTCACTCCTATTTCATTCACTTCCGTTCACTGGGCTTGAGTGGGAAGTCCCCTTATTCATCAAATGCAGTTGGTCATGTGTTCAATCTCATTCACTTTGTTGGATGCTACATGGGGCAAGTAAGGTCCCTAAATGCAACGGTCATTGCCGGATGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTAGGGGGCTACTTAGGGGAGGAGTTCTTCGGAAAGGGAACGTTCGAAAGGAGATTCTTCAGAGACGAAAAAGAACTTCAGGAATATGAGACGGCAGAATTGACAAAAACCGACGTGGCTCTGGCAGATGACGGAACTGTCAATTCGGATGACGAGGACTACTTCTCCGGTGAAACCAGGAGCCCCGAAGCCGTTTATGCTCGAATCATGATGAACGGAGGCCGACTAAAGAGATCACACATACGGAGATATGTTTCAGTCAGCTCCAATCACCAAGCTCGTCCGAACTCATTTGCCGAGTTTCTAAATAAGACATATTCTAGTGACTCATAAGAGGTTGAACAACGGAATGTAGGAAGTCTACAGATTGCGTATATTCTTCATGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTTGAACCATCCCAAATATGAGCAAAATCTTTGTTAATCCGAGTGCAATTAGGGCCGGTCTGGCTGACCTTGAGATGGCTGAGGAGACTGTTGATCTGATCAACAAAAACATAGAAGACAATCAAGCTCATCTCCAGGGAGAACCCATAGAGGTGGACAATCTCCCTGAAGACATGAGGCGGCTCCATCTGGACGATGAGAAGCCTTCTGGCCTTGGGGGGATGGCCAAAGCGGGGGAAGTCAAGTATCGGGAGGACTTTCAGATGGATGAAGGGGAGGATCCTAACCTCCTCTTCCAGTCATACCTGGACAATGTTGGAGTACAGATAGTCAGACAAATGAGGTCAGGAGAGAGATTTCTCAAAATATGGTCACAAACCGTGGAGGAAATCATATCTTATGTCACAGTCAACTTTCCTAACCCCCCAGGGAGGTCTTCGGAGGACAAGTCAACCCAGACAACTGGTCGAGAACTCAAGAAGGAGACCACATCTGCTTCTTACCAGAGAGACAGCCAATCCTCGAAAGCCAGGATGGCGGCTCAAACCGCCTCTGGTCCTCCAGCCCTTGAATGGTCTGCTACCAACGAAGAGGATGATCTATCGGTGGAAGCTGAGATTGCTCACCAAATTGCTGAAAGCTTCTCCAAGAAGTACAAGTTTCCCTCTCGATCATCTGGGATATTTTTGTATAACTTTGAACAGTTAAAAATGAACCTTGATGACATAGTTAAAGAGGCAAAAAATGTGCCTGGTGTCACCCGTTTAGCACATGACGGATCCAAACTCCCTCTAAGATGTGTACTGGGATGGGTTGGTCTGGCCAATTCTAAAAAGTTCCAGTTGTTAGTCGAGCCCGACAAGCTAAACAAAATCATGCAAGATGATCTGAATCGCTATACATCTAGCTAACTAATCTTTTAAACTCTGTCCCGGCAGACAATAGAATCTGAGATGCTCTGAATTCGACGTGAAAAAAACAGGCAACACCACTGATAAGATGAACTTTCTACGCAAGATAGTGAAAAACTGTAGGGATGAGGACACCCAGAAGCCCTCTTTTGTTTCGGCTCCTCCGGATGACGATGACCTATGGCTTCCTCCCCCAGAATATGTCCCGCTGAAAGAACTCACAGGCAAAAAGAACATGAGGAACTTTTGCATCAACGGAGAGGTTAAAGTGTGTAGCCCAAATGGTTACTCGTTCAGGATCCTGCGGCACATTCTGAGATCATTCGACGAGATATATTCTGGGAATCACAGGATGATCGGGCTGGTCAAGGTTGTCATTGGACTGGCTTTGTCTGGGGCCCCTGTCCCAGAGGGCATGAACTGGGTATACAAACTGAGGAGAACTCTTATCTTCCAATGGGCTGATTCTAGGGGCCCCCTTGAGGGGGAGGAATTGGAATACTCTCAAGAGATCACTTGGGACGATGATACCGAATTCGTTGGATTACAAATAAGAGTAAGCGCAAGACAATGTCATATTCAGGGCAGGATTTGGTGTATTAACATGAACTCGAGAGCATGTCAATTATGGTCTGACATGTCTCTTCAGACACAAAGGTCTGAAGAGGACAAAGATTCTTCTCTGCTTCTAGAATAATCAATTTATATCCCGCAAGTTTATCACTTGTTTACCTCTGGAGGAGAGAACATACGGGCTTGACTCCAACCTTTGGGAGCAATAGAACAAAAAACATCTGTAATGGTGCCATTAAATCGCTGCATTTTATCAAGGTCAAACCAATTACCTTTACATTTTGGGTCTCTTAGATGTGAAAAAAACTATTAACATCCCTCAAAAGACTTAAGAAAAGATGGTTCCTCAGGTTCTTTTGTTTGTACCCCTTCTGGTTTTCTCAATGTGTTTCGGGAAATTCCCTATCTATACGATACCAGACAAACTTGGTCCCTGGAGCCCGATTGACATACATCATCTCAGCTGTCCAAACAACCTGGTTGTGGAAGATGAAGGATGCACTAACTTGTCGGGTTTCTCCTACATGGAACTTAAGGTGGGATACATCTCGGCCATAAAAGTAAACGGGTTCACGTGCACGGGTGTGGTGACAGAGGCAGAGACTTACACTAACTTTGTTGGTTATGTTACCACCACGTTCAAAAGAAAGCATTTCCGCCCAACACCAGATGCATGTCGAGCTGCTTACAACTGGAAGATGGCCGGTGACCCCAGATATGAAGAATCGCTGCACAATCCGTACCCTGACTACCACTGGCTTCGAACCGTTAAAACCACAAAGGAGTCCCTCGTCATCATATCCCCAAGTGTAGCGGATCTGGATCCATACGACAAATCCCTTCATTCGAGGGTCTTTCCTAGCGGGAAGTGCTCAGGAATAACAATATCATCTACTTACTGCTCTACTAACCATGATTACACAATCTGGATGCCCGAGAATCCGAGACTGGGGACATCTTGTGACATCTTTACCAACAGTAGAGGGAAAAGAGCATCCAAAGGGGGCAAAACTTGCGGATTTGTTGATGAAAGAGGCTTGTACAAGTCTTTGAAAGGGGCATGCAAGCTCAAATTGTGTGGTGTTCTTGGCCTTAGACTTATGGATGGAACGTGGGTTGCAATGCAAACATCGGACGAAACCAAGTGGTGTCCTCCTGATCAGTTAGTAAATCTACACGACTTTCGCTCGGACGAGATCGAACATCTTGTTGTGGAGGAGTTGGTCAAGAAAAGAGAGGAGTGTCTGGATGCACTAGAGTCCATCATGACTACCAAGTCGGTGAGTTTCAGACGTCTCAGCCACTTAAGAAAACTTGTCCCTGGGTTCGGAAAAGCCTACACCATATTCAACAAAACCTTGATGGAAGCAGATGCCCATTACAAGTCAATCCGAACCTGGAATGAAATCATCCCCTCCAAAGGGTGTTTGAGAGTTGGAGGGAGGTGTCATCCTCACGTGAACGGAGTGTTTTTTAACGGTATAATACTGGGTCCTGACGGCCATGTTCTAATCCCAGAGATGCAATCATCCCTCCTTCAGCAGCATATGGAGTTGTTGGAATCCTCAGTTATCCCCCTGATGCATCCTTTAGCAGACCCGTCTACAGTTTTCAAAGACGGTGATGAAGCGGAGGATTTTGTTGAGGTCCACCTTCCCGACGTGCACAAACAAATTTCAGGTGTTGACCTGGGTCTCCCCAGCTGGGGAAAGTATGTTTTAGTTAGTGCAGGGGTTTTGGTTGTCCTGATGTTGACAATTTTCATAATGATGTGTTGTGGAAGAGTCCATCGACCCAAGTCTACACAACACGGTCTCGGAGGGACAGGGAGGAAGGTGTCGGTCACTTCCCAAAGCGGGAAGGTCATATCTTCATGGGAGTCATATAAGAGCGGGGGTGAGACCAGACTGTGAAGACCGGTCATCCCTTTCAAGCTTTAAGTCCTAAAGATCACCTCCCCTTGGGGTTAGGGGGAAATCTCTGGGTTCAATAGTCCTCCCTAAACTCCGTGTAACAGGGTAGATTCAAGAG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| 9,575
|
PP068461.1
|
Lyssavirus rabies
|
Vinitha,V., Raja,P., Parthiban,M., Pazhanivel,N., Sathish,G., Yamini,C., Parthiban,S., Dhinakar Raj,G.
|
Madras Veterinary College, Department of Animal Biotechnology
|
India
|
2024-01-20
|
ABT/MVC/ICMR-Rabies/Dog/003
|
Lyssavirus rabies
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,866
|
GenBank
| null |
India
|
India
|
Canis lupus familiaris
|
brain
|
2023-06-20
| null | null |
Lyssavirus rabies isolate ABT/MVC/ICMR-Rabies/Dog/003, complete genome
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AATCAGAGAAGAAGCAGACAGCGTCAATTGCAAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATGCCGACAAGATTGTATTCAAAGTCAATAATCAGGTGGTCTCTTTGAAGCCTGAGATTATCGTGGATCAATATGAGTACAAGTACCCTGCTATCAAGGACTTGAAGAAGCCCAGTATCACCCTAGGGAAAGCCCCAGACTTGAACAAGGCATACAAGTCAGTTTTATCAGGCTTGAATGCTGCCAAGCTTGATCCTGATGATGTATGTTCCTACTTAGCAGCTGCAATGCAGTTCTTTGAAGGGACATGTCCTGAAGATTGGACCAGTTACGGGATCCTGATCGCAAGAAAAGGAGATAAGATCACCCCGGATTCTCTTGTGGAGATAAAGCGTACTGATGTAGAAGGGAATTGGGCTTTGACGGGAGGAATGGAACTGACGAGGGACCCCACTGTTCCCGAGCATGCGTCTTTAGTCGGTCTTCTCTTGAGTCTGTACAGGTTGAGCAAAATATCTGGGCAAAACACCGGCAACTATAAAACAAATATTGCAGATAGGATAGAGCAGATCTTCGAGACAGCCCCTTTTATTAAAATCGTGGAACACCATACTCTGATGACAACTCACAAAATGTGTGCCAATTGGAGTACTATACCAAACTTCAGATTCTTAGCAGGGACCTACGACATGTTTTTCTCTCGGATTGAGCACTTGTATTCAGCGATCAGAGTAGGCACGGTAGTCACTGCTTATGAGGACTGCTCAGGGCTGGTGTCGTTTACTGGGTTCATAAAGCAGATAAATCTCACTGCAAGGGAGGCAATACTATATTTCTTCCACAAAAACTTCGAGGAAGAGATAAGAAGAATGTTTGAGCCGGGGCAAGAGACAGCTGTTCCTCACTCCTATTTCATTCACTTCCGTTCACTGGGTTTGAGTGGGAAGTCCCCTTATTCATCTAACGCAGTTGGTCATGTGTTCAATCTCATTCACTTTGTTGGATGCTACATGGGGCAAGTAAGGTCCCTAAATGCAACGGTCATTGCCGGATGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTAGGGGGCTACTTAGGGGAGGAGTTCTTCGGGAAGGGAACGTTCGAAAGGAGATTCTTCAGAGACGAAAAAGAACTTCAAGAATATGAGACGGCAGAATTGACAAAGACTGACGTGGCGCTGGCAGATGACGGAACTGTCAATTCGGATGACGAGGACTACTTCTCCGGTGAAACCAGGAGCCCCGAAGCTGTTTATGCTCGAATCATGATGAACGGAGGCCGACTAAAGAGATCGCACATACGGAGATATGTTTCAGTCAGCTCTAATCACCAAGCTCGTCCGAACTCATTTGCCGAGTTTCTAAATAAGACATATTCTAGTGACTCATAAGAGGTTGAACAACGGAAAGATTGCGTATATTCTTCATGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTTGAACCATCCCAAATATGAGCAAAATCTTTGTCAATCCGAGTGCAATTAGGGCCGGTCTGGCTGACCTTGAGATGGCTGAGGAGACTGTTGATCTGATCAACAAAAACATAGAAGACAATCAGGCTCATCTCCAGGGAGAACCCATAGAGGTGGACAATCTCCCTGAAGACATGAGGCGGCTCCATCTGGACGATGAGAAGCCTTCTGGCCTTGGGGGGATGGCCAAAGCGGGGGAGGTCAAGTATCGGGAGGACTTTCAGATGGATGAAGGGGAGGATCCTAACCTCCTCTTCCAGTCATATCTAGACAATGTTGGAGTACAGATAGTCAGACAAATGAGGTCAGGAGAGAGATTTCTCAAAATATGGTCACAAACCGTGGAGGAAATCATATCTTATGTCACAGTCAACTTTCCTAACCCCCCAGGGAGGTCTTCGGAGGACAAGTCAACCCAGACAACTGGTCGAGAACTCAAGAAGGAGACCACATCTGCTTCTTACCAGAGAGACAGCCAATCCTCGAAAGCCAGGATGGCGGCTCAAACCGCCTCTGGTCCTCCAGCCCTTGAATGGTCTGCTACCAACGAAGAGGATGATCTATCAGTGGAAGCTGAGATTGCTCACCAAATTGCTGAAAGCTTTTCCAAGAAGTACAAGTTTCCCTCTCGATCATCTGGGATATTTTTGTATAACTTTGAGCAGTTAAAAATGAACCTTGATGACATAGTTAAAGAGGCAAAAAATGTGCCGGGTGTCACCCGTTTGGCACATGACGGATCCAAACTCCCTCTAAGATGTGTACTGGGATGGGTTGGTCTGGCCAATTCTAAAAAGTTCCAGTTGTTAGTCGAGCCCGACAAGCTAAATAAAATCATGCAAGATGATCTGAATCGCTATACATCTAGCTAACTAAGCTTTTAAACTCTGTCCCGGCAGACAATAGAATCTGAGATGCTCTGAACTCGACGTGAAAAAAACAGGCAACACCACTGATAAGATGAACTTTCTACGCAAGATAGTGAAAAACTGTAGGGATGAGGACACCCAGAAGCCCTCTCTTGTCTCGGCTCCTCCAGATGACGATGACCTATGGCTTCCTCCCCCAGAGTATGTCCCGCTGAAAGAACTCACAGGCAAAAAGAACATGAGGAACTTCTGCATCAACGGAGAGGTTAAAGTGTGTAGCCCAAATGGTTACTCGTTCAGGATCCTGCGGCACATTCTAAGATCATTCGACGAGATATATTCTGGGAATCACAGGATGATCGGGTTGGTCAAGGTTGTCATTGGACTGGCTTTGTCTGGGGCCCCTGTCCCAGAGGGCATGAACTGGGTATACAAACTGAGGAGAACTCTTATCTTCCAATGGGCTGATTCTAGGGGCCCCCTTGAGGGGGAGGAATTGGAATACTCTCAAGAGATCACTTGGGACGATGATACCGAATTCGTTGGATTACAAATAAGAGTAAGCGCAAGACAATGTCATATTCAGGGCAGGATTTGGTGTATTAACATGAACTCGAGAGCATGTCAATTATGGTCTGACATGTCTCTTCAGACACAAAGGTCTGAAGAAGACAAAGATTCTTCTCTGCTTCTAGAATAATCAATTTATATCCCGCAAGTTTATCACTTGTTTACCTCTGGAGGAGAGAACATACGGGCTTGACTCCAACCTTTGGGAGCAATAGAACAAAAAAACATCTGTAATGGTGCCATTAAATCGCTGCATTTTATCAAGGTCAAACCAATTACCTTTACATTTTGGGTCTCTTAGATGTGAAAAAAACTATTAACATCCCTCAAAAGACTTAAGGAAAGATGGTTCCTCAGGTTCTTTTGTTCGTACCCCTTCTGGTTTTCTCAATGTGTTTCGGGAAATTCCCTATCTATACGATACCAGACAAACTTGGTCCCTGGAGCCCGATTGACATACATCATCTTAGCTGTCCAAACAACCTGGTTGTGGAAGATGAAGGATGCACTAACTTGTCGGGTTTCTCCTACATGGAACTTAAGGTGGGATACATCTCGGCCATAAAAGTAAACGGGTTCACGTGCACGGGTGTGGTGACAGAGGCAGAGACTTACACTAACTTTGTCGGTTATGTTACCACCACGTTCAAAAGAAAGCATTTCCGCCCAACACCCGATGCATGTCGAGCTGCTTACAACTGGAAGATGGCCGGTGACCCCAGATATGAAGAATCGCTGCACAATCCGTACCCTGACTACCACTGGCTTCGAACCGTTAAAACCACAAAGGAGTCCCTCGTCATCATATCCCCAAGTGTAGCGGATCTGGACCCATACGACAAATCCCTTCATTCGAGGGTCTTTCCTAGCGGGAAATGCTCGGGAATAACAATATCATCTACTTACTGCTCTACTAACCATGATTACACAATCTGGATGCCCGAGAATCCGAGACTGGGGACATCTTGTGACATCTTTACCAACAGTAGAGGGAAGAGAGCATCCAAGGGGGGCAAAACTTGCGGATTTGTTGATGAGAGAGGCTTGTACAAGTCTTTGAAAGGGGCATGCAAGCTCAAATTGTGTGGTGTTCTTGGCCTTAGACTTATGGATGGAACGTGGGTTGCAATGCAAACATCGGACGAAACCAAGTGGTGTCCTCCTGATCAGTTAGTAAATCTACACGACTTTCGCTCGGACGAGATCGAACATCTTGTTGTGGAGGAGTTGGTCAAGAAAAGAGAGGAGTGTCTGGATGCACTAGAGTCCATCATGACTACCAAGTCGGTGAGTTTCAGACGTCTCAGCCACTTGAGAAAACTTGTCCCTGGGTTTGGAAAAGCATACACCATATTCAACAAAACCTTGATGGAAGCAGATGCCCATTACAAGTCAGTCCGAACCTGGAATGAAATCATCCCCTCCAAAGGGTGTTTGAGAGTTGGAGGGAGGTGTCATCCTCACGTGAACGGAGTGTTTTTTAACGGTATAATACTGGGTCCCGACGGCCATGTTCTAATCCCAGAGATGCAATCATCCCTCCTTCAGCAGCATATGGAGTTGCTGGAATCCTCAGTTATCCCCCTGATGCATCCTTTAGCAGACCCGTCTACAGTTTTCAAAGACGGTGATGAAGCAGAGGATTTTGTTGAGGTCCACCTTCCCGACGTGCACAAACAGATTTCAGGTGTTGACCTGGGTCTCCCCAGCTGGGGAAAGTATGTTTTGGTTAGTGCAGGGGTTTTGGTTGTCCTGATGTTGACAATTTTCATAATGACATGTTGTGGAAGGGTCCATCGACCCAAGTCTACACAACACGGTCTCGGAGGGACAGAGAGGAAGGTGTCGGTCACTTCCCAAAGCGGGAAGGTCATATCTTCATGGGAGTCATATAAGAGCGGGGGTGAGACCAGACTGTGAAGACCGGTCATCCCTTTCAAGCTTTAAGTTCTAAAGATCACCTCCCCTTGGGGTTAGGGGGAAATCTCTGGGTTCAATAGTCCTCCCTAAACTCCGTGTAACAGGGTAGATTCAAGAGTCACGAGACCTCCATT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| 9,576
|
PP068462.1
|
Lyssavirus rabies
|
Vinitha,V., Raja,P., Parthiban,M., Pazhanivel,N., Sathish,G., Yamini,C., Parthiban,S., Dhinakar Raj,G.
|
Madras Veterinary College, Department of Animal Biotechnology
|
India
|
2024-01-20
|
ABT/MVC/ICMR-Rabies/Cat/004
|
Lyssavirus rabies
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,888
|
GenBank
| null |
India
|
India
|
Felis catus
|
brain
|
2023-06-13
| null | null |
Lyssavirus rabies isolate ABT/MVC/ICMR-Rabies/Cat/004, complete genome
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CAAAATCAGAGAAGAAGCAGACAGCGTCAATTGCAAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATGCCGACAAGATTGTATTCAAAGTCAATAATCAGGTGGTCTCTTTAAAGCCTGAGATTATCGTGGATCAATATGAGTACAAGTACCCTGCTATCAAGGACTTGAAGAAGCCCAGTATCACCCTAGGGAAGGCCCCAGATTTGAACAAAGCATACAAGTCAGTTTTATCAGGCTTAAATGCTGCCAAGCTTGATCCTGATGATGTATGTTCTTACTTGGCAGCTGCAATGCAATTCTTTGAGGGGACATGTCCTGAAGATTGGACCAGCTACGGGATCTTGATCGCAAGAAAAGGAGATAAGATCACCCCGGACTCTCTTGTGGAGATAAAGCGTACTGATGTAGAAGGGAATTGGGCTTTGACGGGAGGAATGGAACTGACAAGGGACCCCACTGTTCCCGAGCATGCGTCCTTAGTCGGTCTTCTCTTGAGTCTGTACAGGTTGAGCAAAATATCTGGGCAAAACACCGGCAACTATAAAACAAATATTGCAGATAGGATAGAGCAGATCTTCGAGACAGCCCCTTTTATTAAAATCGTGGAACACCATACTCTGATGACAACTCATAAAATGTGTGCCAATTGGAGTACTATACCAAACTTCAGATTCTTAGCAGGGACCTACGACATGTTTTTCTCTCGGATTGAGCACTTGTATTCAGCGATCAGAGTAGGCACAGTAGTCACCGCTTATGAGGACTGCTCGGGGCTGGTGTCATTTACTGGATTCATAAAGCAGATAAATCTCACTGCAAGGGAGGCAATACTATATTTCTTCCACAAAAACTTCGAGGAAGAGATAAGAAGAATGTTTGAGCCAGGGCAAGAGACAGCTGTTCCTCACTCCTATTTCATTCACTTCCGTTCATTGGGCTTGAGTGGGAAGTCCCCTTATTCATCAAATGCAGTTGGTCATGTGTTCAATCTCATTCACTTTGTTGGATGCTACATGGGGCAAGTAAGGTCCCTAAATGCAACGGTCATTGCCGGATGTGCTCCTCATGAGATGTCTGTTTTAGGGGGCTACTTAGGGGAGGAGTTCTTCGGAAAGGGAACGTTCGAAAGGAGATTCTTCAGAGACGAAAAAGAACTTCAGGAATATGAGACGGCAGAATTGACAAAAACCGACGTGGCGCTGGCAGATGACGGAACTGTCAATTCGGATGACGAGGACTACTTCTCCGGTGAAACCAGGAGCCCCGAAGCCGTTTATGCTCGAATCATGATGAACGGAGGCCGACTAAAGAGATCGCACATACGGAGATATGTTTCAGTCAGCTCCAATCACCAAGCTCGTCCGAACTCATTTGCCGAGTTTCTAAATAAGACATATTCTAGTGACTCATAAGAGGTTGAACAACGGAATGTAGGAAGTCTACAGATTGCGTATATTCTTCATGAAAAAAACTAACACCCCTCCTTTTGAACCATCCCAAATATGAGCAAAATCTTTGTTAATCCGAGTGCAATTAGGGCCGGTCTGGCTGACCTTGAGATGGCTGAGGAGACTGTTGATCTGATCAACAAAAACATAGAAGACAATCAAGCTCATCTCCAGGGAGAACCCATAGAGGTGGACAATCTCCCTGAAGACATGAGGCGGCTCCATCTGGACGATGAGAAGCCTTCTGGCCTTGGGGGGATGGCCAAAGCGGGGGAAGTCAAGTATCGGGAGGACTTTCAGATGGATGAAGGGGAGGATCCTAACCTCCTCTTCCAGTCATACCTGGACAATGTTGGAGTACAGATAGTCAGACAAATGAGGTCAGGAGAGAGATTTCTCAAAATATGGTCACAAACCGTGGAGGAAATCATATCTTATGTCACAGTCAACTTTCCTAACCCCCCAGGGAGGTCTTCGGAGGACAAGTCAACTCAGACAACTGGTCGAGAACTCAAGAAGGAGACCACATCTGCTTCTTACCAGAGAGACAGCCAATCCTCGAAAGCCAGGATGGCGGCTCAAACCGCCTCTGGTCCTCCAGCCCTTGAATGGTCTGCTACCAACGAAGAGGATGATCTATCGGTGGAAGCTGAGATTGCTCACCAAATTGCTGAAAGCTTCTCCAAGAAGTACAAGTTTCCCTCTCGATCATCTGGGATATTTTTGTATAACTTTGAACAGTTAAAAATGAACCTTGATGACATAGTTAAAGAGGCAAAAAATGTGCCGGGTGTCACCCGTTTAGCACATGACGGATCCAAACTCCCTCTAAGATGTGTACTGGGATGGGTTGGTCTGGCCAATTCTAAAAAGTTCCAGTTGTTAGTCGAGCCCGACAAGCTAAACAAAATCATGCAAGATGATCTGAATCGCTATACATCTAGCTAACTAATCTTTTAAACTCTGTCCCGGCAGACAATAGAATCTGAGATGCTCTGAATTCGACGTGAAAAAAACAGGCAACACCACTGATAAGATGAACTTTCTACGCAAGATAGTGAAAAACTGTAGGGATGAGGACACCCAGAAGCCCTCTTTTGTTTCGGCTCCTCCGGATGACGATGACCTATGGCTTCCTCCCCCAGAATATGTCCCGCTGAAAGAACTCACAGGCAAAAAGAACATGAGGAACTTTTGCATCAACGGAGAGGTTAAAGTGTGTAGCCCAAATGGTTACTCGTTCAGGATCCTGCGGCACATTCTGAGATCATTCGACGAGATATATTCTGGGAATCACAGGATGATCGGGCTGGTCAAGGTTGTCATTGGACTGGCTTTGTCTGGGGCCCCTGTCCCAGAGGGCATGAACTGGGTATACAAACTGAGGAGAACTCTTATCTTCCAATGGGCTGATTCTAGGGGCCCCCTTGAGGGGGAGGAATTGGAATACTCTCAAGAGATCACTTGGGACGATGATACCGAATTCGTTGGATTACAAATAAGAGTAAGCGCAAGACAATGTCATATTCAGGGCAGGATTTGGTGTATTAACATGAACTCGAGAGCATGTCAATTATGGTCTGACATGTCTCTTCAGACACAAAGGTCTGAAGAGGACAAAGATTCTTCTCTGCTTCTAGAATAATCAATTTATATCCCGCAAGTTTATCACTTGTTTACCTCTGGAGGAGAGAACATACGGGCTTGACTCCAACCTTTGGGAGCAATAGAACAAAAAAACATCTGTAATGGTGCCATTAAATCGCTGCATTTTATCAAGGTCAAACCAATTACCTTTACATTTTGGGTCTCTTAGATGTGAAAAAAACTATTAACATCCCTCAAAAGACTTAAGGAAAGATGGTTCCTCAGGTTCTTTTGTTTGTACCCCTTCTGGTTTTCTCAATGTGTTTCGGGAAATTCCCTATCTATACGATACCAGACAAACTTGGTCCCTGGAGCCCGATTGACATACATCATCTCAGCTGTCCAAACAACCTGGTTGTGGAAGATGAAGGATGCACTAACTTGTCGGGTTTCTCCTACATGGAACTTAAGGTGGGATACATCTCGGCCATAAAAGTAAACGGGTTCACGTGCACGGGTGTGGTGACAGAGGCAGAGACTTACACTAACTTTGTTGGTTATGTTACCACCACGTTCAAAAGAAAGCATTTCCGCCCAACACCAGATGCCTGTCGAGCTGCTTACAACTGGAAGATGGCCGGTGACCCCAGATATGAAGAATCGCTGCACAATCCGTACCCTGACTACCACTGGCTTCGAACCGTTAAAACCACAAAGGAGTCCCTCGTCATCATATCCCCAAGTGTAGCGGATCTGGATCCATACGACAAATCCCTTCATTCGAGGGTCTTTCCTAGCGGGAAGTGCTCAGGAATAACAATATCATCTACTTACTGCTCTACTAACCATGATTACACAATCTGGATGCCCGAGAATCCGAGACTGGGGACATCTTGTGACATCTTTACCAACAGTAGAGGGAAAAGAGCATCCAAAGGGGGCAAAACTTGCGGATTTGTTGATGAAAGAGGCTTGTACAAGTCTTTGAAAGGGGCATGCAAGCTCAAATTGTGTGGTGTTCTTGGCCTTAGACTTATGGATGGAACGTGGGTTGCAATGCAAACATCGGACGAAACCAAGTGGTGTCCTCCTGATCAGTTAGTAAATCTACACGACTTTCGCTCGGACGAGATCGAACATCTTGTTGTGGAGGAGTTGGTCAAGAAAAGAGAGGAGTGTCTGGATGCACTAGAGTCCATCATGACTACCAAGTCGGTGAGTTTCAGACGTCTCAGCCACTTAAGAAAACTTGTCCCTGGGTTCGGAAAAGCATACACCATATTCAACAAAACCTTGATGGAAGCAGATGCCCATTACAAGTCAATCCGAACCTGGAATGAAATCATCCCCTCCAAAGGGTGTTTGAGAGTTGGAGGGAGGTGTCATCCTCACGTGAACGGAGTGTTTTTTAACGGTATAATACTGGGTCCTGACGGCCATGTTCTAATCCCAGAGATGCAATCATCCCTCCTTCAGCAGCATATGGAGTTGTTGGAATCCTCAGTTATCCCCCTGATGCATCCTTTAGCAGACCCGTCTACAGTTTTCAAAGACGGTGATGAAGCGGAGGATTTTGTTGAGGTCCACCTTCCCGACGTGCACAAACAAATTTCAGGTGTTGACCTGGGTCTCCCCAGCTGGGGAAAGTATGTTTTAGTTAGTGCAGGGGTTTTGGTTGTCCTGATGTTGACAATTTCCATAATGATGTGTTGTGGAAGAGTCCATCGACCCAAGTCTACACAACACGGTCTCGGAGGGACAGGGAGGAAGGTGTCGGTCACTTCCCAAAGCGGGAAGGTCATATCTTCATGGGAGTCATATAAGAGCGGGGGTGAGACCAGACTGTGAAGACCGGTCATCCCTTTCAAGCTTTAAGTCCTAAAGATCACCTCCCCTTGGGGTTAGGGGGAAATCTCTGGGTTCAATAGTCCTCCCTAAACTCCGTGTAACAGGGTAGATTCAAGA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| 9,577
|
OQ473645.1
|
Lyssavirus rabies
|
Hsu,W.C., Lee,F., Chen,Y.W., Tu,Y.C., Chang,C.C., Chiang,Y.L., Hu,S.C., Hsu,W.-C., Chen,Y.-W., Tu,Y.-C., Chang,C.-C., Chiang,Y.-L., Hu,S.-C.
|
Animal Health Research Institute, Epidemiology Division
|
Taiwan
|
2023-11-26
|
Marten-RABV/Tt/2021
|
Lyssavirus rabies
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,924
|
GenBank
| 1
|
Taiwan
|
Taiwan
|
Martes flavigula
|
brain
|
2021-06-10
| null | null |
Lyssavirus rabies isolate Marten-RABV/Tt/2021, complete genome
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ACGCTTAACAACAAAATCAGAGAAGAAGCAGACAGTGTCGTCTGCAAAGCAAAAATGTAACACCCCTACAATGGATGCCGACAAGATTGTATTCAAAGTCAATAATCAGGTGGTCTCCTTGAAGCCCGAGATCATCGTAGATCAATATGAGTACAAATATCCGGCCATCAAAGACTTGCAGAAGCCGAGTATCACCCTAGGGAAGGCCCCAGATTTAAACAAAGCGTACAAGTCAGTCCTTTCTGGCATGAATGCCGCCAAGCTTGATCCGGATGATGTGTGCTCTTACCTAGCAGCCGCGATGCAATTCTTTGAGGGGACGTGCCCTGAAGACTGGGTCAGCTATGGGATCTTGATTGCGAGAAAAGGGGATAAGATCACCCCCGATTCCCTCGTAGATATAAGACGTACTGATGTCGAAGGGAACTGGGCCCTGACGGGAGGTATGGAGTTGACGAGGGACCCCACTGTTTCTGAGCATGCATCTTTAGTTGGTCTTCTCTTGAGTTTGTATAGGTTGAGCAAAATATCGGGACAAAACACCGGCAACTATAAGACAAACATTGCAGATAGGATAGAACAGATTTTTGAGACTGCCCCTTTCATCAAGATCGTGGAGCACCATACTCTGATGACAACTCACAAGATGTGCGCTAATTGGAGCACCATACCGAACTTCAGATTCTTGGCTGGGACTTATGACATGTTTTTCTCCCGGGTTGAGCATCTGTACTCAGCTATTAGAGTGGGTACAGTAGTCACCGCTTACGAAGACTGCTCAGGGTTAGTATCATTCACAGGGTTCATAAAGCAGATAAACCTCACTGCAAGAGAGGCAATACTATATTTCTTCCATAAGAATTTCGAAGAAGAGATAAAAAGAATGTTTGAACCAGGGCAAGAGACCGCAGTTCCTCATTCTTATTTCATTCACTTCCGGTCATTGGGATTGAGTGGAAAGTCTCCTTATTCATCTAATGCAGTGGGCCATGTGTTCAATCTTATTCATTTTGTGGGATGCTATATGGGTCAAGTCAGATCTCTCAATGCGACTGTTATTGCCGCTTGTGCCCCCCATGAAATGTCTGTTCTAGGAGGCTATTTGGGAGAGGAGTTTTTCGGGAAGGGAACGTTTGAAAGAAGATTCTTTAGGGATGAGAAAGAACTTCAAGAATATGAGGCGGCTGAGTTGACCAAAACTGATGTGGCATTGGCAGATGATGGAACCGTTGACTCGGATGACGAGGACTACTTCTCCGGTGAGACCAGAAGCCCTGAAGCTGTCTATACTCGAATCATGATGAACGGAGGTCGACTAAAGAGGTCGCACATAAGGAGATACGTTTCTGTCAGTTCCAATCATCAAGTCCGTCCAAACTCCTTTGCTGAGTTTCTAAACAAGACGTATTCTAGTGACTCGTGATGAGTTAAACAGCAAGATCGAACAGAACCTACATATTGTGTGTTTCCCACATGAAAAAAAACCAACACCCCTCCTTCTGAACCATCTCAAACATGAGCAAAATCTTTGTCAATCCGAGTGCAATTAGAGCTGGTCTGGCCGATCTCGAGATGGCTGAAGAAACTGTTGATTTGATCAGCAGAAACATAGAGGATAATCAGGCCCATCTCCAGGGGGAGCCCATAGAAGTAGACAATCTCCCTGAGGACATGAGGCGGCTTCAATTGGATGACGGAAAGCCATCGGACCCCAGCGGGGTGGCAACGGTGGGAGGAGATAAGTACAAGGAAGACTTCCAAATGGATGAGGGGGAAGATCCGGCCATCTTGTTTCAGTCATATCTGGATAATGTTGGGGTCCAAATAGTCAGACGAATGAGGTCTGGAGAGAGATTTCTCAAGATTTGGTCTCAGACTGTAGAGGAGATTATCTCCTATGTCACTACCAATTTCTCTAACCCATTGGGAAAGTCCTCCGAGGACAAATCTACCCAGACTGCTGGGGGAGAGCTCAAGAAGGAAACCCCATCGGCATCTTCCCAGAGAAAGAGCCAGTCCTCGAAAGCCCGAATGGTGACCCAACCAGCCTCTGGCCCTCCAGCTCTTGAATGGTCTGCAACCAACGAAGAAGATGACCCATCAGTAGAAGCAGAGATCGCTCATCAGATTGCTGAAAGCTTTTCCAAGAAATACAAATTCCCCTCCCGGTCATCTGGGATATTTTTGTATAACTTTGAACAGTTGAAAATGAACCTCGACGACATAGTCAAGGAGTCAAGAAATGTACCAGGTATAACTCGTTTGGCTCTTGATGGATCCAAGCTCCCTCTAAGATGTATACTGGGGTGGGTTGCGCTGGCCAACTCTAAGAAGTTTCAGCTGTTGGTCGAGCCAGACAAGTTGAACAAAATCATGCAAGATGATCTGAACCGTTATACATCCTGCTGACAGCTTTTAAACTCAGGCCTGCTAGATAATAAAGCCCAGTCTGTTCTGGATTCGACATGAAAAAAACAGGCAACACCACTGATGAGATGAACTTTCTGCGGAAGATAGTGAAAAACTGTAGGGATGAGGACACCCAGAAGCCCTCCCCTGTGTCTGCTCCTCCAGATGATGATGACCTGTGGCTGCCTCCTCCCGAATACATCCCGTTGAAGGAACTCACTGGCAAGAAAAACATGAGGAACTTCTGTATCAACGGGGAGGTCAAGGTGTGTAGTCCGACTGGCTATTCGTTCAGGATCTTACGGCATATTCTAAAATCATTTGACGATATATATTCGGGAAATCACAGAATGATCGGATTGGTCAAGGTGGTCATTGGACTGGCCCTGTCAGGAGCCCCAGTCCCTGAGGGCATGAACTGGGTATACAAACTAAGGAGAACTCTCATCTTTCAATGGGCTGATTCCAGGGGTCCCCTCGAGGGGGAGGAGTTGGAGTACTCTCAAGAGATCACATGGGATGATGATACCGAGTTTGTCGGATTACAGATGAGAGTGAGTGCAAGACAATGTCATATCCAGGGTAGATTATGGTGCATCAACATGAATTCTAGGGCATGTCAATTATGGTCAGACATGTCTCTTCAGACACAAAGGTCAGAAGAGGACAAGGACTCGTCTCTGCTTCTAGAGTAGTCAGATTATATCCCACAGATTTATCAATTGTTTACCTCTGGAGGAGAGAGCACACGGGCTTAACTCCAGCTTTTGGGAGCAATAGAACAAAATATATGTTATGGTGCCATCAAACAGCTGCATTTTATCAAAATCAGACTAATTACCTTTGCATTTTAAGCCTCGTGGATGTGAAAAAAACTTTTAACATCCCTCAAAAGACTTAAGGAAAGATGATTCTTCAAGCTCTACTGTTTGCACCCCTTCTGGTTTTCCCGTTGTGTCTTGGGAAGTTTCCCATTTACACGATACCAGACAAACTTGGTCCCTGGAGCCCTATTGATATACATCATCTCAGCTGTCCGAACAATTTGGTTGTGGAGGACGAAGGATGTACCAACTTGTCAGGATTTTCATACATGGAACTCAAAGTAGGATACATTTCAGCCATAAAAGTGAGCGGGTTCACATGTACGGGTGTGGTGACAGAAGCAGAGACCTACACCAACTTTGTTGGCTATGTCACCACCACGTTCAGGAGAAAGCACTTTCGTCCGATGCCGGATGCATGCAGAGACGCGCATAACTGGAAGATGGCCGGGGACCCCAGATATGAAGAATCTCTGCACAATCCTTATCCTGATTATCATTGGCTCCGAACTGTAAAGACTACCAAAGAGTCTCTTATTATCATATCTCCCAGTGTGGCAGATTTAGACCCGTATGACAAATCTCTTCACTCAAGCGTTTTTCCCGGCGGGAAGTGCTTAGGAATAACAGTGTCCTCTATCTACTGCTCTACCAACCATGATTACACCATCTGGATGCCGGAAAATCCCAGACTGGGGACATCCTGTGATATTTTCACCTATAGTAAAGGGAAGAAAGCATCCAAAGAGGGCAAAACATGTGGATTCGTGGATGAGAGAGGCTTGTACAAGTCTTTGAGAGGAGCATGTAAACTGAAGCTGTGTGGGGTTCTCGGACTCAGACTTATGGATGGAACATGGGTCGCTATTCAGACATCAGATGAGGTTAAATGGTGCCCTCCTGATCAGCTGGTGAATCTACATGACTTTCGCTCGGATGAGCTTGAGCATCTTGTTGTAGAAGAGTTGGTCAAGAAACGGGAGGAATGTCTAGACGCACTGGAGTCCATTATGACCACTAAGTCAGTAAGTTTCAGACGTCTTAGCCACTTGAGAAAGCTAGTGCCTGGGTTTGGGAAAGCATACACCATATTCAACAAAACCTTGATGGAGGCTGACGCTCACTACAAATCAATTAGGACTTGGAATGAGATAATTCCCTCTAAAGGGTGTTTAAGAGTCGGAGGTAGATGTCATCCCCACGTGAACGGGGTGTTTTTCAACGGCATCATTCTAGGCCCTGATGGTCATGTTCTAATCCCGGAAATGCAGTCGTCCCTCCTCCAGCAGCATATGGAGTTGTTGGAATCCTCGGTCATCCCCTTAATGCATCCCTTGGCAGATCCCTCGGCGGTTTTTAAAGATGGTGACGAGGCGGAGGATTTTGTTGAGGTTCACCTTCCGGATGTCCACAAACAGATCTCAGGGGTTGATCTCGGTCTCCCAAGCTGGGGAAAATATGTGTTGATGAGCGCAGGTGCCTTGATTGCACTAGTGTCAATGATCTTCTTGATGATGTGTTGTAAAAAGCCTAATAAAACAGAATCAATACACCACAGCCTTGGGGAGACAGGGAGGAAAGTGTCAGTAACCTCCCAAGGCGGGAGAGTCATATCTTCATGGGAGTCGTATAAAAACGGAGGTGAGACCAAGTTGTAAGAGCAAGCCATCTCCCTTGTATCTCGAACCCCGAGGTTCATATCCCTTTGAGGTGAAGGGAACATCTCTGAAATCAACAACTCTCTTTTGACTTCATGCAACAGGGTAG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| 10,554
|
OR474090.1
|
Lyssavirus rabies
|
Helal,Z.H., Soriano,N.F.B., Chung,H., Sims,M., Wheeler,A., Risatti,G.R.
|
University of Connecticut, Pathobiology & Veterinary Science
|
USA
|
2023-10-09
|
23_306_USA/CT_bear
|
Lyssavirus rabies
|
Lyssavirus
|
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,910
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Ursus americanus
|
brain
|
2023-02-09
| null | null |
Lyssavirus rabies isolate 23_306_USA/CT_bear, complete genome
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