Datasets:
LiteFold
/
SwissSidechain

Dataset card Data Studio Files
xet
 Community
entry_id
string
residue_code
string
stereochemistry
string
smiles
string
smiles_reference_file
string
source_smi_path
string
source_pdb_path
string
source_mol2_path
string
source_top_path
string
source_rtp_path
string
source_hdb_path
string
has_smi
bool
has_pdb
bool
has_mol2
bool
has_top
bool
has_rtp
bool
has_hdb
bool
has_bundle
bool
has_png
bool
has_bundle_bbdep_lib
bool
has_bundle_bbind_lib
bool
bundle_file_extensions
list
pdb_residue_names
list
pdb_atom_names
list
pdb_elements
list
pdb_atom_count
int64
pdb_heavy_atom_count
int64
pdb_hydrogen_atom_count
int64
mol2_molecule_name
string
mol2_molecule_type
string
mol2_charge_type
string
mol2_atom_names
list
mol2_atom_types
list
mol2_atom_charges
list
mol2_atom_count
int64
mol2_bond_count
int64
mol2_total_partial_charge
float64
charmm_residue_name
string
charmm_residue_charge
float64
charmm_residue_comment
string
charmm_atom_names
list
charmm_atom_types
list
charmm_atom_charges
list
charmm_atom_count
int64
charmm_bond_count
int64
gromacs_residue_name
string
gromacs_residue_comment
string
gromacs_atom_names
list
gromacs_atom_types
list
gromacs_atom_charges
list
gromacs_atom_count
int64
gromacs_bond_count
int64
gromacs_improper_count
int64
hdb_rule_count
int64
hdb_declared_rule_count
float64
bbind_rotamer_rows
int64
bbdep_rotamer_rows
int64
split_bucket
int64
D:MED
MED
D
[NH3][C@@H](C(=O)O)CCSC
MED.pdb
D_SMI/MED.smi
D_PDB/MED.pdb
D_MOL2/MED.mol2
D_top/MED.top
D_rtp/MED.rtp
D_rtp/MED.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "MED" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "SD", "CE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "S", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
20
9
11
MED.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "SD", "CE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "S.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.3871, 0.0212, 0.3421, -0.2483, -0.0469, -0.0076, -0.1642, -0.0181, -0.2483, 0.0198, 0.0262, 0.0262, 0.0376, 0.0376, 0.034, 0.034, 0.034, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]
20
19
-0.0003
MED
0
null
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "CE", "HE1", "HE2", "HE3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.22, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
17
17
MED
null
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "CE", "HE1", "HE2", "HE3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.22, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
17
17
2
5
5
27
36,963
9
L:004
004
L
[NH3][C@@H](c1ccccc1)C(=O)O
004.pdb
L_SMI/004.smi
L_PDB/004.pdb
L_MOL2/004.mol2
L_top/004.top
L_rtp/004.rtp
L_rtp/004.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "004" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "OXT", "HA", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
20
11
9
004.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "CB", "CG1", "CD1", "CE", "CD2", "CG2", "CA", "C", "N", "O", "OXT", "HA", "H1", "H2", "H3", "HG1", "HD1", "HE", "HD2", "HG2" ]
[ "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.3", "C.2", "N.4", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.1253, -0.094, -0.134, -0.109, -0.137, -0.115, -0.0182, 0.9376, -0.8356, -0.8123, -0.6963, 0.0947, 0.4198, 0.4278, 0.4818, 0.172, 0.141, 0.136, 0.136, 0.129 ]
20
20
-0.001
004
0
Phenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "HE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
17
18
004
Phenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "HE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
17
18
2
7
7
1
1,369
5
L:0A1
0A1
L
COc1ccc(cc1)C[C@@H](C(=O)O)[NH3]
0A1.pdb
L_SMI/0A1.smi
L_PDB/0A1.pdb
L_MOL2/0A1.mol2
L_top/0A1.top
L_rtp/0A1.rtp
L_rtp/0A1.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "0A1" ]
[ "CA", "C", "CB", "O", "OXT", "N", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CZ", "CE1", "OH", "CH", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HE1", "H1", "H2", "H3", "HH1", "HH2", "HH3" ]
[ "C", "C", "C", "O", "O", "N", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
27
14
13
0A1 .pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "CA", "C", "CB", "O", "OXT", "N", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CZ", "CE1", "OH", "CH", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HE1", "H1", "H2", "H3", "HH1", "HH2", "HH3" ]
[ "C.3", "C.2", "C.3", "O.co2", "O.co2", "N.4", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.0685, 0.9356, -0.0441, -0.8043, -0.7103, -0.8356, -0.1523, -0.118, -0.092, -0.15, 0.1291, -0.203, -0.3229, 0.1117, 0.0887, 0.1137, 0.0697, 0.131, 0.147, 0.157, 0.142, 0.4258, 0.4828, 0.4248, 0.0727, 0.0387, 0.0317 ]
27
27
0.001
0A1
-0
4-methoxy-beta-Phe
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "CH", "HH1", "HH2", "HH3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OCC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.08, -0.36, 0.01, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
24
25
0A1
4-methoxy-beta-Phe
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "CH", "HH1", "HH2", "HH3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OCC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.08, -0.36, 0.01, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
24
25
2
8
8
12
16,428
2
L:0AF
0AF
L
[NH3][C@H]([C](=O)=O)Cc1c[nH]c2c1cccc2O
0AF.pdb
L_SMI/0AF.smi
L_PDB/0AF.pdb
L_MOL2/0AF.mol2
L_top/0AF.top
L_rtp/0AF.rtp
L_rtp/0AF.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "0AF" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "OZ2", "CH2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
28
16
12
0AF.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "OZ2", "CH2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8326, -0.0645, 0.9336, -0.8083, -0.0162, -0.2032, -0.077, -0.057, -0.0563, -0.123, -0.2164, 0.1191, -0.111, -0.5071, -0.199, -0.7133, 0.4258, 0.4798, 0.4278, 0.0887, 0.0667, 0.1097, 0.173, 0.3137, 0.146, 0.427, 0.138, 0.137 ]
28
29
0.001
0AF
-0
7-hydroxy-l-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CZ2", "OZ2", "HZ2", "CE3", "HE3", "CZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
25
27
0AF
7-hydroxy-l-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CZ2", "OZ2", "HZ2", "CE3", "HE3", "CZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
25
27
2
9
9
9
12,321
3
L:0BN
0BN
L
[NH3][C@H](C(=O)O)Cc1ccc(cc1)[C](=[NH2])=[NH2]
0BN.pdb
L_SMI/0BN.smi
L_PDB/0BN.pdb
L_MOL2/0BN.mol2
L_top/0BN.top
L_rtp/0BN.rtp
L_rtp/0BN.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "0BN" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "NJ2", "NJ1", "CG", "CD1", "CE1", "CZ", "CE2", "CD2", "CB", "CH", "OXT", "HN1", "HA", "HJ21", "HJ22", "HJ11", "HD1", "HE1", "HE2", "HD2", "HB1", "HB2", "HN2", "HN3", "HJ12" ]
[ "N", "C", "C", "O", "N", "N", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
29
15
14
0BN.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "NJ2", "NJ1", "CG", "CD1", "CE1", "CZ", "CE2", "CD2", "CB", "CH", "OXT", "HN1", "HA", "HJ21", "HJ22", "HJ11", "HD1", "HE1", "HE2", "HD2", "HB1", "HB2", "HN2", "HN3", "HJ12" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "N.pl3", "N.pl3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.3", "C.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8296, -0.0925, 0.9466, -0.7573, -0.4681, -0.4741, -0.0123, -0.131, -0.084, -0.2659, -0.082, -0.11, -0.0501, 0.5393, -0.7263, 0.4988, 0.0897, 0.3167, 0.3377, 0.3327, 0.156, 0.145, 0.153, 0.229, 0.0417, 0.1217, 0.4348, 0.4228, 0.3167 ]
29
29
0.999
0BN
1
4-carbamimidoyl-l-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CH", "NJ1", "HJ11", "HJ12", "NJ2", "HJ22", "HJ21", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "C", "NCN", "HNCN", "HNCN", "NCN", "HNCN", "HNCN", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.03, 0.73, -0.75, 0.45, 0.45, -0.75, 0.45, 0.45, 0.51, -0.51 ]
26
27
0BN
4-carbamimidoyl-l-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CH", "NJ1", "HJ11", "HJ12", "NJ2", "HJ22", "HJ21", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "C", "NCN", "HNCN", "HNCN", "NCN", "HNCN", "HNCN", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.03, 0.73, -0.75, 0.45, 0.45, -0.75, 0.45, 0.45, 0.51, -0.51 ]
26
27
5
9
9
6
8,214
7
L:200
200
L
[NH3][C@H]([C](=O)=O)Cc1ccc(cc1)Cl
200.pdb
L_SMI/200.smi
L_PDB/200.pdb
L_MOL2/200.mol2
L_top/200.top
L_rtp/200.rtp
L_rtp/200.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "200" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CLZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "CL", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
13
10
200.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CLZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "Cl", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0715, 0.9376, -0.8003, -0.0511, -0.1113, -0.114, -0.149, -0.117, -0.121, 0.0164, -0.0814, -0.7093, 0.4248, 0.4258, 0.4838, 0.0897, 0.1177, 0.0717, 0.151, 0.135, 0.155, 0.152 ]
23
23
-0.001
200
-0
4-chloro-Phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CLZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.51, -0.51 ]
20
21
200
4-chloro-Phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CLZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.51, -0.51 ]
20
21
2
7
7
6
8,214
9
L:2AG
2AG
L
[NH3][C@H](C(=O)O)CC=C
2AG.pdb
L_SMI/2AG.smi
L_PDB/2AG.pdb
L_MOL2/2AG.mol2
L_top/2AG.top
L_rtp/2AG.rtp
L_rtp/2AG.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "2AG" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD1", "HD2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
17
8
9
2AG.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "CA", "C", "CB", "O", "OXT", "CG", "CD", "N", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD1", "HD2", "HN1", "HN2", "HN3" ]
[ "C.3", "C.2", "C.3", "O.co2", "O.co2", "C.2", "C.2", "N.4", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.0685, 0.9366, -0.0672, -0.8033, -0.7093, -0.2002, -0.222, -0.8356, 0.0887, 0.0667, 0.1187, 0.127, 0.12, 0.116, 0.4238, 0.4248, 0.4848 ]
17
16
0.001
2AG
-0
2-Allyl-glycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD", "HD1", "HD2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "HE2", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.15, 0.15, -0.3, 0.15, 0.15, 0.51, -0.51 ]
14
14
2AG
2-Allyl-glycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD", "HD1", "HD2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "HE2", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.15, 0.15, -0.3, 0.15, 0.15, 0.51, -0.51 ]
14
14
4
5
5
9
12,321
1
L:2AS
2AS
L
OC(=O)[C@H]([C@@H]([C](=O)=O)C)[NH3]
2AS.pdb
L_SMI/2AS.smi
L_PDB/2AS.pdb
L_MOL2/2AS.mol2
L_top/2AS.top
L_rtp/2AS.rtp
L_rtp/2AS.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "2AS" ]
[ "C", "O", "CA", "N", "CB", "CG1", "OD1", "CG2", "OD2", "OXT", "HA", "HN3", "HN2", "HB2", "HG21", "HG22", "HG23", "HN1" ]
[ "C", "O", "C", "N", "C", "C", "O", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
18
10
8
2AS.pdb
SMALL
NO_CHARGES
[ "C", "O", "CA", "N", "CB", "CG1", "OD1", "CG2", "OD2", "OXT", "HA", "HN3", "HN2", "HB2", "HG21", "HG22", "HG23", "H1" ]
[ "C.2", "O.co2", "C.3", "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
18
17
0
2AS
-1
3-methyl-aspartic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "CG1", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "OD1", "OD2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.19, 0.09, 0.62, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
15
15
2AS
3-methyl-aspartic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "CG1", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "OD1", "OD2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.19, 0.09, 0.62, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
15
15
3
4
4
9
12,321
3
L:2FM
2FM
L
FC(SCC[C@@H](C(=O)O)[NH3])F
2FM.pdb
L_SMI/2FM.smi
L_PDB/2FM.pdb
L_MOL2/2FM.mol2
L_top/2FM.top
L_rtp/2FM.rtp
L_rtp/2FM.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "2FM" ]
[ "O", "C", "OXT", "CA", "N", "CB", "CG", "SD", "CE", "FZ1", "FZ2", "HA", "HN1", "HN2", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE", "HN3" ]
[ "O", "C", "O", "C", "N", "C", "C", "S", "C", "F", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
20
11
9
2FM.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "O", "C", "OXT", "CA", "N", "CB", "CG", "SD", "CE", "FZ1", "FZ2", "HA", "HN1", "HN2", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE", "HN3" ]
[ "O.co2", "C.2", "O.co2", "C.3", "N.4", "C.3", "C.3", "S.3", "C.3", "F", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.7033, 0.9396, -0.7963, -0.0775, -0.8376, -0.0874, -0.0243, -0.3112, 0.492, -0.2223, -0.2333, 0.0917, 0.4898, 0.4258, 0.1337, 0.0707, 0.0417, 0.0837, 0.1047, 0.4188 ]
20
19
-0.001
2FM
0
s-(difluoromethyl)homocysteine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "CE", "HE", "FZ1", "FZ2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT1", "HA", "F2", "F2", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, 0.64, 0.09, -0.34, -0.34, 0.51, -0.51 ]
17
17
2FM
s-(difluoromethyl)homocysteine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "CE", "HE", "FZ1", "FZ2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT1", "HA", "F2", "F2", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, 0.64, 0.09, -0.34, -0.34, 0.51, -0.51 ]
17
17
2
5
5
81
110,889
5
L:2HF
2HF
L
[NH3][C@H](C(=O)O)C[C@@H]1CN[C@@H](N1)F
2HF.pdb
L_SMI/2HF.smi
L_PDB/2HF.pdb
L_MOL2/2HF.mol2
L_top/2HF.top
L_rtp/2HF.rtp
L_rtp/2HF.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "2HF" ]
[ "C", "N", "O", "F1", "CA", "CB", "CG", "ND1", "CD2", "CE1", "NE2", "OXT", "HN3", "HN2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HN1" ]
[ "C", "N", "O", "F", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
21
12
9
2HF.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "C", "N", "O", "F1", "CA", "CB", "CG", "ND1", "CD2", "CE1", "NE2", "OXT", "HN3", "HN2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HN1" ]
[ "C.2", "N.4", "O.co2", "F", "C.3", "C.3", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 1.0376, -0.6666, -0.5303, -0.0239, -0.6375, 0.1119, -0.0336, -0.1561, -0.1283, 0.1953, -0.1391, -0.4753, 0.4138, 0.3638, 0.1217, 0.0477, 0.0937, 0.3627, 0.236, 0.3657, 0.4438 ]
21
21
1.003
2HF
1
2-fluoro-l-histidine (NE2-ND1)
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "ND1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "NE2", "HE2", "F1", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CPH1", "NR3", "H", "CPH1", "HR1", "CPH2", "NR3", "H", "F1", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.05, 0.09, 0.09, 0.19, -0.51, 0.44, 0.19, 0.13, 0.67, -0.51, 0.44, -0.17, 0.51, -0.51 ]
18
19
2HF
2-fluoro-l-histidine (NE2-ND1)
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "ND1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "NE2", "HE2", "F1", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CPH1", "NR3", "H", "CPH1", "HR1", "CPH2", "NR3", "H", "F1", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.05, 0.09, 0.09, 0.19, -0.51, 0.44, 0.19, 0.13, 0.67, -0.51, 0.44, -0.17, 0.51, -0.51 ]
18
19
6
6
6
9
12,321
7
L:2HF2
2HF2
L
[NH3][C@H](C(=O)O)Cc1c[nH]c(n1)F
2HF2.pdb
L_SMI/2HF2.smi
L_PDB/2HF2.pdb
L_MOL2/2HF2.mol2
L_top/2HF2.top
L_rtp/2HF2.rtp
L_rtp/2HF2.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "2HF" ]
[ "C", "N", "O", "F1", "CA", "CB", "CG", "ND1", "CD2", "CE1", "NE2", "OXT", "HN3", "HN2", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE2", "HN1" ]
[ "C", "N", "O", "F", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
20
12
8
2HF2.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "C", "N", "O", "F1", "CA", "CB", "CG", "ND1", "CD2", "CE1", "NE2", "OXT", "HN3", "HN2", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE2", "HN1" ]
[ "C.2", "N.4", "O.co2", "F", "C.3", "C.3", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.9346, -0.8216, -0.8023, -0.1902, -0.0625, -0.1117, 0.2926, -0.725, -0.2166, 0.6077, -0.3259, -0.7213, 0.4348, 0.4298, 0.0907, 0.0697, 0.1207, 0.197, 0.3197, 0.4788 ]
20
20
-0.001
2HF2
0
2-fluoro-l-histidine (NE2)
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "ND1", "NE2", "HE2", "CE1", "F1", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "C5B", "C5A", "HP", "N5B", "NY", "H", "C5A", "F1", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.08, 0.09, 0.09, 0.22, -0.05, 0.09, -0.56, -0.36, 0.32, 0.37, -0.13, 0.51, -0.51 ]
17
18
2HF2
2-fluoro-l-histidine (NE2)
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "ND1", "NE2", "HE2", "CE1", "F1", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "C5B", "C5A", "HP", "N5B", "NY", "H", "C5A", "F1", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.08, 0.09, 0.09, 0.22, -0.05, 0.09, -0.56, -0.36, 0.32, 0.37, -0.13, 0.51, -0.51 ]
17
18
8
5
5
9
12,321
4
L:2NP
2NP
L
OC(=O)[C@H](CCC[C](=[C](=O)=O)=C)[NH3]
2NP.pdb
L_SMI/2NP.smi
L_PDB/2NP.pdb
L_MOL2/2NP.mol2
L_top/2NP.top
L_rtp/2NP.rtp
L_rtp/2NP.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "2NP" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "CZ1", "CZ2", "OJ1", "OJ2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HZ21", "HZ22" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
25
13
12
2NP.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "C", "O", "OXT", "CA", "N", "CB", "CG", "CD", "CE", "CZ2", "CZ1", "OJ1", "OJ2", "HA", "HN1", "HN2", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HZ21", "HZ22", "HN3" ]
[ "C.2", "O.co2", "O.co2", "C.3", "N.4", "C.3", "C.3", "C.3", "C.2", "C.2", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.9196, -0.8323, -0.7643, -0.0395, -0.8316, -0.0784, -0.0954, -0.0272, -0.1652, -0.215, 0.8956, -0.7843, -0.9173, 0.0747, 0.4488, 0.4318, 0.0517, 0.0737, 0.0657, 0.0357, 0.0217, 0.0317, 0.128, 0.078, 0.4918 ]
25
24
-1.002
2NP
-1
l-2-amino-6-methylene-pimelic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD2", "HD1", "CE", "CZ1", "CZ2", "HZ22", "HZ21", "OJ1", "OJ2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "C=C", "CC", "CE2", "HE2", "HE2", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.38, 0.9, -0.3, 0.15, 0.15, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
22
22
2NP
l-2-amino-6-methylene-pimelic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD2", "HD1", "CE", "CZ1", "CZ2", "HZ22", "HZ21", "OJ1", "OJ2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "C=C", "CC", "CE2", "HE2", "HE2", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.38, 0.9, -0.3, 0.15, 0.15, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
22
22
5
6
6
54
73,926
1
L:32T
32T
L
O=[C](=O)[C@H](Cc1c[nH]c2c1scc2)[NH3]
32T.pdb
L_SMI/32T.smi
L_PDB/32T.pdb
L_MOL2/32T.mol2
L_top/32T.top
L_rtp/32T.rtp
L_rtp/32T.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "32T" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "NE1", "CZ2", "CZ3", "OXT", "SUL", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "O", "S", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
24
14
10
32T.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "NE1", "CZ2", "CZ3", "OXT", "SUL", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "S.2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8316, -0.0645, 0.9346, -0.8083, -0.0171, -0.1463, -0.1313, -0.1451, -0.0873, -0.1631, -0.139, -0.1401, -0.7123, 0.0392, 0.0877, 0.1107, 0.0697, 0.173, 0.3057, 0.159, 0.174, 0.4288, 0.4248, 0.4798 ]
24
25
0.001
32T
0
(s)-2-amino-3-(4h-thieno[3,2-b]-pyrrol-6-yl)-propionic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "SUL", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "STHI", "C5B", "HP", "C5A", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, 0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.11, -0.16, 0.15, -0.07, 0.15, 0.51, -0.51 ]
21
23
32T
(s)-2-amino-3-(4h-thieno[3,2-b]-pyrrol-6-yl)-propionic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "SUL", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "STHI", "C5B", "HP", "C5A", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, 0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.11, -0.16, 0.15, -0.07, 0.15, 0.51, -0.51 ]
21
23
2
7
7
9
12,321
7
L:3CF
3CF
L
N#Cc1cccc(c1)C[C@@H](C(=O)O)[NH3]
3CF.pdb
L_SMI/3CF.smi
L_PDB/3CF.pdb
L_MOL2/3CF.mol2
L_top/3CF.top
L_rtp/3CF.rtp
L_rtp/3CF.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "3CF" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CH", "NJ", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE2", "HZ", "HD1" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "N", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
24
14
10
3CF.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CH", "NJ", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE2", "HZ", "HD1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "C.1", "N.1", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0745, 0.9386, -0.7983, -0.0521, -0.1153, -0.087, -0.134, -0.007, -0.129, -0.091, -0.7063, 0.2238, -0.3428, 0.4238, 0.4268, 0.4858, 0.0907, 0.1207, 0.0727, 0.137, 0.145, 0.152, 0.158 ]
24
24
0.002
3CF
-0
3-cyano-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "CH", "NJ", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CN", "NC", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.07, 0.48, -0.55, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
21
22
3CF
3-cyano-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "CH", "NJ", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CN", "NC", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.07, 0.48, -0.55, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
21
22
2
7
7
12
16,428
3
L:3FG
3FG
L
OC(=O)[C@H](c1cc(O)cc(c1)O)[NH3]
3FG.pdb
L_SMI/3FG.smi
L_PDB/3FG.pdb
L_MOL2/3FG.mol2
L_top/3FG.top
L_rtp/3FG.rtp
L_rtp/3FG.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "3FG" ]
[ "N", "OD1", "CD1", "CG1", "CZ", "CD2", "OD2", "CG2", "CB", "CA", "C", "O", "OXT", "HN1", "HN2", "HA", "HD1", "HG1", "HZ", "HD2", "HG2", "HN3" ]
[ "N", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
22
13
9
3FG.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "OD1", "CD1", "CG1", "CZ", "CD2", "OD2", "CG2", "CB", "CA", "C", "O", "OXT", "HN1", "HN2", "HA", "HD1", "HG1", "HZ", "HD2", "HG2", "HN3" ]
[ "N.4", "O.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.ar", "C.ar", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.4901, 0.1691, -0.168, -0.293, 0.1711, -0.4921, -0.201, -0.0283, -0.0372, 0.9486, -0.7973, -0.6903, 0.4248, 0.4858, 0.0977, 0.423, 0.162, 0.14, 0.424, 0.16, 0.4258 ]
22
22
-0.001
3FG
0
(2s)-amino(3,5-dihydroxyphenyl)ethanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CZ", "HZ", "CD1", "OD1", "HD1", "CD2", "OD2", "HD2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
19
20
3FG
(2s)-amino(3,5-dihydroxyphenyl)ethanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CZ", "HZ", "CD1", "OD1", "HD1", "CD2", "OD2", "HD2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
19
20
2
7
7
1
1,369
7
L:3GL
3GL
L
OC(=O)[C@H](C[C@@H]([C](=O)=O)O)[NH3]
3GL.pdb
L_SMI/3GL.smi
L_PDB/3GL.pdb
L_MOL2/3GL.mol2
L_top/3GL.top
L_rtp/3GL.rtp
L_rtp/3GL.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "3GL" ]
[ "N", "CA", "C", "CB", "CG", "OH", "CD", "OE1", "OE2", "O", "OXT", "HN1", "HN2", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HH", "HN3" ]
[ "N", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "O", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
19
11
8
3GL.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "CB", "CG", "OH", "CD", "OE1", "OE2", "O", "OXT", "HN1", "HN2", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HH", "HN3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "C.3", "C.3", "O.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8276, -0.0215, 0.9186, -0.0914, -0.0169, -0.6928, 0.9066, -0.7983, -0.8353, -0.8473, -0.7413, 0.4608, 0.4498, 0.0857, 0.0687, 0.0957, 0.0217, 0.45, 0.4148 ]
19
18
-1
3GL
-1
4-hydroxy-glutamic-acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG", "OH", "HH", "CD", "OE1", "OE2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.04, 0.09, -0.66, 0.43, 0.62, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
16
16
3GL
4-hydroxy-glutamic-acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG", "OH", "HH", "CD", "OE1", "OE2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.04, 0.09, -0.66, 0.43, 0.62, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
16
16
3
5
5
27
36,963
5
L:3MY
3MY
L
OC(=O)[C@H](Cc1ccc(c(c1)Cl)O)[NH3]
3MY.pdb
L_SMI/3MY.smi
L_PDB/3MY.pdb
L_MOL2/3MY.mol2
L_top/3MY.top
L_rtp/3MY.rtp
L_rtp/3MY.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "3MY" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "CLE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HH", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "CL", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
24
14
10
3MY.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "C", "OXT", "CLE", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HH", "H1", "H2" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.2", "O.co2", "Cl", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8346, -0.0715, -0.8003, -0.0461, -0.1413, -0.087, -0.112, -0.145, -0.0726, 0.1421, -0.4841, 0.9376, -0.7093, -0.0854, 0.4848, 0.0897, 0.1177, 0.0707, 0.153, 0.146, 0.163, 0.434, 0.4248, 0.4258 ]
24
24
-0
3MY
0
3-Chloro-tyrosine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "CLE", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
21
22
3MY
3-Chloro-tyrosine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "CLE", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
21
22
2
7
7
12
16,428
1
L:4CF
4CF
L
[NH3][C@H](C(=O)O)Cc1ccc(cc1)C#N
4CF.pdb
L_SMI/4CF.smi
L_PDB/4CF.pdb
L_MOL2/4CF.mol2
L_top/4CF.top
L_rtp/4CF.rtp
L_rtp/4CF.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "4CF" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CH", "NJ", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "N", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
24
14
10
4CF.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CH", "NJ", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "C.1", "N.1", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0735, 0.9386, -0.7973, -0.0561, -0.0873, -0.128, -0.163, -0.084, -0.087, -0.014, -0.7073, 0.2258, -0.3468, 0.4238, 0.4268, 0.4848, 0.0907, 0.1217, 0.0737, 0.154, 0.137, 0.153, 0.15 ]
24
24
0
4CF
-0
4-cyano-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CH", "NJ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CN", "NC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.07, 0.48, -0.55, 0.51, -0.51 ]
21
22
4CF
4-cyano-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CH", "NJ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CN", "NC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.07, 0.48, -0.55, 0.51, -0.51 ]
21
22
2
7
7
6
8,214
2
L:4CY
4CY
L
N#CSCC[C@@H](C(=O)O)[NH3]
4CY.pdb
L_SMI/4CY.smi
L_PDB/4CY.pdb
L_MOL2/4CY.mol2
L_top/4CY.top
L_rtp/4CY.rtp
L_rtp/4CY.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "4CY" ]
[ "C", "N", "O", "CA", "CB", "CE", "SD", "CG", "NZ", "OXT", "HN1", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HN2", "HA", "HN3" ]
[ "C", "N", "O", "C", "C", "C", "S", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
18
10
8
4CY.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "C", "N", "O", "CA", "CB", "CE", "SD", "CG", "NZ", "OXT", "HN1", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HN2", "HA", "HN3" ]
[ "C.2", "N.4", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.1", "S.3", "C.3", "N.1", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.9416, -0.8366, -0.7923, -0.0795, -0.0914, 0.1739, 0.0138, -0.0703, -0.3188, -0.7023, 0.4188, 0.0687, 0.1347, 0.0847, 0.0457, 0.4908, 0.0937, 0.4248 ]
18
17
-0
4CY
-0
nitrilo-l-methionine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "CE", "NZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "CN", "NC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.05, 0.09, 0.09, -0.27, 0.59, -0.55, 0.51, -0.51 ]
15
15
4CY
nitrilo-l-methionine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "CE", "NZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "CN", "NC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.05, 0.09, 0.09, -0.27, 0.59, -0.55, 0.51, -0.51 ]
15
15
2
4
4
27
36,963
1
L:4HMP
4HMP
L
OCc1ccc(cc1)C[C@@H](C(=O)O)[NH3]
4HMP.pdb
L_SMI/4HMP.smi
L_PDB/4HMP.pdb
L_MOL2/4HMP.mol2
L_top/4HMP.top
L_rtp/4HMP.rtp
L_rtp/4HMP.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "4HM" ]
[ "CA", "C", "CB", "O", "OXT", "N", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CZ", "CE1", "CH", "OJ", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HE1", "HH1", "HH2", "HJ", "H1", "H2", "H3" ]
[ "C", "C", "C", "O", "O", "N", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
27
14
13
4HMP.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "CA", "C", "CB", "O", "OXT", "N", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CZ", "CE1", "CH", "OJ", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HE1", "HH1", "HH2", "HJ", "H1", "H2", "H3" ]
[ "C.3", "C.2", "C.3", "O.co2", "O.co2", "N.4", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.3", "O.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.0675, 0.9366, -0.0501, -0.8033, -0.7103, -0.8356, -0.1153, -0.127, -0.154, -0.125, -0.0853, -0.096, 0.1747, -0.5988, 0.0897, 0.1157, 0.0707, 0.145, 0.132, 0.135, 0.158, 0.0327, 0.0387, 0.407, 0.4268, 0.4828, 0.4248 ]
27
27
0.002
4HMP
0
4-(Hydroxymethyl)-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CH", "HH1", "HH2", "OJ", "HJ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]
24
25
4HMP
4-(Hydroxymethyl)-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CH", "HH1", "HH2", "OJ", "HJ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]
24
25
2
9
9
12
16,428
7
L:4HT
4HT
L
O=[C](=O)[C@H](Cc1c[nH]c2c1c(O)ccc2)[NH3]
4HT.pdb
L_SMI/4HT.smi
L_PDB/4HT.pdb
L_MOL2/4HT.mol2
L_top/4HT.top
L_rtp/4HT.rtp
L_rtp/4HT.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "4HT" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "OE3", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "O", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
28
16
12
4HT.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "OE3", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "O.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8296, -0.0775, 0.9366, -0.8023, -0.0242, -0.1862, -0.091, -0.155, 0.0037, 0.1651, -0.2364, -0.5001, -0.179, -0.184, -0.075, -0.7143, 0.0937, 0.0717, 0.1037, 0.172, 0.3037, 0.436, 0.139, 0.155, 0.138, 0.4278, 0.4808, 0.4278 ]
28
29
-0
4HT
-0
4-hydroxytryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CZ2", "HZ2", "CE3", "OE3", "HE3", "CZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
25
27
4HT
4-hydroxytryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CZ2", "HZ2", "CE3", "OE3", "HE3", "CZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
25
27
2
9
9
9
12,321
7
L:4IN
4IN
L
OC(=O)[C@H](Cc1c[nH]c2c1c(N)ccc2)[NH3]
4IN.pdb
L_SMI/4IN.smi
L_PDB/4IN.pdb
L_MOL2/4IN.mol2
L_top/4IN.top
L_rtp/4IN.rtp
L_rtp/4IN.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "4IN" ]
[ "N", "CA", "CB", "CG", "CD1", "NE1", "CE2", "CZ2", "CH2", "CZ3", "CE3", "NZ1", "CD2", "C", "OXT", "O", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HZ2", "HH2", "HZ3", "HZ11", "HZ12", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
29
16
13
4IN.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "CB", "CG", "CD1", "NE1", "CE2", "CZ2", "CH2", "CZ3", "CE3", "NZ1", "CD2", "C", "OXT", "O", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HZ2", "HH2", "HZ3", "HZ11", "HZ12", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.3", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.pl3", "C.ar", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8306, -0.0705, -0.0192, -0.1732, 0.0172, -0.2374, 0.0097, -0.197, -0.062, -0.233, 0.1976, -0.8292, -0.137, 0.9336, -0.7203, -0.8053, 0.4268, 0.4788, 0.0997, 0.0687, 0.0987, 0.0398, 0.3007, 0.137, 0.133, 0.135, 0.3998, 0.4098, 0.4288 ]
29
30
0
4IN
0
4-amino-l-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CE3", "NZ1", "HZ11", "HZ12", "CH2", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "H", "H", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
26
28
4IN
4-amino-l-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CE3", "NZ1", "HZ11", "HZ12", "CH2", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "H", "H", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
26
28
2
9
9
9
12,321
3
L:4PH
4PH
L
[NH3][C@H](C(=O)O)Cc1ccc(cc1)C
4PH.pdb
L_SMI/4PH.smi
L_PDB/4PH.pdb
L_MOL2/4PH.mol2
L_top/4PH.top
L_rtp/4PH.rtp
L_rtp/4PH.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "4PH" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CH", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HH1", "HH2", "HH3", "HE1", "HE2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
26
13
13
4PH.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CH", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HH1", "HH2", "HH3", "HE1", "HE2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "C.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0675, 0.9366, -0.8033, -0.0491, -0.1193, -0.118, -0.153, -0.124, -0.128, -0.0713, -0.7113, -0.0578, 0.4268, 0.4248, 0.4828, 0.0887, 0.1147, 0.0697, 0.144, 0.129, 0.0477, 0.0507, 0.0477, 0.139, 0.136 ]
26
26
0
4PH
-0
4-Methyl-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CH", "HH1", "HH2", "HH3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
23
24
4PH
4-Methyl-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CH", "HH1", "HH2", "HH3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
23
24
2
8
8
6
8,214
5
L:6CW
6CW
L
O=[C](=O)[C@H](Cc1c[nH]c2c1ccc(c2)Cl)[NH3]
6CW.pdb
L_SMI/6CW.smi
L_PDB/6CW.pdb
L_MOL2/6CW.mol2
L_top/6CW.top
L_rtp/6CW.rtp
L_rtp/6CW.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "6CW" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "CLL", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "CL", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
27
16
11
6CW.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "CLL", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "Cl", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8326, -0.0665, 0.9346, -0.8063, -0.0192, -0.1892, -0.08, -0.088, -0.0243, -0.08, -0.2344, -0.139, -0.145, 0.0374, -0.0884, -0.7123, 0.0877, 0.0687, 0.1117, 0.173, 0.3047, 0.149, 0.152, 0.152, 0.4268, 0.4258, 0.4808 ]
27
28
-0.001
6CW
0
6-chloro-l-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ3", "HZ3", "CZ2", "HZ2", "CH2", "CLL", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.51, -0.51 ]
24
26
6CW
6-chloro-l-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ3", "HZ3", "CZ2", "HZ2", "CH2", "CLL", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.51, -0.51 ]
24
26
2
8
8
9
12,321
1
L:ABA
ABA
L
CC[C@@H]([C](=O)=O)[NH3]
ABA.pdb
L_SMI/ABA.smi
L_PDB/ABA.pdb
L_MOL2/ABA.mol2
L_top/ABA.top
L_rtp/ABA.rtp
L_rtp/ABA.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "ABA" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HG3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
16
7
9
ABA.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HG3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8386, -0.0725, 0.9356, -0.8033, -0.0974, -0.1071, -0.7093, 0.0887, 0.1167, 0.0557, 0.0547, 0.0417, 0.0057, 0.4228, 0.4188, 0.4878 ]
16
15
0
ABA
0
2-Aminobutyric acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "HG3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
13
13
ABA
2-Aminobutyric acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "HG3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
13
13
2
4
4
3
4,107
3
L:ACZ
ACZ
L
[NH3][C@H](C(=O)O)CC[C@@H]1C=C[C@@H](C=C1)[NH3]
ACZ.pdb
L_SMI/ACZ.smi
L_PDB/ACZ.pdb
L_MOL2/ACZ.mol2
L_top/ACZ.top
L_rtp/ACZ.rtp
L_rtp/ACZ.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "ACZ" ]
[ "NJ", "CH", "CZ2", "CE2", "CD", "CE1", "CZ1", "CG", "CB", "CA", "N", "C", "OXT", "O", "HJ1", "HJ2", "HH", "HZ22", "HE22", "HD", "HE11", "HZ11", "HG1", "HG2", "HB1", "HB2", "HA", "HN1", "HN2", "HJ3", "HN3" ]
[ "N", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
31
14
17
ACZ.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "NJ", "CH", "CZ2", "CE2", "CD", "CE1", "CZ1", "CG", "CB", "CA", "N", "C", "OXT", "O", "HJ1", "HJ2", "HH", "HZ22", "HE22", "HD", "HE11", "HZ11", "HG1", "HG2", "HB1", "HB2", "HA", "HN1", "HN2", "HJ3", "HN3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "C.2", "C.3", "C.2", "C.2", "C.3", "C.3", "C.3", "N.4", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8526, 0.2439, -0.2792, -0.0472, -0.0693, -0.0042, -0.3112, -0.0524, -0.0804, -0.0865, -0.8296, 0.9426, -0.7543, -0.7563, 0.4518, 0.4478, 0.1117, 0.147, 0.153, 0.1587, 0.195, 0.153, 0.0477, 0.0507, 0.0377, 0.0887, 0.0867, 0.4958, 0.4358, 0.4498, 0.4248 ]
31
31
0.999
ACZ
1
cis-amiclenomycin
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD", "CE1", "HE11", "CE2", "HE22", "CZ1", "HZ11", "CZ2", "HZ22", "CH", "HH", "NJ", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CE1", "HE1", "CE1", "HE1", "CE1", "HE1", "CE1", "HE1", "CT1", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.19, 0.09, -0.29, 0.15, -0.29, 0.15, -0.29, 0.15, -0.29, 0.15, 0.69, 0.09, -0.85, 0.45, 0.45, 0.45, 0.51, -0.51 ]
28
29
ACZ
cis-amiclenomycin
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD", "CE1", "HE11", "CE2", "HE22", "CZ1", "HZ11", "CZ2", "HZ22", "CH", "HH", "NJ", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CE1", "HE1", "CE1", "HE1", "CE1", "HE1", "CE1", "HE1", "CT1", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.19, 0.09, -0.29, 0.15, -0.29, 0.15, -0.29, 0.15, -0.29, 0.15, 0.69, 0.09, -0.85, 0.45, 0.45, 0.45, 0.51, -0.51 ]
28
29
6
11
11
27
36,963
1
L:AGM
AGM
L
C[C@H]([NH]=[C](=[NH2])=[NH2])CC[C@@H](C(=O)O)[NH3]
AGM.pdb
L_SMI/AGM.smi
L_PDB/AGM.pdb
L_MOL2/AGM.mol2
L_top/AGM.top
L_rtp/AGM.rtp
L_rtp/AGM.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "AGM" ]
[ "N", "CA", "CB", "CG", "CD", "CE2", "NE1", "CZ", "NH1", "NH2", "C", "O", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "HE21", "HE22", "HE23", "HE1", "HH11", "HH12", "HH21", "HH22", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "N", "N", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
30
13
17
AGM.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "CB", "CG", "CD", "CE2", "NE1", "CZ", "NH1", "NH2", "C", "O", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "HE21", "HE22", "HE23", "HE1", "HH11", "HH12", "HH21", "HH22", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "N.pl3", "C.cat", "N.pl3", "N.pl3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8276, -0.0285, -0.0924, -0.0964, 0.042, -0.1141, -0.4021, 0.5511, -0.5281, -0.4781, 0.8966, -0.8043, -0.7703, 0.4578, 0.4778, 0.1147, 0.0517, 0.0717, 0.0827, 0.0817, 0.0607, 0.0507, 0.0677, 0.0637, 0.3407, 0.3147, 0.3157, 0.3587, 0.3037, 0.4378 ]
30
29
1
AGM
1
5-methyl-arginine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD", "NE1", "HE1", "CE2", "HE21", "HE22", "HE23", "CZ", "NH2", "HH22", "HH21", "NH1", "HH12", "HH11", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "NC2", "HC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.29, 0.09, -0.7, 0.44, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]
27
27
AGM
5-methyl-arginine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD", "NE1", "HE1", "CE2", "HE21", "HE22", "HE23", "CZ", "NH2", "HH22", "HH21", "NH1", "HH12", "HH11", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "NC2", "HC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.29, 0.09, -0.7, 0.44, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]
27
27
3
9
9
81
110,889
8
L:AHB
AHB
L
OC(=O)[C@H]([C@@H](C(=O)N)O)[NH3]
AHB.pdb
L_SMI/AHB.smi
L_PDB/AHB.pdb
L_MOL2/AHB.mol2
L_top/AHB.top
L_rtp/AHB.rtp
L_rtp/AHB.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "AHB" ]
[ "N", "CA", "CB", "OB", "CG", "OD1", "ND2", "C", "O", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB", "HOB", "HD21", "HD22", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "O", "N", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
18
10
8
AHB.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "CB", "OB", "CG", "OD1", "ND2", "C", "O", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB", "HOB", "HD21", "HD22", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.3", "O.3", "C.2", "O.2", "N.am", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8266, -0.1225, 0.0831, -0.5538, 0.6131, -0.6811, -0.63, 0.9566, -0.7833, -0.7163, 0.4808, 0.4468, 0.0957, 0.1497, 0.402, 0.3275, 0.3255, 0.4338 ]
18
17
0.001
AHB
-0
beta-hydroxyasparagine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OB", "HOB", "CG", "OD1", "ND2", "HD21", "HD22", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]
15
15
AHB
beta-hydroxyasparagine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OB", "HOB", "CG", "OD1", "ND2", "HD21", "HD22", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]
15
15
6
5
5
18
24,642
9
L:ALA
ALA
L
[NH3][C@@H](C)C(=O)O
ALA.pdb
L_SMI/ALA.smi
L_PDB/ALA.pdb
L_MOL2/ALA.mol2
null
null
null
true
true
true
false
false
false
true
true
false
false
[ ".mol2", ".pdb", ".png", ".smi" ]
[ "ALA" ]
[ "N", "CA", "O", "CB", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HB3", "H1", "H2" ]
[ "N", "C", "O", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
13
6
7
ALA.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "O", "CB", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HB3", "H1", "H2" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.3869, 0.0176, -0.2483, -0.0683, 0.3418, -0.2483, -0.0889, 0.0195, 0.0219, 0.0219, 0.0219, -0.0889, -0.0889 ]
13
12
-0.0001
null
null
null
[]
[]
[]
0
0
null
null
[]
[]
[]
0
0
0
0
null
0
0
5
L:ALC
ALC
L
[NH3][C@H](C(=O)O)CC1CCCCC1
ALC.pdb
L_SMI/ALC.smi
L_PDB/ALC.pdb
L_MOL2/ALC.mol2
L_top/ALC.top
L_rtp/ALC.rtp
L_rtp/ALC.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "ALC" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CG", "CD1", "CE1", "CZ", "CE2", "CD2", "CB", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD11", "HD12", "HE11", "HE12", "HZ1", "HZ2", "HE21", "HE22", "HD21", "HD22" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
29
12
17
ALC.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CG", "CD1", "CE1", "CZ", "CE2", "CD2", "CB", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD11", "HD12", "HE11", "HE12", "HZ1", "HZ2", "HE21", "HE22", "HD21", "HD22" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8326, -0.0735, 0.9346, -0.8063, -0.0857, -0.0704, -0.0794, -0.0784, -0.0784, -0.0724, -0.0924, -0.7123, 0.4158, 0.4848, 0.4278, 0.0907, 0.1167, 0.0547, 0.0667, 0.0587, 0.0157, 0.0457, 0.0487, 0.0477, 0.0327, 0.0427, 0.0497, 0.0017, 0.0447 ]
29
29
-0.002
ALC
0
3-cyclohexyl-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "CD2", "HD21", "HD22", "CE1", "HE11", "HE12", "CE2", "HE21", "HE22", "CZ", "HZ1", "HZ2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
26
27
ALC
3-cyclohexyl-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "CD2", "HD21", "HD22", "CE1", "HE11", "HE12", "CE2", "HE21", "HE22", "CZ", "HZ1", "HZ2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
26
27
2
9
9
9
12,321
8
L:ALN
ALN
L
O=[C](=O)[C@H](Cc1cccc2c1cccc2)[NH3]
ALN.pdb
L_SMI/ALN.smi
L_PDB/ALN.pdb
L_MOL2/ALN.mol2
L_top/ALN.top
L_rtp/ALN.rtp
L_rtp/ALN.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "ALN" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE2", "HZ", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
29
16
13
ALN.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE2", "HZ", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8346, -0.0705, 0.9366, -0.7133, -0.0531, -0.0963, -0.033, -0.154, -0.037, -0.132, -0.11, -0.126, -0.121, -0.119, -0.12, -0.8013, 0.0917, 0.1167, 0.0697, 0.13, 0.137, 0.138, 0.152, 0.136, 0.141, 0.138, 0.4258, 0.4268, 0.4828 ]
29
30
0.001
ALN
0
1-Naphtalene
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CD2", "HD2", "CE1", "CH1", "HH1", "CE2", "HE2", "CH2", "HH2", "CZ", "HZ", "CJ1", "HJ1", "CJ2", "HJ2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
26
28
ALN
1-Naphtalene
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CD2", "HD2", "CE1", "CH1", "HH1", "CE2", "HE2", "CH2", "HH2", "CZ", "HZ", "CJ1", "HJ1", "CJ2", "HJ2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
26
28
2
10
10
12
16,428
3
L:ALO
ALO
L
[NH3][C@H](C(=O)O)[C@H](C)O
ALO.pdb
L_SMI/ALO.smi
L_PDB/ALO.pdb
L_MOL2/ALO.mol2
L_top/ALO.top
L_rtp/ALO.rtp
L_rtp/ALO.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "ALO" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OG1", "OXT", "HA", "HB", "HG1", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
17
8
9
ALO.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OG1", "OXT", "HA", "HB", "HG1", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8226, -0.1265, 0.9366, -0.7923, 0.1641, -0.1201, -0.6038, -0.7283, 0.1047, 0.0557, 0.458, 0.0797, 0.0357, 0.0187, 0.4198, 0.4288, 0.4878 ]
17
16
-0.004
ALO
0
Allo-threonine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "HG1", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
14
14
ALO
Allo-threonine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "HG1", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
14
14
2
5
5
3
4,107
8
L:ANTH
ANTH
L
OC(=O)[C@H](Cc1c2ccccc2cc2c1cccc2)[NH3]
ANTH.pdb
L_SMI/ANTH.smi
L_PDB/ANTH.pdb
L_MOL2/ANTH.mol2
L_top/ANTH.top
L_rtp/ANTH.rtp
L_rtp/ANTH.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "ANT" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "OXT", "CD1", "CF1", "CJ1", "CJ2", "CF2", "CE1", "CZ", "CE2", "CD2", "CG", "CH1", "CH2", "CM2", "CM1", "CB", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HF1", "HJ1", "HJ2", "HF2", "HZ", "HH1", "HH2", "HM2", "HM1" ]
[ "N", "C", "C", "O", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
35
20
15
ANTH.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "OXT", "CD1", "CF1", "CJ1", "CJ2", "CF2", "CE1", "CZ", "CE2", "CD2", "CG", "CH1", "CH2", "CM2", "CM1", "CB", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HF1", "HJ1", "HJ2", "HF2", "HZ", "HH1", "HH2", "HM2", "HM1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0695, 0.9356, -0.8023, -0.7163, -0.019, -0.132, -0.115, -0.121, -0.122, -0.036, -0.099, -0.043, -0.042, -0.0933, -0.166, -0.106, -0.135, -0.109, -0.0551, 0.4338, 0.4258, 0.4808, 0.0907, 0.1157, 0.0737, 0.154, 0.142, 0.138, 0.135, 0.139, 0.136...
35
37
-0.001
ANTH
0
3-(9-anthryl)-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CF1", "HF1", "CE2", "CH1", "HH1", "CF2", "HF2", "CZ", "HZ", "CJ1", "HJ1", "CH2", "HH2", "CM1", "HM1", "CJ2", "HJ2", "CM2", "HM2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0, 0, 0, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
32
35
ANTH
3-(9-anthryl)-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CF1", "HF1", "CE2", "CH1", "HH1", "CF2", "HF2", "CZ", "HZ", "CJ1", "HJ1", "CH2", "HH2", "CM1", "HM1", "CJ2", "HJ2", "CM2", "HM2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0, 0, 0, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
32
35
2
12
12
6
8,214
4
L:APM
APM
L
OC(=O)[C@H](Cc1cccc(c1)[C](=[NH2])=[NH2])[NH3]
APM.pdb
L_SMI/APM.smi
L_PDB/APM.pdb
L_MOL2/APM.mol2
L_top/APM.top
L_rtp/APM.rtp
L_rtp/APM.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "APM" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH", "NJ1", "NJ2", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HZ", "HJ12", "HJ21", "HJ22", "H1", "HJ11" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
29
15
14
APM.pdb
SMALL
NO_CHARGES
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH", "NJ1", "NJ2", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HZ", "HJ12", "HJ21", "HJ22", "H1", "HJ11" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.2", "N.pl3", "N.pl3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
29
29
0
APM
1
m-amidinophenyl-3-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CZ", "HZ", "CE2", "HE2", "CE1", "CH", "NJ1", "HJ12", "HJ11", "NJ2", "HJ21", "HJ22", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "C", "NCN", "HNCN", "HNCN", "NCN", "HNCN", "HNCN", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.03, 0.73, -0.75, 0.45, 0.45, -0.75, 0.45, 0.45, 0.51, -0.51 ]
26
27
APM
m-amidinophenyl-3-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CZ", "HZ", "CE2", "HE2", "CE1", "CH", "NJ1", "HJ12", "HJ11", "NJ2", "HJ21", "HJ22", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "C", "NCN", "HNCN", "HNCN", "NCN", "HNCN", "HNCN", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.03, 0.73, -0.75, 0.45, 0.45, -0.75, 0.45, 0.45, 0.51, -0.51 ]
26
27
3
9
9
12
16,428
8
L:ARG
ARG
L
[NH3][C@@H](CCCNC(=[NH2])N)C(=O)O
ARG.pdb
L_SMI/ARG.smi
L_PDB/ARG.pdb
L_MOL2/ARG.mol2
null
null
null
true
true
true
false
false
false
true
true
true
true
[ ".mol2", ".pdb", ".png", ".smi", ".zip" ]
[ "ARG" ]
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "CD", "NE", "CZ", "NH1", "NH2", "C", "OXT", "H3", "HA", "2HB", "3HB", "2HG", "3HG", "2HD", "3HD", "HE", "1HH1", "2HH1", "1HH2", "2HH2", "H1", "H2" ]
[ "N", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "C", "N", "N", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
27
12
15
ARG.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "CD", "NE", "CZ", "NH1", "NH2", "C", "OXT", "H3", "HA", "2HB", "3HB", "2HG", "3HG", "2HD", "3HD", "HE", "1HH1", "2HH1", "1HH2", "2HH2", "H1", "H2" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "N.pl3", "C.cat", "N.pl3", "N.pl3", "C.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.3871, 0.0206, -0.2483, -0.0531, -0.0232, 0.0645, -0.2787, 0.341, -0.2919, -0.2919, 0.342, -0.2483, -0.0889, 0.0198, 0.0255, 0.0255, 0.0295, 0.0295, 0.0655, 0.0655, 0.2578, 0.2545, 0.2545, 0.2545, 0.2545, -0.0889, -0.0889 ]
27
26
0.9897
null
null
null
[]
[]
[]
0
0
null
null
[]
[]
[]
0
0
0
0
null
81
110,889
5
L:AS2
AS2
L
O=CC[C@@H]([C](=O)=O)[NH3]
AS2.pdb
L_SMI/AS2.smi
L_PDB/AS2.pdb
L_MOL2/AS2.mol2
L_top/AS2.top
L_rtp/AS2.rtp
L_rtp/AS2.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "AS2" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
15
8
7
AS2.pdb
SMALL
NO_CHARGES
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.2", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
15
14
0
AS2
0
(2r)-2-amino-4-oxobutanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "OG", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "C", "HCO", "O", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.51, 0.06, -0.57, 0.51, -0.51 ]
12
12
AS2
(2r)-2-amino-4-oxobutanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "OG", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "C", "HCO", "O", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.51, 0.06, -0.57, 0.51, -0.51 ]
12
12
3
4
4
9
12,321
2
L:ASN
ASN
L
[NH3][C@@H](CC(=O)N)C(=O)O
ASN.pdb
L_SMI/ASN.smi
L_PDB/ASN.pdb
L_MOL2/ASN.mol2
null
null
null
true
true
true
false
false
false
true
true
true
true
[ ".mol2", ".pdb", ".png", ".smi", ".zip" ]
[ "ASN" ]
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "ND2", "OD1", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HD21", "HD22", "H1", "H2" ]
[ "N", "C", "O", "C", "C", "N", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
17
9
8
ASN.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "ND2", "OD1", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HD21", "HD22", "H1", "H2" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.2", "N.am", "O.2", "C.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.3874, 0.0288, -0.2482, 0.0209, 0.2094, -0.3294, -0.2761, 0.3425, -0.2482, -0.0889, 0.0203, 0.0347, 0.0347, 0.1449, 0.1449, -0.0889, -0.0889 ]
17
16
-0.0001
null
null
null
[]
[]
[]
0
0
null
null
[]
[]
[]
0
0
0
0
null
18
24,642
2
L:ASP
ASP
L
[NH3][C@@H](CC(=O)O)C(=O)O
ASP.pdb
L_SMI/ASP.smi
L_PDB/ASP.pdb
L_MOL2/ASP.mol2
null
null
null
true
true
true
false
false
false
true
true
true
true
[ ".mol2", ".pdb", ".png", ".smi", ".zip" ]
[ "ASP" ]
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "OD1", "OD2", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "H1", "H2" ]
[ "N", "C", "O", "C", "C", "O", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
15
9
6
ASP.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "OD1", "OD2", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "H1", "H2" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "C.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.3874, 0.0307, -0.2482, 0.0464, 0.355, -0.2464, -0.2464, 0.3426, -0.2482, -0.0889, 0.0203, 0.0368, 0.0368, -0.0889, -0.0889 ]
15
14
0.0001
null
null
null
[]
[]
[]
0
0
null
null
[]
[]
[]
0
0
0
0
null
9
12,321
9
L:AZDA
AZDA
L
[NH3][C@H]([C](=O)=O)CN=[N]=N
AZDA.pdb
L_SMI/AZDA.smi
L_PDB/AZDA.pdb
L_MOL2/AZDA.mol2
L_top/AZDA.top
L_rtp/AZDA.rtp
L_rtp/AZDA.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "AZD" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "ND", "NE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "N", "N", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
15
9
6
AZDA.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "ND", "NE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "N.2", "N.2", "N.1", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8246, -0.0965, 0.9406, -0.7923, 0.1128, -0.4572, 0.217, -0.028, -0.7123, 0.0887, 0.0907, 0.1197, 0.4358, 0.4208, 0.4838 ]
15
14
-0.001
AZDA
0
azido-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "NG", "ND", "NE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "N=C", "=N=", "NAZT", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.07, 0.09, 0.09, -0.56, 0.68, -0.37, 0.51, -0.51 ]
12
12
AZDA
azido-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "NG", "ND", "NE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "N=C", "=N=", "NAZT", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.07, 0.09, 0.09, -0.56, 0.68, -0.37, 0.51, -0.51 ]
12
12
2
3
3
9
12,321
6
L:BB8
BB8
L
O[C@H]([C@@H](C(=O)O)[NH3])c1ccccc1
BB8.pdb
L_SMI/BB8.smi
L_PDB/BB8.pdb
L_MOL2/BB8.mol2
L_top/BB8.top
L_rtp/BB8.rtp
L_rtp/BB8.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "BB8" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "OG2", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
24
13
11
BB8.pdb
SMALL
NO_CHARGES
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "OG2", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "O.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
24
24
0
BB8
-0
Phenylserine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG2", "HG2", "CG1", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "HE2", "CE1", "HE1", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
21
22
BB8
Phenylserine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG2", "HG2", "CG1", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "HE2", "CE1", "HE1", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
21
22
2
9
9
6
8,214
3
L:BCS
BCS
L
[NH3][C@H](C(=O)O)CSCc1ccccc1
BCS.pdb
L_SMI/BCS.smi
L_PDB/BCS.pdb
L_MOL2/BCS.mol2
L_top/BCS.top
L_rtp/BCS.rtp
L_rtp/BCS.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "BCS" ]
[ "N", "CA", "CB", "SG", "CD", "CE", "CZ1", "CZ2", "CH1", "CH2", "CJ", "C", "O", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HZ1", "HZ2", "HH1", "HH2", "HJ", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "S", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
27
14
13
BCS.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "CB", "SG", "CD", "CE", "CZ1", "CZ2", "CH1", "CH2", "CJ", "C", "O", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HZ1", "HZ2", "HH1", "HH2", "HJ", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.3", "S.3", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8376, -0.0725, -0.0083, -0.3802, 0.064, -0.0893, -0.118, -0.108, -0.131, -0.128, -0.118, 0.9406, -0.7973, -0.7053, 0.4428, 0.4778, 0.0997, 0.0837, 0.1217, 0.0687, 0.0827, 0.13, 0.143, 0.135, 0.138, 0.136, 0.4288 ]
27
27
-0.001
BCS
-0
benzylcysteine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "SG", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "CZ1", "HZ1", "CZ2", "HZ2", "CH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ", "HJ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
24
25
BCS
benzylcysteine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "SG", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "CZ1", "HZ1", "CZ2", "HZ2", "CH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ", "HJ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
24
25
2
9
9
54
73,926
4
L:BHD
BHD
L
O=[C](=O)[C@H]([C@@H]([C](=O)=O)[NH3])O
BHD.pdb
L_SMI/BHD.smi
L_PDB/BHD.pdb
L_MOL2/BHD.mol2
L_top/BHD.top
L_rtp/BHD.rtp
L_rtp/BHD.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "BHD" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OB", "CG", "OD1", "OD2", "OXT", "HA", "HB", "HOB", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "O", "C", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
16
10
6
BHD.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OB", "CG", "OD1", "OD2", "OXT", "HA", "HB", "HOB", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "O.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8466, -0.0455, 0.9306, -0.8513, 0.0181, -0.6068, 0.8746, -0.8963, -0.7543, -0.7583, 0.0837, 0.1097, 0.403, 0.4798, 0.4558, 0.4038 ]
16
15
-1
BHD
-1
beta-hydroxyaspartic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG", "OB", "HOB", "OD1", "OD2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CC", "OH1", "H", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.04, 0.09, 0.62, -0.66, 0.43, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
13
13
BHD
beta-hydroxyaspartic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG", "OB", "HOB", "OD1", "OD2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CC", "OH1", "H", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.04, 0.09, 0.62, -0.66, 0.43, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
13
13
3
4
4
9
12,321
7
L:BIF
BIF
L
[NH3][C@H](C(=O)O)Cc1ccc(cc1)c1ccccc1
BIF.pdb
L_SMI/BIF.smi
L_PDB/BIF.pdb
L_MOL2/BIF.mol2
L_top/BIF.top
L_rtp/BIF.rtp
L_rtp/BIF.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "BIF" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CE1", "CD1", "CD2", "CE2", "CZ", "C12", "C10", "C11", "C13", "C8", "C9", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HE1", "HD1", "HD2", "HE2", "H10", "H11", "H13", "H8", "H9", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
33
18
15
BIF.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CE1", "CD1", "CD2", "CE2", "CZ", "C12", "C10", "C11", "C13", "C8", "C9", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HE1", "HD1", "HD2", "HE2", "H10", "H11", "H13", "H8", "H9", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0685, 0.9366, -0.8023, -0.0501, -0.1143, -0.117, -0.156, -0.122, -0.114, -0.029, -0.048, -0.129, -0.118, -0.115, -0.129, -0.122, -0.7103, 0.0887, 0.0707, 0.1157, 0.14, 0.131, 0.145, 0.143, 0.135, 0.133, 0.136, 0.136, 0.135, 0.4248, 0.4838, ...
33
34
0.001
BIF
0
biphenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "C12", "C11", "H11", "C13", "H13", "C10", "H10", "C8", "H8", "C9", "H9", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
30
32
BIF
biphenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "C12", "C11", "H11", "C13", "H13", "C10", "H10", "C8", "H8", "C9", "H9", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
30
32
2
12
12
12
16,428
2
L:BTH3
BTH3
L
O=[C](=O)[C@H](Cc1csc2c1cccc2)[NH3]
BTH3.pdb
L_SMI/BTH3.smi
L_PDB/BTH3.pdb
L_MOL2/BTH3.mol2
L_top/BTH3.top
L_rtp/BTH3.rtp
L_rtp/BTH3.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "BTH" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "SE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "S", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
26
15
11
BTH3.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "SE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "S.2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8336, -0.0685, 0.9366, -0.8023, -0.0342, -0.1172, -0.428, -0.072, -0.0371, -0.093, 0.2441, -0.096, -0.127, -0.115, -0.7123, 0.4268, 0.4258, 0.4828, 0.0907, 0.1167, 0.0717, 0.17, 0.152, 0.14, 0.141, 0.138 ]
26
27
-0
BTH3
0
3-(3-benzothienyl)-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "CD2", "CD1", "HD1", "CE3", "HE3", "CE2", "SE1", "CZ3", "HZ3", "CZ2", "HZ2", "CH2", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CPT", "STHI", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, -0.02, -0.09, 0.15, -0.115, 0.115, 0.07, -0.08, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
23
25
BTH3
3-(3-benzothienyl)-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "CD2", "CD1", "HD1", "CE3", "HE3", "CE2", "SE1", "CZ3", "HZ3", "CZ2", "HZ2", "CH2", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CPT", "STHI", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, -0.02, -0.09, 0.15, -0.115, 0.115, 0.07, -0.08, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
23
25
2
8
8
9
12,321
2
L:BTR
BTR
L
OC(=O)[C@H](Cc1c[nH]c2c1ccc(c2)Br)[NH3]
BTR.pdb
L_SMI/BTR.smi
L_PDB/BTR.pdb
L_MOL2/BTR.mol2
L_top/BTR.top
L_rtp/BTR.rtp
L_rtp/BTR.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "BTR" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "OXT", "CB", "CG", "CD1", "NE1", "CE2", "CD2", "CE3", "CZ3", "CH2", "BR2", "CZ2", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ3", "HZ2", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "O", "O", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "C", "C", "BR", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
27
16
11
BTR.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "OXT", "CB", "CG", "CD1", "NE1", "CE2", "CD2", "CE3", "CZ3", "CH2", "BR2", "CZ2", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ3", "HZ2", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "Br", "C.ar", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8316, -0.0665, 0.9346, -0.8053, -0.7113, -0.0192, -0.1922, -0.077, -0.2344, -0.0333, -0.076, -0.088, -0.126, -0.0079, -0.0821, -0.114, 0.4808, 0.4258, 0.0877, 0.0677, 0.1127, 0.173, 0.3047, 0.15, 0.152, 0.151, 0.4258 ]
27
28
0.001
BTR
-0
6-bromo-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "BR2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "BR", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.11, 0.51, -0.51 ]
24
26
BTR
6-bromo-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "BR2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "BR", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.11, 0.51, -0.51 ]
24
26
2
8
8
9
12,321
3
L:BUG
BUG
L
[NH3][C@@H](C(C)(C)C)C(=O)O
BUG.pdb
L_SMI/BUG.smi
L_PDB/BUG.pdb
L_MOL2/BUG.mol2
L_top/BUG.top
L_rtp/BUG.rtp
L_rtp/BUG.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "BUG" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CG3", "OXT", "HA", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3", "HG31", "HG32", "HG33" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
22
9
13
BUG.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CG3", "OXT", "HA", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3", "HG31", "HG32", "HG33" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8336, -0.0605, 0.9326, -0.8083, -0.051, -0.0881, -0.1101, -0.1021, -0.7123, 0.0887, 0.0917, 0.0387, 0.0357, 0.0117, 0.0587, 0.0357, 0.4298, 0.4188, 0.4828, 0.0477, 0.0087, 0.0857 ]
22
21
0.001
BUG
0
Tertleucine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CG3", "HG31", "HG32", "HG33", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
19
19
BUG
Tertleucine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CG3", "HG31", "HG32", "HG33", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
19
19
2
5
5
1
1,369
1
L:CCS
CCS
L
O=[C](=O)CSC[C@@H](C(=O)O)[NH3]
CCS.pdb
L_SMI/CCS.smi
L_PDB/CCS.pdb
L_MOL2/CCS.mol2
L_top/CCS.top
L_rtp/CCS.rtp
L_rtp/CCS.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CCS" ]
[ "N", "CA", "CB", "SG", "CD", "CE", "OZ1", "OZ2", "C", "O", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "S", "C", "C", "O", "O", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
19
11
8
CCS.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "CB", "SG", "CD", "CE", "OZ1", "OZ2", "C", "O", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.3", "S.3", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8586, -0.0375, -0.0133, -0.3452, -0.1293, 0.9216, -0.8773, -0.7643, 0.9206, -0.8233, -0.7663, 0.5058, 0.4468, 0.0847, 0.0717, 0.1127, 0.0567, 0.0807, 0.4118 ]
19
18
-1.002
CCS
-1
carboxymethylated cysteine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "SG", "CD", "HD2", "HD1", "CE", "OZ1", "OZ2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.23, 0.09, 0.09, 0.62, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
16
16
CCS
carboxymethylated cysteine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "SG", "CD", "HD2", "HD1", "CE", "OZ1", "OZ2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.23, 0.09, 0.09, 0.62, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
16
16
3
4
4
81
110,889
8
L:CHG
CHG
L
[NH3][C@H](C(=O)O)C1CCCCC1
CHG.mol2
L_SMI/CHG.smi
L_PDB/CHG.pdb
L_MOL2/CHG.mol2
L_top/CHG.top
L_rtp/CHG.rtp
L_rtp/CHG.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CHG" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HD11", "HD12", "HD21", "HD22", "HE1", "HE2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
26
11
15
CHG.mol2
SMALL
AMBER ff99SB
[ "CA", "C", "CB", "O", "OXT", "N", "CG1", "CD1", "CE", "CD2", "CG2", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HD11", "HD12", "HE1", "HE2", "HD21", "HD22", "HG21", "HG22", "H1", "H2", "H3" ]
[ "C.3", "C.2", "C.3", "O.co2", "O.co2", "N.4", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.0695, 0.9326, -0.0657, -0.8043, -0.7133, -0.8326, -0.0864, -0.0724, -0.0794, -0.0784, -0.0754, 0.0897, 0.0717, 0.0047, 0.0427, 0.0397, 0.0437, 0.0407, 0.0437, 0.0447, 0.0497, 0.0437, 0.0977, 0.4178, 0.4818, 0.4318 ]
26
26
-0.001
CHG
0
Cyclohexylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "HG12", "CG2", "HG21", "HG22", "CD1", "HD11", "HD12", "CD2", "HD21", "HD22", "CE", "HE1", "HE2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
23
24
CHG
Cyclohexylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "HG12", "CG2", "HG21", "HG22", "CD1", "HD11", "HD12", "CD2", "HD21", "HD22", "CE", "HE1", "HE2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
23
24
2
8
8
3
4,107
7
L:CHP
CHP
L
OC(=O)[C@H](c1ccc(c(c1)Cl)O)[NH3]
CHP.pdb
L_SMI/CHP.smi
L_PDB/CHP.pdb
L_MOL2/CHP.mol2
L_top/CHP.top
L_rtp/CHP.rtp
L_rtp/CHP.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CHP" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "OXT", "CB", "CG1", "CD1", "CLD", "CE", "OE", "CD2", "CG2", "H3", "H2", "HA", "HG1", "HE", "HD2", "HG2", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "O", "O", "C", "C", "C", "CL", "C", "O", "C", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
21
13
8
CHP.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "OXT", "CB", "CG1", "CD1", "CLD", "CE", "OE", "CD2", "CG2", "H3", "H2", "HA", "HG1", "HE", "HD2", "HG2", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "Cl", "C.ar", "O.3", "C.ar", "C.ar", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0162, 0.9386, -0.8093, -0.6933, -0.1553, -0.051, -0.0786, -0.0794, 0.1571, -0.4861, -0.16, -0.078, 0.4818, 0.4198, 0.0957, 0.189, 0.436, 0.16, 0.137, 0.4298 ]
21
21
0.002
CHP
0
3-chloro-4-hydroxyphenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CD2", "HD2", "CD1", "CLD", "CE", "OE", "HE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
18
19
CHP
3-chloro-4-hydroxyphenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CD2", "HD2", "CD1", "CLD", "CE", "OE", "HE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
18
19
2
6
6
2
2,738
9
L:CIR
CIR
L
OC(=O)[C@H](CCC[NH]=[C](=O)=[NH2])[NH3]
CIR.pdb
L_SMI/CIR.smi
L_PDB/CIR.pdb
L_MOL2/CIR.mol2
L_top/CIR.top
L_rtp/CIR.rtp
L_rtp/CIR.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CIR" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "NE", "CZ", "NH", "OH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "C", "N", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
25
12
13
CIR.pdb
SMALL
NO_CHARGES
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "NE", "CZ", "NH", "OH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "N.pl3", "C.2", "N.pl3", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
25
24
0
CIR
0
Citrulline
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "NE", "HE", "CZ", "OH", "NH", "HH1", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH1", "H", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.12, 0.09, 0.09, -0.73, 0.37, 0.63, -0.57, -0.62, 0.3, 0.32, 0.51, -0.51 ]
22
22
CIR
Citrulline
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "NE", "HE", "CZ", "OH", "NH", "HH1", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH1", "H", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.12, 0.09, 0.09, -0.73, 0.37, 0.63, -0.57, -0.62, 0.3, 0.32, 0.51, -0.51 ]
22
22
5
7
7
81
110,889
9
L:CNP2
CNP2
L
N#Cc1ccccc1C[C@@H](C(=O)O)[NH3]
CNP2.pdb
L_SMI/CNP2.smi
L_PDB/CNP2.pdb
L_MOL2/CNP2.mol2
L_top/CNP2.top
L_rtp/CNP2.rtp
L_rtp/CNP2.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CNP" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "NJ", "CH", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "N", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
24
14
10
CNP2.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "NJ", "CH", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "N.1", "C.1", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8366, -0.0745, 0.9386, -0.8003, -0.0571, -0.0723, -0.009, -0.162, -0.087, -0.104, -0.132, -0.7003, -0.3308, 0.2148, 0.4238, 0.4238, 0.4868, 0.0957, 0.1237, 0.0777, 0.141, 0.152, 0.144, 0.147 ]
24
24
0.003
CNP2
-0
2-cyano-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CH", "NJ", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CN", "NC", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.07, 0.48, -0.55, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
21
22
CNP2
2-cyano-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CH", "NJ", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CN", "NC", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.07, 0.48, -0.55, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
21
22
2
7
7
12
16,428
9
L:CP24
CP24
L
OC(=O)[C@H](Cc1ccc(cc1Cl)Cl)[NH3]
CP24.pdb
L_SMI/CP24.smi
L_PDB/CP24.pdb
L_MOL2/CP24.mol2
L_top/CP24.top
L_rtp/CP24.rtp
L_rtp/CP24.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CP2" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CLZ", "OXT", "CLD", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "CL", "O", "CL", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
14
9
CP24.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CLZ", "OXT", "CLD", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "Cl", "O.co2", "Cl", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0735, 0.9376, -0.8013, -0.0511, -0.1063, 0.0234, -0.14, -0.118, -0.121, 0.0234, -0.0704, -0.7043, -0.0614, 0.4238, 0.4248, 0.4848, 0.0967, 0.1257, 0.0757, 0.143, 0.168, 0.156 ]
23
23
0
CP24
-0
2,4-chloro-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CLD", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CLZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.51, -0.51 ]
20
21
CP24
2,4-chloro-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CLD", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "CLZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.51, -0.51 ]
20
21
2
6
6
12
16,428
7
L:CP34
CP34
L
OC(=O)[C@H](Cc1ccc(c(c1)Cl)Cl)[NH3]
CP34.pdb
L_SMI/CP34.smi
L_PDB/CP34.pdb
L_MOL2/CP34.mol2
L_top/CP34.top
L_rtp/CP34.rtp
L_rtp/CP34.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CP3" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CLZ", "OXT", "CLE", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "CL", "O", "CL", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
14
9
CP34.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CLZ", "OXT", "CLE", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "Cl", "O.co2", "Cl", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0735, 0.9386, -0.7983, -0.0521, -0.1023, -0.113, -0.149, 0.0214, -0.113, 0.0154, -0.0564, -0.7073, -0.0544, 0.4238, 0.4268, 0.4848, 0.0917, 0.1207, 0.0737, 0.164, 0.14, 0.156 ]
23
23
0.002
CP34
-0
3,4-chloro-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "CLE", "CE2", "HE2", "CZ", "CLZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.51, -0.51 ]
20
21
CP34
3,4-chloro-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "CLE", "CE2", "HE2", "CZ", "CLZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.51, -0.51 ]
20
21
2
6
6
12
16,428
8
L:CPA3
CPA3
L
[NH3][C@H]([C](=O)=O)CC1CCCC1
CPA3.pdb
L_SMI/CPA3.smi
L_PDB/CPA3.pdb
L_MOL2/CPA3.mol2
L_top/CPA3.top
L_rtp/CPA3.rtp
L_rtp/CPA3.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CPA" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD11", "HD12", "HD21", "HD22", "HE11", "HE12", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
26
11
15
CPA3.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD11", "HD12", "HD21", "HD22", "HE11", "HE12", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8376, -0.0715, 0.9356, -0.8043, -0.0904, -0.0747, -0.0804, -0.0764, -0.0784, -0.0794, -0.7103, 0.0907, 0.1187, 0.0537, 0.0137, 0.0607, 0.0297, 0.0547, 0.0397, 0.0397, 0.0497, 0.0397, 0.0487, 0.4228, 0.4878, 0.4178 ]
26
26
0
CPA3
0
3-Cyclopentyl-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "CD2", "HD21", "HD22", "CE1", "HE11", "HE12", "CE2", "HE21", "HE22", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
23
24
CPA3
3-Cyclopentyl-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "CD2", "HD21", "HD22", "CE1", "HE11", "HE12", "CE2", "HE21", "HE22", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
23
24
2
8
8
9
12,321
7
L:CPG2
CPG2
L
O=[C](=O)[C@H](c1ccccc1Cl)[NH3]
CPG2.pdb
L_SMI/CPG2.smi
L_PDB/CPG2.pdb
L_MOL2/CPG2.mol2
L_top/CPG2.top
L_rtp/CPG2.rtp
L_rtp/CPG2.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CPG" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "CLG", "OXT", "HA", "HG1", "HD1", "HD2", "HE", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "CL", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
20
12
8
CPG2.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "CLG", "OXT", "HA", "HG1", "HD1", "HD2", "HE", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "Cl", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8366, -0.0142, 0.9356, -0.7983, -0.1053, -0.062, 0.0024, -0.128, -0.126, -0.106, -0.1294, -0.7063, 0.1047, 0.188, 0.148, 0.151, 0.143, 0.4288, 0.4238, 0.4868 ]
20
20
-0
CPG2
-0
2-Chlorophenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "CLG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "HE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
17
18
CPG2
2-Chlorophenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "CLG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "HE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
17
18
2
6
6
2
2,738
2
L:CPG4
CPG4
L
[NH3][C@@H](c1ccc(cc1)Cl)C(=O)O
CPG4.pdb
L_SMI/CPG4.smi
L_PDB/CPG4.pdb
L_MOL2/CPG4.mol2
L_top/CPG4.top
L_rtp/CPG4.rtp
L_rtp/CPG4.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CPG" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "OXT", "CLE", "HA", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "CL", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
20
12
8
CPG4.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "OXT", "CLE", "HA", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "Cl", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8346, -0.0222, 0.9386, -0.8103, -0.1243, -0.086, -0.106, -0.129, -0.133, 0.0344, -0.6933, -0.0834, 0.0957, 0.178, 0.135, 0.156, 0.151, 0.4198, 0.4298, 0.4818 ]
20
20
-0.002
CPG4
0
4-Chlorophenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "CLE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.51, -0.51 ]
17
18
CPG4
4-Chlorophenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "CLE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, 0.51, -0.51 ]
17
18
2
6
6
1
1,369
4
L:CPH2
CPH2
L
OC(=O)[C@H](Cc1ccccc1Cl)[NH3]
CPH2.pdb
L_SMI/CPH2.smi
L_PDB/CPH2.pdb
L_MOL2/CPH2.mol2
L_top/CPH2.top
L_rtp/CPH2.rtp
L_rtp/CPH2.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CPH" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CLD", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "CL", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
13
10
CPH2.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CLD", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "Cl", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8366, -0.0705, 0.9366, -0.8033, -0.0511, -0.1063, 0.0164, -0.149, -0.12, -0.125, -0.119, -0.7063, -0.0714, 0.4248, 0.4238, 0.4838, 0.0967, 0.1237, 0.0747, 0.138, 0.154, 0.142, 0.144 ]
23
23
-0
CPH2
-0
2-chloro-Phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CLD", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
20
21
CPH2
2-chloro-Phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CLD", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
20
21
2
7
7
12
16,428
6
L:CSA
CSA
L
CC(=O)CSC[C@@H](C(=O)O)[NH3]
CSA.pdb
L_SMI/CSA.smi
L_PDB/CSA.pdb
L_MOL2/CSA.mol2
L_top/CSA.top
L_rtp/CSA.rtp
L_rtp/CSA.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CSA" ]
[ "N", "CA", "CB", "C", "SG", "CD", "CE", "OE", "CZ", "O", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "C", "S", "C", "C", "O", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
22
11
11
CSA.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "CB", "C", "SG", "CD", "CE", "OE", "CZ", "O", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.3", "C.2", "S.3", "C.3", "C.2", "O.2", "C.3", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8266, -0.0775, -0.0153, 0.9386, -0.3002, -0.1413, 0.5941, -0.5741, -0.2031, -0.7943, -0.7143, 0.4748, 0.4528, 0.0967, 0.1277, 0.0887, 0.1107, 0.1067, 0.0797, 0.0697, 0.0767, 0.4308 ]
22
21
0.001
CSA
0
s-acetonylcysteine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "SG", "CD", "HD2", "HD1", "CE", "OE", "CZ", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, 0.55, -0.55, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
19
19
CSA
s-acetonylcysteine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "SG", "CD", "HD2", "HD1", "CE", "OE", "CZ", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, 0.55, -0.55, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
19
19
3
5
5
81
110,889
3
L:CSE
CSE
L
[NH3][C@H]([C](=O)=O)C[SeH]
CSE.pdb
L_SMI/CSE.smi
L_PDB/CSE.pdb
L_MOL2/CSE.mol2
null
null
null
true
true
true
false
false
false
true
true
true
true
[ ".mol2", ".pdb", ".png", ".smi", ".zip" ]
[ "CSE" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "SE", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HE", "H2", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "SE", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
14
7
7
CSE.pdb
SMALL
NO_CHARGES
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "SE", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HE", "H2", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "Se", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
14
13
0
null
null
null
[]
[]
[]
0
0
null
null
[]
[]
[]
0
0
0
0
null
3
4,107
1
L:CTH
CTH
L
ClC[C@H]([C@@H](C(=O)O)[NH3])O
CTH.pdb
L_SMI/CTH.smi
L_PDB/CTH.pdb
L_MOL2/CTH.mol2
L_top/CTH.top
L_rtp/CTH.rtp
L_rtp/CTH.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "CTH" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "OXT", "CB", "CG2", "CL2", "OG1", "H3", "H2", "HA", "HB", "HG21", "HG22", "HG1", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "O", "O", "C", "C", "CL", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
17
9
8
CTH.pdb
SMALL
NO_CHARGES
[ "N", "CA", "C", "O", "OXT", "CB", "CG2", "CL2", "OG1", "H3", "H2", "HA", "HB", "HG21", "HG22", "HG1", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "C.3", "C.3", "Cl", "O.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
17
16
0
CTH
0
4-chlorothreonine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "HG1", "CG2", "HG21", "HG22", "CL2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT2", "HA", "HA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0.11, 0.09, 0.09, -0.29, 0.51, -0.51 ]
14
14
CTH
4-chlorothreonine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "HG1", "CG2", "HG21", "HG22", "CL2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT2", "HA", "HA", "CLAL", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0.11, 0.09, 0.09, -0.29, 0.51, -0.51 ]
14
14
2
5
5
9
12,321
7
L:CYS
CYS
L
[NH3][C@@H](CS)C(=O)O
CYS.pdb
L_SMI/CYS.smi
L_PDB/CYS.pdb
L_MOL2/CYS.mol2
null
null
null
true
true
true
false
false
false
true
true
true
true
[ ".mol2", ".pdb", ".png", ".smi", ".zip" ]
[ "CYS" ]
[ "N", "CA", "O", "CB", "SG", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "H1", "H2" ]
[ "N", "C", "O", "C", "S", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
14
7
7
CYS.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "O", "CB", "SG", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "H1", "H2" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "S.3", "C.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.3876, 0.0294, -0.2482, -0.0122, -0.1794, 0.3428, -0.2482, -0.0888, 0.0206, 0.0363, 0.0363, 0.1016, -0.0888, -0.0888 ]
14
13
0.0002
null
null
null
[]
[]
[]
0
0
null
null
[]
[]
[]
0
0
0
0
null
3
4,107
8
L:D4P
D4P
L
OC(=O)[C@H](c1ccc(cc1)O)[NH3]
D4P.pdb
L_SMI/D4P.smi
L_PDB/D4P.pdb
L_MOL2/D4P.mol2
L_top/D4P.top
L_rtp/D4P.rtp
L_rtp/D4P.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "D4P" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "OXT", "OE", "HA", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "H1", "H2", "H3", "HE" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
21
12
9
D4P.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "OXT", "OE", "HA", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "H1", "H2", "H3", "HE" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "O.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8366, -0.0112, 0.9376, -0.8123, -0.1643, -0.062, -0.072, -0.161, -0.224, 0.1461, -0.6973, -0.4911, 0.0927, 0.176, 0.131, 0.16, 0.138, 0.4188, 0.4278, 0.4808, 0.423 ]
21
21
0
D4P
0
4-Hydroxy-phenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "OE", "HE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
18
19
D4P
4-Hydroxy-phenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "OE", "HE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
18
19
2
7
7
1
1,369
7
L:DAB
DAB
L
[NH3]CC[C@@H]([C](=O)=O)[NH3]
DAB.pdb
L_SMI/DAB.smi
L_PDB/DAB.pdb
L_MOL2/DAB.mol2
L_top/DAB.top
L_rtp/DAB.rtp
L_rtp/DAB.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "DAB" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "ND", "OXT", "HA", "HB2", "HB3", "HG2", "HG3", "HD1", "HD2", "HD3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
19
8
11
DAB.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "ND", "OXT", "HA", "HB2", "HB3", "HG2", "HG3", "HD1", "HD2", "HD3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "N.4", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.6696, -0.6315, 1.0436, -0.4913, 0.0516, 0.0688, -0.8376, -0.5273, 0.1227, 0.0327, 0.0577, 0.0867, 0.1087, 0.4498, 0.4498, 0.4588, 0.4448, 0.3678, 0.4128 ]
19
18
0.999
DAB
1
Diaminobutyric acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "ND", "HD1", "HD2", "HD3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]
16
16
DAB
Diaminobutyric acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "ND", "HD1", "HD2", "HD3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]
16
16
2
5
5
9
12,321
4
L:DAH
DAH
L
OC(=O)[C@H](Cc1ccc(c(c1)O)O)[NH3]
DAH.pdb
L_SMI/DAH.smi
L_PDB/DAH.pdb
L_MOL2/DAH.mol2
L_top/DAH.top
L_rtp/DAH.rtp
L_rtp/DAH.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "DAH" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD2", "CD1", "CE2", "CE1", "OE1", "CZ", "OZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB2", "HB3", "HD2", "HD1", "HE1", "HE2", "HZ" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
25
14
11
DAH.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD2", "CD1", "CE2", "CE1", "OE1", "CZ", "OZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HD1", "HE1", "HE2", "HZ" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.ar", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0695, 0.9366, -0.7113, -0.0471, -0.1083, -0.153, -0.182, -0.184, 0.1111, -0.4701, 0.1061, -0.4691, -0.8013, 0.4838, 0.4268, 0.4258, 0.0887, 0.1157, 0.0717, 0.134, 0.149, 0.422, 0.141, 0.419 ]
25
25
0
DAH
-0
3,4-Dihydroxy-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "HE2", "CE1", "OE1", "HE1", "CZ", "OZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
22
23
DAH
3,4-Dihydroxy-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "HE2", "CE1", "OE1", "HE1", "CZ", "OZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
22
23
2
8
8
12
16,428
7
L:DBY
DBY
L
OC(=O)[C@H](Cc1cc(Br)c(c(c1)Br)O)[NH3]
DBY.pdb
L_SMI/DBY.smi
L_PDB/DBY.pdb
L_MOL2/DBY.mol2
L_top/DBY.top
L_rtp/DBY.rtp
L_rtp/DBY.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "DBY" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CE1", "CD2", "CE2", "CZ", "OH", "BR1", "BR2", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HH", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "BR", "BR", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
24
15
9
DBY.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CE1", "CD2", "CE2", "CZ", "OH", "BR1", "BR2", "OXT", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HH", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "Br", "Br", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8346, -0.0755, 0.9386, -0.7973, -0.0461, -0.1493, -0.088, -0.0619, -0.046, -0.1169, 0.1901, -0.4701, -0.0451, -0.0611, -0.7083, 0.4848, 0.4238, 0.0897, 0.0727, 0.1197, 0.149, 0.165, 0.441, 0.4268 ]
24
24
0.001
DBY
0
3,5 dibromotyrosine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "BR1", "CE2", "BR2", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "BR", "CA", "BR", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.11, 0.11, -0.11, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
21
22
DBY
3,5 dibromotyrosine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "BR1", "CE2", "BR2", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "BR", "CA", "BR", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.11, 0.11, -0.11, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]
21
22
2
6
6
6
8,214
4
L:DILE
DILE
L
CCC([C@@H](C(=O)O)[NH3])CC
DILE.pdb
L_SMI/DILE.smi
L_PDB/DILE.pdb
L_MOL2/DILE.mol2
L_top/DILE.top
L_rtp/DILE.rtp
L_rtp/DILE.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "DIL" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "OXT", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CB", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HG11", "HG12", "HD13", "HG21", "HD21", "HG22", "HD11", "HD12", "HD22", "HD23", "HB" ]
[ "N", "C", "C", "O", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
25
10
15
DILE.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "OXT", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CB", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HG11", "HG12", "HD13", "HG21", "HD21", "HG22", "HD11", "HD12", "HD22", "HD23", "HB" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8296, -0.0745, 0.9326, -0.8053, -0.7133, -0.0874, -0.0854, -0.0911, -0.0921, -0.0627, 0.4178, 0.4798, 0.4338, 0.0907, 0.0077, 0.0367, 0.0477, 0.0437, 0.0327, 0.1017, 0.0437, 0.0337, 0.0427, 0.0207, 0.0737 ]
25
24
-0.002
DILE
0
Diethylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "HG12", "CG2", "HG21", "HG22", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
22
22
DILE
Diethylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "HG12", "CG2", "HG21", "HG22", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
22
22
2
7
7
27
36,963
2
L:DIPH
DIPH
L
[NH3][C@@H]([C@H](c1ccccc1)c1ccccc1)C(=O)O
dipenyl_2.pdb
L_SMI/DIPH.smi
L_PDB/DIPH.pdb
L_MOL2/DIPH.mol2
L_top/DIPH.top
L_rtp/DIPH.rtp
L_rtp/DIPH.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "DIP" ]
[ "N", "CA", "CE2", "CD2", "CG1", "CD1", "CE1", "CZ1", "CZ3", "CE4", "CD4", "CG3", "CD3", "CE3", "CB", "C", "O", "OXT", "HD3", "HD4", "HE4", "HZ3", "HE1", "HD1", "HD2", "HE2", "HE3", "HA", "HN2", "HN1", "HN3", "HZ1", "HB" ]
[ "N", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
33
18
15
dipenyl_2.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "CE2", "CD2", "CG1", "CD1", "CE1", "CZ1", "CZ3", "CE4", "CD4", "CG3", "CD3", "CE3", "CB", "C", "O", "OXT", "HD3", "HD4", "HE4", "HZ3", "HE1", "HD1", "HD2", "HE2", "HE3", "HA", "HN2", "HN1", "HN3", "HZ1", "HB" ]
[ "N.4", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8313, -0.011, -0.1273, -0.1117, -0.0858, -0.1248, -0.1346, -0.1262, -0.1253, -0.1323, -0.1496, -0.1253, -0.1215, -0.1294, 0.0264, 0.3524, -0.5314, -0.4513, 0.1491, 0.143, 0.1396, 0.1392, 0.1301, 0.1303, 0.1748, 0.1358, 0.1404, 0.0905, 0.4351, 0.4762, 0....
33
34
0.0002
DIPH
0
di-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG3", "CG1", "CD3", "HD3", "CD4", "HD4", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE3", "HE3", "CE4", "HE4", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ3", "HZ3", "CZ1", "HZ1", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, 0, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
30
32
DIPH
di-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG3", "CG1", "CD3", "HD3", "CD4", "HD4", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE3", "HE3", "CE4", "HE4", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ3", "HZ3", "CZ1", "HZ1", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, 0, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
30
32
2
13
13
12
16,428
2
L:DMK
DMK
L
O=[C](=O)[C@H](C([C](=O)=O)(C)C)[NH3]
DMK.pdb
L_SMI/DMK.smi
L_PDB/DMK.pdb
L_MOL2/DMK.mol2
L_top/DMK.top
L_rtp/DMK.rtp
L_rtp/DMK.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "DMK" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CG3", "OD1", "OD2", "OXT", "HA", "HG21", "HG22", "HG23", "HG31", "HG32", "HG33", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
21
11
10
DMK.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CG3", "OD1", "OD2", "OXT", "HA", "HG21", "HG22", "HG23", "HG31", "HG32", "HG33", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.2", "C.3", "C.3", "O.co2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8646, -0.0015, 0.9116, -0.8513, -0.164, 0.9046, -0.0861, -0.0661, -0.8863, -0.7673, -0.7683, 0.0767, 0.0187, 0.0517, 0.0337, 0.0337, 0.0387, 0.0497, 0.4958, 0.3978, 0.4438 ]
21
20
-0.999
DMK
-1
3,3-dimethyl aspartic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "OD1", "OD2", "CG3", "HG33", "HG31", "HG32", "CG2", "HG22", "HG23", "HG21", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "CC", "OC", "OC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.1, 0.62, -0.76, -0.76, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
18
18
DMK
3,3-dimethyl aspartic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "OD1", "OD2", "CG3", "HG33", "HG31", "HG32", "CG2", "HG22", "HG23", "HG21", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "CC", "OC", "OC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.1, 0.62, -0.76, -0.76, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
18
18
3
4
4
9
12,321
5
L:DMP3
DMP3
L
CCc1cccc(c1)C[C@@H](C(=O)O)[NH3]
DMP3.pdb
L_SMI/DMP3.smi
L_PDB/DMP3.pdb
L_MOL2/DMP3.mol2
L_top/DMP3.top
L_rtp/DMP3.rtp
L_rtp/DMP3.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "DMP" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CJ", "CH", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HZ", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3", "HJ1", "HJ2", "HJ3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
29
14
15
DMP3.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CJ", "CH", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HZ", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3", "HJ1", "HJ2", "HJ3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "C.3", "C.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
29
29
0
DMP3
-0
Dimethyl-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "CZ", "HZ", "CH", "HH1", "HH2", "CJ", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
26
27
DMP3
Dimethyl-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "CZ", "HZ", "CH", "HH1", "HH2", "CJ", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
26
27
2
9
9
48
65,712
1
L:DPP
DPP
L
[NH3]C[C@@H]([C](=O)=O)[NH3]
DPP.pdb
L_SMI/DPP.smi
L_PDB/DPP.pdb
L_MOL2/DPP.mol2
L_top/DPP.top
L_rtp/DPP.rtp
L_rtp/DPP.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "DPP" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HG3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
16
7
9
DPP.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HG3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "N.4", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.6786, -0.5725, 1.0286, -0.3963, 0.2738, -0.9036, -0.5813, 0.1407, 0.0617, 0.0947, 0.4208, 0.4128, 0.4348, 0.4008, 0.4228, 0.4418 ]
16
15
1.001
DPP
1
2,3-Diaminopropanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "HG2", "HG3", "HG1", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]
13
13
DPP
2,3-Diaminopropanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "HG2", "HG3", "HG1", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]
13
13
2
4
4
3
4,107
3
L:ESC
ESC
L
CCSCC[C@@H](C(=O)O)[NH3]
ESC.pdb
L_SMI/ESC.smi
L_PDB/ESC.pdb
L_MOL2/ESC.mol2
L_top/ESC.top
L_rtp/ESC.rtp
L_rtp/ESC.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "ESC" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CE", "SD", "CZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "S", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
10
13
ESC.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CE", "SD", "CZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "S.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8456, -0.0765, 0.9366, -0.8003, -0.0844, -0.0123, 0.0067, -0.3722, -0.0901, -0.7193, 0.0847, 0.0747, 0.1207, 0.0647, 0.0837, 0.0737, 0.0567, 0.0527, 0.0587, 0.0427, 0.4738, 0.4228, 0.4478 ]
23
22
-0
ESC
0
2-amino-4-ethyl sulfanyl butyric acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "CE", "HE2", "HE1", "CZ", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
20
20
ESC
2-amino-4-ethyl sulfanyl butyric acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "CE", "HE2", "HE1", "CZ", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
20
20
2
6
6
81
110,889
2
L:F2F
F2F
L
OC(=O)[C@H](Cc1ccc(c(c1)F)F)[NH3]
F2F.pdb
L_SMI/F2F.smi
L_PDB/F2F.pdb
L_MOL2/F2F.mol2
L_top/F2F.top
L_rtp/F2F.rtp
L_rtp/F2F.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "F2F" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FZ", "FE1", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "F", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
14
9
F2F.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FZ", "FE1", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "F", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0745, 0.9386, -0.7973, -0.0521, -0.0993, -0.14, -0.146, 0.1029, -0.139, 0.0959, -0.7063, -0.1189, -0.1179, 0.4238, 0.4268, 0.4858, 0.0917, 0.1217, 0.0737, 0.167, 0.141, 0.159 ]
23
23
0.001
F2F
-0
3,4-Difluoro-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "FE1", "CE2", "HE2", "CZ", "FZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "CA", "HP", "CA", "F1", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, 0.51, -0.51 ]
20
21
F2F
3,4-Difluoro-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "FE1", "CE2", "HE2", "CZ", "FZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "CA", "HP", "CA", "F1", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, 0.51, -0.51 ]
20
21
2
6
6
12
16,428
7
L:FCL
FCL
L
OC(=O)[C@H](Cc1cccc(c1)Cl)[NH3]
FCL.pdb
L_SMI/FCL.smi
L_PDB/FCL.pdb
L_MOL2/FCL.mol2
L_top/FCL.top
L_rtp/FCL.rtp
L_rtp/FCL.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "FCL" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CLE", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HZ" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "CL", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
13
10
FCL.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "CLE", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HZ" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "Cl", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0715, 0.9376, -0.8003, -0.0521, -0.1033, -0.12, -0.157, 0.0214, -0.116, -0.123, -0.7083, -0.0794, 0.4248, 0.4258, 0.4848, 0.0907, 0.1187, 0.0727, 0.159, 0.135, 0.142, 0.153 ]
23
23
-0.001
FCL
-0
3-chloro-Phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "CLE", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
20
21
FCL
3-chloro-Phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "CLE", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
20
21
2
7
7
12
16,428
6
L:FGL
FGL
L
[NH3]C([C](=O)=O)[C](=O)=O
FGL.pdb
L_SMI/FGL.smi
L_PDB/FGL.pdb
L_MOL2/FGL.mol2
L_top/FGL.top
L_rtp/FGL.rtp
L_rtp/FGL.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "FGL" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OG1", "OG2", "OXT", "HA", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H" ]
12
8
4
FGL.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OG1", "OG2", "OXT", "HA", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.2", "O.co2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8476, -0.1565, 0.9296, -0.8723, 0.9296, -0.8743, -0.7413, -0.7433, 0.0717, 0.4598, 0.4608, 0.3848 ]
12
11
-0.999
FGL
-1
2-aminopropanedioic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "OG1", "OG2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.52, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
9
9
FGL
2-aminopropanedioic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "OG1", "OG2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.52, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]
9
9
2
2
2
3
4,107
2
L:FLA
FLA
L
[NH3][C@@H](C(F)(F)F)C(=O)O
FLA.pdb
L_SMI/FLA.smi
L_PDB/FLA.pdb
L_MOL2/FLA.mol2
L_top/FLA.top
L_rtp/FLA.rtp
L_rtp/FLA.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "FLA" ]
[ "N", "CA", "O", "CB", "C", "OXT", "FG1", "FG2", "FG3", "HA", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "O", "C", "C", "O", "F", "F", "F", "H", "H", "H", "H" ]
13
9
4
FLA.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "O", "CB", "C", "OXT", "FG1", "FG2", "FG3", "HA", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.2", "O.co2", "F", "F", "F", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8196, -0.1705, -0.6583, 0.6459, 0.9656, -0.7723, -0.1813, -0.2313, -0.2693, 0.1247, 0.4258, 0.4438, 0.4988 ]
13
12
0.002
FLA
-0
Trifluoro-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "FG1", "FG2", "FG3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "F3", "F3", "F3", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 1.02, -0.34, -0.34, -0.34, 0.51, -0.51 ]
10
10
FLA
Trifluoro-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "FG1", "FG2", "FG3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "F3", "F3", "F3", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 1.02, -0.34, -0.34, -0.34, 0.51, -0.51 ]
10
10
2
2
2
1
1,369
5
L:FPG2
FPG2
L
OC(=O)[C@H](c1ccccc1F)[NH3]
FPG2.pdb
L_SMI/FPG2.smi
L_PDB/FPG2.pdb
L_MOL2/FPG2.mol2
L_top/FPG2.top
L_rtp/FPG2.rtp
L_rtp/FPG2.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "FPG" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "OXT", "FG2", "HA", "HG1", "HD1", "HE", "H1", "H2", "H3", "HD2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
20
12
8
FPG2.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "OXT", "FG2", "HA", "HG1", "HD1", "HE", "H1", "H2", "H3", "HD2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8346, -0.0132, 0.9346, -0.7993, -0.1383, -0.05, 0.0939, -0.14, -0.161, -0.093, -0.7083, -0.1659, 0.1027, 0.188, 0.149, 0.143, 0.4278, 0.4308, 0.4838, 0.151 ]
20
20
0.001
FPG2
-0
2-Fluoro-phenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "FG2", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "HE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "F1", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
17
18
FPG2
2-Fluoro-phenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "FG2", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "HE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "F1", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
17
18
2
6
6
2
2,738
7
L:FPG4
FPG4
L
[NH3][C@@H](c1ccc(cc1)F)C(=O)O
FPG4.pdb
L_SMI/FPG4.smi
L_PDB/FPG4.pdb
L_MOL2/FPG4.mol2
L_top/FPG4.top
L_rtp/FPG4.rtp
L_rtp/FPG4.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "FPG" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "OXT", "FE", "HA", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
20
12
8
FPG4.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE", "OXT", "FE", "HA", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8346, -0.0192, 0.9386, -0.8103, -0.1413, -0.069, -0.089, -0.17, -0.175, 0.1479, -0.6933, -0.1339, 0.0957, 0.179, 0.135, 0.158, 0.153, 0.4198, 0.4298, 0.4818 ]
20
20
0.003
FPG4
0
4-Fluoro-phenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "FE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, 0.51, -0.51 ]
17
18
FPG4
4-Fluoro-phenylglycine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG1", "CG2", "HG2", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE", "FE", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, 0.51, -0.51 ]
17
18
2
6
6
1
1,369
6
L:FPH2
FPH2
L
OC(=O)[C@H](Cc1ccccc1F)[NH3]
FPH2.pdb
L_SMI/FPH2.smi
L_PDB/FPH2.pdb
L_MOL2/FPH2.mol2
L_top/FPH2.top
L_rtp/FPH2.rtp
L_rtp/FPH2.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "FPH" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FD1", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
13
10
FPH2.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FD1", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8366, -0.0715, 0.9366, -0.8033, -0.0471, -0.1513, 0.1309, -0.128, -0.161, -0.141, -0.102, -0.7053, -0.1299, 0.4238, 0.4238, 0.4848, 0.0967, 0.1217, 0.0747, 0.139, 0.156, 0.143, 0.145 ]
23
23
-0.001
FPH2
-0
2-Fluoro-Phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "FD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "F1", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
20
21
FPH2
2-Fluoro-Phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "FD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "F1", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
20
21
2
7
7
12
16,428
9
L:FPH3
FPH3
L
OC(=O)[C@H](Cc1cccc(c1)F)[NH3]
FPH3.pdb
L_SMI/FPH3.smi
L_PDB/FPH3.pdb
L_MOL2/FPH3.mol2
L_top/FPH3.top
L_rtp/FPH3.rtp
L_rtp/FPH3.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "FPH" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FE1", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HZ" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
13
10
FPH3.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FE1", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HZ" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0725, 0.9376, -0.8003, -0.0531, -0.0853, -0.162, -0.174, 0.1359, -0.099, -0.165, -0.7083, -0.1329, 0.4248, 0.4258, 0.4838, 0.0907, 0.1197, 0.0727, 0.161, 0.135, 0.143, 0.155 ]
23
23
-0.003
FPH3
-0
3-Fluoro-Phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "FE1", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
20
21
FPH3
3-Fluoro-Phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "FE1", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
20
21
2
7
7
12
16,428
4
L:FT6
FT6
L
OC(=O)[C@H](Cc1c[nH]c2c1ccc(c2)F)[NH3]
FT6.pdb
L_SMI/FT6.smi
L_PDB/FT6.pdb
L_MOL2/FT6.mol2
L_top/FT6.top
L_rtp/FT6.rtp
L_rtp/FT6.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "FT6" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "FAP", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "O", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
27
16
11
FT6.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "OXT", "CB", "CG", "CD2", "CD1", "NE1", "CE2", "CZ2", "CH2", "FAP", "CZ3", "CE3", "O", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HZ2", "HZ3", "HE3", "HE1", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "F", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8356, -0.0705, 0.9376, -0.7303, 0.0118, -0.2002, -0.082, 0.1032, -0.2344, -0.0133, -0.177, 0.1319, -0.1449, -0.184, -0.076, -0.7993, 0.0967, 0.0277, 0.0827, 0.0968, 0.15, 0.145, 0.127, 0.3057, 0.4188, 0.4838, 0.4278 ]
27
28
-0.001
FT6
0
6-fluoro-l-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "FAP", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, 0.51, -0.51 ]
24
26
FT6
6-fluoro-l-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "FAP", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, 0.51, -0.51 ]
24
26
2
8
8
9
12,321
5
L:FVAL
FVAL
L
[NH3][C@@H](C(F)(C)C)C(=O)O
FVAL.pdb
L_SMI/FVAL.smi
L_PDB/FVAL.pdb
L_MOL2/FVAL.mol2
L_top/FVAL.top
L_rtp/FVAL.rtp
L_rtp/FVAL.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "FVA" ]
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG1", "CG2", "C", "OXT", "FG3", "H3", "HA", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2" ]
[ "N", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
19
9
10
FVAL.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG1", "CG2", "C", "OXT", "FG3", "H3", "HA", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.2", "O.co2", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8336, -0.1025, -0.7883, 0.1853, -0.1091, -0.1361, 0.9426, -0.7103, -0.2443, 0.4918, 0.0967, 0.0777, 0.0427, 0.0887, 0.0197, 0.0667, 0.0607, 0.4238, 0.4288 ]
19
18
0.001
FVAL
0
3-Fluoro-valine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "FG3", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "F1", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.34, -0.34, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
16
16
FVAL
3-Fluoro-valine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "FG3", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "F1", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.34, -0.34, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
16
16
2
4
4
3
4,107
1
L:GBUT
GBUT
L
O=[C](=O)[C@H](CC[NH]=[C](=[NH2])=[NH2])[NH3]
GBUT.pdb
L_SMI/GBUT.smi
L_PDB/GBUT.pdb
L_MOL2/GBUT.mol2
L_top/GBUT.top
L_rtp/GBUT.rtp
L_rtp/GBUT.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "GBU" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "ND", "CE", "NZ1", "NZ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "HZ11", "HZ12", "HZ21", "HZ22", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "N", "C", "N", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
24
11
13
GBUT.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "ND", "CE", "NZ1", "NZ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "HZ11", "HZ12", "HZ21", "HZ22", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "N.pl3", "C.cat", "N.pl3", "N.pl3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8256, -0.0415, 0.9006, -0.7623, -0.1164, 0.0163, -0.3791, 0.5611, -0.4831, -0.4721, -0.8083, 0.1187, 0.0787, 0.0707, 0.0927, 0.0867, 0.2957, 0.3217, 0.3167, 0.3047, 0.3417, 0.4588, 0.4398, 0.4818 ]
24
23
0.998
GBUT
1
Guanidinobutryric
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "ND", "HD", "CE", "NZ2", "HZ22", "HZ21", "NZ1", "HZ12", "HZ11", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]
21
21
GBUT
Guanidinobutryric
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "ND", "HD", "CE", "NZ2", "HZ22", "HZ21", "NZ1", "HZ12", "HZ11", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]
21
21
3
7
7
27
36,963
5
L:GDPR
GDPR
L
[NH3][C@H]([C](=O)=O)C[NH]=[C](=[NH2])=[NH2]
GDPR.pdb
L_SMI/GDPR.smi
L_PDB/GDPR.pdb
L_MOL2/GDPR.mol2
L_top/GDPR.top
L_rtp/GDPR.rtp
L_rtp/GDPR.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "GDP" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "CD", "NE1", "NE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HE11", "HE12", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "N", "C", "N", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
21
10
11
GDPR.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "CD", "NE1", "NE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HE11", "HE12", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "N.pl3", "C.cat", "N.pl3", "N.pl3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.6816, -0.6065, 1.0346, -0.4743, 0.1463, -0.4141, 0.5281, -0.5271, -0.5421, -0.5223, 0.1317, 0.0367, 0.0747, 0.2967, 0.3227, 0.3167, 0.3167, 0.3157, 0.3828, 0.4458, 0.4168 ]
21
20
0.998
GDPR
1
2-Amino-3-guanidinopropionic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "HG", "CD", "NE1", "HE11", "HE12", "NE2", "HE22", "HE21", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]
18
18
GDPR
2-Amino-3-guanidinopropionic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "HG", "CD", "NE1", "HE11", "HE12", "NE2", "HE22", "HE21", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]
18
18
3
6
6
9
12,321
3
L:GGB
GGB
L
[NH3][C@H]([C](=O)=O)CCON=C(N)N
GGB.pdb
L_SMI/GGB.smi
L_PDB/GGB.pdb
L_MOL2/GGB.mol2
L_top/GGB.top
L_rtp/GGB.rtp
L_rtp/GGB.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "GGB" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OD", "NE", "CZ", "NH1", "NH2", "OXT", "HH12", "HH21", "HH22", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HH11", "HA", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "N", "C", "N", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
24
12
12
GGB.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OD", "NE", "CZ", "NH1", "NH2", "OXT", "HH12", "HH21", "HH22", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HH11", "HA", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.3", "N.pl3", "C.cat", "N.pl3", "N.pl3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8266, -0.0595, 0.9326, -0.8053, -0.1054, 0.1004, -0.2143, -0.6362, 0.5681, -0.5201, -0.4831, -0.7253, 0.2607, 0.2517, 0.2607, 0.0657, 0.1187, 0.0527, 0.0597, 0.2717, 0.0857, 0.4438, 0.4748, 0.4288 ]
24
23
0
GGB
0
Canavanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "OD", "NE", "CZ", "NH2", "HH21", "HH22", "NH1", "HH12", "HH11", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "OCC", "N=C", "CC", "NH2", "H", "H", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.217, -0.513, 0.55, -0.85, 0.4, 0.4, -0.85, 0.4, 0.4, 0.51, -0.51 ]
21
21
GGB
Canavanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "OD", "NE", "CZ", "NH2", "HH21", "HH22", "NH1", "HH12", "HH11", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "OCC", "N=C", "CC", "NH2", "H", "H", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.217, -0.513, 0.55, -0.85, 0.4, 0.4, -0.85, 0.4, 0.4, 0.51, -0.51 ]
21
21
5
6
6
81
110,889
3
L:GHG
GHG
L
NC(=O)[C@H](C[C@@H]([C](=O)=O)[NH3])O
GHG.pdb
L_SMI/GHG.smi
L_PDB/GHG.pdb
L_MOL2/GHG.mol2
L_top/GHG.top
L_rtp/GHG.rtp
L_rtp/GHG.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "GHG" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG1", "CD", "NE2", "OE1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HG1", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "C", "N", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
21
11
10
GHG.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG1", "CD", "NE2", "OE1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HG1", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.3", "C.2", "N.am", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8346, -0.0815, 0.9416, -0.7923, -0.1264, 0.0661, -0.5978, 0.6291, -0.652, -0.6261, -0.7143, 0.0997, 0.0867, 0.1247, 0.0747, 0.423, 0.3185, 0.3215, 0.4308, 0.4888, 0.4198 ]
21
20
-0
GHG
-0
(2s,4s)-2,5-diamino-4-hydroxy-5-oxopentanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "OG1", "HG1", "CD", "OE1", "NE2", "HE21", "HE22", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]
18
18
GHG
(2s,4s)-2,5-diamino-4-hydroxy-5-oxopentanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "OG1", "HG1", "CD", "OE1", "NE2", "HE21", "HE22", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]
18
18
4
6
6
36
49,284
9
L:GLN
GLN
L
[NH3][C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O
GLN.pdb
L_SMI/GLN.smi
L_PDB/GLN.pdb
L_MOL2/GLN.mol2
null
null
null
true
true
true
false
false
false
true
true
true
true
[ ".mol2", ".pdb", ".png", ".smi", ".zip" ]
[ "GLN" ]
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "CD", "NE2", "OE1", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE21", "HE22", "H1", "H2" ]
[ "N", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
20
10
10
GLN.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "CD", "NE2", "OE1", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE21", "HE22", "H1", "H2" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.2", "N.am", "O.2", "C.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.3871, 0.0209, -0.2483, -0.0477, 0.0227, 0.2104, -0.3293, -0.276, 0.342, -0.2483, -0.0889, 0.0198, 0.0259, 0.0259, 0.0358, 0.0358, 0.1449, 0.1449, -0.0889, -0.0889 ]
20
19
-0.0002
null
null
null
[]
[]
[]
0
0
null
null
[]
[]
[]
0
0
0
0
null
36
49,284
5
L:GLU
GLU
L
[NH3][C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O
GLU.pdb
L_SMI/GLU.smi
L_PDB/GLU.pdb
L_MOL2/GLU.mol2
null
null
null
true
true
true
false
false
false
true
true
true
true
[ ".mol2", ".pdb", ".png", ".smi", ".zip" ]
[ "GLU" ]
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "CD", "OE1", "OE2", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "H1", "H2" ]
[ "N", "C", "O", "C", "C", "C", "O", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
18
10
8
GLU.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "CD", "OE1", "OE2", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "H1", "H2" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "C.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.3871, 0.021, -0.2483, -0.0458, 0.0482, 0.356, -0.2464, -0.2464, 0.342, -0.2483, -0.0889, 0.0198, 0.0259, 0.0259, 0.0378, 0.0378, -0.0889, -0.0889 ]
18
17
-0.0004
null
null
null
[]
[]
[]
0
0
null
null
[]
[]
[]
0
0
0
0
null
27
36,963
7
L:GLY
GLY
L
NCC(=O)O
GLY.pdb
L_SMI/GLY.smi
L_PDB/GLY.pdb
L_MOL2/GLY.mol2
null
null
null
true
true
true
false
false
false
true
true
false
false
[ ".mol2", ".pdb", ".png", ".smi" ]
[ "GLY" ]
[ "N", "CA", "O", "C", "OXT", "H", "3HA", "HA" ]
[ "N", "C", "O", "C", "O", "H", "H", "H" ]
8
5
3
GLY.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "O", "C", "OXT", "H", "3HA", "HA" ]
[ "N.3", "C.3", "O.co2", "C.2", "O.co2", "H", "H", "H" ]
[ -0.2453, 0.1121, -0.2449, 0.3709, -0.2449, 0.1412, 0.0554, 0.0554 ]
8
7
-0.0001
null
null
null
[]
[]
[]
0
0
null
null
[]
[]
[]
0
0
0
0
null
0
0
5
L:HCS
HCS
L
[NH3][C@H](C(=O)O)CCS
HCS.pdb
L_SMI/HCS.smi
L_PDB/HCS.pdb
L_MOL2/HCS.mol2
L_top/HCS.top
L_rtp/HCS.rtp
L_rtp/HCS.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HCS" ]
[ "N", "CA", "CB", "CG", "SD", "C", "OXT", "O", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "H1" ]
[ "N", "C", "C", "C", "S", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
17
8
9
HCS.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "CB", "CG", "SD", "C", "OXT", "O", "H3", "H2", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "H1" ]
[ "N.4", "C.3", "C.3", "C.3", "S.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8446, -0.0795, -0.0864, 0.0087, -0.4319, 0.9376, -0.7183, -0.7983, 0.4758, 0.4468, 0.0857, 0.0767, 0.1237, 0.0867, 0.0657, 0.2268, 0.4238 ]
17
16
-0.001
HCS
0
homocysteine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "HD", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "HS", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.11, 0.09, 0.09, -0.23, 0.16, 0.51, -0.51 ]
14
14
HCS
homocysteine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "HD", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "HS", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.11, 0.09, 0.09, -0.23, 0.16, 0.51, -0.51 ]
14
14
2
5
5
9
12,321
6
L:HHK
HHK
L
[NH3]CCCCCC[C@@H](C(=O)O)[NH3]
HHK.pdb
L_SMI/HHK.smi
L_PDB/HHK.pdb
L_MOL2/HHK.mol2
L_top/HHK.top
L_rtp/HHK.rtp
L_rtp/HHK.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HHK" ]
[ "N", "CA", "CB", "CG", "CD", "CE", "CZ", "CH", "NJ", "C", "O", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3", "HJ1", "HJ2", "HJ3" ]
[ "N", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
31
12
19
HHK.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "CB", "CG", "CD", "CE", "CZ", "CH", "NJ", "C", "O", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3", "HJ1", "HJ2", "HJ3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "N.4", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8326, -0.0005, -0.0864, -0.0804, -0.0874, -0.0964, -0.1024, 0.1088, -0.8606, 0.9096, -0.8483, -0.7703, 0.1187, 0.0577, 0.0607, 0.0797, 0.0667, 0.0557, 0.0427, 0.0637, 0.0697, 0.0877, 0.0667, 0.0987, 0.0897, 0.4428, 0.4788, 0.4528, 0.4388, 0.4988, 0.4808...
31
30
1.004
HHK
1
(2s)-2,8-diaminooctanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE2", "HE1", "CZ", "HZ1", "HZ2", "CH", "HH1", "HH2", "NJ", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]
28
28
HHK
(2s)-2,8-diaminooctanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE2", "HE1", "CZ", "HZ1", "HZ2", "CH", "HH1", "HH2", "NJ", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]
28
28
2
9
9
729
998,001
5
L:HIL4
HIL4
L
C[C@H]([C@@H]([C@@H](C(=O)O)[NH3])C)O
HIL4.pdb
L_SMI/HIL4.smi
L_PDB/HIL4.pdb
L_MOL2/HIL4.mol2
L_top/HIL4.top
L_rtp/HIL4.rtp
L_rtp/HIL4.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HIL" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OXT", "CG1", "OD1", "CD2", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HG21", "HG22", "HD11", "HD21", "HG11", "HD22", "HD23", "HG23" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "C", "O", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
10
13
HIL4.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OXT", "CG1", "OD1", "CD2", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HG21", "HG22", "HD11", "HD21", "HG11", "HD22", "HD23", "HG23" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.co2", "C.3", "O.3", "C.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8236, -0.0665, 0.9326, -0.8043, -0.0957, -0.1021, -0.7193, 0.1221, -0.6358, -0.1221, 0.4388, 0.4368, 0.4698, 0.0877, 0.0867, 0.0217, 0.1027, 0.418, 0.0577, 0.0547, 0.0507, 0.0477, 0.0427 ]
23
22
0.001
HIL4
0
4-Hydroxy-L-isoleucine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "CG1", "HG11", "OD1", "HD11", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
20
20
HIL4
4-Hydroxy-L-isoleucine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "CG1", "HG11", "OD1", "HD11", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
20
20
2
7
7
9
12,321
5
L:HIS
HIS
L
[NH3][C@@H](Cc1c[nH]cn1)C(=O)O
HIS.pdb
L_SMI/HIS.smi
L_PDB/HIS.pdb
L_MOL2/HIS.mol2
null
null
null
true
true
true
false
false
false
true
true
true
true
[ ".mol2", ".pdb", ".png", ".smi", ".zip" ]
[ "HIS" ]
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "CD2", "ND1", "CE1", "NE2", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "H1", "H2" ]
[ "N", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "C", "N", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
20
11
9
HIS.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "O", "CB", "CG", "CD2", "ND1", "CE1", "NE2", "C", "OXT", "H3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "H1", "H2" ]
[ "N.4", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "N.ar", "C.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.3873, 0.026, -0.2482, -0.0118, 0.0578, 0.0242, -0.2409, 0.0936, -0.3506, 0.3424, -0.2482, -0.0889, 0.0202, 0.0318, 0.0318, 0.0825, 0.1027, 0.1662, -0.0889, -0.0889 ]
20
20
0.0001
null
null
null
[]
[]
[]
0
0
null
null
[]
[]
[]
0
0
0
0
null
9
12,321
7
L:HL2
HL2
L
CC([C@H]([C@@H](C(=O)O)[NH3])O)C
HL2.pdb
L_SMI/HL2.smi
L_PDB/HL2.pdb
L_MOL2/HL2.mol2
L_top/HL2.top
L_rtp/HL2.rtp
L_rtp/HL2.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HL2" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OH", "OXT", "HA", "HB", "HG", "HD11", "HD12", "HD13", "HD22", "HD23", "HH", "H1", "H2", "H3", "HD21" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
10
13
HL2.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OH", "OXT", "HA", "HB", "HG", "HD11", "HD12", "HD13", "HD22", "HD23", "HH", "H1", "H2", "H3", "HD21" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8276, -0.0695, 0.9326, -0.7983, 0.1481, -0.1147, -0.0871, -0.0931, -0.6578, -0.7173, 0.0947, 0.0637, 0.1277, 0.0357, 0.0237, 0.0467, 0.0487, 0.0177, 0.43, 0.4798, 0.4418, 0.4278, 0.0467 ]
23
22
-0
HL2
0
(2s,3r)-2-amino-3-hydroxy-4-methylpentanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OH", "HH", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
20
20
HL2
(2s,3r)-2-amino-3-hydroxy-4-methylpentanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OH", "HH", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
20
20
2
7
7
9
12,321
2
L:HLEU
HLEU
L
[NH3][C@H]([C](=O)=O)CCC(C)C
HLEU.pdb
L_SMI/HLEU.smi
L_PDB/HLEU.pdb
L_MOL2/HLEU.mol2
L_top/HLEU.top
L_rtp/HLEU.rtp
L_rtp/HLEU.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HLE" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE1", "CE2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "HE11", "HE21", "HE12", "HE22", "HE13", "HE23" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
25
10
15
HLEU.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE1", "CE2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "HE11", "HE21", "HE12", "HE22", "HE13", "HE23" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8376, -0.0715, 0.9356, -0.8043, -0.0974, -0.0844, -0.0647, -0.0931, -0.0921, -0.7093, 0.4178, 0.4878, 0.4238, 0.0887, 0.1187, 0.0537, 0.0077, 0.0487, 0.0497, 0.0467, 0.0267, 0.0387, 0.0347, 0.0357, 0.0417 ]
25
24
0.002
HLEU
0
Homoleucine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD", "CE1", "HE11", "HE12", "HE13", "CE2", "HE21", "HE22", "HE23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
22
22
HLEU
Homoleucine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD", "CE1", "HE11", "HE12", "HE13", "CE2", "HE21", "HE22", "HE23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
22
22
2
7
7
27
36,963
8
L:HLU
HLU
L
CC([C@@H]([C@@H]([C](=O)=O)[NH3])O)C
HLU.pdb
L_SMI/HLU.smi
L_PDB/HLU.pdb
L_MOL2/HLU.mol2
L_top/HLU.top
L_rtp/HLU.rtp
L_rtp/HLU.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HLU" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OH", "OXT", "HA", "HB", "HG", "HD11", "HD12", "HD13", "HD21", "HD22", "HD23", "HH", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
23
10
13
HLU.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OH", "OXT", "HA", "HB", "HG", "HD11", "HD12", "HD13", "HD21", "HD22", "HD23", "HH", "H1", "H2", "H3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8256, -0.1245, 0.9356, -0.7923, 0.1671, -0.0787, -0.0991, -0.0771, -0.6048, -0.7283, 0.1037, 0.0577, 0.0207, 0.0457, 0.0047, 0.0587, 0.0587, 0.0517, 0.0287, 0.458, 0.4318, 0.4868, 0.4198 ]
23
22
-0.001
HLU
0
2s,3s)-2-amino-3-hydroxy-4-methylpentanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OH", "HH", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
20
20
HLU
2s,3s)-2-amino-3-hydroxy-4-methylpentanoic acid
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OH", "HH", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]
20
20
2
7
7
9
12,321
2
L:HOX
HOX
L
[NH3][C@H](C(=O)O)Cc1ccc(cc1)N
HOX.pdb
L_SMI/HOX.smi
L_PDB/HOX.pdb
L_MOL2/HOX.mol2
L_top/HOX.top
L_rtp/HOX.rtp
L_rtp/HOX.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HOX" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "NH", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "H1", "H2", "H3", "HH1", "HH2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "N", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
25
13
12
HOX.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "NH", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "H1", "H2", "H3", "HH1", "HH2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "N.pl3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8346, -0.0665, 0.9356, -0.8053, -0.0411, -0.1653, -0.082, -0.114, -0.189, -0.193, 0.1496, -0.7133, -0.8222, 0.0877, 0.1107, 0.0687, 0.142, 0.129, 0.138, 0.136, 0.4278, 0.4818, 0.4248, 0.3968, 0.3978 ]
25
25
-0
HOX
-0
4-amino-L-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "NH", "HH1", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, 0.51, -0.51 ]
22
23
HOX
4-amino-L-phenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "NH", "HH1", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, 0.51, -0.51 ]
22
23
4
8
8
6
8,214
2
L:HPE
HPE
L
[NH3][C@H](C(=O)O)CCc1ccccc1
HPE.pdb
L_SMI/HPE.smi
L_PDB/HPE.pdb
L_MOL2/HPE.mol2
L_top/HPE.top
L_rtp/HPE.rtp
L_rtp/HPE.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HPE" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OXT", "CG", "CD", "CE1", "CZ1", "CH", "CZ2", "CE2", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HZ1", "HH", "HZ2", "HE2" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
26
13
13
HPE.pdb
SMALL
GASTEIGER
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OXT", "CG", "CD", "CE1", "CZ1", "CH", "CZ2", "CE2", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HZ1", "HH", "HZ2", "HE2" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ 0.3871, 0.0208, 0.342, -0.2483, -0.052, -0.2483, -0.0287, -0.0474, -0.0586, -0.0615, -0.0617, -0.0615, -0.0586, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.0198, 0.0257, 0.0257, 0.0313, 0.0313, 0.062, 0.0618, 0.0618, 0.0618, 0.062 ]
26
26
-0.0002
HPE
-0
Homophenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "CE2", "HE2", "CE1", "HE1", "CZ2", "HZ2", "CZ1", "HZ1", "CH", "HH", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
23
24
HPE
Homophenylalanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "CE2", "HE2", "CE1", "HE1", "CZ2", "HZ2", "CZ1", "HZ1", "CH", "HH", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
23
24
2
9
9
18
24,642
5
L:HQA
HQA
L
OC(=O)[C@H](Cc1cnc2c(c1)cccc2O)[NH3]
HQA.pdb
L_SMI/HQA.smi
L_PDB/HQA.pdb
L_MOL2/HQA.mol2
L_top/HQA.top
L_rtp/HQA.rtp
L_rtp/HQA.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HQA" ]
[ "OXT", "C", "O", "CA", "N", "CB", "CG", "CD1", "NE1", "CZ1", "CH1", "OH1", "CJ", "CH2", "CZ2", "CE2", "CD2", "HA", "HN1", "HN2", "HB1", "HB2", "HD1", "HH1", "HJ", "HH2", "HZ2", "HD2", "HN3" ]
[ "O", "C", "O", "C", "N", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
29
17
12
HQA.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "OXT", "C", "O", "CA", "N", "CB", "CG", "CD1", "NE1", "CZ1", "CH1", "OH1", "CJ", "CH2", "CZ2", "CE2", "CD2", "HA", "HN1", "HN2", "HB1", "HB2", "HD1", "HH1", "HJ", "HH2", "HZ2", "HD2", "HN3" ]
[ "O.co2", "C.2", "O.co2", "C.3", "N.4", "C.3", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.7083, 0.9386, -0.7983, -0.0735, -0.8346, -0.0461, -0.2286, 0.3842, -0.663, 0.3236, 0.0968, -0.4921, -0.166, -0.08, -0.152, -0.1103, -0.07, 0.0907, 0.4848, 0.4238, 0.0727, 0.1197, 0.0191, 0.445, 0.159, 0.143, 0.143, 0.154, 0.4268 ]
29
30
0.002
HQA
-0
3-(8-hydroxyquinolin-3-yl)-l-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "NE1", "CZ1", "CD2", "HD2", "CE2", "CZ2", "HZ2", "CH1", "OH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ", "HJ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.16, 0.15, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
26
28
HQA
3-(8-hydroxyquinolin-3-yl)-l-alanine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "NE1", "CZ1", "CD2", "HD2", "CE2", "CZ2", "HZ2", "CH1", "OH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ", "HJ", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.16, 0.15, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
26
28
2
9
9
12
16,428
1
L:HRG
HRG
L
[NH2]=[C](=[NH]CCCC[C@@H](C(=O)O)[NH3])=[NH2]
HRG.pdb
L_SMI/HRG.smi
L_PDB/HRG.pdb
L_MOL2/HRG.mol2
L_top/HRG.top
L_rtp/HRG.rtp
L_rtp/HRG.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HRG" ]
[ "N", "CA", "CB", "CD", "CG", "CE", "NZ", "CH", "NJ1", "NJ2", "C", "O", "OXT", "HN1", "HN2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HZ", "HJ12", "HJ21", "HJ22", "HN3", "HJ11" ]
[ "N", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "N", "N", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
30
13
17
HRG.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "CB", "CD", "CG", "CE", "NZ", "CH", "NJ1", "NJ2", "C", "O", "OXT", "HN1", "HN2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HZ", "HJ12", "HJ21", "HJ22", "HN3", "HJ11" ]
[ "N.4", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "N.pl3", "C.cat", "N.pl3", "N.pl3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8316, -0.0235, -0.0834, -0.1174, -0.0724, 0.0013, -0.3881, 0.5291, -0.5361, -0.4731, 0.9076, -0.8183, -0.7693, 0.4508, 0.4808, 0.1137, 0.0547, 0.0597, 0.0527, 0.0677, 0.0837, 0.0627, 0.1187, 0.0837, 0.2987, 0.3137, 0.3147, 0.3737, 0.4368, 0.3097 ]
30
29
1.001
HRG
1
homoarginine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE2", "HE1", "NZ", "HZ", "CH", "NJ1", "HJ11", "HJ12", "NJ2", "HJ21", "HJ22", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]
27
27
HRG
homoarginine
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE2", "HE1", "NZ", "HZ", "CH", "NJ1", "HJ11", "HJ12", "NJ2", "HJ21", "HJ22", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]
27
27
3
9
9
243
332,667
5
L:HRP
HRP
L
OC(=O)[C@H](Cc1c[nH]c2c1cc(O)cc2)[NH3]
HRP.pdb
L_SMI/HRP.smi
L_PDB/HRP.pdb
L_MOL2/HRP.mol2
L_top/HRP.top
L_rtp/HRP.rtp
L_rtp/HRP.hdb
true
true
true
true
true
true
true
true
true
true
[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]
[ "HRP" ]
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "OZ3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HH2", "H1", "H2", "H3", "HZ3" ]
[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
28
16
12
HRP.pdb
SMALL
AMBER ff99SB
[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "OZ3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HH2", "H1", "H2", "H3", "HZ3" ]
[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "O.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]
[ -0.8316, -0.0655, 0.9336, -0.8083, -0.0162, -0.2042, -0.067, -0.053, -0.0643, -0.129, -0.2354, -0.101, 0.1051, -0.186, -0.7123, -0.4971, 0.0897, 0.1087, 0.0687, 0.174, 0.3017, 0.16, 0.139, 0.138, 0.4258, 0.4278, 0.4798, 0.42 ]
28
29
0.001
HRP
-0
5-Hydroxy-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "OZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
25
27
HRP
5-Hydroxy-tryptophan
[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "OZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]
[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "C", "O" ]
[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]
25
27
2
9
9
9
12,321
5