docs/eyepacs_README.md

EyePACS / APTOS / Messidor DR Combination Dataset

本目录为 Kaggle 数据集 ascanipek/eyepacs-aptos-messidor-diabetic-retinopathy 的本地副本。

本地路径

/mnt/tidal-alsh-share2/dataset/qinshengqian/research/c3/Data/Generation/EyePACS

模态与任务

• 模态：彩色眼底照相图像，Color Fundus Photography，简称 CFP。
• 主要任务：糖尿病视网膜病变，Diabetic Retinopathy，简称 DR，五分类分级。
• 标签形式：目录名 0-4 表示 DR 严重程度等级。
• 来源组成：EyePACS/Kaggle Diabetic Retinopathy Detection、APTOS 2019、APTOS Gaussian Filtered、Messidor。

文件结构

EyePACS/
├── augmented_resized_V2/
│   ├── train/0..4/
│   ├── val/0..4/
│   └── test/0..4/
└── dr_unified_v2/
    └── dr_unified_v2/
        ├── train/0..4/
        ├── val/0..4/
        └── test/0..4/

说明：4.archive 源压缩包已在清理时删除，数据已经解压到上述目录。

数据量

dr_unified_v2/dr_unified_v2

这是原始统一数据集，共 92,501 张 JPG，随机划分为 train/validation/test = 80:10:10。

split	0	1	2	3	4	合计
train	55,162	3,706	12,119	1,006	2,002	73,995
val	6,895	462	1,514	125	249	9,245
test	6,896	466	1,518	128	253	9,261
合计	68,953	4,634	15,151	1,259	2,504	92,501

augmented_resized_V2

这是 2024-01-05 更新后的增强版本。数据集页面说明为：手工数据增强后样本数增加约 55%，所有图像 resize 到 600 x 600，磁盘体积从约 18.5 GB 降到约 3.8 GB。当前本地统计为 143,669 张。

split	0	1	2	3	4	合计
train	55,162	18,470	24,198	7,936	9,475	115,241
val	6,895	1,840	3,024	1,000	1,468	14,227
test	6,896	1,862	2,999	978	1,466	14,201
合计	68,953	22,172	30,221	9,914	12,409	143,669

标签说明

DR 分级标签通常按如下语义使用：

标签	含义
0	No DR
1	Mild DR
2	Moderate DR
3	Severe DR
4	Proliferative DR

来源与引用提示

该组合集不主张拥有原始图像版权。使用前应核对并遵守原始数据集的许可证、使用条款和引用要求：

• EyePACS / Kaggle Diabetic Retinopathy Detection。
• APTOS 2019 Blindness Detection。
• APTOS Gaussian Filtered，派生自 APTOS 2019。
• Messidor。推荐引用：Decencière et al., "Feedback on a publicly distributed database: the Messidor database", Image Analysis & Stereology, 2014.

Messidor 官方要求致谢：Kindly provided by the Messidor program partners.

按接入手册的整理建议

• 该数据集属于 A 类：疾病分级标签。
• 推荐 cohort：public_eyepacs_combo_dr。如果确实要接入增强版，建议另设 public_eyepacs_combo_dr_aug600，不要和原始统一版混在同一 cohort。
• modality=fundus_color，scan_protocol=single_shot，has_segmentation=False，SEGMENTATION_TYPE=none。
• diagnosis_group=["normal"] 对应 0 类，diagnosis_group=["DR"] 对应 1-4 类。
• severity 映射为 0->none, 1->mild, 2->moderate, 3->severe, 4->proliferative。
• 因为该组合集已经包含 APTOS、Messidor 等公开来源，若同时接入单独的 APTOS2019、Messidor2，应先做文件哈希或感知哈希去重，避免训练/验证/测试泄漏。
• 对严格评估，优先使用 dr_unified_v2；augmented_resized_V2 更适合作为预训练或数据增强版训练源，不建议作为独立泛化测试集。