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Messidor-2 Dataset

本目录为 Messidor-2 diabetic retinopathy 数据集的本地副本。

本地路径

/mnt/tidal-alsh-share2/dataset/qinshengqian/research/c3/Data/Generation/Messidor2

模态与任务

  • 模态:彩色眼底照相图像,Color Fundus Photography,简称 CFP。
  • 主要任务:糖尿病视网膜病变,Diabetic Retinopathy,简称 DR,五分类分级。
  • 辅助标签:糖尿病黄斑水肿,Diabetic Macular Edema,简称 DME,以及图像可分级性。

文件结构

Messidor2/
├── messidor-2/
│   └── messidor-2/
│       └── preprocess/
├── messidor_data.csv
└── .complete/

数据量

  • 图像数量:1,744 张。
  • 标注行数:1,744 行。
  • 主要标注文件:messidor_data.csv

messidor_data.csv 字段:

字段 含义
id_code 图像文件名
diagnosis DR 分级,0-4
adjudicated_dme DME 标签,0/1
adjudicated_gradable 图像是否可分级

标签分布

DR 标签:

diagnosis 数量
0 1,017
1 270
2 347
3 75
4 35

DME 标签:

adjudicated_dme 数量
0 1,593
1 151

可分级性:

adjudicated_gradable 数量
1 1,744

按接入手册的整理建议

  • 该数据集属于 A 类:疾病分级标签。
  • 推荐 cohort:public_messidor2_dr
  • diagnosis 按 DR 0-4 映射到 severity
  • adjudicated_dme=1 可转成 lesion_tags=["DME"],也可保存到 cohort sidecar 中,具体取决于后续训练是否使用 DME 标签。
  • adjudicated_gradable=1 可作为质量过滤依据;当前本地 CSV 中全部样本均为可分级。
  • 该数据源也可能出现在 EyePACS 组合集中;如果两者都接入,需要做图像去重或 split 隔离。