Opth_proj1 / docs /messidor2_README.md
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# Messidor-2 Dataset
本目录为 Messidor-2 diabetic retinopathy 数据集的本地副本。
## 本地路径
`/mnt/tidal-alsh-share2/dataset/qinshengqian/research/c3/Data/Generation/Messidor2`
## 模态与任务
- 模态:彩色眼底照相图像,Color Fundus Photography,简称 CFP。
- 主要任务:糖尿病视网膜病变,Diabetic Retinopathy,简称 DR,五分类分级。
- 辅助标签:糖尿病黄斑水肿,Diabetic Macular Edema,简称 DME,以及图像可分级性。
## 文件结构
```text
Messidor2/
├── messidor-2/
│ └── messidor-2/
│ └── preprocess/
├── messidor_data.csv
└── .complete/
```
## 数据量
- 图像数量:1,744 张。
- 标注行数:1,744 行。
- 主要标注文件:`messidor_data.csv`
`messidor_data.csv` 字段:
| 字段 | 含义 |
|---|---|
| `id_code` | 图像文件名 |
| `diagnosis` | DR 分级,0-4 |
| `adjudicated_dme` | DME 标签,0/1 |
| `adjudicated_gradable` | 图像是否可分级 |
## 标签分布
DR 标签:
| diagnosis | 数量 |
|---:|---:|
| 0 | 1,017 |
| 1 | 270 |
| 2 | 347 |
| 3 | 75 |
| 4 | 35 |
DME 标签:
| adjudicated_dme | 数量 |
|---:|---:|
| 0 | 1,593 |
| 1 | 151 |
可分级性:
| adjudicated_gradable | 数量 |
|---:|---:|
| 1 | 1,744 |
## 按接入手册的整理建议
- 该数据集属于 A 类:疾病分级标签。
- 推荐 cohort:`public_messidor2_dr`
- `diagnosis` 按 DR 0-4 映射到 `severity`
- `adjudicated_dme=1` 可转成 `lesion_tags=["DME"]`,也可保存到 cohort sidecar 中,具体取决于后续训练是否使用 DME 标签。
- `adjudicated_gradable=1` 可作为质量过滤依据;当前本地 CSV 中全部样本均为可分级。
- 该数据源也可能出现在 EyePACS 组合集中;如果两者都接入,需要做图像去重或 split 隔离。