OTAR3088/AL_Test_data_IOB · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 0 404	tags listlengths 0 404
[ "the", "striatum", "and", "cortex", "were", "ac", "curate", "ly", "outlined", "at", "low", "magnification", "(", "2", ".", "5×", "objective", ")", "." ]	[ "O", "B-Tissue", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "optical", "fraction", "##ator", "probe", "was", "selected", "to", "perform", "systematic", "sampling", "of", "the", "immunoreactive", "cell", "population", "distributed", "within", "the", "serial", "sections", "to", "estimate", "the", "population", "number", "in", "the", "volume", "of", "tissue", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "counting", "frame", "of", "the", "optical", "fraction", "##ator", "was", "defined", "at", "50", "##×", "##50", "µm", "squares", "and", "the", "systematic", "sampling", "was", "performed", "by", "translating", "a", "grid", "with", "200", "##×", "##200", "µm", "squares", "onto", "the", "sections", "of", "interest", "using", "the", "stereo", "investigator", "software", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "sample", "sites", "were", "systematically", "and", "automatically", "generated", "by", "the", "computer", "and", "examined", "using", "a", "60", "##×", "objective", "of", "a", "nikon", "eclipse", "te", "300", "microscope", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "counting", "frame", "displayed", "inclusion", "and", "exclusion", "lines", "and", "only", "immunoreactive", "cell", "bodies", "falling", "within", "the", "counting", "frame", "with", "no", "contact", "with", "the", "exclusion", "lines", "were", "counted", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "cell", "dispersion", "was", "measured", "by", "counting", "the", "number", "of", "cells", "within", "200", "µm", "distance", "from", "the", "graft", "site", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "number", "and", "distance", "in", "µm", "of", "cells", "dispersed", "beyond", "200", "µm", "was", "also", "measured", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "an", "average", "of", "2", ",", "000", "cells", "was", "counted", "per", "animal", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "double", "labeling", "was", "determined", "using", "the", "confocal", "laser", "scanning", "microscope", "by", "random", "sampling", "of", "100", "or", "more", "cells", "per", "marker", "for", "each", "animal", ",", "scoring", "first", "for", "hn", "##uc", "+", ",", "followed", "by", "dapi", "+", "nuclei", "and", "then", "the", "marker", "of", "choice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "double", "labeling", "was", "always", "confirmed", "in", "x", "-", "z", "and", "y", "-", "z", "cross", "-", "sections", "produced", "by", "the", "orthogonal", "projections", "of", "z", "-", "series", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "reverse", "transcription", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "rt", "-", "pcr", ")", "analysis", "##to", "##tal", "rna", "was", "extracted", "from", "cultured", "cells", "using", "rna", "##eas", "##y", "kit", "(", "qu", "##ia", "##gen", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "aliquots", "(", "1", "µg", ")", "of", "total", "rna", "from", "the", "cells", "were", "reverse", "transcribed", "in", "the", "presence", "of", "50", "mm", "tris-hcl", ",", "ph", "8", ".", "3", ",", "75", "mm", "kcl", ",", "3", "mm", "mgcl2", ",", "10", "mm", "dtt", ",", "0", ".", "5", "µm", "dntps", ",", "and", "0", ".", "5", "µg", "oligo", "-", "dt", "(", "12", "–", "18", ")", "with", "200", "u", "superscript", "rnase", "h", "-", "reverse", "transcriptase", "(", "invitrogen", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "pcr", "amplification", "was", "performed", "using", "standard", "procedure", "with", "taq", "polymerase", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "aliquots", "of", "cdna", "equivalent", "to", "50", "ng", "of", "total", "rna", "were", "amplified", "in", "25", "µl", "reactions", "containing", "10", "mm", "tris-hcl", ",", "ph", "8", ".", "3", ",", "50", "mm", "kcl", ",", "1", ".", "5", "mm", "mgcl2", ",", "50", "pmol", "of", "each", "primer", ",", "400", "µm", "dntps", ",", "and", "0", ".", "5", "u", "ampl", "##ita", "##q", "dna", "polymerase", "(", "perkin", "-", "elmer", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "pcr", "was", "performed", "using", "the", "following", "thermal", "profile", ":", "4", "min", "at", "94°c", ";", "1", "min", "at", "94°c", ",", "1", "min", "at", "60°c", ",", "1", ".", "5", "min", "at", "72°c", ",", "for", "30", "–", "40", "cycles", ";", "7", "min", "at", "72°c", ",", "and", "finally", "a", "so", "##ak", "at", "4°c", "overnight", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "following", "day", ",", "10", "µl", "aliquots", "of", "the", "amplified", "products", "were", "run", "on", "a", "2", "%", "agarose", "tris", "–", "acetate", "gel", "containing", "0", ".", "5", "mg", "/", "ml", "ethidium", "bromide", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "products", "were", "visualized", "through", "a", "uv", "trans", "##ill", "##umin", "##ator", ",", "captured", "in", "a", "digital", "format", "using", "quantify", "one", "gel", "analysis", "software", "(", "bio", "-", "rad", "laboratories", ")", "on", "a", "mac", "##int", "##osh", "g4", "computer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "pcr", "primers", "specific", "to", "each", "transcript", "were", "as", "follows", ":", "gfap", ",", "forward", "(", "f", ")", ",", "5", "′", "-", "tca", "##tc", "##gct", "##ca", "##gg", "##agg", "##tc", "##ctt", "–", "3", "′", "reverse", "(", "r", ")", ",", "5", "′", "-", "ctg", "ttg", "##cc", "##agag", "##atgg", "##agg", "##tt", "–", "3", "′", ";", "map2", "(", "f", ")", "5", "′", "-", "gaa", "##gac", "##tc", "##gca", "##tc", "##c", "##gaa", "##tg", "##g", "–", "3", "′", ",", "(", "r", ")", "5", "′", "-", "cgc", "##agg", "##atag", "##gag", "##gaag", "##aga", "##ct", "–", "3", "′", ";", "mbp", "(", "f", ")", "5", "′", "-", "tta", "##gct", "##gaa", "##tt", "##c", "gc", "##gt", "##gtgg", "–", "3", "′", ",", "(", "r", ")", "5", "′", "-", "gag", "##gaag", "##tg", "##aat", "##gag", "##cc", "##ggt", "##ta", "-", "3", "′", "were", "de", "##igned", "using", "the", "primer", "design", "##er", "software", ",", "version", "2", ".", "0", "(", "scientific", "and", "educational", "software", ")", "[", "48", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "18s", ",", "β", "-", "tubulin", "class", "iii", ",", "n", "-", "cam", ",", "nestin", ",", "nf", "-", "m", ",", "notch", "-", "1", "primers", "[", "51", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "oct4", ",", "nanog", "primers", "[", "11", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "fox", "##a2", "(", "hnf", "##3b", ")", ",", "brachy", "##ury", "primers", "[", "52", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "behavioral", "tests", "##the", "cylinder", "test", "was", "used", "to", "assess", "the", "spontaneous", "forelimb", "use", "during", "lateral", "exploration", "movement", "[", "22", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "rats", "were", "placed", "in", "a", "transparent", "acrylic", "cylinder", "(", "20", "cm", "diameter", ")", "for", "5", "minutes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "cylinder", "encourage", "##s", "use", "of", "the", "forelimb", "##s", "for", "vertical", "exploration", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O" ]
[ "a", "mirror", "was", "placed", "behind", "the", "cylinder", "so", "that", "the", "forelimb", "##s", "could", "be", "viewed", "at", "all", "times", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "testing", "sessions", "were", "video", "##ta", "##ped", "and", "forelimb", "use", "was", "scored", "by", "a", "blinded", "operator", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "movements", "scored", "were", "the", "independent", "use", "of", "the", "left", "or", "right", "forelimb", "or", "simultaneous", "use", "of", "both", "the", "left", "and", "right", "forelimb", "to", "contact", "the", "wall", "of", "the", "cylinder", "during", "a", "full", "rear", ",", "to", "initiate", "a", "weight", "-", "shifting", "movement", ",", "or", "to", "reg", "##ain", "center", "of", "gravity", "while", "moving", "laterally", "in", "a", "vertical", "posture", "along", "the", "wall", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "animals", "were", "tested", "for", "their", "baseline", "##s", "after", "stroke", "and", "4", "and", "8", "weeks", "after", "cell", "transplantation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "statistical", "analysis", "##out", "##come", "measurement", "for", "each", "experiment", "was", "reported", "as", "mean±", "##sem", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "all", "data", "were", "analyzed", "using", "spss", "11", "for", "mac", "os", "x", "(", "spss", "inc", ".", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "significance", "of", "inter", "-", "group", "differences", "was", "performed", "by", "applying", "student", "'", "s", "t", "-", "test", "where", "appropriate", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "one", "-", "way", "anova", "analysis", "was", "used", "to", "compare", "group", "differences", "for", "the", "forelimb", "use", "as", "the", "depend", "##ant", "variable", "and", "groups", "as", "the", "single", "independent", "factor", "variable", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "differences", "between", "the", "groups", "were", "determined", "using", "bonferroni", "'", "s", "post", "hoc", "test", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "a", "p", "-", "value", "of", "less", "than", "0", ".", "05", "was", "considered", "to", "be", "statistically", "significant", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[]	[]
[ "background", "##using", "antibod", "ie", "##s", "to", "specific", "protein", "antigens", "is", "the", "method", "of", "choice", "to", "assign", "and", "identify", "cell", "lineage", "through", "simultaneous", "analysis", "of", "surface", "molecules", "and", "intracellular", "markers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "embryonic", "stem", "cell", "research", "can", "be", "benefited", "from", "using", "antibod", "ie", "##s", "specific", "to", "transcriptional", "factors", "/", "markers", "that", "contribute", "to", "the", "\"", "stemness", "\"", "phenotype", "or", "critical", "for", "cell", "lineage", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "results", "##in", "this", "report", ",", "we", "have", "developed", "and", "validated", "antibod", "ie", "##s", "(", "either", "monoclonal", "or", "polyclonal", ")", "specific", "to", "human", "embryonic", "stem", "cell", "antigens", "and", "early", "differentiation", "transcriptional", "factors", "/", "markers", "that", "are", "critical", "for", "cell", "differentiation", "into", "definite", "lineage", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "conclusion", "##the", "##se", "antibod", "ie", "##s", "enable", "stem", "cell", "biologists", "to", "convenient", "##ly", "identify", "stem", "cell", "characteristics", "and", "to", "quantitatively", "assess", "differentiation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "although", "the", "stem", "cell", "concept", "was", "introduced", "decades", "ago", ",", "to", "date", ",", "stem", "cells", "can", "only", "be", "defined", "functionally", ",", "not", "morphologically", "or", "phenotypically", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "two", "functions", "define", "stem", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "firstly", ",", "they", "are", "self", "-", "renew", "##ing", ",", "thus", "able", "to", "propagate", "to", "generate", "additional", "stem", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "secondly", "they", "can", "differentiate", "into", "various", "progenitor", "cells", ",", "which", "commit", "to", "further", "maturation", "along", "a", "specific", "lineage", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "while", "stem", "cells", "can", "be", "best", "defined", "functionally", ",", "a", "good", "number", "of", "molecular", "markers", "have", "been", "used", "to", "prospectively", "identify", "various", "stem", "cell", "populations", "." ]	[ "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]
[ "although", "the", "functional", "importance", "of", "many", "of", "these", "antigens", "remains", "unknown", ",", "their", "unique", "expression", "pattern", "and", "timing", "of", "expression", "provide", "a", "useful", "tool", "for", "scientists", "to", "identify", "as", "well", "as", "isolate", "stem", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "embryonic", "stem", "cells", "(", "esc", ")", ",", "derived", "from", "the", "inner", "cell", "mass", "of", "pre", "-", "implantation", "embryos", ",", "have", "been", "recognized", "as", "the", "earliest", "stem", "cell", "population", "[", "1", ",", "2", "]", "." ]	[ "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "this", "pluripotent", "population", "can", "differentiate", "into", "all", "somatic", "tissue", "including", "germ", "cells", "." ]	[ "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "in", "the", "case", "of", "human", "esc", ",", "they", "can", "differentiate", "into", "some", "extra", "-", "embryonic", "derivatives", "as", "well", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O" ]
[ "like", "mouse", "esc", ",", "human", "es", "cells", "can", "be", "maintained", "and", "propagated", "on", "mouse", "fibroblast", "feeder", "##s", "for", "extended", "periods", "in", "media", "containing", "basic", "fibroblast", "growth", "factor", "(", "bfgf", ")", "[", "3", "]", "." ]	[ "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "gene", "expression", "of", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "has", "been", "investigated", "among", "several", "es", "cell", "lines", "by", "a", "variety", "of", "techniques", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "they", "include", "comparison", "with", "databases", ",", "reverse", "transcriptase-polymerase", "chain", "reaction", ",", "focused", "cdna", "microarrays", ",", "and", "immunocytochemistry", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "a", "list", "of", "molecules", "comprised", "of", "known", "es", "-", "specific", "or", "-", "highly", "expressed", "genes", "and", "candidates", "that", "can", "serve", "as", "markers", "for", "human", "escs", "and", "may", "also", "contribute", "to", "the", "\"", "stemness", "\"", "phenotype", "has", "been", "established", "[", "3", "-", "11", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "for", "example", ",", "pluripotent", "esc", "can", "be", "characterized", "by", "high", "level", "expression", "of", "oct", "##3", "/", "4", "(", "pou", "domain", ",", "class", "5", ",", "transcription", "factor", "1", ",", "pou", "##5", "##f1", ")", "and", "nanog", ",", "which", "are", "a", "member", "of", "pou", "domain", "and", "homeobox", "transcription", "factors", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "a", "critical", "amount", "of", "oct", "##3", "/", "4", "and", "nanog", "expression", "is", "required", "to", "sustain", "stem", "-", "cell", "pluripotency", "and", "both", "of", "these", "markers", "are", "downregulated", "as", "cells", "differentiate", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "[", "4", "-", "9", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "antibod", "ie", "##s", "to", "oct", "##3", "/", "4", "which", "cross", "react", "with", "human", "oct", "3", "/", "4", "have", "been", "widely", "used", "to", "monitor", "the", "presence", "of", "undifferentiated", "esc", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "no", "single", "marker", "however", "is", "sufficient", "or", "unique", "for", "identifying", "escs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O" ]
[ "oct", "##3", "/", "4", "for", "example", "is", "expressed", "by", "germ", "cells", "and", "may", "be", "expressed", "by", "specific", "populations", "later", "in", "development", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "likewise", ",", "nanog", "has", "been", "shown", "to", "express", "in", "other", "tissues", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "we", "and", "other", "have", "noted", "however", ",", "that", "while", "no", "single", "marker", "is", "sufficient", "a", "const", "##ellation", "of", "positive", "and", "negative", "markers", "can", "in", "concert", "unambiguously", "allow", "one", "to", "define", "the", "state", "of", "esc", "cultures", "and", "that", "surface", "markers", "in", "combination", "can", "be", "used", "to", "prospectively", "sort", "for", "esc", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "based", "on", "published", "data", "at", "the", "level", "of", "gene", "expression", ",", "we", "have", "cloned", "a", "number", "of", "candidate", "marker", "genes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "we", "have", "also", "expressed", "the", "recombinant", "protein", "and", "generated", "a", "panel", "of", "monoclonal", "or", "polyclonal", "antibod", "ie", "##s", "to", "these", "proteins", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "using", "these", "antibod", "ie", "##s", "we", "have", "confirmed", "the", "specificity", "and", "selectivity", "of", "these", "antibod", "ie", "##s", "on", "several", "esc", "lines", "and", "established", "their", "utility", "as", "stem", "cells", "markers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "our", "results", "confirm", "the", "expression", "pattern", "and", "timing", "of", "these", "cell", "markers", "at", "the", "protein", "level", ",", "whereas", "previous", "data", "reported", "at", "the", "level", "of", "gene", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "characterization", "of", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "and", "differentiated", "ebs", "by", "antibod", "ie", "##sal", "##l", "monoclonal", "antibod", "ie", "##s", "were", "initially", "selected", "for", "their", "abilities", "to", "recognize", "recombinant", "proteins", "in", "direct", "elisa", "##s", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "a", "subset", "were", "also", "tested", "by", "western", "blot", "analysis", "using", "recombinant", "proteins", "and", "cell", "lysate", "to", "confirm", "binding", "to", "a", "single", "epitope", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "best", "clone", "was", "later", "screened", "for", "its", "applications", "for", "immunocytochemistry", "and", "flow", "cytometry", "using", "various", "cell", "lines", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "human", "peripheral", "blood", "platelets", "were", "used", "for", "screening", "mouse", "anti-human", "cd", "##9", "antibod", "y", "." ]	[ "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "mcf", "-", "7", "cells", "were", "used", "for", "screening", "mouse", "anti-human", "e", "-", "cadherin", "and", "pod", "##xl", "(", "pod", "##ocal", "##yxin", "-", "like", ")", "antibod", "ie", "##s", "." ]	[ "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "mg", "-", "63", "cells", "were", "used", "for", "screening", "mouse", "anti-human", "gata", "##1", "(", "gata", "binding", "protein", "1", ")", "antibod", "y", "." ]	[ "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "beta", "-", "tc", "##6", "cells", "were", "used", "for", "screening", "for", "mouse", "anti-human", "/", "mouse", "pdx", "-", "1", "(", "pancreatic", "duodenal", "homeobox", "-", "1", ")", "antibod", "y", "." ]	[ "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "nt", "##era", "-", "2", "cells", "were", "used", "for", "screening", "mouse", "anti-human", "oct", "##3", "/", "4", "and", "sox2", "(", "sex", "-", "determining", "region", "y", "-", "box", "2", ")", "antibod", "ie", "##s", "." ]	[ "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "all", "polyclonal", "antibod", "ie", "##s", "were", "affinity", "-", "purified", "using", "recombinant", "proteins", "and", "validated", "by", "direct", "elisa", "##s", "and", "western", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "caco", "-", "2", "cells", "were", "used", "for", "validation", "of", "goat", "anti-human", "gata", "##6", "antibod", "y", "and", "nt", "##era", "-", "2", "cells", "were", "used", "for", "validation", "of", "goat", "anti-human", "nanog", "and", "anti-human", "oct", "##3", "/", "4", "antibod", "ie", "##s", "(", "summarized", "in", "table", "1", ")", ".", "table", "1s", "##um", "##mar", "##y", "list", "of", "antibod", "y", "verification", "by", "western", "blot", "." ]	[ "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "antibod", "ys", "##amp", "##le", "used", "for", "analysis", "##mo", "##l", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "wt", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "(", "kd", ")", "gt", "×", "hb", "##ra", "##ch", "##y", "##ury", "##mo", "##use", "es", "-", "derived", "eb", "lysate", "##48", "##ms", "×", "hd", "##pp", "##a5", "##n", "/", "an", "/", "agt", "×", "hg", "##ata", "##6c", "##aco", "##2", "cell", "lysate", "##65", "##gt", "×", "hn", "##ano", "##gn", "##tera", "-", "2", "cell", "lysate", "##33", "##gt", "×", "hoc", "##t", "3", "/", "4", "##nt", "##era", "-", "2", "cell", "lysate", "##39", "##gt", "×", "hp", "##dx", "##1b", "##eta", "-", "tc", "6", "cell", "lysate", "##32", "##gt", "×", "hs", "##ox1", "##7", "##mo", "##use", "es", "-", "derived", "eb", "lysate", "##45", "##ms", "×", "hcd", "##9", "##pb", "##mc", "##25", "##rt", "×", "hg", "##ata", "-", "1n", "/", "an", "/", "ams", "×", "he", "-", "cadherin", "##mc", "##f", "-", "7", "cell", "lysate", "##97", "##ms", "×", "hp", "##od", "##xl", "##mc", "##f", "-", "7", "cell", "lysate", "##57", "##ms", "×", "hs", "##ox", "##2", "##nt", "##era", "-", "2", "cell", "lysate", "##36", "##n", "/", "a", ":", "1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "dpp", "##a5", "is", "still", "being", "subcloned", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "only", "elisa", "verification", "is", "available", ".", "2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "clone", "for", "gata", "-", "1", "(", "mab", "##177", "##9", ")", "does", "not", "work", "for", "western", "blot", "application", "but", "is", "useful", "for", "ihc", ",", "the", "clone", "picked", "for", "western", "blot", "analysis", "does", "not", "work", "for", "ihc", "(", "mab", "##177", "##91", ",", "see", "data", "in", ")", ".", "after", "antibod", "ie", "##s", "were", "validated", "in", "direct", "elisa", "##s", ",", "western", "blot", "or", "cell", "lines", "(", "fig", ".", "1", "and", "data", "not", "shown", ")", ",", "they", "were", "used", "to", "examine", "the", "expression", "of", "individual", "molecules", "in", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "and", "differentiated", "ebs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]
[ "when", "examined", "by", "immunoh", "is", "##to", "##chem", "##istry", ",", "high", "level", "of", "expressions", "of", "oct", "##3", "/", "4", ",", "sox2", ",", "e", "-", "cadherin", ",", "pod", "##xl", "and", "nanog", "were", "observed", "in", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "(", "fig", ".", "2a", ",", "2b", "and", "2c", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "dpp", "##a5", "(", "developmental", "pluripotency", "associated", "5", ")", "expression", "was", "also", "observed", "in", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "(", "data", "not", "shown", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "we", "noted", "that", "a", "subset", "of", "the", "proteins", "used", "were", "membrane", "bound", "proteins", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "to", "test", "if", "any", "of", "the", "antibod", "ie", "##s", "generated", "could", "recognize", "an", "extracellular", "epitope", "and", "thus", "be", "used", "for", "live", "cell", "sorting", ",", "we", "repeated", "staining", "of", "live", "cells", "as", "previously", "described", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "cd", "##9", ",", "e", "-", "cadherin", "and", "pod", "##xl", "antibod", "ie", "##s", "recognized", "an", "extracellular", "epitope", "and", "their", "ability", "to", "select", "cells", "by", "facs", "was", "confirmed", "(", "fig", ".", "3", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "minimal", "or", "no", "expressions", "of", "oct", "##3", "/", "4", ",", "e", "-", "cadherin", ",", "pod", "##xl", "and", "nanog", "were", "detected", "in", "the", "differentiated", "ebs", "(", "fig", ".", "2d", ",", "2e", "and", "2f", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "however", ",", "sox2", "expression", ",", "which", "is", "observed", "in", "neural", "progenitor", "cells", ",", "is", "persistent", "in", "subsets", "of", "ebs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "figure", "1", "##western", "blot", "analysis", "for", "gt", "×", "hoc", "##t3", "/", "4", "(", "a", ")", ",", "gt", "×", "hn", "##ano", "##g", "(", "b", ")", "and", "ms", "×", "hs", "##ox", "##2", "(", "c", ")", "in", "nt", "##era", "-", "2", "cell", "lysate", ",", "ms", "×", "he", "-", "cadherin", "(", "d", ")", "in", "mcf", "-", "7", "cell", "lysate", ",", "ms", "×", "hcd", "##9", "(", "e", ")", "in", "pbmc", "lysate", "and", "ms", "×", "hp", "##dx", "-", "1", "(", "f", ")", "in", "β", "-", "tc", "-", "6", "cell", "lysate", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O" ]
[ "numbers", "indicate", "the", "positions", "of", "molecular", "weight", "markers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "figure", "2", "##und", "##ifferentiated", "human", "es", "cells", "(", "a", ",", "b", ",", "and", "c", ")", "and", "differentiated", "ebs", "(", "d", ",", "e", "and", "f", ")", "were", "analyzed", "using", "antibod", "ie", "##s", "to", "indicated", "molecular", "markers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "immunostaining", "with", "goat", "anti-human", "oct", "##3", "/", "4", "(", "red", "in", "a", "and", "d", ")", ",", "mouse", "anti-human", "sox2", "(", "green", "in", "a", "and", "d", ")", ",", "goat", "anti-human", "e", "-", "cadherin", "(", "red", "in", "b", "and", "e", ")", ",", "mouse", "anti-human", "pod", "##xl", "(", "green", "in", "b", "and", "e", ")", ",", "and", "goat", "anti-human", "nanog", "(", "red", "in", "c", "and", "f", ")", ",", "are", "contrasted", "with", "dapi", "nuclear", "staining", "(", "blue", "in", "c", "-", "f", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "note", "the", "dramatic", "downregulation", "of", "esc", "specific", "markers", "(", "oct", "##3", "/", "4", ",", "e", "-", "cadherin", ",", "pod", "##xl", ",", "and", "nanog", ")", "in", "ebs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]
[ "however", ",", "sox2", "expression", "is", "persistent", "in", "subsets", "of", "eb", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "scale", "bars", "=", "100", "μm", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "figure", "3h", "##uman", "embryonic", "stem", "cells", "stained", "with", "anti-cd9", "(", "a", ")", ",", "anti-e-cadherin", "(", "b", ")", ",", "and", "anti-podxl", "(", "c", ")", "and", "antigen", "expression", "detected", "by", "a", "flow", "cytometer", "." ]	[ "O", "O", "B-CellType", "B-Tissue", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "specific", "staining", "is", "indicated", "by", "green", "histogram", "and", "corresponding", "isotype", "control", "is", "indicated", "by", "black", "histogram", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "suspension", "culture", "with", "fgf", "withdrawal", "is", "known", "to", "induce", "differentiation", "of", "es", "cells", "to", "all", "three", "germ", "layer", "precursors", "[", "12", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O" ]
[ "the", "differentiation", "status", "of", "the", "eb", "used", "here", "was", "detected", "to", "contain", "all", "germ", "cell", "markers", "by", "rt", "-", "pcr", "(", "fig", ".", "4", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "in", "order", "to", "examine", "how", "more", "antibod", "ie", "##s", "can", "be", "used", "for", "characterization", "of", "early", "differentiation", "events", "from", "human", "es", "cells", ",", "we", "examined", "the", "expressions", "of", "endodermal", "markers", ",", "sox", "##17", ",", "gata", "##6", "and", "pdx", "-", "1", ",", "and", "mesoderm", "##al", "markers", ",", "brachy", "##ury", "and", "gata", "##1", ",", "in", "the", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "and", "differentiated", "ebs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]
[ "expressions", "of", "sox", "##17", ",", "gata", "##6", ",", "pdx", "-", "1", ",", "brachy", "##ury", "and", "gata", "##1", "were", "not", "detected", "in", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "(", "data", "not", "shown", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "in", "contrast", "to", "the", "undifferentiated", "es", "cells", ",", "subpopulations", "of", "sox", "##17", "-", ",", "gata", "##6", "-", ",", "brachy", "##ury", "-", "and", "gata", "##1", "-", "positive", "cells", "were", "observed", "(", "fig", "4", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "striatum", "and", "cortex", "were", "ac", "curate", "ly", "outlined", "at", "low", "magnification", "(", "2", ".", "5×", "objective", ")", "." ]

[ "O", "B-Tissue", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "optical", "fraction", "##ator", "probe", "was", "selected", "to", "perform", "systematic", "sampling", "of", "the", "immunoreactive", "cell", "population", "distributed", "within", "the", "serial", "sections", "to", "estimate", "the", "population", "number", "in", "the", "volume", "of", "tissue", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "counting", "frame", "of", "the", "optical", "fraction", "##ator", "was", "defined", "at", "50", "##×", "##50", "µm", "squares", "and", "the", "systematic", "sampling", "was", "performed", "by", "translating", "a", "grid", "with", "200", "##×", "##200", "µm", "squares", "onto", "the", "sections", "of", "interest", "using", "the", "stereo", "investigator", "software", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "sample", "sites", "were", "systematically", "and", "automatically", "generated", "by", "the", "computer", "and", "examined", "using", "a", "60", "##×", "objective", "of", "a", "nikon", "eclipse", "te", "300", "microscope", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "counting", "frame", "displayed", "inclusion", "and", "exclusion", "lines", "and", "only", "immunoreactive", "cell", "bodies", "falling", "within", "the", "counting", "frame", "with", "no", "contact", "with", "the", "exclusion", "lines", "were", "counted", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "cell", "dispersion", "was", "measured", "by", "counting", "the", "number", "of", "cells", "within", "200", "µm", "distance", "from", "the", "graft", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "number", "and", "distance", "in", "µm", "of", "cells", "dispersed", "beyond", "200", "µm", "was", "also", "measured", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "an", "average", "of", "2", ",", "000", "cells", "was", "counted", "per", "animal", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "double", "labeling", "was", "determined", "using", "the", "confocal", "laser", "scanning", "microscope", "by", "random", "sampling", "of", "100", "or", "more", "cells", "per", "marker", "for", "each", "animal", ",", "scoring", "first", "for", "hn", "##uc", "+", ",", "followed", "by", "dapi", "+", "nuclei", "and", "then", "the", "marker", "of", "choice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "double", "labeling", "was", "always", "confirmed", "in", "x", "-", "z", "and", "y", "-", "z", "cross", "-", "sections", "produced", "by", "the", "orthogonal", "projections", "of", "z", "-", "series", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "reverse", "transcription", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "rt", "-", "pcr", ")", "analysis", "##to", "##tal", "rna", "was", "extracted", "from", "cultured", "cells", "using", "rna", "##eas", "##y", "kit", "(", "qu", "##ia", "##gen", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "aliquots", "(", "1", "µg", ")", "of", "total", "rna", "from", "the", "cells", "were", "reverse", "transcribed", "in", "the", "presence", "of", "50", "mm", "tris-hcl", ",", "ph", "8", ".", "3", ",", "75", "mm", "kcl", ",", "3", "mm", "mgcl2", ",", "10", "mm", "dtt", ",", "0", ".", "5", "µm", "dntps", ",", "and", "0", ".", "5", "µg", "oligo", "-", "dt", "(", "12", "–", "18", ")", "with", "200", "u", "superscript", "rnase", "h", "-", "reverse", "transcriptase", "(", "invitrogen", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "pcr", "amplification", "was", "performed", "using", "standard", "procedure", "with", "taq", "polymerase", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "aliquots", "of", "cdna", "equivalent", "to", "50", "ng", "of", "total", "rna", "were", "amplified", "in", "25", "µl", "reactions", "containing", "10", "mm", "tris-hcl", ",", "ph", "8", ".", "3", ",", "50", "mm", "kcl", ",", "1", ".", "5", "mm", "mgcl2", ",", "50", "pmol", "of", "each", "primer", ",", "400", "µm", "dntps", ",", "and", "0", ".", "5", "u", "ampl", "##ita", "##q", "dna", "polymerase", "(", "perkin", "-", "elmer", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "pcr", "was", "performed", "using", "the", "following", "thermal", "profile", ":", "4", "min", "at", "94°c", ";", "1", "min", "at", "94°c", ",", "1", "min", "at", "60°c", ",", "1", ".", "5", "min", "at", "72°c", ",", "for", "30", "–", "40", "cycles", ";", "7", "min", "at", "72°c", ",", "and", "finally", "a", "so", "##ak", "at", "4°c", "overnight", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "following", "day", ",", "10", "µl", "aliquots", "of", "the", "amplified", "products", "were", "run", "on", "a", "2", "%", "agarose", "tris", "–", "acetate", "gel", "containing", "0", ".", "5", "mg", "/", "ml", "ethidium", "bromide", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "products", "were", "visualized", "through", "a", "uv", "trans", "##ill", "##umin", "##ator", ",", "captured", "in", "a", "digital", "format", "using", "quantify", "one", "gel", "analysis", "software", "(", "bio", "-", "rad", "laboratories", ")", "on", "a", "mac", "##int", "##osh", "g4", "computer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "pcr", "primers", "specific", "to", "each", "transcript", "were", "as", "follows", ":", "gfap", ",", "forward", "(", "f", ")", ",", "5", "′", "-", "tca", "##tc", "##gct", "##ca", "##gg", "##agg", "##tc", "##ctt", "–", "3", "′", "reverse", "(", "r", ")", ",", "5", "′", "-", "ctg", "ttg", "##cc", "##agag", "##atgg", "##agg", "##tt", "–", "3", "′", ";", "map2", "(", "f", ")", "5", "′", "-", "gaa", "##gac", "##tc", "##gca", "##tc", "##c", "##gaa", "##tg", "##g", "–", "3", "′", ",", "(", "r", ")", "5", "′", "-", "cgc", "##agg", "##atag", "##gag", "##gaag", "##aga", "##ct", "–", "3", "′", ";", "mbp", "(", "f", ")", "5", "′", "-", "tta", "##gct", "##gaa", "##tt", "##c", "gc", "##gt", "##gtgg", "–", "3", "′", ",", "(", "r", ")", "5", "′", "-", "gag", "##gaag", "##tg", "##aat", "##gag", "##cc", "##ggt", "##ta", "-", "3", "′", "were", "de", "##igned", "using", "the", "primer", "design", "##er", "software", ",", "version", "2", ".", "0", "(", "scientific", "and", "educational", "software", ")", "[", "48", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "18s", ",", "β", "-", "tubulin", "class", "iii", ",", "n", "-", "cam", ",", "nestin", ",", "nf", "-", "m", ",", "notch", "-", "1", "primers", "[", "51", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "oct4", ",", "nanog", "primers", "[", "11", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "fox", "##a2", "(", "hnf", "##3b", ")", ",", "brachy", "##ury", "primers", "[", "52", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "behavioral", "tests", "##the", "cylinder", "test", "was", "used", "to", "assess", "the", "spontaneous", "forelimb", "use", "during", "lateral", "exploration", "movement", "[", "22", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "rats", "were", "placed", "in", "a", "transparent", "acrylic", "cylinder", "(", "20", "cm", "diameter", ")", "for", "5", "minutes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "cylinder", "encourage", "##s", "use", "of", "the", "forelimb", "##s", "for", "vertical", "exploration", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O" ]

[ "a", "mirror", "was", "placed", "behind", "the", "cylinder", "so", "that", "the", "forelimb", "##s", "could", "be", "viewed", "at", "all", "times", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "testing", "sessions", "were", "video", "##ta", "##ped", "and", "forelimb", "use", "was", "scored", "by", "a", "blinded", "operator", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "movements", "scored", "were", "the", "independent", "use", "of", "the", "left", "or", "right", "forelimb", "or", "simultaneous", "use", "of", "both", "the", "left", "and", "right", "forelimb", "to", "contact", "the", "wall", "of", "the", "cylinder", "during", "a", "full", "rear", ",", "to", "initiate", "a", "weight", "-", "shifting", "movement", ",", "or", "to", "reg", "##ain", "center", "of", "gravity", "while", "moving", "laterally", "in", "a", "vertical", "posture", "along", "the", "wall", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "animals", "were", "tested", "for", "their", "baseline", "##s", "after", "stroke", "and", "4", "and", "8", "weeks", "after", "cell", "transplantation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "statistical", "analysis", "##out", "##come", "measurement", "for", "each", "experiment", "was", "reported", "as", "mean±", "##sem", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "all", "data", "were", "analyzed", "using", "spss", "11", "for", "mac", "os", "x", "(", "spss", "inc", ".", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "significance", "of", "inter", "-", "group", "differences", "was", "performed", "by", "applying", "student", "'", "s", "t", "-", "test", "where", "appropriate", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "one", "-", "way", "anova", "analysis", "was", "used", "to", "compare", "group", "differences", "for", "the", "forelimb", "use", "as", "the", "depend", "##ant", "variable", "and", "groups", "as", "the", "single", "independent", "factor", "variable", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "differences", "between", "the", "groups", "were", "determined", "using", "bonferroni", "'", "s", "post", "hoc", "test", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "a", "p", "-", "value", "of", "less", "than", "0", ".", "05", "was", "considered", "to", "be", "statistically", "significant", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[]

[ "background", "##using", "antibod", "ie", "##s", "to", "specific", "protein", "antigens", "is", "the", "method", "of", "choice", "to", "assign", "and", "identify", "cell", "lineage", "through", "simultaneous", "analysis", "of", "surface", "molecules", "and", "intracellular", "markers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "embryonic", "stem", "cell", "research", "can", "be", "benefited", "from", "using", "antibod", "ie", "##s", "specific", "to", "transcriptional", "factors", "/", "markers", "that", "contribute", "to", "the", "\"", "stemness", "\"", "phenotype", "or", "critical", "for", "cell", "lineage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "results", "##in", "this", "report", ",", "we", "have", "developed", "and", "validated", "antibod", "ie", "##s", "(", "either", "monoclonal", "or", "polyclonal", ")", "specific", "to", "human", "embryonic", "stem", "cell", "antigens", "and", "early", "differentiation", "transcriptional", "factors", "/", "markers", "that", "are", "critical", "for", "cell", "differentiation", "into", "definite", "lineage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "conclusion", "##the", "##se", "antibod", "ie", "##s", "enable", "stem", "cell", "biologists", "to", "convenient", "##ly", "identify", "stem", "cell", "characteristics", "and", "to", "quantitatively", "assess", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "although", "the", "stem", "cell", "concept", "was", "introduced", "decades", "ago", ",", "to", "date", ",", "stem", "cells", "can", "only", "be", "defined", "functionally", ",", "not", "morphologically", "or", "phenotypically", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "two", "functions", "define", "stem", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "firstly", ",", "they", "are", "self", "-", "renew", "##ing", ",", "thus", "able", "to", "propagate", "to", "generate", "additional", "stem", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "secondly", "they", "can", "differentiate", "into", "various", "progenitor", "cells", ",", "which", "commit", "to", "further", "maturation", "along", "a", "specific", "lineage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "while", "stem", "cells", "can", "be", "best", "defined", "functionally", ",", "a", "good", "number", "of", "molecular", "markers", "have", "been", "used", "to", "prospectively", "identify", "various", "stem", "cell", "populations", "." ]

[ "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]

[ "although", "the", "functional", "importance", "of", "many", "of", "these", "antigens", "remains", "unknown", ",", "their", "unique", "expression", "pattern", "and", "timing", "of", "expression", "provide", "a", "useful", "tool", "for", "scientists", "to", "identify", "as", "well", "as", "isolate", "stem", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "embryonic", "stem", "cells", "(", "esc", ")", ",", "derived", "from", "the", "inner", "cell", "mass", "of", "pre", "-", "implantation", "embryos", ",", "have", "been", "recognized", "as", "the", "earliest", "stem", "cell", "population", "[", "1", ",", "2", "]", "." ]

[ "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "this", "pluripotent", "population", "can", "differentiate", "into", "all", "somatic", "tissue", "including", "germ", "cells", "." ]

[ "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "in", "the", "case", "of", "human", "esc", ",", "they", "can", "differentiate", "into", "some", "extra", "-", "embryonic", "derivatives", "as", "well", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O" ]

[ "like", "mouse", "esc", ",", "human", "es", "cells", "can", "be", "maintained", "and", "propagated", "on", "mouse", "fibroblast", "feeder", "##s", "for", "extended", "periods", "in", "media", "containing", "basic", "fibroblast", "growth", "factor", "(", "bfgf", ")", "[", "3", "]", "." ]

[ "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "gene", "expression", "of", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "has", "been", "investigated", "among", "several", "es", "cell", "lines", "by", "a", "variety", "of", "techniques", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "they", "include", "comparison", "with", "databases", ",", "reverse", "transcriptase-polymerase", "chain", "reaction", ",", "focused", "cdna", "microarrays", ",", "and", "immunocytochemistry", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "a", "list", "of", "molecules", "comprised", "of", "known", "es", "-", "specific", "or", "-", "highly", "expressed", "genes", "and", "candidates", "that", "can", "serve", "as", "markers", "for", "human", "escs", "and", "may", "also", "contribute", "to", "the", "\"", "stemness", "\"", "phenotype", "has", "been", "established", "[", "3", "-", "11", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "for", "example", ",", "pluripotent", "esc", "can", "be", "characterized", "by", "high", "level", "expression", "of", "oct", "##3", "/", "4", "(", "pou", "domain", ",", "class", "5", ",", "transcription", "factor", "1", ",", "pou", "##5", "##f1", ")", "and", "nanog", ",", "which", "are", "a", "member", "of", "pou", "domain", "and", "homeobox", "transcription", "factors", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "a", "critical", "amount", "of", "oct", "##3", "/", "4", "and", "nanog", "expression", "is", "required", "to", "sustain", "stem", "-", "cell", "pluripotency", "and", "both", "of", "these", "markers", "are", "downregulated", "as", "cells", "differentiate", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "[", "4", "-", "9", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "antibod", "ie", "##s", "to", "oct", "##3", "/", "4", "which", "cross", "react", "with", "human", "oct", "3", "/", "4", "have", "been", "widely", "used", "to", "monitor", "the", "presence", "of", "undifferentiated", "esc", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "no", "single", "marker", "however", "is", "sufficient", "or", "unique", "for", "identifying", "escs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O" ]

[ "oct", "##3", "/", "4", "for", "example", "is", "expressed", "by", "germ", "cells", "and", "may", "be", "expressed", "by", "specific", "populations", "later", "in", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "likewise", ",", "nanog", "has", "been", "shown", "to", "express", "in", "other", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "we", "and", "other", "have", "noted", "however", ",", "that", "while", "no", "single", "marker", "is", "sufficient", "a", "const", "##ellation", "of", "positive", "and", "negative", "markers", "can", "in", "concert", "unambiguously", "allow", "one", "to", "define", "the", "state", "of", "esc", "cultures", "and", "that", "surface", "markers", "in", "combination", "can", "be", "used", "to", "prospectively", "sort", "for", "esc", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "based", "on", "published", "data", "at", "the", "level", "of", "gene", "expression", ",", "we", "have", "cloned", "a", "number", "of", "candidate", "marker", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "we", "have", "also", "expressed", "the", "recombinant", "protein", "and", "generated", "a", "panel", "of", "monoclonal", "or", "polyclonal", "antibod", "ie", "##s", "to", "these", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "using", "these", "antibod", "ie", "##s", "we", "have", "confirmed", "the", "specificity", "and", "selectivity", "of", "these", "antibod", "ie", "##s", "on", "several", "esc", "lines", "and", "established", "their", "utility", "as", "stem", "cells", "markers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "our", "results", "confirm", "the", "expression", "pattern", "and", "timing", "of", "these", "cell", "markers", "at", "the", "protein", "level", ",", "whereas", "previous", "data", "reported", "at", "the", "level", "of", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "characterization", "of", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "and", "differentiated", "ebs", "by", "antibod", "ie", "##sal", "##l", "monoclonal", "antibod", "ie", "##s", "were", "initially", "selected", "for", "their", "abilities", "to", "recognize", "recombinant", "proteins", "in", "direct", "elisa", "##s", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "a", "subset", "were", "also", "tested", "by", "western", "blot", "analysis", "using", "recombinant", "proteins", "and", "cell", "lysate", "to", "confirm", "binding", "to", "a", "single", "epitope", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "best", "clone", "was", "later", "screened", "for", "its", "applications", "for", "immunocytochemistry", "and", "flow", "cytometry", "using", "various", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "human", "peripheral", "blood", "platelets", "were", "used", "for", "screening", "mouse", "anti-human", "cd", "##9", "antibod", "y", "." ]

[ "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "mcf", "-", "7", "cells", "were", "used", "for", "screening", "mouse", "anti-human", "e", "-", "cadherin", "and", "pod", "##xl", "(", "pod", "##ocal", "##yxin", "-", "like", ")", "antibod", "ie", "##s", "." ]

[ "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "mg", "-", "63", "cells", "were", "used", "for", "screening", "mouse", "anti-human", "gata", "##1", "(", "gata", "binding", "protein", "1", ")", "antibod", "y", "." ]

[ "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "beta", "-", "tc", "##6", "cells", "were", "used", "for", "screening", "for", "mouse", "anti-human", "/", "mouse", "pdx", "-", "1", "(", "pancreatic", "duodenal", "homeobox", "-", "1", ")", "antibod", "y", "." ]

[ "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "nt", "##era", "-", "2", "cells", "were", "used", "for", "screening", "mouse", "anti-human", "oct", "##3", "/", "4", "and", "sox2", "(", "sex", "-", "determining", "region", "y", "-", "box", "2", ")", "antibod", "ie", "##s", "." ]

[ "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "all", "polyclonal", "antibod", "ie", "##s", "were", "affinity", "-", "purified", "using", "recombinant", "proteins", "and", "validated", "by", "direct", "elisa", "##s", "and", "western", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "caco", "-", "2", "cells", "were", "used", "for", "validation", "of", "goat", "anti-human", "gata", "##6", "antibod", "y", "and", "nt", "##era", "-", "2", "cells", "were", "used", "for", "validation", "of", "goat", "anti-human", "nanog", "and", "anti-human", "oct", "##3", "/", "4", "antibod", "ie", "##s", "(", "summarized", "in", "table", "1", ")", ".", "table", "1s", "##um", "##mar", "##y", "list", "of", "antibod", "y", "verification", "by", "western", "blot", "." ]

[ "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "antibod", "ys", "##amp", "##le", "used", "for", "analysis", "##mo", "##l", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "wt", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "(", "kd", ")", "gt", "×", "hb", "##ra", "##ch", "##y", "##ury", "##mo", "##use", "es", "-", "derived", "eb", "lysate", "##48", "##ms", "×", "hd", "##pp", "##a5", "##n", "/", "an", "/", "agt", "×", "hg", "##ata", "##6c", "##aco", "##2", "cell", "lysate", "##65", "##gt", "×", "hn", "##ano", "##gn", "##tera", "-", "2", "cell", "lysate", "##33", "##gt", "×", "hoc", "##t", "3", "/", "4", "##nt", "##era", "-", "2", "cell", "lysate", "##39", "##gt", "×", "hp", "##dx", "##1b", "##eta", "-", "tc", "6", "cell", "lysate", "##32", "##gt", "×", "hs", "##ox1", "##7", "##mo", "##use", "es", "-", "derived", "eb", "lysate", "##45", "##ms", "×", "hcd", "##9", "##pb", "##mc", "##25", "##rt", "×", "hg", "##ata", "-", "1n", "/", "an", "/", "ams", "×", "he", "-", "cadherin", "##mc", "##f", "-", "7", "cell", "lysate", "##97", "##ms", "×", "hp", "##od", "##xl", "##mc", "##f", "-", "7", "cell", "lysate", "##57", "##ms", "×", "hs", "##ox", "##2", "##nt", "##era", "-", "2", "cell", "lysate", "##36", "##n", "/", "a", ":", "1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "dpp", "##a5", "is", "still", "being", "subcloned", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "only", "elisa", "verification", "is", "available", ".", "2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "clone", "for", "gata", "-", "1", "(", "mab", "##177", "##9", ")", "does", "not", "work", "for", "western", "blot", "application", "but", "is", "useful", "for", "ihc", ",", "the", "clone", "picked", "for", "western", "blot", "analysis", "does", "not", "work", "for", "ihc", "(", "mab", "##177", "##91", ",", "see", "data", "in", ")", ".", "after", "antibod", "ie", "##s", "were", "validated", "in", "direct", "elisa", "##s", ",", "western", "blot", "or", "cell", "lines", "(", "fig", ".", "1", "and", "data", "not", "shown", ")", ",", "they", "were", "used", "to", "examine", "the", "expression", "of", "individual", "molecules", "in", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "and", "differentiated", "ebs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]

[ "when", "examined", "by", "immunoh", "is", "##to", "##chem", "##istry", ",", "high", "level", "of", "expressions", "of", "oct", "##3", "/", "4", ",", "sox2", ",", "e", "-", "cadherin", ",", "pod", "##xl", "and", "nanog", "were", "observed", "in", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "(", "fig", ".", "2a", ",", "2b", "and", "2c", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "dpp", "##a5", "(", "developmental", "pluripotency", "associated", "5", ")", "expression", "was", "also", "observed", "in", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "(", "data", "not", "shown", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "we", "noted", "that", "a", "subset", "of", "the", "proteins", "used", "were", "membrane", "bound", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "to", "test", "if", "any", "of", "the", "antibod", "ie", "##s", "generated", "could", "recognize", "an", "extracellular", "epitope", "and", "thus", "be", "used", "for", "live", "cell", "sorting", ",", "we", "repeated", "staining", "of", "live", "cells", "as", "previously", "described", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "cd", "##9", ",", "e", "-", "cadherin", "and", "pod", "##xl", "antibod", "ie", "##s", "recognized", "an", "extracellular", "epitope", "and", "their", "ability", "to", "select", "cells", "by", "facs", "was", "confirmed", "(", "fig", ".", "3", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "minimal", "or", "no", "expressions", "of", "oct", "##3", "/", "4", ",", "e", "-", "cadherin", ",", "pod", "##xl", "and", "nanog", "were", "detected", "in", "the", "differentiated", "ebs", "(", "fig", ".", "2d", ",", "2e", "and", "2f", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "however", ",", "sox2", "expression", ",", "which", "is", "observed", "in", "neural", "progenitor", "cells", ",", "is", "persistent", "in", "subsets", "of", "ebs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "figure", "1", "##western", "blot", "analysis", "for", "gt", "×", "hoc", "##t3", "/", "4", "(", "a", ")", ",", "gt", "×", "hn", "##ano", "##g", "(", "b", ")", "and", "ms", "×", "hs", "##ox", "##2", "(", "c", ")", "in", "nt", "##era", "-", "2", "cell", "lysate", ",", "ms", "×", "he", "-", "cadherin", "(", "d", ")", "in", "mcf", "-", "7", "cell", "lysate", ",", "ms", "×", "hcd", "##9", "(", "e", ")", "in", "pbmc", "lysate", "and", "ms", "×", "hp", "##dx", "-", "1", "(", "f", ")", "in", "β", "-", "tc", "-", "6", "cell", "lysate", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O" ]

[ "numbers", "indicate", "the", "positions", "of", "molecular", "weight", "markers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "figure", "2", "##und", "##ifferentiated", "human", "es", "cells", "(", "a", ",", "b", ",", "and", "c", ")", "and", "differentiated", "ebs", "(", "d", ",", "e", "and", "f", ")", "were", "analyzed", "using", "antibod", "ie", "##s", "to", "indicated", "molecular", "markers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "immunostaining", "with", "goat", "anti-human", "oct", "##3", "/", "4", "(", "red", "in", "a", "and", "d", ")", ",", "mouse", "anti-human", "sox2", "(", "green", "in", "a", "and", "d", ")", ",", "goat", "anti-human", "e", "-", "cadherin", "(", "red", "in", "b", "and", "e", ")", ",", "mouse", "anti-human", "pod", "##xl", "(", "green", "in", "b", "and", "e", ")", ",", "and", "goat", "anti-human", "nanog", "(", "red", "in", "c", "and", "f", ")", ",", "are", "contrasted", "with", "dapi", "nuclear", "staining", "(", "blue", "in", "c", "-", "f", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "note", "the", "dramatic", "downregulation", "of", "esc", "specific", "markers", "(", "oct", "##3", "/", "4", ",", "e", "-", "cadherin", ",", "pod", "##xl", ",", "and", "nanog", ")", "in", "ebs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]

[ "however", ",", "sox2", "expression", "is", "persistent", "in", "subsets", "of", "eb", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "scale", "bars", "=", "100", "μm", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "figure", "3h", "##uman", "embryonic", "stem", "cells", "stained", "with", "anti-cd9", "(", "a", ")", ",", "anti-e-cadherin", "(", "b", ")", ",", "and", "anti-podxl", "(", "c", ")", "and", "antigen", "expression", "detected", "by", "a", "flow", "cytometer", "." ]

[ "O", "O", "B-CellType", "B-Tissue", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "specific", "staining", "is", "indicated", "by", "green", "histogram", "and", "corresponding", "isotype", "control", "is", "indicated", "by", "black", "histogram", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "suspension", "culture", "with", "fgf", "withdrawal", "is", "known", "to", "induce", "differentiation", "of", "es", "cells", "to", "all", "three", "germ", "layer", "precursors", "[", "12", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O" ]

[ "the", "differentiation", "status", "of", "the", "eb", "used", "here", "was", "detected", "to", "contain", "all", "germ", "cell", "markers", "by", "rt", "-", "pcr", "(", "fig", ".", "4", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "in", "order", "to", "examine", "how", "more", "antibod", "ie", "##s", "can", "be", "used", "for", "characterization", "of", "early", "differentiation", "events", "from", "human", "es", "cells", ",", "we", "examined", "the", "expressions", "of", "endodermal", "markers", ",", "sox", "##17", ",", "gata", "##6", "and", "pdx", "-", "1", ",", "and", "mesoderm", "##al", "markers", ",", "brachy", "##ury", "and", "gata", "##1", ",", "in", "the", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "and", "differentiated", "ebs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-Tissue", "O" ]

[ "expressions", "of", "sox", "##17", ",", "gata", "##6", ",", "pdx", "-", "1", ",", "brachy", "##ury", "and", "gata", "##1", "were", "not", "detected", "in", "undifferentiated", "human", "es", "cells", "(", "data", "not", "shown", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "in", "contrast", "to", "the", "undifferentiated", "es", "cells", ",", "subpopulations", "of", "sox", "##17", "-", ",", "gata", "##6", "-", ",", "brachy", "##ury", "-", "and", "gata", "##1", "-", "positive", "cells", "were", "observed", "(", "fig", "4", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]