OTAR3088/CeLLaTe-V2-split · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 311	tags listlengths 2 311
[ "Combinatorial", "approaches", "to", "dissect", "the", "genetic", "underpinnings", "of", "HIV-1", "latency", "and", "discover", "new", ",", "synergistic", "drug", "interactions", "should", "be", "prioritized", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Targeting", "mediators", "of", "DNA", "repair", "has", "become", "a", "state-of-the-art", "strategy", "for", "cancer", "[", "90", "]", ",", "leading", "to", "the", "development", "of", "inhibitors", "of", "key", "mediators", "of", "DNA", "repair", ",", "including", "DNA-PK", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Differences", "between", "the", "means", "of", "two", "independent", "groups", "were", "analyzed", "using", "an", "independent", "t-test", ",", "with", "p", " ", "", "", "", "Results", "", "", "", "Effect", "of", "a.", "incana", "dcm", "fraction", "on", "cell", "cycle", "analysis", "To", "investigate", "the", "effect", "of", "the", "A.", "incana", "DCM", "fraction", "on", "cell", "cycle", "progression", ",", "HeLa", "cells", "were", "treated", "with", "the", "IC50", "concentration", "(", "135.6", " ", "µg/mL", ")", "of", "the", "fraction", "for", "48", " ", "h.", "Cell", "cycle", "distribution", "was", "assessed", "by", "flow", "cytometry", "using", "Propidium", "Iodide", "(", "PI", ")", "staining", ",", "which", "binds", "to", "DNA", "and", "allows", "differentiation", "of", "cell", "cycle", "phases", "(", "G0/G1", ",", "S", ",", "G2/M", ")", "based", "on", "DNA", "content", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "study", "revealed", "moderate", "or", "weak", "cytotoxicity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "NG", "MIO-M1", "cells", "have", "the", "capacity", "to", "modulate", "this", "gene", "when", "exposed", "to", "sustained", "high-glucose", "and", "GF", "treatments", ",", "exhibiting", "a", "consistent", "upregulation", "of", "SOX2", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "finding", "corroborates", "prior", "studies", "demonstrating", "that", "STAT1-deficient", "cells", "fail", "to", "upregulate", "PD-L1", "in", "response", "to", "IFN-γ", ",", "emphasizing", "the", "centrality", "of", "STAT1", "in", "this", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "illustrated", "in", "Fig.", " ", "2", ",", "a", "significant", "increase", "(", "p", " ", "A.", "incana", "exerts", "cytostatic", "effects", "on", "HeLa", "cells", "by", "inducing", "cell", "cycle", "arrest", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cytotoxic", "therapies", "eliminate", "cancer", "cells", "by", "triggering", "various", "pathways", "of", "cell", "death", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "same", "assays", ",", "catechin", "was", "more", "effective", "(", "EC50", "=", "5.56", "±", "0.05", "and", "3.70", "±", "0.03", "μg/mL", ",", "respectively", ")", "[", "26", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "value", "of", "p", "", "", "*", "5", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "de", "Vriese", "bark", "[", "44", "]", ",", "and", "procyanidin-rich", "extract", "of", "Pinus", "koraiensis", "Siebold", "&", "Zucc", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "products", "concentrated", "by", "beads", "were", "used", "for", "subsequent", "experiments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "effect", "of", "Endostar", "in", "inhibiting", "HIF-1", "and", "promoting", "MHC", "class", "I", "expression", "on", "cancer", "cells", ",", "such", "as", "lung", "cancer", "cells", ",", "may", "counteract", "cancer", "immune", "evasion", "and", "thereby", "benefit", "cancer", "immunotherapy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "level", "of", "p", " ", "", "", "", "Results", "", "", "", "Discussion", "The", "host", "immune", "system", "exerts", "immunosurveillance", "to", "control", "cancer", "development", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "That", "being", "said", ",", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "the", "7SK", "RNP", "complex", "has", "been", "shown", "to", "directly", "correlate", "with", "increased", "BRD4", "binding", ",", "suggesting", "that", "release", "from", "any", "one", "complex", "will", "not", "necessarily", "increase", "the", "amount", "of", "unbound", "P-TEFb", "or", "the", "amount", "recruited", "to", "specific", "sites", "of", "transcription", "[", "33", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "this", "did", "not", "necessarily", "mean", "that", "the", "expression", "of", "HIF-1", "in", "control", "and", "untreated", "cells", "was", "really", "high", "because", "it", "was", "detected", "with", "the", "expression", "in", "Endostar", "treated", "A549", "cells", "and", "NCI-H1299", "cells", "as", "the", "backgroud", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "primary", "and", "secondary", "antibodies", "are", "listed", "in", "Table", " ", "1.Table", "1The", "description", "of", "primary", "and", "secondary", "antibodies", "AntibodySpeciesCloneDilutionCa#SourcePD-L1RabbitMonoclonal1:1000ab213524AbcamSTAT1MouseMonoclonal1:10009176Cell", "Signaling", "TechnologypSTAT1RabbitMonoclonal1:10009177SCell", "Signaling", "Technologyβ-actinMouseMonoclonal1:500047,778Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USAAnti-mouseHorse-1:10,0007076Cell", "Signaling", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USAAnti-RabbitGoat-1:10,0007074Cell", "Signaling", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", "Quantitative", "real-time", "pcr", "(", "qrt-pcr", ")", "analysis", "Total", "RNA", "was", "extracted", "from", "A549", "cells", "using", "the", "RNeasy", "Mini-Kit", "(", "Qiagen", ",", "#", "74,104", ")", "according", "to", "the", "manufacturer", "’s", "instructions", ",", "and", "the", "eluted", "RNA", "purity", "and", "concentration", "were", "assessed", "using", "a", "NanoDrop", "One", "spectrophotometer", "(", "Thermo", "Scientific", ",", "USA", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "DNA", "was", "diluted", "by", "ChIP", "Dilution", "Buffer", "[", "0.01", "%", "SDS", ",", "1", "%", "Triton", "X-100", ",", "1.2", " ", "mM", "EDTA", ",", "16.7", " ", "mM", "Tris-HCl", ",", "pH", "8.1", ",", "167", " ", "mM", "NaCl", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "finding", "suggests", "that", "either", "KL-2", "has", "secondary", "effects", "not", "mediated", "by", "P-TEFb", "or", "that", "the", "redistribution", "of", "P-TEFb", "away", "from", "SECs", "has", "secondary", "effects", "that", "could", "impact", "transcriptional", "initiation", "at", "proviral", "integration", "sites", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Similar", "phenotypic", "alterations", "were", "also", "noted", "in", "HEK293", "cells", "in", "response", "to", "ectopic", "MYT1L", "(", "Figure", "1E", "–", "G", ",", "I", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "future", "comprehensive", "research", "is", "imperative", "to", "fully", "comprehend", "the", "extent", "of", "PRMT3", "’s", "involvement", "in", "mediating", "viral-host", "interactions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Results", "Discussion", "Several", "LRAs", "have", "shown", "their", "biological", "activity", "both", "in", " ", "vitro", "and", "in", " ", "vivo", "but", "are", "clinically", "unsafe", "for", "further", "evaluations.46,47", "The", "most", "potent", "LRAs", ",", "including", "HDACi", "and", "protein", "kinase", "C", "(", "PRKC", ")", "agonist", "bryostatin-1", ",", "activate", "the", "canonical", "NFKB", "pathway,46", "causing", "explicit", "T", " ", "cell", "activation", "and", "broad", "cytotoxicity", ",", "and", "hence", "eliciting", "significant", "collateral", "damage", "on", "host", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "IL-8", "receptor", "CXCR1", "may", "be", "a", "biomarker", "for", "cancer", "stem", "cells", "[", "64", "]", ",", "including", "glioblastoma", "stem", "cells", "[", "58", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Phosphatidylethanolamine", "cytidyltransferase", "2(PCYT2", ")", "is", "the", "rate-limiting", "enzyme", "of", "the", "CDP-Etn", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "previous", "work", "demonstrated", "that", "DNA-PK", "may", "also", "function", "as", "a", "repressor", "of", "MYT1L", ",", "resulting", "in", "the", "transcriptional", "inhibition", "of", "tumor", "suppressor", "p21", ",", "a", "transcriptional", "target", "of", "MYT1L", "[", "29", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "further", "explore", "the", "Tat", "dependency", "of", "KL-2", ",", "we", "tried", "to", "rescue", "Tat", "function", "in", "the", "U1", "cell", "line", "using", "a", "Dox-inducible", "system", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "that", "knock-out", "of", "SEC", "components", "from", "activated", ",", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "from", "12", "independent", "donors", "did", "not", "inhibit", "viral", "replication", ",", "suggesting", "that", "the", "SEC", "is", "not", "required", "in", "this", "cellular", "context", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Effects", "of", "CYTOR", "on", "HIV", "infection", "and", "latency", "establishment", "were", "also", "confirmed", "in", "stimulated", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "(", "Fig", "3", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "in", "the", "loss-of-function", "DNA-PK", "M059J", "cell", "line", ",", "the", "knockdown", "of", "MYT1L", "promoted", "cell", "proliferation", ",", "attenuated", "apoptosis", ",", "and", "shortened", "the", "S", "phase", "(", "Figure", "2A", "–", "D", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Taken", "together", ",", "our", "results", "demonstrate", "that", "MYT1L", "functionality", "depends", "on", "DNA-PK", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "SOCS1", "is", "known", "to", "act", "as", "a", "feedback", "inhibitor", "of", "JAK-STAT", "signaling", "(", "Liau", "et", "al.", "2018", ")", ",", "but", "paradoxically", ",", "its", "overexpression", "in", "tumors", "has", "been", "associated", "with", "immune", "escape", "mechanisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", "to", "phytol", ",", "the", "saponifiable", "matter", "of", "the", "DCM", "fraction", "contained", "palmitic", "acid", "(", "31.27", "%", ")", "and", "linolenic", "acid", "(", "26.98", "%", ")", "as", "the", "major", "components", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "eukaryotic", "PE", "in", "vivo", ",", "two", "main", "synthetic", "pathways", "exist", "[", "12", "]", ":", "including", "the", "Kennedy", "pathway", "of", "CDP-ethanolamine(CDP-Etn", ")", "and", "mitochondrial", "phosphatidylserine", "decarboxylation", "pathway", "[", "13", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "these", "analyses", "all", "genes", "whose", "gene", "symbols", "could", "be", "mapped", "to", "ENTREZ", "Ids", "using", "the", "org", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "reducing", "power", "assay", ",", "polar", "conifer", "bark", "extracts", "exhibited", "EC50", "values", "ranging", "from", "9.17", "±", "0.13", "to", "25.32", "±", "0.62", "μg/mL", "[", "29,35,37", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "If", "a", "sgRNA-Cas9", "combination", "can", "target", "and", "disrupt", "the", "LTR", "sequence", ",", "a", "reduction", "in", "luciferase", "activity", "is", "observed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "in", "addition", "to", "PRMT3", ",", "other", "members", "of", "the", "PRMT", "family", "should", "be", "explored", "as", "potential", "targets", "for", "developing", "effective", "antiviral", "drugs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "ns", ",", "∗", ",", "∗∗", ",", "∗∗∗", ",", "signify", "not", "significant", ",", "Figure", " ", "2", ",", "the", "exact", "p", "values", "were", "∗p", " ", "=", "0.026", ",", "∗∗p", " ", "=", "0.007", ",", "∗∗∗p", " ", "=", "0.0004", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "we", "found", "that", "in", "normal", "DNA-PK", "glioblastoma", "M059", "K", "cell", "lines", ",", "knockdown", "of", "MYT1L", "attenuated", "cell", "proliferation", "and", "induced", "apoptosis", "and", "S-phase", "cell", "cycle", "arrest", "(", "Figure", "1A", "–", "D", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Flavopiridol", ",", "abemaciclib", ",", "and", "palbociclib", "are", "a", "few", "examples", "of", "antitumor", "drugs", "that", "suppress", "the", "cell", "cycle", "via", "inhibition", "of", "enzymes/proteins", "(", "cyclin-dependent", "kinases/cyclins", ")", "responsible", "for", "driving", "the", "progression", "of", "the", "cell", "cycle", "from", "one", "phase", "to", "the", "next", "one", "[", "60", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "aimed", "to", "investigate", "the", "role", "of", "PCYT2", "in", "human", "hepatocellular", "carcinoma", "cells", "(", "HepG2", ")", "by", "inhibiting", "their", "proliferation", ",", "invasion", ",", "and", "migration", "abilities", "and", "promoting", "cell", "apoptosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PRMT3", ",", "which", "has", "been", "shown", "to", "function", "in", "transcriptional", "regulation", "and", "antiviral", "innate", "immunity15,30,36", ",", "was", "among", "the", "hits", "with", "the", "highest", "fold", "enrichment", "of", "sgLTR/sgGal4", ",", "and", "was", "therefore", "selected", "for", "subsequent", "investigation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "the", "IL-8/CXCR1/STAT3", "pathway", "is", "crucial", "for", "the", "maintenance", "of", "glioblastoma", "stem", "cells", "[", "59", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "both", "compounds", "reduced", "LRA", "efficacy", ",", "KL-2", "still", "boosted", "the", "activity", "of", "JQ1", "and", "PMA", ",", "but", "not", "AZD5582", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "One-way", "analysis", "of", "variance", "(", "ANOVA", ")", "followed", "by", "Tukey", "’s", "post-hoc", "test", "was", "used", "to", "compare", "multiple", "groups", ",", "and", "an", "unpaired", "Student", "’s", "t-test", "was", "used", "for", "pairwise", "comparisons", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ectopic", "MYT1L", "induced", "down-regulation", "of", "caspase", "3", "(", "Figure", "1", "K", ",", "Supplementary", "Figure", "S1", ")", "in", "both", "HEK293", "and", "M509", "K", "cells", ",", "which", "may", "play", "a", "contributing", "role", "in", "apoptotic", "inhibition", "(", "Figure", "1I", ",", "J", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pause", "release", "is", "regulated", "by", "positive", "transcription", "elongation", "factor-b", "(", "P-TEFb", ")", ",", "a", "heterodimeric", "protein", "complex", "composed", "of", "cyclin-dependent", "kinase", "9", "(", "CDK9", ")", "and", "cyclin", "T1", "(", "CCNT1", ")", "[", "19–21", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "mentioned", "earlier", ",", "the", "sub-G1", "population", "is", "a", "hallmark", "of", "apoptosis", "[", "39,40", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Blocks", "to", "transcriptional", "elongation", "are", "major", "contributors", "to", "establishing", "and", "maintaining", "HIV-1", "latency", "[", "13,14", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "CYTOR", "is", "an", "important", "regulator", "of", "TCR-induced", "actin", "polymerization", "in", "T", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "This", "approach", "would", "provide", "a", "deeper", "understanding", "of", "the", "cellular", "response", "to", "sustained", "high-glucose", "and", "glucose", "fluctuations", "and", "could", "improve", "the", "development", "of", "targeted", "therapeutic", "strategies", "for", "retinal", "pathologies", "in", "human", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Piceatannol", "caused", "apoptosis", "and", "G0/G1", "phase", "arrest", "in", "T24", "and", "HT1376", "human", "bladder", "cancer", "cells", "[", "70", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Only", "peptides", "with", "at", "least", "six", "amino", "acids", "in", "length", "were", "considered", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Following", "20–25", "d", ",", "the", "tumors", "achieved", "a", "certain", "size", "and", "the", "micewere", "anesthetized", "with", "isopentane", "and", "sacrificed", ";", "the", "tumors", "were", "collected", "for", "follow-up", "evaluation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "steps", "are", "crucial", "for", "validating", "the", "preclinical", "promise", "and", "advancing", "the", "clinical", "applicability", "of", "the", "Alnus", "incana", "DCM", "fraction", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "previous", "studies", "indicated", "that", "MYT1L", "was", "overexpressed", "in", "glioblastoma", "cell", "lines", "and", "46.9", "%", "of", "malignant", "glioma", "tissue", "samples", "(", "n", "=", "32", ")", "[", "29", "]", ",", "functioning", "as", "an", "oncogene", "in", "glioblastoma", "cells", "with", "normal", "DNA-PK", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "washing", "with", "TBST", ",", "membranes", "were", "incubated", "with", "horseradish", "peroxidase", "(HRP)-conjugated", "secondary", "anti-mouse", "IgG", "antibody", "or", "anti-rabbit", "IgG", ",", "HRP-linked", "antibody", ",", "for", "1", " ", "h", "at", "room", "temperature", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Resveratroloside", "(", "1", ")", "and", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "are", "not", "the", "sole", "stilbenes", "that", "cause", "tumor", "cell", "death", "by", "triggering", "non-apoptotic", "mechanisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "saponifiable", "fraction", "presented", "a", "balanced", "composition", "of", "saturated", "(", "48.69", "%", ")", "and", "unsaturated", "(", "51.29", "%", ")", "fatty", "acids", ",", "with", "palmitic", "acid", ",", "linolenic", "acid", ",", "and", "linoleic", "acid", "as", "the", "predominant", "compounds", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "was", "to", "be", "expected", "that", "hyperglycemia", "alone", "did", "not", "modulate", "VEGF-A", "expression", "and", "secretion", "within", "6", "h", ",", "as", "possible", "changes", "likely", "manifest", "only", "after", "extended", "exposure", "(", "32", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "conceivable", "that", "such", "an", "impact", "is", "significant", "considering", "the", "modest", "effect", "of", "APG-1387", "on", "latency", "reversal", "in", "this", "experimental", "condition", "and", "the", "limited", "functional", "immune", "clearance", "mechanisms", "present", "in", "hu-BLT", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "On", "cellular", "gene", "promoters", "such", "as", "the", "three", "genes", "mentioned", "above", ",", "it", "is", "conceivable", "that", "transcription", "can", "also", "be", "modulated", "through", "controlling", "the", "function", "and/or", "binding", "of", "the", "PRMT3-TEAD4", "complex", "to", "the", "GGAAT", "motif", "in", "response", "to", "changes", "in", "physiological", "or", "pathological", "conditions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cells", "were", "subsequently", "fixed", "in", "3", "%", "paraformaldehyde", "for", "15", "minutes", ",", "permeabilized", "for", "2", "minutes", "in", "0.1", "%", "TritonX-100", ",", "and", "blocked", "for", "30", "minutes", "in", "1", "%", "Fetal", "Calf", "Serum", "(", "FCS", ")", "in", "PBS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "example", ",", "a", "recent", "study", "reported", "synergistic", "reactivation", "potential", "between", "an", "activator", "of", "non-canonical", "NF-kB", "signaling", "(", "AZD5582", ")", "and", "BET", "bromodomain", "inhibitors", "that", "act", "to", "lift", "blocks", "to", "transcriptional", "initiation", "and", "elongation", ",", "respectively", "[", "12", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Trimmed", "reads", "were", "aligned", "to", "the", "Homo", "sapiens", "reference", "genome", "GRCh38", "and", "transcripts", "quantified", "using", "the", "Hisat2-StringTie", "pipeline", "[", "76", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "soluble", "chromatin", "fraction", "(", "25", "μg", ")", "was", "collected", "and", "immunoprecipitated", "(", "IP", ")", "overnight", "at", "4", "°", "C", "on", "a", "rotating", "wheel", "in", "IP", "buffer", "(", "0.5", "%", "Triton", "X-100", ",", "2", "mM", "EDTA", ",", "20", "mM", "Tris", "pH-7.8", ",", "150", "mM", "NaCl", "and", "10", "%", "glycerol", ")", "with", "2.5", "μg", "of", "one", "of", "the", "indicated", "antibodies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "reinforce", "the", "potential", "of", "A.", "incana", "DCM", "fraction", "as", "an", "effective", "anticancer", "agent", "by", "simultaneously", "inducing", "cell", "cycle", "arrest", "and", "apoptosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Previous", "studies", "have", "reported", "similar", "synergistic", "interactions", "in", "pine", "bark", "extracts", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Selected", "ions", "were", "sequentially", "fragmented", "by", "HCD", "with", "30", "%", "normalized", "collision", "energy", ",", "specified", "isolated", "windows", "1.6", " ", "m/z", ",", "and", "15,000", "resolutions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Specifically", ",", "we", "selected", "three", "host", "genes", ",", "PRDM1", ",", "SLITRK5", ",", "and", "TGFB2", ",", "for", "further", "validation", "of", "our", "proposed", "PRMT3-TEAD4", "regulation", "model", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cellular", "genes", "regulated", "by", "CYTOR", "include", "actin", "remodeling", "genes", "that", "promote", "actin", "polymerization", "and", "the", "indirect", "activation", "of", "HIV", "gene", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "assay", "detects", "phosphatidylserine", "translocation", ",", "a", "hallmark", "of", "early", "apoptosis", ",", "by", "Annexin", "V-FITC", "staining", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "increasing", "number", "of", "studies", "have", "focused", "on", "the", "progression", ",", "pathological", "features", ",", "and", "prognosis", "of", "liver", "cancer", "[", "3–5", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Experimental", "evidence", ",", "however", ",", "is", "required", "and", "further", "research", "with", "experimental", "evidence", "remains", "to", "be", "performed", "in", "the", "future", "to", "confirm", "the", "possible", "suppression", "of", "immune", "evasion", "tactic", "with", "endostar", "treatment", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "reveals", "a", "positive", "feedback", "DNA-PK/MYT1L-CXCR1", "proliferative", "signaling", "loop", "that", "contributes", "to", "the", "progression", "of", "glioblastoma", "via", "the", "ERK1/2", "pathway", "and", "provides", "a", "novel", "insight", "into", "the", "role", "of", "DNA-PK", "in", "the", "MYT1L-mediated", "transactivation", "of", "CXCR1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Other", "polar", "conifer", "bark", "extracts", "exhibited", "higher", "activity", "on", "HeLa", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]
[ "Its", "unique", "ability", "to", "activate", "apoptotic", "and", "cell-cycle", "arrest", "pathways", "supports", "its", "promise", "as", "an", "adjunctive", "therapy", ",", "particularly", "in", "combination", "with", "conventional", "chemotherapeutic", "agents", ",", "which", "may", "improve", "treatment", "outcomes", "by", "reducing", "associated", "toxicities", "or", "overcoming", "resistance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "statistical", "analyses", "were", "performed", "in", "GraphPad", "Prism", "version", "9", "(", "GraphPad", "Software", ",", "Inc.", ")", ";", "means", "and", "standard", "deviations", "are", "provided", "as", "numbers", "or", "as", "scatter", "plots", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Future", "research", "could", "benefit", "from", "using", "primary", "Müller", "cells", "to", "better", "reflect", "the", "in", "vivo", "context", "of", "human", "diabetic", "retinopathy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "important", "strategy", "in", "cancer", "therapy", "is", "the", "induction", "of", "cell", "cycle", "arrest", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "the", "first", "time", ",", "our", "findings", "demonstrated", "that", "DNA-PK", "may", "functionally", "modulate", "the", "transcriptional", "activity", "of", "MYT1L", "by", "phosphorylation", ",", "eventually", "leading", "to", "the", "transcriptional", "activation", "of", "CXCR1", ",", "although", "this", "requires", "further", "validation", "using", "chromatin", "immunoprecipitation", "quantitative", "PCR", "(", "ChIP-qPCR", ")", "and", "the", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", "(", "EMSA", ")", "when", "a", "ChIP-grade", "antibody", "to", "the", "phosphorylated", "MYT1L", "is", "commercially", "available", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "e", "Proteins", "showing", "over", "1.5-fold", "enrichment", "relative", "to", "the", "control", "sample", "identified", "from", "3", "×", "Flag-dCas9", "immunoprecipitation", "following", "by", "mass", "spectrometry", "analysis", "were", "listed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "indicated", "that", "in", "cooperation", "with", "DNA-PK", ",", "MYT1L", "may", "function", "as", "an", "oncogene", "in", "the", "progression", "of", "glioblastoma", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "attempted", "to", "test", "this", "by", "inhibiting", "Tat", "in", "the", "J-Lat", "5A8", "model", "cell", "line", "using", "two", "previously", "described", "Tat-dependent", "transcription", "inhibitors", ",", "Triptolide", "and", "Spironolactone", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "example", ",", "BET", "bromodomain", "inhibitors", "(", "such", "as", "JQ1", ")", "have", "been", "shown", "to", "be", "potent", "LRAs", "in", "ex", "vivo", "models", "by", "releasing", "P-TEFb", "from", "BRD4", "[", "12", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "4.9", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "precise", "mechanism(s", ")", "underlying", "these", "transcriptional", "effects", "of", "PRMT3", "remain", "unclear", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Source", "paper", ":", "PMC12115102" ]	[ "O", "O", "O", "O" ]
[ "BET", "bromodomain", "inhibitors", "have", "also", "been", "reported", "to", "increase", "HIV-1", "transcriptional", "initiation", "[", "12,13", "]", ",", "though", "these", "effects", "have", "been", "suggested", "to", "occur", "through", "modulation", "of", "the", "epigenetic", "regulatory", "functions", "of", "these", "proteins", "[", "66", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "additional", "pathways", "were", "identified", "by", "our", "RNA-seq", "analysis", "in", "CYTOR-depleted", "cells", ",", "we", "visualize", "that", "future", "work", "will", "identify", "novel", "downstream", "targets", "of", "CYTOR", "and", "elucidate", "their", "mechanisms", "of", "function", "in", "regulating", "HIV", "gene", "expression", "and", "latency", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "as", "MIO-M1", "cells", "secreted", "increased", "quantities", "of", "IL-6", "when", "exposed", "to", "hyperglycemia", "and", "angiotensin", "II", ",", "the", "pro-inflammatory", "axis", "seems", "to", "exceed", "the", "anti-inflammatory", "response", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "materials", "and", "methods", "4.7", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Extending", "these", "studies", "to", "primary", "Müller", "cells", "in", "future", "research", "would", "provide", "a", "more", "physiologically", "relevant", "system", ",", "helping", "to", "validate", "and", "refine", "our", "findings", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Additionally", ",", "the", "relatively", "high", "IC50", "necessitates", "exploration", "of", "advanced", "drug", "delivery", "systems", "or", "combination", "therapies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "context", ",", "the", "aim", "of", "the", "“", "shock-and-kill", "”", "strategy", "is", "to", "reactivate", "latently", "infected", "cells", "with", "latency", "reversal", "agents", "(", "LRAs", ")", "and", "render", "them", "vulnerable", "to", "cell", "death", "or", "clearance", "by", "the", "immune", "system.7,8", "Previously", "reported", "approaches", "to", "HIV", "reactivation", ",", "including", "protein", "kinase", "C", "(", "PRKC", ")", "agonists", ",", "histone", "deacetylase", "(", "HDAC", ")", "inhibitors", "(", "HDACi", ")", ",", "and", "toll-like", "receptor", "(", "TLR", ")", "agonists,9", "have", "been", "highly", "effective", "in", "in", " ", "vitro", "models", "of", "latency", ",", "but", "their", "efficacy", "is", "only", "moderate", "when", "tested", "in", " ", "vivo.10,11,12,13", "Moreover", ",", "by", "broadly", "activating", "cellular", "pathways", ",", "these", "compounds", "elicit", "significant", "proinflammatory", "effects", "or", "alter", "the", "function", "and", "fate", "of", "specific", "immune", "effector", "cells,14,15", "hence", "limiting", "their", "use", "in", "clinical", "settings.16,17,18,19", "Similarly", ",", "promising", "candidates", "such", "as", "bryostatin-1", "and", "analogs", ",", "phorbol", "esters", ",", "and", "phosphatidylethanolamine", "binding", "protein", "1", "(", "PEBP1", ")", "agonists", "reactivate", "HIV", "via", "activation", "of", "the", "canonical", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NFKB", ")", "pathway,13,20", "inadvertently", "leading", "to", "uncontrolled", "cytokine", "release", "and", "overt", "T", " ", "cell", "activation.21,22", "Consequently", ",", "there", "is", "a", "need", "to", "develop", "alternative", "approach(es", ")", "that", "can", "reactivate", "latent", "reservoirs", "and", "eliminate", "infected", "cells", "without", "triggering", "systemic", "activation", ",", "inflammation", ",", "or", "impairment", "of", "immune", "clearance", "mechanisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Statistical", "significance", "was", "set", "at", "P", " ", "", "", "", "Results", "", "", "", "Discussion", "PCYT2", "is", "a", "rate-limiting", "enzyme", "in", "PE", "synthesis", "that", "is", "commonly", "used", "in", "the", "study", "of", "obesity-related", "diseases", ",", "such", "as", "non-alcoholic", "fatty", "liver", "disease", "and", "type", "2", "diabetes", "[", "12,20–22", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Antigens", "must", "be", "processed", "into", "antigenic", "peptides", "by", "APM", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "processes", "are", "of", "pivotal", "importance", "in", "the", "onset", "and", "progression", "of", "retinal", "neurodegeneration", "and", "diabetic", "retinopathy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "findings", "have", "demonstrated", "a", "positive", "feedback", "DNA-PK/MYT1L-CXCR1-ERK1/2", "proliferative", "signaling", "loop", "in", "glioblastoma", "cells", "and", "might", "have", "significant", "therapeutic", "implications", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "could", "be", "suggested", "that", "an", "incubation", "time", "of", "6", "h", "is", "too", "short", ",", "but", "due", "to", "the", "short", "half-life", "of", "angiotensin", "II", ",", "longer", "exposure", "times", "would", "likely", "not", "result", "in", "more", "relevant", "data", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Combinatorial", "approaches", "to", "dissect", "the", "genetic", "underpinnings", "of", "HIV-1", "latency", "and", "discover", "new", ",", "synergistic", "drug", "interactions", "should", "be", "prioritized", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Targeting", "mediators", "of", "DNA", "repair", "has", "become", "a", "state-of-the-art", "strategy", "for", "cancer", "[", "90", "]", ",", "leading", "to", "the", "development", "of", "inhibitors", "of", "key", "mediators", "of", "DNA", "repair", ",", "including", "DNA-PK", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Differences", "between", "the", "means", "of", "two", "independent", "groups", "were", "analyzed", "using", "an", "independent", "t-test", ",", "with", "p", " ", "*", "*", "*", "Results", "*", "*", "*", "Effect", "of", "a.", "incana", "dcm", "fraction", "on", "cell", "cycle", "analysis", "To", "investigate", "the", "effect", "of", "the", "A.", "incana", "DCM", "fraction", "on", "cell", "cycle", "progression", ",", "HeLa", "cells", "were", "treated", "with", "the", "IC50", "concentration", "(", "135.6", " ", "µg/mL", ")", "of", "the", "fraction", "for", "48", " ", "h.", "Cell", "cycle", "distribution", "was", "assessed", "by", "flow", "cytometry", "using", "Propidium", "Iodide", "(", "PI", ")", "staining", ",", "which", "binds", "to", "DNA", "and", "allows", "differentiation", "of", "cell", "cycle", "phases", "(", "G0/G1", ",", "S", ",", "G2/M", ")", "based", "on", "DNA", "content", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "study", "revealed", "moderate", "or", "weak", "cytotoxicity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "NG", "MIO-M1", "cells", "have", "the", "capacity", "to", "modulate", "this", "gene", "when", "exposed", "to", "sustained", "high-glucose", "and", "GF", "treatments", ",", "exhibiting", "a", "consistent", "upregulation", "of", "SOX2", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "finding", "corroborates", "prior", "studies", "demonstrating", "that", "STAT1-deficient", "cells", "fail", "to", "upregulate", "PD-L1", "in", "response", "to", "IFN-γ", ",", "emphasizing", "the", "centrality", "of", "STAT1", "in", "this", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "illustrated", "in", "Fig.", " ", "2", ",", "a", "significant", "increase", "(", "p", " ", "A.", "incana", "exerts", "cytostatic", "effects", "on", "HeLa", "cells", "by", "inducing", "cell", "cycle", "arrest", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cytotoxic", "therapies", "eliminate", "cancer", "cells", "by", "triggering", "various", "pathways", "of", "cell", "death", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "same", "assays", ",", "catechin", "was", "more", "effective", "(", "EC50", "=", "5.56", "±", "0.05", "and", "3.70", "±", "0.03", "μg/mL", ",", "respectively", ")", "[", "26", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "value", "of", "p", "*", "*", "*", "5", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "de", "Vriese", "bark", "[", "44", "]", ",", "and", "procyanidin-rich", "extract", "of", "Pinus", "koraiensis", "Siebold", "&", "Zucc", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "products", "concentrated", "by", "beads", "were", "used", "for", "subsequent", "experiments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "effect", "of", "Endostar", "in", "inhibiting", "HIF-1", "and", "promoting", "MHC", "class", "I", "expression", "on", "cancer", "cells", ",", "such", "as", "lung", "cancer", "cells", ",", "may", "counteract", "cancer", "immune", "evasion", "and", "thereby", "benefit", "cancer", "immunotherapy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "level", "of", "p", " ", "*", "*", "*", "Results", "*", "*", "*", "Discussion", "The", "host", "immune", "system", "exerts", "immunosurveillance", "to", "control", "cancer", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "That", "being", "said", ",", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "the", "7SK", "RNP", "complex", "has", "been", "shown", "to", "directly", "correlate", "with", "increased", "BRD4", "binding", ",", "suggesting", "that", "release", "from", "any", "one", "complex", "will", "not", "necessarily", "increase", "the", "amount", "of", "unbound", "P-TEFb", "or", "the", "amount", "recruited", "to", "specific", "sites", "of", "transcription", "[", "33", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "this", "did", "not", "necessarily", "mean", "that", "the", "expression", "of", "HIF-1", "in", "control", "and", "untreated", "cells", "was", "really", "high", "because", "it", "was", "detected", "with", "the", "expression", "in", "Endostar", "treated", "A549", "cells", "and", "NCI-H1299", "cells", "as", "the", "backgroud", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "primary", "and", "secondary", "antibodies", "are", "listed", "in", "Table", " ", "1.Table", "1The", "description", "of", "primary", "and", "secondary", "antibodies", "AntibodySpeciesCloneDilutionCa#SourcePD-L1RabbitMonoclonal1:1000ab213524AbcamSTAT1MouseMonoclonal1:10009176Cell", "Signaling", "TechnologypSTAT1RabbitMonoclonal1:10009177SCell", "Signaling", "Technologyβ-actinMouseMonoclonal1:500047,778Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USAAnti-mouseHorse-1:10,0007076Cell", "Signaling", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USAAnti-RabbitGoat-1:10,0007074Cell", "Signaling", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", "Quantitative", "real-time", "pcr", "(", "qrt-pcr", ")", "analysis", "Total", "RNA", "was", "extracted", "from", "A549", "cells", "using", "the", "RNeasy", "Mini-Kit", "(", "Qiagen", ",", "#", "74,104", ")", "according", "to", "the", "manufacturer", "’s", "instructions", ",", "and", "the", "eluted", "RNA", "purity", "and", "concentration", "were", "assessed", "using", "a", "NanoDrop", "One", "spectrophotometer", "(", "Thermo", "Scientific", ",", "USA", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "DNA", "was", "diluted", "by", "ChIP", "Dilution", "Buffer", "[", "0.01", "%", "SDS", ",", "1", "%", "Triton", "X-100", ",", "1.2", " ", "mM", "EDTA", ",", "16.7", " ", "mM", "Tris-HCl", ",", "pH", "8.1", ",", "167", " ", "mM", "NaCl", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "finding", "suggests", "that", "either", "KL-2", "has", "secondary", "effects", "not", "mediated", "by", "P-TEFb", "or", "that", "the", "redistribution", "of", "P-TEFb", "away", "from", "SECs", "has", "secondary", "effects", "that", "could", "impact", "transcriptional", "initiation", "at", "proviral", "integration", "sites", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Similar", "phenotypic", "alterations", "were", "also", "noted", "in", "HEK293", "cells", "in", "response", "to", "ectopic", "MYT1L", "(", "Figure", "1E", "–", "G", ",", "I", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "future", "comprehensive", "research", "is", "imperative", "to", "fully", "comprehend", "the", "extent", "of", "PRMT3", "’s", "involvement", "in", "mediating", "viral-host", "interactions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Results", "Discussion", "Several", "LRAs", "have", "shown", "their", "biological", "activity", "both", "in", " ", "vitro", "and", "in", " ", "vivo", "but", "are", "clinically", "unsafe", "for", "further", "evaluations.46,47", "The", "most", "potent", "LRAs", ",", "including", "HDACi", "and", "protein", "kinase", "C", "(", "PRKC", ")", "agonist", "bryostatin-1", ",", "activate", "the", "canonical", "NFKB", "pathway,46", "causing", "explicit", "T", " ", "cell", "activation", "and", "broad", "cytotoxicity", ",", "and", "hence", "eliciting", "significant", "collateral", "damage", "on", "host", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL-8", "receptor", "CXCR1", "may", "be", "a", "biomarker", "for", "cancer", "stem", "cells", "[", "64", "]", ",", "including", "glioblastoma", "stem", "cells", "[", "58", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Phosphatidylethanolamine", "cytidyltransferase", "2(PCYT2", ")", "is", "the", "rate-limiting", "enzyme", "of", "the", "CDP-Etn", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "previous", "work", "demonstrated", "that", "DNA-PK", "may", "also", "function", "as", "a", "repressor", "of", "MYT1L", ",", "resulting", "in", "the", "transcriptional", "inhibition", "of", "tumor", "suppressor", "p21", ",", "a", "transcriptional", "target", "of", "MYT1L", "[", "29", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "further", "explore", "the", "Tat", "dependency", "of", "KL-2", ",", "we", "tried", "to", "rescue", "Tat", "function", "in", "the", "U1", "cell", "line", "using", "a", "Dox-inducible", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "found", "that", "knock-out", "of", "SEC", "components", "from", "activated", ",", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "from", "12", "independent", "donors", "did", "not", "inhibit", "viral", "replication", ",", "suggesting", "that", "the", "SEC", "is", "not", "required", "in", "this", "cellular", "context", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Effects", "of", "CYTOR", "on", "HIV", "infection", "and", "latency", "establishment", "were", "also", "confirmed", "in", "stimulated", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "(", "Fig", "3", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "in", "the", "loss-of-function", "DNA-PK", "M059J", "cell", "line", ",", "the", "knockdown", "of", "MYT1L", "promoted", "cell", "proliferation", ",", "attenuated", "apoptosis", ",", "and", "shortened", "the", "S", "phase", "(", "Figure", "2A", "–", "D", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Taken", "together", ",", "our", "results", "demonstrate", "that", "MYT1L", "functionality", "depends", "on", "DNA-PK", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "SOCS1", "is", "known", "to", "act", "as", "a", "feedback", "inhibitor", "of", "JAK-STAT", "signaling", "(", "Liau", "et", "al.", "2018", ")", ",", "but", "paradoxically", ",", "its", "overexpression", "in", "tumors", "has", "been", "associated", "with", "immune", "escape", "mechanisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", "to", "phytol", ",", "the", "saponifiable", "matter", "of", "the", "DCM", "fraction", "contained", "palmitic", "acid", "(", "31.27", "%", ")", "and", "linolenic", "acid", "(", "26.98", "%", ")", "as", "the", "major", "components", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "eukaryotic", "PE", "in", "vivo", ",", "two", "main", "synthetic", "pathways", "exist", "[", "12", "]", ":", "including", "the", "Kennedy", "pathway", "of", "CDP-ethanolamine(CDP-Etn", ")", "and", "mitochondrial", "phosphatidylserine", "decarboxylation", "pathway", "[", "13", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "these", "analyses", "all", "genes", "whose", "gene", "symbols", "could", "be", "mapped", "to", "ENTREZ", "Ids", "using", "the", "org", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "reducing", "power", "assay", ",", "polar", "conifer", "bark", "extracts", "exhibited", "EC50", "values", "ranging", "from", "9.17", "±", "0.13", "to", "25.32", "±", "0.62", "μg/mL", "[", "29,35,37", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "If", "a", "sgRNA-Cas9", "combination", "can", "target", "and", "disrupt", "the", "LTR", "sequence", ",", "a", "reduction", "in", "luciferase", "activity", "is", "observed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "in", "addition", "to", "PRMT3", ",", "other", "members", "of", "the", "PRMT", "family", "should", "be", "explored", "as", "potential", "targets", "for", "developing", "effective", "antiviral", "drugs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "ns", ",", "∗", ",", "∗∗", ",", "∗∗∗", ",", "signify", "not", "significant", ",", "Figure", " ", "2", ",", "the", "exact", "p", "values", "were", "∗p", " ", "=", "0.026", ",", "∗∗p", " ", "=", "0.007", ",", "∗∗∗p", " ", "=", "0.0004", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "found", "that", "in", "normal", "DNA-PK", "glioblastoma", "M059", "K", "cell", "lines", ",", "knockdown", "of", "MYT1L", "attenuated", "cell", "proliferation", "and", "induced", "apoptosis", "and", "S-phase", "cell", "cycle", "arrest", "(", "Figure", "1A", "–", "D", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Flavopiridol", ",", "abemaciclib", ",", "and", "palbociclib", "are", "a", "few", "examples", "of", "antitumor", "drugs", "that", "suppress", "the", "cell", "cycle", "via", "inhibition", "of", "enzymes/proteins", "(", "cyclin-dependent", "kinases/cyclins", ")", "responsible", "for", "driving", "the", "progression", "of", "the", "cell", "cycle", "from", "one", "phase", "to", "the", "next", "one", "[", "60", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "aimed", "to", "investigate", "the", "role", "of", "PCYT2", "in", "human", "hepatocellular", "carcinoma", "cells", "(", "HepG2", ")", "by", "inhibiting", "their", "proliferation", ",", "invasion", ",", "and", "migration", "abilities", "and", "promoting", "cell", "apoptosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PRMT3", ",", "which", "has", "been", "shown", "to", "function", "in", "transcriptional", "regulation", "and", "antiviral", "innate", "immunity15,30,36", ",", "was", "among", "the", "hits", "with", "the", "highest", "fold", "enrichment", "of", "sgLTR/sgGal4", ",", "and", "was", "therefore", "selected", "for", "subsequent", "investigation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "the", "IL-8/CXCR1/STAT3", "pathway", "is", "crucial", "for", "the", "maintenance", "of", "glioblastoma", "stem", "cells", "[", "59", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "both", "compounds", "reduced", "LRA", "efficacy", ",", "KL-2", "still", "boosted", "the", "activity", "of", "JQ1", "and", "PMA", ",", "but", "not", "AZD5582", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One-way", "analysis", "of", "variance", "(", "ANOVA", ")", "followed", "by", "Tukey", "’s", "post-hoc", "test", "was", "used", "to", "compare", "multiple", "groups", ",", "and", "an", "unpaired", "Student", "’s", "t-test", "was", "used", "for", "pairwise", "comparisons", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ectopic", "MYT1L", "induced", "down-regulation", "of", "caspase", "3", "(", "Figure", "1", "K", ",", "Supplementary", "Figure", "S1", ")", "in", "both", "HEK293", "and", "M509", "K", "cells", ",", "which", "may", "play", "a", "contributing", "role", "in", "apoptotic", "inhibition", "(", "Figure", "1I", ",", "J", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pause", "release", "is", "regulated", "by", "positive", "transcription", "elongation", "factor-b", "(", "P-TEFb", ")", ",", "a", "heterodimeric", "protein", "complex", "composed", "of", "cyclin-dependent", "kinase", "9", "(", "CDK9", ")", "and", "cyclin", "T1", "(", "CCNT1", ")", "[", "19–21", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "mentioned", "earlier", ",", "the", "sub-G1", "population", "is", "a", "hallmark", "of", "apoptosis", "[", "39,40", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Blocks", "to", "transcriptional", "elongation", "are", "major", "contributors", "to", "establishing", "and", "maintaining", "HIV-1", "latency", "[", "13,14", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "CYTOR", "is", "an", "important", "regulator", "of", "TCR-induced", "actin", "polymerization", "in", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "This", "approach", "would", "provide", "a", "deeper", "understanding", "of", "the", "cellular", "response", "to", "sustained", "high-glucose", "and", "glucose", "fluctuations", "and", "could", "improve", "the", "development", "of", "targeted", "therapeutic", "strategies", "for", "retinal", "pathologies", "in", "human", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Piceatannol", "caused", "apoptosis", "and", "G0/G1", "phase", "arrest", "in", "T24", "and", "HT1376", "human", "bladder", "cancer", "cells", "[", "70", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Only", "peptides", "with", "at", "least", "six", "amino", "acids", "in", "length", "were", "considered", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Following", "20–25", "d", ",", "the", "tumors", "achieved", "a", "certain", "size", "and", "the", "micewere", "anesthetized", "with", "isopentane", "and", "sacrificed", ";", "the", "tumors", "were", "collected", "for", "follow-up", "evaluation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "steps", "are", "crucial", "for", "validating", "the", "preclinical", "promise", "and", "advancing", "the", "clinical", "applicability", "of", "the", "Alnus", "incana", "DCM", "fraction", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "previous", "studies", "indicated", "that", "MYT1L", "was", "overexpressed", "in", "glioblastoma", "cell", "lines", "and", "46.9", "%", "of", "malignant", "glioma", "tissue", "samples", "(", "n", "=", "32", ")", "[", "29", "]", ",", "functioning", "as", "an", "oncogene", "in", "glioblastoma", "cells", "with", "normal", "DNA-PK", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "washing", "with", "TBST", ",", "membranes", "were", "incubated", "with", "horseradish", "peroxidase", "(HRP)-conjugated", "secondary", "anti-mouse", "IgG", "antibody", "or", "anti-rabbit", "IgG", ",", "HRP-linked", "antibody", ",", "for", "1", " ", "h", "at", "room", "temperature", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Resveratroloside", "(", "1", ")", "and", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "are", "not", "the", "sole", "stilbenes", "that", "cause", "tumor", "cell", "death", "by", "triggering", "non-apoptotic", "mechanisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "saponifiable", "fraction", "presented", "a", "balanced", "composition", "of", "saturated", "(", "48.69", "%", ")", "and", "unsaturated", "(", "51.29", "%", ")", "fatty", "acids", ",", "with", "palmitic", "acid", ",", "linolenic", "acid", ",", "and", "linoleic", "acid", "as", "the", "predominant", "compounds", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "was", "to", "be", "expected", "that", "hyperglycemia", "alone", "did", "not", "modulate", "VEGF-A", "expression", "and", "secretion", "within", "6", "h", ",", "as", "possible", "changes", "likely", "manifest", "only", "after", "extended", "exposure", "(", "32", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "conceivable", "that", "such", "an", "impact", "is", "significant", "considering", "the", "modest", "effect", "of", "APG-1387", "on", "latency", "reversal", "in", "this", "experimental", "condition", "and", "the", "limited", "functional", "immune", "clearance", "mechanisms", "present", "in", "hu-BLT", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "On", "cellular", "gene", "promoters", "such", "as", "the", "three", "genes", "mentioned", "above", ",", "it", "is", "conceivable", "that", "transcription", "can", "also", "be", "modulated", "through", "controlling", "the", "function", "and/or", "binding", "of", "the", "PRMT3-TEAD4", "complex", "to", "the", "GGAAT", "motif", "in", "response", "to", "changes", "in", "physiological", "or", "pathological", "conditions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cells", "were", "subsequently", "fixed", "in", "3", "%", "paraformaldehyde", "for", "15", "minutes", ",", "permeabilized", "for", "2", "minutes", "in", "0.1", "%", "TritonX-100", ",", "and", "blocked", "for", "30", "minutes", "in", "1", "%", "Fetal", "Calf", "Serum", "(", "FCS", ")", "in", "PBS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "example", ",", "a", "recent", "study", "reported", "synergistic", "reactivation", "potential", "between", "an", "activator", "of", "non-canonical", "NF-kB", "signaling", "(", "AZD5582", ")", "and", "BET", "bromodomain", "inhibitors", "that", "act", "to", "lift", "blocks", "to", "transcriptional", "initiation", "and", "elongation", ",", "respectively", "[", "12", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Trimmed", "reads", "were", "aligned", "to", "the", "Homo", "sapiens", "reference", "genome", "GRCh38", "and", "transcripts", "quantified", "using", "the", "Hisat2-StringTie", "pipeline", "[", "76", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "soluble", "chromatin", "fraction", "(", "25", "μg", ")", "was", "collected", "and", "immunoprecipitated", "(", "IP", ")", "overnight", "at", "4", "°", "C", "on", "a", "rotating", "wheel", "in", "IP", "buffer", "(", "0.5", "%", "Triton", "X-100", ",", "2", "mM", "EDTA", ",", "20", "mM", "Tris", "pH-7.8", ",", "150", "mM", "NaCl", "and", "10", "%", "glycerol", ")", "with", "2.5", "μg", "of", "one", "of", "the", "indicated", "antibodies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "reinforce", "the", "potential", "of", "A.", "incana", "DCM", "fraction", "as", "an", "effective", "anticancer", "agent", "by", "simultaneously", "inducing", "cell", "cycle", "arrest", "and", "apoptosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Previous", "studies", "have", "reported", "similar", "synergistic", "interactions", "in", "pine", "bark", "extracts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Selected", "ions", "were", "sequentially", "fragmented", "by", "HCD", "with", "30", "%", "normalized", "collision", "energy", ",", "specified", "isolated", "windows", "1.6", " ", "m/z", ",", "and", "15,000", "resolutions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Specifically", ",", "we", "selected", "three", "host", "genes", ",", "PRDM1", ",", "SLITRK5", ",", "and", "TGFB2", ",", "for", "further", "validation", "of", "our", "proposed", "PRMT3-TEAD4", "regulation", "model", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cellular", "genes", "regulated", "by", "CYTOR", "include", "actin", "remodeling", "genes", "that", "promote", "actin", "polymerization", "and", "the", "indirect", "activation", "of", "HIV", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "assay", "detects", "phosphatidylserine", "translocation", ",", "a", "hallmark", "of", "early", "apoptosis", ",", "by", "Annexin", "V-FITC", "staining", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "increasing", "number", "of", "studies", "have", "focused", "on", "the", "progression", ",", "pathological", "features", ",", "and", "prognosis", "of", "liver", "cancer", "[", "3–5", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Experimental", "evidence", ",", "however", ",", "is", "required", "and", "further", "research", "with", "experimental", "evidence", "remains", "to", "be", "performed", "in", "the", "future", "to", "confirm", "the", "possible", "suppression", "of", "immune", "evasion", "tactic", "with", "endostar", "treatment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "reveals", "a", "positive", "feedback", "DNA-PK/MYT1L-CXCR1", "proliferative", "signaling", "loop", "that", "contributes", "to", "the", "progression", "of", "glioblastoma", "via", "the", "ERK1/2", "pathway", "and", "provides", "a", "novel", "insight", "into", "the", "role", "of", "DNA-PK", "in", "the", "MYT1L-mediated", "transactivation", "of", "CXCR1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Other", "polar", "conifer", "bark", "extracts", "exhibited", "higher", "activity", "on", "HeLa", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]

[ "Its", "unique", "ability", "to", "activate", "apoptotic", "and", "cell-cycle", "arrest", "pathways", "supports", "its", "promise", "as", "an", "adjunctive", "therapy", ",", "particularly", "in", "combination", "with", "conventional", "chemotherapeutic", "agents", ",", "which", "may", "improve", "treatment", "outcomes", "by", "reducing", "associated", "toxicities", "or", "overcoming", "resistance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "statistical", "analyses", "were", "performed", "in", "GraphPad", "Prism", "version", "9", "(", "GraphPad", "Software", ",", "Inc.", ")", ";", "means", "and", "standard", "deviations", "are", "provided", "as", "numbers", "or", "as", "scatter", "plots", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Future", "research", "could", "benefit", "from", "using", "primary", "Müller", "cells", "to", "better", "reflect", "the", "in", "vivo", "context", "of", "human", "diabetic", "retinopathy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "important", "strategy", "in", "cancer", "therapy", "is", "the", "induction", "of", "cell", "cycle", "arrest", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "the", "first", "time", ",", "our", "findings", "demonstrated", "that", "DNA-PK", "may", "functionally", "modulate", "the", "transcriptional", "activity", "of", "MYT1L", "by", "phosphorylation", ",", "eventually", "leading", "to", "the", "transcriptional", "activation", "of", "CXCR1", ",", "although", "this", "requires", "further", "validation", "using", "chromatin", "immunoprecipitation", "quantitative", "PCR", "(", "ChIP-qPCR", ")", "and", "the", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", "(", "EMSA", ")", "when", "a", "ChIP-grade", "antibody", "to", "the", "phosphorylated", "MYT1L", "is", "commercially", "available", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "e", "Proteins", "showing", "over", "1.5-fold", "enrichment", "relative", "to", "the", "control", "sample", "identified", "from", "3", "×", "Flag-dCas9", "immunoprecipitation", "following", "by", "mass", "spectrometry", "analysis", "were", "listed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "indicated", "that", "in", "cooperation", "with", "DNA-PK", ",", "MYT1L", "may", "function", "as", "an", "oncogene", "in", "the", "progression", "of", "glioblastoma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "attempted", "to", "test", "this", "by", "inhibiting", "Tat", "in", "the", "J-Lat", "5A8", "model", "cell", "line", "using", "two", "previously", "described", "Tat-dependent", "transcription", "inhibitors", ",", "Triptolide", "and", "Spironolactone", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "example", ",", "BET", "bromodomain", "inhibitors", "(", "such", "as", "JQ1", ")", "have", "been", "shown", "to", "be", "potent", "LRAs", "in", "ex", "vivo", "models", "by", "releasing", "P-TEFb", "from", "BRD4", "[", "12", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "4.9", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "precise", "mechanism(s", ")", "underlying", "these", "transcriptional", "effects", "of", "PRMT3", "remain", "unclear", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Source", "paper", ":", "PMC12115102" ]

[ "O", "O", "O", "O" ]

[ "BET", "bromodomain", "inhibitors", "have", "also", "been", "reported", "to", "increase", "HIV-1", "transcriptional", "initiation", "[", "12,13", "]", ",", "though", "these", "effects", "have", "been", "suggested", "to", "occur", "through", "modulation", "of", "the", "epigenetic", "regulatory", "functions", "of", "these", "proteins", "[", "66", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "additional", "pathways", "were", "identified", "by", "our", "RNA-seq", "analysis", "in", "CYTOR-depleted", "cells", ",", "we", "visualize", "that", "future", "work", "will", "identify", "novel", "downstream", "targets", "of", "CYTOR", "and", "elucidate", "their", "mechanisms", "of", "function", "in", "regulating", "HIV", "gene", "expression", "and", "latency", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "as", "MIO-M1", "cells", "secreted", "increased", "quantities", "of", "IL-6", "when", "exposed", "to", "hyperglycemia", "and", "angiotensin", "II", ",", "the", "pro-inflammatory", "axis", "seems", "to", "exceed", "the", "anti-inflammatory", "response", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "materials", "and", "methods", "4.7", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Extending", "these", "studies", "to", "primary", "Müller", "cells", "in", "future", "research", "would", "provide", "a", "more", "physiologically", "relevant", "system", ",", "helping", "to", "validate", "and", "refine", "our", "findings", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Additionally", ",", "the", "relatively", "high", "IC50", "necessitates", "exploration", "of", "advanced", "drug", "delivery", "systems", "or", "combination", "therapies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "context", ",", "the", "aim", "of", "the", "“", "shock-and-kill", "”", "strategy", "is", "to", "reactivate", "latently", "infected", "cells", "with", "latency", "reversal", "agents", "(", "LRAs", ")", "and", "render", "them", "vulnerable", "to", "cell", "death", "or", "clearance", "by", "the", "immune", "system.7,8", "Previously", "reported", "approaches", "to", "HIV", "reactivation", ",", "including", "protein", "kinase", "C", "(", "PRKC", ")", "agonists", ",", "histone", "deacetylase", "(", "HDAC", ")", "inhibitors", "(", "HDACi", ")", ",", "and", "toll-like", "receptor", "(", "TLR", ")", "agonists,9", "have", "been", "highly", "effective", "in", "in", " ", "vitro", "models", "of", "latency", ",", "but", "their", "efficacy", "is", "only", "moderate", "when", "tested", "in", " ", "vivo.10,11,12,13", "Moreover", ",", "by", "broadly", "activating", "cellular", "pathways", ",", "these", "compounds", "elicit", "significant", "proinflammatory", "effects", "or", "alter", "the", "function", "and", "fate", "of", "specific", "immune", "effector", "cells,14,15", "hence", "limiting", "their", "use", "in", "clinical", "settings.16,17,18,19", "Similarly", ",", "promising", "candidates", "such", "as", "bryostatin-1", "and", "analogs", ",", "phorbol", "esters", ",", "and", "phosphatidylethanolamine", "binding", "protein", "1", "(", "PEBP1", ")", "agonists", "reactivate", "HIV", "via", "activation", "of", "the", "canonical", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NFKB", ")", "pathway,13,20", "inadvertently", "leading", "to", "uncontrolled", "cytokine", "release", "and", "overt", "T", " ", "cell", "activation.21,22", "Consequently", ",", "there", "is", "a", "need", "to", "develop", "alternative", "approach(es", ")", "that", "can", "reactivate", "latent", "reservoirs", "and", "eliminate", "infected", "cells", "without", "triggering", "systemic", "activation", ",", "inflammation", ",", "or", "impairment", "of", "immune", "clearance", "mechanisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Statistical", "significance", "was", "set", "at", "P", " ", "*", "*", "*", "Results", "*", "*", "*", "Discussion", "PCYT2", "is", "a", "rate-limiting", "enzyme", "in", "PE", "synthesis", "that", "is", "commonly", "used", "in", "the", "study", "of", "obesity-related", "diseases", ",", "such", "as", "non-alcoholic", "fatty", "liver", "disease", "and", "type", "2", "diabetes", "[", "12,20–22", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Antigens", "must", "be", "processed", "into", "antigenic", "peptides", "by", "APM", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "processes", "are", "of", "pivotal", "importance", "in", "the", "onset", "and", "progression", "of", "retinal", "neurodegeneration", "and", "diabetic", "retinopathy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "findings", "have", "demonstrated", "a", "positive", "feedback", "DNA-PK/MYT1L-CXCR1-ERK1/2", "proliferative", "signaling", "loop", "in", "glioblastoma", "cells", "and", "might", "have", "significant", "therapeutic", "implications", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "could", "be", "suggested", "that", "an", "incubation", "time", "of", "6", "h", "is", "too", "short", ",", "but", "due", "to", "the", "short", "half-life", "of", "angiotensin", "II", ",", "longer", "exposure", "times", "would", "likely", "not", "result", "in", "more", "relevant", "data", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]