OTAR3088/CeLLaTe-V2-split · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 311	tags listlengths 2 311
[ "However", ",", "increased", "IL-6", "expression", "is", "likely", "independent", "of", "the", "angiotensin", "II/AT1-axis", ",", "as", "possibly", "endogenously", "produced", "peptide", "hormone", "is", "inactivated", "by", "high", "levels", "of", "ACE2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Samples", "were", "centrifuged", "(", "15", "minutes", ",", "14,000", "rpm", ",", "4", "°", "C", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "large", "number", "of", "studies", "conducted", "on", "polydatin", "has", "revealed", "versatility", "in", "modulating", "numerous", "targets", "related", "to", "oxidative", "stress", "(", "Nrf2", "and", "Akt", "pathways", ",", "glutathione", ",", "catalase", "(", "CAT", ")", ",", "SOD", ",", "GPx", ",", "GST", ",", "MPO", ")", ",", "inflammation", "(", "NF-κB", ",", "phospholipase", "A2", "(", "PLA2", ")", ",", "COX-2", ",", "iNOS", ",", "TNF-α", ",", "IL-1β", ",", "IL-6", ",", "ICAM-1", ",", "MAPKs", ",", "ERK1/2", ",", "JNK1/2", ")", ",", "and", "apoptosis", "(", "p53/MAPK/JNK", "and", "PI3K/Akt/mTOR", "pathways", ",", "B-cell", "lymphoma", "2", "(", "Bcl-2", ")", ",", "Bcl-2-associated", "x", "(", "Bax", ")", ",", "D-cyclins", ",", "caspase-3", ",", "cytochrome", "c", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "HIV-Tat", "orchestrates", "transcription", "elongation", "of", "the", "provirus", "by", "binding", "to", "TAR", "RNA", "and", "recruiting", "P-TEFb", "and", "Super", "Elongation", "Complex", "(", "SEC", ")", "to", "the", "viral", "promoter", "[", "22–26", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Consequently", ",", "their", "antagonists", "are", "thought", "to", "either", "directly", "induce", "or", "sensitize", "cancerous", "cells", "to", "death", "by", "triggering", "proapoptotic", "pathways.50,51", "Interestingly", ",", "IAPs", "such", "as", "BIRC2", "have", "recently", "been", "shown", "to", "be", "negative", "regulators", "of", "HIV", "transcription", ",", "and", " ", "their", "expression", "is", "found", "to", "be", "correlated", "with", "viral", "latency.23,31,32", "Indeed", ",", "both", "BIRC2/3", "and", "XIAP", "are", "overexpressed", "in", "HIV", "latently", "infected", "CD4", "+", "T", "and", "myeloid", "cells", ",", "and", "the", "SMs", "which", "induce", "the", "degradation", "of", "these", "IAPs", "can", "reactivate", "HIV", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Significantly", ",", "upon", "T", "cell", "stimulation", ",", "depletion", "of", "CYTOR", "promoted", "entry", "of", "HIV", "into", "a", "latent", "state", ",", "while", "its", "over-expression", "delayed", "entry", "into", "latency", "and", "enhanced", "latency", "reversal", "(", "Fig", "2", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Research", "on", "the", "antitumor", "potential", "(", "mechanisms", "underlying", "cytotoxic", "activity", "in", "HeLa", "cells", ",", "cytotoxicity", "against", "other", "tumor", "cell", "lines", ")", "should", "also", "continue", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "conclusion", ",", "this", "study", "provided", "compelling", "data", "demonstrating", "the", "aberrant", "expression", "and", "functional", "role", "of", "PCYT2", "in", "HepG2", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]
[ "Despite", "these", "findings", ",", "no", "evidence", "exists", "that", "suggests", "that", "PCYT2", "expression", "is", "associated", "with", "HCC", "occurrence", "and", "development", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "g", "ChIP-qPCR", "analyses", "were", "conducted", "to", "assess", "the", "occupancy", "of", "PRMT3", "at", "LTR-luciferase", "regions", "in", "the", "absence", "or", "presence", "of", "Tat", "(", "p", " ", "=", " ", "0.0022", ",", "p", " ", "=", " ", "0.0012", ",", "p", " ", "=", " ", "0.0045", ",", "p", " ", "=", " ", "0.0017", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "P-TEFb", "phosphorylates", "the", "C-terminal", "tail", "of", "RNA", "Pol", "II", "and", "several", "negative", "elongation", "factors", ",", "which", "collectively", "license", "transcriptional", "elongation", "[", "22–24", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Unlike", "IL-8", ",", "GROα", "more", "selectively", "binds", "to", "the", "CXCR2", "receptor", ",", "while", "the", "affinity", "to", "CXCR1", "is", "significantly", "lower", "[", "55", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "suggest", "that", "curcumin", "may", "serve", "as", "a", "therapeutic", "adjuvant", "in", "NSCLC", ",", "potentially", "improving", "immune", "checkpoint", "inhibitor", "(", "ICI", ")", "efficacy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "Tat", "induction", "itself", "was", "sufficient", "for", "reactivation", ",", "this", "reactivation", "was", "completely", "abolished", "by", "the", "addition", "of", "KL-2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "the", "SH-SY5Y", "cell", "line", "is", "a", "subclone", "of", "the", "SK-N-SH", "cell", "line", ",", "the", "global", "gene", "expression", "microarray", "showed", "a", "profound", "differential", "expression", "of", "genes", "in", "these", "two", "cell", "lines", "[", "60", "]", "." ]	[ "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "mammalian", "cell", "cycle", "comprises", "four", "distinct", "phases", ":", "G1", ",", "S", ",", "G2", ",", "and", "M", ",", "where", "RNA", "and", "protein", "synthesis", "occur", "in", "G1", "and", "G2", ",", "DNA", "replication", "in", "S", ",", "and", "chromosome", "segregation", "in", "M", "[", "18", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Resveratroloside", "(", "1", ")", "exhibited", "higher", "activity", "than", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "in", "both", "assays", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "KL-2", "alone", "failed", "to", "significantly", "increase", "HIV-1", "gag", "transcript", "levels", "in", "patient", "PBMCs", ",", "in", "combination", "with", "AZD5582", "it", "resulted", "in", "a", "16-fold", "increase", "over", "AZD5582", "treatment", "alone", "and", "a", "53-fold", "increase", "over", "the", "DMSO", "control", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "conclusion", ",", "the", "results", "of", "the", "present", "in", "vitro", "study", "provide", "evidence", "that", "the", "responses", "of", "Mueller", "cells", "to", "activation", "of", "the", "RAAS", "by", "angiotensin", "II", "depend", "on", "the", "environment", ":", "A", "pro-inflammatory", "response", "is", "observed", "under", "hyperglycemic", "(", "plus", "hypoxic", ")", "conditions", ",", "whereas", "changes", "induced", "by", "hypoxia", "are", "not", "modulated", "by", "angiotensin", "II", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "4", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "Their", "structures", "were", "confirmed", "by", "1H-NMR", ",", "13C-NMR", ",", "and", "HRESIMS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "failures", "highlight", "our", "lack", "of", "knowledge", "of", "the", "molecular", "mechanisms", "that", "govern", "latency", "establishment", "and", "reversal", "and", "the", "need", "for", "alternative", "therapies", "capable", "of", "eliminating", "the", "viral", "reservoirs", "[", "10–15", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "inhibition", "of", "HIF-1", "and", "improvement", "of", "MHC", "class", "I", "expression", "on", "cancer", "cells", "is", "important", "to", "induce", "effective", "responses", "of", "cell-mediated", "immunity", "against", "cancer", "such", "as", "lung", "cancer", "for", "immunotherapies", ",", "including", "PD-1/PD-L1", "inhibitor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "the", "effects", "of", "other", "stressors", ",", "such", "as", "oxidative", "stress", "or", "hypoxia", ",", "which", "also", "play", "a", "role", "in", "diabetic", "retinal", "damage", ",", "were", "not", "included", "in", "our", "model", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "we", "demonstrate", "that", "APG-1387", ",", "a", "bivalent", "SM", "initially", "developed", "as", "a", "cancer", "therapy", ",", "can", "efficiently", "reactivate", "HIV", "in", "CD4", "+", "T", " ", "cell", "line", "models", "of", "HIV-1", "latency", "via", "a", "process", "that", "involves", "activation", "of", "the", "noncanonical", "NFKB", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "human", "breast", "cancer", "cells", "(", "MCF-7", ")", ",", "the", "level", "of", "PCYT2", "in", "cancer", "cells", "is", "elevated", "in", "response", "to", "the", "stressful", "environment", "[", "26", "]", "." ]	[ "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "1", ")", "sgRNAs", "targeting", "the", "LTR", "were", "complex", "formation", "with", "dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", ";", "(", "2", ")", "Crosslinking", "of", "proteins", "bound", "to", "the", "LTR", ";", "(", "3", ")", "dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag-sgRNA", "complex", "was", "incubated", "with", "sheared", "fragments", "from", "NH1", "cells", "that", "stably", "expressed", "LTR-luciferase", "reporter", ";", "(", "4", ")", "Immunoprecipitation", "was", "used", "to", "capture", "LTR", "bound", "proteins", ";", "(", "5", ")", "LTR-interacted", "proteins", "were", "identified", "by", "mass", "spectrometry", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "PCR", "cycles", "were", "as", "follows", ":", "50", "°", "C", "for", "2", "minutes", ",", "95", "°", "C", "for", "20", "seconds", ",", "followed", "by", "40", "cycles", "of", "95", "°", "C", "for", "1", "second", "and", "60", "°", "C", "for", "20", "seconds", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "MS", "spectra", "(", "350–1500", " ", "m/z", ")", "were", "collected", "with", "120,000", "resolutions", ",", "AGC", "of", "4", "×", "105", ",", "and", "50", " ", "ms", "maximal", "injection", "time", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Conclusion", "This", "study", "demonstrates", "that", "the", "A.", "incana", "DCM", "fraction", ",", "rich", "in", "bioactive", "compounds", "such", "as", "phytol", ",", "palmitic", "acid", ",", "and", "linolenic", "acid", ",", "exerts", "notable", "cytotoxic", "effects", "on", "various", "cancer", "cell", "lines", ",", "particularly", "HeLa", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]
[ "Similarly", ",", "ISG15", "has", "been", "implicated", "in", "tumor", "progression", "and", "resistance", "to", "therapy", "(", "Meng", "et", "al.", "2024", ")", ",", "suggesting", "that", "its", "downregulation", "by", "curcumin", "may", "have", "additional", "therapeutic", "benefits", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "findings", "provide", "strong", "evidence", "that", "curcumin", "inhibits", "IFN-γ-induced", "STAT1", "activation", ",", "thereby", "reducing", "PD-L1", "expression", "and", "enhancing", "the", "anti-proliferative", "effects", "of", "IFN-γ", "in", "NSCLC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "would", "allow", "us", "to", "understand", "the", "interlink", "between", "DNA-PK-MYT1L-CXCR1-pERK1/2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Membranes", "were", "blocked", "with", "5", "%", "BSA", "in", "Tris-buffered", "saline", "with", "0.1", "%", "Tween-", "20", "(", "TBST", ")", "for", "1", "h", "at", "room", "temperature", "to", "prevent", "non-specific", "binding", "and", "incubated", "overnight", "at", "4", " ", "°", "C", "with", "primary", "antibodies", "against", "phospho-STAT1", "(", "Tyr701", ")", ",", "total", "STAT1", ",", "PD-L1", ",", "and", "β-actin", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "the", "ectopic", "expression", "of", "MYT1L", "promoted", "cell", "proliferation", ",", "inhibited", "apoptosis", ",", "and", "shortened", "the", "S", "phase", "(", "Figure", "1E", ",", "F", ",", "H", ",", "J", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "same", "assay", ",", "the", "aglycones", ",", "resveratrol", "and", "pinostilbene", ",", "were", "more", "active", "than", "the", "corresponding", "glycosides", ",", "showing", "ORAC", "values", "of", "5.26", "±", "0.26", "and", "5.01", "±", "0.27", "Trolox", "equivalents/μM", ",", "respectively", "[", "48", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Despite", "these", "promising", "results", ",", "the", "study", "possesses", "limitations", "typical", "of", "in", "vitro", "investigations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Resveratrol", "was", "reported", "to", "induce", "tumor", "cell", "death", "by", "apoptosis", ",", "autophagy", ",", "necroptosis", ",", "and", "necrosis", "[", "56,57", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "despite", "extensive", "efforts", "to", "elucidate", "the", "mechanisms", "of", "metazoan", "transcriptional", "control", "and", "its", "role", "in", "the", "regulation", "of", "HIV", "gene", "transcription", ",", "the", "knowledge", "of", "how", "HIV", "latency", "is", "established", "is", "still", "incomplete", "[", "27", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Dynamic", "exclusion", "was", "set", "to", "40", " ", "s.", "Unassigned", "ions", "or", "those", "with", "a", "charge", "of", "2", " ", "+", "and", ">", "7", " ", "+", "were", "rejected", "for", "MS/MS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "previous", "study", "demonstrated", "that", "high-glucose", "conditions", "have", "been", "associated", "with", "increased", "SOX2", "levels", "in", "human", "Müller", "glial", "cells", ",", "which", "may", "support", "cell", "survival", "and", "regeneration", "under", "stress", "conditions", "[", "51", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Equal", "amounts", "of", "protein", "(", "20", "μg", "per", "sample", ")", "were", "separated", "on", "10", "%", "sodium", "dodecyl", "sulfate", "–", "polyacrylamide", "gels", "(", "SDS-PAGE", ")", "and", "transferred", "onto", "0.45", "μM", "nitrocellulose", "membranes", "(", "Merck", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", "to", "our", "findings", ",", "Dar", "et", "al.", "(", "2016", ")", "reported", "a", "strong", "antioxidant", "potential", "for", "resveratroloside", "in", "the", "DPPH", "assay", "(", "IC50", "=", "14.0", "μg/mL", ")", "[", "47", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "step", "is", "done", "in", "the", "presence", "of", "ART", ",", "so", "there", "are", "no", "further", "rounds", "of", "HIV", "replication", ".", "[" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "proliferative", "inhibition", "mediated", "by", "ectopic", "expression", "of", "MYT1L", "in", "M059J", "cells", "may", "not", "be", "attributed", "to", "the", "activation", "of", "these", "two", "pathways", "(", "Figure", "2I", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "cDNA", "synthesis", ",", "500", "ng", "of", "RNA", "was", "reverse", "transcribed", "using", "the", "RevertAid", "First", "Strand", "cDNA", "Synthesis", "Kit", "to", "cDNA", "as", "per", "the", "manufacturer", "’s", "instructions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Members", "of", "this", "family", "have", "been", "divided", "into", "four", "subfamilies", ",", "CXC", ",", "CC", ",", "C", ",", "and", "CX3C", ",", "based", "on", "the", "arrangement", "of", "the", "first", "two", "of", "the", "four", "conserved", "cysteine", "residues", "in", "the", "amino", "terminus", "of", "the", "proteins", ",", "which", "can", "bind", "CXCR", ",", "CCR", ",", "XCR1", ",", "and", "CX3CR1", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "software", "used", "in", "data", "analysis", "along", "with", "statistical", "parameters", "were", "mentioned", "in", "the", "appropriate", "Figure", " ", "legends", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Notably", ",", "we", "performed", "Cleavage", "Under", "Targets", "&", "Tagmentation", "(", "CUT&Tag", ")", "sequencing", "by", "using", "IgG", "or", "PRMT3", "antibody", "in", "CD4", "+", "T", "cells", "isolated", "from", "HIV-1", "infected", "patient", "cells", ",", "and", "demonstrated", "that", "while", "IgG", "displayed", "undetectable", "signal", "at", "the", "LTR", ",", "PRMT3", "showed", "significant", "binding", "signal", "around", "LTR", "(", "Fig.", " ", "1h", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "consistent", "gate", "was", "then", "used", "to", "quantify", "the", "fraction", "of", "remaining", "cells", "that", "expressed", "the", "target", "of", "interest", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Quantitative", "real-time", "PCR", "(", "qRT-PCR", ")", "was", "conducted", "using", "the", "SYBR", "Green", "PCR", "Master", "Mix", "(", "Applied", "Biosystems", "™", ")", "on", "a", "QuantStudio", "5", "Machine", "(", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ",", "Inc.", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "general", ",", "the", "eluted", "LTR", "binding", "proteins", "were", "reduced", "in", "20", " ", "mM", "DTT", "at", "95", " ", "°", "C", "for", "5", " ", "min", ",", "and", "subsequently", "alkylated", "in", "50", " ", "mM", "iodoacetamide", "for", "30", " ", "min", "in", "the", "dark", "at", "room", "temperature", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Indeed", ",", "SEC", "disruption", "by", "KL-2", "in", "the", "original", "report", "of", "the", "inhibitor", "demonstrated", "an", "outsized", "impact", "on", "Myc-dependent", "transcription", "[", "32", "]", ",", "suggesting", "that", "additional", "factors", "driving", "the", "SEC", "dependency", "of", "proviral", "transcription", "have", "yet", "to", "be", "described", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Source", "paper", ":", "PMC12101583" ]	[ "O", "O", "O", "O" ]
[ "Source", "paper", ":", "PMC11419360" ]	[ "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "work", "demonstrates", "the", "importance", "of", "increasing", "the", "production", "or", "availability", "of", "free", "P-TEFb", "for", "recruitment", "to", "viral", "loci", "as", "a", "powerful", "strategy", "for", "bolstering", "current", "LRAs", ",", "most", "notably", "non-canonical", "NF-kB", "agonists", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "said", ",", "further", "experimentation", "with", "a", "larger", "group", "of", "animals", "analyzed", "at", "endpoint", "is", "needed", "to", "confirm", "the", "modulatory", "role", "of", "APG-1387", "on", "VRs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cells", "were", "fixed", "with", "1", "%", "formaldehyde", "for", "15", " ", "min", "at", "room", "temperature", "and", "0.125", " ", "M", "Glycine", "for", "5", " ", "min", "to", "quench", "unreacted", "formaldehyde", "at", "room", "temperature", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "A.", "incana", "DCM", "fraction", "demonstrated", "IC50", "values", "ranging", "from", "135.6", "to", "273.1", " ", "µg/mL", ",", "with", "HeLa", "cells", "(", "a", "cervical", "cancer", "model", ")", "showing", "the", "highest", "sensitivity", "(", "IC50", " ", "=", " ", "135.6", " ", "µg/mL", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "lower", "HIF-1", "and", "higher", "MHC", "class", "I", "were", "found", "in", "Endostar", "treated", "A549", "and", "NCI-H1299", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]
[ "Immunofluorescence", "confirmed", "that", "p-STAT1", "is", "translocated", "to", "nucleus", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "On", "the", "other", "hand", ",", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "exhibited", "higher", "activity", "than", "resveratroloside", "(", "1", ")", "in", "increasing", "the", "number", "of", "dead", "cells", "through", "non-apoptotic", "mechanisms", "(", "at", "25", "and", "50", "μg/mL", ")", "and", "in", "reducing", "HeLa", "cell", "proliferation", "(", "at", "25", "μg/mL", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Phase", "1", "and", "2", "clinical", "trials", "in", "prostate", "cancer", "with", "Navarixin", ",", "a", "small-molecule", "inhibitor", "of", "CXCR1/2", ",", "have", "been", "completed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "IL-8-CXCR1/2", "axis", "has", "been", "proposed", "as", "a", "potential", "therapeutic", "target", "for", "numerous", "cancers", "due", "to", "its", "contributing", "roles", "in", "proliferation", ",", "migration/invasion", ",", "angiogenesis", ",", "and", "tumor", "immunosuppression", "[", "61,62", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cells", "were", "lysed", "with", "lysis", "buffer", "[", "1", "%", "SDS", ",", "10", " ", "mM", "EDTA", ",", "50", " ", "mM", "Tris", ",", "pH", "8.1", "]", "and", "incubated", "on", "ice", "for", "20", " ", "min", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Exposure", "of", "cells", "to", "these", "conditions", "seemed", "to", "not", "result", "in", "induction", "of", "cellular", "stress", ",", "which", "may", "adversely", "affect", "the", "outcome", "of", "the", "investigations", ",", "since", "expression", "of", "IL-6", "mRNA", ",", "a", "marker", "of", "cellular", "stress", ",", "remained", "stable", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Even", "if", "transcriptional", "reactivation", "is", "achieved", ",", "it", "is", "unlikely", "this", "is", "sufficient", "to", "result", "in", "the", "clearance", "of", "these", "infected", "cells", "without", "additional", "immune", "augmentation", "such", "as", "the", "administration", "of", "antibodies", ",", "vaccines", ",", "or", "immunotherapies", "to", "prime", "the", "immune", "system", "[", "6", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "see", "whether", "MYT1L", "is", "also", "up-regulated", "in", "neuroblastoma", ",", "we", "compared", "its", "expression", "in", "both", "glioblastoma", "and", "neuroblastoma", "cell", "lines", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cells", "from", "blood", "and", "tissues", "were", "analyzed", "by", "flow", "cytometry", "as", "described", "in", "Section", "‘", "flow", "cytometry", "’", "below", "for", "the", "effect", "of", "APG-1387", "on", "cell", "proliferation", "and", "activation", "." ]	[ "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Regarding", "the", "impact", "of", "resveratroloside", "(", "1", ")", "and", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "on", "the", "HeLa", "cell", "cycle", ",", "both", "compounds", "induced", "a", "significant", "dose-dependent", "increase", "in", "the", "sub-G1", "phase", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Animal", "experiments", "Five-week-old", "BALB/c", "female", "nude", "mice", "were", "purchased", "from", "Jiangsu", "Jicui", "Pharmaceutical", "Biotechnology", "Co", ",", "passed", "SPF", "level", "training", "and", "assessment", ",", "and", "were", "routinely", "reared", "using", "standard", "SPF", "conditions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "By", "halting", "cells", "in", "the", "G0/G1", "phase", ",", "the", "A.", "incana", "DCM", "fraction", "appears", "to", "block", "progression", "to", "DNA", "synthesis", ",", "which", "could", "lead", "to", "senescence", "or", "cell", "death", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Regarding", "the", "mechanism", "whereby", "PCYT2", "influences", "cancer", "development", ",", "a", "previous", "report", "showed", "that", "PCYT2", "downregulation-induced", "phosphoethanolamine", "(", "PEtn", ")", "accumulation", "correlated", "with", "tumor", "growth", "under", "nutrient", "starvation", ",", "thereby", "PCYT2", "overexpression", "reduced", "PEtn", "levels", "and", "tumor", "growth", "[", "18", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "assays", "had", "been", "optimized", "for", "enough", "sensitivity", "to", "detect", "the", "reduced", "expression", "in", "Endostar", "treated", "A549", "cells", "and", "NCI-H1299", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]
[ "A", "p", "value", "of", "less", "than", "0.05", "was", "considered", "statistically", "significant", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "Cancer", "Genome", "Atlas", "(", "TCGA", ")", "datasets", "were", "used", "to", "analyze", "a", "relationship", "between", "MYT1L", "expression", "and", "CXCR1", "expression", "in", "glioblastoma", "and", "neuroblastoma", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "show", "that", "KL-2", ",", "a", "small", "molecule", "inhibitor", "of", "the", "interaction", "between", "the", "SEC", "and", "P-TEFb", ",", "is", "sufficient", "to", "enhance", "viral", "transcription", "in", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "and", "can", "synergistically", "enhance", "the", "activity", "of", "other", "LRAs", "in", "certain", "cell", "line", "models", "of", "latency", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "align", "with", "previous", "reports", "that", "curcumin", "enhances", "the", "anti-tumor", "activity", "of", "cytokines", "by", "modulating", "cell", "cycle", "regulators", "and", "apoptotic", "pathways", "(", "Hu", "et", "al.", "2018", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "elucidate", "the", "molecular", "mechanisms", "behind", "these", "effects", ",", "we", "evaluated", "the", "expression", "of", "apoptotic", "regulators", ",", "including", "p53", ",", "Bcl-2", ",", "and", "Bax", ",", "through", "RT-PCR", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Many", "FDA-approved", "drugs", "target", "upstream", "regulators", "of", "the", "ERK1/2", "pathway", ",", "resulting", "in", "an", "indirect", "inhibition", "of", "ERK1/2", "kinase", "[", "74", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Palmitic", "acid", ",", "for", "instance", ",", "has", "been", "reported", "to", "upregulate", "pro-apoptotic", "proteins", "such", "as", "Bax", "and", "p53", ",", "while", "downregulating", "anti-apoptotic", "Bcl-2", ",", "leading", "to", "enhanced", "apoptosis", "via", "caspase", "activation", "in", "colorectal", "and", "breast", "cancer", "models", "[", "30", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "effective", "adaptive", "response", "can", "be", "achieved", "through", "a", "multi-step", "antigen", "processing", "and", "pathway", ",", "namely", "the", "cellular", "antigen", "processing", "machinery", "(", "APM", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Materials", "and", "methods", "Analysis", "of", "actin", "dynamics", "in", "response", "to", "t", "cell", "activation", "Actin", "remodeling", "in", "response", "to", "T", "cell", "receptor", "(", "TCR", ")", "engagement", "was", "monitored", "by", "forming", "circumferential", "F-actin", "rings", "as", "previously", "described", "[", "61,62", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "highlights", "that", "the", "negative", "regulation", "of", "SHH", "activity", "in", "astrocytes", "is", "context-dependent", "and", "varies", "with", "the", "degree", "of", "cellular", "damage", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Likewise", ",", "in", "primary", "CD4", "+", "T", " ", "cells", "infected", "with", "a", "dual", "reporter-encoded", "HIV", ",", "APG-1387", "reduces", "the", "level", "of", "latent", "cells", "without", "notably", "affecting", "the", "productively", "infected", "pool", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "are", "consistent", "with", "the", "observed", "upregulation", "of", "SHH", "in", "NG", "MIO-M1", "cells", "exposed", "to", "different", "glucose", "treatments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Resveratrol", "[", "57", "]", ",", "piceatannol", "[", "10", "]", ",", "pterostilbene", "[", "61,62,63", "]", ",", "and", "polydatin", "(", "piceid", ")", "[", "64", "]", "were", "reported", "to", "suppress", "the", "proliferation", "of", "various", "cancer", "cell", "lines", "(", "lung", ",", "prostate", ",", "breast", ",", "colorectal", ",", "liver", ",", "pancreatic", ",", "cervical", ",", "ovarian", ",", "bladder", ",", "leukemia", ",", "multiple", "myeloma", ",", "bone", ",", "oral", ",", "esophageal", ",", "head", "and", "neck", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "increased", "SHH", "protein", "expression", "in", "NG", "cells", "was", "accompanied", "by", "significant", "changes", "in", "the", "intracellular", "localization", "of", "SHH", ",", "exhibiting", "a", "more", "spotted/punctate", "pattern", "in", "the", "cytoplasm", "and", "in", "close", "proximity", "to", "the", "plasma", "membrane", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "curcumin", "downregulates", "IFN-γ-induced", "ISGs", "and", "enhances", "IFN-γ-mediated", "tumor", "cell", "growth", "suppression", ",", "highlighting", "its", "potential", "as", "a", "therapeutic", "adjuvant", "in", "NSCLC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Notably", ",", "Müller", "glia", "in", "lower", "vertebrates", "exhibit", "a", "remarkable", "ability", "to", "regenerate", "retinal", "neurons", ",", "contrasting", "with", "the", "limited", "regenerative", "capacity", "seen", "in", "mammals", ",", "including", "humans", "[", "40", "]", ",", "where", "Müller", "cells", "typically", "respond", "to", "injury", "with", "reactive", "gliosis", ",", "leading", "to", "scarring", "rather", "than", "regeneration", "[", "11,20", "]", "." ]	[ "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Source", "paper", ":", "PMC12081701" ]	[ "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "the", "7SK", "RNP", "complex", "and", "BET", "proteins", "such", "as", "BRD4", "have", "been", "explored", "as", "strategies", "for", "HIV-1", "latency", "reversal", ",", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "SECs", "has", "not", "been", "explored", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "ERK1/2", "pathway", "was", "activated", "in", "M059", "K", "and", "M059J", "cells", ",", "while", "it", "was", "inhibited", "in", "HEK293", "cells", "in", "response", "to", "MYT1L", "(", "Figure", "1", "K", "and", "Figure", "2I", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Herein", ",", "PCYT2", "overexpression", "was", "determined", "to", "inhibit", "HCC", "cell", "proliferation", ",", "migration", "and", "invasion", "both", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Based", "on", "the", "current", "studies", ",", "we", "hypothesized", "that", "PCYT2", "may", "be", "involved", "in", "the", "regulation", "of", "cellular", "processes", "in", "HCC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Conclusions", "", "", "*", "The", "results", "showed", "that", "MIO-M1", "Müller", "cells", "exhibit", "distinct", "responses", "to", "different", "glucose", "treatments", ",", "which", "are", "strongly", "dependent", "on", "their", "metabolic", "environment", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Materials", "and", "methods", "Statistical", "analysis", "The", "data", "were", "described", "as", "mean", " ", "±", " ", "standard", "deviation", "(", "SD", ")", "and", "the", "statistical", "significance", "was", "determined", "by", "one-way", "ANOVA", "before", "LSD", "test", "for", "multiple", "comparisons", "and", "independent-sample", "t-test", "for", "comparison", "between", "the", "two", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Then", ",", "we", "performed", "anti-Flag", "ChIP-qPCR", "in", "cells", "transfected", "with", "the", "sgLTRs-dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", "plasmids", "to", "further", "verify", "the", "abilities", "of", "the", "sgLTRs", "to", "target", "dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", "to", "the", "LTR", ",", "and", "found", "that", "sgLTR-1", "and", "-2", "failed", "to", "recruit", "dCas9", "to", "LTR", "efficiently", "(", "Supplementary", "Fig.", " ", "1a", ",", "b", ")", ",", "sgLTR-5", "and", "-6", "displayed", "the", "most", "significant", "effect", ",", "whereas", "sgLTR-3", ",", "-4", "and", "-7", "all", "displayed", "a", "similar", "and", "partial", "effect", "(", "Supplementary", "Fig.", " ", "1c", ",", "d", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "this", "is", "the", "first", "report", "regarding", "the", "critical", "role", "of", "DNA-PK/MYT1L", "in", "the", "proliferative", "IL-8/GROα-CXCR1", "signaling", "loop", "in", "glioblastoma", ",", "the", "significant", "contributing", "role", "of", "IL-8-CXCR1/2", "axes", "in", "the", "proliferation", "and", "angiogenesis", "of", "glioblastoma", "cells", "has", "been", "demonstrated", "before", "[", "28", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "alkylation", ",", "the", "samples", "were", "transferred", "to", "a", "10", "kD", "centrifugal", "spin", "filter", "(", "Millipore", ")", "and", "sequentially", "washed", "with", "200", " ", "μl", "of", "8", " ", "M", "urea", "for", "three", "times", "and", "200", " ", "μl", "of", "50", " ", "mM", "ammonium", "bicarbonate", "for", "two", "times", "by", "centrifugation", "at", "14,000", " ", "×", " ", "g.", "Next", ",", "tryptic", "digestion", "was", "performed", "by", "adding", "trypsinat", "1:50", "(", "enzyme/substrate", ",", "m/m", ")", "in", "200", " ", "μl", "of", "50", " ", "mM", "ammonium", "bicarbonate", "at", "37", " ", "°", "C", "for", "16", " ", "hours", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "increased", "IL-6", "expression", "is", "likely", "independent", "of", "the", "angiotensin", "II/AT1-axis", ",", "as", "possibly", "endogenously", "produced", "peptide", "hormone", "is", "inactivated", "by", "high", "levels", "of", "ACE2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Samples", "were", "centrifuged", "(", "15", "minutes", ",", "14,000", "rpm", ",", "4", "°", "C", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "large", "number", "of", "studies", "conducted", "on", "polydatin", "has", "revealed", "versatility", "in", "modulating", "numerous", "targets", "related", "to", "oxidative", "stress", "(", "Nrf2", "and", "Akt", "pathways", ",", "glutathione", ",", "catalase", "(", "CAT", ")", ",", "SOD", ",", "GPx", ",", "GST", ",", "MPO", ")", ",", "inflammation", "(", "NF-κB", ",", "phospholipase", "A2", "(", "PLA2", ")", ",", "COX-2", ",", "iNOS", ",", "TNF-α", ",", "IL-1β", ",", "IL-6", ",", "ICAM-1", ",", "MAPKs", ",", "ERK1/2", ",", "JNK1/2", ")", ",", "and", "apoptosis", "(", "p53/MAPK/JNK", "and", "PI3K/Akt/mTOR", "pathways", ",", "B-cell", "lymphoma", "2", "(", "Bcl-2", ")", ",", "Bcl-2-associated", "x", "(", "Bax", ")", ",", "D-cyclins", ",", "caspase-3", ",", "cytochrome", "c", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "HIV-Tat", "orchestrates", "transcription", "elongation", "of", "the", "provirus", "by", "binding", "to", "TAR", "RNA", "and", "recruiting", "P-TEFb", "and", "Super", "Elongation", "Complex", "(", "SEC", ")", "to", "the", "viral", "promoter", "[", "22–26", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Consequently", ",", "their", "antagonists", "are", "thought", "to", "either", "directly", "induce", "or", "sensitize", "cancerous", "cells", "to", "death", "by", "triggering", "proapoptotic", "pathways.50,51", "Interestingly", ",", "IAPs", "such", "as", "BIRC2", "have", "recently", "been", "shown", "to", "be", "negative", "regulators", "of", "HIV", "transcription", ",", "and", " ", "their", "expression", "is", "found", "to", "be", "correlated", "with", "viral", "latency.23,31,32", "Indeed", ",", "both", "BIRC2/3", "and", "XIAP", "are", "overexpressed", "in", "HIV", "latently", "infected", "CD4", "+", "T", "and", "myeloid", "cells", ",", "and", "the", "SMs", "which", "induce", "the", "degradation", "of", "these", "IAPs", "can", "reactivate", "HIV", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Significantly", ",", "upon", "T", "cell", "stimulation", ",", "depletion", "of", "CYTOR", "promoted", "entry", "of", "HIV", "into", "a", "latent", "state", ",", "while", "its", "over-expression", "delayed", "entry", "into", "latency", "and", "enhanced", "latency", "reversal", "(", "Fig", "2", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Research", "on", "the", "antitumor", "potential", "(", "mechanisms", "underlying", "cytotoxic", "activity", "in", "HeLa", "cells", ",", "cytotoxicity", "against", "other", "tumor", "cell", "lines", ")", "should", "also", "continue", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conclusion", ",", "this", "study", "provided", "compelling", "data", "demonstrating", "the", "aberrant", "expression", "and", "functional", "role", "of", "PCYT2", "in", "HepG2", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]

[ "Despite", "these", "findings", ",", "no", "evidence", "exists", "that", "suggests", "that", "PCYT2", "expression", "is", "associated", "with", "HCC", "occurrence", "and", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "g", "ChIP-qPCR", "analyses", "were", "conducted", "to", "assess", "the", "occupancy", "of", "PRMT3", "at", "LTR-luciferase", "regions", "in", "the", "absence", "or", "presence", "of", "Tat", "(", "p", " ", "=", " ", "0.0022", ",", "p", " ", "=", " ", "0.0012", ",", "p", " ", "=", " ", "0.0045", ",", "p", " ", "=", " ", "0.0017", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "P-TEFb", "phosphorylates", "the", "C-terminal", "tail", "of", "RNA", "Pol", "II", "and", "several", "negative", "elongation", "factors", ",", "which", "collectively", "license", "transcriptional", "elongation", "[", "22–24", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Unlike", "IL-8", ",", "GROα", "more", "selectively", "binds", "to", "the", "CXCR2", "receptor", ",", "while", "the", "affinity", "to", "CXCR1", "is", "significantly", "lower", "[", "55", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "suggest", "that", "curcumin", "may", "serve", "as", "a", "therapeutic", "adjuvant", "in", "NSCLC", ",", "potentially", "improving", "immune", "checkpoint", "inhibitor", "(", "ICI", ")", "efficacy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "Tat", "induction", "itself", "was", "sufficient", "for", "reactivation", ",", "this", "reactivation", "was", "completely", "abolished", "by", "the", "addition", "of", "KL-2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "the", "SH-SY5Y", "cell", "line", "is", "a", "subclone", "of", "the", "SK-N-SH", "cell", "line", ",", "the", "global", "gene", "expression", "microarray", "showed", "a", "profound", "differential", "expression", "of", "genes", "in", "these", "two", "cell", "lines", "[", "60", "]", "." ]

[ "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "mammalian", "cell", "cycle", "comprises", "four", "distinct", "phases", ":", "G1", ",", "S", ",", "G2", ",", "and", "M", ",", "where", "RNA", "and", "protein", "synthesis", "occur", "in", "G1", "and", "G2", ",", "DNA", "replication", "in", "S", ",", "and", "chromosome", "segregation", "in", "M", "[", "18", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Resveratroloside", "(", "1", ")", "exhibited", "higher", "activity", "than", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "in", "both", "assays", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "KL-2", "alone", "failed", "to", "significantly", "increase", "HIV-1", "gag", "transcript", "levels", "in", "patient", "PBMCs", ",", "in", "combination", "with", "AZD5582", "it", "resulted", "in", "a", "16-fold", "increase", "over", "AZD5582", "treatment", "alone", "and", "a", "53-fold", "increase", "over", "the", "DMSO", "control", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conclusion", ",", "the", "results", "of", "the", "present", "in", "vitro", "study", "provide", "evidence", "that", "the", "responses", "of", "Mueller", "cells", "to", "activation", "of", "the", "RAAS", "by", "angiotensin", "II", "depend", "on", "the", "environment", ":", "A", "pro-inflammatory", "response", "is", "observed", "under", "hyperglycemic", "(", "plus", "hypoxic", ")", "conditions", ",", "whereas", "changes", "induced", "by", "hypoxia", "are", "not", "modulated", "by", "angiotensin", "II", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "4", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "Their", "structures", "were", "confirmed", "by", "1H-NMR", ",", "13C-NMR", ",", "and", "HRESIMS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "failures", "highlight", "our", "lack", "of", "knowledge", "of", "the", "molecular", "mechanisms", "that", "govern", "latency", "establishment", "and", "reversal", "and", "the", "need", "for", "alternative", "therapies", "capable", "of", "eliminating", "the", "viral", "reservoirs", "[", "10–15", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "inhibition", "of", "HIF-1", "and", "improvement", "of", "MHC", "class", "I", "expression", "on", "cancer", "cells", "is", "important", "to", "induce", "effective", "responses", "of", "cell-mediated", "immunity", "against", "cancer", "such", "as", "lung", "cancer", "for", "immunotherapies", ",", "including", "PD-1/PD-L1", "inhibitor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "the", "effects", "of", "other", "stressors", ",", "such", "as", "oxidative", "stress", "or", "hypoxia", ",", "which", "also", "play", "a", "role", "in", "diabetic", "retinal", "damage", ",", "were", "not", "included", "in", "our", "model", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "demonstrate", "that", "APG-1387", ",", "a", "bivalent", "SM", "initially", "developed", "as", "a", "cancer", "therapy", ",", "can", "efficiently", "reactivate", "HIV", "in", "CD4", "+", "T", " ", "cell", "line", "models", "of", "HIV-1", "latency", "via", "a", "process", "that", "involves", "activation", "of", "the", "noncanonical", "NFKB", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "human", "breast", "cancer", "cells", "(", "MCF-7", ")", ",", "the", "level", "of", "PCYT2", "in", "cancer", "cells", "is", "elevated", "in", "response", "to", "the", "stressful", "environment", "[", "26", "]", "." ]

[ "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "1", ")", "sgRNAs", "targeting", "the", "LTR", "were", "complex", "formation", "with", "dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", ";", "(", "2", ")", "Crosslinking", "of", "proteins", "bound", "to", "the", "LTR", ";", "(", "3", ")", "dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag-sgRNA", "complex", "was", "incubated", "with", "sheared", "fragments", "from", "NH1", "cells", "that", "stably", "expressed", "LTR-luciferase", "reporter", ";", "(", "4", ")", "Immunoprecipitation", "was", "used", "to", "capture", "LTR", "bound", "proteins", ";", "(", "5", ")", "LTR-interacted", "proteins", "were", "identified", "by", "mass", "spectrometry", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "PCR", "cycles", "were", "as", "follows", ":", "50", "°", "C", "for", "2", "minutes", ",", "95", "°", "C", "for", "20", "seconds", ",", "followed", "by", "40", "cycles", "of", "95", "°", "C", "for", "1", "second", "and", "60", "°", "C", "for", "20", "seconds", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "MS", "spectra", "(", "350–1500", " ", "m/z", ")", "were", "collected", "with", "120,000", "resolutions", ",", "AGC", "of", "4", "×", "105", ",", "and", "50", " ", "ms", "maximal", "injection", "time", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Conclusion", "This", "study", "demonstrates", "that", "the", "A.", "incana", "DCM", "fraction", ",", "rich", "in", "bioactive", "compounds", "such", "as", "phytol", ",", "palmitic", "acid", ",", "and", "linolenic", "acid", ",", "exerts", "notable", "cytotoxic", "effects", "on", "various", "cancer", "cell", "lines", ",", "particularly", "HeLa", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]

[ "Similarly", ",", "ISG15", "has", "been", "implicated", "in", "tumor", "progression", "and", "resistance", "to", "therapy", "(", "Meng", "et", "al.", "2024", ")", ",", "suggesting", "that", "its", "downregulation", "by", "curcumin", "may", "have", "additional", "therapeutic", "benefits", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "findings", "provide", "strong", "evidence", "that", "curcumin", "inhibits", "IFN-γ-induced", "STAT1", "activation", ",", "thereby", "reducing", "PD-L1", "expression", "and", "enhancing", "the", "anti-proliferative", "effects", "of", "IFN-γ", "in", "NSCLC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "would", "allow", "us", "to", "understand", "the", "interlink", "between", "DNA-PK-MYT1L-CXCR1-pERK1/2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Membranes", "were", "blocked", "with", "5", "%", "BSA", "in", "Tris-buffered", "saline", "with", "0.1", "%", "Tween-", "20", "(", "TBST", ")", "for", "1", "h", "at", "room", "temperature", "to", "prevent", "non-specific", "binding", "and", "incubated", "overnight", "at", "4", " ", "°", "C", "with", "primary", "antibodies", "against", "phospho-STAT1", "(", "Tyr701", ")", ",", "total", "STAT1", ",", "PD-L1", ",", "and", "β-actin", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "the", "ectopic", "expression", "of", "MYT1L", "promoted", "cell", "proliferation", ",", "inhibited", "apoptosis", ",", "and", "shortened", "the", "S", "phase", "(", "Figure", "1E", ",", "F", ",", "H", ",", "J", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "same", "assay", ",", "the", "aglycones", ",", "resveratrol", "and", "pinostilbene", ",", "were", "more", "active", "than", "the", "corresponding", "glycosides", ",", "showing", "ORAC", "values", "of", "5.26", "±", "0.26", "and", "5.01", "±", "0.27", "Trolox", "equivalents/μM", ",", "respectively", "[", "48", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Despite", "these", "promising", "results", ",", "the", "study", "possesses", "limitations", "typical", "of", "in", "vitro", "investigations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Resveratrol", "was", "reported", "to", "induce", "tumor", "cell", "death", "by", "apoptosis", ",", "autophagy", ",", "necroptosis", ",", "and", "necrosis", "[", "56,57", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "despite", "extensive", "efforts", "to", "elucidate", "the", "mechanisms", "of", "metazoan", "transcriptional", "control", "and", "its", "role", "in", "the", "regulation", "of", "HIV", "gene", "transcription", ",", "the", "knowledge", "of", "how", "HIV", "latency", "is", "established", "is", "still", "incomplete", "[", "27", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dynamic", "exclusion", "was", "set", "to", "40", " ", "s.", "Unassigned", "ions", "or", "those", "with", "a", "charge", "of", "2", " ", "+", "and", ">", "7", " ", "+", "were", "rejected", "for", "MS/MS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "previous", "study", "demonstrated", "that", "high-glucose", "conditions", "have", "been", "associated", "with", "increased", "SOX2", "levels", "in", "human", "Müller", "glial", "cells", ",", "which", "may", "support", "cell", "survival", "and", "regeneration", "under", "stress", "conditions", "[", "51", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Equal", "amounts", "of", "protein", "(", "20", "μg", "per", "sample", ")", "were", "separated", "on", "10", "%", "sodium", "dodecyl", "sulfate", "–", "polyacrylamide", "gels", "(", "SDS-PAGE", ")", "and", "transferred", "onto", "0.45", "μM", "nitrocellulose", "membranes", "(", "Merck", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", "to", "our", "findings", ",", "Dar", "et", "al.", "(", "2016", ")", "reported", "a", "strong", "antioxidant", "potential", "for", "resveratroloside", "in", "the", "DPPH", "assay", "(", "IC50", "=", "14.0", "μg/mL", ")", "[", "47", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "step", "is", "done", "in", "the", "presence", "of", "ART", ",", "so", "there", "are", "no", "further", "rounds", "of", "HIV", "replication", ".", "[" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "proliferative", "inhibition", "mediated", "by", "ectopic", "expression", "of", "MYT1L", "in", "M059J", "cells", "may", "not", "be", "attributed", "to", "the", "activation", "of", "these", "two", "pathways", "(", "Figure", "2I", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "cDNA", "synthesis", ",", "500", "ng", "of", "RNA", "was", "reverse", "transcribed", "using", "the", "RevertAid", "First", "Strand", "cDNA", "Synthesis", "Kit", "to", "cDNA", "as", "per", "the", "manufacturer", "’s", "instructions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Members", "of", "this", "family", "have", "been", "divided", "into", "four", "subfamilies", ",", "CXC", ",", "CC", ",", "C", ",", "and", "CX3C", ",", "based", "on", "the", "arrangement", "of", "the", "first", "two", "of", "the", "four", "conserved", "cysteine", "residues", "in", "the", "amino", "terminus", "of", "the", "proteins", ",", "which", "can", "bind", "CXCR", ",", "CCR", ",", "XCR1", ",", "and", "CX3CR1", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "software", "used", "in", "data", "analysis", "along", "with", "statistical", "parameters", "were", "mentioned", "in", "the", "appropriate", "Figure", " ", "legends", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Notably", ",", "we", "performed", "Cleavage", "Under", "Targets", "&", "Tagmentation", "(", "CUT&Tag", ")", "sequencing", "by", "using", "IgG", "or", "PRMT3", "antibody", "in", "CD4", "+", "T", "cells", "isolated", "from", "HIV-1", "infected", "patient", "cells", ",", "and", "demonstrated", "that", "while", "IgG", "displayed", "undetectable", "signal", "at", "the", "LTR", ",", "PRMT3", "showed", "significant", "binding", "signal", "around", "LTR", "(", "Fig.", " ", "1h", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "consistent", "gate", "was", "then", "used", "to", "quantify", "the", "fraction", "of", "remaining", "cells", "that", "expressed", "the", "target", "of", "interest", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Quantitative", "real-time", "PCR", "(", "qRT-PCR", ")", "was", "conducted", "using", "the", "SYBR", "Green", "PCR", "Master", "Mix", "(", "Applied", "Biosystems", "™", ")", "on", "a", "QuantStudio", "5", "Machine", "(", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ",", "Inc.", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "general", ",", "the", "eluted", "LTR", "binding", "proteins", "were", "reduced", "in", "20", " ", "mM", "DTT", "at", "95", " ", "°", "C", "for", "5", " ", "min", ",", "and", "subsequently", "alkylated", "in", "50", " ", "mM", "iodoacetamide", "for", "30", " ", "min", "in", "the", "dark", "at", "room", "temperature", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Indeed", ",", "SEC", "disruption", "by", "KL-2", "in", "the", "original", "report", "of", "the", "inhibitor", "demonstrated", "an", "outsized", "impact", "on", "Myc-dependent", "transcription", "[", "32", "]", ",", "suggesting", "that", "additional", "factors", "driving", "the", "SEC", "dependency", "of", "proviral", "transcription", "have", "yet", "to", "be", "described", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Source", "paper", ":", "PMC12101583" ]

[ "O", "O", "O", "O" ]

[ "Source", "paper", ":", "PMC11419360" ]

[ "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "work", "demonstrates", "the", "importance", "of", "increasing", "the", "production", "or", "availability", "of", "free", "P-TEFb", "for", "recruitment", "to", "viral", "loci", "as", "a", "powerful", "strategy", "for", "bolstering", "current", "LRAs", ",", "most", "notably", "non-canonical", "NF-kB", "agonists", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "said", ",", "further", "experimentation", "with", "a", "larger", "group", "of", "animals", "analyzed", "at", "endpoint", "is", "needed", "to", "confirm", "the", "modulatory", "role", "of", "APG-1387", "on", "VRs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cells", "were", "fixed", "with", "1", "%", "formaldehyde", "for", "15", " ", "min", "at", "room", "temperature", "and", "0.125", " ", "M", "Glycine", "for", "5", " ", "min", "to", "quench", "unreacted", "formaldehyde", "at", "room", "temperature", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "A.", "incana", "DCM", "fraction", "demonstrated", "IC50", "values", "ranging", "from", "135.6", "to", "273.1", " ", "µg/mL", ",", "with", "HeLa", "cells", "(", "a", "cervical", "cancer", "model", ")", "showing", "the", "highest", "sensitivity", "(", "IC50", " ", "=", " ", "135.6", " ", "µg/mL", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "lower", "HIF-1", "and", "higher", "MHC", "class", "I", "were", "found", "in", "Endostar", "treated", "A549", "and", "NCI-H1299", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]

[ "Immunofluorescence", "confirmed", "that", "p-STAT1", "is", "translocated", "to", "nucleus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "On", "the", "other", "hand", ",", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "exhibited", "higher", "activity", "than", "resveratroloside", "(", "1", ")", "in", "increasing", "the", "number", "of", "dead", "cells", "through", "non-apoptotic", "mechanisms", "(", "at", "25", "and", "50", "μg/mL", ")", "and", "in", "reducing", "HeLa", "cell", "proliferation", "(", "at", "25", "μg/mL", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Phase", "1", "and", "2", "clinical", "trials", "in", "prostate", "cancer", "with", "Navarixin", ",", "a", "small-molecule", "inhibitor", "of", "CXCR1/2", ",", "have", "been", "completed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "IL-8-CXCR1/2", "axis", "has", "been", "proposed", "as", "a", "potential", "therapeutic", "target", "for", "numerous", "cancers", "due", "to", "its", "contributing", "roles", "in", "proliferation", ",", "migration/invasion", ",", "angiogenesis", ",", "and", "tumor", "immunosuppression", "[", "61,62", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cells", "were", "lysed", "with", "lysis", "buffer", "[", "1", "%", "SDS", ",", "10", " ", "mM", "EDTA", ",", "50", " ", "mM", "Tris", ",", "pH", "8.1", "]", "and", "incubated", "on", "ice", "for", "20", " ", "min", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Exposure", "of", "cells", "to", "these", "conditions", "seemed", "to", "not", "result", "in", "induction", "of", "cellular", "stress", ",", "which", "may", "adversely", "affect", "the", "outcome", "of", "the", "investigations", ",", "since", "expression", "of", "IL-6", "mRNA", ",", "a", "marker", "of", "cellular", "stress", ",", "remained", "stable", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Even", "if", "transcriptional", "reactivation", "is", "achieved", ",", "it", "is", "unlikely", "this", "is", "sufficient", "to", "result", "in", "the", "clearance", "of", "these", "infected", "cells", "without", "additional", "immune", "augmentation", "such", "as", "the", "administration", "of", "antibodies", ",", "vaccines", ",", "or", "immunotherapies", "to", "prime", "the", "immune", "system", "[", "6", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "see", "whether", "MYT1L", "is", "also", "up-regulated", "in", "neuroblastoma", ",", "we", "compared", "its", "expression", "in", "both", "glioblastoma", "and", "neuroblastoma", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cells", "from", "blood", "and", "tissues", "were", "analyzed", "by", "flow", "cytometry", "as", "described", "in", "Section", "‘", "flow", "cytometry", "’", "below", "for", "the", "effect", "of", "APG-1387", "on", "cell", "proliferation", "and", "activation", "." ]

[ "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Regarding", "the", "impact", "of", "resveratroloside", "(", "1", ")", "and", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "on", "the", "HeLa", "cell", "cycle", ",", "both", "compounds", "induced", "a", "significant", "dose-dependent", "increase", "in", "the", "sub-G1", "phase", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Animal", "experiments", "Five-week-old", "BALB/c", "female", "nude", "mice", "were", "purchased", "from", "Jiangsu", "Jicui", "Pharmaceutical", "Biotechnology", "Co", ",", "passed", "SPF", "level", "training", "and", "assessment", ",", "and", "were", "routinely", "reared", "using", "standard", "SPF", "conditions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "By", "halting", "cells", "in", "the", "G0/G1", "phase", ",", "the", "A.", "incana", "DCM", "fraction", "appears", "to", "block", "progression", "to", "DNA", "synthesis", ",", "which", "could", "lead", "to", "senescence", "or", "cell", "death", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Regarding", "the", "mechanism", "whereby", "PCYT2", "influences", "cancer", "development", ",", "a", "previous", "report", "showed", "that", "PCYT2", "downregulation-induced", "phosphoethanolamine", "(", "PEtn", ")", "accumulation", "correlated", "with", "tumor", "growth", "under", "nutrient", "starvation", ",", "thereby", "PCYT2", "overexpression", "reduced", "PEtn", "levels", "and", "tumor", "growth", "[", "18", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "assays", "had", "been", "optimized", "for", "enough", "sensitivity", "to", "detect", "the", "reduced", "expression", "in", "Endostar", "treated", "A549", "cells", "and", "NCI-H1299", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]

[ "A", "p", "value", "of", "less", "than", "0.05", "was", "considered", "statistically", "significant", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "Cancer", "Genome", "Atlas", "(", "TCGA", ")", "datasets", "were", "used", "to", "analyze", "a", "relationship", "between", "MYT1L", "expression", "and", "CXCR1", "expression", "in", "glioblastoma", "and", "neuroblastoma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "show", "that", "KL-2", ",", "a", "small", "molecule", "inhibitor", "of", "the", "interaction", "between", "the", "SEC", "and", "P-TEFb", ",", "is", "sufficient", "to", "enhance", "viral", "transcription", "in", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "and", "can", "synergistically", "enhance", "the", "activity", "of", "other", "LRAs", "in", "certain", "cell", "line", "models", "of", "latency", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "align", "with", "previous", "reports", "that", "curcumin", "enhances", "the", "anti-tumor", "activity", "of", "cytokines", "by", "modulating", "cell", "cycle", "regulators", "and", "apoptotic", "pathways", "(", "Hu", "et", "al.", "2018", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "elucidate", "the", "molecular", "mechanisms", "behind", "these", "effects", ",", "we", "evaluated", "the", "expression", "of", "apoptotic", "regulators", ",", "including", "p53", ",", "Bcl-2", ",", "and", "Bax", ",", "through", "RT-PCR", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Many", "FDA-approved", "drugs", "target", "upstream", "regulators", "of", "the", "ERK1/2", "pathway", ",", "resulting", "in", "an", "indirect", "inhibition", "of", "ERK1/2", "kinase", "[", "74", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Palmitic", "acid", ",", "for", "instance", ",", "has", "been", "reported", "to", "upregulate", "pro-apoptotic", "proteins", "such", "as", "Bax", "and", "p53", ",", "while", "downregulating", "anti-apoptotic", "Bcl-2", ",", "leading", "to", "enhanced", "apoptosis", "via", "caspase", "activation", "in", "colorectal", "and", "breast", "cancer", "models", "[", "30", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "effective", "adaptive", "response", "can", "be", "achieved", "through", "a", "multi-step", "antigen", "processing", "and", "pathway", ",", "namely", "the", "cellular", "antigen", "processing", "machinery", "(", "APM", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Materials", "and", "methods", "Analysis", "of", "actin", "dynamics", "in", "response", "to", "t", "cell", "activation", "Actin", "remodeling", "in", "response", "to", "T", "cell", "receptor", "(", "TCR", ")", "engagement", "was", "monitored", "by", "forming", "circumferential", "F-actin", "rings", "as", "previously", "described", "[", "61,62", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "highlights", "that", "the", "negative", "regulation", "of", "SHH", "activity", "in", "astrocytes", "is", "context-dependent", "and", "varies", "with", "the", "degree", "of", "cellular", "damage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Likewise", ",", "in", "primary", "CD4", "+", "T", " ", "cells", "infected", "with", "a", "dual", "reporter-encoded", "HIV", ",", "APG-1387", "reduces", "the", "level", "of", "latent", "cells", "without", "notably", "affecting", "the", "productively", "infected", "pool", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "are", "consistent", "with", "the", "observed", "upregulation", "of", "SHH", "in", "NG", "MIO-M1", "cells", "exposed", "to", "different", "glucose", "treatments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Resveratrol", "[", "57", "]", ",", "piceatannol", "[", "10", "]", ",", "pterostilbene", "[", "61,62,63", "]", ",", "and", "polydatin", "(", "piceid", ")", "[", "64", "]", "were", "reported", "to", "suppress", "the", "proliferation", "of", "various", "cancer", "cell", "lines", "(", "lung", ",", "prostate", ",", "breast", ",", "colorectal", ",", "liver", ",", "pancreatic", ",", "cervical", ",", "ovarian", ",", "bladder", ",", "leukemia", ",", "multiple", "myeloma", ",", "bone", ",", "oral", ",", "esophageal", ",", "head", "and", "neck", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "increased", "SHH", "protein", "expression", "in", "NG", "cells", "was", "accompanied", "by", "significant", "changes", "in", "the", "intracellular", "localization", "of", "SHH", ",", "exhibiting", "a", "more", "spotted/punctate", "pattern", "in", "the", "cytoplasm", "and", "in", "close", "proximity", "to", "the", "plasma", "membrane", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "curcumin", "downregulates", "IFN-γ-induced", "ISGs", "and", "enhances", "IFN-γ-mediated", "tumor", "cell", "growth", "suppression", ",", "highlighting", "its", "potential", "as", "a", "therapeutic", "adjuvant", "in", "NSCLC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Notably", ",", "Müller", "glia", "in", "lower", "vertebrates", "exhibit", "a", "remarkable", "ability", "to", "regenerate", "retinal", "neurons", ",", "contrasting", "with", "the", "limited", "regenerative", "capacity", "seen", "in", "mammals", ",", "including", "humans", "[", "40", "]", ",", "where", "Müller", "cells", "typically", "respond", "to", "injury", "with", "reactive", "gliosis", ",", "leading", "to", "scarring", "rather", "than", "regeneration", "[", "11,20", "]", "." ]

[ "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Source", "paper", ":", "PMC12081701" ]

[ "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "the", "7SK", "RNP", "complex", "and", "BET", "proteins", "such", "as", "BRD4", "have", "been", "explored", "as", "strategies", "for", "HIV-1", "latency", "reversal", ",", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "SECs", "has", "not", "been", "explored", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "ERK1/2", "pathway", "was", "activated", "in", "M059", "K", "and", "M059J", "cells", ",", "while", "it", "was", "inhibited", "in", "HEK293", "cells", "in", "response", "to", "MYT1L", "(", "Figure", "1", "K", "and", "Figure", "2I", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Herein", ",", "PCYT2", "overexpression", "was", "determined", "to", "inhibit", "HCC", "cell", "proliferation", ",", "migration", "and", "invasion", "both", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Based", "on", "the", "current", "studies", ",", "we", "hypothesized", "that", "PCYT2", "may", "be", "involved", "in", "the", "regulation", "of", "cellular", "processes", "in", "HCC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Conclusions", "*", "*", "*", "The", "results", "showed", "that", "MIO-M1", "Müller", "cells", "exhibit", "distinct", "responses", "to", "different", "glucose", "treatments", ",", "which", "are", "strongly", "dependent", "on", "their", "metabolic", "environment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Materials", "and", "methods", "Statistical", "analysis", "The", "data", "were", "described", "as", "mean", " ", "±", " ", "standard", "deviation", "(", "SD", ")", "and", "the", "statistical", "significance", "was", "determined", "by", "one-way", "ANOVA", "before", "LSD", "test", "for", "multiple", "comparisons", "and", "independent-sample", "t-test", "for", "comparison", "between", "the", "two", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Then", ",", "we", "performed", "anti-Flag", "ChIP-qPCR", "in", "cells", "transfected", "with", "the", "sgLTRs-dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", "plasmids", "to", "further", "verify", "the", "abilities", "of", "the", "sgLTRs", "to", "target", "dCas9", "-", "3", " ", "×", " ", "Flag", "to", "the", "LTR", ",", "and", "found", "that", "sgLTR-1", "and", "-2", "failed", "to", "recruit", "dCas9", "to", "LTR", "efficiently", "(", "Supplementary", "Fig.", " ", "1a", ",", "b", ")", ",", "sgLTR-5", "and", "-6", "displayed", "the", "most", "significant", "effect", ",", "whereas", "sgLTR-3", ",", "-4", "and", "-7", "all", "displayed", "a", "similar", "and", "partial", "effect", "(", "Supplementary", "Fig.", " ", "1c", ",", "d", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "this", "is", "the", "first", "report", "regarding", "the", "critical", "role", "of", "DNA-PK/MYT1L", "in", "the", "proliferative", "IL-8/GROα-CXCR1", "signaling", "loop", "in", "glioblastoma", ",", "the", "significant", "contributing", "role", "of", "IL-8-CXCR1/2", "axes", "in", "the", "proliferation", "and", "angiogenesis", "of", "glioblastoma", "cells", "has", "been", "demonstrated", "before", "[", "28", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "alkylation", ",", "the", "samples", "were", "transferred", "to", "a", "10", "kD", "centrifugal", "spin", "filter", "(", "Millipore", ")", "and", "sequentially", "washed", "with", "200", " ", "μl", "of", "8", " ", "M", "urea", "for", "three", "times", "and", "200", " ", "μl", "of", "50", " ", "mM", "ammonium", "bicarbonate", "for", "two", "times", "by", "centrifugation", "at", "14,000", " ", "×", " ", "g.", "Next", ",", "tryptic", "digestion", "was", "performed", "by", "adding", "trypsinat", "1:50", "(", "enzyme/substrate", ",", "m/m", ")", "in", "200", " ", "μl", "of", "50", " ", "mM", "ammonium", "bicarbonate", "at", "37", " ", "°", "C", "for", "16", " ", "hours", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]