OTAR3088/CeLLaTe-V2-split · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 311	tags listlengths 2 311
[ "Importantly", ",", "in", "mice", "treated", "with", "multiple", "doses", "of", "APG-1387", ",", "the", "proportion", "of", "cells", "carrying", "the", "integrated", "HIV", "DNA", "was", "meaningfully", "reduced", ",", "suggesting", "that", "the", "bivalent", "APG-1387", "might", "preferentially", "target", "latently", "infected", "cells", "directly", "or", "indirectly", "for", "death", "(", "Figure", " ", "4", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "the", "retina", "is", "damaged", ",", "Müller", "glia", "can", "dedifferentiate", "into", "Müller", "glia-derived", "progenitor", "cells", "(", "MGPCs", ")", ",", "acquiring", "a", "progenitor-like", "phenotype", "and", "starting", "to", "proliferate", ",", "thus", "contributing", "to", "retinal", "repair", "[", "39,40", "]", "." ]	[ "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Angiotensin", "II", ",", "on", "the", "other", "hand", ",", "increased", "the", "expression", "of", "ACE2", ",", "resulting", "in", "its", "own", "inactivation", "by", "the", "formation", "of", "angiotensin", "(", "1", "-", "7", ")", ",", "which", "does", "not", "activate", "AT1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "findings", "extend", "these", "observations", "by", "demonstrating", "that", "curcumin", "effectively", "blocks", "STAT1", "activation", "in", "lung", "cancer", "cells", ",", "preventing", "the", "downstream", "induction", "of", "PD-L1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "speculate", "that", "the", "DNA-PK/MYT1L-CXCR1-ERK1/2", "might", "be", "up-regulated", "at", "WHO", "grade", "IV", "and/or", "recurrent", "glioblastomas", "due", "to", "chemo-", "or", "radio-resistance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Crosswise", "dose", "titrations", "in", "J-Lat", "5A8", "cells", "showed", "a", "strong", "synergistic", "potential", "between", "AZD5582", "and", "KL-2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Experimenters", "were", "blinded", "during", "data", "analysis", "of", "samples", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Hu-mice", "with", "variable", "levels", "of", "human", "CD45", "+", "cells", "were", "equally", "distributed", "among", "experimental", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "At", "25", "µg/mL", ",", "both", "compounds", "induced", "S-phase", "cell", "cycle", "arrest", "in", "HeLa", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]
[ "a", "Schematic", "of", "dCas9-targeted", "proteome", "analysis", "workflow", ".", "(" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mobile", "phase", "A", "contained", "0.1", "%", "formic", "acid", "(", "v/v", ")", "in", "water", ";", "mobile", "phase", "B", "contained", "0.1", "%", "formic", "acid", "in", "80", "%", "acetonitrile", "(", "ACN", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "we", "expected", "KL-2", "to", "enhance", "the", "transcriptional", "elongation", "of", "integrated", "proviruses", "due", "to", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "cellular", "SECs", ",", "we", "also", "saw", "increases", "in", "transcriptional", "initiation", "as", "measured", "by", "qRT-PCR", "for", "TAR", "transcript", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cells", "were", "then", "lysed", "for", "10", "minutes", "on", "ice", "in", "130μl", "sonication", "buffer", "(", "20", "mM", "Tris", "pH-7.8", ",", "2", "mM", "EDTA", ",", "0,5", "%", "SDS", ",", "0.5", "mM", "phenylmethylsulfonyl", "fluoride", "(", "PMSF", ")", ",", "and", "1", "%", "protease", "inhibitor", "cocktail", ")", ",", "and", "the", "nuclear", "pellets", "were", "collected", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "one", "of", "the", "most", "well-defined", "functions", "of", "DNA-PK", "is", "to", "govern", "the", "repair", "of", "DNA", "double-strand", "breaks", "through", "both", "non-homologous", "end-joining", "(", "NHEJ", ")", "and", "homologous", "recombination", "(", "HR", ")", "[", "42", "]", ",", "it", "was", "originally", "identified", "as", "a", "component", "of", "the", "Sp1", "transcription", "complex", "in", "which", "it", "may", "modulate", "the", "transcriptional", "activity", "of", "the", "complex", "by", "phosphorylating", "Sp1", "[", "43", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "the", "impact", "of", "Mueller", "cells", "on", "angiotensin", "II-mediated", "inflammatory", "responses", "observed", "in", "the", "early", "development", "of", "RVO", "is", "likely", "low", "when", "hypoxia", "plays", "a", "dominant", "role", "accompanied", "by", "induction", "of", "expression", "and", "secretion", "of", "the", "angiogenic", "and", "permeability-inducing", "growth", "factor", "VEGF-A", "(", "9", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "oncogene", "and", "non-oncogene", "addiction", "have", "been", "demonstrated", "as", "fantastic", "targets", "for", "cancer", "therapy", "due", "to", "their", "crucial", "role", "in", "supporting", "cancer", "progression", "[", "86", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "signals", "were", "normalized", "relative", "to", "input", "DNA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CYTOR", "also", "exerts", "its", "effects", "indirectly", "by", "controlling", "global", "gene", "expression", "along", "with", "actin", "dynamic", "pathways", ",", "thereby", "affecting", "T", "cell", "activation", "and", "HIV", "infection", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Given", "the", "fact", "that", "TEAD4", "is", "a", "DNA", "sequence-specific", "transcription", "factor", ",", "it", "remains", "to", "be", "investigated", "whether", "it", "plays", "a", "key", "role", "in", "recruiting", "SEC", "to", "both", "host", "and", "HIV-1", "gene", "promoters", "that", "contain", "the", "TEAD4-binding", "motif", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "get", "the", "most", "effective", "sgRNAs", "that", "target", "LTR", ",", "we", "used", "two", "methods", "for", "screening", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Previous", "studies", "have", "reported", "that", "curcumin", "can", "interfere", "with", "JAK-STAT", "signaling", "in", "other", "cancer", "types", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Paclitaxel", ",", "another", "cornerstone", "treatment", ",", "acts", "by", "stabilizing", "microtubules", ",", "causing", "prolonged", "G2/M", "mitotic", "arrest", "and", "promoting", "apoptosis", "through", "a", "p53-independent", "pathway", "involving", "cyclin", "B1/CDC2", "activation", "and", "Bcl-2", "phosphorylation", "[", "24", ",", "26", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "demonstrated", "that", "25", " ", "μg/ml", "Endostar", "inhibited", "expression", "of", "HIF-1", "with", "the", "upregulation", "of", "MHC", "class", "I", "α-heavy", "chain", "and", "β2", " ", "m", "light", "chain", "in", "A549", "and", "NCI-H1299", "lung", "cancer", "cells", ",", "suggesting", "the", "potential", "for", "Endostar", "to", "facilitate", "cancer", "immunotherapy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Whether", "PCYT2", "downregulation", "induced", "PEtn", "accumulation", "contributes", "to", "HCC", "development", "further", "study", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fig.", "1**dCas9-targeted", "HIV-1", "LTR-interactome", "analysis", "identified", "PRMT3", "as", "a", "LTR-binding", "factor", ".", "", "", "" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Consistently", ",", "reduced", "levels", "of", "CYTOR", "expression", "are", "associated", "with", "reduced", "polymerization", "of", "cortical", "actin", "in", "response", "to", "TCR", "engagement", "(", "Fig", "6", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "SOX2", "is", "a", "transcription", "factor", "crucial", "for", "maintaining", "stemness", "and", "promoting", "cell", "progenitor", "proliferation", ",", "and", "its", "upregulation", "could", "be", "a", "response", "to", "cellular", "stress", "in", "order", "to", "maintain", "or", "enhance", "regenerative", "capacity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interestingly", ",", "CDK6", "was", "down-regulated", "in", "M059J", "cells", "in", "response", "to", "MYT1L", "(", "Figure", "2I", ")", ",", "which", "may", "play", "a", "role", "in", "a", "G1", "cell", "cycle", "arrest", "(", "Figure", "2", "G", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "4", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "The", "kinetics", "of", "STAT1", "phosphorylation", "followed", "a", "time-dependent", "pattern", ",", "with", "phosphorylation", "detected", "as", "early", "as", "2", " ", "h", ",", "peaking", "at", "6", " ", "h", ",", "and", "remaining", "elevated", "up", "to", "24", "h.", "These", "results", "are", "in", "agreement", "with", "earlier", "reports", "that", "demonstrated", "a", "similar", "pattern", "of", "IFN-γ-induced", "STAT1", "activation", "in", "various", "cancer", "models", ",", "including", "melanoma", "(", "Schmitt", "et", "al.", "2012", ")", ",", "colorectal", "cancer", "(", "Zhao", "et", "al.", "2020", ")", ",", "and", "lung", "adenocarcinoma", "(", "Gao", "et", "al.", "2018", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "trend", "toward", "a", "decrease", "was", "also", "observed", "in", "response", "to", "sustained", "high-glucose", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Endostar", "was", "administrated", "to", "A549", "and", "NCI-H1299", "lung", "cancer", "cells", "and", "the", "protein", "of", "HIF-1", "and", "MHC", "class", "I", "and", "their", "mRNAs", "was", "detected", "by", "western", "blot", "and", "RT-qPCR", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Notably", ",", "disruption", "of", "the", "SEC", "using", "KL-2", "resulted", "in", "significant", "increases", "in", "HIV-1", "replication", "in", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "whereas", "genetic", "knockout", "of", "most", "SEC", "members", "had", "minimal", "to", "no", "impact", "on", "replication", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "h", "CUT&Tag", "sequencing", "was", "performed", "in", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "isolated", "from", "virologically", "suppressed", "HIV-1-infected", "patient", "cells", "that", "were", "treated", "with", "PMA", ",", "by", "using", "IgG", "or", "PRMT3", "antibody", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Differences", "between", "means", "were", "considered", "statistically", "significant", "when", "p-values", "were", "at", "least", "", "", "*", "5", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "One", "of", "the", "most", "significant", "findings", "of", "this", "study", "is", "the", "ability", "of", "curcumin", "to", "inhibit", "IFN-γ-induced", "STAT1", "activation", "and", "PD-L1", "expression", "in", "A549", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]
[ "Pinus", "cembra", "L.", "(", "Pinaceae", ",", "Swiss", "stone", "pine", ",", "Arolla", "pine", ",", "cembran", "pine", ",", "cedar", "pine", ")", "is", "a", "coniferous", "tree", "growing", "in", "the", "Alps", "and", "Carpathian", "Mountains", "[", "32", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "is", "a", "groove", "in", "the", "MHC", "class", "I", "molecules", "to", "preferentially", "bind", "8", "-", "11mer", "peptides", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "previously", "assessed", "the", "antioxidant", "potential", "of", "the", "raw", "bark", "extract", "(", "80", "%", "methanolic", "bark", "extract", ")", "and", "found", "EC50", "values", "of", "71.1", "±", "0.5", "and", "26.0", "±", "0.3", "μg/mL", "in", "the", "DPPH", "radical", "scavenging", "and", "reducing", "power", "assays", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Significantly", ",", "the", "DCM", "fraction", "exhibited", "a", "selectivity", "index", "(", "SI", ")", "of", "2.72", "against", "HeLa", "cells", ",", "indicating", "preferential", "cytotoxicity", "toward", "cancer", "cells", "over", "normal", "cells", "and", "highlighting", "its", "therapeutic", "potential", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "comparing", "multiple", "groups", ",", "non-parametric", "tests", "Kruskal-Wallis", "or", "Friedman", "were", "performed", "and", "followed", "by", "Dunn", "’s", "multiple", "comparison", "test", "(", "e.g.", ",", "vehicle-treated", "group", "compared", "to", "those", "treated", "with", "different", "concentrations", "of", "APG-1387", "or", "combined", "PMA", "and", "ionomycin", ";", "effect", "of", "APG-1387", "on", "viral", "rebound", "at", "different", "time", "points", "post", "treatment", "interruption", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "IFN-γ", "alone", "resulted", "in", "a", "modest", "reduction", "in", "cell", "viability", "(", "21", "%", ")", ",", "the", "combination", "of", "IFN-γ", "and", "curcumin", "led", "to", "a", "significantly", "greater", "reduction", "(", "47", "%", ")", ",", "suggesting", "a", "synergistic", "effect", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "alignment", "results", "of", "sequencing", "with", "the", "HIV-1", "genome", "in", "three", "patients", "were", "displayed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "c", "Luciferase", "activity", "was", "measured", "in", "NH1", "cells", "transfected", "with", "a", "plasmid", "encoding", "each", "sgRNA", "and", "control", "sgRNA", "(", "sgGal4", ")", ",", "which", "expresses", "the", "Cas9", "in", "the", "presence", "of", "Tat", "(", "p", " ", "=", " ", "0.0016", ",", "p", " ", "=", " ", "0.0024", ",", "p", " ", "=", " ", "0.0042", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "our", "study", ",", "we", "observed", "an", "increase", "in", "SHH", "expression", "in", "NG", "MIO-M1cells", "exposed", "to", "sustained", "high-glucose", "and", "GF", "treatments", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "With", "this", "in", "mind", ",", "it", "is", "possible", "that", "compounds", "JQ1", "and", "PMA", "result", "in", "de", "novo", "recruitment", "of", "RNA", "Pol", "II", "thereby", "increasing", "transcriptional", "initiation", "whereas", "AZD5582", "may", "be", "more", "reliant", "on", "RNA", "Pol", "II", "pause-release", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "our", "results", "provide", "valuable", "insights", ",", "further", "in-depth", "studies", "are", "needed", "to", "elucidate", "the", "mechanisms", "involved", "and", "to", "explore", "the", "potential", "therapeutic", "implications", "for", "mitigating", "retinal", "neurodegeneration", "associated", "with", "diabetes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Finally", ",", "we", "observed", "that", "curcumin", "enhances", "the", "anti-proliferative", "effect", "of", "IFN-γ", "in", "A549", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]
[ "Raw", "data", "was", "processed", "using", "Proteome", "Discoverer", "(", "PD", ",", "version", "2.4", ")", ",", "and", "MS/MS", "spectra", "were", "searched", "against", "the", "reviewed", "SwissProt", "human", "proteome", "database", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "instance", ",", "in", "zebrafish", ",", "PRMT3", "has", "been", "shown", "to", "negatively", "regulate", "antiviral", "responses17", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Surprisingly", ",", "a", "large", "body", "of", "evidence", "also", "indicates", "a", "contributing", "role", "of", "ERK1/2", "activation", "in", "cancer", "cell", "apoptosis", "primarily", "induced", "by", "chemical", "compounds", ",", "including", "glioblastoma", ",", "bladder", ",", "breast", ",", "colon", ",", "endometrial", ",", "head", "and", "neck", ",", "lung", ",", "renal", "cell", ",", "and", "testicular", "germ", "cell", "carcinomas", "[", "76,77,78,79,80,81,82,83,84,85", "]", ",", "and", "mechanically", ",", "through", "activation", "of", "caspase", "3", "and", "induction", "of", "reactive", "oxygen", "species", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Regarding", "FOXP3-expressing", "CD4", "+", "T", " ", "cells", "in", "the", "spleen", ",", "there", "was", "no", "significant", "difference", "between", "ART-suppressed", "mice", "treated", "with", "APG-1387", "or", "with", "the", "vehicle", "control", "." ]	[ "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "next", "day", ",", "the", "IP", "material", "was", "incubated", "with", "25", "μl", "dynabeads", "protein", "G", "for", "two", "hours", "to", "ensure", "the", "binding", "of", "the", "antibody", "to", "the", "magnetic", "beads", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "percentage", "of", "cells", "in", "each", "quadrant", "was", "calculated", "to", "assess", "the", "extent", "of", "apoptosis", "and", "necrosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DNA", "was", "fragmented", "by", "sonication", "at", "the", "following", "settings", ":", "amplitude", "20", "%", "for", "30", "cycles", "at", "10", "seconds", "on/10", "seconds", "off", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Statistically", "significant", "differences", "were", "assessed", "using", "Prism", "6.05", "(", "GraphPad", "PRISM", "Software", ",", "Inc.", ",", "La", "Jolla", ",", "CA", ",", "USA", ")", "with", "Student", "’s", "t-test", "for", "statistical", "comparison", "between", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "many", "small", "molecule", "latency", "reversing", "agents", "(", "LRAs", ")", "have", "been", "described", "that", "reactivate", "latent", "proviruses", "ex", "vivo", ",", "they", "have", "had", "little", "success", "in", "clinical", "trials", "[", "8,9", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "expression", "and", "secretion", "of", "VEGF-A", "by", "MIO-M1", "cells", "were", "not", "altered", "by", "angiotensin", "II", "likely", "reflecting", "the", "different", "behaviors", "of", "both", "cell", "types", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "angiotensin", "II", "did", "not", "significantly", "increase", "IL-6", "mRNA", "expression", "in", "MIO-M1", "cells", "cultured", "under", "hyperglycemic", "conditions", ",", "more", "IL-6", "was", "secreted", "under", "these", "conditions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "have", "several", "implications", "for", "our", "understanding", "of", "viral", "transcription", "and", "future", "directions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "ERK1/2", "signaling", "pathway", "contributes", "to", "numerous", "biological", "and", "pathological", "processes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Together", ",", "these", "findings", "have", "revealed", "the", "mechanistic", "basis", "for", "PRMT3", "’s", "control", "of", "the", "transcription", "of", "HIV-1", "and", "a", "selected", "group", "of", "host", "genes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Angiotensin", "II", "and", "aldosterone", "did", "not", "modulate", "VEGF-A", "levels", ",", "proving", "the", "dominant", "role", "of", "hypoxia", "in", "the", "regulation", "of", "the", "growth", "factors", "'", "expression", "and", "secretion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Source", "paper", ":", "PMC12072392" ]	[ "O", "O", "O", "O" ]
[ "Functional", "analyses", "show", "that", "following", "T", "cell", "stimulation", ",", "over-expression", "of", "CYTOR", "activates", "HIV", "gene", "expression", ",", "while", "its", "depletion", "inhibits", "viral", "gene", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "similar", "inflammatory", "response", "to", "angiotensin", "II", "was", "also", "observed", "after", "additional", "exposure", "of", "the", "cells", "to", "hyperglycemia", "plus", "hypoxia", ",", "as", "the", "expression", "of", "IL-6", "mRNA", "was", "substantially", "upregulated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "They", "have", "received", "increasing", "recognition", "because", "they", "specifically", "activate", "the", "non-canonical", "NFKB", "pathway,23,24,25", "which", "naturally", "exhibits", "higher", "functional", "selectivity", "and", "more", "confined", "proinflammatory", "effects", "compared", "to", "the", "canonical", "NFKB", "pathway.24,26", "Engagement", "of", "the", "non-canonical", "NFKB", "pathway", "by", "SMAC", "leads", "to", "degradation", "of", "cellular", "inhibitor", "of", "apoptosis", "(", "cIAP", ")", ",", "accumulation", "of", "NFKB-inducing", "kinase", "(", "NIK", ")", ",", "and", "activation", "of", "component", "of", "inhibitor", "of", "NFKB", "kinase", "complex", "(", "CHUK", ")", "homodimer", ",", "culminating", "in", "cleavage", "of", "inactive", "NFKB2", "p100", "to", "active", "p52.26", "An", "association", "between", "RELB", "and", "p52", "induces", "expression", "of", "target", "genes27", "and", ",", "in", "the", "context", "of", "HIV", ",", "the", "pathway", "reactivates", "latently", "infected", "VRs.20", "The", "non-canonical", "NFKB", "pathway", "can", "also", "be", "triggered", "by", "signaling", "intermediates", "of", "the", "apoptosis", "cascade", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Excessive", "activation", "of", "the", "ERK1/2", "pathway", "is", "a", "hallmark", "of", "human", "malignancies", "[", "67,68,69,70,71,72,73", "]", "due", "to", "its", "crucial", "role", "in", "maintaining", "sustained", "cellular", "proliferation", ",", "resistance", "to", "cell", "death", ",", "angiogenesis", ",", "invasion", ",", "and", "metastasis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "2", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "The", "whole", "cellular", "lysates", "(", "30–100", "µg", "per", "sample", ")", "were", "electrophoresed", "via", "10", "%", "SDS-PAGE", "and", "electrophoretically", "transferred", "to", "PVDF", "membranes", "(", "Amersham", "HybondTM-P", ",", "GE", "Healthcare", ",", "Chicago", ",", "IL", ",", "USA", ")", "at", "4", "°", "C", "for", "1.5", "h.", "The", "blots", "were", "incubated", "for", "1", "h", "with", "5", "%", "nonfat", "dry", "milk", "to", "block", "the", "nonspecific", "binding", "sites", "and", "subsequently", "incubated", "with", "polyclonal/monoclonal", "antibodies", "specific", "to", "MYT1L", "(", "Abnova", ",", "Taipei", ",", "China", ")", "or", "AKT1", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "GH", ",", "UK", ")", ",", "CDK2", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "GH", ",", "UK", ")", ",", "DNA-PKcs", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "GH", ",", "UK", ")", ",", "p21", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "GH", ",", "UK", ")", "or", "CDK4", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "CDK6", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "cyclin", "A2", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "cyclin", "D1", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "cyclin", "E1", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "ERK1/2", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "p27", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "pERK1/2", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", "or", "BAX", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", ",", "BCL2", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", ",", "GROα", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", ",", "IL8RB", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", ",", "pAKT1/2/3", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", ",", "or", "CXCR1", "(", "LSBio", ",", "Lynnwood", ",", "WA", ",", "USA", ")", "at", "4", "°", "C", "overnight", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "VEGF", "receptors", "are", "expressed", "in", "various", "retinal", "tissues", "including", "the", "retinal", "vasculature", ",", "Mueller", "cells", ",", "and", "the", "retinal", "pigment", "epithelium", "(", "33,34", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "we", "investigated", "how", "IFN-γ-induced", "STAT1", "phosphorylation", "leads", "to", "PD-L1", "upregulation", "in", "A549", "cells", "and", "explored", "the", "potential", "of", "curcumin", ",", "a", "bioactive", "polyphenol", "with", "known", "anti-inflammatory", "and", "anti-cancer", "properties", ",", "as", "a", "therapeutic", "agent", "capable", "of", "modulating", "this", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pterostilbene", "was", "reported", "to", "induce", "apoptosis", "and", "S-phase", "arrest", "in", "MOLT4", "human", "leukemia", "cells", "[", "71", "]", ",", "Jurkat", "and", "Hut-78", "T-cell", "leukemia/lymphoma", "cells", "[", "72", "]", ",", "and", "diffuse", "large", "B-cell", "lymphoma", "cells", "[", "73", "]", ",", "apoptosis", "and", "G1", "phase", "arrest", "in", "HT-29", "colon", "cancer", "cells", "[", "58", "]", "and", "human", "gastric", "carcinoma", "AGS", "cells", "[", "74", "]", ",", "and", "autophagy", "and", "S", "phase", "arrest", "in", "HCCC-9810", "and", "RBE", "human", "cholangiocarcinoma", "cells", "[", "62", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "MYT1L", "protein", "was", "undetectable", ",", "which", "may", "implicate", "the", "involvement", "of", "post-transcriptional", "regulation", ",", "such", "as", "miRNA(s", ")", ",", "in", "MYT1L", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "mechanism", "of", "MHC", "class", "I", "regulation", "involves", "the", "innate", "immune", "molecule", "NLR", "family", "CARD", "domain", "containing", "5", "(", "NLRC5", ")", ",", "which", "is", "a", "member", "of", "recently", "discovered", "NLRs-like", "receptor", "family", "of", "the", "highly", "conserved", "one.46", "NLRC5", "is", "an", "MHC", "class", "I", "gene", "transactivation", "factor", "which", "induces", "the", "MHC", "class", "I", "gene", "transcription", "and", "subsequently", "activates", "antigen", "presentation", "process.47,48", "NLRC5", "is", "transcriptionally", "regulated", "in", "JAK2/STAT3", "signaling-dependent", "pathway.49", "This", "study", "demonstrated", "that", "some", "concentrations", "of", "Endostar", "decreased", "the", "relative", "levels", "of", "STAT3", "and", "pSTAT3", "in", "A549", "lung", "cancer", "cells", "with", "statistical", "significance", ",", "which", "is", "in", "line", "with", "the", "role", "of", "JAK2/STAT3", "pathway", "in", "regulation", "of", "MHC", "class", "I", "via", "NLRC5", ",", "suggesting", "the", "underlying", "mechanism", "of", "MHC", "class", "I", "upregulation", "involving", "JAK2/STAT3", "signaling", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Given", "the", "documented", "cytotoxic", "activity", "of", "the", "DCM", "extract", "from", "the", "related", "subspecies", "A.", "rugosa", "[", "8", "]", ",", "we", "hypothesized", "that", "A.", "incana", "might", "exhibit", "similar", "effects", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Accordingly", ",", "we", "propose", "a", "model", "where", "CYTOR", "exerts", "its", "effects", "on", "global", "gene", "expression", "and", "promotes", "HIV", "gene", "expression", "by", "both", "direct", "and", "indirect", "effects", "(", "Fig", "7", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "significantly", "higher", "levels", "of", "SHH", "were", "observed", "in", "HG", "MIO-M1", "cells", "compared", "to", "NG", "MIO-M1", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]
[ "These", "findings", "highlight", "that", "MIO-M1", "cells", "in", "chronic", "hyperglycemic", "conditions", "may", "adapt", "or", "develop", "enhanced", "tolerance", "over", "time", "due", "to", "constant", "and", "prolonged", "exposure", "to", "high", "glucose", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "we", "also", "aim", "to", "dissect", "the", "role", "of", "CYTOR", "in", "gene", "expression", "control", ",", "specifically", "for", "HIV", "gene", "regulation", ",", "it", "will", "be", "essential", "to", "define", "how", "events", "within", "the", "nucleus", "are", "regulated", "by", "CYTOR", "and", "translated", "to", "the", "control", "of", "downstream", "effector", "functions", "of", "stimulated", "T", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "Introduction", "The", "persistence", "of", "replication-competent", ",", "but", "transcriptionally", "inhibited", "HIV-1", "proviral", "DNA", "in", "long-lived", ",", "latent", "cellular", "reservoirs", "is", "a", "significant", "barrier", "to", "the", "development", "of", "a", "functional", "cure", "[", "1,2", "]", "Even", "after", "long-term", ",", "suppressive", "antiretroviral", "therapy", "(", "ART", ")", ",", "spontaneous", "reactivation", "of", "proviral", "gene", "expression", "from", "the", "latent", "reservoir", "is", "sufficient", "to", "initiate", "viral", "rebound", "shortly", "after", "ART", "cessation", ",", "thus", "requiring", "life-long", "adherence", "[", "3–5", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "observations", "underscore", "the", "notion", "that", "glial", "cells", ",", "including", "Müller", "cells", "and", "astrocytes", ",", "exhibit", "differential", "SHH", "responses", "depending", "on", "the", "extent", "of", "glucose", "stress", ",", "highlighting", "the", "dynamic", "regulation", "of", "SHH", "signaling", "in", "glial", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]
[ "Based", "on", "these", "findings", ",", "we", "may", "propose", "that", "under", "non-stimulated", "conditions", ",", "MYT1L", "may", "act", "as", "a", "transcriptional", "repressor", "suppressing", "CXCR1", "transcription", ";", "DNA-PK", "may", "function", "as", "a", "coactivator", ",", "and", "once", "it", "is", "phosphorylated", "by", "the", "CXCR1-dependent", "activation", "of", "the", "ERK1/2", "kinase", ",", "it", ",", "in", "turn", ",", "phosphorylates", "MYT1L", ";", "the", "phosphorylated", "MYT1L", "recruits", "histone", "acetyltransferases", "(", "HATs", ")", "and", "transcription", "factors", "(", "TFs", ")", "to", "the", "CXCR1", "promoter", "and", "promotes", "CXCR1", "transcription", "(", "Figure", "5", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "enforced", "expression", "of", "MYT1L", "caused", "an", "elevation", "of", "GROα", "in", "HEK293", "and", "M059J", "cells", "(", "Figure", "4B", "–", "E", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "in", "APG-1387-treated", "mice", "the", "fact", "that", "the", "viral", "rebound", "was", "consistently", "lower", "throughout", "the", "ATI", "and", "plateaued", "at", "a", "level", "below", "pre-ART", "further", "strengthens", "the", "notion", "that", "APG-1387", "impacts", "negatively", "the", "pool", "of", "VRs", "(", "Figure", " ", "6", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Induction", "of", "apoptosis", "(", "programmed", "cell", "death", ")", "has", "been", "a", "primary", "objective", "in", "cancer", "therapy", "for", "more", "than", "30", "years", "[", "54", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "statistical", "analysis", "was", "done", "using", "GraphPad", "Prism", "(", "Version", "8.0", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "define", "DEGs", ",", "we", "used", "as", "cut-offs", "an", "absolute", "log2", "fold", "change", ">", "1", "and", "a", "false", "discovery", "rate", "(", "FDR", ")", "compareCluster", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "previous", "studies", "confirmed", "the", "cytotoxic", "properties", "of", "its", "methanol", "extract", "[", "10", "]", ",", "the", "effects", "of", "the", "DCM", "fraction", "remain", "unexamined", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Data", "were", "exported", "as", "FCS3.0", "files", "using", "Attune", "NxT", "Software", "v3.2.0", "and", "analyzed", "with", "a", "consistent", "template", "on", "FlowJo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", "to", "the", "important", "role", "in", "metabolic", "adaptation", "to", "hypoxia", "stress", "caused", "by", "deficient", "supply", "of", "nutrients", "and", "oxygen", "because", "of", "uncontrolled", "growth", "of", "cancer", "cells", "and", "disorganized", "neoangiogenesis", ",", "the", "signaling", "pathways", "of", "HIF-1", ",", "a", "heterodimer", "highly", "expressed", "in", "a", "variety", "of", "tumor", "cells", ",", "suppress", "innate", "and", "adaptive", "immune", "systems", "to", "escape", "immune", "attack", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Future", "studies", "should", "explore", "the", "ability", "of", "resveratroloside", "(", "1", ")", "and", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "to", "modulate", "cellular", "signaling", "pathways", ",", "enzymes", ",", "and", "other", "molecules", "involved", "in", "the", "antioxidant", "defense", "and", "oxidative", "damage", "repair", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "observe", "a", "trend", "toward", "a", "reduction", "in", "Th17-cell", "frequency", "in", "both", "ART-suppressed", "mice", "treated", "in", " ", "vivo", "with", "APG-1387", "and", "in", "ART-naïve", "infected", "mice", "whose", "splenocytes", "were", "stimulated", "ex", " ", "vivo", "with", "APG-1387", "(", "Figure", " ", "5", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Precipitated", "DNA", "fragments", "were", "then", "extracted", "using", "a", "ChIP", "DNA", "clean", "and", "concentrator", "kit", "(", "ZYMO", "Research", ")", ",", "and", "HIV", "DNA", "levels", "were", "quantified", "by", "qPCR", "with", "the", "primers", "specifically", "located", "on", "the", "NFκB", "region", "at", "the", "HIV-LTR", "promoter", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "the", "SHH", "level", "has", "decreased", ",", "the", "cells", "that", "express", "it", "maintain", "a", "dot-like", "distribution", "of", "SHH", "inside", "the", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Elevated", "permeability", "of", "retinal", "endothelial", "cells", "due", "to", "IL-6-mediated", "trans-signaling", "in", "vitro", "likely", "contributes", "to", "the", "breakdown", "of", "the", "inner", "blood-retina", "barrier", "in", "vivo", "(", "42", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "finding", "is", "particularly", "relevant", "in", "the", "context", "of", "NSCLC", ",", "where", "high", "PD-L1", "expression", "correlates", "with", "poor", "prognosis", "and", "resistance", "to", "immunotherapy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Briefly", ",", "10", "μL", "of", "reaction", "was", "mixed", "using", "5", "μL", "of", "Taqman", "Master", "Mix", ",", "0.5", "μL", "of", "20x", "primer", "probe", "mix", "(", "18", "μM", "of", "primers", "and", "5", "μM", "probe", ")", ",", "2.5", "μL", "water", ",", "and", "2", "μL", "of", "template", "cDNA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "post-translational", "modification", "of", "P-TEFb", "(", "i.e.", ",", "through", "phosphorylation", "of", "CDK9", "at", "Serine", "175", ")", "has", "been", "shown", "to", "influence", "P-TEFb", "distribution", "in", "certain", "regulatory", "complexes", ",", "again", "highlighting", "the", "unique", "properties", "of", "release", "from", "each", "complex", "[", "40", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Previous", "studies", "have", "demonstrated", "its", "ability", "to", "induce", "apoptosis", "across", "various", "cancer", "cell", "lines", ",", "including", "lung", ",", "colon", ",", "and", "breast", "cancers", ",", "primarily", "through", "the", "disruption", "of", "mitochondrial", "membrane", "potential", "and", "subsequent", "activation", "of", "the", "intrinsic", "apoptotic", "pathway", "[", "28", ",", "29", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Importantly", ",", "in", "mice", "treated", "with", "multiple", "doses", "of", "APG-1387", ",", "the", "proportion", "of", "cells", "carrying", "the", "integrated", "HIV", "DNA", "was", "meaningfully", "reduced", ",", "suggesting", "that", "the", "bivalent", "APG-1387", "might", "preferentially", "target", "latently", "infected", "cells", "directly", "or", "indirectly", "for", "death", "(", "Figure", " ", "4", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "the", "retina", "is", "damaged", ",", "Müller", "glia", "can", "dedifferentiate", "into", "Müller", "glia-derived", "progenitor", "cells", "(", "MGPCs", ")", ",", "acquiring", "a", "progenitor-like", "phenotype", "and", "starting", "to", "proliferate", ",", "thus", "contributing", "to", "retinal", "repair", "[", "39,40", "]", "." ]

[ "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Angiotensin", "II", ",", "on", "the", "other", "hand", ",", "increased", "the", "expression", "of", "ACE2", ",", "resulting", "in", "its", "own", "inactivation", "by", "the", "formation", "of", "angiotensin", "(", "1", "-", "7", ")", ",", "which", "does", "not", "activate", "AT1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "findings", "extend", "these", "observations", "by", "demonstrating", "that", "curcumin", "effectively", "blocks", "STAT1", "activation", "in", "lung", "cancer", "cells", ",", "preventing", "the", "downstream", "induction", "of", "PD-L1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "speculate", "that", "the", "DNA-PK/MYT1L-CXCR1-ERK1/2", "might", "be", "up-regulated", "at", "WHO", "grade", "IV", "and/or", "recurrent", "glioblastomas", "due", "to", "chemo-", "or", "radio-resistance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Crosswise", "dose", "titrations", "in", "J-Lat", "5A8", "cells", "showed", "a", "strong", "synergistic", "potential", "between", "AZD5582", "and", "KL-2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Experimenters", "were", "blinded", "during", "data", "analysis", "of", "samples", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Hu-mice", "with", "variable", "levels", "of", "human", "CD45", "+", "cells", "were", "equally", "distributed", "among", "experimental", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "At", "25", "µg/mL", ",", "both", "compounds", "induced", "S-phase", "cell", "cycle", "arrest", "in", "HeLa", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]

[ "a", "Schematic", "of", "dCas9-targeted", "proteome", "analysis", "workflow", ".", "(" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mobile", "phase", "A", "contained", "0.1", "%", "formic", "acid", "(", "v/v", ")", "in", "water", ";", "mobile", "phase", "B", "contained", "0.1", "%", "formic", "acid", "in", "80", "%", "acetonitrile", "(", "ACN", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "we", "expected", "KL-2", "to", "enhance", "the", "transcriptional", "elongation", "of", "integrated", "proviruses", "due", "to", "the", "release", "of", "P-TEFb", "from", "cellular", "SECs", ",", "we", "also", "saw", "increases", "in", "transcriptional", "initiation", "as", "measured", "by", "qRT-PCR", "for", "TAR", "transcript", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cells", "were", "then", "lysed", "for", "10", "minutes", "on", "ice", "in", "130μl", "sonication", "buffer", "(", "20", "mM", "Tris", "pH-7.8", ",", "2", "mM", "EDTA", ",", "0,5", "%", "SDS", ",", "0.5", "mM", "phenylmethylsulfonyl", "fluoride", "(", "PMSF", ")", ",", "and", "1", "%", "protease", "inhibitor", "cocktail", ")", ",", "and", "the", "nuclear", "pellets", "were", "collected", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "one", "of", "the", "most", "well-defined", "functions", "of", "DNA-PK", "is", "to", "govern", "the", "repair", "of", "DNA", "double-strand", "breaks", "through", "both", "non-homologous", "end-joining", "(", "NHEJ", ")", "and", "homologous", "recombination", "(", "HR", ")", "[", "42", "]", ",", "it", "was", "originally", "identified", "as", "a", "component", "of", "the", "Sp1", "transcription", "complex", "in", "which", "it", "may", "modulate", "the", "transcriptional", "activity", "of", "the", "complex", "by", "phosphorylating", "Sp1", "[", "43", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "the", "impact", "of", "Mueller", "cells", "on", "angiotensin", "II-mediated", "inflammatory", "responses", "observed", "in", "the", "early", "development", "of", "RVO", "is", "likely", "low", "when", "hypoxia", "plays", "a", "dominant", "role", "accompanied", "by", "induction", "of", "expression", "and", "secretion", "of", "the", "angiogenic", "and", "permeability-inducing", "growth", "factor", "VEGF-A", "(", "9", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "oncogene", "and", "non-oncogene", "addiction", "have", "been", "demonstrated", "as", "fantastic", "targets", "for", "cancer", "therapy", "due", "to", "their", "crucial", "role", "in", "supporting", "cancer", "progression", "[", "86", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "signals", "were", "normalized", "relative", "to", "input", "DNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CYTOR", "also", "exerts", "its", "effects", "indirectly", "by", "controlling", "global", "gene", "expression", "along", "with", "actin", "dynamic", "pathways", ",", "thereby", "affecting", "T", "cell", "activation", "and", "HIV", "infection", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Given", "the", "fact", "that", "TEAD4", "is", "a", "DNA", "sequence-specific", "transcription", "factor", ",", "it", "remains", "to", "be", "investigated", "whether", "it", "plays", "a", "key", "role", "in", "recruiting", "SEC", "to", "both", "host", "and", "HIV-1", "gene", "promoters", "that", "contain", "the", "TEAD4-binding", "motif", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "get", "the", "most", "effective", "sgRNAs", "that", "target", "LTR", ",", "we", "used", "two", "methods", "for", "screening", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Previous", "studies", "have", "reported", "that", "curcumin", "can", "interfere", "with", "JAK-STAT", "signaling", "in", "other", "cancer", "types", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Paclitaxel", ",", "another", "cornerstone", "treatment", ",", "acts", "by", "stabilizing", "microtubules", ",", "causing", "prolonged", "G2/M", "mitotic", "arrest", "and", "promoting", "apoptosis", "through", "a", "p53-independent", "pathway", "involving", "cyclin", "B1/CDC2", "activation", "and", "Bcl-2", "phosphorylation", "[", "24", ",", "26", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "demonstrated", "that", "25", " ", "μg/ml", "Endostar", "inhibited", "expression", "of", "HIF-1", "with", "the", "upregulation", "of", "MHC", "class", "I", "α-heavy", "chain", "and", "β2", " ", "m", "light", "chain", "in", "A549", "and", "NCI-H1299", "lung", "cancer", "cells", ",", "suggesting", "the", "potential", "for", "Endostar", "to", "facilitate", "cancer", "immunotherapy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Whether", "PCYT2", "downregulation", "induced", "PEtn", "accumulation", "contributes", "to", "HCC", "development", "further", "study", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fig.", "1***dCas9-targeted", "HIV-1", "LTR-interactome", "analysis", "identified", "PRMT3", "as", "a", "LTR-binding", "factor", ".", "*", "*", "*" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Consistently", ",", "reduced", "levels", "of", "CYTOR", "expression", "are", "associated", "with", "reduced", "polymerization", "of", "cortical", "actin", "in", "response", "to", "TCR", "engagement", "(", "Fig", "6", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "SOX2", "is", "a", "transcription", "factor", "crucial", "for", "maintaining", "stemness", "and", "promoting", "cell", "progenitor", "proliferation", ",", "and", "its", "upregulation", "could", "be", "a", "response", "to", "cellular", "stress", "in", "order", "to", "maintain", "or", "enhance", "regenerative", "capacity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Interestingly", ",", "CDK6", "was", "down-regulated", "in", "M059J", "cells", "in", "response", "to", "MYT1L", "(", "Figure", "2I", ")", ",", "which", "may", "play", "a", "role", "in", "a", "G1", "cell", "cycle", "arrest", "(", "Figure", "2", "G", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "4", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "The", "kinetics", "of", "STAT1", "phosphorylation", "followed", "a", "time-dependent", "pattern", ",", "with", "phosphorylation", "detected", "as", "early", "as", "2", " ", "h", ",", "peaking", "at", "6", " ", "h", ",", "and", "remaining", "elevated", "up", "to", "24", "h.", "These", "results", "are", "in", "agreement", "with", "earlier", "reports", "that", "demonstrated", "a", "similar", "pattern", "of", "IFN-γ-induced", "STAT1", "activation", "in", "various", "cancer", "models", ",", "including", "melanoma", "(", "Schmitt", "et", "al.", "2012", ")", ",", "colorectal", "cancer", "(", "Zhao", "et", "al.", "2020", ")", ",", "and", "lung", "adenocarcinoma", "(", "Gao", "et", "al.", "2018", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "trend", "toward", "a", "decrease", "was", "also", "observed", "in", "response", "to", "sustained", "high-glucose", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Endostar", "was", "administrated", "to", "A549", "and", "NCI-H1299", "lung", "cancer", "cells", "and", "the", "protein", "of", "HIF-1", "and", "MHC", "class", "I", "and", "their", "mRNAs", "was", "detected", "by", "western", "blot", "and", "RT-qPCR", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Notably", ",", "disruption", "of", "the", "SEC", "using", "KL-2", "resulted", "in", "significant", "increases", "in", "HIV-1", "replication", "in", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "whereas", "genetic", "knockout", "of", "most", "SEC", "members", "had", "minimal", "to", "no", "impact", "on", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "h", "CUT&Tag", "sequencing", "was", "performed", "in", "primary", "CD4", "+", "T", "cells", "isolated", "from", "virologically", "suppressed", "HIV-1-infected", "patient", "cells", "that", "were", "treated", "with", "PMA", ",", "by", "using", "IgG", "or", "PRMT3", "antibody", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Differences", "between", "means", "were", "considered", "statistically", "significant", "when", "p-values", "were", "at", "least", "*", "*", "*", "5", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "of", "the", "most", "significant", "findings", "of", "this", "study", "is", "the", "ability", "of", "curcumin", "to", "inhibit", "IFN-γ-induced", "STAT1", "activation", "and", "PD-L1", "expression", "in", "A549", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]

[ "Pinus", "cembra", "L.", "(", "Pinaceae", ",", "Swiss", "stone", "pine", ",", "Arolla", "pine", ",", "cembran", "pine", ",", "cedar", "pine", ")", "is", "a", "coniferous", "tree", "growing", "in", "the", "Alps", "and", "Carpathian", "Mountains", "[", "32", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "is", "a", "groove", "in", "the", "MHC", "class", "I", "molecules", "to", "preferentially", "bind", "8", "-", "11mer", "peptides", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "previously", "assessed", "the", "antioxidant", "potential", "of", "the", "raw", "bark", "extract", "(", "80", "%", "methanolic", "bark", "extract", ")", "and", "found", "EC50", "values", "of", "71.1", "±", "0.5", "and", "26.0", "±", "0.3", "μg/mL", "in", "the", "DPPH", "radical", "scavenging", "and", "reducing", "power", "assays", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Significantly", ",", "the", "DCM", "fraction", "exhibited", "a", "selectivity", "index", "(", "SI", ")", "of", "2.72", "against", "HeLa", "cells", ",", "indicating", "preferential", "cytotoxicity", "toward", "cancer", "cells", "over", "normal", "cells", "and", "highlighting", "its", "therapeutic", "potential", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "comparing", "multiple", "groups", ",", "non-parametric", "tests", "Kruskal-Wallis", "or", "Friedman", "were", "performed", "and", "followed", "by", "Dunn", "’s", "multiple", "comparison", "test", "(", "e.g.", ",", "vehicle-treated", "group", "compared", "to", "those", "treated", "with", "different", "concentrations", "of", "APG-1387", "or", "combined", "PMA", "and", "ionomycin", ";", "effect", "of", "APG-1387", "on", "viral", "rebound", "at", "different", "time", "points", "post", "treatment", "interruption", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "IFN-γ", "alone", "resulted", "in", "a", "modest", "reduction", "in", "cell", "viability", "(", "21", "%", ")", ",", "the", "combination", "of", "IFN-γ", "and", "curcumin", "led", "to", "a", "significantly", "greater", "reduction", "(", "47", "%", ")", ",", "suggesting", "a", "synergistic", "effect", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "alignment", "results", "of", "sequencing", "with", "the", "HIV-1", "genome", "in", "three", "patients", "were", "displayed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "c", "Luciferase", "activity", "was", "measured", "in", "NH1", "cells", "transfected", "with", "a", "plasmid", "encoding", "each", "sgRNA", "and", "control", "sgRNA", "(", "sgGal4", ")", ",", "which", "expresses", "the", "Cas9", "in", "the", "presence", "of", "Tat", "(", "p", " ", "=", " ", "0.0016", ",", "p", " ", "=", " ", "0.0024", ",", "p", " ", "=", " ", "0.0042", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "our", "study", ",", "we", "observed", "an", "increase", "in", "SHH", "expression", "in", "NG", "MIO-M1cells", "exposed", "to", "sustained", "high-glucose", "and", "GF", "treatments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "With", "this", "in", "mind", ",", "it", "is", "possible", "that", "compounds", "JQ1", "and", "PMA", "result", "in", "de", "novo", "recruitment", "of", "RNA", "Pol", "II", "thereby", "increasing", "transcriptional", "initiation", "whereas", "AZD5582", "may", "be", "more", "reliant", "on", "RNA", "Pol", "II", "pause-release", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "our", "results", "provide", "valuable", "insights", ",", "further", "in-depth", "studies", "are", "needed", "to", "elucidate", "the", "mechanisms", "involved", "and", "to", "explore", "the", "potential", "therapeutic", "implications", "for", "mitigating", "retinal", "neurodegeneration", "associated", "with", "diabetes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "we", "observed", "that", "curcumin", "enhances", "the", "anti-proliferative", "effect", "of", "IFN-γ", "in", "A549", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]

[ "Raw", "data", "was", "processed", "using", "Proteome", "Discoverer", "(", "PD", ",", "version", "2.4", ")", ",", "and", "MS/MS", "spectra", "were", "searched", "against", "the", "reviewed", "SwissProt", "human", "proteome", "database", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "instance", ",", "in", "zebrafish", ",", "PRMT3", "has", "been", "shown", "to", "negatively", "regulate", "antiviral", "responses17", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Surprisingly", ",", "a", "large", "body", "of", "evidence", "also", "indicates", "a", "contributing", "role", "of", "ERK1/2", "activation", "in", "cancer", "cell", "apoptosis", "primarily", "induced", "by", "chemical", "compounds", ",", "including", "glioblastoma", ",", "bladder", ",", "breast", ",", "colon", ",", "endometrial", ",", "head", "and", "neck", ",", "lung", ",", "renal", "cell", ",", "and", "testicular", "germ", "cell", "carcinomas", "[", "76,77,78,79,80,81,82,83,84,85", "]", ",", "and", "mechanically", ",", "through", "activation", "of", "caspase", "3", "and", "induction", "of", "reactive", "oxygen", "species", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Regarding", "FOXP3-expressing", "CD4", "+", "T", " ", "cells", "in", "the", "spleen", ",", "there", "was", "no", "significant", "difference", "between", "ART-suppressed", "mice", "treated", "with", "APG-1387", "or", "with", "the", "vehicle", "control", "." ]

[ "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "next", "day", ",", "the", "IP", "material", "was", "incubated", "with", "25", "μl", "dynabeads", "protein", "G", "for", "two", "hours", "to", "ensure", "the", "binding", "of", "the", "antibody", "to", "the", "magnetic", "beads", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "percentage", "of", "cells", "in", "each", "quadrant", "was", "calculated", "to", "assess", "the", "extent", "of", "apoptosis", "and", "necrosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DNA", "was", "fragmented", "by", "sonication", "at", "the", "following", "settings", ":", "amplitude", "20", "%", "for", "30", "cycles", "at", "10", "seconds", "on/10", "seconds", "off", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Statistically", "significant", "differences", "were", "assessed", "using", "Prism", "6.05", "(", "GraphPad", "PRISM", "Software", ",", "Inc.", ",", "La", "Jolla", ",", "CA", ",", "USA", ")", "with", "Student", "’s", "t-test", "for", "statistical", "comparison", "between", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "many", "small", "molecule", "latency", "reversing", "agents", "(", "LRAs", ")", "have", "been", "described", "that", "reactivate", "latent", "proviruses", "ex", "vivo", ",", "they", "have", "had", "little", "success", "in", "clinical", "trials", "[", "8,9", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "expression", "and", "secretion", "of", "VEGF-A", "by", "MIO-M1", "cells", "were", "not", "altered", "by", "angiotensin", "II", "likely", "reflecting", "the", "different", "behaviors", "of", "both", "cell", "types", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "angiotensin", "II", "did", "not", "significantly", "increase", "IL-6", "mRNA", "expression", "in", "MIO-M1", "cells", "cultured", "under", "hyperglycemic", "conditions", ",", "more", "IL-6", "was", "secreted", "under", "these", "conditions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "have", "several", "implications", "for", "our", "understanding", "of", "viral", "transcription", "and", "future", "directions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "ERK1/2", "signaling", "pathway", "contributes", "to", "numerous", "biological", "and", "pathological", "processes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Together", ",", "these", "findings", "have", "revealed", "the", "mechanistic", "basis", "for", "PRMT3", "’s", "control", "of", "the", "transcription", "of", "HIV-1", "and", "a", "selected", "group", "of", "host", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Angiotensin", "II", "and", "aldosterone", "did", "not", "modulate", "VEGF-A", "levels", ",", "proving", "the", "dominant", "role", "of", "hypoxia", "in", "the", "regulation", "of", "the", "growth", "factors", "'", "expression", "and", "secretion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Source", "paper", ":", "PMC12072392" ]

[ "O", "O", "O", "O" ]

[ "Functional", "analyses", "show", "that", "following", "T", "cell", "stimulation", ",", "over-expression", "of", "CYTOR", "activates", "HIV", "gene", "expression", ",", "while", "its", "depletion", "inhibits", "viral", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "similar", "inflammatory", "response", "to", "angiotensin", "II", "was", "also", "observed", "after", "additional", "exposure", "of", "the", "cells", "to", "hyperglycemia", "plus", "hypoxia", ",", "as", "the", "expression", "of", "IL-6", "mRNA", "was", "substantially", "upregulated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "They", "have", "received", "increasing", "recognition", "because", "they", "specifically", "activate", "the", "non-canonical", "NFKB", "pathway,23,24,25", "which", "naturally", "exhibits", "higher", "functional", "selectivity", "and", "more", "confined", "proinflammatory", "effects", "compared", "to", "the", "canonical", "NFKB", "pathway.24,26", "Engagement", "of", "the", "non-canonical", "NFKB", "pathway", "by", "SMAC", "leads", "to", "degradation", "of", "cellular", "inhibitor", "of", "apoptosis", "(", "cIAP", ")", ",", "accumulation", "of", "NFKB-inducing", "kinase", "(", "NIK", ")", ",", "and", "activation", "of", "component", "of", "inhibitor", "of", "NFKB", "kinase", "complex", "(", "CHUK", ")", "homodimer", ",", "culminating", "in", "cleavage", "of", "inactive", "NFKB2", "p100", "to", "active", "p52.26", "An", "association", "between", "RELB", "and", "p52", "induces", "expression", "of", "target", "genes27", "and", ",", "in", "the", "context", "of", "HIV", ",", "the", "pathway", "reactivates", "latently", "infected", "VRs.20", "The", "non-canonical", "NFKB", "pathway", "can", "also", "be", "triggered", "by", "signaling", "intermediates", "of", "the", "apoptosis", "cascade", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Excessive", "activation", "of", "the", "ERK1/2", "pathway", "is", "a", "hallmark", "of", "human", "malignancies", "[", "67,68,69,70,71,72,73", "]", "due", "to", "its", "crucial", "role", "in", "maintaining", "sustained", "cellular", "proliferation", ",", "resistance", "to", "cell", "death", ",", "angiogenesis", ",", "invasion", ",", "and", "metastasis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "2", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "The", "whole", "cellular", "lysates", "(", "30–100", "µg", "per", "sample", ")", "were", "electrophoresed", "via", "10", "%", "SDS-PAGE", "and", "electrophoretically", "transferred", "to", "PVDF", "membranes", "(", "Amersham", "HybondTM-P", ",", "GE", "Healthcare", ",", "Chicago", ",", "IL", ",", "USA", ")", "at", "4", "°", "C", "for", "1.5", "h.", "The", "blots", "were", "incubated", "for", "1", "h", "with", "5", "%", "nonfat", "dry", "milk", "to", "block", "the", "nonspecific", "binding", "sites", "and", "subsequently", "incubated", "with", "polyclonal/monoclonal", "antibodies", "specific", "to", "MYT1L", "(", "Abnova", ",", "Taipei", ",", "China", ")", "or", "AKT1", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "GH", ",", "UK", ")", ",", "CDK2", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "GH", ",", "UK", ")", ",", "DNA-PKcs", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "GH", ",", "UK", ")", ",", "p21", "(", "Abcam", ",", "Cambridge", ",", "GH", ",", "UK", ")", "or", "CDK4", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "CDK6", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "cyclin", "A2", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "cyclin", "D1", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "cyclin", "E1", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "ERK1/2", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "p27", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", ",", "pERK1/2", "(", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "Danvers", ",", "MA", ",", "USA", ")", "or", "BAX", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", ",", "BCL2", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", ",", "GROα", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", ",", "IL8RB", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", ",", "pAKT1/2/3", "(", "Santa", "Cruz", "Biotechnology", ",", "Dallas", ",", "TX", ",", "USA", ")", ",", "or", "CXCR1", "(", "LSBio", ",", "Lynnwood", ",", "WA", ",", "USA", ")", "at", "4", "°", "C", "overnight", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "VEGF", "receptors", "are", "expressed", "in", "various", "retinal", "tissues", "including", "the", "retinal", "vasculature", ",", "Mueller", "cells", ",", "and", "the", "retinal", "pigment", "epithelium", "(", "33,34", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "investigated", "how", "IFN-γ-induced", "STAT1", "phosphorylation", "leads", "to", "PD-L1", "upregulation", "in", "A549", "cells", "and", "explored", "the", "potential", "of", "curcumin", ",", "a", "bioactive", "polyphenol", "with", "known", "anti-inflammatory", "and", "anti-cancer", "properties", ",", "as", "a", "therapeutic", "agent", "capable", "of", "modulating", "this", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pterostilbene", "was", "reported", "to", "induce", "apoptosis", "and", "S-phase", "arrest", "in", "MOLT4", "human", "leukemia", "cells", "[", "71", "]", ",", "Jurkat", "and", "Hut-78", "T-cell", "leukemia/lymphoma", "cells", "[", "72", "]", ",", "and", "diffuse", "large", "B-cell", "lymphoma", "cells", "[", "73", "]", ",", "apoptosis", "and", "G1", "phase", "arrest", "in", "HT-29", "colon", "cancer", "cells", "[", "58", "]", "and", "human", "gastric", "carcinoma", "AGS", "cells", "[", "74", "]", ",", "and", "autophagy", "and", "S", "phase", "arrest", "in", "HCCC-9810", "and", "RBE", "human", "cholangiocarcinoma", "cells", "[", "62", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "MYT1L", "protein", "was", "undetectable", ",", "which", "may", "implicate", "the", "involvement", "of", "post-transcriptional", "regulation", ",", "such", "as", "miRNA(s", ")", ",", "in", "MYT1L", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "mechanism", "of", "MHC", "class", "I", "regulation", "involves", "the", "innate", "immune", "molecule", "NLR", "family", "CARD", "domain", "containing", "5", "(", "NLRC5", ")", ",", "which", "is", "a", "member", "of", "recently", "discovered", "NLRs-like", "receptor", "family", "of", "the", "highly", "conserved", "one.46", "NLRC5", "is", "an", "MHC", "class", "I", "gene", "transactivation", "factor", "which", "induces", "the", "MHC", "class", "I", "gene", "transcription", "and", "subsequently", "activates", "antigen", "presentation", "process.47,48", "NLRC5", "is", "transcriptionally", "regulated", "in", "JAK2/STAT3", "signaling-dependent", "pathway.49", "This", "study", "demonstrated", "that", "some", "concentrations", "of", "Endostar", "decreased", "the", "relative", "levels", "of", "STAT3", "and", "pSTAT3", "in", "A549", "lung", "cancer", "cells", "with", "statistical", "significance", ",", "which", "is", "in", "line", "with", "the", "role", "of", "JAK2/STAT3", "pathway", "in", "regulation", "of", "MHC", "class", "I", "via", "NLRC5", ",", "suggesting", "the", "underlying", "mechanism", "of", "MHC", "class", "I", "upregulation", "involving", "JAK2/STAT3", "signaling", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Given", "the", "documented", "cytotoxic", "activity", "of", "the", "DCM", "extract", "from", "the", "related", "subspecies", "A.", "rugosa", "[", "8", "]", ",", "we", "hypothesized", "that", "A.", "incana", "might", "exhibit", "similar", "effects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Accordingly", ",", "we", "propose", "a", "model", "where", "CYTOR", "exerts", "its", "effects", "on", "global", "gene", "expression", "and", "promotes", "HIV", "gene", "expression", "by", "both", "direct", "and", "indirect", "effects", "(", "Fig", "7", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "significantly", "higher", "levels", "of", "SHH", "were", "observed", "in", "HG", "MIO-M1", "cells", "compared", "to", "NG", "MIO-M1", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O" ]

[ "These", "findings", "highlight", "that", "MIO-M1", "cells", "in", "chronic", "hyperglycemic", "conditions", "may", "adapt", "or", "develop", "enhanced", "tolerance", "over", "time", "due", "to", "constant", "and", "prolonged", "exposure", "to", "high", "glucose", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "we", "also", "aim", "to", "dissect", "the", "role", "of", "CYTOR", "in", "gene", "expression", "control", ",", "specifically", "for", "HIV", "gene", "regulation", ",", "it", "will", "be", "essential", "to", "define", "how", "events", "within", "the", "nucleus", "are", "regulated", "by", "CYTOR", "and", "translated", "to", "the", "control", "of", "downstream", "effector", "functions", "of", "stimulated", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "Introduction", "The", "persistence", "of", "replication-competent", ",", "but", "transcriptionally", "inhibited", "HIV-1", "proviral", "DNA", "in", "long-lived", ",", "latent", "cellular", "reservoirs", "is", "a", "significant", "barrier", "to", "the", "development", "of", "a", "functional", "cure", "[", "1,2", "]", "Even", "after", "long-term", ",", "suppressive", "antiretroviral", "therapy", "(", "ART", ")", ",", "spontaneous", "reactivation", "of", "proviral", "gene", "expression", "from", "the", "latent", "reservoir", "is", "sufficient", "to", "initiate", "viral", "rebound", "shortly", "after", "ART", "cessation", ",", "thus", "requiring", "life-long", "adherence", "[", "3–5", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "observations", "underscore", "the", "notion", "that", "glial", "cells", ",", "including", "Müller", "cells", "and", "astrocytes", ",", "exhibit", "differential", "SHH", "responses", "depending", "on", "the", "extent", "of", "glucose", "stress", ",", "highlighting", "the", "dynamic", "regulation", "of", "SHH", "signaling", "in", "glial", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "O" ]

[ "Based", "on", "these", "findings", ",", "we", "may", "propose", "that", "under", "non-stimulated", "conditions", ",", "MYT1L", "may", "act", "as", "a", "transcriptional", "repressor", "suppressing", "CXCR1", "transcription", ";", "DNA-PK", "may", "function", "as", "a", "coactivator", ",", "and", "once", "it", "is", "phosphorylated", "by", "the", "CXCR1-dependent", "activation", "of", "the", "ERK1/2", "kinase", ",", "it", ",", "in", "turn", ",", "phosphorylates", "MYT1L", ";", "the", "phosphorylated", "MYT1L", "recruits", "histone", "acetyltransferases", "(", "HATs", ")", "and", "transcription", "factors", "(", "TFs", ")", "to", "the", "CXCR1", "promoter", "and", "promotes", "CXCR1", "transcription", "(", "Figure", "5", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "enforced", "expression", "of", "MYT1L", "caused", "an", "elevation", "of", "GROα", "in", "HEK293", "and", "M059J", "cells", "(", "Figure", "4B", "–", "E", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "in", "APG-1387-treated", "mice", "the", "fact", "that", "the", "viral", "rebound", "was", "consistently", "lower", "throughout", "the", "ATI", "and", "plateaued", "at", "a", "level", "below", "pre-ART", "further", "strengthens", "the", "notion", "that", "APG-1387", "impacts", "negatively", "the", "pool", "of", "VRs", "(", "Figure", " ", "6", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Induction", "of", "apoptosis", "(", "programmed", "cell", "death", ")", "has", "been", "a", "primary", "objective", "in", "cancer", "therapy", "for", "more", "than", "30", "years", "[", "54", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "statistical", "analysis", "was", "done", "using", "GraphPad", "Prism", "(", "Version", "8.0", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "define", "DEGs", ",", "we", "used", "as", "cut-offs", "an", "absolute", "log2", "fold", "change", ">", "1", "and", "a", "false", "discovery", "rate", "(", "FDR", ")", "compareCluster", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "previous", "studies", "confirmed", "the", "cytotoxic", "properties", "of", "its", "methanol", "extract", "[", "10", "]", ",", "the", "effects", "of", "the", "DCM", "fraction", "remain", "unexamined", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Data", "were", "exported", "as", "FCS3.0", "files", "using", "Attune", "NxT", "Software", "v3.2.0", "and", "analyzed", "with", "a", "consistent", "template", "on", "FlowJo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", "to", "the", "important", "role", "in", "metabolic", "adaptation", "to", "hypoxia", "stress", "caused", "by", "deficient", "supply", "of", "nutrients", "and", "oxygen", "because", "of", "uncontrolled", "growth", "of", "cancer", "cells", "and", "disorganized", "neoangiogenesis", ",", "the", "signaling", "pathways", "of", "HIF-1", ",", "a", "heterodimer", "highly", "expressed", "in", "a", "variety", "of", "tumor", "cells", ",", "suppress", "innate", "and", "adaptive", "immune", "systems", "to", "escape", "immune", "attack", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Future", "studies", "should", "explore", "the", "ability", "of", "resveratroloside", "(", "1", ")", "and", "pinostilbenoside", "(", "2", ")", "to", "modulate", "cellular", "signaling", "pathways", ",", "enzymes", ",", "and", "other", "molecules", "involved", "in", "the", "antioxidant", "defense", "and", "oxidative", "damage", "repair", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "observe", "a", "trend", "toward", "a", "reduction", "in", "Th17-cell", "frequency", "in", "both", "ART-suppressed", "mice", "treated", "in", " ", "vivo", "with", "APG-1387", "and", "in", "ART-naïve", "infected", "mice", "whose", "splenocytes", "were", "stimulated", "ex", " ", "vivo", "with", "APG-1387", "(", "Figure", " ", "5", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Precipitated", "DNA", "fragments", "were", "then", "extracted", "using", "a", "ChIP", "DNA", "clean", "and", "concentrator", "kit", "(", "ZYMO", "Research", ")", ",", "and", "HIV", "DNA", "levels", "were", "quantified", "by", "qPCR", "with", "the", "primers", "specifically", "located", "on", "the", "NFκB", "region", "at", "the", "HIV-LTR", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "the", "SHH", "level", "has", "decreased", ",", "the", "cells", "that", "express", "it", "maintain", "a", "dot-like", "distribution", "of", "SHH", "inside", "the", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Elevated", "permeability", "of", "retinal", "endothelial", "cells", "due", "to", "IL-6-mediated", "trans-signaling", "in", "vitro", "likely", "contributes", "to", "the", "breakdown", "of", "the", "inner", "blood-retina", "barrier", "in", "vivo", "(", "42", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CellType", "I-CellType", "I-CellType", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-Tissue", "I-Tissue", "I-Tissue", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "finding", "is", "particularly", "relevant", "in", "the", "context", "of", "NSCLC", ",", "where", "high", "PD-L1", "expression", "correlates", "with", "poor", "prognosis", "and", "resistance", "to", "immunotherapy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Briefly", ",", "10", "μL", "of", "reaction", "was", "mixed", "using", "5", "μL", "of", "Taqman", "Master", "Mix", ",", "0.5", "μL", "of", "20x", "primer", "probe", "mix", "(", "18", "μM", "of", "primers", "and", "5", "μM", "probe", ")", ",", "2.5", "μL", "water", ",", "and", "2", "μL", "of", "template", "cDNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "post-translational", "modification", "of", "P-TEFb", "(", "i.e.", ",", "through", "phosphorylation", "of", "CDK9", "at", "Serine", "175", ")", "has", "been", "shown", "to", "influence", "P-TEFb", "distribution", "in", "certain", "regulatory", "complexes", ",", "again", "highlighting", "the", "unique", "properties", "of", "release", "from", "each", "complex", "[", "40", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Previous", "studies", "have", "demonstrated", "its", "ability", "to", "induce", "apoptosis", "across", "various", "cancer", "cell", "lines", ",", "including", "lung", ",", "colon", ",", "and", "breast", "cancers", ",", "primarily", "through", "the", "disruption", "of", "mitochondrial", "membrane", "potential", "and", "subsequent", "activation", "of", "the", "intrinsic", "apoptotic", "pathway", "[", "28", ",", "29", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]